Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score ATGCAAGAGCAGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 11609194 5' - roo 9041 1 59.40 GCAAGCGTTGGCGAGAGCAGGGCAAAAGTTTAAAAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3L 13634177 5' + 297 39 2 59.59 ACGGCCAATTAAACAGTGCTGATCGCAGACCAGCCATCGTTTTTATACCCGTTACTCATAGAGTGAAAGTGTTTCACTGGCAGGAGGGAGCGTTTCCGACCATATAAATAATATAAATTCTTGATCAGGAACAATAGCCGAGTGG:1 + chr3R 31045664 5' + INE-1 93 1 80.00 TTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATGTCG:1 + chr3L 9571669 5' + jockey 4540 1 67.12 TTTGAATAATTTTTCCCATATTTTAACTTTTTATCAAGGCCATGAAAACCAGAATCACTTGAATGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTACAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 957958 5' + roo 42 2 52.67 GCCTGACACATTTTTTACTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCACAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - 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Tabor 7288 2 60.27 CGATGTTATTTTTATTTCACTGCACGCACAGCAACAACAACCATCCGTCGAGGTGGGTGACTTGAGGTGCGCACTTATCAACGTGCACTGCTCCAGGTTCGTCGAGGAGAGGGCGCAACTCGTGGCG:1 + chr3R 25295453 5' + Rt1a 4621 1 62.20 AAATATCTAAATTGTATAAACTTAGATCATTTTTACACACATCGTGCTGAATTTGTAATTAGTTATAAAGTATCTCAGCTTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chrX 19537015 5' - roo 9031 1 56.16 GCACACACACCATAAATTTTGATTTTCGAATATCAGAAATTGAATTGGTAAGAGCAGTATATCTTCGTCTTACCCACCCCGCGGTATGGCCGTGAAGCATTGCTTCGTGAAGACGATCAAGATTTGCTTT:1 - chr3R 30893399 5' - Rt1c 5305 1 58.46 TGATGGTGGTTATCATTAATATCAATTTCGTTTTCAAGATTTCTAAATTTAGTGCACTGATTGCTATCATCAGCAGTCGCCTTAGTCTTCTCAGTTTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTA:1 - chr3R 17662136 5' - mdg3 5163 1 63.01 CGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAT:1 - chr3L 27415297 5' + transib2 79 1 71.23 AATTGCAGCTTAACAAATATACATAAAAAAAAAACAACAGAGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCT:1 - 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412 7501 2 52.74 CTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAAGGTAATTGTGATCAATCACA:1 - chr3L 19349985 5' + jockey 69 1 59.20 GCATTTGGGGAAAATCAGCGCCTGGCTGGCGTCGTTTTTCGACGAAGTTGATGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAG:1 + chr2R 12121543 5' - Doc 458 1 71.83 GAGTCGCGAAATGAAGCAGTATGTAAAAGAGTGGGAAGGGAAAAAGCTGAATAAAAAAAGGGGCGGCCAGAGCTGCTAGCCATCTAATTTATGCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTA:1 + chr3R 24992193 5' - P-element 135 1 59.72 ACTGTCGGCTTCTATGTTAAGGATATAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 - chrX 3099142 5' - P-element 2816 1 23.14 CAAACAAATGCTGCTATGTTCATCTACCTATTTTCGCTATATAAAAGCTTAGTGACTGGCAATAAATATAATCCTTTATATTTATAAAATATTAAAAATAATATTGATAATTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAA:1 + chr2L 15918440 5' - X-element 4701 1 72.60 AAAAATAAAAAAAATAGATTTTAGTGGGTAGAGGCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCT:1 - 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Tc3 1620 1 76.71 TGGTTCTCAACTGGTTTTCTTGAGTGTTGTTTTTTTTTT:1 - chrX 3319695 5' - Penelope 634 1 61.54 GGAAAGGCGGAAAATTTTAAGGCAAGATATCTAAGCCACGGTCCAAATAGAGAAAAGCTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chrX 12866388 5' + roo 19 2 63.46 GGCTTGGAACTGTCCACTATCCGTGCCCCTTTCCCCTTTTAGATGGAGGTACTAATTAATTGAGTGCTGGGAGCCGCTCCATGGTAGCAAAGAAGGGTGTTCACACATGAACACGACTATATTT:1 + chr3R 31521504 5' + roo 6 2 75.00 GGGTACAACATCGAAACAAGAAATGGTGGCAAAACTAGAACATGCAACAGAGGATGCAGAGGGGAATATTACACCGAAAAATGTTTCGAAAACGACACGGACCGATTCGATTCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATGTA:1 + chr2L 22030211 5' - Idefix 61 2 75.34 CTGTGGTTACAATGTAATAAACCTTGACAAGCTTCAGATGGGTTTTTTGTTGGTCGCCGTTGGCGGAAGGGGAGCTTAACCGAAAAAAGAGCATAGACAAATTTAGGCAAAAGGCGCTACTAACATCAACTTAATTACAGTTTTG:1 - chr3L 3397152 5' - transib3 467 1 59.31 TTTGGTTAAGTGCGCTTAAAATTGAAGAGTATGACTGCTATTGGGAATTTAAAATGATTAACTGCCAATCAATCAATTGTCAAACTAAACTTAAACATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 14964750 5' + roo 22 2 70.14 GCAGAAAAACCGAAATCTCAGCAAAAAGACGACGAAACCGGAAGGGAAATACACTTTCGAGGTCGATCTTTAAATAACTTCGAAACATTATACATATATAAGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 - chr2L 14248146 5' + I-element 21 1 69.66 GTTGTGTATGTTGCTATTGTTGTTGTTAGCTGCCATGCTGCGAAATATTTCTGCAAGAGCAAGGTAAACAAGCAACGCTGCTTTACGCTGCCCCTATCTGGAGCTGCAAAATCGTTTGGGATGGCCAATCGAAACGATAGATAAGG:1 + chr3L 20784572 5' + Rt1a 4764 1 51.37 CGCACTCCAGCCAATCAACAGTTTGCCAGGCCTTTCCGCCGTGGTGAGTTTCGTTGCTCTCCCTCTCACTTCGGTGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAAAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCA:1 - chr3R 18121708 5' - R1A1-element 265 1 50.68 ACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chrX 5150362 5' - roo 8993 2 73.79 AACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chrX 12138944 5' - roo 336 2 68.49 TTTGAATCGTTCCTCGGCCTGACACATTTTTTACTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 - chr3L 22978681 5' + 1360 12 1 76.71 ATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - 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chrX 16405038 5' - Doc 4654 1 65.07 TAGGCTAGAGATGACCAGATCCAGTGAATTGTCCTCAAACTGAAAGGGATTCTCATTTAGACTTGCAACTTTGGCCTTAGTAGCTTAATTACCCACATCCAGCTCAACAACAGAAAGTAAGCATAGTTCTCAATATTAATATTATA:1 - chr2R 13984215 5' - Stalker4 6894 2 67.12 CCACTTTTAAGCCAAACTTGACTCGTAATATGTGTGTTTCGTACAGAGAACGAAAGACCCAATGATCACGTGTTATCGGTATCAACAGCTACATTCGGCTCAAGTTACTGCGAACAACTCAGCAG:1 - chr2L 19157437 5' + G-element 221 1 54.40 ATATATGAACATTGGACCTTGAAATACTTATTAAATGTTGAATATCTTTTAAAAAATTAGCATCAGCATATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr2L 17136279 5' - hobo 2917 1 73.29 GCATTAATTCTCGAGGAGCGGAGAACTTTATTATTGATTGGCTGGTAAAAGGGGTTTTTGTTGTCACAGTACTAGTCACCGTAGGTAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGGTTTGTGACAGTAGTGAGGGG:1 + chr3R 30698048 5' - Doc2-element 467 1 60.96 ATGGGTTCAGACCTCCTTCGGAGACGAGCGGACCCATCATCATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTT:1 + chr2R 8641520 5' - diver 160 2 67.44 AAAATGACTATATTTATAATAATTTCACATAAATCCACACATCTTATACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGA:1 - chr2L 21951214 5' - Burdock 187 2 69.18 ACGCAGCGAAAAACAAGATAAATTAGCTTAATCAGCGGTTGCCATTGGAAGTTTTTTTCGACTTAAGACTTAAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTT:1 - chrX 18409581 5' - jockey 4936 1 56.16 GCTCAAGATTAACGATGTGATCTGCAAGGTGAACAACTTGGACTGCCAGTCTTTGTCGAAACGGATGGTTCTTGATGAGATCCGCGCCTGTGCTCCTCGCTCCCTCCCGCTCGTTTTTGCACAGTTTTTACACTGTC:1 - chr2L 11514274 5' - S2 1518 2 81.75 GCCCAACGCCCACTTTGTCCGCCCAGTTTCCCACATGCCCAAAAATATGCAACATTTTTTATATGTTTCTGCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 + chr3R 8707339 5' + jockey 4674 1 48.06 GAAGGGGTTTTGCCATATATCCATGTGCGAGATGATTCCCTTGCCTTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCG:1 - chrX 17468768 5' - G2 2780 1 54.90 AAGTGGCAAAGAGTGTGCTGCACTTTCTTGGGCAACTAAACAAGCTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 15987933 5' - roo 394 1 73.76 TTGACGGATAATTTATTCGACTCACAAAAATTAATAACTACGTAAGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTAC:1 - chr2R 3146358 5' + rover 7023 2 66.44 TAAGACCTATTATTAATTAGTTCGATTAATTTTTACCCGTTACTCTTAAAGGGGTATACTAGATCCGTTGAAAAGTATGTTACAGGCAGAATAAAGCGTTTCCGTCTATATTAAGTATATATGTATATCCTTGATCAGGATCAAT:1 - chr2R 4726556 5' + INE-1 83 1 80.00 AAAAGGTTTCCATTTTACTCAACAGTAATCATAAGCTAATTAACAACTACAGCTGAACTACGGACTCGGAACTCTCATTTAACGTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAAC:1 + chr3R 13349017 5' - BS 5064 1 61.27 CAGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2R 11609203 5' - roo 9035 1 53.85 CATTTTTTCAAATATTATAATTCATTTCAAATAACTTGAAAAAGTCTATTAAATACGATCAAAGATCTTTTAATATTAAAAATGTGATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:2 + chr3R 17546593 5' + blood 38 2 58.22 CGCAATTCGGCAGAAAAGTTTGCGGAACCAAGTTTATCAATTAACCCAGCCAACGGCTGTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGC:1 - chr2L 20492512 5' - hobo 171 1 55.56 ATATATGCCTTATCATTTCATAGTACAACCCAAATGGATATTCCAAAATGGCATAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGGGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1 - chr3L 20255243 5' + Transpac 63 2 63.70 ATTTTTTTCGCAAATGTACCCAACAGACATTATAAGTTATAGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTT:1 - chrX 21741728 5' + HMS-Beagle2 78 2 78.20 AATATTTATTCATTCAATGTTATATTGTCTTCGTGAATAGACATAGATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCT:1 - chrX 16384083 5' + diver 5963 2 67.12 TCATTTGACTGATATTCTTTCGGAGTGCCTTCACCCCGAAATTCGTGCTTTTCCTGGTCAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chr2L 9237455 5' + blood 22 2 69.18 TACTTTGCTTTGCTAGCCGCTGTCACTTCAGCCCCGCCTATTTTCGTTTTCATTTTCATTTTCAATTGCTGCCGTCTTATTAAGGTTACGTTTATACTAATACACTAGTGGGCGTAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGC:1 + chr3L 9059608 5' + Tc1-2 23 1 50.68 AGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAACATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATTATTGCTATCTCGCTCTCACTTATA:1 - chr2R 2248341 5' + invader3 5282 2 78.77 GATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATACATTA:1 - chr2L 22684595 5' + transib3 76 1 60.27 CGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 - chr3R 18815961 5' + hobo 66 1 65.69 AGGGACATACTATCCAAACTAGCTACCAAGAACTGGGTATAGCTAAACACAATTTCCGGTGAATTAATAACCAAACTCACCTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr3L 14076358 5' - roo 406 1 78.08 TAACAATTTCCTGTCAATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 31490941 5' - roo 8999 2 63.70 TATTACTAAACTGCATTTCCCTCGAAACCTAGGATGGCATTTTCAGGACAACAATGCCCCTATCCACACTGCACGTTTGGTAAAAACATGGATTCAAAGCGAACAGTCGTGTTTTTTTTTGCGCTCCGAATTTTATT:1 + chr3R 1847950 5' + Cr1a 28 1 67.15 AGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 - chr2R 19553281 5' - mdg1 7400 2 57.53 GTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACA:1 - chr3R 18815960 5' + hobo 76 1 68.49 AGGTAATAAGACTACCAAAATCACTTAAGTGCGCTATTTCCATTTCGCCTTCACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCACG:1 - chr3R 2555582 5' + Bari1 53 1 58.46 CCGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGAC:1 + chr2L 16089583 5' - 3S18 280 2 56.85 GGAGTTCACTGTGCAGAACCAGATGTGCAACGACTGCCATCGGACCGAGGCCAAGGACTTCTGGCGCTGCCTCGTGCAGGTTCGTCAGCGGGATTTAAGTATAATAGCATACCAACATATAGAAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chrX 2184095 5' + 412 59 2 64.79 GTACTCACTAAATGGGGGGATATAATTTAAAGCACTTCTATTAATATCTAGCCATTATTCCAGTAAATGAATCAGATTTTTAGCTAATAATTTTTTAACTATTTTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3L 13374065 5' + pogo 13 1 70.55 TCTCTGACACCAACGTATATCTACCTAAATATTTTGATATATTTTGCAATGTATATATTAATGTATATGTTATGAATATAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 - chr2L 5694247 5' - copia 248 1 48.97 TTGATATATTTTGCAATGTATATATTAATGTATATGTTATGAATATAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 - chr2L 5694214 5' - copia 5083 2 71.23 GTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTA:1 + chr2R 7727098 5' + BS 4694 1 56.16 CCTTAAGGGCGTTTTCTTTTAATGTTTTTACTGTTATGGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGAC:1 - chr3L 5538077 5' + jockey 4753 1 73.97 ATGTTTCTCCAGCTGCGAGTGTCGCCGAGCGTGAACGGGTTGGGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 17305409 5' - roo 9046 1 67.12 CGAATGAAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3L 14550967 5' + P-element 7 2 58.02 GCCTTCACCCCGAAATTCGTGCTTTTCCTGGTCAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 + chr2L 9237481 5' + blood 33 2 57.25 GGTCTATGCTGTTATTCTAACAAAAGATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTG:1 + chr2R 7020525 5' - Bari1 1668 1 55.48 GCTGAGTGGCAACGAGGAACCGAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr3L 17890721 5' + 412 39 2 53.54 AATAATTGATTTTTTCGCGGCGATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 + chr2R 11763562 5' + Tabor 35 2 59.29 CTTTATATTTATTTTTGGTCAATATGGCCCTTACCTGATACTCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:2 - chr3L 96580 5' + roo 80 2 73.97 CAAGGAGCAAAAAGAAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTA:1 - chr2R 6526625 5' - jockey2 3343 1 68.97 CAAGGTAATCCCTTATAGTTTCCAAGATATCGTTCGTCAGAATCTATCTGTCAAATATTTTTCTAAGAATATAGTACTGTAGTACAAGTTCATAAATGATGAACTCCAATTAAGAGCACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr2R 24453403 5' - 412 7513 2 51.37 ATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCA:1 - chr2L 1558692 5' - 412 7462 2 79.86 TCTAGTCCCGATCTCATTTATTATTTACAGTATTTCCCCTCACACACGAATTCTATTCGAGTGATTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 24437665 5' + hopper 142 15 76.19 TTTTAATAAACTTTTCCTAGGCATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3L 17707786 5' + Doc 40 1 58.22 ACACGAAAATCATCACAGTCACTGACTCAGTCAGGGTAACATCATCACGTAACTATTTATTTATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACA:1 + chr2L 7825206 5' - I-element 5293 1 60.27 CGAGAGTGGGAAAAAGACAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3L 18658900 5' - roo 9003 2 67.59 AGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGAGAGCGTGATATAAGATCAC:1 + chr3L 6775370 5' + blood 7095 2 72.60 AGATGGAGATAGAGGACGAAGTGTAAGAGGGACAGAAAGATGGAAGAGATGGTAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr3R 19531318 5' - hobo 2919 1 57.00 AAAAGCCTGGAAACCAGGGTTTTAACAGCTCCCATGTGATTGTGTGTACGTGTGTAATTTTCCAGACCGTTGTCATTGCCAATTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chr2R 6632682 5' - P-element 2850 1 60.27 TCGCCATAATATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr2L 22016019 5' + Tirant 8114 2 75.24 CAATATCATTTCTATTAAATAATTAGATACATACATTTTGTCAAGAAAATGTTTGCACAATGAAAATAAATTGTATTTTTGACTTTCAATGCCTCTTTTAAAAATTAATGAATTTTTTTTATTGATATCTATTTATTCATAGGTTT:1 - chr3R 18917840 5' - S2 1609 1 52.05 AGCCCATAATTAAATGTTTACACTTTCAGATTATTCCCAATTACAAGGCGGCTTTTATCACCGAAGATAAAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 + chr3L 11776654 5' + mdg3 5304 2 50.00 TTAACAAAATGACATAATAACAAATGTTCGATTGAAATGCCTCAAAAATGTATAAGATCGATAAGATTGATTGGCAAATACATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chrX 4300198 5' + opus 7146 4 64.83 GGTGTACGACTCTAGGAACTCTGGTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 25304826 5' - roo 351 2 58.90 ATATGTATACCGATATCCGCACATTCACCGCAACTAGAACAGGTCAAATGAAAATCGGATCGGCGGCAAAATGCCAAAAAAGTCTCGCATTTGCCTTGGAGTATAAAGAGAAGCCTATCGAGGTCTGGTTT:1 + chr2R 22615671 5' + Bari2 627 1 51.15 AAACTCCTTAAACTTTATCGCCTCCTTAGGTAAGCTTTTTCTTGAACCCTGATATTTAATGTTCAGTTACCCTTAACCAAAATAAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 - chr3R 17656500 5' + mdg3 5287 2 60.27 TTTACCCATTTTTTTATTTATTTTTTGGTTTTAAAATACCTGTTACTCGGCAGATGTTAAAAATATTAAAATAATCGAGGTTTCTTATTATTAGAATACAAAAAGATTTAACTCTTTACAATCACGCGGTCAAAAAAAG:1 + chr2L 20057804 5' - Tc3 354 1 64.75 GCTGATCCGGATTGAGCACCACGTTCAGACCCCATGTGTTGTTCATGATCGCCTTCAGGCACCGAATCGCCTCGAACTCGATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTCTTAATTGTTGGCTAT:1 - chr2L 20763790 5' + Q-element 116 2 68.33 ACAAAATGTTCCAAAGAAACTTAAATTGGTGGAATAATTTGAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACC:1 + chr2R 5917791 5' + I-element 5085 1 53.42 GCTTAAGTTGATAATACGGTCTAAGGATCAAAGTATTGAGTTTTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr3L 4115266 5' + 1360 17 1 69.18 AAAGTAAACCGCATAGTATTTACAAAGTTATGTTAACACTTTACCAGACAGATACACAATATACTTGAATACAATACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTTT:1 - chrX 12772751 5' + 1360 3191 1 55.94 GTATCTGCTGGAACATCGACATTAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 - chr2R 17891003 5' + Tabor 29 2 63.01 GTCTAATGAACATACGAGTGCCGGACTCATTCAATACCATTTCCACAAATGGAAATTCCAGATTTTTTGATACCAATAGATACATAAGAACGTCTCTCCGTTGTTGTCTGCCCTTAAGACTAGCCAACCAATTCAATGATAACAGC:1 - chr2L 10894906 5' - springer 210 2 58.90 GAAAAATCTGTATTTCAACGGGAAGGCGAAACTTCGTAATAACTTGTAGAGATAAAGCGTATACTTGGTTGTTTGGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCGGACAATTACAGCGGTGCGATGCTTACATTGATTCCGCTGACA:1 - chr4 436204 5' - 3S18 89 2 57.86 GTGAAATCAATTTGTCGAAATACGAGCTGTAAGAGTGCCGAGTGCGGACAGATATATACTCGTAGATGATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTA:1 - chrX 4186734 5' - I-element 5308 1 52.86 ATTATAACAAATACCGGATTTCATCGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAAT:1 + chr3L 24291954 5' + rover 38 2 57.66 ATTTAACATTTTTGGAAAATTAGTCAAACACTTTGTTGTGGGTCGTGCTAATAGCTTCCGTTTCCCAAGCCAAAATGCTTAAGCTTGTGATTCAGCCCATAGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 17114166 5' + roo 19 2 69.86 TCTGTCACCTGGCTAACACAGACACAACTTACCCACACCCACATCACCACCAACACTCTTTCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr2L 11915501 5' + hobo 46 1 57.69 GTAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr2L 16948747 5' + jockey 4710 1 53.54 AGTCTGACTTCATAGTCTAGATGTTGTGGGTCACAGAAAATTAAAGATCCGGGTCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAG:1 - chr2R 12265222 5' + jockey 4601 1 69.18 AGGGAAAGTAAAAAAACACGGTGGGGTCAATTCTTTGCAGAACATAACAAATTGTCTTATCATAATTTGGTAATTATTGCGGCTGTTAGTCTTGCATGCTTAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATG:1 - chrX 278011 5' + roo 8611 1 73.38 TTGCATAAAGGTTTCAATTTTGTTGCACATTTTTTCAATAAATTTAACACACTCAAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr3L 18467137 5' + hobo 15 1 73.79 AAAGAAAGTTGGCTAGCATGCGGCAAATGGCGACAGGTGTTTCAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAA:1 - 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chr3R 23240302 5' + jockey 58 1 56.25 TCCTTCTCTGTTTCGATCTAAGCCATTCTTTGTTGAGTTATCCTCTGCATTTGCTTGGAATTTAAATGACAGTATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGTGTAAGCCCA:1 + chr3R 7739426 5' + I-element 49 1 54.11 AAAAATGATACGCAAAGTGAGATGGAAAACGACTTTTATGCAAAATACTAAACAATATCCGTTGTGCGTTGTCAACAAATGACATGATCGTTACTTAGCTAGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCTTC:1 + chrX 13918860 5' + Max-element 8285 2 60.71 AAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2L 6717208 5' + jockey 15 1 69.39 CAGTTGTTTAACAAAAGAAAACATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACACTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 - chr3L 9909801 5' + Transpac 28 2 62.60 TTAAATGGGAAAGCTCCAAGCAGACCCGATTTCAATGGGGAATCGAAAACGCTAGTCTCAATTTCTTCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chrX 1061633 5' - 412 456 2 53.44 AGCTACACATTTCATACACATATTATGTCCCGAGCATAAGTCCCCCTCCTAAGTCAATGATTTCTCTATTGCGTTGCGTGCTATATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGT:1 - chr3L 16358875 5' - Bica 262 1 58.22 TTTACCGTTACTTTTCACACACACATACAGCACCTCTCTCTCTTTAGCTATTGCGTTTTAGATTATTGCTCAGCACGTTTTTGCGTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chrX 4701103 5' - P-element 2852 1 59.59 CGCAAAATACAGCAGAAAAACGACTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTT:1 + chr3R 10266109 5' - 1360 3317 1 80.33 AATTTAAAATGATTAACTGCCAATCAATCAATTGTCAAACTAAACTTAAACATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chrX 14964705 5' + roo 69 2 68.49 ATACAAGCGGCAAAAAAGAGAAAAAGTCAGTAGGCGACGCAGCGCAATTAAGCGCGGCAAAAGTTCTGCCTCTGTGTTGGTGCTACTTCTGGATGCGTTGCACCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATA:1 - chr2L 1633256 5' - Doc 4285 1 63.85 CCTAAAAATATTTTCTGCCTTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:1 + chr3R 9160660 5' + copia 50 2 52.05 AATGTCTAAATTGTTACAATATTGATTAAGATTTTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAAT:1 + chr3L 24213305 5' + invader2 4778 1 76.71 GGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3R 21705987 5' + 297 6633 2 62.02 ACTGGTAATTAACAAAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 - chr3R 17605760 5' + Tabor 34 2 60.96 CTATAAATTCAATAGTCTAGTTGCTTGGTGCAACCCTTTTGTTCTAACTAGTAATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATA:2 - chr2R 4638680 5' + 1731 69 2 62.33 TCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3R 7035260 5' - roo 8992 2 72.60 TTCAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCC:1 + chrY 2346867 5' - micropia 450 2 67.05 GAAGCATGCAATTTTACAATAAAAGCGATCTTAATCGTATTAGGATTATAATGAAAATTGCGGTGAATGTGATTTTTAAATAAATTTTCAAAACTAATTGCTCCGCTGATAAAGGCCAATAAGAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 27984311 5' + BS 5102 8 54.68 AGCGTATCCCCCCCAAAAAAAACAAACAACAACGCTGACTTCCACTCCACTACTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCA:1 + chr3L 7583106 5' - flea 52 2 74.80 CGGAGATGCATCATTTTATAGAGAATTCAATGGGGTGGATGGAAGTGTCGACAAAGTGTTTACTCCTCTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCGG:1 + chr3L 7995362 5' - P-element 2876 1 77.24 AAGCACATGCATGCACATACATATGCTATGCAAATTGCGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr2R 19554890 5' + pogo 22 1 68.53 AGCTGCATATTTATGATTCACTAACATGCTGAGGTGGTGACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 16181265 5' - roo 9042 1 65.07 AGGCATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr3L 17707804 5' + Doc 58 1 52.05 AATGTTTTGGTTGCAACGAAGATGGACATAATTCGAGTAACTGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAG:1 - chrX 22574746 5' + 17.6 6941 1 66.94 CGGGAAGCGGGGACCCCAGAGCCGGGTGTCTGAGATAAGTCATTTGGGTCCTTCAATTACAAATGTCAGACGGCAGGCCAGCCAGACTATAAACTGAAAAACAAATAGACAACGAGCAAA:1 + chr3R 14484773 5' + Doc3-element 185 1 77.50 GTGGCAAAGAGTGTGCTGCACTTTCTTGGGCAACTAAACAAGCTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 15987935 5' - roo 394 1 73.38 AAAGGAATAAGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTA:1 + chr2L 15834443 5' - hopper2 1553 1 52.74 TTTTTGCCATTTTGATTTCATTTATTGTACTTGACAGTGGCGCAGAGGTACGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTT:1 + chrX 21495606 5' - Porto1 202 1 65.60 ATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 - chr3L 12224690 5' + 412 88 2 76.55 TATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:1 + chr3L 24934268 5' + HMS-Beagle2 6915 2 63.70 GGGAAAAAGTCAGCCCTCTGCATGCATTAGACATAAAAATTCCAAGACATAAAGCCACCACAAAGAGAAAATAAAATAAATCCAACAACAAAAACAACAATACTGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGAC:1 - chr3L 14354273 5' + I-element 174 1 61.64 TTTTTTGCTACCAGCACGTGCAACAGGACCAAACTGAAGCTGAAGACCAGGAAACCTTAGGATGGAAGGCAAAGTAATAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTG:1 - chr2R 7020670 5' + Bari1 44 1 56.16 CAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr2L 2276778 5' + F-element 36 1 53.68 CAGCTGTTTATATATTACTGAGCACAGCTACCCCACACAAACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTA:1 - chr2R 7665830 5' - Transpac 240 2 71.22 ATATTAGAGCACTCAATTTCCAATAAAACAAGACCAAATTAGACAAATTAAATAATTGTCAGTTCATTCAGAACAAGAATAAGATGATTACTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTT:1 + chr3R 12592993 5' - flea 227 2 64.38 CGGGGGGAACTGTGTTGTGTTTTTGTGTTTAATGCTTTATGTTTCAGTGTACACACATAAATGACCACTACACACATATACATATACATTGTTTAGTGTTTTTTTTTATATTTATAT:1 + chr3L 8926569 5' - Tc1-2 484 3 85.47 AACAAAACAAGGCACAAGGATCGGGGTGTGGGGGCAGGACCAAAGGAACGACTGAAAAGCCACGCAGTGCCGAAAAATAAACGAAAAGTCGCACGACTTTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTAT:1 + chrX 20989775 5' - INE-1 163 1 47.95 AGTCAGTATCGTCATGGTGGGATCTCGTTTCAATTGCTACATAAATGGAAAAAAAAAATGCCGAGGCAGGCAGAAATTTAGGTTGACATTCAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3L 16580392 5' + 412 29 2 65.75 TGAGTGGGGCGATTTTTTTGGTCGATTTTAATGGGTCCATTAAATGCAAAATTTTGATTTATCTTGCTTCGGCCATTTAAATGCAAATAATTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTTCTCCCTATCCAATGTTTAAT:1 - chr3R 13946160 5' - invader2 4704 1 60.96 AGTAAGAATTGCCTACTTTTAGGGGTAGTTGATGTTTTTGTCTGCGAAGCAAATATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTA:1 - chr2L 13215712 5' + jockey 4826 1 63.70 AATTGGCATTAAAATTAATAAAATGAAAACATGTACATATGTGAACATGTATGGAGTGGGCGTGGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTC:1 + chr2R 17876892 5' + Transpac 4973 2 54.79 CGAGAACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr2L 17029579 5' + blood 50 2 51.37 CATATGTATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chrX 5150285 5' + roo 8722 2 61.59 GCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439054 5' - P-element 2495 1 62.41 AATTCATGCGAATTGCTTGATTCGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTG:1 - chrX 8027498 5' + Juan 45 1 48.92 CCAAAGAAACTTAAATTGGTGGAATAATTTGAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCT:1 + chr2R 5917801 5' + I-element 5095 1 47.95 GCGGTCAACACTCCCACTAAAAACCAAAAGCCCCATGCAAAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 - chr3L 10144732 5' + blood 7068 2 74.38 ATTATATGCACTAGTTGCCGTTGTATTTTAAAAGACGGATTACAACACTATCACCGCGGAAGGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATT:2 + chr2L 9485591 5' - 412 7487 2 56.85 ATCGCCTCCTTAGGTAAGCTTTTTCTTGAACCCTGATATTTAATGTTCAGTTACCCTTAACCAAAATAAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 - chr3R 17656484 5' + mdg3 50 2 49.66 CTGGACAAACGTTTTATAGTATATTTTCCCTTGGCATGCCTGGCTCGTTTCATATTTTAAAATGGCAACAATTTGCCAAAAACGTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAAC:1 + chr2R 21414363 5' - BS 5053 1 59.59 ATTTTGGCAATGAGAGCGACTCTAAATTGGTTTAGAATGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATAC:1 + chr3L 14062702 5' - Doc 4471 1 72.79 ATTTGCATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTTACGTAAGTTTTCAAATCATATGCCTAACAAATTTAACGCTGGGCTGGGTTGGTCGTTCCGGTGTAGTCGGCTTTCGCTGCATACTCGAATAA:1 - chr3L 25929324 5' - Doc3-element 4550 1 57.69 CCTTGCCCCCCTCCCTTCACATCCACACACCATTTTCCTTTTCTTTCCGAGTTGCGTTTGTGTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 - chr3R 15022173 5' + Tabor 6849 2 77.24 AGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGATCTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACAT:1 - chr3R 29288802 5' - BS 5039 1 59.40 GCCAGCTATCACCGTACCTATCACTTCATCTATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3L 14122658 5' - 1360 3374 1 58.57 AGTCGTGGGGGTTGGCATAAGAGAACTATTAAAGTGTTTTATGGTGGCCGAGACAAGACGAACGTTGCAACTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATC:1 - chr2L 21875606 5' + roo 38 2 50.68 AAATAAAGAGCGGCACTTGTTTCTCACTTTGTTATTGGCCCGACCGACACGCGTTCGAAATCGGAATATACAAATGAACCCATAAACAGACTCTGTGGGTTTGTGCACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 + chr3R 17067768 5' - 297 383 2 77.93 GTTGAGTTGCAATCTAATCTTGTCTAAGGGCTGTATCTATATTTATGTTTGTTTTGTAAACAAAATTTTACTTGTAAATATAAAAATTAGAGAACACTCTTTAGTTGTGTGTTGCGACTATAAAAAATTATTTATTTATTTTTAGA:1 - chr3L 8809458 5' - mariner2 830 1 69.18 ATCATAGAAATATAAATAAAGGATGAAAAATGGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2L 6717245 5' + jockey 14 1 75.37 AGGAATTGCAGTTAACCGCATTCGTACATTTATCTATGTATTTATGCGCAAAATTAACTAGTTTAAGTGACATGAAATATTTTGGTTATCACTCGGTTTTGTTGAATGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAA:1 + chr2L 14889365 5' + 1360 485 1 69.18 TATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTAGACGGTCTAAGGGCGTTAGAGTGGGGGGTGGACAAAATGCTTTTATTTATAACTTATATAACTACAAAAAACAACTTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chrX 22902354 5' + F-element 22 1 35.86 CTTATTATGCGTGATGTTCTAGGACTTTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 + chr3R 15022005 5' - Tabor 7281 2 55.17 TGTACATAGATACTCACACACGCAATGCCAAACTGTGTCTGTGCATCAATTAATTGTACTGTTCGGCTATTTATAGATTTTGCGGTAAATTCGCTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2R 21371578 5' - roo 9050 2 71.23 TTTGGACTAAAGATCAGATCTGGATAGCTTTCAATGGCTCCAAGCGTAGATTTATGACCTTTTGTCGTATCAACCCAATACAAACGACTTACTCTTTAAGATCTCGCTGATAATCCCGAATTGGTTAGTCGGCTAAACTTCTCTGT:1 - chr3R 1561737 5' + Cr1a 4089 1 73.97 AAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr3L 96515 5' - roo 332 2 69.44 ACGGTTGGATAATTAATACCGCATTATTGTTTCTATTATGTGCGCATCATATTGTAATCTCTTTCAATTCCTTGGTGATTTAAAATAAAAGTGTTGTAAGTTATATTTGTTGTTAGTGTTTTTGGGAGCATTGCTCTTGGATGCTT:1 + chr3L 16369417 5' - 17.6 257 2 69.18 GACGCTGTACGACAGCAAGGGCATATTTGCGTTGTCCCTGATTTCTTGGCATATATGCAGAGAAAAATGTAAAATACAATGAAACACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTTTCGAGTATGCAGCCAAAGCCGAC:1 + chr2R 5109071 5' + Doc3-element 4555 1 61.64 CCGGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr3R 4528438 5' + F-element 36 1 61.48 TGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCC:1 + chr2L 17250721 5' + opus 160 4 62.10 ATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 12525982 5' + roo 8724 2 69.35 TCCAAGATGTTTACAAGCGACCAAAATATGACATCTTTCCAAGGTTAAAATAGCTAAGGCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGACATATCTTCGGAT:1 - chrX 18806248 5' - roo 9016 2 55.00 ATGGAGAATAAAGTAATGGAATTACTTCAACAATTTTCCCCGTCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCGGAGCGTGGG:1 - chr3L 25827829 5' + roo 248 2 69.67 GTTGCTTTTTTTGTAAACAATGATCGGTCCAGTTTTATGGGTCATGACTATCCAGAAAAACTATAGAAAATAAAGAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCAC:1 + chr2L 18149311 5' - Bari1 1703 1 56.85 AATTCGTGCTTTTCCTGGTCAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr2L 9237494 5' + blood 7071 2 59.31 TTGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTCAAAAGTGTGTAACAGGTAGAAGGAAGCGTTTCGACCACATAAACGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTG:1 + chrX 22651470 5' - roo 8669 2 51.37 AACTGTCCTTCAGATAATATTAATGTCATCTGATAAAAGCTAATGCTTGCAACGCTCGACCAAGCAAAATTCCACTTAAGTTGTCAACACTCTGCTGCCTACCAGAATCACATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAA:1 + chr3R 13182217 5' + Burdock 6143 2 69.86 AACTGCATCGGCATCAACCATTCTTTGGGACCCAATCCATAGATGCACTGGAAGTATTTAGTTATCTTCGCATATAACTAATATATTTTTATAGTTCAATACTTAGATTGGATGTTACTTATTTAATTTGCTTTATTTGATTTTAT:1 - chr3L 18322054 5' - TAHRE 31 1 54.79 CAGCCCTCTGCTCCGAGTTCGACGCCTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr3R 8258868 5' + Tirant 8139 2 70.89 GTGTGGAGGGAAAAGAAAACAGTGGGAGGTGGGAATGGAGATGCTTAAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGT:1 + chr3R 25880266 5' - P-element 2813 1 34.25 ACTAGATTCGTTGAAAAGTATGCAACAGACAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCATGTCCGGATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGTTTGAAGGTTGAGATTCAGCATTCAG:1 - chr2L 22211545 5' + INE-1 174 1 84.29 ACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chr3R 22100527 5' + 412 80 2 69.86 AGTCTGTATATGTAGTTCCGGTTTCCGGATTTGATTGAACTTGGCGGAAGTTGATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCACC:1 + chr3R 29733024 5' - opus 7446 2 59.42 AAAATGCAGGTCACGAAATGTTTAACCCGAAAGCCAAGGCAAAACATATACAAATACAAATAAAAATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATGCATATACATATACATATGCATGTA:1 - chrX 3351710 5' - Stalker 241 4 78.08 GTTGTTGATGAGTAATATTTCTTTCAGCGAGCTGTAGAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCT:1 - chr2R 4313053 5' - gypsy 7388 2 53.42 AAGGGCATTCAAAAGAAAAGCCGTCCACTTTCATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 + chr3L 15276615 5' - hopper 1370 1 53.79 TAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGA:1 + chr3L 25782387 5' + F-element 102 1 81.51 GTATACTTAAATATTTAAGGGCAAGCGTTGGCGAGAGCAGGGCAAAAGTTTAAAAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr3L 13634157 5' + 297 11 2 77.54 AGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTG:1 + chr3L 25482885 5' + accord 6906 2 58.90 TGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chrX 12866463 5' - roo 321 2 78.08 GAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTG:1 - chr2R 4181294 5' - accord 499 2 65.00 ACTTGGGCACCGAGAGTGGGAAAAAGACAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 18658890 5' - roo 350 2 60.42 ATCGGCCCGCTCGGCTGGCTGTGTGTATATATGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3R 17067898 5' + 297 6596 2 67.50 AATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 + chr3L 11336347 5' + blood 7072 2 63.50 ATGGCCACCCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr2L 685996 5' + roo 8736 2 66.44 ATCGTTATTTGTGTTCTTTATTATTTGGAAGTACTATGTTGCTTATACTATTTCAAACACAGAATATGTATTCGAGCGATGGTGCATCGCACAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTC:1 - 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chr3L 20713038 5' + roo 84 2 80.82 AATCCCGCTGAAGATTTCTTTGGCTGGAACTGGTTTGGTTCGTTCGCCTTGAAACCCGTTTTGGCCGAAAGTGAAGTGCAGCCTCATCGGGAGAGCAGAACACGAATGTAGTGATAGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAA:1 + chr2L 4996466 5' - FB 993 3 76.71 TTTCGCTAGCTTTGACATGGACATTGCCTATAAATCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAAAATTCTGGGATTTATACAGTGCAGTGGACTTCAGGGAGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCTACTGG:1 - chr3L 22052826 5' + baggins 5397 1 58.22 ATTGAGCTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr2L 10184432 5' + Doc 58 1 62.79 TTTAGATTTGTGAAAAATTAAGATAAATCGTTTAATCACCATTGAATAGATAGGTTTCACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 14553035 5' - roo 409 1 58.90 GAAACAAAATGCGAAAATGACAAATTGCATTAGGAGGACCTTTGTAATAAACCCATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTTTTTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 + chr3L 10144673 5' - blood 7342 2 59.82 TGGCTCATTTCGATCCCTGCACTTTATTTCCATGACCAGGAGCGGAGCAGGTGGGTGGGGGGATGGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr2R 23287428 5' - roo 9033 1 53.85 CATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chrX 4778189 5' + 412 74 2 67.12 TTGATCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATAATATATTCTAGGGTCTTTGATCTAGCCGTGTCCGTATGTCCGTATGAACGTCGAAATCTCAGGAAATATAAA:1 + chr2L 21791150 5' + INE-1 146 1 64.17 GGATTATTGAAGTGTAGCAGAAATCACTTCCGCTTTCAAATCCAGTAAGTAATTTCGAAATTTTAAAAATACTTTTTATAATTTCCAAACTTTTAAGACAGAGCCAATCATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCAT:1 - chr3R 27510222 5' + Bari1 14 1 67.12 AGCAGCAGCAGAAAAAATTTTATGATCCTACCTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGA:1 - chr3R 8709828 5' - jockey 4906 1 78.08 GTCTATAATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACA:1 - chr3L 24208228 5' + Quasimodo 36 2 57.45 GAAAATGTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGC:1 - chrX 1103728 5' - pogo 2052 1 52.05 AAAATCGGTCTTCTCTGCCTTCACTGTCCCGTTTCGAACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTCCAAATA:1 + chrX 22564554 5' + Transib5 62 1 76.03 GGCCGCTCTGCGCGTGCGATTAAACACATATGTATGTATTTATGTAGTAACTTAAAGCGAAAGCAAAAAAAAAATGTCGGTAGACAACGTTCTATCACAAAAATGGATTTTATAATATATTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTA:1 + chr3L 15099903 5' + copia 4872 2 77.40 AATGCCTTAAGGCTGGACATATTGATGGAAGCAAAACATAGAATTGCAGAAGGAAGCGTTTCCGATTTAATATTTATTCTTGATCAGAATCAATAGCCGAG:1 - chr2L 21281967 5' + INE-1 90 1 55.45 AGCGTTTTAAGAATGGGATGCCAAAACACTTTATAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3R 7539458 5' - roo 323 2 76.03 AACCAATTTAAAATGTTTAACAATATTTGCCTCGTTCAACAAAATACATATCATTTATTCAGCGATCTAAAATTAAAATTAATTTAATGCGTTCCCTTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAG:1 - chr2L 5602174 5' - mdg3 5304 2 71.33 CACTAAATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAA:1 + chr3R 11750172 5' - Tabor 424 2 58.22 ACCATTACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTTCGTCCGTCCGTCCATTTCAGCGTGGCTCAAATCTCTT:1 - chrX 10161184 5' - micropia 408 2 60.00 GGGCAACCCGATCCCAGGCACCGGCCACAAGTAGCCCGCAGTGCCTCCTCATTGTTGCCAATCCCGGTGATAACTACCAAGAAGATGATTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATC:1 + chr3R 27828744 5' - rover 331 2 70.16 GTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chr3L 14553133 5' - roo 8980 2 81.51 AAATTAAAAGAAAAATCTGAAAATCGAGACAGTTATAAATTTCTATGTCATTTGCAATATTGCTTCGATATCACCACGCAAAAAGGCTCTGAGAACACGC:1 - chr3L 12792188 5' + G6 372 1 68.00 ATGTTGCGCGATATGTAAGCCAGTTTTATGGTCCACTCTTTCGAGAGTGGAAGTTAAGAACCAAATGCTTTTGGCTTTTAAGGGTGTTGGCTTTTAATGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 - chr3R 28627730 5' + copia 25 2 70.55 GAAAAACGTTCTCAGAAGCACAACGAATGCGAAACACTCTTAATACTTGTTACTGTCTCATTATGTCCTTAAAGAAGTATATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:1 + chr3R 10968688 5' - I-element 5319 1 62.86 AAATATTTCTGCAAGACGTAAAGAATAATGAAGATTAAGCTATTAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATCATTGTAACAAA:1 - chr3L 27176001 5' - copia 4706 1 71.92 ATGCAATAAAGCGTGATTTTCCAAACTGAAGCGTAACGAGCAACGAACGAGCAGCAACAAAGGCACCATATATATATATATATGTATATATATATACATATATCCAGTTAGACATATACATATGTATATGTATATGTATAAATATA:1 - chrX 10101168 5' + Stalker4 7203 4 64.38 AGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCCGTTAG:1 - chrX 23108315 5' + BS3 1468 1 63.24 ATAGAAATTTAGATACAGATGGGCTCCGGTTTGGGTTTTATTTTAAAAAGCGGTGACTTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chr3R 26191609 5' + hobo 60 1 59.72 GATTTTAAGAGTTTTGACTTTTGCTAACATGGAAGTTCTCTTTTTTATATCGTGCCTATATCTTTTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGG:1 + chr3R 4579408 5' + Cr1a 4412 1 69.91 AGTGTAATAATAAATGCAATCGGCAACGCGTACAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGA:1 + chr2R 4362548 5' - gypsy 7384 2 58.22 TAGCAGACATGCGGTCAGCGGGTGCGGTGGTTGGCAGCTGCCAAAGGGCCACTAATGATGACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3R 12599023 5' + 412 7074 2 58.10 GCAAACTTCTGTCACTTCCTCCATATCTTCAATCAATTTTTGTACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:4 + chr3R 4581801 5' + 297 10 2 78.08 CGCGAGTTTCCCTGGCAACCAAAAAAGAACCCATCGAAACTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr2L 17901086 5' + blood 25 2 58.43 ATTACAATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATT:2 - chr3R 16913453 5' + pogo 68 1 69.18 AGTCCAATGCGCCAAAATAAATGTTTTTCTTGTTCTCAAAAGTTAAATGTTTTTATATGGGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chrX 18806148 5' + roo 8725 2 61.64 ATCTAGCCAAAGACACTAGAATAATTCTAGCTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGAGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTT:1 - chr3R 4604461 5' + Ivk 91 1 73.68 AAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chr3R 4528415 5' + F-element 47 1 60.91 TGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr2L 4173990 5' + roo 8751 2 78.08 AAGCTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:2 + chr2L 15987974 5' - roo 9011 2 60.96 GTCAAGTACGTGGTCTGGGATTCAAATTGGTTTGTTGAGGCATCCACCGTCTATATATATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2R 12543163 5' - roo 346 2 63.01 GTAATTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGG:1 - chr3R 11547826 5' + G2 290 1 73.97 GTGTGATTCAGAGGACACCCCTCACATAATGAACGTAATGAAATCGAAAGGACTCGTTTGCATTCTGCAGGTGTTGCAGGTCGTTGACCGGGTGGATGATTTGGCACACGCGGGCGTCTGACACGACGGTGAAG:1 - chr3R 17605535 5' - Doc3-element 301 1 60.45 AGAAGTCCAGCTATCCCGCCATCGAGGTGGACTATTCTATCGAGGAGGTCAAGACCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATG:1 + chrX 6595534 5' - invader4 2621 1 62.33 GTGCTGATTGCACTGGGCCATGGAATCAGCGATTCCATGCGGAGCCACGCGATAACACCGAATCACGACCCATACGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGGCTCATCCATATTATTT:1 - chr2R 15829653 5' - invader4 313 2 76.03 ATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3L 96510 5' - roo 8999 2 66.44 GAGCGAGTCAAGGATTGTTTGGTGGCCAAATGGGTGGCAACAGTAAAGCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACACATATTTATT:1 - chrX 1690069 5' - 412 7492 2 65.12 TCCAATGTTAAAAATTAACAGCTGTTGGTTTCTGATTTTAGTGCTTACGAAAATAAATGTCTTTTCAATCGCAAGGCCTAAATCTATCACATTTAAAATTAATAGTCATTCTTCAGGTGTTTACTATGTGTTTTTACTAATATATT:1 + chr2R 15309474 5' - hopper 1117 1 70.55 GAAACGTTGGCAAAGTTTAAATTGAAAACATATTTCAAACACAAAGAAAGCGCTTCTAATTTGGAACTCGTGAGCTTGGCAGAAAATGCATAAAACATAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTCT:1 + chrX 6129565 5' + roo 9068 1 66.44 AAGGCGATGAGACTCTGTTTCTATTCTATTCAACGAAATGCCACAATACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 - chrX 19281791 5' + opus 155 4 62.18 TTTGAATTTGGCTGAGTTACATGGCTGTGTGCTTAGACGATTGTGCAAAACAGATTTGAGCTGGGCACAAACAAAAAAAAACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chrX 13395370 5' - roo 9044 1 62.96 GAAAGCGCTTTACAACAGCAATATGAGTTTTTGTTCGTCTGCCTGTCTTCAAAGTGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 10684679 5' - roo 401 1 79.45 ACCAAGGATGTGCCACTGGCGGGCGGGAGATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATATCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr2L 18317475 5' - mdg1 375 2 68.00 AGAATTTCGAGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chrX 7515763 5' - roo 9033 1 58.90 TCATTGAGTGGCATCGCATAAGTGTGGCGACTCATTGCGGTAACAAAAACAGACAGATGAGGTGGTTTTTCTTTTGGGGGTCATTGTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTACAAATTAGAGGTGGCTTAAGTATTTAGACAAA:1 + chrX 7666922 5' - Tc1-2 1433 1 55.56 AGCTGGAAATAGTCGGCGGCAAAACTATCAGGTCTGCGAATTAGTTATAACTATTATTATATAGTTATAATATATATATGTCGGCAAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAA:1 - chr3R 12929310 5' - invader4 3038 2 54.11 AACAATGTCTTAATTTGTATGCAGTTTGGTTTTATGTTTCAAAGATATAATCATAAATGCAAATGGTGTTACGTAAACATTGCTAATAATTAATAAGAAAAATCAATTTCAAAAAAAAAATTTTCCTTTCTAAACACAATATTAAT:1 - chr3R 29394210 5' + Stalker 6777 2 49.32 TTCAAATTTGTAGCCGCTTTTAATTTGGTTTTTTAGTGCCCAGTTAGACGTATTTGTAATTTATGCTCCTAAGACCTTTTGCTGATTTAAAGTATCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTG:1 + chr2L 5601516 5' - mdg3 5473 2 67.81 ATGGCGGATTCATTGAAACCTGAAGCCAGAGTGTAAAGTCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATG:1 + chr3R 23765388 5' - roo 8978 2 77.40 ATAAGACTAGTGAAACCTATTCATATTTTACTTAAAACTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chrX 10567885 5' + roo 8705 2 53.42 AGTTCATAGAATGCATGATCCAAATTTGTGGAAAACTTAATTTTCCTCAGTGCTTACTCTCGTATTCTTGTATGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTC:1 + chr3L 20724553 5' - R1A1-element 359 1 50.72 CAGCGACATGAGGAGGATAATGGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTGATATCTTATGTAAATGAATCTAGAGTGATAAATT:1 - 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chr3L 13634337 5' - 297 6961 2 74.81 GGCATATCGGTGTGGATGTACACGTTCATCCTGCCCGCCATCGCCTGTCAGAGCGTGGTTCTCGTCATATTCCGGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTCGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAG:1 - chr3R 27872136 5' - Doc2-element 477 1 60.66 GATAGTCTATCGGGTGAGTGCCATCAAGTAGTTTGTAGATACTTACACTTTAAGATCTATATATGTATAGCCCTTCAAAATGGCTATAATTACTACTAAGCACACATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATG:1 - chr2R 21366654 5' - invader2 130 2 46.90 CTCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTGTTTAAATCATTTAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 + chr3L 21144036 5' + jockey 4721 1 52.05 CATTCATTTTGTTTGTCCTGGCCGCCTGTTTGTTTTCGTTATCCTGGCTGTTTACGCACTTCGCTTTTTGCATTTCTGCGCTAACCCCGCGGCATTCGCATCTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr3R 28951964 5' + jockey 4688 1 73.29 GCTGCGTTTGGTTTTTTGTTAAGACCCTTTTATTGTGCTTGTATTTTATTTGGTTTCAAATATGTTGTTTTGTTATCTTATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 - chr3R 4581977 5' - 297 6937 2 59.59 AAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATT:1 + chr3R 11750190 5' - Tabor 406 2 70.55 CCAATTTTGGGGCTGAAAATTCAGACAAATTTCCAACGCAGTGTCACTTCAAATGAAATATTTGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr3R 27535420 5' - 412 7490 2 55.17 TATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1 - chr2L 17029666 5' - blood 7316 2 72.39 GGTTTTATGGCCTACGCATCATTTGGCTAAAAGAGGCAAAACGGATTACAACACTATCACCGCGGAAGGACTGTAATGATGAACTCCAATTA:1 - chr2L 3659176 5' - 412 494 1 47.83 AATGCACACAAAACACACAGGAGACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGAACTAGGATTCCATAACTGGCCCGCTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGC:1 + chr2R 22722988 5' + 3S18 8 2 70.87 TGAGTCGAGCTAAAAAGCTGTCTGTCTCAATTTTTTGTTTTTTAGCCATTTATTTCGGCATTTATGCTCTTTTGGCATATACACAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAAATGCGTAACGGCCATACATT:1 + chr2L 22348877 5' - 1360 3369 1 76.15 TCTAGGCACAATATATCTTCAATTGCTCTATGTGAACTTTTTGTTTCCGAGGTTTTTTGAGACTTAAAGGATTTTTCCTGCGTGTACCAATCGATTTATAAGCTTTGTACTATGAACCGTTATCTTTCGTATTTCTTTTCGACTAC:1 + chr2R 16235710 5' + Bari1 1575 1 62.33 GTTCGTAATGAGTTCTATGGATTTTAGACTGGCAGTTAAATTGACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - chr3R 21001881 5' + 412 79 2 72.60 ATCAGACGTCATGGGGCCAGCTGGTCTCGATGTGGGCATGAAAGAATGACTGAATATGAATATAAATAGAATACAAAACGAAAAATGGGTTTCAACTACAGTTATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTT:2 - chr3R 2474411 5' + Juan 3990 1 71.92 CACATGCGGAGCTAAGAGGTTTCTTGGCAAAAAACTAGGCCGGGAACATTATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAA:1 + chr2R 4638600 5' - 1731 4554 1 68.49 TATTCAAGCTGTGATATATACTTTATAAAAGGAAAAAAATATTAAACAAATTGCAGCGCAAACATTGTCTTCATAGCAAACTTAGAGTTTATTTTTAATTATGGAAAAAACAAGTCAGAGTATGTAAATTATTCGTAAATACACGT:1 - chr3R 31992602 5' + transib4 294 1 72.60 GGAAAGCAATGTCTTTACTTGGCCCCAGACGTAAAGAAGTTATCAGCATGGCGTTTATGGTTGGAGCTTTCAAGGGGGGTGGAGTTTCCCGAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTT:1 + chr2L 3738564 5' - Tabor 416 2 53.73 TGTATATTTCTGATTAACTTTCTCACTTCTGCCGCTTCGCCCGCTTATATTGTCTGGCTCTTACCGAGTTTCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATT:1 + chr3L 23773435 5' + Transib5 2936 1 67.89 ATGAGCGCGACAATTCCCCAAATCCTAGACGATTGCATCGCCCTCCAATCACATACAATTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAATTTACTTAACCAAACGCACTTTTTAAAAAATATTGATCATTTTGGGAC:1 - chrX 21084014 5' - HB 250 1 53.57 ATTTCAGTCCCTAGAATGGCCACCCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2L 685981 5' + roo 8715 2 54.29 ATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTGAAATAGGTGTCATGAGA:1 + chr3R 30634940 5' - roo 8998 2 63.70 ATTATAATTATTATTATTATTATTATAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAACGTAGTGGTGTAGTTGACG:1 + chrX 13383540 5' - Copia1_DM 112 1 61.64 GAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3L 17890742 5' + 412 7127 2 69.50 TATATATTAAGATGTATATGTATATGTCGAAGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCCTCTTCACTATTTTCGTTGTCTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGC:1 - chr3L 23143313 5' + 1360 42 1 47.26 CTTGGCATTTAACGAGCATGTTAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAAC:1 + chr3L 12867257 5' - roo 9043 1 53.10 GAAGAGAGCATGCATTGAAAATTGGAAAACTTTTGTTCGGGCAAAAAGTTGTCCCGAAGCAAAGATTAATTTACCTGTTCGCTCATTAACAAATATCGATCAAATAAAATGATATTATCTGAAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTA:1 - chr2R 16642338 5' + Cr1a 4237 1 76.71 CTGGAATAGAAGGAAGAAATATCTTCGACTTTGTTCAGAGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATC:1 + chr3L 6339804 5' - 412 7170 2 73.29 AATAATAATTAAAAAAAAAAACAAACAACCCATTTCAAGGGGCAAAAATAACAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chrY 3637652 5' + Rt1a 5078 10 76.47 GTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr3L 22052776 5' - mdg1 7404 2 70.43 TAATATCCAGTCAGGCCTAAAAAAATTCGAAGCTGTCTAATGTTTTGTGGAGCCGGATACTTTATAATTGTGGAATTATGTTTCAAAGAATTTCGATTTTTCAAGAGAGATTTTCACATTGGCTTGTTGTAAAATATTAAATATTT:1 + chr3L 27176551 5' - TLD2_LTR 106 1 51.37 ATGAGAGAGCAAATTCCGGCCAGAGCTCAGCTTATCGCAACTTTCTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 23765441 5' + roo 8740 2 70.55 AACAACCTTTTTGCAAGTTTGTAGAAAATATAATAATATGCAATAAAACTAATACTTTAAAGAGCCCTATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGTTG:1 + chr2R 15829490 5' + invader4 37 2 57.04 TTTTTTGGGCAAAGGGAGCATCGAACAACGAGCACCTCGGCACCTTCCTCAGTTTCCCTGCCACTGCCCCGCTGCGTGTTGCATTGGAAGTGAGATGTTGCAGATAAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGC:1 - chr3R 15647196 5' + diver2 318 2 70.71 CGACAAAACGATCGTCATGAGATTAAGTCGGCAGAGACAAGACCATTATGCAAAATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chrX 6481363 5' + hobo 41 1 52.42 TTATAAATAAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCT:1 + chr2L 11574799 5' + Max-element 8281 2 53.42 CGATTAAAGCAAATCAACTCTTTTTTTTCCCATTTTTACCTTCCGGTTTTCCCTTTTTTTTTT:1 + chr2R 12553616 5' - Bica 342 1 49.21 ATTCCTTTTTTGCATAACAACAACAGAGATTGAACATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 + chr3L 23986480 5' + opus 139 4 63.01 TCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr3L 19349981 5' + jockey 74 1 65.87 TGCTATAAATTGTGGTCCACAGCGACAAAGCAATTCCACGCTGACTGCAATCGAATTTCGCTTCCTGGCTGATTAAAAATATATATCTTTCAGCATAATTAGATCCTACTTACACTTATATTTATTAGAGTTATTTTACATTATAT:1 + chr3R 24454698 5' + Cr1a 4317 1 63.01 AATATCGGCTTTCGTTTGTTGAAGTCGATTAAACTATATGCAACGATATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 25904253 5' + 412 7125 2 70.55 CCCAAATAGTGCCTTCTTTTCGCTTTGCGGAAGTGTTACAAAGGGACAGAAAAGTTAAAAGGAGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 16181091 5' + roo 8683 2 70.55 GGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGA:1 + chr3L 7995452 5' - P-element 2785 1 17.81 CTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCAC:1 + chr2R 5070925 5' + Tirant 10 4 25.55 ATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr3L 17707808 5' + Doc 46 1 50.00 ACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGGTGCCGTGTAT:1 - chr2R 1949142 5' - Cr1a 4405 1 68.57 CTCCATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGCACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 - chr2R 10865251 5' + blood 7068 2 54.48 GTTCGCATCTAGGGTCCAGCCATGCAAGTAATAGTATCCTTCTCTTATGGGACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTA:1 - chr3L 22648375 5' - Tabor 415 2 63.45 CAAGCGACCAAAATATGACATCTTTCCAAGGTTAAAATAGCTAAGGCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chrX 18806235 5' - roo 8997 2 68.49 ATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chrX 5150292 5' + roo 8737 2 68.49 GTGTTCCACTTGCCGAACGTTCCGCTATGTACTGGCTTCCTTTCTTTACGTTTGTGTTTGCACTTGTGTTTTTGCTTTTCTCGTTGCCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATC:1 + chr2L 16422953 5' - Bica 242 2 64.83 GGCATACTTTAAGGCTGCGGCTGGCACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAGTGCGGGTGTGATGCTATGTATGATGGGGAGAGAAATCTGCGGTGCCACACACACACACACACACATTCACACAC:1 + chr3L 6015010 5' + accord 7037 2 73.02 CGACTCTAGGAACTCTGGTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3R 25304820 5' - roo 345 2 63.01 GGGGCTTCATTAACTGGTTTTTCTTTCCCTTTTGGTTCGACGGCCTAACGAGGCGCACAATCAACCACTAATTAATGGAGTCAAGAAATAATAATTAAGTATAATTCTGGTATTTCGGTACAAAATATCATTGATTTATACAAAAT:1 + chr3L 22008377 5' + Tc1-2 435 1 58.22 CTTGTGCACCGTCTTGTGTCAAGTAATTTGGGTTCTTTGGGGGATGGTCGGGATATATGTATATATATATGTAAGTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chrX 6138606 5' - opus 459 2 59.57 AAGAGATTAATTTATGGATGTTGGAAAAAAACCCAGAAATCTTGGAATTATACAACCCATTAAAACAAAATAAAACAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAAGC:1 - chr2L 21762408 5' - INE-1 528 1 58.62 GTTTCCTGCTCGGAGGCCTGCACAATTTAATATGAATAACATTTTAACCAAAAAATAAATTTTTTTTCATTTTATTTCCCAAAATCTATTGATATACCGAAAAATGATGAAATTTTGCGTTCGCATTCACACTTGCTGAGTCACGG:1 + chr4 869362 5' + INE-1 536 1 60.27 TCACGTGGCAAAGGCTTTGATTCCATGCTTTGTTTGGCCTCTCAATTAGTTGCCTCATTGCATGACCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr2R 20865765 5' - 412 440 2 54.55 GAAGGAAGAGTTTCTGACCATGTAAAGTAAATATATTCTTGATCAGGATCAATAGTCGAGTCGATCTGGTCTTGTTCGTCTGTCCGTCCGTATGAACTCAGGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr3R 2790045 5' + pogo 14 1 75.35 GAATGCCGAGCCGCATAATATCCACTCAAGGAACAGCGTTCACCTCAAAAGACTTCGGCAAATTCTGCCGATAATAATATAAAGCACACCCTAACAGCCTTCAGAAGATTTTAAAAACTTAATGAT:1 + chr2R 4878341 5' - gypsy8 4612 1 82.54 CAAATTCTGTTTGCCCGAGTGTAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chr2L 16948767 5' + jockey 4709 1 60.27 ACACTCTTGTTCTCTCGACTGCTATGCTCGGGAATTATGATTGGGGCGCGGTTCATTAAAAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGT:1 - chr3L 5983487 5' + Circe 34 2 50.00 ATGGCTGTGTCCCAAGTCTCTGTTCACGTGCTCTTCGGTGGTTATTAAAGGTATCACTCCAGTAGCTCATATTAAATGGGTTCTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAAT:1 - chr2R 20673755 5' + mdg1 39 2 56.85 TTTAATATTTTTATCTAGTTTGTCTATTCATTAAAAAAAAAATGGTTCAAAAATAAAGTGGCCAACTAACAAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3R 17305561 5' + roo 8713 2 52.74 AAGCTTTCCCAGCCCCACCCCATTATTTCCATATCTTTTTTTTTTCTATATATGTACGAATAAGTATTCGATTGGTTGGGCATCTTGTGCCACAATTGTCCATGTGGGAGTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chrX 1689927 5' + 412 10 2 78.77 CTTAAATCGAATAAAGTAACTTATTCTAATTTGCTAGAAAATTAAATTTAAATTTATAGATCTTTTTACGAAATATATGTTGTACGTCAATTGAGATGATATGGATGCTTTCGCTGCGTAGATACCATGGTGCCCCAGTGATAGTT:1 + chr2R 16643356 5' - 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chr3R 17305569 5' + roo 8705 2 56.16 GGAAGTATGTGACGGATTGGCAAAATTGTTTTCGATCCTTTGATCGTGACAATTCTGGAATATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTC:1 + chr3R 3623494 5' + mdg3 5379 2 52.00 GCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAA:1 + chr3R 8709797 5' + jockey 4761 1 78.08 AGCCACGCGATAACACCGAATCACGACCCATACGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGGCTCATCCATATTAGT:1 - chr2R 15829611 5' - invader4 3073 2 66.99 TATGAGGCTTTAATATTTTTATCTAGTTTGTCTATTCATTAAAAAAAAAATGGTTCAAAAATAAAGTGGCCAACTAACAAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 17305569 5' + roo 40 2 56.55 GGCGCGATATTCAATTTCATTTTTTCAAATATTATAATTCATTTCAAATAACTTGAAAAAGTCTATTAAATACGATCAAAGATCTTTTAATATTAAAAATGTGATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 + chr3R 17546576 5' + blood 7032 2 69.86 GCGACTAGTTTAAATGCCACAACAGCTGGCAATTAGCTGTGTAATTACACGGTCTTTGTGGACCGCAAAAGTCCAAGTCAAGCATTCCACTTATAGTATCGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 27794917 5' - roo 9053 2 72.60 GATCAATTGACGATATAATGGAGATCTATGCTTAGAGTGATTCCACGATTACTATAGCATGGATTAACAGTGGTCAAAGTAAGATCAAATTTATAAGAAGAAGATCTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATG:1 + chr3R 19446308 5' + roo 120 2 71.23 TAGCCAGTCTGTATATGTAGTTCCGGTTTCCGGATTTGATTGAACTTGGCGGAAGTTGATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1 + chr3R 29733019 5' - opus 448 2 57.25 CGATTAAAACAATAGAAAAGCAGTGATGGATGATGCGGACTACGACAACGACGAGTAAGTGCAGGCGTAACGCAATCAATAGCTGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAG:1 + chr3R 5371862 5' + HB 34 1 77.48 GAGTGGGATGGGAAGGAGGCATACAAAACAAAATAAATAAACCCAATACATATGCAAAGCTTTTATTCTTGATATGTATAAAAAAAAACTTTGGCACAGCAGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTG:1 + chr3R 9351949 5' - Tirant 8494 2 76.76 GGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATT:1 + chr3L 25232768 5' - accord2 7554 2 67.12 TAGTGTTTTGAGTTAGCTAAAATTAATTAAGACACTTTAATCAAATTTATAATGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr3L 18471568 5' - hobo 2937 1 46.43 GAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 7515751 5' - roo 9036 1 56.49 AGAAATTTAAATCATAATTCCAGCTTCTTGTTTTAATTAATACGTTCAATATGTATACATTCTATGTATGTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAA:1 - chr2R 8642980 5' + Doc2-element 4751 1 52.05 GCTGGAAAAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 76026 5' + roo 8712 2 56.85 GAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTA:1 + chr3L 24152419 5' + HMS-Beagle2 6920 2 58.33 ATGACCCACAACGAGTGAGTGCGTGTGTGTGTTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr3R 28396589 5' + jockey 65 1 54.79 GGTTCCCTGCACACCGGCTGCCCGGTCATCGTGGGTTCCAAATGGGGTTCGTAGACTTGGAGCTCAGATTGATTTGGGTATTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGG:1 - chr3R 30510422 5' + gypsy12 8 2 73.64 TTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTGGGTGAGGACTT:1 + chrX 21772473 5' - springer 7083 1 64.38 ATTAGCTCGTTGCGACCTGCATTAAAAAAGGCATAAAGATTACATAAAGTTGAATAAATACATAGCGGAATACTACATCACATTGCTAGAGTTACAGAAACTAGTGATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAG:1 - chrX 15820417 5' + Quasimodo 478 2 68.49 TATCTAATGTTTGCAGACAACTAAAGGCCCCTGGAGACTGCAGCTTTTATCACTCCATATAAGTCTATAAAAACGTGTATTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3R 27478603 5' - hobo 2922 1 69.11 AAATACTTATCATCTACTCACGACATGTGTGCTTTATCATTAAAAAAAAAAATTTTTGTTTAAATTACAATTGATTGAAAGATTATTGTTTTAACATCGAGATGACGATACCTTCCCAAAAAGCCAAGGACGACTTTAA:1 + chr3L 21190315 5' + gypsy4 6534 1 66.91 CAATTATCGACGGTCGACCGACGTCATTAGCAGCAAATTAGAGTCGCTGACCCACTCACCAGGATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACA:1 - chr3R 15655036 5' + Tabor 499 1 65.77 TTGGTCGACTCGATTGCAGATAATGCGGATAATTTGATTAGAGATTTTTTTTGTTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGTAGATGTGTCTAAGGTCGTTACAATAAATAACTCCCTTAGAGATCTTTAATGTT:1 + chr3L 3424478 5' - I-element 474 1 63.04 GATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTACGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCTTTA:2 + chr3L 24757197 5' - Cr1a 4257 1 54.11 GCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3R 4581846 5' + 297 6617 2 54.33 CAGTGACTGGGTTTTGCTGAACCTATATTTTCTTAGTAAATGTATATATGTATCCATTACATTGCATTGGGGGAGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCACGGAAGC:1 - chrX 6510155 5' + jockey 4676 1 80.43 CAGCTTGATTTGGCCGGCAACGAAAGGATCACAAAGTTGCAATATGTTTTCAACTTTTCGTGTTTTACGTTAACGTAACTTTATTTCGACTGTCAGTTCAGAACTAAATAATACAAAGAGAGAGAGCTTAAGATTACCCTATCTCG:1 - chr3R 8494678 5' - Chouto 92 1 56.16 AAAAGAGAACTTAAGAACCAATGATCCTGCATTTAACTTGTATAGACTATATATATTCTTGATAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTT:1 + chr2L 13154223 5' + Juan 44 1 44.52 GGAAGCTATGAACGCTATGATCGAGTTATAGAACTGTAAGATACCCCTCAACTCACCTAGTGGTTAAATAATAATAAAAAACAAACAAACATTAAAAATAAATTCGCGTTCGCATTGTCACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAG:1 - chrX 21290995 5' + INE-1 547 1 48.63 AGGTGCCCATATTAGGATACAAGCTCGTTTTAGTAATACAACAAGTAATTATCCCAAAAACAATATAGGTAAACTTTTTTCTATTTTAAAATATCTCCAAAATCAAAGATCAAAATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAG:1 + chr3L 9399499 5' - Quasimodo 7108 2 77.40 GAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 + chrX 1103610 5' + pogo 59 1 60.27 AAAAACCTAATTCAAAAGATATGTAAGAAATTCTTGTTACCGCCAAGCACCGGGTGAAGTTGATGATGCCAGCCTTGGTGGCTCCGTAAACCAGCCCAGTCGCTACCGGAGAGTCTGG:1 + chr3L 16353640 5' + baggins 282 1 77.12 GACTACCAGTGACCCAGTGACTGCGGCGAGGGATCCCAACTCCAGGAACCCACACCACTACCCTGAATCATGTAAGTGGGATTCTCAACTTAAACACTACTCCAAACTGCGTCTAGAATTTTAAAATATTTAAAATATTTGTGCGA:1 - chrX 21907831 5' + gypsy3 499 1 76.03 AGCTGTCCAAAAGTATGCTGCAAAATGTTTTAATTCTTGCGATATAATACTGTTTACATGCAACCTAAGAAGTTCTCATGCTGAAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr2L 4179512 5' + jockey 21 1 63.11 GCACCGTAAAGTGAAGTGAAAAATGCACTTGAATTTTCCTATTTTTCCCTAACTGTTAAATCTGCGCCAAGGTTTGTTCTTTTTTCTATTGTAGTTTTCGAAGGCCAAATAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 + chr3R 22097554 5' - copia 5078 2 73.29 CTCACTGAGCTCTGCGCACACATTTGGCGGTATTGATTAGAAGTTGCGACATTGCGAATTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chrX 1523682 5' + jockey 20 1 75.00 AATATATCGAAAATGGACTAATTGGTTAGCCGTAGAAAATCGAAACTTATAATTGGAATACGTAAGCAGGATTGCGTTTGCCGTTTATTCCGCTGATGAAATCGCAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTC:1 + chrX 17488021 5' + 1360 3224 1 77.44 CATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCT:1 - chr2R 4261944 5' - invader4 2965 2 69.78 CGAAAAGGCGCACAACTATTTTGATTGCCACAATTTGTCACAGAATAAAATAGGTGAGAGGATTTGGCCCGCTGCAATTCAATTTAACGTTTTTGGCTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTG:1 - chr2R 21414512 5' + BS 5059 1 73.33 TAGTAACAAAATAGAAAAAATGTCTAAGTGAAATATTACTTAAATTTTTTCAGTTCAAGAACTCCAGCTTAAAAATATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr3L 18729819 5' - mdg1 7415 2 47.95 CTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 + chr2R 5214943 5' + F-element 44 1 53.85 TTTTATGTTGTTAATTTGTACCGTGTTTTGTGATAAGAATGAAATCTGTTGTTTAATATTTAGTCTGTCGCCTTCATCTAGTGTGCCAAAACAGTACTCTAGATACAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATAGGTTATGGGCCCA:1 - chr2R 2953881 5' + Dm88 190 1 67.81 CTGTAATTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGA:2 - chr3R 11547828 5' + G6 1632 2 75.34 TACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:3 - chrX 21852438 5' + Tirant 8170 2 67.44 TCTAATCGAGGTTAAATATACGTTTAAATATTTTGAAAGAATCTACATTTCTTCGAGTTTTATTGAATTTTTATCTTCTGGTGTTGATAATAGAGGGACCGAGGAATCAATCGCTCTGTGCAAAATATCACTCATCGTATTGATCC:1 - chrX 22562585 5' - transib2 2353 1 54.79 ATTATGGCAAGACAAAAGCCCGTATTAATTACACAACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr3R 18816010 5' + hobo 23 1 71.33 AAAGAATACTTTTAAATGTAAAACTAATAAACAGGGAAAAGAATAAATCAAATTTAAGTTTTTTTGATCATCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr3R 17546720 5' - blood 7343 2 50.00 CAGATACACGCGCCAAATGGCCACCAAGTCGGAGCCAGATCCATCGGAGAAGATATAGTGCATCCAAAATGAATCGCCTAATTGAGACCTACCACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTC:1 - chr3R 15841384 5' + I-element 5144 1 70.55 CACGAGCAAGGTACTTGTAATCAAATACTTCATAGATTTTACTTCTAAATTCTGTTGTATTTATATAAAGATAGAAGAGACATGGGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGG:1 + chr2R 11133757 5' - roo 301 2 33.33 GAACTTTATATGCTGTAATCAATTCAAAATGGTAGTGTAAGCCCATAATTAAATGTTTACACTTTCAGATTATTCCCAATTACAAGGCGGCTTTTATCACCGAAGATAAAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCT:1 + chr3L 11776615 5' + mdg3 5262 1 74.13 TGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr2R 8305234 5' + roo 84 2 78.08 GAGCGGTTTTAGTTTTCGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTT:1 + chr3L 11447862 5' - Doc2-element 322 1 77.27 AACACACCTGAATTCTACACTTGGAACAGAGGCACTCTCTAATTTGATAAATAATTATAAAAACTTCATATTTATACTGTACTACTACTATATACTCACTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTG:1 + chr3L 9713899 5' + G2 2662 1 69.18 ATGCATGCTCAAATTCACCGCGAACCACACAAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr3R 24476409 5' + 412 7070 2 70.80 CGGCTTTCCTTTATGCTACTCTCTTAGTTTTTTTTTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCGACTTTTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTATTTATGATGAATGGTGAAAATCTT:1 - chrX 3060720 5' - I-element 294 1 80.82 AGCAATGCCAATGCTCGGAAAAACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 - chr2R 21402701 5' + mdg3 5301 2 50.36 AACTTCACTCTCCTTAGCCAGCAATCTATGTGGCTATAGATTTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAATTTTGCGGTCATAGCGATCAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAA:1 + chrX 16385780 5' + diver 141 2 70.34 AAAATTCAACTAAAAATATTTATTTCTTATCCAGTTTCGTCGATTTTAAGCTATGCATAATAAGCTATGATAATATAAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAA:1 - chr4 1147487 5' + invader4 39 2 58.22 ATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 + chr2L 17250704 5' + opus 46 4 54.29 CAAAAAGGCCAATACAAATACACACGCAAAATACAGCAGAAAAACGACTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 + chr3R 10266085 5' - 1360 3329 1 65.67 GGTGGGAAAAAGCGTCGATGCTGCGCCTATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCC:1 + chr3L 24152386 5' + HMS-Beagle2 6 2 80.14 TAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTACACACAAGTGCC:1 + chr3L 24152438 5' + HMS-Beagle2 49 2 53.28 AGTTCTCCAAGTACTGATTGGATTAGGCTCGTGCCTAATATGGATTGCTCAAAGTGACGGGCTCTGGCCAGAGATTCCAGCCTGTTGAGTAATTAATAAATAAGTGGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 + chr2R 20865614 5' + 412 5 2 81.48 GGAGCCCTTATAAAACGCTTGTTAATACCACTAGTTTCTAACATGGCAATTATATGTTTATATTGTCGGATCATTATCTATCCAATAAGCAGGAGATCTACAGCGGAGCTGATGGAGTTGT:1 - chr3L 14277259 5' + aurora-element 3910 1 75.21 AATGGGGTTCGTAGACTTGGAGCTCAGATTGATTTGGGTATTGTAGAGGCGACTGCAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGTCAGCTGTGACACACTAAAG:1 - chr3R 30510382 5' + gypsy12 57 2 64.71 CATTACATCACCTCTGCAGGAAAAACAACAAAAATATGGGAGCCTTGTTTTTCATACACATACTGACCAGGAGGAAAAAAGAGTATGCTAACATAAAAATCAACAAAAAGAAATCAGAGAGATGTACACACACACACACACA:1 + chr3R 11096914 5' + accord 7026 2 72.54 CAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAG:1 + chr3L 9571675 5' + jockey 4533 1 69.92 AGTATTTCATTCACGTAGTATTTTGTTTTTGTTTTATTTTTTTATTTACACCTTATTAAGGCATACGGGTTAGCTGAAAACCCCTTTGTCACCTTGGTATCTATTAATTCAGCCCTTGCAGGCG:1 - chr3L 23955827 5' - BS3 1702 1 75.81 CTTGACTTGGGAATACAGAAGCTGTGCATCAGCACAGACTCTCAGTTTTTGATCAACTCCATAACGCTGTGGGTTGCGGGTTTTTGTAATATTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATTCTGAAATGGAATCGT:1 - chr2R 7931452 5' - Bica 4538 1 56.16 GTATTTGTTATCTGTTTAAAGCAATAACATTTTGTAAATGTTTTCAATTTATTGTTTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3L 20712936 5' - roo 9036 1 60.69 GTTTGCTACACGCATAGTGAAACGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGATTCGCATCTTAA:1 + chrX 3996525 5' - roo 8986 2 82.96 CAGAGCAGAGCAGTTGATTATCTTAATCGCGATATAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 + chr3R 27478509 5' + hobo 85 1 75.17 GAATAGATAGGTTTCACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3L 14553084 5' - roo 9029 1 54.79 GTCATGCAGATGGGCGACGCGAAAGCATATTTAACAAAATTTACACGAAATTTCCCACTTCAAACGCCGGCCACTTAAAGCTTATTAACCAATTTTGCTTTAAGTAAAAAATGAGTTACAAACAAATATATTG:1 - chr3R 20128131 5' + Tc1-2 1586 1 56.39 ATATCGACATATAAATAATGAAATGTATAGTGGCATTTTAAACAGTTTTTAACAGTTTAAACAATTTAAAAACTCGCAGCTTTTCATCTTAATTTAGAATGAAATTTAAAAAATATTTTTTTTTA:1 - chr2R 18695080 5' + Transib5 2729 1 44.00 AAAAACCGTTCATAGTTTCCCAGATCCAGATCCACCTCGGCGCCATCGTCCAAAACGTAAACCTCGCCTGCGAAAAAAATTATAAATACAACGAGCACAATCAAAAATCCTGCGAACAATAACTGGAC:1 - chr3L 15110861 5' + Doc4-element 2674 1 66.41 ATTCTATGGAGATTAAAGGTGTCTAAAAGTATGCAATGAAAGCTGTCCAAAAGTATGCTGCAAAATGTTTTAATTCTTGCGATATAATACTGTTTACATGCAACCTAAGAAGTTCTCATGCTGAAGCATTCGCATGGGAGATGAGC:1 - chr2L 4179563 5' + jockey 5 1 54.11 AGCTGCATATATTTAATGTCGGCATCCTACCCGCTACTATATAAACTTTTCCCAGATCGAGATTTATACCACACATTGCGTCATGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCAA:1 + chr3R 10204847 5' + pogo 1849 1 60.43 AGAGGGAAAAATCATCAATCATATTTTCTGCATAGCTGAATCATTTGCGCCGATCAGTTGGGGTTACTTAATGGGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr2L 12553528 5' + 412 47 2 52.74 AGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATAT:1 + chr2L 15834452 5' - hopper2 1544 1 58.90 GTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCTATGTTCCCTTTGCTCT:1 - chr2L 23295892 5' + micropia 134 4 50.68 GGCAAAACTTATTTCCTATTTCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3R 28272252 5' + Tirant 39 2 77.91 GTGCGGTTGCACCGACGAGCAAACAGAAGTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAAGAATTT:1 - chrX 22610763 5' - pogo 2014 1 76.71 CACCTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3L 14076281 5' - roo 8992 2 72.60 ATGTGTGAACGTTGGAAACCAATTACGTCGTGAATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTT:1 - chr2R 19352037 5' + Burdock 6221 2 76.03 AAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGTA:1 - chr3L 19350001 5' + jockey 16 1 69.66 GATGCCAAAGAATGCAAGCAGCGAAAGAGCGAAAATTTGTTTTCATTGTTGAAAAATTCTGTGCAAATTTATTGAATTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACT:1 + chr3L 1404983 5' - Ivk 5333 1 56.16 AAAGACTTTCAGCTCTGCTCGTAGTCTCGGCCAATTCAAAACTGCCGTTTCATTCATGAATGCTCTTGTCGATTCAATCATTATAAATATATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr3L 23042000 5' + pogo 29 1 64.38 ACAATCGATCAATTGGTATTTTTAAATACATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr2L 14201441 5' + roo 8750 2 82.98 ATAAGAATTGAGAACATGACAGAAGTTCTTAAAGAAAATTATTATGTTTATAAGGAATCAATAAAATTCTTTATGATTACGAAACAGCTACACTCATTGCACGGTTTTATGAAACGAAGATCAACAACCACTAACCTCTTGA:1 + chr3R 19448758 5' + Q-element 232 2 69.72 GGTAGTCACCGAGGTAGAGAAAGGATGGCACATTGTTCGCATCTAGGGTCCAGCCATGCAAGTAATAGTATCCTTCTCTTATGGGACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1 - chr3L 22648409 5' - Tabor 448 2 59.59 CCGGACTTTAATGATCTCTCTGGCCCAATTGCATTGCTACATTGTTTACCATTAAAAAAAAAAACTTGTTAAAACCTTTAAAACCAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAA:1 - chr3R 30818759 5' + I-element 5003 1 51.37 AGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACAAAGTGTATAGTGC:1 + chr3L 17707838 5' + Doc 92 1 72.60 GAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:1 - chr2R 17890966 5' + Tabor 55 2 57.78 CATGGGCGTTAGAGTGCCGGGTGCTGGCCTCTTGAAATTTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:2 + chr2R 21371455 5' + roo 8743 2 75.34 AAACAAACAGTTGATGGGAAGGTTTAGCACTCGGAATTAATACGATTTGTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 + chr2R 23000017 5' - mdg1 7422 2 59.59 GGATCATCGGAACTCGTACCTGTATGTGTTTGACTACCAGACGCGATTCGGTGATTATCCTCAGGTGAGTTCAAGTTCAGCTTGGAAAATGCGGTGCAAATTAAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAG:1 - chr3R 7574320 5' + F-element 4607 1 76.12 CTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAA:2 - chr3R 934264 5' - Rt1b 4713 1 42.47 TTGGGTTCTCAAATTCTCGGGTTCTCCGGCCGGAGATGCTGCGCGTCCGAATTAAATGAGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGT:1 + chr3R 16937591 5' - 1360 3157 1 59.31 ACATACAATAATATTCAAGGTTACCGAATGTTAACAAAGGCAGTTACCTTTGCCACACCTTATTAGCCCCCATCCAGTCGATCATCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTCATTATA:1 + chr2L 12079583 5' + mdg3 5291 2 58.22 AAATACAATAATTATTCCATTTCTGACATAAATCCCAAATTTTTTGCTGTACAAGTTAGCGACGAATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAAATAATAAGAACCATGCACGCACCGAGAGC:1 + chr3L 10545237 5' + invader4 441 1 51.13 TGGGATGTCAAAGTAGAATGCTCTAAATAGGTCGGTTTTAAGCACTTGAAATATATTTTAAAAATATATAAAAAATATTCAGAAGTTTTAGCAGTAAATCTAGTGTGTCTTAGTGAAGTCGTGCCAACCCAATACGCATGACTTAC:1 - chr3R 23027434 5' + Q-element 700 1 75.34 TATAACTTATACTACAGTGAATCATAGGTGTATATGAGTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGA:1 + chr3L 23875798 5' + X-element 76 1 68.55 GAATGTTATGTTATGTTATGTTATTTCATCATGCCCCCGCTCCAACCCGCGACCACACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGC:1 + chr2R 4878987 5' - invader1 89 2 58.89 ATGTAATCCAATACCAGAACATAAAGTGCACGAGATGTGGCACTCGTTACGTGGCTGTATGTTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTT:1 - chr3L 11376567 5' - Bari1 1648 1 58.90 AATACACACCCATACCACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTCTGATCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1 - chr3R 20175783 5' - hopper 1352 1 65.19 ACAAACCTCCAGCCCAGTTCAGTCCAGTCCTTTCCTTTTCGGTTCCCTGCTTTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chrX 17806037 5' + roo 64 2 63.64 TAAATAAAAAGCGCAAAGGCTGAAAAATAAAGCACTCGACATGCACACATAGATCTACTCCTTCTGCCAACGCCCACTCAGACAGACCCCGACCAGACTCTGATTCAGATCCAGATCCAGAGCTATATATATATATACATATAGCT:1 + chr3L 4716767 5' - 1731 4409 1 65.07 CGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAG:1 + chr3L 9571684 5' + jockey 4533 1 75.00 AGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGAGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chr3R 6388783 5' + jockey 82 1 69.85 AATTAAATGCAATCATTTTGGAAACATACTTATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 12138902 5' - roo 9053 2 67.41 CAGTAAATTACTTTGTGGTCAGGACTAAAGCCCCCAAATTAACTTAAGCCAAGCCCAGTCATCGTTGCATAATCCCTCAGATTTTGGGCCATCATAATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCAGCG:1 + chr3R 9904608 5' + blood 212 2 73.88 GTTAGTTGAAAATTTTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr3R 20744060 5' + roo 71 2 69.86 AGTTTCCCAAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTG:1 - chr2L 12340819 5' + diver 5947 2 62.02 TGCAAATTCCACTCGAGAGAATATAGTGCATAAATTGGACCGAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTA:1 + chr3R 14860112 5' - BS 5060 1 57.53 ATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAACGTAAA:1 + chrX 10567795 5' - roo 8980 2 76.03 ACATTTTATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTCTAAGATATCGTCCCACATCTTATATTTC:1 + chr3L 24934262 5' + HMS-Beagle2 6903 2 70.71 ATGTGTTTTTGTAAATAGAAGTATTTGTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:2 + chr3R 13122494 5' + blood 61 2 58.22 GAATCATAAGCGCACTTTCCTTCTCGACACAAAGAGTCCGACGTTGCGAATCATTGTACAGAGAGAAAAATATTACGTTTCAAGTTTGAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACG:1 + chr3R 26519930 5' - FB 836 2 52.05 TGCCGCCTTCGATGGCTTCATTCCATTTTATGGACATTTATTTTGTTTTTGGGCCTACTAAATGGCCAGCAGTTTGCTTTTTTTTGTTTTTACTTTACTTTTCAGTCTTGTTGTTTTTTCTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTA:1 + chr3R 27789514 5' - jockey 4886 1 70.55 TAAATCTAAAATCCATTTATTTACCATGTTACCATTACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATC:1 - chrX 10161214 5' - micropia 5397 2 52.74 TTTTTCAAATATTATAATTCATTTCAAATAACTTGAAAAAGTCTATTAAATACGATCAAAGATCTTTTAATATTAAAAATGTGATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr3R 17546596 5' + blood 41 2 56.16 CTTTTTGAGTGCCTTTGAGCAGACTACTGGCATTAATATTAAATTGGCTTTTACGGGTGCTATGGGCTCTTAAAGTTTAATATCTACAATCGATCAATTGGTATTTTTAAATACATATTTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2L 14201526 5' + roo 8668 2 72.92 CGAGCGTGAACGGGTTGGGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:3 + chr3R 17305434 5' - roo 9021 2 54.11 ATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAA:1 - chr2L 1260001 5' + Burdock 72 2 68.97 TGCTAAATGTAGTAAATAATATTCTCTTAAATGTTAAGATCCTCAATGGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAA:1 + chrX 16383966 5' - diver 6082 2 65.07 AGTGCTTCAGTGCTGACGTAGGCATCCCACACACAGACAATTAGAAACATGAATGCACTGTGAGAAACCAGCTTCGAGCCTATGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chrX 22725660 5' - roo 9035 1 60.96 AAAAAAGCTAAATGTCTTATGTGAATTTTTGGTAAACTATTAAAATTTCTGAAATTTCTGACACTTCAATATAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTGTAGCCTACTACAATTCGACCA:1 + chr3L 6747439 5' - invader2 4850 1 51.37 TAGTCCGTGCAATGAAAGCAAATTAGCTTAAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 7035195 5' - roo 395 1 75.86 ATTTTTGTACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 + chr3R 4581836 5' + 297 6626 2 54.11 AACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTAACACCCCACCCCCTAAA:1 - chr2L 22016006 5' + Tirant 3 2 73.86 ACAACATTTGTTCTCCTGTTGAAATGTTATTCTACCTACACAAAATGCGTATTTCAACATAAGTAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATG:1 + chrX 8257305 5' - Ivk 102 1 58.90 CGTGAATGGTCAAATACGTACTATGCTTGCAAATAAAAGTCTTTCACTCTTTTATGCTGGTCATAAAAGAAAACACTTCTTTTTGCTTATAAATTTATAGAATATTGGTTTCCAATAGTCTAACTCAAACTACATTTTTTTTTT:1 - chr3R 24088610 5' - invader5 3615 1 54.17 GCAAACAAGTCCGCCCCAATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGTCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAACGCAACTAATATACTAATGTA:1 + chr2R 6842800 5' + roo 8613 1 69.86 AAGTTGGCAGAACCCCCTTCGTCCCGCGGCTCGTAGCTTAAAACTATGCAAATATGTCAAAAGTTTCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr3L 2147683 5' - roo 9039 1 56.80 CCTTTGTGCCGCGTGCGCATAATTGATTTTTTCGCGGCGATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1 + chr2R 11763545 5' + Tabor 24 2 69.18 CAGTGCAGTGCTTAATTTGATTTTTTTTCGGCGACCACAGACTAATCAAGTCGGGCCTCTCAACATCACCACCAATGAGCTTACAAATAAAGACTAATCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGGAAATTAATTAAAAGT:1 + chr3R 1192889 5' - Cr1a 3988 1 71.92 GTACTGTGAGGTGGGATAGTTCAGATCTTTACTGCTTTCAATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - 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chr2L 246092 5' - roo 345 2 61.64 GGTATTAAATAACAATTATCTGTTCGTATCTGGCGCTGGTGCGTTGAAACTGTCACAGATAAATCGGGAAAACTGAAACCCCAGTGCACCGTTTGTCATTTGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2R 7953786 5' + roo 20 2 72.60 ATGAAGGTTTGATTTGCTGCCTGTGTGTGTTAGTGGCTCAATTTGCGACGACATTTGCTCAAAATAATGCATAAAAACTTAAGGTGTTCTCAAGTATCAAGAATGAATTATATATATCAATAAAAAAAAAATAAAAATATGTTTTC:2 - chr3L 7835824 5' - INE-1 462 1 71.92 ATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTT:1 - chrX 20999592 5' + BS 56 1 60.27 ATCACATTCTGAGGGTAGCAATGCCTCTGTGATCAGCCATGAATTGATGTGCTGTATGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGC:1 - chr2R 4362616 5' + gypsy 46 2 59.06 ATCCCGCGAACAATCTAGCGGATGCAATCGAATTTAAGCTAAGTGTTAAATGGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCACGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3L 19836515 5' + pogo 46 1 57.36 GAATTGACTTTAATTTTTATGTTATGTTTTACCAATTCCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTT:1 - chr3L 24291192 5' - pogo 1689 1 73.97 AAGAAAATATTTTTGTGGTATTCCTTCATTTATTACAATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr3R 16913484 5' + pogo 37 1 60.96 GGTTGCAAAGAGATTGACAGCTTAATTACCTGGAGCCTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 14964573 5' - roo 396 1 73.72 TAGGAGGTAAACAAATGTTCTGGCCAGATATGTATGTATATATGTAGTAATAAATATTTAGGATCGTAAATGAATAAAGTATGCTTTTTAGATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTT:1 + chr3R 23859792 5' + jockey 4791 1 65.07 GCGAGATGTGGCTCCTGTGTCTATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAG:1 - chr2L 22780932 5' + HMS-Beagle2 6949 2 63.70 AATTCTTCTCACAGAACGATCGCATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACCCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCTATATAACAATTGATTTAAGGCAGTAGCCCCTCTTGAACGG:1 - chr2R 4802883 5' - mariner2 80 1 25.76 GATGAGGCAATCCGCCAGGATGCCAAACACAATGGCCAGAATCCACATGGCCAGGTAGGGCAGCGAGGATATTATGCCATTTGTGCGAATGTTCACATTGAGAACTCTGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chrX 4785220 5' + roo 12 2 78.08 ATAAAAAAGCCACCAAGCGAAAAAAAAAACACACAAAGGACGGGTTGGCAGTGACAAAGCTTTTCAGGACTTTTCACGGAAATTCCGAATTCTAAAATATAAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGGCGAACTAATGTCC:1 + chrX 21234398 5' - 297 375 2 64.38 ATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr2R 641859 5' - opus 474 2 57.94 ATCTGTTGGACGTGTTGCATTGGCTAACTGGTGACTAAGACAGCATAGGGTTATTTCTTTCGGAATGCTGACACAAAAAAAAAACCTAAACTTTATTTAGGTCTCTTAAAAAATATTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAA:1 + chr2L 5694073 5' + copia 6 2 67.81 ACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 - chr3R 9160781 5' - copia 5074 2 48.63 TGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3L 23456269 5' - 1360 3348 1 57.60 AATTAAGGAAAGTGCAGAAAAAGTGACTGACACTTGGTAAATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr2R 6842844 5' - roo 8995 2 69.18 AAGGACACTGTGCAATTGAAGCACTCCTCCATTTTATTCCTTCCCTGTACATCTTAGCATACCAACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAAT:1 - chr3R 26246943 5' - 1731 293 1 65.07 AAATTGTAAATTTTTCGTCAGATGCGACTACCCCTCCATTCGAATCCTATGTCCATTGCCACACTTAGCAAAATCAATCAATGCTTAATAATTAATAACAATATTTATATCTAAAAATAAGTACATACTAAAGGAACCA:1 - chr2R 15000782 5' - gypsy12 9737 2 52.52 CACTCGCAGCGGGAATTCAATTTGGTTTACAACAATAAAACGTCTTATTTAGGTTCGGTTATTAATGATGAGTTATGGGTTCAGACCTCCTTCGGAGACGAGCGGACCCATCATCATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTG:1 + chr2R 8641446 5' - diver 218 1 79.31 GCCCCGGGAAAATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAG:1 + chr3R 30634929 5' - roo 345 2 57.53 TAATACGGGGGATGACATTTATCTAGCTTTTTATCAAAGCATGGTGCGATAGAAAATCGAAAAATTGATTCAAGCGTCCTTTTTTAATTAAATTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chrX 13786999 5' - pogo 2077 1 67.12 AACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 + chr2R 5214941 5' + F-element 44 1 54.55 TTGTGTGGTATTCATTTGCGCATATGTATGTATATCGGCCCGCTCGGCTGGCTGTGTGTATATATGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr3R 17067931 5' + 297 6629 2 61.64 CATCTAGATTTTTGTCTATTAATTTAAATCTTAAACTTTACGTTTCAACTTTTTTGCACCAAACCTAATCATGTTTTCAACATTTTCAGAACATTTTTTTATAAATCCCATTTTACTTTTTTTTTCAAGCACATACATGTATGTAT:1 + chr3L 18262475 5' - INE-1 72 1 66.44 ATGGTCTTTGATTACTGCTCCAGAGGATCGCTGCAAGATGTGCTTATCATGGATGAGATCAAGCTGGATAGCTGGATAGGTCCAGGTCGGTTTTAGGACGGAGTTGTAGAGTAAGACCTTATATTCTAGTCTCAGAGGAGAGCGTA:1 - chr3R 4497035 5' - Fw2 3486 1 58.22 ACTTCACAATTTAAATAGATAGTGATTTATTCCGTTTCCTTGATTGCTGTATATTGGGCATTTTATTTGGCAAAATTAACAAAATCACTCTGGCCTTTAAAAAAATAGAAGAAAAACAAGAGAGAATACTTTAGTCGAGTT:1 + chr3R 20125954 5' - INE-1 575 1 46.81 ACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGC:1 - chr2R 4181303 5' - accord 492 2 62.07 CGTGCTGGAGATTATTCGATGTTAAAATTAGTTTAGATTATTAAATTAAGCTAGGCCTATTATAACCAAGTGTGACTGAACAGCGTAAAGGTTTGGACACATGCCCCCAGAAATATTTTGGAAAAGTGTG:1 - chr3L 17868675 5' + hopper 102 2 73.85 CTCCTACTCTGGTTACCCAATTTACGTTAAATGTCACTGACAATGTTTGATGACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACT:1 + chr2R 5542305 5' - 1731 292 2 70.55 ATCGACTTGTAGGACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 - chr2R 5737202 5' - 1360 3346 1 61.86 AATTAAAGTCATTAACCATCCGAACCAATTGGCTTTGCTCCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGACTAACTTCGATTGATTTACTTCTTCCTAAGTGTGTAAACTAGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAAT:1 + chr3L 16973320 5' - S-element 160 2 68.49 CATCGCATTAACACATCGACGACTGCTTCCGATTAAACTGAAAACGAAACTAAGGCGTACTTTGAGGTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACTTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAA:1 + chr2R 22306374 5' - pogo 59 1 54.11 AGATATCGTTCGTCAGAATCTATCTGTCAAATATTTTTCTAAGAATATAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr2R 24453379 5' + 412 72 2 65.75 GGATTGGTTATATAAAAATATGTGATTAAGTAATATTTTATATTTAACAAGAGAGAACACGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGGATGCGAACGCGAAATTTCATGATATTCTGGGATATCGATAGATA:1 - chr4 987550 5' - INE-1 499 1 63.70 GTAGTCTCGGCCAATTCAAAACTGCCGTTTCATTCATGAATGCTCTTGTCGATTCAATCATTATAAATATATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr3L 23042020 5' + pogo 29 1 58.73 ATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGT:1 - chr3L 9909757 5' + Transpac 4995 2 71.85 AAGGTATGCTATGGATTTTGAAGACCATGAGAATTAACTTCATATTTTATAAAGCTCGATTTTTGCGTTTGTCAATATATTTCCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 + chr3L 9497724 5' + jockey 4807 1 54.79 CACACGCGTGCGACGAGTGTCTCTGGTTTCTCTTTGTGTAATTAGGCGAAGTAATTTATTTTTATTACTATTCATTTTCAGCCATGCTCTTCTTCGCTGACCACTTAGAAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTA:1 - chr2R 21418650 5' + jockey 4843 1 73.97 CAGTTTTTTCCGAACTGCTTATTCTGGGATGTTATGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAA:1 + chr2R 10865173 5' - blood 291 2 78.77 AATTGAATTAATTGTGGAGTAGGTTATTAGCGGTATCGAAGGTGATATTAGATCCGTAATTATAGCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCG:1 - chr3R 12593137 5' + flea 4808 2 55.48 CCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATG:1 + chr2L 12349791 5' + F-element 117 1 77.10 AACCATTTGTGTGTACGAAGTAGGTCTTATATCTGGCCAGCTAGCCATATTTACCTTTAAGCCGAACGCACTGGGACCATTCTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTA:1 - chr3L 7015309 5' + F-element 4665 1 61.54 ATAAGTTGCAGGCGGCAAAAGAAATGGCTCAAGTAAATAAAAACAATCAAAGTTGGGTGCCGACTGGCAAGCCGAAGTTTTAGATGCTCTGGATGAAAGCCCAAATTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAA:1 - chr3L 1892185 5' - jockey 4821 1 69.18 AAGCTGGGGGAAACACTGAAAACAGAAACAGTTGATGCCACAAAAGGTAAGTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGAACTCTAGGCACCCCGTCT:1 - chrX 7980877 5' - hobo 2888 1 58.46 ATCGACATTAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chr2R 17890989 5' + Tabor 43 2 53.42 GTTTCTCTTCTTTTCTTCTTATTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr2L 21151496 5' + 1360 38 1 45.89 GCATCCGAACGCTGGAGACTTGGATTGCCAAACGCTGAGAGGGCCAAAAGTCGAACGAGTAAAAAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATC:1 + chrX 7599824 5' + Quasimodo 6899 2 71.15 ATTTTTAATAATTATTTTATTTTATCAAATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTAAACATAACGCAAACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAG:1 + chr3L 27677386 5' + 1360 3249 1 55.63 CTAAAATAGTTTTTTTTTTATTGCTGATAAAAAATAAAAAAAAAAAGGAAAAC:1 - chr2L 3049090 5' + Doc2-element 247 2 84.91 TTTTGAAATAATAATAAGTACAACATTTCTATCACAGGATGATTAGAAAAATTATATAGTGGCGTACTTGGGTGATCCAAACCGGACATTTCAATTATTTCATCCTATAGCCTGGCCTAAACAGATTTGACTGCTCT:1 + chrX 22901592 5' + 297 153 2 67.88 ACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGT:1 + chr2R 5922983 5' - jockey 4915 1 73.29 GTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr2L 2276768 5' + F-element 49 1 65.31 ATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 - chr3L 12224694 5' + 412 85 2 73.97 ACATACACTTTGCAATATTAGTTTACCCTGCAAAAGTGCATATAATTTACGACTTAAAGGCAGACATTAACCGATAAGATAAAAGAAAGCTTAACTGAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 18659028 5' + roo 8686 2 69.93 GCCTGGTAATTAAAACCGAATACTCACACAATGTGCCTTAAAAACAATAAAACACCTTTTTTTTAGGGTTTAAATCATTTTTTATTATTCATTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAATGTCTAGCTTAAAAGATATTATG:1 + chrX 6952093 5' - G5A 2770 1 66.90 ACATACATATATTGTTTTGATTTTGTCCAACATATTTAGTTAGAAAAAATGTATGTATGCATTTAAAAAAAAATATTTGTTTTAATAGTAAAAAAAAGTAAAAGCATGAGAAATTTGTTGCTAGCGAAACACCGGTGTAGTTGTGT:1 - chr2L 20117973 5' - Gypsy12A_LTR 1982 1 28.08 ACAATCTTGTAATATTAATCCCTTATTATGAAGGGATTTCAACGTGTGCATCATTTATCTTAGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTA:1 - chr3L 15327651 5' - blood 7331 1 56.85 ATGTTTTCGAAAATAAATCAGTTCACTGAAAAAAAATCGCATCTCTCACGGCGAACACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chrX 958047 5' - roo 345 2 64.83 ACCAAAAGGTATATTAGAGCACTCAATTTCCAATAAAACAAGACCAAATTAGACAAATTAAATAATTGTCAGTTCATTCAGAACAAGAATAAGATGATTACTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 + chr3R 12592983 5' - flea 4997 2 71.72 ATAATTAATTAATAAAAATATGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGACCGCCGGCTCTCAATTCAACCTAACAACGCGTACTTTTCTTATGTCTCCG:1 - chrX 14900223 5' + Doc2-element 357 1 81.82 GAAGCGTTTGCGACTATATCATCAAGTATATATCAGTATATAGATCAGGATCAATAGCCGTGTCGGTCCAGCCATCTCCGTCTGCCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAT:1 - chr3R 4947762 5' + INE-1 143 1 73.91 CTTAAAAATCGTTTAAAAAGTTAGAAATTAGTTAGTTATAGAAATGTCCATTTATGCCAGCTATCACCGTACCTATCACTTCATCTATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3L 14122713 5' - 1360 3354 1 52.41 TTTGTGCCACTTTGTTTTCAAGGCAAGCACCATGTTTTGTAAATTTTCCAAGAGAGCGACTCGTGCCACTGGCATTGTCTATTTCAATTTCAATATTATGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGAT:1 - chrX 4778312 5' - 412 7524 2 68.53 AGTTACAGTAACTCCTGAAGCTAATAAAATAGCTGTATTTAATAAAGGAATTTGAAATGGATTAAATGAGATAATTCCTATAGGAGGTCATGATGCCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCG:1 - chr3R 1272129 5' + opus 457 2 65.71 GGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAA:1 - chr3R 9352113 5' + Tirant 19 2 68.07 TGAACATGTTCGATATCTACACCAAGATTTTTCTATGGCATTATTTTGTGTAATGTATTTAAATAATAATTACCCACGTTTCCTTCCTTCCTCAATTTAAATACGGCAGCTGTTCTAGCAAATTTGTAATGATCACTTCTGATGTT:1 + chr3R 29264283 5' - invader3 298 1 69.18 AAGATAATTAAATATGTTCAGCCACACAAGTACACGTGCCAACAGATGGCGGAACCTTGTTTTTAATGTACATATACAAAACGGCGATAAGAGTTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACAT:1 + chr2R 12591950 5' + roo 98 2 76.86 CCGGCATAAAATTTCATTTCATTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:2 - chrX 12866528 5' - roo 9050 2 70.55 GGTTCAAATATGGTGGGGGAACTTAATGGGCAAGGGGGACATGGGCGTTAGAGTGCCGGGTGCTGGCCTCTTGAAATTTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2R 21371416 5' + roo 29 2 61.48 AATCCCAATAAGCCAATTGCAGCATGTGTGTGTGTTCAAAGAAAGTCCATCCACCGGGCTTAAGGAATTTGCTCGCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 - chr3L 905935 5' + 412 7 2 77.62 CACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGT:1 + chr2R 13644441 5' - Burdock 182 2 78.63 AGCTTTTTATGTATTTTCAATATGCATCTGATCTTGAATCTGCCATCTTGTTAATGGTACAAATCGGCTGAGTCAGTTTATGTGACAAATCACAAAAGAAAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGA:1 + chrX 8896653 5' + P-element 265 1 72.60 CAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 + chr2R 6632593 5' + P-element 79 1 23.66 GGGTGCCGGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chr3R 27768792 5' + 297 46 2 51.37 AAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTCCTTACAAACACACAGTA:1 + chr2L 17136169 5' + hobo 87 1 74.48 ATTTGCGCATATGTATGTATATCGGCCCGCTCGGCTGGCTGTGTGTATATATGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGACCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr3R 17067918 5' + 297 6601 2 60.95 TTAATATCTACCCGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTA:1 + chr2L 16089572 5' - 3S18 291 2 50.00 ACTAATAATGATTCATACTAGTAAAAGAAAACAAACAAATGTAGGATACTGATTAGGTCTTTACCTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3L 15612699 5' + roo 8721 2 55.48 TGAATGCACTGTGAGAAACCAGCTTCGAGCCTATGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chrX 22725611 5' - roo 322 2 76.71 CCGGTCACCAACAATCAGCGAAAAAGTGAGTATATCTTCAGGCTCTCACAACAATCTACTTAGCACACGTAAGTGAAAAATTACTAAACATATGTTTTGTTAAACAGCGGAGACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTTGGGGA:1 - chr2R 22092145 5' + INE-1 554 1 69.18 AACTTAAAACTTTTTACACGTTGGTGATCGTTCTGACATTTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGA:1 + chr3R 7981491 5' + jockey 87 1 73.29 ATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAAT:2 + chr2R 13644423 5' - Burdock 6321 2 68.49 GTAGGATGGCCGCCTGGAAAGAATAAGGACGAAAGGATTAAAAACCATGCTTAAGATGTACATATGTGAAAGTTTTATGCAAGCAACGGTTCCATGAAGTCGGTTGAACGTAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGAATGTTG:1 + chr2L 16267005 5' - gypsy7 258 1 65.07 GTTTAAAGTTGAAAGGTGTATCTGAATCTGCCGTCAGGTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAA:1 - chr2R 12240161 5' + copia 4954 2 73.29 AATACAGAACTGTTAAAGAAACATACAGAAAGAGATTAATTTATGGATGTTGGAAAAAAACCCAGAAATCTTGGAATTATACAACCCATTAAAACAAAATAAAACAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCT:1 - chr2L 21762437 5' - INE-1 556 1 61.64 AAATGAAAATATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGAGCTTGGCAGTTTCGTGGGCGTGGCCACATTTGGATACAAACTTGCGCTGCGTCTATGCGGAAGCTGCATACTTAATCTCAATCTTCTATCTTTTATAGTTCCTGAGAT:1 - chr3L 24163240 5' - INE-1 151 1 51.75 GTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGA:1 + chr2R 11763595 5' + Tabor 73 2 66.21 GAACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTT:1 + chr3L 2724961 5' + Ivk 44 1 55.48 TGGGGGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTCCTATGCGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGACGTTATCACTGATGACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAA:1 - chr3L 5498517 5' + Doc2-element 250 1 64.38 AACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3R 21705942 5' + 297 6595 2 69.85 ATATTCTTATTTTTTGGACAGTACTTATAATGTAAATACGTCACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 - chr2R 1478226 5' + opus 7047 4 64.96 GGCGTTGAAATGTGTGCGCATTAATCTGTGAAATTGACAGCAACAAAAACGAGCGTAGCAAGTTTGCATAAATGTGCGGGTTTCGGGCGAAAATTGAAAAGATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTT:1 + chr2R 17890828 5' - Tabor 7305 2 69.86 AACATTCGGTTGGACTTTGGTTTTCTATTAAAATCAATCAATTACCCAATAAGTTCAACTGCTTCCTTTAAAGTTAATCATTTTGGTAGTTGATGAAATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTCGAAACGGTTT:1 - chr2R 19467048 5' - Stalker3T 297 1 54.79 CATAATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr3L 11336344 5' + blood 53 2 59.85 TTATAGCTACCACAGCTGTCGCGATTCTCGCTATCCTGGAGCACCGGCCCAGCATGCGTGAGTTACGTCCGTGATCGAGGGCGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTATATGT:1 + chr2L 22015906 5' - Tirant 8472 2 52.17 TTAGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1 + chr2R 11489170 5' - mdg1 365 2 57.53 ATAGTAATCGACTATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATA:1 + chrY 680445 5' + invader2 4894 2 68.75 GCATGGTATCATCCAGTTCCATCTTCTTTTTGTGCCGTCTTTCAATCTTCAATCTTGACAATCGCCTACCGCCACTCGTTAAGTTTTCTGCCAATCGCTTTCGCTAAAGCGAAATGCGTTACTGGGCTGG:1 + chr3R 1446884 5' - gypsy10 5733 2 75.38 GAGGACAGTACATTTCAATGTCTAATTTTTTAAATAAATATTCTCATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAA:1 - chr3L 15915835 5' + Doc 4579 1 69.18 GTGTAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3R 10684820 5' + roo 8738 2 68.49 ACAGCACAGCTGTTTATATATTACTGAGCACAGCTACCCCACACAAACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 - chr2R 7665836 5' - Transpac 239 2 68.49 GCATCCTAAAAGTAGGCAATAGCTATCCCCACTGTGCCTGCCATGCACTGCTGCCTCACGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGCGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chrX 19121053 5' + jockey 36 1 45.54 ACGTCTGTTTGAAACGAGCGCGCCGTCGCGACTGTCTCAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chrX 8891771 5' - P-element 2847 1 40.20 GTTCCTCCTATGAACCGTACGCTTCGACGATGCGAAAACGAATGAAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr3L 14550929 5' - P-element 2883 2 73.28 CATCCACAAGCGGATCCACCAGTTCGGAAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTGCACGAAATATAATATCATAACGTTAAAGTGCTGACCCAGCATCGGACCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACAGC:1 + chr2L 7412550 5' + Gypsy6A_LTR 89 1 78.79 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTTGAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTAT:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 35 1 66.17 GAAACGTGTTTCAGTTATTTTATTTTAAAATTAGAATATGTTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGT:1 - chr2R 6638148 5' + P-element 2700 1 19.86 ATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGGGTAGTCGCTGTTTACTTC:1 - chr2L 23295897 5' + micropia 25 2 61.24 ACAGTTAACAAAATGACATAATAACAAATGTTCGATTGAAATGCCTCAAAAATGTATAAGATCGATAAGATTGATTGGCAAATACATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:2 - chrX 4300202 5' + opus 7030 4 67.12 ATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr3R 19445980 5' + roo 87 2 81.38 AGTAAATCACAAGCATCGCTCTTGGCAGCATTCACAAGTTCAAATAAGCGATAATAAGTATTTATGGGCGGGGCAAGCAGATTCGGTTTCTTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCG:1 - chr3L 13634341 5' - 297 373 2 71.92 GTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGC:1 + chr2L 11574815 5' + Max-element 45 2 52.71 ACGAGGAACCGAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr3L 17890732 5' + 412 7115 2 61.87 ACATTTGGCCGGCGGGCGAGAGAGTTCAGTAACCTCCATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr2R 10865284 5' + blood 7036 2 67.12 TATCAAGTGTACTGGGAATTTCACAGTTTTTGCAGTGACAAAAGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3L 9907320 5' + jockey 18 1 65.60 TATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGA:1 + chr2R 961128 5' - transib2 2666 1 58.90 ACGATTTTGCAATATCTAAATAGATTATATTATGAAAAGCAATAATAAAATGAAAGCCAGCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1 + chr2R 22492021 5' - pogo 2043 1 59.59 ATGGCAATCAATTTTTGGTAAAGTTATGAAAAAAACTCAATTTCTGCCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 - chr3R 24493160 5' + jockey 4745 1 66.44 CATTCTGATAACATTACAAACGCTCCACTAACATGTCTATATGTCTTGGAAGGGAATTCAAACACCCAATCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTGTCGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr3L 14551104 5' + P-element 9 2 73.29 CAGTTTTTTCCGAACTGCTTATTCTGGGATGTTATGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1 + chr2R 10865173 5' - blood 7313 2 77.04 CTGTAGGAAGATCATCTAGTTACTTGTAGAAGGCGAGCTGCAGCGCCATCTGAACAAAGCTGTCCGGACCCAGACGCTGTTTCTTTATGAAGCTGACGCTGTGCGCGAGTATCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAG:1 + chr3R 6371835 5' - F-element 176 1 64.54 ATTAGACGATAAACCTTCACTATAGACTACTTCGCAGAAAACTACTTGCAATCACTTCTCTTCAATTCCAAGCCCCCACAATGCCGGTCATTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 - chr2L 436589 5' + copia 19 2 69.63 GTACCAAAGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGC:1 + chr2R 7727083 5' + BS 4679 1 66.44 ATTTTTTTTTTTATGAGTATATACAAGTTATGTGTTTCTCTTCTGTGTCCAGAATTATGCAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGCCCAGAGATCCTCCTTCTTTCGCTGAG:1 - chr3R 2971878 5' - gypsy 7396 2 54.81 AAAACGAATGAAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chr3L 14550963 5' + P-element 57 1 37.78 CGAGGCGCCACATGTAAACTGGTGGAATATGGGAGCGCTTAATGAAGCCGACACACGATGTTTAATGTGAAATTAAATTTTAATTAAGCCTGCTTTAAACAGGGACCCCTTTTGCGCACGGCCCGCTCG:1 + chr3R 27189867 5' - gypsy8 298 1 81.40 GTGAGAGAGCAAAAGAAGTACGAGGTAACTGGAAGGTTAAATTATAAATGTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTTATTTAAAT:1 - chr2L 12729191 5' - TART-C 11099 2 65.00 GCGAAGTGAGTTTAAGTCTGAGAGAGCCAGAGTTCCACAGTCTCAAAGTTCACTGCACCGGGGATGTCTTATCAAAACTGTTCACTGCCCTCGGATTCAGACACTTCAATGCTTAATAATTAATAACAATATTTATATCTAAAA:1 - chr2L 659924 5' - gypsy12 9760 2 72.92 GTGCATGTGCATGTTGTCATGTGCTTGTGTGCGCGCGAGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chr2R 6632541 5' + P-element 42 1 56.85 AAAGCATTTGTGCTAAACCTTCGTCTAACTAACAATACATATAACAAAACGATATTATCCCTGTTAAGCAGTAGGTGTTTGCATTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 + chr3R 19223030 5' + FB 39 1 59.59 CAAATGCAGCAGCCGCACTGCCAGCCTTCGCATCCACACAGTTGCAAACACCACCGCTCACACACACACGCACACACATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATATTGTGTGC:1 - chrX 7979624 5' + hobo 40 1 45.89 AGGGTACACTGAATGGATTGGATTGGCTTTGACATGGCAATCAATTTTTGGTAAAGTTATGAAAAAAACTCAATTTCTGCCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chr3R 24493193 5' + jockey 4711 1 53.79 ATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTTTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACCTT:1 + chrX 1103639 5' + pogo 88 1 76.03 GTTCTCAAAAGTTAAATGTTTTTATATGGGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAGTTTGTTATCT:1 + chrX 18806179 5' + roo 88 2 80.99 CGGAGAAGTTGCCACGGACACGTTACACAAGTGGCAGCCGAAAACAAAATAAAAACTGAAGCCAGCTTCGTGTAAAGAGCAGAAAAATCATAAAACCAGTTTGTGCTTCAAACCTA:1 + chr2R 20180957 5' + Transib5 105 1 77.59 ATTGTTTCTGGTTGTGAGAAATGTGCAGGAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr3R 10472831 5' - mdg1 7440 2 71.53 AAAAGTGATGACTGCATGTTAATTTGGTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACA:1 + chrX 20999481 5' - BS 5057 1 56.16 CGGTTCGATTGTTTCTGGTTGTGAGAAATGTGCAGGAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGT:1 - chr3R 10472838 5' - mdg1 407 2 75.34 GCTTTGATCAAGGGCTCTCAGGAGTCGATATATCGACGGTGGTTTACGTCCATGCTGAAGGTGGGAAACTTCGCTACGAGCTGTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 + chr3L 22648262 5' + Tabor 39 2 58.90 CACTATTTTTTTGAGTGCATGATTCAGAGTGTAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr2L 12414875 5' + pogo 15 1 64.29 GGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3L 17707819 5' + Doc 51 1 55.65 ACAGAGATTGAACATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3L 23986502 5' + opus 7043 4 50.72 TACTTGTAGAGTAAAAGGGTACGTACACTAGATTCATTGAAAAGTATGTAACAGGCGGAAGGTAGCCTTTCCGACTATATAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGTCAAGATATCTGCAT:1 - chr2L 22140080 5' + pogo 35 1 56.85 GGCGAGAGCAGGGCAAAAGTTTAAAAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGCCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATAAGTAATGCAC:1 + chr3L 13634186 5' + 297 42 2 55.71 ATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGAGAAAACAAAAACGCAATTGTG:1 - chr2L 6717190 5' + jockey 59 1 56.91 CGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCACACTTCACTGA:1 - chr2R 15829579 5' - invader4 245 2 77.86 GAGGCTTTAATATTTTTATCTAGTTTGTCTATTCATTAAAAAAAAATGGTTCAAAAATAAAGTGGCCAACTAACAAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3R 17305566 5' + roo 45 2 53.42 CTGTGCTTTGATCAAGGGCTCTCAGGAGTCGATATATCGACGGTGGTTTACGTCCATGCTGAAGGTGGGAAACTTCGCTACGAGCTGTCCTGTAATGTGCACACATATCGACTAAGCAC:1 + chr3L 22648258 5' + Tabor 8 2 75.63 ATTGGCCATAAAGTTTGGACTTTGGCAGGTTATGTGTGTGCTACTAGCATGTGCAATTTTTGGATATTTTT:1 + chr3L 969678 5' - TART-B 10250 1 88.73 TGTTGGGGAACATTCTGGGACTTGCCTAAAACTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr2L 15988047 5' + roo 89 2 80.14 ATCAATCAGACAAATAAGAAAATTAAATTCCGCATTGGAATTAATTCAAAGTGGTATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chrX 10645093 5' + jockey 35 1 62.04 TTATATTGTTATTTGCTTACATGCTAACTTTGGAGACTCAGTTCAACTTTACTGCACTCAGCTATCATCGTGATCTATGCCGCCCAGCACAAGGACATATCTCGCCATTTGGACTTACAATCTAACTAGGAGTTGCATGACCCTTA:1 - chr3L 23205337 5' + Cr1a 4167 1 53.42 GAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 - chr2L 22015988 5' + Tirant 8161 2 67.77 CGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr3L 22400248 5' + 1360 17 1 66.67 CGAGCGTTGTCGGATCGATGGGAAAAATAAGAGATAAAGGATAAGCTAGGCACTTATGGAATAAAAGTCATGCAAAACATATTATATCTAAACATCTTCTATTAAAAATATCAAACAAAATTTAAAAATATTTATTTATTTTTTTT:1 + chr2R 14432427 5' - mariner2 830 1 52.74 CCCTTTTCCAATAAATGCCAAATTAATTAAAAAATACAGCGGCAAAGTAAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 13563444 5' - roo 389 2 71.92 CACCAAGATCTGGTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 24122648 5' - roo 9047 1 58.26 ATTATTTTATTATTAAGTTTATCGTATGTAAATGATAACATTTTTGGCCTGATAAAATCGTGGGGTCATTGACATGATTAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGAC:1 + chrX 9578589 5' - flea 151 1 48.63 TGTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chrX 21852449 5' + Tirant 38 2 53.91 TTTAAATTAAAATGTGAACCGAATGTAATAATTGGAATCATTGAGCTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr2L 10184393 5' + Doc 36 1 63.70 ATAGCAAAACTAGAAAATGTAATACAGTTTAATTAAGATTAACATTAAAAACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1 - chr3R 11750315 5' + Tabor 19 2 73.29 ACTCATCACTTACGAGCTCTACAGAATTTCTTAGACTGTGGGTCACACATAGATTTTATGCAGTTTTGGTTTAAATGTTTTTAAACATTTAGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr2R 8396038 5' + pogo 27 1 67.12 GTTCTGTTTCTGTGGGCGAAAACGCAAAAAACGAACGAAAAAATCTCGTGAAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATCTTGTGTGCGGGAGCTACTCGCC:1 + chr3R 23236399 5' + hobo 54 1 56.15 TATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAGGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGG:1 + chr2L 11574845 5' + Max-element 55 2 69.72 GTAAGTTCTCCGAAGTTAATTATTATCGCAGAGATTGCTATATTCGCGACTATTGGATGTACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTAGACACCATTA:1 - chr2R 6164646 5' + Tc1-2 11 1 68.06 GACCTTTGAAGTCAGGGTTTAGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGCCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr2R 11489152 5' - mdg1 383 2 59.59 CAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr2R 10695887 5' - roo 359 2 54.11 GGAGGGAAGCGTAATTGGGCAGAAGTCTATTGCGGTGACTTAATTTTTTTTTAGGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTTCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCATGGTTCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATA:1 - chr2L 476399 5' - baggins 5296 1 61.64 AGTGTACACATGAGCGCGCACACAGATTTAAATGCCACGGATTAGAGAGATTTTTATTAAGATACAAGTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAAGGTGTCAAGACGA:1 + chrX 13521812 5' + R1A1-element 426 1 63.46 TATTTTTGTGTAACCTGCAATTTATTCAATGCAAGCTGAAAGTTAAAAGTTTTCGGAGGTTTTGGAAAACCTAGATATTTTAGGGCAATATAATATATAAAGAGAATATATAATATATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGT:1 - chr3L 22408797 5' + Ivk 5 1 78.08 AACAAGGATTTGTTCCATCGGCTGGATATCTTCGATTCTAAGTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTC:1 - chr4 436888 5' + 3S18 5823 2 64.80 CATCACATTTAATTCGTTTTGGCGCTGTACGCGTGCGCACGCAAATCCCCAGTTCCCCAACTGGATACCCCTCTTTATACTCCACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2L 16458559 5' + roo 8680 2 68.80 GTGTCCGCTTCTCGGAGGCCATTGTCTTTGGCAGCAGCCGCTGATATGACCGACCTAATAGACTTTAGTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr3R 12599130 5' - 412 7518 2 58.33 GATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2L 4174001 5' + roo 39 2 75.86 AGCAATATGAGTTTTTGTTCGTCTGCCTGTCTTCAAAGCGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 10684695 5' - roo 396 1 72.59 ACATTTTTTAATACGTTTATTTCTTTGTTTGATCTTTTATTTCTGCTCGGGTCTTATACACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr2R 641983 5' + opus 7040 4 60.27 GTGCGTTTTTATGGACAACAAGGCTGTAGGCCTCATCCAGTTATTTAAGCACGGACACACGCACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chr2L 10089724 5' + opus 7159 4 53.33 CATAGGAAATCCAAAAGGCCTGATGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACA:1 - chrX 6137233 5' - opus 7173 4 81.65 GCAAGCAATTGTTGTGCTGTGTTTGGGTTATTTTTACTCTTTTTTTTCGCTTTTATATTTCCTGAGGTCTCGACGTTCATACGGACAGACCGACATGGCCAGATCGACTCGGCTA:1 - chrX 7588987 5' - INE-1 104 1 58.26 AATGTATGCTACATTTTATGACCCACAACGAGTGAGTGCGTGTGTGTGTTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3R 28396572 5' + jockey 36 1 60.74 ATTGCCATTGCCATTTACTTGGGGAAGTGGAGGATTGGCTGTCGGGGCAATGGGCAAGGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCT:1 + chrX 2348075 5' - F-element 223 1 51.75 GGTGTGGAGTTCCAAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 - chr3R 29645768 5' + jockey 78 1 65.75 AGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr2L 686011 5' + roo 8751 2 76.71 AACCTACTCTTTCAAATGTCAATACAATTTAATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAAT:1 + chr3L 12224645 5' - 412 7457 2 78.08 AACAAGACCAAATTAGACAAATTAAATAATTGTCAGTTCATTCAGAACAAGAATAAGATGATTACTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAA:1 + chr3R 12593019 5' - flea 4960 2 57.53 AGGGCGAAAAAAGGAGGGAACTAATATTTTAAGAAAACTCAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCT:1 - chr3R 15711849 5' + diver 83 2 72.60 GCATTCCCGTTTTCCGATTTTATACGTGTTTTTGGTTGCTTTTTAATTTGTATGTTGTTTTAACAGTTTGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTT:1 + chr3L 15456513 5' - gypsy4 465 1 74.48 TCAAAGAGTTGCAAGGTAATTTACCAAGTCTTTACAGCTTTCCTTGCTAACCGTAGAACGATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTCATTCGTGGCGAAGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTCA:1 - chr3R 3074694 5' + Cr1a 4080 1 74.63 AAGGCATCAATAACAAGAAAGCATTACTCGAGATAAGATTGAATGAATATGTTTGGCACCTATAATAAAATAATATTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGTCAGCTGTG:1 - chr3R 30583888 5' + gypsy12 46 2 52.78 TAGCCGAGCAAAATAAGATATACAATGCCCCCCTTAATGTTAAGTGTGCGAACTGGACAAGAGCGCGAGCACCACTGTGCGCAGGGTCAGTGCACAGTGGTTCGATTTGGCTGAGATTAGAAACAACAAAAAAAAACAAAAAATAA:1 - chr3L 737831 5' + gypsy7 5004 3 79.45 CCACGCCAAAATACACTTTTTTTTGCGCGCGCTACAGGTTGCGTGAGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACATTCCGCCCCCCTTGCAAT:1 - chr2L 19165357 5' - GATE 8218 1 66.91 CAACGTAGATATAAAAACTGAAGAATTCTATAAGTGTAACCGAGATATTTAGCAAATATTTTTAAAATTTGTAAATTATTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTA:1 + chr2L 12173702 5' - Porto1 4405 1 66.67 CGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTT:1 - chr3R 13349116 5' + BS 5070 1 67.81 GCCGTGGGAAAAAGTGTTGCATACTTATGAGTGTTGGCAAAGAGCTCCGGAATGAAATGTGAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCAT:1 + chr3L 17133803 5' + jockey 4750 1 58.22 CCGACGACTCATCCCAGACAGCTTAGCATAAAATTTCGAAATCAGAACCCGCCACTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGA:1 - chr3R 20739196 5' - F-element 133 1 63.01 AAACTAGAAAATGTAATACAGTTTAATTAAGATTAACATTAAAAACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 - chr3R 11750309 5' + Tabor 25 2 69.18 GTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2L 6717212 5' + jockey 35 1 57.38 GTAAGCCGCTCAGCTGGAGATAGAAATCCTGGCGGTCCTGAAAGGAGCTGGCACAATGGCCAGGAGAAATGCGTCCTTTCTTTTGGGTCACCGCACATCGGGTCAAACAGGATCAAAGAGATATGACCTAACTGAGAGCCTGTTTC:1 + chr2L 11455421 5' - baggins 116 1 79.45 ACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 17305456 5' - roo 335 2 69.18 AGTAAAAGTGATTCACTTCAATTTATTTTTTTTTTCTGCAACAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2R 10695738 5' + roo 24 2 69.18 GAGAAAATCAATAAGCTGGCAAAATTGAAGAAAGGAGACTTCCCAGACATGGCAAAACAGCGCAGAGTTCGTTAATAATGCTAATATGCTGGCGTCATTTGGCTTTCAATACTTATGTAATAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCA:1 + chr3L 20376909 5' - INE-1 579 1 63.70 AATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTT:1 - chrX 8027472 5' + Juan 77 1 68.97 AAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGATCTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATATATGAT:1 - chr3R 29288806 5' - BS 5030 1 56.16 TCTATCGATTTTCAACCAAAAACAACTGGGAAACAACATCGAACCATCCATCCGTGCGCCCTCACACACAAACACCCATACACCCACAATTATTTCAGGGGGACACCACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTG:1 - chr3L 15923764 5' - jockey 184 1 76.34 GTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1 + chr2R 19554933 5' + pogo 68 1 64.38 GGATGCTACGTGCCTGGACTTTGACTTGGACTAGGAGCTGCTGGTAGTGGAGCTGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr3R 22100632 5' - 412 476 2 68.25 ACTTACAACTTTTTAAATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:2 + chr3R 9190436 5' + Tabor 13 2 43.84 TGCCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTA:1 + chr3R 11750199 5' - Tabor 7254 2 73.44 AAAAGAAGAAGCCAGTCGATTGGACGAGGCCCGTTCGCCTTTACTTCTTGTGGGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGACCGTTTTAAG:1 - chr3L 22900179 5' - 412 7526 2 51.52 AAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGA:1 + chr3L 14550974 5' + P-element 18 1 47.06 ACTAATATCTTTTCGCATTCTGACCTCGGTAAACATGAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3L 14076221 5' + roo 8747 2 76.03 GCATGGGGAGCGTGTAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCGGGTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 10684831 5' + roo 8715 2 54.48 CATTAGTATTATTATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTC:1 - chr3R 19859544 5' + micropia 28 2 64.38 ACCATACGGAACACATATTGAATCACCATGATCACAGCTCTAATTCTCCAGCACATCATCACAATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCCATTTTT:1 - chr2L 8954839 5' + pogo 1759 1 56.85 AAGTGTCAAGTGCATTATGCTTGTGTGGATGTTTTCGAAAATAAATCAGTTCACTGAAAAAAAATCGCATCTCTCACGGCGAACACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTAAT:1 - chrX 958075 5' - roo 9039 1 49.65 AATAGTTCTTGATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCATGGGCCGTTTCGTCTTGGTTTTTTCACTTGATTTTTTTTTTT:1 + chr3L 16184115 5' - Porto1 170 1 67.20 GAGTTAATAGTGCTTGAGATTTCTTATATGGTCTATGCTGTTATTCTAACAAAAGATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCA:1 + chr2R 7020496 5' - Bari1 1697 1 75.34 ACTTATTAATCCAATGGCATATTGACTAATTTTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 3890114 5' + jockey 35 1 62.12 ATGCATCTTGACCTCGCATGACCTCAATAAGCATCGCCCGAGGACCTTCACTCATTAGCGATGGGGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr2R 16403405 5' - copia 233 1 55.56 TTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCT:1 + chr3L 9571679 5' + jockey 4549 1 75.17 CTCGTCGCTGAAGTTCCTCACGTTCTTGTCGGCCTCCTTGGGGCCAATCGATGGCTTGTTGAAGTTGGAGGCCTATGCAAAAGCAAAACATATTAGTATCCTTTTCACATATCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 + chr3L 4115071 5' + 1360 2 2 68.89 CGAGGCGCAAACTTAAGCCTGGCAGCCGTTGTTGGGGAACATTCTGGGACTTGCCTAAAACTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - 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F-element 4643 1 57.53 CAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATACATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 + chr2L 9237513 5' + blood 7083 2 69.57 ACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 + chr2R 6632598 5' + P-element 87 1 19.40 GCGCTGTGAGCTGCATGGAAAATTAAATTTGCTGCGTTGCCTTTGCTCGGCTCTTTCGTTCACCACTGTTAGTTGGCAACAGACTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATGACAACCA:1 + chr3L 3107486 5' - R1A1-element 5288 1 62.41 CAAAGAGTGTGCTGCACTTTCTTGGGCAACTAAACAAGCTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 15987939 5' - roo 394 1 74.07 ATATGCCACCAGGCACTTTTCCGTTTTTCAATCCACACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCG:1 - chrX 16860511 5' + roo 8758 2 79.45 ATAAATGCCAAATTAATTAAAAAATACAGCGGCAAAGTAAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - 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Tc1 216 1 74.82 ATTATTTTATCTCTGTATTTTCTGGACAAACGTTTTATAGTATATTTTCCCTTGGCATGCCTGGCTCGTTTCATATTTTAAAATGGCAACAATTTGCCAAAAACGTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACA:1 + chr2R 21414342 5' - BS 5074 1 73.97 TGTTTGTAGCGAAGGAATACATAGGCCAAAAACATAATATCTTAGGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTC:1 - chr3R 15338111 5' - blood 7317 2 70.92 GAATTGAATTGAATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr2L 2157855 5' + Doc 39 1 30.10 AGAGTGAGAGCGGATAAGTGAGAGAGAGCATTCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chrX 14951177 5' - P-element 2841 1 32.38 TTTAGGGTTTTTTTTCATCGAATCTGGTACCCTATTATAACTTTTGATCGATGCGTACATGCATGCATGCGCTGCATTCTTCTTTCTCTTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTT:1 - chr4 500501 5' - mdg1 7359 2 67.12 TTTTAGTTTGAATTAAACTTATCGTGTATGTGAATTGTGGCGTAATGTTGTTGAGCAAATGGGTTCTACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 24279318 5' + roo 53 2 57.93 GGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTG:1 + chr3L 11115124 5' + micropia 4999 4 51.79 AGATTTCATTTATTTTTATTGTATTAGTGTACCTAAATGAAAGCTTAATCAATGCCAAGATTTCAGATTTAATTATTGCTTAGATATAAAGGAAATCTGTGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr3L 21110211 5' + 297 6599 2 73.97 TTCAAGAGTCTGAAACTAATTAACTTTGTATCCAGGAGATAAGCCTCTTATAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGCAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTTATTTTATCTTCATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 + chr3R 11113186 5' - mdg1 345 2 63.70 GGGTAATAAATATTTTCTCTAAATTTCTCTTTCTCTAAATATGGTTATATATATATACATATGTTTTCTTTATATACCCCTATCACACCGAACGCATTTCAGAAGACATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr2R 5260592 5' - 1360 3338 1 72.41 TGCCACGAATTTTCCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGGGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTC:1 - chr2L 18279989 5' - gypsy5 411 1 75.82 GCAGATGCATGATAATCCCGATACGTACATGGCGGCGGGGGTAAACACAGCCAACTCGACGCCATCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 - chr3L 11747304 5' + opus 7035 4 60.95 GTTTGAATTAGCTAAATAATAATTGCTTGTAAATTATAACAAATACCGGATTTCATCGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATA:1 + chr3L 24291922 5' + rover 6966 2 76.03 AGGCGTATGCCATTGCTGACCATTCAACTCTAGGAACAAACGCTTTTCGTCCGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAA:1 + chr2R 558092 5' + copia 4938 2 63.89 GGGGGGGAATGTTTACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 16855350 5' - roo 9036 1 57.46 ATAAGTATCGCCCGAGGACCTTCACTCATTAGNGATGGNGTTGTAATNNANANTTTANANNTCCTTTCNNNNNAANTNAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCA:1 + chr2R 16403431 5' - copia 5039 2 65.52 CGACCGTCTGAATTGTGTGTGAAATCAATTTGTCGAAATACGAGCTGTAAGAGTGCCGAGTGCGGACAGATATATACTCGTAGATGATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:1 - chrX 4186752 5' - I-element 5320 1 63.01 AAAAGCGTACTGTGAGGTGGGATAGTTCAGATCTTTACTGCTTTCAATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 7539557 5' + roo 8703 2 59.59 GTCTGATTTCGCAATTGCTGTTTTGGTATCCTTGGGGCTTGGCTTGCGACAGCCAAATTTGTCGCATTCAGGCTGCCCAAACCAAAATCGCCAGGACGATTGCCGGC:1 - chr2R 5617229 5' + BS3 1378 1 63.55 ATTAATAAACATATATATTTATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATGCACATTTTAGTTATAAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2R 8305323 5' - roo 358 2 52.74 AGGTGGTTAAAATCTACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGC:1 + chr2R 8157164 5' + Transpac 59 2 63.01 ACTCCTTTGCAGCACTAGTGCTAATTTTTTATTTTTTCGAATTTTCCTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATACTGTG:1 + chr3R 13505459 5' - opus 435 2 65.07 ACCGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGA:1 + chr2L 16089582 5' - 3S18 6046 2 56.16 GTTCATGAATGTAGTTCGAGAACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr2L 17029563 5' + blood 34 2 60.27 CACATGCATGCACATACATATGCTATGCAAATTGCGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chr2R 19554893 5' + pogo 28 1 61.64 AAATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAG:1 + chr2L 19364080 5' + BS 4829 1 63.70 TGAAACAAAACAAAAAACGGCTACAGGAAACGAACCCTTTTTACATTATTTGAATCCCTTTTCATTATGTCGCTTTCTCATTCTAACCAAGCAGCGCAAGGGGCAACGTTCA:1 - chr2R 12553808 5' - micropia 5206 1 46.43 AACAAAATTTGCTGCTTCATCCATATTCATTCGTTCCCGGAGCATTTATGTGCGGATTTGCGCGAAAATGCCAAAAAGTTAAGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGC:1 + chr2R 23123147 5' + jockey 211 1 57.93 CCTGGAGCCTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chrX 14964601 5' - roo 9022 2 56.16 ATTCGGGAAGAGGATCAGCGTGAGCATGAAAAAAGCAACAAAAAATGATTTATTCTAATGCACCCGGGGCGTAATATCGATTGGATCCGCTCTTGAGCTTAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATA:1 - chr3R 22793459 5' + invader2 4785 1 67.59 GCTCTATGAAAAGGCAATACCCAGAATTTCGAGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 7515785 5' - roo 9055 2 73.97 CTTGAATACAATTTCTTTCCGTGTCTAGATGTCTGGTGTTTTTTCGATGTTTGGCTGAGTTCAATCTCGGTTTCCTGTGCTCCATTTTGATTTCTTTTTCCGCTCGCCACCCACTTCATTTTTCGTTGTTTTTTATTTTTTTT:1 + chrX 22736091 5' - transib2 2641 1 69.93 TCCCTAGTCCATTTTCAGCCACAAGGTCAGACAAATGAGTTTACGCAAATCCAGGAGCTGTCTGCCCCTAATCCCGAGTAAATCCGATCATGGGATTTCGGCTGTCTGTCCAGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTGTCGGAAGAGAC:1 + chr3R 20849105 5' + diver2 4753 2 64.38 GGAATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1 - chr3R 13349145 5' + BS 5032 1 55.47 TATGCTGAGTGGCAACGAGGAACCGAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3L 17890718 5' + 412 7095 2 53.38 GAATATAACATAGATCTGTGTATACTTTGTAAACTATGATTCTTTAGTTACTCTGCTTAAATTATTATAGTCGGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTTATAGTTAGATCTACAATGATTTACGATAAGGGGTATATAGT:1 - chr2R 16650348 5' - Cr1a 4131 1 56.16 ACTCAAAAGATAAACATTCTATACTCAGATTCATTAGAAATGTACAGCTTTCAAAAGCAATTCAAGTGAAAGACGTATTATAGCAGGAGTGCAGCCGTAATAGAGGAACGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAA:1 + chrX 17419335 5' + Juan 4040 1 71.92 AATAATATTAAATTCTGCATTCTTAGCTAATTTGTTAAATACAATAAGTAAAATAAATAGGTAAATTATATAAATTTACTGCCAAAATACTTTTAAACTTTTTAAACAGTAAGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr3L 13787172 5' - 1360 3345 1 73.97 CTTAAGGCGCTTACTCTGTCACCTGGCTAACACAGACACAACTTACCCACACCCACATCACCACCAACACTCTTTCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr2L 11915487 5' + hobo 27 1 56.80 GAAGTGTAAGAGGGACAGAAAGATGGAAGAGATGGTAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chr3R 19531301 5' - hobo 2904 1 65.31 ATAATTAAATAATTAATTAATAAAAATATGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGTGCGAGCAAGACGACCGCCGGCTC:1 + chr3R 12057805 5' + Doc2-element 317 1 73.08 TATATATCCTAGCACCAGCAGTTGACAGCCTTTGTAAGCAATCGTGGCGGTCCAACGAAGCGGTGAAACAGAAAGTTCTTTCTGGACAGTCAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTTAAAACGTCGAGATCTTAGGAACTATA:1 + chr3L 25709025 5' + INE-1 144 1 68.57 CGCAGGATGCAGTGTCATTAAAGCCGAAAATGGGTGGCGAGTGAGGCGGGGGTGACTCGAAGGAGGGACGAGGCAGCGGATGGTAATGTTTACATTAGGG:1 - chr2L 19883697 5' - Quasimodo 171 2 74.00 AAAAAAAAAATAATTATAAATTTTTTAAAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGTGTATCTATCCTCAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCGAG:1 + chr3L 9614239 5' + Stalker3T 115 1 63.01 ATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGGATGCAAATT:1 - chr3L 13827350 5' - hopper 1375 1 56.52 AGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2L 6717160 5' + jockey 35 1 70.00 ATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 - chr2L 22016009 5' + Tirant 34 2 56.56 CTGTGTCTGTGCATCAATTAATTGTACTGTTCGGCTATTTATAGATTTTGCGGTAAATTCGCTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr2R 21371546 5' - roo 354 2 57.53 CTTTTCCTAGGCATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr3L 17707796 5' + Doc 50 1 51.37 GCACTCGTGCCCCTGCACTTGCACGCCGGTAGGCGCAATCGCGGTGCAGTGAACTTGAAGGGGGTTCGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACAC:1 + chr3L 22642824 5' - hobo 2920 1 63.96 CAGAGGTAAAGTTTGCTACACGCATAGTGAAACGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chrX 3996515 5' - roo 322 2 78.62 ATAGGGAAAGCGGATGACCGGCGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCA:1 + chr2R 21402597 5' - mdg3 184 2 57.64 GAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGCGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGAGTTTCTTTCAA:1 - chr3L 25401033 5' + Doc 26 1 54.41 AGGCACAGTTTGAAAACGCTGGTTCTGATGTGGGGCATCCAACATGCCCCTCCCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 24279528 5' - roo 388 2 47.00 ATCTAACTAGGTACGAACATAAATGTATAGTTGTTGAGCACATCCAGTAAGAGGAATCGAAACCCTGATAGATTGAGTGACTTAAAATTCACTTATACAAAAGACCGACCGCG:1 + chr3L 19355154 5' + Tom1 32 1 78.76 CTTTGCATTAATTATGACGTGTGTCTAAATGGGGCTAAAGTAATTTTATTGCCATGCACAGGAAGCTGCATAGACGACGACGACGACAAGGATTCCTGTAAGAGGTCCTGCTGTAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr2L 16371805 5' - blood 169 2 71.11 ATAAAAATCATTGCCTACTTTTCTGCGTTTTGCTTTTCCTGGCCTTCCTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGTTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAA:1 - chr2R 23116200 5' + jockey 29 1 65.57 TTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAATATG:1 - chr3L 16260407 5' - hopper 1381 1 62.33 GAAGAACCCGAAGCTGAGTTTTTGGTTAAGCCAAAGACGCCTGTCCAAGAAGAAATTGCCAACATAACACCTGCTATGCTAACAAGAGTCGCGACAAACGCTAGAAATCGGTTTACGCAATGTATTGAGAATGTG:1 - chr3L 2048505 5' + mariner2 742 1 59.26 ATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chrX 14964634 5' - roo 8989 2 78.77 GTTGCTTATTATGCGTGATGTTCTAGGACTTTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 + chr3R 15022001 5' - Tabor 7284 2 57.53 GTTTGCATACTTTCAGGCGCCTCTGACAGGGCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr3R 19531217 5' + hobo 53 1 52.05 AAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2L 76109 5' - roo 322 2 85.71 ACATTCCTGCGAGCCTCATTTGACCATCGCCAACGGCACTTGGCCAAAACAAAATTTGCTCCTTCTGCCCACATACTCTTCGATTCTGGATGGAGTTTTGGGTATTTCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chrX 8012399 5' + 297 4 2 79.17 CTTGCATAAAGGTTTCAATTTTGTTGCACATTTTTTCAATAAATTTAACACACTCAAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3L 18467136 5' + hobo 14 1 74.48 AGCTCGATTTTTGCGTTTGTCAATATATTTCCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTAT:1 + chr3L 9497776 5' + jockey 4859 1 79.45 CTGATTCTAGATTGGTTATTTCTTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 + chr3L 25322861 5' + Doc 81 1 68.75 AATGTATATATGTATCCATTACATTGCATTGGGGGAGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAA:1 - chrX 6510117 5' + jockey 4722 1 50.68 TCTCCCTCGCTTTTATAAATAAACAAACAACTCTATTTCATTTTTTGTTATTCGGGCTGGATTCGTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 7035377 5' + roo 18 2 71.74 ATTATTTCCATATCTTTTTTTTTTCTATATATGTACGAATAAGTATTCGATTGGTTGGGCATCTTGTGCCACAATTGTCCATGTGGGAGTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chrX 1689948 5' + 412 31 2 64.38 GGAATTTAGGTTGCACGCGCCTTGGTGATTAAGTTATCCAGACGCTAGATCAGCCTTTTATTAGCGAGCTAAGTTAGGTTGTGCAATTTTTGTAGTTATATAGTAAACTTGTTTTTGTTTTGAGTCGAATAAATGATCCTTATTTG:1 - chr3L 25850557 5' - Tom1 366 1 59.59 ACATTTTGTAAATGTTTTCAATTTATTGTTTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 20712962 5' - roo 9018 2 62.04 CTCGCAGTGCACTGAGCACACAGTTAGACTGACAAACACGCACTGCGAATGTGTGTGTGAATGTGCGACTGTGTGTGTGTGTGCCTGTGACTGTGACTGTGAAGGACACACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTA:1 + chr3L 4001030 5' + hopper 9 2 48.97 AGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr3L 15026668 5' + opus 7052 4 72.41 GTCCGGCTTCGTGGTCACGAGATTGGGAAAGACACTGCTGTCGTGGTTGGTCACCAGTTAGTGTTTGTCAGGAGTAGCTATGAAATCTAGCATTTAAGCAAAGACGATAGAATAAATAAAAAAAATCGTGTGCAAAAAA:1 + chrX 4112760 5' - 1360 41 1 60.43 AATGTGTGTGTGAATGTGCGACTGTGTGTGTGTGTGCCTGTGACTGTGACTGTGAAGGACACACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAT:1 + chr3L 4001077 5' - hopper 1359 1 57.93 TTTAGAGAGTGAAATTAACGATTGGCCTACGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTT:1 + chr2L 3294141 5' + hopper 61 1 73.95 TGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr3L 18467195 5' + hobo 58 1 65.38 CACATTCTGCTGTCTCCGCTTGCTGTGGCAATGCCCCACGAAATGGCCAAATGGCAATTTAACAATGAAAAATTAAAAGGGAATTCCAAGTTTTAATAGTTTAGTTCCAACTTTGTCATCGGTATTTCTCTCAAGTTTG:1 + chr3R 31635382 5' - Porto1 4484 1 66.19 AACTGCGGTGAAATATAGTTGTTGTTTTGTTGGCTGTTTGCTGCCGTCTACAAAACGTACATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chr3R 10266216 5' + 1360 18 1 73.97 ACGTATGCAGCTATTAGATTATTTACATGCCTTCAAGCTATGAAATAGTACTACATTATTGAATTGATTTGTTAAGTGAATAGTATAATAGTATCAATCATAAGCCTCACATCTTGTATTGCTTGTATTTACTTAAAACTAAAAAA:1 + chr2R 8549332 5' + rover 6820 1 55.48 AGGCTTTTGTATTCATAAATTAGCATGAGAAACATGAAAAGTGCAGAAACACAGCAGGGAAACAGTGTTGGCAGTACGCACACAGACACATAAACTGTGTGTTGGCTTCAAGAAACAACGTAAACGATTGGATTAGAGAC:1 - 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chrX 21907835 5' + springer 464 1 66.96 GGATACGGAGGGGAAATAGCGATGTACTCGGAGCATGTGGGCCTGTACAGTGAACCCTAGGAGCAGAGTCCTTAGGCTCTTTCGATTTAAGCTTTAGTATCTACAAAATCCCTAGATAAATTGAAATAATAATAATATTCCTAATA:1 + chr2L 5288261 5' + mdg1 7078 2 76.71 GTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAACG:1 + chr3L 14553133 5' - roo 8984 2 79.58 AACGAGTAAAACGGATATTAGAGTATTAGACAGGAAGCTGGTTGACATGGCTGGCTCTTCGTTTCTCCATTTTGCTCCGAAATGGTTTCCAGATGTAAAAATTCTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATCGGC:1 + chr2L 19844843 5' + 1360 3114 1 65.93 ATTTATGGGATTTGCAAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 5150383 5' - roo 349 2 59.59 GAGAAAGAGATGTTAAAATTTAAGAACTAATATCTTTTCGCATTCTGACCTCGGTAAACATGAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3L 14076196 5' + roo 8722 2 58.90 CTAGCTTTGTCGCTTATTAAAAGAAGCTTATCGCCGCAGCCAGCAGCTCGAGATCATTTCCAAGTTGATAATCTGAAGGGGAAGTGCTTGCCATTACTGGCTTTAAACCTAGCAACAATACCAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTC:1 - 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chr3R 10030783 5' + BS 5073 1 60.96 AATGGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2L 6717217 5' + jockey 35 1 59.06 TTTGATAAGTACCACTATTTCTTAAGATTTCACTGTGCACATCGTTGTACTTTGCCACACCGACCTGTTACAATTAGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTA:1 - chr3L 20344406 5' - Idefix 421 2 61.64 TATTACAGTTTTGGGATAATCCGGTTTTTATCTCTGTTTTCTTAAAATATCAAATCGATCAATTGTACGGGACTTGATGATTGTCAAATTAAATAAGTGTGGTGTAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr3R 26191751 5' - hobo 2923 1 70.55 GGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 - chr3R 9352105 5' + Tirant 8127 2 65.18 GTGAAGAACAAACGGCGGAAGCGTCGAGCAGCAAGAGGCTCGCAGGACACGAAAGAAAGAGCAGTTTGCACAACTAACTATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATA:1 + chr3R 1363043 5' + Doc 176 1 60.96 ATTTGAAATTTCATTAGATATTGATTACCAACTTTACCCTTTGACATGAATTGATTATGGCCAAATCGCAGCGCTGCTCATTCGTGGACCTCTACGCTCATTCTTCGGCTCATCTCCTGCAGAGGTTGTCTTGAAAGTGCGTCGGC:1 + chrX 5438206 5' - Osvaldo 239 1 49.32 ATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAAG:1 - chr3L 24208221 5' + Quasimodo 48 2 54.11 TATTAATGAATGAAATCAAGTACGAACTTTTCAAGTGATATCTGGGTAACATCATTATAATATTATAGGTTTAGTAGGGAAGTATTCCTTATGGGCGATTAACTGTAAACAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 2014210 5' - accord 7030 2 69.70 ATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 - chr2L 22015978 5' + Tirant 8172 2 76.23 AATTATCATAAATTACTTTAGTATGCGATAAATCGTGATAAATTTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 + chr2L 17250659 5' + opus 7 2 77.40 GCTCGGAAAAACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:2 - chr2R 21402689 5' + mdg3 5320 2 60.96 GTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - 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jockey 4984 1 61.64 AAATCCTGAGCAGTTACACTTCAGATTAATGGACAGTTGCCAGTAAATAATTTTTGTGCAATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:2 - chr3R 5453765 5' + 412 7069 2 74.66 CTCTGGGAAATGTTGCGGTTGCGGTAAGTGGCAGGAAAAGGATCAATCACTTCAGCTGGTCAACTTTGCTGGACATTTTCAACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACA:1 - chr3L 11400035 5' + Quasimodo 22 2 67.16 ATATTTATTATTATCTTGATATGTAGCACTACTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCACTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTC:1 - chr2R 10916657 5' + GATE 53 3 76.30 GGCTGTTTACGCACTTCGCTTTTTGCATTTCTGCGCTAACCCCGCGGCATTCGCATCTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTA:1 - chr3R 28951919 5' + jockey 4715 1 54.69 TTTGGTTCGATAAGAAAAAATCGTCAGTGAATCACGAGCATTTGCCCCGTTTCCAGTTCGTAATCCGATCAATGTAGGAAGGATGCATACATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chr3R 29733163 5' + opus 7029 4 66.44 ACCACTGATCGTATCGTCCTTTAAAGCTGCTCCCGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCAGT:1 - 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HMS-Beagle2 262 2 52.05 TTCATTTTTTGTTATTCGGGCTGGATTCGTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr3R 7035341 5' + roo 8726 2 63.70 ACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATC:1 - chr2L 6717206 5' + jockey 66 1 54.11 CCGGGACGAACTCGCCGACAATTAGTGACCGTCGTCAAACGGACACAAATTCGCTGACACGGCACCTTGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATA:1 - chrX 21947738 5' + mdg1 55 2 55.48 CAGGATTACATGGGTGTCATATCAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chrX 13395274 5' + roo 73 2 71.92 AAAAAAACCTGGACAAACCAAAGTTAAGATTATTAAACTCCAAAATAACATTTTTATCATATACATCCCCCAAGGATACCAAAACAGCAATTGCGAAATCAGACGCACAAAAGGGAGAGTTAACAAAACACAAAGACAAAAAATG:1 + chr2R 5617147 5' - Cr1a 194 1 72.41 GTTGTTGTTGTTGTTCTGGTTGTTGTTGTTGCTGTAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCGG:1 - chrX 3701242 5' - gypsy4 54 2 56.79 TAAGAATCAGCAAAATTAAAGTCCTTGCCCCAAAATCATTCTACTAGATTATATGCACTAGTTGCCGTTGTATTTTAAAAGACGGATTACAACACTATCACCGCGGAAGGACTGTAATGATGAACTCCAATCAAGAACACAAG:1 + chr2L 9485544 5' - 412 7537 2 74.83 GGTTAAGGACCAGGAATAGGATCAGGCCACCAAATGCTGCAGGAGCAGCCCAGCAGCATAAACGCTGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 + chr3R 27822193 5' - I-element 5302 1 53.42 AGCTGATCTATGGAGCTTACTAGCTTGTTGTTGACACTGACCCGAGGCTCTGGGGTGTCCACGGCTACCCGTCTCTCCGCAGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGCGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 - chr3R 8258953 5' - Tirant 8473 2 59.85 CACTTTTTTCAAACAACCCAACAGCCCCAACACCCCAGTTTTCCCTACCCCTGCCCCCATCTCCGGTCAGATAGAAGCGATGTTCGCTCGCATGGAAGGAATGATGGAAAGGATGATGGAGCGCATGTTCACCCAGATGACACAGC:1 - chr2L 11942452 5' + G6 1555 1 60.96 AGCAATCGCTACACTTGGAGAAATGTAAAGAATTGTCGAATTTTCAAAAGTTTCATAAGAAATTAGTATTATACTAGTTTTTAATTAGTTTTATAGGCTAAAAAAAGGGATATATAATTCATAGAAATGTGCAAAGTGCAGTATTT:1 - chr2R 8722675 5' + gypsy4 451 1 73.29 ATGAATTTATTTTATATAATGTTTTATTCAAATTCTTATTACAAGTTGCAAATATTGTTTTAATATTTATCGAATACTATTATTTAATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 16399290 5' - roo 9051 2 57.14 AGGGGAAAGTGCGGCGACAAGTTATAAAAGTCGTTATATGAAAGCCAATATCAAAAAGTATCCTACGCCTTTGTTTGTTTGCCTTGCTTACCTCTTGCTCTCCCTCTCTCTCCCACACACACACAACAACACACACATAC:1 + chr3R 26528124 5' + gypsy3 416 1 59.29 TAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGAT:1 - chrX 1018145 5' + 1360 250 1 69.18 CTTAAATATTTAAGGGCAAGCGTTGGCGAGAGCAGGGCAAAAGTTTAAAAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3L 13634162 5' + 297 6605 2 69.86 CCGAGCCCTATGCCACATGCCCCGAAAAGTATGCCACGTTGTTGTCGTTGCAAGTCTCGCCTCTTACGCTTTTTTGTTTACACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 + chr2L 3395666 5' + jockey 4671 1 74.00 CATACATAATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGT:1 + chr3R 4504042 5' - INE-1 554 1 69.37 AACATATTTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr3L 6775348 5' + blood 7073 2 58.90 ATTTCTAAACAAATAAATTCTATTAAATTCTATGCCATCTTAATGTTTGTTATATCTATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chrX 13531600 5' - roo 9009 2 62.07 CATATGCAGTATCTGCCCAAAAGTATGCATTGGATATGACACGAATGCACTGAGTTGGGGAAGAGTAATCCCTAAAATTGACCTATAATTTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2L 3762887 5' + jockey 36 1 60.00 GAATGAGTCGCCCAACCAAAATGGGGTACTAATGAACAGCAGAGCAGTGGAGAGGTATGTGGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1 - chr2L 6184109 5' - pogo 2043 1 60.27 TTACTCATCTCCAGGTGTTCAGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTTTTTGCTGCTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTTCTTTATAATGTACCATTCGGCTTCTGTGATTATTCTGACCATTTTT:1 + chr2L 6069510 5' - Porto1 4340 1 80.14 GCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGCAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chrX 12191548 5' - pogo 2034 1 66.19 AAGTTACACTAGGCTACGCAATCAAAGAAGAGTTTTAAGTATGCGCTGAAGGAAATAAAATCGAATAGATTTGCTATTAAAAAGTGTCGGAATATTGGAGTAGGAAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:2 - chr3R 18873342 5' + copia 17 2 58.90 CTTAAAAAAGATTTCAGGTATTTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 96481 5' - roo 9028 1 55.48 CAAGTTCTTAGTAAATACAACGCACTTGCAAAAACTGCTATCTAAACCACTCGGCGTATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATA:1 + chr2R 19553181 5' + mdg1 7102 2 60.27 ATTATAGTCAGCTGTTTTATTTGGGGCAACGAGAATGTATATAAAGGATCATTTAAAACCAGTTACTAAAGTCACTTTTTTTAAGGCATACGGAGTAGCTGAAAACCCCTTTGTCACCTTGGTGACCCCTTTCAGGCCCGCCGGCT:1 + chr4 353412 5' - BS3 1694 1 51.37 GTGGTTGGGAAGTTGTGGGTGTAGAATGGACATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCT:1 + chrX 22252766 5' - diver 6021 2 78.08 TCTGAAACTAATTAACTTTGTATCCAGGAGATAAGCCTCTTATAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGCAGTTAATAACGTCTCAAAACGCAGTTGGTTATTTTATCTTCATTTGGTTTTTATTA:1 + chr3R 11113194 5' - mdg1 7392 2 63.57 GATAAGTCTCTGCATGATGACAACAGGTACGACTGGAACCAGCATCTCGTTGAGGAAGGCTACCTGGTACTATCCTCAAAAGTCCGTTCACAGAGCTGTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCT:1 - chr2R 11881139 5' - roo 492 1 73.81 GGGGAGGAGTACGTGACCATAACCATAACATGAACTGCTGCCACCAACCTCAGCCCCGCCCACCGCCCAACGCCTTCGCTCCCGTTTGGAACAATTTTAAAATTTTTTCTCATTTTATTCTCCCATATCTATCGATATCCCAGAAA:1 + chr2R 6610153 5' + INE-1 498 1 60.27 TTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCG:1 - chr3R 11547760 5' + G2 333 1 66.67 GTTTCGCGATAAGCATTAAATAAAGAATTGTAAAAAGTCACAGCTGCACAGAGCGGGTTTTGTAGGGCGTTCTCAGCTGCTCTTAATTAAAAGTCATCACATATATTTATATCCCTTACTTGCCGAGTAAAACCAAAGACATTAGA:1 - chr3R 23759646 5' - Tc3 319 1 55.48 TTCATATTTATACTGTACTACTACTATATACTCACTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGC:1 + chr3L 9713963 5' + G2 2700 1 71.67 TGGTTGTGAGAAATGTGCAGGAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 - chr3R 10472823 5' - mdg1 392 2 65.07 GCTGCAATTATCTATTTGCGACAAACATTTGCAAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 2762567 5' - roo 9018 2 52.74 CTGTAGGTAATTGTAATATATACAAAATAAAAAAATAACTCAAATTTCTAGCTATAGGTCATTTTAAACACATTTATTTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGG:1 + chr2L 13294727 5' - G2 3017 1 50.00 ATGCATTCAGTCCGAGGTGCTAATATTTCAGTGTGTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACGTATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chr3L 16358732 5' - 412 417 2 74.64 ACTTTATATACAGCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGTCCACACATTGGTTTGGCACTATGCAGCTACATTTT:1 - chr2L 9668288 5' - 1360 3343 1 50.71 TTCACGATCAAGATCAACGAAAGAGAATACAAACTCGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr2L 1558739 5' - 412 462 2 60.15 GACAATCCAAACTGGGCGTGACACCTGCACCAAAGGAAAAAAGGACATGACTTGAAAATCACTTAATCTACTTGGCCAGCAAAGAAAGCAAAGAAATTGAGACGGGGGACAAACAAAGAAATAGAAAGCG:1 - chrX 7466432 5' + Doc2-element 93 1 76.15 TAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCCCTTTT:1 + chr2L 23295812 5' - micropia 5391 2 70.00 GTTAGAGTGCCGGGTGCTGGCCTCTTGAAATTTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr2R 21371462 5' + roo 81 2 79.43 GGGGCAATGAAAGTATACGATATATGGCGTTAAAGTTCAACATAATTAAGAATTAGTAAACATTTGATTGCGGGAATGAGATTTAATGTATAATCTCAAGGTGGTAATACAATCCATTATTAACAAATATTTAACAATTTTTTTTT:1 + chr3L 12255129 5' - Tc1 53 1 47.95 ATTTAAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1 + chr2R 20673629 5' - mdg1 363 2 56.85 ACCCACACATACATAAGCCAAAGCAATCTTTCTCTCGATAGTAGACCGGGTTACTCGTAGAGTGAAAGGGTATGCTAGGTTCGTTGAAAAGTTTCGGACTATAAAAAGTACATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTTGAT:1 - chrX 22789279 5' + INE-1 95 1 47.26 GTCAGTTGCGCAATGGCTTCTAAAAAGCAGGGGTGTAAAATTAAAAAGATTAATAAATACATTTAATTCAAAGCAAGAGAAAATGTTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCCGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGG:1 - chr3R 31997593 5' - INE-1 539 1 59.70 AAATATATATCTACTGATAATGAAGCTTGTGAAATCACCAGAAGAATGTTCGTTTTTGAGAGTTTTTTATTTGAAATATAAATTTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chrX 3197043 5' - mdg1 386 2 59.59 CGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr3L 27391399 5' - 1360 3342 1 52.05 CCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATCACGCGCAAATTTTATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGAAAAATTAAAAGTTAAAATCGTCTTCCGGCCGCAAAGTTTGAACCGCGACGATACAAACATTTAATAGACAAACAAAAAGCGAACA:1 - chr4 1294991 5' + TAHRE 221 1 55.48 ATGAGTTATTTTGCTAGTTATTTCATAGCTACGACTGGGATATTAAACGACAGGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:2 + chrX 1061529 5' + 412 66 2 62.76 CACTTAGCTTAAAAAAGATTTCAGGTATTTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3L 96474 5' - roo 9036 1 60.69 AATTGGGGAATTTGATTCATTTGTCATTTATTTAAATTCTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACACTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2L 9472098 5' - roo 357 2 51.37 GCCGTCCATCATATCGTCCGGATATATCTTACCGCCCCCGTAGCGAGTGCCGTTCCTTTGAAGCGACGACCATACGCAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATA:1 + chr3R 7573057 5' + Quasimodo 111 2 54.33 CTTAATACTAAAACAACATATTCACTGTGGTCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAAAGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAGG:1 + chrX 22633233 5' + INE-1 77 1 52.59 TTAAATCAGCGGCGACTGTGGCGCAACTAAATTGATCTTTTATCGCTTCAACGACACTGCTGCTCGCTGGAATCGAGAATCGTTTCGTATCAGAGATCGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAAT:1 + chrX 7490757 5' + Circe 228 1 75.19 GCATGATAGTGAATATTAGTAACATATGTATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chrX 5150263 5' + roo 8708 2 52.74 GATAGGGTGGCTGTGCAATGAATCGAAAGCTGGCGGCAAATTTTAAAAAACAATATTTTGGTCCGCATTAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr2R 22492140 5' + pogo 49 1 52.05 GAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTTTTTTCGAGAGCGAGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAG:1 - chr2R 5531169 5' + 1360 139 1 71.83 CTGCAAAATTTCTTACTGGAGATATTTGTCCATCGACTTTTTTGCTGGCTTGCACCACTGATAATAATATGATATTGCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATG:1 - chr2L 4641385 5' - FB 209 1 66.96 TATAAAAGAATACTTTTAAATGTAAAACTAATAAACAGGGAAAAGAATAAATCAAATTTAAGTTTTTTTGATCATCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr3R 17546724 5' - blood 331 2 48.63 GATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATACA:1 + chr3R 907902 5' + gypsy11 365 2 30.14 CACATGTGGCCCCATTTTAATGGACCTGCCTCGTAAAATGCCACAAAAAGTGTCACAAATTTATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCCCCCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr3R 28272434 5' + Tirant 8139 2 57.50 ATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATC:1 + chr2R 23000070 5' - mdg1 333 2 79.17 GGATATTATGCCATTTGTGCGAATGTTCACATTGAGAACTCTGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGTGAAATTATATTTAG:1 - chrX 4785154 5' + roo 75 2 69.93 GTTACGCAAGTCCCCTTGGATAAGCCTATCTTCTATGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 + chr2L 2031050 5' + 412 57 2 69.49 ATATCAACAATAAAAATCGCGACCAACAGTGCACTGTAGAGTGGGATGCAATTTTAATAAAAAAAAACCCAGAATATTTAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTACATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 + chr2L 21943895 5' - opus 7473 2 63.04 AAAATGGTCGAGCAATAATTGCGCGTGTCGTTTGCTAACCAAAAACGAAAATCCCATCGTGTGTGCTCATCGCACCTGTTCCTCATGGAGGCATATTTATTGTTTTTAAATTTATCAGCTGAGTAACGTGTATCTGA:1 - chr2L 15989312 5' + INE-1 544 1 63.50 CAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 + chr3L 9909715 5' - Transpac 5196 2 64.29 GCTGCAATTATCTATTTGCGACAAACATTTGCAAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chrX 2762567 5' - roo 9054 2 64.55 ATGGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr2L 6717216 5' + jockey 33 1 59.68 ATCATTTTATAGAGAATTCAATGGGGTGGATGGAAGTGTCGACAAAGTGTTTACTCCTCTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr3L 7995371 5' - P-element 2874 1 74.64 GTGGTTGTGGTTCAAATGCTGAATGTGCTGCATATATATGCATACATACATATGTCAAATTCTCGATGTGATAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTAC:1 - chr3L 1963735 5' - Idefix 184 1 50.68 GCCTTTTCTTCCAAATTGTTGTATTCCCAAATTGTAGTCGAAGACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATTCA:1 + chr2L 3659083 5' + 412 7130 2 67.81 CGCAACAACAAATGCGGCATATAAACGAGCGCATAATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATC:1 + chr3L 11336313 5' + blood 7009 1 77.78 AACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATG:1 - chr3R 11750266 5' + Tabor 68 2 63.01 AGCCGCTTTTAATTTGGTTTTTTAGTGCCCAGTTAGACGTATTTGTAATTTATGCTCCTAAGACCTTTTGCTGATTTAAAGTATCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1 + chr2L 5601527 5' - mdg3 5478 2 67.69 ATACCATTTTTTTTTGTTTTTCCTTAATTTCTTAGCTTAAGAATTAAAACCCACTAAAATATAATTTTTAAATTTTTTTTTTTAATTTATTGCCGATTTAAATATACGAATTTACTTATCTAAACTCACTTTTTAGAAAATATTA:1 - chr2R 10796317 5' - HB 263 1 61.38 GGACAAACGTTTTATAGTATATTTTCCCTTGGCATGCCTGGCTCGTTTCATATTTTAAAATGGCAACAATTTGCCAAAAACGTTATTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATTCAATAACAG:1 + chr2R 21414365 5' - BS 5062 1 62.96 ACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 + chr2R 16891844 5' - hobo 2903 1 56.19 GCGCTTTCCGTACCGTTAACAAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATT:1 + chr3L 23773882 5' - Transib5 2860 1 74.07 CAACATTCGCCATTGCATACTTTTAGGCTGAGGGCGCAATGGGCGTATGTGTAATATTTCCATGCCACATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr2L 2004915 5' + jockey 60 1 55.48 AGAGGATACCAATCTGTGCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:2 + chr3L 15026613 5' + opus 7140 4 65.07 AATACTTGTTACTGTCTCATTATGTCCTTAAAGAAGTATATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGCGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTT:1 + chr3R 10968729 5' - I-element 5272 1 71.23 GGGTTAAGTTTGCAGTTGAGTAAGTTAACACTAAAGTAAATAATGATTGCGATCTCTTCATGTTTCCTAAAATAGCAATCTTTTATTTTTCCCTCTGTGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATA:1 + chr3R 10472654 5' + mdg1 7063 2 68.49 CTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGCGATATAAGATCA:1 - chr3L 7962269 5' + blood 7094 2 71.92 ATTGGGAATGTGGATAAGACGTTGTTTTTTTATGTGGTACTAATTTGACAATTGTCAATATGTTTGCTTTGTCGGACATAATTTACTAGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 - chr2R 2843423 5' - 1360 3360 1 59.59 AGGTAATGAAAAAAGCACTGTGTTTATTTTTTTTTGCTTATTTCTAAATAATGGAAACAAGGATTTGTTCCATCGGCTGGATATCTTCGATTCTAAGTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCCGTATACGC:1 - chr4 436943 5' + 3S18 5773 2 78.46 GTGGGATAGTTCAGATCTTTACTGCTTTCAATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 7539541 5' + roo 8719 2 56.16 GGTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3R 24122659 5' - roo 341 2 64.38 GCTAGAAGTTCATCCAATAAATACATAGAGGAAAATGCGAAGCTTTATATTTTGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCG:1 + chr3R 27510074 5' - Bari1 1643 1 60.69 AATTTACGACTGTAACGACTTCATTTCCACAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACT:1 - chr2R 4029371 5' - 297 6890 2 78.08 GGCTGCTGACGATGTCCTTGTTCCCATCCTCGTCCTTTGGCCAAAACTCGCTATGTGGTTAACTCGGTTGGTATGTCTGTATCCGCCGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr3R 27859142 5' - hopper 1384 1 65.07 AGTCGGTCAGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGACTT:1 + chr3L 23146442 5' + 1360 21 1 68.89 ATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGG:1 + chr2L 23299985 5' + invader4 389 1 73.91 GCGCCAAGTCTTTACCTTTTGTGGCTTATCACCTGGTCCTGCACCTTCAATCACCCACTCCCCCTCGTCGCCCACCTTTGAGGCATATATTGTAATCCAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCGATG:1 + chrX 17731937 5' - pogo 2073 1 65.75 GATGTAAACTTAAAATAAAACAAAACAAACATTTACATACAAAAATATCTTTATTTCTCTAGACTACTACTGACTTGAATTTCTGATTAAAAGCACAGATTAGGGACACCAAAAAGAAATTTAAAAACACTTAAGTTGCAACACTG:1 - chr2R 14252610 5' + transib3 120 1 63.01 TATTTAAATTCTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACACTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr2L 9472070 5' - roo 8994 2 70.34 ATTCCATTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 12866513 5' - roo 9036 1 59.31 AGCCCTATAAAAACTAAACTTAAGGGCAATGCAAGGAATCTTATAAGTAATGAGCAGACAATTGCTGCAATCATTATCCAACTGTCAAGTGCAGTAAAGTCAGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr3L 6082048 5' + Doc 16 1 72.59 ACCAATCGCAGGGTACACTGAATGGATTGGATTGGCTTTGACATGGCAATCAATTTTTGGTAAAGTTATGAAAAAAACTCAATTTCTGCCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 - chr3R 24493202 5' + jockey 4703 1 59.59 CACATAAACGATCGCTACCCCTCTGCCTGGATTTCAGGTTCTATAAGTCCTTAGATCTTTCTGTTAAACCCGTTAAGGATGATGTATTCAAACAAAAAGCGACATACACTTTAAAGCGGAGTTAAATACTTGGGTGTTTCAAAAA:1 - chr2R 5939608 5' + hobo 261 1 72.41 ATAATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 76147 5' - roo 355 2 60.00 AATAATACGAGTATTACAGTTTTGGGATAATCCGGTTTTTATCTCTGTTTTCTTAAAATATCAAATCGATCAATTGTACGGGACTTGATGATTGTCAAATTAAATAAGTGTGGTGTAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr3R 26191762 5' - hobo 2937 1 79.72 AAGCGTTGAAATTAGGCTACCTGAGCCATAGGAGAAAGATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3L 3770313 5' - accord 185 2 76.79 TTGTGGTATTCCTTCATTTATTACAATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:2 - chr3R 16913472 5' + pogo 49 1 56.85 GGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chr3R 9352113 5' + Tirant 32 2 61.36 ACTTGAAAATATTGATTTCATTCTATTCAAATCTTTGCAGGTTGGCGATTGGCAACACCTCATGAATGCCAGGCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAA:1 + chr3L 18344677 5' + McClintock 6069 2 50.00 GTACCGTTAACAAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTTTTCGGCA:1 + chr3L 23773891 5' - Transib5 2851 1 67.41 CATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTG:1 + chr2L 15834470 5' - hopper2 1526 1 71.23 GACAGCAGCAGCAGAAAAAATTTTATGATCCTGCCTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1 - chr3R 8709831 5' - jockey 4917 1 74.64 AGAGTAATCCCTAAAATTGACCTATAATTTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1 + chr2L 3762948 5' + jockey 98 1 77.93 ATTTTTATATATATAATTTTTTAAATTGTTTCTCATTTTATACCCCAATATCTATTGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGATTAACGGGTATCTGATAGT:1 - chr3L 1997090 5' + INE-1 548 1 79.20 AGTGAATTAAAGTCATTAACCATCCGAACCAATTGGCTTTGCTCCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGACTAACTTCGATTGATTTACTTCTTCCTAAGTGTGTAAACTAGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATT:1 + chr3L 16973316 5' + S-element 1552 2 71.23 CTACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3L 12224704 5' + 412 7128 2 67.12 GCCTTTGCGTTAATTAACCAAATAGATAGAGAGTCAGCGAGGCGCAAACTTAAGCCTGGCAGCCGTTGTTGGGGAACATTCTGGGACTTGCCTAAAACTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2L 15988113 5' + roo 8681 2 72.86 TGGAGTTCCAAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAACAACGTAATTGTGATCAATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chr3R 29645764 5' + jockey 82 1 65.75 ATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 + chr2L 17029608 5' + blood 79 2 71.23 TTAGTTTCCAGTTCACCCAACCACTGATCGTATCGTCCTTTAAAGCTGCTCCCGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:2 - chr3L 17890855 5' - 412 7515 2 63.70 GCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 + chrX 14964620 5' - roo 411 1 74.67 GTTGTATTGCTGTTGTGAACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1 - chr2L 16089691 5' + 3S18 53 2 52.05 GAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 12866491 5' - roo 9047 1 58.93 AAAAGGATAATTCGAGGGTGCCGGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3R 27768777 5' + 297 31 2 61.64 CTCTTGATCACAACTACAACAATGTGGATTTATTTTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTC:1 - chr2L 20644625 5' + Ivk 218 1 74.64 TGCAACAACAACAGCGGACCGCAACAACAAATGCGGCATATAAACGAGCGCATAATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3L 11336294 5' + blood 3 2 78.03 AACTAACTGCTATTGCTATTTACGATACGATAGTTACGTGGCACATGGTTGTGGATCTATATGGAATGGTACATATACGTTTCTATATGGGGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr3L 13868603 5' + 412 7088 2 56.16 GTTTATTTATAAATGCCCACGTTGTCGGGAAGGTTATCTCTGGGGAACGGCGGATTCATTGAAACCTGAAGCCAGAGCGTAAAGTCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3R 23765342 5' - roo 9030 1 57.86 ACAGAGAAAAAAATATACATAAACCACCGATTTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr3L 3534368 5' + 412 7104 2 69.37 TAAATGAAAAGATTCCCACAAATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr2R 5237939 5' + Doc 39 1 63.70 GTTACATGGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - chr3L 23986621 5' - opus 7450 2 59.29 AGAATAACCTTCTACAGCCACGAAATCAACGAGCTGCGGCATTATTAAATGTAATCATTTTTATTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGG:1 + chr3R 17453180 5' - Ivk 5323 1 58.22 GGCTGGATTCGTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr3R 7035323 5' + roo 8744 2 76.03 CTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2R 19555004 5' - pogo 2069 1 67.03 TGTCGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGTTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTT:1 + chr2R 4260421 5' + micropia 5212 1 44.14 AGTCAGCTTGAAAGTGCAGAATGAGGTAAATTGTTAAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTCT:1 + chr3R 25304744 5' + roo 81 2 79.02 CAAAAGACATAATACATTTTCCCATGATATTTTCTTTGCCATTGGATTGAGCTTTGTATTTTCAGGTAAAAGCAAACGATCCTCTTGGGAAATGTGGGCTGCTGAAACAGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCA:1 - chr2L 20234925 5' + Stalker 7060 4 73.29 ATTTTTTAATACGTTTATTTCTTTGTTTGATCTTTTATTTCTGCTCGGGTCTTATACACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr2R 641981 5' + opus 7030 4 64.18 GCCGAGGGATAATAATATACCTAGCCAGGGACTGAATTTAATTGCAATTATCACTAGGCAGGCTTACGGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chr2L 2030107 5' - 412 7496 2 51.37 ACTTCTTCAGCCGTTTTTATTTATTGGCTGTGTGCCACAAAGAAAACTATTTACAAGTTTTTTCACAAGTAAACTACATAATTGAGAGCTCATAAATGTGTTTATACGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACT:1 - chr2L 13294872 5' + G2 3023 1 68.49 GGACATGGGCGTTAGAGTGCCGGGTGCTGGCCTCTTGAAATTTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr2R 21371452 5' + roo 73 2 72.73 GCATATAGTACAACTTTTTAAATTGGCAATTGTTGTTTTCGTGATTCACGTCACATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAATATTTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAA:1 + chrX 22901472 5' - Quasimodo 7321 2 56.25 CCAAATGTTTTCAATGATGTTAATGTCAGGGAAGTAAGGCGGCCACTCGAGCAATTTAACGTTTTGGTCTTTAACAAGTGGAAGTTCCATGTCTTTGTGGATGTCATGATTAGTCATATACCATGGAGCACCTGTGATTGTTCTAA:1 - chr3L 27358327 5' - G3 4275 1 54.79 ATTTTTTACTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr3L 22978656 5' + 1360 37 1 57.53 GCACATGGTCACCAGCAAAAGTTCCCAGTCCCAACCACCCACACTTTTTGATGTGATCAGCACAAAGTTGCTCATTGTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 - chr3L 9907460 5' - jockey 4966 1 54.96 ATAGTACAACTTTTTAAATTGGCAATTGTTGTTTTCGTGATTCACGTCACATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAATATTTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCT:1 + chrX 22901476 5' - Quasimodo 7299 2 64.38 CGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGA:2 + chr3L 9571673 5' + jockey 4523 1 66.40 GGATGACATTTATCTAGCTTTTTATCAAAGCATGGTGCGATAGAAAATCGAAAAATTGATTCAAGCGTCCTTTTTTAATTAAATTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chrX 13786990 5' - pogo 2084 1 68.46 AATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3L 96517 5' - roo 8992 2 71.23 CAGGATTACATGGGTGTCATATCAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chrX 13395274 5' + roo 8715 2 66.94 AGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTACTGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chr3R 21705983 5' + 297 61 2 61.27 TAACTACCGCAAACTATGCAACCAGAAAGCCAACTGAATACAAAAACGGAGACTATGTAATGGTAAGGAATTTCGACAGCACATCAGGCATCTCTATAAAATTGATTCCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAAAGAGCGGAGAGCGCTA:1 + chr3L 25983250 5' + 1360 110 1 78.08 GATTTTTATTTATTATAAAAAATTATTTGTATGAAACTCATGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCT:1 - chr2R 10078044 5' + jockey 4526 1 68.22 GTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chrX 1103591 5' + pogo 40 1 56.85 GATAGTAATCGACTATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATA:1 + chrY 680444 5' + invader2 4889 2 67.14 TACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGC:1 - chr3R 11547817 5' + G2 293 1 70.71 GAGTGGAATTGCGAATAGTTTTGCGCTAGATCGCGCGTACATTTTCCAACGTTGCTTAGTTTCGTTAGTTCGATTCCATCTTTCGGAATCTTCAGAGCCATCTTCTGGCTTTACATATTGACCACAAACGACTTTCCA:1 - chrX 1618673 5' - Copia1_DM 422 1 51.45 GGATAACTGTTTCATTATTTTTGTGTATATGTGTCAAACACTTAATTTTTCTAGACGTAGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 + chr2R 4628335 5' - Transpac 5208 2 70.55 CCCAAGAAAACTTGATTTTTCTCTTATCAGCGCAGTGGTTGTGATGTAGCTAATTTAGATATTGCATCAGCCAGGATTACATGGGTGTCATATCAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chrX 13395203 5' + roo 2 2 72.60 GTGTGTGTGTTCAAAGAAAGTCCATCCACCGGGCTTAAGGAATTTGCTCGCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr3L 905910 5' + 412 7088 2 58.90 ATTAAAGCATTTGCATTTTAAATCAGTCCTTTCTATATTTTTGTATGTGTATGTGTGTGTATGTATATATACATATATATATAGATATATCCTCGCACACCATTACACCTGAGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chrX 5145354 5' - hopper 1408 2 78.77 TAGGAGCAGTGTGGTACTAATTATACGGCTGCTTATGTTATTTGTGTAGTGTAGTAGTAGACTTCATTCGCTAAAAGATGCGTAACGGCAATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTG:1 + chr2R 5403470 5' - 1360 3338 1 56.25 AAGTCTATTAAATACGATCAAAGATCTTTTAATATTAAAAATGTGATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 + chr3R 17546634 5' + blood 7090 2 71.92 ATTAATACGATTTGTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 + chr2R 23000052 5' - mdg1 7388 2 66.90 CATTTGCTGGTGCATCACATTTAATTCGTTTTGGCGCTGTACGCGTGCGCACGCAAATCCCCAGTTCCCCAACTGGATACCCCTCTTTATACTCCACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2L 16458547 5' + roo 13 2 73.13 AAAAGTACACTCTGAGAAATCGGGAAAGAATTCGGTTGCAATTTGGATAAGCTAAGAAAATATGTGGTGGAACTTGTTTACATTTTACTGGAGATAAAAACTCGTACTTTAAATTACCCGCGCAATTACGAAAAGTCTGGTGTT:1 - chr2L 11086536 5' + GATE 8418 2 77.78 AATATAATATAATGTATAAAGCTAACCAACTCTTAAATGTTATTGTACAACCAATCATATATGTATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3R 6711411 5' + pogo 42 1 56.62 ACTGCACATCGGTGGTCAGAAAACCACACAAGGTGTTGAAATGATTGCCCAGTGGTACTGGTCACACATACTTTCACTCAAACTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATC:1 + chr3L 3286013 5' + hopper 344 1 62.99 AAACTATAAACATAACATACCAGGAAACTGGTTAATTTGTTGTTGGTTGCGGCATTGGGGAAGTGCACTCTTCGCTCCAAGATTTTGGAACTGTGCTCGGCAACGACGGAGAGCAAGAGTGCGCTCTCTGGTCTTGGGAGAG:1 - chr3L 25952937 5' - Doc4-element 106 1 77.46 AGGCAACTCGTTGTCAAGTCCTCGGACGTAACGTACTTTAAAAGCGCTGACTAAATCTACGTTGAGTATACGCTAAGTGTTCCGCAGGGAGCCGCTCTTAGTGCAGATTTCGCCTTTAATGTAACTACTCTGACTAGCGAGTCCG:1 + chr3R 9368144 5' - diver 5726 1 69.66 AATAGACTGTTGAGATCCAGGGCTTTTATTTTGATGGTTGATTCAGCGTTTGATCTCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAA:1 - chr2R 8055355 5' - F-element 168 1 61.64 GTGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 - 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chr2R 13644498 5' + Burdock 6176 2 63.89 TCGAATGAGTTTGTTTGGGCTTGCTGTAACAGAACAGGTAATTGTTGTTGTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATTGCCGCTCG:1 - chr3R 435940 5' - 1360 2994 1 57.63 ATAAAATTGAATCATAAACGCACTTTCCTTCTCGACACAAAGAGTCCGACGTTGCGAATCATTGTACAGAGAGAAAAATATTACGTTTCAAGTTTGAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATT:1 + chr3R 26519922 5' - FB 706 2 65.65 AAACTAAAGAGGAGGAATATTTTTGAAACGATATACAACGCTACAGCTACTGGATATATATAAAAAACTTATTAAATGCGCGTGGCAAAATGTTTTGGCAAATAAAAAAAAATTAACAAAACTAAAAAAATAACAAAATAATTAAT:1 + chr2L 22757440 5' + gypsy11 3938 1 69.18 CAGGCTCCGATACGCTGGATAATTAAAATATATGGATCAGACAAAAGTATTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCT:1 + chr3L 22648580 5' - Tabor 7215 2 65.00 AATACCCAGAATTTCGAGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGTATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chrX 7515770 5' - roo 399 1 73.39 TAAACTTTTCCTAGGCATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr3L 17707792 5' + Doc 46 1 54.11 CTTTGGATTTGGTATACTGGTATAAGCTGTGTGTGTTTTCTTGTAGTTTGGGTGGTCGGCAGTACCTAGGGTGTACTTTGCCCGTACCTTTGCAGTACCTGACCTGTATTTAAGCGTACCTAGCACAGAAAATTAAATTTGAAAAA:1 + chr3R 20724877 5' - copia 4676 1 42.47 AACCCTAATCGATTGAAAATACTTAAGTAGTAGTAGATAGTAGGTAGTAGTTTATAAAAAAAGTTTCGACCCGAAAAAAGGAAATATGTACTTTCTAGCTCAAGATCAGAACCTGTCCTTATAAACGTCGAGATCTCAGGAAG:1 - chr3L 10097483 5' + INE-1 140 1 58.04 AGAGGAAAATGCGAAGCTTTATATTTTGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGACATAGTTCTTATCGCTT:1 + chr3R 27510100 5' - Bari1 1616 1 77.40 GCAGCAGCAGAAAAAATTTTATGATCCTGCCTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTA:1 - chr3R 8709827 5' - jockey 4913 1 77.54 AAAAAGTTCGTTCTTAAATGAGATATTTCATAAAAGGTATTTTCGCATTTTGCGACCCGATTACTTATTAGGTCTTTGTGTTTGGTTTACTCTCTTTCGTGCGTTCTCTCTTGCGGTACTTTCAACAGCTCGCTTGCAAGTTTTT:1 - chr3R 906379 5' + Cr1a 372 1 53.10 GTCTTGTATATAATAGTGTCATTAAATGCCTTAGTTACTTAACTAACACCTACTTTATTCATGGTGTGTTAAGTATACAAATGTACTAGAACTTACTTTTTTTTAATAAATGCGTGCCAGCGTCTATTAGGCGTTGAAAATTTAAA:1 + chr2R 21763910 5' + TART-C 11084 1 74.66 GTCTGCTTCGAGGGAATAGGGAGGGAAGTGGTATGAAGCTGAGAAAAATGGAGTTAAGGAATGGTAATAATGATAAGAATAAAGATGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGATCCCTGCACATTGTAAGTCCTCACATGATT:1 + chr3R 29288655 5' + BS 4990 1 76.71 ACTCTATTCCCAATTGGTCGGAAGGTTAGTGGCGATAAGCGAGCTGTTCCGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3R 18815887 5' - hobo 2911 1 53.40 ACAACTGCAATTGAAGAGATCGAAACACGACACACCGAGAATCTATCGACAAAGATGGACTATGAACGAGCCATTGCAGAGTACGAATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATGGCTTTAAGAGCGGCAGA:1 + chr3L 24759009 5' - Cr1a 4246 1 65.89 GTTATTGTTCAAGATGGTTCCCAGCAACCTCAACAGCCAAATCCTTGGCTAAATCGAGGACAAAGTCCTCCCTGTACCATTAATAGAGCAACATTATCTTTCAATAACGTTTTATTTAATTTTTATATTTCACCACTCACTAATAA:1 + chr3L 12890731 5' + accord2 7327 1 54.79 ACACATAATAATCATCATAACAAGGCATTAACTTGCTCATTAGCCAGCCCAGGCGCACAAAAAGGATTCGTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 7035727 5' + roo 8685 2 47.95 ATTGTGTGGAGTGTGACCTGTGTGCATGTGCATGTTGTCATGTGCTTGTGTGCGCGCGAGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chr2R 6632520 5' + P-element 21 1 70.55 TTAGCGAGCTAAGTTAGGTTGTGCAATTTTTGTAGTTATATAGTAAACTTGTTTTTGTTTTGAGTCGAATAAATGATCCTTATTTGAACTAAGATCAACGCTTTTATTGATTGAATATCAGCTTAAGACTGAAACAATTGGTGTGA:1 - chr3L 25850490 5' - Tom1 268 1 38.36 ATCACAACTTCATATTTGGTTGCTTATTATGCGTGATGTTCTAGGACTTTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 + chr3R 15021983 5' - Tabor 464 2 68.97 GAGCAGAACTGCTCCTACTCTGGTTACCCAATTTACGTTAAATGTCACTGACAATGTTTGATGACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAA:1 + chr2R 5542294 5' - 1731 303 1 78.08 AAAGTTCGAAGTTTGTGCTCTTAACTATTATTTTTGGACAGTCTTCTATCATAAATGTTAGTCTTCTGGTTTATACCCACACCTTGTGCACCTTCTTATGCATCTGCACCGAATTAAAATAAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 7304518 5' - hopper 152 3 51.49 ATAAATATCATAAATTATAGCTGGAAATAGTCGGCGGCAAAACTATCAGGTCTGCGAATTAGTTATAACTATTATTATATAGTTATAATATATATATGTCGGCAAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTT:1 - chr3R 12929328 5' - invader4 3056 2 66.44 ATTTTTGTAGTATGCACTTTTAAATTTGTACACACGTCATCCGCACTCATTACAAAAATATCAAAAATGGCTAACCAATGCGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTA:1 - chr2R 5542461 5' + 1731 43 2 56.16 CTCAAACATCAGCCAGCAACGTCAATCCAAATCATAGACTTTGCCCAGACTCAACTGATTATATATGCACCAATGCAATGCATACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chrX 17732100 5' + pogo 35 1 60.27 CTTCACATGCGGAGCTAAGAGGTTTCTTGGCAAAAAACTAGGCCGGGAACATTATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCACACTCAGCGCATTGAGAGC:1 + chr2R 4638597 5' - 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roo 334 2 69.86 AAGAAAATCACTTAGCTTAAAAAAGATTTCAGGTATTTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3L 96466 5' - roo 9043 1 65.75 GGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAG:1 + chr3L 2724975 5' + Ivk 36 1 54.03 TCGATTGCCTGCAGCTCTCATAACAAGAAAAGAGATGGAGATAGAGGACGAAGTGTAAGAGGGACAGAAAGATGGAAGAGATGGTAGCTACCAGAGCACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr3R 19531350 5' - hobo 2916 1 65.93 AGCTGATTGTAAATCTATGCGGGCCTCAAGAACCGCCAACCCCTAAAAACCTCATGGAGATAATAAGAACCATGCACGCACCGAGAGCATCGGCGTCAAATGAAAAGTCCTTGCACGTCGCACTGCCACAATTCTGCGCTGACAGC:1 + chr3L 12976755 5' + invader4 499 1 66.44 GATGTGCACTGAAATAATTTCGTAAGTATCCTTAAAAATCTTAAAAAATAGAACATTTTTTGGTAGCTCTACAAAACTGAGTTATGTGCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTCCCCTCTTCCGTGACTCTTAGTCATACATACCTA:1 - chr2L 5601681 5' + mdg3 5285 2 60.27 TTTCCACACAAAAACTTTCGTGAAAAGTCATCTCTTAATTGAAAATTAACAGCCACAGAACAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTG:1 + chr3R 24509058 5' + FB 62 1 59.59 ACACAACACATAAACCAAGAACAAACAATTATCAACAACAAATTCATTAAGAACTAATAATATAAAATATATAAGAAGGAATGTCTCTTGCGAGTTGTTTATCAAAAAACTAAGAAGACGCAATTAACAGCCGAGACACTCGACCA:1 - 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chr2R 5206900 5' + G4 3759 1 63.04 CTAAGGATCAAAGTATTGAGTTTTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGCTTTT:1 - chr3L 4115246 5' + 1360 37 1 55.48 GCACAAATAGGTTGTATTAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTT:1 + chr2R 5617462 5' - invader1 3985 2 60.27 GGGGTGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chrX 12866461 5' - roo 323 2 78.87 GGAAAACCGGGCGAAAAAAGGAGGGAACTAATATTTTAAGAAAACTCAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTT:1 - chr3R 15711856 5' + diver 5964 2 67.81 TATATTTATTAAATTGTGCTTATCTATCATATGTTCCTGCCACTGTTTTCTTAACTGTTTTTCTAATTTTTTGTTTGTGTAACTTTTGACCTTTAGTTGTTAGGAAAGATTCGGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 - chr2L 3694470 5' + Doc 8 1 77.14 GACTGCTATTGGGAATTTAAAATGATTAACTGCCAATCAATCAATTGTCAAACTAAACTTAAACATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chrX 14964718 5' + roo 56 2 59.59 GATACGAGGCTTTTTGGTTTAAAAATAGCCATCTTTATATTTATTTTTGGTCAATATGGCCCTTACCTGATACTCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 96612 5' + roo 8686 2 66.67 CCTCAGGATTTAGGTGGAGTTTTTTAATAGTTCTTGGGCCTACTTGTAGCGGTGGTGGCGTAGCCTCAAAGACAATAGCAGTGAATTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACAAAACGATTTAGCTAAG:1 + chr3L 24120957 5' - R2-element 3350 1 63.43 GAACAGTTGTCTTACCTTGCAGTTCGGACTTACTGCGTTGTTGATGAGTAATATTTCTTTCAGCGAGCTGTAGAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAG:1 - chr2R 4313089 5' - gypsy 7424 2 49.32 GTGTCGGGGTGATATAAAGGAATCGACTTGTAGGACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 - chr2R 5737223 5' - 1360 3353 1 55.30 TCCATCCACCGGGCTTAAGGAATTTGCTCGCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGCAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3L 905890 5' + 412 36 2 51.97 CTCTTCTTAATTTATATGTACCTATATTTATATGTACCTCTCAGTCTTGATCAGTCCCCGTTGGCAGGCATGTTGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 - chr2R 5019813 5' + Doc 80 1 47.52 AGTTGGCTACAGATTAAAAGTTAAGCTGAACGATAGTTTTCCACCTGCTCTCGGTTAAAGTTTTTCCCACACAAGGCTTTTGAAATTTCAACTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 - chr3L 10133656 5' - 412 7540 2 76.71 TAAATAAATTAGCTAAGATTTCAGTCCCTAGAATGGCCACCCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTC:1 + chr2L 685964 5' + roo 8692 2 60.45 CAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGTTCCGCTCATTTCTTATGTAAAT:1 + chr2L 76039 5' + roo 48 2 52.63 CGTACTATTTTTCTTCAGTGCATCAGTGTCTGCCGTTCCCCCTGGCACTATTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chrX 5858906 5' - hobo 2927 1 57.95 CACAAAACACGTGTCAGTGACCGCAGAGCAGAGAAGGAAAAAATAATAATAATAATATTA:1 + chr3R 24423204 5' + mdg1 34 2 53.33 AGTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGAGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAAT:1 - chrX 1018156 5' + 1360 199 1 69.90 TGGGAAAAAGCGTCGATGCTGCGCCTATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCAC:2 + chr3L 24152388 5' + HMS-Beagle2 6891 2 78.77 GTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 + chr2R 4628394 5' - Transpac 241 2 74.81 ATTGAGATTGGGCATGGCAAGTGAATGGCTGGGCCAAATGATTCGCCTCTAATGTTGGCAGGACTAGCAGCTGGATGGCAGCCTGGCAAGCTGGGTTCACTTTTTTTTTTTCTTTTTTT:1 + chr2R 15438784 5' + hopper 142 3 52.94 GGTATGCAAACTTTTTCCCATCAACAAACTTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chr3L 22052720 5' - mdg1 391 2 65.07 CGCCTCATCAGGGGATGTTCGGGATCCGGTCGATTGTTATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr2R 1921392 5' - mdg1 7421 2 58.90 TTTGCTGCGTGCCAAGCGGCCACATTTACAAATACAGATACAGATCCATTTGCAGATGCAGATACATTTTGCTGGTACAGCTGCAGATGCGGATACACATTCTGTATCTATTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2R 11609362 5' + roo 8673 2 79.86 GCTGGAACATCGACATTAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 - chr2R 17890997 5' + Tabor 6874 2 58.90 AGATCGCGAAGGCCAAGGTTGAGCAGTATTGGTAACGCGCTGTTTACGGAAAGAGAAGGAGAAAATTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - chr3L 25443110 5' - opus 447 2 54.11 AAGACAGATATATTAAATTTAAATGCTAATGTCTTTTAAATTAATAACTTCATACAAACTTACTTACTTGCTTAAAAATGTCTATATTATATTTGAGTGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTT:1 - chr3L 20594264 5' + roo 22 2 70.55 TGACACCCACACACATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTA:1 + chr2L 17240209 5' - hopper2 1550 1 57.53 TTAAGGCGCTTACTCTGTCACCTGGCTAACACAGACACAACTTACCCACACCCACATCACCACCAACACTCTTTCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chr2L 11915488 5' + hobo 38 1 51.85 AAAAGAATACTTTTAAATGTAAAACTAATAAACAGGGAAAAGAATAAATCAAATTTAAGTTTTTTTGATCATCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 - chr3R 17546721 5' - blood 7340 1 50.68 ATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr3R 30634955 5' - roo 320 2 76.55 AAACGCGACTTTAAGGTAAGCCAATAAACTCAAAGAGGGTTACGCAAGTCCCCTTGGATAAGCCTATCTTCTATGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 2031012 5' + 412 7095 2 53.90 GACATAATTATACCTACACGCTAGCCTGCATGGATTAGGAGGAAATCACGTGGCAAAGGCTTTGATTCCATGCTTTGTTTGGCCTCTCAATTAGTTGCCTCATTGCATGACCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 - chr2R 20865807 5' - 412 7541 2 76.43 GAGCACCGATTCTATAGAAACCAAATGACCTTCTTTAGAGAGTGAAATTAACGATTGGCCTACGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTT:1 + chr2L 3294108 5' + hopper 55 1 56.16 ATATAAAAGTGTTAAATTCAAATGAGTTCAGAATGGGCCAAAATCCGAAGCGGAGGGCCAAATGGCTTTTCCAGCTGCGCCAACAGGGCGTATGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3L 19199757 5' + hobo 25 1 63.45 ACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chrX 16855336 5' - roo 346 2 57.53 GTTGCAAGACAGTTGGTAAATAACAGAGTCATAATCACAGCGTTCGGTAATATATTTAGTTTAACATTAGGTTAAACTAATTTATTGAATAAATAAAGTCTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3L 19792337 5' + pogo 13 1 50.00 CTTGTGGTGGAATCACCAAACCTAGGTATAGATTTACCTAGATATAGATTTATGGTAAATTAAATCTAAAAACAACTAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr3L 4187310 5' - pogo 2060 1 56.16 TGCGCTGCAAACATTTAAACAAGCAGAGCGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTTAA:1 + chr3R 8308820 5' - blood 7175 2 50.91 GTTTTAGTGATTAAAATACACACACACACACATACAGACAAACTTGCAAGCGAGCATTACTGTTAATTAATTCGTAATGTAATCTTTTTTTTCGCAGTTTCTTCGCTCTCCACACTTTTCATTTTCTTTCTCATTTT:1 - chrX 5825133 5' + INE-1 471 1 86.13 ATCCTTTGACTTAATATTTATTGCAGTTGACTGCACAAGCAAAACACGAGATACAACTGCAAGTTTGAGGAACTCAAAAAGAAACGACGAATGCCCTTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCC:1 + chrX 21577658 5' + roo 173 2 63.01 CGATTTCAAGTTATTTTTCGCATACCCTGGTACCCCTTGTTCGCAACGAGGAAAAAGTTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTAT:1 + chr3R 31887716 5' - HB 1555 1 76.71 GGAATCGGATTCAGGCATAACAATTTCCTGTCAATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 31490924 5' - roo 352 2 53.42 ACGCCAGCTCCCTATTTTACATAAAGTATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr2R 12543088 5' + roo 8750 2 78.77 GGAATTGGATTTAGATTTGAATTTGGCTGAGTTACATGGCTGTGTGCTTAGACGATTGTGCAAAACAGATTTGAGCTGGGCACAAACAAAAAAAAACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 13395385 5' - roo 396 1 74.07 CGGGCACATGTGGCCCCATTTTAATGGACCTGCCTCGTAAAATGCCACAAAAAGTGTCACAAATTTATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 + chr3R 28272430 5' + Tirant 30 2 59.84 AAGGCAACTAAACATGTTCCACCTTCGTTGACTTAAGGTGATTTAAATTGCAAGTCTTAAAGGTGTTGGACACACTTCAATCTTAAGTTCTTAAGAAAAAGTTCATAATATTCTGAAATCACACACAATGAACACACAATAGCAAT:1 + chr3L 9656807 5' - G3 63 1 76.03 TAACAATATATTAACACTGGATTCTTTTCTTAACTGCTATTAAGAGACTTTAAAAAATTATACAATAATTTCCAAATGTTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGATATCAGTAATG:1 + chr3R 13631331 5' + 297 6620 2 59.31 GTCATTTTTGTGCCACTTTGTTTTCAAGGCAAGCACCATGTTTTGTAAATTTTCCAAGAGAGCGACTCGTGCCACTGGCATTGTCTATTTCAATTTCAATATTATGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chrX 4778318 5' - 412 7533 2 74.29 AGCCACCTTTTCTAACAAGAAGAACGAGGAAAACGTTTTCGGTAAACAAAAATATGTCATGTTTACTCAGTGAGCAGTCCAAGTAAAGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACT:1 + chr3L 7073302 5' + I-element 310 1 59.59 CTTCAGGTTACAGGACTGCGCGGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 22400385 5' + 1360 4 2 77.39 CAGTCCATGGGTGTACGACTCTAGGAACTCTGGTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 25304835 5' - roo 9024 2 53.42 TTTAGGTACTTCGGGTAACCCGAGAATACCCACTGCGAAGAGCCTCCATTTTTAAGGGACTAAAGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2R 9873726 5' - roo 9016 2 55.48 GTGCTCGCTTTATGGACACTTAGGTGATTAACAAATGCACCTCAAGATATTGGGGATGGACCTTTGGCCTTGCCCTAGGGCAGATCTATTAAGGGAGGAATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTG:1 - chr2L 8807461 5' - roo 155 2 68.28 AAGCCGCTCATAGCTAATATAGGCGATTTAGGGGATTACTCCCTAAAAAATGAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACACCATGGATATAAACACATACT:1 - chr2L 1957728 5' + hopper2 1180 2 73.79 GTGTAGCTAAGGGTGTAGGGTGCAGGGTGCAGGGGGTAGGGCAATCGGTAGCCGGAAAAGCGGAAAATCGAAAATCTTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAA:1 - chrX 17977207 5' + jockey 4912 1 52.05 ATTTAAGTTTGTTGTGTTGTTCACTTATTAATTTAATTCACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTCACTTCGAGCCG:1 + chrX 8823735 5' + rover 7141 2 75.34 GGTTGCGCACTGTTTTTTTTCTTACTCTCATTCAGAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAA:1 - chr3R 18872954 5' - copia 4905 2 76.03 TGCATTTAACGCCATTTTGATATAGTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 24122721 5' + roo 8715 2 78.64 AGGACTTTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTACAATTGTAACT:1 + chr3R 15022025 5' - Tabor 422 2 57.24 ATTAGTAAGAGCAGCCTCAAAATGAATATTAAAGCTTTGCATTTTTTTTTCTTTTTTT:1 + chr3L 16757792 5' - gypsy7 5009 1 74.14 CAGCACAGCTGTTTATATATTACTGAGCACAGCTACCCCACACAAACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 - chr2R 7665835 5' - Transpac 5200 2 56.31 CATAGTTTTCAATTTCCATTAAAATGCCAGCATTGCGCCGTCAAGTATGCAACGCGACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 + chr2R 5922927 5' - jockey 4978 1 55.40 GATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATACATCA:1 - chr2L 22684595 5' + transib3 76 1 58.90 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACA:1 - chrX 21292604 5' + accord 170 2 65.07 CCCGGTGCGTGTGTGTGGGCATGAGGGCGCTACGTGAAAAGTCGCAAGTCACAAATCAAAATGCTCGCCATTGTTTGGCTGGCCTCGCTTTTGGTTCCACTCTGTGTTAGGCTCTTAAGTAAAAGGGAAG:1 - chr3R 30613446 5' + Doc3-element 4689 1 79.23 TATCGATGTTTTGATATATTATCACCCCATACATAAGGACACTTGCAAAATGTGGTCTCAAATAAAAGTATTAAATATGCTCAAATTTATACAATTTCATCACTTAAACAGCGATAAGAAATACATTTTGTCAAGAAAGTGTTTAC:1 - chr3R 25495895 5' - S-element 1714 2 48.63 TACATCTGCGTGTAAACTCCGTGTGTTTGTGCTCTTTTTTTTTACTGTGTTTTTGGTGCGGATGCCAAACGTATTTCCAATTGGTTTGTTTATTAAAGCTTCTCATTATGAGACTAACAACAAGTTT:1 + chr3R 10451216 5' - Fw2 3905 1 70.08 TGTGTATCTGTGTCCCGCCGCATGTGTATCTGCATATGTGTTTGTATCTTCTACTCGATTTTCGGTGCCCGTGCGTTTCTTGGTTTCTTGGTTTTTGTTTGTTGAAATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATAT:1 - chrX 19774337 5' + Juan 88 1 72.73 ATATAAAAAACATTTCCATTATTAAACGTTTTCAAGAGGCGCAATAAATTGTTTGTTAATTTAGAGATTCTGATCGTGAATAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGGGCATTTGCTCTTGGATATAAGTGCTCTTAGAT:1 + chr3L 10202376 5' - Idefix 7137 2 55.48 AGGAATGTCTATTTAGCGTTTTTTTAATTTTTGTAAAAATTAATTTATTAAATAGCATAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr3L 23124102 5' + pogo 56 1 65.07 AGCTTAAAAATGAAATGCGTTTCTCGTTTTCACATGGCTGCCATCGAATAGGTCACAGTGGTTCAAAATGTCAAGGAAATAGTTAATTTTAAGCAGTGGATATGAGAAGAAAGTAATTATGATAAAAAAAATATGAATATAATCAA:1 + chr3L 5010239 5' + invader2 301 1 76.03 GAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCC:1 + chr3L 25482867 5' + accord 6 2 75.45 GCGTTGCGATTCCATTTCGTTTGCTTCACTAAATGATAGCAGACATGCGGTCAGCGGGTGCGGTGGGTGGCAGCTGCCAAAGGGCCACTAATGATGACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 12598987 5' + 412 7073 2 67.86 AATGCTGAATAAAGGATGTGAAACCATGCGAGATGGGCGTTTTGAGATGTGGGGCAAACCGAAGGAAGGCAGCTGTCGACCGACAAACTTACAGGCAGTATCGAAAATGAAATATCCTCAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAC:1 - chr2L 5817678 5' + Stalker3T 57 1 76.71 AGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCA:1 + chr3R 28396623 5' + jockey 99 1 78.08 CTAGTTTAAAAAATAATATTTTAAGCAATAGCTATGTAATTTACTAACGACCATCATGAAAGAAATATAAATTGATAAATTAGGTGTAAAAAATAAGTGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr2L 18193160 5' - mdg1 7440 2 67.12 CTATTTAATGACTTTCTTTATCTTCTGTTTGTATCTAATGTTTGCAGACAACTAAAGGCCCCTGGAGACTGCAGCTTTTATCACTCCATATAAGTCTATAAAAACGTGTATTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr3R 27478634 5' - hobo 2931 1 80.00 GGGCACATAAGACTAGTGAAACCTATTCATATTTTACTTAAAACTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTC:1 - chrX 10567891 5' + roo 8697 2 58.33 ATTAATTAACCAAATATATTATGAGCCATGGGTCAAACACACAAAGTGCAACTAGCTGGCAGACCGCTTGTATTGGCCATCAATTTGAGTTCGGCCAATCGCTTAATTAAAATTAAAATTAAAAAATTAAAATCTAATTAAAATT:2 + chr3R 9922525 5' - Rt1b 124 1 73.79 TGGGCCAATTAAAAAGTTGTATTGCTGTTGTGAACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACAGCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATC:1 - chr2L 16089706 5' + 3S18 27 2 63.70 TTTTACTTTTGACTGGATAGCGAGGGTTCGTAATGAGTTCTATGGATTTTAGACTGGCAGTTAAATTGACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3R 21001906 5' + 412 43 2 52.59 CTGGGGAGCGAATTACCCGAGTAACTCCACATTGCAGCGAGATATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 - chr2R 17121671 5' + blood 78 2 70.55 TTTTAGGCTTCTATTTATGGGGAATCAATCTAAAATACAGTTGTTACCATTACAAATATCAACTGCTTTATAAATTTAACAACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chrX 13531727 5' + roo 23 2 58.78 AAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chr3R 27768807 5' + 297 6642 2 60.96 CTTAGAATAGGCCACCCAGCTGCGCTGCTCCTCCCAAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAG:1 - chr3L 19344011 5' + jockey 4926 1 75.17 AAATCCTTGTCCGACCCCGTTTCCGTCAATCAATCAGACAAATAAGAAAATTAAATTCCGCATTGGAATTAATTCAAAGTGGTATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chrX 10645121 5' + jockey 16 1 77.40 TGGAAATACTTTCATATCAGGAAAACGTAAGAGCTTTATAAAGGCAATAAAGCGCCTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCTTATAT:1 + chr3R 13176293 5' - Burdock 246 2 78.08 AAATTAGCTTAAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 7035214 5' - roo 394 1 71.65 GCACGGAGAACCTATAAGATTAAAACGAAAGAAATTTATTATTTGGTTAGAATTTTACAAAATTGCTTGGAGAATTTTTTACTATTCGGTCATCTTAACGATATACCTATTAAATTATAAAACAAGAGAATGCTATGGTCGAGTTC:1 + chr2R 13155859 5' - INE-1 574 1 78.08 AATTAAATAAACATTTTCGTGTAAGTGTGCGCGAGTACTGCCAAAAAAGTTAACCAACTTTTACAGGTGGGTAACGAGTTTTTTAGCTGCTTTTAACTTGATTTTTATGCCAGTCCGAAAGACCGACGCGTTCGATGATCCAATTT:1 - chr3R 19564521 5' - gypsy7 5352 2 78.08 AAATCGTGATAAATTTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chr2L 17250688 5' + opus 7033 4 60.00 TAACATACATATTTAATGATGCGGCCTACTTTGCAGCTGACAAAACTTGCAAAGTTGTCTGTTGCTTTTTAAAGGTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr3L 22978516 5' - 1360 3362 1 62.02 ATAAAGCAGCCTCTTATGCGATTTGTCACCGGCGAATCAGCTGTCATCTTAGAGGCATTCAAATGCTTAACAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 - chr3R 10720649 5' - Transpac 5209 2 56.72 GTCGTTTATAATAATTTGCGTAGTGGCAATTAAAATGCCAACAACTCAAGGAATGCGTAAATCTACCTTAACTGCGCGTAATTAAAAGAATTGTTAAATCGTATTGTCCGTCAGTCCGACGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAG:1 + chr2R 23407697 5' + INE-1 129 1 70.55 CATTACCACAAAAATGCATTAAATGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:1 + chr2R 16469344 5' - accord 182 2 76.47 GCAAAGTAAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 13563403 5' - roo 9019 2 57.97 AAATTGACATTGAGCATATTGTAGGCCACCCAGCCAGCGAACGGGCTCCTCCTTGAGTTCCAGCAGACATCCACTGGGATGGGCCAGGACAATACAATATCCGGGAAGTGTTGTAACGTGTAACGAACTAAACGGATGGTCGACTG:1 + chrX 4305728 5' - gypsy12 10184 2 71.92 TGGAAACGGGGCTAATTGTGAGAATTCGGACAAGTTGTGCGCGGGGAAATCTGATAAAAACATATCCAAAAACACATGTTGCCAATAACCTTTTTGTATTTTGTCCATATTTTCTTCCTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTT:1 - chrX 9760819 5' + hopper 147 108 80.71 CTGCCACCGGACTCATTGACACCAAATATGGCGTGATTGATCCCAAGAAGGGAACATTGGAGGCTCTTAATACCAAGACCGGAAAGAAGGAAGTGTTCCAGGGCGTATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr2R 19239786 5' + roo 8739 2 69.18 CAAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACA:2 + chr3R 178120 5' + BS 85 1 77.40 GGATCAATCACTTCAGCTGGTCAACTTTGCTGGACATTTTCAACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAA:1 - chr3L 11399996 5' + Quasimodo 73 2 70.55 CTGCTGGATTAATAATTCTATTATTATTATATACTTTTTTTTTAATATTCACAGACTTAAAATGCGTTTATCATCGGTTCCCACTCACATAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATC:1 + chr2R 2143213 5' - I-element 387 1 66.21 GCGTTCGGTAAGCTTAAATATTTGTTGATATATTTTATGCCTGTAACTCTTAAAATTCATTTGTAATTTCCTCCATATTTTCTGTTTAGACATGATAAGTAGGCAAACTATAAATATGTTCTATTTATGGGCTGCAATAAACATGT:1 - chr2L 53063 5' + rooA 7290 2 56.16 ACTCGGAATTAGTCAAGGAATCGCACTGATAGCACTTGATGGCGTAGCCTAGAAATCGTAGAATGTGTATAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAATGACCTTACTTTTTAGAAAATATTGACAATTTGGGACTTTACGTTGGTC:1 - chr2L 20865438 5' - HB 238 1 52.74 GTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGA:1 + chr3L 22052776 5' - mdg1 335 2 76.71 CGATGGGCCTAAATCAATAAATTAAATCTGCACTCACATCGCCTAGCATTTGTACTGCTTATCGGGGCTCAATTGGGTTCAATGGACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 + chr2L 4998082 5' + FB 37 1 60.27 TAAATTATAGAACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 + chr3L 2724952 5' + Ivk 34 1 62.07 GCATTTGTCAAACTTTCTATCAATGCTCACATTTCATCGTTTTCGTTTTTTTTCGTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTT:1 - chr3L 17133869 5' - jockey 4931 1 69.18 GGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 14553218 5' + roo 46 2 54.11 TTGAACAACAAAGGACATAAGCGAATGGCTAAAAAGTTTCGAAACCTTATAGGCATTTAAAGTTAACTACTTTGGGATACCTTAGATAACTTTGGTATTCTTTTAAACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTA:1 - chr3L 5317598 5' + G6 1947 1 44.52 AAGTGAAAGTATAAAAATGGTTATTTTTACCAATTAACTCTAATGCTCCACTTGAAAGAATCAGTATCACTTTTTAAATTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTT:1 + chr3R 13170421 5' - gypsy7 5009 1 77.00 AACTAATATATAAATGATTTGAAGCACGTTTGAAAAATCATTCTTTTTAATCTCACCATTTGAAAGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 - chr3L 16496729 5' + jockey 4758 1 53.24 CCACATCGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCCAGTCATGTTCATATGTAACAGAAATATATAGAGCTGAAGGGTAGATAAGTTGAAAAGCGCACACCGACCGGATATCACACATCGA:1 - chr2R 4577114 5' + Chouto 5921 1 68.49 GTTAGTAGTTTGGCTTTTACTACTTTTCCATCAGCATAAGCACAAATTATTGCTCAGCGGGATGGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr2R 23497030 5' - 412 462 2 55.83 GTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr3R 9352091 5' + Tirant 8135 2 55.66 ATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1 + chr2L 21367226 5' + Doc 78 1 65.75 AGTGTGACCTCACCAGGGGACGCCATCGAATACTCAAGTGCATCCCAAACCCGAATCAACAGTTTCCCAACAAAAACAACATAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTG:1 - chr2R 16589263 5' - jockey 4717 1 51.37 GATGTGTTTCGTTCTAAACGGCAGCTTAGACCCTGATCTTTATGATCTTTATTCTCAAATACATTGAATGCTATTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAGGGCCATACATTGATTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr3L 17942277 5' - 1360 3343 1 51.37 AATATTCTAATTTTTGTAGCTGGCCAAATTTTGGGGAATGAAATTGAAATTGTGGCAGCCAGCGACGACGAATTAATTGAAAATACAATGATTTAAGATAAGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTAC:1 - chrX 9949681 5' - Cr1a 4116 1 66.93 GTAGCACATCATGAGTTGCAAACATATTTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr3L 6775328 5' + blood 36 2 59.29 CAGTACAAATTGAATGAGTTTCATTTTTTTTAAATAGACGTGATGTATAAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATATATATAACGAAAATAACTATATTAAATATTAGTGTTACTAACATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCG:1 - chr3R 1952845 5' - Cr1a 4266 1 77.40 AGGGTTTTTTATTTTTTGTTTTACGTTTTTACGATTTTTACCGTTATTTTGTTTGTCGCGAATCCACCGTAACCGCAAATTTCGCTGATTTATCATAATAGATTCGGACTGGATACTGTCTTAGCATTAAGTCCAGTAT:1 - chr2L 5112811 5' - gypsy9 5037 2 41.01 GGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAAT:1 + chr2R 4312963 5' + gypsy 78 2 69.18 CCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACA:1 - chrX 21667901 5' + gypsy2 6517 2 72.86 GCATACTTTTAGGCTGAGGGCGCAATGGGCGTATGTGTAATATTTCCATGCCACATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACACACAT:2 + chr2L 2004929 5' + jockey 74 1 63.70 ATTACACGGTCTTTGTGGACCGCAAAAGTCCAAGTCAAGCATTCCACTTATAGTATCGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTATTGTAAGACACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCT:1 - chr3R 27794874 5' - roo 9016 2 54.29 ATGATCCGCACAGGTAGTTGGTCCTTCAGTAAACAACATACCGACCCACACACGCACACACCGCAACAAACACACACACACACACACACT:1 - chrX 10432460 5' + accord 7030 2 68.89 ATGATACTGGTGCTAGTCTTCTGGTTGCCCTTCCGGCTATTTCCCAGCACACCAACGGGTTCTGGCACTCCATTCGAGGTCAGGGCAACCAGCTTC:1 + chr3R 16204354 5' - R1A1-element 498 1 53.12 TTTGGCGTCGTTTTCTCATGGGCCATCAGACGTTTCAGCCAGCCGACGACTTTCAGCCTTCCTCGCCGCTTCTCCATTTGCAATAAGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGA:1 + chr2R 14006214 5' - F-element 4317 1 56.16 AATAATTGCATAATTCTTTTTATAACCTTATCCAAAATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 + chr3L 15327569 5' + blood 7088 2 75.00 GGAGGGGGTAAAATGCAATTTCAAGTGCAACCGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3L 14553249 5' + roo 8678 2 75.17 AACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAA:1 - chrX 21667949 5' + gypsy2 18 2 70.09 AAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAAACAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr3L 19350002 5' + jockey 70 1 52.45 GTTGGTCTATCTATTCTATTCCGAATATCTACAGCGTAGCAAATGAAGAGTTGTCCGTGAACTCCACCTAGCGGAGGATATACGTATTACTCATATATTCTGACGTCGTTCTAAAAATCTTCATTTATTTAAAACATTTTTTTT:1 - chrX 21058692 5' - Stalker2 7186 1 52.08 CGGGGTTACTGCACACTTTTCCCAGGCACATTAAAAAAAATCTTAGCTATAACGTATGTGACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:2 - chrX 16787185 5' + pogo 58 1 60.27 GAGGGAGGGTCTCGATGTGCTGAAGAACAGAGAGTGCTGAATACTGAATGGCAAATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAA:1 + chrX 6142207 5' + opus 7376 2 54.55 ACCGGTCCATAAGTCACTTTAATGGGCTTTCAATGAGGTGTGCCCCGGGAAAATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTTTTG:1 + chr3R 30634888 5' - roo 9051 2 73.10 GGGCCATGGAATCAGCGATTCCATGCGGAGCCACGCGATAACACCGAATCACGACCCATACGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATCATTTAT:1 - chr2R 15829639 5' - invader4 3070 2 72.39 CTATCCACTTTTTAAATTAAAAAGGCTTCGAAAAAAAGCTTTACTTGCTTTACGCGTTTCTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAG:1 + chrX 264862 5' + opus 459 2 59.31 ATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 - 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chr3L 905928 5' + 412 17 2 71.23 AGGATTACATGGGTGTCATATCAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chrX 13395275 5' + roo 8737 2 72.41 CAGTATGTATGCGATAAAATGAGGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAATTTAAAA:1 - chr3L 13374237 5' - pogo 2059 1 52.74 ATATAAATAAAGGATGAAAAATGGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2L 6717236 5' + jockey 35 1 64.38 GTGTCCTGTGGCCTCTCACTGCGATACACTTTTACAGTTAATTGGTTTTTATTTTTTAGATCGAAAGCGACCGTTTATTGTAATTGATCATTGAAAACTAAACCTAATATACAATATGTTCCCCTAAGTCCCTAGCAAT:1 - chr2R 2679566 5' - HMS-Beagle 152 2 77.70 AAGTTGGCAAATCCCACCAAAAATGTTGTTTTATCTGTATGGCTTTGGTGCAACATGTTTGTGGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTT:1 - chr2R 17992369 5' + R1A1-element 4879 1 60.19 GTTTTAGTAACTTGCTTGTTTGTGTACATTGTAAATGGCACTGAAAGAAATGAGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATAT:1 + chr2L 2698361 5' - I-element 5286 1 70.55 ACGCCAGCTCCCTATTTTACATAAAGGATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr2R 12543088 5' + roo 8669 2 56.92 AAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTC:1 - chr2L 12340811 5' + diver 5972 2 71.92 CCCAGACTCAACTGATTATATATGCACCAATGCAATGCATACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:1 - chrX 17732057 5' + pogo 78 1 73.97 GTGACAATGCAGTGATTACATCTTTTGAGCATACATATAATATATACACACACATACGTACACCCCCGCAATTTCCGTGATGGGAAAATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGGGGCATTCTCTCTGTTTCGCA:1 - chr2R 15892824 5' + invader2 4944 2 59.31 AAGCGAGGCGCAAACTTAAGCCTGGCAGCCGTTGTTGGGGAACATTCTGGGACTTGCCTAAAACTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTACAT:1 - chr2L 15988079 5' + roo 8712 2 54.01 ACTTGCAATCACTTCTCTTCAATTCCAAGCCCCCACAATGCCGGTCATTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAA:1 - 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P-element 2799 1 25.35 TCGGAATTAATACGATTTGTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1 + chr2R 23000047 5' - mdg1 354 2 63.70 ATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:2 + chrX 1103612 5' + pogo 61 1 61.64 ATTTTGCTATAATTAAACAGTTGTCCGGCTCCAGGATGCCAGGATCTCTGGCTGCACTGCAGCACTTAATGGCCTGGCCACAAACAGAAAAAATAATGTAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTGTGTCAA:1 + chrX 11203100 5' - 1360 211 1 58.90 TCCCACACACAGACAATTAGAAACATGAATGCACTGTGAGAAACCAGCTTCGAGCCTATGGCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chrX 22725636 5' - roo 402 1 66.30 GATGGAAAGATGTTAGAGCCACGAACATGGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chrX 17805972 5' - roo 317 2 79.45 CGACGATCCAGATGTCATGCTTTTTGCTTCAGTAACTACTCGGGATCCTGTGATGCGTACCGGTTGGGGGTTAGACTATGGCGCTGCCTTCAGTCCTTGGAGTCCTCCGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:1 + chr2L 22747212 5' + transib2 3 1 75.74 GTACTGATTGGATTAGGCTCGTGCCTAATATGGATTGCTCAAAGTGACGGGCTCTGGCCAGAGATTCCAGCCTGTTGAGTAATTAATAAATAAGTGGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr2R 20865624 5' + 412 7068 2 75.56 GATTAAATAGATGTGCATTTTTGAATGTTCCATAATCTGAACCACAGTGCCTAAGAGCAATAAATAGGTTACCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGG:1 - 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pogo 2035 1 72.66 ATACTCACACACGCAATGCCAAACTGTGTCTGTGCATCAATTAATTGTACTGTTCGGCTATTTATAGATTTTGCGGTAAATTCGCTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTT:1 - chr2R 21371569 5' - roo 9041 1 65.07 GTTCCTCACGTTCTTGTCGGCCTCCTTGGGGCCAATCGATGGCTTGTTGAAGTTGGAGGCCTATGCAAAAGCAAAACATATTAGTATCCTTTTCACATATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr3L 4115083 5' - 1360 3365 1 55.86 AGGCAGCTCGGAACGAAAGTTAATTAAAAATGTTCAACGCATTTTTCTCAATAAAGGGGCAAACAAGGATGGGCAAAAAAGTAAAAAAAAATAAACAAATCATTTGCATCTCATTAATGCAAATCACACACACACACATACATACC:1 - chr2R 16059958 5' + Quasimodo 40 2 56.16 CCAGCACGTGCAACAGGACCAAACTGAAGCTGAAGACCAGGAAACCTTAGGATGGAAGGCAAAGTAATAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAG:2 - chr2R 7020660 5' + Bari1 53 1 52.41 ACTTAACAAAATTAAATATATTGTAGTATACAATAGGCTACGGAGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTACTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGTTACTTAA:1 + chr2L 3813589 5' - Ivk 5219 1 69.86 CACATATTCACTTACACACATTCATGTTTAACATTTGCTTTACACGTGTGTTGATATGCAAAAAAAACATTGCATAGTTTTCAGGGCAAATGAGCATATGAGAGGATGTTTGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1 - 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chr3R 11749719 5' - Tabor 7244 2 71.92 AATTACCTCAAACCCAATTGTCATGACTATCCAGAAAAACTATAGAAAATAAAGAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCA:1 - chr2L 18149567 5' - Bari1 1686 1 71.83 CTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr2R 19555004 5' - pogo 2082 1 61.54 CAACTGTTGCAAGTGACAGCTTTCATCAAAGCGATTTGTTACACAGAATGGTCCAGCACATATGTATTGTATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chr2R 12787928 5' + 297 6626 2 56.16 GGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 7515743 5' - roo 349 2 58.22 ATTCTTTTACGAGAATTTGAGTAATGATATTATCTTGAAAACTTGGTCTAAGATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 - chr2L 17029719 5' - blood 345 2 57.53 GCGGTCAACACTCCCACTAAAAACCAAAAGCCCCATGCAAAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 - chr3L 10144732 5' + blood 79 2 78.32 GAAATTGCAAATAGCCGATACGTCATCGGTGCAAAGCATTTCAAAGCAGTTCGTTGATCTCCCAAAAAAAAAATGGAGAGCGAGCTGTAATAAACCTATAAATGCCACCTATTGAGAACA:1 - chr2L 9237617 5' - blood 364 2 70.00 GTAGAGGAAACCAAGTAGCATGGATAGTCATCTGCAGCATCCCACGTCCTGCACTAAGAAAAATGGGACGTTGTTAACGAAGTATTTTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTA:1 - chr2L 14772465 5' + 412 207 2 59.59 ATAGTATATATACTTTTTGCGTCCTCTAGCTATAAGCTGTTTGTTTTTGTTGTGACGGGCGCGGCATAACAAACTGCCATCATAAATTAAGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGAGGTCAATGC:1 + chr2L 12353898 5' + jockey 4701 1 58.90 CAGCATAAAAAGCCATGCATTTATGATATCACAAGATATAATTAAAATAGGCTTATGGTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGA:1 + chr3R 5775632 5' + invader4 2797 2 59.59 ATGTAGTAACTTAAAGCGAAAGCAAAAAAAAAATGTCGGTAGACAACGTTCTATCACAAAAATGGATTTTATAATATATTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 + chr3L 15099940 5' + copia 37 2 56.83 GCTAGAAACCGGCAAAGGAATAAGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 + chr2L 15834430 5' - hopper 1373 2 56.85 ACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTACTTGCGAGTGCACACTTTAG:1 - chrX 22824235 5' - gypsy12 10153 2 55.48 ATACAGTTGTTACCATTACAAATATCAACTGCTTTATAAATTTAACAACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chrX 13531693 5' + roo 8736 2 67.81 ATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr3L 17707815 5' + Doc 62 1 57.55 GTTTGCGTCCGGATTGCATAGTTTTGTTTACTCGATCGCATCTCGCTCTAGTTCCTTGGTTCTGTGTGCGTGCTCAATGAGTGCTCACTTACTCATTTATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATC:1 + chr3L 15235427 5' - jockey 4528 1 75.78 AGAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGA:1 - chr2L 18149515 5' - Bari1 1633 1 69.93 CCCGACCATGGATTGCCGAAACCGAGCAGACGAAGCGAAAATCAACAACAACAACGAAAAAATCAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 4453688 5' - hopper 148 105 67.44 AGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr2L 4173980 5' + roo 8740 2 71.03 TGGAAAATTCAATAAGAGAGGGTTCACAGTTTTATTGAGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTAC:1 + chr2L 1259931 5' - Burdock 176 2 73.29 TAACAGCAAATTCGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGGGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chr2L 2276806 5' + F-element 31 1 59.32 AAATTTTTAGGAAATAACACGTTATAATTTTTGTAGTATGCACTTTTAAATTTGTACACACGTCATCCGCACTCATTACAAAAATATCAAAAATGGCTAACCAATGCGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATAT:1 - chr2R 5542487 5' + 1731 4329 2 73.97 TAATTATATAAAATAAAAAATAAAATATTTCTACTTCCACCTCTTTCGATAGAAATATTACATCTACACATATACACTAGAATTACAATATGCATATTATCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAG:1 + chrX 10450613 5' - baggins 5137 1 31.51 CGGTTAGAAAATGTTTTGGTTGCAACGAAGATGGACATAATTCGAGTAACTGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGCAGAGTAAACATATT:1 - 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INE-1 164 1 59.59 TTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr2L 3890157 5' + jockey 72 1 71.20 AATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3R 5453706 5' + 412 7128 2 74.66 ATCAAAAAAAGGGTGCTAGCCAAGAAAATTTTTGCAGTTTTAAATCCTTGCCAACTACAAAATCGTGTGCTAATCTTTAATGAAAAGTATATCCAGCGGAATGTAAGTGGATACCTCTAGATATACTTTTCAGTTGCTATGTGTA:1 - chr2L 7768933 5' - Fw3 164 1 69.66 TTTGAACGTGATTGTAGTCTCTTCTTTTTGAACCCCCCTTTTTTCGCACAGTGTTTGCGCAAGCATTGCGTACGAGTACGTACATATATGATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 + chr3R 23009983 5' - I-element 5327 1 63.70 AGGAGTCGATATATCGACGGTGGTTTACGTCCATGCTGAAGGTGGGAAACTTCGCTACGAGCTGTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAAC:1 + chr3L 22648281 5' + Tabor 58 2 54.79 AGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCC:1 + chr3L 24213771 5' - invader2 185 2 62.86 ATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTACA:3 + chr2L 15834480 5' - hopper2 1516 1 78.08 AATAGTAAAATATCAAAAAAAAAAA:1 + chrX 14540672 5' + F-element 4683 1 76.00 GTCTACAAAACGTACATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTATGGCACACGAGTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr3R 10266171 5' + 1360 59 1 54.93 TTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAGTGCATAAATAAATG:1 + chr3L 6775355 5' + blood 7068 2 58.96 TATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAATATTTATAGCGGCACTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTTCTCACGC:1 - chr3R 3080552 5' - gypsy9 156 2 85.51 ACATTGTTCGCATCTAGGGTCCAGCCATGCAAGTAATAGTATCCTTCTCTTATGGGACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATAGCAGTAAAATTGTAACTTCT:1 - chr3L 22648380 5' - Tabor 7258 2 58.90 CACACAATACAAGACAGTTTTGGTAAAGGTTTTTTCTGGAACAATTCTTTTTTTCATACGTTTATGTTTTATTAAATAAACCGAAATTTTAGAGTACAATAATATTGAAATGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATA:1 + chr3L 8310458 5' + Stalker4 7042 4 76.03 CAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTAT:1 + chr3L 25482892 5' + accord 27 2 54.72 ATTATCAGCGGCATCAAGTTGAATGAAAGAATTGCATTCTTTTTCTGCTGTTTTGGCCACAACAAAGGCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAA:1 - 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chr2L 14248104 5' + I-element 49 1 54.20 CTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATTCCCCCGCCCAAGAGGCATATCAAGTATTTAAAAAAGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTCTAT:1 + chr3R 19450171 5' - roo 9034 1 44.80 AGATGTTAGCTCCAAAGTTAGTGTCGCCTTCCAGAGTTTTAACAACGAAACATTGGCCAACTCAGTGTCCATTATGGTACGAAATATGACAGTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAA:1 - chr2L 4203109 5' - FB 892 3 60.96 GGGGACAGTCGCCGGGTCGGAGAGATGTGGATAATTCAATTTTGCAGAATACAAAAATGTTTTGGTTCAAAAGATAATAAAATATTTGTACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr2R 4930640 5' + Ivk 12 1 69.60 CTCTTTTTTGTGGTCTAGAATTTGGATTATCAGTATGTATGCGATAAAATGAGGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr3L 13374267 5' - pogo 2089 1 71.92 AAAAGTCTATTAAATACGATCAAAGATCTTTTAATATTAAAAATGTGATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 + chr3R 17546632 5' + blood 77 2 69.18 AAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGA:1 - chr2L 16948716 5' + jockey 4729 1 70.43 TATTAATCTTAAGTTGTAAAAAAGATCTTATGTAAAGTCAAATATTTCTAGCGCTGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACA:1 - chr3R 13582323 5' - BS 5057 1 58.22 ATGTTGGTTTTTTTTCCAGAAATTGAAGTAGATGTTGAAGATATTCAGGTGTGAAGGCTTTTAAGTTTTAAATACGAGATGCTGGATCTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTT:2 + chrX 21083893 5' + HB 40 1 54.79 ACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAAC:2 - chr3R 9160750 5' - copia 5043 2 69.18 ACATGTTAATAATGTTGACTTCTTGACCAAGTTTAATTAATCCATTTAAGCGGTTATAAATTGAAAGCTGTTTAATCTCATATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAG:1 - chrX 4777600 5' - 412 295 2 57.14 TTTTGCACATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAATTTATTTAAAAATGTCAATACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTAT:1 + chr2R 5667269 5' - INE-1 163 1 60.27 GGCAAAAGGCATCAGCTGGCTGGCTGGAAATGCAAATTTAATGCGCCGTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATT:1 - chr2R 21401609 5' - mdg3 115 2 62.37 ACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCG:1 - chr3R 26246879 5' - 1731 4549 1 71.74 ACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTTGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 7035244 5' - roo 345 2 60.00 AAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACC:2 - chr3R 9160741 5' - copia 5034 2 75.34 AGATACTGCAAAGCATGGGAATACATCGATACATATCAATGAAGTGCAAAATTATTTATTTTTTGATTTGATTTGATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTA:1 - chr3L 1517336 5' - Juan 4154 1 57.53 TATCGATATCCCAGAAAAATGATTAAAGTTCGCGTTCGCTTTTTTACTAGCTGAGTAAGGGGTACCTGATAACCATACAAGAGAGAGAACGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACC:1 - chr2R 4823084 5' - INE-1 557 1 43.44 ATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGAAGAGGCATTTGGCTATTTATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCC:1 - 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chr2L 14201466 5' + roo 8730 2 66.44 GTGGAGAATATAGTTGCCGGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr3R 4528454 5' + F-element 44 1 62.33 CCTCGGCCTGACACATTTTTTACTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGCGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr3L 22978670 5' + 1360 16 1 71.22 AGTATAAAGTCCCAAGAGCAGACTTGTGCAGTTTTAGGCCAAATTTTATCACATTGATGTGCCATTCCAAAAAGAAAACAAAGCAAACCAGTTCATACACCTAACAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr2R 8395853 5' - pogo 2087 1 74.66 GGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGT:1 - chr2L 6717214 5' + jockey 58 1 49.32 ATTCGAGTGGAATGAGTTGTGGGTGTGCCAGACATTTGTTGCTGTTTGTCTGGCTGTAAAGCTGGCCGTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr2R 19726946 5' - 1360 3343 1 52.52 CAGATTAATAGGGATTATCTGCTGCTGCAGAGCATTGGCACACACACACACACGCACACACACACACACACACACACACATGTGC:1 - 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chr3L 10144757 5' + blood 7068 2 61.64 CATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chr2L 17136164 5' + hobo 66 1 68.99 ATAAAGGACCCTCAAGTCCAATTATCAAACTTAACCAAAAACAATAACTTAGACAACTAAAAGCGAAAAGACACTAACACATATGTATATGTGTTAAAAACCTTATTTATCTCTGTGAACAAGATAAACAAAAAAACAAGTGAAAA:1 + chr3L 5658008 5' + Porto1 170 1 63.70 AAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chr3L 14553178 5' + roo 8746 2 75.52 CGGATGCTACGTGCCTGGACTTTGACTTGGACTAGGAGCTGCTGGTAGTGGAGCTGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr3R 22100633 5' - 412 473 2 66.92 ACTCAATTTCCAATAAAACAAGACCAAATTAGACAAATTAAATAATTGTCAGTTCATTCAGAACAAGAATAAGATGATTACTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTAT:1 + chr3R 12593003 5' - flea 233 2 64.62 AAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGATTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr3L 17707845 5' + Doc 53 1 69.00 GCTGAATCTGATTGGGCATTATAAGGGCATTTTTGCCCAATCGTGAGACAACATTTTTCGGGACTGTGACACCTCACTGTTTTGTAAACAGCCTCTAAAGCGTTTCCGACCATATTAAGTATATATTCTTGATCAGGATAAATAGC:1 + chr2L 21234831 5' + INE-1 86 1 66.44 AAAACATACTGAAATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTG:1 + chr4 123928 5' + HB 100 1 65.75 CGTGGGAACTTATCGCCGCAATTGGAAGGGGATCTATAACTTCGCGTTACATTACTTTATTTGTTTAAGGACCCGAGCTCATGTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAACTTTG:1 + chrX 16384787 5' + diver 5985 2 65.00 ACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGACATATCTT:1 - chr3L 13563382 5' - roo 357 2 66.09 GCTTCGTCAAAAGCTTGCCACGAATTTTCCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCT:1 - chr2L 18280004 5' - gypsy5 7310 2 58.90 ATGCTGGTTTTGCCATTGTATTGGTACCAACGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr3L 22400218 5' + 1360 19 1 72.60 AGAATCTCCATTAATAGTAGTTGGCGATTTCTCAGCAAAGTGATAATTGTCTTTGAAGGCAAGACAATAAAAATCATCCTACTTAGTGGTATCTATATAGGTACCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGA:1 - chr2L 4093109 5' - roo 8668 2 53.42 AGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr2L 76134 5' - roo 9037 1 60.53 ATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAA:1 + chr3L 24152426 5' + HMS-Beagle2 6927 2 53.47 GTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr3L 27391422 5' - 1360 3376 1 69.63 CTAATGGTCTTTTGCCTCCTGTAACTGACTGATGTTTGGCACACACACTGCCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr3L 17175072 5' + 412 7070 2 73.97 GTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr2L 17029596 5' + blood 7071 2 61.15 GGATGGATTGGTGTCCATGAGCGAGTCAAGGATTGTTTGGTGGCCAAATGGGTGGCAACAGTAAAGCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 - chrX 1690087 5' - 412 467 2 59.66 GAATTGTGTGTGAAATCAATTTGTCGAAATACGAGCTGTAAGAGTGCCGAGTGCGGACAGATATATACTCGTAGATGATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGCTAGTAT:1 - chrX 4186743 5' - I-element 5315 1 58.45 AATTGTTTTCCAAATGGTTTATTGTGTTACAACAACTATAGGCTCTTATTAAAAGAACTCACATTTCAGCTATATAGTGTGGAATTCAAACTTGAAGATTAATTGCAAACAAATTTAATAGGAGTTCAGTGAAAATATTTTTTTTT:1 - chrX 19225021 5' - transib1 40 1 69.86 CTGTGGTGGTGACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 16181237 5' - roo 9026 1 50.75 AAATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3L 25406607 5' + 1360 7 2 67.63 GATTCAAAGTGGGCAGTACGAATTTTTGTTTGTACCGTTTGGCATTTCGAATTCGCCTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATGTCTGTTTTTCAAGAGTTGGTCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACATGATA:1 + chr2R 4193265 5' - 1360 3386 2 75.34 AAGATGATAGAGAGCAATTAGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAGATAACCAGAACAACCTTGATAAACTAATTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCC:1 + chr3R 19448597 5' + roo 8837 2 59.85 AATGAGGTGTGCCCCGGGAAAATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 30634919 5' - roo 9019 2 52.05 CCGAGTTTCGAGGAGAGCAGCTGTTGTGTCCATCGCACTTAGCACTCGAAACACTTCCCACCACTACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATC:1 - chr2L 21930485 5' + Copia1_DM 175 1 56.20 GCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCA:1 - chr2L 22684602 5' + transib3 69 1 55.48 CCTCTTGCCAAGACTTTTACTTAGGGTATTTACCTATTTCGGTCTTGAGTGATTTCTTCTCTGCTATTGTCTTAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTCTCTGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATACCATGGAGCTCCAGTAATGCTT:2 + chr3L 22147137 5' - Doc3-element 4404 1 63.70 CTTTAAAAGCAGCTGCAACTTTAGTCTTTACGAACTTTTAAGTTTGACATTTCCATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAA:1 + chr2L 12349711 5' + F-element 58 1 69.18 AATGTATATGATGATTTATTTTAACTTTTTTAGGCTTCTATTTATGGGGAATCAATCTAAAATACAGTTGTTACCATTACAAATATCAACTGCTTTATAAATTTAACAACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chrX 13531756 5' + roo 11 2 69.18 AATTAACGGTGTACGTATTACTTAACCGAGATATATAATGAATAAAATATAAGCACTAAAATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACT:1 - chr3R 28844944 5' - 412 4 2 60.96 GATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCAT:2 + chr3L 24152454 5' + HMS-Beagle2 6957 2 68.49 AGCGTAAAAATAAATACAGACCGCATTGTTAGCCAACATACATAAATGGGGCTGTCTATCATGGAAAATTACAATGAAATAATATGTAAAAGAAATTAAAAAAAAAAATATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGA:1 + chrX 15973888 5' + flea 4756 1 70.63 GGGTGGATGGAAGTGTCGACAAAGTGTTTACTCCTCTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chr3L 7995394 5' - P-element 2843 1 56.16 GATAGGAGGTAAACAAATGTTCTGGCCAGATATGTATGTATATATGTAGTAATAAATATTTAGGATCGTAAATGAATAAAGTATGCTTTTTAGATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTT:2 + chr3R 23859790 5' + jockey 4789 1 66.44 GGAATTATATGGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGATAGCT:1 + chr3R 23639096 5' + pogo 14 1 74.31 GCTGGCAATTTCCGCACCTACTTAGCTGCCTCGCATGTCTAACCGTAAATCCCTATTGACCCCCATTTCCCAACCGTAATGCTTGACCACACACATCCTCTTTCGCAGATTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGC:1 - chr3L 14530825 5' - F-element 331 1 72.92 CAATTAGTGAGCGACGTGTGACGATAATAATATCAACAATAAAAATCGCGACCAACAGTGCACTGTAGAGTGGGATGCAATTTTAATAAAAAAAAACCCAGAATATTTAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCAACTTACATCAGG:1 + chr2L 21943866 5' - opus 7494 2 79.45 ATCATGAAAATATTACGAATTTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAA:1 - chr3L 23702236 5' + G4 70 1 67.91 AAAGAAGAGTTTTAAGTATGCGCTGAAGGAAATAAAATCGAATAGATTTGCTATTAAAAAGTGTCGGAATATTGGAGTAGGAAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 - chr3R 18873319 5' + copia 4909 2 44.52 GATTAACATTAAAAACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATAGTAGCACTTTTGC:1 - chr3R 11750279 5' + Tabor 6894 2 52.74 AATATATCACGATTATGTCAGTCGCTTGTGTTTGTTACCCAGCAGGCGGTCACTTCTTAACCATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCTGTTTA:1 - chr2L 16458687 5' - roo 350 2 57.53 AAACCGAGGGTGAATGATTATTCTAGGTGTTAATGGAAATCTTTTCACGCGGGTGTTCTCTTTCGATAAATTCTAGGTGGCCAATTGAACAATTTTTAATATTTTTCTCATTTTACTGCCCAATATCTATCGACATCCCAGAAA:1 - chr3R 22203989 5' + INE-1 498 1 63.89 AGCTGGGGGAAACACTGAAAACAGAAACAGTTGATGCCACAAAAGGTAAGTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chrX 7980876 5' - hobo 2905 1 56.25 ATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTT:1 - chr2R 13644501 5' + Burdock 6211 2 71.23 AAGTTCATTTCCATTCAAATTTAAAACGCAACCCAATGTACATATATGTATATAGTAACGTATTTGTGTGCTCCAAACTGCTCTCTTTGAATCTTTTCCTAATCTTAAGAAGTCAAGAGCGAGGCTCAGCCGAAATACAAATATT:1 - chrX 3663218 5' + 297 213 2 77.93 AACCAGCTTGATCTTCTGCAAATAATTGAGGTAACTCCTCGGATTTTATGGCTGCACTTAAAGAGAGGAATTTAAATTTAATTTATTTATTGGACCTGAACAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCC:1 + chr3L 16819674 5' + I-element 5046 1 76.92 TATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2R 10695863 5' - roo 9010 2 66.67 AGTTTTTGTTCGTCTGCCTGTCTTCAAAGTGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 10684704 5' - roo 388 2 67.91 GTAGTTGTGTAAAAAAAACGTAAAACGAACAAAATGACTATATTTATAATAATTTCACATAAATCCACACATCTTATACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAG:2 - chr2R 24602105 5' - Burdock 216 2 57.53 ATGTTATTCTGCCAGCTGGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTT:1 - chr2L 22224621 5' - Rt1c 5415 1 64.38 GATGAATGCGAACATAAGCTGGCCTTACATTTACATACATGTTTATTTAGGAAGAGAAAAAAAACATTCTAATATCTACCAAACTGTTTGGAAATCTATTTATATTTTCCAGACAAGAGACTATCAGATAACCGTTACTCAGCTAA:1 + chr2L 12156834 5' - INE-1 543 1 50.68 CAAGTCTTTTTGTTTTTATTGCAGGCTGACTTAGGTTTTTATTTGATTTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCAGGAT:1 + chrX 21948948 5' - 412 7363 2 82.19 AAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCT:1 + chr2R 22723017 5' + 3S18 56 2 54.11 AATATTAATAATATTATTGGCACGTATAATTAACAATCAAAACCTAACCAGGTGGCCTACATGGAGTTCCTGAAGGCGAACGGCATCGAAAACGAGAGCCTGGCCAAAGAGATGGACGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATA:1 + chrX 17604444 5' + Cr1a 4115 1 78.77 GATGACCCCAAAAACTAAAGCAATTTGTCAGGGTTTCGGGATTGGTTTGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGGGCTCTTTCTTGATTTGTTGG:1 + chr2L 12345082 5' - F-element 351 1 56.36 GAGTGGTGGTGGTGGTGCCCCAGTAGAGGGAGGTGGCAGGATAATTGCATTTGTAAAGTTTTTTAAAAAATTTTCTCATTTTTTTCCAATATCTATCGATATTTGCATTTCCACTAGCTGCGTAACGAGTATCTGATAGTCGGGAA:1 + chr2L 19772691 5' + INE-1 554 1 62.33 TAGGAACTGTATTCCTATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 - chr2R 8157299 5' - Transpac 5212 2 72.18 GATAAAAGACACGCACACAGTGGCAATAATTTTTGGGAGAGATCGTTTTTAGAATGTGTGTGAGTGCTATGTGCGTCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr2R 21076119 5' + P-element 26 1 63.28 ACTGAGATAGGCTGCTGAAAATTTATAGTCCTTTGTATGTTTATAATTTCTGCAAGCTCGGAATTTATTATAAGTTTTTTGGAACTGAAAAATGCAAAATTATGTTAGAGTATACAACAATGAAGTTATCCATATGTTTATGTTAC:1 - chrX 7053350 5' + Tc1-2 1498 1 76.71 AAGTTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACGGAAAA:1 - chr3R 18641287 5' + Doc2-element 246 2 81.82 AATATATCCACAGAAGAATACTAATTCTTACTAATTCTTTATCTTGACAATGTGGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCA:1 + chr3R 2555453 5' - Bari1 1679 1 66.21 CATAAAATGCGTCAAATAAAATTTAAGCCATGAAATAGTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2R 8305177 5' + roo 8691 2 67.12 GAATACTAAAGCATTATAGGGTACAATTAATATTTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGGAGCTTGCACTCGATATCGCATAAGCCAGGTAAAGAAGTCACTTTGATAAATTT:1 + chr2R 1007657 5' - Ivk 495 1 43.15 TCTATGGAAAATTCAATAAGAGAGGGTTCACAGTTTTATTGAGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAA:1 + chr2L 1259927 5' - Burdock 180 2 70.55 CAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATG:1 - chr2R 4181296 5' - accord 487 2 67.54 ATTATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCC:1 - chr3R 30872894 5' + micropia 38 4 59.31 ACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAGATCTGCATTATTTTTCCCTTTTTT:1 + chr3R 23639135 5' + pogo 51 1 51.39 AATCATAATTAAATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGT:2 + chr3R 19589878 5' + BS 5021 1 64.38 GCAATGCCGAGAAAATGTGTTTGTGTGTATTTCCCTTATGCTCTACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr3L 12224746 5' + 412 7086 2 63.70 ATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3L 17707808 5' + Doc 36 1 54.17 GACCGGCGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGC:2 + chr2R 21402612 5' - mdg3 5431 2 65.67 GAACATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 + chr3L 23986511 5' + opus 29 4 51.69 GTCAGCAAATATCGCCGAAACCGCGTGCTTAGAGATCTGGACTTCACTCTGGCCAAGCAAGTATTCATTGTGATGATGTTTTTATTATTTGACCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 + chrX 21290578 5' - jockey 4961 1 58.82 CTTACAACTTTTTAAATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:4 + chr3R 9190437 5' + Tabor 6853 2 43.84 ACTTCATTAGTGCAATGATATGTTGTAAACAAAACAACTTTTGACCCTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 + chr2R 5737089 5' + 1360 37 1 59.59 TTTTCGGAAAAGCCAAAGAGCTTTGGTCTGCTGCTGAGAGCCATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2L 245968 5' + roo 8679 2 69.60 AATGTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chrX 1103725 5' - pogo 2049 1 55.48 CAGACGAAAGATGAATGGAGAGGCCCACTTGAGATGATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTTTGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGC:1 - chr3R 13612879 5' - 412 410 2 70.55 GATTCTCGCTATCCTGGAGCACCGGCCCAGCATGCGTGAGTTACGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAG:1 + chr2L 22015928 5' - Tirant 324 2 75.37 ACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 14553099 5' - roo 350 2 58.22 TGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chrX 14964630 5' - roo 329 2 76.03 AAGTCTTTAGGATTTAACTCTAACGATATCATTGAATTCTTTTTCTATGTAAAGTACTTTGTTGGCTTTTTGCACAAAGCAAATGAGAAAGAAATGGATTGGACAGGTTTTTGCAGGTCATCTTCAAACGGGATCTTTTCACACTC:1 + chrX 22634993 5' - S-element 1334 1 63.01 ATGGGGGGGTTGCCAAGGCAGATTGATAATGGGGTTGTGCCCCGTTAACCAGTGGAACCAAGGAATGGGTCTCTTCAGTCAACCATCCATTCACATGTACTCGTTGAACTATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chrX 12525851 5' - roo 399 1 69.18 GGTTATTCGCGTAATCCCGGCTTTAGGAATTAAGAAAATTACCAAAATCGCAATATTTCTATGTTACACATATAATAGAGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 - chr3R 11749756 5' - Tabor 7281 2 54.79 AGGAGACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATT:1 + chr2R 22723006 5' + 3S18 5810 2 53.42 ACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr2R 10695891 5' - roo 9035 1 56.52 AGCTGGGCACAACGCATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chrX 12525997 5' + roo 28 2 53.27 AACCGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 - chr3R 9160787 5' - copia 213 2 53.47 CACACATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGG:1 + chr2L 17240218 5' - hopper2 1541 1 63.70 ATCTACATGAAGTCACCACAGATCTAGATTATCTAGATTGAGATCTAGAGATCTAGATTGTGCCACTGGCGTGTTGATAAGACTTTCTTTCCACCTGATTGATTTGCACTTTCTTTGGCATATTTTATACCAATAATAATAATAAT:1 - chr3R 27654901 5' + mdg1 7068 2 41.10 AGTGGGAGATTCTGCGTATAAAGCTGTTTTAGAGGAAGTATCGTTATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chr2R 5923021 5' + jockey 4679 1 61.73 TAACAGACCCAACGGAGCCCCATTGCCAGGAACAAAAACTTTGGTATACCTTTGGTAACGGGCGTAAATGAATTTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGTCCGACAAAACAGGAAACAAATATAACAAAAACGAAGATCTCGAAATG:1 - chrX 8330787 5' + G4 109 1 52.41 ATTTTCCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTT:1 - chr2L 18279981 5' - gypsy5 7319 2 55.26 AAATTTTAAGGCAAGATATCTAAGCCACGGTCCAAATAGAGAAAAGCTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chrX 12866399 5' + roo 72 2 67.12 ATAGACTTTACAAACAAAGTAATTTATTAGGGTTAATATCTACCCGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTC:1 + chr2L 16089540 5' - 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mdg1 7446 2 76.03 GTTAGTAATGTGTGTTAATGTTACGCTGTGGCATAAATGCAATTATATTGCAGTTATTGCAGTTGCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCA:1 - chr2R 17392109 5' + BS 5051 1 55.48 GGCGTGGAATTGCGGCTGAATGGATTAAAGCCTCTGAAAACATGAATTTCCTTGCGCCATTATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTA:1 + chrX 10567734 5' - roo 9041 1 64.38 CGGCGAACCGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 - chr3R 9160792 5' - copia 5085 2 56.16 TAGATCATTTTTACACACATCGTGCTGAATTTGTAATTAGTTATAAAGTATCTCAGCTTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chrX 19536993 5' - roo 345 2 60.96 TGCACCTTAAACGAATGAGTCGCCCAACCAAAATGGGGTACTAATGAACAGCAGAGCAGTGGAGAGGTATGTGGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chr2L 6184121 5' - pogo 2055 1 54.11 TATCGAAATAGCTTTTCCACTAAACACAACTTAAGTCTTCATGAATCCGAAAGTGGGTGTTTTTGTTGCTAAAAAACCTTCAAACATTTATTTATTTGACTCGTTGCATTTGGTTGAGAAAGTGAAGTGATCTTTGCTCCAGTTAG:1 + chr3L 23101135 5' + S2 364 1 71.23 TAGCCATTAAAACCTTTATATGTACGGTTACATATAGACATACATACATATAGAAACAAAGAAATGCGAAAAAAGTGACATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 - 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jockey 4944 1 52.05 GGCGTATTTTATTAAAGCTACTCCTATATATATTCCGATCAAAGAGCGAAGAATCTCAGAGCGCTCTGCAACTGGAAGCACTGGACGATTACATTCAGTTGTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTAC:1 + chr3R 5393348 5' - roo 8972 2 69.18 ATTTGATGTGTTTTTGTAAATAGAAGTATTTGTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTATACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3R 13122489 5' + blood 7037 2 59.48 CTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr3L 15026633 5' + opus 7034 4 56.39 ATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:1 + chr2R 20673655 5' - mdg1 337 2 73.29 AGATACATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 - chr3R 21276660 5' - BS 5069 1 58.90 ATTTTATTTATTAACAAAAATATTGTATAATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr2L 76173 5' - roo 9044 1 67.12 AAAAGCAGCTGCAACTTTAGTCTTTACGAACTTTTAAGTTTGACATTTCCATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 + chr2L 12349715 5' + F-element 51 1 71.85 ATTGGCATTTTGACACGGACGGCGGACGAGCTGAGCCCTCGACGGCGGATTAAGAGCATCAGCATCTTGAAGCGGTAGCCGAAAAACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGGGGCCATTCATATCAAAT:1 - chr3R 28974793 5' - copia 55 2 66.15 TAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTT:1 - chr3R 9160769 5' - copia 5062 2 56.16 GTTGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTT:1 - chr2L 22684608 5' + transib3 59 1 50.00 ACCTATAAGATTAAAACGAAAGAAATTTATTATTTGGTTAGAATTTTACAAAATTGCTTGGAGAATTTTTTACTATTCGGTCATCTTAACGATATACCTATTAAATTATAAAACAAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTAT:1 + chr2R 13155868 5' - INE-1 565 1 71.92 GCATTGCTCACCAGATACTCAATGATTTTGGTCAGGCGCTTCTCGTAGAGAGCCAACCGAATCCACAGATACCTAGGCGAAGATATAACACAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 20461701 5' + G2 3076 1 75.23 ATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTAT:1 + chr3R 3922964 5' + Cr1a 98 1 77.40 ACATTTATTTGACCTCTTATGCATTGTGCAAAAACAGTTGGCAATAAAATTGGTGAATGTTGAAGAAGTCGATCGCCACAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATT:1 - chr2R 5674782 5' - S-element 1692 1 72.60 AGAGACAATTTCTAAACAAATAAATTCTATTAAATTCTATGCCATCTTAATGTTTGTTATATCTATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chrX 13531593 5' - roo 9015 2 57.53 ATTCAATGGGGTGGATGGAAGTGTCGACAAAGTGTTTACTCCTCTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr3L 7995386 5' - P-element 2851 1 58.22 AAAGAAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAA:1 - chr2R 6526615 5' - jockey2 3332 1 61.64 ATAAGTTTAATTATATATTATATATATGCCTTGCCCATTCCTCCTGAAACGCAGGTAGCTCCGTGTACTGGATGCCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGC:1 - chr3R 11548667 5' - G2 452 1 70.09 AATGATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAATTAGTATCATCCTACCGACTGCGC:1 - chr2R 4122895 5' - rover 369 1 78.77 GGCTAAATGAAAACAAAATTAACTGGGGAGCGAATTACCCGAGTAACTCCACATTGCAGCGAGATATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 - chr2R 17121693 5' + blood 7067 2 55.48 ATTTGTCATTTATTTAAATTCTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACACTCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr2L 9472080 5' - roo 9004 2 62.07 GACTTGCAGCCTGATTTTATTTTGTCTAGGCCCATAGCATTTACATTTAATTGATTTTGTGTAATTGGTGCCATTGAACCAGCAAAAGTCGACCCTTTTGTGAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 + chr3R 15702857 5' - copia 237 1 71.23 ACAAATGTAGGATACTGATTAGGTCTTTACCTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 + chr3L 15612733 5' + roo 8755 2 78.77 GGTGTCCCATGCCGGGCACAATTATGGCTATGAAACGCTGATGACCATGCTGCCCACCTATATGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chrX 4785067 5' - roo 9051 2 56.88 CATAAAAATTAATAAACATATATATTTATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATGCACATTTTAGTTATAAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr2R 8305330 5' - roo 9029 1 54.79 ATGTATGTATCCTAAGACATTTGTTACTTTATTGTTTTTAGAAAGCGCGTACGTATGTATAAATTTGCAATTTTTATTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 20713077 5' + roo 8709 2 55.48 ATTCAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAG:1 + chrY 2346866 5' - micropia 457 1 73.17 ATGCCGGCTTTGTCCATCTCCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTT:1 - chr3R 17243632 5' + blood 7178 2 63.64 AATATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATA:1 - chr3L 12976350 5' + invader4 2807 2 54.29 GGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAG:2 + chr3L 24213773 5' - invader2 177 2 65.75 AACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chr3R 21705942 5' + 297 6589 2 73.08 TGGAGGGATAAACCTAATGCGAAACTATATCCAAAGAAAGTATTGGATTTTCGGGTTGAAAAATTCGTTGAAAAAGTATTTAAGAGAATGTGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTT:1 + chr3R 19447035 5' - 412 187 2 64.38 CTAATAAAATGGGCTCCGAACTGTTTAAAATAGAATGCTCATTATTCGGCACAACTATTGTATTTTTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 3263428 5' - roo 9018 2 54.11 TAATCCAAAACGAAAATAAATTTTTCAATTCAGACGCCATAAGGTAGGCAAAAAATTTGTAATAGAGCCGGAAACAGAGCTTTCAGAAAATATTATTAATTCTTTTTTTTTGTTAACGAAATTATTTTATTTTATTGACTAGCATA:1 + chr3R 25087317 5' - jockey2 3372 1 55.48 ACGATAACATTGTCAGCAGAAGCAGAGTTTCAAACTGAAGACCACGAATGTTGGATGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTAC:1 - chr3R 30632585 5' - roo 64 2 62.33 TCTGAGGCGGCTTAAGGCGCTTACTCTGTCACCTGGCTAACACAGACACAACTTACCCACACCCACATCACCACCAACACTCTTTCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chr2L 11915477 5' + hobo 38 1 55.48 GAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr2L 23310610 5' + 1360 48 1 51.37 ATAAACGAGCGCATAATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 + chr3L 11336333 5' + blood 7067 2 56.16 CACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chr2R 1857480 5' - 1360 3374 1 58.22 ACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGGTCAACGCTCCACGCGAA:1 + chr2R 4312959 5' + gypsy 7061 2 65.07 ATATCATTTTTTCTTGGTAAACAAAGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGGCTCAAAACGCAG:1 - chr2R 19553305 5' - mdg1 7424 2 58.22 ATTCACATAACTGATGCCCTTCCACAAAGGATATGCTTGTCATAAAGTTGTTACAGAATATATATTAATATAAATATATATATATATATATCTTAGCATATCCGTAGATATTTGAATTAGCCTCTTAGTAATTATTATTATATT:1 + chr2L 11052558 5' - Burdock 412 1 43.06 GCGTGACAGGGAAAACCAGGATGTGGTTTAGGAGTTCAATTTGCAAATATCAAAAGGGTCTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGTCCATGGTTAATAAATT:1 - chrX 18353726 5' - Ivk 180 1 64.38 CGATAAAATGAGGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAATTTAAAAATGCAGCTAAC:1 - chr3L 13374226 5' - pogo 2048 1 56.16 TTACCATTTTCCTAGCCATTTTCCTCCTCACTCACTCCCACACTGCCACACACACACACACACACACACACATCA:1 - chrX 5466869 5' + Quasimodo 39 2 90.67 TAGTTTCCGCTGTCACGTGTGTTGCATGGGTTGGATTGCGTTGCCGGAATTACGTAAGGGTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATT:1 - chr2R 5955036 5' - copia 195 2 53.42 AACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCACAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1 + chr2R 22723024 5' + 3S18 53 2 55.88 AAAACAATAAGGCAGGTAATCATCCCAAAATCAATCGAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATCGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGG:1 + chr3R 7598810 5' + Juan 46 1 56.80 GTAACATTTTTTAATACGTTTATTTCTTTGTTTGATCTTTTATTTCTGCTCGGGTCTTATACACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr2R 641986 5' + opus 30 4 64.08 CCGAAATTTGTAACAAAAACCTTGCGAGGCCAAGTGGTGTATGAAAGATAATAAGAAAGGGAACGCTTGGTTTTGGTCATGCTTGGTGATGAAATAAAGAGGGATAGTCATCCCACGTGCCAGAAAGCGGTTCGTTGAGGAAACAG:1 - chrX 23182834 5' + invader5 3973 2 78.08 GGGCCCAAAAGTTTTCAACTTTAATATTTCATAAACAGAGTGAAACTCGCATTTCGCATATGTAATTGCGCATTAATGAACTGAAATCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACA:1 - chr3R 25672239 5' + F-element 410 1 59.85 AGAAGACAACAAAAAAAAAATGTAACAAAAACCTTTTAGTAAGTAATGAGAGATCTTGCCACAATTTGTTGCTTATTTTTATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACA:1 - chr2R 20425155 5' + Stalker4 6970 4 46.58 ACTGACCAGGATATCGCCAATTCGCTGCGAGACATTGGCGTGAGTGATCTACAGGAAGTGAAGTTTTTTGAGAACAGGGCCAACGGTCAGTCGAAGGGCTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1 - chr3L 8314409 5' - mdg1 7384 2 77.69 TCGTTTACAACAAACTCCTCCCCCCTCCCCCCCC:1 + chr3R 9223372 5' + accord2 221 1 76.47 AGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr3L 22978616 5' + 1360 38 1 62.62 TAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTGCGCCACGAA:1 - chrX 21852441 5' + gtwin 85 2 76.71 ATGAAGGGAAAAGCAAAACATTTTTAATTAATGTATGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chr3L 20289117 5' + jockey 4744 1 72.39 AAATTGTATACATAACAAATTTTTGACAGTATTTTGTATTTTTTTTTATTTTCTA:1 - 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chr2R 8642992 5' + Doc2-element 4738 1 51.72 CAATTTAAGGTCTTGTTAGAATCAGGATGGCCGAGTGTGGTTCTCCATTTTGTTGCAGTTAAGTTTAAATCTGGTAACGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGA:1 + chr2R 4165033 5' - F-element 4412 1 60.00 CTGGGGGCGTTCGACAAAACGATCGTCATGAGATTAAGTCGGCAGAGACAAGACCATTATGCAAAATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATATTGTGTGCGGGTG:1 - chrX 6481374 5' + hobo 45 1 50.36 GGACTGGAATTAAAGAATAATAATTAATTTTTTTTGTTAAATCAAGCGTTATATGTAAGCGTTATATGCTTTGTGGCACACGATTTTTTCGCGGTGGCTCTAGAGGTGTTCGAGAGCGAGAGAGCGGGGAGCGCTACAGC:1 + chr4 377667 5' + 1360 114 1 52.14 CCAATCTGTGCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr3L 15026621 5' + opus 7143 4 61.70 CAAGCTCGAGTGTTCAATTAACAGCAAATTCGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGC:1 - chr2L 2276824 5' + F-element 34 1 63.31 GCGATTGGAGGGGTTTTTAAAACTGCAGCCAAACTACGAAGTGAACAAGAAATTTGGTAGTAATTTGAAAAGTGTTTAATCGATATTGCCCAATGAAATACCTAACTGAAACTAAGAGTGGATG:1 - chr3L 3522167 5' - Circe 330 1 75.81 AAAAGTAGCAAAATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chr3R 28728739 5' + jockey 79 1 66.42 ATTTGGCTAAAAGAGGCAAAACGGCTTCCACGGAATCCATTTGGAGGCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATGT:1 - chr2L 3659156 5' - 412 7473 2 64.38 GTGGCGGCAACGCGTCGTATGCGCAATTTTCCCCTATGCGAAACCGTAAATCATTGCGACCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 - chr2L 17240314 5' + hopper 39 1 56.80 AGAATATATATATATATATTTCTAATGAGTTTAAACAGCCGAGACGATTATAGTATTCCTTTCTCTACGCCAACAAATTGTTAAAATTTCCCTGTGATCTCCCACTAGTGTAGTATAGTCGGTGATAGTCGGGGAACTCGACTATA:1 + chr3R 18030717 5' + INE-1 565 1 69.18 AAGCAGGACATAAACGAACTGTCAACGTCTTTGACGAAGTGAAAATTCGAAGCAACAGTGAGCAACGAGTTGAACTTTGCATATACATACATATATATATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTAT:1 + chr2R 20489331 5' + 3S18 26 2 66.44 GGGGTAAAATGCAATTTCAAGTGCAACCGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3L 14553245 5' + roo 8683 2 73.29 AATTATAACAAATACCGGATTTCATCGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACA:1 + chr3L 24291953 5' + rover 6997 2 54.79 GTATACATATACGAACACCAAAATCCACAATCTATAGCTAAAGCTATACGATTATCTTGCAGATACGCCAAGCACGCCCACACAGTACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAA:1 + chr3R 25568434 5' - pogo 1804 1 54.11 TCCATCGTTACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGAACATATAAAGTATATTTATTCTTGATCTGGATCAATAG:1 - chr3L 22721129 5' + INE-1 85 1 75.52 ACCCAGAAATCTTTCTTCATTTTTTGGATAAGTCTCCACCTATCCAAATTTCCGATTTTTTCATCTTCCATTGGTTCGACTATTTCTAGAGGTGTAGAAGCGACAGAGTTTACTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGCAAATGGCTG:1 - chr3R 19447844 5' - baggins 5163 1 63.45 CCGGCAAAGGAATAAGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 + chr2L 15834438 5' - hopper2 1558 1 51.37 ATTTCTTCCCAATCGTTTAAGTCAGGAGTACCGGCAATGACCTTCAGTGCCATCCCGATCAAATTATAAACCTTTTGCAAGAACACTTGTCCCAATGTCTGCTTAAATTTTTACTCTCTCAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACT:1 - chr3L 24083899 5' + Tc1 160 1 75.34 CATATGTCTATAGCTGGATGGGTAAATCACCGAGCGACGTTGCTCCGTATTTGCGTTTGTGTTTAGACACCTTTTATTTATTATTATTAACATGGGCTAGTAGGTGTACTGTTTGTAGGTGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGT:1 + chrX 18318832 5' - baggins 5402 1 53.79 TTTGCAACAACAACAGCGGACCGCAACAACAAATGCGGCATATAAACGAGCGCATAATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chr3L 11336292 5' + blood 7013 2 78.95 CAAGGAATATTCCCTTTTATAAAAAATGGCAAATACATTTATATGTTAGGATTTCAAAATTTGTACTGCTTTTTTTTTTATTTTTACCTTT:1 + chr2L 19100480 5' - TAHRE 10441 1 80.22 CCTATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATGTCAACATCA:1 + chr3L 24152411 5' + HMS-Beagle2 6910 2 64.79 CCACTGCCCCACCACCACCACCCACCGCAACCCACGGAAAAGCACGCCCTATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCTTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTT:1 - chr3L 15276721 5' + hopper 61 1 67.41 GACTGCCAATCAATTGTAGACAGGGGGAAATAACCATGCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCGCAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 12414971 5' - pogo 2033 1 67.67 TAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chrX 21852423 5' + Tirant 8119 2 57.14 GGCAAATTGCAAAAGGCAGATGATGGGGTATGTGTGGCGTCATTATATAATCAAATCAAATAACAATTTGTACTTTGTTAAATTTCTTGTCGCCCTCGATGGCTGGCTGTCTTTGCCTCGAAAAAATATGCAAATTTCCAGTATTT:1 - chr3R 6014082 5' - hopper2 1558 1 69.86 CTACAATGTTACTTGTAGTAGATACAGATACGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATAAGTTT:1 + chr2R 22306010 5' + pogo 89 1 78.08 AGGATCCGCAAAAACAACAAGCCGAACATGATAGGGATGGCATGATCCTTTTTCTAAAAGCTTACGGGTCGAGGGACTCCAGTTCTTCGTATTGTCGCTTTGGAGTAGCCCCTATTGAACAGGACCACTAGCGCTCCGCTATGATA:1 - chrX 22818488 5' - mariner2 56 1 72.60 ACAAACCAAACAAAAAACGTGTTTTGAAAATAAACGGCAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTT:1 + chr2R 1731821 5' + I-element 5016 1 73.79 TTATTATAAAAAATTATTTGTATGAAACTCATGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGG:1 - chr2R 10078035 5' + jockey 4544 1 76.81 GAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAAAATCGATGGAAATTTACAAGAATGTGAAAAATATCAACACATTTTTGAAAAGTTTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCTGTTTGTGGGCATTAGAGTG:1 - chr3L 23747150 5' - INE-1 221 1 59.06 ATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCC:1 + chrX 4459349 5' + gypsy3 6584 4 79.45 GATGAACTGTTCAATTTACTTGAATCAGCGATACACTAGATGAGATACTCCACCTCCAACAACCGGCGGCTATAAATCAGCAACCAGAGCCACCCTATGAAATTCTTAATGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAGCAATGATAT:1 + chr3R 10683924 5' - invader3 5275 2 71.92 CACTTTCTAATAGGGTTATTCAAACTGTTAGACTTTTGATATTGATATTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1 + chrX 4778103 5' + 412 2 2 67.81 GGGGTGGATGGAAGTGTCGACAAAGTGTTTACTCCTCTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr3L 7995393 5' - P-element 2847 1 58.04 TCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATT:1 - chrX 21667953 5' + gypsy2 53 2 71.23 AATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 + chr2L 17029607 5' + blood 7089 2 70.55 AACATTAATTAAAGTTACATAAAATAGTAGAAGTTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 + chr3L 10133527 5' + 412 88 2 76.71 ATTTGTGGCAATAATAAAATAAATGAATAAATTACAATTTGTACAATTTAAATTTATAAAAATCTTATTGAGCAGCTAATATATTTTCGGCTATTTTCTAGCTATCATATTTCAAGTTTTCTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTAGC:1 - chrX 12496863 5' - G-element 4325 1 75.17 AAATTGCATGTACCATCACGTTGATTTGATAATTTGATTGATAATTGACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGC:1 - chr3L 24916726 5' + Porto1 147 1 38.36 ATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chr2L 22015996 5' + Tirant 8156 2 62.10 AACCCTTTTCCAATAAATGCCAAATTAATTAAAAAATACAGCGGCAAAGTAAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3L 13563446 5' - roo 391 2 73.29 AAAGCACAGCGTACACCCACAATAATGCAAATTTATGCTGATATCTTCAAATCCCTGTGCTACTGTAGGGAGTTAAAACGAAGTTCTCTCGCACATATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGATAATTGAAAAGGTA:1 + chr3R 4489207 5' - Tc1-2 147 1 69.86 TAAATGTAGTAAATAATATTCTCTTAAATGTTAAGATCCTCAATGGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATA:1 + chrX 16383969 5' - diver 191 2 63.01 GAGCCATGACGTTTCACAAAACCTTTGGTTACGGATGCATTGTATTAATATGTTTTGAACTCCTGTTTGCTGGAGTTGAAATCAATCAGAAAAAAGGGTTTCCGACTATATAATGTATATACATATATTCTTGATTAGGATCAATA:2 - chr4 1121557 5' + INE-1 84 1 55.48 CATTTCATTTTCATTTGAGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTTCTTCTTGAAATAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 + chr2L 12553420 5' - 412 7478 2 63.70 AAGGAAAGTGCCTACTGCATACCATATGCTTAATATAAAGTAAATCTAATTTATTACCCAAATATATTAAGATATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 + chr3R 25768761 5' - copia 5082 2 50.71 GCTGGAACATCGACATTAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGAACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 - chr2R 17890997 5' + Tabor 35 2 58.90 GTCGTCGCATTGACGCTGATTACGCAAAAAATATGTTTTTCTTTTTGGCAATTTTGAGCTGTGCTTATGCAAATTAGGATCGGCGCCTCATCTCTAATCTTCGAGATGGTAACCTTCTCC:1 - chr3R 26504768 5' + Ivk 444 1 73.33 CTTGTTGCTGAGCAACGCCTTTGATCCCAGGTACGAATGATATTCGCCATATCTATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAA:1 - chrX 16829048 5' - Quasimodo 7308 2 65.75 GTGATGTGGTCCGTCATATATTTACATAATTTACGAGTGTGCTGTGTATTTGCATGTGTGTTGGTACGACCATTAGGCCAACCAATCCTCCTGCGCGGAGCGTGAGAGTGCCGAGCATACACCTAGCAGCTCAAGTGATTAAGATA:1 - chr3R 26860445 5' + Stalker3T 187 1 62.33 ATATAATTTGATAATTTTATAGATTTGTGCGACACATCGATCGTGGGGATTACAATTCGTGCACGAGAACAGATTTGATCTTCAAGCCGGTGGAGAGACTAACAATAAGAGTTCACATCTTAAT:1 + chr3L 8468317 5' - Doc 4637 1 73.39 CCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGA:1 + chr3L 17707813 5' + Doc 67 1 58.22 ATGCAAGAGCAGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 11609194 5' - roo 9028 1 54.11 TGTTCATGCATGCTCAAATTCACCGCGAACCACACAAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr3R 24476414 5' + 412 7074 2 69.86 CGTTGGCCCTGACGCGCGAGTTACCAAAGTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCGCACATATAACAAATTAATTAATATAA:1 + chr2L 23372495 5' + gtwin 39 2 57.53 AATATGTATACATTCCAAAGCTACAGAATGCTTTCAAATTCAACTGCAGAATATAAACAATCTATAATCAATAAAAATCTTAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATCTTGGGCTCCCTTCATA:1 + chrX 22725510 5' + roo 8700 2 60.96 GGTCAGGCGCACAAATAGATGTCGGCAGTGCCACCCGCTGGACCTCCGCCATGGATACAGATTCCATATGTACTCCCTGCATCACAATGGCATTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 + chrX 1287764 5' + jockey 4807 1 63.70 GGTCTTGATTTATGGGATTTGCAAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 5150390 5' - roo 9020 2 54.79 ATAGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chr2L 17136148 5' + hobo 67 1 61.64 GCTTTGTTTGGCCTCTCAATTAGTTGCCTCATTGCATGACCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 - chr2R 20865739 5' - 412 412 2 73.10 AAAGTTGTATTGCTGTTGTGAACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCT:1 - chr2L 16089694 5' + 3S18 5815 2 50.68 ATCAGGAAAACGTAAGAGCTTTATAAAGGCAATAAAGCGCCTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTT:1 + chr3R 13176308 5' - Burdock 6367 2 67.81 CGAAGTGATCAGCTTTTGCAATATTTTCGATTGCGCTATTTAAACAATTGTGCTGCATTTGAGTAAAAAACCAAATAGTGTGAGAAAACAGCATTACGAATCATTTAAGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTT:1 + chrX 4064447 5' + Transpac 4985 2 78.26 ATAATCTGCGTATGGGTTTTCAATGAAACTTCATTTTAGTCCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:1 + chrX 22610702 5' + pogo 78 1 69.86 TGATTTGTCAACGCACCTTGACAAAGCACTGACTATATAAAAACCATGAAATGTAATAATAACTTGACCATTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTT:1 - chr3L 11776774 5' - mdg3 5447 2 50.68 AAATTCCCTGTGCCCTGCCATTCAAAAAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 + chr3L 9909665 5' - Transpac 5211 2 67.23 CTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATAC:1 - chrX 21667918 5' + gypsy2 6558 2 71.88 ACTAGTGCTAATTTTTTATTTTTTCGAATTTTCCTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAA:3 + chr3R 13505472 5' - opus 422 2 75.34 AGTGTGATCTGGAATTTAGGATACATATTAAAAATCCAAAAGGGGCACTTCAGCATTATGGGCAGGGATTGAGCGCTCTCTTGAGTGGATCGCGCATGGATACTGGATATGCCAAGGATTTGAGCTGCGTAAGCAGTTTTGACCCT:1 + chr3R 32057295 5' - Quasimodo 6948 2 54.11 CAGTTAGACGTATTTGTAATTTATGCTCCTAAGACCTTTTGCTGATTTAAAGTATCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAG:3 + chr2L 5601556 5' - mdg3 180 2 59.59 GATGCTGCGCCTATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCA:1 + chr3L 24152402 5' + HMS-Beagle2 6904 2 69.66 CAGTCCAAGGATAATATGCTCAGGTGAGTGCTGTGGACCGCAAGATCTTAGGATCTCTAAACAAAAAATGATTAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAC:1 - 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chr2L 2657376 5' - diver 214 1 74.65 CTTTCAAATGTCAATACAATTTAATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 + chr3L 12224653 5' - 412 420 2 80.33 CTCGAATATCTGGCCCAACTGTTGCAAGTGACAGCTTTCATCAAAGCGATTTGTTACACAGAATGGTCCAGCACATATGTATTGTATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 - chr2R 12787943 5' + 297 30 2 65.75 TACTAAAATCCACTTAAACCTAACCACCTTAAAGGCTGTTTGATCAGAACTCTTTGGTAAAGGATATATTTATTCAAGATGCATTTACTCTTTACTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTGAAAAATC:1 + chr2R 16771458 5' - F-element 4628 1 58.22 AAAAATCATAAATTATAGAACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTG:1 + chr3L 2724944 5' + Ivk 6 1 78.40 CCCCATAACATCCTAATACTAGTGTAAGGATGACAACTAATTCTGAACACGGTTTTATGAAACGCAGATCAACAACCACTAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCTTCAAACAGATGTCATC:1 - chr3R 2772067 5' + Q-element 288 2 69.18 TCCATGTGCGTTGTATGTTTTAATACAAATTATAATCAATTGCCGATATAGCTATCTTATTCAGGTAACAATCTAGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTT:1 + chr3R 19278597 5' - Idefix 7179 2 56.15 ATCTGATATATGTGGAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGACTAAC:1 + chr2L 22121318 5' - I-element 5326 1 57.53 CGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAAT:1 - chr2R 8157267 5' - Transpac 5174 2 56.83 ATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGCCCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCATTTTTTTACCACTCGACTCACACCATACTATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr3L 18467206 5' + hobo 45 1 62.26 GAAATCCCAATAAGCCAATTGCAGCATGTGTGTGTGTTCAAAGAAAGTCCATCCACCGGGCTTAAGGAATTTGCTCGCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 - chr3L 905937 5' + 412 8 2 77.40 ACCATAGACCCTAATTACCAGTCAAAACAATGGAAAATTAGATGCAAAACTTTGATGTTGTTTGCTGTTCTTGGGCCCTTTCAATAAACCATGTTCGCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGCCGAAAATAATG:1 + chr3R 17174834 5' + micropia 5043 1 60.96 TAATGATGAGTTATGGGTTCAGACCTCCTTCGGAGACGAGCGGACCCATCATCATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTT:1 + chr2R 8641508 5' - diver 6044 2 62.76 CACAGGCACAAGAATCAATTATATATTCATTATACCCGTTTAAGATATATTTTTTAAGGTAAGGTAAATAAAATGGTAAAAATAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAG:1 - chr3R 20504437 5' + 1360 380 1 50.00 CTATTGCATAGTTTTCAATTTCCATTAAAATGCCAGCATTGCGCCGTCAAGTATGCAACGCGACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTG:1 + chr2R 5922921 5' - jockey 4977 1 56.85 ACTGTCAGTGTTTTTATTAGTTTGTTGCAGCATTAACACGCATAAATATTTATGTGAGGCGGTGTGGAGTTCCAAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr3R 29645828 5' + jockey 14 1 62.94 CGGTGTGCTAGTGTGGCTGCCGGTGTGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCACCGCAGATTTCTCTCACCATCATACATAGCATCACACCCGCACTTGCACACACACACACACACACA:1 - chr3L 6015104 5' + accord 7028 2 70.83 GATGAGTTATGGGTTCAGACCTCCTTCGGAGACGAGCGGACCCATCATCATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTACTGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATAC:1 + chr2R 8641512 5' - diver 6065 2 56.67 TAAATGTTGTGCACAGCAATAAAAGGGAATGTGAATGGCGACAGGCGACAGGAGGCGCTGACACTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGGCAGCTGTGACAC:1 - 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chr2R 8643022 5' + Doc2-element 4709 1 71.92 ATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGCATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr3L 17707808 5' + Doc 62 1 53.42 AGTAGCTTCTGTCGGTCTGGACATCAGAATTTTTCTGCGGGACATTAGTACGACTTGATCGAGCTGATCCTCCATAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGG:1 + chr3L 15301024 5' - G2 2779 1 50.00 CCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr3L 17707812 5' + Doc 34 1 53.51 GAAACCTTATCGAAAACGTTTAAACGCACGCAAATTCCACGTGGGCAAGATAAAACATGCATAAGCCAGGTGGGGCGGGGAGGAGGCAGGCGACCATGGGGGGGGGGGCGGGTGGAGG:1 - chr2L 17081589 5' - accord2 225 1 78.81 CCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAA:1 + chr3R 9160681 5' + copia 70 2 64.83 TGCACATATAGTTCGAAATTTACGTTTACCCCTTTTGACATCGACTTTTTTTTTTTGGGCATTAGGTTGGTTTTTTTTTAGCGGTTGGTTGGGTTGGTTTCCTATTTTCTCTTTTCGTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 1582771 5' + hopper 142 6 44.53 ACTATTGATATTTATAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGTTATTGCTTGCATTCTTTGTTGCACAGCACATTTCCGTATGAAATATATTATTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAG:1 - 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chrX 4501720 5' - TART-C 10699 1 51.20 CGTATTTCCTGTTAGTATCTGATACTCTGGAAATTGGACTGTCGCGTGCTCTCTTGTTATTATAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAAAGTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGG:1 + chrX 22601898 5' + INE-1 99 1 52.05 CTGGTCGTTGCAGTCTCACTCGCCTGCTATAAAAACATTAAAAGTTCCCAGAAACAATAAATGTCTTTAAATTGCAATATACAAGGCGATAATATAACAATATGGACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCA:1 + chrX 359001 5' + Porto1 4291 1 53.42 GTGCAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTACGCAGTACAAATTAGGAGATTACATTATGGTCAAGAATTTCGATAGTACAGGAGGAGTTGCTTGCTAATACCTTAACATTAACATTAACAGGTTTTCAAATGAAGATGTTGAAGGTTTTCA:1 - chrX 3446870 5' + invader2 4639 1 69.86 AAAATGGAAAAAATTGATCCTTAAAGTGCTCGTGTTATAAGAAGAAATCCCAAATTTCTTGGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 - chr2L 19068154 5' + pogo 59 1 59.59 AGGGAAAAGAATAAATCAAATTTAAGTTTTTTTGATCATCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGC:1 + chr3R 18496036 5' - blood 7307 2 73.29 ATATCTTCAATCAATTTTTGTACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3R 4581823 5' + 297 32 2 63.01 ACGATGTTCTATTATGTCCTTTACGATATATGAACAACTATTACATCTTTTTATTGTCATTAGTTTTAATGAGAAAGCTTTTTCTAAAACCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 - 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chr2R 12265271 5' + jockey 4542 1 68.38 GAAATTGTTGCCTACTTTTGTGGGCCGCTCAACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1 + chr2L 17210266 5' - jockey 4955 1 53.78 CTGCAGGAAATGGCCAAAGTTTGTCTGGGCCAAAAGGGAAAGCGGATGACCGGCGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTT:1 + chr2R 21402565 5' - mdg3 215 2 60.27 CATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCATCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCC:1 + chrX 21772471 5' - gypsy3 6565 1 49.04 ATTTTCTAAATATTTTCGAGTTCACGATCAAGATCAACGAAAGAGAATACAAACTCGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr2L 1558759 5' - 412 480 2 74.07 CCCTTATGCTCTACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 - chr3L 12224714 5' + 412 65 2 60.27 ACTAGTTTAAAAAATAATATTTTAAGCAATAGCTATGTAATTTACTAACGACCATCATGAAAGAAATATAAATTGATAAATTAGGTGTAAAAAATAAGTGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 - chr2L 18193161 5' - mdg1 403 2 67.81 ACGTAATTTGCGAAATGATCCCCATTTCCGTTGCCTACTTGAAGGGGCGCCGACTTTGTCAACACAAATCTTTCCGCTTGTTATTCCTCAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGT:1 - chr3R 12953235 5' + jockey 269 1 68.15 ACATGTGTCGGGGAAAAACTGCAAGCAATAAAACACAGCTGAGCAACAATGTTTCAACAAAGATGGGGGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATACAAAGAGACTTAAATATCCCGACAGTTACCAACG:1 + chr2R 18564845 5' + F-element 4403 1 58.22 TAAGTATTCGATTGGTTGGGCATCTTGTGCCACAATTGTCCATGTGGGAGTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 + chrX 1689987 5' + 412 7123 2 64.38 CATTCGACGTTTTGCATATGAATGAAAATGGCTGGAAACTTGAGGTGTCTACATTAATCAGTTTTTCTAGATAGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGA:1 - chr3L 16571803 5' - R1A1-element 5297 1 53.42 TTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr3L 13827359 5' + hopper 10 2 67.02 AAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr3L 18467191 5' + hobo 65 1 65.25 AATATACATATATTGTACAATTTTGAAACAGGTGCCATAATCATACGAAAATAAAAATAATTTCAACATTTTTAGGATTTACCAACTTTTGCAATACTTAATTAGCAACCAAAATAGCCAACTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCG:1 + chr2L 16250467 5' - Bica 4911 1 76.71 AATCAGAGCAGAGCAGTTGATTATCTTAATCGCGATATAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1 + chr3R 27478506 5' + hobo 83 1 73.29 GGGGTCAAGAAATCTTCTTTCTTCCCAGCTTTCGAATTAAATACAATACACTCCACACAACTGTCCACAACACGAGCAACCGTTTCTTTAAGTTTTGGTAGCATTTTCTCGAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAAA:1 - chr2R 2004907 5' + Bica 227 2 67.12 ATTGCAAACTAACTAGAAACCACTTAAGAGTCAAGCTGATGTGTTATGCCAAAGACGGAAGTTGTGCTTGGGGCCCAGCAGCTCCTCCTTTCGATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAA:1 + chr2R 22750706 5' - Cr1a 74 1 75.81 GCCTGTGTCTAGCCAGCCCGAGACTCATCCTCTTCGCTCAGTTTTCCCTTTTCCCATTTCCCATTTCCCCACTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 - chr3R 28172556 5' - hopper 1369 1 54.11 ACTTTTCCTAGGCATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr3L 17707795 5' + Doc 32 1 58.91 TAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chr2L 6717193 5' + jockey 79 1 63.01 ATATTATTGATTGACTAGCTGTAACAATAATACCATTATTATTACAAATTTAAACATCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGC:1 - chr2R 19018822 5' - Stalker4 186 4 61.64 GCAACGACCCCGGCAAGTTTCGTAGCAGACGTTGGCCCTGACGCGCGAGTTACCAAAGTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAG:1 + chr2L 23372466 5' + gtwin 6925 2 77.93 ACTTTGAAAATATCATTTTCTAAGGAGAAACAATGTTTTAAAAGCGGATTGCAAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGATCTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAA:1 - chr3R 29288858 5' - BS 5082 1 67.81 GAGTGGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTTGGAGTTGAGTTTGAAATTCTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATATTCCTTTTAGGCTATGAAGTGCGCCTTCGCTGCC:1 + chr2R 5039339 5' - gypsy11 4284 2 60.00 AAAATCATCTTCACTTACACAATGTCCTTTAAATTAGTATTATACACATGATAGTAAATGACTGATAACGAGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGAC:1 + chr2L 15945697 5' + X-element 72 1 52.05 TCTGTAATTATTTTGTTTATTATGTATGATATGGACGGGTGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAATTAAATATATGGTGCAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGG:1 + chr3L 27396714 5' - gypsy6 7781 2 52.29 AAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGC:1 - chr3L 23702260 5' + G4 52 1 52.14 AGTTGCCGGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATTGTGCTCCGCACAAA:1 - chr3R 4528443 5' + F-element 39 1 61.54 AAGTTGAGTTTTAAATTAAAATGTGAACCGAATGTAATAATTGGAATCATTGAGCTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr2L 10184384 5' + Doc 16 1 75.56 TGACAAATCCTTTTCGGGTGTGAAAACCGTAGGCCCTTTTTAAAGTGCCATACCCCGGACTTTTTCACTGTTTTAGATTTTCGCACAGCGACATGAGGAGGATAATGGAAGGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 16562997 5' + roo 8677 2 76.71 ATAAAACTGGTAATTAACAAAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 - chr3R 17605765 5' + Tabor 6868 2 64.38 ACACTCTCTCCACTTGAAAATAGATGAGTGTTTTGAGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTTTGTGCGGCTTAGTTTTTGTTTTTTTTTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCT:1 - 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chr3L 14551072 5' - P-element 2846 1 51.37 AAGATCGGTAGAACTTAAAACTTTTTACACGTTGGTGATCGTTCTGACATTTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3R 7981480 5' + jockey 74 1 65.97 ATTCTTTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTT:1 - chrX 12082246 5' + Cr1a 241 1 77.40 ATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 + chr2L 17136165 5' + hobo 84 1 73.29 ATAGGAGCTTTAACCGAAATACACTTTTAAGCTAATTCTACTAAACCATAGAATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr3L 27350475 5' - pogo 2049 1 61.19 CATATTTTAGACATATATGATTTGTGATTTAATTGCAATTTAATCTTCGGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAAAATAATAATTGTGCTCCGACATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATACATATGTTATGTAT:1 - chr3L 23529720 5' - Stalker2 226 2 69.86 CAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGGGGAACACCTCC:1 - chr3R 11547801 5' + G2 315 1 56.85 AATGAAAGCAAATTAGCTTAAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:2 + chr3R 7035205 5' - roo 9047 1 68.49 GTCCAATAAATACATAGAGGAAAATGCGAAGCTTTATATTTTGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAA:1 + chr3L 6491266 5' - Bari1 1631 1 68.49 TACCGTCACCTACAAAAGCCAGCTAGCATAAGACTGAAAAAATAAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACA:1 - chrX 23050614 5' - blood 7088 2 69.86 CCGGAAAACTTAGGAAGAGGTGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chrX 5858962 5' + hobo 63 1 74.14 GGGCACATTTACGATGTAGCTAATGGGATCCAGGCGGATCCCTATGGTTTTCTGGGAGGATCGGCTGTGTGGTCTTTTATAATATCATTTGGTATTTATTTTCAAACAATTCAACAAATGATTCACTTTTATTTCTTCAATAGTTT:1 - chrX 11348480 5' - HB 1488 1 50.68 GAGAGAAAGCGTAAACTTAAAGAGCTTAAACGTCAAACGTTTAAAAGATGATATTTTCTCGATGGGATTGATGATGTATTTGTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGAAA:1 - 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Stalker 139 4 54.20 AAGTGCTTGCTACAACTCGTTGATTACCGTCCTTAAAATCGAAAAACTGAATGTAATGGAACAAAGCAGATAAACGTATTATACGTACAGATGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTAAAAATAAT:1 - chrX 16361640 5' + Tc1 40 1 78.08 ATTACTATATAGAAATTGAGAAAATTTCTCTTTTTTGTTTTGAATGCCCCTGGCATTCCAAGATAAGATTTTGAGTTTGTCAAACCAGCCGCGGTTTTTAATAATCTTCTTTATTTATCATATATTGTAAACATAATTATTAAA:1 + chrX 22944614 5' + Cr1a 102 1 52.08 GAATACTTTTAAATGTAAAACTAATAAACAGGGAAAAGAATAAATCAAATTTAAGTTTTTTTGATCATCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:1 - chr3R 17546717 5' - blood 7336 1 53.42 TCCGCACTCATTACAAAAATATCAAAAATGGCTAACCAATGCGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTA:1 - chr2R 5542422 5' + 1731 82 1 70.55 ATTTAAATAAATTAGCTTTTTTCCTCACGGAAATATCAAAATTATTTGCTATTAAGCAAATCTCATTCTCATTTCCACTAGCTGAGTAAGGGGTATCTGATAGAAAAAAAGCTTATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAG:1 + chr2R 4820675 5' - FB 641 3 48.63 ATAATCTGCGTATGGGTTTTCAATGAAACTTCATTTTAGTCCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 + chrX 22610702 5' + pogo 62 1 66.15 AAACTGCAAAGTAAAATGCAAAAACTAGAATTTTATTTGTTATACCCATTATCCGTTGTAGAGTAGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGTAGCTTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGATCAATATC:1 - chr3R 18346849 5' + INE-1 86 1 80.71 GAGTGCGTGTGTGTGTTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAACAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr3R 28396605 5' + jockey 80 1 64.14 ACACACCATTTTCCTTTTCTTTCCGAGTTGCGTTTGTGTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 - chr3R 15022149 5' + Tabor 35 2 61.64 GGAGAGCGAAAGAGAGAGAGAGTGCAGAGCAAAAAACAACACCAAAGAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTTAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATGCTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACA:1 + chr3L 21011225 5' - Cr1a 151 1 82.88 TAAACGAAGTGAAACGAAGGCAGCTTCGTGCTTAAAAACCAGGTCGTCGTTGACTGTCGGCTTCTATGTTAAGGATATAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chrX 3099194 5' - P-element 2843 1 54.11 GCAATGGCTAAATTTTATTAACGCCGATCCATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr3L 27415168 5' - transib2 2809 1 75.34 TTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAA:1 + chr3L 24934301 5' + HMS-Beagle2 6948 2 64.38 TACATATGTTTTCGTGGCTTTTACTACAGTAATCACCTATGCATGCAATTTACATCTCCGCCTCGCCCAGGGAAACTTAATTTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 + chr3L 20255118 5' - Transpac 5209 2 72.31 AGGTGGTATTTTTTTCCGTGTGTGGCCATCCTTATCCTTTCAAATTCCACTTTAATAAGTAAGCAGGATCCGAGAGTTTAGTCGAGCTTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGA:1 + chr3L 14883521 5' + Transpac 185 2 60.27 GTACCTGCCCCTGGAGATTGGCCAGTGTGCCAATCTGGGCGTGCTGAGTCTGCGGGACAACAAGCTGAAGTCTCGCTTATGTGTGTGTGCGTACTCTTATTTATGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 26555347 5' - Quasimodo 40 2 59.83 AGCTGCCTCTCGACATTTATTGCCATTGCCCTGGCATTGTCAAAAAGCTAGAAAAAGGCAAAGTTTTCGCCCAAAATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTA:1 - chr3L 2725090 5' - Ivk 5332 1 55.48 ACACATACGATTAAGTTTCACCCCTCGTCGGTTGAGCTGAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATAC:1 + chr3R 15711793 5' - diver 6034 2 71.63 TGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTAAATGCAT:1 + chr2L 17550619 5' - Transib-N1_DM 435 1 79.45 GAAATAAGAATATACAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGG:1 + chr3L 25482870 5' + accord 44 2 53.79 TGGCAGCCGCCCGACGGCCAGCAAAGGGGGCATGGTCGTTGCAGAATCGAGCCATGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAAT:1 - chrX 8755124 5' + transib2 63 1 63.57 AGAGGGTGCCGGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3R 27768789 5' + 297 6624 2 52.74 ATGCGTTGCCCTGCTAGCATTTTGTACTAAATTTAAACGAAGTGAAACGAAGGCAGCTTCGTGCTTAAAAACCAGGTCGTCGTTGACTGTCGGCTTCTATGTTAAGGATATAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chrX 3099227 5' - P-element 2876 1 75.34 CTAATACCCATCATTAGAGCATTTAACAGGAAACACGTGACGCTGCATAGCATCCAACATGCCCCTCCCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTCATTTT:1 + chr3L 16562839 5' - roo 9036 1 54.62 TACATTTTGCGGATGCAAGAGCAGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 11609182 5' - roo 394 1 70.54 CACGAAACGAGTGGAAAATATCATTCTGGGTAAATCAAAGCCGATTTGCAGTTGATCGGTGAGAGCGGGGCAATTGCATGCCACAAATGAACATGGGCATTATATCTTCATCTAGTGTATTTACTTTGGTCATATCTTGAGGCAC:1 - chr3L 10731008 5' - 1360 485 1 75.86 TGGCAGGAAAAGGATCAATCACTTCAGCTGGTCAACTTTGCTGGACATTTTCAACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAAACACATAGCAACAGCCATACACA:1 - chr3L 11400007 5' + Quasimodo 62 2 60.27 TACTTAGTTTTATTATTTGCTCTTAATTCGGTAATTCGTAAATAATTCAATTTATTGTTGCAATTTCGCAGTGCATATATATTATACTAATATATATGTCGTATATTTTGATCCTTCTGGTGTGTTGGTCACCACAGAGTA:1 - chrX 7084254 5' + baggins 4956 1 79.43 GATGAAAAATGGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr2L 6717224 5' + jockey 21 1 68.33 ATGAATGCAAAAACGATAAGCAGCCGAAAGGATTGCCACAGCAGTTTCCCAAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 - chr2L 12340861 5' + diver 30 2 64.08 CACGAACACCGTTGAGGGACCAATAATGGTGGCCAACGAGACGGTGGCCAATGCCGGATGGTTCATTGGCATGATGCTGGCCCTGGCCTTCATCATCATCCTCTTCAAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAA:1 + chrX 8548131 5' + Bica 455 1 73.29 ATGTATGAATCAGAGCTGAGGGTCTGCAGGGCATAAAAGTTGGGTGAGTCACGGATGCGGGATGTTGGTTGTGCCTTTTGGGCACAGAAAACGGGTCTTGAAACAGAGAAATGGGTGAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTA:1 - chr2L 10746273 5' + pogo 354 1 77.40 TATATTTATTTATTTTTGCACTATTTTTTTGAGTGCATGATTCAGAGTGTAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr2L 12414857 5' + pogo 30 1 62.07 ATCCTGCTCTGTCGCCCAACATTCGCCATTGCATACTTTTAGGCTGAGGGCGCAATGGGCGTATGTGTAATATTTCCATGCCACATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chr2L 2004899 5' + jockey 26 1 68.99 ATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr3R 9352069 5' + Tirant 12 2 54.41 GTGGATTCCCGTGTAATTGAGCCTACAGATATGCAACCAACGAGTATGCCAGTAATCGACACTTGGGCGCGGCAAACAGGACTCCGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3L 22642954 5' + hobo 25 1 66.67 CCGTCGGTCGTAAAAAAAAGATGAACGACAAACTGTCGCGAAATAAATCGCTGCTGCGGTCGTCACTTCGCCCCGCCCCCTTGCCACATCCCCACACAGACACACACACACACACACACACACACATATATA:1 + chrX 18002095 5' + Quasimodo 38 4 78.79 TACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCA:1 - chrX 10161179 5' - micropia 5362 2 73.97 ATCTCAAACAGTCCATGGGTGTACGACTCTAGGAACTCTGGTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3R 25304843 5' - roo 9032 1 58.90 ACTTTCCACTCGCAGAAAATGCCACCAGTCACTTGCGTCTGGAGCCCGACTGGCCATCAATTCTTCTGATTTGCGCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGG:1 + chr2L 2740374 5' - accord 139 2 62.50 ACTGTCAGTGTTTTTATTAGTTTGTTGCAGCATTAACACGCATAAATATTTATGTGAGGCGGTGTGGAGTTCCAAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr3R 29645828 5' + jockey 15 1 62.50 TAGATTTTAATTAAGTCAAACAAACAAAACAAATTCCCCGAACTTCCCGCATTGAAAAGCCTTACGAAATCCGACAGACGAAAGATGAATGGAGAGGCCCACTTGAGATGATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr3R 13612953 5' - 412 484 2 77.93 TGCATTTTAAATCAGTCCTTTCTATATTTTTGTATGTGTATGTGTGTGTATGTATATATACATATATATATAGATATATCCTCGCACACCATTACACCTGAGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGT:1 + chrX 5145365 5' - hopper 1397 1 71.23 TTACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTAT:1 - chrX 10161180 5' - micropia 390 2 70.90 CCCGGAAAACTTAGGAAGAGGTGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGCGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1 - chrX 5858963 5' + hobo 71 1 72.00 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTT:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 392 2 66.42 GAAATGAAAATAGGGGTATGCAAACTTTTTCCCATCAACAAACTTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGATAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 + chr3L 22052706 5' - mdg1 405 2 74.66 GCCGAAAGGATTGCCACAGCAGTTTCCCAAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATC:1 - chr2L 12340839 5' + diver 5936 2 50.00 GTAGCGCTAATTAGAATGCGAGTTGGGATCGTCTGTCGAACGTTTGGCAAACTGAAGATCGGACACAATTATCCGGTGGCTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 + chr3R 11057537 5' + flea 16 2 70.40 TCTTCTAACCGCTGCACGAAGTGATTCTTCGTAAGTCTTTTAAGTCTTGGATTCGGCATTTGATTCACGACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chr2L 9485732 5' + 412 13 2 66.44 GTGGTATGAGTGTCCGCAATTGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chrX 10645043 5' + jockey 62 1 71.68 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGC:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 5438 2 64.38 GCATACCATAGATAATTTTCAAAATTTTAAGATATTTTGCTTGAACTGTAAAATGTATAAACATGTGTTTTTTCGGGGGTAATTAATACAATTTATTATTTTTTTTTTAATTT:1 - chrX 3578954 5' - Doc 4699 2 64.60 TAATGATTATTTATGTTTATGACATCCTGGCAAAGGACTGAAGTTTCCAGTTTGCTTGTAATGGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCT:1 - chr2R 16403511 5' + copia 56 2 54.79 CGTGATGGCCAAATATGCAAAATATTTTGCAATATGCGTGTTACACTTTGGAAAGCATTTGGAAACTGACTTTGTTAAATGGAAAATGAAGGGAAAAGCAAAACATTTTTAATTAATGTATGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 - chr3L 20289182 5' + jockey 4671 1 69.86 CGTTGGATGGGATTAATTTGTGGCCTATGCTGAGTGGCAACGAGGAACCGAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3L 17890693 5' + 412 29 2 66.21 GTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAATCCCTACTACATGCTCTAT:1 + chr2L 19817854 5' - G4 3748 1 78.77 CCAACGCTTACCAACAATATTTGGCCAACAGCACAAACCCGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCG:1 - chr3L 24789704 5' + 1360 115 1 52.42 GGGACATACTATCCAAACTAGCTACCAAGAACTGGGTATAGCTAAACACAATTTCCGGTGAATTAATAACCAAACTCACCTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3L 14076357 5' - roo 405 1 77.40 AATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3L 14553208 5' + roo 72 2 69.18 AAAACCAAGTAGATATATCAAAATATTTCACTAAAATTAAAATTATCATTAAATACACTAAAATGACTCTACCAAAAGCAAAAGAAGGAGTGGAAGCATAAGCTTCCCTTTTAAAGGGAGGTAAGTAACATAATATGCTTCTCATA:1 - chr3L 26658831 5' + rover 2 2 56.85 AATCGAATCGATAGAGGTATGTGGAAGCACTGGAGCTCTTTACACGGGATCTCAGCGTTTTAAGAATGGGATGCCAAAACACTTTATAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 7539405 5' - roo 9055 2 70.99 TTTTTACACGTTGGTGATCGTTCTGACATTTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGAGTGCTTATCT:1 + chr3R 7981501 5' + jockey 97 1 79.45 AACAGGGCAAACGAAAATGCTATCCGATACTCATAAAAGTGCACTCGCTGTTTCAAAACATCGTGAAAATCAATGGATTACTTTTTCCTAGGTATTTCTTCTGTATTCATAAAGCGAGGCAGAAATAGTTTCTGTCGACTC:1 + chrX 22706687 5' + invader5 108 2 67.38 CATAAATGTTCCGTTACACATTCAAAAGGCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr2L 246115 5' - roo 9039 1 63.31 GGAGCTAAGAGGTTTCTTGGCAAAAAACTAGGCCGGGAACATTATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAA:1 + chr2R 4638607 5' - 1731 4547 1 73.29 CGAGGTAGAGAAAGGATGGCACATTGTTCGCATCTAGGGTCCAGCCATGCAAGTAATAGTATCCTTCTCTTATGGGACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 - chr3L 22648400 5' - Tabor 7281 2 54.55 AATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTG:1 - chr3R 11547772 5' + G2 344 1 63.70 CTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAAAAGATGCCATCGA:1 - chr3R 11547762 5' + G2 334 1 64.29 ATCAGCTGTTCGGCTGTGGGCAAACTATGAACAGCTGTTCAATGATAACAAATGTCCCCAAAATATTTCTTACCTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCAC:1 + chr3R 11749625 5' + Tabor 49 2 51.37 GATGGCAATCCCTTAAGATTCTAATTTATATCAGCGGCAAAACTTATTTCCTATTTCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr3R 28272217 5' + Tirant 8120 2 66.32 GAATAGATCTTTAATCGCATTCAAATTGCATATCAAATTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTG:1 + chr2R 8158763 5' + Juan 45 1 48.72 AAATTCGGTTTAGTCGGGGTGAAATGTATCTGTTTGAATTGTGACTGTCATGTCGCGCCATGTTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTG:1 - 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chr3R 11749778 5' - Tabor 464 2 69.86 ATACAAGAAAATAAACAACGAATTCCAAGTTTACACACTTTTAAGACTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTCCGTTATTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTAT:1 - chr3L 23583087 5' + S-element 309 1 64.96 ATTTAAATGAGCATACATGTTATTATAACCTCCAAAAATATTCATACCGTTTACATACTTTAAATAGCAAGAAATGTGTTTTTATACCAGTTACTCGTAGAGTATACTAGATTTGTTGAATACTATGTAACAGGCACAAGGAAGCG:1 + chr2L 20923045 5' + INE-1 30 1 44.52 TGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chr3R 9352086 5' + Tirant 8175 2 64.54 GTAAACTGAAATTTAGCCAGTCTGTATATGTAGTTCCGGTTTCCGGATTTGATTGAACTTGGCGGAAGTTGATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCCTACCT:1 + chr3R 29733006 5' - opus 464 2 57.78 ACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATGGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTGTGTCTCCC:1 + chrX 22726192 5' - Helena 1234 1 54.55 TGAAAGGGCAAGTATTTTTAGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chrX 12139029 5' + roo 56 2 61.48 ACTGTTCGGCTATTTATAGATTTTGCGGTAAATTCGCTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr2R 21371521 5' - roo 8993 2 74.66 ATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAG:1 - chr2L 17029667 5' - blood 7305 2 73.97 ATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1 - chr3R 2689429 5' - diver2 4474 1 64.36 TTTGCAACACCAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTGTGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr3L 15026799 5' - opus 7464 2 55.48 AAGATTGTAAGTTTAGCCCTCATTATATACATATAATGAGGGCTAAACTTACAATCTTATCGCCAGCCACATAAACCTGCAAATACCGACAATTATGAATTATACATTA:1 + chr2L 13209594 5' - hopper 206 1 44.95 TCGAGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATCAGAAGACTTTACT:1 - 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roo 8994 2 69.86 GATTCACGTTTGTCAGTTGTCACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATACACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGC:2 - chr2R 954530 5' + Quasimodo 76 2 76.03 ATTTTATTTATTAACAAAAATATTGTATAATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 76173 5' - roo 386 2 69.50 AGAATATAAACAATCTATAATCAATAAAAATCTTAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:2 + chrX 22725557 5' + roo 83 2 76.03 GTTATTTTATTTCACCCTATTGCCCTCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTGTTTAAATCATTTAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:2 + chr3L 21144012 5' + jockey 4697 1 66.44 CTTTATTGTATCTGCGGAAAATGTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 - chrX 1103744 5' - pogo 2068 1 63.01 CTTATTCTCCATATCATTTTTTCTTGGTAAACAAAGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTACTTAGAATTCCAATACTTCTGACGTAGTTAATAAAGTCT:1 - chr2R 19553315 5' - mdg1 7434 2 65.07 AAAACGAAAACGTAAACAAAAAAGCTGGGTCGACCTGGCAGACTGGAATGGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGCCGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTG:1 - chr3L 1307195 5' - F-element 255 1 54.78 ATCTCCACTTTCTCGCTAATTGGCAATGCATGTTCTACTTCTGTGAGCACGACTCACAGAAGCTCTCTTGTCAGCTCAGTAGCGGATCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 + chr3L 23608479 5' + Tabor 6875 2 60.96 CAAGGGAAATGGAGAAAGTGGGCGGGTGTATGGTGCACTGTCCACCCAGCATTTACCAGCTATTTCAAATATTTCCTACAAAAATGTCAACATATGCGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACACTACGTCCAC:1 - chr3R 17902617 5' - hobo 2922 1 37.23 GACGATGCGAAAACGAATGAAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chr3L 14550954 5' + P-element 56 1 41.96 AAATGCGTAGTGCAAACAAGCCAAGCTCGAGTGTTCAATTAACAGCAAATTCGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTG:1 - chr2L 2276845 5' + F-element 11 1 79.56 AAAATAATGATTATTATGTCTAAACACTAAACACTCCTTTATAAATCTAATTTTTTTAAGTATAAACTTGTAATTTACGACTGTAACGACTTCATTTCCACAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAA:1 - chr2R 4029442 5' - 297 380 2 76.03 ATTGCTTTGACACTTACGATTTGATTGGGTAAACCAGTAACCTTTAAGTCTCTCCTATACCTTTAACTTCATTTAGCAAATTCCCGAACTTGAAGGATTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTA:1 + chr3L 1406537 5' + mdg1 7211 2 63.70 CTGTGGCATAAATGCAATTATATTGCAGTTATTGCAGTTGCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAT:1 - chr2R 17392084 5' + BS 5076 1 72.60 ATTGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTT:1 - chr2L 23295898 5' + micropia 4992 2 55.32 ATTTATGCTCCTAAGACCTTTTGCTGATTTAAAGTATCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTC:1 + chr2L 5601574 5' - mdg3 5414 2 71.92 AAACATGTAATAAATTCAGACCAAACAAGAGCACACACATATGTATGTCCTTCAACGGTCACTATCTTCTTCCTGGCTGACTGATCCCTGATCTGTGCTTGCGCCGACCCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTCATTTCCCTTTTT:1 + chrX 4796764 5' - gypsy8 314 1 65.07 CTAAATTTCTCTTTCTCTAAATATGGTTATATATATATACATATGTTTTCTTTATATACCCCTATCACACCGAACGCATTTCAGAAGACATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTATCT:1 + chr2R 5260610 5' - 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roo 9031 1 58.22 AATGTTTTGAAATTGAACTTTTGATAAAGATACAATAGAAAATCCTTCCGAAAAGTCTTACCAAGAATTTTAAAAATTACCAACAGAAGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 + chr2L 3339914 5' + FB 28 1 65.00 TAAATTGGAAATGACACACAAAAAACACTGACAGAAATAACAAAGAGAAATCAACTTAGTAACAAACAGAATTTTGTGGCAAGGAAAACTCACTCTAATAATATATTTCCGCACTAAACAAAATTTACACGCCCGCAGGTTATAAT:1 - chr2L 21570264 5' - Gypsy12A_LTR 318 1 52.05 AAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chr3R 4528410 5' + F-element 50 1 64.81 TTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 + chr3L 15026641 5' + opus 7055 4 59.59 GTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr3R 28396624 5' + jockey 82 1 75.78 AAATCTGGCAGCAAAAATCTACGAAAAAGTCGGAAACACTTTGTCGGTGGCTTGGCTTGTTTTTTTGGGGCTTTGGTTTTGGTTTTGCTTTGCTTTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTTAAGACTTACAA:1 + chrX 7515603 5' + roo 18 2 72.14 GTGAAGAAACGATCGGTTTGAACAACCGGGCAAATATTCCGCTCTGCGGACCATTAATTAAGCTTGACATCTCGCATCACCGGAGCATCAGTGGTGCGGAGTGGAGTTTACTACCAACAAATCAAGAAAGAACGCGCTCCTGCTCT:1 + chr3R 4254011 5' + F-element 362 1 75.34 GTCAGTCATATACAAATAATTTATAAATAAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGC:2 + chr2L 11574779 5' + Max-element 8261 2 67.12 AAGGGCCAAAAGAAGAAGCCAGTCGATTGGACGAGGCCCGTTCGACTTTACTTCTTGAGTGTACTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - 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chr3R 24476377 5' + 412 7111 2 57.53 CATGGGGAGCGTGTAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3R 10684830 5' + roo 56 2 59.42 TGAGATACGATAAAGCCAACAACTATTTGAATCACATGAAAGAGAAGCCCAATGTTGAACACTAAAACGAAAAACAAAACACTAAGAAGAAAATTGCAAAATACTTTATATATTTGTTTAAACTACTACACAAATCAC:1 + chr2R 12452656 5' - Cr1a 152 1 64.49 TCGAGATTTACGAGATCAGTGAGGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATT:1 - chr2R 8641627 5' + diver 5921 2 58.62 GAGTATTGAAGCAATAATCACTGGGCCGACAGGTGGCACTAAATAATGATAATGTTTGTTTCTAAACAATATTTATAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGC:1 + chr2R 15052049 5' + F-element 4255 1 53.44 TGATTGGCCCAAGTATATTTTATGTTCTGCTGCTGATGTGGATGTGTCGTTGCGTTGACAGCCAAGTGAAAAATGCATCTTACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTG:1 + chr3L 18284885 5' - roo 8817 2 57.86 CATATGTACAAATAACGCAAACTTTTAATTTAACTTAAGTTGTATTTCTTATCCTCTTTAATTGGTTAGTTATTTTTTACGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCG:1 + chr3L 26640453 5' - Quasimodo 252 2 59.72 CGTGTCGGGGTGATATAAAGGAATCGACTTGTAGGACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr2R 5737224 5' - 1360 3340 1 54.11 ATGCTTAGTTGTTGAAATTGTTAAATACTACGATATATAACTCATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chr2L 2698431 5' + I-element 45 1 61.74 TAATTACACAACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTGTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3R 18815985 5' + hobo 25 1 64.17 GACAACAACGGGAGCAATGAAGCAAACAGTTCAAGAAACGGACGGTGAAGGTACGTATACAGATATCTCTGAAGGTAAAAAATACGCTGAAATTGGCCGCATTGTCGGTTGTTCAAGCAACATGATCAGCAAAGCACTGC:1 + chr2L 18719286 5' + Tc1 467 1 52.86 AAATGTCTTTCCTTTGAAAAAATACGTTAATAAAACACACTTAGGTCTTAAGTTTTAAAATTTTTAATATCTATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACT:1 + chr3R 28545001 5' - blood 7051 2 50.68 TAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr3L 96519 5' - roo 8990 2 72.60 GAACAATGACGGGAATTTTAAAGCTTCTTCCAAGCAATACAATACTTTGATCACTTCGTTGTTGATGGAATTGTAATTACATAACTCTTTAGCCAATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTG:1 + chr2L 14201329 5' - roo 9051 2 54.11 CACAGTTCAAGTGTGAAAGCAATTAGATTTGATAGTGTATCGGCTTCATTTAAATAAACGGATATTGCAGTCGCTGGCAATCGCCAGAGACGAAAAGTTAGAAGAAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTAT:1 + chr2L 4184400 5' + jockey 4859 1 71.92 GCAGGGTACACTGAATGGATTGGATTGGCTTTGACATGGCAATCAATTTTTGGTAAAGTTATGAAAAAAACTCAATTTCTGCCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chr3R 24493195 5' + jockey 4689 1 64.00 CACTGCTGAGGGTAAGTGCTTGGAAAAAGAATTGATAAGAATGCATACTGCGCAGGTGGCATACAGTATGGGGGTGTCAATATAATTAAACCAAAATGCAAAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGATGGTCACT:1 + chr2L 5543784 5' - 17.6 6999 2 78.08 AGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTTCCTCGAGTACTTTTCAC:1 - chr3L 13374212 5' - pogo 2085 1 56.84 ACAACATCTGCGCGAAAGCTGCAGAAAATAAAGCCAAGGAGGTACTGGAGAAAAAGGGGTCTCTCGATGGTCATAAGCACTCATAAAGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCA:1 + chr3R 30231001 5' - Porto1 339 1 56.16 GGGTCATGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chrX 1103571 5' + pogo 20 1 70.55 TGTCTTTGGGCAATTACGGGCACCAGCATAAATGCACAGCGGGTATGGAGCAATGGGTTTTGAGTTGTTTATGCACTGACAAAAAAGAACTAGTCACCAACTTCTTATTTGCAGAACACAAATAGGGAAAATCTATTCCAGAATTA:1 + chrX 447974 5' + S-element 463 1 46.58 GATTTACAAGGACACTGTGCAATTGAAGCACTCCTCCATTTTATTCCTTCCCTGTACATCTTAGCATACCAACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTG:1 - chr3R 26246950 5' - 1731 306 1 72.86 TACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chrX 12138934 5' - roo 346 2 61.64 TTTAAGGTTCATGATAATCAAATGCAATTTTGCGTAATGAATATTCGTAGATAAACTAAATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATATACATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCC:1 - chrX 21575378 5' + INE-1 87 1 56.16 CCCTTTCCCCTTTTAGATGGAGGTACTAATTAATTGAGTGCTGGGAGCCGCTCCATGGTAGCAAAGAAGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 31491037 5' + roo 8681 2 63.30 GTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAG:1 + chr2R 4012528 5' + F-element 315 1 76.98 ACCTTGACAAAGCACTGACTATATAAAAACCATGAAATGTAATAATAACTTGACCATTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACA:1 - chr3L 11776760 5' - mdg3 181 2 58.90 TGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr3R 18815959 5' + hobo 32 1 55.45 ATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr2R 8305227 5' + roo 8741 2 73.29 ATTTAATTGACAATAAAATTCCCATTTATTTCTGTTTTTTCGTTCCCACACAAAAACTGCAAACAAAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAA:1 + chr2L 9134880 5' + I-element 202 1 59.31 TTCATGTGCCGTTCATTAGCACAAAACCCACACATTAATTCCTTGTCTCTGCGTGGGTGTTTAATCCTCGGGGAGTAACATACATTGTCCCTATCTACTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGAT:1 + chr2L 11781553 5' + R1A1-element 5320 1 50.68 AATTTGGTCTTAATCAGCTTAACATACATATTTAATGATGCGGCCTACTTTGCAGCTGACAAAACTTGCAAAGTTGTCTGTTGCTTTTTAAAGGTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr3L 22978497 5' - 1360 3365 1 68.28 CGATCAATTGTACGGGACTTGATGATTGTCAAATTAAATAAGTGTGGTGTAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACCCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr3R 26191696 5' - hobo 2894 1 60.83 GAAATTAAACACGCACCCCCAATACACACCCATACCACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTCTGATCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGT:1 - chr3R 20175803 5' - hopper 1361 1 54.11 AAAAGTTAAACAGGTGTCAGTCATATACAAATAATTTATAAATAAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGTGCGCAAACAGTTGAGC:1 + chr2L 11574764 5' + Max-element 11 2 77.40 ATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGTG:1 - chr2R 10695867 5' - roo 9006 2 65.73 ATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAG:1 - chr3L 9909757 5' + Transpac 5006 2 73.97 AAATGTCACTTTTTTTTAAACAATTTTTTTTTTATTTATCCATGTCACAACATAATAGGCAGAAATTCTGGTGTTCTGGTGTTCTGGTGAAAAAATAGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTTT:1 + chr3R 7138636 5' - HB 1375 1 66.18 TATTTTTGTGTATATGTGTCAAACACTTAATTTTTCTAGACGTAGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATC:1 + chr2R 4628350 5' - Transpac 274 2 60.27 GCATGGAGGACTCGATGCTGGTGAAGGGTGTCATCGTTGACAAGACCCTCAGCCATTCGCAGATGCCCAAGGAGCTAAGGAACGCACCTCTGGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATT:1 + chr2R 12176284 5' + Bari1 15 1 67.20 GATTCCCAAGGCGTCTGGACTTTCGGTGCGGCTTAAGTATTTGATGGCTGCGCTGCCTTTAAAATGGGAATTACATGTCGCTAATAAAGATACGGATTAGTTTGGCATGTTAACTTTGTCCCTTATAAAATGATAT:1 - chr2L 14314279 5' + frogger 360 1 78.68 ACATACTTATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTCACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCT:1 + chrX 12138925 5' + roo 392 2 46.58 AAATGGCAATATAAAACGTAATGGGCCACATTTAAATGCCCCCAATTTTGGGGCTGAAAATTCAGACAAATTTCCAACGCAGTGTCACTTCAAATGAAATATTTGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 + chr3R 27535379 5' - 412 7540 2 75.74 ATAGGTGTAAATCATGTCAAACTTATCTAAAATTACTGATCGTCACGGTATCACCCATCCAAATTTAGCAAATTATACAAATACACAACGCGCAAGTCATGCTTGCATTGGCTAATTATCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAG:1 - chr2R 18299175 5' + R1A1-element 4860 1 74.66 TGGGTCTCTTCAGTCAACCATCCATTCACATGTACCCGTTTAAATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chrX 12525916 5' - roo 8997 2 70.55 AAGTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGT:1 + chrX 15903132 5' + INE-1 91 1 73.29 ACGTACTCTCACTTGCTGCTCCAACGATCGGATCTGAATCGTCGGGCAAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 + chr3R 4197234 5' - P-element 2830 1 40.00 AATACGTGTCCCAGCTACAACAGTGCAACACTTGGGCTGAACTACGATCGGTCCTCATTGATGAATTCAAACCCCAAATCACATACGAAGAGTTGCTAAGCCGACTAATCAATTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTA:1 + chr3L 1829904 5' - Cr1a 4051 1 66.44 TCGATAAGAAAAAATCGTCAGTGAATCACGAGCATTTGCCCCGTTTCCAGTTCGTAATCCGATCAATGTAGGAAGGATGCATACATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr3R 29733157 5' + opus 7033 4 63.19 ATGTCTATTTAGCGTTTTTTTTAATTTTTGTAAAAATTAATTTATTAAATAGCATAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3L 23124098 5' + pogo 38 1 61.60 TCCACTTAGCCACTCAGGAGGACTGGCTCATTTCGATCCCTGCACTTTATTTCCATGACCAGGAGCGGAGCAGGTGGGTGGGGGGATGGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTAA:1 + chr2R 23287405 5' - roo 9040 1 62.33 CAACATAGCGCTTCTGCACCACATAAAGGTCATCACTGGGGTGTGGGTACGTCTGCGTCTGCATTTAAACTTATGGATTCGTTACAAGTCCCTTTAGGTATTTAGCCTTCTGCTGGCCAATTTCAGTTTTTACAACTGG:1 - chr3R 17800748 5' - Doc4-element 2743 1 52.52 GAAAACAGTTGGGTTTTGCCACTGGCATCAGTTCAAAAACGATTGAAAACCGCACTGAGCTCTTAAAATTCAATTGGAGTACATTGGGTGAAAATATCAAATGGATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATA:1 + chr2R 11422513 5' + Bica 4878 1 66.44 CCCGCAGTGTAATAATAAATGCAATCGGCAACGCGTACAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGG:1 + chr2R 4362543 5' - gypsy 408 2 52.86 CCCCAGTCGGCATTCTCTTTGTTTGACGCGAAATCTGTTCTATTTGTCTGTGGCAGCATTTTGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAA:1 - chr3R 11057667 5' - flea 4960 2 56.94 AGCAGTCAGTGACATAAGTGGGCGTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chrX 6138733 5' + opus 148 4 56.92 ACATAGTACAGACATAGTAAGACAGCTGAACCAATTATATACTGTGATGAATATGAATTAGTTATATTATTGTATTAAATATAACATTTAATATATTTACAAATTTACAAGGATGTATCTTTTACATATTTCAATATTTATTAGAT:1 - chr2R 14434687 5' - Penelope 153 1 74.66 GTATGTACTGCAATATATTTGACTAACGCCCTTCCAGTCGTTGTAGACAGTGTTTACTTCGATGTTGTGGCGCATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr2R 5868398 5' + pogo 44 1 55.48 TGTGTGTATTTCCCTTATGCTCTACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 12224725 5' + 412 7090 2 55.81 GCCTAATGATGCTTATTTCGTGCGTGGCATACACACACGCCCACAGCTGAGCTCAAAGTAACAGTACAGTTAGCATGCCTATCACAGTTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATACTAATATTAA:1 - chrX 3197197 5' + mdg1 7073 2 54.79 AAGAATCAGCAAAATTAAAGTCCTTGCCCCAAAATCATTCTACTAGATTATATGCACTAGTTGCCGTTGTATTTTAAAAGACGGATTACAACACTATCACCGCGGAAGGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr2L 9485545 5' - 412 480 2 72.60 CAGCAGCTTCACTTGTTCGCCTTTTTTCACATTTTTGCTTTCAATTTTTTAGGTTTTTTTTTGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAGTTTCACGCGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGT:1 + chr2L 7559679 5' - mdg3 5439 2 51.37 GCTAAACACAATTTCCGGTGAATTAATAACCAAACTCACCTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 14076317 5' - roo 9044 1 62.31 GCAACTTTCCACTTGGCATTTAACGAGCATGTTAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3L 12867246 5' - roo 407 1 68.22 CATGCTGGACAACATAATTTTGTATTTTTTTATATTTTTTTTGACACGTCCACTCTAACCCCCTAAAGCCGCCGAAATGGCCAAGCCGCACTTTGGAAATTTTTTTATAACTTTATTCCCCAATATCTATGGATATCCCAGAAAA:1 - chr2L 22318995 5' + INE-1 499 1 71.72 GCTGTGCTAGCTGTGTTATTTGCTCATTATTATTTGATTTAGTTGCCAGCCGCTGCTGCTTGCTTGCTCCGCCATTATTATTATTATTCTTATTATTAT:1 - chr3R 15354217 5' - mdg1 26 2 69.70 AGTGTCACTTCAAATGAAATATTTGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCC:1 + chr3R 27535459 5' - 412 461 2 68.29 ATGGATGGATGGATGGATGGGAGCAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGCACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCACGCGAGCGTGATATAAGAT:1 + chr3L 11336372 5' + blood 7092 2 78.91 AAAACCGTCATTGGATCACATTGGAATATTTTATTGGTGCTAACGCAATGAAATCAGAGCAAATACATAAAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 - chr2L 12319352 5' + copia 49 2 52.05 GTTGTTTAATTAAAATGCTGCGCGTCATTTTGGCTTAACTAAATATTTGATGTGTTTTTGTAAATAGAAGTATTTGTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr3R 13122445 5' + blood 7023 2 77.40 AGATGTTTATATGTAGGTCCGGTCCGGGTCGGGACATTATGACTATTATGACAAAGCAATAATCTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAGCAAAAAACCCTTAATTTTTACCTTTAAATTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGA:1 - chr2R 2495482 5' + S-element 1708 2 56.16 TCTATAGTTGGCTACAGATTAAAAGTTAAGCTGAACGTTAGTTTTCCACCTGCTCTCGGTTAAAGTTTTTCCCACACAAGGCTTTTGAAATTTCAACTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 - chr3L 10133661 5' - 412 7545 2 78.77 CAATGACAGTAATTAAGGAAAGTGCAGAAAAAGTGACTGACACTTGGTAAATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2R 6842854 5' - roo 341 2 62.33 ATTTCTTAATTAAAAAGTTGCTCCGCCTTGGTGCCGCTCCATCTTGCATCCTTCGCGTTCGTCGAGGTGTCAGCAACAATGAAAATATTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAA:1 + chr3L 2008881 5' + transib2 82 1 60.27 CGAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCAC:1 + chr3L 25482866 5' + accord 17 2 68.85 TGTAGCTGTAACGGCAATGCCGAGAAAATGTGTTTGTGTGTATTTCCCTTATGCTCTACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3L 12224759 5' + 412 20 2 72.60 GGTGGAAGAGTGGGAGGAAGAGTGGGCAGAACAAGGCAAAACGTTTCCATATTTATTGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGG:1 + chr2R 8326175 5' - F-element 4515 1 55.56 ATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACG:1 - chr3R 16913447 5' + pogo 74 1 71.23 TAAGAGGTTCACATTTGCTCAGTGGGATGCAAATCTCGTCTAGTCGAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCAC:1 - chr2R 9967244 5' - jockey 4712 1 68.49 ATCCACAGTGTCCCAATACTACCTAAAACCGTTTTCATTATTAGCAATAAGCAAACTCTTGTTCTTTCCCTTGTTTATTATATCTGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGGGTATAGATTCGTTGAAAGGTATGTAACAG:1 + chr3L 6145725 5' + INE-1 17 1 58.33 CAATATGAGTTTTTGTTCGTCTGCCTGTCTTCAAAGTGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 10684697 5' - roo 9046 1 67.12 GAAAGTATGCACTACAAAAATGAAGCAAGGATCCTGTGCCTGCGACTCTGTGGTTGTTTGTATGTGTGCGAGCGAGCGAGCTAGCTCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr3R 13628537 5' + hobo 34 1 61.81 TATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr2L 22016010 5' + Tirant 8128 2 63.64 GCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCAT:1 + chrX 8027442 5' - Juan 4131 1 75.17 AAGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACA:1 - chrX 23108342 5' + BS3 1451 1 49.32 CACGATCAAGATCAACGAAAGAGAATACAAACTCGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr2L 1558737 5' - 412 463 2 60.00 ATGTGTAATCTGTTGTTCTTGAGCAATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr3L 14062221 5' + Doc 62 1 53.52 TATCAACTTTCTCTCGAAACGCCGCGAATATTGCACAGAGGTAAAGTTTGCTACACGCATAGTGAAACGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chrX 3996480 5' - roo 9037 1 56.59 CCAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTGTGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chr3L 15026790 5' - opus 480 2 61.02 TAAACCTCGTCTTTTAAAAACTTCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 - chr2R 5531240 5' + 1360 65 1 72.41 GTGGTCAAGCGACATGTGAGTTTCTCTTTCCAAATTCAAATTCAAGTTCTATATCAAAATTGTTTGCAGAATCTTCCGGTGACCAAGATCACCGAGCAGGTGACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGAAAAATGGGCG:1 - chr2L 2490726 5' - Circe 7369 1 70.55 GAGAGCCGTTCTTGTCCACTTATTTTAAGCGAAATTTAAATATTTGATGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGTTGACACGGTGATATT:1 - chr3R 8060485 5' - Q-element 195 2 69.86 CTGTTTGTATCTAATGTTTGCAGACAACTAAAGGCCCCTGGAGACTGCAGCTTTTATCACTCCATATAAGTCTATAAAAACGTGTATTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3R 27478610 5' - hobo 2907 1 63.45 GGTTTTGCTGAACCTATATTTTCTTAGTAAATGTATATATGTATCCATTACATTGCATTGGGGGAGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 - chrX 6510146 5' + jockey 4693 1 69.86 TCTGGGCCAAAAGGGAAAGCGGATGACCGGCGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTT:1 + chr2R 21402588 5' - mdg3 209 2 50.39 TTTACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 16855339 5' - roo 356 2 54.68 GACGTTGCGAATCATTGTACAGAGAGAAAAATATTACGTTTCAAGTTTGAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATT:1 + chr3R 26519966 5' - FB 644 3 66.44 CTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGGTGTTTTGAGTGAAGTGAAC:1 + chr2L 12349776 5' + F-element 64 1 49.46 AAGAATATACATGTATGTATATACTATATATGGTCTAAGACGCTTCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 - chr3L 11264316 5' + hobo 60 1 66.41 TTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 + chrX 4778191 5' + 412 7129 2 68.49 GTTGGCTACAGATTAAAAGTTAAGCTGAACGATAGTTTTCCACCTGCTCTCGGTTAAAGTTTTTCCCACACAAGGCTTTTGAAATTTCAACTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr3L 10133655 5' - 412 486 2 76.03 CTATAAGTGTGGCTATTTTGTTCACTAATGCACTTGAGCTTTTTTTTTCGCTTGTGTATGGTTAAGTTACATTTGGCGTATCACAACTTTAATTTGTACGGGTTTCTTTTTAATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chrX 10127271 5' + roo 8 2 75.34 ATCATTAGGGGCGCAAACTTGTCTTCCCACAGCATTCGTTCGCCAATTAAAAATTCATTCGCGGCATTTCCATTTTTATTTCCCAATCCTGAAAACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGG:1 + chr2R 16743176 5' - hobo 2867 1 65.71 GGTCAACACTCCCACTAAAAACCAAAAGCCCCATGCAAAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 - chr3L 10144730 5' + blood 7095 2 80.14 AGTGAGGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCT:1 - chr2R 8641610 5' + diver 5909 2 58.62 AGTTCGAGAACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGCACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr2L 17029575 5' + blood 7056 2 53.79 TTGTCACTTAGCGAGAAAGTGGAGATGTGCGGGAGCGCATGGTGCAGTGCGTCAAGAGAGTACTGCGTCATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3L 23608483 5' - 1360 3341 1 76.76 AAATACTTACATATATTTTAATATTTATACTTGATGTAACAGGCGGAAGGAAGCATTTCCGATTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCAATGTAGCCATGTCCATATGTCCGTATGAACGTCGAGGT:1 - chr4 869605 5' + INE-1 131 1 77.40 AAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 - chr2R 8157259 5' - Transpac 242 2 65.28 GCGTGCGCATAATTGATTTTTTCGCGGCGATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTTTCCTGCTGCCGTTGGCCTATTAATGTTGTAATGTGCACACCTATCGATTAAGCACTGTATC:1 + chr2R 11763555 5' + Tabor 14 2 67.46 GGCGGAGACAGGTGCAGAAAAAGAGAAGAGGAAAAAAGAAAAGAAGAGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAAACGGAAAGTATCAAATAAACCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATA:1 - chr3R 27791516 5' + invader2 230 2 67.81 GCTATACACATTAAACAAACATAATAATACTAATGGTAGCCAACAAGTGCACATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr3R 19859531 5' - opus 7483 2 37.67 ATTTATGATTCACTAACATGCTGAGGTGGTGACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3R 16181257 5' - roo 9034 1 59.59 TGAAAAACTTTTGCTGGATCGCGAAAAATCACAGATTCCATTTTTAAGTTTACCTGGATTGCATTTGAATTTGACAGTCTTGAAAATTTTTTTATTTTTTTTATTTTAA:1 + chr2L 7535242 5' + hopper 151 5 31.19 GTCGCCATAATATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr2L 22016020 5' + Tirant 8128 2 66.67 GTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 + chr3L 96530 5' - roo 8979 2 80.14 ATATTAGCCTTTAATTAAACAACATGTTAACTTTGACAGTGTTTGCTTTTTCTGCGGGATTTTGTTTGTGTGTGTGTTTGCGGTAGGGTGCACTATGTGGAAATTTACCCCTTTTTTGGACAAAACCTATTTTATGAAAGTCGGCC:1 - chr3L 21767887 5' - Transib-N1_DM 458 1 64.38 GACGGTACTTGCGTTGAATATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATG:1 - chr3L 12976366 5' + invader4 2796 2 46.90 GTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2L 17250720 5' + opus 7043 4 59.32 ACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAAT:1 - chr3R 4528404 5' + F-element 71 1 73.98 TGTGTGCCTAAGCCTTATCTTATCTAATCAGTGCTAATGATGTGTGTTATTGTATCGCTGCTTCACCTTACCCCGCACGATTCAAGTTAGATACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGT:1 + chr3R 18170308 5' - hopper 1052 1 69.17 GAGCTATTCCAAGATATCAATTGTTTTTAGCCTTGCTCTCCAATTCCTGCCTACTTTCTCTTTAACTTAAACTTAGTTTGAAGTATAGTTTTAAACCATATTATTATGCATAGAGTATTTAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGC:1 + chr2L 12791117 5' + G4 3763 1 69.18 AAACACTGTTTTTCATTTTTATGGCCGGGGGAATGAAATTTGATTCTCGGAAGAGTTCATTTATAGCGAATGGAATTGAAAATATTTATTTATTTATTTTTTTTTTTATTTTAAA:1 - chr3L 16749136 5' - TART-C 11100 3 68.70 AATAATAAAAAAAATACAAAACTGGAAATGGGGTCAATGGCAAAAGCATTTGAACTCTTGTTTATTTCTGGCGAGTTTGTTTATGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 13927687 5' - roo 9047 1 64.18 AACGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1 + chr3L 22400246 5' + 1360 41 1 55.71 ATTTCAAATAACTTGAAAAAGTCTATTAAATACGATCAAAGATCTTTTAATATTAAAAATGTGATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 + chr3R 17546616 5' + blood 61 2 58.22 GCAACTGGAATCAATATTTATTATTATCTTGATATGTAGCACTACTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCACTCCCTCTCACGCTCTCCCGCTCT:1 - chr2R 10916670 5' + GATE 8286 3 67.81 AAAAGCCCGTATTAATTACACAACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr3R 18815997 5' + hobo 26 1 66.92 AATGTTTCAAAATTATGTTCTTAATTTTAAATGTTAAGAGGCTCATTATAACATATAACATCTCAATATAAGCTTTCTGCCCTTTTTTTTGGCATAATTTTTATACATCTTAATGTTTTAATGCTATCTTATTGTTTTTTTTTTTA:1 + chrX 12248229 5' - gypsy11 3932 1 71.92 ATGGCAATCCCTTAAGATTCTAATTTATATCAGCGGCAAAACTTATTTCCTATTTCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr3R 28272218 5' + Tirant 37 2 55.08 CTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTCTTC:1 + chr2R 11763612 5' + Tabor 79 2 74.63 GATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAATTAGTATCATCCTACCGACTGCGCCAC:1 - chr2R 4122892 5' - rover 366 1 79.45 GATAAGAATAAAGATGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGATCCCTGCACATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATATATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGAT:1 + chr3R 29288726 5' + BS 5061 1 59.59 ATATAAATGCGAAATCAGCCAAGCAAAGTGGATGGGATTATTAACTAAGCTTATAAGAATGGCGTGGAACTAAAATCCGGGTTAAAAATCCCATAGCAGCTGTTGTAAATTTATTTTATTTTATTTTTT:1 + chr2L 1849356 5' + transib1 1900 1 72.09 GTACATCTAACTTGCTATTCGGCACGAACTCAGATATGGTGGATGTTTTTAAAGGACCGGACATTCACCATCGCCAACCTTGTCTACATATTCCATTTTACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATCCCGAAAAGGGACATGGAA:1 + chr2R 5504969 5' - HB 62 1 60.96 AAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 - chr2L 2276792 5' + F-element 51 1 53.23 AGGCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2L 246089 5' - roo 346 2 62.68 AAGCTAATTAACAACTACAGCTGAACTACGGACTCGGAACTCTCATTTAACGTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAA:1 + chr3R 13349049 5' - BS 5028 1 64.38 ATTTATTCATAATTTGAAATACTATCTAAAGAAAATATGATTTAAAACAAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAG:1 + chr3R 6518107 5' - jockey 4710 1 71.23 CCGCTTTCGCGATTTTCATCAGCTGTCGTCCTCATAGTCGTCATCGTCATCGCCATCGCCATCGTCCTGTGTCCTGCGTCCTTTGGCACAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTAC:1 - chrX 7786696 5' + hobo 9 1 74.58 AATTCAAATGAGTTCAGAATGGGCCAAAATCCGAAGCGGCGGGCCAAATGGCTTTTCCAGCTGCGCCAACAGGGCGTATGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - 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chr3L 10133612 5' - 412 7496 2 51.37 CAACAGAGCAATAAATTGACAAAATGTTCCAAAGAAACTTAAATTGGTGGAATAATTTGAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAA:1 + chr2R 5917773 5' + I-element 5059 1 68.84 TCAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTT:1 - chr2R 13644523 5' + Burdock 53 2 56.16 GAATAAGTATTCGATTGGTTGGGCATCTTGTGCCACAATTGTCCATGTGGGAGTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chrX 1689984 5' + 412 7119 2 62.07 TTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATA:1 - chrX 20999578 5' + BS 70 1 69.86 ATAGACGTAGTCGTTACCTCCATTGGCACCAGCGTTTTTAATTCGTGGCTGCCTCTAGAATCTATTACGCTATTTCTGAACATTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTC:1 + chr2L 22062539 5' - INE-1 148 1 55.45 GTTTCAATTGCTACATAAATGGAAAAAAAAAATGCCGAGGCAGGCAGAAATTTAGGTTGACATTCAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3L 16580366 5' + 412 7102 2 52.86 ATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTACTTGC:1 - chrX 22824250 5' - Gypsy12A_LTR 2230 1 47.26 ATTTACAAGACTGATAATGATGATTGTAAGATTGGGCGTGGCAACATTACGCTGCGTCTATGTCTTAAGAATCTGTATGCTAAATCTCAACCTTTTAGCTTTTATAGTTTCTAAGATCTCAACGTTCATACGGACAGA:1 + chrX 22586098 5' - INE-1 130 1 75.36 GAGATTAAAGGTGTCTAAAAGTATGCAATGAAAGCTGTCCAAAAGTATGCTGCAAAATGTTTTAATTCTTGCGATATAATACTGTTTACATGCAACCTAAGAAGTTCTCATGCTGAAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2L 4179555 5' + jockey 12 1 54.48 GTGGTGTGCAAAAGTTACACTAGGCTACGCAATCAAAGAAGAGTTTTAAGTATGCGCTGAAGGAAATAAAATCGAATAGATTTGCTATTAAAAAGTGTCGGAATATTGGAGTAGGAAATTGTTGGAATATACTATTCAA:1 - chr3R 18873353 5' + copia 4868 1 68.35 TAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGC:1 - chr3L 12976316 5' + invader4 2837 2 77.94 AAATCTGTAGCTTGAAGAATACCGTTAATTTGTTCCAGAATTTAAACAAAATATATGTTTAGACAAACTATAAATATGTTATATTTATGGGCAGCAATAAACATGTCACTGGTCATAGGCCTCAAAAATAGATTTAAGAATAAAAG:1 + chr2R 5018791 5' + rooA 7423 2 39.73 AAAAAAATGGTTCAAAAATAAAGTGGCCAACTAACAAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr3R 17305522 5' + roo 84 2 76.71 GGGGCTTTAAAGTTCATGGTTGATTAACTTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 + chr3R 24476307 5' - 412 415 2 76.15 GCTGGGAATTGGATTTAGATTTGAATTTGGCTGAGTTACATGGCTGTGTGCTTAGACGATTGTGCAAAACAGATTTGAGCTGGGCACAAACAAAAAAAAACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 13395389 5' - roo 389 2 71.23 AACGGAAATTTAGCTGACACTCTGGACTTGGCATATTTCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 17114043 5' - roo 9014 2 65.85 GCTGGGGGAAGGTCTAATTGAATTAGAGTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 11133611 5' + roo 8739 2 78.12 AGAGATCTCTCAAAAATTATAAGACCACCTCTTATGACTGTATGACTGTCCCATGAGCGCGACAATTCCCCAAATCCTAGACGATTGCATCGCCCTCCAATCACATACAATTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAATT:1 + chrX 19821177 5' - HB 296 1 43.15 AGAAAGATGGAAGAGATGGTAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr3R 19531285 5' - hobo 2935 1 64.71 AGCTTTTTTCCTCACGGAAATATCAAAATTATTTGCTATTAAGCAAATCTCATTCTCATTTCCACTAGCTGAGTAAGGGGTATCTGATAGAAAAAAAGCTTATTTTAAAGGATGGGCACACGACATTATTTAGTTTTAAAAGGTG:1 + chr2R 4820688 5' - FB 783 3 51.03 GTGTATGCGCTCAATTCGATTCAGATTGCTTGGTGTATTTGTGCATACTCGTATGTACACGATGATGGCCAAGTGTCGTTGTCTTTCCTTTTAATAATAATACATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTAGTATGATTTTG:1 - chr3R 25058953 5' - I-element 221 1 54.68 CTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGACATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr2L 15987985 5' - roo 342 2 65.71 ATACTCCAAGATGTTTACAAGCGACCAAAATATGACATCTTTCCAAGGTTAAAATAGCTAAGGCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chrX 18806252 5' - roo 350 2 56.85 GTACCACTGCACTCACATCTCGGATGCAATCCGCTCCAAACTCCAAACTGCCCAATCCCCACACCACTCACCTTTCGCGCTCCTTTCGTGGGCTATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATACGTGTG:1 - chr3R 25651374 5' - 1360 3224 1 59.59 GAGAATTTGAGTAATGATATTATCTTGAAAACTTGGTCTAAGATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr2L 17029709 5' - blood 7347 2 50.68 GGAAAGTCGGCCAGTTGATGGTCTCGTACTCTAGCTCAAGTTTTGGATTCAGTTCGGCGCGCCTGCGCGACGCCATCGCGAGATTTCGGATTTCTATCGCTTTGGCAACTATGTATATGTATATATAT:1 + chr2R 20326587 5' + 1731 4409 1 70.31 AAATGGTCAGTGTAATCACATTCTGAGGGTAGCAATGCCTCTGTGATCAGCCATGAATTGATGTGCTGTATGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAA:1 - chr2R 4362630 5' + gypsy 7038 2 54.79 CTGTGGTAACCAAACTTTCACCGGAAGTGGGCCAATAAAAAGTATACACAGAGATACACAGAAGACGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTA:1 + chrX 13426133 5' + BS 16 1 57.14 GTTCTTGGATCAGAAATAAGCTTATAATCCATTAAATACGCTCCTTTTTAACTTTTTCAAACTGAAAATTGCTTACAAAGCCAAAATATTTATGAGTTAACTTTTTCGATTCGAAAGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCC:1 - chr3R 8813424 5' - F-element 446 1 79.45 AAATTAATTCGATATTTCTGTGTGTTATCTTAATGTAGAATTTAATTTTGTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 19422835 5' - pogo 2033 1 67.81 CCGGTGACAGGGGAAAAGCCAAATATAATTTGCCAACTCTAATTGCAAGCAGTCGTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 + chr2R 12787766 5' - 297 375 2 73.97 AATATCCACGAAAGTTGCCTTTTACATCTATGTAGTTGGATGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTTTATTATTATAGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 21393875 5' - accord 7034 2 55.22 TTTAGATCTGGTGAAAAATTTTAATGTATTAATTTGAGTGACACACTGAAAATAGTTTAATGATTGCATAGTTTTATAGTAGTTTAATTTTAGTATAATCAAAAATATTAAGAAAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAAT:1 - chr3L 19995956 5' + G4 3524 1 69.86 AGTCTGGGGCTTATAATTACGTATAGGCTCCTCTCCTGATCGTTAAGACAAATGTTCCTCAGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCTGGCGTTCGTCTTGC:1 + chr2L 53105 5' - Doc2-element 320 1 57.34 CGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3R 7035261 5' - roo 327 2 73.29 CACTGAATGAGTTAAGAAAAACTATATTATCGAATGATCTTAATAAATCCTACATCAATCAGTGAAAATAACTTAAACTAAGAAAGCTTAGAACTTATTTTACAAACCAAAGATTAAACAAAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTCCC:1 - chrX 22672495 5' - INE-1 572 1 49.32 ATCGTTCCTCGGCCTGACACATTTTTTACTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr3L 22978676 5' + 1360 16 1 73.79 CTCTGTCATCGATGATAAATGTTCGCTGCATGTTGCACAAGTCTTTGCAATCGGCTATCAACAATGGACTCTGGGATATGTGAAGAGGGGCGGGGCATGCTACAATGCAACCCATTTGTTGTAATTTATACTTTATATTTCCTTTC:1 + chr3R 28627541 5' - copia 247 1 78.08 ATGAATTTATTTTATATAATGTTTTATTCAAATTCTTATTACAAGTTGCAAATATTGTTTTAATATTTATCGAATACTATTATTTAATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr2L 16399290 5' - roo 9038 1 52.05 TGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTT:1 - chr2L 23295863 5' + micropia 151 4 67.91 CAGCTTAAAAGTATTTAACTGAAGAGTATTTAACATGATAGCGTTCTGGCTCACATAGGATTTCTGCCTTTATTACAAAATCGACAAGAGAAATTGCTATATTTCTCGAGTCGAGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1 - chrX 22784159 5' - INE-1 546 1 66.44 CATGTGGCGACTGCAACGACTGGATCTATCCGAGAATATCATAGGGATATACGCAGCCGCCGGAAGCGACAATACGAGCGAGACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAA:1 + chr3R 8218927 5' - 1360 427 1 63.57 CAAGTTATTTTTCGCATACCCTGGTACCCCTTGTTCGCAACGAGGAAAAAGTTAGACATGCGAATGCTTGTCATTTGCATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCG:1 + chr3R 31887722 5' + HB 57 1 61.64 GAAAGGATGGCACATTGTTCGCATCTAGGGTCCAGCCATGCAAGTAATAGTATCCTTCTCTTATGGGACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAA:1 - chr3L 22648391 5' - Tabor 7269 2 52.74 CCGTCTATCAACAAGTAAGCGCTACTGCACATTGTACCTAGGTGAGTGGGAGATTCTGCGTATAAAGCTGTTTTAGAGGAAGTATCGTTATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr2R 5923065 5' + jockey 4683 1 72.87 GGTTCCGCGCCAAAATCTTCAGCCTCAAAAAGCCGCAGATAACGTGGCAAATCTGGCTAGACTTCGCTGATTGATTATCATCCCCAATCCGATCGTGCCTCAATATGAACCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3L 6258925 5' + roo 48 2 77.69 AAAGTTAAAAGTTTTCGGAGGTTTTGGAAAACCTAGATATTTTAGGGCAATATAATATATAAAGAGAATATATAATATATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAG:1 - chr3L 22408759 5' + Ivk 36 1 54.68 GTATATCTACCTAAATATTTTGATATATTTTGCAATGTATATATTAATGTATATGTTATGAATATAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chr2L 5694233 5' - copia 233 1 58.22 ATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTAC:1 + chr2R 13644432 5' - Burdock 176 2 74.66 GAGCTGGCGATGGCGTCCAAGTTTGTTTTTCAGATTCAAAAAACGGCGATAGACAATTTTTTGTGTCCTGAAGAATTGGGGATCGGCCAAGCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTC:1 + chr3L 25396245 5' + roo 9051 2 67.12 GGTTTAGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr2R 11489167 5' - mdg1 369 2 55.17 GGAGCGGGGCTCCTGGATCCAAACGGCCGCAGAGGCGTTGACTGGCTCTAGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGAGCACTCATGGGTACTGATCAGC:1 - chr2L 20269673 5' - Quasimodo 254 2 58.40 CGTTACGATGAGTTTGAGTACACTGAAATTGATCAAAGTTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1 - chr2L 17250827 5' - opus 7448 2 56.16 CCTGGACTTTGACTTGGACTAGGAGCTGCTGGTAGTGGAGCTGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr3R 22100620 5' - 412 7514 2 57.36 AAAAAATGTCGGTAGACAACGTTCTATCACAAAAATGGATTTTATAATATATTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAA:1 + chr3L 15099966 5' + copia 68 2 66.43 GATTATGAGCTTTGCATATTGTTTAAATATATATCTACTGATAATGAAGCTTGTGAAATCACCAGAAGAATGTTCGTTTTTGAGAGTTTTTTATTTGAAATATAAATTTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 + chrX 3197019 5' - mdg1 7448 2 74.66 ATTTAATAGGCGACACCTTGGCAAATGCATGTAACAGCTTCGCAGACGAGTTAAAACATCGGGAATCCCGAATGATGTCGTCGATTAGCTCCTCATCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGA:1 + chr2R 5238314 5' + Doc 330 1 70.55 ACATGAATCCGAAAGTTTCTCAACTTCTGGGGGAGCACTCAATGAGCTCGAATATATGACAAATGCTTTTTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTAGTATTGAAGTGAAGTATTTTTTCCGACTAAGAACA:1 + chr2R 7374530 5' + gypsy4 467 1 52.74 CTTATATGGTCTATGCTGTTATTCTAACAAAAGATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTT:1 + chr2R 7020518 5' - Bari1 1675 1 60.27 GCATGTACCATCACGTTGATTTGATAATTTGATTGATAATTGACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTCGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAAAA:1 - chr3L 24916721 5' + Porto1 152 1 39.73 GCCCGAATGTATGCTACATTTTATGACCCACAACGAGTGAGTGCGTGTGTGTGTTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAG:1 + chr3R 28396567 5' + jockey 30 1 64.93 AATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr3L 96517 5' - roo 9035 1 59.22 TAGTGGAAATCTTCTAAAACAAACTCTTTTAGTCTCTACGACGGACACTCAATACTAGACACCCAACAAAACAAAATAAGAGAAAGAGACTGCTATAGCCGAGTTCCCCAACTATCAGATACCCG:1 + chr3L 23278919 5' - INE-1 555 1 78.40 GACGCTGCTCGAGGATGATCGCGAACTACACGACAAGTCCTGCAAAGGTAGGTTCCTCTATTATTTTATTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTT:1 - chrX 17419473 5' - Juan 4155 1 57.53 TAGAGCGAGCGAGCGAGCGAGCGGAGAGCTCTACATCGATCAGCTCTTTTCTACGCATAAAGTGTCAGCCGACAACTGTATGTGTGCACATGGATACTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCATCCTAGAAGTTCT:1 - chrX 1990048 5' + 1360 222 1 75.86 AAACGTTTAGCTGTTACCGAAAGCAGAACTGTTATATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTGTGCTTGTTGAG:1 + chrX 3099105 5' + P-element 66 1 33.60 GACTTCCCCAGAGATTCCACTCCTGGCAATTATTGAGCAATGCCAATGCTCGGAAAAACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGT:1 - chr2R 21402736 5' + mdg3 5273 2 70.55 GATTCACTAACATGCTGAGGTGGTGACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3R 16181251 5' - roo 9029 1 55.86 GCTTCTATTCTATTCAACGAAATGCCACAATACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chrX 19281775 5' + opus 7037 4 69.47 AGGGCTGCACAGAGAGAAATAATATCGACATATAAATAATGAAATGTATAGTGGCATTTTAAACAGTTTTTAACAGTTTAAACAATTTAAAAACTCGCAGCTTTTCATCTTAATTTAGAATGAAATTTAAAAAATATTTTTTTT:1 - chr2R 18695101 5' + Transib5 2727 2 52.78 TACTAATGGTAGCCAACAAGTGCACATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATAT:1 + chr3R 19859558 5' - opus 453 2 49.32 ATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACT:1 - chr2R 8641595 5' + diver 63 2 60.14 CAACAACAGCAACAATAAAGGAGGAAAAAAGTGACAGCAGCAGCAGAAAAAATTTTATGATCCTGCCTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGC:1 - chr3R 8709863 5' - jockey 4964 1 55.28 GAAAAAAAAAATTTTTTCCTCTCAGTCTCCGGAGAAGCAGTTTGAGAGCGCCGCGGGGCAGCACATTGGAGGCTCGAGAGAACC:1 + chr3R 11827034 5' - X-element 372 1 50.00 TATGAGTTTTTGTTCGTCTGCCTGTCTTCAAAGTGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTG:1 + chr3R 10684700 5' - roo 9051 2 68.84 TGAGAAGAACATTAAATGTACGATGACAGAACTGATGCAAACCAACCCAACCGTGATGACCCGAGTATGTGGGTGTCATATGGCTCAGGCGGGGTCACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGG:1 - chr2R 5273251 5' + opus 284 2 78.40 ATTATAACTGACAAATAGAACTTATTGTTCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATT:1 + chr3L 15099526 5' - G4 3811 1 74.81 GTATACTAGATTCGATAAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTTCGACTATATAAAGTATGTATATTGTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCTATGTCCGTGTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAAC:1 + chr2L 23075090 5' + INE-1 140 1 88.28 GCTACTTTCCACCAATTAAGCGAAGCTGCAAGTCGGATTGGCTGGCTAATTTGGGGTGTATTCGATATGTCGGATATGCAAAAGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCT:1 - chr2L 12079730 5' - mdg3 5489 2 70.34 GTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 + chrX 4778201 5' + 412 7139 2 75.34 GCCTATTATAACCAAGTGTGACTGAACAGCGTAAAGGTTTGGACACATGCCCCCAGAAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCACTCCGCCCCAATTTTTTTTTTTATAAAAGTTAAAAGTTTCTAAAGTTAATTTTCAATTTTA:1 - chr3L 17868621 5' + hopper2 18 1 68.49 AAGGGCAGCAGTATTGATTAAGTCGGCCGCGATGGCAATCCCTTAAGATTCTAATTTATATCAGCGGCAAAACTTATTTCCTATTTCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr3R 28272187 5' + Tirant 34 2 63.70 AAACCTCGGCTGCCCAAAAAATCAGCTGATCCCAAACCAAGTCCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTAAATATATAGAGTCATTTTTAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTCTTTCTAATCT:1 + chr4 51873 5' - 1360 334 1 67.59 TAATAAAAACTGACCACCATACCAGAAACATGCATTTTTCATTGAATATTTTGTGTGACTGCTATGGGATGCATTCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:1 + chrX 8027372 5' - Juan 4201 1 69.66 GCTCTCCACAGTTATTAACTATTCATAACTTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGA:1 - chr2L 2272527 5' + copia 84 2 79.86 ATAGCAGAAAGCCATACACAGTTTTCGGAAAAGCCAAAGAGCTTTGGTCTGCTGCTGAGAGCCATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2L 245947 5' + roo 15 2 73.97 AAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAGC:1 + chr2L 76033 5' + roo 53 2 53.47 ATATGATAGTCATTATACACATGATTATTATGAACATTTGCGTGATAATTGTAGGTATCGAGAAAAATAAGATAATTCACTGTCTCTTTCCATCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACT:1 - chr2R 18349229 5' - roo 8873 2 69.17 AATACACATTAGGCTTCTGCTAATCTCTTATGGCATCCCATTTTTATAGCTAGCCAGTAAAGTGCATTATTCTCCGAAAAGAGGTAAATTAAAGTATAGATTAAAACAAGCAGAAATAGCAGTAAAATAGCAGTGCTATGAAAAAA:1 + chr3L 1996309 5' - HB 1416 1 57.53 CGACTAAGTGGAATTTTTGTTTGCTGTGCAGGGCTATATCTTGTGGCCTTAATTGTCTTTATCCTGGAGATCTTGACCAGGAATCAATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAACGGCCTACGCAGAG:1 + chrX 7876665 5' - roo 302 2 52.74 AGGCGTGGAATTGCGGCTGAATGGATTAAAGCCTCTGAAAACATGAATTTCCTTGCGCCATTATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chrX 10567733 5' - roo 9042 1 65.07 GATATTATGCCATTTGTGCGAATGTTCACATTGAGAACTCTGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chrX 4785153 5' + roo 8743 2 73.97 TGCTAACTCGTTAGCGCTTAGCCGGCCGAATGATATGGCCAATATCAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chrX 4291950 5' + roo 8738 2 71.92 GGGACAGTCGCCGGGTCGGAGAGATGTGGATAATTCAATTTTGCAGAATACAAAAATGTTTTGGTTCAAAAGATAATAAAATATTTGTACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 - chr2R 4930639 5' + Ivk 34 1 58.90 AAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3R 10684748 5' - roo 9008 2 68.42 TCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTACAGTCAATG:1 - chr3R 16181198 5' - roo 314 2 76.22 AGGAAAAACAACAAAAATATGGGAGCCTTGTTTTTCATACACATACTGACCAGGAGGAAAAAAGAGTATGCTAACATAAAAATCAACAAAAAGAAATCAGAGAGATGTACACACACACACACACA:1 + chr3R 11096931 5' + accord 180 2 68.80 TTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCAG:1 - chr2R 6271502 5' + blood 210 2 79.17 ATCACAGGAGGTTTATGAAAAATATATGGAATGAAAAAAATTTAGAAAAAGTTCAAATACTATTTTCAATATATATATATAGAAGCATATGTGCCATAGAATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATA:1 - chr2L 12658590 5' + Quasimodo 38 2 48.92 ACAGCCCTTCACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCACAAGAGGGAGAGTAAACAAAACA:1 + chr3L 23933546 5' - Cr1a 209 1 68.49 GGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAATCGTATAAAAGGTAGAGTGAAACCTTTCTATATCGCGTCTATCTCTACTCGCGAAT:1 - chr3R 1135323 5' + Cr1a 4372 1 69.88 CGTTTCGTATTACTTTAAAGATATTTATTTTGGTAACAAAAGTAAATATAAGGGGCGGTGTCACGCCCACAATTTTTGGTATCATATAAGATATGATACAAAAAAACAGAAACTATATATCTCTCTCCGTTCTGATGTTATTAATT:1 + chrX 15567834 5' - Transib-N1_DM 35 1 57.53 GACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCAACACCTTTTATGCCATAAA:1 + chr3R 9160685 5' + copia 4938 2 65.00 AATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCCTACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 + chr2R 641856 5' - opus 7441 2 58.90 ACGGTCTAAGGATCAAAGTATTGAGTTTTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr3L 4115251 5' + 1360 32 1 58.90 TTCCACTTGGCATTTAACGAGCATGTTAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 12867252 5' - roo 396 1 61.19 ACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAG:1 - chr3L 12976323 5' + invader4 2839 2 74.48 ATTGTTTTCGAACGTGGCCGGCGGTAAACAACAACAATGGGTTGTTGTTACCATTGCTCATGTTTCACTCAAGATGCGATAAAGATAAAGTCTATTTCACCACTCACTAATAAAATCCCCACAACCACTGCC:1 - chr3L 20922658 5' + accord2 7346 1 66.67 AGAGGAGCTCATGGATGGAGTCGCATCTCATTGTTATGCCAAGACATTGTCGTCATCAAATTATGGGCATGTAAAAATAGTTGCCATCCTCGTCCTTCATTAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGA:1 - chr2L 2070819 5' - diver2 4864 2 73.08 CGGTGCGCAAGGTAGCGCTGTACAAGAAGCTATTGGGTCTCAGGATGGAAGATGGTCAGAGCATATCCAGCCACATAAATGATTTCATCGGAATTTGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACG:1 + chr3L 26380636 5' - invader4 2758 1 66.21 GATTTGTGGGCACGCAAATTCTGTTTGCCCGAGTGTAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1 - chr2L 16948781 5' + jockey 4695 1 69.86 GTGTTTAGTAGACACTCGAGTGTCTCTATGGAAAAATAATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chrX 22771346 5' - pogo 2033 1 71.11 CGTAGCTCTGAAAACAACAAACGAATAAAATAAAGAAAGCTCCATAAAGTTAAACTTACAGCATAGCAGTAAAATCACTTTGTTCTTATCTACATTGCATTGCTAAGCCACAAGGCTAGCAACATAAATAAGGGGGCGAAGTCAAG:1 + chr3R 8510340 5' + gypsy 7334 2 58.90 GACGTCGCGTGCTGGGCTTCATATTTTTGTTGTATTTAATTTTCGTTTTTGTTCGTTTGTATTTGCACCCCGCGATAACAGAATGTTTGCTCTACAGAAAATCCACCCTAAATTGTACTACCTCTTCATGACTCAAAGATCCCCTG:1 + chr3R 8862761 5' - baggins 5372 1 74.66 CGCGGTGCAGTGAACTTGAAGGGGGTTCGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3L 22642863 5' - hobo 2893 1 69.70 AACTGTTCAAAGTGGGTTCTGTTTTGTGCTTCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTAT:1 - chrY 3648896 5' - Stalker 171 6 75.69 GATACATACATATGTATATACAAATAAGAAATAAATTTATTGTGTAGTACTTTAAAATAATAATTGATTTAAATTAACGCTCTGAAGTCATAGAAATAGCAACTTTTAAGTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAATTTACAA:1 + chr4 151580 5' - I-element 5338 1 71.23 GATAAGTATCTGAACAAAATGCAAAGCTGCCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chrX 7786603 5' - hobo 2894 1 69.31 ACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGT:1 - chr3R 11750265 5' + Tabor 69 2 63.70 CTTGCTTGGGCGCTTGATTTTTTTATATTGGTGTGTGCAAGAATATATATACATACATATATAGTATGTATGTGTGTATGAATACATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTTTTTATTTTGTTTT:2 + chrX 11535026 5' - HMS-Beagle2 489 1 50.68 GAGATTGACAGCTTAATTACCTGGAGCCTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chrX 14964582 5' - roo 9047 1 65.71 TGCATGATGACTACAGCACTGCCCGCGTGCAGTTCAATTGAATTTTAGTGGGGAACTTGTGCTGCCAGCTCTATACACCCATACACACCCACACACACACACACACACACACACATATA:1 - chr2R 17929301 5' + accord 184 2 59.66 CGTATTTGTTATCTGTTTAAAGCAATAACATTTTGTAAATGTTTTCAATTTATTGTTTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3L 20712935 5' - roo 9036 1 60.96 GATATTTTTTATTTTATTCAGGCATGCTCCGGTAATCACAATTTTTTCTTTGATCTTTACATAGTATATCTATTTGTTTGTTTTTATTATCAGTGTTTAATTGTGTGTTCGTTTTTTTTCTTGTTGCCTATCCAATGTTTAATATT:1 - chr4 856868 5' - invader3 4995 2 70.55 GAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGC:1 - chr3L 14553170 5' + roo 8757 2 81.51 ATTGCAATTGATGCTGTGCCGTTTTTCCATTTCGGTCTAGCCATCAACAGTGTTGGCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chrX 12191493 5' - pogo 2090 1 77.54 GTGTTGTGAATACTAAAGCATTATAGGGTACAATTAATATTTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAAT:1 + chr2R 1007650 5' + Ivk 54 1 66.12 GGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 + chr3L 22400278 5' + 1360 62 1 66.67 AACGCTTCAGGTTACAGGACTGCGCGGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 - chr3L 22400389 5' - 1360 3358 1 63.70 GAACCACACAAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr3R 24476388 5' + 412 47 2 52.05 AGGATGACGGGATCTTCGAACGGATTGCTGTGGCGCTACCTCAGCCAGTGCGTCGTACTGTGGAAGGGTCATGCAACT:1 + chr3L 18917684 5' - Cr1a 4173 1 56.41 GTATGCATTATATGAATGAAATACGCATAAAGAAACCAATTACGATAATGAAAAGTGGATATCAGAAATCATAATTTAATTATTTCCATCGCTTACTGTGGTTCCGAATGAATTTCTTGACGTATGGCTG:1 + chr3L 20244045 5' - Transpac 366 1 73.08 ATCGCATTGTTCGTGCTTTTAGCTATTTTCTATTCTATAATTCAAATAAATGAAAGGGCAAGTATTTTTAGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chrX 12139079 5' + roo 17 2 76.03 GTAACTATTTATTATGAGGCTTATATATGAGGCTTTAATATTTTTATCTAGTTTGTCTATTCATTAAAAAAAAATGGTTCAAAAATAAAGTGGCCAACTAACAAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 17305594 5' + roo 8681 2 72.60 CATATACATAAATTACACAACGTATTTTTTCTCTGCAGTCAAGAGTCCTCTTCACATGGCCGGCAAATGCCAAAGTTATTTTGGGACAGCAGTAAAGATATGTTGACTCAAGTGTTTAACGGCAATGAGCCGGAGCAAGCTGTGGT:1 - chr3R 10437015 5' - gypsy 262 2 75.34 TAGTCGTTTAGTCTGTACATTTTAGTTGTATTACCCAGCTTATATGGCCTACACATAGGGAGTATATATATATATACATACATACATATGTAAAACTATATAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1 + chr2R 18959340 5' - blood 7369 2 71.23 GATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAA:1 + chr2L 13792598 5' + F-element 90 1 74.82 AGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGC:2 - chr3L 23702276 5' + G4 42 1 54.11 ACAGAAGAATACTAATTCTTACTAATTCTTTATCTTGACAATGTGGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTT:1 + chr3R 2555462 5' - Bari1 1669 1 59.59 GATGCGGTTTTTGGCTCCGCACCTGCGCCACAAGTAAGGGAGTCTTAGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTCTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTT:1 - chr3L 11826472 5' - INE-1 142 1 73.48 TAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTG:1 - chrX 20999591 5' + BS 57 1 60.96 GCAATTCCTAAAATACGTACTCTAATTAAGTACAGTTCATACATAAGATTAAGAAAAAGGGAAGATTAAACCAATGAATGATTAGGCCATTATGCATACATTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAAT:1 - chr2L 686301 5' - 1360 405 1 63.01 GGCCGATGGTAAGCTGAAGGGCACGCCCAACTCGCTGCCCCAGCAGCAGCAACAGCAGC:1 - chrX 18436703 5' + TART-B 152 2 93.22 GAGTTCCAAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr3R 29645762 5' + jockey 62 1 64.52 AAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTT:1 + chr3R 9190513 5' + Tabor 77 2 67.81 ACCGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGT:1 - chr3R 9160786 5' - copia 210 2 52.05 GATTGTGCAAAACAGATTTGAGCTGGGCACAAACAAAAAAAAACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chrX 