Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score ACATAAATTTAAACCATTCTAACTTTTTGTTTTGTAAGATTGTATTTTGTTTTATCCCAAAAGTAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3L 16907765 5' + jockey 30 1 58.04 TCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGA:1 - chr3R 10636179 5' + blood 7091 2 71.23 AACATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTGTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTGGG:1 + chr2L 18177001 5' - INE-1 539 1 78.08 ATTTTATATTTAATTAAAATGAAGTGATTTAATCAGTTGTTTTATACACGACAGAATTTTAATAAATAAATGTGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGC:1 + chr3R 27514648 5' + Ivk 365 1 50.00 TCTAGATAAATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 + chr2L 14480443 5' + Transpac 4984 2 68.89 ATTTGTATCTATGTATCTGAACCTGCCCAATTGAACTTTCCCAGCTAACGAGTATCTGAAGATACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - 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BS3 1372 1 57.53 AACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATA:1 - chr3R 21276620 5' - BS 5029 1 60.96 CCTGTTATCTTCCACCTTGTGTTTGGTATACCCGTTATTCGTAGAGTAAGAGGGTAACCTAGATTCGTTGCATTTCCGATCATATAAAGCATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 + chrX 21191236 5' + INE-1 88 1 57.50 AGGCTGTGGCAGAGATCCTTCGAGATCGCCTTGGGAGCGTTTTGGTCTTTCTAACGCCTTCTCTGAATCCGAGATGAATATCGACTTGACTTTGCTCTCCGACGCAAAATCTGACCTAAAGTCTCTGCTGAGCTCTGGGTCACAGC:1 - chr2R 387844 5' - R1A1-element 5090 1 67.81 GGCAAGCACGGTGGTAACTATCGATGCCCAACTATACTTTACATTCCACCCTGATTTTCTGAGTCTGACTTAGACGACGCAGCATCTTCGTTTTCCACTACGTATTTCCACAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2R 3188620 5' + 1360 15 1 76.39 AATATAAAATATGCATAATCGTTTAATTTAATCAATTGCTCCAATTAAGCCATCTACCACACATTTATTAAATCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr2R 11595811 5' + P-element 39 1 56.83 GTGCATGTGTGTGTTGGCCACTTGACATGCACGTCACAAATACACGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTC:1 - 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I-element 5291 1 66.18 GAGACACTTGAAGTGTAAATTTCATGGCCTCAATCAATGATAAATCTCCACGCAACAATGCGTCTATATCGGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAATAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 12899740 5' - roo 357 2 50.00 CTTGAAAATCAGCATGATTTTTTGATTTATTCTAGAGCGAAATAGCTGTGCAACTATTAAACAAAACTAAAAACCATATGTATATATAGACTAACTTCTCAAATTTCACCGATCAGTTAGTTAAGTGAGGGCCGTCCTCGGGTCTC:1 - chr3R 13854255 5' - gypsy9 4978 1 77.40 GTAATCATTACATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGC:1 - chr3R 934294 5' - Rt1b 4743 1 63.01 GTTCATCCAACCACTCAAACTAGGCGCATGCCTGAGGATGTCCACGTCGATAGTGCTTAATTGGTCTTAAAATGTCACATAAACTGGACTCTATTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAA:1 - chr3R 31359616 5' - invader2 4657 1 65.07 GTGAGCGGTCTTCAAGCAGTTTGCTATAAATGATTACCTAACGTAAGCACACCTCGAAAATATGTATTATGTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 + chr3R 17467076 5' + I-element 26 1 59.20 GGACGCAGCTGCAACACAGGCCACAGTCCGTGAGGTTTATTTAATATATTTGTGATTATAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACCTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chr2R 9455927 5' + 412 60 2 57.53 ACACAAAACTAACATGTTTTACGCTTCTTTCTGAATAAACCAATGAAAATTAATCAAAATTATTAACGTTTAGTTGGTATGAGTAAAACCAGTTTAATAAATGACAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTT:1 + chr2R 17358539 5' - baggins 5313 1 57.97 CAGGACAGTTGGTTCATGAGATTCATATGGATGAGCAGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 - chr3R 22840462 5' - Transpac 5165 2 74.42 GCCACAAATCTTCAATAATGTTGTATCATAAAACAAATACTGCTAATAACAATAACAAATAAAACAAAACAATAATAACAATAAACAAATACTGCTAATAAGAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2R 17187835 5' + roo 8682 2 33.56 GGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAAAGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 + chr2L 17957159 5' - blood 7335 1 54.79 GGGATTCAAAATGTATATTTCAATAGAAAGTGTAATAAACCTTTTGTTAGCGTTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTT:1 - chr2L 3282666 5' - flea 4948 1 63.70 TCTGGTCTTGTGCTTCACCTCCAACTTGTCCATTCTCTTGGGGATAAATGCCAGTTTCTTTGGCTTTAGCTTGGGTTTGGTTTTGGTTTTGAATTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 - chr3R 24021157 5' - mdg1 7435 2 69.18 AAGGCAGAGAAATTGATTTAACTAAATGCTTATCACTTTAATTGTAGGTGATAAATATAATGATTGGAAGCTCTTCTTTGCAATATTATTTTTACGCGAGCCGAGAGAGATCCATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTAGCTGCATAT:1 + chrX 17013170 5' + 1360 3338 1 60.96 CATTAAACCATACAAAAAGATTACGAATTGATTTTGTCCCCTTTTATATTTGTAATATTATTTCCTAGCAATGTACAAACTGGTAAAATAAAAGTCAAAGTATTGCATTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTG:1 - chr3L 16238047 5' - Ivk 5186 1 67.36 TGTGTCAATAATTCGATTTTATTGATATGCTATATGATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCC:1 - chr3R 14563717 5' + Quasimodo 77 2 78.08 AAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTT:1 - chr2R 4774749 5' - baggins 5338 1 64.38 TTTTTTTAATTTGTAATAATCATACAAAAATGTATTAAGCTGAGAAAATGTAAAATAGAAATAGCTAATTTTGTTGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chr2L 16224045 5' + hopper 2 2 48.12 TGTTTCTGGATAAACTGATAATCCCTTTTATCTCTGTGTTGTTATTAGTTACGGATATATGTCCAAATTGTTGTGCCAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2L 11613327 5' + hobo 42 1 55.24 AGCCAAATAATTTCAAACTTCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 - chr3R 19721225 5' - opus 492 2 76.71 AGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTACA:1 - chr3L 10563962 5' - hopper2 1516 1 77.40 GCCTTTATTTTTAGTGAAAAGTAACAGCTTGCATGCGTTTTTAAAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTAAAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGCTCCCGCTTTATTTAATTAC:1 + chr3L 20224090 5' - Chimpo 171 1 73.79 GTGGGCCCTCTTTTTGTCGATATACAATTTCCAATTTCAACAATAGATCGCAACTGAAAAATCAAAGTCCTAGGCGCTTCCCTACCTTACCCAGTGCTGAAGGTTCAGATCCAATTTATTTTCCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTCG:1 - chr3R 31684405 5' - G2 3077 9 79.45 ATGTTGCACTTGAGCTGCCACAGCCGTTTAATACCCTGCTATGAATTCCATTTAATTAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1 - chrX 20607089 5' - I-element 5294 1 58.22 CTGAATTAAAGTTCCTAAGGAACAAATGTAAAATGAGGCTATAATTAAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTT:1 + chr3R 5265656 5' - P-element 407 1 36.30 AATCTTTTCCCAAATAGCTAGTAAGTCAGAATTCGTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTTTAGCAATTATTTTCTAAGAGAAAATTGATCATGTGAATTTCAACAGAGCGATTGATTCCTCGGAAC:1 - chr3L 14951346 5' + transib2 2382 1 78.77 AGGGAGCCAGAAAGCCACAGTCTGCCGGACCGCAGTGCTGATAACAAAGGTGCTTCATGAAAAGCGGATAATAGCAATTATAATCCACAGCCAGGAAGGAGAAGGCGCCAGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 + chr2R 11001435 5' - blood 7178 4 24.06 ATAGGGGCTGGAACTCCGTGCTGGCTTATTTCACTGTTGATTTAGCATTCGATACCAAAGAACTTTGACCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 + chr2R 11379424 5' - hopper 1375 1 56.30 CACCCTGCACCATAGATGGCACAACTGGAAGCGAGTAAATTAAGTAACTTAATCGGAAGTGGTAAATTCTGTGCAGAAAGCGTTGAGACTCCATAAGATAATTTTCCCTCAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTA:1 - chr2R 7554338 5' - P-element 498 1 69.86 ACATAATAAGCCATATTGTTATGCCTCGTCATCCTTTTTACAATATTCCCTTTGTGCCCAACGGCTTACCTTTCACTGTTTTCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAAT:1 - chr3R 19590028 5' - BS 5077 1 61.29 GAAAAGGGGAGTGTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr2L 9319093 5' + jockey 79 1 64.38 ACGATATAGTATATTTACTACACCGGTTTTTCCAATTTCTCTTGGTGTATATGTTGTATATATGTTTGCCATATAATAAACTATTCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 - chr3L 5275032 5' + I-element 38 1 59.59 GCTGCGTTTATGTTTCTTAGCTCGAATTATATATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCGCTCCGCCCGCGAGACGTACACTTCCTCGGTTGCGACATATTCACGCGTCTGCTTTCTCAGAGTTTT:1 + chr2R 5045600 5' - invader6 288 2 77.70 ATCGGCTTGACTTCAGCTTAATATCGATCAGGCAAGGGGGGGGGGCCCATTGATTTTTATTTTTATTTATGTTATTTTTGTTATTATTATTGTT:1 + chrX 10575793 5' - mdg1 22 2 39.36 GGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGCATTTGCCTGGATATAAAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAATGATAACGCCCAGAAATCAAAAATAGTTTTTAGGAGA:1 + chr2L 7271844 5' - 297 324 2 67.91 GCGAGCACTGAGTTTTTCTAGTTCTCTTGCCCAAGTGACAACTCAAAGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr2R 7899192 5' + roo 73 2 67.81 GACAGTCATCAATAGCTAGATCGCCTGAGTGCTTCGATAAAGAATATTCCAGCATTTTTAGTCAAATATCACTGATAGTCAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACA:1 + chr2R 4330708 5' + copia 5 2 72.09 GCCTCGTGTGTATACTTTGTGTATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATA:2 - chr3R 29091434 5' + rover 6966 2 76.03 CGGGTGGTGCCACATGGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGAATTTGCCTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGG:1 + chr2L 7271829 5' - 297 327 2 67.12 CCACTCACTTTCATTGCACTTTAATCTGCTAGACGATGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCTGCTTCTTTGAGCT:1 - chr3L 16703853 5' - FB 1 1 62.00 TTGGAAAATAGAATGACTACATAAGTGAATAAGCGAATGAGTACATTATTTATCATAGAAGAGCAATATAGCGTTTTCCTCTGTGTGGCTGTTGATATAAGATGAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2R 6714000 5' + 297 11 2 77.40 ACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 - chr2L 20324202 5' + Tirant 8161 2 62.99 AAGTATTAAATAAACATAACTATAGTTATATAATTTATTTAAATTCCTTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGATCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCG:1 - chr2R 19289852 5' + BS 5067 1 65.52 GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGGGAGATCAAAATTTCCAATTAGTTATTGTTAATAAATTCCAAACCGCTTGTTTTTGAAT:1 + chr2L 20360644 5' - R1A1-element 117 1 54.33 GGATGCATTTATTGTAATTGACAGACAGGCGGACGGACAATCTTAAGTGGACTTTACAAGTTACTGTACTGTGTAATAAACCAATATATGCCACC:1 - chr2R 8452846 5' - blood 375 2 75.79 CCTCCCCTCCGCGACGCAAAGTGTCTCATTTAATCCTCGAAAATGCTCACAGAGCGTGCATATATATATGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGCG:1 + chrX 1764035 5' + opus 45 4 56.85 ATATCAAAATATTGATTGCGTAAGTGGGCAAAGCGAATGTCACAGATAACGCAAAACTTTTGGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 17904771 5' + roo 42 2 56.15 GATTTGCTCTGCTTCATTAATTATTGCACTTGGGTTCATTGTCTAAGTCCACAGACACCCACACATATGCACACGCATACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chrX 5145958 5' + hobo 33 1 57.97 ATAAGCCTCCCGGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr3L 18199944 5' + Doc 62 1 59.31 CAAATAACGAGCCGAATTTTTAAGGTCACAGTGCGGTGAATGTCCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3L 20399064 5' - roo 330 2 71.23 ACCCGAAGGAAAGGAAAGAGATCTTAAACAGAGAAGGATGGCAATAGCGCAGAGTCGATCTAGCGATGTCCGTCCGTCCGTCTGTCGGTATAAACGTCGAGATATCAGGAACTATAAAACTTATAAGGTTGAAATTCAGCATACAG:1 + chr3L 20500536 5' + INE-1 174 1 78.77 TATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGG:1 - chr2L 14480512 5' - Transpac 5150 2 72.60 TTTTATGGCTAAGTTCGACTTTTGCTTTATGGTAATAAACTTTTTATGGCAAGTTTGAGTTCTGAACTTCGAAGAACTTCAAAGAAGGCTTAAAAATATATGTTCTTAATTTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr3R 29622803 5' + pogo 7 1 68.49 TAATGAATTTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTGTATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGATATATACATATATTCTAGATCTGGATCAATA:1 - chrX 19192435 5' + INE-1 84 1 77.93 ATAAAAATATATATAATTCATTTGTTAAAACCATTTGCCGGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr3L 13545086 5' + hobo 50 1 52.05 TTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAAT:1 - 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I-element 300 1 58.14 AAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTA:1 + chr3R 19589913 5' + BS 5056 1 57.53 ATCCACTGTATCCGATAAGTATACTCTGTGAAGTACCCTCGCCTCGATAAAGTAACCGTTAGCAGGCAGCAGTGTGACACAGTTTGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr3L 20388099 5' - 1360 3375 1 69.92 AAACATTAATTAGCCGATCGATCTATCAGGTGAATGATATTGAGCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCATCTCTATTAAATAAA:1 - chr2R 15822091 5' + invader6 4546 2 54.79 GATTTAAAGAGTTTCACCAGCAAAGTAATACAAATAAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTCTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTCCCTTTAAATAACTTCA:1 - chrX 10128315 5' - invader3 5435 2 60.96 ATTAATATCTGTGTCATTTTTTAGGTTAATAAGGCCAAATTGAGTATATGTGCCAGACACACACTTAATTATCATCATATTTATGGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGA:1 - chrX 20874410 5' + F-element 347 1 67.69 TGAGCGGCATTTTCTTTTTTGCGACCTCCCCTCCCCTCCGCGACGCAAAGTGTCTCATTTAATCCTCGAAAATGCTCACAGAGCGTGCATATATATATGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACT:1 + chrX 1764006 5' + opus 16 2 73.29 AAGGAAGGCGAAGGCGGTAACCACCAGGAACACCAACAGCAACCAAAAGAACTGAGCGAGTTTTGGGTCGGAGTTCGTGTTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTTAG:1 + chr3L 13036114 5' + accord2 163 2 63.48 GGGGGTGATGGTGGGAAAAAGGGAAAAAGCGGCCCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 - 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TART-B 155 2 89.19 CGGTGAAGAACAGCTTTTACTTCTACCACCATGTGAAGCTATGGAAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCG:1 - chr2R 3188749 5' - 1360 3314 1 68.49 GTTGTTATGAAACTATGAAAAATTTTTCAACGAGTCATATGTATTGGTAGAAGCTACATGCTTAATGAATTAATGCCTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr2R 11562796 5' + pogo 43 1 56.16 ACGTAGCCGAGCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - chr3L 14084975 5' - opus 7450 2 55.48 CCCAAAACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGATTTACCACCCCACCCCCTAAACCCACACGCCTCTAAAC:1 - chr2L 20324208 5' + Tirant 8127 2 60.61 ATTTAATTTGACCACCACATAATTTACTTTAACAACACAGACAAATTGATGAAGAAACACATCGACAAAATATAAACATAGATATAAATATGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACGAATTTAAAAAGCTTTA:1 - chr2R 76774 5' + 1360 3010 1 58.90 CGAGCTCCCATTTCCCTGGGTGCCTCCCATTCGAGCCATAGAAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTT:1 - chr3L 18738172 5' - Bari1 1660 1 54.79 GCAGAGATAGATGAATAGAGTTGAACAACTAATTAAACTTGAACAATGGCGTAAAGTTGGCAAACAAATGACATTACTTCGACTCCAGTCTGGTCAGTAAGTAGTAGTAGACTCTGATTAGCTGTTATAGTTCCTGACATCTCGAC:1 + chr2L 8831926 5' - INE-1 145 1 77.40 CCTGGGTGGACCTCCATTTTCTGACACCTCTTTGAATTGCGTATTTTCCTATTTGCAATAATACATTGCAAATTGTCTCGAGAACTTTCGACGACCAAATATTTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACC:1 + chr3L 13837372 5' - Rt1b 5110 1 70.55 ATCCCCTGTTAAAGCGCGTTATAAAATGTTTGCAAATAAAAGAAGGATAACATGAAAAACTAACCGGATTTTCTTTTTTTTCCTTATCTACACATTCCATTTAACAAAAATAATTGGAATAAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACAT:1 - chr2L 21670399 5' - HB 66 1 78.08 TACCAATCCCTCTGAAAGGTATTTGCAATATTAATTTCCCATGCAGCCAGTGACTTGGCCTTTTGTCAGTTAACAAAATGTGTGGCACATAAAAAATTCATTCGCCAACGCTCATTCACTGCCCGCATTATTACTCCAGACGCGGT:1 - chr2R 15621477 5' - diver2 4439 1 78.08 CATATTATTCGATTTGGAATGTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3R 27188649 5' - roo 9029 1 56.85 TATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTTTGCACTTGATTATAAAATATATTAGAATTTATCGTATTTGTGGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTC:1 + chr2R 21425117 5' + HMS-Beagle2 6887 2 65.75 ATACCTAAATACATATTGCACGTCCCCTATTAAACTCCAAATAATACATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGTGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCACAGGTCTGCA:1 - chr2R 2323715 5' + HMS-Beagle2 73 2 62.33 CCACATGATCAAATTTTGAGTTAAATATTTTAAAACTTTCTGTTCATGGATACTCTTTTAAAAGAAATTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATATTTTCATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCA:1 + chr2R 7407935 5' + Idefix 12 2 76.03 GTCTACGTTTCGGGTTGCTGCACTGGGGGAAAATATAAATTAATTACATTTAAAGTGGTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTC:1 - chr2R 16436312 5' - Quasimodo 6928 2 60.27 AATTTGAAAATTTAATTGGCAACACCAAATGCCCAGACAAAGGAGCGTAACAAGAGCGAGCGAATGCAAAACATTTGCTTGCAATTCAGTCTGTCGGGCAGCCTTATTTTTTACCATGCATCGTGCACAACTTGCCAAATCTGACC:1 - chr2R 6111312 5' - HB 1219 1 70.55 GATAACAAGAGGCAAAGTGGCTGCTCGGATCTGTTTACTGACATCAAAAACAGGGCCAACAGTTAGTGCCTCATCAACGGGAAGCTGCAATCGGATATACAATAAAGCCCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chrX 12997950 5' + roo 8676 2 79.45 TATAGGCGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr3L 13472407 5' + jockey 73 1 62.33 CGAAAACAAAACTAAAAGCTAGACAGATTTTTGCCTGATTACGCGCAGCATTCACTCCTATTTCCCCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3R 25409676 5' + jockey 25 1 71.23 TTATAAATTTGGTAGTTTAATTTTTATTAGTCCAAACAAATATCGGATTATATTTTTGTTTCAAGTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 4661920 5' - 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Burdock 6072 1 56.92 CCCATGTCCATAAAGTGGCCGTAGAGCAGTCCTTGCGGGAACTTTCCCCAGGCATCGAAAACTGTAAGACACGGACACGGAAGGTCAGTATATAAAGTATATCCACACGGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTC:1 - chr2L 1219696 5' + 1360 3317 1 73.79 AGTTCGTTAGAACTTAATTATCGTCACACATGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATG:1 - chr2R 3120341 5' + accord 28 2 56.72 GTACGAATGTTGATAGTTGTGTTCGCTGTGTGTTTTCTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr3L 15859585 5' + I-element 30 1 64.14 ATTTCGGGTGGTGCCACATGGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGAATTTGCCTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGATTT:1 + chr2L 7271825 5' - 297 331 2 63.01 GTCTTGTGAGAAACTCTGCGAAAGCGATAGGCGAATAAGTTGCCAACGAAATTTATCGCAAGACCGAAAGAGAAGACTCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chr2R 10599965 5' - 297 355 2 59.03 ATGTGATAAAAGCCCGACTACAGTTTGAGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 + chrX 15137408 5' + jockey 4744 1 79.37 ATTTAGTTACTAAACGAGGAAGCTTAAGATTAAATAAAGCATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:2 + chr3R 12610013 5' - roo 8990 2 73.97 ATTAAGATAGTTTGTAAAGAATTAAGATAAATTATATTGTTCGCAAACAAATATAACACATTCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCA:1 - chr3R 5024913 5' - diver 6051 2 67.12 ATTGCTAAATTTTAACTGAAACATTTATCCACCAAAGCACTAAATTATTCCTGTCCCTATAGAGAACTGGGGTGAGCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 - chr2L 17206116 5' - hopper 1382 1 63.70 AAAAGGAAAAGATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr3R 6412085 5' + Tirant 28 2 65.19 TGATATACATATGATCGCGAGATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAG:1 - chr3L 20224258 5' + Chimpo 39 1 59.59 ATGTAATTTGCATTTCATAAGCCTCCCGGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 + chr3L 18199928 5' + Doc 47 1 52.74 ACGAATTTCTATTTGATTTATGCACTCCCTTTGCAGCATATAGTTATGTGGAGGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAA:1 - 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P-element 2837 1 51.39 GTCCAGTTCCAAGACGGGGAATCGACCTGGCCGAAACCGCAATGCACTTTGACTAGCCGGATTCACCATATTACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 10461638 5' - roo 361 2 53.42 TAGACGATATCCACTGTATCCGATAAGTATACTCTGTGAAGTACCCTCGCCTCGATAAAGTAACCGTTAGCAGGCAGCAGTGTGACACAGTTTGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCA:1 + chr3L 20388091 5' - 1360 3360 1 64.38 CATAATCTATATCGATGAATCTCCTAAAATCCACATTTTCTGTGCGTGTATCCTCTGCAGTTGGATTATCGAGTTCTTGTTGATATAGCTAACAAAGACTCGAAGCGGCCACGC:1 + chrX 7510285 5' - Gypsy6A_LTR 117 1 67.54 ACTTACCTGGGCCAAAAGCCACCGGCTGGGAAAATCTAATAAAACGAAAGAGCTTTTGACAGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chrX 17027858 5' + roo 58 2 56.55 ACTGGGTCTGCTACTCACATTTGCATATCAATTTGTTCGCATTCGTTCGTGTTATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAG:1 - chr3R 25409881 5' + jockey 4568 1 55.83 TCTATAAAAATGTCATATTTTACTCGCAGTAACTTGTACAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGCGATATAAGATCA:1 + chr2R 8452759 5' + blood 7094 2 73.29 GTCATGGGGAAGGAAATCTAATTGTTATATTCGTTAAAAAGGCGTTGAAGAGTATACTAGATTTGCTGAAAAGCCCGTCGGACAATATGAAGTATATATATAGATATAACTTACTGATTTAGAATTATGTGTTCCATGTTGTAATT:1 + chr3L 21223685 5' + transib3 326 1 67.81 GGACGTACTGTTCGCCATGACGACGTCTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGC:1 - 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chr3L 2278265 5' + roo 54 2 54.11 AAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr3L 20388217 5' + 1360 63 1 62.24 ACCGGAAGGAAGTCAGTAAGATTGTGCACAAAAGGCCCAAACGCGCACACAGGCACAAAAACACATACACACTCATACATACGTATAGGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAA:1 + chr3R 16530529 5' + hopper 30 1 65.07 ATTTTGCAAGCCTTTCTTAGCCATGTATGCCATTGTGAACTCGTTAGACTTGCATATATGTACATATATTATTTAAAAATTCCATTTTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chrX 20632698 5' + pogo 30 1 62.07 AAAAGCACCAGAAACAAATTGTTTAGTTTTGCTGCTCATTCTTCTTCTTCCACCGATGCCGTAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chr2L 19158820 5' - P-element 2839 1 48.89 TGTGACATTGCAATACCTCCATATTTCATAAGGTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 - chr2R 14940741 5' + blood 7096 2 75.00 ATTCAAGGGGATCCCATTCCGCAGTCTGCAAATGCAATTTTGTCGTTGCACTGGTCTAAGAAAATGTCTGGCAATTTACGGTCGGCCCCGAAAAATATATCGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGT:1 + chr3R 10515453 5' - BS 4718 1 71.64 GTACTAAAATAGAGGCTTCCGATTGCCCTTTTGTCCCTCAGTATGGAAACCGGGTGCATTGGATCCGATCCAGCTGTAGGATCCAGTTCCCCAAGGGTTGCATTTCCCGCAAAAAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chr2R 10548053 5' + G-element 4324 3 79.84 ATCGTTATTAATTTTTGGTAATACGCCAATCTTTGGAGTTAGTAACCCGGTATACTCAAAATTGATTGTGGCTTAACTTTAACTTCTAACCAACAGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAG:1 + chrX 22493937 5' - 17.6 7248 2 66.44 GTCGTGTGGCAAATGACGTGCGTGCAATATTATTTGGACTTGTTGATTTGCAGTGTTAACGGAACTGCCTCCTAAATCGAAATACGGAGACCAACTGACTAGGCATTGGATATAGATGTATGATTGTTTATTATTATTGCTTATTA:1 - chr2L 19548581 5' - flea 5005 2 71.23 CATAAAATAAGTAAATTGTATGCTAAAGCATTCCAATTCCGCTTCAGTCCTCTCTTGTTTTCTTCAAAGTCTTGTATGTAGTCCTTTTAGTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGG:1 + chr2R 5775455 5' - G2 2971 1 64.38 ACTCGCTGGAGGTTTATTGCATTGAAGGTGAGTTATATGGCCCACACAGAGCTCATACATATACATACATACATATACGTCAAATTGCCAGTATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATAT:1 + chr3R 11040047 5' + Idefix 44 2 58.90 TGCGCCGTCCTTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTATTTTCCCTTTTGCGGACGTCCTGCTGGGTTACGAGGTCCAGTTAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGCTCGTCAAAGTCCGCACTGTTACCGTTTGACCTC:1 - chr3L 24300072 5' - gypsy8 135 2 39.42 ATATGAGTCCACGTACGCAGTAATGTGAAAAGGCTTAAACATATCCAATTTCATACTTTCCCAAATGCCAAACGAAATGTCATTATAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chrX 6423147 5' - roo 9044 1 61.36 GTGTTCATATTAGTGTGACCATTTGCATAAAATTTCACCGTTTTCCCTCAATCCAAACGCGGCCGCATTTCATTCCAACAGTATAAGACCCCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr2R 18440531 5' - P-element 2859 1 63.89 ATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATA:1 + chr2R 22287426 5' + jockey 4848 1 65.07 GCTCTGTACGGCCCAAGAAACCGACGATAATTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr3R 10361922 5' + roo 8749 2 78.32 CTTGTTATATATTATGCGTATTTGCATTAATAACATATCGCGAAAGACCTGCTACTGCGCGGCGTTTTTAGGCCTGCTTCTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr2R 16891735 5' + jockey 4685 1 75.91 GGTAAGTTTATTCAATTTTATGTTTAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGTACAGATATAGTCGTATATGGAATTCCGCGACTATCAGATACCCGGTACTCATCTAGTGTGAATTGCGAAAATTCATCATTTTTCTGGGATATCGATA:1 + chrX 14001011 5' - INE-1 503 1 69.86 ACCCACTCCAGATGAATAGTGAAAAGCCCTCGAATATGATCATAAATATTTAAAGTTTAAAGTGGCAAAGTCCGCACTGCCTTGAAAATTTTTATTTATTTATTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 - chr2L 12832963 5' - I-element 5326 1 61.64 TGGGGACAGCTCTGAAGGTTACACTTTCAAAAAGAAACCTGAACAACGTTGAAGCTAAGGAGATGACATTTGAGTATTTTACTAATATTAGCATAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr3L 24253549 5' + 297 6603 2 71.23 TGCCAGACATGCGCGCTAAAGACGCTCCAGAGTTTGTTGAGCTCTCTAGACAAGGCGGCCCGGCTATATTCCATATCTATATCTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr3R 28579614 5' + pogo 34 1 62.33 ACCGCAAAATGCAGTGAGTATTTAAATACTGAGCTCACCCAACAAACGGGAACGCGAATATAAGAATGTGGACAAATAAGAGTTTCGAAGAGAGTGTGAGATTCGCGAGCATGAGGAAATATCATAAGGTG:1 + chrX 10806823 5' - P-element 2886 2 67.94 TTTCCAAGTACTTTCTCGCCATTTGCAACTTTGAAACTGTGTAAAGAGCTTTAAAGGTCTTATTTTCGACACAATTTCACACATTTCGAAGCTGTGAAAATGTCTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 - chr2R 11595969 5' - P-element 2871 1 71.92 AGTGAATGTATCTGCATGCATATGCGACACGACAATACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATAT:1 - chr2R 15151099 5' + hopper 88 1 77.40 AGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATT:1 - chr2L 15322928 5' + diver 267 1 50.98 GGGAAATGCATTTTCATTTTTCTTGATTTCGCGCATAAAATGCGCATAAGCCTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2R 20739126 5' + hobo 29 1 64.29 GTTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGATCTGTTCCTTAATTATAATGTGTACAAATGTACAGTGAAGAGATTATGTTATCTTACGTGTTCATGGGGGTAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGAAGGGAAATA:1 - chr3L 11816234 5' - G5A 2667 1 62.33 AGATTCTATAGCACTTACCAATAATGAAAATGTCATGAAAACCGTGCATCAAGCACGCCATATTGATTTAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAC:1 - chrX 128743 5' - 1360 397 1 55.56 AATAATGTTGTATCATAAAACAAATACTGCTAATAACAATAACAAATAAAACAAAACAATAATAACAATAAACAAATACTGCTAATAAGAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2R 17187822 5' + roo 31 2 42.47 CATAAAAACACCAGCTCCGCCAGCCAGCATCCTTAAGTGCAGCTTTGTCGTCCTGGGAACTGGGGAATGTGGAATGGGGTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTAATTGTAA:1 - chr3L 20048095 5' + Cr1a 4032 1 52.74 TTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGC:1 + chr3L 24213780 5' - invader2 170 2 70.55 AAGGAGAACCTGGGCCAGCATTCTGTTAATGAGGAAACACTTCAGAAGATGTCCTCGTGTGCATTGTTGGAGAATGCCAAGGCTCAGCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATT:1 + chr3L 2654000 5' - P-element 2697 1 59.59 AGAGCAACAAGGCCTTAATTTGACAAAGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTTTCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTAC:1 + chr2R 9410485 5' - hopper2 1517 1 74.66 TTGGATCATGTATACATATAAAAAATGACTATTATATAAAATGCTATATATCTGTGGTTATATCTATGGAACCACGGTTTTCGGGCTTCCATTCATATTTAATGACATTGGATACCATTTTGGCAGAACATTCAAGGGTTTTTAGA:1 + chr2R 6989083 5' - HB 434 1 71.23 CATACAACAATAGCTGTACGATAAACTGAATGTATAGTATATACATACTAGTTCTGCAAAAAATATTTTCAAAATCGTTATTAAATTTTGAAATTGATATCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2R 8687949 5' - roo 9050 2 70.55 CAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAAGAAATTCCAAGTTTACACACGTTTGAGACTGTCACACTATAACCTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTTC:1 - chr2L 12643085 5' - rooA 7550 2 93.06 AAGGTTACACTTTCAAAAAGAAACCTGAACAACGTTGAAGCTAAGGAGATGACATTTGAGTATTTTACTAATATTAGCATAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCCTTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3L 24253563 5' + 297 36 2 61.64 TTTTCCAGTCGACGGTTGGGGAGCATCTCTAACTTCTACATTTTGCCCCTACTGATTGTGATGCACTTCATTCTCACTCTTTTTCCACAACTACTTACAATAGAACTAATAGAAGGTTTAATAAAGTATTTTCCATTCCAGTTTTC:1 + chr2R 19077342 5' - ZAM 484 1 58.22 TTGAGCAAAGTGACGACAATGGCTCGACAAATATTTTACCAAAGATTCAGTTTTGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3R 19543501 5' + roo 67 2 63.70 GCAGCACCGTTCCCACACACCCCATATGTATTTATATATATTGTTTGCTTATATATGTGGCTTGGCCTACAGTATAGACCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3L 12899868 5' + roo 8690 2 63.28 AATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAAGAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chrX 4214462 5' + jockey 74 1 60.69 CACGACTGAACGGTCGGACGACTTCATTGGTGGAAAAGGCACTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2L 13717304 5' - P-element 2851 1 42.72 TGGGCAAATTTAAAAAATTCCAAAGATGACGCTTTACTGGGATTGCTTTTCCATTGCTCATATATTCAGTAAACAACAGTGAACCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr3L 21151212 5' - 412 457 2 60.27 CGACCCATTGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAAC:1 - chrX 21667978 5' + gypsy2 28 2 71.23 CCCCAATCGATAGGCAGCGTTTAGTGGGACAGATGACTCCTTTTGATTGACAGTGTGTGTTTGTACGTTGGTGTTTCACACTGATATACTATACACAAATGCACATATATTTATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2R 9504365 5' + roo 4 2 77.40 GCGGAATACCAAAATGCAATCAAAATATGCAAGCCACGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 - chr3L 14551371 5' + P-element 84 1 27.59 TCTATCAGATATTAGCTACTCAACAAGAATTTCCAAACTGGGTTGGTTCGCTCAGCAGGTTTTCGACAGCTATACAACTTTTCTGCTTAATATTTAGAGATCATAATATAACATCTCTCTATAGTTTTGTAAATTTGTAAATTTAT:1 + chr3L 7953027 5' - Stalker4 7049 4 84.25 GACCAAACTGGTTCACTTCGAGTTCACTGACCCAGCTAAGACAAAAAGTAAACATATTGGCAAGTGGAGAGCCAATAAAATTAAGAAGTATGTCAGAAATATACATAAATCTTGTTGTAATATGATATAAAAAATGAAATAATAAA:1 + chr2R 16799032 5' + Tc1-2 384 1 54.11 AATCCAATTGAGGGCACACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGTAGACGGCAACTGGTACA:1 + chrX 22834573 5' + Tirant 8168 2 80.00 GTTTGGGAAATGCATTTTCATTTTTCTTGATTTCGCGCATAAAATGCGCATAAGCCTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr2R 20739130 5' + hobo 31 1 63.01 GTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr3L 27391430 5' - 1360 3373 1 67.81 GAGAGCGCTTGGGTGAGAGGAGAATGTCTGGCATGGAGAGTGAGAGAGCGTAGCGTGGTTGGGAAAAACTGCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr3R 11773878 5' - P-element 2838 1 52.74 AACATCGAACACGAAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGAC:1 - chr3R 2520364 5' - Tc1-2 1620 1 59.59 AGACAGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGACGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTTACATCCTGCTCATCGAGGTCATACCTTGACTGGCAGTC:1 + chrX 19820622 5' + Rt1b 4980 1 53.04 AGAATATAATATAAACCTAATTTAGATTTTTTTTTCAAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTATTGTGATATTCGCAAAAAACTA:1 + chr2R 5357208 5' + Juan 101 1 34.88 GATGGAAAATTAAATTGGTGCTAATTTTTTTTGCTAACTGATTGGCGTAGAGTTTTTCTTTGTCGTTTTTACTGTTGAAAATTGGCCAACTTGACATAAATTTGATATGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 3648667 5' - roo 396 1 75.34 ACGTTGAGCAGGATCAAAGAGTCTACAAAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2R 16510220 5' + roo 8713 2 52.05 AGCGCAACTATGCCACATGGACACGGACGCAGCTGCAACACAGGCCACAGTCCGTGAGGTTTATTTAATATATTTGTGATTATAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr2R 9455951 5' + 412 28 2 64.49 TGTGCGTGGAAAGTCGGAAAATTTATGCCGAACGGGGAGAAAAGTCATTGGGAGTCATTGAACCCATTGAGAGTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTCTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCGCTCT:1 - chr3R 9028779 5' + Cr1a 288 1 50.00 GCACAAACTTTTCTCGTTCCCAGCATGCCACTGTGTGGTATGTGTGTGTGGTGCGTGTGTATGGGTGTTGGAAAATCTTTATAAATCACATTTATTTATTATGTACTTATTATTGGTTCCTATAAATATTGTTATTAATCATTAGT:1 + chr3L 10313558 5' + Gypsy12A_LTR 1817 1 44.52 ACACTGATTCATGCCAGTTATCTTATCGTACATACATAGAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCATTTTTTTTATAAAAT:1 + chrX 15019725 5' + S-element 87 2 77.40 AAGGTGAAAGGTGTTCGTCTGTTGATTCAACCCTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chrX 5206562 5' + Tirant 8 2 74.53 AAACCCGTTAAGAGAGCCGAACAGAGCGAATTTCGTGAGCAGGACATGAGTAACAAGTTGTTGCACTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chr3R 25137850 5' - P-element 2844 1 52.59 CTTTGTTAAATAAAAGTTAAGCTTTTCACTTTAATTTCAATCGAATTGTACATACGAATAAAATTGTAATTCCACCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chrX 6423285 5' + roo 8707 2 55.17 ACGAGTGTGCATGTTAACGTTCGAATGCCCGATATACATATGAATGTTTGTATGTATGTAGTACATACTAAGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 - chr2L 470316 5' + Burdock 6183 2 58.22 GATCGAAAATCAATTTGAAGCTCAACATTGTTGCCATATCTCAGTTAAAAGGCGACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGAGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACGGAAATG:1 + chrX 20460557 5' + diver 69 2 58.90 TTCCTGCTTATAAGGAAGTAGGTGCCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAGGCGAGTGTACATTCCAGATCTAT:1 + chr2R 14722695 5' - mdg1 7368 2 77.40 GTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:2 - chr3L 2184953 5' + jockey 74 1 68.15 CTCGAAAGCTAAAGGATTGTTTTGAATTTCAAATCGTACCCATTAGGCTTAGAGAGCAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 19543408 5' - roo 9009 2 60.27 GTACCAATCATGTTTTTCGTAGATTTTCCTAATGGTTTGACATACTACAGTGAGCTTAAAATACCATTATTAAAGATAAGTAAAATCAAGCTATCCAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:2 + chr2R 9091904 5' + 412 7078 2 68.49 AAAAGCAATTGCTGGAGCAGTTAGAAAGAGAAAATATAGATACTTTTGTTCCCGGCTTGCATTGTGTTGTCTGTGCCAAGTGTTACAGTTACCCGGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3L 4855872 5' - P-element 2861 1 53.42 CATACATACAGTCACGTACGCGATTCTAAACAAGTTGATGAACTCTACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr2L 19158906 5' + P-element 64 1 39.26 TTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGATGCATACGAAGAAGCATACGATCATATC:1 + chrX 10128192 5' + invader3 51 2 57.28 AGGCTGAACCCATAGCACCGCTTTCCATCTTCTCGTGTCGTAGCAAACGAGTGAAAACGCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACA:1 - chr3L 1538811 5' + roo 9031 1 59.59 CTAAAAGGAGACTACGATAATTGCGAGCCAAAGTGGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCT:1 - chr3L 9762297 5' + jockey 4784 1 60.96 ACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTACTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 24021633 5' - pogo 2033 1 74.42 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTT:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 408 2 61.34 ATTACGCTTTCAATGGGCAACAATAATGGACAGTGTGCTGCCTCTAGTCTTCTTCTTCTCGCTCTTTGCGGCCATAATTTATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chr3R 16228800 5' + P-element 38 1 56.85 CACGACACTTTCTACTACGTCCAGGGAGTGCAGTATCTCGACCTGTCCTTCACTAACTTCCTGACCTATAGCTACCAACTGCAGTTGCCCACTCCGTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr3L 20363946 5' - blood 169 2 79.66 CTGCAACACAGGCCACAGTCCGTGAGGTTTATTTAATATATTTGTGATTATAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTTTGTTTAT:1 - chr2R 9455919 5' + 412 68 2 63.01 AACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATA:1 + chr3R 21276555 5' + BS 5077 1 72.22 TTTCCGAACTCTCCATTTTCACTCAAGTCTTTAGCGCGCCATAATTTGATTTGTAGTTATTTAACGTGCTGCTGATCTGGCTCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTG:1 - chr2L 6268064 5' - 1360 48 1 56.16 TGGCGCACTCCCAGATACTCGCACGCATACACGCGAGCACGTGCGGCGCACACAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCCGATAAACAC:1 - chrX 6377360 5' - hobo 2911 1 51.89 CAACAATGTGCGCAACGACATCAGCGGCTTATGTTAATGAGCACTTACAAGCTATAATGACGGTGGGTACGATGGCGGTGTGGGTGGAAATGGACAGGAAATTTTATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 - chr3R 20942556 5' - jockey 4978 1 70.71 ATGAATTTGTAATGTCTTGAATATTTGCCTTCATCGGTGACAGAGCAATTAGTTAGCCGGCACTTTGCACTTGGGATGGCATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGC:1 - chr2R 13471455 5' - flea 4974 2 57.53 TAGCTTGTTGAGTTGCTAACCAGGATCCGATCCGAGGGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3R 10461731 5' + roo 8747 2 75.34 GTTTAAATGGGTTTTCTAATTTACCTGTGTGATGATTATGATGTGCACCTTGGGTGTAGCTAAATGATTACAAATGCGCATCAATGCGTTCCATTCTATCCTCTGTTTTTATTTAATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 - chr2R 2127182 5' - I-element 5337 1 63.01 CACAAATTGCTTGAAAGCGAAAGTTAAAAAACAGCTTGCTTAAAAACTGAAATAACAAATTTAAACTTAGTGCACAAAACAAAAGGCTATTTTTGTTTATTGAGGAAACGCCACAGAATTTTTTTAAATAATCAAAAAAAGGCTAC:1 - chrX 13975961 5' + G2 3056 1 66.44 GCGAGAAGTTCTTTTCTGCCAACCTTAATTTGGGGTTAAATTATTGGTAAGTGGTTCTTTTAAAAAAGTTTTCTTTTTTCCCATCACTGGATGATGGGAACATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTC:1 + chr2L 11856174 5' + jockey 4886 1 70.55 GTAAGTCCAAAAATGGCTAATTTGAAACTTTGATGTTAGTATCATTAGTATCTAGGATAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr2R 5268961 5' + pogo 60 1 60.27 AGTGAACAATTGGATTGGCAATAGTTTAACAACCAGTTAATCAATCGGTTTCTAGTAATTATAATAAAATGATCTGTGACATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2R 17187723 5' - roo 9031 1 54.11 GGTAGGCTCCTGTCTCGTCCTGCAACCGAATTACTGATTAGTATCGAACCAAAGACAGAAAGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACACACACATAATGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGTGTAGAAAAGAGCTGT:1 - chrX 1514480 5' - 1360 138 1 58.22 GATGTAGCCGTAGGAAGGAAAAAAGGAAAAGATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr3R 6412105 5' + Tirant 8114 2 79.10 TAATTGAAGGACCTACGATATGATTGGAATAATAACATTATTCTAACGTGTCCAAAGTCAACCGAATATATTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTT:1 - chr3L 19995035 5' - roo 8617 1 52.05 AGACGGGGAATCGACCTGGCCGAAACCGCAATGCACTTTGACTAGCCGGATTCACCATATTACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:2 + chr3R 10461649 5' - roo 9014 2 58.22 ATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGATGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGT:1 - chr4 651046 5' + micropia 54 4 55.48 CATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3R 14494097 5' - roo 8997 2 70.55 TAATTTTACATGTCTTTTAATTTGTATTTTTTAGTTAAATATATTTTTTTTAAATTGAAAGTTGCAGAGGAATTTCTTGTACGAATTATATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chrX 22676306 5' + 297 6610 2 63.01 CAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATA:1 + chrX 10128183 5' + invader3 5235 2 53.64 CCCCACATAACACAATATTTCCCTAATGTCTTTATTATGTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCA:1 + chr2R 9934113 5' + Rt1b 4943 1 67.81 AATTGAGGGGTAATTCGGAAGAGGAAGCGCGAAAAGGATATTACAATCAGCAGCTCTGATTGGGTGCTCTATACCTTTTTGTACTTCAAAAAAACTTTGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chr2L 12682331 5' - P-element 2863 1 65.75 ATTTTGTATTGCCGACACTCGTCGGGGGGTTGACGTTTTTTGGTTTTTGCCCGCTCGTTGAATTCGAGTGCTTTCGGATACCCTAAAAACGAAATTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAAT:1 - chr2R 11097414 5' + Juan 4052 1 62.33 GCAACAGTGGATCCCAGATCGACAGCAAGCAGAACATCGAGTGCGTCGTCTGCGGCGACAAGAGTTCCGGCAAGCACTACGGACAATTTACCTGCGAAGGTTTGGTTTCAACAAGAAGGTGCAACGGCATACACTTCAAGAGCA:1 + chr3R 12282151 5' + mariner2 475 1 70.14 AGAAGGGGAAAAGGGGAGTGTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 9319086 5' + jockey 35 1 56.36 GCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 + chr3L 19574040 5' + 297 54 2 60.27 GTTTCTGTGTTGCATATCCGCAGGCGCGCAATTTGTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTTAATTATTT:1 - chr3R 5868243 5' - jockey 4936 1 70.87 AGGCCCCCAAACGAGGCGACAGTATGTGTATTTGTGTGCGAGAGTGTATGTATGTGTGAGTTGTGTCGCCATGTGTTAAGTAACGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGT:1 - chr2R 14995030 5' - roo 8958 2 43.15 ACGTGCCTCAGTATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr3R 4532991 5' + 1360 37 1 59.86 AATGCCTCGCTGCGCTCAAGTGAAAACAGCACGGGGAAGAAAATATATAAGTATATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAA:1 - chr3R 26432073 5' + Quasimodo 63 2 69.18 ATTTGCATATTTTGACAGCGGAATCGACTGAAGAGCAAAAAATGTTGGCCCAAATGAGAAATGAGAACGCCTGACGCTAATTACAAGAATTTATTGAAAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGG:1 - chr2L 15799952 5' - R1A1-element 5255 1 66.44 ATAAAGTGTTGAGCATATTATTCGATTTGGAATGTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTT:1 - chr3R 27188662 5' - roo 390 2 71.11 TATTAAAGATAAATGAACGATGCCTGTACTGTCAAAATTTTTATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAA:1 - chr3L 13166303 5' - I-element 5276 1 73.97 CGCTAAATCGAAACCACAACTACAATCACTGCGGAATACCAAAATGCAATCAAAATATGCAAGCCACGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTGACCGAAGTATACAATTAAATACAGTGCACGTT:1 - chr3L 14551401 5' + P-element 55 1 47.95 ATTCGAACAGGCAGTCTTTGGATCCTAATATGTCTTGGATATTTGTAAAGACTTATAAGCTTTAGTCTTAGTTTTGGTATATTCTGAACTTAACGAACTTAAGTTAATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAG:1 - chr2R 25075839 5' - 17.6 7162 2 71.03 CTGCTTCAAAGTGGAGTCCGACTTATAAACTACTTTTGGATAAACCTTGACAGAGATTATTCCCCTGGAGTTATAATCCCCCTATAGAGCTGTTGATTTAAAACTCTTAAGCATTCAAACCTTTATAAAAAAAAAAGAAAAAGAAA:1 - chrX 19332855 5' + BS 5103 9 41.10 ACCGTGGGAAACCGTGGCAAACCCAGGAAAACCAAGGAAAAACCAATGAAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTG:1 + chrX 12806169 5' + 297 473 1 66.44 TACTTGAACCTTTTGAAAACGAAAAAAACATTTAAAATAACGTTTTTACTAGCGATACGCGTTATTTGACACTTTTTATTGAGCCTGCATTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTT:1 + chrX 21186631 5' + hopper 90 1 65.32 CATCTTTTTTGCAGCCACTGATTTTTGGTTGTTAGTGTTTACTTTTCTGCGTTCCCCAATCCTTATCACAGTGCAAATTATTTAAAGATGGATCGCACCGTCTTACGATCGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGCAGGGCTTC:1 - chrX 691639 5' - Gypsy6A_LTR 348 1 52.05 ACGGAAATAAATATTTTTTAATTGCATACCAGATCTGTGTTGTGTCGTGATCGGCATTTGTAAATATATGTATTTTATCTTGATAACCACAATTTTAGTAGTTGGTTTTTTTTTTAATAATTTAGTTTT:1 - chrX 22637796 5' + hopper 163 1 68.22 GCTGAGTGCAACCAATGGCAAAAATGAATCCACCAGTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATG:1 + chr3R 30558232 5' - I-element 5274 1 73.97 ATTTCATGCCGTAAAACTTCCGCGTGATATATGTACGCCTTCTAGACGCGTTTCTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCC:1 + chr2R 15481063 5' + 1360 3176 1 63.01 AAGGGGAGTGTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACACAC:1 + chr2L 9319096 5' + jockey 72 1 62.50 GTATTGCATTTTTACTAGTTGACACCGCATCCGTTAATTACACAAGCGAATAACAGAATCTTGTGGAATACCTGTGCCGACGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr2R 18440380 5' + P-element 39 1 59.59 TAGGAATATTGGCACTTGTATATATCTGAACATGTTCTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGCAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGCGGTCCAAACCAGAC:1 + chr3L 19573997 5' + 297 6590 2 77.08 TGTATTTTGTTTTTGGGCTGACTGTCGTGTGGCCCCAAGGGACCGCTGCAGTTGCAAATGCTTGAAATTACATTTTTCGCATTAATAAAAATGAAATAAAAATAAAAACCGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr3R 25843486 5' + I-element 14 1 76.22 CATACGAATAAAATTGTAATTCCACCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chrX 6423234 5' + roo 52 2 74.04 GAAGGATGCTGCACTCAATGCGCTGCTCCGTCGCCAGCCCCTCGTCACCGCAATTTAGTGACGTCAATGGCTAAATGACTGAGTGGCCAAATAGCAATGGCAGAGTGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr2R 7889320 5' + jockey 20 1 76.55 GCACATGTTAGCGTTATAGCGCCAATTATGGCTTGCGACAGGCAAATTCGTCGCATTCAGGCTGCCCCAAACCAA:1 - chr2L 21591731 5' + BS3 1357 1 89.33 TCTGTGATGTCAAACCAATAGACAAGCATATAACCGAACAATCATGTTGATTTTCACACGACTGAGTCAAAATGAACACTCTCTACTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCC:1 + chr2R 17701231 5' + Quasimodo 405 2 58.90 TAAATTCCTTCGAGGAGGAGGGACATCCGTTGGAGGTCTTACATTCGGGGCAATGGAGACCGATCGACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2L 8396946 5' + roo 8718 2 56.16 CAATAACCCAAATATTTGCCTAATATTAATAACGCTCTAAAATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGCCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 + chr2R 9455839 5' - 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roo 9030 1 56.85 GTGCAGCGCCCGCTGTCAGCTGGTGTTTTTATTGCAGATTATGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr2L 20986527 5' + roo 76 2 72.92 TACATGTTTTGGGATGCAGAGGGAAAAAAAACAATCGACGAAAATTTTTTATCATAATTAAAATGTTAATCTGCGTGAAGTAAAAGGTTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr3R 26633155 5' - 1360 3360 1 62.94 ATTATTAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCGATTT:1 - chr2R 4886044 5' - INE-1 575 1 52.74 TAAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCA:1 - chrX 10128281 5' - invader3 5401 2 59.59 GATTCAGATAGAATCTGGTAATACTTTTTACCGTTACTCGTTGGGTAAAGGTACATTAGTTGAAAATATATCTATATATTTTTATCAATATCGGTAGCCGAGTCGATCTTGCCATGTCCCCTCAATCTCAGGAACTATAAAAGATA:1 - chr2R 1776901 5' + INE-1 151 1 24.66 GCTGATTTTTTCACTCCTCTGGCCGACAATATGTTGCACTTGAGCTGCCACAGCCGTTTAATACCCTGCTATGAATTCCATTTAATTAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 - chrX 20607119 5' - I-element 5324 1 63.01 TTTTCTGCCCCATTTCTGGTTCTATAAATCATCCGTAGCGGCACCAAGCCTTCTTGCCTCATGGATGACGCTTAATTCAACTACCTGGCGCAAGCATTAGTTAGGAGTCTTAAAACTCCC:1 + chr3L 17525422 5' + gypsy8 4650 1 17.50 ATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTAC:1 - chr3R 28659151 5' - Burdock 221 2 54.11 AAACATCCCATTCCATCGGCTCTGACGTGGTCAAATCATGTCGATGAAAATTTGAAGCTTTTAAACTACTTCAACTTCACAGAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chrX 14346568 5' - roo 403 1 79.45 CGCGTCGAAACGAAACGAAAGGAGCGTGCGTTTGGCCGCCGACATGATGTGGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2L 19643526 5' - hobo 2909 1 54.29 ATCTTCAATAATGTTGTATCATAAAACAAATACTGCTAATAACAATAACAAATAAAACAAAACAATAATAACAATAAACAAATACTGCTAATAAGAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2R 17187828 5' + roo 24 2 37.93 CGAGCAAAACAAAACGGTCCAAAAGTCTAAGCCTAAACTATTTTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTT:1 - chr3R 5316613 5' - Juan 4135 1 71.92 TTTCTCTTGTTTCGTAACGTTGATTTCATTTTATTGTTGCCCGTTTGCCACTCCAACTTCACCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATT:1 - chr2R 20447901 5' - hopper2 1551 1 54.79 GGATATAATTTGAAATTTTGTTACGGATCTGTTGTTTTATCCTGTGGCCTTTGATTTGGCAACGCCTTTCGCGGCCCACCGAAAAAATGTTCGTTTACTATTCCTCTTTTCCCTTTTTTTTTTCGACGTTTGCTATATCGTGCCGT:1 - chr3L 5665146 5' - Bica 314 1 65.75 CCGAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCC:1 + chr3L 25482865 5' + accord 37 2 59.44 ATATATAACCTTCAATGCAGAGTGTCCACAGGGGCAGGCTCTACAATAATCTCAACCAACTGCTAGCGAACTTATATAAAAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chrX 5171469 5' + TART-C 11102 10 58.16 TCATAGTCATTGCAGTCTTCAAGAACTACAACTTATTCCATTTTATTAAAGATCTTTTCAAGCCAACAAGGGACGGATGTCTTTGTGAATGCTTTTCTCGCAGTATACAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTAT:1 - chr3L 20176812 5' - gypsy 7433 2 29.45 CAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTG:1 - chr2R 21425148 5' + HMS-Beagle2 6942 2 65.41 ATATGTGACATTGCAATACCTCCATATTTCATAAGGTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 - chr2R 14940744 5' + blood 7095 2 73.29 AGTGAGAGAGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 - chr3L 5179210 5' + P-element 54 1 33.04 GAATGGGATACAGTGCCGCAAAGATGATGTTCGACGTGGACAGCGGCATGGTGACCCACGAATTAGCTACCGTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATGTGTAATAGTCGGTACCCAGGGAA:1 - chrX 2597621 5' - 1360 2914 1 58.57 GACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chrX 5206519 5' + Tirant 29 2 65.48 ACGGCTTCAGTGGGCCACTCAAAAAAAAAATCAGCAACAAAGGGATATAAACAAATTCATGTAACATTTTAAGCTGAACACTAATAAAATGACAGCGTTGCCTTTTATTACTTTAATAATAATATAATAATATAATAATAATATT:1 - chr3R 16193466 5' + invader3 5052 5 77.24 TATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:2 + chr2L 5447896 5' - roo 330 2 75.34 ACTGAGAAAAAACCTATGCATTTTCGTTTTTCTTGATTTCGCGCATAAAATGCGCATAAGCCTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr2R 20748887 5' + hobo 18 1 59.71 ATTCAAATACAATGTGAATGGGTGTATGGTTACACTTCGATATGCCTAAGTACAATTACACTTGAAGAAATATGTGTAAAATATCATTCCCTTCTCCGACAAATTTATATTTAAATAACAAATATTTTATTATTTAAGTAAACAAT:1 - chr2L 11150463 5' - F-element 168 1 52.05 GTCAAACAAGTTCATTCAACTTAACCAAAGAAAAAATATTTCAATCTCGCAAAAGGAACATAACCTAAAGAAAAAGTAAAAATGTCGCTATCTACTCTGCTTTCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCACAGCA:1 - chr3L 9377248 5' + Porto1 474 1 70.55 CAATGGGTAATGCGAAGTCTATTTCGGAAAGGCACAGACTTTTTATTATTTCTACCATAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACA:1 - chrX 19820223 5' + Juan 4090 1 60.27 CGTTTAAAAGCACATGACAGCTACACATGCAGAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGT:1 + chrX 21585228 5' + mariner2 255 1 73.97 GCTTCAGCTTTGGCCATACCTTTTGCCCACCCATAGATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGAGCCCCCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:1 + chr2R 11610390 5' - flea 247 2 75.34 GAGCGTGCGTTTGGCCGCCGACATGATGTGGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2L 19643547 5' - hobo 2909 1 67.86 GGCGTTTTTTGAATTGGGAAAATCTATTTTAGACCAAGCATCATTAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCG:1 + chr3R 22771902 5' + opus 178 4 70.68 ATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1 - chr3L 24208210 5' + Quasimodo 59 2 63.01 ATGAAATTTCAATGATAATATAATCTTGCGGCCTTCTGTTTTCGTCTGCCGGCACTGTAGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGGTCTCG:1 - chr3R 9193258 5' - opus 7487 2 66.98 CATAAGCATATGCATTTGTATATGGGAGGCACTGGCATATATGCATGTACATAAATGCGTTCAAATACAGAAGATCAGAGTCAGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3L 20398957 5' + roo 8680 2 71.20 GATTGAAAATATGTATGTATGTGATTTTGCAAGTCGTCATACGTTACATAAATTTTTATATCCGTTGCTCGTAGAGTAAAGGGGTATACAAGATTCGTTGAAAAGTATGTATGTAACTGGCAGACGGAAGCG:1 - chrX 22508713 5' + INE-1 30 1 73.48 GCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTA:1 + chr2R 22287424 5' + jockey 4846 1 63.70 GATAAGGCGAACAAACGCACGCGAATGGAACACGTCATAGGACAGAAAAACCCATCCTAACGAATCTTCGACATGACTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCC:1 - chr2L 12721188 5' - roo 96 2 52.05 AATTAAGGACGTATAAATTGGTTTGGGAAAGCTGAAGAGACTTGAGTCCATTTCTGGAACCCCCATGGTAGCTGGTGCAGAACCGAGAAGCAGAAAGCCAACGCGTTCGCCGACCATCTGGAAAACTTCTTTACTCCTTATTGC:1 - chr2R 4939015 5' + G7 58 1 77.08 TATATTCCGGGAAAGTTATTTGCAACAGATTTCCCCAAGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAG:1 + chr2R 20336010 5' + Transpac 79 2 72.41 GGTATATAAAATTAAGCAAATGTATCGATACATAAATAAAGGTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 - chrX 13385095 5' + opus 7160 4 66.09 CGGGACTTGGGATGTAATTTGGAGGAATCAAGTGTGTGCAATGGACAACTACGGCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 - chrX 5399107 5' + opus 42 4 57.60 CACGGTCGCTTAATTCCGGTTTAATTTCAAGTTCCGTTCACTTTTTTTTTGTCACATTTTGAGCCTGTGGCAATGGGAACTTTAAAATTAGCCAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2L 11079361 5' - 1360 3365 1 67.13 AATAAATTTCACACCCACGTATTAGATCTTAATTGAACATCTTCTGCTCAGCTCTGGTATATTAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCA:1 - chr3R 16538398 5' + P-element 2761 1 42.47 ACGAAATAGACTGAGAAACGCAAAACCAATTAATAAACCGCCACGTAGAGCACTCGGGGTAAATTAGAAACAAAGATATACATAATGACTTAAAAATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAAAAAAACAGCAAAAAACACACA:1 - chr3L 19143085 5' + Porto1 4437 1 59.72 CGTCCACTTCTGGGTGTTCTTCTCTGATTGCTGGGTTGCTCGAGCCCCAAACAAACCAGACCTCGCCCCCTAGAACAGAAATTCAAAAAAAGAAAAAAAAAACTAACAA:1 - chr2L 16509196 5' + gypsy7 5012 1 91.74 ACTACGTGACGTTCGTTGCCAAGTGGCTGGGGAAGAAAGGGTCACCTCTGTCGCCTTCTTTTTCGTTTTTTTTTTTCTT:1 - chr3L 762333 5' - Doc2-element 229 1 81.01 TATGGTAATAAACTTTTTATGGCAAGTTTGAGTTCTGAACTTCGAAGAACTTCAAAGAAGGCTTAAAAATATATGTTCTTAATTTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr3R 29622776 5' + pogo 31 1 52.45 GAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGAT:1 - chr3L 4933800 5' + blood 81 2 73.97 GTTTAAATATATAGTTACTGCAAGGTTATACAAGCTTTGGCTTGTCATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAA:1 + chr3R 4166005 5' - HMS-Beagle2 7122 2 66.21 ACACATGTCAGTGATTTTGTGTAAATAAGCTTTTGAGCGTTAAAGCTGCATAATTAATGTTTTATTTTATTAAAGATAAATGAACGATGCCTGTACTGTCAAAATTTTTATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 - chr3L 13166370 5' - I-element 5343 1 73.29 AGTTTCTGCAAAAAAAACTCAAATAAAACCGCGTCGAGAGCCCCGAAAAGTGCGCTTTAAGTTTTGAATTACTTTGCGGCATTAGCGTTTAACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3R 18541276 5' + hobo 31 1 60.96 GCCATCGGATCGGATGGGATGCCATCGGAGGTGGGAATGGGAGTGGGATTGGAACCAGGACAGTTGGTTCATGAGATTCATATGGATGAGCAGCCATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 - chr3R 22840542 5' - Transpac 5215 2 36.57 TGGATAAACTGATAATCCCTTTTATCTCTGTGTTGTTATTAGTTACGGATATATGTCCAAATTGTTGTGCCAGACAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTAT:1 - chr2L 11613321 5' + hobo 34 1 56.59 GTGTTCTTTTTTTTATAAAACTTTCGGTCCGAATTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAGCGAGGCATGTCTGTTACG:1 + chr2R 4448000 5' - invader1 327 2 70.83 AATTAAGCAAAAGCAGGCGGCACAAACTCACGGCAGCGCTGTGACTGCGAAATTGCAAACAAAATTGCAATTGCAACTGCAACTGCATTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGGACTCGAGGCAG:1 - chr3R 30294005 5' + pogo 2083 1 70.23 AAGAGAAAACAGGATGCTCATTTAAATATTTAATGAAGTGCCTGTGTTGCTGCAAGAGATCTAGGCTGCAGCTAATCGTGCCAAGCTCCCCACATGTAACAAACAATATAATCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTCAGA:1 + chr3R 22186528 5' - TLD2_LTR 156 1 69.18 GTATTTCGCTGACTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3R 24976224 5' - roo 8992 2 71.92 CGTCACACATGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGC:1 - chr2R 3120320 5' + accord 6907 2 56.16 GTTTTCTTATCGATGGGGGGCAAATTGAATTTGGACTGCTGCTTATCAGACTTTTGTTTACTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 - chr2L 13140706 5' + blood 7073 2 57.53 TCACCCTTCGGTTTTGTGTCCCCTCGTTTTCTTATCGATGGGGGGCAAATTGAATTTGGACTGCTGCTTATCAGACTTTTGTTTACTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr2L 13140731 5' + blood 36 2 60.69 CCTAGAAATATAATGACAAATTGTTTGCTTAGAACCTTATCAAAGGAAATGATTAGAATACTCACGAATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGC:1 + chr2L 7939727 5' + Burdock 6187 2 54.11 AATTCGAACAATAAAGCTAAAACTATAACGAAACTCCTTAAATAAAAAAAACCAAGAAAAAACGAGTGGCCAAGGCCATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAG:1 + chrX 363850 5' + roo 129 2 53.42 GGCATTTCATGTACTTATCGCCAAGTACAATTCACGTTCGCGTTTTGCTCTAAAAACATGGACGTAGGAAGGGGGGGAAAAATATATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr3L 11903343 5' + opus 19 2 64.29 GACTACATAAGTGAATAAGCGAATGAGTACATTATTTATCATAGAAGAGCAATATAGCGTTTTCCTCTGTGTGGCTGTTGATATAAGATGAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:2 - chr2R 6713986 5' + 297 25 2 67.81 ATCAGATCTTATTTTTAAAGGGAAAATTAGTTCACTTAGCCTATTGATGTTTATTCCATATCCGCAAAATGTCATTCTAGCCACTAAGGTATTTTATAATAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTT:1 + chr2L 22548318 5' - 1360 2979 1 73.24 CAGGACAGTTGGTTCATGAGATTCATATGGATGAGCAGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 - chr3R 22840462 5' - Transpac 5158 2 75.74 TCTTTATGGAGAGTATGGCGAGATATTTATCTATGGATGGAAAATATTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 - chrX 5366240 5' + pogo 67 1 68.06 CCAATTTGTATATGATAAGTGCTGAAATTCATTTGCTTATCTCGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chr2L 10045275 5' + jockey 85 1 67.12 GCTACGAAATTGGCCAAAACTCCCCAAATACGTAAAGTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCAGAAAACCGTCTTCTTACACAAATACGCACCTAAACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGT:1 + chrX 3703808 5' + 1360 3285 1 65.07 GCATACATTTCAGGGCATATTTCATGAGCTGTTAATTTCGCGCGGCGGAAAAGTCATTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAACTAATAAT:1 - chr2L 11922955 5' + jockey 4824 1 58.90 AAATCGATCAGATTGAAATTTTGCGCGAGTGGCGAACGTGGAAACGTGATTTCAGTTGTTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATA:1 + chr3R 22868755 5' + mdg1 64 2 62.33 ATTGTTTGCTACCTTTACCGCACAATGTGTGGGTATTTATTTACGGCCAACGGCCATCGGAGTTGGCTCCTCTTTTCTATTCTGGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chr3L 6675752 5' - 412 406 2 60.27 AGAAGTATTTGGTCAAAGGAACGAGATCCTTGAATTGGTGTCAATATTGCAGAAACAGCATTGGCTGTAGATTGACTGGAAGAATCGGTGCTCATTATACTACAATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACATGCAGAAGGAAGCG:1 + chr3L 18849518 5' + INE-1 30 1 54.86 CGTGAATTAAATTACGCTTGTTGTAGGTAAATACTATAAGTTTGCGGTTTTCTGCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGA:1 - chrX 22711687 5' + transib2 66 1 62.33 ATTGAATTCAAAAGATACTATTTTTATGGCATATCAATTAATGCAAAAGCTATTTGCCTAGGATAATAGAATGAAATTGTTGAAACAATTGCCGACAAAATACGAAGGGCATTAATGCGTCATTTCCCTCTCTCGCTCTATCGCTC:1 - chr2R 10684234 5' + Cr1a 295 1 61.64 CTTGAAGGTACTTCCCAGTCTCCGAGTTTTAGGATGTAGTGCGGAAATTTAAATACATATATATTCGACTACAAAGTCATTTAAAGAAGTGCATAGAATTGTAGTTTTTTTTATATATTTATTTATTTATAAGCGATGAATCAATA:1 + chrX 21590613 5' - BS 5076 1 67.81 CTCAAAGGCATTGGCCATTTCCTGTTTGTATGGAGCAAGCCAAGCAAATCCAAGCTTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr3R 20074553 5' + roo 8729 2 61.64 GGGAAAACAAAAAGCGGAAACCAATTCGACGAAAGGTGAAAGGTGTTCGTCTGTTGATTCAACCCTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTCAACCCCCACGCCTCT:1 - chrX 5206594 5' + Tirant 16 2 76.03 ATATGCTCTAATGGCAACATTGCTGCGGCCTTAAATGTTGATGGAAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGAATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chrX 2517988 5' - P-element 2859 1 65.07 TTTTACTTTAACTTTACATTTACACGCAACAATATTTGTATATATAGGGACAATGGTATCAATAAATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAA:1 + chrX 16479756 5' - 297 6927 2 62.33 GATTAAATATTTCTATTAACATAAATGTTGTGTGTCTTTATAAAACCACTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATAT:1 + chr3L 19437904 5' + copia 4944 2 69.18 GTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGATCTAGATCGATTTCAAATATG:1 - chr2R 1234690 5' + Q-element 644 1 78.99 TCTGCTCCTGCTCCTGTTCCTCCCTTCGGAGATCCTGATCCGCTGAGCCATTGTTCTGTGGCTCCTGCGATGGCATTCCCCAGATTAGAGTAACTTCCAAGCCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTC:1 - chr2L 676975 5' - R1A1-element 94 1 62.86 CTCGTTTGTTGGAAGCTGAAACAAAAATCGTTGCATACTTTCTGGGCCAAGCCGAAATCACACGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr3L 13366196 5' - hobo 2895 1 50.76 AAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTG:1 - chr2L 18178350 5' + Tirant 81 2 72.60 AGGGCAATTTGTGTGGAAAAAGTCAGCAAAATAAATCAAATTTAACTATATAAAATTATTGTACATAGAAACTAGGACAATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1 - chr3L 16109230 5' - jockey 4938 1 52.74 ACATTATCTTAATCAAATTTATTCATAATTCTCTAAGAGTGAATCAGCTTTAAGAACTGGACTACTCAAATACCGTGAGAAACTATCATTCACAGCTATAAATATAGAACATATTAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 - chr3R 22772022 5' - opus 7493 2 65.75 ACTTCTAGTTGCTTATTTCAAGACAAAGAAACTTTATTAAAAACGGGTAATCATATTGAACGTTTAAATATATATCATTTCTATTTTACTTAAAATTTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGA:1 + chr3R 9175114 5' + Juan 4 1 78.08 AAGCAAAACATGTTAGCTTGTGTCAAGTCAGAGACGTAGCTGGAAAAACTGGGAAAATGGATGCGAAAAACGAAAATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 + chr2R 16909645 5' - Transpac 239 2 67.26 TATTAGTCTTTTAAATTTCTATCGATTTGCCACGCCCACTCTAACGTCCTATCTTATTACCCGTTCTCCCATCTTATTACCCAAAATCTATCGATATTCTAGAAAAATAATGAAATTTTGCGTTTGCATTCACACTAGCTGATT:1 - chrY 1654283 5' + INE-1 531 1 43.06 ATTACAGCCCTGGAACAAACACACAACTCAAAGCTGTTATTTGACTATAGTTCGATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTA:1 + chr3L 21151092 5' + 412 7120 2 63.01 AAGAAATGCACTCCGATAAGCGAACTTACTAACGAATGCTACATTTTCTCAAACATAATCCCCCAAAGAGTTCCCTACTCGCATCGGAATATAAGTAGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGC:1 + chrX 3570598 5' + 1360 106 1 63.01 CTTTAAGATCGTCGCCTCTCTCTCTCCGTTCGGCTATCTCTCAGTTTCTATCTGTCCATCTGACTAGATGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCATCTAT:1 + chr3R 19793742 5' - 1360 73 1 53.42 ATCTGCCAAAAGCACAATGCGTCCCTATTTTTCAAATATTACAAATCGTGAAAGCCAAAGCGTTGTCAAAACTTCTCCATCACTTAATTTATACCGCAAAAAGTTAATTTGCATATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCA:1 - chr3R 27614411 5' + gypsy10 8 2 56.85 CGAGCGGTAGATGGGATCTCTAAGATTGGACGTAGCCGAGCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3L 14085004 5' - opus 476 2 70.55 GTATATCCTAACCTGCAAAAGGCAGAACAATCTTCAGCAGCGCACTCAATTTAAAATAAAGACCGACTTGATTAATTCCACGAACGAAACCCTTTTTTAAAAAAAAAACAACAAAAAAA:1 - chr3R 10954336 5' + gypsy11 3933 12 78.99 ATAACCCAATCCCCCAGCTTATAAATATCTTATAATTTATATGGCCAATTACTAAAATCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chrX 11267798 5' - roo 346 2 67.81 CGCCCCATTTAAAGCGGGCAGGAAAAATGGTAAATGAAAATTTCTCGGTGTCACATTCAATGAATTACTTTAACAACAGAATGTGAATTAATTTTGTAGCTGATGTGATCTGCGACATATACATACATATTACATACATATTTTCA:1 + chr3R 30555413 5' - Dm88 4 2 67.81 ACACATAATGGTAGAAATAATTTTATTATTTTTTTTTTTATTTTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTTTT:1 + chrX 19820180 5' - Juan 4117 1 77.93 AGACGCTCTCAATGCGCATTTTAAGTAAAATTTTAAAGAGACGCCAGTCGCAGGCTGAAGGATTATGAAAAGCCGCTGAGTGTATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 + chr3L 18972802 5' - mdg1 7422 2 59.59 TTGCGAAATTGACATTATCTTTTATCGCTAGAAGTTTTTAGATCCCCGCTCTAAGCTAAAGACGAGCATGAAATCACTTTGTGTAGAATTAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATAAAATGTAAACTAACTATATTAAATAT:1 + chr2R 12995866 5' - Cr1a 4310 1 60.27 AAAAAATATGCAAAAATAATCCTTAACACTTGAATCCCCTGGCGATTCTCTGGAATCGGAAGATGTTTAATGTGTGTTCGTAATTCAGACTTATTCCTTTTCCAATAAGTGTGTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAA:1 + chr3R 29269796 5' + diver2 2 2 19.12 AATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr3L 25406608 5' + 1360 15 1 69.86 CAAAGCCCACGGAGTTCCTGCCGGAGAGATGGCTTGTAGGTGTACTGTTTGTAGGTGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTCAAAG:1 + chr3R 19134234 5' - baggins 5380 1 73.79 AAATGAATGAAGAATTTCGAAACTATATTTTGACAGTATGTTGCAGATTGTCCAAATTGTATCACTGCTTCTATAAAGCATGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCA:1 - chr3L 15767122 5' + 1360 3348 1 54.62 CTAATCCACTTTGCGTAAATAATCATGAGCGTCAATTCAATTCCGGCAGCCATCACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGTAA:1 + chrX 19982356 5' - hopper 1346 1 60.69 AACCCTTATGATTAATTAAATATGCATATTTATTCCACACATATATAGGCTAAATCATTTACATGTATCAGAACATTCAGTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2R 8687789 5' + roo 41 2 57.53 GCCATTTGCAACTTTGAAACTGTGTAAAGAGCTTTAAAGGTCTTATTTTCGACACAATTTCACACATTTCGAAGCTGTGAAAATGTCTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chr2R 11595952 5' - P-element 2854 1 60.27 CTCAGACTCATAGAGAGCAAGACGAACAACGCCTACTTCTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr2L 22719531 5' + 1360 22 1 70.55 CGGTGACAGTTGCTGAGTACCCGACATGGTGCTCGCATCAACCCGTTTGACTCTGTCCGTGATTTATGTCCAATTGCCACCTAGCCAAAGTCCTTTAAAGTCACAAAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTG:1 - chr3R 23802488 5' - R1A1-element 5318 1 69.86 CATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAAT:1 + chr3R 556453 5' - Tc1-2 1545 1 70.55 CATGCAAGAATTATGTCCCTCTTAAAAGGGATCGTCAGGCCATTCATAGGCACTGTAATTTGCGTAGCGCTGAAGCAAAAGATATGCACAAATCCAAGGAAAACTTAATACTAAGAAAGCTATAGCTATGTACATAGCGA:1 - chr2L 16331848 5' - R1A1-element 5191 1 79.29 CAAAGCGAAAGTTCTCAGCTTTTGTCTGTCCGCAGGACTCATCCTTCCACGGCAAACTTTGCTTAGCTACATCTATCTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chrX 12214443 5' + opus 151 4 56.85 CCTATTTGGCTGGATTAGTTAACGCTAGCGGTGCTTCGCCGCATATTCCATTAAAATGACTGTCAGCAGTGCATATGTGTTGTCATATTTTCCACTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAA:1 + chr3R 27782586 5' + G2 3002 1 65.07 AAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 - 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chr3L 20744271 5' + 412 7119 2 63.01 AAATCTCTCAAAAGGGGTCAATGGAACATGGTACAAATTGGTTTTTATTGAAAGTGATATTTACTTGTGCCTACTTTTCTTAAGGTACTTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCCGCACTC:1 + chr3L 20083737 5' - opus 478 2 68.97 TGGTGACAATATGAAATGTTATCTATAAATATGAAACTGTTTAAACAGTGATTTTCTTATATATCTGATATATTTGAAATGTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chrX 20632541 5' - pogo 2063 1 56.85 CATTTAATAAAAACGGATTTATGATTCGTGTCTACCAATACGCAGCTGAAAATGTGGAACAAGTGAAGTTAGTTACTAATACTGGCACATATCGTAAATAGTGTAGGGAGTGACTATCAGTGAAATAATAGTGAAACGTAAACATT:1 + chr2R 5614773 5' + X-element 147 1 50.68 ATGTCTTTATTATGTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCT:1 + chr2R 9934138 5' + Rt1b 4968 1 51.37 ATATGTTACACACACACTTTGAGCATACATGGTCTCGAACATTCTAGGAATAGATTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 + chr2R 973751 5' + 1360 65 1 61.64 ATTAAATAGCGCCCATCAGATCCAAACAACCAACCCAGACACTCGCCTATGTAATTGCATTTGTGACAGCAGCAGGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGACTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGC:1 + chr3R 28240111 5' + Ivk 4982 1 54.11 GTTACGTGGAAAAGGCGCAAACCCACCGACAACCTTTTGTGCGCATTTTTATTTATTTATTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTA:1 + chr2L 16385263 5' - I-element 5283 1 67.12 ATCTAATAAAACGAAAGAGCTTTTGACAGGCAATGTTCATGTGTGAACACAAAAGCTTGGATTTGTATGGAGCAAGCCAAGCAAATCCAAGCTTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 17027891 5' + roo 8681 2 31.11 TCCGACGGGTTCTTCGAGTGCTCCATCACTTCCATCCACCATTCCTTACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chrX 14346423 5' + roo 72 2 67.12 ACGCTTTCGCTGTAATTTCCTGTTGGCAAAAACTGAAAACTGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGCGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTAC:1 + chr3L 10563908 5' + hopper 70 1 67.63 CAGTCTCACTTTATCTGACTCAATGAGAATCCAACTTGAGTCTTGCCGGCTCAGATAAGCCCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr3L 13228412 5' - P-element 2876 1 78.08 CAAAAAACGAAGCTGGGAAAGTGCAGAAACAGCAGAAAATCAGCAGAACTGGGGAACACCGAAAACAGAAATAAACTGAATATAAAAAATGAATCTTACAGCTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGTTT:1 - chr3R 6063330 5' - Gypsy6A_LTR 102 1 51.05 AAGTTCCACCTTTGGACAAAACCATACCATAAAAAACTGGTAACCAACTTGAACACATTTTATGAATACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:1 - chrX 21581450 5' + Tabor 56 2 53.42 AATTTTTATTTATTATCTTGACATAATTGTAACACTCATTTTTAACAAGCACTGCTTAAATTACACATCACAAGAGGATATTAAGAAAGTTCTGAGGCTTGAAACTTTTGAAGCCAAATAAACATTTTATTTTATTTAATAAAA:1 + chr2L 14970540 5' + TAHRE 70 1 69.44 CTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGACAAAAAGTGGGCAATCGATTCCAGTTTTCAAATTTAAAAAATTCGATTTTTCCTAACCCAGCTTCTTTGAG:1 + chr3R 20001651 5' - FB 3 1 66.21 TCCTTAATTCACACATAAAATAATCTTTTAATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAAGGACTATATATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCAAGTCTAGCCATGTCCGTATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCTCGAT:1 - chrX 14766978 5' + INE-1 131 1 60.27 ATTAGGGGACGATTCCCAGCTAGGATTTCTATATATTTTTCTAAAAAATATAAATAAGAACTGTGTGTGGAATAATAACGTAAAACTAAAAAAAAAA:1 - chrX 9359482 5' + Doc3-element 170 1 51.55 CACTTTTAATTATAGTAACTTCTAAGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 - chrX 19585267 5' - Transpac 5172 2 80.00 GGTGGCAGTCTGTGGTCTGGCATTTATGAATAGATATAGATATAGAAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr3R 28579491 5' - pogo 2034 1 67.36 CATGAATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTCCGTAGCAACTAAG:1 - chrY 2720335 5' + gypsy 18 2 73.10 CGAATCAACACCATTTGCAATTCTTTTCGATATTCTTGACGGTATTTTTAGAAAGCGCATGAGATGCACGATGTTCATACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGATCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chrX 4724971 5' + roo 8717 2 52.41 CTTTAACACAACGACTACCAACAGATGGAGCCACAAAGTTAAGCGCAAAAAAAATCTAAACATTTTTTAAAATCGTGTTAGTTTTGAAACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTA:1 - chrX 20996643 5' - INE-1 104 1 79.13 ATCATATTGTTTACACATCGGTTTTATAAATTTGGTAGTTTAATTTTTATTAGTCCAAACAAATATCGGATTATATTTTTGTTTCAAGTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3R 4661897 5' - roo 9041 1 64.83 ACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGAACATATAAAGTATATTTATTCTTGATCTGGATCAATAGCCGA:1 - chr3L 22721120 5' + INE-1 89 1 81.16 GATGCTGCACTCAATGCGCTGCTCCGTCGCCAGCCCCTCGTCACCGCAATTTAGTGACGTCAATGGCTAAATGACTGAGTGGCCAAATAGCAATGGCAGAGTGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2R 7889324 5' + jockey 25 1 73.29 GAATTGTGCAAATAACGACGTAAGTGTACGCAGCAATATGGCTGGGAATTTATGTATTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCT:1 + chr3L 19335340 5' + invader4 18 2 60.82 TTATTAAAGATAAGTAAAATCAAGCTATCCAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACTCAGTTA:1 + chr2R 9091970 5' + 412 7138 2 80.71 TTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTGTATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGATATATACATATATTCTAGATCTGGATCAATAGCCGAGT:1 - 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chr2R 4803041 5' - roo 9019 2 54.11 ATATGTGCGAGAGCGAGAGGACGCGAGGATTAGAAGGGCAGCTGGAAAGCTTTAAAAAAAAATGCGATGCAGGATTACAGCTGTTCGGGCTTGTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCGAGAGACATCCACTTA:1 - chrX 7967327 5' - P-element 2859 1 65.75 ATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGG:1 + chr3R 19449956 5' - roo 231 2 60.27 AAGTGAATAAGCGAATGAGTACATTATTTATCATAGAAGAGCAATATAGCGTTTTCCTCTGTGTGGCTGTTGATATAAGATGAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr2R 6713978 5' + 297 6608 2 65.71 TGCATAACCCCAACTTGGCGATGGGAATGACTGGGGACCCAAAACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2L 20324245 5' + Tirant 15 2 74.05 CTTGGGTATCCGCTCCACCACCTGCAAGGCATCGCGGAGTGGCCGAATCTCTCGCTCCGGTTGCTTGCGCGACTGGGAAAAAAATTTTGTTAAAAATTTTAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCG:1 + chr3L 7346134 5' - FB 155 1 60.00 TGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCA:1 - chr3R 19721149 5' - opus 7430 2 72.92 GTATAGATGATTTATTTACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3L 23456268 5' - 1360 3375 1 49.61 GAACCCAACTGTGCAAGGGCTTGAAGAGTTCATTGACTTTGCCTGTGCCTTTGTTGTGCTTTTTATTTTGTTTGCTTTTTTCTCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGCAAGTCTCTGTGTATATTCTCGTTTCGAAGAT:1 + chr2L 3341816 5' - Doc3-element 4427 1 55.48 GTACTGATGATGTCACGCGAATGGTTCCTTAAGCTGGGCAGCTTCAACCCGTATCTGAAGGTGAGAAAACCCAATTATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACCATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAAA:1 - chr3R 28750504 5' + Idefix 406 2 52.74 CCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGCTTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGTAC:1 - chr2L 13510874 5' + diver 5955 2 68.28 TATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTC:1 + chr3R 4160067 5' - invader2 186 2 59.59 GTTCATTTGCACCCCATAATATATACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 + chrX 19005340 5' + F-element 48 1 43.15 TATGGTTGTTGTTGGTTTGTGCAAGGCCGTTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGCATACACTTAAATTCAGTGCA:1 + chr2L 21250966 5' + P-element 51 1 30.48 CGAGAATCGAGCTGGGAATGCAACTGTAAAAATAATAACACCGCGTCAAGGATCGCCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 21587646 5' - roo 385 2 68.28 AATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCTTCGTTAGG:1 + chrX 10128190 5' + invader3 5246 2 57.89 TGGCGCACTCCCAGATACTCGCACGCATACACGCGAGCACGTGCGGCGCACACAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGCCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chrX 6377360 5' - hobo 2907 1 50.91 GTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:2 + chr2L 9319105 5' + jockey 91 1 72.60 TAATAATGTATAATGATTATTATTTGTCCTAATTTATACAAGACAAAACAAAAGCCGATAATATAAAAGTGGAAAAATTTAACTTCTCTTAGGCTAGGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCT:1 + chr2R 22247324 5' + GATE 33 2 68.53 CTTTAACGTATATTTCTAGATAATTGCAGTAGTTTGTATCCCGGACACATAAAATAAGTAACGCGTAAATCACACATTATTTATAGTACACTTAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chr2L 6755874 5' - pogo 2078 1 71.23 TTAAATTTGGTTTTATTTTCCTTAATCTCTGAAACACGGGAAACAATTGATATCGAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCAC:1 - chr2L 7536898 5' - R1A1-element 100 1 55.28 TCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGC:1 - chr2R 4206652 5' + 1360 326 1 68.49 GTTTTGTAAGATTGTATTTTGTTTTATCCCAAAAGTAGTCATTTGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCTCAGATCGTGTGCT:1 + chr3L 16907793 5' + jockey 92 1 71.03 AAAGTTCTCAGCTTTTGTCTGTCCGCAGGACTCATCCTTCCACGGCAAACTTTGCTTAGCTACATCTATCTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chrX 12214450 5' + opus 7153 4 55.07 CAAAATGTGAGCTATTGTAGTACATAAGTAAAACTCAGTCTGTATAATAGTGGTCCAAATCATAGATATTGCAGAGATCCAAATCATAGATATTGCAGAGATATATTGCATTGGGGGAAAATCGCTGTACCAGTCTCAGCGTTAGC:1 + chrX 18703875 5' + Ivk 227 1 60.27 AGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTAACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGC:1 - chr3L 19335443 5' - invader4 284 2 51.49 AGGGGCGGCTGTGTCGTTCTATTCTAAGGGGGTGTCCTGCAGATGCGGCTCAGATCTCTATCTATACGATGTCTTCGTGGTGCTGGGTGGTGGTTTTTACCACTAGTTGAGCGCCACTTATTTAAAGATTGATCGCAACGTCT:1 + chr3R 27968475 5' - Gypsy6A_LTR 393 1 53.15 TCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACCTG:1 - chr3R 14494101 5' - roo 9001 2 66.44 CAATTCTTAATATATATTCTTAATAATAATGCACAAATCATATAAATATTATTCAAAAACTAATATAGAATTTATATTTTTAAGAATGGATTATCATTAGAAAAGTGATGCATCCTGTGAACTGAGATTTAAAAAAAAAAATAAAA:1 - chr3L 6882249 5' + TART-C 11097 3 55.48 TTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGTAGGAAGCGTTTCTGACCATATACGCCCACTCTAACGCCCTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTGTGGTGACGG:1 + chrX 124083 5' - 1360 3334 1 52.74 AGTGAGTCTGAGCATCTCGATGTAGCCATGCCAACCAAGCCGAGAAGCTGGGCGAATCCATCATGGAACCGTTGTACGTAGATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAA:1 - chr3R 24466104 5' + Transpac 461 1 56.16 CTACGGCAAAAATAATTGCAAATTGATGGCTACAGCGGTGGCAGTCTGTGGTCTGGCATTTATGAATAGATATAGATATAGAAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr3R 28579455 5' - pogo 2080 1 67.16 CAAGTGGGTTTTTAGTATAAAACAAGACGAAAGTGGTAATTTACTTAAATATAAGGCAAGGGACTATATCGTAGAAGTTAATTATACACATGTAATCGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTC:1 - chr3L 24308451 5' + F-element 113 1 61.64 ATTAATTATTGCACTTGGGTTCATTGTCTAAGTCCACAGACACCCACACATATGCACACGCATACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chrX 5145943 5' + hobo 50 1 55.00 AAATTTACGATTTTTTACTCTAATTTATAGCGCTAATTTATATGCAGTGTATAAATTAGATGGTGTTATCAGAATAAGTCGCTATGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCG:1 + chrX 18412298 5' + pogo 2090 1 57.04 CACTTGCGACACATTTTGACTTACAATTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTTGT:1 - chrX 19597880 5' - P-element 2524 1 26.39 CACCGCGTCAAGGATCGCCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 21587608 5' - roo 9015 2 63.57 CATCTAATTGATAATTTCCCGAAACAATTCTTCGCTCTGCAAAGGTCTGATTCAGCTTAACAAAACCTGCACTGAACGAAATAATGTATTGAAGAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGC:1 - chr3R 20042641 5' - hopper 454 1 62.33 ATGCCAGGGCATTCCAAATATTCCGCAAGCGCAGTTGAGCAGGCAAAGCAGCACAATATCCCAGTGGAGACCAGAACCCTTCTTTAAGCCACGATAAGTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTG:1 - chr3L 9784550 5' - pogo 1808 1 76.61 TTGGCTTTCTTACTGTTTCGCTCGTTGTAGGAATAAGTTGGTGTATCGGCTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGGTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr2L 22719660 5' - 1360 3340 1 56.80 TCTTACTTTCTGCTTTACAAGTTCTTTGCTCCTTTAACTGGAGCTCTAGTTGGAAAATGGCTGAAGTACTGACTGACGTTTGCCACTTCGCGGGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCC:1 - chr2R 9410591 5' + hopper 26 1 65.75 TATCCTTTTTGGTTTCCGGATTAACTTAACCAACTTTTCAACAAGTATTGAACGCAGATCTCAAAGTGTGTGTCACTAAACTTTGTTATGCTATAATTATATTGATTATATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGT:1 - chr2R 9092114 5' - 412 7532 2 74.66 AGGCACGGTTGAATCCACAACAACACGTTTTTGTCAGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTA:1 - chr3R 6404588 5' - Tirant 8459 2 52.41 CATCGTTTTTGTTCCGACGGGTTCTTCGAGTGCTCCATCACTTCCATCCACCATTCCTTACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 14346411 5' + roo 8724 2 60.27 TTCAGCTAATAAATTCGCTTGAGTATGATGCCCCAAAAAGTATGCTACAAACTTTTCGAAATGCTTATGGATTTTATTAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGT:1 + chrX 9508078 5' + jockey 4719 1 52.05 GAAAGCGTTCCAGCTCCTGACTCTCCGTATTCCCTTTAACCCCCTTACCAAAGGTGGGGAAACAAACACATGATCGAGGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGG:1 + chr2L 6969747 5' + 1360 174 1 52.14 TCGGTCGAATGCAACTTAGAAACTGAATTGAGGAATCGTATTTTGCTGCATTCTCTGCTATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr2L 12678608 5' - P-element 2829 1 47.55 GTAGACGGAGGAAATGGAGAGAGATAGCAACACAAGTGATACATGGGTTCATGGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGGTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 18213078 5' - roo 400 1 74.05 ATGGTCTAAAAGGATGCCATCGCACACACACACACACACATTCTCGCGCAGAGCAGCACAGACAGGACTTAAACAAGCATTCGAGTAGTGCGACATATTACAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTA:1 + chr2L 9403899 5' + flea 283 1 69.18 TAGTCCGTGTTTGTTGGCGGCATCACACCATGGTGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGAGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTG:1 - chrX 16526326 5' + P-element 81 1 21.54 AGATGAAACAGAATACGTACATGTATTCAGATGTGTACACATAAGCAATATATGTTTATATACTTATGTTATAGAATTGGTTTCATATTCTGTAAAATATAAAAAAAAAAACACTGCTTAAACACCACTACTGCCCAACGTTG:1 + chr4 205721 5' + looper1 1719 1 55.94 AAAAATGCAGTCAGTGTTTTTAGTTTTTAATTTTTTATTTCAAATTTAAATACATTTATTTAAAATATCCGCTGTCATTTGCAGAACTTTGACTTCTCGCTTAGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCACGCTGCTTT:1 + chrX 7796938 5' - opus 295 2 76.03 TATAATGCTGAAAACAGGTTTTACAAATACAAATTGCAGTTTACAGAAAACTATATTGTATTCATGGTCCGTTGCAGTTGTTGCCGTACTGGCACCGGTCAGGTGGCCAGTGCAGGGCCG:1 + chrX 6703310 5' - TART-A 294 2 40.83 ATCTGAAGATACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGACGCAGTTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 - chr2R 24021643 5' - pogo 2047 1 64.80 AGCAGGATGCGGGTATTCCGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTACCCTATCCTG:1 + chrX 18354147 5' + jockey 461 1 70.89 TAAACTTTTGCTGATGACACCCCAATTCTCAGCCGATCGAAATGCCATCTGCAAGCATCAGCGCACCTGGCTGCTCACCTAACTATTGTTTATCAAGTGCAAGGTGCGGTTATATAACACAGTTCTAAAACCAATATGGACATATG:1 + chrX 10065387 5' + Doc4-element 2587 1 50.00 AGTGACAGCTTTTCATTTGTTTCATTTTCTTGCCGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTTGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:2 - chr3L 9519623 5' - roo 322 2 73.29 GGAGAACCTCTTTGGTGAGCCGCCTTGGAGTTCTGCACTGGGAATATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAG:2 + chr3R 10636113 5' - blood 7311 2 70.55 GCTGCGAAGTTGTTGACAAATTTTTACTAAATTGTTAAATAGTTAAATACAAAACATTTTTAGATCGAATCGTAACAATAATTAGACATGAATATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGATCTTGTACAA:1 - chr3L 9104458 5' - Bica 420 1 62.07 CGGGCACATGTGTGCGGAAAATTAATATCTGTGTCATTTTTTAGGTTAATAAGGCCAAATTGAGTATATGTGCCAGACACACACTTAATTATCATCATATTTATGGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGA:1 - chrX 20874430 5' + F-element 343 1 73.97 TATATAAGTTAGGGTAAAACGAAAGTGCTTATTACAAAAAAAGATAATATTGTAATAAAATATCAATATATACACCCCACTTAAATAGACTGTAAACAAACGGAGACATGGCCAGAACGACTCGGCTATGGATCCTGATCATGAAT:1 - chr4 268374 5' - INE-1 86 1 75.34 AATTGCGAGCCAAAGTGGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTA:1 - chr3L 9762279 5' + jockey 4802 1 50.00 TTTTGTGTGCGAGACTCGCACGCGCAGTCAGCCAGTCAGTCAACTACCCACCCACCCACTGAACTTCCCCGCTCGGCAGCCGCACCACCCAACCACCCACTCCACCCGGCCAGTCCAAAAAAAAAGAGAAATAAAAAA:1 - chrX 2861740 5' + Doc2-element 253 2 76.81 ATAAGCCCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 + chr3L 13228466 5' - P-element 2823 1 41.38 ATATAAGGTAATATACATAAGGCAAAAAGTAACTGTCAGAAATAGAGTACCTTGTTCACACCAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATA:1 - chrX 15946735 5' + INE-1 546 1 78.82 GCTTAGCATTGACATTTAAATGTAATGAAAAGGTTACAGAAACTAGAGAATGGAACGATTTCTCAATTGAATATTTTTTTTAGTCAAGAAACTGTTAGCGTAAATCAAAAGAAATATGACAACTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chrX 10287140 5' + roo 8666 2 68.49 GTGCGTTTCCTTCCCGTCGCAAAGAGGTATTATTTATCGTTAAATTCCCGTGGCTTTGGCTCTCCCAGGAGGTGACCTAAATATGTTATTGGTGTTTTGATGGGATGTGCGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 - chr3R 19639881 5' + 412 6 2 77.70 AACCTAATTAACTGCAGCCCATGGTAAATTAATTCAATGCCTCGCATAAACTAAATAAACAATGGAAGGCTGATAGCGTGCAGATAATTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTA:1 - chr2R 19522693 5' - Quasimodo 17 2 59.86 GGATAAGTAAACATGCAACTTGTTTGCGCTTTCACCACACACACACACACACACATATTGT:1 + chr2L 9880793 5' + accord 7032 2 91.80 GGATATTAAACTAGAGAGCCAGTCCTTGTACAAATTAGGACACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTT:2 - chr3L 10564030 5' - hopper 1391 1 67.81 AAGCAAATCGAGCAGGCCAAAAAGCCGCCTATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:2 + chr2R 9504177 5' - roo 9041 1 61.64 TATAAAAATTAATTTGTTTGTCGCTCTCCCGCTCTGGCACTTCACCTCTCTCCCTCTGACCCGCTCACTCGCACAGCTGTTGTTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chr2L 14490229 5' + P-element 35 1 61.64 AAAAGCATTTACTTTTTGGATTCGAACATTTTAATTAACTTTTGTCATTGTTTGTTCTTAAATACTTAGCTTATAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chr3R 12727118 5' + I-element 48 1 48.63 ACATTCCCCTCGTTCTTTTTCCCATTTCCCTTTGCCTCGCGCTCTCGCTACCCCCCTTTCTTGTGAATTTTCAATTAAAAGGCGCTTTTCCCACATTCACACATGACTTTTCTTTACGATGATGTTTTTATTATTTTATCAACGCA:1 + chr2L 11922818 5' - jockey 4980 1 67.12 CCGCCCAACCCCCATCGTACACGGCAAAAAACGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCC:1 - chrX 1123646 5' + FB 86 1 80.00 GACACGCCCACAATACGTTCGCAATTTCACACATATACGTGAGGTAATTTTAAATTGTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr3L 13366070 5' + hobo 27 1 63.50 ACGTTCGAATCAAAATACATTGTTTATTGCACATTTTCCGGGCTGCCCCTTTCATCATTCGCTTGTTTTTTATCGGAACACTTCATACTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3R 21587482 5' + roo 8697 2 61.64 GTAACCTATCTTTTTACCAACAAAATATAATTTATTAAGCACGAGAATAAATGTTTTTAAGCCCTGACACTTATTGCCTCCTAATTTCATTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 10852628 5' - transib2 2645 1 72.82 GCGGCGTCATTAATATGCAATTTTAATTAAATTCAAGTGGAATTCTTCACGCAGTGACCCCTGCATATGTGTGTGGCGATGACATTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTC:1 + chr2L 5350394 5' - X-element 4269 1 71.79 GAGGGACATGTATTCAAGGAAATGGTAATAGTAATAGTATTTGTTCTATAGAAGAAAATATTCGTATTAGTGTAGAATTTATTTAAATTTAATTAATTAAATTTTAATTCGAAATGTAAATAAAATGTAATAAGTGAAAAGTAATA:1 - chr3L 18082704 5' - Stalker2 404 1 78.08 TACAGCCAAGTGACGTCATCATTCGGCAAATCAAGAGAGCGACATCTAACAAAACAACAACAGCTGACTCAGAGAGAGCAGGAAAGAGTTTTCGATATATATGTACACATATGTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 + chr2L 19548388 5' + flea 4762 1 72.60 CCCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGAT:1 - chr2L 13510875 5' + diver 5939 2 66.92 TTGCAATCTCCATTCCGTTCCGTTCACTGGTCAAAAAAAAAAAGGAGTGCGGGCCGGAGCATATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCACGACTTAGTGGCATTGCACAAATAAATGTCTCA:1 + chr3R 22624669 5' + blood 7073 2 52.05 CAACACGAGATACAGAGAAATAGTACTCAAATAATAATATACAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCT:1 + chr3L 18789007 5' + 1360 68 1 67.81 CCGCAGGAATTGCTGTGAAAATTCATTAGTTGCCCATTTTTATGCTATTTTATTTCAATATAAAAGACGCACGCAGGCATGCATTTAGTTTTCCATTCTCTAGCCACTGCCGTATAAATATCCGATTTATTTGAAATTTCACGTAC:1 + chrX 8609495 5' + transib3 2764 1 75.34 GCTCCAATTTGGGCATCACTGAAACTCATGTTCCCGAGAAAAGCTAACCGTTGAGAAAGGCACTTATAAAATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAG:1 - chr2L 16509010 5' - invader4 278 2 54.79 AATGAATAGGGAGTAAGTGCACTTGGCAAAATGGATCGTGCTTTAAAACTGGTGGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAAT:1 - chr3R 30558294 5' + I-element 4892 1 62.50 AGTGTGTGTTTGTACGTTGGTGTTTCACACTGATATACTATACACAAATGCACATATATTTATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGATCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2R 9504314 5' + roo 55 2 57.53 TTAAAATAGTCAATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGCTGTGTCCAAAAGATCGT:1 - chr2L 14480553 5' - Transpac 272 2 59.59 TCTCAACCGATTTCTAGTCGAACTCTTAACTTTGACAATTTGAAAGCAAGGCGAGTTCCATTCACAGTTTCGGGCTGTCAGCTAACAACTTCTTTAAGCAGATTGGGAACGTATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTGGAG:1 - chr2L 8851719 5' - Idefix 6979 2 68.49 CATTCGCTGCCTTCGCAGGTCGCAGGAAATGCCCGAATCGAGATGGTTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATAT:1 + chr3L 3757152 5' + copia 75 2 71.23 ACCGACATCGAATCGTTCGATATGCCCCGTGCCCAGACACAAAAATATTTATTTTCAATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTT:1 + chr3L 18034513 5' + Transpac 7 2 77.10 TTTATTATGCAGAAACGTTCAAAAATTTTCGCGCCAAACTTTGCACCCCAAAAACAAAAAAGGACGCAATCATCTCTTTCGGCTTAGATTTTTTCCATTTTCATTTTCAGTTTTTTTTTATTTTTATTTTTTTT:1 - chr2L 9471623 5' + hopper 145 111 75.37 CGGACGCAGCTGCAACACAGGCCACAGTCCGTGAGGTTTATTTAATATATTTGTGATTATAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chr2R 9455928 5' + 412 59 2 58.22 GTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGCAGTCAT:1 + chr2R 9934151 5' + Rt1b 4964 1 48.06 AATTGTGCAAATAACGACGTAAGTGTACGCAGCAATATGGCTGGGAATTTATGTATTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGT:1 + chr3L 19335341 5' + invader4 2824 2 64.34 GGCTGGCCGGCCATTCGTTTATTTCCCAAATGATCGATTTTCATTTAATTTCTTAGCAAACAAACGAGGCTCTCCAAAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAG:1 - chr3R 21871889 5' - opus 351 2 55.22 TATGATGCCCCAAAAAGTATGCTACAAACTTTTCGAAATGCTTATGGATTTTATTAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGCACTAGAGTC:1 + chrX 9508101 5' + jockey 4720 1 56.45 GGGAATGCAACTGTAAAAATAATAACACCGCGTCAAGGATCGCCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTAT:1 - chr3R 21587633 5' - roo 9034 1 58.90 AAAGTGTGTGTCACTAAACTTTGTTATGCTATAATTATATTGATTATATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chr2R 9092047 5' - 412 417 2 71.92 ACATTTTGCAAATAACAATCGCATTTTTTGAATAATTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chr3L 17108614 5' + hobo 67 1 70.77 CACAGAGCCAGTATATCTCATATCATTTGCAGAGATTTGGGATACCCGATAAGCGAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr2L 13140611 5' - blood 7341 2 58.59 TTTACATACCGGTCCGAATCACTGTGACCTTGTTTTCCTCTATTCTAAACCTAAAGAATAATAAGTCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2R 4803040 5' - roo 9020 2 54.17 AAGCGTGATCTGATAGTTTGCTTATGCACTTAAAGAAATTCAGATATTTATTGAGTTATTAAGAAAATAGCTTGTGAAAGTGTCTGAAATATGGTCTTTTTGTTTATATTTATGTTCATAATTATTTATGTGTAATATGTGTAAT:1 + chr3R 16541917 5' - 1360 2931 1 69.66 CGATGGGAAACTCGATTATTTTTAATTAAAACAACATTGAGGCAAAGGAAAAGCCTGAATAAAAGCTGAAAATTCTGAGCCAAAGATTCTTTGTATTACTTAGTTCTAAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGTAAGATA:1 - chr3L 5227356 5' + Chouto 156 1 57.53 GCACTGAGCTGCACACAATAACACATACCACCCAGACACATACTCACACACACACACACATATGCACAC:1 - chr2R 16472833 5' + accord 189 2 60.87 AAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCACAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGA:1 - chrX 16217518 5' + P-element 65 1 37.76 GTATATGTTGTATATATGTTTGCCATATAATAAACTATTCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATAT:1 - chr3L 5274986 5' + I-element 84 1 74.66 ACCCCAACTTGGCGATGGGAATGACTGGGGACCCAAAACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACGC:1 - chr2L 20324239 5' + Tirant 8143 2 62.33 TACAATAAATTATTCATTCTGCATAATAAAAAACCTTTCAGTAAATTCAGGAAAATCGAATAAAAAATGTTCTTGAAAATGCTTCTCTCTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTGTTATTTATGAGTCGTACTAATGTCCCGTC:1 - chr3L 19574187 5' - 297 371 2 69.18 TTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTT:1 - chr4 651045 5' + micropia 42 4 52.63 CCCATTTATATTTTACCAAGACGTCATGAATACCGCTGTACCTTGGGATGACTATTTCGCATAATTTTATTGCACATATATTTACATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 + chr2L 17166248 5' - I-element 5323 1 63.01 ATGGATTCTAGATAAATGGTGTCTTTTATATATATCTCTTTAATTAAGATAGTTTGTAAAGAATTAAGATAAATTATATTGTTCGCAAACAAATATAACACATTCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAAT:1 - chr3R 5024955 5' - diver 205 1 71.92 AAATATTTGACACGTGTGCGAATGTGCGATGGAGTGGGTAGGAAATGGGTGGACCTGGAAAAATCTCCATAAATAACAACATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCCGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chr3L 1981502 5' + opus 28 4 54.68 TGGCCACTTGACATGCACGTCACAAATACACGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTCA:1 - chr3R 15168946 5' + jockey 99 1 78.08 TTAATTTAATCAATTGCTCCAATTAAGCCATCTACCACACATTTATTAAATCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGAGCACGTTTGCTTGTTGATAG:1 + chr2R 11595833 5' + P-element 68 1 39.04 GTCCTCGCGTATGGTAATCGTAAATTGCCGCTGAAGAGCGTAGAACATTGGAGATACACTTCAAAAAAGCGGAATCCGATGTATTTATAGTTGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2R 24745896 5' + 412 29 2 65.75 ATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTG:1 + chr2L 23299989 5' + invader4 380 1 74.40 GTAGACCTATTATTTTCCCGGTGCCCTGTCCAGTTTTCCCTGGGGAATGGCACTCTAGGTGCACGCATACTGGAAAATCCGTTTCGTTTTGACATTTATTGTTTTTAATAGTCTCGAGAGCTATTAAAAACGTCAGTTTGTACCTT:1 - chr2L 21049437 5' + transib2 446 1 44.52 TAGAATTTCGTTTTTGGTTTATCTCTTTTACCGTTGTTTCGTTGCTGACTCGTAATAGCAATCAATGCTTGTGCGCCTATGTTCTTCTTGCCTCTTCTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAAT:1 - chr2R 3132867 5' - Tc1 1554 1 69.18 TCAAGACTCTACATAATATTAATCTAATATTAAATCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTATGTTAT:1 + chr3R 5761963 5' + roo 8750 2 78.62 ACTAAATTATTCCTGTCCCTATAGAGAACTGGGGTGATCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGTATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr2L 17206078 5' + hopper 8 2 63.86 TTTCATTCCACATACTTGGGCTTCCCACTTCCTCTTATGCTTCAACACGCTTTCGCTGTAATTTCCTGTTGGCAAAAACTGAAAACTGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTACA:1 - chr3L 10567509 5' + hopper 30 1 46.90 CACTGGCATATATGCATGTACATAAATGCGTTCAAATACAGAAGATCAGAGTCAGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCTAGAGCGATAAAT:1 + chr3L 20398986 5' + roo 8730 2 63.01 GAATATCCTTAGAACTTAAATTACTTTCACAGCTATCTATCTAAACGTGGGGTCTCGTCCCTGAAGTTATCCATATGTTTATGTTACCTAATTTAACAACGATAGCCTATTTACTAAAATTATTGAACAATTTTGCTTTAAGTTAA:1 + chr3R 20149185 5' + Tc1-2 1561 1 58.22 AATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATGATTTCAAAGACATCAGTAATG:1 + chr3L 19574042 5' + 297 39 2 54.26 AGCATCTCTGAATACATCCATCCGATCCATTCAATTAAAGTCCGGGTTGTGGTGACTCTATAAAATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAAT:1 + chr3L 9404962 5' + Stalker 67 4 56.16 AAGACCTGCTACTGCGCGGCGTTTTTAGGCCTGCTTCTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAG:1 + chr2R 16891778 5' + jockey 4735 1 60.42 GACATTTTCATTGTCGTCTTATTGAGACAAATAAATTTCGGGTGGTGCCACATGGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGAATTTGCCTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 + chr2L 7271791 5' - 297 6947 2 66.90 ATGAAAACATTTCCAGTTGCCAAGAGACTATTTTGGTGCTTGAAAACTATGTGCGAGATTTTAAGGCGCTTTGCGAATGGTTCAAAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCC:1 - chr2L 18942685 5' - P-element 2755 1 63.70 TGTGCTCTCTAATTATTTAGTATGTCATCTATCAATTGCAGCATACTTTTGGGCAAACCTATCAATAGTTTTCCAGCCCATGCGTTTTGCCATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chrX 18353620 5' + jockey 35 1 57.14 GAAATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:1 - chr3L 4933818 5' + blood 63 2 61.64 CTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chr3R 24976236 5' - roo 8980 2 80.14 GAGATTAAATTCATGCGTGTGCTTTATTACTTTTTATTGTCCAAAACTACTCATAATTATGTTGAAATCGGAAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCCAGATTTCGTCTTTAATGTAACCACTCTGACTAGCGA:1 + chr3R 5031504 5' - diver 5731 1 65.75 GCAAATAATTGGTGTTAATGACGTGCCTCAGTATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chr3R 4533011 5' + 1360 21 1 71.92 GGGGGTAGCGATTGATTGGAGCGAGAGTTTAGTATTCGTATAAATACAGGTTGCGGCAGGATAACTTC:1 - chr2R 2948744 5' + mariner2 1 1 91.18 AGTTGTAGTTTAATTGTAAGTGTGGGCATTAAATTACAATTGGTTCAATTGAATTAAAAGCTGAAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTTTAGTTTTTAATTTGTTTCTCATTTTTTTCACCAATATTTATCGATATCTCAGAAAA:1 - chrX 19810394 5' + INE-1 499 1 60.27 AGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATT:1 + chr3R 19589915 5' + BS 5058 1 58.90 AACCTGCCCAATTGAACTTTCCCAGCTAACGAGTATCTGAAGATACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr2R 24021677 5' - pogo 2060 1 57.53 AGAAGGCTATGTAAACGATGTTAATTACGATAATTACATTCTTATACTTTTGTATTTATTTATTCGTAAACTATTTTATTCCTTTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:2 + chrX 18190321 5' + hobo 37 1 60.27 AAAATGAAGTGATTTAATCAGTTGTTTTATACACGACAGAATTTTAATAAATAAATGTGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGA:1 + chr3R 27514663 5' + Ivk 380 1 60.27 ATTCGTTGAAAGGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGAATGTATAAAGTATATATATTCTTGATCTGGATCAATAGCCGAGCCACCGACCAAAGACAATAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGACTTTTTGGCACAC:1 + chrX 124082 5' + 1360 31 1 53.42 AATTGAGTACTGAATTTTTGAGTTTCGGCTGGCAAAGAGGTGACTGAGCGCTGCTCAATCATCGCTTACACATTTTCCACCGATATTACAGAAAATGTTGAAATCTTTCACTTTTCCAGCTGAGTGACGGGGATCTGATA:1 - chr3R 6498128 5' + INE-1 546 1 50.00 ATAATATGGATATGGATAATATGGATATGGATGGACAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACGAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAAATAATAAGAACCATGCACGCACCG:1 + chrX 17650545 5' + invader4 436 1 75.86 AATATAAACCTAATTTAGATTTTTTTTTCAAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAA:1 + chr2R 5357215 5' + Juan 125 1 35.62 AGTAAAATACTATGGTTCAAAATATGGAAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 + chr3R 4532843 5' - 1360 3357 1 63.70 TAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGT:1 + chr2R 2492932 5' - invader2 183 2 61.64 AGCATCCACCCATAATAGTTGGGTTTAACGGTTGACCTTTTGGAGAAGACAATAAATGAGAATAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGA:1 - chr3L 26019436 5' - gypsy 7415 2 44.14 ATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2L 21153508 5' + 1360 63 1 74.58 AAACTGCAAGCGAAATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr3L 4933829 5' + blood 49 2 53.15 AGCAGACGAAGTTTTTATGTTATTCGTTTCGGCAGACAGGCAGACAGAGGGGTTATTAATCTGGTTACTAGGATAAAAAGCGCAATGAATTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTAT:1 - chr3L 17715657 5' - Quasimodo 53 2 56.16 AAATAACTTGAATAACTTATATAGTACGAATGTTGATAGTTGTGTTCGCTGTGTGTTTTCTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:2 + chr3L 15859562 5' + I-element 8 1 79.45 TGGCTCGACAAATATTTTACCAAAGATTCAGTTTTGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 19543482 5' + roo 8750 2 76.71 CAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 - chr2L 20324201 5' + Tirant 8159 2 62.90 ACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr2L 23372624 5' - 1360 3339 1 67.81 TATTAACTGAACAAAATGTAACCTAGTGGACACCATGCCGCATGGGAGTAAGGCTGTGCTAGCTAACAAAGGCTATCCAACTAAGTATTATGCCGTAATTAACATATTAAAAA:1 - 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chr2R 9312245 5' - jockey 106 1 69.29 ATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAA:1 + chr2R 5582161 5' + Cr1a 480 1 50.68 TCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGAC:1 + chr3L 24213791 5' - invader2 159 2 78.08 CAAACACTTTACAATCAAAGTAATCCATGCTAGTGTTCCTAGTTCACAAATGAATTTTAAAACCAGACAAAATGAGTTCAATCTAAAACAACTGTTGACGAATTGTTTTATTATTATTAAGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCC:1 + chr2R 5456641 5' - baggins 5417 1 60.96 CACTCACCTGGCCTGACAGCCCGTGTATTAGATGACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGA:1 - chr3R 18697951 5' - 297 311 2 79.45 ACAATGCTTACAAATTTTAAAAATTTTATATTTTGTTAAAAATATTTAATGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1 + chr3L 18164135 5' + pogo 68 1 65.07 AATCAAAAATAAAAAAAATGTTTACGTCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGA:1 + chr3L 3846446 5' - Stalker4 82 4 72.41 AATGTAAATATTTATTTTACTTCTTTCTTCTTGACAATTTACGTGCAAATGTTTGACGACGGTCGGCTTGCCGGAGAGGAGAGGACAGGATTTTCGTTTTCCTGGCTCTGTTGTGTTTTTTTTTTTGTGTAT:1 - chr3L 22391969 5' - Porto1 163 1 66.67 CGAAAAGCCATCGATACGGAGCTTGAAAGCGTCGCCGTATCGATAAGAATATCGATAGCTTTGACTGTACAAGGTCAATTTAATGTGCCGTTAGTTTACGGTGTGTTCTCTTTGTGCTCGTCCACCGTTACCGTTCGACCTTCTT:1 - chr3L 24293481 5' - gypsy8 4871 2 54.48 ACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3L 13827458 5' - roo 342 2 72.66 AAAATAAAAAATAAAATATTTCTACTTCCACCTCTTTCGATAGAAATATTACATCTACACATATACACTAGAATTACAATATGCATATTATCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAA:1 - chr3R 26900178 5' - baggins 5128 1 37.67 ACTCGCGTTTTCTTTTGCATATTTGATAGAGTCGTACACACAGCAATTTTCGCGTCGTTGAGCGAGGGAATCTAATTTATATATGAGGGACAGTATAATTCGCGTAGCTGCCTCGAGT:1 + chr3R 23668397 5' - pogo 2094 1 74.58 CCCTGTTAAGTATGCTATGATTTATGCATCGCTGCTAAATGCTGCTGAGGTTTTCCCCGTTGATCCTGCGACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTTGCTGTAT:1 - chr2L 14889041 5' - hopper2 1560 1 52.74 GAAAGAAGCACTTATTGATTTCGACGTAAAAACCCACACGTATCTATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTT:1 + chr2L 6319750 5' + Tabor 6915 2 67.12 CCTAATAATCCCTCAAACACCATCGAGAGTTCGTTAACAGGAGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAG:1 + chr3R 22840395 5' + Transpac 4994 2 68.97 ATTGAACTATATTGCTATTATTCTTGCAGGAAAATATAACATTACGAGACCTTGATTTTTAGATATTTTTATTACGCGCGTTGGACGTCAATTATTAAACCAAATACGTTTAATTCATAAATGGTTTTTTTATTAGAGCCAACTG:1 + chr2R 5152760 5' - gypsy10 5953 2 70.34 CTGGTAGTATTGCAGCTTACTGGAAATGTTTGCCATGGTTTAATTTAAAATCGAAAGTCATTTGCAATCCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 + chr2R 12814818 5' - opus 7455 2 55.86 TATTGAAATGTAATTTGCATTTCATAAGCCTCCCGGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3L 18199921 5' + Doc 40 1 57.53 AAGCTGTGGATTTTGCAAAAAAAGATTGCTGCATTTGTTCGGATTAATTAATTAATAATTAATTTTGCTCATTTTTAAATAATCAAAAATTAGCCGTGCTTTCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 + chr3R 11978196 5' + Transpac 16 2 74.66 GTTGGTTCATGAGATTCATATGGATGAGCAGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 - chr3R 22840455 5' - Transpac 239 2 79.84 CTTCGTTATTTCTTTAACAAGTCTAACTTCATTCACTACAAGTTTTATATATATATTAAACTTTTACTTATTTTCGAAAATATTTGCATACGCCTACTGAAACCCCAATCAAACATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCA:1 - chr2L 20556614 5' + invader3 5194 2 77.40 CTTGGGTGTGAGATGCTATTAACCCGGCGCCCCAATAGCAACTTTGTTTTATTTTTCCAGTGGTTGCCGCTGGTTTGTCTGGGCCTTTTTCAAGTCACCGACTTTTATGTTTTATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAG:1 + chrX 6630280 5' + roo 338 2 78.77 TACCAGCCAGCATATGTGAAAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr2L 18178369 5' + Tirant 39 2 52.85 AGTTAATTTACCCTAAAATGCAGATCCTATCGCGGTAATTCCAGCATGTTGCAACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 16463466 5' + roo 8700 2 58.90 GGCACATTTGCATATTTCGTGCACAGGAGGAGCTGCGTTTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTAT:1 + chr3R 25843363 5' - I-element 5282 1 68.49 CTGGAGCAGCACGAAAAACGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - 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Gypsy6A_LTR 249 1 73.29 GAGGTGGTATGCAAATAATTGGTGTTAATGACGTGCCTCAGTATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 - chr3R 4533021 5' + 1360 11 1 78.77 GTAAAAGGATAAAGCAATTAAACCCAGAAATTTTTATGATTTTTCTATGCAAATTTCCTTTTTACGTTGATTTTTTTCAAGTGCCGCACAGGTGGCTTATTTAATTTATTTTATAGTGAACATTTTTTCCTTTTTTAGAAATATAT:1 - chr3L 428425 5' - TART-C 11035 1 74.66 ATTAATTGCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCCTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 - chr2R 9339760 5' - Transpac 5181 2 52.74 TGGTTGCCAAGGCCTAATGCACTGATACTAATTTGCCGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCT:1 + chr3R 5115309 5' + Ivk 98 1 73.29 CACGGCGGGAAAACTACATTTTTTTTGCTGTGCTTAATAAATGGCTTCTCTAGCTGGGCTATTTATTCCAATAAAATTATTCCAATAGAGTTAATAAAGTCGAAAATATTTTCATATTATTTATTTGTTTATTTTTTTTT:1 - chr3L 5292498 5' + S2 107 3 77.86 GGACACATTTTCACTTTTTGATTTGCATGCACTTTAGTTTTGATTGGAAATTATGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chrX 10286987 5' - roo 342 2 65.07 CAGAATAAAAATAAATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAA:1 + chrX 9437192 5' + roo 8778 2 35.62 AGCGTTAGCAACTGCAAAGGCACCCGCAAGGTATGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATA:1 + chr3L 13365562 5' + jockey 4632 1 72.80 CCAGCGAAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chrX 11661345 5' + 297 6617 2 60.27 AATAGTACTCAAATAATAATATACAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 + chr3L 18789025 5' + 1360 70 1 77.69 GCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTACCAAAAAATC:1 - chr3R 4571526 5' - 1360 38 1 76.71 CGATCAGGTAGGCTCCTGTCTCGTCCTGCAACCGAATTACTGATTAGTATCGAACCAAAGACAAAAAGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACACACACATAATGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGTGTAGAAAA:1 - chrX 1514486 5' - 1360 145 1 53.79 TATTTATCTGCTGCTGAGATTGGAGTTTTGAATTTGTATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCC:1 - chr2L 21657076 5' + invader1 3653 2 76.76 AAGTGAAAAACCAGATAGGCACTCGATCATTTCGAGTGTGCTTCCAGGAGCGAATGCCGCTCGCAAACCCTCGCAACACACACAGGCACACACACCTCGCACATACACACACACAC:1 - chr3R 18960800 5' - Stalker 448 1 71.55 CGAGCGGTAGATGGGATCTCTAAGATTGGACGTAGCCGAGCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 - chr3L 14085004 5' - opus 482 2 73.57 CGGTGCAGACGATACCCTTGTTCCCCAATTCCAGAACATCGACAGAGCGACCTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr2L 8396846 5' - roo 9011 2 61.59 CAAACACATACACATACGAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 - chr3L 13228559 5' + P-element 17 1 62.38 CTGAGCATTGCGATGCGACGCCAACCTCCGTACACAGTGTATATTTTCGACATTCAACAAATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr3R 5868173 5' + jockey 69 1 58.90 ATACTTTCAAGTTAAATCACGTTTGACACCAGACTGTCTAGGAACGTCATGGGGATGTGTAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGTCA:1 - chr2L 9347576 5' - opus 7484 2 59.05 AATTTCGGGGGTTCCCGTGCCACATGCGATGGAGTCCAGTTCCAAGACGGGGAATCGACCTGGCCGAAACCGCAATGCACTTTGACTAGCCGGATTCACCATATTATCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr3R 10461605 5' - roo 403 1 78.99 ATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTACACCCC:1 - chr3R 6412062 5' + Tirant 8114 2 71.43 GATCCACTGTCGGTATTTCAAGACAAGCCAAGTACGTTCATATTTCGTTTTTTCGTCAGGGTGGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr3R 32068452 5' - P-element 2829 1 45.89 GGGAGTGTACGCATTTGGCTATTAGAAATTATAACGACAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 14494149 5' - roo 9049 2 70.55 AGTGATTGGAACTTTTTCGGACTGATTTTACAAAGCGATAATAGCGCAGCCAATGAAATATTTATGCATTTCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGGCGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr2R 10600124 5' + 297 6605 2 70.55 AAAGTGTAGTCGAGCTAAAAGGGGGAAATTTCTTAAAAATAACGAAAAGAAACATATTGATTTCAATTTCGACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr2L 11734500 5' + Doc 55 1 58.90 AAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAA:1 - 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Ivk 5325 1 55.48 CAAAAAAATCACAGTATCAATTGAGATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCGCGTTAGGAATAAGTATATCAT:1 + chrX 10128172 5' + invader3 5260 2 55.48 AGGCAACTGTTTAGTGCAACGAGCCGCGACAAGTGCATAAAACACGCCCAAAACGACGACAAGTGCGTTGTCAATGTCTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr3L 815036 5' + hobo 30 1 61.94 AGTATTTGGGGTCTCTGTCGATCAGGTAGGCTCCTGTCTCGTCCTGCAACCGAATTACTGATTAGTATCGAACCAAAGACAGAAAGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACACACACATAATGCACACATACAGTTGTCTGCTATC:1 - chrX 1514504 5' - 1360 162 1 55.48 AAAGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr2L 17957191 5' - blood 7364 2 60.00 GTTGGAATGTACGATTAAAATAAACACTAATATAGATTTGACTATGTTACGCTTAAATAAAATTGCAGAAACGTTATTAGTGCGAAACTAAAAATAGTTCCTATGTTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:2 + chr2R 969100 5' - flea 243 2 78.08 CTCCTCCACCTCGGGATCTGCTTCTGCTGCTCCATTTGCAGTGGTGTTCTCTTGGTCTCCCTGCTCGGTGGTTTCCATAGGGGATTTAATAATTTTAGTAAATTGGTAGACTATCGTTGTTAAATTAGCTAACATAAACATATGG:1 + chr2R 21798090 5' - Tc1-2 1503 1 57.93 ATCGATGAGATATAGTGGATTTAATGGTACCATTCAGCTGCTAATTCGATAGATAAGACATGAGCACTCAGCAACTGTATCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAA:1 - chr3L 10955851 5' + hopper 1093 1 54.11 AATTCCTGCTTCCTGTCTTGCTTTATTTACTTTATTGAGTTCATGATTCTCGTTATAACTTTCATCGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 12813668 5' - roo 355 2 53.42 CAATCGATGCCGCAATATGATACTTTCAAGTTAAATCACGTTTGACACCAGACTGTCTAGGAACGTCATGGGGATGTGTAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2L 9347595 5' - opus 459 2 54.79 AATAATGCAGGCCGCACAGAGCGGCGATGATCAAGAGTAGCGGAAAAGCGGAGTAAATGACAATAATGACACAATAAAAAGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCG:1 - chr3R 7469449 5' - F-element 243 1 64.71 ATAATATTTGATCATATGGTTTAAATTGGTCCAAATAATATCGAAAAGAGCAGTAGGAATATAGACATTAATCCTTCTTTACCGGGGAAGTTTTTGGCTGCGATTTCACCTTGACCTTGTAGGGCGTGGTGCTGGTGCTG:1 - chr3L 22986184 5' + copia 5025 2 50.71 ATGATAATTATTGCATTTCGAGACATTAAGGTTAATTAAGGAACATAGACATTCCACTACACTTCAATTAATAATCCTAGCAAAATATTTATCCGAAATTAAGAATATTGAATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3R 12610144 5' + roo 10 2 76.71 GTGTGTGTGTTTGTGCAATTATACTGGTTTGCTGTGCATGGCCGACAATCAAATGTTGCTTGAGTTTGGCGTCGTTCCTCTGTCTTTGCTCTTTGCCTGTCTTGCTGCTGTTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTATTGTTATT:1 + chrX 2306709 5' - mdg1 7057 3 70.55 ATTTCGGGTGGTGCCACATGGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGAATTTGCCTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAA:1 + chr2L 7271825 5' - 297 6921 2 62.04 GTTTGACACCAGACTGTCTAGGAACGTCATGGGGATGTGTAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 - chr2L 9347556 5' - opus 428 2 71.01 ATGCAATATAACTTAAATGTTAGTGTTCAAAGTTGTGAATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3R 5762022 5' - roo 329 2 71.23 GTATATATAGAGAGATTAAGCTTGCAGCTTCCAGAGTTAGTTTAATTAATTTTTCTAATTTTTCCTAATAGAAAATGTTAAAATTTCTGGTTCGTACTTTCACTAGCTGAATAATGGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCAGCTATA:1 + chrX 14276803 5' + INE-1 565 1 68.49 TTCGCTGACTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3R 24976228 5' - roo 8988 2 74.66 CAGTTGGTCCATTTTTCAATTCTTTTTACATTCCCCTCGAAAAAAGACCCAAGCACAACCAAATGACTGCACATGGACTTGTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 + chr3L 3339310 5' - Transpac 273 2 60.27 CCCCACAGCAAATATAAAGTGCATAAACAAATAAAACTAGAAATTCCCCGCTGAACCAGAAAATCGGGAAGCCGAATAAAGGAAGGCAAAAAGCAAAGTGAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:2 + chr3L 14708867 5' - opus 7490 2 76.71 AAAAGTTACGAATGTCGATTTATTTAGGCGTAGGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGT:1 + chr3R 25718216 5' + I-element 5006 1 70.00 GTGGAAAAAGACAGCATAATTTGCTCGTCGTGTGGTTGTTGTCATCTTAGATTTGTTGTTGCCGTTGCAGTTACACACTAAATTACAGTCAATTAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGTCTTTTAAGATTAC:1 - chr2L 702958 5' + FB 267 1 70.90 ACAACATATTTCTTGTCCACAGCGTGCTGTACGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3L 13545005 5' - hobo 2893 1 68.93 ATTCGATTAAAAATGATAAATGCCTCGCTGCGCTCAAGTGAAAACAGCACGGGGAAGAAAATATATAAGTATATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCAC:1 - chr3R 26432091 5' + Quasimodo 43 2 59.03 GTCAGCCCTTTCAATTTAAATTCCTGGCTGCCCAAGCTGCCCAAGCTGCCTCTGCAACTATTCACTGGGTGAAAAATAATGTGAAAAACTGGCTGAAATGTACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGAC:1 + chr3R 21254919 5' + 297 357 2 63.01 CATAAATTTCATTGGCCAGATACTCTCACAATTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGG:1 + chr3R 9193168 5' + opus 68 4 76.15 ATTTGGCCACAAATCTTCAATAATGTTGTATCATAAAACAAATACTGCTAATAACAATAACAAATAAAACAAAACAATAATAACAATAAACAAATACTGCTAATAAGAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2R 17187840 5' + roo 13 2 35.62 TTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCATATATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTT:1 - chrX 12657098 5' - Stalker 6960 4 50.00 TTCCAACAAGTGGTCCACCATTTGAACATAGTATCGTGGTAAACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAACTTGCGCTGCTGAATCTCAACCTTCTAGGCGGACAGACGGACATGGCTAGAT:1 - chr3L 22016887 5' - INE-1 115 1 61.64 GGCGCCAACTACGAGCACAACTAACGAG:1 + chr2R 8255102 5' + R2-element 240 1 75.00 CTAGTTTTTGGCCATAAAATAGCTAGATTGTTTTCACCTGCTCTTAAAACGCTCTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAG:1 + chr3R 5264831 5' + P-element 66 1 40.00 AAAAAGAAACCTGAACAACGTTGAAGCTAAGGAGATGACATTTGAGTATTTTACTAATATTAGCATAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 + chr3L 24253577 5' + 297 50 2 57.53 AATGTTACGCAATCATTATGCTATTGTTTTGTATTGTTTTTGTGTATATTTCGGTTTTCACAGCCCCATGCTGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACG:1 - chrX 7340157 5' - FB 312 1 51.03 CTTAAATATCCTTTTTGGTTTCCGGATTAACTTAACCAACTTTTCAACAAGTATTGAACGCAGATCTCAAAGTGTGTGTCACTAAACTTTGTTATGCTATAATTATATTGATTATATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAA:1 - chr2R 9092120 5' - 412 7538 2 78.77 TTTCACTTTAATTTCAATCGAATTGTACATACGAATAAAATTGTAATTCCACCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chrX 6423262 5' + roo 61 2 61.43 TACATTTTCTGAATTTTCCGAGTCAAGTGGTTTGTGGAAAATCTCGTTGGCGCGTCTCGCACACAATAAAATACTTTCGAATGCGTTTCTGTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTACACATGCTGAATAAAAACCAAATAAAG:1 + chr2L 3906160 5' + mdg1 351 2 62.33 TGACACATTCGGCGGCGCAGCGAATTTCGCTAGAAAAGCCTTTTTTCGGGGCCTGAGAACTGAGAACGGCAAAAAGGAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chrX 8760063 5' - roo 9035 1 58.27 AATAAAGAAAAACTGTAGCTTACGTAGCTTGAGCCCAAAAGTATGCATTACGAATATATTTAAATTGGCCACACAAACTTTCATATGAAAAGTTTTTTTTTAATTAATTTATATATTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCT:1 - chr3R 4704950 5' - X-element 4687 1 77.40 GGAATGGGTGGGAATAGGGTAAATGACAAAATGACTGCTTTCGCGGGGGCGGGAAATTGTAAAGAAAATCGAAAAACGGAAAAGTTTTGGCCATTGACAAACGCATTAAGAGTTATTATTATTATTATTATGTTAGATAGAATAGT:1 + chrX 18737165 5' - I-element 5344 1 76.03 CTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATACATTAGGGACACC:1 - chr2L 22684587 5' + transib3 84 1 65.75 GTCGCTCTTTATGCTTATTTAAAAAAGTGGCGTCACATCCCAGTTTTGAGAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAAT:1 - chr2L 10519612 5' + X-element 78 1 65.75 AATGGGTCTAGTGATATATCCTTCCTGCATCTTTACTTTAGCCACTCGGACCTTATCATCATTCCCCTTATGCACCTTTTCCACCTTTCCTAAAGGCCATTTACTTTAATATGCGATTCTCATGTCACCTATTTA:1 - chr3R 19448064 5' + roo 330 2 74.07 TTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGGCTATC:1 - chr2L 23373498 5' - Tc1-2 1533 1 77.40 GGACAATGGCAGCCCGAAAAGTGACAAAGACAACACGTTTCGTGCTGCAAAAAGTTACAGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATACACTTAACGT:1 + chr3L 5179138 5' - P-element 2855 1 53.39 GAAATTAAAAATGAACTGAATGGTATATTTTGTGAATAATTTACCACATAAATTTCATTGGCCAGATACTCTCACAATTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr3R 9193122 5' + opus 7143 4 64.44 CTTCAGTTTCTCGGGAAATTAAAAATGAACTGAATGGTATATTTTGTGAATAATTTACCACATAAATTTCATTGGCCAGATACTCTCACAATTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr3R 9193108 5' + opus 24 4 69.18 GCCACAGCTGGCATGGAATCACCACAAAATATCCAGCTGGTGAAATTCCTGACCAAATATTAATTTTTAACTGGGATAAGTCGCAATATTCAATCGATGTAGAGTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:1 - 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Gypsy6A_LTR 104 1 65.75 GCTTGAAGTCCGCAAGGAATTCCGTATTCATTCTGACATGCACTGTATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 - chr2R 12814926 5' + opus 7058 4 65.91 ATTAACTTATATAGTACGAATGTTGATAGTTGTGTTCGCTGTGTGTTTTCTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 + chr3L 15859572 5' + I-element 18 1 71.23 GCCAGTCCTTGTACAAATTAGGACACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr3L 10564013 5' - hopper 1374 2 56.16 CCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 21587591 5' - roo 328 2 75.34 CTAAAATTCTTAAAATTAGCTAAAGTTGTAAAATGGCGGTGAAACGAGCAAAACAAAACGGTCCAAAAGTCTAAGCCTAAACTATTTTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:1 - chr3R 5316657 5' - Juan 4180 1 58.62 TATGGTTGAAAAACATTTTTTGGAAAAATCAAAATGCTAACTTTTAATGTCTGCATACATATAAATCAATAGTAGGATTACAAACTATTCATGAATCGGCTCCAGCTCTTGCTGTCATTATTAAATTGGTTGATTGGTTGACTAGC:1 + chr3L 2918441 5' + gypsy6 7652 2 58.22 ATACATTATGTATGCCGTCTTGGTTCCGTCTTGCAGTTGCCATAAATTTGAGCGCTAATAGTTTGTCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - 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roo 9025 2 54.11 AAACACTTACGGGGGTCTCCCAGATCTAACATCTTTCACTTGAATTTGCTGAGGCTCTGGTTAACACTTTTCTAACACAACTTTATCTCATGTCCGCGTGAACTTAGCACTTTTCCAATATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCAT:1 - chrX 19983506 5' - hopper 83 1 32.88 ATTGTCTCGTTACGTGGAAAAGGCGCAAACCCACCGACAACCTTTTGTGCGCATTTTTATTTATTTATTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 + chr2L 16385255 5' - I-element 5318 1 52.94 AGCGCATGAGGACCCTGCAGATGTGGTACAGGAAGTAGAGAATATTCTTGTAAGGAGTTCGGTAAATAAATGATACCTTGTTAAGTAAAGTGTTTTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr3R 29516446 5' + I-element 28 1 64.38 GTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCAGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAATACATATAAAGTATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGACCAT:1 + chrX 15903134 5' + INE-1 103 1 37.67 AAGAATTACGTACTATCAAAATGCTTAAAAGTAAAACTAATGCGATGTAAAAAAAAAGGAGCGCTTGTAATAAAAAAATCTCAAAAATAAATATAATAATTTCA:1 + chr3L 3940870 5' - copia 4659 1 53.85 AGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATCGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 27188618 5' - roo 334 2 65.75 AATTAGCTAAAGTTGTAAAATGGCGGTGAAACGAGCAAAACAAAACGGTCCAAAAGTCTAAGCCTAAACTATTTTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1 - chr3R 5316644 5' - Juan 4166 1 50.68 AAAGACAAGACAGCAGAAACAAAAAACCGAAATCCCAACCTAGTAGAGCAATGATAAGAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTAAAAAAAAATTATTAAATGTTTTTTATTTTAAGTCAGATTGCATGAATAATAAGTAC:1 + chr3L 21438176 5' + Tc1 90 1 60.96 TAATGTTTTTGAAAATAGTTTTTGAAAGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGTGAAAGAGACCTACTAGGTTATCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGAGAATGCCATAGTCTAGTTCCCCGGCTATCAGATACCCG:1 + chr3R 18346583 5' - INE-1 555 1 41.10 AAGCAAATCGAGCAGGCCAAAAAGCCGCCTATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2R 9504177 5' - roo 404 1 75.00 GCATATTTCGTGCACAGGAGGAGCTGCGTTTTTATTTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATT:1 + chr3R 25843372 5' - I-element 5285 1 73.68 AAATAAAAATGCGCAGCTTCCGCGGCGCTGCGATAGATGGCGCCAAACGGAGTTTGGCCTAGTGCGAAGGAAAACTTTAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAA:1 + chrX 20636911 5' + Quasimodo 39 2 59.59 AATTATCTCGAGCCATGATACGAACACCCTTTTGCTTGCGCCACACTTCAAGCAGGGCAAATGAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATA:1 - chr3L 24150055 5' + hopper2 1170 2 59.59 GACGCGCCAGACGACGTCAGCGAATCCAGCCAACCCCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAGGAATAAGATTCTTAAAAACCCCCAATTCTAAAAAAAAAACCCCAATCCTAGATAAGTAACC:1 + chrX 18187617 5' + Idefix 157 2 73.29 AAGAATATTTCTGTTCTTATCACAAATTACTAATTTTATATTTCTTTCCTCAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAGTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAATGCACTG:1 + chr3L 23150211 5' - hopper 1293 1 64.38 TTTATTCAAGAATTTTCAAAGTGTAGTCGAGCTAAAAGGGGGAAATTTCTTAAAAATAACGAAAAGAAACATATTGATTTCAATTTCGACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 + chr2L 11734483 5' + Doc 38 1 58.22 GAACATGTGATTTGAAATGAGATTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTCTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCG:1 + chr2L 9347503 5' + opus 65 4 80.51 ATACAATACATTTAAAATGATTTACTTTTGACAAATTCTTAGTCAATAATTCTGCTATCATATTATTATTATTATCATTTATTATTCGACTTACGATAGGAAAATTAAAAAATAAAAACCGTAAGTGGCATGCACGATTCATAATG:1 + chrX 21177280 5' - Rt1b 5073 1 64.38 TGGGAATATTATTAGTAATCATGGCAGCAGCGATAAGCACACGTTTCTTTCCACAAGTTTCTAACAAAAATCATAATTTACGCCGTAAAAAAATTAGTATTCAATTTACAACAATTATAGCA:1 - chrX 4965176 5' - accord2 7155 1 87.70 CCATCGGTGGCTGGCAGCTGCAGCGGCTAATCAACGAGAAAGGTCCTTCGACCACTTACAAGTTCCATCGATCGGTGAGGATCGAACCAAATGGCGTGATCACCGTTTTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTTG:1 + chr2L 5545126 5' - F-element 87 1 79.10 TAGAACTAGTTTACTTTCTAGCCACTGTGTTCAACGCTCATCAACCTGATTTACCTATTAAATCATGACTGTGTGCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTGTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3R 30302247 5' + Doc 39 1 57.78 CCGAGCGAAATTTGCCACACAATCAAGAGTTAAAGTTACTCAGTGCGACACTGCGAGAAATAAGTGTCAACTGTTCGATTAAACCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1 + chrX 15565478 5' + transib2 36 1 56.85 AAGCTTTTGGTTCATTTAAAATCCAATCATTTGACTACAAACACTTTCAATTAAAGTTGCAGCCGAGCTGTAAAGCAAGTATTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCT:1 + chr2L 6876587 5' - Rt1a 5036 2 62.31 AAATGAGAATAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTAGGTTG:1 - chr2L 3959978 5' - gypsy 374 2 73.29 GCTGTGATTATTGCGCGGACTCATGCTTTTCTCTGCTCTCTTCTTTGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 - chrX 850131 5' + jockey 78 1 64.79 AAATTAAAATTACATAGTAATAAATGTTCAATACTACATTTAAATGATATATAAATATATCATTTGTAATAAGAAATAAGTAATAGCTCAGCGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTCTTAT:1 - chr3L 17162391 5' - Stalker2 7594 2 52.45 CCTTGGTTGACAAATTACATAGGCTAATTAGCATATATATCACATACTTCCTAAATTAGAAGCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chr3L 20744278 5' + 412 7112 2 58.22 GAGTGTGAGCGCCGATTTGTCAACGCCTAAAAGGACAACATATTTCTTGTCCACAGCGTGCTGTACGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCCGATAAACACTCGGAACTCTAGGCA:1 + chr3L 13544971 5' - hobo 2896 1 52.24 AAGCATTTTATTGATCAAGTTACGCATCCGTAATACGAATCGAAATATAATTGCTCTTTTCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCTCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGC:1 + chr3R 30850755 5' + I-element 63 1 56.85 CTTAATTATCGTCACACATGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCA:1 - chr2R 3120329 5' + accord 52 2 50.00 ACATTTCAGAACTCCATCCATCCTATCATCTTGCATACTCATTTGTAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 + chrX 5399016 5' - opus 7431 2 68.49 ATTAAAGTTATATAAACTATCTTAGAATGAACAATATTTTGGGGAAAGTAGTATGCACAGAATCTATGTATATCTGTGAAAAAAATTTAGGGAGAAAAATGCCATTACATATATCAAAGTTGATATAAATAAAATAAATTTAAAAA:1 - chr3L 2633410 5' + HeT-A 4 1 77.40 CTATATGAGCGTAATTAAAAGTATGATAAGAATTTTGCATTTCTTATCTGTTATTTTTTTTCTTCTTTTTTTATCTGATCCAATAGCAGACTTATTATATAGTTTTCCGATAACGATAATTTTGAATTTCTCGACTATCAGATACC:2 - chr2R 14871509 5' - INE-1 557 1 79.45 ATCGTATTTTGCTGCATTCTCTGCTATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 - chr2L 12678574 5' - P-element 2792 1 23.29 GCAATTTTATTTTTTCATCGCCACAAAATGAGGGGAAAAAAATAAAACGCCAAGGAAGCTACCCAAAACAAAAAAAAAGAACAAAATGCAAAAATTGCAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 6443187 5' - Tc1 1476 1 46.09 AAACGCTTAATAATACATAAAAATCCTCCTTGTGTTCTTTTTTTTATTAAACTATCTGAATTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACG:1 + chr2R 4447969 5' - invader1 361 2 53.28 ATACTTTGTGTATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAAT:2 - chr3R 29091423 5' + rover 6977 2 68.49 GAGGGAATGTGTGCTGACGTCGGAAGTATTTTTTTTTTATTTTTCATAAT:1 + chr3L 16757486 5' + hopper 155 1 88.00 AATTTAATCAATTGCTCCAATTAAGCCATCTACCACACATTTATTAAATCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTGGCTTGTTGAGAGGA:1 + chr2R 11595835 5' + P-element 70 1 37.67 CCTAATGTCTTTATTATGTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCAT:1 + chr2R 9934134 5' + Rt1b 4964 1 54.11 AATTTATGATGACGTTAAAAGCATCAGTATGTATCAGTATAGTATCAGTACACTGTAAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 + chr2R 15942270 5' - opus 460 2 56.45 ATTGTAGAATTTATGATGACGTTAAAAGCATCAGTATGTATCAGTATAGTATCAGTACACTGTAAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr2R 15942263 5' - opus 7475 2 48.74 CATAAAAGACCCATAAAGCACAAGAAAACATCTAAAAAAGAAAAGAGCAAAGAGCTGGGAATACCCTGAACAAAGGCAAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chrX 5366121 5' - pogo 2069 1 62.14 TTGGGCGTGTTTTTATAACCGTTAATCGTAGAGTAGGGCAAAGCTACCCGAGTACAAAAAATCCTTTCGTGGATTTTTCGTGGCCTTTGCCACGTCACTCTAACGCCCTAAAGCCGTTAAAGCGGTCACGCCCACACTTTTGAAA:1 - chr3R 18295949 5' + INE-1 250 1 44.83 AGCAGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3R 27188626 5' - roo 9007 2 61.38 AAATATTTATTTTCAATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGC:2 + chr3L 18034555 5' + Transpac 64 2 62.33 CCATACATATAGCCGGGCTCAAATTTAAATAAATACAAGCAAAGTGGAAAATAAAATGCGCACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTA:1 - chr2L 16385342 5' + I-element 58 1 58.22 TATTGGCATTCAGTTTACAACAAATACAGTGTATTATTCACATATCTACTACAAAGCACAACATATGTAAAATGTTTATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chrX 17510701 5' + roo 43 2 51.37 TCGGGTGGTGCCACATGGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGAATTTGCCTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAAAGTTTTTAG:1 + chr2L 7271828 5' - 297 6909 2 65.07 GCTTGCGTGATGATAAAAATACTCCGAAGAAAAGCCACAAGGCTTCCCGGAAAGATTTGTCTAAATTTCAACAAATCAATGATCGCTTCCCCCCCCCCAAGTATGCAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAAC:1 + chrX 14716355 5' + Doc3-element 4566 1 68.46 ATATTAAACCAAATAACCCAGTTCATTTATTAAAATTATAGTAGTAGCTTACACTACCAGTTCCCAAAAAAAAGTTGCTAAAAAAGTTTTTATGAATAAATTATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGA:2 + chrX 20795920 5' + jockey 4778 1 67.12 ACCATAAACCACAAATACGATAAATTCTAATATATTTTATAATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAAC:1 - chr2R 21425197 5' + HMS-Beagle2 23 2 68.49 CATGTCTTAAACTGCAAGCGAAATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 - chr3L 4933837 5' + blood 44 2 52.05 ATGCTACAAACTTTTCGAAATGCTTATGGATTTTATTAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 + chrX 9508119 5' + jockey 4737 1 72.36 AAAAAAATTTCATATTAATGATTTGAATGATTTGTGGGCTCGTGGTTTTATTAATGAATACCTTGCCTTATTGGCAGCAGTACGCTTTCCGCCTGTTGGAATATACTATTCAAACTACAAAAATA:1 + chr3R 26244594 5' + copia 11 2 67.20 AGCTTAGTTACGTGTCTATTTGTTATTTGTCAATCACTAAGCTACTTCGTGTGTGTGAGTCCGGTTGTGATTTTAATTCCGAGTGAGTGTATGTGTGCCTGCCTGATTGTGTTTGTATGCCGGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTA:1 - chr2L 9314227 5' - accord 182 2 57.53 GGGGTAATCAGCTGATCAGGTTAAAATTAATTGCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr2R 9339785 5' - Transpac 5206 2 69.86 ATTTAGCCAGTAGATCTAACCTAAGTGAGTTGTAATTCTATCTTAGATCCATGAACGCAACTTTCTCCTGTTTCCCCCCCCAAATTACCCAATCTTTGTCATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACAC:1 - chr3R 20860379 5' + roo 8660 1 64.14 GTTGAGGCATAAATTCGGTAAGCCATAAATAATTCTCTCTGCCTGGCGCCGCACCACATCACATACAGCCGCAGCCAGCACAGGCACAACAGTTACCCTATCTTGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGTATCCGAAGTATAG:1 + chr3R 19036808 5' - Chouto 55 1 64.79 AAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATAGTGATCCATCACAAACATATGCGCAGATCGTGTG:1 + chr3L 13472424 5' + jockey 90 1 71.23 AGCCTCTTTATATGGAAAACACGCGCCTGCCGCTCACACATACACCGATAAATTTGAGTCCTTAAACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 10304680 5' - roo 354 2 53.42 CGAGCTGGGAATGCAACTGTAAAAATAATAACACCGCGTCAAGGATCGCCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTCA:1 - chr3R 21587639 5' - roo 9040 1 63.01 GAGGAAGGTAACACAGGTCCTGAATGGACGGGTTTAATTAATTTTTGTAAATGAGTTTCCAATTCAAAGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 18658194 5' + roo 8716 2 55.48 CAATAAAGCTATTATTTTGGCTTATAATAGAATTATATAAATTATTTTCTTTTCCCAATCCCATTGTTCAGATTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCAAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chrX 10823910 5' - pogo 2058 1 54.48 ACCCCGTACGGATCTTCTGTAGATTAAAAAAACTACCTAATCGGACCACAATCAATGACTAAACTTTTGAATAATAATAAAGTACGATATACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTT:1 - chr2L 165163 5' - P-element 2536 1 63.57 ACTTGGCAAAATGGATCGTGCTTTAAAACTGGTGGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACACAAA:1 - chr3R 30558274 5' + I-element 4891 1 68.29 ACCACTCGCAACTGATACTCTTCGGACGCTCCCTGGGCGGAGCTGTGGTGGTCGACGTTGCATGTTATTAATTTTTAAGCAACATTGAATACTGAAAATATGAATTTCTAAAAACCTAAATACTGACTCGGCTGATGTTTCT:1 + chr2L 2988888 5' + gypsy12 9834 2 56.34 TCATAGTTATAAATTATGCAGCAGTTGAGTTAGGAATCGAGATGGCAATAAGGATAAGACAGTGCTTGCACTTAGGAAAACTCAGTCCTAATGCTAATTTAGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3R 8914400 5' - pogo 2084 1 73.79 GTGTTGTAGACGGAGGAAATGGAGAGAGATAGCAACACAAGTGATACATGGGTTCATGGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 18213073 5' - roo 390 2 71.23 CGCTGATGTGGAGAAAGTGGGACGAAGTGGAACATACATCTTCTACCCCCAGCGGGAGTTTCCTGCTTATAAGGAAGTAGGTGCCAGCATATTGTAGGTAATTAGAATTCAAATACTTCTGATGTAG:1 + chr2R 14722636 5' - mdg1 408 2 74.80 AGAGAGAAAACTATAGCCGAGTTGCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCAAACGCGAAATTTCATCATTTCTCTGGGATATCGATAGATCTTGCGGAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTTTTCCAAA:1 + chr3L 23689131 5' + Ivk 5249 1 81.51 CTTTCAATTTTACTAAAAAGTTCTTTCTGAGGCAATAGAAAAAAGTTGTAGGTTTCTAAACTTTATTTCTGGTACTCTATAAAAATTATTTTACTAAAGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGAGCCTCTCAGTCT:1 - chr3L 15277733 5' + I-element 25 1 66.44 ATTTGCGGCTTATCGAAACCATAAAAATTTTCTAATCCACTTTGCGTAAATAATCATGAGCGTCAATTCAATTCCGGCAGCCATCACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chrX 19982325 5' - hopper 1376 1 58.90 TTTCAGTGGCGGCCGTTACTCGCGGCTCAGTCGCCAGCTGCCTGGTCAATTTTTAAATTTAAATTTTAAAATTAA:1 + chr2R 24844235 5' + 1360 3053 1 82.67 AAATTTGGAAAACAGGCAAATAATTCAGCAACTGATTTACGAGCCAACTGGGACCGCCGAGCCTCACAGTCTTTTGTCCTTTAATACCCAGGGATCCTTATGTACTTACATATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATAT:1 + chr3L 16875770 5' - Burdock 6382 2 72.60 CCAGTCAGCCCGAATGCAATTAAAATCGAACATCCATCGAGCTCAAAGTGTCCGCAACTTGTGCTGCATACTTTTGTGCGTCGCCAGGAGCCGCACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chrX 7031720 5' + hopper 3 2 79.84 GCATAAATGAATACCGAATAATGGACGTGCATAATGGAATCATTCTTCGTATACCCTGGAACAAATATATTCAAAGGAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2R 12813797 5' + roo 8704 2 52.74 CACCAAGGATAATTGATTTTTACAGGACAGCGATTAATTGATGTTTTGATATTACACACTTGAGTTTCTATGTATCCTATGCTATTCCTGGTACATACATATGCGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTC:1 + chr3R 5430347 5' + Burdock 14 2 75.69 AAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTGGTCGGCTTCATCCAGATAA:1 - chr2L 15322913 5' + diver 325 1 75.86 AGAACTAACACCAAAGATACATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGA:1 - chr3R 21276674 5' - BS 5083 1 68.49 GTTCTGTTCCATCTAACAAATTTTCAAGCCAAAAGTTACCGAACCGAGGCTTAGCATATAATACCATCCGTAGCCCAGGAGCACCCCACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAG:1 - chr3R 7612576 5' - roo 8697 2 62.07 AAAAGGGGTGCCAATCTCTCTTTTGGAAACGCATATTTTATTGTCAAAATCAATAGATGTCAGCGTTTAACAGCTGCCAGCGGCAAAATACAACCCCTGATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTATACTCGTTGA:1 - chrX 17028002 5' - roo 395 1 79.29 GTCGCCAGCCCCTCGTCACCGCAATTTAGTGACGTCAATGGCTAAATGACTGAGTGGCCAAATAGCAATGGCAGAGTGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2R 7889349 5' + jockey 35 1 62.60 CAAACTTTTAAATTAAAATTGCGGGAAGGAGTGAAGCGGTTCGAATTTATGGCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAA:1 + chr2R 22287373 5' + jockey 4795 1 68.49 CATAGAGAGCAAGACGAACAACGCCTACTTCTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr2L 22719539 5' + 1360 30 1 64.38 TTGTGAAAATTTAATAAAATATCGTACACGATTTCCGGCTCAATAACGTTGAATGCAACTAATTGCTTGACCAGCATCAAGTATTTAAGCCGACTTTCTAACAAAAATTGGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCA:1 - chr3L 12598944 5' - 1360 66 1 69.78 TACAAAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr2R 16510243 5' + roo 8736 2 67.81 TTTGTTGTTATTAAGTTTGGCTTTTTTCATCCTGTTTTTATACCCGTTACTCATAGAGTAAAGGGGTATATTAGACGCATTGCCGCCGAACCGGTCACGTCCACACTTTGGAACAATTTTTAATTTTTTTTCTCTGTTTAT:1 - 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roo 8987 2 75.34 AATGATCAAAGGGTATCCTTTAAAAATAATAAATCGGAATATATAATTGGTAAATATTACTATATATAAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATTAAAAGTAATGACCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:3 + chr2L 18952981 5' - roo 391 2 70.55 AAAATGTCCTTGTATTGGTATTGATGCTCCCCAGTTTCAAAATCCATATTCGTATTACCTACATATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:2 - chr2R 17021426 5' + pogo 52 1 59.59 ACTTCGATTCCTTATTTCAGACCCGTCCTTTTATGTTTTTTTCTCAATTCAGACGCAAGCTTTTCCAGCTCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCA:1 + chr2L 4420444 5' + gypsy5 6946 2 79.45 CGTAGATATAGGATAGAAAGGCTATACAAAATAAAAGTTTACAGCGGCTTTTTGCCGTAAAAGAGAGTTACTTTGCCGTAACAAGATTGGTGTAAGAGGGTTAAGTGGAGCATTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACAACGCTTG:1 + chr2L 55710 5' + Cr1a 4013 1 75.34 AAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAGG:1 - chr2R 9339729 5' - Transpac 232 2 69.66 GACATCTAATTGCGCAAAATAGGGTGAGTTTGAAAGAGGGCAGACATGGAAAATAACACAAAATGCGAATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAA:1 + chr3R 29091274 5' - rover 298 2 52.74 GCTTCTCACATACAAACAATCAGAATTGCGGAGGGGCACACGAATAGCATACACAGACACACACACACGCACGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTA:1 - chr2L 4420609 5' - gypsy5 368 2 47.79 GCTCCATTCTGTGCAGCAGTGTGGTTCATAGTGCCCCGCGGAACTACAGCTTCGTGAAACCAGTGATCCTGAAGATTCCCCACTGCCTGGTGGCTCCGGAGCAAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAG:1 + chr2R 15366062 5' - 1360 226 1 70.55 ATGTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTG:1 + chr2R 9934149 5' + Rt1b 4970 1 48.91 GTGAAAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chr2L 18178354 5' + Tirant 36 2 58.10 CAGACAACATTTTTGGAAATAGATTTGAAACTGTACATACTTTTTACTTATTTAGATTAAATTAACCTTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTG:1 - chr3R 4840201 5' - P-element 71 1 56.25 AGTGCGAAAGAAGCACTTATTGATTTCGACGTAAAAACCCACACGTATCTATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTA:1 + chr2L 6319745 5' + Tabor 70 2 63.45 CAATAACCCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCT:1 - 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chrX 1514505 5' - 1360 163 1 56.16 ATGGTACATTATCTTAATCAAATTTATTCATAATTCTCTAAGAGTGAATCAGCTTTAAGAACTGGACTACTCAAATACCGTGAGAAACTATCATTCACAGCTATAAATATAGAACATATTAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:2 - chr3R 22772027 5' - opus 495 2 69.18 GTTTCATTTTGATAGTTATGATTCATGAAGTAGAGTATAGAATACAAATAAATGCGAAAATGAATCATGAATGGAATGACAAATCATCATGATTGATTCAAACGTTGTTTAATTCCTTTGTTCAAAGCTCGGACCCGCAATCCCGA:1 - chr2L 20905826 5' + Idefix 7077 2 77.40 ATTCGCCCCTGGTTGCCGCTGCATTTTGCATTGCAGGCGAATTCGAAAGTGTTCTCACATACTTCGTACACTCAAAAATGTTTGGTTGGATTAATATATTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATAT:1 - chr3R 14249015 5' + G3 4505 1 60.27 GCATCTTTTAAATAGGAGGTTTTCCCGAGTATTTCGTTTTCCCCACGCTCCGTGAAAAGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3L 22884027 5' - roo 347 2 60.00 CTCTTCCAAGTGGTTATAAAGAAAAGGAAAAGCCGCAGACTGCGGAGGAAATTCATAAAGCTCTTCTGAAATCTCAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGCCGCTTACG:1 + chr2R 5351267 5' + Doc2-element 4575 1 58.39 CGCGACGTAATCGTAATATGATTATCGTGCCACATAAGCCCCCTCATCCACATCCTCTTCCTGTCCTGCTTTATGTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTGTGTATGTGTGTGTGTGGGT:1 - chrX 20325174 5' - Quasimodo 39 4 78.46 GGGCAAAGCGAATGTCACAGATAACGCAAAACTTTTGGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3L 17904796 5' + roo 8747 2 78.08 GTGCTGATCGCAGACCAGCCATCGTTTTTATACCCGTTACTCATAGAGTGAAAGTGTTTCACTGGCAGGAGGGAGCGTTTCCGACCATATAAATAATATAAATTCTTGATCAGGAACAATAGCC:1 + chr3R 31045679 5' + INE-1 87 1 79.03 CAATATGTCGATTTTAAGAGCCGCAATTCCACTTGGCAGCTATATCACCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3L 18658291 5' - roo 8998 2 67.81 TGTCTGAAAAGAACGCAATATTATTGGGTTGCTAAATATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAGC:1 + chr2R 24021539 5' + pogo 19 1 66.10 TTTAGAGAAACCAAAAACCAAATAATTTTTTATTGCATACCCGTTTTTCCCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAG:1 + chr3L 17454663 5' + jockey 4588 1 66.44 AATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTT:2 + chr3R 4160065 5' - invader2 5046 2 58.22 CCATTCGCCGGATCCAGCGAAGCCAGTTAACCGCAATAATTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTAGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATATATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 2276048 5' - accord 7031 2 69.17 GGCCGCCAAAACGCTGGCGATGATTAACACGGTGCACAGAATATTCATGTTGACGGTTATTCCTTTACTCTTTCGGGCCGCGGCCACTAAGAGAGGGCACTGAGGCATACATACAGCTGTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCTTTG:1 + chr2R 18044999 5' - HB 1618 1 51.37 AGGGGCAGATCCCCTGAAGTATGCTACGTTTTTGGCCATCCATTGCGGCGGCTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTTTA:1 - chr3R 14860239 5' + BS 5009 1 68.14 TATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTAT:1 - chr2L 1654716 5' + micropia 5092 4 52.74 GGCAGAGCAATCGCTGGCTTAAGTCACCCTTCGGTTTTGTGTCCCCTCGTTTTCTTATCGATGGGGGGCAAATTGAATTTGGACTGCTGCTTATCAGACTTTTGTTTACTCTGTAGTATGTGCATATATCTAGTGTACACTGT:1 - chr2L 13140754 5' + blood 11 2 77.62 CCTCTTTGGTGAGCCGCCTTGGAGTTCTGCACTGGGAATATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTA:1 + chr3R 10636119 5' - blood 7321 1 71.54 CTGAGAACTGAGAACGGCAAAAAGGAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACTATGTGACATGAGAATCGCA:1 + chrX 8760115 5' - roo 8992 2 74.62 ATCGGAACGAGGCGCGAAAAAGGGGAAAAATATGTTTGTGACTTGACGTAAGTCAACCCTGCTTACAGGAATATACCAAAAAACACTCACTCAGCTAGTGGGAATGCGAACGCAAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGA:1 - chr2R 5795158 5' - INE-1 501 1 39.73 CCGGTTTAAAATTTTAAATGACCGTTTTAAAAAATCATCACTAAAGGTTGAATGTGGGTGACGAGCAGAAAAAAACCAATTAATTTAATATCGTCTTTTCGTCGAACAACGCGTTGGGCAGCCTCGGCTCCCTTCCCTGCGCTCTG:1 + chr2L 12238922 5' - Osvaldo 1098 1 60.96 ACTTAACAAAATTAAATATATTGTAGTATACAATAGGCTACGGAGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTACTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGTTACTTAA:1 + chr2L 3813589 5' - Ivk 5219 1 69.86 ACATAAAATACGACGAAACGTTAAACATTTTCCATACTCCAATTATAGAAGCAAAATGTTTATAGTACATAGCACACGCTTGCTTGAAATTCATGTAAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chrX 3578050 5' - hobo 2924 1 69.34 CGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATCTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCTATC:1 - chr2L 11867386 5' + jockey 66 1 51.37 CATTTGCCTTTGCATTTATTTTGCAATCAGGCGACCTCTTTGCCCCGCCAGCCAGCCGACATGCGAGAATAATAAAAGTTTTCTAGCAATTTTCCATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTT:1 + chr3L 6678369 5' - 412 7234 2 65.75 AGGTGTTCGTCTGTTGATTCAACCCTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chrX 5206554 5' + Tirant 35 2 56.80 ACAATCCCTCATTGGGTGGGCGGTACACAGTTGTGACTGCTACGACTGCTAATTCGGCGTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTATTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGATCCAACAGGTTCTTTTCATCTAATTATATT:1 - chr2R 3161524 5' - rooA 258 2 61.11 AATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 + chr3R 4532871 5' - 1360 3329 1 60.27 AATACAATGACCCCTTTTCCACCTGTTATCTTCCACCTTGTGTTTGGTATACCCGTTATTCGTAGAGTAAGAGGGTAACCTAGATTCGTTGCATTTCCGATCATATAAAGCATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGC:1 + chrX 21191215 5' + INE-1 86 1 61.87 ACTTTTCGGCTTGACACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGTGGGAAAAGCAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chrX 19113580 5' + 412 53 2 52.05 ACACTTGAAGTGTAAATTTCATGGCCTCAATCAATGATAAATCTCCACGCAACAATGCGTCTATATCGGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3L 12899743 5' - roo 9026 1 50.72 TAATAATAAAATATTTTATTTCGAAATTATTAAAATAGCTGCAATATTGTATCAATGAAATGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chr3R 26410001 5' + roo 8723 2 62.33 GTAAATTAATTTGCGGCTTATCGAAACCATAAAAATTTTCTAATCCACTTTGCGTAAATAATCATGAGCGTCAATTCAATTCCGGCAGCCATCACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chrX 19982317 5' - hopper 1384 1 63.01 ATAATTGGGGTAAAGTCAATCGGAAACGATTATTTTGTGCATGTGAGTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCT:1 - chr3L 3565446 5' + gypsy 23 2 66.67 CGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 + chrX 11661363 5' + 297 6635 2 60.96 TGCATATCGCATAAGTAATTTTAGCGGCTGCAACGAAAATTGTTTAAAATTAATCCAAGCCCATACATACAACAAAATAATTTTCAATTGGGAAACGGTAATTTATAAAAAATATATGTAATTATGAAAGTAAAAAATATTAAGAT:1 + chr2L 7418235 5' + Tc3 1363 1 55.48 AAAAAATGAATTCATAACTTTTCATTCAAGCCACATACTCGAGAGATCCACTCGTATAGAGGATATAGATCCATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGGATTTTTGGACACACCCGAGTATTTGTGGA:1 - chr3L 58866 5' - hobo 256 1 50.00 AGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 27188614 5' - roo 351 2 64.80 GCGCATGAATGTCAAAAGTCTTCAAGGAATAATAATAATGTCTTGATCTTCAAATCAAACGAATGGCTTCTGTAAAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTGCATACGGACAGACGG:1 + chr3R 29332268 5' - INE-1 127 1 42.50 CGGAAAAGCAGATTATTCAGTAGTAATGTATTGTAGTTCACATTTCGAAATTTATCACATGAACCTGGTTAAAATACAGAGAGAAAATCGTATTTCGATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTCTTAGTGTAAGTT:1 + chrX 12475239 5' - Burdock 6367 2 68.84 GAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chrX 16217551 5' - P-element 2879 2 74.78 GTATCATTGTAGAAGATTTAATTTTAAACTTTAGGCATCTGTTAAGATTAGTTATAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chr3R 8914253 5' + pogo 61 1 62.33 GTATGTGGCTGGTATTTATGTACGTAGGCATCGAATCGATTCGCCGGAGGTGAAACAGTTTCAGAAATTCTTAGCTGCTGCAAAATGGATTCGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTAG:1 - chr3L 14323638 5' - Ivk 5113 1 63.64 GTTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCGGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 - chrX 2518093 5' + P-element 68 1 29.13 GACATTCGCTGCCTTCGCAGGTCGCAGGAAATGCCCGAATCGAGATGGTTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACAT:1 + chr3L 3757150 5' + copia 73 2 69.86 TTTGGTTTCCTTTTACCATTTTTTTTCTGGTTTTCTTTTAACATTTTTTTACTTTACATTATTAAGTTTCGCTGCTTCTGGTCCCTATTATTTGCTAATGCCGAGCATCTGTGTTTGTGCCTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTAC:1 - chr3R 29598977 5' - F-element 4684 1 55.17 AAAATACGTATAAAATATAAAAGAATTTATTAATTAATTTAATGGAGGGCCAAAAGTGTGTAAACTTGAAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTGATATATTGAATTTGTTTTTTAATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTA:1 + chrX 22443482 5' + S-element 1602 2 65.75 TTTTATTTACCCATTTGGGTTTATTACCCCAACGAGTATGCCTATAATAATAAAGATTTATATATAAGTTTATGTAACTATAAAGATTTTCAATAGCAATACAATATACTTGAATGTTAAGAAAACAGATACCCGTCACTCAGCT:1 + chr2R 10801811 5' - INE-1 545 1 54.48 TCTCTCTTCCGTTGACCAGTGGCCAAAAAAGAGCTGTAAGCCGGGAAATTGAATTACTTTGCTTGTGCAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCT:1 + chr3L 3565303 5' - gypsy 7420 2 44.83 GGTAAGCCCCGGGCGACCCACAAAAACGCAACCAATCGCCTCGCCTCGCCGCTGCTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACCATTGGCGATATTTGGATGAATTTTTTT:1 - chr2R 11379531 5' + hopper 59 1 59.71 CAAGAATAAGAGCTAAGTCCAGTGCATCGATTCGCGAGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATTTTAAATATTACTGTTAGTAGGA:1 - chrX 159033 5' - Cr1a 4296 1 78.74 CTGAGTTTTTCTAGTTCTCTTGCCCAAGTGACAACTCAAAGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr2R 7899185 5' + roo 8744 2 72.60 AGTATTTATTGATCATAACAAATAACGATAACAAATTCCGAAAAACTCAATAACATAAGTTATCTTGTTATGACACCTCATAGACATATGTACATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1 - chr3L 20209682 5' - Burdock 6366 2 67.12 GGTGGGAATAGGGTAAATGACAAAATGACTGCTTTCGCGGGGGCGGGAAATTGTAAAGAAAATCGAAAAACGGAAAAGTTTTGGCCATTGACAAACGCATTAAGAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAA:1 + chrX 18737171 5' - I-element 5338 1 71.92 ACTTCCTCACCGACATCGGGCATCAATTTGGTACAGGCTCATCTTTTGTCGCTTGAAGTCCGCAAGGAATTCCGTATTCATTCTGACATGCACTGTATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2R 12814976 5' + opus 19 2 68.49 AGCCACGTTTATGCGGAGATAAAAACATGAACATTTTTAACCCTTTTCAATAATACTTGAAAGTACAATACAATTTAGAATCGCTGGCATTTTATACATTTTAAATCTGTCAGCTCAACGTCTACAGTGTCTCTCCGATTTTACAG:1 + chr3R 22939683 5' - 412 7413 2 70.55 GCAATTAAAATCGAACATCCATCGAGCTCAAAGTGTCCGCAACTTGTGCTGCATACTTTTGTGCGTCGCCAGGAGCCGCACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chrX 7031705 5' - hopper 1375 1 58.22 TTGTTGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTG:1 - chr2L 22684610 5' + transib3 61 1 50.00 ACAAATAAATGGACATAAAACTCTGATAAAAAAAAAGCATTGGTTAAAAAAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGATACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3L 18792374 5' - roo 408 1 76.80 ACATCGGGCTGCAAGGAATCATCAAGGAAGTGGAATATTTAATATTTAACACCGTCAAATATTTCCCTAAGTCCCTACCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCG:1 - chr3L 23437491 5' - HMS-Beagle2 7045 2 57.35 TGGACGCCGAAAAATGAATATATGCACTCAATCCTTTAAATAATTTCACCATGCCTTTATTCGACTTTTCCCTTTAAGCACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATC:1 + chr3L 24283393 5' + G6 1937 1 77.06 GCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGC:1 - chr2L 18178340 5' + Tirant 79 2 77.61 CCCTTTTATCTCTGTGTTGTTATTAGTTACGGATATATGTCCAAATTGTTGTGCCAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr2L 11613305 5' + hobo 54 1 58.65 AGCTGGCATTTGAGTTTGGTTTGTTTTTGTGCGTTATAATATATTTGATTTGTTGTTGCCATTTGGCCACTTTTTTCGGTCCTTGCCGTTTTGTTATAAAAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTGATTTTATCATATTGC:1 - chr3R 28951065 5' + 1360 3102 1 63.01 ATTTCTGATTAAGATTTACCCATTTCCCTTTACACTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chrX 12998075 5' - roo 8986 2 74.66 GCTTTATTTACTTTATTGAGTTCATGATTCTCGTTATAACTTTCATCGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr2R 12813687 5' - roo 9000 2 66.44 TTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACAT:1 - chr3R 29091396 5' + rover 6998 2 55.71 TTTGTTTTAAATGTCTGCCCTGGCTTGTTCTTGTTCTTCTTCTTTGTTTGTTTGTTTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGATAGCCTGGAGCCAC:1 - chr2R 14077721 5' - 1360 77 1 54.17 ATGTTGTACAACCCTAATCGATTGAAAATACTTAAGTAGTAGTAGATAGTAGGTAGTAGTTTATAAAAAAAAGTTTCGACCCGAAAAAAGGAAATATGTACTTTCTAACTCAAGATCAGAACCTGTCCGTATAAACGTCGTGATCT:1 - chr3L 10097492 5' + INE-1 133 1 54.79 TTGCACACAAAACAGTTTTCAATTCTTTTCATTTATATTAAAATACTAAATGTAATATTGTTTTGATATAGAAGGGATAAAAGTTGATGAAAAGTGATAAAACAAGTATTTTTCTATTTCTGTTTCCTTTAGCAATAATTTACTAA:1 - chr3R 18457353 5' + transib2 62 1 53.42 ATTTAAAAGATTGAAAACATCATGAAAAACAATTAGGGAAAAGCGTGCTTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 - chr3L 20083871 5' + opus 7049 4 60.80 CTCGACAAATATTTTACCAAAGATTCAGTTTTGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGCTAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3R 19543479 5' + roo 89 2 77.40 AATATTTCTAGGGGAAATCTAATTTTATTCAAGAATTTTCAAAGTGTAGTCGAGCTAAAAGGGGGAAATTTCTTAAAAATAACGAAAAGAAACATATTGATTTCAATTTCGACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 + chr2L 11734460 5' + Doc 15 1 73.97 AAAAGTGTGCAATGAAAATTGTGTGAAAGTTGTGCTGACAAAGAGGAGTGGGGAAATCGGCATAGAGATGACAGAACCATTTCTGCCTACTGAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTC:1 + chrX 19113596 5' + 412 7484 2 51.97 ACACGCCCACAATACGTTCGCAATTTCACACATATACGTGAGGTAATTTTAAATTGTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCCCTCGACTCACACCCT:1 + chr3L 13366071 5' + hobo 26 1 63.70 AACTGAAGTTGCTCAATTTAAAAGCTGTGCAAAAAAATCACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGAT:1 + chrX 10128141 5' + invader3 5231 2 57.53 AGTTGTCTTAAAATATTTATGCCCACATCATACCAATGTATTGCAACATCAGGAAACTACAAATTGTAATATATATATTGTATATAATATAATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGCCAGAACATAAAACTCTGTAAGGG:1 + chr3R 4579212 5' - Cr1a 4183 1 37.67 TAGGTATATGTCAAAATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTACG:1 - chr3L 23940556 5' - Cr1a 4399 1 71.23 GTCCTTCATCTTCATGGTCTTCGTCCAGGCGGCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 - chrX 2916733 5' + 412 88 2 75.34 AAGACGTTTAATGTTACCATTCCAGACACATCAAAAGCAACTGTAAAGCTTCCTGGGTCTGGTTGGATACTTTCGAAGGTTTACCCAGTACCTTTCAGTCATTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGAT:1 - chr3R 4138184 5' - I-element 310 1 70.55 CAGCGGTCGGTGCAAGGTCTCCGACGACAACAGACACTCTCCTACCCTATCCTTCTTCCAGATATCAGCTATCTATCTATCTGCTATATGGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 22522759 5' - roo 9047 1 67.63 ACTTACCTAGGCACCCATCTGGCTAATATTTGATGCATTTGCCACTATAGTTAGTTATTGATTTTTGAATGAATAGGATACATAGATACATAAGTTATTTCCCTGCAAATGATTCTCT:1 - chr2L 5711036 5' + HMS-Beagle 6801 2 54.24 ATTGTTTTAAGCAATAATTAGGATTGCAATCAAATGGTGCTGCAGCCCCCTTTTATACACAGAGAGAAGTTTTCTTTGCTGATCTGCTTGGATTCGATATTTAAAGGGATCTACACCAACATAATTAGTTTAATTGGCGCTCAACT:1 + chrX 4018987 5' + gypsy6 397 1 67.81 AGAACGCAATATTATTGGGTTGCTAAATATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr2R 24021548 5' + pogo 42 1 54.55 ATAAATACAAATCTTTAAAAATGAATTATACTTATAGGCGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3L 13472375 5' + jockey 12 1 77.97 GGCAGAATTTTTGTGGAAATATGGGAAATTATATTCAATAAAAAAACTCTCTCACTTGCCAAAAATTCACATTAAAAAATAAAACCCTAACTATGCCGAAAGTTATTAAGTGCATCAGAATATGACTGATCACTTTTGAGTTCTGT:1 - chr2L 18246717 5' - gypsy9 247 2 71.23 ATTGCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACG:1 - chr2R 9339756 5' - Transpac 5177 2 52.74 AATTTGTTAGCTTGTTGAGTTGCTAACCAGGATCCGATCCGAGGGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATTTAGG:1 - chr3R 10461738 5' + roo 76 2 69.18 ATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr2R 10315295 5' + Doc 82 1 71.15 GAGTAAGTGATCACATTGGCCAGCGGTCGGTGCAAGGTCTCCGACGACAACAGACACTCTCCTACCCTATCCTTCTTCCAGATATCAGCTATCTATCTATCTGCTATATGGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 22522779 5' - roo 9060 1 78.08 GTAGCGTGGTTGGGAAAAACTGCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGGGTGAAAGGATTAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 + chr3R 11773927 5' - P-element 2806 1 21.71 CTAAAATCTTCCTTGCAATTTTGCTTCAATAGTTTACCACGAATGTGTGAAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTCACACGATTTTTT:1 - chr3L 14041002 5' + 1360 39 1 58.62 ACCCGATACTCCACGAACTGATTTCCAAACTGCAGGGATCGCAGGCTGTTAGTGGCATTGTTCAGCGCTATATCCACTTGCTTCACGCTCGTCTCAAAGTCTCCTTGTCTTTCTTTTTTTTCTTTTTCTT:1 - chr2R 20623896 5' - Doc2-element 220 1 77.69 GTGCCTCATCAACGGGAAGCTGCAATCGGATATACAATAAAGCCCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chrX 12998015 5' + roo 8740 2 71.72 GATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCACATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3R 4662004 5' + roo 8727 2 70.40 AGATTTATGACAGGCGTGCGCTTGCTGGAAGATGGGAAGATGGCAAATGGGTGGTGGTCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTT:1 + chr2R 20447796 5' + hopper 61 1 56.55 GTAATTTCGTGTGCGCACCTGAAAGTATGCTTTAAGAAATTCAGAAGCCCAGACTGGGAAAACTTATCCCTGCGCCTGCCTAATTAAGTTGCCACATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAAA:1 + chr3L 22336237 5' + jockey 4998 1 63.01 TTAAATAATAAATGATTAAAAAGTCATTTCATTATTATATTTATTGGAGTTAATTTAACATTTTTTCCTCAACATTTTTTAGGATTGGCTGGAATACCTCGACGTTATTCAGTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGC:1 - 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accord2 7548 2 69.86 GTCGTGCTGTAAACTCTGGACACTTATGTCGGTTTGCGTTTAAAAATGAAATGAATGATAGTATAAGAATAGGGTGAAAGCAGATTGAATACAAAAGCGCTCTAGTTTTAAAAGTTATTTTTTCAATGAAAAAAACGCCTATAATA:1 + chr2L 4124221 5' + S2 1382 1 69.18 ATTGTTTTTACATGCCATACATACGAGTACATATGTATATGCACAGGGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACT:1 - chr2L 15906089 5' - Tabor 7249 2 67.81 CCTAAATCGAAATACGGAGACCAACTGACTAGGCATTGTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGA:1 - chr2L 19548511 5' - flea 4935 1 75.34 ATACGGTTATAGATATGTTCATTTGCACCCCATAATATATACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 + chrX 19005324 5' + F-element 32 1 54.11 GTTTGGTTAGGAGTTTGAATCGAATGGCATACACCCTTTCATAACAATTATAAAAGTTAACATATTACTAAAAGAACTCACTGGTCTTAAAGTAAGCATTGGTATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAATAATCTTAAC:1 + chr3R 15006341 5' - F-element 4623 1 66.44 GCCATGGGCAAACGTAAAGTGCTGTGGTGATGGTCAAGGTTGAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCT:1 + chr3L 18950979 5' - jockey 4621 1 66.93 TGCGAGTACTTATTGCACTCAGTGTCCGCATTTCCAGTGCGCTTGCCCATTACAGTGTTGAGTAGTTTGCCAAAGTTTCTAGGTGGTTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGC:1 - chr3R 5271060 5' + hobo 2846 1 55.56 CACACTCAGGAAGCGAAACTCCAAGGATGTGTGCGAGTCGACTTTCATTTGAAATCGCCCCTGAGCTCAGAACAAAATTTTGAAAAAATATGTGGTATCAATAGCAATGATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTAAGATATAATC:1 - chr3L 9473081 5' + Tc1 1365 1 75.34 AGCCCGAATGCAATTAAAATCGAACATCCATCGAGCTCAAAGTGTCCGCAACTTGTGCTGCATACTTTTGTGCGTCGCCAGGAGCCGCACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACACAAATGTGTTT:1 - chrX 7031714 5' - hopper 1393 1 68.61 CAGTATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 - chr3R 4532983 5' + 1360 12 1 70.64 GACCCCGGCAAGTTTCGTAGCAGACGTTGGCCCTGACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCGCA:1 + chr2L 23372471 5' + gtwin 15 2 75.34 CAAGCACACAATTTTCAAAAACGTTTTATTTATATACCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTTTAAAGTGTGTAACAGGCAGAGGAAGCGATTCCGACTATATAAAGCTTATATATTCTTGATCAGGATCCAC:1 + chr2L 22002797 5' + INE-1 83 1 65.75 TTTGAAATTTATTGCTGCATTTGCAATAAATATTGTCAGTTGAGTCGGGCCAACAGTGGAAGAGAGATGGGGGAGGTTTGTAGATGTTAAAGTGAACATGACAAACATTTTTTTGTCAAATGTAATGTGTAGCTCAAAAGATAATA:1 + chr2L 14552777 5' - G5A 2772 1 50.00 GCACAACAAAATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGC:1 - chr3L 19335455 5' - invader4 3043 2 55.48 AGCATTCACTCCTATTTCCCCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3R 25409722 5' + jockey 35 1 52.73 ACAATTTTCATTGCACACTTTTCGGCTTGACACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGTGGGAAAAGCAGCATTGTAGTATGAGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chrX 19113596 5' + 412 31 2 61.43 GTATTTAGATTTCGCCCGCTCTTTTCCAGGTTTTCCTTTTCGCGGAGCGTGTGACAGGGTTCGGTAATTAACATCATGAAGGGCTTTAGATGGATGTGCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:2 - chr3L 6675432 5' + 412 23 2 69.86 ATATATAAAATATACAGTAATTACTGATTACTTTTTTAAACAAATGTAAATTATATAAAAAGGAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1 + chr3L 11903200 5' - opus 445 2 60.96 CTCTGCCGTCGCTTAGAAACAAGTGGCCAATACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chr3R 16228889 5' - P-element 2794 1 21.92 CGCTTGATGTCTGCTCCGTTTTCAACCAGGAACTTGACTGCAAGGTTAGGCAATGCATATTGATTATGATAGATTAGCTTTAATATATTGCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAATTAAA:1 + chr3R 17147315 5' - copia 231 1 58.90 CAAGCACAACCAAATGACTGCACATGGACTTGTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCT:1 + chr3L 3339359 5' - Transpac 243 2 73.23 AATAACAATAACGAAAATTTCATTTAAAAATCAACAAAATATTAAAATACAGAATAAGCAGAATAAAAATAAATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 9437134 5' + roo 8677 2 75.34 GCACCCCCTTTGGACACGCACTGTTTACAGTGGGGCTTGCAACATGGTTTCCCGGAATGATTCTGCATTCATGAACGATGAAGGCGGATGACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAG:1 + chr2R 18414483 5' + Bica 131 1 51.37 TATCATATTTATTTTATTATATATTTAATTCCTCCTTTCTTCCGGCTCCTTTTCTCGCCNNNNNNNNGCTTAAGATAAGATANNNNANNNCTATGATTTACACATTTAANNNAAATTTTTTTTAAATAATATCATTAGGTATTTAA:1 - chr3R 10172733 5' - HB 1535 1 40.41 TGAGCTTGTTGCAGAACGCAGAGTTACTTAGAAAACTGAAAAGCGATGGGGGTATGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGC:1 + chr3R 26432335 5' + Quasimodo 269 2 62.33 GCAGCATTCACTCCTATTTCCCCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTTGGATCCATCACAA:1 + chr3R 25409720 5' + jockey 70 1 55.48 ATTTATAATGATCATTAAGGATTTGTGGGGGGATATTCAAAATGAATTGAACTTTGTTTCCAAGACAATCTGCCCTTGTTAAATCAGCAAGCATTGGGCAATGGTGGGGGGACGTCTAAGGTTCAGCTTTGGCAAGTTGTGCAGGA:1 + chrX 11016944 5' + HB 1223 1 50.68 GTTCACACAACATTTGTATGCAAGTGTAGCAAATGGCATCGTAGTGCTTAAATGTGCTTGGGTTCTTCGACATTAAGAGTGATATTTTGGCTGGCAACTTTGTACATCAATGCATATGTATGTACATATGTATGTACGTATGTACT:1 - chrX 19823328 5' - 412 7278 2 52.05 TGGCTAATCTAGGATTAGCCTAACTTTCGCACTTGAGGTCGGTGTAAAATGTTACACCACAAAAGAACTGCTCAAAAGTCACGGATAGTTAAAGTTTAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3R 18541434 5' - hobo 2922 1 70.00 TCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 - chrX 5206513 5' + Tirant 8176 2 80.51 CTTAAAATTAGCTAAAGTTGTAAAATGGCGGTGAAACGAGCAAAACAAAACGGTCCAAAAGTCTAAGCCTAAACTATTTTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 - chr3R 5316649 5' - Juan 4171 1 52.74 AAAAAGCATTGGATAAAAAAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 18792403 5' - roo 355 2 54.79 ATTGTAAGAATAATATATTGACGGAATTGAAGATACATTAAAACGTTTTCTATTTATCTCAAGTGTTCAAAAAATCTTGTGAAAAAGGTTTTTAACTTTCGGCTACGTTTCTTATCTTCCCTATATATTTAAAAAAAAGAAAAATA:1 - chr3L 18229094 5' + TART-B 10631 1 57.53 GTTCGGCCGACTCAAAAATTTACCACATCTAGTTTTACTCTTTCCATCAGGTATATAAAATTAAGCAAATGTATCGATACATAAATAAAGGTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chrX 13385144 5' + opus 7140 4 59.03 GTAAGAGCGTGAGGCATTAAAATTAAAGGTAACCACAGAGGAGAGAGGAAAATGCTTTGATCAACCAGGAAGTACAAAAGTCGGAACAGCCTCGAAAGAATTGGGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 - chr3R 5430541 5' - Burdock 241 2 76.03 GCTGGCTACAGACACAGACTTAGTCTTTCTGAATCCTCAGCAACGAGGGGTTCAACGACTGCGTTTCAGCCTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 - chr3R 24053752 5' - mdg1 7409 2 51.37 AAATTTAAATAAATACAAGCAAAGTGGAAAATAAAATGCGCACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAAC:1 - chr2L 16385322 5' + I-element 78 1 71.92 TTTGGCGCTGCTGTCCCTTTCGGTTTTCTTTTGCTGCTTAGCATTTCCTATTTATGTCGAGGACCTGGCTAAGCATTCGGCTACACAAAATAAATAGAATGAAGTTATAAAAAAAGCTGACACACCGCTGTTTGTGCGATCGCGTG:1 + chr3R 29340484 5' - X-element 225 1 56.85 GGCTATTAGAAATTATAACGACAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3R 14494133 5' - roo 9033 1 59.59 CCGGAAGTACAAAAGTCGGAACAGCCTCGAAAGAATTGGGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTACGTA:1 - chr3R 5430476 5' - Burdock 6313 2 71.92 CGTGCAAGCACATACAACGGTGCACAGAGAGAATAGAATTGGACTGCAGCTGTGTGTAATGTTGAAGTACTGACTTCTAAAATATATACTAATTTTAAAGTAAAAAGATTTTACTT:1 + chr2R 10917280 5' - P-element 2582 1 28.45 CATTCCCTTAAACATTTGCTGGGGAAACACATTGATTTATATGCCGGCATCGCCAAAAATTGAATGTTATTGCTTGAATGGCCCCAATTTACTTAAAAGCTACGCTCCTCCGCCCCACCAACAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAA:1 + chrX 20026300 5' + Doc2-element 231 8 82.52 AATGGTGGGCAACTGTCGATAGTCGCCGATTAACACATAGCACAAAAATACTAGAACACTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGGCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:2 + chrX 4540603 5' - 1360 3329 1 60.27 ACACGTACAACCAAATAACGAGCCGAATTTTTAAGGTCACAGTGCGGTGAATGTCCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGATAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3L 20399075 5' - roo 341 2 63.70 AAAATGCGCCACGCACTCACTCACTCATACGTACGTACGTATGTACGGCCAGCCGTAAACCTTTTCGGTTCTTGGCCATATGTTGCCGCTGTGTTGGCCACTCCTGCATTAAAACTAAGACCTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGG:1 + chr3R 20337014 5' - jockey 4777 1 50.68 AAGTTTAAACCGGCGTAATATGTGAACTTAATGGAAACAGATTCTTGACCCGGGGTAGGAAAGGATAGTTTTTTCAGCATCGCCAATTGCATCACTTGAACGTTTGATTGTAGTTTTTTGCGAATATCACAATTAA:1 - chr3R 8597262 5' - Juan 97 1 54.41 AATTTCCTTAATTCACACATAAAATAATCTTTTAATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAAGGACTATATATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCAAGTCTAGCCATGTCCGTATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCT:1 - chrX 14766982 5' + INE-1 127 1 60.27 AGTAAAAAATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTG:1 - chr3L 23331272 5' - 297 419 1 65.07 TGGTGCATTGAACCGACTTCTGGCCAATTTTCTGGCCTCACCGCTCGTATGCAAATCAGGCAAAATGCAAAGAGTCAGATAAATTTTGTTCCTGTTATTTCTTGGCCACTGTTTGAACAACGACACAAAAAAAAACACCTAAAAAA:1 - chrX 9970102 5' + transib1 2138 2 56.85 GCTTACAATTTACAAATTTTACAAAAATTAATATCGCTATGTCCCTTTCTAACGTATTGGTTTTTTTTTTGTAAACATAATACATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACCAAACTAGATTAACTTAGATAGTATAG:1 - chr3R 17467204 5' - I-element 5313 1 54.79 GAACGGGATCCTCGTAGATGGAAACGATATAATAGGCACAAAATGTGGTTTTTTGTTTTTTTTAACACAAACACAATACACGATACATAATCACAATACACAGAGGCACAACACAGAGGCAGACTCGA:1 + chr2L 5973642 5' - Stalker2 444 1 76.56 CACAGAGAGGAGGAGTGGCTATTGCTCTCACCCCTATAACGACATCGTAAAATGAATGAGATGCAGCTATATAGTAGCATAATATGCTTCACATATTACGCTTACATAAGCATTGTACTGTAATAATTGTAATGCATGTTTGTGTT:1 - chrX 22260231 5' - Tabor 479 2 79.45 AGAGTATTTAAATACTGAGCTCACCCAACAAACGGGAACGCGAAAATGTGAATGTGGACAAGTAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chrX 10806837 5' - P-element 2862 1 65.96 ATAATAATTATGTGAAAGTGAGAGGAAGGTAACACAGGTCCTGAATGGACGGGTTTAATTAATTTTTGTAAATGAGTTTCCAATTCAAAGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATGTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 18658173 5' + roo 8695 2 64.38 GAAGCTGTGTGGTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAGTTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACAT:1 - chr3L 16463591 5' - roo 347 2 56.64 AATGTGCACATGCTTCGTTGCCTGGAGTGCGCTATTTTGCACCTACGGGATTTTGTGCCTCACACACACACAGTGAAACAAACAGTGAAACACACTGGAACACTCGAACAGTGAAACACTGAGGCACACACACACACACACACAT:1 + chrX 21253270 5' + accord 183 2 51.72 TATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTG:1 + chr3L 15859627 5' + I-element 72 1 69.66 CAGACGATTACTTTCAATTTTACTAAAAAGTTCTTTCTGAGGCAATAGAAAAAAGTTGTAGGTTTCTAAACTTTATTTCTGGTACTCTATAAAAATTATTTTACTAAAGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 - chr3L 15277743 5' + I-element 15 1 73.29 GTGAAAACATACTAATCTCGGCTTCACTCGGAGAAAATATACAAATTTAACCATAATAGGGAAATATAATTACTATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 + chrX 9959762 5' + I-element 46 1 51.37 TACAAAGCGATAATAGCGCAGCCAATGAAATATTTATGCATTCCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 - chr2R 10600096 5' + 297 6633 2 62.33 GGGAAATCTAATGGAATAAATAAGTGGCAATCGTGAGCGGTCTTCAAGCAGTTTGCTATAAATGATTACCTAACGTAAGCACACCTCGAAAATATGTATTATGTTTTTTTCAGTACTACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 + chr3R 17467044 5' + I-element 15 1 72.60 GGAGGAAATGGAGAGAGATAGCAACACAAGTGATACATGGGTTCATGGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2L 18213084 5' - roo 9043 1 64.14 AGTGTCATAGTTATAAATTATGCAGCAGTTGAGTTAGGAATCGAGATGGCAATAAGGATAAGACAGTGCTTGCACTTAGGAAAACTCAGTCCTAATGCTAATTTAGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr3R 8914404 5' - pogo 2087 1 76.03 GAATCAGCTTTAAGAACTGGACTACTCAAATACCGTGAGAAACTATCATTCACAGCTATAAATATAGAACATATTAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 - chr3R 22771982 5' - opus 7453 2 56.16 ACTCAAAAATAATTAATTCATTAACTTTTTTATAAAATGAGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGACTCGC:1 + chr2L 20556483 5' - invader3 5378 2 74.66 TATTAATTAATTATTTTGTTTATACAGCTGTGATAATGGATACTACAGGAGATCGTGCGGCAAGAAATTTCAGATAAGTGACGTTGTGCATATAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAAT:1 + chrX 498048 5' - TAHRE 10416 1 50.00 AGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTAT:2 + chrX 4214482 5' + jockey 95 1 74.66 AAAGACCAAAAGCAAGCATTCCAAATAAAACCCTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCA:1 - chr3L 17207018 5' + I-element 4957 1 54.11 GCTAAATCATTTACATGTATCAGAACATTCAGTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chr2R 8687837 5' + roo 8753 2 82.19 ATCTATTCCTAGAATGTTGAGACCATGTATGCTCAAAGTGTGTGTGTAACATGTGTATGAGCTTATTTTATAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAA:1 + chr3L 27382653 5' - pogo 1766 1 52.05 ATTTTTCTATATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr2L 5447887 5' - roo 9003 2 69.18 TACAAGTAAAAACCTTGTTCTTATTTAACGTTTATCTGGAAAATATTATCACATTGCAAAAACCTTGTTTATACCCTTGCATTTTCGTAAGTTATTTCTTTTATTTTGGTCCATGCCGTTGGCATTGTTTTAATGTAATTTTTTTT:1 - chr3L 8026716 5' + transib4 27 1 55.48 GAGATGTGTAGACTTTGGATAAAATAAACAATATTACGAAAAATAATAAAATGAGAAGAAACTCTCACAACGTCGGCGTCACTAGAAGCTGCACTCCTAATCTATTGCTTTTATAGGGGATATCGACGTTCATGCGGACACACG:1 + chr2L 20840108 5' - INE-1 128 1 78.47 ATGGGGATGGGCATAGAGGGAGATGGAGCCACTCTCCTATGCACACTATACTGGTGACCTAGTTTTTGATGCCGTCGAACGCTGCTGCTGCGCTGTTGCCAAACTGCGAAAAAATCATGATCGTCCCACTTCTGATAATGTAGGTG:1 - chrX 6871911 5' - invader2 259 1 80.14 CAATAGCCATTTCAAAAAATTCAAAAGTGTACTAGTTTTTAGAGTATTTAAAATGGAGCACTCGGATGTGGCAATTTATCATGATACGAATTTGTTATTATTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCT:1 + chr2R 13212166 5' + diver 5909 2 69.18 AAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 + chr3R 4532870 5' - 1360 3330 1 59.59 GGCGAAAATATCATCCCAAATTATGCACACCGTTTATTATTAAAATCAATTTGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTGGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAATCTAGGATACA:1 + chr3R 17210013 5' - HMS-Beagle 6974 4 54.79 AGTTCAAATCCATAGCATACTTTTGCGGGCGGCATGTTTAATTTATGGCCGTTTTTAAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGT:1 + chrX 19818427 5' - jockey 4921 1 66.44 AAAATGGTATTCAACGCTCACTCCCTGATAGATTATTACAACTGTTCAAAAATGATTACTAATTGCCCAGCAAGAAGGCCTTTATGAAGACCCAATTTCCAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGC:1 - chr3R 833413 5' + F-element 131 1 76.03 CGGGTTTAATTAATTTTTGTAAATGAGTTTCCAATTCAAAGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3L 18658222 5' + roo 80 2 76.03 GGCCCTTGTTATTCGAGTATTTTGCGTGTAATTAAAATTGTGCAGGAGCCGCGCTGCAGCAAATGATAAATTCATAAACTGGGGTAGGGGAATTTTCGCTGCTGTTTGTAAATTAATTAACTATCTCAATGAGCAGTCTTGGAT:1 + chr3R 31366387 5' - R1A1-element 4960 1 77.78 ATTCGATCTAAAAATGCAACCTTGTAAAGTTCGTTAGAACTTAATTATCGTCACACATGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAA:1 - chr2R 3120368 5' + accord 13 2 70.55 AAATACACAAAACAGTTGTTTCCGTTAGAAGTAATCCATCTTATCCTTCGTCATTTTATCCCTACGTTCTGGATATTCTAGAGTTTATGTCTTGTAATGTTCAAGTGGAACCGTTATATGATCGC:1 - chr3R 15824029 5' + gypsy11 4104 2 70.40 TAAACAAGTTTTTCAATTTCTAAAAAATCCTAACCTATGTATTCTTTATTACATATATATATACACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGC:1 + chr2R 1230428 5' - Stalker 7040 4 76.71 ATATAAAAAAATTAACGCCAAACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCTGTTTAAATAG:1 - chr3L 13827479 5' - roo 9009 2 60.27 GTAAAATGTTACACCACAAAAGAACTGCTCAAAAGTCACGGATAGTTAAAGTTTAACCGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3R 18541391 5' - hobo 2921 1 56.82 CATGAATCTTCGGCTTATTGACCGACCTGGTCGTCTGGACCTGGATCTGTGGCTATTAGCCAGGTCAGCGCCGCATGAGAAAAAACTATTTTTTATTTCTTTGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACAGG:1 - chr2R 10229621 5' + 297 6936 2 62.99 TCTACTGTTTGCTCAAATATCTCATATTGATAGACTTGCTGCTCGTTCTGGCGCTCCACTAGTGGTTTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAACGGCAGATGCTTCAGCATCGCCAATGGCATCACTTGAACGTTTGATTGTAGT:1 + chr2R 5351815 5' - Juan 119 1 69.86 CGGGTGGTGCCACATGGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGAATTTGCCTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAA:1 + chr2L 7271829 5' - 297 6921 2 63.91 AAAGCCCTCGAATATGATCATAAATATTTAAAGTTTAAAGTGGCAAAGTCCGCACTGCCTTGAAAATTTTTATTTATTTATTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:1 - chr2L 12832941 5' - I-element 5304 1 55.48 TTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAG:1 - chr3L 19335433 5' - invader4 3021 2 63.01 CTGTGCATTTATATTTCTGGTCGTAGGGGCTTCTGGCTCTTGAGCATAATGAACAAAATGGGAAGCATTAAATTGCAAATTTATTGAACGCACACGGAGCCGAAGGATTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTT:1 + chr3L 7276461 5' + Cr1a 405 1 74.13 ACATGGGTTCATGGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGG:1 + chr2L 18213118 5' - roo 9008 2 59.59 TTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 14494094 5' - roo 8994 2 72.60 TTGCCGGCTCAGATAAGCCACGCTATGCGCGCGAGAGAGAAACCGATATGAGTTTTGCACAAACAGCCGAAGCATGACGAAATAACATAAGGTGGGCCCGACGGCAA:1 + chr3L 13228454 5' - P-element 2873 1 27.10 TCTTTTGTTTGGTTATGCAGCCTGCAGCCAGCAGCAGCGAATCATAAGTTATTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr3R 3590660 5' - pogo 2035 1 65.75 CGAACAACAACAAACCCGAACCCGAAGTTGGAGCTCGGCTACCGACTCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 - chrX 10806955 5' + P-element 63 1 38.69 CCAGTTATGTGAATGCGGTTCTACAGCGATCGCTGCGAACTTCGACCCGGTCGAAGATATGGTACCCTTGAAGGCTGTTATTGCAATCATATGCAGCTCTCGACTGGACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAG:1 + chr3L 9958874 5' - G5 4412 1 63.89 ACTAACTAACTGATAGACAAGGATCTCAAATGAATACAAATGAAACGCAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGA:1 - chr2R 10517107 5' + I-element 252 1 67.12 GGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr2L 18178348 5' + Tirant 27 2 57.78 GGTTCCATCTCACCTACATTTATTCATAACAAATTCTGGGAATAACCCAAAACCCATACATAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTA:1 - chr2L 20336061 5' - Tirant 8323 2 52.55 CGGAATAGAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATA:1 - chr2L 21403575 5' + G5 4414 1 56.30 GGTGGGTTGGCGTGGGGCAGGTGGCCGTTGGGTTGGCAAAGGAAAATCAATGAGACGACATCCAAAGACATGCCAACACCGGCGGCTTTATGGCGTAAGAGGGGGCGTGTTTGTTTTTTTAACAAATCGATAGAAATTTACAAGA:1 + chr3R 11603085 5' - INE-1 302 1 60.69 GTACTTCCCAGTCTCCGAGTTTTAGGATGTAGTGCGGAAATTTAAATACATATATATTCGACTACAAAGTCATTTAAAGAAGTGCATAGAATTGTAGTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 + chrX 21590620 5' - BS 5069 1 63.01 AAGTACCCTCTGGCTGACCACGGATGCCATGGGCAACAATACTCTATGATGTCAAAATATGTAGGATTACATACAATTTCACTTCAAATGTGTCGTGCTGAGCGCGCTTGCGACAAAAGAATATAGGAGCTAGTAAACAAAATCAG:1 - chr2L 21723899 5' - Gypsy12A_LTR 2076 1 71.92 TGGCCATGTTGAGGCAACTGTTTAGTGCAACGAGCCGCGACAAGTGCATAAAACACGCCCAAAACGACGACAAGTGCGTTGTCAATGTCTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr3L 815047 5' + hobo 31 1 64.38 ATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 - chr3L 4933809 5' + blood 7083 2 67.81 GTATGAACTGTGGCCCTGTCGGACCGTTCGAATACAATTTCGGCCAATTTCAACCAAATTCCTCATTTCCATAGACCGAAATAGCCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGA:1 - chrX 18191920 5' + hobo 2689 1 61.64 GCTGAAGCTATTTCCCAGCATTGTGAAATTGAAATTTGCTGACTGGTCTCCAAGTGGAGATTGTGTTTACTTTAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 + chr2L 22921233 5' + copia 4918 2 54.79 AATGCATCCTCAAACACGGACAAAATGTCCTTGTATTGGTATTGATGCTCCCCAGTTTCAAAATCCATATTCGTATTACCTACATATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGAATCGGCAAGATATCT:1 - chr2R 17021447 5' + pogo 31 1 61.64 TTTAATGTCGGAATAGAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGCGGGGAACTGCCGCC:1 - chr2L 21403583 5' + G5 4398 1 66.14 AAATAAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGC:1 - 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chr3L 13827488 5' - roo 9018 2 55.48 TGATATTTACTTGTGCCTACTTTTCTTAAGGTACTTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTTGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATA:1 + chr3L 20083791 5' - opus 423 2 73.29 GGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 - chr3R 27188600 5' - roo 316 2 78.08 GCGTAAGTGGGCAAAGCGAATGTCACAGATAACGCAAAACTTTTGGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATATAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr3L 17904788 5' + roo 75 2 71.23 ATAATGATTTCAGTCAAAAGTTTGCAAAGCAGTACAAAAGACATTTACTACCATATAGAGTGTATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATGTGCCCATGTCTGCCTGTCCGTCCATATGAACGTCGAGATCTCAGG:1 - chrX 174676 5' + INE-1 137 1 65.97 CAAATATTTGCCATAATCAAATAAGCTAGAAAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chr3L 10442886 5' + roo 82 2 79.71 TTAATTTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCG:1 + chr2L 23299975 5' + invader4 382 1 67.38 GTCACTCACCTGGCCTGACAGCCCGTGTATTAGATGATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAG:1 - 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jockey 4567 1 56.85 ATACATTAATAAATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGACAAAAAGTGGGCAAACGATTCCAGTTTTCAAATTTAAAAAATTCGATTT:1 + chr3R 20001628 5' - FB 25 1 53.42 ATCTGAGTTGGCGCTTTGCCACGCCCCCCATATTCATTACTTCAACTTTGTGCTAATGACACTGCGCTACAAAGGTGGCATAACTCATTGCTGAGTTTATTTTCTGAGATTTTAAAACGAAAGTTTTAACAAATAACTAAATAATT:1 + chr2L 10354470 5' + HeT-A 18 1 67.81 GAACCAGAAAATCGGGAAGCCGAATAAAGGAAGGCAAAAAGCAAAGTGAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTACCACTTGCATCAGGGTTCTCGGTACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1 + chr3L 14708919 5' - opus 7444 2 62.86 CATTTGAGAACGTTGCTATATGGCGATTGCAAATGAGTTGATCAGTTGTTAAATGTACTACGATTCAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTG:1 - chrX 21590768 5' + BS 5054 1 54.79 TTTGTGTATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTA:1 - chr3R 29091419 5' + rover 30 2 65.75 TCCGTACCTTATTGTTTTATTTTTTGATTTTTTGTATTCAGTCTCATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAAATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1 - 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chr3R 19639835 5' + 412 7112 2 58.22 AGTTGAAAGAGAACGAAGCGAGGAGCAAAAAAAATTTGCAAACACTCGGCCAACTTTTATGCGTGTGCCGGATACGATAAGGGCCACAAGACGATGCCAAAACAGATACATTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGG:1 + chr2R 19554051 5' - Stalker 315 4 74.13 TATTTTATTAATAAACAGCCACACAACAAGTTAAGTAGATCGTGTTAAATTGCCCGTTCGAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTT:1 + chr2L 5798263 5' + FB 61 1 60.69 AACTTTTCGTATTTTGTATTGCCGACACTCGTCGGGGGGTTGACGTTTTTTGGTTTTTGCCCGCTCGTTGAATTCGAGTGCTTTCGGATACCCTAAACACGAAATTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGGTTTCCTTAATA:1 - chr2R 11097424 5' + Juan 4042 1 66.44 ATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAA:2 - chr3R 29091412 5' + rover 6988 2 60.96 TTGTTGAAATAAATACTGCATTTTGCGTAAAACGTATACAACTTGTTCATAATTTATTTATTTAATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGG:1 + chr3L 16271884 5' + jockey 145 1 53.28 TCATGTCGATGAAAATTTGAAGCTTTTAAACTACTTCAACTTCACAGAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - 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transib2 2775 1 51.37 AAGCCCCCACGCACTCACACACACACACACACACACACACACACTAGCTCACGCACTCGCACACACACGCACACACAC:1 - chr3L 9172472 5' - Stalker 446 1 78.21 GATCTATCAGGTGAATGATATTGAGCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCT:1 - chr2R 15822072 5' + invader6 4565 2 67.81 GGGAACGAGGGGGAAGTCAGCTAGAGATCTTCAGACGCGTGCCAGTGGATCGAACTTTGAGCGGATATTCAAATGGCGCAGACGGGCCTCTTCACGTTGTTGATTACATCAATCATATAAGTTAAGAAACCTCTTCTAGCGCTCTT:1 - chr2R 15942434 5' + opus 6 2 76.71 GCAATTATACAAATCATGGCAATGTTGGTTCGCCGCGGCGGCTCCTGCTTTATGTTTTGCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTTGTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2L 20986611 5' - roo 9016 2 53.90 CACTCACCCATATACGAACCTGTTCAGCGCTCTCTCTCTCTCTCTTATC:1 - chr3R 10089437 5' + blood 7180 2 87.76 ATTAAATTAAAATTACATAGTAATAAATGTTCAATACTACATTTAAATGATATATAAATATATCATTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTAT:1 - chr3L 17162394 5' - Stalker2 346 2 57.53 CGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chr3L 13827396 5' + roo 62 2 67.94 AAAATGCAGAGAGTATTTAAATACTGAGCTCACCCAACAAACGGGAACGCGAAAATGTGAATGTGGACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 + chrX 10806828 5' - P-element 2866 1 71.23 TAGCTAAATGAATAAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3L 20388230 5' + 1360 53 1 54.11 TCTGAACATGTTCTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:2 + chr3L 19574021 5' + 297 6615 2 62.76 AGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAG:1 - chr3R 21276642 5' - BS 5051 1 46.58 GGAACAAATTTTGTAGGAGCTGCAAGAAAATTAGATCAAGAGTTATTTAATGCAATACAAGAAAATATAACGATTGCAGCGCAGCTTTAAAGACTTACAATTTTGAGCTCCGCTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 19447432 5' + roo 56 2 63.04 ACATTTCCTCGTATTCAATTGAACCATTTTGTTTTTGAAAAAAGCAGCAAGTAATGAATTTTTAATGTGTGAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGTCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3R 31650429 5' + pogo 38 1 58.16 GCAGGCCCCAAAAAGTATGCCATGTTTTGTGCCGAGCCCCTGTTCAGCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr2R 20739014 5' - 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Quasimodo 7026 2 59.66 CATAAGCCTCCCGGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3L 18199943 5' + Doc 33 1 52.99 CATAAATGAATACCGAATAATGGACGTGCATAATGGAATCATTCTTCGTATACCCTGGAACAAATATATTCAAAGGAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCTTATCT:1 - chr2R 12813796 5' + roo 39 2 52.78 TCGTACCCCGAAAAACTTCCCCACTGCAAACTGTTGCTAAATATTTAAGCCCAGTGGGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCT:1 + chr2R 9623336 5' + I-element 70 1 59.59 CACTGATTCGACTGATAAGAAAACATATGTACCCTCGATGTGGATACGGCCCTGCCTTGCACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1 + chr3R 18697861 5' + 297 51 2 58.90 CAAAAGTTGGATATTTCTAAAACAAAATTTTAGCTACTTGCCTTGGCAATGTAAAAGGTCTGAAGTAACCGTATATAACTGAAAATTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGTTCTACTTGCATCAGGGGTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chrX 20664025 5' - opus 468 2 58.22 CAATCAACATGATTGAAGTACGTATCTCCGATCCACCGATTTTATTAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAACTATCTTCGGTTTA:1 - chr3L 17904860 5' - roo 9014 2 65.62 GCTGGGATCAGATCCATAAAGTGTTGAGCATATTATTCGATTTGGAATGTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 27188677 5' - roo 9057 1 76.03 CAATAGAAAAAAGTTGTAGGTTTCTAAACTTTATTTCTGGTACTCTATAAAAATTATTTTACTAAAGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 - chr3L 15277701 5' + I-element 48 1 50.36 AAAAATTAATATCGCTATGTCCCTTTCTAACGTATTGGTTTTTTTTTTGTAAACATAATACATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGATTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGC:1 - chr3R 17467182 5' - I-element 5291 1 62.33 AATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 - chr2L 14480542 5' - Transpac 261 2 52.05 AGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGCCGGCAAGAGACATCAACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chrX 16217541 5' - P-element 2844 1 54.29 GCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 21587590 5' - roo 8991 2 77.40 AAAAATTTTCTAATCCACTTTGCGTAAATAATCATGAGCGTCAATTCAATTCCGGCAGCCATCACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATA:1 + chrX 19982347 5' - hopper 1354 1 56.16 TACATTAATAAATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGACAAAAAGTGGGCAAACGATTCCAGTTTTCAAATTTAAAAAATTCGATTTT:1 + chr3R 20001629 5' - FB 24 1 54.11 AATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr2L 21153476 5' + 1360 59 1 57.53 GTTGGAGCAGATAAATGGGTACATATACAACTGTACACCTAGATCGACAGACACCTGGTGGGTGGTGGTCGCCCAGAACAGTTAGCAAGGTCAACAGGCTTCCGATTGACCCTCATCTTTTCATGAAAAGTACATATATA:1 + chrX 19211863 5' + Juan 4178 1 80.00 TTTCACACAATTTTCATTGCACACTTTTCGGCTTGACACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGTGGGAAAAGCAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chrX 19113602 5' + 412 31 2 63.01 AACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:2 + chr3L 16463518 5' + roo 88 2 78.77 AAACCGAAGCAAATGCATAACGTTTGTTGCCAAATCCGTCCTTTATGCTGAAATCAAACAACAATAAAAAGGGGGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACT:1 + chr3L 5388045 5' + P-element 2611 1 54.79 ACTAACACACCAGAATTCGAGCACTCATAATCTAGTTTTTGGCCATAAAATAGCTAGATTGTTTTCACCTGCTCTTAAAACGCTCTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 + chr3R 5264800 5' + P-element 36 1 60.96 GTCGCCTTGCGTCTGACCCAACGCATGCTCGAACACTTCCACCTTCTGCATCAGCGTGAGGTGATTGTGTAAGCAAAAGCAACAGAATTTTGCTAAGTTGCTTGGATTAATATAAATTTTCGTTTTACATCACATATATATAGCAT:1 - chr2L 13012152 5' + Copia1_DM 4297 1 56.16 AGGTGTCCTGCCCGCCTGCCCATAAATAACCAAAAGCACCAGCAACAACAAACCACATCAAAAAGAAACCCAGAAATTTTAAAAGAAACTATTTGTGTATACCCTAAACGTAAATAACAAAAGAAGAAAAAAAAGGGAAAATAAAA:1 + chr3R 10513330 5' + Doc2-element 251 1 77.40 CATTAAATGTTCAACTGACAGCGAAAAAAACTGAAATTTAATTAATTTCATACGCGAGTCAAATATTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTGGACTACTCCAGACAC:1 - chr2L 19679854 5' - invader2 4684 1 54.79 TACAACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGC:1 + chr2R 5582137 5' + Cr1a 455 1 67.59 ATTTAACGGTAAGTTTCAGACATAGGGGTAAAGATTTTTTATTTTCTATTGCCAACATTACCAAAATATGAATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGGCATTTTTTTTTAAATAATCATTCTATTTATTTTGG:1 - chr3L 14944693 5' - G5 4827 1 74.66 GCATGGCTTATGTATTTCCCATAACTTGTTGACATAATATTTCTTAAAAAGTAGAACAATAATTAACCCATTAAAGCCGCCCACTCGGCGTAAAATTTTGATGTGTGAAGGATGTTCAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAGAATGG:2 + chr2R 19338662 5' - hopper 141 1 65.07 GATGCGAACTAATCAGCAATTGATGGAAAAGATTATTGTGAAATTCCACGAAGGAACATAGAAACGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 + chrX 4823524 5' + pogo 53 1 56.85 GAAATTTAATAAACCGCCTAAATTATGAAGGAGACGCTCAAAGCACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAAAAATTTTCATATGTGCTTTTTGT:1 - chr2R 2875256 5' - TLD2_LTR 122 1 76.03 GACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 13827373 5' + roo 52 2 54.86 GTCGGGAGGAGCTCCATATACTGCCATATGTGGCAATATAGGCCAGACGTTGTGGGCCGACCAAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGGAAATGAAT:1 + chr3R 18517929 5' + roo 52 2 53.85 CGATATGTGTGTACCTACATATATCAGAAGATGCAATTTAAAGGCTCATTGTTTTGAGGATCTGCTGCACCAGTGTGGTGATGGCATTTGGCCAACAACAAAAAGCGTTAATCGAAGTGCGGTG:1 - chrX 10569894 5' + BS 152 1 69.35 CAAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACACAATGTCTTAAGCTAAGATGAATAGAATAATGACGTGATAACTATTTCTCCGATAATTTTAGCGTTGTCATTAGTCAACTGACGGGACCTTAG:1 + chr3L 25008313 5' + 297 362 2 71.90 CTCCTAGCACTTAAACTCTACTCGTAGAGTAATAGGGTATACTAGATTCGTTGAGAAGTATGTAGCAGGCAGGAGGAAGCGGTTCCGACTATATAAAGTAAATATATTCTTGATCAGAATCCATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGT:1 + chr3L 23176354 5' + INE-1 105 1 75.34 TCTAAAAATTTAGTCATAATATTTTATGAGTAACTTTTGGGAGTATTTTTCAATTTTCAACGCTCAAAATTTGCCCTTATCGCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr3L 21170986 5' - roo 9032 1 58.22 AAGAGGGAATACCAAGCTATGGATCTGCAATATACCCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chrX 17510617 5' - roo 8987 2 74.66 GCTTGCCAGGACACTCACACCCCGAAGACCCACTACTTCCCGCATCGTTTTTGTTCCGACGGGTTCTTCGAGTGCTCCATCACTTCCTTCCACCATTCCTTACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chrX 14346369 5' + roo 8682 2 71.92 GATTTTTACATGCATAAGCATATGCATTTGTATATGGGAGGCACTGGCATATATGCATGTACATAAATGCGTTCAAATACAGAAGATCAGAGTCAGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 20398945 5' + roo 8683 2 72.14 GCGCACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGATACTCAACCGGGAAGACGTCA:1 + chr2R 12069586 5' + Tirant 8159 2 63.16 ACTGTTCATGTAACAAATGAGTGATTGGAGCAGCTTTCCGCATTTCACACACTAACAGACGAGCATAGAAATCTGCGCTTTGTCGTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTAC:1 + chr3R 13987622 5' + I-element 347 1 63.01 GTGTCATGCAATTGTTATACTCCTAATATTTCTTTCAAATCTTGTACTGCCTGTCCGTTTATATTCCATATGCCTAAATCTACATTTTGTTTAACATTTATATTACAGGAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGT:1 + chr3R 3399825 5' + Juan 3973 1 76.71 TGCTCAAAAGGTTTAAGGATTTTTAAAAGTTTCAGTTATATTTTCTGTTTAGCAGAAAAATAAATGCAATAGAATTGAAAATTGCAAAATTGAAGTAGTTTAATATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTCACTCTCCCTTTTGAGCGT:1 - chr3L 18193873 5' + Cr1a 215 1 65.75 GTTTTATACGTTTGGTGCGCCCGGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTT:1 - chrX 2518082 5' + P-element 98 1 17.81 GAAAAGAAGAAACGTGAACAGTAAATATTTTTATGTACATACATAACCCACCCAACTGGTGGTTATAGTTTATTAATTGGGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTT:1 - chr2R 9874890 5' - S-element 370 1 65.75 CCGCGACAAGTGCATAAAACACGCCCAAAACGACGACAAGTGCGTTGTCAATGCCTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTCTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr3L 815013 5' + hobo 65 1 58.90 CTTTTTTAACTCTCAACAGGTCTAAGCTTTTTTAACGGCTAACTTCCATGTAACTTTTAAATTTTTTAAAATTTGAATTCCACCACATAATCAAAAGAGAAAAAAGCTTAGACCTGTTGAGAGTTAAAAAAGAAAAAATTTTAAAA:1 + chr3L 17913975 5' - FB 176 1 73.29 GTAACAAAGAAGCCGCAACTCAAGTTGTAAAATTCATTGCATACTTTCTGGAGTCGAAAAGTGCCACAATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chrX 10824042 5' + pogo 23 1 57.98 TGGTGTGCAATTTCCTCAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTAAATATATTCGTGTTCATGTGT:1 + chr2R 4802973 5' - roo 8670 2 73.29 ACTGTGTACTCACGAGCTTCTCTGGTTTCAATACGAGCCCGTTCTGTTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCAGGTG:1 + chr3R 14416421 5' - TART-B 152 3 83.56 ACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCAAATATGCTGACCA:1 - chr3R 17210106 5' + HMS-Beagle2 63 2 58.90 AAAGTTTAAAAGTTTTTTAAAAACTTAAAGAGACAAATCTCAAACACTCCAGTTAGACAGGTCAAATTTTTGAAAAAACACCAATTTCTTGGGTCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 + chr2R 4950010 5' - 1360 3363 1 65.75 GTTGTTTTTCATCTGGCGGCTTTAAACGCCCTGATTTATGGCCATCAGACATCAAAATTGGCAACATGTTCGCGGCAATGATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCT:1 - chr2R 23282709 5' + accord2 7248 1 55.47 CCTCAGCGACGAGGGGTTCAACGACTGCGTTTCAGCCTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:1 - chr3R 24053718 5' - mdg1 7375 2 74.66 ATGTGGGGACAAACGGTGATGCGGGGTAGATCGATTCAGTTTGGCAGCAGCCACATATCTGGAAAGGGAGTTAGGAGTTTACAAAAGCAAGTTTAAGTCAAAGAATTTAGCTATTTGTATATATGTATATATATTTAATAAT:1 - chr3L 7272614 5' + Dm88 4380 2 76.06 ATTTCTTAAAAATAACGAAAAGAAACATATTGATTTCAATTTCGACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr2L 11734527 5' + Doc 82 1 77.40 CCTGAACCCTCCACATTTGACCCGGATCCCATTTGTTTTTCCTATGCATGGATGTGGTTGGGTGTTCCATACGATTGTCATAACGTTTTGGTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCG:1 + chr3L 9519515 5' + roo 30 2 60.96 GATGTGACCAAGGCCATATAAAAAGCAAACGTTTATTTAATAGTATGTACAATATTATATATAATAATATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 9437292 5' - roo 9020 2 56.16 ACTAGCTCCTCGTTCTCCGTACCTTATTGTTTTATTTTTTGATTTTTTGTATTCAGTCTCATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAAATAACCACATAGGAACAGCC:1 - chrX 17472225 5' + Quasimodo 55 2 60.27 GTTGACGCATACTTCGCATATTTGTGGAGATAGATAAGCACCTTTACGGCGCTCTCACAAGCACTCGCGCCACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACGC:1 - chr3R 20833426 5' + accord 7033 2 76.52 ATATTAAACTTTTACTTATTTTCGAAAATATTTGCATACGCCTACTGAAACCCCAATCAAACATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGG:1 - chr2L 20556562 5' + invader3 60 2 58.90 TGCAAGGTCTCCGACGACAACAGACACTCTCCTACCCTATCCTTCTTCCAGATATCAGCTATCTATCTATCTGCTATATGGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 22522749 5' - roo 391 2 68.85 CACCGAGAGTTCATTCCTTCTCTGAAACGGATGAATTTCGAAAACCCGAAAGGCGGCCGAAAGCCGAAGTCACTGGCGTCACGAATTGGCATCGTCGTTTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGCAGC:1 - chr2L 13717439 5' + P-element 21 1 72.60 TGCTGAGGTATTATTTACCAATTATTTATATATTTTTTTTTGTTTTTCTCCTGACTAGAATCAAATAAAAAGTAAAACAAACATACCATACTGCCTGTAAAATCCAAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTT:1 - chr3L 12468893 5' - roo 9053 2 65.93 AAATTTTTGCCTCCATTTTGCGCGTTTAATTTGGCCCCAGCTATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAG:1 - chr3R 23668519 5' + pogo 69 1 67.81 GGAAGTTGCGAGGATGGCGTTCCACACCGCCAACCATTTGGCGCGTCAAAGTTGGACTTTTGAATATATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 22522620 5' + roo 52 2 56.55 CATAAATGCGTTCAAATACAGAAGATCAGAGTCAGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3L 20399006 5' + roo 86 2 78.08 AATCAGATTAGCAACCAGATTAAAATAGGGAATACGCTGGTTCTCGCTTAATATAGTTTTTAATTGCCGATCTCGAACAATGGGTAATCTTCTGTTTCAAACAATACGCCTAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGA:1 - chr3R 25718330 5' - I-element 5349 1 77.40 CAAGATCCAGAAAGATATAAATTAGATAATGATGAATGGATGAGCATAGTACTAACTGAACATAGAGTGTACAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTAC:1 - chr3L 18802732 5' - hopper 384 1 51.03 ATAGCCATCCAAGGATATTAAACTAGAGAGCCAGTCCTTGTACAAATTAGGACACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGCTTTTTTTACAA:1 - chr3L 10564042 5' + hopper 12 2 76.03 CTTAAGTGGACTTTACAAGTTACTGTACTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 - chr2R 8452805 5' - blood 7314 2 79.53 AAATATTTCATATTTCAAGAAAATTACCTATGCCCATTCAACGTACAAGTTATAGGAATAATAAATTAATAGTTATTAAAGCTGGATCAAAAATAAATTAAAGAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTAA:1 - chr3L 21821560 5' + Tc3 315 1 76.03 CAATGGCTCGACAAATATTTTACCAAAGATTCAGTTTTGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTATGTAAATTAAT:1 - chr3R 19543485 5' + roo 52 2 64.35 ATTACCGCATGTGGCAGGAGCGTCTTTGGTCTTAGCAAAGACATTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAG:1 - chr2R 6487185 5' - 1360 3299 1 76.71 GCACCCCATAATATATACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chrX 19005348 5' + F-element 56 1 48.63 CTATTTTACTTAAAATTTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTC:2 + chr3R 9175199 5' + Juan 64 1 56.85 CATCTCTTCCAGGGATTCCTTTATTCCCACTTTATTATCGAATTTTAATCGCATTGCCCGAGTACTGTAAGTTAGCTAAAAGAGCGAGAACAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGT:1 + chr3L 12221422 5' - 1360 214 1 62.33 TCGCTTGTCTGCGAGCGTCTCAATTCACTGCACTTTTTGCAAATAACAATCGCATTTTTTGAATAATTCAATTCAGAGAACTGCTAGGTTGGCACTGTTTTAGCACTCGACTCACAC:1 - chr3L 17108645 5' + hobo 23 1 58.97 AGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTT:1 - chr3L 5179202 5' + P-element 96 1 19.86 CGAAAGTATGTGAGTTGAATGTTTGAAGATGTTTGAAAAAGTACAGTACAGTAATTGAAATATACTACTTAATGATTCCCTTTGTATTTTATTTAGAAGCGATGAATCCATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTA:1 - chrX 21027152 5' - BS 5043 1 60.69 CAAAACAGTTGCAAATAAACAGTTGTGCTCGCTCACTATTAAGAGAGAGGAACATAGCACAAAGGGGAATGCAAAATGTGTTGGTGCACAGAGCAATGTATAAAAGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr3R 3590808 5' + pogo 12 1 74.66 AAAATAACAAGCATAACAAATAAAATGAAGAAAAATTAAAATCTGTTGGTAAAAATTATCATTATGGTCTTAAAGAGCCCGCAAGCTTCCAGATCGACTCGGCTATTGATCATGATCAAGCCGGAAACGATTCCTTCTGCCTGTTA:1 - chrX 22760457 5' - INE-1 33 1 67.12 AAAATGTCTAATTATGGAAAAGTACCTTAGCTCGTTTCATACTAAAATCCTAGAAATATAATGACAAATTGTTTGCTTAGAACCTTATCAAAGGAAATGATTAGAATACTCACGAATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCC:1 + chr2L 7939679 5' + Burdock 6139 2 79.45 AGAGAATGAGTATAAATGGTATAACGGTATAAATGGATTTATTTATAATTAAAGCTTTTAAGTAAATCTTACAGCAAACTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAAGGAATGGAAATTTCGTAC:1 + chr3R 17354936 5' - GATE 341 1 56.16 GTATGCAATATTCGAATTCAGAGCATACAGTTTTGGAGCGACTGAAATGTGATAAAAGCCCGACTACAGTTTGAGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 + chrX 15137362 5' + jockey 4675 1 71.84 CGCTGCCTTGGCCAGCGCGAATCAACCAACCACAATTGTTTTGCACTTGCAAGAGGATGGCTTTGAGGTCTCCTCGCTCAAAATACATATCATTTTATCGTTTATTTTTGGCCCGCTTTCAAAGTCAGCTGATTGAGATGTGCTTT:1 + chr3R 19084513 5' + transib4 164 1 66.44 GAAGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCT:1 + chrX 21636186 5' - Stalker2 321 2 71.23 AAGTAAAGAATTTAACGTATTATTTTTCAGCTGAATTATGATTTTAGAATCCAGCTTTTAAGTGGTGCACATTTTTAATTATTTCTCCGACCACAAACAAAATATGTGTATATATTTGTCGATCCAAGGTCTGTAGACTCCTCGTT:1 - chr2R 576478 5' - invader5 4009 2 73.97 GATAATAAGACAATCAGCTAAAAATGAAAGAGGTAAATAATTGCACAGAGCAACACGACGTATACGTAATATATAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr2L 12541744 5' + TART-B 10630 3 77.53 GAACATGTGATTTGAAATGAGATTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chr2L 9347503 5' + opus 7159 4 78.12 TCCTGTTTGTATGGAGCAAGCCAAGCAAATCCAAGCTTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 20074572 5' + roo 8720 2 68.64 ACTATAATCCCCAATGGTATATAGAAGCCAGACGACACCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCAC:1 + chr2L 12678050 5' - P-element 207 1 29.45 CTGAAATGGGAAGTATTTTTAAAATAGTCAATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 - chr2L 14480571 5' - Transpac 5209 2 71.92 ATTCAAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATT:1 - chr3R 28659157 5' - Burdock 6363 2 58.22 ATTGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCG:1 - chrX 21667972 5' + gypsy2 6520 2 68.06 ATGCTACGAAGGGCATTCCATTATCGCTACTGATTATTATTTGGTGGCAAGTCGGCGAAAATGATTTCACAAATCCGACAGATGCAACGAACAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 18041771 5' + gypsy2 398 2 71.56 GCCATCGTCATCGCGTCGCAGGAAACAACAGTCAGTCGCAGGCGCAGACCTTAAACAAACAGAAATTAATTATGTTTCGATGCGAGAGCCCAAAAAGATACTCAAGTCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCT:1 + chr3L 19162896 5' + P-element 2768 1 73.29 CAGCAAATATAAAGTGCATAAACAAATAAAACTAGAAATTCCCCGCTGAACCAGAAAATCGGGAAGCCGAATAAAGGAAGGCAAAAAGCAAAGTGAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr3L 14708872 5' - opus 7485 2 73.29 GACGTTGCTGGTGGAGCGCAGCATGGAACGCGGCTCCCACATTCATTAAAAGGGCCAGACTTTACGACCGCACTGCGCGAATTCCAGTGGCCAAATAATATTACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAG:1 + chr2L 4325496 5' + invader2 483 1 71.97 CCAGAGAAACTATGCGAAACAAACTCAGAGATACTCCCCACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCACATTCTGGT:1 + chr2L 10102805 5' + Quasimodo 128 2 71.23 CTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTTGTCTTCGTTT:1 - chr2R 5045648 5' + invader6 4576 2 76.03 AATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTA:1 + chrX 9437205 5' + roo 127 2 44.52 TTTCCCATTCCCAGCGATTGTCTGTTATTTGCCTTTCTACTCACACAGCGCACTTAATTATGTATGTCAAATTTAATTGGCTTGTCAGTCCAGGCATCACCCTGCAGCATGAATGGGACTAGGTTATCCGCAGTCAGTCTGCTGC:1 + chr2R 14688119 5' - Rt1c 5171 1 66.21 AGTGGGCTGGGGAGTGGCCGGCAGTTGTGGGGACGGGGATGGGAGTGTGGATGGGAGTTGATGCACGTCGTCTGCCCAATTGAGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGG:1 - chr3R 31682014 5' + Doc 6 1 80.85 CCAATAAGCCGTCACGTTCGAATCAAAATACATTGTTTATTGCACATTTTCCGGGCTGCCCCTTTCATCATTCGCTTGTTTTTTATCGGAACACTTCATACTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 21587469 5' + roo 20 2 70.55 TAATGGCGCAGTTGTCGTAGTAGTCTTTTCCGGACGTCTCATCGGATCGGTTTCGTAAGAAAAAAGTGGGGTAGGGATAAGGAATGAGGCACGAAGTGCGGACACAGACACAAGGAATCAACAATCGATGCCTTATTAA:1 - chrX 8106052 5' - 1360 444 1 61.15 CTTTTAATTTGTATTTTTTAGTTAAATATATTTTTTTTAAATTGAAAGTTGCAGAGGAATTTCTTGTACGAATTATATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chrX 22676319 5' + 297 6623 2 54.79 ATTTCCGTTCAGAGTATTTACTTTGTGGTGAATCCCATTTGATTTGGTAATAAAACTACATCGAATTTTGAAGGGCGTGAACGAATAGCATGTAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 + chr2R 21029321 5' + Transpac 26 2 65.07 AATCTACGTGCTAAAAAGTGTAACATACTTGTTGGGATCACCACTTATGTTAAATGGTCCACTTAAGGGTGGGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCAAAGACACTAGAATATTATTATTATT:2 - chr3R 17615233 5' - Tc3 305 1 78.08 GAACATTAAAATTCAACTTAAGAATGAAAATGGCATAATTTTCTCAGGTACAGCCACTTATGCTCTTAAAAAATCACAAGGGGACAGATCGTGCCGGCCATTCCAAATCGCCTCTAATTGAGATAAGGCGCTCTGGAAAGTGTTCC:1 + chr4 1071689 5' - mariner2 514 1 54.11 GATTAGTGCGAAAGAAGCACTTATTGATTTCGACGTAAAAACCCACACGTATCTATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTAT:1 + chr2L 6319741 5' + Tabor 6906 2 60.96 ATGTAGGAAAACAAAATCGCACTACGATGTCGTAAACAATTTTCAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTGTGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCG:1 - chrX 22834619 5' - Tirant 246 2 39.39 TCTAACTAAAATCTAAAGTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCAGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAATACATATAAAGTATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGC:1 + chrX 15903117 5' + INE-1 86 1 49.32 ATTTTTAAGTTTATTTTATTATTGCACAACCTATTTGAAATCTTGAAAAATATTAAAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 + chr2R 22012126 5' + opus 55 4 62.41 GTATGTATATGGAGATGTAATTCATGCAATGTATATGTATAAATGGCGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTC:1 + chrY 2720331 5' + 297 439 1 65.67 ATCATATATGGATGGATAGTGAGCGAGGTAATGTTCTCAAATTAAATTTTAAGTATATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAG:1 - chr3R 20090036 5' + mdg1 7104 2 63.45 AGGAAACTGAGCTGAACTGAACTGAAACTTTTGCCTTTCGAGTTTCGAGTATTCCCAAAATTAGAAACAAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 20074658 5' - roo 9019 2 56.16 TCAGCTATAATCATCTGTTATGTTGCAGATAACTAAAAAAACACTGTGCTTATGAAAGATATGGAATAAATCGTTTACTAATGACATTAAAGTCTTGCATTAATCATTTTATTTTACTAGATACTACTTTTTTCTTTTTTTCTTTT:1 + chr3R 14323367 5' - Doc2-element 224 1 44.52 ATACTCACTTGGTCGGCGAGATGACCTCGACGTTCTCGGACAGACAGACGGACAGGGTCAAATAACCCTGTTATGTAAAGTGCCTGGCAGAATGAAGCGCTTGCGACACCCTAGTCGGTTTTACCAAAGACACTAGAAT:1 - chr3R 23121931 5' + Tc3 236 1 27.34 CCCATGGCATGTTGTCAATCCTTTGTTTTTCTGTGAAGCTGTGTGGTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3L 16463625 5' - roo 388 2 67.15 CTCAGGTCTTTAAAGATTCAGGCAACTGCAGACACAAGGCCAGCGTTTCAATCCGTCGAGCTGATTTGTGAACATTAATAGGCCGGTCTATAACAGCATAATATCCACAAGTCCCTAAGACTTAAGCACATGCCTACATACTAATA:1 - chr3L 11029563 5' + Idefix 30 2 69.86 AACTGAAACATTTATCCACCAAAGCACTAAATTATTCCTGTCCCTATAGAGAACTGGGGTGAGCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:2 - chr2L 17206103 5' - hopper 1369 1 54.79 AAATGTTCATGGCAGATGTTAGCCGATAATCTGTGATTTGCCGCTTACTTTACCGCGATTTTCGGTTAAAGTGCGAGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGG:1 - chrX 5203512 5' - Tirant 400 1 67.68 GGCTTTTGTTAGTGATTTAATATTTCCTTAATGTCTTTTGTTTGGTTATGCAGCCTGCAGCCAGCAGCAGCGAATCATAAGTTATTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 + chr3R 3590627 5' - pogo 2068 1 63.01 ATTTGTCTGAAAAGAACGCAATATTATTGGGTTGCTAAATATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr2R 24021536 5' + pogo 4 1 76.42 TTTCGATTCAATCAGTCAAGCAAGTTCTTTATGACTTAGAAATTTATTTCATATAATTCCTGCTTCCTGTCTTGCTTTATTTACTTTATTGAGTTCATGATTCTCGTTATAACTTTCATCGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2R 12813614 5' - roo 410 1 66.44 GAAAGTAAATTCCATGTTGAAAAGCTGCAGTCTGCTGGCCCCATTCGCGCACTTCTGACTCACTTATTTCCCTTTTTTTTTTTCTATTT:1 + chr3L 967171 5' - Doc2-element 245 1 76.40 CTTTAACGATCATTTCATTTGGCATTACGGTTTAAAAAAAAAAAGCATAATATTGAACGACAAAATGCACTATGTCCGTTATAGCAATAATTAATATTGCATAAGAAAAAGAAAAAAAATTGTAAAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 + chrX 12747519 5' + gypsy7 5005 18 78.32 GGGGAGTGTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 + chr2L 9319098 5' + jockey 84 1 67.81 AATCAGCTGATCAGGTTAAAATTAATTGCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr2R 9339780 5' - Transpac 5201 2 66.44 CCAGTTGTTTTTCCAATTTATAGATATGCCGAAGATATGCTATCTTAAACCGCCCAATATCTATCGATATTACAGAAAAATAATAAAATTTGGCGTTCGCATTCACACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTAGGGGAACT:1 - chrX 22855677 5' + INE-1 557 1 54.55 GTCTCATTTAATCCTCGAAAATGCTCACAGAGCGTGCATATATATATGTATATATATAAGATAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTTGTCAGGACTCACCAGCGCTCGTCTCTCGT:1 + chrX 1764057 5' + opus 149 4 60.87 AAATATACAGTAATTACTGATTACTTTTTTAAACAAATGTAAATTATATAAAAAGGAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1 + chr3L 11903207 5' - opus 445 2 64.03 ATATGTTGTTGTCCAAAAATTTAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAAT:1 + chr3L 2151148 5' + Doc2-element 229 2 88.89 CAAAAGGAATTTGATGTTCGAACTGCAGACCACGAAATGAACTACACAACCATAGATGATAAGCTTTATGAAGGGGGCGAAGTCAAGCCCTCCAACATAATCTCCATAAACAGTGTCTTAGACGAACCTCAGCGAAAG:1 - chr2R 10804125 5' + gypsy 7385 2 49.28 GAGAATCCAACTTGAGTCTTGCCGGCTCAGATAAGCCCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chr3L 13228436 5' - P-element 2853 1 62.07 ACGATCCAACTGATCCTCAATGAGCACTAGAACGGTGAGAGGATGATATTCGGTCTGTCCGCGACCTATGTGCCTTTTCCCCTTTCTTAGCGAAAGAGACGCTCTGTGCGATGCACCATCGCTCG:1 + chr3L 27656486 5' + Doc2-element 126 1 75.20 TCTTGCCAATTTCTATCGGTAGTCCACAGACACGCCCAGACTTTTGAACAATTTTAAATTTCTTCTCATTTTATACCAGAACATCTAATGATATCCCAGAAAAATGATGAAATTTTGCGATCGCATTCCCACTAGCTGAGTAAAGG:1 + chr2R 6165461 5' + INE-1 536 1 58.22 TTAGTCTTTTAAATTTCTATCGATTTGCCACGCCCACTCTAACGTCCTATCTTATTACCCGTTCTCCCATCTTATTACCCAAAATCTATCGATATTCTAGAAAAATAATGAAATTTTGCGTTTGCATTCACACTAGCTGATTAATG:2 + chr3L 27282408 5' + INE-1 535 1 40.41 GTAGGCAGTGAAAAAATGGTAGCCATTTTTATTGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr2R 22012263 5' - opus 7476 2 64.44 GCATATATGTACATATATTATTTAAAAATTCCATTTTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1 - chrX 20632647 5' + pogo 81 1 76.55 AAATCATATTGTTTACACATCGGTTTTATAAATTTGGTAGTTTAATTTTTATTAGTCCAAACAAATATCGGATTATATTTTTGTTTCAAGTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3R 4661895 5' - roo 9042 1 65.75 TTATAATTGAAACATATTTTTTTTTATATTTTACCACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chrX 10304594 5' + roo 87 2 78.08 CACAGTGGCCGTTTCCATACTGCATTCGGTGTTCGAACTGCTGGCCTTCAAGAACGACATTCAGTTCTGGAACAATCGCAAGTCGCTCGAATTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAAT:1 - chr2L 4225712 5' - hopper 1088 1 62.33 TTTATACACGACAGAATTTTAATAAATAAATGTGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGAC:1 + chr3R 27514687 5' + Ivk 404 1 77.24 TTCGCGCTCAGACTCATAGAGAGCAAGACGAACAACGCCTACTTCTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr2L 22719525 5' + 1360 16 1 73.97 AGTAATCTTGCCATTTGCACAACAAAATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGA:1 - chr3L 19335471 5' - invader4 300 2 66.44 GAAAGGCGGCCGAAAGCCGAAGTCACTGGCGTCACGAATTGGCATCGTCGTTTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr2L 13717392 5' + P-element 56 1 44.03 AAGATAGAAGGCAGCCGAAATGCGATAGCTTGGTCGACTTGGTGAGAAGATACCCTAATTTTTCTATATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 5447830 5' - roo 397 1 74.66 GCTTGCGGGCCCTTTGGCAGAAAGTTAACACATGCACACGAATAAATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 19450209 5' + roo 17 2 83.33 ATAAACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCACCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAT:1 - chr2R 4206662 5' + 1360 316 1 73.97 ATATTTGGCCACAAATCTTCAATAATGTTGTATCATAAAACAAATACTGCTAATAACAATAACAAATAAAACAAAACAATAATAACAATAAACAAATACTGCTAATAAGAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr2R 17187842 5' + roo 11 2 34.93 CGGTCGAATGCAACTTAGAAACTGAATTGAGGAATCGTATTTTGCTGCATTCTCTGCTATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 - chr2L 12678607 5' - P-element 2825 1 45.89 ATAAACGCTGATTGGGCTTTTGCGGTTCGCTGGGGAATACCTTAATGGGTGGATTGGTCATTCTCTTTAGAAGGGAATGGTAATTTGAACTTCAACCCCGACGGACGTGTT:1 + chr2R 15931204 5' + Porto1 9 1 74.77 TAAGAGAAGCAGTTGATTGGTTCTTTTGCTCGTAACCAAAAAGCGTAAGATTTCTTAACAAAATCATTGCAAGCTCTCTTGGTCAACTTTTCTCTTTGCCATTTTCCACTTTTAATCAAAGCCCTACTTGCTCCAACGTGGAGTTA:1 + chr2L 9744681 5' + G5 4370 1 71.23 AAATTAACATTTTCTTTGGCTGCAGCACCACGCACATGCGTGGCACAATGGCGGTGGTGCAAGTTGTGCCAGTGGTGCCAGTGGTGCGAGTGGTGCCAGTGGTGCCACTGCGTGTACGAGCCAAAACAATTAATAGCTTCAATTA:1 + chr2L 3635817 5' + Doc4-element 394 1 77.93 ATTTAACTTTAATTTTTATATACTTTGTTTACGCAAAAAAAAAACCTTACATTAAATACTGTTTTACATATATCTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTAT:2 - chr3R 11146466 5' - flea 206 2 53.42 CGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr3L 13472413 5' + jockey 79 1 66.44 AAATGCCATATTTTTTCTCTCTGCAATGCGACAACAGCAACAACATCCAGCTAGCTGACCCCAAACGAGAATCCGAAGAAAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGTATAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAG:1 + chr3L 13911972 5' - diver2 165 2 52.74 CAAGTACTTCACATGCCCCACAATTCAGCGTTGGGGAGCGCGTGTTAGTGTAAGGGCCAAGAGAAGGGGAAAAGGGGAGTGTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr2L 9319011 5' + jockey 10 1 45.89 AAAATATTTCCTTCTACGCTGCTTGTATATTATGAAACATTTAATGGAATTTTATAGAAATTTTTGTTTTTTTAAGGCTTATTAAATTTTAAATACACTTTCATTTACTCATTCCTAAGTAATGATTCTTTTCCCAGGCATTTCTA:1 + chr2L 14280176 5' - S2 398 1 53.42 ACATTTATAGGGAAAGGAATTACCCTAAATTCAATAACAACATGCATTTGAGCAGTTATGCAAATAAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 - chrX 17737286 5' + jockey 4725 1 52.82 AGATTTTCAAATACATATCTATCCAAAAGCAAGCTCACCTTGAAAGTTACGCTTTATGATTGATGAGTGTAGGACTTTATTTTCCAGAGTGGTTG:1 - chr2L 17513600 5' - G4 3376 1 74.74 TATTGAGTGTTCCCGTTGATTAATAAATATTAACTTGTTTAAGGACTTCTTAGTGTTTAACACTAGAAAGTTAACTTAATCGAGGGCGTAATGAAAAAGACGTAATATATATTCTAAAGATTTAAATAAAAAAAAATGTAATATTT:1 + chr3L 3593877 5' + P-element 142 1 59.59 ACAAATTCAATTAAATCAAACATTTAAATATTATACCCTATTAACACCGTGCACTTATTTCTTATTAAAGCTGCACAGTTTCCTTCATTTTCCCTTCCCACTGCCGTTTTTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTAT:1 + chrX 2524464 5' + P-element 2872 1 73.97 CAACCATCAAAAACGAGCAAAGCGGCCACGTTTGAAACAACACGACGGAATCCAGGATGCCCCGGCTCCAGGACTCTTACTCTGATTCAGTTTCAGCATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAA:1 - chr3R 5941546 5' + X-element 37 1 64.38 AGTGACGTCAATGGCTAAATGACTGAGTGGCCAAATAGCAATGGCAGAGTGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr2R 7889376 5' + jockey 56 1 57.26 TGGAACATACATCTTCTACCCCTAGCGGGAGTTTCCTGCTTATAAGGAAGTAGGTGCCGGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr2R 14722663 5' - mdg1 7445 2 60.40 GGGAGAGGGAGAGCGCTTGGGTGAGAGGAGAATGTCTGGCATGGAGAGTGAGAGAGCGTAGCGTGGTTGGGAAAAACTGCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGCATGCCTGCA:1 + chr3R 11773870 5' - P-element 2846 1 58.22 CCACGGCTTCGCTGCCCAGCTGGACGAGCGTGGAGTGGAGGTCTGCCTGGACATCGACGAGTGCGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTT:1 + chr2R 10318092 5' - jockey 126 1 50.77 GTAATTTCTAATGCTGTACCAACATTTCACTTTATGTAATTATAAATTCCGAACAAACAATATCAAGTTATTCTCTTTCCTAGCATTGTCCTAGTTTAAACAGCGCGCTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 + chr3L 13156661 5' - transib2 2804 1 70.55 ATTAATAATTGAAATGCCCATATTGGTTTACAATCGCTGTAACAAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGC:1 - chr3R 25783309 5' - micropia 380 2 68.49 GAAAATCTGCTTTGCAAGCTCAAAGGCATTGGCCATTTCCTGTTTGTATGGAGCAAGCCAAGCAAATCCAAGCTTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 20074535 5' + roo 8703 2 56.52 AAATCTACCAAATGTTTAATCAATAGCACACAATATAGGGATAGTCTTTAAGTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATG:2 - chr2L 6820956 5' - I-element 5274 1 63.70 TCTTGAGGGGGGAGTAGTTAACTAAGTTAACCATTTAAGCATTTGGCAAAGCTCTGCACTTTGGCAGAGGCCGCTATGAAGCTCTTTCTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGAATTTGCATTTATCAGAATAAAGAGCGGCAGCTC:1 - chr3L 25810382 5' + Gypsy6A_LTR 184 1 69.18 GTTTGGGTTTTTGACGCATTACTTCGTCGCGTTTTTACCGGTCGATTCAGTTTTTAATTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr3R 12725637 5' + 297 6640 2 63.01 AATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCTTCACCCATACTCAGCGAATTGAGAGCAAAGGCTGAAAG:1 - chr3R 433131 5' - 1731 233 1 71.23 ATGGAAAAGTACGAAGTTATCGTACTACAAAGTTGATTATTCAAACCACTTTATTCATTAGGCACCATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 + chr3L 20209533 5' + Burdock 50 2 56.16 ATGCGTGCATCGAATATTGCAATTTAGAATGCGGAATAGTTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCC:1 + chr2L 14888943 5' + hopper 77 1 69.86 AAGATGTACAACTATAAATTAGAAGATTTGTGTCATCATCATAATATGAATGCAAGTTAGTTTTTTAAAAAAGTTAAGTATGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTA:1 + chr3R 12825356 5' - jockey 4913 1 53.42 TTGCAAAAAAAGATTGCTGCATTTGTTCGGATTAATTAATTAATAATTAATTTTGCTCATTTTTAAATAATCAAAAATTAGCCGTGCTTTCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 + chr3R 11978208 5' + Transpac 4947 2 66.44 AGCGCTATCCGAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGC:1 + chr3L 25482857 5' + accord 32 2 63.70 AACAACAAAAGCAAGAGCACTCACACCGACTCTAGAAAGCGGAAGCGACAAGAACCAAAACGAAACAAAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGCATATATATTCTTGATCACGATCAATAGCCAAG:1 - chr3R 11020189 5' + INE-1 90 1 53.42 TGGCGATTCTCGCTGGCGTTTTTTTTTTCTTCGGTTTTTAGGTTTGCCCTAGTTTCGCAACATTTTGCAACCGAGCAGCGGAAAAGTCGCGGTAAATGTCTTAGTCTCGCGGAAATAATATTAATAATAATGGTAA:1 - chr2R 9989542 5' + mdg1 47 2 80.88 TATTATTATTTAAAAATTAATTATACGCCACGTTGGCTCGTTTGGGTTTTTGACGCATTACTTCGTCGCGTTTTTACCGGTCGATTCAGTTTTTAATTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr3R 12725676 5' + 297 6601 2 71.23 GTTGCTCCTGTCGTTCGTTTGTTTCTTGCTGCCGTAATTGCATAATGAGGCCAACTGCAATTGCGACAAAAAGTGCAAGCGTGAGTGCTGGAATATACTATTCAACCTACACAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 - chr3L 7790790 5' + copia 4909 2 57.53 GATATTGCCTAGGAATATTGCAATGTGCGCGAGCAAGCAAACAGTTTTTGTTGCATACTTACAGCCTGCGAATGGTATCTTTATAGTGCTGTGTGGTCTGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr3R 23539368 5' - hobo 2937 1 74.60 TAGCTGTTTAATAGCCAAATAGCCAGCTTTTGACGGGGATTCATTCGGGAAAGGCTGTTCAATTTTGAATAATTTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr2R 22464481 5' + pogo 44 1 53.79 AGTCTACAAAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr2R 16510239 5' + roo 66 2 64.58 GTTCGTGAAGGGGATTAAAGCTGCATAAAGCTGACAACTTATGATGTGCCATAAATCAATCGTTTGAAGCCCGCATACGTTAATTTAACAGTGCACCGTTATAATAACAGCTGTTAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCAC:1 - chr3L 2580725 5' - hopper 1248 1 53.15 CAACAAATAAGTGAAGTATAAAATATTTAAACTAGATTATCTGACAGACAGCCATTGTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAG:1 + chr2R 21425057 5' - HMS-Beagle2 7135 2 60.69 AGTGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGTAAAAATTCCCCAGATATCAAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCTC:1 - chr3R 17210131 5' + HMS-Beagle2 6 2 73.68 ATTTAGTCGTCATTTAAGCACAAACCTTACAATTTATTTCAAACTTGATGATGTGTATCAGGTAAGAGTTGGGCACATAATATTGACCCATTAAGAGGAAATGAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAA:1 - chr3R 5215056 5' + FB 19 1 71.72 GGAGAGTGAGAGAGCGTAGCGTGGTTGGGAAAAACTGCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTG:1 + chr3R 11773912 5' - P-element 2804 1 29.45 AATGTCTTTATTATGTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCAC:1 + chr2R 9934137 5' + Rt1b 4955 1 56.72 CAGCAGTGCGAGAGATCCCCCTGACTTTTTACACATAGCTGCACACACGCGCTCCGACCACCGAAAGGATAGTGCTGCACTGAGAGAAAAATAGTAGTACAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr3R 8596479 5' - hobo 2918 1 71.23 TTTTTCTCGCACATTTCCCCAGCCTCAATTCATGACAAAAGTTTTTCGGCGCAGCGACAGGCAGATCGGGCTACTATATACATATATATATGTCTACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chrX 12214616 5' - opus 479 2 72.60 ATTATGCAACTACTGGTTACATTTACCCCTTACTCGTAGAGTAAAAGTGTAAAAATATGTAACAAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTCCATAAAGTTGATATATTCTAGATCAGGATCATCCGTATGAACGTCGAGATCTTAGTA:1 - chr3R 18377447 5' + INE-1 138 1 76.71 TGGGTGAGAGGAGAATGTCTGGCATGGAGAGTGAGAGAGCGTAGCGTGGTTGGGAAAAACTGCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chr3R 11773887 5' - P-element 2843 1 51.52 AGGGAGAGCAGAAAGAGATGGATAGCTGCGGCAGGAAGTGGGTTTCCCTTGGCGTGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTG:1 + chrX 17484515 5' - blood 166 2 84.27 TTTGTATATTTATATTTATTATGACCATTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGGGCTGACGTTCCTGCGGCCGCGTCCG:1 - chr2L 23069853 5' - gypsy4 6615 2 76.19 TGATATAAGCCTATTTAATTCGGTGCATTTCTCTTTTAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGG:1 - chrX 20637018 5' - Quasimodo 7315 2 71.67 TATTTATGGGAAAACCTTTTATTTATGCTCATTTGTTGACATTCTTGTTTATTTGGGTTTTTTTTTCCTATTTGTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGTTTTACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGAAGCG:1 - chrX 11906381 5' + INE-1 30 1 53.42 GTATATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACA:1 + chr2L 21930797 5' + INE-1 135 1 76.07 GGGCGGCGGTTTTGGGAACAGAGTTGGTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTA:1 - chrX 4214513 5' - jockey 4903 1 77.40 TAAAGATAAATGAACGATGCCTGTACTGTCAAAATTTTTATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGT:1 - chr3L 13166300 5' - I-element 5273 1 76.03 TACTGTATATTATTATTAAATAATTGTTCCGCTCTTCAAAGTTTATTTTAAGTCGTATTATTATGACCATTAATACCCATTTATGCATGTTATAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2L 21928622 5' - roo 9030 1 65.52 ATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATACAA:1 + chr3R 907903 5' + gypsy11 366 2 29.45 GTAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTGACATGAGAA:1 + chr2L 18213131 5' - roo 8997 2 68.06 TGTCGCTTGTGACGAATTTCTATTTGATTTATGCACTCCCTTTGCAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCGCCAGAAACGACTTCGTTGT:1 - chr2R 21029446 5' - Transpac 248 2 65.19 TGTTGTGTTTTATGTTTAACTTTCTTAGAAGAATATATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCATGCGCCATAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCACGGGT:1 - chr3R 3953134 5' + invader1 113 2 69.66 GGAATGACTGGGGACCCAAAACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 - chr2L 20324222 5' + Tirant 8160 2 54.11 TAAGGTTAGCAAAGTTAATATTCATTCGGGCCTGTGGAGATCCGATCTGGGATCGATCTCTGGCTAACTGAGTGATTTGCTGAAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAA:1 - chr2R 10611615 5' + P-element 180 1 55.94 TTTTATTGTTGCCCGTTTGCCACTCCAACTTCACCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTA:1 - chr2R 20447873 5' - hopper2 1523 2 73.97 CATTAGGCATTCGGGGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTCGA:1 - chr2R 4368663 5' + Doc4-element 20 1 45.74 CTTATACGGTTATAGATATGTTCATTTGCACCCCATAATATATACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 + chrX 19005321 5' + F-element 29 1 56.16 TTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTTAAAATCGACTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chrX 21844333 5' + pogo 49 1 52.74 ATATGTATAACATATAAAATAGAAGCAAAATGCATAAGTATCATTGTAGAAGATTTAATTTTAAACTTTAGGCATCTGTTAAGATTAGTTATAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3R 8914216 5' + pogo 24 1 67.81 AAGAGCGAAAGGCTAAACCGTAAATAGGCTTGGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr2L 7449719 5' + roo 8752 2 80.82 CAGATTTTCAATATTTTAGAAAAGGTAAAAACAAAAAGTTATTGGTATTAACAATATTTACCGATGGTGGCCCCCGCAAATCCAAAAAATTAAAGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTT:1 - chr3R 16431747 5' - Doc 69 1 65.07 TTTTTAAGTTTATTTTATTATTGCACAACCTATTTGAAATCTTGAAAAATATTAAAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 + chr2R 22012127 5' + opus 60 4 64.14 TTTATTGGCTAATCTAGGATTAGCCTAACTTTCGCACTTGAGGTCGGTGTAAAATGTTACACCACAAAAGAACTGCTCAAAAGTCACGGATAGTTAAAGTTTAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 - chr3R 18541439 5' - hobo 2929 1 75.00 ATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3R 4532979 5' + 1360 53 1 55.48 GTCTTATAATTAGCTCTTTTAGCATTCTATAGATTATTTATTTTTTTTACGAAATCTGAGACTGACATAGCATAGGGATATTGTTTGCTCAAAGACAAATTGTAAATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAG:1 - chr4 295795 5' + 1360 215 1 67.86 AAGTGTACTTTGGCTAACAGAGGAAATCGCACCGACGACTTCCATTTGGGCAAATAACTTTTTGTCCCGAAGATTACACGAGCATTACAAGACTGCCTGAATTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTC:1 - chr3L 1356580 5' - invader2 478 1 59.70 GCATCGGTATCCAACAGTCTAGTCCTAGAAAGCACACATCTGAATTATATGCTCTGTACGGCCCAAGAAACCGACGATAATTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 10361972 5' + roo 19 2 68.50 TTTGTTTTGTAAGATTGTATTTTGTTTTATCCCAAAAGTAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACGTTTGCGCAGATCGTGTG:1 + chr3L 16907790 5' + jockey 90 1 70.55 ACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3L 16463519 5' + roo 73 2 76.92 GTGTCATTTTTTAGGTTAATAAGGCCAAATTGAGTATATGTGCCAGACACACACTTAATTATCATCATATTTATGGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATT:1 - chrX 20874400 5' + F-element 373 1 53.42 AAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAGGGAAGAGTGACAAACACAAAATAAAAAATCGGGGCGCAAAAAAAAAATACGACCGTTCGCTTTAAAAGCTA:1 - chrX 9023558 5' - Cr1a 2 1 59.59 TGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATATACATTTCCATATACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGG:1 + chr2R 24024587 5' - Transpac 5157 2 69.18 AAGAAAGGGAATATTTTTGTTGAAATAAATACTGCATTTTGCGTAAAACGTATACAACTTGTTCATAATTTATTTATTTAATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACG:1 + chr3L 16271868 5' + jockey 138 1 49.32 AAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:1 - chr3R 28659153 5' - Burdock 223 2 55.48 CAAGCCCAAAAGCATGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3L 2184981 5' + jockey 57 1 51.37 CAGTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATCTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr2L 11867412 5' + jockey 26 1 68.42 ATTTGTGTGCTTAATATGCCTATTTAAAATGCCAGTTTATCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:2 + chr2L 8707447 5' + 412 80 2 71.92 GTTAATCGTCCGTAGTTCCTGGTTTTGTTTAAAACACATACGATATCTAACATGAAATAAGTACGCAATGGATTAAACAAAACCAGGAACTACGGACGATTAACGTTTTGATTGATCCTGATCTAGATCAGAGTTGATTTCGGCCA:1 + chr2L 22995666 5' + 1360 3177 1 67.81 AACAATTTAAAGTTGAGCAGGATCAAAGAGTCTACAGAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2R 16510211 5' + roo 8704 2 58.22 ACACCTCAGCTGCTAGACAATTTAATCCATTCTTCCTTTATCTGCTTTGCATTATCCAAAACAGTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAAT:1 + chrX 21581340 5' - Tabor 429 2 55.17 AAACGGGAACGCGAAAATGTGAATGTGGACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chrX 10806866 5' - P-element 2841 1 49.62 AAGCAAACCCAATTCCATGGAGGTGGACGAGGTGATAGAGGAAACTAAAAGTTTGCCCTACGTCAAGGCCTTCAGCTTTGGACATCAAACGCAGAGGAGTTTCTACACAGGCAAGGATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGCTCTCT:1 + chr2R 9399568 5' + Cr1a 4340 1 78.08 GGTATTGCATTTTTACTAGTTGACACCGCATCCGTTAATTACACAAGCGAATAACAGAATCTTGTGGAATACCTGTGCCGACGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chr2R 18440379 5' + P-element 21 1 68.22 ACGTATTTATTTAGGCCGCAGTCTGTCTTTTGATTTTGCGACGAAGTAAACAAGTGCTTTATTTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAG:1 + chrX 10367542 5' - Juan 4151 1 57.24 TATGGTTAGTTTGCTTATTTGAAGAAAAATCCTTATGCGTTACTTGATTGACATCAGCCATAACAACCATTATATTTAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGG:1 + chr2L 18251938 5' - I-element 4881 1 47.95 CCTATAAAGTGTAACAATTCTTTTTACGGTGCAATAGGCGAATCGACCTGGTCGCGTCCGCCTATCCGTTTGATTGTCTATATCTCAACTATCTAAAAAGGGTACAATGAAGGAATGGAGTGCGACTTGGCCTCACATC:1 + chr2R 5497038 5' + Rt1b 4947 1 70.50 GCGTATGCTTAATATCTTAGCAAAAGGCCCATTTTCTAAGAGAGAACGCTGGAGTTGAGTTCCCCGACTATCAGATACCC:1 + chrX 848811 5' - INE-1 556 1 90.00 TTGATGTCGGCGATGGCACTTGTTAGTCCTGAGATGCGCGGCATGCGCTGCAAGGTTGCAACGGATGCAAAAGGATGCCAGGTTGGTGAGATGGCGAAATGTGCAGGTGTATGACAAAGCTGCTCATATTTTTCAAGGTCTATAGG:1 + chr3R 30029013 5' + hopper2 450 1 69.86 CATATTATTCGATTTGGAATGTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 27188649 5' - roo 9052 2 67.48 ACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chrX 16217523 5' - P-element 2837 1 44.96 CTCCATAAAATATTCATAGTTTAGGCTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTCAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAG:1 + chr3R 5316579 5' + Juan 4122 1 79.45 CTACACAGACAGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGACGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTTACATCCTGCTCATCGAGGTCATACCTTGACT:1 + chrX 19820616 5' + Rt1b 4973 1 61.40 CTTTGGGCGTTTGATTCTCGACGCTTAGCGCTCGGAATTCAGTGCTCAGTTCAGTAGGTGACACCATTGCGCTTAGGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 18518052 5' - roo 9028 1 53.10 GTTTGATATCAAAATATTGATTGCGTAAGTGGGCAAAGCGAATGTCACAGATAACGCAAAACTTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 17904766 5' + roo 52 2 56.85 AATTCAAATTCGATTTCATGGGAAAGCGTTATACAAATGCCAAGCGTTTTGAATTGGACTACGCTTAAGGTCCCGTCGCAGTCGAATTGGAAGAAGGCAACAATTCTTATTGTCAGATGATGACAACGGTGCCCGAGTGATGGTTC:1 + chrX 9165004 5' - F-element 4347 1 81.51 CTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTG:1 - chr3L 10563988 5' - hopper2 1542 1 59.59 GAAAAGTGCGCTTTAAGTTTTGAATTACTTTGCGGCATTAGCGTTTAACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr3R 18541320 5' + hobo 51 1 62.30 CTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr3R 6412027 5' + Tirant 8123 2 63.08 ATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 + chr3L 13472428 5' + jockey 93 1 76.55 TTTTTCCCAGACGCAAGCAGCGAGGGTCAAAGATTACGGACTGCGGATTGGGGGTTGCATCCGATCCGTTAAGCCCTGCTGCCGCTTATTAGCTGCATTATTTATATTTTTATTAGGTTTTAAGATTTATATCGATTTGCCAACAA:1 + chr3L 22207497 5' + INE-1 445 1 66.44 AAGTCGATTATTGCACAGCCGTCGGGTAAATTGTAAAAAAGAGGCCAAGTTATAACGCTTTACTTTTTAGACCCTTGCAGAAGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGG:1 + chr3R 5477922 5' - 297 6940 2 62.07 AATACCTACTAAGGAGTCTCCCCTATGCGTTGCCCTGCTTATTATCATTGCCTTATCTTTGTGTGCTTTTGACACTTTTGCGTTCATTTTTGTTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTC:1 + chr2R 13761864 5' + G2 2628 1 36.99 GACAATGGCAGCCCGAAAAGTGACAAAGACAACACGTTTCGTGCTGCAAAAAGTTACAGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr3L 5179139 5' - P-element 2850 1 50.82 AATTAAATTAAAAAGCTTCCAATCAAGTAACTGTTGATTGAAGAAGGGAAAGTTTGAAAGTTTGATTGCTAATTTATTGTCAATAAACTTGATTTTGTATTTTCTTTACTTATTTTACTGAAGAGCTTAGCAAATTTCAATTTCTT:2 - chrX 13023213 5' - NOF 436 1 60.96 AATATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTAGACGGTCTAAGGGCGTTAGAGTGGGGGGTGGACAAAATGCTTTTATTTATAACTTATATAACTACAAAAAACAACTTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 + chrX 22902352 5' + F-element 19 1 38.19 CAAGAATCAACTTAAGAACAACAACTATACACTACTCTACACAGACAGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGACGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTTACATCCTGCTCATCGAGGTCATACC:1 + chr3L 22907537 5' + Rt1b 4967 1 70.83 ATATTGACTATGGAGGGATAAAAGGGACGGCGACACGCCCACAATACGTTCGCAATTTCACACATATACGTGAGGTAATTTTAAATTGTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 + chr3L 13366039 5' + hobo 5 1 78.08 AAATTAACTGCGTCCGCTCACAAGTATGCTACAATTTATTGCAACTTTTATTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAAT:1 + chr3L 15853502 5' - jockey 4925 1 67.12 GACGTTTTCGGACACATTTTCACTTTTTGATTTGCATGCACTTTAGTTTTGATTGGAAATTATGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chrX 10286978 5' - roo 351 2 58.90 CGAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCAC:1 + chr3L 25482866 5' + accord 17 2 68.85 AGCAATAGAAAATGAAGTGACTATTTATATGCTCCATAAAATATTCATAGTTTAGGCTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACAT:1 + chr3R 5316548 5' + Juan 4091 1 59.59 TATGCACACCGTTTATTATTAAAATCAATTTGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTA:1 + chr3R 17210034 5' - HMS-Beagle2 221 2 78.08 CATAAATGAATACCGAATAATGGACGTGCATAATGGAATCATTCTTCGTATACCCTGGAACAAATATATTCAAAGGAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2R 12813796 5' + roo 40 2 52.41 ATTATCAAGCATTAAATGACATCTAATTGCGCAAAATAGGGTGAGTTTGAAAGAGGGCAGACATGGAAAATAACACAAAATGCGAATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGA:1 + chr3R 29091257 5' - rover 7266 2 64.38 AGATTTCATAAAGTTCGCAGACTCAAGTATCAAATATGTTGGAAAAGAAATGTATTTTTTATGAGACTTAATAAGCTAAGCATAACGAATAGGTATTCGTTTGCATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 - chr2L 9067456 5' + flea 15 2 42.47 CACTAGGCCATCTTCAAGACGCTCTCAATGCGCATTTTAAGTAAAATTTTAAAGAGACGCCAGTCGCAGGCTGAAGGATTATGAAAAGCCGCTGAGTGTATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr3L 18972786 5' - mdg1 402 2 71.53 TATGCACACCGTTTATTATTAAAATCAATTTGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGATTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAA:1 + chr3R 17210034 5' - HMS-Beagle2 240 2 73.23 GGCATTTGCCAGTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATCTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2L 11867421 5' + jockey 20 1 72.79 AAGGAAGATGAGGGAACCAACTGACCCAAGCGGGCCTGAAGATCTTGTCCTGATTGTTTTTACATGCCATACATACGAGTACATATGTATATGCACAGGGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTAT:1 - chr2L 15906141 5' - Tabor 473 2 74.81 AATGTTGAATTTTGTACGCAAACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAG:1 - chr2L 21250995 5' - P-element 2788 1 18.49 GAAGCGCATTATAATAATTCTTTCCCTCGACACTTTTGACTGGGATTGCTATAGAGGTCTTCGAGAGAGCCTGAAACCAGCTTTTTAGCCAGCACGAAGAAATCGTGTGCAAAATATCGAAGGGCGTTACCCATCTTGTTATTCGA:1 + chr3L 23250407 5' + 1360 3379 2 76.71 GGGAATTTATTGAATAATTTGGGACGCCTGTTACATTGTCGACAACGCAAATCCTTGATAACATAGACATGGACGAGGACGCCCATTTTTAATGTGATGGGGAGTAGTTAACAAGTAACATCAGGAAAAGCTGCGGGTGACGA:1 + chr2R 4576149 5' + Chouto 17 1 73.43 CATAATAGTTGGGTTTAACGGTTGACCTTTTGGAGAAGACAATAAATGAGAATAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTT:1 - chr3L 26019426 5' - gypsy 417 2 43.84 TTTGACTGTATAACGGTTTTATGCGTATTTACCATTACGCTTTCAATGGGCAACAATAATGGACAGTGTGCTGCCTCTAGTCTTCTTCTTCTCGCTCTTTGCGGCCATAATTTATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3R 16228767 5' + P-element 5 2 79.45 ATCACCATACTTCACAATCTTAAGTTGTATGCATAAGATACATGAAATCGCTTATATGTACATTCCAGAAATACAGGTGTAAATGGCGATTTTGCATACCAACTAAGTTCGTTTTTCCTATTTTTTTTTTTAATAATATAT:1 - chr2L 19461201 5' + hopper 159 1 63.83 AACCGTAATGTGTGGTTCTCAGCCTCTTAAGAAAATATTTTTGTGGTATTCCTTCATTTATTACAATATGAGTAAATAATCCTAAGGGTCACTCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATATTAAATAT:1 - chr3R 16913512 5' + mdg1 149 2 60.47 TACTATACGCATATAAATAAATTGAAAACAAGAGGGAATACCAAGCTATGGATCTGCAATATACCCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chrX 17510588 5' - roo 9016 2 54.79 TATTTAACTAAAAAGCTGAAATCACTGATTAAGCATTAAATAGCTTGTGTAAAGTCCAATCTATATATAAACATTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr3R 8596325 5' + hobo 45 1 54.79 GGCATATTTCAATTAGTGTCAACTTTTTGATTTTATGTAAACACATGCGAAAGCAGAGCAACTTTACAGCCCATCGTTTTCCCCACCCAATTTGTGACCCCCTCCTACACACACACACACACACACACACACACATCCAC:1 - chr2R 13107374 5' + accord 187 2 71.43 AAGTGTGAGCAGTAGACTTGTCCGCTTGCAGTATGCAGCGGCACGTAACAGCCTTAACCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3L 22883929 5' + roo 8721 2 60.00 GTTTCTGTGTTGCATATCCGCAGGCGCGCAATTTGTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGGAACTTATTTTGATCTGCTTTAATTATT:1 - chr3R 5868243 5' - jockey 4937 1 67.46 GAAACGCATATTTTATTGTCAAAATCAATAGATGTCAGCGTTTAACAGCTGCCAGCGGCAAAATACAACCCCTGATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 17027977 5' - roo 9027 1 58.90 TTTGAATTTCAAATCGTACCCATTAGGCTTAGAGAGCAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 19543428 5' - roo 325 2 73.97 AAAGAGGCCAAGTTATAACGCTTTACTTTTTAGACCCTTGCAGAAGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAG:1 + chr3R 5477959 5' - 297 328 2 67.63 GGCTCCTGTCTCGTCCTGCAACCGAATTACTGATTAGTATCGAACCAAAGACAGAAAGGTTTGGCCAAAGACACTAGATTAACACACAAATCATGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGT:1 - chrX 1514476 5' - 1360 157 1 47.15 AAATACAGTGTATTATTCACATATCTACTACAAAGCACAACATATGTAAAATGTTTATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chrX 17510680 5' + roo 64 2 65.75 CTCTACATTTCCTCGTATTCAATTGAACCATTTTGTTTTTGAAAAAAGCAGCAAGTAATGAATTTTTAATGTGTGAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr3R 31650433 5' + pogo 39 1 58.90 GATTTTCCTACTATGAAATAACTTATATTATAAACCAACTATATAAAATACTGTTAATATTCGGCAAATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATTATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGG:1 - chr3R 5115386 5' - Ivk 5325 1 54.79 AATATCAAAAACGGTTTTTATTGCAGTCATTTAATTGAAGAGAAAAATGTCAGTGAAGTCTCTTGTTTAATAATAATATACGCTAAAAAGATCTTTTATCTGTAATTCGATGTCTTCTACATGTTTTTTTTTTTGATTTCCCAATT:1 + chr2L 13043766 5' + Tc1 1477 1 49.32 TCTCTAAAATTCTATTGATATGCCCACAATATTTTTAGTTGCTCCCACTCAGTTTGAGTAATCCCACTCAGTAATGGGTATCTGACAGTCG:1 - chr2L 13558524 5' + INE-1 550 1 43.96 CTAAGGTCAATGTTAAATGCAGTTTTTTTGTATTAATTTAAAAAATTGTTCCAAGTCAAAGAGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAG:1 - chr2L 9074292 5' - flea 200 2 60.96 ATAGAATATTACTTAATAGACAATCTTTCGTTTCGCTTTGTTTTTTTTTATGACTCACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGT:1 + chr3L 7790667 5' - copia 189 2 64.38 TTTTACTTAAAATTTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTG:1 + chr3R 9175202 5' + Juan 48 1 52.76 GACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 - chr3R 4532975 5' + 1360 57 1 58.22 CAAATCTAAAAATTAATAAGGCACATAAAATATATCTAGATAAATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 + chr2L 14480409 5' + Transpac 41 2 57.93 CTATTGCTGTAGCAAAAAAAAAAGAAGTAAAAATTAACTAAACATTAATAACATAACTGGAAACATATAAATTTCCATAGTTTTCATGGCAGGTAATGAATACAATGCAGCGATTTTTTGTTTATTGATTTTTATTTTTT:1 - chrX 3005522 5' - HMS-Beagle2 298 2 79.29 AGGAAGGTGGGGCTATGCGGTCCACTCCAAACTGCAATGTCCGTCTGGCTGACTGATGAGCTGGCCGCCCGAGTGTCGCCTCTGGTTTTGCTGTTTGCTGATTTAGCCGCCTCCAAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 - chr2R 24225950 5' + 297 63 2 77.40 GGATGATAAGAGAGTTCATAAAGGCAAGCAAATATTCTGAATTTGGTGCAAGAGAATTGTATGTATTATAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2R 9868877 5' + roo 8714 2 54.48 GGGCATCTGAAAACGTACACACATTGTCAGTGGGTCCGTGGTACCATTAGGAGACCTATAAGTTTTAACTATAGGCTATATACTACTGCCTATATGCGCATATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGA:1 - chr3R 28889750 5' + opus 14 2 70.55 GAACCTAAAACAGCTGTTATCCTGCTCAAGTAAGATCCACATGCTCTCTTTTCGCTCACGTTCTCTCTCCCGCGCGTTAAGCACGGACACAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCTCGTCG:1 + chrX 7967168 5' + P-element 10 2 75.81 TAGAAGATTTAATTTTAAACTTTAGGCATCTGTTAAGATTAGTTATAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1 + chr3R 8914262 5' + pogo 70 1 67.12 ATTCCATTTGATTCCATTCGATTCGATACGATTCGAGCTGAATGCTCGCTCGATGGCTGCTGATGCTTCTGCGGCCATTGTGCCAATTGCTCTCGTGAATTCCGAAACGACACCGTGAC:1 + chrX 3626665 5' - Rt1a 134 1 76.47 CAAGTTTGCCCCACTCCGACGAATCGTGGTTTTCCTAGGGGACGGTTATTGACTTTGCAGGTAAATGGGACAATGACTCGTAGTTTGTTGCCCACTACAATGTGTAATTGTTCCAGGATATCCGGCTCGAAGGACCAAAA:1 + chr3L 15907162 5' - GATE 273 1 77.86 TTGAAATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chrX 4214458 5' + jockey 71 1 59.59 CATCAAATCAAATTTTTGCCTCCATTTTGCGCGTTTAATTTGGCCCCAGCTATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chr3R 23668528 5' + pogo 60 1 61.64 CGAGTGAGAGAGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 - chr3L 5179212 5' + P-element 68 1 30.47 CATATGTATAAAATATTTAGTTCCTAAACGAGGAAGCTTAAGATAAAATAAAGCATTTGAAAAATCCCAAATGAGAAGACTTAACTCGTTGAGTTTTTGAAAGAACCTGATTT:1 + chr3R 12609999 5' - roo 9037 1 47.79 ATTTACTATGCCATTCATAAGTCTACCAACTGATTCATATGCCCCGCACCCACGCGACCCTCACTTATGCAAATCAGCAGTATCACAGAGCTCACGAAAATTAATTACCACTAAAACAGCACTGCGAACAACGCACGAAAGAGAGA:1 + chr3R 26437900 5' - Cr1a 221 1 77.40 ATAGCTTAAAGGAAGTATATTAATATTTTTGCTTAGTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGACAATAAGTAA:1 + chr2L 19817754 5' - G4 3814 1 39.73 CGGGAGGAGCTCCATATACTGCCATATGTGGCAATATAGGCCAGACGTTGTGGGCCGACCAAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3R 18517931 5' + roo 8721 2 57.53 TATTGACCCGAATGCACAACCAACTTACAGCACGGAAATATTCCAAGAGAAGGTTACCATCGCAAAGATTACAGATGGATGTGGTGTCTTTGCTGATAT:1 - chr3L 27267290 5' - Ivk 412 1 54.55 ATGTGGTTATCCCAAACTGAATACTCAACCGCTTTTTCACCATTTAGCCAACTCACACACACACACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGGAGTCGAGTCAAATGGCGCC:1 - chrX 6379097 5' + hobo 302 1 54.48 TAGGGCACCAGTTCCCTGCTCCGAGATCCCTGCTCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATAT:1 + chr3R 28774109 5' + blood 176 2 67.31 CTGCTTTGCAAATGCTCGGGTTCCGTTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCGGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 - chrX 2518117 5' + P-element 63 1 41.78 GATTATTGAAATATACTGGCGGCGAGTGCCATTTGATGAGGGGTAGAACCAACCCACCTTGATATTTGTACATATGTTGGCATGTGTGCACACCAGTGGCACTTAATCAACGCCCACGCACGTATGCACACACACACACACACACA:1 + chr3L 10552254 5' + accord 182 2 82.19 CGGAGGAAGGTCTTTTAGAAATGCTTGTTAATAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chrX 11267724 5' + roo 8752 2 78.77 AGTGCGACACTGCGAGAAATAAGTGTCAACTGTTCGATTAAACCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCAT:1 + chrX 15565519 5' + transib2 77 1 72.60 AATTTTAACAGAAAGGTTTTCGAGATCACGTAGTACCAAAAACCAATCTACATATGTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTAT:1 + chr2L 21673424 5' + HB 72 1 65.07 CAAAAGTGTACTAGTTTTTAGAGTATTTAAAATGGAGCACTCGGATGTGGCAATTTATCATGATACGAATTTGTTATTATTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTA:1 + chr2R 13212187 5' + diver 5930 2 54.79 GAATGCGGCAGCTGAGCAGGTCGCTCTCGCTCTTTACCGTTGGTTACGAAGGAGAGAGAGGCAGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr3R 5264926 5' - P-element 2841 1 50.00 GCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGAC:1 - chrX 21636235 5' + Stalker2 7336 2 79.58 TTTCGCTCACGTTCTCTCTCCCGCGCGTTAAGCACGGACACAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chrX 7967217 5' + P-element 64 1 34.88 CATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGGAAACAACTA:1 - chr3L 23702234 5' + G4 84 1 70.55 AGAGGTCCTCGAGTGCCCAACTTGGCAAGTGGATTCTTCACTTTATGACCGGGACGAACTCAACAGCTTTACGGATGGATTGAAACTATTTCGAACAAGTTTTATTTGTAAGTCTCTGTGTATATTCT:1 - chr3R 11924025 5' - Doc3-element 4439 1 74.22 TTTGGTAATCCTAAAAAATAATAAATTACTGGGCAGAGATTGGTTGCAAACTTGTTTCCTTATTCCGCTTATTTCATGTTGAACGTAATATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAAT:1 + chr3R 14373308 5' - Stalker4 6965 4 60.27 TATGCAACACTTTGTGGGTCGTAATAATCTTTTGGCCAACTTCATTGCCATGGCATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chr2L 20938015 5' + jockey 4718 1 56.69 AAATGGATAGATATTCAAGAGAACTTGAATATGTGTCAGGGAAAATATAGTGAAACATCTTTGGGGCACTACAAGTCGATTAGCATTTGCATAGTAAAAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chrX 18190480 5' - hobo 2928 1 74.44 GGGGATATTTAGTTGGGAAATCCGAAATCCGTCAGCCCCAAGAAGTATGCTTCGCATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr3L 13362789 5' + jockey 24 1 72.60 CTTGTTGGCCATGTTGAGGCAACTGTTTAGTGCAACGAGCCGCGACAAGTGCATAAAACACGCCCAAAACGACGACAAGTGCGTTGTCAATGTCTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr3L 815052 5' + hobo 26 1 67.81 CATGATAACGTTTAAGCAAGGGTTTCTTAAGGCTTCTTTCTTAAATGCAATATAACTTAAATGTTAGTGTTCAAAGTTGTGAATACAAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3R 5762066 5' - roo 9039 1 63.70 ATGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr3L 2184968 5' + jockey 70 1 60.27 CGGTTGTGTTAGCCCGAAAAGCGGAGCTTTTTACGCGCACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr2R 12069552 5' + Tirant 8122 2 69.37 TGTGTTTTATGTTTAACTTTCTTAGAAGAATATATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCATGCGCCATAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCACGGGTAG:1 - chr3R 3953131 5' + invader1 115 2 68.06 GCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATA:1 - chrX 21667961 5' + gypsy2 6509 2 71.31 TACATATGTATAAAATATTTAGTTACTAAACGAGGAAGCTTAAGATTAAATAAAGCATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTG:1 + chr3R 12609997 5' - roo 9006 2 61.64 TTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 14494102 5' - roo 338 2 67.12 AAACGAGATTAGTTATAGAGCAAACCAAGCAAACTGTCTCATAGTCATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chrX 19113484 5' - 412 7472 2 67.12 CTAATCCAATTGAGGGCACACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chrX 22834571 5' + Tirant 34 2 76.00 GCGAATGTGTTCTACCACAAGGAGAAGCCCCACGAAGAGAGATCCATCCTGGTGGACTTCCAACTGTGTCGATATAGCCCACCTGCCATGGATTTCCCCTAACCTGGAAGGGATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCT:1 - chr2L 21083359 5' + jockey 495 1 67.86 CTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACAC:1 - chr3L 24208208 5' + Quasimodo 61 2 64.38 TCTTGTCCCGAGTGCGTTCTACGATAGAGTTAATAGACATATATACAAGAATATATAAAAATGAAATTTGAAGTTGTAAGTAGGGAAACTAAGTAATACAAATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGTCTTTTTATTCCACTTAT:1 + chrX 21626873 5' + HB 81 1 55.48 CTAGCGAAGCTTTCACTCAATTTGGAAATCAGAGGTTAAATACACTAGTGGGCATAAGTATTAAGACAAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTCATTGTTTACTCAACTTAAGGAAAATTGTTGAATAATTTTAGTAAAT:1 - chr3R 15139864 5' - Tc1-2 1545 1 77.40 TTTGTGAAGTACTCTACTTCCACACCACAATGGAAATGGTTTCCATTTCGGGAGCTTCGCATATATACTTAAACAAACTGTTTGAGAGCCGGCGTTCGTCTTGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCG:1 - chr2L 19418081 5' - F-element 203 1 64.12 CATTGGTTTGTATTTAAGTTATTAGGGTATTCGAGTAACTTATTTATTTATTTGTAGATTTCATGTAATATTGTGCCTGGAATTTGACAATATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAT:1 - chr2R 14722795 5' + mdg1 32 2 63.70 AAAGCTGCAGGGAAAAGGATGGGAATTAATGGAAAGTCGAGGCACGAGAGGATTTCTGGACTCTCAATTAGCTTAAAAAATAATCGTCAACTCCGACTAAGAGTCGTAAAATATATTCTTATTACTTACTCTGCCAGACCACAAGG:1 + chr2R 13715578 5' + Gypsy6A_LTR 245 1 54.11 GCGGGATTAATTTAGATTGTGGTCAAGTGAATGATGTGGTAGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr2L 18953106 5' + roo 8727 2 72.87 TACACTGAACTTAACTAGTTGATGAAATATGCGTACAGAATTGCAGTATTTTAATACTAATTAAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chr3R 32032113 5' + 297 54 2 61.64 ATTTACAATGCCCAAAGGTTTCCCACACACACACACACACACACACACAGGCACACCCATGTGCACACACACACACACA:1 - chr3R 8497710 5' + accord 180 2 59.49 GGGGAAAAGGGGAGTGTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr2L 9319090 5' + jockey 73 1 61.54 GTTTCATACTAAAATCCTAGAAATATAATGACAAATTGTTTGCTTAGAACCTTATCAAAGGAAATGATTAGAATACTCACGAATGTATAAGTTAACACAATCACAACACACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 + chr2L 7939712 5' + Burdock 19 2 64.34 CATTAGAGCATCTCGACCCACGGAGGATGCGATGGAATATATCGCGGGCTATGTCATTAAAAAATTGAGAATCAGTGACAAAGTAAAAGAAAATTTGACATTTACATACGTCGACGAGGTGTCTCACGGCGGACTTAT:1 + chr2L 13690219 5' + P-element 2417 1 17.39 TCGGTTTTATAAATTTGGTAGTTTAATTTTTATTAGTCCAAACAAATATCGGATTATATTTTTGTTTCAAGTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGCAATATC:1 + chr3R 4661914 5' - roo 359 2 52.74 GGGGAGTGTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr2L 9319098 5' + jockey 83 1 67.59 ATTGGGTAATGCCCTTGAGTAAAGATTTATGTAAATAATAGATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGAT:1 + chr3R 11146374 5' + flea 46 2 69.09 TAGAAATATTTAACTAAAAAGCTGAAATCACTGATTAAGCATTAAATAGCTTGTGTAAAGTCCAATCTATATATAAACATTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3R 8596319 5' + hobo 39 1 57.53 GATTTCATTTATTTATACGCCTGTTTCGCCAAGGTTTCCCCGAGGATGTTTGCCTAAATCTTAAGCTCAATTTTGGATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCCGAG:1 + chr3R 23109879 5' + INE-1 552 1 59.65 TAGAGTAATATCGAAATTCTTCGCTGTAATATTTCTATCAATAACCCAAATATTTGCCTAATATTAATAACGCTCTAAAATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr2R 9455801 5' - 412 7509 2 60.27 CAATATGACTTTCTTTTTTTTCTTTGACTTTTTAAGGCAATTATCTTGGCACTCTTTTTTTGAATATCCATCTAAACAATCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACC:1 - chr2R 10360505 5' + F-element 4239 1 54.79 GGGAAAGCTAATGTCTTGACCATCACACCCCACTGACCGAGATCATAATTCATGGGGAAAGGAAACCCAAGACAAATCGCATGTGTAATGTATGCTGAATCGCGACCTTCTAGCTTTTATGAGATCTCGACGTTCATACGGGCAG:1 + chr3R 21861827 5' - INE-1 131 1 60.69 GGTGCCACATGGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGAATTTGCCTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAA:1 + chr2L 7271834 5' - 297 323 2 70.34 ATAGTTTTATCAACGGAGGAAGGTCTTTTAGAAATGCTTGTTAATAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:2 + chrX 11267711 5' + roo 75 2 69.86 AAGGTAAAAAACAAGAAGTTGCTTAGGTAGAAGAATTGCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAT:1 + chr2L 4028970 5' + blood 168 2 71.76 AGTTTATTTTCATAGCTTATGACAACAACGTTGGCTTACTTGCTTTGCCTCCAGCAAATGGTAGCTCTATAGTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:2 + chr3L 10442802 5' - roo 359 2 52.74 GTACGGTTATAGATATGTTCATTTGCACCCCATAATATATACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 + chrX 19005324 5' + F-element 32 1 53.42 CAATGGCTAAATGACTGAGTGGCCAAATAGCAATGGCAGAGTGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATATGCGCAGTTCG:1 + chr2R 7889384 5' + jockey 86 1 66.44 CAGGGACAAAGTCCAAGACTATACAGTGGAACTTGACTTTAGAGGCGAGGAATTAAAAGAAAATCATTTAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3R 30782494 5' - pogo 2075 1 61.79 ATCATCAAATCAAATTTTTGCCTCCATTTTGCGCGTTTAATTTGGCCCCAGCTATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chr3R 23668530 5' + pogo 57 1 60.00 GGACGAGAAGTTTGGCCGAAGACCAAACAAAAGGACAGTACATCGCTGGACGGCATGTTAATTTGTTAGCTTGTTGAGTTGCTAACCAGGATCCGATCCGAGGGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3R 10461798 5' + roo 16 2 71.72 CAAGACATGATCACACCTCAGCTGCTAGACAATTTAATCCATTCTTCCTTTATCTGCTTTGCATTATCCAAAACAGTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGAT:1 + chrX 21581328 5' - Tabor 7279 2 47.26 GTGGAAAAAATGGAGTAAACGGACAAACGGAAAAACGTAAAAAAATTGGGACAGGCTCGCACACAAACACACCAACTGAGGAGGAGGGGAGGCGAAGCAAGTTTGTTGACCCATGTTTTCACGCCCACTCTAACGCCCACAAACC:1 + chr2R 8383188 5' + INE-1 219 1 68.28 GGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAAT:1 - chr3L 9762263 5' + jockey 4818 1 57.53 TTTGCGCACGCATAAATGAATACCGAATAATGGACGTGCATAATGGAATCATTCTTCGTATACCCTGGAACAAATATATTCAAAGGAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2R 12813806 5' + roo 8695 2 58.90 TTTACAATAGAATATTACTTAATAGACAATCTTTCGTTTCGCTTTGTTTTTTTTTATGACTCACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATT:1 + chr3L 7790661 5' - copia 195 2 60.27 AGCAACAACAATCCGTCGAGGTCTTTTCAGCGATAATCGCTTCGAGTGGCATTTCAATGCAAAACATCGCAAAACTATTTTTCCATTTAAAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTAGAGTATTCAT:1 - chr3R 9943150 5' + 1360 404 1 60.27 GCTATATGGCTATATGGCCTCGTTCCTTCTATAACTTTTCGTAACGATTTTTCTGCACAGCCCAGGCCAAATATAAAACAAAACGAAAAACAAAAAAATACCAAAAAAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATC:1 - chrX 10692595 5' - Ivk 219 1 75.34 CACTCTAATTATTTTATCTCTAATCCCAAAATAGTCTATATTTTATACCACACTTTTGATAAGTTTCGAATTACATCATTAATTATTATAATTTTTTCGCATTAAGCCCTTCATTTAAATAGTAAATATCCGATCAAAATACTCCC:1 + chrX 16237067 5' + ZAM 365 2 44.52 CCAAGAAGTATGCTTCGCATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr3L 13362752 5' + jockey 62 1 52.74 AGAATCAATTAGAAAGACCAAAAGCAAGCATTCCAAATAAAACCCTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACAACTTCGACTAGGACACACAA:1 - chr3L 17207030 5' + I-element 4944 1 62.33 CATTGCTTAAATCCCATGCCCAATTGAATAAATTCAAAAACGAATTTTTTTTAAGTAAGCCATGTCAGGTTAGACTATGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGTCACTATGCAGCCACTT:1 - chr3R 4422076 5' - 1360 3346 1 54.48 TTACGCTTTCAATGGGCAACAATAATGGACAGTGTGCTGCCTCTAGTCTTCTTCTTCTCGCTCTTTGCGGCCATAATTTATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCCT:1 + chr3R 16228801 5' + P-element 23 1 63.08 AAATCACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCATTGCTA:1 + chrX 10128177 5' + invader3 79 2 60.27 ATAGGGTAGGTAAGTCACCAACAAGCTCTTATAAATATGATTTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 - chr3R 11978329 5' - Transpac 5173 2 70.87 GACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCGCGAGTTAACATTACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTAAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTG:1 + chr3L 25232771 5' - accord2 125 2 69.18 ACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chr3L 16463519 5' + roo 8753 2 79.45 TGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTAT:1 - chr2L 23295873 5' + micropia 153 4 63.70 TAAGTCATGGGAACAGGACATACCACTTCAAGAAAGGGAATATTTTTGTTGAAATAAATACTGCATTTTGCGTAAAACGCATACAACTTGTTCATAATTTATTTATTTAATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAAT:1 + chr3L 16271839 5' + jockey 109 1 67.81 GGAGATCGTTCCTAATCTTAATCTTACTTTTTTATATAGAACAAAGACAATGGAATCAAACCAAACTTAATTTCTTTTGACAAAAGGTCAAAAGATTATTAATGCTTAGGGACAAATATATATGTCGGCGAGACAGGAGTGTCATC:1 + chr2R 10305262 5' - invader4 3082 2 80.14 CACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGTGGGAAAAGCAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTA:1 - chrX 19113566 5' + 412 67 2 60.27 AAAATGTGTTGAAATTTTTTCATTTTTGATTAGTCTTGTAAAAATCTTGTAAAAAACTTTTTGCAACTCCCTAAAACCGCCCAAAACAGCCTAGCTGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGTATTCTCTCTT:1 + chr2R 5466808 5' + INE-1 577 1 35.62 TAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGGGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGC:1 + chr2R 4260435 5' + micropia 5201 1 40.83 GCCCGAGAGAGAGAGGGATGGCCATGTAAATGGGAATGTGGATGTGAACGTACCCACCATGGCGGCACCGGAAAATGTCCAAGTCAGTGTCCATTGAAGCGGAGCAATATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 - chr3R 22624827 5' - blood 7376 2 74.66 AATTTTAATGAAATTTCAATGATAATATAATCTTGCGGCCTTCTGTTTTCGTCTGCCGGCACTGTAGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 - chr3R 9193265 5' - opus 451 2 53.42 GTGTTTGTTTTCTCTGCATTCCTTAAGGAGGAATTTGATGAACACGCTTATATAAACTGAATGTCCCAGTTTATTTATCTAAGTACTTTAGTTAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr2L 20556382 5' - 412 7519 2 66.44 AAATGCCGCACATTTGGGAAACACTTTCAAACGATTCTATTTTCTGTTTCTGTTATATATATTTTTTTTTCTCTCGGTTTTTGGAATCAAAGCTTGCATTTTTCCCACTTCACTGTGCTCGACCTCGCTGAGGTGCAAAAGAGCTG:1 - chrX 15609759 5' + Helena 1021 1 54.11 CCTATCACATAACAAATAAATTAACGCAGCAAAATAAATATTATAATAGAAAGTGAATGATAATGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:1 + chr2R 9339640 5' + Transpac 4967 2 55.80 GCTACTCACATTTGCATATCAATTTGTTCGCATTCGTTCGTGTTATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATAT:1 - chr3R 25409872 5' + jockey 4557 1 56.00 AAGGACAACATATTTCTTGTCCACAGCGTGCTGTACGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3L 13545001 5' - hobo 2930 1 57.14 GTAGAGTAAAAGTGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGTAGGAAGCGTTTCTGACCATATACGCCCACTCTAACGCCCTAAACAAAGACACTAGAATAACACGATGCGTAACGGCCATACATTGCTT:1 - chr3R 2473817 5' - 1360 3365 1 45.65 AAACAATTTGCTATAAATTTGATAAGTATTAATATGCTGCGGTTGAGAGGAGCTCAGTTTGGCCTAAAAATGATAATTTATTGGTTAATACATAACGAATTGGTTCAGTGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAA:1 - chr3L 19438038 5' - copia 243 1 78.62 AATGCAATATAACTTAAATGTTAGTGTTCAAAGTTGTGAATACAAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATGTTATTTGGAAATATCTTCGTATTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3R 5762023 5' - roo 332 2 66.44 GATAATTAGTTTCGATGTTGATTCCTCAGATTAGTGCGAAAGAAGCACTTATTGATTTCGACGTAAAAACCCACACGTATCTATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 + chr2L 6319713 5' + Tabor 6878 2 54.79 AAATCACTGATTAAGCATTAAATAGCTTGTGTAAAGTCCAATCTATATATAAACATTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr3R 8596343 5' + hobo 63 1 58.90 GTACTCGTACTTTTTGAATTTATGCCAAGCCTCGATCCGAACAAGTTGGCTTGTACTTTATGAGCAAGTCCATTTTTCATGTTATCCTTCTTTATTTACATTCTTGAGCAAATTTACAACTTTTAGGCTGTTCATAAGAATAGTAG:1 + chr3R 27324552 5' + HB 205 1 50.68 TTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3R 14494095 5' - roo 331 2 71.92 ATTTAAAGATCGAATGCCAATCAGAACGTATTCCAGCGAAGACCTATCGCCAATCTGTGGCCCAAAAGACGACGACTGCAATCAGTCGTCTGCGTGCCAATGGCCAATGGCTTCACATAAGGCCATTTTTTTTAATTTTTTTAATT:1 + chr2R 10852818 5' - HB 321 1 77.40 ACATTGATGGCAGATACTCCCCCAGCTTACATATAAAAATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCACACCGCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chrX 20124499 5' - opus 7445 2 69.84 GCCAGCAGCAGCGAATCATAAGTTATTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCT:1 + chr3R 3590686 5' - pogo 2031 1 79.03 TACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTTTATATAATTTTATGCAGCTGTTCGCAGTCAACGAGTC:1 + chr2L 23295815 5' - micropia 366 2 77.54 CAAAGGTTGAGGTATCCCCCGCTCAGTGTACACCACCACCACCCACCACCCACAGCCCAGTACCGCCCCACCAACAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAGCA:1 - chrX 20023860 5' + gypsy7 5008 1 77.00 ATAATTATGTGAAAGTGAGAGGAAGGTAACACAGGTCCTGAATGGACGGGTTTAATTAATTTTTGTAAATGAGTTTCCAATTCAAAGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3L 18658176 5' + roo 33 2 62.76 ATTAAATAAGCTACAACATGCGGTACATTTCATTGTTGGACTCAGCTGGACTCACTTAAAAGTCATATCAAAGAATTATTCCAGTGTCTTTGCTTTGGTCACATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTG:1 + chr2R 5426559 5' - 1360 453 1 60.96 TTGAGCCTGTGGCAATGGGAACTTTAAAATTAGCCAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCAC:1 + chr2L 11079419 5' - 1360 3305 1 77.24 TAGCTTTCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGT:1 - chr2R 16073010 5' + Burdock 70 2 70.55 TACTTCCCGCATCGTTTTTGTTCCGACGGGTTCTTCGAGTGCTCCATCACTTCCATCCACCATTCCTTACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chrX 14346402 5' + roo 8683 2 64.91 GGCCGCAAACGCAAATAAATCTGAACAAAAATTCGAATTCCATCCGGATCAAACAAACTCACAAATCCTTTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACAT:1 - chr2R 9819956 5' + mdg3 5321 2 48.46 ACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTCCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAG:3 - chrY 2720347 5' + gypsy 49 2 54.11 AAAAATCGTACCAAAAAGTTAAAAAAAAAAACTAGAACGGCCAAAAACTGTGCTGTATTTTCAGAGAGAAAACTTTTTAAAATACACATTTATTTATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAA:1 - chr3R 27514781 5' - Ivk 5356 1 59.03 ATGTAGTATGTAGTTTATAGTATAGTATGTTTATAGTGATATATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTC:1 - chr3L 11576296 5' + HMS-Beagle2 76 2 70.55 GGGTAGAGAATCAATTAGAAAGACCAAAAGCAAGCATTCCAAATAAAACCCTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGAC:1 - chr3L 17207036 5' + I-element 4938 1 66.44 TTTCATATTCAGAGTAATCTTATGCTAAAGGCGGTTGCTACATTTTTTTACTTTTCTTATTTTTAATTATACAAATTTTCTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCT:1 + chr3L 23277055 5' - invader2 4682 1 67.19 TTTGCAAATTGATATTTTATTGCCATTTACCTTTTTCTCTTAGCTCGGTGTTGTGGCTTACTGCGATTGCCAGACGGTAATTTATAAATCAATTTCAGATTTATGTAACATGGAGGAAGGCTGAAGGCTGGCAACACCCCGGTTGG:1 + chr2R 13471293 5' + flea 21 2 71.23 TAGCATTGACATTTAAATGTAATGAAAAGGTTACAGAAACTAGAGAATGGAACGATTTCTCAATTGAATATTTTTTTTAGTCAAGAAACTGTTAGCGTAAATCAAAAGAAATATGACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chrX 10287137 5' + roo 5 2 66.44 CAGCTGGACAAATTATCATTCTTACATATTGGGGGGAAGCCTGGGAATAAGTGAGGGTTGCGTGATAAATTCCCTGCTTTGGCCAAAACCAATATTAATTAAAAACAAGAGAATGCTATAGCCGACTTCCCCGACTATCAGATACC:1 - chr3R 31970324 5' - INE-1 557 1 55.48 ATAAGCACAGCAAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACACAATGTCTTAAGCTAAGATGAATAGAATAATGACGTGATAACTATTTCTCCGATAATTTTAGCGTTTTCATTAGTCAACTGACGGGACCTTAGTTCT:1 + chr3L 25008303 5' + 297 6947 2 75.56 CATTGCAATGAGTAAAATGCGGAAGCAAATCTTGCGACACATCTGGAAATAAAAAGTAAATGGTCCGAAGAAAGGCAAGAATTGTTAAGGCAATTTCGGAATACATTAAAAGGGGCGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:2 - chr3R 26244778 5' - copia 249 1 78.08 CCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTACAGTCCACTACTGTTATCAATGCAACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 19449420 5' + roo 23 2 71.92 TGCTGCAAAAAGTTACAGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGTGA:1 + chr3L 5179180 5' - P-element 2785 1 14.38 GGGGGGTTTCTAACGGAATTCCTTTGCTCACGCACACATTGAAAGGAGGTTCGTTAAGAGAGAAGGGAACCCAAAAATGTATTGTTGTAGTCCGTGTTTGTTGGCGGCATCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chrX 16526413 5' - P-element 2877 2 78.08 GACTTGCATATATGTACATATATTATTTAAAAATTCCATTTTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 - 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I-element 5349 1 73.97 ATTTTACAAATCGATAATAGCGCAGCCAATGAAATATTTATGCATTTCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr2R 10600100 5' + 297 47 2 59.31 ATTACCATCATTCGAGCAATCGAGTATCACAATGCAGTTATTTATCAGGAAAACACAACCTTATTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGT:1 - chr2R 24114787 5' + 1360 454 1 56.85 ATAATTTCAAACTTCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCACGTTCCACTTGCATC:1 - chr3R 19721219 5' - opus 7497 2 76.81 AAAGTCTATAGACCAATACAAGGTAGGCCCAAACTGAATTAAATTTATAAGAATGGAAAATTTGAGTCAACTACACTGCTTAACTGAGGAGCAAGTGAAAATGTATTAGGGGAATATTGTAAAAAATTTAAAATAAAATAAAAAAA:1 - chr3L 14813248 5' + TART-C 11098 2 44.52 TTCTGAACTTCGAAGAACTTCAAAGAAGGCTTAAAAATATATGTTCTTAATTTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 - chr3R 29622744 5' + pogo 66 1 67.81 CATCACCAAACTTTATTTATTGCTCTGTGTTCACAAGCAAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCA:1 + chr3R 30559058 5' + I-element 5220 1 73.29 ATTTTAACTGAAACATTTATCCACCAAAGCACTAAATTATTCCTGTCCCTATAGAGAACTGGGGTGAGCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - 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Rt1a 5006 1 56.43 ATGCAAAAGGCAAAAAGTGTAGCCAGCATTGCAGCGCTAAACATGCAAAGTGCACAAGTGCTGATATCTGCGCTCCTGTGAGTAATTGTTGGGCCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGTTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTA:1 + chr3R 24484701 5' - Porto1 326 1 54.79 ACATGATAACGTTTAAGCAAGGGTTTCTTAAGGCTTCTTTCTTAAATGCAATATAACTTAAATGTTAGTGTTCAAAGTTGTGAATACAAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 5762067 5' - roo 9045 1 66.67 GTTTGAGATGAAGGATTTGTTGAGCCTCGTATTATTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTG:1 - chr3R 30622052 5' - BS 5003 1 76.03 GTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATCTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2L 11867410 5' + jockey 10 1 78.26 GTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCT:1 - chr2R 5173196 5' - Stalker 324 4 75.34 CTCAATTTAAGCAATTTAACTTTACTATCAAGACTCTACATAATATTAATCTAATATTAAATCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 5761936 5' + roo 8724 2 61.64 CTTTTCTTTTTTGTTTTTTACTACTATACGCATATAAATAAATTGAAAACAAGAGGGAATACCAAGCTATGGATCTGCAATATACCCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:2 + chr3L 556365 5' - 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roo 9019 2 53.42 TAATATCAATTTGAGAGCGTACAAAAGAATTGTGCAAATAACGACGTAAGTGTACGCAGCAATATGGCTGGGAATTTATGTATTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATT:1 + chr3L 19335314 5' + invader4 2762 2 78.70 AACAAATGCAATTAAATGGTTAAAACATTTTTTTTTCTTTTTAATAATCTTTTTTTTCTTCTGCTTAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2R 12239723 5' + roo 8717 2 58.22 AAAAAAGATTACCAATTTGTATATGATAAGTGCTGAAATTCATTTGCTTATCTCGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr2L 10045286 5' + jockey 74 1 59.59 AAGTTCAACAACGAAATTGTTATACTAATGACTTAATTTCAGTTGTTTTTAACTTGAAAACACAATGGAATAAAGGATTCCTCTTGGGTTTATGTACAATTAGTTTGTGTTTGATTTATTCTTTTGATCTCAGCTTAAGACTAAAA:1 - chr3R 16294762 5' - 297 278 2 49.32 GTTGACACCGCATCCGTTAATTACACAAGCGAATAACAGAATCTTGTGGAATACCTGTGCCGACGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chr2R 18440397 5' + P-element 56 1 47.95 CAGGTTGTTTTCTTTAATTAATTGCTAAAAATGGTGTTGCATGTTTAACTTTAAAACTTTATAGTATTCCCTGTATCGTGCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTT:1 - 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roo 9063 1 76.43 TATAATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGC:1 - chr2R 21425160 5' + HMS-Beagle2 6940 2 59.44 ATGCATTTATTGTAATTGACAGACAGGCGGACGGACAATCTTAAGTGGACTTTACAAGTTACTGGACTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGT:1 - chr2R 8452844 5' - blood 7346 2 54.48 AGCGCACTTAAAAATGTCCAAAAGCGAAACCAGGTCGTCCTGTTGTCCAACTGATGGAATCTCTTTTTGGCCCAATCCCTGCGGCTCACTGGGCTTAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGATTAGTTTAC:1 - chr2R 9623456 5' - I-element 5340 1 72.46 GGGAATGCATTTTGGTCTGTTTTCTGGGCGTTCGTGCAGGCGATGCCTTACGAGAATTGTAGTTCTTTAGCTGTTTTTAATAACTACTTGGTCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGCTGAATTGACTGAACGA:1 - chr2R 16958319 5' + G5 4793 1 52.05 ACTCTCACTCTCCTCCTGCCTGCGCCGAGAGAGCCAGTGCCCTCTCTCTTGCGCTCTCACTTCTCTGTGTGATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chrX 16526254 5' - P-element 2862 1 62.50 ACTACGATAATTGCGAGCCAAAGTGGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCT:1 - 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chr2L 18960303 5' - gypsy2 6601 2 55.86 AAAGTCTTACATGGTGACCAATTACCTTAGACAATAAGAATAACTCTTAAGCTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATTCTTTAGTTGTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr3R 5453600 5' + I-element 30 1 65.07 GGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chr3L 19574036 5' + 297 6590 2 72.38 TCTTAGCTCGGTGTTGTGGCTTACTGCGATTGCCAGACGGTAATTTATAAATCAATTTCAGATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGGTGTCAGCGCTGTTG:1 + chr2R 13471330 5' + flea 32 2 55.83 TTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1 - chr3R 4532968 5' + 1360 64 1 63.01 GCTGCTAAAAAGTCAAGCTCCAATTTGGGCATCACTGAAACTCATGTTCCCGAGAAAAGCTAACCGTTGAGAAAGGCACTTATAAAAGGTATATGTCGGCGAAATAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTC:1 - chr2L 16509026 5' - invader4 3063 2 69.12 ATAGATGGCGCCAAACGGAGTTTGGCCTAGTGCGAAGGAAAACTTTAAGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAA:1 + chrX 20636943 5' + Quasimodo 63 2 66.67 GTGTGCGGCATTTTGTCGGGAATGTACGTAATTATCCATTGAATGCCGGATCACGACGACGACGACGATTTAACTCTTAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chrX 18737328 5' + I-element 41 1 56.85 ACACTGAACGCAAGCGGTGAAAAAGCGACTATGCAATAATAAGAAAAAAAGGCTGATAACTTGGCAATTTTCGAGTTAAATTTAGTAGCATTAAACTGAAAATCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAAT:1 + chrX 6077807 5' - I-element 205 1 68.49 AAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACAACCTCCGCCTATGAAGCC:1 + chr3L 25482893 5' + accord 33 2 51.35 CAAGAGAGAATGCTAAAGTCGAATTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGTGAAGGCGAACGCGAATGCGAATTTATCCTGATAAAGAATACATATACTTTATACAGTCGGAAACGCTTCCTGCTGCCTGTTACATA:1 + chr2R 1649123 5' - INE-1 29 1 57.53 GAAGCGTTTGCGACTATATCATCAAGTATATATCAGTATATAGATCAGGATCAATAGCCGTGTCGGTCCAGCCATCTCCGTCTGCCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATCAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAG:1 - chr3R 4947762 5' + INE-1 174 1 76.03 GAAATCCGTCAGCCCCAAGAAGTATGCTTCGCATTCTTCTTTATGGGGCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr3L 13362766 5' + jockey 16 1 70.43 ATTGTAAATTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATTAGTATGCGTGT:1 - chr2L 23295930 5' + micropia 9 2 76.71 ACTTCACCTTCGATCCCCCGCAGTCACCGAAGTCGGCGCGCAGCAGCGAAAAGTCCACTAGTCACTTTTCCTTCAAGAACTATGGTAATGAGTCGGCTAAAGATGCCGGAGTGTCCAAATGATTTAGTCTTCAAC:1 - chr2R 19327203 5' + Bica 4467 1 80.00 GCTAAAAACCTCAAAAAAAACACATTTTTCTCCAGTCCAATGAAGAGTTAAGATATTTTACCACTCCACTTCCCCTTTTCAAGCTCATTGTGATGTGTCGCAAGTAAGCATAAAAATAAAAAAAAGTATCAGACACAGCA:1 + chr2L 3402389 5' - ZAM 8191 2 57.14 CAGCGACAGGCAGATCGGGCTACTATATACATATATATATGTCTACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 - chrX 12214565 5' - opus 428 2 76.71 AGTAATTACTGATTACTTTTTTAAACAAATGTAAATTATATAAAAAGGAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCT:1 + chr3L 11903215 5' - opus 7433 2 71.23 ACAAACATAATCGAGTTTTGCTAGAAATGCTGGAAGTGTGGCCAAACTTTGCAATCTTTTGACGCGACTGTACTGTGAGAGAGCTTTCTTTGTGAAGGGAAAATACATGTGGACGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCG:1 + chr2R 10530539 5' - R1A1-element 337 1 78.77 AATGCATCTTTTTTAAATGTACGTTTAAGGGGTATAAAGGTGGAATTAATTAAAACCAGAAGAGAAAGCTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTGCAACATCATTCCTGGGTACACACAAGTG:1 - chr3R 4166105 5' + HMS-Beagle2 47 2 51.05 TTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGTTTTTTTTTATGTGCCTCGCTGATTGCGATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1 - chr2R 16891859 5' - jockey 4955 1 49.32 GAGTTTGTGTTTGGTAAGAAATAGTTAGCTACATTTTAACAATATATATTTGCGTGCATTAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAA:1 + chr3L 14593546 5' - I-element 4948 1 58.90 GTTTGGGGATAAGGGTAATCAGTTAGTATGTAAAAGGTAATTAGTTCGCTACAACTTCAAAGGCGTTCGGGAATTTAAAACTCCAGTAGATACATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCGGCCACTTCAA:1 + chrX 22738517 5' + 297 6597 2 80.00 CTTTAAAAAGCCAGGTATTACGTGTCTGTATGGACTATGTGGACTGACTCCCCGGCCAGAAGAAACCCACGACTTTCAAATACCAGCACTGCAGTCGCCGAAACAATCAACACATGTCAGCCTTCTAATTAGTTAGGCTATCCC:1 - chr3R 29720869 5' - GATE 106 2 73.61 GGGGGAATTATTTTTTGCACTACATCTGTTGGTGGTGATGGTGATGAGACCCGAGCCTGAAAGCATTCTGCGCAATTAAGAGGTTTACACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTGTTTACATTATCATTTGTCTGCAGCTTCAGCG:1 - chr3R 13515810 5' + 3S18 5827 2 58.22 CTATCATAAATTCCATTTTTTCTGTTGCTGCTAAGACAAAATGCCAAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1 + chr3R 28782574 5' - blood 302 2 69.86 CAGTATCAGCGTAGGTCGACATTCATATGATAAGCGTTTTCGAGGAAAATATTTCCTGCGTTTATCTAACTCTATAAAAATGTCATATTTTACTCGCAGTAACTTGTACAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 + chr2R 8452689 5' + blood 7024 2 76.71 CTTGGCTGGGAAAACTGATCAAGAATGAAGAAAGTGCCTTTTAACCCTTTAAGCCCTGAAAACTTCTGACTGGAAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATTCACT:1 - chr3R 5478067 5' + 297 6624 2 55.48 ATTATATTAGCAAACATACAAAATAAATTAAAACAAGAATGCTATGTCGAGATCGAAAATCAATTTGAAGCTCAACATTGTTGCCATATCTCAGTTAAAAGGCGACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGT:1 + chrX 20460506 5' + diver 19 2 69.86 GAAACAGAAAAATAATAACGGAACAATTTTAGTCGTCGTGATGGTTTTATCCTGGAGTCGAGTAGTAGACTTAAAAAGTCCCAGTAACACACATACAGTTGTCTGCTCTCACTTTATGCGATGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCAC:1 + chr4 938432 5' - 1360 126 1 58.22 ATGTGGGTGGCAAGTGGCAAGTGGCAAGTGGCATTGGGGGGCGGGGCAAATGGCTGAAAAGTGGGCGGAACTGGGTGGGTGAGAGCATTTAGTCGGCGGCAGCGAAACATCCCAGTGGCCACTCAAATATGCTGTGTTTGCCTGCT:1 + chrX 13041939 5' - Gypsy6A_LTR 95 1 69.86 TAATTGTCACGAGCAAGGAAACCGGACCGTCTAGCTTCAACTTCTTCGGTCGAATGCAACTTAGAAACTGAATTGAGGAATCGTATTTTGCTGCATTCTCTGCTATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 - chr2L 12678653 5' - P-element 2871 1 77.40 AAAAGTAGCAATTCGTGAGTGCATACGTTACTCGTACTATATTCATTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCAACTATATAATATATAATATACAATATATATATACTTTCTTGATCAGGATCAATATCCGGGTCGA:1 + chrX 21452120 5' + INE-1 94 1 69.86 TACAGCCCTGGAACAAACACACAACTCAAAGCTGTTATTTGACTATAGTTCGATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3L 21151094 5' + 412 68 2 64.14 CGGCGTTTTTAGGCCTGCTTCTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 + chr2R 16891794 5' + jockey 4697 1 54.44 TTTATCCCTCCGCCATAGCAAATTGCAATTTTAGCCGCTAAACGATTTTGTTAGCCCACGTTAAGGTAGAATTTCAAGAAGCAAAATCTTGTGTAAGCTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2L 3648855 5' + roo 8681 2 68.57 CAAAAATTGTTTAAATTTGACTATTTTGGTTATTAAAGTAAGTTTAAAAACATAATGATTTAAAACATTCAAAAAGAACTGGACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTATGCCAGAGATATCGAACGCGATCTGA:1 + chr2R 4887632 5' + jockey2 3018 1 73.29 GAGCCAGTCCTTGTACAAATTAGGACACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr3L 10564015 5' - hopper 1376 1 57.53 GACGTGCCTCAGTATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTG:1 - chr3R 4532992 5' + 1360 40 1 58.90 CTTTGGCATTCGCACGCCTCAGCGCATTCGCAATCCGAGTTCAAATCCATAGCATACTTTTGCGGGCGGCATGTTTAATTTATGGCCGTTTTTAAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 + chrX 19818390 5' - jockey 4967 1 64.96 ATCGATATTTTATAGGAATATCGATCTTAGAAATTTATTTTATTTTAAATTAAATGTTTCACTACCCAAGGGTACTTAGTTAAAGTATTATCATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCTCTGTCGC:1 + chrX 13384961 5' - opus 470 2 34.25 GAAAATTAATATCTGTGTCATTTTTTAGGTTAATAAGGCCAAATTGAGTATATGTGCCAGACACACACTTAATTATCATCATATTTATGGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGC:1 - chrX 20874414 5' + F-element 359 1 63.01 TATGGTTGTTGTTGGTTTGTGCAAGGTCGTTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 + chr2L 21250966 5' + P-element 73 1 26.77 AATGTAATTTATTTTCTTCAAAATCCAGCTAAATAGTGTTCCTAAATACTAAACTAAGTTTTAAGTGTATACATAACATAGTCATATCATACAAGATAAATAATAATTCATGGCCAGTAATAAACAATAAAAAACAATTT:1 + chr3L 15457150 5' - Penelope 104 1 42.86 CCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATATTGGGTAAACAAATGAGAAAAAATGTAAACATTTTTCAAAAGTGTGAGCGT:1 - chr2R 5321182 5' - INE-1 254 1 57.53 GCCAACCTCCGTACACAGTGTATATTTTCGACATTCAACAAATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chr3R 5868192 5' + jockey 88 1 71.92 AGAAGCATCAGCAGCCATCGAGCGAGCATTCAGCTCGAATCGTATCGAATCGAATGGAATCAAATGGAATCGCGCCAGTTGGGCAAACATTGAGAGGCTATTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGC:1 - chr3L 15423558 5' - 412 328 2 75.57 TTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr3R 6412060 5' + Tirant 12 2 67.02 ACTCTACTTATCGGTTGCACCACCCCCAAAACACTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTAT:1 - chr3R 29516547 5' - I-element 5270 1 76.71 ATACTTTCAAGTTAAATCACGTTTGACACCAGACTGTCTAGGAACGTCATGGGGATGTGTAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 - chr2L 9347576 5' - opus 440 2 58.90 CAACCCTTTGAACTTTGTGGACATTGTCACGGTTGCCATGTAATGTGGTAGATTAAAGTATTTATTTGTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGC:1 - chr2R 4345198 5' + roo 8768 2 53.42 ATTGAGCCCGAAACGAGTCTGAAACGAAATGGAATTAGGCAAATCTGCTTGTCGACTGAATGGGTATGGTTTTGGTTAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 - chr2L 1277923 5' - I-element 5314 1 56.16 AAATGATTCCACCTCTGAAAAATATGAAGTGTTAGCATAGAGGGGCCTACGCGGGATTCTGACGAAACGTAAAAATAAGCCTCAATCAAAGACACTAGAATAACTAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr3L 23219340 5' - 1360 3351 1 57.93 AGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3L 19574035 5' + 297 6630 2 56.85 CAAAGGCTAGCTAAATGAATAAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 - chr3L 20388237 5' + 1360 46 1 54.11 ATCTGACAAACTTGTGACGTTGCAATCTCACTCTTTTTTTAATTCTTCTATTCCATAACAAATATTGACTTATCCTAACAAACTATTTTTCTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 - chr2R 5772405 5' + FB 32 1 63.70 ATTAATTAAATTTTGCTTTTTACTAGGTTAAGACATTCTGTCATCATCTTATCAATTATTGCGATGGCGATCGCTACAACAAAAATAACTGACTACTCACATACGGACTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 + chr3R 1160030 5' - Transpac 5217 2 78.08 TTTTGTGTAATAAATAGTTTCCTAGAAATATATATTGGTTGCCAAGGCCTAATGCACTGATACTAATTTGCCGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTTTGTGAGCTTTGCTTATC:1 + chr3R 5115274 5' + Ivk 47 1 52.11 AACATGTGATTTGAAATGAGATTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGTCCCCGTCAGCATGCGACTC:1 + chr2L 9347504 5' + opus 64 4 79.31 AAAAGTGACTCAAATCGTTAGTTTTGGATGTAAGCTGCACAAAAAAAAATTAAAAGTTTGAAAAAAAATAAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chr3R 27090637 5' - pogo 2052 1 58.90 GACACACATACGAGTGTGCATGTTAACGTTCGAATGCCCGATATACATATGAATGTTTGTATGTATGTAGTACATACTAAGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 - chr2L 470325 5' + Burdock 6174 2 59.59 ATTACTTATATTTTAAGGTAAATAGAAGTACAATAAATTAATAACACACATAACATTAATAAAATGTTGTGCACCCATGTAGCGACCACAAGGTGGAGCTCGTGTGCCAGTTATTTAAGCTTAGTACCAGGTATCTGATAGTCGGG:1 + chr2R 8777918 5' + INE-1 552 1 70.55 CGAGACATTAAGGTTAATTAAGGAACATAGACATTCCACTACACTTCAATTAATAATCCTAGCAAAATATTTATCCGAAATTAAGAATATTGAATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - 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chrX 18353591 5' + jockey 64 1 57.55 ATGCTATAGAACTATAAAACATGCCGGGTTTTACTATATATCCCGCTAAACCAGTGATAAGAAGCCGCGTTCTAGACCAAACCCATATACCAACTACCACGCCTTTTCGTCAACCTCAAGCGTCAGGTTAGCTCTTTCGCCATCG:1 + chrX 1786641 5' - R1-2 371 1 68.28 TGGCGCCAAAACTAATCAAAGCAACTAGGACCGACGCTAAATCGAAACCACAACTACAATCACTGCGGAATACCAAAATGCAATCAAAATATGCAAGCCACGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 - chr3L 14551435 5' + P-element 21 1 71.23 TCGAGCACTCATAATCTAGTTTTTGGCCATAAAATAGCTAGATTGTTTTCACCTGCTCTTAAAACGCTCTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGAGCAC:1 + chr3R 5264816 5' + P-element 52 1 50.00 CATGTGAAAGTTGAGCCTGCCTGGGAGAACACGAAAGCTCAAAGTGAATTTTCCTTTCATTTGCTAAATGTTGTTAATTGTATTCAGTTTCGTGATGACTTCCTCCAGCTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTAT:1 + chr2R 8966100 5' + BS 5010 1 72.60 TGGCAATCGTGAGCGGTCTTCAAGCAGTTTGCTATAAATGATTACCTAACGTAAGCACACCTCGAAAATATGTATTATGTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chr3R 17467068 5' + I-element 39 1 56.16 CAATCGTGGGAAAGGGAGGGCGGGAAGCGAGCACTGAGTGGTCCTACTATGTGGCATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATATAATA:1 + chrX 561034 5' + jockey 4919 1 61.43 CGAAGCTGTGCTGGCTTTTGAAAATAAAACGGCTAGCATAAAGCATAGACATACGCTCGTAACAACATAGGTGTGTAGAAAGGAGAACGGTGGGTAATATGGCGGCGCCCGTGAGAATGAATA:1 + chr3L 17728159 5' - 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roo 361 2 57.53 ACAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTG:1 + chr3L 7319825 5' + 1360 466 1 73.97 GCAAGTGAAGCAAATGTGAAGCAAGGCTTTCCTTGAAGTCCTCATCCGGGACAGAGTGATGTACGCCTCGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1 + chr2R 5640697 5' - 1360 3336 1 53.42 ATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAAT:1 - chr3L 23702280 5' + G4 38 1 55.48 AGTAACTTTTGGGAGTATTTTTCAATTTTCAACGCTCAAAATTTGCCCTTATCGCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATCTGGAAATATCTTCGTGTTAAATAGGTG:1 - chr3L 21170958 5' - roo 342 2 58.33 TAGGTTTGTATTGACCTCACCCACATTACTCTATTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr3L 18034631 5' - Transpac 5169 2 73.77 AGCGAAAGGCTAAACCGTAAATAGGCTTGGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTCAG:1 + chr2L 7449722 5' + roo 91 2 81.51 TTATTTAATAACAAACTAAGCACAAAGCAACTGCGGGCTGCTCTCAAAAACCGAAAAGCAATCAGCGACTAAGCTAATACACTCAGCTGAGCGGAAATATCGGATTTAACTTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCC:1 + chrX 6497183 5' - 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chr2R 12239854 5' - roo 9033 1 55.48 GACCTTAGCACAACGCACGTATTTCGCTGACTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3R 24976206 5' - roo 9010 2 59.59 ACTAATGAACTAAGGCGTTTATTTATGCAAAAGTTGAGACCTCAACTAATGGGTCGAGGACATCAAAGACAGGACTATGGCTCCCTCACACATGACTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTGCCAAAGTTAAGTACATAAGAGCAA:1 - chr2R 21757065 5' + Tabor 249 2 59.59 CAAACAAATATCGGATTATATTTTTGTTTCAAGTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3R 4661952 5' - roo 8985 2 78.77 CTTGTTTACGCTTTACAGCGCTGGCAAATGTTTGATCGAATGTCTCAACGCACATATTGACATTGTGATTAGGGTTCGACGGAAACATTCTTTCAAGCAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAA:1 + chr2L 5256615 5' + invader2 486 1 71.23 TTTTGTTTTTTTTATTTTTCGCAAACAAGCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATAT:1 + chr3R 17059290 5' - hopper 1324 1 79.45 CATCCCGATCTTGGCGAAGAGTTTGACGCACTGCTCGGACGTGCGAACGCTGTTGTTGGTCAGGAAGGTCAGCTGCTTGCCCATCTGCTCGAGAGCGGCGTATCCGTCCAATGCTGGGTCAGCACATTGTTAT:1 - chrX 11874097 5' - Gypsy6A_LTR 52 1 78.20 ATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 + chr2L 23372630 5' - 1360 3333 1 71.92 ATCGGGCATCAATTTGGTACAGGCTCATCTTTTGTCGCTTGAAGTCCGCAAGGAATTCCGTATTCATTCTGACATGCACTGTATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCGCGGCTCT:1 - chr2R 12814962 5' + opus 33 4 58.90 ACTTGAATAACTTATATAGTACGAATGTTGATAGTTGTGTTCGCTGTGTGTTTTCTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 + chr3L 15859567 5' + I-element 13 1 76.03 AATCCCCTGATTTTTCCCCTAGTTCGTTGGCGTTTTTGGATGCAACTTGGGCAGTACGTGCCACTGTAGTTGCAATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTCTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAAT:1 - chr3L 15853593 5' + jockey 4806 1 52.05 AATACATTACTTTATTTATGTGCGTACCGATATGAAAAACTCTTGGTGCATTCCATCACAGTTAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTC:1 - chrX 4540710 5' + 1360 50 1 54.93 AGTAAAATACTCATTCATTTCCAAGGTAGTATTTAAACGTACATATAACCTATATTTTTAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 + chr2R 25252146 5' - 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chr3R 24394002 5' + R1A1-element 4888 1 53.42 ACCACGAATGTGTGAAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGA:1 - chr3L 14040967 5' + 1360 75 1 68.49 TCCCCTCGTTCTTTTTCCCATTTCCCTTTGCCTCGCGCTCTCGCTACCCCCCTTTCTTGTGAATTTTCAATTAAAAGGCGCTTTTCCCACATTCACACATGACTTTACTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACTCACTGT:1 + chr2L 11922822 5' - jockey 4976 1 63.01 CAAGTTGGTGCTGTTAATTTTTTTTAAGGGGAAAGGAAGAGGATACATATTTTAGAAATTTATTTTGTTATGATATGTACATGGATTTGGCTATTTCTAATCTGTTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATT:1 - chr3R 11606559 5' - 1360 291 1 65.75 TGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCGTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGTCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chr2R 9339713 5' - Transpac 244 2 74.36 GAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chr2L 19643582 5' + hobo 67 1 80.00 CTTTGAAACTGTGTAAAGAGCTTTAAAGGTCTTATTTTCGACACAATTTCACACATTTCGAAGCTGTGAAAATGTCTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr2R 11595941 5' - P-element 2843 1 52.74 GAGCAGTTTTAAATGTTTAATAATATTCATACTTTAGTCTATGCTCAGGGGAATTAGTTAAAATTATTAAGATTATATTATTAAGCTATTATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2R 12239866 5' - roo 9045 1 63.70 TGTTAAAAGTGTGGGCGGCGTTTGAGTGGGCCTTTTGGGGTGGCAAAGTAGGTGGTGTGTTGGATTTTCAGCTTTTGTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTC:1 - chr3R 6414265 5' - P-element 85 1 56.03 TCCCTATTATTTAACGGTAAGTTTCAGACATAGGGGTAAAGATTTTTTATTTTCTATTGCCAACATTACCAAAATATGAATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGGCATTTTTTTTTAAATAATCATTCTATT:1 - chr3L 14944701 5' - G5 4835 1 78.77 ACTAAACGAGGAAGCTTAAGATTAAATAAAGCATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3R 12610021 5' - roo 323 2 78.72 TATTGCGCGGACTCATGCTTTTCTCTGCTCTCTTCTTTGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGGTCGTGTG:1 - chrX 850123 5' + jockey 90 1 69.86 GGCAGCAACATGTAATTTCTTTAATGGTTTTTTCCTCAACCCCGTTCCTCTCACCGGGCCACAATTCAAAACGAGTGTGTCCGAAAATAAATGAAATTAAAGTAATTGACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTT:1 + chr3R 17550217 5' + R1A1-element 163 1 65.07 CGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAG:1 + chr2L 22719587 5' + 1360 53 1 66.94 CATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGC:1 - chr2R 1949126 5' - Cr1a 4397 1 79.38 AAAATTTGAAGCTTTTAAACTACTTCAACTTCACAGAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 14346522 5' - roo 356 2 51.37 AGCGCACCAACCTCGATGTTAACTTAGCTGTGAACAATTTGCTTTCGCGCGATGATGAAGAAGCTGAAGATACCGAAGAAGGTGCCGATAATTACGTGCCCGAATGTACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTG:1 - chr3R 9724058 5' - BS 69 1 73.24 GATTGGAACTTTTTCGGACTGATTTTACAAAGCGATAATAGCGCAGCCAATGAAATATTTATGCATTTCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr2R 10600121 5' + 297 27 2 68.49 AAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2R 16510248 5' + roo 60 2 67.44 ACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr2R 4939197 5' - 1360 3365 1 32.88 CCGATTAAATTGTGCGGCTTATTTTGCAGTGATTTAGCGGGAAATAGCCATTATTAGCGGGAAATATATTACCACCCTTAAGACCTGACTGACCGGGACTTGACTTAAATCTTACTTAATTATTATCTTCTAAATATTACTGTCTA:1 + chrX 15746258 5' + jockey2 3238 1 57.53 CCCAACCACAACAAATCAAAACACAGGGCATTTAATTTAAATTCTTCGTTTTTGATGTTTTGCTTTATTTTTACCTTTCGTTTTAAAACTGAACGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAA:1 - chr2L 4115775 5' - invader3 5186 1 63.70 GAAAGACCTGCTACTGCGCGGCGTTTTTAGGCCTGCTTCTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 + chr2R 16891776 5' + jockey 4723 1 55.97 AATAAACTTGTAATAAAACATATAAAGTAATCACTTAACTATGTAATAAATACACTCATAGTTTTATCAACGGAGGAAGGTCTTTTAGAAATGCTTGTTAATAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 11267654 5' + roo 8680 2 71.53 AGTAAGTGCACTTGGCAAAATGGATCGTGCTTTAAAACTGGTGGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGAC:1 - chr3R 30558283 5' + I-element 4897 1 68.84 AAAGGGAAATTTCTACGACTTACCTGGGCCAAAAGCCACCGGCTGGGAAAATCTAATAAAACGAAAGAGCTTTTGACAGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 17027841 5' + roo 8706 2 56.16 GTTCTTGTACCACGTTCTTTGATAAGATGGCTATGTTGATAAACCCACAAACTTGTTTGAATATCACCAAAAAAGTGGCTTCATAATGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTCTTCTAGTGTCTTT:1 - chr3L 17887361 5' + 1360 3387 2 51.11 CTTCACTGGAGTCGAACAATTTCGAATTGGCTTATAATCTCCAATTAGACTTAAAGCTTTTTTTTTTTAACCGTTACCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGATATTCCTC:1 - chr2L 22235616 5' - Bica 465 1 59.29 TGATTATTATATCATGGGACCTGAGAAATCATTAAAAAACTTTTATAGCTCACTGTATTTTGTTTCGCTATTAAACAAAAATTGCAAACATTTGTTTTGATGACCCTAAAGATCAACTGATAACCGAAATTTTTCTAAATATAAAT:1 + chrX 5956223 5' + looper1 1799 1 71.92 GTTAAAATAATTTTAATGAAATTTCAATGATAATATAATCTTGCGGCCTTCTGTTTTCGTCTGCCGGCACTGTAGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTAGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr3R 9193273 5' - opus 479 2 68.25 TTAAGACCCATGGCATGTTGTCAATCCTTTGTTTTTCTGTGAAGCTGTGTGGTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3L 16463631 5' - roo 387 2 68.06 GAAATTCTTCGCTGTAATATTTCTATCAATAACCCAAATATTTGCCTAATATTAATAACGCTCTAAAATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr2R 9455813 5' - 412 444 2 52.05 CAAGGAAGGTGTTGCTTTTACACTTGAATAAATGCATCTCGAAGTTTGTGGTAGTAATGCAATATACAAAGATATTTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTA:1 + chr2L 260953 5' + Juan 4071 1 56.85 ATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTGGTCGGCTTCATCCAGATAAATC:1 - chr2L 15322911 5' + diver 328 1 77.40 TACTTTATGGGCCCCGCTCATTGTCAGCTTCTTTTCGATGCAGTAATGCCAATAGAGACTGTAGCAATAATAGCTAATGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTA:1 - chr2L 7290395 5' - Bica 96 1 52.05 ACGTACGGGCCTACTGCTGTGCTCACTTATATTTAGATAAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAA:1 - chr3R 21706319 5' + I-element 81 1 71.23 ATTACAAGAGCATAAAGAAATCGAACGCCAAAGGCTAGCTAAATGAATAAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chr3L 20388265 5' + 1360 18 1 73.29 CCCCAGCCTCAATTCATGACAAAAGTTTTTCGGCGCAGCGACAGGCAGATCGGGCTACTATATACATATATATATGTCTACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chrX 12214600 5' - opus 7466 2 61.64 AATATCGAAATTCTTCGCTGTAATATTTCTATCAATAACCCAAATATTTGCCTAATATTAATAACGCTCTAAAATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGC:1 + chr2R 9455807 5' - 412 462 2 61.19 GCGACACTGCGAGAAATCTGTGGCACTACTACTTGAGTAGAAGACTCTATGCTGACAGTTTGTAAGCCATTAAAATGCTCTGCTTGTATTAGATTTCCTTCTAATTGTATTCTTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 - chr3L 1981675 5' - opus 493 2 71.23 AATCAAAGCGAAAGTTCTCAGCTTTTGTCTGTCCGCAGGACTCATCCTTCCACGGCAAACTTTGCTTAGCTACATCTATCTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chrX 12214440 5' + opus 7151 4 58.90 TAATGCATGGAATAATTCTGGAACTAAGGATATGGTTCCTTCCTAAGGTCTTTGGTTAGATCGATACTATCTTTAGGGTGAATAAAGCTTAAACAAACGAGGTAAGGATCCTTAAATATGTAAGTTAACACGAGCCAACGAGCTAG:1 + chr3R 7951394 5' + Gypsy6A_LTR 3 1 78.08 TTTAAATATTTTGTAAATAGAAATTTGTGAGGAAACAAGAGAGAATGATCTAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTCACTCAGCTAGTGGGAATGCGAACGCAAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATAGAAA:1 + chr2R 5793476 5' - INE-1 495 1 69.86 GATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 - chr3R 6412055 5' + Tirant 33 2 52.73 CCAACCTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTATGTAAAGCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGAATAAAGTCTAAATATTTATGTCAAT:1 - chr2R 6486728 5' + transib2 34 1 52.71 TAATGGTGGGCAACTGTCGATAGTCGCCGATTAACACATAGCACAAAAATACTAGAACACTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGGCACTTTTTTGGTG:1 + chrX 4540602 5' - 1360 3338 1 58.70 ATTTATGTATATCATTTTTGGATTAAAAAATCATGATAAATTATATATCTAAATTATATTTTCTTATTATATGTGACATTGCAATACCTCCATATTTCATAAGGTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chr2R 14940812 5' + blood 7027 2 76.03 CTGTTATATTTTATGACGCAACTGCGAGAAATCGCTTTGCTTAGCCAAACATGAAATTTGTATCTCTTGGATAACATGCTAAAGCTCGCTAAGTAAACATCGATCGGTTCATGAGAAAATCTTAGATGCACTGGGTTAGTGGATTG:1 - chr2L 17888474 5' - Tom1 236 1 76.03 GGGCTCATCCCGCAGATAGCGCTCCAGTTCGTAGCAGGTCTGCGAATGGAGAAAGCATACAGCTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCCCGATG:1 + chr2R 10991086 5' - Gypsy6A_LTR 72 1 57.46 CAATTTCACACATATACGTGAGGTAATTTTAAATTGTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr3L 13366091 5' + hobo 53 1 53.52 GCAAATATTTTATCATCACTGGCTTTGGGCGTTTGATTCTCGACGCTTAGCGCTCGGAATTCAGTGCTCAGTTCAGTAGGTGACACCATTGCGCTTAGGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 18518074 5' - roo 9049 2 67.81 GCCCGAAAAGCGGAGCTTTTTACGCGCACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr2R 12069563 5' + Tirant 15 2 66.00 AAACTCGTTAAGTTACTCCACAAGGTCTCGCAATCTGGAAGATACATTTTGTACAGTTTTAGCTATGAAATAGCTTCCTTTCTTCTCGCATGCAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACG:1 + chr3L 5172115 5' - P-element 2565 1 78.23 AAGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAAC:1 - chrX 21636257 5' + Stalker2 7318 2 65.07 TTCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr3R 19721207 5' - opus 474 2 64.38 AACCTTCGTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chrX 16217560 5' - P-element 2857 1 62.33 TTTGGAATGTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGTAATATCTTCGGT:1 - chr3R 27188637 5' - roo 9017 2 52.74 AGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chrX 16217547 5' - P-element 2855 1 60.74 CCAAGAAAAAAGCTAATTTCGTATGCATTTTGAAAGCAATTAAATATGAATTTTACATGAGCGTGCAAAGCCAACAAAAAAATACGTATCTACATATATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 - chr3L 15859743 5' - I-element 5333 1 70.55 ATATATTCTATGATTGCCCGACGGCAACTCAAAATTCAAATGTCGATGCGATTCAACTGCCAGCCGGCAAACTCACTTCAATCATATATAGAAATCTATATATAAATTATCATTTTCGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 + chr2L 470160 5' - Burdock 6373 2 71.33 TACTAAGTGCTGCTAAAACTACACACTATATCCCTTTGTTAAATAAAAGTTAAGCTTTTCACTTTAATTTCAATCGAATTGTACATACGAATAAAATTGTAATTCCACCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chrX 6423318 5' + roo 11 2 77.40 TTTGCGGAGATTTTACCGGTCACTCAAGGGCAGGTGTGCACTTGCATGTAGAACATGTGATTTGAAATGAGATTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chr2L 9347453 5' + opus 43 4 52.05 GGCCAGGAGAAGGGGGTATAAAGGACTTTTCGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCA:1 + chr3L 15857894 5' - I-element 92 1 77.86 CAACACCCTCATAACTGGTAATGCAATTTTCAAGGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAAC:1 + chr2L 12832871 5' + I-element 88 1 75.34 AATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:2 - chr3R 10636196 5' + blood 63 2 59.59 CCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3R 21587589 5' - roo 8990 2 78.08 TTGTGTTCGCTGTGTGTTTTCTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 + chr3L 15859601 5' + I-element 31 1 59.23 AAAGACCCTATCATAAATTCCATTTTTTCTGTTGCTGCTAAGACAAAATGCCAAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 + chr3R 28782567 5' - blood 7320 1 65.07 AGTAAATTTTTGATAGTATTTAAAGTTTTTCTCGCTTAAGTAAAAGCATTTACTTTTTGGATTCGAACATTTTAATTAACTTTTGTCATTGTTTGTTCTTAAATACTTAGCTTATAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:2 + chr3R 12727077 5' + I-element 7 1 76.03 GTATAAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCTTAACGCCATACGCTTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr3L 20388221 5' + 1360 51 1 54.07 GCATTCTTATTTACCACAAGCCCAAAAGCATGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3L 2184997 5' + jockey 36 1 64.08 AATTTGAATGATATATATCGATTTTTAAGAATTTAACACACATTATAGAAACATAATACCAATTAAATAATTTGTACATTAGTTAATAAAATTATAGTGCCATCACTCGCGTTTATAATAATAATAAAAGAGAGAATACTATAGTC:1 - chr2L 22130814 5' - INE-1 580 1 40.41 TACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGAACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCG:1 - chr3L 20224225 5' + Chimpo 72 1 67.12 GTCGTTGCTTATTTTTCCTTTTTTGCATTTTCCGCGGCATCTACAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr3L 814935 5' - hobo 2902 1 56.60 AGGCCGCCTCGTCGCCCAAGGACATTGTGAGTATATATTCTGCTAGCGCTGCTATAGCTCATGTTACGAAAACAAAAAAATTATATTTGTTAGTAAAATTTTATAATCAACAAAAATTTGGCATTTACTTACTTATATATATACAT:1 - chr2L 15652351 5' - 1731 4419 1 59.59 TCCTGTGCTAATTGGTCAGGGTCCTTTTTTCGTCTCGTGTGCATGTGTGTGTTGGCCACTTGACATGCACGTCACAAATACACGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr3R 15168998 5' + jockey 7 1 77.57 AACTTGAAATTTTCAACAATAGCAAAATGAAGCAAACGAAGCGGCGAAGCCACTTTAAGCCCCGCAAATCCATAAGGCAAACATTAATTTCGGCCCAAAAATCGTCTTCTAGCACAACACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAG:1 - chr2L 1316875 5' + 1360 3265 1 57.24 ACGTTCGCAATTTCACACATATACGTGAGGTAATTTTAAATTGTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3L 13366084 5' + hobo 43 1 52.52 ATCCATAAAATACAACACGTAACAAACATTTTTTTGCCTTAACTGCTAATAAACTTGATTCAAACCAGAGCCATGAATCAAAAATTGACAAAGTTATGGTCAATAAAGTATTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTC:1 - chr3R 17201873 5' + opus 7190 4 73.29 CAATTAGGGAAAATTAAGACCGTGTATGCGTAAACCTATTTGAACCTCTACTAATTTACAAACTAACTCACCACGCCCATACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAACACTCAAAAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACA:1 + chr3R 15733891 5' + HeT-A 5979 1 67.12 ATATTTATATGAAAGGCAACCGAATAAAAAGTAAAGTGTAGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAA:1 - chrX 2517948 5' - P-element 2732 1 30.14 TTAAAACCATTTGCCGGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTA:1 - chr3L 13545062 5' + hobo 74 1 68.49 CATCGTACAACTGGGGAATCACCTGCTAAATTATTTCTAGGTCGAATGTTGAAAACACGATTTTCCTTGTTTAAACCACCTTTGATTACAGAACAATCATATCACCACTAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATACAGGGCT:1 + chr3L 23818650 5' + Q-element 259 2 63.70 GACAGCACCTCGTCGTTGGACACCAGGCCACCGCTGGCCATCACAGCCTGCAGCTGACGACCCTTGTCCGATCCAGAAGCCACCTACAAGATAGAGGAATATGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCCCGTCCCCC:1 + chr3L 12201007 5' + accord 120 2 73.38 AAAATGTAGCTCTTGTTGCCGTTTTAATTGTGAAACTTTTGTCATGCAACTTGCATATCTGCACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGA:1 + chr3R 25442794 5' - R1A1-element 5302 1 54.17 CCGGACAAGCTTGACAGCATGCGATCAAATCAGCATCGCCTCGTGTGCGGGTAGCCACACCAAACAATTCGGTCTGGCCATGTCCTTCTGTCCCAATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGC:1 - chr2L 21997593 5' + INE-1 168 1 56.16 ATTTTGTTTTACGAGTAGCGAAACTTCTCTTAGTAATTATTATAATAGTTTATTTATGTGTTCCACTTAATTATTTAATGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGT:1 + chr3L 3833750 5' - accord 7240 2 48.63 GAGGCAAACACATACACATACGAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 - chr3L 13228563 5' + P-element 36 1 54.03 TAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 + chr2L 21367222 5' + Doc 74 1 63.01 CAAAAGCGCTGGGGCATAAAAATTAAATAATAGCAACTCGCTGTGTGGGGCGTTAAAAATAAAGAAGGGGGGGGGCGTGGCATAAGGGTCTTAGGCATTTTCAGTGGATTCCAAACCGCTTGTTTTTGAA:1 - chr3R 30081609 5' - R1A1-element 118 1 82.31 AGTTCCATAAATTTTTGGACATATTGAAAAACGTTTATAAAGCTAAGGTCAATGTTAAATGCAGTTTTTTTGTATTAATTTAAAAAATTGTTCCAAGTCAAAGAGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 - chr2L 9074334 5' - flea 5002 2 73.10 GGTTTTTATAGAGAAAGAGAAAAGGCTAAGAGAGAGCATAAACTCACAAGAGGAAGCAGGCAGCAAGGTCAATTTCATGTTTAAGAACTTAACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTAATGCACAAATCACAAA:1 - chr3R 1849014 5' - Cr1a 149 1 66.44 CAAACTTCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGTGTTCTC:1 - chr3R 19721212 5' - opus 485 2 70.71 TACTTAAAATTTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATGTTCTGTTTT:1 + chr3R 9175205 5' + Juan 70 1 59.59 CTTATGCATTTGCTGCCCCTGTTTTCTGGTTTCCTTTACTTTGGGGATATGCTTGAGGAGTTTGGGAAGAACTTACTAGACCTACGGTTAAGTTACCATTAGGATTAGTCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACC:1 - chrX 20465922 5' + jockey 4774 1 72.60 TTTGTGGTGAATCCCATTTGATTTGGTAATAAAACTACATCGAATTTTGAAGGGCGTGAACGAATAGCATGTAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCT:1 + chr2R 21029342 5' + Transpac 47 2 52.74 TGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGACGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAACTGTGATCCATCACAAA:1 - chr3L 2184967 5' + jockey 71 1 58.22 TTAGGCGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3L 13472408 5' + jockey 74 1 63.01 GTAGTGAGGCTTTTACTGTTGCAGCTTTTAAGAGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAA:1 - chr2L 15322960 5' + diver 279 1 48.63 GAGTTTTCACGTTACGAATAAATTTGTAGTAAAAGTTAATACTTATGTAGTTAGAAAAATTTCACTCTTACCCATGCTGAGGGTATATTGATTTCATTCATAAATTTGTTAAACATGGGGAAAACAAAGGAACTGAGCGAATTTAT:1 - chr4 973562 5' + Tc1-2 366 1 65.75 GAACCTCTAATGAGCCAAAAATGCAGTAACTAAAAGTATATATTTAATAAATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chr3L 18164226 5' - pogo 2045 1 78.52 CGGGATGCCATAAGAAATAATGTGCCCACACACACACACACTCACAAAAAGAGAAAGCACTCTCAGATAAGGAGCGCGCACAAAAGTATGCTATGAAAACCGTAATCATAATCGTAAAGCTTAGACACCACCCTCATGACCTCCCT:1 + chr2L 17727875 5' + jockey 4759 1 70.55 TACACTTGAGAAAAATGTTCTGGTCTTAACTACTATAAATGTTAATTACCTTATTTGTGTTGTTCCACACGGAATAAAATGATATTTTACGGCTGCGAGCCGGAGTGAATAGCTGCTCTTTATTAAAGCTC:1 + chr3R 31627307 5' - gtwin 262 2 56.49 GTTGAGCATATTATTCGATTTGGAATGTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 27188655 5' - roo 9042 1 64.03 TGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTG:1 - chr3R 29091406 5' + rover 6993 2 57.24 GGTAAAAGCATTGACAGCAAAGTCAGAGGAGCGGCAGCTGGAACAAGAGCTTTCGGAGCAAGATGAAGAGGGACAACAATAAGGACTCGACTTGTGTTGGAAATTTCACAGATTAACACGAGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTC:1 + chr3R 31349407 5' + Gypsy6A_LTR 15 1 75.34 TGTAATAAATAGTTTCCTAGAAATATATATTGGTTGCCAAGGCCTAATGCACTGATACTAATTTGCCGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAAT:1 + chr3R 5115279 5' + Ivk 54 1 52.08 GCTGCCCCTTTCATCATTCGCTTGCTTTTTATCGGAACACTTCATACTGTGTGTTCACACATGAACACGAGTATATTTAAAGACTTCCAATTTTGGGCTTCGTTTATATCTCATGTAAATGAATCGTG:1 + chr3R 21587523 5' + roo 8720 2 55.47 GATAAACTAAATTAAAACGGTGACGAAATCATTAAAACATGATTCAGCTACGCCTGCGCACTCTCGTTTTGCTGCATACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATG:1 + chr2R 14271132 5' - P-element 125 1 52.05 CTGGGACAGTTTACACATTATTAAGTTCATTTCTATGCAAAGAAATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATAC:1 - chr2R 13212289 5' - diver 146 2 71.23 ATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 - chr3R 4532972 5' + 1360 60 1 60.27 TGCAACCCTTTTGAATAAATTTAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTT:1 + chr3L 5179965 5' + P-element 114 1 14.38 GGAACATACATCTTCTACCCCCAGCGGGAGTTTCCTGCTTATAAGGAAGTAGGTGCCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 + chr2R 14722664 5' - mdg1 7405 2 57.14 AATTTTTCTATCTGTTTATTTAATGGTTGTTTCTAAATTTTTTTATGTTAACTTAAATACCAATATTTGCATTCCTATCTTAATTATTTTTCCTTTATTTTGTACTGGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACGTA:1 - chr2R 5085852 5' + Circe 7009 1 69.86 ACACATTTTAAACTGTTAAACTTAAGGATATATACATAGATACAATTTAATTTCAAATCCTACGTTAATCATGGTCTAATTCTAAAATGCTTAAGCAGATTCTTTCATTGTAAAATAATCACCTCGTTATCCTTGGTTTTTTTCTC:1 - chr3R 13182989 5' - Doc 4457 1 55.48 GGAGTGGCGAAGGTCCTTGAAGGCTGCGTCGCTCTTTATGCTTATTTAAAAAAGTGGCGTCACATCCCAGTTTTGAGAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGG:1 - chr2L 10519639 5' + X-element 51 1 52.05 TTAAGAGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTG:1 - chr2L 15322933 5' + diver 306 1 62.33 AATACAGGACCTTCGGCTAAGTGCAATGTGGCTATATATATAGCCATATAGCCACGTCAAATTCCATCCATTTGACCTTTTAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCCCAGTTATGGGGCA:1 + chrX 12428104 5' + F-element 4271 1 60.77 CATTAAAAAAAAAAACAATTTTAAATGTTTTCTTATTTTATTCCCAAATATCTATCGATATACCAGAAAATCTTAAAAATTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTCTTT:1 + chr2R 5694014 5' + INE-1 581 1 64.29 GGGGGACACGGGATGGCGAATCCGGGATGCAGGCAGAGGCTCCACATTGATGGCAGATACTCCCCCAGCTTACATATAAAAATATACATACAAGTTAACACAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chrX 20124456 5' - opus 476 2 66.67 AGATGCAAATCAAAGGGTAGTAAGTGAGAAAACGTACCTTAATTTATTGAAATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 4214412 5' + jockey 18 1 72.86 ATTTCTGAAGCCTTTAAAATTAGTGTGCTTGTCAATTAAATTTCTTATTTAGGGAAAGTTTTTTTTTCCATTATTATTCACGCGAATGTTTTATTATTAAGGGGAGGTCGTTAATGAATAAGGTAAAAAGAAGCGGCCCAAGATGG:1 - 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chr2L 18178360 5' + Tirant 8114 2 68.29 CTTTGCTTCTGTTTCTTCAATTCTGTTCTTTTTTGCGGCAGAGATGCGCTTTCTATCTTGAAAAAAAATAATAGATACTTTTAAGGAGGGCAAACAATTTCAGGACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 31650262 5' - pogo 2085 1 74.66 ATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTG:1 - chr2R 4774745 5' - baggins 5334 1 67.12 GCGTTACAAGTTTTCTTTTTCCGCTACGTAATTTAATTAGACGAAGAAATATTCAGTATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGT:1 - chr2R 5045715 5' + invader6 4509 2 73.29 ATCAAATAAAAAGGAAAATATCTGGAAAAAAGAAAAGTGCACAGTGCGGGGAAGCGAAACTAAGGCTCGGCGAAACGTGCCTGGTAAAAAGCGTTTTCTTGTTGTGAGCCCTCCAATATAATTTATCGCTCTCGATTGA:1 - chr3L 3720548 5' - roo 69 2 82.01 ATTAATACGCGTTAACTATTTTTTAATATATGCCGCGGTGGTGTCGGGTAGCGGCAAGTCAATATATTATGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATT:1 + chr3R 12725525 5' - 297 190 2 58.82 CCCATTCGAGCCATAGAAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCT:1 - 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chr3L 18738155 5' - Bari1 1643 1 61.64 CCTCAAACACGGACAAAATGTCCTTGTATTGGTATTGATGCTCCCCAGTTTCAAAATCCATATTCGTATTACCTACATATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAGATCTGCATTAT:1 - chr2R 17021440 5' + pogo 38 1 56.85 TTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGATGATATGATGTGTTAATGTATGACGGTTGTTAAGTTTCATCAGATAGTTGTAGTG:1 + chr3R 6411999 5' - Tirant 8436 2 77.39 CAAATAAATTAACGCAGCAAAATAAATATTATAATAGAAAGTGAATGATAATGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTG:1 + chr2R 9339652 5' + Transpac 52 2 62.31 TAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTAT:1 - chr3L 10563968 5' - hopper2 1522 2 73.29 ATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGACAACTG:1 + chr2L 22975408 5' + 1360 155 1 75.00 CTGTGGGCACAGTCCGTCCGTTCAGTTGAAAGCCCGATTCACGACTGAACGGTCGGACGACTTCATTGGTGGAAAAGGCACTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr2L 13717265 5' - P-element 2867 1 65.87 AAAGGCAAGAATTGTTAAGGCAATTTCGGAATACATTAAAAGGGGCGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACT:1 - chr3R 26244708 5' - copia 179 2 67.81 AATAAAAATAATATATTTTATTATTCCATTCGCGCCGATTTCGCTGTGCAAGGAATGCAAATAAATCGTGCCATGAAGATAGATAATAGCTTTGTGGACTTTGAAAAGAATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGC:1 + chr3R 16820031 5' + Stalker4 186 4 75.34 CAACCATTTGGCGCGTCAAAGTTGGACTTTTGAATATATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3R 22522650 5' + roo 83 2 77.40 CAGCCTCGGCGGCTCCCCCCTTTTTTTTCGCTTTTTACTTTTTGCTTTCCAACACCCTCATAACTGGTAATGCAATTTTCAAGGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chr2L 12832822 5' + I-element 39 1 58.90 AGATATACTTGTTTCCTCTAAAGGTAGATGTTTAATAATTAATATTCGATACAATTTCGGCCAGTTTCCTCTGTCTGGGTGTAATATATTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAAT:1 - chrX 132447 5' + Juan 126 1 60.27 GAATTGTACAAGTTCCACCTTTGGACAAAACCATACCATAAAAAACTGGTAACCAACTTGAACACATTTTATGAATACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1 - 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chr3L 3565452 5' + gypsy 7006 2 69.86 GTAATAATTTGAAATAAATTGTTAAAGATTATCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTGTCTGGCCGC:1 + chr4 960159 5' - 1360 3313 1 73.88 GATGGTGGCAATGCTTAGCTAAGCATAAATGTTCGGATTTGTACGCGGAATAGGAGGCTAAATAATTTATTTACTTATTTATGAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGAC:1 - chr3L 21773267 5' + X-element 4661 1 56.85 CAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGAGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr3R 14494112 5' - roo 9012 2 58.90 TACTATATTTGGCCACAAATCTTCAATAATGTTGTATCATAAAACAAATACTGCTAATAACAATAACAAATAAAACAAAACAATAATAACAATAAACAAATACTGCTAATAAGAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2R 17187846 5' + roo 8671 2 39.73 GAACATGGGTTAAAAAATGTGCACAAAAAATTTAATTAAATTGAAATGTAAAACAATTTTCCATTGAAAACCTCGTTCTGCATTTGTTTTCGTACTGCTCGCCCTTTGCAGCTTGGCAACGGGGTTTTTTTTTATTTTTTGTGTAG:1 - chrX 4878815 5' - G2 3074 1 67.12 AGCGAAAGCAGAACGCTAAGCCAAAGGTGTTAATAAAACTAATATGGACGTATGGAATATAACTCTAGGGAACTGCCAGTAAATCCCAGTTACAGCTAGTTCAG:1 - 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chr3L 6675371 5' + 412 7137 2 74.66 GCAAGTCAAAATATATGTACATATATCAATTGTAGGCTACGAAATGGGCGCAATGAAACGGAAAAGGAAAGGAAGCGCGATGAGTACACAAAAAGAAAAAACCGGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 - chrX 3661032 5' - 297 6964 2 75.34 AGAGTCGACTGAACTGAACTGACTGTTGTTCGAAACTTATTTGCATATTATGTCCTTCACAGGCAGTTACACATTCACACGTGCAGACGTAGAATGAGTATTTTTATTTCGTTTTTTATTTTTTTTTGTTTGT:1 + chr2R 8687185 5' - G2 3076 2 67.67 ATGTGTCACGAAAATGTGAACCCTGAAATATATAGTGGACTTCCCCCCGAGCGAACCAATTGAGGTTTCAATTAAGTTTTGGTTATAACCGAAAATAAACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGA:1 - chrX 10289917 5' - opus 7407 2 67.81 ATAAAATGTTAATCTTATATTTTTTATATTAGTGAAAAAGTTTATTTCTAAATTTGGCCTTAAGTAATCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr3R 17734385 5' - P-element 2857 1 44.52 AATTTCACCGTTTTCCCTCAATCCAAACGCGGCCGCATTTCATTCCAACAGTATAAGACCCCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr2R 18440501 5' - P-element 2837 1 46.32 TAGCAACTTCTCTGCTAACATCCTAAAGCGAGTCCAGGTGAATTGGGTAATGCCCTTGAGTAAAGATTTATGTAAATAATAGATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAAC:1 + chr3R 11146333 5' + flea 41 2 57.53 GTCGTCTGGCTATATCCCACTGCCCATACATATAGCCGGGCTCAAATTTAAATAAATACAAGCAAAGTGGAAAATAAAATGCGCACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 - chr2L 16385365 5' + I-element 35 1 59.59 CAATAAGCCGTCACGTTCGAATCAAAATACATTGTTTATTGCACATTTTCCGGGCTGCCCCTTTCATCATTCGCTTGTTTTTTATCGGAACACTTCATACTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 21587470 5' + roo 8685 2 69.86 ATACCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 - chr2R 545172 5' + opus 7047 4 55.48 CGAATTAATTTCATATCTTGTTTGTATATGCTTTAAATTTGATCTATGCACTGGTTTTCAGATTGTATATTTATGTATATTTCACTGTTAAAATATTACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAA:1 + chr3L 7655569 5' + hobo 2501 1 64.38 CCAGTATATCTCATATCATTTGCAGAGATTTGGGATACCCGATAAGCGAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1 + chr2L 13140618 5' - blood 305 2 68.49 AACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACGGGAACACCGC:1 - chr2L 18178337 5' + Tirant 8172 2 75.21 TTATCCGGTAGTAAAATTGTCTAGCTAAAAGTCTAAAAGAATTCTATTTGCTGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCTGCTCTCGTGTT:1 + chr3L 16663860 5' + opus 7155 4 55.65 AATAATCAAGTTAGCATTATATAAAAACGTGAGGCACCAAAAAAAAAGTTAATCCGTTAATCTATAAAACTGCCATCAGCATCATTATACTCGACGATGCTATGAAGAGGCTGTGAAGAATCCGCTCTTTCGCTCTCTAACAAAAA:1 - chr2R 16893895 5' - 1360 98 1 78.08 CTTGTCGTCGACGCCGTCATCATCGTCAATGGTCGCAAGGGACGTACTGTTCGCCATGACGACGTCTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chrX 6407336 5' + jockey 4711 1 51.15 AGCGCTGTGGAACGAATGAAAAGTCGTCTCCCTCTCACTCAGCGCACTCTCTTTCCCGCTCAGATTTATTTTCTCATTTTAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTAATTGACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACT:1 - chr2L 3836708 5' + R1A1-element 152 1 58.65 AGGTGCCCAGTCCAATGGCCAGGGGAGTTCCAAGGATGAGCGCCAGCTGCCACTTTGTCAGCTTCATCGAGCCAATGTTCATCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTT:1 + chr2L 12038037 5' - roo 135 2 65.32 AATTACCCTAAATTCAATAACAACATGCATTTGAGCAGTTATGCAAATAAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCC:1 - chrX 17737269 5' + jockey 4746 1 65.75 AAATCATTTATCATAATCATTGTGATTGATTCGTTGGGAAAAAAGTGAAATATCACAAGTGAATATTCGAGCTCCGTATAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAATGGTTATTAACATAATACAAACAAATAAATCGAAAGCGAA:1 - chr3L 6460524 5' + Doc2-element 95 1 55.48 CTCGCTGACAATGACCGAGGTGAAGATACCCAATCACATAATGCGCCTGAAGAGCGCCACTCTGGGCTAACAGCGAGGGATCCCCCTGCCACCCCCAATTTGAATATCTTGTATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCG:1 + chr2L 17158552 5' + invader4 1 2 50.37 CGCTCCATTGTTTCCGCATTCGATTAAAAATGATAAATGCCTCGCTGCGCTCAAGTGAAAACAGCACGGGGAAGAAAATATATAAGTATATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACA:1 - chr3R 26432108 5' + Quasimodo 24 2 69.86 AAAATATGGGCAAATTTAAAAAATTCCAAAGATGACGCTTTACTGGGATTGCTTTTCCATTGCTCATATATTCAGTAAACAACAGTGAACCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr3L 21151218 5' - 412 463 2 64.38 GGACATGGCTTTGGACAGCAGTTCGGGCAGCTCGGTGGGTTCCAAGAGGAGTCGGAGCAGGCCAAGGAACCTAAAGATGGTGATGTCGGGAAAACCCGCTCAGG:1 - chr3L 9748712 5' - R2-element 3324 1 79.81 ATTATGGGCATTTACAAAGGGAATACGTTTCATATTCAGAACATATTCGGCGCTGCGTAGTCAGAAGAAAAGTCAATACGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGTCCTTTCA:1 + chr2R 22228593 5' - invader4 2741 1 69.72 CTGGAAAACGTGTTGAGCTTGGGAAATTAGTTAAAGTCTTAGTGCGCAAGGAAAGCCATTCAAATTGTTTTACTTGCTTTACAGCTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGA:1 - chr2L 6876716 5' + Rt1a 44 1 60.27 AATGAGGACAACTAAACGGAAAAAACCTTGAACGGAAAGTATCGTGTGCAGAAAAACATATTAAGTCTTTAAAATAAATAAATAAAATAAGAGCACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTT:1 + chr3R 904572 5' + 3S18 29 2 65.75 ATGAAATGATCATATATTGATCATCTTAACTTTCTTAATTCCGAAAAAATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTA:1 - chr3R 10636243 5' + blood 7027 2 73.97 TGAATTAAATTACGCTTGTTGTAGGTAAATACTATAAGTTTGCGGTTTTCTGCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAA:1 - chrX 22711685 5' + transib2 68 1 63.70 CACTTGGCAAAATGGATCGTGCTTTAAAACTGGTGGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATA:1 - chr3R 30558275 5' + I-element 4913 1 76.03 TAAAAAACTGGTAACCAACTTGAACACATTTTATGAATACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCC:1 - chrX 21581421 5' + Tabor 6924 2 73.29 CTGTTGACTTGATTCATATAGTATGCCATGCGTATCGGGCAATTAGTGAGTGGCCATTCTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGA:1 - chr3R 30621416 5' + BS 4838 1 73.10 ATGGGAAATTAGTTAAAGTCTTAGTGCGCAAGGAAAGCCATTCAAATTGTTTTACTTGCTTTACAGCTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAGTCCGGTCAGCCGTAAAC:1 - chr2L 6876698 5' + Rt1a 62 1 54.11 GCCAGTCGCAGGCTGAAGGTTTATGAAAAGCCGCTGAGTGTATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr3L 18972844 5' - mdg1 399 2 55.06 GTTTGTAATTTGTAATGAATCAATAATAATCACGATAAGAGTCGTGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTG:1 + chr2L 22759725 5' + Doc 116 1 71.03 TATTTTATTGTTTTATTTGATTTGTTACTAATTAATTGTTTTGTTTGTGTAGCCCGTCTGTTGCAGCGCGGCATTACTAGTAGATTGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCCTCCACG:1 - chr2R 20201535 5' - HeT-A 6026 1 56.16 AAATTGAGTATATGTGCCAGACACACACTTAATTATCATCATATTTATGGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCC:1 - chrX 20874374 5' + F-element 389 1 63.24 AGTCTACAAAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chr2R 16510239 5' + roo 68 2 65.07 CAGTTCAGTGACAGCTTTTCATTTGTTTCATTTTCTTGCCGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTTGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3L 9519629 5' - roo 8992 2 69.18 AATAGAAAATGAAGTGACTATTTATATGCTCCATAAAATATTCATAGTTTAGGCTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAAT:1 + chr3R 5316551 5' + Juan 4094 1 61.64 CCGGTTTTGATTCATAATCCACCCGCCCAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAACCATTTGCGC:1 + chr2R 11339093 5' + jockey 80 1 74.40 CAAGAAGTCCCAGCAGGGGAGTGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCC:1 - chr3R 17210150 5' + HMS-Beagle2 5 2 80.30 ATTCCACAAGAAAGCTACCAGGATTGTTAAATCAAAAGAATTATTTATATAAAGAATTGTTTCACACGATAGTAACAATAATATACAACTTATTACAAATAAATTATTTTCAACGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAG:1 + chr3R 23255326 5' - 1360 81 1 76.71 CCGCTAAGAGGGACGCGAATGATGGTCAGGACATCAAACCCGTTAAGAGAGCCGAACAGAGCGAATTTCGTGAGCAGGACATGAGTAACAAGTTGTTGCACTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGCCGGCAAGAGA:1 + chr3R 25137815 5' - P-element 2869 1 69.66 ATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chr3R 6412058 5' + Tirant 8144 2 52.99 AGCGCGTCGAATAAACTACTAATTGACTAAAGCAGTTAAACTATTTGGGACATGCGGTATATCATTTCGTTTTAGTTAATAATTGGCAAAATGCGGAATAATATTTGAAACAAATCAGCGTATAAATTTAAATGTACTAAAGCAAA:1 - chr2L 17387626 5' - Bari1 306 1 63.01 ATCGGTGCACCGGCACAAAAATTTTACGTTTCAGCACATATGTATGCACATTTTTCAATTGATATTACAAAAAAAAAAATATATATAGTTACGTATTTAGTTGTTCCAAACCAGCCACTTCCTTTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chrX 3660858 5' + 297 6619 2 49.66 ATAACCGAATATCCAAACGAAATGAACTAAATACAATTCCATGCCCAGTCGTAATCCTTTGAAATTAATTTGCTGCCATGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTG:1 + chr2L 11657941 5' - mdg3 5403 2 60.77 CTAAAAAACCATAACTTATAAATTTACTTTACTTCAATAGCACAATACTTTTTCATTACTTCTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTC:1 - chr3L 2467540 5' + jockey 4732 1 57.53 TCTTTTTTTAATACACATATATTTCAGGAAGAATTATGCAATTGATTATTACCTTTTCACACCCGTTACTAGTAGAGTAAAGGGGTATACTAGAATAGAAGTGTTTCCGACCATTAAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCA:1 - chr3R 18215273 5' + INE-1 81 1 87.50 TATAAATTCCGAACAAACAATATCAAGTTATTCTCTTTCCTAGCATTGTCCTAGTTTAAACAGCGCGCTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTT:1 + chr3L 13156701 5' - transib2 2764 1 58.90 GCAAGATATATAATTTTCCTATAATTGAGATGTACATATAAAAAAATTAACGCCAAACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAA:1 - chr3L 13827514 5' - roo 9044 1 66.44 ATCCCGGACACATAAAATAAGTAACGCGTAAATCACACATTATTTATAGTACACTTAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 - chr2L 6755837 5' - pogo 2041 1 60.27 TATAGGACTTTGTTTTCACCACTTTTGGCAAAACCTGCTAGTTCAGCAGAGAACAGCTCTAGTTTACACAGTCATAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGTCCGTG:1 + chr3R 4421947 5' + 1360 46 1 53.47 TTCGTTGTCTGCGAGTCGTTTGTCTCCTGGACGGGAGAATTGGGGGTCCCCACATTTCAGAACTCCATCCATCCTATCATCTTGCATACTCATTTGTAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chrX 5398965 5' - opus 7483 2 70.34 AAACACCAAAAGCGAAAGAATCAGAAAAGGCTGAATTAAAGCCGATTAAAAAAGAGCCAGGCGTTAACTTTCAAAGTGTTATAACTTAAAAAAAAGATCGCAAAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTAT:1 - chr2L 16902126 5' - hopper2 1343 1 54.11 CATAATGGCAGCAATTTGAGGGTTAAATTGGATATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTACCGTTAATAAGATCTCGACGTTCATACGGACAGTCGGACATGGCTGTATCGACTCGGCTATTGATCCTAATTAAGAA:1 - chr3R 20364133 5' - INE-1 87 1 76.81 CTTCACGAGAGGATAATAAAAACAACAGTAATAGAGGGCAAATCCAGATCCCCCAGCGGTATGGCCGTAAAGCATTGCTTCGTGAGGACGAACAAGAATTGCTTACTCGTGGTCC:1 - chr2L 22660248 5' - Rt1c 5295 1 80.00 GCAATAGAAAATGAAGTGACTATTTATATGCTCCATAAAATATTCATAGTTTAGGCTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATA:1 + chr3R 5316549 5' + Juan 4092 1 60.27 CAAACGTACAGTGACATACGTGCGAGCACTGAGTTTTTCTAGTTCTCTTGCCCAAGTGACAACTCAAAGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2R 7899213 5' + roo 8716 2 53.42 AATAAGTGAAGTATAAAATATTTAAACTAGATTATCTGACAGACAGCCATTGTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGA:1 + chr2R 21425062 5' - HMS-Beagle2 7129 2 64.38 ATAAATTTTATATTTCTTTCATATAATAATATGAATCCATTTTGTATTATACCGTAACGATATAATAATCCAACTTTAAAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chrX 23431580 5' + F-element 47 1 55.71 CAGTTTTGAAACTTAATGCTTATTTCACCAAATTCTTCCCATCCTCGATGGTGCGTTCCAAGGAGTTGGTGCGAAGAAGGTATTCGATGAAGGTCGCGCAGGTGCGAAGATAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTC:1 + chrX 13022262 5' - micropia 4966 2 76.03 GGCAGCAGTCGTCGTCGCTTGTCTGCGAGCGTCTCAATTCACTGCACATTTTGCAAATAACAATCGCATTTTTTGAATAATTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACACACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chr3L 17108659 5' + hobo 38 1 60.27 GTTTTTAACAACTGCAATAGGAGATTTGAATGGAAAAGTACGAAGTTATCGTACTACAAAGTTGATTATTCAAACCACTTTATTCATTAGGCACCATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:1 + chr3L 20209504 5' + Burdock 6157 2 71.23 CATGAACGGGGCGTTATAATGACCGAGTATGGGCCTTCCTGATGAACAGCTTGAGGCCCAGAGCAACAAGGCCTTAATTTGACAAAGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr2R 9410426 5' + hopper 3 2 80.34 CAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 - chr3R 6412044 5' + Tirant 66 2 68.94 AAGCTTATGAGTGGAAAACACCTCTAGGCAAATCAGCTCACTTCACTTGAATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACTT:1 + chr2L 18178773 5' + Tirant 438 1 60.00 TAAGGCCAAATTGAGTATATGTGCCAGACACACACTTAATTATCATCATATTTATGGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGCCAGAAGCCCCG:1 - chrX 20874381 5' + F-element 392 1 59.59 AGTGCGGCGACAAGTTATAAAAGTCGTTATATGAAAGCCAATATCAACCCAGAGTGTTCCAGATGGGCATAATGCATAACAAAAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCGTAACGTAGG:1 + chr3R 26528131 5' - diver2 4700 2 56.16 ATACGCCCTGTGTATTTTCACACAGCGTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chrX 6484684 5' + jockey 35 1 62.59 CTTCCAGATATCAGCTATCTATCTATCTGCTATATGGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr3R 22522705 5' - roo 322 2 73.97 ATTTTTTAGTTTTTATAGTTTTTAGGATTTCATATGTGTCTCATGTTGGTATATAACAGATTTATTAATCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACT:1 - chr3R 10220798 5' - I-element 42 1 56.16 GAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTA:1 - chr3L 9762255 5' + jockey 4826 1 63.01 CAACACTTTGTTTGTTAAGCCTGTATTTTGGAAAAGGGGCTCACTAGATTGGTTATGAAGTATGAAAACAGAAGTACGTAAAACAGATGGAGTCGTTTCCTACTCTATATATATATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCTGAG:1 - chr3R 7436703 5' + INE-1 90 1 73.29 ACCACAACGTGATCTCGCAGAACAGCCGCATCAGCCTGACCTACAATGACCATCGATCGGTGGGTATTACTGCAAACTTAATAAGTTAAGTTGAATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr2L 13690121 5' + Doc 34 1 60.96 TTTTAAGCTTATTTTTACAACAGCCACAACAATGTATGGCCAGAGCATGACTCGGATGTGCCTGGTGATGGGTTTTCTCTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chr3L 3858805 5' - jockey 4950 1 53.10 CTAAATCTAGTGTGACTACAATTTACGATGAACTCATTACAATCTTTATATGTGGCGAATAAAAAATCTTTTTACAACTGTTTTGTCGCTTTCCTTTCATGGTTTCTTAACAGATGCCACTCGCTTGAAGACGTGCGTACAAGT:1 - chr3L 20617539 5' - Chimpo 3947 1 68.75 AAAAGGGCTGTGTTCAAGCAGGCGAAGAATGGATGGAGCACAACTTGATTATTATTTCCGCAACTGTTATAGTTGTGATGTTTTTCCAGGTTTCTGTTTGATTTTTCATTTTTCCTATGACTCCTTTTTCACTTTTCTTGTAAAAT:1 + chr2L 6001505 5' + S-element 337 1 78.77 AACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2L 21153481 5' + 1360 63 1 60.69 GAAAAAAGGTTCTTTAGCATATTTACATACCGGTCCGAATCACTGTGACCTTGTTTTCCTCTATTCTAAACCTAAAGAATAATAAGTCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr2R 4803061 5' - roo 9039 1 63.01 AATTTATGATGACGTTAAAAGCATCAGTATGTATCAGTATAGTATCAGTACACTGTAAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 + chr2R 15942270 5' - opus 7441 2 63.01 GATCAAATATATTATTTAAAAAATAAAATAAAATTTACATGTTCAATAATATTTAAAAATAATAATTTTATGATTTATAATACAATTGCGTCAAATGTAAAGAAATTATTCTTTAAAGCTGTCAAAAAACATGAAAATGATTTGGC:1 + chr3L 8226715 5' - Transib5 2702 1 55.48 CGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTATGCACTATGCAGCCCCACTTTTTTGGTGACAATCAAAATTGCCCTATGTCCGGCTCGCTTACGCTAAGAGCGGAAGAAATCTAAAAATAGA:1 - chrX 22707484 5' - 1360 3276 1 82.19 AAAATATAAGATTATTCTCAATAATTGATATTAATAAGTGCAATTCCCATCAATAGAAATGAAAAATGGTCTGTCGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 18792528 5' + roo 8709 2 54.79 AGGTGTGTGATAATTTTGTTGATATTGTGCGTTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGGTTGCTAAGA:1 + chr2L 9515993 5' - I-element 5117 1 77.40 AGTTTGTGTGTAATTTGTTGTTGGTTGCGGCATTGGGGAAGCGCAATCTTCGCTCCAATTGCGCTTGGAGGGCTTGAGCGTTTCCGTAGAAACGAACGAGAAATACTCGTTT:1 - chr2R 18885049 5' - Doc4-element 66 1 48.21 ATTGTGTTTATGTAGGATTTTTTATAAATATATGCATATGTACATATAACCGACTGTTAAATATGTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 - chr2R 21473697 5' - pogo 2047 1 57.53 ATTACGCTATAATGCTACTGGGTTTTTATACCCGTTATTCGTATTCGTACATTCGTAAAGTATGTTGAAAAGTATGTAAGTGGTAGAAAGAAGCGTTTCCGACCATATGAAGTATATCTATTCTTGAACAGGATCAAAAG:1 + chrX 10326171 5' + INE-1 85 1 47.86 GAAAATCATTGTTTTGACCTTAGCACAACGCACGTATTTCGCTGACTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 24976191 5' - roo 361 2 51.37 CATTGTACTGCAAACACATGCCCTGAATTTTTGATAAAGACAATCCCGAGCAATTTTGATAATTGAATTGTTATTCCCAACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGTTTAATCGTA:1 - chr3R 13051343 5' + 3S18 5956 2 53.79 GATAACGATTATGTGCAAAGTTTTATTTCTCACTCTCGCCGCAAAATTAAAAAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:2 - chr2L 7271928 5' + 297 58 2 65.75 CAATAACAACATGCATTTGAGCAGTTATGCAAATAAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTA:1 - chrX 17737255 5' + jockey 4760 1 75.34 ATCAAATCGAGACACTCGATAAATCAGTTTGACAAATACACAAATCGATCAGATTGAAATTTTGCGCGAGTGGCGAACGTGGAAACGTGATTTCAGTTGTTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAA:1 + chr3R 22868714 5' + mdg1 23 2 69.18 AATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:2 + chr3L 18792422 5' - roo 336 2 67.81 TTTGTATATGATAAGTGCTGAAATTCATTTGCTTATCTCGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 - chr2L 10045271 5' + jockey 87 1 69.44 AAAATATGCGACTATCGATATTTTATAGGAATATCGATCTTAGAAATTTATTTTATTTTAAATTAAATGTTTCACTACCCAAGGGTACTTAGTTAAAGTATTATCATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chrX 13384948 5' - opus 483 2 33.56 GCGGGGAAATGTCGCTTGTGACGAATTTCTATTTGATTTATGCACTCCCTTTGCAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTTCAAAAGATCGTTG:1 - chr2R 21029455 5' - Transpac 5189 2 54.10 GACGTTGGCCCTGACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCGCACATATAACAAATTAATTAATAT:1 + chr2L 23372493 5' + gtwin 37 2 60.27 TATTGTCATGCGAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACA:1 - 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chr3R 27599064 5' + Cr1a 4345 1 64.38 CTTAAGTGGAAAAATAAAAGCTCATCAATTCAAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTT:1 - chr3R 28659184 5' - Burdock 6390 2 75.34 CACACAGATATTCAAAGCACTCTACACATTTAAAAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAAAGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTA:1 - chr2L 18300822 5' + Ivk 5338 1 76.71 CATTTATGCAAGATGCCGGTTTGAGATATTTGAAAGTGCACTACAAAATTTTGAATTTCGGAGTCTAGAAGTAGGCAGATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCACGTCAGTTGACTAAGGAC:1 - chr2R 1375190 5' - 297 6938 2 60.96 TATTACATATTTTAGACATATATGATTTGTGATTTAATTGCAATTTAATCTTCGGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAAAATAATAATTGTGCTCCGACATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTA:1 - chr3L 23529725 5' - Stalker2 231 2 67.81 CTGATTTCGGAGTCGAATGCACCTATCTTATCAGTATTATCAATGATATTTGTGATTTATACTTAGATTTAATTAATTTAAAATAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGAC:1 + chr2R 20657780 5' + BS 4966 1 57.53 ATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - 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chr3R 3286170 5' - Gypsy12A_LTR 1933 1 51.85 CTGCAAAAGCTCCTCCTCTTCTTCCACCACCCCAATAGGCCATCACTTCTCACTGGGCCATGTTTTAATTTTAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGAC:1 - chr3L 16706636 5' - flea 128 1 51.37 TACAGGTTATAGGATTGCAATGTCGCTCTTCATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTT:1 - chr2L 21153603 5' - 1360 372 1 62.07 CTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACT:1 - chr3L 17206986 5' + I-element 4988 1 58.90 AACGAGGACCAGTTCCAATTAGCTTAATTAATGTCGCTGTTGTTCCCAAGTTTTATGACAGAGTAAAGTTGCCAGAAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 2278275 5' + roo 8708 2 54.11 AACTTTGTGGAAGAACTATTCGAAGCTCTAATACCCCTAAAATAAATTCATAATTATTTAATTCTAGTGAAGTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr2R 21473569 5' + pogo 38 1 57.14 AGAAATGTAGATAAGGATGATGAACAATATACAAGGGCACGTGTACCAAGTTGAGTAAAATACTCATTCATTTCCAAGGTAGTATTTAAACGTACATATAACCTATATTTTTAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 + chr2R 25252093 5' - opus 7496 2 77.40 AGGTGGAGGTGGATCGGCGAGCAAGCGCATTGGACTTGCTAAAGGTGAGTCTTTCAGTCCACGTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACAC:1 + chr3R 6359267 5' + I-element 5080 1 56.85 TATTCCCGTTTCAGCCTTCGCGTTCCTTAAGAGAGGTTATAACCGCAGCAGAGAGGTTGGTCCAGGCCTTCAAAAATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3L 22709313 5' + 412 47 2 53.42 GTAATGTGAAAAGGCTTAAACATATCCAATTTCATACTTTCCCAAATGCCAAACGAAATGTCATTATAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chrX 6423166 5' - roo 9011 2 56.85 ATTTGGCAAGCGGCAAACAGCCTGAAACTGAAACAGAAACAGAAACCGAAAAGACACCAAAGCCGAGCCTTAAAATGCACTGAGAGAAACCAGTGGCACCAGCTTGATGTGCGGGGAGACAATAATGACTTTATT:1 + chr3R 29567029 5' - accord 7307 2 74.07 TTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAG:1 + chr2R 5582154 5' + Cr1a 473 1 55.48 ACCCGGATCCCATTTGTTTTTCCTATGCATGGATGTGGTTGGGTGTTCCATACGATTGTCATAACGTTTTGGTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3L 9519534 5' + roo 8697 2 53.85 ATAAAACGAAGAACAATCTAAACATTTTTCAAAAGTGTTGGCGTGGTAGTTTTGAGGCTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAACAATACGTTGCGTCTATGTCTTTAAAATCTGTATGCTAAATCTCAACCTTCT:1 + chr3L 24787907 5' - INE-1 172 1 78.83 TTCTCCTGACTAGAATCAAATAAAAAGTAAAACAAACATACCATACTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3L 12468848 5' - roo 8997 2 72.60 CAGCAATTTTCGCGTCGTTGAGCGAGGGAATCTAATTTATATATGAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chr3R 23668437 5' - pogo 2041 1 67.94 AATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 - chr2L 14480542 5' - Transpac 5189 2 55.47 AACTGTAGGTCAGGTCAGGGGGCACAGGAAAACAGAATGGAACTTTCGGGCTATAATAAATGTACAGTTGGGTAACTTTAGTTATTTAATAAAAATCTGTACAGATTTATATTAAACATCATAAGATAATACGATTTTTTTTTAGA:2 + chrX 14429620 5' + Transib-N1_DM 189 1 67.12 ATGAGTAACAAGTTGTTGCACTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTATCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAG:1 + chr3R 25137895 5' - P-element 2788 1 17.81 ATAATTTTCCTATAATTGAGATGTACATATAAAAAAATTAACGCCAAACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3L 13827505 5' - roo 9035 1 60.27 CGAAATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 - chr3L 4933819 5' + blood 62 2 60.96 GCAGCCAATGAAATATTTATGCATTTCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGACATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chr2R 10600079 5' + 297 6642 2 71.01 CTTATTTCTTTAAACAGTGCTTATTTTTATTTTTTAGACAACTGTTACTATTTATAACTTATACTACAGTGAATCATAGGTGTATATGAGTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTT:1 - chr3L 25008196 5' + X-element 46 1 43.84 GCAAATAACGACGTAAGTGTACGCAGCAATATGGCTGGGAATTTATGTATTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTG:1 + chr3L 19335347 5' + invader4 2833 2 69.18 GTAGCCATTTTTATTGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - chr2R 22012245 5' - opus 7450 2 57.34 ACGCTTCTCAGTCTGTACACGTCGCTCGATCGCATTCGTCATTTTTGCTGCGTTGCGCGTGTCTACCGACAAAAAAACGGGGAGCATATTTATTTTTTTACATATTGATGAAAAAAACCTATGAATAAATAGATATTAATAAAAAA:1 + chr3L 22773529 5' + S2 1619 1 59.59 GTGCGGTGAATAGCCATCGCATGTGCCGCATGAATATGCAAAAGAACAAGTAAACGAGTTGCCCAGCGGGATAACTTAGAGATATCGCCTGATCTTAGTTAAGACAGCGGTTAGAGTTAGCTTTTTTAATATATTTTTTTCAAATT:1 + chr3L 3258940 5' + copia 4665 1 75.34 TTGATGAAATATGCGTACAGAATTGCAGTATTTTAATACTAATTAAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chr3R 32032095 5' + 297 6635 2 70.31 GGATTGATCGGCGTTATTGTGGCTGACTTGGTTGCTTTTGTTATCTAGTAGGCCTAGTGCTAGGACATTATCATGGTTGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCAGCATTTGACTTTATTTCGTCTTTAACAAGTGGAAGTTCCATGT:1 - chr3L 27361318 5' - G3 4329 1 71.92 ATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTTGCTCCAGGCTC:1 - chr3R 4532962 5' + 1360 69 1 65.52 ATTTTCATAGCTTATGACAACAACGTTGGCTTACTTGCTTTGCCTCCAGCAAATGGTAGCTCTATAGTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:2 + chr3L 10442807 5' - roo 355 2 55.86 ACATGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCG:1 - chr2R 3120314 5' + accord 22 2 48.51 GACACCTGCAGACTAATTAATGGCAAATTCCAGGCACATCACTTCGATGTTCATATATGACTGGCGCACACCTTCTTCAGCGTGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCT:1 + chr3L 20176720 5' + gypsy 39 2 55.48 GATGAAGTGCAATATAACTGATTAAATTTGCACGGTGGTTGCCAAGTTACTCACATATACACATACTGTACTATACTGTACTATACTGTACTATACTGTACTATACTGTACTATACACACATATACACACACACACACA:1 + chrX 12820106 5' + Quasimodo 28 3 61.15 GACTTATTAGCCAAATTATGTAGAGCAGAATGGTTCGTAAGGAACACAAACTAGAAAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCGACAG:1 - chrX 17262557 5' + X-element 4420 1 55.46 AATTATTTTCTTTTCCCAATCCCATTGTTCAGATTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chrX 10823949 5' - pogo 2034 1 73.08 GGTGCATATAGTTCGACTTCATTCAGCAAGTAAAAAGAAAGGAACGCTCGGTACATCTTACTAGCAAATGGAATACCTTATGTGGTCTAGCCCCTACTAGTTATTTAATTTTAGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAA:1 + chr2R 19637063 5' + Stalker4 92 4 77.40 ATTAAGTAACCAATACAGTTTTCAAGTGCAGTAATCGCCGAGTTGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 - chr3R 22868844 5' - mdg1 345 2 69.18 AACATACTCTTCATGGCGGAAATTCCAACGAAGGAGTGGCAGTTATAGCGTAGTCCATAATCAATCCAAACCTAAGTTGAGCACTGTGTTTTTGCACACCTTTTATTTTTAATTCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAAC:1 + chr2L 13793088 5' - R1A1-element 86 1 71.03 GTTATCGAAACAACAACTACAACAACGACTCACCCTGCACATGGTGACCTAAATTGCAATTAATTCAATAGAATGTGCGTTGCAGTTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTTCGCCATCTAGCTTATATAGTTCTCGACGTTCATACGGAC:1 + chr3L 10636393 5' - INE-1 133 1 55.48 TATGAGAAATAGTAGTTTAATAAATCAATCCTTAGTTAAGCCCAGCACTTTCACCATCTTCCAACTTTCTTACTCGTCAGATTCATAATCATACTACATTTTCTTCAATATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAG:1 + chr3R 25305606 5' - rover 7011 2 80.00 TTTTTGTATTTTCCTCGAATTTTTTCGAGTGCAAACGAAGGGCAAAAATGTGCAACATGGCAAGAGCAGAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATACATATACATGCACATGCACATACACACACACATACATATC:1 - chrX 14629545 5' + Quasimodo 40 2 54.01 CAACAAGTCCAACAAGACCAGGCCAAAACAGCACGGAGCAGACCGGCAAGTCTGTTCGGGCCATGACACCACACAAAAAGAATAACTTAACTGTTAACAATTATTCGATCAACATCAACTAGAACTTCACTTACTCAATGCAAATC:1 + chr3L 16458917 5' - Bari2 145 1 56.16 ACGCTGTTGCCTGCGCGCGCTACACTTTTTCGCACTCGCACACATACAAGCGCTCGGCACACCACACATACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCAC:1 - chr2L 8403866 5' - roo 8929 2 64.91 AATGCTGTACCAACATTTCACTTTATGTAATTATAAATTCCGAACAAACAATATCAAGTTATTCTCTTTCCTAGCATTGTCCTAGTTTAAACAGCGCGCTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGC:1 + chr3L 13156670 5' - transib2 2795 1 64.38 AGGTAGTTGACGAGTCAGTAAGGTTAATCAATGTCAATTGATGTTTATCATGGCCATCAGACCGATATTTAATCGTACATTAAATACCTATTCAGGAGTAGGTCGGGCTGCCCTGATATGTTGACGTAGTTGCTCGGTTAGTCGGG:1 + chrX 5948980 5' - Chimpo 3846 1 63.01 AGGTGGTATGCAAATAATTGGTGTTAATGACGTGCCTCAGTATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 - chr3R 4533020 5' + 1360 12 1 78.08 GAAGGTAGTAAGCGCAAAAGCGTTGCTAAATATTAAAGGTACATACATACATACACCTCTATACAGTTTGTTAAGAAACTGTTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGAGTTTTTTGCTTAATTATACGCA:1 - chr2L 22150640 5' + S-element 72 1 83.56 CAGAGAGAGCAGGAAAGAGTTTTCGATATATATGTACACATATGTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCA:1 + chr2L 19548457 5' + flea 4831 1 76.03 GACTTCACCTGAGGGCAAACACATGCACCGAAGAAAGAAATACCAGACGCCTAATCAAGTAACGCACAATATACATATACATGTGTATGCAGAGGGCATACATATGATATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTCCTAAGTGCATGCT:1 - chr3R 7673325 5' - Stalker2 7442 2 53.42 CGTCACCAGCAAAGGATACTCCCGCTTGCATTCGATGCCCCAGCGAAATGGGAAGTCCGGTCCTCGCGTTTGTTTAGTGTATACAAATGTACCGTGGAGAGATTATGTTTTATTACGGGTAAGGAGTTCATGGGG:1 + chr2L 5609182 5' - G5A 2698 1 53.33 TGTTGAAATACTAAAATATTATGTATGTTAATATGGCAACAACTATATACTGAAAGTTGGTCACACTGATCTGAATAAGTTCTTTTTGTTTTTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATGTGAAATCACAGAAGGAATTCCTA:1 + chr2R 5110114 5' - invader4 2785 2 62.33 CACCAGTCCTGAAAAAGGGACGGACAGACGGACGTGGGACAACCTACAACCTACAACCTACAAACGACAACCGACAGCCGACAACGACGACATCAACACCCGGGCGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr2R 8334874 5' + transib2 15 1 75.17 AGTCCAAACAAATATCGGATTATATTTTTGTTTCAAGTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 4661948 5' - roo 8989 2 76.03 GGGTGGGAATAGGGTAAATGACAAAATGACTGCTTTCGCGGGGGCGGGAAATTGTAAAGAAAATCGAAAAACGGAAAAGTTTTGGCCATTGACAAACGCATTAAGAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:1 + chrX 18737170 5' - I-element 5339 1 70.55 CTGGAGGGAAGTGGCAGTCTGTAAATGCATATGTTTGTCCGTAGGTTTGTCCGCCTGTCCGTATGAACTTCGA:1 + chr2R 10907219 5' + INE-1 128 1 53.42 AATATTACAATAATAATTATTATGATTAATGTTGTAAGTATTATTATTTTTTTAACTTCAGTTACTTTTTGTTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGGCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAA:1 - chr2R 883094 5' - I-element 484 1 71.23 GGAACATAGACATTCCACTACACTTCAATTAATAATCCTAGCAAAATATTTATCCGAAATTAAGAATATTGAATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3R 12610105 5' + roo 49 2 51.37 ACACTCACACTCCGGCACCCATACGAACACAGAGAGAGACAGTCACAGATTGGGGCATGTTAATTTGTAGGCCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2L 18213252 5' + roo 23 2 69.44 CGGTGTGAGTACATGGCCGGGCACTATAGTGTGACAGAGCGAGAGAGAGGGAGCCGGAGCACAAGAGCGCAAGAGGGAGAGAGCAACGAGAGTGAAATGGCAATGGCCACAGCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGTAA:1 + chrX 16217383 5' + P-element 13 1 76.03 ACCTGCAGAGAAGTCTTAACTTTATGCATTATCAAACTCAATTCTCACACAGGAAAAAAATATTACAATCTGTACGTAACTGTATCGTTAAACTAAATTCAGTTAGGCGTCATCGAAGATACGAATTTACATTGTACATATTAGGG:1 - chr3L 13079652 5' - 1360 3146 1 75.34 TAACTATCTTCTTTTTAATGTTACAGGTTATAGGATTGCAATGTCGCTCTTCATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAA:1 - chr2L 21153624 5' - 1360 393 1 76.55 CGCTAAACTCAAACAAAACGAAGGCAATTTGTTGTAAATTTATAAGCTCAAAGAAGCTGGAGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTT:1 + chr3R 22053300 5' + FB 81 1 73.97 TCTCTGTGTTGTTATTAGTTACGGATATATGTCCAAATTGTTGTGCCAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chr2L 11613297 5' + hobo 67 1 64.49 AATATTTACTAGCGCATTTAATGAAATATTTAACCAAAAAGGGCGCCACATTGAAATGGATACTTCAAATTGGGCTTCACACCGTTTTTCAGTATGTGTTTATATCCACGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAG:1 + chrX 10286312 5' - hopper 942 1 55.48 CATTGGCAGATTACTGGCGCTGGTCATTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGGAACCTGTACTGGCGG:1 - chr3R 3347564 5' - Gypsy12A_LTR 2228 1 79.45 TTTAATCTCGAACGAAACAAATAACTCGCTGGAATAACTAACTGATGGGCATTTATTTTAATATTCTCCAGCTCGCAATCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTCATGCGGCT:1 - 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chr2L 4349360 5' - Doc2-element 4699 1 51.37 ATATAAATTATTTTCTTTTCCCAATCCCATTGTTCAGATTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCT:1 + chrX 10823944 5' - pogo 2031 1 69.57 TCCAGAGCCACAAGTCTCTCTTTAAAATGTAGCTCTTGTTGCCGTTTTAATTGTGAAACTTTTGTCATGCAACTTGCATATCTGCACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGG:1 + chr3R 25442771 5' - R1A1-element 5299 1 60.27 GCTGGATTTTCCGCTGTCCACCCGCCCGCCGCTGGTAGATTCATCATTTTTGCGACATGTCAATTTGTCACTCACCTGGCCTGACAGCCCGTGTATTAGATGATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTAT:1 - chr3R 18698008 5' - 297 392 2 73.68 CATAACACCTTCTTTTCTCTTGGGAATATCATGGAGGGACATACAGTTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTT:1 - chr3R 17057721 5' - hopper 1141 1 67.81 ATGATAATATAATCTTGCGGCCTTCTGTTTTCGTCTGCCGGCACTGTAGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr3R 9193247 5' - opus 7474 2 55.56 GCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGCGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACC:1 - chr3R 25868253 5' + Rt1b 4967 1 59.05 ACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGTGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1 + chrX 19005376 5' + F-element 83 1 66.21 AAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGAGCCAACGCTG:1 + chr3L 25482894 5' + accord 69 2 63.70 GTGAATTTCTCAGGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 + chr2L 18944852 5' - P-element 2786 1 14.08 AGCGGAATCTTTTTTGCAAATATACACTTGCGTTTAAAATACTAGGAATGGTAAAAAAAATATATATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGC:1 + chr3R 28659009 5' + Burdock 51 2 58.22 GCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACA:1 - chr2L 18178347 5' + Tirant 84 2 74.66 ACGCCTGGTATAAAAGTTTGCAAAAATTCCCACTGTAATCAGTATAATGAATTTTTTAAGATAGATTATTTTAATGAGCATTTAAACAGGATCCAAGCGTACAATTTTTCATTATTTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACA:1 - chr2L 12488371 5' + copia 4874 2 34.25 AAAAATCTCCATAAATAACAACATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3L 1981549 5' + opus 40 4 80.65 CAGACGCAAGCTTTTCCAGCTCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTG:1 + chr2L 4420493 5' + gypsy5 6983 2 51.49 TTCTAATAGCTCAAAGCAGGCTGCAAAAGAGCTGTGGTTTTCATTCCCCCTTCTTCTTTATAATTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACA:1 - chr3R 9175268 5' - Juan 4152 1 58.90 TATTGGTACCAACATCTGGACTACTTGTTTCCGAAGCGCACCTATAAGGTGGTTGTAGTCAAGATTTTGCTGGACCAGTTCATCTGCTCACCCTTTTACTACTGCGGTTCTCTCGAGCCTCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTCTC:1 - chr3L 11870979 5' + X-element 391 1 67.81 ATAATTTGGGTCACATACGCAGTGTTTTTGAAAATATCTGGTTGCTTCTACCTACATATAGCCATATGGGCTTATACCATATCTAGGTAATCAATTCGACCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTA:1 - chrX 547694 5' + jockey 4760 1 68.49 CTTAGACGATATCCACTGTATCCGATAAGTATACTCTGTGAAGTACCCTCGCCTCGATAAAGTAACCGTTAGCAGGCAGCAGTGTGACACAGTTTGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCATACATTGGTTTTG:1 + chr3L 20388089 5' - 1360 3362 1 65.75 CACTGAGCGAAAAAAGGGCTCCATTCAAAGGGTATTTATTTACGATTGCTTACGTATATGTATTGTATATTGCATCGTAACTTAAATAATGCATCATAAGATGACTCTAGTTCCTTTCTGAATATAAATTATGCATTGTTTTAAGA:1 - chr3R 22656616 5' + Transib5 437 1 59.59 ACAATGATAATTAATTATGCTTTGGCGCCAATTTTATTAATGCGGGGCGATAAGGAGTACTGTTTTTATTCAAGACATTGAGGCACCGTAGCATCCAAAAACCGCAGTCCTTCAACGAGTGCAGAAGTGCCTACGGACCGACGGCA:1 - chr3R 4103539 5' + G-element 32 1 74.66 CGGCGACAAAAGGTGAGAAACCAAAAGCAATTACATCACAGATTTCTGTTCTTTTCACGAAAAGTTTGTTGATAATTGAAATAGGGCTTCATCCATAAGAACCTATGAACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGATTCGAGTA:1 - chr2L 18804832 5' + Tirant 230 2 71.33 ATTAATTAGTTAATTGACAAAGCTCTTGGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 24976315 5' + roo 8715 2 53.42 CTCCATCTTATTTTTATTTCTTGCTCAATTTTTAGCTGGCCTCTGATTTTCCCTATTCGGATAGCTGCAATTAGAGAGCTAGTCATATACATTGGTAATACTAGATATACACACACACACACACATACACACACATATCCACAC:1 - chrX 4740499 5' + accord 189 2 44.44 TCGCTAGATTTGAAACAATACTAAGTAAATCTAAAGATATATATATATAGTAGCATATGTGCCAGTATAGTATAAGTATAAGATATTATAAGATAAGATATTAATTATAAGTAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACA:1 - chr2R 4673650 5' + Quasimodo 30 2 43.15 ACCACAAATACGATAAATTCTAATATATTTTATAATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 - chr2R 21425190 5' + HMS-Beagle2 6913 2 63.70 AGATTTTCAGTGGCTCTCCCCTCATTTTTTCCCCTCATAACATAAAAAACTAGCGTGTCTAATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCAT:1 - chr2R 14721433 5' - mdg1 442 1 58.22 AAGCCCGATTCACGACTGAACGGTCGGACGACTTCATTGGTGGAAAAGGCACTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAGCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chr2L 13717294 5' - P-element 2839 1 43.20 GAGAGAAGAAAAGATGGATGGGGGCTGACACGTCACACTTCTGACCCATGACCCTGTGTTCCTTTTTAAAACGTGTGGGAGTGGCATATTTAAGCGGCTTGAGGGAGTTCAACGTTCTCAACTCTCTAGCTTTTAGAGTTGCTGAG:1 - chr3L 22706727 5' - INE-1 153 1 54.11 TAAGTGAATGTATCTGCATGCATATGCGACACGACAATACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAAT:1 - chr2R 15151101 5' + hopper 86 1 76.03 GAGCAAATTTTTAATTTTTTAAAGTGGTTAATGAGATTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACATC:1 - chr4 806706 5' - BS 5017 1 74.29 TGGATACGGCCCTGCCTTGCACATATATACATATGTATGCAGAAGCGAATGACTACATAAGAATCCCATCGCCCGAGTAATACGATCTAACGCTCATA:1 + chr3R 18697901 5' + Stalker 152 4 43.88 CCGCATAGAGAAAGAGAAGTCTCGGCGAATGTGTGCGAGTGAGAGAGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 - chr3L 5179247 5' + P-element 43 1 52.17 AATATGAACAGGGAATTGTAGGGGCAGATCCCCTGAAGTATGCTACGTTTTTGGCCATCCATTGCGGCGGCTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTTTATCATTTATATGTTA:1 - chr3R 14860258 5' + BS 5023 1 65.75 TTTGCCTCCAGCAAATGGTAGCTCTATAGTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3L 10442845 5' - roo 323 2 81.29 CTGTCACTCACTCACACAGGCATACATACAGTCACGTACGCGATTCTAAACAAGTTGATGAACTCTACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chr2L 19158926 5' + P-element 41 1 55.30 ATTAAGCATAAATTGAACTATTTTCCAGGCCACTTACAGACTGCATTAATTTGTTTCAGATCATGAAAGCTGTTATTATATTTAAAATTGAAATAAGTGTAAGTCATTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGA:1 + chr2L 11816756 5' - Gypsy6A_LTR 207 1 80.00 CGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGATGATCTTCAAGACGATGCAACAGCACACACTTCAAGAGCATCGATGGCTTTTTTAAAGGGACACATTTTTCAGAGCGCCTTAACTCAATTTGAGGCGATT:1 + chr2R 4802887 5' + mariner2 533 1 73.81 ATTTTCGATTCCCCAGATCCCCGCCCCTCGCAGTCAATCCAATCCACTTAATAATTACATTTCCTTAACTTACTAAAGTAAGTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTT:1 + chr2R 11496445 5' + Cr1a 9 1 63.01 TAATTAATTTTTGTAAATGAGTTTCCAATTCAAAGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3L 18658228 5' + roo 86 2 80.14 GATAAAATTGAAGATCATCATGAACAATTCTTCTCACAGAACGCCGTGGCGATCCCAATATTGACGCTCTCACTGCTTCAATGTTCTCAGGTGATCTAACGG:1 - chr2R 7394616 5' - mariner2 342 1 76.47 CGCCAAATAGTTGAATAGTTAGCCCAGGCCCAGCAACACAAAAAAAAAATAAATAAAATAATAAGAAAAATATGGGAACCCAACCCAAAAGTCCATTTCTCATCTACCCGCGCACCCAGCATCGGGTTAAAAACAAAAAAAAATAA:1 - chrX 13253953 5' - Tc3 91 1 81.51 TTAGGGTTTTCCGAACTGAAGGGTTTTATTAATCTTTTTCTAATAAAATCAGCTTAATCAATGATTAGATGAACCTTGGGCGGGTGATGATGTTTTTTCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 - chr2R 11339176 5' - jockey 4966 1 50.68 GCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 - chr3L 2184966 5' + jockey 72 1 61.64 ATTTTGCTTCAATAGTTTACCACGAATGTGTGAAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr3L 14040985 5' + 1360 55 1 55.56 GGGGACACGGGATGGCGAATCCGGGATGCAGGCAGAGGCTCCACATTGATGGCAGATACTCCCCCAGCTTACATATAAAAATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 + chrX 20124457 5' - opus 7480 2 66.92 GTTTGGGAAGAACTTACTAGACCTACGGTTAAGTTACCATTAGGATTAGTCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGCTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTT:1 - chrX 20465863 5' + jockey 4833 1 66.44 CCCAATTGAATAAATTCAAAAACGAATTTTTTTTAAGTAAGCCATGTCAGGTTAGACTATGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr3R 4422058 5' + 1360 54 1 51.37 GGTGCAAAGTGTTTTTAATTCTCTCATTAGTAACTGAAATTACTCCACACCATTCCGTGTGATGGATGATGGTTGGCATGATACGGAGGAGCGAGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGA:1 + chr2R 12460975 5' + mdg3 5431 2 65.75 GAACAACGTTGAAGCTAAGGAGATGACATTTGAGTATTTTACTAATATTAGCATAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:2 + chr3L 24253589 5' + 297 62 2 65.75 ATCTATCGAAGTGATCTCCTATTCGCAGTAAAGCCACCTAAACACTTTTAATTATAGTAACTTCTAAGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 - 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copia 256 1 78.77 CAAAGTTTCTCGTTTTACGATGTGTTTTCAACAGTTGGTACGTGACTTTTCACTGAGCAGCGCAGTTGCCTCAGATTTCTCCTACCCCATTTTGTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1 + chr3R 20939104 5' + jockey 4702 1 64.38 AATTGGCCTTAGATTTATTAGTTTTTACCCCGTTGATCCTGCGACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTA:1 + chr2L 14884261 5' - hopper2 1533 1 70.55 AAACTTAGATATAAAATGATCATAAAGGATGGGCAAATGAAGTGTACGCTAGACCTAAAAACCAAAACGCAGGGGAGCAAACAATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAAT:1 + chr3R 13644744 5' - pogo 87 1 57.53 GATTGAAGTACGTATCTCCGATCCACCGATTTTATTAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3L 17904850 5' - roo 8990 2 77.46 TGGTGTACATTAAGTAAAATACTATGGTTCAAAATATGGAAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATT:1 + chr3R 4532831 5' - 1360 3369 1 71.92 TCACATATATGTGACATAAATTATAGGGTAGGTAAGTCACCAACAAGCTCTTATAAATATGATTTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGA:1 - chr3R 11978351 5' - Transpac 257 2 59.59 ATTTTTCTATTCCGTTTCTTAGCAAATTTTTAATTAATTGATAAGAGTTAAATATTAAGTTTCAGCTTTCAGAGTACCTTATCAAGTTGCATTCATTTTGTACAAACTAACTCACCACGCCCATACCCCAAACTCACCCCATGCAA:1 - chr2R 17443764 5' + HeT-A 5935 1 64.38 GTCAAAATGCGCGAGACAGACGAGCGGGGTCAGGACTATAATTATGGCAAGGTCAAACCGTTACGAGTGCCGTTGAAGATTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTC:1 + chr2L 18786755 5' + 17.6 225 2 54.79 CGGAACGAGGCGCGAAAAAGGGGAAAAATATGTTTGTGACTTGACGTAAGTCAACCCTGCTTACAGGAATATACCAAAAACACTCACTCAGCTAGTGGGAATGCGAACGCAAAATGTCATAATTTTTCTGGGATATCG:1 - chr2R 5795156 5' - INE-1 506 1 57.97 GCCTACGTCGCTATCTGAGCGCCTGGCTGGCAATTCCATGCGCTTCTCACATACAAACAATCAGAATTGCGGAGGGGCACACGAATAGCATACACAGACACACACACACGCACGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCT:1 - chr2L 4420650 5' - gypsy5 399 2 71.23 TTTTAAATTAAAATTGCGGGAAGGAGTGAAGCGGTTCGAATTTATGGCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCAT:1 + chr2R 22287378 5' + jockey 4800 1 65.07 ATCAAATCTCACCCTCTGATAGAAATCCTAGTTGTTTAAACCAATCAAATCCTTACCATCCGTATGATTTATCCTTTCAGCCCTTACAGGCGCGCTGGCTAACATGAGTTAGGTGTACAAAACAATAATACAAATATAACAGTTAT:1 + chrX 9299082 5' - BS3 1647 1 50.68 TATGCTTCGCATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3L 13362744 5' + jockey 57 1 54.14 GAAACCACAACTACAATCACTGCGGAATACCAAAATGCAATCAAAATATGCAAGCCACGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGAGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr3L 14551392 5' + P-element 64 1 41.78 ATATCAGCCTAGCAACTGGGAAATGGAAAAGCCCCCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTAAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAAT:1 - chrX 20864988 5' + jockey 4824 1 73.79 AAACATACTGAAATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTAAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGT:1 + chr4 123929 5' + HB 101 1 63.70 AAAATTAATTTGCGGCTTATCGAAACCATAAAAATTTTCTAATCCACTTTGCGTAAATAATCATGAGCGTCAATTCAATTCCGGCAGCCATCACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:1 + chrX 19982318 5' - hopper 1383 1 63.70 CGCAGTTTTGTGACTGAAAGCGACCGATTTCTAGAGATGCGTTCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 - 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chr3L 15277679 5' + I-element 79 1 68.49 GTTTTGCCTTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCGAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAG:1 + chrX 22596343 5' - INE-1 577 1 62.71 AGGCCATGCCCATTTCGGTGCAGACGATACCCTTGTTCCCCAATTCCAGAACATCGACAGAGCGACCTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr2L 8396831 5' - roo 9041 1 57.72 TTTGTGGGCTCGTGGTTTTATTAATGAATACCTTGCCTTATTGGCAGCAGTACGCTTTCCGCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAAAACCACTTTATAT:1 + chr3R 26244624 5' + copia 4904 2 49.58 CATGTTGACCTGCGGCGAGCAAAGGATTCAATGCAGTAGTTGGATGGGAAACACAGATGTGGCACATGCTCACCTGTTCGTAGTTGACAAAGACGGCTGCTTGGAACTTCCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chr2L 15765260 5' + Tirant 8133 2 71.92 AACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 + chrX 19005375 5' + F-element 72 1 64.44 TGCCGCACATCCAAATGAAACGAAACGAGACGTAGATGGTTTTCCAGTTCAGTGACAGCTTTTCATTTGTTTCATTTTCTTGCCGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - 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F-element 4686 9 92.19 ATTTAAATGTAATGAAAAGGTTACAGAAACTAGAGAATGGAACGATTTCTCAATTGAATATTTTTTTTAGTCAAGAAACTGTTAGCGTAAATCAAAAGAAATATGACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chrX 10287127 5' + roo 8679 2 34.93 TAAAAAGAAACAAAATAACTTTCTGCAGTTCAGGGACCTTTAAAAGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2L 7449778 5' - roo 332 2 70.55 TAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chrX 4214465 5' + jockey 73 1 63.12 CAAACTTCACAGGCAAAGTTAAATTATTAGCTGTAGGAAATAAAAAATGTTATTGTTTATGTTTAATGTTTATTTTAAATTTATCATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chr3R 19721025 5' + opus 7031 4 63.45 CTTGGGGTCAAGTTTCGCCCAACTCCGTTAAGGGTTGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGCGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 - chr3R 11773964 5' + P-element 83 1 27.78 CAAGAACATTCTCCATCGTTATTCCGATTTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGT:1 + chr3R 21276481 5' + BS 5005 1 75.34 TCTCTCTTTTGGAAACGCATATTTTATTGTCAAAATCAATAGATGTCAGCGTTTAACAGCTGCCAGCGGCAAAATACAACCCCTGATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - 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1360 3372 1 73.97 GAAGGATGCTGCACTCAATGCGCTGCTCCGTCGCCAGCCCCTCGTCACCGCAATTTAGTGACGTCAATGGCTAAATGACTGAGTGGCCAAATAGCAATGGCAGAGTGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr2R 7889320 5' + jockey 21 1 76.03 ATCGGAGTCTGGAAACATATTGAGTCGGCTGTTCCAAAACACAGGGATGTTTGACTCCTGCAGGCATGAGATCAATATCTGGATAGAGGCCCTTATTTTTCACTTATACACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 22444318 5' - roo 397 1 66.44 GAAGTATGCTTCGCATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 - chr3L 13362748 5' + jockey 66 1 55.48 TTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAA:1 + chr2L 14480453 5' + Transpac 5005 2 76.71 TTTAGTATTCTAAAAAACCATAACTTATAAATTTACTTTACTTCAATAGCACAATACTTTTTCATTACTTCTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 - chr3L 2467549 5' + jockey 4723 1 52.74 TACATAGGTTGAAAAAACTCTTAAGCCTTTAAGTACTATTAGCACTGCTTGCTTAAATACAGTACCTTATTATTATGACTTTCTTTAAAAGCATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAAC:1 + chr3L 5264344 5' + I-element 5078 1 67.12 AGCATTTTCCCGAGACACTTGAAGTGTAAATTTCATGGCCTCAATCAATGATAAATCTCCACGCAACAATGCGTCTATATCGGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3L 12899729 5' - 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HMS-Beagle2 295 2 72.60 GAGTGTGCATGTTAACGTTCGAATGCCCGATATACATATGAATGTTTGTATGTATGTAGTACATACTAAGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCG:1 - chr2L 470314 5' + Burdock 6184 2 59.31 AGAAATAATTTGTTAATGTTTTGGGAAAAACAATAAAATATACACAAAAAGACATTTAAACTTCTTATTCACTGGGACAGTTTACACATTATTAAGTTCATTTCTATGCAAAGAAATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTG:1 - chr2R 13212362 5' - diver 218 1 74.48 ACTACACCGGTTTTTCCAATTTCTCTTGGTGTATATGTTGTATATATGTTTGCCATATAATAAACTATTCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACT:1 - chr3L 5275016 5' + I-element 54 1 54.11 AAGTGCGCTTTAAGTTTTGAATTACTTTGCGGCATTAGCGTTTAACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 + chr3R 18541323 5' + hobo 56 1 65.32 CTAGTCTTCCGCTCGATGATTTTCGTAATACTCTCTATGTGTGTATGGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1 + chr2L 6755743 5' + pogo 72 1 67.81 TTTTGAAAATATTTCTAGGGGAAATCTAATTTTATTCAAGAATTTTCAAAGTGTAGTCGAGCTAAAAGGGGGAAATTTCTTAAAAATAACGAAAAGAAACATATTGATTTCAATTTCGACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2L 11734453 5' + Doc 8 1 78.77 ACTGGGAACTTTGGTCCACTCTAAACCTAAATTTAATGTTGCATATTTTTGGGGATTTGGTCATTGTTTTTTGAACCGGTTTTGATTCATAATCCACCCGCCCAATCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr2R 11339018 5' + jockey 12 1 62.41 GTTTCCGAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr2L 21153463 5' + 1360 30 1 57.69 ATGTGTCGGTCTTTGCCGGCGACCTTAGACATCATCAAATCAAATTTTTGCCTCCATTTTGCGCGTTTAATTTGGCCCCAGCTATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr3R 23668560 5' + pogo 18 1 69.12 ATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAA:1 - chr2R 1522954 5' + FB 618 3 69.86 AACTAAAAAGCTGAAATCACTGATTAAGCATTAAATAGCTTGTGTAAAGTCCAATCTATATATAAACATTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr3R 8596330 5' + hobo 50 1 51.37 TTAAAATAGTCAATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 - chr2L 14480553 5' - Transpac 272 2 59.59 ATGAGGTGCTGACCCAAAAAGCCACTGCCGCCGGTTACGAGCAGCACTTCCCCGCTTTTGTTGCCCATTGCGTCCGGGGTCAAAGTACACTGGTTTTTGGTTTAAATAAATAATACTTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCT:1 - chr3L 17057076 5' + jockey 4853 1 70.55 TTTTGAGTTAAATATTTTAAAACTTTCTGTTCATGGATACTCTTTTAAAAGAAATTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATATTTTCATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATA:1 + chr2R 7407948 5' + Idefix 24 2 67.59 GAAGACAATATGTGCGAGAGCGAGAGGACGCGAGGATTAGAAGGGCAGCTGGAAAGCTTTAAAAAAAAATGCGATGCAGGATTACAGCTGTTCGGGCTTGTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chrX 7967334 5' - P-element 2867 1 71.03 AGAGAACGGCATGACGTTTTTCTCGCTTCTTCTCGACCAATCGGAGCAAAGCGCCACTCTCACCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCGCGCACCCACCACCCACCAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chr3R 25138001 5' + P-element 15 1 72.60 ACGATAAACTGAATGTATAGTATATACATACTAGTTCTGCAAAAAATATTTTCAAAATCGTTATTAAATTTTGAAATTGATATCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr2R 8687932 5' - roo 9033 1 58.90 TTTTTGGTTTTTGCCCGCTCGTTGAATTCGAGTGCTTTCGGATACCCTAAAAACGAAATTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGA:1 - chr2R 11097378 5' + Juan 4088 1 58.90 GTTATTCGTTCCCAAGGTTTCGTTTTGCGGCCAATTATTATTTATTCTATTTGGTGTAATATTATTCTGTCTAAAGGTAAATCTAAGGTTGTTTCCTTGATTTTTATTTTCATTATTTCATATTCAAACGGGATCTTTTCACACTC:1 - chr3L 25723683 5' - S-element 1334 1 78.08 GGACCTGGAAAAATCTCCATAAATAACAACATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr3L 1981541 5' + opus 7052 4 76.36 TGTTGTGTGTATTTAGATTTCGCCCGCTCTTTTCCAGGTTTTCCTTTTCGCGGAGCGTGTGACAGGGTTCGGTAATTAACATCATGAAGGGCTTTAGATGGATGTGCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3L 6675440 5' + 412 15 2 75.34 GAAAGTGGGACGAAGTGGAACATACATCTTCTACCCCCAGCGGGAGTTTCCTGCTTATAAGGAAGTAGGTGCCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr2R 14722648 5' - mdg1 377 2 54.79 GAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3L 18199971 5' + Doc 8 1 53.12 CAAGCGAAAACAAAACTAAAAGCTAGACAGATTTTTGCCTGATTACGCGCAGCATTCACTCCTATTTCCCCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3R 25409672 5' + jockey 21 1 73.97 GAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 - chr3L 13228542 5' + P-element 63 1 35.38 ACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTT:1 - chr3R 1977621 5' - micropia 5393 2 60.17 CCAACTTGCCATGCGAGGCAATGAAGCGCTGCATCACACCCTTGGTGGCGCCACCGAAGGCAAACTGCCGCTTCTGGGGCAGACCAGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGGGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAG:1 - chrX 12515099 5' - jockey 117 1 61.87 AAATATATGATCAAATTAACATTATAATTGAAACATATTTTTTTTTATATTTTACCACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chrX 10303787 5' + roo 54 2 60.45 AAACTACTATATTTGGCCACAAATCTTCAATAATGTTGTATCATAAAACAAATACTGCTAATAACAATAACAAATAAAACAAAACAATAATAACAATAAACAAATACTGCTAATAAGAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr2R 17187850 5' + roo 3 2 42.47 CACTAAACAAAGCTGTTGCAATGTGCAAAATGCTGCTGTTGAAAAGTCCTTGTTGTAATTACGTTTTGTTTTACTCGTGTTGAGGCAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAG:1 - chr2L 9861409 5' + BS 4996 1 58.22 AAGCTAAATAAATTTCTTAAAAAGGATTTCGTTTATAACATTTAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTACTGCATATATATTCTTGATCAAGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCCATGCCCATCTGTCCCTATGAACGTCTAGATCT:1 - chr2R 5198444 5' + INE-1 133 1 67.81 ATTTGCCTGTTTTCCAAATTTAATCTCCTTTAATTTGGAATTCAGGCAGGTTTGCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTA:1 - chr3L 16875769 5' + jockey 4829 1 64.38 CAGAAGGCTATGTAAACGATGGTAATTACGATAATTACATTCTTATACTTTTGTATTTATTTATTCGTAAACTATTTTATTCCTTTTACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chrX 18190320 5' + hobo 31 1 61.70 AGCAATACAATACATTTAAAATGATTTACTTTTGACAAATTCTTAGTCAATAATTCTGCTATCATATTATTATTATTATCATTTATTATTCGACTTACGATAGGAAAATTAAAAAATAAAAACCGTAAGTGGCATGCACGATTCAT:1 + chrX 21177276 5' - Rt1b 5077 1 67.12 ATATTAGTAAACTAATTTACTAATCTTGTTTGGTGTTCCGCTTACAGGCTTATCTACTTATTTACTTTCGACTACTTTGTGCTCATCTGAAGTTTAGCTTTGTGCAAGTAAGCAAGTATACTTTAAACAATATAATAATAACAATA:1 - chrX 5478418 5' + hopper 1113 1 71.92 CTGGTGTCCCAACAGCCCAGTTCCTGTGGACAGATGCAGGCCATGCCCATTTCGGTGCAGACGATACCCTTGTTCCCCAATTCCAGAACATCGACAGAGCGACCTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 8396794 5' - roo 394 1 75.00 CAATTTGTTTTTTGTTCGTTGTCTGCGAGTCGTTTGTCTCCTGGACGGGAGAATTGGGGGTCCCCACATTTCAGAACTCCATCCATCCTATCATCTTGCATACTCATTTGTAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 + chrX 5398951 5' - opus 494 2 80.00 ATTTCTATTTTACTTAAAATTTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATAT:1 + chr3R 9175195 5' + Juan 60 1 54.11 CTTGGTTCGGATGGATTCGGCTTGGTGCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTT:1 - chrX 12003980 5' + P-element 93 1 21.92 TACCAAATGTATCTCTAATATATGTAAGATATACTTCAACTGAAATTACATCTATTGAGACCAGCCAAGCGATGTTCAAACATTGTTTAAATATATCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATA:1 + chrX 19849764 5' - micropia 153 4 66.67 GAAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAGGGAAGAGTGACAAACACAAAATAAAAAATCGGGGCGCAAAAAAAAAATACGACCGTTCGCTTTAAAAGC:1 - chrX 9023560 5' - Cr1a 4 1 59.59 AAAATAGTTTTTGAAAGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGTGAAAGAGACCTACTAGGTTATCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGAGAATGCCATAGTCTAGTTCCCCGGCTATCAGATACCCGTTACTCAGCTA:1 + chr3R 18346594 5' - INE-1 544 1 42.47 CGCACTATGAAGCAAGTGAAGCAAATGTGAAGCAAGGCTTTCCTTGAAGTCCTCATCCGGGACAGAGTGATGTACGCCTCGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 + chr2R 5640686 5' - 1360 3347 1 56.16 ACGTGATCAACTCGAGCGCATAGAAATTAATTTATAAATTGCAAAACCTAATTACGTAGCTCAAATACTTCAGTGTGTTAGCGATGCCATCGAAGGCGTCGTCGATGATGTTGTAGG:1 - chr3L 9070414 5' - gypsy10 5707 2 52.14 TATTTTTAAAATAGTCAATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 - chr2L 14480558 5' - Transpac 5200 2 64.79 ATACAGCCAAGTGACGTCATCATTCGGCAAATCAAGAGAGCGACATCTAACAAAACAACAACAGCTGACTCAGAGAGAGCAGGAAAGAGTTTTCGATATATATGTACACATATGTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCT:1 + chr2L 19548387 5' + flea 4761 1 73.29 GGGCACTGGAGAGAAATACCTAACTTGCATAATTCTGGACACTGAAGAGAAATACATAACTTATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTC:1 + chr2R 924423 5' + springer 58 2 58.22 AGCACAGCGCAAAATCCGTCCCTTACACCTGAACTTCCTCTTATGCTTCAACACGCTTTCGCTGTAATTTCCTGTTGGCAAAAACTGAAAACTGACAGTGCACTATGGGGCATTTCGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTC:1 + chr3L 10563856 5' + hopper 25 1 67.12 AGTTGGAGTAAAAACAAAACAAAAAAACGATAGAATGCTAGTGCAAATGTCAACGAGAAATTTCAAAACCTTTCAGCTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr4 367146 5' + opus 7043 4 57.24 CTTAACTATGTAATAAATACACTCATAGTTTTATCAACGGAGGAAGGTCTTTTAGAAATGCTTGTTAATAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chrX 11267687 5' + roo 51 2 53.42 ATGAGTAATAGGTAGCTCAGTCACATTGGAAAAAAATTTCATATTAATGATTTGAATGATTTGTGGGCTCGTGGTTTTATTAATGAATACCTTGCCTTATTGGCAGCAGTACGCTTTCCGCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTA:1 + chr3R 26244565 5' + copia 4872 2 76.71 CTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chrX 5206530 5' + Tirant 37 2 61.17 AGTGATTGGAACTTTTTCGGACTGATTTTACAAAGCGATAATAGCGCAGCCAATGAAATATTTATGCATTTCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr2R 10600124 5' + 297 6605 2 70.55 CAAAGTCTTACATGGTGACCAATTACCTTAGACAATAAGAATAACTCTTAAGCTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATTCTTTAGTTGTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 + chr3R 5453599 5' + I-element 29 1 65.75 AGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chrX 16217525 5' - P-element 2853 1 52.17 CGTTTCCTTTAATTTCCCTTTTCGAGTGACTCGAAGTTTGTCAAGAGCGTGTTTTTTGTGTCATTTGCGTTTGGAATAGTTGGATAGCAGCACAATAGCAATGATGTGTGTGTGTTTATGCACACAGTAAATTCTTTTTGCACAGC:1 + chr3L 8016067 5' - G3 19 1 60.27 TTAAAATACCATTATTAAAGATAAGTAAAATCAAGCTATCCAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chr2R 9091959 5' + 412 80 2 75.34 AAAGAAATCGAACGCCAAAGGCTAGCTAAATGAATAAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 - chr3L 20388252 5' + 1360 25 1 67.14 TTTTATTCACGAAGGTAGTAAGCGCAAAAGCGTTGCTAAATATTAAAGGTACATACATACATACACCTCTATACAGTTTGTTAAGAAACTGTTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGAGTTTTTTGCTTA:1 - chr2L 22150650 5' + S-element 62 1 84.93 AAGTACAAAAAATACGAATAGTAAGTAAAAAGGAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCT:1 + chr3R 5024840 5' + diver 87 2 75.86 AACTTGCAACTTTAAGTAGCGCGCCCAAAAGTACGCTTCGCATTAATGGCGCAACGTCTCGCCGCTTAACCGCACTCACTTCCAGAACTTCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 - chr2R 7889523 5' + jockey 4676 1 51.37 AAGTCATCGAGGGTCTCCAGCGGATGAGTGATGTCCGACAGCAAAAGAAATGTGACCGCAACTAAAGTTTGTTTTAATTATTTCAGGAAAATAAAAGCTAGACAGACAACAACAATTTGGGCGGTGGCAAAAGTATTGAGACATCA:1 - chr3R 13086366 5' + Tc1-2 205 1 64.38 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAACTGTTCTATTATTAAACGGCCCTAATAATTT:1 - chrX 706056 5' - F-element 4552 1 62.33 TACAAGCTCAACGGCCGAGGAAGCAACAACAACCACTGCTTCTCCTACTACTACTGAAGAATTGACAACAACAATATCTCCCACAACCACATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGC:1 - chr2L 14161664 5' + mdg1 7206 2 71.01 AAAGAAAATAATCTCATCTGCATGTGGAACAAATAAACGATGAATGGATATGAACAATAAGAAGAATTAATACCACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chrX 19959914 5' + roo 8710 2 54.79 CCTTATTCAGAGGTCGATAATTAGTTTCGATGTTGATTCCTCAGATTAGTGCGAAAGAAGCACTTATTGATTTCGACGTAAAAACCCACACGTATCTATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1 + chr2L 6319698 5' + Tabor 24 2 65.07 CATAGCAATAACTTATGTATGTACGTCTACGAGACGCATCTTTTAAATAGGAGGTTTTCCCGAGTATTTCGTTTTCCCCACGCTCCGTGAAAAGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3L 22884062 5' - roo 9045 1 67.81 CTCTTTTTTCTATTAATGTGAACGTGGTGGATTTGGACGAGGAATTTTGTGCACAGTGATCTGATTTTAGATAAACATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGGTATTAACCCTGAGCAGCCAAAAA:1 + chr3R 3346042 5' + Cr1a 483 1 69.86 CGTGGCGTGAAAAGAACAGAAATGGCTATGCTAGACTACCTATCTCATACTCTTTAAAATATTTGTCGTATAACTCTACGAGTAACTGGTGTTAAGTGAAGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACCAT:1 + chrX 20350507 5' - INE-1 565 1 69.78 AGAGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1 - chr3L 12861801 5' + pogo 71 1 67.81 GGATTCAAAATGTATATTTCAATAGAAAGTGTAATAAACCTTTTGTTAGCGTTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTT:1 - chr2L 3282665 5' - flea 4947 1 64.38 GCTTAGAAATATTTAACTAAAAAGCTGAAATCACTGATTAAGCATTAAATAGCTTGTGTAAAGTCCAATCTATATATAAACATTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr3R 8596316 5' + hobo 36 1 59.59 AGTTGAGAGACAATCATGGCACCCCAAGAATTCATTAAAAATAAACATACATTGGCACTATAGTACCTTTTGTGGCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTAATACCAAAGACACTAGAATAATTTTATTCTAGTGTCTTTGGTA:1 - chr3R 13376094 5' - Tc3 240 1 71.23 TATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATATATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAATTAGCAGTGCTTGGGCAATTTTTTTTATAATCTCATTAGGTATT:1 - chrX 22460188 5' - HB 1538 1 78.77 CATTTGCATATTTCGTGCACAGGAGGAGCTGCGTTTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTGACAGCTATATTTATTTAC:1 + chr3R 25843367 5' - I-element 5278 1 69.86 TGGGGACCCAAAACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACA:1 - chr2L 20324214 5' + Tirant 8128 2 62.26 CCATGCTTACGAATATTTCGTTGTAATTGGTTTAATACATTTAGTTGGAGGTTAGAAGGTAAAATATAATATATAATTAATATTTTTTAGGAGGCACATAATGACTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCA:1 - chr3L 5427274 5' + G2 2845 1 71.92 AAACATTTATTCCTGGAATCACAGAGGAGAAGCGACAATATATGTATACCGATTATTCGGAAATTGAACCTTGATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGT:1 + chrX 21581109 5' + Tabor 63 2 53.15 TCCATTTTTTCTGTTGCTGCTAAGACAAAATGCCAAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAA:1 + chr3R 28782585 5' - blood 7302 2 77.40 CCCCTGCCGCCGAACATCGCCCACCTAAAACGGAGAGGTTCGTTGTCGGCTCCACTTGGTCCTACCCCAAAAAGAGCCGATGTATCCCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr2R 9456178 5' + 412 34 2 52.05 GCCAGTTCACCCAGTTGTCAATATAGTACGCTGGACTGGTATTTTTATTATTTATTTTTTTATTTATACCAGATTCGTTAAAAAGTATTTAAAAGGCAGAGGGAAGCGTTTCAGACCATATAAAGTATTCTTGATGAGGATCAATA:1 + chr2L 20413498 5' + INE-1 84 1 54.79 AAATAACTTGAATAACTTATATAGTACGAATGTTGATAGTTGTGTTCGCTGTGTGTTTTCTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 + chr3L 15859562 5' + I-element 7 1 80.00 GGCAGGAGGAAAAAAGGCTGGAAAATTCGATTAAAGGCGACCAGGTAAAATGCAATTAGAGGGTGGGATGCGTTATTAATGTGGAGCGCGAGCTCTGGCAGCCAATTGCCCTGCACCGCGGCTGTTGCTAGGC:1 + chrX 13916005 5' - gypsy8 4695 2 78.95 CCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACAT:2 - chrX 21636246 5' + Stalker2 7329 2 72.60 AGGGAAGCGCTTTCCGTACCGTTAACAAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCC:1 + chr3L 23773876 5' - Transib5 2863 1 76.81 GCGTGTGTGTGCCACTGCACTGAGCGAAAAAAGGCATACCCTCTGCATTTTATGCATAGAAAACACAGTTAGAGAGCAAAGTTTTTGTGGCCACAGTCGAAATAACAAAAATATATAATGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAAC:1 + chr3L 17162245 5' + Stalker2 7253 2 36.99 CTTTTATAGTATAATTAAATTAAAATTACATAGTAATAAATGTTCAATACTACATTTAAATGATATATAAATATATCATTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTT:1 - chr3L 17162407 5' - Stalker2 7607 2 53.42 AAATTAATTTGCGTTTACGGGTACTTAACAACTTGGGCACCCCTCTGGAAATATCCGAGTGTATTAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCA:1 + chr3L 26019333 5' + gypsy 60 2 58.22 AACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGA:1 - chr2L 14480538 5' - Transpac 257 2 54.79 CAGGCGGAAGCGATCGGCTGGAGGTCGGGGGACCAGGAGTCAGTTGGGCCGTGCGCAAAAAGGGAAA:1 - chr2R 4297818 5' + gypsy8 303 1 89.55 AGTTATTGAATTGTGAATGAATAGGATACATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACA:1 - chr2L 5710984 5' + HMS-Beagle 6864 2 74.42 GCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2L 18213176 5' + roo 51 2 82.29 GATAAGCCCAAGGTCCATGCCTGTCGTCTGGCTATATCCCACTGCCCATACATATAGCCGGGCTCAAATTTAAATAAATACAAGCAAAGTGGAAAATAAAATGCGCACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 - chr2L 16385387 5' + I-element 7 1 77.86 CTGAAAGAAAAGGGAAAACTCACTCTTACACATATATACATATGTATAAAATATTTAGTTACTAAACGAGGAAGCTTAAGATTAAATAAAGCATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 12609961 5' - roo 9043 1 64.83 ATATAAACCTAATCTAAATGAACTCGAAAGCTAAAGGATTGTTTTGAATTTCAAATCGTACCCATTAGGCTTAGAGAGCAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3R 19543386 5' - roo 367 1 56.85 AATCACGTTTGACACCAGACTGTCTAGGAACGTCATGGGGATGTGTAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 - chr2L 9347562 5' - opus 7445 2 64.62 ACCCTCGCTGTGGGCACAGTCCGTCCGTTCAGTTGAAAGCCCGATTCACGACTGAACGGTCGGACGACTTCATTGGTGGAAAAGGCACTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr2L 13717258 5' + P-element 9 2 73.77 GTGCGGAAAATTAATATCTGTGTCATTTTTTAGGTTAATAAGGCCAAATTGAGTATATGTGCCAGACACACACTTAATTATCATCATATTTATGGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCT:1 - chrX 20874419 5' + F-element 354 1 66.44 AGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGT:1 - chr2R 21425152 5' + HMS-Beagle2 68 2 65.75 GTCTGTGGGCCACGGATTCCAATCAAGCGTTGCGCGTATTCGTGGGTCACTTGTCGGACGTGGATTGTGTACATTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1 - chr2R 10878035 5' + 412 84 2 58.87 AAAGTACGAAGTTATCGTACTACAAAGTTGATTATTCAAACCACTTTATTCATTAGGCACCATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1 + chr3L 20209538 5' + Burdock 54 2 59.31 GTTCGAAGAAATACAGTTGCTAGGATATTTAAGTACCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATAT:1 - chr2L 6319813 5' - Tabor 401 2 73.97 GTGCGCTTGCTGGAAGATGGGAAGATGGCAAATGGGTGGTGGTCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATG:1 + chr2R 20447811 5' + hopper 64 1 64.66 GTCTCACTTTATCTGACTCAATGAGAATCCAACTTGAGTCTTGCCGGCTCAGATAAGCCCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:2 + chr3L 13228414 5' - P-element 2874 1 76.71 GGTGGTAGAGCAAGGTATCGCAATTATGATTATGTATATCCTGGAAAATTCAGCTTGCCTTTCGGTTCCTTGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTGCGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGCTACCCATGC:1 + chr2L 11867243 5' - jockey 4967 1 67.12 ACATAATAACCATGCTATGGATAATTTATCTATAGCGGGTGGAATAATAGGTAATAACTACCTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr3L 14084857 5' + opus 24 4 60.87 CTGAAATTCATTTGCTTATCTCGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr2L 10045254 5' + jockey 73 1 76.11 AAAATGCTTTGATCAACCAGGAAGTACAAAAGTCGGAACAGCCTCGAAAGAATTGGGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAAT:1 - chr3R 5430493 5' - Burdock 194 2 61.64 ACAGTGTGCTGCCTCTAGTCTTCTTCTTCTCGCTCTTTGCGGCCATAATTTATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAGACTTAAATT:1 + chr3R 16228829 5' + P-element 44 1 45.53 AGGCCCAGAGCAACAAGGCCTTAATTTGACAAAGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTTTCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTA:1 + chr2R 9410479 5' - hopper 1330 2 70.55 TTTGCATAATTGCAAAAAACGAATGGCTCGAAGTTCGAGCCAAGTCAAAGAATTCTGACAGAATGTCAAGAGTGTATTTCTATCGTTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCCCC:1 + chr2R 1708615 5' + 17.6 231 2 59.31 ACTGTTGCTAAATATTTAAGCCCAGTGGGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTCAACCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1 + chr2R 9623365 5' + I-element 79 1 74.60 CAAATAACGATAACAAATTCCGAAAAACTCAATAACATAAGTTATCTTGTTATGACACCTCATAGACATATGTACATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCT:1 - chr3L 20209664 5' - Burdock 212 2 54.79 ATTGATCATCTTAACTTTCTTAATTCCGAAAAAATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chr3R 10636228 5' + blood 7037 2 65.96 AGTAGCTTTCCATGTTGTCCACGCCGCTGGGCGTTGCTCCAAGGACGGCCATTCATCTGCTGTCGCCGGGTGGTTGGTTAGGTAATACCTCAAGAGATCGAACTAACCGGACATATTTTCCACAGAGCTATTGATTCCTCGGACCC:1 + chr3R 28900696 5' + transib2 2383 1 77.40 CCCTTAATAAATTAAAAGCAATAGAAAATGAAGTGACTATTTATATGCTCCATAAAATATTCATAGTTTAGGCTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAA:1 + chr3R 5316532 5' + Juan 4075 1 51.37 AAATCGAAACCACAACTACAATCACTGCGGAATACCAAAATGCAATCAAAATATGCAAGCCACGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 - chr3L 14551397 5' + P-element 59 1 45.21 CCCTTGTATTTTTTTATTTTGTTGCCTGACAACCCTGGCACAGTGTTGTTGTTTGATATGTAAAGTTGTTTACATAAATACTACATTCATTTATTTTTTAATTTAGGAAATGCTTAAATTATATTACAAAATACA:1 + chrX 11645123 5' - HeT-A 5802 1 62.22 AATTTTTAAATTTTCTCTTATTTTATTATCCCCAATATATATATATATCCCAGAAGAAATTATGGAACTTTGCCTTAACATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACTATAACATTCTCTCTTTTTT:1 + chrX 21452476 5' + INE-1 581 1 74.66 AATGGGTGGGAATAGGGTAAATGACAAAATGACTGCTTTCGCGGGGGCGGGAAATTGTAAAGAAAATCGAAAAACGGAAAAGTTTTGGCCATTGACAAACGCATTAAGAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGT:1 + chrX 18737167 5' - I-element 5344 1 75.69 AGACCCGGGGTATCCTCATTGTGCGAGTCAACTTTGATTTTGCACGTTAAGCGGCTTAGAGGTGGCTTCAGGCTCTCTCGAATATTTGTTCGAGAGCAAGAGAGCGGACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTG:1 + chr2R 19007058 5' + 1360 155 1 60.96 TTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGG:1 - chr2R 2868559 5' - Rt1b 4704 1 54.69 AAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTAAAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTCTTATGCCGTAAGCTTGTTGCGCG:1 + chr3L 20224133 5' - Chimpo 126 1 58.22 ATGCACACCGTTTATTATTAAAATCAATTTGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATCTTTCCCTAAGTCCCTAG:1 + chr3R 17210035 5' - HMS-Beagle2 7103 4 77.40 GCTCATTCTTCTTCTTCCACCGATGCCGTAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGT:1 + chr2L 19158853 5' - P-element 2795 1 22.60 GCGAGCGTCTCAATTCACTGCACATTTTGCAAATAACAATCGCATTTTTTGAATAATTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATGTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 - chr3L 17108635 5' + hobo 62 1 58.22 ATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCACAATGCTGACCAA:1 - chr2R 21425156 5' + HMS-Beagle2 6947 2 61.64 TTAAATCTGGTCTAACGTTCAAAATGTGCCCCAACTGAAGAAGAGTAAATAAGAAATTTTGAATGTATCTGTATTTGTGTGCTTAATATGCCTATTTAAAATGCCAGTTTATCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 + chr2L 8707375 5' + 412 8 2 76.03 GACTTTTACTGCCAGATACTGTTGCTAATTAATTTCTTTCATCTAAGCGACGTGCAGGTGGGCCGTGAAATGATTTTTCTATTTCTAGATCTGCGAGTTCAGGCTCATTAATATGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTC:1 - chr3L 18602401 5' - R1A1-element 4927 1 74.83 ACAAACAATCGATAGTCGACAGTACTGTGGATGGTTGAACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 + chr2L 2999221 5' + P-element 84 1 28.77 CACATTTTGCAAATAACAATCGCATTTTTTGAATAATTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 - chr3L 17108615 5' + hobo 64 1 69.53 AAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCA:1 - chrX 22574696 5' + 17.6 114 2 45.89 GTTTGTTTGGTTGTTGGACCGTAGAACGCCAATAGCTCCGTTGGCAGGAAAGACCAAACCGAAGTGGTTCTTATTCTTACAAGAGGTATCGAAGCATATAGCTAACAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAA:1 - chrX 3504639 5' - Gypsy6A_LTR 114 1 66.15 TGTGCGACGCAAGAATTAATGAACCTCTCGAGTGTGTTTTAAAACGCGCCAAGATAAATCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 + chr3L 6675293 5' - 412 7493 2 55.07 GTTCAATGAATGGAGCAACGCACGTATTTATTTAGGCCGCAGTCTGTCTTTTGATTTTGCGACGAAGTAAACAAGTGCTTTATTTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 + chrX 10367521 5' - Juan 4171 1 52.05 ACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCA:1 - chr3R 21276614 5' - BS 5023 1 63.70 AAGTAGCAAACATCAGCATCTCATCCCATCCCCAGAAGCTTTTCCTTTCCTGCCTTTCTTATGGAAATTTGATGTTGTTGGAAAGTTAAGTTCATTAAGTGTTAGTATTTGTAATATCGCAACTAATTATGTAATTAAAATGTTAA:1 + chr3L 15190361 5' - Cr1a 4271 1 76.03 TCGGTCAATTAAGTTGTCACTGGAGAACTATATATACATACGTGTATATGCACAATATGGTATGACCTATTAATAAATTATATGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAAGATAAAGTCTATTATA:1 - chr3R 23082012 5' - Cr1a 4208 1 57.75 ACTACATAAGTGAATAAGCGAATGAGTACATTATTTATCATAGAAGAGCAATATAGCGTTTTCCTCTGTGTGGCTGTTGATATAAGATGAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr2R 6713985 5' + 297 6607 2 67.12 AACTAATTTGAAAGTAATTTGTTTTCGCATAGATTGCATATTCTCTTGTCAGCCCACCGCACATCATAATCATAATCACATAAAAAAGTCATATCTTGAGGCACGAAGCGCAGACACAAGCACTCAAGAAGCAT:1 - chrX 12979394 5' - 1360 455 1 63.43 CACAGCGGATCAATCAACATGATTGAAGTACGTATCTCCGATCCACCGATTTTATTAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3L 17904870 5' - roo 342 2 64.38 TCACTCCTCTGGCCGACAATATGTTGCACTTGAGCTGCCACAGCCGTTTAATACCCTGCTATGAATTCCATTTAATTAATATTTATTTACTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 - chrX 20607109 5' - I-element 5314 1 56.16 CGACAATCGTGATAAACGAGATTAGTTATAGAGCAAACCAAGCAAACTGTCTCATAGTCATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 + chrX 19113471 5' - 412 7493 2 55.80 TCTCTCTTTAAAATGTAGCTCTTGTTGCCGTTTTAATTGTGAAACTTTTGTCATGCAACTTGCATATCTGCACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTG:1 + chr3R 25442785 5' - R1A1-element 5318 1 65.49 AGGTTAATTAAGGAACATAGACATTCCACTACACTTCAATTAATAATCCTAGCAAAATATTTATCCGAAATTAAGAATATTGAATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 12610116 5' + roo 8702 2 57.53 AATCCCGAATGTGACTAGAAATTTGATTACATTAAAGTACAAAAAATACGAATAGTAAGTAAAAAGGAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCT:1 + chr3R 5024806 5' + diver 54 2 56.16 AGAAAATGAAGTGACTATTTATATGCTCCATAAAATATTCATAGTTTAGGCTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTA:1 + chr3R 5316554 5' + Juan 4096 1 63.45 ATGTTTTTAAACAGCTGCACGCCTTGGTTGACAAATTACATAGGCTAATTAGCATATATATCACATACTTCCTAAATTAGAAGCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - 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chr3L 3565448 5' + gypsy 23 2 67.12 CCCATACAACAATAGCTGTACGATAAACTGAATGTATAGTATATACATACTAGTTCTGCAAAAAATATTTTCAAAATCGTTATTAAATTTTGAAATTGATATCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:2 - chr2R 8687951 5' - roo 389 2 71.92 AATTTATTGTCAGCAACAAGAATCACAGCACGATGGACAAAAAACAAAATAAAAAAAAACTGAGACTGCAAACAACATTGCGATTTGTTTGCCGATATATGAATTCATACACACATACATACTATATATGTATGTATATATATTCT:1 - chrX 11541606 5' + 1731 4412 1 80.14 ATGGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGAATTTGCCTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATA:1 + chr2L 7271842 5' - 297 6901 2 75.00 ACTCTCAGATAAGGAGCGCGCACAAAAGTATGCTATGAAAACCGTAATCATAATCGTAAAGCTTAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAA:1 + chr2L 17729347 5' + jockey 4817 1 58.90 TAAACGAACAGTGGGCATGAGCAGTTTGCTTAAAAAACCAGGATATTATGTAAAGTGAAAGTCATTACTACTTGCTACTTTTAAATTTTATTGTTTGTATTATTCTCCCATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTGGGT:1 + chr3R 11997797 5' - FB 449 1 80.14 GCCCTTAATTAATTTTAGTATTCTATCTCGTTAGAATGGATTTAGTGCCTTTTTTTAACTCATTTTTGAGAAATCCATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTA:1 - chr3R 6439492 5' + Juan 3887 1 53.42 AATGGGTGTTTTATAATACGATTTCGAAGTTATGTGTTCAACAAATGTATAACAATTATATATTATCTTATATATTAAGAATGAAAAGTGCGTTATAGTTTAAATAACTACTTAAGAGGAACAAAATTTAAAAAAAATAAATAAAA:1 - chrX 15174202 5' + TART-C 11098 1 74.66 TGGTCTAGGCAATCAATGTGCTGCTTTTATGCGGAAAGATATGCATAAGTATGAACCATATCTTTCTGTCACTCGAGGATACTACAGTATTGTTTTTTTTTTTACTTTTTA:1 - chrX 5075579 5' - Doc 4696 1 74.77 GTGGGAAAATATGCTCTAATGGCAACATTGCTGCGGCCTTAAATGTTGATGGAAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACATCGGGAATGATGAAATAACATAAGGTGGCCCCGTCGGCAAG:1 + chrX 2517980 5' - P-element 2872 1 71.63 ACTGACCACTCTTCACTGTGATGCTGCAGTTTCTGAAAAAAAAATAGGAAAAAGTTGATCCAAATTTAAGTTGCTTTAATTGGCAATGGCTACGTTTTGAAACATGTACATCACCATGCTGTCCCGGAGTAGGGAAGGAGGGGAGG:1 + chr2L 10906212 5' - G-element 293 1 75.34 ATAAGTTTCTGAGCTAACTTAGCAAACATCCAATCTATTGGTTCCCCTTCCGAGGCTTCACTGTATGTGAAAAGCACCAAAAAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATT:1 + chr3L 6777800 5' - I-element 5189 1 44.52 TGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:2 + chr2R 9504223 5' - roo 8995 2 72.60 AACTAGTTTACTTTCTAGCCACTGTGTTCAACGCTCATCAACCTGATTTACCTATTAAATCATGACTGTGTGCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr3R 30302250 5' + Doc 53 1 51.37 ATAAATCTAATATACAAGCAATATATCATATTTAAAATATTTATGTTTTGTTTCATCAAATGGCTGCTAATGCTATAGTGTAAAAAGATATATCCTTGTTGCAAATTGAATAAAACAAATTTATTTAATTATTTAGTAAACTGTTT:1 - chr3R 24893590 5' - HeT-A 20 1 50.00 ATGCAAATAATTGGTGTTAATGACGTGCCTCAGTATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chr3R 4533013 5' + 1360 19 1 73.29 GATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCA:1 - chr3L 24208211 5' + Quasimodo 56 2 61.81 GCCATAAAATAGCTAGATTGTTTTCACCTGCTCTTAAAACGCTCTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTG:1 + chr3R 5264841 5' + P-element 77 1 32.88 ATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 - 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chrX 3578199 5' + hobo 41 1 47.14 CTCTGACGTAGCTCATAGGTTTGTATTGACCTCACCCACATTACTCTATTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chr3L 18034646 5' - Transpac 5160 2 67.81 TACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGAC:1 + chr3R 19450159 5' + roo 96 2 76.71 GCCAAGACATGATCACACCTCAGCTGCTAGACAATTTAATCCATTCTTCCTTTATCTGCTTTGCATTATCCAAAACAGTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 + chrX 21581326 5' - Tabor 7281 2 48.63 GCTCACTCGCACAGCTGTTGTTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1 - chr2L 14490167 5' + P-element 22 1 39.44 GGTATGCGCGATTTCATCGGTGCACCGGCACAAAAATTTTACGTTTCAGCACATATGTATGCACATTTTTCAATTGATATTACAAAAAAAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chrX 3660843 5' + 297 6595 2 64.44 AGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3L 13827347 5' + roo 28 2 67.12 GGATTGGAGGTAACGGCGAAAATATCATCCCAAATTATGCACACCGTTTATTATTAAAATCAATTTGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACT:2 + chr3R 17209999 5' - HMS-Beagle2 256 2 54.11 GAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTATGTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTGATTATCGTCAACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGATACAAACCTTA:1 + chr3R 12717758 5' - R1A1-element 251 1 63.57 GATTATTTTGTGCATGTGAGTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGCGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGCAGCTTTG:1 - chr3L 3565419 5' + gypsy 7013 2 57.50 TTTTGGCCAACGACACCTGCAGACTAATTAATGGCAAATTCCAGGCACATCACTTCGATGTTCATATATGACTGGCGCACACCTTCTTCAGCGTGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACT:1 + chr3L 20176709 5' + gypsy 15 2 69.17 TAATTTAATTAGACGAAGAAATATTCAGTATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGTCATCTCTA:1 - chr2R 5045687 5' + invader6 45 2 54.11 CTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr2L 18178333 5' + Tirant 7 2 58.18 GCCCCAAACAACAATTTAACCTCGAATAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTAATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAA:1 + chr2R 13193812 5' + Tc1-2 476 1 78.08 CGGTTATAGATATGTTCATTTGCACCCCATAATATATACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 + chrX 19005327 5' + F-element 34 1 52.41 GCTCCGCAGCCAGCAACCCATGAGATTTATCGCGTTGCCAGTCACTCGACCTCCGATTTCGTTCCGTTTCAACTGAGTGTGAATTTCTCAGGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr2L 18944774 5' - P-element 2876 1 75.38 ATACACGCACAGCCTCCATCCGCGCGTGTTTGCCCTGTTAAGTATGCTATGATTTATGCATCGCTGCTAAATGCTGCTGAGGTTTTCCCCGTTGATCCTGCGACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAAT:1 - chr2L 14889073 5' + hopper 16 1 74.66 AAAAAGTTAATTAGAGTTATTCACGTACTATAACACGATACTCACAATTAAACGGGCTATGGCACTAAAGGATGACAGTACTAAGGACAAACAAGGACATAGCAAAGACCCTATAATAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTC:1 + chr3R 17615041 5' + Tc3 306 1 61.64 AAAGGTGAAAGGTGTTCGTCTGTTGATTCAACCCTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chrX 5206563 5' + Tirant 8122 2 70.18 CACCGAGGGTTAGATTTGTTTAAAAAAAAAATGTACATAAATGCCATAAAATTCAGTAGCACTCCGTTTATTTAACATTCACAGCAAGGTTAGAGTGTAAAAAGTGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 - chr2L 8707574 5' - 412 7531 2 70.55 ATTGATGGAAAAGATTATTGTGAAATTCCACGAAGGAACATAGAAACGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1 + chrX 4823542 5' + pogo 70 1 66.90 GGGAAAATGGGATTCAAAATGTATATTTCAATAGAAAGTGTAATAAACCTTTTGTTAGCGTTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTAT:1 - 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chr3R 12610073 5' + roo 81 2 73.29 CAATTTCATACTTTCCCAAATGCCAAACGAAATGTCATTATAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chrX 6423192 5' - roo 321 2 74.66 CCTTCTTATTCTGTAGTGAGGCTTTTACTGTTGCAGCTTTTAAGAGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATT:1 - chr2L 15322972 5' + diver 267 1 56.85 ATACCACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAATGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTGTGGTCT:1 - chr2L 18689239 5' - Gypsy6A_LTR 256 1 68.70 GGGTACCATTAAATCGCGCTATTGAAATGTAATTTGCATTTCATAAGCCTCCCGGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr3L 18199902 5' + Doc 21 1 70.55 CATACAAATTAAATACGTATATGTTTAAATTGAATATAAATGAGTGTGTACGCTTGGCACAAAAAGTAAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAA:1 + chrX 6234927 5' + Doc 4459 1 54.11 GCATAATTCTGGACACTGAAGAGAAATACATAACTTATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGCTCTGCGC:1 + chr2R 924449 5' + springer 7221 2 76.03 ATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 + chr3R 4532907 5' + 1360 66 1 61.29 TTCATTTGAGACCAAGGAATATAGTATCGATTGGCAAAATGTTCTTGTAAGCATAAAGATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3R 29622654 5' - pogo 2053 1 59.26 AACCATTTTAACCATTTCAAATAACTCATAGTTCGGTGAATTTGATTTCGTTTTTTTAATTTTTAATTTTTATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTTT:1 + chr2R 11097297 5' - Juan 4157 1 54.79 ATAGAATTTTAAATCGGTCTACGGCAAAAATAATTGCAAATTGATGGCTACAGCGGTGGCAGTCTGTGGTCTGGCATTTATGAATAGATATAGATATAGAAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr3R 28579437 5' - pogo 2098 1 80.60 GGCTTCACTCGGAGAAAATATACAAATTTAACCATAATAGGGAAATATAATTACTATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAA:1 + chrX 9959781 5' + I-element 65 1 61.64 CTTGCTCACATTTTCATATCGGTCTCGGATCGTTTTAGCCAAGCTCTACACTTTTTCACTATCAAAACACAGTTTTGGGTCAGTAACCCCGATTCAAAACACACACATATATATACACTTTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTTATA:1 + chr2R 11100353 5' - Tc1-2 491 1 78.08 TTGGCACTTGTATATATCTGAACATGTTCTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr3L 19574005 5' + 297 19 2 71.92 CAATCAGTTATCCTGCGAACATTTGGACAACCCTACTTTACCTGGTTTAATTACCATCTTTATAGGTTAATTCCATGAACTACTCGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGG:1 - chr2L 22707257 5' - 1360 3147 1 60.42 TTAATGAAGGTTTGATTTGCTGCCTGTGTGTGTTAGTGGCTCAATTTGCGACGACATTTGCTCAAAATAATGCATAAAAACTTAAGGTGTTCTCAAGTACCAAGAATGAATTATATATATCAATAAAAAAAAAATAAAAATATGTT:1 - chr3L 7835827 5' - INE-1 465 1 75.34 GGGCATGAGTCTTCCGGTGGGCGATCAGTCGGTTCAGTCAGTGGCTCCTGCCCTCTGCGATTCGCTACTCAGTCCACAGGACCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGAGAAAGTTAATTAA:1 - chrX 10522922 5' + Doc 4610 1 55.48 GGTCGACCAACAAATGCAGAAAGAGAAAGCTCAGTGGTATCATTGGGATCCCCAAGCAGTGTTTCTTCGCATTAATCAAAGAAGTACAAATTTCAGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGT:1 + chr3L 25911960 5' + looper1 1510 1 76.71 ATTTATAAACTGACACATTCGGCGGCGCAGCGAATTTCGCTAGAAAAGCCTTTTTTCGGGGCCTGAGAACTGAGAACGGCAAAAAGGAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chrX 8760053 5' - roo 9038 1 62.33 CAAGGCCATATAAAAAGCAAACGTTTATTAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chrX 9437284 5' - roo 8987 2 84.06 ATGGCTTTTCCTGGCTGAATAACTTAAGTATTGCTGTGCAGCTAATTTGCTTGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTGCTGCATTGACAACTTGATTGCT:1 - chr2L 5710318 5' - HMS-Beagle 6605 1 57.94 CAAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGGCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCA:1 + chr3R 178120 5' + BS 49 1 66.36 GAGAGGGAAGCGAGGAAGTAGCCAGCCCAAGGGGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTG:1 + chr2L 18178292 5' - Tirant 334 2 74.19 GAGGGACATCCGTTGGAGGTCTTACATTCGGGGCAATGGAGACCGATCGACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTATGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 8396929 5' + roo 8704 2 57.39 TTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTTGT:1 - chr2R 5045656 5' + invader6 76 2 70.55 GTAAAGTCAATCGGAAACGATTATTTTGTGCATGTGAGTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACA:1 - chr3L 3565437 5' + gypsy 34 2 59.59 GGCCATGAACGGGGCGTTATAATGACCGAGTATGGGCCTTCCTGATGAACAGCTTGAGGCCCAGAGCAACAAGGCCTTAATTTGACAAAGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr2R 9410423 5' + hopper 10 2 76.38 TGTCGAGATCGAAAATCAATTTGAAGCTCAACATTGTTGCCATATCTCAGTTAAAAGGCGACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 + chrX 20460551 5' + diver 30 2 51.33 TTTCAAAAAATTCAAAAGTGTACTAGTTTTTAGAGTATTTAAAATGGAGCACTCGGATGTGGCAATTTATCATGATACGAATTTGTTATTATTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCGGTCTTAACAGCG:1 + chr2R 13212175 5' + diver 5917 2 63.45 ACAGGCAAGAAGTATTGTTTTAAACAGTAATTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAAAGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATTGTAATAAACTAATATATGCCACCTATTGAGAACACGTGT:1 + chr2L 17957123 5' - blood 7371 2 71.23 GTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTC:1 - chr2L 15322923 5' + diver 303 1 66.17 AAGTCGCAGTGTGCTGTACTGGGCTGGGCACTTTGTTTGTACGGCCTTTATCAATGGCTAAATAAATATCGCATAGTTTGAACTGCAAATACACACGATTTTCCCTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTC:1 - chr2R 13604638 5' - Idefix 267 2 72.60 ATACCGGTCCGAATCACTGTGACCTTGTTTTCCTCTATTCTAAACCTAAAGAATAATAAGTCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2R 4803035 5' - roo 9013 2 58.22 ATTACATAAAATACGACGAAACGTTAAACATTTTCCATACTCCAATTATAGAAGCAAAATGTTTATAGTACATAGCACACGCTTGCTTGAAATTCATGTAAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chrX 3578047 5' - hobo 2928 1 72.06 CATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGA:1 - chr2L 14480508 5' - Transpac 5146 2 75.34 GACACAAGTAATAAGAAAACTCTTTATATCCTTACCTGAAAGTAAAGAAAGGTAAAAAGAATAAGTTTATATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chrX 3767688 5' + I-element 50 1 52.41 AAAATCACCATACTTCACAATCTTAAGTTGTATGCATAAGATACATGAAATCGCTTATATGTACATTCCAGAAATACAGGTGTAAATGGCGATTTTGCATACCAACTAAGTTCGTTTTTCCTATTTTTTTTTTTAATAATATATTA:1 - chr2L 19461204 5' + hopper 161 1 63.70 CCAGGAAAGTAATATTTTATTGTCAAGTGGACTTATCTAATAAGTGCTTAAGTGCAATTGTAGGAGTCTTCAATCAATTTATCGATTCAAAATCGTAGTAGCCAAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACG:1 + chr2L 3751396 5' + P-element 2734 1 69.86 ACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACT:1 + chr3R 19450201 5' + roo 137 2 50.34 GCTAGCTAAATGAATAAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 - chr3L 20388232 5' + 1360 50 1 52.41 TCAAGCGAAAAAACTGGTCGCGGATAGTGGATCCCTTAATAAATTAAAAGCAATAGAAAATGAAGTGACTATTTATATGCTCCATAAAATATTCATAGTTTAGGCTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAA:1 + chr3R 5316500 5' + Juan 4043 1 73.29 TTATATAAACCTAATCTAAATGAACTCGAAAGCTAAAGGATTGTTTTGAATTTCAAATCGTACCCATTAGGCTTAGAGAGCAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTGACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATT:1 + chr3R 19543384 5' - roo 369 1 58.22 ATGCTGTTTGATCTTTAATAAACTAAAACGACTTTTGTTTGCCTGAATCGTTTGAGTTGAAGAGACTGTTGCTGTTAATGTTGTTGTCGATGCGATTGCGGTTGTGAGAGAGGCAACCATGCTGGTAGTTACTGCAGCTAGGCTTA:1 + chr3R 3187319 5' - Doc4-element 257 1 71.23 GGGGAATCGACCTGGCCGAAACCGCAATGCACTTTGACTAGCCGGATTCGCCATATTACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3R 10461653 5' - roo 9010 2 60.96 ATAGTATCTTAAGTTCTTTTAAGTACCTGTTACTTATAATTTCGATAATTTCACACAGTAACTTTAGTGATTTAAATCTTTAGTTAGGCTATGCATTACAAGTTGATATATGCGAATTATATATTCATTTCTTGATAACAATGTTA:1 + chr3L 12646675 5' - pogo 1994 1 58.22 AAAAACTCATATACACGCGCACAGATAGGCCGAAAGATTATGTAAGTTCACGTGAAAAGCAACAACACGAGATACAGAGAAATAGTACTCAAATAATAATATACAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:2 + chr3L 18788945 5' + 1360 5 2 75.17 CGACTGACAATCTAGAATTGTAAAATGAGTTGGATTCATTATCAATAAATATCCTTTACTTCAGTTTTTTAAGAACTGAAATCATGCAGTGAATATATATATATGTCGGAGCGCGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATTA:1 - chr2R 10305461 5' + invader4 38 2 61.64 TCTTTTTTGTCAGCTTGCAAATTAAATTTAAATACCCGCATAGAGAAAGAGAAGTCTCGGCGAATGTGTGCGAGTGAGAGAGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 - chr3L 5179282 5' + P-element 16 1 73.29 GGCAATTCGTGTTGACAAGTGCAAACATTAATTAGCCGATCGATCTATCAGGTGAATGATATTGAGCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAA:1 - chr2R 15822113 5' + invader6 32 2 48.63 TATCGCCGAATAATAAGACATCGAGTGGCTATAAGACCATTGTGAATGTCACACCCGGTAATTATTTGGAAGTCTCTGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATACCATGGAGCTCCAGTAATGATTCCAAGAATCCTA:1 + chrX 7327208 5' - Doc3-element 4392 1 54.81 ATCAACTTGGCCATGAACGGGGCGTTATAATGACCGAGTATGGGCCTTCCTGATGAACAGCTTGAGGCCCAGAGCAACAAGGCCTTAATTTGACAAAGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCGTGTTTTTTTTACAACAATGTGT:1 + chr2R 9410415 5' - hopper 1395 1 72.41 TTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTATTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGAGTTTGTACAA:1 + chr4 1294993 5' - TAHRE 10361 1 73.79 TGGAATCGGAGGAGCCCTACAAGGCTATGACTGCTGGTAAGTGGCGACGGTCAAAAAAAAAAAGAAAAA:1 - chr3L 2040790 5' + R2-element 3581 1 73.91 ATTTTAGACATATATGATTTGTGATTTAATTGCAATTTAATCTTCGGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAAAATAATAATTGTGCTCCGACATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTATAGC:1 - chr3L 23529717 5' - Stalker2 223 2 73.29 ATTCGACTGATAAGAAAACATATGTACCCTCGATGTGGATACGGCCCTGCCTTGCACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 + chr3R 18697866 5' + 297 56 2 62.33 CCCTGATGTATGCTATATTATATTTGTGTGTTTCCGCAGCCAACGCACGGATTTTAGATTTTTCGTCAGGGTGTCGTTTGAATGACAAAATTTTAAGGACAGCCATTTGCTGAACTAAAAGTACTTTTTATTATTGTTATTATATT:1 + chr2L 13625512 5' - mdg1 14 2 74.66 TGGCAAACAAATTATTATAAAGATATACACGAAAATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1 - chrX 20124563 5' + opus 64 4 73.81 CCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCGAGAGCTGC:1 - chr2L 21403546 5' + G5 4442 1 64.93 TTGTTAAAATAATTTTAATGAAATTTCAATGATAATATAATCTTGCGGCCTTCTGTTTTCGTCTGCCGGCACTGTAGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr3R 9193275 5' - opus 461 2 60.27 AAACTTCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr3R 19721211 5' - opus 7481 2 67.12 AGAGTTGGGCACATAATATTGACCCATTAAGAGGAAATGAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTT:1 - chr3R 5214992 5' + FB 78 1 76.43 AAATATACAGTAATTACTGATTACTTTTTTAAACAAATGTAAATTATATAAAAAGGAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 + chr3L 11903207 5' - opus 438 2 65.75 ACAGGTTCTATTTGTGTGTCGATTAAATGACAATAAAGCTAGTTAATGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCCTATCTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGG:1 - chr3L 4900790 5' - G2 2779 1 44.07 TAAAACTTTCTGTTCAGGGATACTCTTTTAAAAGAAATTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATATTTTCATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATA:1 + chr2R 7407965 5' + Idefix 30 2 58.96 CATGGGTTCATGGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2L 18213119 5' - roo 9010 2 60.84 CTATATGTGTGTGAGTGTTGTCTGCGACTGTCAGTGCCAACGCAACTTCCCTGTAACTGTAACTGCAACCAACTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTT:1 - chr3R 27859598 5' - hopper 1364 1 50.68 CCAAGCTACTCTTAAATCGAACGACAAAGGAAACTGAGCTGAACTGAACTGAAACTTTTGCCTTTCGAGTTTCGAGTATTCCCAAAATTAGAAACAAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 20074685 5' - roo 390 2 71.22 GAGCGAATTTCGTGAGCAGGACATGAGAAACAAGTTGTTGCACTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCATTAAGTGCGAGTG:1 + chr3R 25137873 5' - P-element 2833 1 37.40 CAATTTCACACATTTCGAAGCTGTGAAAATGTCTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAG:1 - chr2R 11595898 5' - P-element 2802 1 26.39 GTTGATTAAAATTAGGACTGATTTTCGAACAATCCATCTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGAG:1 - chr3R 8183474 5' + Doc 66 1 66.13 CTTGCAGTTATGTTTAGAATAAAAGCTTTATGCTGAAGCTATTTCCCAGCATTGTGAAATTGAAATTTGCTGACTGGTCTCCAAGTGGAGATTGTGTTTACTTTAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAA:1 + chr2L 22921202 5' + copia 4887 2 76.03 AGGAGGCTAAATAATTTATTTACTTATTTATGAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGCTTCAAGACCTCCCCGTATGCCCTAATAAATAAATTAAATAA:1 - chr3L 21773216 5' + X-element 4712 1 74.66 GATGGAGGCAATGATCAAAGGGTATCCTTTAAAAATAATAAATCGGAATATATAATTGGTAAATATTACTATATATAAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATTAAAAGTAATGACCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 18952972 5' - roo 400 1 76.03 AAAGGTTGCTGTGCCTGTGCCTGCAACATGTTCGTTTGGAGTGCTTCCAAGCAAGCAGTCAGACACCGAATTCAGTCATTATGAGGTTGGGAAACCGTAATATCCGAACACGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCT:1 + chr2R 23119877 5' + 412 7279 2 74.66 ATTTATATGTACATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCCCACCGTGTCGATCTAAGGCAATTTGGTAACTCACGCAGCTGTACAAATTGAGTAGTGAAAATCATTATGAGTGACGCCGATATGGACGGACGGACGAACG:1 + chr2R 981778 5' + micropia 5412 2 52.74 TTTTTCTTTTGTATTTTTATTCGTATTAGCTATAAATAGCTAGGGAACCCGTGTTTATGTGAACCGTCCAAGAACCCTAGAAGATTTGAAAGCCAACATCCAAGATGAAATTGCCAACATAACACCTGCTATGCTAACAA:1 + chr2L 22008095 5' + mariner2 692 1 66.43 AAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATTCACATGGCGCTAAGCTTT:1 + chr3L 18034577 5' + Transpac 49 2 67.89 TTGAGCCTGTGGCAATGGGAACTTTAAAATTAGCCAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACG:1 + chr2L 11079419 5' - 1360 3304 1 76.71 ATAGGAAAGAACGCCCACAAACGGGCGGCTAAAAGCTTACAAACAGAAAATGCTACAACAGCAAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATA:1 + chr2L 7152600 5' + I-element 451 1 56.85 ACAACTGAAGCGAAATAAATGGATAGATATTCAAGAGAACTTGAATATGTGTCAGGGAAAATATAGTGAAACATCTTTGGGGCACTACAAGTCGATTAGCATTTGCATAGTAAAAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chrX 18190496 5' - hobo 2931 1 78.77 GTACTAATGAACACTTAAAAAGTACTAACATTAATTAGTTAATTGACAAAGCTCTTGGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 24976344 5' + roo 8686 2 69.18 CTCGAGTGTGTTTTAAAACGCGCCAAGATAAATCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTA:1 + chr3L 6675319 5' - 412 7466 2 74.10 AGTCGGCCGGACTAACGGTTACAGCCCGCCCCAAAAAAGGGCATGGCCTCCACCAAAGACACTAGAATAAAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGCCACTATGCAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGA:1 + chr2L 18627691 5' - 1360 3324 1 63.57 TTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGTAATATATAGGTACAATAATTTGCATTTTTGAATATAGCATTACATGTGGTG:1 + chr4 311376 5' - TAHRE 10314 1 71.62 ATAATAGAATTTTTCATCATAATATTTTAGTTTACGATGCTAACGGCTTCAAAATCTGCTAATGACTGAATAGAACTTAGAAAATGTTACTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATCAGCGTAAGTTTATTA:1 - chr2L 7939871 5' - Burdock 226 2 63.01 ACCGGAGTTTAGTGTTGCCAAATACCAAAGCATGACCGCCTACCAGAATGTTTGCACTACGATAGATAAAATACTAAAAGTTACAAAAAAATGATATATATCTTTGTTTAATTTTTTTGTATATTTGTTTTTTTTTTTGTATTAT:1 - chr3R 26717886 5' - Rt1a 5076 4 79.31 TCGGGAGAAGAGCTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATATAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGTGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCA:1 - chrX 22576491 5' + Burdock 189 2 54.11 GAAAAACGTGCACTTTTCGGCGACAGGTTTTTCCCTTCTTATTTTTCACTTCTTTTTTTTT:1 + chr2L 8806880 5' - gypsy2 408 1 90.16 TGGGCGTTTGATTCTCGACGCTTAGCGCTCGGAATTCAGTGCTCAGTTCAGTAGGTGACACCATTGCGCTTAGGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 18518049 5' - roo 9024 2 50.68 TTTTGTGTTTAACGTAAACTTTTTCAAATTTATTAAGGTTACGTTTATACTAATACATTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAATCAAATAAATAAGTAAACTATTG:1 - chr3R 556530 5' + Tc1-2 70 1 64.38 ATGCACTCGCGTTTTCTTTTGCATATTTGATAGAGTCGTACACACAGCAATTTTCGCGTCGTTGAGCGAGGGAATCTAATTTATATATGAGGTAAAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr3R 23668393 5' - pogo 2088 1 73.44 GGCGCTACGAGACCACCTCCTGATCCTGGTGGTCCTCCCATTTCTACAGGAAGATTATAAACAAATGATCATTTGCGCCAATGGGATTCTCAATTCTTACGCCAGCCAAACCATATGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTATGC:1 - chr3L 3945679 5' - accord 7025 2 68.49 TGGCTAAAATTGGCAGTTCGCTGGCTAGCTGAAGGACATTAATATTTATTAACATGCGGTGCATGATTAATGCACAGTAATAAAATTAGTTAAAGCCTCGAGATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:1 - chr2L 14770164 5' - Juan 4193 1 70.55 TGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGT:1 + chrX 12003956 5' - P-element 2795 1 17.78 ACTCAGAAGGAAAGTTACTTCTGTATACTCACCCGAGGCAAAGACATTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGA:1 - chr2R 5640778 5' + 1360 87 1 78.08 AAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTT:1 - 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chr2L 17206075 5' - hopper 1341 1 67.81 TACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACTGCCAAAA:1 + chr3R 4532880 5' - 1360 3328 1 63.04 CGAGTATGTCCCACTCTAACGCCCATATTTAATGTCTTTCTTACTAATATCCATCGATATGCCAAAAAGAATGTTGAACTTTCTTATTTGCACTCCCACTAGCTGAGTAACGGGCATCTGTTAGTCGGGGAACTCGACTATAGCAT:1 + chr3L 22940031 5' + INE-1 569 1 65.75 GATGCCCCGGCTCCAGGACTCTTACTCTGATTCAGTTTCAGCATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATA:1 - chr3R 5941491 5' + X-element 91 1 68.97 CAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATATTGG:1 + chr3L 13827343 5' + roo 8688 2 69.86 GAACCAACTGACCCAAGCGGGCCTGAAGATCTTTTTATTATTGTTTTACAGGCTTAAGTGACCATGTCACGGTCGCCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATA:1 - chr2L 15906128 5' - Tabor 439 2 80.14 GGGCTTACGTGACTTGCCGATGACCTATAAAAAGAATTTGGACTGTCATCGTTCCAAGAAGTATTTATTTGCAAGTATTACAGGCAAATAGTTCCAAAGTTACCATATAAATTTAAGGGTTACAAATTATTAAGTATAAAAGTAAA:1 - chr3L 19014157 5' - G5 4724 1 67.12 AGATGCGGATGGGCTGCTGCTCCATGTCCGTGGAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCCGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr2L 18627751 5' + 1360 81 1 73.91 ATATATCATTTATCACAACCAAAGTATAAATATATCTAATGATTGTTATTTGGTTCATTAAAATTGTAATCCCAATAATATTTTCTATTCTTTTGATGCGCGGCAGAGAACCGCTAGAGTTTCTCCCGAACGTAGTCTGGTCGCGG:1 + chr2L 15110583 5' + invader1 3720 2 56.85 TTTCTGCCCTGGTCGCCCATCCTGCTGCCGCCGTGGAACCATGCCCTCCTACCAGCCGCCTTCTATCCGGCGGCCCTGCGAAACGCTTTGCCTGGAAGATTTCATTCGCATTCGCGACTCCCAC:1 + chrX 591857 5' + Quasimodo 318 2 73.39 CTTGAGTTACAGGACAAAGAAAGCCTTCTTAAAACGCATGAGATTCATTTTTGTACTCAGAACGAAGCTAAAGTTTTGTTTTCCTCTCGGATTGATCAGATCTCGCTTCGATTCTTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGT:1 + chr3R 8067455 5' - jockey 371 1 76.71 TTTCATATAATTCCTGCTTCCTGTCTTGCTTTATTTACTTTATTGAGTTCATGATTCTCGTTATAACTTTCATCGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAA:1 + chr2R 12813660 5' - roo 9027 1 47.95 AACAAACCCGAACCCGAAGTTGGAGCTCGGCTACCGACTCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chrX 10806947 5' + P-element 60 1 35.71 AAAACATAATAACCATGCTATGGATAATTTATCTATAGCGGGTGGAATAATAGGTAATAACTACCTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr3L 14084854 5' + opus 150 4 55.73 AAAGTTTGATCAAAATAAACTTTGAACATAAATTTAAACCATTCTAACTTTTTGTTTTGTAAGATTGTATTTTGTTTTATCCCAAAAGTAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3L 16907740 5' + jockey 29 1 66.18 ATAAAAAGCGCTGCCAAAGCTATACAGTAATTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 - chr3R 12001022 5' + FB 34 1 66.29 CTACCCTATCCTTCTTCCAGATATCAGCTATCTATCTATCTGCTATATGGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 22522718 5' - roo 335 2 65.75 CTAACACTTAACAATTTGTTATAGTATGCATTTGCAACATAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACA:1 + chr3R 10137014 5' - I-element 5277 1 70.83 CTCTGGCCGACAATATGTTGCACTTGAGCTGCCACAGCCGTTTAATACCCTGCTATGAATTCCATTTAATTAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 - 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chr2L 7271935 5' + 297 6632 2 60.96 AGAGCCGAACAGAGCGAATTTCGTGAGCAGGACATGAGTAACAAGTTGTTGCACTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTA:1 + chr3R 25137862 5' - P-element 2821 1 40.41 TAAAAAGTATTAAGACACAAGTAATAAGAAAACTCTTTATATCCTTACCTGAAAGTAAAGAAAGGTAAAAAGAATAAGTTTATATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 - chrX 3767701 5' + I-element 28 1 65.44 CTTTATGCTTAAATGTCGACTCCATCGGCTAAAACTAACTAGAGAGGACAAATTATATTTTAAAAAGTAATTCAAAATTCGAATTTAATGATGAAGATGACGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 9869031 5' + roo 19 2 73.29 CACCCTGAACATCATTCACAATTTCATTCTCAGCTGCTGCAAATCTCCTTATGACATATTTTGATATTTATTTATTATCTTGTCACTCTGATTTGCAACAGCATAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTT:1 + chr2L 11421271 5' + 1360 3386 2 69.86 CCATCAAAGTGTGAGCAGTAGACTTGTCCGCTTGCAGTATGCAGCGGCACGTAACAGCCTTAACCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 22883923 5' + roo 52 2 56.03 GTATTCAATGTGCGTCATTCAATCAATCCTTGTTAACAATTAATTTAATTGCCTTTCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCG:1 - chr3L 4417417 5' - opus 198 2 59.42 CGCTCACTATTAAGAGAGAGGAACATAGCACAAAGGGGAATGCAAAATGTGTTGGTGCACAGAGCAATGTATAAAAGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr3R 3590779 5' + pogo 41 1 56.16 AAACCCACTTTTAAAATTGAATTAATTTTAACTTGAAACAGCCAAGACAATTATCGAAAATAATAAAAACGTTATCATAGTTTCGTTGTTATACCCATGACTCGTAGAGTAAATGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1 + chr2R 5689877 5' + INE-1 13 1 75.00 CGATTATGTGCAAAGTTTTATTTCTCACTCTCGCCGCAAAATTAAAAAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 - chr2L 7271923 5' + 297 6644 2 69.18 TAAGAGAGAAGGGAACCCAAAAATGTATTGTTGTAGTCCGTGTTTGTTGGCGGCATCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chrX 16526359 5' + P-element 64 1 41.78 CATTTGTTGATTAAAATTAGGACTGATTTTCGAACAATCCATCTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGT:1 - chr3R 8183479 5' + Doc 83 1 69.18 CGTCAACGGATAACTTTCCAGTAGTGTTACCCTTCTAGTCTTCCGCTCGATGATTTTCGTAATACTCTCTATGTGTGTATGGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:3 + chr2L 6755709 5' + pogo 38 1 59.59 CTTTTGGCCAGCGAAGGTGCCAAGTAAGGGCTAGAGTTGGAATGGGGGAGTAACGTGCACGGTGCCATTAGGAAATACTCTTGCTGTTCTAAGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGC:1 + chr3L 17832581 5' - F-element 4525 1 58.16 ATTGGTATTTTCCAAAAACTTTATCGTTTTTAGCGTAGCGCATTGTGTTCAAGCTCTGATCCAAATTCCCCAAGAGTATCCGTTTAGGTAGTCTAAGATTCTCCTCCGAGAATGTAACCATAATAGGTTCAAGA:1 + chr3L 22120123 5' + baggins 5071 1 62.69 TTTTTCAACTAAAATCTTCCTTGCAATTTTGCTTCAATAGTTTACCACGAATGTGTGAAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr3L 14041010 5' + 1360 32 1 63.70 CGCTGACCATAAAATATGCGACTATCGATATTTTATAGGAATATCGATCTTAGAAATTTATTTTATTTTAAATTAAATGTTTCACTACCCAAGGGTACTTAGTTAAAGTATTATCATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 + chrX 13384938 5' - opus 495 2 40.97 AACTAGAGAGCCAGTCCTTGTACAAATTAGGACACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTT:1 - chr3L 10564022 5' - hopper 1393 1 66.91 AGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACA:1 - chr3R 29091376 5' + rover 58 2 67.94 ACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTCCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGG:1 - chrY 2720341 5' + gypsy 55 2 58.22 GTTTGACACCAGACTGTCTAGGAACGTCATGGGGATGTGTAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCACATAATA:1 - chr2L 9347556 5' - opus 420 2 71.23 AAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGT:1 - chr2L 21153544 5' - 1360 313 1 67.12 CAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGTAAGGTTGTGTG:1 - chr3L 13228519 5' + P-element 81 1 18.40 GTGCATTTCCTTATTTGTATTGATAATACCCAATGATGCAAACTGTCGGGTCTCACAGCCGCCACCAACGGCAGGAATGGCAGGACGCAACAAGTCCTCCTTAAAAATACTTTATCTTGTATTCTTCGAGTCACATCCGGTGTCCC:1 - chr2R 5265179 5' + Q-element 470 2 46.58 ACCACTTTGAAACCTGATTTAGTTTTTAATGTTTGCAAATTTAACTAAATATTAATATTTGTTTGGTGTTAGCATCTAAATCTTCACAAATGTTTATATGTTCATTTAATATACCTTAAAAATATACATTTATTTAAAAAAAAAAA:1 + chrX 8506490 5' + transib2 2630 1 69.18 TGGCCCATTTTATCACCCGGCCATTTATCACCCGGCAAGTAAAGTCATGACCCCATAATTTCCGTTTTATATTACAAAAATTAACAACAAAGGGAATACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACACATGAA:1 + chr3R 6701430 5' + TLD2_LTR 118 1 65.07 AACAAAATATTAAAATACAGAATAAGCAGAATAAAAATAAATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chrX 9437166 5' + roo 88 2 54.11 ATAGAAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTG:1 - chr3L 18738135 5' - Bari1 1638 1 72.52 GAACAAAGTAGCTGGGTACCATTAAATCGCGCTATTGAAATGTAATTTGCATTTCATAAGCCTCCCGGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3L 18199889 5' + Doc 8 1 79.45 AGTTAATTAGAGTTATTCACGTACTATAACACGATACTCACAATTAAACGGGCTATGGCACTAAAGGATGACAGTACTAAGTACAAACAAGGACATAGCAATGACCCTATAATAATAATAATAATAAGTAT:1 + chr3R 17615045 5' + mdg1 7083 2 65.65 CTTTTGTCGCTTGAAGTCCGCAAGGAATTCCGTATTCATTCTGACATGCACTGTATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 - chr2R 12814934 5' + opus 7063 4 63.45 ATTTGGATTTTGCAAGCGAAATGAGTGTGAGGCGTTTGTAGATTGCATAATTATGCTAATTTTGTTGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTT:1 - chr2R 16496705 5' - hopper 1391 1 66.44 ATAAACAAATAAAACTAGAAATTCCCCGCTGAACCAGAAAATCGGGAAGCCGAATAAAGGAAGGCAAAAAGCAAAGTGAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCTGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chr3L 14708889 5' - opus 466 2 62.07 AAGAATATTTTAAAAAAGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCT:1 + chr2L 17957177 5' - blood 307 2 66.90 TCAATTAGAAAGACCAAAAGCAAGCATTCCAAATAAAACCCTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACA:1 - chr3L 17207026 5' + I-element 4947 1 60.00 ATCCAAGAAAAAGCAAAAAAAAAAAGGAAAGGGAAA:1 - chr3R 25366878 5' + Doc2-element 232 1 88.89 TCTGTTAAATAATACAATAATATTTATAATGATTTACCCCACACATGCCAGCAAATATTTCACACTTCTCTGGTATTCCAGTAGGTCCAGAGATCCTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTAAGACACTGGTTATGGAGATTATGT:1 + chrX 22832302 5' - gypsy 376 2 51.72 CAAAATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAG:1 - chr3L 19335449 5' - invader4 3037 2 52.05 ACTTTTACTTATTTTCGAAAATATTTGCATACGCCTACTGAAACCCCAATCAAACATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAA:1 - chr2L 20556555 5' + invader3 65 2 63.19 CACCAAATGGTTGTAAACGAATGCAAAAAGGTGGCTTCTATTTGACTGAGCGCTCTGTGTTTGAAGAAAAGAATGGCATGGTAAAAACTTCTTCAAGATGCAAAAAATTGAAATGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGC:1 + chr2R 25177141 5' + hobo 360 1 77.40 GAAACTTTTGCCTTTCGAGTTTCGAGTATTCCCAAAATTAGAAACAAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 20074635 5' - roo 8998 2 71.53 GTCAGCTAGAGATCTTCAGACGCGTGCCAGTGGATCGAACTTTGAGCGGATATTCAAATGGCGCAGACGGGCCTCTTCACGTTGTTGATTACATCAATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGC:1 - chr2R 15942419 5' + opus 113 3 77.60 AATTCCGAAAAAATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr3R 10636207 5' + blood 52 2 52.05 TATTAGTCTTTTAAATTTCTATCGATTTGCCACGCCCACTCTAACGTCCTATCTTATTACCCGTTCTCCCATCTTATTACCCAAAATCTATCGATATTCTAGAAAAATAATGAAATTTTGCGTTTGCATTCACACTAGCTGATTAA:1 - chrY 1654283 5' + INE-1 533 1 43.84 AACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 + chrX 19005379 5' + F-element 50 1 59.63 CCTACTGTTGCTGAGAGAAATGGGTAACCGAACATTTTAAAGTTGATTTTCCAGTAATTAGTTCGGTTATAACTTCGTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGT:1 + chr3L 5437321 5' + invader2 4906 2 50.00 AGAGCAAGACCACGAGGCAAACACATACACATACGAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTATATTC:1 - chr3L 13228576 5' + P-element 45 1 54.79 ATACGCCCTGTGTATTTTTACACAGCGTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chrX 6484684 5' + jockey 30 1 63.43 AGTGGTGCAACTTATAAACAGCGTTTTGTGTTTCGCAAAATAATATTCAATTTTCAGTCAGTAAGTAAACGAGAAGTGCAAATACTTTTTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGCTACTGCATTGTATTGAT:1 + chr3R 23996424 5' + BS 5061 1 59.59 ATTATATAAACCTAATCTAAATGAACTCGAAAGCTAAAGGATTGTTTTGAATTTCAAATCGTACCCATTAGGCTTAGAGAGCAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 19543383 5' - roo 370 1 58.90 TTTCTCCTGACTAGAATCAAATAAAAAGTAAAACAAACATACCATACTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3L 12468849 5' - roo 334 2 71.92 TTTAGAGCAGTTTTAAATGTTTAATAATATTCATACTTTAGTCTATGCTCAGGGGAATTAGTTAAAATTATTAAGATTATATTATTAAGCTATTATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGACGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2R 12239870 5' - roo 386 2 66.44 TTTCAGTAAATTCAGGAAAATCGAATAAAAAATGTTCTTGAAAATGCTTCTCTCTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATA:1 - chr3L 19574152 5' - 297 6917 2 60.96 GAGCAAATACCTAGACACGTGCTTCAAGTCTGGCTGAGCTATATATAATATACCTTACGCATCCACCAATCTACCTGCGTCAGTAGCCCCCCTCCCCATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTG:1 + chr3R 30616303 5' - Doc 120 1 65.75 AAGCTTTCACTCAATTTGGAAATCAGAGGTTAAATACACTAGTGGGCATAAGTATTAAGACAAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTCATTGTTTACTCAACTTAAGGAAAATTGTTGAATAATTTTAGTAAATAGGTAG:1 - chr3R 15139858 5' - Tc1-2 1539 1 73.29 AAGACTTTGGTAGCCGCTCTAGTCGGCCGGACTAACGGTTACAGCCCGCCCCAAAAAAGGGCATGGCCTCCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr2L 18627671 5' - 1360 3370 1 64.60 TTTTGAGCACAAAACAATTATCAATTAATGTACCGTTATGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTTGTTTGCATTTGTATCTGTGTCTGTATCCGTATCTGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chrX 6377232 5' + hobo 16 1 68.49 TAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATG:1 - chr3L 9762250 5' + jockey 4831 1 66.44 ATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTCCGTAGCAACTAAGTAGCTT:1 - chrY 2720330 5' + gypsy 7011 2 69.18 TATATGCCGCGGTGGTGTCGGGTAGCGGCAAGTCAATATATTATGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTG:1 + chr3R 12725551 5' - 297 6740 2 67.74 GGCTTTTACTGTTGCAGCTTTTAAGAGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCA:1 - chr2L 15322953 5' + diver 235 1 67.37 CGTACGCAGTAATGTGAAAAGGCTTAAACATATCCAATTTCATACTTTCCCAAATGCCAAACGAAATGTCATTATAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chrX 6423158 5' - roo 9019 2 51.37 ATCTTATGATATGATAATTGTCTATTAAACATGAAGTGCATTAAATATTCTAAATAACAATCATAATTACATAATTTTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCA:1 + chrX 17123962 5' - flea 4797 2 52.74 ATATTTCGCGTGGATAGAGTCGCGTCGAATTAACCACACGCGACTATTTCAGCATTTACATACCTAATTTATGTGGACTTTAGCTCAACGGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 26224701 5' + hopper 144 105 73.68 ATGTAATGCATAACAACCAACTAAAAGGCGGAAACAAAAAAGAACGAAAAATTACATTTAATAAATTGTTATTATTATTATTTAATTATTAATATTTTTATAGTTATTATTATTATTGTTGTTATTATTGCTATTATTATTATTAT:1 + chr3L 14800679 5' - mdg1 7058 4 61.64 GAATCGATACATCATGTCCATCGATGATGAATACTAGAGTGTTTTTTGTATACCGTTGCAAATTGGCACGAAGAAAAATCTAAATGTGTGAGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCG:1 + chr2R 3399744 5' - INE-1 346 1 69.17 GGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATATGTGACATG:1 - chr3R 27188613 5' - roo 9001 2 67.39 ACTGATTCGACTGATAAGAAAACATATGTACCCTCGATGTGGATACGGCCCTGCCTTGCACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3R 18697862 5' + 297 6633 2 59.59 AAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTGG:1 - chr2R 9339724 5' - Transpac 235 2 71.53 AAACAAATGTGTGAAATTTCGTCTGGCTCTTTTTCTTCTTCTTCTAAGTCTATGCCCCCAAAATTAAATCGAAAACACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 - chr3L 3756183 5' - hopper 1372 1 56.16 ATATATATAATTCATTTGTTAAAACCATTTGCCGGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr3L 13545080 5' + hobo 29 1 57.98 TTGTCATTTCCCATCGATAGCTGTTGTCTTGTGTTTTCATTATTTACCTTCATTTACACATTTTCCTCACATGAGCATACGTTCGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGT:1 - chrX 7660269 5' - accord 254 2 75.34 GATATATTTTATAAATTATTGCTTAATGTCTTAAATTAAATGTTACATATAATCTTGATATAAGCCTATTTAATTCGGTGCATTTCTCTTTTAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTT:1 - chrX 20637073 5' - Quasimodo 7344 2 69.18 GTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGAC:1 - chr3L 13228535 5' + P-element 86 1 26.71 GGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATTT:1 + chr3L 27356092 5' - Tc3 1626 1 73.10 AATAATTTATTTGATTTTATTAAGTTCCAAGTTCCGTTTAAATACATTTAATATAATTTTTCTCAATTTTTCGTTAGACTTTTGTCATTAGTTTATAAGTACTTCTTCGCTTTGCTACAATTTATTTTAGCTCAAATATTTTCTTT:1 - chr3R 17049071 5' - G7 1158 1 56.85 AAATTTTCAAATTAATATAAAGCGTGTCGGGCCTGGCCTAAATACACTACCCTTCTCCAAGCCGACGACGGCTCGGTTGATGCCACAAATCGTGTAGTATTTAAGTTAAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGGCAGAAAATAGAGA:1 + chr3L 20141978 5' + Tc1 1588 1 61.64 ATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATCTCTGGGTAAACACAAGTGCCCATAATGCTGATCA:1 - chr2R 21425156 5' + HMS-Beagle2 63 2 58.62 TCGTCTGCCCAATTGAGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1 - chr3R 31681938 5' + Doc 78 1 68.49 TTCAAACAATTGTTTTTGGAAATGAGCGAAATTTCTTAATTTCTTACTCTCATGTCATTTAGCAATAATTTGTGTATAAATAATTCGAATCTCCACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGA:1 + chrX 19872558 5' - INE-1 18 1 59.59 GGGAAATTACATAAAATACGACGAAACGTTAAACATTTTCCATACTCCAATTATAGAAGCAAAATGTTTATAGTACATAGCACACGCTTGCTTGAAATTCATGTAAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chrX 3578042 5' - hobo 2932 1 75.18 AAGTCTGCAATTTCAACGCGAGTGGGAGTGAAAATCTTTGGTACATCTCACTTTTCAGTATTTATAATTTTTTGTAGGCTTAGTTCTTTCAATGAGATTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGT:1 - chr3R 7895469 5' + R1A1-element 223 1 67.12 ATATGAGTCTCATGCTCAGTTTTATCTGCTGCACTGCACGCGGCACATTTGCATATTTCGTGCACAGGAGGAGCTGCGTTTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 + chr3R 25843322 5' - I-element 5323 1 68.49 ATCTTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAA:1 - chr3L 13156779 5' + transib2 85 1 78.77 CAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 - chr2L 14480516 5' - Transpac 235 2 69.86 GTCTCTACTAACAATGCGTTTAGCATTTTTTACTTCATCCTCAACGGAACACGCCCAAGTTAAACGTTACTGATGTTGCCACGCCGTTAATCCGCCCAAAACATAAAATGTAATGTAATGTATTTTTTTAATTTTTTTAATTAAAT:1 - chr2R 1368091 5' - HB 317 1 64.38 TCCCCAATTGTACTCCCAAAAATCTAGGAATTATATAGGGTTACATATATAGTGGGTCGGTCGGTCCGTGGGTGTTAATTTTTATCGTAGAGCTTTATGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAA:1 - chr3R 24215873 5' + 1360 3322 1 63.70 AATTTCATACTTTCCCAAATGCCAAACGAAATGTCATTATAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chrX 6423193 5' - roo 8985 2 75.17 CACATCATCCTTGTGTCCTTTGCCGCTCATAACGGCAATTCGTGTTGACAAGTGCAAACATTAATTAGCCGATCGATCTATCAGGTGAATGATATTGATCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATCATTAGTCT:1 - chr2R 15822146 5' + invader6 4491 1 64.38 GGCCATGAACGGGGCGTTATAATGACCGAGTATGGGCCTTCCTGATGAACAGCTTGAGGCCCAGAGCAACAAGGCCTTAATTTGACAAAGCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAA:1 + chr2R 9410423 5' - hopper 1386 1 66.44 AACGTGCTACATTCCTTATTATATAAACCTAATCTAAATGAACTCGAAAGCTAAAGGATTGTTTTGAATTTCAAATCGTACCCATTAGGCTTAGAGAGCAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 19543366 5' - roo 387 2 70.55 GATAGTCGAGGAACTCAATTATAGCGTAATGTCTTGTAAGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCA:1 - chr2R 6166406 5' - 297 314 2 76.03 CATTTCTCTTGTTTCGTAACGTTGATTTCATTTTATTGTTGCCCGTTTGCCACTCCAACTTCACCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTA:1 - chr2R 20447903 5' - hopper2 1553 1 53.42 GATCACGACGACGACGACGATTTAACTCTTAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACC:1 - chrX 18737280 5' + I-element 89 1 78.77 GCAGGGTGTTTGAAAAAGAACACTACCTACCGCACACATATTTACGTTAAGAATAGGTTCTTGAAAAATATGTACAACAACAAAAACTACTGCGTAACTAGGCAACACTAACCTTATTTAAAAGATGTTAAAATTGATTTAAAAAA:1 - chr2R 19063283 5' + Transib5 2792 1 86.30 GTATAATGCAAATATGTTCAGCATTTTTTAATCATATCTTTAGTAAAATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACA:1 + chr3L 15277619 5' - I-element 5277 1 69.18 CTTTTATTTTTCAACAACCAATAGAACTTAGATGCTAGCTAAGCATTTCGCAATTTGAGCAAAACCAGTTCCCACAAAGGAAATGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAATT:1 + chr3R 10361822 5' - roo 9037 1 61.64 TCCCTCCTCTTCATACCAGCCAGCATATGTGAAAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACAAATCATCGGACACTC:1 - chr2L 18178382 5' + Tirant 36 2 58.65 AATGCCTTCTTGGTTCGTATAAAAGCGGATAGATTGCCGGCATTGCAATACTCCAAAACGATGTAAATATTTCTGAAATAAAGTAGACATTGTAGCATTCTTAATTCTGTTCACTACGTAAGCACTCCAACGCCCTAGTAATACG:1 + chr3R 9333874 5' + Stalker 6987 4 77.93 GTTGCATGCCACACCCAGGCAGCGCAGATATCGCCTGACAGCCGGCTATCCGCAGTTCGCAATCCCCATTCCGGCATCCGGATAGCTGGCCAATGGTATCGGTATCTGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 + chr3L 20977755 5' + mdg1 14 2 76.39 CTAAATTATTCCTGTCCCTATAGAGAACTGGGGTGAGCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATA:1 - chr2L 17206077 5' - hopper 1343 1 66.44 TAATAATAATAATAAAGTAATATTAATAATATTATTACAAAATGCTTTTATGAAATTAAAAAGGCATAAACCTATTCAAATGTTAAAAATTGCATGAATTAAAAGATTTCAATATTTTCAATAAGTTTTATTTATTTTCTTTATTT:1 + chr2R 3262661 5' - HeT-A 2 1 41.10 GTGAAAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr2L 18178354 5' + Tirant 40 2 59.63 ATGCTTCGCATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGCCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 - chr3L 13362743 5' + jockey 71 1 58.90 ATATCAAAGTTTATTCGACTTGGGATGGTATTGCATTTTTACTAGTTGACACCGCATCCGTTAATTACACAAGCGAATAACAGAATCTTGTGGAATACCTGTGCCGACGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 + chr2R 18440353 5' + P-element 12 1 78.08 AATCTAAAAATATAATTTGCTTGATTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chr3R 20683399 5' + P-element 47 1 53.10 ATCGAATGCAATATCTCAAAGGTATTGTTATCGTTTGAGTTATTTAAAAGATTGAAAACATCATGAAAAACAATTAGGGAAAAGCGTGCTTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chr3L 20083912 5' + opus 7142 4 67.81 CTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCAATGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 - chr3R 6412021 5' + Tirant 41 2 73.81 GAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCC:1 - chr3L 3565393 5' + gypsy 7054 2 68.89 AAAAAAATCACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCAT:1 + chrX 10128173 5' + invader3 74 2 57.24 GAAAAATTGTTGAATAAATAACTTAAGTTTAAATACAATATTTGTTTAATTACGTACGGGCCTACTGCTGTGCTCACTTATATTTAGATAAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr3R 21706370 5' + I-element 30 1 63.70 AGACAACATTCAGTTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1 + chrX 3541955 5' + hopper 142 3 90.62 GAAGGAGCCAAAAGTGATCCATCAATAGTACGATTATTACAGTGTGATCCACAGTCTCATTAACTTAATTACTATTGAAAAGCAAGCAATAATCATTTAAACGTGTATATTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCT:1 + chr3L 19997424 5' - roo 243 2 74.66 TAGCAAAATATTTATCCGAAATTAAGAATATTGAATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr3R 12610067 5' + roo 87 2 77.40 AGGAGCGGCGTGGTTTTCGACGTTTTCGGACACATTTTCACTTTTTGATTTGCATGCACTTTAGTTTTGATTGGAAATTATGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTGATTTTATT:1 + chrX 10286960 5' - roo 9033 1 58.22 TGGGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAA:1 - chr3L 5498517 5' + Doc2-element 250 1 43.15 TATGCTTGGTGACAATATGAAATGTTATCTATAAATATGAAACTGTTTAAACAGTGATTTTCTTATATATCTGATATATTTGAAATGTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chrX 20632535 5' - pogo 2069 1 60.96 ATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3R 21587582 5' - roo 8985 2 82.64 CCCTTGTTCGCAGCGAGGAAAAAGTTAGACATGCGAATGCTTGTCATTTGCATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATCCCACTTATTTT:1 + chr3R 31887749 5' + HB 84 1 76.03 GAAAGTTTTGCTAAGACTAACAAGCCGGAACAAACAAATCAGCGGAAGAACTTTTACAATTGTACTTTAATGTGTTGCAGCAGAAACAAGCAAAAGATGAGAACTTTTATTATAATTATATATATTGTTATTATTATATTGTTTAA:1 + chrX 5478196 5' - hopper 1111 1 75.34 GGGTGGCAGCACCGTCGTCATTGAAATTCCCGCATGATGGCGTCCCCCTGCTGACATAAAGCTGAAATGTACAACATTCTTCTTTGCGATATAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr3L 12861668 5' - pogo 2079 1 69.18 GCACCGCGCCCGGCACATGCTGATCCGGTACGACTTGCACAGCCAGTAGGTCTTCATGCCCTGCTGCGTGGCCACCGTGTTGTTCCGGTTGAACACGCAGTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTGTGAACTCCA:1 - chr3R 22458448 5' - Doc 4245 1 74.81 GCTGTTGCAATGTGCAAAATGCTGCTGTTGAAAAGTCCTTGTTGTAATTACGTTTTGTTTTACTCGTGTTGAGGCAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTT:1 - chr2L 9861398 5' + BS 5007 1 50.68 CGATGTTTATTTTTATTACCGCTTTGCGATCGCATTTTGTTTGGCTTAATTGCGCGTGGCGTAGGCATTCGAATGATTCTAATCTTAGGTATATACTCCTGACATTTCTTGGCGATCATTAAAAGCCAAAAAAAAACACTTAAAGA:1 - chr3L 21392664 5' - transib1 10 2 61.64 TTTATGGTAGGTAGAAAACTGTTGGAGTAAAAACAAAACAAAAAAACGATAGAATGCTAGTGCAAATGTCAACGAGAAATTTCAAAACCTTTCAGCTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 - chr4 367165 5' + opus 7023 2 71.53 ATAAAATTTAAATAAAAAAATGATATAAAATACAATTTATAATTCGAATACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGTACGG:1 + chr2L 12971723 5' - Cr1a 4398 1 48.92 ACTTTCAATTTTACTAAAAAGTTCTTTCTGAGGCAATAGAAAAAAGTTGTAGGTTTCTAAACTTTATTTCTGGTACTCTATAAAAATTATTTTACTAAAGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 - chr3L 15277734 5' + I-element 24 1 67.12 CGACTCAAAAATTTACCACATCTAGTTTTACTCTTTCCATCAGGTATATAAAATTAAGCAAATGTATCGATACATAAATAAAGGTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 - chrX 13385137 5' + opus 7035 4 53.79 GACAGGCGGACGGACAATCTTAAGTGGACTTTACAAGTTACTGTACTGTGTAATAAACCAATATATTCCACCAAT:1 - chr2R 8452823 5' - blood 7384 2 65.33 CTTAGAACCTTATCAAAGGAAATGATTAGAATACTCACGAATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGT:1 + chr2L 7939754 5' + Burdock 77 2 72.41 GCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr2R 9504212 5' - roo 9006 2 65.07 ATGTAAAGGTTGTTTTTTGAATTTAAAGAAGAAGAACACTTATGGCTTAATAATGAACGACTTTTCTTACTATGTTCCTTATTTCGAAATATCAAGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2L 5448015 5' + roo 26 2 67.81 AAATAGAGTTTTATGAGCCATAAATATGAATTAAACATGCGATGCCGAGATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 + chr2R 16072893 5' - Burdock 6354 2 56.16 TTTCAAAAGAACCTTCGTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chrX 16217569 5' - P-element 2866 1 71.23 CAATTTCTATGGAAATGCCAGAAAAATGACCATACCAGCAGAACCGATCGGCTAATCTCAAACTTGTCTTAAACGGCAAAATATAAAGAGCATAAGCAAATTTGGGCAAAAGCCTTTCTAACATCAATTTAATTACAGTTTTG:1 - chr3R 4549226 5' - transib3 467 1 74.13 AGACAAACGGAGCAAGGACCCTAAACCTATACATATACACACTTACATACACACACACACACACATTCAG:1 - chr2R 11051137 5' + accord 7033 2 68.57 ACAAAATCTCGTGTCGTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chr3R 10636187 5' + blood 31 2 52.38 GGAGATCCTTTCAGAAGCGCTCAGGCAGCGCATTTTTTTCTTCCTTTTTTTTTGT:1 + chr3L 4795128 5' - gypsy7 5005 1 58.18 GTTGGCTTCCACAATATGTAAATAATACTTTAACAAGAATACATACAACATACAACATACATATTATGGAAATATATTACATGTCATAAAAATCTTATTCATTCGTTCATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTAT:1 + chrX 15644889 5' + Doc 4356 1 72.60 AAATTCAAAAGTGTACTAGTTTTTAGAGTATTTAAAATGGAGCACTCGGATGTGGCAATTTATCATGATACGAATTTGTTATTATTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAAC:1 + chr2R 13212182 5' + diver 5924 2 58.62 GGTGTATACTGTTATGAGTAAAAAATAGGCGGAGTTTGATCAATATTACCTATGAAATGGCGTATTGCTTAATATAACATATTGCTGAGCAGTACATTATTTTCATTTGACTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTA:1 - 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chr2L 19548579 5' - flea 244 2 76.71 GGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTC:1 + chr3L 24213772 5' - invader2 179 2 64.83 ACCTGAATTCAGCTCCATCAAAGTGTGAGCAGTAGACTTGTCCGCTTGCAGTATGCAGCGGCACGTAACAGCCTTAACCTGCTGTTCACACATGAACACCAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3L 22883909 5' + roo 30 2 63.91 TCTATTTTGGTCTGATATGATTATTTATTTCCTCAGTTAACTTAAAACTCTGAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGCGTTTTCGGGCCC:1 + chr3L 16664053 5' + opus 7164 4 60.00 AGTTGTTTGCCATTTATAATGGCAATTCCACCTGTTAACTTTATATGTGTTCCATGACTCACCTCAATTTTGCTCGAATAGTCCTCGATGAGCTTTTCCTTAAATACCAGTATTTGCATTCCTATCTTGATTATTTTTCCTTTATT:1 - chr3L 13941516 5' + Circe 6962 1 65.75 AAGTATTATCATTATAGATGCAAATCAAAGGGTAGTAAGTGAGAAAACGTACCTTAATTTATTGAAATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 + chrX 4214397 5' + jockey 8 1 79.31 CTTCAGGAACAATCCGCGTGGTATTAAGTTTCGGGAAAAACTGTGCAACTCCTTTGCCCACTCCAACATCCATGGGATGCAGCACGTCTTCGGGGATATGTAATAAAAAAGTTATAATCGATTGCTTTAAGATCGGCAGAGAGTC:1 + chr3R 29672512 5' - Cr1a 4241 1 66.21 GTGCCGATCACTACTCTAAAGTATGTTCTTATCTCTGGCTGAAATTGTCTTGACTTAAATCAAAATCCAAAAAGGTCATAGCAGTTATTAAAATCGGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTACT:1 - chr2L 22719403 5' - Quasimodo 15 2 69.86 AATAATATTAATAATAGTTATTTTACCTTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTGCTATACCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACATGACAGCGCCCCTCCGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGC:1 + chr2L 19875668 5' + Cr1a 4426 1 84.29 GAAAGATTATGTAAGTTCACGTGAAAAGCAACAACACGAGATACAGAGAAATAGTACTCAAATAATAATATACAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chr3L 18788976 5' + 1360 32 1 56.74 CTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGT:1 + chr3R 2169845 5' + gypsy11 4085 2 64.38 CTGGAAAAATCTCCATAAATAACAACATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr3L 1981545 5' + opus 7154 4 74.74 GCAAAGTGCCATCAAGAGAGCGACAGAGTGCGAGCGTGCGAGCGAGCGAGAAGTGGAGTGAATCTTATTAGCCGAGCCAAGAAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACGGGG:1 - chrX 19448234 5' - hopper 139 1 79.13 TATGGCTAAGTTCGACTTTTGCTTTATGGTAATAAACTTTTTATGGCAAGTTTGAGTTCTGAACTTCGAAGAACTTCAAAGAAGGCTTAAAAATATATGTTCTTAATTTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr3R 29622800 5' + pogo 10 1 66.44 TAATATCTGTGTCATTTTTTAGGTTAATAAGGCCAAATTGAGTATATGTGCCAGACACACACTTTATTATCATCATATTTATGGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCA:1 - chrX 20874408 5' + F-element 332 1 74.34 TATTTAAAAAAAATCCTAAAATTGGTGTAAACACGTTTAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATATTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGT:1 - chrX 15709302 5' + opus 430 2 72.22 AAAAACTCATATACACGCGCACAGATAGGCCGAAAGATTATGTAAGTTCACGTGAAAAGCAACAACACGAGATACAGAGAAATAGTACTCAAATAATAATATACAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr3L 18788945 5' - 1360 3383 2 74.66 AGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2L 18213142 5' - roo 321 2 77.24 TGGATATGAACAATAAGAAGAATTAATACCACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chrX 19959870 5' + roo 8751 2 84.62 GAGGCTTTTACTGTTGCAGCTTTTAAGAGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCT:1 - chr2L 15322955 5' + diver 284 1 47.26 ACATGTTCTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr3L 19574026 5' + 297 6621 2 58.90 TTGAAATTGCCACAAATGAGCCGCATAAAATTTGATTTCAGCATTTAAGCCATAACCGGAATGGGAGTAAAAACAACAATGTAGATATCAATCGAAGGACAACACTTAAAACACATGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATA:1 + chr2L 9040870 5' - F-element 4251 1 77.40 CCAGCTGCACATTAAAGCCCAGCGAAGGAGCTGGAGTGGCGAAGGTCCTTGAAGGCTGCGTCGCTCTTTATGCTTATTTAAAAAAGTGGCGTCACATCCCAGTTTTGAGAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGA:1 - chr2L 10519671 5' + X-element 19 1 73.97 GTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCT:1 + chr3R 21276545 5' + BS 5069 1 65.75 GGTGCTGCGTCTTCTTCTTCGTGGTTTGCTTCGCCGCCGCTGTCGTCGCTATGGTTGTTGTTGGTTTGTGCAAGGTCGTTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 + chr2L 21250917 5' + P-element 43 1 56.85 CAAAACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTTACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCACCAAGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr2L 20324206 5' + Tirant 27 2 53.85 CTGGACTATTTTCGGTGGCACTACACTGCACTACAAAAACAAAATATGGGGGGACTGGAAGAGAGAGGGAGAGAGAGTGGCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTGTTAGTTCTTATACACGAAGATTCAATAAATAAAAGCAA:1 + chr2L 7809985 5' + F-element 4661 1 54.79 TATTGGTTCATTTCATCTTGAAGAATTGTGATCTTAAAGTTCTTCAGCACATGGAAATACTTTCGATTATTGATGTGAGTTTCGCACGATAGCTTTTGGTTTATTCGATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTACA:1 + chr3L 20469598 5' + transib2 2595 1 73.97 CGGAAAATACACCAGAACAACAAACAGCAAAGGGAAATTTCTACGACTTACCTGGGCCAAAAGCCACCGGCTGGGAAAATCTAATAAAACGAAAGAGCTTTTGACAGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chrX 17027813 5' + roo 14 2 73.97 GTTAAAATTAATTGCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 - chr2R 9339766 5' - Transpac 268 2 56.85 AATATGCTGCTTAAATTCGTTAAAGAACATAATTATCCGATATAGAAAAACGTTGAAAAGCCACTTGAAACAGATTAAAACCGATTTCGGAAAATAATTATAAGCTAAGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGT:1 - chr3R 12727280 5' - I-element 5344 1 69.18 TAAACAAATAAAACTAGAAATTCCCCGCTGAACCAGAAAATCGGGAAGCCGAATAAAGGAAGGCAAAAAGCAAAGTGAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 + chr3L 14708890 5' - opus 470 2 63.57 TTTGACCCGGATCCCATTTGTTTTTCCTATGCATGGATGTGGTTGGGTGTTCCATACGATTGTCATAACGTTTTGGTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 + chr3L 9519530 5' + roo 45 2 51.37 GCTTTTACTGTTGCAGCTTTTAAGAGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTT:1 - chr2L 15322952 5' + diver 287 1 49.32 TAGCTTGGTCGACTTGGTGAGAAGATACCCTAATTTTTCTATATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 5447855 5' - roo 390 2 65.62 AAAAACAAAAATTGACATTATAAATATGCAACAGATTATCAGGAGATATACGAATGTACGATTATATCACAATAATAAAGGAATACATACAATTTAAATGATCAACGCAACAACCCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAAT:1 - chr3R 11673752 5' + F-element 274 1 71.33 TTCTAACGGAATTCCTTTGCTCACGCACACATTGAAAGGAGGTTCGTTAAGAGAGAAGGGAACCCAAAAATGTATTGTTGTAGTCCGTGTTTGTTGGCGGCATCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGA:1 - chrX 16526406 5' + P-element 11 1 77.14 CATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGGTGAAGGTTGAACT:1 - chr2L 14480505 5' - Transpac 224 2 76.03 AAATAATTGTATTGAAAAGAGATCTATACACCCATGTGATGCGCATATTTCTGGATTTACATTGAACTTTTCTTTAAACGACTCTTAAATATTACACATTTGAAACCTTAAAATTATAATAAATA:1 + chr3R 13135800 5' - INE-1 427 1 60.00 TAAAATTAATTGCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr2R 9339764 5' - Transpac 5185 2 55.48 CAAGAAGTCCCAGCAGGGGAGTGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTT:1 - chr3R 17210150 5' + HMS-Beagle2 19 2 72.60 AGATTTGTTGAAAAGTATGTAACAGATAGAGGGAAGAGTTTCTGACCATATAAGGTATATATATACTTGATCAGGGTCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGCCCGCATGAACGTCGAGCGCTCAGGAACTA:1 - chr3R 13936192 5' + INE-1 142 1 75.71 GAGCGTGCGTTTGGCCGCCGACATGATGTGGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr2L 19643547 5' - hobo 2905 1 69.32 AAATGGTGTTGCATGTTTAACTTTAAAACTTTATAGTATTCCCTGTATCGTGCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGT:1 - chr3R 904695 5' - 3S18 6035 2 63.70 AAATTCTCTGCGAACCGCAGAGGCATTCCATTGCACTTGGTGGTCGTCGTTCTCTGGGCCGCTGGCTTGAGTTGTGTATCTACCAACTAGAATTACTCATCATCAGCATTTCCATAGAAATCATGTATAAGATGAAAACGGAGGAT:1 + chr2L 18457934 5' + Tirant 8330 2 75.34 CGATGTTCGGATTCAGGTGTTGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGT:1 - chr2R 15041321 5' - Transpac 5156 2 67.12 AATCTGTCTTCTTTCTGCTTTTGGGTTCCAGTGGTATTGTGCAAATTGCAACTTTCAAGTCGATTGCAGAAGTATAATAAGTTTCCTGTCGACTTGTTAGTTGATGTAATAGCAGAGCACTAGTGGTCCCGTTCAAGAGGGGCTAC:1 - chr2L 22569233 5' + mariner2 76 1 63.70 GGATACGCAACCTGAGCATTGCGATGCGACGCCAACCTCCGTACACAGTGTATATTTTCGACATTCAACAAATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3R 5868162 5' + jockey 56 1 52.78 GTGACCATTATGATGGGTTTTATACCCAAATACACGGGCAGTGTGATCAACGTGAGTCCCGTGATCTGTGGAATGTCGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTT:1 + chr2L 21080372 5' - Juan 4146 1 54.79 TTTATGTGCAACTCCGTCCAAATAGCAGAAACTTTTGGCTAAGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCAC:1 + chrX 6155178 5' + accord 466 2 67.19 TTTACCCTAAAATGCAGATCCTATCGCGGTAATTCCAGCATGTTGCAACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 16463472 5' + roo 42 2 54.79 AAGCGAAATGAGTGTGAGGCGTTTGTAGATTGCATAATTATGCTAATTTTGTTGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - chr2R 16496692 5' - hopper 1378 1 57.53 CGCAATTTGACGCACGCCCGTTGTACTAACAACTAAAAATGCAGCCCAATCCCAAAAATCAGGAACATTCAGAAAAATAATACTTGAAAATTGATATTGGACTGCTCTTAACACTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3R 14493956 5' + roo 8671 2 77.40 AAAAGATTGCTGCATTTGTTCGGATTAATTAATTAATAATTAATTTTGCTCATTTTTAAATAATCAAAAATTAGCCGTGCTTTCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chr3R 11978215 5' + Transpac 4954 2 61.64 ATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCT:1 + chr2L 21325123 5' - invader4 2993 2 80.14 TATATAAAATAGTATTAATTGATTTTCTGTAACAAAATTAGAATATTTAAATATTCACTTATATATTCACTAAAGATCTAACAGGTAAAGCATATAAAGTATATATATTCTTTATCACTAGAATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCC:1 + chr3L 20306530 5' + INE-1 101 1 52.05 GTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:2 - chr3R 21587579 5' - roo 316 2 84.93 GAAGAACCCCAATTTGGACCAACAGTTTTAAACCCTATATACTTGGCCAAACTTCAAGCACCTCCCTATAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATG:1 - chr2R 16736055 5' + pogo 251 1 53.42 CAAAAGGGGTCAATGGAACATGGTACAAATTGGTTTTTATTGAAAGTGATATTTACTTGTGCCTACTTTTCTTAAGGTACTTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 + chr3L 20083745 5' - opus 469 2 63.01 AATGCGTAAATGGAACAAAAACCCAAACGTTTGTGCTCGTTTGTTGGAAGCTGAAACAAAAATCGTTGCATACTTTCTGGGCCAAGCCGAAATCACACGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr3L 13366231 5' - hobo 2918 1 69.44 ATGCACAAACATTCTGCCATTTATATACGCCAGCCAAAGGAGAGGGAAGCGAGGAAGTAGCCAGCCCAAGGGGCGGGAGTTAAGTCCGTGAGCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 + chr2L 18178253 5' - Tirant 372 2 61.60 GCTCGGGTTCCGTTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCGGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chrX 2518104 5' + P-element 60 1 36.92 ACTAAGTGCTGCTAAAACTACACACTATATCCCTTTGTTAAATAAAAGTTAAGCTTTTCACTTTAATTTCAATCGAATTGTACATACGAATAAAATTGTAATTCCACCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chrX 6423317 5' + roo 8676 2 76.71 CGTTGAGCTGGGAAAACATTTAATATTATCTTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTT:1 - chr3L 13156806 5' + transib2 58 1 60.27 ATTATCAATTAATTGAAAAAATATCGAAGAATGTCTATGGCTTGCGCAAAAAAATTCAAATCAAAAATAAAACTAGACTGCAAATAAATGTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGCTAGATTTGACAATAAAGCTTACAGCAA:1 + chr3L 9644240 5' - GATE 410 1 59.72 CTTGAAATTACATTTTTCGCATTAATAAAAATGAAATAAAAATAAAAACCGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAA:1 - chr3R 25843426 5' + I-element 77 1 67.12 ACAACTTAACGTATGTAAGAATGTGTAAAATATTGTAAAACACAACGATTTTCTACTAATGTTTTTAAAACATTTTAAATGATCATTTGAATAAGTTTTCCATTTTTGATTTCACTTTTTGTTTGACCGCGTGATTGTAAAGAGTT:1 + chr2R 5995545 5' + Tc3 362 1 54.11 CTTACATTCGGGGCAATGGAGACCGATCGACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 8396909 5' + roo 21 2 64.47 CGGCTCAGATAAGCCCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chr3L 13228458 5' - P-element 2848 1 53.12 AGCGACGCGCAGAATAAGCAAAGGACGACCTTCAAATAATGTTGAATTTTGTACGCAAACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 - chr2L 21251032 5' - P-element 2825 1 43.84 AGCTTTCAGCTTAATTTAGATTCTACTAGTGACAGCCTTAGATTACACTGAACTTAACTAGTTGATGAAATATGCGTACAGAATTGCAGTATTTTAATACTAATTAAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr3R 32032156 5' + 297 6592 2 78.77 CAGCGTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chrX 6484706 5' + jockey 64 1 57.93 AAATTTCAATGATAATATAATCTTGCGGCCTTCTGTTTTCGTCTGCCGGCACTGTAGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCTGCACTC:1 - chr3R 9193255 5' - opus 478 2 62.39 CACAGGATCAAAAGTTATCAAGTCCCCATTGAAGGCAGTGCAGCAGTGCTTAGATGGTCCGTGTTAAATGATGATTTGAAGGTGGTACTTATAGTGATAACCAATAAAACCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATATCCGTCTGTCC:1 + chr2L 251754 5' + INE-1 115 1 66.44 TGACAAAAATTTCAAAAGAACCTTCGTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chrX 16217578 5' - P-element 2875 1 77.40 AGTACAAACTTTTCGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGTAGGACGATA:1 + chr2L 20928054 5' + Chimpo 59 1 57.53 AATGCAACTTAGAAACTGAATTGAGGAATCGTATTTTGCTGCATTCTCTGCTATGTGCATGGTGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:1 - chr2L 12678601 5' - P-element 2819 1 41.78 GGTGCCGTGCTCGCGGGGATCGGGTGGATAAGTGTCGTGTGTCGCGTCAACATCCTGGGGACTGGCGAGGTTCAAAGGCTGGAATCGCTCCGCGAGGCGAACAGCAAACACTTCGGC:1 - chr3R 29733805 5' - BS3 77 1 70.09 CGGAAAAGCAGCCCTCCACTGAGAAGGAATCATCCGACGAGGAGATAAGCGAAAGTCCAAATGCAGCAAACAAGGTAAGAGTAAGGCTATTCGGCAGACAACCACAGTCTTTAACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAACGATTCA:1 + chr2R 13136784 5' + Doc4-element 338 1 68.97 AAATATAACAGTGGAGCAGAAAAAAAGCGGACACACATGGCGATGATTTTTAGATGCGGATGGGCTGCTGCTCCATGTCCGTGGAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr2L 18627802 5' + 1360 38 1 60.27 AACAAAAACGTCGCTCGGCGAAAGTTATTCAAATGAAAATCCAGTAACGAACAAATCGATAGTTATAAAATGAGCCAACGCGAATTACGCGCTCAGCGGCAAAAAGAGCAAGACGAGCG:1 + chr2R 12293149 5' + Doc3-element 249 1 62.18 GATATGTATATGCATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCAC:1 + chr2R 12817170 5' - 297 313 2 89.04 AGACAGCACCAACACCTTGAATTCGGTTTAGTAAAACAGTTTTGGTTTTCGGTTAGTTTTTAGCATAGACTTAAAAGCGTGATCGTATATTTCTCTAGCGCAATTAACATATTAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATG:1 + chr2R 13185427 5' - BS 5005 1 69.44 TCCATAAAGTGTTGAGCATATTATTCGATTTGGAATGTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGTGAGGGTACTATCCGATTGGGATTCACTCTTTGTTAAATCCCAAATGAGATGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGA:1 - chr3R 27188665 5' - roo 9046 1 65.52 CACTGCATCTGTGCAAACATGGCAAATGGCGGCAAACTTTTTCTTTCACTGTGTCTCGGGCGATTTCTGCCAGTTGCCAGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTGTGG:1 - chr3L 12225886 5' - G2 3074 2 61.54 TTTTCCTTTTCGCGGAGCGTGTGACAGGGTTCGGTAATTAACATCATGAAGGGCTTTAGATGGATGTGCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 - chr3L 6675402 5' + 412 7105 2 53.10 GGCTCGACATCATACGAAGTAAGATTTATGAAAATAGATTTTTTAAAAAGTATATAACAGGCAAAATGAAGCGTTTCCGACTATATGAAGTATATATTGCAACGAACTTTTTACGGGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCG:1 + chrX 21132930 5' + INE-1 559 1 73.29 TGCTGCGCAATATGGCGGGGTTTTAATTTTTAGTTTTTTTTT:1 + chr2R 16104716 5' - gypsy9 469 1 73.81 AAGCAACATGAATGCCGCGAAATGTTTCGGTTAAAGTAATGGATTTCGTAACTAATACATTACTTTATTTATGTGCGTACCGATATGAAAAACTCTTGGTGCATTCCATCACAGTTAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chrX 4540763 5' + 1360 1 2 80.82 ACGAAACACACATGGGCAGACGGTAAAGTATCTTTAAATTTCAGCAAAACATTTAAGGAAGAACCAACCTATGCTTCACTCTTTGAACTAATTGAAAGGCCGAGAAATATACTAGCAGTGAGTAATAATATTAATTAATTAATAAT:1 - chr2R 21900811 5' - Tc3 268 1 70.55 ACCCGAGCTCCCATTTCCCTGGGTGCCTCCCATTCGAGCCATAGAAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTAT:1 - chr3L 18738175 5' - Bari1 1664 1 57.24 GGTAGTTTAATTTTTATTAGTCCAAACAAATATCGGATTATATTTTTGTTTCAAGTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACTAGGT:1 + chr3R 4661930 5' - roo 343 2 62.33 AAATGTCTAATTATGGAAAAGTACCTTAGCTCGTTTCATACTAAAATCCTAGAAATATAATGACAAATTGTTTGCTTAGAACCTTATCAAAGGAAATGATTAGAATACTCACGAATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCG:1 + chr2L 7939680 5' + Burdock 6140 2 78.77 AATAAAAATAAATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAAC:1 + chrX 9437195 5' + roo 117 2 37.67 AAATCGAATTCATTAAATACCTGAACAAACTGTGTTTATGGTGAAAACATACTAATCTCGGCTTCACTCGGAGAAAATATACAAATTTAACCATAATAGGGAAATATAATTACTATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 + chrX 9959722 5' + I-element 6 1 78.77 ACAAGAAAACATCTAAAAAAGAAAAGAGCAAAGAGCTGGGAATACCCTGAACAAAGGCAAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chrX 5366140 5' - 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P-element 2863 1 67.59 AATTTCGCGGAAATAAATCCCGAATATATTTTGTAGAATTTATGATGACGTTAAAAGCATCAGTATGTATCAGTATAGTATCAGTACACTGTAAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr2R 15942234 5' - opus 7479 2 45.83 CCAGGAATTTCTAATTTACTGTGATTCTAAGACCGCAACCGTGCAACCAAAGACAGGAGAATAACAAGATGCGAAACGGCCATACATTGGTTTAGCACT:1 + chr3R 3627198 5' - 1360 3358 1 89.90 GGACTCATGCTTTTCTCTGCTCTCTTCTTTGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTC:1 - chrX 850115 5' + jockey 98 1 75.34 ATGTGACATTGCAATACCTCCATATTTCATAAGGTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1 - chr2R 14940742 5' + blood 86 2 74.66 GAGAGCGTACAAAAGAATTGTGCAAATAACGACGTAAGTGTACGCAGCAATATGGCTGGGAATTTATGTATTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGCGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCG:1 + chr3L 19335326 5' + invader4 2812 2 53.42 CCCGATAATAATTCCTTCTTTCGCCGATCTGCGAATTAGTTCCAGTGTTTCTTGAACCTGAAACTGAAAAAGGGAGCCCCACCGATTAGCATATTTTATTATTATTATTATTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGT:1 + chr3L 1807321 5' + Ivk 13 1 65.07 TTGTGAGTTACAATGTTTTTCGTTCAAGAAATCTCGCAGGACCAGGAGAGAGAGAGGTTTTTGTTTAGTACATATGCAAAATTGTCTAACTGAGGGTTAGGAATCGTGCATGCCATCTACGGACGATAGATGGTATCTTT:1 - 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chr2L 520145 5' - S-element 1514 1 57.53 GCCGTAGGAAGGAAAAAAGGAAAAGATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCTACGCC:1 - chr3R 6412099 5' + Tirant 8120 2 76.12 GATACTTTTAGTGATTATGCAAGAGGAAAAACTTTGCACACCACGGGAAATATGAAAAATGAGTGAAAGATTGAGTCATAATGACAGTTACTTGTTTTTTATTGAAAAATATTGTATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACA:1 + chr3L 14331670 5' - P-element 97 1 73.97 ATATAATATATATGCATGTACATTGAAACCCCCTTTTGGTTCGTTGGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGA:1 - chr2R 21638694 5' - Tirant 361 2 59.59 TTATCATTCCTAACCTTTGCCCTTCTCATCGGCTTAATGGCAAAGGCCATAGCTTTTATTTTACCAGTTGGATGCAACTTATCAAAAAGTAAAAAAAAAAATAAAA:1 + chrX 4692743 5' + Doc 4698 3 71.70 GCCCGTCATCCGGCTGCTTAATGTCAACTCTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 - chr3R 28782629 5' + blood 89 2 78.32 AAAGCGGAAACCAATTCGACGAAAGGTGAAAGGTGTTCGTCTGTTGATTCAACCCTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chrX 5206584 5' + Tirant 8119 2 76.52 CAACGAATTGCTAAATTTTAACTGAAACATTTATCCACCAAAGCACTAAATTATTCCTGTCCCTATAGAGAACTGGGGTGAGCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chr2L 17206122 5' - hopper 1388 1 67.81 ATTACAATATGAAATATTACAGCACAACATATGTAAAATGTTTATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGCTAAATTATATTTAGGA:1 + chrX 17510949 5' + roo 8741 2 71.92 TGTGGACCCCCGGAGCGTTATTTGGCCCGATAAGCTGGCTACAGACACAGACTTAGTCTTTCTGAATCCTCAGCAACGAGGGGTTCAACGACTGCGTTTCAGCCTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 - chr3R 24053785 5' - mdg1 404 2 73.97 GACAGGGAAATCTAATGGAATAAATAAGTGGCAATCGTGAGCGGTCTTCAAGCAGTTTGCTATAAATGATTACCTAACGTAAGCACACCTCGAAAATATGTATTATGTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 + chr3R 17467040 5' + I-element 10 1 75.86 AAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGA:1 - chr2R 4774754 5' - baggins 5343 1 60.96 ATGATGACCGCCAGTATGTAAATCACATTACTTTAGACTTTCCAGGTATTTGGATAATAAAGTGGTAGCCGGTAAGAACGCAAAATCAATTTCATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGC:1 - 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chr2L 10343985 5' - mdg1 7264 2 75.34 CATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTCGATCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTAT:1 + chr3L 9218281 5' - Stalker2 144 6 76.71 GAATTTTGAGGATAATATATCTCACATTAAAATTAACCTTTTATTGGCATTCAGTTTACAACAAATACAGTGTATTATTCACATATCTACTACAAAGCACAACATATGTAAAATGTTTATAGGTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chrX 17510742 5' + roo 2 2 54.11 GCCGGTTTGTGTGGATTGAACTAGACGCGTTGTATGCGAATGCGGTTCGTCTGATTCAGTTATAAAGTTATATTATAGTAGTGGTGTTATGCGTGTGGATATATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCG:1 - chr2L 16752876 5' + Stalker 282 4 70.55 TATGCTACAAACTTTTCGAAATGCTTATGGATTTTATTAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 + chrX 9508118 5' + jockey 4758 1 75.86 GTTTTTAACTAACCATTTTAACCATTTCAAATAACTCATAGTTCGGTGAATTTGATTTCGTTTTTTTAATTTTTAATTTTTATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTAT:1 + chr2R 11097287 5' - Juan 4167 1 49.32 GTGTAGTCCAACATCCTATTTAACCAGGTTTCCGAAGTCGTCAGAGCTTGCCAGTTGGCTAAAAGCGGCATAGTCGACTCAAACCTGCTGGATCATCGCCGTCAGCGACACAGAGGGACGCAGCCAG:1 - 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chr2R 24745887 5' + 412 38 2 58.90 ACAAAGCTCTTGGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 - chr3R 24976299 5' + roo 8729 2 63.89 GCACGTCTGCTTGGAATGAAAGTTGGCTTATAACTGGTTTTAATGTCCCACAGAAGTTTGTAACGAACCGCACTCCAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chrX 12003876 5' - P-element 2867 1 71.33 AAAATTAGGACTGATTTTCGAACAATCCATCTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 - chr3R 8183467 5' + Doc 79 1 74.62 AGAACCTTCGTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chrX 16217562 5' - P-element 2859 1 66.44 AAATATTTAAACTAGATTATCTGACAGACAGCCATTGTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCC:1 + chr2R 21425077 5' - HMS-Beagle2 7114 2 74.66 CTCGGAGAAAAGGGTTAAGACGCCACACGGCTAATGGCTATTCGAGGTTCGAGCGAAATGAAAGGGTTAAATAGCTGGGAAATTCACTTCATTTGCATGCTGGAGGTGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTG:1 - 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Quasimodo 7299 2 71.92 CGTGTGTATACTTTGTGTATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTA:1 - chr3R 29091430 5' + rover 6970 2 73.29 GCTTATTGTTAGCTTTTAAGCTTATTTTTACAACAGCCACAACAATGTATGGCCAGAGCATGACTCGGATGTGCCTGGTGATGGGCTTTCTCTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 - chr3L 3858818 5' - jockey 4967 1 62.41 TATTAGGTCTTTAGTGTACCCACCCTCCGCTTCATTCACTCAATTCTTTTGTTTGTGTTCGGAAACCTAATAATCCCTCAAACACCATCGAGAGTTCGTTAACAGGAGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 + chr3R 22840330 5' + Transpac 9 2 75.00 AAATTCTATAGAAATTGTATGCACACATTTTCTCTCACTGGCAGGTATCGGATAGTCGAGGGACTCAATTATAGCGGAATGTCTTTTTAGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTAT:1 - chr2R 16867940 5' - 297 6973 2 72.88 TTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAAT:1 + chr3R 9175215 5' + Juan 80 1 67.81 AAACAGCTGTGTCAATAATTCGATTTTATTGATATGCTATATGATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1 - 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chr3L 3813827 5' + HB 84 1 75.34 GAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCCACTATGGGGCATTTGGCATGTTT:1 + chr3L 23146501 5' + hopper 3 2 61.64 CGAATCGTGAATTGGAATGCGCTTGTGCTACGAGAATGTTTTGCTTTAGTTTCTGCCCTTTCATCTGATCTCCATTGAGTTTATGTTTATGTTTAGAGTGTGTTTATTATTATATGAAGTAATTAACCCCTAAGTCTCGAGTC:1 - chr3R 15304075 5' + Ivk 5295 1 74.13 ATTTGGAATGTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 27188638 5' - roo 354 2 53.42 TCAAGTGCTAAAAACTTGCGAAAAATTGTTGAATAAATAACTTAAGTTTAAATACAATATTTGTTTAATTACGTACGGGCCTACTGCTGTGCTCACTTATATTTAGATAAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chr3R 21706389 5' + I-element 10 1 77.24 ACCCTTATTCCATCAGGAACAGAGTTGGTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACT:1 + chrX 4215070 5' - jockey 4904 1 76.71 ATGTGGACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:2 + chrX 10806888 5' - P-element 2806 1 30.14 TATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2L 22719579 5' + 1360 63 1 65.47 TTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTTAAAATCGACTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chrX 21844334 5' + pogo 50 1 53.42 TATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATATACATTTCCATATACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 - chrY 2720344 5' - Transpac 5195 2 43.15 TACATAGTAATAAATGTTCAATACTACATTTAAATGATATATAAATATATCATTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCT:1 - chr3L 17162381 5' - Stalker2 7581 2 65.07 CAGGAAGCACACTCTCCCAAGGAAGACTCTCGAATCTGTTGACTGCTTCTGATTCCGATTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAG:1 - chr3R 24975375 5' - roo 8968 2 60.27 GCGGCCAGTTAAGCTAAGGATTACGGATTGCGCCGGCAAGCTCGAAAATAGCCACCGAAATTCACAGTTCGCTGTCCTTGAACTTGCGTATACATGCTTCACTACTTTGAGTGGCAAATG:1 - 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chr2L 18741010 5' + X-element 80 1 70.55 GAAAAAAGGAAAAGATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chr3R 6412088 5' + Tirant 8143 2 62.33 GAGAAATAACTTTCAAATGCAGATTTCCTCTCTTTTATTTTCTACTTGATTTTCTTTCAGCGGATATCTTTTTGCATAAATTACATACATTTCGAACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACC:1 + chrX 7031544 5' + hopper 23 1 37.67 AGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGGATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAA:1 - chr3R 31681923 5' + Doc 87 1 76.43 CACAAGTGTGTTGCAAATAACGATGGCATCGTGTCACGTTGGGTTGACAGCTCAGCTTATATAATTATTAGAACTTGAAGTATCACCATTACTTGTACAATAAAATAACAATTGGTTAAGTAGAATAATAGGTTTTAATTTCATTT:1 + chr2L 1265622 5' - Tc3 1360 1 60.27 TGGATTTTGCAAGCGAAATGAGTGTGAGGCGTTTGTAGATTGCATAATTATGCTAATTTTGTTGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chr2R 16496702 5' + hopper 3 2 77.05 AATTGAATAAATTCAAAAACGAATTTTTTTTAAGTAAGCCATGTCAGGTTAGACTATGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTAC:1 - chr3R 4422055 5' - 1360 3324 1 62.33 TTTGCTTCTGTTTCTTCAATTCTGTTCTTTTTTGCGGCAGAGATGCGCTTTCTATCTTGAAAAAAAATAATAGATACTTTTAAGGAGGGCAAACAATTTCAGGACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3R 31650263 5' - pogo 2084 1 73.97 GAATCGCTTTGAAGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCT:1 + chrX 21636176 5' - Stalker2 333 2 63.89 TGTAAAAATGCCAAAGATCTAAACAAACAACAAGAAAAGACAAAACTGGATAAAATAAAAAAAATGCATAAAATAAGTGAGAGTGAAAGAGAACGCATTATAAAGGCTTAATATAAAGTAGCCCGTCTTTTGAAGCAGCGCTCACG:1 + chrX 8807327 5' - gypsy4 156 2 69.86 ATAGAATGGAAATTGAACTCAGTTGTTGAATATTATATCGGTTGTATGAGGTGCTAACTTGTTAAGTATCATCAGGCTTTTAGATGTCAAATTTAAGATTTTTATTGGAAACAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAA:1 - chr3L 13162004 5' + copia 4669 1 67.81 TTGAAAAAATAAACTAAGAAATCAAAGAATTATTATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTAATAA:1 + chr2R 9874779 5' - S-element 1632 2 78.08 CAACGTTGGCTTACTTGCTTTGCCTCCAGCAAATGGTAGCTCTATAGTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3L 10442827 5' - roo 8998 2 69.86 TGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCAATCACAA:1 - chr3L 2184967 5' + jockey 70 1 59.31 TGACACGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTTTGCCGTGTGGTTAGCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGACTAATACAGGTTCCTCTAACCCTGCTTGTCG:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 4883 1 63.97 GACCGCAAAATGCAGAGAGTATTTAAATACTGAGCTCACCCAACAAACGGGAACGCGAAAATGTGAATGTGGACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chrX 10806822 5' - P-element 2872 1 75.34 TTCACACATATACGTGAGGTAATTTTAAATTGTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCCCTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTCCAATTT:1 + chr3L 13366095 5' + hobo 33 1 52.54 GACTTCATTTGGGGAAAAAGTTTTGTCGAGCAGCTGGCCGCAGATTGATGAGTTTTCTTTTTTGGGTGGAACATTAATTTCCCTTTAACAAATTCAACAATTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCT:1 - chr3R 30527729 5' - F-element 362 1 68.49 ATGTAGCCTGGACATGAACCTAAAACAGCTGTTATCCTGCTCAAGTAAGATCCACATGCTCTCTTTTCGCTCACGTTCTCTCTCCCGCGCGTTAAGCACGGACACAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chrX 7967153 5' + P-element 17 1 74.66 CTCATTATAGGACTTTGTTTTCACCACTTTTGGCAAAACCTGCTAGTTCAGCAGAGAACAGCTCTAGTTTACACAGTCATAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr3R 4421942 5' + 1360 31 1 61.19 GAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATACCCAATC:1 + chr3L 25782390 5' - Stalker4 6998 4 53.10 ACTAAAGCCAACATCAGAGGGTCATGGTGGTCATCACAATGGGTATCAGCAGGGCCATCGCAAAGGATAACAGGAATATGCGCTGGCCAGATAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCTTTGGCTGAGCTTATTTACT:1 + chr2L 15163569 5' - Quasimodo 490 2 62.33 TCTATAACATTTTTGGACCACCCCATCCTTCGTACCCCGAAAAACTTCCCCACTGCAAACTGTTGCTAAATATTTAAGCCCAGTGGGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 + chr2R 9623307 5' + I-element 41 1 56.85 AGTTTTTTTACTCAACTCTTTTTTACTTCTTATTTAAATATTTTAAGGTGTAGAATATGTTTCGCAGTTGTGTCTCATACACAGGTCATACAAAGGTATTTTCCCTTTTTGGAATCGACTTTTTATTTCACTTATTTTT:1 + chr2L 21795722 5' + HB 85 1 56.12 CCATTGTAGGTGGGATAAAAACTTAATTTAAAATATATAAGTATTAACACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3L 21162031 5' - roo 9001 2 67.12 TGCACAAGACCGGAACGCTGCGATCGGACCATCTGAATGGTGCGCTGGATGTCGATTTCAGTATCCAATCCTGTGAGGAAACACATATCCGGGGAGCAGAAGTGTATTTTTTACGTTGAGAGGAACTTTCCCCTT:1 - chrX 2110998 5' - Gypsy6A_LTR 278 1 64.44 ATTCCATGCGCTTCTCACATACAAACAATCAGAATTGCGGAGGGGCACACGAATAGCATACACAGACACACACACACGCACGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTT:1 - chr2L 4420618 5' - gypsy5 7320 2 56.06 GAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chrX 14346487 5' - roo 327 2 74.29 AGTGGCAATCGTGAGCGGTCTTCAAGCAGTTTGCTATAAATGATTACCTAACGTAAGCACACCTCGAAAATATGTATTATGTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 + chr3R 17467066 5' + I-element 35 1 58.33 AGTATCACTTTAAATTCTAAGAATCTTACTATATTTATATTCTATTATATCATTTAAATAGTTCACTACGACTGTGTCAATTTTCCAGGGTATATGGAAACTTCTATATTTTTTTTTTCGTTTTATTTTGGCAAAACTTAATTTT:1 + chrX 3551519 5' + 17.6 7338 2 75.17 TAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 - chr2L 18178345 5' + Tirant 8176 2 72.87 TGAGATACATATCAATAATAATCCCATCTTACCTTTCTTTGACGCTTTCTTTTTAAACCTGACGCGGCCACAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTTTTGTAAAATGCGGTTGACTGTGGATCTGTCGCATTTGAACTTGGCACACAT:1 - chr2L 19798259 5' - pogo 430 1 76.03 ACTGCATCGAGGATGAGGACTCCTGTGTGGCAGTCGGGAGGAGCTCCATATACTGCCATATGTGGCAATATAGGCCAGACGTTGTGGGCCGACCAAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 18517897 5' + roo 23 2 70.55 GGATAGGGCCACAGCTGGCATGGAATCACCACAAAATATCCAGCTGGTGAAATTCCTGACCAAATATTAATTTTTAACTGGGATAAGTCGCAATATTCAATCGATGTAGAGTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 - 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roo 398 1 77.40 GCTAGTCAGTAATGCATAAAAATTACCCAGGTAGACAGTTTTTTATAGTGGGGCTACTTTTGTATGGGCGTTTTTTGAATTGGGAAAATCTATTTTAGACCAAGCATCATTAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 + chr3R 22771836 5' + opus 12 2 77.40 CTTTTAAGTAAAAATCGATCCCTATTAATTTGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr2L 21367189 5' + Doc 42 1 54.79 CCTGTCATTAGGCGAATTATCAAGCATTAAATGACATCTAATTGCGCAAAATAGGGTGAGTTTGAAAGAGGGCAGACATGGAAAATAACACAAAATGCGAATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCC:1 + chr3R 29091242 5' - rover 7281 2 74.66 CAGAAATAGAGCCCAGGAAATTGCAATTGTATTTACCCGTATATGTTTGTTTGTCCGTGTGTGTGTGTGTAATGTGCGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chrX 5145819 5' - hobo 2927 1 67.54 CAGGATCAAAGAGTCTACAAAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr2R 16510228 5' + roo 57 2 57.53 GATGCGCTTTCTATCTTGAAAAAAAATAATAGATACTTTTAAGGAGGGCAAACAATTTCAGGACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1 + chr3R 31650304 5' - pogo 2043 1 56.16 GGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3R 27188616 5' - roo 9033 1 57.80 AATCCTCAGCAACGAGGGGTTCAACGACTGCGTTTCAGCCTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATT:1 - chr3R 24053721 5' - mdg1 340 2 72.60 GGGAATATTTTTGTTGAAATAAATACTGCATTTTGCGTAAAACGTATACAACTTGTTCATAATTTATTTATTTAATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCG:2 + chr3L 16271874 5' + jockey 144 1 49.32 TCCATCACTTCCATCCACCATTCCTTACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chrX 14346444 5' + roo 87 2 82.14 AGAATATTTGGATCGGTTCTGTCTAGTTTTTTTACTCAACTCTTTTTTACTTCTTATTTAAATATTTTAAGGTGTAGAATATGTTTCGCAGTTGTGTCTCATACACAGGTCATACAAAGGTATTTTCCCTTTTTGGAATCGACTTT:1 + chr2L 21795698 5' + HB 68 1 69.86 CCCTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGTGAAGACGGCAACTGGAACACCG:1 - 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chr2L 8450287 5' + F-element 4578 1 76.03 GAATTTCGCTAGAAAAGCCTTTTTTCGGGGCCTGAGAACTGAGAACGGCAAAAAGGAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAATTAATTTTATTTGGACATATCTTCGCTTT:1 + chrX 8760084 5' - roo 9015 2 50.72 AAATGAATTATACTTATAGGCGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:3 + chr3L 13472393 5' + jockey 59 1 52.74 GCGAAGATATTTATTTTTACATTTGTCCCTATAATAACCGGGGTGCCAACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACA:1 - chr2R 2552189 5' - HMS-Beagle2 7125 2 64.38 ACAGTTGGTACGTGACTTTTCACTGAGCAGCGCAGTTGCCTCAGATTTCTCCTACCCCATTTTGTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGAGGTCAATGCTGACGCTCGGACTA:1 + chr3R 20939134 5' + jockey 4715 1 51.16 TAACATCTTACAACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGG:1 + chr2R 5582129 5' + Cr1a 437 1 78.52 TAACAAATAAATTAACGCAGCAAAATAAATATTATAATAGAAAGTGAATGATAATGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGTGCTTAGCT:1 + chr2R 9339649 5' + Transpac 4984 2 63.01 GGAGTGTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr2L 9319100 5' + jockey 80 1 67.86 GAAATACAGCCAAGTGACGTCATCATTCGGCAAATCAAGAGAGCGACATCTAACAAAACAACAACAGCTGACTCAGAGAGAGCAGGAAAGAGTTTTCGATATATATGTACACATATGTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAG:1 + chr2L 19548384 5' + flea 4758 1 76.71 ATTGTAGTCCACTTTGTTGTTCTCTTAGCCAGTCCGTCCAAAGGCGAGTGAGTGTGTGTGGCTGTGTCCAGATGGTCCAACAACAATCGATTGTTATAAATTATTTTGTTCACAAGAATGTGAAAAAAAAAATGCTATTTCACAAT:1 + chr2L 9008415 5' - copia 340 2 72.60 ATGGGAAGTATTTTTAAAATAGTCAATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 - chr2L 14480566 5' - Transpac 285 2 68.49 GCCATTATTAGCGGGAAATATATTACCACCCTTAAGACCTGACTGACCGGGACTTGACTTAAATCTTACTTAATTATTATCTTCTAAATATTACTGCCTAAACATTCCACTTCTTTAATACTCATAATCATATAATCTTTGGAAAT:1 + chrX 15746304 5' + jockey2 3284 1 65.75 CCCCTGATTTTTCCCCTAGTTCGTTGGCGTTTTTGGATGCAACTTGGGCAGTACGTGCCACTGTAGTTGCAATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAA:1 - chr3L 15853590 5' + jockey 4808 1 50.34 AATTTGGTCATATCCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATATCCCTATGTCCGTATGAACGTC:1 - chrX 21587780 5' + INE-1 126 1 36.30 GCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGCGAAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr2L 20324178 5' + Tirant 61 2 77.27 GTTAATAAGGCCAAATTGAGTATATGTGCCAGACACACACTTAATTATCATCATATTTATGGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCCGCTCTCCCGC:1 - 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hopper 1406 2 75.34 CAATGTGATACGTCATCAACGGTCTATCTCTCTTTTCAATCGGGGTCAAAAACCTTCTTTCTTCCCAGCTTTCGAATTAAATACAATACACTCCACACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACA:1 + chr2R 3052524 5' + I-element 171 1 68.49 CGCTGTAATTAAAAACAGGCTCCAAACTAAATAAGATTACAAGACATTTTTGCAAGACATCTCTCTATTTTTTTCTTTCTGTTATTTTGTTATTTTTAAGAGCACGATTTAATTTCAACTAATTATTAATTTATATTATT:1 - chr3L 18855409 5' + Tc3 269 1 77.14 GTACTCTGAAAATGTTTATTTGTTTACGGTTCATCAAACAGGAGACTGCTGGATGTCAACACTGTTCAAATATGTGTCATTGGTTTATTTGGTACTTCACGTGTTCAGCTTGAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATC:1 + chr2L 1024182 5' - invader2 4998 2 54.48 ATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr3R 10636168 5' + blood 7075 2 73.95 GCCAACGTCGCGCGTCGGGGAGGAGTCAACATGACGGGCTCTCCAAACTGGTTCCATCATCATCAGTTTGGACCGATATGTTGTATTTTAAGCAGATTTAGTTCATCTTTGAATGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATA:1 + chr2L 11027847 5' + R2-element 41 1 76.03 CAACAAACTTAACCTATCCATCTCCATACTTTATAAACATAAATCAGCCATAGCAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTCTAATGAAATGTACATATAT:1 + chrX 19820435 5' + Juan 4177 1 61.64 ACTGGGTCCACCTTAAAAGAGCGTAAAGAAAACTACACACACACACATCCGCATGTACACACGCACACGCACACGCACACACATGCATGCGCTTTACGGCCATAAATTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 - 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chr2L 11441620 5' - G-element 4144 1 66.67 GTGAAAGTGTTTCACTGGCAGGAGGGAGCGTTTCCGACCATATAAATAATATAAATTCTTGATCAGGAACAATAGCCGAGTGGATCTGACCCTGTCCGTATGTCCGTCCGTCCGTATGAACGTTGATATCTCAGGAACTATAAAGG:1 + chr3R 31045726 5' + INE-1 148 1 79.45 GATGAACAATATACAAGGGCACGTGTACCAAGTTGAGTAAAATACTCATTCATTTCCAAGGTAGTATTTAAACGTACATATAACCTATATTTTTAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr2R 25252111 5' - opus 475 2 65.07 AAGAGATAACGTGTTCAAGCCAACAATAAAACCATTATTTATAGATATTCAATAATTTCAGAACACAAAATAAATTATCCCCAAAATCTATCCATATCCCAGAAAAATAATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAATAA:1 - chr2L 3962968 5' + INE-1 533 1 47.95 ACCATCAATGATAGTCAGTACGTATTTTTACCCATTCAAGGCAATTAACAGTCACTTTTTAATGCAGGACCATAGATAAGCTCGAATATGAATTTTTTACAATTTTTTTTTACAATTTTTTTTTT:1 + chr3R 22843097 5' + Tc3 78 2 84.80 GGTAACACAGGTCCTGAATGGACGGGTTTAATTAATTTTTGTAAATGAGTTTCCAATTCAAAGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3L 18658200 5' + roo 8721 2 60.69 ACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3L 13827395 5' + roo 76 2 70.55 CGTGCAATATTATTTGGACTTGTTGATTTGCAGTGTTAACGGAACTGCCTCCTAAATCGAAATACGGAGACCAACTGACTAGGCATTGTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - chr2L 19548561 5' - flea 4985 2 64.38 ATTTCGTTAAACCAATCATATTTCAGCATCGCTTTTTTTCATTATTTACTTAATTCTTTATAATTTTAATTTAAGATAGAGTAAAATTGTTTCTGTTCTTTAAAAGGTGATCAACACAAAACCCACGCCCATCTTTCCTGAGCATG:1 + chr2L 17225328 5' + Circe 7368 1 67.81 TCGCTTATTAATTGGAGCACGAGCTCGGCATTCGCAGGTCTACTTTACTTTCCGGATAACTCATTGCCCAGATATCGCATACCCTAGTTAAGACTTTATCCTCTTATCATGTATTTGTGTCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCA:1 - chr2R 16905994 5' - pogo 298 1 76.03 CCAAGTATTTCCAGTTAATCATTAGCATGCAAATTGTTCAATGTTTTTTTGAGTTTATATATTGTTGTCCCCAAATGATTTAAAATTTCGCGTTCGGACTCGGACTAGCTGATTAACGGGTATTTGATAGTTGGG:1 - chr3L 42522 5' + INE-1 552 1 65.93 AAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTGGTCGGCTTCATCCAGATAAATCAC:1 - chr2L 15322909 5' + diver 330 1 78.77 TTCTGTAAACTCACCTTTTCATATCCGCACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTAC:1 + chr2R 16496597 5' - hopper2 1517 1 78.08 TTCATGACTTTAATTGAGGCAGTGAGATGTTAAGAAGCTGGCAAAACGGGCAAAATGTTGATGAATTGGTTAACTCAGCTGCAATTGTAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTA:1 + chr2L 9439649 5' + P-element 496 1 59.59 ATTTGTTTTTATATCATTTTGTTTTTGTTTTTCAATTCATTCATTTTTTTTTTGTCTCAACTGAATAGGTTTGACCTATACATTTATTAGTATAAAGCAAAATTTCAAGGTACTGGATAGTTTAAATAATAAAAGGCACTGTTTT:1 + chr2R 4715497 5' - Tc3 1453 1 43.45 CAACAGAAAATTAAATGACGTAGAATGTAAAATCCAAACTGATTTCGAAGCGGAAAATAAATTATGAATTTGATGAGCTCGAAATAAAGGAACATTAAGTTGTAACGTGTAACGAAAGGCAAGGGAACCTGTACTGACGGGTGCAC:1 + chr3R 6966501 5' - Gypsy12A_LTR 2222 1 56.16 AGATCCTAGAACTAGTTTACTTTCTAGCCACTGTGTTCAACGCTCATCAACCTGATTTACCTATTAAATCATGACTGTGTGCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3R 30302241 5' + Doc 39 1 59.57 GATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCTAGTGGTCCCTTAAGCACCCTACGTCCGGAGAAACATCAGCCGA:1 - chr3R 3286156 5' - Gypsy12A_LTR 1887 3 69.29 AAGACAAGGAAAAGCGGCTGCTAAAAAGTCAAGCTCCAATTTGGGCATCACTGAAACTCATGTTCCCGAGAAAAGCTAACCGTTGAGAAAGGCACTTATAAAATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATT:1 - chr2L 16509042 5' - invader4 3069 2 76.71 CTACATTCCTTATTATATAAACCTAATCTAAATGAACTCGAAAGCTAAAGGATTGTTTTGAATTTCAAATCGTACCCATTAGGCTTAGAGAGCAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTG:1 + chr3R 19543372 5' - roo 396 1 74.05 AACACGCCCAAAACGACGACAAGTGCGTTGTCAACGTCTGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCGACGCA:1 - chr3L 814996 5' + hobo 59 1 65.04 ACTTTCTAGCCACTGTGTTCAACGCTCATCAACCTGATTTACCTATTAAATCATGACTGTGTGCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAACAC:1 + chr3R 30302259 5' + Doc 51 1 50.37 AACTACTTCGACAAGTACGCCAAGTGCCGCAGTTCTCTGGAGAGCCAAGCAGCCTAAGTTCGTTAATCAGACGAATCGAATTCCTGCTCATGCTACCAACAACGGACATGAGGTGTTCGCCTTTCGACTCCAGTTCGAT:1 - chr3L 25006591 5' - R1-2 2735 1 70.50 ATTGAACCATTTTGTTTTTGAAAAAAGCAGCAAGTAATGAATTTTTAATGTGTGAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chr3R 31650412 5' + pogo 60 1 60.96 GTACAGTGACATACGTGCGAGCACTGAGTTTTTCTAGTTCTCTTGCCCAAGTGACAACTCAAAGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTATATGAATCGAG:1 - chr2R 7899208 5' + roo 56 2 55.17 CTTTTGTTTGGTTATGCAGCCTGCAGCCAGCAGCAGCGAATCATAAGTTATTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr3R 3590661 5' - pogo 2034 1 66.44 CTCTCGAGTGTGTTTTAAAACGCGCCAAGATAAATCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTGCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 + chr3L 6675317 5' - 412 408 2 72.60 AAATACCAGATAAATTAGTTTAATTTTTCCATATCGAATTGCATTCTTCATTTGAGACCAAGGAATATAGTATCGATTGGCAAAATGTTCTTGTAAGCATAAAGATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chr3R 29622608 5' - pogo 2090 1 70.14 CAGGGTTCGGTAATTAACATCATGAAGGGCTTTAGATGGATGTGCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - chr3L 6675378 5' + 412 7130 2 69.86 TAGTCGGCCGGACTAACGGTTACAGCCCGCCCCAAAAAAGGGCATGGCCTCCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 + chr2L 18627690 5' - 1360 3345 1 60.50 GCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAC:1 - chr3R 29091386 5' + rover 63 2 61.64 GAGTGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGG:1 - chr3R 17210132 5' + HMS-Beagle2 6918 2 61.11 AAGTTTGAGGTCTACGAATGATATACATATGATCGCGAGATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCACCACGGCGAA:1 - chr3L 20224276 5' + Chimpo 20 1 72.41 CCTGATTGTTTTTACATGCCATACATACGAGTACATATGTATATGCACAGGGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTA:1 - chr2L 15906093 5' - Tabor 415 2 64.83 AACAAATAAAACTAGAAATTCCCCGCTGAACCAGAAAATCGGGTAGCCGAATAAAGGAAGGCAAAAAGCAAAGTGAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr3L 14708892 5' - opus 7487 2 68.55 ATGTTAATTACGATAATTACATTCTTATACTTTTGTATTTATTTATTCGTAAACTATTTTATTCCTTTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chrX 18190338 5' + hobo 35 1 55.91 ATTATGGCCAATATTCAGTGTGGAAATGGGCTCGATGCTTCCTGAGAAAGGTCGACTAGAAAGCAGTAAGTAATTAAAAGCTTGGTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chr2R 11562944 5' - pogo 2066 1 61.64 TAAATATTACTATATATAAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATTAAAAGTAATGACCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr2L 18953031 5' - roo 9004 2 67.81 GTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTA:1 + chr2L 21325125 5' - invader4 2991 2 81.51 CTCTCATACATACGTGTTTCCGTCACAGGAAAATCTAGTCAAAGACATGACAACTATATAGTCGTGTGTCTCAATTAAGAATCCAGATGCACATTGCTTATATCTATGCATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATG:1 - chr3R 5766359 5' - Stalker4 243 4 65.28 CTATCAATTGCAGCATACTTTTGGGCAAACCTATCAATAGTTTTCCAGCCCATGCGTTTTGCCATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGGGATCCA:1 - chrX 18353592 5' + jockey 64 1 55.71 GGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATG:2 - chr3R 27188598 5' - roo 8978 2 79.45 CGCAATAGCTTTCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAA:1 - chr2R 16073015 5' + Burdock 65 2 67.12 TATTAAAACATTTTAACATTGAATGTTTTTTTTATATTCGAATATATTGAGGTTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAACCGTTGTAACTAGGTTATATGCAATCCAATTTAAGCGAAATAAATTTTTATGTATG:1 + chr3L 9333793 5' - Tc3 1642 1 65.07 GGCAACGTCGTTGACATTTTTATTGCCTGAGAAAATAGAATTTTTTCTTTATTTACTCGCAGCTCTAGTTGCATTTTTCCTCCTTTTATTTGTATGCTAAAAACAAGATTTATCCGCAGTCAGTCTGCTGCCAAGTACGGTTTCCA:1 + chr3R 22157117 5' - Rt1c 5156 1 73.97 CCTGGGTCTGCTACTCACATTTGCATATCAATTTGTTCGCATTCGTTCGTGTTATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCC:1 - chr3R 25409881 5' + jockey 4594 1 63.70 TTTGTTGCATTCACTTGTTATTCGATTTTCATCACCATCATTATCACTCTCTGTGTGTGTGTGTGCGTGGTCTGGTGCCGGCAAAACAAAACAAATGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTGTG:1 - chrX 4841270 5' - R2-element 3532 1 62.33 TTTTAAACTACTTCAACTTCACAGAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chrX 14346510 5' - roo 346 2 59.03 GTGGTGATGTTTTGGTGCTTTGCTCCGCCGATGTTGCGAAACAGGGAGAATGCCACCCAAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTTAAGGTTTATATACTATGTTGCTATACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTA:1 - chr2R 23845137 5' - invader2 4864 2 78.08 GGGAGGGGGGGGGGCGTTTAGCTCAACATCTTTGCCGTGTGGTTAGCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCAGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGGTGGGCAGCTATCC:1 - chr3R 12975376 5' + R1A1-element 4942 1 45.80 AAATTGCCTGCATCCAGTGAGTTATGAAAGTGAAATGGATTTGTGTGATTGCCGGCCAGACGCAAAGGTGAACGCATTAGAAGATGCCTGGCCAAAACAAAGAAAACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTACTTAATATAAAC:1 - chr3L 1415189 5' + gtwin 6957 2 73.29 TTGGGAGACAGAGACACGTTTTCACGTGCATCGTTGAAAGTTCCCCCTTAACTGCATTTTATGCACTTTTCTTCTCATCGGGTGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACA:1 - chr3L 18767874 5' + roo 8615 1 56.85 ATTAATTAATTATGGCCACCTAATGACGAAGAAGGCCGATGTACATTCGGGAGTATTCGAAAGTTTTTAATTAGCCTTTTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAA:1 - chr3R 16030593 5' + Quasimodo 474 2 54.79 GGCCAGGCTGTCCAGTCCGCATGAAAGTTGCCACCTGCCGCATTCTAACTGCCATTGATTTCGACTGGGATCGGTGCTGGGATTCCAAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCG:1 - chr2L 20033742 5' + roo 335 2 58.22 TCTGTGTAAACTATGGGTAGTAGATGGGTGGCTCCCCACACCCACGGAAATGGAAACAACAAATTTGAGATACGGCCCAAAGGTGAACTGTTTATCCAGTGTGATACCTATATATGTTGCTTGCAGCGGCTGATTCATGGTAACTC:1 + chr2L 12249420 5' - Helena 869 1 55.48 GATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 - chr3L 13228531 5' + P-element 84 1 25.00 ACACTGAGAGAAAATCGCTTACAACTTGGCAAAATAAAAGGACTCCTAATTGTTGGAAAGTGCTATGGAATAATAAAGTACATTAAGCTAGAATTATAAAGCTTTCATAGTTATGAAGAAAAAACTAAAAAATCAAATAATAATTA:1 - chr3L 16169126 5' + Tc1-2 386 1 70.55 ACGGTTCCATGAGTTGAGCCTAAAAGTAGGCAATTGTGCAAGAGCAAACCTGCCTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1 + chr3L 16875693 5' - jockey 4930 1 63.01 GGGTTCGGTAATTAACATCATGAAGGGCTTTAGATGGATGTGCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:2 - chr3L 6675376 5' + 412 7132 2 71.23 ATGGATACTCTTTTAAAAGAAATTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATATTTTCATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACA:1 + chr2R 7407980 5' + Idefix 57 2 65.75 ATATATTCCCACACTATTTAGTTGCGAACCGTACATAATGAAATAAATTGAGTTTTAGTTTGGAGGAAAGGAAACCATTAAATATGTGCTAATACTAATAACAATGGGAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCC:1 + chr3R 5557747 5' + G5A 2595 1 76.76 ATGGAAAATAACACAAAATGCGAATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGTATTTTTTTTGTTTAGATCTTTATT:1 + chr3R 29091319 5' - rover 254 2 79.45 AGTATTTTAACAAACGATCCACTGTCGGTATTTCAAGACAAGCCAAGTACGTTCATATTTCGTTTTTTCGTCAGGGTGGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr3R 32068467 5' - P-element 2851 1 58.99 GGAAGCTGAAACAAAAATCGTTGCATACTTTCTGGGCCAAGCCGAAATCACACGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACGCTACGTCCACCCGATAACCA:1 - chr3L 13366186 5' - hobo 2912 1 54.29 CCACATCTACCAAGATACCAACGAAACCAAGAACAACAGCTAACCCAAACACAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTT:1 - chr2L 4531913 5' + I-element 269 1 57.00 CACTGAGAGAAAATCGCTTACAACTTGGCAAAATAAAAGGACTCCTAATTGTTGGAAAGTGCTATGGAATAATAAAGTACATTAAGCTAGAATTATAAAGCTTTCATAGTTATGAAGAAAAAACTAAAAAATCAAATAATAATTAA:1 - chr3L 16169125 5' + Tc1-2 387 1 70.55 AAATTCCGTTACATTTATAGGGAAAGGAATTACCCTAAATTCAATAACAACATGCATTTGAGCAGTTATGCAAATAAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 - chrX 17737296 5' + jockey 4678 1 76.19 TTTCTATTCAAACGCTGCCTACTTTCAGGTCAACTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAA:1 - chrX 18320017 5' + jockey 4812 1 80.69 TAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGATTCATAAAAATGGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATG:1 + chr2R 5582183 5' + Cr1a 499 1 54.55 ACACCGGTTTTTCCAATTTCTCTTGGTGTATATGTTGTATATATGTTTGCCATATAATAAACTATTCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 - chr3L 5275013 5' + I-element 56 1 55.86 ATTATGAAATGATCATATATTGATCATCTTAACTTTCTTAATTCCGAAAAAATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - chr3R 10636246 5' + blood 8 2 78.72 ATATTGCCTAGGAATATTGCAATGTGCGCGAGCAAGCAAACAGTTTTTGTTGCATACTTACAGCCTGCGAATGGTATCTTTATAGTGCTGTGTGGTCTGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chr3R 23539369 5' - hobo 2932 1 71.54 AAAGAGAGCCAAATGTGGGGAAAATGGGATTCAAAATGTATATTTCAATAGAAAGTGTAATAAACCTTTTGTTAGCGTTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:2 - chr2L 3282691 5' - flea 4973 2 58.90 ACTTTTTTTTTGTCACATTTTGAGCCTGTGGCAATGGGAACTTTAAAATTAGCCAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCT:1 + chr2L 11079400 5' - 1360 3323 1 64.38 AATGTGTACAAAAATTATTCTTTAAATACAATTTTCAGTCGAGTACATTTATTTTGTACATTTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chrX 4823641 5' - pogo 2045 1 60.27 ATTCTGTGGGAAAATATGCTCTAATGGCAACATTGCTGCGGCCTTAAATGTTGATGGAAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGAATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chrX 2517975 5' - P-element 2872 1 73.97 GTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTGAGTC:1 + chr3L 25804307 5' + gypsy 145 2 84.44 CGCATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 - chr3L 13362737 5' + jockey 77 1 63.01 GCAAGGCTTTCCTTGAAGTCCTCATCCGGGACAGAGTGATGTACGCCTCGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTC:1 + chr2R 5640717 5' - 1360 3316 1 67.12 AGTGTCATAGTTATAAATTATGCAGCAGTTGAGTTAGGAATCGAGATGGCAATAAGGATAAGACAGTGCTTGCACTTAGGAAAACTCAGTCCTAATGCTAATTTAGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr3R 8914404 5' + pogo 14 1 76.03 AGATTAGTTATAGAGCAAACCAAGCAAACTGTCTCATAGTCATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTTCAG:1 + chrX 19113489 5' - 412 7468 2 67.59 GTAGAATTTATGATGACGTTAAAAGCATCAGTATGTATCAGTATAGTATCAGTACACTGTAAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chr2R 15942266 5' - opus 442 2 60.27 AATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTC:1 - chr3L 19335446 5' - invader4 3034 2 54.11 ATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAAGAAATTCCAAGTTTACACACGTTTGAGACTGTCACACTATAACCTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGCG:1 - chr3L 23583103 5' - rooA 7546 2 94.20 GCGAATAAGTTGCCAACGAAATTTATCGCAAGACCGAAAGAGAAGACTCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAA:1 + chr2R 10599995 5' - 297 339 2 63.85 TCTGGCTTTTGCGCTCAGTTTCGAAACGAACTTCAAAGCTCGCGCAAGCGTACCGCACGCGAATCGGAAAACGGTTATACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAAA:1 - chr3L 12056465 5' + Bica 318 1 56.15 GTGTCGACTTATTCCCTGAACCCTCCACATTTGACCCGGATCCCATTTGTTTTTCCTATGCATGGATGTGGTTGGGTGTTCCATACGATTGTCATAACGTTTTGGTGACTGGTCACACATTAACACGAATATATTTTAAGACTTAC:1 + chr3L 9519501 5' + roo 8680 2 70.55 ACAGTCGAGGCTCAGCTTATAAAGCTATTGATTCAATGCCAAATAACCTATTTAGTTTAGCAATGAAAAGTTAGAAATCTTAAAAGATTCGTACAGAAAAAGATAATAGTTGGAAGTTATTAATAGTTC:1 - chrX 11226404 5' - Penelope 281 1 75.97 TTTTTCTAAGCAAACATAATAAAACCCAGTAATTGCCTGCATCATAAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCGACGT:2 + chr2R 11574966 5' - INE-1 143 1 69.18 GATTATCAAAGAAAAGTTAGTGCTGCAGTGCTTATCACCATTTGAAATGTTTTCCTGCATCATCCTCTGAAGAACTTCATGTTCCTAATTAGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTT:1 + chr2R 21853861 5' + Transpac 5086 2 62.33 TAAGCTTTTGAGCGTTAAAGCTGCATAATTAATGTTTTATTTTATTAAAGATAAATGAACGATGCCTGTACTGTCAAAATTTTTATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 - chr3L 13166345 5' - I-element 5318 1 57.53 TTTACATGTCTTTTAATTTGTATTTTTTAGTTAAATATATTTTTTTTAAATTGAAAGTTGCAGAGGAATTTCTTGTACGAATTATATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chrX 22676310 5' + 297 6614 2 60.27 CTACGTGCAGAACTACGCAACATCCGATGTGGTGAGTTGAATGTCCAAGTTGAGTAGTATATATATGTATGTACCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 + chrX 19585143 5' + Transpac 4963 2 52.05 CAATGATAAATCTCCACGCAACAATGCGTCTATATCGGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:2 + chr3L 12899774 5' - roo 8987 2 73.97 TTTGATTTTTGATGCATTTAAAATCTAGCGGCTGTCAGTGCGGCTGATGATTAAGTAATTAGTGAAACGCAGGCGAACGATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGC:1 - chr2L 2599381 5' + Ivk 211 1 52.05 ATTTAATGTTCATTTAAAAGACTTCAGACGTAAAAGTTGTTCTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGATCTGTTCCTTAATTATAATGTGTACAAATGT:1 + chr3L 11837685 5' - G5A 2736 1 54.79 AATTGATTTAAAGAGTTTCACCAGCAAAGTAATACAAATAAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAAC:1 - chrX 10128319 5' - invader3 5439 2 65.07 TAAATTCAATAACAACATGCATTTGAGCAGTTATGCAAATAAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACC:1 - chrX 17737261 5' + jockey 4754 1 71.23 GAATTTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTGTATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGATATATACATATATTCTAGATCTGGATCAATAGCCGA:1 - chrX 19192431 5' + INE-1 89 1 78.08 GGGCTGTTCAATGACGTTCAATGCAGCAGATGGCTGGCAATTAAAGCATGCATATTTTAAGCACTTAACAACTGTCCATGTGTTTTCACATATGAACATACATATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTA:1 - chr3L 16875968 5' + Burdock 17 2 73.97 ATAATAAATTCAACAAAATATAAAGTATACGTGCCGTTGCCGAAAGTGATCATTAGAGTATCACGTATACGCAGTGTTAACTTTTTAATACAATTTGTGTAATACTTTAAATTTCAAAAGCAATTATTTCTTTCTCCTTTTTTTTT:1 - chrX 9828209 5' - Doc2-element 234 1 80.14 ATCGGGTTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGATCTGTTCCTTAATTATAATGTGTACAAATGTACAGTGAAGAGATTATGTTATCTTACGTGTTCATGGGGGTAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGAAGGG:1 - chr3L 11816239 5' - G5A 2672 1 60.27 CCCAGTTCATTTATTAAAATTATAGTAGTAGCTTACACTACCAGTTCCCAAAAAAAAGTTGCTAAAAAAGTTTTTATGAATAAATTATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAA:1 + chrX 20795936 5' + jockey 4794 1 55.48 GCTTAAAGGAGCAGTTTCCTACAGTCGGCCTGCATTTAAAGTGCAATGTGCCAGGGAATTACGGTCAAATCATATACAAAATCAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATTATATGCG:1 + chr3R 23883036 5' + Circe 7086 1 56.83 AGATACATGTCTTAAACTGCAAGCGAAATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 - chr3L 4933842 5' + blood 39 2 55.48 TGGATTCCAAACAAACGAGCACCGATTCATCTTCGGAGAACCTCTTTGGTGAGCCGCCTTGGAGTTCTGCACTGGGAATATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCGGT:1 + chr3R 10636079 5' - blood 7346 2 53.79 TAAGTGGCAATCGTGAGCGGTCTTCAAGCAGTTTGCTATAAATGATTACCTAACGTAAGCACACCTCGAAAATATGTATTATGTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 + chr3R 17467064 5' + I-element 33 1 59.72 AATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGTTTTTTTTTATGTGCCTCGCTGATTGCGATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATG:1 - chr2R 16891828 5' - jockey 4924 1 70.55 GACTAAACTTGGAGCGTGGAAAGTGAAATGAAAATGCAGCGAAATGCACATAAATTTAATTTCAATTTCACATAAATCGGCAGGGCTTTAAATGTTAAACGGGCTTATAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr2R 23183668 5' - roo 9004 2 72.60 CTTCAATTACCTTACGAGAGGTCAAAGAAGATGGAGGTCTTCTGGGGTGTCCATGGTGTCCTTGGTATCATGACCAAAATCGTTACCTATTTCAATCTACATTTTTAAATATCTTCTAAGCACTCCCATTAGCTGAGTAACGGGTA:1 + chr2R 10940016 5' + INE-1 539 1 58.22 TAGTCGGTCAGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:2 + chr3L 23146441 5' + 1360 31 1 64.38 ATACCTGCTTGGTTTATGAAATGCTTGAAAATTGCTTAAAAACTTGTTAAAACAGTTTTGATTTATTTCCAAGCATAAAAATTCGTTATCAGGTCAATGATCTATGTGTAAGCTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACA:1 + chr2L 13510730 5' - diver 215 1 75.86 ACCGTTCCCACACACCCCATATGTATTTATATATATTGTTTGCTTATATATGTGGCTTGGCCTACAGTATAGACCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 12899863 5' + roo 46 2 53.15 TGTGTCCTTTGCCGCTCATAACGGCAATTCGTGTTGACAAGTGCAAACATTAATTAGCCGATCGATCTATCAGGTGAATGATATTGAGCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTT:1 - chr2R 15822135 5' + invader6 4502 2 63.70 GCTTATAAGGAAGTAGGTGCCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGATGGTCATTGTATCTTTATTGGGATTTTATTAGGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCT:1 + chr2R 14722700 5' - mdg1 326 2 75.17 TCTGGAAATAAAAAGTAAATGGTCCGAAGAAAGGCAAGAATTGTTAAGGCAATTTCGGAATACATTAAAAGGGGCGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1 - chr3R 26244737 5' - copia 5077 2 50.00 GCCAATTTTGTTTTTTTTATTTTTCGCAAGCAAGCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAAT:1 + chr3R 17059285 5' + hopper 86 1 73.97 CCGATGGGGGGCAAATTGAATTTGGACTGCTGCTTATCAGACTTTTGTTTACTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGT:1 - chr2L 13140697 5' + blood 7082 2 63.70 ATGACTGGGGACCCAAAACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCAGCCCACCCCCTAAAACCCCACGCCTCTAAA:1 - chr2L 20324219 5' + Tirant 19 2 65.14 AACAAAAAATGCACAAGGTGAAGAAGTAGTTCTATATATTATATGAATTTTTCACATTTAAAATATGTGACTTGTCATACAATTTACCAAATATTTATATTATATATTTATATTTATTTATCTCACAGCGTGAGATATGCTAGCAG:1 - chr3R 25194559 5' + G2 2833 1 66.44 TTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTA:1 + chr3R 4160062 5' - invader2 191 2 56.16 CACAGAATAAGAGGAACCCAATTTCTTTTGATTTAGGCTACTTCCAACTGCCTTTTGTTGATTTGTACAACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTG:1 - chrX 3512058 5' + hopper 1262 1 52.74 GGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr3R 24976288 5' + roo 78 2 71.92 AAAAATGATAAATGCCTCGCTGCGCTCAAGTGAAAACAGCACGGGGAAGAAAATATATAAGTATATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAG:1 - chr3R 26432083 5' + Quasimodo 53 2 62.33 GACCTATAAATACTTTTTAATTTTAATAAAGTTGTTTTTGTCAACAATCCTTTGTTAAACAATAATAAACATAGCTCACTCACAAACGCATACACACTTCAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTG:1 - chr3L 20042616 5' + invader3 5376 2 58.62 AAAAGTTGGGAGACAGAGACACGTTTTCACGTGCATCGTTGAAAGTTCCCCCTTAACTGCATTTTATGCACTTTTCTTCTCATCGGGTGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAA:1 - chr3L 18767879 5' + roo 8609 1 60.69 AGATGCGGATGGGCTGCTGCTCCATGTCCGTGGAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr2L 18627751 5' + 1360 81 1 75.36 CACACAATTTTCATTGCACACTTTTCGGCTTGACACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGGGGGAAAAGCAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chrX 19113599 5' + 412 34 2 59.59 AATTTATAACCAACTCTGTGGATCTGGTGGCTGCTCCTCCACGAATGCCAGCATATTTCCATACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCG:1 - chr2R 13471073 5' + flea 4815 1 55.07 ACTTTCGGTGGCTTATTGTTAGCTTTTAAGCTTATTTTTACAACAGCCACAACAATGTATGGCCAGAGCATGACTCGGATGTGCCTGGTGATGGGTTTTCTCTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 - chr3L 3858828 5' - jockey 4972 1 68.49 GAAGACTTTATCAGAATTTTGTGTAATAAATAGTTTCCTAGAAATATATATTGGTTGCCAAGGCCTAATGCACTGATACTAATTTGCCGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:1 + chr3R 5115258 5' + Ivk 35 1 61.64 CGCACAAAAGTATGCTACAAAATGGCAATGGCTTACGTTGTGTGGGTGCTTAGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGA:1 - chr3R 16530654 5' - hopper 1347 1 63.70 GCACAAGCAAATAAGATGTAAAAAAAATTTTTTTTATGAGACTTAATAAGCTAAGCATAACGAATAGGTATTCGTTTGCATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTG:1 + chr2L 9074187 5' + flea 32 2 43.48 ACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAA:1 + chrX 19005380 5' + F-element 88 1 70.55 CAGTGAATAATGTAGTTCCTTGGAATCAGAATCTTTCTCAAGAACCAACCCCACCGCCCCACTTCATTCAATAAGCGGTCTTTTGTATGTTTATTTGTAGATATCGTGATTGCTGTACTGTTAGCTAAAG:1 + chr3R 18844228 5' - Doc3-element 480 1 72.31 GCCCCTTTATTTTGGCTAACCTTAAGGACATGTTCATAATCAGGGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATATTTG:1 - 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chr3R 28782671 5' + blood 50 2 51.37 AAGCAAAAGTGTGTGTTGAACCACGTTGAGCAAAGTGACGACAATGGCTCGACAAATATTTTACCAAAGATTCAGTTTTGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3R 19543526 5' + roo 8689 2 64.34 ATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTTGTTGTCGTCTGTAGG:1 - chr2L 14480504 5' - Transpac 5157 2 74.05 CAAGCGGGTCTATTAATTAGGCATCAAATCTAAAAATTAATAAGGCACATAAAATATATCTAGATAAATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACACTCTTATTAGATTAAG:1 + chr2L 14480385 5' + Transpac 4937 2 73.97 TATGGTTCAAAATATGGAAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 + chr3R 4532853 5' - 1360 3347 1 56.85 GCTTTCCGTACCGTTAACAAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAATGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTTTTCTGCAAACA:1 + chr3L 23773884 5' - Transib5 2847 1 67.12 GGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 + chr3L 18199955 5' + Doc 74 1 67.12 GTGATAATCTGCAGCGACAAAGCCTTGCCACAGCCTCCCGGCCACCATCATCGCAATCATCACCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTG:1 + chr3R 26432913 5' - Quasimodo 6942 2 51.85 TCTTAAAATCACTCACGCCCCCTTTTTGTGGTCAATTCTTCAAAAGCCTTTTTTCTCTAGATGGCCTCATTTGCCAAAAAAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGT:1 - chr3R 14738860 5' - 1360 17 1 56.16 CTGGAACTGATGCGCTTAACTCTTTGACTTCGTTTTGGGTAAGGCAGAGATCGGATTAGGTTAGGATCGATTTAAGCCCAACTCTACTTATCGGTTGCACCACCCCCAAAACACTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAG:1 - chr3R 29516627 5' - I-element 5350 1 79.45 CAGAAAAATATGCAAAAAATGTGTTGCTCCTGTCGTTCGTTTGTTTCTTGCTGCCGTAATTGCATAATGAGGCCAACTGCAATTGCGACAAAAAGTGCAAGCGTGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 - chr3L 7790812 5' + copia 16 2 72.22 ACCAGCAAAAATATTGTCATGCGAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr2L 19643604 5' + hobo 52 1 63.78 AGCTAATTTTGTAGATTGAAGTATATGGTTTTTTTTCCATATACCTTAACAATACGGTAGCAAATATGTCTACGACTATACACTCGCATCTGGTCTTCTTTCGTTGTTATTATTATTTGCCAAATTTAAGGCTAAGTTATTTTCAT:1 - chr2L 22090612 5' - G4 3634 1 66.44 AAATATATAACTTATGCAAAAAAAAAAATTAAAAAAATTTTCAGAAGTGTACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGAT:1 + chr2R 330441 5' - gtwin 442 2 57.94 GTGTGTGCCACTGCACTGAGCGAAAAAAGGCATACCCTCTGCATTTTATGCATAGAAAACACAGTTAGAGAGCAAAGTTTTTGTGGCCACAGTCGAAATAACAAAAATATATAATGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTA:1 + chr3L 17162249 5' + Stalker2 9 2 34.25 ATGGTTTTAATTGAGCCCGAAACGAGTCTGAAACGAAATGGAATTAGGCAAATCTGCTTGTCGACTGAATGGGTATGGTTTTGGTTAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 - chr2L 1277932 5' - I-element 5323 1 62.33 GAGGATGAGGACTCCTGTGTGGCAGTCGGGAGGAGCTCCATATACTGCCATATGTGGCAATATAGGCCAGACGTTGTGGGCCGACCAAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 18517905 5' + roo 30 2 65.52 ATTGGAACTTTTTCGGACTGATTTTACAAAGCGATAATAGCGCAGCCAATGAAATATTTATGCATTTCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCACAGA:1 - chr2R 10600120 5' + 297 6609 2 67.81 AAGCAATAGAAAATGAAGTGACTATTTATATGCTCCATAAAATATTCATAGTTTAGGCTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACA:2 + chr3R 5316547 5' + Juan 4090 1 58.90 GAGTACAATATTGTAAGAGGTCTAATTTCAACTGGCACCTGCTCTCAGTTTTATTCAACAGCGAGAGAGCGGAGAGCTCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGACAGCTGACAACTTCATGTGTGCACACGTATGTT:1 - 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P-element 2802 1 27.40 TAGGGGCTGGAACTCCGTGCTGGCTTATTTCACTGTTGATTTAGCATTCGATACCAAAGAACTTTGACCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAGGTATTTT:1 + chr2R 11379425 5' - hopper 1364 1 52.41 CGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr2R 9504221 5' - roo 8997 2 71.23 CAAACCTTACAATTTATTTCAAACTTGATGATGTGTATCAGGTAAGAGTTGGGCACATAATATTGACCCATTAAGAGGAAATGAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 - chr3R 5215036 5' + FB 40 1 58.90 CTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chrX 11661355 5' + 297 46 2 55.48 TCCGTAACGATTATTTAAAAAGTAAGTTGTATATAATTTAAATAATATAAACAAACATGGGCTTATCTCCTGAAATAGAAAGTCTACGTATTGCACATTGCCAACTTTATTTGGTTCCTTTTATATTGGAAACTACAAATTATTCA:1 + chr2L 3145783 5' + P-element 2674 1 78.08 ATTTTGTGGGGAAATCAATCAAATTACAGCTCCCTCGATTTGCTCTGCTTCATTAATTATTGCACTTGGGTTCATTGTCTAAGTCCACAGACACCCACACATATGCACACGCATACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chrX 5145994 5' + hobo 5 1 79.45 TAGATTTTCTAATAGCTCAAAGCAGGCTGCAAAAGAGCTGTGGTTTTCATTCCCCCTTCTTCTTTATAATTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 - chr3R 9175274 5' - Juan 4161 1 53.85 TCCGAAATACATTGAAATACATTTGGGAACACTACTGCTCTGTACTAAGTTGCTTTCGGAGCAAGGACGAAGGTGTCCTTCTATTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATT:1 - chr2L 19742107 5' - mdg1 426 1 57.53 GGTGTATACACTGCTCACCATTTTTACACATCAACATCAAGGAGGAACACAGGCCCCCTGTGCAAATTATCATTTTTTTGGGTTATGATTGTAAATAAGAACAATTGTGTTTAACGGCAATGAGCCGGAGCAAGCTGTGGTT:1 + chr3R 25713600 5' - gypsy 7248 2 57.75 GATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATC:1 - chr2R 5173223 5' - Stalker 351 4 56.85 ACTGCTGCTTTGATTGATGGCTCCACTGATTCGACTGATAAGAAAACATATGTACCCTCGATGTGGATACGGCCCTGCCTTGCACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAAA:1 + chr3R 18697838 5' + 297 6609 2 64.38 ACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATCTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr2L 11867393 5' + jockey 59 1 50.00 TGCAGCTTACTGGAAATGTTTGCCATGGTTTAATTTAAAATCGAAAGTCATTTGCAATCCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 + chr2R 12814828 5' - opus 7449 2 57.45 TATGCTACGTTTTTGGCCATCCATTGCGGCGGCTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTTTATTATTTATATGTTAATTTCGCTGTTATGTT:1 - chr3R 14860220 5' + BS 5039 1 50.81 AATGCGATATATATAGGTATAATGATAATAATGATAATGAGCGACTTAATTGCAGAGCGAACAACTGAACGATAAGCTAAGGGTGTAGGTGCGAGCGAACTGTGACAAACAAATTATAAGTGCAAAGCTAATTATAGAACTCAGAA:1 - chr2R 1247781 5' + gypsy4 392 1 65.07 AAGGAAAAGCGGCTGCTAAAAAGTCAAGCTCCAATTTGGGCATCACTGAAACTCATGTTCCCGAGAAAAGCTAACCGTTGAGAAAGGCACTTATAAAATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTT:1 - chr2L 16509037 5' - invader4 3064 2 73.29 AGATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3R 4662005 5' + roo 8747 2 75.34 GTCTTTTAGAAATGCTTGTTAATAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 11267733 5' + roo 60 2 79.82 AAAAATTCGTTATCAGGTCAATGATCTATGTGTAAGCTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCA:1 + chr2L 13510806 5' - diver 6026 2 74.66 ATTTGTTTAATTTATTTTATTTAATTTAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTATAAATTCTGTTCCGCATCCACGAT:1 - chr2L 4034960 5' - HeT-A 6024 1 55.07 TGGGTTACCCCGGTCGTCAAGTGTTCCCACCTAAGAGTCATATTTCGTCTATTATTATATGTATATGTATAAGTTAACTTAAGTTAACGCCGCTACGTATGTGAAAAACGGCAACAACAACATTCTGCAATGTAAGCATTATGCCG:1 + chr2R 4815868 5' + gypsy2 6547 2 72.60 AGGTGATAAAGGCAGGGAAGAGCGACACCAATTAGCGGACCACAAATGTGTCCCAAATGTGTTTTTAAGCCCAGCCCCAGGGGCCACGCCCATTGCATGTGTTGTGTTCTAGTCCTTTTTTTTTGTTTTGTTTTT:1 + chrX 1258044 5' - Doc2-element 223 1 67.41 ACTTTGTGTATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTG:1 - chr3R 29091421 5' + rover 28 2 67.12 ACTTATAGGCGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTCGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCTATCA:1 + chr3L 13472404 5' + jockey 67 1 55.94 AAAAAAATCACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCATT:1 + chrX 10128173 5' + invader3 75 2 57.53 CCTGCTTCTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 + chr2R 16891807 5' + jockey 4710 1 68.89 GTGATACACAGCAGGCGGGCAAAGTTGGCGTATGAGTAATCTGCAGTGTGCGACGCAAGAATTAATGAACCTCTCGAGTGTGTTTTAAAACGCGCCAAGATAAATCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr3L 6675248 5' - 412 7531 2 73.29 ACACTGATTCATGCCAGTTATCTTATCGTACATACATAGAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCATTTTTTTTATAAA:1 + chrX 15019725 5' - S-element 1631 2 77.08 ATCGGCGAACTGGATAAAGAAGTAGGTGAGATGACCGATAGACGAATGGCCACTTTAATAACGCACTACTAGTGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTAAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGGCCTCTTTGGTTTAT:1 - chr3L 24368819 5' - invader2 197 2 65.71 GCTCGGTCCTCTCGCAATGGAAATGGCAAAATGGAATGGGCTTAGATGCTCAGGGATGCAGGAATATTAAGGTTTCTATTGGGTTTCTATTTGGGTATCAGTTATTATTGGAATATTGAGATTTCTTTGTACATTTTATAGTTAAA:2 - chr3L 6870056 5' - transib2 2760 1 77.40 GGCGGTTCTGTCGCAGCTTCTTGTCCCGAGTGCGTTCTACGATAGAGTTAATAGACATATATACAAGAATATATAAAAATGAAATTTGAAGTTGTAAGTAGGGAAACTAAGTAATACAAATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATC:1 + chrX 21626855 5' + HB 62 1 66.90 GAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chrX 16217538 5' - P-element 2852 1 56.59 AACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGCTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACA:1 - chr3R 29091391 5' + rover 58 2 60.96 TAATGACGTGCCTCAGTATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTATATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 - chr3R 4532996 5' + 1360 11 1 72.73 CTTAAAATGTGCTTGATTATTTTATATTCCCGTTTCAGCCTTCGCGTTCCTTAAGAGAGGTTATAACCGCAGCAGAGAGGTTGGTCCAGGCCTTCAAAAATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3L 22709289 5' + 412 7076 2 69.86 ATTCGGGGAGTGTACGCATTTGGCTATTAGAAATTATAACGACAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 14494154 5' - roo 9054 2 73.97 TACGCACCATAAAGCATATGCCCCGAAAAACAAGGGGCTTCCGGAGAGGGAAAGAGAGGGCGCGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGCGACAGAGCGAGAGA:1 - chrX 18285845 5' - Cr1a 299 1 73.74 GGGTACTTCTGATCTTCATTGGGAATATATGTACTTAAAGCGATCATATAAGCATCAAAAATCTGTTCAAACATTGTACTATAAATAATAAATATTCTCACCTTTTTAGGGTTAATGTGTTTTATTAAAAATTTTATTAAAAATTA:1 + chr2L 7579179 5' - Juan 3781 1 48.63 ATAAAAAACTGGTAACCAACTTGAACACATTTTATGAATACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTC:1 - chrX 21581422 5' + Tabor 6923 2 72.60 AATAGGGAGTAAGTGCACTTGGCAAAATGGATCGTGCTTTAAAACTGGTGGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACC:1 - chr3R 30558290 5' + I-element 4898 1 65.75 ATGCGAAAGTGTTTGCTGTCTAAAAAAGTTTTCTACACTAGCACAAAGAGGAAAAAGATTGAAGCGGCCCTTTGAAGAAAAATTAAAACCCAATAAAATGTAAGTATAAACAATTAGACTAGCTCACAAAAAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chr3R 13148638 5' + gypsy7 5004 1 66.44 GATTCAACCCTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chrX 5206539 5' + Tirant 39 2 57.02 GGACCACCCCATCCTTCGTACCCCGAAAAACTTCCCCACTGCAAACTGTTGCTAAATATTTAAGCCCAGTGGGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGCAAACCCAAAA:1 + chr2R 9623321 5' + I-element 52 1 49.65 CGTAGAGTTTTTCTTTGTCGTTTTTACTGTTGAAAATTGGCCAACTTGACATAAATTTGATATGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAAAAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2L 3648712 5' - roo 350 2 53.42 GAAATAAGCTACTTCTTTGAGTAGCAGATGTTTAAATTGACTGGGTTATCTGCGTATCATATTGATATCTAAATATAATTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGT:1 - chr3L 19356938 5' - I-element 4898 1 53.42 CGGACTCATGCTTTTCTCTGCTCTCTTCTTTGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chrX 850116 5' + jockey 79 1 72.66 GAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGTTATATGGGTCACTACATTCA:1 + chrX 21585259 5' + mariner2 275 1 58.52 CACACACACGCACAACCAAATAACGAGCCGAATTTTTAAGGTCACAGTGCGGTGAATGTCCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3L 20399080 5' - roo 9010 2 60.27 TGGGGGAGGAAGTGTAAGTGTGAGCTTGAACCATGAGAAATGCCATAAAAATTCCTCTGTCTACCAGTCTGTCTTCCTCTTTGTGGGCTTACTAATGTGAATACCCCATTTTTTATTTTATTTTTTTTTATTTTTTGTTATTTAT:1 - chr3L 12054494 5' - BS 5096 3 60.00 AAAGTTAGTGCAAACAACCCTGGAGTCGGCGAATCAAGTTGAAAAGCTATTGCTGCTTTATCCTAGTTAGATTAGTTTTATAAGTTAATATTTTATGACCACTTGGACGCAAGGATAGATTCAGATGAAAGAAGAATAGAAAATAT:1 - chr2R 17193075 5' + Bari1 137 1 47.95 GTCTTTGAAGTTTTTGGCAGCTGTCAGGTGTGGCTCGGGCAGTTCATAGCAAAATTTATTAGCTGAGTCTTTATGAACAGATCGATAGTCTGTTTTCGCGGGGGGGTAAAAAAAATTTTAAATAAAAAAAATAAAAAAAATTTTAA:1 - chr2L 7535435 5' + HB 325 2 63.70 AACATTTTTTAGGGACTAACAAGGGAACTAACAAAAATTTGGTTAACAATGCTTACAAATTTTAAAAATTTTATATTTTGTTAAAAATATTTAATGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3L 18164090 5' + pogo 23 1 69.86 AACATTTTTGGACCACCCCATCCTTCGTACCCCGAAAAACTTCCCCACTGCAAACTGTTGCTAAATATTTAAGCCCAGTGGGTACCACTTCAACCTCCGAAGCGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 + chr2R 9623312 5' + I-element 38 1 56.52 GTATTATCATTATAGATGCAAATCAAAGGGTAGTAAGTGAGAAAACGTACCTTAATTTATTGAAATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chrX 4214399 5' + jockey 11 1 77.40 AATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCT:1 - chrX 10128279 5' - invader3 224 2 57.78 TATTAAGTGATTATGCTAAAAATATCAATATCAATATAAAGCAAAAAAGAATGCTATAGACGACTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTGCTCAGCTAGTGGATATGCAAACTAGAAATTTCATCATAATTTTTCTGGAATATCGAT:1 - chrX 22485105 5' - INE-1 504 1 81.51 AATGATAAATCTCCACGCAACAATGCGTCTATATCGGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3L 12899775 5' - roo 8986 2 74.66 GGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr3R 27188599 5' - roo 322 2 77.70 GCATAAACAGAGGCGCGCACAAAAGTATGCTACAAAATGGCAATGGCTTACGTTGTGTGGGTGCTTAGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1 - chr3R 16530669 5' - hopper 1362 1 53.42 GAGCATGACTCGGATGTGCCTGGTGATGGGTTTTCTCTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTT:1 - chr3L 3858763 5' - jockey 4910 1 77.62 TGTCGAGATCGAAAATCAATTTGAAGCTCAACATTGTTGCCATATCTCAGTTAAAAGGCGACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAAT:1 + chrX 20460551 5' + diver 57 2 59.29 CGCTCATAACGGCAATTCGTGTTGACAAGTGCAAACATTAATTAGCCGATCGATCTATCAGGTGAATGATATTGAGCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCAT:3 - chr2R 15822123 5' + invader6 22 2 55.48 ATTAACAAACAATAATGAAATTTAATGCATTACAAATGAATTAAAACCACATGAATAATAATTCTCGAAGTTTAAATCAATAATTAAATAAATTAAAATCAATTTAATAAATCTACAAAGTGAGATTATTAAAAAAAAAACAACAA:1 + chrX 18357365 5' - hopper 155 1 56.85 CAACAGACACTCTCCTACCCTATCCTTCTTCCAGATATCAGCTATCTATCTATCTGCTATATGGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 22522732 5' - roo 349 2 56.16 AAGACAAACGTACAGTGACATACGTGCGAGCACTGAGTTTTTCTAGTTCTCTTGCCCAAGTGACAACTCAAAGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 7899217 5' + roo 48 2 52.05 CCTACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGT:1 + chr2R 2552121 5' + HMS-Beagle2 86 2 78.77 TAATTAAAACCCTTGTTAAACAAGACACCCTGGCCACTTGCAGTAGTTCATATTTTCGGATGTCAATATCTAAATAATTTGTAGAACTCTTTCGGACAGTTGTATGAAGAGGGGCAGCGAACGAACAATAATAAAAACAATAATTA:1 - chrX 3532500 5' + mdg1 23 2 68.49 GATAGAAGGCAGCCGAAATGCGATAGCTTGGTCGACTTGGTGAGAAGATACCCTAATTTTTCTATATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 5447832 5' - roo 396 1 73.79 AAATACTCTAATAATAGATACTATTCTCTTTTATGCTTTTTAAATTAATTCAAATTTGAAAATCTAATAAGTTTGAAAGATGATATTGTAAAAAAGCTGAAGTATTGTCAAGACCGATCGTAGGCAGGGTCATCACTTTCACCATC:1 + chr3L 20555095 5' + gypsy9 4873 1 63.01 CATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGT:1 + chr2R 9934155 5' + Rt1a 4914 2 56.16 CATTTCATAAGCCTCCCGGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr3L 18199938 5' + Doc 57 1 55.48 TATTGTGAAATTCCACGAAGGAACATAGAAACGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACG:1 + chrX 4823557 5' + pogo 86 1 76.71 CGGGTGGATTGTAAGACCGAGTTAGCAAGAAATGTCCTTATATTGCACGCAGAATAAATCGAACCACGTAAAAGCAAAGCAACAGCAACTAAAACAAAAAAGTTTGAAGATGACCTGGTTGCTTGGCCGAAAATCTGCAACCACTC:1 + chr2R 5531646 5' + G4 3363 1 58.22 AAAGAAGCACTTATTGATTTCGACGTAAAAACCCACACGTATCTATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTT:1 + chr2L 6319751 5' + Tabor 6916 2 67.81 CGACACTAAAAGAAAAATAGAGTTTTATGAGCCATAAATATGAATTAAACATGCGATGCCGAGATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGT:1 + chr2R 16072879 5' - Burdock 6368 2 65.75 ACTTATCGCGCAAAATCGAAGGTAGAGCTAACGTTTCAAACAGATAAACTCCGGTAGGTTGAGTGCTGGCTAATTGTAGTTGGGCTGGAGCTGGTAACTCTCAAAAATTTCCACATCTCC:1 - chr2R 5217660 5' + baggins 189 1 54.17 GGTCTAGCCGAACGGCTCTATTGTCGATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAAT:1 + chr2R 1320642 5' - diver2 4873 2 60.27 AATGGTGGGCAACTGTCGATAGTCGCCGATTAACACATAGCACAAAAATACTAGAACACTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGGCACTTTT:1 + chrX 4540603 5' - 1360 3344 1 57.25 ATGCGAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGTTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1 - chr2L 19643586 5' + hobo 83 1 78.57 TTTAAACGCTATCAATTTCAATTTTCCAAATTAAATGCGTTGTTGCAGCGGGCAGGTGGAGAAGGGGTTCAATGGAGTTTTTTGGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACAC:1 + chr2R 13754758 5' + I-element 4961 1 55.48 ATAATAATAATAATAATAATTATTCGTTTCAAGTATTTATTGTGACTGATCTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAA:1 - chrX 13383538 5' + invader4 2816 2 49.32 GTACGCAGTAATGTGAAAAGGCTTAAACATATCCAATTTCATACTTTCCCAAATGCCAAACGAAATGTCATTATAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 6423159 5' - roo 354 2 52.05 AAACAGCAGCGGCGGAAAAGCTCTTCGAAAAACAGATGATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 4662041 5' + roo 46 2 53.79 GTAATACAAATAAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTC:1 - chrX 10128291 5' - invader3 5413 2 52.78 CTGAGAGGCTGAGACAGTTGGCCCGGTTGCCCACCTACGTGCCAAAAAGCCGTTGGGCCAAATTTGTCGGCGGATTTTAAGTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3L 19080637 5' - HMS-Beagle2 490 1 75.00 AATCAAAATACATTGTTTATTGCACATTTTCCGGGCTGCCCCTTTCATCATTCGCTTGTTTTTTATCGGAACACTTCATACTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 21587489 5' + roo 8704 2 56.85 TTAAGACCCATGGCATGTTGTCAATCCTTTGTTTTTCTGTGAAGCTGTGTGGTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 16463631 5' - roo 385 2 67.12 CATTTTCATTTTTCTTGATTTCGCGCATAAAATGCGCATAAGCCTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chr2R 20739118 5' + hobo 27 1 63.08 AGGTTAATTAAGGAACATAGACATTCCACTACACTTCAATTAATAATCCTAGCAAAATATTTATCCGAAATTAAGAATATTGAATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGCGCTCCGCTCATATC:1 - chr3R 12610116 5' + roo 38 2 57.53 ATTAATTGATGTTTTGATATTACACACTTGAGTTTCTATGTATCCTATGCTATTCCTGGTACATACATATGCGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCG:2 + chr3R 5430379 5' + Burdock 6184 2 53.42 CATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 + chrX 19005368 5' + F-element 72 1 61.27 ATCTCCTCGAAAAGTTATGTCAAGTGTAATAAAACGAGTAAAACACAAATCACAATAGAGCGCATGCAACAGCTGCAGAATTAGCAACAACACCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTTTGTTTTGGGCATTTTATTTAATAACTGTA:1 - chr3R 12090450 5' - Bari1 362 1 61.64 GCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGT:1 - chr3R 17210123 5' + HMS-Beagle2 6929 2 54.11 CAAGGAGCCTAAAAGGAGACTACGATAATTGCGAGCCAAAGTGGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 - chr3L 9762305 5' + jockey 4776 1 66.44 CTGTGCCATCGGATCGGATGGGATGCCATCGGAGGTGGGAATGGGAGTGGGATTGGAACCAGGACAGTTGGTTCATGAGATTCATATGGATGAGCAGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTT:1 - chr3R 22840546 5' - Transpac 5223 2 40.77 AGTCGCGACACTAAAAGAAAAATAGAGTTTTATGAGCCATAAATATGAATTAAACATGCGATGCCGAGATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAATTATCATTTTAGTAGCTTTTCCATATATTTATTAGCG:1 + chr2R 16072874 5' - Burdock 237 2 69.18 AAAATACTATGGTTCAAAATATGGAAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATTGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr3R 4532846 5' - 1360 3354 1 60.27 AGCGCAAAATCCGTCCCTTACACCTGAACTTCCTCTTATGCTTCAACACGCTTTCGCTGTAATTTCCTGTTGGCAAAAACTGAAAACTGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr3L 10563861 5' + hopper 3 2 78.15 GAACTCCATCCATCCTATCATCTTGCATACTCATTTGTAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTC:1 + chrX 5399024 5' - opus 7432 2 72.26 ATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATCTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGAAATTGTGATC:1 - chr2L 11867390 5' + jockey 62 1 48.63 AGGAGTTTGGGAAGAACTTACTAGACCTACGGTTAAGTTACCATTAGGATTAGTCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTA:1 - chrX 20465867 5' + jockey 4829 1 65.07 CTGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATTTATATATATAGTGACATATTCACATACAACACGACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAGGCAGCTAATGTGGATCAAATAACAAATATATC:1 - chrX 22574706 5' + 17.6 91 2 42.86 ATATAAGTTGAAGCTACTCCAAGATTTGTCCTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAATCTTCTTCCTCGATTTTTAATAATAATTTCAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAA:1 + chr3L 2871944 5' - invader2 399 1 78.77 ATTGTAATACAACAGCTTTTGCATATCAACATGTATTTGACATGTGCTGTGGAAGCCGTTTTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTAAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:1 + chrX 1123579 5' + FB 60 1 58.22 GCGGGGTTGATTTTACAAAGTTCTTAAATATTTCATTGGTTGGCTTATTAGCAAAAAAGCGCAAACTATGTGAAGAAAAAGGTGGAGAGAGTAACAACAATCACGATCGGCACGACATGCATTTGGGCTACCCTGGTATGTGAGGA:1 + chr2R 2950795 5' + G5A 2521 1 73.29 TACGTCGACGTCACCGGAAGTTGCAACACGTCGCCGTCTACGCACACAAACGTAAAAACCAACATACGATGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACC:1 - 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Tirant 391 2 60.81 GAGTTTCGGTATGTTAATCTATATGGTAGCTCCAGTCTTTGTTCACACATTCCGTTCGGCGGATAAAAAGCCTTTGTTTACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2R 24745743 5' + 412 7095 2 56.85 CCTGTGTGTGCGTCTGTGTGGAGCTCTCAGCTGCTGTGGTCGTAACCGATTATATTCGCGTTTTTCCAGGGAAAACGGAAAAACATGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGCTGAGTCTGAAGAATTTTTATCAG:1 + chr3L 19675594 5' + hopper 247 1 58.62 ATTTCCTTAATTCACACATAAAATAATCTTTTAATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAAGGACTATATATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCAAGTCTAGCCATGTCCGTATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCTC:1 - chrX 14766981 5' + INE-1 128 1 60.27 ACTCTATAAAAATGTCATATTTTACTCGCAGTAACTTGTACAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGAT:1 + chr2R 8452757 5' + blood 81 2 73.29 ATTAAAATGACTGTCAGCAGTGCATATGTGTTGTCATATTTTCCACTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAG:1 + chr3R 27782635 5' + G2 3051 1 67.81 GTTTAACTTTAAAACTTTATAGTATTCCCTGTATCGTGCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAG:1 - chr3R 904681 5' - 3S18 6021 2 73.29 ATTTGTTTAATTTATTTTATTTAATTTAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATTCACGATTTATTT:1 - chr2L 4034960 5' - HeT-A 6018 1 56.94 GTAAGACCTAGTGATATTGCTGATAACAGTGCCCTGCATGTCTTATACCCTATTGTATTTCCAGAAAAGAAATATAACAGTTCAAGGGCCTTTACTAGTGCTAAATATCCGGTTATAAATAAAACAAAAGAGAATGCTATAGTCGA:1 - chr3L 27147797 5' - INE-1 578 1 60.27 TAAATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGACAAAAAGTGGGCAAACGATTCCAGTTTTCAAATTTAAAAAATTCGATTTTTCCG:1 + chr3R 20001637 5' - FB 20 1 58.45 CTTTTGAGCGTTAAAGCTGCATAATTAATGTTTTATTTTATTAAAGATAAATGAACGATGCCTGTACTGTCAAAATTTTTATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 - chr3L 13166341 5' - I-element 5314 1 52.05 ACTCAGGCACGTTCCAAGAACAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 14811564 5' + gypsy2 395 1 82.86 CTAACGGTACCGCGCTGGACCTTGGAGGTGCACCTAACGGTGCATGCACAAAGAGGCCGCACCGTGAAGTAACGGTACAACTGTTGGACCTTATACTCGAGCGGGCCGTGCGCAAAATAACGGGATCCCTGCGGCC:1 + chr4 249261 5' + gypsy8 322 1 63.97 ATACTTTCTGGGCCAAGCCGAAATCACACGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - 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roo 8987 2 73.97 AACTGAATGGGTTTGACTACTTGTTTAGGTTTGAACGTTGTAACTTAGTTATATACAATCCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATAAGTCATTTGTTAAATAACTGATCTATTCATACATACAAATTTAT:1 - chr3R 3589815 5' + Tc3 1637 1 83.10 TGGTCATCAGTGCTACAAGCAGATAACTGTTGAGTCGCGAATGTGCTTCGACGCCAAGCCAATCGGTAAGTGCCTTCTGTGTTTTTACCGAACATATAAAATGATGTTCTTCTGTCACTCCGCTTTTATTTTTTTTTATAATTTT:1 + chr2L 8051634 5' - Doc 4698 1 55.86 AGCAGCGGCGGAAAAGCTCTTCGAAAAACAGATGATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 4662037 5' + roo 51 2 53.42 AGTCTTACAGATTTGTTGATAAATACAAATCTTTAAAAATGAATTATACTTATAGGCGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr3L 13472357 5' + jockey 22 1 75.34 CCTCGTGGGTTTTTGGGCTTGCTTATCGGACTAATTTCCACAAAGGAATGGTGCTCGCGTATCGCATATAAATTGGCTCATTTTATTAGTTTTTTGTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr2R 19541718 5' + F-element 43 1 56.55 GCTGCTAAAACTACACACTATATCCCTTTGTTAAATAAAAGTTAAGCTTTTCACTTTAATTTCAATCGAATTGTACATACGAATAAAATTGTAATTCCACCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - 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chr2R 8335045 5' - transib2 2789 1 62.07 CCACGCTCGTAATCATACAGTTTGCATTATAATAATATCTGTGCGCAATTTACGAAACATCTACATATATATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTATCGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr3R 16678416 5' - 1360 3354 1 56.15 TTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 + chrX 6484719 5' + jockey 78 1 67.12 AAAAATTAACGCCAAACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3L 13827473 5' - roo 9004 2 65.52 CATTGGCCATTTCCTGTTTGTATGGAGCAAGCCAAGCAAATCCAAGCTTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3R 20074561 5' + roo 8737 2 67.12 TGAGGATCAGACAGTTTTAGTTAACTACTCCTAAAAAAATATCAGAGGACAATTATCTGAGGAATGAATCGCTTTGAAGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTG:1 + chrX 21636111 5' - Stalker2 396 2 78.77 GTTCATATTAGTGTGACCATTTGCATAAAATTTCACCGTTTTCCCTCAATCCAAACGCGGCCGCATTTCATTCCAACAGTATAAGACCCCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr2R 18440529 5' - P-element 2855 1 62.33 CTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTAC:2 - chr3R 29091365 5' + rover 7035 2 76.03 GTGGTTATGAAATCAAAGGGACTGAATCATAGAGATAAAACAACAACAAAGAGCAAAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1 + chr3L 3339955 5' + Transpac 4982 2 60.27 ATACCCTGGAACAAATATATTCAAAGGAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chr2R 12813747 5' + roo 90 2 83.56 GGGGAAAAAAGAAATCTATTTAAATTGGACTTAAGTTCGGGCCGAATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTGGTTCTCATATACCA:1 + chr3R 4456996 5' - jockey 4571 1 62.99 ATTATATATGTATGTAAGAGAGTTGAGCGAAAATGCTATGTGCGCACAATAAGAGCATAGCGGCATTTGGTTAGCGTGGGAATACTGACCATGCACTTATGCAGTGTGCTTCATAGGCGGGCGATAATATAACGCTTCCACTTGAA:1 + chrX 4338635 5' - gypsy11 4100 2 80.14 AGTGCAGAGTCGCTACTAGCGATATTTTAACTGTCACGTGTGGCAAATGGGTTACATTGCTTGAAGAAAGAAAAAAAATTAACTGTAGAATTAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAG:1 + chrX 8583314 5' - flea 463 1 53.42 GTAGAATTTCAAGAAGCAAAATCTTGTGTAAGCTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2L 3648789 5' + roo 52 2 71.82 AAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTG:1 + chr2L 20928090 5' + Chimpo 49 1 76.00 ATCCACTGTATCCGATAAGTATACTCTGTGAAGTACCCTCGCCTCGATAAAGTAACCGTTAGCAGGCAGCAGTGTGACACAGTTTGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCA:1 + chr3L 20388099 5' - 1360 3360 1 62.32 ATTTTGTGCATGTGAGTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGCGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGG:1 - chr3L 3565415 5' + gypsy 7043 2 57.53 GCCATAGAAACACGGACAATGGCAGCCCGAAAAGTGACAAAGACAACACGTTTCGTGCTGCAAAAAGTTACAGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chr3L 5179125 5' - P-element 2862 1 61.29 TAGATGTACATATATATATATATATATAGTTTATATATGACTAAAGCTTAGGTATTTCGCAAGCCATGTATAAAGACTTATGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACACACAGTTGCT:1 + chrX 2326452 5' + Bari1 42 1 54.11 TTATATTAGCAAACATACAAAATAAATTAAAACAAGAATGCTATGTCGAGATCGAAAATCAATTTGAAGCTCAACATTGTTGCCATATCTCAGTTAAAAGGCGACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTG:1 + chrX 20460507 5' + diver 9 2 74.81 TTCTAACACCTGTCAGCCATTTTACAAGGTGTTTCCACTTAATACATCGACACACGCACACATACGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 - chr2L 12847307 5' + 412 7109 2 56.85 CTACTGGGAGGTGGATAGTGCCGGTCTGAGGACATGGAACACTGGACGGCGTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAG:1 + chr3R 18898458 5' + jockey 4926 1 65.07 AGATCTCAAAGTGTGTGTCACTAAACTTTGTTATGCTATAATTATATTGATTATATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr2R 9092054 5' - 412 440 2 64.62 AAGTAACAAGAGAGATTGTTATATTCGACTTCCCAGACTATAAGATAGCCGTTACTCACCTCAAAGTTTTAATGGGAAATTTCAATATTTTTTGGCAAGACAAACAATAAAACAAAGTAAATCAAAACATTTTTTAAAAGTGTGGG:1 + chr3L 1298627 5' - INE-1 257 1 60.96 AGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTGTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTGG:1 + chr2L 18177011 5' - INE-1 540 1 76.30 CACCCCATGCAAAGTAAAGAGAGAAGAAAAATGCAAAAGGCCACTCCACAAAGTCCAAAGGAATGTGCCAGCAGTGGACAAAACACTCACTACATATATTACGTCACTTCTTTAAAAAGGGA:1 - chrX 13471563 5' + Stalker 6826 2 71.31 TACACCACTGACACTTCTGAAAACAATCGCGATTTCAGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - 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chr3R 26244771 5' - copia 242 1 73.29 CCTGTCAGCCATTTTACAAGGTGTTTCCACTTAATACATCGACACACGCACACATACGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 - chr2L 12847299 5' + 412 64 2 62.33 AGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGACTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2L 21153486 5' + 1360 63 1 61.43 AATTTTAGTGCCCTGGCTAGGAAGTCGATGCCAGGACTCTAAGGTCTGCCTGCCTGCCTTCATCCTGGCGGAAGGCAAAGGCGGAAATACGCGTGAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGGGCCAAT:1 + chr3L 22657037 5' - 1360 274 1 66.44 CGCGACACTAAAAGAAAAATAGAGTTTTATGAGCCATAAATATGAATTAAACATGCGATGCCGAGATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAA:1 + chr2R 16072877 5' - Burdock 6370 2 67.12 CACAGAATCAGGAAAAGCGAGGGTCTCATCGTACTCAGAATCGACTAGAGAGAACTGAAATTCTGGCAGGCAGCGGTTATGATGCTCGACAACCGCTTCGTCTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATATAAAGTATTTTGCATTTTTT:1 - chr2R 6249743 5' + Cr1a 180 1 75.34 GGAAATGCTGCACTTTTTTTTAGCAATCCTGCGACATCTGGAAAGTATATACATATATATATATATATATATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 + chrX 2550840 5' + I-element 50 1 54.17 TTTGCCATCGGCTAATCGAATGTGTGCCTAATCTGCATTAAAAATGTGCACCTAAAAGCCCATTAGCCCATCATCATTCACTAGCCGCCGCACTCACTTTGCAAACAATCAAACACCTCCGTGATCGAAGGGAGGAGACTGATTGG:1 + chr3R 21560648 5' - BS3 440 1 73.29 ACTTAACAAAATTAAATATATTGTAGTATACAATAGGCTACGGAGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTACTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAACTTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGTTACTTAA:1 + chr2L 3813589 5' - Ivk 5219 1 68.49 GAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGAATAATAATAATAATAATAATA:1 - chr2R 4032635 5' + mdg1 7066 10 63.01 AATGCCCCTCAAAAAGTTAAAGTTCTGTGGGTCAGTAGAATTTTCTCAGGCCGCAATCAGCGCAGAGCATGGCATTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGC:1 - chr2R 18927042 5' + mdg3 5226 1 53.73 CGGCTTGACTTTTACGTTGCACTATGGAAACCTTTTTGTGGCCAAAATCAATAACTTCAAAATAAATAAATTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCTCTGTCTGTCTGTCCGTATGATCGTCGAGATC:1 + chrX 22575966 5' + INE-1 132 1 52.74 CCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTG:1 + chr3R 25409741 5' + jockey 90 1 71.53 TAACACGAGGACCAGTTCCAATTAGCTTAATTAATGTCGCTGTTGTTCCCAAGTTTTATGACAGAGTAAAGTTGCCAGAAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - 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chr3L 20083851 5' + opus 7161 4 72.12 ATCCAAACTGGCGGGTTATGGCCTGTAATCCCAACAAGTACATCCCCAGACCTCCGGCCACCGAGCAAGATTTCAATGCCAGAGGTGCCTGTGCCCGTGGGGTGTTTTAATCTTCTTCTCGGACTTGTCC:1 - chr3R 4504912 5' - jockey2 3154 1 71.54 GCCATTAGGGTTTCTTAGCAAACATGATAACGTTTAAGCAAGGGTTTCTTAAGGCTTCTTTCTTAAATGCAATATAACTTAAATGTTAGTGTTCAAAGTTGTGAATACAAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 5762088 5' - roo 398 1 77.40 CAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGCG:1 - chr3R 19721152 5' - opus 7438 2 68.35 ACTGCGGAATACCAAAATGCAATCAAAATATGCAAGCCACGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGC:1 - chr3L 14551374 5' + P-element 82 1 29.45 GTGGTAAACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAATATGCATGCTTAATCTAAAATTTAAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCTCAGTTCATATGGAAGGTCAGACCAAAGACACTAGAAT:2 - chr3L 22016852 5' - Tc3 317 2 71.23 ATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTC:1 - 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roo 397 1 73.33 CGGACATGGAGCAGCAGCCCATCCGCAAAGACAATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCCACAATCAGTGCCTTATTAA:1 + chr2L 18627743 5' - 1360 444 1 75.63 GCGTGTGTGTGTGTGTGTCTTTCTATGCAGCTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 4869050 5' - accord 7031 2 88.89 CGATGTTGATGATTAATGTGTGTATATAGAATTGAAATCCCATTTGTAAATGACCAACTGGTATTCAAATTAATGTGTTCCTAACATTTAAGATGTTAAGACAATCTAGTTGTACAGATTTGACACTGTCAAGAAATTGTTTGCAC:1 - chrX 11962808 5' + S2 211 2 76.03 TTCAATAAAACGACCACGCCTATTTTGGACCAGCGTCCCTTTCGAATGAGTCACAACTACAAACACACACACACACACACATGTACA:1 - chr3R 28988721 5' + accord 186 2 89.66 AAAAACACAACATAAAACAGACATTGAAACAGTTTTTCGAGCTCCTGCCCCCCCTTCTACACCACCCTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr3L 18789116 5' - 1360 3345 1 52.90 CCTATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2R 9504204 5' - roo 9014 2 59.59 AGTTAAAAGCAAATCGAGCAGGCCAAAAAGCCGCCTATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 9504171 5' - roo 390 2 68.57 AATCGAACCCTTATGATTAATTAAATATGCATATTTATTCCACACATATATAGGCTAAATCATTTACATGTATCAGAACATTCAGTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr2R 8687784 5' + roo 8700 2 60.96 CTTTTCGATATTCTTGACGGTATTTTTAGAAAGCGCATGAGATGCACGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chrX 4724993 5' + roo 8739 2 70.34 ATTTGACTACAAACACTTTCAATTAAAGTTGCAGCCGAGCTGTAAAGCAAGTATTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAATGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCA:1 + chr2L 6876615 5' - Rt1a 4999 1 61.87 CTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCT:1 + chr2L 22719569 5' + 1360 49 1 57.04 CGGCATATTTCAATTAGTGTCAACTTTTTGATTTTATGTAAACACATGCGAAAGCAGAGCAACTTTACAGCCCATCGTTTTCCCCACCCAATTTGTGACCCCCTCCTACACACACACACACACACACACACACACATCC:1 - chr2R 13107375 5' + accord 185 2 71.22 AACAATATGGGCGAATATGTGTTTCAGTTTCATGCTTTAGTTCATCCGACAAAAGCGAAAATCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTT:2 - 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chr3R 18518031 5' - roo 9006 2 60.27 GTTAGTGATTTAATATTTCCTTAATGTCTTTTGTTTGGTTATGCAGCCTGCAGCCAGCAGCAGCGAATCATAAGTTATTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr3R 3590634 5' - pogo 2061 1 58.22 AGCAGGATCAAAGAGTCTACAAAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2R 16510226 5' + roo 24 2 62.61 TATGCTATGTAGATGAATGTTCAACATGTGTACCACTATTAATTGCTTTCCCGTTTCTCCTGCTCTTATTTTCATATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCT:1 - chr3R 7465158 5' - Stalker 7027 4 51.75 ATACACCCGTTACTTCGCTACTGCAAGTGCTAGTAAAAAATGCAACATTTTCTGGAACATAAAATGGAAATAAAATTGGAAATTGGAATGGAAATAAAATAAAAAAAAAATAAAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTAGAGTTC:1 - chr2R 5741250 5' - INE-1 574 1 76.71 CATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 - chr3L 14084959 5' - opus 454 2 60.16 GCAGAGCAATCGCTGGCTTAAGTCACCCTTCGGTTTTGTGTCCCCTCGTTTTCTTATCGATGGGGGGCAAATTGAATTTGGACTGCTGCTTATCAGACTTTTGTTTACTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 - chr2L 13140753 5' + blood 14 2 75.86 AGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATT:1 - chr2R 4774751 5' - baggins 5340 1 63.01 TAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr2L 5447904 5' - roo 8988 2 80.56 AAGCATGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATCAAACAAAAACGTAAGTGTGATCCA:1 - chr3L 2184972 5' + jockey 64 1 54.17 TCAATCTCGCAAATGGATGAGGCAATAAAAATTTAAATATTTTCGAAATTTAAAATGCCATTCCACTCAATTGGGGAATGGATTTTGGTCAACGTGGTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTA:1 + chr3L 17830295 5' - Transpac 5107 2 66.44 ACTTATAAATTTACTTTACTTCAATAGCACAATACTTTTTCATTACTTCTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCTTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACT:1 - chr3L 2467527 5' + jockey 4731 1 61.36 AACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGTGAAGACGGCAA:1 - chr3R 6412065 5' + Tirant 53 2 54.29 GCCGCCACACACACCACACACACACACACACACACACACATATCT:1 - chrX 16932828 5' + accord 185 2 77.78 AAATGCAATATAACTTAAATGTTAGTGTTCAAAGTTGTGAATACAAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:3 - chr3R 5762024 5' - roo 8997 2 69.86 ATGGAGCTGTGGACACGACAATATCCGGTGACAGTAAAAGTTTATTGTTCAATAAGTATTAAGCACTTCATTTCTTCATTAGAAATAAGATAAGTGATAAGTTATTTTTCAAATGGTCAAACATATGCACTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2L 14433721 5' + pogo 51 1 41.78 ACGGAGTACTGCATAAATCGCAAAATGTCATTAAGTAACCAATACAGTTTTCAAGTGCAGTAATCGCCGAGTTGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 - chr3R 22868873 5' - mdg1 374 2 51.37 GGATCTCGGACTCCAAGAGGGATCGGCCTTTACATTGTCCACATAGCGTAATTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCT:1 + chr3R 4425861 5' + 1360 3154 1 65.75 GTTCCACCTTTGGACAAAACCATACTATAAAAAACTGGTAACCAACTTGAACACATTTTATGAACAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCAATGTATCAAATCAGAATATTGAGAACAATCAC:1 - chrX 21581448 5' + Tabor 6878 2 48.82 AATGTCTTCATTAGTGTAATAGTATCAATTATGTTTTGCAAGTCGAATATTAATAATCGTAAACCATGTTTTCGTAATTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGG:1 + chr3L 27174438 5' - F-element 297 1 57.53 AAATGCGATGCAGGATTACAGCTGTTCGGGCTTGTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGTAAGGAGTAGTATTCTGAGTGTCG:1 - chrX 7967269 5' - P-element 2809 1 26.28 GAGAGCCCCGAAAAGTGCGCTTTAAGTTTTGAATTACTTTGCGGCATTAGCGTTTAACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chr3R 18541311 5' + hobo 66 1 62.33 ATATAAAACTTACCAAAGGTAGAGGGTTTATCTTCTGACCAAATTAATTTGCGTTTACGGGTACTTAACAACTTGGGCACCCCTCTGGAAATATCCGAGTGTATTAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGT:1 + chr3L 26019281 5' + gypsy 7006 2 47.59 TTCATATAACCTCTACATTTCCTCGTATTCAATTGAACCATTTTGTTTTTGAAAAAAGCAGCAAGTAATGAATTTTTAATGTGTGAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 31650443 5' + pogo 29 1 65.75 GTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3L 16463580 5' - roo 339 2 67.86 TGGTGAGTTGAATGTCCAAGTTGAGTAGTATATATATGTATGTACCTTATATAGTCATGGATACCCTTACATACCCTCTTATTAGAATAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTCTTG:1 + chrX 19585172 5' + Transpac 52 2 62.40 GAGACCAAGGAATATAGTATCGATTGGCAAAATGTTCTTGTAAGCATAAAGATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chr3R 29622661 5' - pogo 2052 1 62.79 CGAAGCGTGAAGAGATATCCAGCCGGAAGCGGCACTATCCTGGTATGAGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGAGTTGGCCACAGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGAT:1 + chr3R 27859467 5' + hopper 41 1 54.79 AAAAGTACAAACTTTTCGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCT:1 + chr2L 20928051 5' + Chimpo 43 1 52.63 AGCACTAAATTATTCCTGCCCCTATAGAGAACTGGGGCGAGCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTCTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGCATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGA:1 - chr2L 17206081 5' - hopper 1347 1 60.96 CGGCGCAGTCCTTTGAAATCACATAATAATGTGCAGCGCCCGCTGTCAGCTGGTGTTTTTATTGCAGATTATGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 20986497 5' + roo 48 2 52.74 TCGGACACATTTTCACTTTTTGATTTGCATGCACTTTAGTTTTGATTGGAAATTATGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chrX 10286985 5' - roo 345 2 63.45 TAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGTTTTTTTTTATGTGCCTCGCTGATTGCGATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chr2R 16891854 5' - jockey 4950 1 52.74 ACCGTATAAGTATTTTTTGTTGTTGTTTTGTTGTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCC:1 + chr3L 23797643 5' + Helena 1148 1 62.33 AGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTC:1 + chr3L 24213771 5' - invader2 5037 2 64.38 CGATAATTACATTCTTATACTTTTGTATTTATTTATTCGTAAACTATTTTATTCCTTTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chrX 18190348 5' + hobo 62 1 59.03 AGTGGAAAATAAAATGCGCACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCAAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAATCTTATC:1 - chr2L 16385300 5' + I-element 60 1 78.30 TCTTTACTTTTATTTTCGTTTTCTTTAGAACTGAAATCTAAATTAAGCCAGCTTTCAGAGTTGTCCTCTTCGATATTTCCCGAATTTCTTAACATTTCTGTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTT:2 - chr2R 14541804 5' - P-element 400 1 16.44 AACCTAAAACAGCTGTTATCCTGCTCAAGTAAGATCCACATGCTCTCTTTTCGCTCACGTTCTCTCTCCCGCGCGTTAAGCACGGACACAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1 + chrX 7967169 5' + P-element 14 1 73.23 ATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATG:2 - chr3R 17210113 5' + HMS-Beagle2 6939 2 56.85 AGACATTTTTCTAAAAATCTATACGATAGTTTAGGTTTACCTTCATTTCTTTTACTGCGTCTGATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCCTTA:1 - chr3R 3286218 5' - Gypsy12A_LTR 1943 3 71.23 AATTTCTATCAAATATGTTACATTTAGTTCGTTATTGTACTTACTATTGCGACCAAAAATATTTAAATATATTTAAAAAGAAATTATGTTAATTTAAATGTTCTGAATTTAAAATTTTAGAAATATATTTATATTTTAGAAAATAT:1 - chr3L 16689289 5' + FB 250 1 50.68 AGTTCACCCAGTTGGATATTGAGCTATCATTTACCAGCAGGGATGATATCATGCAACTGATTGAGGAGACTCTGCGTTATTCCTGGCCCAATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGG:1 + chr2L 16829961 5' + 412 7175 2 62.33 CGTGTCTGGCCCAATGTAAGTCTTTGTATCTGTATCTGTCTCTGTTGTTTTTATTCCTTTGATTTCATTATTATTTTTATTGCTACGGACTTTTTGTGTCCATTCTTATTATATTCACCAACATCTATCGATATCCCAGAAAAATT:1 - chr2R 21794937 5' + INE-1 502 1 68.49 CCACACATATATAGGCTAAATCATTTACATGTATCAGAACATTCAGTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr2R 8687823 5' + roo 75 2 72.60 AAATATAATAATGTTTTGATTTTTCTTCGTTTTATTGTTTGTCTTGCCAATTTCTATCGGTAGTCCACAGACACGCCCAGACTTTTGAACAATTTTAAATTTCTTCTCATTTTATACCAGAACATCTAATGATATCCCAGAAAAAT:1 - chrX 5849574 5' + INE-1 501 1 39.04 CAAAATGGAAGTGCAGAAACATCGATGTTATTGATCTTTCAAAGCCTTTCCCATTTCCGAACGCACTTAAACTGCACTGTGCTCCCGCTCTCTCGCACTCTAGCGGTACATTTGACATCCCGATGCAAGTTTTGATTTTGTGTTTT:1 - chr2R 5179424 5' + Cr1a 384 1 65.07 AAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chrY 311341 5' + 1360 59 1 59.59 CGTCTTGAAGATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCCATATAACAATTGATTT:1 - chrX 21585430 5' - mariner2 266 1 40.77 ATGTATTGTTGTAGTCCGTGTTTGTTGGCGGCATCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chrX 16526337 5' + P-element 60 1 32.50 TGTCACATTTTGAGCCTGTGGCAATGGGAACTTTAAAATTAGCCAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGC:1 + chr2L 11079410 5' - 1360 3313 1 71.23 CGCCGACAATAAATACGAGGGCATGCTCTACTCTGCATGAATATCATCTATCTTTGGTTTCATCATTACCAGTTACTAGTACTAGTTGCTAGCAAATATAATAATGTATGTATTTTTTTTACAAACATTTTTATCATACCTAAATA:1 - chrX 7705686 5' + Penelope 471 1 77.40 AGCCATCCAAGGATATTAAACTAGAGAGCCAGTCCTTGTACAAATTAGGACACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAA:1 - chr3L 10564040 5' + hopper 14 1 74.66 ACTTGTGTCGACTTATTCCCTGAACCCTCCACATTTGACCCGGATCCCATTTGTTTTTCCTATGCATGGATGTGGTTGGGTGTTCCATACGATTGTCATAACGTTTTGGTGGCTGGTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr3L 9519497 5' + roo 6 2 76.43 AATTGAAAACAAGAGGGAATACCAAGCTATGGATCTGCAATATACCCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chrX 17510607 5' - roo 333 2 67.81 GCAAAAATGTTCATTTGTTTGTTTAAAGCACCGACAACAACAATTGAAATTGAGTGGAAAAACAATTGCCGGAGACCAAAGACTTGAGCGTTAAGAGTGACAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 + chr2L 20324064 5' - Tirant 8501 2 80.00 TTTTAACAAATATATTCACAGATGTAGAGATGAAATAAAGACAAAGGCAGTAAAAACACTTGAATAAATACAATTAAAGTTAATTATTTCGTACTTTACTTCTTCAGCTTTAGCATTGGACTTTACCCTCTCCGTTTGCGATCTGC:1 - chr3L 14622120 5' - invader2 137 2 56.85 ATTCGTAATGATAATTGCAAGTACTGGAAATGCATTTTCGCTTGTGGTAATCTCGGCCAACGATTAGCTTTGCTTTTATTTACTTATTAAATAACATTTAGCTGTACAAGGCCATCCTGAAGCCAATTTGGACTTATGGGATTCA:1 + chr3L 6999941 5' + G-element 3906 1 66.90 TCGTTGAATTCGAGTGCTTTCGGATACCCTAAAAACGAAATTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTT:1 - chr2R 11097360 5' + Juan 4106 1 71.23 ACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAA:1 - chrX 21636243 5' + Stalker2 84 2 74.66 GACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chrX 10806893 5' - P-element 2857 1 43.33 AAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTT:1 - 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chr3L 23702306 5' + G4 12 1 73.29 GGATGTCAACATGCTTTGTCAATTTTTACGGGGTTTCGATCAAGTTGACCAGCTTCTTGATTGTCGTTGTGGATGACAATGGTTCTCAGTCTTCCAAAAAAATTGAATGTTTAGGCAATAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTA:1 + chr2R 3118545 5' - jockey2 3226 1 69.66 ACGGGCATAGATAGACATTTAAATGTCTAAACATTGATACAGACAAATGTATTTTTTTCGAATAGTTAAGTGGTTCTTTTAAATCGAAAAAAAAATGTTTGTTAAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATA:1 - chr3L 22754528 5' - FB 368 1 65.07 ACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTGAACCCCCACGCCTCTACACAA:1 - chr3R 6412064 5' + Tirant 8129 2 62.04 TACGTAATTATCCATTGAATGCCGGATCACGACGACGACGACGATTTAACTCTTAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 - chrX 18737304 5' + I-element 29 1 53.64 GCTCCACATTGATGGCAGATACTCCCCCAGCTTACATATAAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCA:1 + chrX 20124494 5' - opus 7430 2 73.97 ATGCGAAGTCTATTTCGGAAAGGCACAGACTTTTTATTATTTCTACCATAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATA:1 - chrX 19820214 5' + Juan 4099 1 66.44 ACCCTTTTTCGGGGCAGCCAGCGAAAACAATGGAAGTGCAGCCCCAAAAGTAGGCAACGCTTTTCACTCGAATCTGCTCCGTGTATTTGTTATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 + chr3R 15168857 5' - jockey 4958 1 60.69 CGACGCAGCATCTTCGTTTTCCACTACGTATTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 + chr2R 3188694 5' + 1360 74 1 78.29 AGATTTAGCTACCATGGTAAGAGAGAGGAAAGTACTGAAGAGGGTCGACAAGATCATTCGCCAACGTGTTCGGGTGGGCGCTGTCTGTCGGCATATCGGCAGCTGGGG:1 + chr3L 23040158 5' - G5A 2598 1 61.11 CTTTTATTTACCCATTTGGGTTTATTACCCCAACGAGTATGCCTATAATAATAAAGATTTATATATAAGTTTATGTAACTATAAAGATTTTCAATAGCAATACAATATACTTGAATGTTAAGAAAACAGATACCCGTCACTCAGCT:1 + chr2R 10801810 5' - INE-1 545 1 54.79 AATTATTATATTTGCTAAGAAAGAGAATAACAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGAATGTACCTTATATCATTTATAGTTCCTGATATCTCAACGTTCATACGG:1 - chrX 10939940 5' - INE-1 135 1 80.00 TGATTAAGATTTTCGGTTGTTGCTGTTGGCTTGGCTTTTCCCCTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTGTAG:1 - chr2L 12302811 5' - G2 3074 1 71.60 GTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCA:1 - chr2R 21425151 5' + HMS-Beagle2 51 2 61.72 GGCAACATTGCTGCGGCCTTAAATGTTGATGGAAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGAATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chrX 2518000 5' - P-element 2847 1 56.85 CGTGGAAAAGGCGCAAACCCACCGACAACCTTTTGTGCGCATTTTTATTTATTTATTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:2 + chr2L 16385267 5' - I-element 5279 1 69.86 CCACCACCCACCTCGAAGTCCTTTGAATGGTGCCAAGCGGCCAGCGCTCGAAGGCATTTCCATGATTACAAGCAAAGGACATGGGCCTTGCTATGTGGTAATGTATGTGTGTGTG:1 - chr2R 6533482 5' - Quasimodo 44 2 75.65 ATTACATAGGCTAATTAGCATATATATCACATACTTCCTAAATTAGAAGCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 20744265 5' + 412 7125 2 67.12 GTTAGCATAGAGGGGCCTACGCGGGATTCTGACGAAACGTAAAAATAAGCCTCAATCAAAGACACTAGAATAACTAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1 - chr3L 23219310 5' - 1360 3320 1 64.38 GAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTA:1 - chr2L 13510871 5' + diver 71 2 73.29 GTTGGGGGGCAAATTGAATTTGGACTGCTGCTTATCAGACTTTTGTTTACTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 - chr2L 13140695 5' + blood 72 2 64.83 TAATTAAAATTTTAGTTCGTTCTAAAAATTTAGTCATAATATTTTATGAGTAACTTTTGGGAGTATTTTTCAATTTTCAACGCTCAAAATTTGCCCTTATCGCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 21171006 5' - roo 389 2 71.92 GTTATGTTATGGTGTAAAATGAATTAGGGAATAGCCGGTTAAATATGTGTATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGGCCTCTGTTGCCGCGCTCC:1 + chr2R 15822004 5' - invader6 350 2 53.68 ACTTTGTGTATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAAT:1 - chr3R 29091421 5' + rover 26 2 68.06 ATTACTTTTATTTTTCAACAACCAATAGAACTTAGATGCTAGCTAAGCATTTCGCAATTTGAGCAAAACCAGTTCCTACAAAGGAAATGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 10361818 5' - roo 389 2 68.15 CGTATGACAGTTGCAAAGTGACACAATCTTGGCGTTTATGATCCTTATCATATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCGCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 - chr3L 16663947 5' - opus 7441 2 62.59 AGTCAGTCGACAGCAACAACGAAATATAACCAAAATGTATTTCAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr3L 18787261 5' + 1360 63 1 64.08 TCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr3L 23456282 5' - 1360 3340 1 54.79 AATAAATAAAACCGCCAGCGAAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chrX 11661331 5' + 297 22 2 69.86 TTTTCTCTCTCGCTCTACCTCTCCGCCCCTCCGCAGAACAGCACATCCAGGACATTCAGAACAAACAGGAGGCGGTAAAATGAATGGCCAACGATTTATAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGG:1 - chr2R 22434178 5' - R1A1-element 5022 1 70.37 AGTTATCGTACTACAAAGTTGATTATTCAAACCACTTTATTCATTAGGCACCATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGA:1 + chr3L 20209547 5' + Burdock 6200 2 65.75 ATTGTTTTGAATTTCAAATCGTACCCATTAGGCTTAGAGAGCAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3R 19543423 5' - roo 9001 2 69.06 ATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr3L 13362734 5' + jockey 80 1 65.07 TGCTGCAGTTGGAGGCAATTTTTCATGCGTATTAAGGGGGGGGGGGTGGGGGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAG:1 + chrX 2916671 5' - 412 7520 2 50.00 TAAATAAAACCGCCAGCGAAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chrX 11661333 5' + 297 16 2 72.46 CATCGGGCATCAATTTGGTACAGGCTCATCTTTTGTCGCTTGAAGTCCGCAAGGAATTCCGTATTCATTCTGACATGCACTGTATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 - chr2R 12814963 5' + opus 145 4 59.59 TTTTTTTTAACCAATATGTCGATTTTAAGAGCCGCAATTCCACTTGGCATCCATATCACCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAATACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 18658302 5' - roo 9048 2 54.21 TGCAGAAGGATTCCAGAGCAGGCTGCTCCGATGCACCGATGCAGGCCCCAAAAAGTATGCCATGTTTTGTGCCGAGCCCCTGTTCAGCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2R 20738974 5' - hobo 2927 1 72.80 TCTAATATATTTTATAATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 - chr2R 21425172 5' + HMS-Beagle2 6931 2 52.05 TATATTATAAACCAACTATATAAAATACTGTTAATATTCGGCAAATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATTATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATG:1 - chr3R 5115363 5' - Ivk 5302 1 70.55 ATAGTGCAGTGGCTGTGCTTTTGTTGTTGTTCTTCCTGCGCTGCACACACAAAATTTATCGATTGCCGCATACACATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGT:1 + chr3L 8243134 5' - flea 4945 1 52.05 AGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATT:1 + chr2R 22287441 5' + jockey 4863 1 75.34 CACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCATTGCTATCTC:1 + chrX 10128181 5' + invader3 83 2 63.01 GTGAAAAAATGGTAGCCATTTTTATTGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 - chr2R 22012256 5' - opus 7458 2 54.79 AGTCCGTACTAGGCAACTATATTTAAAGGATAGGATTAATTGGAAAATTTAGCTTGAAAGGTAATCCTGATCAAAAGAAGAGAGAATGCAATAGTCAAGTTCACCGACTATTAGATACCCCTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAA:1 + chrX 22743684 5' - INE-1 531 1 67.59 GTCGGCAAAGTATTTTGACAAGATCGCCTTCTTCTTTTAAAACTTGCATGCGCTTGATACCGTTAACAAACAGTGCGAAGACGATAAGCAATGCAAATAATAAAGTCTAGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGCTTTAAG:1 + chr2R 4887376 5' - Cr1a 4147 1 71.23 TGTTTAGTTTTGCTGCTCATTCTTCTTCTTCCACCGATGCCGTAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGA:1 + chr2L 19158839 5' - P-element 2815 1 33.57 GGAAAACTCACTCTTACACATATATACATATGTATAAAANATTTAGTTACTAAACGAGGAANNTTAAGATTAAATAAAGCATTTNTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr3R 12609973 5' - roo 9030 1 54.11 CTGACCCATTGTAATGGCCTTTGGGTTTATCACCGTGTAAATAGCTTTGTTTTCGGAACCATCCTTAAGACATAAATAGAATCAATTATATTATTAAGCTATTATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2L 17508967 5' - roo 395 1 54.79 GTTTCCTAATGGTGGGCAACTGTCGATAGTCGCCGATTAACACATAGCACAAAAATACTAGAACACTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGGCACTTTTTTGGTGA:1 + chrX 4540596 5' - 1360 3337 1 56.55 AGCTCCTCCACTTTTTTACTCCCACCCTAAACAAAATTCTATTTCGATTAATCCACATTTAGTTGTCACGGCGACCAACACAGCATTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTC:1 - chr3R 17986880 5' + Rt1b 4802 1 52.78 GCGCGGACTCATGCTTTTCTCTGCTCTCTTCTTTGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTA:1 - chrX 850119 5' + jockey 94 1 72.60 AAATATAATCTTAATTTAAATAAAATTACACAGTTTTGGGCGTTTTAGGGCGTTAGAGTGGGTGTTGCAACATGGGTCAACAAACTTTACTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTAGCTTTTATAGTTCCTGAG:1 + chrX 22905339 5' - INE-1 153 1 63.01 CGGGAGAGCAAGACCACGAGGCAAACACATACACATACGAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 - chr3L 13228580 5' + P-element 17 1 68.85 AAAAATATTGTATGTACGTTTTATTAATTTCATTATTATAAAAAAAAGTTACGAATGTCGATTTATTTAGGCGTAGGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTT:1 + chr3R 25718174 5' + I-element 4998 1 48.97 AGTGCATGTGAAATTTTTGGTGATTATATGTATGTGTATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGGGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTATG:1 + chr2R 19178778 5' - gypsy 377 2 77.40 CTCCCGCGCGTTAAGCACGGACACAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 + chrX 7967234 5' - P-element 2812 1 22.76 CAATTAACTCATTCAGGCACGCGCTTCTGAAGTAGAACACCGATTGTTGAGGTGGGGCGTTATCAGGGAACGTCTTGATAAGAGATACCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTA:1 + chr3R 24053613 5' + mdg1 34 2 60.96 CATTGAAACCCCCTTTTGGTTCGTTGGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAG:1 + chr3R 6411956 5' - Tirant 341 2 59.59 GATGGAGCTGTGGACACGACAATATCCGGTGACAGTAAAAGTTTATTGTTCAATAAGTATTAAGCACTTCATTTCTTCATTAGAAATAAGATAAGTGATAAGTTATTTTTCAAATGGTCAAACATATGCACTATTTTTCCATTTTT:1 + chr2L 14433720 5' + pogo 50 1 41.78 TACATAAAATACGACGAAACGTTAAACATTTTCCATACTCCAATTATAGAAGCAAAATGTTTATAGTACATAGCACACGCTTGCTTGAAATTCATGTAAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chrX 3578049 5' - hobo 2921 1 68.09 TATCACCGTTTTTAACAACTGCAATAGGAGATTTGAATGGAAAAGTACGAAGTTATCGTACTACAAAGTTGATTATTCAAACCACTTTATTCATTAGGCACCATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTC:1 + chr3L 20209497 5' + Burdock 14 2 76.03 TGCTACGCCCACTCTAACGCCCACACTTTTCAACAATTTTTTCTCATTTTATTCCCAAATGTCCATATCCCAGAAAAATGATGAAACTTGCTTGTTCGCATACACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGAC:1 + chrX 22790627 5' + INE-1 561 1 67.81 CCTCGTATTCAATTGAACCATTTTGTTTTTGAAAAAAGCAGCAAGTAATGAATTTTTAATGTGTGAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr3R 31650423 5' + pogo 49 1 53.42 ATTAAAAGGCGCTTTTCCCACATTCACACATGACTTTTCTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAACTTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTT:1 + chr2L 11922891 5' - jockey 4910 1 73.43 CTTGTCCGCTTGCAGTATGCAGCGGCACGTAACAGCCTTAACCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3L 22883945 5' + roo 8743 2 72.60 AAGCTAGAAAAGCGAGGGTGGATCGATGGGTTCTAATAAATGGAGAAAATGTGACAAATGAGCCTTTTTATTATAATTATTTATTATTCATTAGTCACTGAGAATCGTTCAGTTTCTTCTGAACTTCACCTAATGTGTAGCTTAAA:1 + chr2L 15204005 5' - G5A 2780 1 76.71 AACACTTTTCGTTTAAAATTGATATGCCGAGTGCGACAGTGCAGCCAAACGAGCAAACAAATCTAACATACAAACCCTTGACTGCGGATGAGAATATATCCTCGATTTATAGCAATACATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 19062932 5' - accord 185 2 77.40 TTATCTTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAAT:1 - chr3L 13156781 5' + transib2 83 1 77.40 CCATTCCCATTTGACATTTGCAATAAACCAACACTGGTAGTACTCAAGGAGCCCAATCTACCGCCCTCTAAATGGATTCTTGGCCGCATCACCGCAGTGCACGCAGGAATCGACAACAAAGTCCGAGTCGTTACAGTGAAGACTGC:1 + chrX 22966750 5' + 3S18 5666 1 79.45 AGAGTTGAGATTAGACATAAAGATTTCAGAGTTTTTGTCGTGACTCTTGTTGGTTAGCATAGCAGGTGTTAAGTTGTCAATTTCTTCTTGGATGTTGGTTTTTAAATCTTGTAGGGTTCTTGGACGGTTCACATAAACACGGGATT:1 - 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chr2L 18610350 5' - I-element 5165 1 64.83 ACTAAAAGAAGTAATCAATTAATGCCCAATTATGAGAATTGAGATATGGAAAAAGAAATAAAGACACGGAGTATTCACAATCTTCATGTTTGCTTCTTGACAGCAAATTAGGTCTTAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTG:1 - chrX 18885497 5' - Idefix 455 2 63.70 AGTAACCGTTAGCAGGCAGCAGTGTGACACAGTTTGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAA:1 + chr3L 20388149 5' - 1360 3328 1 75.83 TTCGGAGCTGCAAGATCCTAGAACTAGTTTACTTTCTAGCCACTGTGTTCAACGCTCATCAACCTGATTTACCTATTAAATCATGACTGTGTGCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr3R 30302229 5' + Doc 32 1 65.75 AGTTATAGAGCAAACCAAGCAAACTGTCTCATAGTCATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTTCAGTAGGCA:1 + chrX 19113494 5' - 412 409 2 71.23 CACTGCTAACCAATCTGTACGGGTCCGAGGTCCTGATCAAGACGCGTCGCTACAGGAGACACCTGACCGGTGGCGTCTACGACGAGTGCTGCGTCATGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCAGGGCGCCTTAGATA:1 + chr3L 9798756 5' - roo 105 2 61.64 TCACCCTCTCCATTCCCTCCTCTTCATACCAGCCAGCATATGTGAAAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2L 18178395 5' + Tirant 13 2 73.98 AAATTGTGAAATCTACCCACAGCAATATAAAATATGCATAATCGTTTAATTTAATCAATTGCTCCAATTAAGCCATCTACCACACATTTATTAAATCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chr2R 11595788 5' + P-element 21 1 70.83 CTGCCCAATTGAGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:2 - chr3R 31681934 5' + Doc 82 1 71.23 AAACACATTATGAGCCGAAAGCGAACCAGAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 13045902 5' - blood 169 2 72.55 AAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATATCCCTATGTCCGTATGAACGTCGAGTTCTCAGGAACTATAAAAGCTAG:1 - chrX 21587754 5' + INE-1 152 1 58.22 TAGGCCAGTGCAGGCGGAAGGCCTTTTTGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCGCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATATATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr2L 18213185 5' + roo 89 2 79.02 AACTAGCTTATAACAAATTATTCAAACATATTAAACCAATAAACTTGCCCCATATCATCTCAAAAACACCATACTCACCATTCTATATGGCAGTAAAAAATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr3L 23331363 5' + 297 6593 2 76.71 AAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGA:1 - chr3L 14040953 5' + 1360 89 1 78.08 ACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCCAGCGACTATGGGCTGGCCGCCTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTACTTTGCAACG:1 - chr3L 23678150 5' + Osvaldo 36 1 74.81 ATTGCCAAAAGACTGGTGTACATTAAGAAAAATACTATGGTTCAAAATATGGAAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 4532818 5' + 1360 7 2 78.77 GCGAGTGGCGAACGTGGAAACGTGATTTCAGTTGTTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAA:1 + chr3R 22868779 5' + mdg1 82 2 76.43 AAAACTACACACTATATCCCTTTGTTAAATAAAAGTTAAGCTTTTCACTTTAATTTCAATCGAATTGTACATACGAATAAAATTGTAATTCCACCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chrX 6423304 5' + roo 21 2 69.72 ATAAACCTAATTTAGATTTTTTTTTCAAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTT:1 + chr2R 5357218 5' + Juan 113 1 34.35 AGGATGATAAGAGAGTTCATAAAGGCAAGCAAATATTCTGAATTTGGTGCAAGAGAATTGTATGTATTATAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2R 9868876 5' + roo 18 2 64.04 ACTTATCAGAACCGGTGTTTCCGTAGTTGTACCACCTTCTTTTCCCATCACACTGACACTCTACTCACTCAGATCGCTTTTTTCTTCATAATTGCCGCCGTCTTGGTGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGCGGTTTC:1 + chr3L 20970580 5' - mdg1 490 1 73.29 AAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGCTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 - chr3L 4933811 5' + blood 7081 2 65.07 AATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 13827358 5' + roo 39 2 59.59 TAGCCCCATGTATTCCCTGTATTCTCCATTATCTGACTCTCTGGAGTCTAGACCAACATTTACTCTCATCTTAGACCCGGCTCTGTCCGGTTTTTCTTTTTGCCCGCATTGCATTCGGTTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGG:1 - chr3R 4689031 5' + jockey 362 1 78.62 ACTTGTATATATCTGAACATGTTCTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3L 19574010 5' + 297 24 2 68.49 AAACGGAAAAAACCTTGAACGGAAAGTATCGTGTGCAGAAAAACATATTAAGTCTTGAAAATAAATAAATAAAATAAGAGCACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTA:1 + chr3R 904585 5' + 3S18 5790 2 62.79 GGTCTATTAATTAGGCATCAAATCTAAAAATTAATAAGGCACATAAAATATATCTAGATAAATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 + chr2L 14480391 5' + Transpac 4943 2 69.86 AAAAAAATCACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATACGCATATCATT:1 + chrX 10128173 5' + invader3 75 2 54.79 TCTGGACACTGGAGAGAAATACCTAACTTGCATAATTCTGGACACTGAAGAGAAATACATAACTTATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAG:1 + chr2R 924420 5' + springer 7192 2 56.16 ACAGATACAAATGCAGAGAAAGAAAAATGTATCTCTTAATTACAAAAATCTCAAAAATGTAGAACAGTGACTTGTTCGCGCATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATACCGGCCCCCCTGAACGGTTGTTGAGCAGAGAGGCAGTA:1 + chr3L 10838499 5' - 3S18 5726 1 54.79 ATCTAATGGAATAAATAAGTGGCAATCGTGAGCGGTCTTCAAGCAGTTTGCTATAAATGATTACCTAACGTAAGCACACCTCGAAAATATGTATTATGTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chr3R 17467049 5' + I-element 20 1 69.18 ATTAAACAGGAAAATATTTCAAAAATTCTAAGGAACACTTACTGATGAGAACGGCGTTACCAACATGCCAACTATGCTGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTTTCGACGCCTGCCGTCAATTGCACTCACTTAGATCTCACTTA:1 - chr3R 4148287 5' + Ivk 5170 1 74.66 AGCTTAGTGTTGTCTAACAGTTTCATTGCTGGCTGTATGTCCATCGTTACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAG:1 - chr3L 22721168 5' + INE-1 28 1 65.19 GAATTTTCCGCTGTCCACCCGCCCGCCGCTGGTAGATTCATCATTTTTGCGACATGTCAATTTGTCACTCACCTGGCCTGACAGCCCGTGTATTAGATGATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 - chr3R 18698005 5' - 297 6957 2 63.70 CACAATTTTCATTGCACACTTTTCGGCTTGACACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGTGGGAAAAGCAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chrX 19113597 5' + 412 7089 2 59.59 GCAGCATTCAAATTCAAATACTAATCAATGGTTGTTAAAGTTATTAGTGTGCCATTATTATTTTTTAAATAGTTTCGAAAGTATAAATTAAAACAACATAATAGACAGAAATCTGGTGTTCACTGAAATAGCAGTGCTATGGAAAA:1 - 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roo 9046 1 65.94 GGACAATCTTAAGTGGACTTTACAAGTTACTGTACTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAA:1 - chr2R 8452812 5' - blood 291 2 77.40 AACAAATGTGTGAAATTTCGTCTGGCTCTTTTTCTTCTTCTTCTAAGTCTATGCCCCCAAAATTAAATCGAAAACACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr3L 3756182 5' - hopper2 1566 2 56.25 TTTTACGCGCACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr2R 12069580 5' + Tirant 15 2 59.04 TATCTGAAGATACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 - chr2R 24021644 5' - pogo 2040 1 67.67 GTACTACAAAGTTGATTATTCAAACCACTTTATTCATTAGGCACCATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTA:1 + chr3L 20209554 5' + Burdock 71 2 70.55 TTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTG:1 - chr2R 5173221 5' - Stalker4 7305 4 58.22 CGATGCTTTTCGGATTCGCCCGTTTCAAAGGAATCTCTGCCCGCCGAGAAAACAATTTTCTATTTCCGCAGTCGCAGTTTCGGTTTTGTGACACATGCAAAAGGGAAAAAGACGAAAAAAAAAGGAAAAATAAAA:1 - chr3R 6955970 5' + Doc2-element 233 2 69.63 ATTAGTGTGACCATTTGCATAAAATTTCACCGTTTTCCCTCAATCCAAACGCGGCCGCATTTCATTCCAACAGTATAAGACCCCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr2R 18440523 5' - P-element 2852 1 59.44 CAAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAAT:1 - chr3R 28659154 5' - Burdock 6360 2 56.16 CGGGTTTACATTGCCCACCCGCATGCGACAGATGAAACCACGACGAGCACCCATGCTCAAACGCATGCTGGACTATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACA:1 + chr3R 9019089 5' + Quasimodo 6891 2 50.68 AAAAGCTCATCAATTCAAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAG:1 - chr3R 28659169 5' - Burdock 6375 2 66.44 TATAAAGATCATTGATCACATAGTGGGTGATTTGCCTCTTCTGTGTTGTGCTCGCTGTTCCGGCCACCGCAATGCTTCCACCAACAAAACACACACCAAAAAACAAACAAAAACCAAACAAAACAAAACAAAACACACAAACACA:1 - chr2L 12111466 5' + gypsy3 419 1 55.17 GCGCAGAATAAGCAAAGGACGACCTTCAAATAATGTTGAATTTTGTACGCAAACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr2L 21251026 5' - P-element 2847 1 49.15 CTACGAAATTGGCCAAAACTCCCCAAATACGTAAAGTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCAGAAAACCGTCTTCTTACACAAATACGCACCTAAACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTC:1 + chrX 3703809 5' + 1360 3286 1 64.38 AAACGATATTCTTCAGGATCCCCTAATTTCATCGTACGACAGACTTAAAAAACTTGGTGAAATGTGTCTTGTCGACATATTACCAATCCTTGAGAACATTTCAGAGCACTATTAAATATTAGTATTAGTAGGAGCTAATTATGT:1 + chr2L 625731 5' - Cr1a 4285 1 73.61 ATTTTTGTGCAATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTA:1 - chr3R 5453716 5' - I-element 5289 1 64.38 ACATTCGATTGTTTGGGCAATATCAAAGTTTATTCGACTTGGGATGGTATTGCATTTTTACTAGTTGACACCGCATCCGTTAATTACACAAGCGAATAACAGAATCTTGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGC:1 + chr2R 18440334 5' - P-element 256 1 76.71 GGCTGCAAATCATAAAGCATATCACACACACACACACACTAGCAACCAGCGGAGAGAGTGAGAGAGAGGGCAGCGAGTGCGAGCGAGAGGTGGCATGCACATAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 + chr2L 12678467 5' + P-element 14 1 72.86 TCTTTTTCTAATAAAATCAGCTTAATCAATGATTAGATGAACCTTGGGCGGGTGATGATGTTTTTTCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTA:1 - chr2R 11339144 5' - jockey 4934 1 57.53 TCTTGCCATTTGCACAACAAAATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTG:1 - chr3L 19335466 5' - invader4 295 2 63.01 GCATGGGCCTATGACGGACTATATGGACTATAGGGGCTGGAACTCCGTGCTGGCTTATTTCACTGTTGATTTAGCATTCGATACCAAAGAACTTTGACCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 + chr2R 11379395 5' - hopper 1393 1 71.92 ATAACATTGTAAAAATAATTGCAGCTAGGCAAACAGAAAACTGTGAAAAACACAACATAAAACAGACATTGAAACAGTTTTTCGAGCTCCTGCCCCCCCTTCTACACCACCCTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr3L 18789161 5' + 1360 7 2 71.92 TTGTGACTGAAAGCGACCGATTTCTAGAGATGCGTTCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAG:1 - chr2L 2999272 5' - P-element 2802 1 29.45 AGCGGTGCTTCGCCGCATATTCCATTAAAATGACTGTCAGCAGTGCATATGTGTTGTCATATTTTCCACTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGAC:1 + chr3R 27782612 5' + G2 3028 2 52.05 ATTTTCAATGGCAATCTGCAAGCTTAACTGCAATTAAATGAAAAGTAAATATGGGCTACTGAATTAAACGTAAAAGCGTAACAAATAATAAAGCAGGAAAATTTATCAAGGACGTCTGAAGAGCATACATCCCCATGAAGTCCT:1 + chr3L 18468530 5' + G5A 2690 1 69.44 ACGCATAGACTGTCAACACTTTGAACTGTTGCACCCGAGCTCCCATTTCCCTGGGTGCCTCCCATTCGAGCCATAGAAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACA:1 - chr3L 18738207 5' - Bari1 1695 1 77.40 CAAATACGTCAAATTTCTTGGATTTTATTTCTTCAACTATTTCAAGTTTAGAAATATTATTGTTCTTTCCCTTGTTTATTATACCCGTTATTCGTGGGGTAAAAGGGTAAAAGGATTGAAAAGTATGTAACACTCAGAAGGAAGCG:1 + chr2R 25217500 5' + INE-1 30 1 55.48 GTTTTGGTTTCATTTTTAATACCCCTATTCGCAACCCTTGTGTGGAATTTTTAACTCACACCTGCTGGACAACACCCCATCTTTTTATATTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCG:1 - chr3R 15725831 5' + 1360 3149 1 58.90 GAGATACCAATCTGAACACTGAATCGCAACACTCGGTGTATGTAGCTCCCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAA:1 + chr3L 20066178 5' - transib2 2753 1 64.38 GTGTTTTCCGAAAACAAAACAATAAAACTTCTCCCTTGCCACCGACAAGCGAAGCAAAAAAGATTACCAATTTGTATATGATATGTGCTGAAATTCATTTGCTTATCTCGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2L 10045341 5' + jockey 18 1 74.66 GGGGGTTGTCCTCGAAATATAACACAAAAACAAAAATAACAAAAAAAAAAACTT:1 - chr3L 10377386 5' + HMS-Beagle2 490 1 85.19 ATTGCATGTTAAACCGTTTAATGCGTGAGCAAACCTAGAGCACTAAAATCATTGCCTACTTTTTAGCGCAACACTGGGATTGAGATGAAGGATTTGTTGAGCCTCGTATTATTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATC:1 - chr3R 30622129 5' - BS 5080 1 75.34 GGCCATCTTTATAGTCATCAGTTGCAGAAAGACGTTAAACGCAATGCGCCCACTGCAGTCCTTGTCAATGTCGGAAATCATCCTCTTAATCTCCTCCTTAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACA:1 - chr2L 22550861 5' - 1360 204 1 67.81 AGTGTACGCATTTGGCTATTAGAAATTATAACGACAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 14494146 5' - roo 9046 1 68.49 ATCAATTTGATTTTGGCTTTTGTTATCAAACCAGCGTTTAGTTTCTAGTGCTAAACTTTTATCTTTTTATAGTTCACTTCATAAAGCTCATCTTTAACATAAAATAGCTTTAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr3L 14040831 5' + 1360 10 2 78.77 AGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr2R 9339751 5' - Transpac 266 2 51.88 CAGATGGCTGGCAATTAAAGCATGCATATTTTAAGCACTTAACAACTGTCCATGTGTTTTCACATATGAACATACATATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 - chr3L 16875942 5' + Burdock 6179 2 56.16 CGCCTGGCAGCGAAGGCAGGAATCTGGATAAGATTGAAAATACTCGTTAGCAAAAGTCATAAGAACATTAAAAGAACTAAACAAATTCAATATAAGATCAGTTTGAAAGATGAAATACCTATTTCAATTATTCAATGGATAATAAA:1 + chr2R 11653061 5' + Fw2 61 1 52.74 GTAGTAAAATTGTCTAGCTAAAAGTCTAAAAGAATTCTATTTGCTGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3L 16663867 5' + opus 7043 4 61.47 GTAGCAAACTATAAAATGCAAATCAGTTGCATATAAAAATATATATAATTCATTTGTTAAAACCATTTGCCGGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3L 13545118 5' + hobo 18 1 73.29 TACGTACTTTCCATAAAATTAATAAATGGAAATATATTATTATTAATAATACAACTAAAAAGTTAAGAATGATACTAAATAGATTGCTGAAATGTAATATTTAAAATAATAAACCTTTAACAAACTTT:1 - chr3R 19496162 5' + FB 399 1 78.12 GAATCCGGGATGCAGGCAGAGGCTCCACATTGATGGCAGATACTCCCCCAGCTTACATATAAAAATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCCTACCTCACCTTG:1 + chrX 20124473 5' - opus 457 2 54.74 AGTTTGTAAAGAATTAAGATAAATTATATTGTTCGCAAACAAATATAACACATTCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTC:1 - chr3R 5024905 5' - diver 6043 2 72.60 TTTCACGTGAATTAAATTACGCTTGTTGTAGGTAAATACTATAAGTTTGCGGTTTTCTGCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1 - chrX 22711692 5' + transib2 61 1 58.90 GAAGAGTCTATAAAAAATGCATCAGCATTGAACAGGGTGATCAACCGGATCCGGTTACCAATAGGAACTGAACAGGTGTATGGATATTTTAAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGA:1 - chr3L 10117850 5' + P-element 421 1 56.85 ATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGG:1 - chr2R 1949125 5' - Cr1a 4398 1 80.00 CTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTT:1 - chr3L 14084938 5' - opus 432 2 77.42 AGGTAGAAAACTGTTGGAGTAAAAACAAAACAAAAAAACGATAGAATGCTAGTGCAAATGTCAACGAGAAATTTCAAAACCTTTCAGCTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr4 367157 5' + opus 143 4 65.07 TATATTGGTTGCCAAGGCCTAATGCACTGATACTAATTTGCCGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCG:1 + chr3R 5115304 5' + Ivk 65 1 66.15 GAGCGAGCGGTAGATGGGATCTCTAAGATTGGACGTAGCCGAGCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr3L 14085007 5' - opus 7482 2 72.60 AAATAAAAGTTAAGCTTTTCACTTTAATTTCAATCGAATTGTACATACGAATAAAATTGTAATTCCACCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chrX 6423278 5' + roo 49 2 51.39 TTAAATAAATACAAGCAAAGTGGAAAATAAAATGCGCACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAA:1 - 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hopper 1330 1 75.34 AAGGGGTAACTTGGAAAGCACCTGTCAGCAGGGTCTGTGCTGGATATTCTTATAGGTATGTTGGAACTTTGGGCATTCAACTGAGTTGCAAAGATTCCTATTTCCTTCAACGAAATCAGAAGGATTACAGACGTAAACCAATTATC:1 + chr3L 2305326 5' - looper1 1432 1 53.42 ATGTGGCCATTGGTTTTCCTGCATAAACATAACAAAAATATAGCCAAATGTGCCACACTCGACTTAAGATTCTCAATTGTAAACTACGCAATGCCCCATTGTACGAATACATGTGCATATATGTATGTATGTACATATGTATACAT:1 + chrX 19817457 5' + invader3 5086 1 74.66 AGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGACGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGCCCTTACATCCTGCTCATCGAGGTCATACC:1 + chrX 19820626 5' + Rt1b 4967 1 62.24 ACAGATGCAGGCCATGCCCATTTCGGTGCAGACGATACCCTTGTTCCCCAATTCCAGAACATCGACAGAGCGACCTTGTTGTAAAATCCCACATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr2L 8396823 5' - roo 9039 1 59.40 AAATCAGGAACATTCAGAAAAATAATACTTGAAAATTGATATTGGACTGCTCTTAACACTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chr3R 14494011 5' + roo 8726 2 61.64 TTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - 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roo 347 2 62.69 ACCATTTCAAATAACTCATAGTTCGGTGAATTTGATTTCGTTTTTTTAATTTTTAATTTTTATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTT:1 + chr2R 11097307 5' - Juan 4147 1 63.01 GTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTGGTCGGCTTCA:1 - chr2L 15322923 5' + diver 316 1 69.18 AATGGTCGCAAGGGACGTACTGTTCGCCATGACGACGTCTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCAT:1 - chrX 6407309 5' + jockey 4750 1 73.43 AAAATTAAAAATTGTTCAAAAGTGTTGGCGCGACCGGTTTGGCGGTCTTAGGGCGTTAGAGGGGGCTTGGCAAAAGGTGTTTTAGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTACTAATAATGTGAAAAAACATCAACACATTTTTCAA:1 - chr3R 4100726 5' - INE-1 266 1 61.64 ATTTTAAGTAAAATTTTATAGAGACGCCAGTCGCAGGCTGAAGGTTTATGAAAAGCCGCTGAGTGTATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGGAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGTGCATTTTATCTTTAT:1 - chr3L 13365598 5' - mdg1 367 2 51.37 CATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGT:1 - 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roo 9045 1 67.12 ACAGGGTTCGGTAATTAACATCATGAAGGGCTTTAGATGGATGTGCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3L 6675379 5' + 412 75 2 68.97 CTTTTCTCTTGACAATTTCTTGGCCAACATCTTTATGGAGAGTATGGCGAGATATTTATCTATGGATGGAAAATATTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chrX 5366269 5' + pogo 40 1 58.22 AGAGTAGAGGGTCTAATACCCTTCCTCAACGAGGTCACCTTTCCTGTACTGGCCTGTAATCTGGACCTAAGCAAGGTTCCCCAATTCCCCCATAGCTGGATAGCTGGATAGGTCCAGGTCGGTTTTAGGACGG:1 + chr2R 17491452 5' - Fw2 3531 1 61.65 GATGCACGTCGTCTGCCCAATTGAGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGCATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 - chr3R 31681946 5' + Doc 66 1 60.56 TTTGTCAACGCCTAAAAGGACAACATATTTCTTGTCCACAGCGTGCTGTACGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr3L 13544986 5' - hobo 2913 1 53.92 ATTCCTTCGAGGAGGAGGGACATCCGTTGGAGGTCTTACATTCGGGGCAATGGAGACCGATCGACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - 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INE-1 103 1 60.50 GCGTTGCCTTTGCTCTTGTTTTTGTCGCCACCCGATAAATAACCAAACTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:1 - chr2L 22921334 5' - copia 5086 2 65.07 TCTCGCCATTTGCAACTTTGAAACTGTGTAAAGAGCTTTAAAGGTCTTATTTTCGACACAATTTCACACATTTCGAAGCTGTGAAAATGTCTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr2R 11595956 5' - P-element 2858 1 63.01 GGCTGCCGTTGCAAGCGGCAGGGGCAGCATTCCCCAGAAAGAAATTATATTAGAAAAAAATAAAATTAGAAAAAA:1 + chr3R 28346106 5' - FB 174 1 56.00 GGGCATATTATGTTAAAAATGATATGTATAAATAAGCCCCAGCTATCAACAATAGTAATTATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTA:1 - chrX 9959867 5' - I-element 5295 1 56.85 CAGAAAGTTTGCCCAAACACTTAGCCACTTCCCCATTGCAGCAATTGAAGCAACAGTGGGATCGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAA:1 + chr2R 22608643 5' + invader4 395 1 54.62 TAATGTTCTGAAGAACGTGAGCTATTCCCCCTCAATGCGACATAATTTCAGTGTTTTACCCGTTTTAATTACGCCAAAAAGTCAAATCATTTCCAATAGGTTGCTCACTTTTTGAAACTACTCTAATATGTACAATGTAAATTCAT:1 - chr3L 15476823 5' + 1360 3150 1 76.71 ATATATAACAGGCGGTGCCACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGTTAACACATTCAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACGAT:1 - chrX 22913222 5' + gypsy7 5274 2 57.53 AATCGGATGAGACACTTATGCATAGCTACAGGATGTGCTTACAGGATCTTACGAACGAAATTAAACAGACTTACACAGAAACGAAAGAAGACAATTTTTAATTATAGACGTTTTTTTTGAGTGGGCGTGTTGGAATATACTATTCA:1 - chrX 6233063 5' + copia 4867 1 54.79 CGCGGCGGAAAAGCTCTTCGAAAAACAGATGATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGGACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTGCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 4662034 5' + roo 48 2 51.43 AAACATTTATCCACCAAAGCACTAAATTATTCCTGTCCCTATAGAGAACTGGGGTGAGCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTT:1 - chr2L 17206098 5' - hopper 1364 1 52.05 CAACTGTCCATGTGTTTTCACATATGAACATACATATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTT:2 - chr3L 16875900 5' + Burdock 6221 2 80.14 ATGTATATGGAAAAATGTTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTC:1 - chrX 16243795 5' - copia 5052 2 68.49 TTTCACTTTTTGATTTGCATGCACTTTAGTTTTGATTGGAAATTATGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chrX 10286995 5' - roo 334 2 70.55 GTTGCATACTTTTAGGCGCGAGTGTGAGCGCCGATTTGTCAACGCCTAAAAGGACAACATATTTCTTGTCCACAGCGTGCTGTACGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3L 13544952 5' - hobo 2909 1 63.57 GGTTTTGGGGGATGCACGGATGCTTCTCCCATTAATCAATTTTTTCGCCAACAGCAACCCAATTTATGACGCTCTGCACTACTATTAATATCTGATAAAAAATGATGCACAAAAAAGTGGTAAGAGTAATAATTATAATATGAATC:1 - chr3R 17608904 5' + mdg1 55 2 66.44 AAAGCTAATTAAACAAGAAATATAGGGCGATTCCAACTCGTTTTTGATGAATGACATCCTTTGTCCTGCTGCAGTTGCAAGGCAGTTACAGTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACA:1 + chr2R 13195366 5' - BS 5063 1 67.12 CCTCTCAACATCGACGATAACGATTATGTGCAAAGTTTTATTTCTCACTCTCGCCGCAAAATTAAAAAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr2L 7271943 5' + 297 6624 2 56.85 GTTTTATTTTTTGATTTTTTGTATTCAGTCTCATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAAATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATC:1 - chrX 17472197 5' + Quasimodo 67 2 76.92 CGCAGTTTTGTGACTGAAAGCGACCGATTTCTAGAGATGCGTTCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 - chr2L 2999279 5' - P-element 2814 1 35.46 TTTATCGTTAAATTCCCGTGGCTTTGGCTCTCCCAGGAGGTGACCTAAATATGTTATTGGTGTTTTGATGGGATGTGCGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr3R 19639849 5' + 412 45 2 52.05 GGTGCAGAAAAGGCGACTAAACAAAAAAAAATAAAAAAAAGAAACCCAAATATTTGCCATAATCAAATAAGCTAGAAAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 10442929 5' + roo 44 2 49.32 CGGCACAAAATATGTCTCTGTTTACATTAAAAACCTATGTTGCTATACTGAACTTATGTATGATCTTGTCGAATTTTTTAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGTAGCTATTTGTTTAAATTTTTTTTTTCACTTTTCTTATCT:1 - chr3L 25824645 5' - invader2 4748 1 76.71 AATTTAAATGTAATTTATTTTCTTCAAAATCCAGCTAAATAGTGTTCCTAAATACTAAACTAAGTTTTAAGTGCATACATAACATAGTCATATCATACAAGATAAATAATAATTCATGGCCAGTAATAAACAATAAAAAACAATTT:1 + chr3L 15457144 5' - Penelope 104 1 43.84 CCCTCCGCGACGCAAAGTGTCTCATTTAATCCTCGAAAATGCTCACAGAGCGTGCATATATATATGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chrX 1764039 5' + opus 7153 4 57.46 TTTCTCGCTAGATTTGAAACAATACTAAGTAAATCTAAAGATATATATATAGTAGCATATGTGCCAGTATAGTATAAGTATAAGATATTATAAGATAAGATATTAATTATAAGTAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 - chr2R 4673654 5' + Quasimodo 28 2 41.10 CATCCTCGTCACCCACTCTCAAAAGGCACAGATATATAGATACATACGTACGTAGGTATGGTACGGAATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTA:1 - chr2R 20297999 5' - R1A1-element 5168 1 49.61 GACGTGGTCTTATAAGACTTTGGTAGCCGCTCTAGTCGGCCGGACTAACGGTTACAGCCCGCCCCAAAAAAGGGCATGGCCTCCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 + chr2L 18627658 5' - 1360 3369 1 67.72 TTTTGGTTCATTTAAAATCCAATCATTTGACTACAAACACTTTCAATTAAAGTTGCAGCCGAGCTGTAAAGCAAGTATTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAATGTCCTTGGATGGCATG:1 + chr2L 6876591 5' - Rt1a 5017 1 53.10 TTGCTTTTCCATTGCTCATATATTCAGTAAACAACAGTGAACCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 - chr3L 21151170 5' - 412 7468 2 71.92 ATTTAACAAACTTGTTGGCCATGTTGAGGCAACTGTTTAGTGCAACGAGCCGCGACAAGTGCATAAAACACGCCCAAAACGACGACAAGTGCGTTGTCAATGTCTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3L 815062 5' + hobo 14 1 74.31 TTTAATGTTACAGGTTATAGGATTGCAATGTCGCTCTTCATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAA:1 - chr2L 21153611 5' - 1360 379 1 67.12 AGTATTTACTTTGTGGTGAATCCCATTTGATTTGGTAATAAAACTACATCGAATTTTGAAGGGCGTGAACGAATAGCATGTAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTTGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 + chr2R 21029333 5' + Transpac 38 2 56.85 TATACATACTAGTTCTGCAAAAAATATTTTCAAAATCGTTATTAAATTTTGAAATTGATATCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr2R 8687910 5' - roo 9011 2 63.70 ATGGAGGCGTATTGAAGGATTAAAGCAAAGACACTACAATAACAAGTTGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCCTGGCTCTCTCGAATGTTT:1 - chr3L 24034553 5' + 1360 81 1 91.30 CAGGAAAAAGGCAATAAGGAAATGGTTTAACATTTGAATTATGATTACCATGCAAATAAAATGATTTATAACTTCTTTAGTATTATACTTATATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTG:1 + chr3L 14889751 5' - hopper2 1274 2 58.22 CCTGAGAACTGAGAACGGCAAAAAGGAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chrX 8760114 5' - roo 8987 2 77.94 AAGGTACTTCCCAGTCTCCGAGTTTTAGGATGTAGTGCGGAAATTTAAATACATATATATTCGACTACAAAGTCATTTAAAGAAGTGCATAGAATTGTAGTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAAT:1 + chrX 21590617 5' - BS 5072 1 65.07 AACGAATATTACTCACACGCAGCGTGGGCAGTGACATTTTGCCCATCATGTTTTTTGGCAGCTTTGCACTTTAATTAAATTGTAAATATTTTATTTCGCATGACCTTGCGATCTCATATTCGTAGCGGCCACGCAAATCTGCAGTG:1 + chrX 5277511 5' - gypsy2 104 2 74.66 ATCCAGCGGCAGATACAATAGCCACCCCACACATAATGGTAGAAATAATTTTATTATTTTTTTTTTTATTTTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAG:1 + chrX 19820152 5' - Juan 4144 1 60.27 GTTTGTTTAAAGCACCGACAACAACAATTGAAATTGAGTGGAAAAACAATTGCCGGAGACCAAAGACTTGAGCGTTAAGAGTGACAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAA:1 + chr2L 20324080 5' - Tirant 368 2 63.45 ACTCATGCTTTTCTCTGCTCTCTTCTTTGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTCAC:1 - chrX 850113 5' + jockey 100 1 76.71 TTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 - chr3R 4532958 5' + 1360 57 1 65.89 TTAGTGAGAAAGTCGTTCTCAAATGTTCCTAATACTAAGCTTTTGCCTGCTCTTACTGGGGGTATAATGATTCAGTTAAAAGTTTCCAACGCGAAGAAGTGAACAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAG:1 + chrX 20381348 5' - INE-1 577 1 78.20 ATATATGTACATATATCAATTGTAGGCTACGAAATGGGCGCAATGAAACGGAAAAGGAAAGGAAGCGCGATGAGTACACAAAAAGAAAAAACCGGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 - chrX 3661022 5' - 297 6955 2 68.97 ACACCGCGTCAAGGATCGCCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 21587609 5' - roo 9010 2 64.38 AAATAGAAAATGCCGCAGAAAAGCCGCAGCGGAAGTTGCGAGGATGGCGTTCCACACCGCCAACCATTTGGCGCGTCAAAGTTGGACTTTTGAATATATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 22522590 5' + roo 23 2 69.86 GGACTCGAACCATCTGCATACGAGGTATAAGGTGAGATTATTTTAATGCCATTGCCTTCGTTGTGAATAAAATATTAATTTAATATTGATAACATTACTCGCAGTAACTTTAGCCGAATGTAACTGTTGATACCGATAACACGCAC:1 - chr3L 14537465 5' - G-element 183 1 55.48 AAGGTATTGTTATCGTTTGAGTTATTTAAAAGATTGAAAACATCATGAAAAACAATTAGGGAAAAGCGTGCTTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGGTTTCGG:1 - chr3L 20083894 5' + opus 7047 4 55.48 TCATTCGCGTAAGCACACACATTACTCAATATGAATGCCCAGCTTATCCCCTTCTGCACTTATTGTTTTACTGCGAAAATAAGGAGCACACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAG:1 + chr3L 22530842 5' + F-element 375 1 61.64 GCCCATCAGTTTGAAATAATTTATTGCATACTCACGGGCGGCGGTTTTGGGAACAGAGTTGGTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTATATTAT:1 - chrX 4214548 5' - jockey 4938 1 52.05 AAGGCTGCGTCGCTCTTTATGCTTATTTAAAAAAGTGGCGTCACATCCCAGTTTTGAGAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAG:1 - chr2L 10519620 5' + X-element 70 1 60.27 CACACAGCGTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAACAACGTAATTGTGAT:1 + chrX 6484702 5' + jockey 61 1 54.11 GTATTTTGTTTTTGGGCTGACTGTCGTGTGGCCCCAAGGGACCGCTGCAGTTGCAAATGCTTGAAATTACATTTTTCGCATTAATAAAAATGAAATAAAAATAAAAACCGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 - chr3R 25843485 5' + I-element 18 1 73.97 CGGACAATGGCAGCCCGAAAAGTGACAAAGACAACACGTTTCGTGCTGCAAAAAGTTACAGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chr3L 5179137 5' - P-element 2839 1 47.41 ACTGACAATTTTTGGCACTTTTATGCATTTTTGATGAAATTTTCCGAGTGCAGGCCCAGAGTCTGGCATTGGCAACAAATGCCGTAAGTGGTCGACGCACAGAGATTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATACTATTTC:1 - chr3R 13472711 5' - mdg3 226 2 70.55 TACTAGGGAAAATGCGCAGAGGAAAAGCTTTTTTTATCAATGATATATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATA:1 + chr3L 18554607 5' + jockey 4634 1 68.49 AACTATGGCTAAAGCTTAGAAATATTTAACTAAAAAGCTGAAATCACTGATTAAGCATTAAATAGCTTGTGTAAAGTCCAATCTATATATAAACATTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3R 8596303 5' + hobo 23 1 68.49 AAGTTAATTGAATGACTAACTGCAAACTTTAAAATTTATATTATATATCATTAAAGATATGGGCTGGTGTAAGGCAATGCAAAAAAAAGTTGGAGTTATTGAGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGTGGTCAAATTTTCCATAGTA:1 - chr2R 16581815 5' - Transib-N1_DM 1 1 78.77 TTTTGAATTTCAAATCGTACCCATTAGGCTTAGAGAGCAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr3R 19543427 5' - roo 326 2 73.29 TATAAAATGCAAATCAGTTGCATATAAAAATATATATAATTCATTTGTTAAAACCATTTGCCGGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3L 13545109 5' + hobo 25 1 68.06 GCTGAAGTACTGACTGACGTTTGCCACTTCGCGGGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAAT:1 - chr2R 9410532 5' + hopper 86 1 73.29 GTACCAAAAAGTTAAAAAAAAAAACTAGAACGGCCAAAAACTGTGCTGTATTTTCAGAGAGAAAACTTTTTAAAATACACATTTATTTATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAA:1 + chr2L 724905 5' - Ivk 5347 1 53.42 CATTTGTTAAAACCATTTGCCGGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATCTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chr3L 13545068 5' + hobo 68 1 63.01 CTTGGCCCCAAGCTACTCTTAAATCGAACGACAAAGGAAACTGAGCTGAACTGAACTGAAACTTTTGCCTTTCGAGTTTCGAGTATTCCCAAAATTAGAAACAAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 20074692 5' - roo 397 1 76.26 GAAGTATTTTTAAAATAGTCAATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 - chr2L 14480562 5' - Transpac 5200 2 65.75 CGCAAAGAGCCTTCTTATTCAGCCACAGTCAACACTTGTAAGATTGGAGGTAACGGCGAAAATATCATCCCAAATTATGCACACCGTTTATTATTAAAATCAATTTGCAAGTAAATAATTCCAATTTATTGATTTTTATTTTGTAG:1 + chr3R 17209959 5' - HMS-Beagle2 296 2 73.29 GGAAGGAAAAAAGGAAAAGATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr3R 6412093 5' + Tirant 16 2 73.28 GGCGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3L 13472411 5' + jockey 74 1 64.34 ATATTCTTGACGGTATTTTTAGAAAGCGCATGAGATGCACGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chrX 4725000 5' + roo 83 2 73.97 CCTAATTTTTCTATATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr2L 5447883 5' - roo 9007 2 66.44 GAACCGTTTCGTTTGCCTTCATTTTGCAATGTGAAACGATTACCGATTCGCGAGCCTCTCTTTCACATGCATATGTATATGCCATGCGGTTGCGGTTGATGGCTGATGCTGTGCATTGCGAAACGGTTACAATTAACCGCTTGCAG:1 + chrX 14897243 5' + Chouto 5999 1 57.53 AGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr2R 16510254 5' + roo 8747 2 75.34 TAATTTCTGTTTTGGCAAAACGTGCGCCCTAAACTATGCAACACTTTGTGGGTCGTAATAATCTTTTGGCCAACTTCATTGCCATGGCATCGTACACCCCAACAGCGTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGGCAATG:1 + chr2L 20937981 5' + jockey 4700 1 61.54 GGGTTCGGTAATTAACATCATGAAGGGCTTTAGATGGATGTGCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3L 6675376 5' + 412 39 2 60.38 AAATTATAACGACAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCACATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 14494124 5' - roo 360 2 53.42 CATATATCCAACGGGGCGGCCACACACACGCACAACCAAATAACGAGCCGAATTTTTAAGGTCACAGTGCGGTGAATGTCCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 20399100 5' - roo 392 2 68.33 GTTTCACAAAACCTTTGGTTACGGATGCATTGTATTAATATGTTTTGAACTCCTGTTTGCTGGAGTTGAAATCAATCAGAAAAAAGGGTTTCCGACTATATAATGTATATACATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGA:1 - chr4 1121547 5' + INE-1 94 1 50.68 AAATTAGGACACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATT:1 - chr3L 10563999 5' - hopper2 1559 1 50.00 AGGATTTTTTATAAATATATGCATATGTACATATAACCGACTGTTAAATATGTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAACAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 - chr2R 21473684 5' - pogo 2039 1 63.83 TGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3L 19574035 5' + 297 6630 2 56.85 ACCAGAAAATCGGGAAGCCGAATAAAGGAAGGCAAAAAGCAAAGTGAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGT:1 + chr3L 14708921 5' - opus 7436 2 66.44 TCGACAAATATTTTACCAAAGATTCAGTTTTGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATATATTATATTTAGG:1 - chr3R 19543478 5' + roo 8740 2 75.76 GGCATCCCATCGCATCGGATCGCATTGGATCTGAACCCATCCCGAGAAAACCCATTACACCACAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 + chrX 2580462 5' + jockey 4679 1 69.41 ATAAAATCAAAAAATACCAATGTGAAGCAGTCAAAATATGCATCATCATATTTTTCAAAATGGGGGCGTGGCAGTTTTTGGCGGTTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTTATACTTTTTAATATTGT:1 - chr3L 26169318 5' + diver2 40 2 65.07 ATTTGATTTTATTAATATTCAAGCAAATACTAGAACCTGTTTTAATATTCTAACGACAAACATAATCCTTAGGACAAACAAAATGAAGATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCG:1 - chrX 10816663 5' + copia 4705 1 60.96 ACCCGAAAGGCGGCCGAAAGCCGAAGTCACTGGCGTCACGAATTGGCATCGTCGTTTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCATTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr2L 13717396 5' + P-element 64 1 43.15 ACTCATAAAAATCATTAAGACCCATGGCATGTTGTCAATCCTTTGTTTTTCTGTGAAGCTGTGTGGTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 16463645 5' - roo 400 1 77.24 GAAACCCCCTTTTGGTTCGTTGGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chr3R 6411960 5' - Tirant 374 2 57.80 TATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTGCCGATCGACGTCAGCAGTC:1 - chr3L 19335421 5' - invader4 257 2 68.35 ATATGCCTAGCCTGATAGGTCATTGTTTTGTTTAACATTTTGTAGTGGTTTCTTCCAACACGCAACTTTTCCGCTCCTGCGTAATCGGTTGATCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTA:1 + chr3L 16356184 5' - P-element 341 1 63.01 TGCAGCCCAATCCCAAAAATCAGGAACATTCAGAAAAATAATACTTGAAAATTGATATTGGACTGCTCTTAACACTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCTTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 14493995 5' + roo 46 2 50.68 GCAGTCAGTGCTTTGGAAGACGACAAAGTAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTTAAGTAAAT:1 + chr2R 7899135 5' - roo 315 2 78.77 CGTATGAGTGATATAATCTTGCATGTTTTGCGTATATTTTTGCATATATAAAATATACAGTAATTACTGATTACTTTTTTAAACAAATGTAAATTATATAAAAAGGAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGAATCAGGGTT:1 + chr3L 11903157 5' - opus 488 2 78.77 ACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGTGGGGAAAGCAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAATTAAAATAGAATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTGTATGTGTAT:1 - chrX 19113565 5' + 412 7121 2 56.85 TTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTC:1 + chr3R 4532878 5' - 1360 3322 1 65.07 ATTAATCTCATTGAGAGTATCGTAGAGTGTGGCCAATGAGGATTCCAGGTACATCATTAACTGGTCCATGGAGTTGGAGTCCTTGGCGAGCACCTCAGCACCTTCGGCCAAGTATTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTAT:1 - chr3R 25063235 5' + 1360 304 1 78.77 TTTTGTTCGCTCCGGTTGCTCTTACTTTTGAATTGCTTGCCGACCAATTTTTGCGCACACCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 + chr3R 32068350 5' + P-element 60 1 45.21 GAACAAACTGTGTTTATGGTGAAAACATACTAATCTCGGCTTCACTCGGAGAAAATATACAAATTTAACCATAATAGGGAAATATAATTACTATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chrX 9959744 5' + I-element 28 1 63.70 TTTTGTATTTATTTATTCGTAAACTATTTTATTCCTTTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 + chrX 18190368 5' + hobo 84 1 73.29 CCCATCTATATGTGTGTGAGTGTTGTCTGCGACTGTCAGTGCCAACGCAACTTCCCTGTAACTGTAACTGCAACCAACTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAG:1 - chr3R 27859603 5' - hopper 1370 1 54.48 AGAACCTTCGTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chrX 16217562 5' - P-element 2876 1 75.19 GAAGAGTCTGACTGGGACAAGGAGCAGTTTATTAAATCTGATATCGCCAAACCATTGGGATTTGCCTAGGATCCGGCTTCAGATAAGCCTCTATTTAATAATTGGCGCCCCACTAAGGAAACACACAACAACACACACAAACACAC:1 - chr2R 5581080 5' + gypsy3 420 1 67.81 ATCAGTCGCTCCTAAAAATAAACCTCGACCTTCCGAGCAGGAAACCGATTCGGATTCCGACTCTGTTGTGGCTGAGAGTGAAGAAGAGCAGGAACCACATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTATTCTTATTTGGGTT:1 - chr3L 8174637 5' + roo 402 1 66.44 AAAATATTTTATTCCACTTGCGTTGATTTACTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 - chr3R 23539479 5' + hobo 85 1 75.69 CCGATGTAGCCGTAGGAAGGAAAAAAGGAAAAGATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTACACCCCCACGCCTCT:1 - chr3R 6412107 5' + Tirant 16 2 74.48 CCATCAAAGTGTGAGCAGTAGACTTGTCCGCTTGCAGTATGCAGCGGCACGTAACAGCCTTAACCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3L 22883923 5' + roo 56 2 57.24 ATTTCACATTTATAAACTGACACATTCGGCGGCGCAGCGAATTTCGCTAGAAAAGCCTTTTTTCGGGGTCTGAGAACTGAGAACGGCAAAAAGGAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chrX 8760046 5' - roo 9045 1 65.75 CCTTTGAGATTCTGGCTCATTTCACCAACCCTCGTCAAATGGGCAAATTTGTTCATTTCCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCAAAGCGGTCTTATTTTAGATAAACATGGAAACCGAAATGTTGTCTGCTTTTATAAA:1 + chrX 9714885 5' + Cr1a 446 1 57.93 TGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACA:1 - chr3R 29091376 5' + rover 73 2 68.49 GTCTTCTTTTCGCGAACAACAACAAACCCGAACCCGAAGTTGGAGCTCGGCTACCGACTCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chrX 10806967 5' + P-element 46 1 49.24 GATAGCAACACAAGTGATACATGGGTTCATGGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr2L 