13395332 5' - roo 8995 2 72.60 CACTTTAGTTAACTCTTAATGGATTATACCCAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCAT:1 - chrX 12191617 5' + pogo 83 1 74.66 GGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 - chr2L 13250423 5' + opus 43 4 78.79 GCCTGACTCGCTGATGGCTAAAACCTTTCATCACATTTTTCATTTCATATTTCATATTGCTTTTTTAATTAAACGGCGCCTAAATTGGGATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGT:1 + chr2L 8874266 5' + Cr1a 3986 1 50.68 ACACTCCGCTTTCTGGAACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACC:1 + chr2L 18279892 5' + gypsy5 18 2 57.14 AAAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr2L 76032 5' + roo 8718 2 54.79 GACGTTTTGTTTTACTTCGCCAGCTGCCGTCGAGTCGAGTCGAAGTGCAAAAAGTTAAATAAAATGCTTAAAATCCACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAATTCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCT:1 + chr3R 30099734 5' + F-element 132 1 54.79 GTCCATCCATTCAAATGGGTATGTAGTAACGATACAGTTGGGTCCCTGATTGGGTCGGGTAATATGGCTTTCGGGCTTCCATTCATATTTAATGGCATTGGATACCATTTTGGCATTTTGACATTCAAGGATTTTTTGAATGTCCT:1 - chr2L 21152155 5' - HB 427 1 53.42 GGACCTTGAAATACTTATTAAATGTTGAATATCTTTTAAAAAATTAGCATCAGCATATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr2L 17136266 5' - hobo 2917 1 70.68 GATGAATGAGAAACAGCTCCACGAAATTCAACTGTGGTCAATTTTCCGGTCTAGACCGTAATGACACACGGGAAAAAGACCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGCG:1 + chr2L 22592752 5' + baggins 5169 1 64.38 AAGTACATTTCTGTTGTTGGTGCTTATCAAATAAATCTAATCCCTATCTGCACTTCACCTCCTTCGATACCCCACACTTTAAAGTGAGTGTTTAAGTTTGCTCGGTGTTTTGAAAACCGTTCTGTTTTCGAACATTTTCGAAATAT:1 + chr2R 20281768 5' - FB 139 1 73.97 CATCTGTATCCGTTTCCAAAACGATATGGATGTATACATACATACATAGATATATCGAATCACTATACATCCAAATACATATACAATATATATATATATATGTACATATATATATATAT:1 - chrX 7850579 5' + G3 4507 1 72.27 AGAATTCTAGGAAACTCTGGGAAATGTTGCGGTTGCGGTAAGTGGCAGGAAAAGGATCGATCACTTCAGCTGGTCAACTTTGCTGGACATTTTCAACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACA:1 - chr3L 11400049 5' + Quasimodo 20 2 69.86 GTTTCTATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTC:1 + chr2R 961123 5' - transib2 2678 1 65.47 GCATCTGTATGTATATGTATATTAATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCCTACCTCAC:1 + chr2R 641833 5' - opus 461 2 60.27 CTACTGATAATGAAGCTTGTGAAATCACCAGAAGAATGTTCGTTTTTGAGAGTTTTTTATTTGAAATATAAATTTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chrX 3197053 5' - mdg1 376 2 52.74 AGGAGAGATCGTTTTTAGAATGTGTGTGAGTGCTATGTGCGTCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 - chr2R 21076085 5' + P-element 75 1 32.17 CACACACACAGACAGAAAAATAGATTGGTATCGAATCGCTTGGAATTTGAATAATTTTTCCCATATTTTAACTTTTTATCAAGGCCATGAAAACCAGAATCACTTGAATGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chrX 957913 5' + roo 12 2 76.03 GTATTTTCTTCTAAGTAGTAAGCAAACATCAGGTTGTTTACGATGGTAAATATTTATTCATTCAATGTTATATTGTCTTCGTGAATAGACATAGATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAG:1 - chrX 16384131 5' + diver 27 2 67.12 ACACGCGTTCGAAATCGGAATATACAAATGAACCCATAAACAGACTCTGTGGGTTTGTGCACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCACGAAATAAAAAATA:1 + chr3R 17067814 5' - 297 6917 2 59.59 AATACCCATACGTACTCATCTCATCCTATCCGAAGCCCCTGTCGGGCAGATCATTAAATGATCATTAAATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 - chr3L 15100064 5' - copia 236 1 53.42 CAAATAATGCGCTTTGGCATTTGCAGTTTCCATGGCAATCGTGCCAAACATAACCCACACAGAAAGCAAATGAAATGAACGGCGCAGAATTAGAGTGAGTAGCAGCATACAATACTGTAGACAGAGATACGGAATATTAAAAAAAA:1 + chr3L 14321149 5' - Circe 83 1 73.29 ATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 - chr2R 10865247 5' + blood 7073 2 58.90 ACGCATTCTGCACGCGATGCCGGCTATTCCTGGGATTCAATCTCACCGACATGCAGTAAGGAACCATACGATTGCGTAATTTCTTGAACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGC:1 + chrX 20781087 5' - invader4 2779 2 61.11 AATAAGGAAAGGCGGAAAATTTTAAGGCAAGATATCTAAGCCACGGTCCAAATAGAGAAAAGCTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chrX 12866383 5' + roo 8720 2 56.16 TAATGATAATAATAATAAGAGTATGCGTTTATTAATTTGTTAATGCAACTCTTTACAACTCTTCACAAAGAGTTTATATTGAAATCTACAGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGT:1 + chrX 18142909 5' - hopper2 1312 1 59.23 GTAAATAGCGTTCACAACATCTACGTTTACAAATTCTTTAATAGATCCGTACAGAGATTATAATTAAGTCTATAATAGTCAGAGCAAAAATTTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATTA:1 + chr3L 27549308 5' - Cr1a 4143 1 61.97 ATAATGTATAAAGCTAACCAACTCTTAAATGTTATTGTACAACCAATCATATATGTATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr3R 6711419 5' + pogo 60 1 65.07 GACTTTGGAGTATGGTAAATAAATTAGCTAAGATTTCAGTCCCTAGAATGGCCACCCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTG:1 + chr2L 685949 5' + roo 25 2 65.75 ACGCATTTGACTTTAAAAGCAGCTGCAACTTTAGTCTTTACGAACTTTTAAGTTTGACATTTCCATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 + chr2L 12349701 5' + F-element 48 1 75.34 CTGTTTAAAGCAATAACATTTTGTAAATGTTTTCAATTTATTGTTTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 20712947 5' - roo 360 2 52.74 CATTAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCA:1 - chr2R 17890984 5' + Tabor 48 2 50.00 AGGTATTCAGCTATCCAGGCAAATCAGATAATTTAATTATCCATTTACATTAAAAATGTCCAATTTACAAGTTAGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAAT:1 - chr3R 11113285 5' + mdg1 7086 2 56.16 ATTAATAAATGCTTAATACTAAAACAACATATTCACTGTGGTCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAANNNNAGAAGGAGGGGATTCCGNNNNNATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAGG:1 + chrX 22633222 5' + INE-1 77 1 45.21 CTGGAAACTACGGACTACAACTGGAACTACGTCCGCAGTTTTACAACTTTACAACCGCATGTATGGGAGCTTATAAATACATAAATTTTCAGCAACGGCAACGGGCCCCCAAAAATAAGGAAAATAAAAATA:1 - chr3R 21607155 5' + Doc2-element 254 1 59.09 GCACTTGATGTGACTTAATTTAATGACTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 - chr2R 23497101 5' + 412 7127 2 78.40 TGGCCCTTCAGATATAAGTAATTATAGGAGCTTTAACCGAAATACACTTTTAAGCTAATTCTACTAAACCATAGAATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr3L 27350452 5' - pogo 2060 1 56.16 CGTAAAAAAAAGATGAACGACAAACTGTCGCGAAATAAATCGCTGCTGACGCCGTCACTTCGCCCCGCCCCCTTGCCACATCCCCACACAGACACACACACACACACACACACACATATATA:1 + chrX 18002103 5' + Quasimodo 38 4 80.33 GATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 7035262 5' - roo 8999 2 72.26 ACAGGCAGTGTAATTTCCTTCAAATGGCTCGCTATTATAACAACTACCATGGGATTAGGCGATTGCATTGCACAAGTTCGCGATATTGTTAATAACATCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACG:1 + chr2R 17350466 5' - micropia 370 2 66.44 CATGCGGAGCTAAGAGGTTTCTTGGCAAAAAACTAGGCCGGGAACATTATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCA:1 + chr2R 4638602 5' - 1731 4570 2 65.62 AACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1 - chr2L 2276765 5' + F-element 83 1 75.97 AGTTTAAATGCCACAACAGCTGGCAATTAGCTGTGTAATTACACGGTCTTTGTGGACCGCAAAAGTCCAAGTCAAGCATTCCACTTATAGTATCGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 27794911 5' - roo 9047 1 68.49 CGGCCCGATGGCCCCAATATGTCCTCGCCTGACCTGCTAGTTCAATTTGCACATGAAACATACAGTGTGTGTATATGTATATTCGAGTACCACCAACACATATAAATCTATATATATATACATATATTCATATT:1 + chr2R 22063066 5' - G3 4506 1 65.67 TGGGCATTGCCAAATCGCCACCCTTCTATGCCATTCTGGTGTCCCATGCCGGGCACAATTATGGCTATGAAACGCTGATGACCATGCTGCCCACCTATATGTACTGTAAAATCCTAAATAAGAAGACTT:1 + chrX 4785030 5' - roo 405 1 75.97 GATGCAGCACGTTGCCAATTTAATTGGCGGCCTTAACGAAATGATCTGGTATCCGAGCATCCGAGCATCCAAGCATAATTAATAAGAAAAATCAATTTCAAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAA:1 - chr3R 27771226 5' + Stalker 6790 2 50.68 GAAGCCCCTGTCGGGCAGATCATTAAATGATCATTAAATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 - chr3L 15100033 5' - copia 205 2 74.66 AATCCCACACAAGTAATTTATCTCGCAATTGGTCTTCAATAAAAAGTTCAAGCCACTATCTTGTTGTTGTTTGGTGGTGCTCCATTCAGATAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCAACAGGGAAACCTAAAAGATCAAGTTTTCT:1 - chr3L 8068079 5' - Q-element 361 2 62.33 CCCGTTAACCAGTGGAACCAAGGAATGGGTCTCTTCAGTCAACCATCCATTCACATGTACCCGTTTAAATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:2 + chrX 12525891 5' - roo 9022 2 53.42 AGCATTGAACCTGAACTGCCCCTCTCACAGATACGAAAAAATACCCACACACTGGCACTTAAAGACTCCGCTGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGA:1 - chr3L 7093089 5' + hopper 51 1 53.10 ATCTGGTACTGGGAAATTTTTCTTCTTGATCACCTTACACAGGTGGCGGTAATCTACACACATTCAATCACTACCGTTTGGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 - chr3R 4562442 5' - copia 215 2 60.96 CAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr2L 15988010 5' - roo 340 2 82.05 CTATAGACTACTTCGCAGAAAACTACTTGCAATCACTTCTCTTCAATTCCAAGCCCCCACAATGCCGGTCATTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 - chr2L 436570 5' + copia 4918 2 51.37 CAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr2R 11609224 5' - roo 334 2 68.49 ACCAAGGAATACTAATTTTTCAACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTGGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTTGCTCGCGTTGT:1 - chr2R 4025749 5' - Doc2-element 311 1 80.70 AATCATTTTGGAAACATACTTATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chrX 12138912 5' - roo 9032 1 55.48 GATTTGTTGTTGTATGGTTTTTGTTAGGAAGTTTTGTTTTGTATAGAATTTATTCTTAACTTGTTTAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTA:1 - chr2L 22975180 5' + Stalker 7169 4 60.27 GGTACTTGCGTTGAATATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATAT:1 - chr3L 12976363 5' + invader4 2789 2 48.15 GCCGGCATAGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr2L 17136142 5' + hobo 39 1 56.45 GTCGCCATAATATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 - chr2L 22016020 5' + Tirant 20 2 67.23 GGTGTGCATTGTTTAAAAAAGGTATTCAGCTATCCAGGCAAATCAGATAATTTAATTATCCATTTACATTAAAAATGTCCAATTTACAAGTTAGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAA:1 - chr3R 11113304 5' + mdg1 29 2 65.75 ATATTAATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGCT:1 + chr2R 641851 5' - opus 7458 2 52.24 CTTCATTAGTGCAATGATATGTTGTAAACAAAACAACTTTTGACCCTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2R 5737090 5' + 1360 15 1 69.92 GCAGAAAACTACTTGCAATCACTTCTCTTCAATTCCAAGCCCCCACAATGCCGGTCATTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 - chr2L 436556 5' + copia 49 2 55.30 AAGAGCTTTATAAAGGCAATAAAGCGCCTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 + chr3R 13176321 5' - Burdock 218 2 58.90 TCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCG:1 - chr3L 23702284 5' + G4 29 1 60.28 GGGGGTTGAGTGGGGTTGGGCGTTGGCTTTGTCGCTGTTTAAGTAGTCATTAAGATCGAGTGTGGATAAGATTTTTTCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATG:1 + chr2L 6541091 5' - rover 7017 2 54.29 GAAACAAGGATTTGTTCCATCGGCTGGATAACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCAC:1 - chr4 436890 5' + 3S18 5784 2 43.55 TGCCTCCTGTAACTGACTGATGTTTGGCACACACACTGCCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3L 17175084 5' + 412 23 2 68.57 CGGTTTTGGTAACACATCACAACTTCATATTTGGTTGCTTATTATGCGTGATGTTCTAGGACTTTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTC:1 + chr3R 15021968 5' - Tabor 478 2 78.77 AATTATCTGCTCTATGAAAAGGCAATACCCAGAATTTCGAGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTC:2 - chrX 7515793 5' - roo 400 1 79.45 CGCAGTGTCACTTCAAATGAAATATTTGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1 + chr3R 27535456 5' - 412 7471 2 77.34 GCGTATAAAGCTGTTTTAGAGGAAGTATCGTTATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGGTAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chr2R 5923008 5' + jockey 4744 1 71.43 ATTGACGTCAGCATTGAGATATTGTTTTGAATTCAGTACTTCAAAGCCTAGTATAGTATAGTATATTCTAGTATGGTATCGTATAATATAGCATAGTTATAGGTAAGAAAATGATACAAAAAAATAATAATAATATTCA:1 - chr3L 20218212 5' - copia 4820 1 59.71 GGAGAATATAGTTGCCGGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chr3R 4528452 5' + F-element 33 1 66.92 ATTTAATTGCGCTTCTTGTGGCCTTTTATTTCCGACATTAAATAATCAACGTTATGAATTATAACGTTATGAACGGGGCATGAATGAAAATGGTATCACTCCTCATTTGCAGCACTTTTGTATTGTAGATCAATCATACCATCGTG:1 + chr3L 19872910 5' + Q-element 185 2 64.38 GTTTTGCTGAACCTATATTTTCTTAGTAAATGTATATATGTATCCATTACATTGCATTGGGGGAGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGCAGCTAGGAA:1 - chrX 6510145 5' + jockey 4682 1 75.37 ATTACAATTAATGTACTTTTAATCGTTGCATAGATAACATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATT:1 - chr3L 16497480 5' - jockey 4833 1 73.97 AACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 + chr3L 13634212 5' + 297 6639 2 68.46 ATGTGGCGATAAGTGGGAGAGATTGGATTGGTGGGTTAACTGTGTTGGCCAAAGGGCAGAATTGAACAATTAGATGAAAAACGTAACTAAAACAATAGAGGTATTATAAATTTAATTAAAAACAAGAGTGTATGCTATAGTCGAGT:1 - chr2L 13874598 5' - INE-1 576 1 60.96 CGCAAGTTCATTTCCATTCAAATTTAAAACGCAACCCAATGTACATATATGTATATAGTAACGTATTTGTGTGCTCCAAACTGCTCTCTTTGAATCTTTTCCTAATCTTAAGAAGTCAAGAGCGAGGCTCAGCCGAAATACAAATA:1 - chrX 3663221 5' + 297 6792 2 78.08 AACGTGATGAAAGGCCAGAGTGGAGCCGCCGAAGCAACAAACCAAAGTCGGAATAGTCAACCGCAGAGCGTTGGATGAACACGCCCAGCAAAATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chrX 20066089 5' + opus 7024 2 68.28 ATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGTAACTTTTTATAATCATTCAACTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 + chrX 4778190 5' + 412 69 2 63.01 GTAGTGTGTGGTTGGGAAGTTGTGGGTGTAGAATGGACATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAAT:1 + chrX 22252759 5' - diver 140 2 73.29 ATGAGAGAGCAAATTCCGGCCAGAGCTCAGCTTATCGCAACTTTCTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3R 23765441 5' + roo 8738 2 70.14 CAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCA:2 + chr3L 27415220 5' - transib2 2757 1 64.38 GTGTAATCTGTTGTTCTTGAGCAATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr3L 14062223 5' + Doc 62 1 54.29 AGGAGATATAAGCCGACAGGAGACGAAACGAGACTGTTTGCATACTTTCAGGCGCCTCTGACAGGGCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 19531182 5' + hobo 17 1 73.79 ACATGGTTGCCAGGGAAATACGCTTGTTCCTGGTTCAGCAGCTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACG:1 + chr2L 13792549 5' + F-element 7 1 78.10 AAGAAAATCAACACCAAGAAGGAAGGAAGAGCTGAGGGCACTCCCTTGCTACAACTAAATACAAAAAATTGAAGGAAGACCCAACGAGATAATAATCAGGACAATTAACCTGAAGGAAGACCCCAACCTAATCTCCATAAACAGTG:1 + chr2R 1845408 5' + gypsy 7362 2 78.08 GGGTGGTGCGAGGGGGTGTGTAAAACTGTTGCAACTTCTAATGGGTTTGCTTGTTGCTGCTCTTGCTGTGTCATTGTGTACACGTGTGTGTGTGATATTTGATATATATTTGATATATAAAATAATTTGTCAAATTTACAATGCA:1 - chr2R 15449404 5' - 1360 199 1 64.14 AATTTTGCAACACCAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTGTGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 - chr3L 15026802 5' - opus 466 2 57.64 TCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATACCAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 - chr3L 22978628 5' + 1360 43 1 56.45 GATTACGGTTTTCCATTTCCCTTTTCCCTGCTGCCGTTTGTGTATTTATTTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTAC:1 - chr2L 20631455 5' - Stalker4 2 4 71.94 GAATGACAGGACAAACAGGACTGTCGACAGACTCAGAGGGCTCTGCCTTTTTCCAGGAGTCATCTACCTCGTTAGGCATTAAACCATCAACTACTTTAAGCACATCTTGCTCGGCTAAAAGAGCCCTAATTCTAAA:1 - chr2R 12240435 5' - copia 492 1 71.32 AGCGGTACAAAAAAAAAACTTCTTACTTTTTGCCTTGCGGCGCCGAAATTTGGATGCAAACCGTATATTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 - chrX 11496668 5' + copia 4923 2 56.16 ACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGCAGAC:1 - chr3R 9352053 5' + Tirant 48 2 78.41 AAACGAAAATAAAAGTAAAGATGATGAGCCTGTCGATGATGAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGA:1 + chr2R 14541805 5' + P-element 2736 1 17.12 AGCGTGGGCCGACTTGAAACGATGACGTATTAAAACGCCATTCAGTGAAGCACCCCCACCCATATCGGTGTCCCCTCTCTGTCAGCACTTTAACGTAATGGTATAAAATTTCGTGCACTGAGCCAACTGGTCT:1 + chr3R 16817549 5' - Gypsy6A_LTR 23 1 59.40 CTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAAACATATGCGCAGATCGTGTGCTT:1 - chr2L 6717179 5' + jockey 93 1 71.23 CATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 + chr3L 13634224 5' + 297 54 2 74.56 CTACAATTCCTTCACAGTAGTGCTTGCCTCACAACGCCATGTCGTGGGATCCGCAAAACACAATACAGGAAATAATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr3R 4569488 5' - opus 7462 2 58.99 CATCAGCCCCAGATTCGTACCACACACCTCCCCATCTCTTAGTATTATGCCGCAGAAGCTTTGAATAGTTTATTATATGGCAAATATCTTGAGGCACAAAGTACGGACACAAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3L 5274905 5' + 1360 1 2 58.70 AAACATAATAATACTAATGGTAGCCAACAAGTGCACATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 + chr3R 19859547 5' - opus 7473 2 39.29 AATTAACTCGCAAGAGGTATAGCTATACCTATGTATAGCTGTTAGTTGTCAGAGTAACATTTATTTACGTATCAGTGTTATAAAATAAGACAAGAGAGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTA:1 - chr4 730403 5' - INE-1 544 1 64.38 AATCCACTGAATATGTCAAGTATTTCAGTTGAGTGGTTATTAGATATGACGCATTTCAATTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGA:1 - chr3R 11484829 5' - F-element 344 1 52.03 ACACACACTCCGCTTTCTGGAACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTACACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACA:1 + chr2L 18279888 5' + gypsy5 61 2 57.97 TATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCACGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 + chr2L 17029613 5' + blood 84 2 73.29 AACAAGGGATGCTAAAACTTTTCCACTCAAAGGATGATATACGATCTGCTGAGCTTGAGAAAGAACTGGGTCTGTTCTATACAACATTAAATTCCATTCTATAAAGTTATCCAATAAATAAAATATTTAACAATTTTTTTTTTGTT:1 + chr2L 7129570 5' + accord2 345 1 68.49 CAACTGTTCAAAGTGGGTTCTGTTTTGTGCTTCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCG:1 - chrY 3648897 5' - Stalker4 181 4 73.33 AAGAAGTAGAAGTAGTCCACAGAGTTGCCGTTGCATAAATCAAATTCATTTGCCAACTGTTTTCACTGCAAGCCAAATGTGTCTTTGGCTTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 7164200 5' - accord 184 2 78.95 GGGTGTGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGACGTG:1 - chr3L 25401040 5' + Doc 16 1 62.41 TTGGGGCTATTTGAGGGGTAGGAATGGGACTTTCTCAATAAGGGGTTTGGAGTTTGGTACATTACGAAAAGCAAAACTACAACACTACTTTGATCGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTT:1 + chrX 16504378 5' - mdg3 5085 1 67.12 ATAGCATACCCCAAATGGAAATCAATTCAATTCACTTGACAGGCAGACACAGCAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAA:1 + chr3L 13825249 5' - hopper 1345 1 63.01 ACGTGAGCGTGAGATTTGAGAGACGTCCCGCGACGCATATAAAAACAACATAGTTTACATTTACATAGTAGGGTAAATCATAGTACCTAGTAGTGGTATGTCTATGGGGAACACGTATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3R 22464371 5' - roo 332 2 77.40 CACTGGCATTAATATTAAATTGGCTTTTACGGGTGCTATGGGCTCTTAAAGTTTAATATCTACAATCGATCAATTGGTATTTTTAAATACATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2L 14201502 5' + roo 8693 2 59.31 GGAAAACCTATACGGACAGCGGATTCCAATACACATGCAACCGGCACACACACACACACACACACACACACACACACATACGCA:1 - chr2R 12093594 5' + accord 7032 2 69.05 AATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr3L 27391407 5' - 1360 3351 1 54.48 AGTTGTTACCATTACAAATATCAACTGCTTTATAAATTTAACAACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chrX 13531689 5' + roo 75 2 70.34 GTTCTATTGCACAAATTTGACTATTGTCCTGCACAGCGAATCTCGAAGAGTGCGGACCATGCCCAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTAT:1 - chr3R 29266008 5' - R2-element 3404 1 56.16 CGAAATCGGAATATACAAATGAACCCATAAACAGACTCTGTGGGTTTGTGCACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 + chr3R 17067823 5' - 297 6930 2 61.29 AGACGGATTACAACACTATCACCGCGGAAGGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGC:1 + chr2L 9485624 5' - 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pogo 2035 1 67.81 ATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 + chr3R 22100517 5' + 412 70 2 63.01 AGTGCTGGGAGCCGCTCCATGGTAGCAAAGAAGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATTTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 31491001 5' + roo 54 2 70.91 TTTATTCGATCTTTTTGTTTTTGGGAGGGGTTGGCTACCATTTTTCGGCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCT:1 + chrX 7474571 5' - F-element 4323 1 60.98 AGGAGTTAATAAATTCATTAACTCAAACCAAAATAGAACTTTTAATGAATTAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGT:1 + chr2R 4312904 5' + gypsy 7006 2 70.55 AGGATAACTGTTTCATTATTTTTGTGTATATGTGTCAAACACTTAATTTTTCTAGACGTAGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 + chr2R 4628334 5' - Transpac 5209 2 71.23 GTTTGGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACG:1 - chr3R 9352117 5' + Tirant 11 2 73.91 CACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 - chr2R 8157233 5' - Transpac 281 2 69.62 GTGCAGGAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:3 - chr3R 10472809 5' - mdg1 378 2 55.48 GTCAACAATTTTGATTCTATTTACACATTATTATTATTATTATTATGGCAAGAGTTTCGCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAAT:1 + chr2R 18482408 5' - hopper 1355 1 58.90 CATTGCGCCGTCAAGTATGCAACGCGACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACCGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAAT:1 + chr2R 5922957 5' - jockey 4941 1 54.11 CTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCA:1 + chr2R 22723020 5' + 3S18 5824 2 56.16 TATGCGTAGATGGAGCGTCCCCATCGCGGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2R 11133529 5' - roo 360 2 53.42 TGCGGCCTACTTTGCAGCTGACAAAACTTGCAAAGTTGTCTGTTGCTTTTTAAAGGTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 + chr3L 22978535 5' - 1360 3348 1 56.45 AGATAGTCCTATCGGTAGTTACTTGTATTTTTACACCGTAAACACATGTGAAGGAGCTAGACTTCAGCCCTGAATCCCAATAAAATTCTGGCATTTAAACAGTGGATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGG:1 - chr3R 3713384 5' + baggins 5375 1 77.14 ATTTGCCAATCAGTAGAGCGAATATGGGCAGAGAGCACAGATAAGGCGATGAGGAGCATTTGAAATCAGTCTTAAGTTGAAAGTTAGACCGTAAAGTTCAATAAGTCTTAAACCGATATTTAATAAAAACCAAAACCGAATTTATT:1 + chr2R 20438342 5' + McClintock 333 2 61.64 ATAAAGAAAGAAAACTGCATGTTTTCGAAACAATAAATGGTGTTACGAAAGACGGTAATGTAATCCGCCATGCATAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAA:1 + chrX 5014094 5' + Doc 143 1 49.32 ATGCTGATCAAGAATATTTATATTTTACATGATCGGAAACGCTTCATTGCTCTACGAGTAATGGGTACAATAATTTAAAACAAACATATTAAAAGTATAGCAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chr4 572598 5' + 1360 19 1 72.60 ACAATTTTGATTCTATTTACACATTATTATTATTATTATTATGGCAAGAGTTTCGCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGGATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1 + chr2R 18482412 5' - hopper 1351 1 60.27 ATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3L 23986515 5' + opus 7043 4 54.40 ATCGCAACTGAGTTTTGTCTACTTTTTGGCTTTTTCGGGTTTGCCAGACTGACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGC:1 + chr3R 17495718 5' - Quasimodo 7324 2 55.48 ATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:2 + chr3L 27415198 5' - transib2 2779 1 54.79 GCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr3R 9352083 5' + Tirant 8123 2 59.30 AGTTCATCCAATAAATACATAGAGGAAAATGCGAAGCTTTATATTTTGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGC:1 + chr3R 27510080 5' - Bari1 1637 1 64.83 AAAAGAAACTGATAACATAGAGCGATCTATTTGCCCGTTACACGTAGAGTAAAAGTATATACCAGATTCGTTGAAAAGTAGAAGAAAACGCTTCCGACCATATAAAGTATAAGTCGATCCAAGGTCTGTAGACTCCTCGTTACAAG:1 - chrX 22694304 5' - invader5 318 2 70.55 GTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAGAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3R 7035313 5' + roo 89 2 81.38 CTTGCCTCACAACGCCATGTCGTGGGATCCGCAAAACACAATACAGGAAATAATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chr3R 4569510 5' - opus 447 2 61.24 AAAGGGCAAGTATTTTTAGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chrX 12139027 5' + roo 8733 2 65.75 TTTGGCAAGCGGCTCTCTCTTTCTCTCCCCTCTCACCATTTCCCGTTCAAAAATGGCCAAAAGCGAAGAGTGTCAGGAATTATGCTTGCCAGCGGTGTTGGTTTGGTGGGGTTTTTCTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTCTTTTTTTT:1 + chr2R 17346792 5' + hopper 148 110 67.12 TGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACA:1 - chrX 21667970 5' + gypsy2 29 2 69.06 ATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGC:1 + chr2L 16089605 5' - 3S18 258 2 71.92 TTTGTCATGCCGAATGAAATTGGGATGTAATCGAAATATTTTATCTTCCTTTTTTGTTTGGCATAAAGTCAAATTATAAAGCTAGAGAGCAGCATTTTTGTAGAATTGGTGCATTTGACATTTAAAA:1 + chr3R 1139183 5' - transib3 2789 1 64.57 GAGTTATGAACTCGATACATTTTCAATTCAATTTTCGAGAAAGTGCGCATTGATAGTGAAAGTGCATCTCTATTGCGAAATATAAGTTCTTTGTGACATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:2 + chr2L 6183971 5' + pogo 21 1 40.41 TTTGCAAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chrX 5150373 5' - roo 339 2 66.44 AACCTTTACAATGCTTAGCCCATTTCTTATTTTCAGCCATTAATCGCGGAAAGCATTGTACCGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAACCTACTCTGAAATTGGTCGCAGTGTCG:1 + chr3L 24029457 5' + Tc1 434 1 66.67 TAACTTCTATTATAATACGCAGATTGGGCTCCACAAGTGTAGTCATGTAAATGGGTGTGTATTATCAGCGGTCATTGTTTCGCGTTGAATACTGTGTATCAATTACCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr2L 3294263 5' + hopper 7 2 77.14 CTCGGCCTGACACATTTTTTACTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr3L 22978669 5' + 1360 17 1 71.94 GCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGTGAG:1 + chr2L 4173983 5' + roo 58 2 65.32 CAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr2R 10695779 5' + roo 8729 2 63.01 AGACTACTTCGCAGAAAACTACTTGCAATCACTTCTCTTCAATTCCAAGCCCCCACAATGCCGGTCATTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 - chr2L 436566 5' + copia 37 2 54.62 GCGTAGTTAAATCAGTTTAGCCTGGCTTTCCTGTTCTCTCTCCATCGCTTTCATTGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr3R 25387774 5' + roo 65 2 63.01 TAAGCGGAAAATTGTGGAGGGAAATCGTACAAGAAAAGCCACTTGAGCATGAAATAGGAGAGCGAAGTAAAAAAAAAGTATGTAAAAGGCTGAAGGAATCGTTTTTGACTATATAATGTTTATATATTCTTGATCAGGATTAATAG:1 + chrX 20810586 5' + INE-1 85 1 47.95 GAACATCGACATTAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 - chr2R 17890993 5' + Tabor 6873 2 58.16 AGTCAAAACATTTTCGCATTTACTCACAAAAGCATCGCAACTGACTGCAATAATGGCTCATAATTTTTATTTGCATTATCAGACGGCAATTTCATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGA:1 + chr3R 6517119 5' - jockey 4906 1 66.90 GTGTCGGGGTGATATAAAGGAATCGACTTGTAGGACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr2R 5737223 5' - 1360 3350 1 54.07 GAAAGACGTATTATAGCAGGAGTGCAGCCGTAATAGAGGAACGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTT:1 + chrX 17419402 5' + Juan 4106 1 70.55 GGCTACTTTCTGCATATAAATCGCGGAAAGAAATTCCAGCTAAGCAGGCCTATTGTGTGGTTGTAAGTCATGCGAACTCATTTCGAAAATTAAGCAAATGTGCTTAAGTATAGGTGCGGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTATGT:1 - chr3R 23594283 5' - accord 7100 2 57.53 GTCAATAACCTGTTGCCTGGTAAACAAAGCCGTTAGCGAAGCAGAAAACGTGGTCAAAGCATAGTAAATATTTGAACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr3R 5208110 5' + hopper 8 2 73.87 GAAACAGCACGTGCGCCAGGCACCGACGCTTTTAATAATTCAGCTATCACTTTATTTTGCCTTGTCACACACAATCGTCTCAGTAATTCTCCAGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGGCAAACA:1 - chr2R 3021418 5' + X-element 464 1 69.40 TTTTATTGCTGCAAATGATGTTCGAGTTGGGTATTTCCTTTTCCCATTCCTAACATTTTTTTATCAACGGAATGTTTGAGTTTTCACATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACACATACACATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCA:1 - chr3R 13627319 5' + hobo 2692 1 63.01 ACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAG:1 - chr3L 12976335 5' + invader4 69 2 66.44 GAATAAACTCGGCATTAACATAAAACGAAATTAATTTTAATAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATCATTG:1 - chr2R 16402942 5' - copia 4713 1 72.60 ATGAGCTCTTTATTTTTGGCATATCTTTATAAATAGAGCTGCGGACACTTTCATGCCTTTCGCAGGTTCAGGTTTTTCCATTTAAGCTGGGCTTACAGGTGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCA:1 - chr3R 29183074 5' + R1A1-element 5283 1 68.75 AAGCGGAACGAACAGATCGACAATATTAGAATTAGAAGTGCAGCGAGATAAGTACTACTGCTTTTAATCAGAAAACTACTTGCGGAGAATAAATAAAATATAAAAAAATCTATAAAATTCAAGAAAATAAATAATAAACATTAATA:1 + chr2L 7029240 5' + flea 4998 2 59.59 ACTTTCTCGCTAATTGGCAATGCATGTTCTACTTCTGTGAGCACGACTCACAGAAGCTCTCTTGTCAGCTCAGTAGCGGATCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGGATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATT:1 + chr3L 23608485 5' + Tabor 6881 2 56.85 ATGGAAATAAAGGAAGCGGCAGGAACAACGCGTCAAGTACGTGGTCTGGGATTCAAATTGGTTTGTTGAGGCATCCACCGTCTATATATATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2R 12543194 5' - roo 389 2 68.89 CACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATTTTAACGATTC:1 - chr2R 6526603 5' - jockey2 3320 1 53.42 GTTTGGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGCGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr3R 9352117 5' + Tirant 8115 2 77.68 ATTAATTCAAAGTGGTATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 - chrX 10645054 5' + jockey 84 1 70.55 ATTAACCGAAGTGGGTGCTGTGGGTCGTTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAG:1 + chr2R 13591475 5' - ZAM 33 2 61.54 AAAAGCGCGCATTGTTCTGATGATTTTCGCAATGCCAATTTCCATTTCCAACGAATGTAAATTTTCCGCCGCGGACTTTTCGCCTTTCAATTCAGCGTGAGTCAGGCCTCAATAAGGACCATTATTTGTTTACGAGGGCGCTG:1 + chr2L 12576884 5' - Fw2 241 1 77.62 ACATTTTTTCAATAAATTTAACACACTCAAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 18467163 5' + hobo 42 1 56.85 TCATTGTTTCGCGTTGAATACTGTGTATCAATTACCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTT:1 - chr2L 3294192 5' - hopper 1331 1 73.97 GTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAG:1 + chr3L 24934290 5' + HMS-Beagle2 6928 2 54.01 GCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGCCAGCACAGTTAATTGAATATTCTCGCCACCCAAAC:1 - chr2R 2308822 5' + McClintock 5991 2 69.85 CTAAAGAACTTGCACTTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCAC:1 - chr3R 3905857 5' + GATE 55 3 50.71 ATTTAAGAGCTTTAAGTGCTATTATCGCATTCGAGACAAATACCATAAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTTATTTTCTTATCCTTAATTATACAAATTCATTTTCTACTCCCTATCCAATGTTCAATATTTTGACT:1 - chr2R 21380686 5' - invader2 4695 1 54.79 GCGGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr2R 11133554 5' - roo 335 2 67.81 GCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3L 27391411 5' - 1360 3354 1 56.85 TCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTACATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr2R 10695782 5' + roo 64 2 61.27 ATAGGCTATGTGCATATTTCTCACCAAAGCAAAATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 + chr2R 2832897 5' - 1360 3327 1 62.76 TATCAGAAGAAAATCACACAATATCTGCAAAATGCCAACAAAAAAACATTAAAGGATAAACAGTTGTGAAACAGCAGCAGAACCCAGATTCTTAATCTGAACCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAAT:1 + chr2L 21739424 5' - INE-1 542 1 71.43 AAGCCTGCCTTGACAAAATTCAAAAGTATTGCAATAATAGTGTATTTTTTATGATACCAACAATTGAAAAGAAATCATAGCTTTCATTATCATTAAGTGTGCTTGTTAGGTATACATCAGTTGTTTTTTGTTTTACCAATTATTTA:1 + chr2R 8579050 5' + Tc1 1482 1 67.12 GTTCGATTGTTTCTGGTTGTGAGAAATGTGCAGGAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTA:1 - chr3R 10472836 5' - mdg1 7443 2 73.97 CAAAAAATAAATATCTTCAGAGTTTTTCTTGTTGAGCAACTTTTTCGAACCAAAGATGCATGAGGTGCAAATCGATTTGCCACACTGTTGAGAGCGGCAAAGAGAGAATGCTATACTCGATTTCCCAGACTATCAGATACCCGTTA:1 - chr3R 1649832 5' - INE-1 552 1 72.60 ACTGGCTGTTTATAAGCATTTAAGCGGCTTAACTCGCAGCCTCTGACTTATCGCATTGTCATCAATTTGTGAGGCGAATTGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTTCTAAACTCCCAAAATCGACTGACTTCAGTATAGTAAGAG:1 + chr2L 2123125 5' - Burdock 6254 2 51.37 GTTGTAAACAAAACAACTTTTGACCCTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr2R 5737110 5' + 1360 58 1 63.01 AGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAATTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGG:1 + chr3L 14553136 5' - roo 8977 2 81.51 ATCCTGTGCCTGCGACTCTGTGGTTGTTTGTATGTGTGCGAGCGAGCGAGCTAGCTCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chr3R 13628567 5' + hobo 66 1 66.44 CGTTTTTGACTATATAATGTTTATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTATGCACGTCGAGA:1 + chr2R 25049475 5' + INE-1 130 1 82.00 TAGACAAGTGGCCAAGCCAAGTGTAGATGGGAAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 + chr3R 13612828 5' + 412 88 2 76.03 GGACATTTCAATAACCCTGAACGTCAACACGAAAGCAGAAAGATTAAAAAATCATACGTTCTTGCATGCGAATTATAAACAAGGATATTCAAACTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACA:1 + chr2L 6839159 5' + rover 7111 2 71.43 ATGTTGTTGTTGGGATAACAGGGGAAGAAGCTGAATATGCGGCAGTCCGAAGCCATGCGTGCGCATTTGAACGGCGTTGCGGTGCTGTTATCCAAATGCTCTTACACAATTTAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAG:1 - chr2R 15568950 5' - Quasimodo 7255 2 68.49 GTTCTTAAACACTTTCTCTTGACGGTACTTGCGTTGAATATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCT:1 - chr3L 12976386 5' + invader4 2777 2 60.27 CATACAGAAAGAGATTAATTTATGGATGTTGGAAAAAAACCCAGAAATCTTGGAATTATACAACCCATTAAAACAAAATAAAACAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGCTACTCAGCTAGTGTGAATG:1 - chr2L 21762416 5' - INE-1 535 1 52.05 GATGAATAACGGCAACACAACTTTTGTTGTCCGAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3L 12867376 5' + roo 56 2 57.53 AAAGAAACTTAAATTGGTGGAATAATTTGAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTC:1 + chr2R 5917803 5' + I-element 5097 1 49.32 GTGTAGAAACGGTCTCTCGAAAGCGTGGGAGGTTAAAGGTATAGTGTCACCTGTTGCTAGATAGCCAGCAAATTAATTATATAAAGAATATATAATCATTTAAGTAATAATAAACAATAATATAAA:1 + chr2R 25024882 5' + flea 5002 2 68.25 GTACTACCATAATTGTGGCTTGGGCCAGGCTATGATCTCCATCCAAGCGGCATGGAAATAGTTTAAGGCAATCTCCAGACAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCC:1 + chr3R 19006736 5' + R1A1-element 4874 1 68.38 ATTTATTTTTTTTTTCTGCAACAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr2R 10695758 5' + roo 44 2 55.48 ACATATTTAATGATGCGGCCTACTTTGCAGCTGACAAAACTTGCAAAGTTGTCTGTTGCTTTTTAAAGGTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr3L 22978522 5' - 1360 3339 1 54.11 CATATATAGTTCACCCCAATGAAATGTTTGTGCACGTTAGCCGAACGAGACGCTTTTGATAGACTGTTCAAATTAGGGTCTGTAATGATGAACTCCAATTA:1 + chr3R 21001781 5' - 412 494 1 75.25 ATCAGGCTAGTGCTAGAAACCGGCAAAGGAATAAGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr2L 15834419 5' + hopper 10 2 75.20 GTGACAGCTTTCATCAAAGCGATTTGTTACACAGAATGGTCCAGCACATATGTATTGTATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCA:1 - chr2R 12787916 5' + 297 6638 2 64.38 TTCATTTTTGACATTTAAGCTGTACTATATTCGAAAACATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCA:1 + chr3L 12976260 5' - invader4 3008 2 72.60 AATCAATTTTTGTACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr3R 4581831 5' + 297 6621 2 57.53 AATCGCGATTCGAAGGGCGATCTGTGGTGGAAGAAGTACATCACTATCGTTCAGCTCATCCAGTTTGGAATCGTTCTGGGGCATATGGTCTGGTAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTTACGACGCTTAGTCGGAG:1 - chr3R 9819224 5' - Gypsy6A_LTR 211 1 62.50 ACATATGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGTGGTTGGAAGCTCTTGGATGCCAGACTTCCGCCACAAAAGCGGAACTAATAGTGCGTCTGCAGGCCATTTCCCCAGAAACGC:1 - chr3R 1048004 5' + invader3 432 1 80.36 AATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGC:1 + chr2L 23299988 5' + invader4 390 1 75.74 GTCGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGTTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAG:1 + chr2R 4260422 5' + micropia 5214 1 45.21 CTTCACATCCACACACCATTTTCCTTTTCTTTCCGAGTTGCGTTTGTGTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:1 - chr3R 15022159 5' + Tabor 6852 2 74.63 AACACATAGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTA:1 + chr3R 10030721 5' - BS 5011 1 72.60 GTAAGTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTT:1 + chr3R 3922951 5' + Cr1a 85 1 69.18 AAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAC:1 - chr2R 8157275 5' - Transpac 256 2 54.79 CACTGAAAAAAAATCGCATCTCTCACGGCGAACACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chrX 958024 5' - roo 8985 2 80.82 AAATATATATCTACTGATAATGAAGCTTGTGAAATCACCAGAAGAATGTTCGTTTTTGAGAGTTTTTTATTTGAAATATAAATTTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chrX 3197043 5' - mdg1 403 2 67.44 TTCAGCTCGCAGCCATTTGAAGTCCCTCCACTTGTCCGCGAATCCCCTCAAGCATTGCGCTTCCATGGCTTCTATATGTTTGCGCCAAGTGAGCCGCCTGTCCAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCTG:1 + chr2L 9860325 5' + Doc 4503 1 45.21 GAAGTGACGAAGCGAAACGGAAAGGCAACTCACCCGCCGTGAAATTTGAGTCCTGCGAAAGAAAAGATCAATTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGCATCTTAGAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAG:1 - chr2R 11085969 5' - roo 295 2 51.37 GGAGGCGAGCGAGCTCGAGGAGCGCGAACCGGAGCCGGAAACTGAAATAGACCACCAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCT:1 - chrX 16120023 5' + Stalker3T 113 1 53.68 AAGCATAACCACACGTCCATGTGAACAGCGAAAAGAGGCAAAATGGATTGCGGAATTCTCTGCGCTTTTTTCACGTACAAGCAGAGCTCATCCATGTAAACGGCCCAACGCCTACAGAGTCTCTCCGCTTTTACAGCTTTTTATAT:1 - chr3R 31801867 5' - 412 350 2 71.92 GCGATCCCTTGAGTGGTGGAGTCTCCTTGTTCTGGGCATCTGAAAACGTACACACATTGTCAGTGGGTCTGTGGTACCATTATTATAGCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGC:1 - chr3R 28889783 5' + flea 27 2 56.55 TTCCACACGGGAAGAGCGCCCAACAGCTTGTCGATATTCGTTGCCACGGTCACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 + chr2R 19726848 5' + 1360 34 1 55.45 GAGATCCGTTCAAGCAATGCGTCGTCCTCCCACCGATTGCTGTTCCAGACGTAAAGTCACCTCCCCAAGATCCCTGTGTGCCATCCCCCTGCGGACCCAACTCGATCTGAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTT:1 - chr2L 4517640 5' + F-element 4613 1 74.66 TATGATTCACTAACATGCTGAGGTGGTGACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 16181254 5' - roo 397 1 71.79 GAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chrX 12866497 5' - roo 9030 1 53.33 ATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGA:2 - chr2L 16089667 5' + 3S18 5842 2 67.12 TTTAGAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr2R 10695901 5' - roo 9037 1 60.27 TACGATTTTTATTTATTATAAAAAATTATTTGTATGAAACTCATGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCG:1 - chr2R 10078047 5' + jockey 4540 1 69.86 AGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACATGTCCCT:1 - chr2R 4261968 5' - invader4 2982 2 54.79 AATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 - chr2R 5237919 5' + Doc 59 1 50.00 GTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGA:1 - chr3R 9190576 5' - Tabor 412 2 71.32 TAACGGGGATCTGATAGTCGGGGTACTCAACTATAGCATAATCTCTTGTTTTTATGTATGTAAATTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chrX 15903346 5' - roo 9035 1 52.59 CTCTTGCAATTGAAGATCGGATACGAGGCTTTTTGGTTTAAAAATAGCCATCTTTATATTTATTTTTGGTCAATATGGCCCTTACCTGATACTCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3L 96631 5' + roo 29 2 67.81 GTGCTTGTTGCTGGCTTTTCCTTTTGTCGTGTTTTGATGGTGAAAACTTTTGTGCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAA:1 + chr3R 15675621 5' + hobo 2555 1 62.76 TACTAAGCCAAATATTTTTGCACAGCTTTGTTGTTTCATTTATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTT:1 - chr2L 1260042 5' + Burdock 32 2 58.90 ATCAAGTCAACGGCTTGCTGCTGCCACACAGACAGTAAACAACACATATATACCCCATTTATATTTTAGGTATAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACGTATTGTTAGTCTCTAAAGTAAAAGGAAAGATTCAATAAATAAGCAAA:1 - chr3R 9882754 5' + Doc3-element 4707 1 51.39 AAGCACTCTGAGCGTTCAGCAAAACGTGGAGTTCTTCCACTGACTCACGAACAACGAATGTATCGCTTTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr3R 4197328 5' + P-element 52 1 50.34 ATATAAGTTCTTGAATCAAAACAATCTCAATCTCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chrX 19536922 5' + roo 8753 2 80.82 TTTGAAAAGTTTCTGACATATTTCGCTCGACCCACTGTCCGAAAAAGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATA:1 + chr3R 17243543 5' - blood 7177 2 79.73 CCTCATTTCGCAGTTTTAGAAGAAGGCTAATTAGCTCGTTATCCATGAGGCTCTGGTTTTGAACGGAAATATCCGCTATGTGGGCTGCCATATATTCCAGCAACTACGTCAACATATCAGGGCAGCCCGACCTATTCCTGCAGCGC:1 - chr2R 15501928 5' + Chimpo 3884 1 64.38 AATGTGGGTAATAGAATAATATATATTTTTCCGAATATGTAGCTATAGCCTTAGTCAAACTGATAATCAGCAAAAGTTCCATCCAAACACGCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chr2L 19462093 5' + blood 166 2 55.45 TACGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATC:1 - chr2R 15829581 5' - invader4 3029 2 73.50 CGCCAAGAAGGCCACGCAACACACATAAGTGAGGGGATATCCTGAATCAACCATTATTTCATACTCTCAAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:1 + chr2L 4106278 5' + jockey 4813 1 54.79 GTCTATACTCACGAATCCAAATTATTGCACGTATAATTCCAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:1 - chr2L 2052757 5' + blood 7094 2 71.92 GTTTTGGTCCGTGCAGTGAGACAAGTGGAAAGCCGAATGAAACTCTAAGTGTGGATACCACTTATGATGGCCCACAGCTATTAAATTGTATTCCCAACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTACTTTCAAATAATAATAACGTTAAC:1 - chr3L 4744499 5' - 1360 309 1 63.01 ATGATACGATGTGACAAGCTCTACTATAATTTTGATCGCAGTCGTGTGTCCTGAATGAGTCTGATGGGGCTGGCGTGGGGGTTTAGGGGG:1 + chr3L 5977428 5' - gypsy5 6968 2 67.78 GGATGTGCCTCGGTCCGGAGTCTCGAGTTGGAAATGAGGAAAAGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATG:1 - chr3R 22671500 5' + FB 58 1 70.40 AATTTAATTATCCATTTACATTAAAAATGTCCAATTTACAAGTTAGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAA:1 - chr3R 11113256 5' + mdg1 77 2 74.66 AATCGCCGCGCACTTGTCGCCGACATTCAATTCGATTTTTAAAAATAAATACAAATCGAGCGCAAGCAATCTGATTCATATCTATAATAAAGTCGCATACACATAGATGGCGATTTCATTATTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3R 23216655 5' - transib2 2642 1 80.74 CGATGACGAAAGACTCTCCCCTAGCCACCGTTGAAGGCAACATTTGCTGATCGAATCAATTTGGAAATGGCTTTAAAAAAACACGCTTCCTTGGGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGG:1 - chr3L 10800994 5' - Doc3-element 422 1 76.80 GGGTTATAAAAAGTAATTTATACCCAACAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACAAAGTGTATAGTGCAGTTT:1 + chr2L 22954433 5' + Doc 97 1 76.03 CTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTT:1 - chr2R 5531217 5' + 1360 81 1 61.31 TAATTAATGAAATTTTTAGCATATGAAGTAGGTAAATTTAAAGAGACACTCAGAAAACTCAGACTCAGAAAACCAAAAAAAAAATTTTTTTAACCCTTATATACATATATCAATAGCCGAATCGATCTGGCCATATCCGTCTGTC:1 - chr2L 22044328 5' + INE-1 114 1 64.83 CTTTTTCACTGTTTTAGATTTTCGCACAGCGACATGAGGAGGATAATGGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3L 16562938 5' + roo 72 2 68.49 GGAACCGGTCCATAAGTCACTTTAATGGGCTTTCAATGAGGTGTGCCCCGGGAAAATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 30634885 5' - roo 399 1 79.56 GAATTTTACAAGACATTCATATAAAAAGGGAAAAATTACGGACATAGTCAGTTTTACTCGGCTATTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATT:1 - chr2R 12994947 5' + BS 5053 1 59.59 GTTTTAATTTAAATATTACGTTTTATGCTTTCTGTTGCATACTTTGGCGGGCTTAGCTTTTGTTGGGCCATAGGCAACGAATCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAA:1 - chr3R 22516078 5' + jockey 4576 1 66.40 GAATCGAAAGCAAACTTACGTGTATAACTTGTGTGTGAATGGGGCCCATTAAAAGTTAAATTTAATGTATTAATTTATTTTCTGTTTGGCCGCTAGTGTTGCTTTTTGTCCACTCTTGTGTGTGTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTT:1 - chrX 19840113 5' - gypsy7 5009 1 77.40 TTATGTTAATTTAAATTGTGCCCATAATAAGTAGTTATACTCGTAATTAGATGGAAAGCTAATTGATCCAGTATTCAATATTAGGTAGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGC:1 - chr2R 593909 5' + F-element 123 1 62.33 ATAACTCTTAAGTTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 + chr3R 5453639 5' - 412 7465 2 74.66 AAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 + chr3R 27768807 5' + 297 58 2 60.14 GTAACAGAAATTGTTGCCTACTTTTGTGGGCCGCTCAACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1 + chr2L 17210260 5' - jockey 4938 1 57.04 TATTTGTAGACACAAAATCAAGAGCCAAATTGGGGAATTTGATTCATTTGTCATTTATTTAAATTATCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACACTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr2L 9472125 5' - roo 400 1 74.05 AATAATTGGCTCTGAACAGCTTAAATTTTAGCATATGATTTTAATAATTGCCTTTACTTAAACTAAATAAATGCGAGCTAAGAAACTGCAACTGTTTACTCTGTTTTGCGAGACTGGCTCAGTAAAAAATTAAGCTGAAATTTATT:1 + chr2L 8912738 5' + transib3 2655 1 46.58 GCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 7035233 5' - roo 9019 2 54.11 AAAAGTATGCTGTGGAAAATAATGCTCCCTAAAAGCATGCAAAAAAATGGCTGTTAGCTTTTTTTTATTTATTTAATATTCCACACTAAATTCTTATTCGCATGGGAGATGAGTAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr3L 10028884 5' + jockey 28 1 68.61 ATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATATTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chr3L 14553197 5' + roo 8723 2 63.04 ATATCTAAGCCACGGTCCAAATAGAGAAAAGCTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chrX 12866414 5' + roo 8735 2 74.62 CAAGAAAAGAGATGGAGATAGAGGACGAAGTGTAAGAGGGACAGAAAGATGGAAGAGATGGTAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 - chr3R 19531327 5' - hobo 2899 1 53.49 CATTTCCATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGC:1 + chr2L 12349764 5' + F-element 100 1 59.57 GGCGGCGAAAAATGAATTTAATCGGTCTAGCATAATTTTGGTCAGTATTTGAATTTTCTTTGTTCGCATTCAGCGGAAACCATCCACAAGAAATATTATTTAGAATCCTGTCGTAACGAATATCTAATAAATATTGAAATATGTAA:1 + chr2R 14434449 5' + Penelope 156 1 82.88 CCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATATTGGGTAAACAAATGAGAAAAAATGTAAACATTTTTCAAAAGTGTGAGCGT:1 - 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chr3R 4528421 5' + F-element 42 1 55.86 GTAAATTTTCCAAGAGAGCGACTCGTGCCACTGGCATTGTCTATTTCAATTTCAATATTATGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 - chrX 4778274 5' - 412 7484 2 60.69 AAATAACAGGGTCAGGCATCCGAAGCTAAGCCAGATCCACTCCTGCTGCATGCTGCAATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 + chr3R 29418639 5' + mdg3 5289 2 56.16 AATAATGAGCCAAGTGTCGCTGGCAGAGCTTTAACAGATAATCGATGGGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTCCGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chrX 6481279 5' - hobo 2909 1 53.40 GACGAGCAAACGAACCTTTGCCCGCTTTTCCCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCCC:1 + chr2R 14041176 5' + Cr1a 299 1 82.43 GAATACAAAGTTGCAATCAGAAACAAAGCAAAATTAATGTAGTCACATATATTCTGGCAAATTGAAATATCACTTGGCCATAAATTGTTAAGGTCCAGCCACCCACACATACACACACACACACACACACACACACATACACACAT:1 - chr2R 20808978 5' + accord 191 2 79.45 GCGGTATTGATTAGAAGTTGCGACATTGCGAATTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chrX 1523708 5' + jockey 12 1 76.67 CACACAAACACACACACACACCAACAGCACTAAAGCACTAAAATCAGCGAAGAGTCTCCAGCGCACTATGGGGCATTCGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTA:1 - 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roo 8984 2 79.45 ATTTACGACTGTAACGACTTCATTTCCACAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCCAACTAATCTACCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTT:1 - chr2R 4029370 5' - 297 308 2 74.66 CATTTTAATTTCGTTTAATTATCATTAATAAAACGCGGATGAAAGTCGAGTGGCGCAGATCACAAATGGGTTTGCTTATAACTTCGAAGGGAAGGCAGCTCTGCGTGTCTGGATGATCCGAGAAGTT:1 + chrX 17514470 5' - Burdock 5962 1 66.14 TTCATTTTGTTTGCATTGTTTATTTAAATAAATCGTTTTTTGTTCGCTTGTGGTGTAATTAAAGTTTTGAAAATTGTCCTCCAGATTATAAATGGGATAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3L 14122552 5' + 1360 23 1 68.49 TTATACTATTATATTAATCAAAATTTTCTACGTCCAAATGCATAGAAAATTGATCATCGTGATCCGAATCCGAGTCGCTATGTAATATGTTCTACATTTGATGCATCTAAAAGATTGACGACTTCTTTCGGCAAAACGATTTTTTT:1 + chr2R 6173473 5' - transib3 2455 1 76.03 TCTTTTGTCCGATTCCTCTTATTTAATTCCTGAACGACTTTTCGCTGACAACCCTAAAAGATTGGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGGAGGGCACAAAAACCGCATTAATCGCGAGGCTGCAAGACATCC:1 + chr2L 7562669 5' + mdg3 395 1 78.03 GAGTTCCGTGAAATGTTGACCGTTCATTTTGAGCGCTTTTACTTTTGACTGGATAGCGAGGGTTCGTAATGAGTTCTATGGATTTTAGACTGGCAGTTAAATTGACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - 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INE-1 564 1 78.79 GTGACTGTATTATATATGTAGGGCACACATCAATGATTTACGCAAATTATCGCAATTAAGCGCAATATATTTAATCACAAAATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTT:1 - chr3L 11850942 5' - invader2 4772 1 57.24 GGAGTGGGAGGGAGTTGCAGAAATGTCGTTGATTCCGTGGTAGTTGTTTGGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGT:1 + chr3L 5493278 5' - I-element 143 1 65.75 GAGTGTCTATATTTTCCCAACGAAAAATCGTTGGTATTTGTGTTTATGTCTTTAATATCCTATTGAGCTTCCCATTTATGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTT:1 - chr3L 14278533 5' - Doc2-element 4379 1 54.81 AACTCAGACACCGAACAGTGGGTGTGGCCAAGGTTGTTTTATGTAAATATAGTGCACCACAGTCATTCGAAATCTCATGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 - chr3R 27768930 5' - 297 354 2 58.22 TTTGGTACTTCTCCATCGCTTTATGAACTTCATTCTCTACAATTCTCATAATGATTTTTGTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3L 20594122 5' - roo 349 2 57.53 ACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr2R 19554992 5' - pogo 2063 1 78.82 ATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAAT:1 - chr3L 23702280 5' + G4 38 1 55.48 GGCGGAAAGACTGGGATATCAGCGCAAGGGAATTGCGGATATCAAGCGGCATAGTTGGTTCGAAAGTCTCGACTGGCAGAGACTGAAACTAGCGTTCGCATTCACACTAGCTTAGTAACG:1 + chr2L 10154997 5' + INE-1 535 1 73.33 CTAAAACAACATATTCACTGTGGTCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAAAGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAGGATTAATAGACGAGTCG:1 + chrX 22633240 5' + INE-1 93 1 59.03 ATATACACGTATATAAAAAGTAGCAAAATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr3R 28728754 5' + jockey 70 1 57.34 ACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr2R 11609245 5' - roo 403 1 57.89 GGCCACGTCCGGAATTTGGTGGTCCAGAGTGTTGCCTGTAGATCACCTCGTCGCCCTCATCTGTATCCATTTGGTTACGGAAGTCTGTGGAAAAAGGAAGGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 + chr3R 23381277 5' - Tirant 372 2 72.73 CTGGTTGTGAGAAATGTGCAGGAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr3R 10472824 5' - mdg1 7440 2 70.07 CAGAGAGAGAAAGTAACGTCTGTTTGAAACGAGCGCGCCGTCGCGACTGTCTCAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTC:1 + chrX 8891756 5' - P-element 2818 1 38.36 TTTGAGATCATTTTAAGTAGCATTATATTTTTGACAGATCGTTTCCCTTTACAATTTACAGTTGCAGTCTGCTGAGAGTGAGAGCGGATAAGTGAGAGAGTGCATTCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chrX 14951251 5' - P-element 2874 1 75.34 TTTTAAGATTTTAAATATTACTATTAGTGTTACTAATACTATTTGATCAGCACATTTCCCTTCTCCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 20743964 5' - roo 352 2 58.22 CCTCAGCAGCCGTATCGGTTTTCCAAACGTATAGGCCGTGAATGTAAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCTTCAAACAGATGTGATCTACACTGACTTTAGTAAAGCATTTGACTCTGTTA:1 - chr2R 1983677 5' + Q-element 322 2 68.49 GCCTAAAGACCATCAAACTAATCGTTTCTATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTA:1 + chr2R 961100 5' - transib2 2694 1 78.08 GCAAAAATAAGCCCAAACTTGCCATGAAAATGGTCGCCAAGAAGGCCACGCAACACACATAAGTGAGGGGATATCCTGAATCAACCATTATTTCATACTCTCAAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAA:1 + chr2L 4106244 5' + jockey 4779 1 71.92 TATTAAATGGAGAAAATGGGAATTTGTTGTTTCGGCAGACATTGAAAAGATGTACCGACAAATTAAAATAGATAATAATGATCAAAAATATCAATATATTTTATGGAGAAAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTATGTGC:1 + chr3R 19445352 5' - 17.6 7117 2 76.03 ACGCAATGCCAAACTGTGTCTGTGCATCAATTAATTGTACTGTTCGGCTATTTATAGATTTTGCGGTAAATTCGCTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTG:2 - chr2R 21371559 5' - roo 9031 1 58.22 CTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCT:1 - chr3L 23702271 5' + G4 47 1 50.68 CTAGGCCTATTATAACCAAGTGTGACTGAACAGCGTAAAGGTTTGGACACATGCCCCCAGAAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCACTCCGCCCCAATTTTTTTTTTTATAAAAGTTAAAAGTTTCTAAAGTTAATTTTCAAT:1 - chr3L 17868625 5' + hopper2 14 1 65.75 TAAACGACCCTTAAAAGCGTGCTACGTTTTTTTTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3R 6515306 5' + jockey 64 1 58.22 TATTATGGGATAATCTGGAAATTCATTGTTAGAGGTTGGACGCAAATAGAGAATATACTCGTATGAGTTTTACAACATTATTCACTTATTATTAGAAAATAATAGAGATCCCTTGTGAGCGAATGCTGACATTCCGGCC:1 - chr2L 526479 5' + Tirant 8199 2 74.82 TTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTA:1 - chr3R 9160763 5' - copia 5056 2 60.27 AATATGTTGCCAATTTTCTGTTAGGTTTACGATGTTACCGTTAGCCTTTTAACCACGAAATTGAAAAAGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 6388850 5' + jockey 20 1 75.35 GAATAACTATCTCGGGACAGTGTAAGAACAACCTTTAAGAAATTGCATTATTTCGCAAACTTAAAGGATTTACTTTTTATGAATGATGAAAGCTGGATTTTGGCATTTGGCTGGATGACAAATGTATAATGTTCTTTATTTTAACA:1 + chr3R 9176787 5' - Circe 473 1 71.92 ATATGTCATAATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAA:1 + chr2R 13644413 5' - Burdock 6331 2 61.64 GATAATGAAGCTTGTGAAATCACCAGAAGAATGTTCGTTTTTGAGAGTTTTTTATTTGAAATATAAATTTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chrX 3197058 5' - mdg1 7409 2 52.05 AGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 - 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hopper 1339 1 69.86 ACTTAACTTATTAAAACTATACTATGTTGCTCTACATTGCAATCGGTTTCTCTCGATTTTCTTACAAGTATAAATTTAAATATTTATTTACAAACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCG:1 + chr3R 15717269 5' + mdg3 5203 1 65.47 GTATTAGACCTCAAGCGGAATTTCCTTTCGTTTGATTGTAAGTTGTGGGAACGTGCAACAGCATGTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 + chr3R 17605591 5' - Tabor 465 2 71.23 GCTTATGATTTGCCTTCGGTTTTTATTTCCGCGTGTTCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAC:1 + chr2L 12319264 5' - copia 5041 2 76.39 ATGGGTGATGAGTCAACGCTATCTTCTGCAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTT:1 + chr3L 4129767 5' - I-element 5146 1 78.68 AGCAAACAGAACAAAAGTCTGCACAAAAACCCTAGCCCAACGACATGCCCTAATTTGGCAGTAATATCAATCATTGCATACATTAAGGCGCATCCGCTGATTGCACGCCAGGTTGTGGAAGTGCGTATTATTATTATTATTGTGAT:1 - chr3R 28666171 5' - mdg1 7070 2 75.34 GTCAGGGTTTAGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chr2R 11489162 5' - mdg1 7411 2 52.74 ATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTTATGTCTA:1 - chr2R 4261943 5' - invader4 2957 2 70.55 AATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr2L 22016003 5' + Tirant 39 2 55.37 CAGTGGAAATTGCGTTACGCCCACTTCAAATTCAGACGGACGGAAATCAGACAAAAGCCTAGCATACTTTACCCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTAC:1 - chr3R 28640719 5' - copia 98 2 53.42 CAGGATGCCAAACACAATGGCCAGAATCCACATGGCCAGGTAGGGCAGCGAGGATATTATGCCATTTGTGCGAATGTTCACATTGAGAACTCTGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTACAGACTTACAATTTTG:1 - chrX 4785205 5' + roo 8687 2 69.72 AGGTTAGGTTCTCCTAAAGGAAAGAATATTCCTGTCAAATGATTGCGATGTGTTCGGCTCTACCAATTTACGTAAATGTAAAATTTATTAGTGTCCTGTTTTTAATAGCTGAATTATTTAACTTTATTTTATTTTTATGATGTTTT:2 - chr3L 14603201 5' - jockey 4998 1 55.48 ATAGAAGTATTTGTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 + chr3R 13122508 5' + blood 75 2 67.81 ATAGAAAATCAGCTCATTTGCACATTGGTCGTAAGCTCTGACGAAGTCTGACTTCATAGTCTAGATGTTGTGGGTCACAGAAAATTAAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATAT:1 - chr2R 12265266 5' + jockey 4557 1 60.27 GTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1 + chr2R 22723015 5' + 3S18 5818 2 52.41 GACATCGTGGCATGCAAATGAACCAGCGAACCCCCGCATCCCACATACTATGCCATAAAACCAACGCAGGACATCGGCCGGATTTTTAATGAAACACAATAATGTTACTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCG:1 + chr3L 11745222 5' - G2 2798 1 76.03 CTCTAAATTTCTCTTTCTCTAAATATGGTTATATATATATACATATGTTTTCTTTATATACCCCTATCACACCGAACGCATTTCAGAAGACATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCT:1 + chr2R 5260608 5' - 1360 3321 1 60.96 GTGCCATTCAAAAAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 + chr3L 9909679 5' - Transpac 251 2 54.79 AATAGAAGAAATTAAAAATAAGAGAGAATAGAAATATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1 + chr3R 2527710 5' - INE-1 546 1 47.59 CTCATTTCACAATTTGTATCAAAGATTCTCCTACTTACCTCCCTATTTTTACTTTTAGAACAATATATAATATTTCAATTCAAGCACAAAAAATAATATTCATGTATAATATTCATTCATATATTCATGATCAGGATCCATAGCCG:1 - chr4 269497 5' + INE-1 88 1 57.53 AATGTTTGATAAGCTGCCACGTTAATTAAATGCAATCATTTTGGAAACATACTTATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chrX 12138879 5' - roo 402 1 78.08 ATAACCAGCCGAGCCGAAACTAAGTATAAAAATAGATATTCAGAAACCCGAAGAATAAAGTCTACGCAAGTTCGTTCTAAAGCAATACCATGCCGACTCTAACGTCTAC:1 + chrX 23067490 5' + INE-1 214 1 41.28 AATATTCGACTAGCTAATGGGTTTTATACTAAGCCAAATATTTTTGCACAGCTTTGTTGTTTCATTTATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGCA:1 - chr2L 1260068 5' + Burdock 6 2 76.71 GATTCTTTTCTTAACTGCTATTAAGAGACTTTAAAAAATTATACAATAATTTCCAAATGTTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 + chr3R 13631350 5' + 297 6640 2 63.70 ACTACACTGTGACTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chr2R 19555044 5' - pogo 2064 1 54.41 AGGTTGTTTACGATGGTAAATATTTATTCATTCAATGTTATATTGTCTTCGTGAATAGACATAGATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCG:1 - 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chr2R 10781281 5' + FB 10 1 78.77 AATGATGAGTTATGGGTTCAGACCTCCTTCGGAGACGAGCGGACCCATCATCATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCT:1 + chr2R 8641509 5' - diver 154 2 63.70 TATGGATTTTGAAGACCATGAGAATTAACTTCATATTTTATAAAGCTCGATTTTTGCGTTTGTCAATATATTTCCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAA:2 + chr3L 9497733 5' + jockey 4816 1 50.00 CAATAAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGG:1 - chr2R 1874621 5' - accord 25 2 61.42 TTGCAAGGGGCTAGGTTCATCAGCACCAAGATCTGGTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTAAT:1 + chr3R 24122625 5' - roo 9039 1 60.27 AAACTTAGGAAGAGGGGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chrX 5858957 5' + hobo 55 1 75.73 ATTCTATGAATTCAACAATGAAAGCTTAGGAACATAATGTAAAAAGAACTAGAAATAAAAGCAGCTTATGACGAAAAAGAAAAACTTAATGGACAATAAAACGAAAGCAACAAAAATACCAACCAACAAGCTAAGCAAAAAAAAAA:1 + chrX 8672623 5' + Porto1 157 1 76.03 CCATTTCGGTCTAGCCATCAACAGTGTTGGCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATACCCAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 + chrX 12191519 5' + pogo 52 1 56.85 CACTGGGCCATGGAATCAGCGATTCCATGCGGAGCCACGCGATAACACCGAATCACGACCCATACGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATT:1 - chr2R 15829643 5' - invader4 310 2 72.66 GACCCTTAAAAGCGTGCTACGTTTTTTTTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:2 + chr3R 6515311 5' + jockey 69 1 61.64 ATGTCTTACTGGCCCCTTTGCCACTTGCCTCCGTACACATTCCCATAACATCCTCCTGCTCTCCACAGTTATTAACTATTCATAACTTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATA:1 - chr2L 2272584 5' + copia 34 2 59.59 AATCGGCTATCAACAATGGACTCTGGGATATGTGAAGAGGGGCGGGGCATGCTACAATGCAACCCATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1 + chr3R 28627589 5' - copia 5068 2 55.48 CCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 - chr2L 22016007 5' + Tirant 8148 2 54.33 GCCGTTTTTCCATTTCGGTCTAGCCATCAACAGTGTTGGCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chrX 12191510 5' - pogo 2086 1 72.00 GGGCTCAAACGAACAATCAAAGGGACGACAACAGAAATGCGTTGGCAGATTCGAAAAAAAAGTCCCAAACTCACCAGCGCACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAA:1 - chr3R 20099040 5' + Quasimodo 97 2 56.85 GCAATTAAAATATTTCGTGTGTTAAATTCAAACAAGAAATAGTAAATGAAAGGCGATAAATGAAGAAAACAATCATAACAATATAACGGTTGAATATTTAACATGCATTGGTTTTGAACTATGCAGCC:1 + chr3L 10395048 5' - 1360 3350 1 78.91 CAGATTAATGGACAGTTGCCAGTAAATAATTTTTGTGCAATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAGTATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3R 5453744 5' + 412 37 2 60.27 TATACATAAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGT:1 + chr2L 13250358 5' - opus 433 2 72.54 CCTACATCCACATCCGATCCAGCTGGCACACTGTGAACGTAAACCCGCTCTGCAAATAGAAAAAGTTGGCATTGTGAAATTGTAGTTGGGTGAATGCTCTCAATATTGGAATAAAATGAAGCCAAAAAAAAAATGTAGTTTGAGTT:1 - chr2R 16650840 5' + invader5 3616 1 63.01 AGAAAAGCTCACCGGCAATTTGGCTCTCCCATTTTGGCGAACCAATAGCCAGATAAATCTCTATTTCTCACGACGAAGAGAAGAGGCGCCATTCGAGCCAAGTCAATCTCAATTAAGCCTAGAGAACAAATTACGGCTGTATAAAG:1 + chr3R 16076210 5' + G3 4157 1 71.92 AAATAGAACATTTTTTGGTAGCTCTACAAAACTGAGTTATGTGCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACC:1 - chr2L 5601636 5' + mdg3 5330 2 68.49 CATGGTCATTACAAAATATCGCTCGATGTGTTTTCGGTTGCTTGTGTGGGAGTTTTTTTTTTTGACGGTACCGCGTGCCAGTTTTCGGGGGTTTTAGGGCGT:1 - chr2R 5995370 5' - INE-1 345 1 74.51 TATCATTCAAAATAGTAAATATGCGAAAGCAAAAAAAACTTAAAATACCTTAAAGGTGAAAAATATATTTTAGGAAAACTACAAAAAAAATTAAAAAAATTT:1 - chrX 10244384 5' + HB 322 1 79.41 ACTATCATAACATATTATTGAGAATTCGTTTTCTCTTGACCTTCGTTAAGAATCTCTCTCCCGACGTTCTCCATTTCGTCAGGTTCTCACTCCGAATTAGCGATAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 + chr2R 7665699 5' + Transpac 4935 2 75.34 CTTGGAAGTGGACACCAGCGATCAGCAGGAGATTGGCGACACCATCGAGTACTTGGAGGATGTAAGTCTTCCACGTTGCTGTCCACGCACGGCTAGTGTGATGTTAAAACAACTGAAGATTTAGGATGATTATGTTGGGAAGATG:1 + chr3R 6457762 5' - gypsy3 258 2 58.62 TTTATTAGTTTGTTGCAGCATTAACACGCATAAATATTTATGTGAGGCGGTGTGGAGTTCCAAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 29645816 5' + jockey 18 1 57.78 AGAGATAAATAAATACAATAAGCAACATATACACGTATATAAAAAGTAGCAAAATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr3R 28728780 5' + jockey 25 1 74.40 CTGCTCAAAAATCGAGCTTCGAGCTCCTTTTGCATCACCCAAAAATCAAAAATCACCAAACAAAAAACAAATGATAGCAAAACAAAATACGAACAAGCAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAATGTTTAAGA:1 + chr3R 18007590 5' + mdg3 5112 1 77.70 CAACACCAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTGTGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr3L 15026795 5' - opus 7460 2 52.74 TTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chrX 4778150 5' + 412 7088 2 60.27 ACGGCACCTAAAACATTTTGCAGCAAATTTCTGGGCAAAAGCATAAGCATAAGCTGCACTTTCACCAAAAATTATGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr2R 11057237 5' + pogo 10 1 69.91 CAACTGGGCTGCGTGTCAATATATCACGATTATCTCAGTCGCTTGTGTTTGTTACCCAGCAGGCGGTCACTTCTTAACCATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr2L 16458704 5' - roo 9031 1 56.16 AGAATATATATATATATAGTAACATGTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCT:1 - chrX 670524 5' + diver 5942 2 72.82 AACTCGTGAAAGGACATGGATTAACAACTAAGGTTTGTAGTAGGGATTTAACAATATACATATATTTAAGTATATTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCTGGCTGACATATA:1 - chr3L 2878543 5' - 412 445 2 51.37 GCCCAGTTTCCCACATGCCCAAAAATATGCAACATTTTTTATATGTTTCTGCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCCATGCTGACCCTCGG:1 + chr3R 8707359 5' + jockey 4711 1 42.47 GTGTGTGTTCAAAGAAAGTCCATCCACCGGGCTTAAGGAATTTGCTCGCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 905908 5' + 412 7090 2 57.53 AAAAAAATGTAATTGTCTAGCTATTTTTAAAATATGTAATGGTTATGGGCTGACCTTTTCTAATATTCACGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3L 4187175 5' + pogo 50 1 53.42 ATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGCCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTACGAACAATTAAATAAA:1 + chrX 4778163 5' + 412 20 2 61.86 AAAATGTTAAATTAAATTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 18487606 5' + jockey2 3407 1 89.66 AATCGGGAAAACTGAAACCCCAGTGCACCGTTTGTCATTTGTTGTGTTCACACATGAACACGAAGATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 7953725 5' + roo 48 2 67.26 GCAGCAGTCAGTGACATAAGTGGGCGTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chrX 6138735 5' + opus 140 4 61.29 AGCTATTTATCCGGATTTTAAAACAATGATAGAATTAAAAAAAAAAATTGTTCCTAAAAGAAGACTTAAAACTCTGCGTTGCCGACGTATATTTTTATTTAAGGAAAAAAAAAA:1 - chrX 20059328 5' + transib2 2633 1 71.05 GTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3R 24122660 5' - roo 340 2 65.07 CAAATAAAGACGGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTTTGTGTATTTGTATATTTATATTTAT:1 - chr2R 2879475 5' - Stalker 87 4 54.11 AGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGAGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGACCTGTATGGGCTCCGTGGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATA:1 - chr3L 16047626 5' + Cr1a 464 1 55.05 CTTATCTGAGGGCTCACCTGACGGATGGCCCAGGAAACAGGGACTCCCGCTGCGGTGCCAAAATTTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTT:1 - chr3L 14586382 5' - Stalker4 7120 6 64.00 GGAGACGTGCCAAGGAAGCCCTAACGCACGTCGAGCAGCACTTGTTTGAATAGTTTTCAGCCTCTCCAGTTGGTGTTTGGAGGCTGTTCCCCATATTTGGATGG:1 + chr3L 24120300 5' - G5A 2438 1 77.88 CTGTTTGGGATTGTAGTCTATATAGCCATATACATACATAAACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1 + chrX 16828949 5' + Quasimodo 70 2 74.66 GCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACACTGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCA:1 - chr3R 11750247 5' + Tabor 87 2 74.66 CAGCGTGACGTATTGATTTTCGGTGGCTCTCAAGTGCGTTAATCTTGTGGTCATTTGGCTGCTTCGTATTAACCTCTGAGATTAGCTGGCATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 - chr3R 19859734 5' + opus 20 2 70.71 AAACACGATATTTTGAATGTGATATGGTACTTTTCGTCTTTTGGGAATATTGAATATTATAATCCTGAAAAATAGCTTTTAGATATCCTCTTATCAACTGCTTGTGCTGAATGTGCTTAAAAAGAAAATACTTTTTAAATCCTAAT:1 - chr3L 14473695 5' + transib4 2557 1 52.74 AAAGTAAAAGAAATAAATAAATTTGCTTCCGCATCAGGAACTTGTTTGTGTTAAAGGGCGGCTTATAATACAAAACAAACCGTATATTACCTTCTTATTCCAGTAGACTACTTTTATTTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGA:1 - chr3R 14576293 5' + Cr1a 4003 1 52.74 CATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chrX 4778162 5' + 412 7100 2 52.05 AGTGCATGATTCAGAGTGTAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chr2L 12414888 5' + pogo 61 1 61.38 GCGAAAAAAATGGACAAACAAATTCTTAGTGGCGGCAACGCGTCGTATGCGCAATTTTCCCCTATGCGAAACCGTAAATCATTGCGACCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 - chr2L 17240342 5' + hopper 5 2 78.99 ATCAGTTGGCAGCCGCCCGACGGCCAGCAAAGGGGGCATGGTCGTTGCAGAATCGAGCCATGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATT:1 - chrX 8755130 5' + transib2 53 1 59.12 AAATTCACCGCGAACCACACAAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3R 24476399 5' + 412 23 2 65.41 GAAAGTGCCTACTGCATACCATATGCTTAATATAAAGTAAATCTAATTTATTACCCAAATATATTAAGATATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 + chr3R 25768764 5' - copia 5073 2 54.11 GAGGGGAGCAATGCCTCTGTGATCAGCCATGAATTGATTTGCTGTATGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACG:1 - chr2R 4362606 5' + gypsy 7030 2 63.16 AGCACTAAAGCACTAAAATCAGCGAAGAGTCTCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATG:1 + chr3L 7093005 5' - hopper2 1521 2 75.34 GTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTC:1 + chr2R 22723015 5' + 3S18 5814 2 51.06 AGCTACGGCCCATCTATAACTCTTGCGGTATACCGATAGCGCTGCCAACTTGCCGCAGTGGGTGATCTTGAGGGGCTGCCAGATCAACGGTGAGATCAGTG:1 - chr3L 27382320 5' + Rt1b 46 1 43.56 AATATTCATAACTTAAGTAATCGATTTAGGTAACTATTAAAAACAAGAGAGAATAGTAGAGTTCTCCGATTATCAGATACCCGTTTCTCAGCTAGTGAAAATGAGAAAGCGAAATTTCATAAATTTTCTGGGATTTCGATAGATAT:1 - chr3L 23720896 5' - INE-1 498 1 73.97 GTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTG:1 + chr3R 21276536 5' + BS 5059 1 59.31 AAGAGTAATCCCTAAAATTGACCTATAATTTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGCGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 + chr2L 3762947 5' + jockey 95 1 75.52 AGTAGTATTTCCGGTCTGTTCGGCTTAAAATCGGGTGCATGTGACATTCGTTCACAGGATCGCATGTTTAATTATTGAGAGACTGTTAGCACACGAGGACGTG:1 + chrX 7402525 5' + invader1 3569 1 63.11 CAATAATAAATAAATTAACTTAATATGAAATAGTTAAACGACAGTGTTGAAACTAGTAATTAAGATATGATATTAATACTAAAGCTTATCAAATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr2R 16441773 5' + I-element 28 1 66.44 GAAAAACCAAAAATTTAGAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:2 - chr2R 10695914 5' - roo 9051 2 69.66 TCGGTAAATAGATGAAAAATATATAAAAATCTATAACACTTTTCGTTGTGCAGTTATATAGATGATCGAAAATCTGAGCTAGATAAAGTGGGAAAAGATCCGAAAGTATTAATTGGCTTCCTCCGATTTTTGTATTCTAGCTCCTT:1 + chr3R 30508234 5' + gypsy12 10031 2 69.18 ACTCCATCCAGGTACAGAAGCAAACAAGAATTAAACGACCCTTAAAAGCGTGCTACGTTTTTTTTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3R 6515275 5' + jockey 14 1 78.12 GGAGAAGTCGGTTCTTTGCATAAACAAATTGCCAAACGGAACTCGAATTGATGACACATAAAAGCGAAGTAAGAGCAAAGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGG:1 - chrX 2799225 5' + R1A1-element 5013 1 65.83 ATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGACGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 - chr3L 9909779 5' + Transpac 4984 2 57.53 CTGCAAACTTCTGTCACTTCCTCCATATCTTCAATCAATTTTTGTACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chr3R 4581799 5' + 297 6589 2 79.45 AGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTG:1 + chr3L 24152439 5' + HMS-Beagle2 59 2 58.22 AATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCA:1 + chr3L 24934299 5' + HMS-Beagle2 63 2 63.01 GGGGCATTTGGGGCCAAGCACCTGTGGTTCACATATGCAGCAGCCCAGGGGTCCAAAAAACAATAGTTATTATAACCATCCAGTCCATCAAGGTTGAACCAAAGACTCCAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 - chr2L 1624400 5' + 1360 25 1 56.55 GGAGTGTGACCTGTGTGCATGTGCATGTTGTCATGTGCTTGTGTGCGCGCGAGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 + chr2R 6632527 5' + P-element 12 1 74.62 GAAAAACAAAAAACCGAAGAAAAAGCAGATCTTAAAAAATAATAAAACAAAACAAAGGCAGGGCGAACTAAGCAAAGATGGCAATAAAAAGATTTTATAATAGCCGTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAAT:1 - chr3R 14062716 5' - G2 3032 2 67.59 CATGTGGCGAAATTGTCTTCGCCCAAGGGCTCTACTAGCACCATACATTATACAACGTTCGTTAAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGGACATATATTCGTCTGTCCGTATGAATATGCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTT:1 - chr2L 21580583 5' - INE-1 166 1 63.19 TTTCAATATAGAATTCAATTACACATATATTAATTGATTAATTAACAAGCTAAAAATAGTATCTGTTTATATTCAAGTGCAAGAAAAGAAAATAAAAAATATTAACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAAC:1 + chrX 6533787 5' - opus 171 4 71.92 ACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCT:1 + chr2R 22723011 5' + 3S18 5815 2 50.00 CATAACTTCATTCTTAAGCCGTACCCGAGTGTTTTTGAATTAATATAATGTGTATAATATATACCAATTGGCAGACGCTATCAGACCAAAACCACAATGACATCTGTTCTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 - chr3R 24509202 5' + FB 9 1 74.65 GAATTATTTATTAGGCATGTGTTCGTTCTCCTGTTTTTGCACTAAGTGTCATTTTGTTGCTTCAGCCCTGTTGACGTGTCTGCGTTTGATTAACTTGTAGTTAGATTTTTTTAGTTTGTTTTGCACTTTTTTTTTTGTTCGTGGGT:1 + chr3R 20374128 5' - gypsy2 393 1 69.86 TGAGCAGGGGCGTATGCATAGAAAAAAAAAGATGTTACGAGTATCTTTTTTATTTTGCACGGTATTTTAGGCAATATATCATCAAAAATATATTCATCAATATTCATCAAAAATTGAATAAATGTATAAAGGTTTTTTTTTTTGTT:1 + chrX 4014732 5' + Tc1 1468 1 79.45 GTTCGGACTTACTGCGTTGTTGATGAGTAATATTTCTTTCAGCGAGCTGTAGAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTT:1 - chr2R 4313068 5' - gypsy 416 2 43.15 GCAGAATGAGAAACCAATTTGTGTGGAAAACACAAAGGCAACAACAACCACGGCGGTGAAATTAAATTGGCCAAAGGGTTTCAGAGGGTCCACAAATTATAATTGTAATTATTAAAGGTGTCAGAATATGTAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr3R 18879680 5' + TART-B 10630 1 54.11 CAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAG:1 - chr3R 11547812 5' + G2 302 1 65.28 ACCAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTGTGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 - chr3L 15026791 5' - opus 7457 2 55.17 GTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTT:1 + chr3R 29487012 5' - flea 4952 1 62.33 AACATGAAATACTGCACCACATATGAGTTTACGTGTGTAAATAATGTAGTATGTGCCCATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 + chr3L 16358674 5' + 412 81 2 71.92 CGGGTTAGTAACAAAATAGAAAAAATGTCTAAGTGAAATATTACTTAAATTTTTTCAGTTCAAGAACTCCAGCTTAAAAATATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr3L 18729814 5' - mdg1 387 2 46.10 GCCAGACACAGGATACGCTAAGCAGACTGGAGCAGAATCTGCAGCGCTTCGAGGACGAACGACGGCGTTTCGAGGCCGAGAAGCGGCTCTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTT:1 + chr2R 21098518 5' - Stalker4 7313 4 66.67 TTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr2L 2276788 5' + F-element 36 1 49.52 GCCGCCAGCGATAATTATGCGAATTTATTTCAAAATGTATTAAATGCGCGATGACACAAATTCTTTCTAGGTCAAAACCAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGGCAGCAT:1 - chr2R 11112498 5' - jockey 4719 1 54.79 AAAAAGGAATGCTCTGAAATTTATCACGATTTTATTTGACCAACAGCAGCCGGCATTTAAAAAGGTCATAATGTGCATTTCATTACAAGCCACACACCAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 - chr2L 8169049 5' + FB 22 1 65.75 CTAACTTCTATTATAATACGCAGATTGGGCTCCACAAGTGTAGTCATGTAAATGGGTGTGTATTATCAGCGGTCATTGTTTCGCGTTGAATACTGTGTATCAATTACCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 - chr2L 3294264 5' + hopper 11 2 75.17 CAATTCATGGGAAATTAATGTTATTAATTTATTAGCTTCTTCTACCGAATCAGCTCCAGTCAGTAGGTCATCCATATATGTTAAATTAACTTATGCGGGCTGTATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTAT:1 - chr3R 19445667 5' + hopper 1335 1 58.21 CACAGAAACTTGGTCCGCAGACTTCGTCCCCAGTCCGAGTCCGCCTTTCCGCCGACTCGCAGACTCAAGGACACAAGTGGTCGTAAAGTCAAAGGCAAAGAGCGTTCAAGTGTAACTGTATATATATATATATAT:1 + chr2R 8426181 5' + 1731 97 1 78.52 ATTAAAATACATTTTATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATA:1 + chr3L 24934254 5' + HMS-Beagle2 6899 2 74.31 CTTATGATTTGCCTTCGGTTTTTATTTCCGCGTGTTTTTTTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATAT:1 + chr2L 12319265 5' - copia 196 2 71.43 ACACCCATACCACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTCTGATCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGCATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAA:1 - chr3R 20175778 5' - hopper 1336 1 69.86 GGTTTATTTTGGTATTTCGCATTTGGTCCTTTTTCCTGCTCGCAGCTCACAGTTCACAGCTCGTGTTGACAGTTTTTTTTCGCTTTTTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 - chrX 20066266 5' - opus 494 2 79.03 AATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTG:1 - chr3R 13349143 5' + BS 5043 1 50.68 TTAATTACAAAATAAAGTGCACTTTAAGATTACATTCAAATGAACAAGAATTAAATTACCTACAACACAGTATATACATATGTAGTATGTATATTATAGTGAAGTTATGTGATTTTTTCAAAATCACAAACACATAGTACAAGCCA:1 + chrX 18363070 5' + Transib-N1_DM 222 1 61.64 CAGGAAACACGTGACGCTGCATAGCATCCAACATGCCCCTCCCCTTCTGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 16562865 5' - roo 401 1 33.33 GCATAATTGATTTTTTCGCGGCGATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 + chr2R 11763561 5' + Tabor 40 2 58.22 GATTCATTGAAACCTGAAGCCAGAGTGTAAAGTCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3R 23765394 5' - roo 329 2 78.40 GAAAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAGAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGACAAAACAAACAAAACAAAAAACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGCAA:3 + chr2R 23443905 5' - Cr1a 191 1 77.40 GAAAATTAAATTCCGCATTGGAATTAATTCAAAGTGGTATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chrX 10645076 5' + jockey 62 1 55.48 CATATCAGGAAAACGTAAGAGCTTTATAAAGGCAATAAAGCGCCTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAA:1 + chr3R 13176305 5' - Burdock 234 2 69.86 AGCGTTCTTCATGAAGACAGGACCGCTAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATA:1 - chr2R 5321220 5' - INE-1 503 1 60.90 AACAAAAAGTTTACATATCCTTACTTACTGGGAAGTCCCTATTCTCTAGCCCTACTCAACTAACAACACCTTCACATAGTTTTTTTTGACATTTAAAAACAAAATGAAATAGAATAACATTATGGAGGGCAAATCCAGAACCC:1 + chr3R 1137120 5' - Rt1c 5358 1 54.55 CACCTCTCTCTCTTTAGCTATTGCGTTTTAGATTATTGCTCAGCACGTTTTTGCGTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chrX 4701131 5' - P-element 2838 1 46.15 ACATAAAAAATCAACATGGGTATTAAGTTACCATATAGCAGATATAGTGGTTTTCTTTTTTAAGGATGTTTTCACATAGAAAGGCTTCCGTTTTAGTAAAAACGACTGGACAACCACCCTAACCATCTGGCTATTAACCTCTTGGA:1 + chr3R 12724542 5' + G-element 4124 1 67.12 GGGCTACTCTGCCAGAGCGGGATGGCGAGACGGCAAGAGCCAGAGACGGTTGGTTGGCTAAAAAAAACGCATGCACTAAATTATGTGCACCGTGGAACCGAGCTCATCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGGGCG:1 - chr2R 23626421 5' + G6 421 1 69.86 CACAACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chr3R 18815979 5' + hobo 57 1 55.48 AAAAGTCGGAAACACTTTGTCGGAGGCTTGGCTTGTTTTTTTGGGGGTTTGGTTTTGGTTTTGGTTTGATTTGAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 7515627 5' + roo 8680 2 57.02 AAGGAGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3R 16181149 5' + roo 77 2 71.23 ACTCGGAATTAATACGATTTGTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1 + chr2R 23000045 5' - mdg1 7394 2 62.33 GGTTGGGGGTTAGACTATGGCGCTGCCTTCAGTCCTTGGAGTCCTCCGATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGAT:1 + chr2L 22747273 5' + transib2 74 1 68.49 GCATTGGCAGATGAACAGAACGCCTTGGGACTAGTGGTCCATTGCCATTGGTTTACGCACGTTGCCAATGGTTTAAAGTTGAAAGGTGTATCTGAATCTGCCGTCAGGTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 - chr2R 12240231 5' + copia 15 2 73.29 CAAAAATTGCATTTTCATTTTGCAAAAGCCTGGAAACCAGGGTTTTAACAGCTCCCATGTGATTGTGTGTACGTGTGTAATTTTCCAGACCGTTGTCATTGCCAATTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr2R 6632705 5' - P-element 2873 1 76.03 ACAACTTTTGTTGTCCGAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3L 12867360 5' + roo 72 2 68.49 AAATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATT:1 + chr3R 9190450 5' + Tabor 27 2 43.84 AGCACTTCTATTAATATCTAGCCATTATTCCAGTAAATGAATCAGATTTTTAGCTAATAATTTTTTAACTATTTTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr3L 13374095 5' + pogo 43 1 51.37 ATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGATCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCC:1 - chr3L 25232911 5' + GATE 8302 2 58.52 AAGATCGATAAGATTGATTGGCAAATACATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGG:1 - chrX 4300145 5' + opus 7071 4 80.00 GCACCGTCCGTTTCAAAGTACACAATTTTCTTCACGTTTAGTGTTAAAGGAATAAATATAGACAAATGAATTTTAAAAAATTATACTTTAAAAAATAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCT:1 - chr2R 24775435 5' + roo 171 2 67.12 GTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr2R 2427611 5' + Doc 53 1 62.50 AATTGAAAACCAAGCTTATGACGAACGTGGATAGTGCGTCCTAAGTCCCGAGTCCTTAGTTCTGAGTCCTGAGTTCTGGAAAGGTGAAGGAAACTTAAATAAAAGTCGGCCAGAAGTTGTCGGAATACAAAGTACTCCTCTACAAT:1 - chr3R 20353079 5' + Doc2-element 4323 1 76.03 ACAAAGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 - chr2R 19553285 5' - mdg1 373 2 52.52 GAATATGATGCGGATGATCTCAAGCGATATGGAATGAGGCTGGCGCGTTGTGAAGCGATTTTTCAGATGTCAACTCTGCTGCTGGCGTCGTCAGGAGGATGATTTAATTTAAAATTTAAAATT:1 + chr3R 10051285 5' - 1360 3041 1 82.11 GACAAATCCAAGTGGGTCTTGATTTATGGGATTTGCAAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chrX 5150404 5' - roo 9034 1 59.59 ATAAGACCCCAATATATGCAAGAGTTGGACTACAATTCGAAGTTAAATTGTTTAAAAACATCTTATTCCAGTAAGCAATGTTCTCATGCCCGCCTCGCATTACGCTGACCCTTGCACATCGCTTTCGCTAAAGCGAAATGCGTTAC:1 + chrX 20747623 5' - gypsy10 99 2 47.26 ATGGGCTCCGAACTGTTTAAAATAGAATGCTCATTATTCGGCACAACTATTGTATTTTTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chrX 3263420 5' - roo 346 2 59.59 ATGAACCGTACGCTTCGACGATGCGAAAACGAATGAAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 + chr3L 14550938 5' + P-element 43 1 52.05 ATTATTAATTAGCACGCGAACTAATAATCTGCGTATGGGTTTTCAATGAAACTTCATTTTAGTCCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:2 + chrX 22610679 5' + pogo 55 1 54.11 ATTCATTTATGTAGAACGTTTTTTTCTAACCATTGCTACTTAAAAAGTCATGGGTTGCGCTTAGTTTTTGTTGAACATTAACGAGTGCAAAAAAAATAAATTAATGTTTATTTTCGACAAACAGCAGTGCTTTGCGGATCATGTTG:1 + chr3L 12909283 5' - Tc1 466 1 74.66 AAGTTTTTCACACGTTATATAATTTTTTTTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTT:1 + chr3R 6244529 5' + Doc 19 1 58.57 GCTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCCGGCTTGATCATGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGACATGTCCGGCTGTCCGTATGAACGTCGAACTATAAAAGCTAGGTTGAGATTCAGCATACAGA:1 + chr3L 19471447 5' + INE-1 175 1 82.84 CACTAGTTAGAACGGGATAGGGCAATCAAGAGTGTAAACAACAGTTAAATGTTGTTTAACTGAGAAAAGGTTTTACGGCATCGATCAGCTAAATTCAAGCAAAAATAGCACCATTATAATCGAAAAAAAAAAATCAATTAAAAAAT:1 + chr3L 18627521 5' - Tc1-2 1388 1 58.90 AAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chrX 2762599 5' - roo 9036 1 61.46 CAAGTGGTTTTTAACAATCTTTTTTGCTACCAGCACGTGCAACAGGACCAAACTGAAGCTGAAGACCAGGAAACCTTAGGATGGAAGGCAAAGTAATAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATG:1 - chr2R 7020689 5' + Bari1 25 1 69.18 AAATGGGCTCCGAACTGTTTAAAATAGAATGCTCATTATTCGGCACAACTATTGTATTTTTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chrX 3263422 5' - roo 348 2 58.22 AAGAGCAGGAGCAACTTATCCAAGAACGTGATGCGGAGCTCCAAGATGCCAATCTGGTAAGCAAGACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGACAGTT:1 - chrX 3961027 5' - accord2 165 2 54.17 ATGGGCCTGCCATAAATGTTCCGTTACACATTCAAAAGGCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr2L 246125 5' - roo 401 1 79.03 GTTGCTGTCTTTTTTTGTAGACTGGCACAGTGGAATTGGCAGAACTTTATCGGGAGGAGAAATTAGGATAGTTCGAGACTCGAAGCACATTTGACATGAGTAATTATTTTTCCTAATATATTTTTAAAG:1 - chr3L 13922597 5' + hopper 167 1 62.79 GGAAATTGATTGCCGGCATTTAAATATTTTATCGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTATTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACACTCTGGTG:1 - chr3R 30291249 5' - Quasimodo 6942 2 66.95 AATTTTAGACATGTCGCCACCATGATCAAATGCAAATTAACAAAGTATTGAGATATACAGTTGTTGCCATTGTGCACTTTGAGTAAATTATGTAAAAGGTGCAAGTAAGCGTTTTAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATA:1 - chr2R 5698253 5' + INE-1 84 1 33.56 GGGGAGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCCCATGAC:1 - chrX 6510086 5' + jockey 4753 1 70.55 GTAAGCTTTTTCTTGAACCCTGATATTTAATGTTCAGTTACCCTTAACCAAAATAAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTA:1 - 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chr3R 10273214 5' + Doc3-element 4717 1 63.70 CCTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 + chr2R 5737134 5' + 1360 71 1 77.78 CCAAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCG:1 + chr3R 178119 5' + BS 14 1 55.26 ATCATTAAATGTAAGTAAGGAACAATAAGTTCTATTTGTCAGTTATAATTGAGCATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATCTAAATTGGATTCAGGAGAAGCCTGGATGTTTTAACAATATTCGTATTTCGGGAGAGCATTGCTC:1 - chr3L 15099553 5' - 297 6787 2 63.01 ATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGA:1 + chr3R 13176353 5' - Burdock 6323 2 68.49 TTTGGGTACTTGTATTTTCTTAAGGGATAATGCGGGTAATCCGACTTAGATACGATGAAAAATGATGAAATATGTCAAGAATATATATTCATACTTTATATGGTCAGAAACACTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAAT:1 + chr3L 18400799 5' - INE-1 16 1 49.32 AACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGCAGACACTGCAG:1 - chrX 21667916 5' + gypsy2 6578 2 76.71 GTTGAATATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTG:1 - chr3L 12976354 5' + invader4 2793 2 47.69 ACATTTTTCAAAAGTGTGGACGTGGCAGTTTTGTGTAATATCTGTATGCTTAATCTCTACCTTCTGGCATTTAGTTTGCGAGATCTGGACGTTCATACAGACGGGCAAACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTA:1 - chr2R 5212075 5' - INE-1 104 1 71.22 ATATTCCAGCTCTTCAGTGTGGGCATGTTTGTGTCTAGCACCGCTCTACTGCCATCCTCCTTTTCCATGTACTTTGGCTGTGCTGCCCTGGCCGCGTGGTAGATTTTTCGTCCTGCATAATTTACATAGGGATTTTTT:1 + chr3R 25222381 5' + Fw2 3666 1 72.46 ATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGT:1 - chr2R 5237888 5' + Doc 90 1 55.48 CATATTTTTCCTGCTTCCGCTCGTATGTTTCACATATTTGCCTGCTTCCTTCCTTTCTTTCTGCCTCCTTTAGGATTATATACAGGCGCCCCACTAAGGAAACCCACAACAACACACACGAACACACAGATTATGTAAG:1 - chr2R 22364383 5' + gypsy3 432 1 60.43 AGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - 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chr3R 29645829 5' + jockey 16 1 62.33 ACCACAAGTACCAACTTTACTATTACTACTACTAAATTTAACACCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTG:1 + chr2R 12240102 5' - copia 5047 2 72.41 AAGGTTACCGAATGTTAACAAAGGCAGTTACCTTTGCCACACCTTATTAGCCCCCATCCAGTCGATCATCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTC:1 + chr2L 12079599 5' + mdg3 5307 2 52.05 CATCCGCCACGCCCACAGAGGGGCGTTGACACCCACACACATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr2L 17240183 5' + hopper 7 2 76.86 CCATTAATTGCGAGCAATGAAATCGATTTTCCCCACTTCCAGTTCTATTTTCATACATTTGTTTATTTACACTTGATCGTTCGGGCGAAAGACAAGTTAAAAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAA:1 - chr3L 9573230 5' + jockey 4529 1 73.61 TTTCAGGCGCCTCTGACAGGGCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr3R 19531227 5' + hobo 51 1 55.22 AGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTC:1 + chr3L 9571676 5' + jockey 4547 1 73.29 GGGTGTTGGCAATGTCCTTGATCGTCTTTTCATCACGTCGAATATCCTCGATTAGCAAGCATGTCGTGGGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATT:1 + chr2L 14605167 5' - jockey 4555 1 52.74 GTAGCACCCAGCGACAAAAATCAGGAAAAACTGTTGCCTCTTTTCCACCCACCCACACATACGATTAAGTTTCACCCCTCGTCGGTTGAGCTGAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGC:1 + chr3R 15711739 5' - diver 196 2 63.45 ACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 16181206 5' - roo 325 2 76.43 AAGCACTGTGTTTATTTTTTTTTGCTTATTTCTAAATAATGGAAACAAGGATTTGTTCCATCGGCTGGATATCTTCGATTCTAAGTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATT:1 - chr4 436931 5' + 3S18 5798 2 62.94 ATTCTACGCTGAATGTTTTAATGCTCTTAACTATAATATCATACTAAAATATATTTCATATTAACACGAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTT:1 - chrX 16902354 5' + I-element 37 1 52.71 AGACATTCTTGTCCAGAAAATGCCAAACAAAAAATGACGACTTAAAATACAATTTTCATTGGATTAAAATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chr3R 16913344 5' - pogo 2052 1 53.42 GCCATAAATGTTCCGTTACACATTCAAAAGGCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 246117 5' - roo 398 1 75.63 GATTGTATACAAAAGTGGTTGTGGTTTGTTTGGTTTTTTGCCACTCAGCATATTCTTATTTTTTGGACAGTACTTATAATGTAAATACGTCACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chr2R 1478275 5' + opus 137 4 67.81 CATTTTGTACTAAATTTAAACGAAGTGAAACGAAGGCAGCTTCGTGCTTAAAAACCAGGTCGTCGTTGACTGTCGGCTTCTATGTTAAGGATATAAGCATGATGAAATAACCTAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGCGACATCCACTTA:1 - chrX 3099210 5' - P-element 2859 1 64.38 AGTGTTACTAATACTATTTGATCAGCACATTTCCCTTCTCCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3R 20743989 5' - roo 330 2 74.83 ATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCG:1 + chr2L 12349789 5' + F-element 130 1 78.08 ATTTATACTGTACTACTACTATATACTCACTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGATTAGTCTC:1 + chr3L 9713968 5' + G2 2731 1 78.77 TTATACAAAATAAAAGGGGGAGACCCACAAAAACGCCCGCTGCCGTGGGAAAAAGTGTTGCATACTTATGAGTGTTGGCAAAGAGCTCCGGAATGAAATGTGAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1 + chr3L 17133762 5' + jockey 4702 1 74.82 TGCAAGAGCAGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 + chr2R 11609195 5' - roo 411 1 78.79 GATATTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:3 + chrX 4778146 5' + 412 31 2 63.01 ATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chrX 12525982 5' + roo 76 2 72.86 CCCTCAAGTGTAGCCCACAACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr3R 21705924 5' + 297 6 2 76.71 ACTGTGAGGTGGGATAGTTCAGATCTTTACTGCTTTCAATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 7539549 5' + roo 8687 2 64.75 CGAAAAATCGTTTGCATACTTTTGGGAGCGCATAATGACATTTTATTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTCTAC:1 - chr2L 3890208 5' - jockey 4928 1 70.00 AATTTCTGGAAAACAATTGCCGAACTAAGCGCAACCACACAAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3R 24478429 5' + 412 16 2 51.37 GCGTATTCTGTATTTGTGTGGTATTCATTTGCGCATATGTATGTATATCGGCCCGCTCGGCTGGCTGTGTGTATATATGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 - 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Quasimodo 318 2 55.97 TGGTGTGCATTGTTTAAAAAAGGTATTCAGCTATCCAGGCAAATCAGATAATTTAATTATCCATTTACATTAAAAATGTCCAATTTACAAGTTAGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 - chr3R 11113305 5' + mdg1 7066 2 66.44 AGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTT:1 - chr2L 18149508 5' - Bari1 1623 1 75.34 AAAAGGTTCACTGAATACTTAAAACTAATTACGAGAACACAATAATAATAAAAAATCAGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAAC:1 + chr2R 611675 5' + F-element 182 1 67.12 ATCGATTGTTCGAATGTAATTTCATGCACATTTCATCACCATATTCACCATGCACTATCCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chrX 3996590 5' + roo 8725 2 60.96 TGATTCACTTGCTACGGCATTCGATTCAGCTACTCGTACATTATCCCAAATACTCTATTCTAAGCTCCCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr3R 15338020 5' + blood 54 2 55.17 GTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATCTCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chr2R 11133573 5' - roo 316 2 79.45 TTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACCACCA:1 - chr2L 17250789 5' - opus 445 2 74.07 TAAATTGAGTTACTTTATATACAGCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr2L 9668299 5' - 1360 3348 1 56.16 CACAAGTCTTTTTGTTTTTATTGCAGGCTGACTTAGGTTTTTATTTGATTTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTG:1 + chrX 21948946 5' - 412 316 2 85.92 AAATAGTTGCAAAATATATGTTCAAAATGAAGCAATTTTCTGTAGTTCTTATGTTCTTTTTAGGATTATTACAGCCCGTTTAATTTGTAGCCTAGTGTTACAGCTTCATGACAGACCCACAAAGCATTTACAAAATTACTTCAACA:1 + chr2L 10910921 5' + I-element 204 1 64.38 AACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGC:1 + chr3R 9160694 5' + copia 4932 2 69.60 TCCAGGGCTGGAAATTGCTGCCTAGCAGTGTTGTACTGGAACAACTGAATAAGATGTACGATACGTTATCGAAAACGTTACATTGGTCACATTATTATTCATTTATTCAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chrX 16787026 5' - 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roo 345 2 62.33 GTCAATGCTTGATATTTCATCAAAGAAATTACTGATGAAGAGACATAATCTGCTCTTGAACCTAATTCGCAATCGCAACTTTTATTTCCCAACATGTGTAGTCATGGAGCGAATTTTTAATTATTATTTTATTTTATCATATTGC:1 + chr3L 14213449 5' + 1360 3102 1 62.76 GGGTCTATTAATATTCCCCACTGTGTCGCGAACTGAAGCCAGGATCGACAAGACTGTTCACCCAGCAAAACAATACTCGTAAATATATATTTTATATGGACGAAAACGCTTCCTTGTGATTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAG:1 + chr3L 23256735 5' - INE-1 12 1 60.27 ATGGGAAAATATTTTTTAATGTGCACTTTATCATCATCATGTCAGGCTAAGCGAGGAGAGCAAAGTAAAAAAAAAGTATGTAAAAGGCTGAAGGAATCGTTTTTGACTATATAATGTTTATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCC:1 + chrX 20813022 5' + INE-1 87 1 47.26 ATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATT:1 + chrX 15148859 5' + micropia 5004 4 53.19 CATTTGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCA:1 + chr2R 4012523 5' + F-element 299 1 71.09 AGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGT:1 + chr2L 17136150 5' + hobo 69 1 63.01 ACCAGCATACCAAGATCTAATATCAATCAAATCTGTGAACTAAACAAATCAATAAAAAAGTCAAGAGACTTCTATCTGACAACGAATAGTGCGTTGAACTAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTC:1 + chr3L 18030931 5' + invader4 2776 2 71.92 CAGAACATTTTGTTTTTATCCGCATCTGCATGCACTTCTAATGTTTATAAATAAATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAA:1 - 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chrX 1061644 5' - 412 460 2 57.25 TTTGAATTAGCTAAATAATAATTGCTTGTAAATTATAACAAATACCGGATTTCATCGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGT:1 + chr3L 24291923 5' + rover 6959 2 79.71 GGTAATTGTAATATATACAAAATAAAAAAATAACTCAAATTTCTAGCTATAGGTCATTTTAAACACATTTATTTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAAC:1 + chr2L 13294732 5' - G2 3012 1 52.74 CTATTCATATTTTACTTAAAACTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chrX 10567869 5' + roo 8709 2 54.48 AAAATGATTATATACTCAGAATAGTTATATACAGAGAAAAAAATATACATAAACCACCGATTTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr3L 2878424 5' + 412 56 2 56.16 AAATCGGACAGCTGGACAGTTGGATATCCTTAGGGCTTCTTAATAGACATGACCACCGGCTAAGACCACCAGACCGCCAGCATGTGACGACAAACTCAGATTTAAGATAAGGGTTTAAGATATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTG:1 + chr2L 1367468 5' - Cr1a 4113 1 69.18 TGAAACTACACTGTGACTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 - chr2R 19555048 5' - pogo 2065 1 56.12 GGGACATGGGCGTTAGAGTGCCGGGTGCTGGCCTCTTGAAATTTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr2R 21371451 5' + roo 8739 2 72.60 TAATGGACAGTTGCCAGTAAATAATTTTTGTGCAATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 5453739 5' + 412 7095 2 56.85 AGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGATATATCTTCG:1 + chr3L 12867280 5' - roo 9019 2 52.05 GAATGGATTGGATTGGCTTTGACATGGCAATCAATTTTTGGTAAAGTTATGAAAAAAACTCAATTTCTGCCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chr3R 24493183 5' + jockey 4711 1 50.37 GAATCGTTCCTCGGCCTGACACATTTTTTACTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATACCAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr3L 22978678 5' + 1360 14 1 75.17 AGTGAGCGGAAAAAAATGTGCCAGCCGCATACATAATACACGTATCTTGGTGTCTGGGACAGCTGGGCTTCCTTTGCTGCGGTCCACATAAAATGCATAAATTATACAGCGTTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 - chr3R 27822344 5' + I-element 7 1 80.56 TTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCA:1 + chr3L 24213781 5' - invader2 169 2 71.23 AATGAAATGCTGACACAGCGTTAGTAATGTGTGTTAATGTTACGCTGTGGCATAAATGCAATTATATTGCAGTTATTGCAGTTGCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1 - chr2R 17392128 5' + BS 5032 1 58.22 GTATGAGTGATTTATTGCCTTGAACTCCGCTGACCCATCGCCTGAATCGAATTCAAATAATAAAGTCGAAATTAGTTGCGGTCCGAAATGGAAGTGGCTAAATTGGAATTGCAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTG:1 - chr3L 14251555 5' - 1360 229 1 78.77 TGGATAGAGTACATAATTTAGCCAAGCAGTTGTATCTACTGACTCAGACTGTGGAAAATAAATTCAATGCCAGACGCCAGCTCCCTATTTTACATAAAGTATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2R 12543015 5' + roo 13 2 73.97 CTTTTTACACTCATGCATTATCTGTTATATGAAATTTATAATACTCGATCACAACTTTAACTACAACAACAACAACTACTACAACAACAACAACAAATCGTATATCTACAACACCAGCAGAGGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTA:1 + chrX 15096725 5' + Cr1a 75 1 52.05 ATGGAAAGCAATAAAACAATTGGTTAGTCAAGAACAGGTCCCAAATCACCAGCGGAAAATGTTGCAGAACTTGCCAAACCGAAAAGGGTTACTTCTATTATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr2L 5202631 5' + 297 6600 2 73.29 GAGACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATT:1 + chr2R 22723008 5' + 3S18 45 2 52.78 ATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATGGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chr3L 19350019 5' + jockey 34 1 62.40 CCTAGTGTTTGGTATCACAGCTGGCGACGTGATCGACGATTTTGCATGGGGAGCGTGTAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGACCACGAATATATTTAAAGACATACAATT:1 - chr3R 10684874 5' + roo 20 2 71.92 AAATCCAATAAGTTTTAAATGTATTTTTCCTAAAAACCTCTGAGTGGTTAGGTAGCTCGAAAATATTAAGACAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCCTAAAGACTTAGGAATCACTTATGTT:1 + chr3L 17282353 5' + G4 3560 1 56.43 AGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTAT:1 + chr3R 21276523 5' + BS 5047 1 50.68 GCTGCAGGCTGTGAAAAAGATGAAAAGTGGAAAACCTAAGGCCCCCAAGTAGCAAACAATTTAATAATGACAGCAAGAGCTGGAGTCGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAGTACAAAA:1 - chrX 3304454 5' - springer 7297 2 48.39 CTTTACAAAAAGAACGTCCAATCGGTCAGTTGAGTGTGGTGATTACGAAAATAACAATGTTGATCAAGATGTTGTGCTAATCAAGTTTATATGCTATCGCCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTC:1 + chr3L 9008665 5' - aurora-element 4170 1 71.23 TCTTATTTTGAACATTATGACAGGAATCGTTTTGATAATAGTTATTTGGAAGAATTTTAAATATATTTCGTGTGACATCCTTTGTGTACATATACATACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chrX 22559986 5' + Transpac 4937 2 61.64 CTGCATCGGCATCAACCATTCTTTGGGTCCCAATCCATAGATGCACTGGAAGTATTTAGTTATCTTCGCATATAACTAATATATTTTTATAGTTCAATACTTAGATTGGATGTTACTTATTTAATTTGCTTTATTTGATTTTATTT:1 - chr3L 18322052 5' - TAHRE 29 1 54.79 CCCTACTTCTATGAATTTAAAAACATTTTAAGTAAGTCCTTGAAAGAAACAGTGCCAGTATACTATAGTATACGAGCTTTTGTAGTTACAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGACAGAGACGCTCTATG:1 + chr2L 17548480 5' + F-element 117 1 58.99 CAGTTCCCCAACTGGATACCCCTCTTTATACTCCACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2L 16458608 5' + roo 8742 2 73.91 AGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGC:1 - chr2L 23295887 5' + micropia 5094 4 54.11 TTTGGAATGTAACGCTGGAAAAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 76013 5' + roo 8699 2 65.75 AGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGA:1 - chr3R 9352084 5' + Tirant 75 2 67.12 GACCTTGACAGCTGCATATTTATGATTCACTAACATGCTGAGGTGGTGACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 16181274 5' - roo 388 2 71.23 TATTAGCTAATTGGCTATCAACAATTTAAAACTTCAGTTAGGGTTTGAAACTGAACTGCGTCCCAAACATTGCTGTTAATGTTAGCTGTTATGTGCAATGCATGTATAACAGATTTTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTT:1 - chrX 3862862 5' - F-element 4661 1 75.17 ACTGCTGTTAATTATGTGGATAGTAAAATTACAACACGCAGAACAGCAGCTAAATAAAAACTATCCTTAATGTTTTGATTGAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 16399434 5' + roo 39 2 52.74 AATTTAGCCAGTCTGTATATGTAGTTCCGGTTTCCGGATTTGATTGAACTTGGCGGAAGTTGATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 + chr3R 29733015 5' - opus 7454 2 54.68 TGACCCATGTTGCCACACCCACTCTAACGCCCACAAACCGCAAAAAACTGCCATGCCCACACTTTTGAAACATATTTCAAAGTTTGCTTATAATTTTATTTGCCCTGTAAATTTCTTAGGCTCCGTGTGGTCCAGTC:1 + chrX 14770553 5' + G5 4433 1 49.64 GTAAGCAAAATCGTATTGGCCAATAATAAAGCAATTAACAAGTGAGACGTCGAAAAAATCACAGACATCGCAAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAGTAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCA:1 - chr2L 16381456 5' + Porto1 4300 1 56.85 GAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr2R 11609231 5' - roo 327 2 73.29 ATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr3L 23986549 5' + opus 7022 2 67.14 CAATAAGAGGGCCAAAAAACAAAACCAAAAAAGGCCAAACCATTGAAGAAAACCATTCTACAAAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 + chr3L 5333034 5' + G2 3075 1 75.00 AATCTCAGCTGCATTGCCTTTGCCCTTGTTTTTGTCGCCGATAAATAACCAAACTTAAAGTGAACATAACTTCCACTTGGAGACTTATGATCAACTTATTGCGGTAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAATGCACCGTTATAATAAC:1 + chr2L 22306780 5' - hopper 1283 1 71.92 GTAAGATAATGCTATCAGAAGAAAATCACACAATATCTGCAAAATGCCAACAAAAAAACATTAAAGGATAAACAGTTGTGAAACAGCAGCAGAACCCAGATTCTTAATCTGAACCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAATT:1 + chr2L 21739412 5' - INE-1 541 1 73.29 GAATTGGGTGTCTTAAATGGGTACGTTACGATGAGTTTGAGTACACTGAAATTGATCAAAGTTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr2L 17250850 5' - opus 7480 2 59.85 AAATTGGATCATGTATACATATAAAAATTGAATATTACATAAAATGGTATGTACAGCCGTGTTCAGAAAAATAGCATTGCGAGGGAAACTAATTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTATTCCTCTTATTTTTGTTAAAT:1 + chr2R 6989080 5' + HB 92 1 72.60 GAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 + chr2R 16891835 5' - hobo 2891 1 56.35 CAAGTTGGATTACCATTTTCCCACTGTCTTTGTATGGGTGTGCAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGCCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3L 17207766 5' - hobo 2893 1 59.82 AGTGGGAAGGGGGCGCGGTGGGCTGGTGTGTGTAGGCTAGCTGCTTGCCACTGCTGCTCGCTGGCTTGTTATGTACCAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTT:1 - chrX 12784620 5' - I-element 5166 1 50.41 CTTTAGTCGCGTTGATACGAATCAAAACTTGTCGACAAAGCAGATTAAATGCGCTGCATGTTAGATTTAAATCTCGCTTGAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTT:1 - chr3L 11877932 5' + 3S18 5799 2 60.00 CTAATAATCGTTATTGAAAATAGCAATCCAACAGATTAAGCGAGCAGCAGCAGCAGCCCGCAGGACTTTTTACTCTGGATGGGATTGGACGACCGGATGGGTTGGGGGGCCAATAAATTAACTTTTGCGGGCTGTAACATAACAGT:1 - chr2R 19082987 5' + hopper2 1508 1 76.03 AACAGCAAATTCGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 - chr2L 2276805 5' + F-element 23 1 63.30 AATCATTCAATAATTCGAAGATCTCCTTGTTATATCATTTGCAATTTTAGATCCTTGTAACCGTGGGGCAAACACTACCCATTGGAGTGGCCGCTATGAG:1 - chr2R 13943158 5' + gypsy6 114 2 60.00 CCAAACCTAGGTATAGATTTACCTAGATATAGATTTATGGTAAATTAAATCTAAAAACAACTAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3L 4187295 5' - pogo 2051 1 59.29 TATTTAATAGGCTTGTGGTGGAATCACCAAACCTAGGTATAGATTTACCTAGATATAGATTTATGGTAAATTAAATCTAAAAACAACTAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 - chr3L 4187321 5' - pogo 2088 1 72.09 AAGTTTTGTAAAATGTTAATTTCTTTGAAGTAATTTGTAATAAGTAATTTTAAACTGTTTAGTTTTTAAAGAATAGAAGAGCTTCTGCTGTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAACGCCCAAAGTGCGCTGAAGTTGGGTTCAGCTATC:1 - chr3R 14843601 5' - Stalker 7154 4 70.55 AAAGAAATCGCGATCGCACATATGTTTTCGGTATTTTTGGATATTCGATTTGTCGATTACATAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATT:1 + chr2L 436457 5' - copia 5064 2 58.90 AACGTGCAACGCCCGGAAAACTTAGGAAGAGGTGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1 - chrX 5858974 5' + hobo 81 1 71.23 GATTTGTCAACGCACCTTGACAAAGCACTGACTATATAAAAACCATGAAATGTAATAATAACTTGACCATTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:1 - chr3L 11776773 5' - mdg3 194 2 51.37 ATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTT:1 + chr3R 4160066 5' - invader2 5045 2 58.90 ATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chr3L 23986535 5' + opus 152 4 64.42 GCAATCAACAAGAGCGTCATTAAAAAAGCAAATTTCTGAACACGCTAAACACATGTAGGAAGGCAAGAACAACAATATTGCGGGGTGGGGGGAAAAAACTACAACAACAGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATC:1 - chr2R 18352050 5' - G-element 4189 1 77.40 GGAATTGTAATTACATAACTCTTTAGCCAATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2L 14201395 5' - roo 8985 2 78.77 GACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAC:1 - chr2R 21402674 5' + mdg3 77 2 70.00 ATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3R 22100523 5' + 412 7074 2 58.24 CATACTATAAGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCATGGACAATTCAT:1 - chr3L 23702298 5' + G4 17 1 69.23 TTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGATCGCGGGGGAAAAAAAATCTTCGAAAGAAACTTGGTCTGCCAACAC:1 + chrX 13235227 5' - R2-element 3538 1 73.91 CAATTGGAGCTGGTTTGCGATGAATGCGATTATTACGGCGCCACAGACACCATATTTATTGATAATAGTACCCAAACCGATGGCTATGATGATGACGAGTCTTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGAT:1 + chr2L 16558162 5' - jockey 4897 1 69.86 ATTTTCTTGCGATAAATTTCCCCTTTCCTTTATTAAATGATCCATGATCTGAACTGAGCTTATAGGATGCGGCATTTCAAGGGTCTGTGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACGTTAAATC:1 + chr4 1174421 5' + 1360 235 1 60.00 AACTGCTATTGCTATTTACGATACGATAGTTACGGGGTACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr3L 13868607 5' + 412 13 2 67.50 ATTAGAGCACTCAATTTCCAATAAAACAAGACCAAATTAGACAAATTAAATAATTGTCAGTTCATTCAGAACAAGAATAAGATGATTACTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 + chr3R 12592995 5' - flea 226 2 63.45 GTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCAAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 + chr3L 14550982 5' + P-element 53 1 28.57 ATAGGTCAGAAAATGTTCTTATATTTGGATAGGTTTAATTTAATGTATATTTGTACTTAATTCTACGAGTAATGCCAGACCTTTGATTTAAGTATACTGTTGACTTTTATTTCTTTTATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAAC:1 - chr3R 7011622 5' - HB 1466 1 63.01 TTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23291026 5' - P-element 2495 1 80.00 ATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGA:1 + chrX 1103626 5' + pogo 75 1 69.86 GGCACTTTCGGTTAAACTTTTGCGTATGTAATGCATATTTCATTTAATTTTTAAGAGTTGCCAAACCGAAAAATGTGCAAATGATGGCGAGTTTTGGGTCCGAAAGTTGTAAATATTTTATAATGGTAATATAGTTGATAGAAAAT:1 + chr3R 29371450 5' + blood 6951 1 76.03 GGGGGACTCTCGACCCCCATATATGCACGTCGATTACAGAGGGTGTTCTGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAATTTGATTTCCTAAAAAAATTATTAAATGTTTAAAGTCAGATTGCATGAATAATAAGTACCATATG:1 + chr2L 15122673 5' + Tc1 96 1 66.44 GGCAAATAAATAAAAATGCTGTTCACTTCTGCTGCGGCGCGTTTTATGCGCACTTGCACTCACTCACACAGACAGCAACCCTCACACACACACACGTGCAAACAGGTGTGAGCTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3R 13628723 5' - hobo 2930 1 65.52 TTTTATTTAACAGCTCTTTCAGGTGGATTTTTTTAAAAGATGTATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGTATTT:1 - chr3L 8855952 5' - rover 7224 2 71.23 CATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3R 7035254 5' - roo 334 2 68.49 AGAATTGAACAATTAGATGAAAAACGTAACTAAAACTTAATCGTTTAAAATCGATTCATATAAATCCACTTTTAATTTCTAATAGATAATACATATAACCAAGAGAGAATGTAACCGAGTTCACGACTATCAGATACCCGTTACTC:1 - chr3L 25255823 5' - INE-1 549 1 77.40 AAATGTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chrX 1103726 5' - pogo 2059 1 54.01 TACGATAAGAAATTTAAATCATAATTCCAGCTTCTTGTTTTAATTAATACGTTCAATATGTATACATTCTATGTATGTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAAT:1 - chr2R 8642987 5' + Doc2-element 4744 1 47.95 TATATCTATCTATATATCTGTCAACAGTTCTAGAGCTGCTATTTACAGTTTGTCGAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGCATTTTTGAAGATGCAACTCATTGTGGGCCTACTTAAAGAAGAAGGTGGCAAATAGGGGC:1 + chr2L 14546114 5' + S-element 1273 1 35.62 ATCTTCGATGTCAAGGAACCTTGTATTTGTGTTTCGAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 - chr2L 13250467 5' + opus 7160 4 54.86 ATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3L 17707815 5' + Doc 51 1 53.91 GAATTTGAACTGGTTCCATTTGAGGAGCAAGCCAGTGCTTGAAAATACTGTCCCAACGCATTTAGCACATACCCGCCGGCGGTCACACTAATTAAGGCCCACGATAATAATTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACT:1 - chr3L 1602719 5' - Idefix 7107 2 75.34 GTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGATCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 - chr3R 6388773 5' + jockey 81 1 75.20 ATAACAACTGTTTCCGCTATTCTTATCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATAGGCTTTATTTCTTGTTTTCATCTACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 19446773 5' + roo 8717 2 63.50 AACGAGCATGTTAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 12867267 5' - roo 9053 2 53.60 GTACGAACAGCACAGCTGTTTATATATTACTGAGCACAGCTACCCCACACAAACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr2R 7665842 5' - Transpac 5185 2 58.40 AAATGATCAGCTTCGGTTACCTTCACCGATATCCCGTCATTTTCAATATCGACATTCCCCATACAACAGTCAGTAGCACCAAGACTGCTCATTGAGGTAG:1 - chr2L 22746561 5' + R1A1-element 4962 1 80.00 GCTTTAAGCTTGCGTGGTGAAATTAAAATTTAATGGATGAAGTTAAAGTCAGCAAGCAATTGCAGGCTATGCACAGCATATGAATATTATATTCATTTAACACGCCACCAATTATACCGTTCACCTTTTTTTATTTTAATTTTTTT:2 + chrX 5139690 5' - Doc2-element 255 1 80.82 TAAAGCATTTGCATTTTAAATCAGTCCTTTCTATATTTTTGTATGTGTATGTGTGTGTATGTATATATACATATATATATAGATATATCCTCGCACACCATTACACCTGAGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chrX 5145356 5' + hopper 7 2 78.47 TAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 - chr3R 24476342 5' + 412 61 2 76.32 GTTGTCGGGAAGGTTATCTCTGGGGAACGGCGGATTCATTGAAACCTGAAGCCAGAGTGTAAAGTCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTGAAATAGGTGAC:1 + chr3R 23765362 5' - roo 9004 2 58.22 GAAACCCGAGGCAATCACTCTGCGGCTTTCCAAATACCGGGCTATATGGCTATGTATGTATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 + chr3L 16870161 5' + FB 29 1 53.57 CACATCATGAGTTGCAAACATATTTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3L 6775332 5' + blood 37 2 57.66 ATACCCGGACCTCGCAGAGTAAAGGGATTTAGGAAATGTGAACAAAATCGATGACATTAAACAAAAGTTTTACGTGTAAAACAAAGAAAAAAATACAGTTGCAATTTTATTAATTTATTATGATAGACAGAATAGTTTACAAAACT:1 - chr3L 27670262 5' - I-element 5334 1 56.85 AGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr3L 11336359 5' + blood 7071 2 69.35 AACTTTGTATCCAGGAGATAAGCCTCTTATAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGCAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTTATTTTATCTTCATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGGTCTATTCCTGA:1 + chr3R 11113207 5' - mdg1 7362 2 76.71 AATAAAATAATTCACAACTTTTGTCGAGGGTTCAAACACGAGTGCAAGGCAAAGAAGAGAGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATCAGAAGTGG:1 + chrX 18036767 5' + micropia 465 1 50.43 TGGCAATTCTTCTTTATTTTCATAGATCCCCTTTTTGATATAGCGAGATGTGGCTCCTGTGTCTATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTC:1 - chr2L 22780974 5' + HMS-Beagle2 20 2 71.13 AAAAGCACTTGCAGATACTCAAATAAGTTTCTCCTTAGTTACCTTAAGCTGGGTAAAATTTTCACCTATACTAGCTTATACAACTAATTATACATCATTGGTAAGATATATTATGAAATAGTTTTTCTTTTTAAAATGT:1 - chr3L 5507614 5' - HB 1361 1 52.52 GGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCC:1 + chr2R 7020560 5' - Bari1 1644 1 67.41 AAAAGATCTTATGTAAAGTCAAATATTTCTAGCGCTGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATA:1 - chr3R 13582304 5' - BS 5038 1 55.48 AGTACAAATTATTATACATTTATCTAGTTCATTTCATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:1 + chr3R 11925142 5' + pogo 78 1 74.29 AGCTGGTAAAAGTTGCTAATGCGCTGCTTCGTCAAAAGCTTGCCACGAATTTTCCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCT:1 - chr2L 18280029 5' - gypsy5 396 2 74.66 AGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr2L 246086 5' - roo 9004 2 65.52 CTCACAGTTCACTTTATTGACCTCGACCAAATCCAAACTGCTTTAGATATTTTTCATGAAAATTGACGCAGTTCATTATGCGTTAACATTTATTCAGCAAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTTGTACG:1 - chr4 267569 5' + F-element 4352 1 63.01 CTTACTACAAAATGGCATACATCAGGAGCATCTTCCTCATTGACTGCACCATTATTGACTGTAGTAGTGTAGTGAGCAATGTGTACTTAGGTATAGGCTAGCATAAGAATGATGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAA:1 + chr2R 14846190 5' + hobo 425 1 75.52 GTATGCACTTTTAAATTTGTACACACGTCATCCGCACTCATTACAAAAATATCAAAAATGGCTAACCAATGCGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTAT:1 - chr2R 5542452 5' + 1731 4364 2 50.00 ATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr2L 76118 5' - roo 325 2 80.14 AAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3R 17305482 5' - roo 334 2 84.30 CAAATAGCCGATACGTCATCGGTGCAAAGCATTTCAAAGCAGTTCGTTGATCTCCCAAAAAAAAAATGGAGAGCGAGCTGTAATAAACCTATATATGCCACCTATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 - chr2L 9237610 5' - blood 7353 2 56.62 ATATCGATTGGGCTATCGCAAGCACTGGCGCCCCATCTCTACGATAGTGCTTTCGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAG:1 - chrX 14826196 5' + P-element 20 1 57.84 GAAGGAACACTATCCTTTGCTCCGAAGCGTACAACTGTCTTTCAGTAGGGCGTCCTTTCCATTGATATCTTGGTATGCATGCCATCTTGCATTCACCATGCAAGGAAGCATAATCGTATTTGTAGCTTCGCAGATG:1 + chr3L 12967604 5' - hopper2 230 1 65.44 AGTCTTGTAAATTTCTATAAATATGCCAAAAACCTTTTTGCCACGCTCACTCTAACGCCCTAAAGCCGCCCACATTCCCCAATATCTATCGAAATCCTAGAAAATTTATGATATTTCTCGTTTTCATTCACACTAGCTGAGTAACA:1 - chrX 22586088 5' + INE-1 535 1 39.73 AAGTCTCTGTGCAATGGAGTTTATTTCATATTTGCAGCCAACCAGAATCACATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAG:1 - chr3R 13176441 5' + Burdock 63 2 64.08 GTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGCTGACATGAGAATCGC:1 - chr3R 25304803 5' - roo 329 2 73.10 CCATGAGCGAGTCAAGGATTGTTTGGTGGCCAAATGGGTGGCAACAGTAAAGCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 - chrX 1690073 5' - 412 7479 2 67.81 AAGCATTTCATTAAAAACTTCCAGGCTATTAAGCAAAACTTTGTGCAGCATTTTGCCAAAACTGTGTGATAAGCATCTGAACAAAATGCAAAGCTGCCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chrX 7786536 5' - hobo 2932 1 76.92 AAAATCTAATAGGATCGCATACCAAACGTTGATAGGAAAAAGAGAGGTGAAGTCGTTGAAAAGTATGCAACAGGCAGACGGAAGCGTTTCCGACCATATAATCAAATATATAAATATATATTTTTGATCAGGATTAATAGCCAAGT:1 + chr2R 5705572 5' + INE-1 91 1 67.81 AATCCAACCGCCTACCGAACTCCCGCTCCTCATTAAACCCTACAGTTGCAAACACCACCGCTCACACACACACGCACACACATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACCATTTTGT:1 + chrX 7980760 5' + hobo 36 1 60.96 CTGGCCTTCCTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGTTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTAGCGCAGATCGTGTGCT:1 - chr2R 23116162 5' + jockey 92 1 73.29 AGAGTGTAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCCTTATTTTTC:1 + chr2L 12414900 5' + pogo 43 1 60.00 TAATTAAAAAATTACGTCATATTTAAAGTACTGTATCAGGTTGATTGGGGATGTGTGGCTGAACATGATAAGATTACATTTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr3L 19836390 5' - pogo 2063 1 59.59 GCCCCATCTCTACGATAGTGCTTTCGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 - chrX 14826167 5' + P-element 68 1 26.45 CACAAATTATTTTCACTTTTTCACATTTGGAATTTTGCACTATTCGGACTGGATTAATATTTAAATATATTCGGAAATTTGGACTTAGAAATTTTCACGAATGAGATATATACTTAATGATAAGTACTTTTCTTTAATTGCCTTTT:1 + chr2R 18496818 5' - GATE 452 1 71.92 ATTAAGTGCTTAATTTCGATTAATTACTTGTCTAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:2 + chr2L 16884764 5' + pogo 23 1 62.33 ACTTTGGCACTGCAATTTCGATTTCGCCTGTCGTCTATTTAATGATTCCGAATCGGAGCAGGCCCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr2L 11951511 5' + pogo 25 1 62.07 GTCTGCCTGTCTTCAAAGTGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 10684715 5' - roo 9028 1 54.79 TTAAAAATCGTTTAAAAAGTTAGAAATTAGTTAGTTATAGAAATGTCCATTTATGCCAGCTATCACCGTACCTATCACTTCATCTATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 - chr3L 14122712 5' - 1360 3352 1 51.37 AAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATA:1 - chr2L 21403550 5' + G5 4414 1 53.64 TTATTGTAGCTATCATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCAGTTTCGTATGCAATTTGAAATCATATTCTCCTAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACT:1 - chr3L 15099692 5' + G4 3809 1 60.27 CAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr3R 9352078 5' + Tirant 8128 2 53.49 GCATAATTGATTTTTTCGCGGCGATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATCGGGAACAATCACA:1 + chr2R 11763561 5' + Tabor 40 2 58.22 AGGTGAGGATGTAGGGCTTAGGGAAGCAGGATGGATTGGTGTCCATGAGCGAGTCAAGGATTGTTTGGTGGCCAAATGGGTGGCAACAGTAAAGCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chrX 1690115 5' - 412 469 2 67.59 GGTACTTATCGCAATTAAGGTAAAAAGTGCTTGATTATTTGAAGTCGGAATTTAACACATACATGCATTTTGTTCACCAAAGCTTGGATGTCAAGGTGAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACATGTCGCCTTAGATAACA:1 + chr3L 17789974 5' - roo 102 2 64.08 ATTTGGGTTCTTTGGGGGATGGTCGGGATATATGTATATATATATGTAAGTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 + chrX 6138631 5' - opus 434 2 77.30 ACAGGATGTTTTTCCGAGTGCATGGGGGCACTTCCCCCTTTTTCTATGCGTTCGCCATTTGGAGTTGCTCCCTTTGGCCTCAAAAAGGTGGCACTTTTCGCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTG:1 + chr3L 19670786 5' - Cr1a 4413 1 67.63 CTTGTGTCAAGTAATTTGGGTTCTTTGGGGGATGGTCGGGATATATGTATATATATATGTAAGTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chrX 6138618 5' - opus 471 2 61.54 CATACATATGCTATGCAAATTGCGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr2R 19554905 5' + pogo 40 1 58.22 AACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr2L 17029583 5' + blood 7038 2 58.82 TATAAAGGAGTCCATAAAACAAGGGTTAAGAAGGAAGTAAGGTATGGAAGGATATCTTTGCAAACGACACGGAGGACAGTACATTTCAATGTCTAATTTTTTAAATAAATATTCTCATCCCCTCGCACGAAAACTAATCC:1 - chr3L 15915906 5' + Doc 4502 1 77.86 GGGAAAGAAATCGGATTGCTTCTGCTGGTCACAGTGAAAGAAAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 + chrX 3562097 5' - hopper 148 120 83.33 AACAACAACAGAGATTGAACATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGCTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTG:1 + chr3L 23986495 5' + opus 41 4 51.37 CGGAAATAATTGCATTAAGACAAAGAATAAATGGGTGGGTGTGTGTGTGTGCATATGTAGCGACACCAAAAATGAACTTCACATGTCATAACTGCAGCAAAAATAACACCATAAGCACA:1 + chrX 12180306 5' - Tc1 1631 1 84.03 CCATCGATTCCTTTTTCCTGACAATTTCCCGCTACACTGCAGATTATCATAAGCGGTATGACGAAATGGAGCAGAATCTCGACTGGAGTGATAATAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chrX 15240006 5' - 412 455 2 63.70 GAGTAACGAGTTGCCTGACATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGCGAAGACTTTACTC:1 - chr2L 686097 5' - roo 9063 1 72.38 TAATCCATGACACGTTTTCATAGCTATCTACAATAAATATAATTATGCGATATTCATGCCCAGCACTGGAAGACCAGGTGTAGTTCGGCACTAAGAATATATATAAGAATATATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAA:1 - chr3L 8397903 5' - Tc1-2 1614 1 65.07 GGGAGTCCTTCAATGTCAATTAGATATGATATACATATGCATGCCCACACTATCCATTATAAATAATTCTGTCAGTCTCGTAACACTTATTTATTGTTAATGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:2 - chr2R 23287577 5' + roo 19 2 69.86 ATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCT:1 + chr2L 12349771 5' + F-element 112 1 65.75 TTGTTGCGCTATGCATTAGCCTGGTCGAAACGAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 + chr3L 19785318 5' + FB 38 1 70.21 CAAAGAAGAACCTACCGACCCGAGCCTTAACCCTTTAAGCCCGACCCTCCCAATCGCTGGTGGGCAGAACAGGTAGCGCCTCAACGGGACTCTACTTAAGTCAGTCTCCGAAGAAGCACGAGACTTTCGCTTTATTTTTT:1 - chr2L 19938275 5' - X-element 413 1 72.14 TTATGTATGAGCTTCCGGCCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTA:1 - chrX 21772474 5' - springer 7137 2 54.26 CATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACA:1 - chr3L 19349974 5' + jockey 101 1 75.34 GGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCG:1 + chr2R 21402619 5' - mdg3 5417 2 72.34 GAGAGCAGGGCAAAAGTTTAAAAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1 + chr3L 13634189 5' + 297 6632 2 56.16 TTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 - chr2L 16884900 5' - pogo 2034 1 65.07 AATTGCGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 + chr2R 19554922 5' + pogo 56 1 56.55 TATCGGAGCTGAGAGCGCGTATTTACCTTTAAACTGGACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3L 7962318 5' + blood 34 2 59.59 CAAAGAAGAGGTTCCGTTTTAATTTAAATATTACGTTTTATGCTTTCTGTTGCATACTTTGGCGGGCTTAGCTTTTGTTGGGCCATAGGCAACGAATCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGAC:1 - chr3R 22516093 5' + jockey 4570 1 73.13 CAGATTAATGGACAGTTGCCAGTAAATAATTTTTGTGCAATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3R 5453744 5' + 412 37 2 60.27 ACATCGAAAACACCAGATGAGAATGGAAGAGGATATCTTTAACACAAAAAAGGAAGGACTTTGCCGGCATAAAAAACAGGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTG:1 + chr3L 13800154 5' - hopper 1168 1 56.85 TTATACATTATATATTTTAAGTAATTCTATTAATATTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTTCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCA:1 + chr3R 18873221 5' - copia 170 2 77.40 AAGTTAATAAATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAAGAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTG:1 - chr3L 23597302 5' + invader4 2740 1 63.43 GCCCAACATTCGCCATTGCATACTTTTAGGCTGAGGGCGCAATGGGCGTATGTGTAATATTTCCATGCCACATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr2L 2004912 5' + jockey 57 1 53.42 ACGGCACTTGGCCAAAACAAAATTTGCTCCTTCTGCCCACATACTCTTCGATTCTGGATGGAGTTTTGGGTATTTCAATATATATATAGTGACGTATTTGTGTGGTCCAAACC:1 - chrX 8012367 5' + 297 5 2 74.34 TTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGACGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTG:1 - chr2L 23295866 5' + micropia 142 4 62.50 AAGACACGTAAACACACAGAGCAGAAGAAGAATGGGAAACTCATGGATGTCAGCTGTTTCAGAACTTTTTTCAAAAGCTAGTGACGAGAGGGCTTATTAGGTCCAACACTGATCTACGCCATCCAAGTGTGGGGAACAGCGTCTAA:1 - chr2L 9069384 5' + G5A 2444 1 64.38 GAACTACGGTGATCGAAGCAATAAAAAGAAATTGGCAAGGCGAATTTACGCTTGGAAAAGCCAAAGAAAACCCATGAAAGCATCGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTT:1 + chr2L 14680028 5' + pogo 1717 1 76.92 AGGGCTCTCAGGAGTCGATATATCGACGGTGGTTTACGTCCATGCTGAAGGTGGGAAACTTCGCTACGAGCTGTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGTGAACAATCACATTGTAGCAC:1 + chr3L 22648272 5' + Tabor 6888 2 52.05 TTCATTGACTGCATTTTCCACATGAGATTCGGAGTTCCTCCTCTGGGGCCGCAAGTGAAAGTGGCTGTATATTTTTTGCATGTCTTTTTCCATTTGCTTGGCTATTT:1 - chr2L 18288811 5' - Fw2 3708 1 76.64 CGATAGTAAAGTGTCCAAAGATTGCAAATTTTACTTTTTGGTACCATTTCTGGTACTTTTTGGCTCATTTCTATCCATACAGTGCACTGTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAAT:1 + chrX 3464151 5' - hopper 1376 1 54.11 AGACCAAAATGGGCAGATCTGTAGACCTACATTATAGGCTCGAATCTCGTTTAAAAACATCAAATAATATTTTAATTCATATATATATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 + chr3L 27137548 5' + FB 23 1 67.41 ATCGCCCGAGGACCTTCACTCATTAGTGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCAC:1 + chr2R 16403437 5' - copia 163 2 81.51 ATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATA:1 + chrX 21852447 5' - gtwin 7322 2 63.70 GTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGCAAGCATTATGCCGG:1 - chrX 21667923 5' + gypsy2 60 2 65.04 GTGGAATTATCTCAATTTTGCAACAAATGCATAAAATGTAATCAGTTGATACCCAAGCAGACGCTTTACAACACTATGCCGTTAAGTGGTCACACTACGTCGTTATTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTC:1 - chr2L 8320381 5' - Doc 30 1 67.12 TTACATCTCCGCCTCGCCCAGGGAAACTTAATTTCCATATAGTTATGTGGAAGGATGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 + chr3L 20255167 5' - Transpac 266 2 66.67 AGAATGTGAAGAACTCAAGTTGAGTACGGTCGTGGCTGTGGTAACCAAACTTTCACCGGAAGTGGGCCAATAAAAAGTATACACAGAGATACACAGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCG:1 + chrX 13426098 5' + BS 1 1 72.80 CAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 + chr2R 5214982 5' + F-element 47 1 65.96 GTGGGGGCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATGGG:1 + chrX 16183769 5' - hopper 140 1 73.53 CAACCGAATCTGTTTGTCTCTTTCCATTGTGCTCTCTTCTCCGCTCTCCTCACCAATCGCTTTATTACACGTTTTATGTTTTATCATTTCTGCCCTGATATGTTGACGTAGTTGCTCGGTTAGTC:1 + chr2R 9553943 5' - Chimpo 3849 1 70.40 GATTTTGCCTTTGTATCTGCGACATTTTGAGGCCTCCGTTCTGTTTGTACGTTAATTAGTGGAGTTGGCCCACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTACACTATTGGAGATATTTGGA:1 - chr3R 5208242 5' + hopper 48 1 52.74 ACTGAAAACAGAAACAGTTGATGCCACAAAAGGTAAGTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chrX 7980863 5' - hobo 2909 1 62.11 CTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACC:1 - chr2R 21402664 5' + mdg3 93 2 78.08 ACTATGCTATAGAAATTTAGATACAGATGGGCTCCGGTTTGGGTTTTATTTTAAAAAGCGGTGACTTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr3R 26191601 5' + hobo 48 1 52.86 ACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chr2R 641862 5' - opus 479 2 59.60 ATTGATTTTCGGTGGCTCTCAAGTGCGTTAATCTTGTGGTCATTTGGCTGCTTCGTATTAACCTCTGAGATTAGCTGGCATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chr3R 19859723 5' + opus 7142 4 65.19 GCCACACACGTGTATGGTATATGTATGTATATGCTGGGCACAACGCATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chrX 12526028 5' + roo 8698 2 61.81 AGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTTTTTGGT:1 - chr2R 19553281 5' - mdg1 7400 2 56.16 CTAGTTTCACGCTTTGGTTTTCCTTAATCGCTTAACCCAACTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr3L 17207829 5' + hobo 65 1 67.91 TAAATTCAATGCCAGACGCCAGCTCCCTATTTTACATAAAGTATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr2R 12543073 5' + roo 71 2 68.49 CGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCG:1 - chr2R 6271500 5' - blood 146 2 60.27 CAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTC:1 - chr3L 27415331 5' + transib2 45 1 54.79 GCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chrX 14964620 5' - roo 9028 1 62.81 ATTCAAATATAATAATAACCAGACCACATAAATTAATGGAAAAAATGTGTTTGGATCTTCAATTTATCCAAACAAATTGATAAATATTCCTGAATTCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTA:1 + chr3L 5294944 5' - R1A1-element 5180 1 63.89 TTATTTATATTACCGAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGACTCTTTTTTTTTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTT:1 - chr3R 556475 5' + Juan 4159 1 61.64 ATGACTGCTATTGGGAATTTAAAATGATTAACTGCCAATCAATCAATTGTCAAACTAAACTTAAACATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chrX 14964720 5' + roo 54 2 58.22 AGGGTGTTGTCAGATCTTATTTTAATCGTTGAGTGCGTTCTGGTACGAACAGCACAGCTGTTTATATATTACTGAGCACAGCTACCCCACACAAACATATATAGTTATGCGGTAGGGTGATAGGGCCTTTCGAGCAGAGACCGCTG:1 - chr2R 7665884 5' - Transpac 287 2 67.12 ATAAAAAAGAAATTATGCTCCATTGTGCGATTGTGTGAAAAGGTCAAGTGCCCGGCAGGCAAAGGGAAAAGCGAAAGAGACTGGCGTAAAGAATGATTTTTCCTTGTACTACCAAAGAGACTATAATAACAAGATGAGTAACGCCA:1 - chr3L 8421582 5' + 1360 13 1 55.48 CAGAAACAAGATCAGCCACAGAACACAGACCACAAATATATCGTATATATGCATCAGTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATT:1 - chr3L 13539305 5' + mdg1 7440 2 60.64 AACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACTTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATA:1 - chr2R 21402680 5' + mdg3 66 2 62.96 GCCATGCTCTTTCCCTGTCCGAGTGTCAGATTTATGAGTTAAGCTCTGCGAGCCTTGCCACAAAAATTGAAAGCGAAAAATTGTAATAGACTAGCAATGTCCGTATTTACGTCGAGATCTTAGGAACTA:1 + chr3R 25560738 5' + INE-1 142 1 67.44 ACCTGGTCCTGCACCTTCAATCACCCACTCCCCCTCGTCGCCCACCTTTGAGGCATATATTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGATAGTTAGC:1 + chrX 17731967 5' + pogo 13 1 66.34 TATTTGTGCAAAAATGCGTCACGGTGTGTGTGTGCGTGTGTGCATGGGCATTTGTGTTGGTGCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 + chr2L 8366511 5' - 1360 3330 1 57.53 TATTGTCAGCAACAAGAATCACAGCACGATGGACAAAAAACAAAATAAAAAAAAAACTGAGACTGCAAACAACATTGCGATTTGTTTGCCGATATATGTATTCATACACACATACATACTATATATGTATGTATATATATTCTT:1 - chrX 11541602 5' + 1731 4413 1 76.39 ACCCACACACATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTA:1 + chr2L 17240213 5' - hopper2 1553 1 58.27 GAGGCGGTGTGGAGTTCCAAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATAACAAACA:1 - chr3R 29645773 5' + jockey 73 1 60.96 CTCCATCGATTGTTCGAATGTAATTTCATGCACATTTCATCACCATATTCACCATGCACTATCCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chrX 3996594 5' + roo 8719 2 57.64 AACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAG:1 + chr2L 9668207 5' + 1360 88 1 80.82 GGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr2L 246085 5' - roo 338 2 66.44 TAGTAAATGTATATATGTATCCATTACATTGCATTGGGGGAGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGA:1 - chrX 6510122 5' + jockey 4717 1 53.42 ATCTGCTCTATGAAAAGGCAATACCCAGAATTTCGAGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 7515789 5' - roo 396 1 76.71 CTTAGCTATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATGTATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAATTAGCAGTGCTTGGGCAATTTTTTTTTTATAATCTCAT:1 - chrX 22460194 5' - HB 1546 1 75.34 GTAAACTTAAAATTATAAGTTTTGCATAAACTATTTTAAAGAAATAATTGAAGGAACAACATGAATATTTTATTCTATGTTATAAGTAGTATGGCCTCAGTTTGAGTAGTATTTATAAATGCAACATTTAAAAAATATATATTTAG:2 - chr3R 18894338 5' + Transib5 2728 1 78.08 GACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAGATATCTTCGGTTTAAATAGTAGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 24122677 5' - roo 325 2 70.83 TATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGTCACAGAAGACG:1 - chr3L 19350032 5' + jockey 33 1 67.88 AGAACAAGTGAGTGCGAGCGAGATGGGGACACTCCACGATACAGTTGATTGCTTTTTGCAACTGTCTCGTTGGAAAAAAGCGTTTTGCGCGGGTTATTGAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTA:1 + chr2R 10543421 5' - Doc 4639 1 65.75 ATTTCGGACTACCAATCACTTTATAACTCTCCGTAAACTTAACCTCAATTTGGGCCCTACTTAGTGGTTGTTTTTTCCTTAATTATTTAAATTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAG:1 - chrY 380965 5' - G6 2003 1 62.86 CACTTCTATTAATATCTAGCCATTATTCCAGTAAATGAATCAGATTTTTAGCTAATAATTTTTTAACTATTTTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3L 13374097 5' + pogo 44 1 52.41 ATGGCTGAAGTTCCGAGCTACCCTTAACCCCTACCCTTTAACCCTTACCTGGGTGTGGGGGTAGCACAACACAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 30635053 5' + roo 8712 2 51.72 GGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTA:1 - chr2R 8641605 5' + diver 55 2 53.79 AAAAGAGCGGCCAGCAGAGCAATAACAATCGCCGATGCTCGACGACAATGTCGTTCAACCTACTCTTTCAAATGTCAATACAATTTAATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr3L 12224589 5' - 412 7513 2 61.64 CAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACA:1 + chr3L 17707836 5' + Doc 79 1 68.15 ATATTCCAATTAGTTTTGATTTCAAAAGAGCGGCCAGCAGAGCAATAACAATCGCCGATGCTCGACGACAATGTCGTTCAACCTACTCTTTCAAATGTCAATACAATTTAATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAG:1 + chr3L 12224566 5' - 412 484 2 77.93 GGGGCGATTTGGCCGGCGTTTTTAGGAAAATGAAAAATAGCCTTGTTTGTTTTCCGACGCTCGCCAAAAGGAGGCAATTTACAATGGCCAAAAACAATGTGCCCAGACACATATGGGCTTACA:1 + chr3R 10615728 5' - aurora-element 4117 1 58.54 CTTTTTACACTAACGATGGGCTGGCCTTGCATATTTTTGCCAGAGGTTGTTCAAAAATGGGAAAGGTATAAAATTAAAGGTATTATTCTAACATGTATGAAAGTATGTTAGAATTTAATTGTCTTTTTTTTTTATTTTAATAAATG:1 + chr3L 15430614 5' - HMS-Beagle2 478 1 65.75 GAGGAGGATGGCCAGCTGTTGGAGTTCTCCGAACCACTTTCGCTAATCGTCTCCTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTG:1 + chr3R 16093260 5' - Stalker 328 4 63.01 AATGGTTTCATTTAGTACAAATTATTATACATTTATCTAGTTCATTTCATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1 + chr3R 11925129 5' + pogo 71 1 66.44 AACAAAGAAGGGGGTAAAATGCAATTTCAAGTGCAACCGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3L 14553255 5' + roo 8673 2 80.14 ATGGGCAGATGTGTCACTTGGAAGAGTAGAGAATGACCTGGTGAATGGATTCATTCAGACATTGTTCTTGGAACATGTATAAGATGCGATCTCTTAAAGAAGTTACAATTCATTTTCACCTTTTAAATTACAAATATTAAAGACTA:1 + chr3L 1320685 5' - gypsy7 5094 1 86.99 TTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chrX 4778192 5' + 412 7125 2 68.09 ATAGTTTTCCACCTGCTCTCGGTTAAAGTTTTTCCCACACAAGGCTTTTGAAATTTCAACTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 - chr3L 10133624 5' - 412 467 2 59.70 GTTTTATAGTATATTTTCCCTTGGCATGCCTGGCTCGTTTCATATTTTAAAATGGCAACAATTTGCCAAAAACGTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTA:1 + chr2R 21414373 5' - BS 5043 1 52.74 TTTTTATTATTTCTTATCTAAAGTTATATGTAGATAAAATAAAAACAGATACGAGCTTCCTTCCTTCCGGAAATAATGTCTCGAGATCTGGACCTTCATATGGACAGACGAACAGGCCAGGTCTACTCAGCTAGTGATCCTGATCA:1 - chr2R 17451755 5' - INE-1 91 1 84.93 GGGGTTTTGCGACTGGGGGCGTTCGACAAAACGATCGTCATGAGATTAAGTCGGCAGAGACAAGACCATTATGCAAAATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chrX 6481386 5' + hobo 40 1 56.16 AGTCAACCGCAGAGCGTTGGATGAACACGCCCAGCAAAATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGG:1 + chrX 20066143 5' + opus 58 4 71.88 CCTGGCCTAATAAAGTTCTCCCACACAAAAACACAATAAATTCCGATACAAAACTGAAGAAAGCTGGCATATCGACAGATATTTCCGGAATACGATTGGCCAAATCTGTGAGTAAGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACG:1 + chr2L 7388547 5' - F-element 4517 1 77.40 GAAAAGTTATTGCTACACATGTTGCGACACTGAATTATTATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGA:1 - chrX 11234835 5' + I-element 4896 1 69.29 AAGGACCTGGGAGCAAGGACTCGCGGCAAGGACAAGAGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGAATGTTTTCACTCCG:1 + chr3R 8225678 5' - F-element 4376 1 71.11 TACTAAGCCAAATATTTTTGCACAGCTTTGTTGTTTCATTTATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCACGTGCTTT:1 - chr2L 1260042 5' + Burdock 32 2 58.90 ATGGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATA:1 + chrX 16384011 5' - diver 6037 2 67.12 CCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAACGCTAAGCTACAAAATATTTC:1 - chr3L 24934379 5' - HMS-Beagle2 7116 2 71.53 GCAGGGGATTGGGAGTGGAGACGGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGC:1 - chr2L 4174029 5' - roo 312 2 82.19 GCAGATGGCGGATCGGTAGAATTTTGAACATGGGGAAGTTTTTTATTTATTTTATTTTGTTTGTGGGCGTGGCAACAGGGGGGTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCG:1 + chrX 15575859 5' - INE-1 147 1 63.70 CATATGCTGTGACAACTGAGTGAATAAGTATTAGGAAGGGCCAAAAGAAGAAGCCAGTCGATTGGACGAGGCCCGTTCGACTTTACTTCTTGAGTGTACTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTACGTTGA:1 - chr3L 22900221 5' - 412 469 2 67.59 TAGAGAAATTAGAACTTATTAATCCAATGGCATATTGACTAATTTTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:2 + chr2L 3890101 5' + jockey 36 1 63.70 ATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAA:1 + chr3L 25782392 5' + F-element 89 1 83.59 AATCAAATATTTTAATACAGATTTTTAGATAATTGAATTACAAACTTTTAGAGGTATGCCACTTTGAAATCGCGATCGTGGACACCACCTGATCCCGATCCGCACTCTGCACCACACCGCCGCTGCA:1 + chrX 7351235 5' + Chouto 291 1 56.69 ATTCAGTGTCTGGCATTTGGCCAAACGCATGCCAACAATATGGAACGAAAATAGATCCTTGCTTACTCACCGGGACTGC:1 - chr2L 5116681 5' - Rt1b 4996 1 70.89 AATACAGTTGTTACCATTACAAATATCAACTGCTTTATAAATTTAACAACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 13531694 5' + roo 8724 2 64.44 AATGGTCTTTTGCCTCCTGTAACTGACTGATGTTTGGCACACACACTGCCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:2 + chr3L 17175074 5' + 412 7072 2 72.60 TTTTGTTCGTCTGCCTGTCTTCAAAGTGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 10684707 5' - roo 9036 1 60.27 AGTGGGTGCTAAAACTAACGGCACCTAAAACATTTTGCAGCAAATTTCTGGGCAAAAGCATAAGCATAAGCTGCACTTTCACCAAAAATTATGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr2R 11057220 5' + pogo 20 1 68.57 ATTTTGGCTTAACTAAATATTTGATGTGTTTTTGTAAATAGAAGTATTTGTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr3R 13122471 5' + blood 38 2 59.59 ACCCAGAATTTCGAGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 7515767 5' - roo 396 1 72.58 AGTTCAGCAGGTGGTTAAAATCTACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:2 + chr2R 8157156 5' + Transpac 4970 2 57.53 ACTGTGCCTTGCATAAAGGTTTCAATTTTGTTGCACATTTTTTCAATAAATTTAACACACTCAAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr3L 18467129 5' + hobo 8 1 78.77 TACAATTACCATAATTATGCCAGTTGCCATTAGTAGTATCTGATTAGATTAATATTTAAGTCAATGGTTGCTAGAGCGCATTTTATGGTTTTATTTTGATAAATTTAAAGTTGGTAAAATATTGTTTTTTTTTTTCAAATATTTTA:1 + chr2R 24695449 5' - TART-B 10506 4 73.29 GTAGCCCACAACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr3R 21705933 5' + 297 15 2 70.55 AAACACAGCTGCAGAAAATGGTCAAGAAAACTTGGTGGGAACCATAAGGGAAGGGGACGCTGGAGGAGGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr2L 11951632 5' - pogo 2072 1 52.42 ATGGGCAGGTCAATAAGAGATTAATATACTTTGTAACATAATAACAAGAGAAAATACTATAGTCAAGTTCCCCGTCTATCAATGCCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCAAAAGAATCATTTATCTGGGATATCGATGGA:1 + chr4 1128907 5' - INE-1 501 1 74.66 ATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCAT:1 - chr3R 11547785 5' + G2 331 1 54.79 ACACATAAAAAATAAGTGATTAATTAAACAATGAATATTATAGTTTAAATTAGTATTTTTGCCAAAACTATCCCCTGATGTTTCCACTGCTGCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCA:1 + chrX 7632649 5' - R1A1-element 5067 1 48.63 ATAAAATTTCATTTCATTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTCGAGTTTTTGT:1 - chrX 12866523 5' - roo 387 2 69.50 GCACCGAGCATTTATACAAACACCCGCTCATGAATGTCTGGACGCTGTGGTACCTTGAAAACGATCGGTCCAAGTCCTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCC:1 - chr3L 9400769 5' + Doc 459 1 59.26 AATGCCAGACGCCAGCTCCCTATTTTACATAAAGTATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr2R 12543080 5' + roo 57 2 68.80 CGTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAACTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 + chr2R 12787819 5' - 297 6931 2 64.41 ACGGTGGAAGGGTGCTATGTTTATGGGTTGGATAACTTGCACGCTTGCTAATTAAATTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chr2R 4160317 5' + pogo 61 1 63.01 GCGAGGGTTCGTAATGAGTTCTATGGATTTTAGACTGGCAGTTAAATTGACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 21001887 5' + 412 66 2 66.91 AAATAACAGGGTCAGGCATCCGAAGCTAAGCCAGATCCACTCCTGCTGCATGCTGCAATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chr3R 29418639 5' + mdg3 5282 2 58.99 GGAACCGAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chr3L 17890736 5' + 412 72 2 66.21 ATGCGGGTGGCCGTGACTGAGGCGATAACTGCATTTCCTACTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAATTTTGCGGTCAT:1 + chr2R 8638633 5' + diver 104 2 71.92 TGTAAATTTGTCAGTTTTTAGTTGAAGCAAACTAACACCAACGTAGCACCGTTCAGGAAATGTAAGATAACCTGCAACAGCATAATCTTATCTCTAGGTCATGTTGTTCTAAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTC:1 - chr2R 10546605 5' + Cr1a 4224 1 73.29 GATTGGCATATCTTCAAGTTTAAATTGTTGCCAAATCGCCTGCTCCAAAATCTCCACCACTAATCAATAAGAGGAATAAAATTTACAAGTCGGACAGACTTCACCATTCAAGAAAGCATAATCGTATTTGTAGTTTCGCAGATCT:1 + chr3L 5546412 5' - hopper2 229 1 49.66 AACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 + chr3R 22100526 5' + 412 7131 2 68.97 ATAGCGACTTCGACTCAGACCAAGTCTTCGACTCTTTTTGGGTTGCATGCAAATAGGGGACATGTCCTCCGCATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGTGTTCACTTCACTCAAAACAACCGA:1 - chr2R 24529311 5' - F-element 62 1 59.20 AGTCCGTGCAATGAAAGCAAATTAGCTTAAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 7035196 5' - roo 393 1 74.66 GTCATAATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATG:1 + chr2R 13644417 5' - Burdock 6329 2 63.89 AATGTAATATCATTTTTGTACTAATAATGATTCATACTAGTAAAAGAAAACAAACAAATGTAGGATACTGATTAGGTCTTTACCTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 15612680 5' + roo 38 2 60.27 AGATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACAT:1 + chr3L 24272059 5' + gypsy11 4046 2 59.03 AAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chrX 16855321 5' - roo 8995 2 69.18 GAGGCTTTTTGGTTTAAAAATAGCCATCTTTATATTTATTTTTGGTCAATATGGCCCTTACCTGATACTCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3L 96607 5' + roo 8717 2 55.48 GAACGGGGTGTGTTTGATCACTCGGAAAAATAACTATACATTATACCCTTTTCTTGATTCAGAGAAAAAACAATTATCAAATTCTGTTACTCAATTGGATTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 + chr2L 2052638 5' - blood 7379 2 68.89 GTTCACCCAGTTGTCAATATAGTACGCTGGACTGGTATTTTTATTATTTATTTTTTTATTTATACTAGATTCGTTAAACAGTATTTAAAAGGCAGAGCGAAGCGTTTCCAACCATTTAAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2L 20413502 5' - roo 410 1 29.45 ACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGGATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATTTTAACG:1 - chr2R 6526607 5' - jockey2 3324 1 54.79 ACAATTTCTAAACAAATAAATTCTATTAAATTCTATGCCATCTTAATGTTTGTTATATCTATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chrX 13531597 5' - roo 9011 2 60.27 ATACATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAAT:1 - chr3R 21276658 5' - BS 5067 1 57.53 CAAAACCTTTGGTTACGGATGCATTGTATTAATATGTTTTGAACTCCTGTTTGCTGGAGTTGAAATCAATCAGAAAAAAGGGTTTCCGACTATATAATGTATATACATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGAACTGGC:1 - chr4 1121541 5' + INE-1 100 1 54.79 AGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGCGGTCAATG:1 - chrX 6510082 5' + jockey 4700 1 56.18 AAGGGGGTGGAACGTGCACTTAATTAAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAGATAAAATAGCATAT:1 + chr3R 22100488 5' + 412 7082 2 65.67 AGAGCGAGCGAGCGAGCGAGCGGAGAGCTCTACATCGATCAGCTCTTTTCTACGCATAAAGTGTCAGCCGACAACTGTATGTGTGCACATGGATACTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTT:1 - chrX 1990047 5' + 1360 207 1 75.97 GCGGGGGCTTTAAACTGGGTGGGGCAAATAGACAAAAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAA:1 - chr2R 2146596 5' + I-element 371 1 80.14 CAGCTTGGCAAAGCTATAAAATATATATGAGAAATTAAATCTAAAATCCATTTATTTACCATGTTACCATTACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGC:1 - chrX 10161249 5' - micropia 5433 2 77.78 AACTCCTGTTCGACCTGACAGCCCTTCACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCACAAGAG:1 + chr3L 23933529 5' - Cr1a 226 1 56.85 AAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAATTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 13374210 5' - pogo 2033 1 66.90 GCACGTGCAACAGGACCAAACTGAAGCTGAAGACCAGGAAACCTTAGGATGGAAGGCAAAGTAATAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGC:1 - chr2R 7020657 5' + Bari1 41 1 53.08 AAAACATCGAATGAGTTATTTTGCTAGTTATTTCATAGCTACGACTGGGATATTAAACGACAGGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chrX 1061519 5' + 412 45 2 52.24 AAGCGATAATAAGTATTTATGGGCGGGGCAAGCAGATTCGGTTTCTTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 - chr3L 13634296 5' - 297 6945 2 58.18 ATTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chrX 4778149 5' + 412 7087 2 60.96 CAGATCGTTTCCCTTTACAATTTACAGTTGCAGTCTGCTGAGAGTGAGAGCGGATAAGTGAGAGAGTGCATTCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chrX 14951217 5' - P-element 2841 1 52.41 AGCGCGGCCCACACGTTAAAGTCCCACGACGGTGAGCGTGGCCGGTTTGGTGGCTTTAGGGTGGAGTAAAAAGTTATTTGGCAAATCGATAGAAATTTACACGACTAATAACGACTGAATAATTGATCCTGATCAAGAATATATA:1 + chr2R 5322529 5' - INE-1 81 1 78.62 GAATTATCATAAATTACTTTAGTATGCGATAAATCGTGATAAATTTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCT:1 + chr2L 17250658 5' + opus 5 2 78.62 TTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chr3R 9352099 5' + Tirant 37 2 54.47 ACGTGCCTGGACTTTGACTTGGACTAGGAGCTGCTGGTAGTGGAGCTGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr3R 22100625 5' - 412 456 2 56.83 AAGCCGATCGGCGAAATAATAATAAAAAAAATACAAAACTGGAAATGGGGTCAATGGCAAAAGCATTTGAACTCTTGTTTATTTCTGGCGAGTTTGTTTATGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 13927670 5' - roo 9052 2 70.55 GTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGCTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chrX 12866478 5' - roo 399 1 60.71 CAACATTTTCCGAGGAAAAAAACTCGTGAAAGGACATGGATTAACAACTAAGGTTTGTAGTAGGGATTTAACAATATACATATATTTAAGTATATTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr3L 2878563 5' - 412 7518 2 65.07 AAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTCCACAATGCCTCGAT:1 - chrX 1103709 5' - pogo 2074 1 54.29 CCAGCTGCGAGTGTCGCCGAGCGTGAACGGGTTGGGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3R 17305417 5' - roo 407 1 78.95 TTCGCATACCCTGGTACCCCTTGTTCGCAACGAGGAAAAAGTTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTATAATATCATTAGGTATT:1 + chr3R 31887732 5' - HB 1538 1 65.75 TATATATGTATCCATTACATTGCATTGGGGGAGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGA:1 - chrX 6510113 5' + jockey 4726 1 53.42 AAGTGGATTATTACCTCATGCCAATTATCATATCAACGATACACAGGCACAGGTCTCGGTAAATGGGCAGAAACACACACTGAGCCACACTCGAAATACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTAC:1 + chr2L 22078442 5' - 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Bari1 1649 1 56.16 AGTTGCCATATTTGTAGACACAAAATCAAGTGCCAAATTGGGGAATTTGATTCATTTGTCATTTATTTAAATTCTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACACTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 - chr2L 9472133 5' - roo 393 1 74.66 ATATACAGCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr2L 9668283 5' - 1360 3334 1 59.03 ATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr2L 76129 5' - roo 9000 2 72.60 AGCCAAGCGCGGCTGCGAAAAAACTGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 - chrX 8891812 5' + P-element 25 1 39.47 GAGAGACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 + chr2L 9668197 5' + 1360 78 1 75.34 TATATGTAGGTACGATTTTTATTTATTATAAAAAATTATTTGTATGAAACTCATGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAG:1 - 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chrX 18806221 5' - roo 8984 2 77.93 ATGTAGTATGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGC:1 - chr2R 2650889 5' + gypsy 7051 2 70.54 ATGTACTGCCATAATAAGGTTAGCTCTTAAAAATCGTACGATTTCTTAAAGCTGGAAACATTCCCTTAGCTAAATATATATATGTTAGGACATTATCATGGTCGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCTGCATTTGACTTTATTTC:1 - chr3L 18897147 5' - G3 4355 1 43.45 AAAACAATAAGGCAGGTAATCATCCCAAAATCAATCGAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATCGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGT:1 + chr3R 7598810 5' + Juan 67 1 63.01 TTGCGCAGTATGGCCACACTGATAATTCAAATATTTTGGCACTAAATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTA:1 + chr3R 11750133 5' - Tabor 463 2 69.86 ACCTGTGTGCATGTGCATGTTGTCATGTGCTTGTGTGCGCGCGAGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 + chr2R 6632535 5' + P-element 36 1 60.96 CACTGACAATGTTTGATGACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCA:1 + chr2R 5542339 5' - 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I-element 5337 1 63.04 TAGCATGCAACCAAATTGATAAACAGTAGAATGAAAAATTAGGCTGAGATTCTAGGACAAGACCACCACACCACATAACCGACAAGGAGCAGCTGGACAGGCATTTCGTTTCAATTGAAAAACAAGACAGAATGCTATAGTCAAGT:1 - chr2L 23315577 5' - INE-1 576 1 56.85 GTGCGGGGGCGGAGATGCATCATTTTATAGAGAATTCAATGGGGAGGATGGAAGTGTCGACAAAGCGTTTACTCCTCTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGAGG:1 + chr3L 7995353 5' + P-element 2 2 80.69 GTTTATTGACCCATGTTGCCACACCCACTCTAACGCCCACAAACCGCAAAAAACTGCCATGCCCACACTTTTGAAACATATTTCAAAGTTTGCTTATAATTTTATTTGCCCTGTAAATTTCTTAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCG:1 - chr3L 25611189 5' + G5 4434 1 51.39 ACACAACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr3R 18815980 5' + hobo 54 1 52.78 CGGTTGCACCGACGAGCAAACAGAAGTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chrX 22610760 5' - pogo 2033 1 76.61 AGGCAAGTAGCTGAGTCGCGATATCATCAGATAGAAAGGCTCCGGCTTAATGCCCACGATCTCGTCCCGATCCGCCTGGAAGCATATAACCTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTAC:1 + chrX 7323535 5' + Cr1a 4310 1 59.59 GACCTCAATAAGTATCGCCCGAGGACCTTCACTCATTAGTGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCA:1 + chr2R 16403424 5' - copia 5045 2 72.60 AATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chrX 21852440 5' + Tirant 8114 2 65.33 AATTCTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACACTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr2L 9472064 5' - roo 8987 2 74.66 TTAAATAAATAAATAAATATGGCAATATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGGTTTTT:1 + chrX 14625458 5' + hopper 6 2 81.51 GCTTATTTGTGTGTGTGTGTGCGTGAAATTTGATGCCGCACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAGAGGTTGTGTGC:1 - chr3L 7995488 5' + P-element 82 1 29.45 CACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGA:2 + chr2R 4312958 5' + gypsy 73 2 65.75 TTTGGTGTCTGCAATCATAGATATTTAAATTTCAAACACATATATATAGAAATTCGTACTATTTTTCTTCAGTGCATCAGTGTCTGCCGTTCCCCCTGGCACTATTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chrX 5858850 5' - hobo 2923 1 69.86 CTGTTGTAACAACTATCTTGATTGTTAATATAGGAACATGACAAATATTTACCCTTGTAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCTTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGGGATC:1 + chr2L 65078 5' - X-element 4509 1 50.81 GCCAAGGCCTTTTGGAAAAACATCGAATGAGTTATTTTGCTAGTTATTTCATAGCTACGACTGGGATATTAAACGACAGGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chrX 1061503 5' + 412 38 2 54.55 AGTGTCGACAAAGTGTTTACTCCTCTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 + chr3L 7995405 5' - P-element 2833 1 48.97 AGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chr3L 96529 5' - roo 8980 2 79.45 GTGTACTTTTAAGACCAACATCAACAGTATATTTGTTATTCGTAGTCTAAGATTGTTTCGATATTTATGCAATACTTAAATAATCATTATATTCTTGATCAAGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATC:1 - chr3R 29993597 5' + INE-1 120 1 59.59 AATACTTATTTATTATTGTCATCTGTGCGCACCTCGATTTGGGTTAGCAGCCGCGTAGCTGGGAGGCTGTAAATAGCTCAATGTGTATATAATAAAGATACAAACATCTTTTAAAACAAAATACTAAATATTATTTAT:1 + chr3L 13423090 5' - roo 82 2 65.22 TATAGCAATGTGTATTGCTACAGTGTGTTGCCATTTTACAGTTTGAGTATCCTTCACGTCACTATTTTTTATATATTTCTTTTAAGCAAAGCCGTTACATAGAAAACACTAAATGTATCTGCGTTATATTCCTTTTTTTTTTTGTT:1 + chr2R 21831024 5' - Doc2-element 248 1 71.23 TTTGAGACAATTTTCCCCTCGGCCAAATTCAACAATTTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1 + chrX 4300084 5' - opus 448 2 69.23 ATGAAAAACTTTCAAGAGTCTGAAACTAATTAACTTTGTATCCAGGAGATAAGCCTCTTATAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGCAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr3R 11113176 5' - mdg1 386 2 50.43 ATGCTCCTAAGACCTTTTGCTGATTTAAAGTATCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGTCG:1 + chr2L 5601578 5' - mdg3 5419 2 71.53 CCTTCAGACTTCTTTATATCTTTTCTTTTATTATCTCTTTTTTTATTTGCAAGCTTTTTTATTTAACAGCTCTTTCAGGTGGATTTTTTTAAAAGATGTATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCG:1 - chr3L 8856008 5' - rover 7280 2 63.01 GCGCAGAGGCAATGAACAAAAAGGAAAAAAGTATTCAACCCAATAAATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTT:1 - chr3R 845823 5' + FB 76 1 70.55 ATTAATTCCCACGCCCAAGAGGCATATCAAGTATTTAAAAAAGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3L 15612784 5' - roo 329 2 72.92 GAAAACTGAAACCCCAGTGCACCGTTTGTCATTTGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr2R 7953719 5' + roo 8751 2 80.14 AGTACATTAAGTGCTTAATTTCGATTAATTACTTGTCTAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2L 16884759 5' + pogo 18 1 65.75 TATGCACTTTTAAATTTGTACACACGTCATCCGCACTCATTACAAAAATATCAAAAATGGCTAACCAATGCGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATG:1 - chr2R 5542451 5' + 1731 53 2 50.68 CCACACAAAATACTCCATCCAGGTACAGAAGCAAACAAGAATTAAACGACCCTTAAAAGCGTGCTACGTTTTTTTTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 6515264 5' + jockey 15 1 79.29 GTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATAT:1 + chr3R 17605655 5' - Tabor 401 2 72.60 ATTTCATTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chrX 12866513 5' - roo 9035 1 60.27 AAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chrX 2762599 5' - roo 8988 2 74.31 ACTTGAATTAACCCCTTCCATTAAGGATCTCGACGCGGAACCACTGTGCCCACTGGGCGTTGTTCGCCTGACGTTGGTTGTTCGTTTGGGGGATTGGCTCGGTGTAATAAAGCATAAAAAGTAACTCCTAATCTTTCATTGTCAC:1 + chr2L 21023953 5' + gypsy2 265 2 63.45 AAGGCGATATCCTGCCGATATCCCTGGAGTGTCGCTCTTGTTAGCGACAATTTACGGCTTTGAACGCTTCCGCACAAACCGCTGCCGTCAATTTGTCAATACATATGTTATGTATAGCTTAACCAC:1 + chr3R 8280573 5' - Stalker2 7463 2 77.78 ATGTAGTAAATAATATTCTCTTAAATGTTAAGATCCTCAATGGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGA:1 + chrX 16383972 5' - diver 188 2 60.96 TACAATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1 - chr3R 16913451 5' + pogo 70 1 69.18 ATATGCACGAATTGTACACCAAATTGTAGATGAAAGTGGCGTTTATTCGTTTTCTATGCGGCAATAGTGATTTATGTAATTATTCTAAAAACATTGTACTCTATGTATACATGTACTATAAATGTATATGTACGCATACCACATAC:1 - chr3R 18659189 5' - gypsy11 3974 1 54.79 GCCTTAAATGCTCACGCAGCCGATCTGCATAGATAATGTGAAAGGTGCTATTTTAAAGGTTGCTATTTTGATGTTTAATGAAAGAAGAGCTTAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTG:1 + chr3L 23571612 5' - Stalker4 323 4 75.18 TCGATGTGCCTTTAAATATGTCGGGTTGGAAAAGTTCCTTATGACTTTATACATGTCCTTCTATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr2L 10746712 5' - pogo 2070 1 51.67 TACACTTGACACTGCGCTGGCGTGGAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 22100550 5' + 412 7095 2 70.59 CTGGACAACATTCTTTGACTTTCTTTATTTTCTTTTTAGCCCTTTTGCCCCAGTAAGTATGAAATCTTGATCAGGTTCAATAGCCCAGTCGATCTGACCATTTCCGTATGTTCGTCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAACTATA:1 - chrX 15927854 5' + INE-1 144 1 60.96 AGGGCGAATTTGTGTTTGTTTCGAATGGCAAAACTAAATTATTTCATCCACATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTG:1 - chr3R 29418756 5' - mdg3 5441 2 60.15 ACTTGGCCATCGCTCACTTTTTGTTCAGCGCTGATTGATCTGATAGTGCAAAAAAAATGTTTAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACA:1 - chr3R 15924698 5' + Quasimodo 34 2 58.46 ATAGCAATGCAATATTGGCCGGCATTGAATTCTCGTTTAGTTTATCCCCAAAGAATTTCATGAAACAACAGAGGAAAGAGAGGAGCACAAAGCTACATACATACATACATACATACATATGTCTATGTTGTAATTTATAATTTATA:1 - chrX 22858556 5' - copia 256 1 75.34 ATACTTTTTGCGTCCTCTAGCTATAAGCTGTTTGTTTTTGTTGTGACGGGCGCGGCATAACAAACTGCCATCATAAATTAAGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 + chr2L 12353907 5' + jockey 4710 1 52.74 GAATACAAAAGGACTTTGTTTGCGGTCGAGAGATGAAAAGTCATTTCTCTCCATTATTTGCCAACTAATTGGTTGGTAGGACTTGTGTATCAGATTTCATCTTCAAAAAATATAAATAAAAACTTTAGATATGTACCTACATTATA:1 - chr2R 12806290 5' + mariner2 812 1 59.59 CAAATTCCCCGAACTTCCCGCATTGAAAAGCCTTACGAAATCCGACAGACGAAAGATGAATGGAGAGGCCCACTTGAGATGATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr3R 13612924 5' - 412 7533 2 70.00 GTTTAGGATAGTAATCGACTATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGC:1 + chrY 680438 5' + invader2 25 2 62.86 AGTGGGTCTTGATTTATGGGATTTGCAAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTATATTTGGAAATAT:1 - chrX 5150394 5' - roo 360 2 52.74 ATAGTGGCGTACTTGGGTGATCCAAACCGGACATTTCAATTATTTCATCCTATAGCCTGGCCTAAACAGATTTGACTGCTCTCTAGGAATCTTCTCCTAATCTTAAGAATCCAATAGCAATGCTCTCACGAAATACCAATATTGT:1 + chrX 22901644 5' + 297 215 2 66.90 AATCATAGCAAAAGTATCTGCAACTTGACTGAGGAAAAGCAGCGATTGCAGTTGGAGAAAAGCAGGCAGGGGATTGGGAGTGGAGACGGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr2L 4174094 5' - roo 401 1 76.23 CACTTAATTAAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 + chr3R 22100504 5' + 412 57 2 54.11 CGATCGGGTTCTTGGCCTAAAAATATTTTCTGCCTTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAA:1 + chr3R 9160645 5' + copia 6 2 76.92 ATTAATTACTTGTCTAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr2L 16884782 5' + pogo 41 1 50.00 ATTACAAAATATTAGCAAAAACAACACTAGCTCTGTCACGGTCGCCAAAACGTTGAAACTCTTTTTCTTGAGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACAGCAGCTAGG:1 + chr2L 22736907 5' - diver2 4809 2 52.74 CCATAAAAACTGTGATTTTTTATTTTTTACTAAGTGTCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chr2R 9873645 5' + roo 8749 2 82.88 AATGTAATAATTGGAATCATTGAGCTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr2L 10184414 5' + Doc 30 1 60.50 TATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:2 - chr2R 10695882 5' - roo 9018 2 57.53 GTATTCTGTATTTGTGTGGTATTCATTTGCGCATATGTATGTATATCGGCCCGCTCGGCTGGCTGTGTGTATATATGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3R 17067942 5' + 297 6618 2 58.90 ATTCGATCCTGCAGCTTTGTCCATTGGCCCAGTTGATGGCCAATTGTGTCCGCTTCTCGGAGGCCATTGTCTTTGGCAGCAGCCGCTGATATGACCGACCTAATAGACTTTAGTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr3R 12599175 5' - 412 484 2 78.77 ATCCATTTACATTAAAAATGTCCAATTTACAAGTTAGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTA:1 - chr3R 11113247 5' + mdg1 86 2 80.82 CTTCAAGCATTTGCATAGAATATCACACCAACGATGAAACAGTAAAAGGTAGTGTATCAAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCAT:1 - chr3R 9352232 5' - Tirant 230 2 55.00 AATAATTGCAAAATGCCACGAAGCGTCTAGCTTCGTCTGCGTTTACTGGTTTGGGGTAGGTCTTTATTACCTCATATTTAGAGTCATCTGGCAATATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 + chrX 3299685 5' - 412 481 2 72.93 GCTGCAAATCGAATTTTTCCTTTCAATAAAATGTGAAAAAAATAAGGAAAGGCGGAAAATTTTAAGGCAAGATATCTAAGCCACGGTCCAAATAGAGAAAAGCTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chrX 12866344 5' + roo 11 2 77.30 AGTCGGTCAGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr3L 23146442 5' + 1360 17 1 70.99 GGCGGTGGGAACGACGTGGGTTGAGATCTTGTTACCATGTCAATCATGATTATCGTATTTCTTGCCTATATTTGCAGTTCACCGCAATAAGTCTCCGGTTTTCTCAGGGTTAGTATATAGTACAACATAGTATATAAACATTAAG:1 - chr3R 24088761 5' + invader2 47 2 53.79 TAAACTTGACTCGACACAGGGCCTTGTAAACTCCTGTCCCATATCATTTATCCACTTGCTCATAACTGTAGAGGGAAATGTGTTCATGGATACTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGG:1 + chr3R 30510274 5' - gypsy12 10166 2 63.70 ATTTCCATTAAAATGCCAGCATTGCGCCGTCAAGTATGCAACGCGACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACT:1 + chr2R 5922938 5' - jockey 4960 1 45.21 CGTTGGGTTAAAAGCGAAAAGTTCTCAGTCCCGAAAACGTCATATTATTAAAAAAATTTGAGTGGCCGAAGACAGCAAGTAGATGAAGTCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGGTCCAAGCTGCAC:1 + chr3R 25571764 5' - hopper 482 1 76.47 TATTAACACTGGATTCTTTTCTTAACTGCTATTAAGAGACTTTAAAAAATTATACAATAATTTCCAAATGTTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 + chr3R 13631339 5' + 297 6629 2 56.16 GTGGGGGAACTTAATGGGCAAGGGGGACATGGGCGTTAGAGTGCCGGGTGCTGGCCTCTTGAAATTTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAT:1 + chr2R 21371428 5' + roo 8685 2 61.74 TTGTTGATGAGTAATATTTCTTTCAGCGAGCTGTAGAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTT:1 - chr2R 4313052 5' - gypsy 7387 2 47.95 ATATGCACGCTTCGAAGTACTACAGTAAGTCATCAAACTATCAAAATTGTAAGTATTTATTAATACTGAGAGGCAACCGATTCACATTGATATAACTATTTGCTGTGTTCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCAC:1 + chr2L 413003 5' - R1A1-element 5006 1 76.22 AGGACCCTCCGCAGTGCAGCGAGCTATGTAAACGGCACACGGCTCTCAGCGAGTTAACAATGTTTTTAGCCAGGTTGTTGTTACTGCCGCTGTTGCCGTATTATTAGCCAAAAGGAAGCAAGTAAGAAAATAATAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 12836712 5' + BS 5094 2 68.97 ATCCTTTTTAAAACTTTAAACATTTAACCAAAACTATTTACTTAAAGGGTATTAAGAATGTCCATAGCTTTTCTTCTTGTATTTGTTTTTGGTTGTATCAAAACAAAAATCCAATCAGCGGGTGATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr3R 23240369 5' + jockey 7 1 78.62 AAGCCATAAACAGTTGATCCGCTTTTTGTCTTGTTTTTGAGCAAATAACTGCATTTGACCTTGTTTCGATCTACCTTTGTATGGGTTAGCTTAGAACAAGCAAGAACAATGCATACTTCACCGTCGTGCGTGACGCCCGCGAGTGC:1 + chr2L 1668650 5' + Doc3-element 310 1 69.86 AAATATTACTATTAGTGTTACTAATACTATTTGATCAGCACATTTCCCTTCTCCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3R 20743976 5' - roo 9004 2 66.44 GTAAATAATATTCTCTTAAATGTTAAGATCCTCAATGGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCAT:1 + chrX 16383977 5' - diver 183 2 57.53 GTGCGTTCCCATCGATTGGGAAAGGCAAAGGTGTGCAGACAAAGGTTGAATAAAGTTGCTCGACTTTTAGATACCCATTACTCAGCCAGTGGAAGTGCGGGAAAGAAAATCTGATAGACAAAGAACTCGACTATTGCATTCTCTTT:1 - chr3L 21427045 5' + INE-1 576 1 62.33 TTTAAGACGTCAAATAAACTGAACTGATTTAACCTTTATCTTTCGTATCTTGCGTGCACGAAAGCCCAATTTCCATAAGGACTTTTTACCCCTTCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACTCCAACCCTCTAGACCTTCTTA:1 + chr2L 22050530 5' + I-element 5100 1 65.07 AGGGTCCAGCCATGCAAGTAATAGTATCCTTCTCTTATGGGACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAA:1 - chr3L 22648365 5' - Tabor 404 2 70.55 GGGGAATTGGGGTTTTGCGACTGGGGGCGTTCGACAAAACGATCGTCATGAGATTAAGTCGGCAGAGACAAGACCATTATGCAAAATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chrX 6481394 5' + hobo 27 1 63.83 GACTAGGGGACAGTCGCCGGGTCGGAGAGATGTGGATAATTCAATTTTGCAGAATACAAAAATGTTTTGGTTCAAAAGATAATAAAATATTTGTACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:2 - chr2R 4930645 5' + Ivk 28 1 63.01 ATATATATATACATGTAGATGTAATTTTGATTCACTTGCTACGGCATTCGATTCAGCTACTCGTACATTATCCCAAATACTCTATTCTAAGCTCCCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 + chr3R 15337993 5' + blood 28 2 66.44 AAACAGAAACGCTGGTAAGAGTAGAGATAGTTTTTTTTCTATAAAATTTATAAAATTCTATGGCTACAAAGGCTTGAATCAATATAAGAAACGTAATGAAAAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATA:1 + chr3L 11151627 5' + Chimpo 176 1 49.32 TTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTATCAGAAACCCACTTTTGTC:2 - chr3R 11547750 5' + G2 366 1 78.77 GCTGCGCCTGCGCATTCAGTTTAATTTTTATTTCATTTTCGCTGACAATTTGCAGCCGCTGACCAGCAAAGGAGAAATGTATTAGTTAGAGACGGCCCTAGGCTTTCTTTGCTGGGCTGGAGAATCTTTGCGCTT:1 + chr3L 6472338 5' - Doc2-element 4621 1 57.04 TATTACGTGTTAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTTACAAGTATGCAAATT:1 - chr3L 13827381 5' - hopper 1375 1 58.22 CAATAAATGATCTAGAATATCAGTTTGGGCACAGTTTGCAATCAAATCTGAAATGGAAATATTAAAACTACTTACTGCATTAAACGTTCTTTATATTCAAAAAAATATAATAATAATTATATATAATAATAATAACAATTATAATA:1 - chrX 16873389 5' + mdg1 25 3 84.93 GCGGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 - chr3L 22400366 5' - 1360 3335 1 54.79 AAGCGGAGCAACAATCGTTGTCGCAGTTCCAATCGCCACCGCAATCGCAGGAAGGCACTGAGAAAAATGGGATAGTCTTTCGATTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCCAACGTGCTT:1 - chr2L 10104431 5' + S-element 357 1 64.80 CATTTGTGCGAATGTTCACATTGAGAACTCTGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - 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R1A1-element 4933 1 63.91 TTTTAAATTGGAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTC:1 - chr2L 21570267 5' + Dm88 60 2 58.90 GTTTTGCTTTGAGTAACGAGTTGCCTGACATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGT:1 - chr2L 686107 5' - roo 9050 2 67.19 AAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTA:1 - chr3L 25508750 5' + 1360 334 1 63.38 CTGCGCGGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 22400370 5' - 1360 3370 1 64.35 CAAACAAGTTTGCTTCCATTTCCTTCTACCTCCAAAGCAAACAAACGGGTCTAAATTGAATTAGAAACAGCGCATCAATCATATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr3R 23010133 5' + I-element 36 1 59.31 GCTGGTGCTACATGTAAATTAATATCGATATCGATTCGTGTTTATTAGTCTAACTTAATTTAATCAATTTTATTTATTTAGTGTGGCATTCCTAACTAATGTTTAAAAGTAGTATGAATTTACTACACATACACACATATTTACAC:2 - 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Stalker4 7011 4 54.11 TCATGACTATCCAGAAAAACTATAGAAAATAAAGAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATAT:2 - chr2L 18149547 5' - Bari1 1662 1 56.16 ATCTACGAAAAAGTCGGAAACACTTTGTCGGTGGCTTGGCTTGTTTTTTTGGGGCTTTGGTTTTGGTTTTGCTTTGCTTTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 7515619 5' + roo 8701 2 59.44 ATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATCT:1 + chr3L 2725009 5' + Ivk 103 1 74.48 AAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr3R 22100513 5' + 412 44 2 53.23 GGTATTTCTCCCTTTAGGTGATTGCGTGCGAACACTCTGGAATGGACACCAAGGGCAACAAGATCTGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAAT:1 + chr3L 19842275 5' + pogo 1737 1 54.48 CAATCACTGGGGCTTCAACACAGCCATCCTACGGCAGGCCGCAGGCACCGGACACGATC:1 - chr2R 6287413 5' - 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3S18 325 2 75.34 AGTGAAGAAAGCTAAGCAAATACTTTTTTTCTCTGCGGCAGCATCATGTAGTTAATTATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGGCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1 - chr2R 14047704 5' - mdg1 7384 2 65.75 AGCCAATAATTTTCAGCCGGGTCGAAAGGACACAAGAAGGCCTGGACAGGACACCCAGCGATTGGCGCCACACATATGCACAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACG:1 + chr3L 13164789 5' - Doc 476 1 60.47 GACTACTGGCATTAATATTAAATTGGCTTTTACGGGTGCTATGGGCTCTTAAAGTTTAATATCTACAATCGATCAATTGGTATTTTTAAATACATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2L 14201505 5' + roo 8691 2 61.64 GCTTTGTTTGGCCTCTCAATTAGTTGCCTCATTGCATGACCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr2R 20865739 5' - 412 7493 2 66.67 TAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 + chr3R 22100536 5' + 412 75 2 73.48 GGCAAAGGCCCCAATCACTAAATAATAATTCTGTGACAGAGGTTTCCGTTCTGTCTTTTCGAACTTTTTACTCTTTCAGCAACTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACACAAATAACGT:1 + chr2R 5954916 5' + copia 15 2 69.17 CAACGATTTGAGAGACCGCATTTTATAATTGAATCACGTACGACATTTTCAGAGGCGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGG:1 - chr3R 28272317 5' - Tirant 400 1 75.90 AAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 - chr2L 2276791 5' + F-element 38 1 50.00 ATTATTTTTGGTCGCTTAACTTTTATCTTTTTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTT:1 + chr3L 12085410 5' - F-element 109 1 78.77 GACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3R 16181227 5' - roo 347 2 61.15 ATATGAATTTATTTTATATAATGTTTTATTCAAATTCTTATTACAAGTTGCAAATATTGTTTTAATATTTATCGAATACTATTATTTAATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2L 16399288 5' - roo 9042 1 54.17 ATGTTTATTGTGTTTGAAACTAAGAACTATTTGGTACTTCTCCATCGCTTTATGAACTTCATTCTCTACAATTCTCATAATGATTTTTGTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3L 20594093 5' - roo 9042 1 65.07 TTTGGAATGCAGGATCTGAAGACAATGCTTCTTGACCACGAGCGCGGCCAATATTTACTTAAGTGTTGTTTCATGTCACCTGGAAAGCATTTGGACATGAAATTGTTGCGTTTCAGTATGTGGCACACACACAGATACTCACACA:1 - 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roo 358 2 54.17 AAACACCACCGCTCACACACACACGCACACACATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr2R 24687571 5' + hobo 65 1 74.60 CATCGTCCTGTGTCCTGCGTCCTTTGGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chr3L 22322357 5' + hobo 60 1 77.27 ATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3L 14553115 5' - roo 334 2 69.18 GGTGGAATAATTTGAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACACAATC:1 + chr2R 5917818 5' + I-element 5112 1 58.22 ATATTTAAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1 + chr2R 20673627 5' - mdg1 365 2 55.48 CTCAAAGAAATCGCGATCGCACATATGTTTTCGGTATTTTTGGATATTCGATTTGTCGATTACATAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTAT:1 + chr2L 436454 5' - copia 5067 2 56.85 GTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr2R 5214993 5' + F-element 49 1 75.29 AATATGGGTTTGACATTATTTGCTTCTAGCTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGGTCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGAC:1 + chr2L 8959868 5' + Ivk 5107 1 61.64 ATATAATCGTAATCGCAATAGCGAATAGCACATAAAATACGGAAGTAAGCATTTTCAGCCTTAGTAAATAGTTCTCAACATACTCTTAAGGAATGTGGTCATAGGTAGGGTAGGGCAACCTGCGAACACAATTACACCGGTG:1 - chr3R 3322840 5' + Gypsy12A_LTR 1977 1 61.97 ACATGCATGCACATACATATGCTATGCAAATTGCGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr2R 19554894 5' + pogo 29 1 61.64 TAATGCTTTCTCCCTTTCTCCTAGCCTGGCCTTTTTTCCTGTCGTTGAAACGTGTGTCCAGCGGAAATGACAACGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr2L 13704665 5' - hopper 1408 2 72.48 ATCTGCGTATGGGTTTTCAATGAAACTTCATTTTAGTCCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATT:1 + chrX 22610705 5' + pogo 80 1 71.72 GGCTTTATATTTTCACTCATCCTTCCTCTCTTTTCATCCTCCTGCTGCTGCATATGCTGAGTGTCCGCCTGTGTGTGTGCACGAGTGTGTGCGTGTGTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - 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Tirant 372 2 64.18 GATTTCAGGTATTTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 96490 5' - roo 355 2 52.74 AGTACCAACTTTACTATTACTACTACTAAATTTAACACCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAC:1 + chr2R 12240108 5' - copia 172 2 76.55 GTGCAGAAAAAGTGACTGACACTTGGTAAATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr2R 6842833 5' - roo 8985 2 76.55 GTTGTGACGGGCGCGGCATAACAAACTGCCATCATAAATTAAGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 + chr2L 12353946 5' + jockey 4683 1 55.00 GCACTAGCTCATTACACAAATTTGCCAACTTAATTACGAAGATGGCTGGCTATACACAATGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACAACC:1 + chr2R 10859365 5' + jockey 4745 1 62.22 GAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr3R 10684806 5' + roo 8752 2 78.08 ATGCTAGTACTTACACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTG:1 - 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FB 850 2 62.76 GCAATGAAAGCAAATTAGCTTAAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAGATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 7035203 5' - roo 9049 2 68.49 TTTACCAATTCTAATTGCTCTTTTCAACTTTTTCAAGACCAAGAACGATATTTGTAGGGTATTTGTTTAACGGTGAATCGCACCGTCTTGCGACATTGTCATCCGTCAGGTTTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTG:1 - chr2R 3104465 5' - Gypsy6A_LTR 336 1 69.86 AATGGTAGCCAACAAGTGCACATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 + chr3R 19859562 5' - opus 496 2 55.56 CACTTGGCATTTAACGAGCATGTTAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 12867255 5' - roo 9054 2 58.09 ATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAGTTTGTTA:1 - chr3R 7539511 5' + roo 85 2 75.34 GGACGAAGTGTAAGAGGGACAGAAAGATGGAAGAGATGGTAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 - chr3R 19531305 5' + hobo 2708 1 68.75 GTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTC:1 + chr2R 641879 5' - 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invader6 4484 1 56.83 CTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAA:2 - chr3R 26246878 5' - 1731 4540 1 73.97 CAGGAGTCTTAGGCTAAATGAAAACAAAATTAACTGGGGAGCGAATTACCCGAGTAACTCCACATTGCAGCGAGATATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chr2R 17121704 5' + blood 45 2 53.42 ATGTCGTTCACGTTCCTTTAGGTCACGTTCCTTGCGCTTCTCTTCCTTCAGCAGGTGCAAATAGTAAAGTATTGATGATAAAAAGGAGTGCAATTAAAGTTACACGCGAGAGGTATATTTTGCCGTTTACCTTTTCAATTATCCTT:1 - chr3R 4487133 5' + Tc1-2 144 1 60.96 TGATTTATGGATTCGCATTACAAGTTTTTGGTCCGAAACTTTTATTTTTTTATTTTTTTTTATTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTT:2 - chr3R 31450759 5' - Juan 4146 1 63.70 CGAATTACCATCCGTTTTTATCCACGAGCGTCTGGGGCGCTTAATGCCTTCAAAATTGCCAAGAGCCATGGGAAGGAATTATTCTTTATTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGG:1 - chr2L 19218912 5' - 297 6605 2 58.90 AAAAAATAGAACATTTTTTGGTAGCTCTACAAAACTGAGTTATGTGCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATAC:1 - 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X-element 415 1 76.92 GCAAGTGAGAACGCGCAGAGGCAATGAACAAAAAGGAAAAAAGTATTCAACCCAATAAATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCC:1 - chr3R 845835 5' + FB 64 1 62.33 CATTCGATGCCGCTTTTACTACCAAGCTTTAAGCTTAACTTATATTCTTGATCAGGATCAGTAGCC:1 - chr3L 23216615 5' + INE-1 87 1 90.91 GCTACTTTATTTTCATTACGACAGAACCTCTTACACACACATATATAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 - chrX 10974415 5' - opus 7431 2 71.92 TATTACCAAATGATCAGCTTCGGTTACCTTCACCGATATCCCGTCATTTTCAATATCGACATTCCCCATACAACAGTCAGTAGCACCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGG:1 - chr2L 22746568 5' + R1A1-element 4994 1 62.59 ATGCCTGAAGATCAAAGTTTGCAATTTATGTCTAGTTTTAATGATTATTTATGTTTATGACATCCTGGCAAAGGACTGAAGTTTCCAGTTTGCTTGTAATGGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAA:1 - chr2R 16403549 5' + copia 18 2 73.29 TTCAGAGTAAGTAAGTAAGCTACTAAGTAAGTAGCTTTTTATAAACAAAGCTGATGCGTCAGAACTTTTGGCAGCGAGAAGCTGACACTTCTTATTCGTAGTGTTGCTTAACGCTGCAAGAAATGCTGTG:1 - chr2R 13562164 5' + gypsy 7130 2 50.77 CTCGGTCACTGTCATTTGCACCTCTTACACTTTACACTTGCAAAAATGTCGGCCACAGAGCTTCATGCATATGCAAATTGCATTTTCTCGGCATGAACACACACACACACACACATATTCACACATACTGCG:1 + chr2L 17071664 5' + accord 7043 2 79.55 TTTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 20712990 5' - roo 9047 1 65.00 AGTTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATCCCTCACCTTGATATGACAACCAACACGCTGTGGT:1 - chr2L 17250791 5' - opus 7436 2 73.77 AAAAATGAGAAAAAATTTAAAATTTGGTCAAAAATGTGGTCGTAGCAGTCTTGGGCGGCTTGTAGGCGTAACAGCGAATCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTGTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACG:1 - chr2R 12202638 5' - INE-1 136 1 46.58 AAAAAATGCCATTATTTCTCAAGGTATAACTGGTTTCCTATCAGCAAATCAATGTTGACTCAAATACCTTGGTGCTTTCTAAGAATTTTCATTGTACTTGTGAACCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATA:1 - chr3R 10831800 5' + Juan 4046 1 68.49 GTAAACATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACT:2 + chr2L 18176998 5' - INE-1 542 1 78.08 GCACATTGGTCGTAAGCTCTGACGAAGTCTGACTTCATAGTCTAGATGTTGTGGGTCACAGAAAATTAAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACA:1 - chr2R 12265247 5' + jockey 4571 1 51.77 AACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGC:1 - chrX 23108322 5' + BS3 1424 1 50.51 CTTTGTTATTGACGGATAATTTATTCGACTCACAAAAATTAATAACTACGTAAGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAAC:1 - chr2R 3146366 5' + rover 7015 2 59.59 GATTTTCCCATCCCCCGCTTATTTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGAAATTTGATGCCGCACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chr3L 7995504 5' + P-element 33 1 50.43 GGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTT:1 - chr2L 23295912 5' + micropia 4983 2 64.38 TTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGACTTTT:1 - chr3L 4115198 5' + 1360 80 1 71.23 CTTCAGCCGTTTTTATTTATTGGCTGTGTGCCACAAAGAAAACTATTTACAAGTTTTTTCACAAGTAAACTACATAATTGAGAGCTCATAAATGTGTTTATACGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGA:1 - chr2L 13294868 5' + G6 1987 2 65.75 CGAAGTGAAACGAAGGCAGCTTCGTGCTTAAAAACCAGGTCGTCGTTGACTGTCGGCTTCTATGTTAAGGATATAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chrX 3099190 5' - P-element 2839 1 51.37 CACTGCGAATGTGTGTGTGAATGTGCGACTGTGTGTGTGTGTGCCTGTGACTGTGACTGTGAAGGACACACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 + chr3L 4001070 5' - hopper 1366 1 53.10 AAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chrX 16855318 5' - roo 8992 2 71.23 CTTAGTAGTTGTTGTAAATAGAGAGCGGGTGCCACCTATATACCCGCACACAATTCCGCTCGGCAGCAACAACAATGCCCCTTTGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr2L 14095533 5' - pogo 2087 1 70.40 AGTTGAGTGGCCACGGAGAAATGGAAAGAAATATGCGGTAGAACGATTTAAAAATTGATTAATCGCGAATCGAGAACGTAGCACAGCACAATCTTACATGTATACACCAATTTAGAAAACAAATGTAGTAAGCTAGAGGTACACAG:1 + chr2L 7656507 5' + invader2 4860 2 58.90 TCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTA:1 - chr2L 18279971 5' - gypsy5 345 2 64.03 AAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3L 96527 5' - roo 318 2 78.08 GTATACACTTTCTAAACTACTTTTTTTTTTTATTGTT:1 + chrX 11736021 5' - gypsy2 400 1 75.68 GTAGCTAGCAGAACTAAGAAAATAGTTCGTTACAGAATCTTGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 - chr3L 27130351 5' - 1360 3330 1 68.89 CAGAAAATCGCTTTCGCTGCGAAAACCTCTTCTTATACCCTTTACTCTTCCAGTGAAAAGGTATGCTGAATTTTTTAATTTCAATGCCAAAAAGATTGTTGAACTTTCTCGTTCGCACTGCTGCCAGCTGAGTAACGGGTATCTGA:1 + chr3R 19113897 5' + INE-1 544 1 47.26 TTTTAAACAGGCAAACTTCATAATAAAACTATATAAAAACATAAAACAGTAAAACGTTTCACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCT:1 + chr3L 305070 5' - Stalker4 6960 4 56.83 GGATTATGTTGGTTTTTTTTCCAGAAATTGAAGTAGATGTTGAAGATATTCAGGTGTGAAGGCTTTTAAGTTTTAAATACGAGATGCTGGATCTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAGG:1 + chrX 21083888 5' + HB 35 1 58.22 ATTTACCTCCTTCTCTGTTTCGATCTAAGCCATTCTTTGTTGAGTTATCCTCTGCATTTGCTTGGAATTTAAATGACAGTATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 + chr3R 7739419 5' + I-element 41 1 55.86 GTAATTTGGGTTCTTTGGGGGATGGTCGGGATATATGTATATATATATGTAAGTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTT:3 + chrX 6138628 5' - opus 7435 2 76.03 CCATAAACATAACTAAAACGGCACTTTACCGTTTCCATATCCTTATTGTTATAAAAAAGATATTACTCCCTAAAAAATGAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACA:1 - chr2L 19886252 5' + hopper 950 1 59.59 AATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCGAGCTGTGTGCAGCTCACCTGCTTAGTGAATTAATCCAAAGACTAAAAGGAAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAA:1 + chr3R 19446201 5' + mdg1 301 2 75.17 AATCAATTTTTGTACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCTAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr3R 4581831 5' + 297 40 2 57.53 GAAAGCAAATTAGCTTAAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 7035208 5' - roo 390 2 70.80 CTGTGACATATATGTTTAGCGTGTGTTATTCAGTTTAAAATGTTCCTATTGTATCAGTCATCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAAAGACGAGAA:1 + chr2R 3168774 5' - 1360 3238 1 58.90 CAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATTGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATATCCCTATGTCCGTATGAACGTCGAGTTCTC:1 - chrX 21587746 5' + INE-1 134 1 56.67 AGTGCTTCAGTGCTGACGTAGGCATCCCACACACAGACAATTAGAAACATGAATGCACTGTGAGAAACCAGCTTCGAGCCTATGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 22725660 5' - roo 9036 1 61.38 TTATTAAATGAGCATGGTGTTCTCTTAAGCAGAATAACTCATGTCATGTGGTGTTCTTTAATTTACAATAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAA:1 + chr3R 24674228 5' - Juan 4030 1 53.42 GCATACTTTGGCGGGCTTAGCTTTTGTTGGGCCATAGGCAACGAATCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATGAGGAGACAAGC:1 - chr3R 22516034 5' + jockey 4610 1 60.16 GCCGTCCACTTTCATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAAT:1 + chr3L 15276634 5' - hopper 1355 1 60.99 TAATCAGCTTAACATACATATTTAATGATGCGGCCTACTTTGCAGCTGACAAAACTTGCAAAGTTGTCTGTTGCTTTTTAAAGGTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr3L 22978507 5' - 1360 3354 1 60.96 TCTTACGATCGTCTCATCACCTCGGCATCCACACTGGCCCTGATCAGACCCATATTCCTGCTCAGCTGAAAGACCAATTTCGTATAGTTGGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCCAGTGAATCTACTTGGAGC:1 - chr3L 20535316 5' - Cr1a 4109 1 56.85 GGTTGGATTGCGTTGCCGGAATTACGTAAGGGTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTT:1 - chr2R 5955008 5' - copia 200 2 76.03 GGCACTAAATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTACAATTG:1 + chr3R 11750170 5' - Tabor 7266 2 55.17 AAGTTGCCAAAACACTGCTGTTAATTATGTGGATAGTAAAATTACAACACGCAGAACAGCAGCTAAATAAAAACTATCCTTAATGTTTTGATTGAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2L 16399447 5' + roo 8690 2 61.64 ATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACT:1 - chr2R 11367657 5' - Ivk 5359 1 76.03 TATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATGCACATTTTAGTTATAAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTTGACA:1 - chr2R 8305304 5' - roo 339 2 64.38 ACTCACTCGCTTTCGCCCTGGAGTATCGAGAATGGAGAATGGAGCACGCGACTCCATGCCCGGACAAGCAACTCCGGCTCCTGTATATTACTTAACTAGTGTTAGTGTGTGGTCGACATAAACGTCTGTGCTCTTAGTTGTTAACT:1 + chr3R 22208967 5' - gtwin 6917 2 56.85 ATTAAATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTT:1 + chr3R 19589885 5' + BS 5022 1 62.14 TCTCCTAGAGGAATGAAGGAGTGTGTGTATGTACTGCAATATATTTGACTAACGCCCTTCCAGTCGTTGTAGACAGTGTTTACTTCGATGTTGTGGCGCATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr2R 5868424 5' + pogo 16 1 74.31 TAATGCGCTGCTTCGTCAAAAGCTTGCCACGAATTTTCCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGCGGTCCT:1 - chr2L 18280013 5' - gypsy5 7327 2 67.39 TTTTCGGTGTGAAACTTTCTATGAAGGAGTACCATCTTTTCAGAGATTGTGAAAGATAAAGAATGATGGTCTGTTTGTATTTCTATACCAATTACAACTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTT:1 + chr3L 23512599 5' + GATE 36 2 67.12 AGACCCAATGTCACAAACATGTTGTACGTAACGGCGGCACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACA:1 - chr3R 20749783 5' - roo 8727 2 73.97 GAATTGTATTGAAATTGTATTTTGTTAAAATTCATGTTTGTTATTGCTGTTTTAGTTGTTGTTTGGTTGTCGTTGACCAACCCAAATGGGCGGCAATGATTAGGCCCATAACCAACTGTCGCTGGTAT:1 - chr2L 11245727 5' + Helena 1155 1 60.94 AAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTA:1 + chr3R 19589903 5' + BS 5046 1 50.68 AACACCAGACAAACAATAAAAGTGGCAAAAGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1 - chr3R 9190620 5' - Tabor 446 2 58.22 CTTTTATTTTAGGTAGCCTTTTAGGCCTGACGTGGACCAAAAAAACAAAGAGCTTAAATGCCCACAGAACTGCAGGTATGAAGCTCTTCTCTTTGTTAGCTTTAAGCAGTTCGTTTTGGACACTCATAA:1 - chr3L 8642226 5' + gypsy3 6703 2 58.91 AGCTATGTAATTTACTAACGACCATCATGAAAGAAATATAAATTGATAAATTAGGTGTAAAAAATAAGTGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 - chr2L 18193131 5' - mdg1 7411 2 51.37 GGCAGCTGGGGGAAGGTCTAATTGAATTAGAGTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr2R 11133615 5' + roo 89 2 78.08 GGGTAGTTGGTGGGCATTTTTGACCCCTAGCCTAAGTAATGATTGTTCTGCTGAGAGACGATTTTCTTTTGCTATTTTGTTTCATTTTATTTTCTGCTGGGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTAAATAGGTTCTTATCATCTA:1 - chr3R 10397266 5' - rooA 7501 2 64.38 TATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAAT:1 - chr3R 19450128 5' + roo 8788 2 65.75 AAAACTATAGAAAATAAAGAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTG:1 - chr2L 18149532 5' - Bari1 1647 1 58.90 TATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCC:1 - chr2R 545173 5' + F-element 458 1 55.93 AAGGGCATATCTAAGTCGCATTGAATATTGAATTTCCGTTTTTTGCAGTACTTATTTTTTCGGTTTTTTGCTGTTGATTGCTAATAGGCAAATCGTGTTCGATTAAGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCG:1 + chr2L 7588367 5' + G2 2701 1 76.12 AAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 - chr3R 10472802 5' - mdg1 371 2 50.68 GTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTC:1 + chr3L 24934308 5' + HMS-Beagle2 6914 2 57.14 GTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:2 + chr2L 76066 5' + roo 88 2 78.08 AGCGGCAAACAAGTTTGCTTCCATTTCCTTCTACCTCCAAAGCAAACAAACGGGTCTAAATTGAATTAGAAACAGCGCATAAATCATATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - 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chr2R 13644518 5' + Burdock 6193 2 57.93 ATTGCGCTTAACTTCAGCTCACTCACTATACTTGGTGACGCCAATGATGTTAATAAGTCGTATATCGGCGCGCCAGCTAGCGTTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAATAGACGAGAACGCGTA:1 + chr3L 23183168 5' - 1360 3232 1 56.85 ATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTA:1 + chr3R 2555509 5' - Bari1 1622 1 75.34 AGCTGCTCCTTAACTAGAATTCTTTGGTTTTAATCAAATTTATAATGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr3L 18467270 5' - hobo 2894 1 59.17 CGTAAGAGCTTTATAAAGGCAATAAAGCGCCTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTAC:1 + chr3R 13176318 5' - Burdock 6357 2 60.96 AATGGCCAAGACTCCATCGTTGGCCTTTCGGTTTTATGGCCTACGCATCATTTGGCTAAAAGAGGCAAAACGGCTTCCACGGAATCCATTTGGAGGCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGA:1 - chr2L 3659205 5' - 412 469 2 69.18 TCCTCGTCCTTTGGCCAAAACTCGCTATGTGGTTAACTCGGTTGGTATGTCTGTATCCGCCGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATT:1 + chr3R 27859168 5' - hopper 1358 1 56.85 GAGTGCGGACAGATATATACTCGTAGATGATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCT:1 - chrX 4186695 5' - I-element 5263 1 78.08 ACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr2R 16891844 5' - hobo 2893 1 60.00 CTGTCACATTTTGCACTTTCGCTAGCTTTGACATGGACATTGCCTATAAATCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAAC:1 - chr3L 22052842 5' + mdg1 71 2 65.07 GGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAATTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 - chr3L 13374215 5' - pogo 2037 1 63.70 GGTTACGGATGCATTGTATTAATATGTTTTGAACTCCTGTTTGCTGGAGTTGAAATCAATCAGAAAAAAGGGTTTCCGACTATATAATGTATATACATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTC:1 - chr4 1121531 5' + INE-1 92 1 56.25 ACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAGACAGTTATCACATTTAGTTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAAACTAT:1 + chr3R 4604452 5' + 1360 335 1 76.99 GTTAGCGTTATTTTGCCTTTTACTAAAAACCTTTTGAAAGAAAAGGAAACGTCTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 + chr3R 31814066 5' + FB 49 1 58.73 AACCAAACGACCTTGACAGCTGCATATTTATGATTCACTAACATGCTGAGGTGGTGACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - 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chr2R 4122894 5' - rover 368 1 78.77 TTTTTTTTTTTGTGTTTTTTTCTGTATGAGTGTTGTTTGAAAGGGTCACATTTTCTGTAAAATCAATACAGCTACTGTATCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGGGG:1 + chrX 4139042 5' - F-element 417 1 71.70 GGCCACGGCCGCTTCAAGCTCGTCCCTGGAGAAGTCGTACGAGTTGCCCGATGGACAGGTCATCACCATCGGAAATGAGTTGATAATAAACAATGATAACAAGTATTATCCCTCCTCTAGTAAGGCATAT:1 - chr2R 6014696 5' - Transib5 2543 1 60.77 GACAAGTTAGGGATGGAAACTTCATTTCACACTTTAACTTAAGGGTTCTTGAACAGACTAAAAATTTTAAGATAAGTCGTATTATTGCCACACGTTTCTTAAATATGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTAC:1 + chr3R 30583732 5' - gypsy12 10178 2 71.23 CTTTGAAGTCAGGGTTTAGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr2R 11489155 5' - mdg1 392 2 62.69 CGCTTTGTAAATCAAGCACACAACTAAATAATTCGTTTTGCCTTCAGCCAACATCCCCTATATTTTATGCTTAGGTCATAACCAAACGAAGTCCGATCCCCTTTGTTTTTTTTTTCATTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCCTTT:1 + chr2R 17438837 5' - Doc3-element 4702 2 69.18 ACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAGAAT:1 + chrX 1103618 5' + pogo 67 1 64.38 ATACTTTGGCGGGCTTAGCTTTTGTTGGGCCATAGGCAACGAATCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATAT:1 - chr3R 22516032 5' + jockey 4635 1 69.18 AATCTGCGTATGGGTTTTCAATGAAACTTCATTTTAGTCCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATT:1 + chrX 22610704 5' + pogo 80 1 71.23 CTGTGTTTTGACAGCTGTTTTTGGCTATTGACATTCGCTTCTTGACAAAACACCCGCACATGTGCCCCTTTGGGGCTAGCGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGG:1 + chrX 12428564 5' - Ivk 196 1 50.39 TTTGTGCTTGTATTTTATTTGGTTTCAAATATGTTGTTTTGTTATCTTATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAG:1 - chr3R 4581946 5' - 297 325 2 67.12 CTTGATTTAAGGTGCTGCGAAGGGTTAATTTCGGAAAAGTAAGTAGCATAATGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chrX 16579254 5' - roo 8998 2 66.44 AAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCA:1 - chrX 22574696 5' + 17.6 114 2 45.89 AAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAG:1 - 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chr3L 908791 5' - 412 7223 2 52.41 ACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGCC:1 + chr2R 981625 5' + 1360 42 1 60.71 AACCACTTGGGGAATTCCGTTCTGGGGCTCATTGTGTGTGTGCGTGCGTGTATTTGTGTATGTGTGAGTGTGTCGAGAATTTCGAACAAAGGGAAACCAGGTTAAAGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chrX 16579403 5' + roo 13 2 41.78 TCTAAATATTTTCGAGTTCACGATCAAGATCAACGAAAGAGAATACAAACTCGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr2L 1558755 5' - 412 7518 2 65.75 TATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGCTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 + chr3L 17707825 5' + Doc 68 1 62.22 GAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 - chr3R 10472803 5' - mdg1 7410 2 51.37 ATCATTAAGATCATTATAAATATTATGACAGTACCACTCCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chr2R 2009424 5' + I-element 40 1 79.78 TGAGGACGCGATCCAGTGGCTTTTAGATTTTCTAGCTGATTCGAATTCCTTTAAATACTCACCGCGCAATAGAGTCACGAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3L 12757325 5' - roo 8985 2 59.31 TTAGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTCAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTCT:1 - chrX 12139012 5' + roo 8706 2 62.50 AAAAATATTGTACTTGCAAGGTAATCCCTTATAGTTTCCAAGATATCGTTCGTCAGAATCTATCTGTCAAATATTTTTCTAAGAATATAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr2R 24453419 5' + 412 7085 2 62.33 ACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 - chr2R 17890974 5' + Tabor 52 2 53.57 ACGGAACTTATAAGGTACGTTTCAGCTAAATGCTAACAATGCTTAAACGTGTAAAACTAATCAACTTTTTGCTTTACTTTTCGTTTATATCAATTTCGCCTTCTTCGCTGGTGCTCCCCGGATTTGTGGGGAGTTTTAAGACTCCT:1 + chr2R 13000038 5' - gypsy8 3 2 61.64 TTCTTGTCGGTTGATTAAAGGCGCCGCGTTCCCAAGATCCCAACGAAATTGGGTACATTTTCGCGGGAATTGAATAAAAGAGTGGGTCTTTGTATTTAGAATCTGTAAGTTAACACAAGCCAAAGAACTAGAACAGTTGGCTCAGT:1 + chr2L 19865981 5' + Gypsy6A_LTR 18 1 52.74 GTGTGTATTTCCCTTATGCTCTACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 - 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P-element 2832 1 48.63 ACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAG:1 - chr2R 19553270 5' - mdg1 7390 2 64.83 TGAAATCGTATTAAGAATAAAAAATCATCTTCACTTACACAATGTCCTTTAAATTAGTATTATACACATGATAGTAAATGACTGATAACGAGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCG:1 + chr2L 15945677 5' + X-element 50 1 61.81 ATTATCAAATCAAAATAAATGTTAAAAAACAATCAACATTTTTCTTTTTTCTTATCACTTTTTTTTTATACTTAATTTTTTTTCTTTTCAGTGTCTTCAGTTTGGAACATCCTATATATAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTACTC:1 + chrX 13873234 5' + blood 170 2 69.86 TCGCTTCTGCGGCAATTAAAAATTTTTACCTTATTTGCTCTAGTTTTTCTTTTTTTGTGGGGCTTGTGAGGCCAGGACTTGTTATCTGTGCAACATTTTGTTGTTGTGTTTTTTATTTTCTCTTT:1 - chr3L 13282862 5' - I-element 113 1 78.40 ATTAGCTTAAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 7035216 5' - roo 9036 1 60.96 AGACAAAAGCCCGTATTAATTACACAACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGTCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - 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chr3R 7035332 5' + roo 8712 2 64.23 AAAAAAAAGAAATATTTAAAAAATGGCCAAAAGGGGGGGCGTGGCGCGTGGCAAAATGTTTATTGACAAATCAATAGAAATTTACAAGACAAATAAAAATGTGAAAAAATATCAACACATTTATAAAAAGTGTGG:1 - chrX 10130550 5' - INE-1 258 1 66.67 GGTGGAAGGGTGCTATGTTTATGGGTTGGATAACTTGCACGCTTGCTAATTAAATTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chr2R 4160319 5' + pogo 36 1 56.30 AAGTGCGAATTGGTAACCGGGGGAGAAAGAGGGCGCTTCTGCTCT:1 - chr2L 3994631 5' + F-element 362 1 82.22 ATCGACGGTGGTTTACGTCCATGCTGAAGGTGGGAAACTTCGCTACGAGCTGTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTA:1 + chr3L 22648293 5' + Tabor 70 2 63.01 GACAGCAGCAGCAGAAAAAATTTTATGATCCTGCCTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTA:1 - chr3R 8709831 5' - jockey 4909 1 76.03 CAAATAACTTGAAAAAGTCTATTAAATACGATCAAAGATCTTTTAATATTAAAAATGTGATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGT:1 + chr3R 17546620 5' + blood 7076 2 60.96 CCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 - chr2R 19553269 5' - mdg1 350 2 65.75 CGAAACGTTTTCCAAATATTTATTTATTATTTACTCCCGTCCACCTTCTGGTTTTTGGCCTTCAAAAGTCCAGATAGGCGAAATAAAAAAAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGCAGTGG:1 + chr3L 12977123 5' + invader4 335 1 71.64 ATTAAAAGAAAAAAAGAATTAAAAGAATACAAAGATTCGTTGAAAATAAGAGAAGCGTTTGCGACTATATCATCAAGTATATATCAGTATATAGATCAGGATCAATAGCCGTGTCGGTCCAGCCATCTCCGTCTGCCCGTATGAAC:1 + chrX 8630253 5' + INE-1 123 1 50.00 ATAATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTAT:1 + chr3R 4160056 5' - invader2 5055 2 52.05 AATTGGTGGAATAATTTGAGTTTACATTAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTTTTTAACTTATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAG:1 + chr2R 5917814 5' + I-element 5064 1 52.94 ATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr2L 246010 5' + roo 28 2 58.33 GCGAAAATGACAAATTGCATTAGGAGGACCTTTGTAATAAACCCATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTTTTTTGCAGTTTGGTGCAGCCGTCAGGCCACCGTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 + chr3L 10144683 5' - blood 303 2 70.00 AAGGAATTGAAAGCCAAGAAGAAGGACAAGAGTAAGACTGGAGAAGGGGGTGGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCT:1 - chrX 16785733 5' - mdg3 5192 1 71.21 CTGAAGATCAAAGTTTGCAATTTATGTCTAGTTTTAATGATTATTTATGTTTATGACATCCTGGCAAAGGACTGAAGTTTCCAGTTTGCTTGTAATGGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 - chr2R 16403545 5' + copia 4891 2 70.55 TGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTCGAGCGTAAGCTCTCTTCAATAAAAAAAAAACGCGTATTTCTCGTTCGTTTCTACG:1 + chr2R 5206903 5' + Doc4-element 72 1 68.49 GCTTCGTTTATTTTTGAACATTTTTTCGCATTCGGATGTTGTTTTCGACAGGTAAACGAACTACGGAGTGCTATTTAATATTATAGAATGAGGTAAGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 + chr3L 16212683 5' - Transpac 289 2 70.55 CAGGTAGTTGGAAGAGTTAGTTGAAAATTTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr3R 20744075 5' + roo 57 2 60.27 AAGTCATTGAATAGTTTCAAGTTTTTTTGTTTTGTGCTTGCAGAGAATTGGCTCAGACTCTAGGAACACTTTAGATGAATCATTGGCTACTGCGGTTCTCTCGAGCCCC:1 + chr2L 4199027 5' + X-element 366 1 60.55 AATTGAACAATCGTTTTAGTGGACAAACAAAAGCTTAAACCAGAGAACTGCAAAGCTGGCATTTTTTGCCACTCGACTCACACCCAAAAATTTTATGTGCGGGTGCTACCTGCCACGCACATCGCGAGTACTTACAAACACA:1 - chr3R 17867828 5' + hobo 82 1 71.83 GTTCATGTGGGATGCAGTTTGCATATAGTACAACTTTTTAAATTGGCAATTGTTGTTTTCGTGATTCACGTCACATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAATATTTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCG:1 + chrX 22901452 5' - Quasimodo 7323 2 52.05 AGTACTATAAATATCAATAGTAAATAAAAAATAAAATTATATAACAAAAAAAAATATATATACAGTCCACCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCC:1 + chr3R 19449903 5' - roo 8709 2 52.74 AAAAATACTAACCATTAGCGCTAAGTCCGCTTCCATAACAAGAGTGTGAAAGGTTTTGAACTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATG:1 - chr3R 15702999 5' + copia 62 2 60.27 CTATACATAAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chr2L 13250357 5' - opus 442 2 70.15 AAGCGCATAAATCAGTCGAAGGACGAAGGGATCCCTTACCCCAAAGCCACGGACTCAACCCAAGACGTAACTCCCCATGTAGAAGATACTTTTTAATTTCAGTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 + chr2R 17121543 5' - blood 7374 2 70.14 AAATAAGTCGGAATCGGATTCAGGCATAACAATTTCCTGTCAATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3R 31490915 5' - roo 9032 1 56.12 GTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 + chr2R 23000065 5' - mdg1 336 2 76.03 GAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTCGGCCGTCACCA:1 - chr3L 14971177 5' + 1360 3321 1 77.60 TACTTGAGTGCTTATTTCGACACCCATGTGGGCCACAAAGAGGAACAGCAGTCCTATAAAAACATTGCAGACGGTCTTACGGGATACAGGAAACATTTATACTAATTCTGGAAAAGATTTTTCCAACTGGTGGTTATAGTTTAT:1 - chr3R 5255784 5' - S-element 443 1 58.33 GCATGTGTTCCCGCAGCGTCCGTCCGATCACTATAATGTCGTCCTGATATGCGAACGCGTGAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGGAGTTTGAGGTGTGAAA:1 - chr3L 25232859 5' + accord2 7482 2 55.47 CAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGA:1 - chr2R 8157276 5' - Transpac 257 2 54.11 ACACCTTGTTTACGAGCTGCCAATGGAATGAGTAAATGGTATTGCCACTTTCACCTATCCTTCGCCTTACTACCTGATTTGGTGCCCTTCATTGTGGATCGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATA:1 - chr3L 1404141 5' - Ivk 5041 1 75.40 ATTTACTGCAGCTCCGTCTATAAATATACTGATTTCCTTAATAAGAAATTTATATATAAGGAACACTCAAACTAAAAATCTATGTTTGAGGCCTATGACCGCGCTAATCACCTCCCGCGTGGTCATATCTCTTGACACTTCGGCGC:1 - chr2L 21075078 5' - rooA 128 2 50.68 GAATGCAAGCAGCGAAAGAGCGAAAATTTGTTTTCATTGTTGAAAAATTCTGTGCAAATTTATTGAATTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGG:1 + chr3L 1404992 5' - Ivk 5324 1 60.27 GAAAAAATATCAACACATTTTCCAAAAGTGTGGGTGTGGTAGTTTTTGCAGCTTGTGGGCGTAGCAACATGGTTCAGCAAACTTGCGCTACGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATTCTGAATCTCAATCTTATAGCTTTTATAGTTC:1 - chr2R 5466807 5' - INE-1 158 1 71.92 GTGGGTGTGCCAGACATTTGTTGCTGTTTGTCTGGCTGTAAAGCTGGCCGTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTT:1 - chr2R 19726928 5' - 1360 3318 1 66.44 GCATTTGACTTTTCCGCTTCGTTGATATGGTTTTAATAAAGTGCAAAATGTCATTCGGGGCTTGGCAAAAAACGGTAGAAAAAACGGGAAAAAAAAGAAGAAGAATGTCGAGATCTGAAGAATTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGAT:1 - chrX 4525558 5' + INE-1 163 1 73.97 ATTGTAAATTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGT:1 - chr2L 23295930 5' + micropia 9 2 76.71 GCCAGGATTACAATTCATTGATGCCGATTTTTCTTTTTCTTTTGAAATGATCACTTGGGTAGGTCCGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr3R 1916505 5' + 1360 54 1 75.00 AACAGCTTAAAAGTATTTAACTGAAGAGTATTTAACATGATAGCGTTCTGGCTCACATAGGATTTCTGCCTTTATTACAAAATCGACAAGAGAAATTGCTATATTTCTCGAGTCGAGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 - chrX 22784161 5' - INE-1 548 1 65.07 AATAACCAAACTCACCTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3L 14076293 5' - roo 342 2 63.89 AGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chr3R 24476354 5' + 412 7133 2 73.10 AAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGGTGACATGTGAATCGCATATTAA:1 + chrX 2762599 5' - roo 8986 2 70.55 CACTAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACATGT:2 - chr2R 4261972 5' - invader4 2986 2 52.05 CTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 + chr3L 11336353 5' + blood 7086 2 69.66 AGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCC:1 + chrX 21772499 5' - gypsy3 6566 1 68.00 ATAGTGGCGTACTTGGGTGATCCAAACCGGACATTTCAATTATTTCATCCTATAGCCTGGCCTAAACAGATTTGACTGCTCTCTAGGAATCTTCTCCTAATCTTAAGAATCCAATAGCAATGCTCTCACGAAATACCAATATTGTT:1 + chrX 22901644 5' + 297 6797 2 67.12 GGCATCACAAAGTTTTTAATAATAAATTTTAAAA:1 + chr3L 22030217 5' + hopper 166 1 67.65 AATAGTTAATTTCTACAATCGACATATGTGAGCGTACCTTGGTTGATATATGCAATTTCCTCAGTGTATATGCAGCTTTGCTCTTTTTGGGCCTTCTTCGGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1 + chrX 14951066 5' + P-element 22 1 70.55 ATAATAATAAAACTGGTAATTAACAAAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:1 - chr3R 17605771 5' + Tabor 23 2 68.49 GAAATATTTTGCACCAATCGCAGGGTACACTGAATGGATTGGATTGGCTTTGACATGGCAATCAATTTTTGGTAAAGTTATGAAAAAAACTCAATTTCTGCCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 - chr3R 24493214 5' + jockey 4691 1 67.81 CAGCTCCTCTGCGACGTTAGCCCAGGGAACTCTACTCTATATGGCTACTGCAAATCGGATTTGCGTGAGTAATTGGCACGTCGCATTCTCTTTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTG:1 + chr3R 23111524 5' + opus 232 2 73.23 GGGAGGTAAAGTCATCGTCTACACGAGGCTTCAGCATAAAAAAAAAAGAAAACAAAATATCATCAAGCTATTGAAGAGTCTTATGGTCGAGTACTTATGGTCGACCTAAATATATAAAAAAAAAACCAAAAACAAAATTGACCGAA:1 + chr2L 16768880 5' + transib2 109 1 49.32 GATGTATATGTATATGTCGAAGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCCTCTTCACTATTTTCGTTGTCTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr3R 1033035 5' + 1360 16 1 53.64 ATTCGAAAAAGGTGTACGGTGTATATAAAGTCTGTAGATACTTTTCTTTTTCATGATAGCAATAGGACTAATTTAATTTAAACATGTTACAAATCTCATATAGAGGCAAGCTAATATACACAAATTTTTTTTTTATACATTATAAA:1 + chr2L 9603244 5' - BS3 1767 1 72.60 ACTCAACTGATTATATATGCACCAATGCAATGCATACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCAT:1 - chrX 17732052 5' + pogo 83 1 77.40 AAGTTGTATTGCTGTTGTGAACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTC:1 - chr2L 16089693 5' + 3S18 5814 2 50.69 AGAATATGTTTAAAAAGAGAGTTTAATGCAATATAGATCAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAA:1 + chr3R 30295105 5' - Quasimodo 7292 2 73.97 GTTTGGTTGCCATCTGTCATGAGCGTTGCATAATTAGATGAACTTTGCAATGCATTTAATTTGCGTGCATGCCACCTACGGACGGTGGGATCTTTAGAATATTTTAATTTT:1 - chr2R 15452187 5' + Rt1b 5113 1 57.66 GTTTGTGTGCCAAGCGCAGAGAATTTCTGAATTGCACTCGATGCATTGTGTTGCTGTTGCTGTTGGTGTTGGTGTTGCATAAGGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTACTGGTAGGTAATGAACTTG:1 - chr2L 19883554 5' - Doc3-element 474 1 56.72 CCATCTTTTAAATATAATAGTAAATTAAGTTATTTGATTTTCACACCAGTATTTTACTTAATTGTTTTTTTTTTATGAAAACCGATAGAAATTTACACGACTAATAAAATTATGAAAAAATATCAACACATTTTTTAAAAGTGTCG:1 + chrX 707391 5' - INE-1 258 1 53.42 CCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr2L 686004 5' + roo 80 2 71.92 ATTTTGCATGGGGAGCGTGTAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:3 - 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chr3R 29288808 5' - BS 5033 1 56.55 AACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr3L 27391401 5' - 1360 3357 1 56.39 AGCTATTTTCTATTCTATAATTCAAATAAATGAAAGGGCAAGTATTTTTAGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chrX 12139059 5' + roo 37 2 62.33 TAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr3L 15026656 5' + opus 150 4 62.07 ACAGGCATCACCTAACCACGTCAACTAAAACTAAACTAAACTAAACTAAACGGAACTAAGCTAAGCTAGACTAAGCTAAAATGAAAACAGGTGGTTTAGCATGATGCGCTGC:1 + chr2R 16332917 5' - Chimpo 3899 1 69.64 GATTCACTTCAATTTATTTTTTTTTTCTGCAACAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2R 10695747 5' + roo 8683 2 69.70 TGTGTTCTGCTAATGAAACATTTATGCATGCGGACTGACCGAACCAAAAACTTGAAGATAAACTCAGAGAACTAAGTTAAACAAAGAAAAACGTAATTATAATCATACATATTAACCTTTTTTTTTAAACTTACTAAATTAAGTTG:1 - 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chr3L 21756614 5' - G2 467 1 70.68 GTGGGCAGTACGAATTTTTGTTTGTACCGTTTGGCATTTCGAATTCGCCTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATGTCTGTTTTTCAAGAGTTGGTCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACATGAT:1 + chr2R 4193273 5' + 1360 2 2 75.91 ATCTGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTACGATAATA:1 + chr2L 17550609 5' - Transib-N1_DM 445 1 78.08 ATTTTCTTATTAGTATTGTTTCTGTAAATTTGCCACCATTTCTATCTATATTGGGAAATCGATATCGCAGAAAATTTGTAAAATTTCGCGTAAGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCGGATAGTCGG:1 - chr2R 3919507 5' + INE-1 551 1 66.67 AATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAA:1 + chr3L 27356063 5' - Tc3 1654 1 56.16 GCTGTGCAAAATATGGATTTATTATTGCGTATGCCAACCGATGCAGTAAATGAATTTTCGGGAGATACATTGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCAC:1 + chr2L 18300678 5' + accord 17 2 65.79 AAACCAAAATAGAACTTTTAATGAATTAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACCAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACG:1 + chr2R 4312928 5' + gypsy 7030 2 54.11 ATGCTCCAATGCCTTACGTACGTATCAATGGGCATTTTAAAGTACACTCCATCGATTGTTCGAATGTAATTTCATGCACATTTCATCACCATATTCACCATGCACTATCCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chrX 3996640 5' + roo 11 2 75.34 ATTGCGGCGGCTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTT:1 - chr3R 14860198 5' + BS 5070 1 75.19 CTGTGGGTCACACATAGATTTTATGCAGTTTTGGTTTAAATGTTTTTAAACATTTAGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr2R 8396003 5' + pogo 62 1 64.38 AAAATTAAAGTCCTTGCCCCAAAATCATTCTACTAGATTATATGCACTAGTTGCCGTTGTATTTTAAAAGACGGATTACAACACTATCACCGCGGAAGGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTG:1 + chr2L 9485555 5' - 412 470 2 67.12 GTAAATCTCTCGAAAAATGTTACTAATTTATGGGCATGCAGTTATTGTGGATGCAGATAATAGATTAATCATAAATAAAAATTTGGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGG:1 + chr2L 7131374 5' + mdg1 404 2 61.87 TAGGGGACAGTCGCCGGGTCGGAGAGATGTGGATAATTCAATTTTGCAGAATACAAAAATGTTTTGGTTCAAAAGATAATAAAATATTTGTACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTC:1 - chr2R 4930642 5' + Ivk 24 1 64.03 ATGGGAAGGTTTAGCACTCGGAATTAATACGATTTGTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGACTCAAAAAGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr2R 23000030 5' - mdg1 371 2 50.68 AAGTTTGCTTCCATTTCCTTCTACCTCCAAAGCAAACAAACGGGTCTAAATTGAATTAGAAACAGCGCATAAATCATATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr3R 23010128 5' + I-element 25 1 64.34 TGCTCAGTGAACATCGAGCTAATTGATTACAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCT:1 + chr3R 6578558 5' + P-element 2869 1 23.97 TTTGCACATTGGTCGTAAGCTCTGACGAAGTCTGACTTCATAGTCTAGATGTTGTGGGTCACAGAAAATTAAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGA:1 - chr2R 12265250 5' + jockey 4567 1 51.43 ATTATTTTTTGGAAAAGTTTTCCTAGGTCTTCCGGCCGAATACGTTATTTTCTTGCTTAAAAGAAGTAAATACGTTTTATAGACGAACGCCGATCTCTTCGGCTGTATATCGCCGGGAAACACAAGCCGGAATTATTTCGCGCACC:1 - chr3R 18962690 5' - gypsy12 378 2 56.16 TGATCAGCTTCGGTTACCTTCACCGATATCCCGTCATTTTCAATATCGACATTCCCCATACAACAGTCAGTAGCACCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCG:1 - chr2L 22746558 5' + R1A1-element 5011 1 52.74 GGAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr2L 12414905 5' + pogo 57 1 68.55 AAAAAGATCGCTCATGTTTCGATAAGTTATCGATATTATCGTAAGAAAGTCAACTTTCCTGTTAAATATTATGTGGCTAAGCGCTGTAAAGATTCTGCGACTAACCAGCATAAGTCAAAATTGCAAAAATAAAATGAAAAAAAAAA:1 - chrX 3292032 5' - INE-1 477 6 77.40 TACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr3R 9352090 5' + Tirant 8134 2 55.77 TTGGTGGTCCGTCAGTCGGCCATGTCGTGTGCGTCACTCCAAGAGAGAGATCTCGGACATCGGTCGTGCCAAGATTGGGCCACTTGGTATACTTTGGTATTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTG:1 + chr3L 10452208 5' - I-element 5129 1 58.87 GACGGCGAACCGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTAT:1 - chr3R 9160794 5' - copia 218 2 57.53 CATCATATTGATGTTTGGTCGTGTCATTTTATGAGCAATTCAGCTGAAATTCAACGGAAATTTAGCTGACACTCTGGACTTGGCATATTTCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 17113991 5' - roo 9043 1 66.44 AAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCAT:2 - chr2L 23295906 5' + micropia 4989 2 60.27 GCGTTGTTGATGAGTAATATTTCTTTCAGCGAGCTGTAGAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCG:1 - chr2R 4313055 5' - gypsy 414 2 46.67 ATTGAATAGATAGGTTTCACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3L 14553081 5' - roo 9037 1 58.87 GCTATTGGGTTTCATTCGAATCTAATTATGAGGCGCCGAGATAAGAAAAAGGTTCTATCACAACCTGCTATATAAGCAATATAAGTTCTTGAATCAAAACAATCTCAATCTCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chrX 19536844 5' + roo 8675 2 76.71 ATTCTCGGTAATATATGGATATGCTTCAAATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3L 19792499 5' - pogo 2072 1 67.05 CTAAGTTAAATCGAAGTGACCAATTACAATTACGATAAAAACGCATACATTAAAGTGCCCTCTATCGGTGACAAATTACTTTACTTCTTATCGATAGCCAACTTATCCGTTCCACGACAATATAGTTAAATTCAAAATACAATTTA:1 + chr3L 23062887 5' - transib3 50 1 80.14 CGTCACTCAAAGGGTTAATGGACATGGGCATAGGGCATCGTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTAC:1 + chr3R 23020774 5' - INE-1 573 1 67.81 CAGCACTGTACTCTTCAGTTTCGATTCGTGCGTGCTTCTGACATTCGCCCATTTATACATATAATCACTTTTGTGTTTTCGTTTAGTTTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTCCACCCGCTAAACACTGGG:1 + chr3R 17867725 5' - hobo 2907 1 63.01 GAGTGGGAAAAAGACAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3L 18658903 5' - roo 8999 2 69.86 CCATGACGTCTGATGGGGCATCAACGATCTCCACGCCGAGGTTGGCAGCATATATGTTATGCTATGCTCACTTATACATTCAGTGTGACCGCGACAGAAATTGTACATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGATAATAA:1 + chr3R 2474419 5' + S2 15 2 75.86 CGGTGTGCATTGTTTAAAAAAGGTATTCAGCTATCCAGGCAAATCAGATAATTTAATTATCCATTTACATTAAAAATGTCCAATTTACAAGTTAGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 - chr3R 11113305 5' + mdg1 7066 2 65.75 AGTTTTTATTTTGACGTGAACAACGGTATTTGGCTCAGTGTACATGGATATAGAAACAGAACACGGACGCTTTATGTGTAATTAGCCAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCCGCCCGTATGAACGTCGATATCTCAGGAAATATAAA:1 - chr3L 19415944 5' + INE-1 146 1 60.27 ATCGTCCTTTAAAGCTGCTCCCGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 - chr3L 17890824 5' - 412 7484 2 60.96 AGCCCTTCACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCACAC:1 + chr3L 23933548 5' - Cr1a 229 1 63.71 TTTGGAAAAACATCGAATGAGTTATTTTGCTAGTTATTTCATAGCTACGACTGGGATATTAAACGACAGGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chrX 1061513 5' + 412 51 2 52.05 TGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCCAG:1 - chr3L 25401035 5' + Doc 27 1 56.12 GAGCTGCAAGACGACTACTGAAGGGGGAAGACGATACGGAGTAGATTACCCCTGAAGTAGATTTGGCGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATCTTTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 - chr2R 558189 5' - copia 237 1 49.31 TCATTGACTTTACCAGCAACTTTCCACTTGGCATTTAACGAGCATGTTAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGACGACTT:1 + chr3L 12867231 5' - roo 405 1 70.55 CATGGTGTTTTATGAACAATTCGAGTCAAAGTTGGTTGTTTTATTGCCTTCATTATTTCATTTGTGGTACATTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2L 3250985 5' + roo 49 2 55.48 AATTCATTTGTATTTGTAAAAAGTGGTAAAGAAGATTATTTTCAAATGCCGGCAAGTTAAATTTTAATGAATTAAATATTTGTCTAGTTTGGTTTTCTCTTTGGTCGGCGAAGTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCG:1 + chr3R 6587449 5' + rover 289 2 75.69 GTGGACTGCATTAGAAAATGGCTGCTGGTGCTATAAGTGTTAGTGCGTGTGTGGTCTGTCTGTCTTTTTGCCCGTCCTTATGAACGTCGAGCTTTCAGGAACTATACAAGCTTGAAGGTT:1 + chrX 7797271 5' + INE-1 158 1 57.50 ATATTTGTATGTATGTATATAGTAAGGATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 - chr3R 29867974 5' + 1360 36 1 60.96 TTTTTTTCTGCAACAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 10695766 5' + roo 52 2 54.11 AAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:2 + chr2L 17029603 5' + blood 7085 2 67.81 GATACCGATGTGCCGGGTTGTGTGAGCACATTCCACATCCCACAGGCTTTGAGTCGCCGCTGATTTATCATTTGTTTTGACAACTTTTCGACACACAACGGAAACACAAACAAATTAACTCCTCCCCGCGTTAGGTTAAAGTCGTC:1 - chr3R 5186451 5' - gypsy4 6545 1 76.71 CAAACACGCACTGCGAATGTGTGTGTGAATGTGCGACTGTGTGTGTGTGTGCCTGTGACTGTGACTGTGAAGGACACACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 + chr3L 4001062 5' - hopper 1373 2 47.95 CTCAAATAAAAATTCCTCTTGCGTGTTAGCTAAAAGTTATTTATAAAAATTTCTTTTAATTTTGTTTTCTTGCTGGTTTGTGCAGAGATACGAGACTTTAAATACGGCGTATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTG:1 + chr3R 10285238 5' - F-element 4216 1 74.66 GAGAGTGAGAGCGGATAAGTGAGAGAGTGCATTCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGT:1 - chrX 14951178 5' - P-element 2801 1 25.34 AACAAGTCTCTGTGCAATGGAGTTTATTTCATATTTGCAGCCAACCAGAATCACATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCGAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGA:1 - chr3R 13176444 5' + Burdock 6200 2 61.64 GACTTTACAAACAAAGTAATTTATTAGGGTTAATATCTACCCGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTACTTTTCATT:1 + chr2L 16089543 5' - 3S18 320 2 69.86 GATTTTTATGTAAATTTTTGGCGAAAAAAATAGCCAAAAATGTTTCCACACGGGAAGAGCGCCCAACAGCTTGTCGATATTCGTTGCCACGGTCACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr2R 19726805 5' + 1360 21 1 70.71 ACAGAAACGCTGGATAGATATTGCCGGGGTACATCTTCTCAATTACGCTTAGTCCGTAGTCTTATCTAGCATTGAATCTCGTCTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATT:1 + chr3L 22400732 5' - 1360 3202 1 56.85 GCTGTGCCGTTTTTCCATTTCGGTCTAGCCATCAACAGTGTTGGCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCATACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGCTGCAG:1 + chrX 12191505 5' - pogo 2070 1 63.70 TTTGAATTAGCTAAATAATAATTGCTTGTAAATTATAACAAATACCGGATTTCATCGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGAAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATAC:1 + chr3L 24291923 5' + rover 16 2 75.34 ACGACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATATGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - 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accord2 7559 2 67.91 CAAATATTTCTAACGGCTTGACTGTTCTTCATGTCCACGCCGCCAAGAATTTAAATATGTAAAAATAAAGGAAACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAATACGAATCCCTCACACACATGCGATTACC:1 + chr2R 5997468 5' + I-element 4872 1 57.55 GCTATTGGGAATTTAAAATGATTAACTGCCAATCAATCAATTGTCAAACTAAACTTAAACATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chrX 14964714 5' + roo 59 2 62.07 CCATGAGATGGATATAAGGCGGTAAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCGGGAAAAATCAAATAAAATAACATCA:1 + chr3L 17447388 5' - transib1 1898 1 75.71 CCTACTGCCCATTTGAGGCATCCTAAAAGTAGGCAATAGCTATCCCCACTGTGCCTGCCATGCACTGCTGCCTCACGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chrX 19121070 5' + jockey 20 1 58.41 ATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAG:1 + chr2L 12349786 5' + F-element 107 1 72.22 GTAGATTTAACGGAATACGCGCCATAAATTATAATATAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 - chr3R 12568926 5' + hobo 84 1 75.34 CTATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTC:1 + chr3L 24152412 5' + HMS-Beagle2 6914 2 62.76 CGTACTGGATTAATTCCCACGCCCAAGAGGCATATCAAGTATTTAAAAAAGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - 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transib2 2662 1 56.16 TCCCAAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCCTAACAGCGGATTA:1 - chr2L 12340815 5' + diver 34 2 53.00 ATATTCGTTTGAATACAGAACTGTTAAAGAAACATACAGAAAGAGATTAATTTATGGATGTTGGAAAAAAACCCAGAAATCTTGGAATTATACAACCCATTAAAACAAAATAAAACAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGAC:1 - chr2L 21762448 5' - INE-1 568 1 69.66 ATTTGGTTTACAACAATAAAACGTCTTATTTAGGTTCGGTTATTAATGATGAGTTATGGGTTCAGACCTCCTTCGGAGACGAGCGGACCCATCATCATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTGAT:1 + chr2R 8641465 5' - diver 205 1 70.50 GGCCCCCAGGCTCCGAGGTAGTCATACTCCTGCTGCTCGTCATCAGTTCCTGCAAAAATTACGAATATTTACACACACAAAAATCCATGTTTACGAAAAGTCGTTCAGGATGATTTTATCGTCCATTTTGGATTATTAATCTCACT:1 + chr2L 17650457 5' - mdg3 276 1 62.33 TTTTGTTTGCATTGTTTATTTAAATAAATCGTTTTTTGTTCGCTTGTGGTGTAATTAAAGTTTTGAAAATTGTCCTCCAGATTATAAATGGGATAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr3L 14122556 5' + 1360 22 1 68.09 ACCGGCCAAGATGTATCATATTCCAAAGCCCACCCATTTGTATGTCTCCGATTCTGTTTGGGATTGTAGTCTATATAGCCATATACATACATAAACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACT:1 + chrX 16828896 5' + Quasimodo 16 2 73.79 GGCGTCGCGTATTCTGTATTTGTGTGGTATTCATTTGCGCATATGTATGTATATCGGCCCGCTCGGCTGGCTGTGTGTATATATGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATCATTTCAAAGAA:1 - chr3R 17067950 5' + 297 29 2 64.38 AGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTATCAGAAACCCACTTTTG:3 - chr3R 11547752 5' + G2 364 1 77.40 AGTAAGTTAACACTAAAGTAAATAATGATTGCGATCTCTTCATGTTTCCTAAAATAGCAATCTTTTATTTTTCCCTCTGTGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATT:1 + chr3R 10472672 5' + mdg1 43 2 56.16 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGTTAGGCCTCTGCGTAGCTCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGT:1 + chr3L 22908066 5' + roo 320 2 65.94 AGTTTTGGGATAATCCGGTTTTTATCTCTGTTTTCTTAAAATATCAAATCGATCAATTGTACGGGACTTGATGATTGTCAAATTAAATAAGTGTGGTGTAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3R 26191745 5' - hobo 2920 1 67.83 CAAATAAAGCTAAGATGATTCAGCGAGATCTTGAATACATACATATAAAATAATCTAGAAATCTAATCTCTTACGAATGCCATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAAT:1 - chr2R 13833585 5' - Copia1_DM 142 1 53.42 AAGTGGCAGGAAAAGGATCAATCACTTCAGCTGGTCAACTTTGCTGGACATTTTCAACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1 - chr3L 11400010 5' + Quasimodo 59 2 60.96 TTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATACCCAATCATTTATG:1 + chr3L 25782396 5' - Stalker4 6991 4 57.53 TTGTGTTGAAATGTTGAAATTTTGAGAAGCACCACTTACTTTATGGAAACACGGCTTGAAAATTCTAAATATTATGTTTTACTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chrX 18832964 5' + 412 7107 2 56.94 GCGCATCTGATGGAGGTCCGATTTATGGCTTAATGACCATTAAGTACTTTTGGATTTGTGTATTGCGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGATTATTATGAAGTA:1 + chr2L 9014327 5' - gypsy4 182 2 60.28 AAATTGAATTATCATTTGCTGGTGCATCACATTTAATTCGTTTTGGCGCTGTACGCGTGCGCACGCAAATCCCCAGTTCCCCAACTGGATACCCCTCTTTATACTCCACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2L 16458535 5' + roo 8677 2 75.34 CTATGAGTGCCTCAACACGTACTGGATTAATTCCCACGCCCAAGAGGCATATCAAGTATTTAAAAAAGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:2 - chr3L 15612809 5' - roo 352 2 56.16 ACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr2L 23310627 5' + 1360 48 1 57.36 CTTGAGGTGACAATAAGTGTAATCTGTTGTTCTTGAGCAATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 + chr3L 14062207 5' + Doc 52 1 48.63 CTCTGATAGTAAAGTGTCCAAAGATTGCAAATTTTACTTTTTGGTACCATTTCTGGTACTTTTTGGCTCATTTCTATCCATACAGTGCACTGTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCA:1 + chrX 3464148 5' - hopper 1379 1 56.85 AATAAAAGGAACATTTATCATCTCGTATTCTCATAAACATGTTAAATGGAAGAAGCACGGCAAACTTCATGCGAAATAGTATTAGAAAGCGAAGCAAAGAAGATATCTATGAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTC:1 - chr3R 26175470 5' + 297 402 1 72.86 ATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 + chr2R 6632589 5' + P-element 68 1 28.23 GTGGTATAAATTTTTTACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATATATATACTATAATAGATTCGTTGAAAAGGTTTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATTCTTGATCAGGATCAAT:1 + chr2L 21582262 5' + INE-1 83 1 76.64 AGCAAATTCCGGCCAGAGCTCAGCTTATCGCAACTTTCTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3R 23765434 5' + roo 83 2 75.34 GGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAGATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:1 + chr3R 23639158 5' + pogo 76 1 68.49 AGCCGGACAAATGCTAAAGAACACAATTTGAATGTCCTAAGTTTTTCAAGGAAATATATGCCTTATCATTTCATAGTACAACCCAAATGGATATTCCAAAATGGCATAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 - chr3L 20255296 5' + Transpac 4929 2 78.77 TTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3L 20712991 5' - roo 9001 2 80.00 ATAAATGTTATATTACTTGACTAATTCAAAGATAAAAAGTTTTAGTTTGAATTAAACTTATCGTGTATGTGAATTGTGGCGTAATGTTGTTGAGCAAATGGGTTCTACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 24279279 5' + roo 8679 2 73.97 AAATTAATCCTGAATGCAGGATTTATTCAGGTGCAGCCTGGATACTTTTTGTTATGCGAATACTAACTTACCTCATTTTCGGTCATATTTTTGTCGCTTGATAAGTTAAAAAAAAAACAAAAAA:1 - chrX 17522225 5' + TAHRE 10442 1 74.19 GGCTGCGTGTCAATATATCACGATTATGTCAGTCGCTTGTGTTTGTTACCCAGCAGGCGGTCACTTCTTAACCATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr2L 16458698 5' - roo 9036 1 57.78 ATTAAGGAAAGTGCAGAAAAAGTGACTGACACTTGGTAAATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr2R 6842843 5' - roo 8994 2 69.86 TATCTAGCCATTATTCCAGTAAATGAATCAGATTTTTAGCTAATAATTTTTTAACTATTTTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr3L 13374109 5' + pogo 57 1 60.96 GGAGGGTTGGGTTTTAAGTTGCTTGTAATAAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2L 4173926 5' + roo 8687 2 69.86 CATACATAATAAAGAGCATCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATT:1 + chrX 21772487 5' - gypsy3 6534 1 67.50 TTTTCCCATATTTTAACTTTTTATCAAGGCCATGAAAACCAGAATCACTTGAATGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chrX 957968 5' + roo 67 2 65.75 AATCTGCACTCACATCGCCTAGCATTTGTACTGCTTATCGGGGCTCAATTGGGTTCAATGGACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTT:1 + chr2L 4998106 5' + FB 61 1 59.59 AATATTTAAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr2R 20673626 5' - mdg1 7404 2 54.79 AACCACATTATTAGCCATTGGCGCTTGGTTATCAGTTTTTATGTAGGCCACCTGATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 14553956 5' + roo 8679 2 42.07 AAAGCCTCTGAAAACATGAATTTCCTTGCGCCATTATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chrX 10567760 5' - roo 9016 2 53.10 CTAAAGTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 + chrX 15903129 5' + INE-1 88 1 73.29 AAATGGAAAAAAAAAATGCCGAGGCAGGCAGAAATTTAGGTTGACATTCAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chr3L 16580350 5' + 412 7124 2 65.75 TACACTGAATGGATTGGATTGGCTTTGACATGGCAATCAATTTTTGGTAAAGTTATGAAAAAAACTCAATTTCTGCCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chr3R 24493189 5' + jockey 4716 1 50.68 CGATTCATGCATGTATGTGTGGCAGTGTGTCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTC:1 + chr2R 23487768 5' - accord 7029 2 79.63 GAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 - chr2L 22015985 5' + Tirant 20 2 57.14 CTAACATGTCTATATGTCTTGGAAGGGAATTCAAACACCCAATCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTGTCGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr3L 14551077 5' - P-element 2857 1 57.14 ATTGCTGGCCAAAAACTGAACTAAAAACAAATTTTCTGGTGCCGCAGCAGCAGCTGAAATTGACAGACGGACCGATCAAAAACCTCTGTACGTTTAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAAT:1 - chr2R 19823771 5' + rover 235 2 60.00 CAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTT:1 + chr2L 16089603 5' - 3S18 6028 2 69.93 TCTTAATTAAGAGCTGTATTGGTCTGGAAGTATCCTTTATTTCCAGTGCACACACATTCGGATGTTGTCAACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACG:1 - chr3L 17174724 5' + 412 7266 2 55.47 GCTTTACACGTGTGTTGATATGCAAAAAAAACATTGCATAGTTTTCAGGGCAAATGAGCATATGAGAGGATGTTTGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 - chr3L 9571752 5' - jockey 4944 1 50.68 ATGGCCACACTGATAATTCAAATATTTTGGCACTAAATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 + chr3R 11750142 5' - Tabor 7304 2 68.89 ACATATTTTAGACATATATGATTTGTGATTTAATTGCAATTTAATCTTCGGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAAAATAATAATTGTGCTCCGACATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATACATATGTTATGTA:1 - chr3L 23529721 5' - Stalker2 227 2 69.18 GATTTCAGCAAACTTTGTCCTGCCCGAGTCAACAATTTTGATTCTATTTACACATTATTATTATTATTATTATGGCAAGAGTTTCGCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 + chr2R 18482381 5' - hopper 1388 1 58.57 AAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr3L 19350000 5' + jockey 75 1 57.53 ATTAGCAATAAAAAATTCTTGAAATATGTATACATTCCAAAGCTACAGAATGCTTTCAAATTCAACTGCAGAATATAAACAATCTATAATCAATAAAAACCTTAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 22725488 5' + roo 13 2 75.17 CCGTAGACTGCTCACCTTATCACTTTGTTTTAGATCTGTTCTTTTTGATTTTGTGTTTTCCTGCACAGATTTCAGATAAATATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCTGGTTATAAAACCTGAGCAGCC:1 - chr2R 963397 5' + Cr1a 478 1 71.23 CATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:2 + chrX 4778155 5' + 412 40 2 56.85 ACTGCAATATATTTGACTAACGCCCTTCCAGTCGTTGTAGACAGTGTTTACTTCGATGTTGTGGCGCATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr2R 5868392 5' + pogo 50 1 54.79 TCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGTAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr2L 686052 5' - roo 9039 1 69.05 GTTCAAGTGGAAAGGGGCGAAAGGAGAGTGAAAAATACGAAATATTTTTTACAGTCCTCCGATGACTGAGTTCATTAACATTCCAAAACTTAAAAAATAAAATGAGGGCTTATGTAATTATCGAGAGCGATAATTTATATTTAGGA:1 - chr2L 7905637 5' + roo 8741 2 73.29 GCGATAATAAGTATTTATGGGCGGGGCAAGCAGATTCGGTTTCTTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 - chr3L 13634294 5' - 297 352 2 63.33 CTGCTTCGTATTAACCTCTGAGATTAGCTGGCATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 - chr3R 19859676 5' + opus 7039 4 65.31 CTCGCTATTGTGGAACTTTTCAGAAAATATTTACTAATTAGATTTTAAGCATACATTTTGTTATTATCCTGTGATTTGATTATGTTTCCATACACCATTTTAACACATTTTGACTTTTTTAAGTAAAAACAATAATAATAAATAAT:1 + chrX 17508082 5' + flea 248 2 76.03 ATATGCATCTTACCTTCAGACTTCTTTATATCTTTTCTTTTATTATCTCTTTTTTTATTTGCAAGCTTTTTTATTTAACAGCTCTTTCAGGTGGATTTTTTTAAAAGATGTATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGA:1 - chr3L 8856020 5' - rover 7292 2 71.23 AAATTTACGACTACACGTGGTCTCCGCTTTTATAAATAAACAAACAACTCTATTTCATTTTTTGTTATTCGGGCTGGATTCGTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr3R 7037777 5' + roo 9 2 63.01 AGTCGCACGTCAGGCTGTTCCTTGGATGCCTCGCAGCCCTCCACCACGCAGTGCTCGTCCGCAAAGGCCTGCGCTTCGTTGGGATAGATGTCCTCGTCTATGATGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTC:1 + chr2L 19750362 5' + diver2 122 2 67.59 GAAGCAACAGTGAGCAACGAGTTGAACTTTGCATATACATACATATATATATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGC:1 + chr2R 20489379 5' + 3S18 5839 2 66.44 TGCTGGTACTCGCCCGTGATCTGGCAGTCGTCGGGGTCATCGTCGAGGTCACAATGTACAAATTCGTAGGGAGGGAAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCGATGCTGGCATG:1 - chr3R 25192235 5' - accord 118 2 68.70 GGGCCAAATGGCTTTTCCAGCTGCGCCAACAGGGCGTATGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGCACATACAAACA:1 - chr3L 19199703 5' + hobo 80 1 73.97 TTCATGACGACAAAGGGTGTCGGCGGACTGGGGCTCAGGGTTGGGTTGCGGTAATCGTAGACCCTTGGCGCCGCATATTCCTTAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACA:1 - chr2L 17208743 5' - jockey 4900 1 79.28 CTATGCAATATGCAATCCGCTCCTGGTTATCGACTGCGCCAGTTATAGATGGGCCGTAGCTCCACGTGGACAGTTGGTTAAATTATATGTTTAAATTGACGCCCAACGCGCTTAAGTGTCGTAATAACGTAAACTCCGTAATAAAA:1 + chr3L 27390949 5' + gypsy10 392 1 66.44 ATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAA:1 + chrX 21772492 5' - gypsy3 6563 1 60.00 GGGTAGTTACAAACAAACAAAAAGCAACTCAAAATTTGCATAATATTATATGACAATATTATTTCATAATTAAAATTAAATCTCATATTTAAGAGTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCA:1 - chr2L 17209837 5' - jockey 4720 1 56.85 AAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTGGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAA:1 - chr3R 25186432 5' - invader4 2670 1 54.11 ATTTTGCAACGATTTGAGAGACCGCATTTTATAATTGAATCACGTACGACATTTTCAGAGGCGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAACGTATGAAG:1 - chr3R 28272323 5' - Tirant 8466 2 53.08 CACGCATAAATATTTATGTGAGGCGGTGTGGAGTTCCAAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 29645792 5' + jockey 36 1 43.41 GGCACTTCTTGGGCCGTAAAATATTTACCCAGGGTAAACAATACAAACCGCTCTGGGGGCGGATGGCTATGGAAATGGGCGAACCTTTTGTCACTACCAAATCTCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATT:1 + chr3R 11344621 5' - F-element 90 1 72.60 CTTTAGAGCTGTTCAATTGGCTGCTTAACGTAACACAAAATTATATTATATCAAACAAATATACAAAGTCTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTATTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTT:1 + chr2R 1891079 5' + Cr1a 243 1 64.38 CTTTGTCCGCCCAGTTTCCCACATGCCCAAAAATATGCAACATTTTTTATATGTTTCTGCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chr3R 8707351 5' + jockey 4703 1 38.36 CCTGCTCTCCACAGTTATTAACTATTCATAACTTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATAC:1 - chr2L 2272530 5' + copia 4957 2 78.77 ACAGCAATACAACTTTTTAATTGGCCCATTGCCCCAACCCGACCCAACTCGCCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGACTAATCGTATGGCGTGATTACAGCCAAAGCTGAAGTCAGTCACAAT:1 + chr2L 16089700 5' + 3S18 5993 2 61.48 CAGTTCACACAGTTTTTTCTTCTTTTTGAATATTTAATAAAGATGTTTTAAAGTGGATAGATGATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAA:1 + chrX 8012231 5' - 297 340 2 57.53 TATAACTAGAGATAATCAAAATCATATGAAAGATAGTTTAGTTTGCCAAAAGTTTTACATAAAAAGTAACTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGT:1 + chr3R 23765208 5' + roo 9023 2 52.74 AGCCGCTTTTAATTTGGTTTTTTAGTGCCCAGTTAGACGTATTTGTAATTTATGCTCCTAAGACCTTTTGCTGATTTAAAGTATCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATT:1 + chr2L 5601527 5' - mdg3 210 2 60.27 GTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTAT:1 + chr2L 15834453 5' - hopper2 1560 1 54.26 GATCGATGGGAACGGGTTAAAAATAAGTCGGAATCGGATTCAGGCATAACAATTTCCTGTCAATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 31490895 5' - roo 399 1 75.19 AAGCGATGAATAACGGCAACACAACTTTTGTTGTCCGAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 12867380 5' + roo 8716 2 54.79 AGTCCGACGACAGCAGCGCGGATGCGCCGCATCTCGCGGCAACGTGATCCCTTCGAGGATGCCGACGACTTCCTCGCTCCCCAGAGACAACGAAATAAAATAGTCCCTCAGTGGGAGACCACAGATA:1 - chr3R 5582728 5' + roo 8869 2 71.65 CATGAGCATGGATCACATGAGCTTTTCAAATAGTTATTGGATTGGTCAAAACCATTTGCAAGGTCTATAGTTAAGAGTCTCCAACCGATAATTGTCGTTTAAATTGGCATTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCATCCAGTT:1 + chr2L 5614526 5' - rooA 263 2 68.49 TCAGGAGTCGATATATCGACGGTGGTTTACGTCCATGCTGAAGGTGGGAAACTTCGCTACGAGCTGTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1 + chr3L 22648279 5' + Tabor 9 2 69.70 AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAAGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439059 5' - P-element 2495 1 60.27 AGCCTTCTCTACAATCAATTATTTCGTCAGCTGCTCTAAAAGACATTGGGTTGGTCGGTGGTTCTATTCAAACTCAGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 + chr2R 1875697 5' - Tabor 7303 2 64.46 TTCAGGGCAAATGAGCATATGAGAGGATGTTTGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAAC:1 - chr3L 9571711 5' - jockey 4901 1 80.14 AATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTT:1 - chr3R 11750258 5' + Tabor 6915 2 68.49 CTCGGGGTTTATTTTGGTATTTCGCATTTGGTCCTTTTTCCTGCTCGCAGCTCACAGTTCACAGCTCGTGTTGACAGTTTTTTTTCGCTTTTTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chrX 20066271 5' - opus 7492 2 76.87 CGCATGGCAAACAAACTCGCACAGACAAAAGTAATGTGAAACACAATAAAAGTGTCTAACTGTAGGAAGAAATGAAAGTCAAATGCTGGTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGT:1 + chr2L 1558476 5' - Doc 226 1 65.07 GGAGAACGGAGCTAACCTTACTCTGACCTTGAAGCGGAGCGAGCGGGAGAGCAGAGCAGCTGTCTGCATCACAGTACAAGGGGAAGGGATCAAGAAGATAAGATGATGAAGATCAATGTAACGACGAGAAGCTGG:1 + chr3L 16806515 5' - Ivk 85 1 63.70 GCCACGAATTTTCCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTT:1 - chr2L 18279988 5' - gypsy5 380 2 57.85 AAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTT:1 + chr3R 19589903 5' + BS 5045 1 50.34 ATACTTCTTGGCGTCAGAATTTCGAGTTCGAAACACTTTATTTTGTGGCATACAAACAGGATTTTAGGTAAATTTCGTGAACTTTTTTAAAAGGTTGAATAAAACAATGTTGTATGTATTTCCCAATCTATAGATATCCCAGAAAA:1 - chr3R 12363734 5' + INE-1 499 1 72.60 CTGGACATCGTGGCATGCAAATGAACCAGCGAACCCCCGCATCCCACATACTATGCCATAAAACCAACGCAGGACATCGGCCGGATTTTTAATGAAACACAATAATGTTACTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATC:1 + chr3L 11745219 5' - G2 2801 1 78.08 CGCGGGAAAGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGGGGTGGCTCCAGGCTCTCTTGAATTTTTG:1 + chr3L 26852642 5' + 1360 82 1 67.13 CATTAGCAATAAAAAATTCTTGAAATATGTATACATTCCAAAGCTACAGAATGCTTTCAAATTCAACTGCAGAATATAAACAATCTATAATCAATAAAAATCTTAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 22725487 5' + roo 13 2 76.71 TGGCTCTTTCAAATACGCATTAATTTCATTTATTGCAATCATCATTGTTGTTCCTGTTGTTGTCATGGCGAGAAAAGCCAACGCAAACACGAAACTTAGACGGAGCGTTGAAGAAAGGAGTTCGGGAGTGAGAACG:1 + chr3R 26524238 5' + gypsy8 435 1 77.94 TGAAAAAGTTTCACCATTTGTGATTAAAAAAGTCATAGACTTCACATGCGGAGCTAAGAGGTTTCTTGGCAAAAAACTAGGCCGGGAACATTATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGG:1 + chr2R 4638558 5' - 1731 4596 1 63.70 ATTCGATTGGTTGGGCATCTTGTGCCACAATTGTCCATGTGGGAGTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 + chrX 1689992 5' + 412 7128 2 67.81 AGCCTGAGGCACATTATATTAAATATGTTAATATATCTAAACAATAAAATAATATTGCAATTTTGGGCGTGGCAGCATGGGTCAACAAACTTTCGCTGCGTCTTTGTCTTTAGATTCTGTACGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTT:1 + chr2L 169013 5' - INE-1 166 1 56.85 TAAAGTAAAATGAGAAGCAAGCCATGAAAATAATTGATATTCGACTTTTTTACATTAGTTTTCGCATAAAAATTGTATTGCATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATA:1 - chr2L 2657350 5' - diver 6079 2 57.55 ATGTTAGTGAGTAATATCATGGGTTTACATACATAATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTACTCAGC:2 + chr3R 4504015 5' - INE-1 546 1 71.23 TAAAAATAGCCATCTTTATATTTATTTTTGGTCAATATGGCCCTTACCTGATACTCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3L 96593 5' + roo 8719 2 61.94 GCGCTAATTAGAATGCGAGTTGGGATCGTCTGTCGAACGTTTGGCAAACTGAAGATCGGACACAATTATCCGGTGGCTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTT:1 + chr3R 11057540 5' + flea 4776 2 68.00 CATCGTTTGGCCAACACTTTATTTGGATAAATTCGGTTTCCTGCTCCGATTATAAAACCAATTCGAAACCTTGGACTGATTTCCGTCTCAATTGATATGGTTCTTCTTCCCGATTTTAATTAAAAAGGTATTTCCCTTTAAGGTTG:1 + chr3R 4870254 5' - gypsy5 7261 2 69.18 AAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2L 76056 5' + roo 78 2 71.23 GTATGGTATATGTATGTATATGCTGGGCACAACGCATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chrX 12526017 5' + roo 47 2 53.42 TTATATTTCAATTAGCTTCATAGATTCTCAAAAATGGCTTAGAGCTTGTTTTAAGTTAATGATTGAATGGAAGCGACGTTTATTGTGAACTTAGTATTGCTAAAAAGTAAGTGTAAGTAAGTAAGTAATTTAATTTAACAATGCAC:1 - chrX 17557745 5' - hopper 1295 1 78.77 AATGCACACAAAACACACAGGAGACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGGC:1 + chr2R 22722988 5' + 3S18 5782 2 70.59 ATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 + chrX 14964640 5' - roo 319 2 82.88 GGGCGAAAAAATGCGATGAGCCATCGATAGTTCGATAACATCCCGCGAACAATCTAGCGGATGCAATCGAATTTAAGCTAAGTGTTAAATGGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 - chr3L 19836554 5' + pogo 24 1 69.18 GCCGAATTTCGAGTCGCTGTTTCTGCCGTTTAGTTGTTGTTGCTGTTGCCATGGCTGATTCAGGGTAACTCCTTCTAGCCGGATTTGAGGGGTG:1 + chr4 905846 5' - Helena 846 1 60.64 AGGAAAGCTGAGTTGAGGCGCCCGCTTTCGCGATTTTCATCAGCTGTCGTCCTCATAGTCGTCATCGTCATCGCCATCGCCATCGTCCTGTGTCCTGCGTCCTTTGGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chrX 7786717 5' + hobo 14 1 75.69 CGTGGGAAGTAAATTTTTTGGTTCGAAGGCATCAATAACAAGAAAGCATTACTCGAGATAAGATTGAATGAATATGTTTGGCACCTATAATAAAATAATATTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCG:1 - chr3R 30583913 5' + gypsy12 17 2 71.43 CAGAGAGAGAAAGTAACGTCTGTTTGAAACGAGCGCGCCGTCGCGACTGTCTCAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chrX 8891756 5' - P-element 2854 1 50.91 AGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAG:1 - chr3R 26246875 5' - 1731 4543 1 75.00 ACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAA:1 + chr2R 22723043 5' + 3S18 82 2 70.55 TTTTTATAGTCGAACTTTGATCGACTGTAATTATTCGCACATCACTTTAAACACTGTGGACACTGTCACTGTCGCCATGTAAAATGTTAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTCACCCGCACATACATTGCTTATATC:1 - chr3L 26745489 5' - Stalker4 283 4 56.85 CGTGATCGGGTTCTTGGCCTAAAAATATTTTCTGCCTTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 + chr3R 9160643 5' + copia 21 2 69.40 CGATTACTTCTGAAAAAGCAATATACTTCTGATCGATTACAGTTACTTTCTATAACATTTAATTTCATAAAAGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr2L 6319013 5' + pogo 46 1 54.11 CCTTGCGCCATTATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chrX 10567783 5' - roo 332 2 68.31 GGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATG:1 + chr3R 1546406 5' + Tabor 6907 2 62.07 GTGGGTTCTGTTTTGTGCTTCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGAGCGTTAGATCG:2 + chr3R 12611988 5' - Stalker2 147 6 82.19 AAAACTTAAAATTCCAAATTTATGTGACTTTGACGTAGTTAGAAGTAAGACAAAGGCTATTAAAAAAAAACTTTAACATGTCTAAATATATTGACTATTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 - chr3L 9497866 5' - jockey 4970 1 52.74 CGGTTCTCGAAATAAAAGACAGAAAGATCAAAAACAGTTTTTTCTTTCAGTTTTACAAACCTGGGAAAGACACAAAAATTCGGAATTACATTTAATTCCCTACCACTCTTATTTAATTGACCAAACATAAATATATATATGTATAC:1 - chrX 14116457 5' + 1360 2961 1 75.34 CATTTAGACAATTGGACAGCTCTGGGGAGTGGTAATGCTTGTACTGGAACTAGGGGGTGGCAAGGAGTTCGGGGCTTGTTGCAATTAAAGCCAAATCGGAGTTTTTCATAATAGAGAGAGAGAGAGAG:1 + chr3L 15776051 5' - blood 7180 2 78.12 ATCTGTTGTTCTTGAGCAATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1 + chr3L 14062228 5' + Doc 73 1 59.59 ATGTCGAAGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCCTCTTCACTATTTTCGTTGTCTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr2R 4284687 5' + 1360 17 1 57.14 CTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATGGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTGTGTCTCCCAATTTGTGCCTC:2 + chrX 22726201 5' - Helena 1222 1 61.64 TGCTTTGTGTGAGTATATATAGCTGGAAGACCCGAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGACCA:1 - chr3R 16276471 5' + F-element 314 1 63.12 ATATTTCGTGTGACATCCTTTGTGTACATATACATACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCA:1 + chrX 22560052 5' + Transpac 4997 2 74.31 GGTGTAATTACGGTCATAAATGTATTTGCCGTTTAATGGACCAGGCTCCGCACTCTGTGTGTGGGTCCAAGCACGGCGATGAAAAACTTGGATTTGGTTTCGTTTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAAC:1 + chr3L 12660054 5' + mdg1 7033 1 69.18 CCAGAGGTCACCTGACCAAACGCGACTTTAAGGTAAGCCAATAAACTCAAAGAGGGTTACGCAAGTCCCCTTGGATAAGCCTATCTTCTATGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr2L 2030995 5' + 412 7082 2 62.76 ACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2L 76139 5' - roo 9010 2 65.75 ATAACAACAACAGAGATTGAACATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGCGTT:1 + chr3L 23986493 5' + opus 152 4 54.11 GTGGTCTGCCATAGTCTCCATATTCCTCGTTGGAGGCGCCATTGGATCAGTTGTTGGAATTACGTAAGGGTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 + chr2R 5958262 5' - copia 238 1 50.00 GATATACTAGATTCCTTGAAAAGTAATCTAGAAAGGAAGTTTTTCCGATAAAGTATATATATTCTTGGTCATGATCAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGC:1 + chr3R 28636009 5' + INE-1 149 1 75.86 TTATTCATACGGCAGAGTGACGAGGCAGACGAAACGCACCAACGGTCGTGGTTTTTTCTGTGACAGTGCGAGATGTTTTATCCCAAGAGTTGGGGCATACATATACAAGTTAACACAATCACAAAACAACCGAAATATAG:1 + chr2L 21951077 5' + Burdock 12 2 76.43 GCAGAATTTTCTGCAAATAAACAGCGGGGTTACTGCACACTTTTCCCAGGCACATTAAAAAAAATCTTAGCTATAACGTATGTGACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chrX 16787209 5' + pogo 33 1 60.00 AATCATAAATTATAGAACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTG:1 + chr3L 2724947 5' + Ivk 30 1 65.07 TACATCTCCACTTTCTCGCTAATTGGCAATGCATGTTCTACTTCTGTGAGCACGACTCACAGAAGCTCTCTTGTCAGCTCAGTAGCGGATCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 + chr3L 23608476 5' + Tabor 21 2 68.66 AATATTGATAAATGAATGCGCACCATTTGCGGGAATGCCAGCGAAAAATGGCAACCAGTGCGCAGAAATGAACAGTTTCTGTTTTGTACTTAAAAAAATGACATTTACTATTACATTAAGGGTGCTCAGCTGTTATGCTCTGTGAC:1 - 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chr2L 12658614 5' + Quasimodo 21 2 48.63 TACTGCACTGTTTTAAAATTCTCACATCGCATCGAACAACACGCAACAATTGCTCGAAAATGCAAATCCTTTTTTGAAAACAGGTGTCTAAGAGTATGCTACGTTATTAGAAAATAATGATCATTTCGGAACTTTACGTTGGTCAA:1 - chrX 19721407 5' - HB 236 1 74.66 TAATAAATATAACGATGTTCTATTATGTCCTTTACGATATATGAACAACTATTACATCTTTTTATTGTCATTAGTTTTAATGAGAAAGCTTTTTCTAAAACCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 - chr3L 16212869 5' + Transpac 17 2 72.60 GACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2R 11609213 5' - roo 346 2 60.69 GTGTTCGTTTTGGCACGCCCAGAATTCCGAAATGGGTTTCATTATTTTTTGTAAATTGCTTGCACGCGTTCAATGCAAAACTTTAAGCATGATATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACG:1 + chr3L 15776961 5' - 1360 3236 1 64.38 CCACAACAGCAGGCGGCAACTTTGGCACTGCAATTTCGATTTCGCCTGTCGTCTATTTAATGATTCCGAATCGGAGCAGGCCCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 + chr2L 11951493 5' + pogo 8 1 76.92 CAATATGCACAATATGTTTCTACTTTGACTTATATATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAATACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTGCTATA:1 - 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chr2L 13250431 5' + opus 64 4 77.34 CATATATATTTATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATGCACATTTTAGTTATAAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2R 8305314 5' - roo 9014 2 57.24 AAATTCGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGGCGTTTTTATCGTGCT:1 - chr2L 2276799 5' + F-element 30 1 57.27 CGAGGATACCAATCTGTGCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr3L 15026613 5' + opus 137 4 64.38 CAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr3L 25401030 5' + Doc 39 1 50.00 ATAGAAAAAGTCAATACGGCGCGTTCGATGTGCCTTTAAATATGTCGGGTTGGAAAAGTTCCTTATGACTTTATACATGTCCTTCTATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 - chr2L 10746736 5' - pogo 2068 1 51.37 ACTGTGAGATACATCGTTAAAAGTATCGCATGATAGTGAATATTAGTAACATATGTATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:4 + chrX 5150236 5' + roo 17 2 70.55 GAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 - chr2L 13250432 5' + opus 49 4 73.68 AAGGATTCGAAGATTGAGAATATGTATGTATGTGAAACGGGTATGTCAAATTATTTACATTGAGTTTTATACCCGATACTAGTGAAGTAAAGGATTCGCTGAAGAATATGTAACAGGCAGACGGAACCG:1 - chrX 22508724 5' + INE-1 30 1 62.79 GCACCTCGTATACGTGATGTCTGTTCGGAAAAAAGATTGAATATATACAAAATAGATTATTTGTATTGTTAAGAATTAAGCAGCTGCAATATAAATTATATTCACATTGTAGGAAGCAGCGGAAATTAAATATTTAAATAAATACA:1 + chrX 16975835 5' + transib1 1935 1 54.79 TTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATC:1 + chr3R 28396620 5' + jockey 96 1 76.03 AGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCA:1 + chr3L 25482885 5' + accord 52 2 56.52 ATTCAGGACATGTGGCATCTCAAACAGTCCATGGGTGTACGACTCTAGGAACTCTGGTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGACGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 25304859 5' - roo 394 1 74.45 GCACATGGAAAACCCATTGCTTAAATCCAATGTTGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTCAGATACAAAATATTTCCCTAA:1 - chr3L 24152520 5' - HMS-Beagle2 7111 2 75.34 TCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr2R 11609222 5' - roo 336 2 67.12 AACCCAATTTTTAATATGCTTTATTATTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTACACTCGTTGAAGAGTATTTAACAGGCGAAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAAAGTATATATGTATATTCTTGATCAGGATCAAT:1 - chr2R 25211384 5' + INE-1 83 1 71.92 CACTTGCACGCCGGTAGGCGCAATCGCGGTGCAGTGAACTTGAAGGGGGTTCGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 + chr3L 22642839 5' - hobo 2896 1 55.00 CAAACTTTTTCCCATCAACAAACTTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr3L 22052726 5' - mdg1 385 2 60.96 ATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGC:1 + chr3L 25482879 5' + accord 23 2 61.74 CCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACA:1 + chr3L 24152452 5' + HMS-Beagle2 6926 2 58.97 AAATGTATCGTTCCACATCGAAGCGACTTTTCACTCCGTGCTCCTGCTGCCGCCATTGAGTGTCCTCTGATGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 - chr3R 26520481 5' + FB 1 1 76.84 GTCTGGCCTAATACCCATCATTAGAGCATTTAACAGGAAACACGTGACGCTGCATAGCATCCAACATGCCCCTCCCCTTCTGTAGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTAT:1 + chr3L 16562832 5' - roo 9034 1 56.12 GGTCAACGTGGCTTTCGTCACTTGCCTTGATGTTTTGGGAGCACTTGGGCACCGAGAGTGGGAAAAAGACAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 18658848 5' - roo 391 2 71.92 AAAGTGTGCATAGTAAAAATATTTAAGAGCAAATAATATTTGATTATCAACTTGATCAATAAATAAATCTTGAACTTGAATTTGCACAATTCAAATTTCGTTGAATTCTAACCCTTACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTA:1 - chr3L 6789409 5' - Stalker 271 4 66.44 ACCCATAGTTATTTTAAGCACCTACAACAGGTGAATTTATGAAGACAAGGTGTGGGAAAGTTGGTCATATATGTAGCTAGTTATGTTTTGTTATCATAATCGATTTGCTTTGAATGTGTTCACTCCTCCGCTTCTACGACGAAGG:1 - chr2R 7892876 5' - Burdock 6116 1 75.17 ATGAGAGAGCAAATTCCGGCCAGAGCTCAGCTTATCGCAACTTTCTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3R 23765441 5' + roo 8739 2 70.34 GCCATTTTGTGGGGGTGCTGCGAAAATAAAGGGGATAAAATGGAGCCAGGAAGGGCGCTTAAAAAAGGGGGTTAAGTGTGAGCTCGGCTAGGGGAACTTCTCTTCTGTTCTCCTTTTTTTTTCGTTATTTTCTCGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 12301952 5' - gypsy11 3933 1 56.16 ACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr3L 15026632 5' + opus 150 4 54.29 GTTTGGACTGTTGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 - chr3R 9352117 5' + Tirant 30 2 61.94 ATATTGTTATTAATTATTAGTCACCAAAATTAATACAGAAATGAACATCTAAAAATTTAAATACTGAACTCGGCTAATGCTCCTTAACGAAATAGGTACGGTAGGGCAATCCGCGAACACAACTACACCGGTGTTTCGCTAGCAAC:1 + chr2R 4774815 5' + Gypsy12A_LTR 1990 1 44.52 ATTGCGATCTCTTCATGTTTCCTAAAATAGCAATCTTTTATTTTTCCCTCTGTGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAA:1 + chr3R 10472699 5' + mdg1 70 2 63.70 AAGAAATTTAAATCATAATTCCAGCTTCTTGTTTTAATTAATACGTTCAATATGTATACATTCTATGTATGTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCA:1 - chr2R 8642981 5' + Doc2-element 4750 1 51.37 AACTGCTATTGCTATTTACGATACGATAGTTACGTGGTACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr3L 13868607 5' + 412 7092 2 56.85 GATTGTCGCCTTGAAATTTAATCAAGGTTGAAACTACACTGTGACTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCCC:1 - chr2R 19555076 5' - pogo 2098 1 79.10 AATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGA:1 - chr3R 11547779 5' + G2 296 1 58.10 ACGAGGAATTGGTATAAAAAAGATATCATATTTAAAGCATACTTTTCGGATATTTTTTTTTTTCTATTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 + chr3R 6388727 5' - jockey 4972 1 50.93 GGGGAGCGAATTACCCGAGTAACTCCACATTGCAGCGAGATATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 - chr2R 17121669 5' + blood 7085 2 70.71 ATTATACAATCAGGCTAGTGCTAGAAACCGGCAAAGGAATAAGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1 + chr2L 15834411 5' - hopper 1392 1 69.86 TTTTTTATATTTACTCCGGCCCAGCTATCAATTATTTTGTCCTTAAGACAGATTAGTTCATTTTGATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGAAA:1 + chr3R 2914307 5' - Circe 7018 1 67.12 ATGTTACCGTTAGCCTTTTAACCACGAAATTGAAAAAGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 6388819 5' + jockey 33 1 61.29 AGTGTGACAATATTATTAATAAAGCCACAAAACCGGCTTCGTACAAATCGGCTGCGAGTGGTTTGTGCGAAACACCACCCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGGTACCATG:1 - chr2L 62381 5' + X-element 4401 1 67.12 GAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAATTTAAAGCATTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATAACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATA:1 + chr3R 2412144 5' - R1A1-element 5239 1 60.56 CTTTTATTAGATTTGAAATTATATTTAGGTTATGAATTTTTTCTTTGTCGGATAACTCAACGACGGCGTGCTCAGGATTTGTGGATCCTAGACTATTCGATTTAACAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTA:1 - chr2R 614154 5' - F-element 4592 1 70.55 ATTGCATACTTTTAGGCTGAGGGCGCAATGGGCGTATGTGTAATATTTCCATGCCACATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2L 2004926 5' + jockey 69 1 62.50 TGGGCAGCTGGGGGAAGGTCTAATTGAATTAGAGTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr2R 11133617 5' + roo 87 2 76.71 GAAGAAGATGAAGAGGCGGATGGTGCAGTGGTCTGGCCACGTGAGGGAAGTTTAATTCCCACGAGCCCTTTTTTCCTATTTTTTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 + chrX 13710585 5' + copia 4908 2 58.90 ACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - chr3L 23986603 5' - opus 7450 2 68.03 TGAAGGGGAAGTATTTCAGGACTTTTCGGAGGATGTTGTCGGGTAAAAGGATAAATTTTCGACGAGAATCATGTAAAAGGTAGATTGAAGCGTTTCCGAGCCTATACAGTATATATATTTTTGATCAGGATCACTAGCAGAG:1 + chr3L 22022718 5' + INE-1 90 1 70.42 GTTCTGTTTCTGTGGGCGAAAACGCAAAAAACGAACGAAAAAATCTCGTGAAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:2 + chr3R 23236399 5' + hobo 61 1 61.31 AATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGA:1 - chr2R 3760469 5' + accord 85 2 75.34 CGCAAATTCGTTTGAAGTTTATTCAAAAATTACTCTTTAAATGCTTAGTTGTTGAAATTGTTAAATACTACGATATATAACTCATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr2L 2698471 5' + I-element 36 1 57.53 TGACCACCAACTTGGAGCCTAAAAAAAGGTATTTTAAGAACAAGATTTAACTAGGGTAAACAAAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCAT:1 - chr2R 12040049 5' - Cr1a 4028 1 58.57 TTTTTTTTCTGCAACAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2R 10695765 5' + roo 8715 2 53.42 GCTATCTTTCACTTCGATAATTTCATCAATGGACGGCTTGACTTCATTAGTTTCTTTAATACTCTTATTTGTTATTGGTTTTTGTTCATCTTCAGTATCCAATTTTAATTCCTCACTGTATTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCT:1 - chr2L 8440280 5' - Cr1a 478 1 74.66 AGTCAAAATGACAACGACAGCCGCAGTCGCAGCAGTCAGTGACATAAGTGGGCGTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 - chrX 6138763 5' + opus 21 2 71.23 AGCCGTTTTACTCTTCTTACCTGACCATTCACCAGACCACAACCGACCAACGACGTACGCCAAATCATAGAATGTCTTAGGATATAAGTCATAAATTCAAGTATTCCATAAGAACCCCAATTTTGGTGACAATAACAAATCCAGCC:1 + chr3R 3458313 5' + Quasimodo 147 2 59.59 ACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr2L 6717187 5' + jockey 74 1 64.44 ACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 - chr3L 23986603 5' - opus 7455 2 66.67 GCAACAGCATGTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGAC:2 + chr3R 17605645 5' - Tabor 7250 2 65.75 GAAAGGGCAAGTATTTTTAGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 - chrX 12139028 5' + roo 8732 2 65.07 GTCGGCGGTTCGTAGCGAACCACTGCGAACCGAGTGGCACGAAGCTGCACGAAGTTGCACGAAGCGTTTGTCGGCGTGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chrX 14826082 5' - P-element 2847 1 56.25 AACACATATAATACAAACTGATGGGGCTAAATTGATGATCTCCCTGATCTCTGATTGGCGATCGAATAAATTGAGTTATTGAGTTTTATCGAAACTACTTTGTATCAAACAGGTCGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCTGCATTT:1 + chr3L 1968438 5' - G3 4366 1 72.60 ACCAATCCTTGGAGACGAAGACAAAGACTCTATTTCATTTCCTTGCGTACCGCTGCGTCACCTCAATAGCATAAAATCTAAAAACAAAACACGCAAATGTACGTAACAAGCACAGCAATTATTTACAAAATTAGATATTAACTAG:1 - chr3L 5722740 5' + I-element 5237 1 51.72 CAGGCGCAGGAATTGAGTGTTGTAAAAATTGGTCGAACGCTCTAATTCGAATTCTTAACAGAGAATAGTTGAAATAGTTATAGTGCTATACAATACTTTTCAAATTTATAAATAAGTTTAGCAATATAATAAAATATAATA:1 + chr2L 5307351 5' - 1360 3103 1 47.52 GATGCAAGAGCAGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr2R 11609193 5' - roo 9029 1 54.79 CCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chrX 16855310 5' - roo 320 2 76.71 ACTTTTCGTGCCCAAAAGTTAAATGTGGTTAATGTTAATGTTTTTATACCCTTGTTTAATTTTCAAGGATTTGTTTGCAATGCGAAATTATATTTTTTCTATTGAGACCGCTTTTATTTTTGTTTTTTACTTAAATAAAAAAAAAA:1 - chr3R 9221655 5' + transib2 2633 1 69.86 ATTACTTGTCTAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr2L 16884786 5' + pogo 44 1 51.03 TTCGAACGCATTGCATCAAACTCGTGGGCAACACATATAAAAACAAATCTTAATAAACCATTTCTTCTTTAACATAATGGATTCCTAAGTCTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCACTAACAATTTGTCTTAAC:1 + chr2R 1270152 5' - G4 3506 1 59.59 GGAGAAGAGTGCGGAACACATGGTTGCCAGGGAAATACGCTTGTTCCTGGTTCAGCAGCTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTG:1 + chr2L 13792532 5' + F-element 9 1 79.84 TCGATTGTCTTGCCGCTCTCTTTTGGTCTCCACTTTTTTGTTTGGTTTATTTTTTT:1 + chr2L 4638785 5' - Porto1 188 2 92.86 ATCTCTATTGCGAAATATAAGTTCTTTGTGACATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACG:1 + chr2L 6184027 5' + pogo 86 1 76.71 GCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chrY 917823 5' + 1360 59 1 94.62 ATACAGCGGCAAAGTAAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 13563411 5' - roo 9019 2 54.79 AGGGCTCTCAGGAGTCGATATATCGACGGTGGTTTACGTCCATGCTGAAGGTGGGAAACTTCGCTACGAGCTGTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 + chr3L 22648272 5' + Tabor 36 2 57.14 GCAGGATGGATTGGTGTCCATGAGCGAGTCAAGGATTGTTTGGTGGCCAAATGGGTGGCAACAGTAAAGCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTACGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chrX 1690090 5' - 412 456 2 55.64 GCATTATATTTTTGACAGATCGTTTCCCTTTACAATTTACAGTTGCAGTCTGCTGAGAGTGAGAGCGGATAAGTGAGAGAGTGCATTCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chrX 14951232 5' - P-element 2856 1 62.76 GACGGCTGAGACAAATCCAAGTGGGTCTTGATTTATGGGATTTGCAAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 5150413 5' - roo 396 1 73.85 AGGTAAACGAACTACGGAGTGCTATTTAATATTATAGAATGAGGTAAGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 + chr3L 16212732 5' - Transpac 5160 2 65.52 AAGCACTGACTATATAAAAACCATGAAATGTAATAATAACTTGACCATTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGA:1 - chr3L 11776751 5' - mdg3 173 2 64.83 GAGGTTAATGCGCTGCAGCTGCAGCAACAGACGCAGAATGTTGCTAGTTCACAAATCCCCCCATTTTTTTTTTGTTCTTT:1 + chr3L 10975941 5' + hopper 139 1 71.25 AACCTACATCCACGAGTATCTGCACTGTTTGTCATTGTACTGCACAAATCTTTTGGCGCCCGCAGTGTAATAATAAATGCAATCGGCAACGCGTACAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTC:1 + chr2R 4362485 5' - gypsy 7421 2 66.44 GAATAGATAGGTTTCACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr3L 14553084 5' - roo 9030 1 55.17 GGCATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 + chr3L 17707805 5' + Doc 47 1 50.75 ATTCGAGGGTGCCGGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr3R 27768786 5' + 297 6621 2 55.48 ACGTAAAGCAATATGGGTAAGCCGCAGACACACACACACACACACACACACACACATATATA:1 + chr3L 9183580 5' + accord 7032 4 67.74 GCCTTCGAATCGAAGAGAAAAGTGCCCAATAAGCAACCATTGCCTTTGCCAAAACCTGCCACCCAAAAACATATAAAACTAAAAATACAAAAAATAGCACTCACCAGTACATTCGGGCGCTGCTTCGTGCGGTGTCGGCATTTGGC:1 - chrX 12890306 5' + BS 120 1 61.64 GGCAGTGACAAAGCTTTTCAGGACTTTTCACGGAAATTCCGAATTCTAAAATATAAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGATTTTA:1 + chrX 21234443 5' - 297 329 2 63.01 TGAAAGCGTTCTTCGCTAACGATTTTATTAGTACCATTCACTGCCCTGAACTTGCTAATTTTAATTTTGATTCTGGTTACTGTGAGCGCACACGGCTTTAAGAAAGGGGAAAAGG:1 + chr3L 15786297 5' + Rt1b 172 1 46.96 GCTGAGAGCCATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2L 246000 5' + roo 8724 2 63.04 TATGTGTTCAATTCTCGTCCGCAGCAACAAACAACTAAAAGAGAATGGCCTTGAGGAGCCGAATAGCTTTACTACTGGCACCACTGTGGTGGGCATCGTGTTCGACTCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGA:1 - chr3R 5218953 5' - 297 6818 2 72.60 TTACTAGTTTAAAAAATAATATTTTAAGCAATAGCTATGTAATTTACTAACGACCATCATGAAAGAAATATAAATTGATAAATTAGGTGTAAAAAATAAGTGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 - chr2L 18193163 5' - mdg1 405 2 69.18 AGCGGATGCAATCGAATTTAAGCTAAGTGTTAAATGGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAAT:1 - chr3L 19836499 5' + pogo 79 1 74.66 CTATGATTTGTCAACGCACCTTGACAAAGCACTGACTATATAAAAACCATGAAATGTAATAATAACTTGACCATTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTC:1 - chr3L 11776777 5' - mdg3 5451 2 51.72 CATATAGATTTATACTATATGTCATACAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3L 14554496 5' + roo 8692 2 48.63 CAAACAGTCCATGGGTGTACGACTCTAGGAACTCTGGTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3R 25304839 5' - roo 9039 1 60.74 TTGTAAATAGAAGTATTTGTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGC:1 + chr3R 13122502 5' + blood 69 2 63.70 GGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chrX 7515743 5' - roo 9015 2 57.64 GTTGGATGTATGCGCTCTTGGCCGCAGACAGTGTGGAAGGTGAGAGCGAGCGCGAATGTTTGCGTATACTGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCGATAGAAA:1 - chr2R 11209991 5' - diver 363 1 61.17 ACTTGGGGGGGAGAAACATGAAATACTGCACCACATATGAGTTTACGTGTGTAAATAATGTAGTATGTGCCCATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chr3L 16358660 5' + 412 7119 2 62.07 CATCGCTCTTGGCAGCATTCACAAGTTCAAATAAGCGATAATAAGTATTTATGGGCGGGGCAAGCAGATTCGGTTTCTTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 - chr3L 13634328 5' - 297 6952 2 68.15 CGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3R 24476361 5' + 412 74 2 68.49 AGCATGCCTTTACATACTATAAGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAACAAGAATTCCCTGG:1 - chr3L 23702310 5' + G4 8 1 76.03 CGCACGCAAAAATAAGCCCAAACTTGCCATGAAAATGGTCGCCAAGAAGGCCACGCAACACACATAAGTGAGGGGATATCCTGAATCAACCATTATTTCATACTCTCAAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACC:1 + chr2L 4106239 5' + jockey 4774 1 75.34 TATAATGCATCATATATCATATTTTTAATGATATATCTATCATATCTACCTATATCTATCTATCTATCATTTAATATATTTTCTATAAAGAAACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCGTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3L 11257264 5' - 1360 3380 2 78.08 CGATTGTTCGAATGTAATTTCATGCACATTTCATCACCATATTCACCATGCACTATCCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTAAATGAATCG:1 - chrX 3996588 5' + roo 54 2 58.39 GGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGA:1 + chr3L 25232768 5' - accord2 7571 2 62.79 CATTGTCTTAGTCGTTTAGTCTGTACATTTTAGTTGTATTACCCAGCTTATATGGCCTACACATAGGGAGTATATATATATATACATACATACATATGTAAAACTATATAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr2R 18959332 5' - blood 365 2 76.71 AAATAAAAAGCCTGCGAAATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chr2L 8956732 5' + pogo 58 1 58.62 GGGTTTGTATGTGTGTGAGTGCTGGTTGGCTCCCCATTTCCCAGTTTTGTTTAGCTTGAAGATCTCGTTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTTGTTTATTGTTTCCGCTTGTTTT:1 - chr3L 6650364 5' - Porto1 178 1 58.91 TTTTTGTTTACGTTTTCGTTTTGTTTTGCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTG:1 + chr3L 1307195 5' - F-element 448 1 62.63 GCATTTCAAAGCAGTTCGTTGATCTCCCAAAAAAAAAATGGAGAGCGAGCTGTAATAAACCTATATATGCCACCTATTGAGAAC:1 - chr2L 9237582 5' - blood 7377 2 58.33 GTTTTCGTGGCTTTTACTACAGTAATCACCTATGCATGCAATTTACATCTCCGCCTCGCCCAGGGAAACTTAATTTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 + chr3L 20255125 5' - Transpac 5192 2 62.14 CAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAAC:1 + chr3R 9190456 5' + Tabor 6872 2 43.84 TGCAGGATCTAAGATCCTTTTCCCATGGTGTTTGATGTTATTCTTTTCATTTTTTTACTAACAAACGTTCTAGTGTTCTTTGGGATATTACTTTTGTATGGCACAACGAATCACCAAAGTTAAAGTTGTATGTTTTTAACAAATAT:1 + chr2L 18223791 5' + transib4 453 1 66.44 CGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGGTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3L 23146454 5' + 1360 29 1 60.31 ACAACAAACGAAATGAGCGGCTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 + chrX 5679962 5' + P-element 37 1 30.95 TCATGAATGTAGTTCGAGAACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr2L 17029565 5' + blood 36 2 58.90 AAGAGCTCTGGAACAAAATGGCAGCGGCGGCCAATGACAGTAATTAAGGAAAGTGCAGAAAAAGTGACTGACACTTGGTAAATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr2R 6842885 5' - roo 9036 1 62.33 AATGCTGCAGGAGCAGCCCAGCAGCATAAACGCTGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATCTTTATTTACAATGTTAT:1 + chr3R 27822225 5' - I-element 5270 1 73.29 GGCTGCCGTGTGTATAGTAGTACATAGTTATGTATTTTGGAGTTGTCAAAAGTTATTTGATCGAGTCTTTACGATGAGGAGAAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGTGCCAC:1 - chr3L 6549723 5' - 1360 77 1 56.16 CTTAAACGGCATACTATTTTAAACCGACCTAATGGACCTGACCTTGTTTAGGGACCGCAGACTTATACCTTCGCCAACCAACTTAACCAAGAAGGGTTTTTTGTAAAGTTAAATAATCAGGACCTTGTTTAATTTGGCCAACAACA:1 - chr2R 3393433 5' - G3 418 1 61.64 AGTGCCTTCACCCCGAAATTCGTGCTTTTCCTGGTCAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr2L 9237478 5' + blood 45 2 53.42 GCGCAGCTGCTCGTCGCTGAAGTTCCTCACGTTCTTGTCGGCCTCCTTGGGGCCAATCGATGGCTTGTTGAAGTTGGAGGCCTATGCAAAAGCAAAACATATTAGTATCCTTTTCACATATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3L 4115062 5' + 1360 4 2 69.86 AGTCATATTAAATGCAGTATTATGCATCTGGAATATAGTATACGAGATGCAACCCTTATCAGCTGCACACGGAAAGTTCAGGGATATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - 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hobo 2924 1 71.20 CCTTTCTGCACCTTCGGGCGTAAGTTTCTATCTTGCGATTACTGAATTTCGTATTAATAAGACATCTTTGGTCGAAATGATATGCAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCA:1 - chr2R 8158853 5' - Juan 4183 1 60.27 CATTTGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGC:1 + chr2R 4012523 5' + F-element 311 1 73.57 AACACATTTTCCAAAAGTGTGGGTGTGGTAGTTTTTGCAGCTTGTGGGCGTAGCAACATGGTTCAGCAAACTTGCGCTACGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATTCTGAATCTCAATCTTATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATATCG:1 - chr2R 5212078 5' - INE-1 147 1 71.23 AATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAA:2 + chr3L 24934280 5' + HMS-Beagle2 6927 2 55.48 ATTCTTACAATGTTTATGCGCCGCTCGTTTCCTGAAATTGTGAGGTAAGGAAACCCATGTCTGTTTTCGATTCTATTTATATGTGTTAAAAACCTGTGAACAAGATAAACAAAAGAAACTAGTGAAAACAATAAACAAAACGAAAA:1 - chrX 2299246 5' + Porto1 188 1 50.00 GCCATGAAATAGTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCAGTTCATATCTTATGTACATGAATC:1 + chr2R 8305203 5' + roo 53 2 54.11 GGTAGATGAAAATTCTTTCCAGTTCAATGCTTTAGTGAGTTCTGCGATTTATCCTTTGCTTATATCAATACAACCGGTAGGACCATGAGTCGAGTCAAAAACAAAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCC:1 + chr3L 22980593 5' - INE-1 571 1 70.77 AAATAGTAGGAAAAAAGTAGACAAGTTAGAATGAGAGAAATTTTGGAGCTTAAGTAATGAATCCGTTTCGTTTGAATAATATTTAAAATTTTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAA:1 + chr2L 1671752 5' - mdg1 7020 2 56.16 GATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr2L 23372629 5' - 1360 3338 1 73.21 GATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATACACTAAATAAAAAATCTGAA:1 + chr2L 13792598 5' + F-element 97 1 74.66 ACTCTGGTTACCCAATTTACGTTAAATGTCACTGACAATGTTTGATGACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGACCACTGACAACTAT:1 + chr2R 5542310 5' - 1731 4602 1 68.53 AAACAGTTGATGGGAAGGTTTAGCACTCGGAATTAATACGATTTGTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr2R 23000021 5' - mdg1 7418 2 56.85 ATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGTGAACAA:1 + chr3R 9190458 5' + Tabor 35 2 43.84 GGGATAGTTCAGATCTTTACTGCTTTCAATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr3R 7539539 5' + roo 57 2 57.53 GCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTAT:2 + chr2R 11763588 5' + Tabor 67 2 61.64 CAGTTCACCCAACCACTGATCGTATCGTCCTTTAAAGCTGCTCCCGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr3L 17890847 5' - 412 7518 2 62.96 TCGTATCGTCCTTTAAAGCTGCTCCCGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr3L 17890828 5' - 412 7514 2 55.00 GCTGGCATCAATTTCATTAATCCCATCATCTATGTGAAGCTCAATGTTATTAGCCTCTGACTGGGGTAATCGCTCAGGATATTTTAAGACCAAAGTTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTT:1 - chr2L 75465 5' - roo 8611 1 66.44 CGTAGATAACTATTTCTTTGTACACTATTAATAATGTCACGTTTTAGTCGATCTCCTAGTCTCTGTTTGTTTAGCTTTGCCAACAAAGTTCTTGTATGTATGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATA:1 - chr3L 486180 5' - FB 709 2 62.33 ATGCATGTTAATACAATATTATGATGTACAGTTGTGGTAACAATAATAGCACCATAACGCATTTCGTGTTTGTCCCACCGATTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATAATTTTACTCACCAAACTTAAATACTACAATGATTTTCA:1 - chrX 22900310 5' - Tc1 1546 1 77.40 AATCTGAAAAGAAGAAACGTGAACAGTAAATATTTTTATGTACATACATAACCCACCCAACTGGTGGTTATAGTTTATTAATTGGGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGC:1 - chr2R 9874895 5' - S-element 375 1 62.33 CAAGGTCAGGGATTGATTCAACACACCATCCTCTGAAGGATTCAGAACTGACGGGTAGCATAACTGACTATAAGCAACTATGGCATACGGGGATCTATCAAGGCTGAACTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:2 - chrX 11471584 5' + jockey 4687 1 67.81 GGCCAACAACAGCAACAATAAAGGAGGAAAAAAGTGACAGCAGCAGCAGAAAAAATTTTATGATCCTGCCTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 - chr3R 8709866 5' - jockey 4975 1 61.74 GTACACCTAGATCGACAGACACCTGGTGGGTGGTGGTCGCCCAGAACGGTTAACAAGGTCAACAGGCTTCCGATTGACCCTCATCTTTTCATGAAAAGTACATATATA:1 + chrX 19211895 5' + Juan 4178 1 79.63 AAGGTAGATACTCAAATGTCAGTTATGCTGGAAAAAAATGGGACAACCAAATTATGATCAAATCTTTCAAAGAACTGTTGATCGTTCGAAGGAAACCATAAATCAATTAGTTTTAACGTCGGTCTTGGTGGTCTTTTTGTATATTT:1 - chrX 21480554 5' - Stalker4 103 4 78.77 TGGTTTTTAACAATCTTTTTTGCTACCAGCACGTGCAACAGGACCAAACTGAAGCTGAAGACCAGGAAACCTTAGGATGGAAGGCAAAGTAATAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTC:1 - chr2R 7020685 5' + Bari1 29 1 66.44 ATCCCTAAAATTGACCTATAATTTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAATAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr2L 3762954 5' + jockey 73 1 75.44 GCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAGTACACCCCAACGGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 + chr3R 8709797 5' + jockey 4758 1 76.22 TAAGGGCTGGTGGGAGGGAAAAATCATCAATTATATTTTCTGCATAGCTGAATCATTTGCGCCGATCAGTTGGGGTTACTTAATGGGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAACTAGCATATTAACTT:1 - chr2L 12553540 5' + 412 7088 2 60.27 GATGGGAACGGGTTAAAAATAAGTCGGAATCGGATTCAGGCATAACAATTTCCTGTCAATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3R 31490899 5' - roo 9041 1 64.38 CCAACATGTTCGATCGCGCTCGGACTAAAAAACTGTAGCCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 - chrX 5680003 5' - P-element 2823 1 34.62 AAAAATCGGTCTTCTCTGCCTTCACTGTCCCGTTTCGAACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTCCAAAT:1 + chrX 22564553 5' + Transib5 61 1 76.03 CTAGGATGCTTGTAATGAATTGGGCACATAAGACTAGTGAAACCTATTCATATTTTACTTAAAACTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chrX 10567912 5' + roo 14 2 71.92 GTTGAAACTAGTAATTAAGATATGATATTAATACTAAAGCTTATCAAATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chr2R 16441818 5' + I-element 48 1 59.50 CACTGTGAACATTGTCAAGGTCGCCATGTAATGAGTGCTAGTTGATTAAAAGTATTTAGTTGTTAATTTAAAAGGAGAGAAGCAGAAGAACTGCTCTGATTGAGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAAC:1 + chr3L 27411721 5' - hopper2 1295 1 74.66 ATATTTATTTATTTTTGCACTATTTTTTTGAGTGCATGATTCAGAGTGTAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr2L 12414858 5' + pogo 32 1 60.96 CAATTTATCATAAATAAAAATGAAGGTAATTTTGTAATACCCTTTAATTGTACAGTAAAAGGGCAAGCTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAG:1 - chrX 21482228 5' + INE-1 21 1 81.63 ATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTGTTTAAATCATTTAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chr3L 21144045 5' + jockey 4709 1 51.20 TAAGAAGCGATGAATAACGGCAACACAACTTTTGTGGTCCGAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3L 12867384 5' + roo 12 2 68.18 CGGTCGATTGTTATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACGTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 + chr2R 1921418 5' - mdg1 367 2 54.41 GCGTGGAATTGCGGCTGAATGGATTAAAGCCTCTGAAAACATGAATTTCCTTGCGCCATTATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chrX 10567735 5' - roo 9041 1 64.14 TTGGATTATCAGTATGTATGCGATAAAATGAGGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr3L 13374246 5' - pogo 2070 1 59.72 GAGAGCGAGAATAAAAAGAGAGTAAATTTCGTATTTTCTCATTTCAAAGTGTAAACGAAAAAAGTTTTTCTCTCTTTTCTTTAAAATTTTTTTTTTAATTTTTTGCCCTTTTAAATATACGAATTAACTTAACCAAACTCACTTTT:1 - chrX 3451456 5' - HB 275 1 51.37 TATGAGTGCCTCAACACGTACTGGATTAATTCCCACGCCCAAGAGGCATATCAAGTATTTAAAAAAGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3L 15612808 5' - roo 9015 2 56.85 TTGATATTGATATTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chrX 4778138 5' + 412 23 2 68.49 CCATCCTTTTTGGCTGCGCTCTCCGTTTTGGATTCTGATTCGATTTTTCCCACTCACACAGCAAATCTTGAGGAGGGAATAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCAC:1 + chr3L 10516661 5' + springer 21 2 51.64 AAATCAATTTACGTGTAAACTAAGCTGGTCTAGCATAGTCTACAGTATATTGGTATAAAAACCAAATAAGGACTATGAGTATTTGTGTTTTGTTTACTCTACCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCA:1 - chr2L 22099969 5' + Cr1a 248 1 56.16 CGAAAATTCGAAGCAACAGTGAGCAACGAGTTGAACTTTGCATATACATACATATATATATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCATCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTC:1 + chr2R 20489370 5' + 3S18 58 2 57.55 ATCAATTCGTGTAGCGTGTAGTATTATGAGTAAGAAAAGCGTACAGCCTTCTTTTCGAGGCAATGTGTTGTAAAATTAAAACTAAATTTTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTA:1 - chr3R 31058015 5' + Juan 387 1 60.96 GAGGATACCAATCTGTGCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:2 + chr3L 15026614 5' + opus 138 4 64.38 TTACACATTCAAAAGGCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2L 246102 5' - roo 9022 2 53.85 CACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3L 17175123 5' + 412 68 2 62.33 CTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:1 - chr3R 9160770 5' - copia 5063 2 55.48 ATATTCACGTTGGCTTTGTTTGACACGTTCGGTTGGTTCCCCTCGACCTATGTACACATAAAATATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCT:1 - chr2R 20489471 5' + 3S18 5821 2 58.62 ATACAAAATTGCCTAATAAAACAACCATTCAAATAAAAATGTAAGGAATTAGATTGTACATGCTCGATCTCAGATTTTTAAGGTAGATGGTCTTAGTAATTAATATTATATTTTATGTAATCACGAAATTTTTATTTCT:1 + chr3L 21531672 5' - Burdock 385 1 56.12 TGTATAAAGCTAACCAACTCTTAAATGTTATTGTACAACCAATCATATATGTATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 + chr3R 6711423 5' + pogo 64 1 67.81 CGATGTTTATTGTGTTTGAAACTAAGAACTATTTGGTACTTCTCCATCGCTTTATGAACTTCATTCTCTACAATTCTCATAATGATTTTTGTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 20594091 5' - roo 9044 1 66.44 ATTACGCATACGCTGCATATGTCGATAGAGTGGTGAGGGGGGGAATGTTTACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCACTAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 16855386 5' - roo 397 1 76.03 GCAAGTTTGTAGAAAATATAATAATATGCAATAAAACTAATACTTTAAAGAGCCCTATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAAT:1 + chr2R 15829502 5' + invader4 2819 2 62.33 AGGTGTTTCAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGA:1 - chr2R 13644530 5' + Burdock 6181 2 54.48 GGAAAGTACTGATTATGTGAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGATACGGGTGCCTCCGTCGGATC:1 - chr3L 25482996 5' - accord 7381 2 75.00 CGTACACATTCCCATAACATCCTCCTGCTCTCCACAGTTATTAACTATTCATAACTTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAACTTTTATGCCA:1 - chr2L 2272553 5' + copia 4934 2 63.01 AAGCCACGTCTGCCATTCAGGCCAATTAACAGGCTCGCTTCGATTTGAGTCTAATTAAAACAAGAATGCAATGCAAACTATGCACTCGAATATTAACTATGTTATTGTAAAATACCAGTATTTGCATTCGTATCTTGATTATTTT:1 - chr2L 8801001 5' + Circe 6953 1 75.86 GGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - chr3L 25401034 5' + Doc 16 1 60.63 ATACAGTATTTACTTGGCAGTTTATCAAGCACAGTGGCAATTGACTAGCAATAATTTCTACATATCTATGGAAAATTCAATAAGAGAGGGTTCACAGTTTTATTGAGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTA:1 + chr2L 1259863 5' - Burdock 243 2 72.60 AAATAAAATGAAATACATAAATTTTGCAACGATTTGAGAGACCGCATTTTATAATTGAATCACGTACGACATTTTCAGAGGCGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 - chr3R 28272343 5' - Tirant 8479 2 64.96 AGGCGCGATGATCACTCCTCCAGCTGACGTTCATCCCCGGCCACTTGGCTGCATTTCGAATGAGTCGCCGTTTTCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAG:1 - chr3L 1455918 5' - Juan 336 1 53.57 CCGCAGGATCTTCCGTTGGATGGGATTAATTTGTGGCCTATGCTGAGTGGCAACGAGGAACCGAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr3L 17890680 5' + 412 17 2 74.66 CAAACGCGACTTTAAGGTAAGCCAATAAACTCAAAGAGGGTTACGCAAGTCCCCTTGGATAAGCCTATCTTCTATGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr2L 2031011 5' + 412 34 2 57.46 ATATGTACCTATATTTATATGTACCTCTCAGTCTTGATCAGTCCCCGTTGGCAGGCATGTTGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACACCAGTATAGTGAACGTTAAACACAAAGAGTAAAGTG:1 - chrX 1804490 5' + Doc 91 1 51.80 GATACGAGTACTCGACACGAACATTTACAGGGATATGCACTGGCTTAGCTCTAAACTAAAAACTGTTCGCGTGGAATAAGGCGAAGGTTGCGGATTGAGGTTGCTTATTAAACCGCTTGTTGCGTTCAATTACATCTTTTGATTTT:1 - chr2R 12501410 5' - 412 7472 2 63.70 CCAACGGTCGTGGTTTTTTCTGTGACAGTGCGAGATGTTTTATCCCAAGAGTTGGGGCATACATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 + chr2L 21951115 5' + Burdock 6186 2 59.29 CAATATAATATATTTTATTTCAAAACATTGCAGCGAGTCATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTCGAAACGAGAATATACACAGAGACTTGCAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAAAAAGTAAAATACAATGAAAA:1 - chr3R 2743183 5' + Doc3-element 4493 1 74.66 AAGAGATATCCGGCGGTTTACTTTTACAAGGGGATCGGGGAGGGATATGCTGCTCTGTGAGCCAGGAATAAGTTGTTTAGGTTGATTGGTGGGCCTTACATGATGGAAAACCTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCT:1 + chr2L 14967342 5' + S-element 1705 1 68.75 AATTATAAAATAGTTTCATTATATCCAGCATTTCTTAGGGCGTCTTGCTGACTGCGGGAGGTTGTGGTGAGGGTTTTTAGGAGAGAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTG:1 - chr3R 21229014 5' - Porto1 229 1 65.67 CACGTTTGAAAAATCATTCTTTTTAATCTCACCATTTGAAAGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTT:1 - chr3L 16496705 5' + jockey 4789 1 71.92 AGGGGGGGAATGTTTACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chrX 16855351 5' - roo 9041 1 60.00 ATACAAGTAAATTCTATTTTTAGATTTT:1 - chr2L 5270485 5' + 1360 3270 1 89.29 CAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTGAGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTTCTTCTTGAAATAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr2L 12553408 5' - 412 7490 2 55.48 AGAAATGTGCAGGAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 - chr3R 10472815 5' - mdg1 390 2 62.14 GCATGATAGTGAATATTAGTAACATATGTATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTTT:1 + chrX 5150263 5' + roo 8706 2 53.47 AGATCGTTTTTAGAATGTGTGTGAGTGCTATGTGCGTCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 - chr2R 21076080 5' + P-element 62 1 33.60 AGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGAT:1 - chr2R 5532366 5' + G4 3780 1 50.68 CCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr3L 22978604 5' + 1360 63 1 76.67 TAATGCTTTCTCCCTTTCTCCTAGCCTGGCCTTTTTTCCTGTCGTTGAAACGTGTGTCCAGCGGAAATGACAACGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 + chr2L 13704665 5' - hopper 1374 2 55.24 AAGTGCCCTTATGTAAGTTCTCCGAAGTTAATTATTATCGCAGAGATTGCTATATTCGCGACTATTGGATGTACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTA:1 - chr2R 6164658 5' + Tc1-2 1 1 68.49 GATATATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1 + chr2L 10746636 5' + pogo 81 1 73.97 TGATAATGAAGCTTGTGAAATCACCAGAAGAATGTTCGTTTTTGAGAGTTTTTTATTTGAAATATAAATTTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chrX 3197057 5' - mdg1 380 2 52.90 TCGCATATGCGCTCACCTCCCACCGCCCAACGCCCACTTTGTCCGCCCAGTTTCCCACATGCCCAAAAATATGCAACATTTTTTATATGTTTCTGCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAGTACACCCCAACAGCCTAG:1 + chr3R 8707315 5' + jockey 4667 1 58.90 CTGCCTTTTGAAAATATCGTTGTGAAAATATGCTATGTGCTGATGCGGTGACAATTACTATGAATCCAAATTAGTGTAAAACTTAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTG:1 + chr4 255345 5' - INE-1 541 1 58.22 CCATCCCCCGCTTATTTGTGTGTGTGTGTGCGTGAAATTTGATGCCGCACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3L 7995497 5' + P-element 5 2 66.67 TCGCACTTAGACATTAATGTGTGTCTGTGATTGTTTACAATAGTGTGTGGTTGGGAAGTTGTGGGTGTAGAATGGACATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATAT:1 + chrX 22252720 5' - diver 179 2 54.11 AATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTAT:1 - chr2R 8641596 5' + diver 43 2 53.23 AGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3R 16181153 5' + roo 8745 2 73.97 TAATACGTACCTGTTTAAAAATGTTTCCACTTTTATTTTTCCAACGGATGTTTTTTCGTTCCCTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTGACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAAC:1 + chr3R 12136359 5' - BS 5025 1 58.90 AATCACTTAGCTTAAAAAAGATTTCAGGTATTTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr3L 96471 5' - roo 9038 1 62.33 TCGACGCCCACCCGAATTTCTACAGCTGCAATTATCTATTTGCGACAAACATTTGCAAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chrX 2762543 5' - roo 385 2 67.86 ATGGAAATATCATCATTTGAAATATAGTATTTTAGTATCATCTATTGATTATTGCTTATGAGTTTCCTCATATGGAAACAATTAAAATGGATTATTGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACT:1 - chr3R 9354268 5' - 412 7241 2 65.07 ATATCATTTTTGTACTAATAATGATTCATACTAGTAAAAGAAAACAAACAAATGTAGGATACTGATTAGGTCTTTACCTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 15612686 5' + roo 8708 2 56.16 AAACTTTTTCCCATCAACAAACTTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCACAAC:1 + chr3L 22052727 5' - mdg1 7428 2 62.86 GATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAATTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 - chr3L 13374196 5' - pogo 2034 1 73.85 CCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr2L 22015990 5' + Tirant 61 2 68.46 CATTTTTAAATCAGGCTTAAAACACCTTTTTAATTGATACTTCAGAACATTTTATAACCATGCCTTTATTGTTGATATTTTATGTTTTCTTCAATTTCCATTATCAGCGATGGCCTAGTAATTTTCTAATAATAAACTGATATTT:1 + chr3L 10370944 5' - gtwin 7222 2 55.17 CAATAACAAGAAAGCATTACTCGAGATAAGATTGAATGAATATGTTTGGCACCTATAATAAAATAATATTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGTCAGCTGTGACACACTAA:1 - chr3R 30583881 5' + gypsy12 55 2 54.79 ACCTTAGATGAGATACGACGCATCTACTTCAAACTGGCCAAGTGGCATGCAGTCAGCTTGAAAGTGCAGAATGAGGTAAATTGTTAAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3R 25304694 5' + roo 8697 2 62.76 GCCCGGTCATCGTGGGTTCCAAATGGGGTTCGTAGACTTGGAGCTCAGATTGATTTGGGTATTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAAT:1 - chr3R 30510403 5' + gypsy12 26 2 56.88 ATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACACACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCCAGACCTTCTTAGCAACCCCCATCCAGATAACATACACAAACTCA:1 + chr2R 5917839 5' + I-element 5133 1 67.12 ACAAAACTAATTAAATTATGGAAAATTAATAGTGGGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGTAAGTGGCAGG:1 + chrX 9852619 5' - 297 25 2 65.28 TCTGATAACATTACAAACGCTCCACTAACATGTCTATATGTCTTGGAAGGGAATTCAAACACCCAATCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTGTCGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chr3L 14551101 5' - P-element 2875 1 71.23 ATTCAATGCCCTTAAATATATTAGCTGTAAAGTTTTTTCAAGCTACTTGGCACGTTTAAATATATTAGCTGTAAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCCTTTTAAAAAAACCATGCTGACACGGTAATATGATCGATCTACAAAGGAG:1 + chr3L 26716422 5' - Q-element 178 2 52.41 AAATGAAAATGGTCAAAATATTGTGGTAAATGCCTGGCTTTCGTTCAGTACAATTCAGTTCGGAATTCCAGTTCGTCGAGGAAAGATCAGATTTTCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCTC:1 - chr3R 25583606 5' - Gypsy6A_LTR 333 1 73.08 TCGCAGAGCGCAAAGTGTCGTATTTTCACTGTCGTCAATTAACAACAGCGGCAACAAGAACAACAAACGAAATGAGCGGCTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chrX 5679903 5' + P-element 27 1 63.91 AATGAACCAAATCAAGTATTGACCACTTCATTAGTGCAATGATATGTTGTAAACAAAACAACTTTTGACCCTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr2R 5737065 5' + 1360 13 1 76.03 CATTATCAACTTTCTCTCGAAACGCCGCGAATATTGCACAGAGGGAAAGTTTGCTACACGCATAGTGAAACGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chrX 3996477 5' - roo 399 1 69.16 CGAACCCCCGCATCCCACATACTATGCCATAAAACCAACGCAGGACATCGGCCGGATTTTTAATGAAACACAATAATGTTACTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGT:1 + chr3L 11745248 5' - 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invader2 5084 2 59.59 GTTAACTCTTAATGGATTATACCCAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTT:1 - chrX 12191610 5' + pogo 89 1 78.08 AAATATTACGTTTTATGCTTTCTGTTGCATACTTTGGCGGGCTTAGCTTTTGTTGGGCCATAGGCAACGAATCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGAC:1 - chr3R 22516068 5' + jockey 4570 1 66.97 TCATAAACTTTGAGTAAATTGTTTTACAAAGAAATTGCATGTTTCTCAATGTTTTTAGCAAGTTGTCTGTATATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGAGCGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGC:1 - chr3R 13639831 5' + R1A1-element 199 1 52.90 TGATATATTTTTAAATTCTTTAGTAGATATGCTTCAATCAAATCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTAAGTACGCTCAATATGA:1 - chrX 11952949 5' + Quasimodo 465 2 71.92 AGGAATAAGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATT:1 + chr2L 15834445 5' - hopper2 1551 1 54.11 ATTGATTCAAACGGTTCGCAGCTCAAATGTTATAACACGCTACCCATTTCTACCCAATGTTGATTAAGGCTGTTAATCCATAAACTTAGATTAAGAGGCGACTGAAGCAGTGGGTAATAAAGTCTCGATGAATAATCGATAGTGGG:1 - chrX 8653795 5' + gypsy12 36 2 60.96 ATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr3R 16181155 5' + roo 8733 2 72.73 AAATGAAAAGATTCCCACAAATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr2R 5237938 5' + Doc 40 1 63.01 AGAGCCATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:2 + chr2L 246004 5' + roo 72 2 67.81 CATGGGTTGGATTGCGTTGCCGGAATTACGTAAGGGTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1 - chr2R 5955012 5' - copia 208 2 72.54 CAACGGATGCCGAAGCACCTCAAAGATACACAGTGGCGAGCAAAATAATAGCGAATCGATATGGAGATGGAAAAACATAGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 - chr3R 6413810 5' + FB 44 1 56.16 AAAGCGAAAGACTTCGGCAACGAACTTGGCTAGTATTTGGCTTTGTCTTTGTTTTTGGTATGCAATTTACGGATTTGAGTACTATTGATATGGCTTTAACTTAACGGGATTTTAAACCCATCCCTTGGATACACTTTTCATGTTTA:1 + chr2L 15365860 5' - Dm88 4246 1 74.66 TTTTGAACTTAATCAGTGGTGTTTGTTGTCTTTGCGCTAAAAGTTAGTTGTATTTATTATCATTAAAATGGCACTTAAGGCGAATGGCTTTTTTTTACAAGCTGCGGTTATATGTATGTGTGCAGACGTATGCTCATGCATTGTAA:1 - chr2R 22150446 5' + 1360 187 1 35.62 CTGGATAATGAATTTGCGTCCTAGAGCCAGTTTTTCGTCCAAGTGCAGAAGGAATTGTTTCATAGCAGGATCACTGCGGGGAATCGGGGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGG:1 + chr2L 5010601 5' - roo 8900 2 62.90 AACCATCCATTCACATGTACCCGTTTAAATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chrX 12525931 5' - roo 8982 2 80.82 CAGTGGACACAGTTTCGATACTGTCCGTTTTAAATGACCCTGTTGGGTTTTAAGTGTCACTATTCGGACTAACGTATCCGTCCCTGTGTGTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATCTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chr2L 22592505 5' - mdg1 7427 2 63.01 TAGCAATAAAATTGACTTTTTTATTTTGTTTGTTGGCAGCCAAAATGAAAGTACTGCCGCTTATTCATACATGTCCCTATACATATATATATTTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr3R 11493094 5' + 297 6587 2 77.70 CGAGCGCATAATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr3L 11336338 5' + blood 54 2 57.55 GGGTTGGGTTTTAAGTTGCTTGTAATAAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr2L 4173929 5' + roo 26 2 67.81 TCTTATACAATTTTTTTTGAGCATGAGAGAGCAAATTCCGGCCAGAGCTCAGCTTATCGCAACTTTCTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - 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chr2L 16089704 5' + 3S18 5805 2 57.53 AAAGACAAGTGTAGCGCCGGCGCTGCCATCGATCCCGTTCCCATTCCCGTTCCCATTCTCATTCCCGTTCCCGATCCGGATTCGGATCCCTTATCCTCTCTATGTAATTTAAGTACACACTACA:1 - chrX 20746877 5' + roo 140 2 66.13 GAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 - chr3R 9160783 5' - copia 213 2 52.14 GGTGAAAAGTTAAACAGGTGTCAGTCATATACAAATAATTTATAAATAAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAG:1 + chr2L 11574760 5' + Max-element 8240 2 80.56 GACCGTAGCATGCTGGACTCCGGCCAGTTGCTGATCGTCGAGGGGGACGGCCGCACGGGATACCCCCCTAATACACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGAC:1 - chr3R 5553453 5' + Ivk 11 1 58.72 ATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 + chr2R 20673644 5' - mdg1 7386 2 65.75 AGGCATCCGAAGCTAAGCCAGATCCACTCCTGCTGCATGCTGCAATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCACTC:1 + chr3R 29418652 5' + mdg3 50 2 47.95 ACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr3R 4581889 5' + 297 37 2 75.29 GAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr2R 19554961 5' + pogo 50 1 76.00 CATCAGTTATTTTATTTCACCCTATTGCCCTCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTGTTTAAATCATTTAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGT:1 + chr3L 21144007 5' + jockey 4692 1 69.86 AAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCA:1 - chr2R 21402676 5' + mdg3 5332 2 69.66 CCGAGGCAATCACTCTGCGGCTTTCCAAATACCGGGCTATATGGCTATGTATGTATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 + chr3L 16870166 5' + FB 26 1 52.88 ACTAAACAGAGCGTACTGCCGGCATTTTAAGGGCACCCAGGGTCGTCACGGCTATTTTTAAGTACCTGTCCGAAAAAAATCGTATGGCTTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGA:1 + chr2L 14209434 5' + Tc3 316 1 55.65 AGCCGGCAGCTGTCTATGCTGCAACGCGTCATCACTAAACAAAGAAAGAAAAAATTGTAGAATCTCAATATTTGAGTTGCTGGCAGTACCCCAGAGCTATATGCCATAAGTCCACACGGGCTTTA:1 - chrX 8485520 5' - G4 3418 1 56.80 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAACATGATTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGC:1 + chrX 14768481 5' - F-element 11 1 53.42 AAGATAGTTGCTAAAATTCTTTTACGAGAATTTGAGTAATGATATTATCTTGAAAACTTGGTCTAAGATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr2L 17029734 5' - blood 362 2 68.75 TATAATAATACGAGTTACTCGGTAAGGGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATAAATGTTCTTGATAAGGATCACCGGGCAAATGGATCTGGCCATGTCGGTCTGTTTTTTTTTCTCACGGGTCCCACGGCC:1 + chr3L 23205449 5' - Cr1a 4445 1 48.63 AATATCATTTTCTAAGGAGAAACAATGTTTTAAAAGCGGATTGCAAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGATCTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACA:1 - chr3R 29288850 5' - BS 5074 1 63.70 ACTTTGGGGTAGATTCCTCAAAAATCATAAATTATTTTTTCAACATTAATTAAAGTTACATAAAATAGTAGAAGTTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3L 10133486 5' + 412 47 2 53.42 ATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:2 + chrX 14964628 5' - roo 331 2 74.66 AGTAATGAGCCAAAAAAGAAGGCCAACAAATGTCTGTCGCTGTAAAACGAACATTTGAGGCCATGTTAACAACAGAAGAGGGTCACGTTGTGTTAGAATACACTTCTACGAATGAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAATCTT:1 - chr2R 17216306 5' + 1731 4212 1 48.63 TATGCCCGATTCAGCCTGGCATCTAGTTCGTGGTCCAGTTCATTAAAGTGGCGCAGGTAGAGGCGGCCGTAATTGGACCATGTACGCAGGCCAAGGGCACCAGGGTATTTCGTTTGGCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTT:1 - chr2R 16295707 5' + FB 728 2 71.23 CTTTTGCAGTTTGTCAACCTGTGTAGATTGCAACTGTGAGGAAGGATACTTCAAAAGACAGTGCGGCAAGAAAATTCAGGTAAGTGACGTTGTGCATATTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGC:1 - chr3R 8999095 5' - TAHRE 10402 1 65.07 AAAGGACATCTGCTAAATTAACAGAAGGAGGCCTAACAGAAGTCCGATTAAGAGGAGAACCTGTGACAACATTCCCTGCTAGCTTACATGTAATCGGAAACGCATCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTA:1 - chr2L 17328142 5' - INE-1 13 1 63.31 AAATGACCTCGAGACATTCTTGTCCAGAAAATGCCAAACAAAAAATGACGACTTAAAATACAATTTTCATTGGATTAAAATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr3R 16913333 5' - pogo 2063 1 58.22 GAAACATGAAATACTGCACCACATATGAGTTTACGTGTGTAAATAATGTAGTATGTGCCCATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 + chr3L 16358672 5' + 412 79 2 70.55 AATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 - chr3R 10472801 5' - mdg1 7408 2 50.68 GAAAATCAGCTCATTTGCACATTGGTCGTAAGCTCTGACGAAGTCTGACTTCATAGTCTAGATGTTGTGGGTCACAGAAAATTAAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAG:1 - chr2R 12265263 5' + jockey 4560 1 58.22 CCAAGGATGTGCCACTGGCGGGCGGGAGATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATATCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTC:1 + chr2L 18317476 5' - 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chrX 13786963 5' - pogo 2092 1 65.26 CGATCCGAACCTGGGCACATTGAACCAAATTGATCCTGAAAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 + chr3L 22900103 5' + 412 69 2 71.11 CCCTGTTGGGTTTTAAGTGTCACTATTCGGACTAACGTATCCGTCCCTGTGTGTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATCTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAA:1 + chr2L 22592542 5' - mdg1 353 2 62.76 GGAGATTTCTGCAGCTCCATCGAAGCCAAGTAAAAAACTAAAAACAAAATCAAAGCGCTCGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTGCTTACTTACATATTAACTCTACTTTACATATTACTT:1 - chr3R 31730885 5' - Stalker3T 48 1 64.38 AGCCGTTTTTATTTATTGGCTGTGTGCCACAAAGAAAACTATTTACAAGTTTTTTCACAAGTAAACTACATAATTGAGAGCTCATAAATGTGTTTATACGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGA:1 - chr2L 13294864 5' + G2 3031 2 63.01 GCAGGGCAAAAGTTTAAAAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3L 13634193 5' + 297 6636 2 58.90 AATGACTTTCTTTATCTTCTGTTTGTATCTAATGTTTGCAGACAACTAAAGGCCCCTGGAGACTGCAGCTTTTATCACTCCATATAAGTCTATAAAAACGTGTATTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - 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Dm88 4125 1 74.64 CCAACGCCCACTTTGTCCGCCCAGTTTCCCACATGCCCAAAAATATGCAACATTTTTTATATGTTTCTGCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr3R 8707341 5' + jockey 4693 1 41.10 CAGGATCCGTTGGCACTCACTTATTTATGATTTATTGAATTTAATTGAAGCACTCACACACATGAGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACATAAAC:1 - chr2R 15249149 5' + I-element 4946 1 63.70 AACCTGTGAAATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr3L 25406599 5' + 1360 6 2 63.70 CATTTAAATGATCTGCGACATACATATGTATGTATGTAATATATTCGTTTTGCAAACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 + chr2L 22762326 5' - Transpac 5173 2 60.71 CAATGTGGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAA:1 + chr3R 2555500 5' - Bari1 1631 1 69.18 TCTTCCGTTGGATGGGATTAATTTGTGGCCTATGCTGAGTGGCAACGAGGAACCGAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 + chr3L 17890688 5' + 412 7078 2 69.18 GCAAAACAAACAGTTGATGGGAAGGTTTAGCACTCGGAATTAATACGATTTGTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr2R 23000014 5' - mdg1 388 2 62.07 ACTTCGCCCCGCCCCCTTGCCACATGCCCACCCAGACACACACACACACACACACACACACATATAT:1 + chrX 18002159 5' + accord 7031 2 62.69 TAGTGCTTCAGTGCTGACGTAGGCATCCCACACACAGACAATTAGAAACATGAATGCACTGTGAGAAACCAGCTTCGAGCCTATGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chrX 22725661 5' - roo 400 1 74.79 TGCCATAAATCAGCTTTGTTGCATTTAAGCAAGCAACAATAGCAATAAGCCAGCCAGCTAAAGAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACT:1 + chr2R 8531673 5' + INE-1 557 1 69.66 CAAATGAGTTCAGAATGGGCCAAAATCCGAAGCGGCGGGCCAAATGGCTTTTCCAGCTGCGCCAACAGGGCGTATGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr3L 19199739 5' + hobo 43 1 52.41 ACAAAACACCCGAACACAGTTCGCCTTTTAATGTGCAAATGTAGGGCTTAACTAACACACAGATGCACACGCATAATAGATGCATCCCATGGATACAGGCTCCTCCCCACGAATAAGCTTACAAATAATGACTGTTCCAAGCATAG:1 - chr2L 20483121 5' - Cr1a 4026 1 71.23 TATAAATAAAGGATGAAAAATGGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr2L 6717235 5' + jockey 26 1 68.38 GTGGTTTTTTCTGTGACAGTGCGAGATGTTTTATCCCAAGAGTTGGGGCATACATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAA:1 + chr2L 21951124 5' + Burdock 65 2 67.12 CTAGAGCTATCACTTGGTATTTTCAACGTTCATGTTAAATTTTAGTTCTTGTACTAATAAATTGAACTAGCTTAAAAATTCTTTACTATTTTTACTAGTATACACCAACATTTTCCCATAGATGTTCTATTTATGAGCTGAAATAA:1 + chr2R 19000733 5' + rooA 49 2 78.08 CTCTGACAGGGCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 + chr3R 19531237 5' + hobo 73 1 65.75 ATCTGGCAGCAAAAATCTACGAAAAAGTCGGAAACACTTTGTCGGTGGCTTGGCTTGTTTTTTTGGGGCTTTGGTTTTGGTTTTGCTTTGCTTTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chrX 7515605 5' + roo 14 2 73.88 CATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCACCCGGCCGAATGCTGACATTCC:1 - chr2L 22015979 5' + Tirant 8195 2 78.08 CTTTGAGTGCCCAGCCCAGCAGCAGACGTGCACATCCACTTCAGTTGAGTTTAGTTAAGCAAATATATGTACATATGTATGTATGTATGTACATATGTACATATGTATGTATGTATGTACATATGTACATATGTATGTATGTATGT:1 + chrX 6720069 5' - 1731 4390 2 73.97 AATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chrX 1103715 5' - pogo 2074 1 56.76 GAATCGAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr2L 23310605 5' + 1360 11 1 71.93 TGGCAATCAATTTTTGGTAAAGTTATGAAAAAAACTCAATTTCTGCCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCC:1 - chr3R 24493159 5' + jockey 4746 1 67.12 GAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTT:3 - chrX 1018148 5' + 1360 247 1 69.18 AGCAAAATTAAAGTCCTTGCCCCAAAATCATTCTACTAGATTATATGCACTAGTTGCCGTTGTATTTTAAAAGACGGATTACAACACTATCACCGCGGAAGGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 + chr2L 9485552 5' - 412 7545 2 79.53 ATTGCCCTCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTGTTTAAATCATTTAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chr3L 21144030 5' + jockey 4689 1 65.83 CGCTGGGAAATAATTTGAAGCAAATTTTAATTAATGCCGGCAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAATTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCA:1 - chr3R 27859257 5' + hopper 77 1 66.44 ATACATACAAAGAAGAGGTTCCGTTTTAATTTAAATATTACGTTTTATGCTTTCTGTTGCATACTTTGGCGGGCTTAGCTTTTGTTGGGCCATAGGCAACGAATCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGA:1 - chr3R 22516100 5' + jockey 4575 1 71.92 GCCACATAAAACGATTGTTTTCATTGAGGATGAAGTAGTTTGGTTATTATACGTTTTTTTTTTTCTGTGCATAGAGTGGCGAATGAGAGTCTTTTTTTCGATTGCCCACAATTAAAATACAACCAATTTCGTTAGCCCACCTCT:1 - chrX 12780187 5' + FB 451 1 59.03 ATAAAATAAACACTTTAAAACCAATATTTAAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr2R 20673604 5' - mdg1 7426 2 62.33 AGGCACAAATAGGTTGTATTAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCG:1 + chr2R 5617460 5' - invader1 3987 2 61.64 GAAAGTTGGCTAGCATGCGGCAAATGGCGACAGGTGTTTCAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCG:1 - chr2R 13644561 5' + Burdock 6151 2 75.34 GTGCTGCGGGATCGGGACGCCACCTTAGATGAGATACGACGCATCTACTTCAAACTGGCCAAGTGGCATGCAGTCAGCTTGAAAGTGCAGAATGAGGTAAATTGTTAAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 25304673 5' + roo 13 2 71.92 TGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:2 + chr3R 21705970 5' + 297 6633 2 54.79 TGTTAAATTCACCCTAAATGATATTTATAATTTTCTGCGCGCTGACCTCCGTTGGGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3L 14480718 5' - accord 7030 2 69.23 GAGATACGCAGGAAAAGATATACAGGAGTTTTCAAGTTCTTAGTAAATACAACGCACTTGCAAAAACTGCTATCTAAACCACTCGGCGTATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAT:1 + chr2R 19553149 5' + mdg1 7070 2 63.01 GACTTTTATGATAATCAATAGCAGCATTAAGATTATTCCGCATTGGTTTATGGTTAACATGCCCAAATTACGACCTACCTCAATATTGTGTTTTCTTTTGTATGCCTTCAAAAACTGAAAGTTTTTTTTTTCTTTTTTGTTAAATA:1 - chr2L 18418122 5' - TART-B 10632 2 63.70 TGTACATTTTAGTTGTATTACCCAGCTTATATGGCCTACACATAGGGAGTATATATATATATACATACATACATATGTAAAACTATATAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 + chr2R 18959353 5' - blood 344 2 62.33 GAGGAGCACCAGCTTTTAAGCGAACTAATTGTCCTTTTCTTTGCATCCGCAAATTGTAGAAGTATCAAGGCGCATCCGTTATTGTTCGCAGGATTTTTGATTATGCTCGTTGTATTATTTCATTGATGTTGCTGTTGCATGCATTG:1 - chr3L 4995854 5' - Doc4-element 2625 1 58.22 GAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCA:1 - chr2R 21402669 5' + mdg3 5324 2 71.54 GAATGAGGCGCTCAGTAAAAGTGATTCACTTCAATTTATTTTTTTTTTCTGCAACAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2R 10695725 5' + roo 8675 2 78.08 AATCAAAGACAGTTGAACTTCTTCAAAATACCATTTTTAAATACTTTAGTGTGTCAGAGTTTTAATAGGACAAATAAATCGGAGTGTTAATTTTATTCCCGGGAAAAAAGATATATATAAAAATAAAATGTATGTATATACAAATC:1 - chr3L 16174975 5' - transib4 2462 1 33.56 CTTGCAAAAACTGCTATCTAAACCACTCGGCGTATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAG:1 + chr2R 19553205 5' + mdg1 87 2 76.55 TATTGATTTGTCTGAATTGGATTGCCAATATTCATGCTTTACTGAAGGGGCTTTGTGCTATGAAAATTTAGAGTAGATTTATTTGGCAAACGATAATCTATAGATTCCTACATCGTGTAGAATCGTTCCCTTCTTTCGACCACCAT:1 + chr2L 18664475 5' + 3S18 477 1 44.52 ACATTCCCCATACAACAGTCAGTAGCACCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACG:1 - 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opus 440 2 62.33 AGATAGAATTAATTCATTAAGGATATACTATTGTTCATATATGTACTACTATAAATGGTATAAGTAGAGTATTGAAAGCATAATTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTAAATAATTAT:1 + chr3L 16307537 5' - Cr1a 112 1 61.64 ATCAAGTCAACGGCTTGCTGCTGCCACACAGACAGTAAACAACACATATATACCCCATTTATATTTTAGGTATAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACGTATTGTTAGTCTCTAAAGTAAAAGGAAAGATT:1 - chr3R 9882754 5' + Doc3-element 4692 1 57.36 AGGGTGGCTTCTGGCCATTGTACAAATGGGAGCATAAATAATAGCGACTGTCTGCCAAGTTATGAATAATAATGACAACAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr3R 25387889 5' - roo 9029 1 56.16 CCAAGAAACTGCAATTACTTATTTGGTTTTTTTAGCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGG:1 + chrX 7626928 5' - F-element 296 1 66.99 GGAACCGGTCCATAAGTCACTTTAATGGGCTTTCAATGAGGTGTGCCCCGGGAAAATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTT:1 + chr3R 30634885 5' - roo 9053 2 74.66 GGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3R 17305451 5' - roo 9004 2 65.75 ATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 14553115 5' - roo 357 2 63.41 GCCAAAGCAGCAACCAAAAAAAAATCAAGAAACGGCAGCAAAAGAAGAAGCAGCAGCAGCAAAGAAGGTCAACAGAAAACTAAAAAAAAAAACAAAAAGCTTTT:1 - chrX 9876003 5' + HMS-Beagle2 492 1 68.27 ATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTCAACCCCCACACC:1 - chr2L 22015978 5' + Tirant 8120 2 54.29 TTTCTCGCATTTGACTTTAAAAGCAGCTGCAACTTTAGTCTTTACGAACTTTTAAGTTTGACATTTCCATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 + chr2L 12349697 5' + F-element 37 1 82.73 GTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCC:1 - chr2L 9668266 5' - 1360 3315 1 69.86 GATGCGTTGCGATTCCATTTCGTTTGCTTCACTAAATGATAGCAGACATGCGGTCAGCGGGTGCGGTGGTTGGCAGCTGCCAAAGGGCCACTAATGATGACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3R 12598984 5' + 412 16 2 71.94 CTCATAATATATATATTTAAATAACATCATTATGCTGAAATAAAGAAAATGTTATTGGCTTGTCTTAATGGCAAGTGAAAATAGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chrX 21973947 5' - pogo 2083 1 68.75 GTGGTTATCGAGCTGAGCTTAGCGGGTGGTGTTAGATGTAGCATTAGATGTGGTTTAGAAAAGCGGCAGTCAGAGTTCACAACATGCATTAAAAATACAATTCAGAGTATCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCG:1 - chr2L 8927953 5' - roo 234 2 74.66 ACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 + chr3L 13868645 5' + 412 77 2 71.92 TTATATTTATTTTTGGTCAATATGGCCCTTACCTGATACTCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3L 96578 5' + roo 8745 2 75.17 AGTAAATAATATTCTCTTAAATGTTAAGATCCTCAATGGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCA:1 + chrX 16383976 5' - diver 6072 2 58.22 TGCTATGAGGAACACATGAAAACCGTCATTGGATCACATTGGAATATTTTATTGGTGCTAACGCAATGAAATCAGAGCAAATACATAAAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACT:1 - chr2L 12319370 5' + copia 29 2 63.89 AAATGCTTATCAATTAATAAAAATCATTGCCTACTTTTCTGCGTTTTGCTTTTCCTGGCCTTCCTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGTTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - 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chr2L 22130912 5' - pogo 1699 1 64.14 TGCCATAGTCGAGTTTTCGGACTATCAGCTAGTGGAAATGGGAACACAAAATGTAATAAAACTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1 + chr2R 3143658 5' + jockey 4773 1 58.22 ATCCAGTTATTTAAGCACGGACACACGCACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTT:1 + chr2L 10089758 5' + opus 199 2 79.86 GCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTAC:1 + chr3L 24291991 5' + rover 84 2 76.71 TTCATCTTTATGTTTCTCCAGCTGCGAGTGTCGCCGAGCGTGAACGGGTTGGGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 17305400 5' - roo 9055 2 71.92 TTAAAACGGAACTTTATCTGCATTTAGTACGTAAATAATCGAGTGCCTCGGTCCGAGGATTTCGTCAGAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr2L 1759286 5' - roo 9029 1 46.58 ATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chrX 7515737 5' - roo 345 2 61.81 GTGTAGTCATGTAAATGGGTGTGTATTATCAGCGGTCATTGTTTCGCGTTGAATACTGTGTATCAATTACCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 - chr2L 3294227 5' - hopper 1366 1 50.00 CTGGCCCAACTGTTGCAAGTGACAGCTTTCATCAAAGCGATTTGTTACACAGAATGGTCCAGCACATATGTATTGTATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 - chr2R 12787934 5' + 297 8 2 75.65 ATATTACTATTAGTGTTACTAATACTATTTGATCAGCACATTTCCCTTCTCCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATCTCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3R 20743978 5' - roo 338 2 66.44 TTTATTTCTTATCCAGTTTCGTCGATTTTAAGCTATGCATAATAAGCTATGATAATATAAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAA:1 + chr3R 12929188 5' + invader4 2816 2 56.16 GGAACTCTGGTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3R 25304812 5' - roo 9032 1 60.00 CCTGCGAAATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTT:1 + chr2L 8956742 5' + pogo 69 1 65.07 AATCGCTTGCTAAAATTTACAAACATTCCCCTTTTCCTTTTCGTTTTTTCCAGGTAAGCCCACGTGAATTTCCCCCTCGAGCATCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTTATCCAAATATCTCCA:1 - chrX 20897008 5' - hopper 56 1 63.20 CGGCGGGCGAGAGAGTTCAGTAACCTCCATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 - chr2R 10865275 5' + blood 7020 2 73.55 ACGGCACCTAAAACATTTTGCAGCAAATTTCTGGGCAAAAGCATAAGCATAAGCTGCACTTTCACCAAAAATTATGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr2R 11057237 5' + pogo 43 1 54.11 GTCTCTGTGTTCTTAAACACTTTCTCTTGACGGTACTTGCGTTGAATATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGGCTCTTCGCATTCC:1 - chr3L 12976394 5' + invader4 5 2 68.09 CTAATTTTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2L 3890139 5' + jockey 25 1 58.76 GAATATAATGGTTTCTTTGAATGCATACTTGGGAAGCATCTGCGTCATTAAATTTAAATGCAGTATTATTAAAATAAATATTAAATGTTTGAGTAGTCTGTAGATATGCTCTTCGACATTGTAGATGTTGCTTCTCGATGCGATGC:1 + chr3R 8964755 5' - Doc3-element 4346 1 56.85 AGATGGAGCGTCCCCATCGCGGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2R 11133536 5' - roo 9033 1 54.62 GGGAAGGTTATCTCTGGGGAACGGCGGATTCATTGAAACCTGAAGCCAGAGTGTAAAGTCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3R 23765368 5' - roo 334 2 63.70 AATTAGAAACATGAATGCACTGTGAGAAACCAGCTTCGAGCCTATGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chrX 22725622 5' - roo 333 2 69.18 CCACTCCTGGCAATTATTGAGCAATGCCAATGCTCGGAAAAACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 - chr2R 21402720 5' + mdg3 37 2 59.59 AAAAGAGAAATACTTCCATAGGATGTAGCATTAAAAGTAAGTTTTTAATAAAGGCTCACTTAATAACAAATTATACATTATATATTTTAAGTAATTCTATTAATATTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTTCTTTCTTAATAA:1 + chr3R 18873151 5' - copia 240 1 56.16 TCCAGAAAAACTATAGAAAATAAAGAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTG:1 - chr2L 18149538 5' - Bari1 1653 1 54.79 GTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGATGATCACGCGAGGCCCATCCCAA:1 + chr3R 29487012 5' - Rt1a 4703 1 56.36 CACAAGCACATTTATTAGAGTTTTTCCCCACTCGATTTTCCCATCCCCCGCTTATTTGTGTGTGTGTGTGCGTGAAATTTGATGCCGCACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chr3L 7995537 5' - P-element 2854 1 63.01 GAAAAACCGAAATCTCAGCAAAAAGACGACGAAACCGGAAGGGAAATACACTTTCGAGGTCGATCTTTAAATAACTTCGAAACATTATACATATATAAGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr2L 14248143 5' + I-element 25 1 67.12 ACATAAATGTACTTAAAAAACAATCATAACACAACTTTTCTAATAATCTAACTACTTTTAAAATAACTTCATAATATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAG:1 + chr2R 3202638 5' + gtwin 11 2 78.08 AGTATCGCCCGAGGACCTTCACTCATTAGTGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCAC:1 + chr2R 16403434 5' - copia 5035 2 79.45 ATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 + chr3L 27415198 5' - transib2 2790 1 59.26 AGGATCTGTTTTAATTACATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTTAATATGT:2 + chr3R 2102759 5' - TLD2_LTR 3 1 58.90 AATTTGGAGTGCTCTCATCTCTTGGGTTATCCTGTAGCAATTGTCCATTTGCAGTCACTGTTCCCGTCACTGGCTGCCTGGTTTTGTCCCATATCAGCCATCAGCCGGTTTGCGAATGGTACGTAAGGAACACAA:1 - chr2R 12106564 5' + BS3 1403 1 80.00 CACAGCCTTTTGGGGGGAATACGTGCTGCCAAAGTTAAATGAAATATTAAAAGTATAAAAATCTTCTTAGTATACCTTCCTTCTGGCTTTCATGCGGGCAGATGGACATACGGGCATGGCTAGATCGACTTGGCTATTGATCCTG:1 + chrX 18842921 5' - INE-1 95 1 42.07 ATGTCAAGTGTTTGAATATCCCCGTCTTTATCCCACACTTTGGATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 + chr3R 24729533 5' - Juan 4195 1 60.27 GTCTACAGAGAGTGCACTTGAGTTTATTTTGGTCTTTTGCCGGCTCAGTCGATCTTGTTTTCAATTCTCCATTCGTCTTGCTCCATGTTATCAGACTGCACTATGGAAAATTTGAACACTTTTTCTGGCCAAAATTAAAAACTCCA:1 + chr2L 21108539 5' + Transib-N1_DM 27 1 58.22 ACCCGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTC:1 + chr2L 16089581 5' - 3S18 283 2 55.17 CGGTGAATACAGATGCCTTTGTGCAGGGCGAAAGAGAAAGGGTTAACTCCGCTCATTCGGTGTCCGTAAATATGGGCCGTACTGAGGGCAATAACTATCTAGATATCATTTCATTAGAGAAGTCATGAAAGAGGGTCACGTTGTGT:1 - chr2L 8414530 5' + 1731 4159 1 69.18 GAAGGAGGATACATTCAGGATAGTTCGATCTCAGCGTTCGATATCACTTCTTTACTCTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3L 17869903 5' + 1360 4 2 41.18 TGTAAACTTAAAATTATAAGTTTTGCATAAACTATTTTAAAGAAATAATTGAAGGAACAACATGAATATTTTATTCTATGTTATAAGTAGTATGGCCTCAGTTTGAGTAGTATTTATAAATGCAACATTTAAAAAATATATATTTA:1 - chr3R 18894339 5' + Transib5 2727 1 78.08 ATGCTGCATTATTGACAAGTGGACATTCAGAGTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAA:1 - chr4 464572 5' - copia 146 2 76.30 AGATGAGATGGGGCTTTTGGGAATTCGCTTCAGTTTGTGGAGCTAACACTTCAAAAACTATTCGTTCGCTGGCTGAAAATGGATTTGTGCAATAAAAAAGTCGTTATTCCTGCAGACATCTACTTCCCCCCGCTCCTACCAGCGAC:1 - chr2R 18770299 5' - invader1 126 2 60.96 AAATAAATAGGAAAGGAAATTAGTTGGACTCCCGAAAACGAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATATAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAA:1 - chr2L 17404691 5' + hopper 983 2 77.14 AATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTT:1 + chr3L 25782379 5' - Stalker4 52 4 52.74 TTGGTGAATACCTTATTTTAATACATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGATTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAA:1 + chr2R 4673561 5' - Quasimodo 7309 2 62.33 GCTCCTCTAAATTTCAGGAATTGAATCCGTTTTTGATACAGTCAATGAAGTACCCAAAAAAAAACAGAGCATTTAGAGTTGTTATTAAATTTAGATAAAAATTTGTTATTTGAATTTAGATGAAAATAAAAGTGATGTAGAGTCAA:1 - chr3L 26345122 5' + G4 428 1 58.90 ATTGTCTAGCTATTTTTAAAATATGTAATGGTTATGGGCTGACCTTTTCTAATATTCACGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr3L 4187186 5' + pogo 57 1 59.86 CAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 - chr3L 19350003 5' + jockey 68 1 54.23 ATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAA:1 - chr3R 11547787 5' + G2 318 1 51.11 GAACCGAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3L 17890737 5' + 412 74 2 67.12 GGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTA:2 + chr2R 11763591 5' + Tabor 6909 2 63.70 GCATAAATAATAGCGACTGTCTGCCAAGTTATGAATAATAATGACAACAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 25387858 5' - roo 334 2 70.55 GCGTCAAGTACGTGGTCTGGGATTCAAATTGGTTTGTTGAGGCATCCACCGTCTATATATATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr2R 12543165 5' - roo 351 2 60.84 ACAAACTTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr3L 22052743 5' - mdg1 7407 2 53.79 CTAGCCAGGGACTGAATTTAATTGCAATTATCACTAGGCAGGCTTACGGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 - chr2L 2030087 5' - 412 424 2 64.14 CACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAA:1 - chr3R 9160751 5' - copia 175 2 68.49 TCCACTTACGAGTGTTTCATTAACAGACCCACTCCACTCGAATCGAATATTCATGGTCGTGATAGAACTAAAAACCACACTCATTTACTGTAATGGCATAATAGTAGTTACTCAAAGCCTCACTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTA:1 + chr2L 6868749 5' + I-element 58 1 49.32 GGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAA:1 + chr3L 24152440 5' + HMS-Beagle2 6936 2 56.83 AATGTAGGATTGGACTACCCCTAACAATTGGGGGGATAAAAAACTATATGTTGACCAAAAACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGCAATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCT:1 + chr2R 4426859 5' + 1360 63 1 59.71 CCGCTCAACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1 + chr2L 17210290 5' - jockey 4917 1 76.69 TATTCGACTTTTTTACATTAGTTTTCGCATAAAAATTGTATTGCATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCCTCATATA:1 - chr2L 2657313 5' - diver 6035 2 68.49 CGATTGTTATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAGACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1 + chr2R 1921422 5' - mdg1 354 2 60.00 AGACATTAACCGATAAGATAAAAGAAAGCTTAACTGAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3L 18658967 5' + roo 8750 2 78.08 AAAGTGGACAGCAATTTGCAAGTTTGCCAAAGCATAAGCCATTTATGTACATACATAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCA:1 + chrX 22858410 5' + copia 4934 2 61.64 ATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTG:1 + chrX 21772472 5' - gypsy3 6532 1 61.03 CGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCC:1 + chrX 21772479 5' - gypsy3 6538 1 62.60 AATGAGTTATTTTGCTAGTTATTTCATAGCTACGACTGGGATATTAAACGACAGGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chrX 1061528 5' + 412 7119 2 62.33 CAAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGATCTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATATAT:1 - chr3R 29288807 5' - BS 5033 1 56.94 ATAGAGGTATGTGGAAGCACTGGAGCTCTTTACACGGGATCTCAGCGTTTTAAGAATGGGATGCCAAAACACTTTATAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTG:1 + chr3R 7539415 5' - roo 9031 1 57.24 GAGAGTGGGAAAAAGACAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3L 18658901 5' - roo 337 2 68.49 GATTAAGTCGGCAGAGACAAGACCATTATGCAAAATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chrX 6481343 5' + hobo 65 1 69.53 ATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:2 - chrX 23439058 5' - P-element 2495 1 60.69 GCATGTGTGTGTGTTCAAAGAAAGTCCATCCACCGGGCTTAAGGAATTTGCTCGCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr3L 905914 5' + 412 31 2 61.64 ATGGGAAAAATTTTGAAAAAGTTTCACCATTTGTGATTAAAAAAGTCATAGACTTCACATGCGGAGCTAAGAGGTTTCTTGGCAAAAAACTAGGCCGGGAACATTATGTTGTTTGTTGACACGGTGCTCCAAGTGTG:1 + chr2R 4638545 5' - 1731 306 1 77.37 GTCGTTACATGGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3L 23986624 5' - opus 7479 2 64.91 CAAAATAAATAGAATAAAAAAAAAATAGTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACGTAAGTGGAGTACATCTAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTA:1 - chr2R 14781238 5' - G2 2954 1 79.45 ATGGTGGGGGAACTTAATGGGCAAGGGGGACATGGGCGTTAGAGTGCCGGGTGCTGGCCTCTTGACATTTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATACATTTAAAGACTTACCATTT:1 + chr2R 21371425 5' + roo 21 2 61.02 AGCCGAAAGGATTGCCACAGCAGTTTCCCAAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGCTTAACATTTTATATATCGATGCTA:1 - chr2L 12340840 5' + diver 5943 2 50.68 TTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 + chr2R 5214958 5' + F-element 61 1 57.58 TATTATCTCTTTTTTTATTTGCAAGCTTTTTTATTTAACAGCTCTTTCAGGTGGATTTTTTTAAAAGATGTATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAA:1 - chr3L 8855980 5' - rover 301 2 52.05 AATAATAATAATAAAACTGGTAATTAACAAAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGGTGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1 - chr3R 17605775 5' + Tabor 6858 2 69.86 AACCATAGATCTTTATGATAAAAAACTAAAGCATCTTAAACATATATTTCAAATTTGCTTATAAACACAAATTACCTTAGCAAATTTCACGTAGTCAATGTAATACGTATGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGAT:1 - chr3R 20091786 5' - R1A1-element 5104 1 73.29 AACTTTCACTCAGTTACAATGTCTTACTGGCCCCTTTGCCACTTGCCTCCGTACACATTCCCATAACATCCTCCTGCTCTCCACAGTTATTAACTATTCATAACTTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 - chr2L 2272602 5' + copia 16 2 71.92 ATCTCGAGCTGCTGGCTGCGGCGATAAGCTTCTTTTAATAAGCGACAAAGCTAGAAGTTCATCCAATAAATACATAGAGGAAAATGCGAAGCTTTATATTTTGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATAT:1 + chr3R 27510025 5' - Bari1 1691 1 71.92 TTTTGCATTTCAGAGCGGGGCTTTAAAGTTCATGGTTGATTAACTTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGCCATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 + chr3R 24476291 5' - 412 427 2 64.18 CGCACATGAGCATTTCGGTGGGAACGGTGCATTCACATTCACATCCACATCCATATCCACAACCAGAAATAGAGGGAAACACCGAATGGGAGAAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAA:1 + chr3L 13777145 5' - accord2 7261 1 67.81 AGTTTTTACATTATTTTATCTCTGTATTTTCTGGACAAACGTTTTATAGTATATTTTCCCTTGGCATGCCTGGCTCGTTTCATATTTTAAAATGGCAACAATTTGCCAAAAACGTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGA:1 + chr2R 21414333 5' - BS 5083 1 78.77 TGGCACAAAACTTGCAGCCATCGACATTTTTTGGCAAATTGTTAAAGCGAAATGCGATTGAGTAGTTGGAGCCTGATCGATTGATTGGCAGTTCCTTCGATTGAATGCAAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGA:1 - chr3L 4773209 5' - Juan 50 1 75.34 CCTCCTCCTCTTTGACTGCTGACTGATTGCTGGTAGGTGTCCGGCGTAATGCCATCCCCATATCGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGGAAGACCTTGTGGTCTAGGCTG:1 + chr2R 8606637 5' - F-element 4216 1 52.76 ACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCG:1 - chr2R 15829576 5' - invader4 3028 2 76.99 GACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAG:1 + chr2R 5542356 5' - 1731 4553 1 66.44 CAGGAAATCGAAGACGCCCGTTGTCGCCATAATATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGCTACCACCCCACACCCCAAACCCCCACGCC:1 - chr2L 22016042 5' + Tirant 8120 2 76.12 AGTTGCTTGGTGCAACCCTTTTGTTCTAACTAGTAATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTA:1 - chr2R 4638662 5' + 1731 86 1 74.48 AGTGTACGTGTCGAACAATGTTGTAGTACCTTTGCGGCATAAAAGCAAAGCAAACTCCTGCTGGAAGAGGAAAATATTTATTGTTATTGCCATTGCTAGTTTGTTGCTTTGAGTAATTTTGCTTATCAACGATAAAATAAAGGAAA:1 + chr3R 19420306 5' - Circe 6973 1 69.86 AGTGTAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chr2L 16948750 5' + jockey 4694 1 62.28 GGCCAAGGTTGAGCAGTATTGGTAACGCGCTGTTTACGGAAAGAGAAGGAGAAAATTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTG:1 - chr3L 25443100 5' - opus 7440 2 60.96 CCCAACGAGATATCTGATACTATGGCACGCCTCATCAGGGGATGTTCGGGACCCGGTCGATTGTTATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACTTC:1 + chr2R 1921365 5' - mdg1 416 2 79.29 TCGTGAGGTGAGAACAAAGCGTTTGCAACCACAAAAGCAGCGGAAAAGCGAGAAATGGGTACCAGGAATTTGCATAGAGGAGCAAAATGCACAGGAACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCAT:1 + chr3L 1403085 5' + Ivk 4974 1 71.77 GACGTTCTCCATTTCGTCAGGTTCTCACTCCGAATTAGCGATAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTC:1 + chr2R 7665761 5' + Transpac 4996 2 72.41 GACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGG:1 + chr2R 5922982 5' - jockey 4916 1 72.60 AACTGCTATTGCTATTTACGATACGATAGTTACGTGGTACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3L 13868607 5' + 412 7091 2 57.24 ACAAAAGCCCGTATTAATTACACAACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3R 18815999 5' + hobo 37 1 62.33 GGTTCATCAGCACCAAGATCTGGTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 24122638 5' - roo 9026 1 52.74 GCTAGAAACCGGCAAAGGAATAAGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chr2L 15834430 5' - hopper 1379 1 59.29 GTTATGAAAATTCCGTTATACTACAAACTCAACCGCTCGCTACGAAATGTATCGAAGCACTGATTTTCTCAAGTGGCCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 + chr3L 16580240 5' - 412 7504 2 59.59 GTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chrX 4778195 5' + 412 7133 2 71.23 GAAAACGAATGAAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 + chr3L 14550962 5' + P-element 60 1 37.41 CGAGTATTCACGAAACTTTTCCGAAGGTTCTATTTTTAATGCATGCTGCATGTAAATCGAAAAGGGCAGGATGTGAGTACCTAAAATAAATAAAAAACAAGGAAGGAAGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTAC:2 + chr3L 23027511 5' - INE-1 551 1 58.22 TCTTGTTTTTAGATCTGATACTAACTGCTGCGCATTGCGTAACGTCCAACTCAAAACTGTAAGCAACTGCTCAAATCGATGAAAAAATCTTAAATGAATAAATGTTTATATTT:1 + chr2L 14768949 5' + Tc1 59 1 28.32 GCGGATGACCGGCGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGA:1 + chr2R 21402606 5' - mdg3 173 2 64.38 TATATATATATATATTTCTAATGAGTTTAAACAGCCGAGACGATTATAGTATTCCTTTCTCTACGCCAACAAATTGTTAAAATTTCCCTGTGATCTCCCACTAGTGTAGTATAGTCGGTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCAT:1 + chr3R 18030721 5' + INE-1 569 1 71.92 AGATACCTAACATGCCTAACAATAAAGGCCGAAATACATTTCGGATGAATCTCATTCAGATGCACTTCGCACATTAACGCCCTAAATCTGGGATTTGATAATTTAACAGTTCACCGTTATAATAACAGCTGTTAAAGTCGGGTGT:1 + chr3L 63278 5' - hopper 1264 1 67.59 ACAAGAAATGTCGAGATTTACGAGATCAGTGAGGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAA:1 - chr2R 8641637 5' + diver 24 2 65.07 ATAGACAAGTGGCCAAGCCAAGTGTAGATGGGAAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 + chr3R 13612827 5' + 412 86 2 75.17 AATTAAAAAATACAGCGGCAAAGTAAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3L 13563420 5' - roo 9037 1 59.12 ATTTTCGATTCGCGTCTGTCGTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCCCCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCCAATAATCGTTAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGACTAG:1 - chr2L 8531555 5' - opus 7387 2 75.00 CGATAGTCGTAAGGTACTCCAATCCGCGCGGACAGTTCGGAATTCCGGTAGGTATACTCATCCAGTCTCCTGCAAATACCAGATGTTATTGACCTTATTCTATACCCACCCTACCTGT:1 + chr3L 10222033 5' - Circe 7196 1 66.10 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTACTCTGC:1 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 32 1 74.56 ATCAATGCATATTCGTATGTAAACAAGAACAAAATGCGCACCAACTAACCTAATCTAACCAACTTAGCGATCTCTTTACTTTACTTACTTTCCTTTAGTATGTACTTATTTTTAGATATAAATATTGTTATTAATTATTAAGCATT:1 + chr3R 22477451 5' + gypsy12 9775 2 64.38 CTTCTATTTATGGGGAATCAATCTAAAATACAGTTGTTACCATTACAAATATCAACTGCTTTATAAATTTAACAACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chrX 13531720 5' + roo 21 2 57.38 GACAAAGCTAGAAGTTCATCCAATAAATACATAGAGGAAAATGCGAAGCTTTATATTTTGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTT:1 + chr3R 27510068 5' - 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G6 1590 1 65.38 GTGCGCTGCGTAATGACAGAAATTTCTGATCGAGTCCGTTACGTGTCCGTGGATTACTCTTCAGATTTCAGCATGGACAATCCAGAGGTCTATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTGT:1 - chr2R 294422 5' - Porto1 4228 1 60.27 ATATAGGTTGATCGGAAAACACCTTTGGTCAGATGATCTGTTGAACACAAGCATAAAGGTCAACGAATCTGCTTTAAAGTAACAGAAGAACGCTTTTAATCTTAAATATAAAATAAGAATTTTTCTCTTTTTTTTTGTTAT:1 + chrX 15261309 5' - gypsy7 5002 1 76.60 GCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 + chr3L 15026630 5' + opus 7157 4 53.42 CGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCC:1 + chr2L 17250733 5' + opus 7186 4 74.07 GTGGCTCTCAAGTGCGTTAATCTTGTGGTCATTTGGCTGCTTCGTATTAACCTCTGAGATTAGCTGGCATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr3R 19859712 5' + opus 27 4 61.60 ACGTACCTACAAAGATAGCTAAAGTCCTGAAAAAAATTATTCTGAGCATAGATGAACAATGCGCTATCTATTTTTGGCTGCCTTACAAAGTTGCACTATCCGCCAACATCCGCCCATATACATACTTATAAACATACTTATACTTT:1 - 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INE-1 536 1 45.83 AAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3L 19350000 5' + jockey 35 1 57.01 GGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTT:1 + chr3L 27356094 5' - Tc3 1623 1 74.66 AATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGG:1 - chr3R 934254 5' - Rt1b 4703 1 48.63 AAAAATTTAGAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2R 10695906 5' - roo 9047 1 65.96 GCAGACCTTTGAAGTCAGGGTTTAGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:3 + chr2R 11489149 5' - mdg1 7424 2 61.64 CTATTAGATGGCTACTATTCACTTTCAAAAGTTCATACTTGAAAACGAAGATCTTATGTTTTGAATTAGTTTGGTAAATTGGAGACACAAGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr3L 4620852 5' + FB 31 1 54.79 AGTCAAGTTTGTTTTGTCACTTTGATTGATTTAGATGTGGGCTTGCATTTGATTGACTTTAAAACGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTAT:1 + chr3L 24149030 5' - hopper 1111 1 59.59 GATGTGGATTGATTGCTAATGTTCATCTGGGCACATATATATCTGTATATATGTATATATATCTATCTGCGGCAGGCGGTTTTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAA:1 + chr2R 18785567 5' + Tabor 7295 2 56.16 GTCATTGTACTGCACAAATCTTTTGGCGCCCGCAGTGTAATAATAAATGCAATCGGCAACGCGTACAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGG:1 + chr2R 4362515 5' - gypsy 7423 2 47.86 ATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCC:1 + chrX 21772472 5' - gypsy3 6568 1 51.00 ATTTCTGCTCGGGTCTTATACACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGTCGCCGTCAGCAGTCGCCTCGGGGCCTGTCT:1 - chr2R 641945 5' + opus 188 4 65.75 ACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr2R 641924 5' + opus 153 4 76.67 AATTGACAGCAACAAAAACGAGCGTAGCAAGTTTGCATAAATGTGCGGGTTTCGGGCGAAAATTGAAAAGATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAG:1 + chr2R 17890859 5' - Tabor 7274 2 53.42 AAGAAATTTTAGTCGTGTTTAGATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTACACACACACACATA:1 + chr2L 23016848 5' + Quasimodo 32 2 69.32 AAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr2R 20673633 5' - mdg1 386 2 52.10 ACACGAAAATCATCACAGTCACTGACTCAGTCAGGGTAACATCATCACGTAACTATTTATTTATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTA:1 + chr2L 7825206 5' - I-element 5295 1 59.72 CACAAGTCTTTTTGTTTTTATTGCAGGCTGACTTAGGTTTTTATTTGATTTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCAGG:1 + chrX 21948946 5' - 412 312 2 83.56 ATACATGTATGTATATACTATATATGGTCTAAGACGCTTCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1 - chr3R 9247552 5' + hobo 81 1 75.34 TAGCTTAAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:2 + chr3R 7035218 5' - roo 9034 1 59.59 AATTGCTTTCGTCACATTTAATATGTGAGAAATTCATATGACATCCTGTGGATTTTTCTTTTTTCGATGCCGTAAAATGTGCGATAATTCACATAAGCATTCTTATCATGTGTGTGTGTGAGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGG:1 - chr2R 18040733 5' - accord 7101 2 56.85 GTTTATAAATAACATTCTGTGGTTTGTTTGGTTTCTATGGAATCCCTGATAGGAAATCGTTTTGGGCGCTTTTCTTTGGTAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGC:1 - chrX 6663351 5' + roo 243 2 64.71 GAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3R 24476360 5' + 412 7102 2 62.50 GTGGGTCATTTGGGAATTATCTGCAGACGTGCCGGTTCCAATGATTTATGCGTTCGTTTAATTGAGAAGTTCGAAGAGACTTTGATGGCACAAATCCAGACTGAGAATTGCGACAAAACGAAGAACTGGAGTCCCTCGGTCCGTT:1 + chr2L 21967292 5' + mariner2 325 1 68.97 ATAACCACACAAAATACTCCATCCAGGTACAGAAGCAAACAAGAATTAAACGACCCTTAAAAGCGTGCTACGTTTTTTTTGGTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3R 6515260 5' + jockey 14 1 79.02 GCCCCCGTTTCGCAGGCAAAAGTCGAGAGGGCGTTGTCATTTGTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGCAGACGACGAAATCTACAGACACAGC:1 - 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Transib-N1_DM 292 1 64.38 ACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGACATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 + chrX 4778209 5' + 412 77 2 75.19 AGTTATGTGGCTTGTTTCGCAGAACACCAGACAAACAATAAAAGTGGCAAAAGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTA:1 - chr3R 9190642 5' - Tabor 7308 2 73.79 CTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 - chr3L 13827361 5' - hopper 1387 1 57.02 GAAATAGCAGTAGATACTAGCCCTCCTCTTCAAACTGCCAATTTTTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACA:1 + chr3R 14860153 5' - BS 5040 1 65.60 ATAACCATAATTATTCTTCCCTAATCTGTATTCCTAACATTCGATTAGACTTGCAGCCTGATTTTATTTTGTCTAGGCCCATAGCATTTACATTTAATTGATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTC:1 + chr3R 15702810 5' + copia 4722 1 73.57 CTAATGCCAAAGCTATAATTGTGTGGCGCATTTTCATCTATTTGCAAATTAGCCACTAAGCAGTCGAACGAGCTGCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 - chr3R 26182554 5' + hobo 2708 1 60.94 AGTGGGTCTTGATTTATGGGATTTGCAAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 5150394 5' - roo 360 2 52.74 GTCCCTACGTGAAACTACACGGTGCTGCCAACTCGATTAATGATTCTATACCCTCAACGTTGTGAAAACATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chr2L 6318884 5' - pogo 2050 1 55.48 TCCATTCAATTTGCCCGTTTTGCGTTTTTGGGCTTTCAACAAGTTGTAGCCTTGACAATATTTCCGAGCAAAAGGAAGGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTATTAAATAGGTAGACTATCGTA:1 - chr2R 15071801 5' - Tc1-2 1530 1 54.11 TAGGCAAAGTGAACTGGCGACTGGGGGCATTCGGTGGCTGTAGATCTGTGTATCTCTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAAC:1 - chrX 13426217 5' - BS 5025 1 59.31 AATGCGCGCCGTTTACGACTTGTTGCTGAGCAACGCCTTTGATCCCAGGTACGAATGATATTCGCCATATCTATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTGGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGAT:1 - chrX 16829066 5' - Quasimodo 7337 2 62.96 AAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCAC:1 - chr2R 5237877 5' + Doc 101 1 63.01 CTGTGTAATTACACGGTCTTTGTGGACCGCAAAAGTCCAAGTCAAGCATTCCACTTATAGTATCGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 27794881 5' - roo 9017 2 55.48 GATCAACGAAAGAGAATACAAACTCGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr2L 1558728 5' - 412 7498 2 55.40 CATTTTCCTTTTCTTTCCGAGTTGCGTTTGTGTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1 - chr3R 15022143 5' + Tabor 6880 2 57.53 CTGGATACTCGCATAATTAAAAGCGGCAAACAAGTTTGCTTCCATTTCCTTCTACCTCCAAAGCAAACAAACGGGTCTAAATTGAATTAGAAACAGCGCATAAATCATATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chr3R 23010159 5' + I-element 11 1 78.08 CATGTTAAGACTGTTATTTGAATTTGTATATCTTGGGCATTATCCTCGCATTACTATGCTATAGAAATTTAGATACAGATGGGCTCCGGTTTGGGTTTTATTTTAAAAAGCGGTGACTTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:2 + chr3R 26191549 5' + hobo 2 1 77.40 ATTTTGGTATTTCGCATTTGGTCCTTTTTCCTGCTCGCAGCTCACAGTTCACAGCTCGTGTTGACAGTTTTTTTTCGCTTTTTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCTGCACTCGCTGCCG:1 - chrX 20066261 5' - opus 7474 2 65.49 ATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTT:1 - chr2L 23295901 5' + micropia 4983 2 61.48 AAATCTATACATAAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr2L 13250353 5' - opus 7474 2 59.63 AATCCCGGCTTTAGGAATTAAGAAAATTACCAAAATCGCAATATTTCTATGTTACACATATAATAGAGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAA:1 - chr3R 11749744 5' - Tabor 430 2 54.79 GTGCATGTGTGTTCGGAAATACGCGTTTTCAAAAAAAAAAAGGGAAACGAAA:1 - chr2R 21141701 5' + Doc2-element 232 1 80.77 AATAACTTCGAAACATTATACATATATAAGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAA:1 - chr2L 14248074 5' + I-element 76 1 76.56 ACTTATTTCCTATTTCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 + chr3R 28272258 5' + Tirant 3 2 70.45 AAAGGATCAATCACTTCAGCTGGTCAACTTTGCTGGACCATTTCAACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATATATAACCAC:1 - chr3L 11399999 5' + Quasimodo 43 2 59.66 CCTTTAAAGCTGCTCCCGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3L 17890819 5' - 412 440 2 60.61 AGGTACAGAAGCAAACAAGAATTAAACGACCCTTAAAAGCGTGCTACGTTTTTTTTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3R 6515284 5' + jockey 36 1 64.54 CCAGCTATCAATTATTTTGTCCTTAAGACAGATTAGTTCATTTTGATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGAAATCTCTTATTGATTA:1 + chr3R 2914327 5' - Circe 7004 1 78.57 CATTGATTTTAGGGTAAGCGCTTCATTCCCGCCGTTTGTTCTTTTCCATTCTGTTCAAATCTCTGTGTGTCTGTCGGTTCAGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTAT:1 + chr3L 21329897 5' + micropia 185 2 60.27 CTTTTAACCACGAAATTGAAAAAGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3R 6388805 5' + jockey 30 1 57.94 CGGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGCTG:1 - chr3R 4528424 5' + F-element 47 1 54.62 TTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGC:1 + chr2L 12349777 5' + F-element 118 1 69.86 CAGTCCTTTCCTTTTCGGTTCCCTGCTTTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAA:1 - chrX 17806013 5' + roo 75 2 76.15 TGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTAC:1 - chr2R 5532369 5' + G4 3777 1 52.74 CTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGGTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTGCAC:1 - chr2R 23116153 5' + jockey 25 1 57.75 ATGTAACTAGTTGCGTTCAATATTGAATTTCATTTTAAGCCGATTAAGCTCTCAACTAAATTGCTATAAATAGGTAATTCTTTAAAGTATTTTATATATTTAAAGTAGATAAATAAAAAAATTTTATTTAATTTCATTTTTTTTGT:1 - chr3R 14445027 5' - P-element 2636 1 80.14 TGCAGCATAATTTTATTATTCTCGGTAATATATGGATATGCTTCAAATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCT:1 - chr3L 19792516 5' - pogo 2031 1 67.81 ATGCGATTTTTTTTGAAATCGTATTAAGAATAAAAAATCATCTTCACTTACACAATGTCCTTTAAATTAGTATTATACACATGATAGTAAATGACTGATAACGAGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTG:1 + chr2L 15945664 5' + X-element 35 1 71.83 AACTATTTGGTACTTCTCCATCGCTTTATGAACTTCATTCTCTACAATTCTCATAATGATTTTTGTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 20594117 5' - roo 356 2 52.78 AACTGCTATCTAAACCACTCGGCGTATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTA:1 + chr2R 19553213 5' + mdg1 80 2 80.00 AAGTATCTGCAACTTGACTGAGGAAAAGCAGCGATTGCAGTTGGAGAAAAGCAGGCAGGGGATTGGGAGTGGAGACGGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr2L 4174083 5' - roo 399 1 72.57 GATTGGCTGGCTAATTTGGGTTGTATTCGATATGTCGGATATGCAAAAGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTTGCTTGGTT:1 - chr2L 12079695 5' - mdg3 5438 2 60.15 CTCGGAAAAACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACAC:1 - chr2R 21402688 5' + mdg3 69 2 61.64 GGCATGTCATTTGGGACGAAGCACGGCGCTACAGGACGAAGCTCCGCCGACACACATGACTAACGGCATGTCAGGAGCACATGCGAATCCATGCGGTTATGTCCTTCCACTTAGCGTGTGCACATATGTGTGTGTGTGTGTCTTT:1 - chrX 3985860 5' - accord 7029 2 76.55 CTATTGGAGATGTCAAGATGGGGCGGTTGCTGTTTGTTCTTCTGATTTGTTCCCCAATACTGTCATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGG:1 - chr3R 7739535 5' - I-element 5301 1 56.16 GAAAAATTGATTCAAGCGTCCTTTTTTAATTAAATTAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGATAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chrX 13786941 5' - pogo 2033 1 71.21 ACAGGAAATGATGCTACAGAAACCTATATATTGGGTTATATACAAAATATTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTG:1 - chr2L 11574902 5' - Max-element 286 2 58.62 GTCGATGATTCAAACGAATTACACACTTAACAGTTCGGTAGCCGCACACAACAAACATCAGAAACATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 + chr2R 10781128 5' + FB 35 1 56.00 ACTTTCCACTTGGCATTTAACGAGCATGTTAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 12867249 5' - roo 387 2 58.22 AAAAAGAGACGAAGCAAAGCCTTTCCCGAAGTTCAAAGAAAAAGAATTCCCTGAAAAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAAAATAAATAAATAACAAAAACGAAGATCTCGAAATGGTAATTGAAGACAGCGCAACTAATTCTG:1 - chrX 22404232 5' + G4 137 1 54.79 GGGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 17305450 5' - roo 9017 2 61.94 CAGTGCAAATGTTGTGGGTGAACTTAATAATGGATACATTGGCATCACTTGCATTAGCAACTGAGTTTCCTACACCAAATCATTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGAAAATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACCTC:1 - chr4 349657 5' - Tc1-2 129 1 52.74 CCTCACACACACACACGTGCAAACAGGTGTGAGCTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chrX 4038863 5' - hobo 2922 1 58.11 AAAAATTAAAAGAAAATACTCGCAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTGTACATCAAACGCTGATAAGGCACCG:1 + chr3R 32025478 5' - accord2 7193 1 78.30 GCATTTGGCCAGTGTCTGCCCACAGATAGCGCTGTGGTTTCCTTCTTCTCCACGCTGCAGGTGTGATCAGCATCCAAATATCTTTGAATTTGTTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACACA:1 - chrX 8084127 5' + F-element 39 1 67.12 GGCGTCAAGGAATGTTGGCTTAGTGCACACTGAAAAATAACTTTATGTATGAAATTTGGAGCAAATGGCTTCAGAACTAACTAACTATAATTGCTTAAAACATTTTCTCCGATATTCATCAAATTTTTTTTTTTAATATTTTATCT:1 + chr3L 2312719 5' - BS4 729 1 80.82 GTCCACTGGCTACCGATTTCACTCGCAACTGCAACTCGCTGGCTGCAAGTATGCATGTGGATGTGAATCTGGACTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCATGATTACAGATAACAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAA:1 + chr3R 11515404 5' - Cr1a 4201 1 54.48 AAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACATCGTTGTCGTCTGTA:1 - chr2R 8157237 5' - Transpac 240 2 75.81 ATTTAGAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr2R 10695902 5' - roo 9038 1 60.96 ATTATATTAAGGGGCTTTAGTTTGCGCATTTAAAAAAAATTTACTTATATGCTTATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTAC:1 + chr3R 24729576 5' - Juan 4153 1 62.07 GGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGT:1 + chr3L 24152466 5' + HMS-Beagle2 6969 2 76.71 ACTGACTATAAGCAACTATGGCATACGGGGATCTATCAAGGCTGAACTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCA:1 - chrX 11471522 5' + jockey 4749 1 66.44 CTAGTGCTAATTTTTTATTTTTTCGAATTTTCCTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 + chr3R 13505473 5' - opus 462 2 66.67 GGAGGCCAGTTCGAAACGGACAACTTATGAGGACCTCCGGGAAAAGTAATTGGCCATGCATATGCGAAACTCAAAATGATTTAAGCGCATTTTGTAGACCAAATTGCATGAGCTAGACATACATTCTTATTGCTTAATGCTAGCTT:1 - chrX 3531646 5' - invader3 117 2 73.29 CGGGTAAGCAAACTCAAATGAAATGCTGACACAGCGTTAGTAATGTGTGTTAATGTTACGCTGTGGCATAAATGCAATTATATTGCAGTTATTGCAGTTGCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTA:1 - chr2R 17392144 5' + BS 5016 1 68.49 AGGCGGGTGGTACGAAGAAAGAGACGGGACAAGCACTTGACTGTCACAACAAAAGTGGGATTCTCAACTTAAACACTACTCCAA:1 + chr3L 14453193 5' + springer 458 1 67.86 GTCCTTAAAAGCGTACTGTGAGGTGGGATAGTTCAGATCTTTACTGCTTTCAATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 7539563 5' + roo 8697 2 63.70 CTCAACACTTAAGCTTAGTGTTGTCTAACAGTTTCATTGCTGGCTGTATGTCCATCGTTACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAG:1 - chr3L 22721179 5' + INE-1 28 1 67.81 AGTTCACTGAAAAAAAATCGCATCTCTCACGGCGAACACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chrX 958028 5' - roo 325 2 78.08 AGCTAATGGGTTTTATACTAAGCCAAATATTTTTGCACAGCTTTGTTGTTTCATTTATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATA:1 - chr2L 1260057 5' + Burdock 11 2 72.14 ATATTGAGTTTACTTTTCCCACCATGCAACACAATCCATTCGTTTCTGATGCAAATTTAAAGGCGTGGCAACGAATGCGAATGGCACTAAAATAAACAAATTATAAGAACCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAA:1 - chrX 19389088 5' + Idefix 7144 2 59.85 GAAGCGACTTTTCACTCCGTGCTCCTGCTGCCGCCATTGAGTGTCCTCTGATGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 - chr3R 26520462 5' + FB 17 1 58.70 TTGCATACTTTTGGGAGCGCATAATGACATTTTATTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTCTACAATGTGTCTTGGTTACT:1 - chr2L 3890197 5' - jockey 4911 1 78.77 AATCATTCTTTTTAATCTCACCATTTGAAAGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 - chr3L 16496694 5' + jockey 4771 1 74.36 CCATTTCGCCAGTAAATGTTGTGCACAGCAATAAAAGGGAATGTGAATGGCGACAGGCGACAGGAGGCGCTGACACTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGTCAGCTGTG:1 - chrX 4305889 5' + gypsy12 46 2 53.85 GTATCACATAAAATGCGTCAAATAAAATTTAAGCCATGAAATAGTACGATATAATTATATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2R 8305171 5' + roo 8685 2 69.86 CATCTACAATTCAAATAAAGTGGAGCCTCACTAATGCAACTTTTTGTGGAGGTTCAAAGGTACCTTAAAGTAAGGACCTACACTTATTGCATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAA:1 - chrX 7626580 5' + pogo 1669 1 60.96 CTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATG:1 - chrX 21667918 5' + gypsy2 6551 2 70.25 GACGATCAGCGGTGGAAGGAAGTGCCGGTGGAAGACTAGCCGTTCCGAGTGGCCGCGGAAGACGGGTACACGCGAATGTTTTATTATTAAGGGGAGGTCGTTAATGAATAAGGTAAAAAGAAGCGGACCACGATGGTTCCCTTGTG:1 - chr3R 2894739 5' - Q-element 491 2 53.42 ATTTGTTGTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCA:1 + chr3L 27356043 5' - Tc3 1675 1 66.21 GATAAGATGGTCAAAATCACAATTCCAAAGGCACCAAAGGAACCACCATATGTTCCGACTGGCATGTTTCCCGATATCTGTGAAGATTTTCTTAGAATAGAGGAAAGCCAGCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATG:1 - chr3L 20973339 5' + hopper2 1265 2 72.41 CAAATTGAAGAACCATGTAACAATCTTATTAAAGAAAGTCAGGAATGTAAACCAAGAGACTGCAGTGCTGCTGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAGTTTAATAATTCGCTTAAAGCACGTTTGATCAACAAAATTTCACAA:1 + chr3L 23729622 5' - S-element 350 1 63.01 TGTGGTATTCCTTCATTTATTACAATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:2 - chr3R 16913471 5' + pogo 50 1 57.53 AATTAACCAAATAGATAGAGAGTCAGCGAGGCGCAAACTTAAGCCTGGCAGCCGTTGTTGGGGAACATTCTGGGACTTGCCTAAAACTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2L 15988102 5' + roo 5 2 77.78 GAATCGTTCCTCGGCCTGACACATTTTTTACTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 - chr3L 22978678 5' + 1360 15 1 74.66 ATGTGAAGTGTTTGAAACTTACGAAACTTGAATTATTGAATTCTCGGTTCTGCCAAATAAAGTCATCTTTCCATGGCATCCTGCTAAGGAGCTAAGGATTATATCCCCCATCTTATGATGAATGGTGAAATTCTTTCGAAAGAG:1 + chr3R 5120969 5' - I-element 285 1 77.78 TGCAACGCCCGGAAAACTTAGGAAGAGGTGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 - chrX 5858970 5' + hobo 85 1 73.97 AAAGTCTTACATGGTGACCAATTACCTTAGACAATAAGAATAACTCTTAAGTTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 + chr3R 5453600 5' - 412 451 2 55.48 ATAAACCTTCACTATAGACTACTTCGCAGAAAACTACTTGCAATCACTTCTCTTCAATTCCAAGCCCCCACAATGCCGGTCATTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1 - chr2L 436581 5' + copia 4907 2 58.90 ACTTTTCCTTTAAAAAAGCATTGCATACTTTGCAACAGCATTAAAAGATACTTCAATCTTTTGTGTGCTGAAATTGAGAATGTATACATATTTTTTTTTTAAACTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAA:1 + chr2R 8642863 5' - Doc2-element 4734 1 60.27 CGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCT:1 + chr2L 17250706 5' + opus 5 2 70.10 TTCGTTTTGCTTTGAGTAACGAGTTGCCTGACATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2L 686110 5' - roo 9047 1 66.42 GTGGCAAAGGCTTTGATTCCATGCTTTGTTTGGCCTCTCAATTAGTTGCCTCATTGCATGACCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGGCGG:1 - chr2R 20865761 5' - 412 456 2 50.41 TATCAGAAAGAAAAAGAAACAAACGAGACCTAAAAACAACTCAGAATAACAAAAGGAGGGAGATGTAGTATGTGCCCATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3L 16359742 5' + 412 7084 2 55.65 GGGAGAAAATTGACGAAATTTAGTAAATAGCTAATTTCAAAATATTGCATTACGGCAAGTGCACATACATACATATATGTATGATAAAAGGTTAACTTTAAAATTAATTATAATTGAATCGAATCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCT:1 - chr3L 2815348 5' - F-element 223 1 80.14 AATCTTTTTTTGATGGGCAAGATTTATTCTTGTTTCTAGTCGCGGGCAAATATCCCGTATTTTCGGCGCATACACGAGTTGTTAGAGAAAACCATGTCCGACTGTTCGTTTGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCAAG:1 - chrX 3377274 5' + INE-1 152 1 61.81 ATAAGCACTTTGGGGTAGATTCCTCAAAAATCATAAATTATTTTTTCAACATTAATTAAAGTTACATAAAATAGTAGAAGTTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3L 10133480 5' + 412 7094 2 57.53 AAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAA:1 + chr3L 24152432 5' + HMS-Beagle2 6935 2 53.42 AGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCAT:1 + chr3L 2724977 5' + Ivk 60 1 52.74 CAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 - chr2L 2276760 5' + F-element 86 1 79.53 CAAACAAAAGTTCGTATTGCCCACTCTGAGTCACGAACAAAGTGTACGTGCTTCTACGGGCACATGGAAAACCCATTGCTTAAATCCAATGTTGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGC:1 - chr3L 24152579 5' - HMS-Beagle2 7170 2 66.44 TTTCACAAAGTTTCCTCCCCATCGCTCTGCTTAGTTGCTCTGTGAGTTAGTTGGCGGCTGACAAAACTTTAAGTTAGAGTTTTCCAGCTTCAAGTTGAACTTTGCAGCTCACGTGGTCAATGCCTTCTGCACACATATG:1 - chr2L 18878836 5' + Stalker 7080 4 70.50 CAGATTTACAAGGACACTGTGCAATTGAAGCACTCCTCCATTTTATTCCTTCCCTGTACATCTTAGCATACCAACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAAC:1 - chr3R 26246952 5' - 1731 302 1 71.23 ATTAATAAAATTAAAATAAAAATAATTGAAGTAATTGTTCAAATTATAATATTAGAATATTTTATAATAATAATTATAGGTAGAATTAATGCAATCTCTACATCAAAAATTAAAAAAATAATAGGAATTAAAAAAAAA:1 + chr3L 20924503 5' + Doc 4691 1 26.09 CAAGTCTCGAATTCGATTCAATTATGTCAATTATAGGAGTCAACCACGGACCAGTGGACCCCATCCGGTCCATTTGGGGCGACAATTGCTGATGCTGGTCCGCTTTGAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAAC:1 + chr2R 13965569 5' + Stalker 6956 4 72.60 GGGGGATATAATTTAAAGCACTTCTATTAATATCTAGCCATTATTCCAGTAAATGAATCAGATTTTTAGCTAATAATTTTTTAACTATTTTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chr3L 13374079 5' + pogo 27 1 62.33 CGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chr2L 22015989 5' + Tirant 36 2 61.54 ACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3R 24476365 5' + 412 37 2 55.75 GAGGTGCAAGGCGTGGAATTGCGGCTGAATGGATTAAAGCCTCTGAAAACATGAATTTCCTTGCGCCATTATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCG:1 + chrX 10567725 5' - roo 9062 1 76.87 AGTTTTGTCTACTTTTTGGCTTTTTCGGGTTTGCCAGACTGACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGA:1 + chr3R 17495728 5' - Quasimodo 7314 2 58.22 AAAGGGTGGCTTCTGGCCATTGTACAAATGGGAGCATAAATAATAGCGACTGTCTGCCAAGTTATGAATAATAATGACAACAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 25387891 5' - roo 9031 1 57.53 TACCCCTATCACACCGAACGCATTTCAGAAGACATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTTAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTG:1 + chr2R 5260666 5' - 1360 3263 1 78.08 GTCAGCTTGAAAGTGCAGAATGAGGTAAATTGTTAAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3R 25304745 5' + roo 84 2 81.38 GCCTTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAAAGTTAAACAACAC:1 + chr3R 9160676 5' + copia 25 2 57.14 CAGCAAAAGTTCCCAGTCCCAACCACCCACACTTTTTGATGTGATCAGCACAAAGTTGCTCATTGTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATT:1 - chr3L 9907448 5' - jockey 4940 1 51.03 CTTTACCTTTTGTGGCTTATCACCTGGTCCTGCACCTTCAATCACCCACTCCCCCTCGTCGCCCACCTTTGAGGCATATATTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 + chrX 17731946 5' - pogo 2096 1 77.19 AATGGACTTTGTGTACTTATGCCACTCACTTGCTAAGGAACACGTTTACGAAGCCAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGCCGG:1 + chrX 15843414 5' + micropia 5405 2 51.30 TCTCATTTTCCCCCTCCTTTGATTGATGGCTCTGTATAATTTTTCAGGGGGAAAAAAAGAGCATAAATGCGCAACATTTTGTACTAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAG:1 + chr3L 10520905 5' + INE-1 28 1 74.55 AACTATGAAAAGCCCAAAGCGCAAATTAACCCAAACACCCACTCGCACACACACACACACACACACACATATACA:1 - chr2L 7451347 5' + accord 186 2 80.00 ACACCCATACCACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTCTGATCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAA:1 - chr3R 20175778 5' - hopper 1336 1 71.23 AATTTGTTGTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCA:1 + chr3L 27356042 5' - Tc3 1675 1 66.44 GAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chrX 7515712 5' - roo 324 2 78.57 ACGTGTATGGTATATGTATGTATATGCTGGGCACAACGCATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTAT:1 - chrX 12526021 5' + roo 8706 2 56.55 TGATGTGCCATTCCAAAAAGAAAACAAAGCAAACCAGTTCATACACCTAACAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTC:1 + chr2R 8395907 5' - pogo 2033 1 65.07 CTGAAGCTATAAACACAAGAAAATCACTTAGCTTAAAAAAGATTTCAGGTATTTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 96450 5' - roo 396 1 76.71 GCATGGTGGATGAGAGCATCACTGGTCCACTCACCCAGCGTTTGGTGTCCGCCTTAATGGAGGAGTCCCTGATGACGCTGCCCAGCGAACAGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTC:1 + chrX 18086927 5' - FB 30 1 63.01 TTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGACACTTTGTACCTTTTGTTTTTAAACCACAAATAG:1 + chr3L 27415227 5' - transib2 2750 1 66.44 AATCTTGAAATTCCAGAGCACGCATTTCTGTAATCGGTACAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr4 1219234 5' + 1360 51 1 67.83 GGATGAAAAATGGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2L 6717225 5' + jockey 10 1 75.45 TATGTATCCTAAGACATTTGTTACTTTATTGTTTTTAGAAAGCGCGTACGTATGTATAAATTTGCAATTTTTATTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:2 - chr3L 20713074 5' + roo 48 2 56.16 GTGCAAACAAGCCAAGCTCGAGTGTTCAATTAACAGCAAATTCGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 - chr2L 2276836 5' + F-element 29 1 68.49 TCTGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATAT:1 + chr2L 17550610 5' - Transib-N1_DM 444 1 79.45 GTATTTCTATAATATTTCTTTACTCTTATGGGTCACAGTGGGGCATCGATATGTGCGCCCGTTCCGTACTTTTGTTGCGGCCCACGTCAATATGGATGTGTGTGTTTGTTCTGTGTACAATATAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 19375128 5' - accord 7031 2 80.69 TTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3L 96502 5' - roo 343 2 60.96 ATATGTTATATATTGTCAAGAACTGGTGTGAACAATATAGGAGCATTTATGATCAAGAGCTATAAATGTACTTTTTTCCGTTTATTATTGATTTAAAGTTTAAGTGAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGT:1 - chr4 96881 5' - 1360 173 1 63.70 TCTCTGTTTCGATCTAAGCCATTCTTTGTTGAGTTATCCTCTGCATTTGCTTGGAATTTAAATGACAGTATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGTGTAAGCCCAAAAC:1 + chr3R 7739430 5' + I-element 53 1 56.85 CCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTACCTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr3R 24476333 5' + 412 7107 2 79.59 AAAAAAATGTTGCCCGATTTTATTGGTGGCATTCAAAAGTATGCTATGGAAAGTTCCACCGAAGCTGCGATAGAAGAGACAACCGACCACCGACACCCGTTGTGGTGATGTGATAATGATAACATAAAATAAAATAAAGCAAATTA:1 + chrX 2663897 5' + TAHRE 32 1 78.08 ACCAATCTGTGCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr3L 15026620 5' + opus 7034 4 60.27 ACTCCCTAGCAGCTTTTAATTTTTGGCTTCCAAAATGTTAATCAAAAATAGTTGAATTTCATGGGAATTTTTAAGTTTTCTAAACATCTTAATAATAATTCTTAATATTTACAAAATAGCGTGCTTAACTGACCACAACACAGATC:1 - 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chr3L 14553173 5' + roo 8754 2 79.45 GTATGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACA:1 - chr3R 2526465 5' + gtwin 6958 2 56.85 CATTAGGCATTCGGGGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAA:1 - chr2R 4368663 5' + Doc4-element 15 1 46.77 ATCAGGAGCACATGGTCACCAGCAAAAGTTCCCAGTCCCAACCACCCACACTTTTTGATGTGATCAGCACAAAGTTGCTCATTGTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 - chr3L 9907467 5' - jockey 4958 1 54.11 TAGGATGGTTGGCACCAGTCACGGTTTCAGGAAAACTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 19445930 5' - roo 8986 2 80.82 ATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCACCTGGAACACCGCA:1 - chr2L 22015978 5' + Tirant 8173 2 74.80 TAGATGATGTTTTCCTTTCCATTTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACGCTGGGAC:1 - 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hopper 1370 1 53.42 AGCAATATTTGGATTTAGCCGTCCTCTCCATTTCAAAATTTTTCATTGTTATCATATTTCCTGTAGCTAAATCCACATCATTAACCTGTAAGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGGCAATTGTAAA:1 - chr3L 25263327 5' + Burdock 6080 1 67.81 ACTGACCCGAGGCTCTGGGGTGTCCACGGCTACCCGTCTCTCCGCAGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAG:1 - chr3R 8258918 5' - Tirant 8438 2 68.61 TTTTGCCATTGTATTGGTACCAACGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 + chr3L 22400225 5' + 1360 1 2 81.82 ATTAATTTTTGTTTTTGTTTTTCAGGTACATTTGGTGGCAGCTAATCTGGAGGGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTAAGGAGACAGAA:1 - chr2L 11254964 5' - TAHRE 10417 1 59.55 AAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCG:1 - chr3L 23702277 5' + G4 41 1 54.79 GTTTACACCGTGCTTCTTGCCAAGGGGAGTTTTAACCCCAATCGTGGCAGTTTAACGTTAATTTTAGTCATTGTTATGCTGTTTTTTGGCTTTTAGACAGTAACATG:1 - chr3L 1730527 5' - HeT-A 5870 1 73.83 GATGGAAGTGTCGACAAAGTGTTTACTCCTCTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr3L 7995399 5' - P-element 2838 1 52.74 ATGGGGTTGTGCCCCGTTAACCAGTGGAACCAAGGAATGGGTCTCTTCAGTCAACCATCCATTCACATGTACCCGTTTAAATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chrX 12525879 5' - roo 9034 1 59.59 CCCCACTTTGGTTCGCCCTCGAAAGTGTGCTACGAAAATAGATGAGGTTTTTCATGCTTTTTTCGTGTCCATTTTTCATCTTTGTTTTCGTAGGCATTCTATGATTTGGTTTATGTCTGTTGCTATGTGGTAATGTATGTGTGTGT:1 - chrX 13207297 5' - Quasimodo 45 2 67.81 AGTTGCTTCCAAAGAAAGGGCATTCAAAAGAAAAGCCGTCCACTTTCATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGACTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 + chr3L 15276600 5' - hopper 1396 1 67.91 CAGACGATAGAGATAAAAGCCAGTGCACTATGTTAAAGCGAAACACCTGACTAGACCGATTTTGGAGAGAGATGAAACTCCTGAGATAAAAGCACCGAAAAAATACTAAAAGTTAGCTGCGATAATTCTTAAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3L 1008935 5' - hopper 155 1 71.92 TATGTTTCGCAAAATGAAATGTCATTTCAAATACGTGATCTCGCACACATAGCCGCTTCCGAAAGCCGAGGATTCCAAAAGGCTATATATATATAAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 - chr3R 17495880 5' + Quasimodo 19 2 71.92 CCGGCGGGCGAGAGAGTTCAGTAACCTCCATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGCACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 - chr2R 10865276 5' + blood 33 2 61.64 TGGGCATCTTGTGCCACAATTGTCCATGTGGGAGTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 + chrX 1690003 5' + 412 86 2 75.34 AAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAA:1 + chr3L 25482868 5' + accord 30 2 61.65 GTTGATCTTTGTCTTTGTTATTGACGGATAATTTATTCGACTCACAAAAATTAATAACTACGTAAGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATA:3 + chr3R 11762415 5' + rover 7003 2 55.48 ATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACACATCATCGGACACTCAACCGGGACGAC:1 - chrX 21852446 5' + Tirant 48 2 55.74 GGTGGCCCATAGGCTAAAGGATATATATTATGTACACATATATATGCGTGTGTGCGTGTGTTTGGTAATGCTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCG:1 - chr3R 22204812 5' - F-element 453 1 51.54 CTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGAGAGCAGATAGACGCGATATAGAATAGAGAATAGAAACGAGAAAATGAAATAATGTAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTATTAAAAAAGTTAAA:1 - chr3R 2533930 5' - Cr1a 4270 1 66.44 ACGAAGTGATTCTTCGTAAGTCTTTTAAGTCTTGGATTCGGCATTTGATTCACGACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:2 - chr2L 9485717 5' + 412 7081 2 56.16 TGGAAAAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr2L 76028 5' + roo 8708 2 57.86 CGCAGGATGGGTGAATGATTTTTTGGGGAATTTAATTACTGCAAGGATTTAATTATGTCATCCCCAAAGGAGCTTAGTGCCACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCA:1 + chr3R 30636049 5' + roo 8863 2 56.85 TGCACATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGT:1 + chr3R 19859601 5' - opus 7436 2 63.01 TAAAATTGGTTGCAACCTCACAACTTTGCTGGGCTGGAGAATCTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGACTCGCGTAAGCGACTTCG:1 - 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chr3R 24628042 5' - INE-1 30 1 49.62 GTCGGGAAGGTTATCTCTGGGGAACGGCGGATTCATTGAAACCTGAAGCCAGAGTGTAAAGTCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 23765365 5' - roo 9017 2 56.92 GATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1 - chr2R 19553277 5' - mdg1 7396 2 60.27 GCGAAAAAAGGAGGGAACTAATATTTTAAGAAAACTCAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTC:1 - chr3R 15711846 5' + diver 5974 2 74.66 AACTGCGACGTATCTCAAATGTCATGAGATCCCGCCGACCCTCTAGTCAGATGGGACAGCCTGAGAACGAATTAATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTATATCACGTCTATATCTTCTCGCG:1 + chr2R 24909551 5' + Cr1a 4369 1 57.72 GATATGGGCTCATGCTATACGGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCATCCATGCATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chrX 21994008 5' + 297 6626 2 54.48 TGGCCATCACATCGAATTTTCCCATTCTCGAGAGTCATTTTTATTGCTTTTCGCCGCTACTTACTGTGTGTGGGTTATTTTTTTATTTTATTCGACTTACGGTAGAAAAATTAAAATCTTTTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAG:1 + chr2L 10551918 5' - Rt1b 5095 1 52.74 ATTTGTATATCTTGGGCATTATCCTCGCATTACTATGCTATAGAAATTTAGATACAGATGGGCTCCGGTTTGGGTTTTATTTTAAAAAGCGGTGACTTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3R 26191570 5' + hobo 23 1 64.38 GACGGGAATTTTAAAGCTTCTTCCAAGCAATACAATACTTTGATCACTTCGTTGTTGATGGAATTGTAATTACATAACTCTTTAGCCAATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 14201336 5' - roo 387 2 52.14 AGCACTTACAACTTTTTAAATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 + chr3R 9190433 5' + Tabor 6849 2 43.84 ACTCTCGTATAAATATATGGGTTTATTAATTCTTTTTTGTTTTTTTATCAGACGGCGACGCCGAAGTTGCAAGTAAACGAGGTCAAATTCATAATAAACTCAAATACAGTGGTCCCTTGAAGAGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAGCA:1 - chr3L 3545871 5' + Doc2-element 219 1 58.22 GCAAATAAAATTTAAATGGCAAAATAGAACCTCGAGCTAGCGAAATGATATTATAATAAATACAAACAGTTTGAAAAGGAATTGTACATCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTTGCCGTGATGCCACACCGGGCTTCGGCCTGGGCGCC:1 + chr2L 16989879 5' - Chimpo 4 1 59.59 CGAGAGTGGGAAAAAGACAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3L 18658900 5' - roo 338 2 67.81 GCTCAACTGTCAGTGTTTTTATTAGTTTGTTGCAGCATTAACACGCATAAATATTTATGTGAGGCGGTGTGGAGTTCCAAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3R 29645833 5' + jockey 12 1 65.07 TTATACGGAATTATGCGGAATTTTAAGAAGAAATTATAGTCAGCTGTTTTATTTGGGGCAACGAGAATGTATATAAAGGATCATTTAAAACCAGTTACTAAAGTCACTTTTTTTAAGGCATACGGAGTAGCTGAAAACCCCTTTGT:1 + chr4 353380 5' - BS3 1737 1 73.29 AGCCAGCTGTAAGGAAAAATTTCTGACTAGGATCGACAATATTTTTTTTGGCCAAACTGGGAAAAAAAAGCCATTTCGGCACTGGTCGTGTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATA:1 + chr3L 3006064 5' - pogo 1940 1 54.79 TATTAACAAAAATATTGTATAATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2L 76165 5' - roo 9052 2 69.23 TAATAAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 4173951 5' + roo 48 2 52.74 GGTACGTACCAGGGATGACTTTCTCTCGCGCTTTGCTTCCATTGTGGCCGATTGTATTATTTCAATGTTGCTGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACCATCCATATGTCCATATTGGTTTTAAAACTGTGTTGTATAACAGCACC:1 - 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roo 9020 2 54.79 GACTTTTCACTCCGTGCTCCTGCTGCCGCCATTGAGTGTCCTCTGATGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 - chr3R 26520457 5' + FB 27 1 52.58 GCCAGTGCATGTGTATTTGTGGGTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGAGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGG:1 + chr3L 22347037 5' - I-element 5061 1 74.19 TAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chrX 1103589 5' + pogo 38 1 58.22 GGGGAATTGGGGTTTTGCGACTGGGGGCGTTCGACAAAACGATCGTCATGAGATTAAGTCGGCAGAGACAAGACCATTATGCAAAATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chrX 6481394 5' + hobo 32 1 61.64 TATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3L 23986527 5' + opus 40 4 60.18 ATATGTTTTTGTGTCTTGAATGTTAGATGGCGTGACTTTTGATTTTTCCAGTTTTTCGCCAGGAACACTAGTTGCATATAATTTCATGACTGTGGAATATAAAAATGCTATTGAAAAGAAGTTAAAAAAAAGAAAATTTGAAAGAA:2 + chr2R 15339357 5' - FB 174 1 76.71 AATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGAT:1 - chr2R 8641596 5' + diver 5920 2 48.67 ATAATATTTTAAGCAATAGCTATGTAATTTACTAACGACCATCATGAAAGAAATATAAATTGATAAATTAGGTGTAAAAAATAAGTGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAACC:1 - chr2L 18193148 5' - mdg1 7428 2 58.90 GTCTAAAAATTTGGTGATTTCGGTGCATTATTGTGTGTACATAAGTCGCTGCACTTTTCGCCCTAGCTACTTTTTGTTTTTTTTTTCATTTTCGGTTTCTTCTTTGCCTACCGCCAAATTCGTGTCGTTTTGTTTGT:1 + chr3L 25439371 5' + G3 2 1 69.34 AAGAGGGACAGAAAGATGGAAGAGATGGTAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chr3R 19531294 5' - hobo 2892 1 73.79 AAGATCTACACGCCCCCGGATAATTTCTAAGCCTAAGTATCCTTCGCTTGTCTCAATGACACGTTTTATTTGGAAGTCTCTGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATACCATGGAGCTCCAGTAATGATTCCAAGAAT:1 + chrX 9622299 5' - Doc3-element 4396 1 65.19 AGTTCCCAAAAAACTAGCTTGTAATTAAAGTAAGGGTGCTGGAATTATCAACTGTCTTATCACACAAGTACAAGTGCCCATTAGGCATACAGAGAGAATGTATGAATGAATATGAGACCAAGTGGCTTCTTAATTATTAAGTACAA:1 + chr2R 11889492 5' - G5 4731 1 67.12 AGGACATGAAGTGGCCAAAAGGACGAGCCGGAGCCAGGAGGTCAACAACGCGCAGATAAGCAAGGAGACAACAACGCTAACGACACCGACAGCCAGAAGAGACCCACAAACAAAAAAAAAAAGA:1 + chr3R 22866810 5' + gypsy2 394 1 31.45 ATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTATGGCACACGAGTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCGCTCTCGAATTTTTGTT:1 - chr3R 10266137 5' + 1360 84 1 75.19 ATTCGAACAAGGAATTTTTTACATCAAGCACAACTATTAGCTTTCTATTTAAAAAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAA:1 - chr3R 1838265 5' - Cr1a 4110 1 61.97 AGCGGGAATTGGGTGTCTTAAATGGGTACGTTACGATGAGTTTGAGTACACTGAAATTGATCAAAGTTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr2L 17250855 5' - opus 7476 2 59.59 CTATTTGATCAGCACATTTCCCTTCTCCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 20744002 5' - roo 8989 2 82.96 GTAGTGGTCACACCTATGCTGCACTGCAGCTAGCATGTTCGCACTGGCACACTGCGGTCACACTGGCTTCGCTCAGCAAAATATTGCTTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 - chr2L 3466121 5' + P-element 32 1 62.33 GAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:2 - chr3L 12867344 5' + roo 88 2 79.45 ATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 - chr3R 10472800 5' - mdg1 373 2 50.70 GCGTATAAAGCTGTTTTAGAGGAAGTATCGTTATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chr2R 5923008 5' + jockey 4744 1 74.44 CGGGGGCATTAAAGGGAATTACTCGGAAAGTCCTATCTGTGAAACATTCCCCGTTACTCGGAGAGCAAAGTAAAAAAAAAGTATGTAAAAGGCTGAAGGAATCGTTTTTGACTATATAATGTTTATATATTCTTGATCAGGATTAA:1 - chrX 20806527 5' + INE-1 82 1 82.19 ATAACCTCCAAAAATATTCATACCGTTTACATACTTTAAATAGCAAGAAATGTGTTTTTATACCAGTTACTCGTAGAGTATACTAGATTTGTTGAATACTATGTAACAGGCACAAGGAAGCGTTT:1 + chr2L 20923069 5' + INE-1 33 1 48.00 ATTTTCCCCTTATGGCGATGCCAAAGAATGCAAGCAGCGAAAGAGCGAAAATTTGTTTTCATTGTTGAAAAATTCTGTGCAAATTTATTGAATTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAA:1 + chr3L 1404967 5' - Ivk 5357 1 71.01 TATTTATGAAAAGAAAGTCTATTAATTTATATGTCTTATAATACATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2R 8305228 5' + roo 78 2 73.97 GAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCT:1 + chrX 21772481 5' - gypsy3 6548 1 60.36 GAACAGCACAGCTGTTTATATATTACTGAGCACAGCTACCCCACACAAACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chr2R 7665838 5' - Transpac 5160 2 67.12 ATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTA:1 + chr2R 13644428 5' - Burdock 6332 2 68.46 GTAGGCGGTTTGGCCCCACTGCGATTTATGGTCAAAAGCAGCGTTGACTTGGGCGAACAAGAAGTGTGTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTCTTATTAT:1 - chr2R 14925790 5' - Rt1a 5073 6 74.31 ATAAACAATCTATAATCAATAAAAATCTTAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chrX 22725562 5' + roo 88 2 79.45 GCGTTTGTGTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTT:1 - chr3R 15022120 5' + Tabor 6903 2 58.90 TTAAAGGGTATTAAGAATGTCCATAGCTTTTCTTCTTGTATTTGTTTTTGGTTGTATCAAAACAAAAATCCAATCAGCGGGTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 23240328 5' + jockey 33 1 60.77 ATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAA:1 + chr2R 10315295 5' + Doc 110 1 77.27 CAAATTTATTAAGTACATTATTTTAGATACTGCTACTATTTGAAGATTCTTTAAAATTTGGCTGCCACGTTATATATTAAAGTGTATTAATTGAAATATTACATACGCGGCCTGCACCTTACTTCGTCCTTCCAGATATGACTTTA:1 - chr3L 19064239 5' - Helena 485 1 39.73 AACGCCGCTGCCGGCAGCGACGCGGCAGCCAAGCGCGGCTGCGAAAAAACTGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chrX 8891838 5' + P-element 2 2 70.89 TCCGTAGTTGTTCCCCAAAAGCAAATATGTATATCCAAAGATGAACATACATACATTTGTTTTAAGCGTTTCCGACCAAGTACATATATATATATTCTTGATCAGGATCAGTCGATCTAGTATGACCGTCGAGATCCCAGGAACTA:1 - chr2L 20923718 5' + INE-1 142 1 54.11 GAGTTTCCTCTCGCCTCGCTTGGACCTTAAGTGGATATTGCATTGTCGAGGGACTCGCGATCCTTTGTCTTGCCCAGCTGCTGTGGTCTTAGAACAATGAACC:1 - chr2L 8868419 5' + Doc 198 1 84.47 AATGCCAATATTTTAATAAGTCGTAGCTAATAATGTTGACATTGATTTTAATAAATGAGACTATATTCAAATGTGATAATTTCCAAAAGCGTATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCACAGAGAAAAAAAAAT:1 + chr2R 2942254 5' + invader2 288 1 67.12 TTTCGAGTGCACATTTTGGGGTATTAAATGCGATTTCGCTCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAG:1 - chr3L 11336416 5' - blood 300 2 71.53 TAGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 + chr2R 11489171 5' - mdg1 418 2 73.91 ATCTGCTCTCGGTCAGAAGCCACTGGGGCAAACAAGTCCGCCCCAATGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr2R 6842773 5' + roo 75 2 69.18 TATTGTTGAGTTTGCCCAGCATTGTCTATGCTTTTGTTGCTGCTGTAGTTGTTGTTATGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGA:1 - chr3L 5687050 5' - Quasimodo 6939 2 60.27 CGGGTTAAAAATAAGTCGGAATCGGATTCAGGCATAACAATTTCCTGTCAATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3R 31490907 5' - roo 407 1 78.90 GTTTAAAGTTTATTGGTGTTTAGTGTTTAACGAATTTGAGTTCGATTATTGTTTGCTTCTTTTTAATAGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATCATTGCGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGAG:1 + chr3R 21277614 5' - Porto1 4347 1 60.27 TATTTCCTGTTAGTATCTGATACTCTGGAAATTGGACTGTCGCGTGCTCTCTTGTTATTATAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAAAGGATATATATTCTTGATCAGGATCAA:1 + chrX 22601900 5' + INE-1 82 1 48.84 ACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr2L 16884803 5' + pogo 44 1 57.81 ATTGAAGCACACTCTCCGTAAACGCGATATTTTCGAATGGCCCCTTTTCGCCGAACATCTATGATATATATATTCCTGATCAGGAACAACAGCCGAGTCGATCCGGTCCTGTCCGTCCGTATGAACGTCAAGATCTTAG:1 - chr3R 20363173 5' + INE-1 136 1 64.03 TAAGGAGATGTTAAACTTTGGAATGTAACGCTGGAAAAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2L 75997 5' + roo 8683 2 76.03 CATTATATTGAAGAGAGGCAAGGCCCCCATTTCCGCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2L 1558646 5' + 412 7101 2 68.52 AAAGCTCATTAAAGTTTTGGTTCGATAAGAAAAAATCGTCAGTGAATCACGAGCATTTGCCCCGTTTCCAGTTCGTAATCCGATCAATGTAGGAAGGATGCATACATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 - chr3R 29733178 5' + opus 10 2 77.24 GCCAAATCAAACTATTTTTATTGTTATTCCTTGGCTTGCAAGTTCAGAAGTCAGCAACAATTTAATATATTTCTAAATTTCCTTGTTGTGTAGTGATTTTTTAAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATTCTTAAATCATTATGTATA:1 - chr2R 12745451 5' - Porto1 4391 1 65.75 CCTACTTTGCAGCTGACAAAACTTGCAAAGTTGTCTGTTGCTTTTTAAAGGTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACT:1 + chr3L 22978540 5' - 1360 3323 1 65.97 CATAATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGAC:2 + chr2R 13644419 5' - Burdock 189 2 65.75 ACAGCTGGCATTGAAATAAGAATATTTACACGGATATCACAAATATGGCAGAGGGAATTGCATTTAGACTCTTGATTTCATATCTTCATATCTTATCTTGTTCTTAAGAAAGTAAACTATTTAAATTTGATGTCTCAATACTTTT:1 - chr2R 10602768 5' - Tc1-2 209 1 72.41 TTATGTGAAGCTGCAGCAGTTGCCACTTGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCACCCAACGGTAAACATATATCAACAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATA:1 - chr3L 3968763 5' + I-element 4919 1 51.37 GGGCAAAGTAAACAGCCCAAGGGACGGGGCGGGGGTATCGAAAAGCTTCCATTCAATATTGGAATTTATAATAATAAATTTAATGCAAATTTAAGTTTGGAGCGTATTATTGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCG:1 + chrX 9389875 5' + roo 8926 2 76.43 ATTTGGTTAGATATAAAAATAGGTAATTGCATGTTTCGTAAACAAAAAATGTGGATTTAGTGACTACACCTTAGATTTGGATTTTTGATTTTACGCAGATCAATTGATATTCTTTCATAATTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATC:1 + chr3R 8293873 5' + INE-1 297 1 73.29 TAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 + chr2L 16884796 5' + pogo 55 1 58.22 TCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chrX 10645031 5' + jockey 56 1 77.66 AAATGGCCAATCTTCAATGTTGAGCTAAACCATTTATCTTCCGCTCGGTGGCTAAAGTTAGGAGCAAGCTAGTTTCCTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGT:1 + chr2L 14219258 5' - opus 7345 2 54.17 TTAAATGGGAAAGCTCCAAGCAGACCCGATTTCAATGGGGAATCGAAAACGCTAGTCTCAATTTCTTCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chrX 1061633 5' - 412 7505 2 51.85 GCAGAAAACTTAATAAAACAATATTATCAAACATTATCATTGTGTGCATTCCGCTGGAATGGAGGAACTAGTATACAAGATCAGAGGACGCAAATTAATATATTCGAAAGGAGACAGTTCTAGAAGAAGAGGAAAAGCTTGAGAAT:1 + chr3R 4719417 5' - Gypsy12A_LTR 2014 1 59.59 CGATAGTTCGATAACATCCCGCGAACAATCTAGCGGATGCAATCGAATTTAAGCTAAGTGTTAAATGGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3L 19836530 5' + pogo 42 1 55.00 GTGAAACCTATTCATATTTTACTTAAAACTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 10567876 5' + roo 8714 2 53.42 AAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:2 - chrX 1103709 5' - pogo 2033 1 66.44 ATAAATTAGCTAAGATTTCAGTCCCTAGAATGGCCACCCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTCCATATCTTATG:1 + chr2L 685967 5' + roo 8707 2 53.42 CACCCTATTGCCCTCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTGTTTAAATCATTTAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr3L 21144024 5' + jockey 4693 1 65.38 CGTTAATTTGGTCATATCCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATTGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATATCCCTATGTCCGTATGAA:1 - chrX 21587784 5' + INE-1 122 1 38.36 GATAACATATGCGGTAGTAATTGTAACAACTACCGGAATCATTATAGCCACCCAAATCCACACAAGACAACGTGGATGCTTTCGCTGCGTAGGAACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGTACTGAGCTCG:1 - chr2R 19956649 5' - Doc2-element 4423 1 48.57 AATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 + chr2L 16884797 5' + pogo 56 1 58.90 ACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAAC:1 - chrX 21667948 5' + gypsy2 6532 2 68.18 AGTTCGTTTGCATATCTTGGGAAAGCATCGCTCACCGTCCCCCAGCAAACGCACCAAAATCAACGTATTTACCCAATGTACAAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGC:1 - chr3R 8208808 5' + mdg1 7198 2 56.16 AATATACATAACATTTTCTACGTTAAAAAGAAGCATCTCGACTGATTTGTTTGTTTCGCTCTATCAAGCTCACGTTTCCGTTTTCCATTATTATGTAATTTGAATGATATGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATT:1 - chr2L 22130910 5' - pogo 1920 1 71.23 AATGCAAGCTGAAAGTTAAAAGTTTTCGGAGGTTTTGGAAAACCTAGATATTTTAGGGCAATATAATATATAAAGAGAATATATAATATATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTG:1 - chr3L 22408770 5' + Ivk 32 1 59.59 AGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTA:1 - chr3R 9190586 5' - Tabor 7254 2 65.73 AATATTCAAACATATTTATACCGAACAAGAGAGAATTCTATAGTCAAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 - chrX 21133127 5' - INE-1 548 1 92.21 ACTAAATCGGCGGAGAATTGAAAAGTCTAGGGACCACCTATTCGTGACCTCCACTTTCGCAAGCCTTCTATCAAAATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTC:1 - chrX 22638572 5' + INE-1 106 1 64.42 ATATTTTTATACCCATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGCTAGTC:1 + chrX 15408727 5' + INE-1 549 1 84.06 CACAGCCTCCGAATGGACTACTCACTGAGCTCTGCGCACACATTTGGCGGTATTGATTAGAAGTTGCGACATTGCGAATTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chrX 1523662 5' + jockey 20 1 78.47 AAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chr2L 22015966 5' + Tirant 8145 2 79.52 TATATAATCAAACCCAAATGCTTTATTGATGGCCTGACAAGTCTCGCATACGGATACGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr3L 19199629 5' - hobo 2905 1 50.00 CAATATCATCTTTGTGCTTTTAATTAGGTATTGCCAATGAAATTTGGAAAAATAAACATGAAATCAAATGAACTATCGTTTTAATTAGATTTTGATTTAAAAAAAAAACATAATACTCTGTAAGAATCATGCAACTCATAGTTAGA:1 - chr3R 9192617 5' - Cr1a 4163 1 69.86 ATCAAATTGAGGTAAAAGAAATCGCTAGAAAAAATAAACAAAAACAGCAAACCAGAACACAAATTAGCTGCAAAAGGGAGAGTAAACAAAACAAAAAGAAGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAA:1 + chrX 17260321 5' - Cr1a 156 1 52.05 AAATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGT:2 + chr3R 2169839 5' + gypsy11 4079 2 68.49 GAGAGAAAATATTAAAAAATACTTACAACCTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTT:1 + chr3R 25904193 5' - 412 400 2 84.93 CACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 - chr3R 9160779 5' - copia 205 2 48.61 AAAGTGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 10684729 5' - roo 9014 2 62.33 ATTATAGCTACCACAGCTGTCGCGATTCTCGCTATCCTGGAGCACCGGCCCAGCATGCGTGAGTTACGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGA:1 + chr2L 22015905 5' - Tirant 376 2 58.10 AATTGCAAGGGGCTAGGTTCATCAGCACCAAGATCTGGTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3R 24122623 5' - roo 9041 1 61.64 TATCTCCAATCTGATGAAACGGCAGCCTCTTTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGCATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCT:1 - chr2R 10816916 5' + jockey 4584 1 80.58 ATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2L 22015996 5' + Tirant 13 2 63.64 ACATTCCGAGAATCTGATAGTCACCTTTGTTCTGTCAATCTGAAACTTAGTGAATATATGCAACTACACATGTGCAGCATACACACCAACATAGGCAATTATCTGCGAGTTGTCAATTACTTCCAAACCGCTTGTTTTTAATTCGC:1 + chr2L 15003207 5' - R1A1-element 114 1 78.77 TTGTCAAAAAGCTAGAAAAAGGCAAAGTTTTCGCCCAAAATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTC:1 - chr3L 2725054 5' - Ivk 5317 1 69.60 GCGACAAAGCTAGAAGTTCATCCAATAAATACATAGAGGAAAATGCGAAGCTTTATATTTTGAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGT:1 + chr3R 27510066 5' - Bari1 1652 1 54.86 AAAAGCTTGCCACGAATTTTCCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTT:1 - chr2L 18279996 5' - gypsy5 7302 2 53.42 ATTATCAAATGTGGAAAATAATTTCTTGCCTCTAGTCTACTTTAAACAGAGAAGTTTAGCCGACTAACCAATTCGGGATTATCAGCGAGATCTTAAAGAGTAAGTCGTTTGTATTGGGTTGATACGACAAAAGGTCATAAATCTAC:2 - chr2L 6490944 5' - Q-element 675 2 43.15 GAATCGGTTGTGCCTCCGTCTGCGTGGCAACCGACTCCTGGGCGGGATCGGAAAACATTGTGGAAAGAGTAGGGTTCAAATCGGAAAGGTACGAACGATCTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCA:1 + chr2R 16288083 5' + Cr1a 4134 1 73.08 TAGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 + chr2R 4628392 5' - Transpac 5154 2 74.83 AAACTCTTATACATATAGCGTAAGAAATATACTACATAAGAAATTTTATTCCTCGATTCTGCTGCCTCTTCTCCAAAATAGCCGACTGGAAGAACTGTTTGCTCCAAGATATCTTTGAAGTGAACCAATATTTTGTGGACTGTCGC:1 + chr3L 17876931 5' + hopper2 366 1 69.18 CCCAATGCCAATAGCAACTGAATTGGCCCACATTCGAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATATTGTTA:1 + chr2L 9472011 5' + roo 85 2 73.97 GAATCACTCGCAATATACATGGGCGTCGTCCAATCCACGCGCCGGAGCTATTGACAATCTCGGCTAAACTTCCGCCGTTGTAAATTCGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAAACTTTAAATCTATATTATTTT:1 + chr2R 6895934 5' + 1360 246 1 51.41 GAATGGAGAGGCCCACTTGAGATGATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTTTGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3R 13612867 5' - 412 7505 2 68.48 AATAATTGATATTCGACTTTTTTACATTAGTTTTCGCATAAAAATTGTATTGCATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTAGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAAATTCATTTATTT:1 - chr2L 2657322 5' - diver 6044 2 62.33 AAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3L 14553174 5' + roo 8753 2 78.77 TCTGAAAACATGAATTTCCTTGCGCCATTATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chrX 10567766 5' - roo 9016 2 55.40 TTAACACACTCAAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCA:1 + chr3L 18467180 5' + hobo 59 1 58.90 ATATAAAAGCCAGAACGTTAAGCTTTATAGTTCCTGAGATATCGACGTTCAAACGGAAACAGGTCAGATCGACTCAGCTATTGATCCTGATCAAGAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr2L 20413738 5' + roo 25 2 66.44 ATTACTTGATTTAAGGTGCTGCGAAGGGTTAATTTCGGAAAAGTAAGTAGCATAATGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGCAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chrX 16579250 5' - roo 9002 2 62.33 ATTGTGCTGCGGGATCGGGACGCCACCTTAGATGAGATACGACGCATCTACTTCAAACTGGCCAAGTGGCATGCAGTCAGCTTGAAAGTGCAGAATGAGGTAAATTGTTAAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3R 25304670 5' + roo 8674 2 77.40 ATGCATGCACATACATATGCTATGCAAATTGCGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr2R 19554896 5' + pogo 25 1 65.71 TTTTTTGCGATACTTTAACATTGTGTGCTTTTTTAGGTTTGGTTTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3L 3784456 5' + Circe 7279 2 55.17 ATATGTGTCAAACACTTAATTTTTCTAGACGTAGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 + chr2R 4628361 5' - Transpac 263 2 54.11 AAATAAGACTGAAAAACATTGAGCCTGGGGAAAATCACAAAACAAAACGCAGCACTATATCGACTGACTTTTGATATTAAAAAAAAGTGCATAATTACTCCAGAACGGGAAAATCAACAAGTCATCAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 3842012 5' + R2-element 3582 1 68.75 AAGTTCAACAAAAAGTTGATGCCCAACCTGACTGGGCATATGTATCCATAGTTTATTATATCCACCATGACATGTCTATAAGGAGCTGACGGCATTTCTTCGACCATCCCAAAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTCAG:1 + chr2L 13269637 5' - Cr1a 338 1 74.66 GAGCATGAGAGAGCAAATTCCGGCCAGAGCTCAGCTTATCGCAACTTTCTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAACTTATATT:1 - chr3R 23765445 5' + roo 8736 2 66.44 ATACAATCAGGCTAGTGCTAGAAACCGGCAAAGGAATAAGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCA:1 + chr2L 15834414 5' - hopper 1389 1 67.81 ACTTTTGAACTTTCTTTTAAATGCCTTTTTCAGTCCTTTTTTCAAAGTCCTTCCACCGCAACCCTTGGCATAAACATTTCATTTCTTTAATACTCTTAATCATATAACCTTTGTAAATAAGTTAGATATTAAGAATCGTTAAAATT:1 - chr2L 20122486 5' + jockey2 3312 1 52.74 GGTCACGATACGCCCATCAGCTGTTTGCACCGACTTAAGCCGCATTTGCGGTGTTCGAATTCATATTAGTGCTAAATCCCCTCAATCGGAAAGGTATTTCGTTCAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTAC:1 - chrX 16577733 5' - roo 308 2 71.92 GAGGTTCCTCACCAGACCTTCAACGCCGATGACTTTGACCTCTCGGTCAAACGTTCGGTCTCCTTCCGTACTCCCCGTCTAACGCTCATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAACA:1 + chr3R 1031001 5' + Stalker2 176 2 61.60 GCAGCACTAGTGCTAATTTTTTATTTTTTCGAATTTTCCTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGCTCTCCA:1 + chr3R 13505467 5' - opus 7430 2 70.55 ATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTT:1 + chr2R 4260437 5' + micropia 5212 1 51.16 AAATCACGTGGCAAAGGCTTTGATTCCATGCTTTGTTTGGCCTCTCAATTAGTTGCCTCATTGCATGACCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr2R 20865768 5' - 412 440 2 53.42 CGGCGTCGCGTATTCTGTATTTGTGTGGTATTCATTTGCGCATATGTATGTATATCGGCCCGCTCGGCTGGCTGTGTGTATATATGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCGAAACCACGCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chr3R 17067951 5' + 297 28 2 65.07 CCATTTATTTATTTTTCTTTGGTACCACAAATAAAATGATTATATACTCAGAATAGTTATATACAGAGAAAAAAATATACATAAACCACCGATTTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr3L 2878392 5' + 412 24 2 40.41 GACGGCTACCGCTACAAGACTGTGCGCCGTCTGCGTTACCGCTACCGCCACTAGGCCTCCGATCCGAACCTGGGCACATTGAACCAAATTGATCCTGAAAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3L 22900044 5' + 412 7074 2 71.23 ACCAACTCTTAAATGTTATTGTACAACCAATCATATATGTATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chr3R 6711435 5' + pogo 58 1 72.66 AAGATCGATAAGATTGATTGGCAAATACATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGTGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATG:1 - chrX 4300145 5' + opus 7087 2 80.82 ATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chrX 2762605 5' - roo 8980 2 78.77 CTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 - chr3L 10133565 5' - 412 412 2 81.54 CACTCATCCTTCCTCTCTTTTCATCCTCCTGCTGCTGCATATGCTGAGTGTCCGCCTGTGTGTGTGCACGAGTGTGTGCGTGTGTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGCTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr3L 17175241 5' - 412 456 2 58.22 GTCCGCTTCTCGGAGGCCATTGTCTTTGGCAGCAGCCGCTGATATGACCGACCTAATAGACTTTAGTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTACGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr3R 12599128 5' - 412 458 2 54.40 AACTGGCCAAGTGGCATGCAGTCAGCTTGAAAGTGCAGAATGAGGTAAATTGTTAAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3R 25304725 5' + roo 8723 2 66.43 AAAACGTGGTCAAAGCATAGTAAATATTTGAACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATG:1 + chr3R 5208154 5' - hopper 1328 1 77.40 GAGGAGCCTTCATCTATAAAACTAGACATTGGCTTAATAAACGGCTCCCTTTCCACAGGCAGAATAGATTCCGGTATCAGTAATGGTATTTCCGTGTGCCGGGGAGGTGTAGTCAAGTATATACATATGTACATATGTACATATAT:1 - chr3L 4276979 5' + G3 4507 1 63.01 ACGGTCTATAATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATA:1 - chr3L 24208231 5' + Quasimodo 38 2 57.53 GTGTGTTTTGCTGCCTTTACTTTATTATACCCGTGCTGATGTATAAGGGTGTTATAGTGAACCTTTAGAAATATGCACAGCGCTGGTTCTGTCTCTAGAATATGTATGCTTAATATAAACCTTCCAGCTTTTATAATTCCTGAGAT:1 + chrX 303576 5' - INE-1 151 1 54.11 GATCGGGTTCTTGGCCTAAAAATATTTTCTGCCTTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 + chr3R 9160646 5' + copia 4891 2 68.18 TAGTTGCTAAAATTCTTTTACGAGAATTTGAGTAATGATATTATCTTGAAAACTTGGTCTAAGATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGATCATCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr2L 17029730 5' - blood 7374 2 62.32 GCTGTGTGCCACAAAGAAAACTATTTACAAGTTTTTTCACAAGTAAACTACATAATTGAGAGCTCATAAATGTGTTTATACGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAA:1 - chr2L 13294846 5' + G2 3049 1 50.68 AATACATAAATATTTTCTATTTGCCGTCATATTCCGTTTGCTGGCTTAAAATGGGGTACAGGTGAGAAGGGAAAGAAAGAAGTGTGTGTGTGTGAGATATGTGAGTGTCAGCAACGTGACGCTTATAAATTTATGAAGAAAACTCC:1 - chr2R 23193854 5' - INE-1 397 1 61.64 AAATTATAGAACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 + chr3L 2724953 5' + Ivk 34 1 61.81 ACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 + chr3L 7995450 5' - P-element 2809 1 22.58 AATCATTTGCGCCGATCAGTTGGGGTTACTTAATGGGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAATTTGTTGCTATGTTTATG:1 - chr2L 12553490 5' + 412 63 2 67.74 AAGCTGTTTTAGAGGAAGTATCGTTATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 - chr2R 5923001 5' + jockey 4721 1 73.79 GTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr2R 11133573 5' - 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chr2R 16403533 5' + copia 4903 2 62.33 ATCTCCCACTGCACCTCGAGAAATATAATTTAATAGTTTAATAGTTGAAGTCTATACTCACGAATCCAAATTATTGCACGTATAATTCCAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr2L 2052810 5' + blood 34 2 56.16 ACAATTTAAATAGATAGTGATTTATTCCGTTTCCTTGATTGCTGTATATTGGGCATTTTATTTGGCAAAATTAACAAAATCACTCTGGCCTTTAAAAAAATAGAAGAAAAACAAGAGAGAATACTTTAGTCGAGTTCCCCGACTAT:1 + chr3R 20125959 5' - INE-1 565 1 41.78 TCCTGCCTGGCTTTGGTCCCTGGATGGCACCCGCTCGTTTGTTCATTCGCCTTTTTTCCCACGTAATTTTTTATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:1 + chr3R 13607620 5' - I-element 5332 1 57.63 TTAGTAGTTTCAGGTGGTATCTTTAATATCACTCTTGATGATTCACATATATTTCAAGCATGATTCTTATCATAATCACATATTTCAATATCACACAGTACAAACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAT:1 - chrX 6707900 5' - hopper 1399 1 74.66 TGTGTAATTGGTGCCATTGAACCAGCAAAAGTCGACCCTTTTGTGAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTAT:1 + chr3R 15702914 5' - copia 5055 2 68.57 GGAGGACCAATACCCATACGTACTCATCTCATCCTATCCGAAGCCCCTGTCGGGCAGATCATTAAATGATCATTAAATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:1 - chr3L 15100072 5' - copia 251 1 56.12 ATGGTGGGATCTCGTTTCAATTGCTACATAAATGGAAAAAAAAAATGCCGAGGCAGGCAGAAATTTAGGTTGACATTCAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATAAAATAAAATAGCATATTAACTAATG:1 - chr3L 16580379 5' + 412 7091 2 58.45 GAACCCACCGGCGATCGATGGAAAGATGTTAGAGCCACGAACATGGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chrX 17805956 5' - roo 333 2 68.49 AACATACAGAAAGAGATTAATTTATGGATGTTGGAAAAAAACCCAGAAATCTTGGAATTATACAACCCATTAAAACAAAATAAAACAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAA:1 - chr2L 21762418 5' - INE-1 537 1 52.05 ACTTATTGATTTATTGCTTTTCTTCAAGCATGATCGTGGTATATTTTTTTTTTAAGTTCGTTTTTCA:1 + chrX 2491017 5' - gypsy2 421 1 58.21 GAAAAATCGCAGCCCATTGTTCTGATCTTCTCAGGCAAATCAATACCGCCGCTAAATGGTACATTGTAAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTT:1 + chr3R 31667655 5' - 1360 3200 1 60.00 CGTTCCGCATACATCGCCGCACAGGGTCCTGTCCAGGATGCCGCTGAGGACTTTTGGCGCATGCTCTGGGAGCACAACTCCACCATTGTGGTCATGCTGACCAATCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr2L 19729350 5' - mdg1 7423 2 71.23 GGGGGCTAATGAAATTTTAGTCTGTGTCGATCCATAACTGTAGTTATTAATTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTA:1 + chr3R 2474295 5' - Juan 4141 1 69.18 GATAAATAATTATAAAAACTTCATATTTATACTGTACTACTACTATATACTCACTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATATCA:1 + chr3L 9713944 5' + G2 2707 1 62.33 TTAAATGCAGGGTATCGGACTTCCTCAATTATTTTTGCTACCTTTAGCTGCAAGATTAGCTTAGCAATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTCCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCG:1 - chr3R 553052 5' - roo 452 1 78.46 CCTGCTAAGTCTATGTTAAAAAATTATGTTAAAATATTTGAGCTACAAAAAAAATGTATGTATCTATGTAAACACATGTTCGGCCGGATGAACGTCGAATTCTCGGGAACTATGAAAGCAAGAGAGAATGCTATAGTTGAGTTCCC:1 - chr3L 19483115 5' - INE-1 572 1 52.05 GTTAATAAATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAAGAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAG:1 - chr3L 23597300 5' + invader1 3575 1 59.83 GAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 7515731 5' - roo 9022 2 60.80 GTTGTCGCCATAATATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 - chr2L 22016023 5' + Tirant 8138 2 62.41 AACTAAATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATATACATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCTAGCCACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAA:1 + chr2L 12183692 5' + INE-1 154 1 72.14 ATATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCTTGTGTAAAATCGCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCAACTGATTTTA:1 + chr3R 30634945 5' - roo 9035 1 53.85 GCTCTGACGAAGTCTGACTTCATAGGCTAGATGTTGTGGGTCACAGAAAATTAAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAA:1 - chr2R 12265232 5' + jockey 4535 1 57.78 GTAATATATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATAGGTAGTCAAGTGTTGTACTATGGAACATATGCTACTATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTT:1 + chr2L 1692707 5' + Transpac 50 2 53.85 CTGTAGGCGCTTATGAAAGTGTGTGTGAGTCATGCAGGGACTGCAGTTAGACAAAGATAAAAGGAAATGCGCGACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCA:1 + chrX 17491440 5' + transib2 2818 1 50.00 TGGCAATCCCTTAAGATTCTAATTTATATCAGCGGCAAAACTTATTTCCTATTTCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3R 28272219 5' + Tirant 39 2 56.30 ATATCCGCATAAAATAAACACTTTAAAACCAATATTTAAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chr2R 20673596 5' - mdg1 7434 2 66.44 CAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr3L 25401030 5' + Doc 32 1 52.52 GGCACTAAGCGGGTTTACTTAGCTTTTAGTGCAAAAGGCTTGTTAATGATGCGAACAACAAGATTATGAATATTTAATTATTCAGTATTTCTTTATTTTAAATTCGTTTATATATTTTTTTGGTATTGAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 69083 5' - hopper 152 7 62.33 ATACATTTTATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATGAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAAC:1 + chr3L 24934260 5' + HMS-Beagle2 6906 2 69.66 GGTTATAGATGCCAATTCCAACACCACATAGTGCCTAAATATCGAATACTCCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGG:1 - chr2L 7727506 5' - Quasimodo 192 2 62.33 GGGGATATGGGTTGGTTACAAAATTAAAAATGATATGGAATCAACGGCGAACAGTGGGCAATGGGGAGCTGGGGAAATTGGCAAGCAAAAGATGCACTCGACCATGTTAACTTGCGAGATGCCCGGGAGTGCGGACGTGTGCTTGC:1 + chrX 10119102 5' + Bica 49 1 74.66 TAAGCAATAGCTATGTAATTTACTAACGACCATCATGAAAGAAATATAAATTGATAAATTAGGTGTAAAAAATAAGTGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 - chr2L 18193139 5' - mdg1 381 2 52.74 AAAATGGCAAGGAGACCAAGGATGTGCCACTGGCGGGCGGGAGATGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATATCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chr2L 18317461 5' - mdg1 389 2 54.00 ACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTACACTAGCTCAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGTACTCAACTATAGCATAATCTCTTGTTTTTATGTATGTAAAATCCCAAATACGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3L 24797354 5' - roo 9043 1 65.75 CTTTTGCTGTTGGTGACGCTGCGGCAGCTTTTCGCTGGTGTAGAACGCTTCGCTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAA:1 - chr2L 13287149 5' - copia 4985 2 56.91 GGATGGCATCAGCCTTGTTTAACTTCCGCCGTGGACAGGAAACGCACACACTCACAACCATGTTGGTCAACTTTCATAAACAGCCAAAAACAATTTGTCGTAATATATTTGATTGGTAGCGTTGTAGAATCTCAATATTTGAGTTG:1 - chr3R 12186938 5' - G4 3464 1 63.01 TGGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATT:2 - chr2L 22224605 5' - Rt1c 5399 1 53.42 CCTCTGTGTTTTTCCGTGCTTCGATTGTAAGCTGACCTCTCTCTCTGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGGAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGA:1 + chr3L 27413157 5' + invader4 3009 2 64.89 GCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 11609205 5' - roo 9019 2 54.86 ATTCTTGAATTTCTTTCCCTGTGAATATTGTTTCTAAAACATAAAAAAAAACAGCTTATGATTTGCCTTCGGTTTTTATTTCCGCGTGTTCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 + chr2L 12319213 5' - copia 223 1 59.59 ATTTATCTGTCATCGGGCAAGTACTGCGAAAAGAACTGGCGAAAAAAGTGATTCGCTAAGCTTTCCTGCAGAGTTCCTCATGGATTATGTCAAATAAAATAAAACATAATTAAAACCAAAGAAAATGCTATAGTCGAATTCCCCG:1 + chrX 21564938 5' - INE-1 570 1 65.52 ATATTAATTCGAGTTTTAAAGAATCAAAAACGCACTAAGGGTCCTCACGTTGGGCGCCACTTATTATGCTTATTACTTATTACTTATTATTATAATTATTATTATGCCTAACTAAACTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGA:1 - chr2L 10866692 5' - Gypsy12A_LTR 2252 1 58.22 GAAATAACACGTTATAATTTTTGTAGTATGCACTTTTAAATTTGTACACACGTCATCCGCACTCATTACAAAAATATCAAAAATGGCTAACCAATGCGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGC:1 - chr2R 5542477 5' + 1731 4333 2 70.00 GACGTTACCATAATTTTATTTATTAACAAAAATATTGTATAATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2L 76185 5' - roo 393 1 75.34 AAGGGAGTTGCAATAAACAAGAGAGTCGGGAGGCAGCCAATAAGTCGCTAATGCAATTAAAAACTCACACAAAGCAGAGGGAGCTGCTAATGCTAATAAGTCACGAGTTTTTAACAGAGCTCCAGTTAATATCA:1 - chr2R 9200477 5' + Porto1 34 1 78.36 ATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr2L 17136173 5' + hobo 53 1 71.03 AAATTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAACCCTAAAATTCTTATAAGACCATCGGTTCTCAATTAAAATGAGAGACCGTTACCAAAGACACTAGAATAATAAGATGCGTAACGGCCATACATTTGTTTTGCACTAT:1 - chr3L 18452532 5' - 1360 3356 1 76.71 GACCTTTCCCTGCAATATCTTTAATGCTTTCTCCCTTTCTCCTAGCCTGGCCTTTTTTCCTGTCGTTGAAACGTGTGTCCAGCGGAAATGACAACGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chr2L 13704644 5' - hopper 1392 1 65.07 TTGTAATTACGTAGGAATTAAGCCGCCATCAACATTTAATTGCTAAAAGCTTTACTCGCAACGGCGCAGCCACGCATACGATGGGGAAAAGTTGGGAGAACAGAATTGATTTCGGCCCTAAAATCGTCTTCTCGCACAACACG:1 - chr2L 14941878 5' + 1360 3202 1 69.93 GTGTAGTCATGTAAATGGGTGTGTATTATCAGCGGTCATTGTTTCGCGTTGAATACTGTGTATCAATTACCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGA:1 - chr2L 3294227 5' + hopper 48 1 51.03 TATCCATATTGACTATAACTAACTGCTATTGCTATTTACGATACGATAGTTACGTGGTACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr3L 13868587 5' + 412 7072 2 70.55 AGGCAACTCTTCGGGGCGCACTTCAATTTTCCATCACATTTTGGGCTCAATGGTGTGAAGAAAAGCGTTTTTCAGCGGGAAAGAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGACTATACTCTAAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTAT:1 - chr3L 9565484 5' - hopper 1139 1 55.48 TGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCATATATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTG:1 - chrY 3648870 5' - Stalker 6971 4 59.59 CGTAAACAAATTGTGCTAGCTTAGATATATATATAAGACAAAGACATTTTTCAGCATTCAACTCACCTTTTATTCATTCCTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCTTGTTAGACGCCGCTGTCTGCGTTGGTA:1 - chr3R 2833348 5' - rooA 221 2 55.48 CAATTGATTGCCATCCATACACTTATCCTTCTCGTGTTAATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTA:1 + chrX 16902276 5' - I-element 5271 1 72.60 CTACATACATACATATAAACGAAATATTCCTCACCAACTAATAACAAAATACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTAATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACACAAAAATTACTCTCAGCAC:1 + chrX 8803799 5' + Porto1 378 1 66.90 AGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr2R 11489172 5' - mdg1 375 2 55.22 CTTAATGAATATAATCTATTCAGTGCGTTCATATGTTGGCAGTAACATAGGCTTATTTATTATGAATATATTACTTAAAACTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGA:1 - chr2L 14441146 5' + roo 8662 1 47.95 GATTAATGCAGCGTTGTTGCCGAATTTCACAAGCAGCATGGCAAAAGGCAAAAAGCAGAGAAGCACAAAAAAACCCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAA:1 + chrX 12734570 5' + F-element 4209 1 56.85 ATTGTATACAAAAGTGGTTGTGGTTTGTTTGGTTTTTTGCCACTCAGCATATTCTTATTTTTTGGACAGTACTTATAATGTAAATACGTCACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr2R 1478274 5' + opus 25 4 67.12 AGGAGAGGCGAAACAAATAAGTTATGACTATAAAATGAAATTAATAAAAATGAAATTTATAAATAATTTGAAGAACTATTTATCTTAGATATGCAATGGCACAACAATTTCTGCTAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGAT:1 + chrX 20993247 5' + Cr1a 487 1 71.23 GAGTGAGAGAGTGCATTCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATT:1 - chrX 14951162 5' - P-element 2805 1 17.46 CTTGAATTTGTTTGAATTTTTAATTAAAACGCTTTCGTTGACTCATCCTCAAAGAAATCGCGATCGCACATATGTTTTCGGTATTTTTGGATATTCGATTTGTCGATTACATAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 + chr2L 436407 5' - copia 245 1 79.45 TTTGATAAGCTGCCACGTTAATTAAATGCAATCATTTTGGAAACATACTTATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 12138883 5' - 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X-element 4347 1 62.33 GGCCTAGTGGCAATATCAATTTGTATAATAAATGTTACAGGTTGCCCCAGCTAACTCATCCATTTATCCATGCATCATAATGACTTACCTAAGCATCCAGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:2 - chr3R 21706124 5' - 297 6957 2 72.60 CAACATTTTGCACATTTCGTATTTGTTATCTGTTTAAAGCAATAACATTTTGTAAATGTTTTCAATTTATTGTTTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 20712918 5' - roo 390 2 72.60 AACCTTCTAACCGCCCAAACCGCATCTGTATGTATATGTATATTAATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr2R 641812 5' - opus 7485 2 74.66 TTGTCGCTGGAAAAATGTGCTAAGGGTTTTCCTAGTGGGTCGCAAAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGT:1 - chr3R 21962021 5' - G2 2863 1 56.31 GCTCCTTCTGCCCACATACTCTTCGATTCTGGATGGAGTTTTGGGTATTTCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 - chrX 8012342 5' + 297 52 2 65.93 AAATGCCACAAAAAGTGTCACAAATTTATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr3R 28272469 5' + Tirant 37 2 71.11 CAAAGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAG:1 + chr2R 7727087 5' + BS 4665 1 72.66 CATATATATTTATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATGCACATTTTAGTTATAAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - 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roo 354 2 56.85 ATGTGGAAATTCTTTTGTATTAGCTGTCAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGACTAACTTAAATA:1 + chr2L 22121327 5' - I-element 5319 1 63.19 GAGCATCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTC:1 + chrX 21772500 5' - gypsy3 6572 1 66.18 ATTAAGCCCCACAATGAACTTTGATTCTTAGTGCATTAAAACAGATTATGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAG:1 + chr3L 20713976 5' + roo 481 1 59.66 TTGCATTCCCATTGAGTTTGTGCCTGGCGGGAATGTCTTTGTACTATTATTGCTACTTCAGTGATATTGGGCATGTGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTATT:1 + chr2R 19351940 5' - Burdock 224 2 60.00 GATTGGCAATTTTATCTGTCAACAACATGGAAGTGCTGTGTGCAACTGTTTTCGGGAAGCGGGATGCGAGAATCTGAAGGATATTTAATATAGTTATTTTACAATTTATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATA:1 + chr2L 658637 5' + Cr1a 4348 1 57.86 CATTAGTAACAGCGGCACAACGCACACAACGGTAATCAGTGACTGCTCAGAGAGAGAAAGTAACGTCTGTTTGAAACGAGCGCGCCGTCGCGACTGTCTCAGTCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chrX 8891709 5' - P-element 2886 2 82.40 TTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTA:1 + chr3R 3922966 5' + Cr1a 100 1 78.77 CAGGGCCTTGTAAACTCCTGTCCCATATCATTTATCCACTTGCTCATAACTGTAGAGGGAAATGTGTTCATGGATACTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCG:1 + chr3R 30510290 5' - gypsy12 10167 2 59.69 ATCATAATAAATAAGCTGGGGGAAACACTGAAAACAGAAACAGTTGATGCCACAAAAGGTAAGTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chrX 7980889 5' - hobo 2922 1 64.81 CTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACACTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2L 9472060 5' - roo 335 2 74.62 GCCAAGAATTCCATATTACCAAATGATCAGCTTCGGTTACCTTCACCGATATCCCGTCATTTTCAATATCGACATTCCCCATACAACAGTCAGTAGCACCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGG:1 - chr2L 22746581 5' + R1A1-element 4971 1 77.52 GGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 + chrX 14317412 5' + 1360 81 1 76.87 GGGCGAGAGAGTTCAGTAACCTCCATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chr2R 10865271 5' + blood 7042 2 61.15 GGTGGTAGAATTTTACAAGACATTCATATAAAAAGGGAAAAAATTACGGACATAGTCAGTTTTACTCGGCTATTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTCGTTTTATCTTTTATATGTTAATAGCGCTGTTATGTTACTGTT:1 - chr2R 12994954 5' + BS 5045 1 51.37 TAATTGTTAAATGCGCCGTGAGTTTTTTTTTTATTTTCCCACTTTTTTTTTCTTTCAACACCAAACACGCGCCGAGGTCCTCGTACAAGAGTCCTTTTCCTTTGTTTTTTTTT:1 + chrX 14259966 5' - Doc2-element 230 1 59.29 GGAAAAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2L 76029 5' + roo 8715 2 54.79 GTATCGCATGATAGTGAATATTAGTAACATATGTATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chrX 5150258 5' + roo 8703 2 56.16 AAGAAGCGATGAATAACGGGAACACAACTTTTGTTGTCCGAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3L 12867383 5' + roo 49 2 52.74 AATTAATTTGTGTAAATCATTTAAATTTAATGAGATGACACCAAAAATCATTTTGCAATTCTATTTACGAGCTATGCATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chrX 21234562 5' + 297 6620 2 53.10 CGAATTCACTTAACACATACATAACTCATACTTTTGTAAAATTTATGCAACTTAACAACTTGCTTATTATTATCAAAAGCTGTTCTTAAATTCTTTTTAAATAAATATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 - chr3R 25768915 5' + copia 15 2 65.07 ACCACTGATTGGGGGTAGTTTTAACGCGCTTGGTTTTTTTTTGTTTTGCTGTTACATCAAACAAGACAATTTTGAATTACTCCCGAAATACAAATATTGTTAAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTACATTTGAATTTT:1 + chr2L 8626755 5' + 297 260 2 46.21 GGCGGTTCGTCGGAAAAGAGATTCGAGTAATTTTGCATGATTTGCTGCGCAGCAGCCAAATCCGCCGGCTTTCGCGGGGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTC:1 - chr2R 20626460 5' - I-element 4916 1 65.57 ATTAAAAAATGACCTGGTGTTAAAACTTCTTGTTGGTCCTTCTCACTAACTATAGTGTATAATGGCCTTGAATTTAAGCATGCTTCTATTTGACATAAAAGAGTACTCAACATACTTAATCATACTTAAACCCTACCCAAGTACAC:1 - chr3R 19447742 5' + G2 2966 1 71.23 GTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTCAAATAGCACTCACCAG:1 - chrX 20999567 5' + BS 81 1 76.03 GATGAAGATGATAGAGAGCAATTAGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAGATAACCAGAACAACCTTGATAAACTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTCGG:1 + chr3R 19448593 5' + P-element 244 1 57.14 ATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 + chr3L 14062250 5' + Doc 68 1 68.91 GGGCCAGCCATCCGCCACAGCCAGACGGATTGTGTGCCACTTTGCAGGGGTTCACTGTAGACCACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 + chrX 9707133 5' + Doc 63 1 60.27 ACTGTGACTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chr2R 19555039 5' - pogo 2049 1 55.48 ATCCATAGCTCAGCTCTGGTTCGTTAGAAATAAGCTTGAACAAATATTACATTTTTGCCTTGTTAATGATTCGAAAGTTGAAAAAGAATGTACAAATTTTGAGAATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCA:1 + chr2R 19695978 5' - Quasimodo 256 2 71.92 AGCCAAAAACGGAGAGTGTAATATATATGAAAATAGGAATAATAAAAGCTGCTCCACTACCAGGACTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCTCA:1 - chr3R 8710838 5' + jockey 4760 1 57.98 TAAATATTAATTTTCATATGTATATGATTTAATTTACTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTAC:1 + chrX 15947449 5' + G-element 75 1 71.43 ACGTCCATGCTGAAGGTGGGAAACTTCGCTACGAGCTGTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTC:1 + chr3L 22648307 5' + Tabor 84 2 72.60 CTGTCATTTTTTCGGTCAACACTCCCACTAAAAACCAAAAGCCCCATGCAAGGGAGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAATACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATACATACATGTCT:1 - chr3L 10144743 5' + blood 7071 2 51.85 GTAACATTTTTTAATACGTTTATTTCTTTGTTTGATCTTTTATTTCTGCTCGGGTCTTATACACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr2R 641986 5' + opus 7037 4 62.33 GCTGCAAGCTTCTGTCTGAAAAAAAATGTTCTCTGTTAGGGTATACACATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATT:1 - chr3L 19483022 5' + pogo 68 1 72.60 CAAGTGGCCAAGCCAAGTGTAGATGGGAAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 + chr3R 13612832 5' + 412 76 2 76.15 TAGCCGATACGTCATCGGTGCAAAGCATTTCAAAGCAGTTCGTTGATCTCCCAAAAAAAAAATGGAGAGCGAGCTGTAATAAACCTATATATGCCACCTATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGC:1 - chr2L 9237606 5' - blood 350 2 59.35 ACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTATGAACGATTAAATA:1 + chr3L 17175124 5' + 412 7071 2 58.95 AAGAAAAATAGCAACAAAATAAACACTATGAAAAATGGGCATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAAT:1 + chrX 8885632 5' + P-element 2695 1 36.99 TAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 12867278 5' - roo 357 2 52.05 CCGACTATCAGATACCCGTTACTCATTTTAATATTTTTTTGGAATATCGGTAGAAATTGGGAGAAAAAAAATAATAAAATTAAAAATTCAAAATTATTGACGACATGGTCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATGTA:1 - chrX 15903345 5' - INE-1 83 1 87.67 GTTCTTGGCATTAGGTCATAAATGGCCATAAATAGCAATGCCGTCGAGGAGCTTATGAAATTCTAAAAAAAAGACGAGCAAGCGCGTTTATTTCGGCGACAGAGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACCTTTTGAAAATG:1 + chr3L 46090 5' + Q-element 136 2 66.44 CAGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGC:1 - chr2R 6271514 5' - blood 160 2 69.86 GAATAAATAATCATAATTCAAGCAAAAAAAAAAACGAAGTGAAAAGAAATATTCACACGTTTTTTTTTTGCCCACTCTTATAAAACAAAAATGTCGAATTTTTTGGAACTTCTTTGAAATTTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGC:1 - chr2R 10021388 5' - FB 105 1 59.59 GGCACTCAAGCAGCTCAAATTATCCTGCGGAGCAGCGTATAACAAACAAAAAGAGAAAATAATAATGTGAGCCAATTTGGCGGCCAGGCGGCCGTGAGATGGCCGTGACGAACGCCG:1 + chr3R 31085825 5' - gypsy12 432 2 65.81 AAGTGGCAAAAGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTG:2 - chr3R 9190601 5' - Tabor 427 2 56.16 TTTTTATACAATAATTTTATTCTCCTTTAGCTAATCTTGTAACAATTTAAGCTGATCGTCACTCATAATGATGTACACTACGCAATTTGTACAGCTGTGCGCATTCAACAAGTCCACTTGAGTCTGCTTTGGCTTCTCAACGATTA:1 + chr3L 25675256 5' - micropia 334 2 61.64 ATAAAAAGTTGCATATAAAATTCTTAGAATACATAGATACCTTTATAAATATAAATAAATGGTATCAGTAAAAATTAAATTGAGGATGGGTTGCCCGTCGCGCAGAACACGGTG:1 + chr2L 16577856 5' + Max-element 8116 1 67.54 CCCAATCGGAAATCCCCACCCGGTTATTCGCGTAATCCCGGCTTTAGGAATTAAGAAAATTACCAAAATCGCAATATTTCTATGTTACACATATAATAGAGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 - chr3R 11749777 5' - Tabor 465 2 70.14 GTAAGCCATATATGTTAGGATATAAATAAAGTGAACCTTGGATATTAACACAAATGAATATATATACCTGGTACTTAAATCAAAATGAGAAGACTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 9869985 5' - roo 352 2 59.59 GATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATACCC:1 + chr3L 25782385 5' - Stalker 46 4 50.00 CCGTGCGTCAAGTCTAACAAGTCTTCATCATAATGATCATCATCGGGAGAACTGGAACAACGACACTACATACAGTCAGTCTACAGTCGGAGGCAACAACAGCTACGCGATTTCTGTGGCGCTCTATCCTGTCGTGGTACCGGCTG:1 - chr3L 561151 5' - BS3 1480 1 71.23 TTAAAACATTAATAAAATATATTGAAATTATATGGAAAAGTGATTAGTGAAAATAGCAGAAGCTTCAAAGTGTGTCACCAGAACAAAAGTAATTAAGCCATATTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATT:1 - chr2L 8679497 5' + 1360 3260 1 63.70 ATTGTGTATCTGCTGGAACATCGACATTAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1 - chr2R 17891008 5' + Tabor 24 2 65.07 GGTAAATATTTATTCATTCAATGTTATATTGTCTTCGTGAATAGACATAGATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTA:1 - chrX 16384087 5' + diver 5959 2 64.38 CCCATACGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACT:1 - chr2R 15829585 5' - invader4 247 2 75.69 TTGCATTCTAAATTCATTAATTTAAAAGATTTTTAAAATCAACTATTTAAATATGAAATGTAATTTGAGAAAATATATACAACTACAATTTTTACGTTTTTATATCGCAATCGGTTAGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGT:1 - chr2L 7590985 5' + diver2 491 1 62.33 AAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATGGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTGTGTCTCCCAATTT:1 + chrX 22726194 5' - Helena 1229 1 56.85 CTGGGGCTTTTTTTTTTGCAGAAGCCAGGTGTTTCAGAAATAATTAAATTTACCCGATGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGCTTA:1 - chr2L 12158243 5' + R1A1-element 255 1 56.15 TGATATTTAATGTTCAGTTACCCTTAACCAAAATAAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCT:1 - chr3R 17656451 5' + mdg3 5336 2 73.29 AGATGTTAAACTTTGGAATGTAACGCTGGAAAAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2L 76002 5' + roo 8682 2 76.43 GCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chr3L 15026675 5' + opus 163 4 71.82 ATTTGGGTTGTATTCGATATGTCGGATATGCAAAAGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACT:1 - chr2L 12079682 5' - mdg3 171 2 71.85 AATAAAAAACAAATAAAAAGCCTGCGAAATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr2L 8956722 5' + pogo 49 1 52.05 TTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2R 10695876 5' - roo 355 2 59.71 TGAAATTAAAGCATTTGTGCTAAACCTTCGTCTAACTAACAATACATATAACAAAACGATATTATCCCTGTTAAGCAGTAGGTGTTTGCATTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chr3R 19223023 5' + FB 32 1 64.38 GTTGGCCTTTCGGTTTTATGGCCTACGCATCATTTGGCTAAAAGAGGCAAAACGGCTTCCACGGAATCCATTTGGAGGCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAA:1 - chr2L 3659187 5' - 412 7521 2 64.34 AAAGTGGTGTGCAAAAGTTACACTAGGCTACGCAATCAAAGAAGAGTTTTAAGTATGCGCTGAAGGAAATAAAATCGAATAGATTTGCTATTAAAAAGTGTCGGAATATTGGAGTAGGAAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTA:1 - chr3R 18873356 5' + copia 3 2 67.12 AGTATACTTAAATATTTAAGGGCAAGCGTTGGCGAGAGCAGGGCAAAAGTTTAAAAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr3L 13634156 5' + 297 6596 2 75.52 AGTACTTCAACAGACTCGAAAAGTAAAGAACGAACAGACATTACAACTTCCAAACGAACAATATTCCCAGAGTCCACAGAGATGTCCGGATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCAC:1 - chr3R 16461814 5' - Stalker4 7149 4 61.64 GCGTGTCGGGGTGATATAAAGGAATCGACTTGTAGGACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr2R 5737225 5' - 1360 3341 1 53.42 AGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 11609204 5' - roo 9055 2 63.30 TAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr3R 23639114 5' + pogo 12 1 71.77 AAATTGAAAAGCAGAGAGGACACAAAGTAAACAGCCACAAGAAACGGACCCTCACAGTGCGACAGAGACGGATGATAGGTGGAGAAAGAGAGAAAAGATAGCTACCAAATTGAATATTAACTGTAGCTCTGTTAAAAACACGTCC:1 - chr3L 16462820 5' - Porto1 22 1 74.48 AGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2L 76073 5' + roo 8713 2 75.00 AATTATGCGGAATTTTAAGAAGAAATTATAGTCAGCTGTTTTATTTGGGGCAACGAGAATGTATATAAAGGATCATTTAAAACCAGTTACTAAAGTCACTTTTTTTAAGGCATACGGAGTAGCTGAAAACCCCTTTGTCACCTTG:1 + chr4 353388 5' - BS3 1730 1 68.28 TAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTCTTT:1 - chr3L 13827371 5' - hopper 1365 1 51.37 GTGTCTGTGTGTATTTGTCAATTTTCACTCACTTCATTTAAGTAAACACATTTGCTGCATTTCATATTTCCAGTCACGTTCTAAGCATAAATAACAGACACCCACTTTTGTCCCAGATCCCATTTTAGCATTAGCGGCTACGAT:1 + chr3R 8556820 5' + G2 398 1 72.92 TTTTTTTTGTATTTGCAATCTGTAGCGATAAATAATTTTATCACCGTATGAATTGAGCTCCAGTGAGCTCAATCCATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCT:1 - chrY 738407 5' - invader1 380 2 61.72 AGGAGAGGTTACAAATGATGTCAAAGAACAGAACATTATTATCTTGATCCGAGTATATTTGCGGTTTATTTATAAGCTGCGCTTTGCTTTTCGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 - chr3L 22587727 5' - mdg1 7372 2 66.90 ATGGCGTGCACGCTGATAAATCTGAGCAAGCTCGTTGGCCCTTTTAATGGCCGGCCATAAAAGGTAAGCCGATGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCACTTGGCACCATG:1 + chr3R 8202018 5' + 1360 264 1 49.32 TGGGCAGACAAAAAGGGCTAACAAAGTTTAGCGAAAGAAAATGCTTTAGAAATTTCATAGAACAGTAAAATTAGACAGGCTCTGGCCGAATCTTATAAAATTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAA:1 + chr2R 20458209 5' + F-element 4423 1 69.18 ATAGAAATAGAGGATGAACTGGATGAAGAGGACTCCTGCAATTTTTTAGAGTAAAGTCTCTGCTCCCCTACATAACTCGTACGGTAGCAGGAGGGGAAATAACACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATC:1 - chr3R 1585038 5' + Stalker 141 4 69.86 GCCAGCTTTCGGCATCCCTTTTGCCTAGTTTCACGCTTTGGTTTTCCTTAATCGCTTAACCCAACTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTGCCACTCGACTCACACCCTACACTTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr3L 17207853 5' + hobo 53 1 51.37 TGGCGGTATTGATTAGAAGTTGCGACATTGCGAATTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 + chrX 1523706 5' + jockey 67 1 56.16 CTCAAGCAGGGATATAAAATCCTCAAAAATCGTAAAAAAAATTCACTGATATGTGTTATAAAAGTCTTATTTTTCCGTACTGAAACGAAAGTTATAGGTTTAATTTTGAATACAATATATTTTCATAAAACGATTTCACTTTTAAT:2 - chr2L 3142916 5' - gypsy9 421 1 77.40 CGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 - chr3R 6388774 5' + jockey 76 1 75.21 AATCAATATTTATTATTATCTTGATATGTAGCACTACTGTTCGAGTTACGGGGTGACAGTCCAAACCCCGCAACTCGAACATTCCGCCCCCCTTGCAATCACTGGGGTTGCCAC:1 - chr2R 10916662 5' - GATE 8203 1 52.63 GCCACTAATTGCGTACAATCTTGTAATATTAATCCCTTATTATGAAGGGATTTCAACGTGTGCATCATTTATCTTAGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1 - chr3L 15327665 5' - blood 333 2 52.05 GATATCTATATATCCGTCTATTTAAAAAAAAAATGTAATTGTCTAGCTATTTTTAAAATATGTAATGGTTATGGGCTGACCTTTTCTAATATTCACGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3L 4187151 5' + pogo 24 1 67.12 GAATTCAATTTGGTTTACAACAATAAAACGTCTTATTTAGGTTCGGTTATTAATGATGAGTTATGGGTTCAGACCTCCTTCGGAGACGAGCGGACCCATCATCATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAAT:1 + chr2R 8641458 5' - diver 205 1 71.92 TGCGCATAATTGATTTTTTCGCGGCGATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGTG:1 + chr2R 11763558 5' + Tabor 6869 2 63.31 TGACAACGAATAGTGCGTTGAACTAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAA:1 + chr3L 18031007 5' + invader4 2818 2 72.32 CCTACAAATGTAGATACCAAGTGGAGATTCAAAATGCCCAGCAATTCGGAAGTCCAAGAATATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACACCAAATAAAATAAAC:1 - chr2L 16336811 5' + F-element 80 1 63.01 TTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr3L 22400256 5' + 1360 49 1 52.90 TTTACACAACTAAGCACAGCAATGTTTGCGCCAAACAAAATACCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGG:1 - chr3R 24784918 5' + F-element 4268 1 75.34 CTGAGAGTTTAATTCATATGACACGCATATGCAAGTCGATAAATGTCTCTGTGTGCTGGCCTGCATATAGAATTTATATAATATTTTTGTTAACAGATATACTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAT:1 - chrX 6417870 5' - accord 181 6 81.40 GCTTTTCTTCTTGTATTTGTTTTTGGTTGTATCAAAACAAAAATCCAATCAGCGGGTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr3R 23240303 5' + jockey 73 1 59.03 GAAACTTTAAAAGTTATACTTTTATAATTTATATAATTGTGTTATTGACCTATATTTTTTTATGTATGGTGCGGGTTGTGGGCTGCGACTACGACCATATCAAGTACATATATGTATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCAAG:1 - chr2R 13565432 5' + INE-1 90 1 57.93 AAACTGCACATCCAGAAACAAAAGTCAGTATTCCAATGATAACTTTAACGACGGCAATTTGCTTGGGGTTTCACGTTTATTTAGCTTGACTAGCGTTGGGCTAACTGCGTTTTATTTGGTTATTTATTTAGATTTTTTTATTTT:1 + chr3L 6788816 5' - gypsy2 435 1 65.28 GCAAAGAGTGTGCTGCACTTTCTTGGGCAACTAAACAAGCTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 15987938 5' - roo 400 1 77.69 CGGCAGTGGGATCGCTTCCGGCATTAATTTCTTTAATTATGACAACATACCGGTCGGACACCGAACCGGGAAGGCGAACAACTAGAGCACCGCATCCGGC:1 - chrX 22371804 5' + Tirant 8179 2 52.00 CTTCCATTTATAGACTTCTAGCGTGTGACGTTATAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACC:1 - chr2R 1921483 5' + mdg1 94 2 77.40 CCGCCACCGGACAACGACGACATCTTCGTTGGGGATTTGGATTCTCATGTACATATATATATTTCCATTTACACTTACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTT:1 - chr2L 19518388 5' + flea 31 2 60.87 AGGCAAGGTCAACAGGGTCGCAGTGCATTTAAGCGGTTTGTGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGCTTGTGGCAGCTAACTAACTAACTAAATAATGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGCGCTG:1 - chr2L 1539064 5' - Stalker 7172 4 67.59 AAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGTGTGTTCCTAT:1 - chr2L 23295877 5' + micropia 149 4 59.59 GTTGAAGTTGGAGGCCTATGCAAAAGCAAAACATATTAGTATCCTTTTCACCTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCT:1 + chr3L 4115128 5' - 1360 3319 1 66.44 GTGTGCAAGGTTGTTGTTTCTGTTGTTTCTGTTGCTCAAGCCCCTTGAGTATATGTGCTTTCGTTTTCGTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 20702868 5' - Doc2-element 232 1 80.00 ATGCCCATGACTTCCTGTTTTGTTCCCCCAAAAATAAAAGTTCACTTTAATTTATGCATTCAGTCCGAGGTGCTAATATTTCAGTGTGTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr3L 16358785 5' - 412 7515 2 60.27 CTTGTATCTGATGGCAAAATTGCAATTAGAATATCTGTGGAATTTCGATTAAATTCCCCACGTCAAGGCAGAGAAAAAACCAAACTGGAAAATTGTGTCCCAAAGAAGAGAGTGGATGAAAAGCTGTGCATTCGGAACAAGTGCCG:1 - chr3L 15033514 5' + opus 7232 2 61.64 ACCGGCCGTGTTCTTACCATTTTAAGAATATAATTTGTTTACCAAATGAAATTCATGTACAGCTCCCGCCATTTTATTTACTAGTATGACCATCCCCCGCTTTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTCAGTCAACTGACGGGACATTA:1 - chr3R 9711208 5' + 297 361 2 67.81 GCGGCCAGCCAAATTGAAAAGTAACTCACCTTCCCAGTGCACCATATGACGCACTAAGGAATCCTAAGGATTCGGGCTTTGGTTATGACCCCCTTAAAAAAATGTTGTTGAGAGGGCAGAACAACACACACAAACACACACAC:1 - chrX 3982204 5' + gypsy3 424 1 88.81 CAATGACCCCCTTTTGCCTTTTCCCTTTTTCGCCTCTTTGTTTCGGCAATGCGACGAAAGTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chr3R 23242020 5' - HMS-Beagle2 493 1 72.37 ATGCAAATTTTATACAAAATAAAAGGGGGAGACCCACAAAAACGCCCGCTGCCGTGGGAAAAAGTGTTGCATACTTATGAGTGTTGGCAAAGAGCTCCGGAATGAAATGTGAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATG:1 + chr3L 17133753 5' + jockey 4700 1 77.40 ACTGAAAAACTTATCTGACTGTACTAAAGCTAACAGCATATCTTACCATATAACGGTGTTTCGCTAGCAACCAATTCTCAAGCTTTTCCTCTTCTTCTAGAACTGTCTCCTTTCGAATATATTAATTTGCGTCCTCTGATTTTGTA:1 - chr3R 4719282 5' + Gypsy12A_LTR 2065 1 63.70 CATTTAAAGAACTTTCTTTGAAAATAATTGCATAATTCTTTTTATAACCTTATCCAAAATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 + chr3L 15327547 5' + blood 61 2 60.96 ATACGTAGAATAACAGGTAGTTGGAAGAGTTAGTTGAAAATTTTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3R 20744088 5' + roo 12 2 71.30 TACTGCTTATCGGGGCTCAATTGGGTTCAATGGACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTT:1 + chr2L 4998134 5' + FB 82 1 77.70 TTAAGCGTTTGCAAACGTTTGGTGTGAATGAATTCCTTAAAGTATGCAATATTCGAATTCAGAGCATACAGTTTTGGAGCGACTGAAATGTGATAAGAAGCCCGGCTACAGTTTGAGTAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCT:1 + chrX 15137321 5' + jockey 4526 1 77.24 GAGCTGTAAGAGTGCCGAGTGCGGACAGATATATACTCGTAGATGATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:1 - chrX 4186711 5' - I-element 5279 1 67.12 TTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chrX 12866507 5' - roo 9029 1 56.16 AACCACACAAAATACTCCATCCAGGTACAGAAGCAAACAAGAATTAAACGACCCTTAAAAGCGTGCTACGTTTTTTTTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 + chr3R 6515262 5' + jockey 19 1 77.40 ACTAGCACAGATTTTGTTATTTAAATGCTTACATCTAAAAATGTATTACTTTGCGCCTGTAGTTTTAAAAGTTCATTTTTGACATTTAAGCTGTACTATATTCGAAAACATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCAT:1 + chr3L 12976200 5' - invader4 3079 2 45.89 GATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGAGATAAA:1 + chr2L 76044 5' + roo 65 2 61.38 GTTGTAGAGGAACTACTGGGGAATCGTACTTGAATATGGGGAAGCAGCAAGCGACATGGGCCAGCAAAAGACTTATAAAATTGGGGAAAAGAAGAAAGTAAGGGATTACAAAGGAAAAGGAATGTTTAGCAATAGTATGGTCCG:1 + chr2R 1687745 5' + Osvaldo 67 1 75.00 ATCTCTTCATGTTTCCTAAAATAGCAATCTTTTATTTTTCCCTCTGTGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATA:1 + chr3R 10472705 5' + mdg1 7114 2 67.81 GTGCGTGTGTGTGTTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr3R 28396607 5' + jockey 83 1 67.12 GTGGCCAAAGAAATCAGGGCGCCAAGGGTGGGCAATGGCGGCAGAAGGGGCTAAAAAACACATCTCGAACGCCCACGCACAAATTTTTTTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGG:1 + chr3R 18508223 5' - G2 3040 2 62.69 TGTCATCCAAAGAAATGCCGTCGAGCCAATGCATGACATTATTTCCCTTTGTTGTCTACACGCACACATCCGTGTGGCACACACGGCTAACACTCGGACAGAGCGTGTTGGGGTGGACAACGCTCTATGA:1 - chr3R 6479267 5' + Circe 206 2 75.38 TATAGCTGAGGACCACTTTTTATATTAAAGTATATAAAAATATCAAGGATCAAGTATCACTATAGTTTAAATAAAAATATATACATAACATAAGCCCCATCTATAAAAAAACCTCTTCCCAATTAATAATTTAGTTAATTTTATTT:1 - chr2R 20753839 5' - NOF 3961 1 36.99 GCTCCTCATTAAACCCTACAGTTGCAAACACCACCGCTCACACACACACGCACACACATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chrX 7980784 5' + hobo 29 1 56.52 CTTGTTACACTTGCTCCAAGAATTATTGCCTTTGCATATTCACTCCGTGCTGTGTGTGTGTGACTGCGCTTTTTTTTATCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGGGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAAT:1 - chr2L 17894516 5' + copia 5045 2 52.74 TATTTATCTGCTGCTGAGATTGGAGTTTTGAATTTGTATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCCTTT:1 - chr2L 21657076 5' + invader1 47 2 75.17 CATCCCACTTATTACCCGAAATGCAAACAACTGAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGT:1 + chr3R 4199255 5' + P-element 493 1 38.74 AGGTAAACGAACTACGGAGTGCTATTTAATATTATAGAATGAGGTAAGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 + chr3L 16212732 5' - Transpac 242 2 65.28 ACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr2L 17250742 5' + opus 49 4 75.24 CAGCAGTGGGTCACAACAAATGGCTAAGAGAGCGTAGGCCCAACAGCAACATTGGTAGCAAAGGCGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTCTCGAGGTCCCACGCT:1 + chr3R 10686303 5' - roo 8926 2 54.11 ATTATACGGAATTATGCGGAATTTTAAGAAGAAATTATAGTCAGCTGTTTTATTTGGGGCAACGAGAATGTATATAAAGGATCATTTAAAACCAGTTACTAAAGTCACTTTTTTTAAGGCATACGGAGTAGCTGAAAAC:1 + chr4 353379 5' - BS3 1745 1 77.70 ATTAAACAAACATAATAATACTAATGGTAGCCAACAAGTGCACATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr3R 19859540 5' - opus 471 2 37.67 TCTGTTCTGAATCACTTGCCTATATATAATATCCATTATATGTTATGTTACATATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAA:1 - chr3R 9393021 5' + S-element 67 1 65.75 CAGACATCCACTGGGATGGGCCAGGACAATACAATATCCGGGAAGTGTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGCACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAG:1 + chrX 4305791 5' - gypsy12 10153 2 55.26 ATGTACGAGTAAGTATTCGATTGGTTGGGCATCTTGTGCCACAATTGTCCATGTGGGAGTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 + chrX 1689978 5' + 412 59 2 57.64 TCAGATCTTATTTTTAAAGGGAAAATTAGTTCACTTAGCCTATTGATGTTTATTCCATATCCCCAAAATGTCATTCTTCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGA:1 + chr2L 22548319 5' + F-element 108 1 52.74 TTACCGTTACTTTTCACACACACATACAGCACCTCTCTCTCTTTAGCTATTGCGTTTTAGATTATTGCTCAGCACGTTTTTGCGTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chrX 4701104 5' - P-element 2885 2 76.79 GAAGAAGAAACAAGAATCACTTGACACAATTTTAATTGGGTCTTTGGAAGATCTACCCCATTGTCGTCGAACCTCGAAGTCGGGTAAACAAGGCTGAACTATCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 - chr3R 30189480 5' + 1360 74 1 79.53 AATGGTGTAAGCCAACTATATAGCTTCATGTGGCTACTGTACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACT:1 + chr2L 6870683 5' - hopper2 1527 1 71.23 AATCTGTGCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr3L 15026623 5' + opus 34 4 58.22 TTAAACCAAATATTTTCAATGAAAACCAATTTTTTTAGTAACACAATCGTGTGTAGAACGCATTAGGATGTACTTTCTAATTTAATTGCATTTCAAAAATGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chrX 13786815 5' + pogo 19 1 67.81 GGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 + chr3L 9907380 5' + jockey 97 1 77.62 ATACAGTAAGTTTTACTACCAAATTTAATCGGAAAAGAAGGACAAGCCTTTTAAATGATATTGATTTTAACTCAGCTAAAGAAAAAACCAAAAAAAATGTACTGGCTCTTAGGACCCCGCTCTCAATTAAGCCTAGAGAACAACTT:1 - chr3R 10299250 5' + G3 4143 1 52.05 CTACCAAATGAGTTACTACAGAAATTGAGAAATATTATAATATTAGATTATATACATATATGTATGAATTATTAATTTTAAGTCCAAAGGTTTCAAGATGGCATATGTGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACA:1 + chr2L 18149357 5' + Bari1 6 1 43.88 CGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGGGTTTTTCATGGAAAACGCATCCTTCGCCTTCTATAATGTCCCTCGTTGTTTGCGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGCGCAGCTTAATGATACATAAATATATATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 5514674 5' - accord 186 4 78.08 AAAACTGCTATCTAAACCACTCGGCGTATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGTACCACC:1 + chr2R 19553211 5' + mdg1 94 2 79.45 CAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTG:1 - chr3L 12976334 5' + invader4 2778 2 49.47 AGTCGGGACTATACCAATTGATAATGTCGTCCAATGCTCTAATAGCAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGTTGTTTAACACTTCACCTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTGTT:1 + chr2R 4514930 5' - transib2 115 1 70.55 ACATATTCACATAATAAGCACAGCAAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACACAATGTCTTAAGCTAAGATGAATAGAATAATGACGTGATAACTATTTCTCCGATAATTTTAGCGTTGTTATTAGTCAACTGACGGGACCTTAGTT:1 + chr3L 25008290 5' + 297 6945 2 75.34 AAATTCTGTCAGTATATTTTTATACCCATTACTCGTAGAGTAAAAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGATAGAGGGAAGAGTTTCTGACCATATAAGGTATATATATACTTGATCAGGGTCAAT:1 + chr2R 5296815 5' + INE-1 83 1 70.40 TTTAAGTCTTGGATTCGGCATTTGATTCACGACGACTCACTCCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGTACAAATAAATAAAATAGCATATTAACTTATTGCAGCAC:1 - chr2L 9485694 5' + 412 45 2 45.00 AGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:3 + chrX 14964623 5' - roo 336 2 71.23 TATAAAGCTGTTTTAGAGGAAGTATCGTTATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chr2R 5923005 5' + jockey 4744 1 76.15 CCTCAGAACTCGATATGTCGATATGTAACAGTGCATAACTATCGCTTATTGTTACAGGGGGTATAGGCTAAAAAGAATTGCCCGCAAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAG:1 + chr3L 13018000 5' - pogo 51 1 57.53 ACTGCTTACAGTACTCTGTTGAAGTTTTGCAACTAAGTCGGCCAAAACTCCAAATATGTAATCTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCAGAAAACCGTCTTCTTACACAAGTACGCACACATATACACGTTCTCGTCTCTT:1 - chr2R 1921800 5' + 1360 3228 1 68.49 TGGGCAGCTGGGGGAAGGTCTAATTGAATTAGAGTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr2R 11133617 5' + roo 84 2 76.22 TAAGGGATTAAAATTACTTCCAATCAATTGTAACGCGGCAGTGAACAAGCTGTGTCTACTTCCCCTTGAGGACTATGTTGGAAGCCAAGCTTCCAACGGGGGGAGGATGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAATTGTGCAGTAGAC:1 - chr2L 22744216 5' + diver2 4548 2 70.14 ATAGTTGCTAAAATTCTTTTACGAGAATTTGAGTAATGATATTATCTTGAAAACTTGGTCTAAGATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1 - chr2L 17029731 5' - blood 7369 2 65.75 ACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3R 22100527 5' + 412 74 2 68.57 TTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGG:1 + chr3L 15026673 5' + opus 7174 4 77.50 AGCAAGTGTATAAAATAAATTGTTTTTGCCACTTTGAACTCGTTATCACCCCAAGCGCGGAATATAATACCCAACCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 - chr2R 15527847 5' + FB 27 1 51.61 ATCAAGCACAGTGGCAATTGACTAGCAATAATTTCTACATATCTATGGAAAATTCAATAAGAGAGGGTTCACAGTTTTATTGAGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr2L 1259886 5' - Burdock 6356 2 56.85 AAATCTCCGGCATTCCTGGCAACAGCATTTTGTTGCTGCTTTTGTTATGTAGATGCATACTTATATACGCATTGAGAACAAAATCCCCAGCTAAGTTAAGCACAAAGTGTATAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTAT:1 + chr2R 20709685 5' + Doc 121 1 61.64 TATATAGTTCACCCCAATGAAATGTTTGTGCACGTTAGCCGAACGAGACGTTTTTGATAGACTGTTCAAATTAGGGTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAGAT:1 + chr3R 21001783 5' - 412 448 2 52.05 CCCGTTGTCGCCATAATATCCACAATCGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2L 22016026 5' + Tirant 8122 2 70.00 TTAGTTGAAAATTTTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3R 20744059 5' + roo 8736 2 70.55 CATATTTATGATTCACTAACATGCTGAGGTGGTGACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3R 16181260 5' - roo 9037 1 61.64 AGGACTTTATGTCCTTAGCCGGGGAACAAGGGACATAAGGGAGCCTTTGCATAATCAAGTCGTTTTGTGTGTGCGGCTATTGCGGCATAAAGTTTTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGG:1 - chrX 10163271 5' - Ivk 302 1 76.61 GCATTATTACATATTTTAGACATATATGATTTGTGATTTAATTGCAATTTAATCTTCGGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAAAATAATAATTGTGCTCCGACATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATACATAT:1 - chr3L 23529729 5' - Stalker2 235 2 63.70 GTAAAGGTCTTGGCCCGGGTTCAGCAGCTGCAGTTTGATTTATGTAGCGACTAGTTTCTCGGCGGGGTGTTTACGATGTGTTAAACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTT:1 - chr3R 19293118 5' - Circe 184 2 63.08 AATACTTCCATAGGATGTAGCATTAAAAGTAAGTTTTTAATAAAGGCTCACTTAATAACAAATTATACATTATATATTTTAAGTAATTCTATTAATATTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTTCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chr3R 18873159 5' - copia 232 1 52.05 ATGTGATACAATATTTATGTGCTGCGAGGGCTGGCCAAAGAGTTATGGCCGGCATTTGACATTGACACTATTGCAATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTG:1 + chr2L 17231630 5' - 412 7230 2 56.25 AGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAACATGCTGACC:1 + chr3L 24152442 5' + HMS-Beagle2 62 2 58.90 ACATGCCCAAAAATATGCAACATTTTTTATATGTTTCTGCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 + chr3R 8707371 5' + jockey 4723 1 52.05 GACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCA:1 - chr2R 5737190 5' - 1360 3306 1 74.66 CTTTGTGGACCGCAAAAGTCCAAGTCAAGCATTCCACTTATAGTATCGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 27794864 5' - roo 9031 1 58.26 GAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 - chr3R 24476345 5' + 412 86 2 78.87 TATCTAAGCTAAATTCCTAAGACAAAACGATTCCACCTAAGACACCTTTTTGTAATGACTAAATTTATATAGGACAAGAGGTAGAAGACCAACCAAATAAACACGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGA:1 + chr2L 6929610 5' + G-element 23 1 72.54 AATATTTGTAAAATATAAGAAAGAAATAGTTTCTCTTAAACCACGAAAACATACAAAAAAAATAACAGATTTTTAATTGGCACTACGAAGTTTTATGCGACAAATAAATAAACTTATCAAAATTAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 13051458 5' + Doc 4693 1 69.63 GATACCAATCTGTGCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chr3L 15026617 5' + opus 141 4 62.33 TATACAATATATGTGTTATATTTTACATTAGTTAAGCTCATTTAGGGCTAATTAAGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATG:1 + chr2R 16718477 5' + Tabor 68 2 63.70 CATTGTTACATAAGCAAAATGAAATAAATATATGACGATTTTGCAATATCTAAATAGATTATATTATGAAAAGCAATAATAAAATGAAAGCCAGCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr2R 22491987 5' - pogo 2077 1 68.49 CTCCAAGTACTGATTGGATTAGGCTCGTGCCTAATATGGATTGCTCAAAGTGACGGGCTCTGGCCAGAGATTCCAGCCTGTTGAGTAATTAATAAATAAGTGGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr2R 20865618 5' + 412 7073 2 73.29 AGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr2L 76065 5' + roo 81 2 76.43 GAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTC:1 + chrX 21772481 5' - gypsy3 6550 1 59.63 AGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATT:1 + chr3L 27356090 5' - Tc3 1627 1 71.92 TGTTTGTAGCGAAGGAATACATAGGCCAAAAACATAATATCTTAGGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 - chr3R 15338111 5' - blood 7314 2 71.53 CTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGGGTAAAGTGCAGTTTG:1 + chr3L 14062255 5' + Doc 98 1 76.39 ATGATTTGAAGCACGTTTGAAAAATCATTCTTTTTAATCTCACCATTTGAAAGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 - chr3L 16496716 5' + jockey 4762 1 60.00 TATTTAAAAAATATAATTAACATTCAAAATTGATGTTGTGCTAAGAAAAATTAAACAAAAACAATCTTTAAAAACTAGAATACTTTTTCAAACGCATTCCTATCTACCTGTGCATCGACTTTAGTGTATTGCAGCCCATAAATTG:1 - chr2L 14281238 5' - rooA 51 2 86.21 GGACATACTATCCAAACTAGCTACCAAGAACTGGGTATAGCTAAACACAATTTCCGGTGAATTAATAACCAAACTCACCTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr3L 14076356 5' - roo 404 1 76.71 ATTAGCTGGAATTTAAAACCTTTTCGCCGATGGAAAAAGTTTGGGTCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr3R 27535513 5' + 412 62 2 65.19 TGGTGCCCACGTGTACATGGTGGGTATGGGAGTGACCGCGTTGATCACGCAAATGGGCACCTTTTGCGGACCGCTGGGAATGCCATTGTAGCTGGTTACCTAATGACTTTACGTTTTGTTTTTGCTTTTCTTTTCTTGTT:1 + chr3L 10637376 5' - mdg3 5101 1 66.43 AAGGCCACTGATCGTAATGGACTTGGTGATATCCTCGCTGCCGGCCAAAGTGATGCCGAGCAATCCTCCTTTTGTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCA:1 - chrX 5985658 5' + I-element 4985 1 55.12 TCGCCATTGCATACTTTTAGGCTGAGGGCGCAATGGGCGTATGTGTAATATTTCCATGCCACATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTCACA:1 + chr2L 2004921 5' + jockey 26 1 62.62 GACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGGAACGGGGCGTGCACAAAG:1 - chr2R 2994306 5' + gypsy8 4795 2 53.54 GAAGGAGGATACATTCAGGATAGTTCGATCTCAGCGTTCGATATCACTTCTTTAATCTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTC:1 + chr3L 17869903 5' + 1360 50 1 58.02 ATGTTAAGAAAATATTTTTGTGGTATTCCTTCATTTATTACAATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr3R 16913489 5' + pogo 32 1 63.01 GAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGGA:1 - chr3L 23702242 5' + G4 76 1 66.44 GATGCGGAAATGTGAAGCATTCTGGTTTAAAGGAAATTAAGTTTATTAATTTATTATTAAAGCATTGCTTAAAAACCCCAAGCTAATTTTAACGTAGAGGGACAACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGA:1 - chr3R 16283714 5' + Ivk 289 1 69.18 GATCCTGTCCCGCTCCTGCCTGCATTGTTTGTTGTTTTAATGGCAAAACGAAAAGCGCAAGGCATCTGCACGGCGTTGTCCTTTTGTACATTCTCTGCTGCTTTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCT:1 + chr2L 6545184 5' - Porto1 4412 1 77.27 CCTTATATTTGTTTGTTTCTCTGTTTATGGCCCTTCAGATATAAGTAATTATAGGAGCTTTAACCGAAATACACTTTTAAGCTAATTCTACTAAACCATAGAATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr3L 27350425 5' - pogo 2087 1 74.66 CTTTTTAAATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 + chr3R 9190444 5' + Tabor 6860 2 43.84 TGCCTTTTTTCGTTCGTTTTTTTCCAATTAACGAGAGTGTGGATATTTATTTAACTCTACTATTAGTATGCACAAACAGCAGGATAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 - chr2R 22306114 5' - pogo 2068 1 61.64 ACGAGTTGCCTGACATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGT:1 - chr2L 686092 5' - roo 9017 2 54.79 GTCGGGTTGGGGCAATGGGCCAATTAAAAAGTTGTATTGCTGTTGTGAACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTT:1 - chr2L 16089721 5' + 3S18 23 2 69.18 AATACGAGCTGTAAGAGTGCCGAGTGCGGACAGATATATACTCGTAGATGATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTT:1 - chrX 4186716 5' - I-element 5284 1 63.70 GCATTTTGCCAAAACTGTGTGATAAGTATCTGAACAAAATGCAAAGCTGCCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chrX 7786583 5' - 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chrX 10645091 5' + jockey 10 1 71.82 GCAAATTTTAAAAAACAATATTTTGGTCCGCATTAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATA:1 - chr2R 22492105 5' + pogo 84 1 74.66 ATGACGACGAAAATCGAAACATTTTTTTAAAAGTTCCTTAATGAGCTTTAAATGTATCGACTTGGCTGTGAACCAAATCCTAAATAATGCTAAAACAGTGCCTTTTATTATTTTAACCATCCAGTGCCTTGCAATTTTGCT:1 - chr2R 4721535 5' + Tc3 1481 1 54.61 AAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3R 9352076 5' + Tirant 15 2 56.41 GCACAAAACCATTAAAGAAATTTCATAAAAACTTTAAAGGCAAGTCCCATTTTGATGGATAGCGCGTAGACGTCAAGAAATCAATTTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTG:1 + chr3R 15924548 5' - Quasimodo 7339 2 65.75 AACTAACGGCACCTAAAACATTTTGCAGCAAATTTCTGGGCAAAAGCATAAGCATAAGCTGCACTTTCACCAAAAATTATGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr2R 11057232 5' + pogo 20 1 65.62 CGGGCGGACGAGTATATCGCACTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCC:1 + chr3R 20486367 5' - accord 7373 2 63.64 ATTTGGGTGTATGGCCAAGTTGCCAAAACACTGCTGTTAATTATGTGGATAGTAAAATTACAACACGCAGAACAGCAGCTAAATAAAAACTATCCTTAATGTTTTGATTGAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2L 16399463 5' + roo 8673 2 73.10 TTTCTCTAAATAGACACTTAATTTAATTTGTTGTGGATGCTACATATTTTTGCACTCAAAGCCTGACGTTTGTTTTTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAG:1 - chr3R 7485196 5' - mdg1 260 2 52.74 CAGAAGCATTCTGTCCCACGAGATGAACTGCAAGGATCAAGAGCAGTATAACGAACTTATCCGTACCCAAACAAATTACGTGGGCAAATGATTTAAGAAAAGGGGTAAATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACAGAG:1 - chrX 19204540 5' - Cr1a 4105 1 61.87 GCAAGGTATGAAGTTTAAAACTTCCTGCTTCTACTAAAATCAAATCGTCGTTGGTATCCACTCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGAC:1 - chr3L 21748658 5' + jockey 4730 1 56.85 GCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAATT:1 - chr2L 12340801 5' + diver 94 2 78.77 GTTTAAACTAAAAACATAATATTATAATTGAGATTTTGGGGCAAAGCCTTAGGCCAACGAATAGCAGACACCCGACAAACCGTCACGGACTAACTTAATGTTATATATACATATATATAACACACAACAAAAAAAAAAAGAAAAAA:1 - chr2L 11340284 5' + G2 3077 6 50.00 AAGAACAGGTCCCAAATCACCAGCGGAAAATGTTGCAGAACTTGCCAAACCGAAAAGGGTTACTTCTATTATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr2L 5202602 5' + 297 48 2 53.42 ATCTATTTGCGACAAACATTTGCAAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chrX 2762576 5' - roo 345 2 58.90 AGTTCGAGAACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr2L 17029575 5' + blood 45 2 53.79 AGCTTCAAAAACTTTTCGGCATGCTGCACTTTTTAAATGGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCG:1 + chr3R 17656393 5' - mdg3 165 2 71.23 ATCAACAGTGTTGGCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 + chrX 12191535 5' - pogo 2046 1 58.57 TAGTCCGTGCAATGAAAGCAAATTAGCTTAAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 7035195 5' - roo 394 1 75.34 GAGTACATAATTTAGCCAAGCAGTTGTATCTACTGACTCAGACTGTGGAAAATAAATTCAATGCCAGACGCCAGCTCCCTATTTTACATAAAGTATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2R 12543021 5' + roo 8683 2 69.86 AGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATACATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 + chr3L 6775370 5' + blood 7095 2 72.60 TTAATGTTCAGTTACCCTTAACCAAAATAAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCT:1 - chr3R 17656445 5' + mdg3 5336 2 76.43 AGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTCAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chrX 12139010 5' + roo 49 2 67.89 AGTATGCGATAAATCGTGATAAATTTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr2L 17250678 5' + opus 20 2 67.14 GCTTCGGTTACCTTCACCGATATCCCGTCATTTTCAATATCGACATTCCCCATACAACAGTCAGTAGCACCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCC:1 - chr2L 22746552 5' + R1A1-element 4966 1 74.74 ACCGTACTACTTGTTGAACCTATCACAATATAGTTAATTAATAATAAGATAAAGATGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCA:1 - chr3L 24104301 5' + Max-element 8287 2 57.58 CATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAG:1 + chr3L 14062249 5' + Doc 94 1 73.97 AAATGATTAACTGCCAATCAATCAATTGTCAAACTAAACTTAAACATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chrX 14964699 5' + roo 8739 2 72.60 AAATACATAAATCAAAAATTAAAAAAAGAATCAGACAAAATTGTAAAATCCCCAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 16643436 5' - roo 346 2 71.77 TAAACCTCGTCTTTTAAAAACTTCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 - chr2R 5531240 5' + 1360 66 1 71.92 ACAGTTGATGGGAAGGTTTAGCACTCGGAATTAATACGATTTGTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr2R 23000023 5' - mdg1 378 2 55.48 GAGGGCCATAAAAGTTTTTCACACGTTATATAATTTTTTTTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr3R 6244518 5' + Doc 55 1 67.52 TAACACACATTATAGAAACATAATACCAATTAAATAATTTGTACATTAGTTAATAAAATTATAGTGCCATCACTCGCGTTTATAATAATAATAAAAGAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCATGGCTATCAAATACCCGTTACTCAG:1 - chr2L 22130781 5' - INE-1 547 1 57.53 ATGTAATTTTGATTCACTTGCTACGGCATTCGATTCAGCTACTCGTACATTATCCCAAATACTCTATTCTAAGCTCCCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr3R 15338011 5' + blood 46 2 54.11 GTTGTCGCCATAATATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr2L 22016023 5' + Tirant 7 2 76.15 CATAATTCTGCAGATTATTCGCGCCCGGAAGCATAGTGAAGACGATGCTGTATTCAGCCCAGGTTGATATCGCTCATAGACTGCCAAAGTCCTGGTTGGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCTATTGACTAAA:1 - chr2R 13266644 5' - baggins 4988 1 54.93 GCTCAGCCTCGGCCAAATAGTAATGAAATCAATAAATACGAAAAAATACAAAACTACGAATGAAGAAACGAAGAAGAGCAATTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTG:1 + chr3R 14024468 5' - I-element 5134 1 68.97 CATGTATATTTAATTAGGTCATCCTGGAAGTGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTACAAATTACAAAACGTACAAATTTTCTATTCACAC:1 + chr2L 8541982 5' - pogo 74 1 56.85 AACACACAGGAGACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACC:1 + chr2R 22722999 5' + 3S18 5785 2 66.41 ATTGCATAGTTTTCAATTTCCATTAAAATGCCAGCATTGCGCCGTCAAGTATGCAACGCGACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 + chr2R 5922923 5' - jockey 4986 1 60.00 ATTTAAAGTGAATTAGAAAATCCAGATCACAAATCGCTATTCTAGCTCAAGCTAACATACTCAGATCCTTTGAATATAAAACAGAACTTAACAGTTTGCTTAACAATATATTCCGCCTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTT:1 + chr3R 12569657 5' - hobo 488 1 77.40 AAGGAAGCGGCAGGAACAACGCGTCAAGTACGTGGTCTGGGATTCAAATTGGTTTGTTGAGGCATCCACCGTCTATATATATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr2R 12543185 5' - roo 9032 1 57.53 AGAAAACAAAACTAAAAGGCAAAGCAAAGCAAAACAAAGCAAAACAGATTAATGAAATTGAGATAAAATTGCATAAATAAATTTACGATATAAACTAACACATATCAAATCAGGAGAGAATTCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATC:1 + chr3R 14553598 5' - INE-1 564 1 67.81 AAATATTTCCCTCGATTTTTCACAGCATTCGCCTCTTCTAACGAATGGACATATATATTTTCCCTGTCACATTTTGCACTTTCGCTAGCTTTGACATGGACATTGCCTATAAATCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAA:1 - chr3L 22052905 5' + mdg1 7046 2 80.14 ATATTATAAATGAAAATTAGTTGGCCAGGCAAACAAATCATTTCTTTATTTTGCTAACTAAAAGCGTTGAGCTATTATGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCG:1 - chrX 10162912 5' + micropia 5095 4 52.74 GATCGAGTCGTAGAAATTATTTTCTTTAATGTACACCCCACAAGAGCGCAGTTTTAGCACTTTTACTTTGATGTGAGGCACATAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAA:1 + chr2L 22737068 5' + Cr1a 163 1 53.42 CAACACCAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTGTGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGTGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chr3L 15026795 5' - opus 7466 2 55.00 CTATACACATTAAACAAACATAATAATACTAATGGTAGCCAACAAGTGCACATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGCTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 + chr3R 19859532 5' - opus 7497 2 41.98 GGTTGTGAGAAATGTGCAGGAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAAT:1 - chr3R 10472822 5' - mdg1 403 2 70.15 GCTGAGTAAGGGGTATCTGATAGAAAAAAAGCTTATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACG:1 + chr2L 16936423 5' - FB 991 3 78.77 TCCATTTCCTTTGTCATTCTCCCACTGATTCCAAGCACAAATCGCTATAGCTGCCACAAACTGATGGTCAGTTGGGATTTCTGACTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGT:1 - chrX 7523354 5' + rover 7270 2 63.43 GAAAGAGCCATTTGCCGTTGTCCCATCGAACTACTTAAATGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAA:1 + chr2R 16810223 5' + Quasimodo 97 2 73.29 CTCTCAGCACTGGCGACCCACAACAAGAGCGGTGCCGAATCACCAGACCCAGGTACAATCGAGGAAACCGCCTCCTTAAGGAGCGACAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGA:1 + chr2L 6872886 5' + hopper 962 2 63.70 GACAGTGTTGAAACTAGTAATTAAGATATGATATTAATACTAAAGCTTATCAAATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAA:1 + chr2R 16441812 5' + I-element 67 1 62.33 GGCAGGGGCGTTGAAATGAAACGTGCAAATACTGGAAATAATCAAATTCAATTCAGTCAGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 14070644 5' + Doc2-element 218 1 71.95 CACACCATTTTCCTTTTCTTTCCGAGTTGCGTTTGTGTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 - chr3R 15022148 5' + Tabor 36 2 60.96 CAATACCCAGAATTTCGAGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chrX 7515771 5' - roo 9041 1 64.38 AATGGGCATTTTAAAGTACACTCCATCGATTGTTCGAATGTAATTTCATGCACATTTCATCACCATATTCACCATGCACTATCCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 3996614 5' + roo 8686 2 65.65 TTTGTTGGCGCTTAGACGCTGGCTGGTTGCTTCGTTTAGTCCCTCGGCAGACATATATTGGGAATGCTCATTGGACACCACCTTCGCGTTGACAGTGGGAACAGCGGTGTCTCGCTCTCGATTCATTTACATA:1 + chr3R 30357999 5' - roo 8725 2 81.20 GTCAAGATGTGGAAGCGCTTGTGCGACAAGGGACCGCATTGCGGAGTGGGTGGGTGTAGCGAAAAATCAATGTCCGACAAAGGCAGCTCTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGG:1 - chrX 22501256 5' - F-element 4408 1 69.60 TTATATTGAAGAGAGGCAAGGCCCCCATTTCCGCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGGTAGGC:1 + chr2L 1558648 5' + 412 7141 2 76.71 GGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTT:1 + chr2L 17240227 5' - hopper2 1533 1 69.66 CCTTATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3L 19350052 5' + jockey 21 1 77.93 GAATTACGACCTTATCTGATCTACAGATAGGCAGACAATTTAATCTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAA:1 - chr2R 23000126 5' + mdg1 77 2 69.18 TTAACATTTGCTTTACACGTGTGTTGATATGCAAAAAAAACATTGCATAGTTTTCAGGGCAAATGAGCATATGAGAGGATGTTTGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 - chr3L 9571761 5' - jockey 4954 1 53.79 CTTGTTGATTAATGCGGGCTGAAATGATACTCGAATGATAAATAATTTGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTT:1 + chr2L 8168925 5' + FB 61 1 66.42 ACAAGTGTCAAGTGCATTATGCTTGTGTGGATGTTTTCGAAAATAAATCAGTTCACTGAAAAAAAATCGCATCTCTCACGGCGAACACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chrX 958077 5' - roo 9038 1 50.00 AATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGC:1 - chr2R 8641596 5' + diver 53 2 56.72 AAGTTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATG:1 + chr3R 5453648 5' - 412 403 2 80.82 GGGTGGACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATGGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTGTGTCT:1 + chrX 22726186 5' - Helena 1237 1 51.37 TATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 + chr3L 24152413 5' + HMS-Beagle2 6916 2 61.64 CAAACTTCTGTCACTTCCTCCATATCTTCAATCAATTTTTGTACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr3R 4581802 5' + 297 6592 2 77.40 CATATTTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 + chr3L 6775350 5' + blood 64 2 60.27 CTTTGCATATTGTTTAAATATATATCTACTGATAATGAAGCTTGTGAAATCACCAGAAGAATGTTCGTTTTTGAGAGTTTTTTATTTGAAATATAAATTTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 + chrX 3197028 5' - mdg1 7439 2 69.86 AGGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACA:1 - chr2R 8641606 5' + diver 5914 2 54.70 GGGGGATGTCGGTGCAAGCCAGTTGTCACAATGAGACCGTGGGCGTGTAAAATATATGACGTACTTTTGCATACCATATCCCTTGAGAAAAGAGGTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGAGATTTTATT:1 + chr3L 51233 5' - accord2 7344 1 67.16 GTGCACTTAATTAAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:2 + chr3R 22100501 5' + 412 7107 2 52.05 CGTTTAACTTGACTAACTGATAAAAGTTGATATATTTATATATGCTAAATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAAGCGTTTCCGGCTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCAATAGCCGTCTGTCCGTATGAA:1 - chrX 19810268 5' + INE-1 122 1 69.18 CTTGTAATTTACGACTGTAACGACTTCATTTCCACAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCA:1 - chr2R 4029376 5' - 297 6895 2 75.34 ATGTTTCCAACCCTCCGGCAAACAGAAACCTCCTCTGACACATGTAAATGCGTGCTGACAGGCGGAAGGGAAAAGAATAAGTACAAAACCCGAGTGAAATAAAACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 - chr2L 14455920 5' + mdg3 67 2 71.23 CCAAACGGCTGGCCAAGCAAACTGATCAAAGCAGCTGATACCCTTGGCAATGTTTACCAAACGACTCAATCTATAGTCTATTATATAAGTTAAGCATGTGAATGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGT:1 + chrX 4511419 5' - Idefix 7264 2 66.91 CATAAATAATAGCGACTGTCTGCCAAGTTATGAATAATAATGACAACAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 25387857 5' - roo 9051 2 56.52 GTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAA:1 + chr3R 19589936 5' + BS 5078 1 73.10 GCGATATTAAACATATTCAATTCTCTGTGTATCATCCGCTAAAGAACTACAACTACAACTACAACTTCCATATCTCGCGTCGGTAAATCGGTACAATCACTTCAAAATTAAATCATTTAACATTAACATGCAAGCAAATTCTATTT:1 - chrX 23362226 5' + 1360 3261 1 77.40 GTTTAAAGGTGCAGTTAATACCCAAATATTATTGTATATATAATATAAGTTAACTTCCTATACACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTGTTGGCATAAAGTTTAAAAATTAAGCTATAGACTTGAAACTGTGTACATTTTGTTGTTAA:1 + chr3R 1961630 5' - transib2 2761 1 65.75 TTACATTAGTTTTCGCATAAAAATTGTATTGCATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCCTCATATACAAAAATCACGT:1 - chr2L 2657301 5' - diver 6023 2 76.71 AGGCTGCTCTTACTAATATATGACTAATTTTTACAGGTCCCATTGCTTTTCAACAGCTTTTCTAAAAGTATACGAAAAATTAGGCAAATGCTTAAATTAGATAATAGTTTATTTCGCTTTATTTGTATGTATCGATCTATACCAGT:1 - chr3L 16757787 5' - Fw2 14 1 74.66 ATCGGGGTCATGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chrX 1103567 5' + pogo 16 1 73.29 ATTTGGCGCCAAAGAAAATTTTGAAATCAAAAGTCGTAAAATCAAAATGCAAGTTTATATATGACTTCTTCCCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATG:1 + chr2L 4198339 5' + micropia 190 2 55.48 GTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAA:1 + chr3R 3922955 5' + Cr1a 89 1 71.23 TTTTAACAATCTTTTTTGCTACCAGCACGTGCAACAGGACCAAACTGAAGCTGAAGACCAGGAAACCTTAGGATGGAAGGCAAAGTAATAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTT:1 - chr2R 7020681 5' + Bari1 17 1 71.54 CGTCTGCAGACCTTTGAAGTCAGGGTTTAGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr2R 11489144 5' - mdg1 7430 2 65.52 AAATAAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTC:1 + chr2L 11574803 5' + Max-element 50 2 50.68 AAGGGCAATACCCAGAATTTCGAGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 7515776 5' - roo 9046 1 66.44 GGGGCTCAATTATTCTAGTATTCTCAATGGGCTTGAATTCGTTGCATTTGCTATAAAAAAAAGTATTAAGAGGCGATGTTTTTTTACAATAAAATTTATTCAATTCTCGAGGGAATTAAAAAATATTAAAAAAATTGAAACAATTT:1 + chr3L 9758305 5' + HB 322 1 60.27 CAAAATAATGTCAAATCGATTAAATAAATATGTCGGTAAATTAAAATGAAATTGTCACGCACACACACACACACACACATATACACACC:1 - chr2R 15569072 5' + accord 190 2 76.40 AATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:1 + chr3R 9190451 5' + Tabor 6867 2 43.84 ACTATAGCAGATGACTTGTGTTCGTGCACATGTCAAAAGTTTTCTACATTTTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTT:1 + chr2L 5202490 5' - 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chr2R 21402734 5' + mdg3 5269 2 72.14 TTTTGGTCAATATGGCCCTTACCTGATACTCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr3L 96568 5' + roo 78 2 80.30 AATTTATCAGTGACCATCCACTTTTCGAAATCTTTACCACGTTTGCTTCCGCAATCAGAGCAGAGCAGTTGATTATCTTAATCGCGATATAATACAGAGAACTGCACGGGTGGCACTTTTTTACTACTCGAC:1 + chr3R 27478459 5' + hobo 17 1 65.15 TTTGCATATATATATGTATACATGTTAGTAATGATGTGGTACTTGGCCTTACTAAGCTTCGGCAGTGATTATCAGCGATTGATTTCACACAAGTACATGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGAC:1 - chr2L 3853683 5' - gypsy4 84 2 71.64 ACTGTGTGAAGATCACTCAGGAGCCGCCTCCCGAACGCCTCATTCACATTGTCAAGCGCACTTGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACT:1 + chrX 7325648 5' + pogo 1861 1 54.62 GGAGATAGTAAATGATGATGAGACAAACAGACGCCCCTGGGAGCACGGAACATATGCTGGGCAATTAACGCAATAAACGTATAACAAAAGACGTAAGCAACAACAAATGCCGGTGAAAAACTAACGAAGAAAATAAAAA:1 - chr3R 20990417 5' - Tc1 1403 1 53.96 ACTGATTTATCTATGAGCAGGTGTCATCCTGCACACTCACCTCAGAACTATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr2L 16884950 5' - pogo 2084 1 72.60 ATCATTGAGCTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 + chr2L 10184429 5' + Doc 63 1 62.77 ATATATATATACATGTAGATGTAATTTTGATTCACTTGCTACGGCATTCGATTCAGCTACTCGTACATTATCCCAAATACTCTATTCTAAGCTCCCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 + chr3R 15337993 5' + blood 17 2 71.85 CGGTGTAGTGTAGGAGCAGTGTGGTACTAATTATACGGCTGCTTATGTTATTTGTGTAGTGTAGTAGTAGACTTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGG:1 + chr2R 5403460 5' - baggins 5331 1 51.11 GCGGGAATGTCTTTGTACTATTATTGCTACTTCAGTGATATTGGGCATGTGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGTGCTGCACTTAAT:1 + chr2R 19351966 5' - Burdock 6330 2 59.29 CTTCTGACTCTGCGGATGTGGGAAATCTAGCCATTCTGCAGATACAGAGCTGGCTCTTGAGATCTTAAATGACCAATTCGGGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 - chrX 22853495 5' + FB 29 1 61.19 AGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAA:1 - chr3L 27415309 5' + transib2 67 1 63.01 TGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGAC:1 + chr3L 24934307 5' + HMS-Beagle2 6944 2 66.18 CTTTCGTTTGTTGAAGTCGATTAAACTATATGCAACGATATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3R 25904245 5' + 412 74 2 75.00 TAGGTAAGCTTTTTCTTGAACCCTGATATTTAATGTTCAGTTACCCTTAACCAAAATAAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 - chr3R 17656474 5' + mdg3 5302 2 54.07 AATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAA:1 - chr3L 24208204 5' + Quasimodo 65 2 67.12 ATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 14553105 5' - roo 9015 2 60.43 CATCTCAAACAGTCCATGGGTGTACGACTCTAGGAACTCTGGTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 25304844 5' - roo 9033 1 59.59 CGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCT:1 + chr2R 21402618 5' - mdg3 161 2 72.60 GCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr2L 246087 5' - roo 340 2 65.07 GGAAATCCGCATGCTTAATCCCAATTTTAAGCTGCTATAGACATAGAAATATCGAAGTCCAACAAACGGACAACCAGACGGACATGGCTGAATTGAATCGACCAGAAATCCTATCAAGAAATAAATTCATATCAACTAATCTAGTA:2 + chrX 16368847 5' - INE-1 10 1 75.34 AAGGTCTCCAGAGGTCACCTGACCAAACGCGACTTTAAGGTAAGCCAATAAACTCAAAGAGGGTTACGCAAGTCCCCTTGGATAAGCCTATCTTCTATGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr2L 2030988 5' + 412 7076 2 67.12 AAACTGGAAATGGGGTCAATGGCAAAAGCATTTGAACTCTTGTTTATTTCTGGCGAGTTTGTTTATGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:3 + chr2L 13927705 5' - roo 9017 2 54.11 TGGTCTGCTGCTGAGAGCCATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr2L 245991 5' + roo 8723 2 58.90 CAAGCAGTTGTATCTACTGACTCAGACTGTGGAAAATAAATTCAATGCCAGACGCCAGCTCCCTATTTTACATAAAGTATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2R 12543037 5' + roo 29 2 62.86 CCTTTCGTTTGGTTTCTCCACCCTGCAATTCTTCCCCAAACTCTCTACCAGATTCTCCTACCACTCACTGACGTTGATTTCGTGCCATTTGCTTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGA:1 + chrX 7435962 5' - 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chr3L 9497800 5' - jockey 4903 1 79.45 AAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 + chr2L 17250738 5' + opus 7055 4 73.21 CCACTTTAACGACCACAAACCGCCCAATCCTTTCAGCCTTGATTTTAAGCCTGATTTAAGCGAGTTCGCGTGGTAGATGCTGAGGTGGCAATTCGGAAATGGTTGTTGTCTAAATATGTGTTTAGACATGATAAGTAGG:1 + chr2R 1764017 5' + rooA 12 2 78.42 CTGGCAGCAAAAATCTACGAAAAAGTCGGAAACACTTTGTCGGTGGCTTGGCTTGTTTTTTTGGGGCTTTGGTTTTGGTTTTGCTTTGCTTTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chrX 7515607 5' + roo 28 2 66.44 GATAGAAAACATAGTTCATTTGTAAAAATAAGTTTTAAAATGATATATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr2L 10746595 5' + pogo 40 1 54.79 AGTCAGCATACCTGTGATCATGGTTCCCTTGAAAGGGGTCTTGTACTTCTCGCTAATGTCTCCGAGAAATTTGAACAGCAGTCCATCGTTGGACATGGCAAACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTCTTTAA:1 + chr3L 17853443 5' + hopper2 1216 1 71.92 GCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCG:1 + chr3L 25232769 5' - 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roo 9010 2 58.90 ATTTAAGGTGCTGCGAAGGGTTAATTTCGGAAAAGTAAGTAGCATAATGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chrX 16579258 5' - roo 330 2 69.18 TACTTGCCAACTTTATGGGTCAAGTGTTTATTACGCCCACGGGCGTGGCACACGATGAGTACTGAGTAGTGAGAACTGAGTACCAAGTACCAAGTACCGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr2L 16106061 5' - hobo 2937 1 74.19 GGTATTCCCCCAACACACCTGAATTCTACACTTGGAACAGAGGCACTCTCTAATTTGATAAATAATTATAAAAACTTCATATTTATACTGTACTACTACTATATACTCACTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGA:1 + chr3L 9713888 5' + G2 2651 1 76.71 AAGCCCGTATTAATTACACAACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chr3R 18815995 5' + hobo 24 1 67.44 ACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:2 - chr3L 9909771 5' + Transpac 4992 2 64.38 AGTTTTAATCAAGAATATAAACAAGTTAGCGCGGAAATGAAGTCCCATCGGTTGTCATCCATTTATGTATGTATGTATATATATG:1 + chr2R 21197507 5' + G3 4508 1 56.47 GAAGAAGTCGATCGCCACAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATAAA:1 - chr2R 5674721 5' + S-element 85 2 73.29 CGTGTGGGAAAATGAAAAAGTCATTTGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGG:1 + chr2R 4012502 5' + F-element 296 1 60.27 CTGGGCCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAAGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAG:1 - chr2L 22640195 5' - invader4 262 2 68.60 TAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 - chr3R 10472793 5' - mdg1 7400 2 56.16 GGCATTAGCAACGCTGATGTGGCTAATAAACTTGCCGCCTCCGCTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 + chrX 14548368 5' - 297 366 2 56.57 ATGCACATATGTACGTTTCTATATATGTAAGTTCACAGTATGTACATACATACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATT:1 - chr3L 16870245 5' + FB 72 1 68.49 CATTTTAATGGATGGCAGAAAACTGGATGATCTACAAAACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAA:1 + chr2R 3089975 5' + Doc 4576 1 73.97 CATAAAAATGTATAAAATTTTATCTGAGATGATAGTTGAAGAGGTGTATATATATATAACAAGCCCATGAAACCTTCTTCTACTAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCCTCTGCTCTCCCGCTC:1 + chr2L 8348837 5' + F-element 369 1 45.08 CAGCAAACATTACAGCCCGTGTGTGTTTGACACACAAACCATTCAATGTCAACATTCAGCATGTGTACATTCTTGATCTATTCCTGATTCATAACTGAACTTGGTGTGGTCTACAGGCAGATCGCTCGTGACAGCCAAGTGCTGAC:1 + chr2R 10781348 5' - mdg1 265 2 63.70 GTGAAAAATTAAGATAAATCGTTTAATCACCATTGAATAGATAGGTTTCACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3L 14553044 5' - roo 408 1 61.87 CGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTA:1 + chr3L 2724969 5' + Ivk 52 1 50.00 AACTAAACTAAATAATAACTAACGTTTGTAAACCTTGTGCGTGTGTGTGTAAAACAGTTAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAG:1 - chrX 12569649 5' - diver2 42 2 62.33 CAGTGCCACCCGCTGGACCTCCGCCATGGATACAGATTCCATATGTACTCCCTGCATCACAATGGCATTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGT:2 + chrX 1287789 5' + jockey 4832 1 53.42 AAAGATTTTAACTTTAAAAAGCTCAGATACAAAATAAATTATTTCAAAACCCTAAAAAAAAATTGAGTTGTAGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr3L 22753028 5' + Doc 62 1 50.34 GCGGCATGGGATGTTCCGAATGGCCTCTCATCGAGAAGAATTTAAGCCTCGAATTTCGCAGAGGGGAGACCGAGCTAAGCAAATTTTAAGCTGGCGCAAGGCTAGTGATAATAACTAAGGGGGCGAAGTCAAGCCCTCCAACATAA:1 - chr3R 25641655 5' + gypsy 360 2 61.64 AGCACAAAAAAGTGCTGGTAAAAAGCAGCTTAAAGTTCCTTGACTTCAATGCCATATAAACTCGATTTAGGTTGCAGAGAAAAGTATCGTGGTGGATGTGGTTGGTACCCATATC:1 + chr3R 25523297 5' + R1A1-element 5008 1 72.17 GGAGAGCAACGTTTTTCGGCCAGCAGGGGGGGCTATGCCATGAAAATGGCGTGTGGCACGAAAATGTGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCATAGTCATACATACCTAATTAT:1 - chr2L 7559812 5' + mdg3 5290 2 51.13 TGTATGAAAACTAAATGTATAGTTTTATAAAAAATATATTACTGTAATAGGAAAATGATTAAATCTAATTTTTATTCAATAATTTAAATGTATTTAAGCAAACAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAAT:1 - chr3R 16527886 5' - Bari1 262 1 72.60 GGCGCAGAGAATCGCAGATTCAGTATGCCAGTTCTATCGTAGAGCATACAATGTAGTTGAATAGCCAAGCATAAAAAACAATAAAAAAGGCAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 29250591 5' + G2 3066 1 84.62 GCTGACGATGTCCTTGTTCCCATCCTCGTCCTTTGGCCAAAACTCGCTATGTGGTTAACTCGGTTGGTATGTCTGTATCCGCCGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 + chr3R 27859146 5' - hopper 1397 1 70.54 GCTGCCGTGGGAAAAAGTGTTGCATACTTATGAGTGTTGGCAAAGAGCTCCGGAATGAAATGTGAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCC:1 + chr3L 17133800 5' + jockey 4746 1 55.86 ACTGACCGTCCGTTTGAAATGCCATAATTTTAATGGGATATTATAAATCGCACTTGCTAAATGGAAAATCTAGCTATTTTACGGCCTAGTTATATGGAAACCTAAAATATCAAGTTTTCTTATT:1 - chr3R 29082584 5' - Q-element 357 2 75.00 GTCTTAAATGGGATGAGGTTGGTTCAGTTTTGGTGGACGTGGCGATACAAATTTACAAGACAAAAACAAGAAAGAAAGCCATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAACTAGTGTGAA:1 - chr3L 22845260 5' - INE-1 537 1 70.54 ATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 - chr3L 23456271 5' - 1360 3335 1 60.71 AAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGC:1 + chr3R 19450156 5' + roo 109 2 65.22 CATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGATCGTGATATAAGAT:1 + chr2L 17029611 5' + blood 81 2 71.72 ATGGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTG:1 - chr3L 23986616 5' - opus 7440 2 64.14 GAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr2R 19555030 5' - pogo 2061 1 55.20 AAGCTCTCATATGCAGTATCTGCCCAAAAGTATGCATTGGATATGACACGAATGCACTGAGTTGGGGAAGAGTAATCCCTAAAATTGACCTATAATTTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2L 3762880 5' + jockey 30 1 64.38 TGAAGCTATAAACACAAGAAAATCACTTAGCTTAAAAAAGATTTCAGGTATTTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 96451 5' - roo 395 1 76.03 TGGGAAGGAGGCATACAAAACAAAATAAATAAACCCAATACATATGCAAAGCTTTTATTCTTGATATGTATAAAAAAAAACTTTGGCACAGCAGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATG:1 + chr3R 9351957 5' - Tirant 377 2 70.14 TCCCTGCACACCGGCTGCCCGGTCATCGTGGGTTCCAAATGGGGTTCGTAGACTTGGAGCTCAGATTGATTTGGGTATTGTAGAGGAGACTGAAGCAGGTGGGGAGGAAAATCTCGATGAATAAT:1 - chr3R 30510419 5' + gypsy12 26 2 62.40 GCATGACCTTTTTGAGTGCCTTTGAGCAGACTACTGGCATTAATATTAAATTGGCTTTTACGGGTGCTATGGGCTCTTAAAGTTTAATATCTACAATCGATCAATTGGTATTTTTAAATACATATTTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr2L 14201533 5' + roo 8663 1 79.45 TATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTCTGTA:1 + chr3R 9190519 5' + Tabor 70 2 66.92 CGAACAACAACCACTCCAATTCCCCAGATCCCGGTTTTTTGCAGTACTTTTTATTTCACATTTTACTTTAGCGGTAGCCGAAGATGAGAAAAACACGCGAACAAGTTGCCCACTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAG:1 + chr2L 16088899 5' + 3S18 60 2 78.08 AAATGCTTTTGGCTTTTAAGGGTGTTGGCTTTTAATGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAA:1 - chr3R 28627668 5' + copia 69 2 75.78 CTGCTCCTTAACTAGAATTCTTTGGTTTTAATCAAATTTATAATGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3L 18467268 5' - hobo 2909 1 54.37 CTCTCCTTTCTTGTTTGCTTCTCCCCGGACCCCTCGTTTCCCCGTTTTTGGTTGCTTGTGGGCTTTTAACATATATTAAAGTTAATATTCTCTAATGGTGGTCTGTCCTCTAGCATTCTATTGTTATAAATTAATATATTAATATT:1 - chr2L 439372 5' + Tc3 292 1 59.59 TCTTATTTCTTTAAACAGTGCTTATTTTTATTTTTTAGACAACTGTTACTATTTATAACTTATACTACAGTGAATCATAGGTGTATATGAGTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTT:1 - chr3L 25008197 5' + X-element 45 1 44.52 AGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 - chr3R 10472776 5' - mdg1 7383 2 67.81 GGAAAGTACTGATTATGTGAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGC:1 - chr3L 25482996 5' - accord 492 2 52.52 TAAAAATATTTATTTCTTATCCAGTTTCGTCGATTTTAAGCTATGCATAATAAGCTATGATAATATAAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGA:1 + chr3R 12929180 5' + invader4 2797 2 57.04 AAGATACAAAAGTAAATAACAGGGTCAGGCATCCGAAGCTAAGCCAGATCCACTCCTGCTGCATGCTGCAATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCAT:1 + chr3R 29418626 5' + mdg3 24 2 65.07 ACTTACTCTTGACAGGTAAATTTAATGTATTTTACCTGTAAATCTATACATAAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr2L 13250314 5' - opus 7479 2 69.93 AATTGTGGCGTAATGTTGTTGAGCAAATGGGTTCTACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3R 24279350 5' + roo 86 2 80.14 AGTAGGAGGTGACCTTATTAATAATAAAAAGAGATTAAATGAAATGACATATCGTATCCAATTAGACGTATCAAATTGAATACCAGTTTTTCACTGAAACTAAAAGAAATGTTAATGCACATTATTTTATTATAATTTTAAACTTT:1 - chr2L 4157713 5' - 1360 3060 2 81.51 AGAGTCTAGTCTGTCTGTCCTCATAAAAGTCAAGAAGTGAAAAGCCAAAACAGCTTGAAATTCCAATAGCGGCTACAAACTTGAAGTCGTTTTAAAACCTTGTTACCGTCTTTTCGCTTTTACAT:1 + chrX 463549 5' - Porto1 94 1 79.20 GAGACTGTTTGCATACTTTCAGGCGCCTCTGACAGGGCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr3R 19531211 5' + hobo 1 1 78.00 ATATGTATACATTCCAAAGCTACAGAATGCTTTCAAATTCAACTGCAGAATATAAACAATCTATAATCAATAAAAATCTTAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 22725511 5' + roo 36 2 60.69 GTGTAAATCATTTAAATTTAATGAGATGACACCAAAAATCATTTTGCAATTCTATTTACGAGCTATGCATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - 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roo 8612 1 50.68 GGTGGGGCGAAAAAATGCGATGAGCCATCGATAGTTCGATAACATCCCGCGAACAATCTAGCGGATGCAATCGAATTTAAGCTAAGTGTTAAATGGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 19836558 5' + pogo 20 1 71.92 GAGAGTGGGAAAAAGACAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3L 18658901 5' - roo 339 2 68.06 TTTGTGTTTGTTTCGAGTGGCAAAACTAAATTATTTCATCCACATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGC:1 - chr3R 29418748 5' - mdg3 5421 2 68.97 TAATATGAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATG:1 - chr2L 17524645 5' - Quasimodo 6917 2 76.00 AAATACTGCACCACATATGAGTTTACGTGTGTAAATAATGTAGTATGTGCCCATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:2 + chr3L 16358680 5' + 412 7140 2 76.03 ATATTTATAAGATCGGTAGAACTTAAAACTTTTTACACGTTGGTGATCGTTCTGACATTTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGAAATTGTGATCTATCAC:1 + chr3R 7981472 5' + jockey 68 1 58.22 GAAGGAATATTGGAGTTAATCAAATGCTTGGCCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAA:1 + chr2L 12545299 5' + mdg1 492 1 74.62 ATTATTTATTATGATCTTGTTGTTTTTCATCCTAGCTCATTGCCCATGACCATGACCATGCCCATGCGCGTAGGTAAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTT:1 - chr3L 15264509 5' + jockey 4790 1 54.11 GTGAATGTGGAGAATATAGTTGCCGGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 - chr3R 4528460 5' + F-element 38 1 66.44 AATATAGTATATATACTTTTTGCGTCCTCTAGCTATAAGCTGTTTGTTTTTGTTGTGACGGGCGCGGCATAACAAACTGCCATCATAAATTAAGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCCAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr2L 12353895 5' + jockey 4693 1 63.12 CTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chrX 10567848 5' + roo 8742 2 72.60 AGAAACTTAAATTGGTGGAATAATTTGAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACAT:1 + chr2R 5917805 5' + I-element 5095 1 47.89 GATAAACCTTCACTATAGACTACTTCGCAGAAAACTACTTGCAATCACTTCTCTTCAATTCCAAGCCCCCACAATGCCGGTCATTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 - chr2L 436582 5' + copia 4906 2 59.59 ACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr2L 9485663 5' + 412 54 2 66.10 ACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACA:1 - chr3R 18815954 5' + hobo 82 1 72.60 AATTGACCCAAGTGCTTGTGGATTTCATTTTTTTGGGGGGAGAAAATCGATTTCAAATTAGCGGATTTATGAAATATATTTAAGACCGTTTAGCGAATTTATATACAACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 + chrX 2934425 5' - S-element 1708 2 80.00 ATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTCAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr2L 15987996 5' - roo 325 2 74.66 CAATTAGCTGTGTAATTACACGGTCTTTGTGGACCGCAAAAGTCCAAGTCAAGCATTCCACTTATAGTATCGCTAACTGTATAATCCCAAATAAGAAGACTTTAGTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3R 27794888 5' - roo 9030 1 53.57 CACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chr2L 16948723 5' + jockey 4744 1 70.07 CCACAGAAAACAACAGAACATTTTGTTTTTATCCGCATCTGCATGCACTTCTAATGTTTATAAATAAATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCACAA:1 - chr3R 15885230 5' + I-element 52 1 52.05 GACACGAGGAAAAAGTTCTCTTTCTGCGTGGGCGCACAAAAATTCGATGGGTTACACCATCGCAGATTCGGTGAAAACTCATCCTTCTTTTTTTTCTGATCTGACCGGAGGCCTATCTCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAA:1 + chr3L 13224398 5' + 1360 483 1 78.08 CTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCT:1 + chr2R 11763608 5' + Tabor 87 2 74.66 GTTGAAAATTTTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3R 20744056 5' + roo 8739 2 72.60 GGAAGGGCCAAAAGAAGAAGCCAGTCGATTGGACGAGGCCCGTTCGACTTTACTTGTTGAGTGTACTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr3L 22900188 5' - 412 460 2 52.07 CCTACCGAACTCCCGCTCCTCATTAAACCCTACAGTTGCAAACACCACCGCTCACACACACACGCACACACATACACACCAGAGAACTGCAAGGTTGGCACTTTTTTAC:1 + chrX 7980770 5' + hobo 9 1 72.48 GGGCGAAAAAAGGAGGGAACTAATATTTTAAGAAAACTCAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTC:1 - chr3R 15711848 5' + diver 5972 2 73.29 ATTTGCTGTTATTCACAGACTTTGGGAGAGAATAAAAAACAAATAAAAAGCCTGCGAAATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr2L 8956692 5' + pogo 19 1 65.75 AAGGATGTCCAGGTAAATGGCGAGGCCTACGATCCTCTGGAGAGCTCAAGCCACTACGGTGGGGAGCCGCCCTTCAAGAACATGATCACCCAGGAGGTAGCTTGACTCTTTTTATAAAGAATAATATTTTATA:1 + chr2L 14324747 5' + looper1 1664 1 55.64 CATTCTGATAACATTACAAACGCTCCACTAACATGTCTATATGTCTTGGAAGGGAATTCAAACACCCAATCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTGTCGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr3L 14551104 5' - P-element 2880 2 74.31 ATTTACAATAAAATTCAAATTATAAAAACACAAGTAATCATTTATCGTATCCCATTAACCATAAGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTA:1 + chr3R 16354396 5' - accord2 7276 1 56.16 AGCGAAAATTATGAAAAACTTTCAAGAGTCTGAAACTAATTAACTTTGTATCCAGGAGATAAGCCTCTTATAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGCAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTTATTTTATCTTCATTT:1 + chr3R 11113166 5' - mdg1 7403 2 50.00 GATAGATATACCAGTAGATTTTCATTCATTCAAGCTAATCAAATTTGCACCAAGTAATCAACAACTTTAATCACAGTGATCCCTCCATGGGATAGATATTTGGGAGATACATACATTATACATATTTGTACTAAAGAATTCATTAT:1 + chr2L 3358426 5' - accord2 81 2 60.96 GGTCCAAACAAACGCCAAAAGTAGAAGAAGAAAGCGAGGGGCTAGAAGAAAGAGAGAGGTAGAGGTAGGTCGAGAGGAAACGGAAGGATTATAATATGAATCATAATAATAAGTTAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAAT:1 - chr2R 10923284 5' + mdg1 7137 2 57.53 CGACACACAGCCACCCCATTTACCCCCTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTAA:1 + chrX 6616095 5' - Doc 4702 5 57.69 CCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGG:2 + chr3L 23456267 5' - Gypsy6A_LTR 259 1 66.44 AAAAAGATTTCAGGTATTTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 96485 5' - roo 360 2 52.74 ATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr3R 9352071 5' + Tirant 61 2 70.59 AGGCATTTCATAGAACGATTACCATGCCACACCGCCTTTTCTTCCAAATTGTTGTATTCCCAAATTGTAGTCGAAGACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATGAAC:1 + chr2L 3659050 5' + 412 7086 2 58.52 AAAGTATTTAACTGAAGAGTATTTAACATGATAGCGTTCTGGCTCACATAGGATTTCTGCCTTTATTACAAAATCGACAAGAGAAATTGCTATATTTCTCGAGTCGAGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTTGTGAG:1 - chrX 22784152 5' - INE-1 539 1 71.23 TTATAATAATTTCACATAAATCCACACATCTTATACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGT:1 - chr2L 21951201 5' - Burdock 6310 2 78.08 TGAGACAATTTCATTGTTTAAAAACTTAATTGCTTTCTACTTCAGCGTGCATATGTATGTACAAGCCAATGGACAATATGCACAATATGTTTCTACTTTGACTTATATATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACACCA:1 - chr2L 8960041 5' - Ivk 5361 1 65.07 ATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGG:1 - chr3R 24476343 5' + 412 7145 2 80.82 AATAATATTCTCTTAAATGTTAAGATCCTCAATGGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGCGGTTCGCAAATAAGAATCATATA:1 + chrX 16383980 5' - diver 180 2 55.48 TTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAA:1 - chr2L 22780909 5' + HMS-Beagle2 6972 2 79.45 TCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAG:1 + chr3R 9190524 5' + Tabor 6927 2 75.34 AATAACGGCAACACAACTTTTGTTGTCCGAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 12867372 5' + roo 44 2 55.38 CTAGCATTCAACTTTTGACTAACTACATCAAAAGATCTAAGAATAAATCAGAAATGCGGGAAGGAAGGAAGCAATTGCTAGCAGGACGAAGGACATAGAGAGCGACTGAGAGCGATAGAGCGAGAGAG:1 + chr2R 10685302 5' - Cr1a 298 1 62.50 AAGCGTCGATGCTGCGCCTATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTAT:1 + chr3L 24152395 5' + HMS-Beagle2 15 2 73.97 ATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr3R 9352081 5' + Tirant 40 2 58.33 GTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 + chr3L 17175138 5' + 412 7136 2 72.60 GGGCATGGATTAACAACTAAGGTTTGTAGTAGGGATTTAACAATATACATATATTTAAGTATATTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATT:1 - chr3L 2878532 5' - 412 434 2 56.85 GTGGGCAACTAGAATTTCATCGTCGGTTCTTGCCGTACTATAAATATCAATAGTAAATAAAAAATAAAATTATATAACAAAAAAATATAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGAC:1 - chr3R 19449564 5' + gypsy6 7431 2 65.49 GAGCCACGCGATAACACCGAATCACGACCCATACGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGA:1 - chr2R 15829612 5' - invader4 3059 2 59.32 GTCTAAAAGAATGCAACAATTTATTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCAT:1 + chr3R 13582217 5' + BS 5065 1 64.38 TCATAAATTATAGAACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTC:1 + chr3L 2724949 5' + Ivk 14 1 72.66 AATAACAAAAGTGCCAGAAAGTGAAACAATAACAACAACAGCAACGACAGCAGTCGTGTTATTGTCCACTCAGCTTGTTTTTCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACG:1 - chrX 10763601 5' + Doc 452 1 68.91 TTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTGTCGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGGATTCTGAGTGTCGTGTTGAG:1 - chrX 11954343 5' - P-element 2802 1 19.57 CACTATCCATTATAAATAATTCTGTCAGTCTCGTAACACTTATTTATTGTTAATGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2R 23287530 5' + roo 8684 2 59.00 AGGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTA:1 - chr2R 8641606 5' + diver 55 2 53.42 ATAATGAAACATAAGTTAAGCAAATTTTACGGATACGGTTGGATGCAAGTCTTCCTACTACTTACAGTCCTCGTGATTGGTAATCAAAGTCACTTGTTTATAATGATGATTGATCTTAAACTAAATATATATTATTAAAATTTAAA:1 + chr2L 8564164 5' + copia 4669 1 61.64 ATTTTTTCAACATTAATTAAAGTTACATAAAATAGTAGAAGTTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 + chr3L 10133519 5' + 412 79 2 71.03 AAGTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTA:1 + chr3R 3922953 5' + Cr1a 87 1 69.86 AGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCCCGCAAGC:1 + chr2L 11574848 5' + Max-element 64 2 73.91 TATGTCGAGGCTTCTTCTTTTCATTTTTCCCTCGGTCGCGTAGGCGCGGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATT:1 + chr3R 9883818 5' + micropia 48 4 57.52 ATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr3L 14062246 5' + Doc 80 1 69.63 AAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chrX 1103608 5' + pogo 39 1 54.69 GTTAATAGAATCTTTACTGTTTGTTTGAGTATTACTTGATTTAAGGTGCTGCGAAGGGTTAATTTCGGAAAAGTAAGTAGCATAATGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chrX 16579220 5' - roo 9032 1 58.90 ATAATTGCCGACATTTCCAGGGCGTTGAATGCAACTTCCCTCCTGTAATTTATGTGTCAAATGTAAACGCTCCCCTAGCACCTTGGATCCCGAAAAACAAAAGTATTAATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTG:1 + chr3L 18504879 5' + Idefix 7130 2 58.90 TTCATTCTAAAATTATTAGATATGCTCTAAGTTCACACGAAGCGAAAACTTCCCTCTCTTAGTATTCACCTCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGG:1 - chr2L 2279705 5' - F-element 297 1 54.11 AATGGGCCGCCGTCCGCAGTTTTTAATAGTTTGTATAATTGTTAAGCATATTTTTAACTAAATAAATTACATTTCGTTCAAGGTTTTATAATAACACAAATATTTGGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCAAAAATCGTC:1 - chr3L 23840241 5' + 1360 3187 1 73.79 ATATAAAGAGCAGGGAAATCTGAAGAGCAAATACCATTACAGCCGCACCGGGATAGAGCTAGTAAATTTTGGAATATCAATAAAAAAACGAGAGATAATGCTATATTCAAGTTCCCCGACTATCAGATAGCCGTT:1 - chr2R 5791190 5' - INE-1 553 1 62.22 AAGCGGGAAATGTGTCATCTGGTGGGCGAGGAAGCTGCCGAGAAATTGTGTTTTTAGTCAAGGTACGCCAATCGGAGAATCTCTGGGTTCGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAG:1 - chr3R 28844600 5' - I-element 5067 1 75.20 TGGGGGAACTTAATGGGCAAGGGGGACATGGGCGTTAGAGTGCCGGGTGCTGGCCTCTTGAAATTTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTCAAGACTTAC:1 + chr2R 21371429 5' + roo 16 2 64.22 ATTCTTTACGAGGGTATACTAAATAATGTAGGAAGGAAGGAAGGAAGCGTTTACCACTCATACGCTAACAACGCACAAAAGGAAGAGTAAAAGAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTATACTACTG:1 - chr2L 21744518 5' - Cr1a 162 1 53.79 AATGAGTTTTGAAATAATAATAAGTACAACATTTCTATCACAGGATGATTAGAAAAATTATATAGTGGCGTACTTGGGTGATCCAAACCGGACATTTCAATTATTTCATCCTATAGCCTGGCCTAAACAGATTTGACTGCTCT:1 + chrX 22901586 5' + 297 153 2 69.23 AACCCAAGACGTAACTCCCCATGTAGAAGATACTTTTTAATTTCAGTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1 + chr2R 17121599 5' - blood 305 2 67.12 CCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATA:1 + chr4 123950 5' + HB 106 1 56.92 TGTAATATCATTTTTGTACTAATAATGATTCATACTAGTAAAAGAAAACAAACAAATGTAGGATACTGATTAGGTCTTTACCTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 15612682 5' + roo 40 2 58.90 AACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGT:1 + chr3L 2724962 5' + Ivk 33 1 59.70 CAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTA:1 + chr2R 1522954 5' + pogo 1914 1 57.24 TTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2R 5737136 5' + 1360 63 1 77.60 GGGATATTAAACGACAGGATATTGCAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chrX 1061565 5' + 412 7096 2 76.74 GAGCAGGCAGCTTTTTATGCCAAATCATGGATAGTAAAAATCACAAAAAGCAACTAAAATGCAATTTTCAAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCGC:1 - 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transib3 66 1 76.71 CATTTGCGGTAAATATAGAAACGAATGTTTAAGCCCTGTAAAGCACTTACCTACGGCAAAAATTTTAAATTTAAAACACCATTCGGTGGGGGAAGACATTAAATATCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAAT:1 - chr3R 10713328 5' - invader4 80 2 75.71 AGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGG:1 - chr3R 11547800 5' + G2 303 1 61.65 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGAACAATGAAACAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACA:1 - chr3L 11720528 5' + Doc 264 1 61.36 AACCAAAAATTTAGAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2R 10695910 5' - roo 9046 1 66.44 GAGTTTTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGAC:1 - chr3L 4115229 5' - 1360 409 1 35.62 ATATGCAATATTTCTAACCCATAATATAGTGTATTTATGTAGGGTATTTAAACAATCGGCGACAGTAAGTTTTTAATGCTTCTGGGCAGTTTTTGCCGACTTTGTGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3R 15571624 5' + roo 83 2 70.55 GGGTCAAGAAATCTTCTTTCTTCCCAGCTTTCGAATTAAATACAATACACTCCACACAACTGTCCACAACACGAGCAACCGTTTCTTTAAGTTTTGGTAGCATTTTCTCGAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAAA:1 - 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1360 3382 2 70.83 GCGGAGATTTGAGATGACTCTGCAGGTGCATAAATAAAAAGTTGGGTAACAAATAATGATTGTGCTAGTTGATTAAATGTATTAGGTAACTTGAATCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCATTTTGCTATTCCTCGCCGT:1 - chr2R 17234337 5' - Bica 460 1 65.07 GGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGCACACATATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCATTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAAGATGAATACTCTAA:1 - chr3R 4571528 5' - 1360 413 1 73.97 ATTTTCCATAAATACATTTGGCCGGCGGGCGAGAGAGTTCAGTAACCTCCATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr2R 10865297 5' + blood 7023 2 76.03 TGTGTATTTATTTTTAAGCATGCCGCACAACTGTAGGAATACGAGCTCGACCATAATTATGCCAGGTTTTCCCGGGGTTAGTCACTTGCCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAG:1 + chr3L 905742 5' - 412 7516 2 63.70 AAAAGCGAATGCAAAAGAATTTGCTCTTGGGCTGTTGACACACCACCGCGCTTCTCTTTTATAACACTTTTTGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGG:1 - chr2R 16125199 5' - accord 6963 2 69.70 CGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:2 - 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chr3R 13509459 5' - hopper2 1543 1 65.94 CGCAAAAGAAATATTTGGATGCAAACCATATCTGAATCTCAAACGAAGAAACAATCCATTTTGATAGTACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAATAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAA:1 - chr4 347774 5' - Tc1-2 1568 1 63.70 AATTAGCATCAGCATATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr2L 17136225 5' - hobo 2889 1 61.67 ATGGGAACGGGTTAAAAATAAGTCGGAATCGGATTCAGGCATAACAATTTCCTGTCAATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr3R 31490900 5' - roo 9040 1 63.70 AAATTACCAAAATCGCAATATTTCTATGTTACACATATAATAGAGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCAT:1 - chr3R 11749721 5' - Tabor 7246 2 70.55 TCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATACATTAGGGACAC:1 - chr2L 22684588 5' + transib3 83 1 65.07 GGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAG:1 + chr3R 19859621 5' - 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P-element 2844 1 55.56 GTAATTTATTAGGGTTAATATCTACCCGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:2 + chr2L 16089558 5' - 3S18 305 2 59.59 GCTCGCTGATAGCGTTAATTATGCAGGGTCCGCAGCGCTAATTATGATTTGTAAGCCTCGATAAGTATTTGTTTCGCATTTTCTTGCGCTGCTCTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCT:1 - chr2R 9649671 5' + gypsy5 27 4 54.81 CCATTAAGAATACAAATGGTGAGTTATGAACTCGATACATTTTCAATTCAATTTTCGAGAAAGTGCGCATTGATAGTGAAAGTGCATCTCTATTGCGAAATATAAGTTCTTTGTGACATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr2L 6183951 5' + pogo 1 1 40.41 GAATTTGTTTGAATTTTTAATTAAAACGCTTTCGTTGACTCATCCTCAAAGAAATCGCGATCGCACATATGTTTTCGGTATTTTTGGATATTCGATTTGTCGATTACATAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 + chr2L 436410 5' - copia 242 1 77.40 ACGTGCGCATAGTCTTCCTGTTAAGATTCCTTTGGATATTGGTGATTAATTAGACACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCC:1 - chr3L 7837063 5' + G2 2914 1 56.80 AAAGTTTAAAAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 + chr3L 13634201 5' + 297 6643 2 64.14 AGGGTTTAGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 + chr2R 11489165 5' - 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chr3R 16181243 5' - roo 9020 2 52.05 TGGGGAGAGTGTAAGTTCATGAATTTGTTGCATGTTCACATGTTCCCTTATGTGAATACATACATGGGGTAAGGAAGTCCTTAAATTCTAACAAGAAAGAATGCTGTATTCGAGTTCCCCGACCATCCGATACCCTTTACTCAGCT:1 - chr3L 2179754 5' - INE-1 545 1 52.74 CTGTGCCGTTTTTCCATTTCGGTCTAGCCATCAACAGTGTTGGCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chrX 12191506 5' - pogo 2092 1 76.42 CAAATGAAGCATTAATAAAACCAACGAGCTGTTTGCTTTTTCAATAACATGTATATGTTGAGGGAATAGCCAATGTCTAAAAGTGTAATTAGGCCATAAGTATATTAATGTTTAGATACCGGTCAAAATAGTAGACAGAGTG:1 + chrX 12963785 5' + Circe 7392 2 80.28 CATTCGGATGTTGTTTTCGACAGGTAAACGAACTACGGAGTGCTATTTAATATTATAGAATGAGGTAAGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 + chr3L 16212711 5' - Transpac 261 2 51.37 TTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr2L 22015995 5' + Tirant 8115 2 67.07 TTAAATACGATCAAAGATCTTTTAATATTAAAAATGTGATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1 + chr3R 17546641 5' + blood 7097 2 75.34 TATACTGCTCAATTTGGACAAATCGCTGGTGGGCTGGAGACCAAACTCGGCCTGGATCGCCTGGTGGAGGGACTTCTTCAGAGAATGATTAACAGAGTGAAGTGCTGTACTGAAGAGTGTAGATGACATCTGTTTGAAGATTATTT:1 + chrX 8143429 5' - Q-element 285 2 54.11 ATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATT:2 + chr3L 24291982 5' + rover 7026 2 70.55 AAATCGGTTTAACCCTATTTAATCTCTTAATTATATTGCATTGAATTAGACCTTTCAGGCATTCATTAAGATATTATCAAAGTACTTAACGCCGCGAATTTCCACATCTAGTTTTGCATGCGAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTG:1 + chr3L 14249287 5' - baggins 5029 1 78.08 ATAACATTGAGTGATATACGAGAGCGGAGAGGGTTGATTGCTCGACTCGACTCGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGG:1 + chr2L 2530403 5' - accord 139 2 60.33 GATATTGATATTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chrX 4778140 5' + 412 24 2 67.59 AGAGTGTTTACATGTTTAGATGGATTATGTTGGTTTTTTTTCCAGAAATTGAAGTAGATGTTGAAGATATTCAGGTGTGAAGGCTTTTAAGTTTTAAATACGAGATGCTGGATCTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCG:1 + chrX 21083867 5' + HB 12 1 73.61 GCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTT:1 + chr2R 12787831 5' - 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chr2L 2276832 5' + F-element 33 1 65.75 GCTTCCACTTACACAATCCATGGTGGATTGGCCAATGAACTTGAAGTGCCAACGAGGCTATCCAATTACAAGTAGAGCGCTCCAAGCATTTGAAGAGTGTGTGTGTGCTACGAGCAGAATCAGTATCAGAATCAGAATGAGAATCA:1 - chr3R 22816334 5' - transib2 2531 1 73.97 CCAATACACACCCATACCACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTCTGATCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATA:1 - chr3R 20175785 5' - hopper 1343 1 66.44 GTGTAAAAGACGTTGGAAGACTGACGTCCAAAGCTTTGGGTATTTTATTATTTTGTTTTTTAAACTTCATACCAGGTACTTGAAGAAAACGAGGGTATGCGATAGCTTCATCTAAATATTATTTATATAAAAGCAAAGTAAAGTA:1 - chr2R 16156952 5' + F-element 4670 1 74.48 ATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1 - chr3L 13827357 5' - hopper 1351 1 60.96 AGCGTTCTGCAGAACAGGCAGAGACAACATTTTTAATTGTGTCTTACACAATCAGTACTGGGCAACCCTTGGACAGTTTCTCATACCTATCCTATTTTCTTTATTTTTACATAAACCCTACTACCAGATACCAGTTACTCAGCTGG:1 + chr4 1186340 5' - INE-1 543 1 63.01 ACAAACAAAAGTTCGTATTGCCCACTCTGAGTCACGAACAAAGTGTACGTGCTTCTACGGGCACATGGAAAACCCATTGCCTAAATCCAATGTTGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATGTTGTAGATCGCAA:1 - chr3L 24152580 5' - HMS-Beagle2 7172 2 66.21 CTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2L 22015970 5' + Tirant 15 2 67.19 GTACGCTGCATGTATTATTTATATATGTTGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGAT:1 + chr2L 16264209 5' - Tabor 7279 2 47.26 AAATATTTTCTGCCTTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACC:1 + chr3R 9160665 5' + copia 55 2 54.11 GACATTAGTGTGCGTGACCAAAGGATATTTAGTTGAGCTACCAAAGATGGCATCGTGATGGTATTGCGGTAAGGGCTGAAAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTT:1 - chr3L 13000414 5' - roo 66 2 55.48 CAAGCATCAGCTCAGTTCAGTTTTTTTTTTAATGTTTTGCTGTAATTTTTTGGTCTTTTTCGACTCACTTCCGCGTGCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTT:1 - chrX 10542550 5' - I-element 347 1 76.92 ACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3R 21705943 5' + 297 4 2 76.00 GAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATA:2 - chr2L 18149514 5' - Bari1 1629 1 71.23 TAGAAAAACTAGCTAAATAATCAAAAGTCATAAAAATTAATAAACATATATATTTATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATGCACATTTTAGTTATAAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2R 8305358 5' - roo 394 1 73.97 GTTCGCTCATGTGTTTGATGTATTTTAAGTCAGTTAACACAATGGATTTTGAATTTTTATATATTGAAAGCAAATCATTTTCATTAAAAAATTTTAATTGTTGTTTTTGAGTTCCCAATGCTGGGTCAGCACTATGATATTATGTT:1 - chr2R 11844439 5' - Gypsy6A_LTR 46 1 73.29 GGAGTTGCATTCAAAATGTATTTTGGTCGGTGGCTTTTGTTTTGGTCTGTGTTTGTTTTCGCTTTGGCATTGTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGAGTTGT:1 + chr3R 21675521 5' - I-element 5095 1 56.55 ATTTTGTTGCTTTTCTGCTCGTAATTGAGATAAATGCATTTTAAATGAGCCACCGCAGCTGCAGCAGCAGCAGCATCTGATTATCGCCTTGTATATTGCCATTCTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTATCCAGT:1 + chr2R 9026046 5' - Porto1 4192 1 54.11 ATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3R 30634951 5' - roo 323 2 73.97 CCGCGAATATTGCACAGAGGTAAAGTTTGCTACACGCATAGTGAAACGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chrX 3996501 5' - roo 9005 2 67.86 GGATTTAGATTTGAATTTGGCTGAGTTACATGGCTGTGTGCTTAGACGATTGTGCAAAACAGATTTGAGCTGGGCACAAACAAAAAAAAACACACTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chrX 13395379 5' - roo 9048 2 67.14 CTACTCGATGTTTATTGTGTTTGAAACTAAGAACTATTTGGTACTTCTCCATCGCTTTATGAACTTCATTCTCTACAATTCTCATAATGATTTTTGTCTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 20594086 5' - roo 386 2 69.86 CTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCT:1 - chr3L 24934378 5' - HMS-Beagle2 7113 2 75.34 ACCGACCCATTGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACA:1 - chrX 21667980 5' + gypsy2 26 2 72.60 AAATTCACCGCGAACCACACAAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3R 24476399 5' + 412 7089 2 59.59 ATATACGCATTTCTAAATAATCTATGACCAAGTGCACTTCCCAAGGCCGTTAAAAAGTTGTCCCTAGCAATCAAGTGTGTGCGTCGGCAGCGTCGCAGCA:1 - chr3R 24139454 5' - HMS-Beagle2 187 2 59.00 ATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1 + chr2R 11763584 5' + Tabor 6858 2 60.78 CAAAATAAACGTTTTGTATCGTGACCAAAGTCAAATGAAAGTATGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATAC:1 - chr3R 17897200 5' - hopper 1342 1 64.83 ATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGATGATCACGTGAGGCCCATCCCAAACG:1 - chr2L 5069689 5' - Rt1a 4700 1 81.51 