18213100 5' - roo 9033 1 56.83 GATGGCGTCGTTTTGGCCATATGTGACAGGACTGACCATTTAAGGATTTTAGCTGATGAGAATTCAACTAAGCGGACGCAAATTGAATAAAAAGAATCACCAAATGTCCGGCAATCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGC:1 + chr3R 28220179 5' - 1360 87 1 76.71 ACGACAAACTTCCTCACCGACATCGGGCATCAATTTGGTACAGGCTCATCTTTTGTCGCTTGAAGTCCGCAAGGAATTCCGTATTCATTCTGACATGCACTGTATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 - chr2R 12814983 5' + opus 12 2 73.29 ATTAGTTAACGCTAGCGGTGCTTCGCCGCATATTCCATTAAAATGACTGTCAGCAGTGCATATGTGTTGTCATATTTTCCACTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTAT:1 + chr3R 27782599 5' + G2 3015 1 56.16 AGCCCACGTTAAGGTAGAATTTCAAGAAGCAAAATCTTGTGTAAGCTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2L 3648802 5' + roo 8713 2 63.33 CCGATTCCCCAGCTGCACATTAAAGCCCAGCGAAGGAGCTGGAGTGGCGAAGGTCCTTGAAGGCTGCGTCGCTCTTTATGCTTATTTAAAAAAGTGGCGTCACATCCCAGGTTTGAGAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATAC:1 - chr2L 10519679 5' + X-element 11 1 78.08 ATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAG:1 - chr2L 22684598 5' + transib3 67 1 56.43 CGTCATTTCGGGACTAGCTAGACCAAACTACGCGTATTGCAATAGACACCATTTGCTTTATTTAAATAAATTATTAATTAATATTGATGTAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATT:1 - chr2R 9828168 5' - Stalker3T 284 1 58.22 GCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGTTTTAAAT:1 - chr3R 27188625 5' - roo 9011 2 59.29 CCACTAGCTCCTCGTTCTCCGTACCTTATTGTTTTATTTTTTGATTTTTTGTATTCAGTCTCATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAAATAACCA:1 - chrX 17472227 5' + Quasimodo 42 2 55.56 ATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 + chrX 4214463 5' + jockey 68 1 60.87 GACTTACCTATGCCAGGTAACCCCCCAACACTTTGGTACCGCGTATACATGTGCGTTGCGTTTTCGAACAATCCATCTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3R 8184082 5' + Doc 49 1 45.89 TTAGTCAAATATCACTGATAGTCAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTT:1 + chr2R 4330765 5' + copia 58 2 65.60 AATTTTTTTACCCCAATTCCAAAGCCACCCAAAAGTTCTGGGTTGCGTTTGTCTATTCAACATGCTCCTGATTAAAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGT:1 - chr3L 17860216 5' + invader4 2643 1 50.68 TAGATCACGGATGCATAGAGAGCGCAAGTGATGGAAAGGCCTATTGGGCCAATATCTTTGTGAACGAAACTTTGCTGTTGTGCATTTAAAGAACCCGTGAAGTTCCCTTCTCATTCACATTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCT:1 + chr3R 24140617 5' + INE-1 542 1 54.79 CAATAACAACAGGTGTTTCAGCTTTATCTATTGTCAAAACCAAACCAAGAGTCCATAATTGATAAGCAGAAACTTTAATTTAGTGCGTGTCAATTTGAATAGTATCGTATCCTGCGTGCTGACTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCG:2 + chr3L 4557736 5' + Stalker 445 1 65.52 AACTAGGTTATTAGGTCTTTAGTGTACCCACCCTCCGCTTCATTCACTCAATTCTTTTGTTTGTGTTCGGAAACCTAATAATCCCTCAAACACCATCGAGAGTTCGTTAACAGGAGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCC:1 + chr3R 22840322 5' + Transpac 4922 2 79.45 TTGTAAATTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGT:1 - 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roo 348 2 58.90 ACTGGCATATATGCATGTACATAAATGCGTTCAAATACAGAAGATCAGAGTCAGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr3L 20398987 5' + roo 8730 2 64.83 AATGCAATATAACTTAAATGTTAGTGTTCAAAGTTGTGAATACAAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCCGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3R 5762023 5' - roo 332 2 67.81 CGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGGGGGATCAAAATTTCAAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTT:1 + chr3L 11115123 5' - R1A1-element 124 1 55.65 CGGTTGTGTTAGCCCGAAAAGCGGAGCTTTTTACGCGCACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr2R 12069552 5' + Tirant 37 2 57.89 GAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTATA:1 + chr2R 1320679 5' - diver2 4836 2 54.79 ATTTTCACTTTTTGATTTGCATGCACTTTAGTTTTGATTGGAAATTATGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chrX 10286993 5' - roo 336 2 69.18 GGCGCAGCGAATTTCGCTAGAAAAGCCTTTTTTCGGGGCCTGAGAACTGAGAACGGCAAAAAGGAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTATACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTGGGAAATATCTTCGGT:1 + chrX 8760076 5' - roo 353 2 48.61 TTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCTAGTGGTCCCTTAAGCACCCTACGTCCGGAGAAACATCAGCCGAGTCAG:1 - chr3R 3286153 5' - gypsy12 9836 2 71.83 TAAGTCGGAACTCTAAGGGCAATCGCTTGTGCTGATGCTCCACTAGCTCCTCGTTCTCCGTACCTTATTGTTTTATTTTTTGATTTTTTGTATTCAGTCTCATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATA:1 - chrX 17472266 5' + Quasimodo 14 2 74.66 ATGCAATTAAAATCGAACATCCATCGAGCTCAAAGTGTCCGCAACTTGTGCTGCATACTTTTGTGCGTCGCCAGGAGCCGCACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 - chrX 7031707 5' - hopper 1377 1 59.59 GGGACGGCGACACGCCCACAATACGTTCGCAATTTCACACATATACGTGAGGTAATTTTAAATTGTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr3L 13366062 5' + hobo 2 1 77.50 AAGTTCCTCCATTCAAAAATAGCACTTATCTGTGACTTGTCTCGTAGAGGTGATTAGGCCACTCCACTGCCATCAAAAAGTAAGACTCACTTGTATAAACAACTTCTTTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTG:1 - 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chrX 14346529 5' - roo 9027 1 52.74 AATGTATGGCCAGAGCATGACTCGGATGTGCCTGGTGATGGGTTTTCTCTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGTTCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGGCT:1 - chr3L 3858775 5' - jockey 4919 1 67.12 GACCCCGTGCTATCAATGCTAATCCAAAATAGGAGCAGGAAAATTGTATAATGTTTCACACAAAGATCCAATAATGGAAAACCAAATATAAAACGTAAGAATGCGGAGGAAATACAGAACAACAAAGAAAAGAAAACCAAAACAAT:1 - chrX 579203 5' + mdg3 5104 1 76.03 GTTGTACTAACAACTAAAAATGCAGCCCAATCCCAAAAATCAGGAACATTCAGAAAAATAATACTTGAAAATTGATATTGGACTGCTCTTAACACTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 14493975 5' + roo 8683 2 67.63 AACAGAATCTTGTGGAATACCTGTGCCGACGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 + chr2R 18440431 5' + P-element 83 1 25.90 CTCTGGTTCTTGATCTTCTATATTAACATTTTTATGAATGCTCCGAACGCTTTATTCGTATTCTATGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAAC:1 + chr2L 7449227 5' - roo 8715 2 54.79 AGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr3R 27188618 5' - roo 9001 2 66.43 GGTGGGAAAACAGATGTGTGGCATTAAAAATCTGGCAAAAATCACGAAACGTTAAACAACCAGCAAAAATATTGTCATGCGAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chr2L 19643662 5' + hobo 13 1 78.08 GGCACGTTACTGTTTTCAATTTGTTTTTTTTTTATTTTTTTTAA:1 - chrX 7327871 5' + hopper 151 5 79.55 CTAATGTGAAATTCAATTTGCTGCCACAGAAACAACAACAGCTGCACTGGGAAAATCAAACGTTTTGAACTCGTTACTAAGCATATAATAGAAAGACAGATTTGTGAATCATTGGAACTTTTCTATAATAATAATAATAATAATTC:1 + chr3R 13995439 5' + mdg1 7082 3 67.12 GGATTAGTTAACGCTAGCGGTGCTTCGCCGCATATTCCATTAAAATGACTGTCAGCAGTGCATATGTGTTGTCATATTTTCCACTCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATT:1 + chr3R 27782597 5' + G2 3013 1 57.53 ATAATGTTGATGGATTGGATCTTTTCAACTGAAGACTGTGCATCCCTTAAGGTGCAATCCAAGACTTTGGGATTCTTCGAAGATAATTCTTTTGTCTTTTTCGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 365426 5' - Doc2-element 232 1 76.32 TCAATAATCAATGCGACTTAGATATGCCCTTATTTTTGAAGAATCTCGATCAGTAAAAAATGGGATTCCTAACAAAAAAATTTAAGATCAATTGCTTAAAGCGTAAATTACTATTTATTATTATAATTATTATTGTTATTATTACT:1 - chr2L 7588376 5' - mdg1 7063 2 78.77 ATGAGATTTATCGCGTTGCCAGTCACTCGACCTCCGATTTCGTTCCGTTTCAACTGAGTGTGAATTTCTCAGGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 + chr2L 18944793 5' - P-element 2849 1 57.25 ATTTTAAGCCCATACGAAGGTGTCTGGTAGTATTGCAGCTTACTGGAAATGTTTGCCATGGTTTAATTTAAAATCGAAAGTCATTTGCAATCCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr2R 12814795 5' - opus 7477 2 71.23 TTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chrX 4214476 5' + jockey 82 1 70.50 ACGCATATAAATAAATTGAAAACAAGAGGGAATACCAAGCTATGGATCTGCAATATACCCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chrX 17510594 5' - roo 9031 1 52.00 TTAAATCGCATTTCAAAGTTAATTTACCCTAAAATGCAGATCCTATCGCGGTAATTCCAGCATGTTGCAACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3L 16463450 5' + roo 8684 2 69.86 ACCTGGAATTTGAGATGCCTTGTGCATGGTTAGCATTCTAGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 - chr3L 3757219 5' - copia 5078 2 70.55 AACCTTCGTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chrX 16217560 5' - P-element 2859 1 65.97 CATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTACCAAAAAATCG:1 - chr3R 4571525 5' - 1360 37 1 76.71 AAAAGGGAGATAAATTGAATTTTCTATGCTGTTAAATAATTTCATTTCGATTTATTCCTTTCGCCTGATTTTTGTGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTC:1 - chr3L 22341026 5' + jockey 4732 1 54.11 AACCGGTTGCGTTAAATTTGTTGGCACATCATTAGTCAGGGCGATGTCAAGGAAGGTGGAAGGACTCCAACATGAACATTGGGGTTCTTATGGAATACTTGAATTTATGACTTATATCCTAAGACATTCTATGATTTGGTGTATG:1 + chr2L 11474788 5' - Quasimodo 76 2 53.79 AATCGCATTTCAAAGTTAATTTACCCTAAAATGCAGATCCTATCGCGGTAATTCCAGCATGTTGCAACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3L 16463453 5' + roo 8687 2 67.81 AATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATTACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr2L 21153476 5' + 1360 14 1 61.39 TATTTGCATAAAAAGTGAACAACCAGCGGAATGGTCGTAAATTCAGCTGGAAAGTAGTGAACGAAAAAGCGCAACCGCGCACGATGGGCTGGAAAAGATAAATGGGCAAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr2R 14940617 5' - blood 7377 2 76.71 AGCAGACGTTGGCCCTGACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCGCACATATAACAAATTAATTA:1 + chr2L 23372489 5' + gtwin 33 2 63.01 TGCGTTTACGGGTACTTAACAACTTGGGCACCCCTCTGGAAATATCCGAGTGTATTAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCAC:1 + chr3L 26019342 5' + gypsy 69 2 64.38 GTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTACTGGCGAGTGCACACTTTAG:1 - chrX 22824241 5' - Gypsy12A_LTR 2215 1 52.74 AAAGTGTACTAGTTTTTAGAGTATTTAAAATGGAGCACTCGGATGTGGCAATTTATCATGATACGAATTTGTTATTATTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATA:1 + chr2R 13212189 5' + diver 5932 2 53.42 CTAAGCATAAATGTTCGGATTTGTACGCGGAATAGGAGGCTAAATAATTTATTTACTTATTTATGAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAG:1 - chr3L 21773249 5' + X-element 4628 1 68.42 AAGAAGTCCCAGCAGGGGAGTGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTAATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTC:1 - chr3R 17210149 5' + HMS-Beagle2 20 2 71.92 GGAATGCAACTGTAAAAATAATAACACCGCGTCAAGGATCGCCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATT:1 - chr3R 21587632 5' - roo 9033 1 58.22 AGTTCAGTAGGTGACACCATTGCGCTTAGGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCCTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 - chr3R 18518005 5' - roo 8980 2 78.08 GAAGGCTGCGTCGCTCTTTATGCTTATTTAAAAAAGTGGCGTCACATCCCAGTTTTGAGAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAA:1 - chr2L 10519621 5' + X-element 69 1 59.59 AATTGAACCATTTTGTTTTTGAAAAAAGCAGCAAGTAATGAATTTTTAATGTGTGAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr3R 31650413 5' + pogo 58 1 60.00 TACATTGAAACCCCCTTTTGGTTCGTTGGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGC:1 + chr3R 6411954 5' - Tirant 8450 2 58.22 ATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 - chr2L 14480530 5' - Transpac 249 2 60.27 GCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTACATGTATGAAGGTTTTTAAG:1 + chr3R 6411995 5' - Tirant 8457 2 77.55 ACAATTGGATTGGCAATAGTTTAACAACCAGTTAATCAATCGGTTTCTAGTAATTATAATAAAATGATCTGTGACATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 17187728 5' - roo 9026 1 51.37 GCCGTATCCTGAAAGTCTCCTTTCAGTGTCCTTGTCATTTCGCCTCGTTTCTCGTATTGTTTATTGCCACCACCTATTACACAGTGGACCACTTAGTAAGTGTTCGCAGGCCAGTAACAATCGCAATCATAATAACAATAATAACA:1 - chrX 12164539 5' + mdg1 25 2 54.11 GAATTTATTGTGTATTTTGTATAACGAAAATTAATCAAGCAAAGTCCCCAATGCAATCGCTAAACTCAAACAAAACGAAGGCAATTTGTTGTAAATTTATAAGCTCAAAGAAGCTGGAGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 + chr3R 22053243 5' + FB 24 1 67.81 CATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAAAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAATCAGTGTAATTTTGTTCAATTGTATTG:1 - chr2R 2875205 5' - TLD2_LTR 69 1 50.68 ATTTAATAAATAAAATATAAGATATAGGTATACACATAGTACTTTGACATCAGTTTTGAAACGGTGGTGGTAGGTGAGAGTTTATGCAAAATTTTATCTAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:2 + chr3R 21706207 5' - I-element 5334 1 69.86 AAGTAGCAATTCGTGAGTGCATACGTTACTCGTACTATATTCATTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCAACTATATAATATATAATATACAATATATATATACTTTCTTGATCAGGATCAATATCCGGGTCGATC:1 + chrX 21452122 5' + INE-1 96 1 71.23 ACGGAATTCCTTTGCTCACGCACACATTGAAAGGAGGTTCGTTAAGAGAGAAGGGAACCCAAAAATGTATTGTTGTAGTCCGTGTTTGTTGGCGGCATCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1 - chrX 16526401 5' + P-element 22 1 70.55 CAAAGCCGGTGAAGAAGGAGCCTGCTGCCGATGCTTCCGGAGCTGTGAAAAAGCAAACACGCCTGGGTCTGGAGGCTACCAAGGAGGATCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATAT:1 - chr3R 23953900 5' - copia 196 2 59.59 ATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAATCATATATATTATTGATCAGTATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCTATGTGCCTCTGTCTGTCTGTCCGTATGAACGTTGAGATCTGAGGAACTA:1 + chrX 124082 5' + INE-1 142 1 78.77 TTTCTCTTGACAATTTCTTGGCCAACATCTTTATGGAGAGTATGGCGAGATATTTATCTATGGATGGAAAATATTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCCGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATATGCATTATTTTT:1 - chrX 5366267 5' + pogo 42 1 56.85 ATTCGCACGCCTCAGCGCATTCGCAATCCGAGTTCAAATCCATAGCATACTTTTGCGGGCGGCATGTTTAATTTATGGCCGTTTTTAAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 + chrX 19818397 5' - jockey 4951 1 56.16 TTAACAACTTGGGCACCCCTCTGGAAATATCCGAGTGTATTAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGC:1 + chr3L 26019357 5' + gypsy 7058 2 72.18 AAACACAACAAATAAGTGAAGTATAAAATATTTAAACTAGATTATCTGACAGACAGCCATTGTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACT:1 + chr2R 21425052 5' - HMS-Beagle2 256 2 57.53 TTTGTATATTTATATTTATTATGACCATTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGGGCTGACGTTCCTGCGGCCGCGTCCGGTCTTATCG:1 - chr2L 23069853 5' - gypsy4 36 2 78.07 GTCGTCCATGAACATTAACGGACTCTATCTGGAGGTCCACAGGTAATGGGGATCCCTTTGCATATCGATGTTACTTGACAAGCGATACAGCGAACAGGTCTTTTCTAAGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACG:1 + chr2L 20928994 5' + 1360 169 1 58.22 ACCTTCTTTCGTCAGGTTTATAAGATCTCGATATTGAATACATTCGTTTGATTACTGTGCACATAATATTCCTTTCAGTGTTGTGATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTA:1 - chr2L 20340801 5' + roo 127 2 60.00 GTGTGTTGTTGGCTACGTTGCAGCGACAGGCGCCACAATGCAACCCTGCGCGCGCTTTGTGTATATCTTAAGCGGTTTATTCAGTTATCTGTAGTTGCCACTTATACTGTCCGGTGACATGGTTATTGCAGCCCACAAATAGAACA:1 + chr3L 5799555 5' - rooA 7282 2 45.21 GGGTGGGTTTCCAGGCAGATCGGGCGGAATTCGCGCTACCTAAACGACTTATCCTTTTGGAGATGGGAAAACGAAGCGATAGTTTTCGGGGTATCCCAGAGATACGAATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGATGATTTAAATTATAG:1 + chr2L 11794146 5' - Tc3 401 1 73.97 GTGGACGTGGTCAAAATAATTTTGGTTTACCGATAAAAAATGGCAAAATACATTCTCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGGTTCCTGTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTG:1 + chr4 872957 5' - Q-element 90 2 58.87 ATCAATTCAAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTT:1 - chr3R 28659161 5' - Burdock 231 2 60.96 AGAACTCCGGCCTTCAGCACTTCCGTCATCTGTGGAATAGAGTGATAAGACATTAAACAGCTCTTAAAACGGATATAAAAAGCTTAATAAGCTAGAAAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 22545755 5' + roo 23 2 62.07 ACAGCACAGCGCAAAATCCGTCCCTTACACCTGAACTTCCTCTTATGCTTCAACACGCTTTCGCTGTAATTTCCTGTTGGCAAAAACTGAAAACTGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACTAAAATTAATA:1 + chr3L 10563854 5' + hopper 21 1 69.44 TAAGAACTGGACTACTCAAATACCGTGAGAAACTATCATTCACAGCTATAAATATAGAACATATTAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 - 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Stalker2 7586 2 65.67 GAGGCTTCCGATTGCCCTTTTGTCCCTCAGTATGGAAACCGGGTGCATTGGATCCGATCCAGCTGTAGGATCCAGTTCCCCAAGGGTTGCATTTCCCGCAAAAAAAAAGAAAAAAAAACA:1 + chr2R 10548064 5' + gypsy7 5006 1 76.67 ATAATGTGTACATATGTATTTTGTTTTGTTTTAATATATTTTTATCAATAGTTCTAGAAAAATTAAAATCTTTTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAAGTGGTATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTA:1 - chr2L 5985756 5' - Rt1b 5047 1 60.27 GATCATTTTGTGTCGCCGCGGCTTCTCTGTCCATCGCAAACATGCGAAATATTTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTA:1 - chr3L 381804 5' + S-element 66 1 65.75 CCATTATTGATAGGACTTCACGTACACCCAGAAACTGATTTCACCGATCAGCGTGGGCGGACAAAAGAAGAGTTTGGCCGATTTAATGGCCGAATTATCGACACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGT:1 - chrX 7322464 5' - Quasimodo 332 2 72.41 TCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 - chrX 5206516 5' + Tirant 8173 2 77.97 GTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:3 - chr2L 14480527 5' - Transpac 246 2 62.33 GTTGCGTATGATTGATAAACACGTTGTCCAAATTATGGATACGCAGTCGACATACACAGATAGAGATGGCGAGAATTGAAAAAATAAACACCATTAGGCTGATTCAAATGCACATTTTTTGAATTAAATACATTTTTTTCTTTATT:1 - chr2L 14399467 5' + transib4 2472 1 69.86 AAAAGATTTATAATTGATTTATAGCCCTTTATCAATTTATTTAATGTAATAAGGTTACCTTTTCGAATTGGATTTATTGGTGCAGTAATTTATTTAACATGATAATCGGAAAAAGTATATAAATTATTTTATTTTATATTTTATAT:1 + chr3L 10356633 5' + transib1 1904 1 70.55 TAGCCCACGTTAAGGTAGAATTTCAAGAAGCAAAATCTTGTGTAAGCTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2L 3648803 5' + roo 8712 2 62.50 GGCATCACACCGTAAAACCTTCCGGGTCCCAAAAAAAAAATCAAAAGAATTAAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTA:1 - chr3R 25761547 5' - I-element 5289 1 61.64 CCATAGCAAATTGCAATTTTAGCCGCTAAACGATTTTGTTAGCCCACGTTAAGGTAGAATTTCAAGAAGCAAAATCTTGTGTAAGCTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2L 3648843 5' + roo 35 2 58.90 ATTAAAATGAAGTGATTTAATCAGTTGTTTTATACACGACAGAATTTTAATAAATAAATGTGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCAT:1 + chr3R 27514660 5' + Ivk 377 1 58.22 GTGTGGCAAATGACGTGCGTGCAATATTATTTGGACTTGTTGATTTGCAGTGTTAACGGAACTGCCTCCTAAATCGAAATACGGAGACCAACTGACTAGGCATTGTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 - chr2L 19548578 5' - flea 243 2 76.03 GACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCTTTGTAATGCTCAGCTGCATTCGATATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCGAAACCAGCCACTTCTATTA:1 + chr3R 12622171 5' + 297 19 2 69.86 CAATTTTTTGCCGCAACCATTAGTGTCCCCGCCATTTGTGGACGATGTCGCCGATGTGGACATGAGGTCTTCCCTGCCCTCCAGCATGACCTCCTGATCAATGAAAACAAAACAAATGGTTGCGGTTTCATATTCGTAGCGGCCAC:1 - chr3R 4697521 5' - gypsy2 6606 2 68.49 CCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAA:1 - chr2L 13510874 5' + diver 5949 2 69.78 AAAATTAAATAGAAAATGCCGCAGAAAAGCCGCAGCGGAAGTTGCGAGGATGGCGTTCCACACCGCCAACCATTTGGCGCGTCAAAGTTGGACTTTTGAATATATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 22522584 5' + roo 8681 2 73.97 GAATATGATATATGTATGTACATATATATTATGTATTACATATGCAATACCAACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGCTTTCGTACAGACATCTACT:1 + chr3R 12468299 5' - invader1 3759 2 71.92 TCAAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGGTTATTAAT:1 - chr3R 28659155 5' - Burdock 224 2 56.85 GAGGGCAGACATGGAAAATAACACAAAATGCGAATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAG:1 + chr3R 29091309 5' - rover 7267 2 62.37 GCGTTACTGGATCAAGAAGCATTTAACAATGAGATACAAATAAGATTCCAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chrX 21668955 5' - pogo 2045 1 63.64 CTCCTCAATAATTAGCGTCTGATGCTGCTGACCTGAGGGCTAAATTCACAATATGTTAGCATTGGTAAAATACTAAGATAATTTTCCACTCAAGCAAACTCCATATGGCAACTAAGGCTCTCTTAATAAAAGCCATATC:1 - chr2R 16644763 5' + G5A 2396 1 58.27 CTCAGATAAGCCCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAA:1 + chr3L 13228461 5' + P-element 72 1 44.52 GTTTTATTATAATGCTAATGTTTATATTTTGCTGAGGTATTATTTACCAATTATTTATATATTTTTTTTTGTTTTTCTCCTGACTAGAATCAAATAAAAAGTAAAACAAACATACCATACTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr3L 12468922 5' - roo 409 1 81.38 AGGGTTAAGCCAAGGAGCCTAAAAGGAGACTACGATAATTGCGAGCCAAAGTGGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGG:1 - chr3L 9762315 5' + jockey 4766 1 73.29 ACGCGTTAACTATTTTTTAATATATGCCGCGGTGGTGTCGGGTAGCGGCAAGTCAATATATTATGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAG:1 + chr3R 12725531 5' - 297 6795 2 71.91 AGAGATCTTCAGACGCGTGCCAGTGGATCGAACTTTGAGCGGATATTCAAATGGCGCAGACGGGCCTCTTCACGTTGTTGATTACATCAATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 - chr2R 15942412 5' + opus 7144 4 61.64 ATCAGCAGGAGCGGCGTGGTTTTCGACGTTTTCGGACACATTTTCACTTTTTGATTTGCATGCACTTTAGTTTTGATTGGAAATTATGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chrX 10286954 5' - roo 9039 1 62.33 ATTTTAGTTATTGCAAGCAAAACGATTAATGCTTTAGGACAATTAGATGTTTTCCCCTTTTATTCCCCAATATCTATCGATACTCCAAAAAATATATATATTTTCCTGATCGTGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAATAGGTATC:1 - chr2L 21763448 5' + INE-1 541 1 61.64 AACTTCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr3R 19721210 5' - opus 7480 2 66.44 ATACTGCATTTTGCGTAAAACGTATACAACTTGTTCATAATTTATTTATTTAATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGC:1 + chr3L 16271896 5' + jockey 163 1 63.64 CCGACTATATTTGGGATTCCCTTGGTTGAAATTAATTTCCGCTAAATGTAGTACAAGGCTGCACCAATGGTGAGACCTAATAGTATCTCTACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAAAGTTAATTGTT:1 + chr2R 5110818 5' + mdg3 5186 1 61.64 ATGCGCATAAGCCTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 - chr2R 20739087 5' + hobo 66 1 67.39 GGTAGAGAATCAATTAGAAAGACCAAAAGCAAGCATTCCAAATAAAACCCTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACA:3 - chr3L 17207035 5' + I-element 4939 1 65.75 ATTTGAATGATATATATCGATTTTTAAGAATTTAACACACATTATAGAAACATAATACCAATTAAATAATTTGTACATTAGTTAATAAAATTATAGTGCCATCACTCGCGTTTATAATAATAATAAAAGAGAGAATACTATAGTCG:1 - chr2L 22130813 5' - INE-1 579 1 41.10 GGTCCCAAAGGTCCTAGTGTGGTGTGCAATTTCCTCAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr2R 4802954 5' + roo 83 2 79.45 AATACTGAGCTCACCCAACAAACGGGAACGCGAAAATGTGAATGTGGACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chrX 10806847 5' - P-element 2847 1 58.22 AAGGTAGTTGAGCATTTTGGGCTTATGCGGTATACTTTTGGAATTTTTTTATGGCTCAAAAAAATATATATAGAACTAAGAAATTGTCTCTACATTATAAGATATTGTCTCATCTATAGATGTAAAATTATTTATATGTTATATAT:1 - chr3R 11082012 5' - Tc1-2 1414 1 76.03 AAATTATAGTAGTAGCTTACACTACCAGTTCCCAAAAAAAAGTTGCTAAAAAAGTTTTTATGAATAAATTATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATC:1 + chrX 20795952 5' + jockey 4810 1 52.74 TTTGAAAGCAATTAAATATGAATTTTACATGAGCGTGCAAAGCCAACAAAAAAATACGTATCTACATATATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 - chr3L 15859715 5' - I-element 5305 1 56.85 GCACGTGTACCAAGTTGAGTAAAATACTCATTCATTTCCAAGGTAGTATTTAAACGTACATATAACCTATATTTTTAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGTGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr2R 25252129 5' - opus 472 2 58.78 AAGGGAATCGAGCGAATCACTCGCATCGCAATTAACGAATTGAATTGAAAGCCATGTGGAAATAGTTCGAAGCGATTTCATTTCGATTGATATTCAATTGCAATGACACACAACTAACTATTATTGACTATAGTAATTAT:1 - chr3L 16917140 5' + Doc 130 1 74.29 AGAGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTT:1 - chr3L 5179204 5' + P-element 94 1 21.23 AGTATTTGGCTTACAGTGTTGCAAATTAATTTAATTATAAATGCGTTCACTGTTTTATGCCTAAATATGCAGTTGAATATGCGGTTGAACTATTAATACGTAGGTGAATAATGGATCTACGGATAAAAATAATAATAATAATA:1 + chr2R 17436160 5' + mdg1 31 2 76.22 GATTTTTCATCAACGTTTCTTGGTTTTCCTGTGAAGTGCGTTGGAATTGAGTGCGTGACACGACAACAATGTACATGGAAGAGAAATAACCAAGACCTTTACTGGAGGACGATATCTACTGATATCGTCAGACTGGACACACTAAA:1 + chrX 9943574 5' + Chimpo 91 1 60.96 TCATAACAAATAACGATAACAAATTCCGAAAAACTCAATAACATAAGTTATCTTGTTATGACACCTCATAGACATATGTACATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 - chr3L 20209670 5' - Burdock 218 2 58.90 TGCAAAACTTAAGACGCAATAAATGATCGCAGCTGAATGAATTGGCAAAAGCCGGGCCATTCGACAAGGATATGGCCAACTAGGGTCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGACGCGTAACGGCCATAC:1 - chr2R 11163513 5' - 1360 3372 1 70.54 AATCACCATACTTCACAATCTTAAGTTGTATGCATAAGATACATGAAATCGCTTATATGTACATTCCAGAAATACAGGTGTAAATGGCGATTTTGCATACCAACTAAGTTCGTTTTTCCTATTTTTTTTTTTAATAATATATTATT:1 - chr2L 19461202 5' + hopper 163 1 62.33 TGCATTTTTTTAATTGGAACAATTATACCTAGTTTACTAAACGTACAACATTACATTAAGTTCTTCTTCTCCAGGTTGGGTTTCGTCACTCCGTACATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTT:1 - chr3R 11976630 5' - Transpac 481 1 57.69 AGTGAAAGCTTGGTTGAGCTGGGAAAACATTTAATATTATCTTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTA:1 - chr3L 13156817 5' + transib2 47 1 53.42 CCGAGAATGTGGGGCAGGGATTCAAGGATGCACTCGTACAAAAAAGTCCTTCTAAAGTACTCGATCTTCGAACATGCCGTATCTTTTCGACAAAAGAGGTCAATCACAAAGCTTTGTCCACTTCCTATTTCAACATAATTATGATC:1 - chr3R 5098517 5' + diver 5807 1 61.64 GCCACATGCGATGGAGTCCAGTTCCAAGACGGGGAATCGACCTGGCCGAAACCGCAATGCACTTTGACTAGCCGGATTCACCATATTACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 10461623 5' - roo 9046 1 66.43 GGCCATAAAATAGCTAGATTGTTTTCACCTGCTCTTAAAACGCTCTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 + chr3R 5264840 5' + P-element 73 1 34.27 CCACAAACCGCCCAAAACTGCCAATTTCTACCGATTTAGCATTCTCTCTGTCTTTTGTTAGAATCTTTTTTTATCATTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAATGTGTAGCTTAAAAGATATTATGGATTCTGTTCC:1 - chr3L 24159154 5' - G5A 2759 1 51.37 AGCTGTCGGTGCAGGAGGGTAAGTTGACATCCATGAGGTCCAGCTCGGGCGGGATTAATTTAGATTGTGGTCAAGTGAATGATGTGGTAGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr2L 18953154 5' + roo 32 2 63.70 ATATATCATTTCTATTTTACTTAAAATTTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACAT:1 + chr3R 9175188 5' + Juan 53 1 49.32 AAGTAACAGCTTGCATGCGTTTTTAAAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTAAAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATAT:1 + chr3L 20224108 5' - Chimpo 159 1 64.03 AGTTTTATATATATATTAAACTTTTACTTATTTTCGAAAATATTTGCATACGCCTACTGAAACCCCAATCAAACATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACAAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCAT:1 - chr2L 20556574 5' + invader3 5234 2 50.00 AACTTATATAGTACGAATGTTGATAGTTGTGTTCGCTGTGTGTTTTCTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 + chr3L 15859575 5' + I-element 21 1 70.55 GTTATCTATAAATATGAAACTGTTTAAACAGTGATTTTCTTATATATCTGATATATTTGAAATGTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 + chrX 20632558 5' - pogo 2046 1 57.53 GTCCCCCTGCTGACATAAAGCTGAAATGTACAACATTCTTCTTTGCGATATAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr3L 12861709 5' - pogo 2038 1 65.75 ATACTTCGTTCGCAAAATGTCTAAATATAATGGGTACAATATAGGTATCTAAAGAAGTGTTATAAATATTCCATAGATAATCCTTTAAAATTATCAAATATAAATTTATTTTATTTTAAATGTAAATGAAATAAATTATTTTTAAA:1 - chr2L 5080707 5' - FB 696 2 43.84 ACGAACGGGGGCAAGAAGTCCCAGCAGGGGAGTGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGCTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCAC:1 - chr3R 17210161 5' + HMS-Beagle2 6891 2 80.14 CACGCAGACGATCCTGTCCATTCACCACAACGTGATCTCGCAGAACAGCCGCATCAGCCTGACCTACAATGACCATCGATCGGTGGGGATTACTGCAAACTTAATAAGTTAAGTTGAATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 - chr2L 13690144 5' + Doc 8 1 76.92 GCTGCTCTTCTTTATATTTTTGATTTTTTGTCAGAGCATGGCGCGTGTGTGTGTTTGTTTTGGGACTGCTTCCTCTTCTTTAAATTTTTTTGTTTTATTTTTTGAATCATGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATA:1 + chrX 6981236 5' + 1360 342 1 74.66 AATGTTATGGCCAAACCAAATGCGCTGCAATTTTTGATAGTATATAAGGTAGGCCATTTAGCTTAAAGGATTAATGTTTGAAGTTCCTTAACTATTTTGTATTTAAACCAGATATGCAGAGCTGCCTTCCCTTCGATGGTTTAACG:1 - chr3L 2991532 5' + Burdock 5994 1 30.82 CTTTGCTTTCTTTTTTGTCAGCTTGCAAATTAAATTTAAATACCCGCATAGAGAAAGAGAAGTCTCGGCGAATGTGTGCGAGTGAGAGAGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr3L 5179290 5' + P-element 7 2 79.31 GGCGAGCAGTAGTGAGTCATTCCGAGGTTTTATATTATGACACTCCGCTTAAATGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCC:1 + chr3L 21167559 5' + roo 8830 2 63.01 CACCAAGTCATGGGTAACATACTCGCACAAATAGAGCCCCACGAGGGGCCAAAGGGTTAATGGCAGCATACGGAGCCCCCAAAAACAATGCAATCGAGATGCGGGGGCTGGCCGGGGGTGTACCAGAACAATATGGAATAATTATT:1 - chrX 4019419 5' - Doc 163 1 78.77 GACCACCCCATCCTTCGTACCCCGAAAAACTTCCCCACTGCAAACTGTTGCTAAATATTTAAGCCCAGTGGGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr2R 9623322 5' + I-element 24 1 61.40 GAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chr3L 13827409 5' + roo 8753 2 80.00 GAAAACATCTAAAAAAGAAAAGAGCAAAGAGCTGGGAATACCCTGAACAAAGGCAAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 + chrX 5366144 5' - pogo 2040 1 62.33 ACATATATATATATATATATAGTTTATATATGACTAAAGCTTAGGTATTTCGCAAGCCATGTATAAAGACTTATGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAG:1 - chr3L 16725554 5' + Bari1 49 1 48.63 GTTAATATTGTTTAACAATTTAAAGTTGAGCAGGATCAAAGAGTCTACAAAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2R 16510198 5' + roo 27 2 68.49 AGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATGATTTTTGAT:1 - chrX 1018144 5' + 1360 250 1 67.59 AGCGAACCTCTTGAAAGCGAAGTCTAATTAGGCAATGTCTCAAATGAAGGGAAATGGGAGCAGAGACTCAAGACTCAAGATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 + chr3L 16703759 5' + FB 17 1 68.33 CGCTTTCTATCTTGAAAAAAAATAATAGATACTTTTAAGGAGGGCAAACAATTTCAGGACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chr3R 31650308 5' - pogo 2039 1 58.90 AAGGGCTACCTAAGGAAAGAAGTTGGCCATCTGGCTGAGAATCCCGCTGCCCACAAGGATACCAATGATTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAG:1 - chr3R 29666906 5' + hobo 420 1 54.55 AATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3L 19574042 5' + 297 55 2 61.38 TCATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAA:1 - chr3L 15099680 5' + G4 3816 1 52.05 GTTGCCTCACAAAATCCGAGCATCAAAGGCCAATGAAAACTTGGACACAAATAGCTGACTTCACCGAGCATGCTTCTTACCAAGCTTTTAAAGTGTTCCCATTATTAGGAACCATTTATTTTATCATATTGCTAAGAAATTGGCAA:1 - chr3R 5596554 5' + 1360 3116 1 78.08 GCATGTTTAACTTTAAAACTTTATAGTATTCCCTGTATCGTGCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTC:1 - chr3R 904685 5' - 3S18 6025 2 70.55 CAAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACC:1 + chr3R 178120 5' + BS 79 1 76.43 CCAGTTCCTGTGGACAGATGCAGGCCATGCCCATTTCGGTGCAGACGATACCCTTGTTCCCCAATTCCAGAACATCGACAGAGCGACCTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:2 + chr2L 8396810 5' - roo 9039 1 63.01 CGAGCTTCGTTATTAGTTCCTTTAATTTCTCTGAGCTACGGGCTATACTTACATGAATCATTCATTTTCTTGGCTTTTGAGGGATTTGTAACTAACGCACTGTCAAATACCACTGGTTGGGCGCCAATTAGAAAAAGGGTTTGCCG:1 + chr2L 20925982 5' - gypsy2 333 1 60.96 GTAGAAATTGCTTAAACCATATACATATATGTACTAAAAGCTACGGGTCAAAAAATAAGAATAAGCTTTTAAGGCTTGCGAATGTGCAAAAAAAACTAAAGTGAACAGTTTAATAGAATAGAATAAAAAAAAAACTATAA:1 + chr2R 11793026 5' - Circe 75 1 27.14 CGTGTCACTTATATCTGAGTCTCGCCCTGAAACGATGTGAAAAGGAATTCCGATATTTATTAAAACTAAAACTACTAACATTATAAAAGCATAACAAAAAATCTTTTTCTAAAATGGGCCGATTTTGAAAAAGGTCAAATCGAAGG:1 + chr2R 25041901 5' + Tc3 466 1 57.53 CGCCACTCCGGCGCTAAACAACAAAAGGCAATTTGCAAAACAGTTGCTGCGAGGATGGCTGACGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATAT:1 - chrX 1759507 5' + opus 7275 2 56.85 GTTTAGGTATATGTCAAAATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGT:1 - chr3L 23940559 5' - Cr1a 4402 1 73.29 AGCTGGCATGGAATCACCACAAAATATCCAGCTGGTGAAATTCCTGACCAAATATTAATTTTTAACTGGGATAAGTCGCAATATTCAATCGATGTAGAGTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 - chrX 22676485 5' - 297 377 2 67.81 ATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 - chr3R 4532959 5' + 1360 60 1 66.17 AGAGGAAAATGCTTTGATCAACCAGGAAGTACAAAAGACGGAACATCCTCGAAAGAATAGGGTATATAAATTATCATTTTAGGAGTTTTTCCATATATTTAT:1 - chr3R 5430498 5' - Burdock 6378 2 60.78 CGAGTAATCTTGCCATTTGCACAACAAAATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGC:1 - chr3L 19335473 5' - invader4 302 2 67.81 AAAGTTCTCAAAACTTTTTAAACAATAATCAATAACCCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGA:1 - chr2L 13510911 5' + diver 5919 2 63.45 AAAAACTCCAATAAGAGCACGGCCACAGCAACAAGAACAACACCGCCCAGCTGCAGTGCAGACATCTAATTGGAAAAAACAACAACAAAGAGCAAAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 - chr3L 3339473 5' + Transpac 24 2 69.86 AGGAAAGCGCTTAATTAGGAATATGTTTATTAGGAAAGATCATAGATTAATTCGTACGATTACAAAGTTTCCATCGTCACTAATTTCGAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAA:1 + chr3R 6727245 5' + F-element 4328 1 58.90 CCATCACAAAAACAAATTTAATATTGTGATCTTGGGCAAAGGAAAAAGGCAGGGGAAAAGACTACTATATAAATATAAACAGTTGAGGCCCGGGCTGGGATTGTTGCTAGGTTTAAAGCCGGTACACCTGCGGACAAAATAGCTGA:1 - chr3R 31120661 5' + Bari1 446 1 51.37 CTAGAAAAGTCAATACAGCTAACGACATGACTATCTTGAACAAACTGTGTGACTTGGATATATTTGAGTTCTACTTATAGATTTTTATTAATTATACCCGTTACTGGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGACTCGTTGAAAAGAATG:1 - chr3R 25806473 5' + INE-1 11 1 57.24 AAATATATTTCGAAAATTAGCAATTCATCTTGCGATTGCCACTTACATAAATTAAGAACTTCCTGATTGCCGCATGCATTACACATTTCGCATAATGAGGACGATATCATTTTTCCGCCTGTTTTCTCACTCACTCTCTCGCTCTT:1 - chr2R 14793238 5' + Cr1a 289 1 54.11 TTCAATGATAATATAATCTTGCGGCCTTCTGTTTTCGTCTGCCGGCACTGTAGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTG:1 - chr3R 9193251 5' - opus 7440 2 63.01 TTTTTTTTTTCATTCTATTTGTGCTTTTTTAGCCTATCTTTATGTACTATTTGTTGTTTCTTACTTCCTGTTTTAATGGTTATATTGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAGAGGGGAGGTGT:1 + chr3R 25156350 5' + blood 6993 1 62.41 TTACATTTTAAGTTCTGAAATTACAATACAAAATTGAAATATCTTATTTCAGCGCTGCTGCAGTTGGAGGCAATTTTTCATGCGTATTAAGGGGGGGGGGGTGGGGGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACA:1 + chrX 2916616 5' - 412 7539 2 74.63 CGGGAAATTGTAAAGAAAATCGAAAAACGGAAAAGTTTTGGCCATTGACAAACGCATTAAGAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAG:1 + chrX 18737214 5' - I-element 5307 1 53.73 GGTTTTATGTTCTTTGATCGAAAAGAAAATAATCTCATCTGCATGTGGAACAAATAAACGATGAATGGATATGAACAATAAGAAGAATTAATACCACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chrX 19959935 5' + roo 18 2 72.66 CAGACGAAGATGAACCAAGGGAGAAAAGAGAGAACTTACAAAAGCACTTGAAAAAAAAGTAAACCTGAAAACCACCACAATAAAATTATTAGACAACATGTGCTGCGATCCTTGTAACGAAAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCAC:1 + chr3R 31956336 5' + gypsy12 10119 2 77.40 GCCCTTCCTTTCACCTACAAAACGGCCACGTCCACAATTTTACTCAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTAAGCAACGGGTATCTGATA:1 + chr2L 21580876 5' + INE-1 546 1 52.74 AATTTAGCGCGCAATAGCTTTCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTAC:1 - chr2R 16073024 5' + Burdock 56 2 60.96 AACAAAAAGTTCTCAAAACTTTTTAAACAATAATCAATAACCCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAG:1 - chr2L 13510916 5' + diver 5915 2 66.44 GTTTCTATCGCACTATCGATAACCTTGTGCATAGCCATCGTCAACAGTGACAGTCAATGGTTCTATCGATTGTTTGGCCGCACTAATAAATTCCATTTGCAAGCTGAACAGCATCACCGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACG:1 + chr2L 5278990 5' - Doc2-element 4347 1 73.29 AATAATTGCTGCTTAAATGTAATCGCCAGCCATCTGCAATCTTTTTAGCCAAAATTAAACCCTTTTCAACGTGTCTCTGATCTTTAATTTGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 + chr3L 17206880 5' - I-element 5323 1 63.01 GATTAATTGATGTTTTGATATTACACACTTGAGTTTCTATGTATCCTATGCTATTCCTGGTACATACATATGCGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 + chr3R 5430378 5' + Burdock 6183 2 52.74 ATCAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATAT:1 - chr2R 3760472 5' + accord 6928 2 73.29 TTGCATGCGACAAGCAGCTTGAACAGCGGGCGGATAAAAACACAGATCCAAGCAGATTTTCCTGCTTTTCACTGATTTCGTTTGAGCATTTTCTTTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr3L 18327045 5' + opus 20 2 67.12 AAAGAAAAGTTACGAAGACCCATTTGATTCGAACGCCAATTAGCTGAGGTACATTGGTTAATACGTTGGGTACTAAAGGAATTGCAAGAGGGTTTTTATTCGAGAGAGCCTGGAGCCAC:1 + chrX 4386835 5' - 1360 77 1 78.99 ACTAAATGTTGCCTTACTAAGCAACATATTGCAAAATATTAAGTATACGCCTTGTCTAACACTTAACAATTTGTTATAGTATGCATTTGCAACATAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:1 + chr3R 10136959 5' - I-element 5332 1 75.00 CTAATGCTGTACCAACATTTCACTTTATGTAATTATAAATTCCGAACAAACAATATCAAGTTATTCTCTTTCCTAGCATTGTCCTAGTTTAAACAGCGCGCTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGA:2 + chr3L 13156668 5' - transib2 2797 1 65.75 TGGAAAATGGCTTTATGAAGAGTTAAGTTTGATGATATAAATACATCGATTTGCATTCGTAGCTGCAATGCTACAATATTTAACTTGCTCATAAGAACCTTCAGCTTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTGTTATCTACCTACGT:1 + chr2L 13480073 5' + diver2 153 2 54.11 GCTAGACAGATTTTTGCCTGATTACGCGCAGCATTCACTCCTATTTCCCCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 25409693 5' + jockey 23 1 68.50 GAAAGAAAGGAATTTCTATATTAATAAATAGATGTAAAAACCTAAAAGAGCAAATATAGAACGTGCTATTGTCTTAAACCTTAAATATAGACAATATATGTATTTTAATTATTATAATTATTTTAATTATATAATTTAATTATTGT:1 - chr3L 15370366 5' + G4 3803 1 67.12 TTAATATGTTCAAGTAATGAGATCAAATGCGCAGAGATACAATTCATTCAACTTTGTCCGCCTAAAACCAAAAAATGCAAATGTCTGACATATATTTGCAAATTAGTAAATATATATTGTGGACGCCGAAAAATGAATATATGTGC:1 - chr3R 7806381 5' - invader3 270 2 53.42 ACACTCTCCTACCCTATCCTTCTTCCAGATATCAGCTATCTATCTATCTGCTATATGGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 22522726 5' - roo 355 2 56.72 ACTTTGTTTACGCAAAAAAAAAACCTTACATTAAATACTGTTTTACATATATCTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGT:1 - chr3R 11146445 5' - flea 4945 1 67.59 AAAGTAGCTTAATGACTTATTAGCCAAATTATGTAGAGCAGAATGGTTCGTAAGGAACACAAACTAGAAAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAG:1 - chrX 17262570 5' + X-element 4393 1 59.05 ACATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCCCACCGTGTCGATCTAAGGCAATTTGGTAACTCACGCAGCTGTACAAATTGAGTAGTGAAAATCATTATGAGTGACGCCGATATGGACGG:1 + chr2R 981788 5' + micropia 5401 2 55.20 ATTGCCTTAAACTATTTAGCTGAAATTACCCTTGTCAGTTTGATGTAAACAAATAATACGCTTTATGAACTAAAATTATGATATTTTACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chrX 3578211 5' + hobo 29 1 55.71 ATACGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCATCGTCAACTGTGAACGACCAACTTTTTTAATATCACAAAAAATACAGAAAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCC:1 - chr3L 10479975 5' + P-element 270 1 43.15 GGCCAATTTTTGCATTTTTTTTTTAGCTTTCTGTTTCCTAATGGTGGGCAACTGTCGATAGTCGCCGATTAACACATAGCACAAAAATACTAGAACACTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chrX 4540563 5' - 1360 3368 1 70.55 AGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTAC:1 - chr3R 29091376 5' + rover 7023 2 68.28 CGCACAAGCAAATAAGATGTAAAAAAAATTTTTTTTATGAGACTTAATAAGCTAAGCATAACGAATAGGTATTCGTTTGCATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGC:1 + chr2L 9074186 5' + flea 27 2 41.04 AATGCAAATGACGCCCACGAAACAAACTGGACGAGGCGACAGTCCGTCATTTGATAAATTCGCATAGAATGATTTTAATTAAAAACCTGTAAATCTCATCTCGCCGGTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGA:1 + chr3L 2744001 5' + 1360 216 1 74.47 CGGTAATTAACATCATGAAGGGCTTTAGATGGATGTGCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:2 - chr3L 6675371 5' + 412 84 2 74.66 GGGTTCTACTTTATTTTATTATTACGTTTTTTGGGTCTGGGTCTGCTACTCACATTTGCATATCAATTTGTTCGCATTCGTTCGTGTTATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGA:1 - chr3R 25409916 5' + jockey 4559 1 58.90 CTTATTTAAAAAAGTGGCGTCACATCCCAGTTTTGAGAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATA:1 - chr2L 10519599 5' + X-element 91 1 74.66 TTTGTGGTGAATCCCATTTGATTTGGTAATAAAACTACATCGAATTTTGAAGGGCGTGAACGAATAGCATGTAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 + chr2R 21029342 5' + Transpac 4960 2 52.86 TCCTTGCAATTTTGCTTCAATAGTTTACCACGAATGTGTGAAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 - chr3L 14040993 5' + 1360 49 1 52.05 AAGGGTATACAAGATTCCTTGAAAAGTATGTAACAGGCATAAGGAAGAGTTTCCGACTGTAGAAATTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCACGTCGATCCAGCCATGTTCATCTGTCCGTATGAACGTTGAGATAT:1 + chr2R 10974912 5' + INE-1 133 1 80.71 CAAAACAACGATTTCCACTTAAACAGCAAAACAGGAGCCACGAAAAAAAAGAGGGAAAACCAACCGCAGAAGTTAATCGAAAAACGCTAAACAAAGGCCACAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chr2L 14490066 5' - P-element 2865 1 71.92 ACCCTCCACATTTGACCCGGATCCCATTTGTTTTTCCTATGCATGGATGTGGTTGGGTGTTCCATACGATTGTCATAACGTTTTGGTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3L 9519520 5' + roo 35 2 57.53 CCGCTGTCGGTAGTTTCGTCCTTCCGTAAATGAGCGAAAGCAAGAGCAATGTTGCCCTGAAATATTTACTACCGCCCCCTCATTTGTGCCAGTGGAAGTGTATGTGTGTGTATTTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3R 24079918 5' - accord 189 2 72.44 GGGTCTGGGAAATGCATTTTCATTTTTCTTGATTTCGCGCATAAAATGCGCATAAGCCTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2R 20739132 5' + hobo 29 1 65.75 GCTGGATATATGTATAACATATAAAATAGAAGCAAAATGCATAAGTATCATTGTAGAAGATTTAATTTTAAACTTTAGGCATCTGTTAAGATTAGTTATAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr3R 8914209 5' + pogo 17 1 72.60 GGCGAGCGGTAGATGGGATCTCTAAGATTGGACGTAGCCGAGCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 - chr3L 14085006 5' - opus 486 2 75.36 ATTTTTAATGACTTTTAATTGACTTCAGGATGATAAGAGAGTTCATAAAGGCAAGCAAATATTCTGAATTTGGTGCAAGAGAATTGTATGTATTATAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:2 + chr2R 9868850 5' + roo 24 2 67.81 GGTGAGTTTGAAAGAGGGCAGACATGGAAAATAACACAAAATGCGAATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACAC:1 + chr3R 29091296 5' - rover 7233 2 65.00 GAATGGCATGTATCCTGAATACGCAGTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAG:1 - chrX 1018180 5' + 1360 218 1 69.18 TGTAAATGCAGTTTTCGATGCGAAACATACGTGATGGATTGAACAAATAAAGGTGATAAGCTATCAAAAAGTGAATTAAAGAGAGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTT:1 + chr3R 14580763 5' - accord 319 2 58.33 AAAAATGATAAATGCCTCGCTGCGCTCAAGTGAAAACAGCACGGGGAAGAAAATATATAAGTATATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACA:1 - chr3R 26432083 5' + Quasimodo 52 2 62.07 AAAACAATATGCAGAGCCATTGTAGGTGGGATAAAAACTTAATTTAAAATATATAAGTATTAACACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3L 21162015 5' - roo 9017 2 56.16 AATACACCGCCAAGCCAAAGCGGCTAAAAGGAGGAGAAAGGTGGAACGTAGAAAGGCGCCGAGCATGAGATAAAAACCAACGAACTATTGATAAAAATAGAAAACGAGCCATCATTGAAATAGCGGAGAT:1 - chr2L 21933881 5' + Bari1 1274 1 52.31 GTGAATCCAAATGGTCAAATAAATTCCAAGGTGCCAGTAAATCCAATGAAGCCAGTGAATTCAATGGAGGCAATGAATCTAACGGCGCAAATGAATGCAACGGGGAAATCAAATCGACGCACCTGGCATTCAAACCATTGACGCGC:1 + chrX 15479229 5' + HMS-Beagle2 6763 1 77.40 GTGAGGCATTAAAATTAAAGGTAACCACAGAGGAGAGAGGAAAATGCTTTGATCAACCAGGAAGTACAAAAGTCGGAACAGCCTCGAAAGAATTGGGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chr3R 5430533 5' - Burdock 6369 2 70.55 TAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATT:1 - chr2L 23295891 5' + micropia 5004 4 51.37 AAAATTCCAACAACATTATTTGCGCACGCATAAATGAATACCGAATAATGGACGTGCATAATGGAATCATTCTTCGTATACCCTGGAACAAATATATTCAAAGGAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2R 12813824 5' + roo 13 2 71.23 ATGCTTTTATACCCGTTACTCGTTAAATAATGTGGTATACTAGATTCTTTTATACCCGTTACTTGTTAAATAATATGGTATACTAGATTCGTTGTAGGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTGCGATCAGGATCAATAGCCGAGCCGT:1 + chr3L 16164927 5' + INE-1 94 1 64.38 CGAGCTCCCATTTCCCTGGGTGCCTCCCATTCGAGCCATAGAAATTGCTAACGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTT:1 - chr3L 18738172 5' - Bari1 1660 1 53.42 GGTCGGACGACTTCATTGGTGGAAAAGGCACTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGA:1 + chr2L 13717315 5' - P-element 2797 1 22.60 AATTCCTTGACGAATATAAGTCTCTCGGTCATTTGGAGTTGGTGCCTGCTGAACACATAGCCAGCTACAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3L 26291317 5' + 1360 53 1 51.37 TCCCACAGAAGTTTGTAACGAACCGCACTCCAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:1 + chrX 12003921 5' - P-element 2819 1 39.04 TTTGATCATTTTAATGGCTAGACACATTTAGTTGAACACTAGGCATGCAATGTATTGTAATATTTACAAGCATTTTGTTTATTCATATAAAATATGATATTCAATAAGTGCACGATTGCTTTGCTTTTTTAAAATTTTTTTTT:1 + chrX 8916548 5' + FB 171 1 58.74 AATTTTCAAAGTGTAGTCGAGCTAAAAGGGGGAAATTTCTTAAAAATAACGAAAAGAAACATATTGATTTCAATTTCGACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGATCTAAA:1 + chr2L 11734493 5' + Doc 48 1 52.74 ACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAG:1 - chr2L 14480509 5' - Transpac 232 2 73.94 AAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTGGGTGAGGACTTCCTTC:1 + chrX 21772497 5' - springer 7078 1 77.34 ATTATAAAAAGTGTGCTCCCATATGAATGCTTGGTCCAAATAATTAAAAAAAGGGAATGCTATAGTCAAGTTCCATGACTATCATCAGATACCTGTTACTCTAGTGGAAATGCGGAAATGGAAATTGCACAATTTTTCTGGGTTAT:1 - chr2L 21234189 5' - INE-1 508 1 69.86 GTCACTGGGTCCACCTTAAAAGAGCGTAAAGAAAACTACACACACACACACATCCGCATGTACACACGCACACGCACACGCACACACATGCATGCGCTTTACGGCCATAAATTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGA:1 - chrX 19818557 5' + jockey 4772 1 78.08 GTTCAGGGTTCAAAGATCTGTTCGTGATTTCCACACGCAATCCGAAAAGTATACTAGGGAAAATGCGCAGAGGAAAAGCTTTTTTTATCAATGATATATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACC:1 + chr3L 18554556 5' + jockey 4583 1 66.44 GGACGAGAAGTTTGGCCGAAGACCAAAACAAAAGGACAGTACATCGCTGGACGGCATGTTAATTTGTTAGCTTGTTGAGTTGCTAACCAGGATCCGATCCGAGGGAGGGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3R 10461798 5' + roo 13 2 74.13 CCGTGCACAGAAATAACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAG:1 + chr2L 21325076 5' - invader4 3041 2 76.55 TCACACATACAGCTGTAGGAAAACAGTGCGTTTCATAAGCTTAAGTAAGAGCTTAGATATGGATCGGAAATGCTTGTCAGCAAACTATTTTCATTGTTCAAAGTAGGTATAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGAAGAGTCATCAG:1 + chr2R 22905035 5' - invader1 407 1 51.03 AGCCGAGCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chr3L 14084971 5' - opus 484 2 66.67 TGATAAATGGATATGAAAATACTTATCTTAGAGTAGTCGTTTGTAGTCTTTAATATGTGGTCAAACAATTTTCTTAAATATTTTCGTTTTAGGCATCTAATAGAGGTTAAAAAGATTTTTGAGATTGGGGTCCTCCAACCCTATTT:2 - chr3L 8523671 5' - Transib5 2859 1 55.48 ACAACAGCCACAACAATGTATGGCCAGAGCATGACTCGGATGTGCCTGGTGATGGGTTTTCTCTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACT:1 - chr3L 3858789 5' - jockey 4960 1 51.26 AGACGCGCTCCATTGTTTCCGCATTCGATTAAAAATGATAAATGCCTCGCTGCGCTCAAGTGAAAACAGCACGGGGAAGAAAATATATAAGTATATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 - chr3R 26432113 5' + Quasimodo 19 2 73.29 TCATGATAATCAAATGCAATTTTGCGTAATGAAATATTTGTAGATAAACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGTGTAAAATACATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATC:1 - chrX 21575370 5' + INE-1 96 1 57.64 GGCCAAGTTATAACGCTTTACTTTTTAGACCCTTGCAGAAGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGCCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1 + chr3R 5477964 5' - 297 343 2 64.71 CAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr3R 27188604 5' - roo 320 2 75.34 CACCTTTTTGGTATCCAGTTTTTTGTTCTCCTTTTCGTCTTCCTCCTCCTCTCCATCCTTGATATCATCTCCCTCCTCGTCCTCACTAGCGTCGTCATGCCAATCGTTTGTTTAAAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCT:1 + chr2R 8205381 5' + Idefix 200 2 63.01 TTAAGTTGTATTTTTTAGTTAAATATATTTTTTTTAAATTGAAAGTTGCAGAGGAATTTCTTGTACGAATTATATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chrX 22676322 5' + 297 6625 2 52.41 TGAGAAGATACCCTAATTTTTCTATATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2L 5447872 5' - roo 9019 2 58.62 CTACAAAGGGAAATGGGTGGTGGGGAGGGGGTGGGTGGACGGGAGCGAAGGAGTGGAACAAACTGCATTCATGGCATCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCG:1 - chr2L 20943126 5' + Burdock 48 2 63.71 AACAACTGAAGTTGCTCAATTTAAAAGCTGTGCAAAAAAATCACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGACGCATAC:1 + chrX 10128138 5' + invader3 30 4 59.59 CTTGCAGTCGAAGTTGTCGACGAATGCATCCTCAAACACGGACAAAATGTCCTTGTATTGGTATTGATGCTCCCCAGTTTCAAAATCCATATTCGCATTACCTACATATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr2R 17021469 5' + pogo 9 1 75.34 GCTGTGGGCACAGTCCGTCCGGTCAGTTGAAAGCCCGATTCACGACTGAACGGTCGGACGACTTCATTGGTGGAAAAGGCACTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTATCGAATGCTTG:1 + chr2L 13717264 5' - P-element 2848 1 56.16 ACTGTCGCTTTTGTTAAATGCGCCAAAGGGGCGAATAGAAATTGCAACTTACTGTTATTGAAATCAAATACGTTGACCCAACTCCTGTGTCCTGAGTCGGCGTAGGTGTTCGCTCTGTCACATTTTTTGCCACTCGACTCACACTC:1 + chrX 22765773 5' + hobo 25 1 44.52 ATGTTGCAACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3L 16463511 5' + roo 81 2 73.97 GTATGCTACAAACTTTTCGAAATGCTTATGGATTTTATTAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:2 + chrX 9508117 5' + jockey 4758 1 75.34 GCGAGAGGACGCGAGGATTAGAAGGGCAGCTGGAAAGCTTTAAAAAAAAATGCGATGCAGGATTACAGCTGTTCGGGCTTGTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chrX 7967315 5' - P-element 2882 2 75.68 CAAATCGAGCAGGCCAAAAAGCCGCCTATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTTTGTAAGAAACTAACT:1 + chr2R 9504180 5' - roo 9038 1 59.59 ACAAATGCAATTAAATGGTTAAAACATTTTTTTTTCTTTTTAATAATCTTTTTTTTCTTCTGCTTAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr2R 12239724 5' + roo 54 2 58.90 AGCCTCCGCAGGACTCAAGTTCGAAGCACACTGAGATAAATCATACTCAAGTTACATTATTGATTATCATTATTGTTATTCTTGATGCAAAAAAAACTACTTCAAAGTTTTCATTATATTAATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTT:1 - chr3R 25821064 5' + Cr1a 4343 1 64.83 AGGCATTAAAATTAAAGGTAACCACAGAGGAGAGAGGAAAATGCTTTGATCAACCAGGAAGTACAAAAGTCGGAACAGCCTCGAAAGAATTGGGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1 - chr3R 5430530 5' - Burdock 6366 2 68.49 AATATTGTATGTACGTTTTATTAATTTCATTATTATAAAAAAAAGTTACGAATGTCGATTTATTTAGGCGTAGGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGC:1 + chr3R 25718177 5' + I-element 4991 1 50.37 CATTTTAAATAAAAATGCGCAGCTTCCGCGGCGCTGCGATAGATGGCGCCAAACGGAGGTTGGCCTAGTGCGAAGGAAAACTTTAAGTAGATAGTAGCATATGTGCCATAGTATA:1 + chrX 20636905 5' + Quasimodo 2 2 75.65 TACGACAAACTTCCTCACCGACATCGGGCATCAATTTGGTACAGGCTCATCTTTTGTCGCTTGAAGTCCGCAAGGAATTCCGTATTCATTCTGACATGCACTGTATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTGT:1 - chr2R 12814984 5' + opus 5 2 77.14 CGACGTGTAAATGGTTTTAATTGAGCCCGAAACGAGTCTGAAACGAAATGGAATTAGGCAAATCTGCTTGTCGACTGAATGGGTATGGTTTTGGTTAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 - chr2L 1277942 5' - I-element 5333 1 69.18 GTTGGTACATGTATGATAGAATTGCTTCTATATGATAGAAGACAAATACTAAAGTACAAAAAAAAAATGTTTATAATCGCACCTAAAGATCCTGATCAAGAATAT:1 - chr2L 21761636 5' - INE-1 84 1 75.24 ACTATAAATAAAGAGCGAAAGGCTAAACCGTAAATAGGCTTGGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2L 7449709 5' + roo 78 2 73.97 AATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCT:1 + chr3L 25482895 5' + accord 6914 2 65.28 CACTGGCTTTGGGCGTTTGATTCTCGACGCTTAGCGCTCGGAATTCAGTGCTCAGTTCAGTAGGTGACACCATTGCGCTTAGGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3R 18518058 5' - roo 9033 1 56.85 ACCTAGATTTCTATATGGAAAACACAGTAAGATTATAATTAGATAAACATTTTTTGTATAAAACTTACCATCTAAAAACCCGTTACTCGTAGATTAAGTGGTTATACTAGATTCGTTCAAATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTC:1 - chr2L 22009794 5' + INE-1 34 1 47.26 CTGATCCCACAGCGCCTTCGTCTCCAGCACCACAATGGCCTGGGCCAGCGATGGATGCACTGGCTCCGATTCCTTAATTATCAATTGGAATTAAGCACAAAGTGTATAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTA:1 + chrX 8451744 5' + Doc 125 1 62.07 GACCCCCAGCTGATTTCTGCGGTTAAAGTGCGAGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGTTATGGTGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTTCAATAAAGA:1 + chrX 5206473 5' - Tirant 310 2 73.97 AGCTAGGCTACCGAAAAGTTTCCCTCCCGTCTGACACACATTAATCAGCCTAAGAAAACTGTCGGTTGGCACTAATGAAGTTTCCTAACAAGATTATGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCGAGATGAA:1 - chr3L 6460997 5' - 1360 421 1 72.31 GATTGAAAGGTTTTCTTCATCAATATCCCATGCAGCTACTTACTCCTTATTGAAATGATAATATAGCCCAGTGATGTTTAAGATTGGAAAATGGTGCAAAAACAACCACTGTGCGAAGTGGCATTTAAGGACATTCAAAAAACCCT:1 + chrX 4896638 5' + HB 424 1 69.86 TGCAGCCGGAGAAGATATTTGAAAATCAAAGCGAAAGTTCTCAGCTTTTGTCTGTCCGCAGGACTCATCCTTCCACGGCAAACTTTGCTTAGCTACATCTATCTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCA:1 + chrX 12214417 5' + opus 11 2 75.17 AGTTCGATTTCAGTTCGGATAGTACTAGTTAATCTGTCATCCTTAAATTGCCCACTTAAGGCTGATCATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - chr2R 5269076 5' - pogo 2050 1 56.16 AATCTCTAGCTTGACACTGTGACTTTGTTTCCTAACCATTTGTGTATCTGAAAGATACAGCTCAACTATCCCCATCCTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAACAAAAATTCGTCCTCACACA:1 + chr2L 3672469 5' - P-element 97 1 52.74 ATTTGAAATCTTGAAAAATATTAAAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr2R 22012167 5' + opus 150 4 76.92 TATTAAACTATCCCTAAAGTTTATGAAAGAAATACTTTTCCCAAGTGCTTTCAGTTCCATGTGCGAACTCAATATACAAAAACTGAATGAAAACATGAGTAAAAGCCTGATACATTTGGGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 - chr3R 28848036 5' + P-element 103 1 78.08 ACGGAGGAAGGTCTTTTAGAAATGCTTGTTAATAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chrX 11267723 5' + roo 80 2 76.98 ACAAAAAAAAATAAAAAAAAGAAACCCAAATATTTGCCATAATCAAATAAGCTAGAAAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chrX 19398848 5' + roo 58 2 61.43 GGAAAACATTTAATATTATCTTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAA:1 - chr3L 13156796 5' + transib2 68 1 67.12 TAAAGTTAAAATTTTATATAGAATATATTTTAATTTGTTCATATTAACAATTTAATTTTTAATTAATAAATTAACAATCTGCATATTTGACAATGGCATTACACACGCACACACACACACACACACATTTA:1 + chr3R 12630478 5' + accord 186 2 58.78 TATAGGAATATTGGCACTTGTATATATCTGAACATGTTCTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chr3L 19573995 5' + 297 9 2 78.77 AAACTTATACCATCAGAGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3L 12861815 5' + pogo 50 1 57.55 GTATAATTGGCAAATATTTTATTAATAAACAGCCACACAACAAGTTAAGTAGATCGTGTTAAATTGCCCGTTCGAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTT:1 + chr2L 5798249 5' + FB 48 1 51.37 CGCAACAGTGCACTGAAAGAAAAGGGAAAACTCACTCTTACACATATATACATATGTATAAAATATTTAGTTACTAAACGAGGAAGCTTAAGATTAAATAAAGCATTTGTAAAATCCCACATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 12609949 5' - roo 391 2 72.60 ATGGGCACTCGAAGAAATCTTGCCCACTTTTATAGTATAATTAAATTAAAATTACATAGTAATAAATGTTCAATACTACATTTAAATGATATATAAATATATCATTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATT:1 - chr3L 17162433 5' - Stalker2 7633 2 68.49 GGTGGGTCATTCTGAACTGGTTTTGATAATTGGAAAAATCCCGAATGTGACTAGAAATTTGATTACATTAAAGTACAAAAAATACGAATAGTAAGTAAAAAGGAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCT:1 + chr3R 5024770 5' + diver 5905 2 75.86 ATAAAGAAATCGAACGCCAAAGGCTAGCTAAATGAATAAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTCAC:1 - chr3L 20388254 5' + 1360 29 1 65.75 GTCGCGGATAGTGGATCCCTTAATAAATTAAAAGCAATAGAAAATGAAGTGACTATTTATATGCTCCATAAAATATTCATAGTTTAGGCTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTA:1 + chr3R 5316516 5' + Juan 4059 1 62.33 CTGCACTGCGAGAAAATCATTGTTTTGACCTTAGCACAACGCACGTATTTCGCTGACTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 24976180 5' - roo 9036 1 58.90 TGATTTAAGTGTAACTTATAATTAGATATAGAATTAACTCCATGCGTTTTGCCATTAGTTGAACTAGTACACTTTGTTTTAAGCTAATACCATATAATCGTAGATAAAAATATATACTTCTTATTTTTTTCTTTAAAAAACTGCAA:1 + chr3L 9761422 5' - flea 312 1 63.01 ATGACAAAATGACTGCTTTCGCGGGGGCGGGAAATTGTAAAGAAAATCGAAAAACGGAAAAGTTTTGGCCATTGACAAACGCATTAAGAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 + chrX 18737187 5' - I-element 5322 1 62.33 GGGGGTTAGGTGGTGTTGGGAAAGGTTGAGGCATTCCCAATTCGAGGTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACA:1 - chr2R 13193856 5' - BS 5040 1 61.60 AAAACCAGTTCCCACAAAGGAAATGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAATTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGG:1 + chr3R 10361882 5' - roo 313 2 82.19 TTTACTAGTTGACACCGCATCCGTTAATTACACAAGCGAATAACAGAATCTTGTGGAATACCTGTGCCGACGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2R 18440390 5' + P-element 27 1 62.10 TTGTTGAATAAATAACTTAAGTTTAAATACAATATTTGTTTAATTACGTACGGGCCTACTGCTGTGCTCACTTATATTTAGATAAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr3R 21706364 5' + I-element 36 1 59.59 TAATGGCAGTAATGACCTGCTTTTCGCTTTTCCAACTGCAACATCAGCAAAGCTCACAGAGCAACAATACCAACTGAAACTGATGCGATTTTGATGATGCTGGGAAAAAGACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACG:1 - chr2R 11328030 5' + jockey 138 1 79.45 ACTGACACTTCTGAAAACAATCGCGATTTCAGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3L 21162094 5' + roo 89 2 80.82 CATAAAAAGTATTAAGACACAAGTAATAAGAAAACTCTTTATATCCTTACCTGAAAGTAAAGAAAGGTAAAAAGAATAAGTTTATATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chrX 3767703 5' + I-element 36 1 62.33 GCACGGAGATCGAGTTGGGAAGTCCCTGGTTCAGCTGCTGCTGGGCGGCGGAGATGAGCGGATTGCCGGTGGTGGCATTTATGGATTTAGAATACATAGTTACATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTAGCATAAACAATAATGT:1 + chr3L 3767383 5' + gypsy11 103 2 58.22 AAATCGCATTTCAAAGTTAATTTACCCTAAAATGCAGATCCTATCGCGGTAATTCCAGCATGTTGCAACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3L 16463452 5' + roo 12 2 73.53 CAAAAAAATCACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCAT:2 + chrX 10128172 5' + invader3 5260 2 56.85 TGGCTAAGTTCGACTTTTGCTTTATGGTAATAAACTTTTTATGGCAAGTTTGAGTTCTGAACTTCGAAGAACTTCAAAGAAGGCTTAAAAATATATGTTCTTAATTTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr3R 29622798 5' + pogo 6 1 67.86 AGTCTTACAGATTTGTTGATAAATACAAATCTTTAAAAATGAATTATACTTATAGGCGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3L 13472357 5' + jockey 20 1 76.39 GGTAGCAGTAGTTTCTGGCATTTGCCAGTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATCTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2L 11867437 5' + jockey 14 1 78.77 AGATAAATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAG:1 + chr2L 14480446 5' + Transpac 4998 2 73.29 AAAAACTACGATTCACTTTGTTGAGGCAAATTCGCATGCACAATCTACCGTTAACTATGCTACTGCATGGTACCTACCACAACCCTGCCGTGAGTGTGTGTTCTTTTTTTCTTTTTGTTGCCTATCCAATGTTTA:1 + chr3L 26663078 5' - invader3 5000 1 68.89 TAACGACAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 14494118 5' - roo 9018 2 56.16 CAACAACGTTGGCTTACTTGCTTTGCCTCCAGCAAATGGTAGCTCTATAGTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTCAATAGGTGACAT:1 + chr3L 10442824 5' - roo 9002 2 66.21 TTTGGTTCGTTGGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGAT:1 + chr3R 6411970 5' - Tirant 380 2 56.99 CCCACAATTTTGAGAAACATTTTATGTTTGTTTTTGGTTACTTTTTTGTTGGTACAAACAATGAGTTAAAATATCTTTCTAGTAATTCTACTAGTTGAGTAGTTGGTATCTGATAGTCGAGAAAATCGACT:1 + chr3L 14070448 5' + INE-1 562 1 53.44 AGCGGCTGCTAAAAAGTCAAGCTCCAATTTGGGCATCACTGAAACTCATGTTCCCGAGAAAAGCTAACCGTTGAGAAAGGCACTTATAAAATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATT:1 - chr2L 16509030 5' - invader4 298 2 68.49 AAATTGGGTCGCTGTATTATTAAACAACTCAGATAGCAAAGTTAACATATACCGATATTAAGACACCAATATTCACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chrX 15565620 5' - transib2 2779 1 53.42 CGGGTTTCGAGTGTTTCGGAAAAATCTAATTTTCCGTATCCGCAGCGTTCAAATATGGTGATTTAAGGCCCAACAAATTTATGAATTTTATAATACTAAACGAAAAAAAACACTATAATAAACTTTAAAAATATATTAG:1 + chr3L 13922386 5' - hopper 172 1 89.21 GAATTTTGTACGCAAACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAG:1 - chr2L 21250989 5' + P-element 226 1 14.38 TTGCCATTTGCACAACAAAATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTACCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGT:1 - chr3L 19335464 5' - invader4 294 2 60.69 AAAAAGAAAAACCCCAAAAAACAAACTAAAAGCTGGAAAAACTCCTTAAAGCCTAGCCGTTAATGAAAATTCAAGAAGCTCGGACTGCCAATCCAAAAAACAGAAATATTAGATTTCAATAAACCAAATTATTAGAATCTAAGAGC:1 - chr3L 3401506 5' + Idefix 7125 2 54.11 GGTCACCTAACCGACATCGAATCGTTCGATATGCCCCGTGCCCAGACACAAAAATATTTATTTTCAATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTA:1 + chr3L 18034504 5' + Transpac 4930 2 76.39 TTTAAATATCTATCTCTGTATATTTTTATAACCATTACTCGTAGATTCTGTATAAAGTGTATATATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATG:1 + chrX 15408708 5' + INE-1 505 1 68.06 AGACGGATCATATTTAATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGAGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCC:1 - chr2R 4270290 5' + gypsy9 31 2 53.42 AAGAATAACTCTTAAGCTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATTCTTTAGTTGTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAA:1 + chr3R 5453635 5' + I-element 65 1 62.33 AATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 - chr3R 6412035 5' + Tirant 51 2 70.37 AAGTCGATTATTGCACAGCCGTCGGGTAAATTGTAAAAAAGAGGCCAAGTTATAACGCTTTACTTTTTAGACCCTTGCAGAAGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCCGTTG:1 + chr3R 5477922 5' - 297 6947 2 65.22 AGAATTGTGCAAATAACGACGTAAGTGTACGCAGCAATATGGCTGGGAATTTATGTATTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATT:1 + chr3L 19335339 5' + invader4 50 2 59.23 AGCCGTCCACTTTCATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1 + chr3L 15276633 5' - hopper 1351 1 61.64 AGTAGGAAAACAAAATCGCACTACGATGTCGTAAACAATTTTCAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTGTGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGG:1 - chrX 22834618 5' - Tirant 253 2 40.32 GTTCGGTTCTTCGTTCTTTTGGCCAACGACACCTGCAGACTAATTAATGGCAAATTCCAGGCACATCACTTCGATGTTCATATATGACTGGCGCACACCTTCTTCAGCGTGTAAGTTAACAACTAGCAATGTATTGCTTCGTAGCA:1 + chr3L 20176693 5' + gypsy 12 2 73.97 ACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTGTTTCGCCGTGGCTCCAGAGGTGGCTCCAGGCCCTCTCGAATTTTTGTTTCTACGCATACAGTGATAG:1 + chr2L 22719615 5' + 1360 145 1 71.33 ATTTTTTCAAGTTTAAAACTTCCGATAGTCCAAAACAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGAC:1 - chr3R 30854484 5' + I-element 4907 1 79.45 AAAGTAATACAAATAAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTT:1 - chrX 10128294 5' - invader3 5426 2 52.24 GGGCACGTGTACCAAGTTGAGTAAAATACTCATTCATTTCCAAGGTAGTATTTAAACGTACATATAACCTATATTTTTAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr2R 25252127 5' - opus 459 2 54.11 ATAATTATGTTAGGCCTATTATGTTTAAATTATGATATCCTGAATTCGTAATTTTCTATGATATGTAAATTCAAAAACTAATAAAATAACTATGCCCGATTTACATTCCTAATATGGATTACCTAATTAAACTATTAACTTATTAG:1 - chr2L 20862726 5' + Porto1 4550 1 60.96 GTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGAGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGACCTGTATGGGCTCCGTGGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTT:1 - chr3L 16047625 5' + Cr1a 489 1 44.36 GATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTTCTTGGT:1 - chr3L 13228531 5' + P-element 63 1 29.41 CATCCCAAATTATGCACACCGTTTATTATTAAAATCAATTTGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCC:1 + chr3R 17210024 5' - HMS-Beagle2 231 2 71.23 GTACGATAAACTGAATGTATAGTATATACATACTAGTTCTGCAAAAAATATTTTCAAAATCGTTATTAAATTTTGAAATTGATATCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr2R 8687934 5' - roo 9035 1 60.27 AAACTGCAAGCGAAATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chr3L 4933829 5' + blood 7043 2 53.97 AACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACAGCA:1 - chr2L 20324192 5' + Tirant 66 2 69.77 GGCTTGACACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGTGGGAAAAGCAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chrX 19113573 5' + 412 60 2 56.85 TATGGAAAAGTACCTTAGCTCGTTTCATACTAAAATCCTAGAAATATAATGACAAATTGTTTGCTTAGAACCTTATCAAAGGAAATGATTAGAATACTCACGAATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCG:1 + chr2L 7939691 5' + Burdock 15 2 71.23 AGTGTACAATCGTATGTGGTAGGCGTATCGTTCTTAAAAATATTGTATGTACGTTTTATTAATTTCATTATTATAAAAAAAAGTTACGAATGTCGATTTATTTAGGCGTAGGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTAC:1 + chr3R 25718139 5' + I-element 4964 1 71.23 GAGAGCACGGGGCGGATGGCCGAATGGCCTGAGATCTCCCGGGGAGATCCAGGCGAGCACTTGAACTAAATCCGGTAGCTTAAAAGATATTATGGATTTTTTCCTTAATTATAGTGTAT:1 + chrX 2438508 5' - G5A 2744 1 68.91 GCTGGCACGTGAATGCCATCGAATGCGTCGGAAGGTGCTGGCCGGGAACCAAATGTCAGCACGGCATCCGGGGCCATAAATCAGGCCATTTTGTAGCACTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAG:1 - chr3L 11941320 5' + roo 129 2 68.49 ACGGGAGCAAAACACGTTTAATTCCCGACTGGCGACGCCTGTCGTGCGGAAAGGTCCTAATGGGACGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3R 19639727 5' + 412 41 2 53.85 GGACGGGTTTAATTAATTTTTGTAAATGAGTTTCCAATTCAAAGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3L 18658219 5' + roo 77 2 73.97 GAGAATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGATTCTGACCATATTAAGTATATATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTA:2 - chr2R 8568837 5' + mdg3 5289 2 50.00 GCACGATCGTGTTCTTTTTTTTCTAAAATGAAAACAAATGCAATTAAATGGTTAAAACATTTTTTTTTCTTTTTAATAATCTTTTTTTTCTTCTGCTTAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2R 12239689 5' + roo 21 2 70.55 CAATGGGTATTATTAAAATTATTCTTTCCATATCAATATATCTTATCATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 - chr2R 25252236 5' + opus 7176 4 67.65 ATCAATACAAATGCATTTTTTAGTAAACAGATACAGAGATGTAAAAACATGTTTGATAATTCTGTAAACTCACCTTTTCATATCCCACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGGTTTTTTTACAAAAATTAAT:1 + chr2R 16496538 5' + hopper 20 1 63.16 TATTTCTAAATGAAGTTGGGTTGAACATCAAAGTTTCAGAAGGAGCAGTTCTATAAATATTTGAAAGTTACTCTTAATTATCAGTAGATATCACTAGATATATAATCGAAAAAATAGTTTAGTTAAGAAAATTATCCTAATATCTT:1 - chr2L 12331955 5' - Transib-N1_DM 58 1 57.53 TTTTAATGGCATAAAACATTTATGTATGGTGGCGTACATAAATCGTATTTTAGTAGCTTAATCATTTTGTTGCGTATACTTTCAATTACTTTTACAGTTACAATTACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:1 + chr3R 12000911 5' + FB 15 1 63.19 ATAAAAAAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3L 18792415 5' - roo 343 2 63.01 GAATATTGATAAGTTTGAGTGGCTGTTTAATTTTACATCTGGCTAACTATGATTATCTAATTTTCCAGACTGCATTCAACTGCTGCAGTAATCGATGTGTTGGTGATGAGCAGAACGGGCTAAAATGTTAGAAATGAATTTTAA:1 + chr3L 19182352 5' - FB 974 2 61.11 ATGAGTGTGAGGCGTTTGTAGATTGCATAATTATGCTAATTTTGTTGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTGTTTCACAAGTATGCAAATATGC:1 - chr2R 16496685 5' - hopper2 1565 1 53.10 AAGGAAGAATTTAATCTTACCAACTATTCTGAAATAATTATTAGAGCCGCAAAAGAATTCAATCAGAGTATCCATTCAACAACAAACCAAATACCGTACTACTTGTTGAACCTATCACATGGCGACCGTGACA:1 + chr3R 3483366 5' + Stalker 400 5 71.43 AAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - chrX 16217545 5' - P-element 2842 1 54.79 CAGCGTTCTGAACTCGCGTTAGGTTTCTAGAATAGCCCCGGTCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCCTGATCGACGTGGCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr3L 14551280 5' - P-element 2870 1 68.07 ATAGTTGGGGTTACAGTGGGACGTCTTCGCAACTTAAAACTGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGTTAAACACTCGGGACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGA:1 + chr2L 11613231 5' - hobo 2881 1 65.60 AACCAAATACTTAGGAGGAAATAATGGACAAATTTATAGGAGAATGTCTACAAAAACTGCGCATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCACTCCAACC:1 + chr2R 2880045 5' - Transib5 2865 1 48.55 GAAAACAATGGAAGTGCAGCCCCAAAAGTAGGCAACGCTTTTCACTCGAATCTGCTCCGTGTATTTGTTATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAA:1 + chr3R 15168879 5' - jockey 4942 1 53.96 AAGAAGTCCCAGCAGGGGAGTGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTC:1 - chr3R 17210149 5' + HMS-Beagle2 6903 2 71.92 TGGGGGCATAGACTTAGAAGAAGAAGAAAAAGAGCCAGACGAAATTTCACACATTTGTTTATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATT:1 + chr3L 3756145 5' + BS 5058 1 60.96 AATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 - chr3R 10636196 5' + blood 7053 2 52.80 TATAAATATCTTATAATTTATATGGCCAATTACTAAAATCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chrX 11267779 5' - roo 8991 2 80.82 GCAAATCCTATCAGATGTCAATGTAATTAAACAAAAGTGAAAGATAGAAGATGGATGTTTTTATCCATCTGGAAGTTATGTTTCAATTATTAATTTAAGGCAAGTTTTATCCGTTCATTTTTATAGTTCCTGAGATCGAGACGTTC:1 - chrX 6137063 5' - INE-1 141 1 76.71 ATACTTTTCTTGGCCTAATACATAGCGATTCGTTACAGTTGACAAGAAACTATGCCGTTTGTGGTGTTTCCGCCATTAAATGTCCGTTTCATAAACTAAATAAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATC:1 - chr3R 23433758 5' + F-element 129 1 60.96 CAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3L 23146463 5' + 1360 53 1 52.74 AATCATTACATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCC:1 - chr3R 934292 5' - Rt1b 4741 1 61.64 CATCCGTTAATTACACAAGCGAATAACAGAATCTTGTGGAATACCTGTGCCGACGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr2R 18440407 5' + P-element 30 1 54.55 GTCGCTGTATTATTAAACAACTCAGATAGCAAAGTTAACATATACCGATATTAAGACACCAATATTCACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACAT:1 - 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chr2L 9347582 5' - opus 446 2 54.79 AATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCAT:1 - chr3L 12861789 5' + pogo 83 1 76.03 CAGGAGTTTCAAAATTTTCCCAACCAGATTGTAGGCTAATTTATAAAATAAGCTACAACACAAGCAAAACATTTACCACCTGGTCCTGATCCGCACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGAG:1 + chr3R 18001766 5' + Chouto 450 1 52.59 CAGAAAAATTGAATTATGCGCTTGCGGTGCTTCTTTCGAACCCATGGAACCCCTGGAACCCCTGAAAACCCTGGAGCTGCCTCTGCCTTTCTACCTTTAGCTGTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCT:1 - chr2L 19103864 5' - roo 477 1 61.64 AGGTAAGTCACCAACAAGCTCTTATAAATATGATTTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chr3R 11978322 5' - Transpac 5163 2 76.92 CTTGGGTTCGGTGCCACTAAACCCACAGAAGGGCTGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCAC:1 - chr2R 10406339 5' + FB 88 1 76.71 ATTGTCATGCGAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1 - chr2L 19643592 5' + hobo 83 1 76.71 TTCTGCGTTTAGCTGGAAATTGCAATGCACTTTTAATTCAACTTGATGCAGCTCGAACAGAAAAAACGCAAAAAGCAATAAAA:1 + chr3R 30296956 5' + Bari2 915 1 49.40 TAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCG:1 - chr3L 3565393 5' + gypsy 72 2 70.00 AAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAA:1 - chr2L 18178350 5' + Tirant 8166 2 67.74 TATGTGAAAGTGAGAGGAAGGTAACACAGGTCCTGAATGGACGGGTTTAATTAATTTTTGTAAATGAGTTTCCAATTCAAAGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATATTTGGCTCCGT:1 + chr3L 18658181 5' + roo 8695 2 62.32 AAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGACGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTG:1 - chr2L 18178343 5' + Tirant 8188 2 74.82 AATAGCCATCTGTCCGTATAAGCGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACATAGACGTAGCGCAAGTTTGTTTTGCCACGCCCATTCTAACGCCCACAAACCGCACAAAACGCTCACGCCCACATTTTTGAAAAA:1 + chr2R 5720600 5' + INE-1 252 1 66.67 AGTTTTACTCCGCGGGGTGAACTGGGTATTACCTCCCCTAGCAGTTCGACGTTTGTTATATCGTGCGGAATGTCCGAGAGAGTCTCAACATCCTGCAGGATGCGTCGTAGCTCCTCGGAAATATTCTTTTGGATTCAGACTTAAGC:1 - 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Stalker4 202 4 66.44 TCAGATTAAAAATATTAATGCGATTCTAGGAATAAGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCCGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr3R 30782588 5' + pogo 52 1 71.30 GATGCCATAAGAAATAATGTGCCCACACACACACACACTCACAAAAAGAGAAAGCACTCTCAGATAAGGAGCGCGCACAAAAGTATGCTATGAAAACCGTAATCATAATCGTAAAGCTTAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 + chr2L 17727878 5' + jockey 4762 1 70.55 CTTTCCGGCGCCCGCGTGTTTGCCAACACAGCAGCACAATTAATTATGTACATTGCACTATGTGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 + chr2R 18983755 5' - hopper 1397 1 58.51 GAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chrX 16217540 5' - P-element 2860 1 60.98 GGTGAGTACAAAATAAAGGCCAGCGGCCAAGTTCAATTAACACACGGAAAAAAAATTACATACAAATATAAGGCAAAAGGAAAACATTCACGAAAAGGATTGCAAAAGATATTAATCTATTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGT:1 + chr3L 3271279 5' + P-element 454 1 79.45 CAAGGGAACTAACAAAAATTTGGTTAACAATGCTTACAAATTTTAAAAATTTTATATTTTGTTAAAAATATTTAATGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3L 18164109 5' + pogo 42 1 56.85 TAGGCATCAAATCTAAAAATTAATAAGGCACATAAAATATATCTAGATAAATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chr2L 14480402 5' + Transpac 4954 2 62.33 CAGAACTCCATCCATCCTATCATCTTGCATACTCATTTGTAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGCTCTGACAACCAACATGCT:1 + chrX 5399022 5' - 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chrX 18190431 5' - hobo 2893 1 57.14 GCGTTATCAGGGAACGTTTTGATAAGAGATACCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTA:1 + chr3R 24053669 5' + mdg1 80 2 77.21 AAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAG:1 + chr3L 18034578 5' + Transpac 5006 2 78.08 GAAAGGAGGTTCGTTAAGAGAGAAGGGAACCCAAAAATGTATTGTTGTAGTCCGTGTTTGTTGGCGGCATCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chrX 16526373 5' + P-element 50 1 51.37 CCGATATCTTAGTCGAACACAAACAATCGATAGTCGACAGTACTGTGGATGGTTGAACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr2L 2999203 5' + P-element 30 1 54.55 TAAGATAGTTTGTAAAGAATTAAGATAAATTATATTGTTCGCAAACAAATATAACACATTCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATT:1 - chr3R 5024911 5' - diver 161 2 68.49 TGCTAGAAGCTTTTGCATAAATTGTTTTAATTACTTTTCCTGGAGGAAGTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCT:1 - chr2R 8966225 5' - BS 5018 1 64.38 TCTTACTTTTTTATATAGAACAAAGACAATGGAATCAAACCAAACTTAATTTCTTTTGACAAAAGGTCAAAAGATTATTAATGCTTAGGGACAAATATATATGTCGGCGAGACAGGAGTGTCATCCATTTCATTTATTCACTTCGC:1 + chr2R 10305283 5' - invader4 302 2 65.75 CGAATTCAGAGCATACAGTTTTGGAGCGACTGAAATGTGATAAAAGCCCGACTACAGTTTGAGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAACAGAAGAC:1 + chrX 15137374 5' + jockey 4730 1 57.53 TAATATCTGTGTCATTTTTTAGGTTAATAAGGCCAAATTGAGTATATGTGCCAGACACACACTTAATTATCATCATATTTATGGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCCGCTCTCCC:1 - chrX 20874408 5' + F-element 365 1 58.90 ATAATAGAATTTTTCATCATAATATTTTAGTTTACGATGCTAACGGCTTCAAAATCTGCTAATGACTGAATAGAACTTAGAAAATGTTACTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTAT:1 - chr2L 7939871 5' - Burdock 242 2 70.77 CCTTGCAATTTTGCTTCAATAGTTTACCACGAATGTGTGAAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 - chr3L 14040992 5' + 1360 50 1 51.37 GAGAGAGCGAGGACTCTCACTCTCCTCCTGCCTGCGCCGAGAGAGCCAGTGCCCTCTCTCTTGCGCTCTCACTTCTCTGTGTGATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chrX 16526242 5' - P-element 2854 1 62.14 TGGGACAGTTTACACATTATTAAGTTCATTTCTATGCAAAGAAATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACA:2 - chr2R 13212288 5' - diver 6033 2 71.92 ATTTGATAGTGTGAAAGGCGGTCGAGGTGTTCTTCGGGTTGAAGGTGGCGCCCAGCTTCAGTTCCCGCACCTCCTCACCGATGTTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTG:1 + chr2R 7406206 5' - Idefix 179 2 64.29 GATCAGCGTTGTCAGGACAACGATCAGGGTCGAGATGCTCTTAAGTGACCGAGACCCAGCCGTGAACATGAAAGCGGTCTTATCTTCAGAAATTACAAAGGATTAATGTTATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAA:1 + chr2L 17073861 5' + pogo 2018 1 72.60 GACTTACCTATGCCAGGTAACCCCCCAACACTTTGGTACCGCGTATACATGTGCGTTGCGTTTTCGAACAATCCATCTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTACAA:1 + chr3R 8184082 5' + Doc 49 1 43.15 GGCGCGACAATTTTCCAAAGCTGCTGATCGTCCCACTTGGTAACTTGTGCACTGGGAAAAACTGTGTGTGAGTGCAGCTAGCTTGATGGTGTCCTCCGAGCCGGATATATGGGTAACTCATAAATATACAAATATACAAA:1 + chr3R 29534538 5' + Stalker 6941 4 53.57 GAAAAAGGCGAACCTTCGGCAGCATGTTGCTTTCACCTGGTTGGCTGCTTTGCAAATGCTCGGGTTCCGTTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAA:1 - chrX 2518165 5' + P-element 12 1 71.94 AATAAATATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATATATGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAA:1 + chr2L 18093451 5' + Stalker 7092 4 57.53 TTGACACACAAATTTACAAGTTTGTTGCTACTTTCTGCTGGATCCCCAAATACAAAAGCGCTTGAAAGCGATTTCTCCTTCGAACCACCCTCCTCCATACCACCAATTTGGAAATAAATCTGACAGCAAATTGAACGAAAT:1 + chr3L 13680253 5' - GATE 398 1 80.14 TAGACGGAGGAAATGGAGAGAGATAGCAACACAAGTGATACATGGGTTCATGGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 18213079 5' - roo 9047 1 67.12 GCAAGAAGTATTGTTTTAAACAGTAATTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAAAGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 + chr2L 17957127 5' - blood 7367 2 68.49 AAAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACGAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGC:1 - chr2L 18178351 5' + Tirant 79 2 70.34 AAATCAAGAATCAACTTAAGAACAACAACTATACACTACTCTACACAGACAGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGACGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTTACATCCTGCTCATCGAGGTCATA:1 + chr3L 22907533 5' + Rt1b 4965 1 72.60 AAGATTACCAATTTGTATATGATAAGTGCTGAAATTCATTTGCTTATCTCGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 - chr2L 10045282 5' + jockey 78 1 62.33 AATAACATTTTTTAGGGACTAACAAGGGAACTAACAAAAATTTGGTTAACAATGCTTACAAATTTTAAAAATTTTATATTTTGTTAAAAATATTTAATGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGTTGCATC:1 + chr3L 18164087 5' + pogo 19 1 72.41 ACTTCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3R 19721209 5' - opus 476 2 65.75 GCATTAAAAATCTGGCAAAAATCACGAAACGTTAAACAACCAGCAAAAATATTGTCATGCGAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTT:1 - chr2L 19643642 5' + hobo 33 1 64.38 CACGGCAATGTTCTTACCGTGCGCTTTGTTGGGCAGCATTTTGTTGCCGATATTGTGATTTCGTTGCTGTAGCAACGAGTTGCTGCTGATGATATTGCTGTTGCTGCTCTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTACCGAACCCAGCTT:1 + chr3L 453120 5' - FB 10 1 72.60 AATTAAATGTAAAAAACTCAAGGCATATTTGTAAGGGCAATTATTTAGTTATTTGAAATTTATTTTGGATTTTTAAACGTTCAAAAAAAATATCTCAATCTTACATCTGCGCTGTGCACCTATTCTCTCGCTCTTTCGCTCTCCTC:1 + chr3R 7581086 5' + Cr1a 300 1 69.18 TTGTTTTTATATCATTTTGTTTTTGTTTTTCAATTCATTCATTTTTTTTTTGTCTCAACTGAATAGGTTTGACCTATACATTTATTAGTATAAAGCAAAATTTCAAGGTACTGGATAGTTTAAATAATAAAAGGCACTGGTTTAGT:1 + chr2R 4715499 5' - Tc3 1450 1 44.52 AACTTAACCAACTTTTCAACAAGTATTGAACGCAGATCTCAAAGTGTGTGTCACTAAACTTTGTTATGCTATAATTATATTGATTATATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr2R 9092087 5' - 412 7510 2 60.27 GCCCCGCAATATGATCTTGTGGCGTACTTTATCGACTGAACCGCTCCTGAGAGCTGCCACACGACCCACGGGCAATCGGCAACCGATCACCCCCAGCGATATTGCTGAC:1 + chrX 16924636 5' + BS3 205 1 72.48 ACTCGTGACATTCGAACTTAGCAATGAGTGATCAAAAAACCGAAAGATCACTACTGCATTGACCTTCCTAAAAGGGAAAACATGGAAAACAAGGAGAATGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTA:1 + chrX 22859507 5' + micropia 5143 2 65.75 AGTTGTAGGTTTCTAAACTTTATTTCTGGTACTCTATAAAAATTATTTTACTAAAGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAAT:1 - chr3L 15277690 5' + I-element 68 1 60.96 CAACAGTGCTGACCCATTAGCTGTTTAATAGCCAAATAGCCAGCTTTTGACGGGGATTCATTCGGGAAAGGCTGTTCAATTTTGAATAATTTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr2R 22464498 5' + pogo 28 1 65.07 CTAATGTCTTTATTATGTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATA:1 + chr2R 9934135 5' + Rt1b 4965 1 53.42 GAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGAC:1 - chr3L 25482978 5' - accord 467 2 67.12 GGTACAGAATCCAATTCAAATTGGTATTAGCTAACAACAAATTTTCAAATCTTTAGATAACAACAGCCATATTGCTACGAAATTGGCCAAAACTTCCCAAATATGTAAATTCGTGTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCACGAAAA:1 - chr3L 17858771 5' + 1360 3182 1 54.11 GGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAAC:2 - chr3R 29091394 5' + rover 55 2 58.90 AAATCAGTCGGTCGGTCTATTCAAGTGTCTGATTTTCAATTCAATACCCTTTCCAAGTGGCTGCTTTACTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGC:1 + chrX 10019539 5' - I-element 5291 1 52.05 TGGCACGAAAACAAAGCAAATCAAAGCCAACACAATGAGAGGACCCAAATCAATTGTACATGGCCATAAGGCCCGAGAGTATGTCATCAAGGTTAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGGT:1 + chr2L 3603150 5' - Cr1a 62 1 71.09 TCAAATGTTCCTAATACTAAGCTTTTGCCTGCTCTTACTGGGGGTATAATGATTCAGTTAAAAGTTTCCAACGCGAAGAAGTGAACAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACT:1 + chrX 20381366 5' - INE-1 567 1 78.40 ATGATGTTAACTTGATCATTGAAAATAAAATGTTGAACACGATCAGTTTAGGACGGGTAGGTAATATATGCGAAAAATATCTTGATTGGGCTTAAGAGCACTTTCATCGGCCGCCAATCTACGCGCCATCCATACCTTCACTATGG:1 - chr3R 16788186 5' + Tirant 8062 1 67.12 AGATCAGTTCAAGCAACAACTGAAGTTGCTCAATTTAAAAGCTGTGCAAAAAAATCACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCAT:1 + chrX 10128124 5' + invader3 16 2 67.81 CCAGTGCCCTCTCTCTTGCGCTCTCACTTCTCTGTGTGATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGA:1 + chrX 16526287 5' - P-element 2803 1 28.77 TCATGGAATTGTACAAGTTCCACCTTTGGACAAAACCATACCATAAAAAACTGGTAACCAACTTGAACACATTTTATGAATACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATT:1 - chrX 21581464 5' + Tabor 6881 2 56.16 CGCCATGTAAAATGTTAATTTTTATAAGACTAGAAGAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTATTAATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTT:1 - chr3L 26745415 5' - Stalker 7111 4 88.36 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAAAAACTCAAAAATAATTAATTCATTAACTTTTTTATAAAATGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACT:1 - chr3L 11720529 5' - invader3 5438 2 41.78 GCTAAGGTCAATGTTAAATGCAGTTTTTTTGTATTAATTTAAAAAATTGTTCCAAGTCAAAGAGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAA:1 - chr2L 9074293 5' - flea 201 2 60.27 ATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 - chr3R 6412058 5' + Tirant 8173 2 62.33 ATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTC:1 - chr2R 4774738 5' - baggins 5328 1 71.72 TTCTAAGTGGAAAAAAGTCCTTTCTTTTCTGGAATTTTTTGTAAGTTCGAAGAAATACAGTTGCTAGGATATTTAAGTACCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 - chr2L 6319856 5' - Tabor 7284 2 52.05 AGGCTCATCTTTTGTCGCTTGAAGTCCGCAAGGAATTCCGTATTCATTCTGACATGCACTGTATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 - chr2R 12814942 5' + opus 7055 4 57.93 CAGATGATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr3R 4662009 5' + roo 8743 2 72.60 TGTCGCTTGTGACGAATTTCTATTTGATTTATGCACTCCCTTTGCAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTCCGTTGTCGTCTGT:1 - chr2R 21029446 5' - Transpac 241 2 66.90 CAGTGAGAATAAAATCTCAACACTTTAAAAGCATTTTGAAACCATAAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAA:1 - chr3L 13168717 5' + I-element 5077 1 68.28 GAAAGTTAAGTCATGGGAACAGGACATACCACTTCAAGAAAGGGAATATTTTTGTTGAAATAAATACTGCATTTTGCGTAAAACGTATACAACTTGTTCATAATTTATTTATTTAATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAA:2 + chr3L 16271833 5' + jockey 103 1 73.29 ATATTTATTTTCAATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAGGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTT:1 + chr3L 18034557 5' + Transpac 4985 2 63.70 AAGGCAAGAATTGTTAAGGCAATTTCGGAATACATTAAAAGGGGCGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTG:1 - chr3R 26244707 5' - copia 5047 2 68.49 GGCTACAGACACAGACTTAGTCTTTCTGAATCCTCAGCAACGAGGGGTTCAACGACTGCGTTTCAGCCTGGTGTCGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTATTTAATAGAGTCTCA:1 - chr3R 24053749 5' - mdg1 7432 2 60.00 CACAGCGTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chrX 6484704 5' + jockey 63 1 56.85 ACATTAAAATTAACCTTTTATTGGCATTCAGTTTACAACAAATACAGTGTATTATTCACATATCTACTACAAAGCACAACATATGTAAAATGTTTATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 17510719 5' + roo 22 2 40.56 TTTACTTTACTTCAATAGCACAATACTTTTTCATTACTTCTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 - chr3L 2467518 5' + jockey 4733 1 68.00 CGATACTCCTTGATACTCAGCCCGAACACGAGCAGAACAAAAGCCATATAGCGATTCACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr2L 16411086 5' + 1360 51 1 59.40 CACCAGCAAAGTAATACAAATAAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTT:1 - chrX 10128301 5' - invader3 5446 2 63.64 CATTGATTTGGAGATAGATATCTACGGTGCACTGATTTAGATGTACATATATATATATATATATAGTTTATATATGACTAAAGCTTAGGTATTTCGCAAGCCATGTATAAAGACTTATGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCAC:1 + chr3L 18737993 5' + Bari1 5 1 78.08 AATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAA:1 - chr3L 23702249 5' + G4 69 1 61.64 TATTTTGGGGTTTAAGAAAGAACAGAATTACTCTTGGTGATGTATGTATGTATGCATGTGCGAAATTGGTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTC:1 - chr2L 21250763 5' - P-element 441 1 47.26 GATTGTTTTTACATGCCATACATACGAGTACATATGTATATGCACAGGGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGAC:1 - chr2L 15906090 5' - Tabor 7250 2 66.44 ATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCACAGTGCCAA:1 + chr3L 25482911 5' + accord 6910 2 70.97 ATTTACAAATTTTACAAAAATTAATATCGCTATGTCCCTTTCTAACGTATTGGTTTTTTTTTTGTAAACATAATACATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGATTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 - chr3R 17467197 5' - I-element 5306 1 52.05 GGCCTACTGCTGTGCTCACTTATATTTAGATAAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACACATATCAAC:1 - chr3R 21706312 5' + I-element 88 1 74.66 CGATAAAAAAGCAAAAGTGTGTGTTGAACCACGTTGAGCAAAGTGACGACAATGGCTCGACAAATATTTTACCAAAGATTCAGTTTTGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 19543534 5' + roo 8682 2 70.00 TTGTGAAAAGTTCACGGAAAGTGGGTAGGCAGTGAAAAAATGGTAGCCATTTTTATTGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCT:1 - 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chr3L 1981646 5' - opus 464 2 51.37 AAAGTATACTAGGGAAAATGCGCAGAGGAAAAGCTTTTTTTATCAATGATATATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAA:1 + chr3L 18554601 5' + jockey 4628 1 64.38 AGCCCCAGAAACATACAAGGGGGAAAAACCCTAAAAACCCGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3L 18767777 5' - roo 8989 2 74.66 AGTGTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chr2L 9319102 5' + jockey 88 1 70.55 GTATACCCGTTTGTTTGCACCGATGTGTTGGACACCTGCCTGTTGGCCCGATAACTCCATCGAATATGGGATGGATGGGATGCGGACATCTCAGGTATGCCAGTGTCTGTGTCTATGGCACACATAGCAAATAGTGACCCCCCAAG:1 - chrX 4574510 5' + X-element 111 1 78.08 TGTGAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCT:1 - chr3L 25482981 5' - accord 7358 2 54.81 GTTCTTTGACACAGATTGCTGGAGGATTCCATATAGCTAAACTGGTGCAGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGTCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAG:1 - 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chr2L 14889048 5' - hopper2 1567 2 57.53 ATATTAATAAGTGCAATTCCCATCAATAGAAATGAAAAATGGTCTGTCGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3L 18792501 5' + roo 72 2 70.55 ATATTATTTGGACTTGTTGATTTGCAGTGTTAACGGAACTGCCTCCTAAATCGAAATACGGAGACCAACTGACTAGGCATTGTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 - chr2L 19548555 5' - flea 4979 2 60.27 ATGACATCGCTGTTGGCATCGAAATATGTCCATATCTAATATATAGTTCCATTCTGTTTTATTGGATTGAATAAAGTCTGGACTTTACATTTCTTATTACTTATTATTATTAATACATTCTTATTACTTAATGCTAGCTTATA:1 + chr3L 23339290 5' - invader3 5300 2 53.85 AATGGAGCACTCGGATGTGGCAATTTATCATGATACGAATTTGTTATTATTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTTTCTTAACA:1 + chr2R 13212217 5' + diver 26 2 52.00 AGTATCTGAAGATACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCTTCGATGCAGGCAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 - chr2R 24021646 5' - pogo 2047 1 63.28 TGGGTCCACCTTAAAAGAGCGTAAAGAAAACTACACACACACACACATCCGCATGTACACACGCACACGCACACGCACACACATGCATGCGCTTTACGGCCATAAATTACCACGCTCATGACCTCCCTAACCCGGTT:1 - 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P-element 2792 1 20.55 AAAAGGCATAAAAAATCCGGGAATCATTGCTTAAATCCCATGCCCAATTGAATAAATTCAAAAACGAATTTTTTTTAAGTAAGCCATGTCAGGTTAGACTATGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3R 4422100 5' - 1360 3369 1 70.55 AGTGAACAATTTGATTTGACATAATTGGGGTAAAGTCAATCGGAAACGATTATTTTGTGCATGTGAGTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTT:1 - chr3L 3565466 5' + gypsy 5 2 78.08 ACAAAGCTATACCTTTATTGCCTTAGCTAAACTTTTTAAGGCAGTTAAGCGTAACTCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAAC:1 - chr3L 6818043 5' + I-element 161 1 58.65 CGATTGAATGTCCCAATGGTAAGATGAAAAAAATTCCTGTCAAAGACATGGCCAATCGGCCACCTTTTTTTAAAAAGTATGTTAGGCAAAGGTGTTGTCACTATGAATGTAATGCATACAACTAAATAGTTTTTAATAAAAAAAA:1 + chr3R 11177476 5' + S2 1621 1 33.79 CTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 - chr2R 2529356 5' - 1360 3330 1 56.85 GCCATATGTGGCAATATAGGCCAGACGTTGTGGGCCGACCAAAACACCTGTTCACACATGAACTCGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGCATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3R 18517951 5' + roo 72 2 67.38 GATGCGAACTAATCAGCAATTGATGGAAAAGATTATTGTGAAATTCCACGAAGGAACATAGAAACGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 + chrX 4823524 5' + pogo 52 1 56.55 GCCACACACACGCACAACCAAATAACGAGCCGAATTTTTAAGGTCACAGCGCGGTGAATGTCCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATCTTATTTGGAAATATCTTC:1 - 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chrX 14346511 5' - roo 393 1 47.26 CTTACACATATATACATATGTATAAAATATTTAGTTACTAAACGAGGAAGCTTAAGATTAAATAAAGCATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 12609985 5' - roo 355 2 54.48 AAATCCGAAATCCGTCAGCCCCAAGAAGTATGCTTCGCATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGAAGAGCAATCGAGTGGAGGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3L 13362772 5' + jockey 35 1 63.57 GGGGAGTGTACGCATTTGGCTATTAGAAATTATAACGACAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 14494150 5' - roo 387 2 71.23 CTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chrX 5206527 5' + Tirant 39 2 63.73 TTTGCTCTGCTTCATTAATTATTGCACTTGGGTTCATTGTCTAAGTCCACAGACACCCACACATATGCACACGCATACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chrX 5145956 5' + hobo 43 1 53.42 ATATAAAAGCATTCTGCTTAGACGATATCCACTGTATCCGATAAGTATACTCTGTGAAGTACCCTCGCCTCGATAAAGTAACCGTTAGCAGGCAGCAGTGTGACACAGTTTGGCCAAAGTCCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr3L 20388073 5' - 1360 3378 1 76.71 GTAAAGTTCCGGCTTTATAGCTTGTCGTTCAATTTTCTGGTACTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTT:1 + chr3L 381723 5' + S-element 79 2 71.92 AATTCATATCTATAACATAATATGCATCTCAATCTTATTTCATAATTTACGAAACTTTTAAAAATATGATCCATATTATGGATGTATGGATGATTCCTACTGGGCATGAGCATAATTATCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGT:1 - chr2R 12984233 5' + opus 7081 2 79.45 ATTGAAGGAACTGGACCGGAATTGATTTGACTTTTGTATCTGCATAGTGAATCTTAAACAAGTGAATAATATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCAC:1 + chr3R 7979514 5' - micropia 5324 2 52.05 GAATTTCTATTTGATTTATGCACTCCCTTTGCAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 - chr2R 21029433 5' - Transpac 5154 2 76.30 GACTCGAACGACTGAAAAGTGCGTTCCATTGTAATGAAAAACTGAAGCGGCAAACCGAAACGGTAAATATGAATATATCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTTTTTTATTCGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTT:1 + chrX 8925635 5' - F-element 59 1 48.63 GAGCTGTAAGCCGGGAAATTGAATTACTTTGCTTGTGCAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTC:1 + chr3L 3565333 5' - gypsy 402 2 54.79 ACAGGGAAATCTAATGGAATAAATAAGTGGCAATCGTGAGCGGTCTTCAAGCAGTTTGCTATAAATGATTACCTAACGTAAGCACACCTCGAAAATATGTATTATGTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 + chr3R 17467041 5' + I-element 12 1 74.66 CCTTCGCAGGTCGCAGGAAATGCCCGAATCGAGATGGTTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGT:1 + chr3L 3757161 5' + copia 4947 2 76.43 ACATAAGTCGCTGCACTTTTCGCCCTAGCTACTTTTTGTTTTTTTTTCATTTTCGGTTTCTTCTTTGCCTACCGCCAAATTCGTGTCGTTTTGTCTGTGCAAAAACAATTGACTTTATGCATAAACACACACACATCATTGCTATT:1 + chr3L 25439409 5' + G3 50 1 75.34 ATGACACTCGCCAATCTGCGTGCCACGTTTCCAGTTGGCCTGCCGTCCAAAACATAGACAATTGCTCAATTAGACAGCCCAACCCCCATCGTACACGGCAAAAAACGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGCATTTTTGA:1 - chrX 1125392 5' + FB 18 1 53.42 TTTGTTAATATAGTTTATAGTTGCATGACTCCCACCACACCAACAAGTACGGCAGAAATAGCTTTCAGCAAATGGTTGTTACTACTATCTTGGATTAGGTCTAGATTACTTCAACAAGTTGGTTCTGTTTGAAGTATTATAAA:1 - chr2L 1009269 5' - looper1 249 1 55.94 AGTCATACTACATGTCACAGCACAGCGCAAAATCCGTCCCTTACACCTGAACTTCCTCTTATGCTTCAACACGCTTTCGCTGTAATTTCCTGTTGGCAAAAACTGAAAACTGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTGTTTT:1 + chr3L 10563838 5' + hopper 7 2 78.08 GCGGTGAATAGCCATCGCATGTGCCGCATGAATATGCAAAAGAACAAGTAAACGAGTTGCCCAGCGGGATAACTTAGAGATATCGCCTGATCTTAGTTAAGACAGCGGTTAGAGTTAGCTTTTTTAATATATTTTTTTCAAATTTA:1 + chr3L 3258942 5' + copia 4667 1 73.97 GAAGTGATTTAATCAGTTGTTTTATACACGACAGAATTTTAATAAATAAATGTGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATC:1 + chr3R 27514668 5' + Ivk 352 1 53.10 AAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATCCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAA:1 - chr3L 23702268 5' + G4 50 1 48.63 GGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACTAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3R 27188599 5' - roo 8993 2 75.00 GTAATTACGTTTTGTTTTACTCGTGTTGAGGCAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTACATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATT:1 - chr2L 9861355 5' + BS 5048 1 77.08 CTTATTTAAAAAAGTGGCGTCACATCCCAGTTTTGAGAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACAT:1 - chr2L 10519599 5' + X-element 90 1 74.48 GAAACATTCTAAATTTAGCGCGCAATAGCTTTCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAG:1 - chr2R 16073035 5' + Burdock 6180 2 53.79 GTACGGGCCTACTGCTGTGCTCACTTATATTTAGATAAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1 - chr3R 21706317 5' + I-element 79 1 71.83 GTATATTTCTAGATAATTGCAGTAGTTTGTATCCCGGACACATAAAATAAGTAACGCGTAAATCACACATTATTTATAGTACACTTAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr2L 6755867 5' - pogo 2072 1 66.90 GTTAAGGAAATTATGGAAGAATACAGTTTGAATTCAAATATCGATAAATATATTTCTGTTCCGCTTGTATGGAGCAGCGGCCATAAATACTTCCAGTGTAGCCAGAAGCCTAAGATTTCGTTTCAGGCATCTAATAGAGCTTATAA:1 - chr2L 22983832 5' - Transib5 2906 1 47.26 CACGGGCACTGTTTTAGAAGTGCTTCCAATACCATGGTCAAAATGGGAATGTCCATAGAGTTTTTAGAGTACCATTTTTCGAAACAAATGAATAAATGATGGAGCTTTTAATAATAATACTTTTATTAATTAATAATAAATATTA:1 + chr3R 20711690 5' - Tc3 264 1 65.52 GGGATTGTGGCAAACGTATTGAAATGTAACGCATTTATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAG:1 + chrX 7480724 5' + Bica 338 1 74.07 ACCCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAA:1 - chr2L 13510876 5' + diver 35 2 61.74 TATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 - chr3L 23456279 5' - 1360 3337 1 56.85 GATATCATTTTATTACAAGTAAAAGCTCTTATTTGTAGTGTTTAAAAGTATGATGTGGAAAGAATAATCCAGTAAATTCGTATGGCTTTCCTATTTAAAATGTACTGTTGCATATTCTGTCCATCAGATATAAAAGGGGGACTATG:1 - chr3R 13500064 5' - Rt1a 419 1 73.97 GAAAGTGAAGGGGAAGTGTCCTCGAAAGTAAAGAAAGGGAGATCAATATCGGATGATAAATAATGGGCACAATAGAAAAAAACCTTTGATAAATAGAAAAAATTATTTGAATGCCTTCTATGAAAATGAAAAATTAAAAAGAGAAA:1 - chr3L 12605873 5' - Tc3 43 1 58.90 CTTGGCAACTAAATTCATAAGTGTGAACGAAATCATGTTAGCCTTTAGTTTCACAAATGGTCGAATATAAATTATATATATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:2 + chr3R 21753414 5' + 297 34 2 52.05 AGCCATTTATGCAAGATGCCGGTTTGAGATATTTGAAAGTGCACTACAAAATTTTGAATTTCGGAGTCTAGAAGTAGGCAGATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 - chr2R 1375193 5' - 297 6942 2 63.45 GATCCCTATGCTTAACTTGTTATATTTTTTAAGATATCGATTTTTCCTGCCACACAGATATTCAAAGCACTCTACACATTTAAAAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAAAGCAATTAACCCATAAGTC:1 - chr2L 18300872 5' + Ivk 5288 1 54.79 GCAAACATACAAAATAAATTAAAACAAGAATGCTATGTCGAGATCGAAAATCAATTTGAAGCTCAACATTGTTGCCATATCTCAGTTAAAAGGCGACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTC:1 + chrX 20460515 5' + diver 5908 2 67.39 ACCCCAAGTCGCACTGGCAGTCTGAATCTCAGTCCGAGTTCCCGATCCCCATCCCCATCCCGAGTCGTCTTCTTCCAACTGATCACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGC:1 + chr2R 24338708 5' - Stalker 217 4 64.75 GGCGAAAATTGAAAAATAGTTTCGTCCCCCGTTCGCAAACGAAACACAAGCGAGCTGGGTAAAAGTTGCACCCGAAAAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1 + chr2L 15593728 5' + Quasimodo 70 2 52.74 GCACTTTTACGTTTTTTGAACGGCAAACGATCGCAACGATCGCAGTTTTGTGACTGAAAGCGACCGATTTCTAGAGATGCGTTCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr2L 2999319 5' - P-element 2849 1 61.64 CTGAACTCGCGTTAGGTTTCTAGAATAGCCCCGGTCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCCTGATCGACGTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr3L 14551287 5' - P-element 2837 1 51.03 AGCAGCGGCGGAAAAGCTCTTCGAAAAACAGATGATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 4662037 5' + roo 35 2 56.92 AGAAAACTTTGAAGCTCTCTAATGTTTTGTGGAATCGGATACTTTATAATACCATAATACTTCATAATTATATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTGTCTAGAGAAATTTTCAT:1 - chr2R 2879963 5' - TLD2_LTR 135 1 91.78 AAAATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGT:1 - chr3L 19335448 5' - invader4 3036 2 52.74 AATATGTCGATTTTAAGAGCCGCAATTCCACTTGGCAGCTATATCACCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3L 18658290 5' - roo 8999 2 68.06 GCTCTTGTTGCCGTTTTAATTGTGAAACTTTTGTCATGCAACTTGCATATCTGCACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACA:1 + chr3R 25442802 5' - R1A1-element 5268 1 63.01 GTTTTTCGGCGCAGCGACAGGCAGATCGGGCTACTATATACATATATATATGTCTACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGC:1 - chrX 12214576 5' - opus 439 2 69.18 GCTTTAAGTTTTGAATTACTTTGCGGCATTAGCGTTTAACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 + chr3R 18541329 5' + hobo 84 1 74.66 CCCTCAAAAAAGTAAAAAGTTTCATGTTACCAGGAGATGTGCCTCACCGAACTTTTCTTAGCCAGCTTTTTATCCACTTTTTGGTATGTAGGTGTACTGTTTGTAGGTGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCAT:1 + chr3R 17841468 5' - baggins 5389 1 56.16 CAAGTAATATCCAAGAAATGGTTGGCTAACCTGCACTCTGCCACTAATCGTGATTATGATCTTGTCTTTGTTAATTGATTCATGCATGGAATGCATCTGTTGCGGAACTCATACATACATATGTAAATATATATATAT:1 + chrX 10217761 5' + G3 4505 2 47.83 TATTATTTGCCTTGCCAATTTTTTTTCATTTTTTTTTCATTGTATTCCCTAATATATATGGATGTCCAAGAAAAATTATGAAATTTGCGCGTCCGCATTCACTCTAGCTGAGTTACGGGTATCTGAAAGTCGGG:1 + chr3L 22848493 5' + INE-1 552 1 60.45 CCCATACGCCCTGTGTATTTTCACACAGCGTAGCATACTTTTTCGTGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGAGTTATGTCATATTTTGCTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 6484681 5' + jockey 18 1 69.60 TACTCCTCCTACTCAAAATAATTTTAATGATTTAAATGTTAACCTCTAACATATTATTTTAAAAACATATAACTTATTATAGTGAGTAAGGATGTTCGTTAAAATTATATTTTAGTGGGTAGAAGACAGCACTGCTCCCAGGAGAA:1 - chr3L 4966945 5' + HB 361 1 59.59 AGTACTAACATTAATTAGTTAATTGACAAAGCTCTTGGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3R 24976324 5' + roo 41 2 55.86 AGTGGAGTCCGACTTTTTGGAATGCTTCTTTATCAGATACCGGCCAAATCGATAAAAATATATAACTTATGCAAAAAAAAAAATTAAAAAAATTTTCAGAAGTGTACAAATTAATGTGTTCCTCCCTCGGGATGTGTCCGGGGGTC:1 + chr2R 330386 5' - gtwin 7374 2 71.92 TCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCT:1 + chr2L 4420516 5' + gypsy5 6993 2 62.81 GTGCATCGCAACACGTACGAAAGCTATTCGAGGTAGGAATGTGTTTCCATGCACTCTGAGAAACACATGGCTTATGTGGGTATACACATACGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAAT:1 - chr3R 4687539 5' + Cr1a 73 1 61.64 TGTGTGCTTAATATGCCTATTTAAAATGCCAGTTTATCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 + chr2L 8707450 5' + 412 7136 2 73.97 ATTTAGGCGCACACATACATACGTAGCGTTAGCAACTGCAAAGGCACCCGCAAGGTATGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGC:1 + chr3L 13365538 5' + jockey 4592 1 54.13 ATAAAATGTTCCAATTAAACCGAATGCGATCAATAAAGGACACAGGCGCTGGCAACTTAAATTAGGTCGATGTTTGTGTGCCTCAGTCTCTCCCCCGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr2L 18400792 5' - accord 185 2 50.83 ATCATTTTTCTTGAATGGGGATTCTTTTTAGCCAAGACATGATCACACCTCAGCTGCTAGACAATTTAATCCATTCTTCCTTTATCTGCTTTGCATTATCCAAAACAGTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATA:1 + chrX 21581296 5' - Tabor 472 2 67.81 AAATAACGGACCTGCATACAAGTCGAAGGTTTCCCTATATTCCTCTTCAAGCTCATATACGCTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAT:2 + chrX 21554368 5' - 297 6918 2 60.27 GGAAAGAGGGCAGACATGGAAAATAACACAAAATGCGAATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGTATTTTTTTT:1 + chr3R 29091304 5' - rover 268 2 70.55 GTGCGTGTTTGCCTGTTTGGATGTGTGTTGGCCATTGTGCAGGACGTTGGACTGATGTGCATTGAGCTATAAAAAGACGACACCCCGACTCCAGCATCGAGATGACGATACCTTCCCGAAAAGCAGAGGACGAC:1 - chrX 16239511 5' + gypsy4 6529 1 55.97 AGTCAGTAAGATTGTGCACAAAAGGCCCAAACGCGCACACAGGCACAAAAACACATACACACTCATACATACGTATAGGCCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACC:1 + chr3R 16530539 5' + hopper 23 1 65.89 TAACAACAAGTGCAACAAAAGCCGTGAGTCTCACAACAATGTCATGCCACCCACATAGCTGTCATTTTCCCCGCTATTTTACACAAATAAAAATGCAGATTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACT:1 + chr2L 18300711 5' - Ivk 5359 1 70.55 GAGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGC:1 - chr3R 31681924 5' + Doc 92 1 78.08 GTGCTGAAATTCATTTGCTTATCTCGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 - chr2L 10045257 5' + jockey 81 1 75.81 ATGTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTG:1 - chrX 21852450 5' + gtwin 6992 2 70.55 ACTTTCGTCGAGATGGATAGGAAACCGTTTTATTTGCATGTAAAAAAAATCGTTTAAATGTCTTGTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCA:1 + chr2R 25055254 5' - 1360 306 1 55.48 TCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTA:1 - chr3R 29091366 5' + rover 7034 2 75.34 TTTGAGACTGTTAATTCGTTTGCTAGAAGCTTTTGCATAAATTGTTTTAATTACTTTTCCTGGAGGAAGTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATA:1 - chr2R 8966245 5' - BS 5038 1 50.68 CGATTTAAGAAATGTAAAAATAAAGCGTGCGGCAGTATAATTTCCTTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTCATATCATAGCGAAACGCTACTGGCCACGTTCAAGACGGTTCAGTCGCCAACATGCGTTGAAATAGTGAGG:1 + chr2R 7394126 5' + mariner2 131 1 73.97 CATGGAATGCTTATCCAGCGGCAGATACAATAGCCACCCCACACATAATGGTAGAAATAATTTTATTATTTTTTTTTTTATTTTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGTTAATGGTATAATTAGGTATT:1 + chrX 19820140 5' - Juan 4156 1 50.68 GTACGAATGTTGATAGTTGTGTTCGCTGTGTGTTTTCTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chr3L 15859585 5' + I-element 20 1 68.89 ACCCATTGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGAC:1 - chrX 21667976 5' + gypsy2 25 2 72.34 ACTGGGCGCCCGACTAGGTTCTAGTTGATGATGATGTTCTCCATGCCGTCGTCTTGACTCGCGGGAATTCGCCGCCCGGCCTGGCCAGAAACACACAGAAAAGAGCATCTGGCTGTGTCCTTCTGTCCGTATGAACGCC:1 - chr2R 14443714 5' + INE-1 126 1 76.98 AAATCGCATTTCAAAGTTAATTTACCCTAAAATGCAGATCCTATCGCGGTAATTCCAGCATGTTGCAACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTAT:1 + chr3L 16463452 5' + roo 8686 2 68.49 CCTCCAGCTTACTTCCGCCCTAATGAAGCTGAAGTTTGGGTTGTATTTTCATATTTGAAAATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGTTCGGCTCTCAG:1 - chrX 14433682 5' + accord2 163 2 56.03 GATATGTTCATTTGCACCCCATAATATATACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chrX 19005335 5' + F-element 43 1 46.58 CCACGAGCAAATAGTTAATTAGAGTTATTCACGTACTATAACACGATACTCACAATTAAACGGGCTATGGCACTAAAGGATGACAGTACTAAGGACAAACAAGGACATAGCAAAGACCCTATAATAATAATAATAATAATAATATT:1 + chr3R 17615033 5' + mdg1 33 2 68.49 GGAGATTTAGATGACGTTCACAAGTATTTGGTATCGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAAT:1 - chr3L 27391988 5' + I-element 385 1 76.03 AAGCGAACGTGGAAAATTGAAAAATGTGAAAAGGCAGCCCCAGCAGCGCGCCCAGTGCAAAAAAAAAAACCAAAAAAAACCAACAAAAAAAACAAAAAAAAAAAGGGAAAAAAAA:1 + chr2R 21470343 5' + Doc2-element 231 6 61.74 GAAGTGATCGACGCCAATATAGCCTGGGTTGGGGTCCCTTTTTTTTCTTTATATCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACA:1 + chr2R 4024117 5' + Doc2-element 463 1 61.03 GGAATAGGCAATGCTCAAATTGAATTATTTCTTTATTATTTGTGGGCAATTCAAACGTATTTTGGCGGCTTCTTTTAAAATCAGTGTAGATGACATCTATTTGAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCC:1 - chrX 3621244 5' - Q-element 252 2 49.32 CATCGTTTTTGTTCCGACGGGTTCTTCGAGTGCTCCATCACTTCCATCCACCATTCCTTACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chrX 14346411 5' + roo 53 2 58.27 ATGCATTTATTGTAATTGACAGACAGGCGGACGGACAATCTTAAGTGGACTTTACAAGTTACTGTACTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTAGTTTCCTTTCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCCTT:1 - chr2R 8452844 5' - blood 7334 1 50.00 GATGGTGGCAATGCTTAGCTAAGCATAAATGTTCGGATTTGTACGCGGAATAGGAGGCTAAATAATTTATTTACTTATTTATGAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCAGGC:1 - chr3L 21773267 5' + X-element 4625 1 75.45 TTTGAAACAACACGACGGAATCCAGGATGCCCCGGCTCCAGGACTCTTACTCTGATTCAGTTTCAGCATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGAC:1 - chr3R 5941516 5' + X-element 67 1 52.05 GATTACATTAAAGTACAAAAAATACGAATAGTAAGTAAAAAGGAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTC:1 + chr3R 5024830 5' + diver 78 2 72.60 AGGCCACCGAGGGTTAGATTTGTTTAAAAAAAAAATGTACATAAATGCCATAAAATTCAGTAGCACTCCGTTTATTTAACATTCACAGCAAGGTTAGAGTGTAAAAAGTGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 - chr2L 8707578 5' - 412 7535 2 73.29 GTGCATAGTCTGCACTGCGAGAAAATCATTGTTTTGACCTTAGCACAACGCACGTATTTCGCTGACTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 24976171 5' - roo 9045 1 65.07 AGGAGCCCCAGAAACATACAAGGGGGAAAAACCCTAAAAACCCGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 18767774 5' - roo 9025 2 64.60 AGCCAAAATTAAACCCTTTTCAACGTGTCTCTGATCTTTAATTTGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACA:1 + chr3L 17206926 5' - I-element 5277 1 71.92 AAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr3L 18199961 5' + Doc 80 1 71.23 CCTCAACCACTTTTCTGACTGCCTGCTGCATTCAGTCAGCCGAATATGTTGGCTCAGTTTGGCACACAAAACGACGCAGCAGCTTTTCCGCATGCAGCTGCATGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr2R 15803880 5' - roo 8993 2 72.54 AGGAGTTCGGTAAATAAATGATACCTTGTTAAGTAAAGTGTTTTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGA:1 + chr3R 29516498 5' + I-element 73 1 67.63 TCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr3R 14494101 5' - roo 9001 2 67.81 TGTCGAGATCGAAAATCAATTTGAAGCTCAACATTGTTGCCATATCTCAGTTAAAAGGCGACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACG:1 + chrX 20460551 5' + diver 63 2 60.27 ACATATATTTTAAATGATTATATAACCTCATAAGTCAAATGGCGATAATCCGTATCTTTTATTCCGGCTTCAGATTTTCAATGAAGGACAAACTTGAAAAAATCCAGGAGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGG:1 - chr3L 6218258 5' - GATE 265 1 56.12 AATAAAACTTCTCCCTTGCCACCGACAAGCGAAGCAAAAAAGATTACCAATTTGTATATGATAAGTGCTGAAATTCATTTGCTTATCTCGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2L 10045321 5' + jockey 36 1 63.19 GGGCAACCCGTTGTGGCACGGTGTTGTTGCACTTTCGTTTTCTTATTGTTGCTGTGCCTTTGTGACTGGGGCGAAATGTTTATTGCGCGAAAATGAATTCACTTAATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAA:1 - chr2L 14176020 5' - Max-element 442 1 66.44 AATACCGAATAATGGACGTGCATAATGGAATCATTCTTCGTATACCCTGGAACAAATATATTCAAAGGAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2R 12813788 5' + roo 8713 2 55.48 CAGCCATCTGCAATCTTTTTAGCCAAAATTAAACCCTTTTCAACGTGTCTCTGATCTTTAATTTGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCT:1 + chr3L 17206906 5' - I-element 5297 1 58.22 CCTTGTGTCCTTTGCCGCTCATAACGGCAATTCGTGTTGACAAGTGCAAACATTAATTAGCCGATCGATCTATCAGGTGAATGATATTGAGCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTT:1 - chr2R 15822138 5' + invader6 4498 2 66.21 GAAGGAATCGCTTGAAGCTTTAGCCGTTAGCCTAATAAAGACTAAGCTTAAAGGTCATGTCAAGAATCTAATATAAAACGAGAATTCAGTCCAAGAAATAATAATCAAATTTAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTGGAGTTCCCCG:1 - chr2R 332535 5' - INE-1 570 1 28.08 TACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAG:1 + chr3R 19450192 5' + roo 129 2 53.42 ATATGATCGCGAGATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGCCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTA:1 - chr3L 20224250 5' + Chimpo 31 1 60.77 ATTCTCAATAAGACGGATCATATTTAATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAA:1 - chr2R 4270300 5' + gypsy9 21 2 57.53 AAGTCCGCAAGGAATTCCGTATTCATTCTGACATGCACTGTATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chr2R 12814921 5' + opus 41 4 64.60 TTGTGAAAAGTTAATAAATGGCTTATCTCCGACGGAGACGACATGTGTTTGGCTTAATTGTGTCAGCGTGTGGGTTGCCGCTTTTGTTGCCTTCTCTAGATTAATTAAGCGATGTTGTTGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTTTATTTT:1 - chr3L 13406264 5' - gypsy9 453 2 54.11 TTTTGGTCCTGCTCGTTTTTATCTCGACCTTGCGACAAAACAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCA:1 + chr2L 8557353 5' + I-element 4885 1 81.40 ATGTTTTGCGTATATTTTTGCATATATAAAATATACAGTAATTACTGATTACTTTTTTAAACAAATGTAAATTATATAAAAAGGAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chr3L 11903179 5' - opus 7469 2 63.70 CTCATTTTGCTGTAACTTTTGCCAGTGATTCGGAAATGCATTCTCTGCGGATTGTGCTATTACCTGTTTCCCCCGCGGATGCCCTTCCTACACATAGAGGAGGCTATAGGAGCTCACTCCCGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAA:1 - chr3L 13107264 5' - 1360 3280 1 76.03 ATTGATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTACGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCT:2 + chr3L 24757194 5' - Cr1a 4260 1 56.16 AGAAAACTCTTTATATCCTTACCTGAAAGTAAAGAAAGGTAAAAAGAATAAGTTTATATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 - chrX 3767675 5' + I-element 53 1 58.52 ATCACAGAGTTACTGCGGACAGAGCGACAGACAGATAGTAATCATAATATTCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGT:1 + chr3L 27146203 5' + HMS-Beagle2 36 2 54.39 ATTGTAAATATAATTATTAAAAATACGTTCGTTTCGCGAGTGATTCTTGTGATTTGTGCAATAGTTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTACCCTCCTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTTTT:1 + chr3R 18717468 5' + Cr1a 228 1 80.14 ATGAAGATCGATCAATTGGTTTCTGATTTTTGGAAATCCAGCTTTGCTTCCGTTCAGAATAACTCTTAATTTACAAAATTGGCGCCGTTTAAGAAGTCAAAAGTGCGTTTTCGACAATTATAGTATATATATTCTTGATCAGGATC:1 + chr3R 29073705 5' + INE-1 80 1 71.92 CTACAATGACCATCGATCGGTGGGTATTACTGCAAACTTAATAAGTTAAGTTGAATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTACAACA:1 - chr2L 13690081 5' + Doc 58 1 59.23 CATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 - chr3R 4532955 5' + 1360 71 1 70.71 GTGTTTCCACTTAATACATCGACACACGCACACATACGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr2L 12847279 5' + 412 66 2 72.66 ACATCCATGAGGTCCAGCTCGGGCGGGATTAATTTAGATTGTGGTCAAGTGAATGATGTGGTAGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr2L 18953128 5' + roo 8 2 69.79 AACCGACATCGAATCGTTCGATATGCCCCGTGCCCAGACACAAAAATATTTATTTTCAATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1 + chr3L 18034512 5' + Transpac 4940 2 69.86 ATCGGGTACCTGTCAACAATACACGAGCTCAACTTAAAACATAGTTGCGCGAACCGGCCCGTTCCGCCGCAGCAATAAAAATATGTAAGAGGTAGAAGGACCGGCATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGATCTGGCC:1 + chr2R 4996747 5' + INE-1 101 1 58.45 CAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 - chr3R 6412044 5' + Tirant 54 2 65.83 ATTGAAAGGGTATCTGATATATGTGGAAATTCTTTTGTTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTATTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAA:1 + chr2L 22121307 5' - I-element 5338 1 50.68 CTAGTTCAGCAGAGAACAGCTCTAGTTTACACAGTCATAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTA:1 + chr3R 4421984 5' + 1360 85 1 76.71 ATTATTAACATGTTGCTGCACACTCTTTGGCCTAAATTGATTCGCAACTTTGGGAGTGGTGTGTGTGTGTGTGCCTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGGAAG:1 - chr2R 16454376 5' - Quasimodo 36 2 69.70 ATGAGCAGCCTGCATCCATAATGCCGGCCCAAAGAGACATTGAGCCGAAATGAAGTGCATTAGTGCATAAATCCTGACAGATACATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCC:1 - chr2R 16303889 5' - flea 135 2 42.47 ATTCCATCGGCTCTGACGTGGTCAAATCATGTCGATGAAAATTTGAAGCTTTTAAACTACTTCAACTTCACAGAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGAGGGCATGGTGTAAAATCCCAAATACGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 14346559 5' - roo 397 1 73.43 AAAATTTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCAC:1 - chr2R 4774769 5' - baggins 5358 1 50.68 GCCATGATTCATGATTTCATATAAAAAGCGCTCATATTTTAATTATATATATATTTCATTTTGTAAGATTACCTTACCTTTTTCTTGTTGAGTTTCACGAAAGTTCAACGCAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGG:1 - chr3L 9155730 5' - accord2 7551 2 66.44 AAAGGAAATTGTAGATGCATTTAATTATTTTAAATGTGAGTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAA:1 + chr3L 3566573 5' + gypsy 7019 2 45.89 ACTGAGTGTGAATTTCTCAGGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr2L 18944845 5' - P-element 2841 1 28.72 GAAGAAAGGCAAGAATTGTTAAGGCAATTTCGGAATACATTAAAAGGGGCGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:1 - chr3R 26244712 5' - copia 5063 2 62.22 AACTATCTTCTTTTTAATGTTACAGGTTATAGGATTGCAATGTCGCTCTTCATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAAAG:1 - chr2L 21153623 5' - 1360 391 1 75.34 AAACAAAAATCGTTGCATACTTTCTGGGCCAAGCCGAAATCACACGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 - chr3L 13366178 5' - hobo 2933 1 64.47 GCTTTGCAAGCTCAAAGGCATTGGCCATTTCCTGTTTGTATGGAGCAAGCCAAGCAAATCCAAGCTTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3R 20074543 5' + roo 8719 2 54.79 ACAGATAGCACACAAAAGGCCAACAGCAAAACGCACTTTGCCTACCGAGGCATTAACATCTGTTGTCAGCTATTTCATGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATAGCTGCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACA:1 + chr2L 11909104 5' - R1A1-element 5306 1 49.32 CCTGCTCAAGTAAGATCCACATGCTCTCTTTTCGCTCACGTTCTCTCTCCCGCGCGTTAAGCACGGACACAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAATT:1 + chrX 7967188 5' + P-element 44 1 53.62 ATTACATAGTAATAAATGTTCAATACTACATTTAAATGATATATAAATATATCATTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGACTAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTT:1 - chr3L 17162383 5' - Stalker2 7596 2 60.15 CGTATGTACGTTTTATTAATTTCATTATTATAAAAAAAAGTTACGAATGTCGATTTATTTAGGCGTAGGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAG:1 + chr3R 25718182 5' + I-element 5004 1 52.45 GGTTAAAATTAATTGCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr2R 9339767 5' - Transpac 5206 2 65.62 ATTAACCTCTGGTTTCCAGCGAGCTTGAGTTACCAACTATCTTTTACCCAAATTGTGTTTCGGCTCAAAGCTCAGACTTGAGAGAATTGCAAACGAGGATACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAA:1 - chrX 2167455 5' + hopper2 1172 2 66.44 GGGATGGCGAATCCGGGATGCAGGCAGAGGCTCCACATTGATGGCAGATACTCCCCCAGCTTACATATAAAAATATATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATTAGTGTTCTCGGCACTCG:1 + chrX 20124465 5' - opus 477 2 63.20 AATGTCAGTAGTTCTGGAGTTTAAGATTGACGTATTTGTTTGTATTTCGTACATATCTACAGCTGTGTTAAGAAAAATAGCAGTGCTTTGGACTTGAGTGTTTAAGATAAAAAATTCCTATGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTT:1 - chr3R 5367026 5' - HB 1562 1 62.33 GACCGATTTTCTGCAGTATATTCATGATGAGGCCGTGTGTTTTCGCCAGGATTCACAGATTTCCCTCTTGGCAATTTTCATTCTCCTTTTTTTAACCTTTACGTTTTAGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGATTTTT:1 + chrX 6803104 5' + Cr1a 491 1 60.96 TTAATGATTTGAATGATTTGTGGGCTCGTGGTTTTATTAATGAATACCTTGCCTTATTGGCAGCAGTACGCTTTCCGCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAAAACTACTTTATATTTGTTATGAAT:1 + chr3R 26244608 5' + copia 4915 2 51.37 CAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTAAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 - chr3R 6412067 5' + Tirant 8158 2 54.29 ATTCTTTTGTTTGTGTTCGGAAACCTAATAATCCCTCAAACACCATCGAGAGTTCGTTAACAGGAGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGTCGC:1 + chr3R 22840372 5' + Transpac 41 2 52.24 AGGAAGTAGAGAATATTCTTGTAAGGAGTTCGGTAAATAAATGATACCTTGTTAAGTAAAGTGTTTTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 + chr3R 29516475 5' + I-element 53 1 52.11 TAGAACTAGTTTACTTTCTAGCCACTGTGTTCAACGCTCATCAACCTGATTTACCTATTAAATCATGACTGTGTGCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGGGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr3R 30302247 5' + Doc 50 1 53.42 CATTTACCCATTTACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACATACATATTCATATACATCTCCATATACGTAAATAATTACTATTTATTGATTTATATTGTGTAGATC:1 - chrY 2720354 5' - HMS-Beagle2 7176 2 68.38 ATTTGAAGCTTTTAAACTACTTCAACTTCACAGAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chrX 14346519 5' - roo 9017 2 53.42 GGTGTCTAAAAGTGTGCTCTCTAATTATTTAGTATGTCATCTATCAATTGCAGCATACTTTTGGGCAAACCTATCAATAGTTTTCCAGCCCATGCGTTTTGCCATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chrX 18353632 5' + jockey 26 1 64.34 CGTACTGCTGGGGGCCAATTATATTGTGCCCACCAATGTGCTGCTGGGTCCACTGATCAAGGTTCACCTGGTCAAGGATGATATTCCCAAGGCAATCGAAAGGATATACCCAAGATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACAC:1 - chr2L 18451476 5' + S-element 6 2 67.12 CCGATGGACATTGTGCATTGCTACTCCACGTGCAGACACTGCAACCCGAAAAATAATATGGAAGAAACCTATGCGATGATAGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCT:1 - chr2R 3170030 5' + 1360 68 1 68.80 ATATCAATATAAAATAATATGACCATGGGAGAACATGCATAAAATACCACACATTCAAGAAACTTGTTTTTTTTTTTACATTGAACTATTTAAACGAAAAGTACTGAGATTAGATTATAAGTATATAATATATAGTTAAATACAAA:1 - chr3R 25065809 5' - transib3 60 1 40.41 ATTAATAAATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGACAAAAAGTGGGCAAACGATTCCAGTTTTCAAATTTAAAAAATTCGATTTTTCC:2 + chr3R 20001632 5' - FB 21 1 56.16 CTGACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCGCACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGC:1 + chr2L 23372503 5' + gtwin 46 2 53.79 TTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGCATATCATTGCTATCTCGCTCTTACT:1 + chrX 10128192 5' + invader3 5278 2 68.75 ATATAAACTGAATGTCCCAGTTTATTTATCTAAGTACTTTAGTTAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 + chr2L 20556431 5' - 412 7473 2 70.63 CATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTC:1 - chr2R 4774739 5' - baggins 5328 1 71.23 GTCCGCAGGACTCATCCTTCCACGGCAAACTTTGCTTAGCTACATCTATCTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCG:1 + chrX 12214470 5' + opus 65 4 65.75 TTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTC:1 - chr2L 23295922 5' + micropia 4969 2 73.24 AGGCAGAGATCGGATTAGGTTAGGATCGATTTAAGCCCAACTCTACTTATCGGTTGCACCACCCCCAAAACACTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATT:1 - chr3R 29516586 5' - I-element 5309 1 51.37 GTACGATTGTTGCTTTGTTTGTGCTTAGCAACTTCTCTGCTAACATCCTAAAGCGAGTCCAGGTGAATTGGGTAATGCCCTTGAGTAAAGATTTATGTAAATAATAGATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 + chr3R 11146308 5' + flea 4773 2 74.66 GAAGTGATCTCCTATTCGCAGTAAAGCCACCTAAACACTTTTAATTATAGTAACTTCTAAGGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:2 - chrX 19585301 5' - Transpac 5172 2 60.69 TATACAAAAATATCAAGAACTAATTTGTTTTAGTTTGATTATTTAAAATATATGCATGTTTTTATTCATTTTTAATTAGATATACAAATGTGTAGCTTTGACTTTGCTTTATATATTTTGAGCCAAAATACATGAATTTTTATTAT:1 + chr2L 10302136 5' - S2 1633 1 65.07 AACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTA:1 - chr2R 4206659 5' + 1360 318 1 73.79 ATGGCAAAAGTGATAGATTTCTCGAAATGTATAGGTAACCGGCATCTCTGGTAGGAGAATCACGTGTTGGCCATTTAAAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGAT:1 + chr3L 16270242 5' - jockey 129 1 58.22 AAATATTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATATACATATATATGTAATGTGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 - chrX 11661485 5' - 297 356 2 65.94 TTTTAATTTGTATTTTTTAGTTAAATATATTTTTTTTAAATTGAAAGTTGCAGAGGAATTTCTTGTACGAATTATATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chrX 22676320 5' + 297 43 2 54.79 GTGTGAGGCGTTTGTAGATTGCATAATTATGCTAATTTTGTTGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTAT:1 - chr2R 16496681 5' - hopper2 1560 1 50.00 TTGTGTTCGGAAACCTAATAATCCCTCAAACACCATCGAGAGTTCGTTAACAGGAGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 + chr3R 22840382 5' + Transpac 4975 2 58.27 ACTTAACCAACTTTTCAACAAGTATTGAACGCAGATCTCAAAGTGTGTGTCACTAAACTTTGTTATGCTATAATTATATTGATTATATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCGGTTTTAAGT:1 - chr2R 9092086 5' - 412 472 2 66.92 TCTTCTTTTTAATGTTACAGGTTATAGGATTGCAATGTCGCTCTTCATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAAAGTCATT:1 - chr2L 21153618 5' - 1360 386 1 71.92 CACAGCACAGCGCAAAATCCGTCCCTTACACCTGAACTTCCTCTTATGCTTCAACACGCTTTCGCTGTAATTTCCTGTTGGCAAAAACTGAAAACTGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATAC:1 + chr3L 10563853 5' + hopper 22 1 69.18 CGGTTTCTGGCTCGTCGCGCATTGTAAAATGTCCATATATATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chrX 1764140 5' - opus 468 2 65.38 ACTGCTGGTTAATGAATTTGTAATGTCTTGAATATTTGCCTTCATCGGTGACAGAGCAATTAGTTAGCCGGCACTTTGCACTTGGGATGGCATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - chr2R 13471466 5' - flea 226 2 65.07 GCAAGTTTGAGTTCTGAACTTCGAAGAACTTCAAAGAAGGCTTAAAAATATATGTTCTTAATTTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 - chr3R 29622755 5' + pogo 55 1 60.27 GGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 27188617 5' - roo 9059 1 60.71 CAGTTGCCAGTAAATAATTTTTGTGCAATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 - chr3R 5453732 5' - I-element 5305 1 53.42 CTTTCCCTTTTTCCGAGTTGCCGCTTCGATGACTTAATCTCGTCGTCTTTTGGCGCCTGTCAGCCGGCGAAAAGAGTTGAGGGAATGAAAGGAATGGGTGATCTGGTGTGATGAAGTGACGGAGTTTTCTGCTTAATTAAATGCAA:1 + chrX 14636111 5' + S-element 73 1 55.48 AAAATCATTAAGACCCATGGCATGTTGTCAATCCTTTGTTTTTCTGTGAAGCTGTGTGGTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 16463638 5' - roo 9055 2 71.92 CCAGTATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATACATAAATAGATTCGTGCAGATGAAAAGAAACACTCGAAGAAAAGCGAACACTAGACTTTTCGTAATTGCGCGGGCGCGACCGGGCGTATGTTTATTCAGCGCGGTTAGTTGT:1 + chr3R 19446668 5' - GATE 8377 2 58.90 GCTTTATTCCAATTCTGGTTAAAAGAATCTTAAGCAGTCCTTTTGTAGAGTGGCAAGCACTTTATTTGAATTCTCTGTCATCCACTTAACATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAT:1 - chr3L 18972955 5' + mdg1 7070 2 62.07 CCTTACATCATTTGCCGAAGAATTGCAGCTGCAATGCCTGTTGCACCGCAGCGGTTGCAGTTGCAGTTGCAGGCGTTGAAGGGTGAGAGACATACCGACTGCGCCACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTC:1 - chr2L 20333175 5' - rover 7278 2 60.96 ATAAACCATTAAGCAGTTATAAGTAATTTAGAAAAATAGCCAATTGCTAATTTTAAGCACAAAAAGCAAAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAA:1 - chrX 15339313 5' + I-element 470 1 52.74 TACCTCCCACTGGGTCTAATATGTGTTGGCACTTTGAAAACTTTTCCTTTGTTCCATCAACCTTTTGGACAACTTCATTAACGCATAACTGAGTTAACCACATTATTATTATTATTTACCAAACTTAACGCTAAGTTATTTTCATG:1 - chr3L 6627326 5' - G4 3633 1 69.86 ATCGCAGCAAGTACGTAATTTACTCTATCACAGGGCCAGCAAATCATCACCATGCCACTTACAGATTCCGCCAACATTCCAAGAAGGTTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTA:1 + chr2R 10896627 5' - Rt1b 5023 1 60.27 GCAGCTGCAACACAGGCCACAGTCCGGGAGGTTTATTTAATATATTTGTGATTCTAAATATTGTAGCATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACTT:1 - chr2R 9455923 5' + 412 13 2 60.00 GCACACGTACATATTTATGGCTAACCTCTGACCCCGCTGCCTGCCGCTGATAAAGTTTTGCCAACGCTGCAGTTCGCCTATGTAAGTCGGTTGTTTGTTTACGCATACACACACACACACACAC:1 + chrX 6417684 5' + accord 7025 2 81.45 ATTTGATTTTGGCTTTTGTTATCAAACCAGCGTTTAGTTTCTAGTGCTAAACTTTTATCTTTTTATAGTTCACTTCATAAAGCTCATCTTTAACATAAAATAGCTTTAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr3L 14040835 5' - 1360 3375 1 76.03 GAAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chrX 11661350 5' + 297 41 2 56.85 ATCTTGTTATGACACCTCATAGACATATGTACATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTT:1 - chr3L 20209621 5' - Burdock 197 2 74.79 AAAAATGTTTATTTATTTCTCCAGCTCGACACTCACGCTCTGCTCTGCCCGCCCCTAAACAACAACTGACACAGGCAGTAGCAGAAATGTATAACAAAAACCAAGAAAATTAATGTTAAATTAAACAACAAAAAAGAAAAAACAAA:1 + chr3L 5157229 5' + gypsy7 5005 1 59.59 TCCCCAATTCCAGAACATCGACAGAGCGACCTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr2L 8396867 5' - roo 8982 2 78.08 GGTGAGAGGAGAATGTCTGGCATGGAGAGTGAGAGAGCGTAGCGTGGTTGGGAAAAACTGCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3R 11773889 5' + P-element 9 2 69.47 CGAGTTAAAAGCAAATCGAGCAGGCCAAAAAGCCGCCTATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2R 9504169 5' - roo 9049 2 67.12 TCCCTCCTCTTCATACCAGCCAGCATATGTGAAAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:2 - chr2L 18178382 5' + Tirant 12 2 71.56 AATCAATTAGAAAGACCAAAAGCAAGCATTCCAAATAAAACCCTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAAC:1 - chr3L 17207028 5' + I-element 4946 1 60.96 TAAATGGACATAAAACTCTGATAAAAAAAAAGCATTGGATAAAAAAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3L 18792379 5' - roo 9045 1 65.07 CATTTGTGTGCGATTTTTAGTTAAATTATTTTTACACCCCGAATGGCAGACCAGAAACCAGAACACACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGCGTTTTTGTATGTTATCT:1 + chrX 20614211 5' - I-element 5135 1 53.42 GGCTGCTAAAAAGTCAAGCTCCAATTTGGGCATCACTGAAACTCATGTTCCCGAGAAAAGCTAACCGTTGAGAAAGGCACTTATAAAATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTG:1 - chr2L 16509027 5' - invader4 3054 2 66.44 TACTCATACCACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAATGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTGTGGTCTGGCAGAGTAA:1 - chr2L 18689244 5' - Gypsy6A_LTR 246 1 71.23 CATAATAAAAAACCTTTCAGTAAATTCAGGAAAATCGAATAAAAAATGTTCTTGAAAATGCTTCTCTCTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 - chr3L 19574166 5' - 297 350 2 56.16 TGGTGATCTTGTTCTTGACAGCCAACGCTGTGTGGGCACGGGCCACCTCCATCTCGAGATCCCTCAAATTTTCCACATTGCGATGGAGTTGAATTCTCCGCACATAGGGCACCTAAGGGGCCATTG:1 - chr3R 14845636 5' + Gypsy12A_LTR 1909 1 70.63 TTAATAAATAAAATATAAGATATAGGTATACACATAGTACTTTGACATCAGTTTTGAAACGGAGGTGGTAGGTGAGAGTTTATGCAAAATTTTATCTAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:1 + chr3R 21706209 5' - I-element 5332 1 67.12 AAAACAGCAGCGGCGGAAAAGCTCTTCGAAAAACAGATGATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 4662042 5' + roo 8710 2 54.11 CCAGGACAGTTGGTTCATGAGATTCATATGGATGAGCAGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAG:1 - chr3R 22840463 5' - Transpac 5151 2 76.39 ACATTTATAAACTGACACATTCGGCGGCGCAGCGAATTTCGCTAGAAAAGCCTTTTTTCGGGGCCTGAGAACTGAGAACGGCAAAAAGGAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chrX 8760051 5' - roo 9040 1 63.70 ATTAAACCAAATAACCCAGCTCATTTATTAAAATTATAGTAGTAGCTTACACTACCAGTTCCCAAAAAAAAGTTGCTAAAAAAGTTTTTATGAATAAATTATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 + chrX 20795922 5' + jockey 4780 1 64.38 GAAAGTGCTGGTAAAATTGATGGCTGCCGTTGAGATAATAACAAAATTATGGTACTTAATGTGCAATCGGGAAAAGGGAAAGGAAAGCCATTATAAGAATATGGTAATCCCCTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGATTTCAAATC:1 - chrX 19131578 5' - Doc3-element 4670 1 71.92 TATTCGCACTGCAATTATACAAATCATGGCAATGTTGGTTCGCCGCGGCGGCTCCTGCTTTATGTTTTGCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2L 20986621 5' - roo 9030 1 54.01 GGCCGAAAGATTATGTAAGTTCACGTGAAAAGCAACAACACGAGATACAGAGAAATAGTACTCAAATAATAATATACAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGA:1 + chr3L 18788972 5' + 1360 33 1 57.53 ATTATGCACACCGTTTATTATTAAAATCAATTTGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTC:1 + chr3R 17210032 5' - HMS-Beagle2 225 2 76.39 TTTGCGTATATTTTTGCATATATAAAATATACAGTAATTACTGATTACTTTTTAAACAAATGTAAATTATATAAAAAGGAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr3L 11903183 5' - opus 7464 2 59.59 CATTATAGATGCGAATCAAAGGGTAGTAAGTGAGAAAACGTACCTTAATTTATTGAAATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 4214406 5' + jockey 18 1 72.60 AAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGGGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCACCCTTGGTTAAAACTCCCAA:1 + chr2L 16922774 5' + P-element 257 1 16.30 TGCCACATATGGGCATTAGATGCAGCAAGACAAAAAAGGATGAGTTGATTAAAAATTGCTTTTTAAACACACACATTTGAGTATGGTTTCGAACAAGCTTTAATTTATCCCCCTGACGTCCAAAGCACTGTATAAATGCCAGAACT:1 - chr3R 23633488 5' - baggins 5340 1 71.92 AAAAATTTCAAAAGAACCTTCGTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chrX 16217574 5' - P-element 2872 1 75.17 TGAATCTGCAACGAATTGCTAAATTTTAACTGAAACATTTATCCACCAAAGCACTAAATTATTCCTGTCCCTATAGAGAACTGGGGTGAGCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr2L 17206130 5' - hopper 1396 1 73.29 GTTGAAAGGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGGGTTTCTGACCATAAAATGTATATATATTCTTGACGAAATTTCGCTTTCGCATTCACACTAGCCGAGTAAGGGGTATCTGAT:1 + chr3L 19471447 5' + INE-1 545 1 55.36 CAGAATTTTGTGTAATAAATAGTTTCCTAGAAATATATATTGGTTGCCAAGGCCTAATGCACTGATACTAATTTGCCGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTAT:1 + chr3R 5115269 5' + Ivk 46 1 54.11 GGGGCAGCCAGCGAAAACAATGGAAGTGCAGCCCCAAAAGTAGGCAACGCTTTTCACTCGAATCTGCTCCGTGTATTTGTTATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 + chr3R 15168867 5' - jockey 4948 1 53.79 GTTGTATCATAAAACAAATACTGCTAATAACAATAACAAATAAAACAAAACAATAATAACAATAAACAAATACTGCTAATAAGAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr2R 17187816 5' + roo 37 2 46.58 GAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2L 19643582 5' + hobo 42 1 74.74 AATTTTTCAAAGATTTTTAATGACTTTTAATTGACTTCAGGATGATAAGAGAGTTCATAAAGGCAAGCAAATATTCTGAATTTGGTGCAAGAGAATTGTATGTATTATAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr2R 9868838 5' + roo 8676 2 76.03 GGGCAGAAAAAGGCGAACCTTCGGCAGCATGTTGCTTTCACCTGGTTGGCTGCTTTGCAAATGCTCGGGTTCCGTTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCGGTGGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chrX 2518170 5' + P-element 1 2 80.45 TACAGATACATGTCTTAAACTGCAAGCGAAATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr3L 4933845 5' + blood 7047 2 57.53 CCCAAGCACAACCAAATGACTGCACATGGACTTGTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGT:1 + chr3L 3339357 5' - Transpac 5149 2 74.65 AAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTCATTAACTTTTCATTTAACTTTTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCGCTGCTC:1 - chr3L 9764440 5' - P-element 240 1 19.26 CACGCCCGTTGTACTAACAACTAAAAATGCAGCCCAATCCCAAAAATCAGGAACATTCAGAAAAATAATACTTGAAAATTGATATTGGACTGCTCTTAACACTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 14493968 5' + roo 19 2 69.18 CATAAAAATTTTCTAATCCACTTTGCGTAAATAATCATGAGCGTCAATTCAATTCCGGCAGCCATCACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTA:2 + chrX 19982344 5' - hopper 1357 1 54.11 AAGCAAGCATTCCAAATAAAACCCTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACACA:1 - chr3L 17207009 5' + I-element 4949 1 53.85 AACAAATAATACTTCATACACCAATATGCAAAAGAAAATGGTTAAGTACATAACCACTAAATAAGTTTACCCTCGAGCAATGCATCGCGCCGCCACAAGTCGGCAAGCCGACTCAGCATTTCTTGCAGCGTGAAGCAACACTCCCG:1 - chr2R 4270251 5' - gypsy 7117 2 58.22 AGAAATCTTGCTCACTTTTATAGTATAATTAAATTAAAATTACATAGTAATAAATGTTCAATACTACATTTAAATGATATATAAATATATCATTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGA:1 - chr3L 17162421 5' - Stalker2 7621 2 63.01 CTTAAACTATTTAGCTGAAATTACCCTTGTCAGTTTGATGTAAACAAATAATACGCTTTATGAACTAAAATTATGATATTTTACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chrX 3578206 5' + hobo 40 1 50.00 GTCAAGGATCGCCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3R 21587602 5' - roo 9003 2 69.18 AATGCAAATATGTTCAGCATTTTTTAATCATATCTTTAGTAAAATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGT:1 + chr3L 15277623 5' - I-element 5273 1 71.92 TAAGCACTTAACAACTGTCCATGTGTTTTCACATATGAACATACATATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGCCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACT:1 - 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chrX 19005127 5' + F-element 93 1 74.66 GGGTCTTGTGTTGCAAATACTGTTTTCCATGTTTTTAAACAGCTGCACGCCTTGGTTGACAAATTACATAGGCTAATTAGCATATATATCACATACTTCCTAAATTAGAAGCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 - chr3L 20744327 5' + 412 10 2 78.77 AATTCAAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1 - chr3R 28659158 5' - Burdock 6364 2 58.90 CACGAGATTTTAATCTGGAAAACGTGTTGAGCTTGGGAAATTAGTTAAAGTCTTAGTGCGCAAGGAAAGCCATTCAAATTGTTTTACTTGCTTTACAGCTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAAT:1 - chr2L 6876730 5' + Rt1a 30 1 69.86 ATGAATAATGCACGGTAAGAAAAACATTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGATACACCCAT:1 - chrX 5148831 5' - hobo 247 1 76.23 CCTTAACTGCATTTTATGCACTTTTCTTCTCATCGGGTGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACG:1 - chr3L 18767829 5' + roo 8661 1 74.66 CCACTGCAATCCGTGTTGCACTTTAACCATTTTGTGGGCTGTGCCGCGACAATGGGCTCTTTATGCAGACCTTTATTCAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCT:1 + chr3L 15167817 5' - invader2 344 1 52.48 TTTATGCCTGAAATAATGACGTCTCTTGATATATGACAAGGTAGCCGTAGCATATGCCCTGGCAATATAATATATAAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 + chr3R 20089919 5' - mdg1 7420 2 58.22 TTTCACTGTTGATTTAGCATTCGATACCAAAGAACTTTGACCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAGGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAA:1 + chr2R 11379452 5' - hopper 1336 1 71.23 TTCTGAAATTGTTGCCGCACATCCAAATGAAACGAAACGAGACGTAGATGGTTTTCCAGTTCAGTGACAGCTTTTCATTTGTTTCATTTTCTTGCCGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 9519685 5' - roo 9048 2 66.44 GCTTAGCTAGCCCCTCTATATTTTCTTCTTCCTTTTTTTTTTGTT:1 + chr3L 3744647 5' - Doc2-element 230 1 88.89 CCTGGTTATAAAGTATACGACCAGTCAGCTGATTTTTCAAAACAAATAACTATCGAAATTATTTTTAAATGAAAAGGCAGCTTTTTTTGTCACTAAAACCACATAACAATAGATGATGTTGTTATATTTTCTGCAAATAATTTGCA:1 - chr2R 21060764 5' - looper1 150 1 52.05 GCTTAGAGCTCCGGCTTCCATTTGCTGACCCCCAAATCCGGAATCCTTTGCTCCACCACACCAGCTCACATTTCACATTTCGTAGTCCGCGCTCATAAACATTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCT:1 - chr2R 10688520 5' + McClintock 171 2 73.05 TGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAGTATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGG:1 + chr2R 2666326 5' + Rt1a 50 1 52.31 AAATGGGTCAACAAACTTGCGCTTGGTCTTTGTCTCCGGAATCTGTATGCTGAATCTCAACATTCTAGCTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGGCGGACATGGGTAGATCGACTCGGCTATT:1 - chr2R 5296380 5' - INE-1 102 1 78.52 CACATCTATTTACTTTGATTACTCTTACACACTAGCTTCGTTAGTACAAAAAAGTAATCATTTCATTCCTGATAAAAAGCGCTGCCAAAGCTATACAGTAATTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 - chr3R 12001093 5' + FB 17 1 72.73 CATCCTACTGCCAACTTGCAACTTTAAGTAGCGCGCCCAAAAGTACGCTTCGCATTAATGGCGCAACGTCTCGCCGCTTAACCGCACTCACTTCCAGAACTTCGCCCAAAAATATATTGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCC:1 - chr2R 7889535 5' + jockey 4664 1 59.59 GCGAAATGTGCGTGCGCGACTTGGGCAGGATATACCTTATCCTTTGAGTGTTCTTTTTTCCCTATGCCAAGACAGCAAGCAAATTTTTTGAACCAAACGTTTTAGCTAAGTCCAATCTCTGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACT:1 - chr3R 24467899 5' - R2-element 3314 1 56.16 AAAGTATGCTACAATTTTAAAGCCGTGCGCATTTGCACCAAATTTTAATGCAAGTATTTTCAGTGATATTTAGTTTCATCAGATATTAAAAGATTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGGGGTGGCTCCAGGCTCTCTT:1 + chr3R 29963273 5' + 1360 73 1 34.25 GTATCTGAACCTGCCCAATTGAACTTTCCCAGCTAACGAGTATCTGAAGATACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - 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chrX 21587767 5' + INE-1 139 1 34.25 ATTTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCT:1 + chr3R 21276507 5' + BS 5031 1 58.90 GGAAGAACTACATTCCTGAGATCGGTTTTACTCGGGTCTAGCTTTCGAATCAAATCGCAGAATCCCATATCTTCAACAATAGAAAAGGGTTGGACATCTAGCGCGATCATACGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 - chr2R 6492973 5' - copia 245 1 78.08 TAATTGGTGTTAATGACGTGCCTCAATATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCTT:1 - chr3R 4533006 5' + 1360 20 1 70.00 TGATAGCCGGATGCCTCGTTCTCGTCGTAAAGGTCCGATGCCCGCTTGCGAGGATCGGTGGCGCGGTTGAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAAC:1 + chrX 2523906 5' + P-element 464 1 50.00 GAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGGGAGATAAGATCACCCACTTATGCTTT:1 - chr3R 10636162 5' + blood 97 2 78.77 AAAGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGTGAAAGAGACCTACTAGGTTATCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGAGAATGCCATAGTCTAGTTCCCCGGCTATCAGATACCC:1 + chr3R 18346607 5' - INE-1 556 1 47.11 GTTTTGGGAGAATTTCTATCATTATTACTATCATTTGAAATTAAGGTTTAAAAATCGGTATTTTTACATGCAAACATCAAATATTTCCCAATAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGCCACCCTAGTAGATCTTTAGATACA:1 + chr2R 17818073 5' + mdg1 7171 2 62.33 GAACATGTGATTTGAAATGAGATTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chr2L 9347503 5' + opus 163 4 79.61 CCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCTAGGTTCTAAAACCTG:1 + chr2R 5582152 5' + Cr1a 471 1 56.85 ACCAGACCACAATTTACGGCAATAATTCAAAAGATGGATTGCATAATACCATTGAATGCGATGCGGTATTACTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGTTACT:1 + chr2L 13941295 5' - Ivk 5222 1 48.57 TTTGTCGGGAATGTACGTAATTATCCATTGAATGCCGGATCACGACGACGACGACGATTTAACTCTTAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 - chrX 18737317 5' + I-element 31 1 57.60 CGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCCTATCTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCG:1 - chrY 1428633 5' - G2 2771 1 47.87 GTCTGCGGTATTAATCTTCATCTATAAAAACTTTAGCAATCACTACTAAACCATCTGGCTATAAACCTCCTGGACAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCAC:1 + chr2L 11442911 5' + G-element 4190 1 65.71 GATACAAAATTGTTTTTTATTTCTCAGCTAAACAATTCAATTTGGATTGGAAGGCTGTTTTTATTTTCTAAATCCACGATACAAGACAAGAAAATCATGAGTGATCATGACCTAACTAAGAGCCTGTTTCCAGCCGCCCTCGCGTG:1 + chr2L 23167719 5' - baggins 100 1 73.97 GACAATAGCTCTTGCTTAAATGGGTCAAAGATTGAAGTAAAATGACAATCAAATCAATAGAAACCTTTTATGTTTATGAAATAGCAATTTATTACATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAA:1 + chr3L 9753549 5' - TLD2_LTR 166 1 55.40 CACACACCCCATATGTATTTATATATATTGTTTGCTTATATATGTGGCTTGGCCTACAGTATAGACCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3L 12899855 5' + roo 51 2 55.71 AAAAAAGCATTGGATAAAAAAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 18792402 5' - roo 356 2 54.11 AACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 - chr2L 20324192 5' + Tirant 62 2 70.40 TGAATGTAATGGAACAAAGCAGATAAACGTATTATACGTACAGATGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTAAAAATAATTATTAAATGTTATGAGCAATACATTTTTACACTCTCAATTTAACGGT:1 - chrX 16361593 5' + Tc1 140 1 58.22 AATAAAACTGACAGTATACGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCATACTG:1 - chrX 22574691 5' + 17.6 119 2 45.89 CAAATCACTTTTTTGTTTGGCTTTTGCTTTGAGACAGCTTATTTGTATATATTCATATATGTTCATATAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 - chr3L 14709016 5' + opus 45 4 57.04 CTCGAAAAAAGACCCAAGCACAACCAAATGACTGCACATGGACTTGTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGG:1 + chr3L 3339345 5' - Transpac 238 2 67.12 ATAAATCCCGAATATATTTTGTAGAATTTATGATGACGTTAAAAGCATCAGTATGTATCAGTATAGTATCAGTACACTGTAAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 + chr2R 15942246 5' - opus 462 2 46.58 CGCGGACTCATGCTTTTCTCTGCTCTCTTCTTTGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTAT:2 - chrX 850118 5' + jockey 95 1 73.29 AGCACAACTTTCACACAATTTTCATTGCACACTTTTCGGCTTGACACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGTGGGAAAAGCAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATCTTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chrX 19113610 5' + 412 23 2 68.49 TATTTTATTGTCAAAATCAATAGATGTCAGCGTTTAACAGCTGCCAGCGGCAAAATACAACCCCTGATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chrX 17027969 5' - roo 355 2 53.42 AGCGGTAGATGGGATCTCTAAGATTGGACGTAGCCGAGCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 - chr3L 14085002 5' - opus 482 2 73.19 ACAAGTACGAAAAGCTAATCCGGTAGTAAAATTGCCTAGCTAAAAGTCTAAAAGAATTCTATTTGCTGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCTGCTCTCGTGT:1 + chr3L 16663845 5' + opus 7154 4 48.06 GAGCAGTTTTAAATGTTTAATAATATTCATACTTTAGTCTATGCTCAGGGGAATTAGTTAAAATTATTAAGATTATATTATTAAGCTATTATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2R 12239866 5' - roo 9051 2 66.43 AGAAGTATGCTTCGCATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3L 13362749 5' + jockey 36 1 55.93 TGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 13827372 5' + roo 53 2 54.79 ATGGTTCATAAAAATATCTGGTTCGATTTTTCTACAGATACATGTCTTAAACTGCAAGCGAAATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 - chr3L 4933877 5' + blood 7011 1 78.87 AATCAGCTTTAAGAACTGGACTACTCAAATACCGTGAGAAACTATCATTCACAGCTATAAATATAGAACATATTAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chr3R 22771981 5' - opus 449 2 56.85 ACTCACCTTCAATTATTGTAAAACAATCAATACAAATGCATTTTTTAGTAAACAGATACAGAGATGTAAAAACATGTTTGATAATTCTGTAAACTCACCTTTTCATATCCGCACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr2R 16496513 5' + hopper 7 2 76.03 CAATAATCATTTTTCTTGAATGGGGATTCTTTTTAGCCAAGACATGATCACACCTCAGCTGCTAGACAATTTAATCCATTCTTCCTTTATCTGCTTTGCATTATCCAAAACAGTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCT:2 + chrX 21581291 5' - Tabor 477 2 71.23 AAATCAGTACCTGTATATAAACTCTGCACTGACCACGATCATCGACAATCATGACAGTAATAATCCACTAAATGTACACGAAAATATAATGACGCTTGAAAAGTAGGCCTCAACGGCAATGGTACGCTCCCCACTATTCCAACGC:1 - chr3R 18750246 5' - mariner2 136 1 62.76 CGCAGAGTAAAGGGATTTAGGAAATGTGAACAAAATCGATGACATTAAACAAAAGTTTTACGTGTAAAACAAAGAAAAAAATACAGTTGCAATTTTATTAATTTATTATGATAGACAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAA:1 - chr3L 27670250 5' - I-element 5322 1 67.12 ATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGAT:1 + chr2L 14480452 5' + Transpac 5003 2 76.55 TGTCAATCCTTTGTTTTTCTGTGAAGCTGTGTGGTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3L 16463613 5' - roo 9030 1 54.79 ACAAAACAGTTGCAAATAAACAGTTGTGCTCGCTCACTATTAAGAGAGAGGAACATAGCACAAAGGGGAATGCAAAATGTGTTGGTGCACAGAGCAATGTATAAAAGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3R 3590809 5' + pogo 11 1 75.34 GTAATTGTAGTAAAGAAAACATCAATACGTTCATGTCTTATAACACAGGCTATTTTATATAGCAAGAATAAATTGAAAGTACCCAAAAATCGCTAGTTACAATTAACAATTCGGTAAGGAAAGGTAAATTTATTAAAAGTAGTCT:1 - chr2L 21272375 5' - Cr1a 3983 1 75.86 ATAGATGTCAGCGTTTAACAGCTGCCAGCGGCAAAATACAACCCCTGATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chrX 17027950 5' - roo 353 2 61.24 CTGGGAACCCTAGAAGTCGTCCTGCGAGCTGTCCCGCCCGTCATCCGGCTGCTTAATGTCAACTCTTGTGTAGTATGGGAATATATCGGGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTCGCATG:1 - chr3R 28782664 5' + blood 44 2 51.13 CATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 - chr2L 14480512 5' - Transpac 239 2 71.01 ATTGCAATGTGCGCGAGCAAGCAAACAGTTTTTGTTGCATACTTACAGCCTGCGAATGGTATCTTTATAGTGCTGTGTGGTCTGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 23539384 5' - hobo 2909 1 57.97 ATCAGGATACGTTTTTTGTTGTCATCTTTTTATGCGTAAACTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTT:1 - chr3L 5652485 5' - P-element 149 1 35.82 GTTTTAAATGTTTAATAATATTCATACTTTAGTCTATGCTCAGGGGAATTAGTTAAAATTATTAAGATTATATTATTAAGCTATTATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr2R 12239861 5' - roo 9040 1 60.27 GGCTGAAAAGGTTGCTCCTTCCACTAGTTTGGAACGGTTCCTAAAAACTGACCTCACTTATAAAAATGGGTCAAGAAAAAAAAAAACGGAGCTGGACAAGGCGTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 + chr2R 6492782 5' + copia 4889 2 71.92 AAGCGGTCACTAGAAGTAGGGAATCTTGTTGAACTGAGGTAGCTGATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTG:1 + chr3L 23271380 5' + invader2 79 2 69.18 ATAATGAGGCCAACTGCAATTGCGACAAAAAGTGCAAGCGTGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAG:1 - chr3L 7790749 5' + copia 4950 2 73.97 GGCAGTGAAAAAATGGTAGCCATTTTTATTGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2R 22012260 5' - opus 7462 2 57.53 ACAACGATCGGCTTCAAGCTCACACCAACCACCTAGCGGTGGTTATTATATTTTTTGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACGTATTATCACAAAATAAATTTCTAAAATGACTTTATATTAGAAT:1 + chr4 808651 5' + 1360 383 1 58.22 ATCTGAAAGAGCAGAAGGGAGTTTATGAGCTGCAAAAAGCATACGTAAAAGCAAAATTTATCCAAATCGGTTGTTTAAAAATTCATTACACTTTAATCAATCTGGAGCAACATATTATTTAGAAGCGATGAATCCATACAATGTAA:1 + chr2L 17948846 5' - BS 5068 1 73.97 TTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGGGAAAAACTCTAATAAATGTGCTTGTGATACTCTGCTGCATATTATTCAATAAACTTACAAGTTTAAATATAATCTAAATATAATTCTTAGGCCAT:1 + chr3L 7995482 5' + gypsy7 194 2 62.33 CCGACCGAAGCCACGAGTGATGTATTAAATAATTCTTATTCATATTTGCTACTCAATACTTTGGCTTAAAATAAAAAGCAAGCAAAATAGACAAATTTTAAAGCATCTTCTCTTCATATATATGTACATATATACATATACATAT:1 - chrX 16110704 5' - Stalker4 248 5 76.55 TCCGGCACGTTGTGTTAATTCGTTTCTTCTTTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTTGTTTCTAATTTACCATTCTGATTTTGTGATTATTCTGACCATTTTCGATTGCGTTCGCTG:1 + chr3R 27437129 5' - Porto1 4326 1 76.71 TAAGAGAGAGGAACATAGCACAAAGGGGAATGCAAAATGTGTTGGTGCACAGAGCAATGTATAAAAGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3R 3590769 5' + pogo 40 1 53.33 GGGCTTTTCCTCTCAACATCGACGATAACGATTATGTGCAAAGTTTTATTTCTCACTCTCGCCGCAAAATTAAAAAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - chr2L 7271951 5' + 297 6604 2 67.91 GGTGGCAATGCTTAGCTAAGCATAAATGTTCGGATTTGTACGCGGAATAGGAGGCTAAATAATTTATTTACTTATTTATGAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACA:1 - chr3L 21773264 5' + X-element 4664 1 54.79 TTTCACTCCGAGCTTATGCAATTGTTTTTCCTCAAAAGCCCACGACTTTACCACTCACTTTCATTGCACTTTAATCTGCTAGACGATGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCT:1 - chr3L 16703903 5' - FB 8 1 58.04 TCTCTGCATTCCTTAAGGAGGAATTTGATGAACACGCTTATATAAACTGAATGTCCCAGTTTATTTATCTAAGTACTTTAGTTAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:2 + chr2L 20556392 5' - 412 7509 2 59.59 TTAAGGCAACGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGT:1 - chr3R 1844864 5' + Cr1a 109 1 75.51 GGGGAAATTTCTTAAAAATAACGAAAAGAAACATATTGATTTCAATTTCGACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAGAAACTACATCAGTATAG:1 + chr2L 11734521 5' + Doc 64 1 66.42 TTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGAG:1 - chr3R 17210111 5' + HMS-Beagle2 47 2 53.33 CCAGTCAGCCCGAATGCAATTAAAATCGAACATCCATCGAGCTCAAAGTGTCCGCAACTTGTGCTGCATACTTTTGTGCGTCGCCAGGAGCCGCACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1 - chrX 7031720 5' - hopper 1392 1 68.75 ACATATATATTTCAAATTTGTATATGTTCACTTCATCAGGAACTTCTCACTGTGTAACCTAACTTAACCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 - chr2R 8091260 5' + 1360 52 1 53.42 CCCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTG:1 - chr2L 13510875 5' + diver 5947 2 68.84 TTCTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr2L 22719567 5' + 1360 58 1 58.90 CAAAATCAAACGAATGACTTGGGCAACGAACTTGTTTCGCATATTGCGCACACACGACCGCAACAACAATGCGAGGATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGA:1 - chr3L 1845054 5' - invader3 206 2 65.81 AACGTATGTTAATCCTGGCGAGGATGTGCAAAACAAAAACAATGAGCACTTGGGCGACAAAGGTTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTACTTTATTAGGCGTTCACTTCAC:1 - chr3R 13148909 5' - F-element 75 1 52.99 AAATTAAACAATTTTTAAGTTAAGACAAATAATAATCATTATTCTTTATTAAGTGCATCAGAATACGACTGATCACTTTTAAGTTCTGTTTAAAAATAAAGTACAATTTAGATATTTATTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTT:1 - chr3R 1960331 5' - gypsy9 5176 2 72.60 AATTGAATTTTATAAATTATATTTGCTATATATTTCCATACCCTATAGAAACTTCTTGTTCCACCTCCCATGCACCTCCATGTGTGCTCCACACTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAG:1 - chr2R 23187313 5' - R1A1-element 5233 1 65.96 ATATAAATATTTTTACAGATTTTAAGTGGAACAAGGCAATACAATTTTAGTTCGAGCACATCCTTGCACGGAATCTCCTCCTTCCGTCGGCATTTATTTCTCCGTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGC:1 + chr2L 19821531 5' - 1360 68 1 71.03 GCAAGCACTTTATTTGAATTCTCTGTCATCCACTTAACATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTT:1 - chr3L 18972903 5' + mdg1 85 2 74.66 GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAG:1 - chr3R 21907536 5' - 1360 3299 1 77.24 TACTTTTGTATTTATTTATTCGTAAACTATTTTATTCCTTTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1 + chrX 18190365 5' + hobo 81 1 71.23 ATAAATCTCCACGCAACAATGCGTCTATATCGGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3L 12899779 5' - roo 318 2 77.40 ATCCCATTTGATTTGGTAATAAAACTACATCGAATTTTGAAGGGCGTGAACGAATAGCATGTAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCT:1 + chr2R 21029352 5' + Transpac 55 2 59.03 TAATGCATAAATTAATGAATATGTTTTTAGCCCATATATTGTAGATTTTACATATGATCGTAGCTCTACTGACATTTGCTATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 + chrX 3767563 5' - I-element 5315 1 50.68 CAGTTGGTTCATGAGATTCATATGGATGAGCAGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCT:1 - chr3R 22840457 5' - Transpac 243 2 77.95 TTTATCCACCAAAGCACTAAATTATTCCTGTCCCTATAGAGAACTGGGGTGAGCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr2L 17206093 5' - hopper 1375 1 53.85 TCGCAATTTCACACATATACGTGAGGTAATTTTAAATTGTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 13366088 5' + hobo 42 1 51.49 GATGGGAATGACTGGGGACCCAAAACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 - chr2L 20324226 5' + Tirant 18 2 67.83 ACCATTCTAACTTTTTGTTTTGTAAGATTGTATTTTGTTTTATCCCAAAAGTAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr3L 16907777 5' + jockey 62 1 58.78 ACGACACCTGCAGACTAATTAATGGCAAATTCCAGGCACATCACTTCGATGTTCATATATGACTGGCGCACACCTTCTTCAGCGTGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATG:1 + chr3L 20176718 5' + gypsy 37 2 56.85 GACACTCTCCTACCCTATCCTTCTTCCAGATATCAGCTATCTATCTATCTGCTATATGGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3R 22522727 5' - roo 9008 2 59.59 AATATATTTTATAATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCA:1 - chr2R 21425169 5' + HMS-Beagle2 6934 2 54.11 GTCCTGATTGTTTTTACATGCCATACATACGAGTACATATGTATATGCACAGGGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTT:1 - chr2L 15906095 5' - Tabor 416 2 63.70 CACTGATTCGACTGATAAGAAAACATATGTACCCTCGATGTGGATACGGCCCTGCCTTGCACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 + chr3R 18697861 5' + 297 35 2 54.62 TTGCCAATTTATCGCACTCCCACTTTCTAACTAACGGGAATTCGATAAGCTATTGTTTGAACATTGATATTATCGGAATGCCATAACATATGCACGCCTTCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAATTAAGAAT:1 - chr3L 22491335 5' + Stalker4 7212 4 55.48 TAAAGTCGATTGATAATGCAATTATTGAAAATAAATATGCATATGCATTTTTAAATTCTCATCAATCAGCTAGTGGAAATGCAAATGCAAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGGCAGATATGCGTTGGAATAGTAAGGAGCG:1 - chrX 22517553 5' + mariner2 135 1 77.24 ACATGCCACGCCTCCTCTCCCCTCTCCAGTGGCGCACGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTAAATA:1 + chr3L 10051039 5' - Quasimodo 34 2 64.06 ATTGGAACCCGCCCAACCCCCATCGTACACGGCAAAAAACGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCTCACCAATTAGTTTTTTTTGC:1 - chrX 1123654 5' + FB 84 1 73.97 GCAATTTTGCTTCAATAGTTTACCACGAATGTGTGAAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr3L 14040988 5' + 1360 54 1 54.11 GCTTAAAAACAATATGCAGAGCCATTGTAGGTGGGATAAAAACTTAATTTAAAATATATAAGTATTAACACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 21162010 5' - roo 358 2 55.48 GATTTTTAGAAACGGGAAATATCGCAGACATGAATTAGTTCAAAGCCATGCTAATGTCTCGCTCGTTAACTATAATCTTTTGCCCTTGAAACCCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATA:1 - chr2L 18791071 5' + Doc 4475 1 63.70 GAAACGAGTAATCTTGCCATTTGCACAACAAAATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGGCTCATCCAAATTAT:1 - chr3L 19335477 5' - invader4 3074 2 75.18 GTATACTTTGTGTATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACATACACTA:1 - chr3R 29091425 5' + rover 6975 2 69.86 AAGTTGGTGTACCTACTCTTCGGAATAATCCAGATAACTTCTATAGTTGCTCTATTGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCG:1 + chr3L 2187083 5' + jockey 349 1 60.87 GGACAAAAAAACAACCAGAAATCGTCTACTTTTATGTGCTTAACAGGGTTTCAGTTTGTATTTTTGCAATGAACTAAATCAATAATATATTCAAAATTAAACAACAACCATGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTTCCTCTTACGCTC:1 + chr3L 19561732 5' + GATE 8277 2 72.60 ATCTGAGCAGATCAATCGCAGGTGGGTTGTATGTTTATAGTATGTAGTATGTAGTTTATAGTATAGTATGTTTATAGTGATATATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGG:1 - chr3L 11576337 5' + HMS-Beagle2 35 2 60.27 AATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chr3R 6412035 5' + Tirant 8139 2 64.04 AGTGCGATCGCAGCTTTTTTGACGTTTTGTTTGGCCAAGAGGACACTTTCAAATATCGGTAACTAACGGTATTCAATAAACGCACTGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTA:1 + chr2L 6742868 5' - P-element 128 1 56.85 ATCAATCAACATGATTGAAGTACGTATCTCCGATCCACCGATTTTATTAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3L 17904862 5' - roo 8998 2 69.86 CTGTCCGACGGCCTCCGACTGATCGCCCTGATCGAGGTGCTGTCCCAGAAGCGAATGCCCAAATACAACAAACGCCCAACATTCGGTTGCCGTCGAAAGCGCCGTATGTTTTTCCTAATTTTCACTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 17117079 5' - Porto1 171 1 58.99 CAACAAGATTAAGGAATTCCAATGACTCACACCACTGACAAGCAAAAGAGCACTGCATATGTGGTTTACAATTAAATCAGCAACGTTTTATTATATGTAATGTAATGTAATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAA:1 + chrX 6294457 5' + Tirant 450 1 71.92 CTCCTATGGCTTATGCTTGTGAATACAGATCAGTATGCATTTGTTGATTAAAATTAGGACTGATTTTCGAACAATCCATCTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr3R 8183516 5' + Doc 46 1 52.74 TACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2L 5447900 5' - roo 8990 2 78.08 GAGCTTTTTACGCGCACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAATCCCCACGCCT:1 + chr2R 12069575 5' + Tirant 14 2 62.07 GCCAGTGGCGCCAAAACTAATCAAAGCAACTAGGACCGACGCTAAATCGAAACCACAACTACAATCACTGCGGAATACCAAAATGCAATCAAAATATGCAAGCCACGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chr3L 14551440 5' + P-element 15 1 75.17 CAAATTGCAATTTTAGCCGCTAAACGATTTTGTTAGCCCACGTTAAGGCAGAATTTCAAGAAGCAAAATCTTGTGTAAGCTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 3648837 5' + roo 8704 2 53.79 ACCTGTGAAATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr3L 25406600 5' + 1360 6 2 64.14 ATTGCGGACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGA:1 - chr2R 5173250 5' - Stalker 7227 4 62.33 GGACAGTCATCAATAGCTAGATCGCCTGAGTGCTTCGATAAAGAATATTCCAGCATTTTTAGTCAAATATCACTGATAGTCAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 + chr2R 4330707 5' + copia 21 2 64.38 AAATATATATAATTCATTTGTTAAAACCATTTGCCAGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGTGTGCTACTCGC:1 - chr3L 13545082 5' + hobo 53 1 51.72 AATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCC:1 - chr3L 19335429 5' - invader4 3081 2 67.07 GATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTAAATTTAATAACAACTCTAAATGCTCTGTTTTCCTTAAGCTGGTATGTGTGGTA:1 - chrX 23065112 5' - G4 347 1 66.44 AATGAACCGCAATTGCAAAAGTTTCTCCTTGCTCAAAACTCGGCAAAAGACGTATAAATGTTCACTTACGATTAGTCACATTTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATG:1 + chrX 13049833 5' - Doc 4320 1 67.23 GTTGCGAAGGTGGGATTTTGGCAGCCAAAGACAAGGAACGCACTTTCAGCCCCAAGTGCAGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2R 16510334 5' - roo 9013 2 57.24 ATGGATACTCCACTTCCAGTGGTTCTTGATGAATTGGGTATTCTGGTTCGGTTTGGGTGTGCGTTTTTTCAATGGATTAAATTCTCTAATTGATTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGC:1 - chr2L 12542903 5' - I-element 4885 1 62.76 GGCAGCCAGGCAAAAATGTGACGTGTGTCTATGCTCAACTGGGGCTGGGAAATCTGGTTAAAGTTCTGCGAATGTACATATATGTGGAGAGCTTCGAGGAACGGAGACCATGCTCAAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCA:1 + chr2L 20393414 5' - 412 7111 2 76.71 GAAGGGAAAACAAAAAGCGGAAACCAATTCGACGAAAGGTGAAAGGTGTTCGTCTGTTGATTCAACCCTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chrX 5206597 5' + Tirant 8120 2 78.08 AGTGTAACTTTGGTATTGATTACAGTAGTATAAAATTTCTAAACAATAGAACAGTACGATTTATTAATTGAGTTTTCTACTTAAGTTAACATTCGATTAATTTACCTTAAAATGTATAACTTTTTGTAATATGTATGTATGTATTA:1 - chrX 18011920 5' + Dm88 4376 2 54.11 ACTCACCTGGCCTGACAGCCCGTGTATTAGATGATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGA:1 - chr3R 18697950 5' - 297 311 2 81.38 CATATAAAATAGAAGCAAAATGCATAAGTATCATTGTAGAAGATTTAATTTTAAACTTTAGGCATCTGTTAAGATTAGTTATAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr3R 8914226 5' + pogo 34 1 60.96 TGAGTAATCTGCAGTGTGCGACGCAAGAATTAATGAACCTCTCGAGTGTGTTTTAAAACGCGCCAAGATAAATCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr3L 6675279 5' - 412 446 2 52.74 GGGTTAAGCCAAGGAGCCTAAAAGGAGACTACGATAATTGCGAGCCAAAGTGGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAA:1 - chr3L 9762314 5' + jockey 4761 1 75.71 ATGTAATTTGCATTTCATAAGCCTCCCGGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGTATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr3L 18199928 5' + Doc 14 1 68.14 GTTACTCTATTTCAGCGGTGTGGCAGCCTGATCAGGGGGACACTAGCCATCCCGCTTGCACTCAGGCACGCCTGGCATGACTTACTGTGGAAAAGAGATTCGAGGTCCCACGCCCGGGCACATC:1 + chr3R 12426157 5' - roo 252 2 79.84 CTTAGACTCCTATGGCTTATGCTTGTGAATACAGATCAGTATGCATTTGTTGATTAAAATTAGGACTGATTTTCGAACAATCCATCTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3R 8183522 5' + Doc 40 1 56.85 CCGGTATGAGCACTTGCTAAATAATAGGAAACAAAAAAATATGCTAGTGAATTGGCATACACACTTTTGAAATTTTTAATTTAAATTTTTATGATTATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3L 23325941 5' + pogo 22 1 70.55 TTTCAGCACATATGTATGCACATTTTTCAATTGATATTACAAAAAAAAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCAACTTCCATTATT:1 + chrX 3660886 5' + 297 6602 2 51.00 ACTCGAATTCCCACTTGGTTGATTGGCGTGATCTTTGGCTACTTCCTGTCCTTATATTTTTTGTTATCGGCTTTATCGTTGGCAGGCGCAGCTTTTTTAGTTGGTTTTCCCATTTTTTTTTTGTTTTTGT:1 - chrX 9659944 5' + hopper 140 1 64.62 CAAATTAAATTTAAATACCCGCATAGAGAAAGAGAAGTCTCGGCGAATGTGTGCGAGTGAGAGAGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3L 5179265 5' + P-element 10 2 73.17 GCAATTCCCATCAATAGAAATGAAAAATGGTCTGTCGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr3L 18792489 5' + roo 84 2 78.77 ACAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGACATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 14494113 5' - roo 9013 2 58.22 TTTGGCTCTTTTGTTCAAAATTAAGCGCATTAGAATTGGTTCGTTGCGAAGGTGGGATTTTGGCAGCCAAAGACAAGGAACGCACTTTCAGCCCCAAGTGCAGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 16510376 5' - roo 9054 2 67.81 GTGAGGCGTTTGTAGATTGCATAATTATGCTAATTTTGTTGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 - chr2R 16496679 5' - hopper2 1558 1 50.00 AATTCAATAACAACATGCATTTGAGCAGTTATGCAAATAAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAA:1 - chrX 17737259 5' + jockey 4734 1 67.74 CGGCCAGAGCATTAATCACGCCCAGCGTGGTCAGGCGCAGCTGCTCGAAGGGCCTGCTCTTGAACGTGGTCATAGAGCGTTGTCCACCTCAACACACTCTGTCTACTATTTTGACCGTCATGCTCAG:1 + chr2L 9013493 5' - Circe 7381 1 55.91 CAAAGTCTTGGATCAACTGATAAAAGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACA:1 - chrX 21636280 5' + Stalker2 7295 2 50.68 TTTCTATCAATAACCCAAATATTTGCCTAATATTAATAACGCTCTAAAATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 + chr2R 9455832 5' - 412 7478 2 65.07 TGCTCGATCCATGAGTGGTGAACTTGCAAGTTGGTTTTGGGGTAAGTCAATAAACCGGTTTTGATTCATAATCCACCCGCCCAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr2R 11336633 5' + jockey 25 1 44.80 CTACGTCCTTTTTCATCAATTGTTGCAAACTTATGAAGTGAAAGAAGTACTTAGTAGAATATAAAAGTTATCATATATTAAAATATATCTTTTCATTTATATATATCTCTAAATAATGACAAGCAAAACGAAATCAAGTTCAAATA:1 + chr3L 16257810 5' - accord2 7242 1 78.77 ATTCAGACGCAAGCTTTTCCAGCTCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCC:1 + chr2L 4420490 5' + gypsy5 21 2 63.16 CATTATTTTGTTAAAATAATTTTAATGAAATTTCAATGATAATATAATCTTGCGGCCTTCTGTTTTCGTCTGCCGGCACTGTAGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr3R 9193282 5' - opus 7471 2 65.07 GCTGTCAGCTGGTGTTTTTATTGCAGATTATGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:2 + chr2L 20986538 5' + roo 89 2 80.82 AGATAAGCCCAAGGTCCATGCCTGTCGTCTGGCTATATCCCACTGCCCATACATATAGCCGGGCTCAAATTTAAATAAATACAAGCAAAGTGGAAAATAAAATGCGCACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr2L 16385388 5' + I-element 12 1 74.66 CCTGCAGCCATCCGCGAGCCAATACTACGGTTATCCCTATTACGGCGGCGCTAATGCGGGAGCGGGATCGGGATACGGGAACATATACGGCAGCGGCATAAGGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCAGTCTCTCTGGTTC:1 - chr3L 21842269 5' + invader2 4941 2 71.22 TGTAAAGGTTGTTTTTTGAATTTAAAGAAGAAGAACACTTATGGCTTAATAATGAACGACTTTTCTTACTATGTTCCTTATTTCGAAATATCAAGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 5448014 5' + roo 8685 2 70.00 CACATAACAAATAAATTAACGCAGCAAAATAAATATTATAATAGAAAGTGAATGATAATGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 + chr2R 9339645 5' + Transpac 24 2 58.72 GGGTCATGTGAATGCCAGTCTGGCCATTGCCTTCATGAAATATTATCATTTATTTAAAATATTTTATTCCACTTGCGTTGATTTACTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTTACACCCTACAATT:1 - chr3R 23539534 5' + hobo 32 1 63.70 ATTACATAGTAATAAATGTTCAATACTACATTTAAATGATATATAAATATATCATTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATT:1 - chr3L 17162383 5' - Stalker2 7583 2 64.38 TATTTATTTGTAATGATATATGTATAATGCAAATATGTTCAGCATTTTTTAATCATATCTTTAGTAAAATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGC:1 + chr3L 15277598 5' - I-element 5298 1 54.79 AATATGTCGATTTTAAGAGCCGCAATTCCACTTGGCAGCTATATCACCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3L 18658290 5' - roo 8997 2 68.49 TGGACAATAAAAACTTCTTATTTCATTGTTTAAATCGCGATATTCGCGCTCCCTAAAATATCATCTCCACTCTGCACCTGTATCGATACTTTCGTTGCAGCCCTGCGCCACAAAAAGACTACCAAGAACTACGTACGCACTCC:1 + chr2L 2874756 5' + Stalker 121 4 72.73 GCGGCTGTTTGGGAGGCAATGGAGTGGTTCCATCAGCGTGGCATCAAGACAGTGGTCATCTCCAGCAGTGATCTTGGCCAGCCTGGCGGTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTA:1 + chr3L 9361308 5' - Juan 4031 1 57.93 GAGCAGTTACACTTCAGATTAATGGACAGTTGCCAGTAAATAATTTTTGTGCAATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:1 - chr3R 5453758 5' - I-element 5332 1 68.97 ATTTTATTCCACTTGCGTTGATTTACTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chr3R 23539474 5' + hobo 63 1 74.36 GGCGTAGAGTTTTTCTTTGTCGTTTTTACTGTTGAAAATTGGCCAACTTGACATAAATTTGATATGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAAAAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 3648710 5' - roo 9016 2 52.05 ATACTAAAATCCTAGAAATATAATGACAAATTGTTTGCTTAGAACCTTATCAAAGGAAATGATTAGAATACTCACGAATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 + chr2L 7939717 5' + Burdock 41 2 53.42 AAGTTGGGAAACAAGGAAAATATAGTTAAGTTGGGTGATTTTATGACCTCCTATTAAAACTGTACAACTGTACAGAAATCACGCAGCTCGAAACTTTTTGAAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCC:1 - chrX 16977653 5' - R1A1-element 448 1 74.81 ATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTGGTCGGCTTCATCC:1 - chr2L 15322911 5' + diver 319 1 75.91 CACTGTCCGTTTGCCATGGCCAAGGAGCCGTTCCTGAAGAAGAAGAGGACCTTTGCCTATCCCATCGGATCGACTCGGCTATTGATCCTGACCAAAAATATATATACTTTATACGATCGGAAACGCTTCCTTCTGGGTGTTACA:1 - chr3L 20109526 5' - INE-1 31 1 50.69 CGATGTCACTGATGAAAAAGATTGAAGGAATTAGCGCCTGACTTGTCTGCACTTATCTATTAACTGGCGCCCAACATACTATTTACGCACCTACATTTCCCGAGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCT:1 + chr3L 26717315 5' + gypsy7 302 1 62.33 ATATGTATTTATATATATTGTTTGCTTATATATGTGGCTTGGCCTACAGTATAGACCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chr3L 12899845 5' + roo 59 2 62.32 TCATTGAGATTTCATGGCATCAATGTGATGGTAAACTTGATTTGAATAATGCTTGCGTGTCTTAGAGCTCATTTTCATTCCCCTACCCACAATTTCGACACTCCATTCGCATATGTTCGCTGTGTTCCGTTATGCGAGTTTAACGG:1 + chr3L 17168725 5' + invader6 129 2 75.34 GTGCTGGCTTATTTCACTGTTGATTTAGCATTCGATACCAAAGAACTTTGACCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAGGTATTTTAGTATTATTACATTGGA:1 + chr2R 11379441 5' - hopper 1347 1 62.33 ATGTTTTTTTCTCAATTCAGACGCAAGCTTTTCCAGCTCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATT:1 + chr2L 4420476 5' + gypsy5 6974 2 60.56 ATCCACTCATCAGTTTTAAAATTGAATTCGAACTTGACACATTTTGCTGATCTGCAGTTTCTTATGATTTGTGATTTGTGATCTTGCAAGCTGTTGTTGATGGCTTTGGCAATGTCTTGTTTTCTTTTCCTTTTT:1 - chrX 4187305 5' - Doc2-element 257 1 70.37 ACCAAAGCACTAAATTATTCCTGTCCCTATAGAGAACTGGGGTGAGCTCAGTGTCTCCACGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1 - chr2L 17206086 5' - hopper 1352 1 60.27 GTAACAACCATTACTTTCCATCTGAGCAGATCAATCGCAGGTGGGTTGTATGTTTATAGTATGTAGTATGTAGTTTATAGTATAGTATGTTTATAGTGATATATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCT:1 - chr3L 11576356 5' + HMS-Beagle2 6895 2 75.35 TTTACTTTACTTCAATAGCACAATACTTTTTCATTACTTCTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACC:1 - chr3L 2467518 5' + jockey 4754 1 72.60 TCTAATATATTTTATAATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACAC:1 - chr2R 21425172 5' + HMS-Beagle2 42 2 53.57 TATATCTAAGTGTGATTTTAACGGAAACGTCTATGTTGTCGATAACTCTTTAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGC:1 + chr4 1069778 5' + R1A1-element 344 1 54.21 AATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr3L 18199973 5' + Doc 80 1 77.61 GGATGATGCGATGCGGGCACGAAGGCCAAATTGCCGAAGATGCCCGAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 - chrX 21281244 5' + P-element 68 1 35.97 CAACTAAAATCTTCCTTGCAATTTTGCTTCAATAGTTTACCACGAATGTGTGAAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr3L 14041005 5' + 1360 37 1 60.27 TCATATCGCTGTCGGCCTGTCTGAACTTCACTTGAATGTGAATGCTTGCATGATTTTATCAGGCGCCAACTATGTAAATAACAAGCATGCACAGTGGTCTGATTTCAGATAAACATGAAAACCGTAAATGTAGTCTGCTTTTATAA:1 - chrX 6899256 5' + Cr1a 445 1 59.59 ACTCCAGAAGGCTATGTAAACGATGTTAATTACGATAATTACATTCTTATACTTTTGTATTTATTTATTCGTAAACTATTTTATTCCTTTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chrX 18190316 5' + hobo 32 1 63.70 CGTCGACCAGTCGTCCTGCCATCCTGGCCGCCAAGGAAGCTGCGTCTGTAATTTTTTCGCTCTGCATAGTTGTGCGCACATCTAAATAAGCACATCGTCGATGGGGCATCCAATCATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGT:1 + chr2L 19934136 5' - R1A1-element 125 1 72.60 AATAACATACTTAGTGCTATGAACTAATGCTGAATAAATATGAAATTGGAATATATTTAGATAGCGTTTTTTTTTTTAATAATTCTTAATCAAAATAATGGTTTTCCCAGCACACACACAAAACGAAAAAAAAAAACAAAACAAAA:1 + chr3R 8550972 5' + Porto1 187 4 72.60 GCCGGCAACTGAATCCACTGAATCCACTGAATCCCTAAGTGCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGAGAAG:1 + chrX 20540793 5' - HMS-Beagle2 7054 2 68.42 GTGTGTTGAACCACGTTGAGCAAAGTGACGACAATGGCTCGATAAATATTTTACCCAAGATTCAGTTTTGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3R 19543516 5' + roo 11 2 65.71 CTCAAAACATTTATTATTAACATTAATTATCGTGCTCATGCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTG:1 - chr2L 11064808 5' + FB 83 1 72.60 TCTGCATGCACATTAGTGTAAACTGCTTTGATTAAGAGACATGCGCTAGTATGGCTTTAGTAATTGAAGACAAACTCGAAACAGGGGACAGCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTC:1 + chr2L 9798664 5' + 297 6872 2 56.16 AGCGAGGACTCTCACTCTCCTCCTGCCTGCGCCGAGAGAGCCAGTGCCCTCTCTCTTGCGCTCTCACTTCTCTGTGTGATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chrX 16526247 5' - P-element 2843 1 56.16 GAAAAAAGCGAGTTAAAAGCAAATCGAGCAGGCCAAAAAGCCGCCTATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 9504161 5' - roo 394 1 72.60 CGCATCGTTTTTGTTCCGACGGGTTCTTCGAGTGCTCCATCACTTCCATCCACCATTCCTTACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chrX 14346409 5' + roo 58 2 58.90 GGACAACTAAACGGAAAAAACCTTGAACGGAAAGTATCGTGTGCAGAAAAACATATTAAGTCTTTAAAATAAATAAATAAAATAAGAGCACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTT:1 + chr3R 904577 5' + 3S18 34 2 62.33 GTAAATGGGAGTAAGCGAAGGCAAAGTTAATTAGGTGGCCAAAGGTCTCGGTAGTAGCAGAACTATTTTGAAACTTATAATTTAACGTAGATAGTTTTTTCAACAAAATGGATCAATTTATTTTTAAAGTTTTTTTTTATTTTTTT:2 - chr2R 10394158 5' - mariner2 793 3 78.77 GTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chrX 6484710 5' + jockey 69 1 60.96 CTGCTACTCACATTTGCATATCAATTTGTTCGCATTCGTTCGTGTTATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAG:1 - chr3R 25409874 5' + jockey 4601 1 68.49 AAATGAGTGTGAGGCGTTTGTAGATTGCATAATTATGCTAATTTTGTTGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr2R 16496687 5' - hopper 1373 2 54.11 GTAGTTTAATTTTTATTAGTCCAAACAAATATCGGATTATATTTTTGTTTCAAGTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGAAACTGCTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCG:1 + chr3R 4661931 5' - roo 9006 2 60.27 CACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 + chr2R 12069589 5' + Tirant 8133 2 58.82 CTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTG:1 - chr3R 17210122 5' + HMS-Beagle2 6930 2 53.42 ATGTGCGAGAGCGAGAGGACGCGAGGATTAGAAGGGCAGCTGGAAAGCTTTAAAAAAAAATGCGATGCAGGATTACAGCTGTTCGGGCTTGTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chrX 7967325 5' - P-element 2882 2 77.69 CTAGTGCTAAACTTTTATCTTTTTATAGTTCACTTCATAAAGCTCATCTTTAACATAAAATAGCTTTAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 + chr3L 14040875 5' - 1360 3335 1 55.48 GGCCGAACAGAGCGAATTTCGTGAGCAGGACATGAGTAACAAGTTGTTGCACTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 + chr3R 25137864 5' - P-element 2820 1 38.62 AAATGCGCCCGCGCAAAAGTAGAAAGTTTGTTTGTCCGAGTGTGTGGAAATGGATTTTATGGCATCTATAAAACGCAAAAGGTTCCCACAGCGAGTTTATAAGATGCAAAATCAACAGGCAGAGTAATTGTTTTTCTTTTTTTTTA:1 + chr2R 12996979 5' - transib2 2640 1 73.97 TTGTACAAATTAGGACACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATT:1 - chr3L 10564005 5' - hopper2 1559 1 50.68 GTATACTTTGTGTATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTA:1 - chr3R 29091425 5' + rover 24 2 69.86 TCCGCCCATCAGTTTGAAATAATTTATTGCATACTCACGGGCGGCGGTTTTGGGAACAGAGTTGGTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 - chrX 4214551 5' - jockey 4956 1 51.15 TAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATACCCAA:2 + chr3L 25782387 5' - Stalker4 7000 4 51.37 AAGGATAAGACAGTGCTTGCACTTAGGAAAACTCAGTCCTAATGCTAATTTAGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 - chr3R 8914351 5' - pogo 2034 1 65.75 CAACCTACCAACCAACCAACAACCAACAAAACTGATACGCTCGTACTTTGAAAATTGCATTTTCATTTCATTAATTGTTTCTAATTTTATTGATATAAAAGAATTTTGAAGTTTTTCAGGTGTAATCCCACTAGCTGAGTAACGGG:1 - chr2R 10776678 5' + INE-1 537 1 19.86 AAACGTGTTGAGCTTGGGAAATTAGTTAAAGTCTTAGTGCGCAAGGAAAGCCATTCAAATTGTTTTACTTGCTTTACAGCTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAGTCCG:1 - chr2L 6876711 5' + Rt1a 49 1 56.85 ACGACTTTAGCTACTACCACGCCAACAACGATTGCTGTAACCACGACTACAAGCCAAGTTCTTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAA:1 - chr3L 15527190 5' - Doc 63 1 58.22 AAAAGCATGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr3L 2184974 5' + jockey 64 1 56.16 CCATGGCGGCACCGGAAAATGTCCAAGTCAGTGTCCATTGAAGCGGAGCAATATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCT:1 - chr3R 22624771 5' - blood 7323 1 65.03 ATAGGAAAACGCATAGGAACGACAAACGGGAAATTCCGCGCGCGAAACGAAATCCGTTTTTGGCTGGCAAAAATATCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATGA:1 - chr3L 2522804 5' - Quasimodo 442 2 62.50 AAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 + chrX 6484733 5' + jockey 92 1 76.71 TATGCAGTGCGTTTGATATCAAAATATTGATTGCGTAAGTGGGCAAAGCGAATGTCACAGATAACGCAAAACTTTTGGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 17904756 5' + roo 43 2 56.16 AATAAACTTTTTATGGCAAGTTTGAGTTCTGAACTTCGAAGAACTTCAAAGAAGGCTTAAAAATATATGTTCTTAATTTCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3R 29622770 5' + pogo 40 1 50.00 CAGAATGCAACAGCTCATCGGCGAACTGGATAAAGAAGTAGGTGAGATGACCGATAGACGAATGGCCACTTTAATAACGCACTACTAGTGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTAAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGGCCTC:1 - chr3R 3396660 5' - invader2 5065 2 63.70 CATCTTAACTTTCTTAATTCCGAAAAAATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGGTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr3R 10636222 5' + blood 37 2 58.22 TTATTCGGCTTGTGTACTCATTGCTTTCTATTTGTTTTAAAACGCCGCTTACCCCGATTTATTTATTGTGCCATTCATGTTTCTCTATTTTACATTTGGTCCTTCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTA:1 + chr2R 15617883 5' + roo 460 1 60.96 AAGTGATACATGGGTTCATGGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr2L 18213111 5' - roo 351 2 56.16 GAAACCCCCTTTTGGTTCGTTGGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 + chr3R 6411960 5' - Tirant 8501 2 70.79 AGAACCTGAGTTATGCCCCCACATAACACAATATTTCCCTAATGTCTTTATTATGTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAATGGA:1 + chr2R 9934097 5' + Rt1b 4927 1 78.08 TGCATTTTTTTAATTGGAACAATTATACCTAGTTTACTAAACGTACAACATTACATTAAGTTCTTCTTCTCCAGGTTGGGTTTCGTCACTCCGTACATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATAC:1 - chr3R 11976630 5' - Transpac 465 1 62.33 AAACAAAACGGTCCAAAAGTCTAAGCCTAAACTATTTTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCT:1 - chr3R 5316607 5' - Juan 4129 1 76.03 GCACATTAGGAATACGTCGGTGTCGCACCTCTACAGTGAACATTCACTCAAACATTCTCACCGTGATTTTAAATTGTCGTTCTTCCAGATATGACTTTAAAGTACAGAAGTGGGGCGCAGGTAGAAGGGT:1 + chr2R 4009135 5' - Helena 454 1 58.46 CAGCTTACTGGAAATGTTTGCCATGGTTTAATTTAAAATCGAAAGTCATTTGCAATCCACGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 + chr2R 12814830 5' - opus 7500 2 76.14 AAATGGTAATTTGAATTTACCGTTAAGTGACACGAACAGGCAACACACAAACACATTCACATACACAACCACACACACACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTG:1 - chr3R 12577869 5' - jockey 4646 1 51.37 AGTTCCAAGACGGGGAATCGACCTGGCCGAAACCGGAATGCACTTTGACTAGCCGGATTCACCATATTTCCATCTGTAAAATTCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTACTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 10461642 5' - roo 357 2 52.05 CCATTCCAAAGTTGCGTGCATAGAAACGAGTGTGCGGCATTTTGTCGGGAATGTACGTAATTATCCATTGAATGCCGGATCACGACGACGACGACGATTTAACTCTTAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chrX 18737357 5' + I-element 12 1 75.34 TGGGGCAAGAAGTCCCAGCAGGGGAGTGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCTTCCCACATCTTA:1 - chr3R 17210155 5' + HMS-Beagle2 14 2 75.34 GGCATAAAACATTTATGTATGGTGGCGTACATAAATCGTATTTTAGTAGCTTAATCATTTTGTTGCGTATACTTTCAATTACTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTGGGTGTATTTTAAATGTGGGCAATCGAAAAAAA:1 + chr3R 12000918 5' - FB 420 1 49.32 CGACTGGCTGACACCAGTTCCTTCGCTGGCTCAGCTGCCACAGCCGCGTGGGCTGTGTCAACATGGTTCTCCAAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAA:1 - chrX 10858748 5' + F-element 168 1 50.00 TATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTC:1 - chr2R 21425143 5' + HMS-Beagle2 6959 2 71.72 AATTAATTAATTTAATTAAATTTAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGGTTT:1 + chrX 20554008 5' - G6 1926 1 73.68 GGAAACCTAATAATCCCTCAAACACCATCGAGAGTTCGTTAACAGGAGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTT:1 + chr3R 22840390 5' + Transpac 4990 2 65.75 ATCTGCAGCAAATAAATGTTAACTCAGTATACGAACGAACAAAAGCACCAGAAACAAATTGTTTAGTTTTGCTGCTCATTCTTCTTCTTCCACCGATGCCGTAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chr2L 19158780 5' - P-element 2868 1 69.86 CCGAGCCAAATAATTTCAAACTTCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 - chr3R 19721228 5' - opus 495 2 78.77 TCCATCACGAACATTATTAACGTCATTGTGTGGCCGGCCACTCTGCCAGGTTCACTCCCAGAGCCCAAAAAATGTTGTTAACTAAACTTTCGTGGAAAGTTTTGATCCTTAAAGCTGTGTAAGCATTTTTGACCCTCT:1 + chr3R 27862138 5' - Quasimodo 7069 2 65.22 CTTGGGAAATTAGTTAAAGTCTTAGTGCGCAAGGAAAGCCATTCAAATTGTTTTACTTGCTTTACAGCTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATAT:1 - chr2L 6876699 5' + Rt1a 40 1 56.80 TAGAAATATTTAACTAAAAAGCTGAAATCACTGATTAAGCATTAAATAGCTTGTGTAAAGTCCAATCTATATATAAACATTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr3R 8596319 5' + hobo 32 1 60.43 CCCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGCTTAACATT:1 - chr2L 13510875 5' + diver 5927 2 61.86 GTCTGCACTGCGAGAAAATCATTGTTTTGACCTTAGCACAACGCACGTATTTCGCTGACTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr3R 24976178 5' - roo 9038 1 60.27 CCTCCATCTGTGGTGTCAGCTTGTTTCGTAACTAATTCCCAGATTAATGCATTCAGACGAAAATATTTATCAGGCATGCTCATACGATACCCGGCAGGCAGTTCAGAAAGAAAGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGA:1 - chr3R 5026138 5' - Chouto 86 1 74.29 AAATATACAAGAAAATATACAACAAATTCCAAGTTGTGATTACATTAGGCTCTACATATTTTTTTTTCAAAATCAGAATGGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTTGACAAAATATTCCCTTCACCTTAAAAGTTCTTAGAC:1 + chr3L 18075384 5' + 1360 227 1 80.82 TTATTTGGACTTGTTGATTTGCAGTGTTAACGGAACTGCCTCCTAAATCGAAATACGGAGACCAACTGACTAGGCATTGTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 - chr2L 19548552 5' - flea 4980 2 59.86 ACAATATTTCCCTAATGTCTTTATTATGTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCA:1 + chr2R 9934124 5' + Rt1b 4954 1 60.96 GTTTTAATTGTGAAACTTTTGTCATGCAACTTGCATATCTGCACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATG:1 + chr3R 25442814 5' - R1A1-element 5256 1 71.23 ATCGCAAACTTTTAAATTAAAATTGCGGGAAGGAGTGAAGCGGTTCGAATTTATGGCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTT:1 + chr2R 22287369 5' + jockey 4791 1 71.23 TGGAAATAAAAAGTAAATGGTCCGAAGAAAGGCAAGAATTGTTAAGGCAATTTCGGAATACATTAAAAGGGGCGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 - chr3R 26244735 5' - copia 5075 2 49.32 TTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCT:1 + chr3L 15859624 5' + I-element 70 1 67.81 GTGGGTCGGTGCGCTTCGGTTGGGTGGAAGTGAAATGAAATGAAAGTGTGTGAAACCGAGAGCCGGAATTGAGGGATTGGCATCGAGATCTGTTGAATGTATCTCACACACAGGCAAACCCGAAAACTAAAAGCAAATTCAAATAA:1 + chr3L 22201502 5' + HeT-A 327 1 47.26 GCGCTAAAGACGCTCCAGAGTTTGTTGAGCTCTCTAGACAAGGCGGCCCGGCTATATTCCATATCTATATCTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3R 28579602 5' + pogo 46 1 54.11 TTTCTATTTGGATTTTGCAAGCGAAATGAGTGTGAGGCGTTTGTAGATTGCATAATTATGCTAATTTTGTTGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTG:1 - chr2R 16496710 5' - hopper 1396 1 69.86 AGGCCTGCTTCTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCC:1 + chr2R 16891804 5' + jockey 4757 1 77.86 GAACGACTTTTCTTACTATGTTCCTTATTTCGAAATATCAAGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr2L 5447961 5' + roo 80 2 73.29 ACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAGAGCTAGACGATCGAGATTCAGCATACAAATTCTAGAGAGAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGGCCCACAAACATTTCATATTTTTTCACATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATT:1 - chr2L 22036460 5' + INE-1 301 1 54.11 CGTTAATTAAGAGACATGATTAACAAAACGCGCAAAATTGGGCTAAAATCCAATGCGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAAAAAAAAAA:1 + chrX 15153834 5' + Stalker2 497 1 80.65 ACGTCACATATACACACATTTTAATTACATAAATTCAGTGTTTGCCCGATGCTTGGGCGCCATAAACATTTTGGTGCACAAGCAAGACCACCACACCCAATGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGC:1 - chr3R 25422752 5' + gypsy12 10142 3 54.14 CCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTT:1 - chr3R 29091379 5' + rover 7021 2 66.44 GATGACCATCGAGTATGGTGGCACCAACGGCTATCAGGCAGAGGCAGTGGATCATTGGCGCCAGAAGCTTTCATAAAAAAGGCAGCAAACTGGATGCAAGTAATTACAGAGGAATCTTTAAATTGTCG:1 + chr3R 23712589 5' + Q-element 111 2 52.34 TACATTTTCTGCTGCCTGTTAATGTTGATGTAATTTATTCCTACATATGTTTGTCCCTGCCAACCCCAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chrX 16479885 5' + 297 6628 2 56.55 ACAGGCAAGAAGTATTGTTTTAAACAGTAATTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAAAGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGT:1 + chr2L 17957123 5' - blood 359 2 71.23 CTTCATGATGATCTTTAATTCCGTCCGTATAAGATGGCAATAGTGCAACGGTCCCAAAGGTCCTAGTGTGGTGTGCAATTTCCTCAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr2R 4802905 5' + roo 8698 2 60.96 TTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3L 13827404 5' + roo 8748 2 76.55 TGCGATTCAACTGCCAGCCGGCAAACTCACTTCAATCATATATAGAAATCTATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGAC:1 + chr2L 470206 5' - Burdock 6325 2 68.49 GGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTACCTCCAACAGCTTTCTAGGGGACAAACTTAAATTTGTACAAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTGTTTGCACACGA:1 - chr3R 4571527 5' + 1360 33 1 62.33 ATATCAATAAAGCTATTATTTTGGCTTATAATAGAATTATATAAATTATTTTCTTTTCCCAATCCCATTGTTCAGATTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAA:1 + chrX 10823906 5' - pogo 2061 1 56.85 AAAATATATCTAGATAAATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTA:1 + chr2L 14480435 5' + Transpac 4987 2 65.75 CTTTTCAAGTTAAATGGAGAATTTGCAGAGAAATTCAATTTAGCCTTTGAAGAATATCATTTCAATTGCGCTAAATAGCTGCATTATTTCGTATAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTTGATTTTGTGGT:1 - chr3L 15412890 5' - I-element 5182 1 64.38 TTAAACTTTTACTTATTTTCGAAAATATTTGCATACGCCTACTGAAACCCCAATCAAACATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAA:1 - chr2L 20556559 5' + invader3 5248 2 60.69 CGTCAATCCTTTGTTTTTCTGTGAAGCTGTGTGGTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3L 16463613 5' - roo 9034 1 55.63 ACATTTAATATTATCTTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTG:1 - chr3L 13156791 5' + transib2 72 1 70.34 TTCTTCATTTGAGACCAAGGAATATAGTATCGATTGGCAAAATGTTCTTGTAAGCATAAAGATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 + chr3R 29622651 5' - pogo 2045 1 60.27 GCATGCAAAGTGCCATCAAGAGAGCGACAGAGTGCGAGCGTGCGAGCGAGCGAGAAGTGGAGTGAATCTTATTAGCCGAGCCAAGAAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 19448238 5' - hopper 146 103 71.05 AACTTATAAATTTACTTTACTTCAATAGCACAATACTTTTTCATTACTTCTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chr3L 2467528 5' + jockey 4744 1 65.75 GCCTTGTCTTGTAGTTTGCTTAGAATTTTTGAATTATTTGACAGATGTCAATATATCTATCATCAGTTTGATGTAAACAAATAATACGCTTTATGAACTAAAATTATGATATTTTACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2L 18653492 5' + hobo 6 1 43.45 TCTTCCGCTTTGTGCTCTTCTGCGCTCTTTCTCTGCCATTAGCATGCTCACACTATCATCGTCACCATCATCATTTTATAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT:1 - chrX 13272828 5' - mdg1 7066 10 73.11 TTGTATATTTATATTTATTATGACCATTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGGGCTGACGTTCCTGCGGCCGCGTCCGGGCTTAT:1 - chr2L 23069852 5' - gypsy4 6608 2 76.58 CAGACATTGAAACAGTTTTTCGAGCTCCTGCCCCCCCTTCTACACCACCCTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1 - chr3L 18789099 5' - 1360 3320 1 67.12 AATTAAAATTTTAGTTCGTTCTAAAAATTTAGTCATAATATTTTATGAGTAACTTTTGGGAGTATTTTTCAATTTTCAACGCTCAAAATTTGCCCTTATCGCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3L 21171005 5' - roo 388 2 71.23 AAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGGGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTCGCTATTATG:1 - chr2L 23295888 5' + micropia 138 4 50.68 AGAGCGGGAGAGCAAGACCACGAGGCAAACACATACACATACGAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 - chr3L 13228584 5' + P-element 37 1 60.27 GAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 13827356 5' + roo 19 2 69.53 CTCTGATATTAATCCTTTTTACACTAGAAAGGGGCTTTCCTAATTTAATATTTATTTTCAATAAATTTATAAAAATAAATAGGTATATCTAGAAAGTAGACATATCACAAATATAAACATATAAAAATAAATATTTCCAATTAAAC:1 - chr2L 16365500 5' + FB 476 1 73.29 ACATTTATAGGGAAAGGAATTACCCTAAATTCAATAACAACATGCATTTGAGCAGTTATGCAAATAAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAA:1 - chrX 17737286 5' + jockey 4722 1 51.80 CAGCGAAGCAATGCGAATTCCCTGAACTGAACTTTCGCATGCATTTTAATTAAAGGCCAACACAAAGCTCCTCACTGAAAGTATGATGCCTTTGAAGTTTGCTTTTGGAATGCAGAAATTACAATGCATGCAATTTCGCTTCACAA:1 - chr2R 19215636 5' - Transib5 173 1 56.16 AAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAG:1 + chrX 12003952 5' - P-element 2788 1 19.18 AAAGGCTCATGAAAACGAAAAAGTGTTGAATTGATAGGCTGTATCGATTGGAGATGGGAGAAGTCTGGCCCAAAATGGCTCTAAAGTATAAATTAATGTGTTCCTCCTTC:1 - chr3R 22114525 5' - gtwin 476 1 66.36 CTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 - chr2R 20739075 5' + hobo 72 1 75.00 AAACCAATAAAACATAATTGTTCAAAATCGCTACATATAAAACGCCTCACCATCATACCATCAATTAGCTTCCTAGCTTCAAAGCTCCGAATTCTATTTTGTGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGC:1 + chr2L 22678434 5' - copia 5037 2 71.23 TGTTCATTTGCACCCCATAATATATACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATACGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 + chrX 19005339 5' + F-element 47 1 43.84 GATAAACATCAGGAAAATATATATATATAATTATATTCTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAAATTTTATTTCACTAAATGATTACAAAACTTTTTATTTTAGAAGAACACCGACCTTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAA:1 + chrX 23182858 5' - Idefix 477 2 84.25 AATTTAAGACAGCTTTATATACCTTTCTTTCAAGTTCTTTTACTTGCTTTTGAACACTATTATTAACGTTTGGAGGATTAATTTGGCCCGTCCTCCTAACGTTTTAAAACCCATATGGACCTATGGCTTCGAGCTATGGGGCAACG:1 + chr3L 14700250 5' + Doc3-element 4330 1 65.75 ATCATGTTCCTATATAAGAGCTCAGCTCTTAACGTACTTTGCACACAAAAAACACTTTAAAATAGCAATACACAAGGCGATAACAAAACCAATATGGCGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGTCAGTAAATCCCACTTACAGCT:1 + chr2R 102224 5' + Porto1 4300 1 60.96 GTCGGAGTTGCAGAACGGTGAGTCGAGTTGGATTTCCCAGCGATCCCGCAGATAACAATACGTGCCATGTGCAAATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAA:1 - chr3L 1204550 5' + jockey 4820 1 54.11 GGCGATGGAGCGGACATCAAAGCTGCAGCGCCGCACCGAGTGCAGGGAGCCCCGAGGCGCCTCCTTGGGCTGCGGCAAGGGTGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCT:1 - chr2R 23675898 5' + 1360 124 1 66.96 CTGCAAAAAATATTTTCAAAATCGTTATTAAATTTTGAAATTGATATCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr2R 8687896 5' - roo 333 2 73.29 ACGGGCCTACTGCTGTGCTCACTTATATTTAGATAAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATC:1 - chr3R 21706315 5' + I-element 85 1 73.97 GGGCTCGTGGTTTTATTAATGAATACCTTGCCTTATTGGCAGCAGTACGCTTTCCGCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCAT:1 + chr3R 26244629 5' + copia 4935 2 64.83 ATTCGCTGTAGGCCCTGCTTCATCACACAATGTGACCGGCCGTCGGCATCCGTGAAGGGATCATTGACGCCCTCGTCCGTCTTGTTTTCTTAGTGTTGTCCTTAGTTAGCTGACGGGACATTATTTCGACTCACAAA:1 - chrX 13286682 5' + 297 375 2 59.85 GAGAGCCCCGAAAAGTGCGCTTTAAGTTTTGAATTACTTTGCGGCATTAGCGTTTAACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACACTACAATTTTGTGTTCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chr3R 18541311 5' + hobo 55 1 56.30 TTTAAATTGTACTATTTACTTAATGATTTCACCAAAATCTCGAAATCCATTCAAAAGATTAGTTTTTTTGGAAAAAATGTAATAAAATAATTCAGAGATTTGGCTCTCATTATAACCGTATGAACGACGAGATCACAGGA:1 - chrX 19326704 5' + INE-1 138 1 74.29 CATTTGCCAGTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATCTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr2L 11867419 5' + jockey 31 1 66.90 AGATCTGGTTTTGGCCTTCTTATTCTGTAGTGAGGCTTTTACTGTTGCAGCTTTTAAGAGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTC:1 - chr2L 15322986 5' + diver 252 1 66.90 GAGCACTGAGTTTTTCTAGTTCTCTTGCCCAAGTGACAACTCAAAGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 7899190 5' + roo 75 2 69.18 TACGCAATTAATATAATCCGGAATTTTTTTATATTTCGATTTCGAAATATCTAACTTAAAAGGAAACCACAACTCACAATCTGGCATGATGCGACCGTTGACCAGCCCGGACAAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAA:1 - chrX 20441346 5' - micropia 5012 4 73.97 AAGTTGCGTGCATAGAAACGAGTGTGCGGCATTTTGTCGGGAATGTACGTAATTATCCATTGAATGCCGGATCACGACGACGACGACGATTTAACTCTTAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 - chrX 18737349 5' + I-element 20 1 71.23 GTTTTCGGACACATTTTCACTTTTTGATTTGCATGCACTTTAGTTTTGATTGGAAATTATGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGATACTGTTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chrX 10286981 5' - roo 9015 2 57.34 TGGGAATGCAACTGTAAAAATAATAACACCGCGTCAAGGATCGCCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTT:1 - chr3R 21587634 5' - roo 9036 1 60.00 GGCATGAAACTCATCATTCGCTCCATTCAGATGGCACACCTTACCAAGGACTATATGCCCTGCTCAACAGTCGACAAGTAAAGTTCCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCTGCCCTCCGGACTCCCCGGA:1 + chr2R 3481272 5' + Gypsy6A_LTR 313 1 63.08 AGAGCCCCGAAAAGTGCGCTTTAAGTTTTGAATTACTTTGCGGCATTAGCGTTTAACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chr3R 18541312 5' + hobo 67 1 63.01 TCCGTTGTGAAAAGTTCACGGAAAGTGGGTAGGCAGTGAAAAAATGGTAGCCATTTTTATTGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGG:1 - chr2R 22012291 5' - opus 490 2 78.77 CGTTGGTGTTTCACACTGATATACTATACACAAATGCACATATATTTATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTAACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGATAGC:1 - chr2R 9504300 5' + roo 59 2 61.76 CTTGTCTAACACTTAACAATTTGTTATAGTATGCATTTGCAACATAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTT:1 + chr3R 10137009 5' - I-element 5280 1 67.81 AAGCATTTTCCCGAGACACTTGAAGTGTAAATTTCATGGCCTCAATCAATGATAAATCTCCACGCAACAATGCGTCTATATCGGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 12899728 5' - roo 398 1 70.34 TTTTAGTCAAGAAACTGTTAGCGTAAATCAAAAGAAATATGACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chrX 10287065 5' + roo 8743 2 78.77 CACTCAATTCTTTTGTTTGTGTTCGGAAACCTAATAATCCCTCAAACACCATCGAGAGTTCGTTAACAGGAGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCT:1 + chr3R 22840366 5' + Transpac 47 2 52.05 TTCAAGTTAAATCACGTTTGACACCAGACTGTCTAGGAACGTCATGGGGATGTGTAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 - chr2L 9347571 5' - opus 7438 2 62.33 CCGACTTTCCATTTTAAATTCCACCCACTTTAATCTTTGCTGACCTTTAAAATGGCCAGACGTACATACATGAAGTTTCCTTCAGCTGAAGTGCAAAAAGTATACACTTGAAAAATGGAAAATCAAATAAAATGGATCATAAAGG:1 - chr3L 10300068 5' + transib3 263 1 62.76 AGAAATTTGATTACATTAAAGTACAAAAAATACGAATAGTAAGTAAAAAGGAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGT:1 + chr3R 5024822 5' + diver 70 2 67.12 CCTGTGTATTTTCACACAGCGTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chrX 6484690 5' + jockey 36 1 60.45 GGTCCACCAACTCCTGTTCGACCTGACAGCCCTTCACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAAC:1 + chr3L 23933521 5' - Cr1a 235 1 51.03 TATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCATTGCTATCT:1 + chrX 10128186 5' + invader3 5268 2 65.00 GTTATAGTGGAAATGATTACCTTTTTGCGACACCTTTTTGACACTTTTTTTTTATTTCTATCGATATGACAGTTAAATGTTTGAATTTCTCGTACGCGCTTTCACTAGCTGAGTAACGGGTAT:1 + chrX 20460336 5' + INE-1 540 1 44.72 GAAAGGAGCGTGCGTTTGGCCGCCGACATGATGTGGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr2L 19643542 5' - hobo 2902 1 64.58 GAAGTTGTCGACGAATGCATCCTCAAACACGGACAAAATGTCCTTGTATTGGTATTGATGCTCCCCAGTTTCAAAATCCATATTCGTATTACCTACATATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2R 17021460 5' + pogo 18 1 70.55 AAAGAAATCGAACGCCAAAGGCTAGCTAAATGAATAAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 - chr3L 20388252 5' + 1360 31 1 64.38 GAAAAGCAAATACCCTAAACAAAAGTGGAGCAAAACTTGTTAAGCCGAGAAAGTGGTGCATTTCATGTGTAATTTATTGGATTTAAGAGCTTGCTTGTATTAAAAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATA:1 - chr2R 19842684 5' + I-element 5123 1 68.49 AGACACAAGTAATAAGAAAACTCTTTATATCCTTACCTGAAAGTAAAGAAAGGTAAAAAGAATAAGTTTATATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chrX 3767689 5' + I-element 50 1 52.74 AAATTTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTT:1 + chr3R 9175211 5' + Juan 76 1 65.07 CTCATCGCCGCATGTATGTAGGTATGTACATGCATACAAACACCCGTTCCAATTGCCAATCCATTCCCCGTGGCGTTCTGCAGAAACTAGATTTCCCGCTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTC:1 + chr2L 19158264 5' + P-element 2816 1 70.55 ATCCGAGCCAAATAATTTCAAACTTCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 - chr3R 19721230 5' - opus 497 2 80.14 TTCTAGGGGAAATCTAATTTTATTCAAGAATTTTCAAAGTGTAGTCGAGCTAAAAGGGGGAAATTTCTTAAAAATAACGAAAAGAAACATATTGATTTCAATTTCGACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 + chr2L 11734465 5' + Doc 11 1 75.18 AACACTTAAGCTTAGTGTTGTCTAACAGTTTCATTGCTGGCTGTATGTCCATCGTTACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGT:1 - chr3L 22721176 5' + INE-1 31 1 65.75 TTTTTTTTTTGGGCATTTACGTTGATGTTTTTATTATTTGATAAACGCACTGTTACCCATGCGGCCACTTAATTTGATCTGCTTATATTATTTTTTTTTACAATGTGTCT:1 + chr3L 10441306 5' - jockey 4919 1 86.36 CTTCCTTGCAATTTTGCTTCAATAGTTTACCACGAATGTGTGAAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 - chr3L 14040995 5' + 1360 47 1 53.42 ATGGCACTTTCTACTATGATTATTCTGCACATAATTGTAAAGCTAAATATCTTTGTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCT:1 - chr2L 261052 5' - Juan 4142 1 61.64 TGTTATGAAACTATGAAAAATTTTTCAACGAGTCATATGTATTGGTAGAAGCTACATGCTTAATGAATTAATGCCTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr2R 11562798 5' + pogo 43 1 55.56 AAAATTAACGCCAAACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3L 13827472 5' - roo 351 2 63.16 ATTCATATGATAAGCGTTTTCGAGGAAAATATTTCCTGCGTTTATCTAACTCTATAAAAATGTCATATTTTACTCGCAGTAACTTGTACAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 + chr2R 8452709 5' + blood 7044 2 63.01 GGGGTATCTAATAGTCGGTGAACTTGACTATTGCATTCTCTCTTCTTTTGATCAGGATTACCTTTCAAGCTAGAAAATGTCGCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCAT:1 + chr3L 25303448 5' - diver 183 2 54.11 CATTTATGCAAGATGCCGGTTTGAGATATTTGAAAGTGCACTACAAAATTTTGAATTTCGGAGTCTAGAAGTAGGCAGATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGA:1 - chr2R 1375190 5' - 297 365 2 64.49 ACACATTGTAAATTGATTTCCTTGGGAACTGAAATAAAAATGGCATGAAAAGCAAGTGATTCTTATCTAGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGACGAATACTCT:1 + chr3L 5702928 5' - 1360 415 1 59.59 AAGCCTTTCTTAGCCATGTATGCCATTGTGAACTCGTTAGACTTGCATATATGTACATATATTATTTAAAAATTCCATTTTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chrX 20632691 5' + pogo 38 1 56.85 AAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:2 + chr3L 18792421 5' - roo 337 2 67.12 CACGGTGGAGTCGTGTCATAGTTTTGTGCAGTTTTCACGTGAATTAAATTACGCTTGTTGTAGGTAAATACTATAAGTTTGCGGTTTTCTGCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATG:1 - chrX 22711724 5' + transib2 29 1 65.75 ATTACCGACCCATTGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAA:1 - chrX 21667983 5' + gypsy2 18 2 77.30 TAAAAAATAAATAAAACCGCCAGCGAAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chrX 11661326 5' + 297 17 2 73.29 ATTTTTTTTTGTTTTTCTCCTGACTAGAATCAAATAAAAAGTAAAACAAACATACCATACTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 25149393 5' - roo 347 2 63.01 GTTCGGTAGTTGGTTGGTAGAGAGTTATTATAGATATAGTTTTGGGTTGAATGGGACAGGTACGACAATTAGCGGAATAGGTTCAGAGATATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGA:1 - chr3L 8047921 5' - gypsy 7384 2 62.33 TCCACTTAAATTTGCCAAATTGATTTAAAGAGTTTCACCAGCAAAGTAATACAAATAAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGC:1 - chrX 10128336 5' - invader3 270 2 76.71 AGAACTTTAACTTTGAGCTATTTTCGATTTTTAGTTGGGAATACAATTTAATAGCTGTGGGCCATCATATGTGGTATCCACACTTAGAGTTTCATTCGGCTTGCCACTGACCAAAACTTTTTTGTGTTTTTTTTTTAATTTATATT:1 + chr3L 4744390 5' - Doc 4694 1 66.44 ACGATTATTTTGTGCATGTGAGTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGGAGCTTTGTATGAACAATGCTGCCGCGCC:1 - chr3L 3565421 5' + gypsy 47 2 51.05 TAGGCCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr2L 18213185 5' + roo 8753 2 81.82 GAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTCTTATGCTATGTAGTAATGTATGTATGTGTGTGTG:1 - chr2R 4024227 5' - Quasimodo 40 2 74.66 AAGGAAAAAAGGAAAAGATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 - chr3R 6412091 5' + Tirant 33 2 64.38 CAGCCATTTTACAAGGTGTTTCCACTTAATACATCGACACACGCACACATACGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr2L 12847294 5' + 412 7122 2 65.75 TATAGAGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGGGGGAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATATGGCCTTCCGAGCAG:1 - chr2R 9339744 5' - Transpac 5215 2 57.29 GCTTTTTGGCGCGTAGACCTTTTCCAGTGCTTTTGACGTATTTCGCCAGGTAGCGTGGACTTGCACAAATACCAATTAACTAACAACACAAAGTGCAACAACATTAAACAAACATTCGAGAGAGCCTGGAGCCATCTCTAGAGCCA:1 + chr3R 19837817 5' - 1360 66 1 70.55 ACCAGATTTATAACCTTTTCTACTATTAATCGTTATCAATATTACTTAAAATAGAGATTTCAATTAATTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:1 + chr2L 12488234 5' - copia 202 2 57.53 GCTTTTATATTATTATTTAAAAATTAATTATACGCCACGTTGGCTCGTTTGGGTTTTTGACGCATTACTTCGTCGCGTTTTTACCGGTCGATTCAGTTTTTAATTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACAAGCCA:1 - chr3R 12725683 5' + 297 10 2 77.62 CACTGCACTTGCTGCGAAAAGGGTGTGTTAATAAGAAATTTTCCCTGTTCGAGGAATATATTTAACCATTGTTTTTACTACATTTTAATAGGCCAAATGGGAATGAGTCGGCTTGCCGACCATGGGGTTATGGCGTGATGCAT:1 - chrX 18401684 5' + gtwin 186 2 67.13 GGTTTGCTTCGCCGCCGCTGTCGTCGCTATGGTTGTTGTTGGTTTGTGCAAGGTCGTTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chr2L 21250939 5' + P-element 59 1 43.57 ATGATGCCCCCTCCTCCACGACGGAACCCGTTTTCCCGGACTGCGCCCTGCTTTTTTTCTCTTTTTCCTTTTCT:1 - chr3R 16038162 5' - Doc2-element 237 1 66.22 AATAAATAAATAAATAATAAATAAATCGAAATCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTGCAAAATTTTCTGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAAAAAAATACAGATAGACAACGAACGAATCGATCGT:1 + chr3L 18452044 5' + Doc3-element 193 1 81.51 CGAATATATTTTGTAGAATTTATGATGACGTTAAAAGCATCAGTATGTATCAGTATAGTATCAGTACACTGTAAACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 + chr2R 15942254 5' - opus 7457 2 52.05 GAAACAACCTCCGTTGGTGACGCTGCTGGTGAAGGACACGGGTTTCGGTATGTTGTTACCCTTGGCCATCTGACACTTTTGGACCTCCTCCGTTTTTGGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCCCAACCTGCTAGCTTTTATAGTT:1 + chr3L 9719375 5' - INE-1 159 1 50.68 GAAGAAATATTCAGTATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCG:1 - chr2R 5045673 5' + invader6 59 2 58.90 ATGAAGAAACACCTGGTTTCTTTCTGTGCAACCTGTTGCTGTTCCATCTCGAATATGGCACAAATTCAATACTGGTAGATATTCCAATAACTATGTAAATCGACCTCCAATGGCCTTGCTTTAAGAGCGGAAGAGAGTCAAGATTA:1 - chrX 11848735 5' - Cr1a 4234 1 77.40 ATCGTGAGCGGTCTTCAAGCAGTTTGCTATAAATGATTACCTAACGTAAGCACACCTCGAAAATATGTATTATGTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTACAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chr3R 17467073 5' + I-element 43 1 53.10 CCAAACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGTAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATGAGAATCGCA:1 - chr3L 13827462 5' - roo 8992 2 70.55 TGAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTC:1 - chr3L 25482979 5' - accord 476 2 64.49 TTACACTTTCAAAAAGAAACCTGAACAACGTTGAAGCTAAGGAGATGACATTTGAGTATTTTACTAATATTAGCATAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr3L 24253567 5' + 297 40 2 58.90 ACCAAGTTTACAAGTCGCATAAACAGAGGCGCGCACAAAAGTATGCTACAAAATGGCAATGGCTTACGTTGTGTGGGTGCTTAGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - chr3R 16530685 5' - hopper 1378 1 58.90 GGTGGCAGTGACAAGTGAATTAAATGTACATTTAAATCATTCGAACTATTCGAGCTTGAATTATATTTTCCAAAACCGTAAGTAAATTAAAAGCTGAAATGAAAACGAAACACATTGTTGCGGTTTCATATTCGTAGCCGCCACGC:1 + chr2R 2540658 5' - gypsy2 6604 2 47.95 GTGGGAAGTGCAAGAAGTTTCCTCCGCGGTGCAATGGGTATTATTAAAATTATTCTTTCCATATCAATATATCTTATCATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTCCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 - chr2R 25252267 5' + opus 7155 4 60.27 CTTTGTTGCACATTTCGCAGGGCATCCACTTAATTTGAAGACTTTTCCTTTCCGCTAAGAGACTTGTTGCGCCAAGCGCAGCACAAATTGAATAAAATTAGGTTAATTTGCAGCTTTCTTGATTAATAAATAAAATAAATAAATAA:1 - 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chr2L 13690063 5' + Doc 91 1 77.24 CTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chrX 5206530 5' + Tirant 8 2 63.51 AACGCCAAAATTGCCCTGTGTCCTCTGCCGTTTTTAATTAAATTCATAAATCAGCACCAACATGAAGAAATGGAGCAGCGAGTTGCAAGGGGCGTGCTCATACATCTATTATTATTATTCTTATTCTTACGTACATTTATATATAT:1 - chr3R 31297377 5' - Stalker 254 4 67.81 AATCTTGCCATTTGCACAACAAAATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCAGCCATATTATTTATACACTTCGCGATTT:1 - chr3L 19335468 5' - invader4 297 2 64.38 ACCAGCACCGACACCGTCTTCTGTCCGTAGTCATCATCTAAAAAAGTGTATATATATATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGACAAACACAAAATAAAAATCGGGGCGCAAAAA:1 + chrX 3897611 5' - Cr1a 28 1 60.96 AGTCAATATGTGCGGAATTGCCAATTATGCCGCTTATGCAATTGTTTAAACTAAATCTCTTATAACAAAATATCTAAAGTAAAAATCGGCAAATTCATGTTTTCAAGTCTATAAACTAATGAGAAAATAAATGATTTTTTTTAATA:1 - chr2L 10354837 5' - P-element 454 1 71.92 TTGGTGCATTCCATCACAGTTAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 - 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rooA 7471 2 39.73 AGGTGGGTATTACTGCAAACTTAATAAGTTAAGTTGAATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTG:1 - chr2L 13690064 5' + Doc 91 1 76.71 AGCTCAGTTTGGCCTAAAAATGATAATTTATTGGTTAATACATAACGAATTGGTTCAGTGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTC:1 - chr3L 19437988 5' - copia 226 1 58.22 TGATAATACCCAATGATGCAAACTGTCGGGTCTCACAGCCGCCACCAACGGCAGGAATGGCAGGACGCAACAAGTCCTCCTTAAAAA:1 - chr2R 5265159 5' + Q-element 431 2 40.23 CGTGGGCAGCATCGCTGGCGCATCCGGTTCGATTGCAGGACGGCGGCTCCGAGTATCTGCAGATCATGGACCTTGGCTGCTGCATCATCTCATTTTTTTATTTTTTTTTTATTATT:1 + chrX 17843021 5' - Rt1b 5149 3 52.59 GTGGCTAATGCTCTCACCCCTATAACGACATCGTAAAATGAATGAAATGCAGCTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chrX 22382695 5' + 297 6642 2 63.70 GTAAAACGTATACAACTTGTTCATAATTTATTTATTTAATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAG:1 + chr3L 16271910 5' + jockey 180 1 73.97 CGAAGAGCTTGGCTTTNCACAGTTAAAAAAAAGGAATATTTATTACTTAAGCTAATTAGTTTCGCTTCCTTTTTGCATTTTTATTTTTTTTTTTAAATTTTCG:1 + chrX 16930974 5' - TART-C 11094 1 73.79 GCAAAAAAAAAACCTTACATTAAATACTGTTTTACATATATCTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACT:1 - chr3R 11146434 5' - flea 4933 1 75.34 AAAATAATTGCAGCTAGGCAAACAGAAAACTGTGAAAAACACAACATAAAACAGACATTGAAACAGTTTTTCGAGCTCCTGCCCCCCCTTCTACACCACCCTTCTACCAAAGACACTAGAATAACA:1 - chr3L 18789150 5' + Tc3 240 1 74.60 ATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTG:1 - chr3L 19335417 5' - invader4 3005 2 73.97 TTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 + chr3L 19574044 5' + 297 58 2 63.01 GCTACGAAATTGGCCAAAACTCCCCAAATACGTAAAGTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCAGAAAACCGTCTTCTTACACAAATACGCACCTAAACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGC:1 + chrX 3703808 5' + 1360 3283 1 65.97 GGTGAGAAATGTGCTGCACGGAGCAGCTAGTGGAGCCAGAAATGAGGCCGAAGATCAGCTCAATTTGACGCAAAACTATGTGGACTGAGCATTCTCTTTTATTATAAACAATATTTTATTTGGAATATTTAAGTCTCTTTGGATGT:1 + chr2L 10125544 5' - F-element 4386 1 76.71 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTATCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTT:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 24 1 66.39 GAGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 - chr3R 31681924 5' + Doc 84 1 76.81 AGTTCAGAGATTGGTGTTAAAGTTATAGCTTTATATAATCAGCCAAGGGCTGGGTGTAGTAATTTAAATCAATCATAGTTGAGTAGTGTAAAAGTTTAATTTGTTTTAAATGGTTAGAGGAACCAATCGCTGTATTAGTCGTCTCT:1 + chr2L 6593794 5' - R1A1-element 4859 1 38.36 AGCGCTATTCTGCGTTGGGCGCCAATTCCGAATGCATACCATTACATAGGCTTGCCTAAGTGCAAGTTCTCTCTTTTCCTCTTTGCTCAGACATCATCCAACCCATAAATATAGCATGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCT:1 - chr3R 1207893 5' + 1360 212 1 78.08 CGGATGGGCTGCTGCTCCATGTCCGTGGGGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGAGGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 - chr2L 18627746 5' + 1360 36 1 63.64 ACCTACAATGACCATCGATCGGTGGGTATTACTGCAAACTTAATAAGTTAAGTTGAATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 - chr2L 13690083 5' + Doc 69 1 62.94 TTTAACACCCAGGTCTTATGGTGCTCACATTTTGGCTGCTAACTGGCTCGATTGGCTTCTTCGCCGCCTACGTTTTCATTCTAAGAATCTAATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTAATTTAAGATGCGATTCTCATGTCAC:1 + chr2L 13773371 5' + roo 323 2 62.33 AACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chr3R 6412065 5' + Tirant 49 2 54.41 TAAGCGTTTTAAAGAAGGCAGCGGACAAACACGTATGCCGACAGACTTAGAGCCCACCCGAACCCGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTCCGACGTCTGAAGAGAATACATCC:1 + chr2R 2948953 5' + G5A 2678 1 72.95 TTTCACTTGTTGTCCGCTGTCTGTTTTTTTTTTTATTATTTCA:1 - chr2L 3600450 5' - Rt1b 5146 1 90.70 TAGGGAGTAAGTGCACTTGGCAAAATGGATCGTGCTTTAAAACTGGTGGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACGCAAATTGGACCAG:1 - chr3R 30558288 5' + I-element 4900 1 65.75 AGACAAGAATTTGTATCACGGGGAATTTGTATCTGTGATAATCCTGTACTTGTTTTTATATATATGTATGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTCTGAGTTCT:1 - chr2L 23310054 5' - 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chr3R 26244751 5' - copia 222 1 59.59 ATCATGCTTGCTCCGCTCGTACCCACCCTAGGGATTTATTTTTAAAGACTGCACTTTAAAATGAAATAAATGTTTAGTAAAAAACCAGAGAGAATGCTATGCTATAATCGAGTACCCCGAGTACCCGTTACTCAGCAAGTGTG:1 - chr4 872474 5' - INE-1 539 1 76.22 AACTCCACAGTTGCTGTCTTTTTTTGTAGACTGGCACAGTGGAATTGGCAGAACTTTATCGGGAGGAGAAATTAGGATAGTTCGAGACTCGAAGCACATTTGACATGAGTAATTATTTTTCCTAATATATTTTTAAAGTTTATTAT:1 - chr3L 13922606 5' + hopper 175 1 65.75 TATTACTTCTCTTGATTTGCTTTTAGTTTTTTATTTAACTTTAATTTTTATATACTTTGTTTACGCAAAAAAAAAACCTTACATTAAATACTGTTTTACATATATCTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 - chr3R 11146498 5' - flea 4997 2 73.29 GCAAATGTTTGTCACCTGGTCAGTTCCGAGCACCATTGTTAAGCATTTTTGTCAACTGCATACAAAAGTTTTTGGCTTCTCTTTCTCCGGGAATTCCACCGATCAGTTATCATCCTCTTTAGATATATGTATATATGTATATATAC:1 + chr3L 8375220 5' + G3 4507 1 71.92 TATGTCACTGTACGTTTGTCTTGACCATGGCACACAAATGCATGCGGCATGTCATCAGCCACTGCAGCGGCATGGTAACACGATCGCCGATTAATCTACCACCATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCC:1 + chr2R 7899217 5' - roo 8709 2 72.60 TTTTTTGTCACAACTCCAGCATTAAAACATTCTTTACAGCCCCTGGGCACGCTCCATTCCGCACACACATATACGATCGTATAAAAGTCAGGCAATTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCT:1 + chr2L 7607937 5' - I-element 342 1 58.22 TCTAGCAATGTTGCGAAAAATCTCTGAAAAGTATGCCACGATTTGCAAAAGAAGCCCCAAACAACAATTTAACCTCGAATAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTAATATGTTAATTGCGCTGTTATG:1 + chr2R 13193759 5' + BS 5037 1 50.68 TGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATC:1 - chr3L 19335425 5' - invader4 3029 2 64.62 CAATTCAAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTA:1 - chr3R 28659159 5' - Burdock 229 2 59.59 GGAGAAGGAGATGGGCATGGAGCACAATTAATGAACAGCCCCATTGGTGGGCGTGGCAGTCGTTTAATGAACAAACCACCGAAGAGGCAGTAGTGCTTTCCTTTTTTTTTTCGTATTTTTTTCTTTTGTTTTTTTTCTTTTTTTTT:1 + chr2L 14822054 5' - Doc2-element 219 108 73.97 CTGTAAATATTTGTGTTAAACTGTTGCACAGCTACACTCAGAAAAAAAAATAAATAAAAAACACCCCCGAAACACACACTCACATACCAACACAGACAATATAAAAAATCCCTAGCACAACCATAATAATAACAACAACAATAATA:1 - chrX 10057979 5' + mdg1 28 5 75.34 ACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 - chr2R 24021633 5' - pogo 2054 1 72.22 TACATTCTGCACAACTTTGGAGCCAAGACTTTTTACAATTGGTAAGCTAAATAAATTTCTTAAAAAGGATTTCGTTTATAACATTTAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTACTGCATATATATTCTTGATCAAGATCAATAGCCAAG:1 - chr2R 5198487 5' + INE-1 90 1 58.90 ATTTATGTGCGTACCGATATGAAAAACTCTTGGTGCATTCCATCACAGTTAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chrX 4540697 5' + 1360 63 1 64.08 TCGGAAATCCAACTTTGGCATTTCTGATTAAGATTTGCCCATTTCCCTTTACACTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chrX 12998094 5' - roo 9005 2 61.64 TATTGTTTTATTTTTTGATTTTTTGTATTCAGTCTCATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAAATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTT:2 - chrX 17472201 5' + Quasimodo 79 2 76.71 CTAGATTTGAAACAATACTAAGTAAATCTAAAGATATATATATATAGTAGCATATGTGCCAGTATAGTATAAGTATAAGATATTATAAGATAAGATATTAATTATAAGTAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACAT:1 - chr2R 4673647 5' + Quasimodo 33 2 45.21 CAGCACGTCTGCTTGGAATGAAAGGTGGCTTATAACTGGTTTTAATGTCCCACAGAAGTTTGTAACGAACCGCACTCCAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 + chrX 12003874 5' - P-element 2866 1 69.86 TCTTCCGTTGACCAGTGGCCAAAAAAGAGCTGTAAGCCGGGAAATTGAATTACTTTGCTTGTGCAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGA:1 + chr3L 3565307 5' - gypsy 7415 2 41.78 GTTGGTGTTTCACACTGATATACTATACACAAATGCACATATATTTATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr2R 9504299 5' + roo 70 2 69.18 TCTTGTATGTTATCAGATTGAACTCTTGAGTTTCTTTAATTAGCTTAAGGTGCAGCATGAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTCTTTGCCCATGTTTG:1 + chr2L 11064735 5' + FB 62 1 57.24 ATAGATTTATTAGTGAGAAATGAAAACTTACTGTCCCATGGGATATTTCATTATAACTATAATAAATGTAGTCTTTGAAATATATGAAACGCAGATCAACAACTTCTAGTTGTTCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATACAAGG:1 - chr3R 25426497 5' + Q-element 257 2 53.42 ATCTGAGCGCCTGGCTGGCAATTCCATGCGCTTCTCACATACAAACAATCAGAATTGCGGAGGGGCACACGAATAGCATACACAGACACACACACACGCACGAATTAACGAGTGAAGCATTCCAGTGTCTTCCTTCTGTG:1 - chr2L 4420638 5' - gypsy5 393 2 67.14 CTATAAAATGCAAATCAGTTGCATATAAAAATATATATAATTCATTTGTTAAAACCATTTGCCGGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3L 13545110 5' + hobo 19 1 71.22 GTATATACTTTATAACGTAATTAATACTTTATAAATATTGAACAAGTACAGGCAGACAATTTCGGGTAAAGGCGATTATATCAGTGTAAGCCCCTCAATTGTTATCTCTCGAGCTTGCGAAGTTGACAACTAGTAGTAACACCAAT:1 + chr4 1179570 5' + jockey2 250 1 62.33 ATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATAC:1 - chr3R 6412034 5' + Tirant 69 2 73.60 GGTCTTCGCTGGGCATCACACCGTAAAACCTTCCGGGTCCCAAAAAAAAAATCAAAAGAATTAAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:1 - chr3R 25761558 5' - I-element 5300 1 54.11 CATCCAAGCGTAAAGTGTCTCAGCTTGTTTCGCCGTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGAAATTTTTATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGAATGTAAC:1 + chr2L 21936058 5' + INE-1 15 1 39.73 GTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCGGCTCACCGAAGTCATA:1 + chr2R 9934151 5' + Rt1b 4965 1 47.69 AGCAATAAGTATTGAAATCTAAACTAATATACTTTGTATTATACTTTGGCACATTATGTACTAAATCATTATGAAAACATCTCTAAACTAACCAAGTTGGGACTATCAACTTCACTACGAATAAGCTTACAAATAAAGAATGTTC:1 + chr3L 3723424 5' - Cr1a 4035 1 58.62 GCAGACACATTTGCAACATGCCCCACTGCCCCACCACCACCACCCACCGCAACCCACGGAAAAGCACGCCCTATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCTTAAACTATTGGAGATATT:1 - chr3L 15276743 5' + hopper 44 1 53.57 AACCCTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAA:1 - chr3L 17206990 5' + I-element 4980 1 54.93 TTCGCATAATTTTTTATTGATTTATTTGGTTTATAGCCTCCGCACCTTGCCCCGCCTCACCTCCTGATGAAATGGAAAAATGTTTGCTGAATTATGTGGTTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTT:1 - chr2R 15102125 5' + accord2 7280 1 67.81 ACAGCCCAGTTCCTGTGGACAGATGCAGGCCATGCCCATTTCGGTGCAGACGATACCCTTGTTCCCCAATTCCAGAACATCGACAGAGCGACCTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 8396805 5' - roo 9044 1 66.44 ACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGG:1 - chr2L 14480509 5' - Transpac 5150 2 74.13 TATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGA:1 + chr2L 20928076 5' + Chimpo 81 1 73.29 TTTTTGCCAGTGTAACGCAGTGGCGTGGTTTTTAGAAATTAAATTAGAAATTTGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCGGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGAGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACA:1 - 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P-element 2789 1 18.49 AAAGTATGTAAACTTAATAAAGCCATTTATGCAAGATGCCGGTTTGAGATATTTGAAAGTGCACTACAAAATTTTGAATTTCGGAGTCTAGAAGTAGGCAGATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAA:1 - chr2R 1375213 5' - 297 380 2 76.71 GTAAGCTGGGCGTAAGGGCCTTATCTTAATGCCTCGCCATATCTGGGGCCTAATGCATATAATAGGCCATGCCTGCTATTTACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTATG:1 + chr3L 14893027 5' - 1360 3363 1 69.64 GGTAGCACGTTATTGCGGCTTATTTCTGGTCAGCTGTTGGGAAAAGGGCGAAAGTGAAGCGCAGCTGTTGCCCAAGTTGGCGTTTAGGCGTTTTTCATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAAGATGA:1 + chr2L 3422447 5' - 1360 422 1 65.67 GAACCTTTTCAAGGTTGTTGTCATAGATTAACATCAGTGCTATCAATTAAGGTTTTGTGATTCATCATAGACTTGTCATCTTAATATATGTATACAAAAGTTATCATATGTATGCATTTTTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAA:1 + chr2R 21833861 5' - R2-element 3378 1 73.97 TCTCATTGTTTCAACCCCTCGATTCCCGCCCATCTGCGACCGTAAATCACTCAAAACATAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCAC:1 + chr2R 9640132 5' + I-element 4886 1 63.70 ACGAGTACTTAGATCTGACACAATCTCTAAATAATCTCAACAATCTTATTTATCTTAAAAAAGTATGAAAATAAGTAAATTTTATAATAAATGGCGAGAATAATCTTAGGAAAGAATATAATGTAAAATTAAAAAACAAACAAAAA:1 - chr3R 1864404 5' + Doc 4698 1 65.07 GATCAGTAAGTTGTTCGCCGGAAACGTGCGGGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATG:1 - chr2R 1185096 5' - Doc 4588 1 76.15 AAAATATATAACTTATGCAAAAAAAAAAATTAAAAAAATTTTCAGAAGTGTACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTG:1 + chr2R 330440 5' - gtwin 7345 2 61.98 GCAACATGAATGCCGCGAAATGTTTCGGTTAAAGTAATGGATTTCGTAACTAATACATTACTTTATTTATGTGCGTACCGATATGAAAAACTCTTGGTGCATTCCATCACAGTTAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:2 - chrX 4540761 5' + 1360 3 2 79.45 GTTGTTGTCGTTTCCCGTTGTTGGCGCATTTTCATCATATTGCTAGTAAATTGTTATTGCTAGTCTTCTAGCACAACACGCCCACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTT:1 + chr3R 3624116 5' + 1360 3231 1 78.90 ATTCGACGAAAGGTGAAAGGTGTTCGTCTGTTGATTCAACCCTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chrX 5206571 5' + Tirant 8146 2 60.27 ATAATGTGCAGCGCCCGCTGTCAGCTGGTGTTTTTATTGCAGATTATGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATTTATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTTATAT:1 + chr2L 20986522 5' + roo 8735 2 66.67 GCATATTATTCGATTTGGAATGTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - 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chr2R 20739136 5' + hobo 25 1 68.49 TGAAAGCGAACAAAATATTGAAATTTGTAATGAAAAGAATCGAACTATAAGTAACGTATTTCACTTCTTTAAAGCCACTTCGCCTTCAATTTACACACTTTTTCTCTAATTGAAACATTAAGAATATTAGTATTATTGTTATTATA:1 + chr3R 20305826 5' - mdg1 16 4 71.92 CACCATTGTCACATGTATTTGTTTTGAAAGCGAAAGCTTGCAGTTTTGCAAGTGGAACAAAGTAATTAAATAAAAACAGGAGCACGCAATTTAAGTAATCTGCATTAAATAATAAAATATCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAGC:1 + chr3L 18739382 5' - invader1 344 2 80.14 CAATAAAAATTTACATGTTTTGGGATGCAGAGGGAAAAAAAACAATCGACGAAAATTTTTTATCATAATTAAAATGTTAATCTGCGTGAAGTAAAAGGTTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr3R 26633144 5' - 1360 3368 1 69.18 GATAGCTTGGTCGACTTGGTGAGAAGATACCCTAATTTTTCTATATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 5447853 5' - roo 9037 1 58.90 TCTTAAAAATAACGAAAAGAAACATATTGATTTCAATTTCGACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGT:1 + chr2L 11734530 5' + Doc 85 1 79.45 CTTAGTTCTTTTGATTAACATCTCTTAGTTCTCTTAGTTCTACTAAAGATATAAAGAAACTCACCTGAACTCAACCGCCTCGCACTCCAGACTTTGGTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTT:1 - chr3L 15126870 5' - I-element 390 1 67.81 TATGGCCCGACTTCGTTCAAACCACTGGACTTCTGTATAAAAGCGGCTCCAAATGGTGAATATATCCACCATAAACTGGGTCTTCGTCTGCGGCCTGTCCTTTAGTACACACACATGCACACACACACACACATATA:1 + chr3R 25023318 5' + accord 7028 2 75.18 TTGTGATTAATCTCAATTTGTTGAGATGTCCTGGCTGTTTACGCCGACTTGCGACAAAACAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCC:1 + chr2R 16078780 5' + I-element 4883 1 70.55 TGCATATAAAAATATATATAATTCATTTGTTAAAACCATTTGCCGGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3L 13545091 5' + hobo 37 1 57.97 ATTATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCC:2 - chr3R 30872894 5' + micropia 4995 4 58.90 GATGCGATGGCGAGAACATCAAGTGATTGGCAATGTGAGCAATGTGACTCGGTTGCGACAATGGGACCGCCGCGCATAATATTATTAATTTTCCCAAATTTCTACACTTTCAGCTGATAACTTGTATCTGATATTCGGGTAACTCG:1 - chrX 2893653 5' + INE-1 559 1 52.05 TCTTGTTGCCGTTTTAATTGTGAAACTTTTGTCATGCAACTTGCATATCTGCACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAG:1 + chr3R 25442804 5' - R1A1-element 5266 1 64.38 GCTCGATGATTTTCGTAATACTCTCTATGTGTGTATGGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1 + chr2L 6755753 5' + pogo 81 1 74.48 TAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTT:2 - chr3L 10563965 5' - hopper2 1519 1 75.34 CATAGAGTAAACCTAAATATTTAATTAGGATTATAACGAAGCGAGCTTATCGCGGATGGCGGCCGCATCGCAACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTAGATATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTCACTTT:1 + chr2R 14634602 5' - pogo 191 1 54.86 ATTTTTAACACCTGGAATTTGAGATGCCTTGTGCATGGTTAGCATTCTAGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTAT:1 - chr3L 3757228 5' - copia 5087 2 64.38 AATCATTGTTTTGACCTTAGCACAACGCACGTATTTCGCTGACTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 24976194 5' - roo 9045 1 58.54 CGTTGTCATTTCTCTTGTTTCGTAACGTTGATTTCATTTTATTGTTGCCCGTTTGCCACTCCAACTTCACCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATT:1 - chr2R 20447909 5' - hopper2 1559 1 50.68 TGTCGACTTCCTGCGAGTAGCCGGGGGATCCCTCGAACATGTTGCACTTGAGCGTTTCGGGAGCCAAATATTAGCTTTTAGACAGTAACATGGACTGGTAACATTAACATATTGCAAGGATTGGTTACATTTAACAATT:1 - chrX 11697729 5' - HeT-A 5823 1 50.36 CATTTCATTGCAGGGAAAGCACTTTCCAATTATCCGGTCCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTT:1 + chr3L 17245756 5' + I-element 280 1 73.79 CACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAA:1 - chr3L 10563985 5' - hopper2 1539 1 61.64 CTTTTTTGCGACCTCCCCTCCCCTCCGCGACGCAAAGTGTCTCATTTAATCCTCGAAAATGCTCACAGAGCGTGCATATATATATGTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chrX 1764019 5' + opus 7144 4 64.83 AATTCGATAGAAATTTACCAGACTAATAAAGTTATAAAAAAATTAAGAAAGCATTTTACAAGAGTATGGGCGTGGCAGTTTTAGGCGGTTTGTGGAATCTGTATGATGAATCTCAACCGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATG:1 - chrX 7619947 5' - INE-1 102 1 40.28 AATTTGAGATGCCTTGTGCATGGTTAGCATTCTAGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chr3L 3757213 5' - copia 5073 2 74.48 AGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1 - chr3L 12861799 5' + pogo 72 1 68.97 AACGTAAATCGCAGCGGCAGCAGTCGTCGTCGCTTGTCTGCGAGCGTCTCAATTCACTGCACATTTTGCAAATAACAATCGCATTTTTTGAATAATTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr3L 17108674 5' + hobo 23 1 70.55 CACTCAATTCTTTTGTTTGTGTTCGGAAACCTAATAATCCCTCAAACACCATCGAGAGTTCGTTAACAGGAGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGTCGCTACGCT:1 + chr3R 22840366 5' + Transpac 4966 2 52.05 AACCTTTTCTACTATTAATCGTTATCAATATTACTTAAAATAGAGATTTCAATTAATTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTA:1 + chr2L 12488245 5' - copia 192 2 64.83 CCGGGGAGTTTCGGTATGTTAATCTATATGGTAGCTCCAGTCTTTGTTCACACATTCCGTTCGGCGGATAAAAAGCCTTTGTTTACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr2R 24745738 5' + 412 7090 2 58.90 CTAAAGCTTAGGTATTTCGCAAGCCATGTATAAAGACTTATGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTT:1 + chr3L 18738074 5' + Bari1 82 1 71.23 CCATATCCATATCTACATATATCCAACGGGGCGGCCACACACACGCACAACCAAATAACGAGCCGAATTTTTAAGGTCACAGTGCGGTGAATGTCCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 20399115 5' - roo 394 1 72.93 TAAAATAAATTCATAATTATTTAATTCTAGTGAAGTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 + chr2R 21473606 5' + pogo 66 1 71.76 CCTGTCCATTCACCACAACGTGATCTCGCAGAACAGCCGCATCAGCCTGACCTACAATGACCATCGATCGGTGGGTATTACTGCAAACTTAATAAGTTAAGTTGAATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - chr2L 13690132 5' + Doc 16 1 71.94 GCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 - chr3L 2184947 5' + jockey 91 1 74.66 CAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAACATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTGGTCGGCT:1 - chr2L 15322925 5' + diver 313 1 67.59 AGAATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGATTCTGACCATATTAAGTATATATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTAT:1 - chr2R 8568836 5' + mdg3 38 2 50.68 CCAAGGGCACGGAGGTCAAACGGTAACAGTGCGGACTTTGACGAGCACAAAGACGACGCACCGTGAACTAACTGGACCTCGTAACCCAGCAGGACGTCCGCAAAAGGGAAAATAACGGGATCCCTGC:1 - 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chr3L 12854412 5' + mdg1 7091 2 53.10 GGATAAAAAAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3L 18792413 5' - roo 9009 2 61.64 AACTGATAATCCCTTTTATCTCTGTGTTGTTATTAGTTACGGATATATGTCCAAATTGTTGTGCCAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chr2L 11613315 5' + hobo 57 1 55.48 GGGAGCAAAACACGTTTAATTCCCGACTGGCGACGCCTGTCGTGCGGAAAGGTCCTAATGGGACGCTGGAGGATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr3R 19639729 5' + 412 34 2 54.55 AATAGCCACCCCACACATAATGGTAGAAATAATTTTATTATTTTTTTTTTTATTTTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTG:1 + chrX 19820168 5' - Juan 4128 1 71.23 TGTGGACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 + chrX 10806889 5' - P-element 2806 1 29.66 GAGGACCCTGCAGATGTGGTACAGGAAGTAGAGAATATTCTTGTAAGGAGTTCGGTAAATAAATGATACCTTGTTAAGTAAAGTGTTTTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr3R 29516453 5' + I-element 30 1 61.70 AATCCAACTCTTTTTGCCGTAGGAAAAAAGGTTCTTTAGCATATTTACATACCGGTCCGAATCACTGTGACCTTGTTTTCCTCTATTCTAAACCTAAAGAATAATAAGTCCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2R 4803083 5' - roo 398 1 78.08 ACAGATAGGCCGAAAGATTATGTAAGTTCACGTGAAAAGCAACAACACGAGATACAGAGAAATAGTACTCAAATAATAATATACAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr3L 18788965 5' + 1360 22 1 64.08 TCAGTGGTATTATATAAGGTTTGCGGTAAGCGGGGAAAGTGAGGGTAAAATGTCTAAGAGCCTTATTGATAAATCCCAGAGACAAGACGCATTAATGAGTTCATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATT:1 + chr3L 15939546 5' - jockey 4815 1 69.18 CGTAGGAAGGAAAAAAGGAAAAGATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr3R 6412097 5' + Tirant 8128 2 71.43 TTTGGAATACCAAGATACATTTTTAAGGAATTCGGAAGTGCTCTCTATATTTCTAACCATACCATCACTGTAGTTTATAAAATTTAATGGAACGTTATATAAAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr2L 20485201 5' + 1360 20 1 68.49 GACACAAAAATATTTATTTTCAATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 + chr3L 18034548 5' + Transpac 4975 2 57.24 TCTGAGGAATGAATCGCTTTGAAGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAA:1 + chrX 21636166 5' - Stalker2 7589 2 59.59 AAAAGTGTGGGCGTGGAAGTTTTGTGCGGCTTCTCGGCGTTAGAGTGGGCGTGTCAACATGGGTCAACGAATTTGCGCTGCTTCTTTGTCTCTAGAATTTGTATGCTGAAGCTTAACCTTCTAGATTTTATAGTTCTTGAGATCTC:1 - chr2R 5509664 5' - INE-1 148 1 76.71 CGAGATTTTAATCTGGAAAACGTGTTGAGCTTGGGAAATTAGTTAAAGTCTTAGTGCGCAAGGAAAGCCATTCAAATTGTTTTACTTGCTTTACAGCTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTCTTTGCTGCGCTGCGCGAATT:1 - chr2L 6876728 5' + Rt1a 31 1 68.97 ATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 - chr2L 14480541 5' - Transpac 260 2 52.74 AGTCAGTTGGAAGACAATATGTGCGAGAGCGAGAGGACGCGAGGATTAGAAGGGCAGCTGGAAAGCTTTAAAAAAAAATGCGATGCAGGATTACAGCTGTTCGGGCTTGTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chrX 7967343 5' - P-element 2875 1 76.71 GCAATCGCTACACTTGGAGAAATGTAAAGAATTGTCGAATTTTCAAAAGTTTCATAAGAAATTAGTATTATACTAGTTTTTAATTAGTTTTATAGGCTAAAAAAAGGGATATATAATTCATAGAAATGTGCAAAGTGCAGTATTTT:1 - chr2R 8722674 5' + gypsy4 452 1 73.29 ACCACAAAGGTATCCCATCCGCGCCGGTGGAGCAGTACAACACTTTTCAGATGCGTCGGGAAAGCAATATAAATCCAAGCCCGCCATATATTCCTTCTTGCAATATTTAACAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 20774495 5' + TART-B 10629 3 80.33 GATACATAATTGATATGCACATTTGTGTATGTATGTGTTTATTAGTCTCCTGTGTAGTCGCCAAATAAAAAATGCCGACAAAATCATACCCAGTGCTTTTCATACAACAACAACAGAGAATGCTATAGTCGAGTT:1 + chr2L 21371418 5' - INE-1 575 1 70.37 GCCAATCTTTTTTACAGTTGTTATGAAACTATGAAAAATTTTTCAACGAGTCATATGTATTGGTAGAAGCTACATGCTTAATGAATTAATGCCTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr2R 11562780 5' - pogo 2074 1 67.12 CTGATACAACAAACCACGCCCGAACATATCTCATCGAACAGGCTTTCTTTGATTAATTAGTTCCGTGATAATGCACTGCAGCAACGCTAATATACTCCTAATAAAAAACGTAAAAATCAACAA:1 - chr2R 9024699 5' + hobo 2517 1 78.05 TGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGT:1 + chr3L 18034571 5' + Transpac 80 2 73.29 GTCAATCGGAAACGATTATTTTGTGCATGTGAGTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCT:1 - chr3L 3565432 5' + gypsy 39 2 56.16 AGCAATTACAACAATAACAATAATCATAACTAAACAAGTGGAGGAAGAAGGGGCCAAAACCAAGGAAGAGGCCGAGGTAACTTCAACCAGGGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTC:1 + chr3R 23184753 5' + GATE 8277 3 58.90 AAAAGGGGGCACTAGGAGCCAAAGGAGACTGCAAAGTGCCCAAAGACATTCGCTGCCTTCGCAGGTCGCAGGAAATGCCCGAATCGAGATGGTTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACT:1 + chr3L 3757106 5' + copia 4898 2 64.38 AGTGCCTCATCAACGGGAAGCTGCAATCGGATATACAATAAAGCCCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTATATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chrX 12998014 5' + roo 8735 2 67.38 AAAAGCAAAAGTGTGTGTTGAACCACGTTGAGCAAAGTGACGACAATGGCTCGACAAATATTTTACCAAAGATTCAGTTTTGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 19543528 5' + roo 8704 2 58.22 GGGTGAAATTCCTTGACCCCGTCATCGGTCCATTAAGATTAGGGAACGCTTGTTGTTACGACCAAAATTGATGAGCTTTCAAATACTTTTAATGCCGTGTATAAACGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTA:1 - chr2L 324693 5' + HMS-Beagle2 6897 2 59.59 TCTAAACTTTATTTCTGGTACTCTATAAAAATTATTTTACTAAAGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATATACA:1 - chr3L 15277679 5' + I-element 79 1 67.12 CCTCCGGCTGGGAAAATCTAATAAAACGAAAGAGCTTTTGACAGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chrX 17027876 5' + roo 8715 2 62.50 ATACTGAAATCTTGGCTACGTAAAAGTGACATTTAAAGAAATTTTTTGATTTAAAGTTCATTAAAAAGAAACAAAATAACTTTCTGCAGTTCAGGGACCTTTAAAAGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2L 7449839 5' - roo 394 1 73.97 AAGCGAAACCAGGTCGTCCTGTTGTCCAACTGATGGAATCTCTTTTTGGCCCAATCCCTGCGGCTCACTGGGCTTAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGC:1 - chr2R 9623435 5' - I-element 5312 1 54.48 CTTACTGGAAATGTTTGCCATGGTTTAATTTAAAATCGAAAGTCATTTGCAATCCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 + chr2R 12814833 5' - opus 7453 2 58.33 CCGTGTTTGTTGGCGGCATCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAA:1 - chrX 16526322 5' + P-element 101 1 16.44 GGCTTTTCCTCTCAACATCGACGATAACGATTATGTGCAAAGTTTTATTTCTCACTCTCGCCGCAAAATTAAAAAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chr2L 7271950 5' + 297 6617 2 61.64 AACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCT:1 + chr2R 5582150 5' + Cr1a 435 1 75.89 CTCGCCATTTGCAACTTTGAAACTGTGTAAAGAGCTTTAAAGGTCTTATTTTCGACACAATTTCACACATTTCGAAGCTGTGAAAATGTCTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCTGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr2R 11595955 5' - P-element 2859 1 63.19 TGTTGAAATAAATACTGCATTTTGCGTAAAACGTATACAACTTGTTCATAATTTATTTATTTAATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCG:1 + chr3L 16271885 5' + jockey 149 1 55.00 TATATCTGAACATGTTCTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3L 19574017 5' + 297 31 2 64.38 GGAAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr3R 4532868 5' - 1360 3338 1 56.43 AAATTATATATCTAAATTATATTTTCTTATTATATGTGACATTGCAATACCTCCATATTTCATAAGGTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 - chr2R 14940775 5' + blood 53 2 52.05 GGGGAGATGTACATATGTACATATTTTGTCAGGCTGGTCATCGGCTTGACTTTTACGTTGCACTATGGAAACCTTTTTGTGGCCAAAATCAATAACTTCAAAATAAATAAATTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGT:1 + chrX 22575916 5' + INE-1 91 1 64.38 AGATCTTCAAGACTAACATTTATGGAGATAAGGAAATCCATTTGAATTGAGAACGATAATTTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAATCATTTGCACACCACATGAGTCAGTCACTTGAGATC:1 - chr2R 9866936 5' + roo 160 2 67.12 TTAGTTTGTATTTATTTATGTACTTATTTAATTTATTATGTACTTATTGTTATCAGTTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACCATGAATTAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATATTGAACTCGTCTGATGTTT:1 - chr3L 26265113 5' + Gypsy12A_LTR 1878 1 77.40 TATAAAATATTTAAACTAGATTATCTGACAGACAGCCATTGTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATT:1 + chr2R 21425073 5' - HMS-Beagle2 7118 2 71.92 ATGTGTAAGAGCGTGAGGCATTAAAATTAAAGGTAACCACAGAGGAGAGAGGAAAATGCTTTGATCAACCAGGAAGTACAAAAGTCGGAACAGCCTCGAAAGAATTGGGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATT:1 - chr3R 5430545 5' - Burdock 245 2 78.77 AGTCGACCCACTGCCGCGACACTGGATTCCAAACAAACGAGCACCGATTCATCTTCGGAGAACCTCTTTGGTGAGCCGCCTTGGAGGTCTGCACTGGGAATATGGAATAAACCAATATATGCCACCACTTGAGAACACGTGTGTTC:1 + chr3R 10636057 5' - blood 7367 2 65.75 CCTAACCGACATCGAATCGTTCGATATGCCCCGTGCCCAGACACAAAAATATTTATTTTCAATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chr3L 18034509 5' + Transpac 18 2 71.92 AAACAAAAAACATTCTCTTCTTTTGGACCAAACAAATTTATGCATTCATGAGATAAGACGGGACGGACAACGCCCCTTTTCTTAGAACGTTACTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGA:1 - chr3R 18620669 5' + roo 336 2 63.01 AAATGGGAAGTATTTTTAAAATAGTCAATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr2L 14480568 5' - Transpac 287 2 69.86 AAAAAAATAATTACGAAATATAATTCACGTATAAGAATAACCAAAGACACTAGAATATTCT:1 - chr2L 16673056 5' - Tc3 312 1 72.13 CTGGGAAAGTGCATTCTCGTACAACCGTCCGCTTTTCATATCACTCGTATTCTTAATCGCATAAATCGTCAAGTATGCGTAATAATCTAATCGTCATAATTCCTTTTTTTAAAGAGGTGGGCTAAGGAAATTGGTTGTATTTTAA:1 - chr2L 4137285 5' - FB 440 1 73.10 TTATGCTTTTGGTAAGTCATTTTTTACATTAATATAATTTTTACACCTTTTCACGATTATTCAACCAATACAGGTATACCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 + chr2R 9390894 5' - mdg1 390 2 51.85 GAGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGG:1 - chr3L 5179203 5' + P-element 74 1 24.00 AACGCTGGCCATCGAAGGACAACTCAATCGGGCCAACGGCATCTGCGGCATACAAATTAAAATATTTATGTGTGTGCATTAGGCGAGGGCAAACATTAAGGACACAATGTTTTTGAGCAATGCACCTATGTCGCCTTAGATAACAA:1 + chrX 9701204 5' - roo 8765 2 71.92 TTTGCGGCAGAGATGCGCTTTCTATCTTGAAAAAAAATAATAGATACTTTTAAGGAGGGCAAACAATTTCAGGACATACAGTATAATTCGCTCAGCTGCCTCGAG:1 + chr3R 31650293 5' - pogo 2095 1 74.29 AAATCATTGTTTTGACCTTAGCACAACGCACGTATTTCGCTGACTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 24976193 5' - roo 359 2 50.68 CAGTACAATTTTGTTATCCCATCAATTTCAGGCAACTTGGGCCACGTTTCCCCGAAAAACACTACCCTTGCCGCATTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCT:1 + chr2R 22011325 5' - opus 7266 2 66.41 ACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATT:1 - chr3L 10563989 5' - hopper2 1543 1 58.90 ATGCCCAATTGAATAAATTCAAAAACGAATTTTTTTTAAGTAAGCCATGTCAGGTTAGACTATGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3R 4422061 5' - 1360 3348 1 54.69 AAGGCTGCGTCGCTCTTTATGCTTATTTAAAAAAGTGGCGTCACATCCCAGTTTTGAGAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGAT:1 - chr2L 10519620 5' + X-element 29 1 54.29 AGAGGGAAGCGAGGAAGTAGCCAGCCCAAGGGGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGCTTTTAAGTTTCAGCAGATCGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAA:1 + chr2L 18178293 5' - Tirant 316 2 76.60 GGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAA:1 - chr3L 19335424 5' - invader4 254 2 68.97 CAGACAGGATGCTTTCAAGTAGGCGGATTTTATAAGTATTTGCTACAGCTTCTGCATCATTAAGTTATCCGGTATTGGAAGCGATAGATATCCCAATTCATAACCAATGTCATGTAATACAAAATTATTTTGTATATTATAAGTAT:1 + chr2L 17571006 5' + Gypsy12A_LTR 1800 1 80.14 AAAGCTGGCACTTACTTCATCATCGTTTTTATTTTCCTATGTGCCCTGCTCTGTTTGGCCGCAATGTTGGCTAAGAAGGGTAGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTTAATTTTATAATTAATCTTTAATTAACAGAGGCAGTAGT:1 - chr2R 18344431 5' - G4 3777 1 56.16 AATTCTTCATTGATGGTATCCCATGTAGGCGTGTGACCACGGGTTCGCTGATCATAATCCGTTGTTGATCGACTTCACCAGACAAACATCCACAGCCGCATTCGCGACTCCCCTTAAAGGGTCGAAACCACTTACGCAGCTCAAAT:1 - chr2L 23394779 5' + Quasimodo 6955 2 71.23 AAATCGCACTACGATGTCGTAAACAATTTTCAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTGTGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTAT:1 - chrX 22834606 5' - Tirant 8332 2 51.43 ACGCATATTTTATTGTCAAAATCAATAGATGTCAGCGTTTAACAGCTGCCAGCGGCAAAATACAACCCCTGATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chrX 17027974 5' - roo 9035 1 61.48 AAATGTGAACAGCGAAGATTGCGAATCAGCTTCAACAACAAAAACGATTTGATGTTTACGTAAAGGTTGTGAAGGAAATAAACATCAGCTATGAACATAAACCAATATTTAATTCGCATGCTAATATAAACATTTTATAAATTT:1 - chr2L 17773338 5' - Tc1 58 1 50.69 TAGGAATATCGATCTTAGAAATTTATTTTATTTTAAATTAAATGTTTCACTACCCAAGGGTACTTAGTTAAAGTATTATCATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chrX 13384973 5' - opus 7461 2 47.95 GCTCAGATAAGCCCATTTAGCAACGTTGTCATTTCTCTTGTTTCGTAACGTTGATTTCATTTTATTGTTGCCCGTTTGCCACTCCAACTTCACCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCA:1 - chr2R 20447932 5' - hopper 1389 1 66.44 TTGCACACTTTTCGGCTTGACACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGTGGGAAAAGCAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chrX 19113586 5' + 412 32 2 58.02 AAGCGAGTCCAGGTGAATTGGGTAATGCCCTTGAGTAAAGATTTATGTAAATAATAGATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGTTTGTCGGAAAT:1 + chr3R 11146358 5' + flea 4813 2 61.76 GAGATGTGTAGACTTTGGATAAAATAAACAATATTACGAAAAATAATAAAATGAGAAGAAACTCTCACAACGTCGGCGTCACTAGAAGCTGCACTCCTAATCTATTGCTTTTATAGGGGATATCGACGTTCATGCGGACACACGGA:1 + chr2L 20840108 5' - INE-1 126 1 78.77 AACACCAAAGATACATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAAT:1 - chr3R 21276668 5' - BS 5077 1 64.38 CTTAAAGTTTGATTTAAGAGAAATATAATACCAAATCATACTTAGAAGCGAGTAAGCAAAACTCGAAACTAATCGAGACACGTCTTAGATTTTAGTGTTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3L 20744137 5' - 412 7523 2 67.81 AGTCAGAGCAGTCTGAAACAGAAACTTCTAATCAGAATACATATTCCTTTACGGAATACACAAATCAGGAAGATATATTGGACCTAGAAGATAACCCACATAATAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - 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chrX 16217524 5' - P-element 2821 1 40.41 TCTTGGCCAGGCCATTAGAGCGACTTAAGTAAGACACTCAAATCAGAATTGACAGCGCAATCAAAGCTGCGATCCCTCCTAGTTCCTTCCAGTTGATGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACG:1 + chr2R 23295337 5' + invader4 2669 1 71.20 AGAACATCGTCAATAACGTTAAGGAAATTATGGAAGAATACAGTTTGAATTCAAATATCGATAAATATATTTCTGTTCCGCTTGTATGGAGCAGCGGCCATAAATACTTCCAGTGTAGCCAGAAGCCTAAGATTTCGTTTCAGGCA:1 - chr2L 22983849 5' - Transib5 2923 1 45.89 AATATTTAGTTACTAAACGAGGAAGCTTAAGATTAAATAAAGCATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTTGACA:1 + chr3R 12610010 5' - roo 9003 2 68.38 CTACATCGAATTTTGAAGGGCGTGAACGAATAGCATGTAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTA:1 + chr2R 21029376 5' + Transpac 81 2 76.03 GCGCCATTGGTGGAACAGGTGCAAGCACAGGTAACCGAAGGATTCTCGTTGCTACTTGTTAAATCACGCTTCAACATGTTTACAAAAATTAAAACAAATTTAACATTTTCATAAACCCATTATGCTTTCCCTGTGAAAGATT:1 - chr3R 30251818 5' - 1731 4228 1 48.59 AGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 + chr3L 24291978 5' + 1360 67 1 66.21 GGCACTACAAGTCGATTAGCATTTGCATAGTAAAAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAACCTATAAA:1 - chrX 18190416 5' - hobo 2914 1 53.01 AGCAGTCCTTGAAGAAATACACACATTTGGTATCCGATATGTTTGGGAAACTTTTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAAATGGGTA:1 - chr3L 7946301 5' + pogo 325 1 63.01 TCTATCAATTGCAGCATACTTTTGGGCAAACCTATCAATAGTTTTCCAGCCCATGCGTTTTGCCATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chrX 18353593 5' + jockey 18 1 60.42 TCTGGAGGAGCACAGACATCATATAGATGGACCGTGTTTACTTCGCACCCACACACACACACACACACACACACACACACATAT:1 - chr3R 18114613 5' + accord 183 4 79.76 AAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACCCAAGGCTCTGCTCCCAAAATTTTCTCTTAATAGC:1 + chr3L 9764440 5' - P-element 219 1 15.75 GCTGATCGCCGCTTGATCTCCTGGGTTACGTTTGATAAATTCGTCTATATCAATCTAATTTTCTTTTGCTGCTACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGTTAATACCTCCTGAAGGGGACAGTTCTAGAAAAGGAGGAAAAG:1 + chr2L 22280072 5' - Gypsy12A_LTR 2023 1 48.57 TTATTACACATACCATAACCATACCCCAATATATAATTATTCACTATTATTTGCCGCCAATTTTTGTCTTACGCATGTTATCGACA:1 - chr3R 25563357 5' - transib1 173 1 62.79 GGAATGACTGGGGACCCAAAACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGTGAAGACGGCAA:1 - chr2L 20324222 5' + Tirant 53 2 52.74 CTTTATAAAAGAATTTTTCTAAAGAATATATATTATATATTATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACACATAAATAAA:1 + chr3R 29112908 5' + Juan 4206 1 71.03 TACTAGATTTTCTAATAGCTCAAAGCAGGCTGCAAAAGAGCTGTGGTTTTCATTCCCCCTTCTTCTTTATAATTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 - chr3R 9175277 5' - Juan 4161 1 52.74 ATATGTAAAGGTTGTTTTTTGAATTTAAAGAAGAAGAACACTTATGGCTTAATAATGAACGACTTTTCTTACTATGTTCCTTATTTCGAAATATCAAGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2L 5448017 5' + roo 24 2 69.18 TCTTGTTAATAACTAGTGAAATAGTGCAATAAAATAGATGGATTATATGGATGGATGGAGCATATGTGACTTTTTTGATGAAACTATAATTCCGGCTTTATTTCTTATCTTATCTAAAGGTTAATTATTTGTTTATAATTAATCAG:1 + chr2R 8177081 5' - Burdock 308 1 68.49 CAAAAGAACCTTCGTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chrX 16217566 5' - P-element 2875 1 75.37 AGGTTTTCTTAGCAAACATGATAACGTTTAAGCAAGGGTTTCTTAAGGCTTCTTTCTTAAATGCAATATAACTTAAATGTTAGTGTTCAAAGTTGTGAATACAAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 5762082 5' - roo 392 2 74.66 GCATAATGCATTATATAAATATTACGCATACGCCGCGGTGTACGTAAGCCGGAGGTAATGAGTGCGCGAAAAGCAGCTGCAGGCGGCGAATCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGT:1 - chr2R 12069700 5' - Tirant 371 2 66.44 AATTATATTAGCAGTAAAAGGTGCAAGTCATTAATAGTGCGTAGCACCCATTTGTTTCGGTTTAATTGGCAGTTTTAAATCTTACACGTAAAGAAGAAGAAAAATGTCTTGCTCGCTGGATTATTTATTAATAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3R 4603312 5' - hopper 154 1 70.55 AAAATTAACGCCAAACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3L 13827472 5' - roo 9002 2 66.44 GTGCGAGTGAGAGAGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 - chr3L 5179215 5' + P-element 83 1 28.77 GCTTGCTGATCGTTTTGCCGTCTGGTCATCAGGTGCTACACGCGGCAGGCCACACAATCATGTTTGGGGCACAGTTATCTTTTTTTACTCAAACGCATTTTACTAGAAAATGCATCAGGCAGCGCGATCATCGCTTGCCGCACAGT:1 + chr3R 2270600 5' - Stalker 487 1 84.93 AAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCACAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTC:1 - chr3R 17210080 5' + HMS-Beagle2 87 2 76.71 TTTGTTGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTT:1 - chr2L 22684611 5' + transib3 60 1 50.68 AAAAAATGGTAGCCATTTTTATTGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 - chr2R 22012253 5' - opus 452 2 52.74 ATAGCCGTCGTCGTCACTTTTCCACTTTCCATTTTGAGAAAGATATTTCACTTTGCGTAATTCGTACGCTGCCTGGCGCCTGTGTGTGTGGATTTACGTATGGAACCACGGTTTTCGCAGAACATTCAATGGTTTTTTGAATGTCC:1 + chrX 22456164 5' - HB 428 1 61.64 GAGAGCGTACAAAAGAATTGTGCAAATAACGACGTAAGTGTACGCAGCAATATGGCTGGGAATTTATGTATTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCG:1 + chr3L 19335326 5' + invader4 2812 2 54.79 GAAATTTGATTACATTAAAGTACAAAAAATACGAATAGTAAGTAAAAAGGAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTG:1 + chr3R 5024823 5' + diver 5952 2 66.19 GCATAGCCTTTTTTGAATGAATAGGGAGTAAGTGCACTTGGCAAAATGGATCGTGCTTTAAAACTGGTGGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACTCATGCGATTACCTTAAACA:1 - chr3R 30558309 5' + I-element 4879 1 51.37 GTGTTCGGAAACCTAATAATCCCTCAAACACCATCGAGAGTTCGTTAACAGGAGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 + chr3R 22840384 5' + Transpac 41 2 54.10 AACTAGAGAGCCAGTCCTTGTACAAATTAGGACACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGT:1 - chr3L 10564022 5' - hopper 1384 1 62.76 AGTATGTAGTTTATAGTATAGTATGTTTATAGTGATATATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCACAGGTCTGCATTCTTTC:1 - chr3L 11576292 5' + HMS-Beagle2 80 2 71.92 TTGAAACCCCCTTTTGGTTCGTTGGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGAT:1 + chr3R 6411958 5' - Tirant 339 2 60.96 AGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGAATGCTTGCAAT:1 - chrX 16217539 5' - P-element 2844 1 53.62 AGCAGCAACAGTAGCAGCAGCGGAAGTGGGAGCGCCGGTAATGGGAATGGCATCAGCGGGGTGATCCTGGAGAACAATAGTCATCATTCGCATCACCTGTGAGTACTTGAGGGGTTATTCAATGATGTGAACAGATCGAG:1 - chr2L 9552942 5' - Transpac 114 2 75.00 CCGCTACGTAATTTAATTAGACGAAGAAATATTCAGTATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGT:1 - chr2R 5045695 5' + invader6 4529 2 59.59 TTGAACTGTTGCACCCGAGCTCCCATTTCCCTGGGTGCCTCCCATTCGAGCCATAGAAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTT:1 - chr3L 18738187 5' - Bari1 1675 1 65.07 AGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr2L 9319113 5' + jockey 83 1 75.38 GGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATT:1 + chr3R 19589905 5' + BS 5048 1 52.05 GCCAAAACTAATCAAAGCAACTAGGACCGACGCTAAATCGAAACCACAACTACAATCACTGCGGAATACCAAAATGCAATCAAAATATGCAAGCCACGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 - chr3L 14551431 5' + P-element 25 1 68.49 GTCGTCTGCCCAATTGAGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 - chr3R 31681939 5' + Doc 77 1 67.81 TACAACTGAAGCGAAATAAATGGATAGATATTCAAGAGAACTTGAATATGTGTCAGGGAAAATATAGTGAAACATCTTTGGGGCACTACAAGTCGATTAGCATTTGCATAGTAAAAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chrX 18190497 5' - hobo 2932 1 79.45 AACGTTCAAAATGTGCCCCAACTGAAGAAGAGTAAATAAGAAATTTTGAATGTATCTGTATTTGTGTGCTTAATATGCCTATTTAAAATGCCAGTTTATCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr2L 8707388 5' + 412 20 2 67.59 ATTCGAACATTTTAATTAACTTTTGTCATTGTTTGTTCTTAAATACTTAGCTTATAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAA:2 + chr3R 12727137 5' + I-element 67 1 61.64 CGGGACTTGGGATGTAATTTGGAGGAATCAAGTGTGTGCAATGGACAACTACGGCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 - chrX 5399107 5' + opus 55 4 61.59 CGTAAATGGAACAAAAACCCAAACGTTTGTGCTCGTTTGTTGGAAGCTGAAACAAAAATCGTTGCATACTTTCTGGGCCAAGCCGAAATCACACGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACCCGCACTCTAC:1 - chr3L 13366227 5' - hobo 2928 1 73.85 TACAAATCGACAACGAATAATTAACCAACATTTTTGCGCGATTAGAAAACTTATTGACGTCATTCATGTACATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGAT:1 + chr2L 13509175 5' + F-element 4644 1 56.16 GTATTTGCATTTCAATTATGCACTGTGGCCACGGCCAAGCACACGAGGGGATTGGGGCGGGCTACGAAGTTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACAGACTTTTG:1 - chrX 14489959 5' - S-element 1528 1 55.93 AATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGT:1 - chr3L 4933816 5' + blood 7076 2 63.01 AATTCGCGTTGAGATATTCCGAAAATGACATTCGATTGTGGAAAAAGGGGGAGGGGGGAGGGGTTTGCTCAGCTTGTGGTCGTTGCCCGAAAAAGTTAATTTAACAGCGCATCATTATAATAACAGCTGTTAAAGTCAGCTGTTGC:1 - chr2R 9411722 5' - hopper 1261 1 67.81 AAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCACTTTGTGGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAGTTTAAAGTAACTTTACTACATTAACATAACAATCACATAAAAAAAGAAATAGGATATAAAATAAGCGTCA:1 + chr3L 19457488 5' - X-element 4551 1 60.15 GGTATCCTTTAAAAATAATAAATCGGAATATATAATTGGTAAATATTACTATATATAAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATTAAAAGTAATGACCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2L 18952992 5' - roo 9043 1 63.01 CATTTACCCATTTACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACATACATATTCATATACATCTCCATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACC:1 - chrY 2720354 5' - HMS-Beagle2 283 2 63.01 AAAAATCTATTAACCATCAACAATTGATCAAGCCGAGTGGAACTACCGTCTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCG:1 - chr2R 330521 5' + gtwin 71 2 65.75 ATTATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCC:1 - chr3R 30872894 5' + micropia 38 4 59.59 CCTTTTTAAATGACTCACTCACATAGATAGAATGCAGCGCAATCGATCTCGGGGCAGACTATCGATACATATCGGTGAACCGTTATATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGA:1 + chrX 10806006 5' + I-element 425 1 60.00 TAAAAGTGATTGGAACTTTTTCGGACTGATTTTACAAAGCGATAATAGCGCAGCCAATGAAATATTTATGCATTTCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr2R 10600128 5' + 297 6601 2 73.29 AAGTATAAAATATTTAAACTAGATTATCTGACAGACAGCCATTGTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTCAGATACAAAA:1 + chr2R 21425070 5' - HMS-Beagle2 239 2 68.28 GTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1 + chrX 11661360 5' + 297 6632 2 58.90 ACATGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGC:1 - chr2R 3120314 5' + accord 67 2 60.27 AATTAAAATGAAGTGATTTAATCAGTTGTTTTATACACGACAGAATTTTAATAAATAAATGTGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCA:1 + chr3R 27514659 5' + Ivk 376 1 57.53 ACCCCTCCTATTATTTTTGAGGCAGCCCAGGAAAAGTGAAGTAATCTCTGTCCTTTAGCTCACATGAAACGCGGGCAGCTCTAGGTATTGAATACCGCTCCTGATGAGGATGGCTGCTCCACCG:1 + chr2R 9244607 5' - G2 455 1 50.81 CTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAA:1 + chr3L 15859621 5' + I-element 67 1 62.33 TTTAAATTTATTAAATATCTTTATTCACTTTATTAGTTCTTAACCCGTTACTCGTAGACTAAAAGGGTATACTAGATCCGTTAAAAAGTATTTATGTGTGTAACATGTTCAGGATCAATACCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTC:2 + chrX 13860587 5' + INE-1 110 1 70.55 ATAAAAGTTCCATAAATTTTTGGACATATTGAAAAACGTTTATAAAGCTAAGGTCAATGTTAAATGCAGTTTTTTTGTATTAATTTAAAAAATTGTTCCAAGTCAAAGAGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:1 - chr2L 9074339 5' - flea 5006 2 76.03 GCAGTCCCAAAAAACAAAAGTATTGATTTCAATAAACAAATTATAAGAACCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCGAATGCACTTGCATCCAAGAGAAACGCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 1060273 5' + roo 8684 2 71.92 GCATGAAATTCTGAAATTGTTGCCGCACATCCAAATGAAACGAAACGAGACGTAGATGGTTTTCCAGTTCAGTGACAGCTTTTCATTTGTTTCATTTTCTTGCCGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTGACTCGTTGAGT:1 - chr3L 9519693 5' - roo 393 1 70.55 TCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr3R 19721206 5' - opus 7476 2 63.70 CATTTCTATTTTACTTAAAATTTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATA:1 + chr3R 9175194 5' + Juan 59 1 53.42 ATAGAAACACGGACAATGGCAGCCCGAAAAGTGACAAAGACAACACGTTTCGTGCTGCAAAAAGTTACAGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr3L 5179128 5' - P-element 2847 1 53.68 ATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAA:1 + chr3R 19450176 5' + roo 113 2 65.07 GCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAA:1 - chr3R 29091386 5' + rover 63 2 63.01 AGAAGTTTTAATAAGAGTCGGAAAGCTTTCTACCCCGTTAGCTGATAGTCAAAGAACTTTACTACGTTTTTATTTCAAGTCACAACGAATCACTCACGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTACAATATATGATAATTAAA:1 + chr2R 6253498 5' - Cr1a 89 1 57.53 GGCTTATGCTTGTGAATACAGATCAGTATGCATTTGTTGATTAAAATTAGGACTGATTTTCGAACAATCCATCTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr3R 8183509 5' + Doc 53 1 48.63 AGTCATAATATTTTATTAGTAACTTTTGGGAGTATTTTTCAATTTTCAACGCTCAAAATTTGCCCTTATCGCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTATGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 21170975 5' - roo 9022 2 49.66 TTCGAGCTGTAAAACCGAGAGCATCGGGAAAACTTATTGTTATCTGTTCGAAATCGACCAACTAAGGACTGTTTTATTTAATTATTTATTATAATAGAATAGTTTTCAAAACTAGACTAAGTTAAATAGTATAGCATTAGCTACGG:1 - chr3L 20494756 5' - I-element 5301 1 52.05 GATTGGGATTGGGATTTCGATTTCGATTTCGAGTTCGAGGCACTTGGAATCGCACTTGTTTTGCCCGATTTCTTGCGACCCCACGAGTCGAGTGCCAATATTGTGGTTTTGAGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGA:1 - chrX 19054346 5' - 17.6 7174 2 70.34 CCGCCCGTCATCCGGCTGCTTAATGTCAACTCTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTT:1 - chr3R 28782631 5' + blood 90 2 77.40 CTCACCGACATCGGGCATCAATTTGGTACAGGCTCATCTTTTGTCGCTTGAAGTCCGCAAGGAATTCCGTATTCATTCTGACATGCACTGTATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 - chr2R 12814971 5' + opus 13 2 70.37 CAGGCACATCACTTCGATGTTCATATATGACTGGCGCACACCTTCTTCAGCGTGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCC:1 + chr3L 20176750 5' + gypsy 7054 2 64.58 ATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAATTATCTGGTTTTTAATGGTAATCTTAATTAAACTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACTCCATTA:1 + chr3R 11750231 5' + diver 6075 2 54.11 ATCTTTAATTCCATCCGTATAAGATGGCAATAGTGCAACGGTCCCAAAGGTCCTAGTGTGGTGTGCAATTTCCTCAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr2R 4802915 5' + roo 44 2 55.48 ACTGATAGAAAATCAATTTTTAAACAGCGTCAGCAGGACTCTGGAATTCAGATAATGCATGTATAGGGTTTTGAACCTTTTTTTGAGATGGATTAGATGTGTGAGGAGTCTTAAAACTCCCCTCAAATCTCGTGTAGGGGAGTG:1 + chr3L 23318819 5' + gypsy8 22 2 61.81 AATTCGTTAAAGAACATAATTATCCGATATAGAAAAACGTTGAAAAGCCACTTGAAACAGATTAAAACCGATTTCGGAAAATAATTATAAGCTAAGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGA:1 - chr3R 12727267 5' - I-element 5331 1 60.27 ATGGAAATACAAATTTCTTGATTGGGATACAGCCTAGTTATACCCGTTACTTGTAGAGTAAGAGCAAAGACATTAGAATATTATTATTATATTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAAC:1 + chr3R 7081522 5' + INE-1 15 1 63.01 TTTGTTTTGCAAATATTTTATCATCACTGGCTTTGGGCGTTTGATTCTCGACGCTTAGCGCTCGGAATTCAGTGCTCAGTTCAGTAGGTGACACCATTGCGCTTAGGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 18518082 5' - roo 394 1 73.29 AAAATTTCAGTTTTCAAATTACTTTTATTTTTCAACAACCAATAGAACTTAGATGCTAGCTAAGCATTTCGCAATTTGAGCAAAACCAGTTCCCACAAAGGAAATGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 10361801 5' - roo 396 1 76.55 AATGAACGACTTTTCTTACTATGTTCCTTATTTCGAAATATCAAGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr2L 5447964 5' + roo 73 2 70.42 CACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCACAAGAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAAACGA:1 + chr3L 23933555 5' - Cr1a 200 1 74.66 TGCGATAAACAAAAAGTAGCTAGGGCGAAAAGTGCAGCCACTTATGTACACACAAAAATGCACTGGGCACCTATTCTCTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAAATTTCTGAGCATGCAGACTGATCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGC:1 - chr3L 23751476 5' + Cr1a 356 1 60.27 AGCGCAGTTGCCTCAGATTTCTCCTACCCCATTTTGTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACATCCCTA:1 + chr3R 20939162 5' + jockey 4760 1 76.03 GCCACTGACGGCAGCTGCAACCGCACCAGAAGGAAAATTCGGGGGGTAAGTCCGTGCACTGAGACACTGTCATACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGTCGCTCTCT:1 + chr3R 27832533 5' - Quasimodo 7160 2 53.73 GTCAACATTCTAATTCTAAAGTTTGATCAAAATAAACTTTGAACATAAATTTAAACCATTCTAACTTTTTGTTTTGTAAGATTGTATTTTGTTTTATCCCAAAAGTAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3L 16907723 5' + jockey 18 1 71.83 TTTAGCGCGCAATAGCTTTCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCT:2 - chr2R 16073022 5' + Burdock 58 2 62.33 CAAATATACAAATTGATGTTTCATCTTTAAATGCAAAATTTTGGTTTCGAATTCTAGTTTTAAGTTATTTTTTTTTGCATTAAGTATGTATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACT:1 + chr2R 7781192 5' - S-element 1685 2 64.38 GGAAACAAGCATGCCTTTACATACTATAAGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAAT:2 - chr3L 23702317 5' + G4 1 1 80.82 AAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAAT:1 - chr2R 4206655 5' + 1360 323 1 70.55 GTTACGGATGCATTGTATTAATATGTTTTGAACTCCTGTTTGCTGGAGTTGAAATCAATCAGAAAAAAGGGTTTCCGACTATATAATGTATATACATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGAA:1 - chr4 1121530 5' + INE-1 95 1 57.69 TTGGTGTTATACCTAATGATTTTCTGTCTTTGTATATGGCACTTTCTACTATGATTATTCTGCACATAATTGTAAAGCTAAATATCTTTGTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAA:1 - chr2L 261087 5' - Juan 4178 1 62.76 AGGGATTGACGAAAAAGTACTTTTTTCCAATGTTTTGAATAAGTTGTTATATTTGTTGCATGAGTAGCATTTGTTGAACTCGATATTTTTCTGATACGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGT:1 - chrX 20503411 5' + invader1 3722 2 54.11 CTGTTGAGGATTTTCATGGCATGATTGTAACTGTTTGATTTTACCGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCAC:1 - chr3R 5456527 5' + I-element 5024 1 69.86 ATCACATTGGCCAGCGGTCGGTGCAAGGTCTCCGACGACAACAGACACTCTCCTACCCTATCCTTCTTCCAGATATCAGCTATCTATCTATCTGCTATATGGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 22522770 5' - roo 9059 1 76.09 GAAATCTAATTTTATTCAAGAATTTTCAAAGTGTAGTCGAGCTAAAAGGGGGAAATTTCTTAAAAATAACGAAAAGAAACATATTGATTTCAATTTCGACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr2L 11734473 5' + Doc 27 1 65.52 ATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGA:1 - chr2L 14480507 5' - Transpac 227 2 75.86 AGCGTTTTTAGTTGTTATTCTTGCTTTATTTTCCACATCGTAATCAGATTAAAAATATTAATGCGATTCTAGGAATAAGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3R 30782631 5' + pogo 40 1 56.85 TATTAGTATTTATTGATCATAACAAATAACGATAACAAATTCCGAAAAACTCAATAACATAAGTTATCTTGTTATGACACCTCATAGACATATGTACATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAA:1 - chr3L 20209686 5' - Burdock 6370 2 69.86 TGGCATATATGCATGTACATAAATGCGTTCAAATACAGAAGATCAGAGTCAGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTCCAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr3L 20398989 5' + roo 69 2 63.70 TACACCGGTTTTTCCAATTTCTCTTGGTGTATATGTTGTATATATGTTTGCCATATAATAAACTATTCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 - chr3L 5275014 5' + I-element 56 1 55.48 TACAATTACAGCATAAAAAAAGTTACAAGCTAGAAATTTAGCTGCTTGCTGTACTTTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTGATATAC:1 + chr3L 14944495 5' + G5 4748 1 76.71 CAAAAATCGTTGCATACTTTCTGGGCCAAGCCGAAATCACACGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACTTCCACCCGAT:1 - chr3L 13366175 5' - hobo 2917 1 51.69 ACAGCTTTTCATTTGTTTCATTTTCTTGCCGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTTGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3L 9519619 5' - roo 318 2 76.03 GGTGCAGGAGGGTAAGTTGACATCCATGAGGTCCAGCTCGGGCGGGATTAATTTAGATTGTGGTCAAGTGAATGATGTGGTAGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 18953147 5' + roo 8703 2 58.90 GGGAGAGCGCTTGGGTGAGAGGAGAATGTCTGGCATGGAGAGTGAGAGAGCGTAGCGTGGTTGGGAAAAACTGCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr3R 11773876 5' - P-element 2854 1 59.85 GCATAAACAAATAAAACTAGAAATTCCCCGCTGAACCAGAAAATCGGGAAGCCGAATAAAGGAAGGCAAAAAGCAAAGTGAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 + chr3L 14708887 5' - opus 7470 2 63.01 AATTAGAACCCCTGGACATTGCAACCCCTGGCGACTGTTGTTGATATCATGTCAAGCATTTTATTGATCAAGTTACGCATCCGTAATACGAATCGAAATATAATTGCTCTTTTCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:2 + chr3R 30850702 5' + I-element 10 1 78.77 CAATGATGCAAACTGTCGGGTCTCACAGCCGCCACCAACGGCAGGAATGGCAGGACGCAACAAGTCCTCCTTAAAAATACTTTATCTTGTATTCTTCGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCATCTTG:1 - chr2R 5265149 5' + Q-element 487 2 62.41 ATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCG:1 + chr2R 16072942 5' - Burdock 170 2 82.19 CACATTTCCCCAGCCTCAATTCATGACAAAAGTTTTTCGGCGCAGCGACAGGCAGATCGGGCTACTATATACATATATATATGTCTACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chrX 12214607 5' - opus 7473 2 66.44 CACGAGGCAAACACATACACATACGAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr3L 13228566 5' + P-element 55 1 47.95 GTTAAATATATTTTTTTTAAATTGAAAGTTGCAGAGGAATTTCTTGTACGAATTATATTATATAGAGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAATGAAATCAGTAATG:1 + chr3R 11778738 5' + 297 39 2 53.66 CGGGGAAATGTCGCTTGTGACGAATTTCTATTTGATTTATGCACTCCCTTTGCAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 - chr2R 21029454 5' - Transpac 251 2 62.14 AGTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACG:1 - chr3L 3565401 5' + gypsy 70 2 65.75 TTTTTCCTCTGCACTTTCACATTGCTAATTTATCCGATTCTGGTGCTCCTTTCAGCTGCCGGAACAGTATCGTACCACATATGTCACACCTGCGCGTAAATGCATCACCAAGATTGCGGGCATCAACACCAATAGAAGGAGTGGAA:1 - chr3L 17844928 5' + rover 6902 1 68.49 GCACTATGAAGCAAGTGAAGCAAATGTGAAGCAAGGCTTTCCTTGAAGTCCTCATCCGGGACAGAGTGATGTACGCCTCGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 + chr2R 5640687 5' - 1360 3346 1 56.16 ATCCTATTTAACCAGGTTTCCGAAGTCGTCAGAGCTTGCCAGTTGGCTAAAAGCGGCATAGTCGACTCAAACCTGCTGGATCATCGCAGTCAGCGACATACAGTGACGCAGCCAGCGTCGAACGCCGGTACG:1 - chr3L 26803803 5' + aurora-element 300 1 63.64 ACATGTTCTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3L 19574026 5' + 297 6620 2 59.31 ATCAAGTCTGCGGTATTAATCTTCATCTATAAAAACTTTAGCAATCACTACTAAACCATCTGGCTATAAACCTCCTGGACAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGA:1 + chr2L 11442906 5' + G-element 4169 1 57.26 GTGAGAAGATACCCTAATTTTTCTATATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2L 5447871 5' - roo 355 2 58.22 AGCAGGATCAAAGAGTCTACAAAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:2 + chr2R 16510226 5' + roo 55 2 56.16 ATGACTTTTAATTGACTTCAGGATGATAAGAGAGTTCATAAAGGCAAGCAAATATTCTGAATTTGGTGCAAGAGAATTGTATGTATTATAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr2R 9868857 5' + roo 31 2 63.01 GGGGTCACAGGGAAAAGAGGGTCAACTCGGATGGGGAGCTCGGCTAGGTAAATACTGAATTAAAGTGTGAGAAAGTCACAAGTGTGGAATAGCTTCTTTATACTACGTACTAAACAAAAACCTCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTC:1 + chr3R 15991209 5' - Rt1a 4941 1 66.44 CCATTTACATACACATACATATATCCTCCATATGCAGATATATGTATAGAAAACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTC:1 - chr3L 15149262 5' + invader4 66 2 68.49 GAAAAAAGACCCAAGCACAACCAAATGACTGCACATGGACTTGTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 + chr3L 3339348 5' - Transpac 5154 2 69.18 GATTAATAAGGCCTTCAGTTCTATAATTGATCTAACCAGCCTGCTAAGTACTCCACTCGTATATGCTGATCATAGGAAGATCGCAACGCAGAGCTTACATGCTAGCTTACTGGCTCTAGCTCATGGCGTTGGGTGTGGTGGTCTT:1 - chr2R 8320263 5' - Gypsy12A_LTR 2175 1 75.17 TTAATGAACCTCTCGAGTGTGTTTTAAAACGCGCCAAGATAAATCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1 + chr3L 6675308 5' - 412 418 2 67.59 GGAAAAATCTCCATAAATAACAACATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 + chr3L 1981547 5' + opus 55 4 81.82 AACTTATACCATCAGAGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:2 - chr3L 12861814 5' + pogo 58 1 60.27 GTGATTGGAACTTTTTCGGACTGATTTTACAAAGCGATAATAGCGCAGCCAATGAAATATTTATGCATTTCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTCCCATTATTTCAA:1 - chr2R 10600123 5' + 297 25 2 69.86 AGAAGACAGAACAACAGGCAGGTCCGTTGCCCATCCGAATTACCCAGTCATACAAAGACACACCTCGTAAATCCAATCCACCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTG:1 + chrX 15814275 5' - roo 8883 2 52.05 CATTATCTTAATCAAATTTATTCATAATTCTCTAAGAGTGAATCAGCTTTAAGAACTGGACTACTCAAATACCGTGAGAAACTATCATTCACAGCTATAAATATAGAACATATTAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chr3R 22772021 5' - opus 7492 2 65.07 TAATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACC:1 - chr2R 21425158 5' + HMS-Beagle2 62 2 61.64 CTGCAGCAAATAAATGTTAACTCAGTATACGAACGAACAAAAGCACCAGAAACAAATTGTTTAGTTTTGCTGCTCATTCTTCTTCTTCCACCGATGCCGTAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGA:1 + chr2L 19158782 5' + P-element 15 1 71.43 CATTACTTATATTTTAAGGTAAATAGAAGTACAATAAATTAATAACACACATAACATTAATAAAATGTTGTGCACCCATGTAGCGACCACAAGGTGGAGCTCGTGTGCCAGTTATTTAAGCTTAGTACCAGGTATCTGATAGTCGG:1 + chr2R 8777917 5' + INE-1 551 1 69.86 GAATGCACTTCCAAAGCCACTCCAGGTAATCGATTCAAATTCGGTCAAGAGCCAATTGAAGTGCAGCGACTTAAGAGCCCCATAAGCCCAGTAGCATCCGTTCACAATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATT:1 + chrX 11916040 5' - Juan 4181 1 70.55 AAATCACATAATAATGTGCAGCGCCCGCTGTCAGCTGGTGTTTTTATTGCAGATTATGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:2 + chr2L 20986512 5' + roo 8727 2 63.01 CCGAAACCGCAATGCACTTTGACTAGCCGGATTCACCATATTACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTTGACATGAGAATC:1 + chr3R 10461668 5' - roo 331 2 69.86 GCTTACAATTTACAAATTTTACAAAAATTAATATCGCTATGTCCCTTTCTAACGTATTGGTTTTTTTTTTGTAAACATAATACATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGATTAACTTAGATAGTATAG:1 - chr3R 17467204 5' - I-element 5313 1 54.79 AGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 - chr3L 13228518 5' + P-element 97 1 15.71 GAGAAGTCTCGGCGAATGTGTGCGAGTGAGAGAGTGGCCATGGGATTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr3L 5179234 5' + P-element 27 1 54.13 CTTACTAAGCAACATATTGCAAAATATTAAGTATACGCCTTGTCTAACACTTAACAATTTGTTATAGTATGCATTTGCAACATAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 + chr3R 10136971 5' - I-element 5318 1 65.75 CTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3L 18792434 5' - roo 8988 2 76.03 TCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2L 22719582 5' + 1360 63 1 66.91 TGTTTATGTAGGATTTTTTATAAATATATGCATATGTACATATAACCGACTGTTAAATATGTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1 - chr2R 21473693 5' - pogo 2043 1 60.27 AATATCAGCCTAGCAACTGGGAAATGGAAAAGCCCCCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAAT:1 - chrX 20864989 5' + jockey 4824 1 74.66 GAAAGAGACGGCGGCAAGGATAGACGGGCAACAAAGTGGATTTGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3L 17108555 5' - hobo 2900 1 58.88 ATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAG:1 + chr2L 21325114 5' - invader4 243 2 73.97 ATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGTGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGACAAAAAGTGGGCAAACGATTCCAGTTTTCAAATTTAAAAAATTCGATTTTTCCAAACCCAGCTTCTT:1 + chr3R 20001670 5' - FB 7 1 77.05 CTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTG:2 + chr3R 9175219 5' + Juan 84 1 70.55 GTGGAAGGAAACTCTTCTGACCTTATGTAGTACATAGGATTTTAACCATGACTATTATGTCCGTTTTTCTGTCCGTATGAACGACCTAAAAAGCTGAGTCAAGGTAGTGCCAAAGACAAGATGCGTAACGCTATACGATTTTTTGG:1 + chrX 6757122 5' + 1360 26 1 66.44 AACAACCATTACTTTCCATCTGAGCAGATCAATCGCAGGTGGGTTGTATGTTTATAGTATGTAGTATGTAGTTTATAGTATAGTATGTTTATAGTGATATATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 - chr3L 11576354 5' + HMS-Beagle2 6901 2 71.92 TATAAATCAATTGGCTTTCATAATTAAATGCACTGCTCTGCGATTTAAAAAAAAAAATTTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAA:1 - chr2R 11112160 5' - FB 99 1 73.43 ATTATTTTATATTCCCGTTTCAGCCTTCGCGTTCCTTAAGAGAGGTTATAACCGCAGCAGAGAGGTTGGGCCAGGCCTTCAAAAATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3L 22709304 5' + 412 38 2 58.22 CCCACATGTATTTTCTCTTCTTTTTTTGTTGTTGTATCTTTTGGGTGCGATGCAGCGAGTCCGAAGCGTTTTCAAAGAAAACCCGGTTACGAGACCTTGATTTTTAGATATTTTTATTAC:1 - chr3R 14716627 5' - gypsy10 405 1 55.00 CACGACAATATCCGGTGACAGTAAAAGTTTATTGTTCAATAAGTATTAAGCACTTCATTTCTTCATTAGAAATAAGATAAGTGATAAGTTATTTTTCAAATGGTCATACATATGCACTATTTTTCCATTTT:1 + chr2L 14433734 5' + pogo 49 1 45.04 TGGCGGCTGGCTGCTGACGATGTCCTTGTTCCCATAGTGCAGTGGCAACTATTCCGCATCGAATATTGCAATTTAGAATGCGGAATAGTTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:1 + chr3R 27859134 5' + hopper 28 1 37.67 GAATCAGCTCCAAAGACAATCCCGTAGCCCCAGCTCCGTCGAGCCATGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTC:1 - chr2L 20326986 5' - Tirant 247 2 69.33 ATCTGAGACTGACATAGCATAGGGATATTGTTTGCTCAAAGACAAATTGTAAATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACGTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTC:1 - chr4 295743 5' + 1360 274 1 64.38 CAGGAGCCACGAAAAAAAAGAGGGAAAACCAACCGCAGAAGTTAATCGAAAAACGCTAAACAAAGGCCACAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chr2L 14490097 5' - P-element 2862 1 62.71 AAAAGGGGTGCCAATCTCTCTTTTGGAAACGCATATTTTATTGTCAAAATCAATAGATGTCAGCGTTTAACAGCTGCCAGCGGCAAAATACAACCCCTGATTGCCTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chrX 17028002 5' - roo 394 1 78.72 ACATTGAAACCCCCTTTTGGTTCGTTGGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGTTGTGTAAATGTATGAAGGTTT:1 + chr3R 6411955 5' - Tirant 355 2 53.38 GCAATGAACAATGAAAGCGAGTGAAGTGAAGATGTTAACATCCGGAAGACGAGGACTACATTGTACATAGGGCCCTATTTCCGTGCCTATATATTTTTGGATAGTATGAAATAATGGAAGTGGCTGG:1 + chrX 20122941 5' - 297 6606 2 74.02 CTGGCGATGGGGATGCAGCTCCTTGTTATCTGGCTGTCAGCTAAGTGACTTCTTAATACGAGGGTGCGAGGGTGCAAGGGGCGACAGCAGAAAGTGGCTGCAATCTCTGGAGTTGTAAGGGCACCACCAGCAGCAGCAGCAGCAG:1 + chr2R 10995745 5' + TART-B 151 2 80.00 TACATTTAGATTTATTTTTATTAGGCACTCCTAATATCATGATAGTTATATTTTAAGAACCTCTAATGAGCCAAAAATGCAGTAACTAAAAGTATATATTTAATAAATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr3L 18164282 5' - pogo 2090 1 76.71 TATCTTAAGTAAAAATTATTTTACCTCGGAAATAGACTTAACACCCTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 - chr3R 2425641 5' - 1360 3327 1 77.78 TATTTAAAAATTAATTATACGCCACGTTGGCTCGTTTGGGTTTTTGACGCATTACTTCGTCGCGTTTTTACCGGTCGATTCAGTTTTTAATTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr3R 12725670 5' + 297 6607 2 67.12 CAAACACGCTGGTGATCTCCACGTGATGCGGCGACGGCGACGCGTTGTTGCGCGTGAAGTTGGACTCCGAAATATTGTGCGGCAAAAGGAAACGTTTCTGACTAAATAAAGTATATATATTTCTTGATCAGGATCACCAGCCGAG:1 - chr3R 13007591 5' + INE-1 90 1 54.48 CGGTAGATGGGATCTCTAAGATTGGACGTAGCCGAGCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr3L 14085000 5' - opus 7477 2 68.75 ATTCAATAACAACATGCATTTGAGCAGTTATGCAAATAAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACACTCATGACCTCC:1 - chrX 17737258 5' + jockey 4757 1 71.92 ATATGATTTTGACAGCATAATTTTCCAATTTAAACTCAAAGTTCGGCTACAACTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACG:1 + chr2R 5541009 5' + S-element 70 1 63.70 AAAGTGGTGGGCGTGGCGCGTCGCATGTGTACGCCTCACGGAAAATGTCGGCATCAAAACGACAAATAATCAATGCCCTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATA:1 + chr3R 22931826 5' + Stalker 7116 4 52.34 AAGCGGATTTATTTCAGGTGGCTCGCTTTGGGACACCGGATATGACTCGGAGAATAATATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACATCTATATTTATTTACAA:1 - chr2L 13227029 5' - I-element 5276 1 60.96 CAGCGTAGGTCGACATTCATATGATAAGCGTTTTCGAGGAAAATATTTCCTGCGTTTATCTAACTCTATAAAAATGTCATATTTTACTCGCAGTAACCTGTACAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr2R 8452695 5' + blood 7030 2 71.23 TTCCCCTAGTTCGTTGGCGTTTTTGGATGCAACTTGGGCAGTACGTGCCACTGTAGTTGCAATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATA:1 - chr3L 15853580 5' + jockey 4819 1 57.53 CGAGCTGGGAATGCAACTGTAAAAATAATAACACCGCGTCAAGGATCGCCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 21587639 5' - roo 9042 1 63.89 CTTAGTGAAACGAGTAATCTTGCCATTTGCACAACAAAATAGTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTT:1 - chr3L 19335483 5' - invader4 3072 2 75.17 GACACTGGAGAGAAATACCTAACTTGCATAATTCTGGACACTGAAGAGAAATACATAACTTATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGC:1 + chr2R 924424 5' + springer 7148 4 67.35 GCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 - chr3R 6412046 5' + Tirant 8173 2 67.91 CACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAAT:1 - chr3L 10563983 5' - hopper2 1537 1 63.01 GATAAGCCCAAGGTCCATGCCTGTCGTCTGGCTATATCCCACTGCCCATACATATAGCCGGGCTCAAATTTAAATAAATACAAGCATAGTGGAAAATAAAATGCGCACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chr2L 16385387 5' + I-element 9 1 75.35 GTTTTAATTGTGAAACTTTTGTCATGCAACTTGCATATCTGCACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCAC:1 + chr3R 25442814 5' - R1A1-element 5269 1 68.42 AAGTGCTGCTAAAACTACACACTATATCCCTTTGTTAAATAAAAGTTAAGCTTTTCACTTTAATTTCAATCGAATTGTACATACGAATAAAATTGTAATTCCACCATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chrX 6423314 5' + roo 8679 2 74.66 AAGTCTAAGGAAATTTAGGAGGCGAGAACTACAATTACTTCTAGACGAAACATTATTTTTCACAGCTTGCAGTGAAAATTTTCAAATATATGGCTATTTAAATATTTCATTTTGCTAATATTAAAGATATAAATACATATTACATA:1 - chr2L 14010956 5' - Dm88 4374 2 53.42 TGAGCTAACAGAACACGAGAGCGGGAGAGCAAGACCACGAGGCAAACACATACACATACGAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAG:1 - chr3L 13228601 5' + P-element 20 1 71.92 AGTAAGTTTAAATTAATACGCGTTAACTATTTTTTAATATATGCCGCGGTGGTGTCGGGTAGCGGCAAGTCAATATATTATGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAG:1 + chr3R 12725514 5' - 297 6756 2 55.86 GATGCCGCAATATGATACTTTCAAGTTAAATCACGTTTGACACCAGACTGTCTAGGAACGTCATGGGGATGTGTAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 - chr2L 9347590 5' - opus 7457 2 51.37 ATAATCTTAATTTAAATAAAATTACACAGTTTTGGGCGTTTTAGGGCGTTAGAGTGGGTGTTGCAACATGGGTCAACAAACTTTACTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCT:1 + chrX 22905343 5' - INE-1 149 1 65.75 ACAATAAAACAAATAAATGGACATAAAACTCTGATAAAAAAAAAGCATTGGATAAAAAAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 18792366 5' - roo 395 1 73.97 ATATGCAGCACTTGGCTGTGATTATTGCGCGGACTCATGCTTTTCTCTGCTCTCTTCTTTGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 - chrX 850145 5' + jockey 68 1 56.16 TTCGTTGAAAAGGATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGATTCCGACCATATACATTATATATATTCTATATCTATTCTATATATTCTATAGAATATCAGGATCAATAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACC:1 + chrX 124083 5' + Idefix 7066 2 65.07 GCAGTTGAATCGAGGAAAACCCGCCGAGCACTTGATTTAATTAGCCCTAATGACCGACGACCATCATCACCCTTTACCAACGCAACTCAAAGGCATACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGT:1 - chrX 8613987 5' - I-element 408 1 65.97 TTTCCACCGCTCATATCAAAATCCGACTGGAAGAAAAGGCAAAACTAAAGCAAAATCATTGAAACTTGTATGGGGCGCATCATGGGCGAGATCTGTTAAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTC:1 - chr3L 3498804 5' - X-element 4422 1 41.01 TAGTTTTTAGAGTATTTAAAATGGAGCACTCGGATGTGGCAATTTATCATGATACGAATTTGTTATTATTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGC:1 + chr2R 13212198 5' + diver 53 2 50.68 GAATTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTCTTCTTTTT:1 - chr2L 2763609 5' - Doc2-element 238 2 81.82 TTTTACATTAATTTGGGTGTGATTTTAAAAACTGACGTAGTGTTCCATGTGGGTTGACCTGGTCCATAGCATTTGATTACAATCAGATAGCGCACTGGACTCGTATTCAATGCTGGGCGCTGCCGAGCGATCGAGTTGTTGCTGAA:1 - chr2R 18297732 5' + micropia 5188 1 59.59 CCTCCGGCTGGGAAAATCTAATAAAACGAAAGAGCTTTTGACAGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chrX 17027876 5' + roo 77 2 69.18 TATTCGCCAACGTAAATCGCAGCGGCAGCAGTCGTCGTCGCTTGTCTGCGAGCGTCTCAATTCACTGCACATTTTGCAAATAACAATCGCATTTTTTGAATAATTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTATCACTCG:1 - chr3L 17108682 5' + hobo 15 1 76.03 AATTTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTT:1 + chr3R 9175212 5' + Juan 77 1 65.75 AATAACAGAATCTTGTGGAATACCTGTGCCGACGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 + chr2R 18440428 5' + P-element 87 1 26.71 AAACAACGCCAAACTGGTGACGCGCAGTGTATATTAAGATAACTATTACATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGC:1 - chrX 15019793 5' + S-element 71 1 67.12 ATGCCTGTACTGTCAAAATTTTTATTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGCCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATT:1 - chr3L 13166284 5' - I-element 5258 1 85.52 CTACAAAGTTGATTATTCAAACCACTTTATTCATTAGGCACCATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACT:1 + chr3L 20209557 5' + Burdock 74 2 72.60 TTTGGTAGCCGCTCTAGTCGGCCGGACTAACGGTTACAGCCCGCCCCAAAAAAGGGCATGGCCTCCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr2L 18627676 5' - 1360 3383 2 71.58 GGCCAAGAATTTGAAGAACTGTGCTTTTCTCACGCATCTTTCACTGGTTTTATCTTGCTCATTAATGTATATATATATGTATAAGA:1 + chr3R 26237464 5' - blood 7195 2 83.72 AATATCGAGATAAAACTCATTTGCGTGCTGAATCGTATCAAGAACAGTCATCTCAGATACATTTGTTTCCTTACAGCGACACATTTGTTGCCAAAGCTAAATTTGATTTTTAAGGTTAGGTATATCCAAAGACACTAGAATA:1 - chrX 21157198 5' - Tc3 316 1 79.58 CGAAACGAAACGAAAGGAGCGTGCGTTTGGCCGCCGACATGATGTGGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr2L 19643531 5' - hobo 2920 1 55.06 CCCCATATCATCTCAAAAACACCATACTCACCATTCTATATGGCAGTAAAAAATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr3L 23331316 5' + 297 59 2 67.12 GGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACTTGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCAT:1 + chr3R 19589938 5' + BS 5065 1 70.00 CTTTTTTGTTTGGCTTTTGCTTTGAGACAGCTTATTTGTATATATTCATATATGTTCATATAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCA:1 - chr3L 14709009 5' + opus 56 4 64.03 GAATATATAATTGGTAAATATTACTATATATAAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATTAAAAGTAATGACCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2L 18953017 5' - roo 354 2 58.22 GAAAGTAGCTTAATGACTTATTAGCCAAATTATGTAGAGCAGAATGGTTCGTAAGGAACACAAACTAGAAAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGATGGAGCGCGACAGAA:1 - chrX 17262571 5' + X-element 4422 1 48.89 TTCGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATAT:1 + chr2L 20928065 5' + Chimpo 70 1 66.44 CTTGCTTATTTCGTTATTGGCCGTAATAAGATGTCAACGCTGGGCAAAACGATTTTCCGCAAGCCCACAAAGACATGGATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGA:1 + chr2L 5420867 5' + Stalker 7171 4 53.42 AAACCGTTTAATGCGTGAGCAAACCTAGAGCACTAAAATCATTGCCTACTTTTTAGCGCAACACTGGGATTGAGATGAAGGATTTGTTGAGCCTCGTATTATTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGC:1 - chr3R 30622119 5' - BS 5070 1 68.49 ACTTTACTTTGGGACAGATAAGCGAGGTGGTGGCCAGAGGAAGGCTACGAAGGACGCTAAATGTGTGGACAGTTATGAAGATTTTGTTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTTTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAAT:1 - chr2R 5914794 5' - I-element 499 1 56.16 TAGATATTAATTAGGCAGATAATAAATATATACTACTATTATAGGAATTATTTGATAATTTTTTATATTGTATGCATTACAAATTAAGTCAGATGTTCGGTGGCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAAT:1 + chrX 5323555 5' - Doc 4637 1 67.81 GGCTACAGACACAGACTTAGTCTTTCTGAATCCTCAGCAACGAGGGGTTCAACGACTGCGTTTCAGCCTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTGT:1 - chr3R 24053749 5' - mdg1 7407 2 51.72 ATTTTAAAATAGATCAGTTCAAGCAACAACTGAAGTTGCTCAATTTAAAAGCTGTGCAAAAAAATCACAGTATCAATTGAAATGGTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCAT:1 + chrX 10128114 5' + invader3 5186 1 76.43 AAATAAAAAACGCTTACAAACAAAACTTACTATTTGATAGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATGTTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGCCGGCATAACGGCTG:1 + chr2R 3078926 5' - G5 4560 1 71.22 GACTGAACTTAACAGTTATCTCTGTCTCTCTGTTCGCTCAATATGCCTACGCACTAATACACATACAACATGTACACCCAAACAAACCCTACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACTAGATAAGAATAA:1 - chr2R 294054 5' + Idefix 6919 2 67.42 ACAGTTTTGATTTATTTCCAAGCATAAAAATTCGTTATCAGGTCAATGATCTATGTGTAAGCTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTT:1 + chr2L 13510781 5' - diver 165 2 57.64 TATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAACCCGGTATAGTAGTAGTATGTGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTAGTAGTATGTCAAAACCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTG:1 - 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hobo 2906 1 66.28 GGCGGAAAAGCTCTTCGAAAAACAGATGATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTCATG:1 - chr3R 4662031 5' + roo 8707 2 51.52 CCAGTTTTTGTTATTATAAAAAGTTAAATATTTAGATTTTCCGTGACCAGAATTGGTGTTTAGAATTGGATAAGCACTTCTGCTAATCGAGTAACGGGTATCTGATAGTC:1 + chrX 17816592 5' + INE-1 549 1 70.91 CCTATAATTGAGATGTACATATAAAAAAATTAACGCCAAACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 13827497 5' - roo 9027 1 54.79 TTATTACCCATACGCCCTGTGTATTTTCACACAGCGTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chrX 6484675 5' + jockey 30 1 67.13 ATGTTCTGAGTGTATTCCAAGCTGGATTAAGTCGAGGGTACTCCACAGCTGACATCATTTTTAACCGTCCTCTAAGATGCATTTGGCACCATCGTGTATGTAACTAGTTCCTAAGCTATAAAGAGAGAATGCTATAGCCGAGTTTC:1 - chr3L 27875012 5' - INE-1 573 1 76.03 AGGGCGGACAGTGAAAATGTTAATCAGGTCAGATCGTTTTTGGTTGTCTTTTCTTCTCTTCCTCTTCCCTTTCCTTCATCCCCTTCTTTTTGATGATGCAACAAGGAGGCAAGATTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTG:1 + chr3R 9123211 5' + 297 350 2 79.31 ATGGACTCGATTTTCACGTTGATTTCGCCCCGTTGCAAGCATGCGAGTGTTTTATAGCCAACGACCTGTGCTAATCCCATAAATCTAATCAGTTCGTTACGCTCTAAAATGTATGCTGAATCTCAACCTTTTAGCTTTTAAAGTTC:1 + chr3L 4620173 5' - INE-1 158 1 60.96 CCATATACATATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATATACATTTCCATATACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 - chr2L 8089946 5' - Transpac 5172 2 58.90 TTGAAACTGTCGATGTACTCGATATGAATATGGCCAATATCTGGTCAATAGATAAGCCGGCAAAAATGGGCCAAACTCCCGATGAATTACGCTATGTGGACAATGTAAAGCCCTCCCAGCAGCGAGTCGGTTAGATTCAAACACCC:1 - chr3R 4425976 5' + rooA 321 2 75.34 TAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:2 - chr3R 6412032 5' + Tirant 36 2 67.78 TAATTCGAGTAACTGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCC:1 - chrX 22574718 5' + 17.6 92 2 45.89 GCACGGATGCTTCTCCCATTAATCAATTTTTTCGCCAACAGCAACCCAATTTATGACGCTCTGCACTACTATTAATATCTGATAAAAAATGATGCACAAAAAAGTGGTAAGAGTAATAATTATAATATGAAT:1 - chr3R 17608891 5' + mdg1 54 2 65.15 ACTCGAGCAAACAGATGGCTAGATGGCCAGATGGAAGTTGGGAGCAGCCAGCAGCACATTGATTTTTGCCACTATGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGCTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTC:1 + chr3L 5737188 5' - Stalker 73 4 47.95 CTATAGCAACAACAACTACAGTTTTCTATGTTTCAATGCCGATATGCTCTTCTTCAGCGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGC:1 - chrX 10806467 5' + gypsy 7049 2 60.27 GCAAATTAAATTTAAATACCCGCATAGAGAAAGAGAAGTCTCGGCGAATGTGTGCGAGTGAGAGAGTGGCCATGGGTTTTTAAGAGGCAACTGCATGATGAAATAACATAAGGAGGACCCG:1 - chr3L 5179266 5' - P-element 2880 2 73.55 GGATATCCTTATTTGTTAATAATTTGCAAGCAGAACAGAAATTTATCACTATATTCAAGTAAACTTAGTTATAGTTAGTTATATAGCACTTTTTTAACATTTGAAACCGATTTCCTTGCAGGACCCAAAATAAATAGAATGATTTA:1 + chr3R 24180466 5' + G5 4827 1 79.45 AATCAGCCCAGACAGCCATCAGTCGAGGGTTTGCTATCTCTTTCGGAAAAGACCCGCGCGAAAATCGAATATTTCTTACGCTAGCTCGAGTAGTTAAATGGACTCGTGGTTCAACATTATTTAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTAA:1 + chr3L 17198689 5' + Doc 4697 2 59.59 AGCGTGGATGGAGATTTGAAGGTAATACACTCCCAATTTGAAAGGTAAATAAGAATATTTCTGTTCTTATCACAAATTACTAATTTTATATTTCTTTCCTCAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAGTAATACATTGGAAATA:1 + chr3L 23150161 5' - hopper 1343 1 67.81 GCGAGAAATCTGTGGCACTACTACTTGAGTAGAAGACTCTATGCTGACAGTTTGTAAGCCATTAAAATGCTCTGCTTGTATTAGATTTCCTTCTAATTGTATTCTTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr3L 1981667 5' - opus 7488 2 65.75 GTATTTGCATTAATAACATATCGCGAAAGACCTGCTACTGCGCGGCGTTTTTAGGCCTGCTTCTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGTTGCGGTCAATGCTGACCC:1 + chr2R 16891752 5' + jockey 4707 1 61.27 TTTGTACGTTATGTTATGGTGTAAAATGAATTAGGGAATAGCCGGTTAAATATGTGTATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCGCTCCGCCCGCGAGACGTACACTTCCTCGGTTGCG:1 + chr2R 15821997 5' - invader6 320 2 61.36 TTAGGTCTGAAGGAGGTCAACTCCGAAAGCTGCGAATCAGAATAAAGATGGTGCTCTAACTATTCCGAAAGAATTAAAAGAATTAAAGAATTAAAAGAATTATAAGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAAC:1 - chr3R 3854488 5' - INE-1 20 1 53.42 CTGATAATCCCTTTTATCTCTGTGTTGTTATTAGTTACGGATATATGTCCAAATTGTTGTGCCAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chr2L 11613313 5' + hobo 38 1 52.00 ATATCCTTTTTGGTTTCCGGATTAACTTAACCAACTTTTCAACAAGTATTGAACGCAGATCTCAAAGTGTGTGTCACTAAACTTTGTTATGCTATAATTATATTGATTATATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr2R 9092115 5' - 412 480 2 75.34 GAGTCCATGAGCTACGGCGAGTTTGTGAATGTACAATGCACCATTTCGGGTGGTGATCTGCCGGTTAACATTACCTGGACCTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAAC:1 - chr2R 7341939 5' + pogo 447 1 58.90 GGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTC:1 - chr2R 1949130 5' - Cr1a 4395 1 76.70 TATTTATAAGAACTTAATAAATTGAAAAAAATTTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTT:1 - chr2R 4774796 5' - baggins 5392 1 61.64 GTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATG:1 - chrX 21667930 5' + gypsy2 63 2 66.92 ACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr2R 12069590 5' + Tirant 8169 2 71.67 CCATTCCCTCCTCTTCATACCAGCCAGCATATGTGAAAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCGAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chr2L 18178386 5' + Tirant 43 2 56.94 TAAATCTTGCAAAGTCTTCTAACACCTGTCAGCCATTTTACAAGGTGTTTCCACTTAATACATCGACACACGCACACATACGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr2L 12847323 5' + 412 7093 2 56.85 CAATACTACATTTAAATGATATATAAATATATCATTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGGTTCAAGGTTATACGGTATTTTTGTAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTCACTTTG:1 - chr3L 17162363 5' - Stalker3T 277 1 65.07 CGATAAATTCTAATATATTTTATAATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAAC:1 - chr2R 21425180 5' + HMS-Beagle2 40 2 56.85 GAAATCGCTTATATGTACATTCCAGAAATACAGGTGTAAATGGCGATTTTGCATACCAACTAAGTTCGTTTTTCCTATTTTTTTTTTTAATAATATATTATTTT:1 - chr2L 19461154 5' - BS4 728 1 53.85 GCCAAAAGACATTGCCTTAAACTATTTAGCTGAAATTACCCTTGTCAGTTTGATGTAAACAAATAATACGCTTTATGAACTAAAATTATGATATTTTACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chrX 3578221 5' + hobo 25 1 60.27 AAGAATTTGAGTTTGAAATTTACAATTTTGCGACTCACATCGAAATTAGAGTCCACGTCTTGGTCAGCGAACATTAAGTGACCATGTCACGGTCGCCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGA:1 + chr3L 209412 5' - Tabor 459 2 50.68 GTTTGACTGCTTCTGAGTCGTTATTCTACCATTTTCATCATATCCTTTCGGCGATTTTAGCAAACAAAATTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAAGGCGCGAATTTTTAAATTTTTTTTTATTTTATCATATTGCTATGGAAT:1 - 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Bica 431 1 78.77 AATAACGAAAATTTCATTTAAAAATCAACAAAATATTAAAATACAGAATAAGCAGAATAAAAATAAATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACT:1 + chrX 9437140 5' + roo 8683 2 71.23 ATGCATTTCAATAAATATGCCATAATTTATGCATGGTGCAGAAAAGGCGACTAAACAAAAAAAAATAAAAAAAAGAAACCCAAATATTTGCCATAATCAAATAAGCTAGAAAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3L 10442963 5' + roo 10 2 72.60 CTCCAATTAAGCCATCTACCACACATTTATTAAATCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 + chr2R 11595849 5' + P-element 73 1 30.37 GATAATTGCGAGCCAAAGTGGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAAT:1 - chr3L 9762282 5' + jockey 4796 1 53.15 CATCTATCAATTGCAGCATACTTTTGGGCAAACCTATCAATAGTTTTCCAGCCCATGCGTTTTGCCATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chrX 18353595 5' + jockey 22 1 57.84 CAATACAGTTGAGGTAAATCAACTTTTCGCCAATCGAAACCGGACTTTACTTTGCAAACTCAAATTTGATTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 12941235 5' - transib2 2645 1 80.72 TCATTCACTACAAGTTTTATATATATATTAAACTTTTACTTATTTTCGAAAATATTTGCATACGCCTACTGAAACCCCAATCAAACATTTGTGGTAGTTTGAACACGCATAAGGCCCACGAAGCATA:1 - chr2L 20556586 5' + invader3 17 2 66.93 ACTATAGTTAACCGATTAACTTTGGTGATAAGCCTTCATTTGAGAACGTTGCTATATGGCGATTGCAAATGAGTTGATCAGTTGTTAAATGTACTACGATTCAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGCTTGGTTTTATCTTTTATA:1 - chrX 21590804 5' + BS 5018 1 68.49 TTTAATACATTTAGTTGGAGGTTAGAAGGTAAAATATAATATATAATTAATATTTTTTAGGAGGCACATAATGACTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGA:1 - chr3L 5427244 5' + G2 2875 1 52.74 ATATAAAGTAATCACTTAACTATGTAATAAATACACTCATAGTTTTATCAACGGAGGAAGGTCTTTTAGAAATGCTTGTTAATAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 11267673 5' + roo 8701 2 57.53 AGAATGACTACATAAGTGAATAAGCGAATGAGTACATTATTTATCATAGAAGAGCAATATAGCGTTTTCCTCTGTGTGGCTGTTGATATAAGATGAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr2R 6713991 5' + 297 20 2 71.23 TCCTATGGCTTATGCTTGTGAATACAGATCAGTATGCATTTGTTGATTAAAATTAGGACTGATTTTCGAACAATCCATCTTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - 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Tirant 344 2 59.70 TCTGCATCCGAAAGAAGAATCAGAATCTCTTTTCTATCTATCTTCTATTTTACGAGATCTTGAAGTTCATACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTAT:1 - chr2L 20068752 5' - INE-1 103 1 67.92 TGTAATTGGTTTAATACATTTAGTTGGAGGTTAGAAGGTAAAATATAATATATAATTAATATTTTTTAGGAGGCACATAATGACTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCA:1 - chr3L 5427253 5' + G2 2865 1 57.93 CTACGTGGAAGTAGCATTCAAAAGAAAATTCCGTGCGGTCGGAAACAAAAATTAATCAACATTTTTTAATTCCGAAAATTAAAACCAAGTTTAAAACAAACTTAGGGAAAACCTAAAACTCCTCCTGTACACGGCCATCCTGAAG:1 - chr2R 574953 5' + G-element 3883 1 71.72 GCCAACATCTTTATGGAGAGTATGGCGAGATATTTATCTATGGATGGAAAATATTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chrX 5366247 5' + pogo 56 1 62.14 TTCCTTAATTCACACATAAAATAATCTTTTAATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAAGGACTATATATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCAAGTCTAGCCATGTCCGTATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCTC:1 - chrX 14766979 5' + INE-1 128 1 61.11 ATGCCGGGAAAAACTGTAGTTGCTTATAAACACTTGAATATTGTTAATGAATTTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTGTATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1 - chrX 19192479 5' + INE-1 13 1 77.40 GAAAAGTCTATAGACCAATACAAGGTAGGCCCAAACTGAATTAAATTTATAAGAATGGAAAATTTGAGTCAACTACACTGCTTAACTGAGGAGCAAGTGAAAATGTATTAGGGGAATATTGTAAAAAATTTAAAATAAAATAAAAA:1 - chr3L 14813250 5' + TART-C 11096 1 32.88 ACTAAATGTTGCCTTACTAAGCAACATATTGCAAAATATTAAGTATACGCCTTGTCTAACACTTAACAATTTGTTATAGTATGCATTTGCAACATAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGAC:1 + chr3R 10136959 5' - I-element 5330 1 73.97 CATGGCGAAATTCAAGCGAACGAAACGAACCGAACCGGTCGATCCAGTAGCAAGAAATCGAATAGATGTTTCATTTTGTTGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCT:1 - chr3L 12269813 5' - F-element 4298 1 58.96 TTGCACCCGAGCTCCCATTTCCCTGGGTGCCTCCCATTCGAGCCATAGAAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGCGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACACGCAACTGTTTGTGACCCATG:1 - chr3L 18738179 5' - Bari1 43 1 62.59 ATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCT:1 - chr2R 5173222 5' - Stalker 350 4 57.53 CAACATAAAACAGACATTGAAACAGTTTTTCGAGCTCCTGCCCCCCCTTCTACACCACCCTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - 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chr3R 24079937 5' - accord 189 2 64.38 AATGATCTTACGAAGGGCAAAGCCAATTTTCTGCGTTCTACCAAACTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAG:1 + chr2R 3492822 5' + 1360 105 1 64.66 AGGATGATTTATTTAAAAGAGAAAACTTTATACAATTCAAAAAAATCATAATCATCACCTTTAAGATGGGTTTAAATAATAAACACTTTAAAACATTATTACGAATGAAACTACTTAAAGTTAAAAACATATAAACGAATAAAAG:1 - chr2L 9163029 5' - S2 106 1 91.72 AAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGACAATTGTGACTGTATCAAAGTATCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chr3R 19449952 5' + roo 62 2 63.70 TCTGAAATGCTTAATGCCATTTTAAGTGGGTCAATTGCGAAAATGAAGGTATTAAATGTAAATTTTGTTTAATTACTACATTTAACATTTAATACTCGTTGCACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTA:1 - chr3R 11092171 5' + Cr1a 4228 1 67.81 GAGGAAATATTTAATTTAATCAAGAGCATACACTGCCAGAAAACGGTAGGAAAGATGTATTTTGAAATATTAAATTGATGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATA:1 - chr3R 1193661 5' - Cr1a 4197 1 57.24 AACCAAATGTATACCCAAAAATGTTAAAAATAAGAAAATCAACACCAAGAAGGAAGGAAGAGCTGAGGGCACTCCCTTGCTACAACTAAATACAAAAAATTGAAGGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTTTACTAC:1 + chr2R 1845377 5' + Doc3-element 125 1 68.49 AGACTTTATCAGAATTTTGTGTAATAAATAGTTTCCTAGAAATATATATTGGTTGCCAAGGCCTAATGCACTGATACTAATTTGCCGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGC:1 + chr3R 5115260 5' + Ivk 37 1 60.27 ATTCGTTGCAGGGCCTGCACGTTAAATGCGAACGCTGTCAACCTGGCTAATTTGTTTCGTTTGAGCGGCGGAAATTCTTCGAACAAAAGTTTCCTTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCT:1 + chr2L 11638681 5' - invader2 4829 1 68.61 AGTGGCAACTCTTGACCTTAGGATATCTTTTAATGCCGGGGGTTACTAGATTTTCTAATAGCTCAAAGCAGGCTGCAAAAGAGCTGTGGTTTTCATTCCCCCTTCTTCTTTATAATTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCT:1 - chr3R 9175320 5' - Juan 4204 1 75.34 AGCAGTTTTAAATGTTTAATAATATTCATACTTTAGTCTATGCTCAGGGGAATTAGTTAAAATTATTAAGATTATATTATTAAGCTATTATTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2R 12239865 5' - roo 9047 1 64.34 TTATCTGGAAAATATTATCACATTGCAAAAACCTTGTTTATACCCTTGCATTTTCGTAAGTTATTTCTTTTATTTTGGTCCATGCCGTTGGCATTGTTTTAATGTAATTTTTTTTTT:1 - chr3L 8026685 5' + transib4 29 2 69.23 CTGAGTGCAACCAATGGCAAAAATGAATCCACCAGTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGT:1 + chr3R 30558233 5' - I-element 5273 1 74.66 CACATAGCACAAAAATACTAGAACACTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGGCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGC:1 + chrX 4540636 5' - 1360 3303 1 79.86 CCACATGCGATGGAGTCCAGTTCCAAGACGGGGAATCGACCTGGCCGAAACCGCAATGCACTTTGACTAGCCGGATTCACCATATTACCATCTGTAAAATCCAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3R 10461624 5' - roo 9039 1 63.01 CGAACTTAAATATTATGTATTGAAACTAATCGATTTAGGGGGGTCATGAGGGTGGAGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATCGACCACAGCTG:1 + chr3L 13368310 5' - jockey 4707 1 63.64 GTGTAAGTCCAAAAATGGCTAATTTGAAACTTTGATGTTAGTATCATTAGTATCTAGGATAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2R 5268959 5' + pogo 51 1 56.83 ATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGT:1 - chr3L 19335420 5' - invader4 290 2 60.95 GGTTGGGAAAAACTGCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAACGGAATAGTATTCTGCGTGTCG:1 + chr3R 11773934 5' - P-element 2809 1 17.65 GCAAAAATGTTCATTTGTTTGTTTAAAGCACCGACAACAACAATTGAAATTGAGTGGAAAAACAATTGCCGGAGACCAAAGACTTGAGCGTTAAGAGTGACAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTG:1 + chr2L 20324064 5' - Tirant 8494 2 76.06 CTCAAATTTAAATAAATACAAGCAAAGTGGAAAATAAAATGCGCACAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATA:1 - 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Transpac 5182 2 53.42 TGAATCCCATTTGATTTGGTAATAAAACTACATCGAATTTTGAAGGGCGTGAACGAATAGCATGTAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTC:1 + chr2R 21029349 5' + Transpac 54 2 57.53 GGCCACGTTTGAAACAACACGACGGAATCCAGGATGCCCCGGCTCCAGGACTCTTACTCTGATTCAGTTTCAGCATTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCGGACAAAGTGGATTA:1 - chr3R 5941523 5' + X-element 31 1 60.68 GAGACGAATGAAAAAACTGAATACAGTGTGACCGTTTCTACAACCCGATTAAACCCAGCACCTATTCGATACTACCTAGAACGATAACGATAAGTTGATTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGG:1 - chr3R 28600416 5' + R1A1-element 5317 1 67.12 ATCATAGAAGAGCAATATAGCGTTTTCCTCTGTGTGGCTGTTGATATAAGATGAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chr2R 6713949 5' + 297 61 2 64.83 ACAAGTACATAGCTCTCGAGTTATAGGTGGATCTATAATGTCTAAGGAAACGATTTAAGAAATGTAAAAATAAAGCGTGCGGCAGTATAATTTCCTTTTTTTTCAGAACTCAATGAAAATCTATTGTAGGCATCGGAAAATATTTA:1 + chr2R 7394076 5' - mariner2 842 1 66.44 AAGATCTGCATGGACCGCGCCATCAACACAGTGTTCAATCCGTGCTGTCACGTCATCGCCTGCGCCCAGTGCGCTGCACGGTGAGTTGTCTCTGCAGCCTTGTGCTCCCATTGTTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCC:1 - chr2R 22564552 5' - Cr1a 4437 1 78.47 AAACCATACCATAAAAAACTGGTAACCAACTTGAACACATTTTATGAATACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGAC:1 - chrX 21581432 5' + Tabor 6913 2 65.75 GTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr2R 9504222 5' - roo 332 2 71.92 GCTGCCATAAGACCCTCTAAGCTCAATTATTGCAGGATACAAAACAAGAGACAAAAGAGAAACAGCCGGAGAGACAAAGAGCCGTAGTAGTCTGGCCACTGTTGATGGCTATATTCAGAAGTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGG:1 + chr2R 22774680 5' - INE-1 214 1 79.17 CATACTCCAATTATAGAAGCAAAATGTTTATAGTACATAGCACACGCTTGCTTGAAATTCATGTAAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chrX 3578082 5' - hobo 2895 1 51.49 ATATTTTATTCCACTTGCGTTGATTTACTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 - chr3R 23539476 5' + hobo 62 1 72.88 TGTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 27188630 5' - roo 9010 2 58.90 CATTTCCCGCTGTTATACAACCATCAATCAGCAGGCTCGTAAAAGCTGACCATCATGTAATCCACCCAGTCTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGC:1 - chr2L 10727192 5' + Stalker 7015 6 50.77 TTGGCCTTCTTATTCTGTAGTGAGGCTTTTACTGTTGCAGCTTTTAAGAGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTGGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCAT:1 - chr2L 15322976 5' + diver 263 1 58.22 AAGTGTTGTTGTTAAAATTGTTACTATTATAACTGTTCCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTT:1 - chr2R 1323427 5' - diver2 21 2 64.95 TATTAATTCGCTGGAAGTCAAAACTCAGCGAAGAAAATATTAAATATATCTTTACCGTGTGTACCTTGGGTACATTTAAATGTATGCAAGATATCCAATTGAGATAGATGGCAATGCCAAAGTGTCAAGTAATAAAAAATAAAAA:1 + chrX 18977240 5' + Rt1b 5145 1 67.59 AACTTTGCAGTTGATTCGAAAAAATAGAAATTTTTTGACATCATTGCGCTATTGAATGAAATTGCTTTTATGTTGTAGGCTAAAAATTTTTCTCAGTGTCTGAGACGCAGGCCGGCGTCGGAGTTTTATTATGTTTTGCTATTTAT:1 + chr3L 6997113 5' - G4 3587 1 42.47 TCCTACCCACCGGTCACACATTATGGGCATGTGTGCGTGTGTGTGAGGGGAGTAGAATGCGGGGGGGTGGGTGGTTGGTCAGCGATGGGCAGTCTTTTTGTTTCGCACGAATCCTTTCGACAAAAAAAAAAATATATGAAAAAA:1 + chrX 19826503 5' - FB 174 3 70.14 AATGTTTCTTCATATTAATATCGAAAATTAAAAATGAGTATATGTATAAAATAAGAATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAA:1 + chr2R 978431 5' - copia 224 1 67.12 AGGCGGCCGAAAGCCGAAGTCACTGGCGTCACGAATTGGCATCGTCGTTTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chr2L 13717389 5' + P-element 60 1 41.48 CACATGTGCGTCTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGAG:1 - chrX 7228236 5' - Quasimodo 36 2 88.24 AAGTGTAAATTTCATGGCCTCAATCAATGATAAATCTCCACGCAACAATGCGTCTATATCGGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 12899750 5' - roo 356 2 56.20 TTTTCACCTGCTCTTAAAACGCTCTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 + chr3R 5264861 5' + P-element 97 1 19.18 CAGGCACGTCGTTCGGTGGTAGACTTCACTGTACCCTTCATGCAGATGGGCATAAGTATTCTCTCGTACAAGGAGCCTCCACCAAAGGCGGATATATGTAAGAGCGGCAGAGAGTAAAGATTACAGATAATAGGA:1 + chr2L 5562008 5' - Cr1a 4222 1 64.44 CAGAGCCATTGTAGGTGGGATAAAAACTTAATTTAAAATATATAAGTATTAACACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGATATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3L 21162026 5' - roo 9010 2 61.27 AGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATT:2 - chr2L 23295876 5' + micropia 5105 4 61.64 CAAAAAAGAGACGAAGCAAAGCCTTTCCCGAAGTTCAAAGAAAAAGAATTCCCTGAAAAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAAAATAAATAAATAACAAAAACGAAGATCTCGAACTGGTAATTGAAGACAGCGCAACTAATTC:1 - chrX 22404234 5' + G4 135 1 56.16 GAGACAAATAAATTTCGGGTGGTGCCACATGGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGAATTTGCCTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAA:1 + chr2L 7271814 5' - 297 342 2 56.85 GGAGGTTTTCCCGAGTATTTCGTTTTCCCCACGCTCCGTGAAAAGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTACGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3L 22884013 5' - roo 333 2 68.28 CAATCTCTCTTTTGGAAACGCATATTTTATTGTCAAAATCAATAGATGTCAGCGTTTAACAGCTGCCAGCGGCAAAATACAACCCCTGATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chrX 17027991 5' - roo 9041 1 68.49 ACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr2L 20324202 5' + Tirant 61 2 64.93 CAGCCGAAATGCGATAGCTTGGTCGACTTGGTGAGAAGATACCCTAATTTTTCTATATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2L 5447841 5' - roo 386 2 67.12 GACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACC:1 - chr3R 17210107 5' + HMS-Beagle2 62 2 60.96 ATTCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTCGGCGGTGTATGTCCGACGCTTCTCATTTGGAGTATCGCGCTGCGTCGCAAGGAATGCTGAGTCGGCTT:1 + chr4 311218 5' + gypsy 7137 2 54.72 AGCATACTTTTGGGCAAACCTATCAATAGTTTTCCAGCCCATGCGTTTTGCCATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCTTCACAA:1 - chrX 18353581 5' + jockey 70 1 62.22 ACTTAAAAAGTACTAACATTAATTAGTTAATTGACAAAGCTCTTGGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3R 24976332 5' + roo 8698 2 60.96 GGGTCTAGCTTTCGAATCAAATCGCAGAATCCCATATCTTCAACAATAGAAAAGGGTTGGACATCTAGCGCGATCATACGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTTAAGTTA:1 - chr2R 6492940 5' - copia 187 2 55.48 ATTATAGGGATAGTTAATTTTATATTATTAATGGAATATGCCCTATAAGGAAGAAATGTGGGAACATTTGAAGAAGAAGGTCACTAAAAATGGTTATTGTTTTGCATCTATCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACT:1 - chr3L 17463277 5' + Circe 111 1 61.64 GATGTAATTATTCGCACTGCAATTATACAAATCATGGCAATGTTGGTTCGCCGCGGCGGCTCCTGCTTTATGTTTTGCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr2L 20986629 5' - roo 9029 1 56.16 CAGCTTCTTCGAGCCAGTCAGTTTTGTGCGCCCGAAGCGACGAGACATATTAAGAATCGGAAACGGAGATGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGTGAGGAGCG:1 + chr3R 22331978 5' - Doc 451 1 49.29 TATACTACTTTTGGGAAAGTATCAACAAGTTTACTCTGAAACGGACAAGGCTATATCGACTTTGCTGTTGATCAAGAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGGGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGG:1 + chr3R 6461715 5' + S-element 38 2 59.31 TACATGTCTTTTAATTTGTATTTTTTAGTTAAATATATTTTTTTTAAATTGAAAGTTGCAGAGGAATTTCTTGTACGAATTATATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chrX 22676312 5' + 297 34 2 59.31 ATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2R 9504207 5' - roo 356 2 59.12 CTCTTTAAAATGTAGCTCTTGTTGCCGTTTTAATTGTGAAACTTTTGTCATGCAACTTGCATATCTGCACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCAC:1 + chr3R 25442788 5' - R1A1-element 5282 1 53.42 TTTGGGTAGCCACCGGGACTTGGGATGTAATTTGGAGGAATCAAGTGTGTGCAATGGACAACTACGGCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGTGCCCCG:1 - chrX 5399120 5' + opus 7053 4 53.42 ACCGCGGTTTTATGTTCTTTGATCGAAAAGAAAATAATCTCATCTGCATGTGGAACAAATAAACGATGAATGGATATGAACAATAAGAAGAATTAATACCACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chrX 19959940 5' + roo 8684 2 72.60 TATTTAACTAAAGCATTTACGATTTTTTAATTATGGTCCTCTATTTTTATACCCGTTACTATTAGAGTAAAAGGGTATGCTACAGGCAGAATGAATCGTTTCCGACCATATAAAGTGTATATATTCTTGATCAGGATCTATAGCCG:1 + chrX 22484661 5' + INE-1 88 1 52.74 TCAGAGATTTTAGTAAGTTATTCCCTTTTTTGTTCGCTCCGGTTGCTCTTACTTTTGAATTGCTTGCCGACCAATTTTTGCGCACACCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chr3R 32068323 5' + P-element 21 1 69.40 ATTAATTAAATATGCATATTTATTCCACACATATATAGGCTAAATCATTTACATGTATCAGAACATTCAGTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2R 8687799 5' + roo 51 2 56.16 ATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chr3R 6412074 5' + Tirant 8136 2 61.60 ATATTCGTTCTTTTTTACTCTGAAAGACCACGATGATGATGATGATGATGGGCGCAATGATGATCATCATCGGTTCGACGATGCGTTAGAGTGAGACAAATGCTTGTCCTGTGGTGAGTTCGGACCAGCATGTATCAAGCGAGATA:1 + chr3L 3867410 5' + invader6 4721 2 52.74 GTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTGGTCGGCTTCATCCAGAT:1 - chr2L 15322916 5' + diver 323 1 73.97 TTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGC:1 + chr2L 22719573 5' + 1360 42 1 56.45 GAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chrX 16217535 5' - P-element 2832 1 47.95 CTACTACTTGAGTAGAAGACTCTATGCTGACAGTTTGTAAGCCATTAAAATGCTCTGCTTGTATTAGATTTCCTTCTAATTGTATTCTTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr3L 1981650 5' - opus 7471 2 54.11 CATTCAAAACAAGATTTATGACAGGCGTGCGCTTGCTGGAAGATGGGAAGATGGCAAATGGGTGGTGGTCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAGTACCTCCTAAA:1 + chr2R 20447785 5' + hopper 30 1 58.40 CATGCTAAGTGTTAAACCGGCCAGTTCTGTACATTTTCTGCTGCCTGTTAATGTTGATGTAATTTACTCCTACATATGTTTGTCCCTGCCAACCCCAAATATATATAGCGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCATCCACTTCCATTA:1 - chrX 16479914 5' + 297 6600 2 71.23 CAATTAAGCCATCTACCACACATTTATTAAATCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chr2R 11595852 5' + P-element 64 1 30.89 AGTACTCAAATAATAATATACAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAG:1 + chr3L 18789028 5' + 1360 88 1 82.07 AATATCTTATAATTTATATGGCCAATTACTAAAATCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:2 - chrX 11267775 5' - roo 323 2 83.56 GGTGGCTGGTCATAGCTCGAAGAAGGATGTTGGGGTGGTGCGTAACTATTAGTTGGAGGATGCTGGGGAGGAGGCTTCACATTAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCA:1 + chr3L 4202274 5' + blood 7122 2 54.79 CGACACCTTGCTGATAAGCTGAGAACGCAATTATTAGATGACATGCGACTTGTGTGGTGCACTGTAAAAATTTGTATACATTTTATTATGGTCTTATAAACGGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGT:1 + chr2L 20330458 5' + Tirant 8336 2 74.66 ACACCTTTTCACGATTATTCAACCAATACAGGTATACCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTTGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:1 + chr2R 9390935 5' - mdg1 7375 2 76.03 AAATTAAATGGGGGAAAAACAAAGCAAGCGCCCAAAATGAGCACATAATATATGTCGACATGTGCGCAAACAGTCGAGATGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAT:1 + chr2R 10390602 5' - jockey 4556 1 68.81 AACGAAGTCCATGAATCGTTTGTCGGGTTTGTGGAAATAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGCGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTCT:1 - chr3R 3320516 5' + 1360 80 1 71.03 ATAATTAATGCCATTAAGTTATGCGAGCGCGACTTCGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGT:1 + chr2L 11443489 5' - G-element 4145 1 74.29 CGGTATGCGCGATTTCATCGGTGCACCGGCACAAAAATTTTACGTTTCAGCACATATGTATGCACATTTTTCAATTGATATTACAAAAAAAAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chrX 3660842 5' + 297 23 2 60.27 CCATTGATGATCACAAACCAAATATTATTTTATATACAAACGTGCTCGGAACAACAAGCTTAAAATATATTCTACACGGTCAAAACTTGCTATCCAAATGTCACTTGAGAAATAAAATGAGAAATTAATCAAAAGTGTGGGCGTGA:1 - chr3L 11893447 5' - INE-1 252 1 58.90 CGGGAAATTGTAAAGAAAATCGAAAAACGGAAAAGTTTTGGCCATTGACAAACGCATTAAGAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTA:1 + chrX 18737214 5' - 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invader3 5378 2 81.51 ATATATAACTTAAATATTATTTGCAAGAAATATATTCAATTAAAATCTGCTCCTTTATATTAAAAATATAGTTAAATTAACACCGTTCACTAAAGTCTAACCATCTAATTAACAGCATTATTAATTTGTTTCTTTTTTTTTAAATA:1 - chr2L 3508433 5' - TART-B 10632 1 67.12 ATTTGGTAGTTTAATTTTTATTAGTCCAAACAAATATCGGATTATATTTTTGTTTCAAGTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:2 + chr3R 4661926 5' - roo 9011 2 60.96 ATTTGCATCGTCACTTTTGGCCAGTCATAAAGTTCCCACGACTCACGGTGAGCCTGACCTACGTTGTAATGCTTCAATTAGCCAACATCTGCTGCCGTGGCCGAGAAAATTGAGTTCTCAATATTAATAT:1 - chr2L 4282232 5' - Stalker4 6898 2 79.23 GATATCGAATGCAATATCTCAAAGGTATTGTTATCGTTTGAGTTATTTAAAAGATTGAAAACATCATGAAAAACAATTAGGGAAAAGCGTGCTTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chr3L 20083915 5' + opus 7026 2 69.86 GGAATCAAGTGTGTGCAATGGACAACTACGGCATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGGCAGCAGGCGACTCGGG:1 - chrX 5399084 5' + opus 67 4 74.80 TAAGTTGACATCCATGAGGTCCAGCTCGGGCGGGATTAATTTAGATTGTGGTCAAGTGAATGATGTGGTAGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - 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chr2L 20028750 5' + 297 51 2 53.62 GAGAGAGGCGAATGCGATGCTAATATACGGAAATACCGATGTTTCGCCTTGAATCTTCGTCACTCTTAATCGCTGTCCGCTTATGTATTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTG:1 - chr2R 7777442 5' + R1A1-element 5254 1 62.22 AAATGAAAATATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGAGCTTGGCAGTTTCGTGGGCGTGGCCACATTTGGATACAAACTTGCGCTGCGTCTATGCGGAAGCTGCATACTTAATCTCAACCTTCTATCTTTTATAGTTCCT:1 - chr3L 24163240 5' - INE-1 156 1 51.45 AATTATAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chr3R 6412035 5' + Tirant 8175 2 74.40 AGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATA:1 - chr3L 10563967 5' + hopper 87 1 75.34 AGTGAAAAAATGGTAGCCATTTTTATTGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2R 22012257 5' - opus 459 2 56.64 GCACAAACATTCTGCCATTTATATACGCCAGCCAAAGGAGAGGGAAGCGAGGAAGTAGCCAGCCCAAGGGGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGATGATATGATGTGGAAATGTATGAAGGTT:1 + chr2L 18178255 5' - Tirant 8463 2 53.96 CTTCGATGATGACCGCCAGTATGTAAATCACATTACTTTAGACTTTCCAGGTATTTGGATAATAAAGTGGTAGCCGGTAAGAACGCAAAATCAATTTCATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTG:1 - chr3L 22709466 5' - 412 470 2 68.49 GAATTAATGAACCTCTCGAGTGTGTTTTAAAACGCGCCAAGATAAATCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr3L 6675305 5' - 412 7511 2 53.70 ATGGTACAAATTGGTTTTTATTGAAAGTGATATTTACTTGTGCCTACTTTTCTTAAGGTACTTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 + chr3L 20083764 5' - opus 450 2 56.16 GAAAACTTAATGTGATACAATTTGAAGCGAGTAAACGGGAGCAAAACACGTTTAATTCCCGACTGGCGACGCCTGTCGTGCGGAAAGGTCCTAATGGGACGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3R 19639693 5' + 412 7074 2 70.83 CATGTAGGAAAATCCCTTCAAGAAGAATAGATCTCGTTTCAACTTTAGGCTAATGACTCTGAAGCCATCTCCGTCTCTTTCTATATACAGATATATATATATATGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTG:1 - chrX 12775123 5' - F-element 4463 1 71.23 ATAATACCAAATCATACTTAGAAGCGAGTAAGCAAAACTCGAAACTAATCGAGACACGTCTTAGATTTTAGTGTTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr3L 20744161 5' - 412 446 2 51.37 GGAACAGTAAACGGACTGCAAGCCCACTTCCTGCCGGCAACATGCCACATAATATAGTATGGTATGCTTGCAAATAAAATTGGTCACTTTTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATAC:1 - chr2R 20498830 5' + hobo 2665 1 66.42 ATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAG:1 + chr3L 18034570 5' + Transpac 4998 2 72.60 AAGTAATAAGAAAACTCTTTATATCCTTACCTGAAAGTAAAGAAAGGTAAAAAGAATAAGTTTATATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 - chrX 3767683 5' + I-element 56 1 56.16 GAAATGTGTCTTGTCTTGTTTTGATATTCAAAATTGTTTAAGTCATAAACAAATTACACCTACAATGTATATGTATATGCAATGATGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGA:1 + chr3L 18828078 5' + P-element 431 1 56.85 TGCTTTCCAACACCCTCATAACTGGTAATGCAATTTTCAAGGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAA:1 + chr2L 12832864 5' + I-element 81 1 70.55 GACAGAGACACGTTTTCACGTGCATCGTTGAAAGTTCCCCCTTAACTGCATTTTATGCACTTTTCTTCTCATCGGGTGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAG:1 - chr3L 18767868 5' + roo 8621 1 52.74 ATAGATATATTTTGAATATTAGCAAAATCATAAGGCAAACTAACAAGAAATTCTTATACATGATAAGTAGTATTATTATTATAATTAATCTTATATCGCATAAGTACAAAGCAACATGACTACCATCATATATTTTATAAAAAAAA:1 - chr3L 19668412 5' + TART-B 10569 2 78.08 CCGCTACCCCACCCACCATTCAATCCCCCCCCCTCCCCCCCCCCC:1 - chr3L 1365982 5' + accord2 224 1 66.67 ATTTTTGTTTGAGATTGATGATGGACGGTGGTGGTGGTGCTAGTACTGGTAATTCTTCTCGTGGTGGGGGAGTTTTTTAAATTTTTCTGTCAGGCGTAACCATTATATAATTAGATGATAAAAACCTATGTAAGAATGAATAAAAG:1 + chr3L 18315041 5' + rooA 279 2 69.18 AAATGACTATTTGGGGGAGCTGTACGACGTGGACAACAGTGGCTACAATTGGGGTGAGTAGGTTTCGTTGTCCCTGGGCTGATTCAGTTCCACCCCATTACTCATACGCCGCGTTGACTCCAAATAAAAATAATACGACTTCGAC:1 - chr3R 31195089 5' + I-element 4932 1 80.69 GCCAAACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:2 - chr3L 13827463 5' - roo 8993 2 72.60 CAGTTGGAAGACAATATGTGCGAGAGCGAGAGGACGCGAGGATTAGAAGGGCAGCTGGAAAGCTTTAAAAAAAAATGCGATGCAGGATTACAGCTGTTCGGGCTTGTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGCCGGCAAG:1 - chrX 7967340 5' - P-element 2872 1 74.66 CAAAAGTTTTTCGGCGCAGCGACAGGCAGATCGGGCTACTATATACATATATATATGTCTACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCGTCAGGGTTCTC:1 - chrX 12214581 5' - opus 7488 2 67.62 GTATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr3R 4532981 5' + 1360 51 1 54.11 GGTCAGATACATCTGAGGTTAAAGGTAAACCCGACGGCTACTGACTCATTAACTGGATTAGGGAGTGGTTGATGTACCATCAAGCAAATTAAGTTTATATCTTGACATTAAAAGGGAAACCTTAAAGATCAAGTTTTCTTATTAGA:1 - chr3R 18631127 5' - Q-element 354 2 73.29 GTATATGATATTGCCTAGGAATATTGCAATGTGCGCGAGCAAGCAAACAGTTTTTGTTGCATACTTACAGCCTGCGAATGGTATCTTTATAGTGCTGTGTGGTCTGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3R 23539362 5' - hobo 2925 1 69.44 ATCAGAATTTTGTGTAATAAATAGTTTCCTAGAAATATATATTGGTTGCCAAGGCCTAATGCACTGATACTAATTTGCCGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTT:1 + chr3R 5115267 5' + Ivk 44 1 55.48 AATGGCCGACAAGTAACAAAGGAAAAAACAATAACAAAATGACTAAAACTAAACTAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGC:1 + chr2L 11979656 5' + I-element 364 1 62.33 GGGAAATGTCGCTTGTGACGAATTTCTATTTGATTTATGCACTCCCTTTGCAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTCCGTTGTCGTCT:1 - 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invader1 392 2 47.59 ATGCTGCACTCAATGCGCTGCTCCGTCGCCAGCCCCTCGTCACCGCAATTTAGTGACGTCAATGGCTAAATGACTGAGTGGCCAAATAGCAATGGCAGAGTGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr2R 7889325 5' + jockey 20 1 75.71 GTTGATGGAAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGAATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chrX 2518024 5' - P-element 2837 1 44.70 AAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chr3L 13472424 5' + jockey 88 1 73.61 ATTAGCTTAATTAATGTCGCTGTTGTTCCCAAGTTTTATGACAGAGTAAAGTTGCCAGAAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATATTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 2278258 5' + roo 60 2 60.00 CAAAACAATAAAACTTCTCCCTTGCCACCGACAAGCGAAGCAAAAAAGATTACCAATTTGTATATGATAAGTGCTGAAATTCATTTGCTTATCTCGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2L 10045327 5' + jockey 30 1 67.36 CTGTGGGAAGTGCAAGAAGTTTCCTCCGCGGAGCAATGGGTATTATTAAAATTATTCTTTCCATATCAATATATCTTATCATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - 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opus 7484 2 71.23 GAAAGGAATTACCCTAAATTCAATAACAACATGCATTTGAGCAGTTATGCAAATAAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAACAG:1 - chrX 17737275 5' + jockey 4725 1 55.73 ACTTCACCAGGCCACTAATAATCGTTCTGGGTTGCGCCTCAGCCAAGTCTATCTTCAGCACATATAGAGTATTATCTATGTGCTTAGTGCGTTTATGGTGTACTGGATTCTTCGCAATATGATGAGAACT:1 + chr3L 16417898 5' - Copia1_DM 4082 1 55.38 CTGGCAACACAAAAATAAAACCAATAAAGAAATTTTGAAAATCTGCATGCATGGTTTCAATTTTCTAGCAGTTACTAGTTACTAGTTACTGCGACCTTGACGTTCATACGGACGGACAGGGCCAGATCAACTCGTCTATTGATCCT:1 - chr2R 5939466 5' - INE-1 96 1 73.97 TGATACATAATTGATATGCACATTTGTGTATGTATGTGTTTATTAGTCTCCTGTGTAGTCGCCAAATAAAAAATGCCGACAAAATCATACCCAGTGCTTTTCATACAACACCAACAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCTCCGACTAT:1 + chr2L 21371417 5' - INE-1 565 1 70.55 AGGGCGTAGGTCTGTCCAATGTCTCCGTAGTAGGTGCGATTGCAGCCTGCAAGTATATACATGTATATATATATATATATTAAATGCAATTAGTACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCA:1 + chr3L 20856517 5' + R1A1-element 349 1 72.09 ATGCTCAGATCCATGGGTCCTTCTTGAGCGGAAACGGTGGGAGGATGCACTGGCACAACGCTGGTGGTTTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 20693119 5' - gypsy11 3933 3 79.07 GCAAAGTGTTAATAAAATGTAATCTCTTATCGCGTAACTTCCCAAAGCAAAGAGTAAGGGAGAGAAAACGTGTGAGAAGAGAGGCAACTTGGAGGCGATTTGGCCACGAATTCTGACATACATTCGGCTCACGTTACTGCGAACAA:1 - chr3L 16572492 5' + G-element 213 1 70.55 TTGATAGCCAATTTGGTGTTATACCTAATGATTTTCTGTCTTTGTATATGGCACTTTCTACTATGATTATTCTGCACATAATTGTAAAGCTAAATATCTTTGTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTAC:1 - chr2L 261099 5' - Juan 4189 1 69.18 ATAATGGTAAAAGTGTTTCTGAAGCCAGATATGTTTTCTTGTGGCGCCATCTACATAACAGATTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGATCCCCGCCTC:1 + chr3L 3288544 5' + roo 8836 2 51.52 GTCCTCCGGCTGCATCGATGGACAGCGCCAATTGTAGAGGTAGTACTGCAGGTTTCCATCCCCGGCGCCGAATTTTAGCGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTT:1 + chr3L 8176447 5' - P-element 2653 1 54.11 ACCAGCCAGCATATGTGAAAGGCTAAAGGCCAACACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 - chr2L 18178368 5' + Tirant 14 2 65.98 GAAAAGGGAAAACTCACTCTTACACATATATACATATGTATAAAATATTTAGTTACTAAACGAGGAAGCTTAAGATTAAATAAAGCATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 12609967 5' - roo 9036 1 60.27 GCTGATCAGGTTAAAATTAATTGCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGTGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 - chr2R 9339775 5' - Transpac 5196 2 63.01 CTTTTGTATTTATTTATTCGTAAACTATTTTATTCCTTTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACA:1 + chrX 18190367 5' + hobo 80 1 70.63 CATTGAACTTGTACAATCCTAAATAAGAAACGGAAATCCATACAGACGCTTCAAAATATGGTTTCTGTGGCGTATTTTTACAAAAAGACCCAGAAGATTGTTTGTTTCACCCGGTCAATAACCTATCCCCTGCAGAATGCAAACGA:1 + chr3L 25475623 5' + Doc3-element 358 1 80.14 TAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGT:1 - chr3R 19721160 5' - opus 7439 2 65.75 GGTTAAAATTAATTGCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 - chr2R 9339767 5' - Transpac 269 2 57.53 CTCTTGGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3R 24976293 5' + roo 8737 2 68.49 GAAGATTCCGAAGAGGATAAGAAGCAGCAGAAAATGTATTAATTAAAATAGAACCATACAGTTAGGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 - chrX 19597114 5' - 1360 3331 1 59.59 TACGGTATTTTGGTAGTTGATGAAATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGTATTGAAGTGGTATTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTA:1 + chr3L 24104317 5' - Stalker 85 4 69.86 CACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTTCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr2L 22719614 5' + 1360 56 1 84.54 CAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr2L 20324201 5' + Tirant 8 2 66.25 TTATTCTTGCTTTATTTTCCACATCGTAATCAGATTAAAAATATTAATGCGATTCTAGGAATAAGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 - chr3R 30782617 5' + pogo 54 1 57.53 GAGGGGGGAGTAGTTAACTAAGTTAACCATTTAAGCATTTGGCAAAGCTCTGCACTTTGGCAGAGGCCGCTATGAAGCTCTTTCTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGAATTTGCATTTATCAGAATAAAGAGCGGCAGCTCGT:1 - chr3L 25810378 5' + Gypsy6A_LTR 186 1 71.53 TTTGTCGAGCACTTGTCGCTGATTTTTTCACTCCTCTGGCCGACAATATGTTGCACTTGAGCTGCCACAGCCGTTTAATACCCTGCTATGAATTCCATTTAATTAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTA:1 - chrX 20607136 5' - I-element 5341 1 74.66 CACTCTCTTCGCCCTTTTGAGTTTGTTTTTAGGTCATCAACAAAATGATGAAATAAAACATAAGGTGAACACGAAAACAAGGGCAAACAAGGATATAGTCGATTACCTCGTCTATCAGATACCTATTACTCAGC:1 + chr2L 21820455 5' - INE-1 546 1 52.99 CCTATAAAATTTCAATCAAGTCTGCGGTATTAATCTTCATCTATAAAAACTTTAGCAATCACTACTAAACCATCTGGCTATAAACCTCCTGGACAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCCCC:1 + chr2L 11442892 5' + G-element 4177 1 54.11 GCATCAGCCTGACCTACAATGACCATCGATCGGTGGGTATTACTGCAAACTTAATAAGTTAAGTTGAATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 - chr2L 13690094 5' + Doc 61 1 56.85 AGCATGTTGCAACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTCATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3L 16463508 5' + roo 76 2 70.14 AAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chr3R 6412066 5' + Tirant 8136 2 58.97 GGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAA:1 - chr3L 19335424 5' - invader4 3038 2 62.50 ACGAACGGGGGCAAGAAGTCCCAGCAGGGGAGTGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCAC:1 - chr3R 17210161 5' + HMS-Beagle2 6891 2 80.14 ACATTGCTGCGGCCTTAAATGTTGATGGAAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGAATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGCATGCTTGCAATA:1 + chrX 2518004 5' - P-element 2843 1 54.11 GTGCCAACAGTAAAAGAGCCTGCTAAACTTCCAGAACCTTTGATTAAGACAAAGGCTAAGAAAGAAAAACCGTTAAAGAAGAAAGATAAAAAAAGATTTTAAGTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 + chr2L 5172621 5' - hopper 152 7 65.32 TTGTATAAATATGATTGATTTATGTGACAATTTTCGACAGCATAATGCGAACGTGTCACGCATATAGCTGGGATCAAGTTTTGATTTTGGGGTAAGAAAAAAGAAAAAAACTTAATTTAGTCAGCTGACGTGAATGGTTATTAATA:1 - chr3R 16869977 5' + Doc2-element 67 1 79.45 CATTGTGATGCGCTCTTAAATAAGCTGGAATTGCAAAGGGCTGAAGGATTATGAAAAGCCGCTGAGTGTATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 - chr3L 18970641 5' - mdg1 7408 2 53.42 AGACCTCAGACTGATGAAGACAATAACAGTTTTATGTGCGGCTCGTCTCTCGGCCAAAGTCGTTGCCGTACCTACGTACCTATATACCTATACCCAACCCATAACCATACACACACACACACACACACACATCAACACACACACAC:1 - chr2R 8655618 5' + gypsy3 416 1 54.11 ATTCATTATCAATAAATATCCTTTACTTCAGTTTTTTAAGAACTGAAATCATGCAGTGAATATATATATATGTCGGAGCGCGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATTAAATTGTAATATTTCTGCGGCAGAGGCACGAACA:1 - chr2R 10305428 5' + invader4 2850 2 41.78 CATATACATTGCATGAATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chrY 2720346 5' + 297 6623 2 68.49 ACGAATTAAATTTAAAGGAAAGTGAAAGCTTGGTTGAGCTGGGAAAACATTTAATATTATCTTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTA:1 - chr3L 13156837 5' + transib2 27 1 67.12 GTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCG:1 - chr3L 3565400 5' + gypsy 45 2 60.83 ATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTACGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCTTTAA:1 + chr3L 24757198 5' - Cr1a 4256 1 53.42 ACTCATTTCGATTGTTTACTCAATAGTCCGAATCTTCATCTTTTTTCCATAATACGGAAAGTTTGCTTTACGGAGTTTGCAATCTTCAAAGTGTCAAGCCCACATTTTTGAAAAATTGTTGGATATTTTTTTCGTAATTTTATTAG:1 - chr3L 23635759 5' + INE-1 400 1 51.37 GCGCGAGTGTGAGCGCCGATTTGTCAACGCCTAAAAGGACAACATATTTCTTGTCCACAGCGTGCTGTACGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chr3L 13544967 5' - hobo 2908 1 58.73 AATCGCAAGATTACGACAACGACCTCTACCACAGAGGCGTCGCCTGCAGAGATATCCAAACAGAAGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCAACGACAATCCCA:1 - chr2R 17607690 5' + F-element 278 1 55.65 ATCATACTTAGAAGCGAGTAAGCAAAACTCGAAACTAATCGAGACACGTCTTAGATTTTAGTGTTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr3L 20744171 5' - 412 455 2 51.18 AATAAGTGGGTGCAAGCTCAAATAGTTCTTGCCGGAACAAGATGGAGAGATATAGTAGCTATTTGGAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAACAAGAAGACTT:1 + chr2L 9803917 5' - roo 405 1 51.88 AGTTGTCAATTTGCTCGTCTGGCTCCAGGAACACTTCCACCGAACTAGTCCGATTGGTGAAGAACACATGAATGACACGCTTGCGGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTT:1 - chr2L 20677364 5' - P-element 2662 1 58.22 AAAAAATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 - chr3R 10636200 5' + blood 7066 2 55.63 ACCCCCTTTTGGTTCGTTGGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGG:1 + chr3R 6411963 5' - Tirant 400 1 75.00 CCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCCTGATAT:1 - chr3L 14084963 5' - opus 453 2 57.03 GAAATGTAATTTGCATTTCATAAGCCTCCCGGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr3L 18199925 5' + Doc 42 1 55.56 AGAAGAAGAAGAAAAAGAGCCAGACGAAATTTCACACATTTGTTTATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTA:1 + chr3L 3756160 5' + BS 5073 1 71.23 CATTACAAGAGCATAAAGAAATCGAACGCCAAAGGCTAGCTAAATGAATAAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr3L 20388266 5' + 1360 16 1 74.48 GTTAGGTAGCGTAAGTTTGCTTCCATGGCTTGATTTGGTTTATATTGCATTTTTCCGTTATTTTAGGCTTTGCATTGCTTTTTACAATGCTTCTATTGAAATTTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAA:1 - chr3R 1136935 5' + S-element 359 1 67.12 ATTTGGATCGGTTCTGTCTAGTTTTTTTACTCAACTCTTTTTTACTTCTTATTTAAATATTTTAAGGTGTAGAATATGTTTCGCAGTTGTGTCTCATACACAGGTCATACAAAGGTATTTTCCCTTTTTGGAATCGACTTTTTATT:1 + chr2L 21795703 5' + HB 73 1 66.44 TTATTAATTCCGAGCACAACTGATCATTTTGTGTCGCCGCGGCTTCTCTGTCCATCGCAAACATGCGAAATATTTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAA:1 - chr3L 381825 5' - S-element 1672 1 55.17 AAGTATTATCATTATAGATGCAAATCAAAGGGTAGTAAGTGAGAAAACGTACCTTAATTTATTGAAATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chrX 4214397 5' + jockey 9 1 78.77 GTATTCAATTGTTGGGACCAAGGAACGAAGTTGGAAACCCAGCTTGCTCGACTGCGCTTTCGGAATTTTCCTAGCTTGTTAGATATAATAGCATGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATA:1 + chr2R 5467190 5' + jockey 4822 1 64.38 AAGTGTGCATAGTCTGCACTGCGAGAAAATCATTGTTTTGACCTTAGCACAACGCACGTATTTCGCTGACTTAGAGCTCTTTCAATCAACTAGTCCCAATGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 24976167 5' - roo 386 2 67.81 GCGGCTTATCGAAACCATAAAAATTTTCTAATCCACTTTGCGTAAATAATCATGAGCGTCAATTCAATTCCGGCAGCCATCACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGCTTTTCACAAGTAAGCAAATTTG:1 + chrX 19982329 5' - hopper 1373 2 56.55 TGTTTTTCCTATGCATGGATGTGGTTGGGTGTTCCATACGATTGTCATAACGTTTTGGTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3L 9519548 5' + roo 8721 2 62.14 AATTGAAATACGCTGCTCAAAAGGTTAAACTTAAATGGCATTTGGATAATGCGATGACGCCAGAAAAAATTCAAGTCAAACAATTGAAATCATTCAGAAACAGATACAAGAATACTGTTAAGTTTTCTGTGTGTGGAATAATAAAG:1 - chr2L 7599870 5' + Doc3-element 153 1 76.71 GAGTATCATTAAGTTAAGTCTTAGTGTGTCTTAGCCAAGCAAATCAACCTATTCCTCCCAAAACGAAATCAAAAAGATCTCAAATGGCTCAATGCAAATACACCTTTTGCCGGTTTCGACCTCCCAAATACGTCACTCCTCTTTC:1 + chr3R 23228626 5' - 297 6574 1 73.79 AAGGACAACATATTTCTTGTCCACAGCGTGCTGTACGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGACAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr3L 13545001 5' - hobo 2895 1 63.81 ATTATGAAATGATCATATATTGATCATCTTAACTTTCTTAATTCCGAAAAAATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 - chr3R 10636246 5' + blood 7024 2 76.03 AATTTCCGTTTTAGCGTATCTCGTCCCGGTCAACACTAGTTTGCATCGTACCTTACGTCTTCATCATTGTTTCGTCATTGTTCGGCATTAAATACCTAATGATATTATAAAAAAATTGCCCACTAAAACTGTAAATCATAGGATTT:1 + chr3R 7640101 5' + HB 1574 1 45.89 TAAAAAGTGTCATAATCGGTCAGCATAATGAAAAGCAGGCCCAAGTATCCCCTTTCATATGGCACTCAAGTTGTTTCCATAAACCCGTCTTGACCAGTTGGCTTAACTTCTCGGTTACAAGTAGATTCACTTGAAACTATATAGC:1 - chr3L 7851560 5' + Cr1a 4119 1 57.24 AAAGACTGGTGTACATTAAGTAAAATACTATGGTTCAAAATATGGAAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCA:1 + chr3R 4532825 5' - 1360 3375 1 76.03 AGCTAGCCTTGAGTGGCAGCACAGCTTGCTGACTAAGCGTTCTGTCCGCACTTCATTTAAAGGCACCGAGCACCTCCTCCTCGCACTGCTCTTTGTTTCATCTCCATCTTGTGCTCTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTATTTTTTTT:1 + chr3R 28895107 5' - gypsy7 5008 2 76.71 ATTTACCATTACGCTTTCAATGGGCAACAATAATGGACAGTGTGCTGCCTCTAGTCTTCTTCTTCTCGCTCTTTGCGGCCATAATTTATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAG:1 + chr3R 16228793 5' + P-element 20 1 66.67 ATACAAGGGGGAAAAACCCTAAAAACCCGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGG:1 + chr3L 18767789 5' - roo 313 2 82.88 CAAAATAGGGTGAGTTTGAAAGAGGGCAGACATGGAAAATAACACAAAATGCGAATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAAC:1 + chr3R 29091288 5' - rover 284 2 60.96 AAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAAT:1 - chrX 10128270 5' - invader3 204 2 67.12 TCAACTATAGCGTTCTCTTTTCTCAAATATTTAAAAGTGACCAAATAGAATCTTGGGAAAAAACACATGATCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCA:1 - chr2R 15689433 5' + invader2 86 2 52.05 CCAATAAATTACACGAATCGCTTGTAAACAAATCGACAAAACATGTAATTTCACTTATCTTTTTCCTTGGCTTTTCTGTTCTCGCCTAATACAACAGACCCGCTAATGCTGATGACGTTGAACACGTGCAGCGACAACGCGAACAA:1 + chr3L 18265311 5' + Doc2-element 302 1 61.64 AGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATACGAAGTATTTTGCATTTTTCG:1 - chr3R 1844839 5' + Cr1a 181 1 66.44 TCTTAGCCATGTATGCCATTGTGAACTCGTTAGACTTGCATATATGTACATATATTATTTAAAAATTCCATTTTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - 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roo 9036 1 60.14 AACCGAATAGACATGTAACTGCTAGTTAAAATATGAATAATACTATGGATTTTAAGCGTGGTTCATGAGTTTTTCGAATTTGTATTCAAATTTTTGAATAAAGAAATCCGCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chrX 21187893 5' + hopper 8 2 73.97 TAAACAATGTTATTTCATTTACAGCTCTCTCGCGTTCTACTCTATGCAATGCATTACAGCCGACAGCTGCGGTGGCTTTTAAGTCTCACTCTTCTTTTCTTGATCGCTATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTG:1 - chr2R 5541155 5' - S-element 1706 1 76.03 AATAATGTGCAGCGCCCGCTGTCAGCTGGTGTGTTATTGCGATTATGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2L 20986521 5' + roo 8716 2 62.90 AGTTTATTTAAATAATTTCGAATGTGGTTAGGAAACTTACAAATCGACAACGAATAATTAACCAACATTTTTGCGCGATTAGAAAACTTATTGACGTCATTCATGTACATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAG:1 + chr2L 13509138 5' + F-element 4607 1 68.49 ATCAACTTTTTACAAAGACTATATTTTTAAATGGGAATAATTGCAATTTAAATGCAATAATTATGTTAATCATTTGCGTAACGTTTTATTAATTAGTTAGTTTCGCAGATTATAAACAGCTAGAAATTGTAACGAACATTTTATAT:1 + chr2L 11591695 5' + invader5 26 2 82.88 TTTAACATTTTTGAATGGTGATTCACAGCGAAAACCACTTTTGCTTGTAAGGAAAATATATATTCTGACCAACCTTAATTGGCTTTAATTGGCTTAATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAA:1 - chr3L 18365758 5' - Stalker4 214 4 60.27 CATATATAGGCTAAATCATTTACATGTATCAGAACATTCAGTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:2 + chr2R 8687828 5' + roo 80 2 76.03 AAGCCGGAGGTAATGAGTGCGCGAAAAGCAGCTGCAGGCGGCGAATCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATTGTTGTAGTGTGA:1 - chr2R 12069655 5' - Tirant 8433 2 66.44 CCCAAATACAATGACCCCTTTTCCACCTGTTATCTTCCACCTTGTGTTTGGTATACCCGTTATTCGTAGAGTAAGAGGGTAACCTAGATTCGTTGCATTTCCGATCATATAAAGCATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGA:1 + chrX 21191211 5' + INE-1 89 1 61.64 AGATTCGGTGAAAATTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGC:1 - chr4 1007997 5' - gtwin 435 2 52.42 CTTCACTTGGTTATGAAAATGACAAATGTGCCGCAGCTCCAACTGGAGCTGGTGCTGCTGGTGGAGCTGTTGCTACTGCTACTGCTCGGAAAGAATGCAGACCTTTGTGCAGCATTTTGGGGACTTGTGGTTA:1 - chr3R 27724355 5' - HMS-Beagle2 57 2 65.41 AAATAATTTCAAACTTCCAATGGAAATTAATGCATATATATTTGTTGTACTTTAATTAAGCAATGGCGCCTACAAATAATTAAAACTATAAATTTGATATATATTTTGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGAGTT:1 - chr3R 19721221 5' - opus 488 2 73.97 ATGAACGATTGCTTTGGCCCTAATTTTTAACCACAAAAGATAATAAACATAGATATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCT:1 + chr2L 3282572 5' + flea 4761 1 68.97 AATAATTTGTTAATGTTTTGGGAAAAACAATAAAATATACACAAAAAGACATTTAAACTTCTTATTCACTGGGACAGTTTACACATTATTAAGTTCATTTCTATGCAAAGAAATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACAT:2 - chr2R 13212359 5' - diver 214 1 71.92 GCAATTTTGCTTCAATAGTTTACCACGAATGTGTGAAAACCAATCTTGAAAATTCAATTACACAATTTAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 - chr3L 14040988 5' + 1360 43 1 52.59 CTCAATTAATTTGCGTCTGCTTAATTAATGAATCCTCAAAATAAAATTTAGCTATACTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chrX 19959801 5' - roo 344 2 65.07 AAGCTTGTATAATGTCAAGTGACATCAAACTAATTCATGAGGCTGATGTAATATTAGACGACATATGTAGCCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACACCTGGATGGCATAACTCCACGTTGGAGCAAG:1 - chr4 117218 5' - G5 4372 1 52.05 AGAAGATACCCTAATTTTTCTATATCTACGTAGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 5447874 5' - roo 352 2 60.27 CTCGACCGGAGAGCTTCGTTTTGGCGTCAATCTTCTCTCTCGTTCTTTCGTTCCTAACGCGAGTGCATAGCCAAACACTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCG:1 - chr3L 9357744 5' - 1360 120 1 78.18 AGAGTTCTATTGATGGGTTTTTGGTATTAATGGTTTTAATATTTTTTTCATTTTTGTTAAGCTGAACCCTTTGCTCAGAATTCTCAAAGAAAACTTTGGAAAACTACTTCAGGAAGAGCATTTTGGAGAAATAGGACGTTGCAGAC:1 - chr3L 24303769 5' + looper1 1536 1 54.79 CCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 - chr3L 14084963 5' - opus 7485 2 62.63 TTTAAACTCAGATACGTACAGAGGTATAAGGTAACATTTCATTCCTGGCAACTCAGAAGGAAAGTTACTTCTGTATACTCACCCGAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 - chr2R 5640828 5' + 1360 37 1 60.96 GTTGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAA:1 - chr2L 22684608 5' + transib3 63 1 51.37 AAATATTTTATCATCACTGGCTTTGGGCGTTTGATTCTCGACGCTTAGCGCTCGGAATTCAGTGCTCAGTTCAGTAGGTGACACCATTGCGCTTAGGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:2 - chr3R 18518072 5' - roo 9047 1 66.44 AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439059 5' - P-element 2495 1 60.27 CCTTTTCTACTATTAATCGTTATCAATATTACTTAAAATAGAGATTTCAATTAATTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGT:1 + chr2L 12488247 5' - copia 189 2 66.44 ATCCATCCACGTGACTGGTGACTAACAATAACGCATCCATCGACTGGTTTTACCTGCATGGACCTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTC:1 - chr2R 17522055 5' - I-element 189 1 53.28 CGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAGCGTGAACAAGTCGAGCGTAAGCTCTCTTCAATAAAAAAAAAACGCGGATTTCTCGTTCGTTT:1 + chr2R 5206898 5' + Doc4-element 67 1 62.33 AAACGAGTCTGAAACGAAATGGAATTAGGCAAATCTGCTTGTCGACTGAATGGGTATGGTTTTGGTTAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 - chr2L 1277913 5' - I-element 5315 1 53.33 GTGCCATCCTTTTTAAAGGAATATATAAGCCATTGTTTATATAAGATCTTTCATGACCCAAATCTACCAAATGTTTAATCAATAGCACACAATATAGGGATAGTCTTTAAGTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 - chr2L 6820987 5' - I-element 5333 1 52.74 ATTTCTCCTTCTCCTACTGCTGCCGTCTTCTTTTCGCGAACAACAACAAACCCGAACCCGAAGTTGGAGCTCGGCTACCGACTCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chrX 10806991 5' + P-element 10 2 74.17 GCGTGACACGACAATCGTGATAAACGAGATTAGTTATAGAGCAAACCAAGCAAACTGTCTCATAGTCATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 + chrX 19113463 5' - 412 7493 2 52.74 CACCTATATTTCAACCAGCCACTGATAATAACCTTAAATTCTTTAAACATGGCAGTTAATTAATATTAAATCACTCGATTCATTTGAATGTCTATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAA:1 - chrX 15081188 5' + P-element 2620 1 64.38 TAAGTTCGAAGAAATACAGTTGCTAGGATATTTAAGTACCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAA:1 - chr2L 6319816 5' - Tabor 404 2 71.92 TTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATAT:1 - chr2R 6271510 5' - blood 156 2 67.12 ACTTCCCCACTGCAAACTGTTGCTAAATATTTAAGCCCAGTGGGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAAC:1 + chr2R 9623350 5' + I-element 78 1 67.86 TTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCAGCGCAGTC:1 - chr2R 6271493 5' + blood 7228 2 73.94 CAATTACGGCGAACCGTTTTGCCAAAAAAGCGTGTTGCCTACTTTCCGGCGCCCGCGTGTTTGCCAACACAGCAGCACAATTAATTATGTACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chr2R 18983713 5' - hopper 1392 1 67.86 AGACGTCATATTAGCGAATCAACTGACAAAGCATATGAATATCAACAGCGTTTGAACAAGTGGATTAAAGAGCGATCTGAAAACGGATCAGTGGGTTTGTATGTATACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTTATGA:1 + chrX 445899 5' - baggins 5387 1 60.96 ATAGTGCAACGGTCCCAAAGGTCCTAGTGTGGTGTGCAATTTCCTCAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr2R 4802944 5' + roo 8737 2 72.60 CTCGTGTGCATGTGTGTGTTGGCCACTTGACATGCACGTCACAAATACACGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 - chr3R 15168965 5' + jockey 76 1 64.08 AGAGGGGAGGGGACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAAGGAGATGACGTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACGAATTTTATTTGGTAATATCTTCGGTTTAGATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 27188603 5' - roo 8999 2 65.38 CGCTATTGAAATGTAATTTGCATTTCATAAGCCTCCCGGGGGCAAGGATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTGTCTTTCAA:1 + chr3L 18199918 5' + Doc 26 1 64.44 TATTTATTTTTCTAAGCAAACATAATAAAACCCAGTAATTGCCTGCATCATAAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCT:1 + chr2R 11574960 5' - INE-1 149 1 73.29 TAGGCAGCGTTTAGTGGGACAGATGACTCCTTTTGATTGACAGTGTGTGTTTGTACGTTGGTGTTTCACACTGATATACTATACACAAATGCACATATATTTATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2R 9504355 5' + roo 8678 2 70.55 AATGAATAATGTGGGTCGGTGGTTCGGCGAAGGTCGGGGTGTACGTGTGGGTCCTTGACGTGCGTGGCAGTAAATTAATACCCATTGATGTCACAGATGTCACTCTGGAACCAATTAATATATATATATGTATGTATATATATACG:1 + chr2R 16246141 5' + 1731 4412 2 79.45 CAGCTAATAAATTCGCTTGAGTATGATGCCCCAAAAAGTATGCTACAAACTTTTCGAAATGCTTATGGATTTTATTAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chrX 9508080 5' + jockey 4709 1 55.22 AGCTTAATTGTAATACTTAATATTAAAATAATTTAACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2L 5447905 5' - roo 323 2 81.25 ACACGCACACGCACACACATGCATGCGCTTTACGGCCATAAATTACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAAC:1 - chr2R 8280559 5' + jockey 4841 1 72.60 TGGCCCAGTTGAGTTCCAATCGTCGGTCACTGCAGTAGCCATCTAGAAATCGTGCGGAACCAGTCAGTCTAGGAAGTTCAAACCGATCCTAATATCGGGGCGAAAAGTAATCTGTTAGTAGACGCAAAGGTTCTAACTTTTTAGGC:1 - chr2R 7987221 5' + Gypsy12A_LTR 483 1 62.33 CGATTGCCTCGTTTGCGAAAGATCTATCAGGTGAATGATATTGAGCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCATCTCTATTAAATAA:1 + chr2R 15823465 5' + invader6 53 2 54.11 AAATAAACGATGAATGGATATGAACAATAAGAAGAATTAATACCACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chrX 19959884 5' + roo 8740 2 75.34 TATGACAGGCGTGCGCTTGCTGGAAGATGGGAAGATGGCAAATGGGTGGTGGTCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGT:1 + chr2R 20447801 5' + hopper 67 1 60.96 GTAATAACATCAGTAACGCTGAATCTCAAATTTCTATCTTTCATAGTTCTTGTGATCAGGCGTTTATACGGACTGACGGTCATGCCAAATCCATAAAAAAAAAGACTTATAAAAATGAAAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTG:1 - chr2R 5733380 5' - INE-1 244 1 81.82 AATAAGAGCGAGCGGTAGATGGGATCTCTAAGATTGGACGTAGCCGAGCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:2 - chr3L 14085012 5' - opus 7487 2 76.03 GTGTATACTTTGTGTATTGTTTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACAC:1 - chr3R 29091427 5' + rover 22 2 71.23 GTCTACAAAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2R 16510240 5' + roo 8712 2 60.00 CTTGAAGATCTTGTCCTGATTGTTTTTACATGCCATACATACGAGTACATATGTATATGCACAGGGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATC:1 - chr2L 15906107 5' - Tabor 7276 2 52.55 GGGTAGGCAGTGAAAAAATGGTAGCCATTTTTATTGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:2 - chr2R 22012265 5' - opus 7467 2 60.96 AATATGTGTCAGGGAAAATATAGTGAAACATCTTTGGGGCACTACAAGTCGATTAGCATTTGCATAGTAAAAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chrX 18190453 5' - hobo 2892 1 52.82 TACCAAGAGAAGATTCAATAAAATTCACCACCCCATTTAAATAAAAAGAAAACTTGGTTTGATTTAGAACAGAAACGATGAAATTAATATAATGTAAAATAACTCTAATATATATTAGTGTTATGTACTAAAAAAGTTAAAATTGA:1 - chr2R 5284495 5' - Cr1a 4265 1 58.90 CGTAGTTCAAACTTTTGATTTTGAAATGGCCATTGTTACAGCCATTTCTGCGCTAAACCAACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTAT:1 + chrX 19601949 5' + Tirant 319 2 56.16 GATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 - 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gypsy 418 2 52.89 CATCCTATTTCGACGATCCAGACTTTGGTTTCCCCCGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGGTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGGCTTCGCCTGTAAGA:1 + chr3L 13481193 5' - jockey 4530 1 71.01 GCCCGTCGAGGTTGGTAGCATATAAATTATTTAAAGGTTGACCGCACCGTCTCGCGATA:1 - chr3R 2216668 5' - Gypsy6A_LTR 386 1 86.44 AAATCAAAGGGTAGTAAGTGAGAAAACGTACCTTAATTTATTGAAATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chrX 4214418 5' + jockey 14 1 73.85 AAAACAGACATTGAAACAGTTTTTCGAGCTCCTGCCCCCCCTTCTACACCACCCTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACGGCCAAAATTAC:1 - chr3L 18789103 5' - 1360 3324 1 63.01 CCGGCGATGCGCACTTTTACGTTTTTTGAACGGCAAACGATCGCAACGATCGCAGTTTTGTGACTGAAAGCGACCGATTTCTAGAGATGCGTTCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTGA:1 - chr2L 2999329 5' - P-element 2859 1 68.49 CGTATACCCTGGAACAAATATATTCAAAGGAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - 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chr3L 17162405 5' - Stalker2 361 2 52.11 GCAAGGAAAGCCATTCAAATTGTTTTACTTGCTTTACAGCTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAGTCCGGTCAGCCGTAAACTGCAACATA:1 - chr2L 6876671 5' + Rt1a 71 1 68.75 AATAGTTTTTGAAAGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGTGAAAGAGACCTACTAGGTTATCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGAGAATGCCATAGTCTAGTTCCCCGGCTATCAGATACTCGTTACTCAGCTAGT:1 + chr3R 18346596 5' - INE-1 542 1 46.58 TCTCTTTCCTAGCATTGTCCTAGTTTAAACAGCGCGCTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTG:1 + chr3L 13156732 5' - transib2 2733 1 80.14 CTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGATCTGTTCCTTAATTATAATGTGTACAAATGTACAGTGAAGAGATTATGTTATCTTACGTGTTCATGGTGGTAGTTCATGGGGATGTATTC:1 - chr3L 11816257 5' - G5A 2690 1 51.37 CATATTTAGTATGTTAAATGTGCTCAATCAAAATGGTAAAAAATAAAATGTCAAAATATCAAGAGTCTTTTACGTACGAGGTAATACTGTGATTGAATTACTTTGCGGCATTAGCGTTTAACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 - chr2L 17379078 5' + hobo 1 1 63.45 GAATCCGGGATGCAGGCAGAGGCTCCACATTGATGGCAGATACTCCCCCAGCTTACATATAAAAATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 + chrX 20124473 5' - opus 7463 2 55.22 TGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCT:1 - chr3L 24208191 5' + Quasimodo 78 2 76.03 AAGCCTCTCACACCCATCTATTTTCCCACCCCCACTCACTCTCTCACTCACTCTCTCTCTCAGCTTGGGGTCAAGTTTCGCCCAACTCCGTTAAGGGTTGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1 - chr3R 11774029 5' + P-element 22 1 69.86 AGGTCAAAAGATTATTAATGCTTAGGGACAAATATATATGTCGGCGAGACAGGAGTGTCATCCATTTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGGTCCGATCGCCG:1 + chr2R 10305346 5' - invader4 3025 2 67.23 AAAAATGTTTCGGAAACGGCTTTTGATTGTCTTTCACCGGATACAACCCATGCGTCCCTCTAAACCCCTCCAATCTCCCATCATTATTTTCTCAATCAGCATCGGCTTCTTTATTATTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 23204886 5' - Doc2-element 232 1 75.37 GGATGGATTCGGCTTGGGGCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAACGGTTGTGTGCG:1 - chrX 12003972 5' + P-element 83 1 12.50 ATGGTGAGTCTTGAAGTTTTAGACTGTTTTTCATTGTGATTTTAAAGTGGATTAGGATTGTTAATTCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGGTAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACA:1 - chr3L 21272229 5' + Bica 423 1 54.79 GCACTAGGAGCCAAAGGAGACTGCAAAGTGCCCAAAGACATTCGCTGCCTTCGCAGGTCGCAGGAAATGCCCGAATCGAGATGGTTCTTTTCGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 + chr3L 3757114 5' + copia 4899 2 61.87 CCACAGACACCCACACATATGCACACGCATACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGCACTT:1 - chr3L 9994784 5' + hobo 73 1 73.08 AAAGGATTGTTTTGAATTTCAAATCGTACCCATTAGGCTTAGAGAGCAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 19543418 5' - roo 335 2 67.12 ATTTCCTTATTTGTATTGATAATACCCAATGATGCAAACTGTCGGGTCTCACAGCCGCCACCAACGGCAGGAATGGCAGGACGCAACAAGTCCTCCTTAA:1 - chr2R 5265175 5' + Q-element 428 2 51.00 GCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chrX 14346481 5' - roo 331 2 76.92 TATTTTGTTAAAATAATTTTAATGAAATTTCAATGATAATATAATCTTGCGGCCTTCTGTTTTCGTCTGCCGGCACTGTAGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:2 - chr3R 9193279 5' - opus 465 2 63.01 CGCCGCCTTAAAAACTCCAATAAGAGCACGGCCACAGCAACAAGAACAACACCGCCCAGCTGCAGTGCAGACATCTAATTGGAAAAAACAACAACAAAGAGCAAAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 - chr3L 3339482 5' + Transpac 9 2 78.57 ATCGAATAAAAAATGTTCTTGAAAATGCTTCTCTCTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTT:1 - chr3L 19574133 5' - 297 6898 2 73.97 ATGTGAAGTCGCTTCTCGGCTGTACAAATATTTTTCCCGAGAATGGTGTTTATGACAATTGTTTCGCATAAGGCATTGTAACATGATTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTA:1 - chr2L 22570382 5' + P-element 2743 1 48.63 TAATCAGAGTCTTATGCATTTGCTGCCCCTGTTTTCTGGTTTCCTTTACTTTGGGGATATGCTTGAGGAGTTTGGGAAGAACTTACTAGACCTACGGTTAAGTTACCATTAGGATTAGTCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCT:1 - chrX 20465932 5' + jockey 4764 1 79.45 AAGAAAACTCTTTATATCCTTACCTGAAAGTAAAGAAAGGTAAAAAGAATAAGTTTATATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGC:1 - chrX 3767676 5' + I-element 63 1 60.96 CGGGCGAATTGCTAAATATTCCGAATAGGGCAGGGCATAATTAAGCTGGGCGAGTTTAATGTTGCCGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACA:1 + chr2L 20325119 5' + Tirant 110 2 54.81 AACAACGCCTACTTCTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAGTTTTTTGCCGTG:1 + chr2L 22719555 5' + 1360 46 1 53.42 AAACAAACATCTGTGGTTGATTCAACTTCTAATCTATTAAAGAGAACAACAGAAGATGTTAACTCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3R 19448674 5' - roo 338 2 56.16 AAGTACATGCTTTAAAAAACTGAAGCAGCTTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGGGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGGTTCAGCAGGTAGTTG:1 - chrX 5202615 5' - Tirant 334 2 76.03 AAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr3R 4532870 5' - 1360 3352 1 53.23 CCACATCGTAATCAGATTAAAAATATTAATGCGATTCTAGGAATAAGTTAATACAGTATAATTCGCTGAGCTGCATCTA:1 - chr3R 30782599 5' + pogo 5 1 64.56 ACCCTCTCAAAGCGACTCCATGGCGAGGCAACAAACGAACAAACAAACAAGCACGCAGCGCAGACAAACAGACTGACGTACGTGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACAC:1 - chr2L 18944930 5' + P-element 37 1 60.27 TCGGATTCTTAAATTCCTTCGAGGAGGAGGGACATCCGTTGGAGGTCTTACATTCGGGGCAATGGAGACCGATCGACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 8396955 5' + roo 39 2 57.14 TATACACAAAAAGACATTTAAACTTCTTATTCACTGGGACAGTTTACACATTATTAAGTTCATTTCTATGCAAAGAAATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATAT:1 - chr2R 13212322 5' - diver 179 2 50.00 ATGGCCACGAATAATGTTTAATAGTGTTGTCATGTCTTGGGGTTGTGGTTGTGCATACATTAGGCCGCCATTGCCCACCATCGGCAACCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCAC:1 + chr3L 15164308 5' - roo 255 2 60.00 AGCCAGCAACCCATGAGATTTATCGCGTTGCCAGTCACTCGACCTCCGATTTCGTTCCGTTTCAACTGAGTGTGAATTTCTCAGGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr2L 18944781 5' - P-element 2854 1 62.76 GATAAAAAAGCAAAAGTGTGTGTTGAACCACGTGGAGCAAAGTGACGACAATGGCTCGACAAATATTTTACCAAAGATTCCGTTTTGCTTTGTTCTCACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3R 19543533 5' + roo 9 2 71.67 CAGCCTGACCTACAATGACCATCGATCGGTGGGTATTACTGCAAACTTAATAAGTTAAGTTGAATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:2 - chr2L 13690090 5' + Doc 64 1 58.62 ACCCGCAACTGCGTTTCGCCTCTTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGCGTTTGTATGCTAGTGGGCGTATGTGCGCTTGGGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGAG:1 - chrX 8343089 5' - Quasimodo 36 2 84.85 GCCAGGGCACACAGACAGGCAATGGCACTCACACATGCGAACTTTCGCATCCATACGAACATGCCGCTGCTCGCCAATTTTGTTTTTTTTATTTTTCGCAAACAAGCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1 + chr3R 17059230 5' - hopper 1401 1 62.33 CACTTCCAGGGGGCAAGCTGAAGCCCATAAAGCTGGCTCCAGATGCGGCGGCTCCTCCATTCTCTTTGAAAGATTCTTTGTCATAATGGCTGCTATCATC:1 - chr3L 12851704 5' - 1731 4203 1 59.00 GTTAAGATCACTTTGAGGGAAGATTGATCTCAATCACTAAGTACCGATTTGGAAGAGGTCGTCATCTATTACGCGCTTTATATAATAATATAACCTATTAACCCATTATTATCATAGTGCTTTATTTTATTTATTATTTTAAATGT:1 - chr2L 9449639 5' - G2 3050 1 39.73 GGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAATCATATATATTATTGATCAGTATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCTATGTCCCTCTGTCTGTCTGTCCGTATGAACGTTGAGATCTGAGGAA:1 + chr2L 21902490 5' + INE-1 139 1 77.93 GTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chr2L 14480525 5' - Transpac 244 2 63.70 AAATACCATTATTAAAGATAAGTAAAATCAAGCTATCCAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 + chr2R 9091962 5' + 412 83 2 77.40 ATTCCAAATGCTTTCGGCCAACTTCTGGTATTAATTTAAACAAGGCAAAATGGTGTCCTGCATTTTTAGCAGTCGAAGAAGAAGATTGAGGAAAGTAACAGCAAGTGAACACAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTAC:1 - chr3R 23808544 5' + I-element 483 1 69.66 AATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCG:1 + chr3L 27356100 5' - Tc3 1661 1 75.49 AGCGCTTGGGTGAGAGGAGAATGTCTGGCATGGAGAGTGAGAGAGCGTAGCGTGGTTGGGAAAAACTGCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr3R 11773881 5' - P-element 2852 1 57.36 ATTATGGCCAATATTCAGTGTGGAAATGGGCTCGATGCTTCCTGAGAAAGGTCGACTAGAAAGCAGTAAGTAATTAAAAGCTTGGTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr2R 11562944 5' - pogo 2073 1 64.75 ATGATATATAGGCACACTTTATAGGGTGGAGTCCCACAAAACTGATTGAAACGGTGCGGGGGATCAAAGATACTAATGACCATCGGCTCGACACAAAGATGAGCATATGCATGATATGAGTTTATTTTGTTTTAT:1 - chr2L 2435569 5' + transib1 1895 1 40.74 CACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAATGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGAAATA:1 - chr2L 18689235 5' - Gypsy6A_LTR 240 1 70.63 GCTTGACACACGCAGCTGTTGCTCAAGTTTGTGGAAAGCGGTGGGAAAGTGGGAAAAGCAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chrX 19113572 5' + 412 54 2 55.40 TTCTGAGTCTGACTTAGACGACGCAGCATCTTCGTTTTCCACTACGTATTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr2R 3188676 5' + 1360 59 1 63.64 ATTTATAGTCCGCAAAAGTTGCAGTTGTATCTTAAGAAACCCTTATCTTATACGTGGCATGACTATCCCTCTTTATTTTACCAAGGCGTTTTCCTTTCTCATTCTCTTTCATACACCACCACACAGACACACTATGGTGAGTTTGA:1 - chr2L 10189507 5' - invader5 168 2 65.75 CCTTTCTTAGCCATGTATGCCATTGTGAACTCGTTAGACTTGCATATATGTACATATATTATTTAAAAATTCCATTTTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chrX 20632688 5' + pogo 41 1 55.48 TATTGCCATTTACCTTTTTCTCTTAGCTCGGTGTTGTGGCTTACTGCGATTGCCAGACGGTAATTTATAAATCAATTTCAGATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAG:1 + chr2R 13471310 5' + flea 4791 2 61.27 TGGGAGGCACTGGCATATATGCATGTACATAAATGCGTTCAAATACAGAAGATCAGAGTCAGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3L 20398979 5' + roo 8722 2 59.31 AAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCG:1 - chr3L 18738131 5' - Bari1 1619 1 78.08 CCAGATGATGTTGTCGGAATGATGACGATGATGCGAATGAGGAGGCGGCGGAGAGGGCAGTCGGGCGAATTGAATGATTCCAATTGACGCCTTAGATAACAAAAACTTAAATATA:1 + chr3R 22523134 5' - roo 88 2 75.65 AAATTTATTCATAATTCTCTAAGAGTGAATCAGCTTTAAGAACTGGACTACTCAAATACCGTGAGAAACTATCATTCACAGCTATAAATATAGAACATATTAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3R 22772008 5' - opus 7479 2 56.16 ATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGGTTTGTGTGATGTGAACGCCAAATAAACTA:1 + chrX 19005369 5' + F-element 77 1 57.53 CAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGC:1 - chrX 21667926 5' + gypsy2 6567 2 69.66 CAGGGCCAGGTCCGCCGATGAGAGCAATAAAAATCTGCTTTTAAGAGACGCCAAAAGTTCCGAGGAAAACTGGGTAAGCTAAGATTACTTGTGTGGTCATTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTT:1 + chrX 2342272 5' - Transpac 4772 1 66.44 CACGAAAGTTTTCGTATCCCGAACTTGAAGCCATTTGCATTTCGGATGGGGCGGGGGTGGCAAGGTTCCGTCAGGGATTCATCAATTGTCCGCCAGAAAAAAATAAATAAATAAATGGAA:1 - chr3R 14258217 5' + Doc3-element 83 2 41.67 TCGCCAACGTAAATCGCAGCGGCAGCAGTCGTCGTCGCTTGTCTGCGAGCGTCTCAATTCACTGCACATTTTGCAAATAACAATCGCATTTTTTGAATAATTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3L 17108679 5' + hobo 18 1 73.97 TCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCCTGATCGACGGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 + chrX 12649914 5' - P-element 2869 1 45.57 TATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGC:1 + chr2L 23299982 5' + invader4 378 1 70.00 AAACTACATAAATCGCTAAACATCATGGAATGCTTATCCAGCGGCAGATACAATAGCCACCCCACACATAATGGTAGAAATAATTTTATTATTTTTTTTTTTATTTTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAA:1 + chrX 19820117 5' - Juan 4179 1 56.16 CGAGAACCACGATCCCTGCAGGATCTTTGGAATGATGCAGTTGTCCTTCTGCACCAGGTTGTACTGACCGAGGGCTGTAAAATGGATGGGCTTTATTTTTTCCTTATCTACACATTCCATTTACCAAAAATAAGTGGAACAAAAAG:1 + chr3R 23762894 5' - HB 86 1 65.07 CGATGCTCGGGTAGAGAATCAATTAGAAAGACCAAAAGCAAGCATTCCAAATAAAACCCTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCACATAAAAATAATAC:1 - chr3L 17207044 5' + I-element 4923 1 75.54 GTGCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGAT:1 - chr3L 19335442 5' - invader4 271 2 56.85 TTCCACACGCAATCCGAAAAGTATACTAGGGAAAATGCGCAGAGGAAAAGCTTTTTTTATCAATGATATATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAG:1 + chr3L 18554584 5' + jockey 4609 1 52.08 GAAAAACATATTAAGTCTTTAAAATAAATAAATAAAATAAGAGCACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAAT:1 + chr3R 904622 5' + 3S18 79 2 70.55 ACTTCCTCTTATGCTTCAACACGCTTTCGCTGTAATTTCCTGTTGGCAAAAACTGAAAACTGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTT:1 + chr3L 10563888 5' + hopper 57 1 56.85 ATCAGTTGATCCAAGACTTTGGGTATTTCACCATTTGTTTTTTTTTTTAATAATTTATTAAACAAAATTATTTAACGGATTAGCGTACCTTTTGCCCTTTTTAGACACCCTAATCTAATCGGTATCAAT:1 + chrX 21636281 5' - jockey2 3331 1 86.82 TATTTGCGCACGCATAAATGAATACCGAATAATGGACGTGCATAATGGAATCATTCTTCGTATACCCTGGAACAAATATATTCAAAGGAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - 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chr2L 15054060 5' - Max-element 345 1 54.79 GATCCCACTTTTCTAGGCACCATATGCAGTGCGTTTGATATCAAAATATTGATTGCGTAAGTGGGCAAAGCGAATGTCACAGATAACGCAAAACTTTTGGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3L 17904734 5' + roo 8671 2 78.79 ACATACATCTTCTACCCCCAGCGGGAGTTTCCTGCTTATAAGGAAGTAGGTGCCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr2R 14722667 5' - mdg1 380 2 54.03 GTATTGGAAACCTTAGAAAGTAGAAAGTTAAAAGTGCCAAGTTAGTGCAAAAGTAAATTCCGACATTGGGGTGACTGCCGTCTCTTTTTTATCTGTATGCTTAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGTTATCGACGTT:1 + chr3R 5686271 5' - INE-1 142 1 61.64 GCAGACCAGCCATCGTTTTTATACCCGTTACTCATAGAGTGAAAGTGTTTCACTGGCAGGAGGGAGCGTTTCCGACCATATAAATAATATAAATTCTTGATCAGGAACAATAGCCGAGTGGATC:1 + chr3R 31045688 5' + INE-1 96 1 77.42 GAAAAGCATAAACAAAACAGCAGCGGCGGAAAAGCTCTTCGAAAAACAGATGATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTC:1 - chr3R 4662055 5' + roo 33 2 63.01 GTGCAATATTGTAGCAATCTACCCTACCAATACAATAAATTATTGGGTATAACTTGGCGTCAATACATTGTAAGACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAGATAAGCAAGAACTACGTAAGCACTCCATC:1 - chrX 21790163 5' + Stalker 124 4 81.12 AAATATATATCATTTCTATTTTACTTAAAATTTATCTCTAACATTATAAAGAAGAATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTG:1 + chr3R 9175184 5' + Juan 45 1 45.07 TTGGTACATTATCTTAATCAAATTTATTCATAATTCTCTAAGAGTGAATCAGCTTTAAGAACTGGACTACTCAAATACCGTGAGAAACTATCATTCACAGCTATAAATATAGAACATATTAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 - chr3R 22772027 5' - opus 7498 2 68.49 ACAACATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAACATACGAAGAAGCATACG:1 - chr2R 4677367 5' + invader3 43 2 53.57 ATAATAATATAATAATAATATAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCAC:1 - chr2L 14300499 5' - P-element 100 1 18.49 AACCATGATTTGTACGAACTCGCAAATTAAAAGTTGGCAAACTGATGGGCAAAGACAGCGTTTAAATTAGTGTTATTGCAGTGATAATAATACCAGGGGAGCCCAGATGCGTGACGAGCAGCTCTCGACTGGACCACAC:1 - chr3L 448834 5' - G5 4442 1 61.87 GAACGAAAACTTGCATGGCAAAAAAAAAAAGTTTATTTTTTTTT:1 - chr3R 15398503 5' - HMS-Beagle2 496 1 61.36 ATACGTAGCGTTAGCAACTGCAAAGGCACCCGCAAGGTATGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAA:1 + chr3L 13365556 5' + jockey 4647 1 72.60 GAGCCAGTCTTCGGAACGTTGGCTGCCCTACATGAACCCATATATGGAGTTGGCAATACATTCTTGTCTATCAGATTTACGAGGTCAGTTGAATATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAAC:1 + chr3R 20677625 5' - opus 7253 2 68.84 AGCTTCCACAGATACACGAGATTTTAATCTGGAAAACGTGTTGAGCTTGGGAAATTAGTTAAAGTCTTAGTGCGCAAGGAAAGCCATTCAAATTGTTTTACTTGCTTTACAGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCTCGTCTTTTTG:1 - chr2L 6876744 5' + Rt1a 15 1 77.24 GCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGGAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCC:1 - chr2R 9339753 5' - Transpac 302 2 68.69 AATCGGGAAGATGAACGCAAAGAATATTACTTATTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTCGATAAACAAATATCAAC:1 - chr3R 3058602 5' + I-element 88 1 76.71 TGCAGTGCAGACATCTAATTGGAAAAAACAACAACAAAGAGCAAAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1 - chr3L 3339422 5' + Transpac 4980 2 65.15 TATTAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCGATTTCC:1 - chr2R 4886042 5' - INE-1 573 1 51.37 TATTATATGTGACATTGCAATACCTCCATATTTCATAAGGTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGA:1 - chr2R 14940748 5' + blood 80 2 70.55 GGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 14494089 5' - roo 325 2 76.03 ATGAAAGAAAACTTCATTTCAGTGAGTCAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATGTGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGGGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTAC:1 + chr2R 4262574 5' + 1360 111 1 75.34 ACTCCGGGTGCAAGATGAGCTGGTGCTGGACTCTGCTCTACGTGCAGAACTACGCAACATCCGATGTGGCGAGTTGAATGTCCAAGTTGAGTAGTATATATATGTATGTACCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCT:1 + chrX 19585106 5' + Transpac 6 2 57.93 AAAAGACTGGTGTACATTAAGTAAAATACTATGGTTCAAAATATGGAAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCC:1 + chr3R 4532824 5' - 1360 3376 1 76.71 CACATTAAAGCCCAGCGAAGGAGCTGGAGTGGCGAAGGTCCTTGAAGGCTGCGTCGCTCTTTATGCTTATTTAAAAAAGTGGCGTCACATCCCAGTTTTGAGAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAG:1 - chr2L 10519664 5' + X-element 24 1 70.14 GAGGAATTAGTACAAGTTCAATTGAACTAAAAGTTCTCCTGCCAAGCAACAAGAATTGAAAACAAGTACTTTAAAAGTCATTTTAGCGAAGTTAGTTCCTTCTAGAAATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 20132818 5' + Osvaldo 1515 1 59.17 ACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCT:1 + chr3R 25409749 5' + jockey 92 1 76.09 CGTTTGGGTTGGCAGCAGAAATAAAACAGCATGAAAACGAAATAACCAGGAAACGGAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATATATTCTCTCTCTTAAGCGACGGATTTCCCGACAAAACAGGAAACAAATAT:1 - chr2L 12752447 5' + G4 85 1 61.64 ATTTCAGGGCATATTTCATGAGCTGTTAATTTCGCGCGGCGGAAAAGTCATTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTAC:1 - chr2L 11922949 5' + jockey 4827 1 63.64 TTTGCATCCAGTTATTGTAAGCCTAAAAAGCATATATGAAATTATTTAAATCCCATATTGTCTCTATATAGTTTTTTATTTTATGTAAGATGTTTACGTATTTAATTTCCTTATTATTATATCACTTTTATTTTATATGTTTATTT:1 + chr2R 20431651 5' - HeT-A 314 1 68.49 ACCCTTTTAGTATCAAACAGTAGTTTTAATGAAACAATAAGGTTCTACTTATGTATCAGCCTTTCAATATATATTATGATATATATTCAGATAATGCTTCTCCTCTTCCATTTAGTGTTTTTTGTAAAGAGTTTCTTGACACTCTT:1 + chr2L 19800076 5' + S-element 1507 1 75.34 CGGCATGTTAATTTGTTAGCTTGTTGAGTTGCTAACCAGGATCCGATCCGAGGGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3R 10461747 5' + roo 8727 2 63.38 TATATTCCCGTTTCAGCCTTCGCGTTCCTTAAGAGAGGTTATAACCGCAGCAGAGAGGTTGGTCCAGGCCTTCAAAAATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3L 22709311 5' + 412 7085 2 60.15 GCTTGATTAAGCGCTCAATCAAATGAAATTCTATACGCATGACGTCCCGAACAAAAAGTGGAGGAATATGCTGAAAGGAGCGGACTCGACAATGCACAATGGGTTAATTGCTTTATATAATCAACTTAGCTTTTT:1 + chr3R 5117908 5' - Ivk 5268 1 76.30 CGGCTCCTGTCAGACGCACACATTAATGAAGCCCACGCCAGGTCCTTCGGCCAAATATTTGCCCAACGACATTTGGTCTTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCTTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 - chr2L 11079512 5' + 1360 26 1 64.34 TTTATATATCGATGCCTTAATGCCAGACATGCGCGCTAAAGACGCTCCAGAGTTTGTTGAGCTCTCTAGACAAGGCGGCCCGGCTATATTCCATATCTATATCTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr3R 28579634 5' + pogo 14 1 76.03 AAGGAGACTACGATAATTGCGAGCCAAAGTGGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGT:2 - chr3L 9762293 5' + jockey 4788 1 58.22 GCTCAAAAGATGTGAACCGAGTTTGAGTCCAACTGTAGGCATTTAATAGTGTTTTCAATTCTCTGCTTATCGGTATTGTAAATTTAAAATTTGCTCCTCAGCTTCCATCATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTA:1 - chr3L 14601617 5' - jockey 4806 1 71.92 GTTATCCCTATCGATAATCCTTATCTTCGCTTTAATAGAATGTCTCATTGATCAACTGTTCGTTTCACGTGAGCCCCATCCCAAACGATTTTGTCCGCCATCATAGCAGCAACCAAGCCTCTCGGGCTGAGAGGTGACCCAGC:1 + chrX 10791686 5' - Rt1a 4645 1 55.24 AACAAACGGGAACGCGAAAATGTGAATGTGGACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chrX 10806863 5' - P-element 2831 1 47.26 AGTCAACAAAAGATACAGAATAGAAATTATCCATATTTTTTAAGTATAGAACCCCTCAACCATATAGAGCCATATGTTTGAGTTACTAAGATAACTTAAATAATTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAG:1 - chr3L 5666229 5' + Transpac 235 2 58.90 CTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3L 19574033 5' + 297 6628 2 55.48 CCATTTTTCAATTCTTTTTACATTCCCCTCGAAAAAAGACCCAAGCACAACCAAATGACTGCACATGGACTTGTTTGTATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGGCTTTCG:1 + chr3L 3339318 5' - Transpac 301 2 69.09 TAAACCAATGCCAATAAATTATTTCTAACATAGCTATTAAATTTAGTTACTATATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr2R 17021317 5' - pogo 2048 1 62.69 GTGCTGCCTCTAGTCTTCTTCTTCTCGCTCTTTGCGGCCATAATTTATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chr3R 16228834 5' + P-element 69 1 35.66 ATTTTTACAGGACAGCGATTAATTGATGTTTTGATATTACACACTTGAGTTTCTATGTATCCTATGCTATTCCTGGTACATACATATGCGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTT:1 + chr3R 5430362 5' + Burdock 6167 2 63.01 CACCTAACCGACATCGAATCGTTCGATATGCCCCGTGCCCAGACACAAAAATATTTATTTTCAATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 + chr3L 18034507 5' + Transpac 16 2 73.29 CTTCGAGGAGGAGGGACATCCGTTGGAGGTCTTACATTCGGGGCAATGGAGACCGATCGACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr2L 8396939 5' + roo 60 2 60.69 TAGATCAGTTCAAGCAACAACTGAAGTTGCTCAATTTAAAAGCTGTGCAAAAAAATCACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCA:1 + chrX 10128123 5' + invader3 15 2 68.49 GAATTATACTTATAGGCGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr3L 13472397 5' + jockey 63 1 55.48 TATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3L 13827369 5' + roo 50 2 52.74 ATTATTATGAAATGATCATATATTGATCATCTTAACTTTCTTAATTCCGAAAAAATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 - chr3R 10636249 5' + blood 10 2 78.08 ATAAAACAAATACTGCTAATAACAATAACAAATAAAACAAAACAATAATAACAATAAACAAATACTGCTAATAAGAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2R 17187808 5' + roo 8709 2 52.05 GTCCCCGTTGAGATTGCGCTTCCAGCCACGACATCATCACCCACATCAGCACCATCATCAGCGAAGACGCCGCTACACGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCT:1 + chr2R 22812944 5' + McClintock 171 2 54.35 GATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCG:1 + chr2R 1320667 5' - diver2 336 2 53.97 CGAGCAAGGAAACCGGACCGTCTAGCTTCAACTTCTTCGGTCGAATGCAACTTAGAAACTGAATTGAGGAATCGTATTTTGCTGCATTCTCTGCTATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:2 - chr2L 12678644 5' - P-element 2862 1 71.23 CAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACGATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATTAACTT:1 - chr3L 23583084 5' + S-element 404 1 73.97 GGTTAACAATGCTTACAAATTTTAAAAATTTTATATTTTGTTAAAAATATTTAATGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 + chr3L 18164130 5' + pogo 63 1 61.64 GGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTG:1 - 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chr2L 23295920 5' + micropia 19 2 69.86 ATTTTAGCCGCTAAACGATTTTGTTAGCCCACGTTAAGGTAGAATTTCAAGAAGCAAAATCTTGTGTAAGCTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 3648828 5' + roo 8706 2 51.45 CGGAAGCAAATCTTGCGACACATCTGGAAATAAAAAGTAAATGGTCCGAAGAAAGGCAAGAATTGTTAAGGCAATTTCGGAATACATTAAAAGGGGCGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAAT:1 - chr3R 26244759 5' - copia 230 1 65.07 CTTTTGACAGCCGGGGATATTTTATGCTCGAAAAACAACAGAACGTAAATTGAAAAGTTTTGCTCTTAATGCAGGAGTGAGTGGTCGATGTAAGTGTGGGAGTTGGGGTGGATTGTGTTCATTTGTGTTTGCA:1 + chr3L 9249604 5' - Stalker2 75 2 72.18 CATTTTCCGGGCTGCCCCTTTCATCATTCGCTTGTTTTTTATCGGAACACTTCATACTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAGAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 21587513 5' + roo 8716 2 57.46 TCTCTGTGTTGTTATTAGTTACGGATATATGTCCAAATTGTTGTGCCAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 - chr2L 11613297 5' + hobo 72 1 67.13 ACTTCCCGCTGGCCGAGCTGGTACTGTCGGAGAATAAACTGAAGCACGACCTGCACGACTTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTTTACAATTCTATATTGAAAACAATCTGGACCTAT:1 - 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roo 9017 2 59.59 AATGGTTTTAATTGAGCCCGAAACGAGTCTGAAACGAAATGGAATTAGGCAAATCTGCTTGTCGACTGAATGGGTATGGTTTTGGTTAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 - chr2L 1277933 5' - I-element 5324 1 63.01 ATAAATTCTAATATATTTTATAATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGTT:1 - chr2R 21425178 5' + HMS-Beagle2 6919 2 57.86 AAGCGCACTTAAAAATGTCCAAAAGCGAAACCAGGTCGTCCTGTTGTCCAACTGATGGAATCTCTTTTTGGCCCAATCCCTGCGGCTCACTGGGCTTAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 - chr2R 9623457 5' - I-element 5333 1 69.18 GATCATAACAAATAACGATAACAAATTCCGAAAAACTCAATAACATAAGTTATCTTGTTATGACACCTCATAGACATATGTACATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTAC:1 - chr3L 20209672 5' - Burdock 6357 2 60.69 AAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTA:1 + chr3R 21276532 5' + BS 5056 1 56.85 AGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGT:1 - 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Quasimodo 7294 2 71.92 ATAATTCTGTAAACTCACCTTTTCATATCCGCACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATA:1 + chr2R 16496593 5' + hopper 87 1 76.03 GTTTGGCCGAAGACCAAAACAAAAGGACAGTACATCGCTGGACGGCATGTTAATTTGTTAGCTTGTTGAGTTGCTAACCAGGATCCGATCCGAGGTATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 10461789 5' + roo 8687 2 68.75 GCAAATATTTGAATATGGATATGATTTATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCG:1 - chr3L 19335440 5' - invader4 3028 2 58.22 CTCGGGGCCTGAGAACTGAGAACGGCAAAAAGGAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGAAA:1 + chrX 8760107 5' - roo 382 1 57.65 ATGTTGTCAATCCTTTGTTTTTCTGTGAAGCTGTGTGGTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3L 16463617 5' - roo 9034 1 57.53 ACATCCAAATGAAACGAAACGAGACGTAGATGGTTTTCCAGTTCAGTGACAGCTTTTCATTTGTTTCATTTTCTTGCCGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3L 9519667 5' - roo 9034 1 55.63 GCTTGGGAAATTAGTTAAAGTCTTAGTGCGCAAGGAAAGCCATTCAAATTGTTTTACTTGCTTTACAGCTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAGTCCGGTCAGCCGTAA:1 - chr2L 6876700 5' + Rt1a 60 1 52.74 CTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr2R 20739075 5' + hobo 23 1 60.24 TTTGACACCAGACTGTCTAGGAACGTCATGGGGATGTGTAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATTAGGGTTCTCGGCTCTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chr2L 9347555 5' - opus 7461 2 59.81 CTGATAAGAAAACATATGTACCCTCGATGTGGATACGGCCCTGCCTTGCACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATATTCCATAACG:1 + chr3R 18697872 5' + 297 6643 2 65.07 AAGATTAATTTCACGCGAAGATATTTATTTTTACATTTGTCCCTATAATAACCGGGGTGCCAACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCG:1 - chr2R 2552203 5' - HMS-Beagle2 292 2 62.73 AAAGGGGTCAATGGAACATGGTACAAATTGGTTTTTATTGAAAGTGATATTTACTTGTGCCTACTTTTCTTAAGGTACTTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr3L 20083747 5' - opus 7487 2 69.77 GGCAAAAATCACGAAACGTTAAACAACCAGCAAAAATATTGTCATGCGAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - 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Doc3-element 4393 1 54.79 AATAAAAATATAATAAACTTGTAATAAAACATATAAAGTAATCACTTAACTATGTAATAAATACACTCATAGTTTTATCAACGGAGGAAGGTCTTTTAGAAATGCTTGTTAATAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chrX 11267643 5' + roo 8671 2 74.66 GGCATACATACAGTCACGTACGCGATTCTAAACAAGTTGATGAACTCTACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2L 19158908 5' - P-element 2841 1 46.22 CCATTCGGTTCGGTTCGAATCGGTGTTTTTTTGGGGGATTGTGCTTGGAAAAACGAAATGAAGTTGTCGTGCCAAGTCAACATTGCTATTGCAACAATAATAAATAGCAATAATAATAATAATA:1 + chr3L 7596974 5' + mdg1 31 2 35.48 ATGAAAGAAAACTTCATTTCAGTGAGTCAGGCCAAGGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGCCACACGATGTGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGGGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTAC:1 + chr2R 4262574 5' + 1360 111 1 71.23 AATGGTGGCTACTGAATGCCCTTTATAGAGATTTTAAAATACATTAATAAATAAAACACAACTCTGTATATTAACAAAATATCTATGGAGCTTTAAACATATGGTGATGGGGAGCAATTGGTGGGTAAACATGGACA:1 + chr3R 20001590 5' - FB 72 1 70.07 AAATATTTTATTCCACTTGCGTTGATTTACTCCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chr3R 23539478 5' + hobo 67 1 72.80 AAACTGTTTACATTTTTAAGTTTATTTTATTATTGCACAACCTATTTGAAATCTTGAAAAATATTAAAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr2R 22012115 5' + opus 162 4 56.16 GCGAGAGATCCCCCTGACTTTTTACACATAGCTGCACACACGCGCTCCGACCACCGAAAGGATAGTGCTGCACTGAGAGAAAAATAGTAGTACAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATCACCAC:1 - chr3R 8596472 5' - hobo 2911 1 66.44 CAGGCAAATAATTCAGCAACTGATTTACGAGCCAACTGGGACCGCCGAGCCTCACAGTCTTTTGTCCTTTAATACCCAGGGATCCTTATGTACTTACATATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAA:1 + chr3L 16875782 5' - Burdock 6370 2 64.38 ATCTAACAAAAAGTTCTCAAAACTTTTTAAACAATAATCAATAACCCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTA:1 - chr2L 13510920 5' + diver 5911 2 69.18 GATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGA:1 + chr3L 13228503 5' - P-element 2785 1 15.75 ACAACAGACACTCTCCTACCCTATCCTTCTTCCAGATATCAGCTATCTATCTATCTGCTATATGGTATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATATTATTTGGAAATATC:1 - 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INE-1 551 1 63.01 CTTTAAAGCCACCGCTCGCTCACCTTTGCCGTTACACGTGGCGTATGAGCAATAGGCTCATAAATTATAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCC:1 + chr3L 5960250 5' - 297 415 1 51.54 AATTACATTCAACAAAATGCCCATAAAGCGAATGAATAACCACAAAATATTCGAGCACTTAAAATGGCAAAGTGATTGAATTGTGGGCAGGGTTTTCGCCACCCATCCATCTCCCTTTAAAACAGCTTTCATTTGTATATAAATAA:1 - chr2L 1363806 5' + transib4 2457 1 65.75 CATATGGCTAACATCCCACATTTTGGCACCAAATATGTATATTCCATATTAATACAGCATAATATATATATTATTGCTTATGATTCAATTTGATTTTTTCGTTTCTACGGAAACTCTCAAGCCCTCCCAAGACCAAAGAGCG:1 + chr2L 7868812 5' + Doc4-element 105 1 66.90 CCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATATCCCTATGTCCGTATGAACGTCGAGTTCTCAG:1 - chrX 21587767 5' + INE-1 136 1 51.05 GACCCGTCCTTTTATGTTTTTTTCTCAATTCAGACGCAAGCTTTTCCAGCTCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCC:1 + chr2L 4420463 5' + gypsy5 6965 2 64.38 GGGAGAAAATGAAATCAAAGTCGTATCAATTGAAACCTGTTTCGATGTCGTTGTTAACACATGTTAACCAAACGTAGCCAAATTGCCAAGGAAAATGCAAAAAAACGTGGCAGCACTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCC:1 - 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R1A1-element 5283 1 54.61 TTTCCGAGCGTCTAAAAGCAAACAAGATACTCGAGAAAGAGGAAATTTAATCAACTATGTATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAATGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTT:1 + chr3R 21819897 5' + roo 397 1 56.16 AGAAACCTGAACAACGTTGAAGCTAAGGAGATGACATTTGAGTATTTTACTAATATTAGCATAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 + chr3L 24253581 5' + 297 6635 2 60.27 TTCACACAACATTTGTATGCAAGTGTAGCAAATGGCATCGTAGTGCTTAAATGTGCTTGGGTTCTTCGACATTAAGAGTGATATTTTGGCTGGCAACTTTGTACATCAATGCATATGTATGTACATATGTATGTACGTATGTACTA:1 - chrX 19823327 5' - 412 224 2 52.74 CCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTTTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGT:1 + chr2L 23295819 5' - micropia 375 2 80.00 CAGGTTGTTTTCTTTAATTAATTGCTAAAAATGGTGTTGCATGTTTAACTTTAAAACTTTATAGTATTCCCTGTATCGTGCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCATACACTT:1 - chr3R 904723 5' - 3S18 298 2 56.16 TCTTGATTTCGCGCATAAAATGCGCATAAGCCTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - 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chrX 16217531 5' - P-element 2828 1 45.21 GTGTTGAGCTTGGGAAATTAGTTAAAGTCTTAGTGCGCAAGGAAAGCCATTCAAATTGTTTTACTTGCTTTACAGCTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCTCGAATTTCGTCATATACGAGTCCGGC:1 - chr2L 6876707 5' + Rt1a 51 1 54.86 TATTCGATCTAAAAATGCAACCTTGTAAAGTTCGTTAGAACTTAATTATCGTCACACATGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACA:1 - chr2R 3120369 5' + accord 12 2 71.23 GCAACATGTTGTAGTTGTACAGTGAAGCCTGCAAAGCAGTAAATACCCAAACGATTTACTGTTTGTTGGCTTTAAGTATAAACATGAATTTATCTAATTTTTATCTGATCCACACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACA:1 - chr3L 10440226 5' + Chouto 442 1 69.86 CATAACAAATAAATTAACGCAGCAAAATAAATATTATAATAGAAAGTGAATGATAATGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1 + chr2R 9339647 5' + Transpac 63 2 63.01 GCACACATACATACGTAGCGTTAGCAACTGCAAAGGCACCCGCAAGGTATGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGG:1 + chr3L 13365546 5' + jockey 4637 1 65.75 CTTCGTTTTCCCACTACGGAGACCTTGAACTGTCTCTTCACTGTCACTGACTGGGACTTGACTTAAATCTTACTTAATTATTATCTTCTAAATATTACTGCCTAAACATTCCACTTCTTTAATACTCATAATCATATAATCTTTGG:1 + chr3L 22389514 5' + jockey2 3280 1 56.85 TCCCAGTGTTTACGTTTTTTGGCAAAAAAAATCCGCATTGGTACACAAAGATTTCTGTATAAAGGTTTAGACAATCATTTTCAAGATATTTTTTATAGGCACCAACCAAAGACACTAGAATTCTATTATTATTCTAGTGTCTTTGC:1 - 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chr2L 23482558 5' + Doc 439 1 63.38 TATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTG:1 + chrX 4214477 5' + jockey 90 1 71.23 GAACCGAGCGGAGCAAAGTTTCTCGTTTTACGATGTGTTTTCAACAGTTGGTACGTGACTTTTCACTGAGCAGCGCAGTTGCCTCAGATTTCTCCTACCCCATTTTGTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:2 + chr3R 20939091 5' + jockey 4689 1 73.29 TTTTATTTCCCTTCGACTCGTGACTTTTTTCAACCCTGGGTGTCTCTGAAGTTGAACGTCTTCTAACACAACACGCACACATATACGTGCATATATATATACGCATTCTCGTCTCTTGTTTTTAGTCACACAAGCAAGCAAAATCT:1 + chr3R 7677318 5' + 1360 3257 1 61.64 AGCTGAGCTGAAAACAATGCTGGCGACTTCAAGTGGCCCACACCGCAGACATAAAACCCAAACCAAAAAAAAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGC:1 + chrX 17472103 5' - Quasimodo 7324 2 55.17 AAAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTTGACAT:1 + chr3L 18792420 5' - roo 9002 2 65.07 AGTCCTTTGAAATCACATAATAATGTGCAGCGCCCGCTGTCAGCTGGTGTTTTTATTGCAGATTATGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr2L 20986503 5' + roo 8718 2 56.85 ACTTTGTGGGTCGTAATAATCTTTTGGCCAACTTCATTGCCATGGCATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1 + chr2L 20938023 5' + jockey 4714 1 59.13 CACATAGTATTGAAAAATAGAGGCGGGGTTTATTGAGAGAATTTTTTTTGACAAAAATATTAGCTTTTTTTTTTTCTAAAAATTTTTTTT:1 - chr3R 22208523 5' + Tc3 77 1 33.33 GACAAAAATTTCAAAAGAACCTTCGTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chrX 16217577 5' - P-element 2874 1 76.71 ATTTGTAAAATGTATGGGTGCACTATGAATGTATGTTATTGTAAGCAAACACAGCGGTATACTATGAATTCAAACAATTTTATATGCAGACTAAATTTTTATTTTAACCTGCTTTAATATTTACCATCATAAATATAAATATACCA:1 - chr2L 19906427 5' + Stalker4 7039 4 72.60 GGTAACGGCGAAAATATCATCCCAAATTATGCACACCGTTTATTATTAAAATCAATTTGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCT:1 + chr3R 17210007 5' - HMS-Beagle2 7133 2 59.03 CTAATAAGGTAAAAAATAAAATATCAAAGTGCACAGTGCAGTTCACATAAGGCATAAGACTCGATGTACTGTAGCAGTCTGTGAACAAAAACATTAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAA:1 + chr2R 2947595 5' + 1360 2995 1 63.70 GCTCTCCCGCTCTGGCACTTCACCTCTCTCCCTCTGACCCGCTCACTCGCACAGCTGTTGTTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAACGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr2L 14490207 5' + P-element 55 1 47.22 ATTTATAACCACCAATTGCAATGCAAAGCAGCCTCTTTATATGGAAAACACGCGCCTGCCGCTCACACATACACCGATAAATTTGAGTCCTTAAACGTGGTGTAAGATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 10304709 5' - roo 9047 1 69.18 AGAAGCAAAATGCATAAGTATCATTGTAGAAGATTTAATTTTAAACTTTAGGCATCTGTTAAGATTAGTTATAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3R 8914236 5' + pogo 44 1 54.11 GCAGGGGTAATCAGCTGATCAGGTTAAAATTAATTGCAGAAATATATAGTGTCCGGAAAAAAACAAAAGAAAAAGTGGTAATAATTTGCATGCTAAATACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 - chr2R 9339788 5' - Transpac 5209 2 71.23 CCGATTCACGACTGAACGGTCGGACGACTTCATTGGTGGAAAAGGCACTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 + chr2L 13717298 5' - P-element 2814 1 34.25 GGCATCAAATCTAAAAATTAATAAGGCACATAAAATATATCTAGATAAATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATAAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr2L 14480404 5' + Transpac 4956 2 60.96 AATTCAGCAACTGATTTACGAGCCAACTGGGACCGCCGAGCCTCACAGTCTTTTGTCCTTTAATACCCAGGGATCCTTATGTACTTACATATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATT:1 + chr3L 16875791 5' - Burdock 227 2 60.42 ATTTAGGTTTTAAGTTTATTTCTGCACTGATCTATCTATTTATTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTGGCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCG:1 - chr2L 21677714 5' + FB 151 1 68.97 GAAAAACGGAAAAGTTTTGGCCATTGACAAACGCATTAAGAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATG:1 + chrX 18737235 5' - I-element 5274 1 71.92 ACACATTTCGCAAACAGACATAACGTTCAATGAATGGAGCAACGCACGTATTTATTTAGGCCGCAGTCTGTCTTTTGATTTTGCGACGAAGTAAACAAGTGCTTTATTTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 + chrX 10367497 5' - Juan 4195 1 72.60 TGGCCATTTCCTGTTTGTATGGAGCAAGCCAAGCAAATCCAAGCTTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3R 20074564 5' + roo 8740 2 69.18 ACAAATCGACAACGAATAATTAACCAACATTTTTGCGCGATTAGAAAACTTATTGACGTCATTCATGTACATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATT:1 + chr2L 13509176 5' + F-element 4645 1 56.85 ATTACACAAGCGAATAACAGAATCTTGTGGAATACCTGTGCCGACGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAG:1 + chr2R 18440416 5' + P-element 66 1 37.23 AAAGCATTTTTGCAAAAAATTAATTTACAGTGCAATAAATCACCACAAAAACAAAAAATAATCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATAC:1 + chr3L 14407960 5' - 1360 153 1 58.22 TATTTGATTTATGCACTCCCTTTGCAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGTTAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAATGAGCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGCAGGTTGAACTCCTCAGT:1 - chr2R 21029426 5' - Transpac 217 2 77.40 TAAGAGGTATACTACATTTTTTGAAAATTATGTAAATTATGTAAGCGTAATTTAATTAGTATGACTTCACGAGTCGATCTGGCCATGCCGTCAGTCCGTATGAAAAAATAGATCTCATGAACTATAAAAGTTAGA:1 - chr2R 1006800 5' + INE-1 153 1 65.93 AAATCTTAACCTTTTAGCTTTAATAGTTCTGAAATCTCGAAGTTCATACGGACATATTCAGATCGACCCGGCTATTCTAATATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTTAACAAGAAAAATTCGACTAACAGATAGCCGTTACTC:1 + chr2R 5492221 5' - INE-1 549 1 75.34 AATCTAACAAAAAGTTCTCAAAACTTTTTAAACAATAATCAATAACCCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTT:1 - chr2L 13510921 5' + diver 22 2 69.86 TTTATATATATCTCTTTAATTAAGATAGTTTGTAAAGAATTAAGATAAATTATATTGTTCGCAAACAAATATAACACATTCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATAT:1 - chr3R 5024931 5' - diver 181 2 55.48 ATATTCATATACTCAAACTGGTGTGTGCACTCACTGTTCTTCGCTCGGCTTTTTCGGCTATGTAAACACTGCCAACAGTCTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTATCTTTTCTTGGAG:1 + chrX 2505096 5' - Ivk 4922 1 66.12 AACTAAGGCTAAAACATAAGCAGTCAGATATGTATGTACATACACAAAAACCAAAAAGAAAAAAACTCACGTGTTGCCAACGTTGGTTGGCCAGCAGCGGAACATCTTTAAGAAAGGGGAAAAGGCACAA:1 - chr2L 16539288 5' + Rt1b 177 1 74.62 AGGACTCTCACTCTCCTCCTGCCTGCGCCGAGAGAGCCAGTGCCCTCTCTCTTGCGCTCTCACTTCTCTGTGTGATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chrX 16526251 5' - P-element 2840 1 53.79 TCCAAACACAAGTGGGCCAATTGGTAGTCAACATTTTGGCGCCACCAACTGAGCCAGTTGAAGGTTGATTCTCAAAAGCAATAGTTAGAGAAATACTTAATTGAGGAACATGGAAATGTTTCAATAATCAACATAAATATAAATA:1 - chr2L 2412918 5' + 1360 2954 1 51.03 CATCTGTCAGAGGTTTGTCCGGTGGTTTGGGCTAATAATCTGATTGACTTGGGGCCGCCGAACTGTTTCACATCCTAAGTCAACAGAACTGATTGAGAATATATAAATTTTGTATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACTT:1 - chr3L 18719532 5' - INE-1 30 1 60.27 CATAGATAAATACCTTTAAAAAAGAAAGTGCTCACGATTTCTTTGGCTTATCCACAACCTCTTGGTATTCTTAGTTCCTTTTGCTATTATGCGTGTTCATATTTATTGTTAATATGTGATGATGAATAGATGAATTATCTATGA:1 + chr3R 8850413 5' + micropia 191 2 57.64 TATGTGTCAGGGAAAATATAGTGAAACATCTTTGGGGCACTACAAGTCGATTAGCATTTGCATAGTAAAAGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chrX 18190451 5' - hobo 2923 1 66.06 TTTCCTCCCCCGCCCCTTTTGCCAAATCCCCGCCCATTTAGGCGCACACATACATACGTAGCGTTAGCAACTGCAAAGGCACCCGCAAGGGATGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCC:1 + chr3L 13365503 5' + jockey 4594 1 61.64 GCCAATCTCTCTTTTGGAAACGCATATTTTATTGTCAAAATCAATAGATGTCAGCGTTTAACAGCTGCCAGCGGCAAAATACAACCCCTGATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chrX 17027993 5' - roo 9044 1 70.34 CTCAAAGGCATTGGCCATTTCCTGTTTGTATGGAGCAAGCCAAGCAAATCCAAGCTTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 20074553 5' + roo 8718 2 58.52 CTTTGCCGGCTAAAATAGCCGAGTTGAAGACATTTTTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAAGAATTTATTTCTTTATAACAA:1 + chr2L 6756825 5' - pogo 1999 1 75.34 GAAGAATACGACTTTTCAAGGAAGGTGTTGCTTTTACACTTGAATAAATGCATCTCGAAGTTTGTGGTAGTAATGCAATATACAAAGATATTTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATT:1 + chr2L 260937 5' + Juan 4055 1 67.81 TCTTGGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3R 24976292 5' + roo 74 2 69.18 ATACATAGCTACACGCCGGCGAAGTGCGCATGTCCTTGCCATGGGAATCAGCAGCGGAATGAAACTGCAGCTACCGTCGGCAGAGCAATTTCTCGCCATATCTTAGAATTAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTTT:1 - chr3R 11312262 5' - ZAM 211 2 68.49 ACAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 14494113 5' - roo 349 2 59.59 TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCACCGTCGATGCATTGCT:1 - chr3R 27036955 5' - invader2 318 1 61.64 ATATTATCTTAAATATCCTTTTTGGTTTCCGGATTAACTTAACCAACTTTTCAACAAGTATTGAACGCAGATCTCAAAGTGTGTGTCACTAAACTTTGTTATGCTATAATTATATTGATTATATGTAATGATGAACTCCCATTAAG:1 - chr2R 9092127 5' - 412 7545 2 83.56 GATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chr3R 6412075 5' + Tirant 36 2 58.65 AACTAACCATTTTAACCATTTCAAATAACTCATAGTTCGGTGAATTTGATTTCGTTTTTTTAATTTTTAATTTTTATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 + chr2R 11097293 5' - Juan 4161 1 53.42 TTTTTATAATTTGTTAATAAAAAAGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGC:1 - chr3R 15021690 5' + invader4 2747 1 45.54 GCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAA:1 - chr3R 29091386 5' + rover 62 2 62.76 CAAACCCCGATATAAAGATCTTCGTGTGCTAGAAAACGCTTAGAATGCACTGGGTAAGCGAAGATGTTTAACATTAAACTCAAGATTTGATACATGTTAATACAATATTATGATGTACAGTTAACAATAATAGCACCATAAGCACA:1 + chrX 22900903 5' - Tc1 1631 1 68.49 GGGTCCCACCCTATGAGCGATTGTTGAAATTCCAACTAGCTATGCTGAGCAACATCCAAGAAGAAATTGCCAGCATAACACCTGCTGTGCAAACAAGAGTCACGCCAAAACGCCAGAAATCGGATTACGCAAT:1 - chr3R 834497 5' + mariner2 728 1 60.15 ATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGC:1 + chr3R 19450197 5' + roo 8757 2 70.48 ATTTTATATTCCCGTTTCAGCCTTCGCGTTCCTTAAGAGAGGTTATAACCGCAGCAGAGAGGTTGGTCCAGGCCTTCAAAAATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATTTTACGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3L 22709307 5' + 412 29 2 62.69 TTCAATAACAACATGCATTTGAGCAGTTATGCAAATAAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 - chrX 17737257 5' + jockey 4758 1 73.97 TGGTGAGTTGAATGTCCAAGTTGAGTAGTATATATATGTATGTACCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1 + chrX 19585172 5' + Transpac 4992 2 71.92 GTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chrX 16217553 5' - P-element 2850 1 60.27 TTTTACTTTTTCCATTCTCTCTCTTTTTATTTTAACAATTTCCCAATCAAACAATTCAATTATGAAAGTGTATATTAAGCAGTTAGTTAATTGAAAAAAGTGAAATTTTTGATTTTCGGAACTTTTGGAACTTTTTCGAAAATTCA:1 + chr3R 15669511 5' - FB 127 1 50.68 TAGCTCCTTGGAATATTTATTTTTCCTACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACC:1 + chr2R 2552097 5' + HMS-Beagle2 62 2 62.33 ACACAACAAATAAGTGAAGTATAAAATATTTAAACTAGATTATCTGACAGACAGCCATTGTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAA:1 + chr2R 21425054 5' - HMS-Beagle2 254 2 58.90 CCAGAAAATCGGGAAGCCGAATAAAGGAAGGCAAAAAGCAAAGTGAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGT:1 + chr3L 14708922 5' - opus 433 2 66.90 CAATATTTTCGATATGCATCTCATGTGCGTGTGTTTGTGTGGCTTTTTATTGTGATTGGGGGTAAGAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTACGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGT:1 + chrX 19005044 5' - F-element 265 1 53.10 CTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAAC:1 - chr3R 29091385 5' + rover 64 2 60.96 GCAAGATGCCGGTTTGAGATATTTGAAAGTGCACTACAAAATTTTGAATTTCGGAGTCTAGAAGTAGGCAGATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 - chr2R 1375183 5' - 297 6931 2 56.16 ATCTGCTCCTACGGTTGCCATTGCAACGAATACTGTTTAATTTTATTTGAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTG:1 + chr2L 1278881 5' - I-element 5099 1 65.97 GGACACGGCCATCGTCCTGCCGGCTCCTGTCAGACGCACACATTAATGAAGCCCACGCCAGGTCCTTCGGCCAAATATTTGCCCAACGACATTTGGTCTTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr2L 11079532 5' - 1360 3366 1 70.55 GAGTCGGACAAGGCCAAGCGGAAGTACTGGCAGACATGGGTGGCCTGCCCTCCCATCCAGATTAAGCCCAAGAAGATTTGCTGTTTCGCCAAGGCTAAGCCGGCTCCTATCGGAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAA:1 + chr3R 24363550 5' + Doc3-element 4446 1 76.03 TATTCAATTGGCATAGCAATAACTTATGTATGTACGTCTACGAGACGCATCTTTTAAATAGGAGGTTTTCCCGAGTATTTCGTTTTCCCCACGCTCCGTGAAAAGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 22884073 5' - roo 393 1 75.34 GAGAGGGATGGCCATGTAAATGGGAATGTGGATGTGAACGTACCCACCATGGCGGCACCGGAAAATGTCCAAGTCAGTGTCCATTGAAGCGGAGCAATATGTGTAATAAACAAATATATGCCACCAA:1 - chr3R 22624817 5' - blood 7385 2 77.95 GTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCA:1 - chr3R 29091388 5' + rover 7012 2 61.64 ATGGACACTTGTACCTAAGACCCAGCCCAAAAAAACATGCTTTAATCGCTTTATTTGCAACTTGATTTCTTCACTTGAATCAGAATAGTTGTGAACTTTAGGCAAATGAGAACATTCTTTTGGAAATTCCCTGGACATTTCATCAT:1 + chr2R 15909074 5' + G4 20 1 76.71 TTTTACGCGCACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAACCATCGGACACTCAACCGCGAAGACGGCAACTG:1 + chr2R 12069580 5' + Tirant 56 2 61.29 TATCATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTT:1 - chr3L 15099682 5' + G4 3814 1 53.42 AGCTGATTTATCATATAGAAGGGGAGCTTTGTGGGCTTAAAAAATTTGGTTCATATAAGGCAATAATTACATTTGTGACCAAAATAGAGTTTCTCGCCTTTAAATATTAATAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTGCACCCCAAC:1 - 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chr2L 16385315 5' + I-element 84 1 76.55 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGGGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGCTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCA:1 - chrX 21292604 5' + HMS-Beagle 48 2 58.59 AAGCGGGAAGCTCATCTAGTGGCAATGCAGGCAATGCAAATGCCACCAGTACCGATGATGCAGCCTCCTCAACATCCACAAATGGCAATAGCAGCACTTCCAGCAGCGTAGAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr2L 416097 5' + 412 7085 2 76.03 GGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr3R 27188600 5' - roo 8981 2 77.93 ATGTAGTTTATTTTCATAGCTTATGACAACAACGTTGGCTTACTTGCTTTGCCTCCAGCAAATGGTAGCTCTATAGTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3L 10442798 5' - roo 9029 1 56.25 AAAACGGATAATAATTATGTGAAAGTGAGAGGAAGGTAACACAGGTCCTGAATGGACGGGTTTAATTAATTTTTGTAAATGAGTTTCCAATTCAAAGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3L 18658166 5' + roo 8688 2 69.18 TCAATCGATATCCAAAACCGACACCTGCCATAATACAAATAACAGAAAGAAAAAAAAAACCCGAAATAATTAACAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGAAAAACACCCGAAACTCGAATTACATAATTAAATAGCAATATA:1 + chr2L 5738773 5' + Porto1 4225 1 60.69 TTTTAGCCAAGACATGATCACACCTCAGCTGCTAGACAATTTAATCCATTCTTCCTTTATCTGCTTTGCATTATCCAAAACAGTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAGTC:1 + chrX 21581321 5' - 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chr2L 5447966 5' + roo 8739 2 69.86 CAAAGCCCCAGTCTTATGCTATCCATTGAAAAACCCTTCTTGTAGTACCAAGAAGATTTTCCCATTGGGTAACAGTTGACTAACACTTTAGGTCGACCATAAGACTCATCAATAGCTTGATGATATTTTGTTTTCTTTTTTTTTAT:1 - chr2L 16769041 5' - gypsy11 3931 1 51.37 GTTGGTTCATGAGATTCATATGGATGAGCAGCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr3R 22840455 5' - Transpac 250 2 77.97 ATGCATATTTTTAATCAAATATTGCTTGGAAAGATATTCGCAAAATGCCACAGCAAATAAATTATTCCGAGATCCCAGCCAAGCAATTCAAATGGAGCACATGTACATATATTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGAAATCCGTC:1 + chr3L 2306960 5' - G4 74 1 76.71 CAGGGGGTTCGAGATAAACTTCACTGATGACTCAGTTTCCGAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr2L 21153429 5' + 1360 10 2 78.47 GCGAGGATTAGAAGGGCAGCTGGAAAGCTTTAAAAAAAAATGCGATGCAGGATTACAGCTGTTCGGGCTTGTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chrX 7967305 5' - P-element 2874 1 67.89 AGATTTCTAGTTCTTTTTATATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTAGAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCGATTCGCAAAAAA:1 + chr3L 25255422 5' + INE-1 310 1 65.75 CCCACAGCAATATAAAATATGCATAATCGTTTAATTTAATCAATTGCTCCAATTAAGCCATCTACCACACATTTATTAAATCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGCATACACT:1 + chr2R 11595803 5' + P-element 38 1 59.59 AGCAGGCCAAAAAGCCGCCTATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTG:1 + chr2R 9504187 5' - roo 9031 1 54.79 AAATAATAAATAATCTAAATTATATATATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGACGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACACTGGGACAAACAAGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGT:2 + chr3R 13001018 5' - I-element 5344 1 80.14 TGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTT:1 - chr2R 16496640 5' - hopper2 1519 1 76.71 GACCATCCATCAATTAACTCATTCAGGCACGCGCTTCTGAAGTAGAACACCGATTGTTGAGGTGGGGCGTTATCAGGGAACGTTTTGATAAGAGATACCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAAT:1 + chr3R 24053603 5' + mdg1 24 2 69.18 GATCTGTGATTACGCAAGTGCAAGTGCGGTGCAAGCGGCGAACACGAAAACATCACCTTAACTCACCCGAGATCGCCCGAGATCACAACTTACGCACATATCCATGCCAATAGCGATAGTAATAATAATAATAAAAATAATAATGA:1 - chr3R 23372581 5' + mdg1 7064 2 67.81 GACAGACAAGTACGAAAAGCTAATCCGGTAGTAAAATTGTCTAGCTAAAAGTCTAAAAGAATTCTATTTGCTGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chr3L 16663840 5' + opus 39 4 51.11 AATCGCTAAACTCAAACAAAACGAAGGCAATTTGTTGTAAATTTATAAGCTCAAAGAAGCTGGAGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTT:1 + chr3R 22053297 5' + FB 78 1 71.92 AGCAGCAGAAGTAAAGGATTCATCCTCGCCAGTTCTATCTTTTTATAGTTCACTTCATAAAGCTCATCTTTAACATAAAATAGCTTTAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - 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chr3R 12334605 5' - FB 309 1 60.96 TATAATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACA:1 - chr3L 24208225 5' + Quasimodo 44 2 53.42 CAATCGATGCCGCAATATGATACTTTCAAGTTAAATCACGTTTGACACCAGACTGTCTAGGAACGTCATGGGGATGTGTAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTAGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2L 9347595 5' - opus 7462 2 54.79 AGAGTTCATTCCTTCTCTGAAACGGATGAATTTCGAAAACCCGAAAGGCGGCCGAAAGCCGAAGTCACTGGCGTCACGAATTGGCATCGTCGTTTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr2L 13717434 5' + P-element 26 1 69.18 ATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATA:1 - chrX 23182954 5' + Idefix 14 2 63.01 CAATTGACATTTAATCAATATACTTGTTTACTGAACAAACATTTAATTGTAGGCTTAAAGGTGGGCGTGGACAAAAGAAATCCCGACGTTCATACATGGACGTGGCTAGATCGACTCGGTTATTGACCCTGATCAAGAATATAAAT:1 + chr4 855990 5' - INE-1 80 1 58.90 GAAAGGTAAAAAGAATAAGTTTATATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTA:1 - chrX 3767642 5' + I-element 58 1 78.50 TTGGCAAATTCTTGGAAACGTGCTACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTG:1 - chr3R 29091407 5' + rover 42 2 57.53 AAGTGGAAAAATAAAAGCTCATCAATTCAAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCA:2 - chr3R 28659181 5' - Burdock 251 2 73.29 CGAATCGTTCGATATGCCCCGTGCCAAGACACAAAAATATTTATTTTCAATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTTTTAGCTTAAGTTATGT:1 + chr3L 18034521 5' + Transpac 24 2 65.00 AACACTTTGTGGGTCGTAATAATCTTTTGGCCAACTTCATTGCCATGGCATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:1 + chr2L 20938020 5' + jockey 4742 1 65.75 GAAAGGAACCATTCCAACACGCCTGGCTTCTAAATATCAGTTCAATAGAGCTCAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1 - chr3L 1315800 5' - mdg1 7401 2 60.87 AAACTGATATTAACAAGCATGTCTTTTTTTTTACACCAAAGTATTTTAGCTCAACTCTAGACAAATTGCAGATGTGGAAGTAACAGCAACTGAACATAAAACATGAAAGTTCTCTAAGGGTGTTATTTATTGCAACGACCTTAGAC:1 + chrX 8848008 5' + I-element 499 1 57.53 CAAGGTCAGTCAAATACCAGATAAATTAGTTTAATTTTTCCATATCGAATTGCATTCTTCATTTGAGACCAAGGAATATAGTATCGATTGGCAAAATGTTCTTGTAAGCATAAAGATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 + chr3R 29622597 5' - pogo 2099 1 76.71 AAGTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCAGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAATACATATAAAGTATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGAC:1 + chrX 15903132 5' + INE-1 100 1 39.31 AAATTAATATTTTCTTTTATATTAGTCAAAATAAGAACTTTTTCATTGTTGTCATTTTACACAAATAAAATTTTGCAACTGAGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATT:1 + chr2R 6633285 5' - HMS-Beagle2 7159 4 58.22 GGGAGGAGGAGTGTAGAGTGATATTAACAAAGAAAATGCAGCTCGACAAATAACGAGCGTCAAATAGGTATTCCAACGGGCACAATTGTTCACATGGAAATTCTAATTCTAATTGGCGGCAGGTCCCCACACCTGGATGGCATAAC:1 - chr4 115916 5' - G5 4388 1 80.14 CAGCTAAAATCATATAAAACTTACCAAAGGTAGAGGGTTTATCTTCTGACCAAATTAATTTGCGTTTACGGGTACTTAACAACTTGGGCACCCCTCTGGAAATATCCGAGTGTATTAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGT:1 + chr3L 26019270 5' + gypsy 8 2 47.59 ATGAGGGAACCAACTGACCCAAGCGGGCCTGAAGATCTTGTCCTGATTGTTTTTACATGCCATACATACGAGTACATATGTATATGCACAGGGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 - chr2L 15906134 5' - Tabor 455 2 64.38 TTCGCATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr3L 13362739 5' + jockey 75 1 61.64 ATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACAGAACCCACCAACACTACC:1 - chr3L 17206975 5' + I-element 4965 1 54.46 GTATATTTTTGCATATATAAAATATACAGTAATTACTGATTACTTTTTTAAACAAATGTAAATTATATAAAAAGGAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr3L 11903188 5' - opus 457 2 57.53 AAAATGCAGAGAGTATTTAAATACTGAGCTCACCCAACAAACGGGAACGCGAAAATGTGAATGTGGACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATACGTTGGTCCCGTCGGC:1 + chrX 10806828 5' - P-element 2875 1 75.91 AAATACTGAGCTCACCCAACAAACGGGAACGCGAAAATGTGAATGTGGACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chrX 10806846 5' - P-element 2848 1 58.90 TAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3L 13827378 5' + roo 59 2 58.90 ACAAAAGTTTTTCGGCGCAGCGACAGGCAGATCGGGCTACTATATACATATATATATGTCTACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 - chrX 12214582 5' - opus 455 2 62.50 GCGGATCGTGGCCTTGATTGTGAGATTGCCTCTAACTGGTAGGCCACTGGTAAAGTTAGCCATCACCCTTCCGTAGATAAACGGATCCGTTCCGGCAACTCTCTAGCTGGCCGTCTAAACCGTC:1 + chr2L 8079400 5' - aurora-element 164 1 73.39 GTACATTAAGTAAAATACTATGGTTCAAAATATGGAAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTT:1 + chr3R 4532835 5' - 1360 3365 1 69.18 GTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAACATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGA:1 - chr2R 4677355 5' + invader3 61 2 57.53 TTTCACTGAGCAGCGCAGTTGCCTCAGATTTCTCCTACCCCATTTTGTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chr3R 20939151 5' + jockey 4703 1 58.00 GCTGCTTTGATTGATGGCTCCACTGATTCGACTGATAAGAAAACATATGTACCCTCGATGTGGATACGGCCCTGCCTTGCACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr3R 18697841 5' + 297 22 2 66.42 ATCTAGCAATGTTGCGAAAAATCTCTGAAAAGTATGCCACGATTTGCAAAAGAAGCCCCAAACAACAATTTAACCTCGAATAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTAATATGTTAATTGCGCTGTTAT:1 + chr2R 13193758 5' + BS 5036 1 51.37 AAATATCCTTTTTGGTTTCCGGATTAACTTAACCAACTTTTCAACAAGTATTGAACGCAGATCTCAAAGTGTGTGTCACTAAACTTTGTTATGCTATAATTATATTGATTATATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTC:1 - chr2R 9092117 5' - 412 7535 2 76.71 AAAAACTTGGCCCCAAGCTACTCTTAAATCGAACGACAAAGGAAACTGAGCTGAACTGAACTGAAACTTTTGCCTTTCGAGTTTCGAGTATTCCCAAAATTAGAAACAAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 20074697 5' - roo 399 1 78.17 ATTTCTGATTAAGATTTGCCCATTTCCCTTTACACTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chrX 12998075 5' - roo 8986 2 74.66 ACATGACAGCTACACATGCAGAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGTTATATGGGTCA:1 + chrX 21585239 5' + mariner2 266 1 66.44 GGCGATGCGCACTTTTACGTTTTTTGAACGGCAAACGATCGCAACGATCGCAGTTTTGTGACTGAAAGCGACCGATTTCTAGAGATGCGTTCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr2L 2999327 5' - P-element 2857 1 67.12 TATATATCTGAACATGTTCTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3L 19574015 5' + 297 6609 2 65.52 ATGTAGACACAATTCCATAAATTTTTACTCGGAAGACAAAGCCACAAGGTGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGGAAG:1 - chr3L 25730601 5' - Quasimodo 233 2 64.38 AACAAATGCAGAAAGAGAAAGCTCAGTGGTATCATTGGGATCCCCAAGCAGTGTTTCTTCGCATTAATCAAAGAAGTACAAATTTCAGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGTTGTTGGAG:1 + chr3L 25911968 5' + looper1 1518 1 79.45 AGAACACCGATTGTTGAGGTGGGGCGTTATCAGGGAACGTTTTGATAAGAGATACCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGT:1 + chr3R 24053646 5' + mdg1 67 2 63.01 CAAAAATAATTAATTCATTAACTTTTTTATAAAATGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTC:1 + chr2L 20556486 5' - invader3 5382 2 82.73 CCATTTTCAGTGGCACGCACATTTGCGGTTCATAATTTGCGTGCCATTTTTGTACACGTTGATGGACAAAATCAACAAACGACACGATCTGCAGATATGCAGTACGCTTGAAAACAAGAATCAGTATTGATTTTATTTAACAACAT:1 - chr2L 15131124 5' - Ivk 5379 1 56.16 ATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 + chr3L 19574046 5' + 297 6641 2 64.38 AATGCCACAAGAATGCATTCCCTTTTTCTTACTGAAAGTGGAAAATTCTAAACTTTCAAAACTTTCAATCGCGGTAAATTTAACTTTTAGGGAGTTGATATAATATTCGTTTGGAATAGAGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGT:1 + chr3R 6891336 5' - Doc3-element 431 1 34.93 AATTAGCCATAAATAATTGAGAATTTTGCAGTATTTAATTACCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 - chr3L 18556790 5' + jockey 4693 1 66.67 ATATATCTTTATGGTATTTTCTGTGGCTTATTGCTATTCAATCTTTTCAATCCTTTCACATCGAACGCAACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACAC:1 - chr2R 7889727 5' + jockey 4654 1 58.74 TATAAGATCTGGTTTTGGCCTTCTTATTCTGTAGTGAGGCTTTTACTGTTGCAGCTTTTAAGAGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGTGAACCTTG:1 - chr2L 15322990 5' + diver 249 1 69.18 GGTCGGTATATAGTCCCCATTCTCCTCCCCAAACCGAATTCGTTCTTGTTGGCTACGCCACTGGCCAAATTACACTTATGGCCATAATTCAATCAGCGTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATT:1 + chr2R 24801819 5' - I-element 4911 1 73.44 CAGAGGACAATTATCTGAGGAATGAATCGCTTTGAAGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAAT:1 + chrX 21636153 5' - Stalker2 7602 2 50.68 AAACTGAGCTGAACTGAACTGAAACTTTTGCCTTTCGAGTTTCGAGTATTCCCAAAATTAGAAACAAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGTTT:1 - chr3R 20074655 5' - roo 352 2 56.85 AAATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAAC:1 + chrX 9437204 5' + roo 8781 2 40.15 GTTTTTTATAGTGGGGCTACTTTTGTATGGGCGTTTTTTGTATTGGGAAAATCTATTTTAGACCAAGCATCATTAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACT:1 + chr3R 22771873 5' + opus 16 2 65.49 TTTAATTGTTGTATCTATAGTAGTAAATATTTATGTTTAATTTAGTTTATTTTAGTTCCAAAAAAAAGTTTAAAGTATTTTTTTGAAACATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCT:1 - chr2R 14932747 5' - Doc 4635 1 61.11 TCCACCTGTCGATATCTCTCGGCTATCGCTACCCACTCGATCCGACAGATACACGAGCCATCGAACGGTCAAACAGTCAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATACA:1 + chr3R 24511685 5' + I-element 4979 1 74.78 ACAATACGTTCGCAATTTCACACATATACGTGAGGTAATTTTAAATTGTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr3L 13366079 5' + hobo 45 1 53.42 GGTAGCTGAGGGTCGTGTGTGTTTACCTTAGCCAGTATGATGATGATTTTCCGGAATGCATATTCCCACCTTATTAAAGTCCCTTTCGATGACTTGGTTGCTCACATTGTATTGTATTACTCTAAGCCTATTGAGCTGAGTCTTAG:1 + chr2R 12613423 5' - G5A 2462 1 50.00 AGCAAACATACATATACTTTGTTCTATTGATTAGACACTGGCAAACACCGATGATTTAAAGTGTATTCGATAAAGAAATAAAGAAAAGACTGAAATATTATGTTTATCGTGAACAAGATAAACAAAAAAAGTGAAAACAATAAACA:1 + chr3L 22126970 5' + Porto1 179 1 75.34 CTTGACAATTTCTTGGCCAACATCTTTATGGAGAGTATGGCGAGATATTTATCTATGGATGGAAAATATTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chrX 5366262 5' + pogo 47 1 53.42 CATAAACAGAGGCGCGCACAAAAGTATGCTACAAAATGGCAATGGCTTACGTTGTGTGGGTGCTTAGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGT:1 - chr3R 16530668 5' - hopper 1361 1 54.11 TTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTG:1 + chr2L 20928075 5' + Chimpo 80 1 73.29 CGCGCACGATGGGCTGGAAAAGATAAATGGGCAAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAA:1 + chr2R 14940692 5' - blood 291 2 78.77 ACCTTAGCTCGTTTCATACTAAAATCCTAGAAATATAATGACAAATTGTTTGCTTAGAACCTTATCAAAGGAAATGATTAGAATACTCACGAATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 + chr2L 7939702 5' + Burdock 6162 2 63.70 GGCGCGCATGTGGGGATTGCTTATTTATGTACATAGTTGTTTGGTGCGTGGTGTTTAACTTACGTAGATATGTATTTAATTAATTGGCTTCGGCTTTTGTTGTTCCTGCTTTTGCTACCTATTTTTGTTTGTTATTCTTGTTTATT:1 - 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mdg1 7004 1 76.03 CCTCCCATTCGAGCCATAGAAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTG:1 - chr3L 18738150 5' - Bari1 1638 1 65.07 GGGGCCAAACAATTTGACAATTTAATGTGGCGACAGTCGTCAAGCTGCAGTTCCGAAACTGAAAACTCTTACTCAGTGCCGAAACAGTTAACTTCCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTCAGCCCCAAGACATCACT:1 + chr2R 15822210 5' + invader6 408 1 62.04 GTAGAGTAAAAGGATATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAAGACAGAAGGAAGTGTTTCCCTACTATATAAAGTATATATGTATATTCTTGACGAAATTTCGCTTTCGCATTCACACTAGCCGAGTAAGGGGTATCT:1 - chr3R 2473817 5' + INE-1 542 1 75.18 ATATGAATCCTTTCCAAATATTATAGTATGCCACGCGTGCATAGTTCCCAACAAGTCGAAACTTTTAATGGCAAATGGTTTCATCACGGAGGAAAATCTTAGACTGCCCAAGTCCTGGTAGGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTT:1 + chr2L 17201648 5' - baggins 5007 1 56.85 TTTGCGTATATTTTTGCATATATAAAATATACAGTAATTACTGATTACTTTTTTAAACAAATGTAAATTATATAAAAAGGAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCCTACCTCA:1 + chr3L 11903183 5' - opus 462 2 60.96 ACAAATAAGTGAAGTATAAAATATTTAAACTAGATTATCTGACAGACAGCCATTGTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTA:1 + chr2R 21425059 5' - HMS-Beagle2 7132 2 62.33 GTGTATATATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTA:1 - chr4 559328 5' + INE-1 563 1 86.30 GCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chrX 16217543 5' - P-element 2847 1 56.12 TTTGTGAATAATTTACCACATAAATTTCATTGGCCAGATACTCTCACAATTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr3R 9193150 5' + opus 49 4 62.02 TTGGCCATAAAATAGCTAGATTGTTTTCACCTGCTCTTAAAACGCTCTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGACAGG:1 + chr3R 5264838 5' + P-element 74 1 34.93 AAACTTGCGAAAAATTGTTGAATAAATAACTTAAGTTTAAATACAATATTTGTTTAATTACGTACGGGCCTACTGCTGTGCTCACTTATATTTAGATAAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:3 - chr3R 21706378 5' + I-element 22 1 69.18 AAAGCCACCGGCTGGGAAAATCTAATAAAACGAAAGAGCTTTTGACAGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chrX 17027872 5' + roo 62 2 63.70 GTGAATACGAATGCAAAATGCGATCCCTATGCTTAACTTGTTATATTTTTTAAGATATCGATTTTTCCTGCCACACAGATATTCAAAGCACTCTACACATTTAAAAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATAT:1 - chr2L 18300893 5' + Ivk 5267 1 67.81 TTTTTGTGCCCTAGAATAGCGGCATTTCAAGCGCAATTTCAAAGGTTTATGCAATTACGCCCTCTTAAATGCAATAACCAACAACCCCCTCCCCCTTTTCGAAAGTACAAATTGTTTTTATTGTGAGATGATCTTTT:1 - chr3R 30386906 5' - transib3 2437 1 67.15 ATGGCCAATATTCAGTGTGGAAATGGGCTCGATGCTTCCTGAGAAAGGTCGACTAGAAAGCAGTAAGTAATTAAAAGCTTGGTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr2R 11562941 5' - pogo 2063 1 59.59 GTTTATGTTAAATTCAGAAAAAATAGCAAAATAATGTGCGCCAAATTAGTGTCGATAAGTTGGCGGAACGGTGGAACATGGAACTTGGAAACGGTTTTTATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTGTTAGTAAGATCTAATTAT:1 + chr2L 19915506 5' - Cr1a 4287 1 65.07 GCTTTAGTATTAGATTACCATTTCTGTTCTGGGTCAATTAGTTTGTTTGGTCAACTGTTTGACACTTCGATAAGGCTCTAATATTAAGATTCTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAGCACG:1 - chr2R 16725652 5' + Tc1 1606 1 54.11 AGTTGATGCACGTCGTCTGCCCAATTGAGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 - chr3R 31681950 5' + Doc 66 1 60.27 GCAAATTGCAAAAGGCAGATGATGGGGTATGTGTGGCGTCATTATATAATCAAATCAAATAACAATTTGTACTTTGTTAAATTTCTTGTCGCCCTCGATGGCTGGCTGTCTTTGCCTCGAAAAAATATGCAAATTTCCAGTATTTT:1 - chr3R 6014081 5' - hopper2 1557 1 69.86 ACACTTTCAATTCTGATCTGAGAGGTAACTGTTAAATATAACTACTTAACCTCTAAAACAAAATATTTTTACCCTACGCCTCTGCATTTCTATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTAT:1 + chr2R 21440941 5' + Ivk 93 1 64.38 GTACGTTATGTTATGGTGTAAAATGAATTAGGGAATAGCCGGTTAAATATGTGTATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCGCTCCGCCCGCGAGACGTACACTTCCTCGGTTGCGACATATTCACG:1 + chr2R 15822000 5' - invader6 309 2 65.71 CCTGTCTTGCTTTATTTACTTTATTGAGTTCATGATTCTCGTTATAACTTTCATCGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr2R 12813679 5' - roo 344 2 60.96 ATATAGATGACATGGCTCAAATTAAGAGGAATCCTTTTGTTATTCAATGACTTACTTTACGTGTGTAATTATTAACAAACAAATGAATATGTGCTATCAACATTAATTGCCTTATTAATTGTTCACACGGC:1 - chr2L 12619401 5' - 1360 431 1 67.18 CCCCCCTTTTTTTTACCTGTCTCGCCTGTGTTTTTTCCTTATTATTTTCTTCTTTTTTTTTT:1 + chrX 6912245 5' - gypsy11 3934 1 77.42 TTCCTAATGGTGGGCAACTGTCGATAGTCGCCGATTAACACATAGCACAAAAATACTAGAACACTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGGCACTTTTTTGGTGACG:1 + chrX 4540598 5' - 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chr2L 6319809 5' - Tabor 7237 2 76.55 AACTGGAAATGATTACAGGTCTCGTTTTTTTTGTTTTTTGAAATGATGAATGGTACGCAAAGGCTCCCAAAATGTTTATTCCTTTGAGTTTCGGAACATTTTGTTTTCCAATGAATTTTGGAATTTGTATAATTAAAAATCAGAAA:1 - chr2L 19157780 5' + invader2 4736 1 73.29 TAATCAAACCTGAAGCGCAACTATGCCACATGGACACGGACGCAGCTGCAACACAGGCCACAGTCTGTGAGGTTTATTTAATGTATTTGTGATTATAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr2R 9455964 5' + 412 23 2 67.12 AATAAAAATGGAAAGTTGGCATAAAAAGTAAACAGCAGTCTGTTCGAGGGGAAGTGGCGCTGAAGGTAATTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCG:1 + chr3L 20879597 5' + 1360 100 1 51.88 AACGACTTTTCTTACTATGTTCCTTATTTCGAAATATCAAGTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr2L 5447960 5' + roo 81 2 73.97 AATATAGTATTGATTGGCAAAATGTTCTTGTAAGCATAAAGATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAACAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chr3R 29622671 5' - pogo 2036 1 68.89 CTATGCCACATGGACACGGACGCAGCTGCAACACAGGCCACAGTCCGTGAGGTTTATTTAATATATTTGTGATTATAAATATTGTAGTATGTGCCTCTGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr2R 9455944 5' + 412 34 2 59.85 GCAAAACGAATAAAAAATAAATAAAACCGCCAGCGAAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chrX 11661316 5' + 297 7 2 80.14 TAAGCTACGAGCAGGAGACGTCCATTGAAAAATTTTCTGTTGCCTATCTCGAGGGGCATCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGTCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAA:1 - chr2R 16255889 5' - pogo 279 1 60.27 AAATAACTTAATTTGCAAACTCACTTGTATAATGTCGTTAAAGTGCGTGTGCTAATGTGTAGCCATTAACTATATCGTTGTTTTTTCATCTGATTGTCACAAATGACCAAATTAATTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3L 8815906 5' - roo 8992 2 77.40 GATACCCTTGTTCCCCAATTCCAGAACATCGACAGAGCGACCTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGCCATGAGAATCGC:1 + chr2L 8396856 5' - roo 329 2 69.86 AGAGGCGCGCACAAAAGTATGCTACAAAATGGCAATGGCTTACGTTGTGTGGGTGCTTAGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATA:1 - chr3R 16530661 5' - hopper 1354 1 58.90 CATTGGTGGAAAAGGCACTGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGAT:1 + chr2L 13717328 5' - P-element 2784 1 11.64 ACATATGTTAAATTGAACAAAACTCTAGACTGCCAATAATTCACGCTACAAAACCCCGAAAGTTTATGCGAACATAAGTTTCATAAAACGGATGTAATTATTTATTAACAACACCCAAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAA:1 + chr3R 9228665 5' - hobo 239 1 76.03 GCAAATATACACTTGCGTTTAAAATACTAGGAATGGTAAAAAAAATATATATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCTCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAA:1 + chr3R 28659024 5' + Burdock 6202 2 67.12 CCAATTAATTTCATTAATTAATATCAATTTGAGAGCGTACAAAAGAATTGTGCAAATAACGACGTAAGTGTACGCAGCAATATGGCTGGGAATTTATGTATTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAA:1 + chr3L 19335296 5' + invader4 2768 2 78.03 TCATCAATTCAAATGTCATTTTGGTAAAATATTGCCTCTAAGTAACGGCAATATTTTGATGAATTGGCATATTATGACCCTCAGTCAATTTAGTGAGCATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chr3R 28659163 5' - Burdock 233 2 62.33 CTGCTACTCACATTTGCATATCAATTTGTTCGCATTCGTTCGTGTTATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCA:1 - chr3R 25409874 5' + jockey 4595 1 67.14 GGCCAGCGAAAGGAACAGAAAACACACACTGACGGCGGCAGGGAAATAAAATAATAGCGAATAACAAATGAAACAAAAATAAAAATCACTTGATATAATATATGAAAGACATCGCTTTACACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCA:1 - 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Burdock 179 2 79.26 ACTGTGCTGCCAGAGTTGCCACCGCAAACTCACTCACTCACTCAATCATCAATTGTGCTCTGACGTAGCTCATAGGTTTGTATTGACCTCACCCACATTACTCTATTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 - chr3L 18034703 5' - Transpac 5217 2 77.40 GGAGTGAAGCGGTTCGAATTTATGGCATATCTCTGGGCCGCAGCATATTAAACTAGCCGCTTATTTATGGATATCGTCTCCCTAACCTGGTTTAGACCTAGAATGTCTTAGTTTTAAAATTCATT:1 + chr2R 22287400 5' + jockey 4801 1 60.00 TGTGGAGACAGCCCGAGAGAGAGAGGGATGGCCATGTAAATGGGAATGTGGATGTGAACGTACCCACCATGGCGGCACCGGAAAATGTCCAAGTCAGGGTCCATTGAAGCGGAGCAATATGTGTAATAAAACAATATATGCCACCA:1 - chr3R 22624837 5' - blood 374 2 80.14 CGAAATGGAATTAGGCAAATCTGCTTGTCGACTGAATGGGTATGGTTTTGGTTAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCT:1 - chr2L 1277899 5' - I-element 5290 1 60.96 TAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTAC:1 + chr3R 19450195 5' + roo 8796 2 51.37 AAAGCTAATTTCGTATGCATTTTGAAAGCAATTAAATATGAATTTTACATGAGCGTGCAAAGCCAACAAAAAAATACGTATCTACATATATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACT:1 - chr3L 15859735 5' - I-element 5325 1 65.07 ACAGTTGCTTACTGCGGCTTCGTGGGCGGACGGCTGTGCGGCTAAGTGGAAATTAGAAAGGGGGTGGCAACATGGGTCAACATTGCGCCCACATGCACTGCGTCTGTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCT:1 + chr3R 5683699 5' - INE-1 168 1 65.07 ACATGGTACAAATTGGTTTTTATTGAAAGTGATATTTACTTGTGCCTACTTTTCTTAAGGTACTTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 + chr3L 20083762 5' - opus 452 2 54.79 AATCTAAAAATATAATTTGCTTGATTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 - chr3R 20683399 5' + P-element 48 1 52.74 AAGTCTTCTAACACCTGTCAGCCATTTTACAAGGTGTTTCCACTTAATACATCGACACACGCACACATACGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr2L 12847312 5' + 412 43 2 52.17 TATCTCTGTGTTGTTATTAGTTACGGATATATGTCCAAATTGTTGTGCCAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTGGAGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTA:1 - chr2L 11613299 5' + hobo 70 1 62.94 GAAGATATTTGAAAATCAAAGCGAAAGTTCTCAGCTTTTGTCTGTCCGCAGGACTCATCCTTCCACGGCAAACTTTGCTTAGCTACATCTATCTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGCACTCACCAG:1 + chrX 12214427 5' + opus 22 2 67.81 TTCACACAGCGTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chrX 6484700 5' + jockey 59 1 54.11 TTTGTCGCTAACTGGCTGCGAGCAGCCCAATCCCAAGTTACCGAGCCAAACCTATAGACTCCGGTGCCATTTGCAAGGCAGGAAAAACTTTGAATTTGCTCTCTTTTTTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAAACCAA:1 + chr2L 15129591 5' + G5 4809 1 73.97 TCTCCCGCGCGTTAAGCACGGACACAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chrX 7967233 5' + P-element 64 1 25.66 GCACCATCGGTTGCTCTTGCTTTTCGGTCCTCGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGAGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAA:1 - chr3L 25995870 5' + Stalker 92 4 78.77 AAATAAGGGAAATAAGAAATTTGTAAGTAAGTAACGATCAATGAGAACTTCTGTATAACAAATATATTGTAAATGGAAATGTAAAAAATTATGCACTATCCAGGCGGCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chr2L 4378880 5' + 412 13 2 64.38 GGAAAAAGGGGTGCCAATCTCTCTTTTGGAAACGCATATTTTATTGTCAAAATCAATAGATGTCAGCGTTTAACAGCTGCCAGCGGCAAAATACAACCCCTGATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 17028005 5' - roo 9055 2 78.08 CATTTTCCGGGCTGCCCCTTTCATCATTCGCTTGTTTTTTATCGGAACACTTCATACTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr3R 21587513 5' + roo 8728 2 62.33 ATTGTTAACGTTGATTGTTATAGTGAGTATATACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr3R 2503525 5' - roo 337 2 75.97 ATGATTTCTTTTAATTTCTTATACGGTTATAGATATGTTCATTTGCACCCCATAATATATACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 + chrX 19005304 5' + F-element 12 1 67.81 TTGGGAAAAACTATCGCTTAAAATTGATCAACGATCAATGGCAATACGGCGCGTCGTGCATTTAATAACTATAAGGAATTTTCCGAAATAACAGGCGATGACATCCAGCACATTTTTTAATATGAGGACAATATTAATA:1 - 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chr3L 20224262 5' + Chimpo 35 1 62.33 CATGCAAATTAATTGAGTGTGTGCAAGTGCATTGCACTCGTTCACCCCTTTTGTGTGCTCTTCGAAATACACGATGTTCAGTGCGTTTAACGAACTTTTTGAATTCATGGAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTC:1 + chr3R 31603154 5' - gypsy 7038 2 73.29 CCATTCAAATATTTATTGATCGACAGGCTTGGCGGAATATTCGGCGCATGGTGTGTATCGTAGACTTCCCCCAAAAGACTTTAATCAAATATATATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTT:1 + chr2L 5710867 5' - HMS-Beagle 236 2 75.37 TATATTAATAATAAAATTCAGATATTATATATTTGTAACCAAACAAAAACGGCCAGAACTAGAAAAACCAAATAATGAGGTAATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTGTATG:1 + chrY 385933 5' - Ivk 4924 1 56.85 AATGGTAGCCATTTTTATTGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGGTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr2R 22012249 5' - opus 471 2 59.35 CGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACGCTGACGAAG:1 + chr3L 25232770 5' - accord2 7559 2 65.47 GACGCTAAGTGCATTCTTATTTACCACAAGCCCAAAAGCATGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 - chr3L 2185007 5' + jockey 19 1 74.81 TTACCAAAGAAAGCTTGTATGAGTTCGCTAAGACGCCATTTGGGTTCTGCAGTTCTCCTGCGGCATTTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCTTAAAGCCCATACATAGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3R 2422749 5' - 1360 3386 2 46.58 GAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGAATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 + chrX 2518041 5' - P-element 2806 1 30.14 TGTCATTTCTCTTGTTTCGTAACGTTGATTTCATTTTATTGTTGCCCGTTTGCCACTCCAACTTCACCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTG:1 - chr2R 20447906 5' - hopper2 1563 1 51.08 ACAATTACAGCATAAAAAAAGTTACAAGCTAGAAATTTAGCTGCTTGCTGTACTTTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTGATATACA:1 + chr3L 14944496 5' + G5 4749 1 76.03 AAAAAAGAGGCCAAGTTATAACGCTTTACTTTTTAGACCCTTGCAGAAGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGA:1 + chr3R 5477956 5' - 297 6905 2 67.12 TCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 + chr2L 9319106 5' + jockey 92 1 73.29 ATTCTTTTTTTAATACACATATATTTCAGGAAGAATTATGCAATTGATTATTACCTTTTCACACCCGTTACTAGTAGAGTAAAGGGGTATACTAGAATAGAAGTGTTTCCGACCATTAAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCA:1 - chr3R 18215275 5' + INE-1 81 1 85.62 AATATTTAACTAAAAAGCTGAAATCACTGATTAAGCATTAAATAGCTTGTGTAAAGTCCAATCTATATATAAACATTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3R 8596323 5' + hobo 43 1 56.16 AACTTTCACCGTTTTCTTTGTGATTTCAATGGAAGTGTATGCTTAATCTCAACCTTATAGCTTTTATAGTTCCTGAGAACTCGACGTTCATACGGACAGACGGACAGGGCCAAATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATAT:1 + chrX 22600651 5' - INE-1 84 1 76.71 CTCGCAAACCGGACGCCGAACTGAAATTCAAACGCAAGGATATCAACTCCAAGGAAAGGGGGAACCAGCCAAAGTGCAAGGAAGAGGAGAAAAAAGACCCTTTTAGAAATTACAAG:1 + chr3R 11620959 5' + Ivk 267 1 76.72 ACGTGCGCCCTAAACTATGCAACACTTTGTGGGTCGTAATAATCTTTTGGCCAACTTCATTGCCATGGCATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGGCAA:1 + chr2L 20938000 5' + jockey 4722 1 50.68 CTACGCAATGAATGGCCTCTGATGGATCTTCAAACCTATGCTCTTACAATTCGTATGATTACATATGAGAATTTTTTCGTAAGTTTTTATGGATACAAAGCATTTAAAATATAAAATGGAGCATTAACAATTTGTCCTAATTTTTT:1 - chr3L 1263526 5' - G4 3501 1 60.27 ACCACCCAGATGAAGGAAAGGCAGCGGATCCCATGAAGACAATCGATGACGTTGGGATTCGCCGTGGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCC:1 + chrX 19588986 5' - Transpac 208 2 56.85 TAGCGCGCAATAGCTTTCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTAT:1 - chr2R 16073020 5' + Burdock 6196 2 63.70 CACCGGCAGCAGTCGTCGTCGCTTGTCTGCGAGCGTCTCAATTCACTGCACATTTTGCAATTATCAATCGCATTTTTTGAATAATTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chr3L 17108663 5' + hobo 24 1 61.76 ACTAAACTAAAATTGGAAACGGGAGCACTTGGGTTATGTTGAGAAATGAATGTCAAGCCAGGGGATATTTCAATTTCGTTGGAGAAATGTAAAGTATTTTCTGTTTGGAAATACATATAAAGAAATTTCGTAAATATTATTTTTAA:1 + chr2L 9777946 5' - blood 6915 1 47.95 ACTCCAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGA:1 + chrX 12003947 5' - P-element 2793 1 22.60 CAACAACCAATAGAACTTAGATGCTAGCTAAGCATTTCGCAATTTGAGCAAAACCAGTTCCCACAAAGGAAATGCTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCATTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAATTTATTT:1 + chr3R 10361833 5' - roo 9032 1 56.43 ATTAGTTAATTGACAAAGCTCTTGGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:3 - chr3R 24976311 5' + roo 55 2 56.16 AGTGCTGATCGCAGACCAGCCATCGTTTTTATACCCGTTACTCATAGAGTGAAAGTGTTTCACTGGCAGGAGGGAGCGTTTCCGACCATATAAATAATATAAATTCTTGATCAGGAACAATAGCC:1 + chr3R 31045678 5' + INE-1 87 1 79.20 AATAGTTTTTTTTTAACGGTCTTCATGTTTTGATGTTAAAAAAGTCATTATCATTAACGCTTTAGTAAATAAAGGAGATATCAAAGTATTGCGGTACAGTTTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCC:1 + chr3R 22541266 5' + roo 8829 2 69.18 GGCTAAAAAGTTTTCTATTTGGATTTTGCAAGCGAAATGAGTGTGAGGCGTTTGTAGATTGCATAATTATGCTAATTTTGTTGTTTATCCACCCGCCAAGTGTAAAAGGGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr2R 16496721 5' + hopper 8 2 77.40 GCAGCGGCTGGACTTGAGTTTATCCATGGTTGTTATGTTATTATTCCTTATGTTTATTGATCACTGATCTTTGATTTTGTATTTAATAACGA:1 + chr2L 15425404 5' + springer 7293 2 86.96 ACAGCTTTATACCCAGCTCCAACTATGTGGTCATCGATGCCAAGATGTCCGTGCTGCAGCGGCTCCAGCAGGGACGCGAGGACGGCTCCGATTTTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATATGGCTGTCG:1 - chrX 9206818 5' - X-element 4268 1 68.99 GCCGGACTTTCAGACTGGCAGTGGTCGCAGTGCCCAATGCGCGGGACTACTTGCTTCTGCTTTCCGGCCACACAACTAAATAATTTAGCTGCACAAAGGCAGGGATTGGTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGAT:1 + chr3R 28275110 5' - F-element 4571 1 71.92 GCCGTCATCATCGTCAATGGTCGCAAGGGACGTACTGTTCGCCATGACGACGTCTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 - chrX 6407324 5' + jockey 4733 1 62.41 ATTTAATTATAAATTAATGAGCTGTGCAAATTTTTAAAAATAGACGATATAACGTCTACAGCACACCACCACCAGACTGTTTGAACAGTAGAAAGAAGCCATATAACCTTCAACGAAAATATCAGTTATCATAAGTAAGGTCAATA:1 - chr3L 3001951 5' + gypsy9 5015 2 29.45 CGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCTCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGAA:1 + chr2R 4260424 5' + micropia 5216 1 47.95 ATTTAAAAATTCATATAACCTCTACATTTCCTCGTATTCAATTGAACCATTTTGTTTTTGAAAAAAGCAGCAAGTAATGAATTTTTAATGTGTGAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 31650452 5' + pogo 20 1 71.92 GGTGGACGAATTAAATTTAAAGGAAAGTGAAAGCTTGGTTGAGCTGGGAAAACATTTAATATTATCTTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAT:1 - chr3L 13156842 5' + transib2 22 1 69.86 AAGTGATGTGACCAAGGCCATATAAAAAGCAAACGTTTATTTAATAGTATGTACAATATTATATATAATAATATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - 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chrX 16361579 5' + Tc1 154 1 48.63 TTCGCCCGCTCTTTTCCAGGTTTTCCTTTTCGCGGAGCGTGTGACAGGGTTCGGTAATTAACATCATGAAGGGCTTTAGATGGATGTGCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr3L 6675422 5' + 412 7086 2 63.01 GAAAATTAAAAAATAAAAACCGTAAGTGGCATGCACGATTCATAATGCCCCTGTGGTATAATGCCTATGTTGTACTCAATCAAAAACTTCCGTGTGCTCTTTAGTCCTTGCACGCTCACCGAGATTGCCAGTCCAGGTATGACTTC:1 + chr3R 16571383 5' - Rt1b 4978 1 76.03 CGTAGGAAGGAAAAAAGGAAAAGATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr3R 6412097 5' + Tirant 27 2 68.49 ATTGGCACATATCTGAGGTTTTTTTTCATATTTTTTCACTCCACTTTTAACGTGGCATGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGT:1 + chrX 9960018 5' - I-element 4922 1 64.14 TTTTACTCGGGTCTAGCTTTCGAATCAAATCGCAGAATCCCATATCTTCAACAATAGAAAAGGGTTGGACATCTAGCGCGATCATACGCTGTCGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTCATGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 - chr2R 6492948 5' - copia 255 1 61.38 AAGGCAGGAAAGGAGCAGGAAGGATATATACAAGCCACTAACACACACGCACTTTACCCATAAAAGCAAATACAGCTGGCGCCATTTTGAAAGTGATTTTACAAAACACACACACACACATATATA:1 - chr3R 17256792 5' + accord 7030 4 66.67 CTCTCACTCTCCTCCTGCCTGCGCCGAGAGAGCCAGTGCCCTCTCTCTTGCGCTCTCACTTCTCTGTGTGATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chrX 16526255 5' - P-element 2837 1 51.39 TAGTCAAGAAAATATAAGATTATTCTCAATAATTGATATTAATAAGTGCAATTCCCATCAATAGAAATGAAAAATGGTCTGTCGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3L 18792536 5' + roo 37 2 58.90 AAGTCGCTGATGTGGAGAAAGTGGGACGAAGTGGAACATACATCTTCTACCCCCAGCGGGAGTTTCCTGCTTATAAGGAAGTAGGTGCCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 + chr2R 14722632 5' - mdg1 393 2 65.75 ACGCCAACCTCCGTACACAGTGTATATTTTCGACATTCAACAAATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATAGTGATCCATCACACA:1 + chr3R 5868190 5' + jockey 71 1 62.60 TTTTTAAACTTTCAGCGCTAGTATTTGTTGACCTTATCATAATTCAGTTTACAATTATCTTTGTATTATTTAGTTCTGAACTGACAGCCGAAATAAAGTGACGTTATCGTAAAACAACTGCCGTGAATATCAAGTCGGAGCTACGA:1 + chr2L 20026419 5' + Chouto 186 1 60.96 AAGCTCTTCGAAAAACAGATGATGAGGAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chr3R 4662024 5' + roo 64 2 62.33 TTCGCGAAGAATGTTTGAAATAAAAAATTATTGCAGATATCTATGACAGTAGAATCCAATTTTTATTTCTTCCCGTGTGGGACTCCTTCTGTGGTGTTGGTCACCACAGAGCACGGGGCTTACTAAAGTCACTAGAGGAAGAAAAA:1 + chr3R 7612064 5' + baggins 4989 1 58.90 ATTATGTGAAAGTGAGAGGAAGGTAACACAGGTCCTGAATGGACGGGTTTAATTAATTTTTGTAAATGAGTTTCCAATTCAAAGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATAT:1 + chr3L 18658179 5' + roo 8701 2 60.27 CACAAGCCCAAAAGCATGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3L 2184983 5' + jockey 35 1 60.63 GTCCAAATAAAGACGGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATT:1 - chr2R 2879478 5' - Stalker4 7046 4 52.05 AACACCCTCATAACTGGTAATGCAATTTTCAAGGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATC:1 + chr2L 12832872 5' + I-element 85 1 75.35 TGAAATATACTTCGATGATGACCGCCAGTATGTAAATCACATTACTTTAGACTTTCCAGGTATTTGGATAATAAAGTGGTAGCCGGTAAGAACGCAAAATCAATTTCATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 - chr3L 22709475 5' - 412 479 2 74.66 TTTAATAGCCAAATAGCCAGCTTTTGACGGGGATTCATTCGGGAAAGGCTGTTCAATTTTGAATAATTTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr2R 22464475 5' + pogo 51 1 55.48 ACTGTCAACACTTTGAACTGTTGCACCCGAGCTCCCATTTCCCTGGGTGCCTCCCATTCGAGCCATAGAAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGC:1 - chr3L 18738199 5' - Bari1 1687 1 73.29 CACAAGTGATACATGGGTTCATGGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2L 18213108 5' - roo 9018 2 54.11 GTGTTTGGGCTGCCAGCTAAATGAGCAACACGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGG:1 + chrX 18264047 5' - TART-B 151 2 73.68 TCATGTTTTTCGTAGATTTTCCTAATGGTTTGACATACTACAGTGAGCTTAAAATACCATTATTAAAGATAAGTAAAATCAAGCTATCCAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr2R 9091911 5' + 412 7085 2 63.70 AAGCGATAATAGCGCAGCCAATGAAATATTTATGCATTTCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAACGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chr2R 10600092 5' + 297 45 2 60.74 TTGTAGAAGATTTAATTTTAAACTTTAGGCATCTGTTAAGATTAGTTATAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 + chr3R 8914259 5' + pogo 67 1 66.44 CTATACACTACTCTACACAGACAGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGACGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTTACATCCTGCTCATCGAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCC:1 + chrX 19820604 5' + Rt1b 4982 1 59.26 GTACTTTCCTTATAAAGTTGTAACCCTTTAAGCCGTGGGCGACCAACCAACTTGTTGATTCAAAGACTACGCAGCAAGCCAGAAGATATTCACTTATGAAAATTGAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGAT:1 - chrX 5061664 5' - 17.6 385 2 67.81 GTTTTATGTTCTTTGATCGAAAAGGAAATAATCTCATCTGCATGTGGAACAAATAAACGATGAATGGATATGAACAATAAGAAGAATTAATACCACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chrX 19959934 5' + roo 19 2 70.50 CTCACAAGTATGCTACAATTTATTGCAACTTTTATTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTATTTA:1 + chr3L 15853518 5' - jockey 4909 1 76.71 AAGGAAAAAAGGAAAAGATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr3R 6412091 5' + Tirant 12 2 75.20 AACTCAATAGAATTACGAGCTAACCCACACCACTTTCACCCATCATCGATTGCCTTTCATCTCGCTTTATTCTCGTATTTTCCCATTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chrX 3308139 5' + hopper 140 1 67.96 ACGGCAATTCGTGTTGACAAGTGCAAACATTAATTAGCCGATCGATCTATCAGGTGAATGATATTGAGCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATA:1 - chr2R 15822115 5' + invader6 30 2 50.00 TGCTCACTTGTGTAATGTATCGAATTCGAGGCGAACTGCGCAGCTGAAGCTTCGATGATTGATGATGCCGATTTAGGGATGTTTGTTTTGCTCCAAAAAAGTCGTGGTTTCTCTGAGTTCCTTACCTT:1 - chr2L 5899183 5' - roo 476 1 81.25 GACCTACAATGACCATCGATCGGTGGGGATTACTGCAAACTTAATAAGTTAAGTTGAATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAGAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 - chr2L 13690084 5' + Doc 70 1 61.38 GGCATTGTCGAACATCAGCCAAACGTCGTCCACATATTCCCAGGGATCACTGTACTTTCCATTCTGGATGTTGGTGCGTATAGTGCCCAGGTCCATGGGCTTCTTAAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTT:1 + chrX 9676805 5' - Stalker2 7607 2 76.98 TCATCTGAAACCCGACGCTAAGTGCATTCTTATTTACCACAAGCCCAAAAGCATGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCTAGTGG:1 - chr3L 2185020 5' + jockey 15 1 79.17 GTTATTTAAAAGATTGAAAACATCATGAAAAACAATTAGGGAAAAGCGTGCCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTT:1 - chr3L 20083874 5' + opus 7114 3 73.75 CAGCGAAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:2 + chrX 11661346 5' + 297 6618 2 59.59 AGCTCTATATACATTCTTGATTTTACTTTAACGGCAACATGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCT:1 - chr3R 12725780 5' + I-element 468 1 78.08 TATAATCAAGTGCAAACTATTTCTGTCATGTTAGTTAGTTTAGTTTCTAAATTGGTTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGA:1 - chr2R 21425160 5' + HMS-Beagle2 6943 2 60.27 GTAGCAACACCAGCAACAATAGCACCAGCACCGCCACAAACATGGAAACAGCACAAACTGGAGCTGCACTGAAAGAATGAGAGTCCCGACTTGGTTAGTCGGCTTAACTTCTCTGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATAC:1 + chr3R 28591226 5' + Cr1a 4118 1 50.34 TCTCTCATCGGATGGGTTCTCGCATTACACGCGGTTGGCTTTTCCCCTCGACTATTTTCCAGCTTTTCTTGTGGTTTGGCAATTTTGTTAAAGATACAAATACCGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTC:1 + chr3L 1402953 5' + Tc1 396 1 70.50 TCGCATCGGTCTTCGCTGGGCATCACACCGTAAAACCTTCCGGGTCCCAAAAAAAAAATCAAAAGAATTAAGTATTTATTTATTTATTTATTATTATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAATT:1 - chr3R 25761565 5' - I-element 5324 1 56.59 AATACCTTTTCAGTTAACACCATAAGCTTTCTTAGTTATGAAGTCCAGTTTTCCTGTTAGTTTAGTAAGGGATATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTTGGCGCTCAGTTGCAGTACT:1 - chr3R 20241539 5' + accord2 173 2 60.83 CAAGGTGTTTCCACTTAATACATCGACACACGCACACATACGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr2L 12847283 5' + 412 48 2 65.79 GTTAGAGAAACTGGGTTATTTTCCGTTTGGGCGCCAATTAACATACGACTGGTTATTTTTTTAAAGTGTCTTTATTTATTTATTTATGATTCCTGTGCAACTACTCGCAATTACTTGGAATGAGCATCAGATGGTAGCTGAAGCTG:1 - chr3L 24870830 5' - G3 290 1 58.22 CCACCGACCACCTCGCCACCAACCGGTCAGTCAATAGCCAAACAAGCAGACGTGTCATGTNNNNACACCCTCTCGATCTTCGACAACA:1 + chrX 903188 5' + G6 1889 1 76.14 AGTAAGTAGAAATAATTTGTTAATGTTTTGGGAAAAACAATAAAATATACACAAAAAGACATTTAAACTTCTTATTCACTGGGACAGTTTACACATTATTAAGTTCATTTCTATGCAAAGAAATTGAATAGTTGTGATGCCTCACT:1 - chr2R 13212369 5' - diver 224 1 78.77 CCCGAGAGAGAGAGGGATGGCCATGTAAATGGGAATGTGGATGTGAACGTACCCACCATGGCGGCACCGGAAAATGTCCAAGTCAGTGTCCATTGAAGCGGAGCAATATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr3R 22624826 5' - blood 363 2 73.97 TGCTGGCTTTATTCCAATTCTGGTTAAAAGAATCTTAAGCAGTCCTTTTGTAGAGTGGCAAGCACTTTATTTGAATTCTCTGTCATCCACTTAACATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 - chr3L 18972960 5' + mdg1 28 2 65.07 GACAGGGAAATCTAATGGAATAAATAAGTGGCAATCGTGAGCGGTCTTCAAGCAGTTTGCTATAAATGATTACCTAACGTAAGCACACCTCGAAAATATGTATTATGTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 + chr3R 17467040 5' + I-element 11 1 75.34 GCGCTTGCTGGAAGATGGGAAGATGGCAAATGGGTGGTGGTCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTC:1 + chr2R 20447813 5' + hopper 79 1 68.49 GAGTGCTCCATCACTTCCATCCACCATTCCTTACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGCTATC:1 + chrX 14346438 5' + roo 8751 2 77.40 GGGCGTCGAGGGCGTTGGACTGAATGCAGTGCCCATCAGACCCGCCGTGGTGAGATCCAAATTTGAATATGCATCCGGGTAGGAAGGGGGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGT:1 - chr3R 11730230 5' - F-element 4422 1 68.70 GGACAAAACCATACCATAAAAAACTGGTAACCAACTTGAACACATTTTATGAATACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATG:1 - chrX 21581437 5' + Tabor 6901 2 60.43 GGTCTTTGAAATCTCTCAAAAGGGGTCAATGGAACATGGTACAAATTGGTTTTTATTGAAAGTGATATTTACTTGTGCCTACTTTTCTTAAGGTACTTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGTATCAGGG:1 + chr3L 20083729 5' - opus 490 2 76.60 TTTCCATTTGGCTTAGTGCAAGTATTTGACTGTGCACCTGTGTGGGTGCCTCTGTGTGTGTGTGGGTGTTGTT:1 + chrX 10279954 5' - gypsy3 422 1 68.49 CACACAGCAATTTTCGCGTCGTTGAGCGAGGGAATCTAATTTATATATGAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 + chr3R 23668433 5' - pogo 2046 1 64.62 TGCCATTTGGCTCTTTTGTTCAAAATTAAGCGCATTAGAATTGGTTCGTTGCGAAGGTGGGATTTTGGCAGCCAAAGACAAGGAACGCACTTTCAGCCCCAAGTGCAGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2R 16510381 5' - roo 396 1 71.23 CGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGTACTGTGTACTGTATACTGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chrX 16217539 5' - P-element 2857 1 58.40 AAAAACTTGCGAAAAATTGTTGAATAAATAACTTAAGTTTAAATACAATATTTGTTTAATTACGTACGGGCCTACTGCTGTGCTCACTTATATTTAGATAAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 - chr3R 21706380 5' + I-element 20 1 70.55 GCAGCAGGGACTAACTACGGTTGGTCAAGAGGATGGCGACTAAGCACAAAAGGGGGCCTCGAGCAGTTTCTCGTCGTCGACTCTGGGCCACATGACGTATGCGCAATATGCCATCAGCCCGTGTATATATGTATATATGTATATAT:1 + chr3R 11838795 5' + G3 4505 1 81.51 ATAAATCGTAAGGACGCTGTTTTCTGAGTTCGATTTCAGTTCGGATAGTACTAGTTAATCTGTCATCCTTAAATTGCCCACTTAAGGCTGATCATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr2R 5269102 5' - pogo 2076 1 69.18 CTTCCATTTTAAAAGGACACTCTTGTTATCGTAATCATCGATAACTGGCTGGCTGGGAGGACTTGGAGGATCGTATGGATTTCTTGCCACGATCAGCATCAATAGCCTAGACGAACTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr4 748766 5' + 1360 5 2 63.70 ACTGTGTTCAAATTTGAAGTACAAGATTTCTAAAATTCTTAAAATTAGCTAAAGTTGTAAAATGGCGGTGAAACGAGCAAAACAAAACGGTCCAAAAGTCTAAGACTAAACTATTTTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTAT:1 - chr3R 5316686 5' - Juan 4208 1 76.71 ACTGCCATATGTGGCAATATAGGCCAGACGTTGTGGGCCGACCAAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3R 18517948 5' + roo 74 2 69.18 ACATAGTTGTGTGTGGCAAGCGAGGTGGAAACTATTATGCGGGGATAACATAATTATTGGATACAATAGAATTGTGTTGGAGTAATAATATATGCTTATACAATTGCAATAACTATAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGCCCGT:1 + chr2L 19332748 5' - gypsy4 6746 2 78.08 AGTAAGGGGTATCTAATAGTCGGTGAACTTGACTATTGCATTCTCTCTTCTTTTGATCAGGATTACCTTTCAAGCTAGAAAATGTCGCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGA:1 - chrX 19278515 5' - diver 188 2 57.53 GGAAGGCAATTACAATTTCTCTAATTTCTCTAAATAAACAAAAGTCAAATAAAGTATTTAGTTCATAAGTATTTTTGTTAGTTTAAAATTTGAAAAGTATCCCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGT:1 - chr3R 6255892 5' + S-element 1701 1 77.40 GGGGAAATGTCGCTTGTGACGAATTTCTATTTGATTTATGCACTCCCTTTGCAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chr2R 21029453 5' - Transpac 5163 2 64.38 GCAGTCTAGTGCACTGCATCGAGGATGAGGACTCCTGTGTGGCAGTCGGGAGGAGCTCCATATACTGCCATATGTGGCAATATAGGCCAGACGTTGTGGGCCGACCAAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3R 18517885 5' + roo 8675 2 78.77 GCTGGTTGTTGCATGGCAGCGGCGCAGTCCTTTGAAATCACATAATAATGTGCAGCGCCCGCTGTCAGCTGGTGTTTTTATTGCAGATTATGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr2L 20986478 5' + roo 28 2 66.21 ACATAAAATACGACGAAACGTTAAACATTTTCCATACTCCAATTATAGAAGCAAAATGTTTATAGTACATAGCACACGCTTGCTTGAAATTCATGTAAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chrX 3578050 5' - hobo 2915 1 65.07 ATAGCAGGTATACCCCAGGCACCCTCTCCAACTCACTCGCCCCTTCTGTCAACCGCACCTTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGGCA:1 + chr3R 31675451 5' + Doc 354 1 58.25 GGACAGACGGACATGTCTATATCGACTCGGCTATTATTGAGCAGCTTCTTTAGAGCAAAAGTACAGACAATATTCCTTGCTTAGTCTACCCTACGCGACAATGCATTGCGCCACCCAGACATGAGCGGCAAGCCGACTCAGCATTC:1 + chr2R 5879016 5' - gtwin 162 4 69.18 AATTCCGAAAAAATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chr3R 10636207 5' + blood 7062 2 51.72 AAGACCCATGGCATGTTGTCAATCCTTTGTTTTTCTGTGAAGCTGTGTGGTCTCTTGATGGTTGGATTTCATGGTAGATGTCAGATAAGTCAGATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3L 16463629 5' - roo 9046 1 65.75 ATACATGGGTTCATGGCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAGGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2L 18213116 5' - roo 9010 2 58.22 CATTAAGTAAAATACTATGGTTCAAAATATGGAAATACATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr3R 4532838 5' - 1360 3362 1 67.12 GTACATCCTTAGTTTCTGCCGACATCAATCGGTATTTGGGTGATTACGGCCAGTGTGTGTTGTCCAATACCACCATTTATTTGCTTACTTTTGCACATGTTACGATCGTTAATACGCTGTCATAAATTATAGTAAATTATGGAAAA:1 + chr2R 20808693 5' + transib2 257 1 50.68 TGGATAAACTGATAATCCCTTTTATCTCTGTGTTGTTATTAGTTACGGATATATGTCCAAATTGTTGTGCCAGACAGAGAACTGCACGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1 - chr2L 11613321 5' + hobo 44 1 52.52 AGAAAGGCAAGAATTGTTAAGGCAATTTCGGAATACATTAAAAGGGGCGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGGCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATT:1 - chr3R 26244710 5' - copia 185 2 64.08 ATTTGAAAACACAAAGCCGAAAATCTGCTTTGCAAGCTCAAAGGCATTGGCCATTTCCTGTTTGTATGGAGCAAGCCAAGCAAATCCAAGCTTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 20074517 5' + roo 29 2 65.75 TAGGGTGAGTTTGAAAGAGGGCAGACATGGAAAATAACACAAAATGCGAATGTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAG:1 + chr3R 29091293 5' - rover 279 2 64.38 GAGTATTTACTTTGTGGTGAATCCCATTTGATTTGGTAATAAAACTACATCGAATTTTGAAGGGCGTGAACGAATAGCATGTAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr2R 21029332 5' + Transpac 37 2 57.53 TAATTTAGATTCTACTAGTGACAGCCTTAGATTACACTGAACTTAACTAGTTGATGAAATATGCGTACAGAATTGCAGTATTTTAATACTAATTAAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr3R 32032145 5' + 297 6603 2 71.23 GCCTCAGCGCATTCGCAATCCGAGTTCAAATCCATAGCATACTTTTGCGGGCGGCATGTTTAATTTATGGCCGTTTTTAAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 + chrX 19818405 5' - jockey 4943 1 51.37 AACAAATAAAACAAAACAATAATAACAATAAACAAATACTGCTAATAAGAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr3R 21786207 5' + roo 8735 2 69.86 TGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATATTTTCATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTATC:1 + chr2R 7408003 5' + Idefix 80 2 80.14 ATTTCCCCAGCCTCAATTCATGACAAAAGTTTTTCGGCGCAGCGACAGGCAGATCGGGCTACTATATACATATATATATGTCTACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 - chrX 12214604 5' - opus 481 2 71.21 AAATTTAGTTACAATTTATATCAATTCGGGTTGTTGTTTATATAGATTTTAACCAATAGACGATCTATGCAGAGAGTGGTAGATAGGGAGGAGCTTTCTTAATACGTATTTTAATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGT:1 + chr2L 4550482 5' - transib2 2459 1 77.40 GGCACTCCATGGCCCATCTATATGTGTGTGAGTGTTGTCTGCGACTGTCAGTGCCAACGCAACTTCCCTGTAACTGTAACTGCAACCAACTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGCACG:1 - chr3R 27859615 5' - hopper 1381 1 62.33 CAAAAAATGGTTCAAAAGTGTGGCCATGAGAGATTTGGGCGGTTTGTCGTTAGAGTGGGCGTGGCAATAGGGCCAAAAAATCTGTGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTCCGCTTAATCACAACCTTCTTGCTTTTATAGTTCC:1 + chr2R 5722310 5' - INE-1 157 1 77.40 CAGCGAATTGAGTCCCACCCAGAGCAGCATCGGAAGCCATCACATGACATCGCCGGTCAGCCACCAGCAGCACACGCAACAGCAGCAGCACGGGCAGCAGCAGCATCTGGGTTAAGACCGAAGCCGTAGAAGAGAGAGAGAGAGAG:1 + chr2L 8826823 5' - blood 171 2 76.03 CCATTTCATCAGCCTTTATCTTGGAGAACATCAGATTTTATAGGACATCATACATTTTCGGACTGAATTAAATTTTATGAATGCCTTTAAACATGTTAAGCGAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCC:1 - chr2R 20364653 5' + 412 7287 2 74.29 TGTCCCGCCCGTCATCCGGCTGCTTAATGTCAACTCTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1 - chr3R 28782635 5' + blood 86 2 74.66 AAACAAAGGTCAAACATACCCAAAGTGCATTTACGAGCGGAAAATGTCACTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr2L 20324204 5' + Tirant 8168 2 63.97 CTGGGCCAAAAGCCACCGGCTGGGGAAATCTAATAAAACGAAAGAGCTTTTGACAGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chrX 17027864 5' + roo 8708 2 54.40 GATGCTCCAAAGTTTTTTTTTATTTTTTTGTAGCTTTTT:1 + chr2L 18632095 5' - G2 3068 1 66.67 TTAACTTTAAAACTTTATAGTATTCCCTGTATCGTGCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGAT:1 - chr3R 904679 5' - 3S18 254 2 74.66 TGCTACCGTGTTAATTGCATGTTAAACCGTTTAATGCGTGAGCAAACCTAGAGCACTAAAATCATTGCCTACTTTTTAGCGCAACACTGGGATTGAGATGTAGGATTTGTTGTGTCTTGTATTATTTTTTTATATTTATTTATCTA:1 - chr3R 30622142 5' - Tc1-2 479 1 77.40 GAGAGCGAACGAGTAAAAAGCGACGCGCAGAATAAGCAAAGGACGACCTTCAAATAATGTTGAATTTTGTACGCAAACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr2L 21251050 5' - P-element 2843 1 56.16 AATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chrX 4214468 5' + jockey 75 1 65.00 GACATGGGCGCTGGGGAAGGGGGTCCGAAGTGCGTCGAAGGGAACTCAACAATTTGACGCAATTAAAAACTAAAATGGGCCGCGAAAAACCTTTATCCGATTTTGAAAAAGTTCAGATCAAAGGCTATATTGAATCTGGCTTAAAA:1 + chrX 5970373 5' + Tc3 488 1 51.37 ACTGTGGTGGAAGGAAACTCTTCTGACCTTATGTAGTACATAGGATTTTAACCATGACTATTATGTCCGTTTTTCTGTCCGTATGAACGACCTAAAAAGCTGAGTCAAGGTAGTGCCAAAGACAAGATGCGTAACGCTATACGATT:1 + chrX 6757116 5' + 1360 20 1 70.55 AGACATCTAATTGGAAAAAACAACAACAAAGAGCAAAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGA:1 - chr3L 3339414 5' + Transpac 5002 2 73.97 AGATTTCCGTTCAGAGTATTTACTTTGTGGTGAATCCCATTTGATTTGGTAATAAAACTACATCGAATTTTGAAGGGCGTGAACGAATAGCATGTAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 + chr2R 21029319 5' + Transpac 24 2 66.44 CGTTAAGGTAGAATTTCAAGAAGCAAAATCTTGTGTAAGCTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr2L 3648796 5' + roo 8745 2 73.97 AACATAAATTTAAACCATTCTAACTTTTTGTTTTGTAAGATTGTATTTTGTTTTATCCCAAAAGTAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3L 16907764 5' + jockey 64 1 54.11 TCATTTGTTAAAACCATTTGCCGGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chr3L 13545069 5' + hobo 67 1 63.70 ACTCCCCAGCAACTCCTTCTATTTTGTATCTCTCCTACTTGAGAGTTACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCA:3 - chr3R 29091383 5' + rover 66 2 65.07 TTTTTCAAATTCATGTTATCAAACGTATTTGTGTATATGCCAGTAAAATCAGCTTGAAGGGTTTTATTATTCATCTCCCTTTAATCGGAAATAATATGCTTAATTACTCATTGTTGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCGT:1 + chr3R 20348925 5' + baggins 5165 1 75.34 GGACGGAAAAAGTGGGTGTGGATGTCCATGGGGGTTGTGGAGATTGCGGCTTGAGGATGCAGGATGCAGGGGAGGAGGGTTCGCCACTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTT:1 + chr2L 14480809 5' - Transpac 4798 1 79.82 CGTGCTTGTTACGGACTTTAAAAGCTGCTGGGAGCTGCGAACCAAATCGCTGACATCGCTGTCCGAAGTCAGAGGTGGCTCCTCTGCCTCCTTCTCCTCCGTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCCAGGAACTGCAGC:1 + chr3R 18240551 5' + jockey 4689 1 65.75 GATAGTATTTAAAGTTTTTCTCGCTTAAGTAAAAGCATTTACTTTTTGGATTCGAACATTTTAATTAACTTTTGTCATTGTTTGTTCTTAAATACTTAGCTTATAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:2 + chr3R 12727088 5' + I-element 18 1 68.49 AATTCTGCTGCATTTTCCACCACTTTGACACGTTCCATTCTGCATCATTTTTTGTTTTCTTAATTACGTCTATAACTCGTAAAAGCGTATACTAGATTTGCTTGAACAGGTCGATCTATAGCCATTTCCGTCTGTCCGTATGAACA:1 - chr3L 7476948 5' + INE-1 124 1 66.44 AGCTGGAAAGCTTTAAAAAAAAATGCGATGCAGGATTACAGCTGTTCGGGCTTGTGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chrX 7967288 5' - P-element 2837 1 44.19 CTTAAATGTTGATGGAAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGAATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 + chrX 2518017 5' - P-element 2836 1 47.14 GTTCAAGTGTTACTGTAGTTGGCAACGCTAGTGAACAGCTGTTCAATTTGTTTGGCCATTCACTTGTGAGCGAACTCAGTATCAAACTTCAATAGAGCGTTGTCCACCTCAACACACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATACTCA:1 + chrX 8251852 5' - Circe 171 1 61.64 ACTTAAAAAGTACTAACATTAATTAGTTAATTGACAAAGCTCTTGGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCA:1 - chr3R 24976332 5' + roo 34 2 60.96 GAGCTGGGAATGCAACTGTAAAAATAATAACACCGCGTCAAGGATCGCCCCTAATCATCGTCTTTGATGATATGACAATGACGTGTGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 21587638 5' - roo 387 2 67.41 GTCAATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 - chr2L 14480545 5' - Transpac 5183 2 54.11 CCCGAAAGCCCTATTCAAGTCGATTATTGCACAGCCGTCGGGTAAATTGTAAAAAAGAGGCCAAGTTATAACGCTTTACTTTTTAGACCCTTGCAGAAGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 + chr3R 5477906 5' - 297 378 2 74.65 AGGTCGCTCTCGCTCTTTACCGTTGGTTACGAAGGAGAGAGAGGCAGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATA:1 - chr3R 5264909 5' - P-element 2824 1 37.31 GAAGGTGTTGCTTTTACACTTGAATAAATGCATCTCGAAGTTTGTGGTAGTAATGCAATATACAAAGATATTTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAA:1 + chr2L 260957 5' + Juan 4075 1 54.11 AAACAAGATTTATGACAGGCGTGCGCTTGCTGGAAGATGGGAAGATGGCAAATGGGTGGTGGTCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTT:1 + chr2R 20447791 5' + hopper 57 1 53.42 CCGTCACTGTTATTCACCCAAAACTATACTGACGACAATATATGCGACGCCAGCAGCAACGCTAGAAACCTAAAGAAAATAAAACTCACACACGTCCGAACGTCTCGATCTCAGGAATTATAAAAGCTAGAACGTTGAGA:1 - chrX 131009 5' + INE-1 162 1 69.29 CCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr3L 13228472 5' - P-element 2837 1 43.20 TTTAAAATGTAGCTCTTGTTGCCGTTTTAATTGTGAAACTTTTGTCATGCAACTTGCATATCTGCACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTGTACACTGAAGGGATTACAAC:1 + chr3R 25442791 5' - R1A1-element 5290 1 50.37 ACAACAATTGAAATTGAGTGGAAAAACAATTGCCGGAGACCAAAGACTTGAGCGTTAAGAGTGACAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTT:1 + chr2L 20324100 5' - Tirant 8454 2 53.42 GACTTAATGGATTGCCCTTCGATGAACTGCTGTCCAAAATTTCGGAAGATGGTGAACAGCCCCTACTTCTTCACAAGCAACTACTGATCGAAGGAAATGTATGATTTTAGACGAACATGGACAACAATAAATGTTGTCTGCTTTT:1 - chrX 5960871 5' + Cr1a 441 1 71.03 AAAATATCCAGCTGGTGAAATTCCTGACCAAATATTAATTTTTAACTGGGATAAGTCGCAATATTCAACCGATGTAGAGTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 - chrX 22676465 5' - 297 6938 2 54.11 TCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGCCCACATCAGCAGTCCACGCC:1 + chr2L 4420513 5' + gypsy5 7015 2 65.75 TTTGGGCGTTTGATTCTCGACGCTTAGCGCTCGGAATTCAGTGCTCAGTTCAGTAGGTGACACCATTGCGCTTAGGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3R 18518051 5' - roo 9033 1 54.68 GGCCTGCTTCTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGGCAAAAGAAGACTC:1 + chr2R 16891805 5' + jockey 4732 1 71.93 ATTTCCTGCGTTTATCTAACTCTATAAAAATGTCATATTTTACTCGCAGTAACTTGTACAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:1 + chr2R 8452739 5' + blood 7074 2 60.96 ACTTTCTTAATTCCGAAAAAATAGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGATGCATT:1 - chr3R 10636215 5' + blood 7055 2 54.79 GATAAACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGTGTAAAATACATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCTAGCCACGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAG:1 + chr3R 28636009 5' + INE-1 148 1 77.40 AAAATGAATTATACTTATAGGCGGAAAGAACCAAATATAAATCCGAAGAGCTTTTAAAGCCTTGACCACATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTTACAGAAGTCGCG:1 + chr3L 13472392 5' + jockey 35 1 60.48 AGAGAAATATAATACCAAATCATACTTAGAAGCGAGTAAGCAAAACTCGAAACTAATCGAGACACGTCTTAGATTTTAGTGTTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3L 20744153 5' - 412 454 2 56.85 CCATCCAAATTGACGTTAATCGCGTCACTACTTCTCTGGCCCCCACCCACCATGTGTCTAATCCTAATGATGATTTGACATCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACATCTCCTACCTCTCATTCACCCA:1 - chr2R 20920633 5' + Porto1 272 1 53.42 GGCTGCAAAAGAGCTGTGGTTTTCATTCCCCCTTCTTCTTTATAATTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTT:1 - chr3R 9175250 5' - Juan 4134 1 71.23 ATAAAGTAAAACTAAAAAAAAAATACAGATAGACAACGAACGAATCGATCGTTCTAAAATGAGCCAACGAATTGCGCGCTCGGCGGCGAAAAGACCAAGATGAGCGCAAACCCTCTTCGCAGCGGAACAAAGTATACTTCACCGTC:1 + chr3R 836744 5' + Doc3-element 289 1 81.51 ACAATTGCCGGAGACCAAAGACTTGAGCGTTAAGAGTGACAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGAT:1 + chr2L 20324126 5' - Tirant 8429 2 70.55 TGAATAACCACTATTTATAATCAAAGTACGTAGAATGAAGCGTTTGCGAACCAATAAAATGTATGTGTTTTTACTCGTTACTCGTTTCTCGTAGAATAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGGAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAG:1 + chr2R 5497722 5' + INE-1 28 1 56.16 CTCGTTTCATACTAAAATCCTAGAAATATAATGACAAATTGTTTGCTTAGAACCTTATCAAAGGAAATGATTAGAATACTCACGAATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAACTATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 + chr2L 7939709 5' + Burdock 33 2 58.90 TTGTACGTTGGTGTTTCACACTGATATACTATACACAAATGCACATATATTTATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chr2R 9504305 5' + roo 8728 2 65.07 CAAGCGAAATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGT:1 - chr3L 4933823 5' + blood 58 2 58.22 CTTTCAGTTTTTCTTTCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 12995350 5' - HMS-Beagle2 489 1 88.89 ATTTTCTAATCCACTTTGCGTAAATAATCATGAGCGTCAATTCAATTCCGGCAGCCATCACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATT:1 + chrX 19982351 5' - hopper 1350 1 58.90 GCCATGGGTTTTTAAGAGGCCACTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr3L 5179198 5' + P-element 56 1 24.51 ATTTATTTTCAATGTCACAAAGCAGACGAGTGAGGAAGTCTATGTATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTA:1 + chr3L 18034559 5' + Transpac 4987 2 65.07 GAGGAAAATGTAAAGGAAACTTAAAACTGTTGGCTTATTAGCTTATGGAGAGAAGACGGCAAAATGAGTAGATAGATATCACGCATACGCAGTTTGGTTCATATTGGTCCTCCGGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATC:1 - chr2L 4158800 5' - R2-element 285 1 62.33 ATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAG:1 + chr2L 21367242 5' + Doc 94 1 76.71 AGCTGGGAAAATTCGCAAGCAATCCTGCGGTTTCTGGCTCGTCGCGCATTGTAAAATGTCCATATATATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chrX 1764167 5' - opus 7487 2 67.83 TTTTTACACCTTTTCACGATTATTCAACCAATACAGGTATACCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTTGTTTTTATTAAGCGAGTGTACA:1 + chr2R 9390930 5' - mdg1 7380 2 72.60 CCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGC:1 + chr3R 25409740 5' + jockey 91 1 71.23 ATCCGTAAGCCTGCCCCCTTAGACATAGCATCCCCAGTAGTTTGGGGGCGTAGTAGAAGTTCGTGCACGGATAAAAACATAATGCCTCATCCAAGTTATTGTTTTAAAATCAAAATTCCGGTCTATAAAAATATATATATATGTAT:1 - chrX 20008793 5' + G3 4501 1 77.40 ACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 + chrX 19005364 5' + F-element 72 1 59.59 ATATAAAATATGCATAATCGTTTAATTTAATCAATTGCTCCAATTAAGCCATCTACCACACATTTATTAAATCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chr2R 11595812 5' + P-element 47 1 53.42 GTGAATGTGGACAAATAAGAATTTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 + chrX 10806884 5' - P-element 2823 1 36.09 TGACAAGTGCAAACATTAATTAGCCGATCGATCTATCAGGTGAATGATATTGAGCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCATCTCT:1 - chr2R 15822101 5' + invader6 4536 2 47.95 TGTCCCTCTTCCTTTTTATTTAAGGGTTGAATTCATCCTTAATACGCACTAATGACACCTCCTCATTTCTTAATTTCACTTATTTTACCTATTTACCTAAATTACCCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:1 + chr3L 23331163 5' - 297 6963 2 72.60 GAATAAGTACAATAATGAGGGGAATTTGGGGCGGGGATGGACTGCTACACAAAGAAAAATAATTGCCAGTACCTACTGCAATTGCATAGAAATAGTTTTGATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCT:1 - chr3L 11410843 5' + F-element 4220 1 67.81 GCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 + chr2R 12069602 5' + Tirant 8116 2 61.82 GGACGTGATCCATTTTATTGTGGTATTTTCTTATATAGAACATTTTGTTCCTTTCCATTAATATTATATTATATTATAATTATATATTATCGATATAGCTAATATAGGGAGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATAC:1 + chr2R 5173071 5' + Stalker 13 4 75.34 GCATTCAGCAGATTTGCTGGTTGATTTCATCGAAGCGGAATCTTTTTTGCAAATATACACTTGCGTTTAAAATACTAGGAATGGTAAAAAAAATATATATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAA:1 + chr3R 28658976 5' + Burdock 6154 2 68.49 TTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTAT:1 - chr2R 4774764 5' - baggins 5353 1 54.11 GTAATAATCATCAGCTGTGGCTGTTGAACGCCCGATCCGACTACATAACATTATTGATGACAAAGAAAAGTTCGATTTGACAAACGTCATCCCTTTTGTGCGTTGTTCGTAGTGCTGTTTTGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAA:1 - chr2R 5467621 5' + Cr1a 258 1 60.96 ATCGAAATAAGCCGGAAAATCGGGTTGACAACGTTTCCGGATGTCGACAAACGAATTTACATACTGTATATTTCGTACTTCGTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATG:1 - chrX 7113719 5' + G2 186 1 56.16 ATCGTTTTACGTGATTTGTTCTGTGTCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGG:1 - chr3L 18197675 5' - Doc 449 1 78.90 AGCGCTTCCCCCGTTTTTCTCGCGCTTTCCTCAATTTTCTGTCCACAATTAAAACGCGAACCCAGATACAGAGAGGGAGGGATGGCATGATCCTTTTTCTAAAAGCTTACGGGTCGAGGGACTCCAGTTCTTCGTATTGTCGCT:1 - chrX 22818827 5' - mariner2 310 1 67.36 CCCGCTAAGAGGGACGCGAATGATGGTCAGGACATCAAACCCGTTAAGAGAGCCGAACAGAGCGAATTTCGTGAGCAGGACATGAGTAACAAGTTGTTGCACTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 + chr3R 25137814 5' - P-element 2869 1 71.92 AGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGCGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCCTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCCGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCG:1 - chr3L 3565392 5' + gypsy 7059 2 64.75 CCCGACCGCTCTCACCAACCGCCCTCCAAGCACCCACCTGTGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAG:1 - chr2L 17364628 5' + F-element 4540 1 69.23 CTTCTTGCTCCTACCTTCGTCAGGAAGTCCCAGCCCAGCACTAGGGCGTCGATTATGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAAATAATAAGAACCATGCACGCACCGAGAGCATCGGCG:1 + chr3L 23665745 5' + invader4 448 1 56.25 GTATAGTTGTGTTTGTTTTGATGTTGCCTCCTATAAATGTTTAGTATCACACACGTCCAAGTTTAGTTTTTATTCGTTTCGGTTTCCGCGGGGAATTGCCGAATTTCCCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCA:1 + chr2R 6762210 5' - flea 4559 1 73.29 CCATCTAATGGCGGAAACTTAATGGATTAGATTCAAGGCATTCGATTTCCATGATAATCTTCTATTTTTCATTCAATACCAACTTGTCCTTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCATATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCT:1 + chr3L 14430521 5' + I-element 5050 1 52.05 CTTTTACGGTTCGTAATTTGGGATGAATGTCGTGTTATGCATTAAGACGGCATTGTTAAGCACAGTTCAGAATATGTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGTATTTTGTATGTTATCTGAATTGGGT:1 + chr2L 5298199 5' - I-element 5126 1 51.37 TAATTTTAGCCCAAATTTGAATAAAATGAACATGACTCAAACCACCCGCAGCCTACATTTTTCACACAAACTGATAGACATTTTTTAAATAATTCAATATGTTAAATATTCAACTTTGCACAGTATTTTCAGTTCTTTCAACTGCA:1 - chr2R 15298527 5' - copia 176 2 58.90 TCAGATAAGGAGCGCGCACAAAAGTATGCTATGAAAACCGTAATCATAATCGTAAAGCTTAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAA:1 + chr2L 17729351 5' + jockey 4820 1 61.38 GCGCGCAACTGTGCGAAAAACGAAGAGAACAAAAGGGTGGGGAAAGTTGGCTAAAATGAAAGGCTTGAAAAGGGTTATCGAGGTTTATCCAGTTAAATGTTTTTCTCATATTATATAAGTTAACACTAGCAAGTCAGAGGGGTGCG:1 + chr2L 7922578 5' + gypsy10 8 2 63.01 TCGATATCGATTGTTACCAGAGCTGCCATTCGTTTAGCGCGTGTTCGATTCGCACATCGCGTTCGATTTAAAAAGCTCTAAAAATATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATATTATCATATTGCTACGAAATTG:1 + chr3R 14112228 5' + 1360 3112 1 55.48 GTTTCCTAAGTGAGGCAAAGGCACTGGAAACATTCTAAATTTAGCGCGCAATAGCTTTCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGT:1 - chr2R 16073061 5' + Burdock 6149 2 71.43 TCAACGCGGGCAGGAGCATCTCGTATGTAACTACTACGGAAATGGCCAAACCCCAACTCTAACTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTGTATGATGAATG:1 - chr3R 17465869 5' - I-element 305 1 49.50 GATTTAAGCAAACATTTATCGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chr3R 6412075 5' + Tirant 49 2 53.42 AAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCG:1 + chr2L 23299987 5' + invader4 399 1 76.71 ATTTTCAATGGCAATCTGCAAGCTTAACTGCAATTAAATGAAAAGTAAATATGGGCTACTGAATTAAACGTAAAAGCGTAACAAATAATAAAGCAGGAAAATTTATCAAGGACGTCTGAAGAGCATACATCCCCATGAAGTCCTTA:1 + chr3L 18468530 5' + G5A 2692 1 68.49 AGGTTGTCTTGGCAGACTAGCTCCTTGGAATATTTATTTTTCCTACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACA:1 + chr2R 2552080 5' + HMS-Beagle2 43 2 50.69 AATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGAT:1 + chr2L 14480451 5' + Transpac 84 2 76.03 ACAAAGACAATGGAATCAAACCAAACTTAATTTCTTTTGACAAAAGGTCAAAAGATTATTAATGCTTAGGGACAAATATATATGTCGGCGAGACAGGAGTGTCATCCATTTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCA:1 + chr2R 10305302 5' - invader4 3042 2 52.74 CTAAGGGGGAAATGTACACTCAGTGCTGACCAACGTTTTGTTTGCATGGCAACATGAGTCAAGACTCTTGCGTTGCGTCTATGTTTCTAGGATCTGTAGGCCTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGT:1 - chr3L 106402 5' - INE-1 143 1 76.71 TTTTGAAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGAC:1 - chr3L 20224214 5' + Chimpo 83 1 76.03 GCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 - chr3L 14084965 5' - opus 7467 2 53.78 GCTACCTAAAAACGCAGCAAACGAGCAACATCAGCCCCAGATTCGTACCACACACCCCCCCATCTCTTAGTATTATGCCGCAGAAGCTTTGAATAGTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 + chr3L 5274877 5' - I-element 5333 1 71.03 GTGAAAGCTTGGTTGAGCTGGGAAAACATTTAATATTATCTTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAG:1 - chr3L 13156816 5' + transib2 48 1 53.42 ACAAAGCTGTTGCAATGTGCAAAATGCTGCTGTTGAAAAGTCCTTGTTGTAATTACGTTTTGTTTTACTCGTGTTGAGGCAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGT:1 - chr2L 9861403 5' + BS 5000 1 54.86 CATAACAAATAACGATAACAAATTCCGAAAAACTCAATAACATAAGTTATCTTGTTATGACACCTCATAGACATATGTACATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chr3L 20209669 5' - Burdock 6353 2 58.22 CACTTCACTCGTTTATTCACCGGCCCACGCCCACATCCACGCCCACTTATCAGGCTTGTTGTGCATTCCGCTCTCGTCTGAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTGATTCGATATGTGTGC:1 - chr3R 23108507 5' - Tabor 6848 2 59.26 ACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 - chrX 5206518 5' + Tirant 54 2 74.07 AGCGTTTTCGAGGAAAATATTTCCTGCGTTTATCTAACTCTATAAAAATGTCATATTTTACTCGCAGTAACTTGTACAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr2R 8452721 5' + blood 7056 2 54.79 TGATGGAAAAGATTATTGTGAAATTCCACGAAGGAACATAGAAACGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1 + chrX 4823544 5' + pogo 72 1 67.59 ACACACTCATGGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGCCATCTCAGGGAAAATCGGCGTGGGCTGTGAGTTGAGATGATCAAGAGCGTCACAGATTCAATACTGTAGACTGTGGTACGGTAGATTCA:1 - chr2L 23488890 5' - Circe 7300 1 77.93 TTCCAACACCCTCATAACTGGTAATGCAATTTTCAAGGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATC:1 + chr2L 12832868 5' + I-element 85 1 73.29 AAACCTATCAATAGTTTTCCAGCCCATGCGTTTTGCCATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGATCGTGTGC:1 - chrX 18353566 5' + jockey 91 1 74.47 GCACGTGTAAGTTCATTGTGTAAGTTCTCGTTAGCCAAATGCACACGCGACAGAAGATAGTGTTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTCATTTGG:1 + chrX 18318000 5' - jockey 4614 1 55.17 AGCTAACGAGTATCTGAAGATACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 - chr2R 24021654 5' - pogo 2037 1 65.07 GCAAAAATATTGTCATGCGAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chr2L 19643600 5' + hobo 68 1 69.78 AAAAAACAAAACAAACTAAAAATGTAGGAAAACAAAATCGCACTACGATGTCGTAAACAATTTTCAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTGTGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGG:1 - chr2R 13580465 5' - Tirant 253 2 50.00 AATGACTATTGTGAGAATTCTAACGATATTACAATTTGTTCAGAAAAGTTCTGTGTTTGGCCTAACCACAAACCATTACTTTATTTCAACTTCTAGTTCAAACAAAGATACTAGAATATTATAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTT:1 + chrX 20145326 5' + Tc3 313 1 55.48 ATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGT:1 - chr3L 4933813 5' + blood 65 2 64.34 ACTGCTCCAAAATTCCCGCACAGTTTAAGAAACGGAGAAGTGAAAGGGGGGCTCCAGCGGCATTGGGGCAATCAATAATTGTTAGTTGCGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGT:1 + chr3L 8822414 5' - Doc 71 1 47.48 AATTATGGAAGAATACAGTTTGAATTCAAATATCGATAAATATATTTCTGTTCCGCTTGTATGGAGCAGCGGCCATAAATACTTCCAGTGTAGCCAGAAGCCTAAGATTTCGTTTCAGGCATCTAATAGAGCTTATAAAAACATGC:1 - chr2L 22983824 5' - Transib5 2898 1 50.00 CTGCTGCTTTGATTGATGGCTCCACTGATTCGACTGATAAGAAAACATATGTACCCTCGATGTGGATACGGCCCTGCCTTGCACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCCCTTCCAT:1 + chr3R 18697839 5' + 297 6598 2 69.40 GGAAAAAATAAATACGAAATCATTGATCATTGATCTGAGTAATGTATTATTAATGATTTTATATTATCCGGTCTTTCCTGATCGAAGTAATCGAGTAATGTTATGTTGATAAAAACTTTTCAAATATCAAATAAATAAATATAAAT:1 + chr2L 11485695 5' + Tc1-2 476 1 69.86 TTTGCCAAATTGATTTAAAGAGTTTCACCAGCAAAGTAATACAAATAAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTT:1 - chrX 10128326 5' - invader3 260 2 69.86 GCAAATATTTTATCATCACTGGCTTTGGGCGTTTGATTCTCGACGCTTAGCGCTCGGAATTCAGTGCTCAGTTCAGTAGGTGACACCATTGCGCTTAGGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 18518074 5' - roo 386 2 67.81 ATAAACTGAATGTCCCAGTTTATTTATCTAAGTACTTTAGTTAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 + chr2L 20556433 5' - 412 7468 2 72.60 GCATAAAATGAAGATCCAGCTGCGATGGCGCAAAATGCCACCGGAAGACGACGTCGCGGCGCCAAAAGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCTTACTTGTGCAGGCGTGGTGGGTTAGAGGGAG:1 - chrX 15268238 5' - ZAM 33 2 56.45 ATAAATTTGTTAAACAGCTCATTATAGGACTTTGTTTTCACCACTTTTGGCAAAACCTGCTAGTTCAGCAGAGAACAGCTCTAGTTTACACAGTCATAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3R 4421925 5' + 1360 26 1 67.81 CTAGTTGGATGGATATGCACTGCAAACAATTGGAGCTAGATGTGGGCTATTGCAAGTTGCTTCGAAGTACTTGATTGACTTTCAGATACCACAAAAATATGAAAAAATATTATAATAAAACATGAGAGAATGATATAGTCGAGTTC:1 + chrX 19086269 5' - INE-1 574 1 64.38 GCAGGGGAGGGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 - chr3R 17210138 5' + HMS-Beagle2 30 2 63.45 GGGTTTCTAACGGAATTCCTTTGCTCACGCACACATTGAAAGGAGGTTCGTTAAGAGAGAAGGGAACCCAAAAATGTATTGTTGTAGTCCGTGTTTGTTGGCGGCATCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAA:1 - chrX 16526410 5' + P-element 13 1 75.34 GTGGAGAAAGTGGGACGAAGTGGAACATACATCTTCTACCCCCAGCGGGAGTTTCCTGCTTATAAGGAAGTAGGTGCCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 + chr2R 14722643 5' - mdg1 7420 2 58.22 AAATTAGGACACTACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTTCAAAAATGTGGTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr3L 10563999 5' - hopper 1375 1 51.91 ATCGCAACAGATACGAATTGTCCTGCAGAGAAACATAAATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACG:1 - chr3L 19335413 5' - invader4 3025 2 72.13 AGCTCATACATATGTTACACACACACTTTGAGCATACATGGTCTCGAACATTCTAGGAATAGATTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTGTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr2R 973742 5' + 1360 38 1 53.91 CGTCTGCCCAATTGAGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 - chr3R 31681937 5' + Doc 79 1 69.18 GGGAAATCCGAAATCCGTCAGCCCCAAGAAGTATGCTTCGCATTCTTCTTTATGGGTCCTCAAACTGCAAATCGTCGACGCAACCGATGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3L 13362775 5' + jockey 36 1 63.89 AAGACTCTACATAATATCAATCTAATATTAAATCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTCGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chr3R 5761965 5' + roo 89 2 80.14 TTAAAATTCATTAAAAATGATTTGCGTAAAACGCAATTTTATTTTTTCATCGCCACAAAATGAGGGGAAAAAAATAAAACGCCAAGGAAGCTACCCAAAACAAAAAAAAAGAACAAAATGCAAAAATTGCAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 6443219 5' + G3 4584 3 58.22 AATCTAAATTTTCGCATACTTCGGCCAGTTATTTACTTTCGCTTCCTTTCAACTACATAAAACTCAATAAACAACCATTTTTTGCCCATGTTTTTTCGTCATAGTTAAACTTAGTTTTTTTCCAACTTTTTCGAAATTTCATATCT:1 + chr2L 3405975 5' - FB 122 1 49.32 TAGCCACCTTTATATACTCTATGAAACGTTCTAGAATGAAGGTCGAAACCGTTAGAGAGGTAAAACAAGATCCTCGTGTTACGATAACGTCACTTTATTTCGGCTGTCATCTCAGAACTAAATAATACAAAGATA:1 + chr2R 4482958 5' - Chouto 117 1 56.30 ATATGTAATTTTCATAATCCCTAAGTCTAGTGGATGAAAGAAACAATTGGGTTAATCCAATGATTCTTTCGTTTTGCTGACATTATTATCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAAT:1 - chr3L 14155724 5' + copia 248 1 58.90 CATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAA:1 + chr3L 15859632 5' + I-element 77 1 73.79 TTTGGACATACTTCATCTAGAGAGGGAACGATTTCCCTCTGATTTCCGCAATCTGAAATATGGGGATGCGTCTTTAAGTGGAAGACAGTAGACGATAACACAATTAGCATACCCAGACCCGGGCACACCCCCCAATTTCCAAACAC:1 + chrX 20107880 5' + Doc2-element 484 1 66.44 CGGATGGGCACTCGAAGAAATCTTGCTCACTTTTATAGTATAATTAAATTAAAATTACATAGTAATAAATGTTCAATACTACATTTAAATGATATATAAATATATCATTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGAT:1 - chr3L 17162436 5' - Stalker2 7636 2 71.92 GTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTGAGTCGG:1 + chr3L 11474689 5' + gypsy 7134 2 70.91 TCTACTAGTGACAGCCTTAGATTACACTGAACTTAACTAGTTGATGAAATATGCGTACAGAATTGCAGTATTTTAATACTAATTAAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr3R 32032135 5' + 297 6613 2 64.38 GGTCGGGTCGAGTCCTGATTATTTAGCAGCTCGGCATGTGAATGTAAATAAAGTTCAGCCATAAAATACCCCGCAGACAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGT:1 - chr3R 24724203 5' + Tirant 8310 2 60.27 ATAACGAAATCGATTGCTTATGAACTTATTTTATAGTTGAAGATCGATTGGTGGGACCGGGTGGAAGACAGCATTTGCCATAAATTGTGAAAGTGTCAACGAAAGGCAAAAATACACACACACACACACACACACACAGATGCACA:1 - chr3L 3402024 5' + accord 7034 2 62.33 AACAACAGGTAGAAAAACCAGAGAACGATGAAGAACCAAATGAAACCTTCATCACCATATCCGTCGTGACTAGAGCCACTTCACCCACTCTACCGGGCAGCACGACGGTACAACGCACTTTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTT:1 + chr3L 8760065 5' + copia 4690 1 78.08 TGTGAGTTTCAATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGC:1 - chr3L 3565405 5' + gypsy 44 2 58.06 AATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chrX 4214486 5' + jockey 63 1 71.82 CCCCGACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAG:1 - chr3L 23678166 5' + Osvaldo 18 1 63.39 ACATCCTCTTAATTCTATTGGAATTCAATTTTCACATTTAATATTCAACTTTTGCGCGGAGTGTAATTTCATTCCGCGGCATTTTCCATCAATGATTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACAAG:1 - chr3R 11658496 5' - G2 235 1 66.91 GGGCTGGGGAGTGGCCGGCAGTTGTGGGGACGGGGATGGGAGTGTGGATGGGAGTTGATGCACGTCGTCTGCCCAATTGAGGTTAAGTAATGCAGTCAAATGCGTGAAAAATTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chr3R 31682011 5' + Doc 14 1 76.03 TCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTAGACATGAGA:1 + chr2L 18213146 5' - roo 334 2 72.66 AACATTCTTCCATTTATATACGCCAGCCAAAGGAGAGGGAAGCGAGGAAGTAGCCAGCCCAAGGGGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGGGTAAATGTATG:1 + chr2L 18178260 5' - Tirant 8469 2 53.12 AATTGCCGCCATGCAATTAATTTGTGATCTTTAATTAAAGCCAAGGAAAACAAAAAGCGAAGAGCAGTTTTCGTTCAGCTATAGATAAAAATGATTTCAGAGGGCAAGAGAATCTAATTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGAT:1 - chrX 17231317 5' - pogo 394 1 79.45 GAATAATACTATGGATTTTAAGCGTGGTTCATGAGTTTTTCGAATTTGTATTCAAATTTTTGAATAAAGAAATCCGCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAA:1 - chrX 21187859 5' + hopper 30 1 54.81 TTTGGGCTATATTTAGATGAATAAAGGAGAAAGTTTTACATGAGGATCCTTACTTTTTGTAAAATAAGCGGATATCTCCTAAGTAAGAAATTTCAAAATGTTAATATCAAATATCAAAAATTGTTCAAGTCTTTAAATATATTCGT:1 + chr3R 21696929 5' - roo 16 2 69.18 ATAAATAAATTGAAAACAAGAGGGAATACCAAGCTATGGATCTGCAATATACCCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chrX 17510600 5' - roo 340 2 63.01 TTTAGATTTCGCCCGCTCTTTTCCAGGTTTTCCTTTTCGCGGAGCGTGTGACAGGGTTCGGTAATTAACATCATGAAGGGCTTTAGATGGATGTGCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3L 6675429 5' + 412 18 2 71.74 CAGGGACAAAGTCCAAGACTATACAGTGGAACTTGACTTTAGAGGCGAGGAATTAAAAGAAAATCATTTAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTCAAAATGCAGC:1 + chr3R 30782494 5' - pogo 2052 1 56.85 CTGACTCTAAAAAAAAAACGGGCAATAATGAATTTTATAGGTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr2R 2831038 5' - 1360 3356 1 92.00 ACAGTTTACAATAGAATATTACTTAATAGACAATCTTTCGTTTCGCTTTGTTTTTTTTTATGACTCACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1 + chr3L 7790657 5' - copia 5068 2 57.53 AACGAAATTTATCGCAAGACCGAAAGAGAAGACTCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACT:1 + chr2R 10600009 5' - 297 6890 2 77.40 CAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCATTGCTATCTCGCTCTTAC:1 + chrX 10128189 5' + invader3 91 2 68.49 GCATGAGGCAATCAATTACGGCGAACCGTTTTGCCAAAAAAGCGTGTTGCCTACTTTCCGGCGCCCGCGTGTTTGCCAACACAGCAGCACAATTAATTATGTACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 + chr2R 18983701 5' - hopper 1398 1 73.29 TTCGGGAGAAGAGCTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATATAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGTGTCGGTCATCGCCACGC:1 - chrX 22576492 5' + Burdock 156 2 73.39 GCGTTTAATTTCCGCTAGACGAAAGAAAAGCATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGTGCCGTCGCTCGTCTT:1 + chr2L 22693990 5' - Doc 253 1 71.43 GTTATGTGAAGTATCTGGTTCGGCCGACTCAAAAATTTACCACATCTAGTTTTACTCTTTCCATCAGGTATATAAAATTAAGCAAATGTATCGATACATAAATAAAGGTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGT:1 - chrX 13385161 5' + opus 9 2 69.86 ATCTAGACACTTTGGCAATGAAACATGTACAAATACAAAACCGTCCTTAAATTATTTTAAATTCTTAGCGCTTTTAAATTGTTTAATGTACATATACCTTTTCGCTACAAAAATTTATGAATAAGATCAATAATTGAACGTGCTTG:1 + chr3R 10817282 5' - Gypsy12A_LTR 2112 1 58.90 TCTGCAGCTGGCGTTGAGTCGGTGCTTGTGATTCCCATGCCGCGCTAGCTGTAGATCCATCCTCCCCCCAAAAATATTATAGAAACACAACAGGTGAGATTAGTTTGAGGCAATAGGAAATAGCGAAAAACTACAATAACAGACTA:1 + chrX 7917760 5' + jockey2 3077 1 76.03 ACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGTGGAAGTGTAGCACACTGCATAAGTGCATGGTCAGCAATCCCACGCTAA:1 + chr3L 24272124 5' + gypsy11 4154 2 71.23 TTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCCCCCAACCGACCGAG:1 - chr2R 1949128 5' - Cr1a 4421 1 77.33 GTACAATAGTTGGGGTTACAGTGGGACGTCTTCGCAACTTAAAACTGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGC:1 + chr2L 11613226 5' - hobo 2866 1 69.66 AATTTATTGAAATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chrX 4214452 5' + jockey 64 1 55.17 TGGCAAAAATCACGAAACGTTAAACAACCAGCAAAAATATTGTCATGCGAATGTTGCATGCTGCAATATGTAGCCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr2L 19643630 5' + hobo 45 1 56.16 AATGTTATGTATTTTGTTTGTACCTATCATGTTTTTCGTAGATTTTCCTAATGGTTTGACATACTACAGTGAGCTTAAAATACCATTATTAAAGATAAGTAAAATCAAGCTATCCAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 + chr2R 9091885 5' + 412 6 2 78.77 TTCGCATCGCATACTCCATTGAAGATGTGTATTATATGGATATGGATATATACATATATATGTAATGTGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1 - chrX 11661480 5' - 297 343 2 71.23 CACGTAAAGCAATATGGGTAAGCCGCAGACACACACACACACACACACACACACATATACA:1 + chr3L 9183579 5' + accord 186 2 78.69 ACAAACTGTGTTTATGGTGAAAACATACTAATCTCGGCTTCACTCGGAGAAAATATACAAATTTAACCATAATAGGGAAATATAATTACTATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chrX 9959746 5' + I-element 30 1 62.33 AAGGAAGATGAGGGAACCAACTGACCCAAGCGGGCCTGAAGATCTTGTCCTGATTGTTTTTACATGCCATACATACGAGTACATATGTATATGCACAGGGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTAT:1 - chr2L 15906141 5' - Tabor 7301 2 69.18 AGAAACACGGACAATGGCAGCCCGAAAAGTGACAAAGACAACACGTTTCGTGCTGCAAAAAGTTACAGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr3L 5179130 5' - P-element 2850 1 54.20 ATTTCCATTAACTTGGTTTTAATAGTCCGATTTTTGCAATGTCGTGCTTTTCAACGAATCGATCATACCCTTTTACTCAACGAGTAAAGGGTATAAAAGAATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAAAGTTGCACCATAAACATCA:1 - chr2R 22357824 5' + ZAM 8056 2 59.59 CGATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr3R 6412056 5' + Tirant 8146 2 54.70 ACTAAATAAACGAAGCGTGAAGAGATATCCAGCCGGAAGCGGCACTATCCTGGTATGAGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGAGTTGGCCACAGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACACAAATTAATACCTCCTAAAC:1 + chr3R 27859457 5' + hopper 31 1 61.64 TTGTGAACAATTGATTTCTAAGTGTGCTTAATTGAACGCCCACTGAAATGTTTGTTTATGCCACTTAACGATCATTATTTCTATTTTTGTTATTACCCAAGCCAACAGTATTACTTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTAT:1 - chr3L 8197013 5' + opus 206 2 44.52 ATCTAGATAAATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAG:1 + chr2L 14480442 5' + Transpac 75 2 70.55 AGAAAGGCAAGAATTGTTAAGGCAATTTCGGAATACATTAAAAGGGGCGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAA:2 - chr3R 26244710 5' - copia 181 2 66.44 TATTTAGTTACTAAACGAGGAAGCTTAAGATTAAATAAAGCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3R 12610012 5' - roo 8992 2 74.48 CAGGCCAAAAAGCCGCCTATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGA:1 + chr2R 9504189 5' - roo 9029 1 53.42 GCGCATAAAATGCGCATAAGCCTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr2R 20739096 5' + hobo 65 1 63.01 TTAAGGTTAATTAAGGAACATAGACATTCCACTACACTTCAATTAATAATCCTAGCAAAATATTTATCCGAAATTAAGAATATTGAATGCTGTTCACACATTAACACGAATATCTTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 12610119 5' + roo 22 2 65.41 TCGTAGAGTAAAAGTGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGTAGGAAGCGTTTCTGACCATATACGCCCACTCTAACGCCCTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chrX 22651470 5' - 1360 3359 1 45.21 AACGGGGGCAAGAAGTCCCAGCAGGGGAGTGGAACGCTGTGGCATATTTAGGACCGAAGTGTCATCGTAATTACCAAAAAAAGAGCAACAAGGCAAAAATTCCCCAGATATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACA:1 - chr3R 17210158 5' + HMS-Beagle2 6892 2 79.17 AAAATGCAAAAACTATAGTTTTATTTGTTATACCCGTTACCCGTTGTAGAGTAGAAAAGTATGTAGCAGACAGAAGGAAGCGTTTACGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGTTTCAAGCACACTAGCTGAGTAACGG:1 - chr3R 18346837 5' + INE-1 536 1 77.78 CGGGAAATTAAAAATGAACTGAATGGTATATTTTGTGAATAATTTACCACATAAATTTCATTGGCCAGATACTCTCACAATTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:2 + chr3R 9193119 5' + opus 148 4 61.64 ATCTTATTAATCCCTGAACTGGGAAAAATACCTCAAATATTACAGAACTATTATAGGAAATCTTTTCCAATAGCACAATGTAATGAACAAAATTAACAAAAACTAAACTACTGAAACTGTTTACCTTATCTCCGGAATCTTCACAG:1 - chr3R 30842463 5' + Q-element 15 2 65.75 TAGTGCAACGGTCCCAAAGGTCCTAGTGTGGTGTGCAATTTCCTCAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr2R 4802945 5' + roo 74 2 73.29 AAAGTTACAAGCTAGAAATTTAGCTGCTTGCTGTACTTTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTGATATACATTTATACACACAATAGG:1 + chr3L 14944513 5' + G5 4766 1 64.38 ATTTTTATCTGGCCTGTCTACACTTAATTAGCTTCTGACAGACTTTTCGTAGTTCCGGAAATATTACAACAAAAAGCCAAAAAAATTCCAATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAG:1 + chr3R 19609508 5' - Burdock 72 2 57.53 TTACACTTGAATAAATGCATCTCGAAGTTTGTGGTAGTAATGCAATATACAAAGATATTTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGA:1 + chr2L 260970 5' + Juan 4088 1 58.90 GGTAACTTGCAAGGGAGTTTTGTTCATTCAAGGTATTTCTATCTATTTGTAAACTGTTTACATTTTTAAGTTTATTTTATTATTGCACAACCTATTTGAAATCTTGAAAAATATTAAAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTG:1 + chr2R 22012077 5' + opus 112 2 71.92 ATTTATGCTTATCTCTTGAAAAAATACAGAATATTTCACAGCTTGTTCTTATATATCATTAATAAAGTATATCTTTGTACGTTTATTATACTTTGGTTATTCACATATATAAATTCATATTGAAAATATTTAATAATAATTAATAT:1 + chr2L 11176761 5' - Tc3 266 1 55.48 GTGAACGTACCCACCATGGCGGCACCGGAAAATGTCCAAGACAGTGTCCATTGAAGCGGAGCAATATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGA:1 - chr3R 22624784 5' - blood 369 2 65.31 AAAAAAAAACGGCACTTAGTGAGAAAGTCGTTCTCAAATGTTCCTAATACTAAGCTTTTGCCTGCTCTTACTGGGGGTATAATGATTCAGTTAAAAGTTTCCAACGCGAAGAAGTGAACAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTC:1 + chrX 20381333 5' - INE-1 580 1 80.00 GTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATGTATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATAC:1 - chrX 21667930 5' + gypsy2 70 2 67.14 GTCATACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACATATAGATATATTTACATTAATATTACTTAAATTTTTAAGTTACTACCAAAATATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 - chr3R 12622348 5' - 297 6947 2 67.12 CTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTATTGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCG:1 - chr3R 934264 5' - Rt1b 4732 1 48.82 GTGTTTTTATAACCGTTAATCGTAGAGTAGGGCAAAGCTACCCGAGTACAAAAAATCCTTTCGTGGATTTTTCGTGGCCTTTGCCACGTCACTCTAACGCCCTAAAGCCGTGAAAGCGGTCACGCCCACACTTTTGAAAATTGTT:1 - chr3R 18295943 5' + INE-1 256 1 47.59 CGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTGTAAGCGTTAGAACAGTCAGCATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGACTTTGTCTCTAGTATCTGTAAGTTGAATCTGAACCTTCTAGCTTTTAT:1 + chr2L 22017969 5' - INE-1 163 1 66.96 GGAAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGAATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCT:1 + chrX 2518030 5' - P-element 2817 1 36.30 TGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAA:1 + chr2L 21367219 5' + Doc 49 1 56.10 TACCACATAAATTTCATTGGCCAGATACTCTCACAATTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTA:1 + chr3R 9193163 5' + opus 189 4 74.83 GTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGTTTTTTTTTATGTGCCTCGCTGATTGCGATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:2 - chr2R 16891855 5' - jockey 4951 1 52.05 GAGCCGATTAAATTGTGCGGCTTATTTTGCAGTGATTTAGCGGGAAATAGCCATTATTAGCGGGAAATATATTACCACCCTTAAGACCTGACTGACCGGGACTTGACTTAAATCTTACTTAATTATTATCTTCTAAATATTACTGC:1 + chrX 15746255 5' + jockey2 3235 1 59.59 GCGCAATGAAATGTAAAACCGTTAAGATTAGACAAACGTCGCCGCCCACACCGGAATTTCGGAATGTGCAGGACATGAGTAACAAGTTGTTGCACTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chrX 7647379 5' - P-element 2862 1 47.95 AACGCCAACAAAAAGCAGTGCAAAACTGCACAGTGAAAGAATGAAAGTATTTAAGATATTCAAAATATTTGAAACATTTCTGTATTACTTTTTGATTAAAGCTCATCATTAGCCAAAGTATATACATATACATGTCTGTATATACT:1 + chrX 9265662 5' - INE-1 67 1 63.70 GAATGTTGCTAATGTTAATTTAAGAAAATATTCCGACCCGGCCATCTGCGAGAAAATGGTGGGGGTGATGGTGGGAAAAAGGGAAAAAGCGGCCCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTC:1 + chr2R 18983354 5' + hopper 25 1 37.67 GATTTATTTCAGACTTTGATTAGGAGCAGCTATTCTCAACGGTTGAGTGCAAGGGAAATGGGATCATTTCGAAGACAATTCGGGCGTTTTGAGTTTAGTTTTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCC:1 - chr2R 9415879 5' - hopper 57 1 74.66 ATAACACAATATTTCCCTAATGTCTTTATTATGTTCCATTGAGTGTAAATATTTGCCTTGCACCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCT:1 + chr2R 9934119 5' + Rt1b 4949 1 64.38 GCTCAAGTCATTGACGGGAATTAAAAAGTTGACAGCGCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGA:1 - chrX 8299230 5' - Doc 4275 1 74.66 AAGAGCCAGTTATATGTAAAATAAAGTGAAAATATTCGACAGTAATATGTTTAAACTATTCATTGGTGGCCCATGAGGGGAACCTTGCTCATAAGAATCATAATTAATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTGGT:1 - chr2L 15322931 5' + diver 308 1 63.70 AAAAATGTTTGATGGAAGCCAACGAAAAAGATTTGACTTTGCATATGACAACAAATCACTTTTTTGTTTGGCTTTTGCTTTGAGACAGCTTATTTGTATATATTCATATATGTTCATATAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCT:1 - chr3L 14709067 5' + opus 118 2 75.34 TTTGCTGGGGCCCCGTCTTAAAGTCCTCGAACGCCACTGAGGTCCCGCTCATGGAATCCAGAAAACAATTTTGAAAGAATTTTATTCCTCGATTCTGCTGCCTCTTCTCCAAAATAGCCGACTGGAAGAACTGTTTGCTCCAAGAT:1 - chr3L 4936848 5' + hopper2 330 1 54.11 GGATCAATCAACATGATTGAAGTACGTATCTCCGATCCACCGATTTTATTAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr3L 17904864 5' - roo 336 2 68.49 TAAGAGAGAAGGGAACCCAAAAATGTATTGTTGTAGTCCGTGTTTGTTGGCGGCATCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chrX 16526359 5' + P-element 47 1 47.29 GCAGCAGTAAAAGCGTCGTCCTGCCATTCATTTGCGTTTAAAGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr2L 18213131 5' - roo 340 2 67.88 GGGACGTCTTCGCAACTTAAAACTGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGC:1 + chr2L 11613248 5' - hobo 2869 1 81.67 ACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATAT:1 - chr3L 9762244 5' + jockey 4837 1 70.55 TTGCACAATAAACAAAAGAACTTGCCTATATAGTCGGACTGTATAAACAAACCGAATAATGTATACTGACAGCATAAACAAGCACTGCAGAACATGCAAACATTGATAACATATTAAAAAGAAAAACTAAGTTCGTTCTAAGTCAA:1 + chr3R 25058645 5' + HB 1377 1 72.60 CATAGGTTTGTATTGACCTCACCCACATTACTCTATTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGG:1 - chr3L 18034633 5' - Transpac 5150 2 76.22 TGTGTTGTTATTAGTTACGGATATATGTCCAAATTGTTGTGCCAGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAAC:2 - chr2L 11613293 5' + hobo 79 1 70.55 CTTGCTACAAAATAAACATTCAGAGCGTGCCTAAATATAGTTTACACTCTTGATCCATTGTAACAAGATCTCCGCTTGCGATGGGCTCAGCAAAAAAATTAATAGAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTAAAAGGATGGTTGAGTG:1 + chr3R 7296441 5' + invader2 336 1 67.12 TTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGA:1 - chr2L 14480529 5' - Transpac 257 2 58.39 GAATCAACTTAAGAACAACAACTATACACTACTCTACACAGACAGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGACGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTTACATCCTGCTCATCGAGGTCATACCTTGA:1 + chr3L 22907540 5' + Rt1b 4971 1 68.28 CTGCTCTACGTGCAGAACTACGCAACATCCGATGTGGTGAGTTGAATGTCCAAGTTGAGTAGTATATATATGTATGTACCTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 + chrX 19585138 5' + Transpac 4958 2 48.63 GAGAAATCTGTGGCACTACTACTTGAGTAGAAGACTCTATGCTGACAGTTTGTAAGCCATTAAAATGCTCTGCTTGTATTAGATTTCCTTCTAATTGTATTCTTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr3L 1981665 5' - opus 483 2 64.38 CGAGGTAAATTATGAAAATTAAAGGCATAATGACAGTTTTATCTTTTGCTTGAACTAGCTGTTAAATTTACATACTCTGACTGCTTCATTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTTTGGTGTTATTTTTTGCATGCA:1 + chrX 261151 5' + Cr1a 252 1 63.01 TTTGTATTTTTAAGGGCTTTTTCCGGACTCATTCGTATGCAGAGCAAGCGATTTCGTTTTGTTTTGCTGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGG:1 - chr3L 20924142 5' + invader1 105 2 47.66 CTATAAATATGAAACTGTTTAAACAGTGATTTTCTTATATATCTGATATATTTGAAATGTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chrX 20632563 5' - pogo 2041 1 60.96 GATTGTGGTCAAGTGAATGATGTGGTAGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr2L 18953092 5' + roo 8722 2 80.91 GTGTTCTTTTTTTTATAAAACTTTCGGTCCGAATTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAGC:1 + chr2R 4448000 5' - invader1 344 2 67.72 TCAGCGGATATCTTTTTGCATAAATTACATACATTTCGAACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTGAGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTC:1 + chrX 7031601 5' - hopper 1212 1 55.48 ACTTGCCATCGCGATCGTCATAAATCAAACCGCAAAAAGCCCGCAAAGATTCGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGA:1 - chr3L 16459774 5' + roo 8867 2 53.57 ACACTTGCGTTTAAAATACTAGGAATGGTAAAAAAAATATATATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACT:1 + chr3R 28659032 5' + Burdock 74 2 73.97 CGTTGTCAGCATTTTGAAGGGGAAACTTCGCCGGTATGGGCACCAGCAAAATAAGAAGAAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAAC:1 - chr3L 9520000 5' + roo 8598 1 59.59 CAATTACTTCTCTGTTTACTTAAGATTCAAATATGTAGTGAGAGGCGCCGGCCCTTGAACCTATTAGGCTGCGAATGATTATGAAGTGACCAAGGGTCCTGCGAGTTTAAGATAAAAAATCCTATGATTCAAAGTTTTAAT:1 - chr3R 4218641 5' - HB 1571 1 69.50 GATAGTGAAAAGTTGACAGGGAACACGGAACCGGTACAAGTGGCATGATCGTAATAAATACGAAAGTGCAAGTCGCTTTAAAGCTGTAGCAGCCAAATTGAATGATATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTC:1 + chrX 16146186 5' - jockey 350 1 71.92 ACAAGTCTAACTTCATTCACTACAAGTTTTATATATATATTAAACTTTTACTTATTTTCGAAAATATTTGCATACGCCTACTGAAACCCCAATCAAACATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAA:1 - chr2L 20556598 5' + invader3 5210 2 66.44 ATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAG:1 - chrY 2720330 5' - 297 328 2 76.55 TAATTATGGAAAAGTACCTTAGCTCGTTTCATACTAAAATCCTAGAAATATAATGACAAATTGTTTGCTTAGAACCTTATCAAAGGAAATGATTAGAATACTCACGAATGTATAAGTTAACACAATAACAAAACACACGAAATATA:1 + chr2L 7939687 5' + Burdock 6147 2 73.97 AACTACTTCAACTTCACAGAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:2 - chrX 14346505 5' - roo 340 2 62.76 AGCCAACCTGCGCAACTCCAACCTGCACAACGTAAGTCAGCCTCAAGGGACTTCGGGGTTAGGGTCCTTTATAAGGTCTCTTTAATATCGAAAACTTAAGTATTCCTTTGTTTTATAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTAC:1 + chr3L 2947983 5' - Circe 7028 1 76.03 CAATATAGGCCAGACGTTGTGGGCCGACCAAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr3R 18517962 5' + roo 88 2 78.77 AAGACAACACGTTTCGTGCTGCAAAAAGTTACAGTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 + chr3L 5179164 5' - P-element 2812 1 27.41 TCGATAATTAGTTTCGATGTTGATTCCTCAGATTAGTGCGAAAGAAGCACTTATTGATTTCGACGTAAAAACCCACACGTATCTATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATC:2 + chr2L 6319711 5' + Tabor 37 2 56.16 GTGCACTACAAAATTTTGAATTTCGGAGTCTAGAAGTAGGCAGATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAA:1 - chr2R 1375155 5' - 297 322 2 69.86 CCTAAGCTCATATGCCACATGGGAATTCTTGACATTAGCCGATCGCCATATCCACACTTGTTAATATTAATCGTTATGGTCCGGTGCAGGTACATTAAGCGATTTCATTTAACTAAGTTACAA:1 + chr3R 31489370 5' + Tc3 1673 1 64.23 TAGTTACTAAACGAGGAAGCTTAAGATTAAATAAAGCATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3R 12610016 5' - roo 323 2 76.03 TATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAATAAGAATACCCTGGACAATTC:1 - chr3L 23702226 5' + G4 15 1 49.28 ACAATTTCTTGGCCAACATCTTTATGGAGAGTATGGCGAGATATTTATCTATGGATGGAAAATATTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTTCATTTTTT:1 - chrX 5366258 5' + pogo 51 1 54.79 CTCCAACGTGATTGAATTCCATCGAACGCAGGTTGACCAATGACCGGACTTGGGCATCAGAACCCTTCAAGGGGGCAGGAAGGAAGCAGGGGGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTTATGCATTGTA:1 + chr3R 16166004 5' + 1360 186 1 67.39 TCGCAAATGAAGGCTTCCCGAAGGAAGCGCTGGGCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTT:1 - chr2L 14932443 5' + I-element 311 1 76.71 AATTTCCAGGTTGTTTTCTTTAATTAATTGCTAAAAATGGTGTTGCATGTTTAACTTTAAAACTTTATAGTATTCCCTGTATCGTGCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAG:1 - chr3R 904729 5' - 3S18 304 2 60.27 CTAGAACTAGTTTACTTTCTAGCCACTGTGTTCAACGCTCATCAACCTGATTTACCTATTAAATCATGACTGTGTGCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3R 30302246 5' + Doc 49 1 54.11 ACTTTGAAAAAATAAACTAAGAAATCAAAGAATTATTATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTAA:1 + chr2R 9874776 5' - S-element 1635 2 78.08 CCATCAGACAATACCAGTACATTTACAACTTAGTACATACATATGTACGCATACAAAAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTTTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCATTT:1 + chr2R 982342 5' - rooA 245 2 46.21 TTAATATTATATTATATTATAATTATATATTATCGATATAGCTAATATAGGGAGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAA:1 - chr3L 1251818 5' + Stalker 70 4 65.75 TTTTAGCCAAAATTAAACCCTTTTCAACGTGTCTCTGATCTTTAATTTGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATT:1 + chr3L 17206922 5' - I-element 5281 1 69.18 ATTGCGATGCGACGCCAACCTCCGTACACAGTGTATATTTTCGACATTCAACAAATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chr3R 5868179 5' + jockey 75 1 63.01 TTGGCCCTTTTTGTGAATGAGCTCATAAAACGTTTTTCTTTTCACAGCGCGCTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTT:1 - chr2R 8335005 5' - transib2 2748 1 69.86 CCTTTTTTTTCGCTTTTTACTTTTTGCTTTCCAACACCCTCATAACTGGTAATGCAATTTTCAAGGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTT:1 + chr2L 12832840 5' + I-element 57 1 54.11 GCTGCTTGCCGCCAACTGGTAGGCATCCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAA:1 + chrX 18462462 5' + I-element 204 1 74.00 GATTTACCTATTAAATCATGACTGTGTGCACATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACAAAGTGTATAGTGCAGTTT:1 + chr3R 30302294 5' + Doc 97 1 76.03 GAAAAGAACGCAATATTATTGGGTTGCTAAATATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:2 + chr2R 24021544 5' + pogo 52 1 56.16 CATTTCCTCCGCCTCACCGGCTCAAGTTCCCACGCCTATGACAGCTTTTCATTTAGCAGATGCCGGGGACGCTGGGTTCTGTTATTTTTTTTTTATTTTTATTTTTT:1 + chr3R 12799469 5' + hopper 147 111 79.44 GTAGATGGGATCTCTAAGATTGGACGTAGCCGAGCCCAACATACTAGGTTGATTTATTCCCTGTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr3L 14084998 5' - opus 7477 2 68.31 GGTGCTATCTGCGGTTGTGTTAGCCCGAAAAGCGGAGCTTTTTACGCGCACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTCAACACATCATCGGACACTCAAC:1 + chr2R 12069541 5' + Tirant 8146 2 60.27 ATATTGAAAGGGTATCTGATATATGTGGAAATTCTTTTGTTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTATTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTAC:2 + chr2L 22121305 5' - I-element 5340 1 49.32 CTTATAGTTGAATCCCTTTTTGAAAACCCTTCCCTTTTTCTATTTGAGCCACAAAAACAATAACGAAGAGGTGGAGGCTCGGGAACAGCCTGACACATAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAA:1 + chr2R 22967748 5' + Stalker 6892 4 66.44 AAAGTCATTTGCAATCCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr2R 12814871 5' - opus 7487 2 71.67 GCCCTAAAAAACATTCAGAAAATTGAAGAGAAAGTTGGATTTAAATACTTTTAAAGAGTTAATTCCAGGCAATCACATAATTGGGCTTGCTAATCATTTATTAAACCTATTGGTCTAATAAATAAATTTTAAAAATTACTTTATTT:1 + chr3L 5025478 5' + 1360 377 1 70.55 ATCTTCAGTGTGTTTGAGTCAACTCTGAATGGCGGAGGGACCAGTGGCGTGGATCTCATCTACGACGAAGCAACCGCCTAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTGTTTGAAAAT:1 - chr2L 9580239 5' + 1360 312 1 63.49 CGGGACTAGTGTTGGCCACTCTAGAATTGGCTAAATTCGTACTGTGTTAGCTGGATTTTCGAAAAAATGAGCTTCTTCGTATTAATATTTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATT:1 - chr3R 29113003 5' - Juan 4181 1 54.79 ATCAAGAATGAAGAAAGTGCCTTTTAACCCTTTAAGCCCTGAAAACTTCTGACTGGAAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 - chr3R 5478050 5' + 297 6641 2 60.96 ATTTTCCAAACTTTATTGTTATAGGCCGTACAATAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr2R 19556041 5' + F-element 4685 2 82.00 GCTTATAAATATCTTATAATTTATATGGCCAATTACTAAAATCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chrX 11267782 5' - roo 8994 2 78.77 TCAACTAATTAACATTTTTAATGGCGAATCCTTGTAAGCAAACCTTGGATGTGTCTGGAATCGGGGGAGTGGAAAAGTGTGGGGAGGGGAGCTCTTGCGTTATTTTCCTGGCACCGTTATTGAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTT:1 + chr3L 396560 5' - Tc1 1244 1 71.92 AGATCCTTCAAATAACCCGAGTGGCCAAGAGCGATAATGATTTTGATGCCCTGTGCCTTCAGTTTTTTTGCTTCAACACTTTGGAGTAATATTTTCGATATTAAGTGGATTTACATGTTTCCTTTCGCGATTTTGTGCGTCAG:1 - chr2R 17491795 5' - invader4 3046 2 81.12 AGTGGGAGCGTTTTACCCACCAAATCGCGTCACCTGATATGTAAAGTGGGAAAAAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTG:1 - chr2L 7603332 5' - INE-1 539 1 52.68 CCATAATATATACTTCATCTTGAACTAACTATTTATTTTCATTCATTGAATTGATTGAAAAATTGAATTCGGATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chrX 19005353 5' + F-element 54 1 49.64 GAACCAGAAAATCGGGAAGCCGAATAAAGGAAGGCAAAAAGCAAAGTGAAAACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 + chr3L 14708919 5' - opus 7438 2 67.12 TCTGACTCAATGAGAATCCAACTTGAGTCTTGCCGGCTCAGATAAGCCCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGTGGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 + chr3L 13228425 5' - P-element 2869 1 72.14 GGTTCGTTGGCAATTTTTTGGCGCTGTTTTTCCAGCACGCATGACGCGCGAGGTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTG:1 + chr3R 6411973 5' - Tirant 387 2 60.24 CTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3L 23456281 5' - 1360 3341 1 54.86 AAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACACCCACTTAACGTAT:1 + chrX 12003952 5' - P-element 2853 1 34.57 GGGATAAGGGTAATCAGTTAGTATGTAAAAGGTAATTAGTTCGCTACAACTTCAAAGGCGTTCGGGAATTTAAAACTCCAGTAGATACATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCGGCCACTTCAATTATT:1 + chrX 22738522 5' + 297 6602 2 80.00 TTTTAAAAAAAAGTACAAACTTTTCGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCG:1 + chr2L 20928043 5' + Chimpo 2 1 73.00 GGTTGCCAAGGCCTAATGCACTGATACTAATTTGCCGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTT:3 + chr3R 5115310 5' + Ivk 99 1 73.97 TGAATAACTTATATAGTACGAATGTTGATAGTTGTGTTCGCTGTGTGTTTTCTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 + chr3L 15859570 5' + I-element 16 1 73.97 CGCAAGAATTAATGAACCTCTCGAGTGTGTTTTAAAACGCGCCAAGATAAATCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 + chr3L 6675300 5' - 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chr2L 2517923 5' - micropia 5303 1 54.11 ATTAAACCGCAGATACCTTCGATGGCGAACAACTTGCACGGCTTTCGATGTGACATTGAAAAGCCATCAAGTGCAAGGGCTCAAAGCCAGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTC:1 - chr2R 16879381 5' - roo 18 2 58.90 CCAAACAAATATCGGATTATATTTTTGTTTCAAGTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3R 4661951 5' - roo 8987 2 77.93 TTTGAACCGGTTTTGATTCATAATCCACCCGCCCAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTAT:1 + chr2R 11339087 5' + jockey 95 1 73.97 AAGGCAAAGGCAGAGCAAGCCACCAAATCCAGACCGGCCACCTCTATCAGCAAGCCCTGCACCACCCAGCTTCCAACAAATGTTTGCTCGCTTTGAAGGCATGGTCGA:1 + chr2R 5893689 5' + G2 176 1 59.26 TTTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAA:1 + chr3R 1135321 5' - Cr1a 4313 1 79.07 TTTTATAAAGTGCGTCATATTAGCGTCGTTGAGGAACAGTGAAATTTGTAACATGGGTAGGTTTTTTTTTTATTTTATTTGAAGGTGAAAGGATGTGTTGGTTCATAGCTGGACCTACTGTTATGAAATTATCTCAAAAATTTTC:1 - chr2R 16186332 5' + Ivk 5236 1 59.31 CATGATGTCGCAGAAAATATGTTCATCCAATAATAAACATAAGCAAACAAAGAAGTATATCTTTTTTATCCATTATCCTCTATTATATTCTTATCAATTAGAATTTTATTTTATTTTATTTATTAT:1 - chr3L 4683993 5' + transib1 1902 1 43.65 GGAAGGAAACTCTTCTGACCTTATGTAGTACATAGGATTTTAACCATGACTATTATGTCCGTTTTTCTGTCCGTATGAACGACCTAAAAAGCTGAGTCAAGGTAGTGCCAAAGACAAGATGCGTAACGCTATACGATTTTTTGTCA:1 + chrX 6757124 5' + 1360 28 1 65.07 GCCCAATTGAATAAATTCAAAAACGAATTTTTTTTAAGTAAGCCATGTCAGGTTAGACTATGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAA:1 - chr3R 4422059 5' - 1360 3328 1 60.27 GCATTTGCCAGTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATCTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr2L 11867420 5' + jockey 29 1 68.06 AAAATATTGATTGCGTAAGTGGGCAAAGCGAATGTCACAGATAACGCAAAACTTTTGGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3L 17904776 5' + roo 8727 2 64.38 ATTTTAAAAAAGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAG:1 + chr2L 17957183 5' - blood 300 2 71.23 GCCTGTGGCAATGGGAACTTTAAAATTAGCCAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGGTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCT:1 + chr2L 11079423 5' - 1360 3323 1 74.80 AAAGCCATCTTTCTTTTGACCATCTTTCTCAAGTGATCTATACTTTTCAAAATATTCAGAACAGCTTAAATATCGTATTCACAACCCACAAAACTCAATAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTATCCATAT:1 + chrX 7644526 5' + R1A1-element 5007 1 67.12 AAAGCAGCACAGCTAAAAATCTAATAAACTCGTCGAAACACAACAAATAAGTGAAGTATAAAATATTTAAACTAGATTATCTGACAGACAGCCATTGTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTT:1 + chr2R 21425017 5' - HMS-Beagle2 7183 2 75.91 GCCGTTTTTAATTAAAAAACTTTTGCAATTAAAATTATTTTCGCTCGCAAAACTTGGCAAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAATTATCTTCAAACAGATGTCATCTACACTGATTTTAGTAAAGCATTTGACTCTGTTAAT:1 - chr2R 18328394 5' + Q-element 324 2 59.59 AACTGTTCAAAGTGGGTTCTGTTTTGTGCTTCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGA:1 - chrY 3648896 5' - Stalker2 158 6 74.66 ATTCTTATACTTTTGTATTTATTTATTCGTAAACTATTTTATTCCTTTTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGAACATCGCGGG:1 + chrX 18190358 5' + hobo 68 1 63.57 TGATGTTTCCCTATTGAGTTTCTGTGTTGCATATCCGCAGGCGCGCAATTTGTTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGTAACTTAATTTGTTCTGCTTAAATTATTTT:1 - chr3R 5868260 5' - jockey 4935 1 61.38 GAAATCGAACCAAATAATAACAAGCATATAAAACTGAAAAAAAACTATCAAGCGCCACAATAAACAACAAAATAAAAACCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAA:1 + chr2L 13282205 5' + I-element 5174 1 56.16 AGAGCCCAGGAAATTGCAATTGTATTTACCCGTATATGTTTGTTTGTCCGTGTGTGTGTGTGTAATGTGCGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chrX 5145826 5' - hobo 2907 1 55.12 GTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTCGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTACTTGCGAGTGCACAC:1 - chrX 22824238 5' - gypsy12 10158 2 52.17 GAGATTTGTATATAATATATATACTTAATTACGTATATCTAATTATTATACCCACACTAACATGCACACTCACTCCCACTCCCACACAACCACACACACACACAC:1 - chr2R 7737350 5' + gypsy3 418 1 53.33 GACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGC:1 - chr3L 23678162 5' + Osvaldo 14 2 66.35 GGATTGGGGTCTGGGAAATGCATTTTCATTTTTCTTGATTTCGCGCATAAAATGCGCATAAGCCTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr2R 20739138 5' + hobo 23 1 69.86 CGCCTAATTGTGAGCGATGGGAATGGGATATTTACTGTCACTACATTATCACACATTATCAAGATAATATTTTTAGTTAGTAGATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTT:1 - chr2R 12281824 5' + Transpac 145 2 52.74 GAAGAGGATAAGAAGCAGCAGAAAATGTATTAATTAAAATAGAACCATACAGTTAGGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTC:1 - chrX 19597105 5' - 1360 3322 1 65.75 GCGTAGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGCCAGCACAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGC:1 - chr2R 2308827 5' + McClintock 5996 2 69.86 CCTCGGGTCTAGCTTTCGAATCAAATCGCAGAATCCCATATCTTCAACAATAGAAAAGGGTTGGACATCTAGCGCGATCATACGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTTA:1 - chr2R 6492944 5' - copia 251 1 57.93 GCATTTGGCTATTAGAAATTATAACGACAAAGAAGAATTCTACATTTCATGGTTTCGATATGATTTGTTTCCCAGATTTTTATGATACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3R 14494139 5' - roo 400 1 76.23 CAATTTGGTGTTATACCTAATGATTTTCTGTCTTTGTATATGGCACTTTCTACTATGATTATTCTGCACATAATTGTAAAGCTAAATATCTTTGTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATT:1 - chr2L 261091 5' - Juan 4181 1 65.07 CATAAAACTCTGATAAAAAAAAAGCATTGGATAAAAAAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3L 18792387 5' - roo 9037 1 59.59 AAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 + chr3R 4532883 5' - 1360 3333 1 64.62 TAAATACAATACTCGTATTGCAACAAATTATTGTCTGACAAAAAAATATTTAGTTTATTTTAGATAAAATTCCCAAACCAAATAACTTTATCTGCATATCTGGATGATCTGAGAAGTTCGTAAATGCTGTTGATTCTCCATGTCAT:1 - chr3R 26119510 5' - Burdock 5934 1 59.59 GCAGGCTGAAGGATTATGAAAAGCCGCTGAGTGTATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGA:3 + chr3L 18972851 5' - mdg1 335 2 77.40 TTACAAATCGACAACGAATAATTAACCAACATTTTTGCGCGATTAGAAAACTTATTGACGTCATTCATGTACATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAG:1 + chr2L 13509174 5' + F-element 4642 1 55.17 GCCTCCTGGCCATTCCTCAACTTTTGGCCAAGAAGTACACTCGGTTTCCCTTTTTCGAGTGGGTCAGTGCAAAGACCCTAGAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTCA:1 - chr3R 30262959 5' + Tc3 314 1 58.47 CCAAAAAGGAAGGTTTTCAAACAATTGTTTTTGGAAATGAGCGAAATTTCTTAATTTCTTACTCTCATGTCATTTAGCAATAATTTGTGTATAAATAATTCGAATCTCCACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTT:1 + chrX 19872543 5' - INE-1 34 1 68.97 AGCGAAAAACTTGTTTTTGCAGTTTGGCAAACTTTTTCTTAGACAAAACACAGATAAGATTCAGAAAATAATTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGAA:1 - chr2R 6700046 5' + roo 460 1 50.71 AACATTTTCCGAAATGATTTACACTCCATTATATTAAATAAATTCAATGGAGATGCAGGTCACAGTGGTCCTTTATAAAATTATATGTAAATATAATAAATAAATAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTA:1 - chr2L 17166397 5' + I-element 5299 1 63.70 AATACGCAGTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAA:1 - chrX 1018163 5' + 1360 232 1 69.18 GCTTTGCCTCCAGCAAATGGTAGCTCTATAGTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3L 10442843 5' - roo 329 2 79.26 GTCAATTAACTTTTTATTGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 - chr2L 14480545 5' - Transpac 5186 2 55.24 ACTACTTCAACTTCACAGAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chrX 14346504 5' - roo 9002 2 63.70 ACGTCTGCTTGGAATGAAAGTTGGCTTATAACTGGTTTTAATGTCCCACAGAAGTTTGTAACGAACCGCACTCCAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 + chrX 12003878 5' - P-element 2873 1 74.07 ATACGTGCGAGCACTGAGTTTTTCTAGTTCTCTTGCCCAAGTGACAACTCAAAGTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2R 7899198 5' + roo 8730 2 63.45 CAACTGATAAAAGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAAC:1 - chrX 21636267 5' + Stalker2 7308 2 58.22 GAAAAGCGGAGCTTTTTACGCGCACTTTTAGCCACGCGGATGATAAATGGTAGCGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr2R 12069567 5' + Tirant 42 2 53.66 TTCGAAGAGAGTGAGAGAGGCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:1 + chrX 10806906 5' - P-element 2819 1 22.61 ATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chrY 2720343 5' + 297 39 2 76.53 AGCTCAGTCCGGTTGAGTGGCAGGGCCTGCCCCCCCGTTCTCGCGGGGGGTGGGTTTTTTTTGGTTCTTTTTTTTTTGTTTTCTTTTTTTTTCCTTTTCTTTTTTT:1 + chrX 6893615 5' - Doc2-element 237 4 39.62 TTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGTATTCTCTC:1 + chrX 15408745 5' + INE-1 575 1 87.67 CAGAAACCCTTTTATAAGAATTCTTCACCTAAACCTAACTGTGTTGTCCGCACCAAACTAAACAAAACACTAAAGAAAAACCAGAAAAATACATTGCTACGCCATAAGGCTAGCAATATAACTAAGGGGGGGGAAGTCAAGCCCTC:2 - chr3R 5291960 5' + gypsy 352 2 60.96 ATATGCTAGAACTTTTATTAATATTTTCAAATTATTACTTAGCTATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATATATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAAT:1 - chrX 22460237 5' + HB 2 1 76.71 GATTTTAAAATAGATCAGTTCAAGCAACAACTGAAGTTGCTCAATTTAAAAGCTGTGCAAAAAAATCACAGTATCAATTGAAATGTTAACTTTGAAATGCCTGTATTTTTAGTTGAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGC:2 + chrX 10128113 5' + invader3 5 2 75.34 CACATATGAGTCTCATGCTCAGTTTTATCTGCTGCACTGCACGCGGCACATTTGCATATTTCGTGCACAGGAGGAGCTGCGTTTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 + chr3R 25843319 5' - I-element 5326 1 59.59 ACCCATACGAACACAGAGAGAGACAGTCACAGATTGGGGCATGTTAATTTGTAGGCCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 18213236 5' + roo 22 2 66.14 AGTTGCGTGCATAGAAACGAGTGTGCGGCATTTTGTCGGGAATGTACGTAATTATCCATTGAATGCCGGATCACGACGACGACGACGATTTAACTCTTAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 - chrX 18737348 5' + I-element 6 1 78.63 CGGCTCGTTAGCTTTCCGTCCTGCGTCCTTCATCTTCATGGTCTTCGTCCAGGCGGCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chrX 2916757 5' + 412 42 2 54.03 CTTTAATTGACTTTGAATTGGCAATGGTGGCGGCGACCAGGCAAAAAACCCAAACCCAAAACCACCTCACGTATGTGCCATAATAATAATTTATGAGCCTACACTTTTGTTTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTGCT:1 - chrX 18191115 5' + hobo 72 1 64.38 TCTATGCGAGACGACGAGCGGCGGGTGATGATGTTGCATGGTGAGGCTGGTGTTGCCTTTGCTGTTTCGGCTGCTCCTATTATTATTATTTTTATTATTATT:1 - chr2L 20322056 5' - mdg1 25 2 70.59 GCTTGAAATTACATTTTTCGCATTAATAAAAATGAAATAAAAATAAAAACCGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAA:1 - chr3R 25843427 5' + I-element 76 1 66.44 ATCATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTA:1 - chr3L 15099681 5' + G4 3815 1 52.74 CACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATTGGCACACGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 - chr2R 1982172 5' + 1360 67 1 66.67 TGTGCCTGCAGGAACCAATCCAAGGGAATTTAAGCGTGTCCAGCAACTAGTCAGTATTATAATACTCTTAGTCCCAATGAACTTTGTTAACAAGTGTAAGCTTTTTCAAACAGATTAAGGTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTG:1 - chr2R 19408510 5' - F-element 4657 1 80.82 GAAAATACCCACCGTGCAAAGAAGTGAAAAGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3R 4661998 5' + roo 8738 2 77.69 GCCACATGGCGATGCCAACTGCAGTCGTCGCAGAATTTGCCTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTT:1 + chr2L 7271837 5' - 297 6911 2 70.37 TACTTTCTCGCCATTTGCAACTTTGAAACTGTGTAAAGAGCTTTAAAGGTCTTATTTTCGACACAATTTCACACATTTCGAAGCTGTGAAAATGTCTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 - chr2R 11595961 5' - P-element 2863 1 66.44 CAGAAAAACATATTAAGTCTTTAAAATAAATAAATAAAATAAGAGCACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCA:1 + chr3R 904620 5' + 3S18 59 2 66.41 TCTTGCCCAAGTGACAACTCAAAGTTACTGTTCACGCATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTACGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTCAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACA:1 - chr2R 7899168 5' + roo 97 2 80.14 CCATCGAATGGATAGACTGCATGGATATACTAATTAATGACAATTATTATTAAATAGACACAAATTGAAGGGAAAAGTTAATTAAAGAAAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCA:1 + chr2L 10151861 5' + jockey 4586 1 60.00 CTTGGCTGGCGGTAGAGCTCTACCCACTCTACTACCGAGTCTAAGACCTTCTTACGGGGCATTGCCGTCTCACAGCCATTTTCACAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTG:1 - chr2L 22298953 5' + baggins 5215 1 69.18 AGAGTAAGTCGCTGATGTGGAGAAAGTGGGACGAAGTGGAACATACATCTTCTACCCCCAGCGGGAGTTTCCTGCTTATAAGGAAGCAGGTGCCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 + chr2R 14722627 5' - mdg1 405 2 71.22 CAGATAGCAAAGTTAACATATACCGATATTAAGACACCAATATTCACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAG:1 - chrX 15565591 5' - transib2 2750 1 67.81 AATAAGGATAAGACAGTGCTTGCACTTAGGAAAACTCAGTCCTAATGCTAATTTAGAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 - chr3R 8914354 5' - pogo 2037 1 63.70 AAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCAC:2 - chrX 10128280 5' - invader3 214 2 60.27 AACAACAACTCAAAAAGCTAGAAAAGCGAGGGTGGATCGATGGGTTCTAATAAATGGAGAAAATGTGACAAATGAGCCTTTTTATTATAATTATTTATTATTCATTAGTCACTGAGAATCGTTCAGTTTCTTCTGAACTTCACCTA:2 + chr2L 15203991 5' - G5A 2794 1 78.08 GAGATACAGAGAAATAGTACTCAAATAATAATATACAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 + chr3L 18789013 5' + 1360 74 1 71.92 CAAAACCATACCATAAAAAACTGGTAACCAACTTGAACACATTTTATGAATACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAG:1 - chrX 21581434 5' + Tabor 6911 2 64.38 AAACAAATGGTGAAATACCCAAAGTCTTGGATCAACTGATAAAAGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGCAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTA:1 - chrX 21636298 5' + Stalker2 7276 2 62.33 TGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr3R 6412047 5' + Tirant 61 2 66.15 GAATGGTATATTTTGTGAATAATTTACCACATAAATTTCATTGGCCAGATACTCTCACAATTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chr3R 9193139 5' + opus 39 4 53.85 ACCAGTTAAACGGCAGCCAAGCAAAATCCACCAGCTGCCATCTGGGAATGGAAAAAGTCGATTTCCCGCTCTCCATCATCCAACCCGCCAAACTCTTATGCATTTCAATCATGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCG:1 - chr3L 10129365 5' - 1360 3198 1 78.72 GCTCAAAGTGAATTTTCCTTTCATTTGCTAAATGTTGTTAATTGTATTCAGTTTCGTGATGACTTCCTCCAGCTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTA:1 + chr2R 8966136 5' + BS 5046 1 50.68 TTGACAGCAAATTGAATTAGAAACGCATTTTAACGAACAAAAGTGAGCGGCAAATAGTGATGGTCAGATATCGATATAGAAGATAGATAGTAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCG:1 - chr3L 11898513 5' - opus 7365 2 64.38 ACTTCACAGGCAAAGTTAAATTATTAGCTGTAGGAAATAAAAAATGTTATTGTTTATGTTTAATGTTTATTTTAAATTTATCATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 + chr3R 19721028 5' + opus 145 4 60.96 GGTAAGAAACTGGACATCGAACTCGACTTTTTTGTGGCCAAGGACGAGCCGCACCAAGTGTCCCTGCCCACGATGATATACTTTTACATTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGGTGTAACATGA:1 - chr2R 23319093 5' + 412 107 2 58.90 ATCATCAAATCAAATTTTTGCCTCCATTTTGCGCGTTTAATTTGGCCCCAGCTATAATTTGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr3R 23668530 5' + pogo 58 1 60.27 GATTTATGTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chr3R 6412055 5' + Tirant 8136 2 55.66 ATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3L 13827454 5' - roo 8989 2 76.60 CCTCGCATGGACAAAAGTGCTTACAAACAGTTCTAAATTTATCACTATTTGATTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTG:1 - chrX 18740216 5' - I-element 106 1 63.70 GTGCCAAGCGAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chr3R 6412048 5' + Tirant 35 2 57.14 ATTCTGCTTAATATATTTTCGGAAACATCATTCGTATGAAACAGCAATCTTTTCCTCAGTTAAGCATACAACTGTTATTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTG:1 - chr2L 20023843 5' - HMS-Beagle2 7049 2 72.90 AAGTTATTCTCTTTCCTAGCATTGTCCTAGTTTAAACAGCGCGCTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACA:1 + chr3L 13156725 5' - transib2 2740 1 75.34 ATCGTTTTTGTTCCGACGGGTTCTTCGAGTGCTCCATCACTTCCATCCACCATTCCTTACCATGTGGTCACACATGAACACGTATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCCTATGTAACTGAATCGAGAGCG:1 + chrX 14346412 5' + roo 8724 2 51.03 ACCATTTGCCGGCCATTTGCTTTCAACGTTTTTTATGCATACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr3L 13545057 5' + hobo 65 1 68.94 AATGAATCAATATGAATTCATCGAATATTTCAACCGAGAACAATGCATGTTTAATAAATTCAGATTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAA:1 - chr3L 17205538 5' - I-element 5091 1 56.16 GATGCTCCCCAGTTTCAAAATCCATATTCGTATTACCTACATATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1 - chr2R 17021404 5' + pogo 68 1 73.57 CGACGCGATAACTGTCGAGCGGCATAATCACTATTCTCACGTATTTTCGTTTTGGTTTTGAACTTTTAACGAATACATCCGGTCATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1 - chr2L 21394054 5' + flea 35 2 42.47 AAAAGCAGCATTCCTTCTGGAATGCCCCTCCCATATTTGTCTTATTGGAGCCGGTTTCTGCTTCAGTTGGGAAAACAAAAACAAAACGAAAAGCTTTGGCCGCAACAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCAT:1 - chrX 10547965 5' - Cr1a 4179 1 73.97 AAACAAAGAAAATTTTGGAGAAACGGAATCTGTAGCGAGTGAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAGTGTACGCACAGTGGTAAGAAACACAGAAGAAAAAACCAGCGCTTCAAAGTAAAAAGAGCAAGGGTATTCG:1 + chr2R 350587 5' + rooA 465 1 77.40 AATAGATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATC:1 - chr3L 4933799 5' + blood 82 2 74.66 GATTACACACTCCATCGTCGATATATTAAGGCAAACGTTTTCACTTCGGTCTTTTCAAGTCTAGAATTTTATTGTTTTTTGGATACTATGATAAAATAGATGTTTGTCATCCTATAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAT:1 - chr2L 16325838 5' + I-element 436 1 53.10 AAGTACTAACATTAATTAGTTAATTGACAAAGCTCTTGGATTAATTCAGGAAGACATCATATAAATTACCTAGTCTTTCCATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3R 24976325 5' + roo 25 2 63.08 ACTCTGCACATAGGTACATAAGTACGTACATATGTCTGCATATAAAAAATGCAAATGGTTTATGGCTGGGGTGTCTTCTGAACATTAGGGGGACGTTAAAAGAGCTAGAATGTATTTTTTTGCATTATACAAATAATAATAATTTT:1 + chr3R 11774675 5' + P-element 2496 1 63.70 ACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGACGGATGT:1 - 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invader2 5020 2 76.03 AAGCCTTTTTTCGGGGCCTGAGAACTGAGAACGGCAAAAAGGAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chrX 8760098 5' - roo 329 2 68.49 GCTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACA:1 - chr3R 934265 5' - Rt1b 4714 1 42.47 TTACAAGCTAATTAACCAAAGAATAGCTAAACAAATGCGAGCATTTGTTTATTAGATGCTCATATGTTTATTACATAGAAAAGTTACCAGATAGTAATGGTACGTGACGAACCAGGAATCGAAAGAGATCTGAAAGTTACCCCTCT:1 - chr2L 11160801 5' + G5 4514 1 60.96 TATGGCGAGATATTTATCTATGGATGGAAAATATTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chrX 5366227 5' + pogo 21 1 61.18 AAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATA:1 - chr3R 21276627 5' - BS 5036 1 56.16 AACCGCCAGCGAAAACTCATGTGCGAATAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chrX 11661340 5' + 297 23 2 67.39 CTGGAAAGTAGTGAACGAAAAAGCGCAACCGCGCACGATGGGCTGGAAAAGATAAATGGGCAAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCTACC:1 + chr2R 14940663 5' - blood 7337 1 55.71 TTTTTAGCGGGCGCTGAGCTGAAAACAATGCTGGCGACTTCAAGTGGCCCACACCGCAGACATAAAACCCAAACCAAAAAAAAAATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAA:1 + chrX 17472092 5' - Quasimodo 7334 2 63.01 GAGTCCACGTACGCAGTAATGTGAAAAGGCTTAAACATATCCAATTTCATACTTTCCCAAATGCCAAACGAAATGTCATTATAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAAT:1 + chrX 6423151 5' - roo 9026 1 52.74 AATGGCTGTAAAACATAATAACCATGCTATGGATAATTTATCTATAGCGGGTGGAATAATAGGTAATAACTACCTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr3L 14084845 5' + opus 150 4 58.57 ATATTAATTCGCTGGAAGTCAAAACTCAGCGAAGAAAATATTAAATATATCTTTACCGTGTGTACCTTGGGTACATTTAAATGTATGCAAGATATCCAATTGAGATAGATGGCAATGCCAAAGTGTCAAGTAATAAAAAATAAAAA:1 + chrX 18977239 5' + Rt1b 5145 1 67.12 AATATAAAAATTACAAATAAAAAATAAGATTTAAAATAAGAGTCAGCTTCTGCGGGCCCCTGTCAAAGGAG:1 + chr3R 14348692 5' - X-element 4525 1 60.56 ACTCAAGTGCATTCGAATCTAACAAAAAGTTCTCAAAACTTTTTAAACAATAATCAATAACCCGGAAATGCGAATCGAAGTGACCTAATCGATAATAAAATACGTTGATTAATAGCTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 - chr2L 13510936 5' + diver 5895 2 80.14 GTTATTTATGTGTATGGTTTTACGAAAATACGAATGATCATTAGAATCCGTATGCTGGATCTTCCATCTTTTATATTTTGTATTGATCCATATCAAGGATATATCTACTATATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACAT:1 - chr2R 18487359 5' - INE-1 30 1 52.74 CATATAAAATAGAAGCAAAATGCATAAGTATCATTGTAGAAGATTTAATTTTAAACTTTAGGCATCTGTTAAGATTAGTTATAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3R 8914226 5' + pogo 33 1 61.38 GGGAAAACATTTAATATTATCTTACTATGAAGTAAACGTGCAATGAAAATATACGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAA:1 - chr3L 13156797 5' + transib2 67 1 66.44 AGTCTTTAAAATAAATAAATAAAATAAGAGCACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGCATC:1 + chr3R 904635 5' + 3S18 92 2 79.45 TTTGAAAATAGTTTTTGAAAGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGTGAAAGAGACCTACTAGGTTATCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGAGAATGCCATAGTCTAGTTCCCCGGCTATCAGATACCCGTTACTCA:1 + chr3R 18346590 5' - INE-1 548 1 50.68 CCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 + chr3L 13228496 5' - P-element 2792 1 20.55 ATTGCTGCTTAAATGTAATCGCCAGCCATCTGCAATCTTTTTAGCCAAAATTAAACCCTTTTCAACGTGTCTCTGATCTTTAATTTGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:1 + chr3L 17206884 5' - I-element 5320 1 60.69 CGCCTATAAATATGCAGCACTTGGCTGTGATTATTGCGCGGACTCATGCTTTTCTCTGCTCTCTTCTTTGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chrX 850154 5' + jockey 59 1 50.00 TTGCTACGAAATTGGCCAAAACTCCCCAAATACGTAAAGTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCAGAAAACCGTCTTCTTACACAAATACGCACCTAAACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGC:1 + chrX 3703806 5' + 1360 3283 1 66.44 GGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 27188618 5' - roo 356 2 61.29 AAACAATTAAACCGAGAAAAGAAGGAAGCAAAAGAACCCCATTTCATGCCAAAACAAAACACCAAAAAAAAAAAGGAAAAGAAAAACAA:1 - chr3L 10780914 5' + gypsy7 5009 1 68.54 TATAAAATAAAAAATAAAATATTTCTACTTCCACCTCTTTCGATAGAAATATTACATCTACACATATACACTAGAATTACAATATGCATATTATCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGT:1 - chr3R 26900181 5' - baggins 5131 1 35.62 CTATAAATATGTAAATTTTTCCTTTCAACTGCATTGAAAGGAAAACGTGGCTTATATCTGCCCAGATAATATTAATTGCCGCTGCAAAAGCAAAGTAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3L 5476477 5' + F-element 4678 1 76.36 TTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3L 19574034 5' + 297 47 2 55.86 GCACACACATCGACTTGTTTATGCCAAATATGCGTGGCTGTTCTGTTTGTATATGGCTAACTAATTGCCTGGTCTCTGTTGATGCTGATGTAGGTGCTGTTCTTGTTGTTATTGTTGTTGGCTTT:1 + chr3L 16480196 5' + transib3 338 1 85.60 TGTACTAGTTTTTAGAGTATTTAAAATGGAGCACTCGGATGTGGCAATTTATCATGATACGAATTTGTTATTATTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATAT:1 + chr2R 13212193 5' + diver 5935 2 51.03 AGCGAAACAAAATCTCGTGTCTTGAATATTGGAAGTTACATTGTGCAGCGAAACTTTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr3R 10636193 5' + blood 7075 2 61.11 AAGCCCAAGGTCCCGAAACGGTAACCAGCATATATACATACCCTGTTAGAGTATTTAAGATTCAACTCATTAAAGCTTAATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATCATTTG:1 + chrX 15062287 5' + 1360 307 1 51.37 ATAGATGCGCTAGTTAATGAAGTTATTTTCCCTTTAATATTTGTGTGTTTGCAAAGATGCCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chrX 11953115 5' - roo 348 2 58.62 ATTATGCTCCGCATATTCTAGCTGACTACCACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTTCTT:1 - chr3R 2533981 5' - gypsy8 251 4 64.06 CTGGAAATGTTTGCCATGGTTTAATTTAAAATCGAAAGTCATTTGCAATCCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGGGG:1 + chr2R 12814837 5' - opus 7437 2 63.19 AAATTGGCAAGCGAACCTCTTGAAAGCGAAGTCTAATTAGGCAATGTCTCAAATGAAGGGAAATGGGAGCAGAGACTCAAGACTCAAGATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAACGCTGG:1 + chr3L 16703750 5' + FB 32 1 63.19 ATTAATGAAAATACCACAAAAAATAAACCAATGCCAATAAATTATTTCTAACATAGCTATTAAATTTAGTTACTATATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr2R 17021294 5' - pogo 2059 1 54.11 TAGACAATAAACTTCCCTTCTGTCTTTTCTCTTGACAATTTCTTGGCCAACATCTTTATGGAGAGTATGGCGAGATATTTATCTATGGATGGAAAATATTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chrX 5366292 5' + pogo 17 1 73.97 GCTGCGTTTATGTTTCTTAGCTCGAATTATATATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCGCTCCGCCCGCGAGACGTACACTTCCTCGGTTGCGACATATTCACGCGTCTGCTTTCTCAGAGTTTTC:1 + chr2R 5045600 5' - 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chr3L 20399113 5' - roo 9055 2 71.43 GATAATATTTCCCAATTTATATGTAATTTTATATTTCTTTCATATAATAATATGAATCCATTTGTATTATACATTAATAATCCAACTTTACAGGCAGTGCAATATTTTTTCTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGG:1 - chrX 23210711 5' - X-element 4520 1 73.38 CTGACCTACAATGACCATCGATCGGTGGGTATTACTGCAAACTTAATAAGTTAAGTTGAATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 - chr2L 13690086 5' + Doc 69 1 61.64 GCTAAGTGCATTCTTATTTACCACAAGCCCAAAAGCATGCTACACATTTTTGTGTGTTCTGCTGGATCCCCGGGGGTTTTATATGCACAAGATGTACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGATGTG:1 - chr3L 2185004 5' + jockey 20 1 73.68 GTCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAA:1 + chr3L 25782375 5' + F-element 90 1 73.97 AATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTCCGTAGCAACTAAGTAGCT:1 - chrY 2720331 5' + gypsy 7010 2 69.86 ACTTCCCCACTGCAAACTGTTGCTAAATATTTAAGCCCAGTGGGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAAAACTCTTATCAGCAAAA:1 + chr2R 9623350 5' + I-element 67 1 65.12 ATAAATAGCAGCAAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCA:1 - chrX 10128282 5' - invader3 221 2 57.45 ATTGTGCCATCCTTTTTAAAGGAATATATAAGCCATTGTTTATATAAGATCTTTCATGATCCAAATCTACCAAATGTTTAATCAATAGCACACAATATAGGGATAGTCTTTAAGTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAA:1 - chr2L 6820990 5' - I-element 5336 1 54.79 ATAGGGGGGACGAAAAACGGTAGGAGGTGTGGAAAGTGGGCGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAA:1 - chr3L 3565394 5' + gypsy 7064 2 70.55 TGAAGAAGAGTAAATAAGAAATTTTGAATGTATCTGTATTTGTGTGCTTAATATGCCTATTTAAAATGCCAGTTTATCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 8707410 5' + 412 7095 2 52.41 AAAGTTGCGTGCATAGAAACGAGTGTGCGGCATTTTGTCGGGAATGTACGTAATTATCCATTGAATGCCGGATCACGACGACGACGACGATTTAACTCTTAATGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 - chrX 18737350 5' + I-element 6 1 78.95 GAAGCTTTTAAACTACTTCAACTTCACAGAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 14346515 5' - roo 9013 2 56.16 GATTTTTAATGACTTTTAATTGACTTCAGGATGATAAGAGAGTTCATAAAGGCAAGCAAATATTCTGAATTTGGTGCAAGAGAATTGTATGTATTATAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2R 9868849 5' + roo 8687 2 68.49 CATATTTGGCAGATTTCGGTTGCTTTCCCATGATTTTTTATATGGTGCATTAAATACGTGTAAATATTTTCACTAGCCATCATAACTGTTTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCGCTCCGCCCGCGAGACGTACACTTCCTC:1 + chr2L 17069511 5' - 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G5 4666 1 73.29 ATGGTCGTGTTTTCCGAAAACAAAACAATAAAACTTCTCCCTTGCCACCGACAAGCGAAGCAAAAAAGATTACCAATTTGTATATGATAAGTGCTGAAATTCATTTGCTTATCTCGAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2L 10045347 5' + jockey 12 1 80.14 TAAAGTGCACAATAATTGTAGTTTGCTGCTGATTCGTTCATGAATATACAAACATACAGTCGTCCTTTCAAACAGGAAAGGATTCCTCTTTTCATTTCAAGGTTTAGGTGTAATCCCCTTAAAACATTGGCGTGTACTTATG:1 - chr2R 20695214 5' + Q-element 555 2 59.86 AAATACCATTATTAAAGATAAGTAAAATCAAGCTATCCAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 + chr2R 9091962 5' + 412 78 2 76.60 CGAAGAATTCTGCCAGAAGAAAAGCACATTCGGCCACCTGAGCTTGGAGCAACTGTTCCCGGCGGTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAA:1 + chrX 2708850 5' + roo 9048 2 54.10 CAACAAGAAAAACAATTAAAACCAAACCAATATCAATAACCAAAAATATTCAAAAAATGAAAAAATCAACACTATGAGCCAGAACGACAATCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAGACG:1 + chr3R 904370 5' + Doc2-element 306 1 62.18 GCTGTAATATTTCTATCAATAACCCAAATATTTGCCTAATATTAATAACGCTCTAAAATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATT:1 + chr2R 9455823 5' - 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transib2 2751 1 67.81 TTTCAAAGTTAATTTACCCTAAAATGCAGATCCTATCGCGGTAATTCCAGCATGTTGCAACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3L 16463460 5' + roo 30 2 63.01 GATGATAAGAGAGTTCATAAAGGCAAGCAAATATTCTGAATTTGGTGCAAGAGAATTGTATGTATTATAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 9868878 5' + roo 52 2 55.48 GCCTGCAACAGTGCTGACCCATTAGCTGTTTAATAGCCAAATAGCCAGCTTTTGACGGGGATTCATTCGGGAAAGGCTGTTCAATTTTGAATAATTTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr2R 22464503 5' + pogo 23 1 68.49 GAGTGTGAGCGCCGATTTGTCAACGCCTAAAAGGACAACATATTTCTTGTCCACAGCGTGCTGTACGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3L 13544971 5' - hobo 2930 1 70.00 ACAAAACAAAAAAACGATAGAATGCTAGTGCAAATGTCAACGAGAAATTTCAAAACCTTTCAGCTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 - chr4 367133 5' + opus 144 4 57.72 GGTCTTATAAGACTTTGGTAGCCGCTCTAGTCGGCCGGACTAACGGTTACAGCCCGCCCCAAAAAAGGGCATGGCCTCCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr2L 18627663 5' - 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hobo 2918 1 67.81 CATAAGTGTAATATAGAAGTTCTGTACCTTCCTTCATAATGTGTAAAACCAAAATCACCTTAATTCTTAAATAAAACTGTATACCTACCTAATCCTAACTCTAGCTTCTATAGTCCCTGAGATCTTGACGTTCATACGG:1 - chr3L 23265418 5' - INE-1 135 1 56.12 CAAGTCAGTGTCCATTGAAGCGGAGCAATATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTTTCTCTTCG:1 - chr3R 22624748 5' - blood 7313 2 77.69 AGCCTCACAGTCTTTTGTCCTTTAATACCCAGGGATCCTTATGTACTTACATATACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGAC:1 + chr3L 16875829 5' - Burdock 6325 2 66.21 ACATACACACACACACACCGAACCAGACGTTCTCGCTTACATATCCTAGGAAGCTTCCTGCTGCCGTGAGTGTGTTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr3L 15792586 5' - 412 7518 2 56.69 TGTTTGCTTATATATGTGGCTTGGCCTACAGTATAGACCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGTGATAAAATATATTTAGGATT:1 - chr3L 12899827 5' + roo 8743 2 72.86 GGATAAAAACTTAATTTAAAATATATAAGTATTAACACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3L 21162043 5' - roo 8989 2 75.34 GTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3L 27391398 5' - 1360 3377 1 65.45 CGTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 + chrX 6484709 5' + jockey 67 1 60.00 TAGTAAATTTTTGATAGTATTTAAAGTTTTTCTCGCTTAAGTAAAAGCATTTACTTTTTGGATTCGAACATTTTAATTAACTTTTGTCATTGTTTGTTCTTAAATACTTAGCTTATAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 + chr3R 12727076 5' + I-element 6 1 76.71 TTGGGTAAACTACTTTTCGTTCCGCGTCGAAACGAAACGAAAGGAGCGTGCGTTTGGCCGCCGACATGATGTGGGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr2L 19643504 5' - hobo 2921 1 66.09 TTGTAGGCCAGTGCAGGCGGAAGTCCTTTTTGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr2L 18213188 5' + roo 8753 2 80.14 AAAATCAAATGTAAAGCATTACGTACTTTCCATAAAATTAATAAATGGAAATATATTATTATTAATAATACAACTAAAAAGTTAAGAATGATACTAAATAGATTGCTGAAATGTATATTTAAAATAATAAACCTTTAACAAACTTT:1 - chr3R 19496181 5' + FB 399 1 80.14 TACGTAAAAGAGATACCAGAAAAGAAACCCCAACCTGAGTTCAAATGCAAAGTATACGAATAAAACTTTATTGTTTATTAAATAATGAAAATGGAAATCGAAACAATATCTTTATCATCAATTATATGGGGTCCAAAATGAACTAA:1 - chr3R 10583334 5' + Circe 7102 1 72.60 ATTCCATCGGCTCTGACGTGGTCAAATCATGTCGATGAAAATTTGAAGCTTTTAAACTACTTCAACTTCACAGAATACGCTAGACACTCGAGAAGAGGACGATGGCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chrX 14346559 5' - roo 394 1 73.29 CCCTAATCGATGCTTGATTACCCATCCTATCGGAGGTGTTATTTGAATTAAAAGATCGCAAAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACT:1 + chr3L 27413010 5' - hopper2 1301 1 65.07 CAAATACTGTTTTCCATGTTTTTAAACAGCTGCACGCCTTGGTTGACAAATTACATAGGCTAATTAGCATATATATCACATACTTCCTAAATTAGAAGCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3L 20744314 5' + 412 23 2 69.86 AATCTCTCAAAAGGGGTCAATGGAACATGGTACAAATTGGTTTTTATTGAAAGTGATATTTACTTGTGCCTACTTTTCTTAAGGTACTTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr3L 20083738 5' - opus 476 2 67.81 CGAAACCGCAATGCACTTTGACTAGCCGGATTCACCATATTACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3R 10461669 5' - roo 330 2 71.92 GTTTTGTAAGATTGTATTTTGTTTTATCCCAAAAGTAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 + chr3L 16907793 5' + jockey 92 1 73.79 ATCACGGAAATGCCACAAAAAGAAAAAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAACTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chr3L 18199965 5' + Doc 84 1 72.60 GAAAAATTAAAGCTTAAACTGGAGCAGCACGAAAAACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGTAAGACGGCAACTGGAACACC:1 - chr3R 6412039 5' + Tirant 8170 2 69.35 TGCCTACTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTGATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGAAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATA:1 + chr3L 14944564 5' + G5 4817 1 62.33 CAGAAGTCACCAAGCAGTGTGCTCAATGCAAGCAGGGCCTTCAAAGCGACATGGATCTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATACTAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATA:1 + chr3L 1315708 5' + mdg1 7096 2 61.87 TGGCATTCAGTTTACAACAAATACAGTGTATTATTCACATATCTACTACAAAGCACAACATATGTAAAATGTTTATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chrX 17510698 5' + roo 46 2 53.42 ATCAAATAAAAAGTAAAACAAACATACCATACTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3L 12468834 5' - roo 8989 2 80.00 CCCACACACACAGACACACACAAACACAAACTGGACTACATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACG:1 + chr3L 17142822 5' + Rt1b 5010 1 73.79 TCAAGAATGTTGCAGAAGAAGAAGAATTTCAAAGATTAAAAAAAATTTATACGACATGCTGACAAAGCGAGAATGCCAGGAATTTGTCAACGGCGAGAAATCGAAAGTTAACCCCACTCTGGTCTATGTAAATATATATATATATA:1 - chrX 22764262 5' + G3 4508 1 55.48 CTGTCTTTTGATTTTGCGACGAAGTAAACAAGTGCTTTATTTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCT:1 + chrX 10367564 5' - Juan 4129 1 72.41 GACTTCAGGATGATAAGAGAGTTCATAAAGGCAAGCAAATATTCTGAATTTGGTGCAAGAGAATTGTATGTATTATAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2R 9868870 5' + roo 8707 2 54.48 CTTATAGCCACTAAATAAATCACCACAAACAACAATTGCTTCCGTGGTAGACCATTTTATTCATTTGTTCATTTAAAAACAATAAAAGCTTGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGAT:1 - chr3R 7178148 5' + opus 7341 2 61.64 AGGGTATCCTTTAAAAATAATAAATCGGAATATATAATTGGTAAATATTACTATATATAAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATTAAAAGTAATGACCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 18952990 5' - roo 9045 1 64.38 ATAAAACCCGCCTGAAAATTACACAATTTAAATGAACGGATCGAAAAGCAACTTTAGAGACCTTAAAACGGATTCTTACCGTGAATTAAACAACAAATCAAAAACTAGTCGTCCCGAGCGAGGAAAATAATATATGAAAAACAAA:1 + chrX 21032240 5' + BS4 728 1 55.86 TAGGATTTTTCACACTCATAGCCATCCAGTGTTTAAATTATTTGCATGATGATCAGTTTTACGCCGTTTTAATAACTTCACTTTGTGACATTATGATTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTATATTTAAATAATAATAACGTTAAG:1 + chrX 2808481 5' - 1360 309 1 52.41 CAACGTACACATCAGTCCCGCTCAGGCACTGCGTCGCAGCGCCATGATCAAGGAGTTCCGCGAGTCGGATCTTATTGGACCCGGTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTTACTAGAAACTATATACCCCTTATTT:1 + chr3R 9875995 5' + Cr1a 4127 1 62.69 TTGGTGTTTAAATCTGGTCTAACGTTCAAAATGTGCCCCAACTGAAGAAGAGTAAATAAGAAATTTTGAATGTATCTGTATTTGTGTGCTTAATATGCCTATTTAAAATGCCAGTTTATCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATA:1 + chr2L 8707368 5' + 412 1 2 80.82 ATTCAATCAGTCAAGCAAGTTCTTTATGACTTAGAAATTTATTTCATATAATTCCTGCTTCCTGTCTTGCTTTATTTACTTTATTGAGTTCATGATTCTCGTTATAACTTTCATCGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 12813619 5' - roo 405 1 63.01 TAATGCAAAGTGTAAATTGAGCATTTAAGTGAAACGAAACCACAACAAATCGGCAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 + chrX 11661367 5' + 297 58 2 63.70 CAATAACCATAAACATTTTGTCAGAACATCCAGAAGTTGTCCCGCTTTGTTGTAGTGCAACTCAAGATAAGTTCAGAAAGGTATGTTGGACTATGGATGTTAAGGTAACAGAACAGTTTTACTTATTAAAAACAAAAAAACAGTTA:1 - chr3R 15017635 5' - accord2 348 2 62.33 AGCTTTTCATTTGTTTCATTTTCTTGCCGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTTGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 - chr3L 9519617 5' - roo 316 2 77.40 ACATTTGACCCGGATCCCATTTGTTTTTCCTATGCATGGATGTGGTTGGGTGTTCCATACGATTGTCATAACGTTTTGGTGGCTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 9519527 5' + roo 15 2 64.71 TTAGAGAAACCAAAAACCAAATAATTTTTTATTGCATACCCGTTTTTCCCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAA:1 + chr3L 17454664 5' + jockey 4587 1 66.67 ACTCATGTTCCCGAGAAAAGCTAACCGTTGAGAAAGGCACTTATAAAATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATTCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACG:1 - chr2L 16508987 5' - invader4 266 2 65.19 AGCAAGATATATAATTTTCCTATAATTGAGATGTACATATAAAAAAATTAACGCCAAACATATCTGTAACATGAGCGGTTTATTAGCTCGTTAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 13827515 5' - roo 394 1 73.13 AATGGGGTCAAAGAGTCTCTTCCAATTATTCAGTGGCTGAGAGTGGATTGCGGCGGGGGGGTAATTTTAAAATAAAAATTTTT:1 + chr3R 19536713 5' - P-element 2587 1 68.67 GTTTTTAATTGCCGATCTCGAACAATGGGTAATCTTCTGTTTCAAACAATACGCCTAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1 - chr3R 25718275 5' - I-element 5294 1 59.59 GGCTTTTCCTCTCAACATCGACGATAACGATTATGTGCAAAGTTTTATTGCTCACTCTCGCCGCAAAATTAAAAAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2L 7271950 5' + 297 6592 2 72.73 CGCTGTATTATTAAACAACTCAGATAGCAAAGTTAACATATACCGATATTAAGACACCAATATTCACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTT:1 - chrX 15565611 5' - transib2 2770 1 54.11 TTAGGTATTTCGCAAGCCATGTATAAAGACTTATGTACAGTCATGGTCAAAATTATTCTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTT:1 + chr3L 18738081 5' + Bari1 83 1 73.57 CTGGCAATTAAAGCATGCATATTTTAAGCACTTAACAACTGTCCATGTGTTTTCACATATGAACATACATATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 - chr3L 16875935 5' + Burdock 6186 2 56.16 AAGAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGAGAAACTGGTTTTATTTTGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 19449982 5' - roo 9017 2 53.23 AAAGTTAATGAATTAATTATTTTTGAGTTTTTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 - chr2L 20556489 5' + 412 7141 2 76.55 CCTGCGTCCTTCATCTTCATGGTCTTCGTCCAGGCGGCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chrX 2916738 5' + 412 47 2 65.45 CTTCGGCAGCATGTTGCTTTCACCTGGTTGGCTGCTTTGCAAATGCTCGGGTTCCGTTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCGGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1 - chrX 2518152 5' + P-element 26 1 65.00 ACATAAATCTCCAGTTCGGGGCCAAAACCGAAAAGAAAAAAGAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCG:1 + chr3R 15169101 5' + jockey 149 1 69.66 AATGGCTGAACGCAAATGAAACTCCAAAGTGCAACTTTAGGATCAGTATCAAATTTCTGATTAAATATTTCTATTAACATAAATGTTGTGTGTCTTTATAAAACCACTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 + chr3L 19437846 5' + copia 17 2 67.81 GGGAAATGTCGCTTGTGACGAATTTCTATTTGATTTATGCACTCCCTTTGCAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr2R 21029452 5' - Transpac 5169 2 63.31 TTGGCCATTTCCTGTTTGTATGGAGCAAGCCAAGCAAATCCAAGCTTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr3R 20074563 5' + roo 75 2 68.49 AATGCATTTTCATTTTTCTTGATTTCGCGCATAAAATGCGCATAAGCCTATATGGCCATAAACATTTGGAGCGATGAACTTTGCTGCAGAGAACTGCAAGGTTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTGTGTGTG:1 - chr2R 20739122 5' + hobo 39 1 58.90 TGACAATTAGCTCTGTTGCCTCTTTCAATCGGAAATTCTTGATGGCGGCCCCAAACCCTCTTACCCCCATAGATGACGCTGCCGCCACTAGCTGCCACAAGCGCTACTTATGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGAATTCTCTCTT:1 + chr3R 758879 5' + INE-1 577 1 71.92 GGTTGGCTGCTTTGCAAATGCTCGGGTTCCGTTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCGGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chrX 2518123 5' - P-element 2841 1 49.63 CGAGGCGCGCAAAATAAATATTATGCCAAAGTAAGCATTTATTATTTGTTTAATGATAGCGCCACGAATTGCTCTCTTCCGCCCTGCCCCTGCTCCATGTCATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAACACTTAAGC:1 - chr3R 24601333 5' + Idefix 11 2 64.79 CACGGGGCGTTAGTTCTCTGATTAAAAGGGACAAACAATATGGGCGAATATGTGTTTCAGTTTCATGCTTTAGTTCATCCGACAAAAGCGAAAATCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 - chr3L 14280406 5' + FB 21 1 65.71 AAATATGTATACAATGTTTCATCCGAAAAAAAACTTGTATTTGCTTTTTAATTTTCGCAAAACTTTTCTGTTTCCCTTAGAGCGATTTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 + chr3L 14280250 5' + FB 35 1 52.05 CCAGAGATTTTTACATGCATAAGCATATGCATTTGTATATGGGAGGCACTGGCATATATGCATGTACATAAATGCGTTCAAATACAGAAGATCAGAGTCAGGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3L 20398940 5' + roo 20 2 72.60 ATTGCAGAGATATGATGTTCACGTGATTTATGGTTATTTTCCACTTAATTGAACCGCTGATCATTGCTGCCTCGTCTCGAGACTCAAAGGTCGAGCGAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATAT:1 - chr3R 24445249 5' + Doc 157 1 66.44 CATGTTTTGGGATGCAGAGGGAAAAAAAACAATCGACGAAAATTTTTTATCATAATTAAAATGTTAATCTGCGTGAAGTAAAAGGTTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr3R 26633157 5' - 1360 3355 1 60.27 AATAAGTGCAATTCCCATCAATAGAAATGAAAAATGGTCTGTCGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCTATAAATTATATTTA:1 - chr3L 18792496 5' + roo 8738 2 72.03 TGTCATTTGTAGATGTTTTGTGTGCAGGACCCGTCTGTCCCAGTATTCATCTGTTTATTTGCTTTGCTCTCTCGGTGCGGTAATTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTT:1 - 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chr2R 9504283 5' + roo 8730 2 76.98 TGTATCCACCAAGTTATTAAATTCATAAAAACCCCTTAAGAAATTTCAGTCTTTGTTTAATTTCTTTTATTATATTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 - chr3R 21753537 5' - 297 351 2 54.11 GAGAGTACCGTTTTTCTACGTCTAAAAGGCTGCGGTTTGCAAACGAATCAAGCTTTGGATCGACGGTAGTATCTGGTGTCATTGCAACAGCGATAAATTTTTTATACTTTATAAGTTAACTGAAAATGTATTACTTCATAGCAACT:1 - chr2R 2922870 5' + gypsy 7002 2 54.11 AATTTCTTAGTCCGCCCATTATGGCCGAGTGTGAAATGGCTAAAATCGAAGGAAAAACGCTTGCAATAAAAGCAAAAGTCATGCGGTTGCGCACCAGCGCAAAATCAATAGATACGACAGACCGGACATACGCACTGAATTGCGTC:1 - chr3R 24437769 5' + R2-element 3121 1 58.90 AGTTGAGCAGGATCAAAGAGTCTACAAAAATGAAGGATTAGAAGTTTTCTATTCCATTCAAGATCGAATGCCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2R 16510221 5' + roo 50 2 52.74 CTGTGCGGCGACTAAATCAAGGACAACGGCAGCTGCCGCCTTCGATGGCTTCCTTCCATTTTATGGACATTTATTTTGTTTTTGGGCCTACTAAATGGCCAGCAGTTTGCTTTTTTTGTTTTTTCTTT:1 + chr3R 27789481 5' - Doc2-element 225 1 75.78 AAATTGTAAAAAAGAGGCCAAGTTATAACGCTTTACTTTTTAGACCCTTGCAGAAGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1 + chr3R 5477949 5' - 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Stalker 429 1 66.44 TGAAAAGTGAAGGCGCAGCCGCAGCAGCCCGTGTTTCGCGCGTTCCCATTAATTTGTTGTTATTTTCAATTGTGCATATCTTCTATTATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAATTGGCG:1 + chrX 8907170 5' + Juan 131 1 54.29 GGCGGCACCGGAAAATGTCCAAGTCAGTGTCCATTGAAGCGGAGCAATATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTTTCTCT:1 - chr3R 22624767 5' - blood 305 2 67.12 CTGGAAAAATCTCCATAAATAACAACATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 + chr3L 1981545 5' + opus 7058 4 80.36 CAATTCTTTTTACATTCCCCTCGAAAAAAGACCCAAGCACAACCAAATGACTGCACATGGACTTGTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGA:1 + chr3L 3339326 5' - Transpac 257 2 54.11 ACATATCCAATTTCATACTTTCCCAAATGCCAAACGAAATGTCATTATAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chrX 6423185 5' - roo 328 2 69.86 AAATTTAGACAAATGCATTTTTATTGAAACTCAAACGTATTGCGTATGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACC:1 - chrX 10128270 5' - invader3 208 2 66.20 AGCATACTTTTGGGCAAACCTATCAATAGTTTTCCAGCCCATGCGTTTTGCCATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 - chrX 18353581 5' + jockey 81 1 66.44 TGGTTATTTTCCCTTTACTAGTCTACATTACGAGATCACAGAGTTACTGCGGACAGAGCGACAGACAGATAGTAATCATAATATTCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGG:1 + chr3L 27146169 5' + HMS-Beagle2 34 2 60.96 CTATGCAAAATGAAACGCACTTACTTAGCTTTAAAAGGCATTTAATTTTCATTTAGCCATGTTAGCATTATACTTACTGCTGATGGCATTTTTAATTAGACACTCACAGTCTCGAACGGACACGTAACGGAACCGCTAGCAGATCG:1 - chr2L 4628898 5' + opus 7343 2 73.29 CGGTGGTGTTGGGAAAGGTTGAGGCATTCCCAATTCGAGGTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATTAA:1 - chr2R 13193849 5' - BS 5034 1 65.32 GACAATGGAATCAAACCAAACTTAATTTCTTTTGACAAAAGGTCAAAAGATTATTAATGCTTAGGGACAAATATATATGTCGGCGAGACAGGAGTGTCATCCATTTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAG:1 + chr2R 10305307 5' - invader4 282 2 50.70 CTTTTGCTATTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTAGCTCCTTTAGCCCTTTGCAGCTCGTGTTCTCCGTTGTCCTTTGTGTTTTACATTTTTTTTTGTTTTAATTTGTATTATT:1 - chr2R 18145987 5' - Doc 4691 1 89.47 TATAGCGCTCAAAATCGTGTGACAAACTCAAGGAACCATTTCACACACTCCCTTTATACGTATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2R 9504206 5' - roo 349 2 60.69 AAAGGCTAGCTAAATGAATAAACTAAATGCTTGAAAGCGGTTCATGCTCATGGTGTCAAGATCAAATTGACGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACTATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 - chr3L 20388236 5' + 1360 47 1 53.42 ATACAAAATTGAAATATCTTATTTCAGCGCTGCTGCAGTTGGAGGCAATTTTTCATGCGTATTAAGGGGGGGGGGGTGGTGGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chrX 2916641 5' - 412 455 2 53.57 TTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3R 27188610 5' - roo 326 2 71.23 GTCTACATTACGAGATCACAGAGTTACTGCGGACAGAGCGACAGACAGATAGTAATCATAATATTCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 + chr3L 27146189 5' + HMS-Beagle2 6931 2 52.86 AAAACGTACCTTAATTTATTGAAATTAAAATCGAAATTATCAAGTGAATATGTTAAAAACCGTTCCCACCAACTCTGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chrX 4214440 5' + jockey 16 1 67.27 ACATTAAAGTACAAAAAATACGAATAGTAAGTAAAAAGGAATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTC:1 + chr3R 5024834 5' + diver 5970 2 75.34 GGATCTAGGTTCTCATGCAACTACTTACTTGACCACTGGCAATTCGGCCTCCATCACATAGACTCCGCCATCCTTGGCCTGACGACGCACACGATTGTTCTGCGTAACCTTCTGAACAAAGACAGAAAAGCACAACCACTCTTCAA:1 + chr2L 6975703 5' + Fw3 308 1 72.60 GCAGCACTTGGCTGTGATTATTGCGCGGACTCATGCTTTTCTCTGCTCTCTTCTTTGTGAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 - chrX 850141 5' + jockey 72 1 58.90 CAAAAATAAATGCCGAAAATATTTAAAAAAAAAATGAAATAAAGAGGAGCCCCAGAAACATACAAGGGGGAAAAACCCTAAAAACCCGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr2L 1483392 5' - roo 9036 1 56.85 TATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGCTATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr2R 24021575 5' + pogo 60 1 71.54 CAGGACCTGCCGGTAGCCTTAACCGCATGCCATTATGTCCAGATAGAAGAGGGTCAAAATACGCACCGAATGCGAATCAGTTTACTTCCTTCTGAACTTAACCTAATGTGTAGCTTAAAAGACATTATGGATTCTGTTCCTTAATT:1 - chr2R 25051215 5' - G5A 2753 1 59.59 CGGTAATTCCAGCATGTTGCAACTGTCGTCGAAAGAAAACAGATCTGGCATTCACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGCATCGAG:1 + chr3L 16463498 5' + roo 8720 2 60.45 ATATAACTTATGCAAAAAAAAAAATTAAAAAAATTTTCAGAAGTGTACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATA:1 + chr2R 330445 5' - gtwin 7322 2 69.06 AAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCT:2 - chr2R 5173234 5' - Stalker4 362 4 51.37 AAAGTACGAAGTTATCGTACTACAAAGTTGATTATTCAAACCACTTTATTCATTAGGCACCATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTA:1 + chr3L 20209538 5' + Burdock 6191 2 59.59 GATTTCCACACGCAATCCGAAAAGTATACTAGGGAAAATGCGCAGAGGAAAAGCTTTTTTTATCAATGATATATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCA:1 + chr3L 18554581 5' + jockey 4595 1 54.14 AACGGCAATTCGTGTTGACAAGTGCAAACATTAATTAGCCGATCGATCTATCAGGTGAATGATATTGAGCGAGTACTACAAAGTGCAATATATACATGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAAT:1 - chr2R 15822116 5' + invader6 29 2 50.68 CTTCAATTGATTACGCGTGCGGGATTAATCAACTGGCCAGGCGATCGGATAGTCTGGAAATGCATTAAATCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAACTTTATTGGGTTTCAGGGCTGCAATTGTTTTCCGTGGGACTACATACATGC:1 + chr2L 12789792 5' - baggins 5291 1 50.68 ATTCCCTGAACCCTCCACATTTGACCCGGATCCCATTTGTTTTTCCTATGCATGGATGTGGTTGGGTGTTCCATACGATTGTCATAACGTTTTGGTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 9519511 5' + roo 8686 2 65.49 CAAGTTACTAGTGCAATAATTAGGAATGATTTCTATATGGATGACCTAATGACTGGAGCTGATTCGGTAGAAGAAGCTAATAAATTAATAACATTAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCC:1 + chr3R 19445578 5' - Q-element 96 2 97.26 ATGTGTTGCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 - chr2L 14480529 5' - Transpac 249 2 60.69 ACTGTTGCACCCGAGCTCCCATTTCCCTGGGTGCCTCCCATTCGAGCCATAGAAATTGCTAATGCATTCAACAGTCACATCGCCACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGC:1 - chr3L 18738183 5' - Bari1 1687 1 70.00 CGCTTAATTGCTTATGAATACTTAGCTCACTGGCTACCAGGAATGTACTAATCACCGATGTTGATGCAGATGAGGCTTGCCATGGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACC:1 - chr2R 11560753 5' + pogo 1657 1 58.39 AGTAATAAGAAAACTCTTTATATCCTTACCTGAAAGTAAAGAAAGGTAAAAAGAATAAGTTTATATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACT:1 - chrX 3767682 5' + I-element 54 1 55.94 ATCGACAACGAATAATTAACCAACATTTTTGCGCGATTAGAAAACTTATTGACGTCATTCATGTACATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAAT:1 + chr2L 13509180 5' + F-element 4649 1 59.59 CAGTCAAGCAAGTTCTTTATGACTTAGAAATTTATTTCATATAATTCCTGCTTCCTGTCTTGCTTTATTTACTTTATTGAGTTCATGATTCTCGTTATAACTTTCATCGTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2R 12813626 5' - roo 398 1 58.22 GGAAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGAATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chrX 2518030 5' - P-element 2848 1 46.09 GTCAGGGTCCTTTTTTCGTCTCGTGTGCATGTGTGTGTTGGCCACTTGACATGCACGTCACAAATACACGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGAGAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr3R 15168984 5' + jockey 59 1 51.39 GATGGGAAAAGACATATTTTCTAATATGTAAAGTCCGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1 - chr3L 4933795 5' + blood 86 2 77.40 GAAACACAACAAATAAGTGAAGTATAAAATATTTAAACTAGATTATCTGACAGACAGCCATTGTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGACAC:1 + chr2R 21425051 5' - HMS-Beagle2 7140 2 55.48 CGTTTGATTCTCGACGCTTAGCGCTCGGAATTCAGTGCTCAGTTCAGTAGGTGACACCATTGCGCTTAGGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCCTC:1 - chr3R 18518045 5' - roo 9020 2 50.68 TGATAATTGTAATTTAAGCGGTTATCCTTAGTGCTGGAATAAGAAACAGACTCCCAAGAATAAGCCCCAAAAATCCAAGCAAATTATTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATT:1 + chr2R 19114976 5' + accord2 7310 1 56.64 ACCATTAAATCGCGCTATTGAAATGTAATTTGCATTTNNNAAGCCTCCCGGGGGCAAGGANNNNGGAAATGCCACAAAAAGAANNAAAACCAGAAAGACTGGCATTCAGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3L 18199906 5' + Doc 8 1 67.44 ACCGTCTAAGGGTTAAGCCAAGGAGCCTAAAAGGAGACTACGATAATTGCGAGCCAAAGTGGAAGCCTGAAAGTAGGCAACATTGAACGATAACAAGCGTTTTAGCCTTGCAAGCGGGGGAATGGTCACCACCCTCATGACCTCCC:1 - 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FB 203 1 71.94 CTATAATGTATTAGTATTTATTGATCATAACAAATAACGATAACAAATTCCGAAAAACTCAATAACATAAGTTATCTTGTTATGACACCTCATAGACATATGTACATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTAT:1 - chr3L 20209694 5' - Burdock 6378 2 75.34 ATCTCGGCGAGAAAGTGTTCCATCAGCAAAATCAACAGGCCGGGCAGGTATAACATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr4 907645 5' + 1360 63 1 55.12 GGCGCCAAAACTAATCAAAGCAACTAGGACCGACGCTAAATCGAAACCACAACTACAATCACTGCGGAATACCAAAATGCAATCAAAATATGCAAGCCACGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chr3L 14551434 5' + P-element 15 1 74.10 CAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAACCCGGTATAGTAGTAGTATGTGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTAGTAGTATGTCAAAACCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTT:1 - chr2R 5924402 5' - jockey 4736 1 29.45 GCGTGACACGACAATCGTGATAAACGAGATTAGTTATAGAGCAAACCAAGCAAACTGTCTCATAGTCATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chrX 19113463 5' - 412 7508 2 55.73 GCTAAACAACTATACATCATGCTTCTTATACATCATGTTTAAGGTGTCTCGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chr2L 14480522 5' - Transpac 5160 2 65.75 GGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3R 27188598 5' - roo 321 2 78.99 CAGTATGCAGCGGCACGTAACAGCCTTAACCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3L 22883957 5' + roo 8736 2 77.95 AAAATTTGCGAAAATTATACCACTGTTAATAAGGGGCTCATCATCACTCTCTCTGTAACCAATAATTTGTTTACTGCTCTAGTACAACTTTTAAATAATAACTGGCATTTAAACAGTGGATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTC:1 - chr2L 20024207 5' + baggins 5367 1 69.18 CAACTAAACGGAAAAAACCTTGAACGGAAAGTATCGTGTGCAGAAAAACATATTAAGTCTTTAAAATAAATAAATAAAATAAGAGCACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACA:1 + chr3R 904580 5' + 3S18 37 2 60.27 ATTCACATTCTATTTTAAACAAGATTTATCATAATTCACATAACTTCTTCATCCTCTGAATTGTACAATACAAATTCTTATGAGGATATATTTATTATTGTACAAACGTGGGTAGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGATTCT:1 - chr3R 13178079 5' + INE-1 33 1 77.40 GCCCCGAAAAGTGCGCTTTAAGTTTTGAATTACTTTGCGGCATTAGCGTTTAACTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr3R 18541315 5' + hobo 51 1 59.84 CATCACTTCGATGTTCATATATGACTGGCGCACACCTTCTTCAGCGTGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCACGCGAAG:1 + chr3L 20176756 5' + gypsy 75 2 69.18 ACCCCTTGTTCGCAGCGAGGAAAAAGTTAGACATGCGAATGCTTGTCATTTGCATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATCCCACTTATT:1 + chr3R 31887747 5' + HB 82 1 74.66 AAACGATATTCTTCAGGATCCCCTAATTTCATCGTACGACAGACTTAAAAAACTTGGTGAAATGTGTCTTGTCGACATATTACCAATCCTTGAGAACATTTCAGAGCATTATTAAATATTAGTATTAGTAGGATCTAATTATGTCA:1 + chr2L 625731 5' - Cr1a 4283 1 72.60 AAAATAAGAAAACATTTAAAATTGTTTTTTTTTTTAATGTGGGTGACACGCCCATGGGCCAACGAACTTGCTCTGCGTCATTCTCTCTAGAATCTTTTGCATCTCCTGCATCTCAACCTTCTAGTTTTTATAGTTCCT:1 + chrX 20806217 5' - INE-1 156 1 82.61 AATCTGGTCTAACGTTCAAAATGTGCCCCAACTGAAGAAGAGTAAATAAGAAATTTTGAATGTATCTGTATTTGTGTGCTTAATATGCCTATTTAAAATGCCAGTTTATCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 + chr2L 8707378 5' + 412 11 2 73.97 TATATAGTACGAATGTTGATAGTTGTGTTCGCTGTGTGTTTTCTTTTTTATATCATTTGCTTGGTTTTATTTATACATATAATACTATATATGTAGATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chr3L 15859579 5' + I-element 25 1 67.81 TATTGGTATCGTTCCCTCTTGTTTAAATATATAGTTACTGCAAGGTTATACAAGCTTTGGCTTGTCATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAAT:1 + chr3R 4165985 5' - HMS-Beagle2 7154 2 53.38 CCAATTATTGCCGCACCCCAAATCGTTGCGCTGAGCGACAAAAACCATGCTGAAGATTGAATATTAAATGTAAGTGACATTGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAGAAATATGTTAGTGTATTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATT:1 - chr2R 3913752 5' - 17.6 7187 2 64.14 GCACTAAGAGATGCCAAAGTAAGTTTAAATTAATACGCGTTAACTATTTTTTAATATATGCCGCGGTGGTGTCGGGTAGCGGCAAGTCAATATATTATGAACAATATTTGTATTTCTGGAGAGCCACGC:1 + chr3R 12725497 5' - 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G5A 2740 1 56.80 TTTATTAATTTGTTATAATTTTTTAGTTGACCTTTTTTTTCTTTTCAATTTATAACGTTTAAATAATTTGTCTAATTAACTAATTCAACTACGATAGTCAACCTAATTACTAAAATTATCTAAAAATGTTGCTTTAAGTAAAC:1 + chr3L 20029233 5' + Tc1-2 1562 1 46.85 ATTGATTAGAAGGATGTGTCAGTGATGGCAAGTTTGCTTCAGTTATGTACCTAGGATCGGTATTACTTCAAATCAGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAG:1 - chr3R 9986600 5' + Cr1a 4071 1 78.57 GTGGGACAGATGACTCCTTTTGATTGACAGTGTGTGTTTGTACGTTGGTGTTTCACACTGATATACTATACACAAATGCACATATATTTATATATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 9504342 5' + roo 19 2 65.22 ATGCTGAAGCTCAAGCTCCGTTTGGTTCTTCCTATCCTCTGCGTCTGTTGCTGTCAGTGGATAATCAAGAACTTTTTATACGAAAATAACAGGAACAATATAAAAGCCTCTTTGTTTTGGGTTTTTATAGTTTTTAGTTTTTCGTT:1 + chr3R 31949896 5' - gypsy9 469 1 42.47 TGGTTCAGCAGCATTTTTACGCCACGTTGTGAGGCCTAGAAGTATCTTGTTATTCCTACTCAACTGTTGACAATGTATTCCGCACTCACCATGACCTCATCTGATAGCTTGTCGCACATAATACTATAGTCAATAATTGTTAGTTG:1 - chr2L 18128487 5' - Doc 122 1 76.71 ATTTTACAAGCGGGCATGGCTGCTGATAGTGATAATGAATGTGGGTATATACGGTATGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTG:1 + chr3R 4532876 5' - 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Stalker4 299 4 65.07 GCAACATGAATGCCGCGAAATGTTTCGGTTAAAGTAATGGATTTCGTAACTAATATATTACTTTATTTATGTGCGTACCGATATGAAAAACTCTTGGTGCATTCCATCACAGTTAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chrX 4540761 5' + 1360 3 2 78.08 AAATTGATAAATTGCCTTGATTGGAAAGGAAGTTGTGAGTTGCTTGGGGTTGGACATAGTTAGTAATAATGTAAAAGTAGTTAGTATTTTGTAGACTTAGGCTTTTGACAGTAATTAGGACAGGTAACATTATCATATTGTATGGT:1 + chr3L 11244316 5' - TAHRE 10207 1 73.29 ATAGGAATATTGGCACTTGTATATATCTGAACATGTTCTTGGGAGCAATTATGCTTTTCTTTTAAGGAAAAGATACATATATGAAAATGTTATACAATAAATTTGATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chr3L 19573996 5' + 297 6591 2 78.08 CTACTCAGCAACTCCTCCCGCTAACGTTTCGATGGCTCCTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTAT:1 - chrX 6914105 5' - Quasimodo 31 2 70.67 ACTAGATTTTCTAATAGCTCAAAGCAGGCTGCAAAAGAGCTGTGGTTTTCATTCCCCCTTCTTCTTTATAATTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 - chr3R 9175276 5' - Juan 4161 1 53.10 GATGTCATTGGTGGCACGCACGCCCTCTGGCCGATTTAATCAATAGCTCCAATTATGCGTGCATCGAATATTGCAATTTAGAATGCGGAATAGTTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACC:1 + chr2L 14888889 5' + hopper 23 1 68.49 ATAAATATCTTATAATTTATATGGCCAATTACTAAAATCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chrX 11267778 5' - roo 327 2 81.38 AGTTTTTAAATAACGAAATAAAATTGTGTTCAAGTGGATTTAAGGATTTTTGCAAGTAAAAAATTATTCATATTTATACATTTTTTTTGTATAAATAATATATACATACATACATTACATACATACATACATA:1 + chr3L 14284476 5' + 412 7276 2 74.44 AATTGTAGCTGCTTGTGCGTACAGTGCAATAACTTGGCCAAAAGCAAATCGAAATGTTTCAGAATACTCTAACAATTAGACTTTATTTAAGTTCAATTAACATTACAATGCAATTTAGTATTTAAAGCTTAGACAGCAAGGAAAAA:1 + chr3L 10702645 5' + HB 399 1 82.19 AAGTCCTGGGTGTCCTGGGAACCCTAGAAGTCGTCCTGCGAGCTGTCCCGCCCGTCATCCGGCTGCTTAATGTCAACTCTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:2 - chr3R 28782678 5' + blood 7047 2 58.99 ATCGGTATGTGTTTCCATATGCTCCTCCGGCTGTTCGGTCTTGTCAAAGTCCATCATGTCATTGGAGTCCTCATTACGGTTGCCCGAAATCCATTTTAAATTATTTAAATCGAAGCTCCTCACTGAAAGTATGATGCCTTTTAG:1 + chr2L 11985270 5' - Transib5 223 1 59.72 GGACTGATTTTACAAAGCGATAATAGCGCAGCCAATGAAATATTTATGCATTTCAAACATATGTATGTATGTACATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGACACCAGTAATGCAC:1 - chr2R 10600106 5' + 297 6623 2 58.22 GTATCTGAAGATACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 - 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chrX 18190433 5' - hobo 2895 1 60.50 TCGGCTATAATCATCTGTTATGTTGCAGATAACTAAAAAAACACTGTGCTTATGAAAGATATGGAATAAATCGTTTACTAATGACATTAAAGTCTTGCATTAATCATTTTATTTTACTAGATACTACTTTTTTCTTTTTTTCTTTT:1 + chr3R 14323367 5' - Doc2-element 224 1 45.89 TTCGAGGAAAATATTTCCTGCGTTTATCTAACTCTATAAAAATGTCATATTTTACTCGCAGTAACTTGTACAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 + chr2R 8452727 5' + blood 7062 2 52.74 TTCATACTTTCCCAAATGCCAAACGAAATGTCATTATAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chrX 6423196 5' - roo 334 2 74.42 GTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAG:1 + chr3L 25232774 5' - accord2 157 2 61.82 TTTGTACCCATACAACAATAGCTGTACGATAAACTGAATGTATAGTATATACATACTAGTTCTGCAAAAAATATTTTCAAAATCGTTATTAAATTTTGAAATTGATATCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2R 8687957 5' - roo 395 1 76.03 AACACAGGCCACAGTCCGTGAGGTTTATTTAATATATTTGTGATTATAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr2R 9455915 5' + 412 7103 2 61.29 CATTGGATAAAAAAATGCAACTTATCTTAAGAATATGAAATAAATAAGGTTACATAAAAGTGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 18792409 5' - roo 350 2 58.62 GTAAGCTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCTGTTTAAATAG:1 - chr3R 27188629 5' - roo 345 2 58.22 GACCTGGCCGAAACCGCAATGCACTTTGACTAGCCGGATTCACCATATTACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3R 10461661 5' - roo 339 2 66.21 CCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGTTTTTTTTTATGTGCCTCGCTGATTGCGATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAGGCGGCACCTTAATTTGATCTGCT:1 - chr2R 16891850 5' - jockey 4946 1 52.74 GTGGGAGACAGAGACACGTTTTCACGTGCATCGTTGAAAGTTCCCCCTTAACTGCATTTTATGCACTTTTCTTCTCATCGGGTGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACA:1 - chr3L 18767874 5' + roo 8615 1 56.16 GTTGGGTATCGTTGAGTTTCTGTATTCACTTTTGGATTTTCCTCGAACAACCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 23773152 5' - roo 389 2 52.41 ACTTTTTAACTCATTTCCATTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr2L 18178334 5' + Tirant 61 2 78.18 AGTACTTGGATCTTAAGTTGTATAAAAATAGACATGAGCTGTACATAAAAAATCAACATTTCGCTGCGAAGTGGTTCGAACGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCAGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 - chr2L 5798377 5' + FB 43 1 54.79 TTTTAGTTTGATTAAGGTTTAAGTATTCTTTCTCTAAAATTCTATTGATATACCCACAATATTTTTAGTTTCTCCCACTCAGTTTTAGTAATCCCACTCAGTAATGGGTATCTGACAGTCGAGCACTCGACTACAGCGTTCTCTCT:1 - chr2L 13558554 5' + INE-1 576 1 78.77 GTAGAGAATCAATTAGAAAGACCAAAAGCAAGCATTCCAAATAAAACCCTAAGAAATCGATAAGCTCGGCTTAACCACTCGAACACAAATTAAAGATTTCGTTTCATTTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACAC:1 - chr3L 17207034 5' + I-element 4940 1 65.07 AGACAAAGATTTAAAATGAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCATGATC:1 - chrX 22906178 5' - INE-1 92 1 76.47 AAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCT:1 + chr3L 25482893 5' + accord 6914 2 64.38 CTAACTCTATAAAAATGTCATATTTTACTCGCAGTAACTTGTACAGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 + chr2R 8452754 5' + blood 7089 2 71.23 CATTTTCCCGAGACACTTGAAGTGTAAATTTCATGGCCTCAATCAATGATAAATCTCCACGCAACAATGCGTCTATATCGGTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 12899731 5' - 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chr3R 26900181 5' - baggins 5137 1 32.86 AAAAGAAAAAGGTATATAAATTAAATCATAATTTGATACAGTATACAAACCACATTTTTTTTATTATAATAACTACTAAAATACAACAATATTTCGCAGTACACTTAGGTAGGTACACTTTCTAATTATAAATATAAACTTTAGA:1 - chr2L 15782591 5' + mariner2 795 1 60.69 GAATAGCTTCGTTTATTGGAGACTACCGACCGATTAATCTGTAATAAGTACTTCGACCTTTTATCAAATTTAAATTCAAATTTAAAAATT:1 + chr3R 26061794 5' + 1360 3051 1 75.56 GGTCCATGATCTGCAGATACTCGGAGCCGCCGTCCTGCAATCGAAAGCAGCATTCCTGTGGGATAAAGGCAGCAATAAATAATTTTTATTCAATAATTTAAATGTATTTAAGCATACAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATC:1 + chrX 17843452 5' - Bari1 276 1 52.74 TCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAA:1 - chr2L 23295856 5' + micropia 82 2 74.48 CATCTTAAAAATAATGCCATAGAGAAAATTGCGTTAAGGACCCGCTTTTTTTTTCTAACGAAATGTTTTGGAATAAAGAAGTTCACCTCCCTTAATGGAAAAATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAA:1 - chr3L 13459355 5' + 1360 3244 1 60.43 CGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTC:1 - chr2L 23295887 5' + micropia 13 2 63.55 GCGCAGCATTCACTCCTATTTCCCCCAACACAACAATGGGAAATGCACTTCGGTAGTGACTCCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGGGATCCATCAC:1 + chr3R 25409718 5' + jockey 68 1 55.48 AAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAA:1 - chr3L 23702241 5' + G4 69 1 65.22 ACTTTGGTAGCCGCTCTAGTCGGCCGGACTAACGGTTACAGCCCGCCCCAAAAAAGGGCATGGCCTCCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr2L 18627674 5' - 1360 3355 1 56.00 GGCGCACTCCCAGATACTCGCACGCATACACGCGAGCACGTGCGGCGCACACAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCAC:1 - chrX 6377359 5' - hobo 2904 1 52.68 AAGGGGAACGAGATAATTGCGTGAGAAGTCAGGCTAAGTAAGTGCAACATGATTTCTTTATAACAATTGCTAATAGGTCTCTGGGGGAATAATGTTTAACAACATGAATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGTAAG:1 - chr3R 8887757 5' + INE-1 28 1 74.48 ATTGACGTTCAATGCAGCAGATGGCTGGCAATTAAAGCATGCATATTTTAAGCACTTAACAACTGTCCATGTGTTTTCACATATGAACATACATATGTAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 - chr3L 16875959 5' + Burdock 6162 2 66.44 AAAATGTAAGACCATATTTTGCCAAATTCTCATCAGACAACAGAAGAAATGCAAAAAGTTGAAACAGCTGTGTCAATAATTCGATTTTATTGATATGCTATATGATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCAC:1 - chr3R 14563789 5' + Quasimodo 9 2 71.23 ACAGCCTCCATCCGCGCGTGTTTGCCCTGTTAAGTATGCTATGATTTATGCATCGCTGCTAAATGCTGCTGAGGTTTTCCCCGTTGATCCTGCGACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTT:1 - chr2L 14889065 5' - hopper 1391 1 69.18 TTTCAAAAATTAAGAAACTTAATTGTATAACATTTAAGTACATCATACATAATCATCACATATTTTGTCATTTAGACAATAGCAGAGAAGAATCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACTTATTG:1 + chr2R 11630642 5' + Doc3-element 4665 1 54.79 AACTTATGTATGTACGTCTACGAGACGCATCTTTTAAATAGGAGGTTTTCCCGAGTATTTCGTTTTCCCCACGCTCCGTGAAAAGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3L 22884053 5' - roo 9036 1 61.64 CTTCCAAAGAAAGGGCATTCAAAAGAAAAGCCGTCCACTTTCATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1 + chr3L 15276605 5' - hopper 1401 1 70.97 GTTCGTTAGAACTTAATTATCGTCACACATGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAAC:1 - 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chrX 5735272 5' + X-element 155 1 65.75 ATGCCACACCCAGGCAGCGCAGATATCGCCTGACAGCCGGCTATCCGCAGTTCGCAATCCCCATTCCGGCATCCGGATAGCTGGCCAATGGTATCGGTATCTGGTGTAGTATATACGAACATAAGAACAATAATAATAACAATAA:1 + chr3L 20977760 5' + mdg1 7058 2 72.41 AATTTAGTGACGTCAATGGCTAAATGACTGAGTGGCCAAATAGCAATGGCAGAGTGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr2R 7889371 5' + jockey 73 1 60.27 AAAGACCACTTCTGTTTATTTCTGTACTAGAGGAAATTTTGTGGTATTTTTTTTTTACTATGACTATGGGATGCATTGGTTGATTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCT:1 - chr2R 8519278 5' - Doc 4420 1 54.79 AAATCTTTTGCTTTCCCTGTGCAGTTAATGTTAACCTGACGTGGCAAAGTTGCGAAACGTGGTGATTTCTTTTCGTCGCGAAGAAATGTTGGTGCACAGAGCAATGTATAAAAGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 + chr3R 8586360 5' + pogo 3 1 57.93 GGCAATATCCGTAATGGCCAGTGCCGTTAGATATATGTTCGTCGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGGTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATGAGAATC:1 - chrX 4725061 5' - roo 8995 2 68.75 AGGTGGTGATCGCGGGATATATTTTGTATTGTATTTTGTATATATTGGACATACAGATTTTAGTAATGATTAATAAATAGAATATTAATTAATTAATTAATATTAATATTAATTAATTAATTAATTAATATTAATATTAATTAATA:1 + chr3L 25455123 5' - Rt1c 5395 1 75.34 AATATTCAGTGTGGAAATGGGCTCGATGCTTCCTGAGAAAGGTCGACTAGAAAGCAGTAAGTAATTAAAAGCTTGGTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chr2R 11562935 5' - pogo 2057 1 55.48 AATTATTTTAAAATCAAAAATTGCATTAAAACCTAGTAAACTTGTCCGACAAAGCAAACATTTTATTTACATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTG:1 + chr3R 4172207 5' + springer 47 2 51.05 GGCTGCCAGCTAAATGAGCAACACGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGG:1 + chrX 18264054 5' - TART-B 151 2 54.00 GACATCAGATTAGCGACCCCAGCTGTATGCCTCCGTTTCATCTTATGTTCTCTATTTTTCCATTGAACGTAAATCTATCAATGTTATTATTTTTTGTTCACTGATATTCCCTCTTTCAATAGTTCCGTGTCCCTTTCAAAATCCAA:1 + chr3L 23270381 5' - Helena 293 1 75.34 TTCAGAAAAATAATACTTGAAAATTGATATTGGACTGCTCTTAACACTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3R 14494023 5' + roo 8737 2 69.66 ATTATAAATTCCGAACAAACAATATCAAGTTATTCTCTTTCCTAGCATTGTCCTAGTTTAAACAGCGCGCTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTT:1 + chr3L 13156699 5' - transib2 2766 1 57.53 AGCTTTTCCAGCTCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCA:1 + chr2L 4420501 5' + gypsy5 64 2 58.90 TTTTAAACAGCTGCACGCCTTGGTTGACAAATTACATAGGCTAATTAGCATATATATCACATACTTCCTAAATTAGAAGCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3L 20744295 5' + 412 7094 2 57.24 GTGGGCGTGGCAATTTTGGGCGATTGTGGGCGTGGCAGCATGGGTCAACAAACTTTCGCTGCGTCTTTGTCTTTAGATTCTGTACGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTTTAGTTCCTG:1 + chrX 8299527 5' - INE-1 155 1 79.17 TGTGTAATAAATAGTTTCCTAGAAATATATATTGGTTGCCAAGGCCTAATGCACTGATACTAATTTGCCGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAAT:1 + chr3R 5115277 5' + Ivk 54 1 51.37 AAGGTGAAAGGTGTTCGTCTGTTGATTCAACCCTCCTACAACCGACTCCTCCCAGCTTTCCCTTCATTCCTACCGCCCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 - chrX 5206562 5' + Tirant 8151 2 55.63 CAACGGATAACTAGTCTGTGCTAAGAACAAAGAGCTTCAAATAAAATGTATATGAATATACACTAGGTGGCATAAGTATTTAGACGACATTAACTTCCAACTGCCGCGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCAAATATATAAGTAAAC:1 - chr2R 1577038 5' + Tc1-2 65 1 76.71 GTGGTATGCAAATAATTGGTGTTAATGACGTGCCTCAGTATTCGACATCCTTAGTCATAATTCCATACTCTTGGTGACCAACATTTCATACATTTCGTAACAGGTACATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr3R 4533018 5' + 1360 14 1 76.71 ATTTAAATGAGTATACATGTTATTATAACCTCCAAAAATATTCATACCGTTTACATACTTTAAATAGCAAGAAATGTGTTTTTATACCAGTTACTCGTAGAGTATACTAGATTTGTTGAATAGTATGTAACAGGCACAAGGAAGCG:1 + chr2L 20923045 5' + INE-1 30 1 45.89 TATCGGATTTTGTTTGTTTTTTTATCTGACCACGCCTTCACAACTGCCCACAAAAACAATCCTTAAAGTGAAAAATATATTTATATACAAATGAAAGCGGCTTTAAAGGGAGATGGATGGTGGGCGAAGGAGATGTGGGTGTTAAT:1 + chr3L 2936828 5' - transib4 2409 1 80.14 AAGCAGGCTGCAAAAGAGCTGTGGTTTTCATTCCCCCTTCTTCTTTATAATTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAG:1 - chr3R 9175255 5' - Juan 4139 1 67.81 TATTTTGTTAAAATAATTTTAATGAAATTTCAATGATAATATAATCTTGCGGCCTTCTGTTTTCGTCTGCCGGCACTGTAGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chr3R 9193279 5' - opus 7487 2 72.44 CATAAAAAGTGAACAACCAGCGGAATGGCCGTAAATTCAGCTGGAAAGTAGTGAACGAAAAAGCGCAACCGCGCACGATGGGCTGGAAAAGATAACTGGGCAAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chr2R 14940623 5' - blood 7386 2 77.86 ACAATAAGAATAACTCTTAAGCTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATTCTTTAGTTGTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chr3R 5453630 5' + I-element 48 1 55.22 CATAATACTATGTCTGTTTTTGATTAGATTAAAACTAAATTCGTCAGTAATTTTTGGCTTCAGAATACCTGGGCTTGAACCTTGGCTGGCGGTAGAGCTCTACCCACTCCACTACCGAGTCTAAGACCTTCTTACGGGGCATGGCC:1 - chr2L 22299033 5' + baggins 5134 1 65.07 TTCGATATTCTTGACGGTATTTTTAGAAAGCGCATGAGATGCACGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chrX 4724996 5' + roo 62 2 68.99 ATGGCTCCACTGATTCGACTGATAAGAAAACATATGTACCCTCGATGTGGATACGGCCCTGCCTTGCACATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr3R 18697854 5' + 297 44 2 53.42 TACACACAAACACCTGAAATAGTAGAGGGCGGTAGTGGAGGTAGCTTTTCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGCCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTG:1 - chr3L 10563987 5' - hopper2 1542 1 60.00 CTCTAGTCTTATTGCTTCAGACCATCGCAAGGAAAATCCTATGGAAATAAACGATGAACAGAAGACTTTCACAAAGATATTAAAGAAAGTAATGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTTTTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACT:1 - chr2R 16158117 5' + copia 4862 1 63.01 GCAATTATTTATGCACTCGCGTTTTCTTTTGCATATTTGATAGAGTCGTACACACAGCAATTTTCGCGTCGTTGAGCGAGGGAATCTAATTTATATATGAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr3R 23668383 5' - pogo 2080 1 71.23 GACAATCGTGATAAACGAGATTAGTTATAGAGCAAACCAAGCAAACTGTCTCATAGTCATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chrX 19113472 5' - 412 7490 2 57.14 TTTTAAATTGTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACA:1 + chr3L 13366117 5' + hobo 82 1 72.41 CAATTCACTGCACATTTTGCAAATAACAATCGCATTTTTTGAATAATTCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGCACT:1 - chr3L 17108625 5' + hobo 72 1 65.07 TATCTCTTTAATTAAGATAGTTTGTAAAGAATTAAGATAAATTATATTGTTCGCAAACAAATATAACACATTCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTA:1 - chr3R 5024923 5' - diver 173 2 60.27 AACGAGCTTTGCTTTTCAGCTTAGCAGTTTTTCCCTACAATTACCATGGTTATCCTTGACAATTATTTCCGCACAGAAAACTTTCTAAATGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAAAACACCCTCAACTCTCCC:1 + chr2L 12203831 5' + Porto1 464 1 61.64 ATAAGTGGTAAGCTCTTCAAGCCAAATCACATATATGTGACATAAATTATAGGGTAGGTAAGTCACCAACAAGCTCTTATAAATATGATTTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 - chr3R 11978377 5' - Transpac 283 2 66.44 CGTTCAAAATGTGCCCCAACTGAAGAAGAGTAAATAAGAAATTTTGAATGTATCTGTATTTGTGTGCTTAATATGCCTATTTAAAATGCCAGTTTATCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr2L 8707390 5' + 412 21 2 66.67 ATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTA:1 - chr3L 25482974 5' - accord 463 2 69.86 ATAAAGCTAAGGTCAATGTTAAATGCAGTTTTTTTGTATTAATTTAAAAAATTGTTCCAAGTCAAAGAGAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTAT:1 - chr2L 9074298 5' - flea 206 2 56.85 ACATTGCAACCCCTGGCGACTGTTGTTGATATCATGTCAAGCATTTTATTGATCAAGTTACGCATCCGTAATACGAATCGAAATATAATTGCTCTTTTCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 + chr3R 30850717 5' + I-element 18 1 71.94 GCATCAAATCTAAAAATTAATAAGGCACATAAAATATATCTAGATAAATTATAAAAAAATATTTAACAAAATCTATGATGCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 + chr2L 14480405 5' + Transpac 4957 2 60.27 ACTTGTAATTATATAAAATAAAAAATAAAATATTTCTACTTCCACCTCTTTCGATAGAAATATTACATCTACACATATACACTAGAATTACAATATGCATATTATCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTA:1 + chr4 798427 5' - baggins 5142 1 28.08 ACCTGAAAGTAAAGAAAGGTAAAAAGAATAAGTTTATATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATA:1 - chrX 3767655 5' + I-element 83 1 75.17 ATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTT:1 + chr3L 13827359 5' + roo 8696 2 62.32 TCTCGACAGGACCATCTTTTGTTTGTAAGGGCCGAACATGAACCGGAACTGACCCGCCGCTGACCTCACGTACTCGTATCTGAATCGCCTTTCGTGTGTCTAATCGCTAAATGGCCAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 - chr3R 21099210 5' - hopper 146 116 80.00 GAAACATATATCCGTACAGACAGATGAATAGACAGGAGTGCGAACGAAAGGACATCTCAATTTCGACATTGATGCTCTCACTGCATCAATGTTCTCAGGCGATCTAACGGGTCGAGGGACTCCAGTTCTTCGTTTTGTCGCACTTC:1 + chr2L 22017413 5' - mariner2 306 1 52.74 AGAGAAATAGTACTCAAATAATAATATACAAAATATAGTAGAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 + chr3L 18789020 5' + 1360 81 1 76.71 AATCAACATGATTGAAGTACGTATCTCCGATCCACCGATTTTATTAACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3L 17904859 5' - roo 331 2 71.92 GTCCATTGACAGCCAGGTTTAATTGGCGACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTC:1 - chr3L 14084936 5' - opus 429 2 79.20 CGACGGCTCTTAGGCTCTATCGCCTCCATGTATCTGTATCGAACCGATCCGAAAAGAACACCACAGATCCGATCCAAGCCGGAGATACAGCGCTTCCAGAACAAGTG:1 - chr3L 6373959 5' + G-element 3966 1 75.70 ATGCAGACGATTACTTTCAATTTTACTAAAAAGTTCTTTCTGAGGCAATAGAAAAAAGTTGTAGGTTTCTAAACTTTATTTCTGGTACTCTATAAAAATTATTTTACTAAAGCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr3L 15277746 5' + I-element 12 1 75.34 CTCATTATAGGACTTTGTTTTCACCACTTTTGGCAAAACCTGCTAGTTCAGCAGAGAACAGCTCTAGTTTACACAGTCATAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 + chr3R 4421942 5' + 1360 43 1 56.16 ACTTGAGTAGAAGACTCTATGCTGACAGTTTGTAAGCCATTAAAATGCTCTGCTTGTATTAGATTTCCTTCTAATTGTATTCTTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chr3L 1981645 5' - opus 463 2 51.37 AAACATCTCTGTTTCAAAATAAGGTACAATGATATATATTATATATTTTTTTATCCATTTACATACACATACATATATCCTCCATATGCAGATATATGTATAGAAAACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATT:1 + chr2L 16508846 5' + invader4 2771 2 77.40 GTTTAAGCAAGGGTTTCTTAAGGCTTCTTTCTTAAATGCAATATAACTTAAATGTTAGTGGTCAAAGTTGTGAATACAAAGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 5762057 5' - roo 9036 1 58.57 CTGATGTGGAGAAAGTGGGACGAAGTGGAACATACATCTTCTACCCCCAGCGGGAGTTTCCTGCTTATAAGAAAGTAGGTGCCAGCATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr2R 14722638 5' - mdg1 7425 2 60.27 GGCATTTGCCAGTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCACCATCTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2L 11867421 5' + jockey 12 1 77.34 GAAGGATATAGATATTAAGGTGGAGACCTTAATAGAGATTAAGGTGAAAAATGTCGTATTCCCAAACTAGTTAACGCTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGTCAATT:1 - chr3R 2899212 5' - 1360 3346 1 56.16 GAAAGAGCGAGATGATGCGATGCGGGCACGAAGGCCAAATTGCCGAAGATGCCCGAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chrX 21281253 5' + P-element 46 1 47.62 AATATTCAGTGTGGAAATGGGCTCGATGCTTCCTGAGAAAGGTCGACTAGAAAGCAGTAAGTAATTAAAAGCTTGGTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr2R 11562935 5' - pogo 2058 1 55.86 AAAATTAAAGAAAATAAATAGTTCTTGATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCATGGGCCGTTTCGTCTTGGGTTTTTCACTTGATTTTTTTTTT:1 + chr3L 16184099 5' - Porto1 171 1 58.57 AGCACATCTTTGGCGAGCAGTCGGGCAATGCTCGGCTCCGATACGGCGGACACGGCTTTCTGGGATCCCGAAACAAAGCCGAAAGACAGAAACTCAAAATTAGTGTGCGCGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAAGCAAT:1 + chrX 22859362 5' - 1360 3185 1 69.18 CGGTAGTAAAATTGTCTAGCTAAAAGTCTAAAAGAATTCTATTTGCTGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCT:1 + chr3L 16663865 5' + opus 188 4 69.86 TATGAAGCACGTGCCTCGTATTATGAAGCTGGCCAACAAACACACACGCACTCGTGCGCAAGTTTGGGTTTGTGTTTTTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATTTTCTAACGATACCACCTACTGTCCGTAGG:1 - chr2R 9934251 5' - Rt1b 5094 1 50.00 ACTGACTTCCAGGGGCTGCCAAAAGACATTGCCTTAAACTATTTAGCTGAAATTACCCTTGTCAGTTTGATGTAAACAAATAATACGCTTTATGAACTAAAATTATGATATTTTACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chrX 3578238 5' + hobo 8 1 71.92 GTTTTGGGCAAGTTCCGATGGCACACTCCGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 + chr3L 13366126 5' + hobo 56 1 71.82 CTGATAAAAGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACA:1 - 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chr2L 10045322 5' + jockey 37 1 63.01 CATTGATTATGATCTTAACTTAATGTACAGAAAAGTTTATTACAATGAATTGCTTACCATTCAAGTCGAATATCGTATTTTTATACCGTATCGAATATCGTATTATATTTTTACTCATATTATAAAAAACAAATTACTTA:1 + chrX 15127227 5' - blood 6929 1 60.71 TAATATCTTACAGGTAGCAGGCAGCGCTCGCGACCCCCATGATTAAGATTAAGCATGCAGATTTTAGTAACGCAAACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr2L 21256248 5' - P-element 2854 1 57.46 GAGTAATATTGCATTTTATTACCCATACGCCCTGTGTATTTTCACACAGCGTAGCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:2 + chrX 6484660 5' + jockey 18 1 76.03 ATATGTTAAGTTATAAAATGTTATAATAACAAACAACAATAAAAAATTGAATGATAAGAAACTTAATCCTACCTGAAGTTCTTTATAAGAAATAAGAAATTCTATGCGCCTCTACAAACAATAAATAAATTAAAAATATTAAAGAA:1 - chr3L 10757232 5' + HB 318 1 53.42 AGGTCATAAACAAAGATAAGATTGTAAGTCCTCCCGCGGGCGACTGGAATACATCCCACTGGATTTGGGGTTTTGTTTGGCGATGACGTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGATG:1 - chr2L 21360206 5' - BS3 197 1 58.12 TATAGCGGGTGGAATAATAGGTAATAACTACCTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAAGCGACTCGG:1 + chr3L 14084887 5' + opus 66 4 71.65 ATTAATAATCCTAGCAAAATATTTATCCGAAATTAAGAATATTGAATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 12610078 5' + roo 76 2 69.86 GTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:2 + chr3L 13827397 5' + roo 8742 2 71.92 CAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 27188619 5' - roo 8999 2 66.44 GTTCAGGAAAATCGAATAAAAAATGTTCTTGAAAATGCTTCTCTCTACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGATTTTATG:1 - chr3L 19574143 5' - 297 327 2 64.38 CATTTTATTACCCATACGCCCTGTGTATTTTCACACAGCGTATCATACTTTTTCGGGCCTTTAAGGTTAGTAGTAGTAGTGGATTTATGTCATATTTTGCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chrX 6484671 5' + jockey 23 1 70.00 CCAAAGAAAGCGTACACATAAAAGACCCATAAAGCACAAGAAAACATCTAAAAAAGAAAAGAGCAAAGAGCTGGGAATACCCTGAACAAAGGCAAATGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chrX 5366105 5' - pogo 2079 1 70.55 AGTCCAAAAATGGCTAATTTGAAACTTTGATGTTAGTATCATTAGTATCTAGGATAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 + chr2R 5268964 5' + pogo 63 1 62.33 GAGTGAGCATTTTTTACCAATTCGGAAAACAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr3L 13827409 5' + roo 8754 2 80.14 AATTGACAGAAAACACTTGGTTTATTCGTCTCCGGTTGAATTGAATCCAAATCCATCCACTTGTAACGCCAACAAGCTGCCTCAATCCAGCCAGCCAGTTAGCCAGTCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTG:1 + chr3L 14843577 5' - blood 240 2 73.97 CGTCTGCTTGGAATGAAAGTTGGCTTATAACTGGTTTTAATGTCCCACAGAAGTTTGTAACGAACCGCACTCCAAGCTGTATCAAGTATCAGTCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chrX 12003879 5' - P-element 2861 1 67.81 CCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTC:1 + chr2L 21325105 5' - invader4 3034 2 68.29 TTTGTCAATCGCGAGTCGTGCGTTGCGGATACAAAAGTTGCGGAAATTTTGGTCTTTTTGATCACTATTTCGATTAAACAGATAAAAAGCGAATGCAATTTATGAATCAATTTTGTATATCT:1 + chr3L 6924290 5' + pogo 209 1 80.33 CTACGGAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGCATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATGTATGTATATGGTGATGTAATTCATGCAATGTATA:1 + chrY 2720344 3' - gypsy 10 2 77.40 GGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGGGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACA:1 + chr3L 5274981 3' - I-element 89 1 76.71 GAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATACTGGTTTTGTGTGCCTGCAACAAGCGTTGCATTGCAGCGACAATTTGTGTGCA:1 + chr2L 5500599 3' + Juan 4133 1 63.70 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGCCGCCTGGACGAAGACCATGAAGATGAAGGACGCAGGACGGAAAGCGAACGAGCCGCATG:1 + chrX 2916761 3' - 412 7086 2 53.78 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCTCTCTCACTCTCTTCGAAATTCTTATTTGTCCACATTCACATTTTCGCGTTCCCGTTTGTTGGGTGAGCTCCGTATTTA:1 - chrX 10806845 3' + P-element 2849 1 58.22 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGACAACGAAATACT:1 + chr3L 22884000 3' + roo 8989 2 77.86 CGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTTTAGTAGTGATTGCTAAAGTTTTTATAGATGAAGATTAATACCGCAGACTTGATTGAAATTTTAT:1 - chr2L 11442895 3' - G-element 4180 1 55.48 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACTTAATTTGTCGCTGCTGCGACGT:1 + chrX 16217513 3' + P-element 2810 1 31.51 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATCACAACATTAATTAATTGAAATCTCTATTTTAAGTAATATTGATAACGATTAATAGTAGAAAAGGGTATAAATCTGGTG:1 - chr2L 12488233 3' + copia 205 2 54.86 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGCCACTCGCGCAAAATTTCAATCTGATCGATTTGTGTATTTGTCAAACTGATTTATCGCGTGTCTCGATTTGATG:1 - chr3R 22868713 3' - mdg1 7060 2 68.49 ATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTATTGCCCTTCTTGTTGTTGCTACTGTAGTTTATCGTCTTCGGTCCG:1 - chrX 4778720 3' + Stalker4 7164 4 69.18 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTCGAGTTGGTGGCGTAGGTGGCGGTTGTGCTGGAGACGGCGG:1 - chr2R 19460072 3' - 1360 57 1 65.25 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATGATTTTCTCGCAGTGCAGACTAT:1 - chr3R 24976175 3' + roo 9041 1 62.33 AAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGCCGCTTTTTCCCTTTTTCCCACCATCACCCCCACCATTTTCTCGCCCCTTTCCC:1 + chr2R 18983845 3' - hopper 61 1 63.19 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACTTTTCACTTCTTTGCACGGTGGGTATTTTCCTCATCATCTGTTTTTCGAAGAGCTTACAATTTAATCTCACCGCCCCTAGTACTTATT:1 - chr3R 4668575 3' - roo 8695 2 42.07 AAGATTACTGATAAATAAAAGGTAGGCTAAAGTGTGATTCGAAACTTTTAATAAATAAATACGTAAATATACAACAGTAGACATGCACCCACGCTCAAAAAAACTGGTGAAACCTTTACACGATTAAAGAAATGAAAAGTACGGTC:1 - chr2L 15811193 3' + BS4 495 1 34.93 CTCTACGTTCATACGGACAGACGAACATGGCTAATTTAGCTAGCAAATAACTAATACCTAGTAATTCCCCTCATTTTCCTTCTTCAAGCTAATCCTTTCCGCTTCAACTCGTTGGCCATTTCCAACGGCAATTGTCATGGGATTTT:1 + chrX 14745397 3' - INE-1 129 1 74.66 AGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACAGAGTTGGTGGGAACGGTTTTTAACATATTCACTTG:1 - chrX 4214480 3' - jockey 92 1 73.10 TAATTAATATTTTACAATAAGCACATATGAAAATTTCTCTAGACAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATATAATTATGAAGTATTATGGTATTATAAAGTATCCGATTCCACAA:1 + chr2R 1873420 3' + TLD2_LTR 109 1 91.78 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCTCTCTCACTCTCTTCGAAATTCTTATTTGTCCACATTCACATTTTCGCGTTCCC:1 - chrX 10806870 3' + P-element 2855 1 53.91 GGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATGATAAATTTAAAATAAACATTAAACATAAACAATAACATTTTTTATTTCCTACAGCTAATAATTTAACTTTGCCTGTGAAGTTTGACATG:1 - chr3R 19721020 3' - opus 24 4 66.44 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATAAATATATGTGCATTTGTGTATAGTATATC:1 + chr2R 9504283 3' - roo 86 2 80.14 ATTTACATTATATCAAATTATACTAGTCTGTAATGTTTGTAATTTCAAAATAATCAATAAGGCATCGACACGCTGTTACTTTTGATCTCTGCGATCGCATCTGCAACTACGATCTGTGCGAGAACACCTACAAGATCGGGGATCAC:1 + chr2L 10489606 3' + gypsy7 5071 1 58.90 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATAAACATTTTACATATGTTGTGCTTTGTAGTAGATATGTGAATAATACACTGTATTTGTTGTAAACTGAATGCCAATAAAAGGTTAATTTTAA:1 + chrX 17510716 3' - roo 8691 2 40.69 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGGCTTTATTGTATATCCGATTGCAGCTTCCCGTTGA:1 - chrX 12998023 3' - roo 8749 2 77.40 GTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATACCTTCTTCAACTGGCAGCCACCTAGTGATTTAAGCTCGG:1 + chr2R 19639058 3' + Doc 37 1 73.29 AACAGAGAAGTTATGCCGACTAATGAAGTCGGGACTCTCAACTTCACCACGAATAAGCTTACGGTCAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGAAGTATACTGGAATAAGGAGAGCCACAGGGGAGTTGCAACACATCGCTAACGA:1 + chr3L 23794434 3' - Cr1a 4090 1 76.03 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCAAACTGTGTCACACTGCTGCCTGCTAACGGTTACTTTATCGAGGCGAGGGTACTCCACAGAGTATACTTATCGGAT:1 - chr3L 20388108 3' + 1360 3380 2 68.81 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTATTAAATATATACTTTTAGTTACTGCATTTTTGGCTCATTAGAGGTTCTTAAAATATAACTATCATGATATTAGGAGTGCCTAATAAAAATAA:1 + chr3L 18164271 3' + pogo 2079 1 69.18 TATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAATTTATGGCCGTAAAGCGCATGCATGTGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGTACATGCGGATGTGTGTGTGTGTGTAGTTTTCT:1 - chr3R 28097546 3' - jockey 4801 1 58.22 TAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTACATTTCTCTAGAGCATCTACTTGAAGACCGAAGAGGAAGCAGAAACAGAAGACGAAGGCGCCTCGAGAATGCCTCTTGATGTGCTACTTTTACAAATTT:1 + chr3L 5266918 3' - accord 186 2 86.99 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCACTGAATGTTCTGATACATGTAAATGATTTAGCCTATATATGT:1 - chr2R 8687827 3' - roo 79 2 75.34 AGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTTTTCTATACATATATCTGCATATGGAGGATATATGTATGTGTATGTAAATGGATAAAAAAATATATAATATATATCATTGTACCTTATTTTGAAACAGAG:2 - chr2L 16508852 3' - invader4 2777 2 73.29 GTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTATATAAACTTATTCTTTTTACCTTTCTTTACTTTC:1 + chrX 3767651 3' - I-element 88 1 78.08 TGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATATATATTTTTTTTACCATTCCTAGTATTTTAAACGCAAGTGTATATTTGCAAAA:1 - chr3R 28659020 3' - Burdock 6173 2 58.68 GAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAA:1 + chr2R 11097370 3' - Juan 4035 1 55.29 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGATATAGATATGGAATATAGCCGGGCCGCCTTGTCTAGAGAGCTCAACAA:1 + chr3R 28579581 3' - pogo 67 1 64.38 AAGCAGACGCGTGAATATGTCGCAACCGAGGAAGTGTACGTCTCGCGGGCGGAGCGCGGCAACAGAGGACCCCGAAACAGTTAACTTCCCGACATACACATATTTAACCGGCTATTCCCTAATTCATTTTACACCAT:1 - chr2R 15822012 3' + invader6 4792 2 73.72 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCAGCAAATAGAATTCTTTTAGACTTTTAGCTAGACAATTTTACTACCGGATTAGCTTTTCGTACTTGTCTGTCCAAGCGGCTTTTGC:1 - chr3L 16663826 3' - opus 7152 4 56.85 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCAAACTGTGTCACACTGCTGCCTGCTAA:1 - chr3L 20388157 3' + 1360 3343 1 78.35 CAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATTTTATAAGTGCCTTTCTCAACGGTTAGCTTTTCTCGGG:1 + chr2L 16508978 3' + invader4 246 2 75.34 ATAATTTAAAAATTTTATTTTATATTGCTGACACACTATGGCAAAAAGTTTCTGCACAAAATTCAACTTGAAATTATTATTTTTTTTGGTTTACCACTGCCTGGGAAAAATTCGTAAAATCGCAAGGAAAACTCGCGAAATCAATT:1 - chr3L 9927889 3' - 1360 3053 1 69.18 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCTTTTCCTTTTTTCCTTC:1 + chr3R 6412092 3' - Tirant 8139 2 65.07 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATATATAATTTATATTCGACCATTTGTGAAACTAAAGGCTAACATGATTTCGTTCACACTTATGAATTTAGTTGCCAAGGC:1 - chr3R 21753412 3' - 297 26 2 51.43 CTTGTCGCTGGCTGCGACCCGTTCGTACCGGCGTTCGACGCTGGCTGCGTCCCTCTATGTCGCTGACTGCGATGATCCAGCAGGTTTGAGTCGACTATGCCGCTTTTAGCCAAC:1 + chr3L 26803762 3' - aurora-element 323 1 63.16 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTGAGTTGCGGCTTCTTTGTTACTAT:1 + chrX 10824045 3' - pogo 41 1 51.43 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATTGTCAAATTCCAGGCACAATATTACATGAAATCTACAAATAAATAAATAAGTTACTCGAATACCCTAATAACTTAAATACAAACCAATGGCGCT:1 + chr2R 14722800 3' - mdg1 27 2 67.12 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTAGTTTAAAAGCTTCAAATTTTCATCGACATGATTTGACC:1 + chrX 14346540 3' + roo 9039 1 60.69 AGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATACGCACATAATTATTAACTGAGTCATATAGTATTAAAAATAATAATTTTTTGTTCAAACGTTTCTACATTTGTAACTCATTTTAATTTGTTCAATAGGT:1 - 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chr3R 5264844 3' - P-element 80 1 30.82 TTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGGAAGGATATATCACTAGACCCATTACTAAAATTTGTCCCTTGGAAGGAATAAAGTCTGTTGACAAAAATGAGGCTGACC:1 + chr3R 19448119 3' + roo 8716 2 68.38 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGATATCAATTTCAAAATTTAATAACGATTTTGAAAATATTTTTTGCAGAACTAGTATGTATATACTATACATTCAGTTTATCGTACAGCTATTGTTGTATGGGTACA:1 + chr2R 8687955 3' + roo 393 1 74.66 CTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTGCTAACGCTACGTATGACTGTGTGCGCCTAAATGGGCGGGGATTTGGCACAAG:1 - chr3L 13365518 3' - jockey 4609 1 50.00 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAAAAGGAATAAAATAGTTTACGAATAAATAAATACAAAAGTATAAGAATGGAATTATCGTAAT:1 - chrX 18190344 3' - hobo 5 1 69.23 ATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTGTGTTATACAAATGCAGTGGAATTAGATAGCACTGAAGCTACA:1 - chr2R 16185212 3' + Dm88 4390 2 70.97 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTGAGTTGCGGCTTCTTTGTT:1 + chrX 10824040 3' - pogo 52 1 54.11 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTTAAAAATATAGGTTATATGTACGTTTAAATACTACCTTGGAAATGAATGAGTATTTTACTCAAC:1 - chr2R 25252142 3' + opus 7449 2 59.03 ATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCCCTATTGAAACTCACATGCACAAAATAATCGTTTCCGATTGACTT:1 + chr3L 3565434 3' - gypsy 36 2 57.93 GCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACATACTTTTCAACAAATCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAAAAATATACTGACAGAATTTATAGACTGGTAGACCTTT:1 - chr2R 5296797 3' - INE-1 86 1 60.27 TATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTACTATCCTAAAC:1 - chrY 680438 3' - invader2 31 2 64.38 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCCCCCAAATATTTGTTTCTCTTTTTATCACTTTTTTTTTCAATAAAAACGAAGTTTTAATAATT:1 + chr3R 12626585 3' - 297 6608 2 56.84 CCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCTTATGAAATGCAAATTACATTTCAATAGCGCGATTTAATGGTACCCAGCTACTTTGTT:1 - chr3L 18199890 3' - Doc 9 1 78.77 GTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTG:1 + chrX 21667920 3' - gypsy2 6573 2 73.79 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAAAACAATCCTTTAGCTTTCGAGTTCATTTAGATTAGGTTTATATAATAAGGAATGTAGCACGTTTAA:1 - chr3R 19543363 3' + roo 390 2 72.60 TGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGGAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACA:1 + chr3R 29091410 3' - rover 6983 2 62.59 TGAAATATTGCAGAGATACCAGTCTATGATGCTTAGAACAATCACAGGTGCTCCATGGTATATGACTAATCATGACAATTCACTTCCGCATACTGCGCAGTATCCTTGACATCAATTGCAAATTTATATCACCCTCAAAAACAAAT:1 - chr2L 9230567 3' + G3 4243 1 52.74 ATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGTCGGCAATACAAAATACGAAAAGTTA:1 + chr2R 11097425 3' - Juan 4041 1 69.86 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACATCTTGTGCATATAAAACCCCCGGGGATCCAGCAGAACA:1 + chr3L 2184950 3' - jockey 72 1 69.23 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACCGGGCGCACCAAACGTATAAAACCCGA:1 + chrX 2518086 3' - P-element 86 1 21.74 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATAGCAGAGAATGCAGCAAAATACGATTCCTCAATTCAGTT:1 + chr2L 12678588 3' + P-element 2807 1 33.10 AGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCACAAGCAAAGTAATTCAATTTCCCGGCTTACAGCTCTTTTTTGGCCACTGGTCAACGGAAG:1 - chr3L 3565308 3' + gypsy 433 2 42.86 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAGATTTCTATATATGATTGAAGTGAGTTTGCCGGCTGGCAGTTGAATCGCATCGACATTTGAATTTTGAGTTGCCGTCGGGCAATCATA:1 - chr2L 470168 3' + Burdock 6362 2 65.75 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGCGAATGTCTTTGGGCACTTTGCAGTCTCCTTTGTCTCCTAGTGC:1 - chr3L 3757114 3' - copia 4895 2 62.22 AATTTGTGTTTATAACATTTTTAACTTTATTTTAAATTAGTGCAAAAGCGTGCTTCATCAAACGTAATATATAAGTATTTTTGTTTATTATGCATATCATGCCTCAGATTTGAGATATGACTCTCTATAGATAGATACTCTAAGTC:1 - chr2L 7600991 3' - Tc3 1576 1 73.97 AAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAATGTGTGGTATTCTACATGTAATTAAAATCTTTCTGCTTCTCAAATTTGG:1 - chr2L 21980023 3' - Rt1b 5113 1 66.44 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCG:1 - chr2R 24021532 3' - pogo 38 1 59.03 TTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATTCGTGAGTATTCTAATCATTTCCTTTGATAAGGTTCTAAGCAAACAATTTGTCATTATATTTCTAGGATTTTAGTATGAAACGAGCTAAGGTACTTTTC:1 - chr2L 7939695 3' - Burdock 18 2 68.97 TTAGTTGCTACGGAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGCATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATTCATGCA:1 + chrY 2720337 3' - gypsy 17 2 73.97 AAATAAAAAAATCTAAATAAAAATGGCTGCAGTATTTGGGATCTTCTAAATGGTAGGACAATTAATGATTGGGGGTCTTCACTTAAAAAAAAAGATAGTTTACATAGATTCTTTAGTTAAGAAACACACTTCACA:1 + chr3R 19375025 3' + gypsy2 436 2 43.70 AAATATATATATAATATGTATGTTCCATTTAGCACCATTTCTTGCAATTTATATTTAGTTCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGTCACCGAATCGATGAGACGCACGAAAATGTCCTGCTCCTGGCGA:1 + chr2R 14793532 3' + Dm88 4367 2 80.82 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATTGCTCTTTTCAAGTATCTATCGTATATCAAATGAA:1 + chr3R 30850819 3' + I-element 5272 1 73.29 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGACG:1 - 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G2 3076 2 92.00 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTAACGAGCTAATAAACCGCTCATGTTACAGATATGTTTGGCGTTAATTTTTTTATATGTACATCTCAATTATAGGAAAATTATAT:1 + chr3L 13827507 3' + roo 9037 1 61.64 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCAAGCATATCCCCAAAGTAAAGGAAACCAGAAAACAGGGGCAGCAAATGCATAAGACTCTGAT:1 + chrX 20465930 3' - jockey 4765 1 78.62 AACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATGTACATGAATGACGTCAATAAGTTTTCTAATCGCGCAAAAATGTTGGTTAATTATTCGTTGTCGATTTGTAAGTTTCCTAACCACAT:1 - chr2L 13509159 3' - F-element 4625 1 55.24 AAAAAAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTT:1 + chr2L 22150631 3' + S-element 1635 2 83.56 CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTAAAAAACCCGATCGCGTCTATTTCTGCAATTTCTAGCTATTAGAATT:1 + chr3L 24253685 3' + 297 6909 2 65.75 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGGGCATCTTCGGCAATTTGGCCTTCGTGCCCGCATCGCATCATCTCGCTCTTTCC:1 + chrX 21281254 3' - P-element 39 1 50.83 GTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGTAAGTAAATTAAAAGGGAAATTAAAAAATTAAATGTACTGTCGAAACCGATCTGGGGTCGATGAAATGTTAAAGTACAAGTGTAT:1 - chr3R 26698242 3' + accord 7194 2 65.00 GAATTAAAAAAATTAAAAAAATTGCCTTATGGTAAGCCATTGGCCATTGGCACGCAGACGACTGATTTCAGTCGTCGTCTTTTGGGCCA:1 - chr2R 10852875 3' + HB 320 1 60.67 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACTGTACAAGTTACTGCGAGTAAAATATGACATTTTTATAGAGTTAGAGAAACGCAGGAA:1 - chr2R 8452741 3' - blood 65 2 62.33 ATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGAGCATTTTATGTGACATTTTTCATTTCTCTTGATTTAGCACCGAAACTCCTTG:1 - chrX 3521886 3' + hobo 460 1 77.40 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAGTATGGTATGTTTGTTTTACTTTTTATTTGATTCTAGTCAGGAGAAAAACAAAAAAAAATATATAAATAATTGGTAAATAAT:1 + chr3L 12468884 3' + roo 9033 1 54.79 CTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTTTCGTAGCTAATAAGAAGATTAGGTATAAGCACTATTATTCCTACCACTAATATAGGCTAGAATTTCCTATATGTA:1 + chr3R 20425004 3' + jockey 4722 1 49.32 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGT:1 + chrX 17027933 3' + roo 8983 2 77.40 AAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAACTATTCCGCATTCTAAATTGCAATAT:1 - chr2L 14888956 3' - hopper 90 1 78.77 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGGTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATC:1 + chr3R 6412055 3' - Tirant 8170 2 62.86 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGCAAAACATAAAGCAGGAGCCGCCGCGGCGAACCAACATTGCCATGATTTGTATAATTGCAGTGCGAATAATT:1 + chr2L 20986624 3' + roo 9024 2 52.74 GTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGGACCGTTTTGTTTT:1 + chr3R 5316608 3' + Juan 4153 1 70.73 ATCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTGTCATTGATTCAACTAAATTCCCGATATTTTATTGTGTTGTATGTAATGTTTTTCTCCACTCGTTGGCCAGTGGGGCAAGTGAGGGAACTGTGAGTATAGTG:1 + chr3L 8531140 3' + INE-1 577 1 62.79 GCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTGTATATAAAAATATTATTAAACATTTTTAAAATACTTAAAAACAAAATCGAACAACTTTAGCACCTAAGTCCCATCTAA:1 + chr3R 7993055 3' + Stalker 206 4 50.68 ATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTA:1 - 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412 40 2 56.64 GCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAAATTTTTTTGTTATGCAATGTGTAAGAACTCGC:1 - chrX 11992974 3' - P-element 2818 1 22.60 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACTTTGCTCAACGTGGTTCAA:1 + chr3R 19543511 3' - roo 8721 2 56.85 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGGGCGGGTGGATTATGAATCAAAACCGGTTCAAAAAACAATGACCAAATCCCCAAAAATATGCAACATTAAAT:1 - chr2R 11339048 3' - jockey 56 1 48.63 AGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGAATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACTAAAAAACGTCAACC:1 + chr2R 11097387 3' - Juan 4028 1 63.16 AGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTTTGCA:1 + chr2R 21425150 3' - HMS-Beagle2 6953 2 67.12 AATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTGGCCGC:1 + chr3L 20399085 3' + roo 369 1 53.91 TGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACAGCGAGTGTACTTGGTCAGAGTGGAAAATATGACAACACATATGCACTGCTGTC:1 - chr3R 27782647 3' - G2 3057 1 70.71 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGCTGGTATGAAGAGGAGGGAATGGAGAGGGTGAGGAAGTGGGC:1 + chr2L 18178405 3' - Tirant 8124 2 73.72 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTC:1 + chr3L 5179203 3' - P-element 95 1 20.55 TTCGCATTCACACTAGCTGAGTAAGGGCTAACTTATTTATAATTTAATAGGTATATCGTTAAGATGACCGAAAAGTAAACAATTGTCAAAGCAATTTTGTAAAATTCCAACCAAATAATA:1 - chr2R 13155895 3' + INE-1 531 1 92.50 GAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATAAATTCCCAGCCATATTGCTGCGTACACTTACGTCGTTATTTGCACAATTCTTTTGTACGCTCTCAAATTGATATTAATTAATGAA:1 - chr3L 19335305 3' - invader4 2791 2 64.38 CATACAAAAGTTATATTCCACGAAACACAGCTACATTTGTTAAGTTGACTGTAAAAAAGGCACATAAACAAACACGATACAACTACACAAAAACATATAACATACACCACCGGCTCCACTGGCATTAGCAGCGGGGCCAGCCAACA:1 - chr3R 5863922 3' - transib1 406 1 74.66 GGTTCAAAACAAAAAATAACAATTGATATTCCAAAGGTCTCATGTTCGTCATCACATAGTGGTTCAGTTCAGTTCAATTCAATTCAGTTTAACTGCACTTTTTATGGCAAGGGCAAAACCAGAAAACCAAAGTTGCGAGTTGCAGA:1 - chr2R 8769044 3' - Tc3 91 1 76.03 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATCGAACTATAGTCAAATAACAGCTTTGAGTTGTGTGTTTGTTCCAGGGCTGTAATGTTTAATAACT:1 - chr3L 21151081 3' - 412 7109 2 55.48 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATCTACATATATAGTATTATATGTATAAATAAAACCAAGCAAATGATATAAAAAAGAAAACACACAGCGAAC:1 - chr3L 15859605 3' - I-element 51 1 54.79 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCT:1 - chr3R 24976212 3' + roo 9017 2 60.15 TCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTTTTTTTGGTTTGGGTTTTATGTCTGCGGTGTGGGCCACTTGAAGTCGCCAGCATTGTTTTCAGCTCAGCGCCCGCTAAAAA:1 - chrX 17472092 3' + Quasimodo 7338 2 64.79 ACTTACGAATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCAAATACCCCATGATCTCCTAAGTAACCCGTTGCTCCGGAGTCTTGGATCGTCGCTGTGGGCTTACGGGCGACAGGGAGTTGTTGCGACTCAC:1 - chr2R 21098988 3' - R2-element 37 1 53.85 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTG:1 - chr2R 9504215 3' + roo 9003 2 67.12 GAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTTCTTCGTCTAATTAAATTACGTAGCGGAAAAAGAAAACT:1 + chr2R 5045707 3' - invader6 4517 2 67.81 TTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATAAATTCCCAGCCATATTGCTGCGTACACTTACGTCGTTATTTGCACAATTCTTTTGTACGCTCTCAAATTGATATTAA:1 - chr3L 19335313 3' - invader4 40 2 58.90 ATGAACGTTGATATCTCAGGAACTATAAAGGAAGGTTGAGATTAGGCATACAGAGACATAGGCGCAGCGCAAGTTTGTTGACTGGCGCCCACTCCGAATATAACCCGTCCACAACAAGGTAGTCGGCTATAGCATGCTCTCTTGTT:1 + chr3R 31045923 3' + INE-1 139 1 48.63 GCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATATATATTTTTTTTACCATTCCTAGTATTTTAAAC:1 - chr3R 28659040 3' - Burdock 6218 2 79.45 AGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGCATCTGATAAAGAGTGCATATTGGCTTGTGATGAAGTAGCAATAAAAAAAAAACTAA:1 + chr3L 10758743 3' - GATE 49 3 58.70 AGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTA:1 - chrX 9437188 3' - roo 8774 2 32.88 CGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTCACCATAACGAGAATGTTGCATCAGCCCCTAATTGTGCG:1 + chr2R 973825 3' + 1360 3314 1 73.38 CTAATAAGTTAATAGTTTAATTAGGTAATCCATATTAGGAATGTAAATCGGGCATAGTTATTTTATTAGTTTTTGAATTTACATATCATAGAAAATTACGAATTCAGGATATCATAATTTAAACATAATAGGCCTAACATAATTAT:1 + chr2L 20862726 3' - Porto1 4550 1 60.96 TGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGCATTGGGGTTCCTTCATGAGGCACGAGCAGCAGCCAACATGGCGGATTTCCGTGGCGACAATGCACACG:1 + chr2L 17722567 3' - jockey 4969 1 52.90 TTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCCACCAGTTTTAAAGCACGATCCATTTTGCCAAGTGCACTTACTCCCTATTCATTCAA:1 + chr3R 30558297 3' - I-element 4891 1 60.96 GTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTATGGTAGAAATAATAAAAAGTCTGTGCCTTTCCGAAATAGACTTCGCATTACCCATTGT:1 + chrX 19820224 3' - Juan 4089 1 59.59 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGTGTAAGGGACGGATTTTGCGCTGTGCTGTGAC:1 - chr3L 10563851 3' - hopper 20 1 70.55 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTT:1 + chrX 16217518 3' + P-element 2841 1 44.17 AGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAATGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAGCAATAATATTCTTATTCCTAACGGGGATAGTGTACGAATTGAGACATTCTGGCATATATAATTGGCCTACAAAAATGACAATATCTG:1 + chr3R 9545183 3' - invader3 135 2 60.27 AAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATATATCATTGATAAAAAAAGCTTTTCCTCTGCGCAT:1 - chr3L 18554618 3' - jockey 4645 1 76.03 GGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGACGAGCTGGAAAAGCTTGCGTCTGAATTGAGA:1 - chr2L 4420485 3' - gypsy5 48 2 52.74 CGCCAACATACGGTAGTACTCCTTATCTATCGTTCCGATTGGCCATCTCGTCCTTTCGGACACGCTTCATCATGGTGACGAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCGCAACCGCAACATTTCCCAGAGTTTCCTAGAAT:1 + chr3L 11400046 3' - Rt1a 4784 1 59.15 TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTTAACCAAAACCATACCCATTCAGTCGACAAGCAGATTTGCCTAATTCCATTTCGTTTCAGACTCGTTTCGGGCTCAATTAAAACCATTTACACGTCGCAC:1 + chr2L 1277945 3' + I-element 5336 1 71.23 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAA:1 + chr3L 22884021 3' + roo 340 2 64.38 GAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTATCACAACACGCACCCATATCGCGCTTTTTGACCACTAACTTCGACGGG:1 + chrX 11687932 3' + 1360 3183 1 68.35 CTGGATGAAGCCGACCACGAAGATAAAATTGCCAAACAGCTTTTAGCAATTATTAATTATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACAT:1 + chr2L 15322918 3' - diver 321 1 72.60 CGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAACAAGTCCATGTGCAGTCATTTGGTTGTGCTTGGGTCTTTTTTCGAGGGGAATGTAAAAAG:1 - chr3L 3339331 3' + Transpac 5171 2 57.53 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAAAATTAATATTTGGTCAGGAATTTCACCAGCTGGATATTTTGTGGTGATTCCATGC:1 + chrX 22676480 3' + 297 6953 2 64.38 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCAC:1 + chrX 16217516 3' + P-element 2813 1 34.93 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCGTGGGATTTCGGCTTGGCCC:1 + chr3L 13366153 3' + hobo 2905 1 75.95 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCGTTTCTATGTTCCTTCGTGGAATTTCACAATAATCTTTTCCATCAATTGCTGATTAGTTCGCATC:1 - chrX 4823524 3' - pogo 52 1 56.55 AAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAAATGAAACGAAATCTTTAATTTGTGTTCGAGTGGTTAAGCCGAGCTTATC:1 + chr3L 17206976 3' - I-element 4998 1 65.75 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCAGCGGCGAGGCGAGGCGATTGGTTGCGTTTTTGTGGGTCGCCCGGGGCTTACCTCACCTGCCTCACTCACGGCTCC:1 + chr2R 11379554 3' - hopper 25 1 60.16 GCTTGTGTGTGTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGGTGGTTTTTGACTTGGTTCCATGTCCTTGTGCGTTTATGTATGCGTGCGTGTGTGTGAGTGTGCG:1 - chr2L 11516718 3' - gypsy3 416 1 53.00 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATACATTTCAAATATATCAGATATATAAGAAAATCACTGTTTAAACAGTTTCATATTTATAGATAACATTTCATATTGTCACCAAGCAT:1 - chrX 20632536 3' + pogo 2068 1 60.27 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATGTGCAAGGCAGGGCCG:1 - chr3R 18697907 3' - 297 46 2 85.26 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATACCTTATGAAATATGGAGGTATTGCAATGTCACATATAATAAGAAAATATAATTTAGATAT:1 + chr2R 14940768 3' - blood 7071 2 56.85 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGT:1 - chrX 19585162 3' - Transpac 4982 2 65.07 GTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGCTGGTATG:1 + chr2L 18178371 3' - Tirant 8167 2 58.22 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATGTGTCA:1 + chr2R 22464489 3' - pogo 37 1 55.48 GGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGACGAGCTGGAAAAGCTTGCGTCTGAATTGAGAAAAAAACATAAAAGGACGGGTCTGAAATAAGGAATCGAA:1 - chr2L 4420446 3' - gypsy5 6948 2 78.08 TATTTAAACCAAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACCATCTACGTCTC:1 + chr3L 9519647 3' + roo 346 2 56.85 AAAATGTTTAAATCTAATTTCTTTGGGACTTCGCTAGATGTTTAATAAGGGGTTGGAAATTTGTGGACGTTAGAGTGGTCATGGCTACAATGTTTCATCCTGACTAACGATTCATCCATCAATCCGTTCTTAGATTACTTTTTCCA:1 - chr2L 14570521 3' - Bari1 335 1 64.38 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGCAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCAT:1 + chr3L 5179195 3' - P-element 79 1 18.03 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATCGAACTATAGTCAAATAACAGCTTTGAGTTGTGTGTTTGTTCCAGGGCTGTAATGT:1 - chr3L 21151090 3' - 412 63 2 61.11 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGCAGCATAAGAGGAAG:1 - chr3L 10563889 3' - hopper 37 1 52.00 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCACCCGAAATTTATTTGTCTCAATAAGACG:1 - chr2L 7271805 3' + 297 6944 2 61.94 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATCTACAGTGCCGGCAGACGACAACAGAAGGCCGCAAGATTATATT:1 + chr3R 9193242 3' + opus 428 2 69.18 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACTTGATATTTCGAAATAAGGAACATAGTAAGAAAAGTCGTTCATTATTAAGCCATAAGTGTTCTTCTTCTT:1 + chr2L 5447990 3' - roo 8715 2 53.42 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCACCAATCTGT:1 + chr2L 18213208 3' - roo 69 2 66.44 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATATATTCAAAAGTCCAACTTTGACGCGCCAA:2 - chr3R 22522657 3' - roo 90 2 82.19 GGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAAT:1 - chr3R 4160068 3' + invader2 5043 2 60.27 TCCATCATACCAGACCAATTCACCAAACAAGGCACATGGCACCATGAGTCCGGCATATATAGTCCGCCTGGCGCGTGGTAAATTTTCGCAACAAAACATTTCCATCCCCGCTTGTGCTTTCAAGTAATTTTGGCATTTTTGCCAGG:1 - chr3L 18414361 3' - R1-2 3085 1 53.42 CTTCACAATTCTCTCATATATGGAAGGAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAACACGGTTTTATGATTAACCAATAAATATAAATCTATGGATTTTGCAAATC:1 + chr2R 23013553 3' + Q-element 29 2 75.34 TCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATAAGCCTACTCTAGATACGTTTCAACGAATCTAGTAAATCCTTTTACTCCATAAGCAATGGGTATAAAAACTTTTTATTTCAATATAATTCCGCATATTCTATT:1 + chr3L 27146342 3' + HMS-Beagle2 7178 2 73.97 ATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACAGACGGTAGTTCCACTCGGCTTGATCAATTGTTGATGGTTAATAGATTTTTTTAGTATTAACAATCGTATCGGTTTATACAGAGTTATTGTACATTCT:1 + chr2R 330568 3' - gtwin 18 2 72.14 TATTGATCCTAATCAAGAATATATATACCTTATACAGTCGGAAACTGAACGAATTTCTGCAACTGTCGAATTTGATTTGAAAAGTTTATAATCTCCACACAGCTTCCCTGTGCAAAGTGCGAAACCTAAGCAAACA:1 + chr3R 5688653 3' - INE-1 84 1 69.12 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGTCTGGTATGAAGAGGAGGGAATGGAGAGG:1 + chr2L 18178391 3' - Tirant 8136 2 62.96 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATCTTTATGCTTACAAGAACATTTTGCCAATCGATACTATATTCCTTGGTCTCAAATGAAGAATGCAATTCGATATGGAAAAATTAAACTAATTTATCTGGTA:1 - chr3R 29622611 3' + pogo 2085 1 67.12 CAGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGACGAGATATAGTCGGTGACTGTCGGCACATTAGTATCAGTGCATTAGGCCTAGGCAAC:1 - chr3R 5115311 3' - Ivk 66 1 65.32 ACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGAGGATTCCGATGGTGAGAAAGGATGTATCTTTTTAGTTATAAGTTGAGTTTCAGAATTT:1 - chr2L 23286568 3' - Tirant 417 1 50.85 AGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTACTTCGT:1 + chr2R 5173237 3' + Stalker4 7321 2 53.42 TTTTTGAAGAAATAAAAAAGATGGATAACTGATTGGCCTTAAGATGTTATTAGTTACATTGATGATTCGATAAAACATACAATTCAATTCAATTCGAATTCATACAATTCTCTTGAAGAGGGGCTTACCACTTTTTTTAGTTTTTA:1 - chr2R 8299711 3' + Tc3 1563 1 55.48 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGGCACTGAACTGGAAAACCATC:1 + chr3L 9519639 3' + roo 9030 1 55.08 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAATTCATGGAATTTTTCATACTTTTGAAATACATTCTAGTTGTTTTACATTAA:1 + chr3R 22136359 3' - FB 68 1 65.52 ATTTATTTTATTTAAAAAAATTGTGGGACCAAAAGTAGGCAACCTTCTATATCAAAAAATATTGATTTTATTATATAGATTCTGGAAAAAAGCATATCGTATATCAAATTGCCTTTAGTTTGAGTTTAAATTGTGGGACGCCTTTC:1 + chr4 97362 3' - Ivk 5378 1 69.86 TCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCCTCCTGGTCTTGTAGTTTGTGTGCTCTCCTCTTTTTGCTCATATGG:1 + chr2R 8253448 3' + jockey 4906 1 68.49 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCGTGTGATTTCGGCTTGGCCCAGAAAGTATGCAACGATTTTTGTTTCAGCTTCCCACAAACGAGCACAAACGTTTGGGTTTTT:1 + chr3L 13366215 3' + hobo 2923 1 68.29 AAAAAAACGGGGCGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGCGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGTAGATGCCGCGGAAAATGCAATAAAGGAAAAATAAGCAACGACGCCAAAATGGTCAGCACTGGGC:1 - chr3L 814913 3' + hobo 2884 1 50.68 TATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTAAAGTTTTCCTTCGCACTAGGCCAAACTCC:1 - chrX 20636959 3' - Quasimodo 87 2 79.45 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTAAGTGTACTATAAATAATGTGTGATTTACGCGTTACTTATTTTATGTGTCCGGGATACAAACTACTGCAATTATCTAGAAATATACGTTA:1 + chr2L 6755871 3' + pogo 2075 1 69.18 GCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACTGCAAAAAAAAAACAACAACCAGTGCTTGGACATCAAATAAAGGAGAAACTTTAAGCACGTCATGAATTTAGCTCATAGGTACTAGCATTGTTTTAATTGATGTC:1 + chrX 19818805 3' + Juan 4176 1 71.92 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTTGCGTACAAAATTCAACATTATTTGAAGGTCGTCCTTTGCTTATTCTGCGCGTCGCTTTTTACTCGTTCGC:1 + chr2L 21251046 3' + P-element 2839 1 53.42 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGT:1 + chr2L 19643604 3' - hobo 55 1 64.62 ACCGATTTCTTTATGATCAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTATGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGGTCCATGGTGTTGTGGCTTTGGATGATGTTGAGATTGTTG:1 - chr3R 26033708 3' - I-element 305 1 72.60 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACACGGAGTGTGCCATCGGAACTTGCCCAAAACAATTTAAAATTACCTCACGTATATGTATGAAATTGCGAACGTATTGTGGGCGTGTCGCCGTCCC:1 - chr3L 13366062 3' - hobo 15 1 68.42 CAGCAAGAACCCAAAAACAAAAAGAAAAAGGAAAAGGAGCAAGCGAACGAAAGACAGATATGCGTAGAGATGCACTGCGACGCCTTGGAGGCGGAGGGCACGGAGCGACCCACCATCAAG:1 + chr2L 4307942 3' - Tc1 165 1 55.83 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCCACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGT:1 + chr3L 10563989 3' + hopper2 1554 1 55.56 ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGAATATTATGATTACTATCTGTCTGTCGCTCTGTCCGCAGTAACTCTGTGATCTCGTAATGTAGACTAGTAAAGGGAAAATAACCAACACGGATG:1 - chr3L 27146160 3' - HMS-Beagle2 25 2 67.12 AGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTTATCTAAATATAAGTGAGCACAGCAGTAGGCCCGTATGTAATTAAACA:1 + chr3R 21706328 3' - I-element 64 1 62.32 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACAATACACAAAGTATACA:1 + chr3R 29091426 3' - rover 23 2 70.55 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCTTTAGTAAAATAATTTTTATAGAGTACCAGAAATAAAGTTTAGAAACCTACAACT:1 + chr3L 15277690 3' - I-element 68 1 60.96 ACCAGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGAATAGAAAAGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGTAACCTTTATTCGAATGAAATATTTTACACCCTCGT:1 - chrX 9065190 3' - invader1 113 2 73.28 TTATATGTTTTTTATCAATATGTAAAGAAATAATAACAAAACTATTAACAATGAACGAGAAAAACAACTAAATCCAAGCTTGCACACCAGACAGCGATGGAACCTGGGTCACGGCACCCGAGTGGATGCCGGAGTCGCCC:1 + chrX 1896641 3' + S2 117 1 58.57 GCACTGCTATTTTAATTAACACTGAGAATCTGAAAAAATAACCTTTATCTTAAAGTGGAGGCACCCCAATACACCCACAGACTTAGTAACAAAAAATGTTATAGGCACTATATATGTATAGATTAACAGTTTTATTGTAGTTCCAA:1 - chr2L 14706842 3' + HB 1426 1 47.26 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAAT:1 + chr2L 18213190 3' - roo 8751 2 78.77 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTGAGCGCCTTTATGGCTGCTTGACTATCAGTGATATTTGACTAAAAATGCTGGAATATTCTTTATCGAAGCACTCAGG:1 - chr2R 4330731 3' - copia 13 2 57.02 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACATCTTGTGCATATAAAACACCCGGGGATCCAGCAGAACACACA:1 + chr3L 2184954 3' - jockey 84 1 69.86 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGTTTAATCGAACAGTTGACACTTATTTCTCGCAGTGTCGCACTGAGTAACTTTAACTCTTGATTGTGT:1 - chrX 15565494 3' - transib2 52 1 55.48 AACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCATGATGATGACGGCTCTGGCTGGCCAATTTCCACA:1 - chr3R 27911439 3' - pogo 1972 1 76.71 GTTTTGTAAAATTATTTAAATTTATGCTCTAATAGCTTGCCACACACAACAAGGATAGAACATGTTAATTATTTCACGAACAATAAACTAAATTAAATGGAAAATATATTGAACTATAAAGACCGACCTAGATCGTTCGTTCAGTT:1 + chr3L 23346009 3' + HeT-A 5805 1 69.86 AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCACCCGAAAT:1 - chr2L 7271825 3' + 297 331 2 64.38 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATTAGGGTATCTTCTCACCAAGTCGACCAAGCTATCG:1 - chr2L 5447852 3' + roo 9038 1 59.59 GAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGCCTCTGTGTCAATGGAACTGTGTTGGTTTAGCCGCTGGCCAAATATTTTAGGGACCATGATTGAAAAGCAGTTTTGCATTG:1 + chr3L 13471509 3' + jockey 18 1 60.14 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCTCTCTCACTCTCTTCGAAATTCTTATTTGTCCACATTCACATTTTCGCGTTCCCG:1 - chrX 10806869 3' + P-element 2838 1 47.37 ATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACCTCGAATTGGGAATGCCTCAACCTTTCCCAACACCACCTAACCCCCTTGCCATGCACTTAAATACCCTTAGTTGGATTGGTAAGGATCGCATCGCACCACCCACCGGCCACC:1 + chr2R 13193922 3' + BS 5085 1 71.92 ATCTCAGCTAAGGACTAAAAATAAAAATTAATTGCGATTGAGAAGTGCGTTTAAATCAAAAAGTTCGCCAATTTTCGATTTTATTTCTGTCACCGCTGCCATCGAGCGAGTACCTTGTACGCTTC:1 + chrX 22901105 3' - 297 6857 2 75.20 TAAGTGAATTATGAAGAAGGCATAAGAAGGCATGCTTTTCCTTAAAAAGATGCTGTTGGTCACAATAAGGGTAACGGATTTCGTTCAATTTCTATTTCTTGAGGCTGTTCTTCATTTGTTTCGGTTTTCTTATT:1 - chrX 17935676 3' - Tom1 14 1 53.73 GATCAAATAATAAAAACATCATCTTAAAAACGGCCATAAATTAAACATGCCGCCCGCAAAAGTATGCTATGGATTTGAACTCGGATTGCGAATGCGCTGAGGCGTGCGAATGCCAAAGTTACCAGAAAAAAGAGCTGGCGAAAACT:1 - chrX 19818362 3' + jockey 4986 1 80.14 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGATAACGGGGCTTATCTTAGCCGGCA:1 - chr3L 13228455 3' + P-element 2865 1 60.53 CATAATATGTATGTAATATGTACATAGTATGTAGTGTTACTAAAGAATTTAAATAATTTGTTAAATAAATCTAAAATACTTAATAAAGTCAAATGAAATTTTAATCAATTATATACTGGCATTTCTAAAATCCAGAATTTAATTA:1 + chr3L 15417028 3' + Dm88 4365 2 64.14 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTACTCAAAATATGTACTGCAATGAAAATATAGGAAACCAAACCACTTTGAGAGGATTTCGGGTTGAATAATATCTGAAGGTGTTTTCATCTACATATTGTAC:1 + chr2R 7781371 3' + S-element 1701 1 76.71 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGTAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAAT:1 + chr3R 24976282 3' - roo 84 2 76.03 CTATTATTTCACTGATAGTCACTCCCTACACTATTTACGATATGTGCCAGTATTAGTAACTAACTTCACTTGTTCCACATTTTCAGCTGCGTATTGGTAGACACGAATCATAAATCCGTTTTTATTAAATGTTAAATTTGTCAATC:1 - chr2R 5614758 3' - X-element 132 1 60.96 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGAACGCATCTCTAGAAATCGGTCGCTTTCAGTCACAAAACTGCGATCGTTGC:1 + chr2L 2999287 3' + P-element 2867 1 60.42 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAACACACTCACGGCAGCAGGAAGCTTCCTAGGATATG:1 - chr2L 12847226 3' + 412 7499 2 68.22 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACATTTTCCGGTGCCGCCATGGTGGGTACGTTCACATCCACATTCCCATTTACATG:1 + chr3R 22624805 3' + blood 7354 2 59.59 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCCCTGTCCGTCTTTCCGTATGAACGTCGAAATCGCAGTAAAGTAAACCTAATTACAGTACTTAGGAACTTACTGCATACTGCTAGGGATATCTCACTCACAAAGTACAT:1 + chr3L 6618530 3' + INE-1 92 1 48.55 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGCCGCTTTTTCCCTTTTTCCCACCATCACCCCCACCATTTTCTCGCCCCTTTCCCTGCTGTTTGCTCAAGTCTGTGTTTGTCCACACAGAGGGAAAATAATTGGCCATATTATAT:1 + chr2R 18983905 3' + hopper 1412 2 78.08 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTTTTTTAA:1 + chrX 7967277 3' + P-element 2816 1 34.06 AATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGTTCAGTGAAGGAGATGGTTTCGCGATCCGGGGAACGGAGGCAACTCCGCGTGCAGTGCATA:1 - chr2L 15321312 3' - F-element 4535 1 58.22 AGTGAAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGAAAATACCTTTGTATGACCTGTGTATGAGACACAACTGCGAAACATATTCTACACCTTAAAATATTTAAATAAGAAGTAAAAAAGAGTTGAGTAAAAAAACTAGACAGAACCGATC:1 - chr2L 21795708 3' - HB 78 1 63.01 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAAACACGGACTAC:1 + chrX 16526327 3' + P-element 2806 1 19.86 CTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGGATAAAGGCAACAACAAG:1 - chr2L 21325095 3' + invader4 3021 2 64.38 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTAACGCATT:1 - chr3L 23146434 3' - 1360 24 1 69.18 ATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAACGAGGCATGTCTGTTATGCGTAACGATCGAAAACTGACCAAATAAGAAACTGCATTGAGCCAAGCTGCTCATTTGCAAGAGTTTAAAGTGCACTTGCCAGTTGCATATGAATATG:1 + chr2L 8755133 3' - invader1 354 2 53.42 ATTTACACATTTCACATTGAAGCACTTATTCGACTATAACAATTGGTCTTACTAATTGTTAAATGGATTTCTTCGATCAAGTATAATGCAGCATTGCTAGAAACACTGCATAGAGTCAACTCCAATTGACGAGCGATTGTTGGCCA:1 - chr3L 17945040 3' + Bari2 113 1 78.08 GTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAATAAATAAATGTGTATTTTAAAAAGTTTTCTCTCTGAAAATACAGCACAGTTTTTGGCCGTTCTAGTTTTTTTTTTTAACTTTTTGGTACGATTGTTTTGGCA:1 + chr3R 27514787 3' + Ivk 5360 1 60.96 ACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAAATCATAAAACTCAAACATAATGAATGATGTAGGAAACCCACCTGTGACCCGGTCGCT:1 + chr3L 2792227 3' + copia 108 2 73.97 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGTAGGCTGCGTTGGATTGATGTTCGGAAACT:1 - chr2L 21153462 3' - 1360 15 1 63.79 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTTATTTGCATAACTGCTCAAATGCATGTTGTTATTGAATTTAGGGTAATT:1 + chrX 17737269 3' - jockey 4746 1 65.75 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTT:1 - chr2L 18213141 3' + roo 321 2 76.71 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGCAAAACATAAAGCAGGAGCCGCCGCGGCGAACCAACATTGCCATGATTTGTATAATTGCAGTGCGAATAATTA:1 + chr2L 20986625 3' + roo 361 2 53.42 CTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGCCACTCGCGCAAAATTTCAATCTGATCGAT:1 - chr3R 22868757 3' - mdg1 7104 2 63.70 TTATAAACTAACCCACCACGCCCAAGCCCCAAACTCACCCCACGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATAAACGGACAACGTGCCGGCTCGAATGGAATTATGATGTTATCGTCCCCGGGTTAAGACAACG:1 + chr3R 3796899 3' + HeT-A 5910 1 56.25 TAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGCGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGACTCTATCCACCACTCAATTCGCGGAATGATTTCCCCAAAACCACCACTCCA:1 - chr2L 18944996 3' - P-element 451 1 38.81 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATGATAATACTTTAACTAAGTACCCTTGGGTAGTGAAACATTTAATTTAAAATAAAATAAATTTCTAAGATCGATATTCCTATAAAATATCGATAGTCGCATA:1 - chrX 13384952 3' + opus 7482 2 33.56 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACAAAATGGGGTATGAGAAATCTGAGGCAACTGCGCTGCTCAGTGAAAAGTCACGTACCAACTGTTGAAAACACATCGTAAAACGAGAAACTTTGCTC:1 - chr3R 20939101 3' - jockey 4699 1 65.07 CTTTCATAAAATAGGTTTTGTCCAAAAAAGGGGTAAATTTCCACATAGTGCACCCCACCGCAAACACACACACAAACAAAATCCCGCACTCTACAATCGATATAATCCTATGTCAGCTTAAATCTGTGGCACTTGTTGGTTGCCAT:1 + chr3L 3755686 3' + Transib-N1_DM 464 1 70.55 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAAATTAAGAACATATATTTTTAAGCCTTCTTTGAAGTTCTTCGAAGTTCAGAACTCAAACTTGCCATAAAAAGTTTATTACCATA:1 + chr3R 29622776 3' - pogo 34 1 51.37 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACATATACACCAAGAGAAATTGGAAAAACCGG:1 + chr3L 5275010 3' - I-element 60 1 58.22 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTT:1 + chr3R 22624747 3' + blood 7332 1 76.36 GTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAG:1 + chr3R 29091371 3' - rover 7023 2 70.71 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTACTTTTGGGATAAAACAAAATACAATCTTACAAAACAAAAAGT:1 - chr3L 16907786 3' - jockey 86 1 69.18 ATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTTCGGCTC:1 - chr2R 1320646 3' + diver2 361 2 72.95 GCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACC:1 + chr2L 13690063 3' - Doc 92 1 77.40 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTGGCACAACAATTTGGACATATATCCGTAAATAATAACAACACA:1 + chr2L 11613293 3' - hobo 79 1 70.55 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCAAGCATATCCCCAAAGTAAAGGAAACCAGAAAACAGG:1 + chrX 20465905 3' - jockey 4791 1 60.96 AGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCCGGGGAACTAGACTATGGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTATAAATGATGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCACTCTACTCTCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTTTCAAAAACTATTTTC:1 - chr3R 18346593 3' + INE-1 545 1 41.78 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGAACGAAATCGGAGGTCGAGTGACTGGCAACGCGATAAATCTCATGGGTTGCTGGCTGCGGAGCCTGGCCGCC:1 - chr2L 18944765 3' + P-element 2881 2 79.85 ATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATCACTGATCTTAGTGTGGTCTACATGCGGGCACGTGTTTGGCTTGCTGAAATCTACATAAGCTGGCTGGCAG:1 + chr3R 11063046 3' - mdg1 336 2 54.55 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGGGCGGTAGGAATGAAGGGAAAGCTGGGAGGAGTCGGTTGTAGGAGGGTTG:1 + chrX 5206535 3' - Tirant 39 2 59.09 GTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCATTGTGGCGGAAGTGAAGCAGACGCCTGATCAGCGGGTGTGTGCTGTTTGCCAAATATTGT:1 - chr3L 26822244 3' - 1360 150 1 58.22 GCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACA:1 - chr3R 19450172 3' - roo 109 2 67.81 AGAGATGACATGTCCATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTTCTTCGTCTAATTAAATTAC:1 + chr2R 5045688 3' - invader6 44 2 54.79 AAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATACTTTATGTGGTTGGAAACGCTTCTTTCTACC:1 - chr2L 167998 3' - Burdock 84 2 83.33 GGACGGTAACTCCTCCCCCCCCCCAGTTTGGAG:1 - chrX 4882217 3' - ZAM 7952 1 90.91 TTCTGACGTTGTTATTATTATTTGCCAAACTTAAGGCTAAGTTATTTTCATATGTTCTTAGTCTGTCAATATATTTTCTAATATGTGGGTGTGGTATTTTTGTTCTTTTTGTGGGCGTTACAAATACAAATATCAAAATATCTTTC:1 + chr2L 21929742 3' - G4 3663 1 53.42 TACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGAGACACCTTAAACATGATGTATAAGAAGCATGATGTATAGTTGTTTAG:1 + chr2L 14480521 3' + Transpac 5159 2 66.44 CCCTCTTGAATGGGACCACTAGCGCTCCGCTATGACATCAACCTACTGCAACGCTCACTTTAAAAAATTTATTTAAACATGTGTTGGGCACAGGACTCGAATTTGGATGGTGCGGATGTGGAATGCGCATCACAGTGGG:1 + chr3R 10376174 3' - mariner2 71 1 45.32 CCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACT:2 + chr3R 17210101 3' - HMS-Beagle2 6950 2 64.83 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATACGTACAGCACGCTGTGGACAAGAAATATGGTGTCCTTTTAGGCGTTGACAAATCGGCGCTCATACTCGCGCCTA:1 - chr3L 13544964 3' + hobo 2927 1 66.36 GGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCACTAACTACTAACTTTATAACCGATTCGCACAAGCCAACATATGTATATCTGATATAAATACAAATACAATCTGCAT:1 + chr3L 15154143 3' + opus 7283 2 51.37 AAAGTGTGCACTCGCAAGTACAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTT:1 + chrX 22824243 3' + gypsy12 10155 2 52.74 TATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCATTCCGGACATGTCGGGATCTTTAAAAGCTTGAATTTTCAAATTGGTATTTGAGTAGTGATTTTATAAATAAATTTATAAGGTAACATCTGTTACTTTCATCTCCAGTTCCTTTTCTT:1 + chr2R 13259725 3' + INE-1 81 1 64.38 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTATCATAAAAATCTGGGAAACAAATCATATCGAAACCATGAAATGTAGAATTCTTCTTTGTCGT:1 + chr3R 14494116 3' + roo 9017 2 57.24 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAGCAAAGTTCATCGCTCCAAATGTTTATGGCCATATAGGCTTATGCGCATTTTTTGCGCGAAAT:1 + chr2R 20739101 3' - hobo 11 1 64.95 TTTCGGAATCGCTTTAATAAAGCCCCGTTGGCCTTCGTCCCAGACCGCAAGTCAAGTGTTACATGGGTCACTACATTCAGGCGAACTGCAAGTGCGACAAAGCGAAGAGCTGGACACTTAAGTTATGCACATTTCCTTTTCCCAGG:1 + chrX 7969258 3' + mariner2 218 1 78.08 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTAATCTAGCGTCTTTGTTCCTACCCTGGATAATCATTCCGATTGTGAAA:1 - chr3L 23241883 3' - 1360 69 1 95.12 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAAACGACCTTGCACAAACCAACAACAACCATAGCGACGACAGCGGCGGCGAAGCAAACCACGAAGAAGAAGACGCAGCACCGAAGTCAGCTCC:1 - chr2L 21250905 3' - P-element 15 1 73.08 AATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAACAATGGCTGTCTGTCAGATAATCTAGTTTAAATATTTTATACTTCACTTATTTGTTGTGTTTCGACGAG:1 - chr2R 21425045 3' + HMS-Beagle2 7146 2 52.74 TCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAACAATGGCTGTCTGTCAGATAATCTAGTTTAAATATTTTATACTTCACTTATT:1 - chr2R 21425062 3' + HMS-Beagle2 7129 2 64.38 CAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATA:1 + chr2L 261038 3' + Juan 4128 1 71.23 ATATGATTATGAGTATTAAAGAAGTGGAATGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATAATAATTAAGTAAGATTTAAGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAATAATGGCTATTTCCCG:1 - chrX 15746295 3' - jockey2 3271 1 62.68 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGAAT:1 - chr3L 16463503 3' - roo 8737 2 68.49 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTCTTATTAGCAGTATTTGTTTATTGTTATTATTGTTTTGTTTTATTTGTT:1 - chr3R 21786207 3' - roo 71 2 69.86 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGAGCGTTTTAAGAGCAGGTGAAAACAATCTAGCTATTTTATGGCCAAAAACTAGATTATGAGTG:1 - chr3R 5264821 3' - P-element 57 1 46.58 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACATATGGCAGTATATGGAGCTCCTCCCGACTGCCACACAGGAGTCCTCATCCTCGAT:1 - chr3R 18517902 3' - roo 10 2 76.56 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAAAACAATCCTTTAGCTTTCGAGTTCATTTAGATTAGGTTTATATAATAAGGAATGTAGCACGTTT:1 - chr3R 19543365 3' + roo 9051 2 71.23 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGCGAATGTCTTTGGGCACTTTGCAGTCTCCTTTGGCTCCTAGTGCCCC:2 - chr3L 3757111 3' - copia 34 2 60.96 TATATTCGTGTTCATGTGCGAACACTTGTCGATCGGTCTCCATTGCCCCGAATGTAAGACCTCCAACGGATGTCCCTCCTCCTCGAAGGAATTTAA:1 + chr2L 8396947 3' - roo 3 2 75.00 ATACCCGTTACTCAGCTAATGGGAGTGCTTAGAAGATATTTAAAAATGTAGATTGAAATAGGTAACGATTTTGGTCATGATACCAAGGACACCATGGACACCCCAGAAGACCTCCATCTTCTTTGACCTCTCGTAAGGTAATTGA:1 - chr2R 10940018 3' - INE-1 540 1 59.31 AACAGCTTTTAGCAATTATTAATTATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTAAAAG:1 + chr2L 15322951 3' - diver 287 1 49.66 TTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTCCCGAAGACTGTGAATTGCGGAATGAATTTTTCACGCATTTGACTGCATTACTTAACCT:1 + chr3R 31681923 3' - Doc 87 1 75.00 GGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTATGATCGCGCTAGATGTCCTACCCTTTTCTATTGTTG:1 + chr2R 6492900 3' + copia 5028 2 36.57 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCCATACACACATAGAGAGTATTACGAAAATCATCGAGCG:1 - chr2L 6755752 3' - pogo 71 1 72.06 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTCCTCTCTGCTTCTC:1 + chrX 16217548 3' - P-element 31 1 61.48 CAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGCCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGGTAGTTGAAGGTGAAGGTGCGGGTGACAGAAGGGGCGAGTGAGTTGGAGAGGGTGCCTGGGGTATA:1 - chr3R 31675459 3' - Doc 384 1 60.00 AAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAATGCTGTTTTCGACCACTTTTTCGAGTGCACTCACCAGAATTTGGCACGGTAACAGTAACTTGATTGTTGGAGCCGACGTCCACAGATGCCATGCG:1 + chr2R 7406077 3' + Idefix 324 2 69.86 AGTGGTTGTTCGGTTATTAAAACACAGCTTGAATTTCGGAATCGCTTTAATTTAGCCCCGTTGGCTCCCGTCCCAGAACCGCAAATCGAAAATCAATTGTTACATGGTTTTGGATATGCTAAGGATGGCATATTATGTTTACATAT:1 + chr2R 1777995 3' + mariner2 185 1 73.29 CCAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGGGGGGCAGTGGGGCATGTTGCAAATGTGTCTGCGCTGTAGGCAG:1 + chr3L 15276754 3' - hopper 37 1 58.33 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACAGACATTGACAACGCACTTGTCGTCGTTTTGGGCGTGTTTTATGCACTTGTCGCGGCTCGTTGCACTAAACAGTTGCCTCAACATGGCCAACAAGTTTGTTAAATGT:1 + chr3L 815064 3' - hobo 7 1 78.42 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATCTACATATATAGTATTATATGTATAAATAAAACCAAGCAAATGATATAAAAAAGAAA:1 - chr3L 15859618 3' - I-element 62 1 63.19 CTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCATGTGGATCTCCGCTCGTTGTGTGTTTTCTTGGAGTAAAGG:1 + chrX 12786948 3' - Transpac 79 2 72.60 CCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGTTGATAAAGAATAATATTATATTATATTATATTTGAGCATAATGTTGTTGTGAATGTTATATCACTGTTTTCGATATACGACG:1 - chrX 4544953 3' + 1360 476 1 59.31 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCGTTTCTATGTTCCTTCGTGGAATTTCACAATAATCTTTTCCATCAATTGCTTATTAGTTCGCAT:1 - chrX 4823525 3' - pogo 54 1 57.53 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCACTTTTATGTAACCTTATTTATTTCATATTCTTAAGATAAGTTGCATTTTTTTATCCAATGCTTT:1 - chr3L 18792405 3' + roo 353 2 56.16 ATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTT:1 + chr3R 6412038 3' - Tirant 8184 2 74.45 CAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGACAAACTATTAGCGCTCAAATTTATGGCAACTGCAAGA:1 + chr3R 26633263 3' - 1360 82 1 77.40 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAATAACAAAATAAGTACGACAGTTCAGATGCGTTTACTTTTACTAGACTAAAGCTGTATAATTTCCCATTTGTTTAAAAAAATTATACTTCACTAATGTAGGAATGCTTAACT:1 + chr3R 16971428 3' + mdg1 7068 8 50.00 TTTAAGTAACCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAGTAATTAACCCATAAGTCTAACAGCAGCCCGAACAGAACGGGCAGAATGTTTTTCGTTTGCCTCCTTGAATTGT:1 + chr3R 9488581 3' + Ivk 5218 1 58.90 AAAATATTAAACTTGCTTAAAAGCTTGAATTGTCTTGAAGACTCCTAATAAAAACTAAAATTAAGCTAAGGAACATCATGTTTAGACCCTTTTCAAAATTTACATATTATTCTGCAGGTAATTTTCTTCCGTGGAACAAGGACACA:1 + chr3L 7474126 3' + Penelope 487 1 75.34 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGAATAAATCAACCTAGTATGTTGGGCTC:1 + chr3L 14084967 3' + opus 7455 2 57.14 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGATTTAATAAATGTGTGGTAGATGGCTTAATTGGAGCAATTGATTAAATTAAACGATTATGCATATTTTATATTGCTGTGGGTAGATTTCACAATTTGAAGAGGCGAAAAAT:1 - chr2R 11595773 3' + P-element 2879 2 80.14 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGG:1 + chr2R 24021656 3' + pogo 2039 1 63.70 AATCTGGTATTTCGATACAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCCACGGGCAACGGTGCATTACCAAATAAATAAATATAAAAAAAAATTTCAAAGTAATGAAAAAGCATGACAACTTATTTACACAAGTTATTTTCCCTTTGTG:1 - chr2L 4367021 3' + Tc1-2 414 1 56.85 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACATATATATATGCACGCTCTGTGAGCATTTTCGAGGATTAAATGAGACACTTTGCGTCGCGGAGGGGAGGGGAGGTCGCAAAAAAGA:1 - chrX 1764018 3' - opus 7025 2 67.86 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAAAAACTCAAAAATAATTAATTCATTAACTTTTTT:1 + chr2L 20556492 3' - 412 7139 2 74.66 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTT:1 + chr3L 20399059 3' + roo 8990 2 74.48 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATGCGGCTG:1 + chr2L 13690099 3' - Doc 56 1 52.74 AGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAGATAGGGAAATGTGAGAATGACTGATGAATACATATATGTG:1 - chr3L 808624 3' - hobo 2631 1 71.92 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGTGTTAAGAGCAGTCCAATATCAATTTTCAAGTATTATTTTTCTGAATGTTCCTGATTT:1 - chr3R 14494011 3' - roo 62 2 61.64 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGAATTACCGCGATAGGATCTGCATTTTAGGGTAAATTAACTTTGAAATGCGATTTAAATAG:1 - chr3L 16463446 3' - roo 16 2 72.60 ATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACATGCCTGCTAGACCAGCTGATAATCTCGTTGAAGTGTCCGATAAGGGAACGAAAATAAATTAGCTAGAG:1 + chr2R 9602070 3' + I-element 477 1 52.71 CATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTT:1 - chr3R 19589894 3' - BS 5037 1 53.42 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTAACGAGCTAATAAACCGCTCATGTTACAGATATGT:1 + chr3L 13827458 3' + roo 324 2 76.03 GCACAAATAAATAAAAAAAAAATAAAGCACTTGTTTACTTCGTCGCAAAATCAAAAGACAGACTGCGGCCTAAATAAATACGTGCGTTGCTCCATTCATTGAACGTTATGTCTGTTTGCGAAATGTGTAGCAAATTTAGTAGTTTT:1 - chrX 10367479 3' + Juan 4213 1 78.08 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTAATAATGTATCTCATCTTAAATTGATGTGCACTCGATCCGC:1 - chrX 9877719 3' - jockey 86 1 70.14 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGATTTAATAAATGTGTGGTAGATGGCTTAATTGGAGCA:1 - chr2R 11595847 3' - P-element 82 1 29.45 CATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACT:1 + chr3L 10563967 3' + hopper2 1521 2 73.97 ATTTTTGTTTTGCTTACAAACAAATATACAATATTTGGTTTGTGTCTTTTCGTCTTTATTTCAAATCATTTGCCACTTTTGCCAGCCATTTTAATTAAGAGAATCTCGTAAAGGTCGACATCTTTCACAAGGAATCACTGAGAAAA:1 + chr3L 15752938 3' - Penelope 734 1 71.23 GTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCCACCAGTTTTAAAGCACGATCCATTTTGCCAAGAGCACTTA:1 + chr3R 30558281 3' - I-element 4907 1 71.92 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGG:1 - chrX 6484728 3' - jockey 87 1 73.29 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTATGCATAAAAAACGTTGAAAGCAAA:1 + chr3L 13545042 3' - hobo 73 1 79.20 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATACAGTGCATGTCAGAATGAATACGGAATTCCTTGCGGACTTCAAGCGACAAAAGATGAGCCTGTACCA:1 + chr2R 12814948 3' - opus 7163 4 54.11 ACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGGCCAAAAAGAGATTCCATCAGTTGGACAACAGGACGACCTGGTTTCGCTTTTGGACATTTTTAAGTGCGCTTTGTCGGCTTTG:1 + chr2R 9623468 3' + I-element 5344 1 76.71 GTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGCTGGTATGAAGAGGAGGGAATGGAGAGGGTGTG:1 + chr2L 18178396 3' - Tirant 4 2 78.26 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATAAATTATGGCCGCAAAGAGCGAGAAGAAGAAGACTAGAGGCAGCACACTGTCCATTATTGTTGCCCATTGAAAGCGTAATGGGAAATACGCATAAAACCGTTATACAGTCAA:1 - chr3R 16228768 3' + P-element 2881 2 77.40 AGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTATCTTACTAACTCAATGCAAATCAAAGTCATTCATTATGCCAATCCTCCATGTGTCCAACAAGTCGCAGCGATCAGCAAACCTTCTCGTGCGGAATGGAATTGCGTCAATCAGTTTATCGTTC:1 - chr3L 11352679 3' - gypsy10 5940 2 69.18 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGCCATGAACCCATGTATCACTTGTGTTGCTATCTCTCTC:1 - chr2L 18213094 3' + roo 9032 1 56.85 TAATAAGTTAATAGTTTAATTAGGTAATCCATATTAGGAATGTAAATCGGGCATAGTTATTTTATTAGTTTTTGAATTTACATATCATAGAAAATTACGAATTCAGGATATCATAATTTAAACATAATAGGCCTAACATAATTATG:1 + chr2L 20862727 3' - Porto1 4549 1 61.64 GTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGTTCTGGAAGTGAGTGCGGTTAAGCGGCGAGACGTTGCGCCATTAATGCGAAGCGTACTTTTGGGCGCGCTAC:1 + chr2R 7889508 3' - jockey 4654 1 56.88 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATCTACAGTGCCGGCAGACGAAAACAGAAGG:1 + chr3R 9193227 3' + opus 467 2 67.39 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATATTATTATATATAATATTGTACATACTATTAAATAAACGTTTGCTTTTTATATGGCCTTGGTCACATCACTTTTGTCAGTCTGG:1 + chrX 9437308 3' + roo 9036 1 61.64 AACTGCACTATACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGCACACAGTCATGATTTAATAGGCAAATCA:1 - chr3R 30302293 3' - Doc 96 1 75.34 CGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTTTTTATGTAGGGATTTTCCCTGTTATGTGTGTGCTCTTCAAGATATTGATAAAAATGCGCATTCCATTT:1 - chr2R 17139146 3' - Doc 4469 1 52.05 AAAATTTAAATTAAAAACTTAATGCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGACCCTCTTTTCGAACGCGTTTCAAATGCAAAACAATGTTATCCCCACAAAGCCATTAAGTCG:1 + chr3L 11233646 3' + 1360 3047 1 75.37 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCAAATCCACTTTGTTGCCCGTCTATCCTTGCC:1 - chr3L 17108567 3' + hobo 2909 1 62.79 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATGCTGGCACCTACTTCCTTATAAGCAGGAAACTCCCGCTGGGGGTAGAAGAT:1 - chr2R 14722673 3' + mdg1 7426 2 53.64 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTGAGGAAATTGCACACCACACTAGGACCTTTGGGACCGTTGCACTATTGCCATCTTA:2 - chr2R 4802934 3' - roo 8727 2 65.75 GTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGCGGATTTCTTTATTCAAAAATTTGAATACAAATTCGAAAAACTCAT:2 + chrX 21187829 3' - hopper 72 1 69.86 GCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATTGATGTAATCAACAACGTGAAGAGGCCCGTCTGCGCCATTTGAATATC:1 + chr2R 15942371 3' - opus 69 4 66.44 CCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGC:1 - chr3R 14860172 3' + BS 5000 1 82.19 AGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCACTTACTATCACATGGTTTT:1 + chr3L 14549676 3' + P-element 2620 1 21.92 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTAGTTTAAAAGCTTCAAATTTTCATCGACATGATTTGACCACGTCAGAGCCGATGGAA:2 + chrX 14346558 3' + roo 393 1 72.60 AACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACC:1 + chr2L 13690059 3' - Doc 96 1 80.14 ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATAAAAATTAAAAATTAAAAAAACGAAATCAAATTCACCGAACTATGAGTTATTTGAAATGGTTA:1 - chr2R 11097305 3' + Juan 4150 1 61.38 AGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTTGCCCATTTATCTTTTCCAGCCCATC:1 - chr2R 14940699 3' + blood 305 2 80.80 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATGCAA:1 + chr2R 15151107 3' - hopper 80 1 71.92 GGTTCACATAAACACGGGATTTCAAGAAACCATATAGAAAAAAATCACAAGGGTACAGATCGGCTTCATCACTAAAATATAAACATGTCACATCATCGAAATAGATGCCCAGGAGCTGATTTGTAGTGACCCAGAATAGCAGCAAC:1 - chrX 22513723 3' - mariner2 617 1 55.48 CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATG:1 + chr2R 15151104 3' - hopper 83 1 73.97 TTCCTGATTTATCACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGTGATGAGAATCTTCTCCTTCCCACTGAATGTATATACTTTTCGTTTTTCATGGTATTTTTTTTT:1 + chrX 8861526 3' - mdg1 7347 2 54.17 GATGTGTGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATGCCACAGCGTTCCACTCCCCTGCTGGGACTTCTTGC:1 + chr3R 17210151 3' - HMS-Beagle2 6894 2 76.98 ATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGTGGTTTTATAAAGACACACAACATTTATGTTAATAGAAATATTTAATCAGAAATTTGATACTGATCCTAAAGTTGCACTTTGGAGTTTCATTTGCGTTCAGCCATTTCTCG:1 - chr3L 19437841 3' - copia 10 2 72.22 TGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTGGCACAACAATTTGGACATATATCCGTAACTAATAACA:1 + chr2L 11613288 3' - hobo 84 1 73.97 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAAATTAAGAACATATATTTTTAAGCCTTCTTTGAAGTTCTTCGAAGTTCAGAACTCAAACTTGCCATAAAAAGTTTATTACCATAAAGCAAAAG:1 + chr3R 29622785 3' - pogo 25 1 56.85 TAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTTTTAAATGTGTAGAGTGCTTTGAATATCTGTGTGGCAGGAAAAATCGATATCTTAAAAAA:1 + chr2L 18300848 3' - Ivk 5312 1 58.90 CTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAATTATTTCTACCATTATGTGTGGGGTGGCTATTGTATCTGCCGC:2 - chrX 19820157 3' + Juan 4139 1 63.70 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTATGAGTGTATTTATTA:1 - chrX 11267697 3' - roo 60 2 60.00 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGTGTTAAGAGCAGTCCAATATCAATTTTCAAGTATTATTTTTCTGAATGTTCCTGATTTTTGGGATTGGGCTGCATTTTTAGTTGTTAGTACAACGGGCGTGCGTCAAATTGCGG:1 - chr3R 14493955 3' - roo 8670 2 78.08 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTATCATAAAAATCTGGGAAACAAATCATATCGAAACCATGAAATGTA:1 + chr3R 14494099 3' + roo 8999 2 69.18 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCTCTCTCACTCTCTTCGAAATTCTTATTTGTCCACATTCACATTTTCGCGTTCCCGTTTGTTGGGTGAGCTCCGTATTTA:1 - chrX 10806845 3' + P-element 2859 1 62.50 TTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCCCTTGGGCTGGCTACTTCCTCGCTTCCCTCTCCTTT:1 - chr2L 18178288 3' + Tirant 8432 2 75.18 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGCTTGTAAAATGTATTT:1 - chr3R 4532870 3' + 1360 3330 1 59.59 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTTGCCTTTGTTCAGGGTATTCCCAGCTCTTTGCTCTTTTCTTTTTTAGATGTTTTCTTGT:1 - chrX 5366140 3' + pogo 2045 1 59.31 CAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGAAAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTGTATGACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGAC:1 + chr3R 22624745 3' + blood 7294 2 73.29 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATATGTAGGTAATACGAATATGGATTTTG:1 + chr2R 17021389 3' - pogo 67 1 82.26 AGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCC:1 + chr3L 3565389 3' - gypsy 82 2 72.60 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCA:1 - chr2R 24021543 3' - pogo 51 1 55.48 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAATCGGGCTTTCAACTGAACG:1 - chr2L 13717283 3' + P-element 2855 1 54.17 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAACTTGATCAATAAAATGCTTGACATGATATCAACAACAGTCGCCAGGGGTTGCAATGTCCA:1 - chr3R 30850714 3' - I-element 11 1 76.30 GTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATATTTTCGAGCACATATCTAACATTTTCCATCTCGGCATCGCATGTTTAATTCATATTTATGGCTCATAAAACTCTATTTTTCTTTTAGTGTCGCG:1 - chr2R 16072877 3' + Burdock 234 2 67.12 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGGACCGTTTTGTTTTGCTCGTTTCACCGCCATTTTACAACTTTAGCTAATTTTAAGAATTTTAGAAATCT:1 + chr3R 5316663 3' + Juan 4185 1 62.33 AATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTTTTTCCGAATATATTAATTTGCTTCCTCTGATTTTGTTTACTAGCTCCTATATTCTTTTGTCGCAAGCGCGCTCAGCACGACACATTTGAAGTGAAATTGTATGTAATCC:1 + chr2L 21723836 3' + Gypsy12A_LTR 2013 1 76.03 CTCGAGACTTATGGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTTTTAAATGTGTAGAGTGCTTTGAATATCTGTGTGGCAGGAAAAATCGATATCTTAAAAAATATAACAAGTTAAGCATAG:2 + chr2L 18300867 3' - Ivk 5293 1 51.37 GTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGAAAGCTATTG:1 + chr2R 16073013 3' - Burdock 67 2 68.49 ATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGAATGTGTTATATTTGTTTGCGAACAATATAATTTATCTTAATTCTTTACAAACTATCTTAA:1 + chr3R 5024912 3' + diver 6050 2 67.81 TATTACTTTTCACTTATTACATTTTATTTACATTTCGAATTAAAATTTAATTAATTAAATTTAAATAAATTCTACACTAATACGAATATTTTCTTCTATAGAACAAATACTATTACTATTACCATTTCCTTGAATACATGTCCCTC:1 + chr3L 18082704 3' + Stalker2 404 1 78.08 AACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAACAATGGCTGTCTGTCAGATAATCTAGTTTAAATATTTTATACTTCACTTATTTGTTGTGTTTCGACGAGTTT:1 - chr2R 21425042 3' + HMS-Beagle2 7150 2 54.48 AACATTGTATATAAATATAGATTTTAAACTCACGTTATAAACTATACTTTCATCTCAAATAAGTAAATAAATAGAACAATATATTTTAGACTTAAGTCTTTTATATAATTACTTATGTACACATGGTAAACATTTTTGCCTGTTAA:1 + chr3L 18296068 3' + I-element 5272 1 78.77 TCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTCGAAATTGAAATCAATATGTTTCTTTTCGTTATTTTTAAGAAATTTCCCCCTTTTAGCTCGACTACACTTTGAAAATTCTTGAATAAAATTAGATTTCCCCTAGAAATATTT:1 - chr2L 11734459 3' - Doc 10 1 76.76 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGCCACTCGCGCAAAATTTCAATCTGATCGATTTGTGTATTTGTCAAACTGATTTATCGAGTGTCTCGATTTGATG:1 - chr3R 22868713 3' - mdg1 14 2 73.91 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACAATATTTTCCATCCATAGATAAATATCTCGCCATACTCTCCATAAAGATGTTGGCGAAGAAATTGTCAAGAGAAAAGACAGAAGG:1 + chrX 5366277 3' - pogo 19 1 68.42 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATAGCCGTGTGTGTAGTGCGATT:1 - chr2R 15151064 3' + hopper2 1557 1 78.35 GTATTGTTAGACACGAACCTAATGCTGAAACTGAATCAGAGTAAGAGTCCTGGAGCCGGGGCATCCTGGATTCCGTCGTGTTGTTTCAAACGTGGCCGCTTTGCTCGTTTTTGATGGTTGTTTCGGGAACGATG:1 + chr3R 5941560 3' - X-element 11 1 79.10 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATA:2 - chr2L 5447896 3' + roo 8994 2 75.34 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCCGCGAAGTGGCAAACGTCAGTCAGTACTTCAGCCATTTTCCAACTAGAGCTCCAGTTAAAGGAGCAAAGAACTTGTAAAGCAGA:1 + chr2R 9410583 3' - hopper 8 2 74.17 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACTAAGCACCCACACAACGTAAGCCATTGCCATTTTGTAGCATACTTTTGTGCGCGCCTCTGTTTATGCGACTTGTAAACTTGGTCTTCTGTGCCTGGCCCTGTTTGTC:1 + chr3R 16530709 3' + hopper 1402 1 73.97 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACCGATATAGACGCATTGTTGCGTGGAGATTTATCATTGAT:1 - chr3L 12899772 3' + roo 327 2 72.22 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTGGTAAAATATAAAAAAAAATATGTTTCAATTATAATTTATAATTCAATTATTTCAACATTTGCAAATCAAAATGATTGGCAA:1 - chrX 10304547 3' - roo 40 2 51.37 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATATTTAACAGTCGGTTATATGTACATATGCATATATTTATAAAAAATCCTACATAAA:1 + chr2R 21473691 3' + pogo 2041 1 61.64 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACAC:1 + chr2R 16891865 3' + jockey 4961 1 45.21 GAAAAAAAAAATCAAGTGAAAAAACCAAGACGAAACGGCCCATGAATGATGGCCAACTAATAGTTAAAGTATTTCAATTTTGTGGTTTAGCTAAAGTTCCAAGCAAAGTACAATCAAGAACTATTTATTTTCTTTAATTTTGTATA:1 - chr3L 16184094 3' + Porto1 170 1 58.22 AAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAATAATAATAATTATTATAATAAACATTTGGCTGGCCATATAAATTCAACCATCGGAATTTTTAGAGTGCAATTTTTGCTTTGTCTGATGTTAGCGACGGTTTGAAAATACCTTT:1 - chrX 21164181 3' + mdg1 7068 17 59.59 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATGAAATTGATTTTGCGTTCTTACCGGCTACCAC:1 + chr3L 22709400 3' + 412 7482 2 71.90 TACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAACATCGAAGTGATGTGCCTGGAATTTGCCATTAATTAGTCTGCAGGTGTCGTTGGCCAAAAGAACGAAGAACCGAACGAC:1 - chr3L 20176690 3' - gypsy 9 2 76.03 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGCTTACACAAGATTTTGCTTCTTGAAATTCTACCTTAACGTGGGCTAACAAAATCGTTTAGCGGCTAAAATTGCAATTTGCTATGG:1 + chr2L 3648843 3' - roo 35 2 58.90 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAAATGTCGTTGGGCAAATATTTGGCCGAAGGACCTGGCGTGGGCTTCATTAATGTGTGCGTCTGACAGGAGCCGGCAGGACGATGGCCGTGTCCTTGGCCA:1 + chr2L 11079539 3' - 1360 16 1 75.34 AGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGTATTCAACTAAAAATACAGGCATTTCAAAGTTAACATTTCAATTGATACTGTGATTTT:1 - chrX 10128176 3' - invader3 78 2 59.59 TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAAATTAAAGATCAGAGACACGTTGAAAAGGGTTTAATTTTGGCTAAAAAGATTG:1 - chr3L 17206916 3' + I-element 5287 1 65.07 CCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAAATCAGACGCAGTAAAAGAAATGAAGGTAAACCTAAACTATCGTATAG:1 + chr3R 3286200 3' + gypsy12 9879 3 58.90 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAATTACTTAGGCTAGAGAAAGCTGTCAGCTATAAAACTCTCAACACCAAACTTTTAG:1 - chr3R 7644511 3' + roo 9052 2 38.19 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTAT:1 - chrX 2518049 3' + P-element 2811 1 27.07 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGCAAAACATAAAGCAGGAGCCGCCGCGGCGAACCAACATTGCCATGATTTGTATAATTGCA:1 + chr2L 20986612 3' + roo 348 2 57.53 AAAATAGCAATCACAAAATAAAAAGTGAATATTGAACAAAATGTAATCACCGAGATTAAAGATCCATTTTAAAGCTTATCTAGGCTGGCCAAGTTCCGAGCAACTTTGGAAGCTCCATGTTCTGCAATGTATGGTACC:1 - chr3L 1692284 3' - transib4 41 1 68.12 CAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCTCAGTTTGCTTTCCTTCAGTGTCTTCAGCTTTTCTTGGGCCTCTAACATTTTCTTAAACTCCTCCGCTTCCATTTTCTTGAGC:1 - chr2R 18448248 3' + P-element 2777 1 59.59 TGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGTGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGGTCTTCGTATATTGCCTAATGAAATTTGAGGCTGTTGATTTTTGCTGG:1 + chr2L 22041313 3' - 1360 3239 1 67.41 TAATTATTATTTGATTTTTTAGTTTTTTCTTCATAACTATGAAAGCTTTATAATTCTAGCTTAATGTACTTTATTATTCCATAGCACTTTCCAACAATTAGGAGTCCTTTTATTTTGCCAAGTTGTAAGCGATTTTCTCTCAGTGT:2 + chr3L 16169126 3' - Tc1-2 386 1 70.55 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTCATATATAAATTAGATTCCCTCGCTCAACGACGCGAAAATTGCTGTGTGTACGACTCTATCAAATATGCAAAAGAAAACGCGAGTGCATAAATAAT:2 - chr3R 23668386 3' + pogo 2077 1 69.18 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTACATATATATGTATATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTG:1 + chrX 11661490 3' + 297 6934 2 64.38 AAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGA:1 + chr2R 11097396 3' - Juan 4033 1 66.97 TTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTAGGTCTCCAAAGATATCAGAGCAGCTAATAAACGCATTGCTGCAATCGCATAAATCGCAGCTGTTTGAAAAGGACATCAGT:1 + chrX 9960758 3' - I-element 5167 1 61.38 AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTGCTCTTATTTTATTTATTTATTTTAAAGACTTAATATGTTTTTCTGCACACGATACTTTCCGTTCAAGGTTTTTTCTGTTTA:1 - chr3R 904584 3' - 3S18 41 2 53.42 GTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGTAGTCCAGTTTGTGTTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGGGTGCAAGGCAAATATTTACACTCAATGGAACATAATAAA:1 - chr2R 9934143 3' - Rt1b 4972 1 48.28 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTG:1 - chr2L 13336006 3' - pogo 11 1 58.62 GAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACAGAGTTGGTGGGAACGGTTTTTAACATATTCACTTGATAATTTC:1 - chrX 4214472 3' - jockey 85 1 67.81 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTACATATATATGTATATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAAT:1 + chrX 11661481 3' + 297 6925 2 70.55 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGTTTTCACTTTGCTTTTTGCCTTCCTTTATTCGGCTTCCCGATTTTCTGGT:1 - chr3L 14708921 3' + opus 7446 2 66.18 CTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATACAGATTCTAGAAACATAAACCCAGCTCCCACTTGACAATACACAAGTATGAAATATGTTGAAAGTTACACCGATTATATGTATAGTATAACCATTATTTATTCGAT:1 - chr4 1195599 3' + INE-1 153 1 58.22 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAAATGTCGTTGGGCAAATATTTGGCCGAAGGACCTGGCGTGGGCTTCATTAATGTGTGCGTCTGACAGGAGCCGGCAGGACGATGGCC:1 + chr2L 11079526 3' - 1360 12 1 75.19 GAACCAATGCGTGGGGTAGCCGTTTAAGGCAACTCCATGTGACGCACGCCGACAAAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCGATACAAATTTTTGGCCAGATCGACTCTGGCCATAAATCCTGAATCAAAAATATA:1 + chr2R 4916826 3' + aurora-element 60 1 65.75 TAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAACAAATACACGGAGCAGATTCGAGTGAAAAGCGTTGCCTACTTTTGGGGCTGCAC:1 - chr3R 15168892 3' + jockey 4929 1 63.31 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCGTGCGAATGGCAAAACGCATGGGCTGGAAAACTATTGATAGGTTTG:1 + chrX 18353567 3' - jockey 89 1 75.00 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCTATTTTCACTTGCCATTAAGACAAGCCAATAACATTTTCTTTATTTCAGCATAATGATGTTATTTAAATATATATATTATGAGAAAA:1 + chrX 21973951 3' + pogo 2069 1 63.01 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCA:1 + chr3L 5179194 3' - P-element 93 1 15.56 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCTCAGGAAGCATCGAGCCCATTTCCACACTGAATATTGGCCATAATTAATGCTAACTACATGGCCTC:1 + chr2R 11562965 3' + pogo 2087 1 76.03 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATTCCCAGTGCAGAACTCCAAGGCGGCTCACCAAAGAGGTTCTCCGAAGATGAATCGGTGCTCGTTTGTTTGGAATCCAGTGTCGCGGCAGT:1 - chr3R 10636066 3' + blood 358 2 66.42 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATCACCTATGCCAGTCAAACATTTCGCTAAGCCTGTCAACTTATTTCTGCCCAACTTAGTATAAACACTTCTGCCTATAAAACAAAGGTCAGCACATGTATTA:1 - chr2L 22235139 3' - 1360 20 1 71.92 GACAATCTTATTCTTATCTAGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTAGGGTTTGTTTGGGTGTACATGTTGTATGTGTATTAGTGCGTAGGCATATTGAGCGAACAGAGAGACAGAGATAACTGTTAAGTTCAGTCGTAAAGA:1 + chr2R 294061 3' - Idefix 110 2 65.07 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTACATGCTATTCGTTCACGCCCTTCAAAATTCGATGTAGTTTTATTACCAAATCAAATGGGATTCAC:1 - chr2R 21029348 3' - Transpac 53 2 56.85 TCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATCATCTAATACACGGGCTGTCAGGCCAGGTGAGTGACAAATTGACATGTCGCAAAAATGATGAATCTACCAGCGGCGG:1 + chr3R 18697983 3' + 297 6971 2 66.36 AGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATACATAGACTTCCTCACTCGTCTGCTTTGTGACATTGAAAATAAATATT:1 - chr3L 18034556 3' - Transpac 65 2 63.01 TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTTAATTCTTTTGATTTTTTTTTTGGGACCCGGAAGGTTTTACGGTGTGATGCCCAGCGAAGACCGATG:1 + chr3R 25761562 3' + I-element 5304 1 51.37 AGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGGGGGGCAGTGGGGCATGTTGCAAATGTGTCTGCGCTGTAGGCAGCC:1 + chr3L 15276756 3' - hopper 26 1 63.70 CATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATATTTTAGAGCGTTATTAATATTAGGCAA:1 - chr2R 9455854 3' + 412 403 2 80.14 TAATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTTTTAGCAATAATTGAAATACTTAGTACA:1 + chr3L 21809594 3' + mdg1 39 8 77.40 CCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATTTTCGTGTATATCTTTATAATAATTTGTTTGCCAGCAAAACTCTCCCCGGGGCACATTTAAC:1 + chrX 20124591 3' - opus 45 4 54.81 GACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATATATATTTAAACGTTCAATATGATTACCCGTTTTTAATAAAGTTTCTTTGTCTTGAAATAAGCAACTAGAAGTGT:5 - 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chr3R 9193107 3' - opus 7026 2 69.86 TTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCTCCTGTTAACGAACTCTCGATGGTGTTTGAGGGATTATTAGGTTTCCGAACACAAACAAAAGAATTGAGTGAATGAAGCGGAGTGTGGG:1 - chr3R 22840348 3' - Transpac 29 2 63.01 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAATAAAAGTTGCAATAAATTGTAGCATACTTGTGAGCGGACGCAGTTAATTTCTTAGCCTGCCACCTACGACCCATTGGACAATTTATATACCGCTCG:1 - chr3L 15853456 3' + jockey 4972 1 63.45 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATC:1 + chr3R 6412055 3' - Tirant 8176 2 64.38 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATAATAATAGCTTAATAATATAATCTTAATAATTTTAACTAATTCCCCTGAGCATAGACTAAAGTATGAATATTATTAAACATTTAAAACTGCTCTAAAATCTTA:1 + chr2R 12239876 3' + roo 392 2 70.55 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATAAACGGAGTGCTACT:1 + chr2L 8707521 3' + 412 424 2 65.07 GCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGTTCGAACCACTTCGCAGCGAAATGTTGATTTTTTATGTACAGCTCATGTCTATTTTTATA:1 + chr2L 5798357 3' - 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roo 13 2 35.62 CTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATGC:1 + chr2R 15151105 3' - hopper 82 1 73.29 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTCATATTTCTTTTGATTTACGCTAACAGTTTCTTGACTAAAAAAAATATTCAATTGAGAAATCGTTCCATTCTCTAGTTTCTGTAACCTTTTCATTACATTTAAATGTC:1 + chrX 10287130 3' - roo 8676 2 61.64 GAGGGCATTAATCGTGGAGAAGGAGAGAGACGGCGACAAGGAG:1 + chr3R 18872404 3' + micropia 326 2 74.42 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATCGAACTATAGTCAAATAACAGCTTTGAGTTGTGTGTTTGTTCCAGGGCTGTAATGTTTAATAA:1 - chr3L 21151083 3' - 412 7110 2 56.55 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACACTCGTAAAGAATTAGGTGCTATCCCAAGCCAGTAGTGTGAAATCGATGGGG:1 - chr3L 230072 3' - jockey 4766 1 60.16 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGGCTGAAACGCAGTCGTTGAACCCCTCGTTGCTGAGGATTCAGAAAGACTAAG:1 + chr3R 24053734 3' + mdg1 7403 2 60.45 AGGTTGATCTTCAAGTTCATTCAAAATTGTTTCATATTCTCGTTTTCGATTGTGTTTGCATTGAGATTTGTTCGCACCTTTATGCTACAGCAAATTAATGACGCAACAACGTGTAAGTGCACTGGGAGAAATTCCTGAGGCAGGTC:1 + chr2L 2750717 3' - Bica 139 1 69.18 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTTTACAGTGTACTGATACTATACTGATACATACTGATGCTTTTAACGTCATCATAAATTCTACAAAATATATTCGGGATTTATTTCCGCGAAATTTTAA:1 - chr2R 15942230 3' + opus 7481 2 47.95 GAGGAGATCGGCTTTCGTCACGCAACAAAATGAGTCAGTCGGTCGATGGAGTTGTTTTTGTTCTTGTTCCCCTCTTCCTTGCCAAATCAAGTGAATCAAAATGAGCGTATAATTAGGTCAACACAACAAAAATTATACGCTAGCC:1 - chr2R 8061450 3' + gypsy12 424 2 64.14 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAGACGTACATACATAAG:1 + chr3L 22884051 3' + roo 9034 1 60.27 TACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTT:2 - chrX 9437200 3' - roo 8786 2 41.10 ACTTTTCAAATATTTTAAAAATGGTTAGGGAAAACATATTTTTTCTGTGTGTAGTAGCCCTGCTTTACCCACTTTTTCAACTGCTCCATTTTGCCTTCTGGCTCAACTGCTGATACCCGTTACATTGAGAGTAAGATCTGAAGACT:1 - chr3R 10420638 3' + S-element 1443 1 69.18 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGG:1 + chr3R 22522702 3' + roo 8985 2 75.69 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTTTGCACTTCATTACATTTTGAGATTTTCGCTGTTCGGCGCATCGCCTGTTTGTTTGTTTTCGA:1 - chr2L 5589353 3' - HMS-Beagle2 11 2 40.69 ATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTTCTTGTTTTTCTTTGTGTTGTACTTGTTATTGCCGCTTTGGTTGCATTGGAAAACAAGAAGCCTGTTGCTAACA:1 - chr2L 11770297 3' - hopper2 1360 2 55.56 ATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTAT:1 - chrX 9437202 3' - roo 124 2 42.47 TTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGATCTCACTGCACTAAACATGCAAATTTGCCAGAAACCCGACGTTCAGGATATGAAAGCATTTGGATACCAAGTTTGACTTGCTCATAAG:1 + chr3R 17958128 3' - HMS-Beagle2 7179 2 54.79 CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCACCTTTAATTTAATT:1 - chr3R 19589884 3' - BS 5027 1 58.90 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCCTCTCACCC:1 - chr3R 11773888 3' + P-element 2843 1 51.15 AAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAGCTTTCTCTTCTGGTTTTAATTAATTCCACCTTTATACCCATTAAACGTACATTTAAAAAAGATGCATTTCCAGCCCTAGAAAGTATATATATTATTGAT:1 + chr3R 4166136 3' - HMS-Beagle2 6902 2 72.60 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTATAATGACATTTCGTTTGGCATTTGGGAAAGTATGAAATTGGATATGTTTAAGCCTTTTCACATT:1 - chrX 6423168 3' + roo 9009 2 58.22 GATAGTCTACCTATTTACTAAAATTATTCAACAATTTTCCTTAAGTTGAGTAAACAATGAGTTAAAAACAAATATATTGAATATATTACTTGTCTTAATACTTATGCCCACTAGTGTATTTAACCTCTGATTTCCAAATTGAGTGA:1 + chr3R 15139852 3' + Tc1-2 1533 1 69.18 TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCCACTGGGCTTAAATATTTAGCAACAGTTTGCAGTGG:1 - chr2R 9623356 3' - I-element 86 1 72.54 TACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTTGCCCATTTATCTTTTCCAGCCCATCGTGCGCG:1 - chr2R 14940692 3' + blood 298 2 77.70 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTAAATGATTTTCTTTTAATTCCTCGCCTCTAAAGTCAAGTTCCACTGTATAGTCTT:1 - chr3R 30782508 3' + pogo 2047 1 65.69 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAAGATGGATTGTTCGAAAATCAGTCCTAATTTTAATCAACAAATGCATACTGATCTGTATTCACAAGCATAAGCCATAG:1 + chr3R 8183513 3' - 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mdg1 7097 2 63.70 CAAGGTGTATGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTGAAAAAAAATTAAACAAATAGCGACTAACCAAGAAGTACCCGGCCTGGACCCAAATTCACCGCAT:1 + chr3R 4239458 3' + invader2 4680 1 72.60 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGCTTGTAAAATGTATT:1 - chr3R 4532871 3' + 1360 3350 1 53.60 GCTGAAGTTGGGTTCAGCTCACTCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGACACTCTATAGGATTGGCGGGTTAGCACATTTTGT:1 - chr3R 13932745 3' - Stalker4 7261 4 72.66 TGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCGGATATGAAAAGGTGAGTTTACAGAATTATCAAACA:1 - chr2R 16496587 3' - hopper 81 1 71.92 TGATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCCACTGGGCTTAAATATTTAGCAACAGTTTGCAGTGGGGAAGTTTTTCG:1 - chr2R 9623344 3' - I-element 61 1 60.47 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCACCCGACATT:1 - chr2L 7271824 3' + 297 332 2 63.70 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAAGCACGCTTTTCCCTAATTGTGTTTCATGATG:1 + chr3L 20083854 3' - opus 34 4 66.67 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTATCATAAAAATCTGGGAAACAAATCATATCGAAACCATGAAATGTAGAATTCTTCTTTGTCGTTATA:1 + chr3R 14494120 3' + roo 356 2 54.79 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAAGGAGATTAAATTTGGAAAACAGGCAAATAATTCAGCAACTGATTTACGAGCCAACTGGGA:1 + chr3L 16875801 3' - jockey 4797 1 58.22 GGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATTTTATAAGTGCCTTTCTCAACGGTTAGCTTTTCTCGGGAACATGAGGT:1 + chr2L 16508988 3' + invader4 3033 2 64.06 AAGTTAAGATTTTAAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAAAAGATTCAATAAATAAAAGCAAATAAAAAAAATCTATGCTTTTCAAACTTGTTTTAAACACAACAAATATCCGGCTGAGGGAGAACTGGTCGCCGGGCTTCATATC:1 - chr3R 27248621 3' + F-element 4621 1 74.66 TGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAA:1 + chr2R 11097376 3' - Juan 4090 1 60.27 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACATCTTGTGCATATAAAACCCCCGGGGATCCAGCAGAACACACAAAAATGTGTAGCATGCTTTTGGGCTTGTG:1 + chr3L 2184983 3' - jockey 35 1 60.63 ATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTAAAATAAAATTGAAGACACACACGCAGACGCCTT:1 + chrX 22824358 3' + Gypsy12A_LTR 2259 1 43.15 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGGGCGGTAGGAATGAAGGGAAAGCTGGGAGGAGTCGGTTGTAGGAGG:1 + chrX 5206531 3' - Tirant 8170 2 68.46 TATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAAAACAAAGCGAAACGAAAGATTGTCTATTAAGTAATATT:1 - chr3L 7790671 3' - copia 5068 2 74.48 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTTATATATTATATTGCCAGGGCATATGCTACGGCTACCTTGT:1 - chr3R 20089954 3' + mdg1 352 2 67.14 GAATTTATAAAATAAAAAAAAAATAAAATAAATTTAAGATTTAATTTGCCCCAGAGTAAGGTATGTGCCAGTCTTAAAAACTATTTTTCTTTAATTATAATCATATATTAAACTGAAATGCTCCATGTAGGTATCAATTGTTATAA:1 - chr3L 14144910 3' + HMS-Beagle2 477 1 77.40 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGACATTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGGTTCTGAACTGCATCGAATATCCGAACATATGTGTTGTGCACA:1 - chr2R 12580647 3' + roo 9023 2 73.29 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGCACATCCATCTAAAGCCCTTCATGATGTTAATTACCGAACACTGT:1 + chr3L 6675379 3' - 412 7113 2 65.38 AATAAATAAATTAAATAAAACATATTGTATATTATTAGGCATTCACACAATCGGAACTTTGAACTAATTTTAAAAGTTGTATATATTTTCTAATATCTATCAAACGCGCCAGTTTACCTCTTGCAGTTTTAAAACTATATATTTTC:2 - chr3R 13428499 3' + X-element 4716 1 68.49 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGCTTACACAAGATTTTGCTTCTTGAAATTCTACCTTAACGTGGGCTAACAAAATCGTTTAGCGGCTAAAATTGCAATTTGCTATGGCGGAGG:1 + chr2L 3648849 3' - roo 29 2 61.64 TATTATTCCTGATCAAGAATATCATAGTTTCTAGTATTTAAACAATATGCAAAAGTACAAATTTGCAGTTTTAGGAAATTTTGGATAAACTGCGGATAAGGCACCTTGATTACTGATAAATTAATTACTACTACTGCAGTGACTA:1 + chr3L 15067275 3' - INE-1 84 1 89.66 ATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTATAATGACATTTCGTTTGGCATTTGGGAAAGTATGAAATTGGATATGTTTAAGCCTTTTCACATTACTGCGTACGTGG:1 - chrX 6423155 3' + roo 9024 2 50.69 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCACCCGAAATTTATTTGTCTCAATA:1 - chr2L 7271810 3' + 297 6930 2 54.55 GTCAACAGTCCAACTTCACTGAAGGGATCTGCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGTCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATAAAATACTAAGATCTCTCAATAAAAGATTGATCAA:1 - chr3R 1047926 3' - invader4 245 2 70.45 TAATTTACATTTATAATATTTTCTTTAAAAATAATTATGAATTTTAAAGGAATTACTTTCGTTGTAACTATTATTCATATTGCATTCAAAATATGTATTGTTAGTAAAGCTTGTATTTCCATTTCTACGCTAACTGCTTATATCTT:1 - chr3L 5428656 3' + looper1 240 1 43.15 GTGTGTATTTTGCTGCTTTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTTGTTTCTAATTTACCATTCTGATTTTGAAAATTCTGATAGAACTTATTCGAAGGAAACATCCCGATACAAATAT:1 - chrX 7460251 3' - Porto1 4436 1 67.12 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATGTAAATATATGTGCAATAAAATTATGCGAAATAGTCATTCCAAGGTACAGCGGTATTCATGACGTCTTGGTAAAATATAAATGGGAT:1 - chr2L 17166246 3' + I-element 5325 1 65.75 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGCTTCTAATTTAGGAAGTATGTGATATATATGCTAATTAGCCTATGTAATTTGTCAACCA:1 + chr3L 20744275 3' - 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chr3R 13491536 3' + Stalker4 7229 4 71.23 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCCCTCGGATCGGATCCTGGTTAGCAACTCAACAAGCTAACAAA:1 + chr3R 10461736 3' - roo 8730 2 69.40 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATCTACAGTGCCGGCAGACGAAAACAGAAGGCCGCAAGATTATATTATCATTGAAATTTCATTAAAATTAT:2 + chr3R 9193267 3' + opus 7456 2 54.79 AATGTGACCACAGATCACAACAGCTAAGATGGCTCACGACGACAAATAACCAACTGTCCCTGGTATGTACGTAACTATACACTCCATAAAGACCTCAATATTATATATTACAATTGCTAGACAGTGTTTCTTTGGTTGGTATAATT:1 + chr3L 15851224 3' + Helena 965 1 67.12 AAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGGAAACGAAGGCAGATGTTTAAAGTGACGTACTTATATGAACATACAGTATGTATGTATGTATATCCAACAAAGTTGAAT:1 - chr3L 21821392 3' - Tc3 313 1 68.91 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATGACTTTTCCGCCGCGCGAAATTAACAGCTCATGAAATATGCCCTGAAATGTATGCAACGCGCCATTGTTGTGAATCTCG:1 + chr2L 11922979 3' - jockey 4800 1 54.11 TTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTATGATCGCGCTAGATGTCCAACCCTTTTCTATTGT:1 + chr2R 6492898 3' + copia 5014 2 43.15 ATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAA:1 + chr3L 24208195 3' - Quasimodo 74 2 73.29 CATGTCACCTATTTAAACCGAGGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTG:1 + chr3R 18518001 3' + roo 9001 2 76.86 GTTATTATTATTTGAAAATAGATTGGAAATAGCCAAATCTATGTACATATCACAAAATAAATTTCAAAAATGACTTAGAAGGCGAGAGGCAGAGATCAATGAGCAAGACTGCTACGTCATGACGTTCGGCATG:1 + chr3L 23083038 3' + 1360 315 1 57.14 TTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGGTTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATCAAACTCTGGTTTTGGCCAACACGTGGCCCGTTTGGAGAACTT:1 - chr3L 12366835 3' + 1360 275 1 70.55 ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGCAGCGATGCATAAATCATAGCATACTTAACTGGGCAAACACGCGC:1 + chr2L 14889052 3' + hopper 1395 1 66.67 ACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTCCTCCCCGCGTTACGTTAAAGTCGTCCTCGTAATGGGGTTCCCCTTTTGTCCGGATTG:1 - chr2L 2125935 3' - gypsy4 6614 2 77.24 GTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATAAGTTATGTATTTCTCTTCAGTGTCCAGAATTATGCAAGTTAGGTATTTCTCTCCAGTGTCCAGAATTATGCAACTTAGGTATTTCTCTCCTGTGTCCAGAGTTACG:1 - 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I-element 68 1 63.70 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTCTCTCACTCGCACACATTCGCCGAGACTTCTCTTTCTCTATGCGGGTATTTAAATTT:1 + chr3L 5179259 3' - P-element 39 1 57.53 CACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATTAAATAAATAAATTATGAACAAGTTGTATACGT:1 - chr3L 16271915 3' - jockey 185 1 77.40 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAAGCACGCTTTTCCCTAATTGTTTTTCATGATGTTTTCAATCTTTTAAATAACTCAAACGATAACAATACCTTTGAGATATTGCATTCGATATCTCA:1 + chr3L 20083918 3' - opus 20 2 71.92 GAAAAATAAAAGTCAAATAAAAACAGTGCAAAAATGCCAAAAACTGTCGTAGAAAAATGCACTTTTTCTGGGTGTGGCAAAATGGAAAATTGGAAATAGCAGCGACGTTGATTAATGTACAGTTTGAAGACCATCGACCAGGATCA:1 + chr2R 13575885 3' - Tc1-2 1391 1 76.03 GGATGATATAATAATCTTTCCCAATACAATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATTAAAATTTTTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAA:1 + chr2R 2875184 3' + TLD2_LTR 48 1 63.70 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATAAACGGAGTGCTACTG:2 + chr2L 8707522 3' + 412 425 2 64.38 CAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTATCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTTACCCCCCTCGTCAACGAGTGCAATGCTTTATGGCACCCCAA:1 - 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Quasimodo 490 2 54.69 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATGATTTTCTCG:1 - chr3R 24976188 3' + roo 9028 1 53.42 ACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCACGTGAAAACGTGTCTCTGTCTCCCAACTT:1 + chr3L 18767877 3' - roo 8612 1 58.90 TCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACATGTATGTGTGCTTTTGTATCCTTATGTGGGACATTCCGGCGTCTAGCAAATAC:1 - chrX 16218118 3' - P-element 165 1 36.99 CCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACTGTAATTTTTGATTTTAAAATA:1 - chr3R 4172210 3' - 1360 3295 1 69.18 CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATT:1 - chr3R 19589884 3' - BS 5027 1 60.27 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCAAAACACTTTACTTAACAAGGTATCATTTATTTACCGAACTCCTTACAAGAATATTCTCTGCTCCCAGTTTCCAGGGCCCATTCCC:1 + chr3R 29515372 3' - I-element 38 1 40.41 TAGATACAAAAAAAAAACAATATTCTCAATAATTATGGCTCAACAAACATTTTCTCTCTGTATAGCAAATGGAATCAGTCAATCAGTGTCATTCAAAGTGAAACCCTTGAGTTTATGGAATAATTAAAGTTTTAACCAAGCATTTC:1 - chrX 11733933 3' - Circe 7286 1 55.48 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATCTGACTTATCTGACATCTACCATGAAATCCAACCATCAAGAGACCACACAGCT:1 + chr3L 16463589 3' + roo 342 2 63.01 TCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATTAAATAAATAAATTATGAACAAGTTGTATACGTTTTACGCAAAATGCAGTATTTATTTCAACAAAA:1 - chr3L 16271882 3' - jockey 152 1 54.79 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTAGTTTAAAAGCTTCAAATTTTCATCGACATGATTTGACCACGTCAGAGCCGATGG:1 + chrX 14346556 3' + roo 404 1 78.20 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGA:1 + chr3R 22522706 3' + roo 350 2 68.07 GATCATGGTCTACATTGATTGCTTAGTTGTATGATGAATTCTTTTACATTATTTATACATATTTACATACTATATTAAACAAGTGAAATGGGCGCAAGAAGTCTGTGAAACTTAAGCACTTTTTGCTATAATATCTAACAAAAAAA:1 - chr3R 14080038 3' - invader3 5136 1 53.42 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATCGATAAGAAAACGAGGTGACACAAAA:1 + chr2L 13140720 3' - blood 7059 2 51.37 GCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATGCCACA:1 + chr3R 17210121 3' - HMS-Beagle2 6931 2 52.74 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACATATGGCAGTATATGGAGCTCCTCCCGACTGCCACACAGGAGTCCTCATCCTCGATGCAGTGCACT:1 - chr3R 18517892 3' - roo 18 2 73.97 GTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGA:1 + chrX 21667921 3' - gypsy2 85 2 73.29 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAGTGACATTTTCCGCTCGTAAATGCACTTTGGGTATGTTTGACCTTTGTTTTGGGTCCCCAGTCATTCCCATCGCCAA:1 + chr2L 20324231 3' - Tirant 8 2 75.45 ACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTGTATACTGCGAGAAAAGCATTCACAAAGACATCCGTCCCTTGTTGGTGGAAATGTGGATGGCAAAGTGGGTGGAG:1 - chr3L 20174375 3' + gypsy 449 2 36.36 ATTTATTTTATTTATTTATTAAATTTGTTTAATTTTTATTAACTTTTTAACTTTTTCTTTGCTTTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTTTTTTTAGCTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 + chr4 1294994 3' - X-element 4714 1 44.29 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAAATCATATTTATAAGAGCTTGTTGGTGACTTACCTACCCTATAATTTATGTCACATATATG:1 + chr3R 11978348 3' + Transpac 254 2 61.64 TTTCTCTCCGACGTCTGAAGAGAATACATCCCCATGAATCTCTCCACGGTACATTTGTATGCATTATAATTAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACAAGGCACAGTCTTTTTTCGTCAAG:1 + chr3L 23821876 3' + G5A 2669 1 55.97 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACACTTGAAACAAAAATATAATCCGATATTTGTTTGGACTAATAAAAATTAAACTACTAAATTTATAAAACCGATGTGTAAACAATATGATTTCT:1 - chr3R 4661893 3' + roo 9044 1 65.75 TTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTATACTATAGATACGTGTGGGTTTTTACGTCGAAATCAATAAGTGCTTCTTTCGCACTAATCTGAGGAATCAACATCGAAACTAATTATCGACC:1 - chr2L 6319709 3' - Tabor 35 2 57.53 AATAACTTATATGGCAATAACTTACATAAACACACACACAACAATTAGATACGCAAAACCACACCCAAATTTACACACATATATTTAAGACTTAAATTGGCGTCCCTCGCATCGAAAACCAAACCCAAGCGAATGGGAGCTGGATG:1 - chr3L 18874666 3' - HMS-Beagle2 1 2 65.75 TATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCGGCATGCATTCTAATAAACAAATTCTT:1 - chr3R 15236361 3' + 17.6 8 2 64.38 AATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTCGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCA:1 - chr3R 29091298 3' + rover 7225 2 67.81 CCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCACATTTATTTATTAAAATTCTGTCGTGTATAAAACAACTGATTAAATCACTTCATTTTAATTAAATATAAAATGCTCTCCACTCAGGAAAAAATGTAAAAATAAATGAACTAAATTT:1 - chrX 1833458 3' - Ivk 321 1 67.81 TGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGATTCATCATTTTGAAATATCGACTGAACGCCTTGCGTTCCAATGCATTGCATTGGATGGGAAATGCAAGATGACCATGCGATACTCTTGCAATCCTGAAACTTGACCCGATGGC:1 + chr2L 1989500 3' + S-element 1711 2 70.55 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGATATCAATTTCAAAATTTAATAACGATTTTGAAAATATTTTTTGCAGAACTAGTATGTATATACTATACATTCAGTTTATCGTACAGCTATTGTT:1 + chr2R 8687944 3' + roo 9045 1 67.12 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTGGCCGCCCCGTTG:1 + chr3L 20399092 3' + roo 9022 2 52.05 GACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAAGGTCCCTGTGGCAAACCGTATCTCAGGGAGCTAAACGGAAAGTGCTTCTATGTGGGCATCAAA:1 + chr2R 9817448 3' + Ivk 375 1 56.85 AGGAGACACAGGAGCGGAGGACCGCCGGGATCATCAGTCAGTGGAGTTAGTGGTCAGCAAAGGTGGTCCCAGGCCGAGCGCTGTCTCGCCCGTGGACGATACACCCTGCCCCATAACGTCCTAATCCCGGTCGGAC:1 + chr3L 23645852 3' + gypsy8 4583 1 64.71 CCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTGAATATGTCACTTATTCC:1 - chr2R 5226150 3' - 297 6935 2 78.77 GTAAGAATGAATAAAAGGCGAACCCCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAATGTACGCACAAGTTTATAGTGTGAACACCGTTTCAGCAGCTACTGCATCACACTCTTCTTATTATCGCAC:1 - chr2R 4871506 3' + rooA 284 2 69.86 GCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAGCTGTAAAGCAAGAAAAACAATTTGAATGGCTTTCCTTGCGCACTAAGACTTTAACTAATTTCCCAAGCTCAACACGTTTTCCAGATTAAA:1 + chr2L 6876722 3' - Rt1a 16 1 74.19 CACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGATTCGCCGCCTGCAGCTGCTTTTCGCGCACTCATTACCTCCGGCTTACGTACACCGCGGCGTATGCGTAATATTTATATAATGCATTATTCTGGCCAAGCCA:1 + chr2R 12069711 3' + Tirant 397 2 80.92 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGGGAGTCACTACCGAAGTGCATTTCCCATTGTTGTGTTGGGGGAAATAGGAGTGAATGCTGCGCGTAATCAGGCAAAAATCTGTCTAGCTTTTAGTTT:1 - chr3R 25409684 3' - jockey 25 1 69.57 ATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCGTAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTTATATGTACATAGATAAGT:1 + chr2R 981778 3' + Tc3 317 2 61.64 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCT:1 + chr2R 24021654 3' + pogo 2064 1 57.14 CATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTATTATTTCACTTCGCCCCAACGCTGCAGTAATGGTAAGTGCATCGAGGTGCA:1 + chr2R 22186092 3' + I-element 5153 1 64.83 AAGAACCTTCGAGTGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAATACTCAAATGTCATCTCCTTAGCTTCTA:1 - chr3L 24253597 3' + 297 451 1 62.33 GAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATTCGTGAGTATTCTAATCATTTCCTTTGATAAGGTTCTAAGCAAACAATTTGTCATTATA:1 - chr2L 7939735 3' - Burdock 6195 2 58.90 AAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATTATTTTTACAGTAGCATTCCCAG:1 + chr3R 21587635 3' + roo 9036 1 58.90 GATATTTCCAAATAAAACGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACTGCACTTGGGGCTGAAAGTGCGTTCCTTGTCTTTGGCTGCCAAAATCCCACCTTCGCAACGAACCAATTC:1 + chr2R 16510344 3' + roo 359 2 50.34 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCT:1 + chr3L 13228540 3' - P-element 26 1 48.35 TGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGTTCATATTTTCAGTTTATT:1 + chr3R 14860269 3' - BS 5012 1 73.29 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAACAAATCGAATGCGCTAAAATGGGAGTAGTGCGAGTGGCGAGGACGAGGGCGCTG:1 + chrX 823571 3' + roo 8979 2 58.46 AGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAATGATCTCCAACAGCAACAACAACTGACAA:1 - chr2R 2666296 3' - Rt1a 10 1 68.60 GGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTTTGCACTTGATTA:1 + chr2R 21425158 3' - HMS-Beagle2 62 2 61.64 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTATGCGTGTGCATATGTGTGGGTGTCTGTGGACTTAGACAATGAACCCAAGTGCAATAATTAATGAAGCAGAGCAAATCGA:1 + chrX 5145960 3' - hobo 39 1 56.16 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACTTTGAGTTGTCACTTGGGCAAGAGAACTAGAA:3 + chr2R 7899177 3' - roo 8752 2 78.08 CCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGCTCTGCGCATTGGCAGAGGCCGCTATGATGTTTTTCCCTTTGTTAGCTTAAAAATGTTTCAGTTCAAGCGAGTAAATAATACACACTTGCAG:1 + chr3R 26484494 3' + springer 70 2 65.00 TATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCT:1 + chr2L 21153548 3' + 1360 317 1 65.07 GCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTAAACCCAACCAAGGCAAAAACCATTAGTAGCTTCGCAGATGTCATTTAAAGAGCAATCCGGTTGTACATAAAAAAGTCAACAGACAAACAAACAAACAAACAACAT:1 + chr3R 28942554 3' - hopper 451 1 66.44 AACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGATTGCTTTTCCGATGGCTGGCAACGCTGCGGATGGTTGATTTGCTTGCTGTTTTT:1 + chr2L 8637434 3' + R1A1-element 5325 1 63.01 CCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGTATGCGAACAAGCAAGTTTCATCATTTTTCTGGGATATGGACATTTGGGAATAAAATGAGAAAAAATTGTTGAAAAGTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGT:1 - chr3L 22511716 3' - INE-1 553 1 68.66 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTCGGGCTGCCATTGTCCGTGTTTCTATGGCCGTGTGTG:1 - chr3L 5179117 3' + P-element 2852 1 59.15 AAAATAAAAAAATTAAATAAATGTTATCAATTGGTAGGATCTTGTTTCTCTTCACAATATATAAAACTCAAACAAAACCAACTCATGTGACCTCAGATCTAAATAAGCTATATTTAACTATAATGCATATATATATACACATAAAT:1 - chr3R 6897900 3' + HB 320 2 58.22 TAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATAAAAATTAAAAATTAAAAAAACGAAATCAAATTCACCGAACTATGAGTTATTTGAAATGGTTAAAATGGTTAGTTAAAAACTTGTTTTGTAAGTTCAAAGTCTTAAATTGTTGGAC:1 - chr2R 11097252 3' + Juan 4202 1 61.64 AGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAGACAG:1 + chr2L 21153569 3' + 1360 339 1 51.03 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCTGACTCTGATCTTCTGTATTTGAACGCATTTATGTACATGCATATATGCCAGTGCCTCCCATATACAAATGCATATGCTTATGCATGTAA:1 - 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roo 8696 2 56.43 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAAACGACCTTGCACAAACCAACAACAACCATAGCGACGACA:1 - chr2L 21250957 3' - P-element 83 1 29.45 CGTCAGAAGATTTAAAAGATTTCACGTGCTAGATCTCCCCGACAGGTTTTAAGTATTAAAACATAATATGAGTAGGGTATGTAGTAGGGTTTAATGGATTCGCCTGCACAACCTAAATGGAAATGCGACGCAATACATTTAGCAAT:1 + chrX 4958094 3' + G4 3677 1 67.81 CACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTATAATCATGGCATAAATCTATTCGATTTGTTTT:1 - chr2L 16091236 3' + accord 194 2 76.98 ACCCTCAAGACCTGACTGACCACTTGACATAAATCAAATCTATTAGACAGTCTGCAAACTACCATCCGATGGCT:1 - chr2R 6523647 3' + jockey2 3187 1 55.41 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATATAATTCGTACAAGAAATTCCTCTGCAACTTTCAATTTAAAAAAAATATATTTTACTAAAAAATACAAATTAAAA:1 - chrX 22676320 3' - 297 42 2 53.79 TTTTTTTTTTCATTTAATCTTTTCCCG:1 - chr3L 4741640 3' + INE-1 477 2 88.89 ACATTTAAAATAATAAATAAAATAAAGCACTATGATAATAATGGGTTAATAGGTTATATTATTATATAAAGCGCGTAATAGATGACGACCTCTTCCAAATCGGTACTTAGTGATTGAGATCAATCTTCCCTCAAAGTGATCTTAAC:1 + chr2L 9449639 3' + G2 3050 1 39.73 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGTCGTCAC:1 - 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412 7124 2 66.44 AATTCAGTGCACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTATTATTTGTAGTTATACGTTTTTAAATCGTTATTAAAATAT:1 - chr2R 3089699 3' + P-element 62 1 27.40 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAA:1 - chr3R 24976199 3' + roo 9030 1 50.38 GTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAAAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATGTGTGTGCCGTCTATAGGCTCTTGCGATTCGAGCCAAAACACAATG:1 - chr3L 5089340 3' - 1731 78 2 68.49 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTCGGGCTGCCATTGTCCGTGTTTCTATGGCCGTGTGTGTGATTGACACGC:1 - chr3L 5179105 3' + P-element 2860 1 65.75 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATATTTAACAGTCGGTTATATGTACATATGCATATATTTATAAAAAATCCTACATAAACACAATTCTTTGGAAAAATGTATCTGATGACAAAACTGTAT:1 + chr2R 21473732 3' + pogo 2082 1 72.60 GGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAACCGATGACGAGTGTGTGTGGGCAGCAGATAGAATTTGTGGTATGA:1 - chr3L 22189155 3' + Doc 4382 1 68.75 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCTGTCAAAAGCTCTTTCGTTTTATTAGATTTTCCCAGCCGGTG:1 - chrX 17027877 3' - roo 78 2 69.86 CTTTTATTATTTTAACCATCCAGTGCCTTGAAATTTTGCTTTATACTAATAAATGTATACTTTATTAAATAGTTTTAGCGGTCAAACCTATTCAGTTGAGCCAAAAAGATTTGGGTGTTAATACATATTGCGTGTTTTAGGTGCT:1 + chr2L 5282057 3' + Tc3 1463 1 73.79 CATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTT:1 - chrX 9437198 3' - roo 120 2 39.73 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCGGCAAATTAGTATCAGTGCATTAGGCCTTGGCAACCAATATATATTTCTAGGAAACTATTTATTACACAAAATTCTGATAA:1 - chr3R 5115265 3' - Ivk 42 1 56.85 TCCACTCTGGGGTTTGCGCCGCGTTTCTGAGCGTCACGGTGTCGTTCCGGAATTCACGAGTGATCCAGTAAACTGGTAATAAATCAGATCAGCTGCATCAGACAATACAGTAGGATGGTTTGCTGGCTATAAACCTAACACAAGGA:1 + chr2R 11502106 3' + Rt1a 102 1 75.34 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATTTGTTGAATGTCGAAAATATACACTGTGTACGGAG:1 - chr3R 5868198 3' - jockey 85 1 74.45 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCTACCACATCATTCACTTGACCACAATCTAAATTAATCCCGC:1 + chr2L 18953106 3' - roo 8744 2 73.97 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGATTTATCTTGGCGCGTTTTAAAACACACTCGAGAGGTTCATTAATTCTTGCGTCGCACACTGCAGATTACTCATACGCC:1 - chr3L 6675273 3' + 412 7505 2 56.16 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGACCACCACCCATTTGCCATCTTCCCATCTTCCAGCAAGCGCACGCCTGTCATAAATCTTGTTTTGAATGTCCTGCCAGCGTTGATAG:1 - chr2R 20447767 3' - hopper 33 1 62.33 AAAACATTTAAAATAAAAAAAATAAAAAAATTTTCAAGACTGTCAAATTCAAATGCAATCCAGGTAAACTTAAAAATGGAATCTGTGATTTTTCGCGATCCAGCAAAAGTTTTTCAAAAGTATGCTTTCAAAAATATTCATTAAAA:2 - chr3R 21584214 3' + TART-B 10628 2 38.36 CGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGTAGTCCAGTTTGTGTTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGGGTG:1 - chr3R 27499995 3' - Rt1b 4990 1 68.50 AGATAAAATTGCCAAACAGCTTTTAGCAATTATTAATTATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCT:1 + chr2L 15322938 3' - diver 301 1 58.90 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGGGCGCGTAAAAAGCTCCGCTTTTCGG:1 - chr2R 12069565 3' - Tirant 41 2 52.42 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAGCATGAGTCCGCGCAATAATCACAGCCAAGTGCTGCATATTTATAGGCGCA:1 + chrX 850156 3' - jockey 57 1 50.68 TGACTGACCGGAACTTGACATAAATCAAATCTTAATAATTAAAATCTTCCAAATATTACTTCCATTTCCTTTATACTCTTATTCATATAATCTTTGTAAATAACAACTTAGAAAAAAAAAATAGGCGAGTAATTGTGGATGCTTAG:1 + chr3R 25090273 3' + jockey2 3199 1 73.97 ATTTTATGCATAAATATATTTATTGTATGGAGTACAATTTCATTACATTATAATTTAACTTTCCATTTATACGCTGATGATTAGAATACAGATGTAAATGTGCAGATAATTCATCCCCCCATTTCATTTCTTTATTTTGCTTATCG:1 - chr3L 10178373 3' - Transib5 42 1 76.03 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCTTCGGACCATTTACTTTTTATTTCCAGATGTGTCGCAAGATTTGCTTCCGCATTTTAC:1 + chr3R 26244767 3' + copia 249 1 76.30 GCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCGATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATGTATGTATTATAGTTAGTTACATAATCTACAATATTTATAATGAAATGCATGCTGAGGTGTGGACTGCAGAT:1 + chr3L 18237056 3' - 1360 3203 1 50.68 GCATCGTAAAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTGAATCACAAAATCGGTTTCGGATTACACAAAGAGTGCGCGCACACCCGATCGCGTCGACGATTGGTATACGTTATGCCAATAAATTGATATCTCTTTGTTATTTCTCTCAGT:1 + chr3L 25485704 3' - Doc2-element 115 2 52.05 AATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTAATTAGAGTATTCATCTTTTGACGTGTGTACTTCCTATAGATAGCATTATATAGAGCTTAATTTGATTTAGATGCAACATTTACGACTGAGATTTCGCTTTGATTTCACTTT:1 - chrX 22884391 3' + 1360 377 1 55.48 GTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAATAGGCTCCACCCTTGAGCACGGACTTAACTGGGGTACATGCTTAAAATTTAATGAGTTT:1 - chrX 6588539 3' + Tirant 306 2 76.92 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGTATGAAGTGTTCCGATAAAAAACAAGCGAATGATGAAAGGGGCAGCCCGG:1 - chr3R 21587519 3' - roo 8728 2 65.00 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATAAAAATTTTGACAGTACAGGCATCGTTCATTTATCTTTAATAAAATAAAACATTAATTATGCAGCTTTA:1 + chr3L 13166330 3' + I-element 5305 1 54.86 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACCGATATAGACGCATTGTTGCGTGGAGATTTATCATTGATTGAGGCCATGAAATTTACACTTCAAGTGTCTCGGGAAAAT:1 - chr3L 12899732 3' + roo 9029 1 52.05 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACA:1 - chr3R 19589940 3' - BS 5081 1 75.69 GAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCGTGCGAATGGCAAAACGCATGGGCTGGAAAACTATTGATAGGT:1 + chrX 18353564 3' - jockey 98 1 78.08 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTT:1 + chr3R 6412038 3' - Tirant 8144 2 63.92 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACCTAACTGTATGGTTCTATTTTAATTAATACATTTTCTGCTGCTTCTTATCCTCTTCGGAAT:1 + chrX 19597110 3' + 1360 3373 1 60.00 GCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTG:1 + chr3R 6412067 3' - Tirant 8158 2 54.29 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTATGCGTGTGCATATGTGTGGGTGTCTGTGGACTTAGACAATGAACCCAAGTGCAATAATTAAT:1 + chrX 5145943 3' - hobo 42 1 52.27 GAAGCGGACCAAGATGGCTCCCTTGTGGGACACCGGATGTGACTCGAAGAATACAAGATAAAGTATTTTTAAGGAGGACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGTTTGCATCATTGGGTA:1 + chr2R 5265153 3' - Q-element 496 2 62.33 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTTCGAAATGTATGTAATTTATGCAAAAAGATATCCGCTGAAAGAAAATCAAGTAGAAAATAAAAGAGAGGAAATCTGCATTTGAAAGTTATTTCTCTTTCATTTCGACTTAACTGA:1 - chrX 7031524 3' + hopper 1412 2 37.67 CCTCAGCGAAAGAAGGAGGATCTCTGGACCTACTGGAAATAAATCAAACATGCAATCATACCGAACTGGCACATTTGAGGCGCCCACTTAATTACAGAACGTATATACAACTGACTTTATACATCTGGCTTTTAA:1 - chr3L 20172361 3' + gypsy 408 2 68.15 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATGTGGTCAAGGCGTTAAAAGCTCTTCGGATTTATATTTGGTTCTTTCCGCCTATAAGTAT:1 - chr3L 13472402 3' - jockey 68 1 58.90 GCTCATCGTATTGATCCGACTGTTTTTCCTTGCATGTGATAATCGGTCCCTTTTGTAAAGTTTATTCAGGGCTTCACTCGCATTTTCGTTAGTTTTGTCGATTCTGGCTGCACTTTGGATTTTGATTTTTATCACAGCCCTGGACC:1 - chr3L 13161201 3' - transib2 2348 1 57.53 ATGATCAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCGTTTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCC:1 + chr3L 11826434 3' + INE-1 96 1 65.00 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAACGATGAAAGTTATAACGAGAATCATGAACTCAATAAAGTAAATAAAGCAAGACAGGAAGCAGGAATTATATGAAATAAATTTCTAAGTCATAAAGAACTTGCTTGACTGATTGAAT:1 - chr2R 12813619 3' + roo 405 1 63.01 AACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAATAGAGTAATGTGGGTGAGGTCAATACAAACC:1 + chr3L 18034629 3' + Transpac 5148 2 78.72 TCTGATTTTTAATTATACAAATTCCAAAATTCATTGGAAAACAAAATGTTCCGAAACTCAAAGGAATAAACATTTTGGGAGCCTTTGCGTACCATTCATCATTTCAAAAAACAAAAAAAACGAGACCTGTAATCATTTCCAGTTCT:1 + chr2L 19157782 3' - invader2 4734 1 73.29 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCGGAAAGCGTACAGCTGCCACTAAGGCAAGGTATTCATTAATAAAACCACGAGCCC:1 - chr3R 26244629 3' - copia 67 2 63.01 TACTTTGCTTTTATTTATTGGATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGATGTAGAGGTTCTACTCGAAACGGACCGGAACGGAACAAAGCATATGCAAACTCGTTTTGGCGC:1 + chrX 12965221 3' - F-element 4665 1 55.48 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGGATTGCAAATGACTTTCGATTTTAAATTAAACCATGGCAAACATTTCCAGTAAGCTGCACTACTACCAGACACCTTCGTAT:1 - chr2R 12814806 3' + opus 7466 2 62.33 AAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCACTGTCAACGACCAGCTAAAATTACGATACGCCTATGCACTTAGTGATCGCTCGCGACACCCGACCACTACCACCACCACTACCACTAATGAGCATCCAGCCAGAGGTGCAAAAAA:1 + chr2R 14429219 3' + HMS-Beagle2 73 2 67.81 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATGACTTTTCCGCCGCGCGAAATTAACAGCTCATGAAATATGCCCTGAAATGTATGCAACGCGCCATTGTTGTGAATCTCGTTCTGAAGAGCTTGACTCGTCCTTGGATGCCTTGAAA:1 + chr2L 11923016 3' - jockey 4762 1 80.00 AACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAAATTAAAGATCAGAGACACGTTGAAAAGGGTTTAATTTTGGCTAAAAAGATTGCAGATGGCTGGCGATTACATTTAAGCAGCAATTATTCTAATTGAAAGCAAATGAAT:1 - chr3L 17206860 3' + I-element 5343 1 76.71 CGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGACAAAATTTTATAGAATTTGATGAGTGGGGCTGTGTAATATTTTGTATACACTAAAGAACTC:1 - chr3L 3002736 3' + roo 80 2 58.22 GGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACAT:1 + chr3L 24208192 3' - Quasimodo 77 2 75.34 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTAGTTTAAAAGCTTCAAATTTTCATCGACATGATTTGACCACGTCAGAGCCGATGGAATGGGATGTTT:1 + chrX 14346568 3' + roo 403 1 79.45 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTCCACGGACATGGAGCAGCAGCCCATCCGCATCTAAAAATCATCGCCATGTGTGTCCGCTTTTTTTCTGCTCCACTGTT:1 + chr2L 18627796 3' - 1360 43 1 56.55 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACATTTTCCGGTGCCGCCATGGTGGGT:1 + chr3R 22624776 3' + blood 7325 1 62.33 GTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCATTT:1 - chr2R 13212216 3' - diver 67 2 61.97 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTTTAAGGACTCAAATTTATCGGTGTATGTGTGAGCGGCAGGCGCGTGTTTTCCATATAAAGAGGC:1 + chrX 10304679 3' + roo 9041 1 61.48 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTATGCATAAAAAACGTTGAAAGCAAATGGCCGGCAAATGGTTTTAA:1 + chr3L 13545062 3' - hobo 74 1 68.49 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATTTTGGTAGTAACTTAAAAATTTAAGTAATATTAATGTAAATATATCTATATGTGAGCGTAGTATTGTTTCAAAATGCCGTATGACGCCAT:2 + chr3R 12622353 3' + 297 371 2 70.55 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGACGAACATATATCTAACGGCACTGGCCATTACGGATATTGCCTACCTGACGTGCCAGTTGATCTTGTCACTCCAGCACTATGACTATCCCAAGTATCATTTCAAGCTCTACTGG:1 + chrX 4725133 3' + roo 402 1 78.08 TCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGGATGTTAACTCGGGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACG:1 - chr3L 25232773 3' + accord2 7549 2 69.86 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGATTGATCCGCTGTGACTTTTGCTGACGCACTTG:1 + chr3L 17904889 3' + roo 9025 2 53.42 ATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGC:1 + chr3R 29091375 3' - rover 74 2 69.18 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAGTACAGTAACTTGTAAAGTCCACTTAAGATTGTCCGTCCGCCTGTCTGTCAATTACAATAAATGCATCCTTCA:1 + chr2R 8452850 3' + blood 7340 1 52.05 CACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTGTA:1 - chrX 9437181 3' - roo 103 2 30.14 GTTTCACAATTGCAACTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTACTCCAACTCTTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCATTCCCTTCTTTTTTTTAAGTGTCAGCACTTTCCTTTCGACCATTACTTCTAGAGT:1 + chr3L 4379239 3' - aurora-element 4233 1 60.96 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCACTGAATGTTCTGATACATGTAAATGATTTAGCCTATATATGTGTGGAATAAATATGCATATTTAATTAATCATA:1 - chr2R 8687795 3' - roo 47 2 53.42 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTGGATAGCTTGATTTTACTTATCTTTAATAATGGTATTTTAAGCTCAC:1 - chr2R 9091953 3' - 412 7121 2 70.00 GCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTGGGCCCTGCGTGTGTTAACTTGCGCACTCTGCCAAATTCCTTGCTTGTTGGTTTAATTGGAATTGA:1 - chrX 11623800 3' - gypsy4 6600 2 62.89 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGTGCCATATACAAAGACAGAAAATCATTAGGTATAACACCAAATTGGCTAT:1 + chr2L 261096 3' + Juan 4186 1 67.12 CCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTATAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGTTATTGCTTGCATTCTTTGTTGCACAGCACATTTCCGTATGAAATATATTATTAATACTATCATTA:1 - chr3R 19449818 3' + roo 8977 2 68.49 ACCATTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTCAACCCTTAAACACAA:1 + chr2L 2937555 3' + hopper 140 1 60.98 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCACTTTTATGTAACCTTATTTATTTCATATTCTTAAGATAAGTTGCATTTTTTTATCCAATGCTTTTTTTTTATCAGAGTTTTATGTCCATTT:2 - chr3L 18792380 3' + roo 9044 1 64.38 CAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:2 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1688 1 55.81 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACGTTACGAAACAAGAGAAATGACAAC:1 + chr2R 20447908 3' + hopper2 1558 1 50.00 TATATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGAAAAAAACCCTTTGTTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACAGTGTAAAACAAAAAAATTGATGCATTG:1 - chr2R 1526409 3' - S-element 90 2 78.77 TCTGCTCCCCGGACTCCCCGGAGCAGACAACAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGATTCCGGACGACGACGATCGCAAGATTCACCACCATGACCGTATTTCAATAGGCAGCACCAGGACGTGAGAAAATGTGAGGAAGTGGATT:1 - chr2R 2903619 3' + Gypsy6A_LTR 313 1 77.93 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACCGTATATGCAAATTATAGCTGGGGCCAAATTAAACGCGCAAAATGGAGGCAAAAATTTGATTTGATGATGTCTAAGGTCGCCGGCAAAGACAGACACAT:1 + chr3R 23668560 3' - pogo 28 1 65.75 AGGATATTTCAATAGATTATATTAATTTTTTGATTTTACGGCAGGAGAATAACGGTTTTTAGTTTTAAATTCTCCAAATGATTCGAGTCCCC:1 + chrX 6683763 3' + Tc1-2 1281 1 88.04 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTT:1 - chrX 12003941 3' + P-element 2810 1 24.44 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCTTTTCCTTTTTTCCTTCCTACGGCTACATCGGCCACA:1 + chr3R 6412112 3' - Tirant 8119 2 77.40 GAATTGTTTACACCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACTAGTTTAGTCTCTTCCAGACGAAGAAGTGGTAATTAGCGGGCCCCCGTTCTCCTCCCACTCCTC:1 - chr2R 7633254 3' - diver2 276 2 77.68 TTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTTGGCATTTTGTCTTAGCAGCAACAGAAAAAATGGA:1 - chr3R 28782585 3' + blood 7302 2 77.40 TTTTTTTTTTTGTTTTTGCAATTTTTGCATTTTGTTCTTTTTTTTTGTTTTGGGTAGCTTCCTTGGCGTTTTATTTTTTTCCCCTCATTTTGTGGCGATGAAAAAATAAAATTGCGTTTTACGCAAATCATTTTTAATGAATTTTA:1 + chrX 6443218 3' + Tc1 1476 1 57.53 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGATTGATCCGCTGTGACTTTTGCTGACGCACTTGCACCGACT:1 + chr3L 17904897 3' + roo 9033 1 58.90 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGACGTCACTAAATTGCGGTGACGAGGGGCTGGCGACGG:1 - chr2R 7889347 3' - jockey 9 1 78.50 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGTATAGCTAAATTTTATTTTGAGGATTCATTAATTAAGCAGACGCAAATTAATTGAGAAAAGTGTGTCGACTAAAAGATACCCATTACCTGCAGCTAACCGAA:2 - chrX 19959755 3' + roo 9054 2 69.18 AAAAAAAAATTATTTAATGTTTTAATTTTAATATCGTCTGGACAAAAAACATAAAAGGGAGAACTTTACAGGCGAGCTCGCGACTTTTAGATACCCGTTTCTCAGTAAGAAACTAAATATTTGGCATTTTTGGGCATGACAGTTCT:1 - chr3L 11307005 3' + Tc1 53 1 73.97 CACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTTAAGACAAGCCTCAATGGTTCATAAAAATATCTGGTTCGATTTTTCTACAGATACATGTCTTAAACTGCAAGCGAAATATAAATACCATTTGAATAGATGGGAAAA:1 - chr3L 4933807 3' + blood 7148 2 67.81 AACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACGAATTGCCGTTATGAGCGGCAA:1 + chr2R 15822127 3' - invader6 18 2 58.22 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTCTCTCACTCGCACACA:1 + chr3L 5179218 3' - P-element 61 1 35.43 GAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATTTCTAGTCACATTCGGGATTTTTCCAATTATCAAAACCAGTTCAGAATGACCCACCTAAGA:1 - chr3R 5024765 3' - diver 13 2 78.77 AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACATTTTCCGGTGCCGCC:1 + chr3R 22624767 3' + blood 7326 1 66.18 ATAATATTAATTAACAATTAATGCACTCGATTCCGTTGATGCAGTTGCATTCGCAGTTGCATATGCCAGTTGCATTTGCCTTTGCAGTTGAAGTCGCAGTCGCGTGAACATTTTATCGCCCGGGCTCGGCCTGTATTTAAGAGACA:1 + chr3L 22181793 3' - Tc3 268 1 75.34 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTTTT:1 - chr2R 9504195 3' + roo 393 1 65.49 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTGGATAGCTTGATTTTACTTATCTTTAATAATGGTATTTTAAGCTCACTGTAGTATGTCAAACCATTAGGAAAATCTACGAAAAACATGATTGGTACA:1 - chr2R 9091903 3' - 412 7077 2 69.18 AAAGCACATATGAAAATTTTTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTTTATTAAATTTCTATT:1 + chr2R 2875260 3' + TLD2_LTR 126 1 78.77 CCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCAGCCCTTCTGTGGGTTTAGTGGCACCGAACCCAAGGCTCGTGGGGCACAGGATCGCGGCGTTTCGGTGGCATTGG:1 + chr2R 10406379 3' - FB 1 1 73.74 TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTGGTGGATTCATTTTTGCCATTGGTTGCACTCA:1 - chr3R 30558234 3' + I-element 5277 1 74.47 GCCACCCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCAGTCGCCTCGCATTT:1 - chrX 8654768 3' - micropia 5418 2 57.14 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGACATTTTCACAGCTTCGAAATGTGTGAAATTGTGTCGAAAATAAGACCTTTAAAGCTCTTTACACAGTTT:1 + chr2R 11595936 3' + P-element 2838 1 49.32 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGAGTGAATCCCAATCGAATAGTACCCTCCCCTCTGAG:1 + chr3R 27188606 3' + roo 9039 1 61.29 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCCTCTCACCCAAGCGCTCTCCCTCTCCC:2 - chr3R 11773870 3' + P-element 2857 1 62.96 CAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGCTTGTAAAATGTATTTCCATATTTTGAACCATAGTATTTTACTTAATGTACACC:1 - chr3R 4532832 3' + 1360 3368 1 71.23 TCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCCTTGTATGTTTATAAATATAATATCCCTGCACTCAGTTCCTAGAACCCTACTTTACAAGGTACCAAGTGGTCGAGTTCG:1 + chr3L 8314941 3' + roo 9029 1 52.05 GCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTATTGGATACATGAGGCTCTATAAGGGGCTGTAGTCAGGGGTTAATTGAATGCGTGTGTGAATCGATACAATTATAAATGGT:1 + chr2R 15524934 3' - Quasimodo 174 2 53.79 CAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGAACGGAGCAAGGGAGCCATGCCCGGATTCCATTTATTGTTATCTCAGTCATTC:1 - chr3L 4931616 3' - blood 7286 2 62.68 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGC:1 - chr2L 18213143 3' + roo 8983 2 78.08 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTCTACTATATTTTGTATATTATTATTTGAGTACTATTTCTCTGTATCTCGTGTTGTTGCTTTTCACGTGAACTTACATAATCTTTCGGCCTATCTGTGCGCGTGTATATGAGTT:1 - chr3L 18788948 3' + 1360 3380 2 72.60 AGATTATTAAAAACCACGTCTGGCTTGACAAACGGGGTAAAAACGGGGTGCAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATACAGTATATTATATATATATATTATTATATTCTATAATCCGTCTTGGGCCCTCTCCTGCGTCG:1 + chr2R 17071210 3' - Cr1a 65 1 79.72 GGCGAAAACATAAGCGACTATCTATTCCACCAGAAGCTGATTGTGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTTTTATACAATATTGAAATCAAAAATAAACTTTTTGTGAGGATCAATAGACCGTTTTCTAGTGTCATAATACTTTTGCTG:1 - chr2R 2920222 3' - hopper 313 1 67.81 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGTCATCGAATGCTGCTCTAATTTGCCATTGTATTGCATTTTGTATTGAATTTATTACGTTTGTCCACACACATGTGTGTCACATGGTGGCCCCAAACTAATGGCTTCCA:1 + chr3R 8922047 3' - FB 13 1 76.71 TGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATTAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATTCGAGGTTAAATGGTTGTTTGGGGCTTCTTTTGCAAATCGTGGC:1 - chr2R 13193793 3' - BS 5064 1 65.47 TTTTTTTTTTTGTTTAATTTTTTTTTCAAGGTACATTTTGTTTGGGAAAGGGGCTTTGATGCTTTCCTTTGGCGCTTTTAAAAAGGAAACATCCGTTTGCCG:1 + chrX 4810509 3' - Doc 4697 1 45.10 CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGGAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGATAGATGTAGCTAAGCAAAGTTTGCCGTGG:1 - chrX 12214489 3' - opus 67 4 74.42 TTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGTGAGTAGC:1 + chr3R 29091386 3' - rover 63 2 63.01 AGGTGGTTAAAAATACTATAACATCGAGTACCAGCCGTGTTTTTCCTGTCGATTTATCGAAGTCCAATGACTGTGGCGATTGGATTGCATGTCATCGGCACCC:1 - chr2L 820792 3' + TART-C 28 2 65.05 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCGAGGCGTACATCACTCTGTCCCGGATGAGGACT:1 - chr2R 5640733 3' + 1360 3336 1 70.91 TACATCCGGAGTAGTGTAGGGTTTGTTTGGGTGTACATGTTGTATGTGTATTAGTGCGTAGGCATATTGAGCGAACAGAGAGACAGAGATAACTGTTAAGTTCAGTCGTAAAGACTAGATAGTGGATGCCAGTACTTTAACGCGCG:1 + chr2R 294093 3' - Idefix 78 2 55.48 TGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGTCACTCTTAACGCTCAAGTCTTTGGTCTCCGGCAATTGTTTTTCCACTCAATTTCAATTGTT:1 - chr2L 20324102 3' + Tirant 8452 2 54.79 AGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGA:1 + chr3R 4532964 3' - 1360 68 1 65.75 GATGCGCTGTTAAATTAACTTTTTCGGGCTGTAACATAACAGTTTATAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACAAATAAAATTGCATTTGCATGTGGAGATTTCATTATGCCGGG:1 - chr2L 9387048 3' + hopper2 1487 1 68.97 AATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAAAACAATCCTTTAGCTTTCGAGTTCATTTAGATTAGGTTTATATAATAAG:1 - chr3R 19543380 3' + roo 374 1 61.38 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGGCGTCAATTTGATCTTGACACCATGAGCATGAACCGCTTTCAAGCATTTAGTTTATTCATCTA:1 + chr3L 20388226 3' - 1360 51 1 55.00 TAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAACTATTCAAAGCTTCTGCGGCATAATACTAAGAGATGGGGGGG:1 - chr3L 5274932 3' + I-element 5289 1 68.89 GCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATACGCTGAAGAAGAGCATATCGGCATTGAAACATAGAAAACTGTAGTTGTTGTTGCTATAG:1 + chrX 10806467 3' - gypsy 7049 2 60.27 ATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACAACACCACAAACGCATTTTATTGCCT:1 - chr3R 19589918 3' - BS 5061 1 60.96 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGAGTGAATCCCAATCGAATAGTACCCTCCCCTCTGAGCCAATCCTCCCTGCCCAGCTTACATTCCAAATCGAATAATATGCTCAACACTTTATG:1 + chr3R 27188663 3' + roo 9045 1 67.36 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTC:1 - chr3R 19589899 3' - BS 5042 1 50.00 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTGTGACTGTCTCTC:1 + chr2L 18213219 3' - roo 58 2 58.90 TATTCCTCCTTTCTTATGCTCTCTCAAAAGAGAGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAATGTGAATTATGGCCTCGTAGTCTGGGCCAAAATGCAGAATATGTGTCGCAACTGATGGGCAACTCAAACTCGAACTCGGTG:1 - chr3R 29447664 3' - invader3 169 2 55.48 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCC:1 + chr3L 5179199 3' - P-element 82 1 20.16 GAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTCATATGTGAAAACACATGGACAGTTGTTAAGTGCTTAAAATATGCATGCTTTAATTGCCAGCCATCTGCTGCATTGAACGTCATTGAA:1 + chr3L 16875962 3' - Burdock 23 2 69.86 ATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCATTTTAAATACTCTAAAAACTAGTACACTTTT:1 - chr2R 13212188 3' - diver 43 2 54.11 CTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCCCTATTGAAACTCACATGCACAAAATAATCGTTTCCGATTGACTTTACCCCAATTATGTCAAATCAAATTGT:1 + chr3L 3565461 3' - gypsy 10 2 75.34 CTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATGCGGCTGTTCTGCGAGATCACGTTGTGGTGAATGGACAGG:1 + chr2L 13690132 3' - Doc 11 1 74.63 TATGGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTTTTAAATGTGTAGAGTGCTTTGAATATCTGTGTGGCAGGAAAAATCGATATCTTAAAAAATATAACAAGTTAAGCATAGGGATCGCAT:1 + chr2L 18300876 3' - Ivk 5284 1 57.53 GTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATATCTATGTTTATTATCTTTTGTGGTTAAAAATTAGGGCCAAAGCAATCGTTCATTAACAAAATTAAGGTACTACTATAAATTAAAGACTCTCCATCTGCCCAGACA:1 - chr2L 3282523 3' - flea 10 2 73.10 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTCTCAATGTCTGTTTTATGTTGTGTTTTTCACAGTTTTCTGTTTGCCTAGCTG:1 + chr3L 18789140 3' + 1360 3361 1 56.16 CGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCATTAATATTTTATACCCATAATTGAAATTTACAATTGG:1 + chr2L 23295933 3' - micropia 4962 2 78.77 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATATGTAGGTAATACGAATATGGATTTTGAAACTGGGGAGCATCAATACCAATACAAGGACATTTTGTCCGTGTTTGAGGATGCATTCGTCGACAACTT:1 + chr2R 17021459 3' - pogo 19 1 69.86 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGTCGGTAGCCGAGGTCCAAATTCGGGTTCGGGTTTGTTGTT:1 + chrX 10806950 3' - P-element 38 1 41.12 AACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCACACTCATTTCGCTTGCAAAATCCAAATAGA:1 + chr2R 16496708 3' + hopper 1394 1 68.49 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATCGAATGCAGCTGAGAATTACAAAGCTGCACCCATTTTT:1 - chr3R 12622225 3' - 297 45 2 69.49 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGCAAAACATAAAGCAGGAGCCGCCGCGGCGAACCAACATTGCCATGATTTGTATAATTGCAGTGCGAATAATTACAT:1 + chr2L 20986628 3' + roo 9028 1 55.48 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTCTTATTAGCAGTATTTGTTTATTGTTATTATTGTTTTGTTTTATTTGTTATTGTTATTAGCAGTATTTGTTTTATGATACAACATTATTGAAGATTTGTGGCCAA:1 + chr2R 17187838 3' - roo 8679 2 34.93 AACTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCG:1 + chr3L 25232860 3' - accord2 39 2 52.14 ATATATATATAAATACATTTTTGGTTTCCGGGTTATTTAGCTANNNTCTGTACTCACCGNNNNNNNNNTGCCTTAAAATCTANNNNNNNNGCTTATTTCATAATGATTTNNNGTATTGGAGAAACTGTTTAGCTCGTTTCTTTCG:1 + chr3R 7507298 3' + transib4 2463 1 80.00 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTGGTGGATTCATTTTTGCCATTGGTTGCACTCAGCAATATTTTATAATATTTTATATTAGTTTAGGAGATACGTCTCTCTCAATAAA:1 - chr3R 30558180 3' + I-element 5326 1 60.96 AATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGTAAAGTAAACGGACAATTCCTATTCCTTCATTACCAGTAGAATTCATGGCAAAATC:1 - chr3L 4934962 3' - roo 8992 2 60.56 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGAGCGTTTTAAGAGCAGGTGAAAACAATCTAGCTATTTTATGGCCAAAAAC:1 - chr3R 5264834 3' - P-element 56 1 41.67 AATTTTTAAGGGATATCGATAGATTTGCGGAAACATTTAAGTTGTTCAAAAAGTGGCAAAAGTGTTTTTTGTATACCAATAGAAATTGGCTAGACAAACAATAAAACGAAGGATGAATGCTTCCATTTTATTTCAGAGCAAATTTC:1 - chrX 778475 3' - INE-1 502 1 63.01 AAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTCATAAATAAGTAAATAAATTATTTAGCCTCCTATTCCGCGTACAAATCCG:1 + chr3L 21773234 3' - X-element 4694 1 65.75 AAGCTGCTATACTAGAAGAATGGCATAAGATCCCACAACAATATGAAATGGAAAAGATATTTTTTCAATGAAAAACGCCTACAATATGTTATTAATTGAAAAGAGGTTGCCAGGGATTTAAGTTTTATTTAATGGAGCCCCTCGCC:1 + chr2R 13781915 3' + S2 1316 1 65.75 AAAGTAATTTTTAAAATTTATTTATTAGACCAATAGGTTTAATAAATGATTAGCAAGCCCAATTATGTGATTGCCTGGAATTAACTCTTTAAAAGTATTTAAATCCAACTTTCTCTTCAATTTTCTGAATGTTTTTTAGGGCACTT:1 - chr3L 5025474 3' - 1360 373 1 69.86 ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAATAACAAAATAAGTACGACAGTTCAGATGCGTTTACTTTTACTAGACTAAAGCTGTATAATTTCCCATTTGTTTAAAAAAATTATACTTCACTAATGTAGGAATGCTTAACTTT:1 + chr3R 16971430 3' + mdg1 7076 8 51.37 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAGAGAAAACCCATCATTGGGAGAAAGTCTCGCAGTGAACTTTGCACTAGACTACAAGCTTTATAGCTACGATGATCTTTGCCCGGCT:1 - chr3R 11566244 3' + jockey 4956 1 47.95 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCTGTCAAAAGCTCTTTCGTTTTATTAGATTTTCCCAGCCGGTGGCTTTTGGCCCAGGTAAGTCGTAGAAATTTCCCTTTGCTGTTTGTTGTTCT:1 - chrX 17027826 3' - roo 8691 2 66.44 TCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAAGTGACGATCATCCCTAGTTGCCAATTCGAGTCATTAAGCCAGTGGCCGGTGGG:1 + chr3L 6391742 3' + 412 7396 2 63.70 GGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACTTAGTATGTACTACATACATACAAACATTCATATGTATATCGGGCATTCGAACGTTAACATGCACACTCGTATGTGTGTCAGTAGTTTTGATGTTCG:1 + chr2L 470342 3' - Burdock 6157 2 71.23 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAGACGTACATACATAAGTTATTGCTAT:1 + chr3L 22884061 3' + roo 9044 1 67.12 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCGAATGGGAGGCACCCAGGGAAATGGGAG:1 + chr3L 18738168 3' + Bari1 1689 1 67.26 CTACTCTCTTAAGCCTAGCTGCAGTAACTACCAGCATGGTTGCCTCTCTCACAACCGCAATCGCATCGACAACAACATTAACAGCAACAGTCTCTTCAACTCAAACGATTCAGGCAAACAAAAGTCGTTTTAGGTTATTAAAGATC:1 - chr3R 3187328 3' + Doc4-element 248 1 77.40 AAATATAATAACAATAATAAAAAGTACTTTTAGTTCAGCAAATGGCTGTCCTTAAAATTTTGTCATTCAAACGACACCCTGACGAAAAATCTAAAATCCGTGCGTTGGCTGCGGAAACACACAAATATAATATAGCATACATCTGG:1 - 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blood 84 2 73.29 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAATCCGAATTCAATTTTTCAATCAATTCAATGAATGAAAATAAATAGTTAGTTCAAGATGAAGTATATATCATGGGGTGCAAATGAACATATC:1 - chrX 19005335 3' - F-element 42 1 45.52 GTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATTTATGTTTCTCTGCAGGACAATTCGTATCTGTTGCGATAAATCATATCCATATTCAAATATTTGCACTATTTTGTTGTGCAAATGGCAAGATTACTCGTTTCA:1 + chr3L 19335478 3' + invader4 3066 2 71.23 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGAGACACCTTAAACATGATGTATAAGAAGCATGATGTATAGTTGTTTAGCAACACAATAAAAAGTTAATTGACTATTTTAAAAATACTTCCCATTTCAGGGTACTTCA:1 + chr2L 14480580 3' + Transpac 299 2 78.08 AGACAGCGCAAGTGATTCTGCTAAGCCCCCACCTATCATTCTGTCTGACGTCAATGATATAAGTGAAATGCTAGCCTATCTTAATTCTAAAATTTCACCTTTTAGTTAAGCAGAAACCCCGTAAAACT:1 - chr3R 21003794 3' + G4 139 1 73.44 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGTGACATTAAAACCAGTTATAAGCCAACTT:1 - chrX 12003895 3' + P-element 2845 1 55.48 GGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGTTTGATTGGGGTTTCAGTAGGCGTATGCAAATATTTTCGAAAATAAGTAAAAGTTTAATATATAT:1 + chr2L 20556566 3' - invader3 5238 2 54.93 TAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGCTTGTTTGCGAAAAATAAAAAAAACAAAATTGGCG:1 - chr3R 17059284 3' + hopper 1330 1 75.34 CGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCGGCAAATTAGTATCAGTGCATTAGGCCTTGGCAACCAATATATATTTCTAGGAAACTATTTATTACACAAAAT:1 - chr3R 5115273 3' - Ivk 50 1 51.37 TGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATCTGCATTTTTATTTGTGTAAAATAGCGGGGAAAATGACAGCTATGTGGGTGGCATGACATTGTTGTGAGACTCACGGCTTTTGTTGCACTTGTTGTTATTGCT:1 - chr2L 18300706 3' + Ivk 5364 1 73.97 GTTTATGCATGGGCAAGATTGAATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGACGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAA:1 + chr3R 29091360 3' - rover 55 2 71.43 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATTTTCGCGCATATCTTTATAATAATTTGTTTGCCAGCAAAACTCTCCCCGGGGCACATTTAACTAAGGCAC:1 + chrX 20124599 3' - opus 7045 4 52.14 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCTTATGAAATGCAAATTACATTTCAATAGCGCGATTTAA:1 - 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chr2L 13140601 3' + blood 7333 1 56.85 TTTTTTTTTTTGTCTTTCCTTTTTGGGGTTTTTCGGGGTTTGGTTACGCCGGCTTTTCCTTTTTGCCCGCAACGGCCATAAAACTAACAAAGGCGAAA:1 + chrX 4212597 3' - Doc2-element 240 1 89.80 ACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATATATATTTAAACGTTCAATATGATTACCCGTTTTTAATAAAGTTTCCTTGTCTTGAAATAAGCAACTAGAAGTGTA:1 - chr3R 9175111 3' - Juan 1 1 80.14 AGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTCCTCCCCCCTCAAGATCTGCGTCCCGCAGATTAGTGAGTGCCAATATATTAAATATTTTATTATCACTAAAATATAAGAGGATTTTCGTTAA:1 - chr2L 13237313 3' - opus 7036 4 63.01 ACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTACACAAATTGAATAAATGTAGTTTCAAAGTGTACTACTTCAAAGCGATTCATTCCTCAGATAATTGTCCTCTGATATT:1 - chrX 21636148 3' + Stalker2 7613 2 55.71 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGATTGATCCGCTGTG:1 + chr3L 17904870 3' + roo 9007 2 64.14 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATATACCTTTATTTATGTATCGATACATTTGCTTAATTTTATATACCTGATGGAAAGAGTAAAACTAGATGTGGTAAATTTTTGAGTCGGCCGAACCAGATACTTCACATAACATACTTCAAA:1 + chrX 13385171 3' - opus 112 2 76.71 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAAGAGTTGACATTAAGCAGCCGGATGACGGGCGGGACAGCTCGCAGGACGACTTCTAGGGTTCCCAGGACACCCAGGACTTCTCGTTCTCGGCTGCACTGACAGCGATGACG:1 + chr3R 28782702 3' - blood 7020 2 73.43 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCGTCTAATTGAATATTGAACGAGGCTTTTAGTGTTGACTTTATTAGCGTTGCCACGTTGCC:1 - chr3L 9324611 3' - Quasimodo 37 2 75.79 ATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACCGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTG:1 + chr2R 4206656 3' - 1360 316 1 72.86 AGACAACAATTTTCGTTATTGTGGTTTATTCTGCGACTATGCGCGTTCAGATGAGTTCTTAATACTGAAGACAGAAAACTTAATTGATTCCCTCAGTACTCCATAGTACCCTGCTCCA:1 - chr3L 8459991 3' - gypsy4 254 2 66.95 TAATAATAATTTTTATAATAATTTTTGAACAGGCACGTCATCCAATACAAATTTCTAACTACAGGTTTCTAAACCTTCTATATAAATTTTTTGAAAAGGTTCCTTAGCCACGACTGAGATACTACACTGGCCAGGGGACTTCGTTA:1 + chr3R 27938168 3' + mdg1 42 2 78.77 ATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGTGTTAAATACTCGTGCGAATTTCTGTGCTTTTGGAGGCCACCAGAGTGT:1 - chr3R 26434768 3' + Quasimodo 190 2 64.83 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGGCGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCGGGTGTTTGTGTGTAGTTTCCTAATTTGTACA:1 + chr3L 10564004 3' + hopper 1393 1 54.24 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACATCTTGTGCATATAAAACCCCCGGGGATCCAGCAGAACACACAAAAATGTGTAGCATGCTTTT:1 + chr3L 2184974 3' - jockey 64 1 56.16 CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCAC:1 - chr2L 7271832 3' + 297 328 2 68.31 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTAATGATGCTTGGTCTAAAATAGATTTTCCCAATTCAAAAAACGCCCATACAAAAGTAGCCCCACTATAAAACAC:1 - chr3R 22771873 3' - opus 49 4 53.42 CATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGATCACTATTATTGGAGGCAAATAGGCCAATAAATCGATAGGGTTTGAATCCTTAAACC:1 + chr3R 13656493 3' - 1360 264 1 60.27 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAACAAATACACGGAGCAGATTCGAGTGAAAAGCGTTGCCTACTTTTGGGGCTGCACTTCCATTGTTTTCGCTGGCTGCCCCGAAAAAGGGGTTGATT:1 - chr3R 15168851 3' + jockey 4964 1 63.45 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGGGCATCTTCGGCAATTTGGCCTTCGTGCCCGCATCGCATCATCTCGCTCTTTCCCTTGCTCCCGGTCAGCCTTCCTCC:1 + chrX 21281278 3' + P-element 2879 2 73.45 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTGCAGTTACAGTTACAGGGAAGTTGCGTTGGCACTGACAGTCGCAGACAACACTCACACACATATAGATGGGCCATGGAGTGCCGCATGTTCAGTTGTCTGAAAG:1 + chr3R 27859636 3' - hopper 13 1 76.71 GTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAGAAGTAATGAAAAAGTATTGTGCTATTGAAGTAAAGTAAAT:1 + chr3L 2467519 3' - jockey 4753 1 71.92 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTTCCAGTCAGAAGGTTTCAGGGCTTAAAGGGTTAAAAGGGACATTCTTCATTCTTGAGCAGTTTTACCAGCC:1 + chr3R 5478064 3' - 297 6625 2 50.69 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAACACACTCACGGCAGCAGGAAGCTTCCTAGGATATGTAAGCGAGAACGTCTG:1 - chr2L 12847210 3' + 412 7477 2 65.52 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCGAGATAAGCAAATGAATTTCAGCACTTATCATATACAAATTGGTAATCTTTTTTGCTTCGCTTGTCGGTGGC:1 + chr2L 10045304 3' - jockey 20 1 67.57 GTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATG:2 - chr3R 19450202 3' - roo 139 2 51.37 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACAC:1 + chr3L 13228535 3' - P-element 86 1 26.71 AATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGGAGATGTATATGAATATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTAAATGGGTAAATGGCGGGAAAATATTTAATTA:1 + chrY 2720373 3' + HMS-Beagle2 7185 2 76.03 GTTATATGCAATCCGACTTAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTTATTTAACAAATGACTTATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATCGGATTGTATATAACTAAGTTACAACGTTCAAACCTAAACAAGTA:1 + chr3R 3589798 3' - Tc3 1663 1 71.92 TGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTT:1 + chr3R 29091391 3' - rover 58 2 60.96 AATATAAATTATAAATTACAACAGTGAGTCATAAAAAAAAACAAAGCGAAACGAAAGATTGTCTATTAAGTAATATTCTATTGTAAACTGTGAATTATACGATTCGCAAAATTCACTTTCAACATTTGCGAGCGGGCAGCAGCAAC:1 - chr3L 7790602 3' + copia 254 1 80.82 CTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGGTACTTAAATATCCTAGCAACTGTATTTCTTCGAACTTACAAAAAATTCCAGAAAAGAAAGGACTTTTTTCCACTTAGAACTCACGC:1 + chr2L 6319863 3' + Tabor 7291 2 56.85 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTAACGTTTCGTGATTTTTGCCAGATTTTTAATGCCA:1 + chr2L 19643644 3' - hobo 31 1 65.75 GTTTAATTTATTTTATTATTTACGTAAGTTTGTGAAGTATAGCTGATCATGGGATCAGTTTTTGCAAACAAGTTTTTACCTCTGTCCCAACTTTATCCCTAATGTATACCATTTAGATGGAGAGTAGCTGCTCATGTGTTCATTCA:1 - chr3L 16313758 3' - HeT-A 342 1 30.14 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGTGGCTTGCATATTTTGATTGCATTTTGGTATTCCGCAGTGATTGTAGTTGTGGTTTCGATTTAGCGTCGG:1 + chr3L 14551405 3' - P-element 15 1 67.27 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATGACTGTGTAAACTAGAGCTGTTCTCTGCTGAACTAGCAGGTTTTGC:1 - chr3R 4421974 3' - 1360 64 1 67.41 AAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAA:2 + chr3R 29091367 3' - rover 82 2 74.66 AGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTGCTATTTATTTGTATTACTTTGCTGGTGAAACTCTT:1 + chrX 10128309 3' + invader3 5429 2 58.22 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCCCCGTCTTGGA:1 - chr3R 10461645 3' + roo 354 2 55.48 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAAACACGGACTACAACAATACATTTTTGGTTTCCCTTCTCTCTTAACGAACCTCCTTTCA:1 + chrX 16526374 3' - P-element 43 1 52.86 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTAACGTTTCGTGATTTTTGCCAGATTTTTAATGC:1 + chr2L 19643642 3' - hobo 33 1 64.38 GGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCGGCAAATTAGTATCAGCGCATTAGGCCTTGGCAACCAATATATATGTCTAGGAAACTAT:1 - chr3R 5115287 3' - Ivk 64 1 58.22 AGGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGTCATCGAATGCTGCTCTAATTTGCCATTGTATTGCATTTTGTATTGAATTT:1 + chr3R 8921990 3' - FB 214 1 63.70 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCAAAACACTTTACTTAACAAGGTATCATTTATTTACCGAACTCCTTACAAGAAT:1 - chr3R 29516489 3' - I-element 71 1 63.01 GGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGTGCAAAAAGTGCCGTTGTTCCTGCAACAACTTATCGATAGTCCCACCCACATCGATAGACTAGTATGACC:1 + chr3L 18748656 3' - Bari1 278 1 55.86 TAATAATAATTATAATAATTATTTGTTGGTAATGTCCTCAAGCTCAAAAGAATAAGCAAATGTCAATTGTGCTTACTTAAAGTTGACTATCTAGGTTTCATCAAAAGAGGGTACTTTAGAAGTACGAGATTTATATTACGTCTAAC:1 - chr2L 13973945 3' + mdg1 45 2 59.59 ACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAATAAAAGTTGCAATAAATTGTAGCATACTTGTGAGCGGACG:1 - chr3L 15853512 3' + jockey 4915 1 73.97 CTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGTGCAATCTTAATAAATCCATAAATTTATACAATGAGATTAGGCCTCAATGCGCTTTGG:1 + chr3L 7647882 3' - F-element 315 1 60.00 ACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGTCACTCTTAACGCTCAAGTCTTTGGTCTCCGGCAATTGTTTTTCCACTCAATTTCAATTGTTGTTGTCGGTGCT:1 - chr2L 20324090 3' + Tirant 8464 2 56.16 AAAACGAAGGCACGTTGATTTATCTGGATGAAGCCGACAACGAAGATAAAATTGCCAAACAGCTTTTAGCAATTATTAATTATGATTCTTACGGCGACAGAGACAGAAATATTTCGAGGGAGTGAGAT:1 - chr2R 20541754 3' - diver 344 1 71.09 TTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATATACTTATATATTTTCTTCCCCGTGCTGTTTTCACTTGAGCGCAGCGAGGCAT:1 + chr3R 26432072 3' - Quasimodo 64 2 69.86 AGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAAC:1 + chr3R 29091409 3' - rover 6991 2 58.90 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGATTTTAGTAATTGGCCATATAAATTATAAGATATTTATAAGCTGGGGGATTGGGTTATGGGTTATATGAGATTTAAATATTTGCT:1 + chrX 11267825 3' + roo 9037 1 58.22 CAAATAATTTAAAAATTTAGGATTAAACTTCGATTTAGTGTTTTGTGTTTCTTGACAGTCTCAAAATTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGCTTTCTTGTAGCAAGTAGTTGTTGCTGATGTTTTGACACGCATACTATCATAATTAC:1 + chr3R 23298459 3' + S-element 1460 1 67.81 TGTGAGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGAAGCTCCAAGGATGCGTGG:1 + chr2L 13335599 3' - accord 7034 2 77.08 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGCTGCACTCTGCAGTGGTGTGGTTATATTCGTACTTATGAGTGAGTGTTCTTCAGTCTGGAGAGCCAGAGCGCAGCCAAAAGAGCCAGATACAAGTTGCATCTGTATC:1 + chr3R 17059410 3' + hopper 1405 2 77.78 AACCAAAGACACTAGAATATTCTAATGGTTTATGGTCTTATGGTCTTATGGTCACACCACATAATGATGTTTTTAAACGCACTTTAATTTTTTTGATTGTATACAAATTTTAACAAATATTTATCGTCTAATTTAAACGCAAAA:1 - chr2L 16672909 3' - Tc3 313 1 64.58 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGTTTGCTCTATAACTAATCTCGTTTATCACGATTGTCGTGTCACG:1 - chrX 19113464 3' + 412 7492 2 53.42 GGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAATAATACGAGGCTCAACAAATCCTTCATCTCAATCCCAGTGTTGCGCTAAA:1 + chr3R 30622068 3' + BS 5019 1 65.07 ATTTGTTATTATTATTATTGTATGTGGCAAATGCGCAGCATAACCTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATAGCGCATACTCATTTCGATCTTTTCGTGTTTTGGT:1 - chr3R 18582094 3' - invader3 5059 2 69.18 GCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGAATATTATGATTACTATCTGTCTGTCGCTCTGTCCG:1 - chr3L 27146218 3' - HMS-Beagle2 6966 2 74.66 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAAGGAGATTAAATTTGGAAAACAGGCAAATAATTCAGCAACTGATTTACGAGCCAACTG:1 + chr3L 16875798 3' - jockey 4762 1 75.93 ATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTG:1 + chrX 7967251 3' + P-element 2782 1 14.38 GTTATTAAATAAGGTAAAAAGAAGCGGACTAAGGTGGCTCCCTTAGAGATAGAGAATTTTTAAAGAGGACCTTATGCTTTCTGTTTTTTAAGATTTATTCAGGAGGAAGTATTACTATTTTGACCGCAAGTGCATGTGAACTACAT:1 + chr3R 29617467 3' - Q-element 516 2 57.53 GGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAAAAGCTCCGCTTTTCGGGCTAACACAACCGCAGATAGCACCTGCTGCTCCTG:1 - chr2R 12069530 3' - Tirant 8114 2 79.20 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCT:1 + chr3R 6412076 3' - Tirant 8155 2 54.11 GATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAATGATATATTTATATATCATTTAAATGTAGTATTGAACATTTATTACTATGTAATTTTAATTTAATTATACTA:1 + chr3L 17162401 3' + Stalker2 7601 2 52.74 AAAAAAATTAAAATAAAAAAAGGTGAACGGTATAATTGGTGGCGTGTTAAATGAATATAATATTCATATGCTGTGCATAGCCTGCAATTGCTTGCTGACTTTAACTTCATCCATTAAATTTTAATTTCACCACGCAAGCTTAAAGC:1 - chrX 5139690 3' + Doc2-element 255 1 80.82 GATGGTTAAAAGTATTGAAGAATTCAGAAAATTAGTCAAAGCACTTAGAAGCCGTGCGACCAAAACGCCACTGAACATGTTCTATGTAGATATTGAGCCTAACAACATTAGAATGGGAAGCTATTAGTTTAAGTAATGGAAAAGCC:1 + chr2R 16744334 3' + G4 283 1 72.60 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTACGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCGGACTTTACATATTAGAAAATATGTCTTTTCCCATCTATTCAAATGGTATT:1 + chr3L 4933810 3' - blood 71 2 65.75 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATCAAATTTATTGTATAACATTTTCATATATGTATCTTTTCCTTAAAAGAAAAGCATAATTGCTCCC:1 - chr3L 19574036 3' - 297 44 2 55.71 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGCCGGAGTGTGAG:1 + chr2L 18213249 3' - roo 20 2 70.29 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGGCTTTATTGTATATCCGATTGCAGCTTCCCGTTGATGAGGCACTAAC:1 - chrX 12998011 3' - roo 8729 2 67.39 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATAAACGG:1 + chr2L 8707512 3' + 412 415 2 71.23 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATA:1 + chr2L 5307482 3' + P-element 2879 2 80.14 GATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCGAGATAAGCAAATGAATTTCAGCACTTATCATATACAAATTGGTAATCTTTTTTGCTTCGCTTGTCGGTGGCAAGGGAGAAGTTTTATTGT:1 + chr2L 10045323 3' - jockey 9 1 78.15 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCCACCCTGACGAAAAAACGAAATATGAACGTACTTGGCTTGTCTTTAAATACC:1 + chr3R 32068441 3' + P-element 2819 1 37.24 AGGACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGTTTGCATCATTGGGTATTATCAATACAAATAAGGAAATGCACAATTTAAATTATGCTAAACAATACTAAAAACAGTGCCATTAAAGAAAA:1 + chr2R 5265227 3' - Q-element 422 2 70.55 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGTTTGCTCTATAACTAATCTCGTTTATCACGATTGTCGT:1 - chrX 19113470 3' + 412 7486 2 57.53 TATTGTTATTATTATATTGTTTAAAGTATACTTGCTTACTTGCACAAAGCTAAACTTCAGATGAGCACAAAGTAGTCGAAAGTAAATAAGTAGATAAGCCTGTAAGCGGAACACCAAACAAGATTAGGAAATTAGTTTACTAATAT:1 + chrX 5478418 3' - hopper 1113 1 70.55 CGTGAGAATGAATAAGTACTTTTCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAACGAAATTGGATTTTCGAAACTTTTGCTTAAAAGTGTGTGCATTTGTTGTTTGCTGCTTTA:1 - chrX 8188993 3' - GATE 468 1 77.40 TTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAAAAATTTGAAATGAGCGCGCACTTAGTGGGAAAGGGTCACACTGGCTAAATATACTAGA:2 + chr2R 20870734 3' - 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chr2L 178130 3' - INE-1 145 1 59.59 TGGGTAAACACCAGTGCCCAAAATGCTGACCAGACAAAAATTCTAAGTCGCGGAGCAAAATAAAAATTTTGCAAAATCAAGGACTCCCGCTGCGGTGCATTCCCAATCCAGGGTATATTTTCCAAAAGGCGTGGCCCAAAGTCG:1 + chr2L 3820269 3' + HMS-Beagle2 6936 2 52.78 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACTTTGAGTTGTCACTTGGGCAAGAGAACTAGAAAAACTCAGTGCTCGCACGTATGTCACTGTACGTTTGTCTTGACCATGGCACACAAATGCAT:1 + chr2R 7899238 3' - roo 27 2 66.44 GCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACCACCACCCCCCCCCCTTAATACGCATGAAAAATTGCCTCCAACTGCAGCAGCGCTGAAATAAGATATTTCAATTTTGTATTGTAATT:1 - chrX 2916634 3' + 412 7515 2 58.99 ATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATCGAATGCAGCTGAGAATTACAAAGCTGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACAC:1 - chr3R 12622211 3' - 297 20 2 59.81 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGTTTTTATTTTTATTTCATTTTTATTAATGCGAAAAATGTAATTTCAAGCATTTGCAACTGCAGCGGTCCCTTGGGGCCAC:1 + chr3R 25843458 3' - I-element 45 1 55.48 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCAGCATGGCAAAATGAAGAGAAGGCGAAGCTTTTTCCTCTTATTTTTATTTTATTTTATTTATTTTTTTTTCATTTTTCATCATCTCTTGTCGGCAAACAGGATGCACACAAAA:1 + chrX 8760236 3' - roo 8670 2 78.77 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTCATATATAAATTAGATTCCCTCGCTCAACGACGCGAAAATTGCTGTGTGTACGACTCTATCAAATATGCAAAAGAAAACGCGAGTGCATAAATAATTGCCA:1 - chr3R 23668381 3' + pogo 2082 1 72.60 CCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGCTGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATGCGGCTGTTCTG:1 + chr2L 13690104 3' - Doc 9 1 67.31 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGACAACTAAAGAATTACATTTTATACTATACTATATACACAGAGCTTAAGAGTTATTCTTATTGTCTA:1 - chr3R 5453627 3' - I-element 57 1 56.85 TTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAATTAATTGAAATCTCTATTTTAAGTAATATTGATAACGATTAATAGTAGAAAAGGTT:1 - chr2L 12488245 3' + copia 191 2 65.07 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGGTTAAGCTTTAATTTTTCG:1 + chr3R 6412040 3' - Tirant 63 2 70.40 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGCAGCAAAACTAAACAATTTGTTTCTGGTGCTGTTGTTCGTTCGTATACTGAGTTAACATTTAT:1 - chr2L 19158791 3' + P-element 2857 1 60.96 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGCGGATTTCTTTATTCAAAAATTTGAATACAAATTCGAAAAACTCATGAACCACGCTTAAAATCCATA:1 + chrX 21187850 3' - hopper 50 1 56.16 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCACTTTTATGTAACCTTATTTATTTCATATTCTTAAGATAAGTTGCATTTTTTTA:1 - chr3L 18792416 3' + roo 345 2 62.94 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGGTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAAC:1 - chrX 12003912 3' + P-element 2829 1 44.14 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCAGGCTTCCACTTTGGCTCGCAATTATCGTAGTCTCCTTTTAGGCTC:1 + chr3L 9762301 3' - jockey 4780 1 63.70 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTAATTAAATGGAATTCATAGCAGGGTATTAAACGGCTGTGGCAGCTCAAGTGCAACATATTGTCGG:1 + chrX 20607097 3' + I-element 5329 1 58.82 CAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCATCGTCTAGCAGATTAAAGTGCAATGAAAGTGAGTGGTAAAGTCGTGGGCTTTTGAGGAAAAACAATTGCATAAGCTCGGAGTGAAA:1 + chr3L 16703903 3' + FB 5 1 56.85 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGCTTACACAAGATTTTGCTTCTTGAAATTCTACCTTAACGTGGGCTAACAAAATCGTTTAGCGGCTAAAATTGCAATT:1 + chr2L 3648835 3' - 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Doc 59 1 55.17 GAACACGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTATTCATTCGCTTTCATTTCAGCTTGTCTAGCAGCAATCCACTTGAAGGATG:1 + chrX 984012 3' + Rt1b 5025 1 63.77 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAATTAATCCAAGAGCTTTGTCAATTAACTAATTAATGTTA:1 + chr3R 24976319 3' - roo 44 2 53.15 ATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCCTACGCCTAAATAAATCGACATTCGTAACTTTTTTTTATAATAATGAAATTAATAAAACGTACATACAATATTTTTAAGAACGATACGCCTACCACATACGATTG:1 - chr3R 25718145 3' - I-element 4970 1 67.81 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCAACTCGGCGATTACTGCACTTGAAAACTGTATTGGTTACTTGATGACATTTTGCGATTTATGCAGTACTCCGTTAAATGGTTAAATTCCG:1 + chr3R 22868890 3' + mdg1 391 2 61.64 CTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCATTTTAAATACTCTAAAAACTAGTACACTTTTGAATTTTTTGAAATGGCTATTGTCGATA:1 - chr2R 13212160 3' - diver 5903 2 73.29 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAAATTAAAGATCAGAGACACGTTGAAAAGGGTTTAATTTTGGCTAAAAAGATTGCAGATGGCTGGCGATTACATTTAAGCAGCAATTATTCTAATT:1 - 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P-element 31 1 66.44 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTAAATGATTTTCTTTTAATTCCTCGCCTCTAAAGTCAAGTTCCACTGTATAGTCTTGGACTTTGT:1 - chr3R 30782499 3' + pogo 2047 1 61.64 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAATCGGG:1 - chr2L 13717297 3' + P-element 2834 1 40.16 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAATCCGAATTCAATTTTTCAATCAATTCAATGAATGAAAATAAATAGTTAGTTCAAGATGAAGTATATATTATGGGGT:1 - chrX 19005350 3' - F-element 58 1 50.00 TTCGCATTCACATTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTGGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACA:1 - chrX 10445555 3' + INE-1 531 1 73.64 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCTTAGAAGTTACTATAATTAAAAGTGTTTAGGTGGCTTTACTGCGAATTGGAGATCACTTCGATAGATGGCGCCCGCAGCACTAGAAT:1 + chrX 19585328 3' + Transpac 5213 2 72.52 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGATTCCAAGAATTTGCCAAACAATACACAAAGTATACA:1 + chr3R 29091426 3' - rover 6974 2 69.18 CTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGTTTGAAAATATATGTTTGATATATAAACAATAAAATAAAACAGAAACGTAGCACAAATGACCAATACTTAATAAATTCAAATATTTTGCAATACT:1 - chrX 13387459 3' - opus 418 2 61.64 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGCTTGTAAAATGTATTTCCATATTTTGAACCATAGTATTTT:1 - chr3R 4532846 3' + 1360 3354 1 61.64 AGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAG:1 + chr3L 22884036 3' + roo 9019 2 53.42 GAAATCACAGAAGGAATTTCGCGCTCCGACATATATATATATTCACTGCATGATTTCAGTTCTTAAAAAACTGAAGTAAAGGATATTTATTGATAATGAATCCAACTCATTTTACAATTCTAGATTGTCAGTCGAGATGGAGCCCG:1 + chr2R 10305473 3' - invader4 2785 2 69.86 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAATCAAAAAGTGAAAATGTGTCCGAAAACGTCGAAAACCACGCCGCTCCTGCTGATTGGCGGAATTTGCTT:1 - chrX 10286939 3' + roo 9055 2 73.10 CTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGTCATCGAATGCTGCTCTAATTTGCCATTGTATTGCATTTTGTATTGAATTTATTACGTTTGTCCACACACATGTGTGTCACATGGTGGCCCCA:1 + chr3R 8922032 3' - FB 28 1 66.44 TCGACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGACCAAA:1 + chrX 21587778 3' - INE-1 128 1 34.93 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTG:1 + chr2L 18213207 3' - roo 70 2 67.12 ACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGGTTAATGAGATAAGTTTATATTTTGTACACATATTAATAATGTGATCCATTACCAGATTTGTTTACCATTGTATTCAAGAAGATTTATTTTTCATC:1 - chr4 806606 3' - BS 5033 1 67.12 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACTGTACAAGTTACTGCGAGTAAAATATGACATTTTTATAGAGTTAGATAAACGCAGGAAATATTTTCCTCGAA:1 - chr2R 8452727 3' - blood 7062 2 52.74 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATATACTTATATATTTTCTTCCCCGTGCTGTTTTCACTTGAGCGCAGCGAGGCATTTATCATTTTTAATCGAATGCGGAAACAATGGAGCGC:1 + chr3R 26432109 3' - Quasimodo 23 2 70.55 CACTATACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGCACACAGTCATGATTTAATAGGTAAATCAGGTT:1 - chr3R 30302289 3' - Doc 91 1 73.10 TATATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTACCAGAAAATTGAACGACAAGCTATAAAGC:1 - chr3L 381734 3' + S-element 1626 2 79.45 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGTGTTAAGAGCAGTCCAATATCAATTTTCAAGTATTATTTATCTGAATG:1 - chr3R 14494021 3' - roo 8736 2 68.49 GATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTAAAG:1 + chr3L 25350827 3' + baggins 5377 1 55.56 AATACAGTTCCGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTCGCCTTTTAACTGAGATATGGCAACAATGTTGAGCTTCAAATTGATTTTC:1 - chrX 20460561 3' - diver 73 2 66.44 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATAATAATAGCTTAATAATATAATCTTAATAATTTTAACTAATTCCCCTGAGCATAGACTAAAGTATGAATATTATTAAACATTTAAAACTGCTCTAAAATCTTAACT:1 + chr2R 12239879 3' + roo 395 1 72.60 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGCTTCTAATTTAGGAAGTATGTGATATATATGCTAATTAGCCTATGTAATTTGTCAACCAAGGCGTGCAGCTG:2 + chr3L 20744288 3' - 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chr2L 19548390 3' - flea 4764 1 71.23 GCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTTTAGGTGCGTATTTGTGTAAGAAGACGGTTTTCTGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGACTTTACGTATTTGGGGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAA:1 - chrX 3703806 3' - 1360 3283 1 66.44 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATATACCTTTATTTATGTATCGATACATTTGCTTAATTTTATATACCTGATGGAAAGAGTAAAACTAGATGTGGTAAATTTTT:1 + chrX 13385131 3' - opus 7041 4 49.66 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCTAGAATGCTAACCATGCACAAGGCATCTCAAATTCCAGGTGTTAAAAATAAAGTACAAATACACTAAATATTTCGGCACGAATAAGTGAGTG:1 + chr3L 3757271 3' + copia 240 1 70.68 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGGGCTTCAAAACAACTTGACTGACTGCAC:1 - chrX 3576539 3' - jockey 4830 1 78.77 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTAAGCAGAAGAAAAAAAAGATTATTAAAAAGAA:1 - chr2R 12239757 3' - roo 8751 2 81.51 AAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTAAAAAACCCGATCGCGTCTATTTCTGCAATTTCTA:1 + chr3L 24253673 3' + 297 6897 2 73.97 AAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGCATCATAGATTTTGTTAAATATTTTTTTATAATTTATCTAGATATAT:1 - chr2L 14480438 3' - Transpac 71 2 67.81 AGAACGATGCTTGGAACCGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGTGAAGTTGAGAGTCGCTTAACTTATTTGTTCCAAGTAGATTCAATAGGAACTGTAAAAATGCTTCTATACTACTCTAGATGCACATATTATTAATTTTATG:1 + chr3R 21507006 3' + Cr1a 4022 1 51.72 AATAACTAAATAACTAAATAACTAATAACTAAATAAATATCTCTAGAGATATGTATATATTTTGCAATTAAATCAGCAACAAACTGCAAATGAACCGAATCGAAAATGCGAGAGAACCAGCTCAATTATATGGGCATTATCTGCC:1 + chr3L 13232290 3' + HeT-A 25 1 77.93 GTACCCGCGATGTGCGGGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTATGCATAAAAAACGTTGAAAGCAAA:1 + chr3L 13545042 3' - hobo 71 1 77.24 GATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAAATGAAACGAAATCTTTAATTTGTGTTCGAGTGGTTAAGCCGAGCTTATCGATTTCTTAGGGTTTTATT:1 + chr3L 17206995 3' - I-element 4971 1 50.00 CTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACCTTCTGCAAGGGTCTAAAAAGTAAAGCGTTATA:1 - chr3R 5477972 3' + 297 6900 2 76.30 CTTTAAATATATTCGTGTTCATCTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTATGAGTGTATTTATTACATAGTTAAGTGATTACTTTATATGTTTTATTACAAGTTTATTATATTTTT:1 - 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jockey 4937 1 78.77 ATGTTATCTAAATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTAGCTTATTGAATCATTGTGCGTAAATGGCAATCTTAAAAATGCGGT:1 + chr3L 6067761 3' - I-element 5122 1 76.03 CTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAATGATATATTTATATATCATTTAAATGTAGTATTGAACATTTATTACTATGTAATTTTAATTTAATTATACTATAAAAGTGAGCAAGATTTCTT:1 + chr3L 17162422 3' + Stalker2 7622 2 63.70 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCCCAGTGCAGACAATTTCGCCGTTTTCGCTGTCAGTGGTTCCCTCGTTTAGACCAAAATCGATTACGACCCGGCAAGGATAACTTCGCGTGGCGGGGAAGAGGCGCCAGCCCCGTG:1 + chr3R 20936580 3' - jockey 4748 1 76.03 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTAAGGAATGGTGGATGGAAGTGATGGAGCACTCGAAGAACCCGTCGGAACAAAAACGATGCGGGAAG:1 - chrX 14346404 3' - roo 8706 2 53.33 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTACCAGAAAATTGAACGACAAGCTATAAAGCCGGAACTTTACGTTGGACAAGAGAGGGACTGTTTTTCAGGCTGATAT:1 - chr3L 381687 3' + S-element 1673 1 54.79 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCTCTCTCACTCTCTTCGAAATTCTTATTTGTCCACATTCACATTTTCGCGTTCCCGTTTGTTGGGTGAGCTCAGTATTTAAAT:1 - chrX 10806842 3' + P-element 2852 1 61.64 ATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTA:1 + chr3L 25350824 3' + baggins 5378 1 56.43 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGACCGAAATCGGAGGTCGAGTGACTGGCAAGGCG:1 - chr2L 18944804 3' + P-element 2838 1 46.38 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTTCAACCATCCACAGTACTGTCGACTATCGATTGTTTG:1 - chr2L 2999222 3' - P-element 84 1 28.28 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCGTGGTCTTGCTCTCCCGCTCTCGCGTTCTGTTAGCTCACT:1 + chr3L 13228603 3' + P-element 2877 2 76.09 GATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTAGTTCAAAATAGATAGATATTCTTTCTAGTTCAAAATAGATAGATACTCGAAAGAAAACAGCGTACCATAAAGGGGAATATGGTACAAAGGCAAAACTTTTTAAATTTATTT:1 - chrX 22596328 3' + INE-1 564 1 69.86 ACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCTGTGCATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTGTGGCATGCCACGTGTAGCAACTGATAAGCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAA:1 - 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Tc1 3 1 56.85 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCGTCCCATTAGGACCTTTCCGCACGACAGGCGTCGCCAGTCGGGAATTAAACGTGTTTTGCTCCCGTTTACTCGCTTCAAATTGTATCACA:1 - chr3R 19639703 3' - 412 7077 2 67.15 ACCCGTGGTACCGAAAAGAGCCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCTGGACTGTGGTAGTATTCTCGCCCGCTTACCACACGGCAAAGATGTTGAGCTAAATTCAGCGCCCAATTAAACGGCGATGGCGACCCCGAAAG:1 - chr3L 14116908 3' - R1A1-element 4929 1 37.14 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGG:1 - chr3L 12861711 3' + pogo 2036 1 67.12 CACGCCCACATTTTTGAAAAACTTTCGATATTTTATTGGTCTTGTAAATTTATATCGATTTGAAAAAAAAAACTATTTCACACACTCACTATAACGCCCTACAACCACCCAAAACTGAAACCCTTACCAAGTGTTCCACATCCAAT:1 + chr2L 17084556 3' + INE-1 253 1 76.03 ATGTACATATGTATGAATAATGATGTAAGATGAAAAGTTATCTTGAATAATCGTTTCTCTCAAGCTAAGATTCCGAAACGGGTAATTCGACGGGCCTATAAATCCACCCGCTATTGTGTGTTTTGGCCATGTTTTTGTTGGCCCTC:1 - chrX 11624225 3' + invader3 5090 1 78.77 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGAGTCCCCATGAGCCGTTGAACGTGGAGCCGAACC:1 - 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chrX 19005356 3' - F-element 64 1 54.11 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAAGCTTGGATTTGCTTGGCTTGCTCCATACAAACAGGAAATGGCCAATGCCTTTGAGCTTGCAAAGCAGATTTTCGGCTTTGTGTTTTCAAATCA:1 - chr3R 20074515 3' - roo 8691 2 67.12 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCGTCCCATTAGGACCTTTCCGCACGACAGGCGTCGCCAGTCGGGAATTAAACGTGTTTTGCTCCCGTTTACTCGCTTCAAATTGTATCACATTAAGTTT:1 - chr3R 19639695 3' - 412 19 2 71.43 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCTGACAGCGGGCGCTGCACATTATTATGTGATTTCAAAGGACTGCGCCGCTGCCATGCAACA:1 - chr2L 20986484 3' - roo 8698 2 62.07 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGATATAGATATGGAATATAGCCGGGCCGCCTTGTCTAGAGAGCTCAACAAA:1 + chr3R 28579582 3' - pogo 25 1 56.19 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCTGACAGCGGGCGCTGCACATTATTATGTGATTTCAAAGGACTGCGCCGCTGCCATGCAACAACCAGC:1 - chr2L 20986478 3' - roo 23 2 68.57 TAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATATAGTAGATATATCCTTGATATGGATCAATACAAAATATAAAAGATGGAAGATCCAGCATACGGATTCTAATGATCATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACATAAATAACTA:1 + chr2R 18487361 3' + INE-1 33 1 54.48 CAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTACACAAATTGAATAAATGTAGTTTCAAAGTGTACTACTTCAAAGCGATTCATTCCTCAGATA:1 - 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Burdock 6182 2 54.11 TTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATCTACATATATAGTATTATATGTATAAATAAAACCAAGCAAATGATATAAAAAAGA:1 - chr3L 15859620 3' - I-element 66 1 65.75 TTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTG:1 + chr3L 10563977 3' + hopper2 1539 1 65.22 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCT:1 + chr2R 24021654 3' + pogo 2087 1 63.54 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACCACCACCCCCCCCCCCTTA:1 - chr3L 10671003 3' + 412 7506 2 78.75 ATTTGTATATTTGTATTTATTTATTTTATTTATTTATTTTGTAATAGCCAAAAAGTCGTTGAGCAATAAAATGGTATTTAGGGTTAAAAGAGGCCCTTAAAGAGTGGGTACTCTTCGTTTCAGATTCCTTATCAAGGTTTTCAGAA:1 + chr3R 12720385 3' - Stalker4 85 5 72.60 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGTCCTACAAATTAACATGCCCCA:1 + chr2L 18213202 3' - roo 8737 2 70.14 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATACACTCAGCGGCTTTTCATAATCCTTCAGCCTGCGACTGGCGTCTCTTTAAAATTTTACTTAAAATGCGCATTGAGAGCGTCTTGAAGATGGCCTAGTGAA:1 - chr3L 18972784 3' + mdg1 7440 2 71.92 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATCGAATGCAGCTGAGAATTACAAAGCTGCACCCATTTTTCTTCCC:1 - chr3R 12622219 3' - 297 6608 2 60.38 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAAC:1 + chr3L 9519635 3' + roo 9029 1 57.39 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCATTTCTTTGATACAATATTGCAGCTATTTTAATAATTTTGAAATA:1 - chr3L 12468775 3' - roo 8736 2 72.73 GACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATACATAGACTTCCTCACTCGTCTGCTTTGTGACATTG:1 - chr3L 18034568 3' - Transpac 77 2 71.23 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTAACGAGCTAATAAACCGCTCATGTTACAGATATGTT:1 + chr3L 13827459 3' + roo 8989 2 75.34 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGC:1 - chr3L 3757157 3' - copia 4912 2 66.06 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATATAATTCGTACAAGAAATTCCTCTGCAACTTTCAATTTAAAAAAAATATATTTAACTAAAAAATACAAATTAAAA:1 - chrX 22676320 3' - 297 39 2 56.34 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATGATTTTCTCGCAGTGCAGACTATGCACACTTCACTTC:1 - chr3R 24976161 3' + roo 392 2 71.92 GGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGTCG:1 + chr2R 11097402 3' - Juan 4027 1 72.48 AATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATAAATTCCCAGCCATATTGCTGCGTACACTTACGTCGTTATTTGCACAATTCTTTTGTACGCTCTCAAATTGATATTAATTAATGAAA:1 - chr3L 19335304 3' - invader4 2790 2 65.07 GTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTCCTCCATGTTTGGCTTTTCAATTTGTTTTGATTTCG:1 - chr3L 749538 3' - flea 4826 1 75.44 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCACTTTTATGTAACCTTATTTATTTCATATTCTTAAGATAAGTTGCATTTTTTTATCCAATGCT:1 - chr3L 18792407 3' + roo 9015 2 57.53 ATGAAGGGGTAGTACAATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGTCTTATATTTCTTTTTATTTATTAATTTTTTTTCATTT:1 - chr2R 20817762 3' + baggins 5389 1 51.54 ACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTTGTGAA:1 + chr3R 1446150 3' + 1360 3383 2 23.29 GAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCTGCACTTCCTGTCTGTCACAGAAAGAGACAGACGGTGGCGAACCGAAAGAGA:1 - chr3L 5179348 3' - P-element 283 1 41.38 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTATATGGTCAGAAACGCTTCCTACTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACACTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAC:1 - chr3R 3624416 3' + 1360 3373 1 52.05 CTTTTCCCTTTCTTTTTTTTGTTTTTTGCCTTTTTGTTGCGGCTCGCTGATGTTGGCGCAGCAAAGTAAACCGACCCCCGAATGACCCGGCATCCAGTTAAATC:1 + chr2L 3742604 3' - Bica 338 1 47.12 CGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAGGGACATTTTCCGCTCGTAAATGCACTTTGGGTATGTTTGACCTTTGTTTT:1 + chr2L 20324205 3' - Tirant 8171 2 64.29 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATAGTAATTATATTTCCCTATTATGGTTAAATTTGTATATTTTCTCCGAGTGAAGCCGAGATTAGTATGTTTTCACCATAAACACAGTTTGTTCAGGTAT:1 - chrX 9959738 3' - I-element 22 1 67.81 AGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTTTTTTATTTATAAGTAAAATGAGTAAACGCTTCTTTGCCGCGCTACTCTGAGTCACGAACTGTGGAACAT:1 - chr2L 3479043 3' + S-element 1523 1 62.94 TATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCGTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACTGTCTGTGTAGAGTAGTGTATAGTTGTTGTTCTTAAGTTGATTCTTGATTT:1 - chr3L 22907533 3' - Rt1b 4965 1 72.60 ACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATTCATAAAATGTGTTCAAGTTGGTTACCAGTTTTTTATGGTATGGTTTTGTCCAAAGGT:1 + chrX 21581443 3' - Tabor 63 2 58.22 ATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAAGCGAGTCGGATGTGGAATATACATACATATATAGATGCGGGAGAATGACAACTGCGAAACTCCAGGCAAGAACTACCAGCTATATACATCCATAGATG:1 - chr2R 12085575 3' - Tirant 385 2 74.66 GGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCGGAAAGCGTACTGCTGCCAATAAGGCAAGGTATTCATTAATAAAACCACGAGCCCACAAATCATTCAAATCATTAATATGAAATTTTTTTCCAATGTGACTGAGCTACCTATTACTCATGC:1 - chr3R 26244563 3' - copia 1 2 78.08 GGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCCCTATTGAAACTCAC:1 + chr3L 3565404 3' - gypsy 67 2 63.70 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTGCAGTTACAGTTACAGGGAAGTTGCGTTGGCACTGACAGTCGCAGACAACACTCACACACATATAGATGGGCCATGGAGTGCCGC:1 + chr3R 27859617 3' + hopper 1384 1 64.14 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTAAACTTTAACTATCCGTGACTTTTGAGCAGTTCTTTTGGGGTGGAACATTTTACACCGACCTCAAGTGCGAAAGTTAGGCTAATC:1 + chr3R 18541422 3' + hobo 2916 1 60.48 ATTGAGGTCTTTATGAAGTGTGGAGTTACGTTCATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGTAGTGGATATTTTAAGGT:1 - chr3L 23797684 3' - Helena 1188 1 51.72 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGATAACGGGGCTTATCTGAGCCGGCAAGACTCAAGTTGGATTCTCATTGAGTCAGAT:1 - chr3L 13228424 3' + P-element 2865 1 70.34 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAA:1 + chr2R 22464474 3' - pogo 52 1 56.16 CAACATATGGTACTTATTATTCATGCAATCTGACTTAAAAAAAATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTTTTATTGTTACCGCAACTGTATGAAGTGATCGTTATCAAGATGATTGTA:1 - chr4 1162156 3' - Tc1 99 1 73.97 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTCACAGATCATTTTATTATAATTACTAGAAACCGATTGATTAACTGGTTGTTAAACTATTGCCAATCCAATTGTTCAC:1 - chr2R 17187724 3' + roo 9030 1 54.11 ATTCTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTGAACATCCTTCACACATCAAAATTTTACGCCGAGTGGGCGGCTTTAATGGGTTAATTATTGTTCTACTTTTTAAGAAATATTATGTCAACAAGTTATGGGAAATACATAAGCCATGCAC:1 - chr2R 19338660 3' + hopper 143 9 66.44 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGAGTCATAAAAAAAAACAAAGCGAAACGAAAGATTGTCTATTAAGTAATATTCTATTGTAAACTGTGAATTATACGATTCGCAAAATTCACTTTCAACATTTGCGAGCGGGCAGCAG:1 - chr3L 7790606 3' + copia 250 1 78.08 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGGCGATTCCCCG:1 - chr3R 10461652 3' + roo 348 2 60.00 ATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGGATAAAGGCAACAACAAGTG:1 - 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McClintock 6298 2 76.03 AAATAAAAAATAACAAAAAAAAAATATATACTTCCTAAATACCTAACCAAAGGGCAAGCTATCTAACTATCTAATTATATATTATAAAGTACAAAAATTTCATTATAAAGTGCAAAGCTTTAACCGCATTTAAATATATTTATACT:1 - chr2R 18862302 3' + F-element 4687 5 39.04 GGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTGCTAACGCTAC:1 - chr3L 13365560 3' - jockey 4625 1 70.00 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGTATGTGTGCGTGTGTCGATGTATTAAGTGGAAACACCTTGTAAAATGGCTGACAGGTGTTAGAAGACTTTGCAAGATTTATGCGCTGACA:1 + chr2L 12847333 3' - 412 30 2 63.70 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATG:1 - chr3R 24976197 3' + roo 9019 2 53.42 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTTGCGTACAAAATTCAACATTATTTGAAGGTCGTCCTTTGCTTATTCTGTGCGTCG:1 + chr2L 21251030 3' + P-element 2860 1 55.05 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGGTGAAGTGGTACTGGCTTTAGTAAAATAATTTTTATAGAGTACCAGAAATAA:1 + chr3L 15277671 3' - I-element 75 1 70.15 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTC:1 + chr2L 13690084 3' - Doc 70 1 62.76 AAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTCTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTTCAAAATTATTCCTAATGCAACAGCATCGAAACTCGGAAACGAATGTCACCTAGTCCTAAGTTATGTTAGTCACTAAT:1 + chr3L 14034365 3' + 1360 370 1 56.85 CGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACATATACACCAAGAGAAATTGGAAAAA:2 + chr3L 5275006 3' - I-element 64 1 60.27 CAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGATTTAATATTAAATCGTTTATCAATCGCTTGGTAACATTTATTTCACTCTCTATAAATCACAAATTTATTAACTTT:1 + chrX 15550626 3' - F-element 414 1 53.68 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATTAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATTCGAGGTTAAATTGTTGTTTGGGGCTTCTTTTGCAAATCGTG:1 - chr2R 13193795 3' - BS 5072 1 68.28 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTGTTTTCCGAATTGGTAAAAAATGCTCACTCTTAAATTATTACGTGTTAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGC:1 - chr3L 13827342 3' - roo 23 2 70.55 GTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCGGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTTCAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCATCTCTATGCCGATTTCCCCACTCCACTTTGTCTGCACAACTGTCACACAATTTTCATTG:1 - chrX 19113605 3' - 412 459 2 56.85 ATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTACAAATTTTTTATTACTTTGCCAGCGACACTTTTTCAGGTTTTTTAGTTGTGGGTTTCTACGAGTGTGTG:1 + chr2L 17230699 3' - HeT-A 6023 1 54.41 CTGAGATCTCGACGTTCATACGGACACACGGACATAGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAACAATATACATACTTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTTTATACTTTTTATCGAATCTAGTATACCCTTT:1 - chr2L 20491469 3' - INE-1 136 1 85.62 AGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATTTATGTTTCTCTGCAGGACAATTCGTATCTGTTGCGATAAATCATATC:1 + chr3L 19335423 3' + invader4 3011 2 69.86 CTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATTTAATCGCAAATCGGAATAACGATGGAG:1 - chr3R 21276491 3' - BS 4996 1 78.74 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACAAAGAGTAT:1 + chr3R 4532954 3' - 1360 61 1 68.99 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTATAATCACAAATATATAGCTTTTTATTTCGAGATAATCAAAACAAATTCAATGAACGTTTCGGTGAGCTAATC:1 - chr3R 17682708 3' - 412 7099 2 49.32 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTG:1 + chr2R 22464466 3' - pogo 60 1 61.64 GACTTTAAAGGTAGAAATTAAGGGTTCTTTGCTTAATTAAACGCATTTTTTTATGAAATATAATTAAACAGTATTTATTTTACTTATAATACTTATATTACGAACAGTTCCTGACTGATGTCGAAAGCTCGGGAGCACAGCATGGC:1 + chrX 2065834 3' - S-element 1667 1 65.75 CACCCACTGGTAGACTAAACATACGTTCCCTAAATTAAAACATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCAACATTATTCATCACTGACGACAATAAAGAAATGATTTTGTTAAATATTTCTCTGGTGCCACTGTACCCAGCATTTATTTA:1 - chr2R 7987731 3' + Idefix 175 2 52.74 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATT:1 - chr2L 5447886 3' + roo 340 2 68.49 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAGTACAGTAACTTGTAAAGTCCACTTAAGATTGTCCGTCCGCCTGTCTGTCAATTACAATAAATGCATCCTTCATCAGGTTGCGTTAGTGTAGTAAACTACCTTAAA:1 + chr2R 8452883 3' + blood 7373 2 74.66 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCAACCCTTAACGGAGTTGGGCGAAACTTGACCCCAAGCTGAGAGAGAGAGTGAGTGAGAGAGTGAGTGGGGGTGGGAAAATAGATGGGTGTG:1 + chr3R 11774021 3' - P-element 19 1 69.63 TACATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTCTCTAATTTAAAGAAGGAGAAAATTTACACATCGACATTTATTACGCGCAAAGTCTTATTTTCTTAACTTGTATTGACGCGTATTCAAAATTCCTAGTTGTTAAAGAAAT:1 + chr2R 2034737 3' - TLD2_LTR 191 1 71.92 ATGGCAGGACGCAAAAAGTCCTCCTTTAAAATTCTCTATCTTGTGTTCTCCGAGTCACATCCGGTGTCTCACAAGGGAGTCACCTTGGTCCCCTTCTTATTATGCTCACCCGAAAGAGTCCAACCTGTTGTAACCCGTTGTCTTCT:1 - chr4 261445 3' + Q-element 422 2 69.86 CCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAAAATGCGCACAAAAGGTTGTCGGTGGGTTTGCGCCTTTTCCACGTAACGAGACAATTTTTACAC:1 - chr2L 16385247 3' + I-element 5299 1 56.16 GACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAGAAGTAATGAAAAAGTATTGTGCTATTGAAGTAAAGTAAATTTATAAGTTATGGTTTTTTAGAATACTAAATGT:1 + chr3L 2467552 3' - jockey 4720 1 54.11 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAAAGTTTCGCTGCACAATGTAACTTCCAATATTCAAGACACGAGATTTTGTTTCGCTATTTTTTCGGAATTAAGAAAGTTAAGATGA:1 + chr3R 10636223 3' - blood 7047 2 60.27 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGCACATCCATCTAAAGCCCTTCATGATGTTAATTA:1 + chr3L 6675368 3' - 412 7140 2 76.71 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAACTTGATCAATAAAA:1 - chr3R 30850760 3' - I-element 68 1 61.64 GGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTT:1 - chr2R 5582150 3' - Cr1a 469 1 58.22 TAACATGTAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGCCTCAACACGAGTAAAACAAAACGTAATTACAACAAGGACTTTTCAACAGCAGC:1 + chr2L 9861378 3' - BS 5023 1 60.56 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTCGAAATTGAAATCAATATGTTTCTTTTCGTTATTTTTAAGAAATTTCCCCCTTTTAGCTCGACTACA:1 - chr2L 11734504 3' - Doc 59 1 61.64 AGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTGAATCGTAGTACATTTAACAACTGATCAACTCATTTGCAATCGCCATATAG:2 + chrX 21590753 3' - BS 5069 1 65.07 CAGTGCTATTAATCTGAACACAACTGTGCTGTCACTCGTGTTCCCACAGGATGAATATTCGGCTGGAGAACCTCTTTAATGGCGACCAGGCATTGGGCACCAATCTGAATCAGTTCCTCAACGACA:1 + chr3R 25238556 3' + HB 1623 1 69.05 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCACGTACGTCAGTCTGTTTGTCTGCGCTGCGTGCTTGTTTGTTTGTTCGTTTGTTGCCTCGCCATGGAGTCGCTTTGAGAGG:1 + chr2L 18944928 3' - P-element 36 1 60.14 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCAGTGCAACAACTTGTTACTCATGTCCTGCTCACGAAATTCGCTCTGTTCGGCTCTCTTAACGGGTTGGATGTCCTGACCATCATTCGC:1 - chr3R 25137829 3' + P-element 2857 1 62.94 CACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTG:2 - chr3R 19450166 3' - roo 8767 2 71.92 TCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGAT:1 + chrX 21667933 3' - gypsy2 61 2 67.16 AGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGGGAGTCACTTCCCGGGGACGTGTGTACTTGCACCAAATCACGG:1 - chr2L 793567 3' + R1A1-element 4953 1 56.63 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATCGAATGCAGCTGAGAATTACAAAGCTGCACCCATTTTTCTTCCC:1 - chr3R 12622219 3' - 297 6629 2 65.35 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTCCACGGACATGGAGCAGCAGCCCATCCGCATCTAAAAATCATCGCCATGTGTGTCCGCTTTTTTTCTGCTCCACTGTTATATTTTTTTTTCTGTCTCTGTCCCCGTGACT:1 + chr2L 18627829 3' - 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chr3L 15276608 3' + hopper 1398 1 68.55 TCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATGGGGCAGCACTG:1 + chr2R 22464495 3' - pogo 5 1 75.00 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTG:1 + chr3R 6412044 3' - Tirant 28 2 56.38 TCTGATATGTACATAGATTTGGCTATTCCTAATCTATTTTCATATAATAATAATAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAACAATAATATGCCGCTCCGTTGCGGACTGGCGGCCACC:1 + chr3R 15858463 3' - 1360 347 1 75.76 ACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATAAGCGTTAGATCGTATTTCATACTGGCAGATAGACCACAGAAGGCTTCGAAGCGGTG:1 + chr2L 8435619 3' - gypsy 7044 2 59.42 GCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCCATAAATATGATGATAATTAAGTGTGTGTCTGGCACATATACTCAATTTGGCCTTATTAA:1 + chrX 20874385 3' - F-element 388 1 58.22 CGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATT:1 + chr3L 23702253 3' - G4 65 1 58.90 AGTATGTAAATGATTCTTGAATGTATCTTTTAGTTGGAAACCCATCGACAAAGTTCCTATTTAGTAAGTTATTTAGTCGCTCGGGACAAATGGCCTATTTGGCGGCATTTGCATTGCACAATTCCCTCGACTTGGCCGAAAAGGAA:1 + chr2R 18646643 3' + transib4 288 1 71.23 CAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGC:1 + chr2R 16496661 3' + hopper2 1542 1 61.81 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGGTTCACTGTTGTTTACTGAATATATGAGCAATGGAAAAGCA:1 + chr3L 21151169 3' + 412 414 2 72.60 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACTTAGTATGTACTACATACATACAAACATTCATATGTATATCGGGCATTCGAACGTTAACATGCACACTCGTATGT:1 + chr2L 470320 3' - Burdock 43 2 56.16 TCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGTTTGATTGGGGTTTCAGTAGGCGTATGCAAATATTTTCGAAAATAAGTAAAAGTTTAATA:1 + chr2L 20556561 3' - invader3 61 2 59.59 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAAGGTCGCTCTGTCGATGTTCTGGAATTGGGGAACAAGGGTATCGTCTGCACCGAAATGGGCATGGCCTGCATCTGTCCACAGGAACTGGGCTGTTGGGACAGCAGCTGG:1 - chr2L 8396790 3' + roo 396 1 75.34 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAATACTCAAATGTCATCTCCTTAGCTTC:1 - chr3L 24253599 3' - 297 6637 2 69.23 CTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCCATAAATATGATGATAATTAAGTGTGTGTCTGGCACATATACTCAATTTGGCCTTATTAACCTAAAAAATGACACAGATATTAATTTTCCGCACACATGTGC:1 + chrX 20874427 3' - F-element 346 1 71.92 GACAGCTTAAGCACCGGGAGACTTTTCTCATAATCCGTACAGATATAATAACAAATTCGTAACATGAT:1 - chr2R 13212243 3' - diver 5908 2 42.65 GAAGAGAAAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACATTTTCC:1 + chr3R 22624758 3' + blood 303 2 71.94 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACTTTGAGTTGTCACTTGGGCAAGAGAACTAGAAAAACTCAGTGCTCGCACGTATGTCACTGTACGTTTGTCTTGACCATGGCACACAAATGCATGCGGCATGTCATCAGCCAC:1 + chr2R 7899257 3' - roo 8670 2 80.56 TTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACCCAATTCTTTCGAGGCTGTTCCGACTTTTGTACTTCCTGGTT:1 + chr3R 5430479 3' + Burdock 6316 2 71.23 ACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1667 1 61.68 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCA:1 - chr3L 13228481 3' + P-element 2809 1 31.25 ATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTATGGTAGAAATAATAAAAAGTCTGTGCCTTTCCGAAATAGACTTCGCATTACCCATT:1 + chrX 19820222 3' - Juan 4091 1 60.96 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTTATCTAAATATAAGTGAGCACAGCAGTAGGCCCGTACGTAAT:1 + chr3R 21706322 3' - I-element 78 1 69.18 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATATAATTCGTACAAGAAATTCCTCTGCAACTTTCAATTTAAAAAAAATATATTTAACTAAAAAATACAAATTAAAAGACA:1 - chrX 22676316 3' - 297 39 2 56.16 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATATCAAATTTATGTCAAGTTGGCCAATTTTCAACAGTAAAAACGACAAAGAAAAACTCTACGCCAATCAGTTAGCAAAAAAAATTAGCACCAATTTAATTTTT:2 - chr2L 3648671 3' + roo 9055 2 73.97 TACTAGATTCTTTGAAATGTATGAAACAATTAGTCCTATAAAGTACATAATATGTACTATGTATAAACTTTGAGATCAGATGTGAAAGAGATTCAAGATAAGAGGGAAGGATTTTTAGCTCCATACAACTTCACTTATGCGCTATC:1 - chr2L 6279607 3' + INE-1 10 1 58.90 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCACTGGCTCTCTCGGCGCAGGCAGGAGGAGAGTGAGAGTCCTCGCTCTCTCGCCAGC:1 - chrX 16526236 3' + P-element 2870 1 71.54 ATACATACATATGTACATACAATACATACATACATATGTATGTACATACATTTATACATATATTCCGATCGGAAAAGCCTAATTGACCTCTTGGACATTGGCAAAGGTGTAAGCCATGTGCAGAGAGATCGAAGCCGGAGGGAGAC:1 + chrX 6863906 3' - invader3 5086 1 77.40 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGCTGAACAGGGGCTCGGCACAAAACAAGGCATACTTTTTGGGGC:1 - chr2R 20739018 3' + hobo 2929 1 58.23 GTAGCTCGGACTTGATATTCACGGCAGGTATCTTACGATAACATCACTTTATTTCGGCTGTCAGTTTAAAAATTTTAAAGATCTTTTCCCATTCTTAGTCCAAATTGATGTCCTACCACTATAA:1 + chr2L 3705654 3' - Chouto 184 1 54.84 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTGAGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGCCTTTATAATCATAAGTTTGTTTTCGAACG:1 + chrX 10824077 3' - pogo 14 1 71.72 AGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGCAGCGATG:2 + chr2L 14889015 3' + hopper2 1534 1 70.55 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTG:1 + chr2R 24021669 3' + pogo 2063 1 56.30 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATATAATCAATATAATTATAGCATAACAAAGTTTAGTGACACACACTTTGAGATCTGCGTTCAATACTTGTTGAAAAGTTGGT:1 + chr2R 9092081 3' + 412 7505 2 56.55 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGCTCATGTGTGAACACTTGGGCTTTATTGTATATCCGATTGCAG:1 - chrX 12998034 3' - roo 8717 2 76.70 GATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCTTATAGTATGTA:1 + chr3L 23702300 3' - G4 18 1 69.18 GATCTCAGGAACTATAAAACCCATGTTGCCACGCCCACTATAGTGGTTGATAGTGAATCCTGATCTACTATGTCTTCACTTATTTGGTTACTATAAATGAACGTTAAATACATATTTTATTTACTTACCTTTTATGTCATCGTCT:1 + chr4 1045151 3' + INE-1 150 1 28.97 GATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTTTTTTTTGTTTTTGTGCGCTCTGTTGGTTGGTTGGTTGTTTGCTAAGTCAGCCAGCTTAGGCGTTGAGGCTTGGAGATAAAAATAAATAAA:1 + chr3L 7786670 3' + copia 4928 2 58.22 ATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAATTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACGCCCGATTCGAGGATGGTCGGTTAATGCACTTTTTTT:1 + chr3R 18068496 3' + invader2 168 2 72.59 ATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAGGGTGAAGGGCATATTTATTTATTTTGTTTCTATTGGAGAGTATCGTCTCTTCGGCACTG:1 + chr3R 1267661 3' - 1360 298 1 70.55 AGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACACGAAAACAAAAATCATGAAAATTTCGGTGGGAGTCGCCTTGGAAATTCTCTTTATAAGTCAGTGTAGCATAGACATTTAGGCTTTGGAAAATTACAAGGATTCGC:1 - chr2L 17910348 3' - accord2 7290 1 76.71 GCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTATAAAGCACTCACCTAGCACCAATTCCATGACAATCATGATGGGCTGCTTCT:1 + chr3R 9369072 3' - HMS-Beagle 266 2 58.46 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCGTGCGAATGGCAAAACGCATGGGCTGGAAAACTATTGATAGGTTTGCCCAAAAGTATGCTGCAATTGATAGATGACATACTAAATAATTAGAGAGCACACTTTTAGACACCTTCACGGTT:1 + chrX 18353641 3' - jockey 20 1 69.18 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAATGTTTATATATAGATTGGACTTTACACAAGCTATTTAATGCTTAATCAGTGAT:1 - chr3R 8596345 3' - hobo 65 1 60.27 CTGTCCGTGTGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGTTTGTTGACCCATGTGCCTCGCCCACTCTAAATGTGTAGCCAGCAAGCGACACGATTTCCTTG:1 + chr4 186520 3' + INE-1 131 1 70.64 ACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTATTTTTTTATTAAATTATTTTCCTATCCATGTTTTAATTTTTTTCTTGATTTTACATATTTCTATTCTCTCTTATTTTTAATTTCTTCT:1 - chr3R 2527713 3' + INE-1 542 1 47.95 TTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACCAATTTTGTCGTTAGATTCGTAAGTTGTATTATATTTTTCTCAGCCATAAATTAGTGGGAGAAG:1 - chr2R 9457790 3' + 412 7108 2 56.16 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATAAAAATTTTGACAGTACAGGCATCGTTCATTTATCTTTAATAAAATAAAACATTAATTATGCAGCTTTAACGCTCAAAAGCTTATTTACACAAAAT:1 + chr3L 13166357 3' + I-element 5331 1 66.21 GATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGAAGGCAACACATTGTGC:1 - chr3L 14944553 3' - G5 4806 1 56.16 CGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGAGACACCTTAAACATGATGTATAAGAAGCATGATGTATAGTTGTTTAGCAACACAATAAAAAGTTAATATTTTTACGCTGTTGTTTACCCGTTT:1 + chr3R 7167342 3' + Transpac 5209 2 52.82 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTAATAAAATCCATAAGCATTTCGAAAAGTTTGTAGCATACTTTTTGGGGCATCATACTCAAGCGAATTTATTAGCTGAATAATTATGGCAGATAAGATATACAGTAAA:1 - chrX 9508049 3' - jockey 4690 1 70.55 TTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTGCTAACGCTACGTATGTATGTGTGCGCCTAAATGGGCGGGGATTTGGCAAAAGGG:1 - chr3L 13365516 3' - jockey 4587 1 64.29 CGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATGCTCACTAAATTGACTGAGGGTCATAATATGCCAATTCA:1 + chr3R 28659104 3' + Burdock 6311 2 74.66 AAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAGAACCTCAGCAGCACTTGGCAGCGCTGCATAAATCATAGCATACTTAACAGGGCAATCAC:1 + chr2L 14889048 3' + hopper 1374 2 50.68 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCACTGGCTCTCTCGGCGCAGGCAGGAGGAGAGTGAGAGGCCTCGCTCTC:1 - chrX 16526244 3' + P-element 2868 1 66.94 AGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAATGTGCCATACGATTGCGTTAAAAAATTAAACTGAGCATCCAAGGGATCTTCATCTGCCGCAGTTATCAATGTATGAATGTCAGTTTGATGAGTTTGGTTCGCATATGTGA:1 + chr3L 12859154 3' - pogo 2075 1 73.97 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGAATTACCGCG:1 - chr3L 16463496 3' - roo 8727 2 62.94 GATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTAAAAGCCTCACTACAGAATA:1 + chr2L 15322966 3' - diver 261 1 57.46 AAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTCGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCACCC:1 - chr3R 29091295 3' + rover 304 2 58.82 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTAATAGTTATCTTAATATACACTGCGCGTCACCAGTTTGGCGTTGTTTTCAAGGACTTCAGACATTCGTCTGCGAAGTGAATCATATATGTATGTACATATTTCTTGTAGGT:1 + chrX 15019857 3' + S-element 1709 2 78.08 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGCTGGTATGAAGAGGAGGGAATGGAGAGG:1 + chr2L 18178391 3' - Tirant 11 2 74.36 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTTGTTTCTAATTTTGGGAATACTCGAAACTCGAAAGGCAAAAGTTTC:1 + chr3R 20074635 3' + roo 332 2 71.92 CGATGCAGCGAAGCGAATTATCCTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCGTTCCCGAACGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAAC:1 + chr2R 22464476 3' - pogo 4 1 69.00 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTTGCCTTTGTTCAGGGTATTCCCAGCTCTTTGCTCTTTTCTTTTTTAGATGTTTTCTTGTGCTTT:1 - chrX 5366135 3' + pogo 2051 1 55.56 AACCAAAAGTTGTTTTTTTTTTTCAATTCCAAATTACACGAACAAAATGGCGGCGG:1 + chrX 4477136 3' - HMS-Beagle2 496 1 58.93 ATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTCGCCTTTTAACTGAGATATGGCAACAATGTTGAGCTTCAAATTGATTTTCGATCTCGACATAGCATTCTTGTTTTAATTTATTTT:1 - chrX 20460525 3' - diver 38 2 56.85 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGTTAAACGCTAATGCCGCAAAGTAATTCAAAACTTAAAGCGCACTTTTCGGGGCTCTCGACGCGGTTTTATTTGAGTTTTTTTTGCAGAAACTCTGGCA:1 - chr3R 18541270 3' - hobo 25 1 67.12 ATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAACAATGGCTGTCTGTCAGATAATCTAGTTTAAATATTTTATACTT:1 - chr2R 21425070 3' + HMS-Beagle2 238 2 69.86 TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTGAATCGTAGTACATTTAACAACTGATCAACTCATTTGCAATCGCCA:1 + chrX 21590748 3' - BS 5074 1 68.49 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGC:1 - chr2R 9504210 3' + roo 344 2 63.70 GCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCTTAGAACAGTTGGAAAAATAAAACAACCTTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTATGTTGTAGCTGTTGGTGAATTTAATACGTAATACACACA:1 + chr3R 18449040 3' + F-element 4525 1 68.09 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACTTTTCACTTCTTTGCACGGTGGGTATTTTCCTCATCATCTGTTTTTCGAAGAGCTTTTCCGCCG:1 + chr3R 4662032 3' - roo 56 2 56.85 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGTAGACATATATATATGTATATAGTAGCCCGATCTGCCTGTCGCTGCGCCGAAAAACTTTT:1 + chrX 12214580 3' + opus 464 2 60.80 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAATCAAAAAGTGAAAATGTGTCCGAAAACGTCGAAAACCACGCCGCTCCTGCTGATTGGCGGAATTTGC:1 - chrX 10286941 3' + roo 9052 2 71.23 AACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTTGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTACTCAAAAAAAATAAATAAATATACAAA:1 + chr3L 15147223 3' + Transpac 178 2 79.45 GTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTC:1 + chr3R 26244709 3' + copia 180 2 67.12 GTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTTTACAGTTTAAATGGGATACAACCATTCGGAGAGATGACTTGGAACAGTAGGCTTTCTATTCTTGCCATCGATTT:1 + chr3L 14732695 3' - roo 8861 2 53.42 GTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCT:1 + chr3L 23702239 3' - G4 79 1 68.49 CAAAACAATTGACAGCTACAACAACAAGCGGAAAATAAGTGCAACACACAGCAACAAAATGCCGGCATCAAGTGGATTATATCGCATCAAAAATGGCCGTGTCCTTGACAGGCTGCACAAAC:1 - chr2R 18007085 3' + Doc4-element 392 1 59.84 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACACGGAGTGTGCCATCGGAACTTGCCCAAAACAATTTAAAATTACCTCACGTATATGTGTGAAATTGCGAACGTATTGTGGGCGTGTCG:1 - chr3L 13366069 3' - hobo 32 1 61.54 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATAGATACGTGTGGGTTTTTACGTCGAAATCAATAAGTGCTTCTTTCGCACTAATCTGAGGAATCAACATCGAAACTAATT:1 - chr2L 6319716 3' - Tabor 42 2 52.74 TATGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAATTAAATTTAAAAATATGACATAGTTTTGATTATTTAAAAGGATATCATTTAAAATTACTGTATTATTTAACTATAAAGATGGTAACTGAGTTAAGTGCAAACTACTTACAATG:1 + chr3R 6411408 3' + Juan 4202 1 75.34 AAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGG:1 + chr2R 9623386 3' + I-element 5262 1 80.14 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGATAAACTGGCATTTTAAATAGGCATATTAAGCACACAAATACAGATACATTCAAAATTTCTTATTTACTCTTCTTCAGTTGGGGCACATT:1 - chr2L 8707397 3' - 412 7083 2 60.96 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCCTTGAAAATTGCATTACCAGTTATGAGGGTGTTGGAAAGCAAAAAGTAAAAAGCGAAAAAAAAGGGGGGAGCCGCCGAGGCTGCAGGATAAAGTGTCCAGCCAAAAAACCG:1 - chr2L 12832794 3' - I-element 11 1 78.08 AGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAATGTTTGCATTTATTTATTATTTATTCGATTGTATACCAAATTTGTAGAGCGCCATGATATCACTAGCGGGTAAT:1 + chr2L 8719827 3' - Doc 323 1 50.68 GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTCACCATAACGAGAATGTTGCATCAGCCCCTAATTGTGCGTTGATTGGTCAGTTTACATTTCTT:1 + chr2R 973849 3' + 1360 3332 1 57.93 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAAGAATACAATTAGAAGGAAATCTAATACAAGCAGAGCATTTTAATGGCTTACAAACTGTCAGCATAGAGTCTTCTACTCAAGTAGTAGTGCCACAGATTT:1 + chr3L 1981662 3' + opus 480 2 62.33 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGATTGATCCGCTGTGACTTTTGCTGACGCAC:1 + chr3L 17904886 3' + roo 358 2 53.42 ATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACCAAAGCTTCCGTTTCATGTCGTCTGTTGTCTTTACACTC:1 + chr2L 1468291 3' + Doc 245 1 71.74 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAATCTCATTTCAAATCACATGTTCTACATGCAAGTGCACACCTGCCCTTGAGTGACCGGTAAAATCTCCGCAAATATCGATACGTAAACA:1 - chr2L 9347437 3' - opus 27 4 63.01 ATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATAATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTTGCCGAATATTAACAGTATTTTATATAGTTGGTTTATAATATA:1 + chr3R 5115363 3' + Ivk 5303 1 70.34 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACTGTACAAGTTACTGCGAGTAAAATATGACATTTTTATAGAGTTAGATAAACGCAGGAAATATTTTCCTC:1 - chr2R 8452730 3' - blood 48 2 52.86 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATCGATAAGA:1 + chr2L 13140702 3' - blood 7047 2 51.72 ATTTAAATATTTAGTTAACTGTTTTAAATCTTCTTTGTAGTTGCTTCGAGACCTGAACTACAACGAACATCTCTGTGTTACAATTGACAATTGTCTGCATTTTGGCATGAAATGTCATATATATAGAGTTTGAGGTAGATGGCATG:1 - chr3L 10354289 3' - HeT-A 22 1 54.11 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATGCGGCTGTTCTG:1 + chr2L 13690104 3' - Doc 51 1 49.32 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATACACTCAGCGGCTTTTCATAATCCTTCAGCCTGCGACTGGCGTCTCTTTAAAATTTTACTGAAAATGCGCATTGAGAGCGTCTTGAAG:1 - chr3L 18972797 3' + mdg1 393 2 63.38 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATATACTTATATATTTTCTTCCCCGTGCTGTTTTCACTTGAGCGCAGCGAGGCATTTATCATTTTTAATCGAATGCGGAAACAATGGA:1 + chr3R 26432105 3' - Quasimodo 27 2 67.81 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTACCAAGCCTATTTACGGTTTAGCCTTTCGCTCTTTATTTATAGTTGTTGGC:1 - chr2L 7449702 3' - roo 71 2 69.18 TCAAGCTATACATAACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATGTCGGAGCACAATTATTATTTTCCATTTCGCGCAGCGAGTTTCGAACGCACCGAAGATTAAATTGCAATTAAATCACAAATCATATATGTCTA:1 + chr3L 23529713 3' + Stalker2 7467 2 76.03 TACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAACATCGAAGTGATGTGCCTGGAATTTGCCATTAATTAGTCTGCAGGTGTCGTTGGCCAAAAGAACGAAG:1 - chr3L 20176701 3' - gypsy 20 2 68.49 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAGCTTGTCTGTGGGCAAAAATATATTTCGGCTAAAAAGTAGGCAATACTACTTTTATCAGTTGATCCAAGACTTTGGGTATTTCACCATTTGTTTTTTTTTTTAATA:1 - chrX 10609077 3' - Stalker2 7263 2 66.90 GAACTGTAAAAGCTAGAAGGTTGAGATACATGCATACGTACATGCTGTAGAGACATAGACACAGAGCCAGTTTGTTTCCCATATTTCATATTATTATTAGTCTTGTGCATTTCTAATAAAAAAACTTTTTGCCACGCCCACTCTAA:1 - chr3R 4078935 3' + INE-1 158 1 80.14 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTTAACCAAAACCATACCCATTCAGTCGACAAGCAGATTTGCCTAATTCCATTTCGTTTCAGACTCGTTTCGGGCTCAATTAAAACCATTTA:1 + chr2L 1277935 3' + I-element 5326 1 64.38 ACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGTCCCTTACAGATTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTCGATGTCTTTCCATCCATTCTGTCTGCCCGGCATCGT:1 + chr2L 15418937 3' + Cr1a 4124 1 73.29 CTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAA:1 - chrX 16526302 3' + P-element 2788 1 18.49 TCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCATATCTTTTTTCCTTTGCACTGCCTTCCACCAACAAATACATAAAAATAAATCACTTGTAGGACATGTTGGCGCCTCCGGTTTAGTTTTCCCTG:1 + chr2R 12093513 3' + F-element 383 1 74.44 CTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATACTTAAAATTTAATTTGAGAACATTACCTCGCTC:1 + chr3R 20090016 3' - mdg1 7125 2 76.03 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTC:1 - chr3R 10461670 3' + roo 331 2 72.22 GCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCAACCTGGAGAAGAAGAACTTAAGCTGATAAAATTTTTTTTTCTTCGACATACTCCAGTTTGAACCCTTCGGCGTCTGTCAGTTCACATCTTGAGTGCCATAAGTCGTGT:1 + chr3L 4080279 3' + Transpac 497 1 58.90 GCACAATTAAATAAATAAATAAAAACACAAATAATTGACGTTTTATTAGAATATAACTAAACTTTTTAAATTCACTGATCTGTCACTTTCCTTTTGCACGTAAATCAAACACAGGGGACCCTTTGTTGATGGCACAAAATGCTAAG:1 + chr4 176635 3' + Juan 4213 1 52.74 GCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGTGCCATATACAAAGACAGAAAATCATTAGGTATAACACCA:1 + chr2L 261086 3' + Juan 4176 1 61.64 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATGATTTTCTCGCAGTGCAGA:1 - chr3R 24976179 3' + roo 9037 1 59.59 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAAAGTTTCGCTGCACAATGTAACTTCCAATATTCAAGACACGAGATTTTGTTTCGCTATTTTTTCGGAATTAAGAAAGTTAAGATGATC:1 + chr3R 10636225 3' - blood 34 2 61.64 GGGGCGCAGTCGGTAGGATGATACTAATTGATGCGATATTAAACATATTCAATTCTCTGTGTATCATCCGCTAAAGAACTACAACTACAACTACAACTTCCATATCTCGCGTCGGTAAATCGGTACAATCACTTCACAAT:1 + chr2R 4122886 3' + rover 366 1 79.29 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATCGATAAGAAAACGAGGGGACA:1 + chr2L 13140715 3' - blood 7064 2 52.74 ATGCTTAGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTTGAGAATGATGTTGAGAATCCCGACTTGATTATTTGTATTATTGCATTATTCGTTGTTGGGCGCTGGGCAGCAGTAATGTGAAACATGCACGGTGCATGAGGCACCTGGA:1 - chr3R 26492694 3' + Cr1a 4028 1 54.79 GAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGTAGTCCAGTTTGTGTTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGGGTGCAAGGCAAATATTTACACTCAATGGAACATAATAAAGACATTAGGGAAATATTGTGTTATGTGGGGG:1 - chr2R 9934112 3' - Rt1b 4942 1 67.81 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGGACCGTTTTGTTTTGCTCGTTTCACCGCCATTTTACAACTTTAGCTAATTTTAAGAATTTTAGAAATC:1 + chr3R 5316662 3' + Juan 4184 1 61.64 GAAGCAGACACAGCTCATTCACTCCCCGCTTCGTGAATCCTGTTGGTGTCCTCAGCACAGCAACTGGAGCGACTCCATCTCTTCCAGGCAGCAGCTCAAATACTCTCGCTAACGGCCACGTCAGGGCCACTAGTTTTCA:1 - chr3R 2689338 3' - diver2 4466 1 46.76 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCCTATACGTATGTATGAGTGTGTATGTGTTTTTGTGCCTGTGTGCGCGTTTGGGCCTTTTGTGCACAATCTTAC:1 - chr3R 16530544 3' - hopper 44 1 55.17 GTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAACGAGAGAGCTCGGTCCACTTTACTTATGCAAAGAAGTAGACAAACGAAAATCAAACTTCATCTTCAACAG:1 + chr4 1098603 3' + 1360 485 1 76.84 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAGATTGTGGAACGGCAAAAGGAACTGGCAA:1 + chr2L 11867416 3' - jockey 35 1 62.33 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTTGGCATTTTGTCTTAGCAGCAACAGAAAAAATGGAATTTATGATAGGGTCTTTGG:1 - chr3R 28782565 3' + blood 7322 1 63.70 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACGTCATCTTCATCATTAAATTCGAATTTTGAATTACTTTTT:1 + chr2R 9868970 3' - roo 80 2 72.60 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTC:1 - chr2L 13717323 3' + P-element 2808 1 19.69 GATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGC:1 - chr3L 14944553 3' - G5 4806 1 56.16 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATATTATTATATATAATATTGTACATACTATTAAATAAACGTTTGCTTTTTATATGGCCTTGGTCACATCACTTTTGTCAGTCTGGTCACACTGCCTGCTCT:1 + chrX 9437324 3' + roo 389 2 72.60 GATCATCGTCACCATTATGAAGATTGTTCGTAAGGACAAGATGGCCAATCGAAACGATATTGTTATTGGTTTATTATTTTTGGTTTATTATTTTATTATTATTATTGGTTTATTGGAAATATTAAATCAGGATTTCGATATTGTCA:1 - chr2R 5620774 3' + Rt1a 4721 1 63.01 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATAGTAATTATATTTCCCTATTATGGTTAAATTTGTATATTTTCTCCGAGTGAAGCCGAGATTAGTATGTTTTCACCATAAA:1 - chrX 9959756 3' - I-element 38 1 56.25 TCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGGGAAACATTTATACGCCCGCCATTACAGTGATAAACTGTGGGG:1 - chr2L 15906021 3' - Tabor 73 2 68.35 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATTCATAAAATGTGTTCAAGTTGGTTACCAGTTTTTTATGGTATGGTTTTGTCCAAAGGTGGAACTTGTACAATTCTATGAATTATATTT:1 + chr3L 21931720 3' - Tabor 6868 2 59.15 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTAAATGATTTTCTTTTAATTCCTCGCCTCTAAAGTCAAGTTCCACTGTATAGTCTTGGACTTTGTCCCTG:1 - chr3R 30782494 3' + pogo 2069 1 58.91 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTATCCTAGATACTAATGATACTAACATCAAAGATTCAAATTAGCCATTTTTGGACTTACACGATCAGGACGAATGTCTACACCT:1 - chr2R 5268936 3' - pogo 35 1 60.27 ATAAAATAAAAAAAAAATAAAATAAATTTAAGATTTAATTTGCCCCAAATCGGATTGCGGCCCAGGGTAGCCTATTCATGCCCCGCTCAACAACCGAACAACAAATATTTGTCATTTTGCCCGGTAATGTGCCACCAAA:1 + chr3L 14142776 3' + HMS-Beagle2 483 9 64.75 GCCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGTGTTCTAGTATTTTTGTGCTATGTGTTAATCGGCGACTATCGACAGTTGCCCACCATTAGGAAACAGAAAGCTAAAAAA:1 - chrX 4540582 3' + 1360 3350 1 58.90 TGAGTAACGGGTATCTGATAGCCGGGGAACTAGACTATGGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTATAAATGATGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCACTCTACTCTCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTTT:1 - chr3R 18346607 3' + INE-1 548 1 44.96 AACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACA:1 + chr2R 16496640 3' + hopper2 1519 1 76.71 AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATTTTATAAGTGCCTTTCTCAACGGTTAGCTTTTCTCGGGAACATGAGTTTCAGTGATGCCCAAATTGGAGCTTGACTTTTTAGCAGCCGCGTTTCCTT:1 + chr2L 16509037 3' + invader4 3064 2 71.92 ATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTG:2 + chr3L 10563990 3' + hopper2 1544 1 58.22 ATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTATTCTCATTTATTGTCTTCTCCAAAAGGTCAACCGTTAAACCCAACTATTATGGGTGGATGCT:1 + chr3L 26019436 3' + gypsy 427 2 43.84 GCACTATACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGCACACAGCCATGATTTAATAGGTAAATCAGGT:1 - chr3R 30302290 3' - Doc 92 1 73.79 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTGGCACAACAATTTGGACATATATCCGTAACTAATAACAACACAGAGATAAAAGGGATTATCAGTTTATCCAGAAACACAT:1 + chr2L 11613330 3' - hobo 39 1 57.34 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGGGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGA:1 + chr3L 27391397 3' + 1360 3340 1 54.79 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAAACACGGACTACAACAATACATTTTTGGGTTCCCTTCTCT:2 + chrX 16526355 3' - P-element 68 1 39.04 CAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTATTTAGCATGCAAATTATTACCACTTTTTCTTTTGTTTTTTTCCGGACACTATATAT:1 + chr2R 9339747 3' + Transpac 249 2 58.90 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACAACAACAGCTGTGCGAGTGAGCGGG:1 + chr2L 14490170 3' - P-element 82 1 21.64 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATACTTAAAATTTAATTTGAGAACATTACCTCGCTCACTATCCATCCATATATGATTGATAATGTGTATTCA:1 + chr3R 20090052 3' - mdg1 7088 2 53.10 TTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTTTTCTTGGAACAGTCTTTGTGTGTAAGCTTATTTGCGGTGATGTTGATGACGAAGATGACATACATTGCAATACGTTTTATTTGATCTAGGTTTTAAATTTGTCTATATT:2 + chr2R 2074900 3' + Cr1a 3992 1 56.85 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGATATAGATATGGAATATAGCCGGGCCGCCTTGTCTAGAGAGCTCAACAAACTCTGGAGCGT:1 + chr3R 28579593 3' - pogo 19 1 63.64 GACTAGCCTTAAGGGCAGTCAACAACGGAGAGACGTTCTCCCACCGTATCTTCCAATTTAGGAAAAGAGGTCTGAAAGCCGAGAACTCTAGCCAACTTCAGTGACACACGTACACACGATTAAAGGCGAAAGATGGCGAATGGAGC:1 - chr3L 10045417 3' + springer 231 4 51.37 AAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGCTAAGACCAAAGACGCTCCTGCC:1 + chr2R 6487173 3' + 1360 3318 1 80.87 GGTGGTGTTTCGCACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCGACCTTATTTTGGATAGCCTGGATCCTTTTGATTTGGCTGTGCCAAGGTCCATGAGTATTTTACAATTCACCGCATATGTCAAATGCAGGACACGCAAAGC:1 + chrX 16988264 3' - X-element 4334 1 62.33 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGAACGAAATCGGAGGTCGAGTGACTGGCAACGCG:1 - chr2L 18944804 3' + P-element 2836 1 48.57 AACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTCTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCTCTCTACCAATAGATAGAGCTCTACCACCATAGAAAATTCAATATTCTAACAACCCTTTCACTTTACAATGGGGGAATCA:1 - chr2R 14638272 3' + R1A1-element 215 1 62.33 ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTATAAGCTAAGTATTTAAGAACAAACAATGACAAAAGTTGATTAAAATGTTCGAATCCAAAAAGTAAATGCTTTTACTTAA:1 - chr3R 12727112 3' - I-element 42 1 50.68 ACATGACAGACATATTAATATTGTCCTCATATTAAAAAATGTGCTGGATGTCAACGCCTGTTATTTCGGAAAATTCCTTATAGTTATTAAATGCACGACGCGCCGTATTGCCATTGATCGTTGATCAATTTTAAGCGATAGTTTTT:1 + chr2L 20169291 3' + hopper2 478 1 76.03 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGTCGAATGTCGAAATTGAAATCAATATGTTTCTTTTCGTTATTTTTAAGAAATTTCCCCCTTTTAGCTCGACTACACTTTGAAAATTCTTGAATAAAATT:1 - chr2L 11734480 3' - Doc 35 1 60.27 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCCCCG:2 - chr3R 10461652 3' + roo 9011 2 60.27 GGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTGTTACAATATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGCTAACTAATTGCTGGCTTGTTATTGAAGAGGTCGTACGGGAGAATTGACACTGTCCCTTTAAACGTCACGGAAATTGGCT:2 + chr2L 21416307 3' - I-element 5279 1 60.96 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACTGTACAAGTTACTGCGAGTAAAATATGACATTTTTATAGAGTTAGATAA:1 - chr2R 8452750 3' - blood 71 2 67.83 AACGTCGAAATCTCAGGAACTTTAACGCACATTTATTTGGCCCAATTCCTAGGAGTTCCTTCTAAATGTGTTCACGCCAAGATCTCACTTTCCAAATAAGTAATACATACATGGCCCGTTTGCCTGCTGC:1 + chr3L 21363728 3' + INE-1 142 1 76.92 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAATAAAATATGCGTTTCC:1 + chrX 17027978 3' + roo 9039 1 64.44 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGGCGGGAGGCGAGCTCCAACTTCGGGGTCGGGTTTGTTGT:1 + chrX 10806949 3' - P-element 61 1 30.23 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGCAAACCA:1 + chr3L 9519637 3' + roo 359 2 58.54 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGTCATTACTTTTAATACTTTCTTTAATACTTTATTTTATATATAGTAATATTTACCA:1 - chr2L 18953028 3' + roo 9007 2 65.75 AAAATTGCTGCCAGGTTATAAATCCTGAGCAGCCAAAAATTACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTATGACGATCGCAGATATCCATTGCCATGGCCATATGGCAATTTGTTGCCATCTTATATTCACATCCAATTGC:1 - chrX 16134574 3' + Cr1a 466 1 50.00 TTTATCAATAGTTCGTTAGTTTTTAATAAAAGCCCAAACGTTTTCAATGATATTAAGGTCTGGGCTGGTATTGTTGCTAGGTTTAAATGTTAAAAGTTTTGAGAGACGTCAGAGCATACCTAATATTTTTTACAAAAACTTCATAT:1 + chr3R 9836622 3' - Bari1 1233 1 45.21 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCAGTGCAACAACTTGTTACTCATGTCCTGCTCACGAAATTCGCTCTGTTC:1 - chr3R 25137868 3' + P-element 2835 1 42.06 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACGGGTAGCTGTGGAAGAAAGAGACGGGGGGCCACATGTACAGGGAGAAGCAGAAGCAGAAACCCACTAAAGTGTCATGCACGTTTGATGGCCAACTAATAACCGAG:1 - chr3R 4994865 3' + roo 394 1 75.69 GTTTATACAAATAAATGTATACTTTATTAAATACTATTAAACTTTTTTTGTTGAGTGTAATAGTTTAGCCGCTCGACCAAAGCTTTTGGTTTATAAGTATTTACTTGGATATTAACTATTCGCGGTAGCTTGGTTCTTAAAGCTAT:1 - chr3R 4942026 3' + Tc3 1501 1 73.97 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTTTCTAGCTTATTAAGCTTTTTATATCCGTTTTAAGAGCTGTTTAATGTCTTATCACTCTATTCCACA:1 - chr3R 22545785 3' - roo 8717 2 55.86 GAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAAT:1 - chr3R 5024826 3' - diver 5962 2 69.86 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTATAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGACAACTAAAGAATTACATTTTATACTATACTATATACACAGAGC:1 - chr3R 5453650 3' - I-element 74 1 70.00 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACCGGGCGCACCAAACGCATAAAACCCGAACAGAACGGAACCCGAGCATCTGCA:1 + chrX 2518111 3' - P-element 47 1 41.13 ATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTACTACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGAGGAAAGAAATATAAAATTAGTAATTTGTGATAAGAACAGAAATATTCTTATTTACCTTTCAAATTGGGAGTGTATTACCT:1 - chr3L 23150180 3' + hopper 1324 1 55.48 GATAACTTACATAGGGATTTATTCATACTTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCATCCAATTAAGGGGTTTATATTTTCGTGCCTCAGCCCATGGGCCATTACGAGTAGATCCATTGCCTTGGTGCGCAATTCCGCAGATCCGTTTATA:1 + chr3R 4497156 3' + Fw2 3665 1 69.18 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTG:1 + chr3L 20399080 3' + roo 9011 2 60.00 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGTGTTAAGAGCAGTCCAATATCAATTTTCAAGTATTATTTTTCTGAATGTTCCTGATTTTTGGGATTGGGCTGCATTTTTAGTTG:1 - chr3R 14493985 3' - roo 8700 2 57.53 TAACATGTAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGCCTCAACACGAGTAAAACAAAACGTAATTACAACAAGGACTTTTCAACAGCAGCATTT:2 + chr2L 9861382 3' - BS 5023 1 58.90 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCTGACTCTGATCTTCTGTACGCTGCCCAGACTCGATATGGC:1 + chr3R 13295913 3' - roo 8704 2 64.15 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCAAGCATATCCCCAAAGTAAAGGAAACCAGAAAACAGGGGCAGCAAATGCATAAGACTCTGATTAA:1 + chrX 20465933 3' - jockey 4763 1 80.14 AGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCGGCAAATTAGTATCAGTGCATTAGGCCTTGGCAACCAATATATATTTCTAGGAAACTATTTATTACACAAAATTCTGAT:1 - chr3R 5115267 3' - Ivk 43 1 55.86 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATTGGCCACTTGTTTCTAAGCGACGGCAGAGCAACCTGCTGTCATGAATGAA:1 + chr3R 16228910 3' + P-element 2816 1 36.55 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCGTCGGCACAGGTATTCCACAAGATTCTGTTATTCGCTT:1 - chr2R 18440423 3' - P-element 82 1 30.14 TTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTTTGTCAAATTAAGGCCTTGTTGCTCTGGGCCTCAAGCTGTTCATCAGGAAGGCCCATACTCGGTCATTATAACGCCCCG:1 - chr2R 9410432 3' + hopper 1377 1 60.27 CAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGC:1 - chr3L 3757160 3' - copia 77 2 75.71 GTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATAACACGAACGAATGCGAACAAATTGATATGCAAATGTGAGTAGCAGACCCAGACCCAAAAAACGTAATAATAAAATA:1 + chr3R 25409905 3' - jockey 4570 1 51.37 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTGACTGTATGTATGCCTGTGTGAGTGAGTGACAG:1 + chr2L 19158926 3' - P-element 39 1 56.15 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCTTTGAATTGGAAACTCATTTACAAAAATTAATTA:1 - chr3L 18658228 3' - roo 86 2 80.14 GCCCATCCCTCCTACAAGCCAAACTAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCATTTAACATACAAAAACTCATGCTCTCTTGGCACATCTTTCCTCCCAGACGCGGCCGGACAATGTGCAAG:1 + chr2L 16903121 3' + I-element 5059 1 66.44 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGCATATGTATGTACCAGGAATAGCATAGGATACATAGAAACTCAAGTGTGTAATATCAAAACATCAATTAATCGCTGT:1 - chr3R 5430373 3' - Burdock 6178 2 55.48 AAACAATATAATAATAACAATATATATAATTATAATAAAAGTTCTCATCTTTTGCTTGTTTCTGCTGCAACACATTAAAGTACAATTGTAAAAGTTCTTCCGCTGATTTGTTTGTTCCGGCTTTTTAGTCTTAG:1 - chrX 5478206 3' + hopper 1113 1 73.13 ATGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAACTATTCCGCATTCTAAATTGCAATATTCGATGCACGCATAATTGGAGCTATTGATTAAATCGGCCAGAGGGCGTGCG:1 - chr2L 14888905 3' - hopper 28 1 62.22 ATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAAAAGGGATATTCGTT:1 - chr2L 22113015 3' + 1360 3274 1 60.29 GCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCATAATATATTGACTTGCCGCTACCCGACACCACCGCGGCATATATTAAAAAATAGTTAACGCGTA:1 - chr3R 12725530 3' + 297 158 2 58.22 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTTTTTTAAAGCTTTCCAGCTGCCCTTCTAATCCTCGCGTCCTCTCGCTCTCGCACATAT:1 + chrX 7967327 3' + P-element 2859 1 65.75 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGTATGAAGTGTTCCGATAAAAAACAAGCGAATGATGAAAGGGGCAGCCCG:2 - chr3R 21587520 3' - roo 8735 2 67.12 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGCTTACACAAGATTTTGCTTCTTGAAATTCTACCTTAACGTGGGCTAACAAAATCGTTTAGCGGCTAAAATTGCAATTTGCTATGGCG:1 + chr2L 3648845 3' - roo 8681 2 67.69 GCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTG:1 - chr3L 10563907 3' - hopper 76 1 69.86 AATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAACATCCCAGTTTTGATTTGATAAAGCTAAAGAAAAGCAAAGAACAGCAAGTGATAAGGAGAAGGCTCACAGGAAA:1 - chr2L 10519525 3' + X-element 4667 1 54.79 ATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACATAATTAATTGTGCTGCTGTGTTGGCAAACACGCGGGCGC:1 - chr2R 18983762 3' + hopper 1344 1 70.71 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAAT:1 + chr2R 22464483 3' - pogo 41 1 55.56 GGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACTCTTTTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTGTTTGGCTTTGGCTGCCCAAGGATGTGCGCATAAATCAAGGATTTGGTTGCGG:1 - chr3R 30079314 3' + Circe 7199 1 59.29 AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAATGGGTCCCGGGTAATCTTACGTTGGAAGTAGGAAAAATAAATATTCCAAGGAGCTAGTCTGCCAAGACAACCTGCCTTGACTTCCGTAG:1 - chr2R 2552064 3' - HMS-Beagle2 6912 2 65.75 GTTTTTGGTTGTCTTTTCTTCTCTTCCTCTTCCCTTTCCTTCATCCCCTTCTTTTTGATGATGCAACAAGGAGGCAAGATGACAAACATGGCCAGAAATCTCCAGGTGATACGGAATGACTGTGGTCAAGTACTTGTGCTCGGGAC:1 - chrX 2091802 3' - mdg3 5102 1 67.12 ATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCCACCAGTTTTAAAGCACGATCCATTTTGCCAAGTGCACTTACTCCCTATTCATTCAAAAAA:1 + chr3R 30558301 3' - I-element 4881 1 56.43 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTTGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGGC:1 - chr3R 22868785 3' - mdg1 7055 2 60.87 TATGTACATATTACATACATATTATGTATATATATTATATTACTAAATATTATGTATTCGTAAAGAAAAAGAATTCCATCTTTTTGAGGAAAAAACGATTTCCATATTCTTTAGGAACTCTTTAGGAACTGTATTAAATTATTTTT:1 - chr3L 15416830 3' - Dm88 4369 2 57.53 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCGGACTTTACATATTAGAAAATATGTCTTTTCCCATCTATTCAAAT:2 + chr3L 4933804 3' - blood 77 2 71.23 GTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGATGGCTGCCGGAATTGAATTGACGCTCATGATTATTTACGC:1 - chrX 19982368 3' + hopper 1342 1 68.61 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTTCCTGAATTTACTGAAAGGTTTTTTATTATG:1 + chr3L 19574166 3' + 297 350 2 56.16 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTGTATTTTAATATTTTGTTGATTTTTAAATGAAATTTTCGTTATTGTTAT:1 - chrX 9437135 3' - roo 14 2 74.66 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTATGTGCATGCCACCTCTCGCTCGCACTCGCTGCCCTCTCTCTCACTCTCTCCGCTGGTTGCTAGTGTGTGTGTGTGTGTGATATGCTTTATGATTTGCAGCCG:1 - chr2L 12678466 3' + P-element 2883 2 78.63 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCGTTTCTATGTTCCTTCGTGGAATTTCACAATAATCTTTTCCATCAATTGCTGATTAGTTCGCATCGAGAGCA:1 - chrX 4823517 3' - pogo 46 1 54.11 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAGCAAAGTTCATCGCTCCAAATGTTTATGGCCATATAGGCTTATGCGCATTTTATGCGCGAAATCAAGAAAAATGAAAATGCATTTCCCAGAACCCAATCCC:1 + chr2R 20739139 3' - hobo 13 1 73.72 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTG:1 + chr2R 24021655 3' + pogo 2038 1 64.38 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATATATAATTTATATTCGACCATTTGTGAAACTAAAGGCTAACATGATTTC:1 - chr3R 21753442 3' - 297 6613 2 63.79 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGCTT:1 + chr3L 13362714 3' - jockey 97 1 78.32 AAATATGTAAGTCATATCATTAATGAAACATGGGTGGTCTAGGAAACCGCCCAATTGGGAATCGGCCGGGGA:1 + chr2L 19300556 3' + R2-element 3253 1 84.72 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTA:1 - chr3R 24976211 3' + roo 342 2 62.76 AGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGCTGCACTCTGCAGTGGTGTGGTTATATTCGTACTTATGAGT:1 + chr3R 17059344 3' - hopper 78 1 69.86 CTTGTCCCACGGCCACACCTCCCATCCAACCAACCGAGGGGCGCTGCCTTGTATCGTACGGCTCGCTTCGCGAGAAAATCCGAAAATAAATCAACGTAAAATAATTTGTATTGTAAGCCAAATGTTTCAAA:1 + chr4 381966 3' - Cr1a 4437 1 54.96 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTAATATGTTCTATATTTATAGCTGTGAATGATAGTTTCTCACGGTATTTGAGTAGTCCAGTTCTTAAAGCTGATTCACT:1 + chr3R 22771985 3' + opus 7456 2 54.11 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCAACTCGGCGATTACTGCACTTGAAAACTGTATTGGTTACTTAATGACATTTTGCGATTTATGCAGTACTCCGTTAAATGG:1 + chr3R 22868880 3' + mdg1 381 2 56.16 TAACAAAGGTCCTCAACAACGATCGGTATATGGTGGAAGATCTGCCAGACCACACTGTTACTCAGCGACGAGACGCCTGCCCCCTGGACCGCCTGTTTCCACTCCGAGGATGTCGTGAAGCTTGCGGGATCCTGGCG:1 + chrX 17869497 3' + Bica 4751 1 51.09 GTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTAAAAGCCTCACTACAGAATAAGAAGGCCAAAACCAGATCTTATAAATT:1 + chr2L 15322994 3' - diver 245 1 71.92 AATAAACTGAGAAAAAAAATTAAAAATTGTTCCAAAGTGTGGACGTGACCGGTTCGGCGGCAATGCGTCTAATATACCCCTTTACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACAGGATGAAAAAAGCCAAACTTAATAACAACAAAA:1 + chr3R 24506362 3' - INE-1 474 1 72.73 ACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGTCACTCTTAACGCTCAAGTCTTTGGTCTCCGGCAATTGTTTTTCCACTCAATTTCAATTGTTGT:1 - chr2L 20324100 3' + Tirant 8456 2 52.78 TGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTTTTTTTGGTTTGGGTTTTATGTCTGCGGTGTGGGCCACTTGAAGTCGCCAGCATTGTTTTCAGCTCAGCGCCCGCT:1 - chrX 17472097 3' + Quasimodo 7335 2 62.14 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGTCAAAGTTCTTTGGTATCGAATGCTAAATCAACAGTGAAATAAGCCAGCACGGAGTTCCAGCCCCTATAGTCCATATAGTC:1 - chr2R 11379411 3' + hopper 1385 1 64.49 AACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTTTTAAATGTGTAGAGTGCTTTGAATATCTGTGTGGC:1 + chr2L 18300824 3' - Ivk 5336 1 75.34 TTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTC:1 - chrX 9437194 3' - roo 116 2 36.99 TCGTAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTGACGAATTCGGACCGAAAGTTTTATAAAAAAAAGAACACA:1 - chr2R 4447999 3' + invader1 326 2 70.55 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGCGTAATTTAATTCACGTGAAAACTGCACAAAACTATGACACGA:1 + chrX 22711714 3' - transib2 39 1 58.90 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAAATGTCGTTGGGCAAATATTTGGCCGAAGGACCTGGCGTGGGCTTCATTAATGTGTGCGTCTGACAGGAGCCGGCAGGACGATGGCCGTGT:1 + chr2L 11079530 3' + 1360 3383 2 79.53 CTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTTTAGTAGTGATTGCTAAAGTTTTTATAGATGAAGATTAATACCGCAGACTTGATTGAAATTTTATAGGAAGGTAACCTAA:1 - chr2L 11442880 3' - G-element 4152 1 51.13 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGATCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACTAGTTATAAG:1 - chrX 12003902 3' + P-element 2863 1 59.50 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCAAGGAACCGAAAGGCAAGCTGGATTTTCCAGGATATACATAATCATAATTGCGATACC:1 - chr2L 11867256 3' + jockey 4954 1 58.22 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATTAGGGTAT:1 - chr2L 5447879 3' + roo 9014 2 62.94 TTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTAT:1 + chrX 1018162 3' - 1360 233 1 69.18 CCATCCGGAAAAACGAAGTGCACCCAATCTACAAGCTACAGTTTCTTCTGCATCGTAGAATTACCGTAGAAGAACCACAGAAGCGCTTTCATTTGGCCAATTTATTTAGTAATGCTGCAAAAATTAGACAACTGAATTAATTTTCA:1 + chr3R 29535835 3' + Fw3 356 1 58.22 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGACGTCACTAAATTGCGGT:2 - chr2R 7889366 3' - jockey 68 1 56.85 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCCCTGTGCATATACATATGTACTCGTATGTATGGCATGTAAAAACAATCAGGACAAGATCTTCAGGCCCGCTTGGGTCAGTTGGTTCCCTCA:1 + chr2L 15906133 3' + Tabor 454 2 63.70 AAAAATAGATTTTGCTTGTAAGATAAGCACACCATCTGCGCAAATTAAATAAATAAATTATGAACAAGGTGTATACGTTTTACGCACAATGCAGGATTTATTTCAACAAAAATATTCACTTTCT:1 - chr3L 16271869 3' - jockey 117 1 50.81 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTAATTAAATGGAATTCATAGCAGGGTATTAAACGGCTGTGGCAGCTCAAGTGCAA:1 + chrX 20607086 3' + I-element 5309 1 54.69 GATGAAGCCGACCACGAAGATAAAATTGCCAAACAGCTTTTAGCAATTATTAATTATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATA:1 + chr2L 15322921 3' - diver 318 1 70.55 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAAAGAA:1 - chrX 23282938 3' - HMS-Beagle 50 2 53.42 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATAAACGGAGTGCTACTGAATTTTATGTCATTTAT:1 + chr2L 8707539 3' + 412 442 2 52.74 GTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCAAACTGTGTCACACTGCTGCCTGCTAACGGTTACTTTATCGAGGCGAGGGTACTTCACAGAGTATACTTATC:1 - chr3L 20388112 3' + 1360 3348 1 53.28 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTATATACTCACTATAACAATCAACGTTAACAATCCACA:1 + chr3R 2503530 3' + roo 8989 2 75.34 CAGCTGACTTTAACAGCTGTTATTATAATGATGCGCTGTTAAATTAACTTTTTCGGGCTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTAAAAGGGAAACATTTGGTAGAATATAGTTATGAGAAGGATTATATAACTATCTGGTTCTGTAAC:1 + chrX 12069532 3' + hopper 1265 1 56.16 AATCCTATGATTTACAGTTTTAGTGGGCAATTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATGCCAAACAATGACGAAACAATGATGAAGACGTAAGGTACGATGCAAACTAGTGTTGACCGGGACGAGATACGCTAAAACGGAAATTC:1 - chr3R 7640100 3' - HB 1573 1 46.58 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTGTTTTCCGAATTGGTAAAAAATGCTCACTCTTAAATTATT:1 - chr3L 13827399 3' - roo 8736 2 71.74 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGGGCGGTAGGAATGAAGGGAAAGCTGGGAGGAGTCGGTTGTAGGAGGGTTGAATCAACAGACG:1 + chrX 5206547 3' - Tirant 8117 2 68.82 GGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATATTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCAG:1 - chr2R 1320654 3' + diver2 337 2 55.80 TGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGTTTTCACTTTGCTTTTTGCCTTCCTTTATTCGGCTTCCCGATTTTC:1 - chr3L 14708925 3' + opus 442 2 68.42 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTCATATGTGAAAACACATGGACAGTTGTTAAGTGCTTAAAATATGCATGCTTTAATTGCCAGCCATCTG:1 + chr3L 16875942 3' - Burdock 43 2 56.16 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTTGCCCATTTATCTTTTCCAGCCCATCGTGCGCGGTTGCGCTTTTTCGTTCACTACTTTCCAGCTGAATTTACGACCATTCCGCTGGTTGT:1 - chr2R 14940635 3' + blood 347 2 64.38 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATAT:1 - chr3L 13228499 3' + P-element 2815 1 22.50 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAAGGTCGCTCTGTCGATGTTCTGGAATTGGGGAACAAGGGTATCGTCTGCACCGAAATGGGCA:1 - chr2L 8396837 3' + roo 352 2 56.34 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCTTCGGACCATTTACTTTTTATTTCCAGATGTGTCG:1 + chr3R 26244744 3' + copia 215 2 54.79 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCTTTAGTAAAATAATTTTTATAGAGTACCAGAAATAAAGTTTAGAAACCTACAACTTTTTTCTATTGCCTCAGAAAGAACTTTTTAGTAAAAT:1 + chr3L 15277727 3' - I-element 11 1 72.22 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAATTATTCAAAAAATGCGATTGTTATTTGCAAAATGTGCAGTGAATTGAGACGCTCGCAGACAAGCGACGACGACTGCTGCCGCTGC:1 + chr3L 17108664 3' - hobo 33 1 63.70 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGC:1 - chrX 2518057 3' + P-element 2812 1 22.58 CTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGTAACATTTTCTAAGTTCTATTCAGTCATTAGCAGATTTTGAAGCCGTTAGCATCGTAAACTAAAATATTATGATGAAAAATTCTATTATTATTTGTATTATT:1 + chr2L 7939884 3' + Burdock 6375 2 70.55 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGAAGTACCTTAAGAAAAGTAGGCACAAGTAAATATCACTTTCAATAAAAACCAATTTGTACCATGTTCCATTGACCCCTTTTGAGAGATTTCAAAGACCAAG:1 - chr3L 20083726 3' + opus 7492 2 76.55 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCTCCTGTTAACGAACTCTCGATGGTGTTTGAGGGATTATTAGGTTTCCGAACACAAACAAAAGAATTGAGTGAATGAAGCGGAGGGTGGGTACACTAAAGACCTAATA:1 - chr3R 22840330 3' - Transpac 4926 2 76.06 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAGTAAATCAACGCAAGTGGAATAAAATATTTTAAATAAATGATAATATTTCATGAAGGCAATGGCCAGACTGGCATTCACA:1 + chr3R 23539528 3' - hobo 26 1 64.93 GCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTCAGGATACATGCCATTCAGTT:1 + chrX 1018184 3' - 1360 203 1 75.56 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACCCAATTCTTTCGAGGCTGTTCCGACTTTTGTACTTCCTGGTTGATCAAAGCATTTTCCTCTCTCCTCTGTGGTTACCTTTAATTTTAATG:1 + chr3R 5430527 3' + Burdock 227 2 66.44 ATGTTTTGCATATGTATTGAATCTTCTTTTTTTTTACTTATTGGGAGGATCATGTAAGAGAGAACGTGCTCTATTATTGTTCTCTTGGTACTCTGTCATCGTTGCCTCTTACATGCATGTTAGAGAGTAATCGACTTGCAGACA:1 - chr2R 323828 3' - Doc3-element 4711 1 72.92 CGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATAATTTATTTATTTTGAAGTTATTGATTTTGGCCACAAAAAGGTTTCCATAGTGCAACGTAAAAGTCAAGCCGATGACCAGCCTGACAAAATATGTACATATGTACATCTCC:1 - chrX 22575918 3' - INE-1 93 1 63.01 CACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATGATAAATTTAAAATAAACATTAAACATAAACAATAACATTTTTTATTTCCTACAGCTAATAATT:1 - chr3R 19721046 3' + opus 7261 2 50.00 AAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTATGATCGCGCTAGATGTCCAACCCTTTTCTATTGTTGAAGATATGGGATTCTGCGATTTGATTCGAAAGCTAGACCCGAGTAA:1 + chr2R 6492946 3' + copia 252 1 59.59 AGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTTTGCACTTGATTATAAAATATATTAGAATTTATCGTATTTGTG:1 + chr2R 21425188 3' - HMS-Beagle2 32 2 62.33 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGGGCATCTTCGGCAATTTGGCCTTCGTGCCCGCATCGCA:1 + chrX 21281238 3' - P-element 35 1 45.00 CCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATTTTACTAAAGATATGATTAAAAAATGCTGAACATATTTGCATTATACATATATCATTACAAATAAATAG:1 - chr3L 15277597 3' + I-element 5299 1 54.11 GCAAACGAAAAAAAAAACCTTTCTCAATAATATATTTTTTATATGTAGGACCGCCTAGAAACCATGATTTAGCAGAAAAGATAGCCCACTTAATTGGGGTTCGGGTAATTTTTTATTTCATTTTTTTACCTCCGAGTTTAGATTCA:1 + chr3R 25185990 3' - FB 884 1 69.86 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGCTGCACTCTGCAGTGGTGTGGTTATATTCGTACTTATGAGTGAG:1 + chr3R 17059347 3' - hopper 74 1 66.44 AGGGAGAGTGAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGAAACGAAAAAAACACAAATTACGTTAATCAAGTTAAATTTGCTTAAATTAGGCTGAAAATGTACACCATCCGAGGCGGGGTGGAAACTGACTCCTTTGTCCTTCGTTATCCT:1 - chr3R 10744286 3' - Cr1a 206 1 78.08 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTATCATAAAAATCTGGGAAACAAATCATATCGAAACCATGAAATGTAGAATTCTTCTTTGTCGTTATAATTTCTAATAGCCA:1 + chr3R 14494134 3' + roo 9034 1 60.27 TCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGGTTTATATGCTGAACAGGCACAGGCGGATGGCCAA:1 + chr3L 20977876 3' + mdg1 335 2 74.66 CCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGATTAGTGGATTTCAATAAAGCAAGAAAATTTATGTAAACATATG:1 + chrX 12307436 3' - Circe 189 2 70.55 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGACTAAGGATGTCGAATACTGAGGCACGTCATTAACACCAATTATTTGCATACCAC:1 + chr3R 4533018 3' - 1360 14 1 76.71 CTACTCCGGGACAACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCGACCCACCAAGCTGACCAAAGTGCCTAGAAAGAAGGCGCTCAAGGAGAAGGTGAAAAGCATGGGGTATAAGAATAATAGGTTGAGATGGGCCAACACAAATGTAAATGC:1 + chr3L 19027935 3' + G-element 307 1 66.44 GTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCAAGTTATTAGTGCAATAATTAGGAATGATTTCTATATGGATGACCTAATGACTGGAGCTGATTCGGTAGAAGAAGCTAATAAATTAATAACA:1 + chr3R 19445649 3' - roo 452 1 71.92 CCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTTTTTCGCGTATAAGTGGAATCAAATGTTTCAAACATTTGTAAAAAATGTGGGCATGACATTCTATGACGTTACTATACTCGTACTCAGATACTTATTTTAATTATTTTAATC:1 + chr2L 21770139 3' + INE-1 252 1 76.71 CCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATTACGTTGAGAAATAAATATTTCATAAAAATAATACGAAGTAGAAAATAAAAATTTGTAAAATAAATA:1 + chr3R 20181686 3' - 1360 411 1 54.11 ATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 51 1 72.60 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCCCCGTCTTGGCACTGGACTCCATCGCATGT:1 - chr3R 10461626 3' + roo 401 1 73.95 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTG:1 - chr2R 9504228 3' + roo 8990 2 76.03 TACTGAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGTT:1 - chrX 19113506 3' + 412 413 2 76.92 AGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATAGAGACGCAGCTTAAGTACGAAACAATAGAGAATGTTATAGTCGAGATCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTATGCATTCGAACTCGATATTTCATCATTTTTCTGGGATA:1 + chr4 897558 3' + INE-1 168 1 75.00 AATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAACTAATCGTTCAATTAAGTTGCCCGCGGGGAGGCGAGGGGGCGTGGCACCTAGAACATGTCCGA:1 + chrX 6376723 3' + hobo 2625 1 56.55 TGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGTATATTTTCATTGCACGTTTACTTCATAGTAAGATAATATTAAATGTTTTC:1 + chr3L 13156795 3' - transib2 46 1 60.98 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGCTTTATTTAATCTTAAGCTTCCTCGTTTAGTAACTAAATATTTTATACTTATGTATATATGTGTAAGAGTGAGTTTTCCCTTTTCTTTCAGTGCACTGTTGCGG:1 - chr3R 12609948 3' + roo 392 2 71.92 GTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTACGGTTAG:1 + chr3L 24208248 3' - Quasimodo 21 2 69.18 GCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATGCTCAGGAGAAGCTGCGCTCCTCGCTGGC:1 - chrX 18133714 3' - blood 110 2 80.14 ATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACTAATAATCACGATTTTGATAGTTTCAGGGATTGCTATTGTATCTGAT:1 - chrX 23064540 3' + accord 92 2 67.81 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCG:1 - chrX 2518059 3' + P-element 2789 1 17.93 AGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGCGTTTTGTATATCTGTATTTTTTAAGACATTTTTCTTTTCCTTTT:1 - chr3R 24216151 3' - 1360 3227 1 71.23 AACAAGAGAGAATGCTACAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATAGTCTTCAATATAGCATTCCAAGGTCATGTTATGCGGATT:1 - chr2R 10552660 3' - INE-1 580 1 87.67 CTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAAAAACCTAAAGACTGCAGGTTCAGCAGTTCTGCCAGGACCTGGCTGCGCTAGGCAAGGAG:1 - chr3R 13362363 3' + hopper 1056 2 67.12 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCACACTCATTTCGCTTGCA:1 + chr2R 16496695 3' + hopper 1392 1 64.44 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGTTTGGTTATTTATCGGGTGGCGACAAAAACAAGAGCAAAGGCAACG:1 + chr2L 22921333 3' + copia 217 2 65.52 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATACCTATATTTCGTAAGGGTTACAGGAAAACATTGGACTCAACGGACCTCTATAAACCCTTGGAGGAGCAAAAGTCGGGTAAGAAATTTAAATATTAT:1 + chr2R 9391050 3' - mdg1 7062 2 67.12 GTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCGGAAAGCGTACTGCTGCCAATAAGGCAAGGTATT:1 - chr3R 26244650 3' - copia 4957 2 78.08 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTT:1 - chr2R 9504239 3' + roo 315 2 83.56 AATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAATTTCGGGAGAATGTGATTATACCGCGGT:1 - chr2R 4673524 3' + Quasimodo 7346 2 70.55 AGGATAAGTTAGCGTTATTTGAGTGTGTATATGCCTTACTAGAGGAGGGGTAATAATTATTGTCATATTGTTCATTATCATTAATTTAAATTAGGTTCTCGTCGAACTGAAGGCCCTGGTCGCAGTAGAGTAGAGTGTGCACACGC:1 + chr3L 20201255 3' + Transib5 2515 1 62.33 GTTTAATTTATTTTATTATTTACGTAAGTTTGTGAAGTATAGCTGATCATGGGATCAGTTTTTGCAAACAAGTTTTTACCTCTGTCCCAACTTTATCCCTAATGTATACCATTTAGATGGAGAGTAGCTGCTCA:1 - chr3L 16313770 3' - HeT-A 342 1 23.88 TTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAAGATGGATTGTTCGAAAATCAGTCCTAATTTTAATCAACAAATGCATACTGATCTGTAT:1 + chr3R 8183494 3' - Doc 68 1 58.90 TAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCACGTGAAAACGTGTCTCTGTCTCCCAACTTTTCTGTTTGCGT:2 + chr3L 18767889 3' - roo 8600 1 67.12 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATTCGTGAGTATTCTAATCATTTCCTTTGATAAGGTTCTAAGCAAAC:1 - chr2L 7939749 3' - Burdock 6193 2 65.38 CAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTAACTGTGATGGAATGCACCAAGAGTTTTTCATATCGGTACGCACATAAATAAAGTAATGTATTAGTTACGAAAT:1 + chrX 4540721 3' - 1360 41 1 54.17 GGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGCCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGTGTTCTAGTATTTTTGTGCTATGTGTTAATCGGCGACTATCGAC:1 - chrX 4540617 3' + 1360 3315 1 68.49 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATTCCCAGTGCAGAACTCCAAGGCGGCTCACCAAAGAGGTTCTCCGAAGATGAATCGGTG:1 - chr3R 10636098 3' + blood 7372 2 59.00 AAAACAAAAAAAATAAAAAAAACTAAACCTCCCGATCCCCCAAAAAACCCGTCG:1 + chr3R 26080171 3' - hopper 149 108 88.89 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATTTTTGAAGGCCTGGACCAACCTCTCTGCTGCGGTTATAACCTCTCTTAAGGAACGCGAAGGCTGAAACGGGAATATAAA:1 - chr3L 22709309 3' - 412 43 2 56.16 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGTACTTGAAACTGTACTTGTTTTATGCTTT:1 + chr3L 12480477 3' - 297 39 2 75.63 TATTTAAACCAAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACC:1 + chr3L 9519636 3' + roo 9010 2 61.48 CGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGT:1 + chr3R 14860214 3' - BS 5067 1 66.44 ATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTCATGCGTGCTGGAAAAACAGCGCCAAAAAATTGCCAACGAACCAAAAGGGGGTTTCAA:1 - chr3R 6411958 3' + Tirant 339 2 60.96 ACAAAGCTACTTAGTTGCTACGGAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGCATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGT:1 + chrX 3797449 3' - gypsy 7014 2 67.12 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGGGCGGTAGGAATGAAGGGAAAGCTG:1 + chrX 5206510 3' - Tirant 39 2 76.47 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTATTGTTTATTTACTATTGATATTTATAGTACTGGCAACGG:1 - 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chrX 6952088 3' + G5A 2779 1 63.01 GGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAATGATATATTTATATATCATTTAAATGTAGTATTGAACATTTATTACTATGTAATTTTAATTTAATTATACTATAAAAGTGA:1 + chr3L 17162410 3' + Stalker2 7610 2 55.48 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAGATACCGATACCATTGGCCAGCTATCCGGATGCCGGAATGGGGATTGCGAACTGCGGATAGCCGGCTGTCAGGCGATATCTGCGCTGCC:1 - chr3L 20977772 3' - mdg1 7071 2 63.70 AGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCTTTTCCTTTTTTCCTTCCTACGGCT:1 + chr3R 6412100 3' - Tirant 13 2 76.30 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATAAACGGAGTGCTACTG:1 + chr2L 8707522 3' + 412 426 2 64.14 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATACAATGCCTAGTCAGTTGGTCTCCGTATTTCGATTTAGGAGGCAGTTCCGTTAACACTGCAAATCAACAAGTCCAAATAATATTGCAC:1 + chr2L 19548560 3' + flea 234 2 67.88 GCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGGAACGTCAGCCCGACTGCAACTAAGACGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAATGGTCATAATAAATATAAATATACAAAT:1 + chr2L 23069854 3' + gypsy4 12 2 78.42 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGAATTACCGCGATAGGATCTGCATTTTAGGGTAAATTAACTTTGAAATGCGATTTAA:1 - chr3L 16463450 3' - roo 20 2 69.86 TCGAGGGTAAACTTAGTTTTCAATATTGTCTTCTACTCAGTTCAAATCTTGTGTCGAAATAAACCACAAATTTGAATAGTTATAATTTTAAGAAAAATCTAAAAATAAAATAGGGGACTACAACAAGTTATTATTAATAATGTTAT:1 + chr3L 3565749 3' + gypsy 200 2 58.90 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATATAATCAATATAATTATAGCATAACAAAGTTTAGTGACACACACTTTGAGATCTGCGTTCAATACTTGTTGAAAAGTTG:1 + chr2R 9092079 3' + 412 7502 2 54.79 CCTCGATATATGCACATACTACAGTCGGACTTTACATATTAGAAAATATGTCTTTTCCCATCTATTCAAATGGTATTTATATTTCGCTTGCAGTTTAAGACATGTATCTGTAGAAAAATCGAACCAGATATTTTTATGAACCATTG:1 + chr3L 4933879 3' - blood 7013 2 78.08 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGCAGCAAAACTAAACAATTTGTTTCTGGTGCTTTTGTTCGTTCGTATACTGAGTTAACATTTATTTGCTGCAGATATATA:1 - chr2L 19158775 3' - P-element 5 2 76.64 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGGTTAAGGCTGTTACGTGCCACTGCATACTGCAAGCGGACAAGTCTACTGCTCACACTTTGATGGAGCTGAATTCAG:1 - chr3L 22883911 3' - roo 8683 2 67.50 TGAGAAGTCACGAGGCGCAACGTTGACAGAAGTGCCGCTATAAATATTTGAATATGAAATTGTACTTTAGTTTTGGACAGAGCTCAAAAGTGATCAGTCGTATTCCGATGCAAAAAATAATTATTATTTGAAATAACTTAATAATT:1 + chr3R 1960322 3' + gypsy9 159 2 87.67 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACATCTTGTGCATATAAAACCCCCGGGGATCCAGCAGAACACACAAAAATGTGTAGCA:1 + chr3L 2184967 3' - jockey 66 1 59.57 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTTTGCACTTGATTATAAAATATATTAGAATTTATCG:1 + chr2R 21425180 3' - HMS-Beagle2 40 2 56.85 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAGCATGAGTCCGCGCAATAATCACAGCCAAGTGCTGCATATTTATAGGCGCAATCAACTTTATTGCGCTGGCA:1 + chrX 850177 3' - jockey 35 1 65.07 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAGACGTACATACATAAGTTATT:1 + chr3L 22884056 3' + roo 9052 2 69.92 GCGGCCGCGCAATTACGAAAAGTATAGTGTTCGCTTTTATTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGGAAAATTCCAGGACAGCATCCCCCTACAACACAACATTTTGGTCCTTTCTAAGTCCAAATTTCCGAATATATTTCAATAT:1 - chr3R 31688023 3' + GATE 174 2 71.92 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTC:1 + chr3L 13228537 3' - P-element 84 1 28.08 CGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGGACAAGATTGGCATTGCAGACAGTAAACTCTGTCGCTTCTGCTGCACCAGAACAAATAACCAACACGTCCCACTGGCACAATAAATATTGA:1 - chr3L 27716023 3' + baggins 5118 1 69.86 GTTTTTGAATGTCCTTATCTGTTTTTCCTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTAACATTCTTTTCTCCTGGGAGCTGTACTGTCCTCTACCCACTAATCCCTGCAATTTGCAGCTTTTCAACATGAAAATTAATTT:1 - chrX 21557771 3' - HB 420 1 64.66 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGGGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGCACCTTGCAAATACCAAGGATTTT:1 - chr2L 11867322 3' + jockey 4948 1 69.77 CTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAG:2 + chr3R 29091382 3' - rover 7018 2 65.75 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCGGCAATGGGGATGAGCGGGGTCTGCCAACCGCAGGACGAACGCTCTTAATAAATATGAA:1 + chr3L 11903543 3' + opus 450 2 64.38 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTATAATCACAAATATATTAAATAAACCTCACGGACTGTGGCCTGTGTTGCAGC:1 + chr2R 9455920 3' - 412 66 2 63.45 ATAATATTAATATTAATATATTATGGAAATATTGAATATTTGAATCTCAGAAATATTCGAAATTACTCGAAAACGTTGAAAAAGAGCGGGCAGCGCCGAGAGCCCGCAGCAGCAGAGGAAAACGAGCTCTGCCACAGCGACGAGCA:1 + chr2L 16868884 3' - Tc3 300 1 81.51 CATAAAGTCAAATTATAAAGCTAGAGAGCTGCATTTTTGTAGATTTGATGTATTTGACTATTATTAATTCGTGTAATAAATTTAAGCGAAATTTTTCTTATGTATCTATTTATCCTGGAGTCCAAAGAAAGGCAGACATGACACGT:1 + chr3R 7453092 3' - transib3 2833 1 76.71 GCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATAAATTCCCAGCCATATTGCTGCGTACACTTACGTCGTTAT:1 - chr3L 19335351 3' - invader4 2829 2 70.29 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAAATTAAAGATCAGAGACACGTTGAAAAGGGTTTAATTTTGGCTAAAAAGATTGCAGATGGCTGGCGATTACATTTAAGCAGCAATTATTC:1 - chr3L 17206879 3' + I-element 5324 1 63.70 TGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATGAACATATATGAATATATACAAATAAGCTGTCTCAAAGCAAAAGCCAAACAAAAAAGTGATTTGTTGTCATATGCAAAGTCAAATCTTTTTCGTTGGCT:1 + chr3L 14709051 3' - opus 7137 2 64.38 TACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTTTTTTTGGTTTGGGTTTTATGTCTGCGGTGTGGGCCACTTGAAGTCGCCAGCAT:1 - chrX 17472119 3' + Quasimodo 7348 2 61.90 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGCCCGAAAAAGTATGCTACGC:1 - chrX 6484708 3' - jockey 67 1 59.59 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTACTACTATTTTTCTCTCAGTGCAGCACTATCCTTTTGGTGG:1 + chr3R 8596422 3' + hobo 2899 1 60.19 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAACACTCAAATGTCATCTCCTTAGCTTC:1 - chr3L 24253599 3' - 297 40 2 62.28 CGATGATCGAGCACCCTTACCTTCAACTAACTCGAAAAACAAGCTTTTTTCTCGCGCTCTCTCTAGTACTGTCGCACCAAAGACCCTCTAGTGTCTTTGGTCGCACCTACACCTTTGACTTGGAGTTCTGCTGTTTCCTCTGCAAA:1 + chr3L 25118832 3' + Doc 317 1 41.10 ATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAAT:1 - chr2R 5582144 3' - Cr1a 463 1 62.33 GTCACCTATTTAAACCAAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACCATCTA:1 + chr3L 9519641 3' + roo 9004 2 60.96 GTTTGGTTCGGTTTGGTTTGCTCTGCTTGCTCTCCCCATTCGAGGCCATTTGGCGGGCAGTAAAACCATTTTTTTTTCCTTTTGCTAGCTTGCACACGCCACCGCCCCAAAAGCGCCCAACTGACGCCCCACT:1 - chr2R 12975342 3' - G2 101 1 79.70 CATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACCTCTCTCGCCTCAGGTAGCCACTTCTATGGGAGCCTCGTATCCTGGCTCCAT:1 - chr2L 13313727 3' + Tirant 8193 2 51.85 ATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTT:1 + chr2L 19158875 3' - P-element 106 1 15.07 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTATAAGCTAAGTATTTAAGAACAAACAATGACAAAAGTTAATTAAAATGTTCGAATCCAAAAAGTAAATGCTTT:1 - chr3R 12727119 3' - I-element 49 1 49.32 AGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTT:1 - chr3R 5024839 3' - diver 87 2 75.34 GGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGAC:1 + chr2R 21425136 3' - HMS-Beagle2 84 2 76.03 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAG:1 - chrX 7967230 3' - P-element 80 1 24.24 ACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTAC:1 + chr3L 10563966 3' + hopper2 1520 1 74.66 AAAAGAAAAAAAAAAACCAGAAAGAGAAGCGAAAGAGCTGTGCTGCTCCTTGGCGAAAAACTATTCAATGTCAGTTTTCATACTTAAATTAAAATTCT:1 + chr3R 22175251 3' + gypsy7 5012 3 91.84 ATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGTATCTCTTATCAAAACGTTCCCTGATAACGCCCCACCTCAACAATCGGTGTTCTACTTCAGAAGCGCGTGCCT:1 - chr3R 24053627 3' - mdg1 48 2 52.74 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTTCGAAATGTATGTAATTTATGCAAAAAGATATCCGCTGAAAGAAAATCAAGTAGAAAATAAAAGAGAGGAAATCTGCATTTGAAAGTTATTTCTCTTTCATT:1 - chrX 7031537 3' - hopper 16 1 37.67 AATTGTTATTAAATATTTTTAATATGAATTTATATATCTGAATAACCAAAGTATAATAAACGTACAAAGATATACTTTATTAATGATATATAAGAACAAGCTGTGAAATATTCTGTATTTTTCAAGAGATAAGCATAAATTCATTT:1 - chr2L 11176755 3' + TART-C 11025 1 54.11 ACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTGTATACTGCGAGAAAAGCATTCACAAAGACATCCGTCCCTTGTTGGCTTGAAAAGATCTTTAATAAAATGGAATAAGTTGTAGTTCTTGAAGACTGCAATGACTATGAATG:1 + chr3L 20176815 3' + gypsy 449 2 27.40 TTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGTAGTCCAGTTTGTGTTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGGGTGCAAGGCAAATATTTACACTCAATGGAACATAATA:1 - chr2R 9934145 3' - Rt1b 4959 1 52.31 ACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACATGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATGCCACAGC:1 + chr3R 17210123 3' - HMS-Beagle2 6929 2 53.42 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGTATGTGTGCGTGTGTCGATGTATTAAGTGGAAACACCTTGTAAAATGGCTGACAGGTGTTAGAAGACTTTGCAAGATTTATGCGCTGAC:1 + chr2L 12847332 3' - 412 31 2 63.01 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCTTTGAGTTTGTCACACGATTT:1 - chr2R 9504217 3' + roo 9015 2 65.15 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCGAATGGGAGGCACCCAGGGTAATGGGAGCTCGGGTGC:1 + chr3L 18738177 3' + Bari1 1689 1 68.03 GTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGTTGCGTAGTTCTGCACGTAGAGCAGAGTCCAGCACCAGCTCATCTTGCACCCGGAGTAGTCAA:1 - chrX 19585100 3' - Transpac 1 2 61.64 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTTAATTAGTATTAAAATACTGCAATTCTGTACGCATATTTCATCAACTAGTTAAGTTCAGTGTAATCTAAGGCTGTCACTAGTAGAATCTAAATTAAG:1 + chr3R 32032147 3' - 297 6601 2 72.60 TTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAAC:1 + chr2L 22684608 3' - transib3 63 1 51.37 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGCTTTATTTAATCTTAAGCTTCCTCGTTTAGTAACTAAATATTTTATACATATGTATATATGTGTAAGAGTGAGTTTTCCCTTTTCTTTCAGTGTACTGTTGCG:1 - chr3R 12609949 3' + roo 9054 2 71.23 TGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTCATGCGTGCTGGAAAAACAGCGCCAAAAAATTGCCAACGAACCAAAAGGGGGCTTCAATGTACA:1 - chr3R 6411952 3' + Tirant 8452 2 56.85 CCCATACCGCCCATATGACGATATAAAGTTAAGAAGTACATTTGGCATGATTATTTATTTTAAGATATTACCCAATTAAATTTTTAATTTTGCGTCCGTAATTTTCCGTAATAAAGGAAAATTCAATTCCATAATACATTGAATTG:1 - chr4 1172374 3' - transib3 2729 1 60.27 CCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTATAATGACATTTCGTTTGGCATTTGGGAACGTATGAAATTGGATATGTTTAAGCCTTTTCACATTACTGCGTA:1 - chrX 6423160 3' + roo 9018 2 52.41 AGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGAT:1 - chrX 19585164 3' - Transpac 65 2 66.44 ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATGTATCCTATTCATTCACAATTCAATAACTAACTATAGTGGCAAATACGTCAGATATTAGCCAGATGGGTGCCTAGGTAAGTCATCT:1 + chr2L 5711041 3' - HMS-Beagle 6824 2 61.64 CGACTTGTGGCGGCGCGATTCATTGCTCGAGGGTAAACTTAGGTTCAATATTGTCTTCTACTCAGTTCAAATCTTGTGACGAAATAAACCACAGCTTGCTCCGGCTCACTGCCGTTAATGAAAAGCTGAAACTAGATATCGACTTG:1 - chrX 10429670 3' + gypsy 174 2 78.08 TTGGCGGCTGCATGACCCAACAACCGCCAAAAACTGCCACGCCCCCATTTTGAAAAATATGATGATGCATATTTTGACTGCCTCACATTGGTATTTTTTGATTTT:1 + chr3L 26169316 3' - diver2 1 2 53.33 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATGGGTCAG:1 + chr2R 22464490 3' - pogo 36 1 59.59 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCTTTAGTAAAATAATTTTTATAGAGTACCAGAAATAAAGTTTAGAAACCTACAACTTTTTTCTATTGCCTCAGAAAGAACTTTTTA:1 + chr3L 15277720 3' - I-element 38 1 57.53 GCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGTTGCCATTTTAGTTCAGTTTTCAGTTTCAGTTGCTCTAGCAAATTAATTACAATTA:1 - chrX 13003667 3' + diver2 4884 2 39.04 ATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTAGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACCTTTTTTTATAATCCTGGCGAAGGGATGCAAAACGGCAAAAATAGTTTTTCGCTGCTC:1 + chr3L 2797237 3' + Quasimodo 7263 2 68.49 AGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGAAATGTGGTTTCCATCAACCACAGCCAATAAGGATATTATAAGGATATATGATGCTC:1 - chr3R 21409393 3' + 412 188 2 61.64 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTATAAGCTAAGTATTTAAGAACAAACAATGACAAAAGTTAATTAAAATGTTCGAATCCAA:2 - chr3R 12727133 3' - I-element 63 1 58.90 ACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATTTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGTTTTTGCCTTGCCACGTAAGCTATCGGTAATCGGCAGTGGAAAATCGA:1 + chr2L 2236866 3' - McClintock 132 2 65.75 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATATAGTAACTAAATTTAATAGCTATGTTAGAAATAATTTATTGGCATTGGTTTATTTTTTGTGGTA:1 - chr2R 17021305 3' + pogo 2048 1 57.53 ATGTGTGTTTGTGTGTGTTTATGCTGTTGTTTTTGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCCTGTTTGTTTGTGTGGGTGTCAAGTGTTTAAATTTCCAGCTGCTACAGTTATATTTATAGATTATTTGCTA:1 - chr3R 8589399 3' - accord 181 2 57.53 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAGCATGAGTCCGCGCA:1 + chrX 850120 3' - jockey 72 1 68.80 ATGTAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGCCTCAACACGAGTAAAACAAAACGTAATTACAACAAGGACTTTTCAACAGCAGCATTTTGCA:1 + chr2L 9861386 3' - BS 5019 1 56.16 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTTTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATATCAAATTTATGTCAAGTTGGCCAATTTTCAACAG:1 - chr2L 3648738 3' + roo 8989 2 71.03 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGAGACACTGAGCTCACCCCAGTTCTCTATAGGGACAGGAATAATT:1 + chr2L 17206074 3' + hopper 1361 1 63.20 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAGTAAATCAACGCAAGTGGAATAAAATATTTTAAATAAATGATAATA:1 + chr3R 23539494 3' - hobo 72 1 65.75 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACCATCTACGTCTCGTTTCGTTT:1 + chr3L 9519656 3' + roo 9026 1 50.36 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATAAATTATGGCCGCAAAGAGCGAGA:1 - chr3R 16228856 3' - P-element 90 1 20.42 CACCATCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCAGCCCAAAATGGGTGGGGTTCCCAATTTCAACAAACAACAGCAGCAGCAACAGGTGCCGCAGCAGCAACTGCAGCATTATGTTTTTTTCCATAAGTTATTGAAATTCGAAATGAGGGC:1 + chr3R 12797631 3' + TART-B 152 2 68.49 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCAC:1 + chr2R 16496679 3' + hopper2 1558 1 50.00 ATAGATTTAAGAATAAAACTTAGCTGCATTTACCAACGCAGACTGCGGCGTCTTATGTGCCCAATTTATCATCCCAGTGACATTTATTTGGCTTTGTTTGTGCACTGCTTAATGCACATGCACATATGTGCATAGTATTATTTATT:1 + chrX 16297428 3' + rooA 7426 2 62.33 GAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTACACATATATTACATATACCCATTTTCCCTTTGGTAAACACTTTTAACAATGTGTTTCGAGCTAACA:1 + chr2R 6741008 3' - transib2 384 1 66.44 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGTGAAAAGAAAAACGTTTTATGAGCTCATTCACAAAAAGGGCCAAAACACACACACAGGCACACCCAT:1 + chr2R 8335028 3' + transib2 2771 1 54.11 ATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCTCTCGCCAGAGCCTGTCGCTGTTTCTCCTTCTGCTCCTGCATCTTA:1 + chr2L 18939561 3' + P-element 2742 1 36.23 GAGCATTTCCGATTGCGTTCGCTGAATTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCGATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCAATTTGAGCAAACCAATTATAATATTAATATCAATTTACC:1 - 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INE-1 123 1 71.85 AAATAAAAAGTATATTTTTTTAATGTTTTCAAAATTCTGATTTTAATATTAGTTTTACCTCAATTGTGACCACATTTTTTCACGGTGCATGGGCTGGATACGAATGGCTTGCAAACATGGGCATGGGAATGGCTGTGCACTAAACG:1 + chr3L 9489996 3' + Idefix 7363 2 68.49 AGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGAGTAAAGTTTGTTGACCCATGTTGCAACACCCACTCTAACGCCCTAAAACGCCCAAAACTGTGTAATTTTATTTAAATTAAGATTAT:1 - chrX 22905343 3' + INE-1 149 1 65.75 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTCCTTTGAATATATTTGTTCCAGGGTATACGAAGAATGATTCCATTATGCACGTCCATTATTCGGTATTCATTTATGCGTGCGCAAATAATGTTGTTG:1 + chr2R 12813817 3' - roo 8683 2 66.90 GCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACTTAGTATGTACTACATACATACAAACATTCATATGT:1 + chr3R 30012706 3' - Burdock 82 2 82.19 GTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCCATAAATATGATGATAATTAAGTGTGTGTCTGGCACATATACTCAATTTGGCCTTATTAACCTAAA:1 + chrX 20874391 3' - F-element 382 1 54.11 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCTGACAGCGGGCGCTGCACATTATTATGTGATTTCAAAGGACTGCGCCGCTGCCATGCAACA:1 - 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chrX 19585144 3' - Transpac 45 2 52.74 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAAACGACCTTGCACAAACCAACAACAACCATAGCGACGACAGCGGCGG:1 - chr2L 21250950 3' - P-element 48 1 42.37 ATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGAGTGGAAAATATGACAACACATATGCACTGCTGACAGTCATTTTAATGGAATATGCGGCGAAGCAC:1 - chr3R 27782616 3' - G6 1992 2 54.79 TATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTATTTATTTATTATATTTACATATAATTTTATAAAGGACCACTGTGACCTGCATCTCCATTGAATTTATTTAATATAATGGAGTGTAAATCATTTCGGAAAATGTTTAT:1 + chr2L 17166400 3' - I-element 5296 1 65.75 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTC:1 - chrX 12003928 3' + P-element 2812 1 34.25 TATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTCGACTATCGTAGTTAAATTAGGTAACATAACCAACTGCCCAGTTAAATTACACGCTCTG:1 - chr2R 13572043 3' - Tc1-2 1581 1 74.38 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAAGCACGCTTTTCCCTAATTGTTTTTCATGATGTTTTCAATCTTTTAAATAACTCAAACGATAACAATACCTTTGAGATATTGCATTCGATATCT:1 + chr3L 20083916 3' - opus 22 2 70.55 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGGCTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATACACGG:1 + chr2L 8707512 3' + 412 449 2 60.71 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACGACAGACCATTTTTCATTTCTATTGATGGGAATTGCACTTATTAATATCAATTATTGAGAATAATCTTATATTTTCTTGACTAGTATCAATAGTCAAGT:1 + chr3L 18792552 3' - roo 21 2 69.86 AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCAAGCATATCCCCAAAGTAAAGGAAACCAGAAAACAGGGGCAGCAAATGCATAA:1 + chrX 20465921 3' - jockey 4775 1 71.92 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGTCGGTAGCCGAGCTCCA:1 + chrX 10806927 3' - P-element 64 1 22.73 ATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTATTTATTTATTATATTTACATATAATTTTATAAAGGACCACTGTGACCTGCATCTCCATTGA:1 + chr2L 17166354 3' - I-element 5342 1 63.01 CGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATCTGAAATTGATTTATAAATTACCGTCTGGCAATCGCAGTAAGCCAC:1 - chr2R 13471345 3' - flea 4824 1 67.14 TAATTTTAAATTAAATTTTAAAATATAAGTAAATAATGTTATACCTCAAGTTTGATATCAACCATTATATATCTTAGTTTTGTCAATTCTACTAAATATATATATATTTGCAATAATACTGAGAATTTGGCTTTCATAATGGAACT:1 + chr3L 11854223 3' - 1360 3044 1 44.52 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGGTTTTCTCGGGATGGGTTCAGATCCAATGCGATCCGATGCGATGGGATGCCGATGGTGAAGCCGAAG:1 - chrX 17942393 3' - jockey 4724 1 54.79 AAGCAGATCAAATTTTGTTGCCACATAGGTAACAGTGCGTTCCTTATATTGTTGATATAAAAAATAATTATAAAATATCATAAATTTAGGATTCCTTCTGCGCTCAAAATAGTTGGTGTTATAATTATTTTATATAAACGTTTAAA:1 + chrX 5672196 3' + jockey 4945 1 62.33 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTGCTCTTATTTTATTTATTTATTTTAAAGACTTAATATGTTTTTCTGCACACGATACTTTCCGTTCAAGGTTTTTTCCGTTTAGTTGTCCTCATTACTTTAT:1 - chr3R 904565 3' - 3S18 22 2 70.55 AAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACAATACACAAAGTATACACACGA:1 + chr3R 29091431 3' - rover 6969 2 73.97 AATGTATGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCG:2 + chr2L 22684596 3' - transib3 75 1 59.59 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGCTGCGTAGTTC:1 - chrX 19585152 3' - Transpac 4972 2 58.22 CGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTCTCTTTGACTTGGAACAATTTTTTAAATTAATACAAAAAAACTGCATTTAACATTGACCTTAGCTTTATAAACGTTT:1 + chr2L 9074306 3' + flea 4973 2 57.53 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGACGTCACTAAATTGCGGTGA:1 - chr2R 7889364 3' - jockey 66 1 55.48 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATTTGTTGAATGTCGAAAATATACACTGTGTACGGAGGTTGGCGTCGCATCGCAAT:1 - chr3R 5868179 3' - jockey 66 1 60.58 ACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATCATCTAATACACGGGCTGTCAGGCCAGGTGAGTG:1 + chr3R 18697951 3' + 297 6899 2 79.86 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCTTGTACTGGTAGTTCATATCCATCTGGGCGGACTGGAATACGGTTCGAATCG:1 + chr3R 17724918 3' + pogo 2036 1 63.89 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTTAAATTGTGTAATTGAATTTTCAAGATTGGTTTTCACACATTCGTGGTAAACTATTGAAGCAAAATTGCAAGGAAGATTTTAGTTGAAAAAAAAA:1 + chr3L 14041014 3' - 1360 28 1 66.44 CTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGCTTACACATAGATCATTGACCTGATAACGAATTTTTATGCTTGGAAATAAATCAAAACTGTTTTAACAAGTTTTTAAGCAATTTTCA:1 - chr2L 13510755 3' + diver 189 2 58.22 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATAAAAATTAAAAATTAAAAAAACGAAATCAAATTCACCGAACTATGAGTTATTTGAAATGGTTAAAATGGTTAGTTAAAAACTTGTTTTGTAAGTT:1 - chr2R 11097273 3' + Juan 4181 1 48.63 CATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGCAGCGATGCATAAATCATAGCATACTTAACAGGGCCAACACGCGCGGATG:1 + chr2L 14889057 3' - hopper 17 2 69.47 AAATTTTAAAATTAAAATGAAAAGTTATCGTAAAAGACGATTACAAAAATGATAGTAATTCAAAATTACTACTCTTTTCAAATTTTAGGACAAGTTTGTTCCAAGTGCAACA:1 - chr3L 18137678 3' + 1360 3040 1 41.07 TGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCTTTTCCTTTTTTCCTTCCTACGG:1 + chr3R 6412098 3' - Tirant 26 2 69.18 ATCAATAATAATAATAATAATAAGAATAATCAATAATCACAATTGAAAATTTTCTATAAATTGGCAGAGGCCGGCAACATAACAGTTTAATTTTTGTCTGCGGCAGACGATTGAAGGAAATGGTTCTATCTCAAATAGTGATGAAA:1 - chr2R 14310962 3' + mdg1 7072 4 68.49 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTTCTATATCTATATCTATTCATAAATGCCAGACCACAGACTGCCACCGCTGTAGCCATCAA:1 - chr3R 28579477 3' + pogo 2046 1 58.22 AGCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCCGGGGAACTAGACTATGGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTATAAATGATGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCACTCTACTCTCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTTTCAAACA:1 - chr3R 18346601 3' + INE-1 537 1 43.84 CACATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATTATGTGTGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCTTTCTGTCTTTGGTTCGATACTAATCAGTAATTCGGTTGCAGGACGAGACAGGAGCCTACCTGATCGACAGAGAC:1 + chrX 1514494 3' + 1360 152 1 48.63 TATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTT:1 + chr3R 2520347 3' + Tc1-2 1603 1 59.59 CGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGGATAAAGGCAACAACAAGTGGTTAT:1 - chr2L 21325088 3' + invader4 3028 2 67.81 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGATGGCTGCCGGAATTGAATTGACGCTCATGATTATTTAAGCAAAGTGGATTAGAAAATTTTTAT:1 - chrX 19982345 3' + hopper 1410 2 69.57 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATAAACATTTTACATATGTTGTGCTTTGTAGTAGATATGTGAATAATACACTGTATT:1 + chrX 17510679 3' - roo 65 2 66.44 GAAGAAGTAAACAGCCACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACACCACTCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTACCTATCTACATGAGAAAACAATAATAATAATAACAATCATAAT:1 + chr3R 30872894 3' - micropia 28 2 48.89 GTGTTAACTCCTCCTTGTCTTAAGATGAATTCGTCCTCGGATTCAATGGTCTTAGTTGGTTTGGCTTTCAAACGGTAGATAAGAAAGATCATCATCTTTCTTTCTAGCATTTGTCACACTGGCTTTTAGGCCAACATTTTAAGTCT:1 - chr3L 3271635 3' - gypsy10 5630 1 71.23 CTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAGATTTCTATATATGATTGAAGTGAGTTTGCCGGCTGGCAGTTGAATCGCATC:1 - chr2L 470204 3' + Burdock 191 2 67.12 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCACAC:1 + chr2R 16496681 3' + hopper2 1560 1 50.00 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGTTTGAGGACCCATAAAGAAGAATGCGAAGCATACTTCTTGGGGCTGAC:1 + chr3L 13362759 3' - jockey 33 1 60.80 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGA:1 + chr2R 16891851 3' + jockey 4947 1 54.79 GGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTC:1 + chr3R 17210107 3' - HMS-Beagle2 6945 2 60.96 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATGCAATGAAAAGCAACCAAAAAGGAACGAATCAAAGGGG:1 + chr2R 15151141 3' - hopper 25 1 63.20 ACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCTGCTCATCCATATGAATCTCATGAACCAA:1 + chr3R 22840454 3' + Transpac 5160 2 80.16 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATT:1 + chr2R 24021668 3' + pogo 2055 1 54.23 CATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGCAAAGCGGAAAAGCCGCCTATAAATATGCAATGACAGA:1 - chr3L 13542303 3' - hobo 2720 1 70.77 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTGGCCGCCCCGTTGGATATATGTAGATATGGATATGGCCACGC:1 + chr3L 20399121 3' + roo 9050 2 70.55 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGCATTCGATCTTGAATGGAATAGAAAACTTCTAATCCTTCATTTTTGTAGACTCTTTGATCCTGCTCAACTTTAAATTGTTAAACAATA:1 - chr2R 16510203 3' - roo 32 2 65.07 CCTAAATTTATAATTATCAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAATTTCACCATTACAAACAATAACAAATACTGCACGGAATCGGCCGTATGCACGGTGTGTCGACTGCAACGCTCGTTTCTGCTGAAAAACTAATAAAGC:1 + chr3L 27974764 3' + I-element 250 1 62.33 TATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTCTCTTTGACTTGGAACAATTTTTTAAATTAATACAAAAAAACTGCATTTAACATTGACCTTAGCTT:1 + chr2L 9074295 3' + flea 203 2 58.90 CACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCAACCCTTAACGGAGTTGGGCGAAACTTGACCCCAAGCTGAGAGAGAGAGTGAGTGAGAGAGTGAGTGGGGGTGGGAAAATAGATGGGTGTGAGAGGCTTACACTTAAAAAGAGAGAACGT:1 + chr3R 11774050 3' + P-element 2886 2 82.88 AAGTGGAATAAGCCGGTAGCAGGGTCGTAGCTCCGACTTGATATTCACGGCAGTTGTTTTACGATAACGTCATTTCTTGACAATAAATTTGCAACTTACAAGGAGGGCGAACGTTTAAAAGTAATGCAATCTTTTTAAAACACTGT:1 + chr3L 21640732 3' - Chouto 210 1 51.37 GAAGATAAGATAAGATAAGATTAAGATAAGAACTTACCACCCGCATCGAAGGGCACGGAGTAAACGAAACTCTCCTCCCGCACAAAATGTTGGTCCACGGCGCGTTTGTACCAA:1 - chr2R 13816428 3' + Stalker3T 202 1 71.93 ACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCATAATATATTGACTTGCCGCTACCCGACACCACCGCGGCATATATTAAAAAATAGTTAACGCGTATTAAATT:1 - chr3R 12725523 3' + 297 6767 2 56.00 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCTTCGGACCATTTACTTTTTATTTCCAGATGTGTCGCAAGATTTGCTTCCGCATTTTACTCATTGCAATGC:1 + chr3R 26244779 3' + copia 250 1 78.77 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTTGTTTCTAATTTTGGGAATACTCGAAACTCGAAAGGCAAAAGTTTCAGTTCAGTTCAGCTCAGTTTCCTTTGTCGTTCGATTTAAGAG:1 + chr3R 20074677 3' + roo 9038 1 62.33 TATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCG:1 + chr2R 5321197 3' + INE-1 503 1 52.73 CGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCTACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCCCTATT:1 + chr3L 3565395 3' - 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chr3R 32068359 3' - P-element 69 1 39.04 GAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGCGTGTGTGTGTGTCTGTGTATGCTATTCGTGTGCCCCTCCGCAATTCTGATGGTTTGTATGTGAGAAGC:1 + chr2L 4420609 3' + gypsy5 7297 2 51.37 TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAAGATGGATTGTTCGAAAATCAGTCCTAATTTTAATCAACAAATGCATACTGAT:1 + chr3R 8183488 3' - Doc 74 1 63.01 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGTTCCCACCTTCCACATTTCTACTCCTCCGATCTTAGAAGGAAAGTCCGTAGAAGCTACATATAAATAAATAAATAAACAAG:1 - chr3L 3756042 3' - hopper 38 1 55.17 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGATAACGGGGCTTATCTGAGCCGGCAAGA:1 - chr3L 13228452 3' + P-element 2836 1 50.68 ACCGTACTTATCTGTAGTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGACATGTTTATTCCAGCCCATAAATATGCTCTTTTAATGTCCTGCGCTTTATTAAAAGAATTGTTTTTCCAGAAATCAGCTTGCAATGGGGAAGGGAATATGAAATAT:1 + chr3R 21519546 3' - rooA 7329 2 56.16 CTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTGCAGATATGCAAGTTGCATGACAAAAGTTTCACAATTAAAACGGCAACAAGAGCTACATTTTAAAGAGAGACTTGTGGCT:1 - chr3R 25442776 3' + R1A1-element 5300 1 59.29 ATTGATTTCGGAGCGAAAATCGTCTTCCAGCACAAGTACGGAAACATACACACTATTTCCTTTATTGTTTTAGCACGCACAAGCAAGTGCCTTATATTTTTAGATTTTACACTCTCACTCACACAAGATGTTCAGTTGCAACAAAA:1 + chr2R 2121343 3' + 1360 3185 1 78.77 ATATGTATACATATGTACATACATACATATATGCACATGTATTCGTACAATGGGGCATTGCGTAGTTTACAATTGAGAATCTTAAGTCGAGTGTGGCACATTTGGCTATATTTTTGTTATGTTTATGCAGGAAAACCAATGGCCAC:1 - chrX 19817459 3' - invader3 5088 1 74.66 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTTTTTTAAAGCTTTCCAGCTGCCCTTCTAATCCTCGCGTCCTCTCGCTCTCGCACATAT:1 + chrX 7967327 3' + P-element 2862 1 67.13 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATAAATTATGGCCGCAAAGAGCGAGAAGAAGAAGACTAGAGGCAGCACACTGTCCAT:1 - chr3R 16228825 3' - P-element 63 1 41.10 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACATACTTAATGCAAAAAAAAATAACTTAAAACTAGAATTCGAAACCAAAATTTTGCATTTAAAGATGAAACATCAATTTGTATATTTG:1 - chr2R 7781192 3' + S-element 1685 2 64.38 TAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATAT:1 - chr3R 9175190 3' - Juan 55 1 50.68 GTTATGAATGCATGCATTTAATATTATCTTAATCGGCCGACTTTCATAAAATAGGTTTTGTCCAAAAAAGGGGTAAATTTCCACATAGTGCACCCCACCGCAAACAACAACCAAATATTTTATCAATCCCAGCTAGCG:1 + chr3L 21767221 3' + Transib-N1_DM 424 1 75.36 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTTATCTAAATATAAGTGAGCACAGCAGTAGGCCCGTACGTAATTAAACAAATATTGTATTTAAACTTA:1 + chr3R 21706347 3' - I-element 53 1 52.05 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCCAGCCAGCCAGGTAGTCATGGCAGCCAATTAGAGAGCCCTGACATCGAAATGAATGCGATGAAGTGGGGGCCATGCTCCATG:1 - chr3R 10461322 3' - roo 4 2 68.00 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCAGTTTTAAGTTGCGAAGACGTCCCACTGTAACCCCAACTATTGTACGGCACTGCAACATATCCTTGCAACTAAC:1 - chr2L 11613198 3' + hobo 2928 1 69.37 GCTAATGTGGATAAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTCGGTTTAATTATATTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTCGTCTTGTCTATTGACCTCTATTTCAGAGACAG:1 - chr3L 17991117 3' + 17.6 84 2 74.66 AGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAAATGAAACGAAATCTTTAATTTGTGTTCGAGTG:1 + chr3L 17206959 3' - I-element 5015 1 77.40 TATGTATACATATGTACATACATACATATATGCACATGTATTCGTACAATGGGGCATTGCGTAGTTTACAATTGAGAATCTTAAGTCGAGTGTGGCACATTTGGCTATATTTTTGTTATGTTTATTCAGGAAAA:1 - chrX 19817470 3' - invader3 5087 1 70.90 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAAGGTAGTTATTACCTATTATTCCACCCGCTATAGATAAATTATCCATAGCATGGTTATTATGTTTTACAGCCATTTCGATTTTATCCTTT:1 - chr3L 14084830 3' - opus 27 4 66.90 GTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGCAGCGATG:1 + chr2L 14889015 3' + hopper2 1535 1 70.34 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAG:1 + chr2L 261039 3' + Juan 4129 1 70.55 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACACAGATACGGATACAGACACAGATACAAATGCAAACAAACAAACACACACACACACACACACACTCGCATAACGGTACATTAATTGATAATTGTTTTGTGCTCA:1 - chrX 6377235 3' - hobo 19 1 66.44 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCAC:1 - chr3L 5179158 3' + P-element 2819 1 32.09 ACTTGAACGTTTGATTGTAGTTTTTTGCGAATATCACAATAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTTGAAAAAAAAATCTAAATTAGGGTTATATTATATTCT:1 - chr2R 5357208 3' - Juan 118 1 30.82 ATTATTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGGGATCTTAGGAACTATAAACCTTTTGAGTAATGGGCGTTGAGTTAAGATTCCCAATTCCCAATTTTTAGACTGACAGCAC:1 + chr2L 7358196 3' + INE-1 86 1 55.71 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTATGCATAAAAAACGTTGAAAGCAAATGGCCGGCAAATGGTTTTATATTTTTAATATCCCACCTCAAGTGTCCTCTTCAAGGACCACAGA:1 - chr3L 13752896 3' - hobo 21 1 35.77 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGGGTCTTATACTGTTGGAATGAAATGCGGCCGCGTTTGGATTGAGGGAAAACGGTGAAATTTTATGCAAATGGTCACACTAATATGAACAC:1 + chr2R 18440531 3' + P-element 2857 1 63.01 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTAAATGATTTTCTTTTAATTCCTCGCCTCTAAAGTCAAGTTCCACTGTATAGTCTTGGACTTTGTCC:1 - chr3R 30782497 3' + pogo 2049 1 60.27 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTACGGTTAGGTCTT:2 + chr3L 24208253 3' - Quasimodo 16 2 72.60 AACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGAACCCAGCTTCTTTGAGCTGTAAAGTTTTCGTATTTAAAATAATATTGATAAAAATAATTAAGCAGTTGGCGACGCAAC:1 - chr2R 24323866 3' - FB 60 1 78.72 GAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATTAAATAAATAAATTATGAACAAGTTGTATACGTTTTACGCA:1 - chr3L 16271907 3' - jockey 176 1 71.72 ATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTTCGGGTAAACATTAAGTATTTGACGGGCAGTGTGTAAAGTCAATGGTTTGCATAAATCAGCGATGCCGGAGACGATTCTTA:1 + chr2R 17435214 3' - Idefix 7133 2 55.17 AATAATAATAATAATAATAATAAAATAACAAAATAAGTACGACAGTTCAGATGCGTTTACTTTTACTAGACTAAAGCTGTATAATTTCCCATTTGTTTAAAAAAATTATACTTCACTAATGTAGGAATGCTTAACTTTGAAGGACC:1 + chr3R 16971438 3' + mdg1 7075 10 56.85 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTT:1 - chr3R 19589893 3' - BS 5019 1 61.24 GAGATAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGTATTCAACTAAAAATACAGGCATTTCAAAGTTAACATTTCAATTGATACTGTG:1 - chrX 10128181 3' - invader3 83 2 63.01 ATGTTTACGTTTCACTATTATTTCACTGATAGTCACTCCCTACACTATTTACGATATGTGCCAGTATTAGTAACTAACTTCACTTGTTCCACATTTTCAGCTGCGTATTGGTAGACACGAATCATAAATCCGTTTTTATTAAATGT:1 - chr2R 5614772 3' - X-element 146 1 51.37 TGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGTGGTTTTATAAAGACACACAACATTTATGTTAATAGAAATATTTAATCAGAAATTTGATACTGATCCTAA:1 - chr3L 19437882 3' - copia 4922 2 54.11 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTATAATGACATTTCGTTTGGCATTTGGGAAAGTATGAAATTGGATATGTTTAAGCCTTTTCACATTACTGCGTACGTGGACTCATATTGTAACTGACCTTAAATAAAAT:1 - chrX 6423125 3' + roo 9052 2 70.55 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTCATATATAAATTAGATTCCCTCGCTCAACGACGCGAAAATTGCTGTGTGTACGACTCTATCAAATATGCAA:1 - chr3R 23668411 3' + pogo 2052 1 53.42 TGTACTTAGGAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGCTACCATACATTTTATACCCGATATTCGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTAATAAGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCAAGTACATATATATATATTCTTGATCAG:1 + chrX 8878613 3' + Chimpo 163 1 67.12 GTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACATGTTCTCTTTCTCCTTGTGTGAAAGGTAATGAAAAATATTTAT:1 - chrX 6856558 3' - 1731 78 2 68.75 ACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGT:1 + chrX 21667942 3' - gypsy2 6552 2 69.86 CTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATGTAAATATATGTGCAATAAAATTATGCGAAATAGTCATTCCAAGGTACAGCGGTATTCATGACGTCTTGGTAAAATATAA:1 - chr2L 17166253 3' + I-element 5318 1 60.96 AGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATAC:1 + chr2R 5173196 3' + Stalker 7173 4 75.34 TATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATTAGTTTACCACGATACTATGTTCAAATGGTGGACCACTTGTTGGAATATTA:1 + chr3L 22016892 3' + INE-1 150 1 67.12 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCGTGGTC:1 + chr3L 13228569 3' - P-element 52 1 50.00 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGC:1 - chr3L 18199948 3' - Doc 60 1 60.43 CTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACTTTATATAGTCGAACAAAATGATGATAATTTTACAACGCCCGTTCCAAATACCAACATGTACAACATATGAAAATTGTTAA:1 - chr3R 11752350 3' - invader1 39 2 54.11 CAGATACCAGTTACTCAGCTAGTGTGAATGGGAACGCGAAATTTCATCATTTTTCTAGGATAACGATAGATATTGGGGAATAAAATAAGAAAAAAGTTTATCCCGAGTTTGCCAATGATGCAATGATTCAGAAACACACTCGATTA:1 + chrX 14893573 3' - INE-1 543 1 68.49 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTTTTTTAAAGCTTTCCAGCTGCCCTTCTAATCCTCGCGTCCTCTCGCTCTCGCACATATTGTCTTC:1 + chrX 7967334 3' + P-element 2868 1 71.53 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAGAAGTAATGAAAAAGTATTGTGCTATTGAAGTAAAGTAAATTTATA:1 + chr3L 2467524 3' - jockey 4748 1 68.49 TTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATAGATACGTGTGGGTGTTTACGTCGAAATCAATAAGTGCTTCTTTCGCAC:1 - chr2L 6319746 3' - Tabor 6910 2 64.14 GCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTATTTTTTTATTAAATTATTTTCCTATCCATGTTTTAATTTTTTTCTTTATTTTACATTTTTCTATTCTCTCTTATTTTTAATTTCTTCTATTT:1 - chr3R 2527709 3' + INE-1 546 1 45.21 TTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGATTCGCATTTCCGGGTTATTGATTAT:1 + chr2L 13510886 3' - diver 5944 2 63.01 TTTTTATTTTTTATTACTTGACACTTTGGCATTGCCATCTATCTCAATTGGATATCTTGCATACATTTAAATGTACCCAAGGTACACACGGTAAAGATATATTTAATATTTTCTTCGCTGAGTTTTGACTTCCAGCGAATTAATAT:1 - chrX 18977239 3' - Rt1b 5145 1 67.12 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACTTTGAGTTGTCACTTGGGCAAGAGAACTAGAAAAACTCAGTGCTCGCACGTATGTCACTGTACGTTTGTCTTGACCATGGCACACAAATGCATGC:1 + chr2R 7899240 3' - roo 25 2 67.81 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTATATACTCACTATAACAATCAACGTTAACAATCCACAAAAATT:1 + chr3R 2503536 3' + roo 8995 2 71.23 GCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATTTTGTGTCTCCGTTCACAGTGGTCTGATTTCAGATAAATATGGAAAGATGGGAATCTTGCTGGATATTATCCATTACAGACATACATGTATGTACATATGAGC:1 - chr3R 12650062 3' + Cr1a 353 1 56.85 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGAGACTGTATGTATGC:1 + chr2L 19158907 3' - P-element 74 1 35.62 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGTTTTACTTCTGAACAAAGGGCTAACAAATCGTGCCCGGATCAGATTAAGAACAGAAACGAACAGGTAACGCT:1 + chrX 2260340 3' + Juan 4135 1 53.15 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACAGTAACAAATAAAGTTAAGTTTTTAAGAGGTAAAATAAATTGCAATAAAGGCAATGCAAGAAGCTATCCATGCATATACAATGTATGTGGACTACCA:1 - chr3L 2278101 3' + roo 9047 1 40.41 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGATATAGATATGGAATATAGCCGGGCCGCCTTGTCTAGAGAGCTCAACAAACTCTGGAGCGTCTTTAGCGCGCA:1 + chr3R 28579605 3' - pogo 27 1 63.08 GGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCTAGAATGCTAACCATGCACAAGGCATCTCAAATTCCAGGTGTTAAAAATAAAGTACAAATACACTAAATATTTCGGCACGA:1 + chr3L 3757260 3' + copia 251 1 57.24 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAAACATAATACATATTTTCGAGGTGTGCTTACGTTAGGTAATCATTTATA:1 - chr3R 17467100 3' - I-element 71 1 64.38 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATGTACATATGTCTATGAGGTGTCATAACAAGATAACTTATGTTATTGAGTTTTTCGGAATTTGTTATCGTTATTTGTTATG:1 + chr3L 20209669 3' + Burdock 217 2 58.22 GGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCTTTCTGACTCATAGTTTTATTTCGCAAAAAGTAAGCGCTGAAAAAAGCGGACTTCTCCCA:1 + chr3L 1887087 3' - F-element 268 1 73.29 GGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTAATAAAATCCATAAGCATTTCGAAAAGTTTGTAGCATACTTTT:1 - chrX 9508113 3' - jockey 4754 1 72.60 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACGTACAGCACGCTGTGGACAAGAAATATGTTGTCCTTTTAGGCGTT:1 - chr3L 13544992 3' + hobo 2929 1 61.25 AAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCTCCTGTTAACGAACTCTCGATGGTGTTTGAGGGATTATTAGGTTTCCGAACACAAAC:1 - chr3R 22840380 3' - Transpac 4980 2 58.90 GCGGATGTTTATGTTTACATTAGGGCAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAAAATTGGGGGTCTTATTAAATGCCTTAAATTATATTGAGGGATATTGATATTAATAAATTGGAATTATTTTAAAAAATTACAAACTTTAT:1 - chr3R 3461332 3' - Quasimodo 174 2 50.71 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTGCGCATTTTATTTTCCACTTTGCTTGTATT:1 + chr2L 16385311 3' - I-element 78 1 77.78 GCGAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTATCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAAACGGCCCTCTCTCTCACTCTTAGCTCCTC:1 + chr3R 26371839 3' + micropia 5053 2 78.77 ATGAGCATTCATCCGCCTCCTCGTGTCCAAAGCGATTCAGATAGCTGCGAAAGCAACCGTGCCCACTGATCAGCTGCGTCAAAAAAAGTGACGCGTGCAAAGAAGGGTGGATAATTCAGCAACTGTTTCTTTTTGCAATAACAAA:1 + chrX 16293698 3' - Rt1c 5056 1 57.24 ATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTGCTCTTATTTTATTTATTTATTTTAAAGACTTAATATGTTTTTCTGCACACGATACTTTCCGTTCAAGGTCTTTTCCGTTTAGTTGTGCTCATTACT:1 + chr3L 25840846 3' - 3S18 26 2 65.07 GGTTTTTATTTTGTGTTTGTCAAATCAGCCGTGGTTTTTAATAATCATCTTTAATTATCATATATTGTTAACATTATTATTAAAGATGCGTTTGTTTCGGGATTGACTTTAGTGCCAAGAAGACGCGCG:1 - chr3R 11979800 3' + Cr1a 40 1 77.52 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAAAGTTTCGCTGCACAATGTAACTTCCAATATTCAAGACACGAGATTTTGTTTCGCTAT:1 + chr3R 10636195 3' - blood 7075 2 60.27 GTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCCGACATTGATGGTAAAGGGTTATATGGGGGTCATGGCATCCCGTAGTTTTCGATAAGTTTTCTGATAAATTTTGTTAAATTTGCTAGTGTAACTTTTT:1 - chr3R 11145357 3' + flea 349 1 70.34 AGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAAC:1 + chr3R 14860212 3' - BS 5069 1 67.81 CTAGCTTTTATAGTTTTTGAGATCCCGGCGTTCATATGGACGCATAGACATTCGGGCAGACAGCGCTGAGGAGTACTAAGCGTCGCGCCACTTCAACGCCCGATGGGAG:1 + chr3R 7088592 3' - INE-1 152 1 54.13 TACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGTTTAAACTAGGACAATGCTAGGAAAGAGAATAACTTGATATTGTTTGTTCGGAATTTATAATTACATAAAG:1 - chr3L 13156690 3' + transib2 2775 1 51.37 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTTGTATTCACAACTTTGAACACTAACATTTAAGTTATATTGCATTTAAGAAAGAAGCCTTAAGAAACCCTTGCTTAAACGTTATCATGTTTGCTAAGAAAACCTA:1 + chr3R 5762083 3' + roo 393 1 75.34 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATAAACATTTTACATATGTTGTGCTTTGTAGTAGATATGTGAATAATACACTGTATTTGTTGTAAACTGAATGCCAATAAAAGGTTA:1 + chrX 17510709 3' - roo 8699 2 45.89 CGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTTAATTAGGGGACGGATGTTTTTTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGATGGAGTTTGTTTCAGATTCACTCTGGATTGGCACCACACAAATGTAAATTCGCTGGGCAGCCTTAAT:1 + chr3R 27191830 3' - Idefix 7038 2 54.11 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCAAGGAACCGAAAGGCAAGCTGAATTTTCCAGGATATACATAATCATAA:1 - chr2L 11867266 3' + jockey 4944 1 52.74 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGATATCAATTTCAAAATTTAATAACGATTTTGAAAATATTTTTTGCAGAACTAGTATGTATATACTATACATTCAGTTTATCGTACAGCTATTG:1 + chr2R 8687942 3' + roo 9047 1 67.61 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACTAAGCACCCACACAACGTAAGCCATTGCCATTTTGTAGCATACTTTTGTGCGCGCCTCTGTTTATGCGACTTGTAAACTTGGTCTTCT:1 + chr3R 16530690 3' + hopper 1399 1 70.00 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTAATGATGCTTGGTCTAAAATAGATTTTCCCAATTCAAAAAACGCCCATACAAAAGTAGCCCCACTATAAAAAACTGTCTACCTGGGTAATTTTTATGCAT:1 - chr3R 22771847 3' - opus 7026 2 69.86 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAA:2 + chr2R 24021659 3' + pogo 2042 1 61.64 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGTGTATTTGTGACGTGCATGTCAAGTGGCCAACACACACATGCACACGAGACGAAAAAAGGACCCTGACCAATTAGCACAGGAAGCTGTCAGTTATGGCCAACTCTCAG:1 + chr3R 15169024 3' - jockey 19 1 73.79 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATAATAATAGCTTAATAATATAATCTTAATAATTTTAACTAATTCCCCTGAGCATAGACTAAAGTATGAATAT:1 + chr2R 12239844 3' + roo 9023 2 56.85 TTCAGAAGAAACTGAACGATTCTCAGTGACTAATGAATAATAAATAATTATAATAAAAAGGCTCATTTGTCACATTTTCTCCATTTATTAGAACCCATCGATCCACCCTCGCTTTTCTAGCTTTTTGAGTTGTTGTTCGTGCCGTG:1 - chr2L 15203982 3' + G5A 2803 1 78.08 AGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCTCCTGTTAACGAACTCTCGATGGTGTTTGAGGGATTATTAGGTTTCCGAACACAAACA:1 - chr3R 22840379 3' - Transpac 4979 2 58.22 CTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTAAAAACGGCCATAAATTAAACATGCCGCCCGCAAAAGTAT:1 - chrX 19818443 3' + jockey 4907 1 77.08 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTAGTTT:1 + chrX 14346506 3' + roo 9004 2 62.33 TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACG:2 - chr3R 19589931 3' - BS 5074 1 69.86 TCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTGGAAAAGCTCGATACCGAAGCTTGAACGTCAATCAAAGTTTGTGTTTCGGTTTATAATTTAGCTGCCTTGACTGGGCACTATCTGTGTGCAAGAATTATGCACATTTGCTGGCGCTG:1 + chr2L 17669359 3' + Idefix 393 2 54.79 CGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATAAAATGAATAATAATAAAATAATTGAAGTATTTTACATGCCGTAGGTAG:1 - chr3L 15858777 3' + I-element 54 1 67.12 TTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGGTTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACACATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAACGAAGGACCACTGTTTCCACCAAAAGGGACATCGCTTCCT:1 + chr2L 12711602 3' + R1A1-element 234 1 35.71 TAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAAGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTAAGCTTTACGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCT:1 - chr2L 17729361 3' - jockey 4829 1 66.67 TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGTTTGCTCTATAACTAATCTCGTTTATCA:1 - chrX 19113480 3' + 412 423 2 64.38 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTGGATAGCTTGATTTTACTTATCTTTAATAATTGGGTACTTAATATTTTTTGT:1 + chrX 11955205 3' - 412 69 2 67.81 GAATGGCAAGCGGTCAACAGCTTCGCCGCAGCGATAACCACCGAGCTCAGAAGAGCCATCGAGGTGCAGAAAACGCGGGTCGCAAGTGCGAAAATTCTCGATCACTTGCCATTTACATATACATATATGCCACGATTTAAGGGCTA:1 - chr2R 11657622 3' + Rt1c 5224 1 58.22 AGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAATAACCGTAAACAAATCTTCGCTTAATCGTTAATTTATGATATTCCTAGCGGTAACCGACAGCCGGCAATCAAGACC:1 + chr3L 16447522 3' - Stalker4 217 4 52.05 GTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGTCATTATGTGCCTCCTAAAAAATATTAATTATATATTATATTTTACCTTCTAACCTCCAACTAAATGTATTAA:1 + chr3L 5427243 3' - G2 2876 1 52.05 AAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTCAGGATACATGCCATTCAGTTG:2 + chrX 1018185 3' - 1360 213 1 70.55 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAACTTAAAGACTATCCCTATATTGTGTGCTATTGATTAAACATTTGGTAGATTTGGATCATGAAAGATCTTATATAAACAATGGCTTATATATTCCTTTAAAAAGGATGGCACAA:1 + chr2L 6820989 3' + I-element 5335 1 54.11 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGAGACACCTTAAACATGATGTATAAGAAGCATGATGTATAGTTGTTTAGCAACACAATAAAAAGTTAATTGA:1 + chr2L 14480544 3' + Transpac 5222 2 73.58 TGCGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCGGCTCCTGGCGACGCACAAAAGTATGCAGCACAAGTTGCGGACACTTTGAGCTCGATGGATGTTCGATTTTAATTGCATTCGGGCTGAC:1 + chrX 7031717 3' + hopper 1387 1 66.44 AAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTGCTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCA:1 - chr3R 5024829 3' - diver 77 2 71.92 TCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAAGAGTTTAATATCAAATATCGTTTATTATCTTAACGTCCATTCGTTTAAC:1 + chr2R 22012230 3' + opus 7454 2 62.90 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGTTTGAGGACCCATAAA:1 + chr3L 13362727 3' - jockey 87 1 69.86 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCACGTCGATCAGGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGAGACCGGGGCTATTCTAGAAACCTAACGC:1 - chr3L 14551295 3' + P-element 2828 1 45.21 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACGACAGACCATTTTTCATTTCTATTGATGGGAATTGCACTTATTAATATCAATTATTGAGAATAATCTTATATTTTCTTG:1 + chr3L 18792532 3' - roo 8704 2 56.55 ATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGGCCAAAAAGAGATTCCATCAGTTGGACAACAGGACGACCTGGTTTCGCTTTTGGACATTTTTAAGTGCGCTTTGTCGGCTTTGC:1 + chr2R 9623469 3' + I-element 5347 1 78.47 TACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATAGATACGTGTGGGTTTTTACGTCGAAATCAATAAGTGCTTCTTTCGCACTA:1 - chr2L 6319744 3' - Tabor 70 2 63.01 CAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAAAACAATCCTTTAGCTTTCGAGTTCATTTAGATTAGGTTTATAT:1 - chr3R 19543386 3' + roo 367 1 56.85 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTC:1 - chr2R 24021544 3' - pogo 52 1 56.16 CAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGCTTGTAAAATGTATTTCCATATTTTGAACCATAGTATTTTACTTAATGTACAC:1 - chr3R 4532833 3' + 1360 3368 1 71.03 ATTGACATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGTGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGAGACGGGGACAGAGAGTCATTCGCTTTTTGTCGTCGCTTCGA:1 - chr3R 11887142 3' - Idefix 283 2 75.00 TTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTCTGCTTTAGTGCGAGCATTTAAGTAGCTGATAGAGGAGATGGTTGCAC:1 + chr2R 16655095 3' + P-element 295 1 32.19 AATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAA:1 + chr3R 29091361 3' - rover 75 2 76.69 TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATGCCATGGCAATGAAGTTGGCCAAAAGATTATTACGACCCACAAAGTGTTGCATAGTTTA:1 - chr2L 20938010 3' - jockey 4715 1 53.49 AACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATCAGACTTGCAGATTCTAGTCACTTCAAGATATCTTCCTAGTCAACAGTTCAAGAATGTACTGCTACAAGGGCCAGCTCGTATTCAATGTGTAATTCTGATAATTAAGGTGAAATC:1 - chr3R 11511202 3' + INE-1 159 1 68.09 ACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAAT:1 - chr2R 1320668 3' + diver2 4856 2 48.91 GATAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCTCGGAAAGCAAGCACTGGAATTGCTACCGGGGTAGTCGCTATGCACATAACTATGCTGACCTTTGTCTTATACGCAGAAGTGTTTATACTAAGTTGAGCAGAAA:1 + chr2R 3603231 3' + R1A1-element 5120 1 64.29 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGCAATAGCCGTGTGTGTAGTGCGATT:1 - chr2R 15151064 3' + hopper 1412 2 55.10 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCTGACAGCGG:1 - chr2L 20986536 3' - roo 8751 2 79.45 TGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAAATGGTACTTTAATCAGTGGGGCTTTTATTAAAGCAAAAAAAAAACCGTGTTGTACCAAAAATTGGGGTGGGAAAATTGATACCTAAGCTTATGTAACATTTGC:1 - chr3R 21946929 3' + invader2 5083 2 72.60 GATCGACAAATGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGGTAACGGAATTTTTTTACAGATTTTCGAAACGCATTTCTAAGCAACCGACGTGGACGGACTCTTATTGA:1 - chr3L 20060673 3' + Bica 451 1 57.53 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATGCAATGAAAAGCAACCAAAAAGGAACGAATCAAAGGGGATGCCCGCCCACAGACAA:1 + chr2R 15151159 3' - hopper 13 1 74.05 AGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCA:1 - chr2R 7889395 3' - jockey 97 1 75.34 ATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATATTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGTTTGCTGACAACGAATTAAAAAAAATCCAACTGGAAACTAGAAACGAATGTTGTGTGGATTT:1 + chr3R 27854496 3' - G2 90 1 61.64 AATAATAATAATACTTTAAATTAACATTATCGGACACTAAAATGTAATATAATCAGAAAATTATGAGATGTTATTGTTAAAACTTTTTAAAATAGAAGATAATTGCTTTATGACATAGTGCTAATTAATTACCACAATTGTGCCAC:2 + chr3L 16762446 3' - Burdock 499 1 66.44 GCATTTACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTAAAAGCCGGGATACTCAACTATAGCATTCTTTCTTGTTTAAGAAAGCCAGCAGAAGGTGGTGCTCTTTTATTCTTCCATCCACATCTGCATATGTCATTCTCCACTTTATACTGTT:1 - chr2L 14506662 3' + INE-1 534 1 51.37 AGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCGAATGGGAGGCACCCAGGGAAATGGG:1 + chr3L 18738166 3' + Bari1 1676 1 59.68 CTGCGGATTTTCTTGCCTCAGTGAAACGCCTAAAAATAAGCCCGATGCAGATGAGTGCGCAGCATATTGCTCCTGCAATAATTGCTACGAGACGTGTTCTTTGTTGCTAGCAAATGTTGAGTGCGTTTGCAGACTTCGCTTGCAAC:1 - chr2R 13658578 3' - gypsy6 7333 1 70.55 TACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGGAATTATTAACTTATATATATATATATTTGATGAAATTCTTTTGGGGGAAGTCTACGATACACACCATGCG:1 - chr2L 5710911 3' + HMS-Beagle 6976 2 67.81 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAATTATAGCTGGGGCCAAATTAAACGCGCAAAATGGAGGCAAAAATTTGATTTGATGATGTCTAAGGTCGC:1 + chr3R 23668542 3' - pogo 46 1 53.42 CTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTCGTACTTTTCCATTCAAATCTCCTATTGCAGTTGTTAAAAACG:1 - chr3L 20209503 3' - Burdock 19 2 72.41 CTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAGTGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTAAAAGCCTCACTACAGAATAAGAAGGCCAAAACCAG:1 + chr2L 15322982 3' - diver 257 1 63.70 TCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATGTGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATT:1 + chr2R 6085997 3' - 1360 491 1 60.27 CCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTTTTTATTAACTTTTGATCACCTAACCGGGACTTGTAAAATGGATATATAACTCAAG:1 - chr2R 10406208 3' + FB 85 1 64.38 GTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACAATGATCATGTGTTTTACTTTGTTGCAGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTT:1 - chr2R 6271508 3' + Burdock 6325 2 64.38 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACTTTTATACATTGCTCTGTGCACCAACACATTTTGCATTCCCCTTTGTGCTATGTTCCTCTCTCTTA:1 + chr3R 3590769 3' - pogo 50 1 54.48 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATACGTGCGTGGGCGTTGATTAAGTGCCACTGGTGTGCACACATGCCAACATATGTACAAATATCAAGGTGGGTTGGTTCTACCCCTCATCAAATGGCACTCGCCGCCAGTATATTTCAATAATCT:1 - chr3L 10552253 3' - accord 7027 2 82.88 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATACTGTTTTGGATAATGCAAAGCAGATAAAGGAAGAATGGATTAAATTGTCTAGCAGCTGAGGTGTGATCATGTCTTGGCTAAAAA:1 - chrX 21581320 3' + Tabor 448 2 52.74 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATATTTAACAGTCGGTTATATGTACATATGCATATATTTATAAAAAATCCTACATATACA:1 + chr2R 21473693 3' + pogo 2043 1 60.27 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGTGCCATATACAAAGACAGAAAATCATTAGGTATAACACCAAATTGGCT:1 + chr2L 261094 3' + Juan 4184 1 65.75 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGATAACGGGGCTTATCTGAGCCGGCAAGACTCAAGTTGGA:1 - chr3L 13228441 3' + P-element 2861 1 64.39 GGTAATTGTAGCTGTTAATTGTTTTGCCTGCAATGCAAAAGCCGGTAAGGTCGTTCACTGAATCGGTTGAGTTGAAGAGACTGTTTCGGTTGTTGTTGTTGTCG:1 + chrX 7740687 3' - Doc4-element 396 1 86.54 GTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGACAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGGTGGGAGGCAACT:1 + chr3R 8049040 3' - Q-element 118 2 65.07 GTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 47 1 70.83 TTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATGTACATGAATGACGTCAATAAGTTTTCTAATCGCGCAAAAATGTTGGTTAATTATTCGTTGTC:1 - chr2L 13509183 3' - F-element 4652 1 61.64 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAATACTCAAATGTCATCTCCTTAGCTTCAACGTTGTTCAGGGT:1 - chr3L 24253584 3' - 297 6620 2 55.47 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATATATAATTTATATTCGACCATTTGTGAAACTAAAGGCTAACATGATTTCGTTCACACTTATGAATTTAGTTGCCAAGGCTGATTACCCATGTATTTAT:1 - chr3R 21753393 3' - 297 11 2 61.11 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTGAGGAAATTGCACACCACACTAGGACCTTTGGGACCGTTGCACTATTGCCATCTTATACGGATGGAATTAAAG:1 - chr2R 4802917 3' - roo 8710 2 54.11 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACCAAAAGTTTTGCGTTATCTGTGACATTCGCTTTGCCCA:1 - chr3L 17904795 3' - roo 8745 2 77.24 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAATAAAATATGCGTTTCCAAAAGAGAGATTGGC:1 + chrX 17027993 3' + roo 9043 1 69.86 CAAGACTCCCCGGAGGTAACTCGCGCGTCTCGCGAAAATACTCTCCTCGACTATCCTCGCATACGTACGGCGCCACGCGTGTTGAGACTGACTG:1 - chr3R 1027408 3' + ZAM 453 1 77.66 AAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTGCTCTTATTTTATTTATTTATTTTAAAGACTTAATATGTTTTTCTGCACACGATA:1 - chr3R 904611 3' - 3S18 5833 2 63.01 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAAGCTTGGATTTGCTTGGCTTGCTCCATACAAACAGGAAATGGCCAATGCCTTTGAGCTTGCAAAGCAGATTT:1 - chr3R 20074537 3' - roo 8713 2 52.05 TTATACTATCCTCCGGGTAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGTGCATAGATCGATGAAAGCATCGGGATCACGATTCCGAGCGGATCGAACAGGTGGTGCACGGTCCAAATGGGACAGATCTATCACTTC:1 - chr3R 5825816 3' - G5 4665 1 66.44 CAAAACTGTCACGCCCACACATTTACGAAATGTGTTGATATTTCTGCACAATTTTATTAGTCATATAATTTCTATCGATATGGAAAAAAATTTTGCCACGCTCACTTATTTTACATTTTTAAATTCCCCAATATCTATCGATATCC:1 + chrX 23078695 3' + INE-1 244 1 44.52 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATACCTTATGAAATATGGAGGTATTGCAATGTCACATATAATAAGAAAATTCGCTCACTTCCGCATTCGACGATGAGCT:1 - chr3L 3626560 3' - blood 7055 2 45.89 GCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGACTTATTATTCTTTAGGTTTAGAATAGAGGAAAACAAGGTCACAGTGATTCGGACCGGTATGTAA:1 + chr2R 4803039 3' + roo 9017 2 54.79 CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATAATATGTTGTTATTTATGGAGATTTTTCCAGGTCC:1 - chr3L 1981541 3' - opus 7183 4 78.12 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTTCTCCGTGTGATTTCGGCTTGGGCCAGGAAGTATGGAACGATTTTTGTTTTAGCTTCC:1 + chr3L 13366186 3' + hobo 2920 1 50.52 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGCCCGAAAACGTATGCTACGCTGTGTGAAA:1 - chrX 6484699 3' - jockey 57 1 53.10 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTAGGCGTATTGTTTGAAACAGAAGATTACCCAT:1 + chr3R 25718251 3' + I-element 5270 1 76.03 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACGTTACGAAACAAGAGAAATGACAACGTTGCTAAATG:1 + chr2R 20447919 3' + hopper 1376 1 57.53 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGG:1 - chr3L 10563883 3' - hopper 52 1 53.42 CTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGATTTTGGAAGATTAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTTGGCCGGGACGTCGGTTAGGAAAATAGAAACTGGCG:1 - chr2R 11376355 3' + Burdock 118 2 74.29 CCATAGAATAAATAAATAAATCTTTTAACTTTTCACAATTCAGTGCACATAAAATGTGTATATTATTTCTTACACATTTTTTTGATGTCCCTGTAAGTGAGCAATTAAATTTTCGACGTCGATATACGCATTGTTTAAGCCCAATA:1 - chr2L 16948294 3' + Doc3-element 80 1 65.75 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGATAGATGTAGCTAAGCAAAGTTTGCCGTGGAAGGATGAGTCCTGCG:1 - chrX 12214473 3' - opus 164 4 63.57 CTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATAATCAGATATTAATTATTGTTAAATGACTTTAGATTGAGTTCATAGCTTTTAAATTGATCATTCTATTAATTTTAAAAATAATATTTGTTA:1 + chr2R 12719830 3' + Dm88 4503 2 51.37 ATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTT:2 + chrX 10128270 3' + invader3 204 2 67.12 AAAGGGATATGAAAAAATACCTTTGTATTACAAAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTAGCTAGGATATACCAGACGGGATGCAACCCTTAAACGTTGCACACCCTATCTTGGTCTTTAGGCCATTTACTAAT:1 + chr3L 22164316 3' - HB 54 1 72.60 GATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTATGATTTGGACAGTCTGTCTAACGACATTAACTGCCCCACGGATTTTGGTAAACTGTAT:1 + chrX 17602367 3' - mdg1 202 2 60.27 TTGTATTTTAATTTATTTTTAAATTCTGAAAGTAATTTTAATTTAAAAAAAACTTGAGAGCTGAAGAAGAAGAATTAAGAAATATTTGGTTGTAAAATAATTGTTGAATCTATTTTTTTCCAATAACACGACTTATATATTTTTTG:2 + chr3R 22462304 3' + Rt1b 121 1 52.05 AAATCAGAAGGCTTACAGACGTAAACCAATTATCAAAATATAGTTTAAAATTTTTGTCTTTGGGAAGACTTTTTGCCAAATATATGATATACTGGTAACATTGTAAATATTTAACTAGTAAGTAGGATGCGAGAAACGGCGTTAGA:1 + chr3L 21605487 3' - looper1 1444 1 57.53 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTACTTTTGGGATAAAACAAAATACAATCTTACAAAACAAAAAGTTAGAATGGTTTAAATTTATGTTCAAAGTTT:1 - chr3L 16907756 3' - jockey 56 1 50.68 GGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAAACTGTGAACCGTTTTGCACAATGTCTGCGATCGCACTGAAAACGAAACAAGGCAC:1 - chr2R 9139074 3' + P-element 2560 1 38.36 CACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGCTTTATTTATGCG:1 - chr3L 23456268 3' + Gypsy6A_LTR 260 1 66.67 GTTCGGAAAAATCGAATTTTTTAAATTTGAAAACTGGAATCGTTTGCCCACTTTTTGTCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTATTTAT:1 - chr3R 20001636 3' + FB 17 1 58.90 TGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCCATAAATATGATGATAATTAAGTGTGTGTCTGGCACATATACTCAATTTGGCCTTATTAACCTAAAAAATGACACAGATATTAATTTTCCGCACACATGTGCCCGCTTTTCCG:1 + chrX 20874438 3' - F-element 335 1 79.45 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCCACTGGGCTTAAATATTTAGCAACAGTTTGCAGCGGGGAAGTTTTT:1 - chr2R 9623346 3' - I-element 75 1 65.25 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCAAAACACTTTACTTAACAAGGTATCATTTATTTACCGAACTCCTTACAAGAATATTCTCTACTTCCTGTA:1 - chr3R 29516472 3' - I-element 54 1 51.37 ACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTACAATAA:1 + chr3L 15099692 3' - G4 3803 1 60.69 CGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATTGATGTAATCAACAACGTGAAGAGGCCCGTCTGCGCCAGTTGAATATCCGCTCAAAGTTCGATCCACT:1 + chr2R 15942391 3' - opus 7159 4 50.71 GGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATATATCATTGATAAAAAAAGCTTTTCCTCTGCGCATTTTCCCTAGTATACTTTTCGGATTGCGTGTGGAAATCACGAACAGATCTTTGAACCCTGAAC:1 - chr3L 18554556 3' - jockey 4583 1 66.44 AAAATGTTACCACTCATCATTTGCAGAACCTTTTAGGTCAATTATATAAGAATGTCTGCAGGGCTTTATGAAACGCAGATCAAAAAATATTAATATTACTCAGGGAATTAAATGGAAATTAAATTGAAAGGGCAGAATAGGGAAGG:1 - chr3R 18264702 3' + Q-element 152 2 56.85 ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGTATATTTTCATTGCACGTTTACTTCATAGTAAGATAATATTAAATGTTTTCCCAGCTCAACCAAGCTTTCACTTTCCTTTAAATTTAATT:1 + chr3L 13156834 3' - transib2 30 1 65.07 TACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCACAAGCAAAGTAATTCAATTTCCCGGCTTACAGCTCTTTTTTGGCCACTGGGCAACGGAAGAGAGAAGAAGGGTTCACCCTTCGTGCCGGGC:1 - chr3L 3565277 3' + gypsy 438 2 62.14 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAAGTGTTTTGGGGGTGGTGCAACCGATAAGTAGAGTTGGGCTTAAA:1 + chr3R 29516557 3' + I-element 5280 1 69.86 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTGCGCATTTTATTTTCCACTTTGCTTGTATTTATTTAAATTTGAGCCCGGC:1 + chr2L 16385331 3' - I-element 69 1 65.75 CGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTGCGGCT:1 - chr2R 1320647 3' + diver2 336 2 58.90 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGAATTACCGCGATAGG:1 - chr3L 16463491 3' - roo 61 2 60.27 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGTGGCCTTTGTTTAGCGTTTTTCGATTAACTTCTGCGGTTGGTTTTCCCTCTTTTTTTTCGTGGCTCCTGTTTTGCT:1 - chr2L 14490090 3' + P-element 2872 1 70.43 AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACCTTCTGCAAGGGTCTAAAAAGTAAAGCGTTATAACTTGGCCTCTTTTTTACAATTT:1 - chr3R 5477949 3' + 297 331 2 62.33 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGCCACTCGCGCAAAATTTCAATCTGATCGATTTGTGTATTTGTCAAACTGATTTATCGAGTGTCTCGATTTGTTG:1 - chr3R 22868713 3' - mdg1 7060 2 68.49 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAATTAATTGAAATCTCTATTTTAAGTAATATTGATAACGATTAATAGTAGAAAAGGTTATAAATCTGGTGGGCGGGTGTCATGTCTAA:1 - chr2L 12488215 3' + copia 221 1 56.85 TGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCATCGTCTAGCAGATTAAAGTGCAATGAAAGTGAGTGGTAAAGTCGTGGGCTTTTGAGGAAAAACAATTGCATAAGCTCGG:1 + chr3L 16703896 3' + FB 14 1 58.46 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAG:1 + chrX 14346494 3' + roo 360 2 62.28 AAAAAAATAAAAAAAAAACATTCACAATGTTGCATAGACACCTTTGTTTATTGAGCAATCTGAGTAATGAATATATGGGCTAAGCACTGAATTTTACTTATCATTACAAAGAAAAGTTATGTAATATTTGTAGTGTATATTCTTGA:1 + chrX 5485083 3' + HMS-Beagle2 491 4 58.90 CATCACAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTTGGTGGGTTTCTTTTGCCGGCTGGCGCCG:1 - chr3L 5571377 3' + 1360 365 1 73.64 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGTCTATACTGTAGGCCAAGCCACATATATAAGCAAACAATATATATAAATACATATGGGGTGTGTGGGAACGGTGCTGCGCCCTCAAATCTTATCGCTTTCGT:1 + chr3L 12899892 3' - roo 8677 2 74.10 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAATTATAGCTGGGGCCAAATTAAACGCGCAAAATGGAGGCAAAAATTTGATTTGATGATGTCTAAGGTCGCCGGCAAAGA:1 + chr3R 23668551 3' - pogo 37 1 59.59 TAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCC:1 + chr3R 4571527 3' + 1360 72 1 94.53 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCAGTTTTAAGTTGCGAAGACGTCCCACTGTAACCCCAACTAT:1 - chr2L 11613231 3' + hobo 2894 1 65.18 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGAAAAAACATCATCACCCGCCCAAGGTTCATCTAATCATTGATTAAGCTGATTTTATTAGAAAAAGATTAATAAAACCCTTCAGTTCG:1 + chr2R 11339165 3' + jockey 4956 1 43.45 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCTGACTCTGATCTTCTGTATTTGAACGCATTTATGTACATG:1 - chr3L 20399000 3' - roo 79 2 73.79 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACTTAGCTTATAATTATTTTCCGAAATCGGTTTTAATCTGTTTCAAGTGGCTTTTCAACGTTTTTCTATATCGGATAATTATGTTCTTTAACGAATT:1 + chr3R 12727267 3' + I-element 5331 1 60.27 CATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTACTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATT:1 + chr3R 29091401 3' - rover 6999 2 54.11 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACAAAATGGGGGAGGAGAAATCTGAGGCAACGGCGCTGCTCAGTGAAAA:1 - chr3R 20939150 3' - jockey 4748 1 69.18 AGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGGGCACACCAAGGAACAGCTACCCTGATACCATCAGAGACAAATCCTGAAGTAATTTTCTCGAAAGCAGCAAGTTTCGCTCCC:1 - chrX 2343615 3' + gypsy5 369 2 59.59 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAACTTGATC:1 - chr3R 30850767 3' - I-element 75 1 66.44 TATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGTATCTTTGTATCTTGTGGTGTGTTTGTGTTTGGGGTTACGAAGGTATTCCTTTGTTCGCACTGAAGTGGCAGTGCCACACATCCTAATTGTTTCCACCGACTTAT:1 + chr2L 3541499 3' - I-element 5010 1 76.22 ATATATTTTTTAAAAACAAACAAAAAATGGCAAAACGGCACTCTAAATACCCTCTAAAGGTAGCTCCTTTCCAAATTTATGTACGTTACGAATGAATTCTTCTTGTGCTTCACATACTTACTAAACATTTAATTTGTTTAATGTTT:1 + chrX 5717094 3' - transib4 455 1 63.70 TTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTTTACTTGTTGTGCGGAAACTGCAGCTGCGATTCTTATGGCAAAGTGTT:1 - chr2L 13764145 3' - I-element 5222 1 67.12 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATTAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATTCGAGGTTAAATTGTTGTTTGGGGCTTCTTTTGCAAATC:2 - chr2R 13193798 3' - BS 5076 1 70.55 GTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTCTCAAAACTGGGATGTGACGCCACTTTTTTAAATAAGCATAAAGAGCGACGCAGCCTTCAAGGACCTTCGCCACTCCAGCTCCTTCGCTGGGCTTTAATGTGCAGCTG:1 + chr2L 10519670 3' - X-element 20 1 73.29 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAGTACAGTAACTTGTAAAGTCCACTTAAGATTGTCCGTCCGCCTGTCTGTCAATTACAATAAATGCATCCTTCATCAGGTTGCGTTAGTGT:1 + chr2R 8452867 3' + blood 345 2 63.70 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAGACGTACATACATAAGTTATTGCTATGCC:1 + chr3L 22884064 3' + roo 9047 1 69.18 ACAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGGTATGTGATAGAATGGTGCATACTAAGTGCGCTGGTTTTATTGATGTAATTTGCATAAATTTACACTTGCCTCGCAATCTGTCAAAATATTTCAC:1 - chr3L 15416238 3' + Cr1a 465 1 62.33 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGCTTTATTTAATCTTAAGCTTCCTCGTTTAGTAACTAAATATTTTATACATATGTATATATGTGTAAGAGTGAGTTTTCCCT:1 - chr3R 12609971 3' + roo 9032 1 57.53 AAAACTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGGTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGGTAAACGCTG:1 + chrX 17027942 3' + roo 390 2 55.29 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAACATAATACATATTTTCGAGGTGTGCTTACGTTAGGTAATCATTTATAG:1 - chr3R 17467099 3' - I-element 69 1 65.52 GTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTACTTATAATTAATATCTTATCTTATAATATCTTATACTTATACTATACTGGCACATATGCTACTATATATATATATCTATAGATTTACTTAGTATTGTTTCAAATCTAGCGAG:1 + chr2R 4673651 3' - Quasimodo 29 2 44.52 ATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCTTTTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAAACGAGGCGGCGCCCTCTGCTTCATTGAGTCTTACTTCAGTACAAATTCGCCCGCATGTCCAA:1 + chr3L 22759963 3' + R1A1-element 72 1 52.17 TATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATATAGTAGATATATCCTTGATATGGATCAATACAAAATATAAAAGATGGAAGATCCAGCATACGGATTCTAATGATCATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACATAAATAA:1 + chr2R 18487358 3' + INE-1 29 1 52.05 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACA:1 - chr3L 16463512 3' - roo 8746 2 74.66 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTAAGAGTTAAATCGTCGTCGTCGTCGTGATCCGGCATTCAATGGATAATTA:1 + chrX 18737300 3' - I-element 68 1 64.83 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATATGTAGGTAATACGAATATGGATTTTGAAACTGGGGAGCATCAATACCAATACAAGGACATTTTGTCC:1 + chr2R 17021430 3' - pogo 47 1 56.55 CGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTAATGATGCTTGGTCTAAAATAGATTTTCCCAATTCAAAAAACGCCCATACAAAAGTAGCCCCACTATAAAAAACTGTCTA:1 - chr3R 22771867 3' - opus 156 4 56.16 GGGGGGAGGGGGGGGGAGGAGATAGCAAGAAAGCCGTAGAAGGCACAGGCAGGCA:1 - chrX 18245343 3' - accord2 222 1 90.91 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGCTGGTATGAAGAGGAGGGAATGGAGAGGGTGAGGAAGGGGG:1 + chr2L 18178404 3' - Tirant 11 2 75.38 TAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATT:1 - chrX 9437205 3' - roo 8791 2 44.52 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGATTTTAGTAATTGGCCATATAAATTATAAGATATTTA:1 + chrX 11267777 3' + roo 8989 2 82.19 ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGATGGCTGCCGGAATTGAATTGACGCTCATGATTATTTACGCAAAGTGGATTAGAAAATT:1 - chrX 19982350 3' + hopper 1351 1 58.22 AATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATTTAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAGGATTTGCAACGACACCACCTTGACGGATGGAGCCAACCATGATTACCGGCTGTGGTGCACCTCCT:1 + chr3L 4892579 3' - 1360 273 1 50.38 GGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAATTTGTTGAAATAATTGCATCGAGCGGGCGGCTGTGTGGGTGGCTGTGGGCTGAGTGG:1 - chr3R 13557746 3' - G2 2959 1 73.17 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTACACATCCCCATGACGTTCCTAGACAGTCTGGTGTCAAACGTGATTTAACTTGAAAG:1 + chr2L 9347573 3' + opus 7440 2 60.96 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAATGTTTATATATAGATTGGACTTTACACAAGCTATTTAATGCTTAATCAGTG:1 - chr3R 8596347 3' - hobo 66 1 61.38 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGTAGACATATATATATGTATATAGTAGCCCGATCTGCCTGTCGCT:1 + chrX 12214564 3' + opus 433 2 76.43 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAATTGTGAGAGTATCTGGCCAATGAAATTTATGTGGTAAATTATTCACAAAATATACCGTTCAGTTCATT:1 - chr3R 9193131 3' - opus 7050 4 53.42 GCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTT:1 - chr2R 5582176 3' - Cr1a 495 1 54.79 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAATTATTCAAAAAATGCGATTGTTATTTGCAAAATGTGCAGTGAATTGAGACGCTCGCAGACAAGCGACGACGACTGCTGCCGCTGCGATTTACG:1 + chr3L 17108672 3' - hobo 14 1 74.81 AACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGGGAGCAGGCCTTAAATATAAATATTTCTAACCAACCAAATGA:1 - chr2R 13468101 3' + flea 4760 1 71.23 ACACCGGGGGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTCGCCTTTTAACTGAGATATGGCAACAATGTTGAGCTTCAAATTGATTTTCGATCTCGACATAGCATTCTTGTTTTAATTTATTTTGTATGTTTGCTAATA:1 - chrX 20460510 3' - diver 10 2 73.68 ATTTATAACATTTTTATTTTTTTTCTTTTGGTTCTACACACAACCAGAGGTATTTAAAATTCGCTTAATTTGCGGGCTGCATTTTATTTTCATTGCAATTTTTATTGGACTGCTCTGTGCGCGTTCATTTTGTTAGCCTCAAAAAA:1 - chr3L 10657584 3' - Tc3 1569 1 77.40 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGGGGCCGATTTCGTGCGCGTTACACGTTCGTGCGA:1 - chr2L 22719582 3' - 1360 73 1 69.18 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTGTTTTCCGAATTGGTAAAAAATGCTCACTCTTAAATTATTACGTGTTAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTC:1 - chr3L 13827363 3' - roo 44 2 56.16 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGTGAAAAGAAAAACGTTTTATGAGCTCATTCACAAAAAGGGCCAAAACACACACACAGGCACACCCATACAGTCGCA:1 + chr2R 8335037 3' + transib2 2803 2 66.67 CTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGTTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATATTTATATAAA:1 - chr2L 23299980 3' - invader4 355 1 62.39 TCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCATGACATCCTTCGCGACAGGAGCGAACGGTGGCCTCGAAGACCAAGAAATTGGACTCGGGTATCTTG:1 + chr2R 11312271 3' - accord 206 2 54.79 CTGCATGGCGCTTTCCATCAGGATTCTTTAAGATTATTCAGTACAAATTATTTAATCTTATCTTACCGCAGTTTGCCCTCCATTATTATTCCAAACTGGGATACTTGTCTTTCCTCTGCCACCTCGCATCGTTAAGAATCGAAAAC:1 - chrX 1797023 3' + baggins 5253 1 56.16 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATCTGCCTACTTCTAGACTCCGAAATTCAAAATTTTGTAGTGCACTTTCAAATATCTCAAACCGGCATCT:1 + chr2R 1375180 3' + 297 6928 2 54.11 ATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATATATGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAG:1 + chrX 12657099 3' + Stalker4 7057 4 53.10 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCAGTGCAACAACTTGTTACTCATGTCCTGCTCACGAAATTCGCTCTGTTCGGCTCTCTTAACGG:1 - chr3R 25137854 3' + P-element 2829 1 45.89 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGA:1 + chr3R 22522703 3' + roo 320 2 75.34 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACTCCAGCTTCTTTGAGCTTATAAATTTACAACAAATTGCCTTCGTTTTGTTTGAGTTTAGCGATTGCATTGGGGACTTTGCTTGATTAATTTTCG:1 - chr3R 22053267 3' - FB 48 1 51.37 GGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATTCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTCTTATCAGAAGCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTTAGTAACCACTGTATTTGCAGGCTTAAAGATAATAAGGAA:1 - chr3L 6978109 3' - 17.6 7039 2 50.68 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCGGGAATTTCAAT:1 - chr3L 12861687 3' + pogo 2060 1 56.16 AGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAG:1 - chr3R 9175207 3' - Juan 72 1 62.33 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGATAACGGGGCTTATCTGAGCCGGCAAGACTCAAGTTGGATTCTCATTGAGTCAG:1 - chr3L 13228426 3' + P-element 2881 2 78.74 GTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACATCA:1 - chr3R 907901 3' - gypsy11 364 2 30.82 CTTGGAACAGTCTTTATTTGAGGGCTTATTTGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGCTTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCATTATCTTTATAATACATTTAGCTTGCGGAAGAGG:1 - chrX 6936239 3' + Cr1a 4031 1 76.03 ACAAATACATATACATACATATATATATACGTTCTTGAAGGACGCAGCAAAATGCCAAACGCAAATGTCGCCTCTTATAATAATGGCAATCGATGGCTGACTGAGGATGCCGGCTAGCTGAAGGATATTGATGGTGCGACATATTG:1 + chr3L 7461561 3' - 1731 4413 1 54.11 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCGAGATAAGCAAATGAATTTCAGCACTTATCATATACAA:1 + chr2L 10045270 3' - jockey 90 1 70.55 AGAAGGGACATGTAACCAGATCCCTTCAGTGAAGTTGGACTGTTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGCCGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAACGAAATGGACATGTACATGGCCGACACGTACATAAACAGTCCAGCCCAAG:1 + chr2R 4794602 3' + invader4 2979 2 65.07 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAATGTTTATATATAGATTGGACTGTACACAAGCTATTTAATGCTTAATCAGTGATTTCAGCTTTTTAGTTAAATATTTCTAAGCTTTAGCCATAGTTATTAT:1 - chr3R 8596298 3' - hobo 18 1 70.55 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGACTTTTTACAATTGGTTCTCGCAGTGTGTCTGATGAAATATTTATTAAAA:1 + chr3R 15770959 3' - Burdock 44 2 76.03 GAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATATTACTTAAATAATATTTCTTTCCGTGCATACTTTATT:1 + chr2R 21377474 3' + micropia 192 2 73.97 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGCTGGTATGAAGAGGAGG:1 + chr2L 18178380 3' - Tirant 40 2 56.30 GAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTATACAGTGGTTTATAAAGAAATATTTTTGCTGGAAATACTTAACATACTCATTTAATTGCGTGCTTTGGGATCAGGAATTTCCTGAGCTCCATTAAATCTATCTCTTATCAAGA:1 - chr2R 15372409 3' + 1360 3322 1 65.07 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAAATTAAAGATCAGAGACACGTTGAAAAGGGTTTAATTTTGGCTAAAAAGATTGCAGATGGCTGGCGATTACATTTAAGCAGCAATTATTCT:1 - chr3L 17206878 3' + I-element 5325 1 64.38 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATGACTTTTCCGCCGCGCGAAATTAACAGCTCATGAAATATGCCCTGAAATGTATGCAACGCGCCATTGTTGTGAATCTCGTTCTGAAGAGCTGGACTCGTC:1 + chr2L 11923000 3' - jockey 4776 1 68.53 GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATAAACAAATGTGTGAAATTTCGTCTGGCTCTTTTTCTTCTTCTTCTAAGTCTA:1 - chr3L 3756153 3' - BS 5066 1 66.44 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGT:1 - chr3L 10563882 3' - hopper 51 1 52.74 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAGGGTAGGAGAGTGTCTGTTGTCGTCGGAGACCTTGCACCGACC:1 + chr3R 22522755 3' + roo 9042 1 64.29 TTAGGTCACCTTTTTAAATAAGACACAAAAAAAACGCGAAAAGTGCTGCTTATAACGCAGTTTTATATGCATATGCTAGTTTAATGTTTAAAAGACTGGGTCCCCAAAAACTCAAAAATCGCCCAGACCACAGCCCCCCTCCC:1 + chr3L 15942859 3' - TAHRE 354 1 57.34 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAAACGACGATGCCAATTCGTGACGCCAGTGACTTCGGC:1 + chr2L 13717377 3' - P-element 83 1 30.14 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACCTTCTGCAAGGGTCTAAAAAGTAAAGCGTTATAACTTGGCCTCTT:1 - chr3R 5477960 3' + 297 6901 2 69.86 CCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTTTGAACCATTCGCAAAGCGCCTTAAAATCTCGCACATAGTTTTCAAGCACCAAAATAGTCTCTTGGCAACTGGAAATGTTT:1 + chr2L 18942681 3' + P-element 2751 1 60.96 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGAATG:1 - chr3L 15276646 3' + hopper 1413 2 66.20 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGGTATAA:1 + chr3L 12861811 3' - pogo 61 1 62.33 GGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGCATATGTATGTACCAGGAATAGCATAGGATACATAGAAACTCAAGTGTGTAATATCAAAACATCAATTAATCGCTGTCCTGTA:1 - chr3R 5430367 3' - Burdock 36 2 59.59 TTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGGCAAAACCAGGTTAAGGACGTTTAACGGCATTTTTACACTTGCATGCGTCATCGGAGTAACCTTTCCGTTTGTTCGTGCGTGGCTCCAAGTGTT:1 + chr3L 22321597 3' - jockey 4820 1 58.45 GGCTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGAAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTTTGTCAAATTAAGGCCTTGT:1 - chr2R 9410491 3' + hopper2 1513 1 78.47 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTCCTCT:1 + chrX 16217539 3' + P-element 2849 1 55.64 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGACGTC:1 - chr2R 7889379 3' - jockey 63 1 60.94 GCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCCTGT:1 + chr3R 14860251 3' - BS 5030 1 60.96 TAGAAATATATATTGACAATTTTTCATTGGACAATATTAAAATAATACAAATAACTGGCATAACATTTTGTTTTTACATTTTATTCAAGCAAAAGCACACTGTGCCTACTTTCAGCTAATTCATTTTCCTGTTCCCTTCCGCTTTC:1 + chr2L 7401133 3' - TART-A 13337 1 73.29 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATTTGTTGAATGTCGAAAATATACACTGTGTACGGAGGTT:1 - chr3R 5868195 3' - jockey 75 1 70.77 CAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTTTAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACGTTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCATGCAAGCTGTTACTTTTC:1 - chr3L 20224105 3' + Chimpo 155 1 61.64 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGATTCGCATTTCCGGGTTATTGATTATTGTTTAAAAAGTTTTGAGAACTTTTTGTT:1 + chr2L 13510916 3' - diver 25 2 67.36 ACTAAAATTATTCAACAATTTTCCTTAAGTTGAGTAAACAATGAGTTAAAAACAAATATATTGAATATATTACTTGTCTTAATACTTATGCCCACTAGTGTATTTAACCTCTGATTTCCAAATTGAGTGAAAGCTTCGCTAGTAAT:1 + chr3R 15139868 3' + Tc1-2 1549 1 80.14 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACAAAATGGGGTAGGAGAAATCTGAGGCAACTGCGCTGCTCAGTGAAAAGTCA:1 - chr3R 20939146 3' - jockey 4706 1 56.48 CAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAG:1 + chr3L 10563988 3' + hopper2 1542 1 59.59 TTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCTTCGGACCATTTACTTTTTATTTCCAGATGTGTCGCAAGATTTGCTTCCG:1 + chr3R 26244759 3' + copia 236 1 67.86 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAAAAGCTCCGCTTTTCGGGCTAACACAACCGC:1 - chr2R 12069551 3' - Tirant 8147 2 56.93 CCGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCC:1 - chr3R 4532887 3' + 1360 3314 1 69.66 TAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCAAATTGATTTTAATAATAAACGGTGTGCATAATTTGGGATGATATTTTCGCCGTTACCTCCAATCTTACAAGTGTTGACTGTGGCTGAATAAGAAGGCTCTTTGCGTTGACT:1 - chr3R 17209953 3' + HMS-Beagle2 304 2 78.47 ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCACAAACTCCTCAAGCATATCCCCAA:1 + chrX 20465882 3' - jockey 4767 1 64.65 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAATTTTTCACGCATTTGACTGCATTACTTAACCTCA:1 + chr3R 31681925 3' - Doc 42 1 65.98 GTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTTATAACTAATCTTAACAGATGCCTAAAGTTTAA:1 - chr3R 8914276 3' - pogo 85 1 76.03 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTGGCCGCCCCGTTGGATATATGTAGATATGGAGATGGCCACGCCCAT:1 + chr3L 20399125 3' + roo 396 1 74.47 TTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATT:1 + chrX 1018163 3' - 1360 232 1 69.18 ATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTATCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTCTGAGTTCTATATAGCTTCTTCATGCTGTAGATTCTCGATTTGCGGTGCCGTTCTGATTTATGATACTGCACATGC:1 - chr2L 8670921 3' - gypsy4 449 1 54.81 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACTTAGTATGTACTACATACATACAAACATTCATATGTATATCGGGCATTCGAACGTTAACATGCACACTCGTATGTGTGTCAGTAG:1 + chr2L 470330 3' - Burdock 6164 2 65.25 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATTGATGTAATCAACAACGTGAAGAGGCCCGTCTGCGCCATTTGAATATCCGCTC:1 + chr2R 15942376 3' - opus 7026 2 53.33 AGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTT:1 - chr3R 10461671 3' + roo 8992 2 72.60 GCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACAGAAAAGTCGGAGAGCATAAATTTTAAATAAAATACATCGTTATGATTTCAATTAAATGCCGTATTAATTGGCATCTAATTCTA:1 + chrX 12346049 3' + invader2 457 1 56.85 CTTATTCTATTCCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACGGCTGCCTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCATGCAACACTGATGTAATGTTTAAAGTCTAAAGTCTGTGGGGGCATCTCACT:1 + chr3R 30458250 3' - Circe 7199 1 63.70 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTACATGCTATTCGTTCACGCCCTTCAAAATTCGATGTAGTTTTATTACCAAATCAAATGGGATTCACCACAAAGTAAATACTCTGAACGGAAA:1 - chr2R 21029322 3' - Transpac 4946 2 64.38 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTATGTGCATGCCACCTCTCGCTCGCACTCGCTGCCCTCTCTCTCACTCTCTCCGCTGGTTGCTAGTGTGTGTGTGTGTGTGATATGCTTTATGATTTGCAGCCGTAGTTTTCC:1 - chr2L 12678457 3' + P-element 2883 2 80.00 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTATATAAACTTATTCTTTTTACCTTTCTTTACTTTCAGGTAAGGATATAAAGAGTTTTCTTATT:1 + chrX 3767679 3' - I-element 59 1 58.62 GATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTTT:1 - chr2R 9504196 3' + roo 359 2 53.79 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGTTTGCTCTATAACTAATCTCGTTTATCACGATTGTCGTGTCACGCTCGCGTCGTTTGACCCACACACACACACACACACACAATCTCTC:1 + chr2R 21021373 3' + 412 7539 2 77.78 TTAACTTTTTTTTTTGTTTTTTAAGTGATGTTGCAATGTAAGAAAAAGTGTCTATATTTACTATATTACTATTTACTAAATATGTTTAAATATTTACACACATACATAAATGGCCGAAGAAATTATTAACGCCA:1 + chrX 12044297 3' - P-element 2653 4 70.90 AAAGATAATATTTCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGAACGAACGACAAAGACGCCAAGCTTAAGTTTACCGAGTGCAACAAAATTGTCAAAATGCGCGCCTTC:1 + chr3R 9748969 3' - Circe 7069 1 52.55 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCTTTTCCTT:1 + chr3R 6412083 3' - Tirant 41 2 58.90 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTTAACCAAAACCATACCCATTCAGACGACAAGCAGATTTGCCTAATTCCATTTCGTTTCAGACTCGTTTCGGGCTCAATTAAAACC:1 + chr2L 1277930 3' + I-element 5321 1 59.59 GTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACAAAATGGGGTAGGAGAAATCTGAGGCAACTGCGCTGCTCAGTGAA:1 - chr3R 20939152 3' - jockey 4750 1 69.86 CGTGATTGTTTTTTTTTTTCATTTCGCACACACACCCACACACACACACACCCACACATGTGTGGCTTTTTCAGTGCATTGTGGGTGGTGCGGAGGTGTCCAAAAAAATAAAAAAAATAAAAAAATGGCAGATGAATTCGCTAATC:1 + chrX 7280020 3' - Doc 4593 1 80.82 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGAT:1 - chr2R 9504219 3' + roo 335 2 69.86 GGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACTTTGAGTTGTCACTTGGGCAAGAGAACTAGAAAAACTCAGTGCTCGCACGTATGTCACTG:1 + chr2R 7899205 3' - roo 39 2 51.20 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGGCCAAAAAGAGATTCCATCAGTTGGACAACAGGACGACCTGGTTTCGCTTTTGGACATTTTTAAGTGCGCTT:1 + chr2R 9623457 3' + I-element 5335 1 70.14 GAACTATAAAAGGTAGAAAGTTAAGATGAAGCATGAAGACTCTAGTGGCGCCTAAATGGGTATCTGATAGTCGATCTGAACTCGACTAAAGCATTCAATCTTGTTTGCACATAAACAGATGCATACCAGGCGTTCAAATATCCAAT:1 - chr3L 13896349 3' + INE-1 158 1 77.40 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACAGTAACAAATAAAGTTAAGTTTTTAAGAGGTAAAATAAATTGCAATAAAGGCAATGCAAGAAGCTATCCATGCATATACAATGTAT:1 - chr3L 2278112 3' + roo 9037 1 42.07 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGGGTATATTGCAGATCCATAGCTTGGTATTCCCTCT:1 - chrX 17510618 3' + roo 331 2 73.72 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACTGCACTTGGGGCTGAAAGTGCGTTCCTTGTCTTTGGCTGCCAAAATCCCACCTTCGCAACGAACCAATTCTAATGCGCTTAATTTTGAAC:1 + chr2R 16510364 3' + roo 9042 1 59.59 GAGTGGTAAAAACGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGTTAAACGCTAATGCCGCAAAGTAATTCAAAACTTAAAGCGCACTTTTCGGGGCTCTCGACGCGGTCTTA:1 - chr3R 18541299 3' - hobo 14 1 65.09 AAAAAAAAAACCTTTAAATTCAATCCCTTTCCCAGAACAATTAA:1 - chr2L 8578823 3' - Tc1 1464 2 40.91 AAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGTCGGCAATACAAA:1 + chr2R 11097412 3' - Juan 4029 1 73.55 AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATGAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATACGCCTTGTCCAGCTCCGTTTTTTTTTTTCTTGACCCATTTTTATAAGTGAGGTCAGTTTTTAGGAA:1 - chr2R 6492819 3' - copia 57 2 52.74 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTGCAAAGGGAGTGCATAAATCAAATAGAAATTCGTCACAAGCGACATTTCCCCGCAACCGTAACCGCTTGCAATCTTTCAGATACTTTTGTATGCAGTACGACTTCGCTGG:1 + chr2R 21029511 3' + Transpac 302 2 74.66 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGTTTGAGGACCCATAAAGAAGAATGCGAAGCATACTTCTTGGGGCTGACGGATTTCGGATTTCCCAACTAA:1 + chr3L 13362781 3' - jockey 32 1 67.12 TACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATAATTACTATTGTTGATAGCTGGGGCTTATTTATACATATCATTTTTAACATAATATGCCCAAAGTTCGAAAACAAGGAATG:1 + chrX 9959888 3' + I-element 5316 1 48.63 CTTCTAGATAAGTTTGCACTCCTTTTTCTTTTTAAATATGACCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGACCTTGAGGTGGCTTGAGAGATTTAATAGCAACAAATGGCAACACCTGCAAATGCACT:1 - chr3R 15009854 3' - Tc1-2 1221 1 64.34 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATCGAATGCAGCTGAGAATTACAAAGCTGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACACAGGCTGTAATAACATAAGAC:1 - chr3R 12622191 3' - 297 6604 2 64.62 ATTTAAAAGGTCAATAAATTAAAAAAAAAAATTGGTTTTTAGTGGGTAGCACTGCTGCCATGAGAAAAAAATGTTGATTCTTAAGCAAAAACAGGACGGAAAGAGCATGAAGAGTGCTACAAAACTTTATGCATGACATTCTG:1 - chr2R 23315823 3' + HB 305 1 71.33 GCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGGACCGTTTTGTTTTGCTCGTTTCACCGCCATTTTACAACTAT:1 + chr3R 5316636 3' + Juan 4176 1 50.00 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGCTCCTTGCCCCCGGG:1 - chr3L 18199952 3' - Doc 64 1 63.31 AAGAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTACTCAGCTAGGCTGTTTTGGGCGGTTTTAGGGAGTTGCAAAAAGTTTTTTACAAGATTTTTACAAGACTAATCAAAAATGAAAAAATTTCAACACATTTT:1 - chr2R 5466808 3' - INE-1 577 1 35.62 AATAATTGCAGTGCTGTGGACTTTTATTAAGCCAAAATGCTGCGCCTATGAGCCAATTTAATGTACAACATGGATTAGTATGTATCTGCTGACCTCATCGACGGAGGAACTCAAAAAGCGCACAAACAAACAAACCCCGA:1 - chr2R 25020172 3' - HB 1614 1 74.29 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAAACGACCTTGCACAAACCAACAACAACCATAGCGACGACAGCGGCGGCGAAGCAAACCACGAAGAAGAAGACGCAGCACC:1 - chr2L 21250917 3' + P-element 2881 2 76.15 AAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGTAAGATGTTAGCTTCTTG:1 - chr2R 5582121 3' - Cr1a 440 1 78.08 CCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAATTGTATTTTAATGGTATTCGCGTTTTGTTAATTTTT:1 - chr2R 10885264 3' + 297 6782 2 75.00 TAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTAAGAGTTAAATCGTCGTCGTCGTCGTGATCCGGCATTC:1 + chrX 18737288 3' - I-element 58 1 68.29 GCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGAAATCAGAATTGTCACAACAAATAATTCGATTGACTTGGATTATTAACCTTCTTAATCAATTCC:1 - chr2L 9349356 3' + opus 350 2 55.24 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTACCAAGCCTATTTACGGTTTAGCCTTTCGCTCTTTATTTATAGTTGTTGGCTTTTTTTTAAATCGTCGTGTGTATT:1 - chr2L 7449677 3' - roo 8710 2 54.79 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGT:1 - chr3L 10563888 3' - hopper 39 1 53.12 TGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAAGAGTTTAATATCAAATATCGTTTATTATCTTAACGTCCATTCGTTTA:1 + chr2R 22012228 3' + opus 7430 2 69.86 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGTTTGAGGACCCATAAAGAAGAATGCGAAGCATACTTCTTGGGGCTG:1 + chr3L 13362757 3' - jockey 25 1 64.35 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGACTAAGG:1 + chr3R 4532970 3' - 1360 62 1 61.64 GAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGACGCACACTGTTCTTCCAGCCGCTGGGGGCATTCTCGACGTAAGGGAAATGCTGGCATAGGAAACTATAT:1 - chr3R 10359349 3' + invader4 2847 2 50.71 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTATTCCTAGAATCGCATTAATATTTTTAATCTGATTACGATGTGGAAAATAAAGCAAGAATAACAACTAAAAACGCTCGAAGCG:2 + chr3R 30782638 3' - pogo 33 1 61.64 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGGAGGCCATGCCCTTTTTTGGGGCGG:1 - chr2L 18627716 3' + 1360 3338 1 79.00 GAACTATAGAAGCTAAAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGGCATTCTAGAAGTCAGGGTCCAGTTTGTTGCCGCATGTTGCCACGTCCACTCTAACGCCCACAAACCGCACAACTTTCTTTTCATTTTATAACTTTTTA:1 + chrX 6648389 3' + INE-1 158 1 47.26 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATAAATATATGTGCATTTGTGTATAGTATATCAGTGTGAAACACCAACGTACAAACACACACTGTCAATCAAAAGGAGTCATCTGTCCCACTAAACGCTGCCTATCGAT:1 + chr2R 9504360 3' - roo 8673 2 73.97 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGATTTATCTTGGCGCGTTTTAAAACACACTCGAGAGGTTCATTAATTCTTGCGTCGCACACTGCAGATTACTCATACGCCAACTTTGCCCGCCTGCTGTGTA:1 - chr3L 6675252 3' + 412 7527 2 70.55 TAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGCAGCGATGCATAAATCATAGCAT:1 + chr2L 14889030 3' + hopper2 1550 1 60.00 ACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTATTACATTATCTTCGCAACTCCAAGCAATCCTCTTTGAATGGAAAGTAAGCAGTTTTGACTTATATGAGTCAATAATAACATTTAAGATATATTGCCTTTC:1 - chr3R 25758219 3' + I-element 4872 1 71.53 GAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATTCCCAGTGCAGAACTCCAAGGCGGCTCACCAAAGAGGTTCTCCGAAGAT:1 - chr3R 10636107 3' + blood 306 2 66.44 TTTATTAATTTAAAATCTGTCCATGGGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATGGGGTGATGGGTTCGATTGCGAGAGGATGGGGTGAGGAGAGCCACCTTGCGC:1 + chr2L 11447481 3' - G-element 4297 1 62.32 GTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCAATCCAACCAAGTATTAGACCCTAATTAACACATTAAAAATAAAAACTATGTTAGTCACGTTGAATTTTGTTTGCGCTTTCCGAGCTCGAGAGGCGCTGCTCTGCTTG:1 + chr3R 4221413 3' + HB 1307 1 73.13 ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr3L 11115124 3' - micropia 4989 2 53.92 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACATATATATATGCACGCTCTGTGAGCATTTTCGAG:1 - chrX 1764070 3' - opus 7074 4 81.02 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGATAACGGGGCTTAT:1 - chr3L 13228466 3' + P-element 2822 1 41.10 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATAATTACTATTGTTGATAGCTGGGGCTTATTTATACATATCATTTTTAACATAATATGCCCAAAGTTCGAAAACAAGGAATGCAAAAGAAAATTGCCCTGAAAGATTAATGG:1 + chrX 9959918 3' + I-element 5346 1 67.81 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTC:1 - chr2L 13717320 3' + P-element 2795 1 19.58 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGATTTAATAAATGTGTGGTA:1 - chr2R 11595865 3' - P-element 84 1 19.23 AAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTAGGGCTACGGGAACACATTCGCTCCCATCATTC:1 - chr3R 14572553 3' + Quasimodo 245 2 75.74 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATACATTTCAAATATATCAGATATATAAGAAAATCACTGTTTAAACAGTTTGATATTTATAGATAACATTTC:1 - chrX 20632553 3' + pogo 2052 1 53.79 AATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATA:1 - 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transib2 2374 1 78.77 CTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAAACACGGACTACAACAATACATTTTTGGGTTCCCTTCTCTCT:1 + chrX 16526357 3' - P-element 66 1 40.41 CGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCG:1 - chr2R 5070917 3' - gypsy5 24 2 26.71 TACATTTAAATGATCTGCGACATATGTATGTAATATATTCGTTTTGCATACATATGTACACAAAGGATGTCACACGAAATATATTTAAAATTCTTCCAAATAACTATTATCAAAACGATTCAAAAGGGTATATAGCAATCTCAGAC:1 - chrX 22559924 3' - invader1 3610 2 82.19 AAATTTATAAAATGTTTATATTAGCATGCGAATTAAATATTGGTTTATGTTCATAGCTGATGTTTATTTCCTTCACAACCTTTACGTAAACATCAAATCGTTTTTGTTGTTGAAGCTGATTCGCAATCTTCGCTGTTCACATTTC:1 + chr2L 17773339 3' + Tc1 58 1 51.03 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCTGACTCTGATCTTCTGTATTTGAACGCATTTATGTACATGCATATATGCCAGTGCCTCCCATATACAAATGCATATGCTTATGCATGTAAA:1 - chr3L 20398949 3' - roo 29 2 66.44 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTT:1 - chr2R 9504229 3' + roo 8989 2 76.71 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTCGCTTATCGGGTATCCCAAATCTCTGCAAATGATATGAGATATACTGGCTCT:1 - chr2L 13140614 3' + blood 7323 1 65.03 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTATCGTTTCGTGATTTTTGCCAGATTTTTAATG:1 + chr2L 19643641 3' - hobo 33 1 62.76 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGT:2 + chr3L 22884034 3' + roo 353 2 55.48 AATCAAGTCGGGACTCTCAACATCACCACGAATAGCTAGGTTGGCTAGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAATAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGGAATTTCCTGAATGGAGCGACAACATTC:1 - chr2L 13601951 3' - Cr1a 4069 1 62.20 CATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGACTGGCTCTCTAGTTTAATATCCTTGGATG:1 + chr3L 10564037 3' - hopper 17 2 72.60 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAGACGTACATACATAA:1 + chr3L 22884050 3' + roo 9033 1 59.59 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATT:1 + chrY 2720331 3' - 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chrX 12978393 3' - INE-1 558 1 50.68 ATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAACTTTGGGGGAAAATTAAAACTCACCGCCAGTGAGGACGATTTTGTAGACTCGTTTATCTTT:1 + chr2R 18439750 3' + P-element 364 1 41.67 CATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGTTCTGGAAGTGAGTGCGGTTAAGCGGCGAGACGTTGCGCCATTAATGCGAAGCGTACTTTTGGGCGCGCTACTTAAAGTTGCAAGTTGGCAGTAGGATGGCG:1 + chr2R 7889538 3' - jockey 4649 1 67.16 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCCAGAGATATGCCATAAATTCGAACCGCTTCACTCCTTCCCG:1 - chr2R 22287394 3' - jockey 4815 1 55.17 TGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGCCACCCAGGTTTCAGGAGCCTCCAGAAGAACCCATGGTGCATAAAGTGAAAACTCAATTTGGTCAAGGAA:1 + chr3L 16901265 3' + roo 305 2 54.48 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGCCGCTTTTTCCCTTTTTCCCACCATCACCCCCACCATTTTCTCGCCCCTTTC:1 + chr2R 18983843 3' - hopper 33 1 55.26 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGGTTTTCTCGGGATGGGTTCAGATCCAATGCGATCCGATGCGATGGGATGCCGATGGTGAAGCCGAAGCTGGATGATGTCTCCATCGGGCAATGCAC:1 - 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P-element 18 1 59.84 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAAAAGCTCCGCTTTTCGGGCTAACACAACCGCAGATAGCAC:1 - chr2R 12069542 3' - Tirant 8115 2 76.32 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATA:1 - chr3R 24976225 3' + roo 8991 2 72.60 TTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGTAAAAAAAACCACCTTTTTGAAT:1 + chr2R 3104484 3' + Gypsy6A_LTR 355 1 69.86 ACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGACTTAGTTGCATTCAACGAATGTGGTAAACAGCCTGCCACTTATTATATTATCATTGTGTGTAC:1 + chr2L 268244 3' - Burdock 179 2 56.55 ATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTACACAAATTGAATAAATGTAGTTTCAAAGTGTACTACTTCAAAGCGATTCATTCCTCAGATAATTGTCCTCTGATATTTTTTTAGGAGTAGTTAACTAAAACTGTCTGATC:1 - chrX 21636115 3' + Stalker2 7640 2 76.03 CCCTAAGCCGCCTCCAATCTCCAAGAAAAAAGTTCCAGGGTCCTCGTAAGCAAAATAATGGACCTGATTGGGAAAGACAGTTCCCACATAATTCCCCTGACCAAGGGCAACATTCATAATATTTTGTGTGCCAATATTTATAGCCA:1 + chr3R 6225773 3' + Fw2 202 1 67.12 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTAAATGATTTTCTTTTAATTCCTCGCCTCTAAAGTCAAGTTCCACTGTATAGTCT:1 - 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P-element 16 1 71.54 AATTAAAAAAATTAAAAAAAATGGCCTTATGTTAAGCCATTGGCCATTGGCACGCAGACGACTGATTGCAGTCGTCGTCTTTTGGGCCACAGATTGGCGATAGGTCTTCGCTGGAATACGTTCTGATTGGCATTCGATCTT:1 - chr2R 10852823 3' + HB 321 1 76.60 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAAGAATACAATTAGAAGGAAATCTAATACAAGCAGAGCATTTTAATGGCTTACAAACTGGCAGCATAGAGTCTTCTACTCAAGTA:1 + chr3L 1981646 3' + opus 464 2 51.37 GGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCACATTTATTTATTAAAATTCTGTCGTGTATAAAACAACTGATTAAATCACTTCATTTTAATTA:1 - chr3R 27514658 3' - Ivk 375 1 56.85 CGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTTGACCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTATACTCACACGTTCGTCTAGTTTGAAAATAATACTGATAGCTTTATCGATGAAGGCGCAAG:1 + chr2L 8384149 3' + 1360 3169 1 65.07 ATAGTTACAATTTATGGTTTTTTTTGCAGAAATACTAATCAATGTGATATGTAATGAGCCGAATAGTTATAATAAAATGTCAAATATACTAGTTCTTAAATCTCGGAAAAATTTCAATCTAGTTTCTTCATAAATGATTGTTGAA:1 - chr3R 18143451 3' - TART-B 10552 2 56.55 GGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCCTACGCCTAAATAAATCGACATTCGTAACTTTTTTTTATAATAATGAAATTAATAAAACGTACATACAATATTTTTAAGAACGATACGCCTACCACATACGATTGTACACTTAAGCCTG:1 - 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chrX 18296385 3' + micropia 237 2 58.90 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGACTAAGGATGTCGAATACTGAGGCACGTCATTAACAC:1 + chr3R 4533000 3' - 1360 32 1 64.38 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTCCTCTCTGCTTCTCTTCACG:1 + chrX 16217554 3' + P-element 2853 1 61.81 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTTCGGTCCAGCCGCTCTGTAAGCTTAATTAACACTAGGATTGCGGTTGGAAAGGAGATTTCCGTGGGCAGA:1 + chr3L 14709890 3' + opus 428 2 69.52 GGCACACGATTTTTTCGCCATGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCGAGAGCGGAGAGCGTTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTTAAAAAAATAATACAAATGATGCAATAATCCATAGAAA:1 + chr2R 23251075 3' + 1360 46 1 72.60 TTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGTTTTTATTTTTATTTCATTTTTATTAATGCGAAAAATGTAATTTCAAGCATTTGCAACT:1 + chr3R 25843437 3' - I-element 66 1 59.59 GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAATTGTGAGAGTAGCTGGCCAATGAAGTTTATGTGGTAAATTATTCACAAAATATA:1 - chr3R 9193145 3' - opus 7058 4 61.43 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTTCCATCAACAT:1 - chrX 2518022 3' + P-element 2825 1 41.78 GCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCACGTGACAACGTGTCT:1 + chr3L 18767863 3' - roo 8626 1 51.37 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACCGGTTTTTTCTTTTTGTGTACTCATCGCGCTTCCTTTCCTTTTCCGTTTCATTGCGCCCATTTCGTAGCCTACAATTTATATATGTACATATATTTTTACTTGCACCT:1 + chrX 3661036 3' + 297 6968 2 75.34 CTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAATCTCATTTCAAATCACATGTTCTACATGCAAGTGCACACCTGCCCTTGAGTGACCGGTAAAATCTCCGCAAATATCGATACGTAAACATTTTATATGTGAAAT:2 - chr2L 9347422 3' - opus 12 2 73.29 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTATGCGTGTGCATATGTGTGGGAGTCTGTGGACTTAGACAATGAACCCAAGTGCAATAATTAATGAAGCA:1 + chrX 5145949 3' - hobo 50 1 52.74 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTTACATGAATTTCAAGCAAGCGTGTGCTATGTACTATAAACATTTTGCTTCTATAATTGGAGTATGGAAAATGTTTAACGTTTCGTCGTATTTTATGTAATTTCCCCAAGTAAAT:1 - chrX 3578033 3' + hobo 2932 1 75.34 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAG:1 - chr3L 10563889 3' - hopper 40 1 52.34 GTAATAGTCGGTACCCAGGGAACACCACGGGGAGGCCATTACAATTGTAATGGGGTCTTATATTTACGTATATGACCTTCGAGTCGACTTGAAATTGCCGGCATCCGGACGGTAGGGCAGCAGGAAGTGTTGCAGGCCGAACAGCG:1 + chrX 12951551 3' - 1360 2914 1 65.07 AGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGGTTTATATGCTGAACAGGCACAGGCGGATGGCCAACGCCGGTGGCGAAAA:1 + chr3L 20977891 3' + mdg1 7388 2 63.70 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATAACGCTAACAAAAGGTTTATTACACTTTCTATTGAAATATACATTTTGAATCCCATTTTCCCCACATTTGGCTCTC:1 + chr2L 3282688 3' + flea 4970 2 56.85 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTTTTGGCCTGCTCGATTTGCTTTTAACTCGCTTTTT:1 - chr2R 9504163 3' + roo 398 1 74.29 AATTGATTTCGGCCCGAAAATCATCTTCTTACACAAGTACGCACACATATACGCATTCTCGTTTCTTGTTGTTACTCACACATGCAGAGGCACTGCATTTTCTTTGACAACTTTTTCCCGACTGCTAGCAACTTTTTCTGTGACTT:1 + chr3L 8200202 3' + 1360 3184 1 47.95 TAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGCCTAAACTATGAATATTTTATGGAGCATATAAATAGTCACTTCATTTTCTATTGCTTTTAA:1 - chr3R 5316543 3' - Juan 4086 1 56.16 AAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAATTATAAAGAAGAAGGGGGAATGAAAACCACAGCTCTTTTGCAGCCTGCTTTGAGCTATTAGAAAATCTAGTAACCCCCGGCATTAAAAGATATCCTAAGGTCAAGAGTTGCCAC:2 + chr3R 9175319 3' + Juan 4203 1 74.66 GCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTTCGGCTC:1 - chr2R 1320646 3' + diver2 4890 2 71.20 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTTTCAATGTCTGTTTTATGTTGTGTTTTTCACAGTTTTCTGTTTGCCTAGCTGCAATTATTT:1 + chr3L 18789149 3' + 1360 3370 1 63.70 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGAGTCATAAAAAAAAACAAAGCGAAACGAAAGATTGTCTATTAAGTAATATTCTATTGTAAACTGTGAATTATACGATTCGCAAAATTCACTTTCAACATTTGCGAGCGGGCAGCAGC:1 - chr3L 7790605 3' + copia 251 1 78.77 TTTAAAACTAAAAAACTTTAAAACTAACCTACTTGAATAGAAAAGCAAGCATGTATTCTTTTTAAAATTTCACCGATTTCTCCAAGTGTAAAAGCTAAGCCGTGAAAGGCGCAGGGGATCGGGGGCATGGCCCATATATTAAACAC:1 + chr3L 11336767 3' + 1360 3028 1 63.01 CAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGTCATCGAATGCTGCTCTAATTTGCCATTGTATTGCATTTTGTATTGAATTTATTATGTT:1 + chr3R 8921998 3' - FB 62 1 59.59 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTACATATATATGTATATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAG:1 + chrX 11661504 3' + 297 367 2 67.81 GGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCTTTCTGTTTTGTCGCAAGTCGGCGTAAACAGCCAGGACATCTCAACAAATTGAGATTAAT:1 - chr2R 16078785 3' - I-element 4888 1 73.97 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCGGATATGAAAAGGTGAGTTTACAGAATTATCAAACATGTTTTTACAT:1 - chr2R 16496576 3' - hopper 70 1 65.75 GGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTTGCGTTAATTTTATGGAAGATAATGCGGGTCATATGCGTTCTGTTCAGAAAACTCCAGGCGGAAGATACATACATATACAATATG:1 + chrX 22860214 3' - I-element 175 1 60.27 ATTAGTCTTGTAAATTTCTATCAATTTGCCACTCTAACGCCCTAAAATCGCACAAAAGGCTGCTGCTGCGGCTGCACAAGTAATAGCCAAACAGCCCAATTGACCTGGATGCATTGCGGCATTTTCAAATGTAGCTCGCCTGGCAG:1 + chr2R 5691452 3' + INE-1 297 1 63.01 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAAGGTCGCTCTGTCGATGTTCTGGAATTGGGGAACAAGGGTATCGTCTGCACCGAAATGGGCATGGCCTGCATCTGTCC:1 - chr2L 8396821 3' + roo 9044 1 62.31 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATATGTAGGTAATACGAATATGGATTTTGAAACTGGGGAGCATCAATACCAATACAAGGACATTTTGTCCGTGTTTGAGGATGCATTCGTCGA:1 + chr2R 17021453 3' - pogo 25 1 65.75 CATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGAGTGGAAAATATGACAACACATATGCACTGCTGACAGTCATTTTAATGGAATATGCGGCGAAGCACCGCTA:1 - chr3R 27782611 3' - G2 2991 1 63.64 TGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATGTATCCTATTCATTCACAATTCAATAACTAACTATAGTGGCAAATACGTCAGATATTAGCCAGATGGGTGCCTAGGTAAGTCATCTGCTTGCTACGTTTTCGGTG:1 + chr2L 5711060 3' - HMS-Beagle 9 2 74.66 CATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGAAGGAAGACTTAAAATAAATTTAAGGCTTGCCGGTTATAAGGAATCTCATTCTTTAAAGAACATCTCGAAATGGG:1 - chr3R 11016909 3' + 1360 3116 1 49.32 GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATTTTCGTGTATATCTTTATAATAATTTGTTTGCCAGCAAAACTCTCCCCGGGGCACATTTAACT:1 + chrX 20124592 3' - opus 7058 4 57.53 AATAATAACGTTAAGGCAATGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATGAAATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGACTGAAAATGTCAGTCGGATAAACAGGGAGAAATCG:2 + chr2R 11045515 3' - 1360 302 1 76.03 AGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTATGGTAGAAATAATAAAAAGTCTGTGCCTTTCCGTACAGAATTCGTCTGGGCATTGAAGTAGA:1 - chrX 19822251 3' - Juan 4085 1 56.85 AGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGA:1 - chr2L 4420516 3' - gypsy5 79 2 69.18 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGCAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAACATCATCGTAAAAAGAGAAAACCCATCACCAGGCACATCCGAGCCATGCT:1 + chr3L 3858762 3' + jockey 4931 1 71.67 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATAATAATAGCTTAATAATATAATCTTAATAATTTTAACTAATTCCCCTGAGCATAGACTAAAGTATGAATATTATTAAACATTTAAAACT:1 + chr2R 12239862 3' + roo 9041 1 60.96 ATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTTGTTGAGAAAAGGCATGGTCTTCTGATTTTAGTGTCTTTCGTTTTTAATTGCATATGA:1 - chrX 5381996 3' - 297 6837 2 60.27 GTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTATGTTGGTTTGCGTGTCTGCGATTCGCACGCACACACTCTAAAAATGGCTG:1 + chr3R 17465610 3' - I-element 261 1 53.64 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCTAGAATGCTAACCATGCACAAGGCATCTCAAATTCCAGGTGTTAAAAATAAAGTACAAATACACTAAATATTTCGGCACGAATAAGTGAGTGGCAG:1 + chr3L 3757275 3' + copia 248 1 75.97 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAATCTGAACAATGGGATTGGGAAAAGAAAATAATTTATATAATTCTATTATAAGCCAAAATAATAGCTTTATTGATAT:1 - chrX 10823906 3' + pogo 2061 1 56.85 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAAAATTAATATTTGGTCAGGAATTTCACCAGCTGGATATTTTGTGGTGATTCCATGCCA:1 + chrX 22676482 3' + 297 6955 2 65.75 GGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGGATAAAGGCAACAACAAGTGGTTATTTCTG:1 - chr2L 21325083 3' + invader4 3033 2 71.23 GTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACATGACAGCGCCCCTCCGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGCGGTACCCGTGCGGGAAAAGAAAAATAATAATAATAGTATTCGAATTATAAATTGGATTTTATATCATTTTT:1 - chr4 681948 3' + Cr1a 4376 1 58.22 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGCTGGTATGAAGAGGAGGGAATGGAGAGGGGGAGGAAGGGGGCCTTTACACGTTCCA:1 + chr2L 18178419 3' - Tirant 8118 2 76.55 CATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTGCTAACG:1 - chr3L 13365564 3' - jockey 4649 1 77.14 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAGTAAATCAACGCAAGTGGAATAAAATATTTTAAATAAATGATAATATTTCATGAAGGCAATGGCCAGACTGGCAT:1 + chr3R 23539523 3' - hobo 43 1 56.16 ACACTCGCTTAATAAAAACAAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGTATACCTGTATTGGTTGAATAATCGTGAAAAGGTGTAAAAATTA:1 - chr2R 9390927 3' + mdg1 7383 2 70.55 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAACAGCTC:1 - chr2R 12069575 3' - Tirant 8156 2 58.20 TTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTGCGCATTTTATTTTCCACTTTGCTTGTATTTATTTAAATTTGAGCCCGGCT:1 + chr2L 16385332 3' - I-element 67 1 64.83 ATTAGTATTTGCCCGACAGATTATTGCCTACATTTTTAGTAAAATTTTTAAAAATGGTATAGCATTTATAGGAGGAGCTCATTACTAATCATTTTAAACCGATTTCTTAGAATTAATTTAACGCTATATGCTTATATCCGTATCCA:1 + chr2L 1616854 3' + TART-B 414 2 83.56 GGGGAACTCGACTATAGCATTTCTCTTGTTTTACGTTCTGATCAAGTCCCAGCAGTCTAAAGTAATGACATACATCTCGAGTGGCTGGGGGTTAGAAGAATACACCATGCACAAGGTAAGTCCCAAGGTGG:1 - chr2L 22318161 3' + INE-1 571 1 57.25 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCTACCACATCATTCACTTGACCACAATCTAAATTAATCCCGCCCGAGCTGGAC:1 + chr2L 18953117 3' - roo 8733 2 68.49 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCCATACACACATAGAGAGTATTACGAAAATCATCGAGCGGAAGACTAGAAGGGTAACACTACTGGAAAGTTATCCGTTGACGTG:1 - chr2L 6755707 3' - pogo 36 1 60.96 ACGGTGCATGCACAAAGAGGACGCACCGTGAACTAACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCTCCAAAAATCAATTAAAAACAAACAAACATTTCTTTTCG:1 - chr2L 22600444 3' + gypsy8 149 4 61.00 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAAGTGTTTTGGGGGTGGTGCAACCGATAAGTAGAGTTGGGCTTAAATCGATCCTAACCTAATCCGATCTCTGCCTTAC:1 + chr3R 29516589 3' + I-element 5312 1 53.42 GTGTGTGTGTGTATGTGCGAGGTGTGTGTGCCTGTGTGTGTTTCGAGGGTTTTCGAGCTGCATTCGCTCCTGGAAGCACACTCGAAATGCTCGAGTGCCTATCTGGTTCTTCACTT:1 + chr3R 18960800 3' + Stalker 448 1 73.28 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCATTAGTATGTGCATATTTATGTGGGCCAGAGCACTTAAATCGGTTCACTTTCCAGGCGAA:1 - chr3R 17463515 3' - 297 6608 2 54.78 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACCGATATAGACGCATTGTTGCGTGGAGATTTATCATTGATTGAGGCCATGAAATTTACACTTCAAGTGTCTCGGGAAAATGCTTTTCCTATTTT:1 + chr2L 8996163 3' + roo 9043 1 62.33 TGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTATTTAGCATGCAAATTATTACCACTTTTTCTTTTGTTTTTTTCCGGACACTATATATTTCTGCAATTAATTT:1 + chr2R 9339762 3' + Transpac 264 2 54.11 GGGACGGTAAATAAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGAAGGTAATAACAATGTTTATAGCTAAAAATAAGTACATACTAAAGGAAGCAAGTAATTATGCAAATACAATCTAAAGTAAGCCGGGGCCAAGATCTTGTCTTCAGTT:1 - chr3R 22261973 3' - Cr1a 3989 1 55.48 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGCACATCCCATCAAAACACCAATAACATATTTAGGTCACCTCCTGGGAGAGCCAAAGCCACGGGAATT:1 + chr3R 19639839 3' - 412 7108 2 55.48 CTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCACAAGCAAAGTAATTCAATTTCCCGGCTTACAGCTCTTTTTTG:1 - chr3L 3565326 3' + gypsy 409 2 50.00 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCGGAAAGCGTACTGCTGTCAATAAGGCAAGGCATTCATTAATAAAACCACGAGCCCACAAATCATTCAAATCATTAATATGAAATTTTTTTCCAAT:1 - chr3R 26244589 3' - copia 27 2 60.27 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCA:1 + chrX 20465869 3' - jockey 4827 1 63.70 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTG:1 + chrX 16217522 3' + P-element 2835 1 43.85 ATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACCCAATTAATAAACTATAACCACCAGTTGGGTGGGTTATGTATGTACATAAAAATATTTACTGTTCACGTTTCTTCTTTTCAGATTTGGAAGCGGTT:1 + chr2R 9874906 3' + S-element 386 1 54.79 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTTCCTGAATTTACTGAAAGGTTTTTTA:1 + chr3L 19574161 3' + 297 6926 2 54.79 GACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATGTATTTTACACGGAAACGCTTCCTTGTTCCTGTTATATACTTTTCAACGAATCTAGTTTATCTACAAATATTTCATTACGCAAAATTGCATTTGATTATCATGAACCTTT:1 + chrX 21575376 3' - INE-1 92 1 60.96 GCTGCTTCCGTAGAAATCTTCTTCCTCGATTTTTAATAATAATTTCAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACTCTTCTTGTGCCACATGCAACGTGCGGCGACCCAATTGCCAGGGAGATCCGCCTGG:1 + chrX 11773385 3' - invader2 464 1 59.71 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGATAGATGTAGCTAAGCAAAGTTTGCCGTGGAAGGATGAGTCCTGCGGACAGACAAAAGCTGAGAACTTTCGCT:1 - chrX 12214446 3' - opus 41 4 54.79 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCTAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTG:1 + chr2R 24021655 3' + pogo 2044 1 62.86 ATATTAAAGGCCACACCTTTTACTTTACTTACTTAAACGATTGTTATGAACAACTTATTGCACAACTTAGCATATTTTTTTCTGCCAGTGTACTGGGTAAGCCGGACACGGACGGAGCTGGAGGTCAGCGCGTGCGGCGGCTTTTG:1 - chr3R 29711490 3' + copia 60 2 47.26 AGCTGTGTTTTAATAACCGAACAACCACTTGAAAAGTAGGCCTCAACGGCAAAGGCACGATCCTCACTCTCCAGCGAAACCATACTATTCCTTGCCGCGCAGTTATATCTTGGGGATCATGAAGATAAAGACCATTTAGACCCCGT:1 - chr2R 1778613 3' - mariner2 192 1 54.11 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCG:1 - chrX 7967238 3' - P-element 102 1 16.44 GAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTGACGAATTCGGACCGAAAGTTTTATAAAAAAAAGAACACAAGTAGCTTTTTTATGTATTATTAAACGTTTTTATTAATTCCAATAAAGGAAGAACTAGAGCTTTTGGATTA:1 + chr2R 4103369 3' + invader1 397 2 59.59 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCT:1 - chr3L 13228487 3' + P-element 2801 1 26.71 ATATATACATATTTACATTTTAAAATCCGATTTTTTTCGAGCATGCTCAAACTCTTCCTCAAAATCGTTGAAAAGTTGTTGCACTCTCTCCTCTTGTCTTCCTCAATTTCATTCGCTTTGTTTCTGTTAAACATTTTTACTTCCC:1 - chr2L 16496239 3' - G3 4505 1 75.17 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGA:1 + chrX 17027943 3' + roo 340 2 68.15 TTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTTTGCACTTGATTATAAAATATA:1 + chr2R 21425167 3' - HMS-Beagle2 53 2 55.48 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAATTCATGGAATTTTTCATACTTTTGAAATACATTCTAGTTGTTTTACATTAAATCCGGGGCACCACTTAAACAATCC:1 + chr3R 22136384 3' - FB 44 1 55.48 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATATATAATTTATATTCGACCCTTTGTGAAACTAAAGGCTAACA:1 - chr3R 21753449 3' - 297 6619 2 67.83 CAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGCTTGTTTGCGAAAAATAAAAAAAACAAAATTGGCGAGCAGCG:1 - chr3R 17059277 3' + hopper 1349 1 66.67 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGAATATATGATAAGGATCATAAACGCCAAGATTGTGTCACTTTGCAACTGTCATACGAATG:1 + chr3L 16663951 3' + opus 435 2 63.01 TTTTTTTTTTCATTTTTTTTGTCTTGCCCCCAGCTGGATTGAATTTCTGGCCGAGGACCGCCAAGTGCTCGCGAAGGTAAACAAATTACCTGCTAGTGA:1 - chr2L 8719834 3' - gypsy7 5005 1 84.85 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAGCATGAGTCCGCGCAATAATCACAGCCAAGTGCTGCATATTTAT:1 + chrX 850149 3' - jockey 64 1 53.42 ATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGTATATTTTCATTGCACGTTTACTTCATAGTAAGATAATATTAAATG:1 + chr3L 13156790 3' - transib2 74 1 71.23 CGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGG:1 + chr3L 18767829 3' - roo 8661 1 74.66 GGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCATGGTTAGAGGAACCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTACGACAAGCAACAGCGGACTGTGGTAGTATTCTCGCCCGCTATTCTATTATGTTCGTCAATATTAATT:1 + chr4 507662 3' - R1A1-element 4905 1 80.88 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTTGTTTCTAATTTTGGGAATACTCGAAACTCGAAAGGCAAAAGTTTCAGTTCAGTTCAGCTCAGTTTCCT:1 + chr3R 20074658 3' + roo 9019 2 56.16 CGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACACGGCCATTCTGACATTTACACGTCCTCGTGTAAGCTTTTAGGGAACGAACTACTCCCATTGTTGTAATACAA:1 - chr3L 13703010 3' - micropia 140 4 77.40 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAATAAAAGTTGCAATAAATTGTAGCATACTTGTGAGCGGACGCAGTTAATTTCTTAGCCTGCCACCTACGACCCATTGGACACTTTATATACCG:1 - chr3L 15853460 3' + jockey 4969 1 59.72 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCTTCG:2 + chr3R 26244713 3' + copia 184 2 64.38 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGAAAAGTCATGTGTGAATGTGGGAAAAGCGCCTTTTAATTGAAAATTCACAAGAAAGGGGGGTAGCGAGAGCGCGAGGCAACGGGAAATGGGAAAAAGAACGAGG:1 - chr2L 11922825 3' + jockey 4973 1 60.96 GCTGCAATTTGTTTAACTTTTTCTGCCAATTTCCACTAGCTGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATGCTCTCTTGTGTTGTATTTTATGTGGCACAAAGCACATGAGTTCGAACTTTATTTTGTGTGG:1 - chrX 22510853 3' - transib4 205 1 77.93 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGCCATGAACCCATGTATCACTTGTGTTGCTATCTCTCTCCATTTCCTCCG:1 - chr2L 18213083 3' + roo 9050 2 67.63 AGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATACAGTGCATGTCAGAATGAATACGGAATTCCTTGCGGACT:1 + chr2R 12814920 3' - opus 7078 4 73.29 AAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAACCAGCAAACAAAGTGAAAACAAGAATTAAACCGAAATGATTAGTGTGCTATCTATAATGCATAACTCGGCTTTGTTGCTAAGGATCGATTTTAGTAGTTTCCG:1 - chr3R 25419928 3' + gypsy4 453 1 54.79 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATAAATTATGGCCGCAAAGAGCGAGAAG:1 - chr3R 16228854 3' - P-element 84 1 20.29 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTTCTGGCAACTTTACTCTGTCATAAAACTTGGGAACAACAGCGACA:2 + chr3L 2278244 3' - roo 75 2 71.23 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCTCAGGAAGCATCGAGCCCATTTCCACACTGAATATTG:1 + chr2R 11562936 3' + pogo 2059 1 56.55 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCG:1 - chr3R 10461675 3' + roo 9004 2 73.08 AATAATGTTCTAGTGTCTTTGGACTCAACGGTCTATCACCATAATAAAAAATTCAAAATTAAAAAAACAAATACCCAAAAAAAGAAACCATAAAAAAGATTTCTATAACATCCAAAAGATTTTGATTCAAAATTCATAGATAACA:1 - chr2R 18042795 3' + Tc3 311 1 43.45 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTAACGAGCTAATAAACCGCTCATGTTACAGATAGGTTTGGCGTTAATTTTT:1 + chr3L 13827473 3' + roo 355 2 61.54 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGA:1 + chr2R 16891857 3' + jockey 4953 1 50.68 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCT:1 + chr2R 16891836 3' + jockey 4932 1 65.07 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTTGGCATTTTGTCTTAGCAGCAACAGAAAAAATGGAATTTATGATAGGGTCTTTGGGTGTTTTCGCATTCTGCTGGCCACGCAGATTTTGCACCGATAGCTTTTGGCC:1 - chr3R 28782513 3' + blood 370 2 77.54 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACATATATATATGCACGCTCTGTGAGCATTTTCGAGGATTAAATGAGACACTTTGCGTCGCGGAGGGGAGGGGAGGTCGCAAAAAAGAAAATGCCGCTCAATTTGCTG:1 - chrX 1763998 3' - opus 7 2 79.31 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGGGTCTTATACTGTTGGAAT:1 + chr2R 18440460 3' + P-element 2787 1 16.55 GATCTTTTGTATAAGGGAATTATGAGGAAGGTAAAATTCCGTTCCTATATAAGTTAACACTTGAAAGGGGTAAACTTAATCCGATATATATCCGGGTTTGTTACAT:1 + chr3R 2117252 3' - Tom1 25 1 88.68 GCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTTGTCACTGCTAAGGTATGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACGCTACTAACAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCATTAAGATATTCTCATCTATCTGTTTAA:1 - chr3R 21067595 3' + R1A1-element 199 1 79.86 CACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCACGCTTGCACTTTTTGTCGCAATTGCAGTT:1 + chr3L 7790738 3' - copia 4948 2 80.45 GCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAATCTTTATGTGCACAACAGCAAAAGCTGCAGCAGTTGCCGAGT:1 + chr2L 11401964 3' + flea 347 1 71.23 GGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCATCGTCTAGCAGATTAAAGTGCAATGAAAGTGAGTGGTAAAGTCGTGGGCTTTTGAGGAAAAACAATTGCATAAGCTCGGAGTGAAACAAAAG:1 + chr3L 16703909 3' + FB 11 1 60.96 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTTGGCATTTTGTCTTAGCAGCAACAGAAAAAATGGAATTTATGATAGGGTCTTTGGGTGTTTTCGCATTCTGCTGGCCACGCA:1 - chr3R 28782538 3' + blood 7349 2 56.16 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACATAATTAATTGTGCTGCTGTGTTGGCAAACACGCGGGCGCCGGAAAGTAGGCAACAC:1 - chr2R 18983745 3' + hopper 1355 1 60.27 TTGCGATATGTGCCAGTATTCTGCACTTGTCCAAAAGTTTATTACCGCGAAAGCTAATTTCACTTTATCCACTTTCTCAGGTCCGAATTGTTAGACACAAACCTTTTTCTAGAAGGCAAAAAAAAGTAAAAGTA:1 + chr2L 14662854 3' - X-element 95 1 70.15 TTTAGGACGGAGTTGTAGAGTAAGACCTTATATTCCAGTCTTAGGGGAGAGCGTATACTAAAAAGCCAACGTAGATTATTGGTTTTAATTTTAGTCCTGCACACAGGACTATGATGAGTTTTAG:1 + chr3R 25772057 3' - Fw2 3519 1 69.35 ATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGGTCAACAACTTNNNNNNNAGGTCGAGACAGACGNNNNNNNNNAGATCGACNCGGNNTNNNNNNCTGATCAAGAATAAATATANNNTATATATAGCCTTTAACTCTACGAGTAACGGGTAAAAA:1 - chr2R 1949359 3' - INE-1 253 1 80.82 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGTAGATGCCGCGGAAAATGTAAAAAAGGAAAAATAAGCAACGACGCCAA:1 - chr3L 814930 3' + hobo 2907 1 51.89 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATATGTAGGTAATACGAATATGGATTTTGAAACTGGGGAGCATCAATACCAATACAAGGACATTTTGTCCGTGTTTGAGGATGCATTCGTCGACACCT:1 + chr2R 17021458 3' - pogo 20 1 67.81 CCCACCGTATCTTCTAATTCTGAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCGGATACCTGCAACCTACGCCGGATAATGTTCTTTCATTTCCTTTACTTATTTATGCGATGCCGGATCAGGACACATTTCGACACAATTA:1 + chr3L 10138854 3' + gypsy6 7706 2 53.42 CGTAAATAGAGTGACTTTTAGCTGATCGTGATTTCAGCCGATGGCCTAGATTCCGTATAGAGTTTTCGTTCTATTTATTTTCTAATAAAATAGTCGTGGAGTTAAGTCGGTTGACTATGTTTGTTTGCTTTCAATGCA:1 - chrX 15196688 3' + Gypsy12A_LTR 186 1 78.99 ATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAAAGTAAACACAATCTCCACTTGGAGACCAGTCAGCAAATTTCACTT:1 - chr2L 22921259 3' - copia 4944 2 69.86 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGACAGTTCTATTTGTGTTGGCGCTGCTACTGCCATTGTGGTTTGTTGGTCTTGAATTTTGATTATTGTTTGTTCGTAGCTTGGATAAGGTTTGTG:1 + chr3R 3374269 3' - FB 22 1 69.06 TAGCAATTATTAATTATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTAAAAGCCTCACTACA:1 + chr2L 15322961 3' - diver 278 1 49.32 CCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAGATTTCTATATATGATTGAAGTGAGTTTGCCGGCTGGCAGTTGAATCGCATCGACATTTGAATTTTGAGTTGCCGTC:1 - chr2L 470179 3' + Burdock 215 2 58.22 GATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGGCC:1 + chr2R 9623388 3' + I-element 5264 1 78.77 GGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAAATGAAACGAAATCTTTAATTTGTGTTCGAGTGGTTAAGCCTAGCTTATCGA:1 + chr3L 17206978 3' - I-element 4984 1 61.19 ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATAATTTATTCATAAAAACTTTTTTAGCAACTTTTTTTTGGGAACTGGTAGTGTAAGCTACTAC:1 - chrX 20795960 3' - jockey 4818 1 58.22 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTGGTATTAATTCTTCTTATTGTTCATATCCATTCATCGTTTATTTGTTCCACATGCAGATGAGATTATTTTCTTTTCGATCAAAGAACATAAAACCGCGGTC:1 + chrX 19959941 3' - roo 19 2 73.29 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACTTTGAGTTGTCACTTGGGCAAGAGAACTAGAAAAACTCAGTGCTCGCACGTATGTCACTGTACGTTTGTCTTGAC:1 + chr2R 7899220 3' - roo 8706 2 55.24 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCGTGGTCTTGCTCTCC:1 + chr3L 13228578 3' - P-element 43 1 56.16 GTAGAGTGCGGGTGGCGGGCTGCAGTTCTCCGATACGTACAGCACGCTGTGGACAAGAAATAGGTTGTCCTTTTATGCGTTGACAAATCGGCGCTCACACT:1 - chr3L 13544972 3' + hobo 2928 1 64.36 AATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATCCCCCCCCATGATCAGGTCAAATAGATCGGGTGTGCAAATATTTCTATCTACGGACGGAGCGGTCAAATCGGGTGTAATGCA:1 + chr3L 1946347 3' - roo 125 2 55.94 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGCTTTATTTAATCTTAAGCTTCCTCGTTTAGTAACTAAATATTTTATACATATGTATATATGTGTAAGAG:1 - chr3R 12609983 3' + roo 9046 1 60.00 GCGTGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAATCTCATTTCAAATCACATGTTCTACATGCAAGTGCACACCTGCCCTTGAGTGACCGGTAAAATCTCCGCAAATATCGAT:1 - chr2L 9347446 3' - opus 7039 4 56.85 ATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCATGAGCTCAGCTAGGTTGACTAGCATCTACATTATCCAATACGCATC:1 + chr3L 14260093 3' - F-element 4332 1 68.49 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTC:1 - chr3R 10461670 3' + roo 8996 2 72.03 ATATATACATACATATATTCCAGGACCCCTTCATGTCCCAAAATCGTTAAATGAACTAAATAATCGCATTATTCTCCGTGCAGGGTGACAATCCCCAAATAAAAGTGATTGTTCCCTTTAGTCTCAAAACAAAAAATGGAAGAAA:1 + chr3L 8657100 3' - 1731 4407 1 75.86 GCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAAATGAAACGAAATCTTTAATTTGTGTTCGAGTGGTTAAGCCGAGCTTATCGATT:1 + chr3L 17206980 3' - I-element 4991 1 62.24 AATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACGGTTTTGTTAAGACTTTCAGTTGGTTTTTACTCATTTAACTAGCCAACTAGCCAAAAACCTATTAACTATTGAAAATTATTGTTCGCGGGCAT:1 - chr3L 12856695 3' - pogo 1942 1 69.86 GGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCACTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTT:1 - chr3R 14860154 3' + BS 5024 1 67.14 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCACCCGAAATTTATTTGTCTCAATAAGACG:1 - chr2L 7271805 3' + 297 6932 2 56.85 GATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGCTTACACATAGATCATTGACCTGATAACGAATTTTTATGCTTGGAAATAAATCAAAACTGTTTTAACAAGTTTTTAAGCAATT:1 - 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G2 82 1 71.23 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGT:1 - chr3R 24976218 3' + roo 8998 2 67.81 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGCCGCTTTTTCCCTTTTTCCCACCATCACCCCCACCATTTTCTCGCAGATGGCCGGGTCGGAATATTTTCTTAAATTAACATTAGCA:1 - chr2R 18983360 3' - hopper 25 1 39.29 CACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTCTATGTATGTACGATAAGATAACTGGCATGAATCAGTGTTCAGTGGGTTGTCCTATTATGTTGTCACACGTTGCTGCATGTGTGTGCCTGTCTGCATGTG:1 - chrX 15019664 3' + S-element 1706 1 74.62 CAATAATAATAATAATAATAACAACAACAATGTCATTGAGACAAAAACAAGACGAAGTGAACTATCTGCGGCCGCAGGCTGGGGATTAGCCAGGAAGTTTGGCATCTGCTTGGAGTTTGTAGTAGAGAGGTTGG:1 - chrX 16602878 3' + mdg1 36 8 56.72 AGCTCTTTTCTACACATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATTATGTGTGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCTTTCTGTCTTTGGTTCGATACTAATCAGTAATTCGGTTGCAGGACGAGACAGGAGCCTA:1 + chrX 1514478 3' + 1360 140 1 58.45 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTCTACTATATTTTGTATATTATTATTTGAGTACTATTTCTCTGTATCTCGTGTTGTTGCTTTTCACGTGAACTTACATAATCTTTCGGCCTATCTGTGCGCGT:1 - chr3L 18788959 3' - 1360 20 1 66.44 AATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATATATATTT:1 - chr3R 9175184 3' - Juan 42 1 43.88 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTG:1 + chrX 16217527 3' + P-element 2852 1 52.54 TTTTTTTTTTTGTTTTTCTTTTCGGATTTAGATTTTGTGTTTGTTTAAAATGT:1 - chrX 18358178 3' - Doc2-element 218 1 58.49 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGGTCTCTGCCTTTTTCTATGCAAATGCTAATCGACTTGTAGTGCC:1 + chrX 18190416 3' + hobo 2887 1 67.27 TACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTCATATGAAAAGTAGTAGAACAACCACAACACTCACAACCAACGTAGTAGCAAAGTTTACCTAATTCGTCGCCGCAATGGGAGCACTTCTTCTTGCCACTAACGCTGAGC:1 - chr3R 4710303 3' - X-element 4688 1 70.55 AAATAAAAATGAAATAAAAAAAAGACTGAATGCTATGGTCGAGTGCTTCGACTATCAAATACCCTTTACTCTGCTTTACGGTAACCGTTGACTTTAGTTGTTTCGCTGAATGTTAAACGAAAAAATGTTTTATAAATTTAAGTGAT:1 + chrX 14345254 3' + Tc3 1572 1 65.75 ATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTTTTCTATACATATATCTGCATATGGAGGATATATGTATGTGTATGTAAATGGATAAAAAAATATATAATATATATCATTGTACCTTATTTTGAAACAGAGATGTTTT:1 - chr2L 16508845 3' - invader4 11 2 78.08 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACAGCTTGGATTTGCTTGGCTTGCTCCATACAAAC:1 - chr3R 20074576 3' - roo 8740 2 76.87 TAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAAAACATTGAAAAATGCAAAAAAAGCTAAATAAATTAAAACAATTAAGAACAAAAAATATG:1 - chr3R 21807680 3' + Doc3-element 4641 1 70.55 GTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTAACATTCTTTTCTCCTGGGAGCAGTTCTGTTGTCTACCCACTAAAATATAATTTTTTTAATTTATTTCCCTCACTTTTTATAGAACTCCTCCAGTTGGGTATCCAGATTAAGCACCGGCTGATC:1 + chrX 5688720 3' - HB 392 1 69.86 GACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCACAAGCAAAGTAATTCAATTTCCCGGCTTACAGCTCTTTTTTGGCCACTGGTCAACGGAAGAGAGAAGAAGGGTTCACCCTTCGGGCCG:1 - chr3L 3565280 3' + gypsy 434 2 62.41 TATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATGATAATACTTTAACTAAGTACCCTTGGGT:1 - chrX 13385037 3' + opus 7426 2 80.77 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAACTTGATCAATAAAATGCTTGACATGATATCAACAACAGTCGC:1 - chr3R 30850732 3' - I-element 39 1 58.62 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTTTGTGCCATATTATATACACACACGATCAAATTTTT:2 - chrX 17716148 3' - 1360 35 1 57.53 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAAAATTAATATTTGGTCAGGAATTTCACCAGCTGGATATTTTGTG:1 + chrX 22676468 3' + 297 6944 2 57.34 GTCGAGTTTCACGACTATCAGATACCCGTTAGTTCAGCTAGTTCACGTGGGACATAGAATTTTCAACATTTTCAAGGAATAACAAGAGAATAGGAACGCTAGCGGAAGGAAACAGGAAATGAAAAAGACTCCATTTCCCGTTTC:1 - chr2L 12392605 3' - INE-1 561 1 62.50 GAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAACTGACTATTATCATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAATGTACGTGGAACACAAAGAGGTGCATGCAG:1 - chr2R 23908828 3' - 1360 3148 1 79.45 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTAAACTTTAACTATCCGTGACTTTTGAGCAGTTCTTTTGTGGTGTAACATTTTACACCGACCTCAA:1 + chr3R 18541402 3' + hobo 2914 1 55.66 CTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTAACTGTGATGGAATGCACCAAGAGTTTTTCATATCGGTACGCACATAAATAAAGTAATG:1 + chrX 4540706 3' - 1360 53 1 57.45 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGATTTTAGTAATTGGCCATATAAATTATAAGATATTTATAAGCTGGGGGATTGGGTTATGGGTTATATGAGATTTAAATATTTGCTAACATGTCT:1 + chrX 11267834 3' + roo 9046 1 64.38 GCGTGGCGTGCAGCTCTCGACTGGACCACACGGAGCCTAATGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCGACTACTAAAAGAGAAGACAAACATGACGCCTACCTAGTGTCGAGGATGGACTAAAGACCATAAGTGGACTAAAAGGCCAA:1 + chr2R 5284275 3' - G5 4451 1 60.96 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGTTT:1 + chr3L 13362714 3' - jockey 89 1 77.04 AGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGATTCGCA:1 + chr2L 13510867 3' - diver 75 2 76.03 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTAAACTTTAACTATCCGTGACTTTTGAGCAGTTCTTTTGTGGTGTAACATTTTACACCGACCTCAAGTGCGAAAGTTAGGCTAATCCTAGATTAGCCAAT:1 + chr3R 18541436 3' + hobo 2925 1 72.09 TTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATAGATACGTGTGGGTTTTTACGTCGAAATCAATAAGTGCTTCTTTCGCACT:1 - chr2L 6319745 3' - Tabor 6910 2 63.70 ATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCAGCTAAATTTCTAGCTTGTAACTTTTTTTATGCTGTAATTGTATT:1 - chr3L 14944493 3' - G5 4746 1 78.08 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGCATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACAC:1 + chr3L 13228535 3' - P-element 84 1 25.69 ATCTTTCTTATCTATCTATTTATCTATTTCTATATCTATTTATTTCACATTTAAATATCTTTTTAGGCAACATTGAGGTCCTGCACAATGGCAAGTGGGGAGCAGTTTGCGATGACGAGTGGGATTCCACCGAAGCAGACATTGTG:1 - chr2R 21791158 3' - transib3 2639 1 75.34 GATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCACAAAGAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATATATAGTCTTGATCAGGATCAATAGCAGAGTCGATCTAGTTTATTTACTCGTGAATAACTCTTATAGTAGCAATGAT:1 + chrX 17696223 3' + INE-1 15 1 70.15 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTCTCTTTGACTTGGAACAATTTTTTAAATTAATACAAAAAAACTGCATTTAACATTGACCTTAGCTTTATAAACGTTTTTCAATATGTCCAAAAATTTATGGAACTT:1 + chr2L 9074335 3' + flea 5002 2 73.29 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAAGTGTAAAGGGAAATGGGCAAATCTTAATCAGAAATGCCAAAGTTGGATTT:1 + chrX 12998090 3' + roo 9001 2 64.38 ACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCAGGAAATCCAGGAATAGAGCGAGCTAAATGGAAAAGCTTTAAACGTATTTCGCTGAACAAAAGGGGCCAAAAGAAATAAAGAAACATAACACAAAACAATAAACTGTAAAAA:1 - chr2L 15820248 3' + I-element 380 1 78.77 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAAAGTTTCGCTGCACAATGTAACTTCCAATATTCAAGACACGAGATTTTGTTTCG:2 + chr3R 10636191 3' - blood 68 2 63.01 AATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGC:1 - chr2R 24021553 3' - pogo 61 1 61.64 AAGAAACAAATTAAAACATATTACCAATAGGTTAATTATCGATTTTTCATTAAATCTACTTAAAATTGAAGTGAGATTTGTGCGAGGGAAATCTTAATTTCTTCATAGTTGGCTGCGTTTCGTTGGCCACAAAA:1 - chr2L 12275097 3' + HeT-A 5765 1 70.90 AACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAATTCCGAAAGCGAAAGAGAGAGGCAGAGAGGTGCATGCGAAAAGAGCAGAGGAGCCAATGTGGAATGGAAATGCGGACCGAGGTGGAATGGAATTGCACAGCCAAAAAATTAGGTCTC:1 - chrX 3779152 3' + F-element 83 1 73.29 AATTAATAAAAATAAAAAAAAATTAAGTAACCGTACACCAGCGAGTGCGATAGTTATGAAACATCGATGACTTGCTCGCAAAAGGACGTGCAGCGGATCGTAGTGCTTCTCCCACACCTCGTCGATGGGCGTGAAGAGACCCTGCT:1 - chrX 7947908 3' + Rt1b 5148 5 53.42 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTCCTGAAATTGTTTGCCCTCCTTAAAAGTATCTATTATTTTTTTTCAAGATAGAAAGCGCATCTCTGCCGCAAAAAAGAACAGAA:1 - chr3R 31650282 3' + pogo 2068 1 62.24 TTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAAAAAATAATAC:1 - chr3R 3922955 3' - Cr1a 88 1 71.03 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCAGTCGCAGCAACCCTAACAGCTTTAACCACGCCCACACCTATACACACACACACACACATCGCCCACGTTTTGCGTTGCTAATATCTGTG:1 + chrX 19982480 3' + hopper 1412 2 77.12 GCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTAACTGTGATGGAATGCACCAAGAGTTTTTCATATCGGTACGCACATAAATAAAGTAA:1 + chrX 4540704 3' - 1360 60 1 60.27 TTGTTTACTCTCCCTCTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCG:1 - chr3L 23933564 3' + Cr1a 213 1 77.42 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGCCACTCGCGCAAAATTTCAATCTGATCGATTTGTGTATTTGTCAAACTGATTTATCGAGTGTCTCGATGTG:1 - chr3R 22868716 3' - mdg1 23 2 67.36 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATACATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACTTGATATTTCGAAATAAGGAACATAGTAAGAAAAGTCGTTCATTATTAAGCCAT:1 + chr2L 5447974 3' - roo 8731 2 63.01 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCAAGGAACCGAAAGGCAAGCTGAATTTTCCAGGATATACATAATCATAATTGCGAT:1 - chr2L 11867259 3' + jockey 4951 1 57.53 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAACCAACTCTGTTCCCAAAACCGCCGCCCGTGAGTATGCAATAAATTATTTCAAACTGATG:1 + chrX 4214545 3' + jockey 4942 1 53.24 GTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATCATAAAATTTACTTATTGTCATCATTTTTTAAGACATGGGGGTTTTTATAGATAGCTTCTTAGAAAAATTAATGTGTGATCTTACCTCTGTCATCTGCTG:1 - chr3L 15621586 3' + G4 3760 1 53.42 GCATGCACTTTGCAGCTCAAGTAATCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTATGCCGATTTTAAAGGGGTAAACAATTCAAT:1 - chr3R 24102527 3' + Stalker 206 4 77.44 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGATTAT:1 - chr3R 19589876 3' - BS 5019 1 65.75 TGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACAGTCACACCAACGATGACCGTTATCGTTGTCCAGTCCTGCACTGAGAAAAGTTTTATCCATCGTGCATTTTTTATTTGTAATT:1 + chr2R 9660207 3' - P-element 256 1 60.96 CGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTCAGGATACATGCCATTCAGTT:1 + chrX 1018184 3' - 1360 195 1 80.31 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAACACACTCACGGCAGCAGGAAGCTTCCTAGGATATGTA:1 - chr2L 12847224 3' + 412 463 2 60.87 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAACAAGTCCATGTGCAGTCATTTGGTTGTGCTTGGGTCTCTTTTCGAGGGGAATGTA:1 - chr3L 3339336 3' + Transpac 247 2 60.96 GTTTTTTTTCTTTTTCTTTTGAACACATGAAAAAATTCAATTCCTTGGATTTATATTAATCTAATTGAATATTATTTTGTGTCGTACACTCAAATTCTCCGACAAGGTGCACATTCTTTGTGCTCTAAACTCAATTTGCAACAATA:1 + chr3L 9834714 3' - Doc2-element 216 1 47.95 ATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCATCTAAATTTCTAGCTTGTAACTTTTTTTATGCTGTA:1 - chr3L 14944501 3' - G5 4754 1 71.23 GAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAATGTCCGGGTGTCTTATCTAATACTCACCATCGCAGCAGACCTC:1 + chr2L 1019262 3' + 412 172 2 67.67 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGTGGCTTGCATATTTTGATTGCATTTTGGTATT:1 + chr3L 14551367 3' - P-element 33 1 40.00 GACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCATGTTTGCTTAGCGCCGCAGACACCTGCACACGAACTGCAGTCGCTCCGGCTCTCTGGAACAAT:1 + chr3R 6364203 3' + G2 2940 1 56.85 ATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTC:1 + chr3R 29091393 3' - rover 38 2 54.69 TAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTATGTTGCAAATGCATACTATAACAAATTGTTAAGTGTTAGACAAGGCGTATACTTAATAT:1 - chr3R 10136994 3' + I-element 5295 1 57.53 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAAAATGCGCACAAAAGGTTGTCGGTGGGTTTGCGCCTTTTCCACGTAACGAGACAATTTTTACACCGTCCAATC:1 - chr2L 16385238 3' + I-element 5308 1 52.05 CTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGAGTGGAAAATATGACAACACATATGCACTGCTGACAGTCATTTTAATGGAATATGCGGCGAAGCACCGCTAGC:1 - chr3R 27782609 3' - G2 3025 1 50.00 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCCATACACACATAGAGAGCATTACGAAAATCA:1 - 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blood 61 2 60.27 TTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTCGTTGTAGTATATTATATTTATTTTAAGAACGCTTGAAATATTATATTATCAAGCTATATTCGTTTAGATCATTAAAT:1 + chr3R 5107444 3' - Ivk 345 1 56.85 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGC:1 - chr3R 18517961 3' - roo 8751 2 78.08 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAGAGAAAACCCATCACCAGGCACATCCGAGTCATGCTCTGGCCATACATTGTTGTGGCTGTTTTAAAAATAA:1 + chr3L 3858797 3' + jockey 4941 1 54.79 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCACTGGCTC:1 - chrX 16526284 3' + P-element 2864 1 51.14 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATGAAATTGATTTTGCGTTCTTACCGGCTACCACTTTATTATCCAAATACCTGGAAAGTCTAAAGTAATGTGAT:1 + chr3L 22709440 3' + 412 7497 2 50.68 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCGAAATACGTCACTATATATATAAATATTTTTTACTGCCATATAGAATGGTGAGTATGGGGTTTTT:1 + chr3L 23331302 3' - 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copia 5041 2 73.10 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGTAACATTTTCTAAGTTCTATTCAGTCATTAGCAGATTTTGAAGCCGTTAGCATCGTAAACTAAAATATTATGATGAAAAATTCT:1 + chr2L 7939866 3' + Burdock 221 2 57.53 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGCTCCTTTGTTGTATTTGTATTCATGTGGCAAA:1 - chr2L 17206014 3' - hopper 70 1 75.00 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCCGCGAAGTGGCAAACGTCAGTCAGTACTTCAGCCATTTTCCAACTAGAGCTCC:1 + chr2R 9410552 3' - hopper 34 1 52.17 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGCCGCCTGGACGAAGACCATGAAGATGAAGGACGCAGGACGGAAAGCTAACGAGCCGCATGGCAGACAAAACT:1 + chrX 2916773 3' - 412 48 2 49.32 CCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCCCTTGGGCTGGCTACTTCCTCGCTTCCCTCTCCTTTGGCTG:1 - chr2L 18178283 3' + Tirant 8503 2 66.20 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGTGGTTGAAGTGGTACTGATTATAAGCTAAGTATTTAAGAACAAACAATGACAAAAGTTAA:1 - chr3R 12727152 3' - I-element 70 1 67.91 AATAAAACTATTAAGTTTATTTGGTAGTTACGTGCCCTTTTATTGGTGTTTCCCGATAAAGATAAGGGTAATATTATGTGGCATTTGTTGTAAAATTTACAAGAACAACATCCACAAAGAAACATTCATTATTTATTTATGTTTTT:1 + chr2R 13170880 3' + TAHRE 63 1 63.70 GTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTGCAGATATGCAAGTTGCATGACAAAAGTTTCACAATTAAAACGGCAACAAGAGCTACATTTTAAAGAGAGACT:1 - 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roo 8729 2 63.70 GAACTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATACTACACACATACAATCAGCTTAATTTTTGTTGCTCTGTCAATCGATTGTGTATTTAAATACATAAGTATTATGCAGCTTTGTTGAACATAAGAAAGCCGAAGCATA:1 - chrX 23008164 3' + transib2 2583 1 65.07 CGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTCCAACATCTTTGAGAGTAAGAATACTGGAATCACTTTACAAAGGACATCTCAGTAAGACAGCAACCAAA:1 + chr2R 2946068 3' + 1360 3335 1 69.86 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTATATAAACTTATTCTTTTTACCTTTCTTTACTTTCAGGT:1 + chrX 3767655 3' - I-element 84 1 75.34 GTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAACTCAAAGCACTGATATCATTTTAAGTTATCGCCGAATTTATCATAGTCATGGCGCTTGT:1 - chrX 4727191 3' + roo 308 2 62.94 TTAGGGGGGTGGGGAAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGTACTAAGTCTAAGGTGGTGCAGAGAATTCAGTTTTGGATGCCCGAACAAAGCGAAATTGAATAGAATAA:1 - chr3R 22515241 3' - gypsy5 7036 2 52.74 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCTGACAGCGGGCGCTGCACATTATTATGT:1 - 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hobo 49 1 68.42 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCCTATACGTATGTATGAGTGTGTATGTGTTTTTGTGCCTGTGTGCGCGTTTGGGCCTTTTGTGCACAATCTTACTGACTTCCTTCCGGTCGAACA:1 - chr3R 16530523 3' - hopper 24 1 69.18 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTATAATGACATTTCGTTTGGCATTTGGGAAAGTATGAAATTGGATATGTTTAAGCCTTTTCACATTACTGCGTACGTGGACTCATATTGTAACTGACCTTAAATAAAATACAA:1 - chrX 6423121 3' + roo 394 1 73.79 GTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGCGTGTGGGCGAGTGTACAGTAATAAAAGTCCATTATCAAAGTTTACGTTACTCTATGACTTCTAACAAATCACGCTTAGTTCTTA:1 - chr3L 3155276 3' - I-element 347 1 63.45 AGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGCGCCGGCAGAGAGGCCGTCGGCAGAGACGTTGCTTTGCTCTTATGTACTTAACTACTCACTCAGGCAGCGACCCACAATTCCAGTGTTGCCGCCCCTTCGCATGTTTG:1 + chr2L 6319213 3' - Tabor 307 2 63.64 GTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGTG:1 - chr3R 14860121 3' + BS 5058 1 53.96 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATATAATCAATATAATTATAGCATAACAAAGTTTAGTGACACACACTTTGAGAT:1 + chr2R 9092052 3' + 412 432 2 67.65 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTGCTTTTCCCACTTTCCCACCGCTTTCCACAAACTTGAGCAACAGCTGCGTGTGTCAAGCCG:1 + chrX 19113574 3' - 412 7112 2 56.16 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATAGTAATTATATTTCCCTATTATGGTTAAATTTGTATATTTTCTCCGAGTGAAGCCGAGATTAGTATGTTTTCACCATAAACACAGTTTGTTCATGTA:1 - chrX 9959739 3' - I-element 23 1 65.75 TCAGATACCTGTTACTCAGCTGGAAGACTTCTATCTTTTGTGTAATATCGGTAGAAATTGGTGTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCAACCTTCTCATCACCAAATAACCAAACAGGTTTCCTGGTCAAAGCC:1 + chr2L 11630734 3' - INE-1 544 1 75.34 TGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATTTCTAGTCACATTCGGGATTTTTCCAATTATCAAAAC:1 - chr3R 5024789 3' - diver 5925 2 62.33 ACATAACAGCGCAATTAACATGTAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGCCTCAACACGAGTAAAACAAAACGTAATTACAACAAGGACTTT:1 + chr2L 9861367 3' - BS 5038 1 69.18 AAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTTTAATATTTTTCAAGATTTCAAATAGGTTGTGCAATAATAAAATAAACTTAAAAATGTAAACAGTTTACAAATAGATAGAAATACCTTGAATGAACAAAACTCCCTTGTAAGTTACCA:1 - chr2R 22012076 3' - opus 7114 3 71.23 TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATT:1 + chr3L 20399050 3' + roo 8980 2 80.82 GAGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGTTTTCACTTTGCTTTTTGCCTTCCTTTATTCGGCTTCCCGATTTTCTGGTTCAGCGGGGAATTTCTAGTTTTATTT:1 - 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X-element 4715 1 76.92 GGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTGAGCGCCTTTATGGCTGCTTGACTATCAGTGATATTTGACTAAAAATGCTGGAATATTCTTTATCGAAGCACTCCGGCGATCTAGCTATTGATGACTGTCCGTCCATCT:1 - chr2R 4330699 3' - copia 4870 2 70.90 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTGACTGTATGTATGCCTGTGTGAGTG:1 + chr2L 19158918 3' - P-element 47 1 50.00 TTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCTTCGGACCATTTACTTTTTATTTCCAGATGTGTCGCAAGATTT:1 + chr3R 26244752 3' + copia 224 1 60.69 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATACAGTGCATGTCAGAATGAATACGGAATTCCTTGCGGACTTCAAGCGACAAAAGATGAGCCTGTACCAAATTGATGCCCGATGTCGGTGAG:1 + chr2R 12814971 3' - opus 22 2 65.97 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCACACTCCTCAAGCATATCCCCAAAGTAAAG:1 + chrX 20465889 3' - jockey 4807 1 50.00 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCACACTCATTTCGCTTGCAAAATCCAAATAGAA:1 + chr2R 16496709 3' - hopper 14 1 72.14 ATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATAACACGAACGAATGCGAACAAATTGATATGCAAATGTGAGTAGCAGACCCAGACCCAAAAAACGTAATAATAAAATAAAGTAGAACCCAAAGCACTGCGATGAGGGATGGA:1 + chr3R 25409939 3' - jockey 4536 1 74.66 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGTCATCGAATGCTGCTCTAATTTGCCATTGTATTGCATTTTGTATTGAATTTATTACGTTTGTCCACACACATGTGTGTCACATGGTGGCCCCAAACTA:1 + chr3R 8922037 3' - FB 23 1 69.86 GACGTTAGAGTGGGCGTGGCAAAAAACACTGAACCCCAAGGCAGTCAAAAAGCCTAAGGCTGCAATGGTGAGATCCATACGGTTCTAAAAAGGGAACACATTTCCGAGC:1 - chrX 2262415 3' - INE-1 211 1 63.30 AAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACAGAGTTGGTGGGAACGGTTTTTAACATATTCACTTG:1 - chrX 4214480 3' - jockey 93 1 73.29 GTGTGAGAAAATCTTATATATATATAATATATATAAGACAATACATCAGATGATATTTGATCACCTAAATTTCGTAGGCCAAGTAATTATTCTTTAACGTATTTTTTCAACTCGGCTATTTTAGCCGGCAAAGTCAAGGTGAAATG:1 - chr2L 6756812 3' - Tom1 252 1 69.86 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAAATACGTAGTGGAAAACGAAGATGCTGCGTCGTCTAAGTCAGACTCAGAAAATCAGGGTGGAATGTAAAGTATAGTTGGGCATCGAT:1 - 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chr2L 19158780 3' + P-element 2868 1 69.86 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACCTAACTGTATGGTTCTATTTTAATTAATACATTTTCTGCTGCTTCTTATCCTCTTCGGAATCTT:1 + chrX 19597113 3' + 1360 3342 1 56.72 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAGAACGTGAGCGAAAAGAGAGCATGTGGATCTTACTTGAGCAGGATAACAGCTG:1 - chrX 7967178 3' - P-element 26 1 64.62 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATAGCAGAGAATGCAGCAAAATACGATTCCTCAATTCAGTGTCT:1 + chr2L 12678591 3' + P-element 2814 1 34.75 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGTTAAACGCTAATGCCGCAAAGTAATTCAAAACTTAAAGCGCACTTTTCGGGGCTCTCGACGCGGGTTTATTTGAGTTTTTTTTGCAGAAACTCTGGC:1 - chr3R 18541271 3' - hobo 26 1 65.07 CTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTCGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCACCCT:1 - chr3R 29091294 3' + rover 279 2 64.83 AAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTGGCCGCCCCGTTGGATATATGTAGATAT:1 + chr3L 20399107 3' + roo 373 1 60.96 GTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCCTACGCCTAAATAAATCGACATTCGTAACTTTTTTTTATAATAATGAAATTAATAAAACGTACATACAATATTTTTAAGAACGATACGCCTACCACATACGAT:1 - 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chrX 10823897 3' + pogo 2070 1 63.01 CTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCTTCTTGTTGACTTTCATGGCTGTAGCTTCCTTGCTGATTGCGTTGCTTAGCGTTGTTTAATCATATTCTCGTTCTCCTTGAGTGTCTCGTTTTCAACGCTTA:1 - chrX 21184303 3' - hopper 479 1 72.60 GACTGGGCAAACGACCTGTCAGATCGCAAATCATACAGTGGGTATGCATTCTTCCTTGGAGGCAGTGCGTTTTCATGGATCAGGTTGACTTGTCCTTCCATCCTTACATCAACGTCATTCAAAGTACTACCTATTTATGGCATTCC:1 + chr3R 11182492 3' + Copia1_DM 3848 1 54.11 GGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGACCGAAAAGAATTGCAAGTGAAGTGATATAAAAAGAAACTGAGGGAAAAGAGTTTACGCCTTGGCTCGTTAGTGGATTTTTTG:1 - chr3R 30560015 3' - I-element 5045 1 60.27 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCG:1 - chr3R 30850777 3' - I-element 85 1 73.29 CGCTTCCTTGTGCCTGTTACATACTATTCAACAAATCTAGTATACTCTACGAGTAACTGGTATAAAAACACATTTCTTGCTATTTAAAGTATGTAAACGGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGCATACTCATTTAAAT:1 - chr2L 20923045 3' - INE-1 30 1 40.41 GTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTTTAGTAGTGATTGCTAAAGTTTTTATAGATGAAGATT:1 - chr2L 11442923 3' - G-element 4207 1 75.17 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAGGGTAGGAGAGTGTCTGTTGTCGTCGGAGACCTTGCACCGACC:1 + chr3R 22522755 3' + roo 392 2 70.87 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGTCTATACTGTAGGCCAAGCCACATATATAAGCAAACAATATATATAAATACATATGGGGTGTGTGGGAACGGTGCTGCGCCCTCAA:1 + chr3L 12899876 3' - roo 8700 2 60.96 ATATATATTCTTAATCAGGATCAATAGCAAATAAATGTAAGCTCTAGGTCATAGAATGATTATGATAATTTTTTTCTACCTTTGGTCGCCTTGCAAATAAAATTACTCCTGACTTTTTTTTGTTGGGCGGCCCC:1 - chr2L 22216705 3' + INE-1 80 1 34.33 TTGTTTTTTTTTTTATCAATGCGAATACTGCCATTGAACTTGGTGAAAAATGGTTTTTGTTTCCTTTGTCTTGGCTTTGAATGAGCGAAGTGCCGACTCGATTGGAATTTCGGATTAGAATGCCAAAGTAGGTTAATCATTTAATC:1 - chr2R 23799172 3' - HMS-Beagle2 477 1 69.86 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTACATGCTATTCGTTCACGCCCTTCAAAATTCGATGTAGTTTTATTACCAAATCAAATGGGATTCACCACAAAGTAA:1 - chr2R 21029338 3' - Transpac 4962 2 53.42 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTTCCTGAATTTACTGAAAGGTTTTTTATTA:1 + chr3L 19574164 3' + 297 6929 2 54.79 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTATCATAAAAATCTGGGAAACAAATCATATCGAAACCATGAAATGTAGAATTCTTCTTTGTCGTTATAA:1 + chr3R 14494121 3' + roo 9021 2 54.11 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTG:1 + chr3L 10564000 3' + hopper2 1554 1 51.37 AGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTTTAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCATGCAAGCTGTTACTTTTCACTAAAAATAAAGGC:1 - chr3L 20224090 3' + Chimpo 170 1 73.29 CTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAAAGGTGTTACATAATTTCGAAGCAATGCGTACAAGTATTCAAGAGATACTTTGACGA:1 + chr3R 25605316 3' + 1360 9 2 60.96 ATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATGCTCACTAAATTGACTGAGGGTCATAATATGCCAATTCATCAAAATATTGCCGTTACTTAGAGGCAATATTTTACCAAAATGACATTTG:1 + chr3R 28659154 3' + Burdock 6360 2 56.16 GGTGCCTTATCAGCGTTTGATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTAGGCCACAACATCATGATCTGGCGGATTGTACTTGTAGCAGTTGGTGAATATTAATCGCAC:1 + chrX 8052934 3' + accord2 7194 1 58.33 CACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAGATTAATTAATTAATTTAGATTTTATAATAGACCATAACGGGCAGCAAGATGCGCGGACCCTCCAACG:1 + chr2R 5357260 3' + Juan 4149 1 65.75 CTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGGACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAATTTAATTAAATGAATTCCATTTTTAAGCTTCAATTGTTG:1 + chr2L 19633359 3' - S-element 1503 1 71.92 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGACTAAGGATGTCGAATACTGAGG:1 + chr3R 4532986 3' + 1360 3342 1 54.79 AGTATCTTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATT:1 - chr2R 1320674 3' + diver2 309 2 51.37 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTTTTTTAAAGCTTTCCAGCTGCCCTTCTAATCCTC:1 + chrX 7967303 3' + P-element 2836 1 49.66 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATTCGTGAGTATTCTAATCATTTCCTTTGATAAGGTTCTAAGCAAACAATTTGTCATTATATTTCTAGGATTTTAGTATGAAACGAGCTAAGG:1 - chr2L 7939703 3' - Burdock 27 2 63.01 ATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAAATAAAAATTTCACTTCCCACACCGCTTAACAACTGATTAACAGCCGAAAGCAAGCCAGACGTGCGTGATGCCAAACAA:1 - chr3R 15630169 3' - Tc1 1447 1 51.37 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATTCCCAGTGCAGAACGCCAAGGCGGCTCACCAAAGAGGTTCTCCGAAG:1 - chr3R 10636109 3' + blood 304 2 67.81 GAGAGAGAGAGAGAGAGCTAGTAAAGGGAACGGCTGCTGTAAACGCCAGCGAAGTTAGAAATATGGTCCTCTCCCAACTCTGGTCACACTGAGTCGAAACTGAAACTGAAACTGGGTGGATGTGCGGATCGTGAATTT:1 - chr2R 7698852 3' - blood 7175 2 75.36 ATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCTTATAGTATGTA:1 + chr3L 23702300 3' - G4 17 1 68.49 TACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATAATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTTGCCGAATATTAACAGTATTTTATATAGTTGGTTTATAATATAAGTTATTTCATAGTAGGAAAATCCGCAATTATC:1 + chr3R 5115396 3' + Ivk 5335 1 54.79 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGGCCAAAAAGAGATTCCATC:2 + chr2R 9623404 3' + I-element 5280 1 67.81 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAA:1 - chr2L 13717302 3' + P-element 2810 1 31.51 CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCACCCGA:1 - chr2L 7271828 3' + 297 328 2 66.44 ACTTGCACACACACACACACACACACACACGCGCCAGCCGCAGCCTTAAAGTATGCCGCACGTTTTGCCGCTCTTTG:1 - chr3L 6014990 3' + Quasimodo 35 2 66.23 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAA:1 - chr2L 19158861 3' + P-element 2818 1 21.74 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTATAATCACAAATATATTAAATAAACCTCACGGACTGTGGCCTGTGTTGCAGCTGCGTCCGTGTCCATGTGGCATAGTTGCGCTTCAGGTTTGATTAA:1 + chr2R 9455965 3' - 412 7075 2 70.55 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCTAAATTAGCATTAGGACTGAGTTTTCCTAAGTGCAAGCACTGTCTTATCCTTATTGCCATCTCG:1 + chr3R 8914363 3' + pogo 2046 1 57.53 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAAACGACGATGCCAATTCGTGACGCCAGTGACTTCGGCTTTCGGCCGCCTTTCGGGTTT:1 + chr2L 13717398 3' - P-element 58 1 45.77 CGGCGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTGCAATAGAGGAGTGATACCATTTTCAAAAAGTTTTGGGAAAGCCGACAGTTTAGAGATTCCTTTGGAAGCATATTTAGGGATTTATTATTATTAGGGATTTGCTGATTTATACTTTT:1 + chr2R 1655223 3' - Q-element 183 2 67.81 TAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGA:1 + chr3R 29091366 3' - rover 7034 2 75.34 TACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAATCGATATGGAGATGGAAAAACATAGGAACTTTTTTTAAGATTAGCTATTATTATTATTAGTC:1 - chr3R 6413715 3' - Tirant 445 1 60.96 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCACACG:1 - chr2L 7271829 3' + 297 6929 2 61.60 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTTATTTGCATAACTGCTCACATGCATGTTG:1 + chrX 17737249 3' - jockey 4742 1 75.41 CACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTATACTGAATGCTTATGTGCGTAAGCAAAGAAACCAAAAACGGAACGATAGCAAGCGA:1 - chr2L 22218172 3' - Bica 186 1 61.64 GTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGTTCGAAATGAAACGAAATCTTTAATTGGTGTTCGAGTGGTTAAGCCGAGCTTATCGATTTCTTAGGTGTGTATTTGGAATGCTTGCTTTTGG:1 + chr3L 17207013 3' - I-element 4955 1 47.14 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTTATTTGCATAACTGCTCAAATGCATGTTGTTATTGAATTTAGGGTAATTCCTTTCCCTATAAATGTAACGGAATTTCGAGAGGCAGGACGTGG:1 + chrX 17737313 3' - jockey 4702 1 66.44 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGGCTAATTTTAAAGTTCCCATTGCCACAGGCTCAAAATGTGACAAAAAAAAAGTGAACGGAACTTGAAATTAAACCGGAATTAAGCGACCGTGTTTGCTAGGATAATAAC:1 - chr2L 11079344 3' - 1360 10 2 76.03 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTATGTTGCAAATGCATACTATAACAAATTGTTAAGTGTTAGACA:1 - chr3R 10137011 3' + I-element 5278 1 69.18 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACAC:1 - chr2L 9319114 3' - jockey 85 1 76.34 AGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATA:1 - chr3R 9175200 3' - Juan 65 1 57.53 AACTATAAAAGCAAGAAGGTTGTGATTAAGCGGACAGATTCTAGAGACATAGACGCAGCACAGATTTTTTGGCCCTATTGCCACGCCCACTCTAACGACAAACCGCCCAAATCTCTCATGGCCACACTTTTGAACCATTTTTTGAA:1 - chr2R 5722308 3' + INE-1 159 1 76.03 ACCTCACTCAGCTGCAGAGGGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATGTTAATAAAGAAAAGGAAAGTTAAAATAAAGATAGTTTTCCATATATTACATATATTAAAAAACAA:1 + chr3L 5851869 3' - invader4 2871 2 54.11 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCTTCGGACCATTTACTTTTTATTTCCAGATGTGTCGCAAGATTTGCTTCCGCATTTTACTCATT:1 + chr3R 26244772 3' + copia 243 1 73.97 CACAGAGACATACAAATAAAACTTGTCATTGATTGTAATTTGGGCGAAAACGATCGTTCTGCCTCATTGGCTGCCTTTGTTGACTGTACGCCGAACTTTCAGAAAAATACAGGTTCCTCTCTTTGATGGCTACGT:1 - chr3R 773773 3' + Doc3-element 4447 1 76.30 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACCGATATAGACGCATTGTTGCGTGGAGATTTATCATTGATTGAGGCCATGAAATTTACACTTCAAGTGTCTCGGGAAAATGCTTTTCCTATTTTGTCACTTCGGAAACGCAG:1 - chr3L 12899700 3' + roo 398 1 74.66 TTATTGTTATAATTATTGTTATTTCACAAAATACTGCATTAGGATTAAGTTGTACCTGCAACATCTAAATTAACTTTGAAAATCCGAATTTCTAATTAGTTTTAAGCCTACTTTAGGAAGAAACTGAGCCCCAATCACAGAAAAAC:1 - chrX 7711063 3' - mdg1 20 2 71.23 GACTCGGCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACATACTTTTCAACAAATCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAAAAATATACTGACAGAATTTATAGACTGGTAG:1 - chr2R 5296803 3' - INE-1 92 1 63.70 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATGTGGTCAAGGCTTTAAAAGCTCTTCGGATTTATATTTGGTTCTTTCCGCCTATAAGTATAATTCA:1 - chr3L 13472396 3' - jockey 62 1 54.79 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGAATATTATGATTACTATCTGTCTGTCGCTCTGTCCGCAGTAACTCTGTGATCTCGTAATGTAGACTAGTAAAGGGAAACTAACCAACACGGATGTCAGAAAAGGCGTGG:1 - chr3L 27146145 3' - HMS-Beagle2 10 2 76.03 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACATATGG:1 - chr3R 18517952 3' - roo 8742 2 71.92 AAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTTCCTGAATTTA:2 + chr3L 19574146 3' + 297 330 2 65.07 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTT:1 - chr2R 9504230 3' + roo 8989 2 77.24 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGCACATCCATCTAAAGCCCTTCATGATGTTAATTACCGAACCCTGTCACACGCTCCGCGAAAAGGAAAACATGGAAAAGAGCGGGCGAAATCTA:1 + chr3L 6675427 3' - 412 12 2 73.08 ATTTGTATATACATACATTTTATTTTTATATATATCTTTTTTCCCGGGAATAAAATTAACACTCCGATTTATTTGTCCTATTAAAACTCTGACACACTAAAATATTTAAAAATGGTATTTTGAAGAAGTTCAACTGTCTTTGATTC:1 + chr3L 16174976 3' + transib4 2463 1 19.86 GAGAAAAAAAATTAAAAATTGTTCCAAAGTGTGGACGTGACCGGTTCGGCGGCAATGCGTCTAATATACCCCTTTACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACAGGATGAAAAAAGCCAAACTTAATAACAACAAAATGGCCTTTGCG:1 + chr3R 24506373 3' - INE-1 466 1 72.60 GCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCACATTTATTTATTAAAATTCTGTCGTGTATAAAACAACTGATTAAATCACTTCATTTTAATTAAATAT:1 - chr3R 27514653 3' - Ivk 365 1 51.77 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTCGCCTTTTAACTGAGATATGGCAACAATGTTGAGCTTCAAATTGATTTTCGATCTCGACATAGCATTCTTGTTTTAATTTATTTTGTATGT:1 - chrX 20460519 3' - diver 32 2 60.96 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGACCCACTGGGCTTAAATATGTAGCAACAGTTTGCAGTG:1 - chr2R 9623357 3' - I-element 75 1 68.46 TCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAACCAACTCTGTTCCCAAAACCGCCGCCCGT:1 + chrX 4214515 3' + jockey 4906 1 75.86 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGTATGTGTGCGTGTGTCGATGTATTAAGTGGAAACACCTTGTAAAATGGCTGACAGGTGTTAGAAGACTTTGCAAGATTTATGCGCTGACATTAACATGAATATGTA:1 + chr2L 12847349 3' - 412 14 2 74.66 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGCAGCAAAAC:1 - chr2L 19158845 3' + P-element 2810 1 29.50 AGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGAATATTATGATTACTATCTGTCTGTCGCTCTGTC:1 - chr3L 27146220 3' - HMS-Beagle2 84 2 75.86 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCGTCGGCACAGGTATTCCACAAGATTCTGTTATTCGCTTGTGTAATTAACGGATGCGGTGTCAACTAGTTAAAATGCAATACCATCCCAAGTCGAATAAACTTT:1 - chr2R 18440358 3' + P-element 2881 2 79.26 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATGTAAATATATGTGCAATAAAATTATGCGAAATAGTCATTCCAAGGTACAGCGGTATTCATGACGTCTTGGTAAAATATAAATGGGATTTCTTTT:1 - chr2L 17166239 3' + I-element 5332 1 67.81 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTATGCATAAAAAACGTTGAAAGCAAATGGCCGGCAAATGGTTTTAACAAATGAATTATATATA:1 + chr3L 13545079 3' - hobo 57 1 56.85 GACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTGGGCTGTTTCGCAAAGCTTCTCGACCACCAGCCATATGGCGTCGTTGGGCGAGAAGTCCCCTTGCTG:1 - chr3R 8244495 3' - HMS-Beagle2 6847 1 56.85 TAGGCCTACTAGATAACAAAAGCAACCTAAGGCGACTAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATACACAACGCCGGCTTTCGGCTACTGCG:1 + chr2L 15287272 3' + G3 4419 1 75.51 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGACTTATTATTCTTTAGGTTTAGAATAGAGGAAAACA:1 + chr2R 4803010 3' + roo 324 2 75.34 CTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAATCTCATTAACCACTTTAAAAAATTAAAAATTTGCTCCGAATATTTTGCTAGCGTCCG:1 + chr4 806727 3' + BS 5032 1 62.33 ACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTGCCACATAACTATATAAACAAGTCCATGTGCAGTCATTTGGTTGTGCTTGGGTCTTTTTT:1 - chr3L 3339349 3' + Transpac 5170 2 64.34 TCGCTTCTGCTGCATGGAGATGGAGAACTCTGCACTTATATATATATGTGACTGCATGGCGCTTTCCATCAGGAGGAACAGCCGCGGAGGAAGCAACGTTCCACATCAAGCACTTCTGCTGCTATCAGTGCGATGAGCCGCTGGC:1 - chr2R 17466688 3' + baggins 5205 1 55.86 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:3 + chrX 23439059 3' + P-element 2495 1 60.27 ACCTATTGGAACTTATATAATTTGTATACTGCGAGAAAAGCATTCACAAAGACATCCGTCCCTTGTTGGCTTGAAAAGATCTTTAATAAAATGGAATAAGTTGTAGTTCTTGAAGACTGCAATGACTATGAATGCATGAGATATAT:1 + chr3L 20176827 3' + gypsy 461 2 27.40 GTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCCACTGGGCTTAAATATTTAGCAACAGTTTGCAGTGGGGAAGTTTTTCGGGGT:1 - chr2R 9623340 3' - I-element 53 1 56.00 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGCTTGTTTGCGAAAAATAAAAAAAACAAAATTGGCGAGCAGCGGCATGTTCGTATGGATGCGAAAGTTCGCATGTGTGAGTGCCATTGCCTGTCTGTGTGCCCTGG:1 - chr3R 17059231 3' + hopper 1401 1 62.07 TTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATATATCACTATAAACATACTATACTATAAACTACATACTACATACTATAAACATACAACCCAC:1 + chr3L 11576316 3' - HMS-Beagle2 53 2 55.94 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTTGCCCATTTATCTTTTCCAGCCCATCGTGCGCGGTTG:1 - chr2R 14940688 3' + blood 7322 1 73.08 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCACCAAAACGTTATGACAATCGTATGGAACACCCAACCACATCCATGCATAGGAAAAACAAATGGGATCCGGGTCAAATGTGGAGGGTTCAG:1 - chr3L 9519516 3' - roo 31 2 60.27 CACACACACACACACACACATTTTATGCGGGTTGTGGGTTAGTTTTGGGTTGAATGTGGGTGTATCTGTGTGGATGGTTTTCCTATGGGAAGAAGGGGGTGGTGGTGGGCTTCTTTATCGCCGCCCGTTCGCGACGG:1 + chrX 13057863 3' + accord 7030 2 18.98 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAATCAAAAAAGTGAAAATGTGTCCGAAAACGTCGAAAACCACGCCGCTCCTGCTGAT:1 - chrX 10286954 3' + roo 9040 1 61.64 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAGCTTTCTCTTCTGGTTTTAATTAATTCCACCTTTATACCCATTAAACGTACATTTAAAAAAGATGCATTTCCAGCCCTAGAAAGTATATAT:1 + chr3R 4166127 3' - HMS-Beagle2 27 2 66.90 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATATCAAATTTATGTCAAGTTGGCCAATTTTCAACAGTAAAAACGACAAAGAAAAACTCTACGCCAATCAGTTAGCAAAAAAAATTAGCACCAATTTA:1 - chr2L 3648677 3' + roo 392 2 72.86 TATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTAAAAGCCTCACTACAGAATAAGAAGGCCA:1 + chr2L 15322975 3' - diver 264 1 58.90 CCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCGACAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTCGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCACTTCAATTGAAATTCAAGTGCTTACTTCATTTCCACTTAAT:1 + chr2L 17266110 3' + G5A 2586 1 64.34 TTCGTCTGTCGGAAGAGACTAAAATTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACATTGACAAATAGCAAATTATTTATTTTAAAGAAACTTATCCGAGCAGTCTCTGTTAAATTTAATTATTGCTGCATTT:1 + chr3R 17183743 3' + diver2 224 2 52.05 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAATTGTGAGAGTATCTGGCCAATGAAATTTATGTGGTAAATTATTCACAAAA:1 - chr3R 9193149 3' - opus 64 4 65.52 GAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGC:1 - chr2R 13212223 3' - diver 5966 2 67.81 ATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCATAGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACTGTAAAGGTCCTTGCTAAA:1 + chr4 935632 3' + 1360 3119 1 43.15 AATAATAAAAAGTAAATAAAAATAATTGATAGATTTTGAATTCCTGTTTAATAAAAATTAACATATTTACATCTTTCAACATTTTAAAGGTAGATGCTGGAAATATTTTAATCTGTCACATGCATCTAGCGTTGTTAACGATATTG:2 + chr3L 18326625 3' + Doc 4691 1 41.78 TTGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCACGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAAC:1 - chr3R 1047986 3' + Stalker2 7387 2 75.37 GAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGTGGTTTTATAAAGACACACAACATTTATGTTAATAGAAATATTTAATCAGAAATTTGATACTGATCCTAAAGTTGCACTTTGGAGTTTCATTTGCG:1 - chr3L 19437856 3' - copia 27 2 62.33 TTTCTGATTTTTAATTATACAAATTCCAAAATTCATTGGAAAACAAAATGTTCCGAAACTCAAAGGAATAAACATTTTGGGAGCCTTTGCGTACCATTCATCATTTCAAAATACAAAAAAATCGAGACCTGTAATCATTTCCAGGT:1 + chr2L 19157780 3' - invader2 4736 1 70.55 AAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATAAACAAATTAGCAATAAGTGATACCATTGTAGAATATTGCTTTAGACGGTTCAATCTAGCATCCACCAAGCC:1 + chr2R 5357416 3' + accord 7368 2 42.96 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTAGTTTAAAAGCTTCAAATTTTCATCGACATGATTT:1 + chrX 14346536 3' + roo 9036 1 58.33 TCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGAAAGCTATTGCGCGCTAAATTTAGAATGTTTCCAGTGCCTTTGCCTCACTTAGGAAACATTTTGCGATGAAA:1 + chr2R 16073075 3' - Burdock 5 2 78.08 GATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAATTCTGGGCAATTAAATGAGCATTTGGCATTTGCTGGCCTAAACATTTTTGGCCGGAAAATTGTTTTCAAA:1 + chr3R 17236106 3' + Stalker4 7239 4 52.05 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCGGATATGAAAAGGTGAGTTTACAGAATTATCAAACATGTTTTTA:1 - chr2R 16496579 3' - hopper 67 1 66.43 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGCTTACACAAGATTTTGCTTCTTGAAATTCTACCTTAAC:1 + chr2L 3648795 3' - roo 8740 2 73.57 TGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAAAAGCTCCGCTTT:1 - chr2R 12069569 3' - Tirant 11 2 66.67 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTTGTATTCACAACTTTGAACACTAACATTTAAGTTATATTGCATTTAAGAAAGAAGCCTTAAGAAACCCTTGCTTAAACGTTATCATGTTTGCTAAG:1 + chr3R 5762075 3' + roo 9051 2 71.33 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGACATTTTCACAGCTTCGAAATGTGTGAAATTGTGTCGAAAATAAGACCTTTAAAGCTCTTTACACA:1 + chr2R 11595932 3' + P-element 2871 1 62.39 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTAATCGATAGGCATTGTTTTGTATGTACCTTTTTTAAAATATTCTTTATCAAATCAACTGAACCTT:1 - chr2L 17957157 3' + blood 7337 1 53.42 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCTGTCAAAAGCTCTTTCGTTTTATTAGATTTTCCCAGC:1 - chrX 17027882 3' - roo 83 2 73.29 AAAAGGCTTCAACTTGTAGCTAAAGCCAATGGGAAACATACTACATACCAAAACTTTTAAAATTTTAATAAAATAATTAAAAAATTTAGGATTAATAGTGTATAAGTATTATAAGTTACTTACTTAATCTTATCATTAGAGCAGCG:1 - chr3R 18363747 3' + S-element 1391 1 63.70 CAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTAGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATACAATACCACTGAAGTCACCATACAATTTGCAAACATGTCAAC:1 + chrX 20109827 3' + I-element 4895 1 75.34 GGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATAGCATGCTGTTGCCAGTCGTCTTTCTTGTTGTTATTGTTGTTATTCATTTTTCTTTTCTCTTATTTATT:1 - chr2R 16220384 3' + 1360 86 1 51.43 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAACAAATTGCGCGCCTGCGGATATGCAACACAGAAACTCAATAGGGAAACATCAAAACAAACAGCAGGAATCAG:1 + chr3R 5868280 3' + jockey 4955 1 51.03 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCACCAAAACGTTATGACAATCGTATGGAACACCCAACCACATCCATGCATAGGAAAAACAAATGGGATCCGGGTCACATGTGGAGG:1 - chr3L 9519522 3' - roo 28 2 58.39 CACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCGGCTCCTGGCGACGCACAAAAGTATGCAGCACAAGTTGCGGACACTTTGAGCTCG:1 + chrX 7031683 3' + hopper 1396 1 61.17 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCT:1 + chr3R 6412042 3' - Tirant 49 2 65.49 TGCCAGGCATTTTTCAATTTCAATGTCTTTAAATGAAAGAAAGTTTTAAAAATAACTTAAGAATACTTTTATGAAGTGCTAATGAACAGGGAAAATTAAGTTTTGTATATAGTTTTAGGAAGCTTTTCATTTTTTTATATTTAGT:1 - chr2R 13547258 3' - S2 391 1 78.62 AGTTCACGGTGCATCCTCTTTGTGCTCGTCCAAAGTACGCGCCGTTAACGTTCGACATCCGCCTAGAGTTCAAGGTCCAGCGCGGTACCGTTAGTTCACAGTTTTCGGTAACCAAGATATATTTCTGTCTTTATTGATGGAAAAGT:1 - chr3R 24840500 3' - gypsy8 249 2 28.77 GGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCGCATGGGAGG:1 + chr3L 18738150 3' + Bari1 1644 1 63.57 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCAACTCGGCGATTACTGCACTTGAAAACTGTATTGGTTACTTAATGACATTTTGCG:1 + chr3R 22868855 3' + mdg1 356 2 61.64 AGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTAC:2 + chr2R 5173232 3' + Stalker 7209 4 50.68 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGTCTATACTGTAGGCCAAGCCACATATATAAGCAAACAATATATATAACTACATATGGGGTGTGAGGGAACGGTGCTGCGC:1 + chr3L 12899870 3' - roo 8677 2 67.52 TTTATGTTCCATTTTATTTGTAAATAGAATCACAAAGTTGAGTAAAAGCTTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAACAGCTCATCTTACATATGAATTTGATTTGTTTTGCTGAATCGTTGTCTAAAATGGGTAAATTAATCAAACGA:1 + chr3R 2120014 3' - transib3 261 1 68.49 GTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAAATGAACCAAAAAGAAACGAAAATCCAGCAGACTTCAATCGAGTTGCTCCACTTACAACATCATATGGTCTCTGACCTCACATTACGTATACGCCCCAGCTGTTT:1 - chr3R 19724716 3' - opus 7242 2 76.03 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTGTATCCCGTTAGTCGATG:1 - chr3L 23456153 3' - 1360 85 1 73.23 GACGGCGGACCATCGCGGTCGGTCTTTTGTATAAGTGAATTATGAGGAAGGCATAATTACGTTACTATATAAGTTGCAGTACTAAAAGAGTCGGAAAAAATACCAACAGTTCAACAATTCATTGTAGTGAACTTATCGATGCGGTT:1 + chr2R 4833506 3' - Tom1 45 1 69.86 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGC:1 - chr2L 19158853 3' + P-element 2795 1 22.60 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCCCTCGGATCGGATCCTGGTTAGCAACTCAACAAGCTAACAAATTA:1 + chr3R 10461739 3' - roo 75 2 69.86 TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTTAATTCTTTTGATTTTTTTTTTGGGACCCGGAAGGTTTTACGGTGTGATGCCCAGCGAAGACCGATGCGAACTGAAATGCCT:1 + chr3R 25761577 3' + I-element 5319 1 58.22 TTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTTTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGATCGTCTCCTTCATA:1 + chr2R 2875233 3' + TLD2_LTR 99 1 61.64 AGTGTGTCCTCCAACTCCTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCAATTTACAATGGCGATAATACCTGCACCTCCCCCAAACCGGAATGTAATGGCACCATTCACGTAAAGCAGATCCATAAACCTGAAACACCCAGCAC:1 - chr2L 10318718 3' - aurora-element 4193 1 54.11 GCCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCATTGCTCCGCGAATAATTATTTTCACTTTTTATGTGGTATGAGTAATTGG:1 + chr2L 18689249 3' + Gypsy6A_LTR 253 1 69.44 GTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTGCTTCCAGCGACCAAAAGCAACCAACTCCAAACCCTAACTCAAACTCAAACCCAAACCAAAACCAAAACCGAGCCAAACAAACAAACAGCAAGCAGTTCAAATGCGAATAAAT:1 + chr2R 21258801 3' - I-element 5136 1 71.92 TGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATCTGAAATTGATTTATAAATTACCGTCTGGCAATCGCAGTAAGCCACAAC:1 - chr2R 13471342 3' - flea 4827 1 66.44 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCTTAGAAGTTACTATAATTAAAAGTGTTTAGGTGGCTTTACTGCGAATAGGAGATCACTTCGATAGATGGCGCCCG:1 + chrX 19585316 3' + Transpac 5204 2 66.41 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAATTATAAAGAAGAAGGGGGAATGAAAACCACAGCTCTTTT:1 + chr3R 9175244 3' + Juan 4135 1 74.10 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTCCTCTCTGCTTCTCTTCACGAA:1 + chrX 16217556 3' + P-element 2853 1 62.33 GTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAA:1 + chr3R 6412061 3' - Tirant 8169 2 60.00 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAACTAAAGTACTTAGATAAATAAACTGGGACATTCAGTTTATATAAGCGTGTTCATCAAATT:1 - chr2L 20556413 3' + 412 7505 2 53.49 GACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCGGCAAATTAGTATCAGCGCATTAGGCCTTGGCAACCAATATATATTTCTAGGAAACTATTTATTACACAAAATTCTGATAAGGTCTTCAG:1 - chr3R 5115256 3' - Ivk 20 1 66.17 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACTAAGCACCCACACAACGTAAGCCATTGCCATTTTGTAGCATACTTTTGTGCGCGCCTCTGTTTA:1 + chr3R 16530666 3' + hopper 1367 1 52.90 GCTAAGATTATCTTTGATTTGGCACCACTTTGGCCGAGTTTGCAAGTGTGATAACCAATCACGAGACCATTGAGACCAGAAGGCTAAGCACTGCGATATTCCTGGGCGGATTGGCCACGACGGCGGGTAGCTAATAGAATTTCACT:1 - chr3L 7593156 3' - diver 5619 1 55.48 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAATTCATGGAATTTTTCATACTTTTGAAATACATTCTAGTTGTTTTACATT:1 + chr3R 22136357 3' - FB 68 1 66.43 ACTGCTAATTTTATGAACACAGCTGTACATACATACATATATTAAGTGAATTCGATTTTGAAAAGTATATTGCTTTGTATGGCAACTGATTAACTGCCTTCACACCAATTTATCGAGCTTTCATATTGAATAAAATGCGTATTCAC:1 - chrX 22458462 3' - HB 9 1 42.47 GAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATGATTTTCTCGCAGTGCAGACTATGCACACTTCACTTCACTTTACT:1 - chr3R 24976153 3' + roo 9063 1 77.40 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGGCTGAAACGCAGTCGTTGAACCCCTCGTTGCTGAGGATTCAGAAAGACTACGTCTGTG:1 + chr3R 24053740 3' + mdg1 7397 2 59.59 AAAAAGAAATCGAAAGCGAAAGAAATCTATTTGGAGGATTAGACCCAATACTTCGGCCATCCATGGTTTTGTCTTTAAGATAGCATACATTTTTAATTGTATTATTGATATACAGTCCAACGAGCTGCCATAGCGCTCAGAATTGT:1 + chr2R 14498637 3' + Doc2-element 97 2 73.97 GACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGT:1 + chr3R 1977612 3' + micropia 374 2 70.14 GTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTTTAGTAGTGATTGCTAAAGTTTTTATAGATGAAGATTAATACCGCAGACTTGATTGAAATTTTATA:1 - chr2L 11442894 3' - G-element 4179 1 55.48 AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAATTAATTGAAATCTCTATTTTAAGTAATATTGATAACGATTAATA:2 - chr2L 12488257 3' + copia 179 2 73.29 ATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTGCTAACG:1 - chr3L 13365564 3' - jockey 4631 1 73.77 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGCACATCCCATCAAAACACCAATAACATATTTAGGTCACCTCCTGGGAGAGCCAA:1 + chr3R 19639826 3' - 412 68 2 64.38 CCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTCTCAAAACTGGGATGTGACGCCACTTTTTTAAATAAGCATAAAGAGCGACGCAGCCTTCAAGGACCTTCGCCACTCC:1 + chr2L 10519639 3' - X-element 51 1 52.05 GCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACATATTCACACCCGGCCCCTTCGATTTATAGAGACATATTTTCTAGGTGACAAACTTATTATGAGCCCTGGACAGAGG:1 + chr2L 9609617 3' + accord 130 2 53.42 AGTTTTATTTATTATTTTATTTATAGAGATAAAGAAATTCTTTTCGTAATGACTTTTTTCTTCTTAATAAGTTATTTTGCTTTCACTTAATGCAAATATGCGAAGTTATAATGTTAGAGTAAAGTTATAAGTTAAGAGAAAAAATT:1 - chr3R 8306052 3' - HeT-A 343 1 56.16 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATATTTTAGAGCGTTATTAATATTAGGCAAATATTTGG:1 - chr2R 9455846 3' + 412 7464 2 74.66 GTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTTATATGCGAGTTTAATTTTTTGCAGAATCTCAAAGATCAAATTCTAACGACCAACGTGTGGCTGGAGCACGAGTGGCA:1 + chr3R 24487162 3' - roo 8650 1 50.68 ACACATGAACACGAATATATTTAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTGAGGAAATTGCACACCA:1 - chr2R 4802973 3' + roo 6 2 73.29 TTTTATTTCTTACTCTGCCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCATTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTG:1 + chr2L 18689235 3' + Gypsy6A_LTR 237 1 71.23 TTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCTTCGGACCATTTACTTTTTATTTCCAGATGTGTCGCAAGATTTGCTTCCGC:1 + chr3R 26244760 3' + copia 231 1 65.75 GATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAAGGTCAGGAGAGGCCGGATGCCAAGAGGAAGAGCATGAGATGTGAGGAGATGAACACTTGGGGTAACGTTGACTCGGAGGAGC:1 + chr2L 10644786 3' + Bica 4888 1 66.39 CAAAGGGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAAGTGACTTTAGTAACTGGTTTTAAATGATCCTTTATATACATTCTCGTTGCCCCAAATAAAACAGCTGACTATAATTTCTTCTTAAAATTCCGCATAATTCCGTATA:1 - chr4 353381 3' + BS3 1738 1 73.61 GCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATGAAATTGATTTTGCGTTCTTACCGGCTACCACTTTTTTTTCCAAATACCTGGAAAGTCTAAAGTAAT:1 + chr3L 22709435 3' + 412 7518 2 54.17 TCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTGAATCCTTGAATTCATTAAAGCAGGTCGAACGGTAACATGCCACTCTTGGGGATATAGGACGATCCCATAAGTTGGAATAACAGGTAGA:1 - chr2R 2095394 3' + Tabor 453 2 63.01 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGATTTAATATTAGATTAATATTATGTAGAGTCTTGATAGTAAAGTTAAATTGCTTAAATTGAGTA:1 - chr3R 5761934 3' - roo 58 2 60.27 CGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGATAGATGTAGCTAAGCAAAGTTTGCCGTGGAAGGATGAGTCCTGCGGACAGACAAAAGCTGAGAAATTTCGCTTTGATTTTCAAATATC:1 - chrX 12214430 3' - opus 1 2 77.05 CAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAAAACAATCCTTTAGCTTTCGAGTTCATTTAGATTAGGTTTATATAATAAGGAAT:1 - chr3R 19543376 3' + roo 377 1 63.70 AAGTTTTCATTTTGTGTTTTCGTCCACAGTGGTCTGGCTTAATATAGCCATTACATTATTGCACTTGACTGCAGCAGAGTCCATTTCGGCC:1 - chr2L 14075149 3' + Cr1a 386 1 63.74 AAGAAAGGAAGGAAAAACATATAAGGACATTCAAAAAACCATTGAATGTTCTGCGAAAACCGTGGTTCCATACGTAAATCCACACACACAGGCGCCAGGCAGCGTACGAATTACGCAAAGTGAAATATCTTTCTCAAAATGGAAAG:1 - chrX 22456188 3' + HB 404 1 56.16 GATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTGCTATTTATTTGTATTACTTTGCTGGTGAAACTCTTT:1 + chrX 10128310 3' + invader3 244 2 58.90 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTAACGTTTCGTGATTTTTGCCAGATTTTTAATGCCACACATCTGTTTTCC:1 + chr2L 19643658 3' - hobo 17 1 75.34 GCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTCATATGTGAAAACACATGGACAGTTGTTAAGTGCTTAAAATATGCATGCTTTAATTGCCAGCCATCTGCTGCATTGAACGTC:1 + chr3L 16875956 3' - Burdock 6165 2 65.75 GGATGGGCATGAGTTAAATATGAAGTTGTGAGGTTTAAGGTTATTTATTGTGTGTTCGTATAATTTTCTGTATTGATCTGGACCAAAATTGCAGGTGGAAAATGCAGGTGAGTGGGCTGAAGGCC:1 - chrX 17405731 3' - I-element 5045 1 47.20 AAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGA:1 - chr3R 9175198 3' - Juan 63 1 56.16 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATACATAGACTTCCTCACTCGTCTGCTTTGTGACATTGCAAATAAATATTTTTGTGTCTTGG:1 - chr3L 18034544 3' - Transpac 53 2 54.79 AAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTAT:1 + chr3L 18738135 3' + Bari1 1623 1 75.34 AGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCCGAGGCGTACATCACTCTGTCCCGGCTGAGGACTTC:1 - chr2R 5640731 3' + 1360 3302 1 75.34 ACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATCGTCAGCACATACAATCCGTTGAAGATGCGGTTGTCCAGCGTGTGCAGGC:1 - chr2R 20113059 3' + Ivk 6 1 65.03 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGGCGTCAATTTGATCTTGACACCATGAGCATGAACCGCTTTCAAGCATTTAGTTTATTCATTTAGCTAGCCTTTGGCGTTCGATTTCTTTATGCTC:1 + chr3L 20388258 3' - 1360 25 1 68.49 TATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCAAATTGATTTTAATAATAAACGGTGTGCATAATTTGGGATGATATTTTCGCCGT:1 - chr3R 17210011 3' + HMS-Beagle2 244 2 62.33 AAAAAAAAAAATTATCGAAAATTTCGAACCGCAAAATTACGATGTATAAAAAAAAACGCCACAGACTTTAAGAGCAGCAAACTG:1 - chrX 2477790 3' - Tc3 79 1 76.19 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACGTCATCTTCATCATTAAATTCGAATTTTGAATTACTTTTTAAAATATAATTTGTCCTCTCTAGTTAGTTTTAGCCGATGGAGTCGACATTTAAGCATA:1 + chr2R 9869028 3' - roo 8686 2 71.23 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAGCATGAGTCCGCGCAATAATCACAGCCAAGTGC:1 + chrX 850138 3' - jockey 75 1 60.96 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAATTAATCCAAGAGCTTTGTCAATTAACTAATTAATGTTAGTACTTTTTAAGTGTTCATTAGTACTTT:1 + chr3R 24976347 3' - roo 8683 2 71.23 AAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGTCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACGAATCGCCGTTATGAGCGGCAAAGGACACAAGGAT:1 + chr2R 15822140 3' - invader6 4497 2 64.38 TAAAAAAAAATATTTTTTAAATTTTATTCTAAATTAAGATGAAAAGCTGCGAGTTTTTAAATAGTTTAAACTGTTAAAAACTGTTTAAAATGCTACTATACATTTCATTATTTATATGTCGATATTATTTCTCTCTGTGCAGCCCT:1 + chr2R 18695101 3' - Transib5 2729 1 46.58 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCCCGTTCGTTGATATGCACAGAG:1 + chrY 311460 3' + 1360 3385 2 53.42 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGACAACTAAAGAATTACATTTTATACTATACTATATACACAGAGCTTAAGAGTTATTCTTATTGTCTAAGGTAATTGGTCACCATG:1 - chr3R 5453609 3' - I-element 38 1 59.31 CTTCCTTCTGCCTGTTGCATACTTTTCAACGAATAAAGTATACCCTTTTACTTTATGCTCTGCTCCTGGCGGAAATGACTATTTGCTTTCTACTATCGTGTGCAATTGCTTGGCGCTTTATTTTGAATATTGGCTT:1 - chr3L 23227876 3' - INE-1 28 1 58.82 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGGTGAAGTGGTACTGATTTGTGCGTATTTTATTTTCCACTTTGCTTGTATTTATTTAAATTTGAGCC:1 + chr2L 16385327 3' - I-element 44 1 58.97 TTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTTTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCAT:1 + chr2R 2875232 3' + TLD2_LTR 98 1 62.33 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAATTATAGCTGGGGCCAAATTAAACGCGCAAAATGGAGGCAAAAATTTGATTTGATGATGGCTAAGGTCGCCGGCAAAGACAGACACATAAAAAAACAA:1 + chr3R 23668570 3' - pogo 16 1 72.22 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGC:1 + chr2L 18178364 3' - Tirant 8153 2 56.80 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACAGAGGGAAACGCTATATTGCTCTTCTATGATA:1 + chr2R 6713950 3' - 297 61 2 64.38 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAATACTCAAATGTCATCTCCTTAGCTTCAACGTTGTT:1 - chr3L 24253590 3' - 297 63 2 66.44 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACGCACATTACACACACACACACGGACAAACAAACATATACGGGTAAAAACAATTGCAATTTCCTGGGCTCTATTTCTGT:1 - chrX 5145818 3' + hobo 2937 1 72.38 TAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGATTTAAATTGCAAGCATTTTTTGTTTTTATAAGATAAACTTTACTAGTCAAGTTCGTTTCGAATATGATTGATCACC:1 + chr3R 26979040 3' - accord2 7305 1 52.05 ATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCCCGCACGTTTCCGGCGAACAACTTACTGATCCACTGAATTTTTCTCCGAACGAAATTGAAAATGTTAT:1 + chr2R 1185133 3' + Doc 4609 1 53.42 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTATGAGTGTATTTATTACATAGTTAAGTGATTACTTTATATGTTTTATTACAAGTTTATTATAT:1 - chrX 11267650 3' - roo 14 2 73.29 AAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGATTCGGTAGCCGAGCTCC:1 + chrX 10806926 3' - P-element 98 1 13.99 GCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGCATCATAGATTTTGTTAAATATTTTTTTATGGTTTTAAATTCAATACAATAGTT:1 + chr3L 5186368 3' - Transpac 4983 2 63.01 GAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCCCTATTGAAACTCACATGCACAATGATTCATCAGAATTGTAGAAAGATGAAATATAGAGAAAACCCTA:1 - chr2L 5388070 3' - gypsy 6 2 44.93 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTTTACAGTGTACTGATACTATACTGATACATACTGATGCTTTTAACGTCATCATAAATTCTACA:1 - chr2R 15942265 3' + opus 443 2 59.59 CAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGCTGCGTATTTAGAAGCTGCCTTACAT:1 + chr2R 5321244 3' + INE-1 514 1 71.92 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATCTTGAGTCTTGAGTCTCTGCTCCCATTTCCCTTCATTTGAAAAATCTTTATAGTCCCAATACATTTCTAAATGTTTGCCATCATTTTATA:1 + chr3R 12835284 3' - FB 32 1 39.04 CACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTC:1 + chr2R 5173200 3' + Stalker 328 4 72.60 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGTATAGCTAAATTTTATTTTGAGGATTCATTAATTAAGCAGACGCAAATTAATTGAGAAAAGTGTGTCGACTAAAAGATACCCATTACCTGCAGCTAACCGAAACTA:1 - chrX 19959751 3' + roo 395 1 71.92 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGACATTTTCACAGCTTC:1 + chr2R 11595882 3' + P-element 2784 1 15.07 CATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCCGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTTTATTGGCTAATTTGTGGGCCACCGAAAATGATAGCAAATTT:1 - chr3L 12181173 3' - Bica 128 1 68.42 TAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATAATTACTATTGTTGATAGCTGGGGCTTATTTATACATATCATTTTTAACATAATATGCCCAAAGTTCGAAAACAAGGAATGCAAAAGA:1 + chrX 9959895 3' + I-element 5323 1 53.42 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGGTTTTCTCGGGATGGGTTCAGATCCAATGCGATCCGATGCGATGGGATGCCGATGGTGAAGCCGAAGCTGGATGATGTCTCCATCGGGCAATG:1 - 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chr3R 14563810 3' - jockey2 3391 1 51.37 CTTGGCATGGAGTCCACCAAGTCCTGGCACTGTTTTTGAGGAATTTTGCTTCCTGAATCCTTGACCACACCCCAAAATTCCTCGTTATTATTGGTGAACACAGCCCGTAAAAAGTGCGTATTGAATTTCCTTCGATGTG:1 - chr3L 18472796 3' - Tc1 1284 1 66.19 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGTTCTGGAAGTGAGTGCGGTTAAGCGGCGAGACGTTGCGCCATTAATG:1 + chr2R 7889483 3' - jockey 4716 1 71.23 CTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATGCTGAAACTGAATCAGAGTAAGAGTCCTGGAGCCGGGGCATCCTGGATTCCGTCGTGTTGTTTCAAACGTGGCCGCTTCGCTCGTTTTTGAT:1 + chr3R 5941541 3' - X-element 42 1 59.59 TTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCTCGAAGTCTCTCAAGAATTACGCAACATAGAGG:1 - chr3L 19546674 3' + 1360 3093 1 77.08 AGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGTCGGCA:1 + chr2R 11097405 3' - Juan 4028 1 72.57 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATACACTCAGCGGCTTTTCATAATCCTTCAGCCTGCGAC:1 - chr3L 18972848 3' + mdg1 338 2 75.34 GTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAAATGAAACGAAATCTTTAATTTGTGTTCGAGTGGTTAAGCCGAGCTTATCGATTTCTTAGGGTTTTATTTGGAATGCTTGCTTT:1 + chr3L 17207010 3' - I-element 4964 1 48.63 GTAGATATTAATAAAAAAAAAAACACAAAATTAATACAATACATTTGAATAAAACTAAACAGCATTTGGTTAATTCTGATACATGACTGCAGTTGCCCCGTTTAAACGGACACGGCTTTAATAATTATTTATCTAGGAATTCTGC:1 + chr3L 21473994 3' + Rt1a 5069 1 62.07 ATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGTAACATTTTCTAAGTTCTATTCAGTCATTAGCAGATTTTGAAGCCGTTAGCATCGTAAACTAAAATATTATGATGAAAAATTCTATT:1 + chr2L 7939869 3' + Burdock 224 2 61.64 CATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAGGAATTTAAATAAATTATATAACTATAGTTATGTTTATTTAATACTTAGCACACTTTTGGGGGACCTATACAAGTTGA:1 + chr2R 19289883 3' - BS 5037 1 54.11 CATCCTACCGGCTGCGCCAGTTACCATTCGGGCCGAATGATGGGAGGTGAATATAACAGCAGTAAAGATGTTGGGTGTTGCATATATAGCTGCGGTATTTACAATC:1 + chrX 15351416 3' - Tirant 416 1 72.64 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTTGCGTACAAAATTCAACATTATTTGAAGGTCGTCCTTTGCTTATTCTGCGCGTCGCTTTTTACTCGTTCGCTCTCTCTTCC:1 + chr2L 21251056 3' + P-element 2849 1 60.27 GTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCCATAAATATGATGATAATTAAGTGTGTGTCTGGCTCATA:1 + chrX 20874364 3' - F-element 409 1 72.60 CAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAATAGAGTAATGTGGGTGAGGTCAATACAAACCTA:1 + chr3L 18034631 3' + Transpac 228 2 77.78 TGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAATAATACGAGGCTCAACAAATCCTTCATCTCAATCCCAGTGTTGCGCTAAAAAGTAGGCAATGATTTTAGTGCTCTAGGTTTGC:1 + chr3R 30622101 3' + BS 5052 1 56.16 TAATAAAAATAATTATAATATACATAGTGTTAGGTTTTGACATAAGTAAAGCTCCCATTTTACTTAAAGAAAACCTTTTAAACAAAAAAATAAAGCGAAGACAGATCAAATTAGGAAGGCGGAAAACTTTTCAATTACCATCGGAT:1 - chr2L 2393078 3' - Gypsy12A_LTR 1808 1 45.89 ATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACGACTTGCCGTTATGAGCGGCAAAGGACACATG:1 + chr2R 15822137 3' - invader6 4500 2 62.33 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATCTTTATGCTTACAAGAACATTTTGCCAATCGATACTATATTCCTTGGTCTCAAATGAAGAATGCAATTCGATATGGAAAAATTAAACTAA:1 - chr3R 29622622 3' + pogo 2074 1 59.59 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACATGCCAAATGCCCCATAGTGGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCA:1 - chr3L 23146526 3' - hopper 27 1 74.48 GTGGAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAACATCGAAGTGATGTGCCTG:1 - chr3L 20176750 3' - gypsy 69 2 65.07 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTTATCTAAATATAAGTGAGCACAGCAGTAGGCCCGTACGGAATTAAACAAATATTGTATTTAAACTTAAGATATTTATTCAACAATTTTTCGCAA:1 + chr3R 21706374 3' - I-element 26 1 63.70 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCG:1 + chrX 16217501 3' + P-element 2804 1 25.71 TTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTTTACTGTGAGCTTATGTTACGTATGTACGTTTGTGTGGTTCCGTCGCGTATCAGTGACCTGTTCGAACATAATTGTTCGCGTGCAACTTGACGGAACCTCCCTCCAC:1 + chr3L 27390675 3' + 1360 210 1 75.54 CGTTTAATTGAATTAATTTAAAGCTATAATACCTTGAAAAAATTGCGACTAATAGAAAAACTATGCCACCGATTGCTAGTTGAAATGCTGAGATACAGTTAGAGATACAGATACATCTATAGATATATG:1 - chr2R 16944394 3' - HeT-A 384 1 75.19 GAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTGCTATTTATTTGTAT:1 + chrX 10128288 3' + invader3 5408 2 54.79 AAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCTTTCGTTGTTGTTTATATTTTATTATTACTTATTATTGTTATTTTGTCCCTAACTGTTACAGTGAATT:1 - chr2R 1345436 3' - I-element 4874 1 54.29 AAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAAAAAGCACATGCCGATGGCACCACTTTGGATGCTTTAAAAATCGATCATGTCTGAGA:1 - chr3L 6179055 3' + roo 8730 2 59.57 GCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCCGGGGTAATCGACTATAGCATTCCCTCTTGTTAGTTTTCGACTTGTTCCTTTTAATTATTGAATCTTAAGAATTCTTCGCCCTATTTGGAACTCTCTTTTTATGTTCCTCCTGATAGTGAT:1 + chr3L 19425253 3' + INE-1 546 1 83.45 GCATAGTGCAAAACCAATGTACGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGGAACATGTCGACACTGTGGGACTAACTTCGTGAAATGTGCATCCAGCTGATATTATGTATTTAATATGTGCAAT:1 - chr2R 8807981 3' + 1360 3354 1 76.87 GTGTTTTGCAATTACAAATTTGCATAAATACAATACGGTGATTTATCTGCGCATTTGCTTGAAACGTAATTAATATTTCTGCAATGCGATTTGTGAAATTCGATTGGAGGTGGATGGTGTCAAAACGGAGGAGAATGCAGCCGTCA:1 + chr3L 8099510 3' + frogger 229 1 69.18 AGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACATGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGAAAGCTATTGCGCGCT:1 + chr2R 16073019 3' - Burdock 6194 2 62.24 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAACAAATTGCGCGCCTGCGGATATGCAACACAGAAACTCAATAGGGAAACATCAAAACAAACAGCAGGAATCAGGA:1 + chr3R 5868282 3' + jockey 4983 1 63.87 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGTGAAAAGAAAAACGTTTTATGAGCTCATTCACAAAAAGGGCCA:1 + chr2R 8335004 3' + transib2 2747 1 70.55 TTGAAAAAGTAACTTTTCAAGCAGAAAATAGTTAACATGATTGCTGGATGTAGTGGATATTAGGAAGTAAAGAGTTACAAAGTGGAATTCGTAACATTTTACCCAGGGAATAATAACATGATTGATACTTAAAGGAATATGTTAGG:1 + chr3R 17803794 3' - S2 1362 1 80.14 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATCTGCCTACTTCTAGACTCCGAAATTCAAAATTTTGTAGTGCA:1 + chr2R 1375154 3' + 297 321 2 70.55 TTTTTGTTTTTTTCTTTATCTTCTTTGGCCTAACATGGGTTAACTAACAGAGCTACT:1 + chr2R 18609716 3' - Doc2-element 220 2 66.67 AAAACACAAAGACGAAAAACGCAAAATACTTTGTATTTTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAATCATACGAAAGTTTGACTGTACACGCTTTTCGTGGCTCACAAAG:1 - chr3L 22834812 3' - Cr1a 193 1 64.04 AGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGTCGGCAATACAAAATACGAAAAGATATGCA:1 + chr2R 11097429 3' - Juan 4037 1 71.23 CTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACCTCGAATTGGGAATGCCTCAACCTTTCCCAACACCACCTAACCCCCTTGCCATGCACTTAAATACCCTTAGTTGGATTGGTAAGGATCGCATCGCACCACCCACCGG:1 + chr2R 13193917 3' + Tc1-2 478 1 74.63 CCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGTAGTCCAGTTTGTGTTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGGGTGCAAGGCAAATATTTACACTCAATGGAACATAATAAAGACATTAGGGAAATATTGTGTTATGTGGGGGCATAACTCAGGTTCTGT:1 - chr2R 9934095 3' - Rt1b 4925 1 79.45 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGAGTGAATCCCAATCGAATAGTACCCTCCCCTCTGAGCCAATCCTCCCTGCCCAGCTTACATTCCAAATCGAATAATATGCTCAACACTT:1 + chr3R 27188659 3' + roo 9039 1 63.70 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGATATATTTCTCTTTAAACTCAAATTATAAGTTTTCAACCTCCTTC:1 - chr3L 15371491 3' - roo 8748 2 74.66 TTGGTCATTTATATCCGGAGGAAACGCATAAATGAGAGAAGACTACTGAACGTACATATAATAATCTTGTTGTCTTATTATGAATATAAAAAAACATTATTTTGTTATTAGTAAAAATTTTGAATACTGCGTTAATTTAAATAATA:1 + chr3L 24535868 3' + rooA 7171 1 46.58 ATATATATATGTATATACTATATGATATATGACGAGCATGCCGATTACAGCCCGGTTATACCAATATAATATTTTATGGCCAGACAAATCACGCAAACTCACATCACCGAGTGATATGATAGTGCTAGAAGCGTCTCAATGGCAAA:1 + chrX 16919122 3' - INE-1 64 1 69.86 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAACTATTCAAAGCTTCTGCGGCATAATACTAAGAGATGGGG:1 - chr3L 5274935 3' + I-element 5275 1 73.29 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGA:1 - chr3R 11773904 3' + P-element 2833 1 40.80 CTTAGTCGGAGTTGACAAGCTGCCGCTTCTTAATATGGTTAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAAATGATTCTTATATTCAATAAAGTTACATATGCAAACGAGAAGCATGGCAGCATTTTACGAAATATTAAAAAACAAACAA:1 + chr3R 21585838 3' - Gypsy6A_LTR 200 1 54.11 TGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGTCATCGAATGCTGCTCTAATTTGCCATTGTAT:1 + chr3R 8921971 3' - FB 66 1 73.98 ATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCTTCGGACCATTTACTTTTTATTTCCAGATGTGTCGCAAGATTTGCTTCCGCATTTTAC:1 + chr3R 26244767 3' + copia 238 1 70.55 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATGTATCCTATTCATTCACAATTCAATAACTAACTATAGTGGCAAATACGTCAGATATTAGCCAGATGGGTGCCTAGGTAAGTCATCTGCTTGCTAC:1 + chr2L 5711050 3' - HMS-Beagle 19 2 67.81 GAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAGATTAATTAATTAATTTAGATTTTATAATAGACCATAACGGGCAGCAAGATG:1 + chr2R 5357244 3' + Juan 4133 1 76.71 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATGAAATTGATTTTGCGTTCTTACCGGCTACCACTTTATTATCCAAATACCTGGAAAGTC:1 + chr3L 22709426 3' + 412 7483 2 58.90 GTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTGCTGTATCAATCTAATATCTCGCGATCATATGTATATCATTCGTAGACCTCAAACTTGGAGTG:1 + chr3L 20224282 3' - Chimpo 14 1 76.55 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCTTTTCCTTTTTTCCTTCCTACGGCTACATCGGC:1 + chr3R 6412108 3' - Tirant 8123 2 74.66 AGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCACGTGAAAACGTGTCTCTGTCTCC:1 + chr3L 18767871 3' - roo 8618 1 54.79 TGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGGTTAATGAGATAAGTTTATATTTTGTACACATATTAATAATGTGATCCATTACCAGATTT:1 - chr4 806642 3' - BS 5069 1 58.22 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTCGGGCTGCCATTGTCCGTGTTT:1 - chr3L 5179132 3' + P-element 2833 1 47.26 CGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAGATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCT:1 - chr2R 9504199 3' + roo 355 2 52.74 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCCTCTCACCC:1 - chr3R 11773888 3' + P-element 2841 1 50.38 TATTAATTAATTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTTGCAGATCAAAAATGTGACTAACTTAAGCTTTGGCTGTACTCACGCCATACGATTAATGTTTTCTCAAACAGATATTATATTTTAGTTTGATTTGATTAAAGTCTTACATG:1 - chrX 15092991 3' - 3S18 6039 2 63.01 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATCATTTTTACAGTTGCATTCCCAGCTCGATTCT:1 + chr3R 21587644 3' + roo 9045 1 65.07 AGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGAATAATGAAATGAGACCTATTTAATAAAACATTTTGCACTGAACAGATTGTTTAATT:1 - chr2L 8449675 3' - I-element 5047 1 60.96 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCCCCGTCTTGGAACTGGACCCCAT:1 - chr3R 10461633 3' + roo 398 1 67.83 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTTTTTAATTTTGCGGCGAGAGTGAGAAATAAAAATTTGCACATAATCGTT:1 + chr2L 7271925 3' - 297 6607 2 56.76 GCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATCTATTATTTACATAAATCTTTACTCAAGGGCATTACCCAATTCACCTGGACTCGCTTTAGGATGTTAGCAGAGAAGTTGCTAAGC:1 - 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chr2R 8452711 3' - blood 27 2 65.22 TACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTGGCTAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAGTCAGACTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACA:1 - chr3R 4571527 3' - 1360 399 1 36.30 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTTCCATCAACATTTAAGGCCGCAGCAATGTTGCCATTAGAGCATATT:1 - chrX 2517987 3' + P-element 2870 1 70.59 GACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGCTGCTCATCCATATGAATCTCATGAACCAACTGTCCTGGTTCCAATCCCACTCCCATTCCCACCTCCGATGGCATCCCATCCGATCCGATG:1 + chr3R 22840540 3' + Transpac 283 2 40.69 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGGTTTATATGCTGAACAGGCACAGGCGGATGGCCAACGCCGGTGGCGAAAACTCAGCACTCGACTGGTCTTATCACTCGACAGGCGACGCTGACA:1 + chr3L 20977935 3' + mdg1 408 2 71.97 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCTAGAATGCTAACCATGCACAAGGCATCTCAAATTCCAGGTGTTAAAAA:1 + chr3L 3757227 3' + copia 217 2 65.07 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTCGGGCTGCCATTGTCCGTGTTTCTATGTCCGTGTGTG:1 - 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hobo 26 1 55.00 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATCTACATATATAGTATTATATGTATAAATAAAACCAAGCA:1 - chr3L 15859636 3' - I-element 82 1 76.03 GTATCTTTCGAAGATTTCCATACCATAAACATTAATGTTTAGCTTCATCCAAGCGAACTGTGGCCGAGGCAGAGCTGCGACCATCGAGCTCGGAGTACAAACGCCAGGTACGTGTCCAAAATCATGAATCGAAATTAAATGAACAA:1 + chr3L 4170436 3' + R2-element 3553 1 65.75 ACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTG:1 - chr3L 20209560 3' - Burdock 6213 2 74.66 TAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATTATGTGTGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCTTTCTGTCTTTGGTTCGATACTAATCAGTAATTCGGTTGCAGGACGAGACAGGAGCCTACCTGATCGACAGA:1 + chrX 1514491 3' + 1360 156 1 48.92 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAGGG:1 + chr3R 22522715 3' + roo 332 2 67.81 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGTTTGAGGACCC:1 + chr3L 13362722 3' - 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chr2R 11339021 3' - jockey 17 1 59.26 AAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAAAACAATCCTTTAGCTTTCGAGTTCATTTAGATTAGGTTTATATAATAA:2 - chr3R 19543381 3' + roo 372 1 60.27 AGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACGAATTGCCGTTAT:1 + chr2R 15822118 3' - invader6 24 2 53.15 GCAGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTATGAAGTTAGGACACTATAGACTACCTTAAGAACGGGGCAA:1 - chr3L 2925491 3' + flea 120 1 72.60 ATCCTATGATTTACAGTTTTAGTGGGCAATTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATGCCAAACAATGACGAAACAATGATGAAGACGTAAGGTACGATGCAAACTAGTGTTGACCGGGACGAGATACGCTAAAACGGAAATTCC:1 - chr3R 7640099 3' - HB 1572 1 47.26 AAACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCTGTTGCTCACATACCAGGGTAGCCCAGATGCATGTCGTGCCGCTCGCGATTGTATTACTCTAAGCCTATTGAGCTTCTTTCTTTGCACTGAAAAAGCAGATATATCTTGTTTAGAAAAA:1 + chr3R 6054166 3' - G5A 2551 1 69.86 ATGATTTTAATGTTGGTTATTGAGAACTTTATAGAACTTTATAGAAACAGAATGAGTATATTGAGTATATAGATGAAATATCTCTTTTCATTTATACTGCAATATGATCCCACTGTGCGATAGTAGTTAATCATGACTTTATTGC:1 + chr2L 5567386 3' - Doc2-element 4397 1 55.17 TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGGTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTATGTTGCAAATGCATACTATAACAAATTGTTAAGCGTTAGACAAGGCG:1 - chr3R 10137006 3' + I-element 5287 1 63.38 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGACTTATTATTCTTTAGGTTTAGAATAGAGGAAAACAAGGTCACAGTGATTCGGACCGGTA:1 + chr2R 4803034 3' + roo 9012 2 58.90 AAACGCTTCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAATAGGAAAAAAAAACCCAAATAAACAAGAATGTCAACAAATGAGCATAAATAAAAGGTTTTCCCATAA:1 + chrX 11906378 3' - INE-1 33 1 55.48 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCGGACTTTACATATTAGAAAATATGTCTTTTCCCATCTATTCAAATGGTATTTATAT:1 + chr3L 4933815 3' - blood 61 2 62.41 CAACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTATTCTCATTT:1 + chr2L 3959978 3' + gypsy 7361 2 73.29 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTATATAAACTTATTCTTTTTACCTTTCTTTACTTTCAGGTAAGGATATAAAGAGTTTTCTTATTACTTGTGTCTTAATACTTTTTATGTAGAG:1 + chrX 3767708 3' - I-element 24 1 69.06 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCCACTGGGCTTAAATATTTAGCAACAGTTTGCAGTGGGGAAGTT:1 - chr2R 9623349 3' - I-element 38 1 56.44 CTATGTTATCAAGGATTTGCGTTGTCGACATCGAGGCTCCACTTTGCCGCTTGATAAATCATGATATTTAACATTACGTAGAATGCATCGATTGTCTTTCCAAATTTCCATGTCCGTGTGGGGCAGAGCCACAGAGGGAGAGAGAG:1 - chr3R 11377892 3' - Chouto 6273 1 58.22 AGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTTTAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCATGCAAGCTGTTACTTTTCAC:1 - chr3L 20224103 3' + Chimpo 157 1 64.38 GGAGCAGTGCTGTCCTCTACCCACTAAAATAGATTTTTTTATTTTTGCTCTTCTAAATGCTTTATACATATTTTCATTGCGGTTTATATGACTTAAATTTGACTTCGGTGCCAGGTCTTTAGCCTTTGCGTGTGCCGTTAGTCCGT:1 + chr2L 21691332 3' - HB 353 1 77.40 ACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATC:1 + chrX 21667934 3' - gypsy2 6560 2 69.86 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATTGGATGTTGCG:1 - chrX 19585158 3' - Transpac 55 2 61.27 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGTGTAAGGGACGGATTT:1 - chr3L 10563867 3' - hopper 36 1 60.96 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAATCAAAAAGTGAAAATGTGTCCGAAAACGTCG:1 - chrX 10286977 3' + roo 352 2 58.22 GCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATCTGCATTTTTATTTGTGTAAAATAGCGGGGAAAATGACAGCTATGTGGGTGGCATGACAT:1 - chr2L 18300749 3' + Ivk 5321 1 58.22 TCTGATGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGGTACCAAAGGTATCAGCCTAAAGTGGAATGGTTTGGAATTTATAAATCAAAATGTCAGAAATTGTTAACGATTCGAGCAGCGATGGGTTGTGTGTCAGTCGTCGTCCTCACATGAC:1 - chrX 15567088 3' - Transib-N1_DM 29 1 60.27 ATCATTTTATGAAATGATTCGTGATGAGTGGCGGAATGCAGATCCCGGAACATCGGGCACAGCAAGACGACAGGCGGCGCCACTTGCC:1 + chr3R 819390 3' - Doc3-element 4628 1 67.05 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACAAAATGGGGTAGGAGAAATCTGAGGCAAC:1 - chr3R 20939168 3' - jockey 4766 1 81.51 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGAAAACAGTAAATTGCATTTTTATACAATTTTCCATCATTTGACTTGGCAGTTGTTCGTCTGGGCTTTGTAATTTTCAAATGAAATACTTTCCGA:1 + chr2R 20700758 3' - mdg1 7053 2 72.93 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCTGACTCTGATCTTCTGTATTTGAACGCATTTATGTACATGCATATATGCCAGTGCCTCCCATATACAAATGCATATGCTTATGCATGT:1 - chr3L 20398952 3' - roo 32 2 64.38 GGAATATATTGTTTGCCGAAAAAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTAACGGT:1 - chr3L 23773893 3' + Transib5 2838 1 63.70 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACCATCTACGTCTCGTTTCGCTTCATT:1 + chr3L 9519660 3' + roo 9023 2 49.32 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCACGCTTGCACTTTTTGTCGCAATTGCAGTTGGCCTCATTATGCAATTACGGCAGCAAGAAACAAACGAACGA:1 + chr3L 7790780 3' - copia 41 2 54.01 ACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGC:1 + chr3R 21276652 3' + BS 5061 1 53.42 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAAGAGTTTAATATCAAATATCGTTTATTATCTTAACGTCCATTCGTTTAACAATAAAAATGGCTACCATTTTTTCACTGCCTACCCACTTTCC:1 + chr2R 22012272 3' + opus 472 2 66.21 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCG:1 - chr3L 18199954 3' - Doc 62 1 63.70 ACAAACGTTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTAAACTGCTTTGGTAACAGGAATTTTTCATTGGGGGTTTTTTTTCGG:1 - chr2R 9532567 3' - HMS-Beagle2 494 1 68.00 ATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAACAAATTGCGCGCCTGCGGATATGCAACACAGAAACTCA:1 + chr3R 5868246 3' + jockey 4925 1 73.05 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAA:1 + chr2R 22464482 3' - pogo 38 1 56.43 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCAGTCGCAGCAACCCTAACAGCTTTAACCACGCCCACACCTATACACACACACACACACATCGCCCACGTTTTGCGTTGCTAATATCTGTGGCATACTTTTGTGGGCTCC:1 + chrX 19982499 3' + hopper 1407 2 77.46 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATG:1 + chr2L 18213233 3' - roo 44 2 55.48 AAAAAAAACAGGTGATAACAATACGGTAAGTATGATATTACGCTATATAATATAAACTTGTACTATAATAAAACGTTTTTATATTAGACATTATCGATATAAGAATGTAGTATGTAATTACATATTGATAGTATCAATATAATA:1 + chr2L 1214684 3' + Porto1 174 1 80.56 ACGAGAGCCGAGCCCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAATCTCATTTCAAATCACATGTTCTACATGCAAGTGCACACCTGCCCTTGAGTGACCGGTAAAATCTCCGCAAATATCGAT:1 - chr2L 9347446 3' - opus 7152 4 56.85 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTAATAAAATCCATAAGCATTTCGAAAAGTTTGTAGCATACTTTTTG:1 - chrX 9508111 3' - jockey 4750 1 70.83 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCGTCGGCACAGGTATTCCACAAGATTCTGTTATTCGCTTGTGTAATTAACGGATGCGGTGTCAACTAGTAAA:1 - chr2R 18440390 3' - P-element 49 1 52.74 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTGTTTTCCGAATTGGTAAAAAATGCTCACTCTTAAATTATTACGTGTTAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCAT:1 - chr3L 13827361 3' - roo 32 2 61.76 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTCCTTTGAATATATTTGTTCCAGGGTATACGAAGAATGATTCCATTATGCACGTCCATTATTCGGTATTCA:1 + chr2R 12813790 3' - roo 47 2 54.11 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACAGAGGAAAACGCTATATTACTCTTCTATGATAAATA:1 + chr2R 6713954 3' - 297 22 2 60.36 ATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGCGACAAATTTTAATGCGTTGTATATTTTAGCTCGTTTTCAATTTTAATACCTTGTAAGCGAAATACATTGAAAA:1 - chrX 20635500 3' + Quasimodo 77 2 52.05 CGGGGGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGGATGTTCATATGTGAAAACACATGGACAGTTGTTAAGTGCTTAAAATATGCATGCTTTATTTGCCA:1 + chr3L 16875934 3' - Burdock 4 2 70.71 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGACAACTAAAGAATTACATTTTATACTATACTATATACACAGAGCTTAAGAGTTATTCTTATTGTCTAAGGTAATTGGTCACCAT:1 - chr3R 5453610 3' - I-element 40 1 58.22 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGATATCAATTTCAAAATTTAATAACGATTTTGAAAATATTTTTTGCAGAACTAGTATGTATATACTATACATTCAGTTTATCGTACA:1 + chr2R 8687935 3' + roo 9036 1 60.96 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTGCAGTTACAGTTACAGGGAAGTTGCGTTGGCACTGACAGTCGCAGACAACACTCACACACAT:1 + chr3R 27859594 3' + hopper 1397 1 64.22 GATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTTGAAATTTTCCACTCCGGACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTGAAAACCAAGACAATGTCCAATTTGTTGGCAGCCGGTAATATTTATTCAT:1 + chr3L 19003398 3' + R1A1-element 116 1 63.01 CCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGAAGTACCTTAAGAAAAGTAGGCACAAGTAAATATCACTTTCAATAAA:1 - chr3L 20083780 3' + opus 434 2 67.12 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCCTTGAAAATTGCATTACCAGTTATGAGGGTGTTGGAAAGCAAAAAGTAAAAA:1 - chr2L 12832853 3' - I-element 70 1 63.01 ATATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGA:1 + chr2R 5321215 3' + INE-1 502 1 58.91 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATACTTAAAATTTAATTTGAGAACATTACCTCGCTCACTATCCATCCATATATGATTGATAATGTGTATTCAATTAATTAAAAATCACAGAAATCACTTAAGTATGCA:1 + chr3R 20090088 3' - mdg1 7053 2 75.34 ACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGT:1 - chr3R 19450185 3' - roo 121 2 58.62 AACGTCGAGTGCTCAGGAACTATAAAAGCTAGATGGTTGAGATTCAGAATACAAATTCATTAAGACACAAAACCTAATCCTAACCTAGCTAAGAACCTAAAAAGAAAAAATGTACCCTTATTTACCTGAATAATGGACATGTTTTT:1 - chr4 993806 3' + INE-1 142 1 58.90 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATGAAATTGATTTTGCGTTCTTACCGGCTACCACTTTATTATCCAAATACCTGGAAAGTCTAAAGTAATGTGATTTAC:1 + chr3L 22709444 3' + 412 448 2 53.42 GCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTGTGCACTTGATTATAAAA:1 + chr2R 21425163 3' - HMS-Beagle2 6940 2 58.22 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGAGACACCTTAAACATGATGTATAAGAAGCATGATGTATAGTTGTTTAGCAACACAATAAAAAGTTAATTGACTATTTTAAAA:1 + chr2L 14480555 3' + Transpac 5193 2 60.96 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATTCCCAGTGCAGAACTCCAAGGCGGCTCACCAAAGAGGTTCTCCGAAGATGAATCGGTGCTCGTTTGTTTGGA:1 - chr3R 10636084 3' + blood 7340 1 50.68 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAA:1 - chr3R 19589933 3' - BS 5076 1 71.23 CAGCGACGCTATTGTAACGTGATGTCAAGCGACCATATGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATTACGCCTCGTGATGCCGCGCATCTTGTCTTGCCTCCACGTATTCTGTGAGGACTGC:1 + chrX 9167194 3' + Bica 4813 1 61.64 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGC:1 - chr3R 18517961 3' - roo 8745 2 77.14 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGAAGTACCTTAAGAAAAGTAGGCACAAGTAAATATCACTTTCAATAAAAACCAATTTGTACCATGTTCCATTGACCC:1 - chr3L 20083751 3' + opus 7466 2 58.90 CTCGCTTAATAAAAACAAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGTATACCTGTATTGGTTGAATAATCGTGAAAAGGTGTAAAAATTATAT:1 - chr2R 9390924 3' + mdg1 348 2 68.49 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGGTGGAATTACAATTTTATTCGTATGTACAATTCGATTGAAATTAAAGTGAAAAGCTTAACTTTTATTTAACAAAGGGATATAGTGTGTAGTTTTAGCAGCACTTAGTAATA:1 + chrX 6423321 3' - roo 8672 2 79.45 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATACATTTCAAATATATCAGATATATAAGAAAATCACTGTTTAAACAGTTTCATATTTATAGATAACATTTC:1 - chrX 20632553 3' + pogo 2052 1 53.79 TAGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTCAAAGATCTCCCTGAAGTCCACTGCACTGTATAAATCCCATTGTGTTTTTTGTTTTTTGATTTAATTTTTTATACGACTCCAAAAACGTGTCTTCTTTCAGTTACATTTTTCGAAA:1 + chr3R 16934013 3' - baggins 5393 1 50.00 AAAATACCTTTGTATTACTTAGCTTCCCTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACATAGCTGTATGTATGCCTCAGTGCCCTCTCTTAGTGGCCGCGGCCCGAAAGTC:1 - chr3R 4515189 3' - HB 41 1 64.76 CTTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGGAGAGCGCAAGAAGAGGGCTCTTAACTTATATGAAGGTAGTTATTACCTATT:1 - chr3L 14084902 3' - opus 58 4 75.96 GGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAATATGAAAAGCAAAGAGGTAAAGCAGTTAGGACAGTTAGTTATGCGGCAGTGGTG:1 - chr3L 16902269 3' + jockey 347 1 56.00 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGCGAATGTCTTTGGGCACTTTGCAGTCTCCTTTGGCTCCTAGTGCCCCCTTTTA:1 - chr3L 3757105 3' - copia 27 2 65.52 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCACCCGATATTTATTTGTCT:1 - chr2L 7271815 3' + 297 354 2 53.38 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGTAGAGCGCAAGATGAGGGTTCTTAACTTATATATAAATTGTGAGAGTATCTGGCCATTGAAATTTATG:1 - chr3R 9193168 3' - opus 7065 4 71.77 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGGAGGCCATGCCCTTTTTTGGGGCGGGCTGTAACCGTTAGT:1 - chr2L 18627701 3' + 1360 3368 1 57.65 CACTCAACAAGCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGTCGCACGCTAAATACTCTAATGACAAATATTTTAATATAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATTATACCAAGTTAGATTTATATAAATTTATTTTTTAATTGT:1 - 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chr2R 16510261 3' - roo 90 2 80.14 CCAACAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAACCTACGCAAACTTGGATTCAGTTGTTTTTATCGTCCATTATTATTATTATTTTTTTTACATATGGCCTTCACCATCATTCTGCCGCTGC:1 + chr3R 21108796 3' - 1360 26 1 81.69 CTGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGAAAGCCGAGTAGAGAAAACTTGTAACCTCCTGCTAATATGCAAAATCAATAGCTCCCCGGGGCGTATGTGGAATGGGAATTTTCCCA:1 - chr2R 20126017 3' - jockey 4765 1 66.44 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACTTTTATACATTGCTCTGTGCACCAACACATTTTGCATTCCCCTTTGTGCTATGTTCCTCTCTCTTAATAGTGAGCGAGCAC:1 + chr3R 3590784 3' - pogo 36 1 59.59 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATAAACGGAGTGCTACTGAAT:1 + chr2L 8707525 3' + 412 7481 2 62.33 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGTGCGATAAGGGCAAATTTTGAGCGTTGAAAATTGAAAAATACTCCCAAAAGTTACTCATAAAATATTATGACTAAATTTTTAGAACGAACTAA:1 + chr3L 21170995 3' + roo 9041 1 64.38 TCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAACACGACTCTTATCGTGATTATTATTGATTCATTACAAATTACAAAC:1 - chr2L 22759725 3' - Doc 117 1 71.23 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAAATTAAAGATCAGAGACACGTTGAAAAGGGTTTAATTTTGGCTAAAAAGATTGCAGATGGCTGGCGATTACATTTAAGCAGCACTTATTC:1 - chr3L 17206879 3' + I-element 5324 1 62.33 TTTAAATATTAAAATCTTTTAATGTCAAAGTAATTTTGAGAGTATAATTTACTTTAAATTGTAGTTCTTAGTTTTATTCGGTACATACACAAGGATAACCATTATACTATATTTTGCTATATATTTAGGAATTTCTACATATAAAT:1 - chrX 15182577 3' - 1360 3035 1 53.42 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTGTATTTTAATATTTTGTTG:1 - chrX 9437165 3' - roo 8751 2 54.11 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTAAAAAACCCGATCGCGTCTATTTCTGCAATTTCTAGCTATTAGAATTACATTTGACACAGCAA:1 + chr3L 24253701 3' + 297 6925 2 56.16 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTGACTGTATGTATGCCTGTGTGAGTGAGTG:1 + chr2L 19158922 3' - P-element 48 1 51.11 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGTCGGTAGCCGAGCTCCAACTTCGGGTTCGGGTTTGTTGTTGTTCGCGAAAAGAAGACGGCAGCAGTAGG:1 + chrX 10806979 3' - P-element 37 1 57.04 TTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTTAACAAATTTGAATAATCTTGAATAACTTCAAAAATGTTGTATCTCTCAATTAATATTTCTAATAATCGAGAAATATATAGAGCTCAATTTATTCAGACAGTCAGTCTGGTCTAGCTTGTCTAC:2 - chr3L 12059437 3' - Doc 4692 109 75.34 TTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATACTTCCTCCAGGAAAAGTAATTAAAACAATTTATGCAAAAGCTTCTAGCAAACGAAT:1 + chr2R 8966232 3' + BS 5026 1 59.31 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACATATGGCAGTATATGGAGCTCCTCCCGACTGCCA:1 - chr3R 18517924 3' - roo 8695 2 59.84 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATAAAAATTTTGACAGTACAGGCATCGTTCATTTATCT:1 + chr3L 13166297 3' + I-element 5272 1 77.78 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACT:1 + chr3L 10563967 3' + hopper2 1522 2 73.79 CTCGGTTATTGATCCTGATCAAGAATATATATATATACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTCCTACTGCCTTTTGTATACTTTTCAGCGAATCTAGTACTCCCTCTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAATATATTTCATAAAAA:1 - chr2R 10578246 3' - INE-1 90 1 71.03 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTAACGAGCTAATAAACCGCTCATGTTACAGATATGTTTGGCGT:1 + chr3L 13827465 3' + roo 331 2 71.23 TATTAAAATATTTATTATTTATTAGGTAATTTTGTTGTTTTATAATATATTAAGATATCATGTTGTATGTTATTTTTGGATAAGATGAGGTACTGTGACATTCTCAAAGTGGACAAGAACAGAGATATACTTATAAATAGTCTTGA:1 - chr3L 14394196 3' - Juan 4061 1 45.21 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAAATGTCGTTGGGCAAATATTTGGCCGAAGGACCTGGC:1 + chr2L 11079476 3' - 1360 79 1 71.23 ATGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGCGTC:1 + chr2R 11097401 3' - Juan 4029 1 69.09 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTTTTGGCCTGCTCGATTTGCTTTTAACTCGCTTTTTT:1 - chr2R 9504162 3' + roo 400 1 75.54 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAGTATGGTATGTTTGTTTTACTTTTTATTTGATTCTAGTCAGGAGAAAAACAAAAAAAAATATATAAATAATTGGTAAATAATACCTCAGCAAAATATAAACATT:1 + chr3L 12468906 3' + roo 392 2 69.86 AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCAAG:1 + chrX 20465871 3' - jockey 4825 1 62.33 GTCGAGTTGTCCGACTATCAGACACCATTCTTGCTTTTCCTGAGAACTCGACGGTCATGAGGATGGATCCTGATTAAGAAGATATATATTTTATATAGTCGGAA:1 - chr4 1132900 3' - INE-1 561 1 34.62 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGTTTGAGGACCCATAAAGAAGAA:1 + chr3L 13362733 3' - jockey 75 1 64.29 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTAACTGTGATGGAATGCACCAAGAGTTTTTCATATCGGTACGCACATAAATAAAGTAATGTATTAGTTACGAAATCCATTACTTTAACCGAAACATTTCGCGGCATT:1 + chrX 4540753 3' - 1360 11 1 73.97 TATCGCTGTCTCATTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGGTTTTCCCAACCA:1 - chr3R 11773933 3' + P-element 2783 1 11.64 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTCATATGTGAAAACACATGGACAGTTGTTAAGTGCTTAAAATATGCATGCTTTAATTGCCAGCCATCTGCTGCATTGAACGTCAT:1 + chr3L 16875958 3' - Burdock 27 2 67.12 TACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACGTTACGAAACAAGA:1 + chr2R 20447897 3' + hopper2 1547 1 57.53 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTGAGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGCCTTTATAATCATAAGTT:1 + chrX 10824065 3' - pogo 27 1 63.01 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTTAAACGCTTGTTATCGTTCAATGT:1 + chr3L 9762244 3' - jockey 4779 1 51.14 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAATTATAGCTGGGGCCAAATTAAACGCGCAAAATGGAGGCAAAAATTTGATTTGATGATGTCTAAGGTCGCCGGCAAAGACAGACACAT:1 + chr3R 23668560 3' - pogo 21 1 69.06 ACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTAAAAGGCTGAACATAATAAAGTATCTTGGAAATATTCCCGCTCTATATTAGACAC:1 + chrX 7389402 3' - jockey 4908 1 63.01 AGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCA:1 + chr3R 29091406 3' - rover 40 2 58.04 AGCTTTAGGACGCTTACAAAATACACTACAAAAATCTACTACACCTATCAACTGAAAAGTAGCAATGGCCTTCAAGTCGTTCTAAAGAATATATGGAATTTCCATTTCGATTTCCATTTGGTCCGTCCAACAACAACGAACAATGA:1 + chrX 20914428 3' + Fw3 125 1 63.70 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTTAAAAATATAGGTTATATGTACGTTTAAATACTACCTTGGAAATGAATGAGTATTTTACTCAACTTGGTACACG:1 - chr2R 25252132 3' + opus 7457 2 52.74 ATACTAAAAAAAAAAGAAAAAAATACTAAACGTATACCAAAACCTAATATTCTTAGAAACTTTTAATCAAAGTAAGACCTTTTTCGAATTATATTAATATTCTGGCTATTTTCGCATATTTAAAATCCTTGAAATAACCCATAA:1 + chrX 13947357 3' + BS 5100 4 50.00 GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGTAACATTTTCTAAGTTCTATTCAGTCATTAGCAGATTTTGAAGCCGTTAGCATCGTAAACTAAAATATTATGATGA:1 + chr2L 7939858 3' + Burdock 6349 2 55.48 ATTTATACATATACATATATATAATACATATATGCATATATTTATTTCAATCGCGTTGTGTGGAAATCGATTTTTCAAGTGATATCCCAAGAAAACAAGGCACAACCGTTTGAAAAGAGAAAGTTTGTCATAAATTCCTATACTT:1 + chr2L 17152096 3' - Stalker4 244 4 81.38 GTCATACTGTCTGCTATCATCTCATTCGTAGAAGTGTACTCTAACACAACGTGACCCTCTTTCATGACTTTTCTAATGAAATGATATCGAATGTTGAATGATTGCAAAAATACACAATTCACTAAAATTCAACTACCAGGCTTATA:1 + chr3R 11605439 3' - 1731 4202 1 63.01 TGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGT:1 + chr3R 29091383 3' - rover 7017 2 65.07 GCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCTCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAAC:1 - chr3R 17660025 3' + micropia 380 2 67.81 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGCAAAACATAAAGCAGGAGCCGCCGCGGCGAACCAACATTGCCATGATTT:1 + chr2L 20986601 3' + roo 337 2 65.07 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATCGAACTATAGTCAAATAACAGCTTTGAGTTGTGTGTTTGTTCCAGGGCTGTAATGTTTAATAACTC:1 - chr3L 21151080 3' - 412 7108 2 54.79 GGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAATGAT:1 + chr3R 934291 3' + Rt1b 4740 1 60.96 ATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTACACATTTGCCTTCTATATTTTTTTATGAATTCAATTTAGTTGTTAAGCCTTTGGAAAAAATATTCACCTTGCGGCAGCTCCT:1 + chrX 14685836 3' + HMS-Beagle2 271 2 53.42 TTTGATGAAAAGTATGAGTTCTCTGTTTGTTTACTTGCTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTCGTTGGATGTGTTGTTTGTTGTGACGCTTTTGGTATCAGGTTGCCATTGCCTCGTTAGAGAGTGTGCACGAGTGTGTGTT:1 - chr2L 18720406 3' - I-element 5147 1 58.70 AGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGATTGGCATTTCCGG:1 + chr2L 13510874 3' - diver 5956 2 71.23 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTATGCATAAAAAACGTTGAAAGCAAATGGCCGGCAAATGGTTTTAACAAATGAATTATATATATTTTTATATGCAACTGATTTGCATTTTATAGTTTGCTACGCTTTG:1 + chr3L 13545124 3' - hobo 12 1 77.40 AGAAAAAAAATTAAAAATTGTTCCAAAGTGTGGACGTGACCGGTTCGGCGGCAATGCGTCTAATATACCCCTTTACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACAGGATGAAAAAAGCCAAACTTAATAACAACAAAATGGCCTTTGCGG:1 + chr3R 24506374 3' - INE-1 465 1 65.07 AACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGAGTGTATATGTATATGTGTATGGATGGCATTGGGTGTTTCCAAAGTGTAAGTGTGTGCTTCTCTGGAACTGTAATAATAATAATTATGC:1 + chr3R 19734937 3' - opus 424 2 69.86 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAATTATTCAAAAAATGCGATTGTTATTTGCAAAATGTGCAGTGAATTGAGACGCTCGCAGACAAGCGA:1 + chr3L 17108645 3' - hobo 51 1 52.41 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAAAATTAATATTTGGTCAGGAATTTCACCAGCTGGATATTTTGTG:1 + chrX 22676468 3' + 297 360 2 56.16 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGGGCGGTAGGAATGAAGGGAAAGCTGGGAGGAGTCGGTTGTAGGAGGGTTGAATCAACAGACGAACACCTTTCACCTTTCGTCGAATTGGTTTCCG:1 + chrX 5206580 3' - Tirant 8115 2 78.23 TGTGTGTGTGTGTTTGTGTAAGTTGTGGAACCCGTTTTCCGCTCCCCCCATTCTCCTGCTCATCTCGGTCTGTTACACTGAACAACAGCATTTGAAACAGCCACAAATCCTAGACGAGACCAGAAATACGACAAACGAGCGCACAG:1 - chr3R 13065506 3' - Quasimodo 36 2 71.23 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGTATATTTTCATTGCACGTTTACTTCATAGTAAGATAATATTAAATGTTTTCCCAGCTCAACCAAGCTTTCACTTTCCTTTA:1 + chr3L 13156825 3' - transib2 39 1 58.90 GGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAAATGAAACGAAATCTTTAATTTGTGTTCGAGTGGTTAAGCCGAGCTTATCGATTT:1 + chr3L 17206981 3' - I-element 4993 1 62.33 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATACATTTCAAATATATCAGATATATAAGAAAATCACTGTTTAAACAGTTTCATATTTATAGATAACATTTCATAT:1 - chrX 20632549 3' + pogo 2056 1 51.72 ATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACCGTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATACAGATCAGCAAAGTTTTATTCGATAAATGGATGTATTAAGGAAATTCTAAGGAACTGTTA:1 + chr3R 22772907 3' - Quasimodo 7203 2 69.86 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTAACGTTTCGTGATTTTTGCCAGATTTTTAATGCCACAC:1 + chr2L 19643647 3' - hobo 28 1 67.81 AACTAATAAAATTATGAAAAAACAAGAGAGAATGCTATACCAGTTACTCAGCTAGTGTTAATGCGAACGCGAATTTTTATTATTTTTCTGGGATATGGTAGATACAGGGGATTGTTTGTTTTTGCTCTGGCTTTTATTGTTGCGG:1 - chr2R 22271899 3' - INE-1 402 1 76.55 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACATATGGCAGTATATGGAGCTCCTCCCGACTGCCACACCGGAGTCCTCATCCTCGATGCAGTG:1 - chr3R 18517896 3' - roo 5 2 79.07 CTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGAAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGACAGAATATTTCGCTTAGCACAAACAAAACATAAAGC:1 - chr2R 15721803 3' + micropia 5294 1 73.97 CCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATGATAAGATATATTGATATGGAAAGAATAATTTTAATAATACCCATTGCT:1 + chr2R 25252238 3' - opus 7184 4 68.49 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAAGAATACAATTAGAAGGAAATCTAATACAAGCAGAGCATTTTAATGGCTTACAAACTGTCAGCATAGAGTCTTCTACTCAAGTA:1 + chr3L 1981646 3' + opus 7481 2 56.82 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAAACGACGATGCCAATTCGTGACGCCAGTGACTTCGGCTTTCGGCCGCCTTTC:1 + chr2L 13717392 3' - P-element 68 1 40.41 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTTGCGTACAAAATTCAACATTATTTGAAGGTCGTCCTTTGCTTATTCTGCGCGTCGCTTTTT:1 + chr2L 21251036 3' + P-element 2829 1 46.58 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCCCTCGGATCGGATCCTGGTTAGCAACTCAACAAGCTAACAAATTAACATGCCGTCCAGCGATGTACTGTCCTTTTGTTTTGGTCTTCGGCCAAACTTC:1 + chr3R 10461792 3' - roo 8674 2 77.61 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAATCTGAACAATGGGATTGGGAAAAGAAAATAATTTATATAATTCTATTATAAGCCAAAATAATAGCTTTATTGAT:1 - chrX 10823908 3' + pogo 2059 1 55.48 GTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTATCCCACATTTCGGACCAACAGGTTGTTTGCCTCGTATTCAC:1 + chr3L 16328966 3' - F-element 4222 1 59.00 GTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAATTTAATTAGAGAAACGGGTGAAGAAAAGTTGCAAATAGACAATCGCT:1 - chrX 19579718 3' + Transpac 424 1 67.12 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCAGTTTGGAGTTTGGAACAGAAGCTCACTTACATAGTTTGTGTGTGGTATTGTGGATTAGTAATCCGTTAGTTGGGCGCCAATTATGAA:1 - chr3L 24080181 3' - mdg1 7071 2 62.33 AAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTTTTTGGTCGAAATGAAACGAAATCTTTAATTTGCGTTCGAGTGGTT:1 + chr3L 17206962 3' - I-element 4998 1 71.21 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATGCTGGCACCTACTTCCTTATAAGCAGGAAACTCCCGCTGGGGGTAGAAGATGTATGTTCCACTTCGTCCCACTTTCTCCACATCAGCGAC:1 - chr2R 14722634 3' + mdg1 7437 2 68.12 GTTCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACATTGTCCGTGTGTGTGGCCGGGAAAGGTCGTTTAAATACAATAAATTAGTTTAAACAGAGCATCACGACTTTAGCACCGTTTACAACATCAGA:1 - chr2R 2906092 3' - 1360 8 2 37.98 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAATCAAAAAGTGAAAATGTGTCCGAAAACGTCGAAAACCACGCCGCTCCTGCTGATTGTCGGAATT:1 - chrX 10286944 3' + roo 9049 2 67.81 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAA:2 + chrX 16217494 3' + P-element 2791 1 19.86 TTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTCGTACTTTTCCATTCAAATCTCCTATTGCAGTTGTTAA:2 - chr3L 20209508 3' - Burdock 25 2 68.49 GTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAACCAACTCTGTTCCCAAAACCGCCGCCCGTGAGTATG:1 + chrX 4214522 3' + jockey 4912 1 71.23 AATCATCCACCCCGTCAATGACCTATCCCCTGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAATCCTTATGACTGCACGAAATGAACCCGAAAGTCCTATATATAATACCTAAACATATTCGAAATGCACTGGGGCGACCATCT:1 + chrX 17858741 3' + Doc3-element 334 1 65.75 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGAATAAATCAACCT:1 + chr3L 14084953 3' + opus 7441 2 67.67 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTAAACTTTAACTATCCGTGACTTTTGAGCAGTTCTTTTGTGGTGTAACATTTTACACCGACCTCAAGTGCGAAAGATAGGCTAATCCTAGATTAGCCA:1 + chr3R 18541434 3' + hobo 2915 1 64.96 TGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTC:1 + chr3L 23702250 3' - G4 68 1 60.96 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAGACACGGACTACAACAATACATTTTTGGGTTCCCTTCTCTCTTAACGAACCTCCTTTCAATGTGTGCGTGAGCAAAGGAATTCCAT:1 + chrX 16526401 3' - P-element 22 1 67.81 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCTTATGAAATGCAAATTACA:1 - chr3L 18199929 3' - Doc 48 1 52.05 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATTTGTTGAATGTCGAAAATATACACTGTGTACGGAGGTTGGCGTCGCATCGCAATGCTCAG:1 - chr3R 5868173 3' - jockey 58 1 55.56 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGACGTCACTAAATTGCGGTGACG:1 - chr2R 7889362 3' - jockey 64 1 54.11 CTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAGTTTTTTTTTTTATGGAAAAATAAAGAATTTAATTCTTTATAATTTTCGGAATTTAAGATCCTTA:1 - chr3L 21060685 3' - pogo 2079 1 77.05 ATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCGCGCTCCGACATATATATATATTCACTGCATGATTTCAGTTCTTAAAAAACTGAAGTAAAGGATATTTATTGATAATGAATCCAACTCATTTTACAATTCTAGATTGTCAGTCGAG:1 + chr2R 10305463 3' - invader4 36 2 63.01 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACAGAGTTGGTGGGAACGGGTTTTAACATATTCACTTGATAATTTCGATT:1 - chrX 4214468 3' - jockey 78 1 65.73 TATATATGTACTTTTCATGAAAAGATGAGGGTCAATCGGAAGCCTGTTGACCTTGCTAACTGTTCTGGGCGACCACCACCCACCAGGTGTCTGTCGATCTAGGTGTACAGTTGTATATGTACCCATTTATCTGCTCCAACTGGCGG:1 - chrX 19211857 3' - Juan 4178 1 80.82 AATTATTTAATTTACAAATCATTTTAAAAAAATATATAGTATATATTCAATTTGAATTTTAATTTAATATATGTTCGATTTTCTGGTATGAGTAAGAACCCTTCGACCATTGCAAATCCATATGAAATCGGCTAATTTCTCAAGTG:1 + chrX 3139101 3' - invader4 2627 1 76.03 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTGGCCGCCCCGTTGGATATATGTAGATATGGATATGGCCACGCCCATAGC:1 + chr3L 20399128 3' + roo 394 1 75.34 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCATGGCGAAAAAATAGTGTGCCAAAAAATCGTATAGCGTTACGCATCTTGTCTTTGGCACTACCTTGACTCAGCTTTTTAGGTCGTTCATACGGACAGAAAAACGGACATAATAGTCATG:1 - chrX 6757168 3' - 1360 72 1 65.07 AAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGTATTCAAACATACATTGGCCAG:1 - chr2R 5070890 3' + Doc2-element 226 1 46.38 ATAGAGATGACATGTTTATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGT:1 + chr2R 15822099 3' - invader6 4538 2 49.32 TGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATGATAAATTTAAAATAAACATTAGACATAAACAATAACATTTTTTATTTCCTACAGCTAATAATTTAACTTTGCCTGTGAAGTTTGACATGCCCTAA:1 - chr3R 19721014 3' - opus 18 2 69.18 GCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAACATCGAAGTGATGTGCCTGGAATTTGCCATTAATTAGTCTGCAGGTGTCGTTGGCCAAAAGAACGAAGAACCGAACG:1 - chr3L 20176692 3' - gypsy 11 2 74.66 ACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTA:1 - chr2R 2492932 3' + invader2 5041 2 61.64 CGCTGATGGACAAACTTGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGAACATTGTTGAGCCTTGAATTCGAGCGGGTCGCAAAAGAGAGAAATAACCATGTGACCAGTAAGTTAGTACACGCGGTGGG:1 - chr3L 25255137 3' - GATE 302 1 64.00 GCAGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTA:1 - chr2R 4260435 3' - micropia 5206 1 48.00 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATATAATCAATATAATTATAGCATAACAAAGTTTAGTGACACACACTTT:1 + chr2R 9092047 3' + 412 7482 2 70.90 GTCGGAGAACTCGACTATAGCATTCTCTGTTGTTGTTGTATGAAAAGCACTGGGTATGATTTTGTCGGCATTTTTTATTTGGCGACTACACAGGAGACTAATAAACACATACATACACAAATGTGCATATCAATTATGTATCAAAT:1 - 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HMS-Beagle2 481 1 42.47 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGGGCGGTAGGAATGAAGGGAAAGCTGGGAGGAGTCGGTTGTAGGAGGGTTGAATCAACAGACG:1 + chrX 5206547 3' - Tirant 8170 2 60.96 AACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACTTTTAAAGGTCCCTGAACTGCAGAAAGTTATTTTGTTTCTTTTTAATGAACTTTAAATCAAAAAA:1 + chr2L 7449798 3' + roo 9016 2 56.85 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGAGCGTTTTAAGAGCAGGTGAAAACAATCTAGC:1 - chr3R 5264852 3' - P-element 82 1 26.43 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTAT:1 + chr3L 13228552 3' - P-element 50 1 44.09 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGC:1 - chrX 6484727 3' - jockey 86 1 72.60 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAAAAGGAATAAAATAGTTTACGAATAAATAAATACAAAAGTATA:1 - chrX 18190363 3' - hobo 73 1 68.57 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTTCTGGCAACTTTACTCTGTCATAAAACTTGGGAACAACAGCGACATTAATTAAGCTAATTGGAACT:1 + chr3L 2278265 3' - roo 8718 2 56.85 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATGCTGGCACCTACTTCCTTATAAGCAGGAAACTCCCGCTGGGGGTAGAAGATGTATGTTCCACTTCGTC:1 - chr2R 14722656 3' + mdg1 7407 2 53.42 AATATTTAAAAATTTAAATTAAAAACTTAATGCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGACCCTCTTTTCGAACGCGTTTCAAATGCAAAACAATGTTATCCCCACAAAGCCAT:1 + chr3L 11233639 3' + 1360 3039 1 75.56 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAATTGTGAGAGTATCTGGCCAATGAAATTTATGTGGTAAATTATTCACAAAATATACCATTCAGTTCATTTTTAATTTCCCGAGAAACTGAAGCGTG:1 - chr3R 9193104 3' - opus 7023 2 71.92 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGACTCACATGTCGGTCCGTTCAAATCCCGTTAATCCATCGACCCCTAAACAAAGCG:1 - chrX 8877089 3' - jockey 4795 1 54.62 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTC:1 + chr2R 24021664 3' + pogo 2047 1 58.22 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGACACTCCCCTTTTCCCCTTCTCTTGGCCCTTACACTAACACGCGCTCCCCAACGCTGAATTGTGGGGCATGTGAAGTACTTG:1 - chr2L 9319011 3' - jockey 10 1 48.63 GCAGCGGCGTCACCATCGCCGTGGTCCCAATTGTTTATGGGATCATCCAAAGCATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGATTGAGTTCCTGCGCCACGAGGACAGGAAGTACGCAATCAAAAAATTGTACGACTC:1 - chr3R 16341248 3' + gypsy4 6417 1 57.78 TGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTATAAGCTAAGTATTTAAGAACAAACAATGACAAAAGTTAATTA:1 - chr3R 12727149 3' - I-element 79 1 69.86 GCAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCAAAATATATATCAAATTTATAGTTTTAATTATTTGTAGGCGCCATTGCTTAATTA:1 + chr3R 19721160 3' + opus 7439 2 65.07 AAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAATTCCCGGCAAATCTGCGCCAGATTGCAGCCCTCGTGGATGAGG:1 + chr2L 5048876 3' - FB 715 3 71.23 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATAGTAATTATATTTCCCTATTATGGTTAAATTTGTATATTTTCTCCGAGTGAA:1 - chrX 9959784 3' - I-element 68 1 63.70 GCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCACATTTATTTATTAAAATTCTGTCGTGTATAAAACAACTGATTAAATCACTTCATTTTAATTAAATATAAAAT:1 - 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Juan 4029 1 76.06 ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGAATAAATCAACCTAGTATGTTGGG:1 + chr3L 14084964 3' + opus 436 2 63.01 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAATAAAATATGCG:1 + chrX 17027973 3' + roo 359 2 56.16 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGATTTATCTTGGCGCGTTTTAAAACACACTCGAGAGGTTCATTAATTCTTGCGTCGCACACTGCAGATTACTCATACGCCAACTTTGCCCGCCTGCTGTGT:1 - chr3L 6675253 3' + 412 473 2 69.86 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACCAGTT:1 - chrX 12003907 3' + P-element 2833 1 48.63 GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATTAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATTCGAGGTTAAATTGTTGTTTGGGGCTTCTTTTGCAAATCGTGGCATACT:1 - chr2R 13193788 3' - BS 5066 1 63.70 TTTGTGAGAAATTGTCAGAAAATGAGTTATAATCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTTGCACAACACAAAAACAGTACAACTATGAACGTTGCCGCTGCCACTTTGACCTC:1 - chr3R 29474768 3' - transib2 421 1 80.69 CTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTACTTCGTCTTGGTCCGCAATTTTCTCGAATGAAAAAAATCAA:1 + chr2R 5173272 3' + Stalker4 400 1 77.40 AATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACAAACTTCGAGATG:1 - chr2L 260987 3' - Juan 4105 1 70.55 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTACATATATATGTATATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTT:1 + chrX 11661485 3' + 297 6929 2 67.81 TTTAAAATTCATTTCTAACATTTTAGCCCGTTCTGCTCATCACCAACACATCGATTACTGCAGCAGTTGAATGCAGTCTGGAAAATTAGATAATCATAGTTAGCCAGATGTAAAATTAAACAGCCACTCAAACTTATCAATATTC:1 - chr3L 19182352 3' + FB 973 2 60.69 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTCACAGATCATTTTATTATAATTACTAGAAACCGATTGATTAACTGGTTGTTAAACTATTGCCAATCCAAT:1 - chr2R 17187731 3' + roo 359 2 50.68 AAATAAATTAAATTAAATAAAATACTTCTTAAGAACTCCACTATACTATTTATTTTAGTTTTAATTTTAGTTTTTTAGTATTTAATTTAGTTTTTATGTTATGCAAATCGTACATTTTAGAGTATTGTATATCTTGGAATTTGTAA:1 + chr3R 14525719 3' + X-element 4719 2 42.47 ACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAAC:1 + chr2R 16496639 3' + hopper2 1525 1 76.26 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAAACACGGACTACAACAATACATTTTTGGGTTCCCTTCTCTCTTAACGAACCTCCTTTCAATGTGTGCGTGAGCAAAGGAATTCCG:1 + chrX 16526400 3' - P-element 23 1 69.86 ACTTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACATAATTAATTGTGCTGCTGTGTTGGCAAACACGCGGGCGCCG:1 - chr2R 18983760 3' + hopper 1340 1 69.18 ACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATGCTGAAACTGAATCAGAGTAAGAGTCCTGGAGCCGGGGCATCCTGGATTCCGTCGTGTTGTTTCAAACGTGGCCG:1 + chr3R 5941524 3' - X-element 25 1 64.29 TTTTTTTTTCTTTTTTTTTGGGAACTTTTTCCTTTGCTGAAGGGTAGCTCGGCTTTTGGGGGGTAATGGGTTTGAGGGGGGGGCCAGGCGAAAAGGGCTGCCCC:1 + chr2R 18337617 3' - gypsy7 5004 4 64.42 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGCTGAACAGGGGCTCGGCACAAAACATGGCATACTTTTT:1 - chr2R 20739023 3' + hobo 2919 1 53.57 AGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAAATCAGACGCAGTAAAAGAAATGAAGGTAAACCTAAACTATCGTATAGATTTTTAGAAAAATGTC:1 + chr3R 3286217 3' + gypsy12 9899 3 72.03 GCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACGGTGCACTGTTAAATTAACGTATGCGGGCTATAACATAACAGTTTAACGGATTTCCATGTTTTCCAAGCTGACAATGCTATCATGACCCA:1 + chr2L 16304444 3' + hopper 1257 1 72.44 AGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATTATGTGTGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCTTTCTGTCTTTGGTTCGATACTAATCAGTAATTCGGTTGCAGGACGAGACAGGAGCCTACCTGATAGACAGAGACCCC:1 + chrX 1514497 3' + 1360 159 1 50.70 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAAAAATGGAATTTTTAAATAATATATGTACATATATGCAAGTCTAACGAGTTCACAATGGCATACATGGCTAA:1 + chrX 20632682 3' - pogo 47 1 59.59 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTATGCGTGTGCATATGTGTGGGTGTCTGTGGACTTAGACAATGAACCCAAGTG:1 + chrX 5145932 3' - hobo 67 1 64.38 CGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATATATCATTGATAAAAAAAGCTTTTCCTCTGCGCATTTTCCCTAGTATACTTTTCGGAT:1 - chr3L 18554595 3' - jockey 4622 1 60.27 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCC:1 - chr3R 10461655 3' + roo 9031 1 55.28 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCACTGGCTCTCTCGGCGCACGCAGGAG:1 - chrX 16526266 3' + P-element 2854 1 52.59 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACTTGATATTTCGAAATAAGGAACATAGTAAGAAAAGT:1 + chr2L 5447956 3' - roo 8749 2 76.71 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGCCACTCGCGCAAAATTTCAATCTGATCGATTTGTGTATTTGTCAAACTGATTTATCGAGTGTCTCGATTTGATGGCGT:1 - chr3R 22868709 3' - mdg1 7056 2 72.60 TATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCA:1 + chr2R 11097367 3' - Juan 4099 1 66.44 ATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCAGCACGCGTACATATTGTTTAAAGATCAAAATCATTGTTTCTAAGCATCTTCTCTTAAAGAGCTTTAGATTTGACGAAGAAAATTATAACAAT:2 + chr2L 19145706 3' + P-element 2698 1 65.07 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTG:2 + chr2R 16891837 3' + jockey 4933 1 64.38 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAGGAATTTAAATAAATTATATAACTATAGTTATGTTTATT:1 + chr2R 19289844 3' - BS 5076 1 72.60 TATTTAATTGCGAATTCATCTCAAGTCTAAAACGTTATTTATCTTCTTTTGTTCCACATAAATCATCTACTGTCAAAAATCCATTATGAAATACTGTCTGATTTGAGTGTGATCTAATTGTTTGTGGTCCACACACCTGTGGCATC:1 + chrX 9299184 3' - invader4 2624 1 73.97 GTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTA:1 + chr3R 1844812 3' - Cr1a 161 1 77.78 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGCATTCGATCTTGAATGGAATAGAAAACTTCTAATCCTTCATTTTTGTAGACTCTTTGATCC:1 - chr2R 16510230 3' - roo 59 2 58.90 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTTCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGCATGTGTATGTGTT:1 + chr3L 13228557 3' - P-element 64 1 39.04 CTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGCCATCCCAAGTGCAAAGTGCCGGCTAACTAATTGCTCTGTCACCGATGAAGGCAAATATTCAAG:1 + chr2R 13471440 3' + flea 200 2 55.48 GTTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGGTTTTATGTTTTATGCGGTTTGTGGCAACATGGGTATGCCTAATCTCAATCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAACTGGCAGCATATGTACTCAGGATTTTCAATTGGATTTTTTGCGG:1 + chrX 22904322 3' - INE-1 253 1 50.68 CACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTGT:1 - chrX 9437182 3' - roo 8767 2 30.34 CAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAAT:1 + chr3L 23702257 3' - 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chr2L 9347449 3' - opus 152 4 53.42 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCGTTTCTATGTTCCTTCGTGGAATTTCACAATAATCTTTT:1 - chrX 4823550 3' - pogo 71 1 70.29 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTTGCATTGATAACAGTAGTGGACTGTAAAAGTTACTGGGTAGAGTTAGAAAAGAAAAGT:1 + chr3R 19449414 3' - roo 8692 2 75.86 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTCGGGTGAGTATACAGAAGTAACTTTCCTTCTGAGTTGCCAGGAATGAAATGTTACCTTA:1 + chr2R 5640802 3' - 1360 63 1 63.01 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAAACGACCTTGCACAAACCAACAACAACCATAGCGACGACAGCGGCG:1 - chr2L 21250951 3' - P-element 49 1 41.53 ATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGCCTAAACTATGAATATTTTATGGAGCATATAAATAGTCACTTCATTTTCTATT:1 - chr3R 5316551 3' - Juan 4094 1 61.64 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACAATGCATAAAATCTGAGCGAATTTAATGAAAAACTTAAGTGCTACGAGGTTGTTCGAGGAAAATCCAAAAGTGAATACAGAAACTCA:1 - 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chr3L 14551254 3' + P-element 2870 1 73.79 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAACTAAAGTACTTAGATAAATAAACTGGGACATTCAGTTTATATAAGCGTGTTCATCAAATTCCTCCTTA:2 - chr2L 20556405 3' + 412 7496 2 53.42 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCAAAATATATATCAAATTTATAGTTTTAATTATTTGTAGGCGCCATTGCTTAATTAAAGTACAACAAATATATATGCATTAATTTCCATTGGAAGTTTGAAA:1 + chr3R 19721215 3' + opus 7485 2 69.86 AGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGTTTTCACTTTGCTTTTTGCCTTCCTTTATTCGGCTTCCCGCTTTTCT:1 - chr3L 14708924 3' + opus 430 2 70.14 ACAAAAAAAAAAACAGTCAAATGGTTTTTTACCAAAAAAAAAAACGTAGATCCAGGGGCAAATTGAAAACACGATTCAGCCCGCCGAAAAAAACCCAATAAAATGGTAATAAAAAACCCAGCAACCAAAAATGATTTTCACATTG:1 - chr2R 22987081 3' - Tc1 1467 1 73.10 AAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGCTTACACATAGATCATTGACCTGATAACGAATTTTTATGCTTGGAAATAAATCAAAACTGTTTTAACAAGTTTTTAAGCAATTTTCAAGCATTTCATAAACCAAGCAGGTATTTTTAA:1 - chr2L 13510724 3' + diver 220 1 79.45 ACAAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAAAATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCCCGATGCTGGGGTCAGCACTTTAACGTAATGGTATTATTTTTTTCACCACATTAACGGAAAAGAGGATTCTTTCAAGGGTCT:1 + chrX 20853829 3' - Gypsy6A_LTR 119 1 67.59 CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATACATATATATATGCACGCTCTGTGAGCATTTTCGAGGATTAAATGAGAC:1 - chrX 1764057 3' - opus 180 4 73.29 GACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGAGACACCTTAAACATGATGTATAAGAAGCATGATGTATAGTTGTTTAGCAAC:1 + chr2L 14480525 3' + Transpac 5163 2 63.70 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCC:1 - chr2R 12069604 3' - Tirant 8132 2 71.01 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCCTCTCACCCAAGCGCTCTCCCTCTCCCGCGCGGGCGCTCTTACC:1 - chr3R 11773853 3' + P-element 2880 2 79.07 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTCGAAATTGAAATCAATATGTTTCTTTTCGTTATTTTTA:1 - chr2L 11734533 3' - Doc 70 1 78.91 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTTAATTAGTATTAAAATACTGCAATTCTGTACGCATATTTCATCAACTAGTTAAGTTCAGTGTAAACTAAGGCTG:1 + chr3R 32032124 3' - 297 6617 2 58.27 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTTACATGAATTTCAAGCAAGCGTGTGCTATGTACTATAAACATTTTGCTTCTATAATTGGAGT:1 - chrX 3578085 3' + hobo 2913 1 53.10 AATTCAGTGTTTAATTTATTTCGGAGTTGATCCTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGACTTGAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTATGGCAAATAGTCGAAAAAGTTTACGAACCGGTATACGGACAAAA:1 + chrX 16175787 3' + McClintock 6303 2 69.66 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAATTTATGGCCGTAAAGCGCATGCATGTGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGTACATGCGGATGTGTGTGTGTGTGTAGTTTTCTTTACGCTCTTTTAAGGTG:1 + chrX 19818546 3' - jockey 4783 1 70.55 AAATATTACAATTTAATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCGCGCTCCGACATATATATATATTCACTGCATGATTTCAGTTCTTAAAAAACTGAAGTAAAGGATATTTATTGATAATGA:1 + chr2R 10305426 3' - invader4 51 2 47.58 ATGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAACTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGATCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCAGGAGACACTAATGACATGTACTTATATTTACAATGTTGA:1 - chr4 333639 3' + 1360 174 1 73.29 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAGGGCTGGCATATGTGATAATTTATTTACTCGCTCTACCCACGTCTCGATGACGGATTCAATTTCGCATTTTATTAACTTTTGA:1 - chr2R 10406248 3' - FB 40 1 54.11 AAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATTTATGTTTCTCTGCAGGACAATTCGTATCTGTTGCGATAAATCATATCCATATTCAAATATTTGCACTATTTTGTTGTGCAAATGGCATGATT:1 + chr3L 19335468 3' + invader4 3056 2 60.96 CTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCCCTTGGGCTGGCTACTTCCTCGCTTCCCTCTCCTTTTGC:1 - chr2L 18178285 3' + Tirant 8448 2 70.16 AAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAGCTGGAGCATCCACAGCCCTGTCGGGACTACACTCCCGTTTGGATGGTCTAGTGGAACAGCTCGTCTACT:1 - chr3L 7145996 3' + hobo 2527 1 52.05 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTACA:1 - chrX 6484730 3' - jockey 89 1 74.66 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTG:1 - chr2L 7271839 3' + 297 346 2 67.52 GGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAATGGGTCCCGGGTAATCTTACGTTGGAAGTAGGAAAAATAAATATTCCAAGGAGCTA:1 - chr2R 2552097 3' - HMS-Beagle2 6945 2 62.33 CTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAAGATGGATTGTTCGAAAATCAGTCCTAATTTTA:1 + chr3R 8183468 3' - Doc 94 1 76.71 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAATTATTCAAAAAATGCGATTGTTATTTGCAAAATGTGCAGTGAATTGAGACGCTCGCAGACAAGCGACGACGACTGCT:1 + chr3L 17108656 3' - hobo 26 1 64.89 GGCCGAAATTAATAACTCAAGAACGGGGAGAGATATTAAGATAATTTTCGCAATGGGGTTTATTTTTTGTGGCTTATAACTCCAGAACGGAAAAATATATTTAATTAACTAATTTTGTATAGGGATTTCCCTAATTCCCTATGCTT:1 + chr2L 22107785 3' + Transib-N1_DM 29 1 61.64 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACCAAAAGTTTTGCGTTATCTGTGACATTCGCTTTGCCCACTTACGCAATCAATATTTTGATATCAAACGCACTGCAT:1 - chr3L 17904757 3' - roo 8708 2 55.48 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCTTTAGTAAAATAATTTTTATAGAGTACCAGAAATAAAGTTTAGAAACCTACAACTTTTTTCTATTGCCTCAGAAAGAACTTTT:1 + chr3L 15277718 3' - I-element 40 1 56.16 TTCCTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGATGAACATGGCTGGATCGACGTGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATAATTTCTACAGTCGGAAACTCTTCCTTATGCCTGTTACATACTTTTCAAGGAATCTTGTATACCCTT:1 - chr2R 10974912 3' - INE-1 139 1 77.40 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTTGCCTTTGTTCAGGGTATTCCCAGCTCTTTGCTCTTTTCTTTTTTAGATGTTTTCTTGTGCTT:1 - chrX 5366136 3' + pogo 2048 1 56.85 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTAATCGATAGGCATTGTTTTGTATGTACCTTTTTTAAAATATTCTTTATCAAATCAACTGATCCTTA:1 - chr2L 17957156 3' + blood 7359 2 56.80 AGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACGAATTGCCGATATGAGC:1 + chr2R 15822122 3' - invader6 4505 2 57.35 GCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGGGACTTTAAACTGGGTGGATTCCGGATGGGTGGGCGAGGGGTCTGGAAAAGTCATCGGTGTCGTTGCTGCTGCATTGATTTTTCGCTGCCTTG:1 + chrX 19035888 3' - I-element 63 1 63.71 CTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAATGGGATCTTTAAAGGGGTAGTACAATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGTCTTATATTTCTTTTT:1 + chr2R 4774755 3' + baggins 5344 1 60.27 CAGATACCAGTTACTCAGCTAGTGTGAATGGGAACGCGAAATTTCATCATTTTTCTAGGATAACGATAGATATTGGGGAATACAATAAGAAAAAAGTTTATCCCGAGTTTGCGAATGATGCAATGAT:1 + chrX 14893554 3' - INE-1 543 1 77.17 CTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAA:1 + chrX 22676425 3' + 297 319 2 75.69 GTCACGCCCACACTTTTGAAAATTGTTTTTGATATTTTTTCATATTTTTATTAGGCTTTTAATTTTCTATCGATCTATCTAACTCCCTGTTCAGGAAGAGGTTTTGAAGCGCGCCTCGCAAAGGCACTGCCACTTAACTTTTGCTG:1 + chr2R 1736871 3' + INE-1 251 1 60.27 ATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTATGTTGCAAATGCATACTATAACAAATTGT:1 - chr3R 10137024 3' + I-element 5265 1 78.08 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAAACGACGATGCCAATTCGTGACGCCAGTGACTTCGGCTTTCGGCCGCCTTTCGGGTTTTCGAAATTCATCCGTTTCAGAGAAGGAATGAACTCTCGGTGG:1 + chr2L 13717440 3' + P-element 2878 2 78.52 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATGATAAGATATATTGATATGGAAAGAATAATTTTAATAATACCCATTGCTCCGCGG:1 + chr2R 25252244 3' - opus 7065 4 64.38 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATTAGGGTATCTTCTCACCAAGTCGACCAAGCTATCGCATTTCGGCTGGCT:1 - chr2L 5447838 3' + roo 395 1 70.71 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATGTGGTCAAGGCTTTAAAAGCTCTTCGGATTTATATTTGGTTCTTTCCGCCTATAAGTATAATTCATTTTTAAAGATTTGTATTTATC:1 - chr3L 13472374 3' - jockey 34 1 65.96 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAACTATAGAGCTACCATTTGCTGGAGGCAAAGCAAGTAAGCCAACGTTGTTGTCATAAGCTATGAAAATAAACTACATTTACCACAGAAGCCGAACGAATGACAAGCCACC:1 - chr3L 10442765 3' + roo 397 1 78.08 CGACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATGTATTTTACACGGAAACGCTTCCTTGTTCCTGTTATATACTTTTCAACGAATCTAGTTTATCTACAAATATTTCATTACGCAAAATTGCATTTGATTATCATGAACCTT:1 + chrX 21575375 3' - INE-1 93 1 60.27 AAATCCGAGATATTTAGTGGTCTTATCAAAAAACACTCCGAAAACCATATCCGACTATAACTGCTTTGCCGTCCACAGAGCCTTTAAGTATATAAGCAAAGACATCACATCCATTGATCTCATAGGGAGGCGGGAAATGAAAGAAA:1 + chr3L 22226232 3' + Ivk 323 1 78.08 TCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATCTACAGTGCCGGCAGACGAAAACAGAAGGCCGCAAGATTATATTATCATTGAAATTTCATTAAAATT:1 + chr3R 9193265 3' + opus 451 2 53.42 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTCGTACTTTTCC:1 - chr3L 20209535 3' - Burdock 43 2 54.74 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTATAAGCTAAGTATTTAAGAACAAACAATGACAAAAGT:1 - chr3R 12727155 3' - I-element 85 1 73.97 ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGC:1 - chr3L 10563900 3' - hopper 63 1 63.57 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACTTGATATTTCGAAATAAGGAACATAGTAAGAAAAGTCGTTCATTA:1 + chr2L 5447965 3' - roo 8740 2 70.55 AATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAACAATGGCTGTCTGTCAGATAATCTAGTTTAAATATTTTATA:1 - chr2R 21425073 3' + HMS-Beagle2 7118 2 71.92 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATAATAATAGCTTAATAATATAATCTTAATAATTTTAACTAATTCCCCTGAGCATAGACTAAAGTATGAATATTAT:2 + chr2R 12239847 3' + roo 9026 1 53.42 TACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCGTTTCTATGTTCCTTCGTGGAATTTCACAATAATCTTTTCCATCAA:1 - chrX 4823543 3' - pogo 72 1 67.12 TTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGAATAAGAAGTAAATAGAAGAAATACCACATAGTTCA:1 + chr3R 23562605 3' - 297 6862 2 76.03 AGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGGCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAAACTTTTTTGTACCACTCGTCCTTGTAGTCAGCAAATTGGATCGGCATTCATAT:1 - chrX 1113579 3' + P-element 307 1 35.62 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAATTATAGCTGGGGCCAAATTAAACGCGCAAAATGGAGGCAAAAATTTGATTTGATGATGTCTAAGGTCGCCGGCAAAGACAGACACATAAA:1 + chr3R 23668563 3' - pogo 25 1 67.81 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGGGTAAGGGACGGATTTTGCGCTGTG:1 - chr3L 10563858 3' - hopper 14 1 71.43 TATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAATACTTGCTTTACAGCTCGGCTGCAACTTTAATTGAAAGTGTTTGTAGTCAAATGATTGGATTTTAAATGAACCAAAAGCTTATTTAAGGGAATTAATGCAATT:1 - chr2L 6876565 3' + Rt1b 5112 1 70.55 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGA:1 + chr3R 4532964 3' + 1360 3380 2 66.67 ATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACAAGTCGAACTAATACGATAAATAAATAAATAATAAATAATTTGAAAATA:1 + chr3L 18452056 3' + jockey 4829 1 67.12 AATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTTTTAAATGTGTAGAGTGCTTTGAATATCTGTGTGGCAGGAAAAATCGATATCTTAAAAAATATAACAAGCTAAGCATAGGGATCGCATTTTGCATTCGTATTCACAAAG:1 + chr2L 18300897 3' - Ivk 5263 1 65.75 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTATATGGTCGGAAACGCTTCTTTCTACCTGTTACATATTTTTCAA:1 - chr2L 21902497 3' + 1360 3330 1 56.85 ACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTACGAATCTAGTATACCATTTACTCTACGAGTAACGGGTATAATTAGGATATTGTAACTGAACGATAAAGACTTGACCACCTTTTATCC:1 + chrX 22742364 3' - INE-1 105 1 89.21 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATTCCCAGTGCAGAACTCCAAGGCGGCTCACCAAAGAGGTTCTCCGAAGATGAATCGGTGCTCGTTTGTTTGGAATCCAGTGTCGCGG:1 - chr3R 10636070 3' + blood 360 2 66.41 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAAAATTAATATTTGGTCAGGAATTTCACCAGCTGGAT:1 + chrX 22676460 3' + 297 352 2 52.05 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGATCAGCCTTAAGTGGGCAATTTAAGGATGACAGATTAACTAGTACTATCCGAACTGAAATCGAACTCAGAAAACAGCGTC:1 + chr2R 5269090 3' + pogo 2064 1 60.96 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTCTCTCACTCGCACACATTCGCCGAGACTTCTCTTTCTCTATGCGG:1 + chr3L 5179247 3' - P-element 51 1 49.32 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGCTGCACTCTGCAGTGGTGTGGTTATATTCGTACTTATGAGTGAGTGTTCTTCAGTCTGGAGAGCCAGAGCGCAGCCAAAAGA:1 + chr3R 17059385 3' - hopper 37 1 60.96 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATAATGTACATACATACATATGTTTGAAAGGCATAAATATTTCATTGGCT:1 + chr2R 10600077 3' - 297 6596 2 60.00 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACTTTGAGTTGTCACTTGGGCAAGAGAACTAGAAAAACTCAG:1 + chr2R 7899185 3' - roo 8742 2 72.22 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACTTTTCACTTCTTTGCACGGTGGGTATTTTCCTCAT:1 + chr3R 4662003 3' - roo 8749 2 76.71 ACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATACAATGCCTAGTCAGTTGGTCTCCGTATTTCGATTTAGGAGGCAGTTCCGTTA:1 + chr2L 19548525 3' + flea 4949 1 65.75 GCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGTTTTACCGAAATTGTTGCAGCTTTAACTTCCGTTCCGTTCCGATATT:1 + chrX 17700696 3' + 1360 62 1 67.90 ACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTCTCTTTGACTTGGAACAATTTTTTAAATTAATACAAAAAAACTGCATTTAACATTGACCTTA:1 + chr2L 9074291 3' + flea 199 2 61.64 ATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTGAATCGTAGTACATTTAACAACTGATCAACTCATTTGCAATCGCCATATAGCAAC:1 + chrX 21590757 3' - BS 5065 1 62.33 CTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAAAACCTTCTTTCTTTCACAAGAAGTTGGAGCAGAAG:1 - chr3L 9007545 3' - hobo 2597 1 76.03 TTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTCGTACTTTTCCATTCAAATCTCCTATTGCAGTTGTTAAAAACGGTGATATCACCCA:1 - chr3L 20209490 3' - Burdock 6143 2 80.82 ACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGA:1 - chr2R 981622 3' - 1360 45 1 62.33 ATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGA:1 + chr3R 29091398 3' - rover 51 2 56.16 GAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAA:1 + chr2R 11097385 3' - Juan 4023 1 70.45 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTTCTATATCTATATCTATTCATAAATGCCAGACCACAGACTGCCACCGCTGTAGCCATCAATTTGCAATTATTTTTGCC:1 - chr3R 28579459 3' + pogo 2064 1 58.90 CCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATAGGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTATTTTTTTGGCCGCATTGCCCAAAGCTGAAGCC:1 - chr2L 1543804 3' - R1A1-element 79 1 75.86 CCCCGACAGGTTTTAAGTATTAAAACATAATATGAGTAGGGTATGTTGTCTCGCTTTAACTTTATCCGTTTCAAAAATGAAAGACTGTGGCCGTGCCATAGGATTTTCTTAATGCCGGTTGGCTTTATTATCACTTACAAGCCGGT:1 - chr3R 6683236 3' + G4 3713 1 70.55 ACTGGACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGATTTGGGTAAACAACCAAAC:1 + chr2L 21403566 3' - G5 4432 1 53.47 GGGAAGGAATATATTGTTTGCCGAAAAAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTA:1 - chr3L 23773898 3' + Transib5 2833 1 66.44 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTTATCTAAATATAAGTGAGCACAGCAGTAGGCCCG:1 + chr3R 21706314 3' - I-element 85 1 74.48 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGAAAACAGTAAATTGCATTTTTATACAATTTTCCATCATTTGACTTGGCAGTTGTTCGTCTGGGCTTTGTAATTTTCAAATGAAATACTTTCCGAATGC:1 + chr2R 20700762 3' - mdg1 24 2 69.18 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTAACCCAATAAAATATTGTGATTCCCATAGAAATTGTAATGGTTCCATGCTCATACTGCTTTAGGACTTCAGGCTGGGCACTATCACTGTGGCCGCTGCTG:1 + chrX 13277755 3' + S-element 1708 2 77.54 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCAAGTCAAATCGCATTGCGGTTTCGGTCAGGTCGATTCCCCGTCTTGGAACTGGACTCC:1 - chr3R 10461635 3' + roo 392 2 61.34 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTATGCATAAAAAACGTTGAAAGCAAATGGCCGGCAAATGGTTTTAACAAATGAA:1 + chr3L 13545070 3' - hobo 66 1 63.01 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTTTTTT:1 + chrX 7967275 3' + P-element 2806 1 30.82 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAACACACTCACGGCAGCAGGAAGCTTCCTAGGATATGTAAGCGAGAACGTCTGGTTCGGTGTGTGTGTGTGTATGTAAGCGTCTATTGGTCTGTCTTTGCCTTTGTACGCCATG:1 - chr2L 12847151 3' + 412 484 2 75.34 CCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATGAAATTGATTTTGCGTTCTTACCGGCTACCACTTTATTATCTAAATACCTGGAAAGTCTAAAGTAATGTGATTTACATACTGG:1 + chr3L 22709451 3' + 412 456 2 57.24 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCATAATTTGAATAAAACGATCAAAGATCGCACTTATCTATATGTTTTCACGGCGAGCACCGTTGTGCACAGGTAG:1 + chr3L 21955532 3' + roo 9023 2 76.03 TGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTCATGCGTGCTGGAAAAACAGCGCCAAAAAATTGCCAACGAACCAAAAGGGGGTTTCAATGT:1 - chr3R 6411955 3' + Tirant 8449 2 58.90 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCTACCACATCATTCACTTGACCACAATCTAAATTAATCCCGCCCGAGCTGGACCTC:1 + chr2L 18953120 3' - roo 62 2 65.49 ATATTTTTTTAAAAAAGAAGAAATCTTTATCTGTATTGACAACCACCAAACAGTCAAGCAAGTAAATTACTAATTGTTAAATGTCAAGTTGTCTCCTATGATGTTTATGAACATGTCTTTAAAAACGTGTCTGTTTTAGCTAATGG:1 + chr3L 18423904 3' + TART-C 11035 1 63.01 AAAAAAAATAAAATAAAAAATGGGGTATTCGCATTAGTAAGCCCACAAAGAGGAAGACAGACTGGTAGACAGAGGAATTTTTATGGCATTTCTCATGGTTCAAGCTCACACTTACACTTCCTCCCCCAAAGCACACACAACACACA:1 + chr3L 12054512 3' - hopper 142 3 71.92 GTATGCTGAATCTCAAGCTTCTAGATCGAGACGTTCATACGGACAGACGGATATACGGACATGGCTAGACTTGACTCGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATATATAGTCCTTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATTAAAAG:1 - chrX 14770430 3' - INE-1 172 1 60.27 AGACGCGTGAATATGTCGCAACCGAGGAAGTGTACGTCTCGCGGGCGGAGCGCGGCAACAGAGGACCCCGAAACAGTTAACTTCCCGACATACACATATTTAACCGGCTATTCCCTAATTCATTTTACACCATAACATAACGTACA:2 - chr2R 15821999 3' + invader6 304 2 66.44 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAATTATTTCTACCTTTAGGTGTGGGGTGGCTATTGTATCTGCCG:1 - chrX 19820158 3' + Juan 4172 1 53.57 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTTATAACTAATCTTAACAGATGCCTAAAGTTTAAAATTAAATCTTCTACAATGATACTTATGCATTTTGCTTCTATT:1 - chr3R 8914233 3' - pogo 41 1 56.16 ATACCTAATGAGATTATAAAAAAAATTGCCCAAGCACTGCTAATTTTATGAACACAGCTGTACATACATACATATATTAAGTGAATTCGATTTTGAAAAGTATATTGCTTTGTATGGCAACTGGCTTCAATGAATTAGATTTATAG:3 + chrX 22460189 3' + HB 1539 1 78.77 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTGAGGAAATTGCACACCACACTAGGACCTTTGGGACCGTTGCACTATTGCCATCTTATACGGATGGAATTAA:1 - chr2R 4802919 3' - roo 48 2 55.48 ATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGGCTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGAAAGCTATTGCGCGCTAAATTTAGAATGTTTCCAGTGCC:1 + chr2R 16073042 3' - Burdock 38 2 56.85 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTACCAAGCCTATTTACGGTTTAGCCTTTCGCTCT:1 - chr2L 7449720 3' - roo 72 2 79.07 AAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAATATTTCGCATGTTTGCGATGGACAGAGAAGCCGCGGCGAC:1 + chr3L 381793 3' - S-element 77 1 73.29 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGCCGGAGTGTGAGTGTGCGTAAGAGTG:1 + chr2L 18213263 3' - roo 7 2 78.42 ATAATAACAATAATACTAATATTCTTAATGTTTCAATTAGAGAAAAAGTGTGTAAATTGAAGGCGAAGTGGCTTTAAAGAAGTGAAATACGTTACTTATAGTTCGATTCTTTTCATTACAAATTTCAATATTTTGTTCGCTTTCAC:1 - chr3R 20305825 3' + mdg1 7067 2 71.92 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGGCTTTATTGTATATCCGATTGCAGCTTCCCGTTGATGAGGCACTAACTGTTGGCCCTGTTTTTGATGTCAGTAAACA:1 - chrX 12997981 3' - roo 8707 2 58.22 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTGTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCC:1 - chr3R 11773896 3' + P-element 2820 1 40.41 CGAGGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTGAACTGAGCACTGAATTCCGAGCGCTAAGCGTCGAGAATCAAAC:1 + chr3R 18518044 3' + roo 355 2 51.37 GGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTTTCCCCAATCAACAAACAAATTATGTAATTTGTAAGTTTTCCCAGCATGTATCCCTCTTATCAAGTGTCATTCTTGGA:1 - chr3R 30388345 3' + BS 5024 1 51.37 CAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAGCTGTAAAGCAAGTAAAACAATTTGAATGGCTTTCCTTGCGCACTAAGACTTTAACTAATTTCCCAAGCTCAACACGGTTTCCAGATTAAAATCTCGTGTATCTGTG:1 + chr2L 6876738 3' - Rt1a 15 1 77.70 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAATAAAATATGCGTTTCCAAAA:1 + chrX 17027982 3' + roo 9032 1 62.33 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGCTTGTAAAATGTATTTCCATATTTTGAACCAT:1 - chr3R 4532854 3' + 1360 3346 1 56.16 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACGTTACGAAACAAGAGAAATGACAACGTTGCTAAAT:1 + chr2R 20447918 3' + hopper 1375 1 56.85 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGACTGGC:1 + chr3L 10564013 3' + hopper 1393 1 64.57 CTTGTTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTTAAATAATTTTTAAATTAGTTTTCATTATTATGTACTACTTGGAAACGGCCCATTA:1 - chr2R 25200905 3' - gypsy4 489 1 61.38 CGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCGAGGCGTACATCACTCTGTCCCGGATGAGGACTTCAAGGAAAG:1 - chr2R 5640723 3' + 1360 3310 1 71.23 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGCACATCCATCTAAAGCCCTTCATGATGTTAATTACCGAACCCTGTCACACGC:1 + chr3L 6675386 3' - 412 69 2 64.38 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACATATGGCAGTATATGGAGCTCCTCCCGACTGCCACACAGGAG:1 - chr3R 18517916 3' - roo 8699 2 60.43 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCGCGGTCTTGCTCTC:1 + chr3L 13228577 3' - P-element 30 1 59.85 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAACTAAAGTACTTAGATAAATAAACTGGGACATTCAGTTTATATAAG:1 - chr2L 20556428 3' + 412 7473 2 69.18 TGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTCTTTATTGATTTCTTTCGATGACTTCGGTATTGTGTCCGATAGTTTTAGTGCTCTACATGCATTCCAATGTT:1 - chr3L 7995586 3' - opus 432 2 54.11 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTG:1 + chr2L 19158894 3' - P-element 73 1 31.06 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGATAACGGGGCTTATCTGAGCCGGCAAGACTCAAGTTG:1 - chr3L 13228443 3' + P-element 2851 1 59.29 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGGAAGGTTCAGATACAT:1 + chr2R 24021686 3' + pogo 2069 1 62.33 AAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCTCCTGTTAACGAACTCTCGATGGTGTTTGAGGGATTATTAGGTTTCCGAACA:1 - chr3R 22840385 3' - Transpac 4985 2 62.33 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGGCCAAAAAGAGATTCCATCAG:1 + chr2R 9623406 3' + I-element 5288 1 65.00 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGTTGCGTAGTTCTGCACGTAGAGCAG:1 - chrX 19585138 3' - Transpac 39 2 48.63 CTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCTCTCTCACTCTCTT:1 - chrX 10806910 3' + P-element 2792 1 15.94 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAAGAGTTTAATATCAAATATCGTTTATTATCTTAACGTCCATTCGTTTAACAATAAAAATGGCTACCATTTTTTCACTGCCTACCCACTTTCCGT:1 + chr2R 22012274 3' + opus 7476 2 67.12 CGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTCGCCTTTTAACTGAGATATGGCAACAATGTTGAGCTTCAAAT:1 - chrX 20460569 3' - diver 63 2 68.75 GTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATAATAATTAAGTAAGATTTAAGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAATAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACAATTTAAT:1 - chrX 15746261 3' - jockey2 3241 1 55.48 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGTCGGTAGCCGAGCTCCAACTTCGGGTTCGGGTTTGTTGTTGTTCGCGAAAAGAAGACGGCAGCAGTAG:1 + chrX 10806978 3' - P-element 20 1 64.96 AGTAGAATGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGGTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCTAAGAGGCAACTTTAATCCCGAACGTGTCT:1 - 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roo 8745 2 80.00 ACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATTTATGTTTCTCTGCAGGACAATTCGTATCTGTTGCGATAAATCATATCCATATTCAAATATTTGCACTATTTTGTTGTGCAAATGG:1 + chr3L 19335461 3' + invader4 290 2 59.59 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAAATTAAGAACATATATTTTTAAGCCTTCTTTGAAGTTCTTCGAAGTTCAGAACTCAAACTTGCCATAAAAAG:1 + chr3R 29622764 3' - pogo 46 1 54.11 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCTCAGGAAGCATCGAGCCCATTTCCACACTGAATATTGGCCATAATTAATGCTAACTACA:1 + chr2R 11562958 3' + pogo 2080 1 71.23 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATG:1 + chr2R 22464484 3' - pogo 37 1 57.45 GTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACAGCGACTACAAGCGACTAATTTTGAATGCAGGGACTGGACACGAAACAGAAAAAGGAGCATTTTACAATTTTCGAAAAATTAAATC:1 + chr2R 5953545 3' + mdg1 471 1 61.64 TAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAAACACGGACTACAACAATACATTTTTGGGTTCCCTTCTCTCTTAACGAACCTCCTTTCAATGT:1 + chrX 16526378 3' - P-element 24 1 64.00 CGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCCCGCAATCACCGAAATTGATGCTTAACGCAGCGGGAAATCCCATTTTCCC:1 - chr3R 30931190 3' - R1A1-element 5163 1 59.02 ATTACTGTTAGTAGGATCTAATCATGAAATAAAAAAAGGTAAAATCAATTGCTTTGTGAGCGGCAGAGAGTCTGGCGTACAAAGTGGCGGCGG:1 - chr4 920182 3' - Cr1a 4290 1 75.27 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTCCCTGAATTAATCCAAGAGCTTTGTCAATTAACTAATTAATGTTAGTACTTTTTAAGTGTTCATTAGTACTT:1 + chr3R 24976346 3' - roo 20 2 69.18 GCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATATATATTTAAACGTTCAATATGATTACCCGTTTTTAATAAAGTTTCTTTGTCTTGAAATAAGCAACTAG:1 - chr3R 9175118 3' - Juan 8 1 75.34 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACCAAAAGTTTTGCGTTATCTGTGACATTCGCTTTGCCC:1 - chr3L 17904796 3' - roo 83 2 78.08 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAAATTAAAGATCAGAGACACGTTGAAAAGGGATTAATTTTGGCTAAAAAG:1 - chr3L 17206920 3' + I-element 5286 1 67.13 TGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCCATAAATATGATGATAATTAAGTGTGTGTCTGGCACATATACTCAATTT:1 + chrX 20874374 3' - F-element 383 1 61.54 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCGAGATAAGCAAATGAATTTCAGCACTTATCATATATAAATTGGTAATCTTTTTTGCTT:1 + chr2L 10045290 3' - jockey 64 1 55.00 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTTTCTAGCTTATTTGATTATGGCAAATATTTGGGTTT:1 + chr3L 10442891 3' - roo 8749 2 77.40 CATCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCGATGGCGCGATATGCGACTGACCACAAGGAAAAAGCTGGCGGAACTGAAGCGCTGTCAACTCTCT:1 - chr2R 14847699 3' + GATE 316 1 54.35 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGGCTAATTTTAAAGTTCCCATTGCCACAGGCTCAAAATGTGACAAAAAAAAAGTGAACGGAACTTGAAATTAAACCGGAATTAAGCG:1 - chr2L 11079367 3' + 1360 3356 1 61.64 ACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGTCTGCAATA:1 + chr2R 11097408 3' - Juan 4057 1 57.24 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAGGGTAGGAGAGTGTCTG:1 + chr3R 22522729 3' + roo 9063 1 68.82 AAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAATGAAGGAACACATGCCTTGCTGGGATTGTTTGTTCAGGTCCTACATGATAATCGCTCTAACCGTAAATGCCCT:1 + chr3L 7467569 3' + Bica 233 2 52.74 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACTTTGCTCAACGTGGTTCA:1 + chr3R 19543510 3' - roo 8722 2 57.53 CGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTTTAATATTTTTCAAGATTTCAAATAGGTTGTGCAATAATAAAATAAACTTAAAAATGTAAACAGTTTACAAATAGATAGAAATACCTTGAATGAACAAAACTCCCTTGCAAGTTA:2 - chr2R 22012079 3' - opus 1 2 70.55 TGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATTCAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATT:1 + chrY 2720331 3' - 297 6638 2 73.97 CTCAGCGAATTGAGAGCAAAGGCTGAAAGAGTAAACGAGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGCGTGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTTTGCAAATGATATTGGGCCAAAAGCTGAAACTAGCCCAAATAATTAA:1 - chr2R 24187222 3' - 1731 240 1 66.44 GGTGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATTATCCGCGTGGCTAAAA:1 - chr2R 12069592 3' - Tirant 8120 2 50.72 ACACACACACACACATACATGTAGGCACCCAGCAACTCCCAATCGCACACATACGCAGAGACAAAGGCACGCACATTTTGTTTTCACCGCCGGTGTCACCGTTT:1 + chr3L 9324756 3' + Quasimodo 39 2 83.65 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTAAGGAATGGTGGATGGAAGTGATGGAGCACTCGAAGAACCCGTCGGAACAAAAACGATGCGGGAAGTAGTGGGTCTTCGGGG:1 - chrX 14346388 3' - roo 8701 2 60.27 AAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAA:1 + chr2R 21425141 3' - HMS-Beagle2 79 2 73.29 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAAATCATATTTATAAGAGCTTGTTGGTGACTTACCTACCCTATAATTTATGTCACATATATGTGATTTGGCTTGAAGAGCTTACCACTTATCTTCTGTTATTGTTAAATG:1 + chr3R 11978396 3' + Transpac 302 2 79.45 CGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGGTAATATTACATTTGAATTCCGGAAATAAATATTCCGTGGAGCCAGTCTGCCGTAAC:1 + chr2R 1394942 3' + Doc 224 1 61.00 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGGTTCACTGTTGTTTACTGAATATATGAGCAATGGAAAAGCAATCCCAGTAAAGCGTCATCTTTGGAATGTTTTAAA:1 + chr3L 21151204 3' + 412 450 2 53.79 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCGAGGCGTACATCACTCTGTCCCGGATGAGGACTTCAAGGAAAGCCTTGCTTCACATTTGCTTC:1 - chr2R 5640703 3' + 1360 3330 1 57.53 CAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAACTTGATCA:1 - chr3R 30850766 3' - I-element 72 1 65.28 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGTGGCTTGCATATTTTTATTGCATTTTGGTATTCCGCAGTGATT:1 + chr3L 14551378 3' - P-element 43 1 40.54 GAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTGTAAATATATATTTTTTTTTGAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGATTTAATAAATTATTGCGAGTCAAATTCAATTTTACGCAACAA:1 - chr3R 11813988 3' - 1360 2973 1 76.03 GAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTAGAACAAATTTTTGTAGGTAAAAGAGCTAACTACTTTCTTAATATTGAGACATTTCATTTTTTAAATATTTCTTCGATGAAATTTCCAACGATACTTGATTTG:1 + chr3R 17060554 3' + hopper 965 2 67.59 ATTATTTAATTAAATACAAATATTTTTCACAAGATCCTCATTCTTAAAGTAAATAAGTTGACCACATTTTTTAGTAATATACATGCAGTTTCTTGGATCTTATAGTCGAAACAATAGAATTGAATATAACTACCATTTGGTAATAA:1 + chr3R 18862693 3' + transib1 1939 1 60.27 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCTAGAATGCTAACCATGCACAAGGCATCTCAAATTCCAGGTGTTAAAAATAAAGTACAAATACACTAAAT:1 + chr3L 3757248 3' + copia 238 1 50.68 ATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCACACTTTATTACACTACAAAACACAAAACTGAACTCAACGCGAGATGATCTCTCCGG:1 - chr3L 3851836 3' - jockey 4859 1 61.64 TCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCCTTGAAAATTGCATTACCAGTTATGAGGGTGTTGGAAAGCAAAAAGTAAAAAGCGAAAAAAAAGGGGGGAGCCGCCGAGGCTGCAG:1 - chr2L 12832819 3' - I-element 3 1 78.76 TTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACATACTTAATGCAAAAAAAAATAACTTAAAACTA:1 - chr2R 7781246 3' - S-element 85 2 79.45 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGCAGCGATGCATAAATCATAGCATACTTAACAGGGCAAACACGCGCGGATGGAGGCTGTGCGTG:1 + chr2L 14889070 3' + hopper 1405 2 77.37 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGCCACTCGCGCAAAATTTCAATCTGATCGATTTGTGTATTTGTCAAACTGATTTATCGAGTGTCTCGATTTGATGGCGTGGAAA:1 - chr3R 22868704 3' - mdg1 7047 2 78.17 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATGGGT:3 + chr2R 22464487 3' - pogo 39 1 57.53 GAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCACCGCCCGACTTGTTGCCCAACACACACACACACACACATTCACATACACACACACAGCTGCTGTG:1 + chr2L 12896998 3' - accord 7031 2 48.39 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTGACTGTATGTATGCCTGTGTGAG:1 + chr2L 19158916 3' - P-element 48 1 48.84 CTTTCGAGATCCCCCACCAGAGGAGTCGGTAACCAGACCCATGGTGACGGAATCTCGGTCCCGTCGGTGGTTTCATTCATTTAACTATCGGTAAATACTATGTGCAATT:1 - chr2R 19528608 3' + Rt1b 446 1 64.22 AGTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTACGCTCATTAGCTTTTAATCTGTCCGCCAATTCAATTTTCGTTTTTGCTTTGTCTTTCCTTTGCACTTTTTTTTATAATTTTGTGCCTCGTCGCCAATTTGTTGTGGATTCGTACAAGCTTGA:1 - chrX 21520184 3' - HMS-Beagle2 489 1 69.66 TTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGCAGCGATGC:1 + chr2L 14889016 3' + hopper 1378 1 62.73 CTGTATGTATATATAATAAAATTTGAGATAACCTTCTTTATAAGTAATGTATTTATTATATCAGTAGCATAGTACGTTCCGTAACTCAGGAAGTTTTATTGATAAAAATTATTATCGATGGGTAAAGTA:1 - chrX 17161237 3' + Dm88 4382 2 77.52 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATCAAATTTATTGTATAACATTTTCATATATGTATCTTTTCCTTAAAAGAAAAGCATAATTGCTCCC:1 - chr3L 19574036 3' - 297 6620 2 56.30 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTAAGGAATGGTGGATGGAAGTGATGGAGCACTCGAAGAACCCGTCGGAACAAAAACGATGCGGGAAGTAGTGGGTCTTCGGGGTGTGAG:1 - chrX 14346382 3' - roo 8674 2 75.20 CCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAATTATAAAGAAGAAGGGGGAATGAAAACCACAGCTCTTTTGCAGCCTGCTTTGAGCTATTAGAAAATCTAGTAACCCCCGGC:1 + chr3R 9175286 3' + Juan 4170 1 53.42 TGGCTATTCCTAATCTATTTTCATATAATAATAATAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAACAATAATATTTTTGCATAAATTATTCAAATTTCGATGCTTTTTGTGAAACTGTCAATTGTAGTGAAAATT:1 - chr3L 18650096 3' - 1360 328 1 55.48 GTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATGCTTTATATGATCGGAAATGCAACGAATCTAGGTTACCCTCTTACTCTACGAATAACGGGTATACCAAACACAAGGTGGAAGATAACAGGTGGAAAAGGGGTCATTGTATTTGG:1 - chrX 21191212 3' - INE-1 90 1 60.96 GTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATAGAATGATTATTTAAAAAAAAATGCCTAATTTAAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGTTTATTCATATTTTGGTAATGTTGGCAATAGAAAAT:1 + chr3L 14944654 3' + G5 4787 1 50.68 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGATTGATCCGCTGTGACTTTTGCTGACGCACTTGCACCGACTTCTTT:1 + chr3L 17904902 3' + roo 9038 1 62.33 GGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAGATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGAGGAAAACACGCCAACTACGCATAAAACTAAAGAACTTTCGGGTCCAAAGT:1 + chr3R 30091475 3' - jockey 4584 1 63.70 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATTTCTAGTCACATCCGGGATTTTTCCAATTATCAAAACCAGTTCAG:1 - chr3R 5024781 3' - diver 28 2 66.90 TCGTACTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATTTGATAATCGGGGAACTCGACTACATCATTCTCTCATGTTTTATATCAAATCAGATTTTTGCGATTCGCCTGCCATGCAAAAACAATTACGCGCTTAAATGGCATACAATTTCT:1 + chrX 969459 3' + INE-1 532 1 42.36 GAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTACACAAATTGAATAAATGTAGTTTCAAAGTGTACTACTTCAAAGCGATTCATTCCTCAGATAATTGTCCTCTGATATTTTTTTAGGAGTAGTTA:1 - chrX 21636132 3' + Stalker2 376 2 64.83 GATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTGCTCTTATTTTATTTATTTATTTTAAAGACTTAATATGTTTTT:1 - chr3R 904623 3' - 3S18 80 2 71.23 AGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCG:1 - chr3L 10563909 3' - hopper 78 1 71.23 AAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACGGAAGATTCTGGGAAAACACTCTTAGGCTTACTTATGTCGACTCAT:1 - chrX 4169263 3' + F-element 107 1 68.49 GTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCTAAGAAATGAATTTACATTGTATATATTAGGGTAGGAACCAGAACAACAACAACAACAG:1 + chrY 880221 3' - 1360 3242 1 80.69 AAAAAAAAAAAGGAAAAAATAAAAAGAAAAACCTGATGCCTTCAGCTGGCAAAGGCACACACCCACCGACTGGAAATGTGGAATAAATACCGTATATGTAGCATACGATGCTGATCTCCTAGTCTCTATCTCTAATCGGTTCGA:1 - chrX 15696811 3' + Doc2-element 251 5 55.56 TCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGC:1 - chr2L 7271845 3' + 297 6892 2 78.08 ATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATATTTATTTTAATAAATTAAATGCAGTCTGGCGCATACAAACGAG:1 - chrX 4879777 3' - McClintock 304 2 70.55 TTTACTTAATAAATAAATAAATTTAAATAAAATAAATTATATCTGATTTATACGTTTGTACTATAACTTAGATTCCACTACTCAGAATAATCTGTATTAACCCACTGTCCGGGCCACTCGAGTCCGCCGCGCTGTGCTGCTGTCTC:1 - chrX 2396528 3' - copia 230 1 74.66 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGCACACAGTCATGATTTAATAGGTAAATCAGGTTGATGAGCGTTGAACACAGTGGCTA:1 - chr3R 30302265 3' - Doc 59 1 56.93 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTATTAAATATATACTTTTAGTTACTGCATTTTTGGCTCATTAGAGGTTCTTAAAATATAACTATCATGATATTAGGAGTGCCTAATAAA:1 + chr3L 18164266 3' + pogo 2074 1 65.75 CCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAAAACTTAATTGAAAAATTGACTTAATATTCCACCAAACAGCGGTTGATTCAGATCGGATAA:1 + chrX 14531714 3' + copia 123 2 57.14 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAATTAATCCAAGAGCTTTGTCAAT:1 + chr3R 24976303 3' - roo 8726 2 61.38 GTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATAACACGAACGAATGCGAACAAATTGATATGCAAATGTGAGTAGCAGACC:1 + chr3R 25409877 3' - jockey 4577 1 60.80 TCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGTTCACTTCTTCGCGTTGGAAACTTTTAACTGAATCATTATACCCCCAGTAAGAGCAGGCAAAAGCTTAGTATTAGGAACATTTGAGAACGACTTTCTCACTAAGTGC:1 - chrX 20381344 3' + INE-1 569 1 77.24 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAAACACGGACTACAACAATACATGTTTGGGTTCCCTTCTCTCTTAACG:1 + chrX 16526362 3' - 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rover 38 2 60.27 AAAAAGAAAAAAAAAACAGAGGCCAAAGAGAAAAGCTGAGACTTTGCCAAGGGTTAAGTGTATTAGAGTTGTCTCTGTTTGCCGCTCTGCTTCCTCTATATTCCCGTTGTTTTCCTCCATTTTCTCC:1 - chr3R 28973758 3' + Doc2-element 223 1 61.42 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACTTTGCTCAACGTGGTTCAACACACACTTTTGCTTTTTTATCGTACCCATTCCTCGCTCTTGACACCAAAT:1 + chr3R 19543563 3' - roo 6 2 77.40 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTCGATCGGTCTCCATTGCCCCGAATGTAAGACCTCCAACGGATGTCCCTCCTCCTCGAAGGAATT:1 + chr2L 8396944 3' - roo 8720 2 57.53 AATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTATACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTTTATTTTATCATATTGCTATTTTTAAATTGAATTTAATGAAAGGCG:1 - chr3L 15409536 3' + 1360 2972 1 79.45 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCTGACAGCGGGCGCTGCACATTATTAT:1 - chr2L 20986519 3' - roo 8733 2 67.59 GATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCT:1 + chrX 1018144 3' - 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chr2L 13717310 3' + P-element 2809 1 27.34 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCCTTGAAAATTGCATTACCAGTTATGAGGGTGTTGGAAAGCAAAAAGGAAAAAGCGACAAAAAAGTGGGGAGCCGCCGAG:1 - chr2L 12832826 3' - I-element 43 1 52.05 GTAAAAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGATAGAGATGGAGTTTTGCTGACACAAATCCAAAAGTTTTCG:1 + chrX 20849965 3' - blood 170 2 52.13 GTGTCCGCATTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCATGAGATAATCGTGCTAGGCGATGCGGATCTTAACTCTTCAATAGCTTCCGACGCAGTGTCCGAGGACC:1 + chr2L 2366795 3' + 1360 472 1 53.42 CAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAACGATGAAAGTTATAACGAGAATCATGAACTCAATAAAGTAAATAAAGCAAGACAGGAAGCAGGAATTATATGAAATAAA:2 - chr2R 12813656 3' + roo 9031 1 45.21 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAAGGTCGCTCTGTCGATGTTCTGGAATTGGGGAACAAGGGTATCGTCTGCACCGAAATG:2 - chr2L 8396841 3' + roo 344 2 60.27 AATGAGATTTATTTATTTATTATGCATTTTAATATCTAGGACACAAACAAATATAAATTTCTGACAGTGTAGAGGCCTGAAAAGTTGAAACTATGCCGCGTAGGCGACGTGGCAATGGCATCTGCCCTTTCCCTGGATTTTGCGCA:1 + chr2L 1615540 3' - G3 347 1 64.38 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATAAACATTTTACATATGTTGTGCTTTGTAGTAGATATGTGAATAATACACTGTATTTGTTGTAAACTGAATGCCAATAAAAGGTTAATTTTAATGTGAGATATATTATCCTCAAAA:1 + chrX 17510739 3' - roo 8669 2 52.05 CTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAATATCCTGATATTCCTGATCAAGAATATATACACTTCATATTGTCGGAAACGTTTCCGCGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAAGGGGAATAAATATTTATATATAACATTTCAAT:1 - chr2R 5374749 3' - INE-1 148 1 44.52 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAATAAAAGATGCAATAAATTGTAGCATACTTGAGAGCGGTCGCAGTTAATTTCTTAGCCTGCCACCTACGACCCATTGGA:1 - chr3L 15853474 3' + jockey 4968 1 51.15 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGTGTAAGGGACGGA:1 - chr3L 10563870 3' - hopper 39 1 58.90 GGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGC:1 - chr3L 3757166 3' - copia 89 2 79.45 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTGGCCGCCCCGTTGGATGTATGTAGATATGGATATTGCCACG:1 + chr3L 20399120 3' + roo 390 2 69.01 TAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATTGTCAAATTCCAGGCACAATATTACATGAAATCTACAAATAAATAAAT:1 + chr2R 14722754 3' - mdg1 73 2 65.75 ACACTTTTACTTAAGATCAACATCATCTGTTTTGCAATTACAAATTTAAACAAATCCAAGTGATTTCAAAAAGCCACAATGCTTTTGCTTACTTAAACCTTATGGGAAGAAGAAAATGTAATCAAATTGAGACACTTACCTC:1 + chrX 2957442 3' + frogger 203 1 71.13 CCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAAGACGGCGGCAATTATGAAGAAAAAAGCGATCTGATTTTCCTAAGCACGTGACCAAAACTAATTTTATTTTCATTATCCAATTGCATTTCCCCGCACCTAATCCCC:1 + chr3L 1915928 3' + mdg1 494 1 51.03 ATTAATTGTATTTAATAATATTGAAATTACTTCCATATACGTATATTTTCAACTACAATTTTTTTGAACTAAATAAAAAGAGCCATAAACATGTGGGCAAAGACTTTTTTTTTAGTTCTCGTTTCGATCGCCTGACAGCCGTTAAT:1 + chrX 12243348 3' + TAHRE 72 1 74.66 ATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTCATGTCCGTATGAACGCCGAGATCTCAGAATTATGCAAAAGCACAACGAATGCAAATTGAATTACGCAGAAAA:1 + chrX 15557020 3' + INE-1 86 1 58.72 AAACAAACTCAAAAAAAAATAAAATATTTGTCTGCGTTTGCCAGTATAAATTAATATTTTGCATTTTCCATGAAAATATTTAGATAAAGGAAACAAAAATAACACTGTTTATTCATTGTTTCGGGCCTTGCTGCATGACATAAAAT:1 + chr2R 18897844 3' + gypsy2 425 1 86.30 CTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAATTGCCTCGCCGCAGAGGAACTCGAATTAGAATGGAAAATAATTGCAGCTGGCGCCGTTTCAATTAGGTACG:1 + chrX 5800499 3' + Juan 4144 1 51.37 GTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTCGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCACCCTATTTTG:1 - 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chr3R 10461635 3' + roo 397 1 71.05 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTAACGAGCTAATAAACCGCTCATGTTACAGATATGTTTGGCGTTAATTTTTTTATATGTACATCTCAATTATA:1 + chr3L 13827495 3' + roo 361 2 53.42 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCTTAGAAGTTACTATAATTAAAAGTGTTTAGGTGGCTTTACTGCGAATAGGAGATCACTTCGATAGATGGCGCCCGC:1 + chrX 19585317 3' + Transpac 5187 2 58.90 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTGTGACTGTCTCTCT:1 + chr2L 18213220 3' - roo 8718 2 57.34 GCTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCACAAGCAAAGTAATTCAATTTCCCGGCTTACAGCTCTTTTTTGGCCACTGGTCAACGGAAGAGAGAAGAAGGG:1 - chr3L 3565296 3' + gypsy 7426 2 49.32 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTT:1 + chr2L 11867384 3' - jockey 26 1 60.95 GCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTACATATTTTCGTGTATATCTTTATAATAATTTGTTTGC:1 + chrX 20124561 3' - opus 69 4 74.42 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCCGCGAAGTGGCAAACGTCAGTCAGTACTTCAGCCATTTTCCAACTAGAGCTCCAGTTAAAGGAGCAAAGAACTTGTAAAGCAGAAAGTAAGAAGG:1 + chr2R 9410594 3' - hopper 23 1 67.12 GCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATAAATTCCCAGCCATATTGCTGCGTACACTTACGTCGTTATTTGCACAATTCTTTTGTACGCTCTCA:1 - chr3L 19335325 3' - invader4 2811 2 54.11 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGATTGCTCTATATCTAATCTCGTTTATCACGATTGT:1 - chrX 19113473 3' + 412 7495 2 55.97 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAATAAAAACGCAGCTCCTCCTGTGCACGAA:1 - chr3R 25843378 3' + I-element 5280 1 76.69 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGGCCGCTTTTTCCCTTTTTCCCACCATCACCCCCACCATTTTCTCGCCCCTTTCCCTGCTGTTTGCTCAAGTCTGTGTTTGTCCACACAGAGGGAACATAATTGGCCATATTAT:1 + chr2R 18983903 3' + hopper 1411 2 75.86 GCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATGTCGGAGCACAATTATTATTTTCCATTTCGCGCAGCGAGTTTCGAACGCACCGAAGATTAAATTGCAATTAAATCACAAATCATATATGTCTAAAATATGTAATAAT:1 + chr3L 23529727 3' + Stalker2 7487 2 65.00 AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATGAACATATATGAATATATACAAATAAGCTGTCTCAAAGCAAAAGCTAAACAAAAAA:1 + chr3L 14709008 3' - opus 7066 4 65.52 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACCGATATAGACGCATTGTTGCGTGGAGATTTATCATTGATTGAGGCCATGAAATTTACACTTCAAGTGTC:1 - chr3L 12899742 3' + roo 9019 2 52.05 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGAATAAATCA:1 + chr3L 14084949 3' + opus 7461 2 64.22 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAATCTGAACAATGGGATTGGGAAAAGCAAGTAATTTATATAATGCTATTATAAGCCAAAATAATAGCTTTATTGATATCTATGCATAATCGCAATTTACAA:1 - chrX 10823883 3' + pogo 2087 1 69.93 AGAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTCAGTGGTTAGTGGGCTTCATTCGAGAGGACTGCAGTCGTCGAAACATTCGACATTAGAGAGCTGCACATTTAAGATTTATGCCCGGAAAGAGGGGTATCTGGATCTGTT:1 - chr3R 30262808 3' + mdg1 7070 5 75.34 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTCCTTTTTGCCGTTCTCAGTTCTCAGGCCCCGAAAAAAGGCTTTTCTAGCGAAATTCGCTGCGCCGCCGAATGT:1 - chrX 8760067 3' + roo 9024 2 52.74 TCTTGATCAGGATCAACAGCGGAGTCGACCTGGCCAAAGACACTGGGTGGCTCTAGAGTGGCTCCAAGTTCTCTCGCATTTTTGTTCAAGAGCGAGAGAGATTAGAGCTCTACAGCGAACATCTCTTTTCTACGCATACAGTGACA:1 + chrX 3464216 3' + INE-1 88 1 60.96 GAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGACCGTTAGGCATCTTGGCATTTCAATGTCTTTGGACGAACCTTATCAGATCCATTGGACACCGAGGATATATCCTACAG:1 - chr2L 6956176 3' - 1360 40 1 53.10 ACAGAGTACGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGAAGGATTAGCTCTTTAACAAAGCCAAACAATGAGGCATGGCCAGTTGTACGTACGTATGTATGTATGTATCTGCCGGGCTCATAAAATAC:1 - chr2R 16807800 3' + baggins 4970 1 53.42 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACAGACATTGACAACGCACTTGTCGTCGTTTTGGGCGTGTTTTATGCACTTGTCGCGGCTCGTTGCACTAAACAGTTGCCTCAACATGGCCAACAAGTTTGTTAAATGTCA:1 + chr3L 815066 3' - hobo 11 1 76.55 GACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTCGAATGCATTAGCAATTTCTA:1 + chr3L 18738134 3' + Bari1 1645 1 71.54 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGACT:1 + chr3L 10564010 3' + hopper2 1564 1 54.11 ACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTGAATCTCAAGGTTAGAAAACCATAATAGATACGTCATAATCAGGCCTCAATAGAAATATAATTGAGTCTCCCGCCCATGGCAACACCTTATACGTATTCACACCTCAACTT:1 - chr2L 6753641 3' + pogo 1880 1 78.77 TGGAGCCACCTCTAGAGCCATGGCGAAAAAATAGTGTGCCAAAAAATCGTATAGCGTTACGCATCTTGTCTTTGGCACTACCTTGACTCAGCTTTTTAGGTCGTTCATACGGACAGAAAAACGGACATAATAGTCATGGTTAAAAT:1 - chrX 6757160 3' - 1360 64 1 59.59 AAAAAAAAATAAAATAAAATCGTGTCAAGAGAAAAACCCGAAAGTGCAAGGGGTGGACACTGATAGGCAAATGATGCAAATCACGAGCGGATTTGATTGATGATATTTCTCCCATCAAAGAAGCCGGATACTGGCATGCTAATGGG:1 + chr2L 9562056 3' - transib1 1898 1 63.01 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATGATTTTCTCGCAGTGCAGACTATG:1 - chr3R 24976174 3' + roo 9043 1 63.45 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTCCTGAAATTGTTTGCCCTCCTTAAAAGTATCTATTATTTTTTTTCAAGATAGAAAGAGCATCTCTGCCGCAAAA:1 - chr3R 31650292 3' + pogo 2073 1 60.16 ATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATCTGCATTTTTATTTGTGTAAAATAGCGGGGAAAATGACAGCTATGTGGGTGGCATGACATTGTTGTGAGACTCACGGCTTTTGTTGCACTTGTTGTTATTGCTGC:1 - chr2L 18300704 3' + Ivk 5372 1 78.57 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAAATACGTAGTGGAAAACGAAGATGCTGCGTCGTCTAAGTCAGACTCAGAAAATCAGGG:1 - chr2R 3188668 3' - 1360 65 1 63.01 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAACAAGTCCATGTGCAGTCATTTGGTTGTGCTTGGGTCTTTTTTCGAGGGGAATGTA:2 - chr3L 3339336 3' + Transpac 247 2 60.96 CAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATATTTTAGAGCGTTATTAATATTAGGCAAATATTTGGGTTATTGATAGAAATATTACAGCGAAGAATTTCGATATTACTCTAGCTTAAAATGAAA:1 - chr2R 9455788 3' + 412 7523 2 69.66 GCCTGTGAAGCAATTTAAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATTTTTCAATACGCTTTATCCAATTTCACCACTCACGGGGGAAACGAAAAGCGGAAAACGGAAAACTCCTAGGACTCCCC:1 + chrX 2755348 3' + accord2 7231 1 66.44 TAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTATGTTGCAAATGCATACTATAACAAATTGTTA:1 - chr3R 10137022 3' + I-element 5268 1 76.55 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATTTTACTAAAGATATGATTAAAAAATGCTGAACATATTTGCATTATACATATATCATTACAAATAAATAGTCACTATATTCATTTTAT:1 - chr3L 15277579 3' + I-element 5317 1 60.96 ATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGCATCATAGATTTTGTTAAATATTTTTTTATAATTTATCTAGATATATTT:1 - chr2L 14480436 3' - Transpac 4988 2 66.44 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACCAGTTATAAGCCACCTTTCATTCCAAGCAGACGTCC:1 - chrX 12003876 3' - P-element 2 2 78.40 ATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACCACCAAAATTATTGGAATTGGCACAGAAACCAGATTTTGTTGAGCCTGAGCCGTGGATATCTGTA:1 + chr3L 19388860 3' + 412 7255 2 55.48 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAG:1 + chr3L 22884036 3' + roo 355 2 54.11 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTACTTTGTCGTCTTCCAAAGCACTGACTG:1 - chr2R 7899136 3' + roo 8991 2 80.45 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAACATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGTATGTGTGCGTGTGTCGATGTATTAAGTGGAAACACCTTGTAAAATGGCTG:1 + chr2L 12847294 3' - 412 68 2 64.14 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCATTTCCTCTTAATGGGTCAATATTATGTGCCCAACTCTTACCTGATACACATCATCAAGTTTGAAATAAATTGTAAGGTTTGTGCTTAAATGACGACTAA:1 + chr3R 5215054 3' - FB 22 1 69.86 CACACACACACACACCTTCACACAAAATGCCACGCACACCAGTACACACGCACACTCTATAAAGCACCGTTGCACGGAAGTACTCACAAACACACACGTGACGCGTTTGCATGTGAGCACCTGAAA:1 + chr3R 22476446 3' + accord 188 2 66.67 TAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTACCAGAAAATTGAACGACAAGCTATAAAGCCGGAACTTTACGTTGGACAA:1 - chr3L 381714 3' - S-element 62 1 63.77 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGTCGGCAATACAAAATACGAAAAGTTATGCAAAAATG:1 + chr2R 11097435 3' - Juan 4030 1 77.24 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATAAATTATGGCCGCAAAGAGCGAGAAG:2 - chr3R 16228854 3' - P-element 92 1 19.18 AGAGCGTATACTAAGAAGCCAATGTAGACTATTGGCTTTTAGTGTGTTCTTTTTGCCTCGACGTGTCTACGCCAAGTGACGAAAGACATCATATCTTTTTTATTAACTTGACCTTTAGGACTGAGCATGTGGGTGGCTT:1 + chr3R 10238816 3' - Fw2 3472 1 56.83 GCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAACAAAAAAGCTTAGTTCCTGATTCCTTAATGCGTTATTGACAAGTTGAATTGTTACCA:1 - chr2L 9553528 3' + F-element 480 1 70.55 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATAAACGGAGTGCTACTGAAT:1 + chr2L 8707525 3' + 412 7481 2 62.33 AGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCCCTTGGGCTGGCTACTTCCTCGCTTCCCTCTCCTTTGGCTGGCGTATATAAATGGCAGAATGTTTGTGCATT:1 - chr2L 18178252 3' + Tirant 391 2 72.90 CTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATGAAATTGATTTTGCGTTCTTACCGGCTACCACTTTATTATCCAAATACCTGGAAAGTCTAAAGTAATGTGATTTACATACTGGCGGTCATCATCGAAGTA:1 + chr3L 22709468 3' + 412 7526 2 70.34 AATAGGCTCCGTGTCGTCTAGTCGAGAGCTGCACGTCGTGCTTTTGGGCTCCCCTGGTACGTGACAAACAAGGTAATCGAAAGAGATCTGAAAGTTACCCCTCTTGGGGATTTAAGTAAACTCACAGAGCAAAAAATTCAATCGTA:1 + chr3L 14339774 3' + G5 4432 1 76.03 AAATAAAATCTTTTAAATATTATTTTTATTTCTTGACAATTGTTTAAAGGAAAAGTTTGTATTTCCCTTGAATTAGCTCACAAGAATGCACTGAACGAGGCTTGACTGTACTTACATACATACACACCCTATTTCATCCACATCCA:1 + chr2R 22674031 3' + jockey2 3231 1 58.22 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATATTATTATATATAATATTGTACATACTATTAAATAAACGTTTGCTTTTTATATGGCCTTGGTCACATCACTTTTGTCAGTCTGGTCACACTGCC:1 + chrX 9437318 3' + roo 9046 1 68.49 TTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 50 1 71.92 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGACACTCCCCTTTTCCCCTT:1 - chr2L 9319088 3' - jockey 74 1 60.96 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCCATACACACATAGAGAGTATTACGAAAATCATCGAGCGGAAGACTAGAAGGGTAACACTACTGGA:1 - chr2L 6755725 3' - pogo 54 1 56.85 AAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGAA:1 + chr2R 16073005 3' - Burdock 75 2 73.97 GCTTCCTTCTGCTTGTTACATACTTTTTGACGAATCTAATATACCCTTTTACTCTACGAGTATATGAAATGCAAACATCGAATTCGGCTTGACTTCGAAACTTTGCCATATGATTTGATATTTTCGAACACTCGCGAAGAAAATTT:1 + chrX 17247833 3' - INE-1 29 1 76.03 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCGTCATCGAATGCTGCTCTAATTTGCCATTGTATTGCATTTAGTATTGAATTTATTACGTTTGTCCACACACATGT:1 + chr3R 8922013 3' - FB 31 1 58.46 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAGCAAAGTTCATCGCTCCAAATGTTTATGGCCATATAGGCTTATGCGCATTTTATGCGCG:1 + chr2R 20739097 3' - hobo 60 1 61.27 GAAATTAATTTGTAAATTGCTTTAATGTAATACAGGTTCCACTTCCATTCCAGTTTGCTCGCCGAAGTTCTGGCTCCACATTAACGAAAGTTCCCATACGCTAAGCCCCATCCTTAAGTCCCCCTTTTCTGGATAAACCCCCTTGG:1 + chr3L 12283783 3' - Juan 233 1 86.30 GTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTACCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTT:1 - chrX 14317416 3' - 1360 168 1 67.81 TTGATTTCGGCTCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTATATTTCTTGCACGGGGTCAAGAGGTCAGATGCAGAGAGTAGCTTTT:1 - chrX 20353579 3' + 1360 3186 1 72.60 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACTGTACAAGTTACTGCGAGTAAAATATGACATTTTTATAGAGTTAGATAAACGCAGGAAATATTTTCCTCGAAAACGCTTATCATATG:1 - chr2R 8452712 3' - blood 7047 2 60.96 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTTTGTCAAATTAAGGCCTTGTTGCTCTGGGCCTCAAGCTGTTCATCAGGAAGGCCCATACTCGGTCATTATAACGCCCCGTTCAT:1 - chr2R 9410427 3' + hopper 1382 1 63.70 GTAACAGGCAGAAGGAACCGTTTCCGACCTTATAATTCTTTTAATTCTTTAATTCTTTTAATTCTTTCGGAATAGTTAGAGCACCATCTTTATTCTGATTCGCAGCTTTCGGAGTTGACCTCCTTCAGACCTAATTATATTCGTTT:1 + chr3R 3854500 3' + INE-1 32 1 61.64 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCTTTTCCTTTTTTCCTTCC:1 + chr3R 6412093 3' - Tirant 8117 2 76.80 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTCGATCGGTCTCCATTGCCCCGAATGTAAGAACTCCAACGGATGTCCCGCCTCCTCGAAGGAATTTA:1 + chr2L 8396946 3' - roo 48 2 54.29 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATGCCACAGCGTTCCACTCCCCTGCTGGGACTTCTCGCCCCCGTT:1 + chr3R 17210158 3' - HMS-Beagle2 8 2 78.32 AGACAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATATAATTATGAAGTATTATGGTATTATAAAGTATCCGATTCCACAAAACATTAGAGAGCTTCAAAGTTTTCTAGGCCTCGCCGGCT:1 + chr2R 2879977 3' + TLD2_LTR 149 1 91.78 AAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1639 1 69.63 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTAGGCGTATTGTTTGAAACAGAAGATTACCCATTGTTCGAGATCGGCAATTAAAA:1 + chr3R 25718273 3' + I-element 5292 1 60.96 GTTTTTTTATTTTTTTTTTAATTTTTTGCAAATTCTGCGGCGAAAGTTGATCGGGCGAAAAGAGATGGAGAGCGATTCCCGTGCCGAAATCCCGAAAAAAGGCAGAAAAGAAATGCACATTTATTAGAGGTCTGGGCATGCTGGGG:1 - chrX 1166164 3' + hopper 152 2 80.82 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATCGAATGCAGCTGAGAATTACAAA:1 - chr3R 12622240 3' - 297 6613 2 74.44 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTATGCGTGTGCATATGTGTGGGTGTCTGTGGACTTAGACAATGAACCCAAGTGCAATAATTAATGAAGCAGAGCAAATCGAGGGAGCTGTAAT:1 + chrX 5145972 3' - hobo 27 1 64.38 CTGAAACGAAATCTTAGGCTTCTGGCTACACTGGAAGTATTTATGGCCGCTGCTCCATACAAGCGGAACAGAAATATATTTATCGATATTTGAATTCAAACTGTATTCTTCCATAATTTCCTTAACGTTATTGACGATGTTCTCGC:1 + chr2L 22983852 3' + Transib5 2926 1 47.95 AAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAAT:1 - chr3L 24213777 3' + invader2 173 2 68.49 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTCACAGATCATTTTATTATAATTACTAGAAACCGATTGATTAACTGGTTGTTAAACTATTGCCAATC:1 - chr2R 17187735 3' + roo 355 2 53.42 AGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCGGCTCCTGGCGACGCACAAAAGTATGCAGCACAAGTTGCGGAC:1 + chrX 7031671 3' + hopper2 1534 1 66.44 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACCACCACCCCCCCCCCC:1 - chr2L 14858820 3' + 412 7487 2 85.42 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATACATATGTTTATACTTGAATATATGCAAACGCTTTTTTGGCTTCGATTTTCGGTTCTTTTGGCGTTCTGCAAC:1 - chr2R 6713823 3' + 297 357 2 60.69 ATGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATCTTGAGTCTTGAGTCTCTGCTCCCATTTCCCTTCATTTGAGACATTGCCTAATTAGACTTCGCTTTCAAGAGGTTCGC:1 - chr3L 16703760 3' - FB 44 1 55.48 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGTGGCCTTTGTTTAGCGTTTTTCGATTAACTTCTGCGGTTGGGTTTCCCTCTTTTTTT:1 - chr2L 14490109 3' + P-element 2841 1 47.24 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTATAATCACAAATATATTAAATAAACCTCACGGACTGTGGCCTGTGTTGCAGCTGCGTCCGTGTCCATGTGGCATAGTTGCGCTTCAGGTTTGATTAAAAATTC:1 + chr2R 9455971 3' - 412 16 2 74.66 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGT:1 - chr3L 5179170 3' + P-element 2795 1 21.23 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACTGCACTTGGGGCTGAAAGTGCGTTCCTTGTCTTTGGCTGCCAAAATCCCACCTTCGCAACGAACCAATTCTAATGCGCTTAATTTTGAACAAAAGAGC:1 + chr2R 16510372 3' + roo 9050 2 65.07 CCCAGACCCCAAGGTTCGACTGGTGCAGTAACAGGCGGCAGTAAGAGAGAAAAGAACCGAGTCAGGCCGTCTAGTGAGCACCCTTCCCATTGGGCTAAGCCTCCACCTGAACTGCCAATCA:1 - 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BS 4971 1 73.97 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATATAATCAATATAATTATAGCATAACAAAGTTTAGTGACACACACTTTGAGATCTGCGTTCAATACTTGTTGAAAAGTTGG:1 + chr2R 9092080 3' + 412 450 2 55.48 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATGACTTTTCCGCCGCGCGAAATTAACAGCTCATGAAATATGCCCTGAAATGTATGCAACGCGCCATTGTT:1 + chr2L 11922969 3' - jockey 4804 1 49.29 ACACACACACAGACACATTGCGAAGGGAAAAGGGGGAGATATACACATATAGGG:1 + chrX 2914135 3' + accord 258 2 92.59 GTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACACTGTTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATATATATATCCGTCGATCTATTTAGCTCGATAACAGGTCGAGCAAACGTCTAGCAAATCTTTATAATAGA:1 + chr3L 2191882 3' - Stalker 7158 4 55.71 CGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATAGAATGATTATTTAAAAAAAAATGCCTAATTTAAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGTTTATTCATATTTTGGTAATGTTGGCAATAGAAAATAAAAAATCTTTACCCCTATGTCTGA:1 + chr3L 14944678 3' + G5 4812 1 64.38 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAATA:1 + chrX 17027964 3' + roo 9030 1 56.15 CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCATAGTCTAACCTGACATG:1 + chr3R 4422016 3' - 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invader4 2674 1 69.86 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTGTATTTTAATATTTTGT:1 - chrX 9437167 3' - roo 89 2 54.11 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTTTTTAATTTTTCGGCGAGAGTGAGAA:1 + chr2L 7271902 3' - 297 63 2 79.20 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTAAAGTTTTCCTTCGCACTAGGCCAAACTCCGTTTTGCGCCATCTATCGCAGCGCCGCGGAAGCTGCGCATT:1 - chrX 20636918 3' - Quasimodo 28 2 60.94 AAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGTATTCAAACATAAATTGGCCAGAAGATAAG:1 - chr2R 5070882 3' + Doc2-element 226 1 50.68 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAAGTGTTTTGGGGGTGGTGCAACCGATAAGTAGAGTTGGGCTTAAATCGATCCTAACCTAATCCGATCTCTGCCTTACCCAAAACGAAGTCAAAGAG:1 + chr3R 29516608 3' + I-element 5331 1 66.44 AGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCCCTATTGAAACTCACATGCACAAAATAATCGTTTCCGATTGACTTTACCCCAATTATGTCAAATCA:1 + chr3L 3565455 3' - gypsy 7002 2 72.41 CTTCTAATCTTCCAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGTGTGGAATTATGAAAGAATATCGACTTAATTGATTTCAACTAGTAAACTTTGGAATATCTCCCT:1 + chr3R 18491361 3' - Burdock 6274 2 56.16 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAATAAAATATGCGTTT:1 + chrX 17027976 3' + roo 9026 1 58.22 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACACTTGAAACAAAAATATAATCCGATATTTGTTTGGACTAATAA:1 - chr3R 4661943 3' + roo 330 2 72.60 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCACTTTTATGTAACCTTATTTATTTCATATTCTTAAGATAAGTTGCATTTTTTTATCCAATGCTTTTTTTTTATCAGAGTTTTATGTCCATTTATTTGTTTTATTGTCATCA:1 - chr3L 18792361 3' + roo 400 1 77.40 AATTTGTCTTAATATTTTTGATTGGTAGCGTTGTAGAATCTCAATATTTGAGTTGCTGGCAGTACCCCAGAGCTATATGCCATAAGTCCATTCGCCTTCGCGCACAGTCATGGTGCTAAAACGTTGAACAAATTGTGGTGCGACAA:1 + chr3L 2105483 3' - G4 3497 1 61.64 CGCGTGGAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAACATCGAAGTGATGTGC:1 - chr3L 20176753 3' - gypsy 72 2 67.12 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCGAGATAAGCAAATGAATTTCAGCACTTATCATATACAAATTGGTAATCTTTTTTGCTTCGCTTGTCGGTGGCAAGGGAGAAGTTTTATTGTTTTGTTTTCGGAAAAC:1 + chr2L 10045339 3' - jockey 20 1 74.66 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAACTATTCCGCATTCTAAATTGCAATATTCGATGCACGCATAATTGGAGCTATTGATTAAATCGGCCAGAGGGCGTGCGTGCCACCAATGA:1 - chr2L 14888893 3' - hopper 27 1 65.75 GGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCAAGATGTGCTTAAAGTAGTTGATGGTTTAATGCCTAACGAGGTAGATGACTCCAAAAAAAAAAGGAGAGATTGAAGTTAGAGAGCGGGAAGTG:1 + chrX 20770418 3' + copia 467 1 74.66 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGGTTACTCATGTGCACGACTTCATTCATACATACATACATATACATATGAATGGGTATTCTCATGCGGCTATATTGTACCCT:1 + chr3L 3027893 3' - hopper 37 1 60.00 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCATTCAATATTCTTAATTTCGGATAAATATTTTGCTAGGATTATTAATTGAAGTGTAGTGGAATGTCTATGTTCCTTAATTAACCTTAATGTCTCGAAATGC:2 + chr3R 12610132 3' - roo 22 2 68.49 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGTATGTGTGCGTGTGTCGATGTATTATGTGGAAACACCTTG:1 + chr2L 12847283 3' - 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hopper 167 1 54.11 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTGAGCGCCTTTATGGCTGCTTGACTATCAGTGATATTTGACTAAAAATGCTGGAATATTCTTTATCGAAGCACTCAGGCGATCTAGCTATTGATGACTGTCCGTCC:1 - chr2R 4330703 3' - copia 16 2 67.59 ATATATTTGTATAAACAAAAATCGGGCAGGTAAATCAGTTTAACAAAAAGTATGTCTATATTTTAGACATACATGCAGTTGGTGCGACCTCTTGGCGGTTTTAAC:1 - chr3R 26215708 3' - Tc3 1495 1 61.90 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAACTAAAGTACTTAGATAAATAAACTGGGACATTCAGTTTATAT:2 - chr2L 20556431 3' + 412 7470 2 71.23 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCGTCCCATTAGGACCTTTCCGCACGACAGGCGTCGCCAGTCGGGAATTAAACGTGTTTTGCTCCCGT:1 - chr3R 19639727 3' - 412 57 2 58.90 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTATTCCTAGAATCGCATTAATATTTTTAATCTGATTACGATGTGGAAAATAAAGCAAGAA:1 + chr3R 30782614 3' - pogo 57 1 59.59 CCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGATTTTTTCCAAGCTGCCGGCAGTGAGCTGCGAATTGCAATTCTAAGCAAAATATCGGTCATCAGAATACAGTTTTACC:1 + chr2R 14147951 3' - R2-element 3311 1 52.74 TCGCATTCACACTAGCTGAGAAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACACCAAAGTAACAATTTTAGGAGGATGACTAGATAAATCGATTTTATTTGTCTATTTAAACCATGTAGATTCGCTATTCAGATCAATCGACCTTTGGATTG:1 - chr2R 6964353 3' + INE-1 532 1 71.23 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCTAGAATGCTAACCATGCACAAGGCATCTCAAATTCCAGGTGTTAAAAATAAAGTACAAATACACTAAATATTTCGGCACGAATAAGTGAGTGGCAGGTATTTATGACCTTTT:1 + chr3L 3757291 3' + copia 249 1 79.17 ATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGCTATTCATTTAGTTTTTTTTCACTTATGTAACTTAATATGACCTCTTATAGTATGTA:1 + chr3L 23702300 3' - G4 17 1 64.38 TTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATTTATTGATACCATTGTCCCTATATATACAAATATTGTTGCGTGTAAATGTAAAGTTAA:1 - chrX 16479763 3' + 297 6920 2 67.12 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGGGTATATTGCAGATCCATAGCTTGGTATTCCCTCTTGTTTTCAATTTATTTA:1 - chrX 17510601 3' + roo 339 2 63.70 TTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTCATTTCATTTCACTTACGAGGCGTAAAAACAAAATCAAGGATGAATGCGAGAAGTGGAAGGAGGAGC:1 - chr3R 15683475 3' + McClintock 135 2 55.17 TATCAGATACCCGTTATTCAGCTAGAGTGAAAGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTTCTGAGATATCGATAGATATTGAGGAATAATGTTGTCGTGTGACAAATCCTTGCAATTACCGTAATGCCAGC:1 - chrX 5264368 3' - INE-1 546 1 67.44 AGATTTATTTATTTATTCTATGGTAACGAAGCCATGCTAAAAGTTCTTTTTTAAATTCAGGGCAGTTACTAATTCATATGCTAGTACAGTATTCCTACTAAGAAGATTGCATTATTTTCTAGATTTAGAAACCGATTTCTCAATCT:1 + chr2L 16948512 3' - Doc3-element 81 1 71.23 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTTGTATTCACAACTTTGAACACTAACATTTAAGTTATATTGCATTTAAGAAAGAAGCCTTAAGAAAC:1 + chr3R 5762045 3' + roo 9018 2 55.48 ATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCCAATGGGAGGCACCCAGGG:1 + chr3L 18738159 3' + Bari1 1693 1 65.00 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAACTTTGAGTTGTCACTTGGGCAAGAGAACTAGAAAAACTCAGTGCTCGCACGTATGTCACTGTACGTTTGTCTTGACCATGGCACACAAATGCATGCGG:1 + chr2R 7899242 3' - roo 8686 2 69.66 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCTGACAGCG:1 - chr2L 20986537 3' - roo 81 2 79.14 ATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATAATTAGAAAGCTCCGTTACTGGAAAATCGGTTTAGTGGGAACGGTTGCTAGCTATTTTCATATGCCATGAAAGTTTCTCCACCAACACGACACCTACAACTT:1 - chr3L 9974367 3' + Burdock 270 1 68.49 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTTTCTAGCTTATTTGATTATGGCAAATATTTGGGTTTCTTTTTTTTATTTTTTTTTGTTTAGTCGCCTTTTCTGCACCATGCATAAATTATGGCATATTTATTGAA:1 + chr3L 10442957 3' - roo 8680 2 68.49 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTAATCGATAGGCATTGTTTTGTATGTACCTTTTTTAAAATATTCTTTATCAAATCAACTGAACCTTATAATTACTGT:1 - chr2L 17957146 3' + blood 336 2 56.85 ACCAAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACCATCTACGTCTCGTTTCGT:1 + chr3L 9519654 3' + roo 9017 2 52.05 GCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGATTTTCGCTTTTGTCGGATGAACTAAAGCATGAAACTGAAACACATATTCGCCCATATTGTTTGTCCCT:1 + chr3L 14280380 3' - FB 53 1 54.11 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAGTAAATCAACGCAAGTGGAATAAAATATTTTAAATAAATGATAATATTTCATGAAGGCAATGGCCAGACTGGCATTCACATGACCCTGCAAGAATGTGAGAAA:1 + chr3R 23539551 3' - hobo 15 1 73.97 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCA:1 - chrX 16526291 3' + P-element 2833 1 33.93 AAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTTTTGGCCT:1 - chr2R 9504190 3' + roo 9032 1 54.93 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACTTTGCTCAACGTGGTT:1 + chr3R 19543508 3' - roo 59 2 58.62 GCGTACGTTTTCTCGCAGATCAAAATTGTGACTGACTTCAGCTTTGGCTGTAATCACGCCATACGATTAGTCTAGCATAAGACGTAATCTAAATTGTATTTCAACAAAACCCGATTAACACGATTTCAAGACTCGAAAATAAAGCC:1 + chr3L 2545874 3' - 3S18 6017 2 59.59 CGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTTTAGTAGTGATTGCTAAAGTTTTTATAGATGAAGATTAATACCGCAGACTTGATTGAAATTTTAT:1 - chr2L 11442895 3' - G-element 4164 1 50.77 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGNATTACNTTTGCCTTTGTTCAGGGTATTCCCAGCTCTTTGCTCTTT:1 - chrX 5366162 3' + pogo 2068 1 59.00 GGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGTTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTGCGCATTTTATTTTCCACTTTGCTTGTATT:1 + chr2L 16385311 3' - I-element 89 1 78.08 CCACACACACACATACACACTTTGCCAACCCATTCCCATTTTCCAGCTACACCTGTTTGTTATTGCGGCTCATCATCTTTCGACTGGGAAACGAATGCCCCCAGTTTTCCATGGCCATTCTTTTGCCCATCCGAGTGCCAGGTATG:1 + chrX 7460685 3' + accord 256 2 74.66 ATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCCAGAGATATGCCATAAATTCGA:1 - chr2R 22287413 3' - jockey 4835 1 56.16 ATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTTAATAGTTAAATTAATTTGTACCCTTAAAGCTTTAACTTTATACAGGAATTTTTCTGAGCGGAAAACGGTTGGAAAAATGTAGCATAAATTTACAGAATGTAAATTTCACACTAAT:1 + chr2R 18984929 3' + hopper 83 1 56.85 TAAATAAATAAAATAAAATAAAAATATATAAAATATTTCATAAAACTATGGTAATTTTCATACAAAAATGCGTTGACTGTCATTTCACTTGCTTCTTCATAATGTATGAATGCAATTTTTATGCCCATTAATATAGACATTTGGGT:1 - chr3L 14334752 3' + HeT-A 1 1 76.03 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTCTCTCA:1 + chr3L 5179208 3' - P-element 90 1 23.97 CATTTTTTTTTTTATTTTTGTTATTTTTCATTAATGTACTTCTGGCATGTTCACGCTCTGACGCCTTGGACAATCATAAATGATATATTGCCAGGCGTGCAGCTGGGAAAGTTTTTTTCAAAATTCAAGACTCACAAAGTCGCAG:1 - chr2R 21418183 3' + hopper 142 3 76.55 TTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATGTATCCTATTCATTCACACTTCAACAACTAACTATAGAGCCAAATACGTCAGATATTAGCCAGATGGGTGC:1 + chr2L 5711026 3' - HMS-Beagle 43 2 48.63 TTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAATCCGAATTCAATTTTTCAATCAATTCAATGAATGAAAATAAATAGTTAGTTCAAGATGA:2 - chrX 19005367 3' - F-element 75 1 61.64 TTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCC:1 + chr2R 22464447 3' - pogo 76 1 74.13 ACCATCGCCGTGGTCCTAATTGTTTATGGGATCATCCAAAGCATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGACACCCCGACTCCAGCATCGAGATGACGATATATATGTATATTTGTTGATTGATATAATGGGCCG:1 + chrX 10131888 3' + gypsy4 6428 1 74.44 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCCTATACGTATGTATGAGTGTGTATGTGTTTTTGTGCCTGTGTGCGCGTTTGGGCCTTTTGTGCACAATCTTACTGACTTCCTTCCGGTCGAACAGGCCGT:1 - chr3R 16530517 3' + hopper 1408 2 79.26 ATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATATTTTCGAGCACATATCTAACATTTTCCATCTCGGCATCGCATGTTTAATTCATATTTATGGCTCATAAAACTCTATTTTTCTTTTAGTGTCGCGACTCTTGA:1 - chr2R 16072869 3' + Burdock 6378 2 72.60 ATGATTTACAGTTTTAGTGGGCAATTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATGCCAAACAATGACGAAACAATGATGAAGACGTAAGGTACGATGCAAACTAGTGTTGACCGGGACGAGATACGCTAAAACGGAAATTCCAGTTA:1 - chr3R 7640094 3' - HB 1567 1 50.68 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAGATTAATTAATTAATTTAGATTTTATAATAGACCATAACGGGCAGCA:1 + chr2R 5357239 3' + Juan 4129 1 80.00 ACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATACTCTGTACATATACTCACATTCACAAAGAGATGAAACATGTTTGCATTGC:1 - chr3R 10738047 3' + 297 167 2 65.07 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGCCGCCTGGACGAAGACCATGAAGATGAAGGACGCAGGACGGAAAGCTAACGAGCCGC:1 + chrX 2916758 3' - 412 7085 2 54.78 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCA:1 + chr2R 24021665 3' + pogo 2048 1 57.53 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCTTTGAATTGGAAACTCATTTACAAAAATTAATGAAACCCGTCCATTCAGGACCTGTGTTACCTTCC:1 - chr3L 18658196 3' - roo 8718 2 58.22 ACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATACAAAAACTA:1 + chr2L 19144956 3' + P-element 2524 1 17.93 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGATCAGCCTTAAGTGGGCAATTTAAGGATGACAGATTAACTAGTACTATCCGA:1 + chr2R 5269062 3' + pogo 2036 1 65.75 GGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAGGGTCAGTCGAAATGCGCACGGTGTTTTTCAGGTGTGTCAGATCTTTTCTATGTTGAGAAGCGATAACTTTAGGTTTACATCGTCTTGTTCTTAACTGACTCCAGTTAGCATAGGTC:1 + chr3L 24721324 3' - baggins 5146 1 59.59 TTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAAACACGGACTACAACAATACATTTTTGTGTTCCCTT:1 + chrX 16526351 3' - P-element 72 1 34.93 GTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGTAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTGTC:1 + chr3R 29091393 3' - rover 35 2 52.80 CACTCAAGCAAACTCCATATTGCAACTAAGGCTCTCCTAATAAAAGCTATAGTAGGTCCAACACTGACCTACGCCATCCACGTGTGTGAACTGCCTTTCGACCCTATTCTCTTTTCCGCTGCCGTTGATCTTTTGGGCGATTTCCT:1 - chr3L 3059942 3' + G5A 2365 1 73.97 TATACATATGTATATGTATATATGCAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAAAATAGACTTCGATCATTCTAAAATCGTCGTGGTATTTAAAATAGCAAATTGATAAGCTTGGGTGAGTTCTGCATAAACAATTCTCA:1 + chr2R 4621114 3' + Stalker2 251 2 63.70 GATTGCTCATCTCCCATGCGGATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGCCCGAAAAAGTATGCTACGCTGTGTGAAAAT:1 - chrX 6484697 3' - jockey 9 1 74.00 ACACACACACACACACATTCACATACACACACACAGCTGCTGGGGTTGTTGCACTCGTTTTTCGTTGTCGTCGATGCATTTGCATGCAACACTTT:1 + chr2L 12897049 3' + accord 187 2 75.79 CAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGAGTCTTGAACCTCTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGCAGGGGGTCCCAGAATGTTTGATTACTTTTCTTTCATCTACAGC:1 + chr2L 6209035 3' - baggins 5132 1 72.39 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGATATAGATATGGAATATAGCCGGGCCGCCTTGTCTAGAGAGCTCAACAAACTCTGGAGCGTCTTTAGCGC:1 + chr3R 28579602 3' - pogo 46 1 54.11 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAGGGTAGGAGAGTGTCTGTGTTCGTCGGAGACCATGCACCGACCTCTGGCCAATGTGATCACTTACTCA:1 + chr3R 22522780 3' + roo 9061 1 73.29 GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATGACTTTTCCGCCGCGCGAAATTAACAGCTCATGAAATATGCCCTGAAATGTATGCAACGCGCCAT:1 + chr2L 11922965 3' - jockey 4798 1 50.00 AATATCAGATACCCGTTACTCAGCTTGCCAGAATGCGGGGGAGAAAAGTAATAAAACCAAAATTAAGGGCATTTGAATTGGCTTATGGCTTATCTTCACATTCGTAGTTCCCGAGATTCCACCGGCCATACGGACAGGCCATACG:1 - chr3R 20343258 3' - INE-1 548 1 86.21 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAGACGTCGTCATGGCGAACAGTACGTCCCTTGCGACCATTGACGATGATGACGGCGTCGACG:1 + chrX 6407331 3' - jockey 4719 1 55.22 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGA:1 - chr3L 16463505 3' - roo 75 2 69.86 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGGTCAGGTG:1 - chr3L 10563881 3' - hopper 37 1 54.89 ATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAA:1 + chrX 22711670 3' - transib2 83 1 73.29 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCGTCGGCACAGGTATTCCACAAGATTCTGTTATTCGCTTGTGTAATTAACGGATGC:1 - chr2R 18440406 3' - P-element 38 1 51.26 AGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGATTATGGATATAAATATTTATATTGAAAAATAACTTTTAAAAGTGAAACATTTTCGAA:1 + chr2R 19628259 3' + P-element 18 1 39.73 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGTGTTAAGAGCAGTCCAATATCAATTTTCAAGTATTATTTTTCTGAATGTTCCTGATTTTTGGGATTGGGCTG:1 - chr3R 14493997 3' - roo 48 2 52.05 AGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAA:1 + chr3R 29091362 3' - rover 87 2 78.08 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCCTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGAAGCGGCGCGTAATTGAAAATGTGCTGCCTAATTAGT:1 - chr2L 2682961 3' - jockey 4777 1 68.07 AGCCTGTAATATGTGTTTCACCAGTCTGTGGACCTGTTCAATAGTTCCGTGTCCCTTTCGAAATCCAAATTGATGATCCGGCAAGATATTGCCTTGTCTTATATTCAATGTAACGACACATGTATTTGTGGTAAAAGC:1 - chr2R 16410496 3' - Helena 339 1 74.64 TCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCTCCTGTTAACGAACTCTCGATGGTGTTTGAGGGAT:1 - 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chrX 15137336 3' - jockey 4691 1 67.59 TCTTTAAAGATACACATTAGGTTAAGTTGAGAAGGAACTGAACGGTTCCTACTGACTAATCTAATAATAGTGGTCAATCGCATACGAAAATTATTTTAATACTCATCCAAATATAATATATGCACATTTTACATACATTTTTTAAG:1 + chr3R 4200203 3' + G5A 2777 1 63.01 AGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTTTAGTAGTGATTGCTAAAGTTTTTATAGATGAAGATTAATACCGCAGACTTGATTGAAATTTTATAGGAAGGTAACCTA:1 - chr2L 11442881 3' - G-element 4166 1 46.58 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAGAACGTGAGCGAAAA:1 - chrX 7967216 3' - P-element 80 1 31.51 TTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCAAATTGATTTTAATAATAAACGGTGTGCATAATTTGGG:1 - chr3R 17210027 3' + HMS-Beagle2 228 2 73.29 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCATTCAATATTCTTAATTTCGGATAAATATTTTGCTA:2 + chr3R 12610067 3' - roo 87 2 77.40 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATATTTAACAGTCGGTTATATGTACATATGCATATATTTATAAAAAATCCTACATAAACA:1 + chr2R 21473693 3' + pogo 2043 1 60.27 GGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGTCGGCAATACAAAATACGAAAAGATATGCAA:1 + chr2R 11097430 3' - Juan 4036 1 71.92 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGGTATAAGTTTATGGGTTTCTTCCCGTCTTTCCTGATTCGATTGCAGTTTCATTATGGTAG:1 + chr3L 12861865 3' - pogo 7 1 73.97 AAATGAATTTACATTGTATATATTAGGGTAGTTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTAAAAAAGTCGAGTACGAACAATAAAAACAATGGCGGAGGAAATGGTAGTAGAACACCCAG:1 - chrX 4539284 3' - 1360 3152 1 58.82 CAAAAAACCTTTAATTTTGGGCCAAAAAATCATAACGAACGACTTTGTGCATAAACTTGGTCAAAAATGTTGCGAAAAGTTGACTTTCACTTGGAACCTTTTTCGACGTTCACTCGAAGAAAATGTCGCAAAGGCCTGGGAAAAT:1 - chrX 13900515 3' - S-element 58 1 59.31 ATATACCTACACACACACACATGCAGACCGGCAGGATTCGGTGGCTTGGCAAATTTGCGATAGTTGTTGCTTTGTTACTGTATTATATGGGAAAACGATTTTCCAGGGAAGCGAACTTCCCAGAGCTATAGGTTATTTAAATTTTA:1 + chr2R 22408013 3' + Quasimodo 31 2 69.86 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAAGGAGATTAAATTTGGAAAACAGGCAAATAATTCAGCAACTGATTTACGAGCCAACTGGGACCGCCGAGCCTCACAGTCTTTTGTCC:1 + chr3L 16875827 3' - jockey 4771 1 76.03 TTATAAGCTCTTTTAGATGCCTGAAACGAAATCTTAGGCTTCTGGCTACACTGGAAGTATTTATGGCCGCTGCTCCATACAAGCGGAACAGAAATATATTTATCGATATTTGAATTCAAACTGTATTCTTCCATAATTTCCTTAAC:1 + chr2L 22983832 3' + Transib5 2906 1 45.89 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTTGCCCATTTATCTTTTCCAGCCCATCGTGCGCGGT:1 - chr2R 14940690 3' + blood 7320 1 74.62 TAACTACGATAGCCTACCTATTTCCTAAAATTATTAAAAAATTTTCTCATTTTATTTCTTGTTTTTAAGCTAAAAATGTTTCTGTACTTAAAATATGAATATTAGTACGCAAAAACATTATTTTGGGAACCATAATTTCATTGGAT:1 + chr2R 4707543 3' + Tc1-2 1526 1 74.66 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTCACAGATCATTTTATTATAATTACTAGAAACCGATTGATTAAC:1 - chr2R 17187758 3' + roo 8996 2 69.18 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAGCATGAGTCCGCGCAATAATCACAGCCAAGTGCTGCATATTTATAGGCGCAATCAACTTTATTGCGCTGGCAG:1 + chrX 850178 3' - jockey 12 1 77.42 TGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATAGATTGATTATTCAAAAAAAAATGCCTAATTTAAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGTTTATTCATATTTTGGTAATGTTGGCAATAG:1 + chr3L 14944649 3' + G5 4804 1 53.23 TTTAAAAAAATAAAATAAAAAAGAAAATCAATTAAGGGTTGTCTCTTATGCTAAAGTAAAGAGAAAGTTTTTAATAAGTTCATAATTATTTCAAATGTTCCTTATTTTCTCAGTGCCCACGCTGTTGACAGTTATGCCAGGTTGTG:1 + chrX 11630563 3' + G7 1146 2 78.08 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCGCTGTCAGTCGCCGCAGCCAT:1 - chr2R 24021512 3' - pogo 20 1 70.55 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGCTGGAGGAAGTCATCACGAAACTGAATACAATTAACAACATTTAGCAAATGAAAGGAAAATTCACTTTGAGCTTTCGTGTTCTCCCA:1 - chr2R 8966121 3' - BS 5031 1 58.22 TAACAATAAAAACTTTTTTTGTACCATTTTGCAGGAAAACTTGAAATGATTGTTATGCAATTGTTGGTAACACAATTTTGTCGTTTTTGTCAACAGCAGTTGGGTGTTGGTATTCCCCAAGAACTGACCACTGGGAAAACTTCACA:1 - chrX 15546300 3' + looper1 1619 1 67.81 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAATACTCAAATGTCATCTCCTTCGCTTCAACGTTGTT:1 - chr3L 24253590 3' - 297 47 2 62.31 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAATCAAAAAGTGAAAATGTGTC:1 - chrX 10286988 3' + roo 9005 2 65.75 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCACCCGAAATTTATTTGTCTCAATAAGACGACA:1 - chr2L 7271802 3' + 297 377 2 69.92 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTTTCCAGTCAGAAGTTTTCAGGGCTTAAAGGGTTAAAAGGCACTTTCTTCATTCTTGATCA:1 + chr3R 5478052 3' - 297 32 2 55.00 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGCCCGAAAAAGTATG:1 - chrX 6484714 3' - jockey 71 1 63.19 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGATTGATCCGCTGTGACTTTTGCTGACGCACTTGCACCGACTTCTTTGTTC:1 + chr3L 17904906 3' + roo 9042 1 65.07 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGAGTGAATCCCAATCGAATAGTACCCTCCCCTCTGAGCCAATCCTCCCTGCCCAGCTTACATGCCAAATCGA:1 + chr3R 27188641 3' + roo 9021 2 51.37 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAGGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTGAACTGAGCAC:1 + chr3R 18518011 3' + roo 8986 2 73.97 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCCCTCGGATCGGATCCTGGTTAGCAACTCAACAAGCTAACAAATTAACATGCCGTCCAGCG:1 + chr3R 10461754 3' - roo 8723 2 59.31 GTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGCGGGAAATGCAACCCTTGGGGAACTGGATCCTACAGCTGGATCGGATCCAATGCACCCGGTTTCCATACTGAGGGACAAAAGGGCAATCGGAAGCCTCTATTT:1 - chr2R 10548059 3' - gypsy7 5005 2 78.23 ATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTGTATTTTA:1 - chrX 9437176 3' - roo 98 2 30.14 GAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATACAGTGATAGCAGCCAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAAGCCTTTTGTTTGCGCATTGATTGAATCCTTTCGATGTCCTG:1 + chr2R 17342308 3' + 1360 115 1 71.92 GTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCAGCTAAATTTCTAGCTTGTAACTTTTTTTATGCTG:1 - chr3L 14944503 3' - G5 4756 1 71.23 AGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGAATATTATGATTACTATCTGTCTGTCGCTCTGTCC:1 - chr3L 27146219 3' - HMS-Beagle2 84 2 75.34 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGTCATTACTTTTAATACTTTCTTTAATACTTTATTTTATATATAGTAATATTTACCAATTATATAT:1 - chr2L 18953019 3' + roo 9016 2 59.59 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAAAATTAATATTTGGTCAGGAATTTCACCAGCTGGATATTTTGTGGTGATTCCATGCCAGCTGTGGCCCTATCC:1 + chrX 22676497 3' + 297 389 2 76.03 GGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGCTTTAGTAAAATAATTTTTATAGAGTACCAGAAAT:1 + chr3L 15277669 3' - I-element 89 1 75.34 ACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCCGAGGAACTTAAAAAAACCTACGCTTTATATGTTTATAATCTATAAAGAGTATTCTTTTTTAGGCTAAAAATAGATATTACACGACT:1 + chr3L 21647016 3' + INE-1 542 1 86.09 CGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATTTTATAAGTGCCTTTCTCAACGGTTAGCTTTTCTCGGGAACATGAG:1 + chr2L 16508986 3' + invader4 3025 2 67.16 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAAACATCTACGTCTC:1 + chr3L 9519647 3' + roo 359 2 54.14 AGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTA:1 + chr3L 18738134 3' + Bari1 1624 1 75.69 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACAGACATTGACAACGCACTTGTCGTCGTTTTGGGCGTGTGTTATGCACT:1 + chr3L 815005 3' - hobo 73 1 69.18 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAATTAATCCAAGAGCTTT:1 + chr3R 24976297 3' - roo 8733 2 65.75 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTAA:1 + chr2L 19643611 3' - hobo 64 1 63.70 ATATCGACTTTCATACGGACAGGCGAACTTGGCCAGATCGACTCGTCTACTGATCCTGATCAAGAATATACATACTTTGTATATACTATATTTATATAGTCTGAATGCCTGTTACATACTTTATGTTTCAATTGATCGAATTATT:1 + chr3L 25607928 3' - INE-1 131 1 72.41 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTTATAACTAATCTTAACAGATGCCTAAAGTTTAAAATTAAATCTTCTACAATGATACTTATGCA:1 - chr3R 8914246 3' - pogo 54 1 57.53 CCATGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGGCCTGGTCATGTGTTCTCCTTGTATTTTCTTTTCGTTCGCCTCTGTGTGGCTTATCGAGCGATTGGCAAATTCGCCAGCGTTAATTGGGGG:1 - chr2R 22358424 3' + hopper 141 1 69.49 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTAAGCTTTACGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGAGTGCTTTCTCTTGT:1 - chr2L 17729335 3' - jockey 4800 1 53.90 AAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGC:1 + chr3L 15099684 3' - G4 3810 1 55.56 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTACCAAGCCTATTTACGGTTTAGCCTTTCGCTCTTTATTTATAGTTGTTGGCTT:1 - chr2L 7449700 3' - roo 8733 2 67.81 GTCGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGGCAATTACTGGGTTTTATTATGCTTGC:1 - chr2R 11574975 3' + INE-1 145 1 64.44 TATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATATTTATAAG:1 - chr2R 5582164 3' - Cr1a 444 1 64.49 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTCGGGCTGCCATTGTCC:1 - chr3L 5179138 3' + P-element 2827 1 43.15 AGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGTGCGTGATCGAAGAAACGAATTTACATAATTGG:1 + chr2R 631300 3' - HMS-Beagle2 6967 2 76.03 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATAAACATTTTACATATGTTGTGCTTTGTAGTAGATATGTGAATAATACACTGTATTTGT:1 + chrX 17510682 3' - roo 62 2 64.38 AGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACAGACGGTAGTTCCACTCGGCTTGATCAATTGTTGATGGGTAATAGATTTTTTTAGTATTAACAATCGTATCGGTT:1 + chr2R 330545 3' - gtwin 6963 2 52.05 TTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCACGCTTGCACTTTTTGTCGCAATTGCAGTTGGCCTCATTATGCAATTACGGCAGCAAGAAACAAACGAACGACAGGAGCAACACATTTTTTGCATATTTT:1 + chr3L 7790808 3' - copia 4891 2 68.49 GCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATATACTTATATATTTTCTTCCCCGTGCTGTTTTCACTTGAGCGCAGCGAGGCATTTATCATTTT:1 + chr3R 26432082 3' - Quasimodo 54 2 63.01 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGATTTTAGTAATTGGCCATATAAATTATAAGATATTTATAAGCTGGGG:1 + chrX 11267787 3' + roo 8999 2 75.34 TTTGTAAACTATTCTGTCTATCATAATAAATTAATAAAATTGCAACTGTATTTTTTTCTTTGTTTTACACGTAAAACTTTTGTTTAATGTCATCGATTTTGTTCACATTTCCTAAATCCCTTTACTCTGCGAGGTCCGGGTATAAT:1 + chr3L 27670265 3' + I-element 5337 1 56.85 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCACTGAACCAATTCGTTATGTATTAACCAATAAATTATCATTTTTAGGCCAAACTGAGCTCCTCTCAACCGCA:1 + chr3L 19438001 3' + copia 242 1 53.85 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACATAATTAATTGTGCTGCTGTGTTGGCAAACACGCGGG:1 - chr2R 18983765 3' + hopper 1353 1 70.31 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATCGATAAGAAAACGAGGGGACACAAAACCGAAGGGTGACTTAAGCGAGCGAT:1 + chr2L 13140745 3' - blood 7034 2 68.49 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTGTCACTCACACACACACACACATTCTCGGCCGTACTCATATTTATTTATTACTTTTTATGTTGTTTTAATGACGCCGACGACGACGACGCCGCTCTACTTCATCTGTTTCGCTG:1 - chr3R 16231750 3' + P-element 2799 1 77.40 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATATAATTCGTACAAGAAATTCCTCTGCAACTTTCAATTTAAAAAAAATATATTTAACTAAAAAATACAAATTAAAAGACATGTAAAATTAC:1 - chrX 22676305 3' - 297 6603 2 66.43 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTGCGCATTTTATTTTCCACTTTGCTTGTATTTATTTAAAT:1 + chr2L 16385320 3' - I-element 63 1 69.77 CAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAATGATATATTTATATATCATTTAAATGTAGTATTGAACATTTATTACTATGTAATTTTAATTT:1 + chr3L 17162391 3' + Stalker2 343 2 59.59 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATGAAATTGATTTTGCGTTCTTACCGGCTACCACTTTATTATCCAAATACCTGGAAAGTCTAAAGCAATGTGATTTACATACTG:1 + chr3L 22709450 3' + 412 454 2 56.16 GACTATCGGTTACCCGTTACTCAGTTGAAGAGAATGCGAGTGCGAAAACTCGACATTCATATCATTTTCATTTGATAAGATTTCTTTCCAACAATAACTGACGGACATGACATCCGGATCAGGATATATGT:1 + chrX 19434547 3' - INE-1 549 1 74.05 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTG:1 + chr3R 6412044 3' - Tirant 35 2 59.41 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGCACATCCATCTAAAGCCCTTCATGATGTTAATTACCGAACCCTGTCACACGCTCCGC:1 + chr3L 6675391 3' - 412 58 2 59.29 CAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCGTTTCTATGTTCCTTCGTGGAATTTCACAATAATCTTTTCCATCAATT:1 - chrX 4823541 3' - pogo 70 1 66.44 AAACATAAACATAAACATAACATAAACAACATTATGTATCTGATGGTATAATTTTTAAGACCTAGGTGTAATGAACTTTGAATTTGGAATTGGATTCGTTATAGTTAGAAACACTGGCGAAGTCCAATAGATTATTACCGTCGAGA:1 - chrX 5065906 3' - 412 7125 2 56.85 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTTCCTGAATTTACTGAAAGGTTTTTTATTATG:1 + chr3L 19574166 3' + 297 351 2 56.55 CTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGACTACGTTCGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAGAAAATGCACTGCAGTCGCTGCGATCTGGCCACACTCTGGCTAGCTATCTGGCA:1 + chr3L 9898567 3' - invader1 3727 2 63.01 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCACCAAAACGTTATGACAATCGTATGGAACACCCAACCACATCCATGCATAGGAAAAACAAATGGGATCCGG:1 - chr3L 9519536 3' - roo 8702 2 51.13 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCACATTCAATTTGCCCCCCA:1 + chr2L 13140693 3' - blood 75 2 66.44 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGCGTTCAATTCACTTTGCGTCAACTGTGTATAACAAAATGTGTCAACAC:1 + chrX 16992439 3' - jockey 4802 1 67.12 ATAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCACGTGAAAACGTGTCTCTGTCTCCCAACTTTTCTGTTTG:1 + chr3L 18767886 3' - roo 8601 1 65.97 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATAGCCGTGTGTGTAGTGCGATTGGAAGTGCAGTGGCGTGCACAAAAGGGGTTAGTTAGCTCCTTAACTAATCGAAAGGCTA:1 + chr2R 15151245 3' + hopper 1374 2 45.21 ATTTTTAAGGAGGACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGTTTGCATCATTGGGTATTATCAATACAAATAAGGAAATGCACAATTTAAATTATGCTAAACAATACTAAAAACAGAGCCA:1 + chr2R 5265217 3' - Q-element 432 2 60.27 AAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGTCGGCAATACAAAATACGAAA:1 + chr2R 11097420 3' - Juan 4029 1 75.19 AGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCACGTGAAAACGTGTCTCTG:1 + chr3L 18767866 3' - roo 8623 1 51.37 TTTTTTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGAGTGGAAAATATGACAACACATATGCACTGCTGACA:1 - chr3R 27782646 3' - G2 3062 1 75.34 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATTATTTTTACAGTTG:1 + chr3R 21587626 3' + roo 400 1 71.82 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATAACATCAAATGAAATTTATGGCAACTAAATCAAAGGCTACTAATCGAAGCGAAAAAGTT:1 + chrX 20909723 3' - jockey 4683 1 59.59 ATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCTAAATTAGCATTAGGACTGAGTTTTCCTAAGTGCAA:1 + chr3R 8914335 3' - pogo 83 1 78.08 GCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATTAGCAAGTTGGCCCAAGTTGAGCCGCATTGAATCGACTTTTTTCCCCTCTGGCCGCCCTGACTTTTGGCACTCTTA:1 + chr2R 9513764 3' + FB 202 1 51.37 ACTGTGGTGAGTTTTACCGGACTCATTCATGCCCATGCCAAACTGAATTGAAGGAAACTATTTCAGCATCGCTTTATGAATACAGAAGACATACCTCCTGGTATTTAATTCAGCATAAAAAGTCTGTCAAATTTCCTTGCATTTAT:1 - chr3R 11260889 3' - invader5 162 2 63.70 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCTCAGGAAGCATCGAGCCCATTTCCACACTGAATATTGGCCATA:1 + chr2R 11562942 3' + pogo 2100 1 80.00 ATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATATGTAAAACAGTATTTAATGTAAGGTTTTTTTTTTGCGTAAACAAAGTATATAAAAATTA:1 + chr3R 11146457 3' + flea 197 2 59.59 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACGTACAGCACGCTGTGGACAAGAAATATGTTGTCCTTTTAGGCGTTGACAAATCGGCGCTCACACTCGCGCCTAAAAGGATGCAACAAGCAAAA:1 - chr3L 13544944 3' + hobo 2937 1 79.17 GTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAACTACAATTCTATGCACTTCTTTAAATGACTTTGTAGTCGAATATATATGTATTTAAATTTCCGCACTACATCCTAAAACTCG:1 - chrX 21590635 3' + BS 5075 1 61.60 TGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTTACTCGAATTATGTCCATCTTCGTTGCAACCAAACCATTTTCTAACCGCTGCGCAATCCTTCTGTTTAT:1 + chrX 22574776 3' - 17.6 6 2 76.03 CTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATGTACATGAATGACGTCAATAAGTTTTCTAATCGCGCAAAAATGTTGGTTAATTATTCGTTGTCGATTTGTAAG:1 - chr2L 13509173 3' - F-element 4642 1 54.79 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGGGCATCTTCGGCAATTTGGCCTTCGTGCCC:1 + chrX 21281230 3' - P-element 73 1 28.46 ATATAAATATGTATATATATGTATAATAATACACGAGCACGTCAACTTGACATTGCGACTTGTTAAATATTTTCCAGCAAATTCACTTTACGAAAATGTTGTAGATTCCAAAAGATAAACACGGTAATTGTCGGCAAATAGAAAAT:1 + chr3R 14728636 3' + G3 4509 1 75.34 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATTAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATTCGAGGTTAAATTGTTGTTTGGGGCTTCTTTTGCAAATCGTGG:2 - chr2R 13193794 3' - BS 5072 1 67.81 CGGATGCAGAACTTTATAAATCAAGTTATCATTCTAATAATGAACAAGAAGAAGAAGTGGAAGACGAATTCAATTTCCTTAATATATTTTTAGAGGAGGAAGTTGAAGAAGAGCAATAAATTTAATAAAATATAAAAAAAAATTAT:1 - 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P-element 79 1 17.21 ATGGGAACTTAGTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCAGGACATTAATTTTAAGTGGAAGAATCGCAGGATGGGTCGTAATATTATAATTTAAGTGGCCTTCTCAAGCTATATGACAGCTACACAGAAATGAAAACAAATC:1 - chr3R 5436936 3' + Burdock 6034 1 73.97 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACGTCATCTTCATCATTAAATTCGAATTTTGAATTACTTTTTAAAATATAATTTGTCCTCTCTAGTT:1 + chr2R 9868995 3' - roo 33 2 57.26 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAG:1 + chr2R 24021661 3' + pogo 2044 1 60.27 AGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGTAGTCCAGTTTGTGTTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGGGTGCAAGGCAAATATTTACACTCAATGGAACATAATAAAGACATTAGGGAAATATT:1 - chr2R 9934126 3' - Rt1b 4952 1 61.27 ACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAACTTAATTTATTATCCTGAGCTGCTCGATTGATTGCTATTCCAACTTGTATCTCTAGTT:1 - chrX 15305206 3' - Transpac 5155 2 60.27 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAATTTTTCACGCATTTGACTGCATTACTTAACCTCA:1 + chr3R 31681925 3' - Doc 91 1 77.40 TCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGA:1 + chr3L 14084941 3' + opus 413 2 78.77 CTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGTATTCAACTAAAAATACAGGCATTCCAAAGTTAACATTTCAATTGATACTGTGATTTTTTTGCACAGCTTTTAAATTGAGCAACTTCAGTTGTTGCTTGAAC:1 - chrX 10128130 3' - invader3 22 2 62.33 TTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTACGTGTTGATTGCTCGTTCCAGCACAGCAAGCGAAACTTGTTTCGCAAAATGCCATTCAAATGCTCGAAGTAGTCTGAATCTTGGCCCAACTAATGACTTCAT:1 - chr3L 13236180 3' + P-element 2515 1 76.30 AAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGGAATATTATCTTTTGAGGTAAGAGAATACATAGAATACTGTGTACTTACGCTCGAGATGGTACTGCTGCTCTCGGTCTGGTCGCTGCATATCAGCCGG:1 + chr3R 26846969 3' + Circe 7030 1 58.22 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTAAGAGTTAAATCGTCGTCGTCGTCGTGATCCGGCATTCAATGGATAATTTCGTACATATCTACATAAATCAAAGTTTCAAAATTTCTAGTCTCGCTGGAATGCA:1 - chrX 18739791 3' - I-element 15 1 41.10 GGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAATACTTGCTTTACAGCTCGGCTGCAACTTTAATTGAAAGTGTTTGTAGTCAAATGATTGGATTTT:1 - 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mariner2 652 1 63.45 CAGGATCAATAGCCTAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTTTCCATCTGTCCGTATGAACGTCGAGATGTCAGGAACTATAAAAGCTAAAAGGTTAAGGTTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGAGGCGCAAGTTCGTTGACC:1 + chr2R 25007912 3' + INE-1 95 1 79.45 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTATCATAAAAATCTGGGAAACAAATCATATCGAAACCATGAAATGTAGAATTCTTCTTTGTCGTTATAATTTCTAATAGCCAAATGCGTACACTCCCCGAATTTTC:1 + chr3R 14494158 3' + roo 396 1 77.24 TTTACGTTTCTCTTGGATTCAGGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTGATAGGTGTATGTAAATACAAATAGCCCGGCGACACGAGAAACACTCGCATTTGCACA:1 - chr2L 20440293 3' - Idefix 354 2 58.90 TAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACA:1 + chr3R 29091359 3' - rover 7034 2 79.14 GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAAATACGTAGTGGAAAACGAAGATGCTGCGTCGTCTAAGTCAGACTC:1 - chr2R 3188680 3' - 1360 60 1 67.44 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTATTCCTAGAATCGCATTAATATTTTTAATCTGATTACGATGTGGAAAATAAAGCAAGAATAACAACTAAAAACGCTCG:1 + chr3R 30782633 3' - pogo 35 1 59.44 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTAATTATCGTCGGTTTCTTGGGCCGTACAGAGCATATAATTCAGATGTGTGCTTTCTAGGACTAGACTGTTGGATACCGATGCAGTTCGTGTCCT:1 + chr3R 10361984 3' - roo 25 2 68.28 GAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTAAAACCTTTTCAACGAATCTATTATAGTATATATATACCCTTTTACTCTACGAGCAACGGGTAAAAAATTTATACCACAAATGTGGTATTAAAGTAAATGAATTAGACTTCAAGTTGAAGTGAG:1 - chr2L 21582216 3' - INE-1 34 1 53.42 TATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTACAGAAATGTTAAGAAATTCGGGAAATATCGAAGAGGACAACTCTGAAAGCTGGCTTAATTTAGATTTCAGTTCTAAAGAAAACGAAAATAAAAGTAAAGA:1 + chr2R 14541804 3' + P-element 417 1 18.60 CTACTCGAAGAGAAAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACAGTTTCCG:1 + chr3R 22624759 3' + blood 297 2 72.60 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTTTCAATGTCTGTTTTATGTTGTGTTTTTCACAGTT:1 + chr3L 18789123 3' + 1360 3344 1 50.68 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAAT:1 + chr2R 24021667 3' + pogo 2064 1 56.06 CGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTTGCTCTTTGTTGTTGTTTTTTCCAATTAGATGTCTGCACTGCAGCTGGGCGGTGTTGTTCTTGTTGCTGTGGCCGTG:1 + chr3L 3339456 3' - Transpac 4959 2 58.62 CTTAGCGTTGTACTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAAATCACAAAAAGTATGCGAATTAGAGAGCTGTGAGGAGTACGAGAGACGGCATTGCCAGCCGCGAAACATTTTGAGCTGACATGACTGCG:1 - chr3R 1440317 3' + 297 6929 2 57.25 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTGACTGTATGTATGCCTGTGTGAGTGAGTGACAGTGTGTTGGTGCTGCCTTTTT:1 + chr2L 19158946 3' - P-element 33 1 64.58 ATATACTAATACTAAAATACAGAAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTTTGTCAAATTAAGGCCTTGTTGCTCTGGGCCTCAAGCTGTTCATCAGGAAGGC:1 - chr2R 9410458 3' + hopper2 1544 1 56.16 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGTCGGTAGCCGAGCTCCAACTTCGGGTTCGGGGTTGTTGTTGTTCGCGAAAAGAAGACGGCAG:1 + chrX 10806972 3' + P-element 2878 2 68.00 CACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTT:1 + chrY 311341 3' - 1360 58 1 58.22 AATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCACGACTCTTGTTTATTTCTCTCCCTGCTCTTCAGATTTATCATTCGGCTTTCTAGTTAGAA:1 + chr2L 18262224 3' - I-element 4977 1 58.62 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGTGAAAAGAAAAACGTTTTATGAGCTCATTCACAAAAAGGGCCAAAACACACACACAGGCA:2 + chr2R 8335021 3' + transib2 2764 1 58.90 TTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATGC:2 + chr3R 17210117 3' - HMS-Beagle2 6935 2 54.11 TAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGTCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTTT:1 + chr2R 4206660 3' - 1360 318 1 72.60 TCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACG:1 + chr3R 1844850 3' - Cr1a 163 1 56.83 GGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCAGTTGGGGTGGTGCTTCCATCAGTAGGCGTTGTGCTTCCATCGGTGGGATCGTCTTCGGCAAAACTGTAGCTGGAAAAGCACA:1 - chr3R 14565989 3' - Quasimodo 7047 2 68.33 CCCTCTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAGTGAAGGGCTGTCAGGTCGCACAGGAG:1 - chr3L 23933531 3' + Cr1a 224 1 58.22 ATTTGTTCTTGATAACGTGTTATTACCTAATACAAACTGGGTTTATGGCTATCCATATGCATATATGTATGTATGTATGTATGTGCATATCTACAAATTGGTAAATCACTGCGAGCCACACAGACTGCCTGCATTTGTACATAATT:1 - chrX 8198136 3' + Tc1-2 298 1 75.34 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCGGCTCCTGGCGACGCACAAAAGTATGCAGCACAAGTGGCGGACACTTTGAGCTCGATGGATGTTCG:1 + chrX 7031694 3' + hopper2 1557 1 50.68 AATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGAATGTGTTATATTTGTTTGCGAACAATATAATTTATCTTAATTCTTTACAAACTAT:2 + chr3R 5024907 3' + diver 6045 2 71.23 CAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTTTATTCTAGGGTCTTTGCTTAGTGGGTACTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 1982172 3' - 1360 79 1 88.81 TGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTTGTGGGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAATTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAAAAACTATATTCTTTGGTTTTATATGAATTTTTTAGAGTTTTTATGCACTCAACATGAAAA:1 - chr3R 13492960 3' + Cr1a 4033 1 65.07 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATTATTTTTACAGTTGCATTCCCAGCTCGATTCTCGCG:1 + chr3R 21587648 3' + roo 386 2 67.81 CTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACAGAGAGAGCTGCCGCCAGTGGAAATACAAACGAACATGGCGCGTACTTGTAATTCCGCCTAGGTGCA:1 - chr2R 13315673 3' + accord 6978 2 58.22 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGCGAATGTCTTTGGGCACTTTGCAGTCTCCTTTGGCTCCTAGTGCCCCCTTTTAGCCACTACTT:1 - chr3L 3757095 3' - copia 4887 2 71.92 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCAGCCCTTCTGTGGGTTTAGTGGCACCGAA:1 + chr2R 10406333 3' - FB 33 1 67.06 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATACTTAAAATTTAATTTGAGAACATTACCTCGCTCACTATCCATCCATATATGATTGATAATGTGTATTCAATTAATTAAAAATCACAGAAA:1 + chr3R 20090073 3' - mdg1 30 2 65.07 CGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAAAAGCTCCGC:1 - chr2R 12069572 3' - Tirant 64 2 61.43 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACTGAACAAGTTACTGCGAGTAAAATATGACATT:1 - chr2R 8452767 3' - blood 57 2 71.43 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGACTGGCTCTCTAGTTTAATATCCTT:1 + chr3L 10564032 3' + hopper 1393 1 69.18 CCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTTTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATATCAAATTTATGTCAAGTTGGCCA:1 - chr2L 3648749 3' + roo 313 2 78.77 GTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACG:1 - chr2R 5070930 3' - Tirant 10 4 26.52 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGGCTGAAACGCAGTCGTTGAACCCCTCGTTGCTGAGGATTCAG:1 + chr3R 24053724 3' + mdg1 7400 2 66.14 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACG:1 + chr3L 27391399 3' + 1360 3360 1 57.03 ATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGGGCGGTAGGAATGAAGGGAAAGCTGGGAGGAG:1 + chrX 5206517 3' - Tirant 8174 2 77.50 GCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTGCTAACGCTACGTATGTATGTGTGCGCCTAAATGGGCGG:1 - chr3L 13365532 3' - jockey 4623 1 56.16 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCATTTCATTGATACAATATTGCAGCTATTTTAATAATTTCGAAA:1 - chr3L 12468777 3' - roo 8741 2 74.66 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAATTATTTCTACCATTATGTGTGGGGTGGCTATTGTATCTGCCGCTGGATAAGCATTCCATGATGTTTAGCGATTTATGTAGTTTG:1 - chrX 19820116 3' + Juan 4189 1 62.04 AATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATTTATGTTTCTCTGCAGGACAATTCGTATCTGTTGCGATAAATCATATCCATATTCAAATATTTGCACTATTTTGTTGTGCAAATGGCAAGATTA:1 + chr3L 19335469 3' + invader4 298 2 65.07 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATATGTAAAACAGTATTTAATGTAAGGTTTTTTTTTTGCGTAAACAAAGTATATAAAAATTAAAGTTAAATAAAAAACTAA:1 + chr3R 11146476 3' + flea 4975 2 58.22 TTGGTAGTCTGAAATCTGACATCATCATCAACATTAAAAACTCATCAGAACGCGCATAGTCGCATAATAAATCTCAATACCCAAAAGCCTTGTCTGTTAATTTACATAACCACTAACCACTTTATATAAAATCCAACAACTCAGAA:1 + chr3L 27874140 3' + gypsy4 6375 1 77.40 GGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTTTGCACTTGATTATAAAATATATTAG:1 + chr2R 21425171 3' - HMS-Beagle2 6932 2 52.74 GCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGGAACGTCAGCCCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAATGGCCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAA:1 + chr2R 545201 3' + gypsy4 6582 2 73.97 GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTGCTCTTATTTTATTTATTTATTTTAAAGACTTAATATGTTTTTCTGCACACGATACTTTCCGTTCAAGGTTTTTTCCGTTTA:1 - chr3R 904584 3' - 3S18 5805 2 57.93 TGACTGCGAGAAATGTCGCAAGAGAGTTTGGGGACCGTCTCCTTGGCCTACTTCGGTAGTAACACCAAATATTTTCGTTAATTTTACTGATCGCTGATATTTTAAAATAACTAAATGTTTCATCCCTGCAATGTCAGGGGACCCAA:1 + chr2R 12833268 3' + baggins 438 1 50.00 CACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACATTTTCCGGTGCCGCCATGGTGGGTACGTTCACATCCACATTCCCATTTAC:1 + chr3R 22624802 3' + blood 7353 2 58.33 ACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGTGGATGTGGATTGTGTGTATTT:1 - chr3L 25482894 3' - accord 59 2 62.50 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATTCATAAAATGTGTTCAAGTTGGTTACCAGTTTTTTATGGTATGGTTTTG:1 + chrX 21581434 3' - Tabor 33 2 51.40 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTTAAAAGCTCCGCTTTT:1 - chr2R 12069568 3' - Tirant 48 2 56.25 AAAAAGATAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATCCAAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATGATTATTATGAATAATATTTTGCCAAGC:1 + chr3R 8950720 3' + Q-element 80 2 78.08 TCACTATTACAACGCATGATGGCGACTGAACCGTAACAAAACTTAGCTGTAGCCCCTCTTGAACGGTACCACTGCGCGCTGCTATGACATCTGAGATTGCTTTGGGTGATCAGGGGGTCT:1 - chr2L 13486242 3' - mariner2 129 1 75.83 GGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACCACCACCCCCCCCCCCTTAATACGCATGAAAAATTGC:1 - chrX 2916685 3' + 412 481 2 52.86 GGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCATCGTCTAGCAGATTAAAGTGCAATGAAAGTGAGTGGTAAAGTCGTGGGCTTTTGAGGAAAAACAATTGCATAAGCTCGGAGTGAAACAAAAGTAATGGCCA:1 + chr3L 16703918 3' + FB 21 1 67.59 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACGACAGACCATTTTTCATTTCTATTGATGGGAATTGCACTTATTAATATCAATTAT:1 + chr3L 18792508 3' - roo 65 2 65.75 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCG:1 + chrX 16217509 3' + P-element 2810 1 30.99 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGTTTGCTCTATAACTAATCTCGTTTATCACGATTGT:1 - chrX 19113473 3' + 412 430 2 59.59 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCCAGCAAGATGGCTTTAAATTTCAGGGCGTCCTTTGTG:1 - chr2R 13724905 3' - jockey 4763 1 72.39 ATAAAGTAATTTTTAAAATTTATTTATTAGACCAATAGGTTTAATAAATGATTAGCAAGCCCAATTATGTGATTGCCTGGAATTAACTCTTTAAAAGTATTTAAATCCAACTTTCTCTTCAATTTTCTGAATGTTTTTTAGGGCAC:1 - chr3L 5025476 3' - 1360 375 1 68.49 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAATTTTTCACGCATTTGACTGCATTACTTAACCTCAATT:1 + chr3R 31681928 3' - Doc 62 1 70.00 GGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACACAAAAAACCTAAACAAAAAAATATCTTAACATTTTTTGTTTTAAACGAATAGAAGGCAGGCAATGAAAGAAAATCTCT:1 + chrX 9188259 3' + I-element 343 1 66.19 TTTTTTTTTTTCAATTTTTTTTTCTGCTGCGTTGTGGGGGGGTGTGTTGGGTGTGAGTACGTGCACTTTTCAAACTACAGTGCCCGAAGGAGAGAGCGAGGGGGACGAAACGGT:1 - chrX 1566021 3' - Doc 4694 3 85.96 AAATAAATCAAAATTAAATTGTAGAATTGTTCATTTTCTTTTATTTTGCTGTTAAAATATGATCAATATTATTCGGCCCACAAAAGCCGGTTATGTAAAGACCGTATAGGCCAAATATCTGCACACATATCGTACTCGTTAAATTA:1 - chr2R 12756072 3' + Fw2 76 1 52.05 ATTTAAAGAAAAGTACTGATCCATTTATGAAGTAAAGTATTTGTGAATAAAACCAAGAAATTCAGGACATTTTTATAGATCAAAATATGCATTTTTGCGTTGACTTATAAAGTAAGCATCTTAAGTAAGCCAATTGCTATTTTTAT:1 - chrX 20545742 3' + GATE 459 1 77.40 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAATTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCAGCATTTCCTTTGTGGGAACTGGTTTTGCTCAAATTGCGAAATG:1 - chr3R 10361865 3' + roo 8994 2 70.55 TATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACCCGTAAAAAGTTCGTTGCAATATATACTTCATATAGTCGGAAACGCTTCATTTTGCCTGTTATATACTTTTTAAAAAATCTATTTTCATAAATCTTACTTCGTATGATGT:1 - chrX 21132936 3' - INE-1 565 1 70.55 ACACTGCATAAGTGCATGGTCAGCATTCCCACGCTAACCAAATGCCGCTTTGTACACAATGTGCACACATAGCATTCTCTCTCAACTCTCTTAACATAAGTATATCCGAGGCGAGTCTGGTTAGAAATTTACATGGACTGCAAAAA:1 + chr2R 24791392 3' + gypsy11 163 2 71.92 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTGAGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGCCTTTATAATCATA:1 + chrX 10824061 3' - pogo 31 1 60.27 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGAACGAAATCGGAGGTCGAGTGACTGGCAACGCGATAAATCTCATTG:1 - chr2L 18944791 3' + P-element 2860 1 61.24 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACCGGTTTTTTCTTTTTGTGTACTCATCGCGCTTCCTTTCCTTTTCCGTTTCATTTCGCCC:1 + chrX 3660987 3' + 297 351 2 59.40 AATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCAT:1 - chr2R 13212218 3' - diver 5961 2 64.38 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTT:1 - chr2L 18213139 3' + roo 8987 2 75.34 AATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATAACGCTAACAAAAGGTTTATTACACTTTCTATTGAAATATACATTTTGAATCCCATTTTCCCCACATTTGGCT:1 + chr2L 3282685 3' + flea 4967 2 54.79 CTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTTGCCAACACAATTGAATTTCATGTTTGACACGACACCACCACCACCACCATCACTGCCCGGAAAAACCACCTGACCTGACCCCCTTCAAACGTTTCCTTTTGTTT:1 + chrX 5210865 3' + I-element 5054 1 68.75 AATAAACAAATTATAAGAACCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTTAGGGGATGGCTATAGAGTTATAGTTGATTTATTGGGCTGTTATGGGGCCGGAGAAAATG:1 - chr3L 15701317 3' + Idefix 7119 2 58.90 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGTATGAAGTGTTCCGATAAAAAACAAGCGAATGATGAAAGGGGCAGCC:1 - chr3R 21587522 3' - roo 73 2 68.49 GTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAGCTTGTCTGTGGGCAAAAATATATTTCGGCTAAAAAGTAGGCAATACTACTTTTATCAGT:1 + chrX 21636265 3' - Stalker2 7310 2 59.59 TCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCGTGGTCTTGCTCTCCC:1 + chr3L 13228579 3' - P-element 18 1 68.03 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGTAAAATATCATAATTTTAGTTCATAAAGCGTATTATTTGTTTACATCAAACTGACAAGGGTAATTTCAGCTAAATAGTTTAAGGCAATGTCTTTTGGCAGCCCCTGGAAGTCAG:1 + chrX 3578237 3' - hobo 9 1 71.23 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAACTATTCCGCATTCTAAATTGCAATATTCGATGCACGCATAATTGGAGCTATTGATTAAATCGGCCAGAGGGCGTGCGTGCCACCAATGA:1 - chr2L 14888893 3' - hopper 25 1 66.67 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTTTAAAGTTGGATTATTATATCGTTACGGTATAATACAAAATGGATTCATATTATT:1 + chrX 23431556 3' - F-element 70 1 61.15 ATTTTATTTTATTTTATTTTATCCCTAAAGTCATAGAAGTCGGCACGTTGAGTTGGTAAGTGGAATGGGCGATTCGGAACCTTTATATATAGCATATACTAATGTATTGCGCAAC:1 - chr2L 2330597 3' + transib1 1900 1 74.78 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGGCTGAAACGCAGTCGTTGAAC:1 + chr3R 24053703 3' + mdg1 7410 2 77.08 GAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACA:1 + chr2R 15822104 3' - invader6 4511 2 50.00 CTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATGCTCACTAAATTGACTGAGGGTCATAATATGCCAATTCATCAA:1 + chr3R 28659108 3' + Burdock 179 2 71.92 ATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAAACACGAGCACGAGTCTGTTCCAAAATATGGATGAGGGTGATGAT:1 + chr3L 5179018 3' + P-element 2712 1 34.53 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATTTTTGAAGGCCTGGACCATCCTCTCTGCTGCGGTTATAACCTCTCT:1 - chr3L 22709342 3' - 412 7129 2 71.23 TATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTGTTAAGTAGAAAAGGAAAAATTAAAACATCCAAATTAATCCAACGACATCTAACTACTGTGACAGTGATCGTGGAAAAACTTAATTGGAAATTAATCAATGCAACAATCGAATTAAGTATT:1 + chr2R 3220394 3' - G5 4745 1 73.97 CGTAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATTGACGAATTCGGACCGAAAGTTTTATAAAAAAAAGAACACAA:1 - chr2R 4447998 3' + invader1 327 2 69.86 CACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACATCTCATTTATCGACATCCGTTTAATGTCCAGCAATTTGAATGGGGCAGACCTGAG:1 + chr3R 12045062 3' + accord 108 2 62.07 GAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGCACGTATGAACGTAGAGATCTCAGGAACTATAAACGCTAGAAGGGTGAGATTCAGCGTAAGGATTCTAAAAAAGTGCCTCACAATCGAAGGAAATCATTCCAGCTCTTCGTCTTCTACAG:1 - 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roo 91 2 76.71 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTTATGACTGCTTACAGCAGATACCGAGTGGGGATGGGTAATTAAATTTAAGTATTT:1 + chrX 16635375 3' - roo 8752 2 62.33 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGATCAGCCTTAAGTGGGCAATTTAAGGATGACAGATTAACTAGTACTATCCGAACTGAA:1 + chr2R 5269068 3' + pogo 2042 1 61.64 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGACTTATTATTCTTTAGGTTTAGAATAGAGGAAAACAAGGTCACAGTGATTCGGACCGGTATGT:1 + chr2R 4803037 3' + roo 9015 2 56.85 AGTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATGTTTACTATAGTTATTTCATTATAATTAATTATTACATTATTTTCATTCCGTTGTGCAATCTGTTATGGAATGTCTATAAATTCAATAGTCTTGTTGCTTGTTGCAACCCTTTGGT:1 + chr2R 4522111 3' + Cr1a 4282 1 52.05 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATTGTCAAATTCCAGGCACAATATTACATGAAATCTACAAATAAATAAATAAGTTACTCGAATACCCTAATAACTTAAATACAAACC:1 + chr2R 14722791 3' - mdg1 7074 2 60.96 GTCTTTCCAATTGTGTGCGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCCAGCTTATTGCCTGCTCAATCAATATCAATCATCTCCCTCTGTGCTACTGACTTAGA:1 + chr2R 1920651 3' + Ivk 39 1 56.73 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAATTTTTCACGCATTTGACTGCATTACTTAACCTCAATTGGGCAGACGACG:1 + chr3R 31681940 3' - Doc 32 1 52.94 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGGCTTTATTGTATATCCGATTGCAGCTTCCC:1 - chrX 12998028 3' - roo 8713 2 73.33 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCATTATCATTCACTTTCTATTATAATATTTATTTTGCTGCGTTAATTTATTTGTTATGTGATAGGTATGTTTAGGATACCGAGTTTTTTCCAGTGCCGGATTGCAGGGCGCCTG:1 - chr2R 9339587 3' - Transpac 7 2 80.14 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGC:1 - chr3R 19589930 3' - BS 5072 1 68.97 CCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAAAACAATCCTTTAGCTTTCGAGTTCATTTAGATTAGGTTTAT:1 - chr3R 19543388 3' + roo 366 1 55.86 TGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTTATCTAAATATAAGTGAGCACAGCAGTAGGCCCGTACGTAA:1 + chr3R 21706321 3' - I-element 79 1 69.86 TTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAAATAATTCAACGAATGGATTATATCTTATGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTGTATTCGGATAAATCGCTTGGTCATCGAACACCACAA:1 - 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chr3R 19589875 3' - BS 5018 1 65.75 TTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAATAGAGTAATGTGGGTGAGGTCAATACA:1 + chr3L 18034625 3' + Transpac 5179 2 75.47 CCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGCTGCGTATTTAGAAGCTGCCTTAC:1 + chr2R 5321242 3' + INE-1 512 1 70.55 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGTTCCCACCTTCCACATTTCTACTCCTCCGATCTTAGAAGGAAAGTCCGTAGAAGCTACATATAAATAAATAAATAAACAAGCGTTTAATTGAACCGGAAATTA:1 - chr3L 3756020 3' - hopper 17 1 69.86 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGGTGGAATTACAATTTTATTCGTATGTACAATTCGATTGAAATTAAAGTGAAAAGCTTAACTTTTATTTAACAAAGGGATATAGTGTGTAGTTTTAGCAG:1 + chrX 6423309 3' - roo 19 2 71.72 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTCATGCTGCACCTTAAGCTAATTAAAGAAACTCAAGAGTTCAATCTGATAACATACAAGACATCTCTTCTTAATTATAACCGATAAATATGACATTTGTCTCA:2 - chr2L 11064692 3' - FB 20 1 71.23 TACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTTGTGA:1 + chr3R 1446149 3' - 1360 7 2 27.40 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTTCTATATCTATATCTATTCATAAATGCCAGACCACAGACTGCCACCGCTGTAGCCATCAATTTGC:1 - chr3R 28579472 3' + pogo 2051 1 54.79 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGAGCGTTTTAAGAGCAGGTGAAAACAATCTAGCTATTTTATGTCC:1 - chr3R 5264840 3' - P-element 76 1 32.19 AATACTCTAATGACAAATATTCTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTGGAGCCATCTATAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTG:1 + chr4 311376 3' - 1360 401 1 56.16 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATTAGGGTATCTTCTCACCA:1 - chr2L 5447869 3' + roo 358 2 56.55 TTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGCGTCG:1 + chr2R 11097402 3' - Juan 4064 1 50.68 ATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTAC:1 - chr3R 19589916 3' - BS 5052 1 57.55 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAGAAGCAGGCCTAAAAACGCCGCGCAGT:1 - chr2R 16891788 3' - jockey 4736 1 65.19 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACATATGGC:1 - chr3R 18517951 3' - roo 57 2 66.67 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCAGGCTTCCACTTTGGCTCGCAATTATCGTAGTCTCCTTT:1 + chr3L 9762294 3' - jockey 4778 1 62.77 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGT:1 + chr2R 24021662 3' + pogo 2045 1 59.59 GGGCACTTATGTTTGAAAACTCTGAGAAAGCAGACGCGTGAATATGTCGCAACCGAGGAAGTATTCTCAAGGATGATGCTACGGGAGAGGTTGACCCTGGACTTTATGT:1 - chr2R 11291391 3' + invader6 273 2 56.88 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAGTACAGTAACTTGTAAAGTCCACTTAAGATTGTCCGTCCGCCTGTCTGTCAATTACAATAAATGCATCCTTCATCAGGTTGCGTTAGTGTAGTAAACTACCTTAAAAG:2 + chr2R 8452885 3' + blood 363 2 76.03 ATTTGAACTTGATTTCGTTTTGCTTGTCATTATTTAGAGATATATATAAATGAAAAGATATATTTTAATATATGATAACTTTTATATTCTACTAAGTACTTCTTTCACTTCATAAGTTTGCAACAATTGATGAAAAAGGACGTAGA:1 - chr3L 16257809 3' + accord2 7243 1 79.45 CAAGTGTATTAGATTATATAGAATTGGGTTTTTTTTATATGAGTATATATTATCAGCTACAGTTGTATTTAATTGTTGTTTTCACATAGATTGGCTTTATAATTATAATGTTACAATTTTATATCGATCGTGTAATTTTCATACAA:1 + chr2R 20598862 3' + NOF 4070 2 70.55 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGTATGTGTGCGTGTGTCGATGTATTAAGTGGAAACACCTTGTAAAATGGCTGACAGGTGTTAGAAGACTTTGCAAGATTTATGCGCTGACATTAACATGA:1 + chr2L 12847342 3' - 412 7074 2 69.86 GAGATGTTCGCTGTAGAGCTCTAATCTCTCTCGCTCTTGAACAAAAATGCGAGAGAACTTGTAGCCACTCTAGAGCCACCCAGTGTCTTTGGCCAGGTCGACTCCGCTGTTGATCTTGATCAAGAATATATAAACTTTATATAGT:1 + chr3R 4112110 3' - 1360 123 1 45.52 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATGATAAGATATATTGATATGGAAAGAATAATTTTAATAATACCCATTGCTCCGCGGAGG:1 + chr2R 25252247 3' - opus 59 4 62.33 ATGAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATACGCCTTGTCCAGCTCCGTTTTTTTTTTTCTTGACCCATTTTTATAAGTGAGGTCAGTTTTTAGGAACCGTTCCAAACTAGTGGAAGGAG:1 - chr2R 6492796 3' - copia 33 2 62.76 GTGGAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGGAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGCATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGT:1 + chrX 3797449 3' - gypsy 69 2 67.81 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCGTACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTT:1 - chr3L 5179156 3' + P-element 2830 1 36.00 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAACACTAAAATCTAAGACGTGTCTCGATTAGTTTCGAGTTTTGCTTACTCGC:1 - chr3L 20744184 3' + 412 7486 2 61.76 CGAATTTGAATTTGAATTTGAATTTGAATTTCGAAAAAATATATGTATACCCGAACCGAAACAGCGATGATCAGCGCAATTTTTGCACCCATCTAATCCATCCAACCGATCCTCAGTCAAAAGTGAACTGGCAAAACAACCCACAT:1 + chrX 14187925 3' - Rt1a 312 2 71.92 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTTGCGTACAAAATTCAACATTATTTGAAGGTCGTCCTTTGCTTATTCTGCGCGTCGCTTTTTACTCGTTCGCTCTCTCTTCCCC:1 + chr2L 21251058 3' + P-element 2853 1 62.50 TTGGCGAAAAGGCGCTGAACGTCTTTGAGCAGACCGGACGGGTCTATATTAAGTGGTTCAGTTACCGTTGCCAGTCGCTTGTCCACACCTATGCTTTGAACAAGCTAACCAGGCACACTCCCTGCTCCAGAAGCCATCGAGTAAAC:1 - chrX 18611772 3' + R1-2 403 1 65.75 TATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACGTTACGAAACAA:1 + chr2R 20447895 3' + hopper2 1545 1 58.90 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCAGTGCAACAACTTGTTACTCATGTCCTGCTCACGAAATTCG:1 - chr3R 25137876 3' + P-element 2807 1 30.82 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCAAGGAACCGAAAGGCAAGCTGAATTTTCCAGGATATACATAATCATAATTGC:1 - chr2L 11867262 3' + jockey 4948 1 55.48 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCAAGCATATCCCCAAAGTAAAGGAAACCAGAAAACAGGGGCAGCAAATGCATAAGACTCTGATTAAAAG:1 + chrX 20465936 3' - jockey 4760 1 82.19 TATCTGATAGTCGCGACACTCGACTAAAACGTTCTCTCTTGTTTAAAGAATAGAATATAATAGAAAATTGACAGGACTATTTCTTGCAGTGTCTGAACCTGAACCGCCGTCACAAGCGATGCC:1 + chrX 17816767 3' + INE-1 559 1 42.28 GGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTTATCTAAATATAAGTGAGCACAGCAGTAGGC:1 + chr3R 21706311 3' - I-element 89 1 76.71 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGCTTCTAATTTAGGAAGTATGTGATATATATGCTAATTAGCCTATGTAATTTGTCAACCAAGGCGTGCAGCTGTTTAAAAACATGGAAAACAG:1 + chr3L 20744308 3' - 412 29 2 65.75 TTTTTTTTTTTAAAATAACAGTCGATATCGCTATATAGTGGACCACGTACCTTTGTTCATCTCGAGCGCTTATCGATCGCCCTCCATGCGGACCTGCGCTGGGCGTC:1 + chr2R 6749226 3' - transib2 2631 1 77.57 CATATCCGACTATAACTGCTTTGCCGTCCACAGAGCCTTTAAGTATATAAGCAAAGACATCACATCCATAATTGTTTTATTTTCTCTCCCCACAGGGCCATCAATTATTAATCATTTTTCATTTCACTTTGTTCCGTTTGACTTTC:1 + chr3L 16253289 3' + Ivk 368 1 51.37 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGAGACACCTTACACATGATGTATAAGAAGCATGATGTATAG:1 + chr2L 14480513 3' + Transpac 5151 2 76.03 GTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAGAAGTAATGAAAAAGTATTGTGCTATTGAAGTAAAGTAAATTTATAAGTT:1 + chr3L 2467528 3' - jockey 4744 1 65.75 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAAGGAGATTAAATTTGGAAAACAGGCAAATAATTCAGCAACTGATTTACGAGCCAACTGTGACCGCCGAG:1 + chr3L 16875809 3' - jockey 4762 1 76.47 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTCCTGAAATTGTTTGCCCTCCTTAAAAGTATCTATTATTTTTTTTCAAGATAGAAAGCGCATCTCTGC:1 - chr3R 31650299 3' + pogo 2048 1 52.74 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTTGATTTCCCGTCTTGGACGTGGACTCCATCGCATGTGGCA:1 - chr3R 10461622 3' + roo 9041 1 58.90 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGCGTAAACTAGGACAATGCTAGGAAAGAGAATAACTTGATATTGTTTGTTCGGTATTTATAATTACATAAAGTGAAATG:1 - chr3L 13156683 3' + transib2 2790 1 52.17 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTTATTTGCATAACTGCTCAAATGCATGTTGTTATTGAATTTAGGGTAATTCCTTTCCCTATAAATGTAACGGAATTTCGAGAGGCAGG:1 + chrX 17737307 3' - jockey 4695 1 68.42 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTAAGGAATGGTGGATGGAAGTGATGGAGCACTCGAAGAACCCGTCGGAACAAAAACGATGCGGGAAGTAGTGGGTCTTCGGGGTGTGAGTGTCCTGGCAAGCGAAGC:2 - chrX 14346364 3' - roo 13 2 76.71 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATTTATATATATTTTTTTTAATTTTGCGGCG:1 + chr2L 7271892 3' - 297 6639 2 83.64 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTAAATGATTTTCTTTTAATTCCTCGCCTCTAAAGTCAAGTTCCACTGTATAGTCTTGGACTTTGTCCCTGATTT:1 - chr3R 30782490 3' + pogo 2068 1 59.70 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATACTTAAAATTTAATTTGAGAACATTACCTCGCTCACTATCCATCCATATATGATTGATAATGTGTATTCAATTAATTAAAAATCACAGAAATCACTTAAGTA:2 + chr3R 20090084 3' - mdg1 19 2 72.60 ATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAACTCCCTATATTAGCTATATCGATAATATATAATTATAATATAATATAATATTAATGGAAAGGAACAAAATGTTCTATATAAGAAAATACCACAATAAAATG:1 - chr2R 5173081 3' - Stalker 23 4 68.49 AGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCACAACAATGAACCCCCGACCAATTTACAACTTTGTAATCGAAGTCGCGCTCGCATAACTTAATGGCATTAATTATTTAATTATTTTTATTTATGCGAT:1 - chr2L 11443466 3' + G-element 4162 1 59.59 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGTCAAAGTTCTTTGGTATCGAATGCTAAATCAACAGTGAAATAAGCCAGCACGGAGTTCCAGCCCCTATAGTCCATATAGTCCGTCA:1 - chr2R 11379406 3' + hopper 1382 1 64.38 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCCAGAGATATGCCATAAATTCGAAAC:1 - chr2R 22287410 3' - jockey 4807 1 52.07 TAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATGCTGAAACTGAATCAGAGTAAGAGTCCTGGAGCCGGGGCATCCTGGATTCCGTCGTGTTGTTTCAAACGTGGCCGCTTTGCTCGTTTTTGAT:1 + chr3R 5941541 3' - X-element 31 1 65.93 GCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGTGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGT:1 - chr3R 19450167 3' - roo 104 2 69.86 TGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTCCACAGGTAGTGTTGCACAATTGTTCAATTGAAAGTGGAGCTTATGATTATTTGATAAGTTTAACTTTACGCGGCACTTGTCTTGGTCA:1 - chr2L 4131231 3' + Circe 7137 1 54.11 TAATAAAGTAAAGGCAATGCAAAAAAAGAATTTTTGACACTAAAACTAAACGGCATATTTTGTCATCACCTGGTAACTGTAGTACATCTTCACCACCCACTGATGATCGGACTCGACCAGGACATCGCGCTCGGCGCGTACG:1 + chr3L 19833661 3' - 1360 300 1 52.11 CATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAATCTACTGGCGGCCCATAATGCATCGC:1 - chr3L 7068260 3' + invader4 2906 2 74.00 GAGAATGCTATATTCGAGTTTCCGTCTATCACCTGTTAATCAGCTAGTGGAAATGCTAACATGATATTTTATTTTATCATATCATTGCTGGTGAGTAGAATCTGTCCCTTGAACAGTTCCGTCCAAATTGTTGTCGCTACGCTTCT:1 + chr3R 6267081 3' - INE-1 573 1 53.42 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTT:1 + chrX 7967271 3' + P-element 2813 1 30.37 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAGCAAAGTTCATCGCTCCAAATGTTTATGG:1 + chr2R 20739067 3' - hobo 56 1 76.85 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTCCTCTCTGCTTCTCTTCACGAAGGTTCTTT:1 + chrX 16217564 3' + P-element 2864 1 69.23 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAATCGGGCTTTCAACTGAACGGACGGACTGTGCCCACAGCGAGGGTCGC:1 - chr2L 13717255 3' + P-element 2857 1 63.70 AGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAAAAAATATAAAACAAGAATTGAAAGCATAGCT:1 + chr2L 18117110 3' + roo 30 2 78.77 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTTGCCCATTTATCTTTTCCAGCCCATCGTGCGCGGTTGCGCTTTTTCGTTCACTACTTTCCAGCTGAATTTACGACCATTCCGCTTGGTGTTCACTTTTTATTCAAATAC:1 - chr2R 14940616 3' + blood 7384 2 76.43 GAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTCTCGCTTAAGTAAAAGCATTTACTTTTTGGATTCGAACATTTTAATTAACTTTTGTCATTGTTTG:1 + chr3R 12727150 3' - I-element 281 1 55.48 CTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAATTTTCATGTGTGCTTTTTGTAAAATAATACATCAGCTTGTGTATTTTCGTTGTTTGAAAATCAGAAATTTCCGTTTGCTTTAAATGGCTAAAGCGTTGCCGCTCATCAGTTGT:1 + chr2L 22924904 3' - TLD2_LTR 153 1 64.38 ACAAGCTTGGAACAACACCACGCAAAAAGGCTCTGAGAACACGCAAGAGCAGCCCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACATTCAATTCACGTTTCACTGCCTCTGGGTCAATACTTATTTGCTGTCTCTTACTTTCCCTCACC:1 - chr2R 11639695 3' + G6 350 1 56.85 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGGTTCACTGTTGTTTACTGAATATATGAGCAATGGAAAAGCAATCCCAGTAAAGCG:1 + chr3L 21151183 3' + 412 7481 2 63.01 CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAATTGTGAGAGTATCTGGCCAATGAAATTTATGTGGTAAATTATTCACAA:1 - chr3R 9193151 3' - opus 7183 4 67.12 ATATATAAATATGTATATATATGTATAATAATACACGAGCACGTCAACTTGACATTGCGACTTGTTAAATATTTTCCAGCAAATTCACTTTACGAAAATGTTGTAGATTCCAAAAGATAAACACGGTAAT:1 + chr3R 14728618 3' + G3 4507 1 72.31 CGGGGGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATTTCTAGTCACATTCGGGATTTTTCCAATTATCAAAACAAGATCAGACTGACCCACCTAAGATAT:1 - chr3R 5024762 3' - diver 5894 2 78.87 TAATCTATATTATTTTTTATCAATTTTATCAATTTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCCAAGTTGATTGCCTTCACTGGCAATTTAAAGGAAGTGCCAATCCAAAAACTAAAGAACAAGATTTACAATTTCAATTGCAATGCCTT:1 + chr3L 16047749 3' + 1360 252 1 29.45 AATATTCTATTGTCTTTGTTTTTACTATTTAAAAAAACTTAAAATATTTATAAATTTGTAACCATTCGTGTGACATGAGAGAAATGGCATACCCTTAGTAATAATATAGAATTTTTAAAAATTAAGACCCAAATAAAAAGCACCAG:1 + chr3L 11314566 3' + Tc3 314 2 43.15 ACATGACCTAACTAGGAGCCTGTTTCTAGCCGCCATTGATTTCGATTGGAGAGCAGAAGGAGTAGGAGCAGGGAACGGGGAAATGAGACAGACAAACAGAGGATG:1 + chr3R 27969609 3' - baggins 120 1 66.67 CTCGCTTTTTAATAATAATTTCAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTTAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTTATAGCTGAATGAATCTATGATATGTACTCGAATAGCTTAGT:1 + chr2R 20003669 3' - invader2 440 1 71.23 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAAC:1 + chr2R 22464476 3' - pogo 44 1 52.86 ATTCGTCGGGATTTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCTGTTTCAATTAGATTCACTAGAAACTATATAACCCTTATCCTAAATAATTGTAGATGTAACTTTGCCTCAGTCCCAGCCGCATCTCTCTTTGACAC:1 + chr2R 7620118 3' + Cr1a 4058 1 76.71 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAATAAAATATGCGTTTCCAAAAGAGAGATTGGCA:1 + chrX 17027994 3' + roo 9044 1 70.55 GTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATGTATCCTATTCATTCACAATTCAATAACTAACTATAGTGGCAAATACGTCAGATATTAGCCAGATGGGTGCCTAGGTAAGTCATCTGCTTG:1 + chr2L 5711046 3' - HMS-Beagle 6819 2 65.07 ACTAGCTGAGTGACGGGTATCTGTTTTCTTAACATTCAAGTATATTGTATTGCTATTGAAAATCTTTATAGTTACATAAACTTATATATAAATCTTTATTATTATAGGCATACTCGTTGGGGTAATAAACCCAAATGGGTAAATAA:1 - chr2R 10801813 3' + INE-1 542 1 52.74 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTATGCATAAAAAACGTTGAAAGCAAATGGCCGGCAAATGGTTTTAACAAATG:1 + chr3L 13545068 3' - hobo 63 1 63.12 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATCGATAAGAAAACGAGGGGACACAAAACCGAAGGGTGACTTAAGCCAGCGATTGCTCTGCCATT:1 + chr2L 13140757 3' - blood 11 2 78.08 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCGTCGGCACAGGTATTCCACAAGATTCTGTTATTCGCTTGTGTAATTAACGGATGCGGTGTCAACTAGT:1 - chr2R 18440393 3' - P-element 41 1 54.81 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCGGGTTTTTAGGGTTTTTCCCCCTTGTATGTTTCT:1 - chr3L 18767783 3' + roo 319 2 78.77 CATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAG:1 - chr3R 19450205 3' - roo 8806 2 53.42 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAATTTTTCACGCATTTGACTGCATTACTTAACCTCAATTGGGCAG:1 + chr3R 31681934 3' - Doc 20 1 52.38 CAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTACCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACAT:1 - chr3R 4160059 3' + invader2 194 2 54.11 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTAGGGCGGGAGGAATGAAGGGAAAGCTGGGGG:1 + chrX 5206514 3' - Tirant 8146 2 68.54 CGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTTCCAACGACTTTTCCGAACCGGAGTTTTGAGTTTATAAATAAGTTCCAGTCGGAAAAGTCGTTGGAACAAGAGAGAGGGAAACATACATTATTTTCTCGTACT:1 - chr3L 4134063 3' + diver 69 2 63.01 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCTAGAATGCTAACCATGCACAAGGCATCTCAAATTCCAGGTGTTAAAAATAAA:1 + chr3L 3757231 3' + copia 221 1 62.33 GTGGGTAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCAGAATGTACATAATATATTCAATCCATTTGTTGTTCCT:1 - chr2R 11185718 3' - FB 67 1 73.60 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACT:1 + chr3R 19543493 3' - roo 24 2 52.63 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGTATGAAGTGTTCCGATAAAAAACAAGCGAATGATGAAAGGGGCAGCCCGGAAATTGTGCAATAA:1 - chr3R 21587505 3' - roo 8720 2 56.85 ATTACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCGAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAAAAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATATTTTATAAAATAAAATAAATTCATAAATTATTATATTAATTCGCAGAGATA:1 - chr2L 10450945 3' + I-element 214 1 64.38 TTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Cr1a 481 1 48.42 TCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAAC:1 + chr2R 4677355 3' - invader3 61 2 57.53 AAAGTAGAGTTAATTTGTATGTTTAATTAGTAATGAGTTGTGTTACTGTTTCGACACAATTGTTAACCAATTCCAAGACCATGTTCGATAATAACCGAAACATCACTCTTTTTCCAAAGGTTCTCATCGCGATGAACAGCGTGGG:1 + chr2R 19172716 3' + Stalker3T 59 1 80.00 ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCACACTCATTTCGCTTGCAAAATCCAAATAGAA:1 + chr2R 16496709 3' + hopper 1395 1 69.18 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACTTGATATTTCGAAATAAGGAACATAGTAAGAAAAGTCGTTCATTATTAAGCCATAAGTGTTCTTCTTCTTTAAATTCA:1 + chr2L 5447998 3' - roo 8707 2 56.16 CAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAACTCTGCGGTACCCCAGCCGTGCCTCAAGATATGACTTGCAATAAACAGTTTTCATATATTTATTTATTTTATATATTATTTTATTATTTTGTT:1 + chr3L 13594583 3' - 1360 26 1 51.37 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGGCAGGTTCAGATACATAGA:1 + chr2R 24021689 3' + pogo 2077 1 68.09 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGTGTAAGGGACGGATTTTGCGC:1 - chr3L 10563862 3' + hopper 1404 2 73.02 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTTCAACCATCCACAGTACTGTCGACTATCGATTGTTTGTGTTCGACTAAGATATCGGAGTGGAATGTGTTTGGTTTAAAGTGTGGGCATA:1 - chr2L 2999170 3' - P-element 31 1 64.58 ACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCATTTTTTCCGTGACAACAGAAAAAGGAGAAAATCACGAAGTCCTGTGAATTCATCTGTGCATCT:1 - chr3R 20715719 3' + copia 271 1 61.64 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGAACGCATCTCTAGAAATCGGTCGCTTTCAGTCACAAAACTGCGATCGTTGCGATCGTTTGCCGTTCAAAAAACGTAAAAGTGCGCATCGCCGGCTGAATTA:1 + chr2L 2999337 3' + P-element 2867 1 73.97 AAAATAAAATTGATTAAAAACAAAGCGATTAAAGCGATAATGCGTGTGTAGGTGTAGGCGTGTGAAGAAGATTCAAATTTGCCAAAAGCTCGCCAGAGATGGAGCCACTCAAGAATTTCGGGAGCAAACAAAGAACAGGTGCCCAA:1 - chr2R 16135631 3' + Tc1 389 1 52.05 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATATGTAGGTAATACGAATATGGATTTTGAAACTGGGGAGCATCAATACCAATACAAGGACATTTTGTCCGTGTTTGAG:1 + chr2R 17021439 3' - pogo 39 1 56.16 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATGTTATACAGTGCATGTCAGAATGAATACGGAATTCCTTGCGGACTTCAAGC:1 + chr2R 12814926 3' - opus 7067 4 66.67 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCAGGCTTCCACTTTGGCT:1 + chr3L 9762272 3' - jockey 4809 1 51.37 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTCGAAATTGAAATCAATATGTTTCTTTTCGTTATTTTTAAGAAATTTCCCCCTTTTAGCTCGACTACAC:1 - chr2L 11734503 3' - Doc 52 1 59.29 GCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTC:1 + chr2R 11097349 3' - Juan 4117 1 78.77 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATGCTGGCACCTACTTCCTTATAAGCAGGAAACTCCCGCTGGGGGGAGAAGATGTATGTT:1 - chr2R 14722666 3' + mdg1 359 2 60.27 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATGCGGCTGTTCTGCGAGATCACGTTGTGGTGAATGG:1 + chr2L 13690127 3' - Doc 25 1 66.43 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGCCATGAACCCATGTATCACTTGTGTTGCTATCTCTCTCCATTTCCTC:2 - chr2L 18213085 3' + roo 9041 1 63.01 ATATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTGTGTTATCCTCTTTAGCGTGTAATTTGCTGGAAACCTTGTCGGCCCACGACAACTAGATCCGT:1 + chr2R 24474938 3' + Dm88 4388 2 75.34 CTTTTCATGTTTAAATCTATTCAAATTCTTGGTTAGAACATCTGCCATCATGTTTTCTGTGGGTACATAATTAACTTCTCTCCTTTTACCTTTTCAATTGCATGCTTCTTCATAAGTTACGACCAAAGGTGCAACTTAATAATTAC:1 - chrX 16287480 3' - Dm88 4237 1 54.11 GGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATACAATGCCTAGTCAGTTGGTCTCCGTATTTCGATTTAGGAGGCAG:1 + chr2L 19548517 3' + flea 4941 1 71.23 TATTGATCCTCATCAAGAATACTTTATATGGTCTGAAACGCTTCCCTCTGCCTTTTAAATACTTTTTAACGAATCTGGTATAAATAAAAAAATAAATAATAAAAATACCAGTCCAGCGTACTATATTGACAACTGGGTGAACTGGC:1 - chr2L 20413498 3' - INE-1 84 1 54.79 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCT:1 - chr3R 11773898 3' + P-element 2818 1 39.04 TTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATATATATTTGTTTAAAGTCTTTTGGGGGA:1 - chr2L 5710933 3' + HMS-Beagle 194 2 79.09 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTAATTATCGTCGGTTTCTTGGGCCGTACAGAGCAT:1 + chr3R 10361924 3' - roo 84 2 77.08 TTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTACCAGAAAATTGAACGACAAGCTATAAAGCCGGAA:1 - chr3L 381729 3' + S-element 1631 2 76.03 ATTGTCATACTATTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAAAAAATAATAATAAAGAAAAGTTGATACGTAAGCGTTACTTTGAATAAAAAAATATTACTAAGCAAAAATATTAATATACTTCCTTTAAGCTATGTGATT:1 - chr2L 19817748 3' + G4 3820 1 39.04 CTAGCTGAGTAACGGGAATCTGATAGTCGGGGAAGACGACTATAGCACTGACTCTTGTCGGATTTTGCATTAGCTTTCCTTGCTGCAGGGTTCAATCAGAGTGGTT:1 + chrX 22795113 3' + INE-1 543 1 86.79 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCATTATCATTCACTTTCTATTATAATATTTATTTTGCTGCGTTAATTTATTTGTTATGTGATAGGTATGTTTAGGATACCGAGTATTTTCCAGTGCCGGATTGC:1 - chr2R 9339597 3' - Transpac 4931 2 74.47 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATAGATACGTGTGGGTTTTTACGTCGAAATCAATAAGTGCTTCTTTCGCACTAATCTGAGGAATCAACATCGAAACTAATTATCGACCTCTGAAT:1 - chr2L 6319702 3' - Tabor 6848 2 71.65 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGCCGCCTGGACGAAGACCATGAAGATGAAGGACGCAGGACGGAAAGCTAACGAGC:1 + chrX 2916755 3' - 412 7119 2 61.64 AGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCGAGGCGTACATCACTCTGTCCCGGATGAGGACTTCAAGGAAAGC:1 - chr2R 5640722 3' + 1360 3312 1 70.34 GAAGATATCGTCCTCCACGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCTGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAGTTCAACTTAATTACTGTCGCGATTTCAATTTATTTGCATGTTAATTCAACGATACTTTG:1 - chr3L 7605260 3' - Chimpo 64 1 68.49 CATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTGCTCTTATTTTATTTATTTATTTTACAGACTTAATATGT:1 - chr3R 904627 3' - 3S18 5849 2 73.97 ACTTCAACTGCGGATTTTCTTTCAACATCAACAATCAACATCAATACACTAAATAATATTAATTAAGAAAAATGAGATTCCCGTTATATTTCGCTTCCTTTCATTCCAAGCCGCTCTGGCTGCGCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAG:1 - chr2R 6564024 3' + gypsy7 304 1 52.05 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAATCGGGCTTTCAACTGAACGGACGGAC:1 - chr2L 13717276 3' + P-element 2861 1 59.50 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTCGAAATTGAAATCAATATGTTTCTTTTCGTTATTTTTAAGAAATTTCCCCCTTTTAGCTCGACTACACTTTGAAAATTCTTGAATAAAATTAG:1 - chr2L 11734478 3' - Doc 33 1 61.64 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTTAATTCTTTTGATTTTTTTTTTGGGACCCGGAAGGTTTTACGGTGTGATGC:1 + chr3R 25761546 3' + I-element 5288 1 62.33 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGCTTGTAAAATGTA:1 - chr3R 4532873 3' + 1360 3333 1 60.00 GCATGCCATCCAAGGACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAATACTTGCTTTACAGCTCGGCTGCAACTTTAATTGAAAGTGTTTGTAGTCAAATGATTGGATTTTAAATGAACCAAAA:1 - chr2L 6876591 3' + Rt1a 5016 1 52.74 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCTCGTACGTG:1 + chr2L 19158894 3' - P-element 87 1 26.71 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAGGGTAGGAGAGTGTCTGTTGTCGTCGGAGACCTTGCACCGACCGCTGGCCCATG:1 + chr3R 22522766 3' + roo 9047 1 67.81 TATTATAAATATTATTATTAATATAGGGTAAAATAATAATATATATTAAATGGGATTGTGATTACAAGTAGTATCTTTACCGAAGTTGTAATATTTTTATATTTTTCATTAATTTTAAGCTATATTTTGTGTAAGTTTAATTTAA:1 + chr3L 11398845 3' + Gypsy12A_LTR 1810 1 51.03 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCCTATACGTATGTATGAGTGTGTATGTGTTTTTGTGCCTGTGTGCGCGTTTGGGCCTTTTGTGCACAATCTTACTGACTTCC:1 - chr3R 16530536 3' - hopper 37 1 60.27 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTAATTATCGTCGGTTTCTTGGGCCGTACAGAGCATATAATTCAGATGTGT:1 + chr3R 10361939 3' - roo 8735 2 67.12 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTTTAAGGACTCAAATTTATCGGTGTATGTGTGAGCGGCAGGCGCGTGTTTTCCATATAAA:1 + chrX 10304674 3' + roo 392 2 67.96 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACAAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGTATACCTGTATTGGTTGAATAATCGTGAAAAGGTGTAAAA:1 - chr2R 9390931 3' + mdg1 7379 2 73.29 TAATGACAAATATTTTTATATAAATACCATTAAGTGGCCTTTACTGATTGTCGTTGAGGAGCTAATTGATTTAATGAAAGTAAAGCTGGTCTTGAATGATGTGCACACATAAAAAAAGAGTTCAATATTAAAATATAAATGGGTGA:1 - chr2L 1512714 3' - 1360 394 1 51.37 AAAAATTAAAAACAAAAATTAACTAGCCTAGTTAGGATTTTTTGAAATAAAAAACCACAGAAAACATAGAGCCGAAAAGAAATTATTTAACAAACAAACAAAGAGTGAATTATAAAATGACGTTGCGGATCAAAAA:1 - chr3L 17973299 3' + P-element 2653 4 50.00 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGA:1 - chr2R 9504214 3' + roo 340 2 65.07 CGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTCAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAGCTTGAGAGTATGATATCACTGCCTCTTGCGCCATAGTAAAATATATAT:1 - chr2L 1989351 3' - S-element 70 1 65.07 CGTCTGTCCGTATGAACGTCTAGAACTATAAAAGCTAGAAGGGTGAGATTCAGCGTACAGATTCTAGAGACACAGACGCAGCGCAAGTTGCCACAAGGCGCCTTATATTTCTACGGCAATTTAATTTAATTTAATT:1 - chr3R 7739991 3' + INE-1 128 1 63.97 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGAAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTG:1 + chr2R 16891847 3' + jockey 4944 1 57.24 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGTATACCTGTATTGGTTGAATAATCGTGAAAAGGTGTAAAAATTATATTAATGTAAAAAATGACTTACCAAAAGCATAATGACG:1 - chr2R 9390889 3' + mdg1 384 2 51.37 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAATTATAGCTGGGGCCAAATTAAACGCGCAAAATGGAGGCAAAAATTTGATTTGATGATGTCTAAGGTCGCCGGCAAAGACAG:1 + chr3R 23668554 3' - pogo 19 1 68.70 AAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCATTGAATGCGAAGCTCTACCCGAGGAGATTTACGATTTTGGGGGC:1 - chr2R 19432902 3' + roo 278 2 60.00 TACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACGCCGCCAGATTCAGTTGCTCGAACGCAAGTTGGCAGCAGCTCATCAGGTAATTCCTTTTGCAGAATGGGTTCGGTAATATGTATATGTA:1 - chr3R 11439843 3' - P-element 411 1 60.99 TTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTACTATCCT:1 - chrY 680442 3' - invader2 21 2 63.64 GTATGGCCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGTCATGAGTTTAATATTTTTTTTTTCGCATGGTTCTTCGGGATCTCCATATGCATATGGATGTGAGTTGATG:1 - chr3R 17965376 3' + 1360 3372 1 73.79 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGTCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAG:1 - chr3R 10461664 3' + roo 407 1 66.67 ACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACCACCACCCCCCCCCCC:1 - chr2L 14858820 3' + 412 7536 2 74.47 ATGAACGGAGCCCAACATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCACCAAAACGTTATGACAATCGTATG:1 - chr3L 9519582 3' - roo 35 2 75.00 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTATCATAAAAATCTGGGAAACAAATCATATCGAAAC:1 + chr3R 14494088 3' + roo 8988 2 76.71 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGATCAGCCTTAAGTGGGCAATTTAAGGATGACAGATTAACTAGTACTATCCGAACT:1 + chr2R 5269065 3' + pogo 2039 1 63.70 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTCTTATTAGCAGTATTTGTTTATTGTTATTATTGTTTTGTTTTATTTGTTATTGTTATTAGCAGTATTTGTTTTATGATACAACATTATTG:2 + chr2R 17187823 3' - roo 8694 2 41.78 CACACACACACACACACATTCAGCCGAAACGCACGTGCTCCAATGAAAACTGGGCCACACGGACAGAACCGTGGACGGACAGTAAATACGGACGGACACG:1 + chr3L 7032363 3' + accord 7032 2 80.00 ATAGTAACCCTATTCAATTCTTCAATTATTATCCACAAAAGAACTAACGCAGTCGCGTCGTGCTAAGTGGAAAAGAGTTAACCAATGGTACTCAATCCCATAAAGTGACCACGAAGTGATTTCCACATTTGAACATTCTGCGTATC:1 + chr2R 10522731 3' + rover 402 1 78.77 TACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTCGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCAC:1 - chr3R 29091297 3' + rover 276 2 66.90 CGAGCACTGGGTTTTTTGCGCTGATAACACGCACACTCGGGTGTGCGATGGTGTTAGTGCGAACTACCGTTAGGTATTATAATAATAATGTTTAATGTAAAAGAATTTTTAAGTCAAAAAACTTAATGTTGGAAGACCAAATTTCA:1 + chr2L 6023055 3' - G6 196 1 52.05 AGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATT:1 - chr3R 4160065 3' + invader2 189 2 57.93 TAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTAATACGAAGAAGCTCATTTTTTTCGAAAATCCAGCTAACACAG:1 + chr3R 29112962 3' + Juan 4141 1 70.55 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGGTTAAGGCTGTTACGTGCCGCTGCATACTGCAAGCGGACAAGTCTACTGCTCACACTTTGATGGAGCTGAATTCAGGTAAAAAAAAGCTTTGTCAAGCCGATGCTTATATAC:1 - chr3L 22883875 3' - roo 8673 2 81.51 TTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTCAAAACTATCTTCTTGTTGTAGAACCGTATATACATATGGTTTATAAATTTCATCTATTCGCTAAACTTTAATGTTGTTGTAATATTTTGCAAAACCA:1 - chrX 17457543 3' - jockey 4840 1 69.86 AAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTGCAGTTACAGTTACAGGGAAGTTGCGTTGGCACTGACAGTCGCAGACAACACTCACACACATATAGATGGGCCATG:1 + chr3R 27859608 3' + hopper2 1567 2 57.53 ATTTATATTAGAATATTTTTCACAAAGTGGAACTCCTTACAAACAACGATGGTTCAACAGAATGTTATCAAAATCACTGTTAAGCTGTCCAGAAGTATGCAACAAATTATTTCGACGGACAGTGATAGCTCATTGCATACTTTTGA:1 + chr2L 12958091 3' + 1360 391 1 78.77 GAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTTCTTCGTCTAATTAAATTACGTAGCGGAAAAAGAAAACTTGTAAC:1 + chr2R 5045713 3' - invader6 19 2 71.92 CCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCC:1 - chrX 11267728 3' - roo 8756 2 81.51 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTT:1 + chr3R 6412038 3' - Tirant 8155 2 65.74 TCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATGCGGCTGTTCTGCG:1 + chr2L 13690106 3' - Doc 10 1 69.16 CCCAGATGTTATTGACCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACCGCTGCTTTACATTGTCGTACCTTGGGTTTCTCAGTAAAAAGGCCCAAAGCAACCCCATTCGCCGGCACAACAG:1 + chr2L 16005927 3' - Circe 5 2 58.22 ACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATATATATTTAA:2 - chr3R 9175182 3' - Juan 47 1 45.21 AATAGAGATGACATGTTTATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTG:1 + chr2R 15822098 3' - invader6 47 2 47.95 ATAAAAAACATTAAAAAAAAAACCAAAAACATTGAACAAGTGCAAACAATTATTGTCAAAAACAGAGAGATTATTTTATTTTATACATTATATCCGCCGCGATTTTTTTTATTATTGTTTTTGTTTTAAGAAGTGTTACGTTAAAA:1 - chrX 19898557 3' + Doc 4692 3 48.63 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGCCCGAAAAAGTATGCTACGCTGTGTGACAATACACAGGGCGTATGGGT:1 - chrX 6484680 3' - jockey 36 1 61.81 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACGACAGACCATTTTTCATTTCTATTGATGGGAATTGCACTTATTAATATCAATTATTGAGAATAATCTTATATTTTCTTGACTAGTATC:1 + chr3L 18792541 3' - roo 32 2 62.33 AAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGGAGATGTATATGAATATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGC:1 + chrY 2720332 3' + HMS-Beagle2 7145 2 55.86 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATATACCTTTATTTATGTATCGATACATTTGCTTAATTTTATATACCTGATGGAAAGAGTAAAACTAGATGTGGTAAATTT:1 + chrX 13385129 3' - opus 153 4 49.66 GATGTTAGTAGCGCCTTTTGCCTAAATTTGTCTATGCTTTTTATATTTTGCCTTTTAAGACAAGTTTGAGATTAGCCGATCGGTTCTGCTGGATGAATGGATCAAAGGAGTTTAGTATGTTTCGATTCAGCAGTGGCAGATTAAGC:1 - chr3L 11659085 3' + transib3 485 1 75.34 CCAACACACACACACACACATAGAATAAAAAACGAAATGGCACGGAGGAAGCAGCGAGGAAGAAGCGAGGAACGAGCAGCGGAAAGCGGAGGCAAAAACAAAGTAGCGCC:1 + chr2L 11362925 3' + accord 182 3 73.64 AACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAATTACCGTTTGAGGCCGACGCTTTTGGTGCCCAATTTGCTCAGTTTGCC:1 - chrX 12464576 3' + F-element 238 1 64.44 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCCATACACACATAGAGAGTATTACGAAAATCATCGAGCGGAAGACTAGAAGGGTAACACTACTGGAAAGTTATCCGTTGA:1 - chr2L 6755711 3' - pogo 40 1 58.22 TGCATGTGTGAGTAAAAACAATAAACGTGCACGTCTATATGCAAAACGTTGCAAAACTTCAAGTAATCTCGTTATTCAGCAACTCCCTCTCTCACGCTCTCTGCTCTCTCCTGGACTCACTCAC:1 + chr2L 12483200 3' - 1360 3247 1 55.65 ATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTTGTAATTTCAAAATTATTATTATTTGTATAATGCAAAAAAATACATTGCGTATTTGTGCTCTTAATTTATGTATTTCGGTGAAGTTTTTTGACCGTGACAC:1 - chr2R 14109795 3' - P-element 2550 1 36.30 GCGAACAGCTCTTTTCTACACATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATTATGTGTGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCTTTCTGTCTTTGGTTCGATACTAATCAGTAATTCGGTTGCAGGACGAGACAGGAGCC:1 + chrX 1514476 3' + 1360 134 1 60.96 AAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCCCACTGTGGCGCTCTCTCTCTATCTCTCTCGCCCGCTCGATACTCATCTGCTCTCCGTTCGGCCTCCCTCTATCTTTCTCTCGCGGTAAGCTTTGCTTGCCTTC:1 - chr3L 13477381 3' + jockey 4660 1 79.23 ACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACCTCGAATTGGGAATGCCTCAACCTTTCCCAACACCACCTAACCCCCTTGCCATGCACTTAAATACCCTTAGTTGGATTGGTAAGGATCGCATCG:1 + chr2R 13193904 3' + BS 5067 1 59.59 AGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTTACTCGAATTATGTCCATCTTCGTTGCAACCAAAACAT:1 + chrX 22574745 3' - 17.6 6964 2 56.16 CAGACAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATGATCTTGTCCATTTAAGTTGTCAACTCCTAAATAGATGCAATCCTATTAGCCACAAAAACGTTGAATAT:1 - chr3L 26131066 3' + G5A 2615 1 57.01 CGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGATACGATGGAAGCGACCATACCGGAGAAGAAACCACCATCTCGACGAGGGCGCAAGGCTTCCGCGAGTGTCGATGAGGAACAGCCAGCGGCCAAGAA:1 - chr3R 16459668 3' - 1360 3185 1 70.77 GCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTC:1 - chrX 14317418 3' - 1360 99 1 78.77 AGCAGCAGCAGCAGCAACCACAGCAGCAAGAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAACTGCACTTCAGATCCCAAGCGCGGCCTTAACTTGGCCCGTTGGCG:1 - chr2R 20219535 3' + Max-element 268 4 63.46 AATATTTCATATTTTTTTTTTCGCCTTTTCATTTAATATGGAATTATAACAAATTCAAGGTTGACTGAAATTTCCTCTAAGTGCCAGCTAACTAGCATTGAAAATGGGATTGCGAATCGCGTGTTGCATGACCATATACCCACATA:1 - chrX 14152280 3' - P-element 141 1 67.12 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTAAAAACGGCCATAAATTAAACATGCCGCCCGCAAAAGTATGCTATGGATTTGAACTCGGATTGCGAATGCGCTGAGGCGTGCGAATGCCAAAGTTACCAGAAAAAAGAGCTGGC:1 - chrX 19818369 3' + jockey 4982 1 76.92 GACCTATGGCTTCGAGCTATGGGGCAACGCATCGAGAAGCAACATCGACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAGGATAAATTGGCAAATATTGACAGGTGTATTTATGTGCGTGTACATTTGTATATATGTACATATGAACTTAACAA:1 + chrX 18646117 3' + Doc3-element 4323 1 51.37 GTTTGTTATTTTTTTTTTTGTTTTTTCGTTTTCTTGCCTTAATTAATTAT:1 + chrX 7525660 3' - gypsy7 5014 2 94.00 GATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCGGCAAATTAGTATCAGTGCATTAGGCCTTGGCAACCAATATATATTTCTAGGAAACTATTT:1 - chr3R 5115285 3' - Ivk 61 1 56.55 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGATCAGCCTTAAGTGGGCAATTTAAGGATGACAGATTAACTAGTACTATCCGAACTGAAATCG:1 + chr2R 5269072 3' + pogo 2046 1 58.90 CAAACAACTTAACAAATGTTTCACTTTTATTTCTTCAATAGTTTCACTTTTTAAAAAATATTGATCATTTCGGGACTTTACGTTTGTAAAACCAGACACTGCTACCGCTGGGTGCAGCATAAGTGAATGTATGTACACACGCGTA:1 + chr3R 18329005 3' - HB 1510 1 70.34 ACTGGGGAGGGAGGAGTTACCACAGTCACCACACCCCCTAAACCCCCACGCCTACACCACTGAACACATCGACGCCCATGGGCACTCCGGTACAACGAACCGGGAATTAGGGCATTGATATAAAATTTTTATTAATTTTGCATTTG:1 - chr3R 7363836 3' + Tirant 8096 1 72.60 CTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATTACCTACCCCATGTGTGACGATAATTAAGTTC:1 + chr2R 3120332 3' - accord 43 2 47.86 GGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGCTTGTAAAATGTATTTCCATATTTTGAACCATAGTATTTTACTTAATGTACACCAGTCTTTT:1 - chr3R 4532824 3' + 1360 3376 1 76.71 GGGTGAAGAAAAACCTTAATTGACTATGGTAGAAATAATAAAAAGTCTGTGCCTTTCCGAAATAGACTTCGCATTACCCATTGTTTTGAGTACGAAACATCCTTTGCTGTTATCTGGTCCAGTGTTCTTCACTCGCCAAC:1 + chr2L 10023390 3' - Juan 4027 1 52.86 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCCTTGAAAATTGCATTACCAGTTATGAGGGTGTTGGAAAGCAAAAAGTAAAAAGCGAAAAAAAAGGGGGGAGCCGCCGGGGCTGCAGGATAAAGTGTCCAGCCAAAAA:1 - chr2L 12832798 3' - I-element 15 1 73.97 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTACTTTTGGGATAAAACAAAATACAATCTTACAAAACAAAAAGTTAGAATGGTTTAAATTTATGTTCAAAGT:1 - chr3L 16907758 3' - jockey 58 1 50.00 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTCACACATTAAAAATTCATTACTTGCTGCTTTTTTCAAAAACAAAATGGCTCAATTGAATACGAGGAAATGTAGAGGTTATATGAATTTTTAAATT:1 + chr3R 31650453 3' - pogo 7 1 77.61 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACTTTTATACATTGCTCTGTGCACCAACATTTCTTCGCGACGAAAAGAAATCACCAC:1 - chr3R 8586418 3' - pogo 62 1 62.33 AAAATTTTAAAATTAAAATGAAAAGTTATCGTAAAAGACGATTACAAAAATGATAGTAATTCAAAATTACTACTCTTTTCAAATTTTAGGACAAGTTTGTTCCAAGTGCAACACCGATAAATGGAGCAAGCAATTCGAGACTTCAA:1 - chr3L 18137645 3' + 1360 3039 1 34.93 GGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAGGATATTTCCAAATAAATTACACACGCAATATCTGTAAATCGTTTTAAGAGTCGAAACGAATTGAATATGATGTCCGGTCGAGTGCAGATTATATT:1 - chr3R 18521587 3' + roo 311 2 58.74 ATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATATATATTTGATTAAAGTCTTTTGGGGGAAGTCTACGATACA:1 - chr2L 5710920 3' + HMS-Beagle 6970 2 74.83 AAAAAAACAAAAAAAAAAGGGGGCAACTTCATGCCACTTTCACCACCTCCGCCGCAGCCGTCCAAAAAGCCCACCTTTGAAATA:1 + chrX 9384826 3' - hopper 139 2 65.48 GCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGGCACGACCTATCATCGCCCATTCCGCTGG:1 - chr3L 3027799 3' + hopper 1380 1 65.17 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGACTGGCTCTCTAGTTTAATATCCTTGG:1 + chr3L 10564034 3' - hopper 16 1 72.54 ATCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAACTTTTCAACTATATATTCCTTACACCCAAAAGTATGTTACATCAATGGTTACTTGTATGATATGTATATACCGATTAGACAATAATATTATTGCAAATGCCGGCGTTT:1 - chr3R 22530581 3' + BS 5082 1 74.66 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATTATTTTTACAGTTGCATTCCCAGCTCGATTCTCGAGTGCCAAG:1 + chr3R 21587655 3' + roo 393 1 73.29 GAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGAATGTGTTATATTTGTTTGCGAACAATATAATTTATCTTAATTCTTTACAAACTATCTTAATT:1 + chr3R 5024914 3' + diver 6052 2 66.44 GTGTGTGTGGTGTTGTGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTCTGTGCAGTGGAGCATCGTTTTATTTATGCTCATAATGCTGCGCAATGAATAATTATGCAAATGGAGCGGCTTATGGTCAA:1 + chr2R 12839583 3' - gypsy3 414 1 78.77 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATGGGACAGCACTGTT:1 + chr2R 22464497 3' - pogo 29 1 63.01 ATAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGGGGCAGTGGGGCATGTTGCAAATGTGTCTGCGCTGTAGGCAGC:1 + chr3L 15276755 3' - hopper 29 1 63.50 ACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCC:1 + chr3R 1844832 3' - Cr1a 188 1 71.23 GAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAATGGGTCCCGGGTAATCTTACGTTGGAAGTA:1 - chr2R 2552123 3' - HMS-Beagle2 80 2 78.99 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTGAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTACCAAGCCTATTTACGGTTTAGCCTTTCGCTCTTTATTTATAGTTGTTGGCTTTTTTTTAAATC:1 - chr2L 7449689 3' - roo 58 2 58.90 TTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAATAATACGAGGCTCAACAAATCCTTCATCTCAATCCCAGTGTTGCGCTAAAAAGTAGGCA:1 + chr3R 30622077 3' + BS 5028 1 57.53 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTGGATAGCTTGATTTTACTTATCTTTAATAATGGTATTTTAAGCTCACTGTAGTATGTCAAACCATTAGGAAAATCTACGAAAAACAT:1 - chr2R 9091913 3' - 412 34 2 62.33 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTATTAAATATATACTTTTAGTTACTGCATTTTTGGCTCATTAGAGGTTCTTAACATA:1 + chr3L 18164234 3' + pogo 2042 1 74.66 AGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTAAACTTTAACTATCCGGGACTTTTGAGCAGTTCTT:1 + chr3R 18541372 3' + hobo 2872 1 70.34 ATCAACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTTAAAAAACCTTTAAATCAAATGAGTGGCTCGCCAAA:1 - chr2L 5800057 3' + FB 341 1 77.66 CTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACTTAGCTTATAATTATTTTCCGAAATCGGTTTTAATCTGTTTCAAGTGGCTTTTCAACGTTTTTCTATATCGGATAATTATGTTCTTTAACGAATTTAAGCAGCATATTAATAAA:1 + chr3R 12727286 3' + I-element 5350 1 73.29 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCCCCGTCTTGGAACTGGACTCCATCGCATGTGGCACGGGAACCCCC:1 - chr3R 10461611 3' + roo 9053 2 72.41 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATATAATCAATATAATTATAGCATAACAAAGTTTAGTGACACACACTTTGAGATCTGCGTTCAATAC:1 + chr2R 9092065 3' + 412 7488 2 60.96 ATATTTTTATATTTTTTCTCATTTAATAAGTTTGCAAAAAAAAACCTAGGTACCGTGAAATGGTTATAATTAATAAGATTACCTAAAGAACCAATTTCAGAAAGGTATTTACATTGATCCCTCATTTTACATAACATTAATTAAGA:1 + chr3L 5185448 3' + INE-1 468 1 68.49 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATTGGCCACTTGTTTCTAAGCGACGGCAGAGCAACCTGCTGTCATGAATGAACGG:1 + chr3R 16228913 3' + P-element 2821 1 38.46 AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACTAAGCACCCACACAACGTAAGCCATTGCCATTTTGTAGC:1 + chr3R 16530641 3' + hopper 1350 1 69.23 TATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTGTCCAAG:1 + chr3R 29091397 3' - rover 52 2 56.85 ATTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATCCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAAAAAAAATAATAACAAACACTCTTTGTAGTTTCGCGTTCAAAGCTTTTTAATATGAATCTACATTTTTGTTTT:1 + chr2L 13934106 3' + F-element 4617 1 62.33 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAATTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCAGCATTTCCTTTGTGGGAACTGGTTTTGCTCAAATTGCGAAATGC:1 - chr3R 10361864 3' + roo 331 2 69.86 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACATTTTCCGGTGCCGCCATGGTGGGTACGTTCACATCCACATTCCCATTT:1 + chr3R 22624800 3' + blood 7354 2 58.16 GCCTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAGTTCTACATCATCAGCATTCATGGACAAGAGAAGGCCATATCAGTCGATCGATTTATTGGCCTATCGCGAAAGCAAGCGCGAAATTTAAAAACCCAACG:1 + chr2R 13552507 3' + Chimpo 4000 1 65.97 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAATTATTTTCCTTTTTTCCTTCCTACGGC:1 + chr3R 6412099 3' - Tirant 13 2 73.13 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCTTTTCCTTT:1 + chr3R 6412084 3' - Tirant 8115 2 76.32 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGACTGGCTCTCTAGTTT:1 + chr3L 10564023 3' + hopper 1393 1 67.15 GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCCCTGTGCATATACATATGTACTCGTATGTATGGCATGTAAAAACAATCAGGACAAGATCTTCAGGCCCGCTTGGGTCAGTTGGTTCCCTCATCTTCCTTTCTGTC:1 + chr2L 15906147 3' + Tabor 7307 2 73.29 AAAACACTAGAACAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGTACTTGCCAAGCTTTGCGTGGTAAGTTGTAAGTTTGTAAATATTATTTGACTTACAAAATAATTACATA:1 - chrX 19505027 3' - 1360 3386 2 52.74 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACATTTGCCTTTGTTCAGGGTATTCCCAGCTCTTTGCTCTTTTCTTTTTTAGATGTTTTCTTGTGCTTTATGGGTCTTTTATGT:1 - chrX 5366120 3' + pogo 2065 1 60.69 GCATATTATTGATCAGGATCAACAGCCGAGCCGATCTGGCCCTGTCCGTCCGTATAAAACTATAAAAGGTGAAGGTTGAGATTAAGCGAAACTCGCGATCAACGTCAAACAAATAACGGTACGATAAATAATGAAGCCAAAACCCC:1 - chr4 369210 3' + INE-1 82 1 59.59 CAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTCGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCACCCTATTTTGCGCAATTAGATGTCATTTAATGCTTGATAATTCGCCTA:1 - chr3R 29091250 3' + rover 7273 2 69.18 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTCTCTCACTCGCACACATTCGCCGAGACTTCTCTTTCTCTATGCGGGTATTTAAATTTAATTTGCAAGCTGACAAAAA:1 + chr3L 5179279 3' - P-element 19 1 71.23 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAG:1 + chr3L 10564006 3' + hopper2 1560 1 51.37 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTTAACCAAAACCATACCCATTCAGTCGACAAGCAGATTTGCCTAATTCCATTTCGTTTCAGACTCGTTTCGGGCTCAATTAAAACCATTTACACGTCGCACTTTACA:2 + chr2L 1277951 3' + I-element 5342 1 75.34 AATTGTTTTTTTTTTGTTTTTATATTCATATGGGTTGTGTGGCAAGCATTTGTTCAACGTTAATAGCACAAAGGCACACAAAAACACATTGTGAATCGAAACTCCAACAGGGGCAAATGCAACTCTGTGGCCAAGGTGCCAACACA:1 + chr2L 16201495 3' + Tc3 88 1 78.77 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTGAGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGC:1 + chrX 10824048 3' - pogo 38 1 53.57 ATTAATAAACATTAAAAAAAAAACCCCACTGAAAAATAAGAAATCTAATAAATGCTTCTATTTAGGAGGTTTGAAATAAA:1 + chr3R 24228683 3' + Doc 4691 1 86.25 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATCAAATTTATTGTATAACATTTTCATATATGTATCTTTTCCTTAAAAGAAAAGCATAATTGCTCCCAAGAACATGT:1 - chr3L 19574026 3' - 297 6621 2 58.90 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTTCCATCAACA:1 - chrX 2518023 3' + P-element 2824 1 41.10 ACTTAGTCATTATAAAGGATGATAATCTACCACCAGCTAAATGGACTATAGGCCGAGTCGTCGAACTGCACCCTGGATCGGACTCGCTAGTCAGAGTGGTTACATTAAACCGTAGGCAGGCTGCATCCTTTATTCCTTGCTCATCC:1 + chr2R 10698316 3' + diver 5648 1 74.66 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAATAAAAGTTGCAATAAATTGTAGCATACTTGTGAGCGGACGCAGTTAATTTCTTAGCCTGCCACCTACGACCCATTGGACAATTTATATACCGC:1 - chr3L 15853459 3' + jockey 4968 1 60.96 CGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATGTACATATGTCTATGAGGTGTCATAACAAGATAACTT:2 + chr3L 20209626 3' + Burdock 175 2 76.03 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTAAC:1 + chr2L 19643612 3' - hobo 50 1 59.40 AGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGTGAGGATTGTGGAGTAACCAGTTTTTCTTTATATTTAAAACAAAATGTTATCACGTCTGTGTGAATAACTAGCTAGAAGGCGAAAACCAAACCCAAACGTCTTAACCGATCTTTTGGCGAT:1 - chr3R 14566531 3' + Quasimodo 261 2 77.40 CGATATGCTAGAAAAATATTTATATATTTATTTAATATTGCTGTTGCCTTTCGAGAGTTTCAGGGCTGCTGAAATTTCAGCCCTCAAAGGTAGGCTACACCTTTTGCCATTTGATGGGTGAGGGAAACTTTGCTTGGATTTCCGAT:1 + chrX 684881 3' - transib1 1986 1 69.18 CTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGGGCCCTGCCTAACACATGTGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGT:1 - chr2R 1320653 3' + diver2 359 2 66.67 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCCAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGGTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGG:1 - chr3L 18199952 3' - Doc 70 1 63.45 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCCCTTGGGCTGGCTACTTCCTCGCTTCCCTCTCCTTTG:1 - chr2L 18178287 3' + Tirant 380 2 57.83 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGAAAACAGTAAATTGCATTTTTATACAATTTTCCATCATTTGACTTGGCAGTTGTTCGTCTGGGCTTTGTAATTTTCAAATGAAATACTTTC:1 + chr2R 20700755 3' - mdg1 31 2 64.38 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTGTGACTGTCTCTCT:1 + chr2L 18213220 3' - roo 57 2 58.22 AGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAGGTTCGTTGCACCATCGACAACGTAGCCATGAGACCATTGAATTTGAAAAGGGTACGAAGATCATCTAAATCTG:1 - chr2L 2139706 3' + I-element 65 1 50.68 ATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGACACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAGGACAACAAATTTTT:1 - chr3L 27356039 3' + Tc3 1678 1 67.12 CGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATTGTGCCATAAATTGTTGCAATGTTGGCCATAATAATTCTACTTTCCGCCACAAATCTC:1 + chr2R 22980821 3' + jockey 4757 1 61.11 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGCTTGTAAAATGTATTTCCATATTTTGAA:1 - chr3R 4532858 3' + 1360 3342 1 53.42 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAAACGACGATGCCAATTCGTGACGCCAGTGACTTCGGCTTTCGGCCGCCTTTC:1 + chr2L 13717392 3' - P-element 49 1 46.46 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACAAAATGGGGTAGGAGAAATCTGAGGCAACTGCGCTGCTCAGTGAAAAGTCACGTACCAACTGTTGAAAACACATCGTAAAACGAGAAACTTTGCTCCGCTCGGTTCGCTTAAAAGGCA:1 - chr3R 20939079 3' - jockey 4677 1 80.14 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAAAAGCTCC:1 - chr2R 12069574 3' - Tirant 8155 2 59.02 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGCCACTCCCCTTTTCCC:1 - chr2L 9319091 3' - jockey 66 1 60.00 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTTTAAGGACTCAAATTTATCGGTGTATGTGTG:1 + chrX 10304646 3' + roo 320 2 78.08 TGCCAAACAGCTTTTAGCAATTATTAATTATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTA:1 + chr2L 15322947 3' - diver 292 1 52.74 CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGGCGTCAATTTGATCTTGACACCATGAGCATGAACCGCTTTCAAGCATTTAGTTTATTCATTTAGCTA:1 + chr3L 20388230 3' - 1360 47 1 52.14 TTTTTTTTTTTGCATATCTTCATGGGAGTGTGGCAGTGGGTTTGGCTCCATAATATGAAGCACAAAACGACTGAAAGCAACGACTAAGGTACACCCTATTATTATTATTATT:1 + chrX 21014721 3' - TART-A 13401 1 81.25 GAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGCCGCATGCATTTGTGTGCCATGGTCAAGACAAACGTACAGTGACATACGTGCGAGCACTGAGTTTTTCT:1 - chr2R 7899195 3' - roo 9056 1 52.74 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACATCTTGTGCATATAAAACCCCCGGGGATCCAGCAGAACACAC:2 + chr3L 2184953 3' - jockey 85 1 70.55 CTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATAAACAAATTAGCACTAAGTGATATTTTCACATAATCAGTACTTTCCGA:1 + chr3L 25482998 3' + accord 7355 2 58.06 TTTAACTTTTTTAAGTTATTGTATATTCTTTGGAACTATAGTGGTTTTGGACTAGAATTGGAACAGTATGGCAGCCCTGTAACTACACTTGGCTTACGATTACAAAATCGCAACTGTGCCTCCAACTCCGCAACTGAAAACTTGTT:1 - chr3L 18078539 3' - HB 315 1 78.77 ACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAATAATACGAGGCTCAACAAATCCTTCATCTCAATCCCAGTGTTGCGCTAAAAAGTAGGCAATGATTTTAGTGCTCTAGGTTTGCTCACGCATT:1 + chr3R 30622110 3' + BS 5061 1 62.33 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATGCGGCTGTTCTGCG:1 + chr2L 13690106 3' - Doc 49 1 50.68 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAG:1 - chr3L 10563884 3' - hopper 53 1 54.11 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTATAATGACATTTCGTTTGGCATTTGGGAAAGTATGAAATT:1 - chrX 6423193 3' + roo 320 2 75.34 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAAGCTTGGATTTGCTTGGCTTGCTCCATACAAACAGGAAATGGCCA:1 - chr3R 20074564 3' - roo 76 2 69.18 GCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGCCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGTGTTCTAGTATTTTTGTGCTATGTGTTAATCGGCGACTATCGACAGTTGCCCA:1 - chrX 4540608 3' + 1360 3324 1 62.33 ACTGAATTTAAGTGTATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCT:1 - chr3L 13228483 3' - P-element 48 1 29.45 ACATATTTAAAAAAAAAAATAATTAATGCAAGACAAAGA:1 - chr3R 15841229 3' + TART-B 10508 2 89.74 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAATCTGAACAATGGGATTGGGAAAAGAAAATAATTTATATAATTCTATTATAAGCCAAAATAATAGCTTTATTGATATCTATGCATAATCGCA:1 - 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chr3R 17615033 3' - mdg1 31 10 69.44 TTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCT:1 + chr3R 26244710 3' + copia 224 1 52.43 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTAAGAGTTAAATCGTCGTCGTCGTCGTGATCCGGCATTCAATGGATAATTACGTACATTCCCGACAAAATGCCGCACACTCGTTTCTATG:1 + chrX 18737339 3' - I-element 22 1 68.12 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGGGCATCTTCGGCAATTTGGCCTTCGTGCCCGCATCGCATCATCTCGCTCTTTCCCTTGCTCCCGTTCAGCCTTCCTC:1 + chrX 21281277 3' - P-element 26 1 64.62 ATGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTGCGGCCAGCTACAAATTGGGTCCTTTTAATTGCAACCAGATCACCTGCTTTGTATTTGTATTCATGTTGTTGAAAGTTTATTTAAATTAGTAAATGAGAAATGTAGTTGTTGGCCG:1 + chr3L 2698837 3' - flea 4561 1 63.89 GAAAAGAACGAAACACGGCGAAGAAAGCCCTCAATGTCCAACGTGGAGATCAGGCGCTTGGTTCGGCATTTTTAAGTGCATCTGATTTTTGGTAGTGGCCAGAGCAGGCAGG:1 + chr2L 19734492 3' + Tc1 497 1 60.71 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACCAGTTATAAG:1 - 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HB 374 1 78.08 TGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATCATCTAATACACGGGCTGTCAGGCCAGGTGAGTGACA:1 + chr3R 18697954 3' + 297 6895 2 78.77 GAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAATTTCTCTCCGTGCAAAGGCCACTAAACCAGGCCAAGCGCTGAAAAT:1 + chr3R 29405907 3' + Stalker 6846 2 68.49 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATACTTAAAATTTAATTTGAGAACATTACCTCGCTCACTATCCATCCATATATGATTGATAATGTGTATTCAATTAATTAAAAATCACAGAAATCACTTAA:1 + chr3R 20090081 3' - mdg1 22 2 70.55 AAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCAAATTGATTTTAATAATAAACGGTGTGCATAATTTGGGATGATATTTTCGCCGTTACCTCCAATCTTACAAGTGTTGACTGTGGCTGAATAAGAAGGCTCTTTGCG:1 - chr3R 17209959 3' + HMS-Beagle2 7183 2 75.35 GACGATGAAAATGATGAAAAACCAAGAGTGGGGGAATCTCGAGATATACAGACTTTAGAGTTTATCAGTAGAGAAGAATTTGTAAATAGTTTAATTAATTAATATATTGGTGCCCATTATACAATAATCTTTACT:1 + chr3L 9020098 3' + Juan 272 1 61.48 ATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGGAATAGCCAAATCTTTCTTGGTTTAATTCTATTTTATTTAAGTTTAACAAAACGCACAAAACAGTTTTAAGTAAAAAA:1 - chr2L 12172474 3' + 1360 274 1 56.16 TTTTTTTTTTTGCTTTTTAAATTTAAACTTTTGTTTAAATTCTTTGCTTTTTTTTAATTTTTTTG:1 - chr3R 17447649 3' - TART-C 11099 4 55.38 CCGTCACGCATCTTTTTATTCTAATGTATTTGGTCCTACGTCATTAGGAATAGCTTAATTAAAAAATTGATCAATTATGCACTATAATTAGGCTATACCTAAGATATTTCAATTTACCATAAGGGCCTTGCACAAATTTACCCAAC:1 - chr3L 22722103 3' + 1360 3378 1 56.85 AGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGAAAATGGCTGTGAGACGGCAATGCCCCGTAAGAAGGTCTTAGACTCGGTAGTGGAGTGGGTAGAGCTCTACCGCCAGCCAAGGTTCAAGCCCAGGGATTCTGAAGCCAAAAATTA:1 + chr2L 22298986 3' - baggins 5182 1 46.58 ATAACAGTTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAATATTTTCGATATGCATCTCATGTGCGTGTGTTTGTGTGG:1 + chrX 19005064 3' - F-element 154 1 71.53 GAGTTTTACAACTGATACAAGTCTAACTATAAAATAAGCGGAGCTATGCTTCAGAAAGAAACATTCAAAGGATTTTCAATATAGCATGGCGACCGTGACAGGATCAGGATCTAATGATGACCTTTTCCTTGAGGAAGCTTTCG:1 + chr2L 14416967 3' + gypsy11 368 2 51.05 AGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCT:1 - chr2R 5582184 3' - Cr1a 488 1 55.73 AGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAATACTTGCTTTACAGCTCGGCTGCAACTTTAATTGAAAGAGTTTGTAGTCTAATGATTGGATCTTAAATGAAGCAAAAGCTTATT:1 - chr2L 6876584 3' + Rt1a 5036 2 57.14 TAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAAT:1 - chr3R 9175213 3' - Juan 78 1 66.44 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTATTAAATATATACTTTTAGTTACTGCATTTTTGGCTCATTAGAGGTTCTT:1 + chr3L 18164228 3' + pogo 2036 1 78.77 GCTACACATTAGGCGAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTACTGACCAATGAATAATAATAGAATTAAACTTTAAAAGGATAAGCTGAAAAAGAAGTGCAAGAAGTTGCTCAAGAAGGATAAGTGCAAGAAAAAAGATACTTGC:1 + chr3R 7061455 3' + G5A 2785 1 54.79 TAAAAAAAAATATTAAAAAAAAAAACAAATAAAAAAGCAGCACATCAGGTCAAAGGCACTTAAACTAGCAGATGAGTGACAACGAATGCTCAGATGAAACCCAAATCT:1 + chr2L 14487875 3' + BS4 727 2 88.89 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGTTGCGTAGT:1 - chrX 19585154 3' - Transpac 4974 2 59.59 AGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTAAAATAAAGAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTAAGCTCATCTTTCATTAAACATCAAAATAGCAACCTTCGATATTCAACGTTTTTGTGGCTAATAGGATTGCATCTA:1 + chr3L 26131081 3' + Stalker 7151 4 72.60 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCTTTTACTATGCAAATGCTAATCGACTTGTAGTGCCCCAAAGATGTT:1 + chrX 18190427 3' + hobo 2897 1 63.06 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAGCATGAGTCCGCGCAATAATCACAGCCAAGTGCTGCATATTTATAGGCGCAATCAACTTTAT:1 + chrX 850167 3' - jockey 36 1 62.04 TATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCCCTGTGCATATACATATGTACTCGTATGTATGGCATGTAAAAACAATCAGGACAAGATCTTCAGGCCCGCTTGGGTCAGTTGGTTCCCTCATCTTCCTTTCTGTCGGCT:1 + chr2L 15906151 3' + Tabor 472 2 76.03 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTCATATATAAATTAGATTCCCTCGCTCAACGACGCGAAAATTGCTGTGTGTACGACTCTATCAAATATGCAAAAGAA:1 - chr3R 23668406 3' + pogo 2057 1 55.48 CGAAATGAACCCGAAAGCACTGAGAGCGTCTCTCTTAAGCTCTATTGGATGACTGCGAAGTGCAGGAGCAGGAGCAGAAGAAGATAAAGCCGCCACCAATATATATAAATTAACAGACAA:1 - chr3R 1153374 3' + Doc3-element 413 1 65.00 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTACCAAGCCTATTTACGGTTTAGCCTTTCGCTCTTTATTTATAGTTGTTGGCTTTTTTTTAAATCGTCGTGTG:1 - chr2L 7449681 3' - roo 8714 2 54.79 GGCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACACTTGAAACAAAAATATAATCCGATATTTGTTTGGACTAATAAAAATTAAACTACCAAATTTATA:1 - chr3R 4661921 3' + roo 352 2 56.16 TAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTTTTAAATGTGTAGAGTGCTTTGAATATCTGTGTGGCAGGAAAAATCGATATCTTAAAAAATATAACAAGTTAAGCATAGGGATCGCATTTTGCATTCGTATTCACAAAGCTTAACGG:1 + chr2L 18300905 3' - Ivk 5255 1 76.03 CGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATTTATGTTTCTCTGCAGGACAATTCGTATCTGTTGCGATAAATCATATCCATATTCAAATATTTGCACTATTTTGTTGTGCA:1 + chr3L 19335456 3' + invader4 285 2 56.16 TATAGAAAAATATAGAAAATAATATAAATATTTAATTTTAAAAGGGTGTTATGTATGATACGCAATCTATTAATGTTCAGAGTAGGAGATTGCTAACTAAGCGCCTTCAAAACTGCTGCTGACACATTTGGTACACGGTGGGTGGG:1 - chr3L 10505224 3' + transib2 260 1 71.92 TAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTACCAGAAAATTGAACGACAAGCTATAAAGCCGGAACTTTACGTTGGACAAGAGAGGT:1 - chr3L 381707 3' + S-element 1682 2 52.99 TTTTAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGTTCAGGAATGGCTGCATTCAATCGAGCGGTGGACTGCCAAATGGAACATCTGGTTGGACTAGAGCGGGCTACGCGGCCTATAAATGG:1 + chr3L 23824153 3' - Cr1a 366 1 68.75 TCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTCATGCGTGCTGGAAAAACAGCGCCAAAAAATTGCCAACGAAC:1 - chr3R 6411974 3' + Tirant 8430 2 71.92 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAATTGTGAGAGTATCTGGCCAATGAAATTTATGTGGTAAATTATTCACAA:1 - chr3R 9193151 3' - opus 7067 4 66.43 CAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGTCACTCTTAACGCTCAAGTCTTTGGTCTCCGGCAATTGTTTTTCCACTCAATTTCAATTGTTGTTGTCGGTGCTTTAAACAAACAAATGAACATTTTTGCGCAT:1 - chr2L 20324060 3' + Tirant 8494 2 76.71 CCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAATAGAGTAATGTGGGTGAGGTCAATACAAACCTATGAGCTAC:1 + chr3L 18034639 3' + Transpac 5157 2 71.83 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTTTCAATGTCTGTTTTATGTTGTGTTTTTCACAGTTTTCTGTTTGC:1 + chr3L 18789133 3' + 1360 3354 1 52.74 TAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTCGCCTTTTAACTGAGATATGGCAACAATGTTGAGCTTCAAATTGATTTTCGATCTCGACATAGCATTCTTGTTTTAATTTA:1 - chrX 20460529 3' - diver 42 2 54.11 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCAACTCGGCGATTACTGCACTTGAAAACTGTATTGGTTACTTAATGACATTTTGCGATTTATGCAGTACTCCGTTAAATGGTTAAATTCCGCATTCAAA:1 + chr3R 22868898 3' + mdg1 7437 2 68.49 ATGATCAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCGTTTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACT:1 + chr3L 11826440 3' + INE-1 96 1 66.44 CGTAAAAGTGTACATCAAACGCTAATAAGGCACCGAGATTGCCTGTGCGGGCCGTGCTGTGTTTGATGACCGTATATGTGTACATCAATCGCTGATAAGGCACCGGGATCATCCATTATTGTTCTTGATCATGCTACATGTGAAG:1 + chr3R 8836381 3' - accord2 7206 1 42.76 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCC:1 - chrX 2518063 3' + P-element 2784 1 15.07 AACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGCCATCCCAAGTGCAAAGTGCCGGCTAACTAATTGCTCTGTCACCGATGAAGG:1 + chr2R 13471428 3' + flea 4948 1 63.45 CACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCCAATTTTTTAGTGATGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATGCGGGTTGCATGCGTTGGCCTGGCCCTTACCT:1 - chr3R 17702468 3' + 1360 7 2 76.03 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTGCTTTTCCCACTTTCCCACCGCTTTCCACAAACTTGAGCAACAGCTGCGTGTGTCAAGCCGAAAAGTGTGCAATGAAAATTGTGTGA:1 + chrX 19113600 3' - 412 7086 2 61.64 ATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCGTAGAGTTCATCAACTT:1 + chr2L 19158875 3' - P-element 106 1 13.01 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGTATGTGTGCGTGTGTCGATGTATTAAGTGGAAACACCTTGTAACATGGCTGACAGGGGTTAGAAGACTTTGCAAGATTTATGCGCTGACATTAA:1 + chr2L 12847337 3' - 412 26 2 63.70 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACTAAGCACCCACACAACGTAAGCCATTGCCATTTTGTAGCATACTTTTGTGCGCGCCTCTGTTTATGCGACTTGTAAACTTGGTCTTCTGTGCCTGGCCC:1 + chr3R 16530701 3' + hopper 1397 1 70.63 AAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTTTT:1 - chr2R 9504195 3' + roo 9036 1 55.64 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCGTCGGCACAGGTATTCCACAAGATTCTGTTATTCGCTTGTGTAATTAACGGATGCGG:1 - chr2R 18440404 3' - P-element 26 1 57.80 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGAACGCATCTCTAGAAATCGGTCGCTTTCAGTCACAAAACTGCGATCGTTGCGATCGTT:1 + chr2L 2999294 3' + P-element 2824 1 44.52 TAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAATATCACCACGAATAAGCTTATAAATAAGGACTGCTCCAAGCATATTTCTACGGTTAGCTAGGGATAGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTAGTTTTTTTTTTAAATTAATTTATTTA:1 - chr2R 18403082 3' - Cr1a 4079 1 72.41 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCATTTTAAATACTCTAAAAACTAGTACACTTTTGAATTTTTTGAAATGGCTATTGTCG:1 - chr2R 13212163 3' - diver 5905 2 71.72 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTTGTTTCTAATTTTGGGAATATTCGAAACTCGAAAGGCAAAAGTTTCAGTTCAG:1 + chr3R 20074642 3' + roo 9003 2 67.12 CGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTTTTATTCACAATTTACCTACATTCGGCATCGCTTTATTTTGCTGCCCCCTGGGGGAACTTTTCCTGCGACAATAAAACGGCCAACTTCATTCCGGTAGT:1 - chr3R 30624825 3' - 297 423 1 63.70 AATAACAGAAAATAAAGAAATAATTGTAATTATTTCCTACATATTAAGACAACAATAAAATTTCCATTTGATTGTTTTCCTATGTTTTCTTTTCGAATTTTTTTTCAGTGCACTGCCGCTTTTTCATGGCCTTCATGACTGCTGAC:1 + chr3L 12311046 3' + Doc3-element 76 1 58.22 AGGAAGAAGGGCGTCCTGATGAATTTCCGGCATATACTTAAAAGTATTTTATTATATTAAATTCAATAGGTTCAATAGGCCCAGTTACATTTTCGGACAATACTGTAACACGAATGGCATTCATATATAAGGACTCCTCCATTTTG:1 + chr2R 2923686 3' + invader1 4001 2 67.12 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACAGACATTGACAACGCACTTGTCGTCGTTTTGGGCGTGTTTTATGCACTTGTCGCG:1 + chr3L 815012 3' - hobo 51 1 60.31 GGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTACCTGCTCGAGTGCTGGTTTATGTCTTTATTTTTTAGCTTATAAAATAAATACTTTTTATAATGCCAACACGGCTGGTGCCTGTTTTGAATTTT:1 + chr2L 18419971 3' - X-element 4434 1 74.44 TGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACAGACATTGACAACGCACTTGTCGTCGTTTTGGGCGTGTTTTATGCACTTGTCGCGGCTCG:1 + chr3L 815017 3' - hobo 59 1 60.42 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGGCTTTATTGTATATCCGATTGCAGCTTCCCGTTGATGAGGCACTAACTGTTGGCCCTGGTTTTGATGTCAG:1 - chrX 12997987 3' - roo 8704 2 56.20 GGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAACAAGTCCATGTGCAGTCATTTGGTTGTGCT:1 - chr3L 3339361 3' + Transpac 5141 2 78.08 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTAAATGATTTTCTTTTAATTCCTCGCCTCTAAAGTCAAGTTCCACTGTATAGTCTTGGACTTTGTCCCTGATTTGGGGTT:1 - chr3R 30782484 3' + pogo 2068 1 61.43 TATTTAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTGAAATATTAAGACATTGGCAAAATGAAGTCAAG:1 + chr2L 4078481 3' + Cr1a 117 1 77.40 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGTGTATTTGTGACGTGCATGTCAAGTGGCCAACACACACATGCACACGAGACGAAAAAAGGACCCTGACCAATTAGCACAGGAAGCTGTCAGT:1 + chr3R 15169008 3' - 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chr2L 17729359 3' - jockey 4829 1 67.12 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACACTTTTGTCGCTGCA:1 + chr2R 16891839 3' + jockey 4935 1 63.01 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAATAACTTATGATTCGCTGCTGCTGGCTGCAGGCTGCATAACCAAACAAAAGACATTAAGGAAATATTAAATCACTAACAAAAGCCTTTAATTAT:1 - chr3R 3590618 3' + pogo 2077 1 69.18 AGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGTTGC:1 - chrX 19585159 3' - Transpac 4979 2 63.01 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGGCATTAATTCATTAAGCATGTAGCTTCTACCAATACATATGACTCGTTGAAAAATTTTTCATAGTTTCATAA:1 - chr2R 11562800 3' - pogo 47 1 53.42 CTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCCCAAGTCATAAAGCATAGAAAAGTGCCGAATTGAACCACTTTCAGCAATC:1 + chr2R 22317817 3' + roo 8644 1 65.52 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTGATTTAATTGATCTTACTATTGCATAGGCACATACTACACATGCACATCAATCTAAAGCCCTTCATGATGTTAATTAC:1 + chr3L 6675369 3' - 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gypsy 70 2 65.75 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATATATATATTGCCGATTTGTTGTGGTTTCGTTTCACTTAAATGCTCAATTTACACTTT:1 - chrX 11661373 3' - 297 6609 2 54.55 CTACTACCACGGATTAGTCTTCCCTTTCTTTCGGGAACCAATGCGTGGAGTAGCCGTTTAAGGCAACTCCATGTGACGCACGACGACACTGAAATTGGATGTTGGTGGTGGCTCCAATCATGCACAAGTTCCTAGTGAATCTTAAA:1 + chrX 21962481 3' + aurora-element 26 1 57.53 GATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATGGACCGAGGAACTTGTTGAGGGCTTAAGTGGCAAATTGACAAGGTAATGGATTATCAGCGACCGCCTTTGAAGAGCAAGTCTGCCATTTTAATAGATTATTTTAAAAATTCAAT:1 + chr2R 23822637 3' - Rt1b 4774 1 74.83 GTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTATTTATTTATTATATTTACATATAATTTTATAAAGGACCACTGTGACCTGCATCTCCATTGAATTTATTTAATATAATGGAGTGTAAATCATTTCGGAAAATGTTTA:1 + chr2L 17166399 3' - I-element 5297 1 65.07 ACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGCGTGTGTGTGTGTCTGTGTATGCTATTCGTGTGCCCCTCCGCAATTCTGATTGTTTGTATGTGAGAAGCGCATGGAATTGCCAGCCAGGCGCGCAG:1 + chr2L 4420636 3' + gypsy5 407 2 72.58 ACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAACCGCCAAAAACTGCCACGCCCCCATTTTGAAAAATATGATGATGCATATTTTGACTGCTTCACATTGGTATTTTTTGATTTTATAT:1 + chr3L 26169320 3' - 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chr3R 12727138 3' - I-element 68 1 62.33 ATATAGAAAATGAAGTAAAATATGATGCTCATAATGATCATACTCCCACTTGGAACCACATTGCATTTCCCTTTCCCAGCTC:1 - chr2L 1451246 3' - transib1 1904 1 89.02 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTG:1 + chr3L 13228522 3' - P-element 95 1 18.31 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTCTATGTATGTACGATAAGATAACTGGCATGAATCAGTGTTCAGTGGGTTGTCCTATTATGTTCTCACACGTTGCTGCATGTGT:1 - chrX 15019681 3' + S-element 1673 1 56.16 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGA:1 + chr3L 22884005 3' + roo 326 2 75.00 CAATAATTAAGAAATCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGGATCCAAAATAAATAACGAAGGCAATTTCGAATGCTCAATGGGCATGGGGGGGATTACAT:1 - chr3L 6776694 3' + G5 4738 1 69.18 AGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCGCA:1 + chr3L 18738143 3' + Bari1 1658 1 63.03 CGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGGCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTG:1 - 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chr3L 16271834 3' - jockey 104 1 72.60 AGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTGCAAAGGGAGTGCATAAATCAAATAGAAATTCGTCACAAGCGACATTTCCC:1 + chr2R 21029452 3' + Transpac 243 2 65.07 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTTATCTAAATATAAGTGAGCACAGCAGTAGGCCCGTACGTAATTAAACAAATATTGTATTTAAACTTAAGTTATTTATTCAACAATTTTTCGCAAGTT:1 + chr3R 21706377 3' - I-element 23 1 68.49 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTCACAGATCATTTTATTATAATTACTAGAAACCGATTGATTAACTGGTTGTTAAACTATTGCCAATCCAA:1 - chr2R 17187732 3' + roo 9022 2 51.37 AAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1671 1 60.19 TCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGACTAAGGATGTCGAATACTGAGGCACGTCATTAAC:1 + chr3R 4532998 3' - 1360 33 1 63.45 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTCGGGTGAGTATACAGAAGTAACTTTCCTTCTGAGTTGCCAGGAATGAAATGTTACCTTATACCTCTGTACGTAT:1 + chr2R 5640817 3' - 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Doc 65 1 58.90 TTTTTTTTTTTATTTTTGTTATTTTTCATTAATGTACTTCTGGCATGTTCACGCTCTGACGCCTTGGACAATCATAAATGATATATTGCCAGGCGTGCAGCTGGGAAAGTTTTTTTCAAAATTCAAGACTCACAAAGTCGCAGGA:1 - chr2R 21418181 3' - HMS-Beagle2 483 12 77.93 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAG:1 + chrX 21668949 3' + pogo 2051 1 65.00 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATAAACATTTTACATATGTTGTGCTTTGTAGTAGATATGTGAATAATACACTGTATTTGTTGTAAACTGAATGCCAATAAAAGGTTAATTTTAATGTGAGATATA:1 + chrX 17510727 3' - roo 8681 2 45.21 CTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCTACTTGTTTAGTCGGCTTTGGAAATGGCGGAGTGCGGCACGCCGGATTTCACGAATCCACAGGCTCCTCCTTTT:1 - chrX 9920812 3' + Cr1a 4010 1 61.64 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCAAGGAACCGAAAGGCAAGCTGAATTTTCCAGGATATACATAATCATAATTGCGATACCTTGC:1 - chr2L 11867252 3' + jockey 4958 1 62.33 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACTGTGGCCAACTCACACACACACAGACACACACTCATACCAGGATAGTGCCGCTTCCGGCTGGATATCTCTTCACGCTTCGTTTAT:1 - 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jockey 4810 1 64.41 AAATATTAAATATTAAAAAAAAAGTAACTCCCCTTTTTTAATAAGATTTATATGAAGAATTCCACACTTTGACTGGGCAAACATTTACAATCAATTTGAAGGCATCGACTGAGCAATTTCCCAGGCCTGCAGTTG:1 - chr2L 8474029 3' + Doc 4690 1 52.59 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTATAATACATACAATTCTCTTGCACCAAATTCAGAATATTCGCTTGC:1 - chr2R 9868900 3' - roo 73 2 70.34 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCGTCGGCACAGGGATTCCACAAGATTCTGTTATTCGCTTGTGTAATT:1 - chr2R 18440415 3' - P-element 54 1 39.68 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATAGCGATCAAGAAAAGAAGAGTGAGACTTAAAAGCCACCGCAGCTGTCGGCTGTAATGCATTGCATAGAGTAGAACGCGAGA:1 + chr2R 5541128 3' - S-element 37 2 57.53 CTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTTTTAAATGTGTAGAGTGCTTTGAATATCTGTGT:1 + chr2L 18300821 3' - Ivk 5339 1 77.40 CGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATATATATTTAAACGTTCAATATGATTACCCGTTTTTAATAAAGTTTCTTTGTCTTGAAATAAGCAACTAGAAGTG:1 - chr3R 9175113 3' - Juan 3 1 78.77 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAGACGTACATAC:1 + chr3L 22884046 3' + roo 9029 1 56.85 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAAATGTCGTTGGGCAAATATTTGGCCGAAGGACCTGGCGTGGGCTTCATT:1 + chr2L 11079488 3' - 1360 51 1 58.46 GCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAACATCGAAGTGATGTGCCTGGAATTTGCCATTAATTAGTCTGC:1 - chr3L 20176727 3' - gypsy 7033 2 50.68 AAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAAC:1 + chr3R 1844849 3' - Cr1a 171 1 59.59 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATCATCTAATACACGGGCTGTCAGGCCAGGTGAGTGACAAATTGACATGTCGCAAAAATGATGAATCTACCAGCGGCGG:1 + chr3R 18697983 3' + 297 6959 2 59.84 ATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTTTTTTTTTGGTTTGGGTTTTATGTCTGCGGTGTGGGCCACTTGAAGTCGCCAGCATTGTTTTCAGCTCAGCGCCCGCTAAAAATAGTCAA:1 - chrX 17472085 3' + Quasimodo 7341 2 67.81 AAAAATGAATATATGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCAGTGCCACATAGCTCGCGACATACATATTAGAGTGCTGCATAACAC:1 - chr3L 27264765 3' - invader3 5452 2 63.41 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCACATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTGACTCACTGAAATGAATTCTTTGGGTTCTATTGGGGACATTTTGCTGAACTGGTTTGCTC:1 - chr2L 15147747 3' - 1360 79 1 54.79 AACTCTATGTGTGCACACGTATATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATTCCCTTCATCTTTTTTTTTTGATCAATTGGCACCTTGCGAAAAATTCTTGTTTTTCATTGCCTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chrX 14317418 3' + 1360 172 1 81.51 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTCCTGAAATTGTTTGCCCTCCTTAAAAGTATCTATTATTTTTTTTCAAGATAGAAAGC:1 - chr3R 31650309 3' + pogo 2038 1 59.59 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTAC:1 + chr2L 19158891 3' - P-element 86 1 26.76 GGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACAGATGTCTTCTTTCACAACCAAAGCGCTGATTACTACCAACCCATCAAGATGGTCAAGCATAGCACAGGGCCAAT:1 + chrX 19592651 3' - 1360 211 1 49.24 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGATTTTAGTAATTGGCCATATAAATTATAAGATATTTATAAGCTGGGGG:1 + chrX 11267788 3' + roo 337 2 74.48 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGAACGAAATCGGAGGTCGAG:1 - chr2L 18944818 3' + P-element 2844 1 45.76 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTTCCTGAATTTACTGAAAGGTTTTTTATTATGCAGAATGAATCATTTATTGTACAGCCAATCGTCTGTA:1 + chr3L 19574203 3' + 297 387 2 78.77 CAATTAAATTCTGGCATTTATAGAGTGCATTGGACTTCAGGGATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATTTTATTTT:1 - chrX 8125374 3' + baggins 5334 1 86.05 ATGCATTTAATATGACCCTTAATTAGAATATCACATCTGAGCGCAAGCTTCCAAAAGCTCGCCTTTGGGGAGCTTTCATAGTGATCTACCATAAGGGCTTGTCGCCACCACCGATCAAAAAACAACATTGGATATACTACTTGTCG:1 - chr3R 4725345 3' - Gypsy12A_LTR 84 1 78.77 TTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATA:1 - 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chr2R 13028934 3' - gypsy7 5012 1 47.44 TCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAG:1 + chrX 16217487 3' + P-element 2785 1 15.17 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGATTCGCATTTCCGGGTTATTGATTTTTTGGCTTACCATTTTGTTCGGTGACTTT:1 + chr2L 10244454 3' - diver 28 2 45.89 CGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGCCATCCCAAGTGCAAAGTGCCGGCTAACTAATTGCTCTGTCACCGATGAAGGCAAATATTCAAGACATTACAAATTCA:1 + chr2R 13471454 3' + flea 214 2 56.85 TACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCGCTGGGAATGGGACAAGGCACATATTTTTTCTCACTGCACCTTCCTGC:1 - chr3L 18192898 3' - R1A1-element 5179 1 69.86 AAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATAGATACGTGTGGGTTTTTACGTCGACATCAATAAGTGCTTCTT:1 - chr2L 6319752 3' - Tabor 78 2 68.49 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACCGATATAGACGCATTGTTGCGTGGAGATTTATCATTGATTGAGGCCATGAAATTTAC:1 - chr3L 12899754 3' + roo 9007 2 60.27 AAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCATTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCTAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTTTAAAAGTTAATTGTTTCTTTTGTGGTTTTTCTAATTGCGGTGGTGATACTGTCATC:1 - chrX 7574933 3' - S-element 340 1 60.96 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTA:1 - chrX 6484732 3' - jockey 91 1 76.03 ACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGAGACACTGAGCTCACCCCAGTTCTCTATAGGGACAGGAATAATT:1 + chr2L 17206074 3' + hopper 1340 1 68.49 GAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTGCTAACGCTACGTATGCATGTGTGCGCCTAAATGGGCGGGGATTTGGCAA:1 - chr3L 13365521 3' - jockey 4585 1 62.18 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGAAAAAACATCATCACCCGCCCAAGTTTCATCTAATCATTGATTAAGCTG:1 + chr2R 11339127 3' + jockey 4917 1 69.18 GTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGTTTGATTGGGGTTTCAGTAGGCGTATGCAAATATTTTCGAAAATAAGTAAAAGATTAATATATATATAAAACTTGTAGT:1 + chr2L 20556580 3' - 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pogo 51 1 57.53 TGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1695 1 60.76 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAAATTAAAAACTGAATCGACCGGTAAAAACGCGAC:1 + chr3R 12725612 3' - 297 61 2 74.80 AATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAATTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACATCTATTATATAAACCATTCGAATTCTTCGGGAATAGCATGGGAAC:1 + chr3L 7818373 3' - Doc 115 1 67.81 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAATGTACATACATACATATGTTTGAAATGCATAAATATTTCATT:1 + chr2R 10600073 3' - 297 53 2 74.19 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGACGTCACTAAATTGCGGTGACGAGGGGCTGGCGACG:1 - chr2R 7889348 3' - jockey 35 1 62.88 CAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACAGAGTTGGTGGGAACGGTTTTTAACATATTCACTTGATAATTTCGATTTTAA:1 - chrX 4214464 3' - jockey 77 1 63.70 CTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATAATATAATAAAAGAAATTAAACAAAGACTGAAATTTCTTAAGGGGTTTTT:1 + chr3R 21753511 3' + 297 325 2 71.92 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATTAGGGTATCTTCTCACCAAGTCG:2 - 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chr3R 5477956 3' + 297 325 2 66.90 TTCCAAATAAAATTAGATTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGCCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGCCATGAACCCAT:1 - chr2L 18213120 3' + roo 9028 1 52.42 AGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGGAGGCCATGCCCTTTTTTTGGGCGGGCTGTAACCGT:1 - chr2L 18627705 3' + 1360 3319 1 73.85 TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGTGCGATAAGGGCAAATTTTGAGCGTTGAAAAT:1 + chr3L 21170934 3' + roo 8980 2 78.77 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAATCCGAATTCAATTTTTCAATCAATTCAATGAATGAAAATAAATAGTTAGTTCAAGATG:1 - chrX 19005368 3' - F-element 70 1 60.71 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGCCGG:1 + chr2L 18213241 3' - roo 8698 2 61.81 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCGTATG:1 - chr3L 18199943 3' - Doc 62 1 58.90 AAATATATTATTTAAAAAATAAAATAAAATTTACATGTTCAATAATATTTAAAAATAATAATTTTATGATTTATAATACAATTGCGTCAAATGTAAAGAAATTATTCTTTAAAGCTGTCAAAAAACATGAAAATGATTTGGCATAA:1 + chr3L 8226882 3' - hopper 161 1 58.22 TTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTATAAGCTAAGTATTTAAGAACAAACAATGACAAAAGTTAATTAAA:1 - chr3R 12727147 3' - I-element 77 1 68.49 TAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGTTCTGGAAGTGAGTGCGGTTAAGCGGCGAGACGTTGCGCCATTAATGCGAAGCGTACTTTTGGGCGCGCTACTTAAAGTTGCAAGTTGGCAGTAGGA:1 + chr2R 7889533 3' - jockey 4666 1 58.22 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACCAGTTATAAGCCAACTTTCATTCCAAGCAGACGTGCTGGG:1 - chrX 12003872 3' + P-element 2870 1 73.61 AACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATAAACAAATTAGCAATAAGTGATATTTTCACATAATCAGTACTTTCCGAAGAAATAAGAAT:1 + chr3L 25483010 3' + accord 7353 2 62.32 AAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACGAACAAAATTTTGAGATTTCAGCTGCAAAAATTGATGG:1 - chr3R 8856258 3' + HMS-Beagle2 488 5 58.33 CGCCTGAAGCCAAACTGGTGATCAGGGATCAGTCCAGCCTCGTCCAGCACTGGCAACAACTTGTTAAAAATTTCCGCTGCCAGTTTATTAGAGGGCAACTAACTAAGGCAGCGTAGGGGAAGAAT:1 + chr2R 23311185 3' - G7 364 3 61.60 ACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTATTTATTTATTATATTTACATATAATTTTATAAAGGACCACTGTGACCTGCATCTCCATTGAATTTATTTAATATAATGGAGTGTAAATCATTTCGGA:1 + chr2L 17166390 3' - I-element 5306 1 58.90 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGAACGAAATCGGAGGTCGAGTGACTGGCAACGCGATAAATCTC:1 - chr2L 18944795 3' + P-element 2862 1 62.60 CTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAGCTTGTCTGTGGGCAAAAATATATTTCGGCTAAAAA:1 + chrX 21636241 3' - Stalker2 7334 2 76.03 AAAATATAAAAAAAAAACTTTTTTTGTAGCTTATAACTTACAAATTATGTACAAATTTGAGAACAAGTTGCAACTTGCTGTTATGTTACTTACTTTCCGTTAAGTTTGCCATCCCAATTTCTCGCAGTGTGCACCAAGAGGGACAA:1 + chr3R 14354008 3' + HMS-Beagle2 492 1 75.34 TCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATAAACGGA:1 + chr2L 8707513 3' + 412 416 2 70.55 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTAT:1 + chr3L 9762234 3' - jockey 4837 1 75.74 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGTTTGCTCTATAACTAAT:1 - chrX 19113491 3' + 412 7486 2 67.20 ATGACTGATCTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCG:1 - chr3L 27356096 3' + Tc3 1628 1 75.36 GCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATACATAGACTTCCTCACTCGTCTGCTTTGTGACATTGAAAATAAATATTTTTGTGTCTGGGCACGGGGCATAT:1 - chr3L 18034532 3' - Transpac 41 2 56.16 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAAAGTTTCGCTGCACAATGTAACTTCCAATATTCAAGACACGAGATTTTGTTTCGCTATTTTTTCGGAATTAAGAAAGTTAAGATGATCAATATATGATCATTTCATAATAATA:1 + chr3R 10636250 3' - blood 9 2 78.77 AAGCTGAGATCAAAAGAATAAAGACGTGAAAACTATTTCTCCAATAATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTACTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAATTTTTTCATGAGTCTTTTCTTTCCGGGTTCGCGTCAACACA:1 + chr3L 18400284 3' + 297 288 2 71.92 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTGGTATTAATTCTTCTTATTGTTCATATCCATTCATCGTTTATTTGTTCCACATGCAGATGAGATTATTTTCTTTTCGATCAAAGAACA:1 + chrX 19959928 3' - roo 8696 2 64.38 AGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGGAACGTCAGCCCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAATGGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAG:1 + chr2R 545203 3' + gypsy4 6584 2 74.66 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTG:1 - chrX 12003946 3' + P-element 2799 1 21.28 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCGGATATGAAAAGGTGAGTTTACAGAATTATCAAACATGTTTTTACATCTCTGTATCTGTTTACTAAAAAATGCATTTGTATTGATTGTTTTAC:1 - chr2R 16496530 3' - hopper 24 1 64.38 TTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATG:1 + chr3R 17210116 3' - HMS-Beagle2 53 2 54.79 CAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGCAGCAACAAATTGCAAACTCAGGATGCAGCCTTA:1 - chr2L 11968260 3' + TART-B 155 2 85.45 AACCAGTATTATTAGTTTTTAACGTTTGACCACCCTCAACGTCACCGGATTTAAGTTGTATTTCAGGACAGCTGATTTGAATAAATAATGTAATGTAAATCATAGCTCAGTCGCAGCCATACCGAGCCTGACATTTGC:1 + chr3L 27085060 3' + FB 362 1 78.26 GCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTTTGCAAAATTCCAATGCAGAATTTAATGTTAAACATCCAATCATTTTAGAAAAATGCCACCTAACAAGC:1 + chr3R 19446978 3' - R1A1-element 5019 1 52.74 TTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCTGTCAAAAGCTCTTTCGTTTTATTAGATTTTCCCAGCCGGCGGCTTTTGTCCCAGGGAAGTCGTAGACATTTCCCTTTGCTGTTTGTTGTTCTGGTGTATTTTC:1 - chrX 17027815 3' - roo 8663 1 73.64 CAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1653 1 66.12 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCT:1 + chr2R 11562887 3' + pogo 2042 1 73.45 ATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGTCACTCTTAACGCTCAAGTCTTTGGTCTCCG:1 - chr2L 20324134 3' + Tirant 322 2 74.64 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCAGCAAATAGAATTCTTTTAGACTTTTAGCTAGACAATTTTACTACCGGATTAGCTTTTCGTACTTGTCTG:2 - chr3L 16663842 3' - opus 165 4 54.11 CCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGAGTGGAAAATATGACAACACATATGCACTGCTGACAGTCATTTTAATGGAATATGCGGCGAAGCACCGCTAG:1 - chr3R 27782610 3' - G2 3026 1 50.68 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGCTTGTTTGCGAAAAATAAAAAAAACAAAATTGGCGAGCAGCGGCATGTTCGTA:1 - chr3R 17059266 3' + hopper 1359 1 60.00 TTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGGGCCAAACCAATGTATGGCCGGTACGCATCTTGGTTTTCTAGTGTTCTTGGTGGAAGGTTGCTTGATTAGATTCAATGAAACCGTTTTTTTTTTTGTTTCGCA:1 + chr3R 2448019 3' + 1360 3329 1 82.09 ACGACAGTATCGCAAGACGCTGCGATCAATCGTTAAATAATTTACACACAAAAGTGCACCGAAATTAGTTAAACTGTTTTTTGAGTTCACGATAAAGAAATGTTACCGAACGTCAGGGTCACCAAATGTTGAGGCAATGAGCTTTT:1 + chr3L 25996040 3' + Gypsy6A_LTR 379 1 78.77 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGTATGTGTGCGTGTGTCGATGTATTAAGTGGAAACACCTTGTAAAATGGCTGACAGGTGTTAGAAGACTTTGCAA:1 + chr2L 12847317 3' - 412 7099 2 52.74 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTTCCCCCCATCGATAA:1 + chr2L 13140700 3' - blood 7079 2 61.64 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATTGTCAAATTCCAGGCACAATATTACATGAAATCTACAAATAAATAAATAAGTTACTCGAATACCCTAATAACTTAAATACAAACCAATG:1 + chr2R 14722795 3' - mdg1 7070 2 63.70 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGCACACAGTCATGATTTAATAGGTAAATCAGGTTGATGAGCGTTGAACACAGTGGCTA:1 - chr3R 30302265 3' - Doc 37 1 52.17 GTTTTTTCTTTTTTTTCTTTTTTTGCTCCCATCATGAAGAAACCTCAGGACAAAAACGAACCGAACAAGTAAATTTTATGGTAATTATAAACTTTATGGTTTCATTAAAAAATATTGAAGAGAGAACAGAGCCGGAAAATGTAAAA:1 - chr3L 5711364 3' - Rt1a 5087 5 71.92 TTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTGCCACTGAAGTTTCACAATTACCGAAATGGCTTATACAAAAAAGTTCGTTTATAAACCACTTAGGTGTGACATCCAGAATAAAAGACAGTAGCCATTTTCCACGCTATCTGCCATATG:1 + chr3R 11551981 3' + hopper 147 114 77.40 AAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAATCGAGTTAGTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTTTAATTTATTTTTATTAAAAGTCCGTATTAATAATTTCTCCTAGCTTT:1 - chr2L 7648382 3' + pogo 338 1 67.12 AAAGCTCTCCTCCTCTATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCATTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAGTCACAATTGTCGATGGCTGGCTTCCATTTCATT:1 - chr3R 11701744 3' - baggins 5214 1 66.95 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGTGTTAAGAGCAGTCCAATATCAATTTTCAAGTATTATTTTTCTGAATGTTCCTGATTTTTGGGATTGGGCTGCATTTTTAGTTGTTAGTACAACGGGCGTGCGTC:1 - chr3R 14493964 3' - roo 8679 2 71.92 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGTGGCTTGCATATTTTGATTGCATTTTTG:1 + chr3L 14551363 3' - P-element 73 1 23.81 CATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAG:1 - chr3L 27356053 3' + Tc3 1677 1 64.66 GTAGACTACTTTTAATAAATTTACCTTTCCTTACCGAATTGTTAATTGTAACTAGCGATTTTTGGGTACTTTCAATTTATTCTTGCTATATAAAATAGCCTGTGTTATAAGACATGAACGTATTGATGTTTTCTTTACTACAATTA:1 + chr2L 21272374 3' + Cr1a 3981 1 74.66 ATAAATTATAAATTACAACAGTGAGTCATAAAAAAAAACAAAGCGAAACGAAAGATTGTCTATTAAGTAATATTCTATTGTAAACTGTGAATTATACGATTCGCAAAATTCACTTTCAACATTTG:1 - chr3L 7790620 3' + copia 257 1 80.00 CAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAAATGGGTAAAACAATAAATCAAACCGCAAACACGCAGCCCATACCG:1 - chrX 14509727 3' + pogo 239 1 78.08 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCTTATGAAATGCAAATTACATTTCA:1 - chr3L 18199924 3' - Doc 42 1 55.86 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCCTCTCACCCAAGCGCCCTCCCTCTC:1 - chr3R 11773872 3' + P-element 2856 1 60.45 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTTTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATATCAAATTTATGTCAAGTTGGCCAATTTTCAACAGTAAAA:1 - chr2L 3648733 3' + roo 329 2 67.81 CTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGTTGCGT:1 - chrX 19585157 3' - Transpac 58 2 61.64 GCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAACTCCCCAGTTTCCCAGCTAAATGGCATTTCAGCGGGCAGGCGGTCGACCGCAGATGTGTCTCCACCACGAG:1 - chrX 19721706 3' - 17.6 285 2 52.99 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCGGACAGCG:1 - chr2L 20986537 3' - roo 8752 2 80.14 GTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTATGTTGCAAATGCATACTATAACAAATTGTTAAGTGTTAGACAAGGCGTATACTTAATATTTTGCAATATGTTGCTTAGTAAGGCAACATTTAGT:1 - 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chr3L 13228507 3' + P-element 2781 1 13.01 ATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGG:1 - chr2R 22287437 3' - jockey 4859 1 72.60 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCGGATATGAAAAGGTGAGTTTACAGAATTATCAAACATGTTTTTACATCTCTGTATCTGTTTACTAAAAAATGCATTTGTATTGATTG:1 - chr2R 16496536 3' - hopper 30 1 60.27 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCATTATCATTCACTTTCTATTATAATATTTATTTTGCTGCGTTAATTTATTTGTTATGTGATAGGTATGTTTAGGATACCGAGTTTTTTCCAGTGCCGGATTGCAGGGCG:2 - chr2R 9339591 3' - Transpac 4930 2 77.40 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGGTTCACTGTTGTTTACTGAATATATGAGCAATCGA:1 + chr3L 21151163 3' + 412 7463 2 76.39 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAATTTTATTTTGTTGCTCCCTTTTTTTACGAGGTCATTAAGGCCAGGACAATTTCAAATGG:1 - chr2R 7891116 3' - jockey 4732 1 57.76 CTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTCGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCACCCTATTTTGCGCAATTAGATGTCAT:1 - chr3R 29091272 3' + rover 300 2 54.11 TTCTTATGCTCTCTCAAAAGAGAGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAATGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGATACATGGGTATTTCGAATTTGTGTTTACCGACTTGCTTTTGTGAAGACTAAAGACGCTTATTATTTTT:1 + chr2L 1401701 3' - invader3 159 2 54.79 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGTTTTTATTTTTATTTCATTTTTATTAATGCGAAAAATGTAATT:1 + chr3R 25843421 3' - I-element 82 1 69.18 ATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGTGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTGAATA:1 - chrY 2346865 3' + micropia 413 2 51.56 TGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACATATTTATTTTCTATGCATATCACCGTTTGGCTTTTTGTATTTTCTGCCGC:1 - chr2L 840968 3' + 1360 45 1 71.92 CTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCAGGTACTGCTTGTCGATGTCCGTGCCCTTGACGATCTGATAGGCGGTCTTCGAGGAG:1 + chr3L 16565744 3' + Stalker2 7496 6 57.46 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATGAACATATATGAATATATACAAATAAGCTGTCTCAAAGCAAAAGCCAAACAAAAAAGTGATTTGTTGTCATATGCAAA:1 + chr3L 14709030 3' - opus 42 4 50.68 AGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAACGATGAAAGTTATAACGAGAATCATGAACTCAATAAAGTAAATAAAGCAAGACAGGAAGCAGGAATTATA:1 - chr2R 12813665 3' + roo 358 2 51.37 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAACCGCAT:1 - chr3R 19589928 3' - BS 5071 1 67.81 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTACCAGAAAATTGAACGACAAGCTATAAAGCCGGAACTTTACGTTGGACAAGAGAGGTACTGTTTTTCAGGCTGATATTTTATC:1 - chr3L 381681 3' + S-element 1679 2 60.27 ATGCTATAGTCGAGATTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGATAGTCGAAATGCAAAAGCGATACATCTTGCAAAAAACTTTTTGTCACTCTCATTCTAACGCCCTTATTATCTTATTTTATTCCCCATATAAATGGCATATA:1 + chr2R 5744726 3' - INE-1 569 1 54.11 ATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCATCCCCAAAATATTACTAACGGACAAGGTGCTCTTAAGGC:1 + chr3R 25760570 3' - G2 2825 1 71.92 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACTTTGCTCAACGTGGTTCAACACACACTTTTGCTTTT:1 + chr3R 19543528 3' - roo 8684 2 67.46 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTCACAGATCATTTTATTATAATTACTAGAAACCGATTGATTAACTGGTTGTTAAACTATTGCCAATCC:1 - chr2R 17187734 3' + roo 356 2 52.74 CTTAACGTTATTATTATTTAAATAAAGCTTAGAAATAGTAATAGCCGAATCATAATATCACAAAATAAATTTCAAAAATTACCTTTCATTAGAATATCATCAGACAAACGAAAGAGAATCCGTGCTGTGACACTTGAAATTGGCCA:1 + chr3L 5376177 3' + 1360 309 1 66.44 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATTTTTGAAGGCCTGGACCAACCTCTCTGCTGCGGTTATAACCTCTCTTAAGGAACGCGAAGGCTGAAACGGGAATATAAAATAATCAAGCACATTTTAAGC:1 - chr3L 22709288 3' - 412 18 2 72.54 AAGGTAAAAAGAAGCGGACTAAGGTGTCTCCCTTTCGGGACGGGAAAAGTTGAAATTGTTTGGAATGATGTTGTGGTTATCACATGGTAAATGTTAACGCATAATGAACTGCGTCAATTTTCATGAAAAATATCTAAAGCAGTTTG:1 + chr4 267536 3' - Q-element 506 2 78.08 TCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATC:1 + chr2L 13140695 3' - blood 7078 2 63.57 AGATTTAAAAACCATCATCCAAGAAGAAATTGCCAACATAACACCTGCTATGCTAACAAGAGTCACGACAAGGGAAAAAGGGAAAAATTCCGCAGCCTGTATATCTAATAATTATTCAAAAATGTGGGCGTGGCAGTTTTGCGCGG:1 - chr3L 19271024 3' + mariner2 655 1 47.26 ATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAACCGCCAAAAACTGCCACGCCCCCATTTTGAAAAATATGATGATGCATATTTTGACTGCTTCACATTGGTATTTTTTGATTTTATATTAGACAATGG:1 + chr3L 26169330 3' - diver2 20 2 54.35 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATCAAATTTATTGTATAACATTTTCATATATGTATCTTTTCCTTAAAAGAAAAGCATAATTGCTCCCAAGAACAT:1 - chr3L 19574028 3' - 297 6623 2 57.53 GTAAGAAGGCCAGTCAAAATGTGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTTTCACAGCCACACACATGAATGAAGAAGTGGGGAGGTGGAGTGGATACACATAGAGACAATGCAACAAACAATGACAGGAGTGACAAAAAT:1 + chr3L 21902070 3' - baggins 5123 1 65.07 GTGACAAACAAATTATAAGTGCAAAGCTAATTATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTCCGACATACATATATATAAAAACAAGTACAGGATTATCAC:1 + chr2L 23310020 3' + gypsy4 369 1 76.03 TATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTTGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTGAGTGTTTTTGGTATATTCCTGTAAGCAGGGTTGACTTACGTCAAGTCACAAACATATTTTTCCCCTTTTTCGCGCCTCGTTCCG:1 + chr2R 5795156 3' + INE-1 499 1 41.38 CGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCGAA:1 + chr3L 18738143 3' + Bari1 1699 1 65.38 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGAAAGCTATTGCGCGCTAAATTTAGAATGTTTCC:1 + chr2R 16073036 3' - Burdock 44 2 53.42 ATTGCTTATATCTATCTATTCTTACTTTCATTTATACATATACAAATGCATGAAGGCATTGACCACTTGAGCCTCCGAGCGGGTCAAGCAAAGGCCAGCGACGTTGCCAACTATGCCATAGCTGGAATTTCTTGGCTATTTGCTG:1 - chr3R 22818089 3' - Stalker4 7229 4 51.03 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCGTGGGCTTGCTCTCCCGCTCTCTTGTTCTGT:1 + chr3L 13228594 3' - P-element 16 1 69.63 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACATAATTAATTGTGCTGCTGTGTTGGCAAACACGCGGGCGCCGGAAAGTAGGCAACACGCTTTTTTGGCAAAACGGTTCGCCGTAATTGATTGCC:1 - chr2R 18983707 3' + hopper 1392 1 69.18 AATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTCAGTGGTTAGTGGGCTTCATTCGAGAGGACTGCAGTCGTCGAAACATTCGACATTAGAGAGCTGCACATTTAAGATTTATGCCCGGAAAGAGGGGTATCTGGATCTGTTCC:1 - chr3R 30262806 3' + mdg1 7072 4 76.71 ATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTCGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCAC:1 - chr3R 29091297 3' + rover 7226 2 67.12 TACTATTTAAGTTAATCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATGTATTATGTTTACAAAAAAAAAACCAATACGTTAGAAAGGGACATAGCGATATTAATTTTTGTAAAATTTGTAAATTGTAAGCTTG:1 + chr3R 17467207 3' + I-element 5316 1 56.85 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCACTTTTATGTAACCTTATTTATTTCATATTCTTAAGATAAGTTGCATTTTTTTATCCAATGCTTTTTTTTTATCAGAGTTTTATGTCCATTTATTTGTTT:1 - chr3L 18792372 3' + roo 389 2 69.86 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCAGTTTTAAGTTGCGAAGACGTCCCACTGTAAACCCAACTATTGTACGGCACTGCAACATATC:1 - chr2L 11613210 3' + hobo 2914 1 55.75 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATAAAAATTTTGACAGTACAGGCATCGTTCATTTATCTTTAATAAAATAAAACATTAATTATGCAGCTTTAACGCTCAAAAGCTTATTTACACAAAATCA:1 + chr3L 13166359 3' + I-element 5332 1 67.12 ATCTACTGAATAAAAAAAAAGCAATCACTTTGGTTATTTCCCTTCCTTTGATTTCCCGTTCAGGATTTCCCTGGCGAAAAGTCCCAGTCATTTCAGTTCTCTGCTAATTATGAGAAATTCACGTC:1 - chr2R 16522441 3' - Transpac 84 2 44.00 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTAAGTGGATGACAGAGAATTCAAATAAAGTGCTTGCCACTCTACAAAAGGACTGCTTAAGATTCTTTTAACCAGAATTGGAATAAAGCCAGCAAATTCTGATTTTAAAGTA:2 + chr3L 18972978 3' - mdg1 10 2 77.40 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGGCCAAAAAGAGATTCCATCAGTT:1 + chr2R 9623408 3' + I-element 5284 1 65.07 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGTATGTGTGCGTGTGTCGATGTATTAAGTGGAAACACCTTGTAAAATGGCTGACAGGTGTTAGAAGACTTTGCAAGATTTATGCGCTGACATTAACAT:1 + chr2L 12847340 3' - 412 7076 2 68.49 TGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTATGTCAACGTGGAAAAAATTAATCGTTATACTACCCTTTTTATGGCTTTCCCATGGATTTTCTGTTCC:1 - chr3R 10643875 3' + 17.6 238 2 49.62 ATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTT:1 + chr2L 13510858 3' - diver 51 2 76.99 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCATTATCATTCACTTTCTATTATAATATTTATTTTGCTGCGTTAATTTATTTGTTATGTGATAGGTATGTTTAGGATACCGAGTTTTTTCCAGTGCCG:1 - chr2R 9339603 3' - Transpac 23 2 69.18 GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTATAATACTTAGAGAATATGGGAATATTTCAACATTTTTC:1 - chr2L 7133586 3' + copia 5043 2 74.66 AGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCACTTGATTTTGAGGAATATGGCGATGATGATGATAGCCCAATATTATTGG:1 + chr2R 5259990 3' + 1360 106 1 66.44 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAATTAATCCAAGAGCTTTGTCAATTAACTAATTAATGT:1 + chr3R 24976317 3' - roo 49 2 52.05 GCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACAGCGAGCCCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGAGCACCATGGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATTAGAAAATGAAGTCATTTGAAAATGTTTTCAAG:1 - chr3L 18418801 3' + Doc2-element 4393 1 74.66 GTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTTTAAAGTTACTTTCCTCTGTGCGGTAATTAACTCGAGTGTGCTGGTGTTGAAGCTG:1 - chr2L 5636633 3' + Ivk 51 1 61.38 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCAACCCTTAACGGAGTTGGGCGAAACTTGACCCCAAGCTGAGAGAGAGAGTGAGTGAGAGAGTGAGTGGGGGTGGGAAAATAGATGGGTGTGAGAGG:1 + chr3R 11774026 3' - P-element 22 1 69.23 TATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGAAAATATATTGTTTAGTTTCTAAATTAAATTGACAATTTCTTTTAAAAGAGTATCCATGAACAGAAAGTTTT:1 - chr2R 7407966 3' - Idefix 43 2 56.16 AGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCTTTTCCTTTTTTCCTTCCTACGGCTACATCGGCCAC:1 + chr3R 6412111 3' - Tirant 13 2 76.71 AACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATTTCTTTTAGTTACCAATACTATGCCTTTTTCAGGATACTCACAAGGAGGCCTTTTGGCCCG:1 + chr2L 11280827 3' + jockey 4781 1 56.12 GGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATGCAATGA:1 + chr2R 15151110 3' - hopper 77 1 69.86 ATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGTGAATGCGAACGAGAATTTTAATTATTTTTTTGTGATATAGGGTATTAGGTATATCGGATTAAAATGATTAACAATCGTTTGATATGCATATCTATTACTACTTTAAACATAACAAATGC:1 + chr3L 21577431 3' - INE-1 545 1 64.38 TATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAA:1 + chr2L 261033 3' + Juan 4123 1 74.66 CTTAAATATGTTTTTTTTTTCTTTGTCTAATAATGGAATTTGAAATTTGCATAAGCCCTTTAGTAGTCGGTGATTGAAGGGTGGAAAACACTTCAATTAGGGTTCTCTATCTGTGGGTGTTCACCGTACGGACCTGAGTTCTGTTA:1 - chr2R 18315696 3' + Circe 424 1 83.56 CCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAATAAAAGTTGCAATAAATTGTAGCATACTTGTGAGCGGACGC:1 - chr3L 15853511 3' + jockey 4916 1 73.29 TTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAATTATCAATCAAATTATCAAATCAACGTGATGGTACATGCA:1 + chr3L 24916722 3' - Porto1 151 1 38.36 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAACACTAAAATCTAAGACGTGTCTCGATTAGTTTCGAGTTTTGCTTACTCGCTTCTAAGTATGATT:1 - chr3L 20744170 3' + 412 7490 2 54.79 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTAAGTGTACTATAAATAATGTGTGATTTACGCGTTACTTATTTTATGTGTCCGGGATACAAACTACTGCAATTATCTAGAAATATACGTTAAA:1 + chr2L 6755873 3' + pogo 2077 1 70.55 TATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCAAGCATATC:1 + chrX 20465877 3' - jockey 4819 1 58.22 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGCAAAACATAAAGCAGGAGCCGCCGCGGCGAACCAACATTGCCATGATTTGTATAATTGCAGTG:1 + chr2L 20986615 3' + roo 9034 1 53.54 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGAACGAAATCGGAGGTCGAGTGACTGGCAACGCGATAAATCTCATGG:1 - chr2L 18944791 3' + P-element 2860 1 62.79 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATCGATAAGAAAACGAGGGGACACAAAACCGAAGGGTGACTTAAGCCAGCGATTGCTCTG:1 + chr2L 13140752 3' - blood 7027 2 74.66 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCCCCGTCTTGGAACTGGACTCCATCGCATGTG:1 - chr3R 10461625 3' + roo 9038 1 62.33 GGATGATATAATAATCTTTCCCAATACAATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTTTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAA:1 + chr2R 2875184 3' + TLD2_LTR 48 1 65.07 ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATGCCACAGCGTTCCACTCCCCTGCTGGGAC:1 + chr3R 17210144 3' - HMS-Beagle2 25 2 68.49 AGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGTTTTTATTTTTATTTCATTTTTATTAATGCGAAAAATGTAATTTCAAGCATTTGCAACTGCAGCGGTCC:1 + chr3R 25843447 3' - I-element 56 1 51.37 AAGGGAACCATCGTGGTCCGCTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCCCTTAATAATAAAACATTCGCGTGTACCCGTCTTCCGCGGCCACTCGGAACGGCCAGTCTTCCACCGGCACTTCCTTCCACCGC:1 + chr3R 2894731 3' + Q-element 494 2 55.56 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTTTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGAGCTACAATGTGTTTATAGCCCAGGTGTGCAGTGTAAAAAACAGCAACATAAATCAGGTTCCGGAAAGTATGCTACTA:1 - chrX 20502988 3' - 1360 61 1 57.53 GGCTGACCGGACTCGTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAGCTGTAAAGCAAGTAAAACAATTTGAATGGCTTTCCTTGCGCACTAAGACTTTAACTAATTTCCCAAGCTCAA:1 + chr2L 6876704 3' - Rt1a 56 1 52.05 GGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATGTATCCTATTCATTCACAATTCAATAACTAACTATAGTGGCAAATACGTCAGATATTAGCCAGATGG:1 + chr2L 5711022 3' - HMS-Beagle 47 2 51.37 CGTAGCCAACAAATCATTTTTGGCTACTCGGGTTATATAACCTGGCAGCCTAACCTTTTATAAGAACAGAATATAAATAGCGCCGCTGCTTGCTTTCGAAAAACGTGGGTTTAAGTGGAATGCAATTACTGGATGTGGC:1 - chr2L 75723 3' - Cr1a 499 1 54.68 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGATTGATCCGCTGTGACTTTTGCTGACGCACTTGCACCGACTTCT:1 + chr3L 17904900 3' + roo 9036 1 60.96 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTGCTTTTCCCACTTTCCCACCGCTTTCCACAAACTTGAGCAACAGCTGCGTGTGTCAAGCCGAAAAGTGTGCAATGAAAATTGTGTG:1 + chrX 19113599 3' - 412 31 2 62.24 TTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATACAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGTTTAAAAGTGTGTGCGTTGTGTAGGAGAAAGGAGAGGCATGTCCACAGTGTTTTTGGCTTTGATTGCAATTCGCAGTTTTTGTGGCCAAG:1 + chr3R 27841240 3' - INE-1 499 1 77.40 GAAAAAAAAAAATAAGGAAAAAAAACCCCAAAAAATGTGGGCTAGAAAAGGCCCAACA:1 - chrX 5821250 3' + Doc2-element 228 1 86.21 AAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTACAGAAATGTTAAGAAATTCGGGAAATATCGAAGAGGACAACTCTGAAAGCTGGCTTAATTTAGATTTCAGTTCTAAAGAAAACGAAAATAAAAGTAAAGA:1 + chr2R 14541804 3' + P-element 400 1 16.44 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACTGTACAAGTTACTGCGAGTAAAATATGACATTTTTATAGAGTTAGATA:1 - chr2R 8452751 3' - blood 75 2 69.18 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGTGGTTTTCCCGCGGAGACGCCAACG:1 - chr2L 23189393 3' - 1360 46 1 91.67 TATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACAATACA:2 + chr3R 29091415 3' - rover 6985 2 63.01 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTCCTTTTTGCCGTTCTCAGTTCTCAGGCCCCGAAA:1 - chrX 8760106 3' + roo 342 2 69.60 GTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCCTACGCCTAAATAAATCGACATTCGTAACTTTTTTTTATAATAATGAAATTAATAAAACGTACATACAATATTTTTAAGAACGATACGCCTACCACATACGATTGTACACTTAA:1 - chr3R 25718136 3' - I-element 4961 1 73.29 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCTTATGAAATGC:1 - chr3L 18199937 3' - Doc 56 1 54.79 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTGCCTCTCTCTCCTTCGTAACCAACGGTAAAGAGCGAGAGCGACCTGCTCAGCTGCCGCATTCGGAAAACGAACG:1 + chr3R 5264938 3' + P-element 2879 2 73.15 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAATTTTCTACAATTTTTGCAATCATAATTGTATAAATTTCAACCAAATTTTTAATGGCTCTTAATAATAGTGCGAAATCATCGAGACA:1 - chr3R 22136244 3' - FB 35 1 58.90 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATGTAAATATATGTGCAATAAAATTATGCGAAATAGTCATTCCAAGGTACAGCGGTATTCATGA:1 - chr2L 17166271 3' + I-element 5301 1 53.79 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTAATACGAAGAAGCTCATTTTTTCGAAAATCCAGCTAACACAGTACGAATTTAGCCAATTCTAGAGTGGCCAACACTAGTCCCACTTAAAAGTGATTT:1 + chr3R 29113017 3' + Juan 4195 1 63.70 TAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAAAATTTTCAAGGCAGTGCGGACTTTGCCACTTT:1 + chr2L 12832905 3' + I-element 5268 1 80.14 AAAACAAAGGAAAAAATATATATGGCACTAAACCAGACAGAAAGTGTTTGTTGAATTAGTTAATTCCCTAGGGTCGACAAAGCTGCTTTACTTTTATGTTTACGTCGCTTAATATCTTTAAGCAAATATTAAAAAATAGTAGGCTC:1 - chr2L 5818467 3' + G4 3596 1 76.03 CAGAGCTATTGATTCCTCGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTACGCAGGCTGGAGCGAACGACCTGATAGCCGAGACCTGAG:1 - chr2R 24505193 3' + transib2 2381 1 72.03 CTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATTGCTCTTTTCAAGTATCTATCGTATATCAAATGAATTGCATTTGCATCTCCGCCCTTCTGCATTCGAGTCCGTTCGAGCAGAGAG:1 + chr3R 30850869 3' + I-element 5322 1 60.27 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAA:1 - chr3R 24976199 3' + roo 353 2 54.79 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTATAATCACAAATATATTAAATAAACCTCACGGACTGTGGCCTGTGTTGCAGC:1 + chr2R 9455920 3' - 412 67 2 63.70 TAAAGAAATGTCGTAATACATGTAGTCATTTAGTTTTATTGTTAATATATTCTGTTACAAAATATATATTGTTTGAAATGAAGATTTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 + chr2L 9019833 3' - Stalker 6818 2 69.86 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAAAACAATCCTTTAGCTTTCGAGTTCATTT:1 - chr3R 19543401 3' + roo 9016 2 55.48 ATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATTCGTGAGTATTCTAATCATTTCCTTTGATAAGGTTCTAAGCAAACAATTTGTCATTATATTTCTAGGATTTTAGTATGAAACGAGCTAAGGTACTTTTCCATAATTAG:1 - chr2L 7939686 3' - Burdock 6146 2 74.66 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTC:1 + chr3L 13228542 3' - P-element 79 1 31.51 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCACTGGCTCTCTCGGCGCAGGC:1 - chrX 16526271 3' + P-element 2881 2 69.05 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAACAACAGCTGTGCGAGTGAGCGGGTCAGAGGGAGAGAGGTGAAGTGCCAGAGCGGGAGAGCGACAAACAAATTAATTTTTATATGACATTAAAACGA:1 + chr2L 14490243 3' - P-element 19 1 72.22 AATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATTAAAATTTTTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAG:1 + chr2R 2875211 3' + TLD2_LTR 75 1 48.63 ATGCCTATCCCTCCTACAAACCAAAAAAGACATCGTCAACATCATGACCCCGGAGCTACCGAACTTACTCAACAATCTGTCAGAAGCTGGTTCCAATTTCGACAAGGATTATGCAAATACGGAGCTTCACGATAGAATGGAACACA:1 - chr3L 27383005 3' + I-element 5057 1 81.51 TTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAAAAATGGAATTTTTAAATAATATATGTACATATATGCAAGT:1 + chrX 20632651 3' - pogo 78 1 73.97 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGAGCGTTTTAAGAGCAGGTGAAAACAATCTAGCTATTTTATGGCCAAAAACTAGATTATGAGTGCTCGAATTCTGGTGTGTTAGTCGAACATGTG:1 - chr3R 5264790 3' - P-element 26 1 67.81 ATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGA:1 - chr3R 9175193 3' - Juan 58 1 52.74 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGAGACACTGAGCTCACCCCAGTTCTCTATAGGGACAGGAATACTTTAGTGCTTTGGTGGAT:1 + chr2L 17206090 3' + hopper 1357 1 57.24 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCAAAATATATATCAAATTTATAGTTTTAATTATTTGTAGGCGCCATTGCTTAATTAAAGTACAACAAATATATATGCATTAATTTCCATTGGAA:1 + chr3R 19721207 3' + opus 474 2 64.38 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGTCATTACTTTTAATACTTTCTTTAATACTTTATTTTATATATAGTAATATTTACCAAT:1 - chr2L 18953026 3' + roo 9032 1 57.72 CATTTGTACACATTATAATTAAGGAACAGATCCATTAGGATCCGAAATCCCAGGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCCATCAGCTGGAGGCGCCTCTGAAGAACAACTTTTACGTCTGAAGTCTTTTAAATGAAGATTAAATT:1 - chr3L 11837684 3' + G5A 2737 1 54.11 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTACTTTTGGGATAAAACAAAATACAATCTTACAAAACAAAAAGTTAGAATGGTTTAAATTTATGTTCAAAGTTTATTTTGATCAAACTTTAGAATTAGA:2 - chr3L 16907731 3' - jockey 30 1 67.81 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATAAACGGAGTGCTACTGAATTTTATGGCATTTATGTACATTTTTT:1 + chr2L 8707550 3' + 412 7506 2 56.16 TTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACGTTACG:1 + chr2R 20447889 3' + hopper2 1539 1 63.01 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTTCCATCAACATTTAAGGCCGCAGCAATGTTG:1 - chrX 2518002 3' + P-element 2861 1 62.31 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGTGGCTTGCATATTTTGATTG:1 + chr3L 14551355 3' - P-element 95 1 17.14 CCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGG:1 - chr3L 18199953 3' - Doc 9 1 62.65 GTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACAATACACAAAGTATACAC:1 + chr3R 29091427 3' - rover 6973 2 71.23 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGCCCGAAAAAGTATGC:1 - chrX 6484713 3' - jockey 23 1 59.18 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCAACCCTTAACGGAGTTGGGCGAAACTTGACCCC:1 + chr3R 11773961 3' - P-element 49 1 34.58 ACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTTGCCCATTTATCTTTTCCAGCCCATCGTGCGCGGGTGCGCT:1 - chr2R 14940684 3' + blood 299 2 73.29 AGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCGCTTGTGTTTACCCAGAAATGTGGTTGAAATATGAGATGTGGGACAATGACTTATAGGGCAATAGATCTTATAGGGACGGCCTGGAAATATGTTG:1 + chr3L 26386335 3' - HMS-Beagle2 6953 2 73.95 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGATCATATGTGAAAACACATGGACAGTTGTTAAGTGCTTAAAATATGCAT:1 + chr3L 16875921 3' - Burdock 41 2 57.72 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAAATGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATTTATTGATACCATTGTCCCTATATATACAAATATTGTTGCGTGTAAATGTAAAGTTAAAGTAAAATC:1 - chrX 16479754 3' + 297 6929 2 59.59 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAACTTGATCAATAAAATGCTTGACATGATATCAACAACAGTCGC:1 - chr3R 30850732 3' - I-element 38 1 59.03 GAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTTGTGGCGCAGGTGTGGAGCCAAAAACCGCATCTCCACCATTCTCT:1 + chr3L 11826485 3' + INE-1 141 1 71.23 AACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCTCCTGTTAACGAACTCTCGATGGTGTTTGA:1 - chr3R 22840407 3' - Transpac 4996 2 75.56 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATTATTTTTACAGTTGCATTCCCAGCTCGATTCTCGAG:1 + chr3R 21587648 3' + roo 387 2 69.66 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTT:1 - chr2R 24021547 3' - pogo 55 1 58.22 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCACGCTTGCACTTTTTGTCGCAATTGCAGTTGGCCTCATTATGCAATTACGGCAGCAAGAAACAAAC:1 + chr3L 7790774 3' - copia 4912 2 54.14 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGCCACTCGCGCAAAATTTCAATCTGATCGATTTGTGTATTTGTCAAACTGATTTATCGAGTGTC:1 - chr3R 22868724 3' - mdg1 26 2 65.47 TATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTAAAGTTTTCCTTCGCACTAGGCCAAACTCCGTTTGGCGCCATCTATC:1 - chrX 20636942 3' - Quasimodo 70 2 67.81 AAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATGACAAGCCGATACAATTAAAGTTTGGCATAAT:1 + chr2L 2246301 3' - roo 8940 2 75.57 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATATCAAATTTATGTCAAGTTGGCCAATTTTCAACAGTAAAAACGACAAAGAAAAACTCTACGCCAATCAGTTAGCAAAAAAAATTAGCACCAA:1 - chr2L 3648681 3' + roo 9045 1 67.12 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACACTTGAAACAAAAATATAATCCGATATTTGTTTGGACTAATAAAAATTAAACTACCAAATTTATAAAACCGATGTGTAAACA:1 - chr3R 4661904 3' + roo 9033 1 59.59 TCTTGAGGCACGAAGTGCGGCCACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAAAAAGGTTTTTAATTTTTATTTCGGGGCACATTACCGGGAACAGCACTTTTAAATTATTGAGTGTGAAGCAT:1 + chr3R 26410284 3' - 1360 474 1 51.37 GACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTTACGCTGAGAGAAATATAGAAATAGAATTTGCTAGCTGTTCGCTGTAGCGCCCTCTCGCTCTCGAAC:1 + chr2L 2897233 3' - 1360 3317 1 88.78 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTATAATCACAAATATATTAAATAAACCTCACGGACTGTGGCCTGTGTTGCAG:1 + chr2R 9455919 3' - 412 7115 2 62.86 CTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGACCACATCAAAAAG:1 + chr3L 9907417 3' - BS 4998 1 76.03 AAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCAAACTGTGTCACACTGCTGCCTGCTAACGGTTACTTTATCGAGGCGAGGGTACTTCACAGAG:1 - chr3L 20388122 3' + 1360 3363 1 56.25 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCAGTCGCAGCAACCCTAACAGCTTTAACCACGCCCACACCTATACACACACACACACACATCGCCCACGTTTTGCGTTGCTAATATCTGTGGCATACTTTTGTGGGCTC:1 + chrX 19982498 3' - hopper 13 1 74.66 GAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCCCTATTGCAACTCAC:1 + chr3L 3565404 3' - gypsy 59 2 63.04 TAAGATTAGATAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTTCGAGTTGTTACTGTACGGGAAATTGAAAAAGCAATAAGTTCTTGTTTCCAACTGATAAACATGAATATTTGTGGGGTCTTTTTACGACTTTTTGTTCTGTGGAG:1 + chr3R 30098940 3' - 297 6756 2 73.29 ATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAAGCGTATACATATATGTATCAACTTACTGTGCGTTTTTCC:1 + chrX 15755206 3' + R1A1-element 5025 1 67.48 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGGGTCTTATACTGTTGGAATGAAATGCGGCCGCGTTTGGATTGAGGGAAAACGGTGAAATTTTATGCAAATGGTCACACTAATATGAAC:2 + chr2R 18440529 3' + P-element 2855 1 62.33 GCAAAAGGGAAAATAACGGGATCCCTGCGGCCTATAAAAGGACGGCGCAAGCGCAGCTC:2 + chr3L 24300082 3' + gypsy8 312 1 86.44 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCGTCCCATTAGGACCTTTCCGCACGACAGGCGTCGCCAGTCGGGAATTAAACGTGTTT:1 - chr3R 19639736 3' - 412 66 2 65.07 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGAT:1 - chr3L 13228478 3' + P-element 2810 1 32.88 ATCATTGTAGATCTAACTATGACTTGCATGAACTTACAGAGTAATATGTTGTGACTATAATAGCCTTTATCGCAAACTCGCCATTTCGATTCGAAGCGTCAAGGAAATCCAAAATCTTTTTGGACCTTCATAGCGAGTGGACGAAA:1 - chr2R 5637968 3' + Cr1a 4152 1 59.59 TCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTAAGTGTACTATAAATAATGTGGGATTTACGCGTTACTTATTTT:1 + chr2L 6755824 3' + pogo 2028 1 67.81 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACAATATTTTCCATCCATAGATAAATATCTCGCCATACTCTCCATAAAGATGTTGGCCAAGAAATTGTCAAGAGAAAAGACAGAAGGGAAGATTATTGT:1 + chrX 5366289 3' - pogo 20 1 70.55 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACTATAAATACATCGGATTCCGCTTTTTTGAAGTGTATCTCCAATGTTCTACGCTCTTCAGCGGCAATTTACGATTACCATACGCGAGGACGGCGCATGGAA:1 + chr2R 24745907 3' - 412 7071 2 73.29 AGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTAAACGCGCTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATCTGTATATGAATGATATGCATGGCATATGGGGATCTCTGTTTGCCAG:1 + chr2L 258374 3' - Stalker4 7138 4 67.81 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGCTTGTTTGCGAAAAATAAAAAAAACAAAATTGGCGAGCAG:1 - chr3R 17059279 3' + hopper 1359 1 66.39 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTGAGCGCCTTTATGGCTGCTTGACTATCAGTGATATTTGACTAAAAATGCTGGAATATTCTTTTTCGAAG:1 - chr2R 4330739 3' - copia 4 2 61.86 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTAAGTGGATGACAGAGAATTCAAATAAAGTGCTTGCCACTCTACAAAAGGACTGCTTAAGATTCTTTTAACCAGAATTGGAATAAAGCCAGCAAATTCTGAT:1 + chr3L 18972969 3' - mdg1 19 2 71.23 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATTCCCAGTGCAGAACTCCAAGGCGGCTCACCAAAGAGGTTCTCCGAAGATGAATCGGTGCTCGTTTGTTTGGAATCCAGTGT:1 - chr3R 10636075 3' + blood 337 2 56.16 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTAATCGATAGGCATTGTTTTGTATGTACCTTTTTTAAAATATTCTTTATCAAATCAACTGAACCTTATAATTACTGTTTAAA:1 - chr2L 17957141 3' + blood 343 2 61.11 AAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCCCTATTGAAACTCACATGCACAAAATAATCGTTTCCGATTGACTTTACCCCAATTAT:1 + chr3L 3565446 3' - gypsy 7012 2 65.75 GGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATTGTTCGATAAGTTCGTTAAGCAGATACTCAATGTAAATAATAAAAGAAACGAT:1 + chr3R 15135465 3' - F-element 4522 1 63.45 CGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCC:1 + chr3L 3565390 3' - gypsy 7057 2 71.11 ATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTATGGTAGAAATAATAAAAAGTCTGTGCCTTTCCGAAATAGACTTCG:1 + chrX 19820211 3' - Juan 4102 1 68.49 CTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTACCAAAATTCATCTATATAAAGTTATACTTAATTTCAGTTCTGGCAATTTGCACTCGCAGAACAACAGAAAAAACCGTCGAGCAGTG:1 - chr2L 6755543 3' + pogo 112 1 63.19 GCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTCCTTTTTATATAATTTACATTTGTTTAAAAAAGTAATCAGTAATTACTGTATATTTT:1 - chr3L 11903206 3' + opus 439 2 65.07 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGATTGATCCGCTGTGACTTTTGCTG:2 + chr3L 17904880 3' + roo 9016 2 57.53 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGTGTTAATACTTATATATTTTAAATTAAGTTTTTATCCCACCTACAATGG:1 - chr3L 21162031 3' + roo 9002 2 66.90 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGCCGCCTGGACGAAGACCATGAAGATGAAGGACGCAGGACGGAAAGCTAACGAGCCGCATGGCAGACAAA:1 + chrX 2916770 3' - 412 7096 2 52.90 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAAT:1 + chr3R 24976282 3' - roo 8748 2 76.03 AGAGCGAGCGCGAATGTTTGCGTATACTGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCGATAGAAAACGTAGGCACGGTGATTTATCTGGATGAAGCCGACCACGAAGATAATTAAATGGAAATGACAGGGAAATTGGGAGCTCCGTTTTG:1 - chr3R 11923741 3' - diver 402 1 73.29 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTATTCCTAGAATCGCATTAATATTTTTAATCTGATTACGATGTGGAAAATAAAGCAAGAATAACAACTAAAAACGCTCGAAGCGAAGGTAAA:1 + chr3R 30782646 3' - pogo 25 1 67.12 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGGGCGGTAGGAATGAAGGGAAAGCTGGGAGGAGTCGGTTGTAGGAGGGTTGAATCAACAGACGACCACCTTTCACCTTTCGTC:1 + chrX 5206567 3' - Tirant 28 2 62.60 GTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATATATCATTGATAAAAAAAGCTTTTCCTCTGCGCATTTTCCCTAGTATACTTTTCGGATTGCGTGTGGAAATCACGACCAG:1 - chr3L 18554573 3' - jockey 4577 1 63.41 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATCTTTATGCTTACAAGAACATTTTGCCAATCGATACTATATTCCTTGGTCTCAAATGAAGAA:1 - chr3R 29622651 3' + pogo 2074 1 51.28 GTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCTGTCGGCGGCCCACAATTCCCTAGTGTCATTGGAGCAACCGATGGCGATGGGGAGCCAAATAGCACT:1 + chr3R 20084399 3' - mdg1 327 2 52.14 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGTATATTTTCATTGCACGTTTACTTCATAGTAAGATAATATTAAATGTTTTCCCAGCTCAACCAAGCTTTCAC:1 + chr3L 13156816 3' - transib2 45 1 53.85 TACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGCA:1 + chr2L 14889009 3' + hopper2 1547 1 67.72 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGAAAACAGTAAATTGCATTTTTATACAATTTTCCATCATTTGACTTGGCAGTTGTTCGTCTGGGCTTTGTAATTTTCAAATGAAATACTTTCCGAATGCAATTCGC:1 + chr2R 20700769 3' - mdg1 7055 2 73.97 AGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACAAACGAAACAAGAGTTACTATTTCTAAACACACGCAAATGATG:1 + chr3L 20744064 3' + 412 106 2 68.89 TTTTGTGGGCGGAGAAGAAGGCGTTGTCAGATCAAAAAATAAACAAAATCCAAAATTCTATTTAAATCCTAATTATAAATATAAAAAAAAATTAAGTCGCTATGATTGCAAGTTGCAGTTAATACTAGCATGTGACGTATCGCCAT:1 + chr2R 4551491 3' + transib4 2506 1 66.44 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGAACGAAATCGGAGGTCG:1 - chr2L 18944820 3' + P-element 2820 1 37.14 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCGTGGTCTTGCTCTCCCGCTCTCGT:1 + chr3L 13228587 3' - P-element 33 1 62.76 GTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGGCAGGCAGCGGGGTCAGAGGTTAGCCATAAATATG:1 - chrX 6417693 3' - accord 179 2 80.00 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGAACGAAATCGGAGGTCGAGTGACTGGCAACGCGATAAAT:1 - chr2L 18944798 3' + P-element 2836 1 50.68 CACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGGGCAGATATGCAAGTTGCATGACAAAAGTTTCACAATTAAAACGGCAACAAGAGCTACATTTTAAAG:1 - chr3R 25442790 3' + R1A1-element 5318 1 61.11 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGATATCAATTTCAAAATTTAATAACGATTTTGAAAATATTTTTTGCAGAACTAGTATGTATATACTATACATTCAGTTTATCGTAC:1 + chr2R 8687934 3' + roo 9036 1 60.69 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATATACCTTTATTTATGTATCGATACATTTGCTTAATTTTATATACCTGATGGAAAGAGTAAAACTAGATGTGGTAAATTTTTGAG:1 + chrX 13385134 3' - 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P-element 50 1 35.45 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAAAATAAAGCACTTGTTTACTTCGTCGCAAAATCAAAAGACAGACTGCGGCCTAAATAAATACGTGCGTTGCTCCATTCATTGAACGTTATGTCTGTTTGCGAAATGTGTAG:1 - chrX 10367495 3' + Juan 4197 1 73.97 ACTAATAAAATTACGAAAAAAATATCCAACAATTTTTCAAAAATGTGGGCTTGACACTTTGAAGATTGCAAACTCCGTAAAGCAAACTTTCCGTATTATGGAAAAAAGATGAAGATTCGGACTATTGAGTAAACAATCG:1 + chr3L 23635751 3' - INE-1 401 1 54.68 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGACGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAAGAGTTTAATATCAAATATCGTTTATTATCTTAACGTCCATTCGTTTAACAATAAAAATGGCTACCATTTTTTCACTGCCTACCCACTTTCCGT:1 + chr2R 22012274 3' + opus 474 2 67.59 AGATCTCAGGAACTATAAAAGCTTGAAGGGTGAGATTCAGCAACCAGATTCTAGAGAAAATGACACAGCGCACCCATGCTGCCACGCCCCCGAACTGGTCACGCCCACACTTTGGAAAAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTC:1 - chr4 809186 3' + INE-1 149 1 47.95 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAACTAAAGTACTTAGATAAATAAACTGGGACATTCAGTTTATATAAGCGTGTTCATCAAATTCCTCCTTAA:2 - chr2L 20556404 3' + 412 7497 2 52.74 GTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTGCTAACGCTACGTATGTATGTGTGCGCCTAAATGGGCGGGGATTTGGCAAAAGGGGCGG:1 - chr3L 13365512 3' - jockey 4577 1 70.83 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTATTCCTAGAATCGCATTAATATTTTTAATCTGATTACGATGTGGAAAATAAAGCAAGAATAACAACTAAAAACG:1 + chr3R 30782629 3' - pogo 40 1 56.25 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAAT:1 + chr2R 20447879 3' + hopper2 1548 1 65.35 GAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTT:2 - chr2R 9504198 3' + roo 9020 2 55.48 ATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAAAATAAAGCACTTGTTTACTTCGTCGCAAAATCAAAAGACAGACTGCGGCCTAAATAAATACGTGCGTTGCTCCATTCATTG:1 - chrX 10367524 3' - Juan 3752 1 48.63 CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTCGCTTATCGGGTATCCCAAATCTCTGCAAATGATATGAGATAT:1 - chr2L 13140623 3' + blood 7311 2 71.92 AATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACGAATTGCCGTTATGAGCGGCAAAGGACACA:1 + chr2R 15822135 3' - invader6 9 2 64.14 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATTTTTGAAGGCCTGGACCAACCTCTCTGCTGCGGTTATAACCTCTCTTAAGGAACGCGA:1 - chr3L 22709330 3' - 412 45 2 57.48 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGAATGAAAGTGGACGGCCTTTCT:1 - chr3L 15276628 3' + hopper 1376 1 51.59 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTCGCTTATCGGGTATCCCAAATCTCTGCAAATGATATGAGATATACTG:1 - chr2L 13140619 3' + blood 304 2 69.18 TTTTTTTTTATTTACTTAAAAAATGTAAAGCAGCATAATAAGACATATTTTTATATACATGTAATATATATTAAATATTTTTTTAAATTGACGAATTTATGAGGGCATAATATTAAAACTATTAGTTTCTTGACTAAAGCTGTGTG:1 + chr3R 15008047 3' - G7 1144 1 67.81 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGTTGCGTAGTTCTGCACGTAGAGCAGAGTCCAG:2 - chrX 19585131 3' - Transpac 32 2 44.52 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGTATGAAGTGTTCCGATAAAAAACAAGCGAATGATGAAATGG:1 - 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chr2L 11442897 3' - G-element 4182 1 56.85 CCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATGAACATATATGAATATATACAAATAAGCTGTCTCAAAGCAAAAGCCAAACAAAAAAGTGATTTGTTGTCATATGCAAAGTCAAATCTTTTTCGTTGGCTTCCATCAA:1 + chr3L 14709059 3' - opus 7129 2 69.86 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGTTAAACGCTAATGCCGCAAAGTAATTCAAAACTTAAAGCGCACTTTTCGGGGCTCTCGACGCGGTTTTCT:1 - chr3R 18541298 3' - hobo 53 1 53.42 ACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCTTATGAAATGCAAATTACATTTCAATAGCGCGATTTAATGGTACCCAGCTACTTTGTTCT:1 - chr3L 18199888 3' - Doc 7 1 80.14 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAACAAATACACGGAGCAGATTCGAGTGAAAAGCGTTGCCTACTTTTGGGGCTGCACTTCCATTGT:2 - chr3R 15168883 3' + jockey 4931 1 58.90 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGCAGCAAAACTAAACAATTTGTTTCTG:1 - chr2L 19158828 3' + P-element 2820 1 39.73 GTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCACCGACTTAGCGGGCAGTGCCTGCTCGGCCCACTGGCGCAACTTGATGTCTACCAT:1 + chr2R 14231929 3' + accord2 18 2 79.75 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCAAATCCACTTTGTTGCCCGTCTATCCTTGCCGCCGTCTCTTTCGCACTGCGCTTCTCCGTCTCC:1 - chr3L 17108534 3' + hobo 2937 1 74.73 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGAGCGTTTTAAGAGCAGGTGAAAACAATCTAGCTATTTTATGGCCAAAAACTAGATTATGAGTGCTCGAATTCTGGTGTGT:1 - chr3R 5264804 3' - P-element 34 1 60.71 TTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACACGCCGCAGAGAGATAGACGGCGAG:1 - chr3L 17590871 3' + 1360 380 1 71.23 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGGGGTACGGTTTTTATTTTTATTTCATTTTTATTAATGCGAAAAATGTAATTTCAAGCATTTGCAACTGCAGCGGTCCC:1 + chr3R 25843448 3' - I-element 55 1 49.32 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTAAAAAACCCGATCGCGTCTATTTCTGCAATTTCTAGCTATTAGAATTACATTTGACAAAGCAAAAATG:1 + chr3L 24253706 3' + 297 6930 2 55.48 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAGAAGCAGGCCTAAAAACGCCGCGCAGTAGCAGGTCTTTCGCGATATGTTATTAATGCAAATACGCATAATATATA:1 - chr2R 16891740 3' - jockey 4699 1 67.81 GTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATATTTGGTGGGGTTTGTCTTGGTCTTTCGGCATTCTGTCACGCG:1 - chr3L 1514811 3' + F-element 80 1 71.23 AGGACAATATTAATATGTCTGTCATGTCTATTACCTATAGACCTTGAAAAATATGAGCAGCTTTGTCATACAACTGCACAAATTATTGTTGATTAATGGAAAAGTTTCGCGCAAGTGGCACGCTTCAGTTACTCACCCT:1 - chr2L 6201439 3' - hopper2 483 1 66.19 GTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAAAGTAAACACAATCTCCACTTGGAGACCAG:1 - chr2L 22921275 3' - copia 91 2 79.45 CGGTGTGCATACGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTACACTCGGATGGCTTACGTAAGCCATTTGCCT:1 - chr2L 4758620 3' + invader1 3800 2 73.23 AAATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAAAAAGAAAGGTCCCATGGATGCTGTCCGTACGCATCGCTGCTCTTTGACAAC:1 + chr3R 7002222 3' - Juan 424 1 65.07 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGCACATCCATCTAAAGCCCTTCATGATGTTAATTACCGAACCCTGTCACACGCTCCGC:1 + chr3L 6675391 3' - 412 64 2 60.96 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTCTTAATGCGTTTGTCAATGGCCAAAACTTTTCCGTTTTTCGATTTTCTTTACAAT:1 - chrX 18737220 3' + I-element 5312 1 54.47 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACCGGGCGCACCAAACGTATAAAACCCGAACAGAACGGAACCCGAGCATTTGCAAAGCAGCCAACCAGGTGAAAGCAACATGCTGCCGAAGGTTCGCC:1 + chrX 2518159 3' - P-element 16 1 71.53 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTATA:1 - chrX 12003914 3' + P-element 2828 1 43.06 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCAGGCTTCCACTTTGGCTCGCAATTATCGTAGTCTCCTT:1 + chr3L 9762293 3' - jockey 4765 1 69.11 GTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCCTACGCCTAAATAAATCGACATTCGTAACTTTTTTTTATAATAATGAAATTAATAAAACGTACATACAATATTTTTAAGAACG:2 - chr3R 25718167 3' - I-element 4983 1 56.93 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACATATACACCAAGAGAAATTGGAAAAACCGGTGTAGTAAATATACTATATCGTAGATA:1 + chr3L 5275037 3' - I-element 33 1 63.01 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAG:1 - chr3L 10563889 3' - hopper 37 1 53.60 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACG:1 + chr2L 19158892 3' - P-element 79 1 28.68 GAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGGCAATTACTGGGTTTTATTATGTTTGCTTAGAAAAATAAAT:1 - chr2R 11574961 3' + INE-1 148 1 72.60 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAGATTTCTATATATGATTGAAGTGAGTTTGCCGGCTGGCAGTTGAATCGCATCGACATTTGAATTTTGAGTTGCCGTCGGGCAAT:1 - chr2L 470172 3' + Burdock 6359 2 63.45 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATATATATTTTTTTTAATTTTTCGGCGAGAGTGAGAAATAAAACTTTGCACATAATCGTTATCGTCGAT:1 + chr2L 7271934 3' - 297 6608 2 59.50 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGT:1 + chr2L 13690073 3' - Doc 82 1 70.55 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCACGTCGATCAGGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGAGACCGGGGCTATTCTAGAAACCTAACGCGAGTTCAGAACGCTG:1 - chr3L 14551280 3' + P-element 2870 1 68.07 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTCCTTTTTATATAATTTACATTTGTTTAAAAAAGTAATCAGTAATTACTGGATATTTTATATATGCAAAAATATACGCAA:1 - chr3L 11903184 3' + opus 7470 2 61.43 TTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACGACAGGCGGTTTGGATTTTCCTGCCACTTCGAGGCCCATCAGCGGCTTCTTTCGCTTCAAATCA:1 + chr3L 17263521 3' - Tabor 6896 2 55.24 AACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAACCAAAAAGTTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCACGCAAAAAAACAACAAAAACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGA:1 - chr3L 24796712 3' - Cr1a 345 1 84.93 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACATCTTGTGCATATAAAACCCCCGGGGATCCAGCAGAACACACAAA:1 + chr3L 2184956 3' - jockey 79 1 67.83 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCGGGTTTTTAGGGTTTTTCCCCCTTGTATGTTTCTGGGGCTC:1 - chr3L 18767776 3' + roo 326 2 73.97 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTTCGCGTTACACTTTCGTGCGAATATACAAATGAGAAGCAGGTGTTGTTCGTCTTGCTCTCTAT:1 - chr2L 22719540 3' - 1360 2 2 72.65 ATAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTTTAGCA:2 + chr3R 17615225 3' + mdg1 7070 3 72.60 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCGGGAATTTCAATGACGA:1 - chr3L 12861682 3' + pogo 2065 1 59.59 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTCGATCGGTCTCCATTGCCCCGAATGTAAGACCTCCAACGGATGTCCCTCCTCCTCGAAGGAATTTAAGAATCCGACCCGAGG:1 + chr2L 8396962 3' - roo 8696 2 62.14 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGAGTGAATCCCAATCGAATA:1 + chr3R 27188589 3' + roo 356 2 80.00 ATTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGTCATTATGTGCCTCCTAAAAAATATTAATTATATATTATATTTTA:1 + chr3L 5427215 3' - G2 2904 1 67.81 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGACTTATTATTCTTTAGGTTTAGAATAGAGGAAAACAAGGTCACAGTGATTCGGACCGGTATGTAAATATGCTAAAGAACCTTTTTTCCTACGGCAAAAAGAGTTG:1 + chr2R 4803079 3' + roo 394 1 75.34 CTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTGCTCTGCCTCTCTCTCCCTCGTAACC:1 + chr3R 5264885 3' + P-element 2788 1 16.44 ATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTAGAGAAGAACATTTCTGGGCATCATCGCTGACTGAGAGTTTATAAACAAATCTGCTATAAAGATGCTTAATTCGTTTGGTTATA:1 - chr2L 13937776 3' - Ivk 200 1 57.53 TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATATAATCAATATAATTATAGCATAACAAAGTTTAGTGACACACACT:1 + chr2R 9092045 3' + 412 7476 2 73.19 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATATAATTCGTACAAGAAATTCCTCTGCAACTTTCAATTTAAAAAAAATATATTTAACTAAAAAATACAAATTA:1 - chrX 22676323 3' - 297 6627 2 52.74 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGATTCGCATTTCCGGGTTATTGATTA:1 + chr2L 13510885 3' - diver 57 2 63.70 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTT:1 + chr3L 19574136 3' + 297 6901 2 71.92 GTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTGCAGATATGCAAGTTGCATGACAAAAGTTTCACAATTAAAACGGCAACAAGAGCTACATTTTAAAGAGAGACTTGTGGCTCTGGAACGTTA:1 - chr3R 25442765 3' + R1A1-element 5305 1 64.38 TATCTTGAATTTGTTTTTCAATTGCACATTACTAATATACAAATGAGTTGAGCAAAGTACTTTCCATGTGAGCCCGTATGTGAATTTTTGTCAATTATTCACATTTATTTAACAACATTTCTGAAGAACGTTTAAGATTATATATC:1 + chr2R 23658962 3' - S-element 139 2 68.49 TCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTGCTAACGCTACGTATGTATGTGTGCGCCTAAATGGGCGGGGATTTGGCAAAAGGGGCGGG:1 - chr3L 13365511 3' - jockey 4581 1 68.80 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTAAAAACGGCCATAAATTAAACATGCCGCCCGCAAAAGTATGCTATGGATTTGAACTCGGATTGCGAATGCGCTGAGGCGTGCGAATGCCAAAGATACCAGA:1 - chrX 19818382 3' + jockey 4966 1 65.07 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGGATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCC:1 + chr3L 13228561 3' - P-element 39 1 50.40 GAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGTAGTCCAGTTTGTGTTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGGGTGCAAGGCAAATATTTACACTCACTGGAACATAATAAAGACATTAGGGAAATATTGTGTTATGTG:1 - chr2R 9934116 3' - Rt1b 4942 1 66.90 AGCTTAACTTTCAAAGTGTTAGAACTTAAAAAGAAGATCGCAAAAGAATAAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTTTGTCAAATTAAGGCCTTGTTGCTCT:1 - chr2R 9410485 3' - hopper2 1407 1 47.95 AAACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGATATAGAAAAGAAATCATATCATCGTGGTTTTTAATTATAAAGTGTTCTAATTCGGTATAA:1 + chr3R 6579908 3' + 1360 3231 1 58.90 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACAATTGTGTCGCTGCATAC:1 + chr2R 16891842 3' + jockey 4944 1 59.29 AGAGCCTGGAGCCACCCCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCCCGCGG:1 - chr3L 26852641 3' - 1360 70 1 65.15 GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTGCTATTTATTTGTATTACTTTGCTG:1 + chrX 10128298 3' + invader3 232 2 50.68 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTGCTTTTCCCACTTTCCCACCGCTTTCCACAAACTTGAGCAACAGCTGCGTGGGTCAAGCCGAAAAGTGTGC:1 + chrX 19113584 3' - 412 7086 2 55.38 TTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAATCCGAATTCAATTTTTCAATCAATTCAATGAATGAAAATAAATAGTTAGT:1 - chrX 19005376 3' - F-element 84 1 67.81 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTGCAAAGGGAGTGCATAAATCAAATAGAAATTCGTCACAAGCGACATTTCCCCGCAACCGTAACCGCTTGCAATCTTTCAGATACTTTTGTATGCAGTACGATTTCGCTGGCAAGG:1 + chr2R 21029516 3' + Transpac 307 2 79.45 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGATTGATC:1 + chr3L 17904863 3' + roo 9000 2 68.97 ACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGAGTCAGATGAAATCACATCAATCTGTTACAAAAAGAAATAAAATTTGATACAATAATAGGTTTTTC:1 + chr3R 22794271 3' + Bari1 51 1 63.01 AATAATTGCAATAATAATAATAACTGACCAAACACTGGGCGGCTGGAATCCTTAGCCTGCTGCCTTCATGCTTGCCTAAGTAAGTTAATATGCCATTTGAATGTTGTGATTTTGAGCTGGCCCAGACAGACTGCAATGAAGTTTA:1 - chr3R 11076900 3' + mdg1 28 3 68.28 TTTAAAAAATTAGGATTAAACTTTGATTTAGTGTTTTGTGTAATGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGCTGTCTTGAAACTTTCGTCGAGGTATTATTTTGCTCTCCTTACTGTGAAAAGCTTCTCCC:1 + chr3L 23580410 3' + S-element 1467 1 58.90 GTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTTACACAAGCATATTTGTGAATGCGGTCAAATCATGAGCGAATACTTAGC:1 - chr2R 12600475 3' + 1360 3162 1 73.29 TTTTTTTTTTCAAATATTTCCATCTGCCAAAACTTTTCCTCCATTTGTGCCGGTCTTAAAAATTTTCTTCCTTCCAATTCCCGGTAGTGTGTTCTTTTCTAGATTTTTCCTTCCTTCTTGTTTTTGT:1 - chrX 1148640 3' - TART-B 10626 3 82.68 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACA:1 - chr3R 18517957 3' - roo 8746 2 75.17 AATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTATGTTGGCACCCCGGTTATTATAGGGACAAATGTAAAAATAAATATCTTCGCGTGAAATTAATCTTTTAAATAATTTCA:2 + chr2R 2552216 3' + HMS-Beagle2 7153 2 56.55 GGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTCAGGATACATGCCATTCAGTTGG:1 + chrX 1018186 3' - 1360 212 1 71.23 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGGCTTTATTGTATATCCGATTGCAGCTTCCCGTTGATGAGGCACTAACTGTTGGCCCTGTTTTTG:1 - chrX 12997994 3' - roo 56 2 57.53 GCTCAAGTGGTCAATGTCTTCTCCATACATATGTATATGTATAAATATAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTCTTGCAGCGGATATCCCAATGCTCCACTTGATTCAACTTCAAGTGCTATATAATCGCAATTAAATCAGT:1 + chr3L 14898672 3' + Stalker4 7176 4 52.74 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTCCTGAAATTGTTTGCCCTCCTTAAAAGTATCTATTATTTTTTTTCAAGATAGAAAGCGCATCTCTGCCGCAAAAAAGAACAGAATTGAA:1 - chr3R 31650277 3' + pogo 2071 1 64.83 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCTACCACATCATTCACTTGACCACAATCTAAATTAATCACGC:1 + chr2L 18953106 3' - roo 8744 2 73.97 CATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACT:1 - chr3R 19450162 3' - roo 99 2 74.66 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCTTTGAATTGGAAACTCATTTACAAAAATTAATTAAACCCGTCCATTCAGGACCTGTGTTACCTTCCTCTCACTTTCACATAATTATTATCCGTTTTTTATTTCT:1 - chr3L 18658158 3' - roo 8680 2 74.66 ACTTAATTTTTACCTTTAAAGTAAAAAGTTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTCGATGCCGGCGGTTTCATAGTTAGCTCGAATACGGATCCCCGATGG:1 - chr2R 22704879 3' + S-element 1666 1 77.05 AATAAAGTAATTTTTAAAATTTATTTATTAGACCAATAGGTTTAATAAATGATTAGCAAGCCCAATTATGTGATTGCCTGGAATTAACTCTTTAAAAGTATTTAAATCCAACTTTCTCTTCAATTTTCTGAATGTTTTTTAGGGCA:1 - chr3L 5025477 3' - 1360 376 1 67.81 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTCATATGTGAAAACACATGGACAGTTGTTAAGTGCTTAAAATATGCATGCTTTAATTGCCAGCCA:1 + chr3L 16875938 3' - Burdock 47 2 54.11 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTATTCCTAGAATCGCATTAATATTTTTA:1 + chr3R 30782582 3' - pogo 43 1 75.00 GTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACAATACACAA:1 + chr3R 29091418 3' - rover 6982 2 65.07 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACA:1 + chr3L 13228528 3' - P-element 93 1 21.92 ACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTAA:1 + chr2R 6271498 3' - blood 216 2 75.34 GAATAAAAAGTCGATTCCGAAAAGAGACATGGGACATGGAAAAATACCTTTGTATTACTTAGCTTCCCTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACACAGCTGTATGTATGCCTCAGTGCCCTCTCTTAGTGGCCGCGGCCCGAAAGTCT:1 - chr3R 4515188 3' - HB 74 1 63.70 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATGATTTTCTCGCAGTGCAGACT:1 - chr3R 24976177 3' + roo 9039 1 60.96 ACTAATAATAATACTAATAATAAATAATAATAATAATAATAAAAACAAATAATTTTTCTAGTGCATCACAGATAGTCAGACCCACAGATACAAACCCACATGCAAACAACACACTCAAACGAGCATAGAGGGCATCCATCCGCTGT:1 - chrX 11953470 3' + mdg1 40 2 55.48 TACAAAAAGCACATATGAAAATTTTTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTTTATTAAATTT:1 + chr2R 2875255 3' + TLD2_LTR 121 1 75.34 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGATTTAATAAATGTGTGGTAGATGGCTTAATTGGAGCAATTGATTAAATTAAACGATTATGCATATTTTATATTGCTGTGGGTAGATTTCACAATTTGAAGAG:1 - chr2R 11595782 3' - P-element 17 1 73.97 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCACTGGCTCTCT:1 - chrX 16526281 3' + P-element 2809 1 32.88 GTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACCTCGAATTGGGAATGCCTCAACCTTTCCCAACACCACCTAAC:1 + chr2R 13193852 3' + BS 5064 1 54.64 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGC:1 - chr3L 12861707 3' + pogo 2040 1 64.38 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTC:1 + chrX 14346477 3' + roo 9037 1 67.86 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATGTATCCTATTCATTCACAATTCAATAACTAACTATAGTGGCAAATACGTCAGATATTAGCCAGA:1 + chr2L 5711019 3' - HMS-Beagle 50 2 53.42 TAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATACATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGGACCGTTTTGTTTTGCTCGTTTCAC:1 + chr3R 5316619 3' + Juan 4141 1 66.44 GTTAGTAAGATCTAATTATGCAATAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTAAGAGCGGCAGAATCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAATATATTCCAAAATTCGGCTTTTGGGGTTCGGCTT:1 - chr2R 5269486 3' - Cr1a 4284 1 74.81 TTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATACATATGTGTACATATATATCGAAAACTCTTTCCTGCTCTCTCTGAGTCAGCTGTTGTTGTTTTGTTAGATGTCGCTCTCTTGATTTGCCGAATGATGACGTCACTTGGCTGTATGTCA:1 - chr2L 19548383 3' - flea 4757 1 76.03 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAGACGTACATACATACGTTAT:1 + chr3L 22884055 3' + roo 9038 1 61.64 TTTTCATTTGACGCCGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACCGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATATGCTTCGCACCAAGAATCTTTTGGGACATTTGATGTCTG:1 - chr3L 6215344 3' - invader4 459 1 67.97 GTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGATGTTTCATTAGTAGATAGATGTTTTTTATCAATGGATGAACTTTTCCCACTGATTTGTGACATTTCTG:1 - chrX 5334997 3' - I-element 5124 1 53.42 GATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGC:1 + chr3R 29091375 3' - rover 7011 2 68.18 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAAGAGTTGACATTAAGCAGCCGGATGACGGGCGGGACAGCTCGCAGGACGACTTCTAGGGTTCCCAGGACACCCAGGACTAC:1 + chr3R 28782679 3' - blood 36 2 57.86 AGAGGAGTCTCTAAATTGTCGGCTACTCCAAAACTTTTTAAAAATGTTATCACTCCTCATTTGCATTCAGTTCGACCCCATGCGGATTAAGAGTGCTGTTCCCGATTCGTTGGTCTGTCGCCTC:1 - chr2L 1609605 3' + Q-element 112 2 52.42 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTC:1 - chr3R 11773919 3' + P-element 2833 1 32.73 GCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTTGAGCCGTAGGCATTATTGCACACCTGGAGTGAAGTGAGACACTCTCCAG:1 + chr2R 5798262 3' - R1A1-element 209 1 62.69 TAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAAAATGGTTTCTATCGATATGCTCATTAATAGTGGCATTCCCGCTAGATCTGATAGTCGAGGAAGTTGGCTATAGCGTACTCTCCTATTTCTATATACAAATGTAAAGAGCGCATT:1 + chr3L 15114749 3' + INE-1 13 1 45.14 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAATTAATTGAAATCTCTATTTTAAGTAATATTGATAACGATTAATAGTAGAAAAGGTTATAAATCTGGTGGGCGGGTGTCATGTCTAAA:1 - chr2L 12488214 3' + copia 222 1 57.53 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACCAGTTATAAGCCAACTTTCATTCCAAGCAGACGTGCTGTGAGTTTCGCA:1 - 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chr2R 4802947 3' - roo 8726 2 71.97 CGATCGAAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATTTTATAAGTGCCTTTCTCAACGGTTAGCTTTTCTCGGGAACATGAGTTTCAGTGATGCCCA:1 + chr2L 16509001 3' + invader4 3028 2 54.79 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGCGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAATTATTCAAAAAATGCGATTGTTATTTGCAAAATGTGCAGTGAATTGAGACGCTCGCAGACAA:1 + chr3L 17108641 3' - hobo 40 1 53.85 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAACTAAAGTACTTAGATAAATAAACTGGGACATTCAGTTTATATAAGCGTGTTCATCAAATTCCTCCTTAAG:1 - chr2L 20556403 3' + 412 445 2 52.05 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCCCTCGGATCGGATCCTGGTTAGCAACTCAACAAGCTAACAAATTAACATGCCGTCCAGCGATGTACTGTCCTTTTGTTTT:1 + chr3R 10461774 3' - roo 8701 2 60.14 TCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAGTGACATTTTCCGCTCGTAAATGCACTTTGGGTATGTTTGACCTTTGTTTTGGGTCCCCAGTCATTCCCATCGCC:1 + chr2L 20324229 3' - Tirant 44 2 56.25 CTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCC:2 + chr3L 10563961 3' + hopper2 1515 1 78.08 TTTTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATGGGTCA:1 + chr2R 22464489 3' + pogo 2059 1 58.90 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGCTTTATTTAATCTTAAGCTTCCTCGTTTAGTAACTAAATATTTTATACATATGTATATATGTGTAAGAGTGAGTTTTCCCTTTTCTT:1 - chr3R 12609965 3' + roo 9038 1 61.64 AAAAAAAAAACAAAAAATTATAAAAAATGGTGGTAAACCAGGTGAAGGTTTGACGGGGCTTTCCAAGGAATCGAGGCCAGAGTTCGTTGAACTAACAGA:1 - chr3L 13234496 3' - Tc3 85 3 67.68 ATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTTGCTCTTTGTTGTTGTTTTTTCCAATTAGATGTC:1 + chr3L 3339413 3' - Transpac 84 2 74.66 CGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACTTAGTATGTACTACATACATACAAACATTCATATGTATATCGGGCATTCGAACGTTAACATGCACACTCG:1 + chr2L 470315 3' - Burdock 48 2 58.90 ACACATTCCATTTTACAAAAATAAGTGAAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGAAAATACCTTTGTATGACCTGTGTATGAGACACAACTGCGAAACATATTCTACACCTTAAAATATTTAAATAAGAAGTAAAAAAGAGTTGAG:1 - chr2L 21795732 3' - HB 101 1 46.90 AATTGACACGCCCGCAGGTTATAATTTTACAACAAAACTTACTTTTCACGACTTGACTCCACGACGATTTGAGTAGAAAAGAAATAGAACGACCGAGTCCTTTCCCCATGTTCGCTGGTCAATTTGCTGACGATTT:1 + chr3L 21744240 3' - Gypsy12A_LTR 321 1 66.18 ACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGATAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAAAGAAGAAGATGGCAAAAAGGGCTCTAAAACATGAGATACTTCGATAGGGATTTCTGGTTCTT:1 + chr2L 6764280 3' + baggins 5367 1 78.77 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGATTTATCTTGGCGCGTTTTAAAACACACTCGAGAGGTTCATTAATTCTTGCGTCGCACACTGCAGATTACTCATACGC:1 - chr3L 6675274 3' + 412 463 2 61.19 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAACAAATTGCGCGCCTGCGGATATGCAACACAGAAACTCAATAGGGAAACATCAAAACAAACA:1 + chr3R 5868269 3' + jockey 4943 1 58.22 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCACTTTTATGTAACCTTATTTATTTCATATTCTTAAGATAAGTTGCATTTTTTTATCCAATGCTTTTTTTTTATCAGAGTTTTATGTCCATTTATTTGTTTTATTGTC:1 - chr3L 18792365 3' + roo 396 1 74.66 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTATGAGTGTATTTATTACATAGTTAAGTGATTACTTTATATGTTTT:1 - chrX 11267668 3' - roo 8696 2 60.96 CTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATATCATTACAAAACTAAGTAACACCACAGCACAGAATAACAATTAGGCACCAAA:1 - chr3L 13229153 3' - P-element 293 1 32.88 AATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATATA:1 - chr3R 9175189 3' - Juan 54 1 50.00 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACAATATTTTCCATCCATAGATAAATATCTCGCCATACTCTCCATAAAGATGTTGGCCA:1 + chrX 5366249 3' - pogo 60 1 62.33 TGAAAAAGTGTTAGAAAATACAGAAACGGTGGGCCAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACTTGAATTAATTCATTAATAAAGTTTCCCAGGAAGTAAAGGGAACAAAGTTCGAGAGTCGCCC:1 + chr2R 14218764 3' + Tc1 1586 1 56.94 ATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTTTAT:2 + chr2R 4206662 3' - 1360 316 1 75.34 AATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTTACTCGAATTATGTCCATCTTCGTTGCAACCAAAACATTTTCTAACCGC:1 + chrX 22574756 3' - 17.6 6953 1 63.70 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGCATATATTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTT:1 - chr3L 12861726 3' + pogo 2043 1 71.77 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGTTTGAGGACCCATAAAGAAGAATGCGAAGCATACTTCTTGG:1 + chr3L 13362752 3' - jockey 62 1 52.74 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATATGGACATTTTACAATGCGCGACGAGCCAGAAACCGCAGGATTGCTTGCGAATTTTCCCAGCTATTAAGCCATTTCGCTGGCAAC:1 + chrX 1764189 3' + opus 475 2 67.12 AAACAAACAAAAAAAAAAGAAATATTGGCA:1 - chr3R 23026551 3' + mdg3 5093 2 96.67 AGTTTATAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTA:1 + chr2L 14889006 3' + hopper2 1527 1 75.00 CTATTTACTAAAATTATTCAACAATTTTCCTTAAGTTGAGTAAACAATGAGTTAAAAACAAATATATTGAATATATTACTTGTCTTAATACTTATGCCCACTAGTGTATTTAACCTCTGATTTCCAAATTGAGTGAAAGCTTCGCT:2 + chr3R 15139862 3' + Tc1-2 1543 1 76.03 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCAGCTGCTGCCCACCGCCCACCCCTTTGCCGTGTTTCGTCACGCTTTTAGCTAAGCTCGGTCGCACTCCGCGAGGCTTCACTGTG:1 - chrX 6410460 3' - jockey 4837 1 62.76 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTTGTTTCTAATTTTGGGAATACTCGAAACTCGAAAGGCAAAAGTTTCAGTTCAGTTCAGCTCAGTTTCCTTTGTCGTTCGATTTAAGA:1 + chr3R 20074676 3' + roo 9037 1 61.64 CTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACT:1 + chr3R 1977615 3' + micropia 376 2 68.28 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGGTTAAGGCTGTTACGTGCCGCTGCATACTGCAAGCGGACA:1 - chr3L 22883947 3' - roo 8745 2 73.97 AAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGCGGATCAATGATCTCCAACAGCAACAACAACTGACAAGAGCGGACCGACAGC:1 - chr2R 2666281 3' - Rt1a 13 1 67.63 ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGCTGGAGGAAGTCATCACGAAACTGAATACAATTAACAACATTTAGCAAATGAAAGGAAAATTCACTTTGAGCTTTCGTGTTCTCCCAGGCAGGCTCAACTTTCACATGTATTA:1 - chr2R 8966095 3' - BS 5005 1 76.03 TATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTGCTGTATCAATCTAATATC:1 + chr3L 20224238 3' - Chimpo 59 1 59.59 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTTTAAGGACTCAAATTTATCGGTGTATGTGTGAGCGGCA:1 + chrX 10304653 3' + roo 9005 2 70.45 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAGGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTGAACTGAGCACTGAATTCCGAGC:1 + chr3R 18518023 3' + roo 8998 2 65.75 GTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAGACCTCGATCTGTACACCTAGTACTTACAAAACTTTTACAAGAGCTTAAGGAAAGCGTTAGCATATAACCAAACCATTG:1 - chr2L 16543421 3' + Transpac 44 2 57.53 AGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCCACCAGTTTTAAAGCACGATCCATTTTGCCAAGTGCACTTACTCCCTATTCATTCAAAAAAGGCTATGCGGTCAT:1 + chr3R 30558315 3' - I-element 4873 1 52.74 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATACATAGACTTCCTCACTCGTCTGCTTTGTGACATTGAAAATAAATATTTTTGTGTCTGGGCACGGGGCATATCGAACGATTCGATGTCGGTTAG:1 - chr3L 18034510 3' - Transpac 4938 2 71.23 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGCAGCAAAACTAAACAATTTGTTTCTGGTGC:1 - chr2L 19158824 3' + P-element 2824 1 42.47 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCGAGATAAGCAAATGAATTTCAGCACTTATCATATACAAATTGGTAATCTTTTTTGCTTCGCTTGTCGGTGGCAAGGGAGAAGTTTTATTGTTT:1 + chr2L 10045325 3' - jockey 23 1 70.37 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATGCGGCTGTTCTGCGAGATCAC:1 + chr2L 13690113 3' - Doc 27 1 61.83 TAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTCTCAAAACTGGGATGTGACGCCACTTTTTTAAATAAGCATAAAGAGCGACGCAGCCTTCAAGGACCTTCGCCACTC:1 + chr2L 10519638 3' - X-element 31 1 60.00 AGCATACGTGTGCACACATAGAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCATTGTGGCGGAAGTGAAGCAGACGCCTGATCAGCGG:1 - chr2L 22975402 3' - 1360 175 1 73.97 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCACGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGC:1 - chrX 6484727 3' - jockey 86 1 71.23 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTGAGCGCCTTTATGGCTGCTTGACTATCAGTGATATTTGACTAAAAATGCTGGAATATTCTTT:1 - chr2R 4330746 3' - copia 37 2 49.59 ATTGTGGCATGTTTGCATTTCTGCTCATTGATTGTAAAACGCCAGTTAGCCAGCCAATTCTTCCAGCATACCAAAAAGCTAAGCTAGTCGGTAGCAAGTTTCAATATTTCCGCAGGGGTTACTGAAAGTGACCTGACGGAAGTGC:1 - chr2R 20089533 3' - Doc4-element 2336 1 52.41 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGAATAAATCAACCTAGTATGTTGGGCTCGGCTACGTCCAATCTTAGAGATACCATCTACCGCTCG:1 + chr3L 14085004 3' + opus 7487 2 73.19 GAGAGAGAGAGAGAGAAAAGTGCAGGATGAATATGAGTTTTCATATTGCGTATACGCAACCCAGGCAGCGAATTATTCATTTGGGAGGCTTCATCTGGGATCAGAGCATGCTCTGATCGTGTCAAGCCCGACATGAGTTGAAATCG:1 + chr2L 14451729 3' - Cr1a 283 1 51.37 AAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCACAAGCAAAGTAATTCAATTTCCCGGCTTACAGCTCTTTTTTGGCCACTGGTCA:1 - chr3L 3565315 3' + gypsy 420 2 42.47 GCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATTTTATAAGTGCCTTTCTCAACGGTTAGCTTTTCTCGGGAACATGAGTTTCAGTGATGCCCAAATTGGAGCTTG:1 + chr2L 16509013 3' + invader4 281 2 56.85 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTATAATACATACAATTCTCTTGCACCAAATTCAGAATATTTGCTTGCCTTTATGAACTCTCTTATCATCCTGAAGTCAATTAAAAG:1 - chr2R 9868861 3' - roo 35 2 60.27 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATAGCAGAGAATGCAGCAAAATACGATTCCTCAATTC:1 + chr2L 12678584 3' + P-element 2802 1 30.14 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGTACCACTTACG:1 - chr2R 5070930 3' - Tirant 8107 1 22.13 CATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAGCCTAAACTATGAATATTTTATGGAGCATATAAATA:1 - chr3R 5316569 3' - Juan 4112 1 73.97 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTCCTTTGAATATATTTGTTC:1 + chr2R 12813739 3' - roo 69 2 86.32 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTTCCAGTCAGAAGTTTTCAGGGCTTAAAGGGGTAAAAGGCACTTTCTTCATTCTTGATCAGTTTTACCAGCCAAG:1 + chr3R 5478067 3' - 297 6607 2 62.79 GTACTTCATAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACCTTTATACGATTGATTTCGGGTTGATTACTCGTCATTGACAAACTGCGGCGGATCGATCACATCGAGGATCTCCTCAATCTCGCCCAGGAACATGACCTCCTTCTGGGA:1 + chr3R 27566317 3' + G5 4733 1 50.68 GGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCTACGGCCCACAGTGATCCTCGCATCGTGATCTCTTCCTTATCGGCG:1 - chr3R 10571810 3' + Quasimodo 222 2 67.14 ATAACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATGTCGGAGCACAATTATTATTTTCCATTTCGCGCAGCGAGTTTCGAACGCACCGAAGATTAAATTGCAATTAAATCACAAATCATATATGTCTAAAATATGTAAT:1 + chr3L 23529724 3' + Stalker2 230 2 68.49 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGAGTGAATCCCAATCGAATAGTACCCTCCCCTCTGAGCCAATCCTCCCTGCCCAGCT:1 + chr3R 27188626 3' + roo 342 2 61.64 ACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATCCTTAAAACATACTTGTCTGGAGACTGTATAAGCCATTAGCTCAATATTCGTTTTTACAACGAAATAATGCATTCATAATAACTAGGAGTTAACTTG:1 - 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HMS-Beagle2 495 2 75.93 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACACGGAGTGTGCCATCGGAACTTGCCTAAAACAATTTAAAATTACCTCACGTATATGTGAGAAATTGCGACCGTATTGTGGGCGTGTCGCCGTCCCTT:1 - chr3L 13366060 3' - hobo 13 1 66.92 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACTAAGCACCCACACAACGTAAGCCATTGCCATTTTGTAGCATACTTTTGTGCGCGCCTCTGTTTATGCGACTTGTAAACTTGGTCTTCTGTGC:1 + chr3R 16530694 3' + hopper 1398 1 70.37 GTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACATTTATGTATGATGTGTTAGACAGGAACTGCGGCACGGACATGACCACGATAAACCCTTATAGCCCAG:1 - chr3L 18616082 3' + R1A1-element 5003 1 61.34 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTTC:1 + chr3L 19574137 3' + 297 321 2 71.23 GAGTATGCAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGTGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAACCATTTCGTAAAATGATGCTAAGTTAGTTTAGTGCTCGGTAATTGTCGTTACATTTAACTACACTGACT:1 + chr2R 17975214 3' + Doc3-element 4556 1 74.66 ACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTAATTGAAAGTATACGCAACAAAATGATTAAGCTACTAAAATACGATTTATGTACGCCACCATACATAAATGTTTTATGCCATTAAAAGA:1 - chr3R 12000909 3' + FB 87 1 53.42 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGTCGGTAGCCGAGCTCCAACTTCGGGTTCGGGTTTGTTGTTGTTCGCGAAAAGAAGACGGCTG:1 + chrX 10806972 3' - P-element 24 1 59.13 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATGACTGTGTAAACTAGAGCTGTTCTCTGCTGAACTAGCAGGTTTTGCCAAAAGTGGTGA:1 - chr3R 4421962 3' - 1360 63 1 61.64 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGACTTATTATTCTTTAGGTTTAGAATAGAGGAAAACAAGGTCACAGTGATT:1 + chr2R 4803024 3' + roo 9002 2 65.75 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGCATTCATGTGTGAACAGTAACTTTGAGTTGTCACTTGGGCAAGAGAACTAGA:1 + chr2R 7899176 3' - roo 8746 2 74.82 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATTCCCAGTGCAGAACTCCAAGGCGGCTCACCAAAGAG:1 - chr3R 10636120 3' + blood 7315 2 73.33 GATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATTTCTAGTCACATTCGGG:1 - chr3R 5024809 3' - diver 5936 2 55.47 AGAGAGGGAATGCTATAGTCGAGCTCCCCGACTATCAGATACAAGGGGTGAATGTGAATACCATTTGATAATAAATTAGTATTTTGGGAATAGGTCGCATTTACTACGTGTTCTGCTAATATAGCTTTGCTTGTAG:1 + chrX 20464494 3' - INE-1 578 1 63.24 TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATAAACAAATGTGTGAAATTTCGTCTGGCTCTTTTTCTTCTTCTTC:2 - chr3L 3756161 3' - BS 5074 1 71.92 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGTATAGCTAAATTTTATTTTGAGGATTCATTAATTAAGCAGACGCAAATTAATTGAGAAAAGTGTGTCGACTAAAAGATACCCATTACCTGC:1 - chrX 19959766 3' + roo 9043 1 61.64 TTCAACTTGTAGCCAAAGCCAATGGGGAACAAACCACATACTAAAACTTTTAAAATTTTAATCAAATAATTTAAAAATTTAGGATTAAACTTCGATTTATGCCAGCTATTAATTTGAGGCTCCTGAATCACTGGACTTATCTCCT:1 - chr3R 25188313 3' + S-element 1398 1 68.28 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTA:1 - chr3R 9175209 3' - Juan 73 1 63.45 TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGTAACATTTTCTAAGTTCTATTCAGTCATTAGCAGATTTTGAAGCCGTTAGCATCGTAAACTAACATATTATGATGAAAAATTCTATTATTATTTGTATTATTCTACTAAC:1 + chr2L 7939892 3' + Burdock 247 2 74.66 AGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATGTATATACTTTATATGTATTATTAATTTACGAGTAACGGGTATAACAATCTGAGTCGAAATCATAATTTTTATAAAATAAGTTTAATTCCTGATTAGCAACATAGACTTTAG:1 - chrX 15903129 3' - INE-1 97 1 41.38 GGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGAATAAATCAACCTAGTATGTTGGGCTCGGCTACGTCCAATCTTAGAGATC:1 + chr3L 14084990 3' + opus 7468 2 62.24 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACTGGGAATAAA:1 + chr3L 14084946 3' + opus 7427 2 74.29 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAG:1 + chr3L 22884036 3' + roo 9023 2 52.82 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTTTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATATCAAATTTATGTCAAGTTGGCCAATTTTCAACAGTAACAACGACAAAGA:1 - chr2L 3648723 3' + roo 9006 2 60.14 CCTAAAAGTTGTGAATTTGCTCAAGAATGTATAGAAAATAAGAACACGAAAAACTAACGGGACTTTTTTTTCTATCTACACATTACATTTTACAAAAAAACTTTTCATTGAACATATTTACATAAGCACACGTATGGATATAAACA:1 - chrX 22509777 3' - HB 186 1 82.88 GGTAGTACAATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGTCTTATATTTCTTTTTATTTATTAAATTTTTTTCAATTTATTAAGTTCTTATAAATATTGC:1 + chr2R 4774800 3' + baggins 5396 1 64.38 AAATAATATATTATTAAAAAAAAAAATAGGAAAAACGAACTTAGTTGGTATGCAAAATCGCCATTTACACCTGTATTTCTGGAATGTACATATAAGCGATTTCATGTATCTTATGCATACAACTTAAGATTGTGAAGTAT:1 + chr2L 19461195 3' + BS4 729 2 60.00 CAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTATGTTGGCACCCCGGTTATTATAGGGACAAATGTAAAAATAAATATCTTCGCGTGAAATTAATCTTTTAAATAATTTCACACACAGATATTTAATTTCAAATTGTCTTT:1 + chr2R 2552246 3' + HMS-Beagle2 7182 2 76.71 GAATCTAATCGGTATCAATTTTAACGATTCTTAATATCTAACTTATTTACAAAGGTTATATGATTAAGAGTATTAAAGAAATGAAATGTTTATGCCAAGGGTTGCGGTGGAAGGACTTTGAAAAAAGGACTGAAAAAGGCATTTAA:1 + chr2L 20122470 3' - jockey2 3328 1 61.64 CACTGGCGGTTTTATTTTTAAACATAAAAATTGGTCCTTCGAGCCGGATAACCGGAAGTGCGTTTCGTTCGGGCATGGCTTTTCTTTGGCAC:1 + chrX 10114423 3' + 3S18 338 2 80.43 CGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAGAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTATACTT:1 - chr2R 4830330 3' - 1360 92 1 93.84 CGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAAAGTGCAATAGCCCCATTTCAGACTGATATCACTCAAAGACATAGATACATACATATAT:1 + chr3R 25569181 3' - R1A1-element 330 1 57.81 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGC:1 - chr2L 18213131 3' + roo 331 2 69.86 TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGTTTAATCGAACAGTTGACACTTATTTCTCGCAGTGTCGCACTGAGTAACTTTAAC:2 - chrX 15565506 3' - transib2 64 1 63.70 GTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTTTCCATGTCTGTTTT:1 + chr3L 18789103 3' + 1360 3324 1 64.38 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAAGCTTGGATTTGCTTGGCTTGCTCCATACAAACAGGAAATGGCCAATGCCTTTGAGCTTGCAAAGCAGATTTTCGGCTTTGTGTTTTCAAATCAATTGCCGATTCAA:3 - chr3R 20074502 3' - roo 14 2 76.03 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTAACGTTTCGTGATTTTTGCCAGATTT:1 + chr2L 19643635 3' - hobo 40 1 59.59 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAAGAATACAATTAGAAGGAAATCTAATACAAGCAGAGCATTTTAATGGCTTACAAACTGTCAGCATAGAGTCTTCTACTCAAGTAGTAGTGCCACAGATTTCT:1 + chr3L 1981664 3' + opus 7485 2 63.70 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTGTTTTCCGAATTGGTAAAAAATGCTCACTCTTAAATTATTACGTGTTAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCT:1 - chr3L 13827341 3' - roo 8686 2 71.23 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCGTCCCATTAGGACCTTTCCGCACGACAGGCGTCGCCAGTCGGGAATTAAACGTGTTTTGCTCCCGTTTACTCGCTTCAAATTGTATCAC:1 - chr3R 19639704 3' - 412 7087 2 62.33 GGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCATCGTCTAGCAGATTAAAGTGCAATGAAAGTGAGTGGTAAAGTCGTGGGCTTTTGAGGAAAAACAATTGCATAAGCTCGGAGTGAAACAAAAGTAAT:1 + chr3L 16703913 3' + FB 21 1 66.43 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTAAAAAACCCGATCGCGTCTATTTCTGCAATTTCTAGCTAT:1 + chr3L 24253678 3' + 297 321 2 70.55 AAATGCATTACAATTATTACAATACTGTTTTGGATAATGCAAAGCAGATAAAGGAAGAATGGATTAAATTGTCTAGCAGCTGAGGTGTGATCATGTCTTGGCTAAAAAGAATCCCCATTCAAGAAAAATGATTATTGTTTACATTT:1 - chrX 21581282 3' + Tabor 486 1 76.71 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTAAAAATATAGGTTATATGTACGTTTAAATACTACCTTGGAAATGAATGAGTATTT:1 - chr2R 25252150 3' + opus 7453 2 65.91 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAAACATAATACATATTTTCGAGGTGTGCTTACGTTAGGTAATCATTTATAGCAAACTGCTTGAAGACCGCTCACGATTGCCACTTATTTAT:1 - chr3R 17467059 3' - I-element 30 1 62.33 AATTTAAATTTCAAAAATTTATTATAATGAAAGTAAATTTCTGTAGTCAAAATAAAATCAGTTCTTTGTCAGTATAAGTAGTTAGCACAGCATTCAGAGTGCCAAGTCACAAGTGCAATTTTTGTTTCAGTGTGATTGCTGCTGCC:1 - chr3L 13226988 3' - copia 4671 1 52.74 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTAAGTGTACTATAAATAATGTGTGATTTACGCGTTACTTATTTTATGTGTCCGGGATA:1 + chr2L 6755838 3' + pogo 2042 1 59.59 GTTGAAAGGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGGGTTTCTGACCATAAAATGTATATATATTCTTGACGAAATTTCGCTTTCGCATTCACACTAGCCGAGTAAGGGGTATCTGAT:1 - chr3L 22970012 3' + INE-1 20 1 55.36 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACCGATATAGACGCATTGTTGCGTGGAGATTTATCATTGATTGAGGCCATGAAATTTACACTTCAAGTGTCTCGGGAAAATGCTTTTCCTATT:1 + chr3R 11379241 3' + roo 9041 1 60.96 AAGCGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTTGAAATGAACGCAATAAATTCTAAAATGAATATTGGCAAATGA:1 - 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McClintock 415 2 51.37 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGCCATGAACCCATGTATCACTTGTGTTGCTAT:2 - chr2L 18213101 3' + roo 9025 2 53.42 GACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATTTATGTTTCTCTGCAGGACAATTCGTATCTGTTGCGATAAATCATATCCATAT:1 + chr3L 19335428 3' + invader4 257 2 66.44 TATTACGCATTTTTTCAACGGCAGATGCTTCAGCATCGCCAATTGCATCACTTGAACGTTTGATTGTAGTTTTTCCTTGTTTTCTCTCTTTTACTCCCATATGGCCATTCTCATTTTTCAACTACTTATTCTTTCTGTAGCAAGTT:1 + chr3R 9174172 3' - Juan 167 1 53.42 CTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCCATAAATATGATGATAATTAAGTGTGTGT:1 + chrX 20874354 3' - F-element 419 1 79.45 CATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTCAAGTACAACCTCTTATTCTACGGAATAAGTCTATCAGAATCAAAACATCTTTATCCAAATACTTGAAATATTCATGTTAATGCCAATGGAATATCGCTTGCAATTGCAGACA:1 - chr2R 6726025 3' - INE-1 254 1 66.44 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTTGCCCATTTATCTTTTCCAGCCCATCGTGCGCGGTTGCGCTTTTT:1 - chr2R 14940680 3' + blood 350 2 56.12 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCACCATCGATGGCAGCCTCATTCGGGTGGAAATTTACAGCACATCTACTTCAAGCGGAACGCGAGTTCGAAATGGAGATGCATTCGAAGTTT:1 - chr3L 2185911 3' - jockey 90 1 63.70 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTA:1 + chr3R 21587587 3' + roo 339 2 77.10 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTAAAAACGGCCATAAATTAAACATGCCGCCCGCAAAAGTATGCTATGGATTTGAACTCGGATTGCGAATGCGCTGAGGCGTGCGAAT:1 - chrX 19818397 3' + jockey 4951 1 56.16 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTATGTTGCAAATGCATACTATAACAAATTGTTAAGTGTTAGACAAGGCGTATACTTAATATTTTGCAATATGTT:1 - chr3R 10136981 3' + I-element 5308 1 58.90 TCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGT:1 + chr3L 13228556 3' - P-element 65 1 41.10 GATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTACTGCCGACCGCGACAGAGGCGTCATCCCTCGGCAAGGGGTCGGCCATAAAGAACCCGGGGTGCCAGCG:1 + chrX 7273074 3' - opus 7439 2 51.77 AAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTCTGTATGTAAGTATATGTGGTCTTATTTTATGGCACATAAGTGAGGAACATAGGACACATAGGACAAGAAGACATAACTAAAAACTGGAACT:1 - chr2R 4780381 3' - Quasimodo 79 2 60.96 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAAGGTCGCTCTGTCGATGTTCTGGAATTGGGGAACAAGGGTATCGTCTGCACCGAAATGGGCATGGCCTGCATCTG:1 - chr2L 8396824 3' + roo 401 1 72.90 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAAGATGGATTGTTCGAAAATCAGTCCTAATTTTAATCAACAAATGCATACTGATCT:1 + chr3R 8183490 3' - Doc 72 1 61.64 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTT:1 + chrX 16217521 3' + P-element 2820 1 38.89 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATTGGTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGC:1 - chr2R 9504203 3' + roo 9047 1 54.39 AAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACAAACTCCGAGATGCATTTATTCAAGGGTAAAAGCAACACCTTCCTTGAAAAGTCGTATTCTCCTTTCTCGGTTTGCCTGTAGGATAAA:1 - chr2L 260912 3' - Juan 4029 1 81.38 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACACAGATACGGATACAGACACAGATACAAATGCAAACAAACAAACACACACACACACACACACACTCGCATAACGGTACATTAATTGATAATTGTT:1 - chrX 6377244 3' - hobo 13 1 67.18 TTGGATTTAGTTGTTTTTCTCGTTCATTGTTAATAGTTTTGTTATTATTTCTTTACATATTGATAAAAAACATATAAAAAAAATAAATGTAAATAAAAAAATCCATAAAGATGGTAACACCTTCAGTGGGGAATGGCACTGAAACG:1 + chr2L 9636591 3' - S2 172 2 69.18 AAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTT:1 - chr3L 27356081 3' + Tc3 1650 1 64.39 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAAGAGTTGACATTAAGCAGCCGGATGACGGGCGGGACAGCT:1 + chr3R 28782638 3' - blood 7093 2 72.41 TACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTC:1 + chr3L 12861800 3' - pogo 72 1 68.49 AGTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATGCTTTATATGATCGGAAATGCAACGAATCTAGGTTACCCTCTTACTCTACGAATAACGGGTATACCAAACACAAGGTGGAAGATAACAGGTGGAAAAGGGGTCATTGTATTTG:1 - chrX 21191213 3' - INE-1 91 1 60.27 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTTTTGGCCTGCTCGATTTGCTTTT:2 - chr2R 9504175 3' + roo 9045 1 63.89 ATTCAAGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTACTGGTAGGTGTTCACAAAAGGACAAAAGTTTTTCCTCCTCTAGTGACTTTAGTAAACCTGTCCAGAATAATCGAGATCATCAAGCTGGAAGCTGAAGACTAGGACAG:1 + chr2L 7331844 3' - baggins 5050 1 65.00 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTGACTGTATGTATGCCTGTGTGAGTGAGTGACAGG:1 + chr2L 19158927 3' - P-element 54 1 50.00 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGACTAAGGATGTCGAATACTGAGGCACGTCATTAAC:1 + chr3R 4532998 3' - 1360 16 1 71.88 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAAACGACGATGCCAATTCGTGACGCCAGCGACTTCGGCTTT:1 + chr2L 13717380 3' - P-element 76 1 31.69 GAGCTGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACACATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATTATGTGTGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCTTTCTGTCTTTGGTTCGATACTAATCAGTAATTCGGTTGC:1 + chrX 1514459 3' + 1360 117 1 72.60 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTAAAAACGGCCATAAATTAAACATGCCGCCCGCAAAAGTATGCTATGGATTTGAACTCGGATTGCGAATGCGCTGAGGCGTGCGAATGCCAAAGTTACCAGAAAAAAG:1 - chrX 19818376 3' + jockey 4972 1 70.55 GTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGCCACTCGCGCAAAATTTCAATCTGATCGATATGTGCATTTGTCAAACTGATTGATCGAGTGT:1 - chr3R 22868725 3' - mdg1 3 2 73.04 CCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAATTTTTCACGCATTTGACTGCATTACTTAACCTCAATTGGGCAGACGACGTGCATCAACTCCCATCCACACTCCCATCCCCGTCCCCACAACTGCCGGCCACTCCCCAGCCCACTCGACG:2 + chr3R 31682019 3' - Doc 6 1 81.51 CCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAATTATTTCTACCATTATGTGTGGGGTGGCTATTGTATCTGCCGCTGGATAAGCATTCCATGATGTT:1 - chrX 19820135 3' + Juan 4170 1 48.18 CAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGATTTGAGCGCCACTCGCCCACATTCTGCATGTCCTGGC:1 + chr3R 11266180 3' + micropia 5334 2 72.59 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTG:1 + chr3L 15276703 3' + hopper 1389 1 63.41 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCTCTCTCACTCTCTTCGAAATTCTTATTTGTCCACATTCACAT:3 - chrX 10806882 3' + P-element 2812 1 34.25 GGCCACACAGCACGAATCATTTCATAAAATGATATATAGTTAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACGTATTGTTAGTCTCTAAAGTAAAAGGAAAGATTCAATAAATAATCCTTTTTCCTCGCCCTTTTTATTTGTCCTGCCCGGGGT:1 + chr2R 18055393 3' + Doc3-element 4617 1 73.29 TGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTATTTTATTTTATTTTTTATAAAGAGCTAACAATAAATTTTAATTAAGAGCTAGCGAAGTAATCTTGTTAAGTGCAACATTCGAATACGGATAATAGGCTTCATCTTTC:1 - chr3L 22638536 3' + INE-1 563 1 73.29 CGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAG:1 - chr3L 24213787 3' + invader2 5023 2 75.00 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACAGCCTTCGAACTGTCCGGAACGTGTTTCAATTCCCAAAAACTTTCCACCAGAGTCTTGAAAGAAC:1 + chr2R 4044753 3' + pogo 2048 1 56.16 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAATTTATGGCCGTAAAGCGCATGCATGTGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGTACATGCGGATGTGTGTGTGTGTGTAGTTTTCTTTACGCTCTTTTAAGGTG:1 + chrX 19818546 3' - jockey 4770 1 77.44 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGCTTCTAATTTAGGAAGTATGTGATATATATGCTAATTAGCCTATGTAAT:1 + chr3L 20744265 3' - 412 72 2 67.12 GGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCATTTTAAATACTCTAAAAACTAGTACACTTTTGAATTTTTTGAAATGGCTATTGTCGATAAATTTCTCTA:1 - chr2R 13212150 3' - diver 5893 2 80.14 GGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTCTCTTTGACTTGGAACAATTTTTTAAATTAATACAAAAAAACTG:1 + chr2L 9074273 3' + flea 4941 1 73.79 CCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATCTACAGTGCCGGCAGACGAAAACAGAAGGCCGCAAGATTATATTATCATTGAAATTTCATTAAAATTATTTTAACAAAATAATGACAACGAAACC:1 + chr3R 9193293 3' + opus 7494 2 79.10 GGAAGCTCTTGCATAGCCGGCAAAAGCTCTGCACATTGGCAGAGGCCGCTATGAAGCTTTTATATGTTAGCCTTTAAGGCTAACTGCAGTAGCTGCAGGCTACGCTGTCTATGGGGAATTTATTATGGATTTCT:1 - chrX 1500514 3' + springer 7209 2 78.36 TATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATTGCAACTACAGTGGCACGTACTGCCCAAG:1 + chr3L 15853548 3' - jockey 4848 1 79.02 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATATATTCAAAAGTCCAACTTTGACGCGCCAAATGGTTGGCGGTGT:1 - chr3R 22522643 3' - roo 31 2 60.40 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTAAGTGGATGACAGAGAATTCAAATAAAGTGCTTGCCACTCTACAAAAGGACTGCTTAAGATTCTTTTAACCAGAATTGGAATAAAGCCAGCAAATTCTGATTTTAAAGTACTA:1 + chr3L 18972981 3' - mdg1 7 2 79.45 ACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAAGAGTTTAATATCAAATATCGTTTATTATCTTAACGTCC:1 + chr2R 22012219 3' + opus 7421 2 76.03 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACAGTAACAAATAAAGTTAAGTTTTTAAGAGGTAAAATA:1 - chr3L 2278181 3' + roo 323 2 78.77 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGGCAGGTTCAGATAC:1 + chr2R 24021684 3' + pogo 2067 1 62.33 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCGTGCGAATGGCAAAACGCATGGGCTGGAAAACTATTGATAGGT:1 + chrX 18353564 3' - jockey 78 1 74.60 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGCGTAATTTAAT:1 + chrX 22711682 3' - transib2 57 1 62.12 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTCGGGCTGCCATTGTCCGTGTTTCTATGGCCGTGTGTGTGATTGACACGCCCGTGCAAGTG:1 - chr3L 5179094 3' + P-element 2877 2 76.43 TAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAACACTTACTTGGAATATAAAAAATACTATTATAGAACAAGATTGCCAAGAAATAAATAAAAATGTAACAATTAACGGCAACAAAATAATAACAATAAAACAAT:1 - chrX 12349012 3' + Copia1_DM 158 1 69.18 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTG:1 + chr2L 13690090 3' - Doc 43 1 51.61 AATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCATCGTCTAGCAGATTAAAGTGCAATGAAAGTGAGTGGTAAAGTCGTGGGCTTTTGAGGAAAAACAATTGCATAAGCTCGGAGTGAAACAAAAGTAATGGCCAAAATGATTCTC:1 + chr3L 16703929 3' + FB 31 1 73.29 TAATAACAATAATAATTATAATAATAAATAGTAATTTACGCTTTAAGCAATTGATCTTAAATTTTTTTGTTAGGAATCCCATTTTTTACTGATCGAGATTCTTCAAAAATAAGGGCATATCTAAGTCGCATTGATTATTGAATTTC:1 + chr2L 7588381 3' + mdg1 7068 2 82.19 AGCTTTTAATTGCATTAATTAAGACATTAAGACACATTAAGTTACTAATATTTCGCTTAGGTATACCATCTCCGCTGCACAATACTATAACAGGCACTTAGATCTTAAACTTAACATTCTGCTTCGCGTAGAAAACCTATGTACCA:1 - chr2L 20424204 3' - HeT-A 386 1 60.96 TCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGC:1 + chrX 7967249 3' + P-element 2780 1 13.70 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTAATCGATAGGCATTGTTTTGTATGTACCTTTTTT:1 - chr2L 17957188 3' + blood 7308 2 74.31 ACCAAAAGTTGTTTTTTTTTTTCAATTCCAAATTACACGAACAAAATGGCGGCGG:1 + chrX 4477136 3' - HMS-Beagle2 495 2 76.36 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATGATTTTCTCGCAGTGCAGACTATGCACACTT:1 - chr3R 24976167 3' + roo 386 2 67.81 TAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTATATATTTACATTAAATGCCCCTCGCAAAACCGAGCCACCCCTCCGACCCCATCATTTGACCTGCAGTTGGAGCTGTAGAGT:1 - chr2R 22287797 3' + jockey 4806 1 58.46 CATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCTTCGAACCATTTACTTTTTATTTCCAGATGTGTCGCA:1 + chr3R 26244746 3' + copia 5086 2 54.79 TCTTGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAAAGCCACGCCAAAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTATTGTCTTTGGTAAATTGGTATATTCGTTGTTACGGTAGAATGCTTAACCGCATTCG:1 + chr3L 23652949 3' - 1360 89 1 76.39 AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCATAACCATTACCGCATTTAATATGCATTTTTACGAGCCTTACTTTCCAATAATA:1 + chr2L 17727836 3' - jockey 4833 1 58.12 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACA:1 - chr3R 11773902 3' + P-element 2814 1 36.30 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATGGGTCAGCACTGTTGCAGGCAAATGTTGCATTCCGT:1 + chr2R 22464519 3' - pogo 7 1 79.45 TATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGATTCGCCGCCTGCAGCTGCTTTT:1 + chr2R 12069632 3' + Tirant 379 2 65.71 TTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTGAGCGCCTTTATGGCTGCTTGACTATCAGTGATATTTGACTAAAAATGCTGGAATATTCTTTATCGAAGCACTCAGGCGATCTAGCTATTGATGACTGTCCGTCCATCTAAC:1 - chr2R 4330696 3' - copia 9 2 72.41 TAGCATTCTCTCTTGTTTAAATTGTGGATTCCGCAGAGAACGTGACGGTCCTCTAAAGAATTATCATTCATAGAGCACACCTCACCAGCTAACTGTTAACAGCGTGGTATTATTATAGTGTAGTAAATAAAATTGAAAGTGAATTG:1 - chr3L 19465565 3' + INE-1 585 1 76.71 AAAAAGCCATCGATGCTCTTGAAGTGTGTGCTGTTGCATCGTCTTGAAGATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTC:1 - chr2R 7394584 3' - mariner2 488 1 55.56 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATT:1 + chr3R 21587613 3' + roo 350 2 61.64 ATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAGTGAAAAAACTACACTGAAAAAACTGAAATATGGGAATGTCTACTAGTAAGATCGATCCAATTTGAAATGATATACCCTAATGCA:1 + chr2L 18666646 3' - 3S18 26 2 37.04 TACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGTGCCATATACAAAGACAGAAAA:1 + chr2L 261068 3' + Juan 4158 1 50.68 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACATCTTGTGCATATAAAACCCCCGGGGATCCAGCAGAACACACAAAAATGTGTAGCATGCTTTTGGGCTTGTGGTAAATAAGAATGCACTTAGCGTCGGGT:1 + chr3L 2185011 3' - jockey 26 1 71.92 GGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATGCCAC:1 + chr3R 17210120 3' - HMS-Beagle2 6932 2 52.05 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATAACGCTAACAAAAGGTTTATTACACTTTCTATTGAAATATACATTTTGAATCCCATTTTCCCCACATTTGGCTCTCTTTTGTTGCCA:1 + chr2L 3282699 3' + flea 4981 2 64.38 GAAGTGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAAATGCTATTATAATATTTATACTTACACAAATAAATATTGTCTAAAACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCGGTAAGATGGCT:1 - chrX 22576285 3' + Burdock 156 2 52.74 CCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATCTGCATTTTTATTTGTGTAAAATAGCGGGGAAAATGACAGCTATGTGGGTGGCATGACATT:1 - chr2L 18300748 3' + Ivk 5322 1 57.53 GAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGA:1 - chr2R 13212227 3' - diver 5970 2 70.55 ATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGGACCGTTTTGTTTTGCTCGTTTCACCGCCATTTTACAACTTTAGCTAATTTTAAGAATTTTAGAAATCTTGTACTTC:1 + chr3R 5316671 3' + Juan 4193 1 67.81 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATGCCATGGCAATGAAGTTGGCCAAAAGATTATTACGACCCACA:1 - chr2L 20938027 3' - jockey 4748 1 70.34 TTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATAGTAATTATATTTCCCTATTATGGTTAAATTTGTATATTTTCTCCGAGTGAAGCC:1 - chrX 9959781 3' - I-element 65 1 61.64 GAGAAAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACATTTTCCGGTGCCG:1 + chr3R 22624765 3' + blood 7317 2 67.83 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCTGACTCTGATCTTCTGTATTTGAACGCATTTATGTACATGCATATATGCCAGTGCCTCCCATATACAAATGCATATGCTTATGCATGTAAAAATC:1 - chr3L 20398945 3' - roo 8689 2 69.18 TAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATTGCAACTACAGTGGCACGTACTGCCCAAGTTGCATCCAAAAACGCC:1 + chr3L 15853565 3' - jockey 4834 1 67.81 AAGAATATATATACATACATATATAGTATGTATGTGTGTATGAATTCATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTTTTATTTTGTTTTTTGTCCATCGTGCTGTGATTCTTGTTGCTGACA:1 + chrX 11541599 3' - 1731 4413 1 78.57 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGATGGCTGCCGGAATTGAATTGACGCTCATGATTATTTACGCAAAGGGGATTAGAAAATTTTTATGGGTTCGATAAGCCGCAAATTAATTTTCCGCACAGACAGCTT:1 - chrX 19982303 3' + hopper 1404 2 74.29 TTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGATTTAATAAATGTGTG:1 - chr2R 11595868 3' - P-element 101 1 15.28 CTTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGAGAAGCATTAATAATTCGACTAAATATTTTTT:1 - chr2R 1073222 3' + BS 4756 1 77.93 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTTGCCCATTTATCTTTTCCAGCCCATCGTGCGCG:1 - chr2R 14940692 3' + blood 7323 1 75.20 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGCCCGAAAAAGTA:1 - chrX 6484716 3' - jockey 75 1 65.07 GCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATAGGTCACGCCTGACTTATTTAACGGCCTTGCCAGGATTTTGCGGGCACATCA:1 - chr2L 16738395 3' - 17.6 64 1 66.19 TAAGGTCCCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTGAATATGTCA:1 - chr3L 25008288 3' - 297 361 2 77.24 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTGTTTTCCGATTTGGTAAAAAATGCTCACTCTTAAATTATTACGTGTTAACTTGTCGCTT:1 - chr3L 13827380 3' - roo 61 2 60.27 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGG:1 + chr2L 13690072 3' - Doc 83 1 71.23 CGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGTTCACCAAGAGTATGTAATTATGACTA:1 + chr3R 4532967 3' - 1360 44 1 57.60 CACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGAGCCCCCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTACGTATACAGTTCACAAAAAAAGGTTCAAGATTCAATT:1 + chr2L 19547951 3' - flea 330 1 74.66 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGC:1 + chrX 16217508 3' + P-element 2811 1 30.71 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATTTTGGTAGTAACTTAAAAATTTAAGTAATATTAATGTAAATATATCTATATGTGAGCGTAGTATTGTTTCAAAATGCCGTATGACG:1 + chr3R 12622349 3' + 297 6948 2 67.81 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTAAACTTTAACTATCCGTGACTTTTTAGCAGTTCTTTTGTGGTGTAACATTTTACACC:1 + chr3R 18541394 3' + hobo 2899 1 49.56 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATAAATATATGTGCATTTGTGTATAGTATATCAGTGTGAAAC:1 + chr2R 9504293 3' - roo 8740 2 73.29 CCATTTTTTTTTTTGTTTTGTTTAGTTTTCTTTCTTTTAAATGTATATGCAAGATGTATATATCGATTTATGCAGGGAAATATTGGTAACGAGGGCTTCGAGGCGGTGGGTACGC:1 + chrX 4543313 3' + hopper 141 1 61.74 GGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCATCGTCTAGCAGATTAAAGTGCAATGAAAGTGAGTGGTAAAGTCGTGGGCTTTTGAGGAAAAACAATTGCATAAGCTCGGAGTGAAACAAAAGTA:1 + chr3L 16703911 3' + FB 15 1 63.19 AAAATAAAAAAATTATTTAACACATTTTATATAAGTAATATTGCCGAAGCTAATATACCCTTGCATTTAAAAGAAGTTGATTAAATTATATCCAAAATTACAAAAAATATTTGAACACATTATTACACATTGAACACATTATTATT:1 + chr3R 20763241 3' - Tc1 1391 1 69.18 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCTGACAGCGGGCGCTGCACATTATTATGTG:1 - chr2L 20986516 3' - roo 66 2 65.52 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTGAGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGTCTTTATAATCA:1 + chrX 10824059 3' - pogo 33 1 57.53 GTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTGCAGATATGCAAGTTGCATGACAAAAGTTTATCAATTTAAAAGCGCAACTAGTTTAGTTCTCTGTCAAGTCGAAAAGAAAAAGCAATTAAATATCTGATATTAAAGCATTTTTTTG:1 + chr3R 25443367 3' + R1A1-element 5330 1 63.70 ATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAAC:1 + chrX 21667930 3' - gypsy2 62 2 66.67 TTTATTTATTTGTTGGTGCTTTTGAGTATTGACGAGTTAATTTCACAGCGTTTCCTCTTTGTGTTTGTTTTGTTTCGCTTTTTGCTTACTAGTAGTTATATAAAGAATATGTGTGTGCTGGCGCCGTTTCTCTCTCGCACTCTATT:1 + chrX 6694309 3' - Juan 4210 1 67.81 TTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTTGTTTTTATTTGCCCCACTGTTTTTTTTTATATGTAATTGACTCAACGCAAACCTGTGTAAACGCGCAATGCA:1 - chrX 9928292 3' + R1A1-element 9 1 53.42 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTGTACTACTATTTTTCTCTCAGTGCAGCACTATCCTTT:1 + chr3R 8596416 3' + hobo 2907 1 61.70 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGAGTCTTCTCTTTCGGTCTTGCGATAAATTTCGTTGGCAACTTATTCGCCTATCGCTTTCGCAGAGTTTCTCAC:1 - chr2R 10599970 3' + 297 6929 2 54.79 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTATAATGACATTTCGTTTGGCATTTGGGAAAGTATGAAATTGGATATGTTTAAGCCTTTTCACATTAC:1 - chrX 6423166 3' + roo 9011 2 56.85 TTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATTATTTTTACAGTTGC:1 + chr3R 21587627 3' + roo 9028 1 54.79 CTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAGAGTAACCAAAGGACAAACATCAGCGCTACGTGCTGCGGCATCAAACTAAACATGAGCACAG:1 + chr3R 26196523 3' - roo 9049 2 61.64 CTTTAAGTAGGTCCACAAATTTTCAATGGGGTTCAGATCAGGACTCTGAGGGGGCGTATCGATCACTTTACCACAGTTATAAAGGCGCCACGTGCGTACATTCACTCTTTTATTTAAATCTACTTTGAACCCATTGATTGTGTGA:1 - chr2R 11972313 3' - S-element 1252 1 73.10 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATACACTCAGCGGCTTTTCATAATCCTTCAGCCTGCGACTGGCGTCTCTTTAAAATTTTACTTAAAATGCGCATTGAGAGCGTCTTGAAGATGGCCTA:1 - chr3L 18972789 3' + mdg1 397 2 68.49 CTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAAATCAACCGAGTTTACTCCCACAGCACTGCAAATGTTGCTATTG:1 + chr3R 5582168 3' - Quasimodo 478 2 77.78 AAAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTTGAGCTGTTTTCAGTTTTGAAAAGCTAAGAGTACTACTACTAAGAGTAGACTCAC:1 - chr3R 14051451 3' + F-element 186 1 62.33 ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAGGCAAATTCTGCGACGACTGCAGTTGGCATCGCCATGTGGCACCACC:1 - chr2L 7271831 3' + 297 6915 2 66.42 AAAAAAAAAAGAAAAAAAATGTAAACGATTCTGACGCCATTGCCAATACCACGGAAAGCTGCCAAACAATAGAGCTCCAGGGGTCTCATGTTTGTCACTTTAAACGTTTAAACGTTTAATAAGCGATCTCTTGATTGAATTAATAT:1 - chr3R 8847071 3' - hopper 141 4 54.79 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAATAAAAT:1 + chrX 17027968 3' + roo 354 2 53.42 CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGCCATCCCAAGTGCAAAGTGCCGGCTAACTAATTGCTCTGTCACCGATGAAGGCAA:1 + chr2R 13471431 3' + flea 4950 1 61.64 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGATAGATGTAGCTAAGCAAAGTTTGCCGTGGAAGGATGAGTCCTGCGG:1 - chrX 12214472 3' - opus 7055 4 63.36 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCCCAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTCTTGATCAACAGCAAAGTCGATATAGCCTTGTCCGTTTCAGAGTAAACTTGTTGATACTTTCCCAAAAGTAGTATAGATTGG:1 - chr3R 6461709 3' + S-element 1683 2 63.01 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCTCAGGAAGCATCGAGCCCATTTCTACACTGAATATTGGCCATAATTAATGCTAAC:1 + chr2R 11562954 3' + pogo 2077 1 67.59 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTAGTTTAAAAGCTTCAAATTTTCATCGACATGATTTGACCACGTCAGAGCCGATGGGATGG:1 + chrX 14346561 3' + roo 396 1 71.23 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAATAAAATATGCGTTTCC:1 + chrX 17027978 3' + roo 9028 1 59.59 AAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTGCTCTTATTTTATTTATTTATTTTAAAGACTTAATATGTTTTTCTGCACACGATACTTTCCGTTCAAGGTTTTTTCCGTTTAGTTGTCCTCAT:1 - chr3R 904573 3' - 3S18 30 2 65.07 GGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAAAAGCTCCGCTTTTCGGGCTAACACAACCGCAGATAGCACCTGCTGCTCC:1 - chr2R 12069532 3' - Tirant 8118 2 76.38 GCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAAATCAGACGCAGTAAAAGAAATGAAGGTAAACCTAAACTATCGTATAGATTTTTAGAAAAA:1 + chr3R 3286213 3' + gypsy12 9892 3 67.81 GTCTGGCAGAGTAAGAAATAAAAATGTGACATTTAGTCGGAGTTGGCGAGCTGTGAGAAATCCCCGACCGCGACTCACTGTGGAAACACTTCGAGGTCCTCGTGGCATCCAGACCATCGAAGATGATTTTAAGGACATCAAATTCA:1 + chr2L 18690043 3' - Gypsy6A_LTR 238 1 67.81 AAGATAAAGAAAAAAACAAAAATTTAATATAAGTAATTTTTAACTAAGCATTTGAAATATTTAAGTAATATGTATTATCATACTAATTGAAAGTAACTCTATTAAAACTGTGAATTTAAGCAATCTTTTGGCCAACACAATTCCGA:1 - chr2R 18609567 3' + Porto1 160 2 54.79 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTATGAACACGGTCTATACTGTAGGCCAAGCCACATATATAAGCAAACAATATATATAAATACATATGGGGTGTGTGGGAACGGTGCTGC:1 + chr3L 12899868 3' - roo 8708 2 55.48 CATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTGTTGTTTGTTCCCCTTCGTCACGGCGATGATGGTCTGCTCTTTATGGTTTCCCAATCGGACAGTCGCAGTCTAAAGCGCG:1 + chr2L 22024537 3' + hopper 1059 2 55.48 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGCATCATAGATTTTGTTAAATATTTTTTTATAATTTATCTAGATATATTTTATGTGCCTTATTAATTTTTAGATTTGATGCCTAATTAATAGACCCGCTT:1 - chr2L 14480386 3' - Transpac 19 2 73.29 TTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACGCGTTTGAACGGGGGAACTTGATGTTTAGTCTACC:1 + chr3R 970732 3' - blood 58 2 96.52 GTGTTAGAACGAGATGACAATGTGGCACACGCCACTGAGCAGGGGAAAGTTGCGACGGTGGGAGATATACCGCTCTTCTTTTTGCAAAGCCAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAATAAAGGAAACCGAAGACGGAGGCGA:1 - chr2L 22218241 3' + invader4 2916 2 75.69 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGGGCATCTTCGGCAATTTGGCCTTCGTGCCCGCATCGCATCATCTCGCTCTTT:1 + chrX 21281252 3' - P-element 30 1 54.13 GGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGAT:1 + chr2R 4677362 3' - invader3 54 2 52.74 GTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATGCTGAAACTGAATCAGAGTAAGAGTCCTGGAGCCGGGGCATCCTGGATTCCGTCGTGTTGTTTCAAACGTGGCCGCTTTGCTCGTTTTTGATGGTTGTTTCG:1 + chr3R 5941551 3' - X-element 20 1 73.88 CATAATATGTATGTAATATGTACATAGTATGTAGTGTTACTAAAGAATTTAAATAATTTGTTAAATAAATCTAAAATACTTAATAAAGTCAAATGAAATTTTAATCAATTATATACTGGCATTTCTAAAATCCAGAATTTAATTAA:1 + chr3L 15417029 3' + Dm88 4365 2 64.38 TTTGCTTTAGTACATTTAAATTTATACGCTGATTTGTTTCAAATATTATTCCGCATTTTGCCAATTATTAACTAAAACGAAATGATATACCGCATGTCCCAAATAGTTTAACTGCTTTAGTCAATTAGTAGTTTATTCGACGCGCT:1 + chr2L 17387626 3' + Bari1 306 1 63.01 AGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAATTATAAAGAAGAAGGGGGAATGAAAACCACAGCAC:1 + chr3R 9175240 3' + Juan 4136 1 76.12 CTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAATGGAAAGAGTTTTGGCAAATAGAAATAGGAAATGGAAAGTTTTCAGAGTGCGAGGAAAAGCAAATGGGAAAACCCT:1 - chr2R 22017343 3' + HMS-Beagle2 212 4 52.05 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTAATGATGCTTGGTCTAAAATAGATTTTCCCAATTCAAAAAACGCCCATACAAAAGTAGCCCCACTATAAAAAACTGTCTACCTGGGTAATTTTTATGCATTA:1 - chr3R 22771845 3' - opus 20 2 71.72 TTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATTGGATCGAGTTTACCCACCGAGCGGCTG:1 + chr3L 14866486 3' + 1360 146 1 80.28 ACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCATTGGATATATGATGGCTCGCAGAACTCGGGAGATTTGTAACTAATAACAATGTTTTATGCT:1 - chr3L 22856726 3' - opus 430 2 58.22 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCAAAACACTTTACTTAACAAGGTATCATTTATTTACCGAACTCCTTACAAGAATATTCTCTACTTCCTGTACCACATCTG:1 - chr3R 29516463 3' - I-element 36 1 56.20 CGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 135 2 65.22 GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCGTTGGATTGATGTTCGG:1 - 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chr3R 18541273 3' - hobo 28 1 65.07 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAACCAACTCTGTTCCCAAAACCGCCGCCCGTGAGTATGCAATAAATTA:1 + chrX 4214532 3' + jockey 4922 1 64.38 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAACGACGATGCCAATTCGTGACGCCAGTGACTTCGGCTTTCGGCCGCCTTTCGGGTTTTCGAAATTCATCCGTTTCAGAGAAGGAATGAACTC:1 + chr2L 13717433 3' + P-element 2882 2 79.03 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATGCCACAGCGTTCCA:1 + chr3R 17210129 3' - HMS-Beagle2 6923 2 58.22 ACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACATAAGTCTTTATACATGGCTTGCGAA:1 - chr3L 18738089 3' - Bari1 28 1 64.94 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTAATTTATGGCCGTAAAGCGCATGCATGTGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGTACATGCGGATGTGTGTGTGTGTGTAGTTTTCTTTACGCTCTTTTAAGGTGGACCCAG:1 + chrX 19818553 3' - jockey 4776 1 75.34 GTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGTATTCAACTAAAAATACAGGCATTTCAAAGTTAACATTTCAATTGATACTGTGATTTTTTTGCACAGCTTTTAAATTGAGCAACTTCAGTTGTTGCTTGAACTGATCTATTTTAA:1 - chrX 10128117 3' - invader3 5195 2 72.60 AATATATTATTAAATTTTATTTTTACCAGCTTCGGTCAATTTCAATTATCCATTTGTGTTTTGTGGGTTTTTAATGCATAATTTATACTTCATTCCATGTTTGAATAGCTTTACCGAACAATTTTGTTTTCTCCTCAGAGTTTTTT:1 - chr2L 17215007 3' + hopper 174 1 65.75 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGGCCAAAAAGAGATTCCATCAGTTGGACAACAGGACGACCTGGTTTCGCTTTTGGACAT:1 + chr2R 9623443 3' + I-element 5343 1 71.31 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGA:1 - chr2L 19158862 3' + P-element 2787 1 16.55 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAAGTGTAAAGGGAAATGGGCAAATCTTAATCAGAAATGCCAAAGTTGGATTTCCGAAAGACATTAGA:1 + chrX 12998105 3' + roo 352 2 54.11 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCAGCATTTCCTTTGTGGGAACTGGTTTTGCTCAAATTGCGAAATGCTTAGCTAGCATCTAAGTTCTATTGGTTGTTGAAAAAT:1 - chr3R 10361827 3' + roo 9043 1 62.96 ATGCACACACACACACACACACAGACACACAGACACAGAGACAGATACAAATACGGAGACACACACAAGGACAGGGACTTGTGTTTGTTTGCTTTCGTATTTGCCTGTTTGCTG:1 + chrX 20547323 3' + accord 181 2 60.53 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGCGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAAACGACCTTGCACAAACCAACAACAACCATAGCGACGACAGCGGCTGC:1 - chr2L 21250949 3' - P-element 75 1 33.56 ATATCTATATGTTTAGTACGTGTATCGCTCATTTATGATTGATATACTCGCATAGCAAAGTTATATTTACAAATCCCACAACATAATCGCAAGTGATTAATTTGCCATGCCCGAGCGCAGAGAATCGAATACAGATGGGATTGGGA:1 + chr2R 20926645 3' - Dm88 4116 1 65.75 ATAGATTTAAGAATAAAACTCAGCTGCGTTTACAAACGCAGACTGCGGCGTCTTACAAGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATAAAAAACGTTTATAATGTCAATTGCGATTTGGACATGGGAATCAAGAGATATT:1 + chr2R 5329298 3' + rooA 7426 2 62.33 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAAACGACCTTGCACAAACCAACAACAACCATAGCGACGACAGCGGCGGCGAAGCAAACCACGAAGA:1 - chr2L 21250932 3' - P-element 58 1 46.58 TGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGTAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGCAATTCTTCCTTATTATTTATTGATTAGTTAGCTGTT:1 - chr3L 24208965 3' + Quasimodo 177 2 71.92 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGAATAAATCAACCTAGTATGTTGGGCT:1 + chr3L 14084966 3' + opus 7474 2 57.52 GTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCAC:1 - chr3R 907905 3' - gypsy11 4340 2 28.87 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGCTGCACTCTGCAGTGGTGTGGTTATATTCGTACTTATGAGTGAGTGTTCT:1 + chr3R 17059353 3' - hopper 68 1 63.45 GATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTTTGCACTTGATTATAAAATATATTAGAATTTATCGTATTTGTGGTTTAT:2 + chr2R 21425194 3' - HMS-Beagle2 6909 2 66.44 CGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATAAGTTATGTATTTCTCTTCAGTGTCCAGAATTATGCAAGTTAGGTATTTCTCTCCAGTGTCCAGAATTA:1 - chr2R 924416 3' - springer 51 2 52.74 ATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAGAAAAGTCATGTGTGAATGTGGGAAAAGCGCCTTTTAATTGAAAATTCACAAGAAAGGGGGGTAGCGAGAGCGCGAGGCAAAGGGAAATGGGAAAAAGAACGAGGGGAATGTGGCGCTT:2 - chr2L 11922811 3' + jockey 4987 1 71.92 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACATATACACCAAG:1 + chr3L 5274992 3' - I-element 78 1 70.55 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAAAAGCTCCGCTTTTCGGGCTAACACAACCGCAGATAGCACCTGCTGCTC:1 - chr2R 12069533 3' - Tirant 12 2 75.59 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTGGCACAACAATTTGGACATATATCCGTAACTAATAACAACACAGAGATAAAAGGGATTATCAGTTTATC:1 + chr2L 11613319 3' - hobo 52 1 52.41 AGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGCT:1 + chr2L 13510862 3' - diver 5967 2 79.31 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGCTGCACTCTGCAGTGGTGTGGTTATATTCGTACTTATGAGTGAGTGTTCTTCAGTCTGGAGAGCCAGAGCGC:1 + chr3R 17059375 3' - hopper 47 1 54.11 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTGGTATTAATTCTTCTTATTGTTCATATCCATTCATCGTTTATTTGTTCCACATGCAGATGAGATTATTTTCTTTTCGATCAAAGAACATAAAACCGC:1 + chrX 19959937 3' - roo 15 2 74.64 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCTCTCTCACTCTCTTCGAAATTCTTATTTGTCCACATTCACAT:1 - chrX 10806882 3' + P-element 2834 1 40.32 GCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAAACGGAAATGAAATAAATATATATAGAAAAAATTGTATCATTGTGATTTTATATGATTATTT:1 - chr3R 5250155 3' + jockey 111 1 57.64 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATGCAATGAAAAGCAACCAAAAAGGAACGAAT:1 + chr2R 15151133 3' - hopper 54 1 54.11 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCAGCAAATAGAATTCTTTTAGACTTTTAGCTAGACAATTTTACTACCGGATTAGCTTTTCGTACTTGTCTGTCCAAGCGGCTTTTGCAGAGTTGATGTTATTTGTGAAGAGTTGATGTTATTTT:1 - chr3L 16663796 3' - opus 7115 3 57.53 TTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGCATGT:1 + chr3R 21276656 3' + BS 5065 1 56.16 TCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTATATAAACTTATTCTTTTTACCTTTCTTTACTTTCAGGTAAGGATATAAA:1 + chrX 3767666 3' - I-element 73 1 67.81 TCTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTATTTTAGCGAAATGATGTTTTGCAATTCTGCTACGGCAGGCACAGGTGCTTTTACTGACCAAAGTTAA:1 - chr3R 32035091 3' - 297 432 1 75.21 ACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATAGATACGTGTGGGTTTTTACGTCGAAATCAATAAGTGCTTCTTTCGCACTAATCTGAGGAATCAACATCGAAACTAATTATCGACCTCTGAATAAGGAAGGTAGGGGCAC:1 - chr2L 6319685 3' - Tabor 11 2 73.97 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGG:1 - chr3L 18199953 3' - Doc 57 1 62.12 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCATTATCATTCACTTTCTATTATAATATTTATTTTGCTGCGTTAATTTATTTGTTATG:1 - chr2R 9339647 3' - Transpac 63 2 63.01 CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGCCGTAGTTGTCCATTGCACACACTTGATTCCTCCAAATTACATCCCAAGTCC:1 + chrX 5399105 3' - opus 7181 4 65.07 AAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATTTATGTTTCTCTGCAGGACAATTCGTATCTGTTGCGATAAATCATATCCATATTCAAATATTTGCACTATTTTGTTGTGCAAATGGCAAGATT:1 + chr3L 19335468 3' + invader4 297 2 64.38 AGTGAGTCGCGAGAAACGGAAATATGTTTGTCAGCATTTTTATTTATTTGTGTTTAAGTGCATGCAATTGAATTGGAATAAACACACTTTTTATGGATTTAATTCCAGTAATTAGCGTTAAGCCAACGAATAGCTTTAAATCATTC:1 - chrX 449084 3' - rover 7133 2 54.11 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGACGAACATATATCTAACGGCACTGGCCATTACGGATATT:1 + chrX 4725058 3' + roo 8990 2 73.97 CAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCAGCCCTTCTGTGGGTTTAGTGGCACCGAACCCAAGGCTCG:1 + chr2R 10406344 3' - FB 83 1 73.29 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAAGGTCGCTCTGTCGATGTTCTGGAATTGGGGAACAAGGGTA:1 - chr2L 8396858 3' + roo 327 2 71.92 AGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTGCTATTTATTTGTATTACTTTGCTGGTGAAACTCTTTAAATCAATTTGGCAAATTTAAGTGG:1 + chrX 10128335 3' + invader3 269 2 76.03 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTAATATGTTCTATATTTATAGCTGTGAATGATAGTTTCTCACGGTATTTGAGTAGTCCAGTTCTTAAAGCTGATT:1 + chr3R 22771981 3' + opus 449 2 56.85 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATAGTAATTATATTTCCCTATTATGGTTAAATTTGTATATTTTCTCCGAGTGAAGCCGAGATTAGTATGTTTTCACCATAAACAC:1 - chrX 9959753 3' - I-element 37 1 57.53 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAAAACAATCCTTTAGCTTTCGAGTTCATTTAGAT:1 - chr3R 19543397 3' + roo 9020 2 52.74 ATTGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGGCATTAATTCATTAAGCATGTAGCTTCTACCAATACATATGACTCGTTGAAAAATTTTTCATAGTTTCATAACAACTGTAAAA:1 - chr2R 11562789 3' - pogo 36 1 60.96 ACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGATTCGCATTTCC:1 + chr2L 13510872 3' - diver 5958 2 72.60 CGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATATATCATTGATAAAAAAAGCTTTTCCTCTGCGCATTTTCCCTAGTATACTTTTCGGATTGCGTGTGGAAATCACGAACAGATCTTTGAACCCTGAACTTTAT:1 - chr3L 18554551 3' - jockey 4578 1 68.49 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCTCAGGAAGCATCGAGCC:1 + chr2R 11562916 3' + pogo 2038 1 59.59 GTACAAATACCTTTTCCCTACAGGCATTAATAATTAAAATCAAGAATTGAGCGTGCTTTCAACAACGGAATAGAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAAATTTGACTTCTCTATTTATGGCTTATGGCTTG:1 - chr3L 2938744 3' - Gypsy12A_LTR 2149 1 77.21 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAATCTGAACAATGGGATTGGGAAAAGAAAATAATTTATATAATTCTATTAT:1 - chrX 10823933 3' + pogo 2034 1 65.07 TATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGA:2 - chr3L 3757164 3' - copia 4956 2 78.08 ACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCACACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGAAAATTGTTTACGACATCG:1 + chrX 22834595 3' + Tirant 8316 2 60.69 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGCAGCAAAAC:1 - chr2L 19158845 3' + P-element 2808 1 29.08 AATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATGTAAATATATGTGCAATAAAATTATGCGAAATAGTCATTC:1 - chr2L 17166293 3' + I-element 5281 1 68.53 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTAAATGATTTTCTTTTAATTCCTCGCCTCTAAAGTCAAGTTCCACTGTATAG:1 - chr3R 30782512 3' + pogo 2075 1 59.05 TTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATAACGCTAACAAAAGGTTTATTACACTTTCTATTGAAATATACATTTTGAATCCCATTTTCCCCACATTTGGCTCTCTTTTGTT:1 + chr2L 3282695 3' + flea 4977 2 61.64 CGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGCCCCCGGCAAGACGCTTTTGTTGGCTACTTCTTGGAGTCACATGTGAGCTTCGCCCTCCCTGTCGCGCTCCCTC:1 + chr3L 8013848 3' + F-element 236 1 49.66 CGTTACTCAGCTAGTGTGATTGCGAACGCGAAATTTAAAAATTTTTCTGCGATAGCAAAAGATATTGTTGAATAAAATGAGAATACATTTAAACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGTCATGAGGGACAAAGTAAAGGCAGAGCAGG:1 + chrX 10041427 3' - INE-1 535 1 60.27 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGGTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGG:1 + chr2R 24021670 3' + pogo 2053 1 52.74 GTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTG:1 - chr3R 19449931 3' + P-element 74 1 40.41 ATTAGATGCCTGAAACGAAATCTTAGGCTTCTGGCTACACTGGAAGTATTTATGGCCGCTGCTCCATACAAGCGGAACAGAAATATATTTATCGATATTTGAATTCAAACTGTATTCTTCCATAATTTCCTTAACGTTATTGACGA:1 + chr2L 22983843 3' + Transib5 2917 1 46.58 AATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGT:1 + chr2R 21425145 3' - HMS-Beagle2 6958 2 70.55 TTTTTTTATTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTTAACAAATTTGAATAATCTTGAATAACTTCAAAAATGTTGTATCTCTCAATTAATATTTCTAATAATCGAGAAATATATAGAGCTCAATTTATTCAGACAGTCAGTCTGGTCTAG:1 - chr3L 12059446 3' - Doc 4700 1 69.66 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTCTATCGGTCTCCATTGCCTCGAATGT:1 + chr2L 8396906 3' - roo 8726 2 77.19 AGAAACCACTTGGTCTGATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATAGAATGATTATTTAAAAAAAAATGCCTAATTTAAATAATTTTAGTTTTTAGATTT:1 + chr3L 14944614 3' + G5 4747 1 74.66 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATCGAACTATAGTCAAATAACAGCTTTGAGTTGTGTGTTTGTTCCAGGGCTGTAATGTTTAATAACTCGGAAAATTAACCGTAGTCCTGCCAAA:1 - chr3L 21151054 3' - 412 7082 2 65.75 TATATATAAGGGATAAAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAATTATTTCTACCATTATGTGTGGGGTGGCTATTGTATCTGCCGCTGGATAAGCATTCCATGATGTTTAGCGATTTATGTAGTTTGTTTGTGTGAGCTTTAT:1 - chrX 19820100 3' + Juan 4196 1 69.18 AGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTAAACCTATAAACCCACAAGCCCTTAATAATAATAATGACATGGACGGAGTCCTCGATCAGATGCTCGCAGAGCATGCAGCACGGAAAGGAC:1 + chr2R 23472589 3' + baggins 5372 1 60.27 ACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAGAGCTAGACGATCGAGATTCAGCATACAAATTCTAGAGAGAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGGCCCACAAACATTTCATATTTTTTCACATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATT:1 + chrX 4797163 3' + INE-1 143 1 54.11 GTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCTAAACCTAATTAAAAACTTATCAACAGCTGCCGCAAAATGGCAATTTTCCAAGCATTTGTTTGTTGCCACTGGCAACCTCAAGCCAGACACAACCAAACGACTTCGGGTG:1 - chr2L 11618278 3' - hobo 488 1 79.45 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCAACCCTTAACGGAGTTGGGCGAAACTTGACCCCAAGCTGAGAGAGAGAGTGAGTGAGAGAGTGAGTGGGGGTGGGAAAATAGATGGGTGTGAGAGGCTTACACTTAAAAAG:1 + chr3R 11774041 3' + P-element 2877 2 78.08 TTTAAGTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAATAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATAACAAAAGAATTTCCACATATA:1 - chr2L 22121324 3' + I-element 5321 1 62.33 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTATAATACTTAGAGAATATGGGAATATTTCAACATTTTTCCATATACAT:1 + chrX 16243795 3' + copia 183 2 68.49 TGTAGCAACAAGCACAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGAAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAATGTAATTCTGTAATGGACTTTCCTGCCGCGAGGCTGGGCTCGATTGGCGGCAAGTC:1 - chr3R 11445722 3' + invader2 118 2 58.52 AGAACGGAGAAGGATATGTGAAGGGTCAAGATGCCCCGTCGAGATGGGTGCCGAAAAATAGAGAGAAGAGAGGGTGGTGGAGAAACGGGAGGGGGTTAGTTGGTGGGTCACAGTTGCGAAAACAGTCGACGAATGTTGTGAGAG:1 + chr3L 6331764 3' + gypsy8 4479 1 67.36 ACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCACACTC:1 + chr2R 16496683 3' + hopper2 1562 1 51.37 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTTCCATCAACATTTAAGGCCGCAGCAATGTTGCCATTAGAGCAT:1 - chrX 2517990 3' + P-element 2857 1 63.70 ACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTT:1 + chr3L 25508750 3' - 1360 337 1 62.07 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATACATAGACTTCCTCACTCGTCTGCTTTGTGACATTGAAAATAAATATTTTTGTGTCTGGGCACGGGGCATATCGAACGATTCGATGTCGGTTAGGTGACCGCCAGTT:1 - chr3L 18034497 3' - Transpac 5 2 80.69 AACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTCATGCGTGCTGGAAAAACAGCGCCAAAAAATTGCCAACGAACCAAAAG:1 - chr3R 6411968 3' + Tirant 8442 2 66.43 AATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTTGTTTTTCGTGTGTGCGTGCAACTGTTGCCATGCTGTGACTATCATTAATTTTTCATACTCATAATCATC:1 - chr3R 19264424 3' + P-element 2728 1 47.26 ATACATATATACATATACATATATATACATATACATATATATATATATACATATATGTATTACATACATATGCATTTAAGCCAACTTACATTTGTCATTTTAGCCTCATTGTCCATTTTGA:1 + chr3R 23812710 3' - Stalker4 248 4 52.89 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGCACATCCATCTAAAGCCCTTCATGATGTTAATTACCGAACCCTGTCACACGCTCCGCGAAAAGGAAAACCTGGAAAAGAGC:1 + chr3L 6675415 3' - 412 7093 2 58.22 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACAGAGGAAAAAGCTATATTGCTCTTCTATGATAAAT:1 + chr2R 6713953 3' - 297 39 2 55.12 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATGTGCAAGGCAGGGCCGTATCCACATCGAGGGTACATATGTTT:1 - chr3R 18697881 3' - 297 6594 2 60.23 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATC:1 + chr2L 13690067 3' - Doc 88 1 74.66 TACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCACATTTATTTATTAAAATTCTGTCGT:1 - chr3R 27514694 3' - Ivk 391 1 79.20 ATCTGTTTGAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACATAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTTTTTAATAGCATTCCAGAGCCTTTTGGTGTCC:1 + chrX 12117398 3' - Q-element 282 2 68.14 GGGTCGTAGCTCCGACTTGATATTCACGGCAGGGATCCTACGATAACATCACTTTATTTCGGCTGTCAGTTTAGAACTAAGTAATACAAAGAAAGAAATTATGTGCATAACCCACAATCCCCCTTCGAACCC:1 - chr2L 1861871 3' - Chouto 189 1 71.21 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTAT:2 + chr2R 22464471 3' - pogo 55 1 58.22 ATATCAAGGTTAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATATGGACATTTTACAATGCGCGACGAGCCAGAAACCGCAGGATTGCTTGCGAATTTTCCCAGCT:1 + chrX 1764167 3' + opus 7456 2 55.48 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCA:1 + chr3R 19543482 3' - roo 8750 2 76.71 GTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACAAACTTCGAGATGCATTTATTCAAGTGTAAAAGCAACACCTTCCTTGAA:1 - chr2L 260951 3' - Juan 4069 1 58.22 ATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATA:1 - chr3R 21276537 3' - BS 5061 1 60.27 AACAATTACAATAAACGGTCGCATGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTATGTTGGCACCCCGGTTATTAT:1 + chr2R 2552159 3' + HMS-Beagle2 267 2 73.63 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAATCGGGCTTTCAACTGAACGGACGGACT:1 - chr2L 13717275 3' + P-element 2860 1 59.35 ATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAGGGCCAACGTCTGC:1 - chr2L 23372490 3' - gtwin 18 2 70.00 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGT:1 + chr3R 6412064 3' - Tirant 8148 2 52.76 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACGACAGACCATTTTTCATTTCTATTGATGGGAATTGCACTTATTAATATCAATTATTGAGAATAATCTTATATTTTCT:1 + chr3L 18792530 3' - roo 8707 2 55.48 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAAAGTTTCGCTGCACAATGTAACTTCCAATATTCAAGACACGAGATTTTGTTTCG:1 + chr3R 10636191 3' - blood 65 2 62.24 TATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTCCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAACT:1 + chr3L 12861788 3' - pogo 84 1 75.34 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTAATAAAATCCATAAGCATTTCGAAAAGTTTGTAGCATACTTTTTGG:1 - chrX 9508110 3' - jockey 4751 1 70.55 CGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTAATAAAATCCATAAGCATTTCGAAAAGTTTGTAGCATACTTTTTGGG:1 - chrX 9508109 3' - jockey 4749 1 68.97 TAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAACTTAAAGACTATCCCTATATTGTGTGCTATTGATTAAACATTTGGTAGATTTG:1 + chr2L 6820957 3' + I-element 5279 1 61.97 GTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACCTCGAATTGGGAATGCCTCAACCTTTCCCAACACCACCTAACCCCCTTGCCATGCACTTAAATACCCTTAGTTGGATTGGTAAGGATCGCATCGCACCACCC:1 + chr2R 13193912 3' + BS 5075 1 65.07 AACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTATTCAACGAATCCAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAAAGGGGATAACAAACCTTTAGTTCGTAACGATGGACATACAGCCAGCAATGAAACTGTTAGACAACACTA:1 + chr3L 22721164 3' - INE-1 32 1 62.22 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCACGTCGATCAGGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGAGACCGGGGCTATTCTAGAAACCTAACGCGAGTTCAGAACGCTGAATTATGT:1 - chr3L 14551272 3' + P-element 2862 1 65.93 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCCCTTGGGCTGGCTACTTCCTCGCTTCCCTCTCCTTTGGCTGGCGTATATAAATGGCAGAATGTTTGTG:1 - chr2L 18178256 3' + Tirant 386 2 68.52 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATTTCTAGTCACATTCGGGATTTTTCCAATTATCAAAACCAGTTCAGAAT:1 - chr3R 5024778 3' - diver 26 2 69.86 AAAAGAAAAAAAATCCAAAATTGGAATGAGAAAACGTTTCATATTTGCCTTCGCTTTCGTTTTGAAGAACCGTTGAATAAATATTAAGAATATCAAATAATGAATAATATTGGTTGTCAAATATTTAAGAAAATTAAA:1 + chrX 5006191 3' + transib4 2541 1 73.19 AATATATATGTATGTCTATACTTCCACTAACCTTTGCTACTTCAATTCGTCGTATCGCATCGTCTCGCCTTGGATTTCCTTGCCCTGGGCTTGTCTCTGCCCTGGCATTTGACTTTTTAAAGGCCAACTTAGTTAAGGTCTTAAGT:1 - chr2L 14938004 3' - INE-1 67 1 78.08 ATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAAGGAGATTAAATTTGGAAAACAG:1 + chr3L 16875763 3' - jockey 4835 1 68.49 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATTATTTTTACAGTTGCATTCCCAGCTCGATTCTCGA:1 + chr3R 21587647 3' + roo 9052 2 70.42 GTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCAGGCTTC:1 + chr3L 9762262 3' - jockey 4773 1 56.00 AGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAAC:1 + chr3L 23702275 3' - G4 43 1 53.42 ACCTTACCAAAGTTTGTGCAAATTCTAATGTCAATTTGGACCAAATCTCCGCTATTTCAATGATGGCTCCCTCTCGTTTTCAGCAGTGGCAACTGTATTCCCCAC:1 + chr3R 19377659 3' - Bari1 1318 1 77.14 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTATAATCACAAATATATTAAATAAACCTCACGGACTG:1 + chr2R 9455904 3' - 412 83 2 74.66 AAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1669 1 60.95 GGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCGGAAAGCGTACTGCTGCCAATAAGGCAAGGTAT:1 - chr3R 26244651 3' - copia 4958 2 78.77 TGTGAAATTAAATTTTGAAATATGTGTCTTGTATAGGCACATCTAGTTCAAATATGAAATTTAATATATCTTGGACACCTAAATTAGCCAAAAATTTCATTGTAACGTGATTGTATGTCAAATATTCCATGCAAAATGAAAGTCAG:1 + chr3R 26310123 3' + copia 329 1 76.03 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAGAACGTGAGCGAAAAGAGAGCATGTGGATCTTACTTGAGCAGGATAACAGCTGT:1 - chrX 7967177 3' - P-element 41 1 58.22 AGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATACAGTGCATGTCAGAATGAATACGGAATTCCTTGCGGACTTCAAGCGACAAAAGATGAGCCTGTACCAAATTGATGCCCGATGT:1 + chr2R 12814964 3' - opus 144 4 60.27 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCGGATATGAAAAGGTGAGTTTACAGAATTATCAAACATGTTTTTACATCTCTGTATCTGTTTACTAAAAAATGCATTTGTATTGATTGTTTTACAATA:1 - chr2R 16496526 3' - hopper 20 1 67.12 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAACTATTCCGCATTCTAAATTGCAATATTCGATGCACGCATAATTGGAGCTATTGATTAAATCGGCCAGAGGGCGTGCGTGCCACCAATGACA:1 - chr2L 14888891 3' - hopper 25 1 67.12 CAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGCCCGAAAAAG:1 - chrX 6484718 3' - jockey 77 1 66.44 TATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTACCAGAAAATTGAACGACAAGCTATAAAGCCGGAACT:1 - chr3L 381727 3' + S-element 1633 2 74.66 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCGTCGGCACAGGTATTCCACAAGATTCTGTTATTCGCTTGTGTAATTAACGGATGCGGTGTCAACTAGTAAAAATGCA:1 - chr2R 18440384 3' - P-element 41 1 57.64 AATATATATACATACATATATAGTATGTATGTGTGTATGAATTCATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTTTTATTTTGTTTTTTGTCCATCGTGCTGTGATTCTTGTTGCTG:1 + chrX 11541596 3' - 1731 4410 1 79.85 TACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAACCG:1 + chr2R 16496673 3' + hopper2 1553 1 53.79 CTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATACTAGTACGTGCAATTTAATTTTCTAAGGACCTTTAACGATGGA:1 - chr2L 5634248 3' + jockey 4907 1 67.91 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGGCATTAATTCATTAAGCATGTAGCTTCTACCAATACATATGACTCGTTGAAAAATTTTTCATAGTTTCA:1 - chr2R 11562803 3' - pogo 50 1 52.74 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAACTATAGAGCTACCATTTGCTGGAGGCAAAGCAAGTAAGCCAACGTTGTTGTCATAAGCTATGAAAATAAACTACATTTACCACAGA:1 - chr3L 10442788 3' + roo 407 1 80.53 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTTACATGAATTTCAAGCAAGCGTGTGCTATGTACTATAAACATTTTGCTTCTATAATTGGAGTATGGAAAATGTTTAACGTTTCGTCGTATTT:1 - chrX 3578055 3' + hobo 2917 1 64.75 TGTAAATTCGTTTCTTGGATCAGAATTGATTTCGCCCCGAAAATCGTCTTCTAACAAAACTACGCACATATACACGCTATAACATTTCTGATACGACGATATTTTTTGTCACGAGTTAGGGCAATCACTTATCGAGACG:1 + chr3R 1440173 3' + 1360 3161 1 54.68 ATCAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACCTA:1 - chr3L 12688015 3' + R2-element 3583 1 84.85 CAGCACATTGGGGGCTCGAGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGCCGCAGCGGTTTCATTTAAAGTGTTCATTCGATGCTCTGCCCCCATTCCTCGCGAGCGGTGAACGTGGC:1 + chrX 2144058 3' - X-element 376 1 64.96 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAACTTGATCAATAA:1 - chr3R 30850762 3' - I-element 57 1 59.40 AAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCAATCCAACCAAGTATTAGACCCTAATTAACACATTAAAAATAAAAACTATGTTAGTCACGTTGAATTTTGTTACTATTTTTACCAAGAAACATTAACATTTAGATTTGTAAGTTTTGGTACG:1 + chr3R 4217893 3' + HB 1309 1 71.92 CATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCGGCTCCTGGCGACGCACAAAAGTATGCAGCA:1 + chrX 7031659 3' + hopper2 1521 2 73.97 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTATAATCACAAATATATTAAATAAACCTCACGGACTGTGGCCTGTGTTGCAGCTGCGTCCGTGTCCATGTGGCATAGT:1 + chr2R 9455945 3' - 412 42 2 56.85 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCGCTGGCAGTCGCCGCAGCCATCGAA:1 - chr2R 24021508 3' - pogo 16 1 74.66 CCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCCATAAATATGATGATAATTAAGTGTGTGTCTGGCACATATAC:1 + chrX 20874367 3' - F-element 375 1 62.61 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACTTGATATTTCGAAATAAGGAACATAGTAAGAAAAGTCGTTCATTATTAAGCCATAAGTGTTCTTCTTCTTTAAATTCAAAAAACAA:1 + chr2L 5448006 3' - roo 8699 2 61.64 GTACACATACAAACCCACTTAATTAATTAAACTACAAATTAATTAATTCAGACATTCTGACAGGGTTATTGCCTTCATTCTCTGTAGCTTGTATCTATTTGTGAAAGAAACAATAAGTAACGTGTATAAATAGAAAATTACTATTT:1 - chrX 21120835 3' + baggins 5425 1 78.08 ACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATTTCAATCAAATCCGATCGAAAACAAGGCACAAAACATCGCCCCACTCAGAAGAAGAAGATCTTTGGCATTTGTTCGTTGCATAATTAG:1 - chr3R 29518478 3' + I-element 4891 1 70.23 TTTTTCTTTTTTTTTTATAAAGGTTTGAATGCTTAAGAGTTTTAAATCAACAGCTCTATAGGGGGATTATAACTCCAGGGGAATAATCTCTGTCAAGGTTTATCCAAAAGAAGTTTATAAGTCG:1 + chrX 19332837 3' - HMS-Beagle2 479 1 42.74 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATTTTTGAAGGCCTGGACCAACCTCTCTGCTGCGGTTATAACCTCTCTTAAGGAACGCGAAGGCTGAAACGGGAATATAAAATAATCAAGCACACTTTAAGCTC:1 - chr3L 22709286 3' - 412 7070 2 72.03 GTTTACGTTTCACTATTATTTCACTGATAGTCACTCCCTACACTATTTACGATATGTGCCAGTATTAGTAACTAACTTCACTTGTTCCACATTTTCAGCTGCGTATTGGTAGACACGAATCATAAATCCGTTTTTATTAAATGTTA:3 - chr2R 5614770 3' - X-element 144 1 52.74 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTTAAATTGTGTAATTGAATTTTCAAGATTGGTTTTCACACATTCGTGGTAAACTATTGAAGCAAAATTGCAAGGAAGATTTTAGTTGA:1 + chr3L 14041006 3' - 1360 36 1 60.96 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCAAGCATATCCCCAAAGTAAAGGAAAC:1 + chrX 20465894 3' - jockey 4802 1 53.42 ACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATCATCTAATACACGGGCTGTCAGGCCAGGTGAGTGACAAATT:1 + chr3R 18697958 3' + 297 6899 2 76.03 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGCCGTAGTTGTCCATTGCACACACTTGATTCCTCCAAATTACATCCCAAGTCCCGGTGGCTACCCAACAAATAAAAGAGAAATAAGAAACGTCTTCTCTGCAAGATTCAAGTGAT:1 + chrX 5399169 3' - opus 7115 2 79.58 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCGTTTCTATGTTCCTTCGTGGAATTTCACAATAATCTTTTCCATCAAT:1 - chrX 4823542 3' - pogo 71 1 66.44 AAAATTTAGAAAAAAGAAAAAATAAAGGAAACGATTATAATAAATGAACATTCACGGCAAAGACTTTAATTTGAAACAGAAGTTTGAAACACAAAATGTTGTTGTTTAGTAGTTGAGCTGGGCTTAAAATGCTTATACAATTTT:1 + chr3L 2890574 3' + TART-C 11096 2 45.14 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATAC:1 + chr3L 22883999 3' + roo 8998 2 76.92 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCACGTCGATCAGGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGAGACCGGGGCTATTCTAGAAACCTAACGCGAGTACAGAACGC:1 - chr3L 14551282 3' + P-element 2857 1 59.23 ATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGAGTGGAAAATATGACAACACATATGCACTGCTGACAGTCATTTTAATGGAATATGCGGCGAAGCACCGCTAGCGTTAACTAATCCA:1 - chr3R 27782596 3' - G2 3012 1 58.22 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAAACGACGATGCCAATTCGTGACGCCAGTGACTTCGGCTTTCGGCCG:1 + chr2L 13717386 3' - P-element 26 1 54.08 CTGAAGTATCTGATGTTCTGGCGCAACCCTCGGAAGTAAACAAATACGAGCACCTGAATGAGATTATTATCAAGCGATTTACGGAATCGCCTCAAGTGGATTCCGCCCTTTTTCATTATCCTCGCCACGCTCCTCG:1 + chr3L 1384817 3' + Chimpo 484 1 66.91 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGGACCGTTTTGTTTTGCTCGTTTCACCGCCATTTTACAACTTTAGCTAATTTTAAGAATTTTAGAAATCTTGTA:1 + chr3R 5316667 3' + Juan 4189 1 65.07 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCTCTCTCACTCTCTTCGAAATTCTTATTTGTCCACATTCACATTTTCGCGTTCCCGTTTGTTGGGTGAGCTCAGTATTTAAATACTC:1 - chrX 10806838 3' + P-element 2856 1 64.38 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCGGACTTTACATATTAGAAAATATGTCTTTTCCCATCTATTCAAATGGTATTTATATTTCGCTTGCAGTTTAAGACATGTATCTGTAGAAA:2 + chr3L 4933849 3' - blood 7043 2 58.90 CCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTT:1 - chr3L 23456273 3' + Gypsy6A_LTR 254 1 70.34 GCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCATTTTAAATACTCTAAAAACTA:1 - chr2R 13212198 3' - diver 5941 2 50.68 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGACAAACTATTAGCGCTCAAATTTATGGCAACTGCAAGACGGAACCAAGA:1 + chr3R 26633274 3' - 1360 65 1 68.57 TTTAAAAATAATTTATTTCATTTACATTTAAAATAAAATAAATTTATATTTGATAATTTTAAAGGATTATCTATGGAATATTTATAACACTTCTTTAGATACCTATATTGTACCCATTATATTTAGACATTTTGCGAACGAAGTAT:1 + chr2L 5080707 3' + FB 696 2 43.84 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTATTAAATATATACTTTTAGTTACTGCATTTTTGGCTCATTAGAGGTTCTTAAAATATAACTATCATGATATTAGGAGTGCCTAATAAAAATA:1 + chr3L 18164270 3' + pogo 2078 1 68.49 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTGGCCGCCCCGTTGGATATATGTAG:1 + chr3L 20399103 3' + roo 389 2 67.46 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATAAAAATTAAAAATTAAAAAAACGAAATCAAATTCACCGAACTATGAGTTATTTGAAATGGTTAAAATGGTTAGTTAAA:1 - chr2R 11097290 3' + Juan 4164 1 51.37 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTGCGCATTTTATTTTCCACTTTGCTTGTATTTATTTAAATTTGAGCCCGGCTATATGTATGGGCAGGGGGATATAGCCAGACGACAGGCATGGACCT:1 + chr2L 16385377 3' - I-element 23 1 66.44 ATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTATGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGCCACTTTTTCATCATTTTGCACAGGGATAATTGCATTTAATTTTGAATACGAATCGATTGAACGAGCGAGCGAATCAAGGAAGCCAATCATAATT:1 - chr2L 17030195 3' - Tc1 1626 1 54.79 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTCGGGCTGCCATTGTCCG:1 - chr3L 5179137 3' + P-element 2828 1 43.84 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTCGATCGGTCTCCATTGCCCCGAATGTAAGACCTCCAACGGATGTCCCTCCTCCTCGAAGGAATTTAAGAATCCGACCCGAGGAATATACGACACCCAA:1 + chr2L 8396978 3' - roo 8669 2 78.29 GATATTGCGCATCCACTCAAAACGTAACCAAAATCCAGCCACGAAGCAGGCACATAGCCAGGTAGTACAGAAGAGTTGTTTTTCCATATTTCCATACA:1 + chr3L 13281443 3' + Tom1 99 1 68.37 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACGTACAGCACGCTGTGGACAAGAAATATGTT:1 - chr3L 13545007 3' + hobo 2895 1 69.70 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGCCGCCTGGACGAAGACCATGAAGATG:1 + chrX 2916727 3' - 412 65 2 76.07 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGCTTACACAAGATTTTGCTTCTTGAAATTC:2 + chr2L 3648786 3' - roo 91 2 80.82 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTTTCTAGCTTATTTGATTATGGCAAATATTTGGGTTTCTTTTTTTTATTTTTTTTTGTTTAGTCGCCTTTTCTGCACCATGCATAAATTATG:1 + chr3L 10442943 3' - roo 30 2 58.90 ATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCACTAAGTTCCCATACTGCCAACCTGGTACTGCGTTAAACCATCGAAGGGAAGGCAGCTCTGCGTGTCTGGATGATCCGAGAAGTTCGCGCAGTCTGGCAGCTTGGGCAGCGAATTGTGCG:1 - chrX 21340736 3' - Burdock 6050 1 77.24 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGTGAGAGGG:1 - chrX 16526293 3' + P-element 2834 1 31.19 AATTAAAAAAATTAATTAAATTAAAAAATTAACTGATACATTTGGAATCTGACTTCTTTCTCCAAGTGTACAACAGGCATTGCAGAGCAATTGCCCGTTGGCCATATTTTTCGGATCCAAAAATTGTGCTCAAATTGAAATCGGAA:2 + chr2L 16388877 3' + HB 321 1 78.77 CTTTATTTACATTCTTGAGCAAATTTACAACTTTTAGGCTGTTCATAAGTACAAGATTGCAAAAGCAAAACTGAAATATTCTTTGCCTAATATTATTCATTATCTACATATTGCAAATCATAAGTGGGTGAAGACCAAAGCCATT:1 + chr2L 7041493 3' + HB 170 1 69.66 ACTTTATAAAACTTACTTAAAATTGAATTATTATATTAATTAAATTGTCTACAGTAGCGTTTCATTTAGAAATCTTCGTTGAATGAAACTACATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAA:1 - chrX 20361963 3' - pogo 1889 1 53.42 TTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTATGCACTTCAATTACAAGGCAGGGAGGGGGAGGGAGATTTTGAAAAATG:1 - chr2R 8816130 3' + jockey 4570 1 67.12 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTCTTATTAGCAGTATTTGTTTATTGTTATTATTGTTTTGTTTTATTTGTTATTGTTATTAGCAGTATTTGTTTTATGATACAACATTATTGAAGATTTGTGGCCAAATATAGTAG:1 + chr2R 17187847 3' - roo 8670 2 40.41 TTTTCGTTTTTTTTTTAATCTTGCAACGGCCAAAGTTTGTAACCCGGCACTTGACGGGTGGTGTGTGTGAGTATATATATGTGTGTGTGCGTGCGTGCGTTTGGGACCCAAATATTGTTAATCCCATTGATTTGTGTTAATGATTG:1 - chr2R 10946314 3' + Circe 75 1 43.84 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGAAGTACCTTAAGAAAAGTAGGCACAAGTAAATATCACTTTCAATAAAAACCAAT:1 - chr3L 20083773 3' + opus 441 2 62.33 AGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGAGTGAATCCCAATCGAATAGTACCCTCCCCTCTGAGCCAATCCTCCCTGCCCAGCTTACATTCCAAATCGAATAATATGCTCAACACTTTATGGATCTGATCTCAGCTCGTTC:1 + chr3R 27188683 3' + roo 9069 1 82.14 GCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAACA:1 - chr3L 20176767 3' - gypsy 7031 2 67.31 TAGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATATTTAACAGTCGGTTATATGTACATATGCATATATTTATAAAAAAT:1 + chr2R 21473681 3' + pogo 2031 1 67.12 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACA:1 - chr2R 24021539 3' - pogo 46 1 53.79 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAGAACGTGAGCGAAAAGAGAGCAT:1 - chrX 7967208 3' - P-element 30 1 51.92 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTACCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAAGCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTCCGGAGACAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCATTTT:1 + chr2R 5296381 3' + INE-1 92 1 80.14 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGAACGAAATCGGAGGTCGAGTGACTGGCAACGCGATAAATCTCATGGGTTGCTGGCTG:1 - chr2L 18944780 3' + P-element 2864 1 67.65 GACGTTCATGCGGGCAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACATACTTTTCAACAAATCTTT:1 + chr3L 25482718 3' - INE-1 126 1 77.78 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTATCCTAGATACTAATGATACTAACATCAAAGTTTCAAATTAGCCATTTTTGGACTTACACGATCAGGACGA:1 - chr2R 5268948 3' - pogo 46 1 53.79 AAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGA:1 + chr3L 19574132 3' + 297 316 2 74.66 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGG:1 + chr2L 18213235 3' - roo 42 2 56.85 ATGTATGTATATGGAAATGTATATACATATACATATACATTTCCATATACATACATATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGAAAATATTTA:1 + chrY 2720369 3' - ZAM 187 3 71.05 AGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATATATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTGCTATTTATTTGTATTACTTTGCTGGTGAAACTC:1 + chrX 10128307 3' + invader3 241 2 55.48 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATTAGGGTATCTTCTCACCAAGTCGACCAAGCT:1 - chr2L 5447856 3' + roo 9034 1 56.85 ATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCGTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACTGTCTGTGCAGAGTAGTGTATAGTTGTTGTTCTTAAGTTGATTCT:1 - chr3L 22907539 3' - Rt1b 4964 1 70.50 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGCCATGAACCCATGTATCACTTGTGTTGCTATCTCTCTCCATTTCCTCC:1 - chr2L 18213084 3' + roo 9043 1 64.14 CTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTCATGATACATGCCA:1 + chrX 1018177 3' - 1360 218 1 67.13 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTC:1 - chr3L 5179153 3' + P-element 2812 1 32.88 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATAT:1 - chr2L 5447895 3' + roo 8996 2 74.48 ATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAATAATACGAGGCTCAACAAATCCTTCATCTCAATCCCAGTGTTGCGCTAAAAAG:1 + chr3R 30622071 3' + BS 5033 1 60.74 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAAGCTTGGATTTGCTTGGCTTGCTCCATACAAACAGGAAATGGCCAATGCCTTTGAGCTTGCAAAGCAGA:1 - chr3R 20074540 3' - roo 8716 2 52.74 CAATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTATAGAACCCATATTTTACGTTGTAAGCCGTTGGAAATCATTCGCTTAATTCAATTTTAA:1 + chr3R 20898433 3' + G2 2805 1 63.01 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGC:1 - chrX 2518064 3' + P-element 2783 1 14.38 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCG:1 - chr2R 24021532 3' - pogo 40 1 58.22 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTG:1 + chr3L 13228559 3' - P-element 60 1 43.75 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCCTGTCTGTCCATATGAACGTCTCGCCCTTAGGAACTATCAAAGCTAGATTATTGAAATTAGGCATATATAAAAATATCTCTTTAGTAATCTAATGCTTATCTAATCAGAATATAT:1 - chr2L 9123294 3' + INE-1 92 1 63.01 AATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTCATAAATAAGTAAATAAATTATTTAGCCTCCTATTCCG:1 + chr3L 21773222 3' - X-element 4706 1 73.97 ATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCGAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAACAGCAGAGCACCGTACCGCACCGATGGAGCAGAGCCCCAAATACAAATG:1 - chr2L 5684001 3' - invader2 4714 1 65.07 GAAGCAGATTGATGAGCGGGTCCGCAAGGATGTCGCCCCTGCTCCGGTATCCGTGTACACGAGGTGACCGAGTTGAAGAGCTGTGAAGCCGTCATCCGCACACCATCGTATAGGTACTACTACCTTAAGCAATGCA:1 + chr3L 6712607 3' + R1-2 44 1 79.41 ACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAAAAAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGATTACACACTTTTGATAGCATGTTGATGAGAGCATTATTGAATATCACCTGATTCGCCGCTACA:1 + chr2L 10058176 3' + S-element 117 2 63.19 CATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAACATCGAAGTGATGTGCCTGGAATTTGCCATTAATTAGTCTGCAGGTGTCGTTGGCCAA:1 - chr3L 20176711 3' - gypsy 7017 2 61.64 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAACATAGGAACTATTTTTAGTTTCGCACTAATAACGTTTCTGCAATTTTATTTAAGCGTAACATAGTCAAATCTATATTAGTGTTTATTTTAATCGTACATTCCA:1 - chr2R 969102 3' + flea 5000 2 76.71 GAGCATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAATATAATCATTTGAAATATAAACCATTTATTTTCGCTTTCAAGACATTAAAGCAGCCCTATGAAATTGAAATTTATCCCCCATCACCTATTT:1 + chr3R 22277263 3' - 1360 3278 1 61.64 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAATACTCAAATGTCATCTCCTTAGCTTCAACGTTGTTCAGGTTTCTTTTTGAAAGGGTAACCTTCAGA:1 - chr3L 24253559 3' - 297 6604 2 67.15 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATTATTTTTACAGTTGCATTCCCAGCTCGATTCTCGAGTGCC:1 + chr3R 21587652 3' + roo 399 1 75.18 GGCGTCTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGT:1 - chr2R 982349 3' + rooA 7472 2 40.41 CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGTGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCT:1 + chrX 16217506 3' - P-element 77 1 29.37 AATGGAGCACTAACAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGGTAGCGTTGTAGAATCTCAATATATGAGTTGCTGGCACGTAATTAACACAGAAATCAAGCTCGCTGGCTTTGACTGACTCTACGCGCTGCTCTGCAGGTGG:1 + chrX 18412944 3' - G4 3511 1 53.96 TGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGTATGGTGGATTATAATTACGCCAAACGTTTCTTTCAATTCGGAATCGTTAGCCATCTTCGTCAACCATTTCACG:1 + chr2R 16487653 3' - hopper 412 1 63.72 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTGCCTCTCTCTCCTTCGTAACCAACGGTAAAGAGCGAGAGCGACCTGCTCAGCTGCCGCATTCGGAAAACG:1 + chr3R 5264934 3' - P-element 10 2 70.75 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGGTATAAGTTTATGGGTTTCTTCCCGTCTTTCCTGATTCGATTGCAGTTTCATTATG:1 + chr3L 12861861 3' - pogo 10 1 71.72 GAGCAAAACAAAGTAGGAAAACAAAATGTGTAAGGAGTTTCTTGCCACTCTCAAATTCATCAGCTGGAGTAATCGAAGTGACCCACCAAGCAAATCGAACAACACAAATCGATCGAACGTGTAAAAGGACTTTCGGTTTCATTAAG:1 - chr3L 5845211 3' - S-element 240 1 60.96 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAATTATTTCTACCATTATGTGGGGGGTGGCTATTGTATCTGCCGCTGGATAAGCATTCCAT:1 - chrX 19820141 3' + Juan 4172 1 46.51 AGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATGTTTTGTATTTACAAGGGAGATAAGCCTCTGCATACTCTTTATGTTGATCATCTCGGACCAATGGATCATACTTTTAAACATAAGATAAACCGATACATCTTTGCAGCC:1 + chr2R 3287814 3' + Idefix 172 2 75.34 GCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAAAATTTTCAAGGCAGTGCGGACTTTGCCACTTTAAACTTTAAATATTTATGATCAT:1 + chr2L 12832928 3' + I-element 5291 1 64.38 CGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGATACTTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCAAAATAAAATTAAAGCGGTGGAATATGAAACGTGAGGAAGTTGCTTATGTATTTATATTTTCCTTATTTAAAAAAAGTT:1 - chr3L 3461194 3' - Cr1a 112 1 52.05 ACCGAAGATATTTCCAAATAAATTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCAGCATTTCCTTTGTGGGAACTGGTTTTGCTCAAATTGCGAAATGCTTAGCTAGCATCTAAGTTCTAT:1 - chr3R 10361842 3' + roo 9017 2 54.79 AATCGTATAGCGTTACGCATCTTGTCTTTGGCACTACCTTGACTCAGCTTTTTAGGTCGTTCATACGGACAGAAAAACGGACATAATAGTCATGGTTAAAATCCTATGTACTACATAAGGTCAGAAGAGTTTCCTTCCACCACAGT:1 - chrX 6757116 3' - 1360 20 1 70.55 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCACGTCGATCAGGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGAGACCGGGGCTATTCTAGAAACCTAACGCGAGTTCAGAACGCTGAAT:1 - chr3L 14551277 3' + P-element 2846 1 57.53 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTATGCGTGTGCATATGTGTGGGTGTCTGTGGACTTAGACAATGAACCCAAGTGCAATAATTAAT:1 + chrX 5145943 3' - hobo 56 1 56.85 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAAGCACGCTTTTCCCTAATTGTTTTTCATGATGTTTTCAATCTTTTAAATAACTCAAACGATAACAATACCTTTGAGATA:1 + chr3L 20083901 3' - opus 150 4 60.27 AAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATTTCCGCAGGGCTTTTATAGTGCTTGAAATCATCTTGCTGCATTTCATGTTCAATTTGATCACGCTTAATACAGCATTCAATAAGTCTTGTATGACAG:1 + chr3L 23149026 3' - hopper 1163 1 67.81 CCAAGGTGATCTTTCTTTACACAGTTGATCTATGTCTAAAGGTTGCTACAATGAAACCTAGATTACATAAAATACCGCATTTTTGTATTAGTTTTGATTATATACCAACCCACGCCTACGACCGACCACATGGCTTTGTCTTCTCG:1 - chr3L 14282472 3' + I-element 5021 1 76.03 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAATCCAAAATCGAATAAAGCACTCCCGACAATCATCGGCATGGCACTGCCACGCCCTTTTCGTCCCATTTCCTTTT:1 - chrX 14362322 3' + mdg1 394 2 53.62 AACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1666 1 62.04 GGGATCCCTGCGGCCTATAAAAGGACGGCGCAAGCGCAGCTCGAGGCGGCCAGTCACAACACGCGAGAAGCCATACGTATGTACTTGAGATTAGTCCAGGAGAGTACGGGCGC:1 + chrX 3940334 3' + gypsy8 329 1 68.14 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGCACACAGTCATGATTTAATAGGTAAATCAGGTTGATGAGCGTTGAACACAGTGGCT:1 - chr3R 30302266 3' - Doc 38 1 51.30 GTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCTTATGAAATGCAAATTACATTTCAATAGCGCGATTTAATGGTACCCAGCTACTT:1 - chr3L 18199894 3' - Doc 13 1 76.03 GGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTG:1 + chrX 10128274 3' + invader3 208 2 64.38 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCGTGGTCTTGCTCTCCCGCTC:1 + chr3L 13228583 3' - P-element 37 1 57.93 CGGCAATAGGCCGCTGCAATCGTACTTATCTGTAGTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGCCTACCTATCATGTCTAAATATCCACGGGTTCTGGGAACCAGTCTATTTAAAACATTTCGACTATGACTATTATCGCCAAGTTTGGTGG:1 - chr3L 13437291 3' - rooA 112 2 52.05 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCCTATACGTATGTATGAGTGTGTATGTGTTTTTGTGCCTGTGTGCGCGTTTGGGCCTTTTGTGCACAATCTTACTGACTT:1 - chr3R 16530538 3' - hopper 39 1 58.90 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATTGTCAAATTCCAGGCACAATATTACATGAAATCTACAAATAAATAAATAAGTTACTCGAATACCCTAATAACTTAAATACAAACCAATGGCGCTAAGCATT:1 + chr2R 14722807 3' - mdg1 7056 2 72.92 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTCATGCGTGCTGGAAAAACAGCGCCAAAAAATTGCCAACGAACCAAAAGGGGGCTTCAATGTACATGCATATATATTATATATAGATA:1 + chr3L 893467 3' + Tirant 369 2 63.45 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATGGGTCAGCACTGTTGCAGGCAAAT:1 + chr2R 22464507 3' - pogo 19 1 71.23 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGCTTTATTTAATCTTAAGCTTCCTCGTTTAGTAACTAAATATTTTATACATATGTATATATGTGTA:1 - chr3R 12609987 3' + roo 9016 2 56.16 TAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCA:1 + chr2R 16496652 3' + hopper2 1531 1 68.49 AGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACATATACACCAAGAGAAA:1 + chr3L 5274997 3' - I-element 56 1 62.79 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGGAGGCCATGCCCTTTTTTGGGGCGGGCTGTAACCGTTAGTCCGGCCGACTAGAGCGGCTACC:1 - chr2L 18627679 3' + 1360 3386 2 73.03 CAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATT:1 - chr3R 19589889 3' - BS 5032 1 56.85 TATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATGTACATGAATGACGTCAATAAGTTTTCTAATCGCGCAAAAATGTTGGTTAATTATTCGTTGTCGATTTGTAAGTTTCCTA:1 - 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chr3L 21151114 3' - 412 7142 2 78.08 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTACCAGAAAATTGAACGACAAGCTATAAAGCCGGAACTTTACGTTGG:1 - chr3L 381718 3' - S-element 74 1 68.49 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCACATGCATGCAGATACATTCACTTAATGCA:1 + chr2R 15151106 3' - hopper 75 1 71.43 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTAAGAGTTAAATCGTCGTCGTCGTCGTGATCCGGCATTCAATGGATAAT:1 + chrX 18737298 3' - I-element 71 1 66.44 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATAAATTATGGCCGCAAAGAGCGAGAAGAAGAAGACTAGAGGCAGCACACTGTCCATTATTGTTGCCCATTGAAAGCGTAATGGGAAATACGCATAAA:1 - chr3R 16228784 3' - P-element 22 1 66.44 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCGTGGTCTTGCTCTCCCGCTCTCGTGTTCTGTT:1 + chr3L 13228595 3' - P-element 26 1 67.81 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATT:1 - chr3R 10461678 3' + roo 8985 2 78.08 AAACATGCCAAATGCCCCATAGTGGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGAT:1 - chr3L 23146512 3' + hopper 1412 2 66.67 GATAGGGAGTAGAAAGTATATTTGTATAATTAAAGATAAGAGAAGTAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTTGTGTCATATATCATTTGGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTG:1 + chr2R 3341945 3' + invader2 4715 1 50.68 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGTTATAGTATGAATGGTTTTTTGTTTAGTAGGGATATGATGCGATGCCTGAGCCGCGGCGGCGG:1 - chr2R 19223893 3' - Doc 42 1 50.40 GTCTGCATGGCGCATGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAATTATTTCCCCGTTAAATGCTTGAATATAAAATGACTGCCTCTCATTCTCTGTCTT:1 + chrX 22383377 3' - invader1 3650 2 45.52 TTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATAT:1 + chr3L 23702282 3' - G4 36 1 56.85 GACAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCAAAACACTTTACTTAACAAGGTATCATTTATTTACCGAACTCCTTACAAGAATATTATCTACTT:1 - chr3R 29516478 3' - I-element 60 1 54.11 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACGTCATCTTCATCATTAAATTCGAATTTTGAATTACTTTTTAAAATATAATTTGTCCTCTCTAGTTAGTTTTAGCC:1 + chr2R 9869005 3' - roo 8709 2 55.48 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTTCTATATCTATATCTATTCATAAATGCCAGACCACAGACTGCCACCGCTGTAGCCATCAAT:1 - chr3R 28579476 3' + pogo 2047 1 57.53 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATAGTAATTATATTTCCCTATTATGGTTAAATTTGTATATTTTCTCCGAGTGAAGCCGAGATTAGTATGTTTTCACCATAAACA:1 - chrX 9959754 3' - I-element 38 1 56.85 GTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTCTCAAAACTGGGATGTGACGCCACTTTTTTAAATAAGCATAAAGAGCGACGCAGCCTTCA:1 + chr2L 10519622 3' - X-element 67 1 58.62 TGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACAATACACA:1 + chr3R 29091417 3' - rover 32 2 64.38 TATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTTCGGCTCGACCATTCCCTT:1 - chr2R 1320634 3' + diver2 4892 2 74.81 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCTGTCAAAAGCTCTTTCGTTTTATTAGATTTTCCCAGCCGGTGGC:1 - chrX 17027875 3' - roo 8740 2 68.49 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTAAGGAATGGTGGATGGAAGTGATGGAGCACTCGAAG:1 - chrX 14346434 3' - roo 8731 2 73.08 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAGCATGAGTCCGCGCAATAATCACAGCCAAGTGCTGCATATTTATAGGCGCAATCAACTTTATTGCGCTGGC:1 + chrX 850176 3' - jockey 36 1 64.38 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTTTTTTAAAGCTTTCCAGCTG:1 + chrX 7967289 3' + P-element 2839 1 45.31 GTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGCCAGTTTTAAGGTGCGAAGACGTCCC:1 - chr2L 11613248 3' + hobo 2880 1 76.15 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGAATTACCGCGATAGGATCTGCATTTTAGGGTAAATTAACTTTGAAATGCGATTTAAATAGGGT:1 - chr3L 16463443 3' - roo 13 2 74.66 AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCTAGAATGCTAACCATGCACAAGGCATCTCAAATTCCAGGTGTTAAAAATAAAGTACAAATACACTAAATATTTCGGCACGAATA:1 + chr3L 3757263 3' + copia 253 1 58.90 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATTGCTCTTTTCAAGTATCTATCGTATATCAAATGAATTGCATTTGCATCTCCGCCCTTCTGCATTCGAGTC:1 + chr3R 30850854 3' + I-element 5307 1 50.00 GGTTCCTACCGTGCCCTCCTCCCCTCCTTCCCTACTCCGGGACAACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCGAAAAGAGTGAATCCGAAATC:1 + chrX 18884672 3' + G-element 276 1 78.65 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACCAAAAGTTTTGCGTTATCTGTGACATTCGCTTTG:1 - chr3L 17904799 3' - roo 8750 2 80.14 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGTGTATTTGTGACGTGCATGTCAAGTGGCCAACACACACATGCACACGAGACGAAAAAAGGACCCTGACCAATTAGCACAGGAAGCTGTCAGTTATGGCCAACTCTC:1 + chr3R 15169022 3' - jockey 22 1 71.92 GCATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGACACCCCGACTCCAGCATCGAGATGACGATACCTTCCCGAAAAGCCGAGGACGCGCCGGGCAGATATTATGCAATGACAAGCGACGACGCG:1 + chr3R 14064489 3' + gypsy4 6468 1 68.07 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGT:1 + chr2L 18213236 3' - roo 39 2 58.33 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCGTGCGAATGGCAAAACGCATGGGCTGGAAAACTATTGATAGGTTTGC:1 + chrX 18353568 3' - jockey 94 1 75.34 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTCATATATAAATTAGATTCCCTCGCTCAACGACGCGAAAATTGCTGTGTGTACGACTCTATCAAATATGCAAAAGAAAACGCGAGTGCATAAATAATTGCCATCTTTATA:2 - chr3R 23668373 3' + pogo 2090 1 78.08 GCCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAATAAAAGTTGCAATAAATTGTAGCATACTTGTGAGCGGACG:1 - chr3L 15853512 3' + jockey 4915 1 73.29 AGAGCTTTATTTATTTATGATTTATTGGACTTCCTTCGTTGTTTTATTGCTAATTGCCTTTTGTGATTTGTTTACACTTTTCTCTTCGTTTTATTAATTTTCAGCTGTCGCGACTGCGCTGCAGGTAAAAATAAGCGACGCGCG:1 + chr3L 16711444 3' - G3 345 1 54.86 AATATAAAATGTACGTTACAATTGGAAATTAAAAAGGAATACACGACATATATATATTATTATTATTATATTAAATTATAATATAATATTATAAAAATATATATTTTATAATAATTGTAAGTGTTAGAACTATGTGGCGTGCCTCA:1 + chr3L 23392868 3' - invader5 3713 2 67.12 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGCCATGAACCCATGTATC:1 - chr2L 18213115 3' + roo 9011 2 58.90 ATTCCTAGGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATTTTAAACAATTTAACAAATGTTTCACTTTTATTTCTTCAACTGCAAATTGGCATTGGCTAAAGGTGCGATACAATCACCGATTGA:1 + chr2R 6987460 3' - HB 1573 1 66.44 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATATTTAACAGTCGGTTATTTGTACATATGCATATATTTATAAAAAATCCTACATAA:1 + chr2R 21473690 3' + pogo 2069 1 52.99 GTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATATACTTATATATTTTCTTCCCCGTGCTGTTTTCACTTGAGCGCAGCGAGGCATTTATCATTTTTAATCGAATGCGGAAACAATGGAGCGCGTCTAAG:1 + chr3R 26432116 3' - Quasimodo 15 2 75.86 AAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAG:1 + chr3R 29091371 3' - rover 78 2 71.92 ATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGCTAGTGGTCCCGTTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTTCACTAAGTGCTGACATCACAGTCGAGGTATTATGTATTGACGGTTTAATTTATCAGAAACTAAACTACTATTATGCAT:1 - chr2L 754132 3' + mariner2 42 1 53.42 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGATATAGATATGGAATATAGCCGGGCCGCCTTGTCTAGAGAGCTCAACAAACTCTGGAGC:1 + chr3R 28579591 3' - pogo 56 1 57.24 AAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATAAATTCCCAGCCATATTGCTGCGTACACTTACGTCGTTATTTGCACAATTCTTTTGTACGCTCTCAAATTGATATTAATTAATGAAATTAATT:1 - chr3L 19335298 3' - invader4 25 2 69.18 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAATCAAAAAGTGAAAATGTGTCCG:1 - chrX 10286986 3' + roo 9019 2 61.19 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAATTCTTTAGTTGTCAACTAGTAATCAACACATTTAAATGCACTAATTGCACAAAAATTATTTACTGGCAACTGTCCATTAATCTGAAGTGTAACTGCTCAGGATT:1 + chr3R 5453764 3' + I-element 5337 1 72.60 CCGAGGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTGAACTGAGCACTGAATTCCGA:1 + chr3R 18518021 3' + roo 354 2 61.29 AGCCAAGGTATGTTGTTTTTAACGTATGTAGCTAATATGTGTGTAGTTGTACTGTTTATGTGTTGTGATGAAAATGGTACATACATACATCCAGATGGTCGAAACAATGCATTTATTAAGGTACTTTTCAAAGTGCAATGTTAATA:1 - chr2L 23010953 3' + transib2 283 1 50.00 ATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGG:1 + chr3L 18767830 3' - roo 8644 1 70.77 CCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACCTTGAAAAAGTTTATAGAAGAGGGAAGGTAGCAAAAACTTTGATCG:1 - chr3R 1852013 3' + I-element 335 1 65.41 GTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTATGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTAC:1 - chr3R 19450199 3' - roo 8800 2 49.32 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCT:1 + chr2R 11562900 3' + pogo 2088 1 57.50 TAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGCGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGTCAGTAAATCCCATCCACTCGTACTTTTTATGTAGTTCACCAATTTTTTGTGGGTGAAAAGAATTGACAGCTTGAC:1 + chr3L 18271357 3' + Porto1 4229 1 56.16 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTC:1 + chr3L 9907373 3' - BS 5021 1 58.40 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCCACATCATGTCGGCGGCCAA:1 - chr2L 19643557 3' + hobo 2908 1 77.33 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCA:1 + chr2R 16496678 3' + hopper2 1558 1 50.34 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTAGGCGTATTGTTTGAAACAGAAGATTACCCATTGTTCGAGATCGGC:1 + chr3R 25718265 3' + I-element 5284 1 66.44 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACC:1 - chr3R 19589938 3' - BS 5081 1 74.66 ACGGTCTTTTGAGCGACCGGCATTCCCTCGTCGAAGGGCAGGAATCCGGATTGGATAACCTTAGGATAACCTCTCGGTGTTTTCCAATGCCATCGAACGGCAGTCACG:1 + chr3R 15118024 3' - GATE 8134 1 62.04 GAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTCATGCGTGCTGGAAAAACAGCGCCAAAAAATTGCCAACGAACCAAAAGGGGGCTTCAATGTACAT:1 - chr3R 6411951 3' + Tirant 346 2 56.16 CAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACAT:2 - chr3R 4160059 3' + invader2 194 2 54.11 TCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGATTCG:1 + chr2L 13510865 3' - diver 60 2 74.42 TCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGTAGTCCAGTTTGTGTTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGGGTGCAAGGCAAATATTTACACTCAATGGAACATAATAAAGACATTAGGGAAATATTGTGTTATGTGGGGGCATAACTCAGGTTCT:1 - chr2R 9934097 3' - Rt1b 4927 1 78.08 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTAAGCTTTACGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGAGTGCTTTCTCTTTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGGGCACATT:1 + chr2L 16492952 3' - jockey 4777 1 70.55 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTGACTGTATGTATGCCTGTGTGAGTGAGTGACAGTGTGTTGGTGCTGCCTTTTTCCT:1 + chr2L 19158949 3' - P-element 14 1 75.00 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTCTCTCACTCGCACACATTCGCCGAGACTTCTCTTTCTCTATGCGGGTATTTAAATTTAATTTGCAAGCTGACAAAAAAGAAAGCAAAG:1 + chr3L 5179290 3' + P-element 2879 2 78.77 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAATCGGGCTTTCAACTGAACGGACGGACTGTGCCCACAGCGAGGGTCGC:1 - chr2L 13717255 3' + P-element 2869 1 69.40 CCGGGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCTGGCACAACAATTTGGACATATATCCGTAACTAATAACAACACAGAGATAAAAGGG:1 + chr2L 11613305 3' - hobo 67 1 60.96 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATAGCGATCAAGAAAAGAAGAGTGAGACTTAAAAGCCACCGCAGCTGTCGGCTGTAATGCATTGCATAGAGTAGA:1 + chr2R 5541120 3' + S-element 1671 1 52.05 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTCATGTTATTTCATCATGGGCCAATAAATTATGGCCGCAAAGAGCGAGAAGAAGAAGAC:1 - chr3R 16228846 3' - P-element 84 1 26.71 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTAGTTTAAAAGCTTCAAATTTTCATCGACATGATTTGACCA:1 + chrX 14346541 3' + roo 9039 1 60.96 ATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATAACGCTAACAAAAGGTTTATTACACTTTCTATTGAAATATACATTTTGAATCCCATTTTCCCCACATTTGGCTCTCTTTTGTTGCCAAAATTGCAAGC:1 + chr2L 3282710 3' + flea 4992 2 71.92 TTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGAACTCGACTGTTGCCAAACAGTTTGCGGTTTCCGTTCAGACAAAAATACTGGGAATTCTGCATAAAAACGCATTCAC:1 + chr3L 4933555 3' + blood 7256 2 59.59 TCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGTTCTCCCGCTGTTATGGCACATTTAGCGATTTTAAAGTAATAAACTCGGCCCATGTCCTGGCCACCAGGCGTGGCCATTAAAACTCGCAAGGAGTCGGG:1 + chr3L 4932964 3' + blood 7185 2 75.19 TTTTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCCATACACACATAGAGAGTATTACGAAAATCATCGAGCGGAAGACTAGAAGGGTAACACTACTGGAAAGTTATCCGCTGACGT:1 - chr2L 6755708 3' + pogo 2059 1 58.90 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATATTTAACAGTCGGTTATATGTACATATGCATATATTTATAAAAAATCCTACATAAACACAATT:1 + chr2R 21473698 3' + pogo 2048 1 56.85 TGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTCTTAATGCGTTTGTCAATGGCCAAAACTTTTCCGTTTTTCGATTTTCTTTACAATTTCC:1 - chrX 18737216 3' + I-element 5293 1 58.90 AATATTAATATATTATAATATAATTTAATATATAATCTGGTGCTGGTGAAATTTACTTATTCTTAAGTTCTTGTTTTTGTTTCAAATAGTTATAGGATACTTGTGCATACTACACGTGATTATAAATGTGTATAGTGTTTAACGTT:1 + chr2L 14297349 3' - Tc3 292 1 62.33 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTGCTTTTCCCACTTTCCCACCGCTTTCCACAAACTTGAGCAACAGCGGCGTGTGTCAAGCCGAAAAGTG:1 + chrX 19113581 3' - 412 52 2 51.37 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCTGACTCTGATCTTCTGTATTTGAACGCATTTATGTACATGCATATATGCCAGTGCCTCCCATATACAAATGCATATGCTTATG:1 - chr3L 20398957 3' - roo 37 2 60.96 ATATATTGTATATACATATATAGATTGTGGATCCGCTTGCAGTGGGTTATCTCAGATAGATACTTCTGAATCAATTAACCTATCAATATATTTTAGGCAGCTAACTGGGCAGCCTTTGTTGCAATCAATCACTGGCAG:1 + chr2L 10470231 3' - Stalker2 7507 2 44.93 AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCATAACCATTACCGCATTTAATATGCATTTTTACGAGCCTTACTTT:1 + chr2L 17727827 3' - jockey 4833 1 62.96 TCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATTCCCAGTGCAGAACTCCAAGGCGGCTCACCAAAGAGGTTCTCCGAAGATGAATCGGTGCTCGTTTGTTTGGAATCCAGTGTCGCGG:1 - chr3R 10636070 3' + blood 7381 2 71.43 AAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCCCTGTGCATATACATATGTACTCGTATGTATGGCATGTAAAA:1 + chr2L 15906084 3' + Tabor 405 2 70.55 CGGAGGTGGTTGTTGGGGGGGGTTAAGGGGGGGCATGGTAACTAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGATTCTAGTGTCTTTGCT:1 - chrY 917822 3' - accord 22 2 41.18 TATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATGCTCACTAAATTGACTGAGGGTCATAATATGCCAATTCATCAAAATAT:1 + chr3R 28659113 3' + Burdock 184 2 68.49 GATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAAAATCGAATATTTTTTTGTGTTTCGTCTTTTTGGAATTTCCCTTCATTATAAAATGCCTCAAATTAAATTTTCGAAAC:1 - chr3R 6645670 3' - R2-element 3381 1 54.79 GTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGCACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTTAATCGCCTTCCTTTTTTCAGGCTGAACGCTCCAAGACCAAGGGCAAGGGATGGTTTAATCTGCCCGCCACAGAGATC:1 - chr3R 7472791 3' - X-element 4346 1 59.59 TAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGCACGATACAGGGAATACTATAAAGGTTTAAAGTTAAACATGCAACACCATTTTTAGCAATTAATTAAAGAAAACAACCT:1 + chr3R 904722 3' + 3S18 6076 2 59.85 ATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCATTTTAAATACTCTAAAAACTAGT:1 - chr2R 13212196 3' - diver 5939 2 49.32 AGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTCATAAATAAGTAAATAAATTATTTAGCCTCCTATTCCGCGTACAAATCCGAACA:1 + chr3L 21773238 3' - X-element 4686 1 61.27 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTGAGTTGCGGCTTCTTTGTT:1 + chrX 10824040 3' - pogo 14 1 62.04 AATATTATTATTATTTTTATTACGCGCGTAGGCAAAACAAAAATCAAGAATTTCGAGCCACCCTCTAAAACTCTTCTAAGTGATTTCAACCCGGAAATG:1 + chr3L 14325253 3' - mdg1 7071 4 66.67 TTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAAATTAAAGATCAGAGACACGTTGAAAAGGGTTTAATTTTGGCTAAAAAGATTGCAGATGGCTGGCGATTACATTTAAGCAGCAATTATTCTAATTGAAAGCAAA:1 - chr3L 17206865 3' + I-element 5338 1 73.29 ATTTTATTTATTTAAAAATTTAATTTAATTATAGTATCAACTTATATTCGGTTGTATATAGAACTTAGTGTATTAGTAAACTTTTTCTTCAACCAACCATTATTGTTTCGTTTTTAAGATATCGTGTGTAGGAAAAATAAAACAAG:1 + chr3L 6119369 3' - G7 1140 1 50.68 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACATATGGCAGTA:1 - chr3R 18517947 3' - roo 73 2 68.49 AACAGATAGTATTTTAAAGAAATATTTCATTATTTGCTCATTAAATAATCCCTATACTCACTACTCACATTTTTTTGTAATACATATTATCTATTCCACGTGAAGCATATTTCATTGCTAAACTAGAGTAATACATATATTAAAAT:1 - chr3L 13301272 3' + Porto1 4659 1 69.86 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGGTTAAGGCTGTTACGTGCCGCTGCATACTGCACGCG:1 - chr3L 22883951 3' - roo 80 2 75.89 GCAGAGCGCTGAACTCAGTTTGGGCGCGTCAGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATAC:1 + chrX 21852448 3' - gtwin 77 2 71.72 GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGTCTGAAACGCAGTCGTTGAACCCCTCGTTG:1 + chr3R 24053712 3' + mdg1 7381 2 75.37 TAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATAAAAATTTTGACAGTACAGGCATCGTTCATTTATCTTTAATAAAATAAAACATTAATTATGCAGCTTTAACGCTCAAAAGCTTATTTACACAAAATCACTGACATGT:1 + chr3L 13166368 3' + I-element 5341 1 71.92 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCGCTGGCAGTCGCCGCAGCCATCGAAAA:1 - chr2R 24021506 3' - pogo 14 1 76.03 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAATCAAAAAGTGAAAATG:1 - chrX 10286992 3' + roo 337 2 68.49 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATCGAATGCAGCTGAGAATTACAAAGCTGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACACAGGCTGTAATAA:1 - chr3R 12622199 3' - 297 6603 2 62.81 CAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAACCGCCAAAAACTGCCACGCCCCCATTTTGAAAAATATGATGATGCATATTTTGACTGCTTCACATTGGTATTTTTTGATTTTATATTAGACAATGGCACACGTTTGTTCGTCGTTAAA:1 + chr3L 26169553 3' - diver2 6 2 43.15 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTCTGGTGAGTATACAGAAGTAACTCTCCTTCTG:1 + chr2R 5640775 3' - 1360 85 1 77.30 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTGCAGTTACAGTTACAGGGAAGTTGCGTTGGCACTGACAGTCGCAGACAACACTCACACACATATAGATGGGCCATGGAGTGCCGCAGGTTCAGTTGGCTGAAAGCCGAG:1 + chr3R 27859641 3' + hopper 1407 2 77.40 AAAAAAAATATTTTTTAAATTTTATTCTAAATTAAGATGAAAAGCTGCGAGTTTTTAAATAGTTTAAACTGTTAAAAACTGTTTAAAATGCTACTATACATTTCATTATTTATATGTCGATATTATTTCTCTCTGTGCAGCCCTAT:1 + chr2R 18695103 3' - Transib5 2727 2 47.95 CAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACTATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGTGGGAAATGCCAATAAAGTTTGGAGAATATAACATTGTTTGCAGTCCAAGACCATTGAG:1 + chrX 979369 3' + 1360 1 2 59.59 ACTTACCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTGGTGGAAATGCGAACGCTAAGTTTTATCATTTTTCTGGGATATCAATAGATATTTGTGAATGAAATAGGAATTAAGGTTTAGTAGTGGTAGTAGTGCAGACATGCTTGAGAA:1 - chr2L 2945915 3' - INE-1 557 1 71.92 TGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGATAATATGCATATTGTAATTCTAGTGTATATGTGTAGATGTAATATTTCTATCGAAAGAGGTGGAAGTAGAAATATTTTATTTTTTATTTTA:1 + chr3R 26900179 3' + baggins 5129 1 36.99 CTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATTAAAAATTGCGTTTCACTTCATTGAATATTCATTATAACTGCCTAAACATGAATAAATTTAGCTTGGCGATAAGGTAATTCTACTAAAACTTCTTTTTAGCTGTAAGCATGTAAATG:1 - chr2R 9455186 3' - 412 7221 2 79.45 CTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACACTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAACAACGAAGGAGTATCTTTTTTAAATGCCTTGGCAGCTATATGAGTAACACTGAGATACATTTCAATATCTGACATTGAAAATTGA:1 + chr2L 10542876 3' - INE-1 17 1 75.17 GTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTATCAATCTCTTTGCCTTCAACAACAGCCAATTCTGCCCGATTAACAACAATT:1 + chr3L 896789 3' - F-element 4238 1 65.75 ACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATGATTTTCTCACAGTGCAGACTATGCACACTTCACTTCACTTTA:1 - chr3R 24976155 3' + roo 9061 1 74.66 AAACAAATAGATGTAAATAAAAGTTGGTGCTGTCAAGCTCTAAGTACTTTGAACCACCACCACCAAGATGAAACACACACCACCCACCAACCAACCAACCAAAGAACCACCCCCCATTTCTCCAACCCCTTTCACTCAGTATTTTT:1 + chrX 12477897 3' - S2 97 1 76.71 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGGCATTAATTCATTAAGCATGTAGCTTCTACCAATACATATGACTCGCTGAAAAATTTTTCATAGT:1 - chr2R 11562807 3' - pogo 54 1 55.48 TTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAAGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATAAAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATACGAAAAAGATCATCGATCGGGTGGGCGATAGTGATTGCTTCACGTCG:1 - chr3L 11457468 3' - S-element 1671 1 66.43 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGACTAAGGATGTCGAATACTGAGGCACGTCATTAACACCAATTATTTGCATAC:1 + chr3R 4533015 3' - 1360 12 1 77.30 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATACAGTGCATGTCAGAATGAATACGGAATTCCTTGCGGACTTCAAGCGACAAAAGATGAGCCTGTACTA:1 + chr2R 12814948 3' - opus 34 4 52.63 TTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTAC:1 + chr3L 15099660 3' - G4 3835 1 47.26 TACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCACACT:1 + chr2R 16496682 3' + hopper2 1561 1 50.68 CATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACTATAAATACTAATCAAGATTATTTCTCTTGCTCTGCTCTCTTTCCACTGC:1 + chr3R 19594330 3' - BS 5037 1 44.52 GAATTAAAAAAATTAAAAAAAATGGCCTTATGTTAAGCCATTGGCCATTGGTACGCAGACGACTGATTGCAGTCGTCGTCTTTTGGGCCACAGATTGGCGATAGGTCTTCGCTGGAATACGTTCTGATTGGCATTCGATCTTTAAA:1 - chr2R 10852819 3' + HB 320 1 75.34 AGATAGATATAAGCAATGTATATGCGGGTTAGCTGAACCCAATTTCAGCACACTTTGAGCAGTCAAATAATGAACCTGGAACAGAGCAAAAGCGCTTATATTCTTATAAAAATTAAACACAAATTACTTCAAATAAATTAACACAT:1 - chr3L 25931506 3' + Stalker 7127 4 76.71 ATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTAAAAGCCTCACTACAGAATAAGAAGGCCAAAAC:1 + chr2L 15322979 3' - diver 260 1 61.64 AGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCACGCTTCGCCAAGTTCGTTGCCTAAGTCTTTTGTTTTCCATCAACTTCGTAGCTCTTCTGGTATTATCTGAAACCATTTTAAATAGTGATCCTACTGAATAAGTTAATTTTCC:1 + chr3L 10452780 3' + roo 8740 2 74.66 ATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGTTTGATTGGGGTTTCAGTAGGCGTATGCAAATATTTTCGAAAATAAGTAAAAGTTTAATATATATATAAAACT:1 + chr2L 20556574 3' - invader3 5234 2 50.68 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTGACTGTATGTATGCCTGGGTGA:1 + chr2L 19158915 3' - P-element 48 1 46.88 CGGGCAACTGTGTATTACCAAATCAATAAATATAAAAAAAAAACACAACCAAAAACGTTGAGCGTAGTGACCGACCACGTAAAACAACTCAAAAGGACGATGGTTATATTTTACGTCGAATCCTTCCTCCCCAGGGCAACAATAAA:1 - chrX 7207744 3' + Tc1-2 461 1 79.45 GAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGCAGCGATGCATAAATCATAGCATACTTAACAGGGCAAACACGCGCGG:1 + chr2L 14889054 3' + hopper 1380 1 61.64 AATATTGAGGTCTTTATGAAGAGTGGAGTTACGTTCATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGTGCCCAACTTTATGTGCATCATGGAGTGGATATTTTAAG:1 - chr3L 23797686 3' - Helena 1191 1 52.05 ACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGCAACACTTGCCGGCATAATGGAAAAAGTACAAGGGTCGCCATAAAAGCATAACAAGCTAACGTGAAACGGTGCGGCAACTCGAA:1 + chr2L 2072791 3' + roo 8680 2 57.53 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGCCATGAACCCATGTATCACTTGTGTTGCTATCTCTCTCCATTTCCTCCGTCTA:2 - chr2L 18213079 3' + roo 9047 1 67.12 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAAGGAGATTAAATTTGGAAAACAGGCAAATAA:1 + chr3L 16875771 3' - jockey 4827 1 63.01 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATGTGGTCAAGGCTTTAAAAGCTCTTCGGATTTATCTTTGGTTCTTTCCGCCTAT:1 - chr3L 13472408 3' - jockey 66 1 60.87 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTAGAATAATCTATCGAATCATGGAACATCCATTCTCGATCTCTCGTCAAT:1 - chrX 16478524 3' - 297 39 2 61.86 TTTTTTTTATTTAATTTTTCTTCTATAATTTAAAGTATGTTTATATAAATGTGTTCTGAAATGCCAATATTTCTCATTCTAACGGCTTATTCAGAACACTTTCCAGGACACTTCCCCTAGAGTATATAATCTTCGTCTTATC:1 + chr2L 15349981 3' - Doc 4694 1 78.17 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGTATCTCTTATCAAAACGTTCCCTGATAACGCCCCACCTCAACAATCGGTGTTCTACTTCAGAAGCGCGTGCCTGAATGAGTTAATTGATGGATGGTCTGTTGGT:1 - chr3R 24053596 3' - mdg1 7044 2 78.52 TCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTAAGGAACAATAAGTTCTATTTGTCAGTTATAATTGAGCCG:1 - chr3L 15099519 3' + G4 3803 1 71.92 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTTATTTTTTTTCAAACTTTTAATTTTTTTTTGTGCAGCTTACATCCAAAACTAACGATTTGAGTCACTTTTT:1 - chr3R 27090636 3' + pogo 2053 1 55.48 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTAAAAACGGCCATAAATTAAACATGCCGCCCGCAAAAGTATGCTATGGATTTGAACTCGGATTGCGAATGCGC:1 - chrX 19818411 3' + jockey 4937 1 55.48 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAAGAATACAATTAGAAGGAAATCTAATACAAGCAGAGCATTTTAATGGCTTACAAACTGTCAGCATAGAGTCTTCTACTCAAGTAGTAGTG:1 + chr3L 1981652 3' + opus 7482 2 59.12 GTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1700 1 64.86 AATGCTATAGTCGAGTTTCCCGAATATATTTGGTGGAATTAAATATATATTTCAACTTTATACATTTTAGAAATTCTTTTACAATGCTCTTCTTATAATCTATAATGTATCATATTTTTATGTGATAATATATCATATTTTTTGGC:1 + chr3R 27024900 3' - INE-1 570 1 71.92 GCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCACGTACGTCAGTCTGTTTGTCTGCGCTGCGTGCTTGTTTGTTTGTTCGTTTGTTGCCTCGCCATGGAGTCGCTTTG:1 + chr2L 18944923 3' - P-element 21 1 65.85 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCCTCTCACCCAAGCGCTC:1 - chr3R 11773880 3' + P-element 2836 1 51.37 GAGAAACAAAAAAAAAAAGGAAGAAGAAAATATAGAGGGGCTAGCTAAGCAGGCTTATTTGCTGCGCTGCCCCTTCGAGTTTTCCACCCCACCCCACCCAGCGGGCTTACGTGACTTTT:1 - chr3L 3744591 3' + Doc2-element 244 1 78.15 ACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGCTTGTTTGCGAAAAATAAAAAAAACAAAATTG:1 - chr3R 17059287 3' + hopper 1340 1 75.19 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACATATGGCAGTATATG:1 - chr3R 18517943 3' - roo 32 2 54.13 GCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTCGTACTTTTCCATTCAAATCTCCTATTGCAGTTG:2 - chr3L 20209512 3' - Burdock 6165 2 65.75 ATATATTATTAAAAAAAAAAATAGGAAAAACGAACTTAGTTGGTATGCAAAATCGCCATTTACACCTGTATTTCTGGAATGTACATATAAGCGATTTCATGT:1 + chr2L 19461158 3' - hopper 159 1 50.98 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATAGTAATTATATTTCCCTATTATGGTTAAATTTGTATATTTTCTCCGAGTGAAGCCGAGATTAGTATGTTTTCA:1 - chrX 9959763 3' - I-element 47 1 50.68 AGTAATTTTTAAAATTTATTTATTAGACCAATAGGTTTAATAAATGATTAGCAAGCCCAATTATGTGATTGCCTGGAATTAACTCTTTAAAAGAATTTAAATCCAACTTTCTCTTCAATTTTCTGAATGTTTTTTAGGGCACTTAA:1 - chr3L 5025472 3' - 1360 371 1 73.29 ATGAAATCTATATATATATATATTTGTAGAATATAATACCTTTTTCGCTCAGTGCACGCACATCTCTCTGAGCCATTGCCGTCAAAAATTCTCGACGCTTAATCATATAAAAAAAATCTTAATTTCATAAATGTTATCTGCTTAAG:1 + chrX 13541949 3' + Juan 4182 1 62.33 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGTATCTCTTATCAAAACGTTCCCTGATAACGCCCCACCTCAACAATCGGTGTTCTACTTCAGAAGCGCGTGCCTGAATGAGTTAATTGATGGATGGTCTGTTGTTGT:2 - chr3R 24053594 3' - mdg1 15 2 75.34 TTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATCTGCCTACTTCTAGACTCCGAAATTCAAAATTTTGTAGTGCACTTTCAAATATCTCAAAC:1 + chr2R 1375172 3' + 297 339 2 58.22 GTATAGAAGAGCTTTGTACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCTTTAAATTCCAACTATTATTGGACTGCATACCAATCTTATTGC:1 - chr3R 11835381 3' - Doc 4246 1 64.29 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAG:1 + chr3R 22522713 3' + roo 9025 2 60.87 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGGGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGAC:1 + chr3L 10564009 3' + hopper 1381 1 56.30 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATATTAAACAATCTTACATATATTTCTCTTTGACTTGGAACAATTTTTTAATTTAATACAAA:1 + chr2L 9074266 3' + flea 4933 1 76.71 GTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTACA:1 + chr3L 15099688 3' - G4 3808 1 57.53 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCCGCGAAGTGGCAAACGTCAGTCAGTACTTCAGCCATTTTCCAACTAGAGCTCCAGTTAAAGGAGCAAAGAACTTGTAAAGCAGAAAGTAAGAAGGTATTGCAGTTG:1 + chr2R 9410605 3' - hopper 8 2 76.76 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGACTGGCTTTAGTAAAATAATTTTTATAGAGTACCAGAAATAAAGTTTAGAAACCTACAACTTTTTTCTATTGCCTCAGAAAGAACT:1 + chr3L 15277715 3' - I-element 43 1 54.11 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGAATTACCGCGATAGGATC:1 - chr3L 16463488 3' - roo 58 2 56.85 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATT:1 - chrX 12003917 3' + P-element 2823 1 41.78 GCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATTTTGGTATAGTCGGGCTGCGTGCGTAACACATTACGTGGATGCATGCCGACTATCTTTTGGTTTCCCTTAGTTTTT:1 - chr2R 15147971 3' - hopper 498 1 56.55 GCGAACAGCTCTTTTCTACACATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATTATGTGTGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCTTTCTGTCTTTGGTTCGATACTAATCAGTAATTCGGTTGCAGGACGAGACAGTAGCC:1 + chrX 1514476 3' + 1360 134 1 60.96 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAATCTCATTTCAAATCACATGTTCTACATGCAAGTGCACACCTGCCCTTGAGTGACCGGCAAAATCTCCGCAAATATCGATA:1 - chr2L 9347445 3' - opus 7038 4 56.16 CTGGCGTATTGTAATCAACGAGCAGAAATGCAAACAGTCACATTTAATAGGCGTAGCTGTCCCCATACACTAGTTCAGTTCAGTTCTGAGTACGTTATCAATCGCGATAACCCTGCTAAGCCCACTTCAACTTCGAAGTCTATTAT:1 - chr2R 4103403 3' + Doc4-element 2313 1 55.48 GATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATAGAATGATTATTTAAAAAAAAATGCCTAATTTAAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGTTTATTCATATT:1 + chr3L 14944630 3' + G5 4763 1 65.07 ACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGATTCGCCGCCTGCAGCTGCTTTTCGCGCACTCATTACCTC:1 + chr2R 12069649 3' + Tirant 330 2 69.85 GAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGAATATTATGATTACTATCTGTCTGTCGCTCTGTCCGCA:1 - chr3L 27146216 3' - HMS-Beagle2 80 2 73.10 GAAGATAAGATAAGATAAGATTAAGATAAGAACTTACCACCCGCATCGAAGGGCACGGAGTAAACGAAACTCTCCTCCCGC:1 - chr2R 13816461 3' + Stalker3T 202 1 60.49 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAAGGTCGCTCTGTCGATGTTCTGGAATTGGGGAACAAGGGTATCGTCTGCACCGAAATGGGCATGGCCTGCATCTGTCCACAGGAA:1 - chr2L 8396814 3' + roo 9035 1 60.27 CGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATACATATGTGTACATATATATCGAAAACTCTTTCCTGCTCTCTC:1 - chr2L 19548459 3' - flea 4824 1 76.64 ACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCCCCTTGGGCTGGCTACTTCCTCGCTTCCCTCTCCTTTGGTTGGCGTATATAAATGGCAGAATGTGTG:1 - chr2L 18178258 3' + Tirant 8472 2 53.54 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGATTTAATAAATGTGTGGTAGATGGCTTAATTGGAGCAATTGATTAAATTAAACGATTATGCATATTTT:1 - chr2R 11595816 3' - P-element 51 1 50.68 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTCGAGATAAGCAAATGAATTTCAGCACTTATCATATACAAATTGGTAATCTTTTTTGCTTC:1 + chr2L 10045291 3' - jockey 62 1 53.96 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGAACGCATCTCTAGAAATCGGTCGCTTTCAGTCACAAAACTG:1 + chr2L 2999277 3' + P-element 2807 1 32.88 CCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCATGATTCTCGACCCAATCCGCTTAGCGAACTTGGCTTGTTGTTGTTCTTATTGGT:1 - chr3R 31942355 3' + I-element 4992 1 63.01 AAAATTAAAAAAAAAAAGAAAAAAATATATTTTTTTAAAGTGTTAACAAAAGGGGTCAAAAACGTTTTTTTTGCTGTCAG:1 - chr3R 22731149 3' + Doc 4698 1 85.00 AACCTTCTGGATTTTATAGTTCCTGAAATAGAGACGTTCATATGGACAGACGGACGTGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTCTATATGGTCTAGTTAATCTAGTAGGCATTTTATAGTATAATA:1 - chr2L 21300357 3' - INE-1 158 1 74.66 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCGTGCGAATGGCAAAACGCATGGGCTGGAAAACTATTGATAGGTTTGCCCAAAAGTATGCTGCAAT:1 + chrX 18353586 3' - jockey 76 1 63.01 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGCTTGTAAAATGTATTTCCATATTTTGAACCATAGTATTTTAC:1 - chr3R 4532844 3' + 1360 3356 1 63.01 CGCGGGTATCCCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGC:1 - chr2R 4730089 3' - gypsy8 319 1 75.38 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATATAAATTAAAAACTGAATCGA:1 + chr3R 12725596 3' - 297 6639 2 83.65 TACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGC:1 - 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chr3R 11768257 3' - P-element 2830 1 59.59 AATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGGCTGAAACGCAGTCGGTGAACCCCTCGTTGCTGAGGATT:1 + chr3R 24053721 3' + mdg1 7378 2 72.60 ATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGTTGCGTAGTTCTGCACGTAGAGCAGAGTCCAGCACCAGCTCATCTTGCACCCGGAGTAGTCAAAA:1 - chrX 19585098 3' - Transpac 4918 1 63.01 AGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGGTTCAATGTCTGT:1 + chr3L 18789100 3' + 1360 3321 1 66.44 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCGTCGGCACAGGTATTCCACAAGATTCTGTTATTCGCTTGTGTAATTAACGGATGCGGTGTCAACTAGTAAAAATGCA:1 - chr2R 18440384 3' - P-element 43 1 56.85 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGGGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTTTCAATGTCTGTTTTATGTTG:1 + chr3L 18789109 3' + 1360 3330 1 59.59 TGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAATACTCAAATGTCATCGCCTTAGCTT:1 - 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invader6 7 2 60.00 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACTTTTCACTTCTTTGCACGGTGGGTATTTTCCTCATCATCTGTTTTTCGAAGAGCTTTTCCGCCGCTGCTGTTTTGTTTATGCTTTTCCCATCTCATTGTTTTT:1 + chr3R 4662071 3' - roo 13 2 76.06 GGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACATTTTGGCCCTCTCACCTGTCGTTTGCCAGTTGAATTCATGAATTCGCCGTCTGTC:1 + chr2L 10547353 3' + F-element 4377 1 62.07 CGATTATAATAAAAGCATGAAGTGTCCGTGGCCAAAAGAAATATAAATTGAATGAAATCCATTACCCCCCTTACCCCCTTACCTTCACTAAGCATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGTAATTATGCCTTCCTCATAATTCATT:1 + chrY 502465 3' + Stalker4 467 1 76.03 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGGTGGAATTACAATTTTATTCGTATGTACAATTCGATTGAAATTAAAGTGAAAAGCTTAACTTTTATTTAACAAAGGGATATAGTGTGTAGTTTTAGCAGCACT:1 + chrX 6423313 3' - roo 16 2 73.97 CTCGAGGATCATATAACAATCTTTTTCTTATCTGGATCTGTTGCTTGAGGATCCACTGTACGTAAAAAACACAGCACAAGTTGAGCATCATTTCCCAAAGGGTCACCCTGCGGTCAAGAGGTATCCTGGCCTTTCGCAGGATATCC:1 + chrX 15220524 3' - Idefix 124 2 77.40 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCAAAACACTTTACTTAACAAGGTATCATTTATTTACCGAACTCCTTACAAGAATATTCTCTACT:1 - 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chr2L 11064734 3' - FB 62 1 58.22 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTTTCTAGCTTATTTGATTATGGCAAATATTTGGGT:1 + chr3L 10442889 3' - roo 8751 2 78.77 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTT:1 + chr3R 6412066 3' - Tirant 8155 2 53.68 CTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCCCCCATTGTTTTGGTTTTTATTGCTCGCTCGCCATTTGTCCTTTGATCCCAACGAGCC:1 - chr2L 10925887 3' - I-element 475 1 60.43 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAACAAATACACGGAGCAGATTCGAGTGAAAAGCGTTGCCTACTTTTGGGGCTGCACTTCCATTGTTTTCGCTGGCTGCCCCGAAAAAG:1 - chr3R 15168860 3' + jockey 4960 1 60.71 CGGTTACTCAGCTAATGTGAATGTGAACTCAAAATTTCATAATTTTTCCGTTGTGCAATTTAATATTTCCTATAAAATATACAAATTAGTTTCAATTGATTATATAAATGTACATTTTTACCTTCACTGCGGTACCAACCATTAAG:1 - chr2R 578967 3' - INE-1 536 1 69.86 ATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAAATACAAAACCCTCGGTATAACCAGTACGATCACAAATTCATTAACAATATTCAAGTGTTTATAAGCAACTACAGTTTTTCCCG:1 + chrX 19192475 3' - INE-1 10 1 76.26 ACGCTTCCTTGTGCCTGTTACATACTATTCAACAAATCTAGTATACTCTACGAGTAACTGGTATAAAAACACATTTCTTGCTATTTAAAGTATGTAAACGGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATACTCATTTATA:1 - chr2L 20923046 3' - INE-1 31 1 44.52 GTACGCAGACGTTGTTAAATTATGCCTCCAGTGCAAGGACACTTCGTGCCATTTGGACTTACAATCCGATCTAGATCGATTTCAAAAATGGCTCCAAGTGTAAAGTTATCTTCTATGCAACGCTCAAAAACACGTCCGTAAGCCAT:1 - chr2R 12623528 3' + Q-element 576 2 71.92 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTG:1 - chr2R 7889384 3' - jockey 78 1 67.39 GCTAAAAAAAAGAAAAAAAAAACAGAGCGAAAAAACAGCAGAACAAATAGCTCAGCAGAGCACAGGAGTACCAGAAATCCGACAGATACTTCCACTAGCCTAGCTACATAGTGCTGTTAGTGGCTATAGATATTATGCCTATATGA:1 + chrX 20652431 3' + G-element 4325 1 74.66 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGAGACACCTTAAACATGATGTATAAGAAGCATGATGTATAGTTGTTTAGCAACGCAATA:1 + chr2L 14480531 3' + Transpac 286 2 57.27 TTTTGTATTTCTTTTTGACTACATAATGAAAAGTAATTACAATATTATCGATAATGTTACATACTCATTATATAGTTTTGTAAATATAACGATTGTTATGCTAAACTTGAAAAATTCCAAAGAAGCTCCGAATGTTTTCAAAAGGA:1 - 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chr3L 14551270 3' + P-element 2875 1 71.77 CTGTCCGTATGAACGTCAAGATTTAAGGAAACCCGATTCTAGAGACATAGACGCAGCGAAAGTTTGTTGACCCATGAAAAAGCGTATTAACTTCAATTGGTCTATTTGCTAGCTGTTG:1 - chr3R 29114293 3' + INE-1 131 1 64.41 ATTTTTTTTAGCAAATCAACTTTCAACCTGCAGTAGTGCTATTACTAGACGTAGTGCGAAAAACAATATTAGCAACATTAGCTTTGGCCAAAGGCACAGAAACTTCATTTCCAGGAAGACGTTTATCTAATATATCTGCTGCTGT:1 - chr4 685351 3' - Tc1 40 1 69.66 CCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTATTAAAAAAATAAAAAAAAGAAAATTATTAAAAATAAAACTT:1 + chr3L 9764439 3' + P-element 132 1 21.92 AGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTTCTCTTGTTTTACGTTCTGATCAAGTCCCAGCAGTCTAAAGTAATGACATACATCTCGAGTGGCTGGGGTTTAGAAGAATACACCATGCACACGG:1 - chr2L 22318176 3' + INE-1 567 1 65.83 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAATTGTGAGAGTATCTGGCCAATGAAATTTATGTGGTAAATTATTCACAAAATATACCATTCAGTTC:1 - chr3R 9193134 3' - opus 49 4 55.17 GTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTCTTGCGCTTACTACCTTCGTG:1 + chr2L 22150643 3' - S-element 69 1 82.19 CACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTAAACAGAAGAGAACGCTATAGTCAAGTTCAAGTTCAAGTTTTCTGATTTTTTTGTTGTATATTCTTATGTATAAACAAATATTTC:1 - chr3R 10252705 3' - opus 7229 2 56.85 TATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCACGTGAAAACGTGTCTCTGTCTCCCAACTTTTCTGTT:1 + chr3L 18767884 3' - roo 8605 1 63.70 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGACAAAAAACTAATAAATTCTAATAAATGGAAATAATATTGTGAACGATTCGCATTTAAACGGGTCATATTTAATAACATTTAACAGCACAACTACAATAAATATTATTTCATAC:1 + chr2R 617310 3' - F-element 27 1 66.44 GGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATTAGTAAAGAGCTGAAGTGATGTCACAGTAAAGTAGCATAATT:1 + chr2R 5154833 3' + jockey 243 1 71.23 ACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGACCTGACGAAGAGCGCACGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTTTAATATTTTTCAAGATTGCAAATAGGTTGTG:1 - chr2R 22012159 3' - opus 7081 2 76.43 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATTTCACAG:1 - chr3L 25406602 3' - 1360 9 2 65.75 ACCATTAGTAGCTTCGCAGATGTCATTTAAAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATGATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATCGTTGAGAAATGACTTCACATAGGATTATCTCTGATGTATGGTAATTAATATCTAA:1 - chrX 15145548 3' - hopper 392 1 61.64 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTG:1 + chr3L 20399074 3' + roo 341 2 64.14 AGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATTGATGTAATCAACAACGTGAAGAGGCCCGTCTGCGCCATTTGAATA:1 + chr2R 15942369 3' - opus 33 4 56.48 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATCGATAAGAAAACGAGGGGACACAAAACCGAAGGGTGACTGA:1 + chr2L 13140735 3' - blood 17 2 69.23 ATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGCAGAAGAAGGAGCGGTCGCCTCACGTGCGCTGCCTTCGGCAGCAGCGACGTCGACAGCGGCATCAGCATTGTCTGC:1 + chr3R 6419276 3' + Tirant 8291 2 60.00 CAGTCTGACGATATCAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGCTTTTCAAAAGGT:1 + chr3L 20224217 3' - Chimpo 80 1 73.97 TAAGTCAGCATTCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCCCTCTCTCTCTCATATACACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTTCCTCTGCGGGGCAACAGTGCGTATGACCGCATCCGAATGTGCATTTAAT:1 - chr3R 8068238 3' + blood 7134 2 65.75 GCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCATTTTAAATACTCTAAAAACTAGTACACTTTTGAATTTTTTGAAATGGCTATTGTCGATAAATTT:1 - chr2R 13212155 3' - diver 10 2 76.71 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATATTTAACAGTCGGTTATATGTACATATGCATATATTTATAAAAAATCCTACATA:1 + chr2R 21473689 3' + pogo 2039 1 63.01 ATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATTCATAAACTGTGTTCAAGTTGGTTACCAGTTTTTTATGGTATGGTTTTG:1 + chrX 21581434 3' - Tabor 6906 2 63.12 AAAAAAAAAACTAAATAAAAAAAAAAACTAAGCAA:1 - chr3R 7279630 3' + F-element 91 6 74.29 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACAGAGGAAAA:1 + chr2R 6713927 3' - 297 6630 2 72.07 CAAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACCATCTACGTCTCGTTTCGTGT:1 + chr3L 9519656 3' + roo 9019 2 50.68 AAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAGCTTGAGAGTATGATATCACTGCCTCTTGCGCCATAGTAAAATATATATGTTTCTTTCAGTGCACCGAAATTAACCCACTGATATCA:1 - chr2L 1989313 3' - S-element 32 2 58.22 ACACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGTATTCCTCTTTTCTTATGCTCTCTGAAGTGTGTATGCGTTCATTTTGAGTGAGCCATGTTTATTATTGTTTAACAAAGGATTGTTGACAAAAACAACTTTATTAAAATTAAA:1 + chr3L 20042601 3' - invader3 5382 2 56.12 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCAAATCCACTTTGTTGCCCGTCTATCCTTGCCGCCGTCTCTTT:1 - chr3L 17108556 3' + hobo 2906 1 57.00 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCTTATGAAATGCAAATTACAT:2 - chr3L 18199928 3' - Doc 47 1 52.74 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAACACTAAAATCTAAGACGTGTCTCGATTAGTTTCGAGTTTTGCTTACTCGCTTCTAAGTATGATTTGGTATTATATTTCTCTTAAATCA:1 - chr3L 20744146 3' + 412 461 2 61.64 ATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAAC:1 - chr3L 20176768 3' - gypsy 29 2 62.50 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGAT:1 + chr3L 17904858 3' + roo 330 2 72.60 GAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGC:1 - 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gypsy 7068 2 71.92 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCCT:1 - chr3R 11773895 3' + P-element 2821 1 41.10 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGATATCAATTTCAAAATTTAATAACGATTTTGAAAATAT:1 + chr2R 8687887 3' + roo 324 2 79.45 CGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATAA:1 + chrX 21667935 3' - gypsy2 6559 2 68.49 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTCTCTCACTCGCACACATTCGCCGAGACTTCTCTTTCTC:1 + chr3L 5179240 3' - P-element 40 1 51.56 TGGAGGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGCATGTGGGTAGGGGAGGGCCCAGAAAAGAAAATGGCGGGGAACCAA:1 + chr3L 10262619 3' + Tc1 1470 1 72.60 ACCAGAGTTATACTTAATTATTATTTCATTTTTTATAAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGCTTAACAAATTTATGAATGAAATAAAAGAAAGAGTCGTGTACAGTTGGGGCAATTTGGTTTGCCTGCCAAAACTATTCG:1 - chrX 1074113 3' - Tc1-2 400 1 65.07 CGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAATCTGCTCCTCCAACGCGGCTGACTTATACGCACCGCACCTTATATGACGAACGGCG:1 - chr3L 11007081 3' + Bica 68 1 61.64 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGTGAAAAGAAAAACGTTTTATGAGCTCATTCACAAAAAGGGCCAAAACACACACACAGGCACACCCATAC:1 + chr2R 8335030 3' + transib2 2780 1 53.96 GAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAATGCAAAAATAAGTAAAGTTTGAATTTGGCAAAC:1 + chr3R 16862763 3' + P-element 267 1 22.60 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTCTAGGACACTCCCCTTTTCCCCTTCTC:1 - chr2L 9319085 3' - jockey 64 1 56.83 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGAAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGG:1 + chr2R 16891848 3' + jockey 4961 1 51.16 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCGTCCCATTAGGACCTTTCCGCACGACAGGCGTCGCCAGTCGGGAATTAAACGTGTTTTGCTCCCGTTTACTCGCTTCAAATTGTATCACA:1 - 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chrX 21581334 3' + Tabor 7273 2 51.37 CCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTATATGGAAATGTATATACATATACATATACATTTCCATATACATACATATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATAT:1 + chrY 2720345 3' + Transpac 309 2 52.63 GTGGAATTATGCCATCCAGGTGAGGGGAACTGCCACCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCAGTGTGGTCCAGTCGAGAGCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAGACGCGAGGGCGTCTGAGAACATATCTAGTGGC:1 - chr2R 8086242 3' + G5 4383 1 54.11 AGAAAAATAAAAATAATATTTAAAATTGTCAATATAATGTATATGTCGTAGTGTTTATATTAGATCATTATGATCTTTAAACCTTTCATGGGGAATTTATATAGAGAAAGCTCTATTATCTTGACCGCCATTGTAGC:1 + chrX 6664892 3' + invader6 4386 1 47.45 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTATTCCTAGAATCGCATTAATATTTTTAATCTGATTACGATGTGGAAAATAAAGCAAGAATAACAACTAAAAACGCTCGAAGCGAAGGTAAAACGGCAATATATGGA:1 + chr3R 30782661 3' - pogo 10 1 76.03 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAAATTATAGCTGGGGCCAAATTAAACGCGCAAAATGGAGGCAAAAATTT:1 + chr3R 23668519 3' - pogo 32 1 56.88 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAAGAATACAATTAGAAGGAAATCTAATACAAGCAGAGCATTTTAATGGCTTACAAACTGTCAGCATAGAGTCTTCTACTCAAGTAGTAGTGCCACAGATTTCTCGC:1 + chr3L 1981667 3' + opus 7488 2 65.75 AAAACAAAAGAATTTCTTGAAAAGCCTAAGCCTTAGCTGTGTTCTTGGATAATCACGAAAAGGTAAATATGATACCTTTTCGTGCCTTTGCCACACTCCCCAGCGGATGCAAAATCCAAGGAGAGTTGGAGCAGAATTTATTTTTA:1 - 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I-element 33 1 62.33 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGCCCGAAAAAGTATGCTACGCTGTGTGAAAATACACAGGGCGCATGGGCAATAAAATGCAATATTA:1 - chrX 6484663 3' - jockey 9 1 77.61 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAAATTAAGAACATATATTTTTAAGCCTTCTTTGAAGTTCTTCGAAGTTCAGAACTCAAACTTGCCATAAAAAGTT:1 + chr3R 29622766 3' - pogo 44 1 52.74 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTCCTTTTTATATAATTTACATTTGTTTAAAAAAGTAATCAGTAATTACTGTATATTTTATATATGCAAAAATATAC:1 - chr3L 11903188 3' + opus 7460 2 57.53 GTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCA:1 - chr3R 19589898 3' - BS 5041 1 50.68 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCGTTTCTATGTTCCTTCGTGGAATTTCACAATAATCTTTTCCATCAATTGCGGATTAG:1 - chrX 4823532 3' - pogo 58 1 61.54 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTTTTTTTTAATTATCAAAGTAAAAATATTGTCTTAGCAATAAGGTCACAACAAATTTTGGCT:1 + chr2L 18538510 3' - Doc 64 1 62.33 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATTTCTAGTCACATTCGGGATTTTTCCAATTATCAAAACCAGTTCAGA:1 - chr3R 5024780 3' - diver 28 2 68.49 AAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGGAACGTTTGAGGTGTTAGTAGAATACCGACTAGTTACCTTCACT:1 + chr3R 13656908 3' - Stalker4 7015 4 70.87 CCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAATAATTTTGTATAATTAGACACACTTGCCGTCCGGCGATTTGACATAT:1 - chr3L 19669315 3' + I-element 4881 1 67.81 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATCTGCTGCTTATGAGCTCATGTGACATTTAATAAAAAATATAAAAAATGACATTATTCGTTATATACGATAACTTTTTGACATTGTCACCA:1 + chr2R 21476483 3' - roo 8722 2 60.96 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAGAT:1 + chr2L 11867390 3' - jockey 62 1 50.00 AATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCATTCCTCTTTCTTGGCGTTCGGGGATCAATCGAGTGCGAGTTGGGAGCAGCATAGAAGCGGGCACGTCGGGACTTGAGA:1 + chr3R 28321935 3' - 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P-element 32 1 62.33 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAACACTAAAATCTAAGACGTGTCTCGATTAGTTTCGAGTTTTGCTTACTCGCTTCTAAGTATGATTT:1 - chr3L 20744169 3' + 412 7491 2 54.11 GAAAATACTGGAAATTTGCATATTTTTTCGAGGCAAAGACAGCCAGCCATCGAGGGCGACAAGAAATTTAACAAAGTACAAATTGTTATTTGATTTGATTATATAATGACGCCACACATACCCCATCATCTGCCTTTTGCAATTTG:1 + chr3R 6014080 3' + hopper2 1556 1 69.86 CAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCGGCAAATTAGTATCAGTGCATTAGGCCTTGGCAACCAATATATATTTCTAGGAAACTATTTATTACACAAAATTCTGATAAA:1 - chr3R 5115264 3' - Ivk 41 1 57.53 TGTGTGCTTGTGTCCACACTTCGTGCCTCAGGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTTTTATATTTTTATTTATTTTATAAATTTTTTTTCTTCTGCGTTTTGGTTAGTGTTGTTGCTGATTTGTGGTCCGTTTTTGGTAATTTATT:1 - chr3L 28006999 3' + 1360 463 1 67.81 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGAAGCCGCACCTACCAGGACAGAAGTGGATGGGATTGGGACTAGGATTGGGACTGGGACTGGTGACGCTTTATGACTCCATCGCCTGCTGGTGGCCGGGTGAGTCAA:1 + chr3L 13472118 3' - jockey 4790 1 79.85 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGCTACAAACTTCTGTGGGACA:1 - 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HMS-Beagle2 6939 2 57.53 GATGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCTAGTGCCCCCTTGGTGCCCTAGGTCCGGAGAAACATCAACCGAGTTCAATATTCAGTATCATGGTAGTGACAAATAATTAATGTGCTGTGTGCTCAAGCTAGAAATCGTGCCCATGC:1 + chr2L 12429400 3' - Gypsy12A_LTR 1938 1 76.03 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTGAACTGAGCACTGAATTCCGAGCGCTAAGCGTCGAGAATCAAACGCCCAAA:1 + chr3R 18518051 3' + roo 9027 1 52.41 CGGATGTTAATGCTTACATTAGGGCAAGCTGGATTTATTATTGTCAATTATTATTATTATTATTATTAGTACAATTAAGTACTGTATGATTTAGTTTGCCCTATGTATTCAGTGTGGGCTATGTAAGGTACGGGTTTTTATTTTTT:1 + chr2R 3032624 3' - Quasimodo 173 2 51.37 ACAACACGCAAACATATACGCGTTCTCGTCTATTGTTTGTACTCACACCAGCAGGTCCTGTATAACTACCTCTTTTATACCGTTGTCGCAATAATTTCTATCGCTGTTGTAGCTTCCGATGTTG:1 + chr2R 4634414 3' + 1360 3216 1 62.10 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAAATATATGAATACAAGTGTTGTGATTTAAATCCATTCGAACCATATTCCATATAAATCCATATTCG:1 - chr2R 2565944 3' + S-element 1675 1 53.73 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCAGTCGCAGCAACCCTAACAGCTTTAACCACGCCCACACCTATACACACACACACACACATCGCCCACGTTTTGCGTGGCTAATATCTG:1 + chrX 19982478 3' + hopper 1413 2 75.65 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTAATCGATAGGCATTGTTTTGTATGTACCTTTTTTAAAATATTCTTTATCAAATCAACTGAACCTTATAATTACTGTTTAAAACAATA:1 - 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chr2L 11079388 3' + 1360 3346 1 55.56 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATACATATGTTTATACTTGAATATATGCAAACGCTTTTTTGGCTTCGATTTTCGGTTCTTTTGGCG:1 - chr2R 6713832 3' + 297 6928 2 63.01 TATCTTAATTCAAAAAACAAAAGTGATTGCAACACTTTTGAAATTCCCTCTGCATTCATGGCAATCGATTCATTCATTCATTTCACTTTTTTTTCTATCTGTTTTTTGTAATTTGCATTCCGCCGATATGAG:1 - chrX 10507125 3' - Dm88 4296 1 65.15 CGGCTGACCGGACTCGTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCCAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAGCTGTAAAGCAAGTAAAACAATTTGAATGGCTT:1 + chr2L 6876664 3' - Rt1a 57 1 67.29 GCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACTTAGTATGTACTACATACATACAAACATTCATATGTATATCGGGCATTCGAACGTTAACATGCACACTCGTATGTGTGTCAGTAGTTTTGATGTTCGT:1 + chr2L 470343 3' - Burdock 20 2 71.92 ACTCCCAGCCCAGCAACAAACTTACGAGGGCATTAATCACAAACACTATCACCAAGTGAAAGTTAACTAAGCTAGATTAAGATTTGAATACTTATACAGGAAACGTTACAGACCAAAGATGCAGGATTTCCATCTGAAC:1 + chr2L 14926820 3' + Doc 4558 1 67.63 ATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGCGAATGTCTTTGGGCACTTTGCAGTCTCCTTTGGCTCCTAGTGCCCCCTTTTAGCCACTACTTTCTCCACC:1 - 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chr3R 10461672 3' + roo 9015 2 68.85 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTAACGAGCTAATAAACCGCTCATGTTACAGATATGTTTGGCGTTAATTTTT:1 + chr3L 13827473 3' + roo 9003 2 65.75 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGCTGAACAGGGGCTCGGCACAAAAAATGGCATACTTTTTTGGGCCTGCATCGGGGCATCGGAG:1 - chr2R 20738999 3' + hobo 2919 1 56.48 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCAGTGCAACAACTTGTTACTCATGTCCTGCTTACGAAATTCGCTCTGTTCGGCTCTCTTAACGGGTTTGATGTCCTGACCATCATT:1 - chr3R 25137832 3' - P-element 33 1 60.84 CGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGCTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATTCATATTCGTACCGGAATGGTGTCCATCAGGAGATCATACTGCTGCTA:1 - chrX 5743384 3' + Stalker 7030 4 68.97 CACACACAAACACACAGCTCATCGCCCAGCCGAGGCAAGTATTGTTGTGGTGGGAATTGTCGTGGAGAGGGTCCTCCAGTTGCTCTACAGCCAACATGGATGTGTCAGCATAAATAACAAGGGCCATACACTTTCTGCTTTTTGCC:1 - chrX 13352294 3' + gypsy3 427 1 78.08 TGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAAATGAAACGTTATCAGCTAACAAACGTAACACCTAAATAGCCACAGTTGAC:1 - 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Doc 62 1 66.67 CTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCC:1 + chr2R 16496675 3' + hopper2 1555 1 52.41 AATAATAATAATAATAATAATAAAATAACAAAATAAGTACGACAGTTCAGATGCGTTTACTTTTACTAGACTAAAGCTGTATAATTTCCCATTTGTTTAAAAAAATTATACTTCACTAATGTAGGAATGCTTAACTTTGAAGGACG:1 + chr3R 16971438 3' + mdg1 31 10 56.16 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCCCCGTCTTGGAACTGG:1 - chr3R 10461640 3' + roo 9023 2 52.05 CTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATCTATTATTTACATAAATCTTTACTCAAGGGCATTACCCAATTCACCTGGACTC:1 - chr3R 11146362 3' - flea 4818 1 66.42 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAATTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCAGCATTTCCTTTGTGGGAACTGGTTTTGCTCAA:1 - chr3R 10361876 3' + roo 319 2 78.08 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGAGACACTGAGCTCACCCCAGTTCTCTATAGGGACAGGAATAATTTAGTGCTTTGGTGGATAAATGTTTCAGTTAAAATTT:1 + chr2L 17206110 3' + hopper 1376 1 59.59 TGAAACAAAAGCGGAAGTCAAAACGGAAGTAAACTTCAGAGCGCCAAATACCTCAAAAATCCCAAGAAAAACTTTTTTGAAGAAAAACGAGAGTCCCCATTTTGAGCTGAATGAAAACTTATTCACAATAGAAATACTTCAT:1 + chr3R 7408101 3' + Fw2 322 1 69.01 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGGTATAAGTTTATGG:1 + chr3L 12861819 3' - pogo 53 1 56.85 GCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATGAACATATATGAATATATACAAATAAGCTGTCTCAAAGCAAAAGCCAAACAAAAAAGTGATTTGTTGTCATATGCAAAGTCAAATCTTTT:1 + chr3L 14709042 3' - opus 7033 4 58.22 GAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCCAGACGACATTTTTTGCACGTACCAGGTGAACACGATGGCCTTCGCTACCGC:1 + chr2R 1318453 3' + diver2 4896 2 43.45 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGTATGAAGTGTTCCGATAAAAAACAAGCGAATGATGAAAGGGGCAGCCCGGAAAATGTGCAATAAACAATGTATTTTGATTCGAACGTGACG:1 - chr3R 21587478 3' - roo 8693 2 64.38 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTAAAAACGGCCATAAATTAAACATGCCGCCCGCAAAAGTATGCTATGGATTTGAACTCGGATTGCGAATGCGCTGAGGCGTGCGAATGC:1 - chrX 19818395 3' + jockey 4972 1 66.14 ATATGTATGTACGTATGTAATATGTACGTAATAATATTTCTTCGCCGCTGAAGACGTCGATGGTCGCTCACAAGTCCCCAGGCAGTGGGGACTCCAGATTCCTTCGCAGCCAGGGGGGCAGGACTTCTTTGGTTTTGTTA:1 - chr3R 6030945 3' - 412 224 2 75.71 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1657 1 64.96 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTATAATGACATTTCGTTTGGCATTTGGGAAAGTATGAAATTGGATATGTTTAAGCCTTTTCACATTACTGCGTACGTGGACTCATATTGTAACTGACCTTAAATAAAATA:1 - chrX 6423124 3' + roo 9053 2 71.23 GAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTCATATGTGAAAACACATGGACAGTTGTTAAGTGCTTAAAATATGCATGCTTTAATTGCCAGCCACCTGCTGCATTGA:1 + chr3L 16875951 3' - Burdock 6159 2 65.93 AGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACTAATTGCCG:1 + chr2R 15822114 3' - invader6 4518 2 44.68 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTTGCTCTTTGTTGTTGTTTTTTCCAATTAGATGTCTGCACTGCAGCTGGGCGGTGTTGGTCTTGTTGCTGTGGCCG:1 + chr3L 3339454 3' - Transpac 22 2 64.80 CAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGTTTAAACTAGGACAATGCTAGGAAAGAGAATAACTTGATATTGTTTGTTCGGAATTTATAATTA:1 - chr3L 13156697 3' + transib2 2768 1 56.16 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTATAATCACAAATATATTAAATAAACCTCACGGACTGTGGCCTGTGTTGCAGCTGCGTCCGTGTCCATGTGGCATAGTTGCGCTTCAGGTTTGATTAAAAATTCC:1 + chr2R 9455972 3' - 412 15 2 75.34 AAACTGTCACGCCCATACTTTTGAATCATTTTTCGAAAATGTTTTATACACTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGAAACAATAAATTTTTGCCACGCCCAAGTCAATGAAATGGCGTAGCTGGATATAGGGGAAGCTTTT:1 + chrX 21000222 3' + INE-1 246 1 72.60 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATACATTTCAAATATATCAGATATATAAGAAAATCACTGTTTAAACAGTTTCATATTTATAGATAAC:1 - 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jockey 4773 1 77.24 ATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATAATA:1 + chr2L 1654716 3' - micropia 137 4 52.74 ACAAGTTGACGAAGGGTAGTTGGCCGACCCTTGATATGCGTGCTAGGTCGATGAGATGAGCCGACTAACAGGCTGCAAGCGGTTAATTGTACAAACTAGTTATAGACAAACTCTTACTGCCAATACCTCG:1 - chr2R 4576832 3' - Chouto 6071 1 70.77 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAAACATAATACATATTTTCGAGGTGTGCCTACGTTAGGTAATCATTTATAGC:1 - chr3R 17467098 3' - I-element 69 1 63.01 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACCAGTTATAAGCCAACT:1 - chrX 12003896 3' + P-element 2844 1 56.16 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGAAAGCACGGCTAATTTTTGATTATTTAAAAATGAGCAAAATTAATTATTAATTAATTAATCCGAACAAATGCAGCAATCTTTTTTTGCAA:1 - chr3R 11978208 3' - Transpac 28 2 66.44 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGAATAAATCA:1 + chr3L 14084949 3' + opus 457 2 64.55 AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGCTCGACTAATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATACATATGTTTATACTTTAATATATGCAAACGCTTTTTTGGCTTCGATT:1 - 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P-element 36 1 51.67 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACAATATTTTCCATCCATAGATAAATATCTCGCCATACTCTCCATAAAGATGTTGGCCAAGAAATTGTCAAGAGAAAAGACAGAAGG:1 + chrX 5366277 3' - pogo 29 1 65.03 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTTTAAGGACTCAAATTTATCGGTGTATGTGTGAGCGGCAGGCG:1 + chrX 10304657 3' + roo 353 2 65.32 GAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGGCGGC:1 + chr2R 11097404 3' - Juan 4029 1 69.91 AAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGATGACGATGGAATTCATTCCGTTCATGGTGATTATACTG:1 + chr2R 9093954 3' - 412 7507 2 68.25 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATATCAAATTTATGTCAAGTTGGCCAATTTTCAACAGTAAAAACGACAAAGAAAAACTCTACGCCAATCAGTTAGCAAAAAAAATTAGCACCAAT:1 - chr2L 3648680 3' + roo 9046 1 67.81 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCTCAGGAAGCATCGAGCCCATTTCCACACTGAATATTGGCCATAATTAATGCTAACTACA:1 + chr2R 11562958 3' + pogo 2092 1 77.61 GTTGTTGTTATTATTATTGTTATTGTTATTGTTGCTGGCACAGATCATGAGAGAGGCGTGGCTGGGCGG:1 - 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INE-1 84 1 72.60 GTCATCGCCGCGTACTTACAATTCGCCTCATTAAGTGCAAGCCCTATTATAATTAATAAACCTACACTAATATGGCTTTCATTTTCACACGCTGGAAGCTGCTCTCCC:1 + chrX 11397180 3' + Burdock 6301 2 66.67 ATAAATAATAAATATTTTAATATTTTTTTTTTTAAATAAATGCATCTTAACTGTTTGCTTGAGGCTCCAGAAAAGTGCCTCTATAGTTCTTTTCGTTCTTAAATTAAAT:1 + chr3L 11480308 3' + Juan 4061 1 68.81 CGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACCCAAATAATCTGAACATCATCGAATTACAATATTCGATGACGGCGAAATTAAAACCAATAAGATTATCAGGAG:1 + chr2L 8589649 3' - G-element 21 1 61.21 CTCGGAAGGCCCTAACAACCTTCCACATAACTATATGCTGCAAAGGGAGTGCAGATATCAAATAGAAATTCGTCACAAGCGACATTTTCGCGCA:1 + chr2R 21029456 3' + Transpac 299 2 59.57 ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACCAAATGTCGTTGGGCAAATATTTGGCCGAAGGACCTGGCGTGGGCTTCATTAATGTGTGCGTCTGACAGGAGCCGGCAGGACG:1 + chr2L 11079520 3' - 1360 34 1 62.76 GCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTTAACCAAAACCATACCCATTCAGTCGACAAGCAGATTTGCCTAATTCCATTTCGT:1 + chr2L 1277900 3' + I-element 5291 1 60.27 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCGTTGGATTGATGTTCGGAAACTGAGTCATCAGTGAAGTTTATCTCGAACCCCCTGTTT:1 - 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blood 39 2 58.22 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTACATGCTATTCGTTCACGCCCTTCAAAATTCGATGTAGTTTTATTACCAAATCAAATGGGATTCACCACAAAGTAAATACTCTGAAC:1 - chr2R 21029327 3' - Transpac 32 2 60.96 CTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGTCAGGGGCTACTTGCTATGGTGGTAGACAAAGTAATAGTAATAATAGCACCAGCTGTTAACCCATAGATAAAAAGCTTTTACATGAATCGGGCAAGAAAGTGGAACTATTGTT:1 - chrX 16335520 3' - R1A1-element 337 1 59.59 AAACAAACAAAATACAAAATTTGTGGAAAAAAAAAATGTTGGAAATCAAAATCAACACAAGCGATTCGCACCGCACAACTACAAA:1 + chr3L 6640941 3' + Juan 349 1 54.12 CGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTTTATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTA:2 + chr2R 15822081 3' - invader6 64 2 61.64 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATTAGGTGATCTTCT:1 - chr2L 5447874 3' + roo 9016 2 60.27 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGCTTCTAATTTAGGAAGTATGTGATATATATGCTAATTAGCCTATGTAATTTGTCAACCAAGGCGTGCAGCTGTTTAAAA:1 + chr3L 20744295 3' - 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I-element 27 1 67.81 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGTAGATGGTGATCCACTTGATTATTTGGAGAGGGGAGAAA:1 - chr3L 9562469 3' - blood 166 2 80.00 GAGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGCGTGTGCGGTTTCTGTGCGGTTTATTGACATTCAGCGGCTAGAGAGTGTGTGAGTAT:1 + chr2R 7879577 3' - accord 185 2 91.25 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTTGCTTTGGTCTTGGCTAATTTTAAAGTTCCCATTGCCACAGGCTCAAAAT:1 - chr2L 11079416 3' + 1360 3330 1 67.48 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAATTAATCCAAGAGCTTTGTCAAT:1 + chr3R 24976303 3' - roo 8727 2 61.64 CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATGACTGTGTAAACTAGAGCTGTTCTCTG:1 - chr3R 4421993 3' - 1360 56 1 76.85 ACTGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCG:1 + chr3R 6412056 3' - Tirant 8175 2 60.96 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTCGTACTTTTCCATTCAAATCTCCTATTGCAGTTGT:1 - chr3L 20209511 3' - Burdock 28 2 66.44 AAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGTCTTCTTATTGGGGCTTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGCGTGGCCG:1 + chr3L 20399084 3' + roo 372 1 53.23 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGC:1 - chrX 2518057 3' + P-element 2861 1 37.33 TAATAATCGGTACCCAGGGAACACCACGAGGAGGCCATACACAACAATTATAATCTTTTTGCTTATCTTACAACCATAATAAATCCATATATTGGTTGTAAGATAAGCAAAAAGATTATAATTGTTGTGTATGTTTATAAATATAT:1 + chr2R 951006 3' - 1360 2913 1 51.37 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAGAACGTGAGCGAAAAGAGAGCATGTGGATCTTACTTGAGCAG:1 - chrX 7967189 3' + P-element 2834 1 50.00 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAACTTCACTAGAATTAAATAATTATGAATTTATTTTAGGGGTATTAGAGCTTCGA:1 - chr2R 21473588 3' - pogo 62 1 62.07 ATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTT:1 + chr3R 29091402 3' - rover 6998 2 54.11 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGAGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAG:1 + chrX 20465838 3' - jockey 4784 1 54.67 GTTGTGCCTCTGTGTATTGTGATTATGTATCGTGTATTGTGTTTGTGTTAAAAAAAACAAAAAACCACATTTTGTGCCTATTATATCGTTTCCATCTACGAGGATCCCGTTCAGCCCCAGCAGGCCGCTTCCGTG:1 - chr2L 5973619 3' + Stalker2 460 1 60.74 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAAGAGTTTAATATCAAATATCGTTTATTATCTTAACGTCCATTCGTTTAACAATAAAAATGGCTACCATTTTTTCACTGCCTACCCACTTTCCGTG:1 + chr2R 22012275 3' + opus 474 2 67.81 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGTTTCGTAGTTCTGCAC:1 - chrX 19585147 3' - Transpac 4951 2 49.23 TATTTTATAAAAAAAATGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTCTATGTATGTACGATAAGATAACTGGCATGAATCAG:1 - chrX 15019728 3' - S-element 88 2 79.17 AGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACTTTTAGATATGTATATATACTTTTATATCCTACTTGATAAAACGTGCATTAAAAGCCTTTCCCGGTCCTTGACCCAGGAATGCGTGGT:1 + chrX 551073 3' + jockey 4708 1 63.01 CGTTACACATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGGTTATGCCGTGACACAGATTCGACGGTGTCTAAGCACGGTGTCACTCTAAGCCCTTTCTTTTGCCTTGAGTGTTTTTTCCTCGCTCTTTTTGGACTTAGCCTGCTGGCAGGACG:1 - chr3L 22162990 3' + 1360 3379 2 73.10 GGTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGTATATTTTCATTGCACGTTTACTTCATAGT:1 + chr3L 13156774 3' - transib2 90 1 82.19 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCCTATACGTATGTATGAGTGTGTATGTGTTTTTGTGCCTGTGTGCGCGTTTGGGCCTTTTGTGCACAATCTTACTGACTTCCTTC:1 - chr3R 16530533 3' - hopper 34 1 62.33 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTTTTTTAAAGCTTTCCAGCTGCC:1 + chrX 7967291 3' + P-element 2823 1 41.10 CATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTACACAAATTGAATAAATGTAGTTTCAAAGTGTACTACTTCAAAGCGATTCATTCCTCA:1 - chrX 21636168 3' + Stalker2 7587 2 60.27 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATTATTTTTACAGTTGCATTCCCAGCTCG:1 + chr3R 21587639 3' + roo 386 2 67.15 ACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAACCCCCAAAAACTGCCACGCCCCCATTTTGAAAAATATGATGATGCATATTTTGACTGCTTCACATCGGGATTTTTTGATTTTATATTAGA:1 + chr3L 26169324 3' - 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HeT-A 228 1 67.69 TAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAGAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTATTCATAAAATATGCACGCATAAATTGCTGTAGACATAGATGTCACAGAGAAACAATAGAAAAACTCTTTTATTATTGACCGATTACA:1 + chr3R 14997296 3' - roo 330 2 60.27 ATAACCATAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAATATTTGCAATTAACTTTCGAACTGTTCC:1 - chr3L 20894139 3' + Cr1a 4014 1 78.77 GCCGTGTATCGTACGGCTTGATGCGAGAAGAAAGCCGCGATATAGAAAAAAAAAACACATTCGAGCGACAAAAGCCAGTCACAAATACAGAGACGGAGACGGAGACACCTGTGTGCCACGGCAA:1 - chr2R 24831247 3' - Cr1a 4392 1 52.42 ATATATAATAATATGTACCAAAAGTAATTTTATATAATCAAACATTCGATCAAAAGATGCCATTATGGCCAGGTTACAATTAAAATCCTGAACAAAAAGCCAATTTAGCACATTTGGAGTGGGTTTAAAAATGCAAATGAGTGATA:1 - chr2L 15348429 3' + Dm88 30 2 78.77 ATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTTCTCTTGTTTTACGTTCTGATCAAGTCCCAGCAGTCTAAAGTAATGACATACATCTCGAGTGGCTGGGGTTTAGAAGAATACACCATGCACAAGGTAAGTCCCA:1 - chr2L 22318167 3' + INE-1 565 1 61.83 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTCGG:1 - 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chr2L 6755716 3' - pogo 36 1 56.20 ATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTAATAGTTATCTTAATATACACTGCGCGTCAC:1 + chrX 15019777 3' + S-element 1629 2 78.08 TAAAAACAAAAAAAAAACAATTGTTGGAACTATTTAATTAAATGCAAAGTCTAATTATATAGTTAAAATAAGTACAAAATTTATTTTAATTTAAATTTTTATTAATTTGACTGCCGAAAGTCTCAATAACTATGGCCAATCTTTCC:1 - chr2L 16201292 3' - Tc3 88 1 66.44 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTAAGCAGAAGAAAAAAAAGATTATTAAAAAGAAAAAAAAATGTTTTAACCATTTAATTGCATTTGT:1 - chr2R 12239724 3' - roo 54 2 58.90 CCCACATTTTTGAAAAATGTTTGGAATTTTTTTATAATTTTCTAATATATATTGATATTCTAATGTATATTGATCGATTTAGACAAATGATTTGCATTTAAGTAAATGCCAGTACTAAATATGCCATAGGGTCAGAAATATGACG:1 + chr3R 4587643 3' + INE-1 257 1 78.62 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTCTCTCACTCGCACACATTCGCCGAGACTTCTC:1 + chr3L 5179234 3' - P-element 48 1 46.92 TTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCAT:1 + chr3L 23702233 3' - G4 70 1 69.47 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCACGTCGATCAGGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGAGACCGGGGCTATTCTAGAAACCTAACGC:1 - chr3L 14551295 3' + P-element 2834 1 47.14 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACTAAGCACCCACACAACGTAAGCCATTGCCATTTTGTAGCATACTTTTGTGCGCGCCTCTGTTTATGCGACTTGTAAACTTGGTCTTCTGTGCCTGGCCCTGTTT:1 + chr3R 16530706 3' + hopper 1399 1 71.92 GTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACATAAGTGAATCAAATGTAAACGGACAAGGTCTTGACAATTTAGAATTGTTTGCACTACTAA:1 + chrX 22457216 3' + 1360 418 1 60.27 CATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTTGTTTTGAATACAATCGCTATTTGCAGTCTTCCCATTTTTAATTGAAATTTCGAGG:1 + chr3R 9346689 3' + opus 338 2 61.64 GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCA:1 + chr3R 14860196 3' - BS 5066 1 75.59 AGAAAGCACAGGGAGAGGAGCTGGAAGAGAAGCCAAGCACTAGCGCAGCTCTGCGCAAGAAGCTCGCCAACAACGCCTTCGCTTTTCGAGTTTATTTTGAAAATAGAAATAAAGAGAGCAAAGTTATGAGAATTTTAGAATTTT:1 - chr3R 20609687 3' + G6 464 1 59.03 GTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGG:1 + chr3L 18767830 3' - roo 8660 1 73.97 CGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTCGCCTTTTAACTGAGATATGGCAACAATGTTGAGCTTCAAATTGATTTTCGATCTCGACATAGCATTCTTGTTTTAATTTATTTTGTATGTTTGCTAATATAATTACATAAGAAAGC:1 - chrX 20460493 3' - diver 5894 2 77.40 ACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACT:1 + chr3R 17210101 3' - HMS-Beagle2 6951 2 65.07 GAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCCACCAGTTTTAAAGCACGATCCATTTTGCCAAGTGCACTTACTC:1 + chr3R 30558284 3' - I-element 4904 1 69.86 TTATAGTTTTTTTTTTATTCTATTCTATTAAACTGTTCACTTTAGTTTTTTTTGCACATTCGCAAGCCTTAAAAGCTTATTCTTATTTTTTGACCCGTAGCTTTTAGTACATATATGTATATGGTTTAAGCAATTTCTACTTCTTT:2 - chr2R 11793020 3' + Circe 75 1 26.03 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCCCCGTCTTGGAACTGGACT:1 - chr3R 10461637 3' + roo 9026 1 54.11 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTGTTTTCCGAATTGGTAAAAAATGCTCACTCTTAAATTATTACGTGTTAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCG:1 - chr3L 13827354 3' - roo 19 2 70.00 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGCAAAACATAAAGCAGGAGCCGCCGCAGCGAACCAACATTGCCATGATTTGTATAATTGCAGTGCGAATAATTACATCAAAATCAACAATGCTGA:1 + chr2L 20986646 3' + roo 390 2 69.78 GGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTAACGGTACGGAAAGCGCTTCCCTGTCAGAGT:1 - chr3L 23773868 3' + Transib5 2863 1 78.08 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACTTTGCTCAA:1 + chr3R 19543501 3' - roo 8712 2 58.27 GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTCTACTATATTTTGGATATTATTATTTGAGTACTATTT:1 - chr3L 18789024 3' - 1360 67 1 76.56 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTT:1 - 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FB 12 1 77.40 GGCTTGTTGCATATCTATAAAGACAGCGTTTGAGTACTCGTAGTCGTCAAAAGCCTGTAATATGTGTTTCACCAGTCTGGACCTGTTCAATAGTTCCGTGTCCCTTTCAAACGACCGGTCCTTTTCAGCGATTTTCCTTTGCTTTT:1 - chr3R 23621456 3' - Helena 390 1 74.66 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAAAAGCTCCGCTTTTCGGGCTAACACAACCGCAGATAGCACC:1 - chr2R 12069541 3' - Tirant 30 2 64.23 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTTAACCAAAACCATACCCATTCAGTCGACAAGCAGATTTG:1 + chr2L 1277884 3' + I-element 5275 1 71.23 TACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATACACTCAGCGGCTTTTCATAATCCTTCAGCCTGCGACTGGCGT:1 - chr3L 18972842 3' + mdg1 344 2 71.23 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCG:1 + chr3L 20399072 3' + roo 340 2 64.14 CCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGA:1 + chr2L 23372625 3' + gtwin 420 2 52.74 ATTTTTTTGTTGTTTTTTTTTCTACCCCCCCTTCCCACTTGCAAAGATCGTTAA:1 - chrX 18060063 3' - gypsy11 3934 1 92.59 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTATATAAACTTATTCTTTTTACCTTTCTTTACTTTCAGGTAAGGATATAAAGAGTT:1 + chrX 3767671 3' - I-element 62 1 62.86 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTAACGTTTCGTGATTGTTGCCTGATTTTTAATGCCACAC:1 + chr2L 19643647 3' - hobo 14 1 71.97 TCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTTGGCATTTTGTCTTAGCAGCAACAGAAAAAATGGAATTTATGATAGGGTCTTTGGGTGTTTTCGCATTCTGCTGGCCACGCAGATTTTGCACCGATAGCTTTTGGCCTGGC:1 - chr3R 28782509 3' + blood 7379 2 76.55 AGTGGATGCGCAATATCTAGAAAGTTTCTTTGTCTTTTGTATAAGTTAATTATGAGGAAGGCAATATTACGTTACTATACAGATCTTAAATTGTTTCATTTGTATTTACAAAATGTATTACTTTTTAAATGTGGAGAATAAA:1 + chr3R 3468802 3' - Tom1 94 1 55.63 TCGATATCCCAGAAAAATGATGAATTTTCGCAATTCACACTAGATGAGTACCGGGTATCTGATAGTCGCGGAATTCCATATACGACTATATCTGTACGACTATAGCATTCTCTCTTGTTAAACATAAAATTGACTAAACTT:1 - chrX 14001014 3' + INE-1 505 1 68.79 AGTTTATAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGC:1 + chr2L 14889008 3' + hopper2 1527 1 73.97 CTATTATTATTATTATTATTATCGCTCCGGGCACCTGGCAATAGTCATAG:1 + chr3R 11528233 3' - mdg1 7076 11 84.00 TTTTTTTTTTTCGTTTGCTTTTCTCAAACTTTTTTCAGTTAGTCAAAAAGTTGGCCCGT:1 - chr2L 13765923 3' - Doc2-element 218 1 88.14 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACATTTTCCG:1 + chr3R 22624759 3' + blood 7334 1 68.33 TCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATATACTTATATATTTTCTTCCCCGTGCTGTTTTCACTTGAGCGCAGCGAGGCATTTATCATTTTTAATC:1 + chr3R 26432087 3' - Quasimodo 49 2 59.59 CGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAGTGACATTTTCCGCTCGTAAATGCACTTTGGGTATGTTTGACCTTTGTTTTGGGTCC:1 + chr2L 20324211 3' - Tirant 8171 2 61.64 ATTGGATTTACATTGTACATATGTACATCGACTAATACATCATCATTATCATCATCATTATCTTGTCACGTGGCAAATGTATCGCATTATTAGTCATCCAGGTATAGGCCAATTCAAAGCACTCATTGCTCATCGCGTCCCTGGG:1 + chr3L 12954210 3' - 1360 3151 1 61.38 ATAAGGGATAAAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAATTATTTCTACCATTATGTGTGGGGTGGCTATTGTATCTGCCGCTGGATAAGCATTCCATGATGTTTAGCGATTTATGTAGTTTGTTTGTGTGAGCTTT:1 - 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pogo 54 1 62.69 GCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTAACCTTTTTGCATTCTCAAAACTGGGATGTGACGCCACTTTTTTAAATAAGCATAAAG:1 + chr2L 10519606 3' - X-element 84 1 65.75 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAATTGTGAGAGTATCTGGCCAATGAAATTTATGTGGTAAATTATT:1 - chr3R 9193156 3' - opus 184 4 70.34 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTTCTGGCAACTTTACTCTGTCATAAAACTTGGGAACAACAGCGACATTAATTAAGCTAA:1 + chr3L 2278257 3' - roo 62 2 62.33 CGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTTTTAAATGTGTAGAGTGCTTTGAATATCTGTGTGGCAGGAAAAATCGATA:1 + chr2L 18300838 3' - Ivk 5306 1 61.54 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCAGCATTTCCTTTGTGGGAACTGGTTTTGCTCAAATTGCGAAATGCTTAGCTAGCATCTAAGTTCTATTGGTTGTTGAAAAATAAAAGTAATTTGAAAA:1 - chr3R 10361811 3' + roo 9054 2 72.14 ATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACGAATTGCCGTTATGAGCGGCAAAGGACACAAG:1 + chr2R 15822137 3' - invader6 4500 2 65.07 GCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTTATTCAAATAAATTGTTAGTTGGTTTTTTTTTGCATTTTGAAATTTAGATTTAGCATTTTGTTTTGTGTTTTGGTTTTAATCCATTCAATCTTCTGCA:1 - chr3R 15957586 3' + Stalker4 290 4 56.16 GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACCCAATTCTTTCGAGGCTGTTCCGACTTTTGTACTTCCTGGTTGATCAAAGCATTTTCCTCTCTCCTCTGT:1 + chr3R 5430507 3' + Burdock 6349 2 55.00 TAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAATATTTCGCATGTTTGCGATGGACAGAGAAGCCGCGGCGACACAAAATGATCAGTTGTGCTCGGAATTAATAATTAATATTCTT:1 + chr3L 381836 3' + S-element 1682 2 62.33 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGACCACCACCCATTTGCCATCTTCCCATCTTCCAGCAAGCGCACGCCTGTCATAAATCTTGTTTTGAATGTCCTGCCAGCGTTGATAGCGCCATGG:1 - chr2R 20447759 3' - hopper 25 1 67.81 TTTCTTTTTTATTTAAATAAAAATCTAGAAACAAACTGCATCCCATATAAACTTTTCATTAATAGAATTGTTCAACTTTTAGGGGAAAAAAATTTTCAAAATTCAATCACACCAAAAATGTTTGCTGAAGTTGCGCTAACCTGGTG:1 - chr3L 22464600 3' - transib2 2633 1 68.49 AAACTATAACCACCAGTTGTGAAAATCTTTTCCAGAATTAGTATAAATGTTTCCTGTATCCCGTAAGACCGTCTACAATGTTATCACGAAGTAAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGC:1 - chr2R 6460797 3' + S-element 445 1 54.79 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATCAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCAACTCGGCGATTACTGCACTTGAAAACTGTATTGGTTACTTAATGACATTTTGCGATTTATGCA:1 + chr3R 22868864 3' + mdg1 7403 2 54.11 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATACATTTCAAATATATCAGATATATAAGAAAATCACTGTTTAAACAGTTTCATATTTATAGATAACATTTCATATTGTCACCAAGCATAATACCTTAAAAGATGAAATGAT:1 - chrX 20632513 3' + pogo 2091 1 74.66 GGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATTCGTGAGTATTCTAATCATTTCCTTTGATAAGGTTCTAAGCAAACAATTTGTCATTATATTTCTAGGATTTTAGTATGAAACGAGCTAAGGTACTTTTCCATAATTAGACATTTT:1 - chr2L 7939679 3' - Burdock 3 2 79.45 TGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATGTGTGTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCTTCTGCTGCTG:1 + chr3L 13872470 3' - 17.6 6964 2 62.86 CACTAAACCTAAGTTTAATCTAAAAAGTTTAATTTAAAATATTTTATTACAATTTTAAAAGTTTTAGTATGCAGTATGTCCCCCATTGGCTTTCGCTGCAAGTTGAAGCCATTTTTATCCGATTAAAAAGAGGTAAAAAAGCGAAG:1 + chr3R 6461291 3' - S-element 1478 1 82.19 TAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTA:1 - chr3R 19589892 3' - BS 5035 1 54.79 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATAATCATAAAAATTTAAATTAAAAATTTCAAAAGTGTGTATGCCAATTCACTAGCATATTTTTTTGTTTCCTATTATTTAGCAAGTGCT:1 - chr3L 23325949 3' - pogo 30 1 65.07 TTGAATCTTCCCTTTGTTTTAGTATTAAAAGCATTAAGTATTCAAATCTTAATCTAGCTTAGTTAACTTTCACTTGGTGATAGTGTTTGTGATTAATGCCCTCGTAACCACCCGTGGTGGAGGAACCATCCAAGCAGGAGGATAAG:1 - chrX 7868983 3' - Doc 4667 1 73.29 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTCCACTGGCCTACAA:1 + chr2L 18213188 3' - roo 8753 2 80.14 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCTTCTCCTCTCTGCTTCT:1 + chrX 16217547 3' - P-element 20 1 66.67 GGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAGCCGTTTCAAGCAGAGCAGTCCAGCGATAACTGCTGTCAGCTGGCTTGCACCCCGCCACTTTTCCCGGATTTTCATCATCCCGCTACCGCATTCCC:1 - chr3L 10187275 3' + Stalker4 298 4 51.37 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTATCATAAAAATCTGGGAAACAAATCATATCGAAACCATGAAATGTAGAATTCTTCTTTGTCGTTATAATTTCTAATAGCCAAATGCGTA:1 + chr3R 14494142 3' + roo 9043 1 66.21 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCTTATGAAATGCAAATTACATTTCAATAGCGCGATTTAATGGTAC:1 - chr3L 18199904 3' - Doc 23 1 69.18 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTT:1 + chr3R 6412043 3' - Tirant 8177 2 68.89 GCAACCAAGCCTCTCGGGCTGAGAGGTGTCCCAGCGAGCGCCACGAGGTGCTCCCTCTCCTCGCAATGGCATTCATGGTGAATCACATTACGCATACGCCCTGCA:1 - chr3R 7462082 3' - Rt1a 4658 1 70.48 CTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGTGGCTTGCATATTTTGATTGCATTTTGGTATTCCGCAGGGATTGTAGTTGTGGTT:1 + chr3L 14551390 3' - P-element 66 1 39.04 AATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGTACAAACTTAGTTTTTGTTTTTTGTAGAGACCCAAGCCCGCTTTCCCTGCCATTATATCGCTATTACCACGTCTGGATCCAA:1 - chr2L 21187726 3' - HB 1420 1 55.22 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTCATATTTCTTTTGATTTACGCTAACAGTTTCTTGACTAAAAAAAATATTCAATTGAGAAATCGTTCCATTCTCTAGTTTCTGTAACCTTTTCATTACATTTAAATG:1 + chrX 10287128 3' - roo 14 2 34.25 GGAGGCATGTGTAAGGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGG:1 + chr3L 15276713 3' - hopper 80 1 73.97 AGTAAGCATATAGATATAAAATATCATTATATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACAAAAAGAGGGAGACACAGATATTGACTTTATTACATATTATTATATATATGTCGAAGAGTCATCAGGATG:1 + chr2R 4284687 3' + Dm88 4121 1 72.52 AAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGGGGAGAGCGGGGGAGATAGAAAGAGGAGCGAGTGAGAGGCAGTGATTCAAGCCCTCCACACACACTAAAACTGCAATCAAATACCTGTGCCCTTAAGCACAATTGACATT:1 - chr2R 13638031 3' - blood 7179 2 87.50 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGGTTTATATGCTGAACAGGCACAGGCGGATGGCCAACGCCGGTGGCGAAAACTCAGCACTCGACTGG:1 + chr3L 20977907 3' + mdg1 7416 2 50.00 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGCATTCGATCTTGAATGGAATAGAAAACTTCTAATCCTTCATTTTTGTAGACTCTTTGATCCTGC:1 - chr2R 16510227 3' - roo 56 2 56.85 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGTCGGTAGCCGAGCTCCAACTTCGGGTTCGGGTTTGTTGTTGTTCGCGTAAAGAAGACGGCAG:1 + chrX 10806972 3' - P-element 39 1 52.31 TGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCCCGCACGTTTCCGGCGAACAACTTACTGATCCACTGAATTTTTCTCCGAACGAAATTGAAAATGTTATCAAAGAACA:1 + chr2R 1185142 3' + Doc 4618 1 54.11 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGTTGCGTAGTTCTGCACGTAGAGCAGAGTCCAGCACCAG:1 - chrX 19585125 3' - Transpac 26 2 47.26 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATAACGCTAACAAAAGGTTTATTACACTTTCTATTGAAATATACATTTTGAATCCCATTTTCCCCACATTTGGCTCTCTTTTGTTGCCAAA:1 + chr2L 3282701 3' + flea 4983 2 65.75 TAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAA:1 + chrX 20465862 3' - jockey 4834 1 68.49 ATGTACAATTGCCTGCTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATCTGGCGGTTAGACAATTAGTTATTGTTCATGAGGATAACCTGCCATCGCTGCTTTGGCCCCTTAGCAAGAGTTATGTACGTGACTCTTGGAAACGATGCTAAAG:1 + chr2R 503143 3' - I-element 5197 1 71.92 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATTTTTGAAGGCCTGGACCGACCTCTCTGCTGCGGTTATAACCTCTCTTAAGGAACGCGAAGGC:1 - chr3L 22709326 3' - 412 7112 2 60.00 CTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTACACAAATTGAATAAATGTAGTTTCAAAGTGTACTACTTCAAAGCGATTCATTCCTCAGATAATTGTCCTCTGATATTTTTTTAGGAGTAGTT:1 - chrX 21636133 3' + Stalker2 7622 2 63.70 ACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTGCAAAGGGAGTGCATAAATCAAATAGAAATTCGTCACAAGCGACA:1 + chr2R 21029446 3' + Transpac 5156 2 69.18 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGCGAATGTCTTTGGGCACGTTGCAGTCTCC:1 - 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Quasimodo 75 2 76.71 CACTAGAATATTATTATTATTATTATTCTAGGGTCTTTGCACTGACCCACTCGAAAAAGGGAAACCGAGTGTACTTCTTGGCCAAAAGTTGAGGAATGGCCAGGAGGCGAGACCGCAACACAGACAGTCCGTTCACTGATG:1 + chr3R 30262992 3' - Tc3 304 1 70.92 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGAATTACCGCGATAGGATCTGCATTTTAGG:1 - chr3L 16463477 3' - roo 47 2 51.37 TGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATA:1 + chr3R 29091364 3' - rover 7036 2 76.71 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATGCAATGAAAAGCAACCAAAAAGGAACGAATC:1 + chr2R 15151134 3' - hopper 53 1 53.42 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGAATAAATCAACCTAGTATGTTGGGCTCGGCTACGTCCAATCTAAGAGATCACATCTACCGCTCGCTCTTAT:1 + chr3L 14085011 3' + opus 7492 2 75.71 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGCTGCACTCTGCAGTGGTGTGGTTATATTCGTACTTATGAGTGAGTGTTCTTCAGTCTGGAGAGCCAGAGCGCAGC:1 + chr3R 17059378 3' - hopper 43 1 56.55 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACAGAGGAAAACGCTATATTGCTCTTCTATGATAAATAATGTACTCATTCGCTTATTCACTTA:1 + chr2R 6713979 3' - 297 6613 2 63.01 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTTCTGGCAACTTTACTCTGTCATAAAACTTGGGAACAACAGCGACATTAATTAAGCTAATTGGAACTGGTCCTCGTGTTAAAGTAGTCAGTAAAGTGCACA:2 + chr3L 2278299 3' - roo 20 2 71.23 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACATATACACCAAGAGAAATTGGAAAAACCGGTGTAG:1 + chr3L 5275015 3' - I-element 55 1 54.79 CGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAATGACGCACGGCGAAAAGTACTTTTAAAGACAACACCAAGTTATCTGATAGCTATATAAA:1 - chr3R 7673722 3' + FB 621 3 57.55 GAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTACTAAAATCAGTGTAGATGACACCTGTTTGAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTATCGCCTGCTGTGCTTGACCGTTAAATGTGCTCGCTATCTCGCCATCT:1 - chr2L 1119618 3' - Q-element 334 2 66.44 TTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTCTATATCGCGTTAGGGTGATGATTTTGGTGGCACCCCCTTTAGTTAGGAATGATGTTGGGATTGGATTGGCCGTTTGAAGAATACCGGTTCTCTTCGGGAATGCTCTT:1 - 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jockey 4719 1 73.29 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATGAACATATATGAATATATACAAATAAGCTGTCTCAAAGCAAAAGCCAAACAAAAAAGTGATTTGTTGTCATATGCAAAGTCAAATCTTTTTCGTTG:1 + chr3L 14709048 3' - opus 7139 2 62.76 GCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTATGAATAAGACACCATACAATTCCTGATTCTGATGGCATGCGATATTTGAGTTGCAGAAAACAGGCTTAAA:1 - chr2R 22792737 3' - FB 53 1 54.11 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTTCCTGAATTTACTGAAAGGTTTTTTATTATGCAG:1 + chr3L 19574169 3' + 297 353 2 58.22 TGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGTTTGATTGGGGTTTCAGTAGGCGTATGCAAATATTTTCGAAAATAAGTAAAAGTTTAATATATATATAAAACTTGTAGTGAATGAAGTTAGACTTGTTAAAGAAAT:1 + chr2L 20556607 3' - invader3 15 2 72.60 TGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCGGATATGAAAAGGTGAGTTTACAGAATTATCAAACATGTTTTTA:1 - chr2R 16496579 3' - hopper 73 1 67.81 GCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACTCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTCGCTTATCGGGTATCCCAAATCTCTGCAAATGATATGA:1 - chr2L 13140628 3' + blood 296 2 73.79 GGCAGATGAATTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGAGTAATTGTTGGGCCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATTGTTTGGGGACTCTCTGTTTGCTAGGACCACTCAGAAAAAAAAAACACAAAAATAGGTACTGCAAATAACTT:1 - chr2L 15190807 3' - Porto1 411 1 50.00 TCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGATAATGTTTCAATTAGAATACGATTATCGAAGGCAAGCGCACAAGCTGCTCGATGGGATGCGAAGGTG:1 + chr3R 20745988 3' + Doc 172 1 54.11 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCTAGAATGCTAACCATGCACAAGGCATCTCAAATTCCAGGTGTTAAAAATAAAGTACAAATACACTAAATATTTCGGC:1 + chr3L 3757256 3' + copia 246 1 54.11 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATAAATTATGGCCGCAAAGAGCGAGAAGAAGAAGACTAGAGGCAGCACACTGTCCATTATTGT:1 - chr3R 16228819 3' - P-element 36 1 51.20 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAGACGTACATACATAAGT:1 + chr3L 22884052 3' + roo 9036 1 61.38 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGACATTTTCACAGCTTCGAAATGTGTGAAATTGTGTCGAAAATAAGACCTTTAAAGCTCTTTACACAGTTTCAAAGT:1 + chr2R 11595942 3' + P-element 2844 1 53.42 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGATAACGGGGCTTATCTGAGCCGGCAAGACTCA:1 - chr3L 13228448 3' + P-element 2842 1 54.17 AATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATTTTATAAGTGCCTTTCTCAACGGTTAGCTTTTCTCGGGAACATGAGTTTCAGTGATGCCCAAATTGGAGCTTGACTTTTTAGCAGCC:1 + chr2L 16509027 3' + invader4 310 2 74.05 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGTCGGTAGCCGAGCTCCAACTT:1 + chrX 10806931 3' - P-element 60 1 26.36 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTCTTATTAGCAGTATTTGTTTATTGTTATTATTGTTTTGTTTTATTTGTTATTGTTATTAGCAGTATTTGTTTTAT:1 + chr2R 17187808 3' - roo 45 2 52.05 CTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCT:1 + chr3L 24208215 3' - Quasimodo 53 2 59.31 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGCGGGTGGTGGTGGGGGGGCAGTGGGGCATGTTGCAAATGTG:1 + chr3L 15276738 3' - hopper 53 1 57.64 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGCC:1 - chr2L 18213130 3' + roo 332 2 69.18 CTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTATGTCCTTGCAATCCTGTGCTGCTGTTCTGACATGGCCACTGCCAACCGC:1 - chr3L 10181953 3' - 1360 473 1 62.31 TAAGGGATAAAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAATTATTTCTACCATTATGTGTGGGGTGGCTATTGTATCTGCCGCTGGATAAGCATTCCATGATGTTTAGCGATTTATGTAGTTTGTTTGTGTG:1 - chrX 19820108 3' + Juan 4202 1 69.70 CCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGCAAACGAATACCTATTCGTTATGCTTAGCTTATTAAGTCTCATAAAAAAAATTTTTTTTACATCTTATTTGCTTGTGCGCCTCCTCCTTTGCGATTATCCC:1 - chr2L 9074164 3' - flea 4774 2 47.26 TTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAATTTAAAGAAAAAAAAAAATGTGTGTG:1 - chr3R 24487059 3' + Porto1 4576 1 75.00 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACGCACATTACACACACACACACGGACAAACAAACATATACGGGGAAATACAATTGCAATTTCC:1 - chrX 5145834 3' + hobo 2927 1 60.61 TTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGAATGTGTTATATTTGTTTGCGAACAATATAATTTATCTTAATTCTTTACAAACTATCTTAATTAAAGAGATATATATAAAAGACACCAT:1 + chr3R 5024940 3' + diver 6078 2 61.64 CCTTACACGTAAGATAGCATAATCTCTCCACGGCACATTTTGTTAACTGATTTATACAGTTTAAGCGAATTTCCTAGCTGCGGTAGAGCTCAGTGATTTGACCGAGCTCATCTTACAATCTATCTATTCATTTAATAAAAAGATAT:1 + chrX 5870287 3' + G5A 2709 1 52.05 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTAATTTGTCGGTACATCTTTTCAATGCCTGCCGAAACAACAAATTCCCATTTTCTCCATTTAATAATAATGTCAAAAATATCTTTT:1 - 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hopper 36 1 58.90 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAAATCATATTTATAAGAGCTTGTTGGTGACTTACCTACCCTATAATTTATGTCACATATATGTGATTTGGCTTG:1 + chr3R 11978360 3' + Transpac 5185 2 54.79 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCATAGCTTTTTGGCTTTCGAGATTGTGGAACGGCAAAAGGAACTG:1 + chr2L 11867412 3' - jockey 31 1 64.49 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATCAAATTTATTGTATAACATTTTCATATATGTATCTTTTCCTTAACAGAAAAGCATAATTGCTCCCCAGAACATGTTCAGATATATACAA:1 - chr3L 19574012 3' - 297 14 2 70.15 ATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTTATTTTAAGTTTTGCATACAGCAAGGAGGAGCCGACGAAGAGAAAGCCAAGAGGAGTGGAGCTGAAAGT:1 - chr2R 14276703 3' - 297 6523 1 68.49 AAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATATATCACTATAAACATACTATACTATAAACTACATACTACATACTATAAACATACAACCCACCTGCGATTGATCTGCTCAGATGGAAAGTAATGGTTGT:1 + chr3L 11576353 3' - HMS-Beagle2 19 2 71.23 CATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAAAGCATGATAAGTATACTCATAAATAAAAACGGAAA:1 + chr4 364958 3' - Doc 267 1 76.03 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTGAGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGCCTTTATAATCATAAG:1 + chrX 10824063 3' - pogo 3 1 75.00 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCTCCTGTTAACGAACTCTCGATGGTGTTTGAGGGATTATTAGGTTTCCGAACACAAACAAAAGAATTGAGTGAATGAAGCGGAGGGTGGGTACACTAAAGACCTAATAACCTA:1 - chr3R 22840325 3' - Transpac 4924 2 77.93 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGTTCTGGAAGTGAGTGCGGTTAAGCGGCGAGACGTTGCGCCATTAATGCGAAGCGTACTTTTGGGCGCG:1 + chr2R 7889504 3' - jockey 4687 1 54.35 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTA:1 + chr3L 10563968 3' + hopper2 1522 2 73.29 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATGTGGTCAAGGCTTTAAAAGCTCTTCGGAGTTATATTTGGTTCTTTCCGCCTATAAGTATAATTCATTTTTAAAGATTTGTATTTATCAA:1 - chr3L 13472372 3' - jockey 30 1 66.91 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTGCGCATTTTATTTTCCACTTTGCTTGTATTTATTTAAATTTGAGCCCGGCTATATGTATGGGCAGTGGGA:1 + chr2L 16385351 3' - I-element 49 1 52.05 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGCTGCACTCTGCAGTGGTGTGGTTATATTCGTACTTATGAGTGAGTGTTCTTCAGTCTGGAGAGC:1 + chr3R 17059367 3' - hopper 55 1 54.11 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAGAAG:1 - chr2R 16891811 3' - jockey 4693 1 65.22 AAGCCAGGGTATTTATACCTTTACAAGTATCGTTTTAATATAATAAAAACCAACATGTCCATGTCTGATAACCTTTTTTTAGTAGCTACAAAAATAAAGTTAAAAGTAAAGTTCTACCAAAACTATCTTAATGTGATATGGAG:1 - chr3L 17617174 3' + TAHRE 400 2 46.15 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTCTTGTCTTTGTCACTTTTCGGGCTGCCATTGTCCGTGTTTCTATGGCCGTGTGGGTGATTGACACGCCCGTG:1 - chr3L 5179100 3' + P-element 2870 1 68.79 AGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGGCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATAT:1 + chrX 23182899 3' - Idefix 85 2 76.71 TTTTTAAATTTGAAAACTGGAATCGTTTGCCCACTTTTTGTCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTATTTATTAATGTATTTTAAAA:1 - 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X-element 4292 1 72.58 TACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTGCAGTTACAGTTACAGGGAAGTTGCGTTGGCACTGACAGTCGCAGACAACACTCACACACATATAGATGG:1 + chr3R 27859602 3' + hopper 1368 1 53.42 TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAATCCGAATTCAATTTTTCAATCAATTCAATGAATGAAAATAAATAGTTAGTTCAAGATGAAGTATA:3 - chrX 19005361 3' - F-element 69 1 57.53 CCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGAAATAGTTTGCACTT:1 + chr2R 21425153 3' - HMS-Beagle2 67 2 65.07 AGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGTAGTGGAAAACTCAAGCAAAGAAGCCCAAATGCGAAG:1 + chrX 543086 3' - blood 7132 2 68.64 CAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATAGCAGAGAATGCAGCAAAATACGATTCCTCA:1 + chr2L 12678580 3' + P-element 2798 1 27.40 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTCCTGAAATTGTTTGCCCTCCTTAAAAGTATCTATTATTTTTTTTCAAGATAGAAAGCGCATCT:1 - chr3R 31650303 3' + pogo 2068 1 55.74 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATGTGCAAGGCAGGGCCGTATCCACATCGAGGGTACATATGTTTTCTTATCAGTCGAATCAGTGGAGCCATCAATCAAAGC:1 - chr3R 18697844 3' - 297 23 2 65.19 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGACGTCACTAAATTGCGGTGACGAGGGGCTG:1 - chr2R 7889354 3' - jockey 17 1 71.30 CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGTGAAAAGAAAAACGTTTTATGAGCTCATTCACAAAAAGGGCCAAAACACACACACAGGCACACCCATACAG:1 + chr2R 8335032 3' + transib2 2777 1 53.47 CAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGCGATTTCGAATAGAAGCTATAATACTTTCCAACTGCACAGAGAAAACCAAATGACACCTTTTAAAAAATAATCT:1 - chrX 18440947 3' + R1A1-element 4963 1 49.32 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTGAGCGAATTATACTGTATATGCAAATTATAGCTGGGGCCAAATTAAACGCGCAAAATGGAGGCAAAAATTTGATTTGATGATGTCTAAGGTCGCCGG:1 + chr3R 23668545 3' - pogo 42 1 55.86 GACTATCCGATACCCGTTACTGTGTTATAATTATTGCAAAAAACGAGAAGTTAAGAAGTCATTGCGACTTCGGTAACATTTTCTGGGATCAAGCCGCTACCTATCTATTTTTGTTAGCAAGTTTCACAATTAAAGTTCCCCTACGT:1 - 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jockey 4758 1 72.92 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTGCTAAGGTCAAAACAATGATGTTCTCGCAGTGC:1 - chr3R 24976182 3' + roo 9047 1 61.65 AAGATTTTGGAAATTCAAGCCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTGCAAAATAAAATTTAGCAAAGTCATGAACTCATTATGTTAAGTTAAATTTTTTTTATAAAATGTAAAGCAAGCTTGTCCCGAATACAACAATTAGGAAAA:1 - chrX 22924605 3' + Tc1-2 1253 1 67.12 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAGCAAAGTTCATCGCTCCAAATGTTTATGGCCATATAGGCTTATGCGCATTTTATGCGCGAAATCAAGAAAAATGAAAATGCATTTCCCAGACCCCAATCCC:1 + chr2R 20739139 3' - hobo 15 1 74.10 AATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAACTAGAAGGTTGAGATGCAGGGCACTGGGTCCATGGGGCCAGGGGCAACTCGAAGGC:1 + chr3R 12644612 3' + INE-1 102 1 70.45 TGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCCTACGCCTAAATAAATCGACATTCGTAACTTTTTTTTATAATAATGAAATTAATAAAACGTACATACAATATTTTTAAGAACGATACGCCTACCACATACGATTGTACA:1 - chr3R 25718141 3' - I-element 4966 1 67.81 GTTTCATAAAACCGTGTTGACACGGTAATATGATTGAAGGCGTAGTAACCACCTCTCAATACGAGCCGGAGGCTTCGATGTCAGTTTGAAGATAGCCTCTAAGCGTT:1 + chr3L 25727007 3' - 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roo 91 2 80.82 AACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAAGGGGCTAAGCGGCTAAGGGCCATTTGTGCAGCGAACCGCGTTGTTCAGCATGGGAAG:1 - chr2L 5817198 3' - jockey 4942 1 60.00 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATCTTTATGCTTACAAGAACATTTTGCCAATCGATACTATATTCCTTGGTCTCAAATGAAGAATGC:2 - chr3R 29622648 3' + pogo 2048 1 58.22 TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAAGGTCGCTCTGTCGATGTTCTGGAATTGGG:1 - chr2L 8396869 3' + roo 316 2 79.45 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGTGATATAGCTGCCAAGTGGAATTGCGGCTCTTAAAATCGACATATTGGTTAAA:1 + chr3L 18658297 3' + roo 9004 2 63.70 AAGACCAAATATTCTCTAGTCATGGGTCGCGGAAAGCATTGTACCGTCGAACCATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTATATTACGATTACGATTCAGATCCCACATGCCTATATTTCCGGCACCACCTGCAAGTTGGTATA:1 - chr2R 20410488 3' + Tc1 338 1 52.74 AAAATAAATTAAACAAATAATTAAACTAAACTTATTTAACAACATAATCCGCGCTTCCACCTGCAAAATTTTTTCTGACGCGCAAATATCGACTGGAACACTTGCATTTTGCAACCCATTTGGGCCCCAGGGGAAGTT:1 + chr2R 7061141 3' + HeT-A 10 1 64.49 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATTGGCCACTTGTTTCTAAGCGACGGCAGAGCAACCTGCTGTCATGAATGAACGG:1 + chr3R 16228913 3' + P-element 2825 1 39.57 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGG:1 - 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INE-1 90 1 76.71 GTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTATAAAAAACGTAAATATGATTTTTAGTTGGGGTTGCCGCTTGAGATTTTCGAGATCGTCATTATGACGGGCATTTAGATAGATTTATTTAAAAAAAA:1 - chrX 4428098 3' - I-element 5136 1 69.40 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATTGCAACTACAGTGGCACGTACTGCCCAAGTTGCATCCAAAAACGCCAACGAACTAGGGGAAAAATCAG:1 + chr3L 15853587 3' - jockey 4800 1 52.24 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTGACTGTATGTATGCCTGTGTGAGTGAGTGACAGTGTGTT:1 + chr2L 19158932 3' - P-element 48 1 54.48 TGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTG:1 - chr3L 3757167 3' - copia 4959 2 80.14 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGTCACTCTTAACGCTCAAGTCTTTGGTCTCCGGCAATTGTTTTTCCACTCAATTTCAATTGTTGTTGTCGGTGCTTTAA:1 - chr2L 20324086 3' + Tirant 8484 2 66.15 GAGATGACATGTCCATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTTCTTCGTCTAATTA:1 + chr2R 5045682 3' - 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F-element 114 2 79.45 TTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGTAAGATGTTAGC:1 - chr2R 5582127 3' - Cr1a 446 1 73.97 ATGTAATATGTATGTATGTATATTTATATGCATATGTACTATATGCGCATTTTCCTTTGTTTCGTGTCCCAAATTAGTTTAAAGTGAAACCACAAACCGCTTTTGATGACCACTACGAGTTTGGTGTAATGTTAATCAGGAGTACG:1 + chr3R 8576414 3' + Dm88 4375 2 60.96 AAATTAAGAGAGAGAAAAAATATATATATACAGAAGCGATGTAACGAAACAAGAAAAATTGTGCATAAATTTTCGCCCAAACTAAAGCCAGAAATGCCATTTTGATATGTGCATTTTGAATTTGCATTTAAATTGCATCGCCGGTG:1 + chr2R 12101662 3' + transib2 2427 1 60.27 CGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCT:1 + chr3L 23702289 3' - G4 29 1 61.64 TCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCTTAACTGTATCAAAGCATAATTTTGTTATTTAAAATTTCATGGCACAACTTTTTTTTGTTGGCCTTTGTGCACATTTTATGACCTATTGAAATATCTTCAACTGACACCGACTGCA:1 + chr4 1027578 3' - Tc1 18 1 78.08 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCT:1 + chrX 7967258 3' + P-element 2833 1 27.45 AAGAGGCCACTAGGGCTGAACGGGGTACCTGACAGCGTCTTAAGCTGCTCCCTCTCCTCCGGAAACCTGGAAAGGGAAGTGATTGGAAAATGATAAAATGTTTTTTAATCAATAAGTTCAGATTAAATTCGAATACATTTATGGAG:1 + chr2L 17011592 3' - Rt1b 4696 1 51.37 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTCCTGAAATTGTTTGCCCTCCTTAAAAGTATCTATTATTTTTTTTCAAGATAGAAAGCGCATCTC:1 - chr3R 31650302 3' + pogo 2056 1 54.07 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTCATATATAAATTAGATTCCCTCGCTCAACGACGCGAAAATTGCTGTGTGTACGACTCTATCAAATATGCAAAAGAA:1 - chr3R 23668406 3' + pogo 2058 1 55.86 TAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGACGAGCTGGAAAAGCTTGCGTCTGAATTGAGAAAAAAACATAAA:1 - chr2L 4420473 3' - gypsy5 36 2 60.96 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAAGGACAATTTTGTCGCTGC:1 + chr2R 16891838 3' + jockey 4935 1 63.45 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACAGAGTTGGTGGGAACGGTTTTTAACATATTCACTTGATAATTTCGATTTTAATTTCAATAAATTAAGGTACGT:1 - chrX 4214443 3' - jockey 56 1 49.32 ACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGCATTCTCTGTTGTTTTAATGTATTTTCTATGTGTACCTTGCGATTTGCTGGTCTGTGCAAAAACGGGCTATAGCGTATCGCTAAAAACTTGGCTACTTATGC:1 + chrX 22785425 3' + INE-1 540 1 75.57 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGGACT:1 - 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Tc3 310 1 67.59 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGTATGAAGTGTTCCGATAAAAAACAAGCGAATGATGAAAGGGGCAGCCCGGAAAATGTGCAATAAACAATGTATTTTGATTCGAACGTGACGGCTTATTGGATTGTCA:1 - chr3R 21587462 3' - roo 13 2 75.34 TTTATTGTTTTAAGCTATATGTGTTCAAAATGGTACTTGAAATTGATAATTGTGTTTCTTAATATTTTCAGCTATATAGATTTGCCAAAATGCCGAAGCTACTGTTAAATTCGTGCTGTCT:1 - chr3R 16352300 3' + HB 1463 1 92.56 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATAAATATATGTGCATTTGTGTATAGTATATCAGTGTGAAACACCAACGTA:1 + chr2R 9504302 3' - roo 67 2 67.12 CAATGGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCAGCGGCGAGGCGAGGCGATTGGTTGCGTTTTTGTGGGTCGCCCGGGGCTTACCTCACCTGCCTCACTCACGGCTCCATTCGCC:1 + chr2R 11379561 3' - hopper 36 1 57.53 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTA:1 - chr2R 9504208 3' + roo 9010 2 62.33 TTTGAATGTGTTTATATGTTTTTCTACACCCTTCTATAACTACACTCTATACTTATTTTGAAGTATGGGTCTTCTGTGACCCTGTAAACAAAGGTATATCGGACAATGAAATCAGTTGGCCTAAAACCACTAATTGGCATATGGAT:1 + chr2L 8750879 3' - HB 417 1 51.37 TATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGTATATTTTCATTGCACGTTTACTTCATAGTAAGATAATATTAAATGTTTTCCCAGCTCAACCAAGCTTTCACTTTCCTTTAAATTTAATTCGTCCACAATTATCCGCT:1 + chr3L 13156852 3' - transib2 12 1 76.03 CAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTC:1 + chr3L 10563972 3' + hopper2 1526 1 70.55 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTACTCAAAATATGTACTGCAATGAAAATATAGGAAACCAAACCACTTTGAGAGGATTTCGGGTTGAATAATATC:1 + chr2R 7781343 3' + S-element 1674 1 57.93 CAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATGTAAATAAAAG:1 + chr2L 21570284 3' - Dm88 4402 2 58.22 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGT:1 - chr2L 22719603 3' - 1360 35 1 72.41 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGCATTCGATCTTGAATGGAATAGAAAACTTCTAATCCTTCATTTTTGTAGACTCTTTGATCCTGCTCAACTTTAAATTGTTAAACAATATTAACAACAATGG:1 - chr2R 16510190 3' - roo 8683 2 73.97 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGAGTGAATCCCAATCAAATAGTACCCTCCCCTCTGAGCCAATCCTCCCTGCCC:1 + chr3R 27188622 3' + roo 344 2 62.86 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACCATCTACGTCTCGTTTCGTTTCATTTGGATGTGCGGCAACAATTTCAGAA:1 + chr3L 9519685 3' + roo 9055 2 69.78 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATATATTCAAAAGTCCAACTTTGACGCGCCAAATGGTTGGCGGTGGGGAACGCCATCCTCGCAACTTCC:1 - chr3R 22522620 3' - roo 46 2 54.68 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATAC:1 - chr3R 24976224 3' + roo 9034 1 60.58 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCAATCATGTTGATTGATCCGCTGTGACT:1 + chr3L 17904873 3' + roo 9009 2 62.33 AACCGACAATGCCACCGATTTCAGCATTGGTTTTACCTTCAGAGATCATGTTTTTAATCAAGTTTCTTTTTTCGACGGCATAATGCTCTCCGCGACCCATGACTAGAGAACTTGTGGTCTTCTTTTGGAACAAATTAAAAAAAA:1 + chr2R 4608375 3' - Tc1 437 1 76.39 TCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGTTCACATTGGTACGATCGGAGTGAATTCATTCGACCATATCTGTCTCCGACGGTGTCTCCCTC:1 + chr3R 4901407 3' + F-element 4263 1 39.73 TTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTGAAAAATGATTATAAGGGGAGCCACAAAAGGACACAATCGGCGAAGGAGGGGGGTGTACCAAAAGGAGGATTTGTG:1 + chr2L 17207009 3' - hopper 1346 1 54.35 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCCTGACTCTGATCTTCTGTATTTGAACGCATTTATGTACATGCAT:1 - chr3L 20398997 3' - roo 8741 2 71.92 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTGAGCGCCTTTATGGCTGCTTGACTATCAGTGAT:1 - chr2R 4330775 3' - copia 4917 2 68.57 GCATACTTGTGAAAAACGCATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGATGGCTGCCGGAATTGAATTGACGCTCATGATTATTTACGCAAAGTGGATTAGAAAATTTTTATGGTTTCGATAAGCCGCACATTAAT:1 - chrX 19982321 3' + hopper 1380 1 60.27 AAAGGGGTAGTACAATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGTCTTATATTTCTTTTTATTTATTAAATTTTTTTCAATTTATTAAGTTCTTATAAAT:1 + chr2R 4774795 3' + baggins 5391 1 60.96 ACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1646 1 67.97 GTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGGCCAAAAAGAGATTCCATCAGTTGGACAACAGGACGACCTGGTTTCGCTTTTGGACATTTTTAAGTGCG:1 + chr2R 9623454 3' + I-element 5330 1 67.12 TCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTACACATCTTAGTCCGACAAATACATGTATGTATAAATTGATATATTTCGCTGACCACAAAACCAAGAACCAGAACCAAACCGAACGACCGCAACACTACCACACCCCCTCCACCAC:1 - chrX 13383206 3' - HB 13 1 54.79 AAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTT:1 - chr2R 9504197 3' + roo 357 2 54.79 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCTACCACATCATTCACTTGACCACAATCTAAATTAATCCCGCCCGAGCTGGACCTCATGGATGTC:1 + chr2L 18953129 3' - roo 8693 2 57.63 CACAAGAACACACACACACACACACTGATAGCTAGCCAGGTGTGTGGACTGACTGGTCTGTCTT:1 - chr3R 30357842 3' + gypsy3 419 1 76.56 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGGCTGAAACGCAGTCGTTGAACCCCTCGTTGCTGAGGATTCAGAAAGACTAAGTCTGTGTCTGTAGC:1 + chr3R 24053748 3' + mdg1 367 2 54.11 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCGTTTCTATGTTCCTTCGTGGAATTTCACAATAATCTTTTCCATCAATTGCTGAT:1 - chrX 4823535 3' - pogo 49 1 60.31 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAAGGAGATTAAATTTGGAAAACAGGCAAATAATTCAGCAACTGATTTACGAGCCAACTGGGACCGCCGAGCCTCAC:1 + chr3L 16875815 3' - jockey 4783 1 67.81 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGAAAAAACATCATCACCCGCCCAAGGTTCATCTAATCATTGATTAAGCTGATTTTATTAGAAAAAGATTAATAAAACCCTTCAGTTC:1 + chr2R 11339164 3' + jockey 4954 1 43.84 GTCAACATGTAGTTGCTTGAAAAAAATTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTCCATGTCCATGTTGAAGTGTATTCAATTCCTAACTCAAATCTTGTAACCCTTTGGAAATAATCAGGCTC:1 + chr3R 16480930 3' - hopper 1046 1 76.71 ACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTGAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCGACGAAAAAAACCAATTATTGAGAAAGAATTTTTAATAGA:1 - chr3L 25322118 3' - Doc 95 1 74.66 ATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTT:1 - chr2R 9504197 3' + roo 9026 1 51.77 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAGACGTACATACATAAGTTATT:1 + chr3L 22884056 3' + roo 9039 1 63.70 AAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGCGTAATTTAATTCACGTGAAAACTGCACAAAACTATGACACGACTCC:1 + chrX 22711718 3' - transib2 26 1 65.69 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAATCGGGCTTTCAACTGAACGGACGG:1 - chr2L 13717278 3' + P-element 2884 2 72.92 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATG:1 - chr3L 13228498 3' + P-element 2790 1 19.18 ATAGCTGAGTTTCCCGACTATCGGATACCCATTATTCAGCTAGTGAAAGTACGAACCAGAAATTTTAACATTTTCTATTAGGAAAAATTAGAAAAATTAATTAAACTAACTCTGGAAGCTGCAAGCTTAATCTCTCTATATATACT:1 - chrX 14276802 3' - INE-1 564 1 67.81 GAGCCGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGC:1 - chr3R 4532889 3' + 1360 3311 1 71.23 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTACTTTTGGGATAAAACAAAATACAATCTTACAAAACAA:1 - chr3L 16907791 3' - jockey 91 1 72.60 ATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACATACTTTTCAACAAATCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAAAAATATACTGACAGAATTTA:1 - chr2R 5296814 3' - INE-1 103 1 69.86 ATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGATTATAATTCCAATTCGGTTATCCAATAATAAGTGGAAGTGAAATACGAAACAAAACCCATTTATGCTACATGAAGATGTTATTGAAAT:1 + chr3L 9462297 3' + 297 484 1 77.40 GATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGTGTATTTGTGACGTGCATGTCAAGTGGCCAACA:1 + chr3R 15168949 3' - jockey 96 1 76.03 CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAACATAGGAACTATTTTTAGTTTCGCACTAATAACGTTTCTGCAATTTTATTTAA:1 - chr2R 969152 3' + flea 4950 1 62.33 AACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGAATGTGTTATATTTGTTTGCGAACAATATAATTTATCTTAATTCTTTACAAACTATCTTAATTAAAGAGATATATATAAAAGACACCATTTATCTAGA:1 + chr3R 5024949 3' + diver 199 2 67.81 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAACTATAGAGCTACCATTTGCTGGAGGCAAAGCAAGTAAGCCAACGTTGTTGTCATAAGCTATGAAAATAAACTACATTTACCACAGAAGCCGAACGAATGACAAGCCAC:1 - chr3L 10442766 3' + roo 396 1 77.40 CCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAA:1 + chr3R 6412053 3' - Tirant 8157 2 60.00 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATATATAATTTATATTCGACCATTTGTGAAACTAAAGGCTAACATGATTTCGTTCACACTTATGAATTTAGTTGCCAAGGCTGATTA:1 - chr3R 21753406 3' - 297 13 2 58.65 GCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATAAGCCTACTCTAGATACGATTCAACGAATCTAGTAAATCCTTTTACTCCATAAGCAATGGGAATAAAAACTTTTTATTTCAATATAATTCCGCATATTC:1 + chr3L 27146338 3' + HMS-Beagle2 291 2 68.49 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCAGGCTTCCACTTTGGCTC:1 + chr3L 9762273 3' - jockey 4801 1 48.20 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTCCATAAATAAGAATAAGCTAATTCTCCTACCAATCCTAGCGTGGATTCTCATAAGCCTGTCAAACCATAATTGTATTCTTTATCAACAACAAAAGTAAACAAAGGACTCAATTAT:1 - chr2L 5446708 3' - roo 8739 2 73.97 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACGTACAGCACGCTGGGGACAAGAAATATGTTGTCCTTTTAGGCGTTGACAAATCGGCGCTCACACTCACGCCTAAA:1 - chr3L 13544962 3' + hobo 2920 1 63.03 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGGCATTAATTCATTAAGCATGTAGCTTCTACCAATACATATGACTCGTTGAAAAATT:1 - chr2R 11562816 3' - pogo 63 1 61.64 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGTGTATTTGTGACGTGCATGTCAAGTGGCCAACACACACATGCACACGAGACGAAAAAAGGACCCTGACCAATTAGCACAGGAAGCTGTCAGTTATGGCCA:1 + chr3R 15169016 3' - jockey 28 1 67.81 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCTAAATTAGCATTAGGACTGAGTTTTCCTAAGTGCAAGCACTGTCTTATCCTT:1 + chr3R 8914351 3' + pogo 2034 1 65.75 ACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATGTCGGAGCACAATTATTATTTTCCATTTCGCGCAGCGAGTTTCGAACGCACCGAAGATTAAATTGCAATTAAATCACAAATCATATATGTCTAAAATATGTAATAAT:1 + chr3L 23529727 3' + Stalker2 233 2 66.44 TATTTTATGTTATTAATTATTTACTCAAGTGATTTTATACGAAGCTTGATGAAACCACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTAAAATTGAAGACTACGCTCTCATACAGTATTTAATTGACGGCAT:1 - chr2L 21400701 3' - Doc3-element 68 1 46.58 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAGGGTAGGAGAGTGTCTGTTGTCGTCTG:1 + chr3R 22522739 3' + roo 9020 2 51.37 TAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATCTTTATCTGAAATTAGACCACTGTGCACGGAAACACAAAATCAAATGCATGCAAAAAACAACTCCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGA:1 - chr3L 24796712 3' - Cr1a 442 1 49.66 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGGGAATCGGGCTTTCAACTGAACG:1 - chr2L 13717283 3' + P-element 2840 1 46.67 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTTTACAGTGTACTGATACTATACTGATACATACTGATGCTTTTAACGTCATCATAAATTCTACAAAATATATTCGGGATTTATTTCTGC:1 - chr2R 15942240 3' + opus 479 2 42.96 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCACCAAAACGTTATGACAATCGTATGGAACACCCAACCACATCCATGCATAGGAAAAACAAATGGGA:1 - chr3L 9519541 3' - roo 56 2 58.90 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAAT:1 + chr2L 13140683 3' - blood 7096 2 73.29 GTATAGCGTTACGCATCTTGTCTTTGGCACTACCTTGACTCAGCTTTTTAGGTCGTTCATACGGACAGAAAAACGGACATAATAGTCATGGTTAAAATCCTATGTACTACATAAGGTCAGAAGAGTTTCCTTCCACCACAGTACTT:1 - chrX 6757112 3' - 1360 16 1 73.29 GGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATCTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATGTCCGAGTAGCGAAGGTAACTTGCGTGATCGAAAACC:1 - chr3L 2776051 3' - Stalker4 127 4 73.29 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAAAGTAAACACAATCTCCACTTGGAGACCAGTCAGCAAATTTCAATTTCACAATGCTGGGAAATAGCTTCAGCAT:1 - chr2L 22921231 3' - copia 4916 2 56.16 TTTCTGATTTTTAATTATACAAATTCCAAAATTCATTGGAAAACAAAATGTTCCGAAACTCAAAGGAATAAACATTTTGGGAGCCTTTGCGTACCATTCATCATTTCAAAAAACAAAAAAAACGAGACCTGTAATCATTTCCAGT:1 + chr2L 19157779 3' - invader2 4736 1 73.10 ATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAGGACA:1 - chr3L 27356049 3' + Tc3 1668 1 67.12 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAAT:1 - chrX 10287007 3' + roo 322 2 78.08 CACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAG:1 + chr3R 1977620 3' + micropia 381 2 64.83 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGATTCGCATTTCCGGGTTATTGATTATTGTTTAAAAAGTTTTGAGAACTTTTTGTTAGATTCGAAT:1 + chr2L 13510926 3' - diver 5905 2 73.29 TTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCCCTATTGAAACTCACATGCACAAAATAATCGTTTCCGATTGACTTTA:1 + chr3L 3565436 3' - gypsy 35 2 58.90 CATATACATATATATGTATATATATGTTCAAATGGAGGGAGGCGGTGGCACACGCATATTATGCCTAATTGATTTTCGCCTCCTAAGTGGCAACTCAAT:1 + chr2R 13533423 3' + Stalker2 7499 2 77.78 GAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACGAATGGCCG:1 + chr2R 15822114 3' - invader6 19 2 50.00 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATCGATAAGAAAACGAGGGGACACAAAA:1 + chr2L 13140720 3' - blood 7059 2 52.74 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATAGCCGTGTGTGTAGTGCGATT:1 - chr2R 15151064 3' + hopper 1413 2 60.42 GCTATGCTAACAAGAGTCACGACAAGGGAAAAAGGGAAAAATTCCGCAGCCTGTATATCTAATAATTATTCAAAAATGTGGGCGTGGCAGTTTTGCGCGGTTTTAAGGCGTTAGAATGCCTTGATTCTCAACCTTTTAGCTTTTAT:1 + chr3L 22753878 3' + mariner2 701 1 58.22 ACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAACAAGTCCATGTGCAGTCATTTGGTTGTGCTTGGGTCTTTTTTCGAGGGGAATG:1 - chr3L 3339338 3' + Transpac 245 2 62.33 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGAC:1 - chr2L 13717316 3' + P-element 2796 1 21.92 AAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTTTTGG:1 - chr2R 9504193 3' + roo 9036 1 56.30 GTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTA:1 - chr3R 19450195 3' - roo 8796 2 51.37 ACTATCAGATACCCATTACCCATGCAGGTGGGGATGCGACGGAGAAATTTTTGCATTCTATTGGCATAGGGAAGGAAACTGGACGTCACACTGTCTGCCAGCTGAGAAATTATTTTTATTTAAATTGTTTAATTAAAAATCTCAAA:1 - chr2L 18859163 3' - INE-1 548 1 61.64 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGC:1 + chrX 7967260 3' + P-element 2824 1 26.55 GCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAACTATGTCGCTTCTCTTATGTAATGCAAAATTGTAGTTATTCTTATTATTTACCGAAACGTACTTCCATCCACTATTCGCCGATTTGCAGTTGTA:1 - 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chr2R 13212159 3' - diver 14 2 73.97 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTTCCATCAACATTTAAGGCCGCAGCAAT:1 - chrX 2518006 3' + P-element 2853 1 57.46 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGCGTAATTTAATTCACGTGAAAACTGCACAAAACTATGACACGACTCCACCGCGTG:1 + chrX 22711726 3' - transib2 20 1 69.06 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTTATATATTATATTGCCAGGGCATATGCTACGGCTACCTTGTCATATATCAAGAGACGTCATTATTTCAGGCATAAACTCT:1 - chr3R 20089915 3' + mdg1 386 2 60.96 GCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGTGCACACAGTCATGATTTAATAGGTAAATCAGGTTGATGAGCGTTGAACAC:1 - chr3R 30302273 3' - Doc 76 1 63.70 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATT:1 - chr2R 7889393 3' - jockey 79 1 72.31 ATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAGAATAATGCCATTTGATGCTACTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTG:1 + chr3R 25400123 3' + Idefix 49 2 55.56 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGATGGCTGCCGGAATTGAATTGACGCTCATGATTATTTACGCAAAGTGGATTATATATTTTCTTTGGGGTAATTGCACATAAGACTGCCTTCTTGATTAAACGTCAATGG:1 + chrX 3196310 3' + hopper 1402 1 37.93 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATTCTTATTTTATACATATACTCATTTTTAATTTTCGATATTA:1 - chr2R 978446 3' + copia 210 2 77.24 ATAAAAAAAAACAACTAAAAATCCTTTAAATTTCAAGTGCAAAACCATTCAAAAACGTTGCCAAGAAACGCATAATTTTTAGCCACCTTTGCTAGTGATTTCAAATCACTTCGATGAATATTTTTGATAAAAGCCCATTAAATTTG:1 - chrX 11650967 3' + Transib5 27 1 58.90 GGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGCGTGATAGGTAGTTGCGGCGAGAAAGAGGAGGGAAGTGCACTTTT:1 - chr3R 16715865 3' - Cr1a 298 1 85.71 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCG:2 + chr3L 13228564 3' - P-element 57 1 46.58 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATCATCTAATACACGGGCTGTCAGGCCAGGTGAGTGACAAATTGACATGTCGCAAAAATGATGAATCTACCAGCGGCGGGCGGG:1 + chr3R 18697988 3' + 297 6956 2 60.00 CCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAATTGTGAGAGTATCTGGCCAATGAAATTTATGTGGTAAATTATTCACAAAATATACCATTCAGTTCATTTTTAATTTC:1 - chr3R 9193122 3' - opus 7145 4 63.50 AAGGTATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCGTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACTGTCTGTGTAGAGTAGTGTATAGTTGTTGTTCTTAAGTTGATTCTTG:1 - 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I-element 4946 1 59.59 AAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGGACAAAAGGGAGAGTAAACAAAAACGACCAGAACTAGAAAGAAACAAAAACTGAGAAAGAATTTATAACAGAATTAAGAGAGCGTTTAAA:1 + chr2R 3523290 3' - Cr1a 268 1 53.42 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATAAATATATGTGCATTTGTGTATAGTATATCAGTGTGAAACACCAACGTACAAACACACACTGTCAAT:1 + chr2R 9504320 3' - roo 8712 2 54.48 ACTCAACGGGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGCTTTATTTAATCTTAAGCTTCCTCGTTTAGTAACTAAATATTTTATACATATGTATATATGTGTAAGAGTGAGTTTTCCCTTTTCTTTCAGAGCACTGTTGCGG:1 - chr3R 12609948 3' + roo 9056 1 72.41 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTGAACTGAGCACTGAATTCCGAGCGCTAAGCGTCGAGAATCAAACGCCCAAAGCCAGTGATGATAAAATATTTGCAA:1 + chr3R 18518076 3' + roo 388 2 69.18 AACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTAAATGCTCATAATGAAAACCAAACTTTGCGGACATGAAAATGCAATTC:1 - chr3R 5766812 3' - R1A1-element 5271 1 66.67 AAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTCGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCACCCTATTTTGCGCAATTAGATGTCATTTAA:1 - chr3R 29091268 3' + rover 304 2 56.85 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAACTTCACTAGAATTAAATAATTATGAATTTATTTTAGGGGTATTAGAGCTTCG:1 - chr2R 21473589 3' - pogo 21 1 60.19 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGAAAACAGTAAATTGCATTTTTATACAATTTTCCATCATTTGACTTGGCAGTTGTTCGTCTGGGCTTTGTAATTTTCAAATGAAATACTTTCCGAA:1 + chr2R 20700759 3' - mdg1 7065 2 67.12 ATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCACGTGAAAACGTGTCTCTGTATCCCAACTTTT:1 + chr3L 18767879 3' - roo 8610 1 58.90 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAG:1 + chr3L 9907371 3' - BS 5043 1 51.03 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCCTATACGTATGTATGAGCGTGTATGTGTTTTTGTGCCTGTGTGCGCGTTTGGGCCTTTTGTGCACAATCTTACTGACTTCCTTCCGGGCGAACAGGCCGTGTTTTGTTGCTG:1 - chr3R 16530505 3' + hopper 1409 2 78.77 GGCGAAAAAATCGAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAAACTATTATCTTCGCCGAGGCCGATCCAA:1 - 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chr2R 5582118 3' - Cr1a 437 1 80.14 TGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTAACC:1 + chr2R 6271500 3' - blood 7225 2 76.03 GGCCAGTTGGGTGGGGCCCAGCACACTTGCCACAGATTGGATCCTGGAGACAATAGTTTTTGGAGTACCCAAAAACGTGGCATCTCAGACATTGCAGCACTTCTGGAGTGCGACGAGCGCGTCTCTGTCCTTGGCCCCGCTCTTCG:1 - chr3L 18801404 3' - jockey2 397 1 69.18 ATTAAAATATTTAAATATGTATATTCCCATTTCTTTACAAAATGTAGGTTCAGTGATAAATCCATCATAAATTCAGTTCCTCTCTACCAAATGAGTACTTTGAATAATCCGAGCTTTTTAGCGTTACATGATCTACAGCTGCGACT:1 - chr2L 12596672 3' + G3 4501 1 55.48 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATCTACATATATAGTATTATATGTATAAATAAAACCAAGCAAATGATATAAAAAAGAAAACACACAGCGAACA:1 - chr3L 15859604 3' - I-element 50 1 54.11 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTG:1 - chrX 12003926 3' + P-element 2814 1 35.62 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAAGTGTAAAGGGAAATGGGCAAATCTTAATCAGAAATGCCAAAGTTGGATTTCCGA:1 + chrX 12998094 3' + roo 9005 2 61.64 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATTGTCAAATTCCAGGCACAATATTACATGAAATCTACAAATAAATAAATAAGTTACTCGAATACCCTAATAACTTAAATACAAACCAATGGCGCTAAGCATTCATAAATC:1 + chr2R 14722815 3' - mdg1 7050 2 77.40 AAATGATCTGCGACACGGCCTTCCTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTCAATAATTAAACAGAATCTTTCAAAGGCTTATTTTTTTTTAATATTTCATCAATATTTCTCTCAATGATTTATCCAGATTTTCTCA:1 + chr3R 6716453 3' - invader1 3603 1 71.23 ATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACTGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGTGGTACGGCCTCTCCATTTTGAACTCGCCGGTGCTGCAGTACTTCTACCACCAGATATATCACA:1 + chrX 8274992 3' - F-element 4534 1 58.22 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGAATTACCGCGATAGGATCTGCATTTTAGGGTAAATTAACTTTGAAATGCGATTTAAATAGGGTG:1 - chr3L 16463442 3' - roo 10 2 76.39 TTTTTCTGGGATATCTATAGATTGGGAAATACATACAACATTGTTTTATTAAACCTATTAAAAAAGTTCACGAAATTTACCTAAAATCCTGTTTGTATGCCACAAAATAAAGTGTTTCGAACTTGAAATTCTGACGCCAAGAAGTA:1 + chr3R 12363733 3' - INE-1 500 1 72.60 AACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTCTCAAAACTGGGATGTGACGCCACTTTTTTAAATAAGCATAAAGAGCGACGCAGCCTT:1 + chr2L 10519620 3' - X-element 44 1 51.67 AAAAAAAAACTAAAAAAAAAAACAAAACGAGCCGAAAAAGAAGAAGGTTGGTTGTGGTAATTCCAATCCGCATTCTGGCGACAAAGTTGCCGCTAAAATGCGAATACTTGGCAAATTATAATTTGTGCAGCGATCGAACAGTTGGC:1 - chrX 5017888 3' - hopper 144 107 66.44 AACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTAC:1 + chr3L 16047625 3' - Cr1a 461 1 56.19 TATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAAGCCCAGTGAGCCGCAGGGATTGGGCCAA:1 + chr2R 9623390 3' + I-element 5266 1 77.40 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATGCAATGAAA:1 + chr2R 15151112 3' - hopper 75 1 68.49 AACAAAAAATCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCATGGCGAAAAAATAGTGTGCCAAAAAATCGTATAGCGTTACGCATCTTGTCTTTGGCACTACCTTGACTCAGCTTTTTAGGTCGTTCACACGGACAGAA:1 - chrX 6757188 3' - 1360 84 1 77.54 AACAATGTATTATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCATTGGATTTTAAACGGGTTGGCCAGAACGGGAGTACCCTACATAAGATACCAGTG:1 + chr2R 16247092 3' - rover 374 1 60.87 ATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTAGCTGTAAGATTCATTTTTTATATTCAGTTTTATGTTTGACTATAAATAATTGCGATGTCTGTCACACCTTAAAATATAACCGCCACCCCCCAAATATTAAATTCCAA:1 + chrY 132168 3' + Gypsy6A_LTR 111 1 53.96 AAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACTCGGAAATTGTCATAAATTCATTTTTATATGTGAATCA:1 - chr3L 7459406 3' + I-element 427 1 73.97 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGTGTTAATACTTATATATTTTAAATTAAGTTTTTATCCCACCTACAATGGCTCTG:1 - chr3L 21162026 3' + roo 9006 2 63.70 GGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGAAAATATATTGTTTAGTTTCTAAATTAAATTGACAATTTCTTTTAAAAGAGTATCCATGAACAGA:1 - chr2R 7407973 3' - Idefix 50 2 60.96 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAAACGACCTTGCACAAACCAACAACAACCATAGCGACGACAGCGGCGGCGAAGCAAACCACGAAGAAGAAGACGCAGCACC:1 - chr2L 21250917 3' - P-element 22 1 66.40 TTAAGTAATAATAATAATATAATAATATCTTCATCTAAACATTCGCATAACTGCCAAAATACCGCCTGCAAGAGTATTTCAAACTTCCCAACCCGATTATATCCTTTCTTAATACATTTTTTTTCCTTCCGGAAGTGCGTGCGCCT:1 + chrX 13977313 3' + invader3 5042 3 78.77 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCACTTTTATGTAACCTTATTTATTTCATATTCTTAAGATAAGTTGCATTTTTTTATCCAATGCTTTTT:1 - chr3L 18792403 3' + roo 9033 1 54.55 GAACTATAAAAGATAGAATGTTGAGATTCTATCTTGATATTCTTGTTGATATTTTTTCACATTTTTATTAGTCTTGTAAGTTTTGAAATTTTTAAAAAAATTTCCCCATTTATTCCCCAACATCTATCGATATCCCAGAAAAATT:1 + chr2L 21379119 3' + INE-1 158 1 64.83 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTT:1 + chr2R 11562885 3' + pogo 2051 1 72.55 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATCGAACTATAGTCAAATAACAGCTTTGAGTTGTGTGTTTGTTCCAGGGCTGTAATGTTTAATAACTCGGAAAATTAACCGTA:1 - chr3L 21151065 3' - 412 40 2 58.22 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCCGCGAAGTGGCAAACGTCAGTCAGTACTTCAGCCATTTTCCAACTAGAGCTCCAGTTAA:1 + chr2R 9410558 3' - hopper 26 1 56.64 TTATATTTAAATAATAAAACAAGTGTTTAAACATGAATCTTCTGAAAAACTAAACGATTTTTGATTTGGTTTCTTGTTAACAAAAATGATGACTAGACATTTACCTCTTGAGCCTAATTTGCATGCCGACAACGAC:1 - chr2L 11798139 3' + TAHRE 51 1 53.68 ACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTCGCTTATCGGGTATCCCAAATCTCTGCAAATGATATGAGATA:1 - chr2L 13140624 3' + blood 299 2 72.60 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACACAGATACGGATACAGACACAGATACAAATGCAAACAAACAAACACACACACACACACACACACTCGCATAACGGTACATTAATTGATAATTGTTTTGTGCTCAAAAGA:1 - chrX 6377230 3' - hobo 14 1 69.86 TTTTATCTATTAACTTAGTTGTCAAAACTAGTTACTAAATCCATATCGTTATCAACTTTGTATCTATGTATCTTGAAAATAGCTCACAATTGTCTCCATCTTTTTGATTTCTTCCACAGATTGCCCTAAAGCGCTGGTACCGCAAC:1 - chrX 18306802 3' - Bari2 213 1 69.18 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCCCTCGGATCGGATCCTGGCTAGCAACTCAACAAGCTAACAAATTAACATGCCG:1 + chr3R 10461747 3' - roo 30 2 52.29 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCAGGCTTCCACTTT:1 + chr3L 9762268 3' - jockey 4797 1 48.46 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTATAAGCTAAGTATTTAAGAACAAACAATGACAAAAGTTAATTAAAATGTTCGAATCCAAAAAGTAAATGCTTTTACTTAAGCGAGAAAAACTTTAAATA:1 - chr3R 12727093 3' - I-element 23 1 65.07 TCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCGGATATGAAAAGGTGAGTTTACAGAATTATCAA:1 - chr2R 16496590 3' - hopper 84 1 73.97 ACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGACCAAATTA:1 + chrX 21587781 3' - INE-1 125 1 36.99 GTATGACAAAGCTGCTCATATTTTTCAAGGTCTATAGGTAAGGTATAAGTTATAACATTTTATGGAATGTTAAGTTCAACTCATCCTTTTGGTATTATTTTGGACATTAAAAGTTTAAAAATGTTGTCAGTAAACAATAAGTAATT:1 + chr3L 17877534 3' + hopper2 434 1 74.66 AGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCCACTGGGCTTAAATATTTAGCAACAGTTTGCAGTGGGGAAGTTTTTCGGGGTACGAAGGATGGGGTGGTCCA:1 - chr2R 9623320 3' - I-element 54 1 49.32 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGCATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCCACTTGGACATTCAACTCACCACATCGGATGTTGCGTAGTTCTGCTCGT:1 - chrX 19585145 3' - Transpac 4941 2 42.62 AAGGTTAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATATGGACATTTTACAATGCGCGACGAGCCAGAAACCGCAGGATTGCTTGCGAATTTTCCCAGCTATTAA:1 + chrX 1764172 3' + opus 458 2 56.85 CTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACACATAAAAATGTACTTTAATTTAATTTAAACAGTTAAGGAAAATAAGTATTTTTTTAG:1 - chr3L 18046561 3' + mdg1 157 2 60.96 ATGGTCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATGTATATACTTTATATGTATTATTAATTTACGAGTAACGGGTATAACAATCTGAGTCGAAATCATAATTTTTATAAAATAAGATTAATTCCTGATTAGCAACATAGAC:1 - chrX 15903134 3' - INE-1 103 1 36.30 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTTGCGTACAAAATTCAACATTATTTGAAGGTCGTCCTTTGCTTATTCTGCGCGTCGCTTTTTACTCGTTCGCTCTCTCTTCCCCAGCGGGCTTTTTTTT:1 + chr2L 21251073 3' + P-element 2866 1 71.92 AACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTC:1 + chr3L 18738140 3' + Bari1 1651 1 66.67 TAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAAAATAAAGCACTTGTTTACTTCGTCGCAAAATC:1 - chrX 10367573 3' + Juan 4119 1 78.77 AACTGAGAAAAAAAATTAAAAATTGTTCCAAAGTGTGGACGTGACCGGTTCGGCGGCAATGCGTCTAATATACCCCTTTACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACAGGATGAAAAAAGCCAAACTTAATAACA:1 + chr3R 24506356 3' - INE-1 470 1 70.68 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAACAAATACACGGAGCAGATTCGAGTGAAAAGCGTTGCCTACTTTTGGGGCTGCACTTCCATTGTTTTCGCTGGCTGCCCCGAAAAAGGGTTTGATTGTCGAATCT:1 - chr3R 15168842 3' + jockey 4972 1 70.55 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTAAGGAATGGTGGATGGAAGTGATGGAGCACTCGAAGAACCC:1 - chrX 14346429 3' - roo 8713 2 65.81 GAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACGAATTGCCGTTATGAGCGGCA:1 + chr2R 15822126 3' - invader6 19 2 57.53 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTTGTATTCACAACTTTGAACACTAACATTTAAGTTA:1 + chr3R 5762014 3' + roo 323 2 76.71 GTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTAAAGTTTTCCTTCGCACTAGGCCAAACTCCGTTTGGCGC:1 - chrX 20636950 3' - Quasimodo 47 2 65.22 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCCCTGTGCATATACATATGTACTCGTATGTATGGCATGTAAAAACAATCAGGACAAGATCTTCAGGCCCGCTTGGGTCAGT:1 + chr2L 15906122 3' + Tabor 7282 2 56.16 GATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGATCGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAAACATTTAGAAA:1 + chr2L 22684621 3' - transib3 50 1 57.53 AACACACACACACGCATACATACACACGTTTTTCCCATTTCACATATTTTTTTCCCCAAAAAAATTGCCCGAGTTTCTCAGCTTTTGTGCGTGTGTGAGTGGATAATATCGGTCTTGGTTATTCCCGAACAGAGCTAATAGCAGG:1 + chr2L 9560997 3' + Quasimodo 38 2 66.90 ATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGACAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATCACTTCAGAGAAGTTGTTCTGGGCGGCGACGTGGATGGGC:1 - chr2L 5358122 3' - invader4 279 2 62.50 AAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCGTGGTAGTCAGCTAGAATATGCGGAGCATAATACGAGCGGGTCGACAAGG:1 + chr3R 2533999 3' + gypsy8 251 4 68.49 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGTGGCCTTTGTTTAGCGTTTTTCGATTAACTTCTGCGGTTGGTTTTCCCTCTTTTTTTTC:1 - chr2L 14490107 3' + P-element 2825 1 44.14 GAGTGCTGGCTAATCGTAGTTGCTGGCTAGCCCAGTCGCTAACGGAAAGTCCGGACAAGTGGCGTCCGCCTGGTCTGGTTAATATTTGCGGGAGAGATGGAGTTTCGACCGAAAAAATAGGAGCAGCACGCT:1 + chr2L 1276184 3' + baggins 151 1 61.36 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGG:1 - chr2L 21153492 3' - 1360 22 1 51.61 CGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTAATGATGCTTGGTCTAAAATAGATTTTCCCAATTCAAAAAACGCCCATA:1 - chr3R 22771898 3' - opus 7176 4 67.42 ATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAATGCTTGAAAGACAAAGGCCTTGATTGATTGCCGTGGCGGACTTAAAGTTTGCTGCTTATTTAATTAGTCAAATTTTAATGGCT:1 + chr3R 28392590 3' + R1A1-element 5104 1 56.85 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAATATATAATTGTACACGGCAGTCCAAGGATTGACGAAGCAGAACAAGAAAGTGTGTTCTTGTTTCATAAAATCTACAAAGAATGCCAAAAGATTG:1 - chr2L 18040627 3' + pogo 2078 1 71.23 CCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCACAAGCAAAGTAATTCAATTTCCCGGCTCACAGCTCTTTTTTGGCCACTGGTCAACGGAAGAGAGAAGAA:1 - 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chr3L 17108564 3' + hobo 2899 1 64.65 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATACACTCAGCGGCTTTTCATAATCCTTCAGCCTGCGACTGGCGTCTCTTTAAAATTTTACTTAAAAT:1 - chr3L 18972819 3' + mdg1 7405 2 55.48 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTCGATCGGTCTCCATTGCCCCGAATGTAAGACCTCCAACGGATGTCCCTCCTCCTCGAAGGAATTTA:1 + chr2L 8396946 3' - roo 53 2 55.86 AAAGGTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATTAGGTTTACTCCACGAAACACTCGTTTGCTTGTACACGGAGAAAAAACTCCATCAAAATAGCAAGTACACTTTAAGTTGAAATTACTAACCGACGTC:1 + chr2R 15035939 3' - transib2 447 1 52.74 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAAAATAAAGCACTTGTTTACTTCGTCGCAAAATCAAAAGACAGACTGCGGCCTAAATAAATACGTGCGTTGCTCCATTCATTG:1 - chrX 10367524 3' + Juan 4168 1 48.63 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTAACGCAGTTGTTAATC:2 + chrX 21668966 3' + pogo 2042 1 59.59 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAATTATTTCTACCATTATGTGTGGGGTGGCTATTGTATCTGCCGCTGGATAAGCATTCCATGATGTTTAGCGATTTAT:1 - chrX 19820124 3' + Juan 4172 1 52.74 TAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTTCTTCGTCTAATTAAATTACGTAGCGGAAAAAGAAAACTTGTAACGCGTT:1 + chr2R 5045718 3' - invader6 14 2 75.34 ACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTTCCTTCAAAGGTTTAAGTTGTATACCCTATTTTT:1 - chr2R 6720547 3' - Idefix 7246 2 76.55 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTATGATCGCGCTAGATGTCCAACCCTTTTCTATTGTTGAAGATATGGGATTCTGCGATTTGATTCGAAAGCTAGACCCGAGTAAAACCG:1 + chr2R 6492951 3' + copia 257 1 63.01 AATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCATCAGCATTTAGCAGCGATGCATAAATCATAGCATACTTAACAGGGCAAACA:1 + chr2L 14889047 3' + hopper 1381 1 58.70 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACTGCACTTGGGGCTGAAAGTGCGTTCCTTGTCTTTGGCTGCCAAAATCCCACCTTCGCAACGAACCAATTCTAATGCGC:1 + chr2R 16510352 3' + roo 9046 1 57.69 GTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTCCCAGTGGGTGACTTATCTAGAAGCGCTTTTTTGCACCTATTTTGGCAGGCTTTTGGCCTTTTGGCCAAACTGTGCACTTTCCCG:1 - chrX 21215377 3' - Idefix 7042 2 56.16 GCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTTTACAGTGTACTGATACTATACTGATACATACTGATGCTTTTAACGTCATCATAAATTC:1 - chr2R 15942269 3' + opus 7442 2 62.33 TGATTGTTGAATGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAATATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCAAAGCAAGCTAAGCTCAGCATTCTATATCACAAATAAAAAAATTAGCGATATATAAATAATTGACGACTGAAAA:1 + chr2R 4402688 3' + 1360 456 1 46.21 ATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAGGAATTTAAATAAATTATATAACTATAGTTATGTTTATTTAATACTTAGCACAC:1 + chr2R 19289859 3' - BS 5061 1 62.33 ATAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTAAGCTTTACGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGAGTGCTTTCTCTTTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGGGCACATTATTTCTTATGGCATCC:1 - chr2L 17727877 3' - jockey 4761 1 70.55 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTATGAGTGTATTTATT:1 - chrX 11267698 3' - roo 62 2 60.96 CATCTGACGATCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTTATACCTCTCATTCACACACATGTATCCGGCCATGTGGTTCTCTCAACTGCCCTTCCTCACGGGTAAGATATAGACATGGGCGATAAGG:1 - chrX 6201738 3' + Porto1 218 1 54.11 GATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTT:1 - chr2R 21757921 3' + Quasimodo 6985 2 52.74 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGATGTGGTCAAGGCTTTAAAAGCTCTTCGGATTTATATTTGGTTCTTTCCGC:1 - chr3L 13472412 3' - jockey 78 1 65.75 AAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAAAC:1 + chr2L 22684612 3' - transib3 59 1 51.37 AAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGAATACACACACGCAGAATAAAATACATTTTCCTAGTA:1 + chrX 2676324 3' + accord 368 2 75.34 AATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTGGCCGCCCCGTTGGATATATGTAG:1 + chr3L 20399103 3' + roo 369 1 58.22 TTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAATTTTTATTTTCACATGTGGCTGGTAGTGTGGAGAGTATAAAAGAAAATGATTTTGTGGCATAAATTAACGCCAAGA:1 - chr2R 21603668 3' + rover 155 2 56.52 GGTTTAACGCAGTACCAGGTTGGCAGTATGGGAACTTAGTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCAACTTTTTGCGGTGTTGTCGAATGGACACAAGAGGC:1 + chr2R 16474313 3' + Burdock 6007 1 75.34 CAGCCGGCGAACCTTACGGTATCGCTACCACTACCAACGCACTCGTGCGTGCGTGTTATCGGTATCAACAGTTACATTCGGCTAAAGTTACCTCGAACAATTGCTTTATACTAAAGCTAAGTTTACTTAC:1 + chr3L 8622389 3' + G-element 135 1 73.85 CGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGACAAAAATTTCAAAAGAACCTTCGTGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAAGCCCAAGACAAAAAGTGACGTCGCAGCAGCGACAAATTACGT:1 - chrX 16217510 3' - P-element 2817 1 62.33 GTTCCTGAGATCTAGACGTTCATAGGGACAGATGGGCATGGCTAGATCGACTTGGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTAT:2 + chr2R 5198437 3' - INE-1 140 1 72.60 CTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATATATCATTGATAAAAAAAGCTTTTCCTCTGCGCATTTTC:1 - chr3L 18554614 3' - jockey 4641 1 73.29 GAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAATCAATTATAGTCAGAACATAATACTCAGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATATAAGATAAAAGAAAACGCAAACAGAGCAAAGCGGAGAGAGGATGCGAAC:1 + chr3R 16165733 3' - Cr1a 4226 1 66.44 GTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTACATAAGAACAGCTTACTGTGGTTCCGAATGAATTTCTTGACGTATGGCTGGTTTCCTTATTTGGTCTGCACACATTTCTCCTCGCTTTGCCGACGACCGTGTGAC:1 + chr2L 23352925 3' - Transpac 427 1 68.84 AAAAAAAAAACAAAAAAAAACTTAACAAAAATTAAGCTCCAATCCCATTCGGGGCGAAAACAACAACTGCACTCAACGGTTAATTAATTTAATGGATTAATAATAGTTCATGGTTGTTAAATGGAAGGTTCACTGTAGTT:1 + chrX 6641856 3' + HMS-Beagle2 489 1 50.00 AAATAAAAGCAAAATTATATAAAAATAAATAAGAAACAAAAAATTAATTGCAGGACTTGATATAAATATTCTGGGCTGAAAAAATTGTGTGCACTACATTTTTTTGAAAAGTAATGAGGTAAAAGTAATGAAAGTAATAACATGAT:1 - chr2R 14923987 3' + HeT-A 327 1 65.07 AGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCGGATTCGGGCTTGGGTTTCGGTTTCGGTTTCTGTTACTCGACACAAGCATTTTTATAAGACATAAATTCAGCGATTTGGCTAAATGCGCTT:1 + chrX 14700349 3' - Stalker2 6 2 71.67 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTTATTTGCATAACTGCTCAAATGCATGTTGTTATTGAATTTAGGGTAATTCCTTTCCCTATAAATGTAACGGAATTTCGAGAGGCAGGACGTGGGT:1 + chrX 17737315 3' - jockey 4679 1 77.60 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGTGTAAGGG:1 - chr3L 10563875 3' - hopper 44 1 55.48 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGCTTCTAATTTAGGAAGTATGTGATATATATGCTAATTAGCCTATGTAATTTGTCAACCAAGGCGTGCAGCTGTTTAAAAACATGGA:1 + chr3L 20744302 3' - 412 7070 2 70.31 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTGAACTGAGCACTGAATTCCGAGCGCTAAGCGTCGAGAATCAAACGCCCAAAGCCAGTGATGATAAAATATTTGCAAAACAAAAA:1 + chr3R 18518084 3' + roo 396 1 74.66 AATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAAGTGTTTTGGGGGTGGTGCAACCGATAAGTAGAGTTG:1 + chr3R 29516549 3' + I-element 5281 1 73.72 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGCTGGTATGAAGAGGAGGGAATGGAGAGGGTGAG:1 + chr2L 18178396 3' - Tirant 8118 2 75.41 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTCATCTTATATCAACAGCCACACAGAGGAAAACGCTATATTGCTCTTCTATGATAAATAATGTACTCATTCGCTT:1 + chr2R 6713970 3' - 297 17 2 69.67 TTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTACTTTCACATTTTTAGGATTTTGCATCTAATGTCGAGATTAGACTCCTCTTCATCCTTAAGAACTTCTGAAGA:1 - chr2R 20751566 3' - hobo 2499 1 73.29 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTCGGGTGAGTATACAGAAGTAACTTTCCTTCTGAGTTGCCAGGAATGAAATGTTACCTTATACCTCTGTACGTATCTGAGTTTAAAGACAGGAATGAAATGGAATTATCTG:1 + chr2R 5640853 3' - 1360 12 1 78.08 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAATCCGAATTCAATTTTTCAATCAATTCAATGAATGAAAATAAATAGTTAGTTCAAGATGAAGTATATATTATGGGGTGCAAATGAACATATCTATAACCGTATAAGAAATTAAAAGAAA:1 - chrX 19005308 3' - F-element 16 1 65.07 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTAACTGTGATGGAATGCACCAAGAGTTTTTCATATCGGTACGCACATAAATAAAGTAATGTATTAGTTACGAAATCCATTACTTTAACCGAAACATTT:1 + chrX 4540744 3' - 1360 20 1 67.81 TAATACAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTTTGCGATGCACCATCGCTCGAATACATATTGTCATTTTATAAAGTGTTTACACCGAGCGCGTGTCCCTAAGTAATTAACGGAAAAC:1 + chr2L 10623898 3' + Doc2-element 89 1 55.20 CCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTTGGGGGGGGGGAGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGGTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATGAATGTTTG:1 + chr3R 6412067 3' - Tirant 57 2 52.05 AGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATGATAAATTTAAAATAAACATTAAACATAAACAATAACATTTTTTATTTCCTACAGCTAATAATTTAACTTTGCCTGTGAAGTTTGACATG:1 - chr3R 19721020 3' - opus 137 4 66.44 GAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCG:1 + chr2L 13510860 3' - diver 82 2 80.82 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAAACGACCTTGCACAAACCAACAACAACCATAGCGACGACAGCGGCGGC:1 - chr2L 21250949 3' - P-element 26 1 52.58 TAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACAATACACAAAGTATACACACG:1 + chr3R 29091430 3' - rover 6970 2 73.29 AGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGCGTAATTTAATTCACGTG:1 + chrX 22711689 3' - transib2 60 1 59.86 AAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTATGTTGGCACCCCGGTTATTATAGGGACAAATGTAAAAATAAATATCTTCGCGTGAAATTAATCTTTTAAAT:1 + chr2R 2552209 3' + HMS-Beagle2 7145 2 51.37 AAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAGA:1 + chr2R 21425139 3' - HMS-Beagle2 6962 2 74.31 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCTAAATTAGCATTAGGACTGAGTTTTCCTAAGTGCAAGCACTGTCTTATCCTTATTG:1 + chr3R 8914355 3' + pogo 2038 1 63.01 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTGGTGGGTGGTGGGTGCGCGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGGTGAGAGTGGCGCTTTGCTCCGATTGGTCGAGAAGAAGCGAG:1 + chr3R 25137980 3' - P-element 15 1 68.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTGAACTGAGCACTGAATTCCGAGCGCTAAGCGTCGAGAATCAAACGCCCAAAGCCAGTGATGATAAAATATTTGCAAAACAAAAAATGTT:1 - chr2L 2594343 3' + roo 401 1 76.71 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATGACTTTTCCGCCGCGCGAAATTAACAGCTCATGAAATATGCCCTGAAATGTATGCAACG:1 + chr2L 11922959 3' - jockey 4813 1 55.40 CGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCCATAAATATGATGATAATTAAGTGTGTGTCTGGCACATATACTCAATTTGGCCTTATTAACCTAAAAA:1 + chrX 20874393 3' - F-element 380 1 52.74 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAGAACGTGAGCGAA:1 - chrX 7967218 3' - P-element 81 1 30.34 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAATGGAGCCCAAAATTGTTAGTTTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATATTTTTTTAGTAATGTAACTATAT:1 - chr3L 18860184 3' - roo 8734 2 89.92 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTATTCATAAAATGTGTTCAAGTTGGTTACCAGTTTTTTATGGTATGGTTTTGTCCA:1 + chrX 21581438 3' - Tabor 66 2 61.11 CTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTTCCTG:1 + chr3L 19574140 3' + 297 325 2 68.97 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTATAAGCTAAGTATTTAAGAACAAACAATGACAAAAGTTAATTAAAATGTTCGAATCCAAAAAGTAAATGCTTTTA:1 - chr3R 12727117 3' - I-element 47 1 48.63 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAATCG:1 - chr2L 13717299 3' + P-element 2828 1 37.40 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTAATAAAATCCATAAGCATTTCGAAAAGTTTGTAGCATACTTTTTGGGGCATCATACTCAAGCGAATTTATTAGCTGAATAATTATGGCAGATAAG:1 - chrX 9508061 3' - jockey 4702 1 62.33 ATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACACGGAGTGTGCCATCGGAACTTGCCCAAAACAATT:1 - chr3L 13366122 3' - hobo 88 1 76.03 AGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATATACTTTATATAGTGCGAAACGCTTCCTTCTGCATGTTACATACTTTTCAACGAATCTATTGTATGACTTATTATTGTAAACAATCAAATTAAATCTCAAAGGTGCGACGCGCCAAGA:1 - chr3R 11601667 3' - INE-1 88 1 54.11 CTTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGCTCCTTTGTTGTATTTGTATTCATGTGTCAAATCGGG:1 - chr2L 17206009 3' - hopper 83 1 73.29 CCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACAAGAAATATGACGTCATCAAAAATTATCCTGTCCCTCATGATGCGGATAGTGCTGGTATTTAAGTTTACATTAATGCTTTTGTTTGTTTGGCTT:1 + chrX 2306860 3' - G-element 30 1 65.75 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAGGGTAGTAGAGTGTCTGTTGT:1 + chr3R 22522733 3' + roo 9037 1 53.66 CTTTTGGCTCTAGACCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACAAAATGGGGTAGGAGAAATCTGAGGCAACTGCGCTGCTCAGTGAAAAGTCACGTA:1 - chr3R 20939142 3' - jockey 4725 1 58.02 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAATAGAGAGGGCACT:1 - chrX 16526289 3' + P-element 2825 1 31.15 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATAAATATATGTGCATTTGTGTATAGTATATCAGTGTGAAACACCAACGTACAAACACACACTGTCAATCAAAAGGAGTCATCTGTCCCACTAAACGCT:1 + chr2R 9504350 3' - roo 19 2 67.12 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGCAGCAAAACTAAACAATTTGTTTCTGGTGCTTTTGTTCGTTCGTATACTGAGTTAACATTTATT:1 - chr2L 19158790 3' + P-element 2858 1 63.01 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAAGGTAGTTATTACCTATTATTCCACCCGCTATAGATAAATTATCCATAGCATGGTTATTATGTTTTACAGCCATTTCGATTTTATCCTTTAGGCC:1 - chr3L 14084825 3' - opus 23 2 69.86 GAGTAACGGGTATCTGATAGCCGGGGAACTAGACTATGGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTATAAATGATGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCACTCTACTCTCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTTTCAAAAACTATTTTCAAAA:1 - chr3R 18346589 3' + INE-1 549 1 51.37 GAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATGTATTTTTTTACACGTAAATTGTGTAG:1 - chr2L 18951911 3' - P-element 2812 1 21.23 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGGAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACCGGGCGCACCAAACGTAT:1 + chrX 2518077 3' - P-element 103 1 11.64 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCCTTTTTTTTTAAAGCTTTCCAGCTGCCCTTCTAATCCTCGCGTCCTCTTGCTCTC:1 + chrX 7967319 3' + P-element 2852 1 57.93 TTCCTGAGATCACGACGTTTATACGGACAGGTTCTGATCTTGAGTTAGAAAGTACATATTTCCTTTTTTCGGGTCGAAACTTTTTTTTATAAACTACTACCTACTATCTACTACTACTTAAGTATTTTCAATCGATTA:1 + chr3L 10097478 3' - INE-1 139 1 62.32 GTTGAGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATCCATTAGCAATTTCTATGGCTCGAATGGGAGGCACCCAGGG:1 + chr3L 18738159 3' + Bari1 1470 1 68.42 TTTAAAATTTAAATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTTATCTTATAGTCGGTTCTCTCTTGTTTTTGAATCAAAAAATGTATTGA:1 - chr2R 5883553 3' + NOF 3956 1 50.68 ATTTTTAAATTTTACAAAACTAACTGGAACAATGCTCAATTTGGCAAATTTCAAAACCAAATCTGCCACCCACACAACGCATAAAGCGTAATACTTGTACTAGTGTAGTTGTTGTTTCTATTTGGCTGTTCTTGCACAACGGGAAC:1 - chr2L 8088402 3' - S2 383 1 60.96 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCGGGAATTT:1 - chr3L 12861691 3' + pogo 2056 1 53.42 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATATTTAACAGTCGGTTATATGTACATATGCATATATTTATAAAAAATCCTACATAAACACAATTCTT:1 + chr2R 21473701 3' + pogo 2051 1 54.79 GTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTG:1 + chrX 10128274 3' + invader3 209 2 64.14 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAAT:1 + chrX 17027963 3' + roo 361 2 53.73 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGATGGTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAG:1 + chr2L 11867388 3' - jockey 25 1 62.96 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATG:1 + chr3R 4532963 3' - 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chr3L 1981504 3' - opus 148 4 51.39 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGATAACGGGGCTTATCTGAGCCGGCAAGACTCAAGT:1 - chr3L 13228445 3' + P-element 2843 1 55.48 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACATAATTAATTGTGCTGCTGTGTTGGCAAACACGCGGGCGCCGGAAAGTAGGCAACACGCTTTTTTGGCAAAACGGTTCGCCGTAATTGATTG:1 - chr2R 18983709 3' + hopper 1390 1 67.81 CGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATACATATGTGTACATATATATCGAAAACTCTTTCCTGCTCTCTCTGAGTCAGCTGTTGTTGT:1 - chr2L 19548441 3' - flea 4815 1 65.75 AATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATT:1 - chr3R 5024825 3' - diver 73 2 69.18 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTT:1 + chrX 7967271 3' + P-element 2802 1 28.08 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGAAAATATTTAA:1 + chrY 2720370 3' - 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chr3R 11773903 3' + P-element 2813 1 35.62 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGCGGATATGAAAAGGTGAGTTTACAGAATTATCAAACATGTTTTTACATCTCTGTATCTGTTTACTAAAAAATGCATTTGTATTGATTGTTTTACAATAATTG:1 - chr2R 16496522 3' - hopper 16 1 69.86 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGGTATAAGTTTATG:1 + chr3L 12861818 3' - pogo 54 1 57.53 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAATTTTTCACGCATTTGACTGCATTACTTAACCTCAAT:1 + chr3R 31681927 3' - Doc 84 1 75.18 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGTTTTTATTTTTATTTCATTTTTATTAATGCGAAAAATGTAATTTCAA:1 + chr3R 25843425 3' - I-element 78 1 66.44 GTGTAAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTCTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACTTTGATATTTATATATGAGTTTTCAAAACGGTCATTGGCATGTTCATTTCAGCAGTGCCGCCATAAATGCAAACA:1 + chr3R 12851720 3' + 1360 434 1 65.03 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCTCAGGAAGCATCGAGCCCATTT:1 + chr2R 11562921 3' + pogo 2043 1 56.16 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGTAACAC:1 - 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chr4 809188 3' + INE-1 95 1 71.92 GGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGAATATTATGATTACTATCTGTCTGTCGCTCTGTCCGCAGTAACTCTGTGATCTCGTAATGTAGACTAGTAAAGGGAAAATAACCAACACGGATGTCAGAAAAGGCG:1 - chr3L 27146148 3' - HMS-Beagle2 12 2 75.86 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTAACGAGCTAATAAACCGCTCATGTTACAGATATGTTTGGCGTTAATTTTTTTATATGTACATCTCAATTATAGGAAAATTATATATCTTGCTGG:1 + chr3L 13827517 3' + roo 9047 1 68.49 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTTTCAATGTCTGCTTTATGTTGTGTTTT:1 + chr3L 18789115 3' + 1360 3336 1 56.16 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATC:1 + chr3L 13228531 3' - P-element 90 1 23.97 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTTTTTTAAAGCTTTCCAGCTGCCCTTCTAATCCTCGCGTCCTCTCGCTCTCGCACATCTTGT:1 + chrX 7967330 3' + P-element 2862 1 64.38 AGGAGGACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGTTTGCATCATTGGGTATTATCAATACAAATAAGGAAATGCACAATTTAAATTATGCTAAACAATACTAAAAACAGTGCCATTAAAGA:1 + chr2R 5265224 3' - 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P-element 67 1 25.44 GAATTTCTTGACGTATGGCTGGTTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGTTGGGCCACTCTATTGACTCAAAACGGTAGCCGCTCAACAGTG:1 + chr3L 7939835 3' - Transpac 365 1 64.75 GAAAGGAAAACATAGACAATAAGAATGAAAAAAGTTGAAGAAACAAATACTGGAAAAAAGCACCCAAAGAAGACAAGTTGATCGGCTACAGATCGAATCGCTATATAGAGGACTCTTTTCGATAGTGAGTTAGTGCAACTTAGTCC:1 - chrX 13868048 3' + invader5 3600 1 52.05 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATACCTTATGAAATATGGAGGTATTGCAATGTCACATATAATAAGAAAATATAATTTAGATATATAATTTATCATGA:1 + chr2R 14940782 3' - blood 7057 2 55.48 ATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTATTTATTTATTATATTTACATATAATTTTATAAAGGACCACTGTGACCTGCATCTCCATTGAATT:1 + chr2L 17166357 3' - I-element 5339 1 60.96 CCTATTTAAACCGAGGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTGAACTGAGCACTGAATTCCGAGCGCTAAGCGTC:1 + chr3R 18518033 3' + roo 9008 2 58.90 GTGAGCGAGCGGAAAGACAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCC:1 - chr2L 23372628 3' + 1360 3305 1 75.34 AAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGCCGCGAATTTTTACAAATTATTTTCCAAAGCGAATTCCAATGCCTCCCGAACCTGG:1 - chr2L 8188928 3' + 1360 2965 1 77.14 TTAGTTCACGGTGCATCCTCTTTGTGCTCGTCCAAAGTACGCGCCGTTAACGTTCGACATCCGCCTAGAGTTCAAGGTCCAGCGCGGTACCGTTAGTTCACAGTTTTCGGTAACCAAGATATATTTCTGTCTTTATTGAT:1 - chr3R 24840508 3' - gypsy8 251 2 32.14 AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAGATAGATGTAGCTAAGCAAAGTTTGCCGTGGAAGGATGAGTCCTGCGGACAG:1 - chrX 12214468 3' - opus 7179 4 64.38 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCACTTTTATGTAACCTTATTTATTTCATATTCTTAAGATAAGTTGCATTTTTTTATCCAATGCTTTTTTT:1 - chr3L 18792401 3' + roo 357 2 53.42 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACAC:1 + chr2R 16891865 3' + jockey 4968 1 43.88 GGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATACGCACATAATTATTAACTGAGTCATATAGTATTAAAAATAATAATTTTTTGTTCAAACGTTTCTACATTTGTAACTCATTTTAATTTGT:1 - chr3L 21170839 3' - roo 324 2 60.96 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATTTTTTACTGCCATATAGAATGGTGAGTATGGTGTTTTTGAGATGATATGGGGCAAGTTTATTGGTTTAATATGTTTGAA:1 + chr3L 23331343 3' - 297 6599 2 69.70 GTTTACGATTGGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGACACTGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCTAAAACATTTTCCACCCCATCCCCTACTATCCAACCACACTTGTTTGCACATT:1 - chr3L 14711541 3' - opus 7377 2 62.33 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCGTGCGAATGGCAAAACGCATGGGCTGGAAAACTATTGATAGGTT:1 + chrX 18353565 3' - jockey 97 1 77.40 TTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTCCTTTTTATATAATTTACATTTGTTTAAAAAAGTAATCAGTAA:1 - chr3L 11903220 3' + opus 425 2 74.66 AATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTCGAGAATCTGACAAAACGATGAAGTTTTCATTAGGGTGCCATTAGAAACTCCGTTTAAGTTATGGC:1 - chrX 12980019 3' + gypsy5 346 2 54.79 AAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACAAACTTCGAGATGCATTTATTCAAGTGTAAAAGCAACACCTTCCTTGAAAAGTCGTATTCTTCTTTCTCGGTTTGCCTGT:1 - chr2L 260920 3' - Juan 4038 1 79.45 CAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATTTCTAGTCACATTCG:1 - chr3R 5024811 3' - diver 59 2 59.59 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGACGTCACTAAATTGCGGTGACGAGGGGCTGGCGACGGAGCAGCGCATTGA:1 - chr2R 7889334 3' - jockey 35 1 66.44 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAAAATTAATATTTGGTCA:1 + chrX 22676441 3' + 297 337 2 64.08 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTAACGTTTCGTGATTTTTGCCAGATTTTTATTGCCACACATCTG:1 + chr2L 19643652 3' - hobo 23 1 69.86 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCCAGAGATATGCCATAAATTCGAACCGCTTCACTCCTTCCCGCAATTTTAATTTAAAAGTTTGCG:1 - chr2R 22287371 3' - jockey 4791 1 70.83 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATTTTTTACTGCCATATAGAATGGTGAGTATGGGGGTTTTGAGATGATATGGGGCAAGGTTATTGG:1 + chr3L 23331328 3' - 297 6618 2 55.88 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGTATGAAGTGTTCCGATAAAAAACAAGCGAATGATGAAAGGGGCAGCCCGGAAAATGTGCAATAAAC:1 - chr3R 21587503 3' - roo 8718 2 55.48 ATTTCTTATCTTATCTTATCTTATTTATATAGTATTTCTATTTTCTAGCTAACAAAGTAAATTTCATTATTAATTTGCTATTCATGTTTATGCTTTGTAAAGGGTATTTAAAATTCCACCAAAAATGGACATATATAGTAAATGTA:1 + chr3R 15768387 3' - Stalker3T 203 2 48.63 ATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTACACAAATTGAATAAATGTAGTTTCAAAGTGTACTACTTCGAAGCGATTCATTCCTCAG:1 - chrX 21636167 3' + Stalker2 340 2 60.27 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTATGCGTGTGCATATGTGTGGGTGTCTGTGGACTTAGACAATGAACCCAAGTGCAATAATTAATGAAGCAGAGCAAATCGAGGGAGCTGTAATTTGATTGATTTCCCCACAAAAT:1 + chrX 5145994 3' - hobo 5 1 79.45 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAGAGAAAACCCATCACCAGGCACATCCGAGTCATGCTCTGGCCATACATTGTTGTGGCTGTTGGAAAAATAAGCTTAAA:1 + chr3L 3858804 3' + jockey 4948 1 50.68 GAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAAAATAAAGCACTTGTTTACTTCGTCGCAAAATCAAAAGACAGACTGC:1 - chrX 10367559 3' + Juan 4133 1 69.18 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATAAACATTTTACATATGTTGTGCTTTGTAGTAGATATGTGAATAATACACTGTATTTGTTGTAAACTGAATGCCAATAA:1 + chrX 17510702 3' - roo 42 2 50.68 GGTTCGGAAAAATCGAATTTTTTAAATTTGAAAACTGGAATCGTTTGCCCACTTTTTGTCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTATTTA:1 - chr3R 20001637 3' + FB 16 1 59.59 GATGTGTGTGTGTTTATGCATAAAGTCAATTGTTTTTGCACAGACAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAAAGAAGAAACCGAAAATGAAAAAAAAAACAAAAAGTAGCTAGGGCGAAAAG:1 - chr3L 23751466 3' - G3 41 1 76.42 TGAAGAAATGAAGGTGAAACATTGAATGTTTCGAACTCTAATTGGTGCAACACTATAAAAGTAAGCTTATGCACCTGATAAAACATTTTATTTATATACATATACTATTAGATAAGACAAATTGTTTAATAGGTTGAAAAATC:1 - chrX 8887927 3' + HB 1495 1 39.86 GTAGAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCCACGAGAACAGAGGCCGCGCTTT:1 + chr3R 31663017 3' - blood 170 2 90.00 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAAACACGGACTACAACAATACATTTTTGGGTTCCCTTCTCTCTTAACGAACCTCCTTTCAATGTGTGCGTGAGCAAAGGAATTCCGTTAGAAACCCCC:1 + chrX 16526412 3' + P-element 2877 2 77.24 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGAAGAAAAAAAAAACATAAAACGCTTTGAAATTAACTTAAGGATCAGTTTAAAAGGCTTCAAAC:1 - chrX 4022231 3' + roo 353 2 54.86 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTTAATAAAATCGGTGGATCGGAGATACGTACTTCA:1 + chr3L 17904847 3' + roo 319 2 79.45 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTAGAGTTCATCAACTTGTTTAGAATCGCGTACGTGACTGTATGTATGCCTGTGTGAGTG:1 + chr2L 19158918 3' - P-element 63 1 44.52 CACACACACACACGCATATCCAGTCAGACATACAACCAGACGTGCCACGCCCACTTCGAGCACATGTATTATTCATGAGGCAGCACACACGCAATATGCCTGTCTTTGTCCCTGTCGGAGTTTCTGTTTCCGCTGCAGCGATAATC:1 + chr3R 20419916 3' + accord 7032 2 70.55 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGGCGTCAATTTGATCTTGACACCATGAGCATGAACCGCTTTCAAGCATTTAGTTTATTCATTTAGC:1 + chr3L 20388228 3' - 1360 55 1 55.48 GCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCATTGTGGCGGAAGTGAAGCAGACGCCTGATCAGCGGGATTGTGCTGTTGGCCAAATATTGTTGGTAAG:1 + chr3L 24789698 3' - 1360 106 1 52.29 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGCAGCAAAACTAAACAATTTGTTTCTGGTGCTTTTGTTCGTTCGTATACTGAGTTAACATTTAT:1 - chr2L 19158791 3' + P-element 2857 1 62.33 GCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTAAAGAGTTATCGACAACATAGACGTTTCCGTTAAAATCACACTTAGATATAAGAT:1 - chr4 1069774 3' - R1A1-element 344 1 54.05 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCACACTCATTTCGCTTGCAAAATCC:1 + chr2R 16496701 3' + hopper 1387 1 63.70 GAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCATCGTCTAGCAGATTAAAGTGCAATGAAAGTGAGTGGTAAAGTCGTGGGCTTTTGAGGAAAAACAATTGCATAAGCTCGGAGTGAAACAAAAGTAATGGCCAAAATGATTCT:1 + chr3L 16703928 3' + FB 30 1 72.60 ATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTACCAGAAAATTGAACGACAAGCTATAAAGCCGGAACTTTACGTTGGACAAGAGAGGTACTGTTTTTCAGGCTGATATTTTATCGACTTTTGAGCTAC:1 - chr3L 381667 3' + S-element 1693 1 69.86 GAATAAACTCTCTCTCTCTCTCCCAAAAAAAAAACAACCCAGCTTATGGACCAAGGCTATATGCATTGTCCGC:1 - chr3L 12237017 3' + blood 162 2 79.45 AGCTCTGCACACATTATATGTGACTGCATGGCGCTTTCCATCAGGAGGAATAGACTCCTGGGCATGTATGTATTCTCTGGTTCCTTTGAGTGTCTTTTTCAGTTACTGCACTGT:1 + chr3R 10745664 3' + baggins 5230 1 61.40 TAAATATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATATATGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATG:1 - chr3L 9218281 3' + Stalker4 7044 4 56.16 AAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAGCTTGTCTGTGGGCAAAAATATATTTCGGCTAAAAAGTAGGCAATACTACTTTTATCAGTTGATCCAAGACT:1 + chrX 21636277 3' - Stalker2 7298 2 51.37 ACATCTACATCTACATCCCCATCCCCGTCCACATGCCCATCACGCCCACATCCTCATCCACAGGAAGCAGCCACGTGAAGGGGCCACTTAG:1 + chr2L 19848224 3' + gypsy5 6947 2 69.23 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACCGGGCGCACCAAACGTATAAAACCCGAACAGAACGGAACCCGAGCATTTGCAAAGCAGCCAACCAGGTGAAAGCAACATGCTGCCGA:1 + chrX 2518150 3' - P-element 31 1 62.24 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGCACATCCATCTAAAGCCCTTCATGATGTTAATTACCGAACCCTGTCACACGCTCCGCGAAAAGGAAAACCTGGAAA:1 + chr3L 6675410 3' - 412 7097 2 55.17 CATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTATTTATGTTACCCTTTGCCAAACCGAAAAGACCACAGAGAACCC:1 + chr3L 7352573 3' + P-element 2758 1 28.77 ATACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAA:1 + chr3R 3286153 3' + gypsy12 9833 2 72.41 CACGTCGGCGATCGAATTCAATCCGAATTCAATTTTTCAATCAATTCAATGAATGAAAATAAATAGTTAGTTCAAGATGAAGTATATATTATGGGGTGCAAATGAACATATCTATAACCGTATAAGAAATTAAAAGAAATCATAT:1 - chrX 19005302 3' - F-element 9 1 69.66 TTTTCTTTTATTTATTTAAAAAAAACCGGCGTAAATAAAGTGTCATTATAGCACAGAAGATGCAGCTTGATGTATCTAAATATATTGGTGCATTTAAAATTGTTTTAAAATTAGATGAATTAGCTTTATTGATTTTTCGATTTGTG:2 - chr2L 2123958 3' - G7 1144 1 80.82 TTCATATTTAATGGCATTGGATACCATTTTGGAAAACATTCAAGGGTTTTTTGAATGTCCCTATATGTTTTTCCTCCCTTAGGTGCACACGTTTAAGGGGCTCAATTGGTGCGAGTTCTGCGCCAACTTCTTGTGGGGATTCACC:1 - chrX 5617724 3' - HB 467 1 53.79 GATTTGGAAAGTTGTGGAGGATGTATGGGCAGGTATAAAAAGAAAAACTAACTTAGTTCTAGGTCAAGTTGAATTTTGTTACTATTTTTTCATAGCATTTCATTGAATACCGGAAAAAATTTACGAGACGCGTAACGAAGTAATGA:1 - chr2R 15535029 3' + HB 1224 1 73.29 CATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTGCAGATATGCAAGTTGCATGACAAAAGTTTCACA:1 - chr3R 25442822 3' + R1A1-element 5249 1 76.55 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGACAACTAAAGAATTACATTTTATACTATACTATATACACAGAGCTTAAGAGTTATTCTTATTGTCTAAGGTAATTGGTCACCATGTAAGAC:2 - chr3R 5453603 3' - I-element 33 1 63.01 CGAGGAATCAATCGCTCTGTTGAAATTCACATGATCAATTTTCTCTTAGAAAATAATTGCTAAAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAACGAATTCTGACTTACTAGCTATTTGGGAAAAGATTAATG:1 + chr3L 14951350 3' - transib2 2378 1 78.77 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATACACTCAGCGGCTTTTCATAATCCTT:1 - chr3L 18972859 3' + mdg1 7419 2 72.83 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTGCAGTTACAGTTACAGGGAAGTTGCGTTGGCACTGACAGTCGCAGACAACACTCACACACATATAGATGGGCCATGGAGTGCCGC:1 + chr3R 27859617 3' + hopper 1390 1 66.91 GACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTGCTCTTATTTTATTTATTTATTTTAAAGACTTAATATGTTTTTCTGCACACGATACTTTCCGTTCAATGTTTTT:1 - chr3R 904592 3' - 3S18 49 2 50.00 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATCGAACTATAGTCAAATAACAGCTTTGAGTTGTGTGTTTGTTCCAGGGCTGTAA:1 - chr3L 21151093 3' - 412 7121 2 63.70 GATTAGTCTTGTAAATTTCTATTCATTTGAAAAAAAATTTTTGCCATGCCCACGCACACACCAGCAAAGCAGCGTGCATGCAACACTCGAAAGTTGCAAAATGAAGTGCAGCGTAGGTAGGGCCGGCAACG:1 - chr3L 22513482 3' + INE-1 296 1 61.83 TGTGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTAGTGGTTTCGCTTGCGTTTAAGAAGCCCAGCGAGGAATTAGGAACCTTGCAACGTTCGAGGAAGGAGATACAGCAAAAAATCTGTGCAACACTTGCAACTGTGTGTTTTCT:1 - chr3L 26345316 3' - I-element 5198 1 79.02 AATATCAGATACCCGTTACTCAGCTTGCCAGAATGCGGGGGAGAAAAGTAATAAAACCAAAATTAAGGGCATTTGAATTGGCTTATGGCTTATCTTCACATTCGTAGTTCCCGAGATTCCACCGGCCATACGGACAGGCCATACGG:1 - chr3R 20343257 3' - INE-1 548 1 70.55 GTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCCTTTTACTATGCAAATGCTAATCGACTTGTAGTGCCC:1 + chrX 18190417 3' + hobo 2863 1 77.04 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAAAATTAATATTTGGTCAGGAATTTCACC:1 + chrX 22676452 3' + 297 6925 2 57.53 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATTTTTATATGTAAGCTGGGGGAGTATCTGCCATCAATGTGGAGCCTCTGCCTGCATCCCGGATTCGCCATCCC:1 - chrX 20124465 3' + opus 472 2 62.31 ATTCTCCTCCGTGAATAAAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACATGGGAAAAACACCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCCGACGGGGTAAAAATAATCCAAGTTCAAAGAAGAAAGTCCTTTCTCTCGACTCCTTAAGCT:1 + chr3R 8682824 3' + baggins 5056 1 63.70 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAG:1 - chrX 7967232 3' + P-element 2800 1 21.90 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTCGG:1 - chr3L 5179151 3' + P-element 2859 1 49.50 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAATGTTTATATATAGATTGGACTTTACACAAGCTA:1 - chr3R 8596365 3' - hobo 85 1 73.97 GCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGGACCGTTTTGTTTTGCTCGTT:1 + chr3R 5316615 3' + Juan 4137 1 70.55 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGTTTGAGGACCCATAAAGAAGAATGCGAAGCATACTTCTTGTGGCTGACGGATTTCGGACTTCCCAACTAAATAT:1 + chr3L 13362785 3' - jockey 28 1 67.12 AATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCTCTTCCTTTAGGGTTTTTGGTTTTTTTGTTTT:1 - chrX 10317054 3' - gypsy3 425 3 76.67 AAAAGAGGAAAAAGACAAAAAATGGAGGAAATTGCAGAGGAATATTTTCCTCGGAGAAACAACAGAATATTAAATACTTTTCCGCAAAGCCCTATGTACCGCTAGAAACAACGGTACTCTCTAGGGGCAGG:1 - chr3L 13991550 3' + Doc2-element 237 1 59.54 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTCCTTTTTGCCGTTCTCAGTTCTCAGGCCCCGAAAAAAGGCTTTTCTAGCGAAATTCGCTGCGCCGCCGAATGTGTCAGTTTATAA:1 - chrX 8760055 3' + roo 9036 1 60.96 CCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGAAGTTCTGGAAGTGAGTGCGGTTAAGCGGCGAGACGTTGCGCCATTAATGCGAAGCGTACTTTTGGGCGCGC:1 + chr2R 7889505 3' - jockey 4694 1 56.16 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGTGTAAGGGACGGATTTTGCGCTGTGCTGTGACA:1 - chr3L 10563850 3' + hopper 1409 2 78.20 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCAAAACACTTTACTTAACAAGGTATCATTTATTTACCGAACTCCTTACAAGAATATTCTCTACTTCCTGTACCACATCTGCAGGGTCCTCATG:1 - chr3R 29516450 3' - I-element 32 1 61.64 CTACACAAGGAGCTTGGAATGCCATGGGTAGCAGCAGAGAAAATCTCCCGCCTCAGTGAGAGATACACAAAAAGACTGAAGAACCACCCAAACCATTTGGAGGACCTGGACAATACCGAGGGCCTGCATCACCTTCTTG:1 + chr3R 13688614 3' + G-element 4033 1 69.78 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTTTGCTCTTTGTTGTTGTTTTTTCCAATTAGATGTCTGCACTGCAGCTGGGCGGTGTTGTTCTTGTTGCTGTGGCCGTGCTCTTATTGGAGTTTTTAAGGC:1 + chr3L 3339478 3' - Transpac 19 2 73.29 GCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAAATTTAATTTACATGACATATACATACCGGAAGCTATTGAATGAAAAATTTCAAT:1 + chr3L 10593753 3' + F-element 4424 1 59.85 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCACTGGCTCTCTC:1 - chrX 16526280 3' + P-element 2819 1 35.77 GGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGACTTGGGATTTAGGTAGTGTTTGCTTGTGTTATTTGTGTTTGCGTCCATCAAACAATTAACTATCGTATTTTTTTGT:1 - chr3L 16695519 3' - I-element 5046 1 64.38 AAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCACGCTTGCACTTTTTGTCGCAATTGCAGTTGGCCTCATTATGCAATTACGGCAGCAAGAAACA:1 + chr3L 7790771 3' - copia 4928 2 60.27 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAGAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTATAC:1 - chr2R 4830332 3' - 1360 77 1 93.80 AGGAATTAAAAAAAAAAACAAAAAATAAAAAAAAAAGGGGGTAAAAACGCGGACGGGAGCAGGCATTCCGCCTTTTCATCTTCTGCGCCAGACAAAAGGATTAGTGAAAGCCTATTAATGGTTTTTAAATAATATTAAT:1 + chr3L 16155323 3' + Osvaldo 1520 1 58.27 TTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGTTTAATCGAACAGTTGACACTTATTTCTCGCAGTGT:1 - chrX 15565525 3' - transib2 82 1 75.86 TTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAAATATATGAATACAAGTGTTGTGATCTAAATCCATTCGAACCATATTCCATATAAA:1 - chr2R 2565954 3' - S-element 63 1 63.70 GACCCAGTCGGCTCTATTGTACTACTACCCCTTCATGACTCAACGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGGCAGATTGTAGGAGGTACAATAAGCTGAAAAAAGGATGCTACCCAATCGCCGGGGTAAAGAACCAAATA:1 - chr4 142418 3' - baggins 5400 1 54.79 AATGTTTACGTTTCACTATTATTTCACTGATAGTCACTCCCTACACTATTTACGATATGTGCCAGTATTAGTAACTAACTTCACTTGTTCCACATTTTCAGCTGCGTATTGGTAGACACGAATCATAAATCCGTTTTTATTAAATG:1 - chr2R 5614773 3' - X-element 147 1 50.68 GGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGT:1 + chrX 21667919 3' - gypsy2 76 2 72.59 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAAACGACGATGCCAATTCGTGACGCCAGTGACTTCGGCTTTCGGCCGCCTTTCGGGTTTTCGAAATTCATCCG:1 + chr2L 13717412 3' - P-element 38 1 58.09 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAAAAATGGAATTTTTAAATAATATATGTACATATATGCAAGTCTAACGAGTTCACAATGGCATACATGGCTAAGAAAGGATTG:1 + chrX 20632692 3' - pogo 22 1 62.60 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCT:1 - chr3R 11773920 3' + P-element 2796 1 23.97 CAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAAT:1 + chr2R 16496647 3' + hopper2 1526 1 71.92 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATGCCATGGCAATGAAGTTGGCCAAAAGATTATTACGACCCACAAAGTGTTGCATAGTTTAGGGCGCACGTTTTGCCAAAACAGA:1 - chr2L 20937986 3' - jockey 4708 1 56.85 CTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACTCGGACTAAGCCAAGAAAAAGGTGGGTTGCGACTTAGATTAAAGCTCATTTTGAACTCTTCACTAACT:1 + chr3R 25195745 3' + G2 2856 1 53.42 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATCTGACTTATCTGACATCTACCATGAAATCCAACCATCA:1 + chr3L 16463574 3' + roo 8991 2 73.29 GCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACAAAATGGGGTAGGAGAAATCTGAGGCAACTGCGCTGCTCAGTGAAAAGTCACGTACCAACTGTTGAAAACACATC:1 - chr3R 20939122 3' - jockey 4719 1 52.41 TACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACCTCGAATTGGGAATGCCTCAACCTTTCCCAACACCACCTAACCCCCTTGCCATGCACTTAAATACCCTTAGTTGGATTGGTAAGGAT:1 + chr2R 13193897 3' + BS 5060 1 54.79 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAAGAATACAATTAGAAGGAAATCTAATACAAGCAGAGCATTTTAATGGCTTACAAA:1 + chr3L 1981617 3' + opus 457 2 56.45 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTAAGTGTACTATAAATAATGTGTGATTTACGCGTTACTTATTTTATGTGTCCGGGATACAAACTACTG:1 + chr2L 6755848 3' + pogo 2052 1 53.42 GAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCATGAGCATCAGCGTTAAGAGCAACTTGCTTGGCTTC:1 + chr2L 6326915 3' - 297 6798 2 66.67 ATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGTAAGATGTT:2 - chr2R 5582130 3' - Cr1a 449 1 71.92 TTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGTGTGTGGCAGGGAAACTGAAAGGGAGAAAGGTAGAA:1 - chrX 8299894 3' - G2 3076 2 91.23 ACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGTCACTCTTAACGCTCAAGTCTTTGGTCTCCGGCAATTGTTTTTCCACTCAATTTCAATTGTTGTTG:1 - chr2L 20324098 3' + Tirant 8456 2 52.05 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCAC:1 + chr3R 19543492 3' - roo 76 2 69.86 TCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTTTAGTAGTGATTGCTAAAGTTTTTATAGATGAAGATTAATACCGCAGACTTGATTGAAATTTTATAGGAAGGTA:1 - chr2L 11442886 3' - G-element 4169 1 49.31 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCACTGAATGTTCTGATACATGTAAATGATTTAGTCTATATAT:1 - chr2R 8687829 3' - roo 81 2 76.71 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTAATAAAATCCATAAGCATTTCGAAAAGTTTGTAGCATACTTTTTGGGGCATCATACTCAAGCGAATTTATTAGCTGAA:1 - chrX 9508078 3' - jockey 4719 1 52.05 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAAGGTCGCTCTGTCGATGTTCTGGAATTGGGGAACAAGGGTATCGTCTGCACCGAAATGGGCATGGCCTGCATCTGTCCACAGGAACTGGG:1 - chr2L 8396809 3' + roo 9041 1 64.14 AGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTATTATTTTCGCCGCTCCAACGATGAGAATCCATGCAAACATAGACCATGGCTAT:1 + chr2L 19692912 3' + opus 7319 2 53.10 AGTGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAAATGCTATTATAATATTTATACTTACACAAATAAATATTGTCTAAAACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCGGTAAGATGGCTGA:1 - chrX 22576283 3' + Burdock 6294 2 54.11 ACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTAAGTGAGCATGGATCGATGTATCGCGCCTTGGGCGTGGTATATACTGTAGCTTAGATTCGAGG:1 + chr3R 13663095 3' - Quasimodo 7274 2 56.55 CCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGGGAAACATTTATACGCCCGCCATTACAGTGATAAACTGTGGGGCATTAAATCAAAGTTAGCGAAAAAGGACCGAGCACCTTATTATCCTTGTG:1 - chr2L 15905971 3' - Tabor 6869 2 65.75 AATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTGAATCGTAGTACATTTAACAACTGATCAACTCATTTGCAATCGCCATATAGCAACGTT:1 + chrX 21590760 3' - BS 5062 1 60.27 TCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACAAACTTCG:1 - chr2L 260992 3' - Juan 4110 1 73.97 CATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGATAATATGCATATTGTAATTCTAGTGTATATGTGTAGATGTAATATTTCTATCGAAAGAGGTGAAGTAGGAATATTTTATTTTTTATTTT:1 + chr3R 14575673 3' + baggins 5149 1 27.42 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATAACGCTAACAAAAGGTTTATTACACTTTCTATTGAAATATACATTTTGAATCCCATTTTCCCCACATTTGGCTCTCTTTTGTTGCCAAAATTGCAAGCCACTGCCAGA:1 + chr2L 3282720 3' + flea 243 2 78.77 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTCGGGTGAGTATACAGAAGTAACTTTCCTTCTGAGTTGCCAGGAATGAAATGTTACCTTATACCTCTGTACGTATCT:1 + chr2R 5640819 3' - 1360 17 1 68.38 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTAAGCTTTACGATTATGATTACGGTTTTCATAGCATACTTTTGTGCGCGCTCCTTATCTGAGAGTGCTTTCTCTTTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGGGCACATTA:1 + chr2L 16492953 3' - jockey 4776 1 70.55 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATAGTAATTATATTTCCCTATTATGGTTAAATTTGTATATTTTCTCCGAGTGA:2 - chrX 9959785 3' - I-element 69 1 64.38 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTTAATTCTTTTGATTTTTTTTTTGGGACCCGGAAGGTTTTACGGTGTGATGCCCAGCGAAGACCGATGCGAA:1 + chr3R 25761566 3' + I-element 5308 1 50.68 ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATAAAAATTAAAAATTAAAAAAACGAAATCAAATTCACCGAACTATGAGTTATTTGAAATGGTTAA:1 - chr2R 11097304 3' + Juan 4150 1 60.96 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAATCGG:1 - chr2L 13717298 3' + P-element 2817 1 34.97 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGTATCTCTTATCAAAACGTTCCCTGATAACGCCCCACCTCAACAATCGGTGTTCTACTTCAGAAGCGCGTGCCTGAATGAGTTAATTGATGGATGGTCTGTTGTTG:1 - chr3R 24053595 3' - mdg1 16 2 74.66 AAAAATAAAATTGATTAAAAACAAAGCGATTAAAGCGATAATGCGTGTGTAGGTGTAGGCGTGTGAAGAAGATTCAAATTTGCCAAAAGCTCGCCAGAGATGGAGCCACTCAAGAATTTCGGGAGCAAACAAAGAACAGGTTCCCA:1 - chr2R 16135632 3' + Tc1 388 1 52.74 CCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTTGGCAATTTCTTTTGTAGGTTATCTTGGCTGTAAAATTTCCTTGAATATTTCCCTAAGCTTGGTTTTAATA:1 + chr3L 6450621 3' - Quasimodo 48 2 54.11 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTTAAAAATATAGGTTATATGTACGTTTAAATACTACCTTGGAAATGAATGAGTATTTTACTCAACTTGGTACACGTGCCCTTGTATATTGTTCATCATCCTTATCT:1 - chr2R 25252101 3' + opus 7488 2 71.92 ACACTAAACCTAAGTTTAATCTAAAAAGTTTAATTTAAAATATTTTATTACAATTTTAAAAGTTTTAGTATGCAGTATGTCCCCCATTGGCTTTCGCTGCAAGTTGAAGCCATTTTTATCCGATTAAAAAGAGGTAAAAAAGCGAA:1 + chr3R 6461290 3' - S-element 1479 1 82.19 TTTTGACTTTAAAGGTTAAAATTAATCAAACGGAATTTTTTTATTCAATACAATTAAACAAGGGTGGGTAAGGGCAATGCTGCTGAGATAGGAGTTTAAAATTTGTTTATCTACTGGGGCAGATTGCTATATTTGCGGGTTGGATA:1 - chr3L 24321630 3' - S-element 1671 1 60.96 AAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTT:1 + chr3L 18789089 3' + 1360 3318 1 71.94 ATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCTGTAATATTTCAATACCAATGAATATACCATCCTGTTTATGATATTTCATTTCAAATATATTGTAAATATACAAAAT:1 + chrX 3748435 3' + I-element 5001 1 55.48 GCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCATTTTAAATACTCTAAAAACTAGTACACTTTTGAATTTTTTGAAATGGCTATTGTCGAT:1 - chr2R 13212161 3' - diver 5904 2 72.60 ATGGATCACAATTATGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAGCATGAGTCCGCGCAATAATCACAGCCAAGTGCTGCATATTTA:1 + chrX 850148 3' - jockey 65 1 52.74 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGGGTATATTGCAGATCCATAGCTTGGTATTCCCTCTTGTTTTCAATTTATTTATATG:1 - chrX 17510597 3' + roo 343 2 60.96 CAAAAAGTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGACAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGG:1 + chr3R 8049028 3' - Q-element 130 2 58.22 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGTATCTCTTATCAAAACGTTCCCTGATAACGCCCCACCTCAACAATCGGTGTTCTACTTCAGAAGCGCGTGCCTGAATGAGTTAATTGATGGATGGTC:1 - chr3R 24053603 3' - mdg1 7062 2 69.18 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATGTGCAAGGCAGGGCCGTATCCACATCGAGGGTACATATGTTTTCT:1 - chr3R 18697878 3' - 297 6623 2 64.17 GAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTATGGCCGCGCTAATCACCTCCCTAAGACTATGTTCAAATCATGCAGATTCCCTTAATAATTTAGCTAACATAAAGAGAGAGCAGGGGTATATTGAAGAAGCTACGCGACTTTAT:1 + chr2R 5326167 3' - rooA 7425 2 63.70 GTAGATATCGTGATTGCTGTACTGGTAGGTAATGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCATATCGTGCAGTCTTAAGCATCGCTTTTTATCAAAGCTGCAAATGGACGGTACACT:1 + chr3R 10455726 3' - Doc3-element 492 1 79.45 CTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGGG:1 + chr3L 23678157 3' - Osvaldo 18 1 70.97 AAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACAATGCTTATGTAAGCGTAATATGTGAAGCATATTATGCTACTATATAGCTGCATCTCATTCATTTTACGATGTCGTTATAGGGGTGAGAGCAATAGCCACTCCTCCTCTCT:1 + chrX 22260228 3' + Tabor 7315 2 77.40 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTCGATCGGTCTCCATTGCCCCGAATGTAAGACCTCCAACGGATGTCCCTCCTCCTCGAAGGAATTTAAGAATCCGACCCGAGG:1 + chr2L 8396962 3' - roo 8702 2 59.59 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACCTAACTGTATGGTTCTATTTTAATTAATACATTTTCTGCTGCTTCTTATCCTCTTCGGAATCTTCGATGG:1 + chrX 19597119 3' + 1360 3336 1 56.16 TCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTTGCTAACGCTACGTATGTATGTGTGCGCCTAAATGGGCGGGGGTTTGGCAAAA:1 - chr3L 13365519 3' - jockey 4567 1 73.79 AAAAAAATAATAATAATAATTACTCACAAAAAACCGAAAGAATAATTTTTTTAGAATAACTAAAAACTACTGAACCACTGAACCGAACCACTTTAAATTGAAGCGTCTGGGAAAATGGAAAATGGGAAAAAAGAAGTCCCTTGTTA:1 + chrX 9420288 3' + invader6 4386 1 78.08 AAATAAAAGCAAAATTATATAAAAATAAATAAGAAACAAAAAATTAATTGCAGGACTTGATATAAATATTCTGGGCTGAAAAAATTGTGTGCACTACATTTTTTTGAAAAGTAATGAGGTAAAAGTAATGAAAGTAATAA:1 - chr2R 14923993 3' + HeT-A 327 1 65.00 ATATATAACATATAAATAATTTTACATCTATAGATGAGACAATATCTTATAATGTAGAGACAATTTCTTAGTTCTATATATATTTTTTTGAGCCATAAAAAAATTCCAAAAGTATACCGCATAAGCCCAAAATGCTCAACTACCTT:1 + chr3R 11082012 3' + Tc1-2 1414 1 76.03 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAA:1 + chr2L 18213203 3' - roo 74 2 69.86 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGGGTAATTTAGGTAAATAGGTAAAATAAGTGAAATTAAGAAATGAGGAGGTGTCATTAGTGCGTATTAAGGATGAATTCAACCCTTAAATAAAAAGGAAGAGGGACATGCTT:1 - chr3L 23331158 3' + 297 6968 2 76.03 CAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCGAATGGGAGGCACCCA:1 + chr3L 18738156 3' + Bari1 1668 1 53.28 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCCCTCGGATCGGATCCTGGTTAGCAACTCAACAAGCTAACAAATTAACATGCCGTCCAGCGATGTACT:1 + chr3R 10461761 3' - roo 53 2 54.79 GAAATGAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTCTTTGCCTTGGTAACTTCTTCATTCATTTATTTCAGAGAGAACGAGCTTACTGTTAATAACATTAACATTAACATTGGAGATCGAAATA:1 + chr3L 7868953 3' - Bica 171 1 63.01 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCTTTAAACGCAAATGAATGGCAGGACGACGCTTTTACTGCTGCCATGAACCCATGTATCACTTGTGTTGCTATCTCTCT:1 - chr2L 18213095 3' + roo 9031 1 56.16 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCAAAAAGTATTAACCAAGAGCAAGCTATGATAAGTCGATTTTAAGAAACATCTCAAAATAAAATTTGTAAAGC:1 - chrX 21844331 3' - pogo 43 1 52.82 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACCAGTTATAAGCCAACTTTCATTCCAAGCAGAC:1 - chrX 12003880 3' + P-element 2876 1 75.38 ACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACCTTAGAAGTTACTATAATTAAAAGTGTTTAGGTGGCTTTACTGCGAATAGGAGATCACTT:1 + chrX 19585300 3' + Transpac 251 2 61.64 GGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTATATTATTATTATATTATTATACG:1 + chr2L 14300502 3' + P-element 104 1 17.93 AATTAAAAAAAAAACACAAAAAAGTTTTGGTCAGTGGCAAGCCGAATGAAACTCTAAGTGTGGATACCACATATGATGGCCCACAGCTATTAAATTGTATTCCCAACTAAAA:1 - chr3L 4744418 3' + Doc 4700 3 63.39 GTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTATCCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGC:1 - chr3L 14944538 3' - G5 4791 1 47.26 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTATGAGTGTATTTATTACATAGTTAAGTGATTACTTTATATGTTTTATT:1 - chrX 11267665 3' - roo 8693 2 63.01 AAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACGTGGCTAGATCGACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATGTATTTTACACGGAAACGCTTCCTTGTTCCTGTTATATACTTTTCAACGAATCTAGTTT:1 - chrX 16116150 3' - INE-1 151 1 78.77 ATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTAC:1 + chrX 1018155 3' - 1360 240 1 69.18 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATAGCAGAGAATGCAGCAAAATACGATTCCTCAATTCAGTTTCTAAGTTGCATTCGAGCGAAGAAGTTGAAGCTAGACGGTCCG:1 + chr2L 12678631 3' + P-element 2870 1 71.20 GCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGGATAAAGGCAACAACAAGTGGTTAT:1 - chr2L 21325088 3' + invader4 3051 2 80.49 AGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAACAAGCAAATTATATTTTTATGATTGACTCAATCCCCTCTAGAACGAACATCCAATTAGGCA:1 + chrX 11883982 3' + 1360 3182 1 71.92 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTCCACGGACATGGAGCAGCAGCCCATCCGCATCTAAAAATCAT:1 + chr2L 18627760 3' - 1360 80 1 70.55 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAATGTTTATATATAGATTGGACTTTACACAAGCTATTTAATGCTTAATCAGTGATTTCAGCTTTTTAGTTAAATATTTCTAAGCTTTAGCCATAGTTATT:1 - chr3R 8596300 3' - hobo 20 1 70.55 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAAACGACGATGCCAATTCGTGACGCCAGTGACTTCGGCTTTCGGCCGCCTTTCGGGTTTTCGAAATTCATCCGT:1 + chr2L 13717413 3' + P-element 2844 1 56.34 TCCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTGGCCGCAAAAAATCTTCCACAAAAAAATCTCGTTAGGCCCTTT:1 - chrX 3112257 3' - Doc2-element 224 5 76.92 CTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATGCTGAAACTGAATCAGAGTAAGAGTCCTGGAGCCGGGGCATCCTGGATTCCGTCGTGTTGTTTC:1 + chr3R 5941513 3' - X-element 70 1 54.11 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACAAACTTCGAGATGCATTTATTCAAGTGTAAAAGCAACACCTTCCTTGAAAAGTCGTATTCTTCTTTCTCGGTT:1 - chr2L 260927 3' - Juan 4045 1 74.66 GATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTGCTATTTATTTGTATTACTTTGCT:1 + chrX 10128297 3' + invader3 5430 2 54.89 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAACCAACTCTGTTCCCAAAACCGCCGCCCGTGAGTATGCAATAAATTATTTCAAACTGATGGGCGGAAAAATGGC:1 + chrX 4214559 3' + jockey 4950 1 51.72 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATTAGGGTATCTTCTCACCAAGTCGACCAAGCTAT:1 - chr2L 5447854 3' + roo 9040 1 59.86 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGTGCCATATACAAAGACAGAAAATCATTAGGTATAACACCAAATTGGCTATCAATTAGGACCAATT:2 + chr2L 261111 3' + Juan 4201 1 77.40 GATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCCATAAATATGATGATAATTAAGTGTGTGTCTGGCACATATACTCAATTTGGCCTTATTAACCTAAAAAATGACACAGATATTAATTTTCCGCACACATGTGCCCGCTTT:1 + chrX 20874434 3' - F-element 339 1 76.71 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACTTTGCTCAACGTGGTTCAACACACACTTTTGCT:1 + chr3R 19543525 3' - roo 43 2 56.16 CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCGTTGGATTGATGTTCGGAACCTGAGTCATCAGTGAAGTTTATCTCGAACCC:1 - chr2L 21153433 3' + 1360 3384 2 79.26 CTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAATAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATAACAAAAGAATTTC:1 + chrX 3106003 3' + I-element 5313 1 65.75 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTATAATACATACAATTCTCTTGCACCAAATTCAGAATATTTGCTTG:1 - chr2R 9868901 3' - roo 8739 2 71.23 AAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATTTCTAGTCACATTCGGGATTTTTCCAATTATCA:1 - chr3R 5024793 3' - diver 41 2 59.59 ACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGTGATATTTAATTTTATTCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGAAATTGCCATTTTCTTCACCGTGTCGCTGTTGCTTCTTTTATGCTTTTATGCTTTTGTTATGCGACTGC:1 + chr3R 22254243 3' + Cr1a 4274 1 48.63 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGACTGGCTCTCTAGTTTA:1 + chr3L 10564024 3' + hopper 1392 1 66.91 AAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACAACTGAAATCACGTTTCCACGTTCGCCACTCGCGCA:1 - chr3R 22868776 3' - mdg1 7123 2 75.34 CTTATATGTAGTTGCCACTTATGCTGTCTAGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAAATAGAACTTATTTATAGTTTACCTACTTATCATGTGAACGCGTCTGGAAAGGTCGAAGGAAAGCAACAAGAGGACACATTGTAATGATAAT:1 + chr3L 16511202 3' - rooA 7323 2 61.64 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGTTTTTATTTTTATTTCATTTTTATTAATGCGAAAAATGTAATTTCAAGCATTTGCAACTGCAGCGGTCCCTTGGGGCCACACGACAGTCAGCCCAAAAACAAAATACAAAA:1 + chr3R 25843489 3' - I-element 14 1 76.71 GATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCCACTGGGCTTAAATATTTAGCAACAGTTTGCAGTGGGGAAGTTTTTCGGGGTACGAAGGATGGGG:1 - chr2R 9623327 3' - I-element 60 1 53.10 GAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACGAAGACTGTTGCGGTTTCCCCGCATTCACTGGGTCTTCATGATCAATAAGTAATTTTACCGTAGCTT:1 + chr2L 22696215 3' + Doc 258 1 54.11 AAACAAAAAAAAAACACCAAGTCGTGATAAGGGAGCAGAAATGAATATGTTAGTCAGCTCAAAACGAGAATTTCAATACTCTTATGCACAATGATATTATTTGAATGAACCAATAGGAAATGCCATCATAAGAGGCATGGAAAACC:1 - chr2L 13132133 3' + Porto1 165 1 51.37 TATTAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATTCGAGGTTAAATTGTTGTTTGGGGCTTCTTTTGCAAATCGTGGCATACTTTTCAGAGATTTTTCGCAACATTGCTAGATATTTTCAAAAGGAAATTA:1 - chr2R 13193740 3' - BS 5018 1 63.70 TTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACAAT:1 + chr3R 29091412 3' - rover 37 2 60.96 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCCTCTCACCCAAGCGCTCTCCCTCTCCCGCGC:1 - chr3R 11773866 3' + P-element 2850 1 60.96 AGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAG:1 + chr2L 21153565 3' + 1360 334 1 54.11 CTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCCGCGAAGTGGCAAACGTCAGTCAGTACTTCAGCCATT:1 + chr2R 9410536 3' - hopper 82 1 70.55 AAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGGACCGTTTTGTTTTGCTCGTTTCACCGCCATTTTACAACTTTAGCTAATTTTAAGAATTTTAGAAATCTTGTACTTCAAATTTGAACACAGTTC:1 + chr3R 5316688 3' + Juan 4210 1 79.45 ATAGTTAAATAAAATAAATAAAATATCAGAGTTTTTCTCTAGTCTGCCTCACTTAACATTTTATTGCTTTACAGACAAACATTTTTCACATCAGAAGTGACTTTAGAATTTTCCACTGATCAACAATGACGACAGAAAATCAAGGC:1 + chr2L 14023114 3' + Ivk 5381 1 56.85 AAAGACAGTTTCCACATAATTCCACTGACCAAGGGCAACATTCATGAAACAAAAGCGGAAGTCATTAAGTGGGCTGTGGAATCCACATCCACCTGAATGCCGTTGACAAACGGGTTCTTCTCGCCCGAAGAATAGAAGCAAAACC:1 - chrX 4144959 3' + Fw2 278 1 55.86 GAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTATTCTCATTTATTGTCTTCTCCAAAAGGTCAACCGTTAAACCC:1 + chr3L 26019416 3' + gypsy 415 2 47.83 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAATCAAAAA:1 - chrX 10287001 3' + roo 8992 2 74.66 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAACTTCACTAGAATTAAATAATTATGAATTTATTTTAGGGGTATTAGAGCTTCGAATAGTTC:1 - chr2R 21473581 3' - pogo 39 1 53.49 AAAAAAGAAAAACCAGAGGACACTAAGGGCAGGACTGGAAAAGATAACAGGGAAGAGCAAGGCAAATTGTTTATTGTTTGATAATTG:1 + chrX 10676359 3' + TART-C 11045 1 88.51 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGAGTGAATCCCAATCGAATAGTACCCTCCCCTCTGAGCCAATCCTCCCTGCCCAGCTTAC:1 + chr3R 27188629 3' + roo 9009 2 59.59 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTTCGAAATGTATGTAATTTATGCAAAAAGATATCCGCTGAAAGAAAATCAAGTAGAAAATAAAAGAGAGGAAATCGGCATTTGAAAGTTATTTCTCTTTCATTTCGACT:1 - chrX 7031531 3' - hopper 10 2 37.67 GCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGCGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATATAAAGCACGCTTTTCCCTACTTGTTTTTCAT:1 + chr3L 20083850 3' - opus 7185 4 74.80 TTTTTTTTTTTCTAATTTTGATATTTGAAGCCAATGCTGTCAAATATAAATGGAACATGCTGGTAATTTAACATATATAGTTTTGTGACGTTTGTTATGCAAGTGTGTCTAATTACATCTGCATCTTGGTCGTGTGTGCAGTTTA:1 + chrX 3844897 3' - Doc 4695 1 85.52 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGAGTCCCCATGAGCCGTTGAACGTGGAGCCGAACCGGT:1 - chrX 21281183 3' + P-element 2833 1 37.93 TTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTGAATATTGGTGTCTTAATATCGGTATATGTTAACTTTGCTATCTGAGTTGTTTAAT:1 + chrX 15565602 3' + transib2 2761 1 60.27 ACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATATTAAATGCATGCCACCTTCCCCACTTCAGATACTCCGAATATTTTCGCGAAAATTGAAAATTCCGTTGATTTGGCAAAGATATGTTGTTTCACTTC:1 + chr2L 19651698 3' + hobo 76 1 74.81 GGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATGCCACAGCGTTCCACTCCCCTGCTGGGACTTCTTGCCCCCGTTCGTC:1 + chr3R 17210162 3' - HMS-Beagle2 6889 2 81.38 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTTGTATTCACAACTTTGAACACTAACATTTAAGTTATATTGTATCTTTGTCATCGAAAACCGGATTTAATTCGGATATCCTTACTTAGA:1 + chrX 14327572 3' + roo 9040 1 40.41 ACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTTGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCACCC:1 - chr3R 29091295 3' + rover 7228 2 65.75 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTATAAGCTAAGTATTTAAGAACAAACAATGACAAAAGTTAATTAAAATGTTCGAATCCAAAAAGTAAATGCTTTTACTTAAGCGA:1 - chr3R 12727108 3' - I-element 38 1 54.79 AAATAAAAATTTAAAAAAAATTTGACTTATTCAAACCACGCTTAACATCATATTTCAGAAAATGGTTTCAAATTGTATAATTTTTTTTTAAATATAATGATTAAATTCAAAATATTTATAAATAATTAACCCTCACATTTTTTCTT:1 + chr3L 12132051 3' + P-element 2696 1 32.19 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAATTCATGGAATTTTTCATACTTTTGAAATACATTCTAGTTGTTTTACATTAAATCCGGGGCACCACTTAAACAATCCAAAGA:1 + chr3R 22136389 3' - FB 37 1 59.72 CACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTTTCAATTGCAGACCAGTAAAAGTACAAAATATTTTCGTCAGTGCCTCATCACTTCTAGA:1 - chr2L 16388594 3' + I-element 216 1 55.97 TGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACAAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGTATACCTGTATTGGTTGAATAATCGTGAAAAGGTGT:1 - chr2R 9390935 3' + mdg1 337 2 76.03 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAAATACGTAGTGGAAAACGAAGATGCTGCGTCGTCTAAGTCAGACTCAGAAAATCAGGGTGGAATGTAAAGTATAGTTGGGCATCGATAGTTACCACCGTGCTTGC:1 - chr2R 3188621 3' - 1360 16 1 73.61 TTAGGGTGGTTTTCGAGCCTTTTCTCGCTGAGCCTGCAGATTTCATCAGCGACTTGTGGGATGAAGGATTTTCCCGGTTGCGGTT:1 - chrX 13124142 3' - G6 1808 1 71.76 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTCCTTTTTATATAATTTACATTTGTTTAAAAAAGTAATCAGTAATTACTGTATATTTTATATATGCAAAAATATACG:1 - chr3L 11903187 3' + opus 7462 2 58.62 TGATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACCCACTGGGCTTAAATATTTAGCAACAGTTTGCAGTGGGGAAGTTTTTCGGGGTACGAAGGATGGGG:1 - chr2R 9623327 3' - I-element 61 1 53.42 ACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATGTATATATTGCACTTTGTAGTACTCGCTCAATATCATTCACCTGATAGATCGATCGGCTAATTAATGTTTGCACTTGTCAACACGAATTGCCGTTATGAGCGGCAAA:2 + chr2R 15822128 3' - invader6 17 2 58.90 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTTTTGGCCTGCTCGATTTGCTTTTAACTCGCTTTTT:1 - chr2R 9504163 3' + roo 9055 2 71.23 AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCGGCAAATTAGTATCAGTGCATTAGGCCTTGTCAACCAATATATATTTCTAGGAAACTATTTATTACAC:1 - chr3R 5115278 3' - Ivk 55 1 52.05 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGCACATCCATCTAAAGCCCTTCATGATGTTAATTACCGAACCCTGTCACACGCTCCGCGAAAAGGAAAACCTGGA:1 + chr3L 6675408 3' - 412 7100 2 53.42 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGGTTCAATGTCTGGTTTATGTTGTGTTTTTCACAGTTTTCTGTTT:1 + chr3L 18789131 3' + 1360 3360 1 51.45 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAGGCAGGTTTGCTCTTGCACAATTGCCTACTTTTAGGCTCAACTCATGGAACCGTGCAGCTGCTGCCTGAAAGTAGGCAATGAACCAGAAAGC:1 - chr3L 16875655 3' + jockey 4970 1 64.58 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGACAATATTTTTGCTGGTTGTTTAACGTTTCGTGATTTT:1 + chr2L 19643625 3' - hobo 50 1 54.11 TCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATG:1 + chr2R 5173208 3' + Stalker 7185 4 67.12 ACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGGCTACATATTGCAGCATGCAACATTCGCATGAC:1 + chr2L 19643589 3' - hobo 86 1 78.77 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCAGGCTGAAACGCAGTCGTTGAACCCCTCGTTGCTGAGGATTCAGAAAGACTAAGTCTGTGTCTGTAG:1 + chr3R 24053747 3' + mdg1 7404 2 54.79 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGTGTAAGGGACGGATTTTGCGCTGT:1 - chr3L 10563859 3' - hopper 28 1 65.75 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATATGTTGTTATTTATGGAGATTTTTCCAGGTCCACCCATTTCCTACCCACTCCATCGCACATTCGCACAC:1 - chr3L 1981515 3' - opus 7164 4 56.85 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGCAGGGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACGTTACGAAACAAGAG:1 + chr2R 20447898 3' + hopper 1411 2 65.56 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGTAGACATATATATATGTATATAGTAGCCCGATCTGCCTGTCGCTGCGCCGAAAAACTTTTGTCATGAATTGAGGCTGGGGA:1 + chrX 12214601 3' + opus 7475 2 65.94 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAGGGTAGGAGAGTGTCTGTTGTCGTCGGAG:1 + chr3R 22522741 3' + roo 9033 1 56.30 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAGCAAAGTTCATCGCTCCAAATGCTTATGGCAATATAGGCTTATGCGTATTTTATGCGCGAAATCAAG:1 + chr2R 20739105 3' - hobo 14 1 60.58 GTAACGGGTATCTGATAGCCGGGGAACTAGACTATGGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTATAAATGATGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCACTCTACTCTCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTT:1 - chr3R 18346608 3' + INE-1 551 1 44.80 CGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCAAAAAAATCCGACCTCTCGAAAATTTACAGTGAAAAGGGTTCAGCTATTGTTGCTTCTCACTTTTGTTGCGCAATAATGCACGTAATTTGTTCAGA:1 - chr2L 11735466 3' + Doc 4444 1 66.44 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATTTAAAGCTATTTTATGTTAAAGNNNNNNTTTATGAAGTGAACTATANNNNGATAAAAGTTTAGCACTAGAANCTAAACGCTGGTTTG:1 - chr3L 14040857 3' + 1360 3373 1 61.90 GAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 30 1 65.89 ATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAACTACAATTCTATGCACTTCTTTAAATGACTTTGTAGTCGAATATATATGTATTTAAATTTCCGCACTACATCCTAAAACTCGGA:1 - chrX 21590633 3' + BS 5072 1 60.77 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTGCGTGTGTGTGGCCGCCCCGTTGG:1 + chr3L 20399093 3' + roo 360 2 53.10 GCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGATTTAGTATCCATTAATCAATTTGCACTCGCCGCTGATCTTGCGT:1 + chr3R 30303436 3' + F-element 267 1 69.86 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAGAAGCAGGCCTAAAAACGCCGCGCAGTAGCAGGGCTTTCGCGATATGTTATTAATGCAAATACGCATAATATAT:1 - 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chrX 17510595 3' + roo 9009 2 59.59 TACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTACA:1 + chr3L 15099688 3' - G4 3807 1 57.93 ATCTATCGATATCCCAGAAAATGATTTCGTGTTCGCATTTCCATTATCTGAGTTACTATATATTCCCGGATATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTCTCTATTGGCATGCTTAACAAATGTTTTTTGTGCAGCATTT:1 - chr2L 15202416 3' + INE-1 500 1 75.34 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGCGAATGTCTTTGGGCACTTTGCAGTCTCCTTTGGCTCCTAGTGC:1 - chr3L 3757114 3' - copia 4906 2 58.90 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACTTTGCTCAACGTGGTTCAACACACACTTTTGCTTTTTTATC:1 + chr3R 19543533 3' - roo 8693 2 64.29 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGTGCCCTCAATTGGATTAGTTTTGTTTTTT:1 + chr2L 14184682 3' - Tirant 8170 2 74.78 TTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACATATACACCAAGAG:1 + chr3L 5274994 3' - I-element 76 1 69.18 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACGTACAGCACGCTGTGGGCAAGAAATATGTTGCCCTTTTAGGCGTTGACAA:1 - chr3L 13544987 3' + hobo 2910 1 51.92 TAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGGTTTCCAGCGAGATATCAGAACGAAACAAGGAAACGATGACGTACCGAAAAAGACT:1 - chr3R 4997840 3' + invader2 4796 1 54.47 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATAAATTAAAAACTGAATCGACCGGTAAAAACGCGACGAAGTAATGCGTCAAAAACCCAAACGAGCCAA:1 + chr3R 12725644 3' - 297 6632 2 56.55 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATG:3 + chr2L 13690093 3' - Doc 62 1 57.53 ACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACCACGGCGATGGTGATGCCACTGCTTAAAATGGGTCTCGAAATGATGTCAATTGTCTTGTCTCCACGAGTCAAAACGCTTGAGTATGCCGAGCACATCTAAACACACGG:1 + chr3R 30117689 3' - gypsy4 6454 1 59.03 AGACAGGCCCCGAGTCGCTTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATGAAGGTAGGTATTACCTATTATTC:1 - chr3L 14084898 3' - opus 7191 4 78.40 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTACGGCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGCAGCAAAACTAAACA:1 - chr2L 19158839 3' + P-element 2809 1 32.19 GAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACATACCGTATATACCCACATTCATTATCACTATCAGCAGCCATGCCCGC:1 - chr3R 4532885 3' + 1360 3320 1 68.79 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTT:1 + chr2R 16891830 3' + jockey 4932 1 67.86 CGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCGGCAAATTAGTATCAGTGCATTAGGCCTTGGCAACCAATATATATTTCTAGGAAACTA:1 - chr3R 5115288 3' - Ivk 62 1 58.04 GAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCACGTGAAAACGTGTCTCTGTCTC:1 + chr3L 18767870 3' - roo 8619 1 54.11 ATGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAAAATAAAGCACTTGTTTACTTCGTCGCAAAATCAAAAGACAGACTGCGGCCTAA:1 - 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gypsy8 309 1 79.07 CTTATTGTTATTTTTTAAAAACAGATTATATTTAAAGAAAAAAAATCTGTTCGGGCAATTTTTGAAGGAACTCTGCACTTTTACAAGTCTTGCCGTTTTGCCATGAATATCAAGTATCCTTTTTTTCTATAGCAAATAAATTACGA:1 + chr3R 6821290 3' + Porto1 4639 1 29.45 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATGTAAATATATGTGCAATAAAATTATGCGAAATAGTCATTCCACGGTAC:1 - chr2L 17166285 3' + I-element 5286 1 63.70 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCCCCGTCTTGGAACTGGACTCCATC:1 - chr3R 10461632 3' + roo 9031 1 57.53 GTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGA:1 - chr2L 4420516 3' - gypsy5 73 2 67.86 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTTATTTGCATAACTGCTCAAATGCATGTTGTTATTGAATTTAGGGTAATTCCTTTCCCTATAAATGTAACGGAATTTCGAGAGGCAGGA:1 + chrX 17737308 3' - jockey 4707 1 63.01 AAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTGCTATTTATTTGTATTACTTTGCTGGTGAAACTCTTTAAATCAATTTGGCACAT:1 + chrX 10128327 3' + invader3 5447 2 69.18 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGTATGAAGTGTTCCGATAAAAAACAAGCGAATGATGAAAGGGGCAGCCCGGAAAATGTGCAATAAACAATGTATTTTGATTCGAACGTGA:1 - 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chr2L 17727875 3' - jockey 4759 1 70.55 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTTGGGGGCATCATAAGCAGACAAAG:1 - chrX 21257411 3' - accord 184 2 84.13 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACCATCTACGTCTCGTTTCGTTTCATTTGGATGTGCGG:1 + chr3L 9519671 3' + roo 9042 1 60.14 TCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTATTAAAACAGTTTGTTTAGTTTTAACTTTAAATTATGTTTAA:1 - chr3L 7776148 3' + roo 8897 2 71.23 AATATTTATTATTAATTAATAAAAGTATTATTATTAAAAGCTCCATCATTTATTCATTTGTTTCGAAAAATGGTACTCTAAAAACTCTATGGACATTCCCATTTTGACCATGGTATTGGAAGCACTTCTAAAACAGCGCCCGTGTG:1 - chr3R 20711688 3' + Tc3 265 1 65.07 AAAAAAAACAAGGAAAAAGAAATTGAGCATACGCCACTACAAACGGCGGCACTGCAAACGAGAATGTCCTGAGTGT:1 - chr2R 15631878 3' + Doc2-element 232 1 89.47 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATCTTTTCCTTTTTT:1 + chr3R 6412087 3' - Tirant 8143 2 62.07 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTCACAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAGCATGAGTCCGCGCAATAATCACAGCCAAGTGCTGCATATTTATAGGCGCAATCAACTTTATTGCGCTGGCAGCC:1 + chrX 850180 3' - 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accord 478 2 75.34 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATGAACATATATGAATATATACAAATAAGCTGTCTCAAAGCAAAAGCCTAACACAAAAGTGATTTGTTGTCAT:1 + chr3L 14709023 3' - opus 161 4 55.17 GTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTGATGGTATATTAATAGCAATATTATAACGGCTAGAACGATGAAAGCGTTCACTGCAATTAT:1 - chr3L 17245958 3' - I-element 462 1 58.22 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAGCAAACAGGTTAGCACCAATGGACAAGGAGCCTGCAGCTGCAAAAATATCCGCCACTAGGAAGTAGGGTTCGAAAGCAGAACCAGCAAAGCCAACAAAGGTTTCGCATC:1 + chr2R 1875860 3' - Tabor 14 2 76.03 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTA:1 + chr3R 21587587 3' + roo 331 2 78.42 ATATATGTATATACAATATATGTACATATTTGACATATATAGTATAGAATTTCCGAGTTCTTCACAGCCGCCAAGAACTGGAAAATCGCATCATTTGTGGCTAAGTAGGCAAGAAGTGGCGTTCTGGAAATACTTGAGTAGGATGT:1 - chr2L 10469980 3' - INE-1 60 1 84.93 ATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCAAATTGATTTTAATAATAAACGGTGTGCATAATTTGGGATGATATTTTCGCCGTTACCTCCAATCTTACAAGTGTTGACTGTGGCTGAATAAGAAGGCTCTTTGCGTTGACTT:1 - 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mdg1 31 2 64.38 ACGTATTTGGGTGACCCAAACCCAAACACTTCACTTTCAAAGAAAACAGCTGCGCAGCATCTGTTTCTAATAAAGATCGGTAGGCCCACTCGTAGATAACAATCTGAAGGGCATACCGAATTGGGCTGGAAAATATCATTGTT:1 - chrX 13406813 3' + 297 6586 2 53.15 TAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATTAATAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTCTTCTAGTCTTATAAAAATTAACATTTTACATGGCGACAGTGACAGTGTCCACAG:1 - chr3R 3177915 3' + Stalker 7130 4 84.25 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATAGCAGAGAATGCAGCAAAATACGATTCCTCAATTCAGTTTCTAAGTTGCATTCGACCGAAGAGGTTGAAGCTAGACGGTCCGGTT:1 + chr2L 12678634 3' + P-element 2852 1 63.01 CGAAGAAACGAATTTACATTGTACATGTTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAATTACCTTTAAATAGAAATGAATTTTCATGCCGAGCAAGAAATTAAAATGAGAATGGTTCTTGTT:1 - chr2L 10525722 3' - 1360 3157 1 56.16 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACATTTTCCGGTGCCGCCATGGTGGGTACGTTCACATCCACATTCCCATTTACATGGCCATCCCTCTCTC:1 + chr3R 22624819 3' + blood 356 2 69.18 AATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATTGGGGTTGGGGCTGTGGGATAATGCCTGCAATTATTATTATGTAAATCGCGTTGAAGACAGAG:1 - 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gypsy2 6519 2 69.18 ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTAGAGAGAAGCATTTTCAAGAACATTTTTTATTCGATTTTCCTGAATTTACTGAAAGGTTTTTTATTATGCAGAATGAATAATTTATT:1 + chr3L 19574184 3' + 297 368 2 68.49 GAAGAAGACAGCTCTAGAAGAGGAGAAAATGCACGAGAATTTGCTGCTAGCGAAACACCGGTGTAATTGTGTTCGCAGGTTGCCCTACCCTACCTATGACCACACCGCCGCCTGCAGCGGAATGGAGTACCAATGTCGCG:1 - chrX 2501206 3' - Gypsy12A_LTR 2032 1 74.29 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGAGTCCCCATGAGCCGTTGAACG:1 - chrX 21281198 3' + P-element 2799 1 21.48 TCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCACATCCGAGTGCTCCATTTTAAATACTCTAAAAACTAGTA:1 - chr2R 13212195 3' - diver 5938 2 49.32 GGACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGTTTGCATCATTGGGTATTATCAATACAAATAAGGAAATGCACAATTTAAATTATGCTAAACAATACTAAAAACAGTGCCATTAAAGCAAAT:1 + chr2R 5265228 3' - Q-element 421 2 69.86 AAAATATGAATATATGTATATATATATATAGATTTATAAACATGCATATATGTGGTGGTGGTACTCGAATATATACACACACTGTATGATTCATGTGCAAATTGAACTAGCAG:1 - 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chr3L 3985247 3' - F-element 269 1 76.71 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTGCCTCTCTCTCCTTCGTAACCAACGGTAAAGAGCGAGAGCGACC:1 + chr3R 5264908 3' + P-element 2818 1 35.25 GTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTTTAGTAGTGATTGCTAAAGTTTTTATAGATGAAGATTAATACCGCAG:1 - chr2L 11442913 3' - G-element 4190 1 66.67 TGTTATTACTATTATTATTATTATTATTGTTGTTGTTGCTGTTATTGTTGTTACTATTGCTGTTGGACGGCACGATAGAGACCCAGGCGGAGCACTACTACATCGAGCCGGCGCATCGGTATTCCCAGCAGCTAGCCG:1 + chr3R 29727879 3' - mdg1 40 2 57.25 ATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAATACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGACGATATCCATAAATAAGCGGCTAGTTTAAT:1 - chr2R 22287446 3' - jockey 4847 1 73.60 ACCCACTGGTAGAAAAAACATCCGTCCCCTAATTTCCATCGCAGCTCGATAAGCCGACACACGTTCGCATTCCAAGTCCATGTCCCCAAATTCCAGCCGACTGGC:1 + chr3R 17232731 3' + Idefix 176 2 75.24 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTATGCATAAAAAACGTTGAAAGCAAATGGCCGGCAAATGGTTTTAACAAATGAATTATATATATTTTTATATGCAACTGATTTGCATTT:1 + chr3L 13545105 3' - hobo 31 1 64.38 TAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGCCATCCCAAGTGCAAAGTGCCGGCTAACTAATTGCTCTGTCACCGATGAAGGCAAA:1 + chr2R 13471432 3' + flea 4951 1 60.96 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAA:1 - chr3L 10563912 3' - hopper 74 1 71.94 CATCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGATTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTGGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTTCTGGAGTGGCTAACCCATGTGGGGATATCCATAAAATAGCT:1 - chrX 182804 3' - Cr1a 4049 1 67.69 CAACCATTTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGATTTCCTTGAGGCACTGCTTCCGCTCATGAGGGAGGTACCTCTCAGCTTATGTTATCAGATCCTC:1 - chr3R 12354216 3' - R1A1-element 487 1 70.15 ACATAAAAAATTTCCGAATCTGAACTCAGGTTTAAAACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTAATGCCTTCGGCAGTGTTTTTTTTTCCTATTTTTACAATTGACCAAAGGACGAAAGCTTATTTCCGCTGCCAAATGAGCCAC:1 - chr3R 7423802 3' - transib2 2560 1 65.07 GGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCAAATTGATTTTAATAATAAACGGTGTGCATAATT:1 - chr3R 17210031 3' + HMS-Beagle2 7107 2 76.03 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCGGACTTTACATATTAGAAAATATGTCTTTTCCCATCTATTCAAATGGTATTTATATTTCGCTTGCAGTTTAAGACATGTATCT:1 + chr3L 4933842 3' - blood 7050 2 55.48 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTAGTT:1 + chrX 14346505 3' + roo 9019 2 58.46 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTTATCTAAATATAAGTGAGCACAGCAGTAGGCCCGTACGTAATTAAACAAATATTGTAT:1 + chr3R 21706338 3' - I-element 62 1 58.22 CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGTGCCATATACAAAGACAGAAAAT:1 + chr2L 261069 3' + Juan 4160 1 50.34 GGGGTTTAGGGGGTGGGGTAGCGGGAGTCTAGTTATTTTGTTTCATTTCGGCTAAATTGCATTTTATTTTGACCTGCAATGCGGGATGAAAGCGGCGAAGCGGAGGAGGGGTCTTTCTAAAACGTTTCTTGCCTGCGGT:1 + chr3L 1366085 3' - Tirant 8114 2 76.26 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACATAATTTCCAATCAAAACTAAAGTGCATGCAAATCAAAAAGTGAAAATGTGTCCGAAAACGTCGAAAACCACGCCGCTCCTGCTGAT:1 - chrX 10286954 3' + roo 9039 1 62.33 TGTGTGTGTGGTGTTGTGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTCTGTGCAGTGGAGCATCGTTTTATTTATGCTCATAATGCTGTGCAATGAATAATTATGCAAATGGAGCGGCTTATGGTCA:1 + chr2R 12839582 3' - gypsy3 415 1 76.71 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTATGAGTGTATTT:1 - chrX 11267701 3' - roo 8729 2 63.01 CTGTACGTTTGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATTTAAGCTAGAAAGTTTAGATTAAGCGTGCAGATTCCAGAGACATAGACGCAGCCCAAGATTGTTTGTAGTCATAGTCATAGTCCTGCATGTACAGG:1 - chr2L 20073406 3' + INE-1 131 1 73.85 CAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAACAAAAAGACAAAACTCTGAGAGTTTGCCGAG:1 - chr2R 10458952 3' + gypsy7 5008 1 77.78 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTTGTCTTGGGCGTCTCCTCTCTGCTTCTCTTC:1 + chrX 16217551 3' + P-element 2880 2 73.68 TCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTACATATATATGTATATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACC:1 + chrX 11661502 3' + 297 365 2 66.44 TAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTACCTTCGTGAATAAAA:2 + chr2L 22150650 3' - S-element 62 1 84.93 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAACACACTCACGGCAGCAGGAAGCTTCCTAGGATATGTAAGCGAGAACGTCTGG:1 - chr2L 12847209 3' + 412 424 2 65.07 GCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAAATTAAAGATCAGAGACACGTTGAAAAGGGTTTAATTTTGGCTAAAAAGATTGCAGATGGCTGGCGATTACA:1 - chr3L 17206897 3' + I-element 5306 1 52.05 ACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACATTTTATAAAAAAGTTAATGAATTAATTATTTTTGAGTTTTTA:1 - chr2L 20556478 3' + invader3 197 2 78.77 AATATAAAAATATATTAAAAAACCAAATGGGTTATTCAAAAACAATGGTTAATAAATCATCAGAATAAAGTTAGTTTCAGCTGCTGCATTTTGCTATAACTTTTACGACCTTTGTTGTTTGCCCAGTTCGGACTTCAACGTCAATT:1 + chr3R 16552984 3' + BS4 725 1 58.90 ATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACTTAAAGTTTTCCTTCGCACTAGGCCAAACTCCGTTTGGCGCCATCTATCG:1 - chrX 20636941 3' - Quasimodo 69 2 67.12 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTTCCTTTTTGCCGTTCTCAGTTCTCAGGCCCCGAAAAAAGGCTTTTCTAGCGAAATTCGCTGCGCCGC:1 - chrX 8760074 3' + roo 353 2 52.05 AAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTTATTTCAATTTTTTTTCTTTTCATGTTCAATAAAGGGAGTAGCTTATAAGGGAAGGCCCACTTTTATATCAGCATTAGTATTAAAGTCATTCAAAAAAGATAGCGTTCAATATTAATAA:1 - chr2L 21710352 3' + FB 148 1 76.03 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATGTATCCTATTCATTCACAATTCAATAACTAACTATAGTGGCAAATACGTCAGATATTAGCCAGATGGGTGCCT:1 + chr2L 5711028 3' - HMS-Beagle 6837 2 52.74 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGTCGGTAGCCGAGCTCCAACTTCGGGTTCGGGGTTG:1 + chrX 10806945 3' - P-element 60 1 33.06 AGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACAATGTCCCGGTGCCCGAGTCCTGTTTATTACCCAGCAAAACCATCTACTTAGCTCCCTGGGTTT:1 - chr2R 12073332 3' + Tirant 66 2 60.27 CAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGAT:1 - chr3R 9175217 3' - Juan 66 1 65.38 CCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTCCCTAGTCAATGCAGCCACAAACTGATGCAGATTGTATAAATATAATTTCGTGTTATGAAAATGAGATCCCAATGCCAAA:1 - chr3L 14084614 3' - opus 297 2 63.81 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAA:1 + chr3L 13228529 3' - P-element 76 1 25.38 ATTGTTCCTGATCAAGAATTTATATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACGATGGCTGGTCTGCGATCAGCACTGTTTAA:1 - chr3R 31045672 3' - INE-1 83 1 79.53 GTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAATCAAATTTCTAGT:1 - chr3R 5024819 3' - diver 67 2 65.07 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCCTCTCACCCAAGCGCTCTCCCTCTC:1 - chr3R 11773872 3' + P-element 2847 1 58.04 ATGTAACAGGCAAAAGGAAGCGTTTCTCAATTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGACGATGTCCGTCTGTCCGTATGACATCCTCGCAACACGTGAGCAAGTGTTATTGTCCTTTTCGCGTGCGTGTGTGCGGATGCGACGGC:1 - chr2R 23573163 3' + INE-1 30 1 55.48 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGTTTTTATTTTTATTTCATTTTTATTAATGCGAAAAATGTA:1 + chr3R 25843418 3' - I-element 85 1 71.23 CAATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGTCTTATATTTCTTTTTATTTATTAAATTTTTTTCAATTTATTAAGTTCTTATAAATATTGCTATTAAT:1 + chr2R 4774807 3' + baggins 5403 1 69.18 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCTTAAATC:1 + chr3R 6412075 3' - Tirant 49 2 53.42 GTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGCGGGAAATGCAACCCTTGGGGAACTGGATCCTACAGCTGGATCGGATCCAATGCACCCGGTTTCCATACTGAGGGACAAAAGGGCAATCGGAAGCCTCTATTTTAGTACCCATACACATATGTTT:1 - chr2R 10548037 3' - gypsy7 5005 2 81.51 TTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGTTCGAACCACTTCGCAGCGGAATGCTGATTTTTGATGTACAGCTCATGTCTATTTTTATACAACTTAAGATCCAAGTACTTAATAACTTGCATAGAA:1 + chr2L 5798394 3' - FB 26 1 60.96 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATTACTAGTCTTACCAAATACTAGTTCATATGGACAGTAATTATGCGTTACGGATGGTGTAGTGTTAAAACAGTACACAAAATA:1 + chr3L 17159090 3' - 412 7086 2 61.43 AACATAACAGCGCAATTAACATATTAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATTCGAGGTTAAATTGTTGTTTGGGGCTTCTTTTGCAAATCGTGGCATACTTTTCAGAGATTTTTCGCAACATTGCTA:1 - chr2R 13193761 3' - BS 5039 1 50.00 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCT:1 - chr2R 24021548 3' - pogo 56 1 58.90 AATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAA:1 + chr2R 11097371 3' - Juan 4095 1 63.70 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATGCGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCAC:1 - chr3R 11773917 3' + P-element 2799 1 26.03 ATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATGTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTGAGCTGCCAAACCCAAACCAGACGAATTAACAATCAGTAAACAGCATTTGCTCCCAACTTTCAGACCC:1 + chr3L 14763035 3' - F-element 116 1 52.05 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGTTTGCTCTATAACTAATCTCGTTTATCACGATTGTCGTGTCAC:1 - chrX 19113465 3' + 412 438 2 54.11 ACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACTTTATGGAGTTTGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTGTATAATTTTCAACGAATCTAGTATCACATTTTACTATACGAGTAACGGGTATAAAAACAAAACCAAAGAAAT:1 + chr3L 4161101 3' - invader1 13 2 76.03 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGTGTTAAGAGCAGTCCAATATCAATTTTCAAGTATTATTTTTCTGAATGTTCCTGATTTTTGGGATTGGGCTGCAT:1 - chr3R 14493994 3' - roo 8709 2 51.37 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCACT:1 - chrX 16526289 3' + P-element 2817 1 30.77 TTAATCAAAAAAAATACAAAATATTACTCGCTGTGCTCTGTGAGAATAGCTAAATAAATTTCACATTGACCTAGAATTTCTGAAGCTTAAAAGTGTCTCTTAGAGCGATATAAACCTAACTTTAAGCCCACTTTATAGCAGTTTGG:1 - chrX 16762705 3' + Juan 347 1 86.99 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGTAGACATATATATATGTATATAGTAGCCCGATCTGCCTGTCGCTGCGCCGAAAAACTTTTGTCATGAATTGAGGCTGGGGAAATGTGCG:1 + chrX 12214609 3' + opus 7475 2 67.81 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAATTAATCCAAGAGCTTTGTCAATTAACTAATTAATGTTAGTACTTTTTAAGTGTTCA:1 + chr3R 24976337 3' - roo 8693 2 64.38 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTTGCGTACAAAATTCAACATTATTTGAAGGTCGTCCTTTGCTTATTCTGCGCGTCGCTTTTTACTCGTTCGCTCTCTCTT:1 + chr2L 21251054 3' + P-element 2847 1 58.90 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGACGAACATATATCTAACGGCACTGGCCATTACGGATATTGCCTACCTGAC:1 + chrX 4725069 3' + roo 338 2 66.21 AAGCAATTAAAAAAGCCTGGGCAACAATTTCACTAAATGAAATTAAAAAATATTATGATTCCAAACCGTATGTTTGAGGTAATTAAAAACAAGGGTGGCCATATTGGGTTGGCCCGCTTTGAAAAATGTGTTACACAAGACAGCAA:1 + chr3R 29461592 3' + Tc3 1326 1 70.55 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGCGAATGTCTTTGGGCACTTTGCAGTCTCCTTTGGCTCCTAGTGCCCC:1 - chr3L 3757111 3' - copia 18 2 68.46 TGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGAATACACCTGGCGGTTCCGCTACCATAACATTTTAGGTCTCATTCCAAGGCCATTCCTTTTTGTAGAGGCTTGCTGCCTTTGAGTTTCACAGGTGAAAATAGTTTTTGG:1 - chrX 169793 3' + 1731 312 1 57.04 GTGATCGAAGGGAGGAGACTGATTAGTTTGTGAATCATGGAAATAATACCGAGCTTCCAACGGTAGGAATGCCGCTATAAATTTGTTATAAAGTCTCTATTTAATCAATGAGGTTTATTATTTGTGGCATCTGTCATAATATAGCA:1 + chr3L 23615331 3' - BS3 444 1 54.79 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATATTCCCAGTGCAGAACTCCACGGCGGCTCACCAAAGAGGTTCTCCGAAGATGA:1 - chr3R 10636105 3' + blood 7322 1 64.34 ATATCAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTGAAGCATATCTATATGTT:1 + chr3L 20224206 3' - Chimpo 70 1 78.40 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACCATCTACGTCTCGTTTCGTTTCATTT:1 + chr3L 9519661 3' + roo 9038 1 56.82 CTGAGCATGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAAAGTATAAATATTATTGATCAGGATCAATAGCCGATTCGATCCGTCCAAGTCTGTCTGTCCGTCCGTATGAACGTCTGGATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGAA:1 - chr4 829451 3' - McClintock 12 2 55.48 ATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCCGGCGCTTCCTCTTTAGTGCTGACAATCTGTGGAACTCACTACTGATGGGAGTGGTGCGGTATGGATGTGGTCTTCAAACCGGTTGATTCATTGCTGTAATAAATATA:1 - chrX 10938439 3' + INE-1 560 1 75.17 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGTTTGCTCTATAACTAATCTCGTTTATCAC:1 - chrX 19113479 3' + 412 7515 2 52.78 CGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTCCGTCAGCAATGAAGTCATTGCCATGACGGTCAAGGGTCCCGGTCTGCAACGCATGGTCCTAGT:1 - chr2R 14233639 3' + Quasimodo 7253 2 56.16 AAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGTAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATATATTCTTGACCAGGATCAA:1 - chr3L 24757195 3' + Cr1a 4259 1 55.48 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGAAATTAAGAACATATATTTTTAAGCCTTCTTTGAAGTTCTTCGAAGTTCAGAACTCAAACTTGCCATAAAAAGTTTATTACCATAAAGCAAAAGTCGAACTTAGCCATAAAAAAG:1 + chr3R 29622806 3' - pogo 4 1 70.55 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTATCATAAAAATCTGGGAAACAAATCATATCGAAACCATGAAATGTAGAATTCTTCTTTGTCGTTATAATTTCTAATAGCCAAATGCGTACACTCCCCGAATTTT:1 + chr3R 14494157 3' + roo 394 1 76.03 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATGGGTCAGCACTGTTGCAG:1 + chr2R 22464501 3' - pogo 25 1 67.12 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTCTTATTAGCAGTATTTGTTTATTGTTATTATTGTTTTGTTTTATTTGTTATTGTTATTAGCAGTATTTGTTTTATGATAC:1 + chr2R 17187813 3' - roo 40 2 48.63 AATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCACAGGTGGGTGCTTGGAGGGCGGTTGGTGAGAGCGGTCGG:1 + chr2L 17364627 3' - F-element 4538 1 69.30 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTGTATATATCGAGTGCAGCTGATAATTACAAAGCGGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACACA:1 - chr3R 12622210 3' - 297 27 2 50.43 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATGCGGCTGGTCTGCGAGATCA:1 + chr2L 13690112 3' - Doc 17 1 65.00 AAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACATACGCAATACGTTTGAGTTTCAATAAAAATGCATTTGTCTAAATTTGCTGCTATTTATTTGTATTACTTTGCTGGTGAAACTCTTTAAATCAATTTGGCAAA:1 + chrX 10128326 3' + invader3 5446 2 69.86 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCAATCTGAACAATGGGATTGGGAAAAGAAAATAATTTATATAATTCTATTATAAGCCAAAATAATAGCTTTAT:1 - chrX 10823912 3' + pogo 2055 1 52.74 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGTTAAGTTAGGTTACACAGTGAGAAGTTCCTGATGAAGTGAACATATACAAATTTGAAATATATATGTA:1 + chr2R 8091261 3' - 1360 51 1 52.74 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAG:1 - chrX 16526295 3' + P-element 2816 1 27.20 CTTCACCGTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTTGTGTAAAAGACGAACACAAAAGCAACAAAAATAGCGAGACATCCCCGCGGAGTTTTAAACTGGCGCAT:1 + chr3R 5809686 3' + 1360 226 1 52.74 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAAAAGGAATAAAATAGTTTACGAATAAATAAATACAAAAGTATAAGAATGTAATTATCGTAATTAACATCGTTTACATAGCCTTCTGGAGTTCATCCTAAATGAATAAC:2 - chrX 18190298 3' - hobo 14 1 76.03 AATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACAATACACACAGT:1 + chr3R 29091421 3' - rover 27 2 66.21 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACC:1 - chr2L 13717315 3' + P-element 2853 1 36.67 CTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATCTCGAGCTCACTCTTCGCCGGCTAATGGCTCGCTTTCTC:1 - chr3L 21191875 3' - roo 144 2 72.73 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGCTGAACAGGGGCTCGGCACAAAACATGGCATACTTTTTGGGGCCTGCATCGGTG:1 - chr2R 20739007 3' + hobo 2919 1 59.00 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAATGTTTATATATAGATTGGACTTTACACAAGCTATTTAATGCTTAATCAGTGATTTCAGCTTTTTAGTTAAATATTTCTAA:1 - chr3R 8596318 3' - hobo 21 1 65.89 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTACCAAGCCTATTTACGGTTTAGCCTTTCGCTCTTTATTTATAGTTGTTGGCTTTTTTTTAAATCGTCGTG:1 - chr2L 7449683 3' - roo 8716 2 56.16 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAATAAAAGTTGCAATAAATTGTAGCATACTTGTGAGCGGACGCAGTTAATTTCTTAGCCTGCCACCTACGACCC:1 - chr3L 15853480 3' + jockey 4953 1 50.00 ATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCATTCTTATTTATTGGTTGGTTTTAAAACTTTCAAATGTTAGCAAACAGTTAATGTTGTTGTTCTTCATAAGTCTAATACTTGTTGA:1 + chr3R 13228112 3' + Bica 4870 1 58.62 GGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCGACTG:1 + chr3L 18738145 3' + Bari1 1644 1 65.93 TAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATATATACACTTTATACAGAATCTACGCGTAATGGTTATAATAATATACAGAGATAGATAT:1 - chrX 15408713 3' - INE-1 503 1 64.96 GTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCA:1 + chr3L 18767840 3' - roo 8650 1 67.12 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTTTGTCAAATTAAGGCCTTGTTGCTCTGGGCCTCAAGCTGTTCATCAGGAAGGCCCATACTCGGTCATTATAACGCCCCGTTCATGGCCAAGTTGATTGCACAAAAT:1 - chr2R 9410405 3' + hopper 1404 2 78.77 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATAAACATTTTACATATGTTGTGCTTTGTAGTAGATATGTGAATAATACACTGTATTTGTTGTAAACTGAATGCCAATAAAAGGTTAATTTTAATGTGAGATATATTATCCTCAAAATTCCT:1 + chrX 17510744 3' - roo 8664 1 55.48 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGATGCCGCCAACAAACACGGACTACAACAATACATTTTTGGGTTCCCTTCTCTCTTAACGAACCTCCTTTC:1 + chrX 16526373 3' - P-element 50 1 51.37 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGACTAAGGATGTCGAATACTGAGGCACGTCATTAACACCAATTAT:1 + chr3R 4533007 3' - 1360 25 1 69.18 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACATATACACCAAGAGAAATTGGAAAAACCGGTGCAGTAAATATAC:1 + chr3L 5275024 3' - I-element 46 1 52.74 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATTTGTTGAATGTCGAAAATATACACTGTGTACGGAGGTTGGCGTCGCATCGCAATGCTCAGGTTGCGTA:1 - chr3R 5868165 3' - jockey 60 1 53.10 CCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATATTGATTTTCTCCACGAGTAACGGGTATAATAATTCTGTTGGTTTGGAACCATTAAAATAATGAACTATATATTGGACACATAAAATTTTAGAACTAAAAATAGCTTAAAGTCAT:1 + chr4 809498 3' - INE-1 18 1 41.78 GAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGTCACTCAGTC:1 - chr2R 7889396 3' - jockey 98 1 76.03 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTGTGGCACTTTTCGACTCCAGAAAGTATGCAATGAATTTTACAACTTGAGTTGCGGCTTCTTTGTTACTATGGCCTTTATA:1 + chrX 10824055 3' - pogo 36 1 56.55 TCGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGGCAATTACTGGGTTTTATTATGTTTGCTTAGAAAAATAA:1 - chr2R 11574963 3' + INE-1 146 1 71.23 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAACTATAGAGCTACCATTTGCTGGAGGCAAAGCAAGTAAGCCAACGTTGTTGTCATAAGCTATGAAAATAA:1 - chr3L 10442805 3' + roo 9020 2 54.79 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTG:1 + chrX 17027952 3' + roo 339 2 64.14 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTCGCTTATCGGGTATCCCAAATCTCTGCAAATGATATGAGATATACTGGCTCTGTGCCAAATACTTT:1 - chr2L 13140600 3' + blood 7345 2 52.59 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTCGGGTGAGTATACAGAAGTAACTTTCCTTCTGAGTTGCCAGGAATGAAATGTTACCTTATACCTCTGTACGTATCTGAGTTTAAAGACAGGAATGAAATGGAATTATCTGA:1 + chr2R 5640854 3' - 1360 11 1 78.77 AGATCGGATTGTAAGTCTAAATGGCACGAAGTGTCTTTGTACTGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCGAATGTTTTATTATTAGGAGGTCACTCGATTCCTTCCCCGCTCCCATTCTCTGTGG:1 - chr3R 19989885 3' - Q-element 626 1 74.29 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCACCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCCT:1 - chr3L 5179164 3' + P-element 2872 1 46.67 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGCCGTAGTTGTCCATTGCACACACTTGAGTCCTCCAAATT:1 + chrX 5399092 3' - opus 175 4 70.77 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGTGGAGACACTGAGCTCACCCCAGTTCTCTATAGGGACAGGAATAATTTAGTGCTTTGGTGGATAAATGTTTC:1 + chr2L 17206099 3' + hopper 1366 1 52.41 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTATATAAACTTATTCTTTTTACCTTTCTTTACTTTCAGGTAAGGATATAAAGAGTTTTCTTATTACTTGTGTCTTAATACTTTTTATGTAGAGATGTATCTCTCCTATGTGA:1 + chrX 3767727 3' - I-element 12 1 77.40 AACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAACAAGTCCATGTGCAGTCATTTGGTTGTGCTTGGGTCTTTTTTCGAGGGGAATGTAAAAAGAATTGAAAAATGGACCAACTGGGTCTCCACTCCAA:1 - chr3L 3339296 3' + Transpac 5207 2 70.34 TTTTATTTAGATTTTTTTATTTATATATTTTATAAAACCGGACCAAAACTTGTACTGATTATGGATGCGGTTTAATTTTCAAAGGCTGCATAAGTAGGCGTTTTTTTAGTCTTCAGTATGATTTTACAAGTCAAACGACTGAGAAG:1 - chr3R 19374774 3' - gypsy2 436 2 63.01 ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGA:1 + chr2L 13690065 3' - Doc 90 1 76.03 GTATTTTTAAGGAGGACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGGTTGCATCATTG:1 + chr2R 5265149 3' - Q-element 434 2 42.50 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAACTATAGAGCTACCATTTGCTGGAGGCAAAGCAAGTAAGCCAACGTTGTTGTCATAAGCTATGAAAATAAACTA:1 - chr3L 10442801 3' + roo 360 2 53.42 ATGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATCTTGAGTCTTGAGTCTCTGCTCCCATTTCCCTTCATTTGAGACATTGCCTAATTAGACTTCGCTTTCAAGAG:1 - chr3L 16703766 3' - FB 44 1 53.57 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCGCCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATAAATTATGGCCGCAAAGAGCGAGAAGAAGAAGACTAGAGGCAGCACACTGTCCATTATTGTTGCCCATTGAAAG:1 - chr3R 16228806 3' - P-element 26 1 60.16 CTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACCTCGAATTGGGAATGCCTCAACCTTTCCCAACACCACCTAACCCCCTTGCCATGCACTTAAATACCCTTAGTTGGATTGGTAAGGATCGCATCGCACCACCCACCGGCCAC:1 + chr2R 13193921 3' + Tc1-2 478 1 75.36 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACTTAGCTTATAATTATTTTCCGAAATCGGTTTTAATCTGTTTCAAGTGGCTTTTCAACGTTTTTCTAT:1 + chr3R 12727239 3' + I-element 5303 1 53.42 CACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCCTTAAGGTCTTGAACCTATTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCGTGGTAGGTGTTCCCATAATAACGGCATCTTCGGTCGGGGATTGAAGGGCCAGGCG:1 + chrX 3572293 3' - 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chr2L 7852360 3' + hopper 304 1 65.38 GATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGCGTAATT:1 + chrX 22711678 3' - transib2 75 1 67.81 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATCAAATTTATTGTATAACATTTTCATATATGTATCTTTTTCTTAAAAGAAAAGCATAATTGCTCCC:1 - chr3L 19574036 3' - 297 6600 2 64.35 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATGAAATTGATTTTGCGTTCTTACCGGCTACCACTTTAT:1 + chr3L 22709405 3' + 412 419 2 71.32 AAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAGCCGATACACCAACTTATTCCTACAACGAGCGAAACAGTA:1 + chr2L 22719650 3' + 1360 3318 1 69.34 CATTTCATTTATTTTAATAATTAATTTACACACATGATAAATTTCAATTGTTTAGAAAACTGATTGTCTATATTATCTGTCCTCATAATTTAATTAGTCACTTGTTACAAAGTCTTACCAATAGCTTTGGGTTAAATAATAAAATT:1 + chr3L 7949608 3' - S-element 385 1 81.51 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTGCCTCGTGGT:1 + chr3L 13228568 3' - P-element 53 1 49.32 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTAATATGTTCTATATTTATAGCTGTGAATGATAGTTTCTCACGGTATTTGAGTAGTCCAGTTCTTAAAGCTGATTTACTCTTA:1 + chr3R 22771989 3' + opus 7460 2 51.37 CGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAATAAACTAACGCCAGGTTGGCTCTTTGTTTTTTGGGCGTTTGGCTAGTTTCTACGTTGCCTTACCGTTTTTATACCT:1 - chrX 13340415 3' + Doc2-element 217 1 83.81 ACTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATG:1 + chr2R 15151104 3' - hopper 83 1 73.29 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTTATATATTATATTGCCAGGGCATATGCTACGGCTACCTTGTCATATATCAAGAGACGTCATTATTTCAGGCATAAA:1 - chr3R 20089919 3' + mdg1 382 2 58.22 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGACTAAGGATGTCGAATACTGAGG:1 + chr3R 4532986 3' - 1360 46 1 54.79 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATGTAAATATATGTGCAATAAAATTATGCGAAATAGTCATTCCAAGGTACAGCGGTATTCATGACGTCTTGGT:1 - chr2L 17166262 3' + I-element 5309 1 54.79 AGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGAAAAAGCAGGGGTGTGTGTGTGTGTATGTTTCTCTTTAGCAAGTGTGATGCATAGTTATAAAATTATTTTTGGTTACATAATTGGAATTGATAACT:1 - chrX 4764846 3' - accord 7101 2 52.34 AATGGATGAGAACAATTCTCATGACACCCAGCTTTTAAATAAGCAGAGTAACCATAGAACAATGTTCTCAATAGCTGGCAAAATGGAAAGTCCTTGTCCCCCAAATGTTGTAAAAATTGTCCCTCCCTGTAACTTCTCAATCAAGT:1 - chr3R 2924132 3' + BS 340 1 70.55 ATTTTATAAAAAAAATGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTCTATGTATGTACGATAAGATAACTGGCATGAATCAGTGT:1 - chrX 15019725 3' + S-element 1629 2 77.40 CAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAATGTGGATCCTCTTTTCCGGCACGGGGCGGGGCCTTAACTCTGCCTCCCCCTCTC:1 - chr2R 18412589 3' - P-element 485 1 39.42 GTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATGTGATTTTCATTAATTTTAAAGAGGATAGACAGATCGGACTTGTTGCAAAGATGAAGTGCCTCCTGAATTGTTTTTTTTGTTAATTTTTTCCC:1 + chrX 3109144 3' - P-element 2756 1 15.07 ATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCACGTGAAAACGTGTCTCTGTCTCCCAACTTTTCTGTTT:1 + chr3L 18767885 3' - roo 8604 1 64.38 ACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGATTACTTGAGCTGCAAAGTGTCGGTCAAATAATATGCTTACGTAATTTATGTATATCAAAATTGCGATCGGCAGTTGCAG:1 + chrX 4805161 3' - Stalker 7124 4 58.90 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTAAATGATTTTCTTTTAATTCCTCGCCTCTAAAGTCAAGTTCCACTGTATAGTCTTGGACTTTGTCCCTGATTTGGGGTTACGGTTA:1 - chr3R 30782477 3' + pogo 2076 1 66.91 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAACCAACTCTGTTCCCAAAACCGCCGCCCGTGAGTATGCAATAAATT:1 + chrX 4214531 3' + jockey 4922 1 64.83 CGTTCGTCCGTCCGTCCATATCGGCGTCACTCATAATGATTTTCACTACTCAATTTGTACAGCTGCGTGAGTTACCAAATTGCCTTAGATCGACACGGTGGGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGTACATATAAAT:1 - chr2R 981778 3' - micropia 427 2 52.74 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATGATAAATTTAAAATAAACATTAAACATAAACAATAACATTTTTTATTTCCTACAGCTAAT:1 - chr3R 25493352 3' - opus 7052 4 60.99 TGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGCGTAAT:1 + chrX 22711677 3' - transib2 76 1 68.49 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACCAAAAGTTTTGCGTTATCTGTGACATTCGCTTTGCCCACT:1 - chr3L 17904793 3' - roo 8744 2 76.03 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACTTTGCTCAAC:1 + chr3R 19543502 3' - roo 66 2 63.01 TTTATTTAATAGAGATGACATGTCCATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTTCTTCGTCTA:1 + chr2R 5045678 3' - invader6 54 2 55.48 TGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATACTTCCTCCAGGAAAAGTAATTAAAACAATTTATGCAAAAGCTTCTAGCAAACGAATTAACAGTCTCAAACAGCTTTTAAATAACTTCTAATGTG:1 + chr2R 8966270 3' + BS 5063 1 62.33 TTTTATTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAAGTTCTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGGGCGCAATGCAGCCACGTGGTATGTGCTCGCAACAGTTATTATTAGCACCACGCTGTGCCAGTATTGGTGAGCGATTCTGGTTTT:1 - chr3R 7289248 3' + hopper2 1376 1 63.70 GTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAAAACCAAAATCTCATCAAAAGTTTTATAAGGAAATACCCACAAGTGCCTCTCTCTCCAGAGTCCCCGCACTTCCCCATGGGCCGTTGCA:1 + chrX 7580480 3' + transib2 50 1 57.53 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACAAAATGGGGTAGGAGAAATCTGAGGCAACTGCGCTGCTCAGTGAAAAGTCACGTACCAACTGTTGAAAACACATCGTAAAACGAGAAACTTTGCTCCGCTCGG:1 - 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chr3L 1981490 3' - opus 16 2 63.31 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCGGCTCCTGGCGACGCACAAAAGAATGCAGCA:1 + chrX 7031659 3' + hopper 1329 2 74.66 AAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAATGAGGTCGTCGGAGCTTTTTCGCTCTCTCATTCTCTTTGGATTTGGGTGAAAAATATGTACGTGTACGTGTGCTTG:1 - chr2R 9553378 3' - I-element 5140 1 52.74 GTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGGAGTAGCACGTTTCCAAGAATTTGCCAAACAATACACAAAGTATACACAC:1 + chr3R 29091429 3' - rover 20 2 72.60 CGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATTTTATAAGTGCCTTTCTCAACGGTTAGCTTTTCTC:1 + chr2L 16508975 3' + invader4 3025 2 73.17 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGAGTCGTTAGCCGAGCTCCAACTTCGGGTTCGGGGTTGTTGTTGTTCGCGAAAAG:1 + chrX 10806962 3' - P-element 56 1 40.88 TAATAATAATAATAATAATAAAATAACAAAATAAGTACGACAGTTCAGATGCGTTTACTTTTACTAGACTAAAGCTGTATAATTTCCCATTTGTTTAAAAAAATTATACTTCACTAATGTAGGAATGCTTAACTTTGAAGGACCAC:1 + chr3R 16971440 3' + mdg1 27 10 58.22 GCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAGCTTTCTCTTCTGGTTTTAATTAATTCCACCTTTAT:1 + chr3R 4166072 3' - HMS-Beagle2 83 2 73.97 CGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAATAATGAATGCTAGGCGATCATTCATAGATTTGTAACGCTTTCAAATGTTC:1 + chr2R 10788003 3' - 297 353 2 65.75 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTCAGACAAATGTCGCTGGCAGTCTCCGCAG:1 - chr2R 24021516 3' - pogo 20 1 69.72 AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATATTGCTCCGCTTCAATGGACACTGACTTGGACATTTTCCGGTGCCGCCATTGTGGGTACGT:1 + chr3R 22624780 3' + blood 7329 1 59.59 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATCTACATATATAGTATTATATGTATAAATAAAACCAAGCAAATGATATAAAAAAGAAAACACACAGCGAACACAACTATCAACATTC:1 - chr3L 15859589 3' - I-element 33 1 61.81 ATTATTAATTATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTAAAAGCCTCACTAC:1 + chr2L 15322960 3' - diver 273 1 50.71 GACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGAGCGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGAGATTGGGGATCTGGGGATCTGGGGATCCGGGCG:1 + chrX 5002543 3' + R1A1-element 146 1 71.82 ATAAATAAATATAAATACATTAAATCGCAATCGGTTGGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGTCTGTGTTTAAGCGTTGCCCGACTCTTGGGGATCACAAGTGCATATATATCATTTGCAAAAGCTTTT:1 + chr3R 10516732 3' + diver2 447 1 60.45 ATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGCGGCTCCTGGCGACGCACA:1 + chrX 7031646 3' + hopper2 1552 1 76.70 GGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTATGATCGCGCTAGATGTCCAACCCTTTTCTATTGTTGAAGATATGGGATTCTGCG:1 + chr2R 6492918 3' + copia 5034 2 40.41 AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAACAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCC:1 + chr3R 14860236 3' - BS 5045 1 51.37 TGGAGGCATGTGTAAGGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTG:1 + chr3L 15276706 3' - hopper 81 1 77.86 ATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGAGTGAGTTCATTCGTGATGGAAACGTCAAATGGCTTGGATATCCTTT:1 + chr3R 18549738 3' - hobo 2663 1 67.81 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAATGTACATACATACATATGTTTGAAATGCATAAATATTTCATTGG:1 + chr2R 10600075 3' - 297 6635 2 71.65 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAACTATTCCGCATTCTAAATTGCAATATTCGATGCACGCATAATTGGAGCTATTGATTAAATCGGCCAGAGGGCGTGCGTGCCACCAATGACATCGGGCAGAC:1 - chr2L 14888881 3' + hopper 1407 2 76.26 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGAATGCCAGATCTGTTTTCTTTCGACGACAGTTGCAACATGCTGGAATTACCGCGATAGGATCTGCATTTTAGGGTAAATTAACTTTGAAATGCGATT:1 - chr3L 16463453 3' - roo 23 2 67.81 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTATGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAACACACTCACGGCAGCAGGAAGCTTCCTAGGATATGTAAGCGAGAACGTCTGG:1 - chr2L 12847209 3' + 412 424 2 63.70 ACTATTAGATACCCATTACTCAGCACTAAATTAAAAAAAATATGTTTTCATATATTTTTAATTTGAATAATTAAATTTAAACAATGCGCTCATAGGATTTTTTGCAGACAGATTTATTTGCTAAACTGGTTTGCTTTATCTGCTAT:1 - chr3R 19440062 3' - INE-1 548 1 69.86 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTATAATGACATTTCGTTTGGCATTTTTTATTAATAAGCTTGTTAG:1 - chr3R 19446991 3' + roo 8988 2 72.60 CAGATACTCTTTACTCAGCTAGTGTTAATGCGAACGCGAAATTTAATCATTTTTCTGGATATCGAAAGATATTGGGGAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAAAATTTTAAAAGCGTGGGCGCGACAGTCAAGTTAAGAATAACTTT:1 - chr2L 22758856 3' - INE-1 543 1 69.86 CTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAGACGTCGTCATGGCGAACAGTACGTCCCTTGCGACCATTGACGATGATGACGGCGTCGACGACA:2 + chrX 6407334 3' - jockey 4728 1 56.85 GAACTATAAAAACTAGAAGGTTGAGATGCAGGAGATGCAACAGATTCTAGAGAGAATGACGCAGAGCAAGTTCGTTGGCCCATGGGCGTGTCACCCACATTAAAAAAAAAAACAATTTTAAA:1 + chrX 23045660 3' + INE-1 158 1 83.61 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATCGATAAGAAAACGAGGG:1 + chr2L 13140711 3' - blood 7068 2 54.79 AGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCGTGTCGCCTTAGATAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATCTGATCCGAATCTTACTATTTGCCTCAGTTTTCTCCATTACCCAGAAC:1 - chr3L 17904924 3' - roo 126 2 63.01 CTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGATATGAGATACAGTTTGGCCACAGTTTACGGTTATGGCCGGCAGGGT:1 - chrX 4747246 3' + F-element 272 1 66.43 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCAT:1 + chr2L 13690076 3' - Doc 38 1 56.19 CTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATGAAATTGATTTTGCGTTCTTACCGGCTACCACTTTATTATCCAAATACCTGGAAAGTCTAAAGTAATGTGATTT:1 + chr3L 22709442 3' + 412 7520 2 60.80 TTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCCCACGACG:1 + chr2R 11097395 3' - Juan 4065 1 50.00 AAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAAAATAAAGCACTTGTTTACTTCGTCGCAAAATCAAAAGACAGACTGCG:1 - chrX 10367558 3' + Juan 4134 1 68.49 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGTTAAACGCTAATGCCGCAAAGTAATTCAAAACTTAAAGCGC:1 - chr3R 18541327 3' - hobo 67 1 70.23 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGGAGGCCATGCCCTTTTTTGGGGCGGGCTGTAACCGTTAGTCCGGCCGACTAGAGCGGCTACCAAA:1 - chr2L 18627676 3' + 1360 3384 2 72.34 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTC:1 - chr3L 5179160 3' + P-element 2805 1 28.08 GCCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATAACTACCGAACCACCCGACATTTTGGCCAAGTTGGTGTTTTGCTTTCGCATTTTGCTTTGGTGCCCCA:1 - chr3R 12617435 3' + Chimpo 4 1 52.05 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTACATATATATGTATATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACACA:1 + chrX 11661513 3' + 297 6957 2 73.97 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCAAAACACTTTACTTAACAAGGTATCATTTATTTACCGAACTCCTTACAAGAATAGTCTCTACTTCCTGT:1 - chr3R 29516473 3' - I-element 54 1 51.72 CCAATTTGTGGCTGGCCGTAAGCTGGCAAGCGGTTTTCTGGGCCCATATGATATCGTACAAGATAAGCGAAAGGACGTCATATCGTCCGAAAAGCAGTGAGCATAGAAGGGGCCAAAGGAGAATGCCACGGTGAGTCCTGAACCGT:1 + chrX 14865371 3' + flea 4536 1 78.77 AGCCTAGACCACAAGTTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGATATACTTCTGCTAATCCTTAAAAAACTCTC:1 + chr3R 24364860 3' + F-element 4217 1 68.49 AACAGCAATATTGAAATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATACACGCACACACCCACACAGCGCACTCGGGCTTCGATTTTTCCCACTAAAAACAACGCCCGCTCAGCGTATCACTTGGCCAATTTGTTTTGGCCCTGGTTCTATT:1 - chr3R 20948928 3' + F-element 4301 2 73.29 AGAAAAATAAAAATAATATTTAAAATTGTCAATATAATGTATATGTCGTAGTGTTTATATTAGATCATTATGATCTTTAAACCTTTCATGGGGAATTTATATAGAGAAAGCTCTATTATCTTGACCGCCATTGTAGCCATTGCTAT:1 + chrX 6664901 3' + invader6 4386 1 50.68 GTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACCTCGAATTGGGAATGCCTCAACCTTTCCCAACACCACCTAACCCCCTTGCCATGCACTTAAATACCCTTAGTTGGATTGGTAAG:1 + chr2R 13193894 3' + BS 5058 1 53.10 CAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAATGGGTCCCGGGTAATCTTACGTTGGAAGTAGGAAAAATAAATAT:1 - chr2R 2552109 3' - HMS-Beagle2 71 2 69.93 AGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTAACCTTAGAAGTTCTTAGCGTTGTTGCTGTCGATGTCGCATTATTGAATTTGCATGAGGGTGGAAGGTCCTGTGAG:1 + chr3L 4967777 3' + 1360 159 1 60.27 CGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAACCAATTTAGAAACTAAACTAACTAACATGACAG:1 + chr2R 21425138 3' - HMS-Beagle2 6965 2 75.34 TATAGGGAGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTGCAGATATGCAAGTTGCATGACAAAAGTTTCACAATTACAA:1 - chr3R 25442815 3' + R1A1-element 5276 1 65.60 GGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCGTCAGAGAACGTTATACAGACAACGAGAATAGTGAAGAGGAAGAAGAGCGTCCTGATGACTCTTCGACATCAGAAGTGGGATCGG:1 + chr2R 4161581 3' - 1360 3342 1 65.75 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTAATTATCGTCGGTTTCTTGGGCCGTACAGAGCATATAATTCAGATGTGTGCTTTCTAGGACTAGACTGTTGGATACCGA:1 + chr3R 10361969 3' - roo 40 2 57.93 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAACAACAGCTGTGCGAGTGAGCGGGTCAGAGGGAGCACATAAAATTAACCACATATTTCTTCATTTTTATGGCATTTATTATCACAGAAATGTTTGTGTGATAAAAGCGAA:1 - chr2L 14488344 3' + P-element 2879 2 56.85 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTCTCTCACTCGCACACATTCGCCGAGACTTCTCTTTCTCTATGCGGGTATTTAAATTTAATTTGCAAGCTGACAAAAAAGAAAGCAAAGC:1 + chr3L 5179291 3' + P-element 2880 2 79.45 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCACTCTGCCATTGCTATTTGGCCACTCAGTCATTTAGCCATTGACGTCACTAAATTGCGGTGACG:1 - chr2R 7889362 3' - jockey 59 1 52.48 ATGATTTTAATGTTGGTTATTGAGAACTTTATAGAACTTTATAGAAACAGAATGAGTATATTGAGTATATAGATGAAATATCTCTTTTCATTTATACTGCAATATGATCCCACTGTGCGATAGTAGTTAATCATGACTTTATTGCG:1 + chr2L 5567387 3' - Doc2-element 4397 1 55.48 CAAGAGTTTGTGGGTGTTTTGGGGAAGCATTGCTTTGATGTTAAACATTAAACCGTCTAGCCAGACCTTGTAGCAAGGCCTCTGATTCATACCGCGTTATCCCGTCAAGGATCTTAAGCGTCCTGTGTCTCAATTCGGTGACTTG:1 - chr3L 23083063 3' - Fw3 2775 1 53.79 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCA:1 + chr2R 16891867 3' + jockey 4964 1 43.45 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCAGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTCAGGTGTAAGGGACGGATTTTGCGCTGTGCTGTGACATGTAGTATGACTGC:1 - chr3L 10563836 3' + hopper 1410 2 79.45 ATATATATATATACATATGCATATATGTATACACATACATATATATAACTAGAGGAGGGCACTGGGCGCATGCACTCATCACGCTCACGCTTGTGGCGCCGAAGTGGGCATCTTGCTGCGCATTCGCGACTGC:1 - chrX 16957722 3' - Stalker4 7200 4 51.88 ATATACTTGGTACCGAGAAGTTAAGCCGGCTAATCAAGTCGGGGCTGTTAACATTACCACGAATAATAGCTATTGAAGGTAAATTAGTTAAAGAAATTAAGGCGAACGAGAACAATGGGGCAGATGACTCAGTTGACAACCGAAAT:1 - chr3L 2873953 3' - Cr1a 4100 1 61.64 CAAAAGGGAGAGTAAACAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAAGTCTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCAGATAATGGTCGAGTGTGTGCGGCCAAGTATTTAGGCAAATGTCGCCAGCTCAAACCACTAAAAACTGAGCCCCA:1 + chrX 18418763 3' - Cr1a 210 1 51.03 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAACTATAGAGCTACCATTTGCTGGAGGCAAAGCAAGTAAG:1 - chr3L 10442836 3' + roo 325 2 76.03 AAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGACGAGGCGTGGCAGTTGCACAATACATTGCTACTCAAAAA:1 - chr3R 8921922 3' - FB 81 1 71.92 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAGTGACATTTTCCGCTCGTAAATGCACTTTGGGTATGTTTGACCTTTGTTTTG:1 + chr2L 20324206 3' - Tirant 69 2 65.07 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACTTTTCACTTCTTTGCACGGTGGGTATTTTCCTCATCATCTGTTTTTCGAAGAGCTTTTCCGCCGCTGC:1 + chr3R 4662036 3' - roo 52 2 54.11 GCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCACACTCATT:1 + chr2R 16496686 3' + hopper2 1565 1 53.42 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCACTTTTATGTAACCTTATTTATTTCATATTCTTAAGATAAGTTGCATTTTTTTATCCAATGCTTTTTTTTTATCAGAGTTTTATGTCC:1 - chr3L 18792384 3' + roo 9040 1 61.64 TTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCACATTTATTTATTAAAATTCTGTCGTGTATAAAACAACTGATTAAATCACTTCATTTTAATTAAATATAAAATGCTCTCCACTCAGGAAAAAATGTAAAAATAAATGA:1 - chr3R 27514612 3' - Ivk 330 1 67.12 CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATGTATATAGATAGATGTAGCTAAGCAAAGTTTGCCGTGGAAGGATGAGTCCTGCGGACAGACAAA:1 - chrX 12214463 3' - opus 7061 4 60.27 CTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGAT:1 - chr2R 982344 3' + rooA 7477 2 44.52 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCG:1 - chrX 12003939 3' + P-element 2829 1 33.05 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCGCTACCATTTATCATCCGCGTGGCTAAAAGTGCGCGTAAAAAGCTCCGCTTTTCGGGCTAACACAACCGCAGA:1 - chr2R 12069548 3' - Tirant 46 2 55.48 GGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGG:1 + chr3L 18738137 3' + Bari1 1636 1 71.85 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGTATCTCTTATCAAAACGTTCCCTGATAACGCCCCACCTCAACAATCGGTGTTCTACTTCAGAAGCGCGTGCCTGAATGAGTTAATTGATGGATGGTCTGTTGT:1 - chr3R 24053597 3' - mdg1 7056 2 73.29 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATCGCAATCAGCGAGGCACATAAAAAAAAACTCAGCACGGAGTAAATGACAAT:1 + chr2R 16891827 3' + jockey 4949 1 65.00 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATATCTGGGGAATTTTTGCCTTGTTGCTCTTTTTTTGGTAATTACGATGACACTTCGGTCCTAAATATGCCACAGCGTTCCACTCCCCTGCTG:1 + chr3R 17210140 3' - HMS-Beagle2 23 2 68.57 GCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGGGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAAACAGCATAGATGTTAATATACGTCTCTTAGTTGAAAAACATATGTATAACATTGCATTGAGATTGTTGCATCGAGA:1 - chr3L 23149264 3' - hopper 1082 1 66.42 CTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTCATATGTGAAAACACATGGACA:1 + chr3L 16875896 3' - Burdock 89 2 82.88 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTGGTATTAATTCTTCTTATTGTTCATATCCATTCATCGTTTATTTGTTCCACATGCAGA:1 + chrX 19959898 3' - roo 56 2 64.29 ATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCA:1 - chr3L 14944552 3' - G5 4805 1 55.48 ACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATAAACAAATGTGTGAAATTTCGTCTGGCTCTTTTTCTTCTTCTTCTAAGTCTATGCCCCCAAAATTAAATCGAAAACACAA:1 - chr3L 3756125 3' - BS 5038 1 56.16 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTTGGTCGGCCCACAACGTCTGGCCTATATTGCCACATATGGCAGTATAT:1 - 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pogo 85 1 77.40 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTGCAGTTACAGTTACAGGGAAGTTGCGTTGGCACTGACAGTCGCAGACAACACTCACACACATCTAGA:1 + chr3R 27859599 3' + hopper 1407 2 67.31 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACATATACACCAAGAGAAATTGGAAAAACCGGTGTAGTAAATATACTATAT:1 + chr3L 5275029 3' - I-element 41 1 57.53 TAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATA:1 - chr3R 3922963 3' - Cr1a 97 1 76.71 CATGCACACACACACACACATATATTTGTACGTACGCGCACTCGTAAGCCGCAAATGTTTGCTCGCCGCGTTTTCCGACTCTACTAAGTGTTTTCAAGGTAAGACCGTCGAGATAAATGCAAATTACTTTGCAGGACTTTAGTGAG:1 - chr2R 15306830 3' + accord 180 2 54.11 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGCGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTCGTTTCATCATGGTCGTTTGCGTACAAAATTCAACATTATTTGAAGGTCGTGCTTTGCTTATTCTGCG:1 + chr2L 21251025 3' + P-element 2834 1 42.31 GATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTTTTAGCCAAAGAGTAAATGGATTTAAGCTTTTTGAATGTGTGTGAAATTGATTCAAA:1 + chr3L 13545448 3' + hobo 2471 1 60.96 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATGCTCACTTACTTATAGCAAATGTAAATGGATAGTTTTATTTGATTGGATAACATTGATTTAGATTTATGTGTAGCATACATAAATACTTACTTATGCATGCATGAAAA:2 - 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chr3R 22132292 3' + FB 178 1 63.70 TAATTTAGTTTAGTTTACTTTAATATCCTTCCGCGCTTTGGCAATGGATCCTTGTGCCAGGAGCGTCAGCATCAAGACTCTGATTTCCTGATTGTCAGCCAGGGTGTGATGATAGCTCGCGTTCCGCTAAACGGACGTAATGTCCG:1 + chr2R 10320666 3' - TART-A 13131 1 71.92 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGGTTTATATGCTGAACAGGCACAGGCGGATGGCCAACGCCGGTGGCGAAAACTCA:1 + chr3L 20977895 3' + mdg1 7392 2 61.64 ATATTCAAAAAAAAAAAGAAAAACACCAACATTACAAACATACATACATGGAAAGCAACA:1 - chrX 10795939 3' + TART-B 10631 1 81.67 GTACCAGGGGAGCCCAGATGCGTGACGTGCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAATGCAGCCGTCGGGCAGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3L 5685501 3' - G5 4470 1 72.66 GGAGAATGCTATAGTCGAGTTCATCGACTTTCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATTCGAATTTTTAAAAAAGCAAACAAATTTCTTAGGCCCGGAAAACTAGAACTAACTTATAGCCATGGCTGGCCGACTGCTGCG:1 + chr2L 8124390 3' - INE-1 574 1 66.20 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTACATATATATGTATATATCCATATCCATATAATACACACCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGC:1 + chrX 11661491 3' + 297 354 2 63.70 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTTATTTGCATAACTGCTCAAATGCATGTTGTTATTGAATTT:1 + chrX 17737260 3' - jockey 4748 1 70.50 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGACATTTTCACAGCTTCGAAATGTGTGAAATTGTGTCGAAAA:1 + chr2R 11595907 3' + P-element 2809 1 28.08 CGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAATAGTGACCCCCCAAGTCACTAACAGTGAAATAATAGTGATGGCGTTGGCCCAAAACTATAGTTCAGAAAGTGAGGAGGAGGAAGATCAAGTTCAGC:1 + chrX 1044169 3' + X-element 68 1 60.96 ATATCTTAAGAACTTCGTTTAAAGAATCTTAATTTTCGGTTTTAAATACTTTTTGTTCGTCAAAGTATTTTTTATAAAATATTCTTTTAATGGAAGAGCATTTTTTCGCAATTAAACTCAAATCGTTTTTTTCCTCATTGTCAAAT:1 - chr4 1152294 3' - Tc1 1361 1 76.03 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACCGGGCGCACCAAACGTATAAAACCCGAACAGAACGGAACCCGAGCATTTGCAAAGCAGCCAACCAGGTGAAAGCAACATGCTGCCGAAGGTTCGCCTTTTTC:1 + chrX 2518165 3' - P-element 19 1 71.23 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGTTAAACGCTAATGCCGCAAAGTAATTCAAAACTTAAAGCGCACTTTTCGGGGCTCTCGACGCGGTTTTATTTGAGTTTTTTTTGCAGAAACTCTGGCATGTTTCTAATG:1 - chr3R 18541259 3' - hobo 13 1 75.17 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTA:1 + chrX 14346502 3' + roo 9036 1 53.64 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATGTATTATGTTTACAAAAAAAAAACCAATACGTTAGAAAGGGACATAGCGATATTAATTTTTGTAAAATTTGTAAATTGTAAGCTTGCAAATTAATTTGATT:1 + chr3R 17467222 3' + I-element 5331 1 67.12 CTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATCTGAAATTGATTTATAAATTACCGTCTGGCAATCG:1 - chr2R 13471356 3' - flea 84 2 76.03 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTACTTTTGGGATAAAACAAAATACAATCTTACAAAACA:1 - chr3L 16907792 3' - jockey 92 1 73.29 AGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGTATTCAACTAAACATACAGGCATTTCAAAGTTAACATTTCAATTGATACTGTGATTTT:1 - chrX 10128176 3' - invader3 5264 2 59.59 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTAATACGAAGAAGCTCATTTTTTCGAAAATCCAGCTAACAC:1 + chr3R 29112960 3' + Juan 4138 1 72.60 GTAATACCAAAGACACTAGAATAATTTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTAACAAGATATTAACTGTTTGAAACAGATGTTC:1 - chr3R 13375913 3' - Tc3 317 1 69.18 AGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAAGGCACAAAAGGTAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAATCTGGCTTGAGTTAACTGGAAAGATCTGGGAATTAATTCAGCGTATCAGGAGCAATTG:1 + chr3L 2812231 3' - Cr1a 265 1 60.27 AAGGCCAGCCAAAATGCGCACGGTGTTTTCTTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTGTTCCCAGATCTATATACACTTGATTACTTCAAAAACTCCTTTTGTCAATGCCTC:1 + chr2L 16779253 3' - baggins 5118 1 67.12 GAAATAAAATTTTGTAAAAAAACGAAAATTCCAAAAATTGGAAAACTCCATTGATGATCACAAACCAAATATTATTTTATATACAAACGTGCTCGGAACAACAAGCTTAAAATATATTCTACACGGTCAAAACTTGCTATCCAAAT:1 - chr3L 11893376 3' + HMS-Beagle2 394 1 80.14 TTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTAATAGGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATA:1 - chr2R 24021575 3' - pogo 2022 1 72.60 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGCATTCGATCTTGAATGGAATAGAAAACTTCTAATCCTTCATTTTTGTAGACTCTTTGATCCTGCTCAACTTTAAATTGTTAAACAATATTAACAACAATGGTGG:1 - chr2R 16510187 3' - roo 8680 2 76.03 GATTTAATAACAATAATAATAACTAATACCAATAACTTTTTAAGTGTTGGGGTGACATTTTTGTATGGATTGTGGTCGTCAGAAATTGGCAAGATAAATATTAAAACGGAAAAAGAATAAATTGACTTTTGGGAGGTTTGTAGGC:1 + chr2L 22805227 3' + mdg1 7052 2 55.86 GAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCAAATAATAAATAGCCGAATAAAGTTTGTTTAGTTTTACGATACTCCCCCCCCACCCCCAACGTGAAATGCCAAATATTTGCAGGCGAGCGAGCCAAAGTTCCCAGCAGTTACTACTCA:1 - chr2L 676854 3' - diver2 352 2 47.14 AGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATGTAAT:2 - chr3R 5024831 3' - diver 79 2 73.29 GACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAATACTTGCTTTACAGCTCGGCTGCAACTTTAATTGAAAGTGTTTGTAGTCAAATGATTGGATTTTAAATGAACCAAAAGCTTATTTAAGGGA:1 - chr2L 6876577 3' + Rt1a 5030 1 62.33 ATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGCGACATTTTCTAGCTTGAAAGGTAATCCTGATCAAAAGAAGAGAGAATGCAATAGTCAAGTTCACCGACTATTAGATACCCC:1 - chr3L 25303448 3' + diver 183 2 54.11 GGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTAACGGT:1 - chr3L 23773893 3' + Transib5 2864 1 74.17 ACAAGAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCG:1 + chr3R 3320514 3' - 1360 83 1 74.66 AAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGGTACATACATATATATACTACTCAACTTGGACATTCAACTCACCACA:2 - chrX 19585170 3' - Transpac 71 2 70.55 GCAATTAACATGTAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGCCTCAACACGAGTAAAACAAAACGTAATTACAACAAGGACTTTTCAACAGCAG:1 + chr2L 9861377 3' - BS 5028 1 62.33 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAACTATTCCGCATTCTAAATTGCAATATTCGATGCACGCATAATTG:1 - chr2L 14888938 3' - hopper 72 1 66.44 AAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATAAATTCCCAGCCATATTGCTGCGTACGCTTACGTCGTTATTTGCACAATTCTT:1 - chr3L 19335338 3' - invader4 25 2 55.66 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGGTTTATATGCTGAACAGGCACAGGCGGATGGCCAACGCCGGTGGCGAAAACTCAGCACTCGACTGGTCTTATCACTCGACAGGCGAC:1 + chr3L 20977928 3' + mdg1 7427 2 61.11 AGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGCCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGTGTTCTAGTATTTTTGTGCTATGTGTT:1 - chrX 4540634 3' + 1360 3312 1 78.03 ACGTAAGTGGCGCAGTCGGTAGGATGATACTATTTGATGCGATATTAAACATATTCAATTCTCTGTGTATCATCTGCTAAAGGCAACCGGCTGTAATCCGTAATCCCCGCCCTGGTAACCACACAAAAGCTCTGCACGTCCTTCTT:1 - chr3L 11377356 3' + rover 360 1 54.79 TTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAATAAGGGGGGCCGACTTGAGACACGTGACCATCTCTCGGTCACTACCCACTAAGGTTGGGGTTGATAAATGGACCGCCA:1 - chrX 23155230 3' + blood 6961 1 60.17 GGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATTTTATAAGTGCCTTTCTCAACGGTTAGCTTTTCTCGGGCACATGAGTTT:1 + chr2L 16508989 3' + invader4 3033 2 63.57 GAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGCCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGTGTTCTAGTATTTTTGTGCTATGTGTTAATCGGCGACTATCGACA:1 - chrX 4540616 3' + 1360 3316 1 67.81 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAAGAGTTTAATATCAAATATCGTTTATTATCTTAACGTCCATTCGTTTAACAATAAAAATGGCTACCATTTTTTCACT:1 + chr2R 22012257 3' + opus 458 2 56.25 AAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATTAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATTCGAGGTTAAATTGTTGTTTGGGGCTTCTTTTGCAAATCGTGGCA:1 - chr2R 13193792 3' - BS 5070 1 66.44 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGAGTGAATCCCAATCGAATAGTACCCTCCCCTCTGAGCCAATCCTCCCTGCCCAGCTTACATTCCAAATCGAATAATATGCTCAACACTTTATGGATCTGATCCCA:1 + chr3R 27188675 3' + roo 392 2 74.66 ACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGATTTCTTTGTAATCTTTGCCTATTCTACCCGACCCC:1 - chrX 20948092 3' + I-element 151 1 73.68 GTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGAGACAAAGAACCAGCGAACGGGACCGAGAGAGAGCGGGAAATCTAGTTTCT:1 - chr2L 19158345 3' - P-element 2859 1 38.57 TACACAGTTCAGTTCTAATAAAGCATTCACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCTCGGCGGCACTCTTATGCAAACACACACCTACAGGAAGAAGAGGCTGAAAGAAGTAGTGAAAGAAAAGTAACCACGGATAAA:1 + chrX 3557925 3' - frogger 66 1 69.18 GGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTTCAGTCCTTTTAATACGCTCGCAAACTAGAGGTGGTACGCCAATTTGTGTTTAATCGATACTATCGATGTTTGC:1 + chrX 13736269 3' - Rt1b 5071 1 58.04 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTGTTTTCCGAATTGGTAAAAAATGCTCACTCTTAAATTATTACGTGTTAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCTAAAGTCTCCTGCTGGCGTG:1 - chr3L 13827335 3' - roo 8680 2 73.97 CATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAA:1 + chr2R 20447871 3' + hopper2 1521 2 75.34 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGGCACATAAATCGATAAATGTTTGCT:1 + chr3R 6412069 3' - Tirant 8146 2 55.38 CGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTATGAAGACTAAAGTAAGAGAGGTCTGCCAAAACTC:1 + chrX 19178816 3' - G4 29 1 39.73 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTTGTATTCACAACTTTGAACACTAACATTGAAGTTATATTGCATTTAAGAAAGAAGCCTT:1 + chr3R 5762038 3' + roo 9019 2 57.97 TTTGACGGTAAAGTAATATCATTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTCTTAAAATTGATTTTATATAGGCAAGTTCGAGTTCAGACATTCATGGGAGCAGCACATGATGCTTTAAATAACCATAGTACAGATTAAACTTTCAAGGAATTC:1 + chr4 1151770 3' + transib2 479 1 57.53 CCAACGAGCGCGCGGCCGAATGACGATATCACCACTGATCTGGCAACGCCAGACTTACCAGCTCGTCGACTGCGAAAGGTCGGAAAGATCCGTCCTCCAACATTCGACAATATCGATATGTAAACACCATATTGAAAAAGAAACTG:1 + chr3R 16483649 3' - Rt1a 282 1 54.79 TGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACAGACATTGACAACGCACTTGTCGTCGTTTTGGGCGTGTTTTATGCACTTGTCGCGGCTCGTTGCACTAAACAGTTGCCTCAACATGGCCAACAAGTT:1 + chr3L 815054 3' - hobo 24 1 69.18 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGCAGTTTTTCCCAACCACGCTACGCTCTCTCACTCTCCATGCCAGACATTCTCCTCT:1 - chr3R 11773893 3' + P-element 2823 1 42.47 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATCAAATTTATTGTATAACATTTTCATATATGTATCTTTTCCTTAAAAGAAAAGCATAATTGCTCCC:1 - chr3L 19574036 3' - 297 6595 2 69.09 CACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAACATCAAAATCACGTTGCACTCAAAAAGGCTATCGAGTAATTTACACACAAAGACCAACAACAAAAAGTAGCAAAACCCGCTG:1 + chr3L 3757689 3' - copia 153 2 67.44 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCAAAAAGGACTTCCGCCTGCACTGGCCTACAAATTAACATGCCCCAATCTGTGACTGTCTCTCTCTGTGTTCGTATGGGTGCCGGAGTGTG:1 + chr2L 18213247 3' - roo 8683 2 70.37 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCT:1 + chr3L 9762249 3' - jockey 4832 1 67.12 ATGACCGCGCTAATCACCTCCCGCATGGTCATATCTCTTGACACTTCGGCAATAGGCCGCTGCAATCGTACTTATCTGTAGTTGCCACTTATTCAATTATCGTCGGTCAGGTTTGTTTTCGTTTTTTGTTTTTGTCTTGTTTGTTT:1 + chr3L 685186 3' - rooA 158 2 63.01 CAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTGTTTTTGCACTTGGAGATATGCGGATGCTATCACGCCCAATCGTGATCATCAACT:1 + chrX 5713504 3' - transib2 165 1 61.29 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGGGAACATTAATATTCCTTTGAATATATTTGTTCCAGGGGATACGATGAATGATTCCATTATGCTCGTCCATTATTCGTTAT:1 + chr2R 12813787 3' - roo 50 2 54.79 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTG:1 + chr3R 19543485 3' - roo 83 2 74.66 GAAAAGAACGAAACACGGCGAAGAAAGCCCTCAATGTCCCGTGGCGCTCCGGACTGAATCACTTGGGTGGTTGGCTGATATAAGGTGAAGTAAGATCTGTCTGAGAAGTGGGCTTCGGAGATAAGTAGTATGTCTGCTTGGTTT:1 + chr2R 3130386 3' + Tc1 497 1 77.78 GTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGAATGTGTTATATTTGTTTGCGAACAATATAATTTATCTTAATTCTTTACAAACTATCTTAATTAAA:1 + chr3R 5024917 3' + diver 6055 2 64.38 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCTGACAGCGGGCGCTGCACATTATTATG:1 - chr2L 20986518 3' - roo 57 2 64.18 GTGATCTGTGCGAGATAGGGTATTCTTAAGCTCTCTCTCTTTGTATTACTTAGTTCTGAACTGATAGCCGAAATAAAGAAAACCTTTTTCCGGTCATTTCCATTACCTTTGCATACTTTGAGGCTTGTCAAAATTCCTCGCTTTT:1 - 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chr2R 6713828 3' + 297 351 2 60.27 AAAACTTTTCCGATGGGCTGGTTCCCCAGAGGAAATTTATTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACACAATCTGATGACGATGCACACATTTCAATCTGAAATTTACATCACTTTTA:1 - chr3R 5015823 3' + R2-element 191 1 73.91 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCG:1 - chr3R 10461675 3' + roo 8991 2 75.52 TACTAGCTGAGTGACGGGTATCTGTTTTCTTAACATTCAAGTATATTGTATTGCTATTGAAAATCTTTATAGTTACATAAACTTATATATAAATCTTTATTATTATAGGCATACTCGTTGGGGTAATAAACCAAAATGGGTAAATA:1 - chr2R 10801814 3' + INE-1 541 1 50.68 AATTAATTAATATTTTTATATATTTATTTTTATTTGTTAAATTGTGTATTGAGTTGACTATGAATTGTCTAAGGGTTTTATGTGTTTTCCCAAAGCACTATAATTTTAAATTAAAAGTGATAAATGAATTAGAACTTTAAGCTTTA:1 + chr3R 18692096 3' + Tc3 274 1 65.07 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGTTTTTATTTTTATTTCATTTTTATTAATGCGAAAAATGTAATTTCAAGCATTTGCAACTGCAGCGGTCCCTTGGGGCCACACGACAGTCAGCCCAAAAACAAAATACAAAAAA:1 + chr3R 25843491 3' - I-element 10 1 79.17 CTTGCAGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGGCTGCAACACGAACGTCTTC:1 + chr3L 23678154 3' - Osvaldo 35 1 75.21 AAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGATGCAC:1 + chr3L 18767849 3' - roo 8624 1 56.15 TTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACAATCTTCGAGATGCAGTTATTCAAG:1 - chr2L 260975 3' - Juan 4093 1 62.33 TAGGAATTTTTTATCTTAGACTCGCAGGTAACAAGAACTGCTATTTTTATGAACACTGTAAATACTAGAGGCGTGGGTGCACGTGCCAGAGGAGTCGGCCACCACCAAACCCACGCCCACAAGGGTACTTCCCGCCTTGCCCAGAG:1 - chrX 22881860 3' + HB 1588 1 54.79 ATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGTTGGTTCGATTTGATGATGATGACCCAACGTCCATTACTC:1 + chr2R 19477289 3' + invader4 2911 2 72.60 CCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTTGATCTGTGCATATGTACATACACACATATGTTTGCAATCG:1 - chr3R 9831452 3' + Stalker2 7492 6 73.97 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCGG:1 - chr3L 12861697 3' + pogo 2056 1 55.71 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGCTTACACAAGATTTTGCTTCTTGAAATTCTACCTTAACGTGGGCTAACAAAATCGTTTAGCGGCTAAAATTGCAATTTGCTATGGCGGAGGGATAAAGAATG:1 + chr2L 3648860 3' - roo 8669 2 75.94 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAAAATTAATATTTGGTCAGGAATTTCACCAGCTGGATATTTTGT:1 + chrX 22676467 3' + 297 359 2 55.48 ATCGTATAGCGTTACGCATCTTGTCTTTGGCACTACCTTGACTCAGCTTTTTAGGTCGTTCATACGGACAGAAAAACGGACATAATAGTCATGGTTAAAATCCTATGTACTACATAAGGTCAGAAGAGTTTCCTTCCACC:1 - chrX 6757121 3' - 1360 19 1 70.00 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACTTTTTACACTCTAACCTTGCTGTGAATGTTAAATAAACGGAGTGCTACTGAATTTTAT:1 + chr2L 8707530 3' + 412 433 2 58.90 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCAGTGCAACACCTTGTTACTCATGTCCTGCTCACGAAATTCGCTCTGTTCGGCTCTCTTATC:1 - chr3R 25137856 3' + P-element 2828 1 42.07 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGGTTAGACAAACTATTAGCGCTCAAATTTATGGCAACTGCAAGACGGAACCAAGACGGCATACATAATGTATGAG:1 + chr3R 26633294 3' - 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chr2R 10852820 3' + HB 319 1 76.03 ATAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATGTAAATATATGTGCAATAAAATTATGCGAAATAGTCATTC:1 - chr2L 17166293 3' + I-element 5278 1 68.49 TTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCTCTGTCTGTCTGTCCGTATGATCGTCGAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATCCATTGTAACTGGCTTGGTTTTTATCCCAGTAGAATAATAGTAAGCAAAG:1 + chr3R 10747007 3' + INE-1 90 1 63.45 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGTTACACGTTCGTG:1 - chr2L 22719585 3' - 1360 65 1 68.89 TTTTTTTTTTTGTTTTCCCAATTCAAATTATTGACAAATTTGAACCGAGCGTTTTCCCAATTCAAATTATTGACAAATTTTAACAGTGCGGTTTTTTGGTATTTTCAAAATGTAAGCTTATCATATATATGGTATAAACCAAAAA:1 - chr2L 18612259 3' + Tc1 1476 1 60.69 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGTCGTGTCGCATATGCATGCAGATACATTCACTTAATGCAATGAAAAGCAACCAAAAAGGAACGAATCAAAGGGGA:1 + chr2R 15151142 3' - hopper 42 1 55.94 GAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAA:1 - chr3R 19450174 3' - roo 111 2 66.44 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATGAACATATATGAATATATACAAATAAGCTGTCTCAAAGCAAAAGCCAAACAAAAAAGTGATTTGTTGTCAT:1 + chr3L 14709023 3' - opus 49 4 55.48 TAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATGCTGAAACTGAATCAGAGTAAGAGTCCTGGAGCCGGGGCATCCTGGATTCCGTCGTGTTGTTTCAAACGTGGCCGCTTTGCTCGTGTTTGATGGT:1 + chr3R 5941544 3' - X-element 31 1 65.22 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAACTATAGAGCTACCATTTGCTGGAGGCAAAGCAAGTAAGCCAACGTTGTAGTCATAAGCTATGAAAATAAACAACATTTA:1 - chr3L 10442795 3' + roo 9033 1 55.94 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACACTTGAAACAAAAATATAATCCGATATTTGTTTGGACTAATAAAAATTAAACTACCAAATTTA:1 - chr3R 4661923 3' + roo 9014 2 58.90 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTAAATTTGCCCCCCATCGAT:1 + chr2L 13140698 3' - blood 7054 2 56.30 GCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTCCGCTCTCTTGCTCTCGAACAAATATTCGAGAGAGCCTGAAGCCACCTCTAAGCCGCTTAACGTGCAAAATCAAAGTTGACT:1 - chr2R 19007083 3' - 1360 180 1 78.08 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATGATAATACTTTAACTAAGTACCCTTGGGTAGTGAAACATTTAATTTAAAATAAAATAAATTTCTAAGATCGATATTCCTATAAAATATCGATAGTCGCATAT:1 - chrX 13384951 3' + opus 7483 2 32.88 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGGACATTCACCGCACTGTGACCTTAAAAATTCGGCTCGTTATTTGGTTGTG:1 + chr3L 20399070 3' + roo 336 2 67.12 CGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATACATTCGCATTTTGTGTTATTTTCCATGTCTGCCCTCTTTCAAACTCACCCTATTTTGCGCAATTAGATGTCATTTAATGCTTGATAATTCGCCTAATGACAG:1 - chr3R 29091243 3' + rover 329 2 73.97 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTGCTTTTCCCACTTTCCCACCGCTTTCCACAAACTTGAGCAACAGCTGCG:1 + chrX 19113562 3' - 412 71 2 64.38 CAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTT:2 + chr3R 26244707 3' + copia 178 2 68.49 TTCCACTTCCTCTTCTTTTTTTACAGTGCACTGCGAATGTCATCTCCACGCATTTTTGCCCACTTAGCATTTAAGTTGCGTAACAGTCGACACAACCCCATCCAGTCATGGGACCCAAGATCTTTGCCTCTGGAACTGAGAACGAG:1 + chr3L 821856 3' - transib4 2200 1 50.00 AGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTAGTCTCTTACGACAAGCAACAGCGGACTGTGGTAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 4911 1 69.86 GTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCGAA:1 + chr3L 18738143 3' + Bari1 1677 1 56.00 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATATCGAATGCAGCTGAGAATTACAAAGCTGCACCCATTTTTCTTTCC:1 - chr3R 12622219 3' - 297 56 2 68.89 CCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATAACGCTAACAAAAGGTTTATTACACTTTCTATTGAAATATACATTTTGAATCCCATTTTCCCCACATTTGGCTCTCTT:1 + chr2L 3282690 3' + flea 4972 2 58.22 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGGTTCACTGTTGTTTACTGAATATATGAGCAATGGAAAAGCAATCCCAGTAAAGCG:1 + chr3L 21151183 3' + 412 430 2 62.50 GTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGG:1 - 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roo 8702 2 50.00 TACTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTACATCCGAATGAGGAAATACTTTTTAAAGCATTTCCGTTATTAGGAATTTGTTAAAATG:1 + chr2R 20439035 3' - transib2 392 1 61.64 ATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGCTTACACATAGATCATTGACCTGATAACGAATTTTTATGCTTGGAAATAAATCAAAACTGTTTTAACAAGTTTTTAAGCAATTTTCAAGCATTTCATAAACCAAGCAGG:1 - chr2L 13510733 3' + diver 211 1 73.29 TTATGCCAAAAAAAACTATTTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGTGTAATTTATTTCATGTGAAAACTGCACAAAACTATGACACGACCCCA:1 + chrX 22711719 3' - transib2 13 1 66.40 AGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCG:1 - chr3L 23456268 3' + Gypsy6A_LTR 264 1 65.71 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGCACATCCCATCAAAACACCAATAACATATTTAGGTCACCTCCTGGGAGAGC:1 + chr3R 19639823 3' - 412 7124 2 66.44 GGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCCGAGGCGTACATCACTCTGTCCCGGATGAGGACTTCAAGGAA:1 - chr2R 5640725 3' + 1360 3315 1 70.50 ACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCAACGA:1 + chr3L 18767844 3' - roo 8646 1 64.38 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAGAACGTGAGCGAAAAGAGAGCATGTGGATCTTACTTGAGCAG:1 - chrX 7967189 3' - P-element 44 1 53.28 AAAATCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCATGGCGAAAAAATAGTGTGCCAAAAAATCGTATAGCGTTACGCATCTTGTCTTTGGCACTACCTTGACTCAGCTTTTTAGGTCGTTCATACGGACAGAAAAACGGACATAAT:1 - chrX 6757175 3' - 1360 79 1 69.86 AGTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTTATATATTATATTGCCAGGGCATATGCTACGGCTACCGTGTC:1 - chr3R 20089953 3' + mdg1 7385 2 66.44 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGCTTTATTTAATCTTAAGCTTCCTCGTTTAGTAACTAAATATTTTATACATATGTATATATGTGTAAGAGTGAGTTTTCCCTTTTCTTTCAGTGCACTGTTGCGGC:1 - chr3R 12609947 3' + roo 9059 1 75.52 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTTAAATTATTTTAATATTAAGTATTACAATTAAGCTACGTAGATATAGAAAAATTAGGGTATCTTCTCACCAA:1 - chr2L 5447868 3' + roo 358 2 56.16 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGAAAAATAGTTTGTTAGGATAAGTCAATATTTGTTATGGAATAGAAGAATTAAAAA:3 + chr2R 5772370 3' - FB 67 1 65.07 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTACATTTTTTATCTATTTATGTAAGGCGTGGTAATATCTTTTTTTTTACATTTTGGCATAGCTGTCGAAACCCCATAT:1 + chr2R 1590232 3' + S-element 1673 1 54.11 CCCGTTACTCAGCTAGTGTATATGATATGAAGGATATCGATAGATATTGGCAGATAAAATTGGAATTTAAGTACAAAAAGAAACAGATTAAATGCAAATGGTCGTCTTCTCCGAAAAATTATTGCATTATGGTCGTGGACAAAATG:1 + chr2L 21690640 3' - INE-1 537 1 65.75 TGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCCCTGTGCATATACATATGTACTCGTATGTATGGCATGTAAAAACAATCAGGACAAGATCTTCAGGCCCGCTTG:1 + chr2L 15906115 3' + Tabor 436 2 51.37 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCAGGCTTCCACTTTGGCTCGCA:1 + chr3L 9762276 3' - jockey 4804 1 48.28 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATA:1 + chr2R 16496654 3' - hopper 42 1 59.29 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGAAGTACCTTAAGAAAAGTAGGCACAAGTAAATATCACTTTCAATAAAAACCAATTTGTACCAT:1 - chr3L 20083764 3' + opus 450 2 56.16 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAACTTGATCAATAAAATGCTTGACATGATATCAACAACAGTCGCCAGGGGTTGCAATGTC:1 - chr3R 30850716 3' - I-element 14 1 74.26 TTCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTCTAGCTTGTAATTCGTTTTCGGTTTATATTAACAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTCGACAAAAGTTCTGGTTGTTCTTTTAGTGGTTGTTGGTGGTTCGGGGGTGTTTT:1 + chr2L 9804183 3' - I-element 432 1 63.01 CCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGC:1 + chr2R 5321219 3' + INE-1 513 1 65.57 CTTATATTAATTACAATATGAAGTAATTGTATTAGTTAGAGACGGCCCTAGGATTTCTTTGCTGGGCTGGAAAATCTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGACTCGCGTAATTAATATTTAATATTTATTTAATATTGCATTT:1 - chrX 12175823 3' - Doc2-element 4684 1 76.71 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTTTTCGTGCTGCTCCAGTTTAAGCTTTAATTTTTCGCTTGTCACATAAATCGATAAATGTTTGCT:1 + chr3R 6412069 3' - Tirant 48 2 52.52 TTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGCCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGTGTTCTAGTATTTTTGTGCTATGTGTTAATCGGCGACTATCGACAGTTGCCCACCATT:1 - chrX 4540603 3' + 1360 3329 1 60.27 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACCACCACCCCCCCCCCC:1 - chr2L 14858820 3' + 412 7506 2 81.82 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTAAGTGGATGACAGAGAATTCAAATAAAGTGCTTGCCACTCTACAAAAGGACTGCTTAAGATTCTTTTAACCAGAATTGGAATAAAGC:1 + chr3L 18972955 3' - mdg1 7071 2 61.64 CGGACGCGCCCGCAGGAACGTCAGCCCGACTGCAACTAAGTCGCGACATATGACTCCTGCATTTCAGCACCAGCCAAATGGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAA:1 + chr2R 545201 3' + gypsy4 6615 2 65.49 CGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATCTTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTT:1 + chr3L 23702262 3' - G4 56 1 52.74 GTGCTCGCAACAGCTGACTTTAACAGCTGTTATTATAACGGTGCGCTGTGAAATTGACTTTTGCGGGCGGTAACATAACAGTTTAAAGTCCAATGTATTAATAATATATTTCCAACCGCCACCCACGCCAAAAGAGCCC:1 - chr2R 24346421 3' + hopper2 1448 2 78.42 GCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGAAAGCTATTGCGCGCTAAATTTAGAATGTTTCCAGTGCCTTTGCCTCACTTAGGAAA:1 + chr2R 16073060 3' - Burdock 20 2 67.81 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGACTGATACTTGATACAGCTTGGAGTGCGGTTCGTTACAAACTTCTGTGGGACATTAAAACCAGTTATAAGCCAACTTTCATTC:1 - chrX 12003889 3' + P-element 2853 1 61.81 GTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGTTTAAACTAGGACAATGCTAGGAAAGAGAATAACTTGATATTGTTTGTTCGGAAT:1 - chr3L 13156706 3' + transib2 2759 1 62.33 AAATATTTGTGAAATCAAATGGCAGCCGGGGGTCTCAATCGCATTGAATGTGTGTAGGTGTGTGCGTGTGTGTGGGAGGGGGATGTCCTGGGCTTATAAAATGTTAACTGTAAATAAATTATTAGCCA:1 + chr3L 10504455 3' + transib4 469 1 49.22 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTAAGGAATGGTGGATGGAAGTGATGGAGCACTCGAAG:1 - chrX 14346434 3' - roo 83 2 76.03 ATTTATATTAGAATATTTTTCACAAAGTGGAACTCCTTACAAACAACGATGGTTCAACAGAATGTTATCAAAATCACTGTTAGGCTGTCCAGAAGTATGCAACAAATTATTTCGACGGACAGTGATAGCTCATTGCATACTTTTGA:1 + chr2L 12958091 3' + 1360 391 1 77.40 AGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCACCTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGCTTTTTTTTTAGGATAAATGGAGATATCACACACCAAATAAAGATGCACGGAGCCCTTCC:1 - chr3R 2136301 3' - I-element 362 1 66.94 ACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGCATCATAGATTTTGTTAAATATTTTTTTATAATTTATC:2 - chr2L 14480447 3' - Transpac 80 2 73.97 CACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCGCAAAGCGTACTGCTGCCAATAAGGCAAGGTATTCATTAATAA:1 - chr3R 26244641 3' - copia 4948 2 72.60 AAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACTCATATGTTTGTAGTCTACGATTTT:1 - chr2R 5582176 3' - Cr1a 489 1 52.86 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCTGTCAAAAGCTCTTTCGTTTTATTAGATTTTCCCAGCCGGTGGCTTTTGGCCCAGGTAAGTCGTAGAAATTTCCCTTTGCTGTTTGTTGTTCTGGTGTAT:1 - chrX 17027819 3' - roo 20 2 70.55 GTTCGAGTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATGCTTTATATGATCGGAAATGCAACGAATCTAGGTTACCCTCTTACTCTACGAATAACGGGTATACCAAACACAAGGTGGAAGATAAC:1 - chrX 21191239 3' - INE-1 96 1 54.40 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGGTCAG:1 - chr2L 13717309 3' + P-element 2814 1 27.41 ATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAGTGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGGATATCGATAGATTCTGGGGAATAATATGAGAAAAAATTAAAATGTTGTTTTAAAGAAGCCGGCAATTCCGCATACATCTATCTGTATTGA:1 - chrX 5708759 3' - INE-1 540 1 73.29 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTCACACATTAAAAATTCATTACTTGCTGCTTTTTTCAAAAACAAAATGGTTCAATTGAATA:1 + chr3R 31650418 3' - pogo 54 1 56.85 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCCTATACGTATGTATGAGTGTGTATGTGTTTTTGTGCCTGTGTGCGCGTTTGGGCCTTTTGTGCACAATCTTACTGACTTCCTTCCGGTCGAACAGGCCGTGTTTTGT:1 - chr3R 16530510 3' + hopper 1404 2 78.08 CAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCA:2 - chr3R 19589911 3' - BS 5054 1 56.16 GCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTATGATTGTATGTATGTATGTTTTAGTTAGGGCATATGTACATACATAATGTACACTGTTTCAATGCA:1 - chr4 879739 3' + R2-element 3384 1 54.79 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCGGACTTTACATATTAGAAAATATGTCTTTTCCCATCTATTCAAATGGCATT:1 + chr3L 4933810 3' - blood 71 2 67.12 GTAATAAAAAAAAAATAAAAAAAACGCAGAACCAGCTATTGAAGTTCGAGTTCAGCGAATTGACAAATCGTTTTTAAACAATGGCTGCAATGTTTGCAAACCGAAAACAATTGCGGAGACAGGCGGAAA:1 - chr3R 21165367 3' + BS 5100 6 55.81 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTATGAGTGTATTTATTACATAGTTAAGTGATTACTTTATATGTTTTATTACAAGTTTATTATA:1 - chrX 11267651 3' - roo 15 2 72.60 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGGGTCTTATACTGTTGGAATGAAATGCGGCCGCGTTTGGATTGAGGGAAAACGGTGAAATTTTATGCAAATGGT:1 + chr2R 18440514 3' + P-element 2840 1 52.05 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTCGATTCCCCGTCTTGGAACTGGACTCCATCGCATGTGGCACGGGAACCCCCGAA:1 - chr3R 10461608 3' + roo 9055 2 73.97 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTATGAGTGTATTTATTACATAGTTAAGTGATTACTTTATATGTTTTATTACAAGTTT:1 - chrX 11267657 3' - roo 8685 2 68.49 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATACCATATAGCAGATAGATAGATAGCTGATATCTGGAAGAAGGATAGGGTAGGAGAGTGTCTGTTGTCGTCGGAGACCTTGCACCGACCGCTGGCC:1 + chr3R 22522762 3' + roo 9043 1 66.44 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGAAAGGGAATAAATCA:1 + chr3L 14084949 3' + opus 437 2 70.00 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATACTGTTTTGGATAATGCAAAGCAGATAAAGGAAGAATGGATTAAATTGTCTAGCAGCTGAGGTGCGATCATGTCTTGGCTAAAAAGAATCCCCATTCAAGAAAAATG:1 - chrX 21581298 3' + Tabor 7309 2 65.07 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGTCTATACTGTAGGCCAAGCCACATATATAAGCAAACAATATATATAAATACATATGGGGTGTGTGGGAACGG:1 + chr3L 12899862 3' - roo 48 2 52.08 TTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGCGTAATTTAATTCACGTGAAAACTGCACAAAACTATGACACGACTCCAC:1 + chrX 22711720 3' - transib2 33 1 63.01 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACTGTAACTTTTTGCAGCACGAAACGTGTTGTCTTTGTCACTTTTCGGTCTGCCATTGTCCGTGTTTCTATGGCCGTGTGTGTGATTGACACGC:1 - chr3L 5179105 3' + P-element 2860 1 64.38 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTCCTTTGAATATATTTGTTCCAGGGTATACGAAGAATGATTCCATTATGCACGTCCATTATTCGGTATTCATTTAT:1 + chr2R 12813795 3' - roo 8706 2 51.37 GTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAACATCGAAG:1 - chr3L 20176761 3' - gypsy 7029 2 62.96 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAATGTTTATATATAGATTGGACTTTACACAAGCTATTTAATGCTTAATCAGTGATTTCAGCTTTTTAGTTAAATATTTCTAAGCTTTAGCCATA:1 - chr3R 8596306 3' - hobo 26 1 66.44 CGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTTTAGTAGTGATTGCTAAAGTTTTTATAGATGAAGATTAATACCGCAGACTT:1 - chr2L 11442909 3' - G-element 4194 1 65.07 CTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAAACGTCAACCC:1 + chr2R 11097388 3' - Juan 4078 1 52.05 ACTGATTCGTTGCCGACGCCTGCTGCGACGCTGCCGACGCCCACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGATGCCAAATTTGCGCAAAACTACAGAATATATCTTGCCATACCGAATCTTGTGCCAATCTTGTGCTTCAACTTTTCCTT:1 + chr3L 23236124 3' + HMS-Beagle2 7050 2 54.11 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAACCATCTCGATTCGGGCATTTCCTGCGACCTGCGAAGGCAGCGAATGTCTT:1 - chr3L 3757148 3' - copia 4940 2 68.49 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATAAATATATGTGCATTTGTGTATAGTATATCAGTGTGAAACACCAACGTACAAACACACACTGTCAAT:1 + chr2R 9504320 3' - roo 49 2 54.79 TATTATAACAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTACTACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGAGGAAAGAAATATAAAATTAGTAATTTGTGATAAGAACAGAA:1 - chr3L 23150219 3' + hopper 1285 1 69.86 GATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCGGGTGCCTTTGCAGTAGC:1 - chr3L 13365569 3' - jockey 4573 1 54.24 GCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGGAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGCATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCAT:1 + chrY 2720334 3' - gypsy 7049 2 63.01 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATTAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATTCGAGGTTAAATTGTTGTTTGGGGCTTCTTTTG:1 - chr2R 13193804 3' - BS 5081 1 74.48 GTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTG:1 + chr3R 29091377 3' - rover 72 2 67.81 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTGTTAAGAAAAATAAAAATCAAATTACACAGAGAATTAACCAACAAAAAAACATTTTCTCACAAATTTCTTTAATGGCTTCGGC:1 + chrX 3053018 3' - 1360 32 1 75.34 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAAT:1 + chrX 16217495 3' + P-element 2799 1 21.58 GAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTC:1 + chr2R 5173214 3' + Stalker4 7298 4 63.01 AGTGCATTACTGTTTTCTTAGAAATAATTGAAGGTGCCGGTTTCGACCTCCCAAATACGTCACTCCTCTTTGAAATAATATCACAAATACTAAATTAAAGTAATTTATTAGGATTAAAGAATTTGAATGCTAATTCTTGATGTTAT:1 - chr3L 9879830 3' - 297 6624 2 52.74 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTC:1 - chr3L 13228486 3' + P-element 2814 1 29.85 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTACCAAGCCTATTTACGGTTTAGCCTTTCGCTCTTTATTTATAGTTGTT:1 - chr2L 7449705 3' - roo 74 2 71.23 AACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGAAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTTTGTCAAATTAAGGCCTTGTTGCTCTGGG:1 - chr2R 9410482 3' + hopper2 1519 1 71.92 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCCTATACGTATGTATGAGTGTGTATGTGTTTTTGTGCCTGTGTGCGCGTTTGGGCCTTTTGTGCACAATCTTACTGACTTCCTGCCG:1 - chr3R 16530531 3' - hopper 26 1 65.00 GAGTAACGGGTATCTGATAGTCGACTATAACGGGTATCCGACTATAGCCTACTCTCTTGTTTCTTTTGCACATAAATACACAAATAATTTTTGCCTTCATTTAAACAATTTGAGAAAGTCGCCGGGTTCTATATACAATATTTGCC:1 - chrX 22806233 3' + INE-1 549 1 56.16 CTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAATTAATTGAAATCTCTATTTTAAGTAATATTGATAACGATTAATAGTAGAAAAGGT:1 - chr2L 12488246 3' + copia 5059 2 65.75 AAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGT:1 + chr3R 1844842 3' - Cr1a 171 1 62.59 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGGCAAGAAAATGAAACAAATGAAAAGCTGTCACTGAACTGGAAAACCATCTACGTCTCGTTTCGTTT:1 + chr3L 9519656 3' + roo 9042 1 56.91 CATTATATAAATAAATAAATAAATCACTAAGAAATTTCCATTTAATCTTCAAAAGCACAGATTCCCCAGCATTTAATCAATCTAAGTGATGTCCAGCGGTCGGAGCCCAATCCGCTGCAGAGATTACAGGTGGCACGGAACTGTTC:1 - chr3R 17764432 3' + mariner2 827 1 61.64 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGAATATATGATAAGGATCATAAACGCCAAGA:1 + chr3L 16663921 3' + opus 446 2 77.14 GTTGTTGGCAAAAATAAACCAGGTTCTTGGGTTCCTTATCGCACCTTGCTGGCCTCCGGCTCGCAACTACACATAATCACCTCTCGTCTGGCACGCTCGAAGCCATTTGCCAATGTCCTGGCCATACCACCTGCATCCT:1 - chr2R 16412209 3' + G3 419 1 69.06 CTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTACCGATGAGGGAGGGGCAGAATAACCGTCGACTTGATGAATGTCGACACGATGCAGACAAGTTTATAAATTATGCCAGAGTTAAGATAACG:1 - chr3L 18321252 3' - G2 2621 1 61.03 GACCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGATTCATCATTTTGAAATATCGACTGAACGCCTTGCGTTCCAATGCATTGCATTGGATGGGAAATGCAAGATGACCATG:1 + chr2L 1989464 3' + S-element 1676 1 47.59 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCATTAAGAGTTAAATCGTCGTCGTCGTCGTGATCCGGCATTCAATGGATAATTACGTACATTCCCGACAAAAGGCCGCACACTCGTT:1 + chrX 18737333 3' - I-element 15 1 68.80 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACCTAAGCGCAATGGTGTCACCTACTGAACTGAGCACTGAATTCCGAGCGCTAAGCGTCGAGAATCAAACGCCCAAAGCCAGTGATGATAAAATATTTG:1 + chr3R 18518073 3' + roo 393 1 71.01 GCAACAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTAAATGCCAGAAAGTGTGCGGTGTGCACGTATTTGGAAAGAAACGCACAGCATGAGCTTATCAAAGTAACTCTTCGAATCCACAATGATGACCTTCTTCTGCATGGCAGCC:1 - chr3L 14728842 3' + Juan 4213 1 59.59 AGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTAATTAAATGGAATTCATAGCAGGGTATTAAACGGCTGTGGCAGCTCAAGTGCA:1 + chrX 20607085 3' + I-element 5290 1 60.96 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGCACATCCCATCAAAACACCAATAACATATTTAGGTCACCTCCTGGGAGAGCCAAAGCCACGGGAATTTAACGATAAATAATACCTCTTTGCGAC:1 + chr3R 19639866 3' - 412 7081 2 63.70 AAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTTGTTGAATGATGAAAGGTTCTCCGCCCTTTCGAAACCCGTTGACCTGAATCCCAATTCCAACTACTCTGCTCTTTAAGTCGACTCTGTGGGCGGTTGTGTG:1 - chr3L 13368777 3' - hobo 2474 1 69.66 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTTCAACCATCCACAGTACTGTCGACTATCG:1 - chr2L 2999230 3' + P-element 2809 1 22.60 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGTCATCGGTTGCGTCGACGATTTGCAGTTTGAGGACCCATAAAGAAGAATGCGAAGCATACTTCTTGGGGCTGACGGATTTCGGATTTCCCAAC:1 + chr3L 13362778 3' - jockey 35 1 65.07 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGA:1 - chr2L 13717327 3' + P-element 2804 1 16.54 TTTTTCTTTTTCCCTTTTTATTTTTTTCTAGTTTTCACACGTCGCAAGCTGAATACTCTAATCACAATTATTCTATTATAAAGCAGCCAGTGATAGCCGTGATCTCTTTTTGTTTAAGGAAAGCTGAGCATGATTTGTCTACTGGT:1 - chr2R 4640087 3' - Doc2-element 234 1 55.48 TGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGTATCTCTTATCAAAACGTTCCCTGATAACGCCCCACCTCAACAATCGGTGTTCTACTTCAGAAGC:1 - chr3R 24053635 3' - mdg1 56 2 55.48 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGGGCGTTGTGCTAAGG:1 - chr3R 24976208 3' + roo 9008 2 60.96 GGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATAGAATGATTATTTAAAAAAAAATGCCTAATTTAAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGTTTATTCATATTTTGGTAATGTTGGCAATAGAAAA:1 + chr3L 14944653 3' + G5 4786 1 51.37 AGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATACTGTTTTGGATAATGCAAAGCAGATAAAGGAAGAATGGATTAAATTGTCTAGCAGCTGAGGTGTGATCATGTCTTGGCTAAAAAGAATCCCCATTCAAGAAAAATGATTATTG:1 - chrX 21581291 3' + Tabor 7316 2 71.23 AAATTGTTTTTTATTGTTTATTACTGGCCATGAATTATTATTTATCTTGTATGATATGACTATGTTATGTATGCACTTAAAACTTAGTTTAGTATTTAGGAACACTATTTAGCTGGATTTTGAAGAAAATAAATTACATTTAAATT:1 - chr3L 15457144 3' + Penelope 104 1 43.84 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGGTATCTCTTATCAAAACGTTCCCTGATAACGCCCCACCTCAACAATCGGTGTTCTACTTCAGAAGCGCGTGCCTGAATGAGTTAATTGATGGATGGTCTGTTG:1 - chr3R 24053598 3' - mdg1 7051 2 75.71 CGAACAGAAAAAAAAAAGGGAAAACAAACCAACCCCAAAAACCGACCAAACGCTGAGAATTTTTTTTT:1 + chr2R 17869079 3' + Bica 335 1 72.06 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTTTCAATGTCTGTTTTATGTTGTGTTTTTCACAGTTTTGTGTTTGCCTAGCTGCAATTATTTT:1 + chr3L 18789150 3' + 1360 3377 1 65.71 AGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAAATCAGACGCAGTAAAAGAAATGAAGGTAAACCTAAACTATCGTATAGATTTT:1 + chr3R 3286205 3' + Gypsy12A_LTR 1930 3 62.33 GAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTCACCATAACGAGAATGTTGCATCAGCCCCTAATTGTGCGTTGATTGG:1 + chr2R 973833 3' + 1360 3316 1 68.97 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCTCAGGAAGCATCGAGCCCATTTCCACACTGAA:1 + chr2R 11562931 3' + pogo 2053 1 52.74 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAATTATTCAAAAAATGCGATTGTTATTTGCAAAATGTGCAGTGAATTGAGACGCTC:1 + chr3L 17108633 3' - hobo 64 1 60.96 GTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCACGACTGCTCTCTTCGGTTCTTTGTTTTGCTTGGTGTATTCT:1 + chr3L 21240188 3' + 297 6588 2 67.20 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCCCACATCATGTCGGCGGCCAAACGC:1 - chr2L 19643553 3' + hobo 2908 1 73.42 ACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTACATATATTTTTTCAACTACTCCCCTCGTTTATTTTTTCGCGCTTTTGAATAGCTTTTTCTCCTAAAATGTTTTAGTTTTTTTTTCCCCCATATGTTTAAAAACTTTTTTTGTGGACGTTGA:1 - chr2L 5760967 3' - HB 9 1 76.03 ATTATTGTTATAATTATTGTTATTTCACAAAATACTGCATTAGGATTAAGTTGTACCTGCAACATCTAAATTAACTTTGAAAATCCGAATTTCTAATTAGTTTTAAGCCTACTTTAGGAAGAAACTGAGCCCCAATCACAGAAAAA:1 - chrX 7711064 3' - mdg1 21 2 69.18 CTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTGCAGTTACAGTTACAGGGAAGTTGCGTTGGCACTGACAGTCGCAGACAACACTCACACACATATAGATGGGC:1 + chr3R 27859604 3' + hopper 1370 1 54.79 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGCTATTAATCAACGTATTTTATTATCGATTAGGTCACTTCGATTCGCATTTCCGGGTTATTGATTATTGTTTAAAAAGTTTTGAGAACTTTTTGTTA:1 + chr2L 13510917 3' - diver 5914 2 67.12 TAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACTCTTTACTCAGCTGGGTTTTGCTAAGAATTTATATTATATTGTTCTGTAAGTTTATTTGTGAAATTATAAATACCCTAAATTACTCTTTGTCCATTCGTGTCGTGTAGGATAGTAATTA:1 + chr2L 22756700 3' - INE-1 563 1 76.71 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATATGTAAAACAGTATTTAATGTAAGGTTTTTTTTTTGCGTAAACAAAGTATATAAAAATTAAAGTTAAATAAAAAACTAAAAGCAAATCAAGAGAAGTAATAA:1 + chr3R 11146499 3' + flea 239 2 73.97 GTTTTTTTCTTTCTGTTTTTTTCGTAATCATTTACAAAACATTAAACAACAATTTAAAAATGATTCTTTTAGCATGAATTCAAAGAATTCTATATTTTCTTGGAAAGAAATCGAAGAAACATCAT:1 - chr3L 16160207 3' - gypsy7 5007 3 77.60 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGCAAAATATGACATAAATCCACTACTACTACTAACCTTAAAGGCCCGAAAAAGTATGCTACGCTGTGTGAAAA:1 - chrX 6484698 3' - jockey 57 1 52.74 CCTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTACCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAAGCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTCCGGAGACAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCAT:1 + chr2R 5296378 3' + INE-1 89 1 80.14 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTAATATGTTCTATATTTATAGCTGTGAATGATAGTTTCTCACGGTATTTGAGTAGTCCAGTTCTTAAAGCTGATTCACTCTTAGAGAATTATGAATAAATTTGATT:1 + chr3R 22772012 3' + opus 7483 2 58.90 ACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATG:1 + chr3L 18738136 3' + Bari1 1652 1 68.64 AAGGGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAAGTGACTTTAGTAACTGGTTTTAAATGATCCTTTATATACATTCTCGTTGCCCCAAATAAAACAGCTGACTATAATTTCTTCTTAAAATTCCGCATAATTCCGTATAATAG:1 - chr4 353377 3' + BS3 1740 1 75.34 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTTTACAGTGTACTGATACTATACTGATACATACTGATGCTTTTAACGTCATCATAAATTCTACAAAATATATT:1 - chr2R 15942256 3' + opus 7455 2 53.42 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTGCTTTTCCCACTTTCCCACCGCTTTCCACAAACTTGAGCAACAGCTGCGTGTGTCAAGCCGAAAAGTGTGCAATGAAAATTGT:1 + chrX 19113596 3' - 412 37 2 58.90 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGGGTATATTGCAGATCCATAGCTTGGTAT:1 - chrX 17510625 3' + roo 8995 2 77.69 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAGAACGTGAGCGA:1 - chrX 7967219 3' - P-element 76 1 30.94 GTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCAAGCATATCCCCAAAGTAAAGGAAACCAGAAAACAGGGGCAGCAAATGCATAAGA:1 + chrX 20465923 3' - jockey 4773 1 73.29 ACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGAGCGTTAGATCGTATTACTCGGACGCTTTGAAAGCAGCGAGCGTGGATTTTGGCTAGATTCCGACTCTGGTTACATTTCTGCATC:1 - chr2L 3242399 3' - Stalker 209 4 60.27 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGCATTTCAGCTGCCATTCTCGTCCACCTCGATCATGGTCTCTCCAGCGACCCTGGCGGCCACCAGGCACATCCCGAGAGCCAACAAAGCCCAGA:1 - chrX 4558087 3' - blood 7177 2 74.11 AAAAAAAATTAAAATAAAAAAAGGTGAACGGTATAATTGGTGGCGTGTTAAATGAATATAATATTCATATGCTGTGCATAGCCTGCAATTGCTTGCTGACTTTAACTTCATCCATTAAATTTTAATTTCACCACGCACGCTTA:1 - chrX 5139694 3' + Doc2-element 254 3 78.32 CAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTCGCGCACGTGCGAGCGCGACAAAAAATCAAAACAACAAAATCCACGCTGGTAACATCTGCTTTGGCTTTGCATTGAAATCGCGTTGGTGCAAC:1 - chrX 21281320 3' - P-element 243 1 67.36 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCGGACTTTACATATTAGAAAATATGTCTTTTCCCATCTATTCAAATGGTATTTATATTTCGCTTGCAGTTTAAGACATGTATCTGTAGA:1 + chr3L 4933847 3' - blood 7045 2 58.22 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGCCATCGTCCTCTTCTCGAGTGTCTAGCGTATTCTGTGAAGTTGAAGTAGTTTAAAAGCTTCAAATTTTCATCGACATGATTTGACCACGTCAGAGCCGATG:1 + chrX 14346555 3' + roo 396 1 73.57 AAACAACATAAAATAAAATCATATCGAAACAAGGCAAGTGAAGGTAACGATTTTTTGGAAATTTGCTTGGAGGTGGTTACTGGAGTGATTGGGTTTACGATGGCCGCTACTTTAATGGCAATAGGATAGCCAGGATTCGGATGTG:1 - chr2R 18502254 3' - transib1 1897 1 77.24 GTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTTGTAATTTCAAAATTATTATTATTTGTATAATGCAAAAAAAGAAAAAAAAAACTGTTCACTCTGCTGCCACGAAAATTGTATAAAAAATTCAGATGAGATTTAGCGC:1 + chrX 2504021 3' - P-element 2544 1 49.32 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTGCTTTTCCCACTTTCCCACCGCTTTCCACAAACTTGAGCAACAGCTGCGTGTGTCAAGCCGAAAAGTGTGCAATGAAAATTGTGTGAAAGTTGTGCTGAC:1 + chrX 19113613 3' - 412 20 2 70.55 AAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAATTATTTCTACCATTATGTGTGGGGTGGCTATTGTATCTGCCGCTGGATAAGCATTCCAT:2 - chrX 19820141 3' + Juan 4155 1 52.74 TGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAG:1 - chr3R 19450168 3' - roo 8769 2 70.55 ACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTAACACCCCTGCCAAGTTCACTGTCATCTCGGGAAACTCCGCCCACAT:1 + chr3R 31434507 3' + roo 287 2 67.12 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAAATTATTCAAAATTGAACAGCCTTTCCCGAATGAATCCCCGTCAAAAGCTGGCTATTTGGCTATTAAACAGCTAATGGGTCAGCACTGTTGCAGGCAAA:1 + chr2R 22464506 3' - pogo 19 1 71.03 TGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGACTGGCTCTCTAGTTTAATATCCTTGGATGGCTATG:1 + chr3L 10564043 3' + hopper 1404 2 76.71 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACCGATATAGACGCATTGTTGCGTGGAGATTTATCATTGAT:1 - chr3L 12899772 3' + roo 331 2 71.43 CCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTGTATT:1 - chrX 9437179 3' - roo 8765 2 30.14 ACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGCCTCAACACGAGTAAAACAAAACGTAATTACAACAAGGACTTTTCAACAGCAGCATTTTGCACATTGCAACAGCTTTGTTTAGTGAAA:1 + chr2L 9861412 3' - BS 4993 1 60.27 ATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAGCTGTAAAGCAAGTAAAACAATTTGAATGGCTTTCCTTGCGCACTAAGACTTTAACTAATTTCCCAAGCTCAACACGTTTTCCAGATTAAA:1 + chr2L 6876722 3' - Rt1a 38 1 64.38 ATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCATTCCGGACATGTCGGGATCTTTAAAAGCTTGAATTTTCAAATTGGTATTTGAGTAGTGATTTTATAAATAAATTTATAAGGTAACATCTGTTACTTTCATCTCCAGTTCCTTTTCT:1 + chr2R 13259724 3' + INE-1 80 1 63.70 GCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACACGGCCTTCCTGACCTATCACACGTCCTCGTGTGCTAACAGTCTCTCATTATTTAGCGTTTGGCCATGGTTGCCATTGCTTTTGTTGGCCATTTTGCCATTT:1 - chr2R 19584400 3' - invader1 3630 2 62.24 AACATGTAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGCCTCAACACGAGTAAAACAAAACGTAATTACAACAAGGACTTTTCAACAGCAGCATTTT:1 + chr2L 9861383 3' - BS 5022 1 58.22 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGACTAATCCTAATGGTAACTTAACCGTAGGTCTAGTAAGTTCTTCCCAAACTCCTCAAGCATATCCCCAAAGTAAAGGAAACCAGAAAACAGGGGCAGCAAATGCATAAGACTC:1 + chrX 20465926 3' - jockey 4770 1 75.34 ATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTTCGAAATGTATGTAATTTATGCAAAAAGATAT:1 - chrX 7031608 3' - hopper 86 1 74.66 CCTCTCACGAGGATTACTAGCAGGTTGTGGGAGGGCTGGACGATAAACGAATCGTCTTGCTGAATCCCAGTCTTTTAAGTCGCTTTAACGGCCTAGCTAGAAGCAATCTCCTTGAAAAATGCTTTAAAACGAATGAGCGCAAAGAG:1 + chrX 14345569 3' - BS4 633 1 78.08 AAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATATGTTGTTATTTATGGAGATTTTTCCAGGTCCACCCATTTCCTACCCACTCCATCGCACATTCGCACACGTGTCAAATATTTGTCGTCAGTACGAGCACCAAGCCGTGTATC:1 - chr3L 1981472 3' - opus 7114 3 76.26 ACAAAAGGCTCCACCCACGATCTCGGACTTAACTCGCGCGTCATGCTTGTTGGAAAAACAGCGCCAAAAAATTGCCAACGAA:1 - chr3R 6411975 3' + Tirant 386 2 53.66 ATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTACCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAAGCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTCCGGAGACAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCATTT:1 + chr2R 5296380 3' + INE-1 93 1 79.86 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCCTGAGAAATTCACACTCAGTTGAAACGGAACGAAATCGGAGGTCGAGTGACTGGCAACGC:1 - chr2L 18944805 3' + P-element 2851 1 54.03 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTAATTATCGTCGGTTTCTTGGGCCGTACAGAGCATATAATTCAGATGTGTGCTT:1 + chr3R 10361943 3' - roo 8730 2 64.14 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGACCACCACCCATTTGCCATCTTCCCATCTTCCAGCAAGCGCACGCCTGTCATAAATCTTGTTTTGAAT:1 - chr2R 20447786 3' - hopper 46 1 51.43 GAATAAGCGTCGTAAAACATATTCTTATTACTTACTGTGCCAGACCACAAGGCTGTAAGTTAAAAGATTATTCAAAAGATTAATTATTTTTTATA:1 + chr3R 18245514 3' + Gypsy6A_LTR 215 1 61.05 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGACAAACTGTTTCAATGTTTGTTTTATGTTGTGTTTTTCACAGTTTTCTGTTTG:1 + chr3L 18789132 3' + 1360 3365 1 53.73 ATTAATTATTCCGAGTGTATATATAAAAAAAAAAATAATTTTTTTAATTTTACCCTGAAAACATAAAAAGCTTGTGGGCAGAAATATATTTATTTTTCTTGATTTATGAGCTCAGATGAGCTCTTAGGAAAGGTAGAAAACAACCA:1 - chr3L 3820848 3' - NOF 3854 1 80.82 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGGGCGGTAGGAATGAAGGGAAAGCTGGGAGGAGTCGGTTGTAGGAGGGTTGAATCAACAGA:1 + chrX 5206545 3' - Tirant 41 2 54.92 TTTTAATTTTATTATTTATTTATGTAAAAAGTTGGCTTACAATTTGTTTTTCACAATTTTTGAGAAGACAATTTTTCTTATATACATGTATGTATCGTCGCTGTTGTCTAGCACAGTTTAGAACACGACGGATGTAAAAAAACGAC:1 - chr2L 21653181 3' - BS 5093 1 54.79 AGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGCCCACTTTCCACACCTCCTACCGTTTTTCGTCCCCCCTATTGAAACTCACAT:1 + chr3L 3565406 3' - gypsy 7052 2 60.27 GTATTCTTACTTACATTTATACATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAACCGCATCAAGGAACTTTAACACTGATCACATCGACTGCGCTAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAA:1 + chrX 21534509 3' - Stalker4 258 4 57.53 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTTTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATATCAAATTTATGTCAAGTTGGCCAATTTTCAACAGTAAAAACGACAAAGAAAAACTCTA:1 - chr2L 3648714 3' + roo 348 2 54.79 AGGGAGGTCATGAGGGGGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAACAAAATGGGGTAGGAGAAATCTGAGGCAACTGCGCTG:1 - chr3R 20939161 3' - jockey 4759 1 75.34 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTTAATCGATAGGCATTGTTTTGTATGTACCTTTTTTAAAATATTCTTTATCAAATCAACTGAACCTTATAATTA:1 - chr2L 17957150 3' + blood 333 2 54.48 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGCAAAACATAAAGCAGGAGCCGCCGCGGCGAACCAACATTGCCATGATTTGTATAATTGCAGTGCG:1 + chr2L 20986617 3' + roo 9017 2 54.11 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGGTTTATATGCTGAACAGGCACAGGCGGATGGCCAACGCCGGTGGCGAAAACTCAGCACTCGACTGGTCTTATCACTCGACAGGCGAC:1 + chr3L 20977928 3' + mdg1 396 2 64.23 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCCTTGAAAATTGCATTACCAGTTATGAGGGTGTTGGAAAGCAAAAAGTAAAAAGCGAAAAAAAAGGGGGGAGCCGC:1 - chr2L 12832830 3' - I-element 9 1 72.22 ACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGATTCGCCGCCTGCAGCTGCTTTTCGCGCACTCATTACCTCCGGCTT:1 + chr2R 12069655 3' + Tirant 333 2 66.19 GAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCACCCGATGAGAAGAAAAGTGCATAAAATGCAGTTAAGGGGGAACTTTCA:1 + chr3L 18767840 3' - roo 8648 1 66.67 CGGAGGAAGCAAATTAATATTTTCGAAAGGAGGAGGAAGTTCTAGAAGAGGAGGAATAGCTTGAGAATTTGTTGCCTGCGCAACACAGGTTTAATTATGTTCGTTGTATAAGTTGTATAAGATAAAAGATATTACCCGTTCACTTT:1 - chrX 19595883 3' - Gypsy12A_LTR 2057 1 65.07 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATGTGCAAGGCAGGGCCGTATCCACATCGAGGGTACATATGTTTTCTTATCAGTCGAATCAGTGGAGCCATCAATCAAA:1 - chr3R 18697846 3' - 297 15 2 68.80 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGGGGGGGTGGGGCAGTGGGGGATGTTG:1 + chr3L 15276730 3' - hopper 13 1 58.33 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAAGGAGATTAAATTTGGAAAACAGGCAAATAATTCAGCAACTGATTTACGAG:1 + chr3L 16875791 3' - jockey 4800 1 53.96 GCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCGGCAAATTAGTATCAGTGCATTAGGCCTTGGCAACCAATATATATTTC:1 - chr3R 5115298 3' - Ivk 49 1 58.33 ATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCCTACGCCTAAATAAATCGACATTCGTAACTTTTTTTTATAATAATGAAATTAATAAAACGTACA:1 - chr3R 25718186 3' - I-element 5011 1 56.16 ACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGCCAACACCACTAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATATTTTTTTTCGCCTTCCTGCCCCCCAAATAACCCCTTCAATTTTTAGCATTTCTTTTCGCTCTTCTTTCGGCAAATGC:1 - chr3R 8696401 3' + Q-element 179 2 52.74 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGGTTAAGGCTGTTACGTGCCGCTGCATACTGCAAGCGGACAAGTCTACTGCTCACACTTTGATG:1 - chr3L 22883924 3' - roo 8717 2 56.74 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACAGAGTTGGTGGGAACGGTTTTTAACATATTCACTTGATAATTTCGATTTTAATTTCAATAAATTAAGGTACGTTTTCTCACTTACTACCCTTTGATTTGCATCTATAA:1 - chrX 4214408 3' - jockey 20 1 72.60 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTAT:1 - chrX 11267711 3' - roo 8723 2 66.15 AGTCGCTTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAAGGTAGTTATTACCTATTATTCCACCCGCTACAGATAAATTATCCATATCATGGT:1 - chr3L 14084865 3' - opus 7066 4 60.27 ACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGACTGGCTCTCTAGTTTAATATCCTTGGAT:1 + chr3L 10564036 3' + hopper 1397 1 71.92 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATAAAAATTAAAAATTAAAAAAACGAAATCAAATTCACCGAACTATGAGTTATTTGAAATGGTTAAAATGGTTAGTTAAAAACTTGT:1 - chr2R 11097283 3' + Juan 4171 1 46.58 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAATTA:1 + chr3R 24976284 3' - roo 8745 2 74.48 AAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATACATAGACTTCCTCACTCGTCTGCTTTGTGACATTGAAAATA:1 - chr3L 18034562 3' - Transpac 4990 2 67.12 AACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAATCTTTGATGTGAGATATTTAGAAAACTGTATGCGAGAGCTTTGGAAATTTTTTCCCTCAAAAGTTGAAAAATTTTATAAATGAAAAGTTTACATGGGATGCA:1 - chr2R 4241705 3' + 17.6 6956 1 73.97 CTACTGAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGGCTTGTGTTCTGAATTGGAGGTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGGTTGCTCTATAACTAA:1 - chrX 19113492 3' + 412 7465 2 65.52 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACATTGGGACTAGTTGATTGAAAGAGCTCTAAGTCAGCGAAATACGTGCGTTGTG:1 - chr3R 24976214 3' + roo 9004 2 64.58 ACTTGGTCTCATATACCTTTATACGATTGATTTCGGGTTGATTACTCGTCATAATGGTTTGCGTACTGAGTTTTCTCTTCATTTGGATGTAGTGATCCATGCCAGTCTGCACAGTCGAAAGCAGCAGACGCCCATATATAAGTACG:1 - chr3R 8296740 3' + G5 4754 1 80.82 ACACACACACACACACATAAACACACAGTGCAAAAAAGGGGTTCAGTTCACTGGTATTGCGCCTTGTTTATTTTCAGGGGGAGGCGGAAAACGGGGATGAAATCAATAAAAGTGAGGAGCTCCCCTAGATGCCATAGTCGCTCCAT:1 + chr2R 12916306 3' + accord 7031 5 66.44 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGT:2 - chr2R 9504227 3' + roo 8991 2 75.34 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGAAAAAACATCATCACCCGCCCAAGGTTCATCTAATCATTGATTAAGCTGATTTTATTAGAAAAAGATTAATA:1 + chr2R 11339150 3' + jockey 4940 1 53.42 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGGGCGGTAGGAATGAAGGGAAAGCTGGGAGGAGTCGGGTGTAGGAGGGTTGAATCAACAGACG:1 + chrX 5206547 3' - Tirant 63 2 60.96 TTGGATGCGTATTAACGATCGTACTACGTGCAAAAGTAAACAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAAATATATGCATACCTGACATACTTTATGTGGTCAAAAATTTTTTCTTCATTGCG:1 - chrX 340965 3' - transib2 234 1 62.04 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCTACCACATCATTCACTTGACCACTATCTAAATTAATCCCGCCCGATCTGGACCTCATGGAGGTCAACTTAC:1 + chr2L 18953136 3' - roo 23 2 57.98 AGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATATATGCTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTATAGGTACACTCATTTGTAGGTGTGAGCATTTTT:1 + chr3R 14958847 3' + invader1 3964 2 54.81 GAGGCCGCTATGATGTTTTTCCCTTTGTTAGCTTATAGTCAGTTCGTTGTAATTATTAAAAATGCCGTGGATGTTCCATTGTAATATAGTAATTGTCATGATTAAAAATTTTTTTTTTT:1 + chrX 13628885 3' + springer 113 2 68.91 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATGGAAAGACTAGGTAATTTATATGATGTCTTCCTGAATTAATCCAAGAGCTTTGTCAATTAACTAATTAATGTTAGTACTTTTTAAGTGTTCATTAGTACTTTACTTGGC:1 + chr3R 24976354 3' - roo 8676 2 76.03 AGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAACACACAATAACTTATACCCTCAGTTGTCAAAGTTAGCATTAAAACTTTTATCAATACCAGCCAGTAGCGCAGATGGACGTGCAACCAATACTTATTTATTAACTTGCTT:1 - chrX 6372856 3' + hobo 427 1 43.84 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAACACTAAAATCTAAGACGTGTCTCGATTAGTTTCGAGTTTTGCTTACTCG:1 - chr3L 20744185 3' + 412 422 2 65.07 ATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGCTGC:1 + chr2R 5321222 3' + INE-1 504 1 61.94 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAA:1 - chr3R 10461685 3' + roo 8999 2 80.00 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTCGCCAATTAAACCTGGCTGTCAATGGACAGGGAATAAATCAACCTAGTATGTTGGGCCCGGC:1 + chr3L 14084970 3' + opus 7462 2 53.49 GACCCATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTGCATGTGTAGCTGTCATGTG:1 - chrX 21585238 3' - mariner2 265 1 67.12 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAATAAAAGTTGCAATAAATTGTAGCATACTTGTGAGCGGACGCAGTTAATTTCTTAGCCTGCCACCTACGACCCATTGGACAATTTATATACCGCTCGCAAA:1 - chr3L 15853452 3' + jockey 4975 1 65.75 TCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCACAAGCAAAGTAATTCAATTTCCCGGCTTACAGCTCTTTTTTGGCCACTGGTCAACGGAAGA:1 - chr3L 3565307 3' + gypsy 7415 2 41.78 GTTATTTCGCTTTTATATGATGGTTGCACTTGGGCTTGAATTTTGCTTTTAAACTTCGATATTGATTTATCTAGGTAAGTGTTCCGGCAGAGCTTAACTACGCTGCCGACCGAGGCGGGGCATTAAGGGATAAAACAAATGCAAAA:1 - chr2L 6295025 3' - Porto1 90 1 59.59 CCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATATGTAAGTACATAAGGATCCCTGGGTATTAAAGGACAAAAGACTGTGAGGCTCGGCGGTCCCAGTTGGCTCGTAAATCAG:1 - chr3L 16875801 3' + Burdock 6351 2 52.74 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATGACTATGAGACAGTTTGCTTGGTTTGCTCTATAACTAATCTCGTTTATCACGATTG:2 - chrX 19113474 3' + 412 7482 2 60.27 ACATTTTTGTAAAAAAAACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAAAAGCTACCTCCACTACCGCCCTCTACTATTTCAGGTGTTTGTGTGTAGTGTCCTAATTTGTACAAGGACTGGCTCTCTAGTTT:1 + chr3L 10564023 3' + hopper 1397 1 69.17 CTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATATATACTTAATATGGTCAGAATCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATTCTCTTTTACTCTACGAGTAA:1 + chr3L 22932762 3' - mdg3 34 2 62.33 GAATACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTTAGTGTATGTGTGTATTACACATTGTGTAACACAGCACAAACTCAAATTCAACAAATCAAATACGCAGGGTTAAATCCGCACATAGACCGCATTTCGATCCG:1 - chrX 11037729 3' - accord 7031 2 77.27 ATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTAT:1 + chr3L 24208224 3' - Quasimodo 45 2 53.42 AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTCGCTTATCGGGTATCCCAAATCTCTGCAAATGATATGAGATATACTGGCTCTGTGCCAAAT:1 - chr2L 13140605 3' + blood 7329 1 59.59 CCATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTACTTTTGGGATAAAACAAAATACAATCTTACAAAACAAAAAGTTAGAATGGTTTAAATTTATGTTCAAAGTT:1 - chr3L 16907757 3' - jockey 57 1 50.00 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTACCTGTTACGAAATGTATGAAATGTTGGTCACCAAGAGTATGGAATTATGACTAAGGATGTCGAATACTGAGGCACGTCATTAACACCAATTATTTGCATACCA:1 + chr3R 4533017 3' - 1360 15 1 76.03 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAACTTGATATTTCGAAATAAGGAACATAGTAAGAAAAGTCGTTCATTATTAAGCCATAAGTGTTCTTCTTCTTTAAATTCAAAAAA:1 + chr2L 5448003 3' - roo 38 2 59.59 GACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTGGAATTTTGCTTTAAAAGGTATATTAAATTCATTCAAATTAGTGTAATATTTGTCGTTCTTAGGCATTTTCTGCCTGTTTCCTAAGTTTGAAGAATATTATGGTATTATTATTACTTTCA:1 - chr3R 18345119 3' - INE-1 549 1 69.18 GCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAACAAGTCCATGTGCAGTCATTTGGTTGTGCTTGGGTCTTTTTTCGAGGGGAATGTGAAAAGAATAGAAAAATGGACCA:1 - chr3L 3339314 3' + Transpac 269 2 54.79 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAA:2 - chr3R 30850774 3' - I-element 82 1 71.23 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTATGCTAATATTAGTAAAATACTCAAATGTCATCTCCTTAGCTTCAACGTTGTTCAGGTTTCTTTTTGAAAGTGTAACCTTCAGAGCTGTCCCCAGCAAGTT:1 - chr3L 24253542 3' - 297 15 2 76.03 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGTTCGTGTTTCTTATCAGTCCAACTACTT:1 + chr3L 5187957 3' - P-element 93 1 26.71 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATAATAATAGCTTAATAATATAATCTTAATAATTTTAACTAATTCCCCTGAGCATAGACTAAAGTATGAATATTATTAAACATTTAAAACTGCT:1 + chr2R 12239865 3' + roo 9044 1 63.01 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGTTCCCACCTTCCACATTTCTACTCCTCCGATCTTAGAAGGAAAGTCCGTAGAAGCTACATATAAATAAATAAATAAACAAGCGTTTA:1 - chr3L 3756036 3' - hopper 33 1 58.90 TTTTCCCTTTTTTTTTGTTTTTCAGGAAGGGGTATTCATATATATATAATATATTGGGTTAGGAAATCGGGGATAAGGGGATAAGGGGATCCCGACGTAT:1 - chr3L 746937 3' - Bica 337 1 74.00 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGTAAACAAAAGTCTGATAAGCAGCAGTCCAAATTCAATTTGCCCCCCATCGATAAGAAAACGAGGG:1 + chr2L 13140711 3' - blood 44 2 51.13 TAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTC:1 - chr3L 20209545 3' - Burdock 6195 2 63.64 AAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTAATACGAAGAAGCTCATTTTTTCGAAAATCCAGCTAACACAGTACGAATTTAGCCAATTCTAGAGTGGCCAACACTAGTCCCACTTAAAAGTGATTT:1 + chr3R 29113017 3' + Juan 4211 1 71.54 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTTAAAAATATAGGTTATATGTACGTTTAAATACTACCTTGGAAATGAATGAGTATTTTACTCAACTTGGTACACGTGCCCTTGTATATTGTTCATCATCCTTA:1 - chr2R 25252104 3' + opus 482 2 69.86 GCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCACTTTGGTGGTACTATCTTGTCCAACATGACATGGTGCAAGGGGCGTTATTTAAACCAAAGGGCATAGCCACGAACTC:1 + chr3L 25059063 3' + Max-element 8319 2 56.74 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCAGCTTACACAAGATTTTGCTTCTTGAAATTCTACCTTAACGTGGGCTAACAAAATCGTTTAGCGGCTAAAATTGCAATTTGCTATGGCGG:1 + chr2L 3648846 3' - roo 8669 2 74.79 GATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTTTAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCATGCAAGCTGTTACTTTTCACT:1 - chr3L 20224102 3' + Chimpo 158 1 65.07 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATAAATATATGTGCATTTGTGTATAGTATATCAGTGTGAAACACCAACGTACAAACACACACTGTCAATCAAAAGGAGTCATCTGTCCCACTAAAC:1 + chr2R 9504347 3' - roo 22 2 65.07 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAATAGTTTATTATATGGCAAACATATATACAACATATACACCAAGAGAAATTGGAAAAACCGGTG:1 + chr3L 5275012 3' - I-element 57 1 56.55 GAAAATACTGGAAATTTGCATATTTTTTCGAGGCAAAGACAGCCAGCCATCGAGGGCGACAAGAAATTTAACAAAGTACAAATTGTTATTTGATTTGATTATATAATGACGCCACACATACCCCATCATCTGCCTTTTG:1 + chr3R 6014073 3' + hopper2 1556 1 68.35 TCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCG:1 - chr2L 22719598 3' - 1360 89 1 80.14 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATAAATATATGTGCATTTGTGTATAGTATATCAGTGTGAAACACCAACGTACAAACACACACTGTCAATCAAAAGGAGTCATCTG:1 + chr2R 9504336 3' - roo 8696 2 57.93 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTGGATAGCTTGATTTTACTTATCTTTAATAATGGTATTTTAAGCTCA:1 - chr2R 9091954 3' - 412 7116 2 69.40 GTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAA:1 - chr2R 4673576 3' + Quasimodo 7294 2 73.97 ACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAACAATGGCTGTCTGTCAGATAATCTAGTTTAAATATTTTATACTTCACTTATTTGTTGTGTTTCGACGAGTTTATTAGATT:2 - chr2R 21425034 3' + HMS-Beagle2 7157 2 59.59 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTTGCGTACACAATTCAACATTATTTGAAG:1 + chr2L 21251003 3' + P-element 2796 1 22.60 GTTCGAGTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATGCTTTATATGATCGGAAATGCAACGAATCTAGGTTACCCTCTTACTCTACGAATAACGGGTATACCAAACACAAGGTGGAAGATAACAGGTGGAAAAGGGGTCATTGT:1 - chrX 21191218 3' - INE-1 96 1 56.85 CGTAAATATTTTGTGTAAATACTTATACATTTGTCGAACTTCTCGTTCGGGGGCAAACGGAACGCATAAACATGTCGATAAAGAATGCCGGATCAGGTTCTGACTTCCCCCCTAAACCTCCAGGGTGTTTGCGACCACCATCAG:1 + chr3R 28380821 3' - Bari2 81 2 80.56 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCCGCGAAGTGGCAAACGTCAGTCAGTACTTCAGCCATTTTCCAACTAGAGCTCCAGTTAAAGGAGCAAAGAACTTGTAAAGCAGAAAGTAAGAAGGTATTGCAG:1 + chr2R 9410602 3' - hopper 15 1 72.60 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTCGGGCATCTTCGGCAATTTGGCCTTC:1 + chrX 21281224 3' - P-element 78 1 24.03 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATACAGTGCATGTCAGAATGAATACGGAATTCCTTGCGGACTTCAAGCGACAAAAGATGAGCCTGTACC:1 + chr2R 12814947 3' - opus 7026 2 58.68 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGTAGACGTACATACATAAGTTATTGCTATGCCAAT:1 + chr3L 22884067 3' + roo 395 1 75.36 CTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGGCAGACGGAGATGGCTGGACCGACACGGCTATTGATCCTGATCTATATACTGATATATACTTGATGATATAGTCGCAAACGCTTC:1 + chr3R 4947762 3' - INE-1 174 1 77.40 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATCTGACTTATCTGACATCTACCATGAAATCCAACCATCAAGAGACCACA:1 + chr3L 16463584 3' + roo 337 2 66.44 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACATCTTGTGCATATAAAACCCCCGGGGAT:1 + chr3L 2184939 3' - jockey 66 1 74.34 AAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACGAGTTCTCATCTCTTGGTTTTACTCCCACAAGCAAGCGTCTTTTTACAAAAAATTTAAAAAACACGAAATTGACATACCTTTTTAAATATTTTATTATTAGTTCTAAATATTT:1 + chr3R 1466934 3' + HMS-Beagle2 306 2 80.00 AGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTCGTACTTTGCCATTCAAATCTCCTATTGCAGT:1 - chr3L 20209514 3' - Burdock 6166 2 63.45 CAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGTTACACGTTCGTGCGAATATACAAATGAGAAGTAGGCGTTG:1 - chr2L 22719557 3' - 1360 41 1 54.68 AATAATAAATAATTATTTAATTGCATCCGAAACTGGATGCTTTCCTGCATATTCATTGTGATAATGGTAAGTTAATTATTATTGCTCGACGTTTATGTACTGCTTGAGCTAAGACAAAGGGAAATCCTTTTTTAATATTGCCTAAC:1 - chr2L 11450738 3' - invader4 2637 1 51.37 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGCTGGTATGAAGAGGAGGGAATGGAGAGGGTGAGGAAGTGGGCCTTTACACGTTCCA:1 + chr2L 18178419 3' - Tirant 8119 2 78.77 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTGCGCATTTTATTTTCCACTTTGCTTGTATTTATTTAAATTTGAGCCCGGCTATATGTATGGGCAGTGGGATATAGCCAG:1 + chr2L 16385360 3' - I-element 38 1 56.94 AAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAATAATAACAAATTCGTATCATGATAAATTGCCAC:1 - chr2R 13212233 3' - diver 88 2 74.66 AAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCACACGATTTTGAGCGCTATAGGCGGCTTTTT:1 - chr2R 9504195 3' + roo 9032 1 54.01 TTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTAACCCAATAAAATATTGTGATTCCCATAGAAATTGTAATGGTTCCATGCTCATACTGCTTTAGGACTTCAGGCTGGGCACTAT:1 + chrX 13277738 3' + S-element 1704 1 72.00 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCTGCCTCTCTCTCCTTCGTAACCA:1 + chr3R 5264886 3' + P-element 2789 1 18.49 GATCAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCGTTTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTTG:1 + chr3L 11826442 3' + INE-1 98 1 67.81 TAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCACAAGCAAAGTAATTCAATTTCCCGGCTTACAGCTCTTTTTTGGCCACT:1 - chr3L 3565320 3' + gypsy 432 2 41.86 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTGTATTTTAATATTTTGTTGATTTTTAAATGAAATTTTCGTTATTGTT:1 - chrX 9437137 3' - roo 16 2 73.29 ATTTATTATTATATTTAAATTTAAATTTCTGCATTCCAGGACAGTCCTCCTTCATAGTAACTGCAAGTGCACGGGGTATGGGTTATTATGGGAAATTTCAACCACTTGTCTGTTCGGGAGTACCAAACCAAACCGGGCACTTTGAT:1 + chr2L 7340175 3' - HeT-A 337 1 65.07 AAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCACACGTCATTGTCATATCATCAAAGACGATGATTAGGGGCGATCCTTGACGCGGTGTTATTATTTTTACAGTTGC:1 + chr3R 21587627 3' + roo 9032 1 56.34 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCTTTTCACGGAGCGTGGGGAAAACGAAATACTCGGGAAAACCTCCTATTTAAAAGATGCGTCTCGT:1 + chr3L 22884034 3' + roo 9020 2 54.55 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGGCTTTATTGTATATCCGATTGCAGCTTCCCGTTGATG:1 - chrX 12998021 3' - roo 8709 2 67.59 AGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGGCTAATTTTAAAGTTCCCATTGCCACAGGCTCAAAATGTGAC:1 - chr2L 11079411 3' + 1360 3312 1 71.92 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAAACCAAAAACGTCAACCCCCCGACGAGTGTC:1 + chr2R 11097401 3' - Juan 4045 1 60.80 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTTGTTTCTAATTTTGGGAATACTCGAAACTCGAAAGGCAAAAGTTTCAGTTCAGTTCAGCTCAGTTTCCTTTGTCGTTCGATTTATGA:1 + chr3R 20074676 3' + roo 9037 1 60.27 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGGGTCTTATACTGTTGGAATGAAATGCGGCCGCGTTTGGATTGAGGG:1 + chr2R 18440487 3' + P-element 2819 1 35.00 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAACTTGATCAATAAAATGCTTGACATGATATCAACAACAGTCGCCAGG:1 - chr3R 30850728 3' - I-element 36 1 60.96 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATAGATACGTGTGGGTTTTTACGTCGAAATCAATAAGTGCTTCTTTCGCACTAATCTGAGGAATCAACATCGAAACTAATTATCGACCTCTGAATAAGGAAGGTAGTG:1 - chr2L 6319689 3' - Tabor 6848 2 72.86 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGGCATTAATTCATTAAGCATGTAGCTTCTACCAATACATATGACTCGTTGAAAAATTTTTCATAGTTTCATAACAACTGTAAAAAAGATTGGCGCAAATCTAATATCTTAGT:1 - chr2R 11562761 3' - pogo 8 1 80.14 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAAGTGTTTTGGGGGTGGTGCAACCGATAAGTAGAGTTGGGCTTAAATCGATCCTAACCTAATC:1 + chr3R 29516574 3' + I-element 5312 1 53.44 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACAGACATTGACAACGCACTTGTCGTCGTTTTGG:1 + chr3L 814989 3' - hobo 73 1 77.69 CTAGCTTTTATAGTTCCTGTGATCTCGACGCTCATACGGACAGGTGGACATGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTCATCAAGAATATATAT:1 + chrX 22545157 3' - INE-1 152 1 68.94 GTGAGGGTAGATACACTACACATTATATATTTTTGTTATTTCGACTGTGGCCACAAAAACTTTGCTCTCTAACTGTGTTTTCTATGCATAAAATGCAGAGGGTATGCCTTTTTTCGCTCAGTGCA:1 + chr3R 29340941 3' - Stalker2 7247 1 32.80 AAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATT:1 - chr3R 9175212 3' - Juan 77 1 65.75 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAGAACGTGAGCGAAAAGAGAGCATGTGGATCTTACTTGAGCAGGATAACAGCTGTTTTAGGTTCATGT:1 - chrX 7967164 3' - P-element 15 1 73.68 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTTTCAATGTCTGTTTTATGTTGTGTTTTTCACAGTTTTCTGTTTGCCTAGCTGCAATTATTTTTACAATGTTATGTG:1 + chr3L 18789164 3' - 1360 4 2 73.29 GGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGATACGCTACGAGGACAAAAGTATTCTACACAAATAGTTGGGATCCG:1 - chrX 13096808 3' - McClintock 6122 2 69.18 ATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGAACTACTGAGTATATATATATATTCAGCTGCAAAAAAATTTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCTTATCTTCATTAGACGTAAACATTTTTTTTATTTTTGATTTTC:1 + chr3R 21894822 3' + Stalker4 84 4 73.97 AAAGTCTACTATAGTTAGAACATATTACTCTGTAAGGCTAATGCAACACATAGTTAGATCTATAATAGTATATTTATATAGTATATATGTTAAAATAAGTAAGTAAAATAAATATGTTAGGTACTATATAGCTTAAAAAGAAGAGT:1 + chr3L 23927250 3' - Cr1a 4199 1 58.22 AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTCCTTTTTATATAATTTACATTTGTTTAAAAAAGTAATCAGTAATTACTGT:1 - chr3L 11903213 3' + opus 7435 2 69.86 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCGTGCGAATGGCAAAACGCATGGGCTGGAAAACTATTGATAGGTTTGCCCAAAAGTATGCTGCAATTGATAGATGACATACTAAATAATTAGAGAGCACACTTTTAGACACCTTCA:1 + chrX 18353636 3' - jockey 25 1 65.75 GCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCCCGCACGTTTCCGGCGAACAACTTACTGATCCACTGAATTTTTCTC:1 + chr2R 1185111 3' + Doc 4587 1 68.49 AGTGGTTCCGAGGAATCAATCGCTCTGTTGAAATTCACATGATCAATTTTCTCTTAGAAAATAATTGCTAAAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAACGAACTCTGACTTACTAGCTATTTGGGAAAA:1 + chr3L 14951342 3' - transib2 2386 1 77.40 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATAATAATTCTTTGATTTCTTAGTTTATTTTTTCAAAGTGAATTACCTTTTTAAATTAGTGGATATTTTATGAGATATCGCGG:1 - chr2R 9874732 3' - S-element 37 2 60.27 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTATCCTAGATACTAATGATACTAACATCAAAGTTTCAAATTAGCCATTTTTGGACTTACAC:1 - chr2R 5268959 3' - pogo 58 1 58.90 TAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTATGTTGCAAATGCATACTATAACAAATTGTTAAGTGTTAGACA:1 - chr3R 10137011 3' + I-element 5279 1 68.97 AAATTAAAGCAAATTTATCATTTAAGATACTTTTTAGGAATCTTTTGTTCCCATTTAATTGCGCTTAATAAAAAAATACTGTTGCTTTTTTATATTCTGTCAGCTCAAGCAGTTTTGCTAAATTTATAGATTTCTTGCAGTGTAGC:1 + chr3L 11409101 3' - 1731 4263 1 39.04 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTATAATCACAAATATATTAAATAAACCTCACGGACTGTGGCCTGTGTTGCAGCTGC:1 + chr2R 9455923 3' - 412 7117 2 61.64 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATACGTATAAAGGGAGTGTGTGAAATGGTTCCTTGAGTTTGTCA:1 - chr2R 9504225 3' + roo 8993 2 73.97 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCTTTGTATTCACAACTTTGAACACTAACATTTAAGTTATATTGCATTTAAGAAAGAAGCCTTAAGAAACCCTTGCTTAAACGTTATCATGTTTGCTAAGAAAA:1 + chr3R 5762079 3' + roo 389 2 72.60 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACAGACATTGACAACGCACTTGTCGTCGTTTTGGGCGTGTTTTATGCACTTGTCGCGGCTC:1 + chr3L 815016 3' - hobo 56 1 60.00 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAGGGTGGTGTAGAAGGGGGGGCAGGAGCTCGAAAAACTGTTTCAATGTCTGTTTTATGTTGTGTTTT:1 + chr3L 18789115 3' + 1360 3336 1 56.16 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAACTTCACTAGAATTAAATAATTATGAATTTATTTTAGGGGTATTAGAGCTTCGAATAGTTCTTCCACAAA:1 - chr2R 21473572 3' - pogo 47 1 52.74 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAAAATGTACAAAATAAATGTACTCGACTGAAAATTGTATTTAAAGAATAATTTTTG:1 + chrX 4823633 3' + pogo 2038 1 65.52 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACCGGTTTTTTCTTTTTGTGTACTCATCGCGCTTCCTTTCCTTTTCCGTTTCATTG:1 + chrX 3660982 3' + 297 335 2 65.97 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTTTCTAGCTTATTTGATTATGGCAAATATTTGGGTTTCTTTTTTTTATTTTTTTTTGTTTAGTTGCCTTTTCTGCACCATGCATACATTATGGC:1 + chr3L 10442945 3' - roo 8692 2 57.53 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCACAGTATACAGTACACAGTACGTAATTTGTCGCTGCTGCGACGTCACTTTTT:1 + chrX 16217521 3' + P-element 2857 1 52.34 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGCCGATTTTTTGTGGTTTCGTTT:1 - chrX 11661398 3' - 297 6635 2 80.18 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGATAAAACTATGAGTGTATTTATTACAT:1 - chrX 11267694 3' - roo 8722 2 58.22 CAAATATACAAATTGTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGCGCGTTGTTTTTGGCATGCACTGTATACGGCATGTTGTATCGCGGCATGACCGGAATTCACATTACCAAACATGATCG:1 - chr2R 16418654 3' + Cr1a 174 1 50.00 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCAAAATATATATCAAATTTATAGTTTTAATTATTTGTAGGCGCCATTGCTTAATTAAAGTACAACAAATATATATGCATTAATTTCCATTGGAAGTTTGAAATT:1 + chr3R 19721217 3' + opus 7488 2 71.72 TTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAAAACAATCCTTTAGCTTTCGAGTTCATTTAGATTAGGGTTATATAATAAGGAATGTA:1 - chr3R 19543373 3' + roo 9043 2 64.38 ACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATC:1 - chr2R 1320667 3' + diver2 4860 2 50.75 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGACTGCCGTGGGTTGGCTGAGTTGACACACTTC:1 - chr2L 9319111 3' - jockey 63 1 69.64 ATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAGCTAAACAAACGTAGAACTATCGATTTTTTGAAAAAAACTTGACACAAACTTAAGTTGCGTGTG:1 + chrX 10651757 3' + gypsy4 443 1 63.70 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCAT:1 - chr3L 13228501 3' + P-element 2787 1 17.12 AAGGCAGAAATTCTGGTGTTCAATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAACCGTAACAAAATTCAAATTGACCTAGAACTAACATAGCCCTTTTCGGTGCCTTTTGTGCTGTGAAATTAAGCAAATAAGCCCGAGCAAAGAGCAACAAA:1 - chr2L 16995475 3' - HB 1441 1 63.70 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATTCGTGAGTATTCTAATCATTTCCTTTGATAAGGTTCTAAGCAAACAATTTGTCATTATATTTCTAGGATTTTAGTATGAAACGAGC:1 - chr2L 7939708 3' - Burdock 6168 2 59.59 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCACGTCGATCAGGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGAGACCGGGGCTATTCTAGAAACCTAACGCGAGTTCAGAACGCTG:1 - chr3L 14551280 3' + P-element 2848 1 57.45 GTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGACCACCACCCATTTGCCATCTTCCCATCTTCCAGCAAGCGCACGCCTGTCATAAATCTTGTTTTGAATGTCCTGCCAGCGTTGATAGCGCCATGGTGAGAGAGGGGGGCT:1 - chr2R 20447744 3' + hopper 1406 2 78.08 CTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCAATACTTTTGTTTTTCGGGATTGGTTGCTTGCCACCCAGGGGCATTTGTGGAACAACCTTCAGCTGGTAGCTATTCCCATTTAACTGTAATCAATTAATTCATTATTATTCGA:1 - chr2L 15205888 3' - Idefix 307 2 62.33 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGCTCTCTAAGCCTAATGGGTACGATTTGAAATTCAA:1 - chr3R 19543429 3' + roo 8988 2 74.66 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGATACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACACCAAGCTTTTAATTACTTACTGCTTTCTAGTCGACCTTTCTCCGGAAGCATCGA:1 + chr2R 11562913 3' + pogo 2042 1 58.27 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTTCTGGCAACTTTACTCTGTCATAAAACTTGGGAACAACAGCGACATTAATTAAGCTAATTGGAACTGGTCCTCGTGTTAAAGTAGTCAGTAAAGTGCACAGATT:1 + chr3L 2278303 3' - roo 8680 2 73.97 AAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGCATATGTATGTACCAGGAATAGCATAGGATACATAGAAACTCAAGTGTGTAATATCAAAACATCAA:1 - chr3R 5430384 3' - Burdock 53 2 56.85 TAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAATTTCGTTTTTAGGGTATCCGAAAGCACTCGAATTCAACGAGCGGGCAAAA:1 + chr2R 11097370 3' - Juan 4096 1 64.38 ACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAACCAAAAAAAAACCAACTGAGAAAAACACATCGTGACCATTTTGATTGCCAGCAATTTTGGTTAACACCTGTGCCATGTGCCATGTGCCACGCCCACAACTGTCGCCCGC:1 - chrX 9506386 3' + jockey 4793 1 73.29 ATTCTGGCATTTATAGAGTGCATTGGACTTCAGGGATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACCAAATCTATATCAAATGTTATTCTGATATATATAGATCACCGACCT:1 + chr3L 16399447 3' + baggins 5341 1 63.01 AAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGGAGATGTATATGAATATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTAAATGGGTA:1 + chrY 2720350 3' + HMS-Beagle2 7190 2 74.58 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTACATCTTGTGCATATAAAACCCCCGGGGATCCAGCAGAACACACAAAAATGTGTAGCATGCTTTTGGGCTTGTGGTAAATAAGAATGCACTTAGCGTCGGG:1 + chr3L 2185010 3' - jockey 17 1 76.47 GTCACCAATTTAAACCGAAGATATTCCCAAATAAAATTAGTATCTTACACATACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGTGATTTTACAGGCAATCAGGGGTCGTATTATGCCGCTGGCAGCGGTTAAACGCTGACA:1 + chrX 17027945 3' + roo 340 2 59.12 ACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCTAAGAATCGATGGAGCTTTTTGTCTGCATTGCGAAGCGTTTCTTTGCTGCCTGCCCAGAATCAAAATCTCGC:1 + chr2R 24983812 3' - 1360 3230 1 53.42 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAGTGACATTTTCCGCTCGTAAATGCACTTTGGGTATGTTTGACCTTTGTTTGGGGTCCCCAGTCATTCCCATCGCCAAGTTGGGGTTATGCAATTGCCCAAAGGACAGAC:1 + chr2L 20324263 3' - Tirant 11 2 77.93 TTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGACCGCCGGCGTGATGCTCCCGTCAGCAAATATCGTACACCTTTTCTTCTTTTTTATTATAAATTTATTC:1 - chr2R 5106935 3' + 297 6965 2 53.42 CCCGCAGCGCTTTCAGAAAATCAAGCGAAAGTCTCTTGTTTCTCCAGAAACTGACTGGAAAAAATTGAATTTGCGGGAAAAGCGCACAGCAAAGGAGAAACGTGGCAGTTGGAAGGGGGAGGAAAACTTTGATG:1 + chr2R 12444598 3' + X-element 399 1 51.49 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACCGATATAGACGCATTGTTGCGTGGAGATTTATCATTGATTGAGGCCATGAAATTTACACTTCAAGTGTCT:1 - chr3L 12899741 3' + roo 9020 2 51.37 CTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCAGCTAAATTTCTAGCTTGTA:1 - chr3L 14944518 3' - G5 4771 1 60.96 CTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGACGATTGGCTGCTTAATTCCAGGAACGGCTTTAAGGATGATGGCTTCCTGGGCAGGCTGCC:1 + chr2R 7260381 3' + micropia 5199 1 63.19 ATCCACGAAACTAAGGTCCAAGTAAAGAGAAGAGAGAGAAGAGAGAGGGAGAAAGAGAGAGTGCGACGGAGGAAGGATGGAGAGCAAAACGATCCGGCTTGGTGGTTAGCTGGAAAACCAAAGTACGACCGAGTCGTGTTG:1 - chr3R 11543207 3' + Fw3 89 1 80.85 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTCGTACTTTT:1 - chr3L 20209537 3' - Burdock 54 2 58.90 TTAGCAATTATTAATTATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTAAAAGCCTCACTAC:1 + chr2L 15322960 3' - diver 279 1 48.63 CGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGA:1 + chr2R 4677361 3' - invader3 5241 2 53.42 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATATATTTTTCCCCCCCTTCCTACGTCCATGTTTTTAGAGCAAAACGCGAACGTGAATTGTACTTGGCGATAAGTACATGAAAT:1 + chr3L 11903340 3' - opus 141 4 59.59 CTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTCCTTTTTATATAATTTACATTTGTTTAAAAAAGTAAT:1 - chr3L 11903226 3' + opus 419 2 78.77 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCCCCCAAATACGCCACTCTATAATATCATTCGTACAAGAAATTCCTCTGCAACTTTCAATT:1 - chrX 22676359 3' - 297 35 2 59.00 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCAGTGCCTTTTCCACCAATGAAGTCGTCCGACCGTTCAGTCGTGAATCGGGCTTTCAACT:1 - chr2L 13717288 3' + P-element 2835 1 44.44 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTAACTAAAGTACTTAGATAAATAAACTGGGACATTCAGTTTATATAAGCGTGTTC:1 - chr2L 20556421 3' + 412 7480 2 64.38 ACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGA:1 + chr3L 12861785 3' - pogo 87 1 78.77 CCTCCACACACACACACACACTTTT:1 - chrX 19006097 3' + accord 255 2 88.00 TCCGTTAAATATTCTTGCATATCAAGTTTGACAAACTTTTCATCAAAATTAAATTTCCCGCTCCCCTGAAGATGCGTGTGCAAATTCCCCAGTAGCTAATCAGGCAAGCCTAAGCGAATTTGCTCGGAAAATCCGCCAAAGTCACT:1 + chr2L 11493250 3' - Helitron 113 1 75.34 CTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATAAAAATTTTGACAGTACAGGCATCGTTCATTTATCTTTAATAAAATAAAACATTAATTATGCAGCTTTAACGCTCAAAAGCTTA:1 + chr3L 13166345 3' + I-element 5318 1 57.53 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAGTGGCCTCTTAAAAACCCATGGCCACTCTCTCACTCGCACACATTCG:1 + chr3L 5179222 3' - P-element 74 1 34.03 ATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTT:1 + chrX 1018152 3' - 1360 243 1 69.18 CATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACGCTGAAGAAGGTGTGCGCCAGTCATATATGAACATCGAAGAGATGTGCCTGGAATTTGCCATTAATTAGTCTGC:1 - chr3L 20176727 3' - gypsy 30 2 55.38 GTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGTAGTCCAGTTTGTGTTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGGGTGCAAGGCAAATATTTACACTCAATGGAACATAATAAAGACATTA:1 - chr2R 9934136 3' - Rt1b 4966 1 52.74 AGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTAACTCTCAAGTAGGAGAGATACAAAATAGAAGGAGTTGCTGGGG:1 + chr3R 29091380 3' - rover 69 2 65.75 CTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCATAAATAAGTGACTCTTGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGATGTTATTGTGTATCCCGTTGTGTATGTGTGTTCAACGACTGTAAAAGTTAATGAGAAT:1 - chr2R 7017827 3' + roo 487 1 58.90 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTCTTATTAGCAGTATTTGTTTATTGTTATTATTGTTTTGTTTTATTTGTTATTGTTATTAGCAGTATTTGTTTTATGATACAAC:1 + chr2R 17187816 3' - roo 37 2 46.58 AAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGCCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAACTATTTAAAGTAAAAACCACCGAAATTATCTGATATTTTGGTTGCTCAAAAC:1 + chr3R 2208419 3' + 1360 3318 1 66.44 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACTTTTCACTTCTTTGCACGGTGGGTATTTTCCTCATCATCTGTTTTTCGAAGAGCTTTTCCGCCGCTGCTGTTTTGTTTATGCTTTTCCC:1 + chr3R 4662057 3' - roo 31 2 64.38 TGGAGTCCCTAATGTAAGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGCTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTA:1 + chr2L 22684586 3' - transib3 85 1 63.70 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACCCTTTTACACTTGGCGGGTGGATAAACAACAAAATTAGCATAATTATGCAATCTACAAACGCCTCACACTCATTTCGCTTGCAAAATCCAAATAGAAAACTTTTTAGCCG:1 + chr2R 16496722 3' + hopper 1408 2 78.08 AAGAAGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGCTATTTCCAAATAAAATCAGTATCTTACAAACACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTAACGAGCTAATAAACAGCTCATGTTACAGATATG:1 + chr3L 13827457 3' + roo 8988 2 71.03 ATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCAGCCTCCGCGGGGAGTCCTCAATTTGAGATGACGCTATTGCGTTACTTAACAGCCAAGCAAATGAGTTAACACCTGGACAGGTAGAACTAAGAGCGTGCCAC:1 + chr2L 17725815 3' - jockey 4972 1 79.07 ACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAATCTCATTTCAAATCACATGTTCTACATGCAAGTGCACACCTGCCCTTGAGTGACCGGTAAAATCTCCGCAAATA:1 - chr2L 9347451 3' - opus 9 2 68.42 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGTGCGTATTTTATTTTCCACTTTGCT:1 + chr2L 16385305 3' - I-element 51 1 76.47 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCACTGGCTCTC:1 - chrX 16526282 3' + P-element 2838 1 40.52 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTCTAAATTAGCATTAGGACTGAGTTTTCCTAAGTGCAAGCACTGTCTTATCCTTATTGCCATCTCGATTCCTGACTCAACTGCTGCATAATTTATAACTATGACACTAG:1 + chr3R 8914406 3' + pogo 2095 1 79.29 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGTTCCCACCTTCCACATTTCTACTCCTCCGATCTTAGAAGGAAAGTCCGTAGAAGCTACATATAAATAAATAAATAAAC:1 - chr3L 3756045 3' - hopper 42 1 52.74 AAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCGCCCCTTTTAATGTATTCCGAAATTGCCTTAACAATTCTTGCCTTTCT:1 + chr3R 26244710 3' + copia 5063 2 63.16 GGGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGGTACACG:1 - chr2L 22719591 3' - 1360 75 1 72.66 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAACACTAAAATCTAAGACGTGTCTCGATTAGTTTCGAGTTTTGCTTACTCG:1 - chr3L 20744185 3' + 412 443 2 59.20 CAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTTTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAG:2 + chr2R 2875239 3' + TLD2_LTR 105 1 65.75 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACAGACATTGACAACGCACTTGTCGTCGTTTTGGGCGTGTTTTATGCACTTGT:1 + chr3L 815008 3' - hobo 52 1 62.50 CGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATTCAACTTAACTTATTAAGTTTGCAGTAATACCCACCGATCGATGGTCATTGTAGGTCAGGCTGATGCGGCTGTTCTTC:1 + chr2L 13690105 3' - Doc 14 1 64.55 GCACAACACAAAAACAGTACAACTACACATATATTAATCTAAGATTGCAAGCCATAATTTTATCATTTCTTATCATGCCAATTTGTAAAGATATTTTTATAAATATTTTTCCGAGTGGAAAACTAATGCGGCCCCCTTGAACCGTA:1 - chr3R 27988431 3' - transib2 329 1 78.77 ATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGGTATAACTATTTGGAAAATTTTACGGTGATCAAACAAAACTGCTT:1 + chrX 23182945 3' - Idefix 23 2 56.85 CAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATGTATCCTATTCATTCACAATTCAATAACTAACTATAGTGGCAAATACGTCAGATATTAGCCAGATGGGTGCCTAGGTAATTCATCTGCTGGCTACGTTTTCGGTGTCCTGTGTTG:1 + chr2L 5711070 3' - HMS-Beagle 6794 1 79.31 TTGGTTGTGCACTAAGTTCCCATACTGCCAACCTGGTACTGCGTTAAACCACCCAGACATGCGATTGCATTTGGAGCCAGCAACCAGACTTCCCCACCCACGTATCATTTGTCATTGTTTTCCCAGTGGAATGG:1 + chr2L 14173994 3' - Burdock 6035 1 58.96 AGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTT:1 - chr3L 23456277 3' + gtwin 7350 2 60.00 CCTAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACCGGTTTTTTCTTTTTGTGTACTCATCGCGCTTCCTTTCCTTTTCCGTTT:1 + chrX 3660977 3' + 297 328 2 67.81 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAATAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACAGACATTGACAACGCACTTGTCGTCGTTTTGGGCGTGTTT:1 + chr3L 814997 3' - hobo 79 1 72.92 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCATAATCTGCAATAAAAACACCAGCTGACAGCGGGCGC:1 - chr2L 20986532 3' - roo 83 2 76.71 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTTGCGTACAAAATTCAACATTATTTGAAGGTCGTCCTTTGCTTAT:1 + chr2L 21251019 3' + P-element 2818 1 36.43 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTTGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCGTCGGCACAGGTATTCCACAAGATTCTGTTATTCGCT:1 - chr2R 18440424 3' - P-element 83 1 29.45 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGTGTCCGTGCTTAACGCGCGGGAGAGAGAACGTGAGCGAAAAG:1 - chrX 7967215 3' - P-element 78 1 32.41 GATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGGGCGGGTGGATTATGAATCAAAACCGGTTCAA:1 - chr2R 11339088 3' - jockey 96 1 74.66 CGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATCTTGAGTCTTGAGTCTCTGCTCCCATTTCCCTTCATTTGAGACATTGCCTAATTAGACTTC:1 - chr3L 16703777 3' - FB 9 1 68.09 AATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCGGAAATGATCATCCAGCTGCCACATTCTGCAGTTCGCTACATAAATGGCGGATACTATATATTCTCAGTAGCTACAACTTACATAACGTACAGTTTAGC:1 + chr2L 17177491 3' - Stalker 24 4 37.67 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAAAATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGGACCGTTTTGTTTTGCTCGTTTCACCGCCATTTTACAACTTTAGCTAATTTTAAGAATTTTAGAAATCTT:1 + chr3R 5316664 3' + Juan 4186 1 63.01 AATAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAATAAAAAATTTCCTTTGTCTTTGTTTTTGTCATTGCCTTTCC:1 + chrX 22084310 3' + BS 5009 1 97.26 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTTAATTAGTATTAAAATACTGCAATTCTGTACGCATATTT:1 + chr3R 32032089 3' - 297 6629 2 70.69 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACCGATATAGACGCATTGTTGCGTGGAGATTTATCATTGATTGAGGCCATGAAATTTACACTTCAAGTGTCTCGTGAAAATGCTTTTCCTATTTTGTCACTTCGGAAA:1 - chr3L 12899705 3' + roo 393 1 69.86 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTACCAAGCCTATTTACGGTTTAGCCTTTCGCTCTTTATTTATAGTTGTTGGCTTTTTTTTAAATCGTCGTGTGTAT:1 - chr2L 7449678 3' - roo 28 2 62.20 CCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGCATTATTAATAGAGAATGTCGGCGGCTAAACTCAACCACATATACTGAAAGCACTCACATACACGCAAAAGGGATATAAAAGCAA:1 - chr2L 12548823 3' + Tirant 457 1 64.38 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTCTACATCGATTGAATATTGCGACTTATCCCAGTTAAAAATTAATATTTGGTCAGGAATTTCACCAGCTG:1 + chrX 22676457 3' + 297 6930 2 54.11 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCATATCAAATTTATGTCAAGTTGGCCAATTTTCAACAGTAAAAACGACAAAGAAAAACTCTACGCCAATCAGTTAGCAAAAAAAATTAGCACCAATTTAATTTT:1 - chr2L 3648672 3' + roo 9055 2 73.79 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTCTATGTATGTACGATAAGATAACTGGCATGAATCAGTGTTCAGTGGGTTGTCCTATTATGTTCTCACACGTTGCTGCATGTGTGTGCCTG:1 - chrX 15019674 3' + S-element 1707 1 74.79 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACACGGAGTGTGCCATCGGAACTTGCCCAAAACAATTTAAAATTACCTCACGTATATGTGTGAAATTGCGA:1 - chr3L 13366088 3' - hobo 54 1 52.74 ATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGGCTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCACCAAGTCGCACTTCACAGCTGCCC:1 - chrX 13116313 3' + roo 8909 2 72.63 CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTCGCAGGATCAACGGGGAAAACCTCAGCAGCATTTAGCAGCGATGCATAAATCATAGCATACTTAACAGGGCAAACACGCGCGGATGG:1 + chr2L 14889058 3' + hopper 1385 1 64.83 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACAATGAAGGGGCATCCGTATAAGCATAGCCAGTAATGTCTCCGTAATCATATTCTTCGGTTGCTGCGGAACTCGGCTGATTTAAATCGGACGACCTTC:1 + chr3L 23448771 3' - HMS-Beagle2 6923 2 72.06 TGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCAAAATATATATCAAATTTATAGTTTTAATTATTTGTAGGCGCCATT:1 + chr3R 19721151 3' + opus 7430 2 71.92 TTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGACTAATCGTATGGCGTGATTACAGCCAAAGCTGAAGTCAGTCACAATTTTGATCTGCGAGAATCATATCGGGCCATCACCATCGACTGGGAAT:1 + chr3R 30150356 3' + 3S18 150 2 78.77 AGGAACTGTAAAAGCGAGAAGGTTAAGATTCAGGATACAGATTCTAGAGACATAGACGCAAGTTTGTTGACCCATGTGGCCACACCCTCAATAACGCCTACAAACCGCAGAAAACTGCCCCGCCCACACTTTTGAATAATGTGTTG:1 + chr2R 5212079 3' + INE-1 156 1 71.92 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAGATAACGGGGCTTATCTGAG:1 - chr3L 13228461 3' + P-element 2864 1 59.63 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAAACGACCTTGCACAAACCAA:1 - chr2L 21250977 3' - P-element 103 1 15.75 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTGAATGCCAGTCTTTCTGGTTTTTTTTCTTTTTGTGGCATTTCCGTGATCCTTGCCCCCGGGAGGCTTATGAAATGCAAATTACATTTCAATAGCGCG:1 - chr3L 18199916 3' - Doc 35 1 60.96 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTAATAAAATCCATAAGCATTTCGAAAAGTTTGTAGCATACTTTTTGGG:1 - chrX 9508109 3' - jockey 4750 1 69.86 AGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAAAAGGGATATTCGTTGCCAAGTATG:1 - chr2L 22113005 3' + 1360 3285 1 65.93 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGATCACCCAAATACGTTACTATATAACTTAATTTGTATTAAAATACTGCAATTCTGTACGCATAATTCATCAACTAGTTAAGTTCATTGTAATCTAAGGCTG:1 + chr3R 32032124 3' - 297 6602 2 62.10 TTTCCTGAGATCTCGACGTTCATGAGGACAGATCCTGATTAAGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTACTTTTCCCTGTTACATACATACTTTTCAACGAATCTTATAAACCCTTTTACTCTACGAGCAACGGGTATA:1 - chr2R 5249885 3' - INE-1 140 1 75.34 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATCACACAGAGAAGTGAGAGCGCAAGAGAGAGGGCACTGGCTCTCTCTGCG:1 - chrX 16526276 3' + P-element 2828 1 38.64 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAAGATGGATTGTTCGAAAATCAGTCCTAATTTTAATCAACAAATGCATACTGATCTGTATTCACAAGC:1 + chr3R 8183502 3' - Doc 48 1 49.25 ATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAACAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAAACACTATGCTGGTTGTTCGCTCAATTAGCTGTCAATTAATTGAT:1 - chr2L 16653204 3' - S-element 1581 2 73.97 TAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGCGCGCTGTTTAAACTAGGACAATGCTAGGAAAGAGAATAACTTGATATTGTTTGTTCGGCATTTA:1 - chr3L 13156703 3' + transib2 2762 1 60.27 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGAGTCATAAAAAAAAACAAAGCGAAACGAAAGATTGTCTATTAAGTAATATTCTATTGTAAACTGTGAATTATACGATTCGCAAAAT:1 - chr3L 7790636 3' + copia 220 1 57.53 CTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAATAGAGTAATGTGGGTGAGGTCAATACAAACCTATGAGCTACGTCAG:1 + chr3L 18034644 3' + Transpac 239 2 69.18 AGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTAATTAAATGGAATTCATAGCAGGGTATTAAACGGCTGTGGCA:1 + chrX 20607074 3' + I-element 5290 1 65.93 TTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGGTTTTCTCGGGATGGGTTCAGATCCAATGCGATCCGATGCGATGGGATGCC:1 - chrX 2580462 3' - jockey 4727 1 62.41 CGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGGCATTAATTCATTAAGCATGTAGCTTCTACCAATACATATGACTC:1 - chr2R 11562827 3' - pogo 74 1 68.49 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCAAAACTGAATCTTTGGTAAAATATTTGTCGAGCCATTGTCGTCACTTTGCTCAACGTGGTT:1 + chr3R 19543508 3' - roo 38 2 52.42 ATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTGGCGATGTGACTGTTGAATGCATTAGCAATTTCTATGGCTCGTA:1 + chr3L 18738143 3' + Bari1 1662 1 61.74 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTTCTGCAGCGAACCAGAGGGACCATACTTGTGGAAGGGGCACTTGGTCACCC:1 + chrX 6974875 3' - jockey 4809 1 61.36 CTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGTGGCCTTTGTTTAGCG:1 - chr2L 14490150 3' + P-element 2788 1 15.11 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACATTACATATATATGTATATATCCATATCCATATAATACACATCTTCAATGGAGTATGCGATGCGAATATTTAATTGCATAATGTGACCAGACTGACAC:1 + chrX 11661512 3' + 297 375 2 73.29 TAAATAGTGTGTTAGAACGAGATGACAATGTGGCACACGCCACTGAGCAGGGGAAAGTTGCGACGGTGGGAGATATACCGCTCTTCTTTTTGCAAAGCCAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAATAAAGGAAACCGAAGACGG:1 - chr2L 22218247 3' + invader4 149 2 70.55 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATCAGGGGTTGTATTTTGCCGCTGGCAGCTGTTAAACGCTGACATCTATTGATTTTGACAATAAAATATGCGTTTCCAAAAGAGAGAT:1 + chrX 17027989 3' + roo 9046 1 70.50 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACACAAGCCCGAACAGCTGTAATCCTGCATCGCATTTTTTTTTAAAGCTTTCCAGCTGCCCTTCTAATCCTCGCGTCCTCTCGCTCTCGCACAT:1 + chrX 7967325 3' + P-element 2857 1 64.38 TGCCAGGACCTGGTTGACTCCATCCCAAAGCGTTGCGCCCCTATTATTGCTAATAAGGGATGGACTACCAAATATATACATATATTAGTGGGATGGACGCAGTTTTAATAGGCAATTTAATATGCGTTTTTTTATGAGGTAGTAAT:1 - chr2R 8106978 3' + Tc1 1277 1 54.79 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTCTACAGCTTCCTTACGTATAACTCTTTAGAATGCCAATGGCGTTTCGCGACATAAGCTTGATAAATATGAGTATTTTTTTAAGCCACAAAAGCTATCTATGCTGGCGCATTT:1 + chr3R 17169803 3' + roo 9054 2 65.07 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCACGCTCTACGCCATCGGTGGAAGAAGAAGAATGAGCAG:1 - chr2L 19158851 3' + P-element 2814 1 25.58 CGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGACCGCTGTCAAAAAATGGAGTTAATACACATTTAACAAAAGTTTAATGAGGATTAACTACATTTTTTGACAGCGG:1 - chr3L 25802929 3' - 1360 3359 1 46.09 GTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATATCATTTCCCTCGTTGGCTGAAATACACGCTGCTTTAGTGGATCAGATGTGGCTATAT:1 + chr3L 18617111 3' + Doc 422 1 58.99 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTATTAACAAGCATTTCTAAAAGACCTTCCTCCGTTGA:1 - chrX 11267720 3' - roo 8748 2 76.03 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACTAAGCACCCACACAACGTAAGCCATTGCCATTTTGTAGCATACTTTTGTGCGCGCCTCTGTTTATGCGACTTGTAAACTTGGTCTTCTGTGCCTGGCCCTGTTTGTCC:1 + chr3R 16530710 3' - hopper 4 2 78.99 AATTATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTTAAACATATTACTGTCGAATATTTTCACTTTATTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGCTGCAACAGTAAAAGCCTCACTACAGAATAAGAAGG:1 + chr2L 15322972 3' - diver 267 1 56.85 TGTGTGTGTGGTGTTGTGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTCTGTGCAGTGGAGCATCGTTTTATTTATGCTCATAATGCTGTGCAATGAATAATTATGCAAATGTAGCGGCTTATGGTCA:1 + chr2R 12839582 3' - gypsy3 415 1 75.34 CGTTACTCAGCTAGTGTAAATGTGAACGCGAAATGGTATCATCCTTCTGTGATATCGATAAAATAATAAAAAGGTAAAACATTTATAAATTGCTTAAAAGGGTGGGTGTGACCATTTTGGGCATTTTGTAGATGAAAGAAGGGGCG:1 - chr2R 5789340 3' - INE-1 535 1 39.73 CATAACAGCGCAATTAACATGTAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGCCTCAACACGAGTAAAACAAAACGTAATTACAACAAGGACTTTT:1 + chr2L 9861368 3' - BS 5037 1 68.49 CCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAACCTTCTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAATTAGTGACAAATTTATCAAAGTGACTCGCCAGTCACTGACCCACTGCCCACATGCAAATGAGT:1 + chr3R 31316064 3' + Ivk 404 1 74.66 CTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTAATATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTATATTAAAAC:1 + chr3L 24208198 3' - Quasimodo 71 2 70.55 AAAAAATAAAATAAAAAATGGGGTATTCGCATTAGTAGGCCCACAAAGAGGAAGACAGACTGGTAGACAGAGGAATTTTTATGGCATTTCTCATGGTTCAAGCTCACACTTACACTTCCTCCCCCAAAGCACACACAACACACACA:1 + chr3L 12054514 3' - hopper 140 1 72.60 CTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACACTCATTTTCCTGCGCATATGAGGCATATTGTTATTGCACA:1 + chr2L 12210973 3' + Tirant 8141 2 71.01 ATTTTGTCGTGGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTACTCTTCAAGATTTGTAATATTGTAGCTTTTGTATTTTTGTTTTTATTTCAATAAATAGTATTAAGCGT:1 - chr3R 22545569 3' + Circe 6981 1 53.42 GACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATTCTTCTTTATAATGTTAGAGATAAATTTTAAGTAAAATAGAAATGATATATATTTAAACGTTCAATATGATTACCCGTTTTTAATAAAGTTTCTTTGTCTTGAAATAAGCAACTAG:1 - chr3R 9175118 3' - Juan 2 1 78.57 TCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTTTCATATACCAAGGAGCCCATACCTTGCTGGTGCCTTTGCAGTT:1 - chr3L 13365571 3' - jockey 4616 1 73.00 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAACGATGAAAGTTATAACGAGAATCATGAACTCAATAAAGTAAATAAAGCAAGACAGGAAGCAGGAATTATATGAAATAAATTTCTAAGTCATAAAGAACTTGCT:1 - chr2R 12813632 3' + roo 392 2 54.11 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGGATTGCAAATGACTTTCGATTTTAAATTAAACCATGGCAAAC:1 - chr2R 12814845 3' + opus 424 2 70.55 AATTAATTTATTTAATTGATTATGGATAAAAGGTCTTATAAACTTAATTTCAAATTTATGTCGCGATGTTGCACCAAAAATCTTTAGTTGGTCTTGTATGTTGCAGCAATTAGCTTTCAACAGTGGTCAGTATTCAGTGCTGTAAG:1 + chr2L 15118212 3' - jockey2 3377 1 78.77 TTAAAATATTTTAAAATATAAATCCTTTTAATTTGTATTTTAGATTGTATTAGCCAAAAGGCCTAGCTCTTTATCTGTACGCAAACACACACACGAAGTGGAGATCTGGACTTCTGGTTTCGGGATGTTAGGATGCTGGTGCTGCC:1 + chrX 7891267 3' + 1360 3035 1 50.00 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTAATATGGTGAATCCGGCTAGTCAAAGTGCATTGCGGTTTCGGCCAGGTC:1 - 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gypsy 37 2 57.53 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTCATATATAAATTAGATTCCCTCGCTCAACGACGCGAAAATTGCTGTGTGTACGACTCTATCAAATATGCAAAAGAAAACGCGAGTG:1 - chr3R 23668396 3' + pogo 2069 1 63.19 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACAAATTAAAGATCAGAGACACGTTGAAAAGGGTTTAATTTTGGCTAAAAAGATTGCAGATGGCTGGCGATTACATTTAAGCAGCAATTATTCTAATTGAA:1 - chr3L 17206871 3' + I-element 5332 1 69.18 AAACAAAAAAAAACAAAAAAAAAGAAAGAAAGCGAAAAATCGGGGCTGCCAAGTTTTTTTTTTTCGCGTCCACTACAGAGTTATGGGGGTCAAAAAAGGACTAGGGAAAGCAGGTGGAGATCAAAGGATTTCCCAGGACTAGAGTT:1 - chr2L 2547850 3' - hopper 144 111 69.18 AGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATTCCTTTTTACTTACTATTCGTATTTTTTGTACTTTAATG:1 - chr3R 5024835 3' - diver 5971 2 75.34 AAAAGAAGAAAAAAAAGGGAAAATAAAAGCAAGAAAAAAGAAATATTTATGCATAAACAAAAATGAAACGCTTAGCTATAAGTTAAATAAACAAAAAAAAACCTATATATAATGCCAAACAACGAAACCACACAGCAAAAAGCCCA:1 + chr3R 10512280 3' + Doc2-element 246 1 65.07 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATACCTATATTTCGTAAGGGTTACAGGAAAACATTGGACTCAACGGACCTCTATAAACCCTTGGAGGAGCAAAAGTCGGGTAAGAAATTTAAATAT:1 + chr2R 9391047 3' - 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micropia 5088 4 51.37 AAAGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATACAAGTTGTCCACGTACATGTTGATATACAAATTCAAAACTCCAATCTCAGCAGCAGATAAATAA:1 + chr2L 21657077 3' - invader1 47 2 75.34 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGAAAAGAGCAATTATATTTCGATTCGTATTACGGATGCGTAACTC:1 - chr3R 30850771 3' - I-element 51 1 61.86 ATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCCCTGTGCATATACATATGTACTCGTATGTATGGCATGTAAAAACAATCAGGACAAGATCTTCAGGCCCGCTTGGGTCAGTTGGTTCCCTCATCTTCCTTTCTGTCGGC:1 + chr2L 15906150 3' + Tabor 471 2 75.34 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGTAATGGAAATGAGTTAAAAAGTGTTGGCCTTTAGCCTTTCACATATGCTGGCTGGTATGAAGAGGAGGGAATGGAGAG:1 + chr2L 18178390 3' - Tirant 8113 2 77.48