AGAGTGACGAGGCAGACGAAACGCACCAACGGTCGTGGTTTTTTCTGTGACAGTGCGAGATGTTTTATCCCAAGAGTTGGGGCATACATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTT:2 + chr2L 21951090 5' + Burdock 6167 2 64.38 AACACAACTTTTGTTGTCCGAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTACATGAATCGAGAG:1 - chr3L 12867363 5' + roo 58 2 62.22 GGAAAAACTCCAGTGACTAGCGGCCACAGAGGTATACAAATGTTTGGCAATTGGCCGAATTTTTCTAAAATCAAATGCCCACATGTGTGTTGCATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTCTGAGAACATACATAC:1 - chr3R 26242379 5' + 1731 4378 2 53.42 TATTGCTTTTTGGGAAAGGCTATCTTGGTGTTGAATTGAATAAGAATGATGCAAACTAAAACGTAGATACTAGGTTTTCGAAAATTTGTTCTTAAGTTAACGTTACTTCAAATTTCAAAAACGATGAAAGCGCGCCAAAAGTAATC:1 - chr3L 12206202 5' - transib4 139 1 79.45 GAAAGCGGAAGGGAACAGGAAAATGAATTAGCTGAAAGTAGGCACAGTGTTCTTTTGCTTGAATAAAATGTAAAAACAAAATGTTATGCCAGTTATTTGTATTATTTTAATATTGTTCAATGAAAAATTGTCAATATATATTTCTA:1 - chr2L 7401133 5' + TART-A 13337 1 71.92 TTTATTCACGCTTGTTGTCATTGGCTGGGCAGCTGGGGGAAGGTCTAATTGAATTAGAGTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 11133642 5' + roo 30 2 50.00 TCACAGAGCAAACTCATTAACTACACGCTAAACAAACCGAGTGTCGGGACAAGCAGCACCGCCAACATTGGTGTATATTTAATAATTTTAATATATTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATACTGTTTAATTATATTTTATAAAAA:1 - chr2R 14149624 5' - S-element 97 2 48.63 TATATCTGGTATCTTTGAGATGTCAAACAGCTTCGATTTGGTGCTAAAATCCTTCTCAATTTTTTCCACGATCCACCCAAACACGGTCTTTTGAGCGACCGGCATTCCCTCGTCGAAGGTCAGGAATCCGGATTGGATAACCTTAG:1 - chrX 22497530 5' - GATE 8092 1 54.79 TTGAATATGACACATTGATAGGAATAGTTTTCGCTAAGTTTTTGGGCTTTGTGGCCCAATAGTTACAGCAATCAATTCCATGGATTGTAAACTCTCAAACATTATTAAGCTTTGATAAGTAGTAATTTTTAAGTTTTTTAATCTCT:1 - chr2R 18045387 5' - hobo 2511 1 65.07 ATTATATAGGAAAATTTAACTTGGATTCGGAAGTTGGGGCATTGCCTTGCGGGATACTCAGAGCTGATTACAACACATTTTAGTTGAGAAGAACACCGACCTTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATT:1 + chr3R 17904729 5' - Idefix 7274 2 54.79 TATCCTTTGCCAAATAGGATATCCAATTTAATGTTTCGCCACAGAAAACAACAGAACATTTTGTTTTTATCCGCATCTGCATGCACTTCTAATGTTTATAAATAAATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr3R 15885268 5' + I-element 14 1 73.29 ATTATTATTATATAATCAAACCCAAATGCTTTATTGATGGCCTGACAAGTCTCGCATACGGATACGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3L 19199621 5' - hobo 2924 1 62.86 AAAATACGCGCGTGGTTCCTAATGCTTTTATTTTATTTTTTTTTTTAAATT:1 - chrX 10784266 5' - TART-C 11098 1 90.20 CTGGCACGACATTAATATATCAATTGGTTCATCAGATTTTGTTTTCCCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTC:1 - chr3R 22058237 5' + G2 314 1 64.93 TATTGTTTTTTTTTTAATTATTCGACTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr2L 17602773 5' - roo 8997 2 82.40 CTTTCTTTTCGAATGCAGACGTAAACCCTTGTAGCTCTACAGATTATGAGCCGAACTTTAAACCGTGTGAAAGTCCTTTGCCAGCTAAGCAGAACGACTTTGGTAAGGAATTTTGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGCAACGGG:1 - chrX 4799442 5' + INE-1 537 1 69.66 AGCGCATTGTTCATGCATGCTCAAATTCACCGCGAACCACACAAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chr3R 24476421 5' + 412 14 2 74.66 CTGAATGACAAGGAAAATATAGAAATATTCGTAGTGCGTACTGTACACATCCTTAGAGTGCGACACTCAAGGCTTTTATTCCGTTCACGTGCAACAAATGAACGGCTGAGCCAATCACGGTGCGCGAAGAAATCTCGCGACACT:1 - chr3R 7826814 5' - G-element 99 1 70.14 ATTAACTAAACTAAATTGATCCATGTTTAATATGACAATATATGAACATATGTATACTCGGACAACTAAAAATATTTTTGCAATATTAAAAAATCTTTCTATTTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCTTCCACTTAAGAATCCAAGAGCA:1 - chr2L 14301930 5' + 17.6 250 2 63.70 CTGTTTGTTTTTGTTGTGACGGGCGCGGCATAACAAACTGCCATCATAAATTAAGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGG:1 + chr2L 12353934 5' + jockey 4680 1 62.92 GTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3L 96530 5' - roo 327 2 78.36 AAAACTTTGTGCAGCATTTTGCCAAAACTGTGTGATAAGTATCTGAACAAAATGCAAAGCTGCCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chrX 7786570 5' - hobo 2921 1 63.55 ACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chrX 1103606 5' + pogo 43 1 55.22 CCCGCTTAGCAACAACTAGTATTTTGCGTGTAGACCACTTGTAATTACTGCTTTTGAGGTTCCATTTGAACTACCTAGTTGAAATTGCATCAAATTATGAAATCTAACTTCAAGGCAGAGCAAACACAGAACAACACACACACACA:1 - chr3R 17817120 5' + gypsy3 417 1 54.11 TAGTGCTTGCCTCACAACGCCATGTCGTGGGATCCGCAAAACACAATACAGGAAATAATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGT:1 + chr3R 4569505 5' - opus 7439 2 62.07 CACATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAA:1 + chr2L 17240220 5' - hopper2 1539 1 65.07 GAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr2L 23310610 5' + 1360 38 1 55.15 TATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTC:1 - chr2R 5206901 5' + G4 3766 1 60.27 CCTGTACATCTTAGCATACCAACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTG:1 - chr3R 26246900 5' - 1731 4562 1 58.90 AATTGTAAGATAATGCTATCAGAAGAAAATCACACAATATCTGCAAAATGCCAACAAAAAAACATTAAAGGATAAACAGTTGTGAAACAGCAGCAGAACCCAGATTCTTAATCTGAACCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAG:1 + chr2L 21739408 5' - INE-1 547 1 75.69 ACTTGGCATTTAACGAGCATGTTAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 12867256 5' - roo 9044 1 53.79 TTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCC:1 + chr3L 24152435 5' + HMS-Beagle2 6933 2 53.90 GCTGCTCCAGCTCAATCGACTGCACGGGGGGCACGAAGAACTTGTCCATGTTGTAGAAATTTTCTCTCTTCATTTCATCAGAACCCTAAAGTCTAAAGTC:1 - chrX 18566502 5' + Idefix 394 2 64.00 AGAGGCAGAGGCACTGGGCTATCGAGCAACAAAGAGGTGAAATGTGTAAATGGACCAGGCCATCCCAAGTGTTGTAAATAAACAGGCAAATTATTTGCTTACTTTTGGTACGATGGTTAATACGCATCCATAAATTATAG:1 + chr3L 455646 5' + transib2 243 1 61.43 TATCCCTATTAAAATGTGGTTTAAGCAAAAGCGTGAAAAGGCCGTCCTTCAATATCGAGCTGCAATTCAAAAAGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCA:1 + chr2R 17895127 5' + R1A1-element 5119 1 60.48 ATAAAAGTTCACTTTAATTTATGCATTCAGTCCGAGGTGCTAATATTTCAGTGTGTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACGTATA:1 - chr3L 16358752 5' - 412 7498 2 55.38 TAGTCGCCTGAGCATTCCACCCATGCGCATGAATGTTTTAGTGAGATTTTGGGTCATCTTCCTCTGAAATACATTTCGATGATAAAAAAATCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAG:1 - chr2L 680257 5' + INE-1 167 1 60.69 TGATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAACCCCCCCAAAAAAAAGCTCCAGGACATGATACTATCTGCAACTCC:1 + chr3R 1418285 5' + BS3 262 1 65.75 AAAAAACTTTAACATGTCTAAATATATTGACTATTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGA:1 - chr3L 9497803 5' - jockey 4906 1 77.40 ACTTGTTGGTTTGCCCCTTTTTCCCGGTAAAAACAAACCATGTCTATGTTTATTTAAGTGGTGCTTAGTCAGCAAAAAATCACCCGTGTGAGCCTAACTAAAATAACATTTTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGA:1 - chr2L 7396443 5' + micropia 172 2 74.66 GAATGAAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chr3L 14550968 5' + P-element 64 1 33.58 GAACTTGCAACTGGGCTGCGTGTCAATATATCACGATTATGTCAGTCGCTTGTGTTTGTTACCCAGCAGGCGGTCACTTCTTAACCATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr2L 16458711 5' - roo 9038 1 62.33 ATGTCCTCGCAACATTATTAAAATGTTGTCAGGCATTCCGAACAAGTCTCTGTGCAATGGAGTTTATTTCATATTTGCAGCCAACCAGAATCACATATGTAAGTTAACACAATCACACAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 - chr3R 13176484 5' + Burdock 6160 2 69.18 AAATGCGTTAAAGTTGCTACTTTATTTTCATTACGACAGAACCTCTTACACACACATATATAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 - chrX 10974430 5' - opus 443 2 61.64 ATTATCTAACAAAACAAATGGTTTCATTTAGTACAAATTATTATACATTTATCTAGTTCATTTCATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 + chr3R 11925113 5' + pogo 55 1 58.22 CAATTATTCCAAGTAATCGAAATCGGCCTTGTTTCGAAACATTTTAAATTAAAAGATTCGAGCCCACACTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGG:1 - chrX 22748229 5' - jockey 4675 1 52.41 TCATGGGGCCAGCTGGTCTCGATGTGGGCATGAAAGAATGACTGAATATGAATATAAATAGAATACAAAACGAAAAATGGGTTTCAACTACAGTTATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGT:1 - chr3R 2474403 5' + Juan 3998 1 66.44 AAATAAATTAGCTAAGATTTCAGTCCCTAGAATGGCCACCCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 685965 5' + roo 41 2 54.79 ATTAATTTAAAGGATATTTTGGACACTTCTGTTACCACGTTTGGCTTGGACCTTGAAAATAATCCTTGAATATTTATATCTTCTTTTCGACTTATGTCTACAGCAAAGTGAATATTGTGCAAATCGAGATCTCAGGAACTAGAAC:1 - chr2R 12289697 5' + INE-1 146 1 75.86 TAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTC:1 - chr3L 23702278 5' + G4 40 1 55.48 AGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr3L 9907367 5' + jockey 69 1 64.84 GGCATAGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:2 + chr2L 17136145 5' + hobo 64 1 59.59 GCAGATTTAACGATATTAATGAATGAAATCAAGTACGAACTTTTCAAGTGATATCTGGGTAACATCATTATAATATTATAGGTTTAGTAGGGAAGTATTCCTTATGGGCGATTAACTGTAAACAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC:1 - chr2L 2014223 5' - accord 7029 2 71.92 CCTTCCAAGGAGGATCCTTCTTTGATCACGAGGGACTGCCGTACTGCGAGACGCACTACCATGCCAAGCGAGGATCCCTGTGCGCCGGGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAG:1 - chr2L 19401338 5' - X-element 4374 1 75.21 AATCGGGAAGCAGAACATAAATGTGTCTGTTTGTAGCGAAGGAATACATAGGCCAAAAACATAATATCTTAGGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr3R 15338138 5' - blood 7339 1 53.42 AGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chr3L 15026657 5' + opus 7046 4 64.46 CCTAATGGTCTTTTGCCTCCTGTAACTGACTGATGTTTGGCACACACACTGCCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3L 17175071 5' + 412 16 2 74.66 AAATCATCTCCAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTGAGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTTCTTCTTGAAATAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:2 + chr2L 12553398 5' - 412 447 2 52.05 CACTCGATGTTCTGTTTCTGTGGGCGAAAACGCAAAAAACGAACGAAAAAATCTCGTGAAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3R 23236391 5' + hobo 28 1 45.54 GGCTATTATAGCAATAAGAAATTATTAGTTCAATTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGAC:1 + chr3L 16787110 5' + Chimpo 55 1 92.73 CATATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCTGCAACA:1 - chr2L 17136213 5' - hobo 2862 1 73.33 ATTGGGTGTCTTAAATGGGTACGTTACGATGAGTTTGAGTACACTGAAATTGATCAAAGTTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 - chr2L 17250848 5' - opus 466 2 54.79 TGAACATTTTTTCGCATTCGGATGTTGTTTTCGACAGGTAAACGAACTACGGAGTGCTATTTAATATTATAGAATGAGGTAAGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 + chr3L 16212697 5' - Transpac 275 2 60.96 AATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr2L 3890151 5' + jockey 86 1 71.03 GAGGACTTCGATGACGCCACATAGCCAGCATAGCCGCGTCCTTAATATTATTACCATTCCTTGGCAGTCGCATTATTACTATCATTATCATCATTGCCAACATATCCGCCCTAACACACTATTTATGACCACCCGATCGCACCTCA:1 - chrX 7053677 5' - invader4 2887 2 74.66 CTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chr2R 19555032 5' - pogo 2100 1 71.59 CTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2L 15987977 5' - roo 9009 2 62.76 CAATAGCAACACCCTCACCTTCCTCATATTCAGTAGACTCCGGTCGAGAGCCTGCCACAAATCCAAGTCCCAGTCCGAATTTCCGGTTTGCCAGATAATATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAA:1 + chr3L 9543673 5' - mdg3 346 1 77.42 AGTTAAATCAGTTTAGCCTGGCTTTCCTGTTCTCTCTCCATCGCTTTCATTGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr3R 25387778 5' + roo 8733 2 65.75 GAGGTGCAAGGCGTGGAATTGCGGCTGAATGGATTAAAGCCTCTGAAAACATGAATTTCCTTGCGCCATTATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chrX 10567725 5' - roo 9050 2 70.55 GTGCAGTATGGCCACACTGATAATTCAAATATTTTGGCACTAAATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 + chr3R 11750135 5' - Tabor 461 2 67.12 GTCGTTTGTCACTGTCCCCAGTAGAAAGGCTCCACACTCGTCGGCTTTGTAGTTGTAGTCGCAGTCTTTGCATTCCTCACAGTCTCATTGTTGTTACAATTTACTTTACAAGTAAACCGGTAAATCT:1 + chr3L 19351361 5' + jockey 263 1 73.23 GTAGTTTGGCTTTTACTACTTTTCCATCAGCATAAGCACAAATTATTGCTCAGCGGGATGGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr2R 23497034 5' - 412 7511 2 53.33 AACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTA:1 + chr3L 2724962 5' + Ivk 45 1 54.79 GAGCCCCACAACTTTCATTCATTTTGCTGCTCTTATCCCCACTTCCATTTCCATTCCCCCATTCATCAACTGCATTTTAATTCTTTTTTGGTTGTCTTTTCGTTTTGTTTTTTTTTCTT:1 - chr3R 23334635 5' - Doc2-element 226 1 62.18 TAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr2L 17029591 5' + blood 62 2 59.59 CTGTGTGCATGTGCATGTTGTCATGTGCTTGTGTGCGCGCGAGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2R 6632537 5' + P-element 27 1 64.44 AATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTT:1 + chr3L 23456274 5' - Gypsy6A_LTR 277 1 65.29 CACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chrX 7515721 5' - roo 328 2 73.10 AATTTATTATTTGGTTAGAATTTTACAAAATTGCTTGGAGAATTTTTTACTATTCGGTCATCTTAACGATATACCTATTAAATTATAAAACAAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGT:1 + chr2R 13155891 5' - INE-1 542 1 56.16 CAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACATCGACTATCTCTCTTCGAGTGC:1 + chr3L 2724964 5' + Ivk 7 1 73.58 CACCCCTGGCTATTGGCAGTTGGGAACTTCCAAGGCAAGTTCGAGATACAAAATGTGAAGGTCAGACTGCACAAAATGCTCCTAGTTAGAGACGGCCCTAGGATTTCTTTGCTAGGCTGGAGAATCTTTGCGATTCAGTCGGCT:1 + chr2R 20298801 5' - Doc2-element 4612 1 56.94 CAAAATGTGGGAGGGTTGGGTTTTAAGTTGCTTGTAATAAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2L 4173917 5' + roo 14 2 76.03 GGAAAAAGTACATATGAGAAATAGACAAAATGTATGTATCCTAAGACATTTGTTACTTTATTGTTTTTAGAAAGCGCGTACGTATGTATAAATTTGCAATTTTTATTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3L 20713106 5' + roo 15 2 75.86 GCCGACATCTACTTCTACTTGACTACTAACTACTTGACCAAGTGCACCTTAGCCAACATGTAACCAAATGTGCACTCCAAAAAGCAGTACTTTTTCTAGATTCATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCA:1 - chr3R 7721086 5' + I-element 5109 1 74.66 AATATTTATATTTTCTCAATTGATTGCCATCCATACACTTATCCTTCTCGTGTTAATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATA:1 + chrX 16902260 5' - I-element 5287 1 61.64 GAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3R 24476360 5' + 412 75 2 69.18 TATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 + chr2L 17250711 5' + opus 161 4 57.78 GTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTATGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATA:1 + chr3R 29487012 5' - flea 203 2 53.42 ACAACAAAACAGATCGATAGACAAGTGGCCAAGCCAAGTGTAGATGGGAAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chr3R 13612811 5' + 412 7124 2 64.38 ATACGTTTCAACGTAGTGTTAGGTAGCGAATTTTAAAGCAGCAAGAGCAACATTGGAAAATATAAAATACGACAACAAAAGACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGGGG:1 - chr3R 4527598 5' - F-element 4477 1 72.88 GCATCTCGACTGTCGGTTGCATAATTATAACATTTCCCGCAGATTTATTTACAAACGGCAAAGAAACGTAACGCACAAAAAGGGATAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAAATACTG:1 + chr2R 3526020 5' - Cr1a 162 1 50.00 CAAAAATGCAAGCGTTACACTTTTTATGCGGTTTATTTAAACATTTTTCAAAATGTTTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTTGGAAACATACTAATGCAAAAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTACCCGATTATCAGATATCCGTTA:1 + chr3L 27559 5' - INE-1 552 1 63.70 CTGATGTTCCTGAAAAGTCCAAATCCTTTTGCTCAATAATCGGGATGCGGTCGTCATATAACGTAGGAGCTTTAGTTAATTGAAAAAAGTGAAATTTTTGATTTTCGGAACTTTTGTAACTTTTTCGAGAATTCATATCTCAAA:1 - chr3L 23283883 5' - FB 118 1 50.00 AATATAAAATGAAATATTTTTAATCCTTGAAATCAGTGTAACTTTAGCCTAAAAAGAGAATATATATTTTAAATTATTTAAGTACCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGTGTG:1 + chr2L 1703329 5' - blood 7353 2 42.07 GTTAGACGTATTTGTAATTTATGCTCCTAAGACCTTTTGCTGATTTAAAGTATCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 + chr2L 5601558 5' - mdg3 178 2 60.96 CATTTGTGAAGGTGATGTGCGGCACTATAATCGCATTTGATTTGATGTTGATATCAAGAGGGGTACTTGTGTTAATTGGTTACCTTTACTTACCTTTACAAATGCGATTACCCAAAACAATCCCACGCAAATTGGACCAGACTCG:1 + chr2L 4041568 5' + I-element 4905 1 68.28 GCTGAGAGCGCGTATTTACCTTTAAACTGGACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 - chr3L 7962311 5' + blood 7052 2 54.79 GGATTAGGCTCGTGCCTAATATGGATTGCTCAAAGTGACGGGCTCTGGCCAGAGATTCCAGCCTGTTGAGTAATTAATAAATAAGTGGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:2 + chr2R 20865633 5' + 412 7071 2 72.09 ATACGTTAAATCTGCAGTCGCTTTTCAACACTGATTAATTTCCTCTCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGT:1 - chr2L 9938879 5' - P-element 2813 1 32.19 CGTTAGCCTTTTAACCACGAAATTGAAAAAGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGCGATCC:1 - chr3R 6388812 5' + jockey 63 1 52.05 TGCCCCCCTCCCTTCACATCCACACACCATTTTCCTTTTCTTTCCGAGTTGCGTTTGTGTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1 - chr3R 15022170 5' + Tabor 14 2 74.66 GAAAGGCGGAAAATTTTAAGGCAAGATATCTAAGCCACGGTCCAAATAGAGAAAAGCTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chrX 12866389 5' + roo 8726 2 60.27 TCTACTTAGCAGCAGGGCCGTTGGCCAGGCGATCGATTGCCCATTCGATTGTCACGCTCGGCATGACAAATTGAACAATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGTGCACGATTTC:1 + chr3R 15466779 5' - pogo 1643 1 53.42 TATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTG:1 - chrX 10645039 5' + jockey 77 1 75.81 TGTATGTGAATTGTGGCGTAATGTTGTTGAGCAAATGGGTTCTACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr3R 24279342 5' + roo 78 2 74.66 CTTTTCAAGGTCCCCAGAGGTCACCTGACCAAACGCGACTTTAAGGTAAGCCAATAAACTCAAAGAGGGTTACGCAAGTCCCCTTGGATAAGCCTATCTTCTATGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr2L 2030982 5' + 412 17 2 69.86 GAGACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTT:1 + chr2R 22723008 5' + 3S18 5811 2 52.41 ACTGGAATCAATATTTATTATTATCTTGATATGTAGCACTACTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCACTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCA:1 - chr2R 10916667 5' + GATE 8289 3 71.23 GTCTCCTCCACAGCCTCGATAACCGTCTACCGTCTGAAAGCCGAAGGTCAACAACCGCCTAAGACCATTGAATCC:1 + chr2R 3925295 5' + gypsy10 5592 1 62.67 TATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATCGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chrX 5150355 5' - roo 8985 2 77.40 ATTCGATTAGACTTGCAGCCTGATTTTATTTTGTCTAGGCCCATAGCATTTACATTTAATTGATTTTGTGTAATTGGTGCCATTGAACCAGCAAAAGTCGACCCTTTTGTGAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 + chr3R 15702848 5' - copia 246 1 77.40 GTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr3L 17707820 5' + Doc 31 1 51.46 AACCTTGAGCTACTTGGAGTATTTGCTCTTGACGTCTGGAGGTTTTTGATATAACACCACTAGACGACTTTTAATCTCCTTAGGGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATA:1 - chrX 7631036 5' - BS 4852 1 53.42 CATTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chrX 12866509 5' - roo 9031 1 57.53 ATAGAAAATCAGCTCATTTGCACATTGGTCGTAAGCTCTGACGAAGTCTGACTTCATAGTCTAGATGTTGTGGGTCACAGAAAATTAAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTG:1 - chr2R 12265266 5' + jockey 4551 1 62.86 CTGTTGCATACTTTGGCGGGCTTAGCTTTTGTTGGGCCATAGGCAACGAATCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAA:1 - chr3R 22516039 5' + jockey 4596 1 54.39 TATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1 + chr2R 1921429 5' - mdg1 346 2 66.44 TGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chr3R 21705994 5' + 297 61 2 67.94 ATATACATATGCATGCCCACACTATCCATTATAAATAATTCTGTCAGTCTCGTAACACTTATTTATTGTTAATGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 23287549 5' + roo 8710 2 53.10 GGAGACCCACAAAAACGCCCGCTGCCGTGGGAAAAAGTGTTGCATACTTATGAGTGTTGGCAAAGAGCTCCGGAATGAAATGTGAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 + chr3L 17133780 5' + jockey 4706 1 68.80 AATTTCGTATTAATAAGACATCTTTGGTCGAAATGATATGCAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAG:1 - chr2R 8158809 5' - Juan 4139 1 68.49 ATGGGCGGGGCGGACTGCCCCTAAAAGTCGTAAAATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 - chr2R 11057336 5' - pogo 2034 1 75.19 AATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr3R 9352074 5' + Tirant 27 2 56.82 TATACTATTATATTAATCAAAATTTTCTACGTCCAAATGCATAGAAAATTGATCATCGTGATCCGAATCCGAGTCGCTATGTAATATGTTCTACATTTGATGCATCTAAAAGATTGACGACTTCTTTCGGCAAAACGATTT:1 + chr2R 6173474 5' - transib3 2459 1 78.01 CGTCGATGCTGCGCCTATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 + chr3L 24152398 5' + HMS-Beagle2 18 2 71.92 GTTTCACAAAACCTTTGGTTACGGATGCATTGTATTAATATGTTTTGAACTCCTGTTTGCTGGAGTTGAAATCAATCAGAAAAAAGGGTTTCCGACTATATAATGTATATACATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGA:1 - chr4 1121547 5' + INE-1 94 1 50.68 TGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTC:1 - chr3L 24934381 5' - HMS-Beagle2 7116 2 73.29 GAGACTGTTTGCATACTTTCAGGCGCCTCTGACAGGGCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr3R 19531211 5' + hobo 47 1 53.42 AAACAAAGTAATTTATTAGGGTTAATATCTACCCGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTG:1 + chr2L 16089551 5' - 3S18 6103 2 78.33 ACAACAGCAACAATAAAGGAGGAAAAAAGTGACAGCAGCAGCAGAAAAAATTTTATGATCCTGCCTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 - chr3R 8709861 5' - jockey 4972 1 58.41 ACCCTGGTACCCCTTGTTCGCAACGAGGAAAAAGTTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTATAATATCATTAGGTATTAAATTTC:1 + chr3R 31887739 5' - HB 1531 1 60.96 ATTACTTTAGTATGCGATAAATCGTGATAAATTTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACT:1 + chr2L 17250670 5' + opus 16 2 70.83 AGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr2R 11133570 5' - roo 8994 2 77.04 ATTTCCAAACTTTTAAGACAGAGCCAATCATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAG:1 - chr3R 27510142 5' + Bari1 53 1 73.33 AAGGGGCTAGGTTCATCAGCACCAAGATCTGGTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3R 24122629 5' - roo 409 1 77.06 ATGTTTGCTTTATAATTTAATTCATTGAACCAAAAATATTCCAGCAATATTATCATTATTTTCCCCAAACACATCGTGATTAATGGATATAAACACATACTGAACCAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAA:1 + chr2R 16908871 5' + hopper 1021 1 54.11 ATAACTCTTAAGTTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1 + chr3R 5453639 5' - 412 418 2 73.57 CTTCTAACTCCCGAACCTACCAAGGAGTTAACTAAAACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTATTACTACCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTT:1 - chr2R 3463883 5' - invader2 5004 2 79.17 GCTAGCTAAACACTGGCCTATTACTATTATTACTTTATAATGCCCAAAAGGCATATATATATAAAGGTCTACCAGTCTATAAATTCTGTCAGTATATTTTTATACCCATTACTCGTAGAGTAAAAGATTCGTTGAAAAGTATGTAA:1 + chr2R 5296651 5' + INE-1 14 1 52.74 ATTCTCTGTACAAATGCTGGTATACTTGGTTAATTATTTATGCTGGACAAACCCTTTTTTATAAGGTGTTTATGGACATTTCGTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTC:1 - chr3R 19505521 5' + R1A1-element 99 1 58.90 GGGTGTGTATTATCAGCGGTCATTGTTTCGCGTTGAATACTGTGTATCAATTACCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATT:1 - chr2L 3294211 5' - hopper 1350 1 60.96 AAAGTTGCGCAGTATGGCCACACTGATAATTCAAATATTTTGGCACTAAATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACT:1 + chr3R 11750129 5' - Tabor 7306 2 72.60 GCCAAATTGGGGAATTTGATTCATTTGTCATTTATTTAAATTCTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACACTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2L 9472102 5' - roo 9025 2 53.42 AAAACACTGCTGTTAATTATGTGGATAGTAAAATTACAACACGCAGAACAGCAGCTAAATAAAAACTATCCTTAATGTTTTGATTGAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2L 16399439 5' + roo 8680 2 64.06 AAAGGACGGGTTGGCAGTGACAAAGCTTTTCAGGACTTTTCACGGAAATTCCGAATTCTAAAATATAAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 + chrX 21234431 5' - 297 6922 2 57.53 GTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chr3R 5453701 5' + 412 7124 2 76.64 AGAGTCAATGTCAACCAAATGACCTCGAGACATTCTTGTCCAGAAAATGCCAAACAAAAAATGACGACTTAAAATACAATTTTCATTGGATTAAAATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:2 + chr3R 16913317 5' - pogo 2079 1 69.18 CAAATGTTCGATTGAAATGCCTCAAAAATGTATAAGATCGATAAGATTGATTGGCAAATACATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 - chrX 4300178 5' + opus 7042 4 55.97 ACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTT:1 + chr2R 16891862 5' - hobo 2871 1 76.47 TTTCAATTGAATTAATTGTGGAGTAGGTTATTAGCGGTATCGAAGGTGATATTAGATCCGTAATTATAGCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCA:1 - chr3R 12593141 5' + flea 36 2 57.04 GCCACCCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr2L 685999 5' + roo 8739 2 68.49 GGGGTAGATTCCTCAAAAATCATAAATTATTTTTTCAACATTAATTAAAGTTACATAAAATAGTAGAAGTTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr3L 10133491 5' + 412 52 2 52.05 ATAGGGTACACAAATCACAGGAGGTTTATGAAAAATATATGGAATGAAAAAAATTTAGAAAAAGTTCAAATACTATTTTCAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACA:1 - chr2L 12658603 5' + Quasimodo 32 2 45.89 TTTTAAGATGCCATCAAGCGCACTGATTAACCGAAGCGTTAGTGCTGGGTAATTATCGATATTCTATATTTTCGATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGC:1 - chrX 21963598 5' + 1360 3331 1 54.29 GCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGCTATAAG:1 - chr3L 7962270 5' + blood 79 2 70.63 AGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGA:1 + chr2R 5542363 5' - 1731 4548 1 70.83 CCAGTTTCGTCGATTTTAAGCTATGCATAATAAGCTATGATAATATAAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTC:1 + chr3R 12929200 5' + invader4 66 2 63.64 TACCACATATTTGATCATTCGCATTTCATTCATTTCATTGCTAAGGTTATTTACCAATTCGAATTTGCATATGAGTGGATGCTTTTTTTTTTCTTTTTT:1 - chr3R 9609569 5' - gypsy7 5010 2 77.78 ACCAAGACACACACTCCGCTTTCTGGAACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATC:1 + chr2L 18279882 5' + gypsy5 7002 2 57.53 AGGATTCAGAAAAACAAGAAAAAACACTTTGATTAGTTGTGATCCCCTACTGGTTGTCACGTTAACCGTGGTGACGGCATAAAATCTAGGTATGCACCATTCTATCTCATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTG:1 + chr3R 25202653 5' - Cr1a 495 1 68.42 TTTTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr3L 4115226 5' + 1360 55 1 58.33 TATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATATACTTACGCACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGA:1 - chr3L 24486371 5' + Quasimodo 72 2 54.70 AACAATTTCCCCACAGCCACGACCCAAACAAAGGCAGGACAAAAAAAAAAAGAAGGAAAACCGGGCGAAAAAAGGAGGGAACTAATATTTTAAGAAAACTCAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCAC:1 - chr3R 15711915 5' + diver 3 2 78.74 AACAGGTGTCAGTCATATACAAATAATTTATAAATAAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGT:1 + chr2L 11574772 5' + Max-element 19 2 71.92 AACATCTCTTAGTGGGGCAATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAGAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 + chr2R 5214917 5' + F-element 34 1 64.38 TATTACCCACAAACCCCAATACTGTCAGTTTGCATTTGCCAGTCATCTTGGATCATTGAGGAACTGATACCCGAAGGCTGACATGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCAC:1 - 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chr2L 246104 5' - roo 9034 1 57.89 TGCCTGGCGGGAATGTCTTTGTACTATTATTGCTACTTCAGTGATATTGGGCATGTGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAAT:1 + chr2R 19351960 5' - Burdock 194 2 59.59 AATGTAGTAGCAAGGATTGCCAGTCAAGTTTGGATATAATAGGATAAAGTCAATCATAGTCAGAACATTATATTCTCTATATTCTCAGTCATACAATGACTTAAGATTAAGGGTATGTAATTTCTAGTGAATCTGCTTGG:1 - chr2L 22694901 5' - Cr1a 4112 1 43.57 ACATGGTGACCAATTACCTTAGACAATAAGAATAACTCTTAAGTTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 + chr3R 5453608 5' - 412 443 2 53.42 ACAGGGCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr3R 19531242 5' + hobo 32 1 55.00 CGAAAAAGTAAGTAAGAACGGCTTGTGCGGTTGCACCGACGAGCAAACAGAAGTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAA:1 - chrX 22610787 5' - pogo 2058 1 53.97 AGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - 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hobo 2907 1 63.22 GTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAGATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 + chr3R 23639159 5' + pogo 77 1 69.18 CCCTGTCTAGCCACTGACTTCGCCGAGCACTCAAGAAGTTATTGTTCTGGGCGAAAGTCTGGGGAAATTTGATTAGTGGCTGAAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCC:1 + chr3R 13128719 5' + F-element 364 1 83.81 TTATTATACATTGCCCTATATTAAATTAAATTTCAATTTTTATTGAGTGTTGGGCATTCGATATTGATTACATTCGGAAGAACACTATTAAAAAACAAATTCAAAATATCAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTTCAAGTTT:1 + chrX 22550979 5' - S-element 1539 1 59.59 GTATAATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTT:1 + chr3R 4160054 5' - invader2 199 2 50.68 GCAAAATTAAAGTCCTTGCCCCAAAATCATTCTACTAGACTATATGCACTAGTTGCCGTTGTATTTTAAAAGACGGATTACAACACTATCACCGCGGAAGGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGT:1 + chr2L 9485553 5' - 412 7525 2 67.12 ATAAAAATAGTGCCAAAAAGGCGTTACCAAGCCTTTAATTTGTGGCCAGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGGGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCG:1 - chr4 843960 5' - Doc2-element 377 1 60.32 AGTTAAAAAGTCACCTATTAAGTATATTACTTAGTGCCGTGTGCCGTCATTTTTTCGACCTTGTTCGCCTCTTTGCTGTAACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTT:1 - chr2L 3957099 5' - I-element 390 1 50.68 ACTTTCGCTTGAAACAGGTAAGCGGATGCTTTGTCTATTCCGCCTTCGGCAATGGAATTTTTGGAGGAGCCTTTTTTATTATTTTGATTCGCGGCAGAGAACCGTTAGAGATTCTGCCGAACGTAG:1 - chr2L 11764630 5' + invader1 100 2 50.79 CTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGAGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCATATAGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTC:1 - chr3R 26246878 5' - 1731 4571 2 63.48 ACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTAT:1 + chr2L 9668208 5' + 1360 37 1 71.28 GTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTC:1 - chr2L 16948710 5' + jockey 4748 1 78.12 CACTTTGAACGGTGCTTAAAAGTGTGAAACTATATTAACAATATATTAACACTGGATTCTTTTCTTAACTGCTATTAAGAGACTTTAAAAAATTATACAATAATTTCCAAATGTTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chr3R 13631296 5' + 297 5 2 78.77 AAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 76048 5' + roo 22 2 62.24 CCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr3L 11336370 5' + blood 34 2 68.97 AGGGTTAATGGACATGGGCATAGGGCATCGTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCA:1 + chr3R 23020784 5' - INE-1 563 1 60.96 TGTGCATGTTGTCATGTGCTTGTGTGCGCGCGAGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr2R 6632546 5' + P-element 46 1 53.79 CATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTCCAACAGTA:1 + chr3L 17707807 5' + Doc 61 1 52.74 AAACCGTCATTGGATCACATTGGAATATTTTATTGGTGCTAACGCAATGAAATCAGAGCAAATACATAAAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATA:1 - chr2L 12319351 5' + copia 34 2 57.69 ATGGAGTTGCCGTCGACGGATTGGTAATATCAGAGTGGTCATATTCTAACAACGTTTTGAGGAGGGAGACGATGACGACCACTCCGCCCATTATTTGTATGCCAAACGCGGAAACATTTCATTGAAAATAAACAAAAAAAAATGGG:1 - chr3R 28682995 5' - hopper 140 1 76.71 AATAAAAAGAGAAAATAAAATTGAATCATAAACGCACTTTCCTTCTCGACACAAAGAGTCCGACGTTGCGAATCATTGTACAGAGAGAAAAATATTACGTTTCAAGTTTGAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTT:1 + chr3R 26519908 5' - FB 705 2 68.49 TTTTTAATTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTTTTTTTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAAT:1 + chr4 1294980 5' - TAHRE 10412 1 82.03 GCTTAAGGAATTTGCTCGCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 905878 5' + 412 66 2 64.14 TTAGACTTTTGATATTGATATTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chrX 4778130 5' + 412 7068 2 73.97 AGGAGGGACATACTATCCAAACTAGCTACCAAGAACTGGGTATAGCTAAACACAATTTCCGGTGAATTAATAACCAAACTCACCTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATATGAAG:1 - chr3L 14076361 5' - roo 409 1 80.14 TAGCCCAGAATGCACTAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGAC:1 - chr2R 4261984 5' - invader4 267 2 61.86 GCTGATAATAGGATTTAAAATCACACCAGCTGATATACGATATATCGATTGGGCTATCGCAAGCACTGGCGCCCCATCTCTACGATAGTGCTTTCGCTGCACCCTGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chrX 14826237 5' - P-element 2881 2 77.52 AACGCAGCAATTTCGGAGTTGACACCTGCTGCGGATACACTGTGCAAATAAGAAGTAAAGTAAAGTTATGATGTAAATATTGGTATAAGATCTATTCTGAGTGTTAACATATTCAACAATTATTTCATTTTTGTTAATTTTGTCC:1 + chr2L 17307007 5' + frogger 345 1 59.31 CGAGTATTATGATGCAAGTTATTTCCCAGCATCTCCAGAAACGAATTATTATTATATAATCAAACCCAAATGCTTTATTGATGGCCTGACAAGTCTCGCATACGGATACGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3L 19199577 5' - hobo 2933 1 77.14 GCTCGTTAGGGATCTCTGGCGCGCTAATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGCTTGTGCTCGC:1 + chr2L 2550311 5' - F-element 4324 1 75.65 GGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGTGTGAAGTGA:1 - chr3R 4528436 5' + F-element 62 1 54.79 ATACATATGCTATGCAAATTGCGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr2R 19554906 5' + pogo 20 1 67.20 ATATGTACCTATATTTATATGTACCTCTCAGTCTTGATCAGTCCCCGTTGGCAGGCATGTTGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTG:1 - chrX 1804490 5' + Doc 98 1 58.22 CTGCCATTATGGCAAGACAAAAGCCCGTATTAATTACACAACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr3R 18816015 5' + hobo 21 1 73.29 CTTTATCTCTTGCCAAAACTGGTATTCTTGTTGTTTCTTAACAACAACTGTTTCAGCTATTTTTATCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATAAAACTCAGCTGCATTTACAAACGCAGACTGCGGCGTCTTACAAGCGATGCATT:1 - chr3R 19446813 5' + rooA 237 2 60.96 TTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAG:1 - chr2R 5737183 5' - 1360 3299 1 79.45 CTGGGAAAAGGAATACGCAGAATTTTCTGCAAATAAACAGCGGGGTTACTGCACACTTTTCCCAGGCACATTAAAAAAAATCTTAGCTATAACGTATGTGACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chrX 16787225 5' + pogo 17 1 71.03 TGCATGATTCAGAGTGTAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr2L 12414890 5' + pogo 22 1 54.81 TTGCTGCGTGCCAAGCGGCCACATTTACAAATACAGATACAGATCCATTTGCAGATGCAGATACATTTTGCTGGTACAGCTGCAGATGCGGATACACATTCTGTATCTATTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr2R 11609361 5' + roo 11 2 78.62 ACAGCTTGGCAAAGCTATAAAATATATATGAGAAATTAAATCTAAAATCCATTTATTTACCATGTTACCATTACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCC:1 - chrX 10161250 5' - micropia 447 2 77.40 ATGCCCAGTGATTTGGCATTCTGACATTTGTCGCTGTCAGACATAACAATCGACCCGATCCCAATGCCAATAGCAACTGAATTGGCCCACATTCGAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2L 9471952 5' + roo 8677 2 74.44 GAGGCTGAACGTCCAAAGAGAGTGTCGAGGAAACCATCTGCTGAGGTTTTGGAAATAGAAGACCATGGAAGCGACACTAAGCAAGAAGATGATCACCCTTACTCCAGATCGCTCTCTCTCTCTCTCACTCAT:1 - chr3R 16461616 5' + blood 7179 2 72.73 TAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr2L 16948746 5' + jockey 4683 1 67.68 TTTTTGTTATTCGGGCTGGATTCGTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 7035336 5' + roo 8686 2 57.43 TTTGCACATCGCCCTTTATCAACAGACGACTTGGACAGCTCTATCAATTATTGATTATTTTTTTTCATTATACCCGTTATTTGTAGAGTAAAAGGGTATACCACAGTCGTAGATATATATTCTTGATCAGGATATATAGCCGAG:1 + chr2R 4376623 5' + INE-1 90 1 67.36 CGTGTCGGGGTGATATAAAGGAATCGACTTGTAGGACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr2R 5737224 5' - 1360 3355 1 56.49 CATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 - chr3L 23986602 5' - opus 455 2 66.37 GAATATATATAATTTTGACTATAGTCAGAAACGTTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTACTCTACAAGTAACGGGTATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chr3L 9220095 5' + 297 40 2 55.48 AGGCAGGAGGCTGAAATGAAAGTTATGTAGATCTATCAATAAATCTATTAACAATTCTTTCAATTAAAGCTTTGGGTATGTAAATAGACCTATTTCGCCTGTCTATTACACATAATAAATTTCTTTCAAAAAATAAAAACCATTTA:1 - chr2R 12216968 5' + McClintock 412 2 69.86 CGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 - chr3L 17890803 5' - 412 7472 2 73.72 AACGACGCGACGGCAGCGATGATAAAAATCAGTTTGCTTAAGTAAAGTGAGGCATTTAGAGGGTAGGAAGAGTTGAATTGATTGTTCAAAAGTAAGCGTTGCTAAAATGCAATCATGGATGCTTGAGTGTCTCAATGTATGTACGT:1 - chr3L 10358917 5' - Stalker2 50 2 77.40 AAAGATTGTGTATCTGCTGGAACATCGACATTAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 - chr2R 17891012 5' + Tabor 20 2 67.81 CGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGATCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 + chr3L 14062257 5' + Doc 81 1 74.40 TGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 + chr2L 17136160 5' + hobo 77 1 69.44 AGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTATCAGAAACCC:1 - chr3R 11547752 5' + G2 357 1 76.26 AAACCACTTTCTTTTCAAGGTCTCCAGAGGTCACCTGACCAAACGCGACTTTAAGGTAAGCCAATAAACTCAAAGAGGGTTACGCAAGTCCCCTTGGATAAGCCTATCTTCTATGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 + chr2L 2030972 5' + 412 7 2 77.40 CGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3L 25401028 5' + Doc 40 1 48.28 TGTAAAACAATTAGATTCGCATTCATTTTTTTCGAGCTACACCCCGGCGATAAGTTCAAGCGCTTCGAATCAAAGAAACAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2R 7953624 5' - roo 398 1 71.05 ATAAATTCAATAGTCTAGTTGCTTGGTGCAACCCTTTTGTTCTAACTAGTAATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACA:1 - chr2R 4638678 5' + 1731 4383 2 63.70 GAAATGTATCGAAGCACTGATTTTCTCAAGTGGCCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 + chr3L 16580283 5' - 412 459 2 62.11 GTATTGCCACCAATTTGGGAAATACCAACTGGGAGTTCAGGAGTTATCGAAATGGAGATTATTTTACACAAGTTTTAAAAGGAAAAAATCATGCAAATGATTCAGAATTAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:2 + chr2L 19067996 5' - pogo 2092 1 78.08 GAACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGC:1 + chr2L 18279907 5' + gypsy5 75 2 72.18 AATGAATGCAAAAACGATAAGCAGCCGAAAGGATTGCCACAGCAGTTTCCCAAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 - chr2L 12340862 5' + diver 7 2 76.67 TTCACGTAATAAGCACAGCAAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACACAATGTCTTAAGCTAAGATGAATAGAATAATGACGTGATAACTATTTCTCCGATAATTTTAGCGTTGTTATTAGTCAACTGACGGGACCTTAG:1 + chr3L 25008295 5' + 297 362 2 74.10 GCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACT:2 + chr2L 15834462 5' - hopper2 1534 1 65.75 ATAGAAAACATAGTTCATTTGTAAAAATAAGTTTTAAAATGATATATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr2L 10746596 5' + pogo 41 1 54.11 GCTCGAGTGTTCAATTAACAGCAAATTCGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr2L 2276821 5' + F-element 44 1 58.22 AAAAACGGGAAAAGTCGTCTTCTTAATCTTAATTGCGGCACATTAGCACAATAAACCAAACGAATGGCCAGACATTATCATAAATAATAAGGCAGTCGGAAGACACTAAACTAGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGC:1 + chr3R 22894563 5' + diver2 4793 2 61.64 TTAAGCTTTGAAGTTTTCGTTTTTTTTGTTTTTTGTAACTGCGGCATTAATGCGATCTTAATGCACAAGTTTTCCTAATTACATTTTGTTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACCACTGCG:1 + chr2L 16574276 5' - gypsy4 6433 1 60.27 CTTTACTGCTTTCAATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr3R 7539525 5' + roo 8735 2 67.12 GATTTGTTTCGAAAACGATAAAAAAGTATACTTTATAGAAAAATACTAACCATTAGCGCTAAGTCCGCTTCCATAACAAGAGTGTGAAAGGTTTTGAACTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACA:1 - chr3R 15703037 5' + copia 4893 2 69.18 GTTCAACCTACTCTTTCAAATGTCAATACAATTTAATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 + chr3L 12224641 5' - 412 7461 2 75.34 ACTCAAAACACCGCTTAGTAAAAGCATCAGTTGCGAGCCTTTTAATAATACATCAATAAAAAAGCGTTTAGGGTTCCAGACTCTATCAGTCAATAAGCGTATCTGGTAGTCTTCGTATAAAGATGACTTTATATAAGAATATTTGT:1 - chr2L 21813039 5' + 1360 389 1 76.71 ACGATGTCCTTGTTCCCATCCTCGTCCTTTGGCCAAAACTCGCTATGTGGTTAACTCGGTTGGTATGTCTGTATCCGCCGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 + chr3R 27859150 5' - hopper 1385 1 63.50 GCATTATTACATATTTTAGACATATATGATTTGTGATTTAATTGCAATTTAATCTTCGGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAAAATAATAATTGTGCTCCGACATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATACAT:1 - chr3L 23529729 5' - Stalker2 237 2 63.19 GAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chrX 7515724 5' - roo 8994 2 71.23 AAAAGTAAATCACAAGCATCGCTCTTGGCAGCATTCACAAGTTCAAATAAGCGATAATAAGTATTTATGGGCGGGGCAAGCAGATTCGGTTTCTTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 - chr3L 13634344 5' - 297 6957 2 73.97 GTTGTATTCGATATATCGGATATGCAAAAGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCTCTCTCTGC:1 - chr2L 12079676 5' - mdg3 157 2 76.22 TGATGTTCTAGGACTTTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAA:1 + chr3R 15022016 5' - Tabor 431 2 52.41 CATGATTCTTATCATAATCACATATTTCAATATCACACAGTACAAACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACG:1 - chrX 6707842 5' - hopper 1341 1 69.18 AATACCATTTCAGCACCACGGGATGCACGGAAGGCTATCGACGGCTTTAATTCCCGTCTAAGCCTGTTTTCTGTACAGGGGATTTTTTTAGATCATTTGAATAAT:1 - chr3L 12306961 5' + Tc1-2 279 1 89.52 ATATTGATATTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chrX 4778141 5' + 412 7079 2 66.44 AAGTGCGTTAATCTTGTGGTCATTTGGCTGCTTCGTATTAACCTCTGAGATTAGCTGGCATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 - chr3R 19859703 5' + opus 7039 4 54.40 CATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 - chr3L 22978609 5' + 1360 52 1 71.05 TAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 - chr2L 16948734 5' + jockey 4697 1 54.46 ATTGTTAGTAGATCACAAACTTACTGCGAGCTTAAGGCTAGAACTGAACTCTTCTGCTAGATAGGACTTGGAACTTACCTGACAAGAGAGAGCCTTATATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGGT:1 + chr3L 13616323 5' + hobo 2473 1 69.23 TAATACAGTTTAATTAAGATTAACATTAAAAACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCA:1 - chr3R 11750296 5' + Tabor 38 2 60.27 ATAAATTTTTTTTTTATCATTAACCCTTTTGCGCCCAACGTTGCTTGTGAGCAATTTCTATGTATTCAGAACTAATTGTAAGCGTGCCTTTTGCTCTTATCTGCTCATTCTTTATTATAACGGTTCT:1 - chr3R 22075170 5' + looper1 87 1 73.23 TTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr2R 10695861 5' - roo 8997 2 71.92 AAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTAT:1 - chr2L 23295889 5' + micropia 5006 4 52.74 TTTATTTCTTAGATCTTCGATGTCAAGGAACCTTGTATTTGTGTTTCGAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr2L 13250479 5' + opus 7037 4 62.33 GATTGGCAGTGGACACAGTTTCGATACTGTCCGTTTTAAATGACCCTGTTGGGTTTTAAGTGTCACTATTCGGACTAACGTATCCGTCCCTGTGTGTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATCTAGTTAAT:1 + chr2L 22592499 5' - mdg1 403 2 71.01 TCGTGGCTTTTACTACAGTAATCACCTATGCATGCAATTTACATCTCCGCCTCGCCCAGGGAAACTTAATTTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 + chr3L 20255129 5' - Transpac 281 2 64.84 GGAACAGCTTTTGTGAGATTTTACCTACACCTTATATTGTTGCATACTTAAGCAAATATGCCAGGTTCATCCAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAACGAATCAGTGGGCGTCAGCG:1 + chr3L 23239432 5' - HMS-Beagle2 156 2 49.32 GAAGCCCATGATGCTCTCGTTACTCCCTATTTGGGTCGCGGCTCTCTGTGAGATGTGCACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTA:1 + chr3R 9392928 5' + S-element 62 1 60.96 ATTATTATATCGGCGCGTGTCGGGGTGATATAAAGGAATCGACTTGTAGGACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCCAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2R 5737239 5' + 1360 8 2 74.17 ATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr2L 76144 5' - roo 9015 2 62.33 AGCCATTTTATTTTGCACATTCTTCATTTCCATTTGCTCAAACGTATTTTATTCGTATTTAGCATAAATCATTTTTGTGTAGCCGGCAAAATGCAGCAGGCAGCGCGAACATCACTTGCAGCACAGTTA:1 - chr2R 1007446 5' - Stalker 485 1 75.19 GCAATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr2R 5214933 5' + F-element 49 1 55.17 GATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGCATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACCCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCTATATAACAATTGATTTAAGGCAGTAGCCCCTCTTGAACGGT:1 - chr2R 4802896 5' - mariner2 79 1 32.19 AGGAATACATAGGCCAAAAACATAATATCTTAGGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTGTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATC:1 - chr3R 15338099 5' - blood 308 2 75.59 GTAAGAATGCCGGCATAGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGCGCTACTCGC:1 + chr2L 17136134 5' + hobo 53 1 50.68 GAGGTGGGATAGTTCAGATCTTTACTGCTTTCAATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3R 7539544 5' + roo 8716 2 54.11 CATTACAAATGCACTACAGCATTCTACGCTGAATGTTTTAATGCTCTTAACTATAATATCATACTAAAATATATTTCATATTAACACGAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 - chrX 16902374 5' + I-element 34 1 60.27 ACCTCACTTAAGTTTCCCTGCTATTTTTCCTATTTTTTATTTTATATATTTTGTACGTTTTTCTTTTCTTTGCACTTTGGTGCTTCCGCGCTAATTTGCTTAGCGTAATTTGCATTTCGCAAATGCCACCACCTTTGGCATCAATA:1 + chr3L 3520524 5' - Bari1 1365 1 80.82 AAGAATGGGATGCCAAAACACTTTATAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 + chr3R 7539466 5' - roo 315 2 81.51 AGTCTTAGTAACTAATTGCTAAAACATAAGACGGCGAACCGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 - chr3R 9160823 5' - copia 246 1 77.40 GTCTTCCAAAGTAAATCATATCAACCTAAGTTAATTGCCAATAAATATAGATCACCCCATTTCGGAAGAATGGAAAATATATATATTTTGATATTTTTCGTATAACCGAATTCAAATGTAATCAGTTTTTTTTTTTAAGTTTTCAA:1 + chr3R 26022783 5' - TART-C 11093 1 76.03 GTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTCGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGTCCATCCATATCCATATTATCCATATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGC:1 - chr3R 27772458 5' - invader4 3040 2 52.74 AACCTAGGTATAGATTTACCTAGATATAGATTTATGGTAAATTAAATCTAAAAACAACTAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 - chr3L 4187292 5' - pogo 2042 1 63.01 TTTTTAGCATTTTATTTCCGATGGGGTTGGTTTTCGTCGCCCCAGTCAAGTGTTAATTTCTTCCCCTGCAATTAACTTTTTGCCTCTGCCTTTGAAAAGAAAACGAACCCCATCGGAAATAAAATGCTAAAAAAAAAA:1 + chrX 14631608 5' + G2 3064 1 80.43 ATAATTTAGCCAAGCAGTTGTATCTACTGACTCAGACTGTGGAAAATAAATTCAATGCCAGACGCCAGCTCCCTATTTTACATAAAGTATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2R 12543027 5' + roo 25 2 67.12 ACACACACTGCCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr3L 17175112 5' + 412 7097 2 51.88 CTCGGCATTCCTTCAATGTGTCGAAAGACAACGATGGGCAATGGCACAGGAACAAGGACCGGCGAATAGAAGAAACTGGGGCCCTTACAGCCCGACAACGAGTGTTCAAGGAAAATCCAGCTTGCCCTAATGTAAACATAAACATC:1 + chr2L 16200747 5' + Quasimodo 171 2 76.71 CTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACA:1 - chr2R 5532330 5' + G4 3820 1 64.38 GTGTGAAGATTTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTT:1 + chrX 1703350 5' + Tirant 8371 2 51.37 ACACACCCATACCACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTCTGATCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTA:1 - chr3R 20175780 5' - hopper 1338 1 69.86 TATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGT:1 - chr3L 12976348 5' + invader4 2803 2 53.73 AAGTGTAAGAGGGACAGAAAGATGGAAGAGATGGTAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3R 19531300 5' - hobo 2921 1 58.75 GACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTT:1 + chr3R 9160685 5' + copia 4928 2 63.85 CTCCGCCATTACCTGTAAATACTTCTGTCTGAAATTTATAATATTGTATAATAACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACC:1 + chr4 436814 5' - 3S18 6042 2 62.14 ATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 - chr3L 23986608 5' - opus 7431 2 69.86 AAGAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAA:1 - chr2L 18149516 5' - Bari1 1631 1 69.86 TGAAACACTATTCTTTAACACTTTCATTAGATATTATATTAAAACAAAAGTAGTAATGTAAACTTAAATACCAATATTTGCATTCCTATCTTAACTATTTTTCCTTTATTTTGTCGTGGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATG:1 + chr2L 12240093 5' + Circe 6998 1 69.86 TACCTATATGTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATACACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCA:1 - chrX 21852457 5' + gtwin 68 2 64.14 CTTTTTGTGGCCAAAATCAATAACTTCAAAATAAATAAATTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCTCTGTCTGTCTGTCCGTATGATCGTCGAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTA:1 + chr3R 25508370 5' + INE-1 151 1 71.64 TGGAAATTAGGTTGTTTTTCTTTGTTTCTCCTTGAATTGCAAATTTTTTTAAATCTTATAAATAACTATAATAAAATCAATTCAGTTAAAACAAGAGAGAATGCTATAGCCCCGACTATCAGATTACTCAGCTAGTATAAATGCG:1 + chr2L 21636464 5' - INE-1 533 1 75.17 TATGTTGGTTTTTTTTCCAGAAATTGAAGTAGATGTTGAAGATATTCAGGTGTGAAGGCTTTTAAGTTTTAAATACGAGATGCTGGATCTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAG:1 + chrX 21083892 5' + HB 34 1 57.45 AGATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGCAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCC:1 + chr2R 7020549 5' - Bari1 1644 1 60.96 GCTGCTCGATTATTTCTAGAGAATGTGCCTGTGGACGCACAAATAAATTAATACTCCCAAAACGTTATTCAGGAAAATAGAAAGATAATAACATCTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 - chr3R 4569638 5' + opus 7144 4 65.07 CACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGAGCTACTCGCC:1 - chr3R 18815945 5' + hobo 54 1 69.72 ACTTTATGTGCGGGCAAAAATTTAAATGTTTTGCAATTTTGCAACACCAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTGTGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1 - chr3L 15026836 5' - opus 498 1 78.08 ATTTTCCTATATTTGCGTTCGGATCTGACCACCACCACCTCCCATGGAATCTGAGCCTAAAGCCAATATCGGCACGGTTTCGTTTCTGCATAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGTATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAA:1 - chr3R 18636597 5' + 1731 4467 2 66.21 CAATTAAGCCAGCTCCCCTCCCAATAGTGACATCCCGGCAGTATACATCATCTTCAGTCCAAAACATGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTC:1 + chr4 774038 5' + Ivk 339 1 51.82 TTGAGAGAGCAAATTCCGGCCAGAGCTCAGCTTATCGCAACTTTCTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 23765441 5' + roo 76 2 70.55 AATATTTTAAGATTTTAAATATTACTATTAGTGTTACTAATACTATTTGATCAGCACATTTCCCTTCTCCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 20743960 5' - roo 356 2 55.48 GGATCATTCAGGACATGTGGCATCTCAAACAGTCCATGGGTGTACGACTCTAGGAACTCTGGTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 25304864 5' - roo 9053 2 73.29 CGATATGTATGCGTTCCTTAGCTCTCTGCTCTCAAAAGAGACGTACTCTCACTTGCTGCTCCAACGATCGGATCTGAATCGTCGGGCAAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr3R 4197194 5' - P-element 2854 1 61.64 ATTCTGCTTAGCAAGACGATGGCTTGGCTTCTCTAGCTTCTCTAGGTAATTTGGTCTGATCTGGTCTGGTTCTTTCAGTCGTCAGCTGTCTTATTTGAATTAAATAATGTCTGCGTACCTAAGTACACGCGAATGCTTTA:1 + chr2R 7758692 5' - Q-element 554 2 77.86 ATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCA:1 + chr2R 5917839 5' + I-element 5133 1 73.97 ACATCTGTGCCGACAGGCGATGGTGTGCCAAATGGGAGTAAATGGTATGTAAAATATGATCACATGATTCGGAATAAATTATTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATATAGTTATGTCCGTCTATCCGTATGAACGTCGAGATC:1 + chr2R 19792892 5' + INE-1 132 1 49.66 ATGACGGAGCGATCGCGCATGGAAAACCACTTCCCCCTGGCGGTGAAGCTAATTGACGAAGGGAAATTGATTTGTATATGTGATTGCATGGCGCTTTCCATCAAGAG:1 + chr2R 22416306 5' + baggins 5255 1 68.22 ATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 - chr2R 8157283 5' - Transpac 264 2 54.79 TGGTATATTTTTTGCATATATGAACATTGGACCTTGAAATACTTATTAAATGTTGAATATCTTTTAAAAAATTAGCATCAGCATATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCGCGCCACTCGCACT:1 - chr2L 17136294 5' - hobo 2932 1 83.56 TATAAGATCGGTAGAACTTAAAACTTTTTACACGTTGGTGATCGTTCTGACATTTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr3R 7981477 5' + jockey 73 1 64.38 CAAAAAGTCCAAGGCACAGAGTTGATTATGCGGGAAGCTTCAAAAACTTTTCGGCATGCTGCACTTTTTAAATGGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGT:1 + chr3R 17656358 5' - mdg3 5452 2 56.16 AAAAAATCGGTCTTCTCTGCCTTCACTGTCCCGTTTCGAACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATACAGTAACCAACTTGTCTCCAAA:1 + chrX 22564552 5' + Transib5 60 1 77.40 ACCATAATTTTATTTATTAACAAAAATATTGTATAATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2L 76179 5' - roo 9051 2 71.72 CAATCAATATCCTAAGCGGGCGATCTCGCTCCCTAAATAATATAAAAAAATGGCCCCTGTTTTAAACGGCTACCTATGTGGAAAACCAGCTTTTAACATTGAGGGTTGTTCCGGAGGTTTGTTCTCGGTCACCAGAGCCTCTGCT:1 + chr3L 25674195 5' - Rt1b 246 1 32.41 CTTGTTGTCAGCTGCTCCTTAACTAGAATTCTTTGGTTTTAATCAAATTTATAATGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr3L 18467279 5' - hobo 2935 1 71.59 ATGTATAGACTCTTCAATACTTTGGTTACCATTTGTGTCCAAACAACAAGAGTCTTCAACATGATCTGTATTTTCAAGTTTGGATAATATGTCTTGCGATTGCTTGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAA:1 + chr3R 460044 5' + F-element 104 1 71.72 GTGAGGAAAAACCAATTGCAGGCAAGAAAACGATGAAAAAATTCTGATACAATTTGCAGGAAAAATAAAGAAATAAATAAGAAAAATCGCTTTCTTCTCATGAAATACTGAGTGAGGCACACAGACAGACACACACACATACACAA:1 - chr3R 28939987 5' + Quasimodo 39 2 73.97 ATCTATATAAAAGCGAACATAAAGAGGAAGACTGCACAAGTCTGTTATGCGATATATTGATGATTTGTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTA:1 - chr2R 16881376 5' + Doc 4648 1 54.11 CCACATAGCTCCTTTGCCCCCGCTCTTCTTATCAGGAGCTACTTTCTCTCTTTGTTTCTGAGAGCAATCATTTTCTTTTTCAACTAATTACCTCATATTTAGAGTCATCTGGCAATATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 - chr2R 3292415 5' - 412 7542 2 58.22 CCCATCGCGGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGACATATCTTAGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2R 11133548 5' - roo 9005 2 62.33 TAGCTTAAAAAAGATTTCAGGTATTTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3L 96478 5' - roo 9039 1 60.87 GAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATAT:1 - chr3R 9190587 5' - Tabor 7277 2 58.68 CATTAACCGATAAGATAAAAGAAAGCTTAACTGAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3L 18658964 5' + roo 8712 2 72.38 CGGGCGAGAGAGTTCAGTAACCTCCATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGCAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACTTATAAGTACACAGCAACACTCAG:1 - chr2R 10865272 5' + blood 37 2 58.90 CTCAAGTGTAGCCCACAACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chr3R 21705926 5' + 297 8 2 75.34 CATTTATTACATTTTTTTATTACATTTATTATACATTTATATTACATTTATTACCATAAATTTTTTCCATAAATGCTTGGAGCTATGACAAGCAATAGCAAGGGAGAGATTTAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATAGCTGTTACT:1 - chr2L 1342459 5' - INE-1 550 1 27.40 GTTCTTCTCGATTGCCCTTAAAGGTATGCTTTTAATGCCGCCCCCATCCGAAGCCGAAAAAATCAATTGGGTCATCGCCCCGAAATCACAGGAATTTAAATTTTCGCCACTTGATTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTC:1 - chr3L 13644340 5' - micropia 186 2 80.28 GCTTTAATTACTAAAAATATCCGTCGAAATGGAAAACATGGCCAAGCACCTCATCTTCATTAGGTACACTTTCTTGTCTGGTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTGCATCTATCGTATCTCTGTCTACAGTAT:1 + chr3R 11857326 5' + Circe 96 1 64.93 ATATGTACCTATATTTATATGTACCTCTCAGTCTTGATCAGTCCCCGTTGGCAGGCATGTTGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 - chrX 1804490 5' + Doc 77 1 51.20 CCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGATCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGA:1 - chr3L 25232909 5' + GATE 8307 2 60.87 GATCGGTAGTCGTAATGTAATCTTAGAACATTAATTAGATACGTAGAATAACAGGTAGTTGGAAGAGTTAGTTGAAAATTTTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 20744126 5' + roo 8669 2 78.08 GCTTGGTTGTATAGAAATATACATTTTGCAACACAGCACCATATATGTTATTGAACACTAAAACTTCTGGCGCTAACCCATTAAAATATTCAAATTAATACGTTAATTCATGGCGTCTTGTTCTTTCAAATTTTCTTTTTTTT:1 - chr2R 15339620 5' + FB 175 1 78.32 AGTCTGCTGAGAGTGAGAGCGGATAAGTGAGAGAGTGCATTCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 - chrX 14951186 5' - P-element 2809 1 30.82 GAGTGGCCGCAAACGAGGAACATCTGCGGTGTGCGGCTGGACTGCCTGGCAGCTCCTTATTGCGATTTCACCTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGTCTAAT:1 - chrX 19258906 5' - Cr1a 4088 1 73.00 ATAATTTGCCAACTCTAATTGCAAGCAGTCGTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 + chr2R 12787790 5' - 297 352 2 57.93 AAAATGGCTTTTCATCGCCAAATTCCTCTCTGGCCAAGTTTTTTTGTTGCGATTGAAAGAGCGCACTTCACTACTTCTTGATTTGCATGTAATCATGATTGGGTTAATGGGCCTATGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGG:1 + chr3R 5519045 5' - G2 2768 1 80.69 AATGATTTGAAGCACGTTTGAAAAATCATTCTTTTTAATCTCACCATTTGAAAGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAA:1 - chr3L 16496717 5' + jockey 4761 1 59.23 TGTGTAAATTTTTCTTAATTGCTGCATTCAAAATTAACTGTTGTGACTTGGTTTTATTGGCCAGGCGTTGCATAGTTTTAGGCGGCATTTAATTTTGACCGAAGGTAAAACATTTCAGTTGGGGAACAATTATTATTATATATTAT:1 - chr2R 11930299 5' - Tc3 256 1 75.34 AACAAGAGAGAATAGTTTTTTGGTGGTAGAATTTTACAAGACATTCATATAAAAAGGGAAAAATTACGGACATAGTCAGTTTTACTCGGCTATTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAT:1 - chr2R 12994975 5' + BS 5025 1 63.01 AAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr3R 24476379 5' + 412 45 2 52.59 AACTTTTGTTGTCCGAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3L 12867358 5' + roo 74 2 69.86 GTAGAGAGTAACTTTGAATCATACTCATAATCATAATCAAATTCTATCTTCTATCGTAGTCCTATCAATGCAAGGCAAAACGATTAAAATACTAGTATCTTCAGCTAAATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAA:1 + chr3R 29705926 5' - S-element 1704 1 76.03 ATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTG:1 - chr2R 5237886 5' + Doc 91 1 56.55 GGTGTAAGTGCGTCTGTCCTGGGGCATAATGAAGTAACCAGATTCCTGACGGCGCACTTTGTTTTGGGCGTCGTGGAAGGTACGCTTGGTGTGCTAAAAAATAAATAAACAAAATAATAAAAATAAAAACAAAA:1 - chr2R 19361468 5' + Doc 4691 4 73.88 ACAAGGAGCAAAAAGAAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTA:2 - chr2R 6526626 5' - jockey2 3343 1 69.18 AAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:2 - chrX 16855331 5' - roo 9005 2 62.33 GATGACGTCAATGCCAAGTCCTGGTGTAAATTTAAATCCAATCTCATGGCAACGAAGAGGCAATGCCGGCAAAAAAGATGAAGAGAAAATGAAGAAGTGAAATCAATTTCTTTTTAACATTTCACGAATAATTTGTAAACGAATCA:1 - chr2R 20500210 5' + frogger 2219 1 76.71 ACTGATATTCTTTCGGAGTGCCTTCACCCCGAAATTCGTGCTTTTCCTGGTCAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr2L 9237462 5' + blood 7029 2 69.63 TCTAAAAAACAAATGTATAGAGACATCAATATCCTCATTTAGCTAATGGGCATTATTATTGGTCTCATGTCAGGAATAGATCTTTAATCGCATTCAAATTGCATATCAAATTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTA:1 + chr2R 8158690 5' + Juan 15 1 77.14 TGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr2L 76061 5' + roo 83 2 74.66 TAAGTGAGTGGCTTACCATTTTTTAAAAGGGGACTAATTTAAACCTTGATTGGGCACGTGGTGCTATTTTTTCGCCTTATTTTGGACCTTGCTGAACCAAAAAAATTATAAACAAGAGAGATGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAA:1 + chrX 21100675 5' - INE-1 566 1 60.96 AAGACTTCAAAATTGTGGCCTTTACGAATTTAGTATAACATTTTACTCCACGAGGAATTGGTATAAAAAAGATATCATATTTAAAGCATACTTTTCGGATATTTTTTTTTTTCTATTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAAC:1 + chr3R 6388678 5' - jockey 4983 1 69.86 CCAAATGATTTCCCTGCTTTTATCGGAGCTGAGAGCGCGTATTTACCTTTAAACTGGACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 - chr3L 7962338 5' + blood 7018 2 76.98 GAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chr2L 22015967 5' + Tirant 43 2 79.78 GTGAAATTAACGATTGGCCTACGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAT:1 + chr2L 3294149 5' + hopper 43 1 75.27 TAAGAGCTTTATAAAGGCAATAAAGCGCCTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr3R 13176320 5' - Burdock 6356 2 60.00 ACACGTGACGCTGCATAGCATCCAACATGCCCCTCCCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 16562871 5' - roo 352 2 67.80 CGTTCTTTTCTTTTCACTTCCTTTTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3R 23236471 5' - hobo 2920 1 63.24 TGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGATGATCACGTGAGGCCCATCCCAA:1 - chrX 17678734 5' - Rt1a 4703 1 83.56 GGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAA:1 - chr3L 23702286 5' + G4 32 1 59.59 AGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACCGGACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGATGCCTTGCATAAATACATGTCTCAA:1 + chr3L 11336356 5' + blood 63 2 61.24 ATAACCGCACAAGTCAAGTCTCTATTTATCCTCATTTTGAGTTTCAATAGAAATTTTTAGTTCTGGACGAGAATAAGAATCGTGACAGTGGAGTGTAATTAAAGTCCATTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCAT:1 - chr2L 14855868 5' - roo 8825 2 73.97 CACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chr3R 9160779 5' - copia 5073 2 48.97 CCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACG:1 - chr2R 8157277 5' - Transpac 258 2 53.42 AATAATTTGCTTTCTCAGCTCGTAGCTTGATTTTGGTTACTGACTAATGGCAAATCATACTGTTATGTATCTCTGCTCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chr2R 23412503 5' - mdg1 376 2 51.37 TATGTATATTAATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 + chr2R 641846 5' - opus 465 2 58.14 ACTGGAAATGGGGTCAATGGCAAAAGCATTTGAACTCTTGTTTATTTCTGGCGAGTTTGTTTATGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr2L 13927707 5' - roo 9030 1 51.91 GGTATATGTATGTATATGCTGGGCACAACGCATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chrX 12526013 5' + roo 48 2 51.75 CATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTTCTATCACAACACGCACCCATATCGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATATTTAGATTTCTG:1 - chr3R 4571525 5' + 1360 3272 1 59.71 TGGAAAATGAAGGGAAAAGCAAAACATTTTTAATTAATGTATGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCA:1 - chr3L 20289123 5' + jockey 4749 1 70.34 TGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTG:1 - chr3R 13582269 5' - BS 5003 1 79.45 AAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACCGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGATCGTGTGC:1 - chr3R 29645755 5' + jockey 91 1 71.92 GGGGGCGTGGCCTTGAACTTTGTATATATATATATATATATATATATATATATACATATATTT:1 - chrX 10256082 5' - 1731 4409 1 87.30 GACAGCTGCATATTTATGATTCACTAACATGCTGAGGTGGTGACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 16181268 5' - roo 9045 1 67.12 TTTTTTTTAAACACACTTGAGTTTCCCTTACGTTTTCATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACAAAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACAAGAGCGGTCTGCACGCTAAGAAATTTAGATTTTGT:1 - chr3L 24710198 5' - Cr1a 323 1 73.10 TTAAGGAGATATAATTACAACTTTAGAGTTAATCTCTTTGCATAAATTTTGTATTATGCTTAAAACAAAAGCCAGATTGTCAATGCACTTTTATTAATTGGACATTTCAAATAAATGAACGCATTCAATTGGAAATTGTAAAAATA:1 + chr3L 11673964 5' + TAHRE 10186 1 53.42 GTTAACCAATCAAATGACACTTAAAACTCAGCAAGATGGGCAAGAGAAATACCAACAACGGTGGCGTTAAACACAGCCTAATCAGATACATACACACACACACACAC:1 + chr3L 5055661 5' + Quasimodo 33 2 77.57 CTTTCCACTGTCATAACATATTATTGAGAATTCGTTTTCTCTTGACCTTCGTTAAGAATCTCTCTCCCGACGTTCTCCATTTCGTCAGGTTCTCACTCCGAATTAGCGATAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 + chr2R 7665693 5' + Transpac 4929 2 78.08 AAATTAAAAAAGGATGTGCCGAGCTCACCAACCTTTGTAGCCTTCTTTTGGGCTGCTTGTAAATTTGCATAAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGC:1 + chrX 20760342 5' - R2-element 3235 1 51.37 ACATTAAACAAACATAATAATACTAATGGTAGCCAACAAGTGCACATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3R 19859538 5' - opus 7476 2 37.67 ATTACCTGTAAATACTTCTGTCTGAAATTTATAATATTGTATAATAACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTT:1 + chr4 436821 5' - 3S18 6029 2 68.49 AGATAAACTAAATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATATACATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCTAGCCACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAA:1 + chr2L 12183687 5' + INE-1 147 1 69.57 GTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr2L 76131 5' - roo 9002 2 71.23 ACATGTATAAAAAAGAGAAAGAGATGTTAAAATTTAAGAACTAATATCTTTTCGCATTCTGACCTCGGTAAACATGAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 14076182 5' + roo 44 2 56.85 GTATTTTTATTATTTATTTTTTTATTTATACTAGATTCGTTAAACAGTATTTAAAAGGCAGAGCGAAGCGTTTCCAACCATTTAAAAGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3R 16863309 5' - roo 9039 1 43.84 GATAGTTCGATAACATCCCGCGAACAATCTAGCGGATGCAATCGAATTTAAGCTAAGTGTTAAATGGTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 19836529 5' + pogo 20 1 64.96 AAATGTTCAAATTTCAGAGTCAATGTCAACCAAATGACCTCGAGACATTCTTGTCCAGAAAATGCCAAACAAAAAATGACGACTTAAAATACAATTTTCATTGGATTAAAATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 + chr3R 16913302 5' - pogo 2094 1 79.45 CGCTATTACAACTGGCCGGCTGGTCGAGCGAAAGACTAATGTTCTAATTAACCATATGCTACATCATTAATTGTAAGACCAGGCCCGAACATGAACTTAACCGGGCTGCCAGTCCAATCCTTAGCTCAATTTTTAGACTTTAGTCC:1 - chr3L 22387606 5' + transib2 2796 1 80.14 AAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3R 27768801 5' + 297 55 2 56.85 GCTGTCAAAACTTATAAGAACATAAGAACAATTTTAATAATTTGTTCTGTGAAGTCGTCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGGCAAAATGAGTCTTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTG:1 + chr3L 24347000 5' - baggins 5047 1 64.71 ATTCTTGCTAAATGTAGTAAATAATATTCTCTTAAATGTTAAGATCCTCAATGGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTT:1 + chrX 16383961 5' - diver 6087 2 68.49 CATCACATTTAATTCGTTTTGGCGCTGTACGCGGGCGCACGCAAATCCCCAGTTCCCCAACTGGATACCCCTCTTTATACTCCACAATTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr2L 16458559 5' + roo 26 2 62.22 ACTTTCACTCAGTTACAATGTCTTACTGGCCCCTTTGCCACTTGCCTCCGTACACATTCCCATAACATCCTCCTGCTCTCCACAGTTATTAACTATTCATAACTTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 - chr2L 2272601 5' + copia 17 2 71.23 GCTTTATGAATGCATAATTTTATTATGCACAAATTCTATTTACAACGCGACACGTTGCGTGAACGGTTCATGAGGCGCAAATGCGAGGTTCGCTCTACAACTTGATACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chrX 21196647 5' - roo 9056 1 74.66 TTTACAAGACATTCATATAAAAAGGGAAAAATTACGGACATAGTCAGTTTTACTCGGCTATTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTAT:1 - chr2R 12994943 5' + BS 5057 1 62.33 TATATTTGACTAACGCCCTTCCAGTCGTTGTAGACAGTGTTTACTTCGATGTTGTGGCGCATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr2R 5868385 5' - pogo 2051 1 57.55 GAGATGTGGCTCCTGTGTCTATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTG:1 - chr2L 22780930 5' + HMS-Beagle2 59 2 62.77 GCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2L 16884889 5' - pogo 2069 1 60.00 ATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCAC:1 - chr3R 28728727 5' + jockey 100 1 76.71 GAGACCAGTACGAATGTACACATTCATTACACGGTCCCGATTACTTCTGAAAAAGCAATATACTTCTGATCGATTACAGTTACTTTCTATAACATTTAATTTCATAAAAGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr2L 6319050 5' + pogo 9 1 78.08 TTTTAAATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:1 + chr3R 9190446 5' + Tabor 23 2 43.84 AATAGTGAAGTGTATTTCGAAACCTTTATATAAAATATTTTAAGATTTTAAATATTACTATTAGTGTTACTAATACTATTTGATCAGCACATTTCCCTTCTCCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 20743927 5' - roo 397 1 76.26 CCCAAACCGCATCTGTATGTATATGTATATTAATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 + chr2R 641825 5' - opus 7472 2 65.75 TGGTCAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATAT:1 + chr2L 9237509 5' + blood 7087 2 69.86 GCGCCCATCAAAGATGGCAAAGATGCTTGCTTCCAAATGGAACTACAGTGAAAAAGAGAAGAAAGTACACTGAGGGAAAAAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAAT:1 - chr2R 19597384 5' - Tabor 429 2 54.11 GTCCTTAAAAATTTGTTAATAGAATCTTTACTGTTTGTTTGAGTATTACTTGATTTAAGGTGCTGCGAAGGGTTAATTTCGGAAAAGTAAGTAGCATAATGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 16579206 5' - roo 9046 1 68.49 AATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATC:1 - chrX 20999593 5' + BS 29 1 50.83 AATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACA:1 + chr3L 17707831 5' + Doc 79 1 65.71 CTTATTATGCGTGATGTTCTAGGACTTTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGA:1 + chr3R 15022005 5' - Tabor 7280 2 54.79 GAACATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chr3L 23986511 5' + opus 7146 4 51.26 TTCAGACACTTGTGTAATTACTCTAAGGTACAATCACTTTTCCTGTTGCCCAGTTTTCACAAGACTGTCGGTTACCAAAGCAGTAGCAAGTCAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCGTTAAGGGTACGCACAAGTTTATAG:1 + chr3L 14418761 5' + rooA 7592 2 54.11 AATACAATGGTAATGGTAATCAACTTCATACATATTTAAGGAAAGTTATATAGATATAACTTATTGAGAAATATGTGTTCCATGTTGTCTTAGTTTAGGCAAAATCTAACCAAAGTGTTCGTCTATTGTGAAGTGAGAAATGATTT:1 + chr2R 5475118 5' + transib3 404 1 67.81 CTGCATAGCATCCAACATGCCCCTCCCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3L 16562881 5' - roo 334 2 76.19 CATAGCCAACCATTTAACCAACCAGCAGCTCCTTCTTCTCTGCACTTCACCAGATGTCTGTCGTTTGCGTTTCATTTCTAATCTACTCTAAGAATACAATCAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAAT:1 + chrX 4761520 5' + Stalker4 44 4 60.16 AGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr3R 31490962 5' - roo 9036 1 65.91 AGGCAAGTGAAGCGAATGAAAGCTTGAATGATATTGACAAAGGCAAATGCTACCACCCATCGTCCTATGAATGAAAAAAGAAAAAGAAAGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTAT:1 - chr3R 20980160 5' - Chouto 57 1 56.55 TACCACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAACGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGAATTA:1 - chr2L 18689238 5' - Gypsy6A_LTR 240 1 71.23 AGGACTTCCCGCTCGAGTGGCACGAGCAGCAAAAGTTTAGCGTTGTTTTTCCGTTCCATGGCCCACGGAAAACTGCAGCATCAACGGGGCGCAAAATAATAACGTTAAGACAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCTAAG:1 + chr3R 16513114 5' - 1360 242 1 61.64 GAACCGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:2 - chr3R 9160788 5' - copia 5082 2 53.79 CATAAGATTTACCTCCTTCTCTGTTTCGATCTAAGCCATTCTTTGTTGAGTTATCCTCTGCATTTGCTTGGAATTTAAATGACAGTATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 + chr3R 7739413 5' + I-element 12 1 71.31 TCCCCCTTTTTTTCCATGGATTTAAGAACGTAATCACAGCCTTTCATGCCGTGCATTGCATACTTTCCACATGCTCAGCCCAATGACGAACAATAAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCTAC:1 + chrX 12867219 5' + F-element 457 1 74.40 ATAGATTTAAACTAAACCCAAGCTGAGGCGGGAAACCGCTGCTTGGAAAAACTAACAACAAAACTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACGGCTACGACC:1 - chr2R 17373248 5' + gypsy6 13 2 69.09 AATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGC:1 + chr2R 7727105 5' + BS 4701 1 52.74 GTAAACTGCGGTTACAGGCGTAACAGAAATTGTTGCCTACTTTTGTGGGCCGCTCAACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 + chr2L 17210241 5' - jockey 4953 1 58.22 GAATGGCATGTATCCTGAATACGCAGTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAG:1 - chrX 1018180 5' + 1360 218 1 69.18 GTGTCCAAACAACAAGAGTCTTCAACATGATCTGTATTTTCAAGTTTGGATAATATGTCTTGCGATTGCTTGCCAAATAAAATAAACTAAATAACAAATCTGAAAGCGAAAGAGTCGCTCTATG:1 + chr3R 460078 5' + F-element 117 1 58.06 ATTGTAATTTTTGTTTTATTTTTATATGTTGGTTTTAAAACTTAGTTGCCTTTGGACTGAATGGATTACAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTTTTTTTTTCGGATACTTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCA:1 - chr2L 16579497 5' - 297 414 1 53.24 AGAGAAAAGGGGGTAGGGTAGAGCCACACACTCTTACGTCTTTTGACGAAATCGTACGGCGTCGTGTGGCTTATCTGTTATCTTATCCTCGGCTTTTCGGGAATGTATCGTCATCTC:1 - chrX 14209885 5' - gypsy4 6515 1 70.94 AGTGTGTGTGAATGTGCGACTGTGTGTGTGTGTGCCTGTGACTGTGACTGTGAAGGACACACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTA:1 + chr3L 4001079 5' - hopper 1357 1 59.31 AAGTGCGTTAATCTTGTGGTCATTTGGCTGCTTCGTATTAACCTCTGAGATTAGCTGGCATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 - chr3R 19859703 5' + opus 10 2 68.69 ATGCGATGAATTCGAAAACAAACAGGCTGCAAAGCGCTATGAAGCCAGATTGAGTTTACAGAAATCATACCGTAGGCCCAATCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTT:1 - chr2L 4315611 5' - copia 5053 2 54.79 ATAAACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAT:1 - chr2R 4206662 5' + 1360 316 1 75.34 ATAAGTATGGTATAGTTAAGGGGTTCTATTCATATATAGTTCACCCCAATGAAATGTTTGTGCACGTTAGCCGAACGAGACGTTTTTGATAGACTGTTCAAATTAGGGTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr3R 21001751 5' - 412 480 2 73.10 TAAATGCCAAATTAATTAAAAAATACAGCGGCAAAGTAAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 13563433 5' - roo 9042 1 64.83 AGGGTGAAAGAAAACTCTCAATAATATTAAATGCCAATATTTCAATAACAAGAAAGGAAGGACAATCCGTCTAGCTGAAGCTTACACAAAAACAAGGAAGGTTAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 17845072 5' - HMS-Beagle2 489 1 79.20 AACTCATACATAACTCATACTTTTGTAAAATTTATGCAACTTAACAACTTGCTTATTATTATCAAAAGCTGTTCTTAAATTCTTTTTAAATAAATATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACT:1 - chr3R 25768904 5' + copia 4895 2 58.90 GGTGCCGGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3R 27768793 5' + 297 47 2 51.37 ATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCG:1 - chr2R 1949125 5' - Cr1a 4410 1 77.11 CACTTGGCTGTCTTACCACTGGCTTCGGGTCATTGTTTTTACCCACAGGAAAATGACTGGGTGAGGGGAAGGGGGACGGGAGAGAATACGTTGAACATGCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCG:1 + chrX 7165263 5' + Quasimodo 6901 2 74.62 AAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 + chrX 1103608 5' + pogo 56 1 60.00 AGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr2L 17029589 5' + blood 60 2 58.22 CTATAAAGGTATGATATAATGCTCAAAGTAGTCGTAGAATCATTCATAAATAGATTATATCATATTTTTGTTTAATTTCTATTTGAATGTTGATAACTTTGTTCTAACTTTAAGTAATATTGCTCTTTTTTTCTTTTCGTTTTTT:1 - chrX 6543878 5' - Doc2-element 256 1 37.93 ATACATATATATATAGATATATCCTCGCACACCAATACACCTGAGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTT:1 + chr3L 22154636 5' - hopper2 1533 1 67.12 CTGGAGCACCGGCCCAGCATGCGTGAGTTACGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTC:1 + chr2L 22015941 5' - Tirant 346 2 79.80 ACTAGCGAAATTTTGTGGACTCTCCAGAAGACGTTTTTCACGGACATTCTTCGCAATTCCCTCAACTATTCCAGTGGCAAGCTCTCCATGCCCGATGAAGCTTAAAATGTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGATATTCATT:1 - chr3L 21854032 5' - pogo 178 1 74.48 ATACGTAGAATAACAGGTAGTTGGAAGAGTTAGTTGAAAATTTTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 20744088 5' + roo 17 2 68.33 GAAATTTAGCCAGTCTGTATATGTAGTTCCGGTTTCCGGATTTGATTGAACTTGGCGGAAGTTGATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3R 29733013 5' - opus 473 2 59.66 CAAACATTTGCAAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chrX 2762588 5' - roo 8997 2 67.12 TTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGAGTTGCTGACTTTAATTGTCTTTGCATTTCTCTTGAATTCAAGTGCATTCGCTTTTGGATACAAGTGCT:1 - chr3R 934272 5' - Idefix 327 2 51.37 TGTTACAGACACAGAAATGTCTTGAAGTATGAATGCTTTTCTTTCAGTGAGAATATATATGCAATATATATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTAATCAAA:1 + chr3L 11399895 5' - Quasimodo 7333 2 53.68 TATTATATCGGCGCGTGTCGGGGTGATATAAAGGAATCGACTTGTAGGACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr2R 5737237 5' - 1360 3374 1 69.60 CGGATACTCGGAATAAGTGTCTTATACAATTTTTTTTGAGCATGAGAGAGCAAATTCCGGCCAGAGCTCAGCTTATCGCAACTTTCTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 23765482 5' + roo 8683 2 69.23 AACGCCCTTCCAGTCGTTGTAGACAGTGTTTACTTCGATGTTGTGGCGCATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr2R 5868374 5' + pogo 50 1 62.50 CAAATGGCGACAGGTGTTTCAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACACGCAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCC:1 - chr2R 13644541 5' + Burdock 6171 2 61.64 AATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTACTTG:1 - chrX 22824251 5' - Gypsy12A_LTR 2231 1 47.95 CTAGTTTGTCTATTCATTAAAAAAAAAATGGTTCAAAAATAAAGTGGCCAACTAACAAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCTTATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 17305547 5' + roo 50 2 57.14 CGGATGACCAGAGTTTACCTTTAAAACGACGGAGACTCACACTTTTTCCAGGAAAGCGCGCAGAAAATGATTTTATGGCTCTGTTTTTCGCCGGCTGTTTATTGACGTTCAAGCCTCGTTTTCCAGCTTTTCTAAAAAGGACTTTA:1 - chr3R 15453105 5' - Idefix 409 2 69.86 GGTCTAAGATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTCTCTCTTCG:1 - chr2L 17029675 5' - blood 302 2 67.12 AAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATTTTA:1 - chr2R 6526610 5' - jockey2 3327 1 58.22 CCATCGCCAACGGCACTTGGCCAAAACAAAATTTGCTCCTTCTGCCCACATACTCTTCGATTCTGGATGGAGTTTTGGGTATTTCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chrX 8012376 5' + 297 6595 2 71.76 ATGGCAAAAAGCTCAACTGGGCAAACATTCAAGTCAATTACGAGAGCAAGGTAAATAAAGTGCGACCTTGGTAGCCGGATTCCCCCAAAACAAGGAGAAAAAGAGGGAGATAGCTAGAAAGTTAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chr3R 19741391 5' - blood 7179 2 54.11 ACACCTAGCAGCTCAAGTGATTAAGATAAGATAAGATAAGATAACAAACACGTAGTCTTAAGCGCGTCATGTGCGGGTGGCTGTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr2R 8562343 5' + 1360 39 1 61.64 GTTGTTGGGGAACATTCTGGGACTTGCCTAAAACTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr2L 15988049 5' + roo 8734 2 75.97 AAGGATATCTTTGCAAACGACACGGAGGACAGTACATTTCAATGTCTAATTTTTTAAATAAATATTCTCATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAA:1 - chr3L 15915859 5' + Doc 4555 1 52.74 CTAAAATCCATTTATTTACCATGTTACCATTACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAAT:1 - chrX 10161209 5' - micropia 413 2 52.14 CTGGTTACCCAATTTACGTTAAATGTCACTGACAATGTTTGATGACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGAGCTCCAAGGGTGGCACACTGACA:1 + chr2R 5542313 5' - 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INE-1 78 1 71.92 ATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTG:1 + chr3R 11750178 5' - Tabor 418 2 62.33 CTCTAATTTGATAAATAATTATAAAAACTTCATATTTATACTGTACTACTACTATATACTCACTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCA:1 + chr3L 9713935 5' + G2 2698 1 57.53 GATCTATATCTATCGTTAAGCTGATATCTGCAATCGAATCCCATCCTAGAAAGTTGGCGAAAGATTGTAAAACAATTTCCCTTTCCACTTTTATGCGCCTATTTCTAAGAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATG:1 - chr3R 5210253 5' - hopper2 1263 2 71.63 CGTAAGTCTTTTAAGTCTTGGATTCGGCATTTGATTCACGACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCATATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr2L 9485703 5' + 412 32 2 50.00 AAATATTTTTGTGGTATTCCTTCATTTATTACAATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr3R 16913480 5' + pogo 41 1 58.22 CCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAG:1 - chr3L 9909752 5' + Transpac 5006 2 76.60 TGTTTGATGACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGA:1 + chr2R 5542348 5' - 1731 4561 1 60.96 AACTATTGCATAGTTTTCAATTTCCATTAAAATGCCAGCATTGCGCCGTCAAGTATGCAACGCGACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 + chr2R 5922919 5' - jockey 4979 1 58.22 TCATTACTTCCATCGGGAAATAAAATGGAAAGAACATTATTTACGATCTGAAAAATATTTATCTCGTGGTTATCTTAGGTTAAATACAATTCCATTCCATTTCTTACTTAATTATTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTACGACCA:1 - chrX 22803913 5' - Rt1a 4836 1 76.71 GAATACAAACTCGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTTCTTT:1 - chr2L 1558715 5' - 412 425 2 63.70 AAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:2 - chrX 5150368 5' - roo 8998 2 69.86 TATTTATTTTTGCACTATTTTTTTGAGTGCATGATTCAGAGTGTAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTAAGATATCTGCATTA:1 + chr2L 12414863 5' + pogo 37 1 57.53 CGTGAACGGTTCATGAGGCGCAAATGCGAGGTTCGCTCTACAACTTGATACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chrX 21196704 5' - roo 8999 2 65.75 GAAAAGAACAATGACGGGAATTTTAAAGCTTCTTCCAAGCAATACAATACTTTGATCACTTCGTTGTTGATGGAATTGTAATTACATAACTCTTTAGCCAATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2L 14201324 5' - roo 393 1 56.85 GCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 - chr3R 6388782 5' + jockey 93 1 73.97 GCCAACTCTAATTGCAAGCAGTCGTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAA:1 + chr2R 12787797 5' - 297 6927 2 56.94 CGCCTACCGAACTCCCGCTCCTCATTAAACCCTACAGTTGCAAACACCACCGCTCACACACACACGCACACACATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chrX 7980768 5' + hobo 28 1 62.31 TGATATGAATTGCGGCTATTTTGGGGCCGACTTGAGACACGTGACCATCTCTCGGTCACTACCCACTAAGGTTGGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 - chrX 23155303 5' + blood 7033 2 70.14 CATGCATGCTCAAATTCACCGCGAACCACACAAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3R 24476410 5' + 412 20 2 69.50 CGATGATTCAAACGAATTACACACTTAACAGTTCGGTAGCCGCACACAACAAACATCAGAAATATAAATGTTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr2R 10781130 5' + FB 31 1 49.21 TATCTTTCCCAATGCATGATGCATTTAATTTCGTATGTGTGAAACGCACCTAGCAATGTATTTAAATAAGAGCCACACTTTTTAAAAATACTATTTACATAAAGAAAATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTG:1 + chr4 1026604 5' + INE-1 98 1 72.41 CGGCTCCTTCGGTACCCTAGGTGCCTTTGGTTGTTTAGGTGGCTTTGGTAAGGAATTTTGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGC:1 + chrX 4801439 5' + INE-1 531 1 58.33 GAGTTGCAGAACTTTGTTCAAAATCTCATCCAGGAACTTGCCCTTCTGGAGGATGTTACTCAGTTGGAGCAGTCTCGCCCTTAGGAACTATCAAAGCTAGATTATTGAAATTAGACCTAATATGGCTTTTATTAAAAGAGCCTTAG:1 - chr3L 14097095 5' - G5A 2390 1 51.37 GATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCT:1 - chr2R 4261951 5' - invader4 2965 2 66.44 ACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr2L 4173970 5' + roo 67 2 64.38 GAAGGACGCCGGGTGAAAAATCCAAATAACAAAAACTAAAATAAAGTAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAATAGACGCTCTATGCGATGCAAGTTCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAG:1 + chr3R 28435497 5' + F-element 175 1 69.86 ATGTCCTAGTTCAACCGTTTTCGCGAGTCTCTGTGCTTCATTAGATTGACCACAATTCGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCCGGTAACTTAAAAATGCAGTTAACTTAATTTTT:1 - chr3L 23042135 5' - pogo 2039 1 60.27 CTCTAACCTTCTAACCGCCCAAACCGCATCTGTATGTATATGTATATTAATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 + chr2R 641808 5' - opus 486 2 77.40 CTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATT:1 + chr3L 24934319 5' + HMS-Beagle2 6912 2 63.04 ATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1 + chr3R 9190498 5' + Tabor 6880 2 51.20 CCGTTCAGAGCTGTCAGCTTGCCCATTTTCCAGATAGATTCCACTTATGTATTATTTATATAAATGACAACATGAACTTAAATTGTTAAATGTGGGGCCATAGAAGTTTTTTTATTTCTTTATTTATTTAGAAGCGATAAATCCAT:1 + chrX 20266108 5' - BS 5077 1 50.00 AAAGAATGCCGCAGCAAAAAAGCCCAAAACGGAAAACTGTAAAAAAAAAAACAAAAACAACTACACAAGCACAACGAAGAAAATAAAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGGATGACTCCGGTGAGCAGGATG:1 - chr2R 16179765 5' - Rt1b 4965 1 64.18 ACTGCAGCTAGCATGTTCGCACTGGCACACTGCGGTCACACTGGCTTCGCTCAGCAAAATATTGCTTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 - 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chr3R 10266138 5' + 1360 55 1 70.48 ATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr2L 17136210 5' - hobo 2931 1 60.32 GCCGACATTCGCCTGCAATGTGACCTTCACCTTGGCAGTGGCCGCAAGGCCGCGCCTGCACCACCCACCCACTTTCCACAAAAACATTGCTAATAATTAATAAGAAAAATCAATATCAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATAT:1 - chrX 16696788 5' + Stalker4 6880 2 53.42 ATTTGTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTACGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chrX 21852452 5' + Tirant 8139 2 53.57 AGGTTGTACAAGAAATGTCGAGATTTACGAGATCAGTGAGGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCT:2 - chr2R 8641644 5' + diver 17 2 69.86 GGGGGACTAGTCAATATGAATATTATCCAAACCTTTAACAATGACAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGA:1 - chr2R 11486347 5' - mdg1 7362 2 69.66 ACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3L 14553111 5' - 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FB 687 2 56.16 TAGACTAAAGTTGCGCAGTATGGCCACACTGATAATTCAAATATTTTGGCACTAAATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTAT:1 + chr3R 11750123 5' - Tabor 7312 2 76.71 AATACATATTATTCCGATGAAAAGCTTTCTCGTTCTGGTACACAAATATATTTGAATAACTACAATTACATAACAATCACATAGAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGG:1 + chr3L 14194619 5' - X-element 4520 1 59.15 TATGTACACTTGGTCTATATGCGTGTGTCTCCGCCTGCAAATCCTCTTGTGCTGTTGTCACGTGCTTAAGACTACGTGTTTGTTATCTTATCTTATCTTATCTTAATCACTTGAGCTGCTAGGTGCATGCTCGGCACTCTCACGCT:2 - chr3L 9255304 5' - Stalker3T 161 1 59.59 GTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACACCAGTATAGTGAAAGT:1 - chr2R 2427611 5' + Doc 71 1 65.75 TCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTT:1 - chrX 20999602 5' + BS 46 1 53.42 GCGCATTGATAGTGAAAGTGCATCTCTATTGCGAAATATAAGTTCTTTGTGACATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 + chr2L 6184006 5' + pogo 65 1 63.01 GCCACACCGCCTTTTCTTCCAAATTGTTGTATTCCCAAATTGTAGTCGAAGACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 + chr2L 3659075 5' + 412 7118 2 62.68 CAGTTATTTAAGCACGGACACACGCACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 + chr2L 10089761 5' + opus 60 4 77.39 TTTTGCGTGAGTGGTCCTAAAACATCACTAAGAAAAGAGCTTCAAGTGCGTATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACT:1 - chr3R 10030814 5' + BS 5042 1 57.53 AACGGAAATTTAGCTGACACTCTGGACTTGGCATATTTCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTTGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3R 17114043 5' - roo 327 2 69.86 ATGGTCTATGCTGTTATTCTAACAAAAGATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTT:1 + chr2R 7020523 5' - Bari1 1670 1 56.85 AGTTTTTAGCCGCTTTAAGAAGCGATGAATAACGGCAACACAACTTTTGTTGTCCGAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTC:1 - chr3L 12867399 5' + roo 33 2 63.01 GTTTGCATAAATGTGCGGGTTTCGGGCGAAAATTGAAAAGATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTA:1 + chr2R 17890889 5' - Tabor 405 2 73.97 ATCCTACTCAAATTCCCATTCAGTTGAAGTGAATTACATTTACATTTCTCACCAGTTAAAAAACTAACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAATGTCACCATTC:1 + chr3L 21882811 5' + I-element 288 1 62.33 ACCCTCCATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATACCAAAAATTTT:1 - 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invader1 3940 2 67.81 GCGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 - chr2R 5237915 5' + Doc 63 1 46.58 ACGGCGTGAGTGGAAATTGCAAGGGGCTAGGTTCATCAGCACCAAGATCTGGTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 24122609 5' - roo 9055 2 70.55 AAAAAATGCTCACTCTTAAATTATTACGTGTTAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr3L 13827402 5' - hopper 1396 1 72.60 AAAATGTGGGAGGGTTGGGTTTTAAGTTGCTTGTAATAAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2L 4173918 5' + roo 8679 2 75.34 AAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chr3R 4528430 5' + F-element 54 1 56.06 AAAAGCTTAGTGACTGGCAATAAATATAATCCTTTATATTTATAAAATATTAAAAATAATATTGATAATTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTC:1 + chr2L 15918486 5' - X-element 4662 1 51.75 GAAATATTATTATTCTTGCCTCTTCATAAAAAGACCAATATCAAAATTTTTTGTAATATCCGTTACTCGTATAGTAAAAGTGTATATTAGATTTGGTGAAAAGTATGTAAATTCGTATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGGCCG:1 + chr2R 2954204 5' + 1360 3178 1 71.23 ATTGCAGTTGGAGAAAAGCAGGCAGGGGATTGGGAGTGGAGACGGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGTGTGTTTGT:1 - chr2L 4174050 5' - roo 387 2 53.26 ATGGGCTAGTAGTCACGAAGGGAAAATGGAGATGGTGGCTGCCCAGCTGCCACGCGATCGCGCAAACAGCTGTG:1 - chr2R 2074487 5' + X-element 227 1 54.05 CTCATTACAAAAATATCAAAAATGGCTAACCAATGCGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTTCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATATATACACATG:1 - chr2R 5542416 5' + 1731 75 2 69.17 GTTCAAATACTTAAAATTTTAATTATGTTTTTAAGATACATATCAATGAAGTGCAAAATTATTTATTTTTTGATTTGATTTGATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 + chr3L 1519485 5' - Juan 4161 1 52.74 CGATATGTAAGCCAGTTTTATGGTCCACTCTTTCGAGAGTGGAAGTTAAGAACCAAATGCTTTTGGCTTTTAAGGGTGTTGGCTTTTAATGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 - chr3R 28627722 5' + copia 33 2 65.07 TAGTGCTGTGCAGTTGGCTATTATCGGCTACTTAGGAAAACTAGCTAAAAAAAATTTACATGAAAAAAACATGGTACTTTGTTTCCACGGTTTACGGGCTTCCATTCATATTTAATGGAATTGGATACCATTTTGGCAG:1 + chrX 13280724 5' - HB 454 1 43.17 GACAGAAGGTAATAAATGCAGGTTTCAATATGGCGACAACTTCTTCTCTGACGTCTTCACTTTCACCCAAACCAAGCCACCCACTTTCTACCAACTTGGTATGCCCAATCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCAC:1 - chr3R 24673072 5' + R1A1-element 347 1 71.03 CATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 7035234 5' - roo 9018 2 54.79 AAGCCAGTCCAAATTAGTCCTTTGTTGGATTCAAAAATAGAGTCGTCGTTACATGGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 - chr3L 23986674 5' - opus 499 1 85.19 TGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chrX 1103577 5' + pogo 26 1 66.44 GAAGACCTAACCGTAAGACAAAGACGGTCTATAATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTT:1 - chr3L 24208254 5' - Quasimodo 59 2 58.75 ACCACTTCATTAGTGCAATGATATGTTGTAAACAAAACAACTTTTGACCCTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr2R 5737086 5' + 1360 13 1 72.00 AGGCATCCTAAAAGTAGGCAATAGCTATCCCCACTGTGCCTGCCATGCACTGCTGCCTCACGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 - chrX 19121055 5' + jockey 69 1 57.53 GGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTG:1 - chr2L 6717213 5' + jockey 59 1 49.32 GTTTATTTTTTTTTGCTTATTTCTAAATAATGGAAACAAGGATTTGTTCCATCGGCTGGATATCTTCGATTCTAAGTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTT:1 - chr4 436922 5' + 3S18 5799 2 60.00 CATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chr3R 19859605 5' - opus 7471 2 53.27 GCTACCGCCACTAGGCCTCCGATCCGAACCTGGGCACATTGAACCAAATTGATCCTGAAAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr3L 22900084 5' + 412 7090 2 52.46 CAAACAAATGTAGGATACTGATTAGGTCTTTACCTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr3L 15612730 5' + roo 88 2 75.34 TGGGTTTTCTTTTATTTTTTTTGGTTGATCAGACCTTTTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTTTTTGTGTAGTTT:1 - chrX 2950649 5' - Porto1 300 1 70.71 CTTTTATCGGAGCTGAGAGCGCGTATTTACCTTTAAACTGGACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - chr3L 7962322 5' + blood 30 2 62.33 AGAACAGGTCCCAAATCACCAGCGGAAAATGTTGCAGAACTTGCCAAACCGAAAAGGGTTACTTCTATTATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr2L 5202601 5' + 297 6630 2 52.74 GGCCATATTACATTATCGTAATGATTATGTTAATTCCCAGGCAGTTGATCCCGACGCCTTTGTGTCCTGCAACCCGAATGACTGACTGGCCGACCAGTTTGCCTCGTTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGA:1 - chr2R 23479980 5' - F-element 462 1 73.29 GCTAATGGTATTAAAGGAAAATCAGACTAACATTGATATGTATCGTTAAAGTTATGGACTTATTTAAATTCCTTCGTTCCAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGT:1 + chr3R 20481472 5' - 412 414 2 56.03 TAGAGACCAGGAGTTAATAAATTCATTAACTCAAACCAAAATAGAACTTTTAATGAATTAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGC:1 + chr2R 4312896 5' + gypsy 11 2 76.03 ATCCGTTGTCCCTCTTGCTAGCCTGCCTGCTCGAACGTGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGCTTAGTGCGAGGTTTGGTCTTATTATTTACTTGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTATTACT:1 + chr2R 10078264 5' + BS 5048 1 73.60 AAGGAATTTGCTCGCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3L 905874 5' + 412 36 2 56.76 GTGTAATAATTGCTTATACAGTGTGATCAGCGGAGTAGAGCGAAAACAAAAAGCGATAATCAAAACAAAACTCTGACGAAGCTGCATGCAAAGTTGAGAAAGATCGTATATTTTTTGTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACA:1 - chr2R 19703901 5' + copia 4874 2 67.81 GCTTGTTTCGCAGAACACCAGACAAACAATAAAAGTGGCAAAAGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGA:1 - chr3R 9190633 5' - Tabor 459 2 67.12 TTACTCTGTCACCTGGCTAACACAGACACAACTTACCCACACCCACATCACCACCAACACTCTTTCGCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACC:1 + chr2L 11915497 5' + hobo 10 1 62.24 ATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTA:1 + chr2L 12349789 5' + F-element 115 1 75.57 GTCAAGATAAATCCCATTTGACGCTTATCCTTGGGACTTTGCAAAGTTAATGGATAAATATCGAGTGCCATGATAAAGTTAAAGCCAAATCGGAAAGGGGAATTAAATGGTATGAGTATACTCGTATGCACACACACACACACACA:1 + chr3L 2737408 5' + accord 180 2 54.79 GGAGCCACGCGATAACACCGAATCACGACCCATACGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGACTTTGTACGTCAGCGCAGCAA:1 - chr2R 15829613 5' - invader4 3038 2 53.57 GTTTTCGAAAATAAATCAGTTCACTGAAAAAAAATCGCATCTCTCACGGCGAACACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 958045 5' - roo 356 2 62.88 CAATCTGTGCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:2 + chr3L 15026622 5' + opus 7149 4 58.90 CGAAGCTGCAAGTCGGATTGGCTGGCTAATTTGGGTTGTATTCGATATGTCGGATATGCAAAAGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGG:1 - chr2L 12079710 5' - mdg3 5440 2 54.79 CGATTATGTCAGTCGCTTGTGTTTGTTACCCAGCAGGCGGTCACTTCTTAACCATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCTGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2L 16458678 5' - roo 9005 2 63.70 ACCAGTTTAGGTTCACATGTGCTGCACGGCGATGCCAGCCCGCGTAACTAAGTCTGGCGATGTGGCATCATTTCAAAGGCATTTAAGATGTTTTCACATTCCAAAATATGAGCCAGTTTCTGAATATTTTATTTCATTTATTT:1 + chr2R 9398748 5' - G7 1149 1 65.03 TGAGCAAAATAAATGACACTTGAGCGATGCAATGGCAACAAGCAGCTCTTATAATCGAAATGTTTTCGCTCGCAACATGCACAATGCATGTGTGTGTGTGCCCGAAAATTGATGTTAAATTAAACAACAAAAAAGAAAAAACAAAA:1 - chr3R 26501514 5' + gypsy7 5006 1 80.82 CTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTATGAGACGGATTGCCCGACAAA:1 - chr3L 23702244 5' + G4 70 1 61.27 CGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGTATTTTGT:1 + chr2L 76063 5' + roo 83 2 74.31 TTTGGCGGTATTGATTAGAAGTTGCGACATTGCGAATTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chrX 1523704 5' + jockey 20 1 71.57 TTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr3R 20744046 5' + roo 8749 2 79.45 CCATACAACAGTCAGTAGCACCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGCGGGAGTATCGTGG:1 - chr2L 22746503 5' + R1A1-element 4985 1 66.15 GTTTCCACACGGGAAGAGCGCCCAACAGCTTGTCGATATTCGTTGCCACGGTCACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr2R 19726846 5' + 1360 50 1 58.59 AGCCACCTCCGATTCGATTCAAATTGGCACGCAAGCCAAATGAAGTTATGAGTTTGGCTAACAGAGAGGGTCTTGGAGCGAGTGTGTGTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTC:1 + chr2L 14778664 5' - 1360 3316 1 76.52 GTAATTTTGTAGTTGTGTAAAAAAAACGTAAAACGAACAAAATGACTATATTTATAATAATTTCACATAAATCCACACATCTTATACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAAT:1 - chr2L 21951251 5' - Burdock 6360 2 63.01 GGCTTCAACGATGTTCGGCATTGAGTCGAGTGAAAGTGCCGCCTTGTAAGTTTTTTCTTTTTTTTTCTTCACCCCTCCACCCATTGCTGCTTCTTCCTTGTGTTATTTACGCTCAATATGAAGAAGTTAATAAGCTCAGCCAAAGG:1 - chrX 7629270 5' + Quasimodo 490 2 70.55 GCGTGTGCTCAGCATTTAACTAAACTGGCACACACGCACACCAACACCAGCGAACGGAAAACGAAAAAAAATTAAAACACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCACACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATA:1 + chr3L 629651 5' + I-element 5135 1 62.04 ATAACACAAGTCTTTTTGTTTTTATTGCAGGCTGACTTAGGTTTTTATTTGATTTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTG:1 + chrX 21948942 5' - 412 7369 2 86.30 TCATTATTTTAAACATACCGGGTACTTCTGATCTTAATTGGGAATATATGTACTTAAAGCGATCATATAAGCATCAAAAATCTGTTTAAACAATTAATGTGTTAATGTGTTTTATTTGAAATTTTATTAAAATTTTAATTTACATT:2 + chr2L 7579160 5' - 1360 3049 1 63.01 GCTACTACTCACCGCGAATTCATCCAGCAGTATAAAGTTCTAACTTTAAGTTCAGCTCCTTGAAGAAGCGAGGATGTAACCCCAGCTGTTGGCAAACTTGCCACCAATGGATGTCAACTTGCGTGCTTTTATTTTAGCCGCAGCTG:1 + chr3R 29953278 5' - Tc1 3 1 73.97 TTTCTGGTTGTGAGAAATGTGCAGGAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 - chr3R 10472827 5' - mdg1 7434 2 67.81 TCGATTAATTACTTGTCTAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr2L 16884779 5' + pogo 38 1 52.05 CAATTAAGCGAAGCTGCAAGTCGGATTGGCTGGCTAATTTGGGTTGTATTCGATATGTCGGATATGCAAAAGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTT:1 - chr2L 12079718 5' - mdg3 208 2 54.07 ACTGACGCAGTCAACGTGATTGTAGATGCGCTGGCCTTCAGTAGAGTTGGACTCTCGAATTCACCAGTACTGGTACTTTTCATGCTGGTGCCATTGGAGCCTAATCTTCTTGGTTCTAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTT:1 + chr3R 19048450 5' - Porto1 4486 1 69.18 AATAAAAAATAAAAATGGAAAAGCGGCACACACAAAAGTCGTCAAAACGAAATAATCAAAAGCAATGAATTTATATGCTTTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 - chr2L 20127192 5' - hobo 2899 1 56.85 AAATCAATTAAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCTA:1 - chr2L 12297218 5' + Tirant 17 2 52.56 ATAGAACTTTTAATGAATTAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAA:1 + chr2R 4312936 5' + gypsy 7038 2 50.68 GATTGTGTGCCACTTTGCAGGGGTTCACTGTAGACCACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAACAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTACAG:1 + chrX 9707160 5' + Doc 89 1 75.86 GATCCCTGTTGGTCCAAAGACTGCAAGAGTAATAAAATATCCATAAACAAAAATTTTCCATTGTTGGTGGCTTTAAGAGCGAGGTAACACGACTGTGGCTGGCATACCTGAGAACTCGAAAATAATATATTATTAAAAAAAAAA:1 - chr2L 19475073 5' - hopper 161 1 52.78 TTTTAAATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGA:1 + chr3R 9190446 5' + Tabor 6861 2 44.14 ATAAAAATAACCCAAAACATACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1 - chr2R 13644501 5' + Burdock 54 2 66.40 CTCTTCCACTGCCTCTGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGC:1 + chr3L 25850578 5' - Gypsy6A_LTR 93 1 69.81 GCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATTTTAACGATT:1 - chr2R 6526604 5' - jockey2 3321 1 54.11 ATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3L 96518 5' - roo 9010 2 67.72 GTTGTCATTAGCTGGAATTTAAAACCTTTTCGCCGATGGAAAAAGTTTGGGTCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 27535519 5' + 412 66 2 63.45 GTGAGCGGAAAAAAATGTGCCAGCCGCATACATAATACACGTATCTTGGTGTCTGGGACAGCTGGGCTTCCTTTGCTGCGGTCCACATAAAATGCATAAATTATACAGCGTTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chr3R 27822343 5' + I-element 9 1 79.31 AAACGTACTACTTACCATTTAGAGCCTCTAAAGTGAGCGTCTTTATTCTAAAACTGTCAGCTTAAGACTGACTGTACAGAGTTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGAGACACGGGAATGTC:1 + chr2L 15905080 5' - rover 178 2 73.17 GGCGTGAGTGGAAATTGCAAGGGGCTAGGTTCATCAGCACCAAGATCTGGTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 24122611 5' - roo 390 2 69.86 GCAAGGAGTAAGAAAGAATTTTATGTTTGCACGGCATAAACAACATTATTTCTTATGGTCCACGAGCACCCAAGAGCTACACACCCACACATATGCACTGCAGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 11722550 5' + roo 8704 2 71.23 TTTTATTTATTAACAAAAATATTGTATAATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:2 - chr2L 76172 5' - roo 9043 1 66.44 AACGACAGCCGCAGTCGCAGCAGTCAGTGACATAAGTGGGCGTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 - chrX 6138751 5' + opus 12 2 73.60 GTATATTAGTTGCATTTATAACAGTACTGGACTGTATTTATTTGATATACGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGCCCTAGTGTTCATGGCTTTTAATTTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTC:1 - chr3R 19450173 5' + roo 8775 2 77.40 ACGAGATACGCAGGAAAAGATATACAGGAGTTTTCAAGTTCTTAGTAAATACAACGCACTTGCAAAAACTGCTATCTAAACCACTCGGCGTATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAAT:1 + chr2R 19553147 5' + mdg1 30 2 63.70 ATACATAAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 + chr2L 13250359 5' - opus 428 2 73.97 GGCAACGTGCAACGCCCGGAAAACTTAGGAAGAGGTGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chrX 5858977 5' + hobo 57 1 64.00 CGCAGAAGAATAGGCTAAAAGCACATGCATGCACATACATATGCTATGCAAATTGCGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr2R 19554872 5' + pogo 7 1 78.77 ATACCCATACGTACTCATCTCATCCTATCCGAAGCCCCTGTCGGGCAGATCATTAAATGATCATTAAATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCATTTTTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 - chr3L 15100063 5' - copia 237 1 50.69 CATCTCCATTCGGTTGTAAACGCTGCGATTGTTTGAGAAAAATCGCGGCCGCAGTTTCCTAGAATGGCCATAAGAACTGTTTTATGCTAATGAAGCCGCGGATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAA:1 - chr2L 11460358 5' - Cr1a 156 1 74.81 AGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGC:1 - chrX 20999623 5' + BS 13 1 67.91 GCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chr3L 905861 5' + 412 7124 2 73.68 CCTCAAGGTATGCTATGGATTTTGAAGACCATGAGAATTAACTTCATATTTTATAAAGCTCGATTTTTGCGTTTGTCAATATATTTCCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAG:1 + chr3L 9497720 5' + jockey 4803 1 57.53 ATTTAAATAAAGTAACTGCCTCTCAAAAGATTAACATTTAAACTGAGAGTGCTCTCCTTATAAGTTAAACTTATACATGTATATTAGCTTTACCTTTACTGTTCACAATCCAGATATTTGTTAATATTTATATATTACTA:1 + chrX 14150684 5' - Tc3 296 1 83.57 ATTCCCACGCCCAAGAGGCATATCAAGTATTTAAAAAAGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3L 15612780 5' - roo 323 2 76.03 GCCTGAGAATTCCACTGAATTTCATCAGAAATGCGAGAGCGAGAGCTTTTTAGAGGGGCTCGCTCTCCCGCTTTTGCGCTCTTTCAGCCAAATCGTGTTTTTTCATTAACACACACACACACACAC:1 - chr2R 7249098 5' + accord 7027 2 80.95 ATATTTAATAAAGATGTTTTAAAGTGGATAGATGATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAACTAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCAC:1 + chrX 8012260 5' - 297 6894 2 75.69 AGTTAATAGTGCTTGAGATTTCTTATATGGTCTATGCTGTTATTCTAACAAAAGATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCAC:1 + chr2R 7020497 5' - Bari1 1696 1 74.66 GCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTT:1 + chr2R 12787831 5' - 297 6897 2 79.29 CGCTGTCAGACATAACAATCGACCCGATCCCAATGCCAATAGCAACTGAATTGGCCCACATTCGAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATA:1 + chr2L 9471983 5' + roo 36 2 54.40 GATTGCCGCGTAATTGTATAACTTATGCCACTCTAACCCCAAGACACACGTTCCCAATGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTT:1 - chr2L 7630003 5' + rover 7134 2 59.29 TTTACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 16855339 5' - roo 9013 2 56.85 ATTGACGAAGTTATCTTCCTTATAATGGAATACATTTATCTAAATATTATTAAGCAAATTAATGGACTGTTGAGAAAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCACAACTTTCCACG:1 - chr3R 32011758 5' + Quasimodo 7095 2 52.74 AAAAGCTCATTGCCTCAACATTTGGTGACCCTGACGTTCGGTAACATTTCTTTATCGTGAACTCAAAAAACAGTTTAACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTC:1 - chr3L 25996040 5' - Gypsy6A_LTR 394 1 82.44 AATTTATAAATAAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGC:1 + chr2L 11574796 5' + Max-element 8246 2 71.05 TGAGCTTTAGTTATGCATATACATAGTATAGTGTCGGTCAGTTCAGTAAAAATTAAAGCAGTAGTTAGTACCTCCTTCACTTTCATGCATCTATTTGTCATTAATAACCTTCAATAACCTTCGTTAATGTAAAGGTCGTTATGAAA:1 + chr2L 113854 5' - gypsy7 436 1 58.90 GCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chrX 12191548 5' - pogo 2039 1 66.42 ATTATGCAGACGATGAGCTTGCATATTGAGGTTCGTGAGATCTCGACGTTCATACGGACGGACAGACAGACCGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATT:1 + chr2L 22747696 5' - INE-1 102 1 67.35 CGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGA:1 + chr2R 4260424 5' + micropia 5215 1 47.59 TTCGAAGGCATCAATAACAAGAAAGCATTACTCGAGATAAGATTGAATGAATATGTTTGGCACCTATAATAAAATAATATTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATA:1 - chr3R 30583892 5' + gypsy12 31 2 60.15 TCTGAATAGAATAATATAATATAATGTATAAAGCTAACCAACTCTTAAATGTTATTGTACAACCAATCATATATGTATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr3R 6711399 5' + pogo 40 1 58.22 CATGGCGAGGACAGCATGAAAAGTGGACAGCAATTTGCAAGTTTGCCAAAGCATAAGCCATTTATGTACATACATAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 + chrX 22858391 5' + copia 46 2 51.37 GTCGGGAAGGTTATCTCTGGGGAACGGCGGATTCATTGAAACCTGAAGCCAGAGTGTAAAGTCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 23765365 5' - roo 396 1 65.91 ATCTATTAGATGGCTACTATTCACTTTCAAAAGTTCATACTTGAAAACGAAGATCTTATGTTTTGAATTAGTTTGGTAAATTGGAGACACAAGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 + chr3L 4620850 5' + FB 29 1 57.53 AGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3L 14553215 5' + roo 49 2 54.79 CTAACCATTAGCGCTAAGTCCGCTTCCATAACAAGAGTGTGAAAGGTTTTGAACTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCAATAAA:1 - chr3R 15702992 5' + copia 69 2 60.96 ATCGTACCACGCATTTATCGATTGCACAGAGGAGAAAGTGCGAAAGAGAGAGGTAGAACGAGAGAAAGAGAGATGGACATGGCTAGATCGACTCGGC:1 - chr3L 20104847 5' - INE-1 106 1 79.38 TATTGCTGTTCTATTTTAAATTTAAATTAAAACTAATAAAATGCACTCATAGTTTTTATATGTGAATGTATTTTTGTATATTAACACAACCGACATCAGAAATATAATAATACTTAATATTTAGCCTTCTGCTGGACAATTTCAGT:1 + chr4 988992 5' - Doc4-element 2755 1 78.77 GCACCGACAGATTCCAATGCTTTAGGCAGCAGCACAGGACAATAAAGCTAATAACGCCAACGAAAAGGACGATGACCAGCGCCACCAATCCAGCCACTGCTAGATATGCTGGCGAACAGGGGGGCTTGGGAGC:1 + chr3R 11894874 5' + Rt1b 4731 1 78.95 CTTCAGATTAATTTAACATTTTATAGGATTTTTTTAGAAAAAAAAAATTTTGGTGACAAATCAATATTATGGCTTACTGAAGTACATTTACTTTTTATACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCATGCAAGTTGTCAATAGTAT:1 - chr3R 20283321 5' - Bari1 1511 1 56.16 CAAATAGAGCAGTACATAAATTCTAGTAATAAATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATA:1 - chr3R 20988833 5' + I-element 83 1 76.43 AAAAATCAACTAAATGTATCGTTCCACATCGAAGCGACTTTTCACTCCGTGCTCCTGCTGCCGCCATTGAGTGTCCTCTGATGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1 - chr3R 26520492 5' + FB 16 1 69.42 TTTGGGGGTTAGACTATGGCGCTGCCTTCAGTCCTTGGAGTCCTCCGATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGACTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAAT:1 + chr2L 22747274 5' + transib2 63 1 64.93 TAATGATGCGGCCTACTTTGCAGCTGACAAAACTTGCAAAGTTGTCTGTTGCTTTTTAAAGGTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTGTT:1 + chr3L 22978529 5' - 1360 3343 1 54.07 ATGCCGGGCACAATTATGGCTATGAAACGCTGATGACCATGCTGCCCACCTAAAAAAAAAGAAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chrX 4785075 5' - roo 9009 2 60.84 CACTAAAAACCAAAAGCCCCATGCAAAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1 - chr3L 10144718 5' + blood 67 2 85.47 ACGCCCACCCGAATTTCTACAGCTGCAATTATCTATTTGCGACAAACATTTGCAAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chrX 2762546 5' - roo 9039 1 63.01 TTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2R 10695876 5' - roo 349 2 61.38 GCATTCATAAATGCACGCACACACACACACACAC:1 - chr2L 4750348 5' + accord 7025 2 76.47 TCTTGTGGTCATTTGGCTGCTTCGTATTAACCTCTGAGATTAGCTGGCATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chr3R 19859692 5' + opus 7044 4 57.98 TGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTC:3 + chr3L 24152456 5' + HMS-Beagle2 6959 2 69.86 AACATACTTATCCATAACGTCTATTTGATAGCAGATACATAGTAACACTTTATGTAAAATGCTTTTATTTTTTACAAAAATTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAG:1 + chr3L 9450494 5' - roo 8968 2 53.42 GGGGGTACGAAGTGTTAACAGTGGGGGCGAAAGGGGAGTTAAAGGGTGGCTTCTGGCCATTGTACAAATGGGAGCATAAATAATAGCGACTGTCTGCCAAGTTATGAATAATAATGACAACAACTGTAAAATCCCACATAAGAAGA:1 - chr2L 1986406 5' - roo 408 1 69.18 CGGCGGCAAAACTATCAGGTCTGCGAATTAGTTATAACTATTATTATATAGTTATAATATATATATGTCGGCAAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACG:1 - chr3R 12929297 5' - invader4 266 2 58.22 AAGGGGAATAAAAAGGACTGGTAGTAAAAAATTAAAATCTTCTCACTTTATCTGTCATTTATCAATTCCATAGTCTTAGGGATAACCAAAAAAAATCAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCA:1 - chr2R 25216562 5' - INE-1 563 1 67.67 ACTAAGATAAACACTTGTGCTAAACAATAAATATCATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGAC:1 - chr2L 23349106 5' - flea 4934 1 75.17 AGTATTCACGAAACTTTTCCGAAGGTTCTATTTTTAATGCATGCTGCATGTAAATCGAAAAGGGCAGGATGTGAGTACCTAAAATAAATAAAAAACAAGGAAGGAAGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTT:1 + chr3L 23027513 5' - INE-1 549 1 56.85 ATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr2L 15987993 5' - roo 328 2 73.97 GGTTTTGCCATTGTATTGGTACCAACGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTT:1 + chr3L 22400223 5' + 1360 24 1 69.18 ACCATAAAGCATTGGCTCGATGTTTGGGTCATATCTCCCACTGCACCTCGAGAAATATAATTTAATAGTTTAATAGTTGAAGTCTATACTCACGAATCCAAATTATTGCACGTATAATTCCAATGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chr2L 2052842 5' + blood 7013 2 76.71 AGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATTTATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 + chr2R 4628393 5' - Transpac 295 2 60.98 CTTTTCTTGATTCAGAGAAAAAACAATTATCAAATTCTGTTACTCAATTGGATTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTCTCTATTTCTTCT:1 + chr2L 2052685 5' - blood 7323 1 60.42 ATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGC:1 - chr2R 23592060 5' + micropia 4971 2 70.00 AAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCACCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chrX 7515745 5' - roo 385 2 60.18 CCCTAACTAGCAGCTAGGACTTGGTAGCATGGTATCATTCCCCAGTTAAGGAACCTCAAAACCGAGCTCCTATCCTAATTTATGTCATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGC:1 - chr3R 32028251 5' + INE-1 19 1 57.53 TATTGTAAATTGTTCATCTAAATTGAGTTACTTTATATACAGCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - 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chr2R 5111374 5' - mdg3 5320 2 79.26 GACTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATCCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chr2R 19555034 5' - pogo 2055 1 54.07 TTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATAC:1 - chr4 829116 5' - INE-1 137 1 33.56 ATAATGGGTAAACTATAAACACTATGTTTATTGCTAGTTAACGCTTAGCAATATTTCAATAGTAAGCAGCATCCACTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCGCTTAGCTTGATCTAT:1 + chrX 8903906 5' - Bari1 1604 1 46.88 CGTCTAGAAGTCGTGAAGAATCGAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr2L 23310588 5' + 1360 14 1 73.88 TAATGAGATACGTTTCAACAGCTTCATGTAACTAACTAAACCAACGAAGAAGAAATTTAACAAGGAACAAACGAACACAACAACATAATCATTCGAAAACGTGATATTTCTAAGCGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCA:1 + chr3L 24122546 5' + 297 6947 2 71.23 CTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 + chr3L 7995429 5' - P-element 2809 1 33.79 GTAACTTTCATATTCGAGTTCAATTAGCATGCAGCTCCGTTCTTTTTTTTCTTTTTTTGGGTTTCCATTTGGCTTAGTGCAAGTATTTGACTATGCACCTGTGTGGGTGCCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTT:1 + chrX 10279892 5' - gypsy3 421 4 77.78 AGATTGCCTTAAAGCCTACTCTCTACTCTCTATCACCAAACAACCAAATTAGGCACCGTGTAAATAAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTA:1 + chr2R 20530762 5' - Doc 126 1 45.21 GGCAATCCCTTAAGATTCTAATTTATATCAGCGGCAAAACTTATTTCCTATTTCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chr3R 28272220 5' + Tirant 52 2 61.07 TATTGCTATTTACGATACGATAGTTACGTGGTACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGTAGCA:1 + chr3L 13868613 5' + 412 44 2 54.48 ATTAGCTTCCGTTCGAGTATCTTTATTTTGCTTAGCGAAAAAAGCAATTGAATTTACATGGAATGTGTGCGAATGAGTATAAAACAATATAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCTTTGGCTGAGCTTATTTACTTC:1 + chr2L 5786290 5' - Quasimodo 488 2 59.59 TAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chrX 14964622 5' - roo 9001 2 70.55 AGTGCCTTCTTTTCGCTTTGCGGAAGTGTTACAAAGGGACAGAAAAGTTAAAAGGAGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 16181098 5' + roo 22 2 67.61 AACATTGTGGAATGGGGAAAAGTAGCACAAATTGTGCGCTGTTATAATTTCTCTGCTTCTTCTTCTGCCTCCGCTGTTGCTGTTTTTGTTTTTCCTTTTCTTTTAGTTTTACTTTATTATTCCAAACACAGAAAATTTTTTAGTAT:1 + chr2R 21000330 5' - Doc3-element 140 1 69.86 ATAAGAATAAAGATGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGATCCCTGCACATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATATATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATT:2 + chr3R 29288727 5' + BS 5062 1 60.27 TTTTCACAGACCGCCGCAGTACAACAAAAAATACGGCAACATATAAAAAACCGTGATGGCCATGAGTATGGGGGTGCGGAGAAATTGATTGCCATTTCAGTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACG:1 + chr2L 17706780 5' - copia 5031 2 71.94 AAACACGAAAAAAAAAAATACAAAGGTGAATGGAAGCACAGCAGCACTACAAGAACGACATATACTAAGCACCGGGAAACAAAGAACACGCCGCCTAATCACCTTGCTCCGATCCGGCCATTTCCCATTACGGCCTTCTCTTCG:1 - chrX 2004823 5' - accord2 250 1 52.78 ACAGCTTTCATCAAAGCGATTTGTTACACAGAATGGTCCAGCACATATGTATTGTATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 - chr2R 12787913 5' + 297 60 2 66.44 AACCCTTGCTCTGTCCGTTTTGGTCCCGAAGGACGGTGCACTCCTCGATGGCTCCGCCACTTCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCC:1 - chr2L 12298675 5' + Doc2-element 397 1 58.33 ATCGACATTAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 - chr2R 17890989 5' + Tabor 36 2 56.12 ATTAGGCAAAGTGAACTGGCGACTGGGGGCATTCGGTGGCTGTAGATCTGTGTATCTCTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAA:1 - chrX 13426219 5' - BS 5026 1 58.90 AAAAAAGACTTCACAATTTAAATAGATAGTGATTTATTCCGTTTCCTTGATTGCTGTATATTGGGCATTTTATTTGGCAAAATTAACAAAATCACTCTGGCCTTTAAAAAAATAGAAGAAAAACAAGAGAGAATACTTTAGTCGAG:1 + chr3R 20125947 5' - INE-1 577 1 50.00 GTTGACAGCGGCAAGCATATTTATTGGGTGGGGTAAACACTAATTGGTTTTGCAGTCAGTCCTTGTTGTTTTTAAGTCAAAATGATTTAAACTCTTCAGCTCAAAGAAGATGGGTTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 + chr2R 14110984 5' + FB 21 1 60.43 GAAGTGCTAAAAATAAGCCCACAAAACCACAACAGTGCCCCGTTCCCTTCCCTTCGATGATCTGTGTAATAAGTTAATTCCGACAATAAATACCAGGTAATCACTGAAGAGTTTGACTTTGTTGATTTTTATTGTTTATT:1 + chr2R 16337320 5' - flea 5006 2 62.14 GACCCATTCCCCAGAAGCAACTGCCCGCCACACAGCCCTCTGCTCCGAGTTCGACGCCTGAGTTACCACCGCACCCCCTAAACCCCCACG:1 + chr3R 8258836 5' + Tirant 11 2 64.44 ACTAAATTAACCGCAATTAGATTTTTACAAGGCGGCCAAAAGCATTTAATGAAACGCTCAGAAAAAAAACTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTG:1 - chr3R 7727802 5' - 1360 10 2 56.85 ACGATAGTTACGTGGTACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr3L 13868629 5' + 412 7113 2 60.69 AATATTTCCCTCGATTTTTCACAGCATTCGCCTCTTCTAACGAATGGACATATATATTTTCCCTGTCACATTTTGCACTTTCGCTAGCTTTGACATGGACATTGCCTATAAATCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAAT:2 - chr3L 22052904 5' + mdg1 7047 2 79.45 CATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCC:1 + chrX 21772491 5' - gypsy3 6538 1 68.75 GGGCAAAAATTTAAATGTTTTGCAATTTTGCAACACCAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTGTGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 - chr3L 15026825 5' - opus 492 2 74.47 CTTCTAACCGCCCAAACCGCATCTGTATGTATATGTATATTAATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chr2R 641815 5' - opus 479 2 72.60 CCTGGTTCAGCAGCTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 + chr2L 13792577 5' + F-element 45 1 51.30 ACATAGTTCTCGAGTTATAGGTGGATCTATAATGTCTAAGGAAACGATTTAAGAAATGTAAAAATACAGCGTGCGGCAGTATAATTTCCTTTTTTTTTCAGAACTCAATGAAAATCTATTGTAGGCATCGGAAAATATTTATTTGT:1 + chr2R 7394082 5' - mariner2 837 1 65.07 GAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 - chr2R 8157254 5' - Transpac 5154 2 69.18 ATGACCTAAGCCTTTCCTACATGGGAGATAGTGGAAAGGTATGAGAAAAGAGGAGTACTTGCTGCCTTTTTGCCAATTGTCAGCAAAACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGATAAACACAAAGAGTAAA:1 + chr3L 14132890 5' + Doc 88 1 60.27 ACTGGGATCGGTTATAAATTGGGCATAGTATGGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACGTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 24122678 5' - roo 394 1 58.67 CCTTTGCCAAATAGGATATCCAATTTAATGTTTCGCCACAGAAAACAACAGAACATTTTGTTTTTATCCGCATCTGCATGCACTTCTAATGTTTATAAATAAATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chr3R 15885265 5' + I-element 17 1 71.23 TAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCGAGAC:1 + chr2R 5617495 5' - invader1 339 2 62.33 AGTTGCTTCCAAAGAAAGGGCATTCAAAAGAAACGCCGTCCACTTTCATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGGTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr3L 15276600 5' - hopper 1384 1 59.59 GTTTGGCACACACACTGCCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3L 17175105 5' + 412 7094 2 54.74 ATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGC:1 - chr2R 1949144 5' - Cr1a 4397 1 66.96 TTTGCTCTATTATTATTCCTGTATTTGTAAAATCCTATTTACATTGAATATTATTCTGAAAATATGGTAAATCACTCGCTTTGTTTATAGATTTTAAACTAAGAAAGTGAACATAAAACATTAAATTTCTCTAAGGGAGTTATTTA:1 - chr2L 15849194 5' + I-element 482 1 69.18 AACGAGAATTTTATATATATATAAATATATATATATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACTGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAACGCTATGAACGCTAAAGCTAAGATACAAAATAT:1 - chr3R 31096669 5' - HMS-Beagle2 7119 2 83.56 GTAAGCCCGGGCCAAATATCTTCATTATTGAATAATGAGCCAAGTGTCGCTGGCAGAGCTTTAACAGATAATCGATGGGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chrX 6481249 5' - hobo 2921 1 66.12 GCTGCCGTCTACAAAACGTACATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTATGGCACACGAGTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 - chr3R 10266177 5' + 1360 57 1 52.05 AAATAAAATGATTATATACTCAGAATAGTTATATACAGAGAAAAAAATATACATAAACCACCGATTTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr3L 2878420 5' + 412 7105 2 53.42 GTTGTACCCACTTCTAATCCGCCTGCTAAGCGTGCGAGTTCTAACGATGATCCGTCTTCATCGAGTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGTC:1 + chr2R 19402313 5' - I-element 5020 1 54.76 TATTTCTTATATGCTCCTATTCTGGAATTTAATAGTAATAGCTATAGAGCAACTCATGCCAGCTGCTGTCATTTGACTCATCGCAATCAACCCTTTGTGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGT:1 - chr2L 19790789 5' - Bica 4647 1 66.44 CACAGTTGTCCCCCTTCTTTTCCTCGTTTGCCACTCCGTTTTTCCACTCCATCCCAACCGATTTCCCCCTTCTTTTCCTCGTTTGCCACTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTC:1 - chr2L 17279723 5' - invader2 474 1 45.21 GTCGGAAGGTTAGTGGCGATAAGCGAGCTGTTCCGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3R 18815903 5' - hobo 2893 1 69.52 GAACTAATAATCTGCGTATGGGTTTTCAATGAAACTTCATTTTAGTCCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1 + chrX 22610696 5' + pogo 72 1 65.75 CATGCCCCCTCTTCCAGCCACAAGGAAACAACACCGATCCAGCAAACGAAAAACCGAGAGCAGAGCAAAAAATTAAACGAAGATCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTCATACTTTTTAATA:1 - chr2R 5046031 5' + diver2 4568 2 72.00 GACGTGATCGACGATTTTGCATGGGGAGCGTGTAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3R 10684849 5' + roo 8709 2 54.79 CAGTCGTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGA:1 + chr2R 12787815 5' - 297 326 2 69.18 GAGACGCAATTACAAACGTAGAAAAAAGAAAGCAAACCTACATATATAATTACCCACAACAGAACACTATCCGCCTAAAGTGATGTGCAAACCATATATTAACGCATGCTTACCATCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCCT:1 + chr2R 5516354 5' + Cr1a 3986 1 51.37 ACTGATAATGAAGCTTGTGAAATCACCAGAAGAATGTTCGTTTTTGAGAGTTTTTTATTTGAAATATAAATTTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 + chrX 3197055 5' - mdg1 7412 2 51.37 AAATATTTATAAGATCGGTAGAACTTAAAACTTTTTACACGTTGGTGATCGTTCTGACATTTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3R 7981470 5' + jockey 30 1 59.46 AAAAGAGAAAATAAAATTGAATCATAAACGCACTTTCCTTCTCGACACAAAGAGTCCGACGTTGCGAATCATTGTACAGAGAGAAAAATATTACGTTTCAAGTTTGAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAA:1 + chr3R 26519912 5' - FB 865 2 71.11 TTGCTTGGGCGCTTGATTTTTTTATATTGGTGTGTGCAAGAATATATATACATACATATATAGTATGTATGTGTGTATGAATACATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTTTTTATTTTGTTTTT:1 + chrX 11535027 5' - Rt1a 5087 4 51.37 GTGATGTTCTAGGACTTTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAA:1 + chr3R 15022015 5' - Tabor 431 2 52.05 AGAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTTAAAGAT:1 - chr3L 25350811 5' - baggins 5378 1 62.20 AATTGAGGTCTAGGAAAAATTCCAGGAAATTACAATCCGTGCAAAATTTTGGGTTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTAAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTG:1 - chr2L 22252572 5' + FB 62 1 58.82 TCAATAAAGCTTTGTCATCGTGAGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTC:1 - chr2L 23372670 5' - gtwin 7382 2 76.55 TTGGACGAGGCCCGTTCGACTTTACTTCTTGAGTGTACTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chr3L 22900160 5' - 412 455 2 61.22 GCCGAGCGTGAACGGGTTGGGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 17305432 5' - roo 392 2 65.79 ACTGTTTCATTATTTTTGTGTATATGTGTCAAACACTTAATTTTTCTAGACGTAGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGTGCCTTCCGAGCAG:1 + chr2R 4628340 5' - Transpac 5215 2 73.13 ATCTTAATATATTTATTTATTTTTGCACTATTTTTTTGAGTGCATGATTCAGAGTGTAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr2L 12414850 5' + pogo 24 1 66.44 ACCGCGAACCACACAAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:2 - chr3R 24476393 5' + 412 42 2 55.48 GTACAGTTAAAAAGAAATTCAAAATATTTTTCAAAATTGAGGTAAAAAAATTGTGGCCGTTGGTAAGCGTGGGATATTTCCATTCTCGAGGATCATATAAAAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGG:1 - chr3R 7518708 5' - Idefix 100 2 55.38 GCAATACCCAGAATTTCGAGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 7515772 5' - roo 9046 1 66.90 TATTATTGGGCTGTCATTCACATTTTGGGGCTCATTAAATTGTTTGTCTAACTTATCATCACAGTGCATCTTGATCTTAAAAAAGTCTTGAGCCGAGCGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAA:1 + chr2L 14170710 5' - 1731 4464 2 52.74 GTTATGTGGCTTGTTTCGCAGAACACCAGACAAACAATAAAAGTGGCAAAAGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATT:1 - chr3R 9190641 5' - Tabor 470 2 74.13 AGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATATCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGA:1 + chr2R 20673657 5' - mdg1 335 2 71.92 GTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTA:1 + chr2L 17240228 5' - hopper2 1531 1 70.55 CTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAAT:2 + chr3R 11750193 5' - Tabor 7242 2 72.60 GTAATAATTGGAATCATTGAGCTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTACAA:1 + chr2L 10184417 5' + Doc 56 1 54.23 TTAAGTATAAACTTGTAATTTACGACTGTAACGACTTCATTTCCACAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATAGATTTTAGGAG:1 - chr2R 4029387 5' - 297 6906 2 65.75 TACGATGTTGTTCGTAGAAATCGCGTCTTAACCCACATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTAAATGCATTCATAATTGACCAATGCTTAGTTCTGC:1 - chr2L 17552464 5' - Transib-N1_DM 404 1 60.00 GGACCGTGAAACCCTACAACTCCATTCGTTATCATCAAAGACATTAGAAATATTTGGTGACGGCTAAATTGACCTCTCCCCGCTCGTGTGAAATTGAGAAAAATCTAAAAATTGAATTTGCGTGCTAGAAGACAATTTTCGGGCCG:1 + chr4 430913 5' - 1360 3193 1 76.03 ATGAGACAATTTCATTGTTTAAAAACTTAATTGCTTTCTACTTCAGCGTGCATATGTATGTACAAGCCAATGGACAATATGCACAATATGTTTCTACTTTGACTTATATATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAAT:1 - chr2L 8960042 5' - Ivk 5362 1 65.75 TGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 + chr3L 7995430 5' - P-element 2823 1 36.92 ATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTA:1 - chr2R 4261950 5' - invader4 205 2 67.12 TATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 + chr2L 17029613 5' + blood 84 2 74.66 ATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chrX 21852446 5' + Tirant 68 2 64.79 ACGCACCCCCAATACACACCCATACCACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTCTGATCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1 - chr3R 20175793 5' - hopper 1351 1 60.96 GGCGACAGGTGTTTCAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCT:1 - chr2R 13644536 5' + Burdock 6176 2 58.22 GATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chr3L 27391417 5' - 1360 3361 1 61.38 GCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTTTAAATACATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 19450209 5' + roo 8681 2 59.00 CGAGTGTCGCCGAGCGTGAACGGGTTGGGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 17305424 5' - roo 9046 1 63.36 GGCCGTATATTAAATGTAATCCTTTATTTAAACTCATTTAATTTTTGCATTGATTAATTCATGATTAATGTTCTGAATTTATTGGTTTATTCGCTGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAG:1 + chr3R 31668873 5' - GATE 8338 2 58.22 AAATGACATCGCATTAGTCTTGGTCGGGTTAATGTGCGTTTCCTTTGGCCAAAAAACTGCCAACTTCGCACAACTTCATTAGTGGAGAACCATGTGAGAAAAGCACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTC:1 - chr2L 603773 5' + roo 283 2 75.54 TATTTCCATATCTTTTTTTTTTCTATATATGTACGAATAAGTATTCGATTGGTTGGGCATCTTGTGCCACAATTGTCCATGTGGGAGTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chrX 1689950 5' + 412 7086 2 63.01 CAAATGCGAGGTTCGCTCTACAACTTGATACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 + chrX 21196724 5' - roo 8979 2 79.45 CGAAAAGATACAGAACTTTGCAAATTGACCGTGAATACCGCCCATTCTGATGATTCTGTGAAAATTGCCAAAGGGCTAAGTCAAACAAAGTTTGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTC:1 - chr2L 18503642 5' + F-element 265 1 62.33 GAAAAATCATTCTTTTTAATCTCACCATTTGAAAGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACAACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTT:1 - chr3L 16496698 5' + jockey 4770 1 70.00 TAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chr3L 19349965 5' + jockey 82 1 77.12 ACGGGATCTCAGCGTTTTAAGAATGGGATGCCAAAACACTTTATAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 7539448 5' - roo 9006 2 67.15 AAGAGCACGAGCTTTTCCGCAGTTTTCTCGTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTT:1 + chr3L 9571656 5' + jockey 4527 1 59.59 CTTGTTTATGTTTGGGTTTTCTTTTGTTAACTCTTCTTTTTTTTGCTTGTTTATCTTGTGTTTCTCAAGCCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTACAGATCCGTTCGCTGCGCG:1 - chrX 12728893 5' + Cr1a 119 1 65.07 AACTGAAGATCGGACACAATTATCCGGTGGCTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTGGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCG:1 + chr3R 11057586 5' + flea 4824 1 73.23 GGCGGAGGAAAATCATATTTATTTTGTATATACTCGTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCT:1 + chr2R 10084111 5' - jockey 4635 1 75.34 GAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3R 21705950 5' + 297 32 2 60.27 GGTTTATTAAAATTGGAAAGGTAGAGGGAGCTTAAATGTATATAAATTATTGCGTTTAATAAGTGAGGCTACCCGTTTCTGAACCTTTAATCCACAATATCCTCAGGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGACTATGACCGCG:1 - chr3R 9183273 5' - rooA 7406 2 73.79 ACAACGCATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGCATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chrX 12525989 5' + roo 75 2 67.81 AGTACTTTGCTGAGCTATGGTTTTTTAGGAAAGTTCGACTGTAATACAATGCGTTTTGGGCATTATGAAGTAGTAGAATGTATGCAAATATGCCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAA:2 - chr2R 22723153 5' - 3S18 310 2 63.01 CCAAATTAGTCCTTTGTTGGATTCAAAAATAGAGTCGTCGTTACATGGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chr3L 23986666 5' - opus 7483 2 73.29 ATTTGCAAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chrX 2762593 5' - roo 8992 2 70.55 ATACACATAATAAATATTAATTTTCATATGTATATGATTTAATTTACTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTC:1 - chr2L 14683584 5' + G-element 63 1 63.36 GGTAAACAAAGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGGGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr2R 19553290 5' - mdg1 395 2 55.74 ATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr2L 686078 5' - roo 9036 1 55.75 GATTCTAATTTATATCAGCGGCAAAACTTATTTCCTATTTCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCACCTGGAAC:1 + chr3R 28272233 5' + Tirant 8167 2 68.25 CTTTTAAATATGTTTAGCATAAAAGCTTTACACTGAAACTATTTCACAGCTAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAACTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTT:1 + chr3L 25254814 5' - 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accord 7128 2 66.42 AAAAGGAAGACAATTTAGTGACACTGAGACCCTACAAACCCCCGAAACTGTCACGGCCACAATTCGGAAATTTAATTTAATTTTTCCCAATTTCTATTAATAAAATTTAAAATTCCAATAGCTGAGTAACGAGTATCTGATAGTCG:1 + chr3R 4358090 5' + INE-1 550 1 75.34 ATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chr2L 6717182 5' + jockey 82 1 68.84 GCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chr2L 22015971 5' + Tirant 38 2 75.00 CTATACAGATTCACTCCATTCACTACTTTACACATTAATAACTATTTTGCCATCTTCTTCTTTATTATTATTAAGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTATCATGACTCAAAGATCCCC:1 - chr2R 3123178 5' - baggins 5374 1 68.12 TTTTCACAGCATTCGCCTCTTCTAACGAATGGACATATATATTTTCCCTGTCACATTTTGCACTTTCGCTAGCTTTGACATGGACATTGCCTATAAATCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAA:1 - chr3L 22052889 5' + mdg1 23 2 69.66 GTTGAATATCTTTTAAAAAATTAGCATCAGCATATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr2L 17136243 5' - hobo 2919 1 65.74 TTGGCATATCGAAAGAAATTGGCATTAAAATTAATAAAATGAAAACATGTACATATGTGAACATGTATGGAGTGGGCGTGGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 - chr4 1038882 5' + Transpac 38 2 59.59 AAGGGGATATATTATATTTGATTGGCAATTATAGAAGTTCCTTGTTCTCCTAATATTACAAGTTTATCTGGTTCTTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCT:1 - chr3R 14742662 5' - Quasimodo 91 2 54.48 GGGAAAAAGACAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTATTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 18658907 5' - roo 388 2 53.33 TACTATCAGTAAGATATAATTTTCAATATAAATTTAGAAAACGCTGCAAACAAACAAGCAAAGACGTTCGAATGCATGATGGCGACTGAACTGTGTCGGGACAAAACTTTACAGTAGTCCCTCTTGAATGGGACCACTAGCGCTCC:1 - chr2R 3942433 5' - mariner2 65 1 50.68 ACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGC:1 + chr2L 18279911 5' + gypsy5 7005 2 72.50 GCCCCCGAAAACGAGATAGGGATGCAGGCAGGCAGAAACGAGGAAATGAATATAATATAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTACTAAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGATC:1 + chr2R 10440800 5' - Cr1a 4242 1 69.18 TCTGGCTCACCGTCATATTTAATGTCGAACCGAATAGTTTGCCCCTTTTTAACGGTTACATTTTTAAGACCTTCTCCAACAATGAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGC:1 - chr4 748198 5' + Stalker4 7080 4 72.27 AAGAAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAAT:1 - chr2R 6526614 5' - jockey2 3331 1 60.96 GAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCT:1 + chr3L 25782390 5' + F-element 94 1 80.74 CTCTTGACGGTACTTGCGTTGAATATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGA:1 - chr3L 12976371 5' + invader4 8 2 60.33 GCACGTGACTTTTCTGAATTTGTTCTATCACTTAGTCCAATAAAACAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACA:1 + chr3R 7033386 5' + roo 8761 2 68.49 GAAATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3L 25406606 5' + 1360 5 2 66.67 CATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr2L 22015979 5' + Tirant 21 2 62.03 AGCGGAGTGAAAGTGGAGGCGAGTGTCGTCTTGTCTGCCACTGTGCAAGATAATTATAACATACATACATACAATACATATGTGCCCAGAACCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATG:1 - chrX 14622130 5' - accord 443 2 64.38 AAGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTG:1 - chr3R 9190592 5' - Tabor 418 2 62.33 GCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGA:1 - chr3L 25482962 5' - accord 7314 2 75.19 ACCTGGCGCATATCGGCTTTTCCATTTATTTTCCGCTTCTTTTGAACTATTTTTAAATGTTTTCTCATTTTATTCCCTTATATCTATCGATACCCCAAAAACATTATGAAATTTCGGGTTCGCCTTCACATTAGCTGATTAACGGG:1 - chr3R 32039858 5' + INE-1 537 1 73.97 ATATTAAATTGGCTTTTACGGGTGCTATGGGCTCTTAAAGTTTAATATCTACAATCGATCAATTGGTATTTTTAAATACATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 14201491 5' + roo 40 2 52.41 TTAATTGGGAATATATGTACTTAAAGCGATCATATAAGCATCAAAAATCTGTTTAAACAATTAATGTGTTAATGTGTTTTATTTGAAATTTTATTAAAATTTTAATTTACATTT:1 + chr2L 7579193 5' - 1360 3048 1 51.75 CATAAATACATTTGGCCGGCGGGCGAGAGAGTTCAGTAACCTCCATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr2R 10865291 5' + blood 7029 2 71.92 CATCCACGGATGTTAGCTAATGGGATCCGATATCTATAACCACACTGCACATCAATATAAGGCAAAACAATGGAATGCACTTAAGCTCTGTACATGTGTGACGTATGTGTGTGTTTCAAATGAGCATGTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 13231566 5' - Quasimodo 38 2 52.05 GGAACATATGTACATTGTATATTCTATAATGAAAGTAAAGAACATAAAAAATCAAACTTCGTATATTTGTGGCAAACATGTAGAAGGAAGCGATTCCGACACTATAAAATACAAATATTCCTGATCAGGGTCACTAGCCGAGTCGA:1 + chr4 975238 5' + INE-1 94 1 54.11 CGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGTTTTTATTTGTAAATATCTT:1 - chrX 7515700 5' - roo 357 2 81.05 AATAAATCTAATATAAAAACTTAAATTTTATTACCGTTACTCGTAGAGTACAAGGGTGATCCGTTTAAAAGGATGTAACAGGAAGCTAAACAAGGGAGAATGCTATAGTCGAGTCGCCCG:1 - chr2R 4695021 5' - INE-1 570 1 70.83 GAGTGCACAGAATGCATCGCACACGCGAGCCGATATTAATTATATTTTGGCCGGCAACTAAATGGCGGAAAAGCTTTCGCGGCTTTTAGTTAAAAGAAAATTTTTTCTTTTTTTTTATTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCAT:1 - chr3R 20467731 5' - X-element 4709 1 67.12 CTCCATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCACCACT:1 - chr2R 10865251 5' + blood 34 2 54.92 TATCATAAATTACTTTAGTATGCGATAAATCGTGATAAATTTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:2 + chr2L 17250662 5' + opus 10 2 75.34 AATTGCTAGTAAAAGTTTTAATAAATCATCGCAGAAACCAAAATAAACAAAAAAAAAACCGTTGAAAACCCTTTCCCAAAACAAAAAAACAAGCTGGTTAGAAAGCCCAACAAGATTGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATA:1 + chr3L 16442413 5' - 1360 320 1 79.31 ATTTGCAAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chrX 5150374 5' - roo 9004 2 65.75 ACAAACCTCCAGCCCAGTTCAGTCCAGTCCTTTCCTTTTCGGTTCCCTGCTTTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chrX 17806037 5' + roo 8704 2 56.30 AAACAGCTCGCATAATAAGAGAAGCAATCTAATATATAAAAATTGGTCCTTCGAGCCGGATAACCGGAAGTGCGTTTCGTTCGGGCATTTGATTTTGATTATTGGCCTTTTGGCAAACG:1 + chr4 443815 5' + 3S18 423 1 70.59 TGTGTAATACCTCTGTTGGGAAATGCCTTTCAGCTCGCTCCTCCTTCAATCTGCTCTCGGTCAGAAGCCACTGGGGCAAACAAGTCCGCCCCAATGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2R 6842725 5' + roo 19 2 71.74 AAAGTGATATTATGCGGCCCAATTTGCGATTTGTACATATGGCTGGCCATAAAAACAGAGCATGCCCAAAAATTAAGTATACGCACTTGATGTGACTTAATTTAATGACTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chr2R 23497183 5' + 412 13 2 75.34 TAATAAATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAAGAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAG:1 - chr3L 23597298 5' + invader4 2734 1 63.71 CAATAATTACATAAAAATATCTAAAAAGAATCGTTTGGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAACACGCGAGTTACCACCCCACCCACTAAACACCCAC:1 - chr3R 9352149 5' + Tirant 10 2 78.77 GCGTTACCGCTACCGCCACTAGGCCTCCGATCCGAACCTGGGCACATTGAACCAAATTGATCCTGAAAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr3L 22900076 5' + 412 46 2 52.52 GTGCTGCTGCCATGATTTTATTACGTAGAATTGTTAAGGCGATAAAATATTGTTCACTTTCGATTTTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATA:1 + chr3L 25598138 5' + invader2 4970 2 54.79 GTCTTTGATGTTACAAAAAATTCATAAAATTTGGGGCGACACAATGCATACAATACCAGGATTTACTGTAGATCTATACGTACATACATACGTATGTATGTACATAATTGTGAATTAAAAAGGATCCAGGCTATTCAACATAAGG:1 - chrX 3774407 5' + X-element 4287 1 77.24 CATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3L 19350039 5' + jockey 18 1 77.52 TAAGATAATCTGTAAAACAAGACAATACTGAGGAAATTGTAACTATCACAAAGAAAGCGGGATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGC:1 - chr3L 25752555 5' - HMS-Beagle2 251 2 52.17 TAAATATTAATTTTCATATGTATATGATTTAATTTACTCATATAATTGCCAAAATCATATGAACACATACGTTTTGAACAATATGAGAGGTCGGCAACCACTGCCTACCTATATATTATATGAGTCAGTCGCGATCGAACACTCGA:1 + chrX 15947449 5' + G-element 1 1 76.03 ATATGCATGCCCACACTATCCATTATAAATAATTCTGTCAGTCTCGTAACACTTATTTATTGTTAATGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 23287543 5' + roo 53 2 55.48 TGCATGCCCACACTATCCATTATAAATAATTCTGTCAGTCTCGTAACACTTATTTATTGTTAATGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2R 23287540 5' + roo 54 2 56.94 ATAATTATAAAAACTTCATATTTATACTGTACTACTACTATATACTCACTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACA:1 + chr3L 9713949 5' + G2 2712 1 67.12 TTTTGATCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATAATATATTCTAGGGTCTTTGATCTAGCCGTGTCCGTATGTCCGTATGAACGTCGAAATCTCAGGAAATATAAAACCTAGAAGGTTGAGATTCAGCAC:1 - chr2L 21738000 5' + INE-1 170 1 70.55 AATCACACACATTTACCGTTACTTTTCACACACACATACAGCACCTCTCTCTCTTTAGCTATTGCGTTTTAGATTATTGCTCAGCACGTTTTTGCGTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chrX 4701092 5' - P-element 2864 1 67.59 TGAAAAGCTGAAAATATATCCACAGAAGAATACTAATTCTTACTAATTCTTTATCTTGACAATGTGGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATT:1 + chr3R 2555441 5' - Bari1 1690 1 73.97 AATTGGTAAAGGATAAACCATGATTTTCCTTTAGTTTAATACACAGGAACAGCAACAACAAGGTAACCGGAACGCAAACAACAATAATTTATAAACAACAAAGTTATGCATGTGTGTGTGCGTAAGTATATGTGTGCTTATACTAT:1 + chr3L 9709478 5' - Quasimodo 16 2 69.86 GCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGCCAGCACAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTC:1 - chr2R 2308822 5' + McClintock 6001 2 73.29 GGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAA:1 - chr3R 846553 5' - rover 7240 2 63.01 AGAAACTTTAAGAAACCTATTCAGATGACCACATCTGTGCGTAGTTAAATCAGTTTAGCCTGGCTTTCCTGTTCTCTCTCCATCGCTTTCATTGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 25387736 5' + roo 8680 2 74.81 ATAATAAAAAAAATACAAAACTGGAAATGGGGTCAATGGCAAAAGCATTTGAACTCTTGTTTATTTCTGGCGAGTTTGTTTATGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTT:1 + chr2L 13927688 5' - roo 9038 1 59.86 ACATTGGTTTTGCACTATGCAGCTACTTTTTTAGCGACGGATATCTTGCCCACCGTCAACATATGGTTCGACATCGGGGCTAATGGCCCTCTGCCCGCTTGCTTACGCTGAGAGTGTAAGAAGTCTAAAAATAGAATTTGCTTGCT:1 - chr4 872519 5' - 1360 3265 1 78.08 CGCCAAGTCACTTAGCCGGCTTTAACAAATAGCCCAAAGGACAAATGGGCCAGGCGTAGAACAACGCAATCACGGAACTTAAAGAAAAATACCATAGCAAGTTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCACGAGGTCTAATCCAGCTC:1 - chr2L 16398309 5' + F-element 4483 1 56.85 AAGCTTATAGACTTTACAAACAAAGTAATTTATTAGGGTTAATATCTACCCGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTA:1 + chr2L 16089534 5' - 3S18 6094 2 76.03 CGGCATTCTCTTTGTTTGACGCGAAATCTGTTCTATTTGTCTGTGGCAGCATTTTGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTA:1 - chr3R 11057660 5' - flea 4951 1 62.33 GTCTTAAAACCAATGCTAGCACCCTGAGTGCTTGTGATGAGAACGAAGAGCAAAATACGGATGACAACGAGGAAGAAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAAT:1 - chr2L 18940492 5' - I-element 5259 1 52.05 TACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTACAAACTACAACA:1 - chr2R 2427624 5' + Doc 58 1 56.85 CTTGGTAAACAAAGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 - chr2R 19553293 5' - mdg1 374 2 50.00 GCAATCATTTTGGAAACATACTTATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:2 + chrX 12138910 5' - roo 9034 1 56.85 GCTGCTGGAGGGGATTTTGGTGGTTTTGACTCTGGCTTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTT:1 + chr3R 26077673 5' - 17.6 7033 2 76.06 GCCAAAACACTGCTGTTAATTATGTGGATAGTAAAATTACAACACGCAGAACAGCAGCTAAATAAAAACTATCCTTAATGTTTTGATTGAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 16399442 5' + roo 31 2 58.22 CTTAAGTATGGTCCACTTAATTTTAATAAATATTTTGTCGCCTCTTAACATGTAATGATTAAATGTGAAATTCAACGCGGCAACAGCGCAGGCACCGTAATTTCTGTCGTCGAGTCGGTTGCCAC:1 + chr2L 18385622 5' + Chimpo 322 1 57.60 AGTCGGCATTCTCTTTGTTTGACGCGAAATCTGTTCTATTTGTCTGTGGCAGCATTTTGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAA:1 - chr3R 11057663 5' - flea 4960 2 58.57 GCACCAATGCCACGCCCCGCTTGCGAAACTGAACAAAACAAAAATGTTATCAAATTAATTTCAAAAACTCCATCAATAAGCAAAATGCAGAACACCGGAGATTGTTTGCCTG:1 + chr2L 11242491 5' + Chimpo 237 1 66.07 AACACTGGATTCTTTTCTTAACTGCTATTAAGAGACTTTAAAAAATTATACAATAATTTCCAAATGTTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3R 13631343 5' + 297 52 2 58.90 TTTCTAGCTGAATTCAGGCATATTTTCTCGCATGGACTCAGAAGACAGGTCTTCTTTTTCCCGATGTAGCCAATCGACTTATTTAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGG:1 - chr2L 22079779 5' - FB 218 1 58.90 GTGGCTTTGCTGTCCTTTTTGCATTTCAGAGCGGGGCTTTAAAGTTCATGGTTGATTAACTTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 + chr3R 24476275 5' - 412 7484 2 57.53 GCTGTTGTGAACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCA:1 - chr2L 16089683 5' + 3S18 5824 2 56.94 ATACAAATATAAATTTAAAAACTGCAAGTGACCATTAAAGTGTGTATGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTT:1 - chr3L 2061575 5' - Quasimodo 7028 2 70.19 CTGTCAACTGTCAGGCATGCTTTCGTATCCTTGTGCCAGGATGCGAGTGCTGATGCGGATGCGGATGCTGTGGATGCACTCACTGCGAGGGGTGGCTCTAAAATGTATTTATTTGTATGTGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTC:1 + chr2L 19831313 5' - invader1 397 2 68.49 TAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 + chr3R 22100525 5' + 412 78 2 68.49 GCACAAAGTGTACTTAGATGTACATGTAATTGGTCAGCCAATTATTCAATCTGATATTAAAGTCTAATTAAAAGTGGTAGCAGTTGCGATGCCCATAGTGCAAACCACTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCT:1 + chr3R 25761096 5' + diver2 4660 2 50.68 CTATTTGCGCTCTTGCAATTGAAGATCGGATACGAGGCTTTTTGGTTTAAAAATAGCCATCTTTATATTTATTTTTGGTCAATATGGCCCTTACCTGATACTCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 96640 5' + roo 20 2 73.97 AAAGCTGAAAATATATCCACAGAAGAATACTAATTCTTACTAATTCTTTATCTTGACAATGTGGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGC:1 + chr3R 2555444 5' - Bari1 1687 1 71.92 TAAGTCTTTGCCTTGAATAACATTTTTTTATACAGTAACATGTTGATTCCTTGCTTTAATAGGTCGCAGGAGAAGTGTAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGC:1 - chr2R 7385060 5' - HMS-Beagle2 68 2 53.42 GCCATGTTGCTTTTTTATCGTCCATGTGTGTTTTTTGCTGTTTTTTTTT:1 - chr2L 12484299 5' - Porto1 4434 1 63.27 AAAATATTAAAACAAATAAAAATACATTTAAACATAAATAAATTATTATGGTAATAAAGCGTTTAATTCTCACTTACGGCCTGCTGTTTTTTTTTATTTATTTATTTATTTAC:1 - chr3L 13366910 5' - Juan 4215 1 77.88 AAAAAGAAATTGAAATGTTTTGCTGGTAAATAGTTAAACCATTTTATTCTTTCATTGCCGTTGTTGGTTCGATTGATTTTTAATTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 - chr2R 2127312 5' - Juan 4171 1 45.21 CAAGGCTTTTGAAATTTCAACTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1 - chr3L 10133585 5' - 412 418 2 69.44 TGTGCGTAGTTAAATCAGTTTAGCCTGGCTTTCCTGTTCTCTCTCCATCGCTTTCATTGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 25387771 5' + roo 45 2 55.81 AAAAAATCATCTTCACTTACACAATGTCCTTTAAATTAGTATTATACACATGATAGTAAATGACTGATAACGAGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAA:1 + chr2L 15945695 5' + X-element 69 1 50.34 ATTATGCCATTTGTGCGAATGTTCACATTGAGAACTCTGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chrX 4785150 5' + roo 8746 2 76.03 TATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 - chr3R 9352072 5' + Tirant 66 2 71.20 CACTTACACAATGTCCTTTAAATTAGTATTATACACATGATAGTAAATGACTGATAACGAGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTG:1 + chr2L 15945708 5' + X-element 82 1 59.31 ACAGTTTAATTAAGATTAACATTAAAAACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGA:1 - chr3R 11750292 5' + Tabor 31 2 62.22 GCTCACTTGGGATATTGATTGTATACAAAAGTGGTTGTGGTTTGTTTGGTTTTTTGCCACTCAGCATATTCTTATTTTTTGGACAGTACTTATAATGTAAATACGTCACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCG:1 - chr2R 1478291 5' + opus 8 2 78.77 CCATAATATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 - chr2L 22016016 5' + Tirant 50 2 53.79 CTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2L 76111 5' - roo 324 2 84.29 AGCTGCGAGTGTCGCCGAGCGTGAACGGGTTGGATTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr3R 17305419 5' - roo 9036 1 58.90 ATGTGCAAGTGATTAGGCAAGATGGGGGAAATTTTAAATTCGAAACGAAGTGCATGGCAAGGGAAGCAGAGATAATAAACGAATAATTTTAATATATAATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACT:1 + chr3L 8855817 5' + rover 6968 2 73.29 CAACAGCAAACACGGTATGAAAAATGTGAATCCTGGACGAAGAAGACGAAGGGGCCTAAGTGATAAGCACTTTCCACGCTTAAATGAAGCATAACACACTAGACAATGGTTTTAATCAAGAATTTTAAATTAATTAATAAAAAAAA:1 - chrX 12404703 5' + transib3 2675 2 68.49 GCATGCCTTTACATACTATAAGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGA:1 - chr3L 23702309 5' + G4 9 1 75.34 CCTGCCACACAAATTGAAAGAGTTGCCAAAGTTGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAA:1 + chr2R 6845383 5' + roo 206 2 77.40 TTGGGGGAGGAAGTGTAAGTGTGAGCTTGAACCATGAGAAATGCCATAAAAATTCCTCTGTCTACCAGTCTGTCTTCCTCTTTGTGGGCTTACTAATGCGAATACCCCATTTTTTATTTTATTTTTTTTTATTTTTTGTTATTTAT:1 - chr3L 12054495 5' - BS 5096 3 60.27 GCGTAGATGGAGCGTCCCCATCGCGGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr2R 11133532 5' - roo 9027 1 53.57 CAGCATATTCTTATTTTTTGGACAGTACTTATAATGTAAATACGTCACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGC:1 - chr2R 1478230 5' + opus 7185 4 69.18 CGTGAGTCTGTTTATTGTATATGGTATAGTATATAGATAGCTTTGCATACATATGTATAATGGTGTGGTAAATGATATGATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGAATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAG:1 - chr3L 6485781 5' + INE-1 148 1 54.79 CCGAGCAATCTGGCAACCTAATCCACCAGGGGCCCAGCATGGGTCACCGGAAATGGCCCACACAAACACACACACAGACACTGGGATTTGAGACAACACCAATACAAATACTCAGAACACACACACACACACATGCACA:1 - chr3L 11672624 5' + accord 188 2 69.06 AACACAAAAAGAATGGCCACGATGCAAATTGAACTTTCTTGTCTCGAAATTTTCCCCTAAAACTGACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGAC:1 + chr2L 2700715 5' + I-element 492 1 60.96 AATAACCTGCGGGCTCACAAAGAATAACCTTCTACAGCCACGAAATCAACGAGCTGCGGCATTATTAAATGTAATCATTTTTATTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTT:1 + chr3R 17453160 5' - Ivk 5343 1 56.85 GTTGGTAAATATTTATTCATTCAATGTTATATTGTCTTCGTGAATAGACATAGATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACT:1 - chrX 16384090 5' + diver 5956 2 62.33 ACTAGGAATGGCTGAAGTTCCGAGCTACCCTTAACCCCTACCCTTTAACCCTTACCTGGGTGTGGGGGTAGCACAACACAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3R 30635060 5' + roo 11 2 41.74 AGCAAACTTTGTCCTGCCCGAGTCAACAATTTTGATTCTATTTACACATTATTATTATTATTATTATGGCAAGAGTTTCGCCTGTGCACTACGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACTATAATGTGTTTTTCACA:1 + chr2R 18482387 5' - hopper 1387 1 56.30 AAACACTGCTGTTAATTATGTGGATAGTAAAATTACAACACGCAGAACAGCAGCTAAATAAAAACTATCCTTAATGTTTTGATTGAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2L 16399438 5' + roo 8699 2 55.48 GCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chr3R 21705984 5' + 297 46 2 58.73 CGCGTGACAACGTGAACAAATTTTACCAAAAACTTTGCTTCTCGGACAGTGAATACTCAAAGAGTTTTCACGCCAAAATAAAAGGAGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2L 13927838 5' + roo 35 2 62.33 AAAGAAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCA:1 - chr2R 6526615 5' - jockey2 3333 1 62.07 GAAGGGGGTGGAACGTGCACTTAATTAAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3R 22100487 5' + 412 7086 2 64.03 GGGGGAAAATCGTATTTATTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGATTGGAACAGTCCTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATG:1 - chr3L 12176623 5' + Cr1a 4049 1 81.00 ATCACCGCACATGTTAGTTGACATTTCATAGATATCATTATAAACCAAATTTGTGATTTGCTAATGCGTTGGTCGCCGCAAGCTTGTCACCCACGAAAATTGCTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACATA:1 - chr3L 5408407 5' + I-element 4967 1 69.44 AGCAGCGATTGCAGTTGGAGAAAAGCAGGCAGGGGATTGGGAGTGGAGACGGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGAC:1 - chr2L 4174057 5' - roo 407 1 70.89 TCGGAGCTGAGAGCGCGTATTTACCTTTAAACTGGACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCG:1 - chr3L 7962316 5' + blood 7010 1 77.98 AAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTACTTGCG:1 - chrX 22824243 5' - Gypsy12A_LTR 2229 1 47.86 TATCCACTCAAGCGTGTCGAATAAGTAAATAGTATACATTTTATGTCAGCACTTATGTGTGTGGACTGGAGTGGGTCTCCAAGATGTGTTGGCAATGCGTGTAGAGTTAAGAACTACGCGTAATTCGGATTTTGTGA:1 + chr2L 23176546 5' + invader1 270 2 62.77 ATGGAAATAAAGAAACGCCCAAGCAAAACCCATAAAAACTGTGATTTTTTATTTTTTACTAAGTGTCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr2R 9873616 5' + roo 8720 2 63.01 GAAAGTGAAGGGGAAGTGTCCTCGAAAGTAAAGAAAGGGAGATCAATATCGGATGATAAATAATGGGCACAATAGAAAAAAACCTTTGATAAATAGAAAAAATTATTTGAATGCCTTCTATGAAAATGAAAAATTAAAAAGAGAAA:1 - chr3L 12605873 5' - Tc3 43 1 58.90 CCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3L 23146488 5' + 1360 56 1 64.52 CTCGCGATTTGTTTCGAAAACGATAAAAAAGTATACTTTATAGAAAAATACTAACCATTAGCGCTAAGTCCGCTTCCATAACAAGAGTGTGAAAGGTTTTGAACTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 - chr3R 15703042 5' + copia 4888 2 72.60 CATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chrX 21852443 5' + Tirant 16 2 59.77 AACATTTTACTCCACGAGGAATTGGTATAAAAAAAGATATCATATTTAAAGCATACTTTTCGGATATTTTTTTTTTTCTATTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 + chr3R 6388714 5' - jockey 4954 1 52.14 AGTCTGGTAATTACGATATTTAGGGCTGGATTATAGAGAACGCTGTCCAAACATAACCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAGAACGCAGCTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1 + chr2R 7959962 5' - mdg1 358 2 58.90 GGCCGGTTTCACCACAGCTTGTGCTGCGACTGCTGTGCTGGGGTTAAGCCACGTGTTTCACAACTCGACGATTCGGCCAACATACGTGGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 + chr3L 23241828 5' + 1360 12 1 52.80 CTTTGACATGGCAATCAATTTTTGGTAAAGTTATGAAAAAAACTCAATTTCTGCCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 - chr3R 24493167 5' + jockey 4737 1 61.38 AACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTT:1 - chrX 16855330 5' - roo 9016 2 58.21 GATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGC:1 - chr2L 23295895 5' + micropia 5086 4 52.74 AGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:1 + chr2R 20673657 5' - mdg1 7375 2 74.31 CGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCTTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr3L 22400289 5' + 1360 59 1 70.43 TTATGGGTCAAGTGTTTATTACGCCCACGGGCGTGGCACACGATGAGTACTGAGTAGTGAGAACTGAGTACCAAGTACCAAGTACCGAGCAGAGAACTGCAGCCCCCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr2L 16106073 5' - hobo 2920 1 63.57 TGGCGGATTCATTGAAACCTGAAGCCAGAGTGTAAAGTCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGG:1 + chr3R 23765389 5' - roo 313 2 78.08 GAGTATCTGAAGTATCGGAATCAGGTAGAGGTAGACAGAAAGGCGTTAGTCGTTCAACAGCGCTGATCGAGTTTAAATCTATACCGAAATGAGCGGCGGAAAGTGATTATTTTTAGGCGTTTCACTGAGGCAAGAAAATCCGCAGG:1 + chr2L 2451194 5' + gypsy6 7334 1 72.60 CCGGAGCAGACAGCATAATGCCACCCAAGAGCTGTCAATGGAGGAAGACCACACAAGTGGACGCAGGAGTAGGGGAAAATGGAGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTT:1 + chr2R 23243546 5' - HMS-Beagle2 7198 1 59.59 AAAGAGTTTTCACGCCAAAATAAAAGGAGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGCATCGAGTGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2L 13927780 5' + roo 74 2 74.02 AATCTGTGCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr3L 15026623 5' + opus 31 4 59.44 AATTATAACAAATACCGGATTTCATTGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACA:1 + chr3L 24291953 5' + rover 46 2 53.42 GTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTGGGTTCTGTTTTGTGCTTCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAATGTGCATGCTCAGCAT:1 - chrY 3648907 5' - Stalker 7048 4 63.78 GTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGTACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGTGCGAATTTCGACATA:1 + chr2R 2666335 5' + Rt1a 39 1 51.35 AGATCTCGCCAAAGATTAATGATTTTCCCAGTGACAGCGAGAGGTGGAGAGATGGAAAACGTGCGATATACATCTCCGGGCTTGCTTGAGTGAGCAAAACCAGAGACCAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGATAGAAGACGA:1 - chr2L 20631804 5' - 1360 3204 1 56.16 GTAGATGCAGCAGAGTATCACAAGCACATTTATTAGAGTTTTTCCCCACTCGATTTTCCCATCCCCCGCTTATTTGTGTGTGTGTGTGCGTGAAATTTGATGCCGCACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGAC:1 - chr3L 7995555 5' + P-element 9 2 78.57 GAAATGCAGCCGTTAACCAAGACACACACTCCGCTTTCTGGAACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTACACCTCCACGCC:1 + chr2L 18279867 5' + gypsy5 6965 2 62.10 TGCCGAAACACGACGGCTGAGACAAATCCAAGTGGGTCTTGATTTATGGGATTTGCAAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 5150424 5' - roo 9054 2 71.92 CTGTTTGTTCTTCTGATTTGTTCCCCAATACTGTCATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTT:1 - chr3R 7739506 5' - I-element 5272 1 76.03 GTTGCCAAATCAGTCATCAGGAATTGATAAATAAAAACCGATCAGCTGGGTAAATAGAACAATATGTGATAAAGTTACTGTATTAAGCAATATGTGATTATGTTTTGCGATTCCATTTAAATTTTTAAAATTAATATATTGCTATA:2 - chr3L 4733422 5' - Tc3 294 1 81.51 GCCAAAAGAAAGTTGGCTAGCATGCGGCAAATGGCGACAGGTGTTTCAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAACACACCCGAAA:1 - chr2R 13644568 5' + Burdock 7 2 79.31 ATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCT:1 + chr3L 24152464 5' + HMS-Beagle2 6967 2 75.34 CTTTATATCTTTTCTTTTATTATCTCTTTTTTTATTTGCAAGCTTTTTTATTTAACAGCTCTTTCAGGTGGATTTTTTTAAAAGATGTATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTA:1 - chr3L 8855997 5' - rover 7269 2 55.48 ACTATAAGACCTATTATTAATTAGTTCGATTAATTTTTACCCGTTACTCTTAAAGGGGTATACTAGATCCGTTGAAAAGTATGTTACAGGCAGAATAAAGCGTTTCCGTCTATATTAAGTATATATGTATATCCTTGATCAGGATC:1 - chr2R 4726560 5' + INE-1 80 1 77.40 ATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr3L 9907370 5' + jockey 62 1 64.41 AGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:1 + chr2R 5214984 5' + F-element 40 1 64.71 ATCCAAGAAAGACAGTTCAAAGAAGGCCATATCGATTAAGCCCATGCGAGCTAGATTTAGTTCGAGAAAAAATTGACGAATTTCTGAAATGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr2R 3203501 5' - Transpac 282 2 67.12 ACTTATCATTTGTTTAGTTCCTTTAACACATTATTTACTTATCTTTTGTGTAAATCCTTTTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTA:1 - chr3R 1568159 5' - HMS-Beagle2 255 2 56.85 GGAAAGTGATAAAAAATATTTATGTCTGGGCGAAATTCCAGCCGCTGGCTGTCCTTGTTTCCTATTCTGTCCCATTTACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCC:1 - chrX 14744786 5' + I-element 5001 1 66.67 CATGCTATCTATATCCACAATCTATAACTGTGTGTGTGCGAAGGAGTGAGCCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAA:1 + chrX 13600658 5' + 1360 3325 1 55.42 AATTGTATAAACTTAGATCATTTTTACACACATCGTGCTGAATTTGTAATTAGTTATAAAGTATCTCAGCTTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 19537006 5' - roo 358 2 52.05 AATCACATTCTGAGGGTAGCAATGCCTCTGTGATCAGCCATGAATTGATGTGCTGTATGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTA:1 - chr2R 4362617 5' + gypsy 28 2 55.45 GATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCG:3 + chr2R 7020550 5' - Bari1 1643 1 63.01 GAAATGGAAAGCAATAAAACAATTGGTTAGTCAAGAACAGGTCCCAAATCACCAGCGGAAAATGTTGCAGAACATGCCAAACCGAAAAGGGTTACTTCTATTATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chr2L 5202634 5' + 297 16 2 73.97 CCAAATATGCAAAATATTTTGCAATATGCGTGTTACACTTTGGAAAGCATTTGGAAACTGACTTTGTTAAATGGAAAATGAAGGGAAAAGCAAAACATTTTTAATTAATGTATGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chr3L 20289174 5' + jockey 4679 1 64.38 CTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1 + chr2L 13792590 5' + F-element 65 1 64.75 GCTCGTTTGAAATATGCCAAAAACACTCGCACACACACAACGGGCCCCAGCTAGAATACAACAAACACTCACCTGCAATGTTTCCTGAGGCTTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTC:1 + chr3L 5332624 5' + TAHRE 10090 1 65.55 CAGTAATCGACACTTGGGCGCGGCAAACAGGACTCCGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTCTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr3L 22642905 5' + hobo 50 1 66.67 GGCTGATTGCAGCTGGAGGGGATCCGATCAGTGATGCCCACTGAGATCTATTAATAACGCTGTGAGTCATGAAGCGAAGTGGAGTTGCGGCTGCATAGAATTTGAAAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTC:1 - chr3R 5091273 5' - 1360 499 1 75.69 ATCATCAGGGAGCGGTGGCCACAGAAACCGCCGTCTCATGATTTAAATTTAATGCAACTTTTGCTTTATAGCCAAACTGTCGCGCACACAGACACACATCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAG:1 + chr3R 10969865 5' + I-element 4900 1 71.72 CCGTCTGGTTTTGATAGTTGAAGTATGGTTTCAAGTTCACCTAAAGATTAAGAGCCCGTTAACCACTCCCTTTATTGTTCAAATAAATTAGAATTATTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACT:1 + chr3R 27928648 5' + roo 410 1 66.44 CAAAATTGTTTTAGAACTAACTTGCACAGCTGTATACTTAATTGCAAGAACAGACGGACAGACGCACAGGGTCAGATCGACACGGCTATTGATCCTGATCATG:1 - chr4 843897 5' - INE-1 89 1 51.46 AGAGAGCAATTAGAAGAAAATATGAAAAATTTGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAATGAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTAAGCTCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 19448605 5' - roo 9054 2 76.71 GTAACGAGTTGCCTGACATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTA:1 - chr2L 686095 5' - roo 356 2 53.42 GCTCGGAAAATTAAACCTTTCGGACCGACAGGATATTGCTCAGGTTAACATATATGTACATATATACCAAAAAGTGTACTTTATTACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGC:1 - chr4 827090 5' + 412 7324 2 56.16 ATTATGAGGCGCCGAGATAAGAAAAAGGTTCTATCACAACCTGCTATATAAGCAATATAAGTTCTTGAATCAAAACAATCTCAATCTCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 19536868 5' + roo 24 2 65.19 CGTGATAAGCGCATAAATCAGTCGAAGGACGAAGGGATCCCTTACCCCAAAGCCACGGACTCAACCCAAGACGTAACTCCCCATGTAGAAGATACTTTTTAATTTCAGTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 + chr2R 17121537 5' - blood 7382 2 75.35 AAAGTGATTCTGAAATTCATCCTATCAGAATTCGTAATAATAATTCATTTTATAGGTAGCATTTATACATTTTGAAATATAATACAATTGTCTCAGTGTATCATTGTCCAACATCTCATATTTCAACAACATTTCTGGGTAAACAC:1 - chr3L 350852 5' + HMS-Beagle2 6925 2 61.64 AAAAAGAAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTAT:1 - chr2R 6526617 5' - jockey2 3335 1 63.45 ATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGCTTGCTTGTTG:1 + chr2R 6632589 5' + P-element 64 1 29.17 CTATAGCTAAAATACTATTGAAGCGAGCATATGTCTCGGTGAGGGCAGGTCGATCTTTTCCATAGAAAAGAAACGGCGCATAATGACATTTTATTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1 - chr3R 29058849 5' - jockey 4980 1 52.94 GCTTCACTTGTTCGCCTTTTTTCACATTTTTGCTTTCAATTTTTTAGGTTTTTTTTTGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAGTTTCACGCGTCTCTT:1 + chr2L 7559684 5' - mdg3 215 2 51.75 GCCCCATTTAAAGTTGTAAACGTTTAACAGTATTTTTCTTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTAAAGTCTCTTTGGATCTTTTCACTCCGAACGTACCAAGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTG:1 + chr2L 12891992 5' - F-element 4335 1 78.62 GCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1 + chr3R 19531247 5' + hobo 83 1 72.60 AGCACTCAATTTCCAATAAAACAAGACCAAATTAGACAAATTAAATAATTGTCAGTTCATTCAGAACAAGAATAAGATGATTACTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 + chr3R 12593000 5' - flea 4979 2 59.59 AACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGACGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chr3L 12224698 5' + 412 80 2 71.03 TGCACTAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGCCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACA:1 - chr2R 4261974 5' - invader4 230 2 48.97 AAATATCAAAGTAAGAATGCCGGCATAGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2L 17136124 5' + hobo 40 1 52.45 CACGTGCAACAGGACCAAACTGAAGCTGAAGACCAGGAAACCTTAGGATGGAAGGCAAAGTAATAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGTTTGTGCCGCAAGTGGGG:1 - chr2R 7020656 5' + Bari1 58 1 52.74 GCTCCCTATTTTACATAAAGTATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGG:1 + chr2R 12543094 5' + roo 8756 2 82.88 CACTGTTGTCAGCAAATAATTTGCTTTCTCAGCTCGTAGCTTGATTTTGGTTACTGACTAATGGCAAATCATACTGTTATGTATCTCTGCTCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCACAAC:1 + chr2R 23412489 5' - mdg1 7428 2 60.96 GGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 - chr3L 22400364 5' - 1360 3335 1 55.56 GGCTGAGTTACATGGCTGTGTGCTTAGACGATTGTGCAAAACAGATTTGAGCTGGGCACAAACAAAAAAAAACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 13395361 5' - roo 360 2 52.74 TATAAAAAGTAGCAAAATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 - chr3R 28728743 5' + jockey 84 1 65.75 AAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTCGCCA:1 + chr3L 18467191 5' + hobo 55 1 61.07 TTTTTATTTGAAATATAAATTTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTCTTTGGTTTTTATTAAGAGA:1 + chrX 3197107 5' - mdg1 349 2 78.33 TAGGCTTCTATTTATGGGGAATCAATCTAAAATACAGTTGTTACCATTACAAATATCAACTGCTTTATAAATTTAACAACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chrX 13531724 5' + roo 38 2 51.75 ACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTGGG:1 + chr2L 18177006 5' - INE-1 539 1 77.30 AATGAACTGACGAAATATGGAAGAGCAGTCCGCCAGAGAAGCTTTTCCTCAATTTTAAAGGCGATGAGACTCTGTTTCTATTCTATTCAACGAAATGCCACAATACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 - 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accord 7032 2 64.14 GCAACAACAAATGCGGCATATAAACGAGCGCATAATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3L 11336314 5' + blood 37 2 56.85 CATTTAATTCGTTTTGGCGCTGTACGCGTGCGCACGCAAATCCCCAGTTCCCCAACTGGATACCCCTCTTTATACTCCACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2L 16458564 5' + roo 14 2 68.64 GCACAAATAGGTTGTATTAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGT:1 + chr2R 5617462 5' - invader1 377 2 60.69 AGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1 - chr3R 4528390 5' + F-element 69 1 83.18 CAGAGAAAAAACAATTATCAAATTCTGTTACTCAATTGGATTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr2L 2052697 5' - blood 7352 2 60.19 TGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chrX 12191562 5' - pogo 2034 1 75.20 CCTCGCAACATTATTAAAATGTTGTCAGGCATTCCGAACAAGTCTCTGTGCAATGGAGTTTATTTCATATTTGCAGCCAACCAGAATCACATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGA:1 - chr3R 13176480 5' + Burdock 5 2 78.86 ATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACAA:1 + chr3L 17707832 5' + Doc 80 1 65.71 AATTATTTTACTAGTTTAAAAAATAATATTTTAAGCAATAGCTATGTAATTTACTAACGACCATCATGAAAGAAATATAAATTGATAAATTAGGTGTAAAAAATAAGTGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 - chr2L 18193170 5' - mdg1 7450 2 73.97 AAAAAGAGCGAAATAACTATATCGGCATTGCAAAGTTTATATAGAAGCATGATCTTTAATTGGAATTTTCAAATTTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTC:1 + chr2L 5489585 5' - Doc 4468 1 50.68 TCAGCTGTTTTATTTGGGGCAACGAGAATGTATATAAAGGATCATTTAAAACCAGTTACTAAAGTCACTTTTTTTAAGGCATACGGAGTAGCTGAAAACCCCTTTGTCACCTTGGTGACCCCTTTCAGGCCCGCCGGCTAACAAAA:1 + chr4 353419 5' - BS3 1687 1 53.42 GTTATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCG:1 + chr3L 9571685 5' + jockey 4540 1 76.92 ATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCA:1 - 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chr2L 2276779 5' + F-element 62 1 63.11 CAGTGGTAGCCATTTACGACTACTATGCCGACAAGGACGACGAGCTGAGCTTCCAAGAAAGCTCAGTGCTGTACGTGCTCAAGAAGTCGCCATCATGCGTTGAAATAGTGAGGAGCGTGCCTCT:1 - chr3R 14120210 5' + mariner2 142 1 66.94 AAAAGCTAATACGAGTATTCACGAAACTTTTCCGAAGGTTCTATTTTTAATGCATGCTGCATGTAAATCGAAAAGGGCAGGATGTGAGTACCTAAAATAAATAAAAAACAAGGAAGGAAGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAG:1 + chr3L 23027500 5' - INE-1 562 1 65.75 ACAACTTGTGCGCCAGTGGAGTCAGGTACCAAGACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATT:1 - chr2R 24846817 5' + gypsy5 35 2 61.18 ATTGTGCTTGTATTTTATTTGGTTTCAAATATGTTGTTTTGTTATCTTATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 - chr3R 4581946 5' - 297 347 2 61.29 AGGGGGGGAATGTTTACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chrX 16855351 5' - roo 9025 2 53.42 GTTACACATTCAAAAGGCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2L 246103 5' - roo 356 2 54.11 AAAAAATTATTGCTTTAATTAATTAAACAGTTACAATTTTAAGTGGCGCCCAACGTGGGGCGGTGTACTTCAAAAGTTAAAAAAACACCAAATCATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGCAAACGATCG:1 + chr4 1150949 5' + Doc3-element 361 1 61.15 GACCAGGAGTTAATAAATTCATTAACTCAAACCAAAATAGAACTTTTAATGAATTAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACT:1 + chr2R 4312900 5' + gypsy 7002 2 73.29 ACATTTTTTCAATAAATTTAACACACTCAAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGCGTGCGG:1 + chr3L 18467163 5' + hobo 42 1 56.85 CGGGTTCTTGGCCTAAAAATATTTTCTGCCTTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 + chr3R 9160649 5' + copia 39 2 59.59 AATAGAGTTAATTCACGCTTGGGGTGCTTTCAAATATACTATATACAAGTTAACTCAAGCTAACGTCGCTCCCACGGTCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGC:1 + chr3L 24312948 5' + gypsy2 6545 2 75.20 GTATTTCTGAGTTTATTGCTATGCTTGTTTTTTTTTAGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 16855222 5' + roo 50 2 52.74 CAGCGGGAAAAGTCGGAGCTACGCAGCAAGCTGCAAACCCTACAGGTAAACTAATTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACACTTTGTACATT:1 + chr3R 24126723 5' - hopper2 1283 1 61.64 CGAGAAAATGTGTTTGTGTGTATTTCCCTTATGCTCTACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr3L 12224739 5' + 412 7093 2 58.90 CAACTGATTATATATGCACCAATGCAATGCATACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACG:2 - chrX 17732049 5' + pogo 86 1 79.45 TTCAATTGAATTAATTGTGGAGTAGGTTATTAGCGGTATCGAAGGTGATATTAGATCCGTAATTATAGCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCTGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTG:1 - chr3R 12593140 5' + flea 48 2 52.05 TTTCACTGTTTTAGATTTTCGCACAGCGACATGAGGAGGATAATGGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3L 16562935 5' + roo 8739 2 70.55 CATTCATCAGCGCACTTCTTACACATGTGCAAAAAAAACTGTGGCCCAACTGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCCGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATT:1 - chrX 2578087 5' - hopper 1358 1 59.40 CATTACATTGCATTGGGGGAGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 - 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chrX 16525861 5' - accord 185 2 52.05 TGTCTGGGACAGCTGGGCTTCCTTTGCTGCGGTCCACATAAAATGCATAAATTATACAGCGTTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTAT:1 - chr3R 27822294 5' + I-element 59 1 58.22 CTTACAGTTTTATGGCATTGGTAATGGCGATCCAGTGGCTGTAAACCTTAACCAATTTTAACCGTGGCTACTCAAACTGTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCT:1 - chrX 15137485 5' - jockey 4949 1 54.79 CTCTATGCGGGTATTTAAATTTAATTTGCAAGCTGACAAAAAAAGAAAATTGTTGCTTATCAGTTTGTGGAAAAAAGTACAGAGAACATTATGTCAACTGTTTGACAAAACAAGAGCGAAAGATACTATATGTATGTATGTATATG:1 + chr3L 5179259 5' + 1731 4410 1 74.66 ATACATATGCTATGCAAATTGCGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr2R 19554906 5' + pogo 16 1 69.42 TAAAATAAACACTTTAAAACCAATATTTAAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr2R 20673605 5' - mdg1 387 2 61.64 TGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACATCGAAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGACGTATACG:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 48 1 67.81 GTTTTCTTTATATACCCCTATCACACCGAACGCATTTCAGAAGACATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTTAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAA:1 + chr2R 5260654 5' - 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chr2L 18149566 5' - Bari1 1681 1 67.81 TAGGCTGGGTTTCTTAACTTATTCTCCATATCATTTTTTCTTGGTAAACAAAGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chr2R 19553332 5' - mdg1 415 2 77.78 GTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAG:1 - chr3R 15022112 5' + Tabor 6911 2 64.38 GTAAGGGCGTGCATGTGTGTGTGTTTTCGACGGGCACATGTGGCCCCATTTTAATGGACCTGCCTCGTAAAATGCCACAAAAAGTGTCACAAATTTATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3R 28272402 5' + Tirant 8114 2 75.97 GACGAACGAAATTAAATCTCCAGGAGGCAAAGTCTACGAAATTGTCCAAAACTCCCCAAATATGTAAATTCGTTTCTTCGATCTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGGACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTT:1 - chr2R 14635517 5' + 1360 3232 1 77.40 AAATATATATATATTCTTAATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCAACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTTTCTTGT:1 - chr3R 5064117 5' + INE-1 579 1 54.79 GTGCGGAACACATGGTTGCCAGGGAAATACGCTTGTTCCTGGTTCAGCAGCTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr2L 13792540 5' + F-element 39 1 62.33 GGGTTAGTAACAAAATAGAAAAAATGTCTAAGTGAAATATTACTTAAATTTTTTCAGTTCAAGAACTCCAGCTTAAAAATATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr3L 18729815 5' - mdg1 7419 2 45.21 CACTATTCGGACTAACGTATCCGTCCCTGTGTGTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATCTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCT:1 + chr2L 22592562 5' - mdg1 332 2 76.71 ACGAGTGGCCAGAAAGGACGATTGCCAGGACTCACTTGCTCCGGCACTTCTACGCTAATTGCCAGCAAACCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCACGGTGTTTTTCCCGTAT:1 - chr3L 3563855 5' - baggins 5103 1 51.30 CTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGACTCGCATCT:1 - chr3L 14076278 5' - roo 8989 2 73.29 ATTTTTGTGTATATGTGTCAAACACTTAATTTTTCTAGACGTAGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCACAAGATCG:1 + chr2R 4628351 5' - Transpac 5192 2 59.59 ATTGATTTTTTCGCGGCGATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1 + chr2R 11763566 5' + Tabor 45 2 54.79 TCTCTCCGCTTGCGTAAAATTGAGAGCGTGAAAATCTACAGGGTGCGGCAGCATAACTTCCTTTTTTAAATTGAGCGCCATTCCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGCTAGTGGTCCTG:1 - 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Bari1 1691 1 71.23 CCCACAACGAGTGAGTGCGTGTGTGTGTTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr3R 28396593 5' + jockey 69 1 57.53 ACGCGACGCTAATAAATCCCTGGGGTTATGTACAAATCTGGGAATAATTAATGTGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGC:1 - chr3R 20465934 5' + X-element 4621 1 56.52 AATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACA:1 - chr2R 5237876 5' + Doc 102 1 63.70 CGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1 + chr2L 13792608 5' + F-element 67 1 76.42 CCTATGCTGCACTGCAGCTAGCATGTTCGCACTGGCACACTGCGGTCACACTGGCTTCGCTCAGCAAAATATTGCTTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr2L 3466109 5' - P-element 2886 2 76.70 TTAGACCTCAAGCGGAATTTCCTTTCGTTTGATTGTAAGTTGTGGGAACGTGCAACAGCATGTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTAT:1 + chr3R 17605594 5' - 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roo 9036 1 60.96 TATCAGATTGTACAATTGACGAGCTAAAGCTTTTCTTACTCGCACTGAAAGGGCCTAATTCCGCTGTGTTTGCGTAGGTGACGGTCGAAGTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTGTCTC:1 - chr3R 8727675 5' + transib2 459 1 72.00 ATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2R 10695871 5' - roo 9014 2 63.31 GGTGGTATTCATTTGCGCATATGTATGTATATCGGCCCGCTCGGCTGGCTGTGTGTATATATGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTCAT:1 - chr3R 17067928 5' + 297 51 2 62.33 ACAAAACATATTTAAAAAATATACACTATATATTATGCGTAGTTTTTGGTAGTGAAACGTAATTAGTAGTTTGTTAAATAAATTAAATTAAATTAAATACAATATAAAATGTACAACTATTTTGTGTTTTGTTTTTCGATTTTGTT:1 + chr2R 14059026 5' - I-element 5184 1 57.53 GTAGATGGAAAAAAGATGGACAAAGTTTCTACCATGAGAAAAAAAAATTCAACAAAAGTTAAAATGGAGAAAAAAGAAACAGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr4 1219132 5' - 1360 3352 1 60.27 GCCTTTTGTGGTTCCCCCAAGAAATGATTGTATCTCGGTAGTTGCTGTGTATCTACATATCTTCATACCTACATATGCATTCTCAAGATTAGGTATGACCACTGGATTTAGGTAGAATACGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTT:1 + chr2R 21648950 5' - gypsy 352 2 54.11 AAATTTCCCCTAACAGCATTAAATAGCGCCAGCCTGAAGGAGAGCCCAAGGAATTAAAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAG:1 + chr2R 2673964 5' - Cr1a 4276 1 54.31 GCAAGGGCTGCGCAAGTGGGTTGGACTTTTCGGGGTGGGTGGACTTTTCTACTGCACGCGTGTATTTGTGTGGCTTTTCCTTCGTCGGTTGGGCTGGAGCTGGAAACAGGCTCTTAGTTAGGTCAGCTGGAAACTCTAAAAAATTT:1 - chr3R 25590895 5' + baggins 179 1 60.96 AATATAATGTATAAAGCTAACCAACTCTTAAATGTTATTGTACAACCAATCATATATGTATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCTATTTTTT:1 + chr3R 6711416 5' + pogo 51 1 60.00 CTGATTACTCCAGCTTAAGTTGATAATACGGTCTAAGGATCAAAGTATTGAGTTTTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3L 4115278 5' + 1360 5 2 77.40 AAGGTCTATAAGCCTTATTTTTATTCATTAAGTTTTATTTGCAAAAACATTACCAAGCAAAAATTTCAAAACGGATGCTGCGCAGCTGGGATACATTATGGAAAATCACTAAAGTGCATTACTG:1 - chr2L 12196913 5' - 297 6634 2 55.65 ATTTGCATTTTAAATCAGTCCTTTCTATATTTTTGTATGTGTATGTGTGTGTATGTATATATACATATATATATAGATATATCCTCGCACACCATTACACCTGAGCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chrX 5145362 5' + hopper 13 1 74.31 TCCCGCATTGAAAAGCCTTACGAAATCCGACAGGCGAAAGATGAATGGAGAGGCCCACTTGAGATGATGCTGTAGTGATGAACTCCAATTAAG:1 - chr3R 13612909 5' - 412 492 2 74.19 AAGCTATTTACCATCAGTTATTTTATTTCACCCTATTGCCCTCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTGTTTAAATCATTTAAGTACACCCCAACAGCCTAGCACGGAAGCTAGGA:1 + chr3L 21143996 5' + jockey 4681 1 77.40 AAGTTTTAGTTTGAATTAAACTTATCGTGTATGTGAATTGTGGCGTAATGTTGTTGAGCAAATGGGTTCTACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 24279315 5' + roo 8715 2 56.16 AAATTGAATATATACTTTTCCTTTAAAAAAGCATTGCATACTTTGCAACAGCATTAAAAGATACTTCAATCTTTTGTGTGCTGAAATTGAGAATGTATACATATTTTTTTTTTAAACTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTT:1 + chr2R 8642850 5' - Doc2-element 4747 1 69.18 GCTGTTGACAGCCGTGGCATGTCAACATGCTAAAATGCTAAAATACTGGCCATCCAGCGTCCCGAGGCATATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCA:1 + chr3L 10397087 5' + F-element 202 2 58.33 GCCCTTCCTTTCACCTACAAAACGGCCACGTCCACAATTTTACTCAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATA:1 + chr2L 21580876 5' + INE-1 546 1 54.11 AAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCT:1 + chr2R 7020569 5' - Bari1 1624 1 76.03 GCCGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:2 - chr3L 14553220 5' + roo 8708 2 55.48 CACTGAATTCACTGAATTAATGCAAATTCAACGCAACGCTCAATAATTGTTATATATATTCAATGAAATTACCACGAATAAACTATGCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAA:1 + chr3L 14708027 5' - R1A1-element 111 1 58.22 CCATCATGAAAGAAATATAAATTGATAAATTAGGTGTAAAAAATAAGTGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 - chr2L 18193110 5' - mdg1 7393 2 65.03 GGCAGCGCTGCCCTCGAAGGGTTTTTTTTGAAGGATTCTGATTCTAATAGATGGAGGGTTGAGAGTGTAGGAGTATAGCTTTTGGCAATTGGGCGTTTGTATAATCCGTGAGCAGTCTTCACTGTAACGACTCG:1 - chr4 425988 5' - 3S18 5665 1 63.43 GGCATCCGAAGCTAAGCCAGATCCACTCCTGCTGCATGCTGCAATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCAT:1 + chr3R 29418653 5' + mdg3 24 2 57.14 GTGCTCGGTGGAAATTGCTGAATGAAAGCGCACAGCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTT:1 + chr3R 19327190 5' + Doc 96 1 76.03 GCTTAGCTCGTAGTTAGACTCTTGTAAATTAACGCAAAATCTGTTCAACTTAAACGAAGTGAAGGGATAAACGAAAATGAATTGTAATCAATATCGAACAAACCACTCGCAGCCG:1 - chr3R 15175792 5' - X-element 4325 1 81.74 ACTGGAGCTCTTTACACGGGATCTCAGCGTTTTAAGAATGGGATGCCAAAACACTTTATAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTAGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 7539433 5' - roo 9051 2 60.75 CACTGTTCTCGCTGGCCAGACATCATTAACCACCTCAAATCGTCACCTCTTATACCCCCTCAACAAAGCCAAATTTATGCCTATTGGCTCACATGTATAGACATGATGGCACCTCCAGGAAAGATCTTGGCGTTAGTACCTGTTT:1 - chr3R 21687997 5' - Chimpo 41 1 76.55 GTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAG:1 + chr2R 5542369 5' - 1731 4558 1 71.88 AATCCTTTGGAGAACGGATCAAATGGAATAACATTTGAATAATGTTTACCACAAATTATAAACTCTGGGTCTCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTC:1 - chr3L 17459675 5' - R1A1-element 4966 1 57.53 TTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACACAACAACAAAAACAACAAGACCTCCAACCCGGGATCAAGCCCTTAACCAACCTAAATTTACTATTATTAAAGGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAGCATCAC:1 + chr2R 1740237 5' + I-element 283 1 61.64 AGCCGAAGGGGGTGGAACGTGCACTTAATTAAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3R 22100483 5' + 412 33 2 65.03 CTGTTGTTCTTGGGTGAATGCGAGTGCCCAAGTCTATTGTTTAAACGAAAATATTTAATTAGGTGAACGGCACAGCAACAATATAATGAAGCACGGAGCAGCTGGCGGATGGCCTTTGTTATTGTTATTGTTATTATGTTCGTATA:1 + chr3L 22054924 5' - mdg1 8 2 78.77 AATCTGTTGTTCTTGAGCAATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chr3L 14062227 5' + Doc 60 1 55.22 ACCGAATCACGACCCATACGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCA:1 - chr2R 15829597 5' - invader4 263 2 66.43 ATAGGATTTAAAATCACACCAGCTGATATACGATATATCGATTGGGCTATCGCAAGCACTGGCGCCCCATCTCTACGATAGTGCTTTCGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGT:1 - chrX 14826230 5' + P-element 8 2 75.00 GCAAGGGGCTAGGTTCATCAGCACCAAGATCTGGTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 24122627 5' - roo 396 1 69.35 TTCCGAAAATTGGATTGGCAAGATGGCCTGCTCCACAAACGTTTTGAAGGGCTTTGCCCTCTTTTGGGATATTATCCTCGCTGTGAGTATTATATACTATATTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGC:1 + chr2R 7029077 5' + Cr1a 4241 1 69.18 ATACTTATTAAATGTTGAATATCTTTTAAAAAATTAGCATCAGCATATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 - chr2L 17136256 5' - hobo 2903 1 61.31 TGGGCGGGGCGGACTGCCCCTAAAAGTCGTAAAATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGCTGCAG:1 - chr2R 11057335 5' - pogo 2070 1 64.13 TCCATCCAATTAACCCCCCGATATCGGCCTTATATATATATATACATAT:1 - chr3R 13185248 5' - Juan 4185 1 89.80 ATTTTGTGGTATTTAAAAATAAACATCAAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3L 96500 5' - roo 346 2 59.31 TAATTCAAAGTGGTATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chrX 10645052 5' + jockey 82 1 71.13 TTCACTTTATGCGATATTATGCTGCAATTATGTGTGTCATTTTCACCAACCCCCTTCCGCACTCTCCTTCTCATTCTCACACAGTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCAC:1 - chr2R 17356200 5' + blood 7181 2 79.82 ACACGGTCTTTGTGGACCGCAAAAGTCCAAGTCAAGCATTCCACTTATAGTATCGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATA:1 - chr3R 27794871 5' - roo 346 2 60.14 AAAATGGGAATGGGAACTAAAATTGTGCCAATAAAAGATAGTCTGCGAGCTAATACATTTACAACAAGCATAAATAACTAAAGGGCATATATTTATCTTCTTAATCAACTGCTGAAATCACTTCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGG:1 - chr2L 10669513 5' - F-element 410 1 78.08 ACGAAGGCAGGCGCACGGGGAATATTGTTTTGTCAGCTTTTTATTGGCCAACATGGGCCATAAAGCTACTCAAGTAGTATTTTTGCGATAAAATACATACAATTAGGTCTTAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGA:1 - chr2L 15406379 5' - Idefix 450 2 66.44 AATAAACCGCCTAAATTATGAAGGAGACGCTCAAAGCACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATAT:1 - chr2R 2875249 5' - TLD2_LTR 115 1 72.60 GCTTGATTCTCAATCATGATGTGTTACTTACCGTGCCCTCCACCCCTCCTTCACTACTCCGAGACAACATGGACTGGCA:1 + chr3R 10781129 5' + G-element 311 1 62.03 GTTTACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chrX 16855340 5' - roo 9014 2 54.79 AAAAAAAAAATGTTTGGAGCAAATCCTAAAGGTGTCGGTTCTGGAGCACATTGAGTGTAATGTCAAAAATAGTATTGAAAAATATTGAAAAATTAGGATATAGTTTATTAATAAATCAATATTAACAAGAGAGAATGCTACAGTCG:1 - chrX 15836134 5' - INE-1 579 1 52.05 ACAGAAAAGTTAAAAGGAGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTACGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3R 16181136 5' + roo 63 2 60.69 ATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATT:3 - chr3R 9160761 5' - copia 185 2 61.64 CGCCCACTCTAATGCCCACAAACAGCACAAAACTGCCACGCCCAAACTTTTCAAAAATGTGTTGATATTTTTCACATTCTTGTAAATTTCCATCGATTTTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTC:1 - chrX 21581823 5' + INE-1 573 1 52.05 GAGAGAAACAAGCGATCATTTTCAAGGAACTTAAATGGGAAAGCTCCAAGCAGACCCGATTTCAATGGGGAATCGAAAACGCTAGTCTCAATTTCTTCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 - chrX 1061663 5' - 412 7546 2 77.42 GTTCCAATTATAGATGCGAGTTCTGGGCATATCGCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATCTCTATATATATGATATACACACACATATATATGTGTGTATGTATGTGCGTGTGTGTGT:1 - chr3R 14048351 5' - Quasimodo 39 2 50.00 GGGTTAAGCTTAAAATAGTTTATTGTGAAATAAAAACCACCACAAACGGCAACAACAACCAGCTGTACATCCAATATACAAGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGAGCGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATA:1 - chr3R 26254221 5' - 1731 4471 2 62.33 GCTGCTCCTTAACTAGAATTCTTTGGTTTTAATCAAATTTATAATGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCCGTACT:1 - chr3L 18467269 5' - hobo 2903 1 54.55 ATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGCCCCTATTTGGGTGAGGACTTCCTTCAG:1 + chrX 21772492 5' - springer 7076 1 73.88 CAATAAGCAACATATACACGTATATAAAAAGTAGCAAAATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr3R 28728765 5' + jockey 62 1 53.42 GGATCCGGTCGATTGTTATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 + chr2R 1921413 5' - mdg1 7400 2 55.48 GGATGATTAGAAAAATTATATAGTGGCGTACTTGGGTGATCCAAACCGGACATTTCAATTATTTCATCCTATAGCCTGGCCTAAACAGATTTGACTGCTCTCTAGGAATCTTCTCCTAATCTTAAGAATCCAATAGCAATGCTCTC:1 + chrX 22901625 5' + 17.6 258 2 54.11 TAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGTACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 + chr3L 15026656 5' + opus 52 4 64.89 CATTATGCGCAAAATAAACGTTTTGTATCGTGACCAAAGACAAATGAAAGTATGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAACTTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1 - chr3R 17897209 5' - hopper 1352 1 56.94 ACTGATACTGAACACACAGCAATTCCACGATTTTAAATAATCAGTTTCGAACTGTTGATTCCAGCGCAACGAAATATCGCTTATGAATAAAACAATATTTGTATCGCTCAGTTTTATTTCTACACTTACGTGGAAAAAGAAAAAAT:1 + chrX 19837448 5' + P-element 133 1 75.34 GTCTAAGGATCAAAGTATTGAGTTTTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTAGGCACACGATT:1 - chr3L 4115248 5' + 1360 35 1 56.85 TGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chr3L 14550987 5' + P-element 69 1 21.95 ATGTCCATAGCTTTTCTTCTTGTATTTGTTTTTGGTTGTATCAAAACAAAAATCCAATCAGCGGTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 - chr3R 23240312 5' + jockey 67 1 55.48 GTTTCCTAAAATAGCAATCTTTTATTTTTCCCTCTGTGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTA:1 + chr3R 10472715 5' + mdg1 86 2 74.66 GTCCTTTGTTGGATTCAAAAATAGAGTCGTCGTTACATGGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3L 23986658 5' - opus 7479 2 69.72 TTGGTGCCCGGCCAAAATGCGGAATACAAGTGGGGCTGGGAGGCACTGAGTTGGGCTGGGTTGGGTTTGGATTGGTTTG:1 + chr2R 18303136 5' - G2 103 1 92.41 GAATCCTTCCAGCTTAAGATTTCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAA:1 - chr2L 22729355 5' - R1A1-element 4950 1 74.71 CCTAGCATAACCCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACTTCTTGTGGTTCCACATAGTCGCAGCTGCCATCAACGCCAACGTA:1 - chrX 21759568 5' + HMS-Beagle 53 2 76.60 AGAATTAATAATATAAAATATACTTATAAGAAGGAATATCTATTGCGAGTTGTTTAGGTTTTTGTAATAGGAATGCAAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACAC:1 - chr3R 26813647 5' - hobo 348 1 56.16 ATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAA:1 - chr3R 11547794 5' + G2 321 1 52.41 TGCTAATGCGCTGCTTCGTCAAAAGCTTGCCACGAATTTTCCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTG:1 - chr2L 18280016 5' - gypsy5 7322 2 65.75 AGCAGGTGGGTGGGGGGATGGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2R 23287473 5' - roo 404 1 62.75 TTACATAAAGTTTTCTAGTCATGATAACAAAGTATCTTCAAATTGGAAATTTTGTAAATAAATTTTTTTTTATCAGACATCAATGTCCCGCCAAATGCCATTTCTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAG:1 + chr2L 11184298 5' + diver2 4775 2 55.86 TGCCACGTTAATTAAATGCAATCATTTTGGAAACATACTTATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chrX 12138893 5' - roo 9052 2 68.97 GTGAAAGGACATGGATTAACAACTAAGGTTTGTAGTAGGGATTTAACAATATACATATATTTAAGTATATTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGTCAGCCGTCTGGCTGACCTATATTTAT:1 - chr3L 2878538 5' - 412 440 2 48.63 ACGAGATCAGTGAGGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTAT:1 - chr2R 8641618 5' + diver 43 2 52.05 ATTTGCATGAGTCAACCACGAGTGAAAAGAGACAATTTCTAAACAAATAAATTCTATTAAATTCTATGCCATCTTAATGTTTGTTATATCTATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 13531566 5' - roo 9043 1 58.62 ATTATATCCGTTTCTCGTAGAGTAAAAGGGTGTACTAGCATGTAAGTATGTAACAGACAGTATGTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTTGATATAGCCATGTCCGTCTGTCCCTATGAACGTCGAGAAC:1 + chr2R 2749405 5' + INE-1 132 1 54.79 GTGTCATTTTATGAGCAATTCAGCTGAAATTCAACGGAAATTTAGCTGACACTCTGGACTTGGCATATTTCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATC:1 + chr3R 17114011 5' - roo 9023 2 52.74 CATACAAAACAAAATAAATAAACCCAATACATATGCAAAGCTTTTATTCTTGATATGTATAAAAAAAAACTTTGGCACAGCAGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTT:1 + chr3R 9351968 5' - Tirant 8497 2 75.00 CAGGGAAATACGCTTGTTCCTGGTTCAGCAGCTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr2L 13792559 5' + F-element 56 1 50.00 ATGGTAAATAAATTAGCTAAGATTTCAGTCCCTAGAATGGCCACCCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATA:1 + chr2L 685960 5' + roo 8700 2 58.22 ATAAATTAGCTTAATCAGCGGTTGCCATTGGAAGTTTTTTTCGACTTAAGACTTAAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCT:1 - chrX 18409564 5' - jockey 4919 1 67.81 TAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3R 10684817 5' + roo 8738 2 69.93 GAAAGGGTTAGGGTATAGGTTAGTTTCGCACTTTTAGGGGTTGTGCTATCCAGCCCATCGCTGCCAGTCTTTTGATTTATTTTTAATTTGTACGTTGACGCATGATCACCACCGCAGCTGA:1 + chr2L 7590586 5' - jockey2 452 1 71.90 GTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAAT:1 + chr2R 12787820 5' - 297 6902 2 72.60 CGAACCGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 - chr3R 9160789 5' - copia 213 2 54.11 GTCCTGTGTGCTGTGACCCCATCAACGTCAACATTGCGTATACGCAACGAGTGCCGCCCATTATTTGTATAAATATCTCTGCAAATGTGCAGAGCTTTTGCCGAGGGTATGTATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGCCAGCACTTT:1 + chr3R 30087973 5' - springer 48 2 52.05 CTGCAGGAAAAACAACAAAAATATGGGAGCCTTGTTTTTCATACACATACTGACCAGGAGGAAAAAAGAGTATGCTAACATAAAAATCAACAAAAAGAAATCAGAGAGATGTACACACACACACACACA:1 + chr3R 11096927 5' + accord 7026 2 69.77 GGCACAACTATGAAAAGCCCAAAGCGCAAATTAACCCAAACACCCACTCGCACACACACACACACACACACACATATACACACC:1 - chr2L 7451352 5' + accord 7036 2 77.38 AAGACACGGCTGCAAAAAAGGGATCACATGGCGAGGACAGCATGAAAAGTGGACAGCAATTTGCAAGTTTGCCAAAGCATAAGCCATTTATGTACATACATAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAA:1 + chrX 22858365 5' + copia 4889 2 69.18 CTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATT:1 - chrX 20999615 5' + BS 33 1 56.85 ATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3R 21705953 5' + 297 6585 2 73.91 CCAACTAAGCCAACTTAACTAACCGATCGCAGAGCGCAAAGTGTCGTATTTTCACTGTCGTCAATTAACAACAGCGGCAACAAGAACAACAAACGAAATGAGCGGCTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 + chrX 5679877 5' + P-element 14 1 76.03 TTGTATTTAGGGTGTTGTCAGATCTTATTTCAATCGTTGAGTGCGTTCTGGTACGAACAGCACAGCTGTTTATATATTACTGAGCACAGCTACCCCACACAAACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 - chr2R 7665892 5' - Transpac 295 2 73.97 CAAAAATAACTAGAATTATAATTTCCCACCTGAGATCTCAACGTTCAGACGAACGGACAGGCGGACGAACACGCCCAGATCAACCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATA:1 + chr2L 22047552 5' - INE-1 81 1 73.45 GTGTGATGACCGTTAAGGTTGGAAATTAGCCCGGACTATTATGTGCCGTTTGTTTTACAAATTTTAACGCTATTTAACACATTCGCCACGGATCTCCCTCATATACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACTTGGCCTCACATCCTG:1 + chr2R 23037237 5' + Rt1b 4950 1 63.70 ATTACCTCGGTTGGAATTATTCCTTCCTCGGTTGTTTCCTCTGTAGTTTTCTCTGAAATTACCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGA:1 + chr3L 7037044 5' - Stalker2 7590 2 57.53 ATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGT:1 + chr2L 15834476 5' - hopper2 1520 1 75.34 ATTTGCTCGCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 - chr3L 905869 5' + 412 76 2 70.55 AATTTATTATTTGGTTAGAATTTTACAAAATTGCTTGGAGAATTTTTTACTATTCGGTCATCTTAACGATATACCTATTAAATTATAAAACAAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATAC:1 + chr2R 13155891 5' - INE-1 558 1 63.08 AATCGAGTTTGAATTAGCTAAATAATAATTGCTTGTAAATTATAACAAATACCGGATTTCATCGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTT:1 + chr3L 24291916 5' + rover 6960 2 80.14 AAATAGAGTGGATGATAGATACGAGTGTATATGGCGGTGTGTGATGTGAATGGTTATTAATATAATACAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTGTGCGATGCACCATCGCTCGAATACATATTCT:1 - chr3R 20962343 5' + Doc2-element 138 1 66.92 ATAAATGTGAAAGGGGGGAAAAGCGTGGAAAAGTGTATGTAGGAGTACTGATCATGTTGGCCTGTACGTTAGAAATAGTGCAGGTAACACTTGCATTGGTGTTGCTGCTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGT:1 - chr2L 4176928 5' - jockey 495 1 77.24 GCGGAAAAATCCTTGAACAGTCAAGGACTATATATTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTC:1 - chr3R 15059596 5' - jockey 4920 1 68.66 AATGTGGAATGTGAATGTGGAGAATATAGTTGCCGGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr3R 4528470 5' + F-element 28 1 73.29 GGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chrX 12866461 5' - roo 8990 2 78.42 AAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr3L 14550974 5' + P-element 63 1 30.77 TTGTGAAATATTTTCCATCAGTGTCCGTACATATTTTAGATGCATTCTTCCTTGGAGGCAGTGCGTTTTCATGGACTTCAGCTAAGCAGAGCGTCGTCGCCATGAGCAGCACAGAAGCAGAGTACGTTGCTTTATCCACGGCTGCA:1 - chr2R 18028440 5' + Copia1_DM 3976 1 73.29 CTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr2R 5737135 5' + 1360 53 1 75.00 TGACTGTAAGTATGCAATGAAAAAGGAGACGCATTTTAATGCTTAAATATGTAGAACATTAGCTTGTTTTTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTC:1 - chrX 14768072 5' + flea 424 1 52.05 TTGCACAAATTTAACAATTTTTTTTTTT:1 + chr3R 17975916 5' + accord2 343 1 82.14 CAAAAGGCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2L 246093 5' - roo 9010 2 60.96 TAATTAAGATTAACATTAAAAACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCA:1 - chr3R 11750286 5' + Tabor 48 2 53.42 GAGGATGGCGACAGAAGCAACCTGTTGAGTCCCTTCATCCATCCACTCTCTCCCCCATTTCCCCGTTCACCCTTCCCCTTTCGCCAGCTGGAAAATTTTCAAAGTAGCCGGGGTAATAAATTACTATAGATAATA:1 + chr2R 8335080 5' - Tc3 287 1 62.22 AGTTCATTTCCATTCAAATTTAAAACGCAACCCAATGTACATATATGTATATAGTAACGTATTTGTGTGCTCCAAACTGCTCTCTTTGAATCTTTTCCTAATCTTAAGAAGTCAAGAGCGAGGCTCAGCCGAAATACAAATATTGT:1 - chrX 3663217 5' + 297 6796 2 78.08 CCAAAGAATTGAAAAATTTAACAACTTGTTGTCAGCTGCTCCTTAACTAGAATTCTTTGGTTTTAATCAAATTTATAATGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3L 18467303 5' - hobo 2922 1 69.60 ACCTAGGAGCACGATGTTTCTAGAGCTGCAAGACGACTACTGAAGGGGGAAGACGATACGGAGTAGATTACCCCTGAAGTAGATTTGGCGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTAT:1 - chr2R 558211 5' - copia 257 1 63.01 AGGAAAAGCAGCGATTGCAGTTGGAGAAAAGCAGGCAGGGGATTGGGAGTGGAGACGGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2L 4174063 5' - roo 346 2 58.90 TAGCATCATCGTCATTAGCGTGATCGGGTTCTTGGCCTAAAAATATTTTCTGCCTTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:2 + chr3R 9160625 5' + copia 15 2 76.03 TGGAAAGCAATAAAACAATTGGTTAGTCAAGAACAGGTCCCAAATCACCAGCGGAAAATGTTGCAGAACTTGCCAAACCGAAAAGGGTTACTTCTATTATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr2L 5202630 5' + 297 20 2 72.60 AAAGAAACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCGTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTAT:1 + chr3L 11257350 5' + 1360 3375 1 49.00 ATTCACAAGTTCAAATAAGCGATAATAAGTATTTATGGGCGGGGCAAGCAGATTCGGTTTCTTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAAT:1 - chr3L 13634312 5' - 297 344 2 57.53 AACAATTTTGATTCTATTTACACATTATTATTATTATTATTATGGCAAGAGTTTCGCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAC:1 + chr2R 18482411 5' - hopper 1353 1 60.69 TGCCATTTGTGCGAATGTTCACATTGAGAACTCTGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chrX 4785146 5' + roo 86 2 78.77 TCCATATTACCAAATGATCAGCTTCGGTTACCTTCACCGATATCCCGTCATTTTCAATATCGACATTCCCCATACAACAGTCAGTAGCACCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATC:1 - chr2L 22746572 5' + R1A1-element 4981 1 70.00 AATCGCAAAAACACACACATTCGTGCACAGATAAAATCTGTATCTGTTGCCTTGCTTGTATCTTTGTATCTTTAAATCTAAGCCCTCTAGCTTTTATCCTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGAGAGACGGACATGGC:1 + chr2L 18866679 5' - INE-1 120 1 54.29 TGCAATCATAGATATTTAAATTTCAAACACATATATATAGAAATTCGTACTATTTTTCTTCAGTGCATCAGTGTCTGCCGTTCCCCCTGGCACTATTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chrX 5858859 5' - hobo 2931 1 72.09 ACCCTGAAAACGATTTTTCAGCCGGATTGCATTTAATTCTATATTTCTGGTTCTGTTTCTGGTTTCTGGTTGAGTGTCCTTTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCA:1 - chr2L 1697401 5' + Tirant 169 2 54.79 AGCACAAACCTCCAGCCCAGTTCAGTCCAGTCCTTTCCTTTTCGGTTCCCTGCTTTGTTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chrX 17806040 5' + roo 64 2 62.33 GGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTTATATA:1 + chrX 16384013 5' - diver 147 2 64.38 GTGTACATGTGCTCAACATTAGCAGCAACATTTTTATGACATAATTTTTGTGTTGTTCACCAGCAGGGAACAACAACAAAAAAAAATGGAAAACGGCTGGCAAGGGGGCACCCCAAAAACAAAAAAAAAGAGAAAAAAA:1 + chrX 3088732 5' + gypsy7 5004 1 71.22 GGTGGTTTGGGTTTGGGGATGATTTCGCAATGCGTGAGTGGGCAGCCCCCGTTTCGCAGGCAAAAGTCGAGAGGGCGTTGTCATTTGTCGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGCA:1 - chr3R 18508367 5' + G2 2753 1 74.14 GACATATTCACATAATAAGCACAGCAAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACACAATGTCTTAAGCTAAGATGAATAGAATAATGACGTGATAACTATTTCTCCGATAATTTTAGCGTTGTTATTAGTCAACTGACGGGACCTTAGT:1 + chr3L 25008289 5' + 297 6944 2 76.03 CTTAAACTGAAACTTATAATATGTTCAGCATGTAACCATAGGATTTAAACTATGTATCATAAATGCAATCCTGCAAACCAAAAAGACAAGTACATCCTATCGACTTTGAGAAAGGACTAATCTTTTAAAAAAATTAAAAATGTTTT:1 + chrX 7295507 5' + HB 323 1 79.45 AAAAATGCTAAATCACTTTAGTTAACTCTTAATGGATTATACCCAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1 - chrX 12191630 5' + pogo 70 1 65.75 AATGGGCCAATTAAAAAGTTGTATTGCTGTTGTGAACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACACGTCACCCTTTATCTTTATTTAC:1 - chr2L 16089708 5' + 3S18 5801 2 60.27 TTTAAATTGAAATATGTAATTTCCATTTTATAAAGAGGAACCTAAACAAGAGAGAATACTATAGTCGACTATCAGATACCCCTTACTCGGCTAGTGGAAATGCGAACACAAAATTTTATCATTTTTCTGGGATATCGATAGATAC:1 - chr3L 23948248 5' - INE-1 498 1 68.97 CGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATAGGCGACATGAGAA:1 + chr3L 14553132 5' - roo 8997 2 73.85 GTTAACCGTTCCGTGGTGGCTTTGTAAATTTAGAATCGTTCCTTGCAGCACTTTCGGCAACTGATGGAGAGATAATGTATAATCTATTTATTTTGGATCCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTG:1 - chr3L 355791 5' - G5 4777 1 54.79 TACTTAATTTTAACACATATATGGATAGATCAACATATTAGCATTTTGATTTAAGTATGTTAATTAAAATGCAAAAGCCATTAGAATGTAGTATAATGCATTTTTGATATATCTGAAGCAAATAAAATCAAATAAAGCAAATTAAA:1 + chr3L 18321784 5' + TAHRE 34 1 67.81 ACATGCGCTTAATTTACAGAAACAGTTTTTGAGAAAATCCCTTTACAGAACAAGACTTGAAGGGATCCATTCAAAGGCACGAACCACAGTGTCAAATTCCAATCCGAGACATATTATGCGTGCTCCTATTTATTGTCAATGTG:1 + chrX 18137927 5' + micropia 5118 2 79.02 ATATACAGCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr2L 9668283 5' - 1360 3359 1 55.46 CAACGTCATTGTGTTTTATCATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTTCCCC:1 + chr3R 929330 5' - Max-element 8490 2 73.03 GAGGTCATTAAATGGTGTACTTCTTTCTCGGAATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCT:1 - chr3R 13349174 5' + BS 5012 1 71.92 GCCAGCAAAGGGGGCATGGTCGTTGCAGAATCGAGCCATGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATA:1 - chrX 8755108 5' + transib2 84 1 75.34 ACGGACTATGAAAACAGCAATGCCTTGTGACACTTTTGTGGGATTTGCGAATTACTCGAACGTGATGAAACTGAACAAGCACCGATACAGATACATATTCATTATTGCAGCCCATAAATAGAACATATTTATAGTTTGCCTACTTA:1 + chr3L 20945415 5' - rooA 26 2 69.18 ACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr3L 22400251 5' + 1360 52 1 52.05 AACAAAGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGATGGTCATTTTATCTTTAT:1 - chr2R 19553286 5' - mdg1 367 2 52.74 ATCGAGTACGTGGATTTTGCGTCGTTCTCCGATTATCAAAACAAAACAAAACAAAGCTAAATAAAACCGGAATAACGCTTCAAAAAAATCATTAAAAAAATATCTAAAAAAAAAGAAATTAAATAAAAAAAAAACAAAA:1 - chrX 5430048 5' + Doc 4701 2 63.31 GGCCAAAGTCGAAGTCTGAGGCTGTGCGTCAAATAAATATGTAAATTCTTTGACTTTTGTTTTCAATTACTTTTTTCCTCTGGATCCTCTACGCATATCTGTCTTTCGTTCGCTTGCTCCTTTTCCTTTTTCTTTTTGTTTTT:1 + chr3R 30078159 5' - Doc2-element 245 2 55.94 GTGCATCAGTGTCTGCCGTTCCCCCTGGCACTATTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chrX 5858923 5' - hobo 2921 1 51.95 TTTCGCAAAACGTTTTCTATGACACGCAAAATAATAATATATTCGCGACAGACTACTCCGCATCCTCATCCCCCTTCCCTCCCCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGC:1 - chr3R 13638461 5' + hobo 2653 1 71.79 ACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chr3R 4581844 5' + 297 6634 2 56.16 GATGATTCACATATATTTCAAGCATGATTCTTATCATAATCACATATTTCAATATCACACAGTACAAACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTA:1 - chrX 6707864 5' - hopper 1363 1 54.11 TGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCG:1 + chr2R 5617492 5' - invader1 3952 2 60.00 CATGAAACGAGAGCCATTTGGAGGAGCTGCTCTACTCTGGACATCGTGGCATGCAAATGAACCAGTCTGTTAGCATATCTCACACTGTGACTGTAGAATTCGTTGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTC:1 + chr3L 11745183 5' - G2 2793 1 50.78 AGTCTATAAATTCTGTCAGTATATTTTTATACCCATTACTCGTAGAGTAAAAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGATAGAGGGAAGAGTTTCTGACCATATAAGGTATATATATACTTGATCAGGGTCAATAGCCGAGTCGATCT:1 + chr2R 5296808 5' + INE-1 97 1 70.55 CATGATGTCCTTGTTGTTGCCGCTGCCTTTTGCTTTGATGGCCGCCACTCGGAATCCAAATCGGCATTGGAATCAGAATCATCATCATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGCA:1 + chr3R 28728464 5' + jockey 153 1 58.90 GTTTATTTTTTTTTGCTTATTTCTAAATAATGGAAACAAGGATTTGTTCCATCGGCTGGATATCTTCGATTCTAAGTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATT:1 - chr4 436922 5' + 3S18 5810 2 55.48 TTAATGTATTTTTTATGTATTATGTATTATTTTTTCAATAATAATATCATTGCACCTTGGCTACGGTGCAATGCCAATATGTCCTCCTTGTATGGGATCAATAGCCGTGTCGATCTAGCTATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCG:1 + chrX 7557943 5' + INE-1 127 1 66.44 AAATTAGTCCTTTGTTGGATTCAAAAATAGAGTCGTCGTTACATGGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - 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chr2L 17029701 5' - blood 7345 2 48.57 AAAAGTTGAGTTTTAAATTAAAATGTGAACCGAATGTAATAATTGGAATCATTGAGCTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr2L 10184382 5' + Doc 16 1 75.91 AATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:1 + chr2L 8956749 5' + pogo 76 1 69.86 CGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chr3R 9352064 5' + Tirant 32 2 66.27 AAGAGCCCTCTAGACTTGGAGCTTCTTGCGACTTTTCCTGACTGCTGGGTTTCCCCAATGCTGCGTGTGTGTCTCCGCATCTCTCTCTCGTTCCCTGTGTGTGTTAGTCAAGGGTGACCTGTGGAGCCTTCTGGGTGG:1 + chr3L 1170644 5' - BS3 1547 1 73.91 GTTCAAATATTGAAAATATTACAATTTAATGAAAATTAATTTTTAATTATCGAACTATATACATATTGAAAAAGCATATAGCACGGACTGACTGTTCGGGTTTTGGGTGGGTGAATTATTCAGACGTAACAATAGTATTCATTAGT:1 + chr2R 16944484 5' - copia 4815 1 54.11 AAATTAATGGAAAATTCCTGCAGGTTGCCACCGAGTTCAGCGAAACAGTGCGGCCAAGCCGGGGGCAAGTGAACAGAGAGAAACCAGTGTGCTGAAGGGGACAGTTCTAGAATAGGAGGAAAAGCTTGAG:1 - chr2R 10758716 5' - Gypsy12A_LTR 2017 1 66.92 ACGAAAGTACTGGCCAAGATTGCAAAAAAAAAAAGAACTCAGCTAGACCAAAGGAAATGGGAGGGATAGCAAACAGAAACCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATGCGAATAAGTG:1 + chr2R 19697504 5' - 1360 3226 1 53.19 AAACTCATTCAACCAAAACATACAGAAACCGCATCACACGGAAAGAAATGAAAGCTTATAAATACCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 - chr3L 13868735 5' - 412 7490 2 57.53 CAAAATGAAATGTCATTTCAAATACGTGATCTCGCACACATAGCCGCTTCCGAAAGCCGAGGATTCCAAAAGGCTATATATATATAAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 - chr3R 17495871 5' + Quasimodo 28 2 65.75 AACAAATCAATAAAAAAGTCAAGAGACTTCTATCTGACAACGAATAGTGCGTTGAACTAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAA:1 + chr3L 18030973 5' + invader4 59 2 55.48 AGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr2R 6632578 5' + P-element 25 1 50.00 CTCGTGCTCTTGGCAAACCGATCGCTGGGCATGCCAAATGATACTGATCCTTGGAGTTGGCCGGCGCTCAAAATGTTGACTCGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGGGCCTCAGCAAACCAAGCCCAACCAAAC:1 + chr3L 9804209 5' + G2 101 1 61.43 AACCATACCTTAGCAGCCGTTAATGCCAAGGCCTTTTGGAAAAACATCGAATGAGTTATTTTGCTAGTTATTTCATAGCTACGACTGGGATATTAAACGACAGGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACTTAAAT:1 + chrX 1061479 5' + 412 7070 2 69.86 AAATAAACCTCGTCTTTTAAAAACTTCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - 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blood 7320 1 68.66 AACTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chrX 10567850 5' + roo 8718 2 66.13 TTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTA:1 + chr2L 17550614 5' - Transib-N1_DM 442 1 79.17 TACAAGGAGATGTTAAACTTTGGAATGTAACGCTGGAAAAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2L 75995 5' + roo 8681 2 78.08 ACTCGAACCAGGAGAACTACTTTACCAATGATTACCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATACCTGTGACCCATAGG:1 - chr2L 19793310 5' - F-element 4269 1 74.48 ATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chr2L 17250704 5' + opus 7033 4 56.45 TGTCACGTGTGTTGCATGGGTTGGATTGCGTTGCCGGAATTACGTAAGGGTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTAT:1 - chr2R 5955026 5' - copia 5087 2 63.70 GACGGCCGCCAACAAGAAGCAAAAGTACGAGAAGATATTGGAGAAAAATATATAATCAATGAAACGTTTCATTTCACTTAAGAAAAGGTCTGGGGAAGTCTGTAAATTAAAAAAAAAAATAAAA:1 - chr2L 17554889 5' + F-element 4685 5 45.97 GCTGGCGGCAAATTTTAAAAAACAATATTTTGGTCCGCATTAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 - chr2R 22492112 5' + pogo 77 1 69.86 GTGGCAAAGAGTGTGCTGCACTTTCTTGGGCAACTAAACAAGCTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTCTA:1 + chr2L 15987935 5' - roo 403 1 78.46 ATTAAACCAAATATTTTCAATGAAAACCAATTTTTTTAGTAACACAATCGTGTGTAGAACGCATTAGGATGTACTTTCTAATTTAATTGCATTTCAAAAATGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chrX 13786814 5' + pogo 17 1 68.97 AACCGAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3L 17890738 5' + 412 74 2 67.59 ACTCACAGTGATAAGGGAAACGCTGTTAAGGCAATTCCACGAAGTGATTCCGTCATTTACCTCGCAGTTCAATTAGACAGAAGATTAACTTGGCGTAAGCACATTAAAACGAAAAAAACGAATTTGAAGCTGAAAGCCAGTAGGTT:1 - 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BS 5071 1 65.03 TAATCTGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAA:1 + chr2L 17550607 5' - Transib-N1_DM 447 1 76.71 CTCTGGGAAATGTTGCGGTTGCGGTAAGTGGCAGGAAAAGGATCAATCACTTCAGCTGGTCAACTTTGCTGGACATTTTCAACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATA:1 - chr3L 11400035 5' + Quasimodo 34 2 61.64 CGTTTGTGTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTT:1 - chr3R 15022119 5' + Tabor 6904 2 59.59 GTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTCGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGTCCATCCATATCCATATTATCCATATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAG:1 - chr3R 27772458 5' - invader4 287 2 55.00 AGTGAAGTGTATTTCGAAACCTTTATATAAAATATTTTAAGATTTTAAATATTACTATTAGTGTTACTAATACTATTTGATCAGCACATTTCCCTTCTCCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 20743930 5' - roo 9050 2 70.55 CTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3L 14553127 5' - roo 325 2 76.92 CATTTGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGA:1 + chr2R 4012523 5' + F-element 317 1 74.66 CTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCA:1 + chr3L 14062255 5' + Doc 100 1 78.08 CTTGCCAAAACAAACAACCCTCGTATTGTTTCGATGAATATCAAACATGTTTGAAGAGGATCACGATCCTTGTGTTTTAAACATGTTGTGCTCCTTTTGACGAGTCCAGCAAT:1 - chr2L 7591172 5' - R1A1-element 339 1 73.45 AGCAAGGAATCATGATGTATGTGTATGTGGTGGATATATGGTTGTCAGTACTTAACCATTCATGTAAACAAGTCCCAAAGCCTAAAGAGTTTTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTC:1 - chr3R 10821359 5' + 17.6 230 2 60.50 GAGGACAACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACAC:1 + chr3L 22168801 5' + accord 191 2 83.67 GCTTCCTTTGCTGCGGTCCACATAAAATGCATAAATTATACAGCGTTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATA:1 - chr3R 27822278 5' + I-element 75 1 69.18 CAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGG:1 - chr2L 21403531 5' + G5 4426 1 68.93 TAACAGCTCCCATGTGATTGTGTGTACGTGTGTAATTTTCCAGACCGTTGTCATTGCCAATTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr2R 6632660 5' - P-element 2855 1 55.46 ACTTAATTTTAACACATATATGGATAGATCAACATATTAGCATTTTGATTTAAGTATGTTAATTAAAATGCAAAAGCCATTAGAATGTAGTATAATGCATTTTTGATATATCTGAAGCAAATAAAATCAAATAAAGCAAATTAAAT:1 + chr3L 18321785 5' + TAHRE 35 1 67.12 AGACGTCATGGGGCCAGCTGGTCTCGATGTGGGCATGAAAGAATGACTGAATATGAATATAAATAGAATACAAAACGAAAAATGGGTTTCAACTACAGTTATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAG:1 - chr3R 2474408 5' + Juan 3993 1 69.86 TCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3L 13563380 5' - roo 324 2 76.03 TTAATGCGTTTTAAACGCTGTTTAATTCGATAATCATCTTAGAGCCGACCTTGCGACAAAAAAGAAAGAAAACATAATGAACTGCAGTCCATGGTACGAATTAATTAATACGAATACCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAA:1 + chrX 22848409 5' + I-element 4880 1 76.55 GTGTGAAAACCGTAGGCCCTTTTTAAAGTGCCATACCCCGGACTTTTTCACTGTTTTAGATTTTCGCACAGCGACATGAGGAGGATAATGGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3L 16562980 5' + roo 8673 2 76.00 AATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCTATCACAAACATTTGCG:1 + chr2L 3890155 5' + jockey 79 1 70.15 AACGACCAGCAACGCCAGCCCTTTCACAGTGAAAATCAGTGAAGCAAACTTCCCGTCTCTTCCCATTCGAGCAGATAAAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACC:1 + chr3R 13977255 5' + I-element 4887 1 66.94 ATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCA:1 + chr2L 23299989 5' + invader4 369 1 71.93 ACTGAACAAACATGTGGAGGGAAAAGAAAACAGTGGGAGGTGGGAATGGAGATGCTTAAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 + chr3R 25880255 5' - P-element 2825 1 42.76 GTCGTATTCGTCTGAAAATTTTTGAATCACATCACAACTAAAATAGATTAATACTTGTGCTACATACATACATATTTAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAACCTTCTCTTGC:1 + chr2R 6157748 5' + Ivk 447 1 51.03 ATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAGATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 + chr3R 23639148 5' + pogo 65 1 62.07 CTGCTGCATATGCTGAGTGTCCGCCTGTGTGTGTGCACGAGTGTGTGCGTGTGTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chr3L 17175210 5' - 412 443 2 55.47 GCAAATTGCTTCCTCCTCTTCGGACGATATCGATAGATGCCCTGTAGCCTTTACCAACACTGAGCTATCGATGGGCGACGTGTGATAGGAAACTAGTTCATTTTATGGCACTCCCAGTAGTTCAGTAATGGGTATCTGATAGTCGG:1 + chr3L 5662204 5' + INE-1 551 1 65.75 AGAGCAATAAATTGACAAAATGTTCCAAAGAAACTTAAATTGGTGGAATAATTTGAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATT:1 + chr2R 5917777 5' + I-element 5071 1 62.33 GGGTTAGACTATGGCGCTGCCTTCAGTCCTTGGAGTCCTCCGATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATA:1 + chr2L 22747279 5' + transib2 80 1 72.60 ATGGAAAAAAGATGGACAAAGTTTCTACCATGAGAAAAAAAAATTCAACAAAAGTTAAAATGGAGAAAAAAGAAACAGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 + chr4 1219136 5' - 1360 3348 1 57.53 ACAAGACCAAATTAGACAAATTAAATAATTGTCAGTTCATTCAGAACAAGAATAAGATGATTACTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAG:1 + chr3R 12593020 5' - flea 4959 2 58.22 CTGAGCGCACGCAAAAATAAGCCCAAACTTGCCATGAAAATGGTCGCCAAGAAGGCCACGCAACACACATAAGTGAGGGGATATCCTGAATCAACCATTATTTCATACTCTCAAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:1 + chr2L 4106234 5' + jockey 4769 1 78.77 ATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACATTTCGCTTCTTCTTTGTTATATGTGTTTGTTATGTATTGTATTATTATTGTAAACTAGAAAAAGCTAACTATAGTAAGCCGGCGGGCCCAAATGGGCAG:1 - chr3R 19450042 5' + X-element 4641 1 59.59 AAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAA:1 + chr3R 7035224 5' - roo 9028 1 55.48 ATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGA:1 + chr2R 5542365 5' - 1731 4544 1 72.60 CGCCGCGTCTTATTTCAAAAATATTTTATGCCGGCCAAAAAGGCCAATACAAATACACACGCAAAATACAGCAGAAAAACGACTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr3R 10266050 5' - 1360 3370 1 69.53 GACTACTGAAGGGGGAAGACGATACGGAGTAGATTACCCCTGAAGTAGATTTGGCGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:2 - chr2R 558177 5' - copia 223 1 60.96 CTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTGGGTG:1 + chrX 21772485 5' - gypsy3 6528 2 68.50 AAGCCAAGAGAAAGAGATAGTCACAGCTGGTTTTAACCTACTTCATAATTTTGGATATGGAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGGTTCTGCTACTCGAAGAG:1 - chrX 7620883 5' + blood 287 2 53.73 ATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTC:1 + chr3L 24152426 5' + HMS-Beagle2 6914 2 58.78 ATAGTGATACTCTTCATTACTCCATTACGAACCACCAGGCGTATGCCATTGCTGACCATTCAACTCTAGGAACAAACGCTTTTCGTCCGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 + chr2R 558056 5' + copia 35 2 61.64 GAGTATTACAGTTTTGGGATAATCCGGTTTTTATCTCTGTTTTCTTAAAATATCAAATCGATCAATTGTACGGGACTTGATGATTGTCAAATTAAATAAGTGTGGTGTAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 - chr3R 26191754 5' - hobo 2926 1 72.60 GTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr2L 17250720 5' + opus 7165 4 62.20 TAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTTATTCAATTTCTTT:1 - chr2L 1558694 5' - 412 7482 2 72.73 GCTCTGCGCTGCCAACGAAGCCGGAAAAATGTAGCTGTGGAAGCCCCTCACCCGGATGAATAGGATAGTGTTATCAGTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTAT:1 - chr2R 5848945 5' - Stalker 36 4 57.66 TTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTA:1 + chr3R 15022031 5' - Tabor 7254 2 63.01 GACAAGGAGCAAAAAGAAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTGACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCT:1 - chr2R 6526627 5' - jockey2 3344 1 68.49 AGTGGTGGCAAAAAACTAATCAATCATCCGCAGATTATCAAGATTTAATCAAACCACCAACTGCGACGTCGAATTACATACGACTACGCTGCTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAG:1 - chr3R 5278830 5' - F-element 4535 1 67.63 CAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATAAGATTCTACCCATGTTGTCACAAATCGCAAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGTATTGACATTTTTAAATAAATTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGAT:1 - chrX 392290 5' + INE-1 300 1 64.38 ACCGCAGCGCTGTTGGTCATTTGCCAAAGTTTTGCAAGGTACTTTCGGTGCCCTTCAGGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGATGATATAACATAGTGATTATTA:1 - chr3R 6525352 5' - jockey 4839 1 61.38 CAAGTGGGTCTTGATTTATGGGATTTGCAAAAGGACAAATGTATACGTCTGATCATTTCTTTGGTATAACAATTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 5150396 5' - roo 396 1 69.91 GCAAATTCGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGCGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chr2L 2276801 5' + F-element 33 1 56.52 CCCGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCACTTTCT:1 - chr3L 17890805 5' - 412 431 2 68.50 TTTTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr2L 3890143 5' + jockey 79 1 65.75 GATCAGCTCGATCAATGTTTTTGTGCTAAATAAATCAAAATAAATTGAAATGTACAAGAGGCACAAGTTTTTCACACATAAGTGCTGAAAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTA:1 + chrX 14166349 5' - roo 309 2 56.85 ATGTAGTATGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCACGCGAAGAACGCC:1 - chr2R 2650889 5' + gypsy 7068 2 73.97 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGAGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCG:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 5408 2 53.85 AAGTCGGATTGGCTGGCTAATTTGGGTTGTATTCGATATGTCGGATATGCAAAAGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATT:1 - chr2L 12079701 5' - mdg3 5462 2 51.72 GGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGT:1 + chr3L 27356093 5' - Tc3 1624 1 73.97 CAGCAACTTTCCACTTGGCATTTAACGAGCATGTTAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 12867244 5' - roo 396 1 63.38 ACGATAAGCAGCCGAAAGGATTGCCACAGCAGTTTCCCAAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGAGTAAC:1 - chr2L 12340849 5' + diver 36 2 58.09 GTATACGGTAGTTGCAGAGCAAAATACGAGGCCTGCGGTAGTTGAACGCTACTGCCGCACTGCTGATCACCATCCTGAGTAGTGGTACTGTAGGTGATTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:1 + chr3L 15561402 5' - I-element 5321 1 67.12 CACCCACGTAATGGACTTGTTCCAATGCCGTCGTCCGAAAGACACCACTATCGACTGGGATACCCTGATCCAGATGAGAGCCGTGCTCTTATACTGCGCAGATGGCATACAGTAT:1 + chr3R 16474167 5' - 17.6 7062 2 78.26 AGCTATCCATATTGACTATAACTAACTGCTATTGCTATTTACGATACGATAGTTACGTGGTACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3L 13868584 5' + 412 7069 2 72.60 ATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGATTGACATTAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 12138933 5' - roo 9053 2 57.69 ACTGTGTGATAAGTATCTGAACAAAATGCAAAGCTGCCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chrX 7786596 5' - hobo 2916 1 55.81 ATTTTTGACGTAATTGATCACACCTTTGCTGCACTCATTATAGCTACCACAGCTGTCGCGATTCTCGCTATCCTGGAGCACCGGCCCAGCATGCGTGAGTTACGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGACGATATGATGTGT:1 + chr2L 22015869 5' - Tirant 8478 2 65.07 CATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 11609235 5' - roo 8987 2 76.03 AATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTACAGACTCA:1 + chr2L 4173957 5' + roo 15 2 66.36 TATTCGTAAAAACATTTCGACATTTAGAAAATGTTTTCTTTTACACGTATAACAAATAAATTAAATAAATAGTTACGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 - chr2L 7825308 5' + I-element 34 1 58.52 GCACATATTTTTCTGCAACTTATAAACTGACAGCCCATAACTGTACACTGTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATGTGATAATTAAAGAAGATTATTCA:1 + chr3L 23118318 5' - Cr1a 77 1 64.38 CAGCTGGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATT:1 - chr2L 22224609 5' - Rt1c 5403 1 56.16 TAGTGGAGCTGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 - chr3R 22100588 5' - 412 412 2 71.92 ATTTCGTAATTTTGTAGTTGTGTAAAAAAAACGTAAAACGAACAAAATGACTATATTTATAATAATTTCACATAAATCCACACATCTTATACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTA:1 - chr2L 21951256 5' - Burdock 6365 2 66.44 GGCTATTATAGCAATAAGAAATTATTAGTTCAATTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCT:1 + chr3L 16787110 5' + Chimpo 48 1 92.23 CCAGGTCATTGTACGGCTGATCCTCGCTGGCTAAAACATGACTAGCTGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGCAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGCT:1 + chr2R 7741473 5' + accord 6932 2 65.52 GAAGGGATTTTTGTATTTTGGTATTATGAACTGAACCAGAGCAAATTTGCACGGCACACACAAAACACGGCAAACAGAGCATTCTAGTTTAATGTGTGCCGAGTTTCCAGCGAAGGGATTTTTGTATTTTGGTATTATGAACTGAA:1 + chr3R 31663389 5' - invader2 4889 2 63.70 ATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1 + chr2L 13792599 5' + F-element 91 1 75.54 AGAAAAATAGATTGGTATCGAATCGCTTGGAATTTGAATAATTTTTCCCATATTTTAACTTTTTATCAAGGCCATGAAAACCAGAATCACTTGAATGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chrX 957926 5' + roo 8689 2 67.12 AATTGTTTTTTTTTTTATTAATTTACCATTTTAAATTGGTGTCATTTTATGAGTTTGGGTGTATGGATGATCCCGGTGCCTTATCAGCGATTGATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCACTTTGTACTTGATTTGGTTTGTT:1 - chr4 193299 5' + accord2 7244 1 84.25 GCACAACGCACACAACGGTAATCAGTGACTGCTCAGAGAGAGAAAGTAACGTCTGTTTGAAACGAGCGCGCCGTCGCGACTGTCTCAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chrX 8891723 5' - P-element 2867 1 68.46 CCCTTAAGAAGCCACCCCTCTTCATTTGTGGCGGTGGAAAATGTGAAAATGTTTTATGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGGCCTTTCGCCGGAGAC:1 - chr2L 4346960 5' - F-element 4518 1 59.05 ACCCATAAAAACTGTGATTTTTTATTTTTTACTAAGTGTCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr2R 9873643 5' + roo 83 2 81.51 ACACAGGAGACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTAT:1 + chr2R 22723002 5' + 3S18 5797 2 59.85 GTATTTACCTTTAAACTGGACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:2 - 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chr2L 3659213 5' - 412 477 2 74.66 TAAATGCAGGCTGAATTCAATATGGGTTTGACATTATTTGCTTCTAGCTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGGTCGGCGCGACCAACA:1 + chr2L 8959850 5' + Ivk 5089 1 73.97 AGTTACATTCATCAGCGCACTTCTTACACATGTGCAAAAAAAACTGTGGCCCAACTGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCCGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1 - chrX 2578092 5' - hopper 1352 1 59.03 CCATAGAAATCCTGATGTCCGATGAACTTAATGTGCTTTACGCAAATGCCAGATACCAAGCTGTCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGA:1 + chr3L 13833190 5' - hopper 271 1 56.85 ATAGCTGAATTTATGAATATTTAGCCAAAGCTCTACATAGACCCGCATTACGAGCATTTTCGCTTTCACCTCACGCCTTCTGCGGCAGACAGAGCCCTTAAGTATATCTGCAAAGACATTACATCCATCTCT:1 + chr3R 28628078 5' + Ivk 419 1 64.39 TTACACAGGTGGCGGTAATCTACACACATTCAATCACTACCGTTTGGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAA:1 - chr3R 4562408 5' - copia 5050 2 69.86 GAAAGTCCCAAGGGAAATGGAGAAAGTGGGCGGGTGTATGGTGCACTGTCCACCCAGCATTTACCAGCTATTTCAAATATTTCCTACAAAAATGTCAACATATGCGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - 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chr3L 17207828 5' + hobo 42 1 61.82 GGGCGATATTGGAGGAGAGATGTTTTTGATAAAGGGGGTTTTTTAATTTTGAGGGCTAAGTTTTCGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCG:1 + chr2L 7241843 5' - Doc2-element 326 1 54.55 TGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAA:1 - chrX 1103702 5' - pogo 2026 1 71.23 ATTCCATATGCTGTGACAACTGAGTGAATAAGTATTAGGAAGGGCCAAAAGAAGAAGCCAGTCGATTGGACGAGGCCCGTTCGACTTTACTTCTTGAGTGTACTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr3L 22900225 5' - 412 7525 2 69.86 AAGTTGATAATACGGTCTAAGGATCAAAGTATTGAGTTTTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chr3L 4115262 5' + 1360 21 1 66.44 ATTGGAAAGAGCGCGGCTTGGGGGATGTGAAGATCCTGCGCCATAGGCAGACCAAAAAGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTCCTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGC:1 + chr3R 25256434 5' - accord 492 2 54.62 GAATACCAAGGCAACACCCACGACCCCAAAGAAGAAGAACATCACTGGGAAGAACATCTGCAGAGCACACCGAGGTTTTTGTTTTAGTTCGTAGGCATAATCCCAGCAGAGTTTATGAATCGTGCATGCCACCTACTGACGGTAGT:1 - 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chr2L 22016017 5' + Tirant 32 2 60.16 AACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr3L 19349969 5' + jockey 80 1 74.17 CCGAGTTCCGTGAAATGTTGACCGTTCATTTTGAGCGCTTTTACTTTTGACTGGATAGCGAGGGTTCGTAATGAGTTCTATGGATTTTAGACTGGCAGTTAAATTGACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 21001944 5' + 412 16 2 74.66 CGCCACTATATAATTTTTCTAATCATCCTGTGATAGAAATGTTGTACTTATTATTATTTCAAAACTCATTTCAGTGATTTAAAAGCATTTAACAGAGAGATGTACATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGC:1 - chrX 22901631 5' + Idefix 11 2 63.01 AAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr3L 17707837 5' + Doc 55 1 66.36 TCTAATCATTTTCGAATAAATGCGCGCCAATGCAAGAGGTTGCTGCCGTGCAGCATCAGCAGCAGCAACAGCAACTCCAGTCGCCCCAGCAGCAACAGCAGCAGC:1 + chr3L 17964685 5' + TART-B 152 3 72.38 TATGAGTGCCTCAACACGTACTGGATTAATTCCCACGCCCAAGAGGCATATCAAGTATTTAAAAAAGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3L 15612808 5' - roo 403 1 70.53 ATGAAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 + chr3L 14550970 5' + P-element 62 1 33.08 ACGAAAGAAATTTATTATTTGGTTAGAATTTTACAAAATTGCTTGGAGAATTTTTTACTATTCGGTCATCTTAACGATATACCTATTAAATTATAAAACAAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACT:1 + chr2R 13155883 5' - INE-1 550 1 61.64 GTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATT:1 + chr3L 27356050 5' - Tc3 1667 1 60.96 ATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGA:1 + chr2L 12349773 5' + F-element 106 1 65.22 ATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCACCAACCACCTCCGCCTATGAAGC:1 + chr3L 25482879 5' + accord 32 2 57.26 GCAATTAAATGTATATCCATTTTCTGTGCTGAGCAGAAACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACCGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACCTTTGCCCTTCACCTTAGAAGTT:1 + chr3L 16942495 5' + 1360 220 1 73.97 ATTAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCC:1 + chr2R 4312952 5' + gypsy 67 2 61.64 CTGTGGGTCACACATAGATTTTATGCAGTTTTGGTTTAAATGTTTTTAAACATTTAGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 - chr2R 8396003 5' + pogo 57 1 63.12 GTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAA:1 - chrX 1103722 5' - pogo 2066 1 55.56 CATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAA:1 - chr3L 23986602 5' - opus 422 2 73.97 GTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chrX 12866476 5' - roo 335 2 68.97 GGTGTTGAAATTGAAATATGGTGAATTGTGAATTGCGAATTGTGAACGCTATTGGCGTGCGGTTATTGTGAATTTATGTGCACATTTAGCACAATTAAAAATTAACACACACACACACACA:1 - chr3L 16873769 5' + accord 180 2 65.29 CGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCATGCTCCGCACAAA:1 - chr2L 2276769 5' + F-element 39 1 58.43 AGTGCATGATTCAGAGTGTAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 + chr2L 12414888 5' + pogo 62 1 61.64 AATGCTATACACATTAAACAAACATAATAATACTAATGGTAGCCAACAAGTGCACATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr3R 19859528 5' - opus 484 2 37.93 ATACCTTAAGGGCGTTTTCTTTTAATGTTTTTACTGTTATGGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGGCAAAAGAAGACTCA:1 - chr3L 5538080 5' + jockey 4733 1 66.67 CACTCTAACCTTCTAACCGCCCAAACCGCATCTGTATGTATATGTATATTAATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 + chr2R 641806 5' - opus 489 2 79.31 CAGGGCCAAAACCAAAAAAAAAAATGACCAGGCAGTTGTCCTCGACATAGACACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCAGCGCAGTC:1 + chr3R 22007285 5' + blood 7228 2 53.47 AGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGTC:1 + chrX 1103580 5' + pogo 22 1 67.63 GGAAAAATTTTGAAAAAGTTTCACCATTTGTGATTAAAAAAGTCATAGACTTCACATGCGGAGCTAAGAGGTTTCTTGGCAAAAAACTAGGCCGGGAACATTATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACA:1 + chr2R 4638548 5' - 1731 295 1 71.03 ATGTGAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTG:1 - chr3L 25482982 5' - accord 485 2 60.61 CCAGACTCAACTGATTATATATGCACCAATGCAATGCATACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1 - chrX 17732056 5' + pogo 73 1 73.57 CTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTC:1 - chr2R 4261962 5' - invader4 2977 2 58.62 ACGCGTGCGCACGCAAATCCCCAGTTCCCCAACTGGATACCCCTCTTTATACTCCACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2L 16458587 5' + roo 19 2 60.00 ACATGATCGCACATGTCACCTTTATTAAAAAAATGTATGTGCAAACTTATCTAGAAGTCACGTAGAAACGATTATAAAGCCTTATGGAAGGATATTTCAATAAATGATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAAAC:1 - chr3R 4487635 5' + Tc1-2 1310 1 77.70 ATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTTTGTGTGCTGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr2L 17136165 5' + hobo 57 1 63.87 GGCGATTAGCCAAATCCAAGTATCAAGTATATAAATTTACAACTACAACTGGGGTGAGTGGGTTTTGTATGAATGCAATAATAGATGTAGGCTTTGACTATAGCAATTTTTTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 - chr2R 17735270 5' - I-element 5337 1 63.01 CCCCGAGAACTCGGCATTGATGGAGCGTATTGAATTATACATAACTACAAGCGTGCACTGCAAGAATATAGATTTAATAAGATATAGATAGAATAAAGTACTTTGAGGTGAAGGGCACATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCA:1 - chr3L 17134290 5' - 1360 193 1 70.55 GCCACTTGCCTCCGTACACATTCCCATAACATCCTCCTGCTCTCCACAGTTATTAACTATTCATAACTTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACA:1 - chr2L 2272565 5' + copia 4922 2 56.16 CGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAA:2 + chr3L 27415239 5' - transib2 2738 1 77.40 ACTCAGTTTTTGGGATTGACCTAGTCAGCCATAATATATGGTATAGCCTGTTAAGATATGCAACATTTTGGCTATTGATTTTTTTGTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 - chr3R 22249230 5' - jockey 4961 1 54.11 CTGTGCACAGATCTGGGGAAAAGTGTCTTTTCCGTGAGAGGGGAAAACGCCGGCCGCCCATGGTAACTTGACTTTGATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATT:1 + chrX 18933500 5' + FB 47 1 53.42 GTGTTGTTTTTGATTCAGTTTTGCATATAGCTAGTTGAAATTTTTCTTTTTTCCACGTAAGAACGTCTTCAACCCTAACCAAGACGAAATTTTATAATATTTTCCTCCACATTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATAAATCCA:1 + chrX 8810371 5' - BS 5078 1 73.29 ACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - chr3L 12224702 5' + 412 7130 2 68.49 CAAAAACTTTTCGGCATGCTGCACTTTTTAAATGGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACT:1 + chr3R 17656398 5' - mdg3 171 2 72.59 AACCACTGGATTTGGCAAAAGCAAAATTAAATTCGATAAATTTGAAGTCACAAGACAAATGGATATACGTCCTTTATTGTTTGATGCTCAGCTTAAGATTGAAAATTAAATGTAAGTGAAATTGAGGAGAAGCCTCTG:1 - chr2R 1113962 5' - 17.6 312 2 52.17 ACTGTCGGCTTCTATGTTAAGGATATAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGAATTCTGAGTGTC:1 - chrX 3099142 5' - P-element 2810 1 22.05 TACATATGAGAAATAGACAAAATGTATGTATCCTAAGACATTTGTTACTTTATTGTTTTTAGAAAGCGCGTACGTATGTATAAATTTGCAATTTTTATTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3L 20713098 5' + roo 24 2 69.86 GTGTTTGTTACCCAGCAGGCGGTCACTTCTTAACCATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCTGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr2L 16458660 5' - roo 323 2 76.03 ACTGCATCGGCATCAACCATTCTTTGGGTCCCAATCCATAGATGCACTGGAAGTATTTAGTTATCTTCGCATATAACTAATATATTTTTATAGTTCAATACTTAGATTGGATGTTACTTATTTAATTTGCTTTATTTGATTTTATT:1 - chr3L 18322053 5' - TAHRE 30 1 55.48 GTCATAATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAG:1 + chr2R 13644417 5' - Burdock 6327 2 64.38 GGAAAAAAATGTGCCAGCCGCATACATAATACACGTATCTTGGTGTCTGGGACAGCTGGGCTTCCTTTGCTGCGGTCCACATAAAATGCATAAATTATACAGCGTTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chr3R 27822337 5' + I-element 10 1 77.86 AAAGATTCCCACAAATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:2 - chr2R 5237932 5' + Doc 46 1 58.90 TATCTTCAATCAATTTTTGTACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTCCCATTATTTCAA:1 + chr3R 4581824 5' + 297 25 2 65.94 GGGGAATCAATCTAAAATACAGTTGTTACCATTACAAATATCAACTGCTTTATAAATTTAACAACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chrX 13531709 5' + roo 56 2 56.85 GGTGTGGTATACATTTTCCATAGTTAATCCAGCACTTTGTAAGCTTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCAC:1 + chrX 11502253 5' - I-element 5026 1 69.18 TAATCGCATTCAAATTGCATATCAAATTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTG:1 + chr2R 8158774 5' + Juan 84 1 66.21 TGCTGCACACTGTGCAACAGCGTTGAAAACAATAAATTAGCAACTAAAAAAAAAAATTACCCAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chr2L 3465992 5' - P-element 2844 1 50.77 TGTTTAGGTATATGTCAAAATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCG:1 - chr3L 23940560 5' - Cr1a 4403 1 73.97 CTCTTAGTGCGTTTTTGCTGCCTTACTTTTTCGAGCCGCTTTCGAAATTAAGATTAATAGTTGCGACGCCAGAACCTAATTACCACTTCTTCGTCTGGAAGAGACTAAACTAGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGTCCCTAGCT:1 - chr4 729207 5' + diver2 262 2 52.05 GTGGCGTAATGTTGTTGAGCAAATGGGTTCTACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr3R 24279354 5' + roo 90 2 82.88 AAAACATTGAGTTAGTAATTGATTGCTATAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAACT:1 + chrX 9660961 5' + HMS-Beagle2 489 1 85.45 TAATTAAATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATT:1 + chr3R 19589883 5' + BS 5026 1 60.96 AATATCATTTTTGTACTAATAATGATTCATACTAGTAAAAGAAAACAAACAAATGTAGGATACTGATTAGGTCTTTACCTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 15612685 5' + roo 43 2 56.85 TATTGGGTCTCGAGTGCGGTTAGTGCTGGTGGCTTTGCTGTCCTTTTTGCATTTCAGAGCGGGGCTTTAAAGTTCATGGTTGATTAACTTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr3R 24476247 5' - 412 480 2 71.20 AAATTGTGTGATTCAATTAACCCTTGTTGATTAATGCGGGCTGAAATGATACTCGAATGATAAATAATTTGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 + chr2L 8168903 5' + FB 51 1 54.11 GCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 6388782 5' + jockey 36 1 57.78 GCAGCTTCGTGCTTAAAAACCAGGTCGTCGTTGACTGTCGGCTTCTATGTTAAGGATATAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chrX 3099175 5' - P-element 2862 1 55.56 CAATAGCTATGTAATTTACTAACGACCATCATGAAAGAAATATAAATTGATAAATTAGGTGTAAAAAATAAGTGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chr2L 18193135 5' - mdg1 7415 2 50.00 GGTTGATATATGCAATTTCCTCAGTGTATATGCAGCTTTGCTCTTTTTGGGCCTTCTTCGGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 + chrX 14951106 5' + P-element 62 1 43.15 GATTTTGCATCCGCCTTCAGCGGTTCGAATGACACTTAATGGCTGACAATTACAAAGTCAAACAATAAATGCGAATTCAGTGTAAATGTTATAAATAACTAAAGTAACCGAGCAAAGTACGACATAAAAATAATAATAATAATAA:1 + chr3R 27376318 5' + mdg1 7067 15 64.14 GAGAGTGGAAGTTAAGAACCAAATGCTTTTGGCTTTTAAGGGTGTTGGCTTTTAATGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATA:1 - chr3R 28627688 5' + copia 4936 2 65.07 TATGGTCTTGAATGTATCAAATAGGATACATACAATATTAAGGATAAGCTCTCACCTTCATGTAAAAGTAAGTTGTTTTACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGGATACTAGAATCGTTGAAAAGTATGTAACAGTCAGAAGGAAG:1 - chr2L 21691061 5' + INE-1 28 1 68.49 GCCGGATTTTTAATGAAACACAATAATGTTACTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGG:1 + chr3L 11745298 5' - G2 2763 1 71.43 TATTGCCAAGTCTCCGTTTGTTTACAGTCTATTTAAGTGGGGTGTATATATTTTTCACTGCGGCACTCTCCGGTCGCTATCTGATTCTCAATTACTTGATGTTATTGTTATAAGCGTCGAGATCTCAGGAACTATAATATCTAGAA:1 + chr4 268280 5' + INE-1 154 1 70.55 GTAATGTTCAGATACAATATATGCAAGCAACTACTGGTTAAATATTTATGATTATTAAATCAAAATTTAATCTTCTTGGTTCCAATTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGATTTGGTGGCTAAGTAGTTGATTTGTGTGT:1 + chrX 22803752 5' - Porto1 4452 1 52.74 GGTCTCATGTCAGGAATAGATCTTTAATCGCATTCAAATTGCATATCAAATTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATT:2 + chr2R 8158750 5' + Juan 61 1 50.00 GAGCTGTACGAAGCTGTTTTGAGGTTTCCCCCTTCGAATATGTGTGTGTGTTTGATTTTTATTACGCTGACAAATGTAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTCTTGTCCGCTTCTTAACCGT:1 + chr3R 5922698 5' + Circe 49 2 54.29 ATTTTATTCCTTCCCTGTACATCTTAGCATACCAACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCA:1 - chr3R 26246913 5' - 1731 264 2 49.66 ATACTCCATCCAGGTACAGAAGCAAACAAGAATTAAACGACCCTTAAAAGCGTGCTACGTTTTTTTTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3R 6515273 5' + jockey 30 1 69.86 GTTTATTTCTTTGCTTGATCTTTTATTTCTGCTCGGGTCTTATACACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr2R 641969 5' + opus 153 4 53.33 ATGAAACACCATTTTAATTGCATTTGCCAGCGGAGAGATTAACTTTTGGGCTCGGATTAAGAAGGTCCGAAAAAAATGAGTACTGTCCGAGAAGCACTTTATTACAAATATGTATAATAAATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCA:1 - chr2R 13712431 5' + accord2 7545 2 64.83 ACAAAACCATTAAAGAAATTTCATAAAAACTTTAAAGGCAAGTCCCATTTTGATGGATAGCGCGTAGACGTCAAGAAATCAATTTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTAT:1 + chr3R 15924550 5' - Quasimodo 7359 2 75.81 CAAGCTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2L 15987973 5' - roo 9014 2 59.72 AATTTTGTTAGTTTTGTAAATTTCTATCGATTTGACAAAAACGGTTGTACGGTTGGTACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTTATAGAGAGAGAGTCTGCCGGGCTGGGGG:2 - chr2R 3170922 5' + baggins 242 1 68.29 CAAACGCTATCGAAAACGGACGACGAGGACAACAAGGACAGCCTCAAAGGTGACGATGATCAGTCCGATAGTAGTAAGTAAAGCACATATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr3R 6711555 5' - pogo 2073 1 64.58 GAGCGAATTACCCGAGTAACTCCACATTGCAGCGAGATATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:1 - chr2R 17121666 5' + blood 7094 2 73.97 GCTGCACGAAGTGATTCTTCGTAAGTCTTTTAAGTCTTGGATTCGGCATTTGATTCACGACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr2L 9485722 5' + 412 23 2 59.59 AACTAAATATTACATTTTTATTTCAAACCATAGACTCAATTATTTGTTGTATCTATAAAAGAGTGATTATTGTATATTTCGTCCGAAATAAAGTTATTATTTGTTATACCCGTTACTTGTAGAGTATGAACGTCGATATCTCAGGA:1 + chr3L 18072335 5' + INE-1 138 1 21.92 GCAAGGGTGCCTCACCACCAATCACACCACACACCATACACCATACACCACAAGAGCCAACACCGTCGCACCACCGACCAAATAAAAATTATACGACACACATAACCTACCAACACTACCTAAATCCAAATTCAATACCAACTTG:1 - chr3R 6112741 5' + I-element 4990 1 55.17 GGTGCCATTGAACCAGCAAAAGTCGACCCTTTTGTGAGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAC:1 + chr3R 15702923 5' - copia 5041 2 75.86 ATGACAACGTCGTAGATCGATATTGGGCTGCTACTTAGAACCGTTTCATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGAC:1 - chr2R 15387486 5' - mdg3 176 2 58.04 GTTTCTGGGCCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAAGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGG:1 - chr2L 22640199 5' - invader4 241 2 71.23 GAAACAATAGAATATGTTTAAAAAGAGAGTTTAATGCAATATAGATCAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGAC:1 + chr3R 30295097 5' - Quasimodo 7311 2 65.93 TTGTGTGTGAAATCAATTTGTCGAAATACGAGCTGTAAGAGTGCCGAGTGCGGACAGATATATACTCGTAGATGATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTCCAAAACTAGACTAACTTAGATAGAATAGCATTA:1 - chrX 4186740 5' - I-element 5308 1 54.79 AGTTTTCGGAGGTTTTGGAAAACCTAGATATTTTAGGGCAATATAATATATAAAGAGAATATATAATATATATCAGTCACCGACTAGCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAG:1 - chr3L 22408750 5' + Ivk 36 1 51.54 AAACAAATAATCAAAACTTTTTACTACGTTTTGTGCAGCTTGTGGACAATAGTCTTCGAAAAAATTTTAAAATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGCATAGACGTTCATGTCCAGAACGACTCGCCTATTGACACTGATCAAGAATATA:1 - chr4 670272 5' - INE-1 83 1 63.70 ATTAAAGTTAGTAATTCCAGTGCTCTATCAGATACTATTAGAGTGGGCTTAGCAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTATATGCTGAACCTCAACCTTCTAGCTTTTATACTTTCTGAGATCTCGA:1 + chrX 18031224 5' - INE-1 146 1 72.60 CAGAAAACGTGGTCAAAGCATAGTAAATATTTGAACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTT:1 + chr3R 5208151 5' - hopper 1331 1 75.34 AAATACAATAAGCAACATATACACGTATATAAAAAGTAGCAAAATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3R 28728770 5' + jockey 57 1 56.85 CATGTTGCATTTGTAATGACTATGTGAATGCTGGCGAAGGGGGAGTGGGCGTGACAACATGGGTCAACGGGCAATATGTATGCATAATATGTATGCATAATCTCTACCTTCTTGCTTTTATAGTTCCTGAGACCTTGACGTTCAT:1 + chr2R 5836814 5' - INE-1 139 1 69.66 CATTATGCGCAAAATAAACGTTTTGTATCGTGACCAAAGTCAAATGAAAGTATGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACCAGGACGCAAATTTGAAGGATTTTAGTATTAATACATT:1 - chr3R 17897209 5' - hopper 1350 1 54.79 ACGGGCACATGTGGCCCCATTTTAATGGACCTGCCTCGTAAAATGCCACAAAAAGTGTCACAAATTTATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr3R 28272429 5' + Tirant 8 2 73.27 GTGCAAGGCGTGGAATTGCGGCCGAATGGATTAAAGCCTCTGAAAACATGAATTTCCTTGCGCCATTATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 10567728 5' - roo 9059 1 73.13 CGTAATATGGTGCTAGCAAATTACTCAGCTCAAAAGCTGTGTTTGCTTTAACTCATTAATTATTCTACTCCTACCATTTTAGACCAACTCTTGCATAAGTGTCCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTA:1 - chr2R 5865467 5' + pogo 1968 1 73.97 GATGCAGAAAAGGGGGCTGCCCGGTGGCGGGAAAAATGGCTGGCTAACATGCGAGGGAAAATGGCTCGGAATGGAGTGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCC:1 - chr3R 20486442 5' + accord 21 2 61.67 CTTATTTTTTAAGGGCTTTATTAGACCCTAAGTGGATGATTTAATGATTTCGATTTAACTTTCTTACAATTTATATTTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACCATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr3L 19482925 5' - pogo 2060 1 57.53 CCTCTATCTCGGTCATTTCTATGCAATGCATGTTTTTAAGTCCACTCTTCGCTTCTTGATCGCTAAGCATTATTGTCAGCGAACTTTTTTGTATTGTTGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCTC:1 - chrX 22946174 5' - Gypsy6A_LTR 333 1 71.23 CTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr2R 5531205 5' + 1360 63 1 66.67 GAGGATACATTCAGGATAGTTCGATCTCAGCGTTCGATATCACTTCTTTAATCTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr3L 17869907 5' + 1360 38 1 55.65 TCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3L 14553206 5' + roo 58 2 60.96 AATCAGTTTAGCCTGGCTTTCCTGTTCTCTCTCCATCGCTTTCATTGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3R 25387783 5' + roo 74 2 69.18 AAATTAAAAATTAAAATTATTATTTAAAATTACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTC:1 - chrX 19160802 5' + 1360 3226 1 79.56 CATTAATTTCAATCCTTCTATCCATATGGATATGTCGAATGGAATAGGTTCATGAAGCCGACGCCTGCCTCGTGCTAGCTAACAAATATTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAG:1 + chr3R 24691413 5' - 297 6831 2 63.38 GGGACTTACGAGGAACCTGGCAACATTGTCGATAAGTCGATTAAAATCGCTTGTGTGCTCCACTCTCCTCTGCTCTATAACTATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAA:1 - chr3L 15909221 5' + Stalker 7117 4 62.10 ATTCGCGTTTAATGTGTGTCAAGTGCTACATTAATGCTGGTCGTCAAGGATTAAGTGGCCATTACTTGTCCGGACTTGCGGACTTTGGTTGGTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAA:1 + chr3L 9558391 5' - 297 279 2 63.01 TATACCTTATACCTGCGGTAGTCGGATTTATTTTAAGTTTACACATAAGCTAGTCACATTTAACCAAAAGTTATTTACAGAGAGAAAATATTAAAAAATACTTACAACCTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 + chr3R 25904114 5' - 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roo 8991 2 70.55 AATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr3R 31490956 5' - roo 8984 2 75.34 GGCATCCTAAAAGTAGGCAATAGCTATCCCCACTGTGCCTGCCATGCACTGCTGCCTCACGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chrX 19121054 5' + jockey 70 1 58.22 GATATCCGCATAAAATAAACACTTTAAAACCAATATTTAAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 + chr2R 20673595 5' - mdg1 397 2 67.12 GTTTTCCACCTGCTCTCGGTTAAAGTTTTTCCCACACAAGGCTTTTGAAATTTCAACTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3L 10133621 5' - 412 7505 2 52.74 ATATTAGTAACATATGTATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chrX 5150275 5' + roo 51 2 55.32 CAATCAATAAATGCAAAAGTTCATTCCATCAATTATAGTCTTAATATATTCGTAACTTTCTATAATCACTCAACTGAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAG:1 - 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chr2R 6526619 5' - jockey2 3338 1 65.28 CTAGATAAAAGCTGCCAATATTACGACCTACAACTACAATAATAATATAAATAATAATAACAACAATGACAAGGTCGATGGCGCCACTGGCAGCAGCCCGAATATAAACAACAATAATAATAATAATAATAATAACAACAA:1 + chr2R 16145981 5' + mdg1 20 4 73.76 AAAAGCTATTACACCCATGGCATCCAACTAAGTTAAGGTAATTTCCAAGACCTACTGCATTTAATTCAATTTTCGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAGTATTTCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATT:1 - chr3L 15750508 5' - Circe 7039 1 52.05 AGTTTTAAAGTTAAAGATGCTTCGTTCAGTGCCCGTCAAACTGTAATTGTGAATTTCAGACTCGAAGCGAATTACTTTCGGCATCCGGCAAATTGATTGCCATCTGTGGTATTTAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTC:1 + chr3L 9217810 5' - invader2 379 1 58.45 CATTTACCAGCACTGTACTCTTCAGTTTCGATTCGTGCGTGCTTCTGACATTCGCCCATTTATACATATAATCACTTTTGTGTTTTCGTTTAGTTTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGC:1 + chr3R 17867718 5' - hobo 2935 1 79.20 ATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTG:1 + chr3L 2724966 5' + Ivk 32 1 58.91 AAGGAGTAGAAAAACGTTCTCAGAAGCACAACGAATGCGAAACACTCTTAATACTTGTTACTGTCTCATTATGTCCTTAAAGAAGTATATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 + chr3R 10968680 5' - I-element 5322 1 66.21 TCGACTTATAAATTCTGCGAATTCGATAAAGTAGTCGCAGCGGCCAGGCAAATAT:1 - chr3L 25846248 5' - Gypsy6A_LTR 111 1 74.55 TATTAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTC:1 + chr2R 5617476 5' - invader1 379 2 57.36 TACCAAGGGCGTTGCCACGCCCACAATTTTTGGTATCATATAAGATATGGCATAGTGTAATTCAATACAAAAAAAAAACAGAAACTAAATATCTCTCTCCGTTTTGATGTTATTAATTTTGGCCACAAA:1 - chr2R 24111006 5' - Transib-N1_DM 24 1 76.74 ATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCC:1 - chr2L 23084407 5' - accord 496 2 55.74 AAATGGAATGTCTATGTGTGTTATGCATACATATCTATTTACTGCTTTCTGCCTATATTGGAGATATATAAGAGTAGCCACCGAAAACTAAAAGAGATCGCCAATTGCGTCACTTGCACGTTTGATTGTAGTT:1 + chr2L 18247144 5' - Juan 118 1 72.93 AACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCAT:1 - chr3R 13349134 5' + BS 5052 1 55.48 TAATTAAGGAAAGTGCAGAAAAAGTGACTGACACTTGGTAAATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2R 6842845 5' - roo 332 2 68.49 ATATTTTTATATATATAAATATAAAATATAAATATGTATATAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGTTACCAGGG:1 + chr2L 23016165 5' - gtwin 7336 2 65.25 GATGGGAAGGTTTAGCACTCGGAATTAATACGATTTGTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:2 + chr2R 23000029 5' - mdg1 7410 2 51.37 CTATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTC:1 + chr2R 961127 5' - transib2 2678 1 64.44 CTCAGCTCCGTACCACCGCCATTCCGGGTTTTTGTATCGAGTGTTTATAAATGTTTTTCTACGTCCGTTGAATGCATATGTCTTTATATGGGTGTTTTGCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCG:1 - chr2R 5953756 5' - I-element 4886 1 76.43 ACTGAAATGCGCATAACATAAAATTGCTTGCTCTGAAAGCTAACAATACCTTTTATACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACT:1 - chr3L 15028030 5' + opus 7402 2 61.64 AATTGGGGGAGCAAATGTTGATGCTGTGTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGATGCGGTCAATGCTGACCCTCGGA:1 - 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chr3R 23765469 5' + roo 8696 2 59.23 TTTAACTTAATTTTGTTTATATTTTCGAATAGTTTTAAATTATAGCTTTTCTGATTTGTTTATTTGTATTTGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGATTGTAATCATTTAGTGAAATAA:1 + chr2L 23373065 5' + Idefix 7347 2 54.11 GCAGCTGCCAAAGGGCCACTAATGATGACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr3R 12599056 5' + 412 54 2 74.29 CATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTG:1 - chr2R 13644507 5' + Burdock 6205 2 67.12 AGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1 + chr2R 22723014 5' + 3S18 5818 2 52.05 TCTTTGTGGACCGCAAAAGTCCAAGTCAAGCATTCCACTTATAGTATCGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 27794865 5' - roo 9002 2 66.21 AATCGCTTGGCTGGTCGGAACGGGGTGTGTTTGATCACTCGGAAAAATAACTATACATTATACCCTTTTCTTGATTCAGAGAAAAAACAATTATCAAATTCTGTTACTCAATTGGATTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chr2L 2052621 5' - blood 374 2 75.86 TGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3L 19350018 5' + jockey 57 1 54.11 ATCATGAGACAATGCAACACCATAACATGCACCACCTGCCACAATTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATTTTAAATCATTGTACATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGTTTAT:1 - chr4 863583 5' + Cr1a 4189 1 69.18 AATCAGATTTTTAGCTAATAATTTTTTAACTATTTTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGACAATTTGTACGAAAATTCA:1 + chr3L 13374134 5' + pogo 82 1 73.97 CATTGCAATCGTTTCAGCCATCGCTCTCAGGGCGTACTTGGTGGCTGAGTAAGGACCGTATCCATATTAATTGTTATAATGTTAATTGTTATATTTGTATTATTGTTTTGTACAGCTAACTCTTGTTAGCCGGTG:1 + chr3R 25261716 5' + BS3 1680 1 51.11 CTAGGGATAGAGCACAGAACATTAACTAGTTGCATTAAATTAACCAAAGGCATTAAAAAGAACTTAAACTATTGATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATA:1 + chr2R 14047608 5' + mdg1 49 2 50.00 ATGTACTCGGGTAAATTTTGCATAACAAGGCACTTATTAAAAAACATTATTAGCTTGATAAAAATAAATTACATGCCAAAAAACTGCCATCTATTAAAAGCTGGAGTGGCTTTTCAACTCAATCAAACTCCATATGGCAACTAAGG:1 - chr2L 10915021 5' + G5A 2374 1 66.44 GCAAAAAGTCCAAGGCACAGAGTTGATTATGCGGGAAGCTTCAAAAACTTTTCGGCATGCTGCACTTTTTAAATGGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTGTTGATCTG:1 + chr3R 17656357 5' - mdg3 5453 2 56.85 CTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chrX 14964609 5' - roo 350 2 61.64 TGATAAAAATGTGACTAAATTGCGCTCGTTTCTCCTCTAACTGCAGGCAATTTTTCTATTTTCCACATCATTAGTTTTCAATGAATATCATCTTTGTTGCTGTAGTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTTT:1 + chrX 8963726 5' - gypsy7 5011 1 77.95 GATTCGTTGAGAATTATGTAACAGCTGAAATGGATATATTCTTAAACAGGATCGCTAGGCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATAATTCTAGCTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCG:1 + chr2L 21902491 5' + Ivk 8 1 77.34 TATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGA:1 - chrX 21667908 5' + gypsy2 6555 2 77.39 TATTCCTTTTTTGCATAACAACAACAGAGATTGAACATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr3L 23986479 5' + opus 138 4 63.70 AACTAGTGACATCATCTGGACAGGAACACTCTTTTGATCCGAAATATGGAAATCGGACTTCGTTTGCTCGGTATTCTTCGGCTGTCTACTGTGGAGCGTTCTTGGT:1 + chr2L 20837305 5' - BS3 1549 1 70.75 CTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCAC:1 - chr2L 6717204 5' + jockey 68 1 55.48 ATTTCCATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chr2L 12349765 5' + F-element 54 1 59.57 TACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - chr2R 2427624 5' + Doc 16 1 64.42 GTACAATTAGGAATTTAGTTTTGTTCAATGGTAAAGGAACAATGTGTGTAGCAATGTATATATGTAATGCTAGCTCGCTTAAACACAGCCACTATCACCGAAATCACCACTCACTTGTCCAACCGATTGCGATTTAATGTATTTAT:1 - chr2L 23052681 5' - diver2 457 1 68.49 GAAGAGCAGTCCGCCAGAGAAGCTTTTCCTCAATTTTAAAGGCGATGAGACTCTGTTTCTATTCTATTCAACGAAATGCCACAATACATATATAAGCTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCGGGACTCAC:1 - chrX 19281829 5' + opus 19 2 68.66 AAGAAACATACAGAAAGAGATTAATTTATGGATGTTGGAAAAAAACCCAGAAATCTTGGAATTATACAACCCATTAAAACAAAATAAAACAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAG:1 - chr2L 21762422 5' - INE-1 547 1 41.43 ATTGCGCAGCGGTTAGAAAATGTTTTGGTTGCAACGAAGATGGACATAATTCGAGTAACTGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTA:1 - chrX 22574764 5' + 17.6 6945 1 69.18 CTTTAAAGGCAAGTCCCATTTTGATGGATAGCGCGTAGACGTCAAGAAATCAATTTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAA:2 + chr3R 15924579 5' - Quasimodo 7308 2 62.33 ACTCTGAAATGTTGGCGGCAGCCTGTGCTGTCGGTGTGGGCGCCTGTTTTGCCGCTCTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAAT:1 - chr3R 11800916 5' + copia 4857 1 53.66 GTCAATAATTACATAAAAATATCTAAAAAGAATCGTTTGGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACACCC:1 - chr3R 9352151 5' + Tirant 8115 2 81.51 TCTGACATTTGTCGCTGTCAGACATAACAATCGACCCGATCCCAATGCCAATAGCAACTGAATTGGCCCACATTCGAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2L 9471971 5' + roo 45 2 54.79 CACGCCGGTAGGCGCAATCGCGGTGCAGTGAACTTGAAGGGGGTTCGGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr3L 22642845 5' - hobo 2895 1 58.26 ATTTTTAAATGGGCAATAAAAATAAAAAAAATAGATTTTAGTGGGTAGAGGCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr2L 16602899 5' + 1360 63 1 65.19 AAACATTTTCCGTTATCTCTCGGCCAGTGTGACCGTTCGACCACGCCAAGAGAGCGTATCGACTCCCCCCAAAAATAAATGAAATACAAGTACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTAC:1 + chr3L 12504201 5' - invader2 16 2 61.38 TAATAGTTGAAGTCTATACTCACGAATCCAAATTATTGCACGTATAATTCCAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 - chr2L 2052768 5' + blood 72 2 64.38 AAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 12867279 5' - roo 360 2 51.41 GAAACCTATTCAGATGACCACATCTGTGCGTAGTTAAATCAGTTTAGCCTGGCTTTCCTGTTCTCTCTCCATCGCTTTCATTGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 25387747 5' + roo 8702 2 61.64 CAATGCAAGCTGAAAGTTAAAAGTTTTCGGAGGTTTTGGAAAACCTAGATATTTTAGGGCAATATAATATATAAAGAGAATATATAATATATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGT:2 - chr3L 22408771 5' + Ivk 31 1 60.27 ATATAAGCAAAATTATTATATATTATATAGAGTAAATGGGTATACTATGTTCGTTGAAAAAAGCGGAACATATTTATCGATTCTATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTATAAA:1 + chr4 497094 5' + INE-1 146 1 52.05 GAAACCTATTCATATTTTACTTAAAACTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chrX 10567874 5' + roo 8716 2 54.79 ACTAGCAGATAACTTAGCGGATTTAACTTAGCAAGATTTAATGTATGTATATATGACAACGTTTTAAAGTGACTTATTGTGCAACGACGAGTCAGCCGCCGACATCCGCCCAAAAAGCTGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACAG:1 - chrX 13740573 5' + ZAM 8119 2 55.48 AATTTGCTCCTTCTGCCCACATACTCTTCGATTCTGGATGGAGTTTTGGGTATTTCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chrX 8012347 5' + 297 42 2 60.77 GTCAGTCAGTTGTTTTGGTGTCCAAGGAGTGAAGAAGTAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGGACGCAAAGCTTCCTGGTTCGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCTGACACGACGGTGAGGTACGCATTGTTCCGCT:1 + chr2L 7003817 5' - Doc3-element 285 1 56.16 CCGCGGAGTTCGGTTCATTCAAGCGAAATTAATTAAACAATAAAATTTGATTAATGGCATTGTTGGGAGCGTGTGTGTTTTGGTTGTTGTTGTTGTCGATGAGATTGCAGTTGTGAGAGAGGCAACCCTGCTGGTAGTTACTGCAG:1 + chr3L 14657712 5' - Doc4-element 266 1 56.85 ATTATTTATAAACTCTTTGGCTAAAAATCAACCGCGCTGTAGAAGTAATTTATTTTTTTGGATCTTTAACCCACACGGTTTAAATGTTCGGCACTACGAGGAGTGTTGCCCACAATACTGTTTTTGTTTTTTTGTTTTTAAATATT:1 - chr3R 13709115 5' - TART-B 10630 2 86.30 GTTTCTATTCTATTCAACGAAATGCCACAATACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chrX 19281775 5' + opus 147 4 69.47 ATTATTTGGTTAGAATTTTACAAAATTGCTTGGAGAATTTTTTACTATTCGGTCATCTTAACGATATACCTATTAAATTATAAAACAAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 + chr2R 13155896 5' - INE-1 548 1 57.04 TTTAGTCTGGTAATTACGATATTTAGGGCTGGATTATAGAGAACGCTGTCCAAACATAACCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 + chr2R 7959959 5' - mdg1 361 2 59.59 GCAGCTGCAACTTTAGTCTTTACGAACTTTTAAGTTTGACATTTCCATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 + chr2L 12349719 5' + F-element 66 1 63.70 CTAATGGGCATTATTATTGGTCTCATGTCAGGAATAGATCTTTAATCGCATTCAAATTGCATATCAAATTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTT:1 + chr2R 8158732 5' + Juan 43 1 47.95 CAATAAACTCGGCATCCAACGGATTTTTCTCTACTGCATTAAAAATCTCTTCAACAGCTTCCTCTGTCCTTCCTGCCCATGTAAGTAGCCGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAG:1 + chr3L 25759348 5' - Quasimodo 6923 2 72.87 TTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGGGTGCTTATC:1 + chr3R 6515339 5' + jockey 96 1 78.77 ACTTCTATTAATATCTAGCCATTATTCCAGTAAATGAATCAGATTTTTAGCTAATAATTTTTTAACTATTTTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:2 + chr3L 13374098 5' + pogo 46 1 53.42 GTGTGTCTCCACGGAGAAAATCGGGGGCTAAGCTAGGAGGAGCATCTCCTGTGGGAAAACTGAGCTGAACTGAACTGAACTGAATCTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAAC:1 - chr2R 21512550 5' + G2 278 1 59.59 ACTGCACTCGAGGGCCATAAAAGTTTTTCACACGTTATATAATTTTTTTTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr3R 6244509 5' + Doc 59 1 63.85 TATGTATGTATATATGTAGTAATAAATATTTAGGATCGTAAATGAATAAAGTATGCTTTTTAGATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATA:2 + chr3R 23859820 5' + jockey 4819 1 58.22 ACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAG:1 + chr2R 5542357 5' - 1731 4553 1 66.90 AGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chrX 12139010 5' + roo 86 2 77.40 AACTTATACTACAGTGAATCATAGGTGTATATGAGTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAATA:1 + chr3L 23875801 5' + X-element 98 1 74.83 ACTCACCTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3L 14076284 5' - roo 8995 2 70.55 AAGGGCAAGTATTTTTAGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chrX 12139026 5' + roo 70 2 66.44 CTTCCATATAAAGGTAATGAAAAAAGCACTGTGTTTATTTTTTTTTGCTTATTTCTAAATAATGGAAACAAGGATTTGTTCCATCGGCTGGATATCTTCGATTCTAAGTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACA:1 - chr4 436954 5' + 3S18 5778 2 77.40 AATATTATATGTAGAATATTTCTAGATTAATTGCGTCTACCAAAAAGGACATTTTCTAAAACAATGAGCGAGGAAGTTAGAAGTACTTTCTAAGATCTACATACAAAAATTGTGCTCCTTTCCAGTGAAAATTTAAAAAAAAAAAT:1 - chrX 19295677 5' + TART-C 11093 1 16.44 ATTATATAAGTGCTCATCACTACTCGTATTACTGGTTCATCGTTTGTACTGGCGATGCGTTAACTTTGAACTGCAATGCCAGTGATGATCAGATGGGGAATTGACTATAGTAATAATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTG:1 + chr3R 18345998 5' + Doc 159 1 67.81 AGTGTTTGCGCAAGCATTGCGTACGAGTACGTACATATATGATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:2 + chr3R 23010035 5' - I-element 5278 1 71.23 AAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3L 23146464 5' + 1360 53 1 53.10 GCCATATTTGTAGACACAAAATCAAGTGCCAAATTGGGGAATTTGATTCATTTGTCATTTATTTAAATTCTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 9472129 5' - roo 390 2 70.34 GGGCAATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACACAATCGGTTGT:1 + chr2R 5214931 5' + F-element 48 1 56.16 TTTTTTGAGTGCATGATTCAGAGTGTAGCGGATGCGCTGTCTATTAGGGGATGCGGTGCAGTTCTAGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 + chr2L 12414881 5' + pogo 55 1 56.85 GATAGTTACGTGGTACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr3L 13868631 5' + 412 62 2 62.07 AATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 - 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chr3L 13868747 5' - 412 7502 2 53.42 AATAATCGTAGTTATATTGACCACATTCCAAACAAATTCCGAATTTGCCTCGACACTGTACCAAAAATTGAATCATGTCCCTTACTTACAAAGTTTTAGCAAAGACCCTAGAATAATTATAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTA:1 - chr3L 23024567 5' + Tc3 316 1 68.28 AATAACAAACAAAGTATTTACTAATGTCCGATTGTTTACTAATTTGTTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTT:1 - chr2R 22722672 5' + Tirant 349 2 67.81 GTAGAGAAATTAGAACTTATTAATCCAATGGCATATTGACTAATTTTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 3890100 5' + jockey 35 1 64.38 GTGTTGTGAATACTAAAGCATTATAGGGTACAATTAATATTTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATC:1 + chr2R 1007650 5' + Ivk 61 1 67.97 ATGTCGACGGACAGTGGCTAACAGCTTTATCGTTTCGTCAATGTCATAAATTCTGATCTAGTTGCCGAAATTGAACTTAATGCGACATAGACACAGCAGACACAAGGAAAAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAG:1 - chrX 7503063 5' - F-element 455 1 73.97 CAAATCGAATTTTTCCTTTCAATAAAATGTGAAAAAAATAAGGAAAGGCGGAAAATTTTAAGGCAAGATATCTAAGCCACGGTCCAAATAGAGAAAAGCTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chrX 12866348 5' + roo 20 2 71.92 TAAACAGCCATAAACAATTAAGGCTTTCATCTTTTGTGTATAACCAAACATAAACAGTCATTAATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chrX 3263316 5' + roo 56 2 58.62 GATGAGCTTGCATATTGGTGTTTGTTGTTCTAGATATTGATCCAGGAATACCAGGTTTGTTAAAAAGAATGTAACAGGTAGAAGGAAG:1 - 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F-element 4574 1 71.32 AATTGGGTGATCTAACATCTGGTAGGAAATCCCTCAACCGATGAAGATATCACCTATCATCGCATGAATATTTTGTTTACTTGAGCAGGTATAAATGAGAGCCTATGTACGGTGAATATGAAGAAGTAAATTAGCTCAGCCAAGGG:1 - chr4 874601 5' + Quasimodo 7218 2 65.07 CATAAAAATATCTAAAAAGAATCGTTTGGACTGTCGGTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr3R 9352140 5' + Tirant 16 2 74.65 GTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 - chrX 21852424 5' + Tirant 8170 2 75.65 ACTGTGACTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCCGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - chr2R 19555039 5' - pogo 2050 1 53.79 CACACACACACACACACACAGACAGATAAACATTTAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAA:1 + chrX 7978951 5' - P-element 2826 1 24.66 CACACACGTGTATGGTATATGTATGTATATGCTGGGCACAACGCATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - 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chr2R 5531244 5' + 1360 62 1 74.66 AGTCAAACACTTTGTTGTGGGTCGTGCTAATAGCTTCCGTTTCCCAAGCCAAAATGCTTAAGCTTGTGATTCAGCCCATAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 17114145 5' + roo 8704 2 58.22 CTCTATGTGGGTTGACTCAAAGAGTCTGCTGACTTTTGAGAGTCTGCTGGTCATTGAACGAAATTTACCGTGACTAGTCCAAACTGCTTCGAGAGTGTAATAAAAAGAAGGCTATAGTCGAGTTTCACGACTATCGGATACCCG:1 - chr2L 22716443 5' - INE-1 555 1 74.31 AATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAG:1 - chr2L 16089655 5' + 3S18 5853 2 75.17 ACATATGTTTTTGGTATTTTTGGATATTCGATTTGTCGATTACATAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTG:1 + chr2L 436474 5' - copia 178 2 70.55 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGAACAATGAAACAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCT:1 - chr3L 11720528 5' + Doc 278 1 65.07 GTGACACTAGTATTTAGATTCAGGACGTTTCCAACACTGCTTGTCAACTCAACCTAACAAATCAGCTGTGAGTTTGGCGTGTGGAAAAGCACTCTGCACCACACCGCCGCTGCAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGAGC:1 - chr2R 12757544 5' + Chouto 322 1 60.69 CACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGTTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACGATAAGAGTCCAGCTTTTG:1 - chrX 22913204 5' + gypsy7 5290 2 69.18 CTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 + chr2R 5737135 5' + 1360 61 1 76.61 GAATCCACATGGCCAGGTAGGGCAGCGAGGATATTATGCCATTTGTGCGAATGTTCACATTGAGAACTCTGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 4785182 5' + roo 8714 2 54.11 ATATATAAAAGAATACTTTTAAATGTAAAACTAATAAACAGGGAAAAGAATAAATCAAATTTAAGTTTTTTTGATCATCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr3R 17546727 5' - blood 7347 2 46.21 CAGCGGCGGCCATAAATAGATGGCAAACAGGAAAATGCAGAAAATGCATAGAAAATATTAGCATTTAAAATATGTATATATATATATATTTAATATATATATATATATATATATATATATTTAAATAT:1 + chr3R 14533363 5' - G3 4507 1 43.75 ATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr2L 76060 5' + roo 8743 2 73.43 ATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr2L 22015978 5' + Tirant 28 2 65.88 GTATTTTACCTGTAAATCTATACATAAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chr2L 13250340 5' - opus 447 2 60.96 GCGAGGAAACACAATCTTTTTGACTGAGATTTGAACGGACAGTGGCCCCTCTTTGGTGGGTTCATGTATAGTTTTTTTTTGTTTTTTTT:1 + chr2L 637012 5' - HMS-Beagle2 491 2 69.66 AGGTTCTATCACAACCTGCTATATAAGCAATATAAGTTCTTGAATCAAAACAATCTCAATCTCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chrX 19536893 5' + roo 8713 2 63.70 ATATAGTTTTTAGAATGTCATATAATACTATCCAGCCTCAACAGTAATCTAGATTTAATCCCCAACATAATACTTCATTATGTCAAATGGACGTAGGCCAAATAAATACAAAAAAATAAAAAAGTAAAATAAAATAAATAAAAAAT:1 - chr2R 2555844 5' + F-element 92 1 76.71 ACTATGTGAAATTGCAAATAGCCGATACGTCATCGGTGCAAAGCATTTCAAAGCAGTTCGTTGATCTCCCAAAAAAAAATGGAGAGCGAGCTGTAATAAACCTATATATGCCACCTATTGAGAACACGTG:1 - chr2L 9237624 5' - blood 7372 2 68.46 AGAACTAATATCTTTTCGCATTCTGACCTCGGTAAACATGAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3L 14076218 5' + roo 80 2 73.97 ATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTT:1 + chr3R 11750180 5' - Tabor 7255 2 63.70 ATTGGCATACACACTTTTGAAATTTTTAATTTAAATTTTTATGATTATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1 + chr3L 23325991 5' + pogo 72 1 70.55 CTGTAGGCACTTATGAAAGTGTGTGTGAGTCATGCAGGGACTGCAGTTAGACAAAGATAAAAGGAAATGCGCGACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCT:1 + chrX 17491440 5' + transib2 2812 1 52.86 AGGCCAAGGATGCGGCAAAAGATACAAAAGTAAATAACAGGGTCAGGCATCCGAAGCTAAGCCAGATCCACTCCTGCTGCATGCTGCAATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCT:1 + chr3R 29418608 5' + mdg3 5258 1 77.40 GGGTAAGTTGGGTTAGTAACAAAATAGAAAAAATGTCTAAGTGAAATATTACTTAAATTTTTTCAGTTCAAGAACTCCAGCTTAAAAATATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 + chr3L 18729806 5' - mdg1 390 2 50.68 CTGTGCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr3L 15026626 5' + opus 37 4 56.16 ATCAAGAACATTCTCCATCGTTATTCCGATTTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTG:1 + chr3R 21276479 5' + BS 5003 1 76.71 CGGTCTTCTCTGCCTTCACTGTCCCGTTTCGAACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTC:1 + chrX 22564559 5' + Transib5 56 1 61.48 TTTGTTCAATGCGCTCTAGAAATAAATCTTAATAATGTAGTGTTTAATTTCCTCTAATTTAATGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTACCAATACAATAAATGACTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCA:1 + chr2L 15375105 5' + Stalker 63 4 59.59 ATTCACTTGCTACGGCATTCGATTCAGCTACTCGTACATTATCCCAAATACTCTATTCTAAGCTCCCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 + chr3R 15338022 5' + blood 57 2 56.16 GGGTGCGTTTTTATGGACAACAAGGCTGTAGGCCTCATCCAGTTATTTAAGCACGGACACACGCACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr2L 10089722 5' + opus 148 4 55.81 AAGGCATCAATAACAAGAAAGCATTACTCGAGATAAGATTGAATGAATATGTTTGGCACCTATAATAAAATAATATTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAG:1 - chr3R 30583888 5' + gypsy12 32 2 58.46 AGTCTCGCATTTCGTAATTACTCACAGAGATAAAAAAAAGTCGATCTTATCTAATGCTCCAAATAGAGCAGTACATAAATTCTAGTAATAAATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr3R 20988895 5' + I-element 30 1 65.75 GCAGGTGGGTGGGTCGCATAGATTTGGGCCTGGCTGGTGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCA:1 - chr2R 17688368 5' - F-element 4344 1 74.66 CAAGAGTTTTGAATTTATTTATGTCAGCAATTATTTTATTTATATTGTCATTGCACACATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 - chr3L 6775447 5' - blood 7335 1 59.42 AAATGCGCAAAACATTCAAGTTTCTTTGGCTCGCACAACAAAACAGATCGATAGACAAGTGGCCAAGCCAAGTGTAGATGGGAAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr3R 13612777 5' + 412 37 2 60.27 AAATTTCTATCTATTTGCAAAAAAGCATTTTGCTACGCCCACTATAACGCCCTATAGCCGCCAAGCCGGTCACGCCCAAACTTTTAATATTTTAATAAAATTTGATTCCCTAAACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAG:1 - chr2R 5667269 5' + copia 83 2 77.40 AGAGTCAGCGAGGCGCAAACTTAAGCCTGGCAGCCGTTGTTGGGGAACATTCTGGGACTTGCCTAAAACTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGAAAATGAAT:1 - chr2L 15988084 5' + roo 8716 2 53.42 ATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACG:1 + chr2L 12349771 5' + F-element 110 1 65.28 AAAATTGAATTCGTATGGGTGTTCTATTCTAATGGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTA:1 - chr3L 7153901 5' - Quasimodo 34 2 72.88 GGGTTTTATACTAAGCCAAATATTTTTGCACAGCTTTGTTGTTTCATTTATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 - chr2L 1260050 5' + Burdock 24 2 64.38 CCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chr3L 17175122 5' + 412 66 2 61.38 TGATAAGCTCTCATATGCAGTATCTGCCCAAAAGTATGCATTGGATATGACACGAATGCACTGAGTTGGGGAAGAGTAATCCCTAAAATTGACCTATAATTTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTCACA:1 + chr2L 3762876 5' + jockey 26 1 67.12 GTAAGAGCTTTATAAAGGCAATAAAGCGCCTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr3R 13176319 5' - Burdock 6356 2 60.27 CCGGTTTCAAAAGCACCTCAAGGTATGCTATGGATTTTGAAGACCATGAGAATTAACTTCATATTTTATAAAGCTCGATTTTTGCGTTTGTCAATATATTTCCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGT:1 + chr3L 9497705 5' + jockey 4788 1 67.81 TGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACATCGAAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAAATTTGTTTTCCGTATTT:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 37 1 65.19 GGGTGAGTGGTACATAAAAAAAAAGAAAACTATCGAAATTATGTGAGTTTTTGCGTCAAGAACCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAATCAGAGAGACTCTGTAGACGTTG:1 + chrX 13867616 5' + 412 369 2 49.60 CATCCGCCACAGCCAGACGGATTGTGTGCCACTTTGCAGGGGTTCACTGTAGACCACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chrX 9707141 5' + Doc 64 1 64.03 ATAGAGCGTTTTACATACTTTCCAGTTGGCCAAAGGCGGAGGCAGTCAAGTTCCTTGTGGGTCTGATCTTCAAGGGCGGGTAAGGATTGGTACTTAAAAGTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATT:1 + chr3R 31587165 5' + 17.6 7394 2 71.72 CTTCTGCCCACATACTCTTCGATTCTGGATGGAGTTTTGGGTATTTCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTCCCATTATTTCAAAGA:1 - chrX 8012338 5' + 297 6609 2 58.88 GGGGTTGTGCCCCGTTAACCAGTGGAACCAAGGAATGGGTCTCTTCAGTCAACCATCCATTCACATGTACCCGTTTAAATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAATTTTAT:1 + chrX 12525881 5' - roo 9034 1 59.03 GGAGGGATGATGCGCTGGGTTAATGACCCTGGTCTTTAGGGAACACTTAGGAGCAGTGATCTTTCAATCTAGTTAATATGTTGATACCAGGAGAAATTGAAGACAGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTATGGATAGCCGAC:1 + chr3L 22133014 5' - Q-element 129 2 72.60 TCAAAGCGCAATGTGTCGAACATCCTGCCAAGGATTCCCTTTGCTCTCTTTCTATTTTTATCGCCTTTCCTTTTCCCTCGAACACACACACAATCACACACACAAAC:1 - chr3L 3798972 5' + gypsy3 416 1 73.83 CATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2L 17136158 5' + hobo 41 1 58.18 TAAATAACCTTAAGAGACTACTTTGATGTACTAAAATCGATTCCAGGATAAAATTTAGAATTATATTAAGGCATACTGGGTAGCTTTGTCACCTTGGGCGCTAATAATTCAGCCCTTTAAGGGGCGCCGGCTAACAAAAGTTAGC:1 + chr2R 5616590 5' - BS3 1681 1 64.83 CATTGAATAGATAGGTTTCACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3L 14553080 5' - roo 9033 1 57.53 TAGTAGTTGCTATATTATTCTAGATTTCGTATTGTTTTTGCTATAAATGTTGAGCTACTCAATTGTTAGTTCTCCTAATGCAATCCGTTGCAGTTGTATATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAAT:1 - chr2L 14061111 5' - HMS-Beagle 16 2 73.10 GTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCAT:1 - chr3R 11547751 5' + G2 331 1 71.43 AAAGGCCAAGAAAAATGCTAAATCACTTTAGTTAACTCTTAATGGATTATACCCAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chrX 10290287 5' + pogo 60 1 60.27 AATATTTTTCACAAGCTGCAACTGGATGGCCAGTTTTTGTCTGCCTTTATGCGCTTGGATTTTGCCCATAAATGAAATGCAAATTTTCCTTTATAAACGCAAGATACATACATATTACATACATATTTTCAACACTCCCTCTCAA:1 + chr3L 14506190 5' - Dm88 4350 1 72.41 GGATCGTCTTCGTTAGTTTCCAGTTCACCCAACCACTGATCGTATCGTCCTTTAAAGCTGCTCCCGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr3L 17890867 5' - 412 476 2 72.92 AAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTCTGTCAATGAATCGAG:1 + chr2L 76056 5' + roo 8720 2 62.90 CAAGGAGCAAAAAGAAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAA:1 - chr2R 6526625 5' - jockey2 3342 1 68.49 ATTTATCCTGCAGCTTGCATATATTTATATTGTAAGCATGGCGCAGCTCCGGTGTCCTGCCATCAAATCGCTCCATTCCTGGACTCACGTAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTT:1 + chr3R 22531490 5' - Circe 7112 1 60.27 TTTTTCCAGCAATTTCTTTTTTATATTTACTCCGGCCCAGCTATCAATTATTTTGTCCTTAAGACAGATTAGTTCATTTTGATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTCCTAAACCTACTCCTTAAACTAAAAATTACGTT:1 + chr3R 2914291 5' - Circe 7034 1 54.79 CGATAAAACAAAATTGTGTATTACTACGCACAAATTGCGAATCTGATTAAAACAAACTACCGAGATATATGACATCGAAATTGGAGAAATACTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAA:1 + chr4 301825 5' - 1360 3172 1 63.01 CTGTCACCTGGCTAACACAGACACAACTTACCCACACCCACATCACCACCAACACTCTTTCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2L 11915502 5' + hobo 28 1 51.35 CGAGGAAAAAGTTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTATAATATCATTAGGTATTAAATTTCAAATAATTTAACAAATGTTTCAC:1 + chr3R 31887762 5' - HB 1508 1 50.68 GATTGTTTACAATAGTGTGTGGTTGGGAAGTTGTGGGTGTAGAATGGACATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTT:1 + chrX 22252748 5' - diver 153 2 65.28 TGGTACAAGAGGTGCCCATTGTTATTGTTGCTGCAACATAAATTTAAACGTGACATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCT:1 + chr3L 5093427 5' + accord 6914 2 58.27 CCAACTGACAGCTCATAATGAGATTGGATTTTTCTCCCTAGTAATTGACAAAGGGTTGAATCTGCCTGAGTCCCCCATAATATATGCAATAGTGTCAATGTCATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 - chr2L 17231767 5' - flea 213 2 70.55 CACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 + chr2L 16884800 5' + pogo 59 1 60.96 TTACATAAAAATATCTAAAAAGAATCGTTTGGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr3R 9352143 5' + Tirant 8117 2 79.29 GTCTGCGTTGTCCTATAAAAGTGGGCTAATGGGATGGTATTCTTTTTTGTGCCGGCCAACTTGAAATTGATAGCCTTAAGTTCAGTTTGATTTTGTACTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTCAATCAACTCCAGCTACTGCTGTT:1 - chr3L 12957124 5' + springer 194 2 50.68 AGTTGTTTGCTTTGCGAATAATTTACACAGAATAAACTTTTGACTTAAGAGAGGGAAAATGCAGAAAATGAATAAAGAAAAAAGCACCAGGCAAGAAAAAAAAATAATGTATCCATGTACACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAAC:1 - chr3L 10535630 5' + INE-1 15 1 76.03 CAGTTCGTTTTCCCACGTTTTCGCTGCACTCCAGGCACTCATATTCTAGCAGAATCTCGCTGGAGCTGCCTCAAGATGAATACTCTAATGACCAATATTCTGCTATCACTTTATGTGTAGAAA:1 + chr2L 8337494 5' - 1360 146 1 56.10 GTTTGCATGTCCAGCGGGGGGGAACTGTGTTGTGTTTTTGTGTTTAATGCTTTATGTTTCAGTGTACACACATAAATGACCACTACACACATATACATATATATTGTTTATTGTTTTTTTTTATATTTATAT:1 + chr3L 8926555 5' - transib4 2578 3 85.61 AGTTAATTAATAATAAGATAAAGATGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGAACTCGAAGCTCCTCC:1 - chr3R 929353 5' + Max-element 51 2 73.00 TTGACTTTTTAGTATTTCAACACTGAAAGAAAAAATGGCATGGACCTTTTTTTTTTGTGGCGAAACAATAGAATATGTTTAAAAAGAGAGTTTAATGCAATATAGATCAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTT:1 + chr3R 30295027 5' - Quasimodo 7361 2 55.48 GGCCAGCAGAGCAATAACAATCGCCGATGCTCGACGACAATGTCGTTCAACCTACTCTTTCAAATGTCAATACAATTTAATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACG:1 + chr3L 12224597 5' - 412 7539 2 73.21 GATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr2L 76044 5' + roo 66 2 63.01 TAGATTATACAATCAGGCTAGTGCTAGAAACCGGCAAAGGAATAAGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGT:1 + chr2L 15834408 5' - hopper 1395 1 71.92 ATAACGCTCCAAACGAATTCCAACCGATATCTTCTTTTCGAAAGCCATTAAAATTAATAATTTGCCACACTCTTATCGGTGTGCATGTGCATGTGTCTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTTCCTGCCG:1 - chr3L 6837075 5' - accord 177 2 62.31 AGGTAGTAAATTATAGCTAATCTGCAGCATCTCGAGCACTTCTTTTGGAGTTTCTTTAGGTTTTCTCTTTTGTTTTTATTTTTTTTTAGATTTATTTTGGTTTTGTCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCATGT:1 + chr3L 7812189 5' - INE-1 154 1 74.81 TATGGGGAGCGTGTAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 10684830 5' + roo 20 2 58.82 AAGGAACCTTGTATTTGTGTTTCGAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGG:1 - chr2L 13250455 5' + opus 7174 4 63.70 CCACAACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chr3R 21705938 5' + 297 6588 2 73.68 GCGGGTGTTTTGCCTATGACAAGTTTTTTTTTTTACTCTTTCTCTCGCTTTTTCCCTTTTTTTTTTTAT:1 - chr2R 14968435 5' - Bica 338 2 82.61 ATTTAATTTATTCATTTTCACGACCTATGAAAAACATTTTTCCCTTATTCATTTTCCCGTTGTCTGAGTTTTCTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAA:1 - chr2L 11872562 5' - copia 4739 1 58.90 CTGTGCTGTAGGAAACCTTTTAATTCATTTTATGCATATTTTTTTTTCTTATTATAGATGCTTAAATGCGGACATTTATTTGTAATCTTTTTTTGTTTTTTTTATTTTGTTTTTATTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTATTATATT:1 + chr3L 20853343 5' - BS4 733 1 58.22 TAATTATTAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATGGATATTAGGGAATATAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCGAT:1 - chr2R 4886046 5' - INE-1 577 1 54.11 ATCCCCCGCTTATTTGTGTGTGTGTGTGCGTGAAATTTGATGCCGCACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr3L 7995495 5' + P-element 64 1 37.04 CAGCCGGTTTCTATTCCAGTTCTTGAAGGTGTATATATCGCTCAATATGGCCGATCCCAACGCCAAGCCCAAGTACACGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTCGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTT:1 - chr3R 26988468 5' - Quasimodo 349 2 60.00 AGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTTCTTCTTGAAATAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 + chr2L 12553437 5' - 412 7461 2 75.34 AGGTAAACAAATGTTCTGGCCAGATATGTATGTATATATGTAGTAATAAATATTTAGGATCGTAAATGAATAAAGTATGCTTTTTAGATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAA:1 + chr3R 23859796 5' + jockey 4795 1 62.33 ATTGTTTCTGGTTGTGAGAAATGTGCAGGAAATGATTTTAACATTGCGAAGGTGCAGTTTAGCTTAGCAAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr3R 10472831 5' - mdg1 400 2 70.55 CAGAATATAAACAATCTATAATCAATAAAAATCTTAAAAAACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chrX 22725556 5' + roo 8725 2 71.20 TTTCAATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCTTATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATATA:1 - chr3R 7539516 5' + roo 74 2 67.86 TAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTACTTGCGAGTGCACAC:1 - chrX 22824237 5' - gypsy12 10158 2 53.15 AACTGGTTTCCTATCAGCAAATCAATGTTGACTCAAATACCTTGGTGCTTTCTAAGAATTTTCATTGTACTTGTGAACCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 10831773 5' + Juan 4073 1 50.00 GGTCGGGGTTGATACTCTGATTTTCTGCGTTAGTGAAGTCGAATGAGTTTGTTTGGGCTTGCTGTAACAGAACAGGTAATTGTTGTTGTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAA:1 - chr3R 435978 5' - 1360 3005 1 56.55 GATTTGCACTCGAAATCAGAGTCATATAAAATATGCTTTTTGTTTGCGCCTTGCGTCTGCCCCCTGCCTCCTGCCTCCACTGGCCTTTTCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr3R 22671394 5' + FB 31 1 63.64 AACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATC:1 - chr3R 4528405 5' + F-element 93 1 77.40 GCGAAGGTAGTAAGCGCAAAAGCGTTGCTAAATATTAAAGGTACATACATACATACACCTCTATACAGTTTGTTAAGAAACTGTTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGAGTTTTTTGCTTAATTATACG:1 - chr2L 22150642 5' + S-element 70 1 82.88 TCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTACGGTTTGTCAACAAACTTGTTTGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTTACTACAATCTGTATGTTGAATCTCAACCTTCTAGGTTTT:1 + chr3R 4322607 5' - INE-1 165 1 73.73 AAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1 - chr3R 17605740 5' + Tabor 6893 2 52.05 CAGCTTTGTTGTTTCATTTATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:2 - chr2L 1260020 5' + Burdock 54 2 56.16 GTTGTATTTTCAGGCAGAGCGTCACCTTGGCGTCTCCATTTTCGTTTTCTTTGTTGTTGCGCCATCTGTATTTAGTTCTAGTATGCAGAACTAAACATTGGTCAGTTATGCATTTAATACTATCTTAATCGACCGACTTTCATAAA:1 + chrX 22936698 5' + Transib-N1_DM 452 1 69.18 AAATGGAAAATTGCACTTTTGCCGGGGCAAAGATAAGATGTGAATGTGAGAAGGATTTGCTCCTTCACTTTGGCTTTTACAAATGACTGAAGTTTAATTTAGGTTTTAGTTTAGTTTTGACAGGTTTTTTCTTTTCTTTTTGTTTG:1 + chr3L 4634054 5' - gypsy7 5006 1 73.97 CCAAATATGTTGCCAATTTTCTGTTAGGTTTACGATGTTACCGTTAGCCTTTTAACCACGAAATTGAAAAAGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr3R 6388853 5' + jockey 15 1 78.57 AGCTAATAAAGTTAAATAACACGGAAATTATGCGTAATTAAACGCATTATGCAAAACCGATGTAAGATAATAAAAACATCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCT:1 + chr2L 16810018 5' - R1A1-element 218 1 60.00 AAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:2 - chr3L 19350001 5' + jockey 74 1 56.85 GAAAATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3R 30634936 5' - roo 340 2 63.19 CCCACAACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr3R 21705937 5' + 297 6599 2 68.28 ATTAATCCCTTATTATGAAGGGATTTCAACGTGTGCATCATTTATCTTAGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCT:1 - chr3L 15327638 5' - blood 7318 2 65.75 AAAACATTCAAGTTTCTTTGGCTCGCACAACAAAACAGATCGATAGACAAGTGGCCAAGCCAAGTGTAGATGGGAAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr3R 13612785 5' + 412 7097 2 55.17 AACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATT:1 - chrX 1018151 5' + 1360 241 1 68.53 ATTAACAACTAAGGTTTGTAGTAGGGATTTAACAATATACATATATTTAAGTATATTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTC:1 - chr3L 2878524 5' - 412 432 2 60.71 AAGTAGTGCATACCCATCTCGGCCAACGAGTGGCTTAAGTCCTGGCCTGGCCTGGCCTGTCCCTGTCATTACGGAACGGAGACCAGTTTCAGGTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAAT:1 + chr2R 16385383 5' + S-element 1590 2 48.95 GAGAATGGTGGAGATGCGGTTTTTGGCTCCGCACCTGCGCCACAAGTAAGGGAGTCTTAGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTCTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCA:1 - chr3L 11826484 5' - INE-1 140 1 73.97 AATTAACTTAATATGAAATAGTTAAACGACAGTGTTGAAACTAGTAATTAAGATATGATATTAATACTAAAGCTTATCAAATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chr2R 16441785 5' + I-element 40 1 58.22 GTGCCGGGAGATCATCATATTGATGTTTGGTCGTGTCATTTTATGAGCAATTCAGCTGAAATTCAACGGAAATTTAGCTGACACTCTGGACTTGGCATATTTCCTAACTGTAAAATCCCAACTACGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 17113979 5' - roo 9055 2 73.29 ATAGAATCATTACTGATCACCTTTTCTTCGAAGGATTTTGAAAAATATTGCAAAGCGAATATTGTGAAGCACATACTCAATGTAGTAAAAACACCAAGAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGA:1 - chr2R 933603 5' - Tirant 8411 2 73.29 GGTGGGACAACGCAGAATCCGTCTGAGTCTTAGTTGCTGGCCCGTTTTGATTAACATAAAGCGAATAATAGACATCGACTGCCAACAACGTGATAGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTC:1 + chr3R 23489586 5' + Porto1 373 1 63.70 AGGGATGCGGAAGTAATTTACAATTTGGTAGAAATAAAAATCAACACATTTGACTGTATGGGTCTGTGCCTCTTGAATCTTTGCGCTGAATCTCAACATTCTATCTTTTATAGTTCCCAATGTCTCAACGTTCATACGGACAGACA:1 + chr2L 22062372 5' - INE-1 128 1 58.22 ATAAAGCCAAACTTGTTTTGAACACTGTTCCGGCTGCCATGTACGAGCTCGCAATAGTCTAATGTCAAATTCAATCACCGTAGAAGAAGTCAAACCACCAGCTGTTAACCTACCTTCTAATAAGAAAACTTGATCTTTTAGGTT:1 - chr2L 57765 5' + Q-element 361 2 76.39 CATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439048 5' - P-element 2495 1 65.19 CAGGGTATCTGATGGCCACATAAATCTCAATTTCAATTGTGCATTCCAAACACTTCTTGTTGTTCCTCTCGTTGTTTTGTGAAATAGCATTTTTTCACATTCTTGTGAAATAGCTTTTTTTTTCACATTCTTGTGAAATTATTT:1 + chr3L 3536787 5' + copia 387 1 51.39 CGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr2L 246013 5' + roo 58 2 69.11 CTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 + chrX 4778198 5' + 412 76 2 71.94 ATTTAATTATTAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATGGATATTAGGGAATATAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTC:1 - chr2R 4886049 5' - INE-1 580 1 56.16 GAGCAATACCATTGGAGAGACACAGTTGTGTGCCGGTTATGAAAACGGTCAAATCGACTCGTGTTGGGTGAGTATTCACTTGGCTGATACGGCACACATGTCATGCTCTGCATTAATTAATGCACTTATCCCGTTTATAAATAAAT:1 + chr3L 18865137 5' + diver2 435 1 72.60 AGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGAGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3L 19350011 5' + jockey 35 1 61.02 GTATCTGAACAAAATGCAAAGCTGCCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chrX 7786608 5' - hobo 2907 1 68.67 AATTGACTTTAGTTTCCATCAAGTTCCCAAGCTGCTGTAGTGTCAATCCAATCCCAGACTTGGCAAATATGTATCTTTTGATAAGGATCTATAACCTAGTCGATCTGGTCATGTCCGTCTGTCCATATGAGCGTCGAGA:1 - chr3R 15156206 5' + INE-1 130 1 51.80 ACTTATTAATCCAATGGCATATTGACTAATTTTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr2L 3890114 5' + jockey 27 1 66.13 ACATATTATTGAGAATTCGTTTTCTCTTGACCTTCGTTAAGAATCTCTCTCCCGACGTTCTCCATTTCGTCAGGTTCTCACTCCGAATTAGCGATAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:1 + chr2R 7665708 5' + Transpac 25 2 69.18 GCTGTTGTTGTTTGTTGCATACGGTTGACAACGGAATAAGAGCCATAAAAATGCGTTAAAGTTGCTACTTTATTTTCATTACGACAGAACCTCTTACACACACATATATAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chrX 10974478 5' - opus 7494 2 78.08 ATTTGGCATTGGCAGATGAACAGAACGCCTTGGGACTAGTGGTCCATTGCCATTGGTTTACGCACGTTGCCAATGGTTTAAAGTTGAAAGGTGTATCTGAATCTGCCGTCAGGTGTGTTGGAATATACTATTCCACCTACA:1 - chr2R 12240236 5' + copia 4874 2 79.43 GAATGTAACGCTGGAAAAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2L 76017 5' + roo 8703 2 63.01 AAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGAAAATCCCGTTAGCTTTTCATGTTATCCTTTTTTATTTACATTCTTGCGCAAA:1 + chr4 123992 5' + HB 171 1 74.66 ATTTATTTGCCGCCGATCAAGAAAAAACGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCTCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGACAG:1 - chr3L 23979562 5' + F-element 421 1 77.78 TACCGGGGTCAGAAGGTCGCCGCATTCATAATTAGCAACGAAACGATGCTCTGCCTGCCGCAGGCCTTCGAGCTCTTCCTGAAGCACTTGAAATCGATAACTGTAATTATTAA:1 - chr2L 16484058 5' + HMS-Beagle 243 2 79.65 CATAAATTATAGAACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGATGGGGGCAAGAATTGTGTGCGACACCGACTAACACTCTGCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 + chr3L 2724950 5' + Ivk 18 1 56.49 TGCCCCGTTAACCAGTGGAACCAAGGAATGGGTCTCTTCAGTCAACCATCCATTCACATGTACCCGTTTAAATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chrX 12525888 5' - roo 9025 2 53.42 GCTTTTGGCAGACAGCAAAAGTTGCATGCGCGCATTTCCGTTTCCGTTTATTAGACCGTGAGAGAGTGTATGTGCAAGACTTCGTGTGTGCCTTGTTGAGTTAAAGGTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAG:1 - chr3R 28271851 5' - transib2 425 1 67.12 AGATGAGTTCAGAGCTAAACCGAAAAGCCTGTGGCTGAATCCTTGATTATCCCGAGCCAAGCGAATACTCCAATGTTTCCCTTGATAATCCCCCCATTGGGCTGCGACTATATCTCTAGAATGTGTATGCTTAATCTTAACCTTCT:1 - chr3R 23603978 5' - INE-1 172 1 64.38 CTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chrX 6138706 5' + opus 140 4 62.11 GAGATTGACAGCTTAATTACCTGGAGCCTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chrX 14964582 5' - roo 9041 1 63.01 CGGTGGGACTGGAAAGAGGACAACATTCTAATCCTCGTAGGAAAAATATAATTCCTAAAAATACCTAATGAATACGAAAACATTAAAAAAAAATTAAAAAAACATATCTGAAATAAAATCAT:1 - chr3R 7614508 5' - transib1 1748 1 64.75 TAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTCTAACTGCCAGCCTTGTGGTCT:1 + chr3L 23456276 5' - Gypsy6A_LTR 256 1 70.00 AGCATTCTACGCTGAATGTTTTAATGCTCTTAACTATAATATCATACTAAAATATATTTCATATTAACACGAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chrX 16902357 5' + I-element 50 1 50.34 CAAATGCTTATCAATTAATAAAAATCATTGCCTACTTTTCTGCGTTTTGCTTTTCCTGGCCTTCCTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGTTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2R 23116217 5' + jockey 36 1 66.44 ATTATTACATATTTTAGACATATATGATTTGTGATTTAATTGCAATTTAATCTTCGGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAAAATAATAATTGTGCTCCGACATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATACATCTGT:1 - chr3L 23529727 5' - Stalker2 7481 2 60.96 CTGTATAGATAAATCTGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCAC:1 - chr3R 2689453 5' - diver2 4466 1 66.92 ATTACAATTGAAAACAAATGAATGCAAAAACGATAAGCAGCCGAAAGGATTGCCACAGCAGTTTCCCAAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGC:1 - chr2L 12340878 5' + diver 5898 2 77.70 ACAACCTGTGAAATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3L 25406597 5' + 1360 4 2 62.33 AGCCATAACATCTCTTAGTGGGGCAATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1 + chr2R 5214911 5' + F-element 16 1 76.12 AAACACACGATAAATAAATATTTTTAAAAACATAATAATGCTTTTATAAAAACATAGTTTAAATATTTAACACTATTTAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATAC:1 + chr2L 14714310 5' + Porto1 4480 1 51.37 GAATCTAATTATGAGGCGCCGAGATAAGAAAAAGGTTCTATCACAACCTGCTATATAAGCAATATAAGTTCTTGAATCAAAACAATCTCAATCTCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chrX 19536861 5' + roo 28 2 65.07 TTTAAAAGCAGCTGCAACTTTAGTCTTTACGAACTTTTAAGTTTGACATTTCCATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr2L 12349712 5' + F-element 59 1 68.49 ACAATAAATATAATTATGCGATATTCATGCCCAGCACTGGAAGACCAGGTGTAGTTCGGCACTAAGAATATATATAAGAATATATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATATTTGTTTGTAACTTATTGTTTACTT:1 - chr3L 8397874 5' - Tc1-2 1576 1 47.95 AACGGCAATGCCGAGAAAATGTGTTTGTGTGTATTTCCCTTATGCTCTACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3L 12224750 5' + 412 7082 2 66.44 GGTTGCCAGGGAAATACGCTTGTTCCTGGTTCAGCAGCTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 + chr2L 13792553 5' + F-element 34 1 60.94 CTCTACATTCCCGAGCCGTTACAATTTTTACTCCTTCAGCAATCGTAAAAGCGTGTGTGTGTGTGTATTTATGGGTGTGTGTGTGTCTACAAGCCTGTAAGCATATTTCAAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGCCTCTGTGCAGG:1 - chr2L 6149178 5' - X-element 4355 1 63.19 CAAGTGCCAAATTGGGGAATTTGATTCATTTGTCATTTATTTAAATTCTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACACTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2L 9472107 5' - roo 9030 1 56.85 ATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr3L 23986519 5' + opus 7052 4 59.23 AAGCACTGACTATATAAAAACCATGAAATGTAATAATAACTTGACCATTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGAC:1 - chr3L 11776751 5' - mdg3 172 2 65.07 ACCGTATGAGATTCTTTGAAAGCGAATGCATTCAGAGATCTGTTTGAGCTGTTGGGGCTTTGAACAAGTAAACGCTGCCATTGTGACTGAAAGGATAAGTTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTG:1 + chr3L 15879209 5' - Quasimodo 7046 2 75.56 GGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr3L 22400254 5' + 1360 39 1 53.85 GTTACCATTACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTT:1 - chrX 10161187 5' - micropia 5391 2 64.00 TTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAG:1 + chr3R 19859616 5' - opus 7422 2 73.10 CGCTTCGACGATGCGAAAACGAATGAAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3L 14550948 5' - P-element 2880 2 66.00 CTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 - chr3L 23456281 5' - 1360 3339 1 55.48 AGCCGGTGCAACATTTGTATGGTAATGGGCTGCAATAAACATGTCACTGGACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGCACGATTGCAGCGGCTT:1 - chrX 15391352 5' + rooA 105 2 74.47 AAAATCATTCTACTAGATTATATGCACTAGTTGCCGTTGTATTTTAAAAGACGGATTACAACACTATCACCGCGGAAGGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr2L 9485575 5' - 412 7505 2 54.17 AAATAAAAGTACCAAAGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGG:1 + chr2R 7727075 5' + BS 4671 1 71.92 TATTGTTTCTAAAACATAAAAAAAAACAGCTTATGATTTGCCTTCGGTTTTTATTTCCGCGTGTTCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTAT:1 + chr2L 12319238 5' - copia 198 2 57.53 AGTAAGTGGTGCCATCGCTGATTCCTTGTGTTACATCATTTGTATCCTCAGTCTGCAAGATAAAATGGAATTAACGAATCACACAACCTTTGGAAGTGCAAAAGCTTTGTTTCTGATAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGCT:1 + chr2R 5492062 5' - INE-1 575 1 58.90 GGCCTGACACATTTTTTACTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - 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chr3R 19859732 5' + opus 7144 4 66.44 GTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 - chrX 21852448 5' + Tirant 8173 2 63.38 GTGGGTGGTTTTCACATGTCAAGGTAATTTGGGCGCACTTTTTGCACCCGCCTCGTTTTATGGGCGAATTCAGGACTCCTTAGCAATCTCTGCGGACGCGGCCGCAGTAACGTC:1 + chrX 7457335 5' + gypsy4 45 2 61.40 TACGACGCATCTACTTCAAACTGGCCAAGTGGCATGCAGTCAGCTTGAAAGTGCAGAATGAGGTAAATTGTTAAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTCCATATCTTATGTA:1 + chr3R 25304707 5' + roo 8709 2 55.56 ATAGACAAGTGGCCAAGCCAAGTGTAGATGGGAAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 + chr3R 13612827 5' + 412 7138 2 75.00 CGGTTGTGGCCTAGTCAGATGGCGATAGGCTATCTTAGCTGGAGATTTTATGCCTGTCAGCCAAGTCGGTTATAATCCTAGATCAGATTATTGAGTTATAACTACTGAAAACCAAGTAAGTACGTTTTCAAAAGTGTGGGCATGAA:1 + chr3L 9875093 5' - INE-1 251 1 80.14 AAGGGGGACATGGGCGTTAGAGTGCCGGGTGCTGGCCTCTTGAAATTTGAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 21371447 5' + roo 8716 2 65.35 AAATGATTAAGCACCATTTAAAGAACTTTCTTTGAAAATAATTGCATAATTCTTTTTATAACCTTATCCAAAATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGCTGCATTGCA:1 + chr3L 15327533 5' + blood 7058 2 52.74 ATATTCATTGTTACTTAGCTTAAGAAAATAAAACATATTTAATGACAAAACATATATAATTTCCATATATATAATTTCCATAATAAAAAAAACAAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACAC:1 + chrX 3641142 5' + roo 8660 1 58.22 TGGGCATAACAACTGTAAGCTGCCTGTCCAGACAAAAACGAGAAGCAGAGTGAACCTGCAACCTGAAACAAGCTCGTAGCCGAAGCGAGTCGAAAAATGTCCAACAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAA:1 + chr3L 8456191 5' + Doc 103 1 73.29 AAGAGATGTTAAAATTTAAGAACTAATATCTTTTCGCATTCTGACCTCGGTAAACATGAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chr3L 14076200 5' + roo 8726 2 61.64 GCGCGTATTTACCTTTAAACTGGACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 - 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diver 182 2 54.11 CGTGATCGGGTTCTTGGCCTAAAAATATTTTCTGCCTTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 + chr3R 9160643 5' + copia 33 2 63.70 TGTAGTATGCACTTTTAAATTTGTACACACGTCATCCGCACTCATTACAAAAATATCAAAAATGGCTAACCAATGCGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTACTT:1 - chr2R 5542456 5' + 1731 46 2 53.47 TGATTATGTGAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGGCCTCCTTTCTCTACTCTTAG:1 - chr3L 25482987 5' - accord 7355 2 55.75 AATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1 + chr3R 19589889 5' + BS 5032 1 56.85 GGGACCGCAAATATGTTGCTTGATAATTAGGATATTTCCAACTCATTTTTCGCATAGTAAAATTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 7470348 5' + F-element 4681 1 60.00 GATATATCGACGGTGGTTTACGTCCATGCTGAAGGTGGGAAACTTCGCTACGAGCTGTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTT:1 + chr3L 22648288 5' + Tabor 65 2 59.59 CCCCCAATTTTGGGGCTGAAAATTCAGACAAATTTCCAACGCAGTGTCACTTCAAATGAAATATTTGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 + chr3R 27535417 5' - 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roo 357 2 51.37 CGTGTGTAATTTTCCAGACCGTTGTCATTGCCAATTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGT:1 - chr2R 6632634 5' - P-element 2808 1 28.57 GCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 10684741 5' - roo 352 2 62.88 ATGGGTTTTATACTAAGCCAAATATTTTTGCACAGCTTTGTTGTTTCATTTATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:1 - chr2L 1260052 5' + Burdock 6157 2 66.21 TCATAGCTACGACTGGGATATTAAACGACAGGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 + chrX 1061551 5' + 412 7142 2 78.08 ACACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 - chr2R 641926 5' + opus 7176 4 79.46 ATAAAATATATATATATTCTTAATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCAACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTTTCT:1 + chr3L 11822366 5' + INE-1 576 1 56.85 TATTAAAGCTAAGCTTCCTAACTAAACATTTATTGATTATAATTGTAATTAGAGTAGCAATAAATTCCCTGATCTTTCGTTTCACGTGGGTGTAGCAGGCATTTTATGATTTTATGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATT:1 - 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roo 9042 1 65.07 CTACTCGTCAGTCAATGGCATGAGCCCAAACATATTCATGCTGAATCCATTTGGACGCGTAATAGCTGCTTCGAAAAGCATTAGACTAAATACCTCCCGAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 + chrX 22853340 5' + FB 1 1 79.03 ATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr3L 23146481 5' + 1360 59 1 61.94 TTGGGTGTCTTAAATGGGTACGTTACGATGAGTTTGAGTACACTGAAATTGATCAAAGTTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr2L 17250847 5' - opus 471 2 56.43 ACTCAAGTTGAGTACGGTCGTGGCTGTGGTAACCAAACTTTCACCGGAAGTGGGCCAATAAAAAGTATACACAGAGATACACAGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTT:1 + chrX 13426110 5' + BS 4 1 69.83 CCCACCGCCTGTGCCATTGAGGGTTTCGTGAATACAATTGTGGATAGCTATGTTAATTCGAAAGATTGTACTATGGCCAACATGAAGATGGCTTGGGTAATGAAAAAGGTAGACACCTCACGAACTATAAAAGCTAGAAGATTAAG:1 + chr2R 20636628 5' + INE-1 161 1 70.55 ATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAACCCGGTATAGTAGTAGTATGTGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTAGTAGTATGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGC:1 - 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Stalker 180 4 52.59 GCTGGACCTCCGCCATGGATACAGATTCCATATGTACTCCCTGCATCACAATGGCATTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTA:1 + chrX 1287800 5' + jockey 4843 1 60.96 GCATAGCTGAATCATTTGCGCCGATCAGTTGGGGTTACTTAATGGGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTTTATGC:1 - chr2L 12553499 5' + 412 76 2 66.44 TGCTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 + chr2L 13792588 5' + F-element 51 1 59.09 AAATTTAAACTTTATTTCTTAGATCTTCGATGTCAAGGAACCTTGTATTTGTGTTTCGAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chr2L 13250489 5' + opus 7140 4 69.18 ATCAGTGGCGGACAACAAAACATTTATCCATCTCTAACAAGAAAGAATGAATCTATAGCCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCTGCTACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATGT:1 - chr2R 5439233 5' - INE-1 498 1 60.74 GATGGGCCGGCGAATTTCCCGTATCTGCTGCATGCTAAACAGATGGGGACTTAGACCGCCGTGGCAACAGAAGATATTCTCCTCAATGATCGCCGCTTCTAAGGTAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGT:1 + chr2R 21881831 5' - 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mdg1 7432 2 66.44 ATTTCAAATTTTTCCCCATCCTCTCATCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTT:1 + chr3L 9571688 5' + jockey 4527 1 76.32 ATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCA:1 + chr3R 29418696 5' + mdg3 94 2 79.45 CTCTACTCTGAGATTACTTTCCAAACATACAATAATATTCAAGGTTACCGAATGTTAACAAAGGCAGTTACCTTTGCCACACCTTATTAGCCCCCATCCAGTCGATCATCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 + chr2L 12079559 5' + mdg3 5261 1 77.86 TTCTATTAATGAAAAATAAACTTATGTAAGAGAAAATTTAGGTAATAAGACTACCAAAATCACTTAAGTGCGCTATTTCCATTTCGCCTTCACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCA:1 - chr3R 2555621 5' + Bari1 30 1 65.75 AAAGATTTCGGAAAATTGGCAGGAAAACAACATTTGTATTAGCAGCTCAAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCAGTTTCGTATGCAATTTGAAATCATATTCTCCTAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTA:1 + chr3L 15094383 5' + G4 3815 1 42.47 CATTTTTTACTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 - 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chr3L 16047626 5' + Cr1a 495 1 42.86 CCGAGAAAATGTGTTTGTGTGTATTTCCCTTATGCTCTACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3L 12224740 5' + 412 7092 2 59.59 GTGGTAAAACCAAGTTCAATAGTACGACTAAATGGGAATTCAAAGTGGGAATAGCCTTTTAGCTACAGACATTTATGAATAAGATCAAGAATTGAGTGTGCTTACAACAACAAAATGGAGGAACTAGTATACAAAATCAGAGGACG:1 - chr2L 6224829 5' - Gypsy12A_LTR 2070 1 65.07 GAAATGGAAAAACATTTTACAAAAGTGTGAGCGTGACTTGCGTGGCTGGAATCTGTATGCTTGATCTCAACTCTATAGGCTTCCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGCTGCAGG:1 + chr2L 22132479 5' - pogo 2069 1 62.14 GAACAAAAACAAGCGTCCATAATAATGTCCTGCCAGCTCTTTCTGTCTCTTTCCCTGCTGCAGAGCAAACAAATTGATACGAATAAGATACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCC:1 - chr3L 19354481 5' + Doc 460 1 70.97 TATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGATGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCT:1 + chr3R 25554216 5' + micropia 29 2 61.19 GATCGATGGAAAGATGTTAGAGCCACGAACATGGCAACTGTAAAATCCAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACT:1 + chrX 17805968 5' - roo 9042 1 59.55 ATTATTGAGCAATGCCAATGCTCGGAAAAACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 - chr2R 21402708 5' + mdg3 5301 2 51.37 AGCTGTTCGGGCTGAAAAATTGTGATAGCTATTTGAGACAATTTTCCCCTCGGCCAAATTCAACAATTTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTCGCATCAG:1 + chrX 4300054 5' - opus 492 2 70.19 AGCGACCAAAATATGACATCTTTCCAAGGTTAAAATAGCTAAGGCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chrX 18806233 5' - roo 341 2 67.65 AGTGATGATTATTGCACTCGATACACGAGTGTCGTCTTGGCTGGCGATTCTGCTGACAGGCCAGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCC:1 + chr2R 9451308 5' - roo 8658 1 50.81 GAATGTACCAAGTACACTTACCAGCAATACATTGTAGACTGCATTAATCCGTTCGCTGGCATTGTCCAGCTTGTCTGTGTTGGTTATCATCTCGGCGAATACCTTTAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCAT:1 + chr2L 17476396 5' - roo 8674 2 74.48 GCTTGTGTGCGCGCGAGAGGGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2R 6632563 5' + P-element 27 1 54.13 GAAAACTGCATCGGCATCAACCATTCTTTGGGTCCCAATCCATAGATGCACTGGAAGTATTTAGTTATCTTCGCATATAACTAATATATTTTTATAGTTCAATACTTAGATTGGATGTTACTTATTTAATTTGCTTTATTTGATTT:1 - chr3L 18322057 5' - TAHRE 34 1 58.22 AGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chr3L 13827355 5' - hopper 1388 1 55.14 CATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCA:1 - chrX 20999575 5' + BS 73 1 71.92 ACCTATGCATCCCACGCAACACTACCCTTACCAAACACCACGCACTATTTCCTGGTGAGGTCCATTTTTTGACTCGACTAAAAATCTGCAGACTCTATATATGAAAAAGTGGCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACATACACGAAA:1 - chr2R 5076365 5' + Tc1 1609 1 71.23 ACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACAAAGTACGGACACAAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 + chr4 158192 5' - 1360 3331 1 55.48 CGAAAAAGGAACTTTATTCAAGTTGAAAGAATACAGCAATGAGCAAAAGTCCATAAATAAAATACAAAAGATATTACAAAGAACGAAATGAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATA:1 + chrX 2521119 5' + Porto1 4225 1 66.44 CGAATGGACTACTCACTGAGCTCTGCGCACACATTTGGCGGTATTGATTAGAAGTTGCGACATTGCGAATTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chrX 1523671 5' + jockey 28 1 72.73 CTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCAGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGACTCGGTGGTCGTCAGCGCCTACGCGGCGG:1 + chr3R 2424361 5' - HMS-Beagle2 144 2 73.79 CGGGGCTTTAAAGTTCATGGTTGATTAACTTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTT:1 + chr3R 24476306 5' - 412 7453 2 78.08 CTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCATGCAGTT:1 + chr3R 22100531 5' + 412 7137 2 71.23 GGGCTGCGACTAATTAACACATTTATGGAGTGGCAAACATGATGTTTGTGGGCGTTATAGCGGGCGTGACAAGATGGGCTGCGACTATATCTCTAGAATGTGTATGCTTAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCATGAGATCT:1 + chr2R 21885321 5' - INE-1 149 1 71.23 AGAAAGCTTTTTCTAAAACCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 - chr3L 16212787 5' + Transpac 4954 2 78.05 GCCGAAAGGATTGCCACAGCAGTTTCCCAAAGCGGGGTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCGTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTGTATATATCGATGCTAA:1 - chr2L 12340839 5' + diver 5944 2 50.00 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTACCAACTTATTCCAGTAGACTAGTTTTAATCAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTCAGT:1 - chrX 10664376 5' + Cr1a 4034 1 63.01 CCAGCACGTGCAACAGGACCAAACTGAAGCTGAAGACCAGGAAACCTTAGGATGGAAGGCAAAGTAATAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGT:1 - chr2R 7020660 5' + Bari1 54 1 52.74 AATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTAC:1 - chr3L 25508749 5' + 1360 339 1 60.96 ATATATTTCGTGTGACATCCTTTGTGTACATATACATACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 + chrX 22560050 5' + Transpac 58 2 69.05 ATTTTGCACACTGAACACTACACCATGGTGGTTACATTTAGTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT:1 - chrX 14568937 5' - Doc2-element 235 2 75.38 TATATGAGGCTTTAATATTTTTATCTAGTTTGTCTATTCATTAAAAAAAAAATGGTTCAAAAATAAAGTGGCCAACTAACAAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 17305571 5' + roo 39 2 57.53 TGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2R 11609237 5' - roo 8985 2 77.40 TAGCTAATTTAGATATTGCATCAGCCAGGATTACATGGGTGTCATATCAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chrX 13395249 5' + roo 8704 2 52.94 ATTATATTACAAGATAGTTGCTAAAATTCTTTTACGAGAATTTGAGTAATGATATTATCTTGAAAACTTGGTCTAAGATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCAACCAATTG:1 - chr2L 17029744 5' - blood 7382 2 74.66 GCGGGAATGTCTTTGTACTATTATTGCTACTTCAGTGATATTGGGCATGTGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACG:1 + chr2R 19351966 5' - Burdock 188 2 63.70 AACCTCGTCTTTTAAAAACTTCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACAAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr2R 5531238 5' + 1360 59 1 75.18 GTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chr3R 21705995 5' + 297 6642 2 68.46 CAGCCATCCGCCACAGCCAGACGGATTGTGTGCCACTTTGCAGGGGTTCACTGTAGACCACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTACA:1 + chrX 9707137 5' + Doc 55 1 58.21 GCCGCGAGATCGAAAACCGAGAATTTTTGCCGTTGTTCAAATTTTTTTGCAAGTGAGAATCTTGAACAACAAGAAGAATATACAACACATAAATACAACAAAACCAAGGACGGTGAGACGAAAGAAAAGCATGCATTGTTGCGTTG:1 - chrX 8805665 5' - Doc 276 1 75.34 TGTACTCACTAAATGGGGGGATATAATTTAAAGCACTTCTATTAATATCTAGCCATTATTCCAGTAAATGAATCAGATTTTTAGCTAATAATTTTTTAACTATTTTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr3L 13374064 5' + pogo 12 1 71.23 ATATTTATTTTGGATTATGAATATTAAAAAGCAATACCAATTTGTTGCTCAAGTTTAATTTAAACTTATTCCAAAACTTTGAAAAGCTGGGTGTCATGAGAATTGTTCTCATCCATTGTCTTAATAATAATTCTTAATATTTACAA:1 - chr2L 12477949 5' - BS 311 1 58.22 TTTAGACTTGAAGGCCAGGGAATGAAGACATACATATCATATTATATCAAACTTACCTCGGAATTGTTATCAATTATTTGAAAGATAGTTTAACCCTTTCGAAAAAGCAGTTGTGTAGAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTG:1 + chr3R 31068178 5' - Cr1a 61 1 78.08 ATTTTTGACGTAATCGATCACACCTTTGCTGCACTCATTATAGCTACCACAGCTGTCGCGATTCTCGCTATCCTGGAGCACCGGCCCAGCATGCGTGAGTTACGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGATGATATG:1 + chr2L 22015869 5' - Tirant 377 2 69.29 CTATGATTTAGTAGCCTGCTTATAACTGTCTTCGTCCGAGTTCGTATTGG:1 + chr3R 8163632 5' + accord2 7558 2 58.00 TATGCGTAGATGGAGCGTCCCCATCGCGGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 11133529 5' - 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chr2R 8395994 5' + pogo 60 1 68.15 AAGTACCAACTTTACTATTACTACTACTAAATTTAACACCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAC:1 + chr2R 12240107 5' - copia 5041 2 76.03 GAAACTTGGAGTAGCTGCCTTCTTCAACTTGTTGAGGCACCCATTCTTGGTTTTACTACTCAGTCCCAGAAAACGTGTCTTGTAGAGGAAGAAAAACGTTTGTCCTTTTGGAAACACCTACCAGGACGTAGGCAGTCTAAGATTCT:1 + chrX 2887911 5' + baggins 5039 1 52.74 GGAATGGGGACTCGTTTCGGTACACCAGGGGTTAAGGAGGGAAGTTGGAAAAGGTTAAGACGCAGTATGTGTACATGTGCTACAAATTGAAAGGAGAATCTTAGACCGCCTAAGCCCTGGTAGGTGTTCCCAGAAGGACAGAAGTT:1 + chr2L 3010673 5' - baggins 5009 1 62.33 AAGCAGCTGCAACTTTAGTCTTTACGAACTTTTAAGTTTGACATTTCCATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 + chr2L 12349717 5' + F-element 63 1 65.52 GCTGCTGGCTGCGGCGATAAGCTTCTTTTAATAAGCGACAAAGCTAGAAGTTCATCCAATAAATACATAGAGGAAAATGCGAAGCTTTATATTTTGAATATACAGAGGTGGTCGAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAA:1 + chr3R 27510032 5' - Bari1 1684 1 67.12 TTGGCCACAGATCTTTTCAATGTTTAATTTCATGAATACTAAAGTTAAGCAACTAAAGTTGGTTGTCCGAAGACATGACTCAGTGCTAGGATCCCAAGGGCCATGCGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAA:1 + chr3L 21714666 5' - S-element 1704 1 59.59 GTACGCTTCGACGATGCGAAAACGAATGAAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAA:1 + chr3L 14550945 5' + P-element 19 1 60.00 ATGAACTATTTCGCGTCGTTATATGTGATTCACGTTTGTCAGTTGTCACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATACACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAA:1 - chr2R 954556 5' + Quasimodo 50 2 58.22 CCGGAAAAGCAGCCCTCCACTGAGGAGGAATCATCCGACGAGGAGATAAGCGAAAGTCCAAATGCAGCAAACAAGGTAAGAGTAAGGCTATTCGGCAGACAACCACAGTCTTTAACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAACGATTCA:1 + chr2R 13136783 5' + Doc4-element 338 1 70.55 AACTAGGACATCGATGTCGATGCTTTTGCTCCTCCTGATGGCGATTGTGATGGTAATGGTGCATACTAATTGCGTTGGTTTTAATGGCCGAACAAGTGACGACCTAGCAAAGGGTAAAAAAAAAAATAAAAACAGAATTCAACAAA:1 - chr3L 15361701 5' - Tc1 1389 1 66.44 TCTAAATTGAATTAGAAACAGCGCATAAATCATATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCA:1 - chr3R 23010084 5' + I-element 86 1 75.34 GTGAACGGGTTGGGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 17305439 5' - roo 354 2 56.94 GTCGTCGTTACATGGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - chr3L 23986627 5' - opus 447 2 56.85 ATGAGGGCTGCAACATTCGGAGTGTGCACAGTGCCCTGGTCAAATGTTTTTGTTTGTTGTGTTTATTTTTTACTTATTTCGCGTTTAAAAGTGTTTTAAAGTGAGATACCCGGGTACTGCGGATCTCTGCCCGGGTGGAC:1 - chr3L 12572534 5' + baggins 347 1 75.00 GGTTGCAAAAAGTTGAGTTTTAAATTAAAATGTGAACCGAATGTAATAATTGGAATCATTGAGCTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2L 10184375 5' + Doc 8 1 80.88 CCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTA:1 - chr2R 13644490 5' + Burdock 6222 2 78.77 TAACTTTCAATTCGTAAGAACTACACGGATTACAGAAGATGTTAATGTGGAAACATTTATTCTATTTCTAGTACAACTAACCAATTGTTTTTCCGGTATATCCATTTCAATTGGGTTTTTTAGGTCGTTTTGTTTATTTTTTTCAC:1 - chrX 11632260 5' - Porto1 185 1 68.49 GAAAAAATTTCTATTTGCACAACTGACACTGACAATTTTTTCTCTTTACCCAAATTTGTAGCCAATTTCACAAGAGTAACATGATATTTTATGACGTTTCCCAGAGGCGACTAGCCTCCTGCCAGAGGCGAATCCTGCTTGGATGC:1 + chr3L 18951906 5' + R1-2 3142 1 67.81 CAGCAAATATCGCCGAAACCGCGTGCTTAGAGATCTGGACTTCACTCTGGCCAAGCAAGTATTCATTGTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACT:1 + chrX 21290580 5' - jockey 4960 1 57.63 GTGGGCTCCCCTCCGTTGTGGCGTTGTGTGCGTGTGTGGCGTTGTGTGCGTGTGGGTGTGAGTGCGCTAGTATGTGTATTGGCAGCAAAAATCCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACA:1 + chr3R 11334492 5' - Copia1_DM 137 1 37.67 ACTTTTTAACTTTTGAAAAGCAATTCCGTAGATTATCGAATTACTTTTTAGAAAACATCCAGGTGCCACTTCGTTGTCCTTAATTATACAAATTCATTTTCTACTCCCTATCCAATGTTCAATATTTTGACTACTCCAGGCACCAT:1 - chrX 16746265 5' - invader2 4681 1 47.95 AGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTAGGCTCCGTTCATATCTTATGTATATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3R 16181153 5' + roo 8738 2 69.78 CTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chr3R 24476364 5' + 412 60 2 63.70 GGTCGCCAGTTGACAAGCAGAACTGCCAAAGGAAGTTATATAAATTGCAGCAGATTCCATCTTGGAGCTCTCTCATTGTACTAACATAAATCTCATGCTGTTAATCTGATATAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGAATATAG:1 - chr3L 14202329 5' - Cr1a 4132 1 77.40 ACTATGCCATAAAACCAACGCAGGACATCGGCCGGATTTTTAATGAAACACAATAATGTTACTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCTTGGAT:1 + chr3L 11745268 5' - G2 2784 1 58.77 CAAATTCGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chr2L 2276800 5' + F-element 33 1 56.14 CATAAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chr2L 13250362 5' - opus 7467 2 67.29 GTAGTCGGATTTATTTTAAGTTTACACATAAGCTAGTCACATTTAACCAAAAGTTATTTACAGAGAGAAAATATTAAAAAATACTTACAACCTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chr3R 25904131 5' - 412 7517 2 65.07 AAAGATTCCCACAAATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCATTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr2R 5237932 5' + Doc 46 1 58.90 GTCTTGGAAGGGAATTCAAACACCCAATCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTGTCGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr3L 14551062 5' - P-element 2873 1 59.63 CAAATGCGGCATATAAACGAGCGCATAATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGGTGCA:1 + chr3L 11336321 5' + blood 42 2 52.78 GGCTATAAGTAGGGAAATTGGAGAGACACGTTCAATCCAGCGATTGTCATTAATCATTGCGGGCGGCCAGACATAACCATAATAACCATTTTGTGGCCAAATATTCTCCCACACATCATCTAAATTTCTGAGCGTGCAGACTGCG:1 + chrX 2507942 5' + Cr1a 334 1 72.41 GAGAGTTTCCTGATCACATTGTTGGCTTTCCCAGTCGAATTCATGTTTGGGAAAATGTTACGATGCGCTGGCATGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTA:1 - chr2R 16146848 5' + R1A1-element 4921 1 60.83 AGCAGCGTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCGTATACAAACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATTTTTCTCCGTTCTGAAGATATTAATTTTG:1 - chrX 22906780 5' - Transib-N1_DM 32 1 66.20 TATGTCAGCAATTATTTTATTTATATTGTCATTGCACACATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 - chr3L 6775428 5' - blood 304 2 73.38 ATAAGTATTCGATTGGTTGGGCATCTTGTGCCACAATTGTCCATGTGGGAGTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTCTGTTTATG:1 + chrX 1689986 5' + 412 7116 2 60.71 AAATTGATCAAAGTTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2L 17250802 5' - opus 457 2 64.22 AGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr2L 76050 5' + roo 54 2 62.50 TTGCCTAGTTTCACGCTTTGGTTTTCCTTAATCGCTTAACCCAACTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 - chr3L 17207833 5' + hobo 66 1 66.19 GAAAAGTGGGTGGTGGGAAAACCTATACGGACAGCGGATTCCAATACACATGCAACCGGCACACACACACACACACACACACACACACACACATACGC:1 - chr2R 12093609 5' + accord 7031 2 74.49 GACACCCATTCACCCTCCCCTAGATGCCAATACACGACATCCATCCAATCACCCAACAACCAACCCCCCTCGACAAAGTTCTACATTCGCTATAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGC:1 + chrX 7628795 5' - 1360 80 1 59.03 CTATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 + chr3L 24152412 5' + HMS-Beagle2 30 2 63.19 ATCATAAATGCACACAAAACACACAGGAGACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGA:1 + chr2R 22722982 5' + 3S18 10 2 75.56 ATAAAAAAAAGAAAAAAAATATGCAAAAATAATCCTTAACACTTGAATCCCCTGGCGATTCTCTGGAATCGGAAGATGTTTAATGTGTGTTCGTAATTCAGACTTATTCCTTTTCCAATAAGTGTGTGTTGGGTCATGCAGCCGCC:1 - chr2R 11325018 5' + diver2 4531 1 17.81 AGAGATGCGTATTTTGGATACGAAATCTATGGTAGTCATACGTGGCGTCGGGAAAATGTATGGTTGGCTAAGGAATGACTTATAACCTAAGGCATTCTATGATTTGGTTTATGTCTGTTGCTATGTGGTAATGTATGTGTGTGTG:1 - chr2L 13573777 5' - Quasimodo 44 2 53.10 ATTATATTGAAGAGAGGCAAGGCCCCCATTTCCGCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 + chr2L 1558647 5' + 412 87 2 77.40 AAGCGTTGGCGAGAGCAGGGCAAAAGTTTAAAAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr3L 13634179 5' + 297 38 2 59.44 ATGTATCTAATGTCTTTGCTTATGCTTGCCGGTTTGAGGGCGTTAGAGCGATACAAAAACTTTTTAGCGAATCGATAGAAATGTAAAAGACTAATCAGAATGTGAAAAGAACAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCG:1 - chr4 54430 5' - INE-1 255 1 64.96 AGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAA:2 + chr2R 7727090 5' + BS 4686 1 61.64 CGAGGGTTCGTAATGAGTTCTATGGATTTTAGACTGGCAGTTAAATTGACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3R 21001886 5' + 412 7127 2 69.18 AGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 7035232 5' - roo 9020 2 52.05 AATGGGGGGATATAATTTAAAGCACTTCTATTAATATCTAGCCATTATTCCAGTAAATGAATCAGATTTTTAGCTAATAATTTTTTAACTATTTTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3L 13374075 5' + pogo 23 1 65.07 AAGCGAAAGCAAAAAAAAAATGTCGGTAGACAACGTTCTATCACAAAAATGGATTTTATAATATATTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 - chrX 14254489 5' + copia 35 2 53.23 GCTCCGCTTTGGACAACAACATTTAATGGTGACAAATGTACGCGTATATATGCTCATATTTATATTCATGTGCGTGGGCGGATTTCTTCGATCAGAATTGATTTTGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATAC:1 + chr2L 1635909 5' + 1360 3213 1 58.90 GTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chr2R 5214961 5' + F-element 42 1 51.82 GCACATGAGTGGTTTAGATGAGTCCCAGTTCTGAAGTGGCCAATTCAATGAATTACGACCTTATCTGATCTACAGATAGGCAGACAATTTAATCTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 - chr2R 23000175 5' + mdg1 7066 2 66.44 ATATACGATATATCGATTGGGCTATCGCAAGCACTGGCGCCCCATCTCTACGATAGTGCTTTCGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chrX 14826205 5' + P-element 28 1 57.14 TGCAAGTGACAGCTTTCATCAAAGCGATTTGTTACACAGAATGGTCCAGCACATATGTATTGTATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 - chr2R 12787921 5' + 297 6633 2 60.96 GGAGCATAAAGTTTATGGGCAACAAAAAACTATCTCACACACAAACACACACACACACCAACAGCACTAAAGCACTAAAATCAGCGAAGAGTCTCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr3L 7092955 5' - hopper 1412 2 68.55 GACTAGGGGACAGTCGCCGGGTCGGAGAGATGTGGATAATTCAATTTTGCAGAATACAAAAATGTTTTGGTTCAAAAGATAATAAAATATTTGTACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCC:1 - chr2R 4930645 5' + Ivk 25 1 64.34 CAATAATATTCAAGGTTACCGAATGTCAACAAAGGCAGTTACCTTTGCCACACCTTATTAGCCCCCATCCAGTCGATCATCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:1 + chr2L 12079588 5' + mdg3 5260 1 70.91 AAGAAAGTTAAACATAAATCCAAAAACATCGTAATTCAACATACATTTTTTGTATAATTCTGTCATTATACAAAATGCTTTGAGACAAAACATTGCTAATTGTCCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCC:1 - chr2R 1193105 5' + GATE 31 2 67.83 GTTAATTAACCAAATAGATAGAGAGTCAGCGAGGCGCAAACTTAAGCCTGGCAGCCGTTGTTGGGGAACATTCTGGGACTTGCCTAAAACTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 15988105 5' + roo 8686 2 68.61 ACGCTCGCACTTGGACCGGACTCTTTATACAACGTGTTTGTAAGTTGTAAATAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAAAGTTGCCCACTGCCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATGG:1 + chr3R 1142109 5' - 1360 3277 1 63.01 CCTTCTACCTCCAAAGCAAACAAACGGGTCTAAATTGAATTAGAAACAGCGCATAAATCATATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCTTAACCCCAAAACTCT:1 - chr3R 23010112 5' + I-element 56 1 52.78 CAGAGGATCCATGAAGATAAGTATCGACCAAATGCAGAACTCCAACAGAATTAAACTATCAAATTATTAATGTATTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTT:1 + chr3L 15719896 5' + Porto1 4626 1 65.75 ACCACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTTCTTTGTGC:1 - chr3R 2533954 5' - gypsy8 158 4 51.89 TAACAAACTAATATTTAAAAAAAAAAACAA:1 + chrX 8983586 5' + TART-B 10629 2 83.33 GTTCGGCACAAGGTCAGGGATTGATTCAACACACCATCCTCTGAAGGATTCAGAACTGACGGGTAGCATAACTGACTATAAGCAACTATGGCATACGGGGATCTATCAAGGCTGAACTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chrX 11471592 5' + jockey 4679 1 73.29 GCTGCAAATCGAATTTTTCCTTTCAATAAAATGTGAAAAAAATAAGGAAAGGCGGAAAATTTTAAGGCAAGATATCTAAGCCACGGTCCAAATAGAGAAAAGCTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 12866344 5' + roo 16 2 74.66 AATGTTTGTACGCCGCAGCTGCGTGCTAAATATATCTGCTTTTGTTTTTTATAAATTCAACAAGTGCTATTTAAATGGGTTAGTTAGCCACAAGTGATCATAGGCTTTGACTCAGCCCAGTGGGTAGCAATTATTAATTATAATTA:1 - chrX 17576530 5' - diver 278 1 72.60 GTAAGTGTTGCAATCGAGTTTGCGTAGTGCAACTTTTTGCCTTTCATATTACTTGAAAAGCAGGCGATGCGAGCGATAAATATATACAACATATTTCCATTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTA:1 + chr2L 20267532 5' + pogo 300 1 69.66 ACAAATCGAGTCCATCGAGGGTAGCTTTCGGAAACTGGAGTTCGACTAACCGATCGCCAGTTGTAGTTTAAGTTTATAGTCTTTAGTCTTAGGCAACATCCAATCAATTAACCCACAGCTGATTCGGAGAATGCAATTCCCGCCAA:1 - chr3L 5783508 5' + transib2 186 1 77.40 TACAGATATGCAACCAACGAGTATGCCAGTAATCGACACTTGGGCGCGGCAAACAGGACTCCGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr3L 22642931 5' + hobo 50 1 55.47 GAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGAAAATCCCGTTAGCTTTTCATGTTATCCTTTTTTATTTACATTCTTGCGCA:1 + chr4 123990 5' + HB 169 1 73.29 TTCATGTGCCGTTCATTAGCACAAAACCCACACATTAATTCCTTGTCTCTGTGTGGGTGTTTAATCCTCGGGGAGTAACATACATTGTCCCTATCTACTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGTGAT:1 + chr2L 11781553 5' + R1A1-element 5320 1 52.05 GCTGTAAGAGTGCCGAGTGCGGACAGATATATACTCGTAGATGATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACA:1 - chrX 4186709 5' - I-element 5277 1 68.49 CAGGTGTAGTTCGGCACTAAGAATATATATAAGAATATATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATATTTGTTTGTAACTTATTGTTTACTTAAAGCAAAATTTTTAGATAATTTTAGTAAATAGGTAGACTATCGT:1 - chr3L 8397829 5' - Tc1-2 1531 1 77.40 AGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAG:1 + chr3L 22052759 5' - mdg1 352 2 65.07 CCATGAAAATGGTCGCCAAGAAGGCCACGCAACACACATAAGTGAGGGGATATCCTGAATCAACCATTATTTCATACTCTCAAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTGTGACCTAGAAAGTCTTAGATTTAAAATTTAT:1 + chr2L 4106265 5' + jockey 4800 1 57.53 CAGGCCTATAAAGTTTTTATATTCTTAATCAGAATAACCAGCCGAGCCGAAACTAAGTATAAAAATAGATATTCAGAAACCCGAAGAATAAAGTCTACGCAAGTTCGTTCTAAAGCAATACCATGCCGACTCTAACGTCTACAAAC:1 + chrX 23067457 5' + INE-1 218 1 56.16 TCTGCGGAAAATGTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chrX 1103734 5' - pogo 2058 1 56.16 CACATTGATGTGCCATTCCAAAAAGAAAACAAAGCAAACCAGTTCATACACCTAACAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr2R 8395902 5' - pogo 2038 1 62.33 TAATTACTTCTAGTAATGTGGTGATGAATTTATTATACCCGTTCGTCGTAGAGTATAAGGGTATACTAGACTTGTTGAAAAGTATGATACAGGCAGAAGGAACCGTTTCCGACCATTTAAGGTATATATATTCTTGATCAGGACCA:1 + chr2L 22130376 5' + INE-1 81 1 61.64 AATGGAAAAACATTTTACAAAAGTGTGAGCGTGACTTGCGTGGCTGGAATCTGTATGCTTGATCTCAACTCTATAGGCTTCCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr2L 22132481 5' - pogo 2077 1 65.38 AACGTCAATCCAAATCATAGACTTTGCCCAGACTCAACTGATTATATATGCACCAATGCAATGCATACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chrX 17732083 5' + pogo 52 1 57.53 AAGGAGAGCCGTCGACAATTCTCCACTTCAGTTAAGGGGGCTTCTCCCCCCCCGAAGCAGAGGGAGAAGGAGAGTATAATTTAAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTAT:1 + chr3L 5686147 5' - hopper 1111 1 54.29 AAGTGACAAGCCTCCGTTTTTTTGGTACACAGAGATCAAAAAAAAATCCAGTGCGAATAAGATAAAAAGCCAACTAAAACTAATTTTAAAATAAAGTTAAAAATGTTATAAACACAAATTCAATAATAAATAAATTAAATATAAA:1 - chr2L 7595520 5' + X-element 4715 1 71.03 GCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATC:1 - chr3L 7962270 5' + blood 7093 2 72.60 CAGTAGCCGTGTTGGTTTATTTTGCTTATTTATACTATGATAGACGAAAGACAAAAATCTGTATTGGGAATAATTAATACAAAAATAATATAAAAGAAGAGAGAATTCAATAGTCGAGTTCTCCGAGTATCAGATACCCGTTACTT:1 - chr3L 27859913 5' - INE-1 549 1 56.16 GGGCCGCTCAACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTA:1 + chr2L 17210287 5' - jockey 4909 1 76.39 GAGCAGAACAATAGTTTACTTCTCCGGAACCATTCCAAAGACCTTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGGTAGAGAGCGAGAG:1 - chr2L 5893389 5' + 1360 96 1 76.43 ATATCTTCAATCAATTTTTGTACACGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr3R 4581823 5' + 297 29 2 62.94 GGCGAGGGTTCGTAATGAGTTCTATGGATTTTAGACTGGCAGTTAAATTGACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 21001888 5' + 412 7125 2 67.81 GGTTATTTGAGCGACGTGTTTACGCATAAAAATTTTCCAGCGCACTTTCTGGTTGCGAGGGTTGGGGGGAATGGTTGGAGATGGGCGGGGCGGACTGCCCCTAAAAGTCGTAAAATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr2R 11057411 5' - pogo 2097 1 74.66 AAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr3R 10684748 5' - roo 332 2 71.03 AATATATAAATGATTTGAAGCACGTTTGAAAAATCATTCTTTTTAATCTCACCATTTGAAAGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:2 - chr3L 16496725 5' + jockey 4769 1 58.22 CTTTTCTGCGTTTTGCTTTTCCTGGCCTTCCTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGTTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTACTTGTGATCCATCACAA:1 - chr2R 23116183 5' + jockey 70 1 58.62 TGCCACACCGCCTTTTCTTCCAAATTGTTGTATTCCCAAATTGTAGTCGAAGACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGACCTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr2L 3659074 5' + 412 68 2 60.27 ACTCAAACCAAAATAGAACTTTTAATGAATTAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCT:1 + chr2R 4312924 5' + gypsy 39 2 56.85 TTACTAACGACCATCATGAAAGAAATATAAATTGATAAATTAGGTGTAAAAAATAAGTGTTATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 - chr2L 18193120 5' - mdg1 362 2 58.90 ATGGAGTGGAATTAGGCATTGGACTGCGCCGCCAGTTAAGAGACACTAGATCAGATGTTCAGATATCAGCTATTCACGACCTGATTAGTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATCTCAGAAGTGGGATTAATAATCCAAAATGGACGATA:1 + chr2R 5395679 5' + mdg3 284 1 58.90 AATATATACTTTTCCTTTAAAAAAGCATTGCATACTTTGCAACAGCATTAAAAGATACTTCAATCTTTTGTGTGCTGAAATTGAGAATGTATACATATTTTTTTTTTAAACTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTG:1 + chr2R 8642856 5' - Doc2-element 4741 1 65.07 ATTCGACTTTTTTACATTAGTTTTCGCATAAAAATTGTATTGCATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATAC:1 - chr2L 2657312 5' - diver 146 2 70.55 CCATAAATACATTTGGCCGGCGGGCGAGAGAGTTCAGTAACCTCCATCTGAACTGACCTATTTGCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 - chr2R 10865292 5' + blood 7028 2 72.60 ATTTTGCAAGAACATACACTTTGCAATATTAGTTTACCCTGCAAAAGTGCATATAATTTACGACTTAAAGGCAGACATTAACCGATAAGATAAAAGAAAGCTTAACTGAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:2 - chr3L 18659039 5' + roo 14 2 76.03 CGCTTGTGTGGAGTGTGACCTGTGTGCATGTGCATGTTGTCATGTGCTTGTGTGCGCGCGAGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 + chr2R 6632518 5' + P-element 16 1 74.13 ATTACTTGATTTAAGGTGCTGCGAAGGGTTAATTTCGGAAAAGTAAGTAGCATAATGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chrX 16579250 5' - roo 9003 2 63.45 CGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATGTATGTATATACTATATATGGTCTAAGACGCTTCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr2L 21738000 5' + hobo 57 1 58.90 GATATTTTTTCATAATTTTGTTAGTTTTGTAAATTTCTATCGATTTGACAAAAACGGTTGTACGGTTGGTACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTTATAGAGAGAGAGTCTGCCGGGCTGGGGGCCCG:1 - chrY 1803444 5' + baggins 246 1 62.86 GCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2L 76133 5' - roo 341 2 69.66 TTCGCCTCTTCTAACGAATGGACATATATATTTTCCCTGTCACATTTTGCACTTTCGCTAGCTTTGACATGGACATTGCCTATAAATCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAA:1 - chr3L 22052878 5' + mdg1 7073 2 61.64 TAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTG:1 + chr3R 11162682 5' - Copia1_DM 103 1 76.15 TAACGAAAGCAAAGAGAAACAACAACAAGAACTTTGAATTGTGGCTTCAAAAAAATAAAAAATGTTTACATTATAATCCGCACAAAAGGAAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAA:1 - chr3L 2003210 5' - Cr1a 168 1 58.22 ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATAGGTAGTCAAGTGTTGTACTATGGAACATATGCTACTATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 - chr2R 15616423 5' + Transpac 58 2 59.03 GCATTTTATATAGGTTGCAAAGAGATTGACAGCTTAATTACCTGGAGCCTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chrX 14964561 5' - roo 399 1 77.40 AAAATACTCCATCCAGGTACAGAAGCAAACAAGAATTAAACGACCCTTAAAAGCGTGCTACGTTTTTTTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3R 6515270 5' + jockey 28 1 71.23 GGACACTCTAATACAAAGCCAATATATAACAATATGCTAATTAATTTTTCCGAGTGCAAAACAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACA:1 + chrX 7351350 5' + I-element 4879 1 61.11 TAGTTGAAGTCTATACTCACGAATCCAAATTATTGCACGTATAATTCCAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 - chr2L 2052765 5' + blood 75 2 66.44 AAATAGTCGGCGGCAAAACTATCAGGTCTGCGAATTAGTTATAACTATTATTATATAGTTATAATATATATATGTCGGCAAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGTGATTTCGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCG:1 - chr3R 12929304 5' - invader4 3032 2 52.05 GAGGAGTGGGTGCTAAAACTAACGGCACCTAAAACATTTTGCAGCAAATTTCTGGGCAAAAGCATAAGCATAAGCTGCACTTTCACCAAAAATTATGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr2R 11057216 5' + pogo 22 1 68.49 ATAAACCTCGTCTTTTAAAAACTTCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 - chr2R 5531241 5' + 1360 65 1 72.60 AAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 - chr3R 9352077 5' + Tirant 8176 2 69.17 AAATACAACAAAATTGGAATTGTCTTCGAAGAGTCGAAACAAGTTGTTGGGAACTGATGATCGTGCAGTTTTTAGAGAAACTAGCACAAACAAATGTTATTTTATCGTTGATAAACAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACG:1 - chrX 22534787 5' + Circe 7007 1 65.75 AGTAATTTGGGTTCTTTGGGGGATGGTCGGGATATATGTATATATATATGTAAGTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGC:1 + chrX 6138627 5' - opus 7442 2 74.29 AAAATCTTAAGGTTAAATCAAATTAAGGTGCAAAATGTATTAATAACAAGCAATTATCTTCAAAATGAGGCAATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTAATCAAAAACTTAAGCGAAT:1 + chr2L 12658435 5' - Quasimodo 7320 2 52.05 ACACCATTTTCCTTTTCTTTCCGAGTTGCGTTTGTGTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 - chr3R 15022147 5' + Tabor 36 2 60.69 AATGTTTTGGTTGCAACGAAGATGGACATAATTCGAGTAACTGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGC:1 - chrX 22574746 5' + 17.6 36 2 56.85 CTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACA:1 - chr3R 11547762 5' + G2 323 1 62.61 CAATGTAAGTTAAATTAAGTGCATCAATCAGATTACTTAAAGACTAATAATAAAACAATAAATCAAAGCACAAATAATTAAAAGTAAAATAGTGATAAGTTAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGG:1 - chr3L 27287437 5' - 1360 224 1 74.66 ATTTGCGCATATGTATGTATATCGGCCCGCTCGGCTGGCTGTGTGTATATATGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chr3R 17067918 5' + 297 6642 2 70.55 GAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 14553212 5' + roo 52 2 56.85 TATGGGTTTGACATTATTTGCTTCTAGCTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGGTCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACG:1 + chr2L 8959870 5' + Ivk 5108 1 60.69 AACCAAACGACCTTGACAGCTGCATATTTATGATTCACTAACATGCTGAGGTGGTGACATGACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATCAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 16181282 5' - roo 396 2 76.71 CAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTATGCATA:1 + chr3L 17707829 5' + Doc 36 1 48.48 AGCATTGCGCCGTCAAGTATGCAACGCGACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTACTTTGATCTGCTTAA:1 + chr2R 5922955 5' - jockey 4943 1 52.74 CGTTACGTGGCCAATTGCCCGGATTCGTTACCTCCCCGGCCATAACCAAGTGAGTATATCAGAAGGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGGACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAG:1 - chr3L 18158048 5' - Ivk 4939 1 52.99 ATTGTCTTTTGAATGTTTTGAAATTGAACTTTTGATAAAGATACAATAGAAAATCCTTCCGAAAAGTCTTACCAAGAATTTTAAAAATTACCAACAGAAGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 + chr2L 3339903 5' + FB 22 1 70.34 TGTTACAAAGGGACAGAAAAGTTAAAAGGAGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 16181124 5' + roo 52 2 54.11 CGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCT:1 - chr2R 15829579 5' - invader4 327 1 63.79 TATGCAGTATCTGCCCAAAAGTATGCATTGGATATGACACGAATGCACTGAGTTGGGGAAGAGTAATCCCTAAAATTGACCTATAATTTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2L 3762889 5' + jockey 36 1 59.44 TAGGTTATTAGCGGTATCGAAGGTGATATTAGATCCGTAATTATAGCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACA:1 - chr3R 12593118 5' + flea 4827 1 68.49 TATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chrX 4778169 5' + 412 7100 2 51.08 TGCAATGTATTTTGCTAACTTGGTTTCGACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTT:1 + chrX 6707783 5' + hopper 90 1 79.45 GCACAAAGCGGTGCGAAAAGTGACAACCCCGGTAGCTTCGTCCTGCATTCTGCAGGTGCTAGCTCATTGACCGGCTGGGTGATTTGGCACTCGCGGG:1 + chrX 12105607 5' - Doc3-element 321 1 53.61 GCAAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGATCTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATATATG:1 - chr3R 29288808 5' - BS 5032 1 56.16 AATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGACCA:1 + chr3R 9190457 5' + Tabor 6873 2 43.84 GTATAAAGCTAACCAACTCTTAAATGTTATTGTACAACCAATCATATATGTATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 + chr3R 6711424 5' + pogo 65 1 68.49 CGAGGTAGAGAAAGGATGGCACATTGTTCGCATCTAGGGTCCAGCCATGCAAGTAATAGTATCCTTCTCTTATGGGACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATA:1 - chr3L 22648400 5' - Tabor 7278 2 53.42 ATGTTGCTGCTGGCTAAACAACTGCAGCTCATCAATAAAACAGCAAGAACAACAATAAACCAGGCAATGAAACCCAGCTAAAGAGATAGACAGAGACAGCGTAAAAGTGAATAGTTCTAAACGAATTAGAATATTCGGCATCTTTA:1 - chr2R 19420949 5' + Dm88 248 1 69.18 CCATAGAGAAAAATGCCGGCTCGACCCAGTTGAGTCGCAAATTAATGTCAATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGTTTTAAAT:1 + chrX 4291871 5' - roo 347 2 62.77 ATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAG:1 - chr2L 686078 5' - roo 9019 2 60.00 ATTTTGCAAAAGCCTGGAAACCAGGGTTTTAACAGCTCCCATGTGATTGTGTGTACGTGTGTAATTTTCCAGACCGTTGTCATTGCCAATTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr2R 6632689 5' - P-element 2857 1 65.07 AAGTTAATTATATGTGCATGGCTATCTGGCAGCTGCATTTGCTTGCCGCTCATTTGTAAAAGTATCTTATAGATAAAATAGCAAAGTTTCTGATTTTTTTTAAACAAAAAAAAAGCTTTATTTTTTGGCTCAACTGAATAGGTTTG:1 + chr3R 14010351 5' + Tc3 219 1 52.74 TCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTT:1 - chr3L 9909773 5' + Transpac 71 2 63.01 CATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAAT:1 + chr2L 17240222 5' - hopper2 1537 1 66.44 TCTATTTGTATAAAGTATGCAGGATTTTTCTTAAATCATTAATTAATTTGTGTAAATCATTTAAATTTAATGAGATGACACCAAAAATCATTTTGCAATTCTATTTACGAGCTATGCATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 - chrX 21234602 5' + 297 6580 1 76.55 GGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAA:1 + chr2R 4312962 5' + gypsy 7064 2 68.49 AATGTTGAATATCTTTTAAAAAATTAGCATCAGCATATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr2L 17136246 5' - hobo 2917 1 65.49 GCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr2L 76112 5' - roo 8985 2 84.03 AAATAAACACTTTAAAACCAATATTTAAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:2 + chr2R 20673607 5' - mdg1 7423 2 60.27 TTGAGCAAATGGTATAAGTTCTAAGATACGCTAAGTTTATCCTTACTATAACCCATACTTAAGATTGCATACTTAACACTTATATGTCATCTTTAATCATCATTAAAAGTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACC:1 + chr3R 5875921 5' + transib2 2817 1 75.34 CTCTTGATTTGCGGCGAATTTTTCTGCGCTCGATTTCACGTGCTCCTCCCTTTGTTTCAACCCTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTG:1 - chr3R 9094727 5' + Doc 98 1 56.55 CAGTGACTGCAGCGAGGGATCCCCTGCGGCGCTTACTCTTCTTAATTTATATGTACCTATATTTATATGTACCTCTCAGTCTTGATCAGTCCCCGTTGGCAGGCATGTTGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr2R 2215934 5' + Doc 49 1 38.62 CATGTTAAGAAAATATTTTTGTGGTATTCCTTCATTTATTACAATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3R 16913490 5' + pogo 30 1 64.14 GGGCGAGGACAAAAAGTAAGCATAATAAATTATAAGGGAAAAAAGGTTCCCAACGGAGAATAAAATCAATAAGAACATAAGTAGTATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTG:1 - chr2L 16396279 5' + accord2 7570 2 57.53 CAGTCCATGGGTGTACGACTCTAGGAACTCTGGTTGCTGATAAAAATTCATATTATTAGAAGAAGAACAATTACTTTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3R 25304835 5' - roo 361 2 53.79 AACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGCTTCCTTCGCTGGCTACTCTGGG:1 - chr3L 25995963 5' - Gypsy6A_LTR 329 1 66.96 TATGAGCAGGTGTCATCCTGCACACTCACCTCAGAACTATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGCTG:1 - chr2L 16884939 5' - pogo 2073 1 65.07 GCCATCTTTATATTTATTTTTGGTCAATATGGCCCTTACCTGATACTCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 96585 5' + roo 8724 2 67.18 AGGGTCAGGCATCCGAAGCTAAGCCAGATCCACTCCTGCTGCATGCTGCAATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 + chr3R 29418646 5' + mdg3 5294 2 52.08 GACAAATAAACCTCGTCTTTTAAAAACTTCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:2 - chr2R 5531246 5' + 1360 60 1 76.03 TAGATGGACAAAGAAACATTATTTCGGATCGACATAAACATGTGTTGCAAGTAAATAGAATTTAAACGGGCACTCCATACAGTGTAATACTTTCTGCCGCCGCCGTCTTGGTGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGCG:1 - chr2L 18319161 5' - mdg1 495 1 70.55 CTTTGACTTGGACTAGGAGCTGCTGGTAGTGGAGCTGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGTCATATATTTAT:1 - chr3R 22100614 5' - 412 7493 2 52.08 GTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGT:1 + chr3L 22052764 5' - mdg1 7385 2 68.49 GGGGGTGGAACGTGCACTTAATTAAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3R 22100490 5' + 412 7094 2 59.72 CAAAATGTTTTAATTCTTGCGATATAATACTGTTTACATGCAACCTAAGAAGTTCTCATGCTGAAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 - chr2L 4179492 5' + jockey 66 1 59.59 GGGCTGGATTCGTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr3R 7035324 5' + roo 70 2 73.72 AGCTGGTCTCGATGTGGGCATGAAAGAATGACTGAATATGAATATAAATAGAATACAAAACGAAAAATGGGTTTCAACTACAGTTATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAA:1 - chr3R 2211133 5' + Juan 4008 1 59.59 ATTAGCCCCGATTTGCAAGTAAGCTGCTTAACATCACCCCCACCACGCTGGTCATTATTTAATAATGAAAAGAGAGGCGGTTTCATTACTCATTTTCATCCCACTGATAATCTAGCTTTAAGCTCTAAGTAAATAGTCCCCGCCT:1 - chr3L 15917022 5' - roo 279 2 79.31 ACTAATCGGGGTCATGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGATAG:1 + chrX 1103563 5' + pogo 12 1 76.03 GCTCTTGGCAGCATTCACAAGTTCAAATAAGCGATAATAAGTATTTATGGGCGGGGCAAGCAGATTCGGTTTCTTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 - chr3L 13634324 5' - 297 367 2 65.19 ACGTTTGTTTTGCATATACATTTATTTTTCTGAGACATTTATTTAGACACAAATACAAGTTATATTATGTAGTATGGGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 - chrX 4940515 5' + blood 7055 2 53.79 CAACTGACAAAAATCGACGATGGCCATAAACAAGAAACAACTGTGGTGCACACACAAAATAAAGTGTTAACTAAAAGGCCAAACAAAATTTTATTATATAAGAAAAAAATAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1 - chr3R 30295251 5' + Quasimodo 6 2 58.22 AATTCTTTATCTTGACAATGTGGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGT:2 + chr3R 2555485 5' - Bari1 1646 1 58.90 AATATCGACATTCCCCATACAACAGTCAGTAGCACCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGATGGCACCCATATCGCGGGTA:1 - chr2L 22746517 5' + R1A1-element 5015 1 65.14 ATTGGGCTCCACAAGTGTAGTCATGTAAATGGGTGTGTATTATCAGCGGTCATTGTTTCGCGTTGAATACTGTGTATCAATTACCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chr2L 3294241 5' - hopper 1388 1 62.32 CTTTATTTCTTAGATCTTCGATGTCAAGGAACCTTGTATTTGTGTTTCGAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTC:1 - chr2L 13250480 5' + opus 17 2 70.77 AAAACTGATATTAAAAGTTTGGAAAAAATATTGATATACTAAAAAACAAAAAGCTTTCATAACGCTTTTATATTGTGATCAAAAAACTAATTTGAAATTTGAAATGGAATTACTATATTATTAATAATAATAATAATAATAATAAT:1 - chr3R 14976703 5' + mdg1 42 8 79.45 ATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACATG:1 - chr2R 4261940 5' - invader4 2987 2 66.37 GACGACGCTTTAGGATTAATTCGCCAGATGAACTCCAGATGCAGACGTACGAATCCTCACCGCCGCTGGCCACAAATGTACGGAGGTAAGCACCCTACTTAAAAGTCTTCTTGTTGATCCTACCGACTGCGCCAATACA:1 - chrX 15770683 5' - 297 409 1 59.71 AAAATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 - chr3R 28728730 5' + jockey 91 1 73.57 TTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chrX 12866506 5' - roo 9028 1 55.48 GACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chr3R 9352112 5' + Tirant 29 2 62.50 ACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGATGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAA:1 - chr2R 8641600 5' + diver 61 2 57.53 TGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 - chr3R 22100579 5' - 412 426 2 73.98 TCTTGGTAAACAAAGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCGTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 - chr2R 19553294 5' - mdg1 7413 2 50.68 AACAGTATTTTCTTCTAAGTAGTAAGCAAACATCAGGTTGTTTACGATGGTAAATATTTATTCATTCAATGTTATATTGTCTTCGTGAATAGACATAGATATTGTACGTATTATGAGCGGAGTCACCCGGGGCTTCAGCTGTCTTA:1 - chrX 16384135 5' + diver 23 2 69.86 TTAAAAAAGGTATTCAGCTATCCAGGCAAATCAGATAATTTAATTATCCATTTACATTAAAAATGTCCAATTTACAAGTTAGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAA:1 - chr3R 11113292 5' + mdg1 41 2 57.53 CATTTTAACTACGCTTTGCTTAGTGCTTTAAATAATCCTGATATAGAATTCAATATTCATGTCTTTCAAAAATTGAGTTTAAAAGTTTCTGTTAATTAATTAACAATTGTTACACAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAA:1 - chr3R 25883649 5' + F-element 4615 1 80.14 AATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTATGGCACACGAGTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3R 10266154 5' + 1360 53 1 60.50 ATATTTGACGTACAGTTTGTAGCGTTAGCCATTAAAACCTTTATATGTACGGTTACATATAGACATACATACATATAGAAACAAAGAAATGCGAAAAAAGTGACATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGT:1 - chr3R 13122640 5' - blood 361 2 73.97 CTAACAAAAGATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGT:1 + chr2R 7020541 5' - Bari1 1652 1 56.85 ACAACGCCATGTCGTGGGATCCGCAAAACACAATACAGGAAATAATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCCTACCTCACCTT:1 + chr3R 4569518 5' - opus 7461 2 60.00 AATATCTGGCCCAACTGTTGCAAGTGACAGCTTTCATCAAAGCGATTTGTTACACAGAATGGTCCAGCACATATGTATTGTATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2R 12787939 5' + 297 6592 2 74.80 CCACACTTTTGAAAAATGTGTTTATATATTTATAGGTCTTGAAAATTTCTATCGATTTGCCCAAAAACTATTTGCCATGCCCTTAAGCCCCGAAAAGGCCGCCACGCCTATAGGTATCACAAGGGGATCAACGCGCCACCAACGGT:1 + chr2R 5212078 5' + baggins 29 1 73.97 CTGCCATCGCAACTGAGTTTTGTCTACTTTTTGGCTTTTTCGGGTTTGCCAGACTGACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTAT:1 + chr3R 17495713 5' - Quasimodo 7341 2 64.18 GCCGTCATCAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATAT:1 - chr2R 3760478 5' + accord 6922 2 69.18 CATTCAGTAAGAGGAGACATTTAAAATTGTTATATCCGCTACTCATAGACTACAGGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCTGACAATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATAAATA:1 + chr2R 6031313 5' + INE-1 84 1 63.70 CGGAAAAACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTC:1 - chr2R 21402686 5' + mdg3 71 2 63.01 GTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr2L 246073 5' - roo 326 2 74.66 CAGTTTTCGGAAAAGCCAAAGAGCTTTGGTCTGCTGCTGAGAGCCATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 245965 5' + roo 8685 2 67.16 AATGTTATGTTATGTTATGTTATTTCATCATGCCCCCGCTCCAACCCGCGACCACACTACGTTCGGCAGAAACTCTAA:1 + chr2R 4878988 5' - invader1 100 2 56.41 GTGTGACATCCTTTGTGTACATATACATACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAG:1 + chrX 22560059 5' + Transpac 87 2 78.08 AAATAGGATATCCAATTTAATGTTTCGCCACAGAAAACAACAGAACATTTTGTTTTTATCCGCATCTGCATGCACTTCTAATGTTTATAAATAAATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr3R 15885257 5' + I-element 25 1 67.12 GGTATGTAAGCCCGGGCCAAATATCTTCATTATTGAATAATGAGCCAAGTGTCGCTGGCAGAGCTTTAACAGATAATCGATGGGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chrX 6481244 5' - hobo 2923 1 68.55 GACAAAAGCCAGAGAGCCAGAGAAACAAAATGCGAAAATGACAAATTGCATTAGGAGGACCTTTGTAATAAACCCATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTTTTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTT:1 + chr3L 10144652 5' - blood 7328 1 55.48 AAATATCTAAAAAGAATCGTTTGGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr3R 9352135 5' + Tirant 8120 2 76.30 AAACGGATTGGCAGTGGACACAGTTTCGATACTGTCCGTTTTAAATGACCCTGTTGGGTTTTAAGTGTCACTATTCGGACTAACGTATCCGTCCCTGTGTGTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATCTAGT:1 + chr2L 22592494 5' - mdg1 407 2 74.10 CGCTCGAAATGCGTTCGAAAGTAGCTTTGTTTACACATGAGTGAATAGATACCGCCTCACAATGACACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCC:1 - chr2R 17076097 5' - G2 444 1 61.90 AATTGGAATAAACAAAAAAAAAACAAAAAATGAAACTGAGCAATTGAATCTAATGTGCATTTTAAATAATAATAATGGATCATACATACATCATATTAAGTCAAATGACTTAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGT:1 + chr3R 25529466 5' - Doc3-element 4505 1 77.40 CATTACTGCATCGCTTAAGTGTCATTATTGGGACCAGAATTTCAACAAGCCGCTGCCGTTGTCGTGTCTTGTGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCC:1 + chr3R 31496406 5' + GATE 348 1 52.82 GAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGG:1 - chr2L 13250428 5' + opus 171 4 78.15 GTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGTAG:1 - chr2L 22015964 5' + Tirant 8153 2 80.90 CCTAGCCTGGCCTTTTTTCCTGTCGTTGAAACGTGTGTCCAGCGGAAATGACAACGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1 + chr2L 13704684 5' - hopper 1352 1 59.59 ATAGCCAGGTAGAGGGCTTGGCCATGATGTCTGTCAAGCATTCTGCGCCAAGTGGCCCAAGAATATTTGCTCCTCGTGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTACATTTACCAGAATAAAGAGCGGCAGCTCGTCAACTCCGAC:1 + chr2L 7338267 5' + Gypsy6A_LTR 196 1 50.00 CGTTACCATAATTTTATTTATTAACAAAAATATTGTATAATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - 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roo 9002 2 66.44 TTTGAGAAATTAGAATGCAAAATCCAACCGCCTACCGAACTCCCGCTCCTCATTAAACCCTACAGTTGCAAACACCACCGCTCACACACACACGCACACACATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chrX 7980740 5' + hobo 16 1 74.66 GAATGTTAACAAAGGCAGTTACCTTTGCCACACCTTATTAGCCCCCATCCAGTCGATCATCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 + chr2L 12079608 5' + mdg3 38 2 50.00 AAGTGGGCGTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGG:1 - chrX 6138718 5' + opus 7069 4 67.12 GATGGAGATAGAGGACGAAGTGTAAGAGGGACAGAAAGATGGAAGAGATGGTAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 - chr3R 19531317 5' - hobo 2925 1 60.22 GAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGG:1 + chr3L 24272066 5' + gypsy11 4055 2 58.22 AAAAAACGTTTAGCTGTTACCGAAAGCAGAACTGTTATATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGCGCACGTTTGCTTGTT:1 + chrX 3099102 5' + P-element 63 1 36.00 AACTTTTTATCAAGGCCATGAAAACCAGAATCACTTGAATGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chrX 957982 5' + roo 75 2 74.29 CGTGGGAAAAAGTGTTGCATACTTATGAGTGTTGGCAAAGAGCTCCGGAATGAAATGTGAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGA:1 + chr3L 17133805 5' + jockey 4752 1 59.59 ACGTTGCAAGGAAATGGGAAGAAAAAAAAGCTGGCAGATAGATTGTCGCGTGTGTAGTTTCATTTTGTTTTTTTATCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACA:1 - 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INE-1 575 1 48.63 AAATGCGAGGAGAGAAAAACAGTCACGGGGGCACAATAATCATAATAAATAAGCTGGGGGAAACACTGAAAACAGAAACAGTTGATGCCACAAAAGGTAAGTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chrX 7980927 5' - hobo 2928 1 77.14 CTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGA:1 - chr2L 1259999 5' + Burdock 64 2 68.15 AACAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr2R 10695777 5' + roo 8727 2 61.64 CTATAGATTATTTATTTTTTTTACGAAATCTGAGACTGACATAGCATAGGGATATTGTTTGCTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGC:1 - chr4 295769 5' - 1360 3313 1 70.55 TTTCTGCGCTAACCCCGCGGCATTCGCATCTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 - chr3R 28951892 5' + jockey 4733 1 73.95 AGCAGCGTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCGTATACAAACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATTTTTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATTTTGGCCA:1 - 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roo 8996 2 70.55 CTATGTGGTGATGAATTGTGGAACGCATGGAAACAAAGGAAAAGAAATACGTAAAGCTTTCAAAGAGAACGGTTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCA:1 - chr3L 21483949 5' + Cr1a 40 1 60.00 AATTGAAGGGAAAAGCAAAACATTTTTAATTAATGTATGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACC:1 - chr3L 20289119 5' + jockey 4754 1 73.29 TGGGGATTTTTGTTTCGATTTGAAGAGATTGCGCTGCTTCAGTTTCTTGATTTCCTCGTGCAATTTAATCAAAGTTGTAATTCGAATTGCATACGCAAAAAATGTAGCATTGAAGTATACTTAATTTTTTTATTTTTATTTTTTTT:1 - chrX 3444642 5' + hopper 148 111 65.07 ACTAGTTCTTAATTTTAATTTATGACTAATGATTGTATTTTGAGCAATGTAGATCGCCGAATAATGTGGTAAACTTCTAATAATAGTTGTGCTGTTTTTTTTTATGTTTAAATA:1 + chrX 18249166 5' - transib2 2636 1 71.93 ATCAAAGTATTGAGTTTTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 - chr3L 4115240 5' + 1360 43 1 51.37 AGACTTTTGATATATTTTCAAATAGAATTACCAACTTCGACCACATTTTTTTTCATCAGTGTCCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCTGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAA:1 - 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F-element 4275 1 61.64 CCACACCTTATTAGCCCCCATCCAGTCGATCATCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATA:1 + chr2L 12079635 5' + mdg3 5343 2 76.71 GTTCATCAGCACCAAGATCTGGTATCTCTAATGGGGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 24122639 5' - roo 361 2 52.05 AAATAAAGGATGAAAAATGGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2L 6717232 5' + jockey 20 1 70.87 AATAAAACTTAATACGATATTGACTTTAATTAAAGCCGTTAATAAACTTGATCATGTTTCCCCTGCGAGTCCCACTTACAGCTTATTCAGCGAAGGCAATCAAAAATGGTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAA:1 - chr2L 23042330 5' + Porto1 4363 1 52.74 TAGAAAGCGCGTACGTATGTATAAATTTGCAATTTTTATTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3L 20713039 5' + roo 83 2 80.14 CACGCTGGTCTCCTGCTTACCATTGTACATAATCAAGTTCTTGCGAAAGAAATGTTCGCCGCCCTCTTACTTGAAGCTCTCTTAGATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTT:1 + chr2L 13300981 5' - Doc 88 1 63.91 TTTATAAAGGCAATAAAGCGCCTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCT:1 + chr3R 13176327 5' - Burdock 212 2 54.79 GATCTTTAAGCCATATACCACGCCCTACCTTTTGATCCAACCCAAAATGTCGAAATGCAGTATCAAAAACAAAACAAAGCAAGAGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACG:1 - chr2R 8944782 5' - BS 4780 1 58.62 ATATGCAACCAACGAGTATGCCAGTAATCGACACTTGGGCGCGGCAAACAGGACTCCGAACCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 - chr3L 22642926 5' + hobo 58 1 58.57 GGACAGAAAAGTTAAAAGGAGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 16181134 5' + roo 8720 2 59.29 TGATATTATGTGGTGGTGACCCCGTTTGGCAAGAAGTGGTGACCCACGCTGTTTCTTAAATCTGCATCGCGTCTTTAAATGACGCACTTGAAATCGGATTTTTACGCTCTACATTATTATTAATTGGGTTTGTATGTGTACTGCGA:1 - chrX 13254951 5' - baggins 5420 1 65.75 AGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTACGGGAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACTAATAGCAA:1 - 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chr3L 18031118 5' - invader4 3065 2 64.14 ATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGAATG:1 + chr2R 4260437 5' + micropia 5218 2 53.33 TTGGTCGTGTCATTTTATGAGCAATTCAGCTGAAATTCAACGGAAATTTAGCTGACACTCTGGACTTGGCATATTTCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGTAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3R 17114005 5' - roo 9030 1 57.24 CGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTA:1 - chr2L 23372624 5' - Gypsy6A_LTR 275 1 55.48 AATTTCATAAAAACTTTAAAGGCAAGTCCCATTTTGATGGATAGCGCGTAGACGTCAAGAAATCAATTTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAA:1 + chr3R 15924566 5' - Quasimodo 7321 2 53.42 ATTTTTGTGCAATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr3R 5453716 5' + 412 7091 2 60.50 ATTAAATTCTATGCCATCTTAATGTTTGTTATATCTATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:2 + chrX 13531621 5' - roo 8987 2 76.71 GAAAGCAAATTAGCTTAAATCGAAAGCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 7035208 5' - roo 9045 1 66.90 AATTCACAAATACAATATATACACGTGTGTAAATTCAAAATTATTGTCACACTCAATTGGGTTGAGATTACTTTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGC:1 - chrX 10130207 5' - F-element 4299 1 61.16 TTGCAAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:2 + chrX 2762595 5' - roo 326 2 71.92 AAATTACTTTAGTATGCGATAAATCGTGATAAATTTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACT:1 + chr2L 17250668 5' + opus 16 2 71.23 AAAGCACTTACAACTTTTTAAATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATA:1 + chr3R 9190431 5' + Tabor 3 2 45.39 ATTTCATTTCATTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chrX 12866518 5' - roo 9040 1 63.70 AGTTAATCCAAATATAACATGAATAAACTTTTTAAACTATAACTACTTATTTGCATTTAAGGGTATTCCCCATTCCTGCTCCCAATTCCCGATTTTCGCCACCTTGTTCTTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATT:1 + chr2R 11548140 5' - Bica 127 1 73.97 ATGAGGAACACATGAAAACCGTCATTGGATCACATTGGAATATTTTATTGGTGCTAACGCAATGAAATCAGAGCAAATACATAAAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 - chr2L 12319366 5' + copia 35 2 60.27 TTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr2L 15987990 5' - roo 332 2 71.72 GTTCTTGAGCAATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGATAAACACAA:1 + chr3L 14062235 5' + Doc 80 1 63.01 GAAGAACTCAAGTTGAGTACGGTCGTGGCTGTGGTAACCAAACTTTCACCGGAAGTGGGCCAATAAAAAGTATACACAGAGATACACAGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGC:1 + chrX 13426105 5' + BS 11 1 66.41 GCTTTCGTTGACTCATCCTCAAAGAAATCGCGATCGCACATATGTTTTCGGTATTTTTGGATATTCGATTTGTCGATTACATAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 + chr2L 436437 5' - copia 215 2 58.90 GGGTGAGTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTTGAAATA:1 - chrX 7515755 5' - roo 9025 2 52.05 TAAACGCACTTTCCTTCTCGACACAAAGAGTCCGACGTTGCGAATCATTGTACAGAGAGAAAAATATTACGTTTCAAGTTTGAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAA:1 + chr3R 26519936 5' - FB 830 4 49.32 AGTCTGTATATGTAGTTCCGGTTTCCGGATTTGATTGAACTTGGCGGAAGTTGATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3R 29733024 5' - opus 7476 2 55.56 CTCTGAAAGAACGGGCCGAGCTCGTCCACAAGGCACTGAACAGCTTCGAAAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATC:1 + chrX 13379182 5' - mdg1 311 2 62.69 TTCGATCAGCTATTAGAATAAGCACAAATGTAAAGTACGAGCAAGTAAAAAAATTCATTCAGATATTTATCTCAAGCGAAATCTTGGGGATGAGTCCTGCGCAGTCTTCGGCGTTGTTCAGTACTGTCCAG:1 - chr2R 3463998 5' - G7 1014 1 53.44 TTCTTCTTCTTTAACACATTAGTACTAACATAAACAGCCATAAACAATTAAGGCTTTCATCTTTTGTGTATAACCAAACATAAACAGTCATTAATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chrX 3263286 5' + roo 27 2 67.12 CGCGTTCCTTCGATACTGACAGTATGTACAGTTTGTCAAAAAACTTTTTACACACTGTGAAATAGGTTGAATTTTTGATTTTAAAGGTAAGAAATTAAAAATATTAATTATACAAGAAAAGAAAAAACAAATTCCAAGTTTACACA:1 - chr4 976798 5' - S-element 1534 1 61.64 CTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATCTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 + chr2L 13250372 5' - opus 7465 2 69.70 GTGGGGAAATCGAAACAAAAAGTTAGGAAGGGAATGCCAGCCAGGGAGTTCGAATGCTGGAACTATGTGCACTGCAAAAAGAGGAGGATTATCCGTAAGGGTTGACATATTGCATTGAGAAGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAAT:1 + chrX 12242412 5' + Dm88 4360 1 58.90 TGGAGCGTCCCCATCGCGGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTA:1 + chr2R 11133539 5' - roo 9014 2 57.53 AATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 + chr2R 11489175 5' - mdg1 7398 2 60.96 GTCGGGAAGGTTATCTCTGGGGAACGGCGGATTCATTGAAACCTGAAGCCAGAGTGTAAAGTCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3R 23765365 5' - roo 9001 2 61.64 GAGTAATAATATGGCATGTCTTAACGTTAAGTATTCAATATTTTAAATCACTTGTTTTGTTTTGTATTTTTTTGTTTTTAAAGTTATGATTACAACTCCCATGATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGT:1 - chr2R 25193882 5' - 412 53 2 67.81 TTGCCACGCTCCGCTTCGCCTCGCATTTGCTGATGCCACATTAAAGTTTTTGGCCCCGTCAACGTCGTCGCCATCGCCATCGCCTCTCTGTGAGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTATGTGTTCGTG:1 - chrX 14979329 5' - accord 7026 2 41.94 CAATATACTTCTGATCGATTACAGTTACTTTCTATAACATTTAATTTCATAAAAGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr2L 6318995 5' + pogo 64 1 65.07 TGGGTGTTGTGGACATTTCGAGCTGCTAACATCTTTTATAGGTCTTTCTTATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTA:1 + chr3L 17886661 5' - 412 34 2 65.75 ATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGC:2 + chr2R 22723050 5' + 3S18 89 2 75.34 ATCTTAAAAAATAGAACATTTTTTGGTAGCTCTACAAAACTGAGTTATGTGCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACAC:1 - chr2L 5601644 5' + mdg3 5321 2 62.76 AAATCAGATGATTAAAGGCAAAAATATGCGAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2L 76035 5' + roo 8717 2 55.63 CTGGTTAAGATATTGTTTTCGCACTTGGGGAACCACAAACTGTCCAGACGGATCCAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTTTATAGTCAGAACATGCAACTCATAGTTAGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTT:1 - chr2R 10096599 5' - Cr1a 4129 1 61.64 ACGTGTTAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr3L 13827377 5' + hopper 8 2 73.64 ATTCGGCACAACTATTGTATTTTTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chrX 3263385 5' - roo 8982 2 82.73 ATATTTGCAAAAGATAATTAAATAGGCTTGTTAGGAAAAGTTAAATGCTTTTCATATTAACTCCTTGGTAGAACGCTTTAATGTTTTTTAAAGTGTAGGCGTGCACGGACATATCTATATACGGTCTGTATGTATGTATATAAATT:2 + chr2R 14518273 5' + 1731 98 1 54.11 GATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3R 7539507 5' + roo 89 2 79.45 AAATTTGTTGTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACT:1 + chr3L 27356041 5' - Tc3 1687 1 72.59 ATTATAATGTACATACATGTATAAAAAAGAGAAAGAGATGTTAAAATTTAAGAACTAATATCTTTTCGCATTCTGACCTCGGTAAACATGAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3L 14076168 5' + roo 30 2 66.44 TTATTCTTTAGCCAAAATAACAATGAATATGAACCACATATAAAGGTGTTCGAAACTTAAAGATGCATATTTAATTTGTTGCAATAAATAATTAATCACCCATACCATGAAAACTCCGTTATCCACAAGGAGCTTGGAATGCCATG:1 + chrX 4792139 5' + G-element 4037 1 61.64 CGAGAATAGAGATGAAAAACATGACCATGTAACACATGAACCACACTTTTTCTCGTCACAGCAGTTTTTGTTATTAAACGGAACCCTGGGGCCACATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAAAAG:1 - chr3R 1443511 5' + INE-1 85 1 76.74 TTAAGCAAAACTTTGTGCAGCATTTTGCCAAAACTGTGTGATAAGTATCTGAACAAAATGCAAAGCTGCCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chrX 7786564 5' - hobo 2922 1 66.07 AGGAATAGGATCAGGCCACCAAATGCTGCAGGAGCAGCCCAGCAGCATAAACGCTGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGTGCTTACAGC:1 + chr3R 27822204 5' - I-element 5291 1 59.59 ATTTGTTTATAAACGGTGGAAGGGTGCTATGTTTATGGGTTGGATAACTTGCACGCTTGCTAATTAAATTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr2R 4160305 5' + pogo 49 1 54.79 GTTATTTATCTGCTGCTGAGATTGGAGTTTTGAATTTGTATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCCTT:1 - chr2L 21657078 5' + invader1 46 2 76.03 AAATGGCAATATAAAACGTAATGGGCCACATTTAAATGCCCCCAATTTTGGGGCTGAAAATTCAGACAAATTTCCAACGCAGTGTCACTTCAAATGAAATATTTGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chr3R 27535379 5' - 412 7530 2 70.55 TATTGATATTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chrX 4778142 5' + 412 7080 2 65.75 TAAGAACAACTTAACATATGTATGTAGGTGGTTTTAATGTATTGTATAACTCGGCTAAAAAGAATTACAGTTACTCTTAACTACCAATACTAATCAAACATATTAGTTTTTGACGAACTTTGGAAAATTAATTTTTGTTTTAAATC:1 + chrX 14660598 5' + Copia1_DM 4282 1 50.68 CTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCACATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAGTAGAAATAG:1 - 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chr3L 19926959 5' + F-element 468 1 58.65 TATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chrX 4778178 5' + 412 7100 2 54.62 GTTGTTATTGTAGCTATCATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCAGTTTCGTATGCAATTTGAAATCATATTCTCCTAACTCTTATAAAATTTACTTATTGT:1 - chr3L 15099696 5' + G4 3803 1 63.89 GAAATGTATCGAAGCACTGATTTTCTCAAGTGGCCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3L 16580283 5' - 412 470 2 58.33 ATGTAATTTCATGCACATTTCATCACCATATTCACCATGCACTATCCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chrX 3996577 5' + roo 8738 2 69.86 GCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chrX 5150296 5' + roo 8741 2 71.23 ATTTGTTTGGCATATCGACAGATATTGGGGAAAAAAATGAGAACAAATTAAACAAATTTTTCAAAATTGTAATCTGTTTCTATTTTTCGCAGTCAAAAGAGCGAATGATAACAAATGGACGCGTACAGAAAAATGCGGTGTGCATT:1 + chr2R 1927013 5' + invader1 180 2 37.67 ACTCGCAGATACTTGTACATTTTGCGGATGCAAGAGCAGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 11609167 5' - roo 392 2 72.60 AAGCTCGCGAACCTGATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACGGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCATCCATGCATACATATATAGTGACGTCTTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATAT:1 - chrX 21994032 5' + 297 22 2 69.86 TATTGGAGCACAATTGTTCAATGGAAAATTTTTTTATTGTACGGACGAAAGTAAACATACTTCCGCAGAGTGCCAGTAAGGAACATCCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTG:1 - chrX 11968704 5' + hobo 252 1 66.13 GTTACGATGAGTTTGAGTACACTGAAATTGATCAAAGTTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr2L 17250826 5' - opus 7464 2 51.16 AAGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGATAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACA:1 - chrX 23108342 5' + BS3 1451 1 47.95 CCCAGCGATATGTTTAGACTTTAATTAATCAATTGTTAATCGATCGCATTGAATTGAGTGAATTATCTTTCCGCTGATTAATGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTC:1 + chr3R 22065574 5' - G2 2840 1 62.33 ACTGTGAGGTGGGATAGTTCAGATCTTTACTGCTTTCAATTTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 7539549 5' + roo 47 2 54.11 GTGCCGTTTTTCCATTTCGGTCTAGCCATCAACAGTGTTGGCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chrX 12191508 5' - pogo 2067 1 63.01 GGAAGCCTTTTTTTAATAGCGACACTGTAAAATACAACATTATACCTGCTTGAGAATCACAAATACTAAATATTTCAACAACATTAAATGAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTT:1 + chr3L 23088433 5' + 1360 3233 1 61.64 GTGTCGGGGTGATATAAAGGAATCGACTTGTAGGACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr2R 5737223 5' - 1360 3368 1 62.39 AAATTTGAGTTAAAGCCCATGTGAAAATAGAATACTGTGGGTAAATATTCAATTTCAGTTATCTTACTAGTAATTTGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGGTTTATCATCATTATCATCGTCTA:1 - chr3L 5415647 5' - Juan 270 1 50.68 ATGCATCTTGACCTCGCATGACCTCAATAAGTATCGCCCGAGGACCTTCACTCATTAGTGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATT:1 + chr2R 16403405 5' - copia 195 2 59.59 TTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCGTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGGC:1 - chr2R 4181307 5' - accord 497 2 54.78 ACATTAACAACGTGGGCGACCAGAGCGCCTTCATCAGCAGCCTGTGCGGTAACTTTAAGCATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGGAAACCCAGAAAAACCCGATCAG:1 - chr2L 4383909 5' - copia 4720 1 57.53 AGGTTTATGAAAAATATATGGAATGAAAAAAATTTAGAAAAAGTTCAAATACTATTTTCAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAG:1 - chr2L 12658582 5' + Quasimodo 53 2 59.59 ATAGTAACGACAAATCTGTAGCTTGAAGAATACCGTTAATTTGTTCCAGAATTTAAACAAAATATATGTTTAGACAAACTATAAATATGTTATATTTATGGGCAGCAATAAACATGTCACTGGTCATAGGCCTCAAAAATAGATT:1 + chr2R 5018780 5' + rooA 176 2 47.59 ATGTGAAGAACTCAAGTTGAGTACGGTCGTGGCTGTGGTAACCAAACTTTCACCGGAAGTGGGCCAATAAAAAGTATACACAGAGATACACAGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCG:1 + chrX 13426101 5' + BS 14 1 65.19 CCGTCATCAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTC:1 - chr2R 3760477 5' + accord 20 2 53.93 ATGCACTTTTAAATTTGTACACACGTCATCCGCACTCATTACAAAAATATCAAAAATGGCTAACCAATGCGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGCTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGA:1 - chr2R 5542450 5' + 1731 54 2 50.00 GTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTAT:1 + chr3R 29487012 5' - flea 233 2 73.29 AATAAAATGGGCTCCGAACTGTTTAAAATAGAATGCTCATTATTCGGCACAACTATTGTATTTTTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 3263426 5' - roo 9016 2 55.48 TAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAGATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACG:1 + chr3R 23639156 5' + pogo 74 1 67.12 GTGCGGTTAGTGCTGGTGGCTTTGCTGTCCTTTTTGCATTTCAGAGCGGGGCTTTAAAGTTCATGGTTGATTAACTTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 + chr3R 24476260 5' - 412 7502 2 53.15 CCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTG:1 - chr3L 12976340 5' + invader4 64 2 63.01 TTCGTCCGTAAATATTTTCGCTGGTCATTATGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGGACGGCTG:1 + chr2L 9035359 5' - F-element 4507 1 67.19 ACTTACGAGCTCTACAGAATTTCTTAGACTGTGGGTCACACATAGATTTTATGCAGTTTTGGTTTAAATGTTTTTAAACATTTAGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr2R 8396031 5' + pogo 34 1 62.33 CGGAGAAAGAAAACTGAAATCGAAATCGAAACATTCATTCATTTATTCATGGCATTAGTTTCTGACAGACGGCTGCACCTTTGCCCTCAATCACCTTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAAT:1 - chrX 5858165 5' + hobo 443 1 67.12 GTAGAATAATTATCTCAAGCGGCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAT:1 + chrX 4556537 5' - blood 7177 2 73.47 ACGATAGTTTTCCACCTGCTCTCGGTTAAAGTTTTTCCCACACAAGGCTTTTGAAATTTCAACTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr3L 10133627 5' - 412 484 2 69.17 CATCACCCCACTTGATCTGGTGTGCGTTTTCTATATTTAATTCGTTAATCAATTGGTGCCTATAAGGCAATAATTAAGTAGAAATATAAATGTTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 - chr2R 10781262 5' + FB 28 1 66.21 TACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr2L 6717202 5' + jockey 70 1 56.85 CAGCTGTTTAGTTTTCTGTGTAGTTGTGGGCGGTGGTTTGGGTTTGGGGATGATTTCGCAATGCGTGAGTGGGCAGCCCCCGTTTCGCAGGCAAAAGTCGAGAGGGCGTTGTCATTTGTAGTCTCCAACGCGCATCCCTACCACGA:1 - chr3R 18508398 5' + G2 2752 1 80.14 AATGTTACAACTTAGTGCAGCTGACAAGGAACAAATTGTGACCATAGATCGGCGTCGTGGCAATAATGCTAATTGGCACTATCGGCACTTCCGCTGTCGTATTTAATTGGCCAAAACAGATGTTTGAGATTAGTCTCCAACGCCCA:1 - chr2L 22140847 5' + G2 2740 1 76.03 GAGTCAGCGAGGCGCAAACTTAAGCCTGGCAGCCGTTGTTGGGGAACATTCTGGGACTTGCCTAAAACTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 15988083 5' + roo 8685 2 63.16 CCAGCAGAGCAATAACAATCGCCGATGCTCGACGACAATGTCGTTCAACCTACTCTTTCAAATGTCAATACAATTTAATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr3L 12224599 5' - 412 450 2 56.16 ATGGGGTTGGTTATGCACTATTGCGACAGGTTGGATCACAATGCATTGCTTATATCCATTTTTTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCCCTTCTGAT:1 - chr3L 8354689 5' - invader2 269 1 57.14 AAAATGTTTGTTGCTGCAACTTGCTCTTTTTGGGCCTTCTTCGGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAGAG:1 + chr3L 14550973 5' + P-element 73 1 18.57 GCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACAAAGTGTATAG:1 + chr3L 17707835 5' + Doc 89 1 69.18 CTCGTAGATTTAACGGAATACGCGCCATAAATTATAATATAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAATTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATAT:1 - chr3R 12568929 5' + hobo 33 1 56.12 GGACAACAAAACATTTATCCATCTCTAACAAGAAAGAATGAATCTATAGCCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCTGCTACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATA:1 - chr2R 5439224 5' - INE-1 499 1 59.20 AAATTAAGGTGCAAAATGTATTAATAACAAGCAATTATCTTCAAAATGAGGCAATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTAATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGT:1 + chr2L 12658454 5' - Quasimodo 7301 2 63.70 TCGGCTATTTATAGATTTTGCGGTAAATTCGCTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2R 21371516 5' - roo 324 2 78.08 CAGTTTTCTAAAAAACAAATGTATAGAGACATCAATATCCTCATTTAGCTAATGGGCATTATTATTGGTCTCATGTCAGGAATAGATCTTTAATCGCATTCAAATTGCATATCAAATTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGGTGTA:1 + chr2R 8158684 5' + Juan 15 1 78.08 AATTTAATATTATTAAGTACTCGTACATACGGATCTTAGGATGATTTATTCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCAAAGA:1 - chr3L 4114689 5' - 1360 241 1 67.12 GATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 + chr2L 17250709 5' + opus 158 4 55.97 GGGAAAGTTACATTGTCTTAGCATTCTCAAACTTAGAGCATTTACAAATAATACTCATACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTG:1 - chr2R 18480482 5' + hopper 1414 2 60.27 CCCAATTTACGTTAAATGTCACTGACAATGTTTGATGACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATC:1 + chr2R 5542320 5' - 1731 4590 1 60.69 CGGGTACCAAATATTATATATATATAAAAAAGGAATGTCTATTTAGCGTTTTTTTTAATTTTTGTAAAAATTAATTTATTAAATAGCATAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:2 - chr3L 23124132 5' + pogo 25 1 63.01 GTCGCAAAGCTCTCACTCTGCCAACTTGCTTCTCGCGCGAGTTACCTCCGGGGAGTCTTGCGGAGGTATTATCACTCAGAAGATAGAGGAGTTATGCGGTCCAGAACGTAGCCACGGCCG:1 + chr3R 3753092 5' - ZAM 391 2 69.17 AGAGATTCCACTCCTGGCAATTATTGAGCAATGCCAATGCTCGGAAAAACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATAC:1 - chr2R 21402727 5' + mdg3 5282 2 64.38 GCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr3L 27391404 5' - 1360 3347 1 52.05 AAGTATGCAGGATTTTTCTTAAATCATTAATTAATTTGTGTAAATCATTTAAATTTAATGAGATGACACCAAAAATCATTTTGCAATTCTATTTACGAGCTATGCATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chrX 21234590 5' + 297 6593 2 69.18 GCAACTCGGTGGATCCGCTTAGGAACTGTATTCCTATCCACCCAAGAATTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:1 - chr2R 8157318 5' - Transpac 300 2 77.93 GGTTGTTTACGATGGTAAATATTTATTCATTCAATGTTATATTGTCTTCGTGAATAGACATAGATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATT:1 - chrX 16384100 5' + diver 58 2 55.48 CATGTTTAACATTTGCTTTACACGTGTGTTGATATGCAAAAAAAACATTGCATAGTTTTCAGGGCAAATGAGCATATGAGAGGATGTTTGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 - chr3L 9571766 5' - jockey 4958 1 56.85 TAATGACTTTCTTTATCTTCTGTTTGTATCTAATGTTTGCAGACAACTAAAGGCCCCTGGAGACTGCAGCTTTTATCACTCCATATAAGTCTATAAAAACGTGTATTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chr3R 27478629 5' - hobo 2932 1 79.86 GTCATTTGGCTGCTTCGTATTAACCTCTGAGATTAGCTGGCATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 - chr3R 19859685 5' + opus 7046 4 62.28 ATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAATTAGGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTA:1 + chrX 9909333 5' - P-element 287 1 14.38 GTGAATATAAATAGAGTAGACATTTGCATTCCCATTGAGTTTGTGCCTGGCGGGAATGTCTTTGTACTATTATTGCTACTTCAGTGATATTGGGCATGTGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGT:1 + chr2R 19351917 5' - Burdock 236 2 71.23 ACAGTTTTGGGATAATCCGGTTTTTATCTCTGTTTTCTTAAAATATCAAATCGATCAATTGTACGGGACTTGATGATTGCCAAATTAAATAAGTGTGGTGTAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCAACTCGCACTCT:1 - chr3R 26191747 5' - hobo 2930 1 71.85 ATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCGTCTTAAAGTAAA:1 + chrX 2762605 5' - roo 8980 2 77.40 ATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTGCTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr2R 10695862 5' - roo 351 2 64.34 GTAGTGGGCCAAAACGGAATATTCAATTTTAGACAGAGGCATTCCTGAAATCTCGAGAATCCAGAGATTCCAATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTT:1 + chr2R 24008180 5' + 17.6 7306 2 50.68 GCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTG:1 + chr3L 24934287 5' + HMS-Beagle2 47 2 53.52 GCATTAATCTTTTCCCAAATAGCTAGTAAGTCAGAATTCGTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTTTAGCAATTATTTTCTAAGAGAAAATTGATCATGTGAATTTCAACAGAGCGATTGATTCCTC:2 - 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I-element 4907 1 51.41 ATAAAGATGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGATCCCTGCACATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATATATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATT:1 + chr3R 29288733 5' + BS 5062 1 62.86 GGTGTTCCCTCTGATTAAATGGCACTTCCCCTTGGCACGGGTCACACATAGAAGAAGCACTGAGTAGCAACTCTTTTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACC:1 + chr3L 6820250 5' + roo 8862 2 73.08 ACACACACACACACACACTTGTGTGCAATAATTATGGTTTCCGGTTCAATGATTTCATTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2R 7381524 5' + roo 60 2 61.38 ATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAGAATAT:1 + chr3R 18346660 5' - INE-1 84 1 58.90 ATGGTGAGTTATGAACTCGATACATTTTCAATTCAATTTTCGAGAAAGTGCGCATTGATAGTGAAAGTGCATCTCTATTGCGAAATATAAGTTCTTTGTGACATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr2L 6183966 5' + pogo 16 1 40.41 TTGATAGATTTCTTAACAACTTCTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTCTATTTAGGATTTTGTTATC:1 - 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opus 437 2 60.96 ATTCAGGTAGTTGCAGATGCCGTCCAGAACGGTACTGGAGAACTGATACGACTTCCACTGTTTGGTGTAGCGCGACAGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCG:1 - chr2R 7918338 5' - F-element 479 1 53.42 CCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCTGGTATGAACGTAACTCCACACTTCATAAAGACCTCAATAT:1 + chr3L 23797685 5' + Helena 1190 1 52.74 CAGTCTCGTCCTTGTCCTGAATGTTGTCCACCGTCAGCCACATGATCTCCTTCTCCAACAGGGAATTATTATCCCCCGCGCTAACTGTCTGCACACGTATGCTCATGCACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTC:1 + chr3L 3213138 5' + 1360 230 1 62.33 GGGAGGGGCTTAAGTTATTATAGTTTTATTATTATACTTTTCTTTAGTTTTATTGGTCCCTTAATAGTGTATAAATTATTAAATGTGGTGGTGCTGCAGGGGGTCCCTCG:1 - chr2L 5760738 5' - gypsy3 6937 2 79.09 CGTTGTGCGACATTTGTAACGTCTGTACCCGCTTAAGGAAATCTTGAAATTCCAGAGCACGCATTTCTGTAATCGGTACAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr4 1219273 5' + 1360 32 1 60.74 GTGTGGCTGCGATGGAGGTACTCGTATCTGGGCTCCATTAGCCCTCGCCTTTTCTCTTACGAAATTTTTAAATACTTTTGGGCCATTCTCAGCTGCCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGATCAACGAAG:1 - chrX 19785371 5' - accord2 7584 2 69.85 ACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 - chr3L 22978633 5' + 1360 60 1 60.96 TGTGGTTGGGAAGTTGTGGGTGTAGAATGGACATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTC:1 + chrX 22252765 5' - diver 6022 2 77.40 AATCAAGGCATTAGCAAACATTTAGGTAAAATAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTCACGCTGAGAGCGTAAAAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTATAAACAAGAGACGA:1 + chr2L 6572657 5' - 1360 3241 1 76.71 AACTATTTACTTAAAGGGTATTAAGAATGTCCATAGCTTTTCTTCTTGTATTTGTTTTTGGTTGTATCAAAACAAAAATCCAATCAGCGGGTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr3R 23240338 5' + jockey 17 1 70.16 GTCTATCAACAAGTAAGCGCTACTGCACATTGTACCTAGGTGAGTGGGAGATTCTGCGTATAAAGCTGTTTTAGAGGAAGTATCGTTATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chr2R 5923063 5' + jockey 4689 1 69.17 ACTTTCATATATGGGTGTGTCAATCCAATGGGAAAAACAAAGTAGCGCCAACAGCTGTTCAAATAATAAAAATTGAGAATAAAAAGATGCTTAACGGCCCTACATTGGTTTTGCACTACGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 - chr3L 16641739 5' - 1360 3329 1 59.59 AAAAAAGATTAACAGTTACATTCATCAGCGCACTTCTTACACATGTGCAAAAAAAACTGTGGCCCAACTGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCCGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTA:1 - chrX 2578105 5' - hopper 1363 1 50.68 CAATTTCCATTAAAATGCCAGCATTGCGCCGTCAAGTATGCAACGCGACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATG:1 + chr2R 5922936 5' - jockey 4968 1 48.57 GGAAATGTTGCGGTTGCGGTAAGTGGCAGGAAAAGGATCAATCACTTCAGCTGGTCAACTTTGCTGGACATTTTCAACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 - chr3L 11400030 5' + Quasimodo 28 2 62.96 AAAAAATAAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTATGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCACCAAGTCCTGGCACCGTTATTGAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTTGACCAGACCCCAAAGATC:1 + chr3R 27223770 5' - Tc1 1226 1 80.14 TATAAGCAATATAAGTTCTTGAATCAAAACAATCTCAATCTCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chrX 19536914 5' + roo 8745 2 75.34 GACACTGTGAAACCCGAGGCAATCACTCTGCGGCTTTCCAAATACCGGGCTATATGGCTATGTATGTATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGTCCATTTTTTGCC:1 + chr3L 16870153 5' + FB 54 1 53.10 ACTCGTTGATGTTAAACTGAAAGTTTGTCAGTTTTGACTTAGGCGTTGTAGTAAGCATATCCGCCAGCAGTGTTGCTGATGTGCTGACGGATTTAGGTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGAG:1 + chr2L 36773 5' - F-element 410 1 74.02 GCGGCTATTTTGGGGCCGACTTGAGACACGTGACCATCTCTCGGTCACTACCCACTAAGGTTGGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 - chrX 23155292 5' + blood 7046 2 61.64 CTTTTAAAAACTTCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 - chr2R 5531230 5' + 1360 71 1 67.38 AAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCC:1 + chrX 21772497 5' - gypsy3 6543 1 72.00 CGGCCCAATTTGCGATTTGTACATATGGCTGGCCATAAAAACAGAGCATGCCCAAAAATTAAGTATACGCACTTGATGTGACTTAATTTAATGACTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr2R 23497169 5' + 412 26 2 66.21 TCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 + chr3L 17707811 5' + Doc 48 1 51.16 GTATTGCTGTTGTGAACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCT:2 - chr2L 16089688 5' + 3S18 5821 2 54.11 GATCCATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTACAAATTGAGCTACAGACTTGA:1 + chr3L 27415193 5' - transib2 2784 1 58.22 GGATATGTGAAGAGGGGCGGGGCATGCTACAATGCAACCCATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAAC:1 + chr3R 28627614 5' - copia 5043 2 72.60 GGGTACGTTACGATGAGTTTGAGTACACTGAAATTGATCAAAGTTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2L 17250832 5' - opus 7460 2 50.36 AACCGAGGAGTTTGGTACGTGCGTTCCGAACCAAATAAGCTTTAAAATGTTACCAATCGAATGCTGAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACA:1 + chr2L 10165561 5' + copia 4693 1 58.87 GGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 - chr3L 23986614 5' - opus 7437 2 65.75 AAATTCTTTTACGAGAATTTGAGTAATGATATTATCTTGAAAACTTGGTCTAAGATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 - 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opus 7242 2 71.92 TTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTA:1 + chr3R 1546403 5' + Tabor 66 2 60.27 AAAATAATTATAATGTCATAACTATACCAGTTACTAATATGGTAATAAGGTATTCAATATTAGATGCAAAATGTGTAACAGGTAGAAGGAAGCGCTTCCATACCATATTAGGTATAGTCGATCTGTCTGTATGAACGTTGAGATC:1 - chr2L 22098041 5' + INE-1 132 1 76.55 GAACGGGTTGGGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 17305441 5' - roo 350 2 58.90 GTATTCTGCCTTTGGCCAAAGAATTGAAAAATTTAACAACTTGTTGTCAGCTGCTCCTTAACTAGAATTCTTTGGTTTTAATCAAATTTATAATGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr3L 18467318 5' - hobo 2927 1 75.56 ATAGAGACCAGGAGTTAATAAATTCATTAACTCAAACCAAAATAGAACTTTTAATGAATTAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAG:2 + chr2R 4312895 5' + gypsy 6997 2 76.71 GTCTCTGTGCAATGGAGTTTATTTCATATTTGCAGCCAACCAGAATCACATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAG:1 - chr3R 13176439 5' + Burdock 63 2 65.00 AGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 - chr3R 6388783 5' + jockey 92 1 73.29 ACCCACACACATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTAT:1 + chr2L 17240213 5' - hopper2 1546 1 60.27 GGTCGGGTTGGGGCAATGGGCCAATTAAAAAGTTGTATTGCTGTTGTGAACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCT:1 - chr2L 16089722 5' + 3S18 5787 2 69.86 GTATGCGATAAAATGAGGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAATTTAAAAATGCAG:2 - chr3L 13374231 5' - pogo 2053 1 52.74 CATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr3L 19350042 5' + jockey 32 1 70.55 CAGCGGTCCAACCGACATCCGATGCCAGCCATTAAAAGTGTCGCTTGTATTTAAATATTCAATTGTCTCACGGACAAGGATGTGAAACATTTAATCAACAATCATTGCCTTATTATTTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTA:1 - chr2L 6806643 5' - 1360 414 1 64.38 CTTAAAAACCAGGTCGTCGTTGACTGTCGGCTTCTTTGTTAAGGATATATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 - chrX 3099164 5' + P-element 63 1 33.33 AAATGGAAAAACATTTTACAAAAGTGTGAGCGTGACTTGCGTGGCTGGAATCTGTATGCTTGATCTCAACTCTATAGGCTTCCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr2L 22132480 5' - pogo 2084 1 69.35 ATATTCACTTACACACATTCATGTTTAACATTTGCTTTACACGTGTGTTGATATGCAAAAAAAACATTGCATAGTTTTCAGGGCAAATGAGCATATGAGAGGATGTTTGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTG:2 - chr3L 9571785 5' - jockey 4977 1 68.49 ATATTTGTTTTTTTTTTAATTTTTC:1 + chr3L 16595748 5' - TART-C 11095 2 92.00 GTAGTCTATATAGCCATATACATACATAAACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATA:1 + chrX 16828961 5' + Quasimodo 36 2 74.00 GGCCACATTTAAATGCCCCCAATTTTGGGGCTGAAAATTCAGACAAATTTCCAACGCAGTGTCACTTCAAATGAAATATTTGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3R 27535402 5' - 412 454 2 58.22 TGTGCAATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chr3R 5453711 5' + 412 7123 2 71.23 ACTTTCTTGGGCAACTAAACAAGCTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAGGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr2L 15987954 5' - roo 9039 1 61.59 CAAAAGGGTTAAGCAAGTGTTAAGGGCTGGTGGGAGGGAAAAATCATCAATCATATTTTCTGCATAGCTGAATCATTTGCGCCGATCAGTTGGGGTTACTTAATGGGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2L 12553560 5' + 412 7068 2 75.34 GGGAACGACCAGAGAAACTTGTATAATAAGATTTCCTAAAAATAATGCCTCAAGTCAAATAAAAAGTCTTGAGCCAAGCGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATACCAGCTTCATGCGG:1 + chr3R 26246027 5' - 1731 4445 1 58.90 GTTGTTCCCCTTGTTGTAGGCAACACTATTTGTGTCATGCAACAATGTAATTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTT:1 - chr2L 13704778 5' + hopper 60 1 60.71 CCAATAAATGCCAAATTAATTAAAAAATACAGCGGCAAAGTAAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chr3L 13563437 5' - roo 408 1 81.67 ACTTTCCAAACATACAATAATATTCAAGGTTACCGAATGTTAACAAAGGCAGTTACCTTTGCCACACCTTATTAGCCCCCATCCAGTCGATCATCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chr2L 12079574 5' + mdg3 5282 2 64.38 GGAAAATGAAGGGAAAAGCAAAACATTTTTGATTAATGTATGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGTGTCAAAAGAAGA:1 - chr3L 20289122 5' + jockey 4729 1 64.52 ATGAAAAATATATGGAATGAAAAAAATTTAGAAAAAGTTCAAATACTATTTTCAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1 - chr2L 12658576 5' + Quasimodo 59 2 63.70 AATTTGGCTGAGTTACATGGCTGTGTGCTTAGACGATTGTGCAAAACAGATTTGAGCTGGGCACAAACAAAAAAAAAACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chrX 13395366 5' - roo 9031 1 57.24 AATATATGCCTTATCATTTCATAGTACAACCCAAATGGATATTCCAAAATGGCATAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGGGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTA:1 - chr3L 20255244 5' + Transpac 62 2 63.01 CTTCAAGCGGGGGAAGTCTACTATATCATTCTCTATTGTTGTACCCTTTATGACAATATAAATGTATTCTGTCAGTTTTGGAAGACCGAGAAGTACTTGGATGAACAGCGAAGCGCAGATCGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGA:1 + chr2R 5720482 5' - INE-1 538 1 71.23 ACTGTTTACATGCAACCTAAGAAGTTCTCATGCTGAAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCGATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1 - chr2L 4179464 5' + jockey 94 1 77.40 AACACACATAAGTGAGGGGATATCCTGAATCAACCATTATTTCATACTCTCAAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTAT:1 + chr2L 4106295 5' + jockey 4830 1 66.44 AAAACAATTATCAAATTCTGTTACTCAATTGGATTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCATTTTATATCTTCTT:1 + chr2L 2052704 5' - blood 7322 1 69.84 GTGGAGAATATAGTTGCCGGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr3R 4528454 5' + F-element 43 1 62.76 AATAATGATTGGATAGTTTTCGCATTCTTAGCGCAACTAAAACCGCATTGCGTATACCACATGTGTGACATCACGTTAAGTATACGACATGTGTGATGTGTCTCCCACGCTCTCCCACTAGCTGCGTAACAGGTATCTGATAGTCG:1 + chrX 1827070 5' + INE-1 550 1 49.32 GGCAGATGATTAATCGATTTTATTGGTGGCATCCATTTTTATGGGCTTGTATTGAGATTGCGGAAAACCGTATGGCTTATATTTGTGGTTAAAGAAATCGTCAAAAATCTTACACATAAACTACTCCCTATCCAATGTTCAATATT:1 + chr3R 13786667 5' - invader2 4701 1 76.71 GAAAGAGCGAAAATTTGTTTTCATTGTTGAAAAATTCTGTGCAAATTTATTGAATTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCG:1 + chr3L 1405005 5' - Ivk 5311 1 69.18 ATATATACCATTCTGATAACATTACAAACGCTCCACTAACATGTCTATATGTCTTGGAAGGGAATTCAAACACCCAATCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAA:1 - chr3L 14551112 5' + P-element 129 1 73.29 AAGCCAATTGCAGCATGTGTGTGTGTTCAAAGAAAGTCCATCCACCGGGCTTAAGGAATTTGCTCGCAAATCCCACTTTGCAGCCAAACAAAACTCCCCGGTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr3L 905926 5' + 412 7072 2 69.86 CACCTTTTTAAACAATTTTTAAATTTGTTTCCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATAATCATGTTTCGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAAAGATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATTGCTTTCTCTCTT:1 - chr3L 24073179 5' + INE-1 577 1 74.82 GCAGAGGCAGTGGAAGAGGAATTTAGGTTGCACGCGCCTTGGTGATTAAGTTATCCAGACGCTAGATCAGCCTTTTATTAGCGAGCTAAGTTAGGTTGTGCAATTTTTGTAGTTATATAGTAAACTTGTTTTTGTTTTGAGTCG:1 - chr3L 25850574 5' - Tom1 385 1 70.83 CTCTAGGCTGGGTTTCTTAACTTATTCTCCATATCATTTTTTCTTGGTAAACAAAGGCGATAATTACCCAGCCTACGAGGCGTATGTGCAATTTCTTCCTATCTGTGGTGATTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 - chr2R 19553335 5' - mdg1 416 2 77.40 GATTTTAAAACTAAACCGTATGTGTTGTCAATGATTGCTACCATTTGATTTTTATAAATAAAAAACAATACACAAGTCAAAAGTATTTTACTTTTGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCAC:1 + chr2R 15373412 5' - 1360 182 1 62.33 AAAATGCAATTTCAAGTGCAACCGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3L 14553240 5' + roo 8688 2 69.86 CATCCACACACCATTTTCCTTTTCTTTCCGAGTTGCGTTTGTGTGGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGG:1 - chr3R 15022154 5' + Tabor 30 2 65.07 TTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGCTCTAAAAACTACAAC:1 + chr3L 17707824 5' + Doc 57 1 56.80 ATCTGCACTGTTTGTCATTGTACTGCACAAATCTTTTGGCGCCCGCAGTGTAATAATAAATGCAATCGGCAACGCGTACAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTC:1 + chr2R 4362502 5' - gypsy 443 2 54.79 AATTTAAGCTAGTTTTCTATCAAGGGTATACTTGATTCTTTAGAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGTAGCTTTTCCGACCTTATAAATGATATATTGACCCATGTTGATCTGGCCATGTCCATCTGTCTGTCTGTATGAACGTCGAG:1 + chr3L 11104237 5' + INE-1 129 1 47.26 CGATCGAGAGCTCTTATAAATTACCCAGCTAAAGACAACTGTCGCCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCC:1 - chr2R 15034973 5' - Doc 4298 1 60.00 ATAACGATGTTCTATTATGTCCTTTACGATATATGAACAACTATTACATCTTTTTATTGTCATTAGTTTTAATGAGAAAGCTTTTTCTAAAACCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:1 - chr3L 16212861 5' + Transpac 25 2 67.12 CATTTTCCCAGTTACATTTCCCTTGCCATATGGCCGGGAATTTGGATACCCAAACACTACCCTACACTTACCAATTGTAATCAACACACCCCACACTACTCTGTATGTACCCAATAGATACCAGATAAGAATAA:1 - 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roo 9005 2 59.59 CGATAATTTCCACAGAATACGTAAAGTGTTGTGTGGTGTGTGCACGTTTTTTGGGCAATTAAAAATTAAATTGCGCATACATCACGTACAAAAAGGAAACACAGAGGAATATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGC:1 + chr2L 14955069 5' - accord 7178 2 75.17 GTGATACGCAATCGCGAATTTGTACTATGATTTGTCAACGCACCTTGACAAAGCACTGACTATATAAAAACCATGAAATGTAATAATAACTTGACCATTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 - chr3L 11776801 5' - mdg3 5474 2 66.44 GATTTTAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCAC:1 - chrX 22386815 5' + hobo 60 1 65.89 GAGTTTTCAGGATAACTGTTTCATTATTTTTGTGTATATGTGTCAAACACTTAATTTTTCTAGACGTAGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 + chr2R 4628326 5' - Transpac 298 2 76.71 AGCAGACCCGATTTCAATGGGGAATCGAAAACGCTAGTCTCAATTTCTTCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 - chrX 1061615 5' - 412 424 2 65.52 GTTTTGAATATTATATTTTTTTGCCCATTTTTTATCAATTTTCCAAAAAAATTTTAACAGTTCTTTTTGTTATTTTTTGGCTGTCTTGCGAGCTATGCATTTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTA:1 + chrX 172949 5' - jockey 4796 1 73.97 AGGATTTGTTCCATCGGCTGGATATCTTCGATTCTAAGTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAAT:1 - chr4 436884 5' + 3S18 5848 2 71.23 AGCCTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chrX 14964606 5' - roo 353 2 59.59 ATGGGCTTATGAGAATTGAGCCCTAAAAAGCGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACTTCGCGTCGCGTGATCTTGTCGCGCG:1 - chr3R 2407420 5' + G6 99 1 75.20 ATCGAAAAAAATCCGGACGTCCGCCAAAGTATTTTCCATTTTTGTTTAAGACTTCTTTTATTAAATCAACGTTATTTACCACTATGCATTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAA:1 - chr3R 3323164 5' - roo 8763 2 70.97 GTGTTTAATTTTTATAAGAATATAAGCGCTTTTGCTCTGTTCCAGGTTCATTATTTGACTGCTCAAAGTGTGCTGAAATTGGGTTCAGCTAACCCGCATATACATTGCTTATATCTATCTATTCTTACTTTCATTTATACATATAC:1 - chr3L 23398264 5' - Stalker 252 4 78.77 ATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAACATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 - chr2R 19555017 5' - pogo 2039 1 66.42 TTCTGGAGCCATAACATCTCTTAGTGGGGCAATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr2R 5214905 5' + F-element 22 1 73.97 AGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAAT:1 - chr3R 16913442 5' + pogo 79 1 74.66 CCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGC:1 + chr3L 23456267 5' - Gypsy6A_LTR 270 1 63.70 AAATATTTAAATGCGTGTAATAATGGCGCATTAGCTATGTAAATTAATGTTCACCCTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTGT:1 + chr2R 17946448 5' - gypsy3 420 2 74.44 ATATTAATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 + chr2R 641851 5' - opus 443 2 56.85 ACATGGTTGCCAGGGAAATACGCTTGTTCCTGGTTCAGCAGCTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACCAAATCGGTTGT:1 + chr2L 13792549 5' + F-element 48 1 56.16 GCCTATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCACCATCATTT:1 + chr3L 24152410 5' + HMS-Beagle2 6913 2 63.70 ACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAG:1 - chr3R 26246879 5' - 1731 4543 1 72.92 ATCGATGGGAACGGGTTAAAAATAAGTCGGAATCGGATTCAGGCATAACAATTTCCTGTCAATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 31490896 5' - roo 9045 1 66.90 AAGTGCAACTTCGCCCAGGGAAATGACTGTTTGAAATGCCATTAAATTGCTTTGGTTCCCAGCCGAACAGGAAGAGGAATCAACAGCGAAGCCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTTATTAAGTG:1 + chr3R 31682854 5' + rooA 7575 2 59.59 AATTTGTAATGCCAGAAGGCCGCAAGGAGTCTTGAGGAGAGGGTCCTGGAAAAAGGACATGCAAGCAGTTCGCTTTGGAGGTCATGCCAAAAAGTGATTGTATAATCTATTGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCAC:1 + chr3R 22967447 5' + INE-1 520 1 69.18 ATTGTACATCTTAGCGTTTCCAAAGGTCACAGCAGAGTCGTATAGGTTCATGCACCTATACTCAACCATCTCCGAGGGAAAACCAGTGATGCTGAAGTACAAGTTAGCCGTAAATCTCGACGAAACGTATGCAGTGTGCTTCATAA:1 - chr3L 24368287 5' - gypsy11 4130 2 77.40 CCATACCACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTCTGATCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGT:1 - chr3R 20175774 5' - hopper 1332 1 73.97 TTCATCGATTCCTTTTTATACCTAAAAGTGCTAATTTTTAATATGCAAATTGGTGCGAATGAGACAGCTAGAGGTTCCTTTCAATGCAAAAGATATATAGTCAGTTACTGCATGTTTAAGGCTAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCC:1 - chr2R 25226366 5' - INE-1 157 1 71.92 GCATCACATGACTCTCCGAATCAATTGGAGGCTGCGGACAGAGACTTTGGACTCACCTTCAGTATCTTATCCCTATAGAGGGAACAGCTGATTCGGAGAATGCAATTCCCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGCACGTGGTACGA:1 - chr2R 10132484 5' + transib2 216 1 55.86 GTAATGCTAAAAAGTTTCGCCTTTCCATATTTGTTTTTCACTATGTAGTTTAGCGGCCAAAGTTAACCGAATATTATGCTACCTTGTTACTTAGGAATCAAAATATG:1 - chrX 4847905 5' - transib4 74 1 68.22 CCTTCGTTTTGCTTTGAGTAACGAGTTGCCTGACATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr2L 686112 5' - roo 9038 1 62.76 TGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACAAATCATCGCACACTCAACCGTGACGACGGCAACTGGAACACCG:1 - chr3R 9352056 5' + Tirant 64 2 73.83 GAAATATTGAAATGAAAAATACACAGCAAATCCACATTTCTCTAAATATTGAATATAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATG:1 - chr2R 8493098 5' + 412 495 1 61.64 CTTTTAGGCGGAGTTAAAGTTGGTTGAAACCTGAACAGCACGAACACTGTTAGTTTAAAGCTGTTTTGAGTTTTATAATACCTTTTATTTTTGGCCTTTGTGCCTCATCGTGGACCAAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCG:1 - chr2R 25162055 5' - blood 167 3 77.24 AGTAGCTATGAGTGCCTCAACACGTACTGGATTAATTCCCACGCCCAAGAGGCATATCAAGTATTTAAAAAAGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:2 - chr3L 15612814 5' - roo 9021 2 52.74 AAGTGATATTATGCGGCCCAATTTGCGATTTGTACATATGGCTGGCCATAAAAACAGAGCATGCCCAAAAATTAAGTATACGCACTTGATGTGACTTAATTTAATGACTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chr2R 23497182 5' + 412 14 2 74.66 CCACCAAGCCAATACGTATACACCAAACCACAATACATTTATCTATCAGGGCAGTTCATGGTACCAATCTATTAATACGAATCCCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAA:1 - chr2L 34316 5' + I-element 4914 1 64.38 CAACAAACTTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chr3L 22052741 5' - mdg1 7429 2 59.20 TATTGAATAATTGGTATTGTGGCATTCGAGTCACACCAACGATTGGTTTTTACTTGTTTCATTTAGAATTTTTTGCGATTTTTCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCCCA:1 - chr2L 10803102 5' + R1A1-element 411 1 56.25 TTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGAGA:1 + chr3L 6775355 5' + blood 7078 2 61.81 CACGAAGGCCCCCATCAAGCAAATGACGGGTGGGCAGATTCAAATCGAAATTTCAAACTTTATATTACCTTTTTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAAC:1 + chr2R 5026320 5' - copia 174 2 57.53 GGTCACACTGCGACTTTGGCGACTTAAAAAACACCCAAGAAAATTGATTTTTCGCTCAAAACGAAATGATTCATCAAATCGACGCACATGGCATTTAAACCATTAATGCGGTGCCCAAACCTCCACGAATCACCCCACCAACGATG:1 + chr3R 16643747 5' + HMS-Beagle 6711 1 43.84 GAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACA:1 + chr2R 5917831 5' + I-element 5125 1 68.49 TTTTTGTTTTCGTTTTCGTTTCTGTTACCCCGACAAGTGGAAATTAAACACGCACCCCCAATACACACCCATACCACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTCTGATCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:2 + chr3L 1307195 5' - hopper 1401 1 75.86 AACTACAAAATAGTACACGAGATACGCAGGAAAAGATATACAGGAGTTTTCAAGTTCTTAGTAAATACAACGCACTTGCAAAAACTGCTATCTAAACCACTCGGCGTATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 + chr2R 19553131 5' + mdg1 7052 2 74.66 AAAAAAATAAAAAATATAATATTTCTTAAGAGGGATATTGTTAAATTTTTGGGGATTGTTCAAGTTACGTGGTTTGGACTGTCTCCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGTCTCC:1 + chr2L 4177209 5' + GATE 8313 2 60.96 GGGAGAGGCTTATAAATTGCATCTTTATGCACTATAAACATTAATTTACTTGCCATTTAGCTAGACGCACAGTTAATTGAAAACAACAATACCCAGGCAGATCCCTCACCTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGCTTTTTTTTT:1 + chr3R 5134240 5' - I-element 313 1 68.49 TCTACCCGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATT:1 + chr2L 16089578 5' - 3S18 6050 2 53.42 AAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCAC:1 + chr2R 4312969 5' + gypsy 7056 2 70.23 ACAAAGCCATAACAAGCGGTGACCCTCGGACTTCCATCTAGAACAATGCCATCCTCAGTATCGAGAACAGGCCGACTTGATATTCACGGCAGGGATCTTACGATAACATC:1 - chr2L 7200616 5' - Chouto 161 1 63.64 TACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATCGTGATACATCA:1 - chr3L 19350008 5' + jockey 67 1 49.32 AGTGCACATTTTGGGGTATTAAATGCGATTTCGCTCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGCGTAGCAGA:1 - chr3L 11336411 5' - blood 7304 2 73.97 GAAAATGGAAAAAATTGATCCTTAAAGTGCTCGTGTTATAAGAAGAAATCCCAAATTTCTTGGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr2L 19068155 5' + pogo 58 1 58.90 ATTTGGGTTGTATTCGATATGTCGGATATGCAAAAGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCTCTCTC:2 - chr2L 12079682 5' - mdg3 5412 2 72.60 CGATCCAGTGGCTGTAAACCTTAACCAATTTTAACCGTGGCTACTCAAACTGTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTG:1 - chrX 15137458 5' - jockey 4922 1 64.38 CAATTTATTCAATGCAAGCTGAAAGTTAAAAGTTTTCGGAGGTTTTGGAAAACCTAGATATTTTAGGGCAATATAATATATAAAGAGAATATATAATATATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr3L 22408780 5' + Ivk 12 1 71.32 GATACAGAGCTGGCTCTTGAGATCTTAAATGACCAATTCGGGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 - chrX 22853455 5' + FB 35 1 60.00 AACGAGTGAGTGCGTGTGTGTGTTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3R 28396598 5' + jockey 74 1 60.96 AATGCAAAAACGATAAGCAGCCGAAAGGATTGCCACAGCAGTTTCCCAAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCC:1 - chr2L 12340858 5' + diver 5893 2 77.19 TGGCATGGCAAATGCGTGTTTGGTCCGTGTCCCGCGGGCGGACGAGTATATCGCACTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCC:1 + chr3R 20486333 5' - accord 497 2 54.62 AAGTGTATTTCGAAACCTTTATATAAAATATTTTACGATTTTAAATATTACTATTAGTGTTACTAATACTATTTGATCAGCACATTTCCCTTCTCCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTGTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 20743934 5' - roo 9046 1 66.44 TGTGGGTCACACATAGATTTTATGCAGTTTTGGTTTAAATGTTTTTAAACATTTAGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr2R 8396002 5' + pogo 63 1 65.07 GGGCTTAAGCCGTCAAACGGAGATGTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCACATTCTGGTGACAATA:1 - chr3R 23085027 5' + Quasimodo 135 2 81.51 ATTATAAAAACTTCATATTTATACTGTACTACTACTATATACTCACTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGA:1 + chr3L 9713952 5' + G2 2714 1 68.97 AGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr2L 17136202 5' - hobo 2928 1 60.34 GGGGGTGCTGCGAAAATAAAGGGGATAAAATGGAGCCAGGAAGGGCGCTTAAAAAAGGGGGTTAAGTGTGAGCTCGGCTAGGGGAACTTCTCTTCTGTTCTCCTTTTTTTTCGTTATTTTCTCGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 12301962 5' - gypsy11 3933 1 61.48 ATAAATTCGTGTGCTTGGTTTTGCAAATTTTATTTTTATACCCTACGAAGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCACCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTC:1 + chr2L 22551753 5' - 1360 3322 1 64.38 GTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1 - chr3L 23456268 5' - 1360 3326 1 63.01 AGCACAGTGGCAATTGACTAGCAATAATTTCTACATATCTATGGAAAATTCAATAAGAGAGGGTTCACAGTTTTATTGAGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAG:1 + chr2L 1259890 5' - Burdock 6352 2 54.11 AAGGAGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 16181149 5' + roo 48 2 64.10 GTGCATGTTGTCATGTGCTTGTGTGCGCGCGAGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr2R 6632547 5' + P-element 30 1 60.16 AGTTAAACAGGTGTCAGTCATATACAAATAATTTATAAATAAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:1 + chr2L 11574767 5' + Max-element 8249 2 75.34 ATGTCAGCAATTATTTTATTTATATTGTCATTGCACACATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCA:1 - 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chr2R 18036807 5' - Q-element 320 2 71.20 TGGAAGAATTTTAAATATATTTCGTGTGACATCCTTTGTGTACATATACATACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGC:1 + chr2R 20284217 5' + Transpac 4983 2 63.70 AAGAGAAAGAGATGTTAAAATTTAAGAACTAATATCTTTTCGCATTCTGACCTCGGTAAACATGAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 14076194 5' + roo 8686 2 63.39 AAAATAAATATAACCGAAAAGAGCGATACTAATTAAATTTAGATTTAGAACTCTTCATTTAATTAGTGAGTAAAAACAATAAACGAAAACGTTTATATGTGTGCGTACTTCTGCTAGAATACAATTTTCGGGCCGAAATCAATTTT:1 - chr2R 5664047 5' - 1360 3182 1 54.11 CCGACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTA:1 - chr3L 23678164 5' + Osvaldo 26 1 66.95 AAAGGTATCACTCCAGTAGCTCATATTAAATGGGTTCTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACT:1 - chr2R 20673709 5' + mdg1 7122 2 74.48 AAGAACTTAAAATCGCTAACTAACTGAAAGGTAATCCAAAATCTAATAGGATCGCATACCAAACGTTGATAGGAAAAAGAGAGGTGAAGTCGTTGAAAAGTATGCAACAGGCAGACGGAAGCGT:1 + chr2R 5705535 5' + INE-1 31 1 67.74 TATTTACATACGCCACACCTTCACGCTTTAAAGTTCATGATTTCTTAAAAGATCCAAAGAAACTTGCATTATCTGTGGGTGAAAATGCATTTAAACAAATTTAAGGTCGCCAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACA:1 + chr3R 25036795 5' - McClintock 6423 2 75.71 AACAGCACAGCTGTTTATATATTACTGAGCACAGCTACCCCACACAAACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chr2R 7665837 5' - Transpac 241 2 67.59 ATCAAAAATTATCTTTAATGAGAATTAGTTAAACAAAACAACCATTAAATAAGTTGCTTATGTTTTCATGTTTCCGTGGAATATTTTTTTAATTGACTTAACATAATTTGTTGATTCCTACTTAATAATAATACTACTTAATAATT:1 + chrX 12987736 5' - Tc3 271 1 75.34 TAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 5453703 5' + 412 7119 2 74.63 ATTTAAAAAACTATATTTGAATTTTTGAACAATATACTAATTTGAGATATAAACACAATATTACTTCTGTCTGAAATTTATAATATTGTATAATAACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGT:2 - chrX 21255823 5' - 3S18 313 2 41.78 AAAGTCTCTGGCAGCAATTAATTTCAAATTTTTTTTCAAATTTTTTTTTTT:1 + chr2L 7355911 5' + FB 173 1 70.59 TCGCTTGAGTAATGGCTGCAATAGGCAACGTGCAACGCCCGGAAAACTTAGGAAGAGGTGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGTGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chrX 5859000 5' + hobo 28 1 55.46 GGCAAGCGTTGGCGAGAGCAGGGCAAAAGTTTAAAAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr3L 13634176 5' + 297 6619 2 60.27 GGCCAAGAACAACAGCGAGACAGATACGGTTGAAACTTGAATTATTGTTTTGACCAACCACTTTCTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTCACTCCCCTTCCC:1 + chrX 10575175 5' - 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roo 9031 1 57.53 GTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAACATAAACTA:1 + chr2R 5214965 5' + F-element 82 1 65.07 CAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:2 + chr3L 18658917 5' - roo 8985 2 79.45 CTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACACTAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTA:1 + chr3R 13176348 5' - Burdock 6332 2 62.68 GTGTGTGTGTTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr3R 28396611 5' + jockey 86 1 69.66 TTTGACTTGGACTAGGAGCTGCTGGTAGTGGAGCTGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 - chr3R 22100613 5' - 412 437 2 54.79 GGTATTGTTGGAATTTCTGTTTTCGAGAAGTCTTGACGGAGTGTGCAACACTTAAAGCTAAGTAACAAAGTTTCATTGTGGGTGAGTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAG:1 + chr3R 27564591 5' + opus 7447 2 58.90 GGGAAAACGTCTAGAAGTCGTGAAGAATCGAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr2L 23310581 5' + 1360 19 1 72.60 AGAGCAGGAATTCGGGCAGCTCTTTGTAGTTTGTTTGGTAGTCGATCGTTGTTAGCTACCTTTGCTTTACCAACATTTTAAACTGGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGG:1 - 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FB 844 2 58.90 ACGCAAGTGTAAAATTAACAGTATAGTGTTGAAAAAAAACAGCTGTAAAGTCAGCTGTTGTAAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGT:2 + chr2R 3338718 5' + Juan 14 1 77.40 GGGCAAAAATTTAAATGTTTTGCAATTTTGCAACACCAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTGTGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 - chr3L 15026825 5' - opus 487 2 71.92 ACGAAGTTGCACGAAGCGTTTGTCGGCGTGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:1 + chrX 14826130 5' - P-element 2800 1 23.08 GATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCT:1 + chr2R 23000069 5' - mdg1 7370 2 78.77 CCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chrX 16855310 5' - roo 8989 2 75.89 GTGGTTGTGATGTAGCTAATTTAGATATTGCATCAGCCAGGATTACATGGGTGTCATATCAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 13395237 5' + roo 30 2 51.43 ATTCGATCCTTTTGCTGGATGCTCAAAGTCAGCAAGGACTTAACCTGTAAGAAAATTTGATTGGAGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr2L 9472281 5' - roo 9027 1 55.48 TATTTAAATTCTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2L 9472070 5' - roo 8999 2 71.83 ATAAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr2L 4173953 5' + roo 42 2 54.35 AACAGGAGGTTATAAATGGGTATTACTGACAGAAAGGTTTAGATATATTCGCCAGTATTGCGAAGTTCAAAGATATAGCAAATATATAATTATATATGATTTTCGCTTTTATAAGCTAGTGAATTATTATTATTATTTATTATTAC:1 + chr2L 7548075 5' - flea 242 2 38.36 CACAATTAGCAATCTTATGCGGGACACTATCGGCAGTTCAGCTGCTTCTTGAGTTTCCATGCTGCTATTGGTGTTGACTATTGACCAAAGCAGAAAACATTGCACAGACAATAACGAGAATAGTGAAGAG:1 - chr2R 14223132 5' + invader1 3981 2 67.69 TCACTTGCTACGGCATTCGATTCAGCTACTCGTACATTATCCCAAATACTCTATTCTAAGCTCCCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chr3R 15338024 5' + blood 7058 2 54.48 CTTTCAAGAGTCTGAAACTAATTAACTTTGTATCCAGGAGATAAGCCTCTTATAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGCAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTTATTTTATCTTCATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 + chr3R 11113184 5' - mdg1 350 2 61.54 ACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTC:1 - chr2R 4261963 5' - invader4 218 2 58.22 GATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTT:1 + chr3L 24213776 5' - invader2 5032 2 67.81 GTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr3L 22978638 5' + 1360 55 1 57.53 TTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 - chr2R 8157270 5' - Transpac 5170 2 58.22 ACTATAAACTTATTGGCTAGGAATAGAAACTAATTTCCTCACTTGCAACTCGGATACATTGAAGTACTGGTCTTAGAGAAATAACTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATAT:1 - chr2L 19643062 5' + baggins 5227 1 63.03 ATATTTTTTTATTCAAAGGTATATTTTACATACATTCTTACATATATCATAGTAACGCTTACGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTT:1 + chr2L 19817792 5' - G4 3809 1 70.55 CTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1 + chr2L 13792590 5' + F-element 67 1 65.32 TTTCCGTAGTATCAGTCAATAACCTGTTGCCTGGTAAACAAAGCCGTTAGCGAAGCAGAAAACGTGGTCAAAGCATAGTAAATATTTGAACCAGTGCACTATGGGGCATTTGTCCTGTTTTTTTT:1 + chr3R 5208096 5' + hopper 8 2 76.80 AGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAA:1 - chr3R 4528419 5' + F-element 79 1 67.81 ATGTGGGCGCTCCAGCGGAATCCTCCATTGAACTTGGCCAAATACACGCATATCCAGCGAACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCACAGCCGGCTGCACCGCAAC:1 + chrX 10447597 5' + Doc 4534 1 51.94 AGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGACAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 - chr2L 16948730 5' + jockey 4745 1 65.52 AATACTGTTTACATGCAACCTAAGAAGTTCTCATGCTGAAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 - chr2L 4179467 5' + jockey 91 1 76.71 TATAAAGAAGTTCTCGTGACTTTCAAGACAAGTCAGTTTAGAAGCACAATTCGAATTCCCATTTCGATTTGCTGCATGTGCGACTGAAGCTGTTATGTTAGAAACTCTGAAGCTTAGGAAGCTTGAGCTTAGCTTTGGGATTCTAG:1 - chr2R 5022321 5' + Gypsy12A_LTR 62 1 54.79 GACTGATTTATCTATGAGCAGGTGTCATCCTGCACACTCACCTCAGAACTATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr2L 16884951 5' - pogo 2090 1 75.89 AATCAATCTAAAATACAGTTGTTACCATTACAAATATCAACTGCTTTATAAATTTAACAACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chrX 13531705 5' + roo 8708 2 54.62 CAAAAGCACAATATCGATATTGGGTACTTGAATGTCCTAGTTCAACCGTTTTCGCGAGTCTCTGTGCTTCATTAGATTGACCACAATTCGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCTTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr3L 23042166 5' - pogo 2070 1 63.01 GAAAAATCGTTATTACATTGTTTTACATATCCTATATGCCCGCCATTTAGACTGCTGTCTCAAGCTTTTCCTAGGAAGGAATTTTCCCCATGCCACACATACTGCAAAATAATCCAACATGCCATACTTTGTCGAAGGCTTGTTGC:1 + chr2R 4008916 5' - Helena 402 1 69.86 GTGGTTAACTCGGTTGGTATGTCTGTATCCGCCGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTT:1 + chr3R 27859196 5' - hopper 1331 1 75.86 GTAATCGAAGCGTGCCACGAAAAGAGAGACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr2L 9668174 5' + 1360 50 1 58.16 CAACATTATTAAAATGTTGTCAGGCATTCCGAACAAGTCTCTGTGCAATGGAGTTTATTTCATATTTGCAGCCAACCAGAATCACATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTT:1 - chr3R 13176475 5' + Burdock 6168 2 63.45 GGCGGGGCGGACTGCCCCTAAAAGTCGTAAAATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGCAACTTAAAAAAGCAGCTACCTTAATTTTTTTT:1 - chr2R 11057333 5' - pogo 2036 1 71.77 CGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTA:1 + chr3L 24291978 5' + rover 71 2 67.81 GGCTAAAAGCACATGCATGCACATACATATGCTATGCAAATTGCGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr2R 19554884 5' + pogo 19 1 71.23 TATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATGTATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAATTAGCAGTGCTTGGGCAATTTTTTTTTTATAATCTCAT:1 - chrX 22460188 5' - HB 1546 1 74.29 TAAGACGGCGACGGCGTTTCAGACCTGAAGACGGCAGCCGCTAAGCTGGTTAACAAAAAAAAATACATATATATATAAAATACAACAAAATAAAATTGATATTCTTCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTT:1 + chr3L 8044923 5' + Ivk 117 1 65.38 AAGTATTGACCACTTCATTAGTGCAATGATATGTTGTAAACAAAACAACTTTTGACCCTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr2R 5737078 5' + 1360 26 1 67.12 CGAGGAGATATAAGCCGACAGGAGACGAAACGAGACTGTTTGCATACTTTCAGGCGCCTCTGACAGGGCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chr3R 19531180 5' + hobo 10 1 77.86 AGGGCGTCAGCGGGGTCAGGGGCCATGTGGGCGTGGCTAAATGTTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAAA:1 + chr3L 7644469 5' + invader2 4747 1 62.62 CAAACAATTTAATTAAGCGGTTCGCTTTTTATATTCACGTTGGCTTTGTTTGACACGTTCGGTTGGTTCCCCTCGACCTATGTACACATAAAATATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATC:1 - chr2R 20489501 5' + 3S18 5792 2 67.12 CCCAAAGTCCTGACGTGTGACGTTCGTTTATCAGTTGGCAGCCGCCCGACGGCCAGCAAAGGGGGCATGGTCGTTGCAGAATCGAGCCATGGCACTATGGTCCAGAATTCGGTTTTTTTGG:1 - chrX 8755159 5' - transib2 2816 2 74.38 CATTTGAACTCTTGTTTATTTCTGGCGAGTTTGTTTATGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCAACTCATTTTATTTGGAACTATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr2L 13927733 5' - roo 9000 2 68.15 GTGCGCGCGAGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGA:1 + chr2R 6632569 5' + P-element 70 1 37.67 GGTAATATATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATAGGTAGTCAAGTGTTGTACTATGGAACATATGCTACTATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 + chr3R 9419675 5' + Transpac 45 2 56.12 AGGGAATATGAGCAATCCGGTAGTGTGTAATAAACAAACATAACTAGTAGTTGCAATTTTACCAAAGAAAAAATAACAGCAAGACCAGAATTTCTACACAGAAGATCAGATATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCT:1 + chrX 10198026 5' + mdg1 332 2 67.81 TATTCGAATGCGTTCGAGACTAGTTTGTTTACTTCTCACTGAATTTGTTTATTGGCGCATTTAATGCCAACATCAAAAATAAAATGAATAGGAGTGATTGCTTTGGGATTTTTTTCGACTAATTTTGAAAAAAGGAGTTGTATTAA:1 + chr3R 10132800 5' + Tc1 289 1 53.42 ACCACCCAAATACGTCACTATATACATATACCTGTGTATGCAGAGGACATACATATGTTATGTATACCTTAACCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCGGCGATCGGCTTATGTATAAGCG:1 - chr2R 1355078 5' - Stalker4 166 6 76.47 GTGTGGGGGTGAGATTGGGGCGAAAGGGGAGTTAAAGGGTGGCTTCTGGCCATTGTACAAATGGGAGCATAAATAATAGCGACTGTCTGCCAAGTTATGAATAATAATGACAACAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 25387924 5' - roo 401 1 80.14 CACTTACACAATGTCCTTTAAATTAGTATTATACACATGATAGTAAATGACTGATAACGAGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACT:1 + chr2L 15945708 5' + X-element 81 1 59.03 CAAATCTGTGAACTAAACAAATCAATAAAAAAGTCAAGAGACTTCTATCTGACAACGAATAGTGCGTTGAACTAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCCGATGAAATTGT:1 + chr3L 18030958 5' + invader4 44 2 53.42 ACTGATATTCTTTCGGAGTGCCTTCACCCCGAAATTCGTGCTTTTCCTGGTCAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr2L 9237462 5' + blood 7040 2 64.38 GTGCGGACAGATATATACTCGTAGATGATATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTA:1 - chrX 4186693 5' - I-element 5261 1 79.45 AATGTCGTCTTTGCTCTTGCCCTTGATCAACTTGTCGATGGCCGCATTCTGGGTCTTTTGCACCGAGGTGCGCTCTTTGGCACTAAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGATATGGCA:1 - chrX 4360118 5' - INE-1 119 1 56.16 GTGTGTGTGTGTGCGTGAAATTTGATGCCGCACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAAT:1 - chr3L 7995480 5' + P-element 90 1 23.97 TTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGNTGANNNNTNGAGTGGACGTGTTCANAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 + chr3R 6515339 5' + jockey 68 1 69.49 ATCATTGCCTACTTTTCTGCGTTTTGCTTTTCCTGGCCTTCCTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGTTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr2R 23116194 5' + jockey 26 1 65.49 ATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:2 - chr2R 10695865 5' - roo 9001 2 69.18 TAGAACATTTTTTGGTAGCTCTACAAAACTGAGTTATGTGCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1 - chr2L 5601633 5' + mdg3 5320 2 67.67 ATGGTCACAATCTTGCGGAAACCATGCACACGCCAATGTTCGGCAAAGCCGTCAAAACTCATTGTCTGTTGCTTTTTAAAGGTTGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr3R 20328929 5' - 1360 3376 1 50.00 CTTGGGTCTGCCGGAGATAAAGGGAAATCTGTTCAGGGCCAATGAATTGATTTTCCTGCGCCCATAGCCATTCGACTGCCGCCTGACTTACGCGACTGACAGGGCAACGCATACAATTCCATATACATACTCATACTTTCTGCTGT:1 - chr3L 13407505 5' + ZAM 213 2 67.81 TTGAGATGAAATAGTTCATGAATGTAGTTCGAGAACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr2L 17029550 5' + blood 20 2 68.28 ACTAGTAAAAGAAAACAAACAAATGTAGGATACTGATTAGGTCTTTACCTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3L 15612715 5' + roo 8736 2 66.21 ATAGTTAATTTCTACAATCGACATATGTGAGCGTACCTTGGTTGATATATGCAATTTCCTCAGTGTATATGCAGCTTTGCTCTTTTTGGGCCTTCTTCGGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTT:1 + chrX 14951067 5' + P-element 23 1 69.86 CTGAGTCGGTCTGGCGTTATTATTATTTCAATTGAATTAATTGTGGAGTAGGTTATTAGCGGTATCGAAGGTGATATTAGATCCGTAATTATAGCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAAC:1 - chr3R 12593166 5' + flea 14 2 73.91 TGTCGACGCCCACAGTTCGGTTGTAGATTTTTTCTTGTTTCTTTTTGTTTTCCTTTGTTTTTT:1 + chr2R 8799780 5' - Doc2-element 252 1 53.97 ATGTAAAAAGTGTGCAAAAGTATGCTATAGTAATACTGCATGCTGACAGTCAGATAGAAAACAATCGTTGCATACTTTTAGACCGCGTTATTTAAAATTTCTAGCCACTAGTCGCTGTAGTGGTTTATTATAAGATAAGATAAGAT:1 - chrX 18051111 5' + Stalker3T 201 1 80.14 AACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTCCAA:1 + chrX 22564590 5' + Transib5 59 1 67.29 ACATTAATTAGATACGTAGAATAACAGGTAGTTGGAAGAGTTAGTTGAAAATTTTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3R 20744099 5' + roo 32 2 63.01 GGCATCTATAAAATAAAAGTAAATTGGTTGTCCGGCTTTGGTTTGCCCAACATCCGTATCCGGGGCATTTTGTTTTCCCACTTTTTTTTTCGCGGGCGGAGCGCGGCAACAGAGGACCCC:1 + chr2L 16611851 5' + invader6 351 2 75.83 ATTGGTGGAATAATTTGAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCA:1 + chr2R 5917815 5' + I-element 5109 1 57.53 ATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCCGTTAGC:1 - 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chr2R 6842854 5' - roo 341 2 62.33 AATCGTCAGTGAATCACGAGCATTTGCCCCGTTTCCAGTTCGTAATCCGATCAATGTAGGAAGGATGCATACATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chr3R 29733145 5' + opus 23 2 64.80 AAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 13563395 5' - roo 9026 1 59.35 ACCATAGCCGTCTAGTGAGAATATCTATGCACATATTACTAATCTAGTTACAGAATTCCCTGAATTCCCTCTGTCTTCGGTATACCGATTGAAATTGTCAAGACGAACTAGTCGACTTTCCCGACTATCAG:1 + chr2L 22156952 5' - INE-1 562 1 77.86 CTTAATTATAAAGTTGTACTAAATGGCAGTAGGTCTTGGGATCTGGGCAGGTGAATCGTTACGTTGGAGGCGCGAGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGG:1 + chr2R 5284558 5' - accord 7376 2 60.95 GGATGGGATTAATTTGTGGCCTATGCTGAGTGGCAACGAGGAACCGAAACCAAGAACAATGATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr3L 17890697 5' + 412 34 2 63.01 TGGAAATAAAGGAAGCGGCAGGAACAACGCGTCAAGTACGTGGTCTGGGATTCAAATTGGTTTGTTGAGGCATCCACCGTCTATATATATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2R 12543193 5' - roo 9042 1 63.89 CTGATGATCGGCCTCGACCAGGACATCGCGCTCGGCGCGTACGTGTGCCACCTGCTCCTTTTCCAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCCATTTTTATGCGAAACAATAATGATGAGTTTTT:1 + chr3L 19833640 5' + pogo 1785 1 56.16 AGTTTTCGGAAAAGCCAAAGAGCTTTGGTCTGCTGCTGAGAGCCATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACACGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2L 245966 5' + roo 18 2 68.46 ATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCG:1 - chrX 21667933 5' + gypsy2 6554 2 68.35 GATCTAATAGCTGGTGTATGGAATCAGCTCCACAGAGCGCTTTATGGGCTTATGAGAATTGAGCCCTAAAAAGCGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACTTCG:1 - chr3R 2407463 5' + G6 77 1 52.74 AATAAACCCAATACATATGCAAAGCTTTTATTCTTGATATGTATAAAAAAAAACTTTGGCACAGCAGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 + chr3R 9351984 5' - Tirant 354 2 52.86 AAAGGTCTACCAGTCTATAAATTCTGTCAGTATATTTTTATACCCATTACTCGTAGAGTAAAAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGATAGAGGGAAGAGTTTCTGACCATATAAGGTATATATATACTTGATCAGGGTCAATAGC:1 + chr2R 5296797 5' + INE-1 86 1 63.70 AATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 + chr3L 6775372 5' + blood 78 2 73.91 CCTTGCCTTAGTAAAGGATACAACCCACAAGAAGAAGAAAAGAGAAAGGGGAAGTAAATTTTATTGTTACACCAGAAAAATAACAACAAACCAGTGAAGAAAAATGTATTTCAAATGCGCAAAACTAAAATAAATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 7589174 5' + F-element 4684 2 64.38 CAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr2R 10695779 5' + roo 8723 2 61.43 TTTCAAGGCCATGGAAATCACGGGAACCAGAGGACGATAAAAAACGGATTTACGCCTTTGATTCAAGTGACAGAGCGACAAAAGGAACAGGACTCCGTTGAGAAGATATCTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACACAAACTCAACGA:1 + chr3R 27856348 5' + roo 9043 1 67.81 GTTTGATAAGCTGCCACGTTAATTAAATGCAATCATTTTGGAAACATACTTATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chrX 12138882 5' - roo 399 1 76.03 AAAAGTGGCAAAAGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAA:1 - chr3R 9190603 5' - Tabor 431 2 54.17 GTCTCGTCTGCAGACCTTTGAAGTCAGGGTTTAGTAATGGTAATAGACCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chr2R 11489140 5' - mdg1 7433 2 67.12 GAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr2R 10695897 5' - roo 9033 1 57.53 ACCTTAGCATGGATTAACAGTGGTCAAAGTAAGATAAAATTTATAAGAAGAAAAGCGAACACTAGACTTTTCGTAATTGCGCGGGCGCGACCGGGCGTATGTTTATTCAGCGTGGTTAGTTTTTACACTGCCGCTTATTCTAATTA:1 + chr3R 19446358 5' - GATE 8354 2 67.81 ACTGTGCCATCGACGCCTGTTGTTCGTTTATTTGCGGCCCATGGGCCGTTGTATATAAATACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 - chrX 14559364 5' - 297 341 2 60.96 ATTCGCAATTACGACCGTAAGTGGGCATAAATTGCGATACTACGAATAGCTTATCTGTAGTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAATTAGAACATATTTATAGTTTGCCTACTTATCATGTCTAAATA:1 + chr3L 22312103 5' - rooA 13 2 65.07 ACCGCATCACACGGAAAGAAATGAAAGCTTATAAATACCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 - chr3L 13868708 5' - 412 7501 2 67.59 GATAAATAAATACAATAAGCAACATATACACGTATATAAAAAGTAGCAAAATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGTACGTGTGCACAGAA:1 - chr3R 28728777 5' + jockey 29 1 71.43 AAAGAAACATACAGAAAGAGATTAATTTATGGATGTTGGAAAAAAACCCAGAAATCTTGGAATTATACAACCCATTAAAACAAAATAAAACAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAG:1 - chr2L 21762423 5' - INE-1 543 1 48.28 CACCCGCGAGTTCTGCATCCATCCCGATCTCCTCTGCGATGGCATCAACCACTGCGGCGACAACTCCGACGAATCCGTGCAGAATCTGTGCCAGAGTGAGTTATATCTTCATGCAATTCCAAAGAATGTTTTTTTTTAAATAATTT:1 - chr3L 11737659 5' + HeT-A 5800 1 78.77 GAAATGCTTTTGTGGCTTAACCAGCCGCCTCCGAGTGCGGTAATCGAAGCGTGCCACGAAAAGAGAGACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr2L 9668135 5' + 1360 16 1 72.60 GCTGCCTAGCAGTGTTGTACTGGAACAACTGAATAAGATGTACGATACGTTATCGAAAACGTTACATTGGTCACATTATTATTCATTTATTCAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:2 + chrX 16787042 5' - pogo 2076 1 61.64 TAGGCAACGTGCAACGCCCGGAAAACTTAGGAAGAGGTGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACTACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGCGCGGGTGCTACTCGC:1 - chrX 5858979 5' + hobo 53 1 58.54 AGCGGACAGGATGAGCTCAATCAGCCGCCGATGACGGCCGACTTAAGATGGCGTCCGCATGGGAGGCTAATCTACTCCGGGTATCCATGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGT:1 - chr2R 12983639 5' + blood 369 2 59.59 CACAGGGATGGGCCAGGACAATACAATATCCGGGAAGTGTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGCTCTAG:1 + chrX 4305799 5' - Gypsy12A_LTR 2202 1 65.55 TGGACTCAGTTTTTGGGATTGACCTAGTCAGCCATAATATATGGTATAGCCTGTTAAGATATGCAACATTTTGGCTATTGATTTTTTTGTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGC:1 - chr3R 22249233 5' - jockey 4964 1 56.16 GTACTATTTTCGTTTTTTTTGGGTTTTTGAGTAATGTTTGTTCGCCGCCAGAAGTGATTATTGACAACGGCATTTTAATGTAAAAAAAGTTGAATGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAG:1 - chr3L 3643287 5' + 1360 497 1 39.73 TATGCTACATTTTATGACCCACAACGAGTGAGTGCGTGTGTGTGTTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3R 28396576 5' + jockey 36 1 59.54 GCCTGGAAACCAGGGTTTTAACAGCTCCCATGTGATTGTGTGTACGTGTGTAATTTTCCAGACCGTTGTCATTGCCAATTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr2R 6632678 5' - P-element 2846 1 57.53 TAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 + chr2R 641872 5' - opus 440 2 67.19 ATTAAACGGAAACCTGGGACCACATACGTGTTTATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGGCAGTTACATACTTTTCAAGGAATCTAGTATACCATTTTACTCTACGAGTAACGGGAATAAAAATTTACAATTTATGAGCATAC:1 - chrX 22635686 5' - 1360 190 1 77.14 TTGCAGCATTAACACGCATAAATATTTATGTGAGGCGGTGTGGAGTTCCAAGCAAAATATTAGTTCATTTATGTAGATATACCTTTTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr3R 29645804 5' + jockey 8 1 58.41 TTGAGTTATCCTCTGCATTTGCTTGGAATTTAAATGACAGTATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGTGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAA:1 + chr3R 7739458 5' + I-element 81 1 76.03 AAAGTTAATTTTCTGTGAACTTTCAGGAGTCTTAGGCTAAATGAAAACAAAATTAACTGGGGAGCGAATTACCCGAGTAACTCCACATTGCAGCGAGATATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 - chr2R 17121727 5' + blood 7033 2 69.18 AGTTGGGATCGTCTGTCGAACGTTTGGCAAACTGAAGATCGGACACAATTATCCGGTGGCTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCA:1 + chr3R 11057557 5' + flea 4793 2 54.40 TAGTGCCCAGTTAGACGTATTTGTAATTTATGCTCCTAAGACCTTTTGCTGATTTAAAGTATCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGT:1 + chr2L 5601549 5' - mdg3 187 2 54.79 ACACGACAAGTCCTGCAAAGGTAGGTTCCTCTATTATTTTATTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTG:2 - chrX 17419446 5' - Juan 4128 1 76.03 CATCACAACTTCATATTTGGTTGCTTATTATGCGCGATGTTCTAGGACTTTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 + chr3R 15021982 5' - Tabor 464 2 67.81 GATAAAAAGTTTTAGTTTGAATTAAACTTATCGTGTATGTGAATTGTGGCGTAATGTTGTTGAGCAAATGGGTTCTACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 24279309 5' + roo 45 2 53.42 AGCGGACCGCAACAACAAATGCGGCATATAAACGAGCGCATAATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr3L 11336306 5' + blood 23 2 65.00 GATGTTTGGCACACACACTGCCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr3L 17175102 5' + 412 7068 2 68.42 ATGGTGGGATCTCGTTTCAATTGCTACATAAATGGAAAAAAAAAATGCCGAGGCAGGCAGAAATTTAGGTTGACATTCAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 16580379 5' + 412 42 2 56.85 ATCAACTGCTTTCTTTTCGTTGCAGTTTGTTTATCGTTTCCTAATTTGGCTGCCGTTGAGCTGGAGTTGTCAGACGCGCTAAGGTGC:1 - chr3L 9858067 5' + aurora-element 3927 1 79.31 AATTTGTGAGCGTTGCAATTTTCATACTTTCCCTTGCCTTTTTAAAGATTTATATGAAGAAATAATGTTTGTATGATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACC:1 - chr3L 24934415 5' - HMS-Beagle2 283 2 63.85 CTTAAGGGGCGCTAACCTGGTGACGCGCAGTGTATATATTAAGATGTATATGTATATGTCGAAGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCCTCTTCACTATTTTCGTTGTCTGTATAACAAACGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3L 23143345 5' - 1360 3379 2 78.77 TAGATCTTCGATGTCAAGGAACCTTGTATTTGTGTTTCGAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGGG:1 - chr2L 13250470 5' + opus 37 4 58.57 CGTAAGTCAAAATAGTGTCGCCGATTATACGCTTTAAATGGTATTTCATTGACTTAACTCCAGCTTCCCAAATACCTCCGACCTCTTAGTACGGTACTGACAAAGACACTAGAATAACATGATGCGT:1 - chr3R 19447627 5' + 1360 6 2 63.78 ATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chr3R 9352057 5' + Tirant 8143 2 73.75 GCAAGGGTTCCTTGTAATCATTAAGGGAAATAAAAAAAAACAAGAGAGAATGCAATAGTCGAGCTCCCCGACTATCAGATACTCGTTACTCAGCTAGTGTGAATTTCTCAGGGATATCGATAGAT:1 + chrX 11905829 5' - INE-1 500 1 72.00 AGTTCTGTATGTAAAAATCGTATAATATAAGTTTTTTAACGAAAAATTATATTTTAGTGGGTTAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAAAGTTAATTCTTAAGCTAAGAAAGAACGGAAAAACATATAAGGATATTCAAAAAATCCT:1 - chr4 845902 5' + HB 424 1 71.72 ATGTGTTTTTGTAAATAGAAGTATTTGTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr3R 13122494 5' + blood 7064 2 55.80 CAAATGACCTCGAGACATTCTTGTCCAGAAAATGCCAAACAAAAAATGACGACTTAAAATACAATTTTCATTGGATTAAAATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr3R 16913332 5' - pogo 2070 1 61.43 CTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGCAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTATCAGACA:1 - chr3R 11547762 5' + G2 354 1 67.81 GCATATTGCTTAAACATTTAACAATTCATTTTTTTTCCTCTTCGACTTTTAGTGGTACAGAAATATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTAGTGGGGTGTATACGTTGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTA:1 + chr2R 1691305 5' - Idefix 28 2 56.85 CATTGCCAAAAAATATGATATATTATTACATAAAAATATGATACATTATAGATTATAAGAAGAGCATTGTAGAAGAATTTATAAAATGGAGAAAGTTGAAATATATATTTAATTCCACCAAATATATTCGGGAAACTCGACTATAG:1 - 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chr3L 25599725 5' + invader2 4883 2 95.12 CAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGT:1 - chrX 20999594 5' + BS 45 1 56.20 ACTGCCGTTTCATTCATGAATGCTCTTGTCGATTCAATCATTATAAATATATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 + chr3L 23042040 5' + pogo 63 1 67.86 AACCAAATTTTGTTAACTAATGACGTACAAGTTTAAATACCCTCTGAACAAATTATAAAAGTTATATAAACCGAATTATTTTCTATTAATAATATAAGTGTTAAATATTCCTAAAGACGTCTTGCAAGACGACTGCAATGGCTCAG:1 + chr2L 16138004 5' - Helena 1267 1 77.40 GTTGACAAACGCAAAGCAAATAATTGCAAATCAGATTTCTAAGCGAGTCAGTCAATGGAAGTTGTGTCGAGCGATAATAAACAAACTGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTG:1 - chrX 17186392 5' - 297 299 2 61.27 AACATGCGCCTCATCAGCGCCGTCGTCTAACTCTAACGCCAAAGTCATTAAACTCGCGCCGCAGCTTCAAGTTGAGAGAAGAGACTCCAGCTCCCAACTACCAACATCCAGCTCAGCAGCCGCTCCCGTCTCCGGC:1 - chr3L 4741453 5' + F-element 4505 1 70.59 ATTTCGTGTGACATCCTTTGTGTACATATACATACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTGAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAG:1 + chrX 22560054 5' + Transpac 5001 2 74.66 ATAGTTTTCAGGGCAAATGAGCATATGAGAGGATGTTTGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAA:1 - chr3L 9571717 5' - jockey 4908 1 75.86 TGACAAATTGCATTAGGAGGACCTTTGTAATAAACCCATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTTTTT:1 + chr3L 10144690 5' - blood 352 2 62.50 TGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCT:1 - chr3L 24208191 5' + Quasimodo 78 2 76.03 AAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr2L 4173955 5' + roo 36 2 56.15 GTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAA:1 - chr3L 23702285 5' + G4 33 1 58.90 CAGTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATGGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGGTCTTAGACTTTAAATCTAT:1 - chrX 1018157 5' + 1360 238 1 67.81 TCCCGGAACTCGATTGTGCGCTTCATCATGTCTCGCAGGGATGTCAGAATGCGGCTTTCGTAGCCAAAGCGGTTCATTAGCTTAGCAATCCTGTACAAAATTTAGTTATACGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTCTGTTGTACGTCTC:1 + chr2R 22653576 5' - Bica 247 2 73.97 GAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGC:1 + chr3L 25482867 5' + accord 36 2 59.29 TTAAAGAAAATTCATGTGTATACACTTTATGATCGAAAGCATCGAAATTGTTAACAACTTGATTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACA:1 - chr4 716995 5' + INE-1 173 1 80.00 ACAGATAGAAATTTTCCAAGAAGTTGAAATAGTGCCAGGGACCCGCTGCGACGAGCCCTTAGATGTTGCACAGGAATCATAAATAAATAAATCTCATCAATGGTCAATCGTCTTTCTTAGTGGCT:1 + chr3L 24871553 5' + G3 374 1 56.00 AAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3L 19350023 5' + jockey 35 1 64.62 TGGATAAATCGTTTTGCTATGTTTAATTGAACAATCGTTTTAGTGGACAAACAAAAGCTTAAACCAGAGAACTGCAAAGCTGGCATTTTTTGCCACTCGACTCACACCCAAAAATTTTATGTGCGGGTGCTACC:1 - chr3R 17867852 5' + hobo 50 1 52.24 TCTGACAGGGAAGCGCTTTCCGTACCGTTAACAAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCC:1 + chr3L 23773870 5' - Transib5 2863 1 77.78 TAATAATATGCAATAAAACTAATACTTTAAAGAGCCCTATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCTTTCTGTGATTTCATATTTTGATGATATTGTAATATTGCG:1 + chr2R 15829520 5' + invader4 2812 2 64.46 AATATACATGTATGTATATACTATATATGGTCTAAGACGCTTCCTTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chr2L 14934838 5' + hobo 66 1 70.90 GCCATAATATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:2 - chr2L 22016017 5' + Tirant 8128 2 65.81 AATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAG:1 + chr3L 24152446 5' + HMS-Beagle2 66 2 63.01 GCAGAGACAAGACCATTATGCAAAATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 - chrX 6481333 5' + hobo 60 1 74.34 GATCAAGCAGCCAATGGTGTAAGCCAACTATATAGCTTCATGTGGCTACTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATACAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAA:1 + chr2L 6870671 5' - hopper2 1539 1 61.64 GACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr2R 2427615 5' + Doc 32 1 53.15 AATTTCCTGGCGCGAGAAAAAAAAAACGGGAGAATTATTTGCCAGGATGTCCGAAACATTGTTGGTGTCAACAAATTCCTTTTCAACGGCTGCAAAGACTTCTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGCACTATGCT:1 - chr2L 16872285 5' + Cr1a 4011 1 64.83 CTTTTTGAATATTTAATAAAGATGTTTTAAAGTGGATAGATGATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAA:1 + chrX 8012252 5' - 297 6921 2 67.20 AATTCAGCTCAATTTTCGTGAGTTCCGCTTGGCATGCAATTTCAAAATTTTAGCAATTTCGCTTCTGGTTTGTTGCTGTTTTCCTCCTTTTCCCACAACGCCCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCG:1 - chr2L 16436401 5' - F-element 225 1 63.45 TCTACGAGTAACTGGTAACATATTATAACCATATTAGTTAAAAGGTATAGTGTATTTTGAGTTGTTGCTTGTAGAGGACATTTGGATCGACTTAAAATCGCTGTGTCGTCGGCAAATGTAGAAGTCGTTAACAGTCTGCTTGTGGG:1 + chr2R 4239228 5' - Fw3 2917 1 61.64 CATAGCACGGGATTTGCTTAGGTGGGGAGATGTGGAAAACGGACTCTGCAGAATGTGGAAATCCAGGACAAGTGCATTTTGAAAGAATAAAAATAAAAATTTTAGATCAGGAATGTACACATGCTGAATAAAAACCAAATAAAGAT:1 - chrX 20746714 5' + mdg1 353 2 57.53 GCAGCAGAGTATCACAAGCACATTTATTAGAGTTTTTCCCCACTCGATTTTCCCATCCCCCGCTTATTTGTGTGTGTGTGTGCGTGAAATTTGATGCCGCACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCAGAAGC:1 - chr3L 7995549 5' + P-element 21 1 71.23 AACAAATCGCCAAAGCCAACGTCTAACAAGCGGCAAGAAAACAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTG:1 + chr2R 12501634 5' - blood 7114 2 75.34 GTCATTTTGGCTTAACTAAATATTTGATGTGTTTTTGTAAATAGAAGTATTTGTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr3R 13122468 5' + blood 35 2 61.64 AGGGCGTTACCGAGCGGCAGACCACACGAACCTTTTGTGGTACTCCAAATTATATGGCTCCCGAAGTAAGTAAATCAGCCGAAAAAAATAAGTGTAAAAATAATCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGC:1 + chr2R 16900713 5' - roo 79 2 72.60 GGTCAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATAT:1 + chr2L 9237510 5' + blood 7087 2 70.34 AGTGGCAAAAGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGT:2 - chr3R 9190600 5' - Tabor 7265 2 56.85 ACGATCAAGATCAACGAAAGAGAATACAAACTCGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 - chr2L 1558736 5' - 412 482 2 70.00 CATTAAACAAACATAATAATACTAATGGTAGCCAACAAGTGCACATTAACCCCTTTAATCGCGCAATTTACTAACATCTTTCTCCTGGTGACTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGCTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr3R 19859539 5' - opus 472 2 37.67 ATTTTCATAGATCCCCTTTTTGATATAGCGAGATGTGGCTCCTGTGTCTATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAA:1 - chr2L 22780959 5' + HMS-Beagle2 6922 2 58.90 ACTCTCTAATTTGATAAATAATTATAAAAACTTCATATTTATACTGTACTACTACTATATACTCACTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGAT:1 + chr3L 9713932 5' + G2 2695 1 55.48 ATGGGCAACAAAAAACTATCTCACACACAAACACACACACACACCAACAGCACTAAAGCACTAAAATCAGCGAAGAGTCTCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chr3L 7092969 5' - hopper 1376 1 48.63 CAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTATGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 - chr3L 15026789 5' - opus 7454 2 56.85 CTGCATTTAACTTGTATAGACTATATATATTCTTGATAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTC:1 + chr2L 13154249 5' + Juan 64 1 60.71 AGCTGTTCAATGATAACAAATGTCCCCAAAATATTTCTTACCTCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCA:1 + chr3R 11749657 5' + Tabor 80 2 73.10 GAAGCGTTTGTCGGCGTGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGA:1 + chrX 14826142 5' - P-element 2785 1 14.38 AAATGTAGTAAATAATATTCTCTTAAATGTTAAGATCCTAATGGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAG:1 + chrX 16383970 5' - diver 189 2 60.96 AATTCCGCATTGGAATTAATTCAAAGTGGTATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chrX 10645068 5' + jockey 60 1 58.09 GCAAACATTTCGGTTGAATTTACTTTATTTATTCGCACAATATAGCTAATCTTTCATATATTTATTTTTGCTTACTAAGCATAGGGTATTGAATATTCAACGTGATTTTCGTTTTGATATCCCATTTTTGCTGCCTTTTTTTAACA:1 - chrX 3567292 5' - Porto1 4430 1 54.79 GTGTCCAAAGATTGCAAATTTTACTTTTTGGTACCATTTCTGGTACTTTTTGGCTCATTTCTATCCATACAGTGCACTGTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTTGCTGTATT:1 + chrX 3464161 5' - hopper2 1559 1 47.95 GAAGAGACAAGAGATCGTTTTCGTCGGCTCCACATTTGCAATTCAACGGACTCATTTGGTCCACTCCACTTACATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAAC:1 - chr3R 11878323 5' - invader4 3012 2 51.37 ATGGTAAATAAATTAGCTAAGATTTCAGTCCCTAGAATGGCCACCCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 685960 5' + roo 8699 2 58.62 GTTGCAAGTCTCGCCTCTTACGCTTTTTTGTTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTC:1 + chr2L 3395712 5' + jockey 4732 1 73.91 GATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chrX 4778167 5' + 412 7096 2 51.82 TACATCGTTAAAAGTATCGCATGATAGTGAATATTAGTAACATATGTATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chrX 5150245 5' + roo 26 2 65.07 TAAGTCTTTTAAGTCTTGGATTCGGTATTTGATTCACGACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - chr2L 9485701 5' + 412 44 2 46.58 AGTTCACGATCAAGATCAACGAAAGAGAATACAAACTCGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr2L 1558741 5' - 412 461 2 60.29 CGTATGTGGCGCAGGTACTGGTAGCAATTGTTTGGCTTTAGAGTGGGTGTGGCAAACATTTTTTGCACATCGATAGAAACAAGACTTAAGAAAATGTGAATAAATATCAACACTTTTTCAAAAGTGTGGGCGTAG:1 + chr3L 313891 5' - INE-1 252 1 74.81 TGAATGAATTCCTTAAAGTATGCAATATTCGAATTCAGAGCATACAGTTTTGGAGCGACTGAAATGTGATAAGAAGCCCGGCTACAGTTTGAGTAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAG:1 + chrX 15137345 5' + jockey 4533 1 68.75 CTATTTCATTTTTTGTTATTCGGGCTGGATTCGTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3R 7035345 5' + roo 8722 2 60.96 GCACAGAAGAAGAGAAAACATTCACGGCGAAACGTTTTAGTTCTTTATGTTTTAATCTAGTTTCCCCCATAACAATTTTAGTTTCAAATCTGCTTCTTTTTTGGGATTGTGTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 21420633 5' - gypsy11 3933 2 76.56 GATGACGGCCACTTGCGTAGCACCCAGCGACAAAAATCAGGAAAAACTGTTGCCTCTTTTCCACCCACCCACACATACGATTAAGTTTCACCCCTCGTCGGTTGAGCTGAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCAT:1 + chr3R 15711723 5' - diver 211 1 73.97 TTGAACTCTTGTTTATTTCTGGCGAGTTTGTTTATGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr2L 13927736 5' - roo 322 2 75.34 AGCGAAGCAATGTGGTGTGATCTATAAATCGTACAATTTAGTGTGATTTTGATTTAAAAGGTATAATTTTTTAATAACTTTTACCTTCCATAGCTAACCGTACAACGATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTACTCG:1 - chr2R 1954074 5' + Cr1a 4041 1 57.75 AAATAAACCCAATACATATGCAAAGCTTTTATTCTTGATATGTATAAAAAAAAACTTTGGCACAGCAGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGT:1 + chr3R 9351983 5' - Tirant 349 2 52.74 ATACTAAAACAACATATTCACTGTGGTCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAAAGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAGGATTAATAGACGAG:1 + chrX 22633237 5' + INE-1 90 1 56.94 CGGTCAACACTCCCACTAAAAACCAAAAGCCCCATGCAAAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGACTCAAGTGAGCGTG:1 - chr3L 10144731 5' + blood 7083 2 76.30 AAACTGGAAATGGGGTCAATGGCAAAAGCATTTGAACTCTTGTTTATTTCTGGCGAGTTTGTTTATGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGA:1 + chr2L 13927705 5' - roo 354 2 53.10 ACACACAAAGGACGGGTTGGCAGTGACAAAGCTTTTCAGGACTTTTCACGGAAATTCCGAATTCTAAAATATAAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 + chrX 21234425 5' - 297 6935 2 51.08 ATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGCGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATACATGTACTACTGGTATCAGAAACCCAC:1 - chr3R 11547744 5' + G2 359 1 76.69 AAAATAAGTCGGAATCGGATTCAGGCATAACAATTTCCTGTCAATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 31490914 5' - roo 9026 1 54.11 GTTCGTCTGCCTGTCTTCAAAGTGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 10684711 5' - roo 9032 1 57.53 GAGGGACAGAAAGATGGAAGAGATGGTAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr3R 19531292 5' - hobo 2918 1 66.67 ATTAATTAGCACGCGAACTAATAATCTGCGTATGGGTTTTCAATGAAACTTCATTTTAGTCCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chrX 22610682 5' + pogo 58 1 56.16 CATGAGTTGCAAACATATTTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATACGTACACAGCACAACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 + chr3L 6775337 5' + blood 51 2 50.68 TTGTCAGTTGTTGTTGCTGTTGGAGATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGTACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGGGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCT:1 + chr2R 2666296 5' + Rt1a 17 1 63.28 CTATACATAAGTTTTTGCACCCAGCTCAATGCGCTTCGTCCCTACGTGAAACTACACGGTGCTGCCAACTCGATTAATGATTCTATACCCTCAACGTTGTGAAAACATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr2L 6318847 5' - pogo 2087 1 74.66 GAAACAATAGAATATGTTTAAAAAGAGAGTTTAATGCAATATAGATCAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTC:4 + chr3R 30295097 5' - Quasimodo 7300 2 68.49 GGGCGATTTGTATCCCTCAAGCTTTGGGTTAAAACAGTTACTGCCACTGCGACTGCATTTTGTGTTTGACCTTCAAAGTGGACACAGAAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATGC:1 - chr3L 16821789 5' - R1A1-element 5275 1 61.64 CACATATTGATTACAAAATAAACAGAGATAATGCCCAAATCATCATTGGTCCATGTTTGTTAATCTCTTCAAGTAAACCCCGTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAA:1 + chr2L 6700749 5' + jockey 4934 1 55.48 ACATAAGGATATAGCCGCCCGATCCGCCCATTTATAGACCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAG:1 + chrX 12138179 5' + roo 8923 2 71.11 GGACGGGTTGGCAGTGACAAAGCTTTTCAGGACTTTTCACGGAAATTCCGAATTCTAAAATATAAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1 + chrX 21234434 5' - 297 343 2 58.16 CGACCCATTGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGC:1 - chrX 21667978 5' + gypsy2 13 2 79.39 GAAAACTGGTAGCACATCATGAGTTGCAAACATATTTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr3L 6775320 5' + blood 34 2 62.33 ACACTGTGACTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCCCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr2R 19555041 5' - pogo 2058 1 51.08 ATCTTTATATTTATTTTTGGTCAATATGGCCCTTACCTGATACTCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr3L 96582 5' + roo 78 2 72.60 GTTTATTTCATATTTGCAGCCAACCAGAATCACATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTT:1 - chr3R 13176423 5' + Burdock 85 2 77.40 AAAATACATTTTATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCA:1 + chr3L 24934257 5' + HMS-Beagle2 6904 2 71.23 TCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGC:1 + chr3L 23456280 5' - Gypsy6A_LTR 266 1 71.43 AATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAG:1 - chr3R 24476344 5' + 412 7144 2 80.14 ATTCGTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 7035317 5' + roo 86 2 80.14 TTTTATTGTGCTTGTATTTTATTTGGTTTCAAATATGTTGTTTTGTTATCTTATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTA:1 - chr3R 4581950 5' - 297 6910 2 64.38 ATGGCTTTTCCAGCTGCGCCAACAGGGCGTATGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr3L 19199696 5' + hobo 65 1 76.61 AATTTATACATACATATACATTCATATATTCATTCATACATATATTAGCCTCTTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACA:1 + chr2L 11342068 5' - accord 89 2 62.59 AAAAATACAGCGGCAAAGTAAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 13563415 5' - roo 359 2 52.05 CACACAAAACACACAGGAGACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTA:1 + chr2R 22722992 5' + 3S18 5796 2 63.01 CATATTTTACTTAAAACTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 10567864 5' + roo 60 2 61.11 CTGCGAAATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1 + chr2L 8956743 5' + pogo 70 1 65.75 ATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACACAATCGGTTGTTTTGA:1 + chr2R 5214936 5' + F-element 53 1 52.74 TAGCATAGAGCCATATGTGTAATTAATACTGCTGTCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chr3R 27768512 5' + 297 6626 2 61.34 GAGCCCACTTTGGGCTGTCATTTTTGCGGTCAACACTCCCACTAAAAACCAAAAGCCCCATGCAAAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chr3L 10144757 5' + blood 32 2 57.02 GAATTGAGGCAAATTTAATAAGGATTTCCATCACAGATTACTGCGATACTATACTGCAAATGTATATTTCGGGCGAATTTGTGTTTGTTTCGAATGGCAAAACTAAATTATTTCATCCACATTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGT:1 - chr3R 29418834 5' - mdg3 246 2 82.88 AAATGACAACGACAGCCGCAGTCGCAGCAGTCAGTGACATAAGTGGGCGTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCTGCGCT:1 - chrX 6138758 5' + opus 139 4 67.81 TCGTAATTAAGCTGCGGTTCGTTTTGGTCCATTTCGATGCGCTTCGCTCAAACCCAACCCAACAAAATCCAATCCAATCGAATCCTCCTCCTCCATACATTTATATTGTCATAAAGGGTATGCTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1 + chr3L 12015200 5' + INE-1 13 1 57.24 ATTTTTGTGAATCACGTATTAGATAAAAAATATATATATTTTTGATCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATAATATATTCTAGGGTCTTTGATCTAGCCGTGTCCGTATGTCCGTATGAACGTCGAAAT:1 + chr2R 5744278 5' + INE-1 131 1 70.55 GCATGTTGCACAAGTCTTTGCAATCGGCTATCAACAATGGACTCTGGGATATGTGAAGAGGGGCGGGGCATGCTACAATGCAACCCATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTT:1 + chr3R 28627568 5' - copia 220 1 60.96 CATACTTTTAGGCTGAGGGCGCAATGGGCGTATGTGTAATATTTCCATGCCACATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCTGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2L 2004930 5' + jockey 69 1 62.86 AGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTAT:1 - chr2R 17890965 5' + Tabor 67 2 61.64 GCTGCCGTCTACAAAACGTACATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTATGGCACACGAGTTTTTGGCCGTCGCTCTAGAGG:1 - chr3R 10266177 5' + 1360 56 1 50.34 GAATGTACACATTCATTACACGGTTCCGATTACTTCTGAAAAAGCAATATACTTCTGATCGATTACAGTTACTTTCTATAACATTTAATTTCATAAAAGTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr2L 6319039 5' + pogo 20 1 71.92 CCGCATAAAATAAACACTTTAAAACCAATATTTAAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:2 + chr2R 20673600 5' - mdg1 7430 2 63.70 AAGAATCTCGAAGGATGCTACTCGAAATATTTTTGAATGTTCGTAGTCTTCGAATTATTAATTAGCACGCGAACTAATAATCTGCGTATGGGTTTTCAATGAAACTTCATTTTAGTCCATTTACGGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chrX 22610627 5' + pogo 1 1 75.17 CTGCTGTAATTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGC:1 - chr3R 11547831 5' + G2 285 1 77.40 TTGGAGGTAAACAAATGTTCTGGCCAGATATGTATGTATATATGTAGTAATAAATATTTAGGATCGTAAATGAATAAAGTATGCTTTTTAGATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 + chr3R 23859792 5' + jockey 4777 1 70.45 AAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr2R 5214988 5' + F-element 86 1 79.53 ATAATGCGTTATTGAATCTCCCATTTCATCTGCCAGCAGAAATCAAAAATAAAAAAAATAAAAA:1 - chr2R 12731300 5' + R2-element 3584 2 51.56 GAATTCAATATGGGTTTGACATTATTTGCTTCTAGCTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGGTCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGC:1 + chr2L 8959862 5' + Ivk 5101 1 65.75 GAAGGGTGATTCTGGGAGTGGAGGAGAAGGACAGACCGTGAACTAACGGTACCGTGCTGAACCTTGGACTGTCCAAGGGCGAAGAGGTCGACCGGTAACGGTGCATGCACAAAGAAGACGCACCGTGAACTAAC:1 - chr3L 23105671 5' + gypsy8 4815 2 76.87 TATATTATAGCTGCAAAACAAACAGTTGATGGGAAGGTTTAGCACTCGGAATTAATACGATTTGTACGATTTGTGGTTCAACTTGATTTAAAGCACTTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr2R 23000002 5' - mdg1 7437 2 69.86 ATAGAACCAAGAATGCCTTAGCACATAAGATAAACAATTATTAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCAC:1 - chrX 22000048 5' + Quasimodo 195 2 66.67 ACTGACTCACGAACAACGAATGTATCGCTTTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGGAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1 - chr3R 4197290 5' + P-element 91 1 23.97 GTCGGGCCTAATTTATGTGAACGGAATGCCAAAAATTGCATTTGAGACAAAAGCCAGAGAGCCAGAGAAACAAAATGCGAAAATGACAAATTGCATTAGGAGGACCTTTGTAATAAACCCATATATGCCACCAATTGAG:1 + chr3L 10144607 5' - 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roo 329 2 72.41 GTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAG:1 + chr2R 6632581 5' + P-element 66 1 33.08 AAACGCTCCACTAACATGTCTATATGTCTTGGAAGGGAATTCAAACACCCAATCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTGTCGGTCCCATGATGAAATAACATACGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr3L 14551087 5' - P-element 2874 1 67.67 TTTTGCAGCAAATTTCTGGGCAAAAGCATAAGCATAAGCTGCACTTTCACCAAAAATTATGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chr2R 11057252 5' + pogo 58 1 60.27 AAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAA:1 - chrX 20999627 5' + BS 21 1 65.07 AAACGACTGCCATTAAAGCCTGTTGTTTAGTTTTCAAAGTTAAAAGTATGATGGACCTTTTATGGCTGATCAGATGTCCATTGTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr2L 17999458 5' - Bari2 911 9 72.28 ATTAGCGCTAAGTCCGCTTCCATAACAAGAGAGTGAAAGGATTTGAACTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 - 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mdg1 19 4 63.16 CAGATACTTGTACATTTTGCGGATGCAAGAGCAGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGTAATTGTAAAATCCCACACAAGAAGACTGTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2R 11609172 5' - roo 387 2 66.44 TTGCTTCGTAAAGCGTGAAACAATAGTGATACTCTTCATTACTCCATTACGAACCACCAGGCGTATGCCATTGCTGACCATTCAACTCTAGGAACAAACGCTTTTCGTCCGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAA:1 + chr2R 558034 5' + copia 4881 2 77.24 GATTGTCGCCTTGAAATTTAATCAAGGTTGAAACTACACTGTGACTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr2R 19555076 5' - pogo 2097 1 78.52 CGCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr2R 19554927 5' + pogo 60 1 59.72 AAATAATGATTGCGATCTCTTCATGTTTCCTAAAATAGCAATCTTTTATTTTTCCCTCTGTGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAA:1 + chr3R 10472691 5' + mdg1 7100 2 58.22 TTTAATAAAGTTTGTGCAAGCTAATCGCGTATTCATGGACCGCGCATGGATACTGATCAGCCGAGAACTTAAGCTGTGTAAGCGGTTTTGACCCTTTG:1 - chr3R 26181640 5' - Quasimodo 6945 2 64.29 AGATTTTCGCACAGCGACATGAGGAGGATAATGGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3L 16562923 5' + roo 63 2 74.59 GTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCT:3 - chrX 20999585 5' + BS 63 1 65.07 AAAAGGAATTTAAGGAATAATTCTAGCACATTATCTATAAAGGCAATAATCGCTTACTCCTTTTGATTTACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGTG:1 - chr3L 21491197 5' + Cr1a 236 1 54.11 ATATATATATATATATTCAATTGATTTTCGAAATGTCTTCTTTTTTCGAGTGCACATTTTGGGGTATTAAATGCGATTTCGCTCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 + chr3L 12664674 5' - blood 353 2 51.13 GAGTGCTATTTAATATTATAGAATGAGGTAAGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 + chr3L 16212748 5' - Transpac 260 2 69.09 GGTACATAACCCGATGCTTAAAGAAGACCACATCCAGTAGGTATACGATGTCAGCGCAAAAGTCGCAGGCCAACCATATAATAGGGCTTGTGCGGTCTGCACTTAATGAGGCAAATAGTAAGTACGTGGCGATGACAG:1 + chr2R 21694487 5' - Burdock 163 2 47.83 AGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAAATGTGATCCATCACAAAC:1 - chr3L 19349977 5' + jockey 72 1 65.83 ATAAAGGTAGTTAGGTTTGGAAAATACGCTGTATACTTATTATAATATTATATTTATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 - chr3R 23639243 5' - pogo 2039 1 64.38 TTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr2L 17250702 5' + opus 151 4 52.99 TGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCGA:1 + chr2R 5617492 5' - invader1 342 2 60.27 AGTTCTTCTGGGAGAAGCTGGACGACTACCTGTACTATGTGCGCGCGTTCGGCAACTCAGTGGAGTTCTGCTTCGGCATCCTGCTGTTCATCAACGGTGCTTGGATTCTGATCCTCTGCTACCCATGGCATTCCAAGCTCCTTGTG:1 - chr3R 29500820 5' - G-element 4036 1 77.40 GAAGTGGCCAATTCAATGAATTACGACCTTATCTGATCTACAGATAGGCAGACAATTTAATCTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAAT:1 - chr2R 23000143 5' + mdg1 7098 2 58.90 CTTAAAAATCTTAAAAAATAGAACATTTTTTGGTAGCTCTACAAAACTGAGTTATGTGCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTT:1 - chr2L 5601651 5' + mdg3 63 2 58.22 TATCTGCGATTGTATTTGTGCAAAAATGCGTCACGGTGTGTGTGTGCGTGTGTGCATGGGCATTTGTGTTGGTGCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr2L 8366499 5' - 1360 3342 1 53.42 CATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGAC:2 - chr2L 686079 5' - roo 340 2 63.70 GTTGACGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGACATCAAGGGCCGCAACAACACCAACTCAGTAGTCCACATACATGAATATACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATATCAAGATG:1 - chr3L 27391436 5' + 1360 3 2 78.42 ATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACACATTGTAAATAAG:1 - chr2R 5532317 5' + G4 3833 1 71.23 TTTGTCGTCGTGCATAGGGGTCTTAATTGCATGGCCATACTCATACGTTCACACACGGACACACACACACACACACACACACGCACAGACACACACACACACAAATACTCACAC:1 + chrX 8932841 5' + accord 189 2 80.70 GAGTATGTGCCACACACGTGTATGGTATATGTATGTATATGCTGGGCACAACGCATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chrX 12526036 5' + roo 8692 2 66.44 ACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - chr3R 18815975 5' + hobo 61 1 58.22 ATGTGTGCGCATTAATCTGTGAAATTGACAGCAACAAAAACGAGCGTAGCAAGTTTGCATAAATGTGCGGGTTTCGGGCGAAAATTGAAAAGATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:1 + chr2R 17890837 5' - Tabor 457 2 63.70 TATCTCCCCGCTCCCAACCGCCTGATTGATTTAAATAATATGGGAAGGAAAGTACGTTGGCTGGCATAAGACAGCTTGACACTGACGCGGCCACAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTTTTGTAAAATGCGGTTGACTGTGGATCTG:1 + chr2L 17231845 5' - pogo 453 1 55.48 TTAATTTTAAACAGAGCGCACACCAGTGATGAGCGGCATAGATGTTCTTGATGTTCGTGTCACGAATTAGCACGATATAAAAACCAAAACCGAATTTATTCAGTGTTTAATTTATTTCGGAGTTGATCCTAGTTTAAATACGGATC:1 - chrX 759020 5' + McClintock 379 2 51.37 TCAGTGAAGCGGCAAAGCTTAACGTCAGCGTGATGTTATTGATTGTAAAGCCTTATTGCAAACCTTAATATTCGAGTATGCAGCCAAAGTCGACTGCACTGGAACGACCAACCAGCCCA:1 + chr2R 4545646 5' + Doc3-element 4580 1 55.46 CAGTGTATATATTAAGATGTATATGTATATGTCGAAGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCCTCTTCACTATTTTCGTTGTCTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr3L 23143318 5' + 1360 37 1 60.27 AATGTAGCGAATTCGTTTTGATTTCATAAAAAAGAAAATTATAAAACAAGCTTGTTATATTTCTCAAACTACTTGTACCTTATTTACTTAATATACTACACCTAATATGACTGCTACATTATTCTTTATTAAAATAATTTTATTTT:1 + chr3R 20394804 5' + 1360 3092 1 63.01 ACGTGGCAAAGGCTTTGATTCCATGCTTTGTTTGGCCTCTCAATTAGTTGCCTCATTGCATGACCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr2R 20865763 5' - 412 7525 2 58.72 GTTAAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGTAGACTTTACTCG:1 + chr3L 12867276 5' - roo 399 1 54.21 TTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:2 - chr2L 76123 5' - roo 330 2 76.71 TAAAATAAAAAAATTTTTTAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATA:1 - chr2L 1962695 5' + copia 4936 2 66.67 TTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCNNNNATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACNNNNNNNACAATCACATTGTAGNNNNNTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAG:1 - chr2R 17890951 5' + Tabor 6920 2 63.01 GTAATAAATATTTTCTCTAAATTTCTCTTTCTCTAAATATGGTTATATATATATACATATGTTTTCTTTATATACCCCTATCACACCGAACGCATTTCAGAAGACATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 + chr2R 5260594 5' - 1360 3335 1 70.55 AAATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCT:1 - chr3R 10472763 5' - mdg1 332 2 76.71 CAACGCTTATCTAAGGATATCTATATATCCGTCTATTTAAAAAAAAAATGTAATTGTCTAGCTATTTTTAAAATATGTAATGGTTATGGGCTGACCTTTTCTAATATTCACGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:2 + chr3L 4187136 5' + pogo 9 1 77.40 ACTGGGTTTTGCTGAACCTATATTTTCTTAGTAAATGTATATATGTATCCATTACATTGCATTGGGGGAGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:2 - chrX 6510150 5' + jockey 4689 1 72.60 CTTTTATTCTTGATATGTATAAAAAAAAACTTTGGCACAGCAGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGGAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGT:1 + chr3R 9352008 5' - Tirant 8443 2 65.67 GACAGGATAGAACAGTTGTCTTACCTTGCAGTTCGGACTTACTGCGTTGTTGATGAGTAATATTTCTTTCAGCGAGCTGTAGAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTAT:1 - chr2R 4313098 5' - gypsy 7433 2 55.48 AATATATATATATTCTTAATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCAACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTC:1 - chr3R 5064116 5' + INE-1 571 1 57.66 ACCCAAATAGTGCCTTCTTTTCGCTTTGCGGAAGTGTTACAAAGGGACAGAAAAGTTAAAAGGAGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 16181090 5' + roo 17 2 71.03 TTTATTAGCGAGGAGCTGGCGGACAGGTTGCAGGTGGCAAGAAAGATCCTACCTACGAGGAGAGAATGGCAGATGGACGGTACGAGGACTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTATGT:1 + chr2R 4930083 5' + roo 8747 2 60.27 AGAGGTAGGTAGATTGTGGCAGAAACTTGAGCATGATTTCTAGCCACATTTTCCATAGTTTCCATCCTCGATTCAGAGCTCACAATTTCACAATTTAAGCGTAAACCGATTTCTGGCGTTTGACGCGACTCTTGTTAGCATAGCAT:1 + chr3R 13153314 5' - mariner2 699 1 67.12 GATAATTGTAATTTCAAATGAATTTTAGCTTTTAGGACCTAACCCTACCATTTCATATTCAGAGTAATCTTATGCTAAAGGCGGTTGCTACATTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCC:1 + chr3L 23277005 5' - invader2 4714 1 65.75 AAGGGAAAGCGGATGACCGGCGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTG:1 + chr2R 21402598 5' - mdg3 5441 2 56.52 GACGATCCAGATGTCATGCTTTTTGCTTCAGTAACTACTCGGGATCCTGTGATGCGTACCGGTTGGGGGTTAGACTATGGCGCTGCCTTCAGTCCTTGGAGTCCTCCGATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAA:1 + chr2L 22747213 5' + transib2 14 1 71.92 ATAAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTATGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2L 4173953 5' + roo 50 2 51.37 GACTGCTCAGAGAGAGAAAGTAACGTCTGTTTGAAACGAGCGCGCCGTCGCGACTGTCTCAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chrX 8891749 5' - P-element 2862 1 57.80 TAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTATGGCACACGAGTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr3R 10266143 5' + 1360 81 1 73.53 AACACGTTATAATTTTTGTAGTATGCACTTTTAAATTTGTACACACGTCATCCGCACTCATTACAAAAATATCAAAAATGGCTAACCAATGCGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACAT:1 - chr2R 5542472 5' + 1731 4344 2 63.70 AGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAATTTCATT:1 + chr2R 961137 5' - transib2 2657 1 52.74 GCCTGTTGTTCGTTTATTTGCGGCCCATGGGCCGTTGTATATAAATACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAATTAATTTCCCGTCAGCTGACTAAGGACAACGCCAA:1 - chrX 14559350 5' - 297 349 2 62.10 GCATGTACCATCACGTTGATTTGATAATTTGATTGATAATTGACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAAAA:1 - chr3L 24916721 5' + Porto1 152 1 41.10 CAAAAGAGCGGCCAGCAGAGCAATAACAATCGCCGATGCTCGACGACAATGTCGTTCAACCTACTCTTTCAAATGTCAATACAATTTAATGGTGTAATTATGAACTCCAATTAAGAACACGAGT:1 + chr3L 12224588 5' - 412 7536 2 73.39 AAAGCATTATAGGGCACAATTAATATTTGTCAGTCACCGACTATCTCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATCTA:1 + chr2R 1007664 5' + Ivk 92 1 78.20 TGTTGAACTGATGGTAACTTTCATATTCGAGTTCAATTAGCATGCAGCTCCGTTCTTTTTTTTCTTTTTTTGGGTTTCCATTTGGCTTAGTGCAAGTATTTGACTATGCACCTGTGTGGGTGCCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTTGT:1 + chrX 10279879 5' - gypsy3 423 1 79.45 CCTAACCGTCTATCAACAAGTAAGCGCTACTGCACATTGTACCTAGGTGAGTGGGAGATTCTGCGTATAAAGCTGTTTTAGAGGAAGTATCGTTATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chr2R 5923070 5' + jockey 4694 1 68.28 CGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTACGCTTTTTGTCTGAG:1 - chr3L 9909776 5' + Transpac 4977 2 56.20 GAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTG:1 + chr3L 15276651 5' - hopper 1333 1 73.97 ATCGTTAGCTCAAATTGCAATTGCGACGCCTCCCGTTCGAACTGTTTTTGGCCGTTATCTGATCGAATGTAATTATGATCATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACA:1 + chr2R 14791411 5' - BS 4993 1 54.48 TGCTCGATTATTTCTAGAGAATGTGCCTGTGGACGCACAAATAAATTAATACTCCCAAAACGTTATTCAGGAAAATAGAAAGATAATAACATCTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr3R 4569636 5' + opus 7146 4 63.70 AGCTGGCGAACTCCATAATTTTTCCGCCAGTGCACGTACAAATATGAGTTGTTAGTTGCACGAGTAGCCCTGTGCAAACGGGTTAGTAGAGGCCAAATGTCAACAATCGAGCGCCCGAACACACACACACACAC:1 + chr2L 751869 5' + accord 7025 2 77.61 AACTAAAACCACAAAAAGTATCTGAAGTTAAAAAAATAATGAAACGGCAAAACCCCAACTCTAACTCCGACACCAACAACATCACATTAGTTGAAACTGGACTCATAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGT:1 - chr3R 28203882 5' - I-element 203 1 75.34 GTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATCACGCGCAAATTTTATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGAAAAATTAAAAGTTAAAATCGTCTTCCGGCCGCAAAGTTTGAACCGCGACGATACAAACATTTAATAGACAAACAAAAAGCGA:1 - chr4 1294994 5' + TAHRE 218 1 49.32 AAGTTCTAACTAATACACACTATCGCGTCGCCCACTTTGGATTTTGTAGTTTTTCTCGGCTAAAATACTTGCAATACTTGGTTTGTTTTGATCAATTGACACTATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATT:1 + chr3L 21951538 5' + 1360 302 1 58.62 GCTGACCTTTTCTAATATTCACGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr3L 4187223 5' + pogo 1 1 61.22 AGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCA:1 + chr3L 24934289 5' + HMS-Beagle2 6934 2 55.56 AGCGGGTGCGGTGGTTGGCAGCTGCCAAAGGGCCACTAATGATGACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 12599039 5' + 412 42 2 60.00 AAGTTACGATAAGAAATTTAAATCATAATTCCAGCTTCTTGTTTTAATTAATACGTTCAATATGTATACATTCTATGTATGTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAAT:1 - chr2R 8642991 5' + Doc2-element 4740 1 50.68 ATGCGTGATAAATGGCTTTTATCATTTTAAAGCACTCCACTGCACGGCTTTTCCAGCGACAAAAATGGCAACGATGAAAATGGGGAAAAATTGTGCGTGTCAAAGGAAGAAGGTACAACTTAGCTTCAAAACATTGTGACACTTTG:1 + chrX 10559874 5' + Stalker 6909 4 76.71 GGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr3L 22400278 5' + 1360 50 1 63.25 TATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTG:1 + chr2L 23299984 5' + invader4 380 1 71.54 ATATGCTAGAACTTTTATTAATATTTTCAAATTATTACTTAGCTATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATGTATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAAT:1 - chrX 22460237 5' + HB 2 1 75.34 ATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr3L 17707832 5' + Doc 59 1 64.71 ATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chr2L 22015978 5' + Tirant 8175 2 76.80 CTGACAACCAGGTACCTGAACATCAGATGGCTCTCTCACGGTCTAAGCCTTTTTCCAGAACGAGAGCACTAACACGACGACGCAACAAGGTTACGGCATAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTAC:1 + chr2L 22636450 5' + Chimpo 173 1 62.33 ATTTGTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 - chrX 21852452 5' + Tirant 8158 2 57.25 CTGCATGTGTGTTCGCAAACAAATTTTAGCGCTCAACTGCACTCGAGGGCCATAAAAGTTTTTCACACGTTATATAATTTTTTTTTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGT:1 + chr3R 6244474 5' + Doc 18 1 66.13 AAAGTTACCCAAAATGATGAGCGAATAAAGTTGACTAATTCAATTCGATTTGCATTTGGCTGGGGAAACTAGCGCTAAATAAGTTGATGGAAACTCTTCAGTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCAC:1 + chr3R 18563134 5' + F-element 4459 1 74.48 AATGCGGAGTAAGGGTCGGTGATGATCTTGCCAATGCTCGAGCCGGAGTATTCGCCTCCACTCCAGGCGCTGGGGGTCCGGTCACCACAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAA:1 + chr3R 17625373 5' - F-element 70 1 64.93 CTCCAATCTGCAGCACAAGTTCCAGACGCTGCTCGAGGATGATCGCGAACTACACGACAAGTCCTGCAAAGGTAGGTTCCTCTATTATTTTATTTATTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1 - chrX 17419497 5' - Juan 4190 1 64.44 ATTTCTGGGCAAAAGCATAAGCATAAGCTGCACTTTCACCAAAAATTATGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr2R 11057263 5' + pogo 33 1 57.27 CGTGCTCCTGCTGCCGCCATTGAGTGTCCTCTGATGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAC:1 - chr3R 26520445 5' + FB 67 1 72.80 ATGGAAAAACATTTTACAAAAGTGTGAGCGTGACTTGCGTGGCTGGAATCTGTATGCTTGATCTCAACTCTATAGGCTTCCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr2L 22132482 5' - pogo 2060 1 57.53 GAATAGGCGCAGGAAGACCTTCTGCCACTCCGCAGAATCCCCCTTCTCCTTCTTATTGTTTTCGCGCTGCCATGAAGCCAAGCGGGAAAACCCCTACCCCCATTTTTGGTTAAGTTAATTAGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTA:1 - chr2L 2331338 5' + HB 304 1 73.29 AGAATTTCATGAAACAACAGAGGAAAGAGAGGAGCACAAAGCTACATACATACATACATACATACATATGTCTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAA:1 - chrX 22858505 5' - copia 239 1 50.68 AAAGCACTTCTATTAATATCTAGCCATTATTCCAGTAAATGAATCAGATTTTTAGCTAATAATTTTTTAACTATTTTTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr3L 13374093 5' + pogo 41 1 52.74 GTGGAAGGGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATCTGGAAATATCTTCG:1 - chrX 7515749 5' - roo 355 2 52.74 ACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTATAATATCATTAGGTATTAAATTTCAAATAATTTAACAAATGTTTCACTTTTATTTCTTCAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAGA:2 + chr2L 21675226 5' - HB 1466 1 78.08 AATTAAACCAAATATTTTCAATGAAAACCAATTTTTTTAGTAACACAATCGTGTGTAGAACGCATTAGGATGTACTTTCTAATTTAATTGCATTTCAAAAATGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:2 + chrX 13786813 5' + pogo 17 1 69.18 AAGGATGCGGCAAAAGATACAAAAGTAAATAACAGGGTCAGGCATCCGAAGCTAAGCCAGATCCACTCCTGCTGCATGCTGCAATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGT:1 + chr3R 29418613 5' + mdg3 5263 1 73.97 AGGCTTTTGAAAATTATCGAACTAGAGTTTATGATGTCGTTGAAAAGGGTGTTAGGGTAAATGCATTTGACGACAGATTTGGTAGTGGGAAGGGTTAGCTGTCCTCTATATAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGC:1 - chr2R 5241141 5' + R1A1-element 464 1 79.29 AACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTT:1 - chr3L 13827370 5' - hopper 1365 1 51.72 CAGAAAAATAGGCACTTTCTATGACCCATTATAAACTGGAAGTTACGATAAGAAATTTAAATCATAATTCCAGCTTCTTGTTTTAATTAATACGTTCAATATGTATACATTCTATGTATGTAATATAAGTTATATAATAAGATTT:1 - chr2R 8643030 5' + Doc2-element 4700 1 77.93 TACCCTTTAACCCTTACCTGGGTGTGGGGGTAGCACAACACAGGCTGTTCACCCATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCACCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3R 30635009 5' + roo 8716 2 63.56 ATCTGTAGATAGATAGATTAATGGAATACATAAGTTAAAAGAATGGTTGTGTATTTCGATGAGTTAATTTTACAAGGTATATGATGCCTTTCAATAACTCGGTTGCTCACATACCAGGGTAGCCCATATGCA:1 + chr3R 871101 5' - G5A 2514 1 69.70 CCGAGAGCTGGTCTGAATTTGTTGCTCACTCGGTGAGCCCACTTTGGGCTGTCATTTTTGCGGTCAACACTCCCACTAAAAACCAAAAGCCCCATGCAAAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTAC:1 - chr3L 10144791 5' + blood 7034 2 70.55 GGGAGTGAGTTATATTAGCCAGGGTGCTATGAGGAACACATGAAAACCGTCATTGGATCACATTGGAATATTTTATTGGTGCTAACGCAATGAAATCAGAGCAAATACATAAAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 - chr2L 12319394 5' + copia 4876 2 78.08 GGGCAGATGTGTCACTTGGAAGAGTAGAGAATGACCTGGTGAATGGATTCATTCAGACATTGTTCTTGGAACATGTATAAGATGCGATCTCTTAAAGAAGTTACAATTCATTTTCACCTTTTAAATTACAAATATTAAAGACTATT:1 + chr3L 1320687 5' - gypsy7 5092 1 85.62 GAGACGTTTTTGATAGACTGTTCAAATTAGGGTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 + chr3R 21001827 5' - 412 415 2 80.00 ATGAAACCGAATGAAATGACTGATAAATTGGAGCAGAAAGAGAGAGGTGGAGAGCGAGAGAGCGAGAGAGAGA:1 + chr3L 10527632 5' - Cr1a 295 1 53.42 AGTCTTGAGTAACTAAAGTATTTAAACAAGCACGTAATGGTAGCCGTTTAAAAAATTCTTTTTTTTTGTAATGGAATTCTATACGGCGATTTTTTTCAAGTGATGATTTTCGCCATTTTCCGCTTTTTCCTCTTTTTTTTTTT:1 + chrX 5167753 5' - Doc2-element 230 1 79.72 CTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 + chr2R 5214952 5' + F-element 23 1 61.00 GACGTGATGGCCAAATATGCAAAATATTTTGCAATATGCGTGTTACACTTTGGAAAGCATTTGGAAACTGACTTTGTTAAATGGAAAATGAAGGGAAAAGCAAAACATTTTTAATTAATGTATGCGTACACCCCAACAGCCTAGCA:1 - chr3L 20289184 5' + jockey 4669 1 71.23 GAACAGCTAATTAAAAGATCTTTTTGGACCGATTTCTTGGACTTTTCAACAAGACAATGCTCCTATTCATAATTCTGGAGTAGTAAAGTTGGCATGTAAACAAATAACAATTTTTAGGATTGCTGGCGGCTGCATGACCCGACACC:1 - chr2L 22632666 5' - diver2 4531 1 60.96 GTGCCTGGACTTTGACTTGGACTAGGAGCTGCTGGTAGTGGAGCTGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGGCGGGCTGACATA:1 - chr3R 22100623 5' - 412 7500 2 52.74 AAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chrX 1103601 5' + pogo 50 1 55.48 AAACTAATCGTTTCTATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGAC:1 + chr2R 961114 5' - transib2 2680 1 68.49 GGGGCTTTCAGCCGGAGTTCCTTAATATCTAGTACTTAAGTATTAGCTTACAACAATTACAATTACAATTATTTACAAGTAATTGATTTACATTGATTTACATTGGTTGGGGATTACTTAACCAAACGCACTTTTTAAAAAATATT:1 + chrX 21083742 5' - HB 264 1 54.11 CGTAGGCATCCCACACACAGACAATTAGAAACATGAATGCACTGTGAGAAACCAGCTTCGAGCCTATGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chrX 22725644 5' - roo 355 2 54.11 ATTTCTTTCCCTGTGAATATTGTTTCTAAAACATAAAAAAAAACAGCTTATGATTTGCCTTCGGTTTTTATTTCCGCGTGTTCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr2L 12319221 5' - copia 252 1 72.48 CGGGCACAATTATGGCTATGAAACGCTGATGACCATGCTGCCCACCTATATGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chrX 4785079 5' - roo 9002 2 65.75 GAACCAGCGAACCCCCGCATCCCACATACTATGCCATAAAACCAACGCAGGACATCGGCCGGATTTTTAATGAAACACAATAATGTTACTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCTCGAGCTCTTCGTGGATGGCGG:1 + chr3L 11745241 5' - G2 2779 1 63.01 GCTTATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGC:1 - chr2R 5206904 5' + G4 3763 1 60.96 GTTGCATACTTTGGCGGGCTTAGCTTTTGTTGGGCCATAGGCAACGAATCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAA:1 - chr3R 22516037 5' + jockey 4597 1 55.75 AGCATTTGCCCCGTTTCCAGTTCGTAATCCGATCAATGTAGGAAGGATGCATACATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr3R 29733127 5' + opus 153 4 59.68 GTGCGGAACACATGGTTGCCAGGGAAATACGCTTGTTCCTGGTTCAGCAGCTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGCGTGACGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr2L 13792540 5' + F-element 39 1 62.33 ATGCGTGTTACACTTTGGAAAGCATTTGGAAACTGACTTTGTTAAATGGAAAATGAAGGGAAAAGCAAAACATTTTTAATTAATGTATGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 - chr3L 20289149 5' + jockey 4687 1 53.49 TAGCTAATGGGTTTTATACTAAGCCAAATATTTTTGCACAGCTTTGTTGTTTCATTTATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGT:2 - chr2L 1260058 5' + Burdock 16 2 69.86 AAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCA:1 + chr3R 9190526 5' + Tabor 6926 2 76.22 GACTATGCGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGATGATCTTCAAGACGATGCAACAGCACACACTTCAAGAGCATCGATGGCTTTTTTAAAGGGACACATTTTTCAGAGCGCCTTATCTCAATTAGAGGCGATTTGGAATTTC:1 + chr2R 7394584 5' + mariner2 542 1 69.86 ACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTT:1 + chr2R 7020554 5' - Bari1 1639 1 65.75 CGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1 - chr3R 9160784 5' - copia 208 2 50.68 TCTCGAGTGCGGTTAGTGCTGGTGGCTTTGCTGTCCTTTTTGCATTTCAGAGCGGGGCTTTAAAGTTCATGGTTGATTAACTTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGGCGGGCTG:1 + chr3R 24476254 5' - 412 452 2 56.16 TTGGAAGGCGGTGCGCCGGTGTGCGTGCTTGCTCGTGTGCGTGTGCTGGTTGGGCAAGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTATCTGCG:1 + chr2L 5325524 5' + Stalker 445 1 80.95 CTCGTAGATGCAGCAGAGTATCACAAGCACATTTATTAGAGTTTTTCCCCACTCGATTTTCCCATCCCCCGCTTATTTGTGTGTGTGTGTGCGTGAAATTTGATGCCGCACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 - chr3L 7995558 5' + P-element 12 1 77.40 AGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chr2L 16948714 5' + jockey 4689 1 56.16 GAGGCACAAAACGTGTCCGTGACATTTAAGATGTGCCACATTGTGTACCTAACTCAACCTCTTTTAGTTACCTCTCAAATATATTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCA:1 + chr2L 8557453 5' - HMS-Beagle2 218 2 53.42 GTGGGTGGCGGCAGTGTTCCACTTTCCACATTGTTTCCATTGCTCAGATTGTTGTGAAGGTGCTGTTGCTGCTGCTGGTG:1 + chr3L 7826162 5' - TART-B 152 2 90.00 GCCGTCCACTTTCATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATT:2 + chr3L 15276634 5' - hopper 1350 1 62.33 GATTTTGCATGGGGAGCGTGTAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr3R 10684837 5' + roo 57 2 56.85 AGTAGCCAGAACGGGAACCCAGAAGCCCGAAAATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTG:1 + chr2L 19364048 5' + BS 4785 1 48.48 CATCAACTACCAAAATACCGTACTACTTGTTGAACCTATCACACCTGATTAGTAAAAGCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCT:1 - chr3L 24104317 5' + Tirant 16 2 45.00 TCCTGTAACTGACTGATGTTTGGCACACACACTGCCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 + chr3L 17175088 5' + 412 7078 2 66.67 TTAATAAACTTTTCCTAGGCATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr3L 17707788 5' + Doc 42 1 56.85 GAATCTCGAAGGATGCTACTCGAAATATTTTTGAATGTTCGTAGTCTTCGAATTATTAATTAGCACGCGAACTAATAATCTGCGTATGGGTTTTCAATGAAACTTCATTTTAGTCCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chrX 22610629 5' + pogo 4 1 73.29 GGATGCGGTGAAGCAAAGTCCATGCAGTTCAAATCTGTCATATCTTATCAAAAATGCTAAATGCTCCCAGGGGTTACGCTTCCAATTGTTTGCTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTA:1 - chr2L 10395790 5' + copia 243 1 61.64 ATCGGCATCTCGACTGTCGGTTGCATAATTATAACATTTCCCGCAGATTTATTTACAAACGGCAAAGAAACGTAACGCACAAAAAGGGATAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAAAT:1 + chr2R 3526016 5' - Cr1a 166 1 47.26 AGATTAACGCACACACGCATCCGCCACGCCCACAGAGGGGCGTTGACACCCACACACATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGCTTTTTTTACAAAAA:1 + chr2L 17240166 5' + hopper 15 1 75.34 GATCGAAAGTTCGAAGTTTGTGCTCTTAACTATTATTTTTGGACAGTCTTCTATCATAAATGTTAGTCTTCTGGTTTATACCCACACCTTGTGCACCTTCTTATGCATCTGCACCGAATTAAAATAAGAAAAAAAAAA:1 - chrX 7304523 5' + Doc 4700 2 49.28 ACCAACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAAT:1 - chr3R 26246883 5' - 1731 4546 1 70.34 AATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCT:1 - chr2L 9668270 5' - 1360 3319 1 67.12 AAACCGGGAATCTAAACGTTTTCGTTCACTCCTCACATACATATGCAGATAAATGAGGAAAGATATTCTTTGTACCCTTCTATGTTCGGACACGCGGCTCAAGACTTTTTATTTCGCGTTTACTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAATT:1 + chr2R 19809853 5' + 1731 233 1 56.16 AGAACTTAAAACTTTTTACACGTTGGTGATCGTTCTGACATTTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 + chr3R 7981489 5' + jockey 85 1 72.60 ATAATCCTGCATGTATAATTTATTCTAAGAATAATGTAAGAAAACCTCCATATCTTTATATTTTCCTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATACAGAAACACTG:1 - chrX 19694224 5' + Tc1 1595 1 54.79 GACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTC:1 + chr2R 22723010 5' + 3S18 5814 2 50.68 CAATGTATGTACGTAACTGTACGAGTTTATGTAGATAATGTGACTATTCGTAGTTTGTAGATCCGTCAATAAAGTGATGAAAAGTGTATGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTG:1 + chr3L 4223907 5' - pogo 1752 1 61.64 CTTGTAATATTAATCCCTTATTATGAAGGGATTTCAACGTGTGCATCATTTATCTTAGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCT:1 - chr3L 15327646 5' - blood 7326 1 60.27 ATCTGTACATGCGATTTTTTTTGAAATCGTATTAAGAATAAAAAATCATCTTCACTTACACAATGTCCTTTAAATTAGTATTATACACATGATAGTAAATGACTGATAACGAGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTA:1 + chr2L 15945656 5' + X-element 31 1 75.34 ATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATATATATATATATAGACCAGTTTCCTCTTTAAATTGGTATTTCACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3L 10814591 5' - roo 9049 2 65.07 AAGTGTAGTCATGTAAATGGGTGTGTATTATCAGCGGTCATTGTTTCGCGTTGAATACTGTGTATCAATTACCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr2L 3294229 5' + hopper 7 2 69.81 TGTACATGCGATTTTTTTTGAAATCGTATTAAGAATAAAAAATCATCTTCACTTACACAATGTCCTTTAAATTAGTATTATACACATGATAGTAAATGACTGATAACGAGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGAGGATTCAGT:1 + chr2L 15945659 5' + X-element 34 1 73.29 GCCAACATGTTCGATCGCGCTCGGACTAAAAAACTGTAGCCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chrX 5680004 5' - P-element 2845 1 42.20 AAATGACCTTCTTTAGAGAGTGAAATTAACGATTGGCCTACGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCC:1 + chr2L 3294130 5' + hopper 77 1 71.23 TGTGACGTTCGTTTATCAGTTGGCAGCCGCCCGACGGCCAGCAAAGGGGGCATGGTCGTTGCAGAATCGAGCCATGGCACTATGGTCCAGAATTCGCTTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 - chrX 8755144 5' + transib2 18 2 64.66 GACAGCTTTCATCAAAGCGATTTGTTACACAGAATGGTCCAGCACATATGTATTGTATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr2R 12787914 5' + 297 6640 2 65.75 CCTGGTGATATCGCGAGTCCAGCACACGGACTCGGGCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAG:1 + chr3R 11504488 5' + Ivk 379 1 73.13 GTGGTAAATGGGTAGGGAAATGGCAAAAAATGATTTGGTAATTGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGT:1 + chr3L 12978359 5' + invader4 2673 1 73.29 GTAGTCACCGAGGTAGAGAAAGGATGGCACATTGTTCGCATCTAGGGTCCAGCCATGCAAGTAATAGTATCCTTCTCTTATGGGACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCA:1 - chr3L 22648408 5' - Tabor 7286 2 58.90 GTATATATGTAGTAATAAATATTTAGGATCGTAAATGAATAAAGTATGCTTTTTAGATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTA:1 + chr3R 23859827 5' + jockey 4826 1 63.01 CAAGACTAATAAAAATATGCAAAATGTCAAAACAATTTGCAAACGTGTGGGCGTTGCAGTTTTGTGTGAGCTGTGAAGCTGTGAGCTGTAAGCTGTAAGCTTAATCTCAACCCTCTAGCTTTTATAGTTCCCGAGATC:1 + chr2R 5254688 5' - INE-1 150 1 49.28 CATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTGCACAGAAGTCGCG:1 - chr3L 19350039 5' + jockey 35 1 68.49 AAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCAC:2 - chr3R 9160742 5' - copia 5035 2 74.66 TGGCCAGGAACCGGTCCATAAGTCACTTTAATGGGCTTTCAATGAGGTGTGCCCCGGGAAAATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 30634879 5' - roo 396 1 78.77 CATATTCCTTCCTCCGAAAACAGTTTGCTCTTTTATTTCGGCTCCGCAAAATATTCTCGCAATTATGCGCACGCAACAAATTGTTTTTCCTTCTTCAGCTGTTTCCCAAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACT:1 + chr3R 4549909 5' - Quasimodo 6974 2 74.66 GGGTGAAGACCTAACCGTAAGACAAAGACGGTCTATAATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACAT:1 - chr3L 24208258 5' + Quasimodo 11 2 76.03 GTTGATCACTGTAAATGTAGGACCACCGACTGAGCCAATAACGAATCCATATATATATACATATAAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 + chr2R 2830395 5' - opus 470 2 58.40 TATTAAGAATAAAAAATCATCTTCACTTACACAATGTCCTTTAAATTAGTATTATACACATGATAGTAAATGACTGATAACGAGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAG:1 + chr2L 15945685 5' + X-element 42 1 64.84 TCTTTACACGGGATCTCAGCGTTTTAAGAATGGGATGCCAAAACACTTTATAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3R 7539441 5' - roo 9004 2 64.38 CTGGGGGGTTGCATCTGCTAGCCAAGCACAAAAACTGGGCCCCCAGCAGATAACAGAAGACCAGTGGCATGAGCGGTGTGTCACACCACCCTCATGACCTCC:1 - chrX 2773571 5' + jockey 4757 1 79.41 GAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr3R 27768811 5' + 297 6599 2 56.57 ACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACA:1 - chr3L 27450447 5' + Quasimodo 44 2 70.64 AAATTTCACTATTTCTGTTTGCGTGCAGCACTTTAAAATGTTATGGATTCTCTGTTTATTATTACTTTTTTTTTATAGCTTTTCCAGCACTCATATATGTGGCGTGACCAAGTGCAATCGGAAAAAATGCTTCACTTTGCACTTTC:1 - chr3R 24672530 5' - gypsy4 451 1 80.82 AGTGCTGGGAGCCGCTCCATGGTAGCAAAGAAGGGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTTAAGACCTACAATTTTTGGCTCC:1 - chr3R 31491001 5' + roo 29 2 55.29 TATAAAATAGGAAAAGGAATCGATTTGTTTCCACAGATTTGCGAGAAGAAACAACATAAAAATGCTATATTCGAGTTCCCCAAATATCAAAAGCCGAGGCGATCTAGCAATGTCCGTCTGTTCGTATGAACGTCGAGATCTCAAGA:1 - chr3L 20909 5' + INE-1 138 1 59.59 CATTTTTGGAAAATTAGTCAAACACTTTGTTGTGGGTCGTGCTAATAGCTTCCGTTTCCCAAGCCAAAATGCTTAAGCTTGTGATTCAGCCCATAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 17114160 5' + roo 8686 2 69.93 ATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGA:1 + chr3R 3617312 5' - micropia 5126 2 73.29 TGCTTATTTTTATTTTTTAGACAACTGTTACTATTTATAACTTATACTACAGTGAATCATAGGTGTATATGAGTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTAT:1 - 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chr2R 5769133 5' - INE-1 96 1 63.01 GTGGTATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 - chrX 10645043 5' + jockey 95 1 78.08 GTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3L 27391422 5' - 1360 3365 1 64.38 GGACTCAACCCAAGACGTAACTCCCCATGTAGAAGATACTTTTTAATTTCAGTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTT:1 + chr2R 17121593 5' - blood 7322 1 63.01 GTTGCTTCCAAAGAAAGGGCATTCAAAAGAAAAGCCGTCCACTTTCATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 + chr3L 15276601 5' - hopper 1394 1 66.67 ATTGCATTCGAAATTCATATCCCTGGTATCAATCGATATCACGGTTTTTCAGTTTTACTTTGTTATTCCACATTGCCCATAGCTTCTCTTACGCTTTCGCTTTATGTATTTATTTTATGTGATTAACTATTTGCT:1 - chr3R 851667 5' - Doc3-element 65 1 65.19 CATTTATTTACCATGTTACCATTACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATA:1 - chrX 10161201 5' - micropia 429 2 56.03 ATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 + chr3L 14062246 5' + Doc 77 1 68.94 AACTAGTCAGAGAAAAACAAGCGATCATTTTCAAGGAACTTAAATGGGAAAGCTCCAAGCAGACCCGATTTCAATGGGGAATCGAAAACGCTAGTCTCAATTTCTTCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 - chrX 1061672 5' - 412 7534 2 73.79 GTAAGCCTCTCACTGCATATGTGTCCGTATTTCGGGTTGTGAATCTCCGACCACAGTTGACAGTGATTTAGTTTTTGGCTGCGAGTCCATTACACGAGGTTTTGTGGGCCCAAAGACCTGGCCTCACATCCTGCTCATCGAAGTCA:1 + chr3L 4974419 5' + Rt1b 4963 1 78.08 ATGAAAAAAAATATTTTTTAATGTAAAAGCAATATAAAAAAGCAATATTAAAAGTGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAAGGACAGACGGACATGGCCATCTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCA:1 - chr3R 12863663 5' - INE-1 91 1 48.39 ATGTGCGTAAGATATGCGTAGATGGAGCGTCCCCATCGCGGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2R 11133517 5' - roo 9036 1 61.64 CCCCGAAATTCGTGCTTTTCCTGGTCAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 + chr2L 9237488 5' + blood 48 2 53.24 TTTATGGGTAAATTACAAATAAATATTTCTAATAAAATGGGCTCCGAACTGTTTAAAATAGAATGCTCATTATTCGGCACAACTATTGTATTTTTTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - 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chr3R 17305605 5' + roo 5 2 80.82 GCTACGGAAAAAAGTACGCTTATCACGGGTCAGCTCCGTAGCTCTAAACGCTCGGCCTTCCTAGTGCCGATAAAAGGCAATGTTTTAGCATTATTTGGTATTTGGTATGGCCA:1 + chr3L 13356391 5' - Tc3 1426 1 64.60 GAGAACGCTTATGAAATATGCCAAAGGTGACTTTCAATTAAATGCGACCCAGCCAGAGGCGTGCGAAGGATTTAATAAGGGGCAGAGAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr3L 3073801 5' - blood 7180 2 75.23 AATTCTATCTTCTTTTTTTTGTGCTTTTTTTCATCTCTGGTTTTTACTATAATTATACAAAAATTGCTAACAAATGTTTTTATTTTTTATCCAAATTTGAACTGCTACCATTTCATTTCAAAGAAAAATTTAAACTAAAATGTTAA:1 + chr3R 8147699 5' + 1360 3047 1 55.48 GCATTGATAGATTTATAAATCAGATCCCTGCACATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATATATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAA:1 + chr3R 29288747 5' + BS 5082 1 73.97 AAGCTTACTTTTAGCTGCCCCACTGGTAGATGAAAATTCTTTCCAGTTCAATGCTTTAGTGAGTTCTGCGATTTATCCTTTGCTTATATCAATACAACCGGTAGGACCATGAGTCGAGTCAAAAACAAAAGAGAATGCTATAGTC:1 + chr3L 22980569 5' - INE-1 580 1 57.24 GTTATACTACAAACTCAACCGCTCGCTACGAAATGTATCGAAGCACTGATTTTCTCAAGTGGCCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 + chr3L 16580254 5' - 412 468 2 63.48 TATTTACACATTTCCCATTTTAGTCTGCTTTCCACATCCGAGTGCCTTGGGCAATGGGTCAGTTATCAGCGGGATGGAGATCGAGGATCAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACA:1 - chr3R 10662748 5' + mdg3 5155 1 60.96 ATACTATTGGGCGATTGTGGCATAAATTACATTGTTTATCATTGCCCATAACCAATCCTAAGTAAATGGGAATATCGAATGAGGAAGTCGCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTG:1 + chr3R 4553452 5' - Quasimodo 239 2 66.91 TTTCCAAATGATTTCCCTGCTTTTATCGGAGCTGAGAGCGCGTATTTACCTTTAAACTGGACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 - chr3L 7962341 5' + blood 11 2 75.34 TGGGTTTTATACTAAGCCAAATATTTTTGCACAGCTTTGTTGTTTCATTTATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTC:1 - chr2L 1260051 5' + Burdock 6159 2 65.07 AGCGCATTATAATAATTCTTTCCCTCGACACTTTTGACTGGGATTGCTATAGAGGTCTTCGAGAGAGCCTGAAACCAGCTTTTTAGCCAGCACGAAGAAATCGTGTGCAAAATATCGAAGGGCGTTACCCATCTTGTTATTCGA:1 + chr3L 23250409 5' - 1360 10 2 76.39 CAATGAAATAACGGACCTGCATACAAGTCGAAGGTTTCCCTATATTCCTCTTCAAGCTCATATACGCTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAA:1 + chrX 21554363 5' - 297 342 2 56.85 GACTGCTTTTCATGTACTTGCTGTGTGTTCGCAGCATATTTAATGAGCCACACATGTTGATGGCTCTGACAGTCTGTAAGTCGTTCTTTTTTTTTTCGTATTTTTTGTT:1 + chr2L 12120461 5' - gypsy7 5004 1 77.98 CCGAAATCTCAGCAAAAAGACGACGAAACCGGAAGGGAAATACACTTTCGAGGTCGATCTTTAAATAACTTCGAAACATTATACATATATAAGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 - chr2L 14248137 5' + I-element 18 1 69.17 GTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAACAAA:1 + chr3R 4571528 5' - 1360 55 1 76.19 CGATTTTGCATGGGGAGCGTGTAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 10684838 5' + roo 8685 2 62.16 CCCATCAACAAACTTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr3L 22052736 5' - mdg1 386 2 58.52 GCTGTGACCACCCGTTGCTGTCGCTTGAGTAATGGCTGCAATAGGCAACGTGCAACGCCCGGAAAACTTAGGAAGAGGGGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chrX 5859020 5' + hobo 11 1 68.85 AGGGAAGGTATTTCTATTGTGGATCAGCTACTGACTGCAGTAGTTATAAAGAGAATTAAAATATAAATTTTTGCCTTGCAGCACCTAAATTGGGATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTATTAATTAATTT:1 - chr3L 4263547 5' + Cr1a 3981 1 52.74 AAATTGCATTTGAGACAAAAGCCAGAGAGCCAGAGAAACAAAATGCGAAAATGACAAATTGCATTAGGAGGACCTTTGTAATAAACCCATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTTTTTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 + chr3L 10144639 5' - blood 330 2 49.32 CTTTCTCTCGAAACGCCGCGAATATTGCACAGAGGTAAAGTTTGCTACACGCATAGTGAAACGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chrX 3996486 5' - roo 9037 1 54.47 GGCGGGAGGAAGAAAGAGGAAACAGCCCAGTCGCTAACGGAGTAGCCCGGGTACTGCGGATCTCTGCCCAGGTG:1 + chr3R 20546890 5' + baggins 344 1 39.19 ACTTTTGTCGTAAATAGATAGTTAGATCATTCTTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCCTTGTGTTATGTTTACTCTCCCTTTTGTACGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTGGT:1 + chr2R 4743546 5' + Cr1a 240 1 79.45 TAAGTCTATAAAAACGTGTATTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chr3R 27478544 5' - hobo 2897 1 77.53 GCTTGGAATGTCAAACTTTGCGGGATTTATAATTGTCTGGATATTAGGATCTGCTATAGCTACATTAACTTTTTTGTTAGAACTATCACTTACATATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGC:1 + chr2R 5021434 5' - copia 5018 2 69.86 GTTTTCCTTAATCGCTTAACCCAACTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chr3L 17207813 5' + hobo 57 1 75.45 AATATTTGATCCGTTAGGATGGTTGGCACCAGTCACGGTTTCAGGAAAACTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr3R 19445916 5' - roo 336 2 71.23 GCACGAAGAGTGAGCTTTAGTTAAACAAAACTACCAAACCAAAATTAAAAAGCCAGTTATTGTGGATTACGCGAAACCGAAACAGAAGCAGATACAGATACAACTTTAAAACGGTGCTAACTGTGCTGCAAGTGATGTTCGCGCTG:1 + chr2L 431982 5' + Stalker 492 1 69.86 CGCCTGGTAATTAAAACCGAATACTCACACAATGTGCCTTAAAAACAATAAAACACCTTTTTTTTAGGGTTTAAATCATTTTTTATTATTCATTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAATGTCTAGCTTAAAAGATATTATG:1 + chrX 6952092 5' - G5A 2770 1 66.44 CATCGAAGCGACTTTTCACTCCGTGCTCCTGCTGCCGCCATTGAGTGTCCTCTGATGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAC:1 - chr3R 26520466 5' + FB 67 1 62.33 GATTCTCGCTATCCTGGAGCACCGGCCCAGCATGCGTGAGTTACGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAA:1 + chr2L 22015928 5' - Tirant 8420 2 77.24 AATGTAAAGCAATATCGAAAATGCAGAGTAAACCAAATGTGAACTGAACCGAACGAGCTTGTTTTGTGAATTAGAAAAGGAATTGGGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGTG:1 + chr2L 1587099 5' - INE-1 253 1 61.19 TAAAAAGTAGCAAAATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr3R 28728741 5' + jockey 86 1 67.12 CAGAACATAAATGTGTCTGTTTGTAGCGAAGGAATACATAGGCCAAAAACATAATATCTTAGGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGTTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr3R 15338128 5' - blood 7339 1 55.88 ATTCATTTGCGCATATGTATGTATATCGGCCCGCTCGGCTGGCTGTGTGTATATATGTACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTCGTAATTTTCCA:1 - chr3R 17067922 5' + 297 57 2 66.44 ATACTATTTGATCAGCACATTTCCCTTCTCCAAGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chr3R 20743999 5' - roo 317 2 82.19 ACATGTGCAAAAAAAACTGTGGCCCAACTGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCCGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAAAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATA:1 - chrX 2578065 5' - hopper 1343 1 73.02 CACTCTATCTAATCCTTCTATTAACCCGCAACTACCTTAACTACTTAACTACCTACCACCTAAATTTCTTAGTCAAGTATCGCCAATACGAACTCTGACGACGATATTTGGGTGATACATACATTATAC:1 + chr2R 21512321 5' - accord2 106 1 59.69 AAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACAACGACCT:1 - chr3R 9160734 5' - copia 158 2 78.77 GTGTTTTTGTAAATAGAAGTATTTGTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:1 + chr3R 13122496 5' + blood 63 2 59.59 ATGTCCTAAGTTTTTCAAGGAAATATATGCCTTATCATTTCATAGTACAACCCAAATGGATATTCCAAAATGGCATAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGGGC:1 - chr3L 20255265 5' + Transpac 41 2 57.53 GTTTGTTTGGGCTTGCTGTAACAGAACAGGTAATTGTTGTTGTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATTGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTA:1 - chr3R 435932 5' - 1360 2958 1 71.23 GTTTTATTGTAGTAAGTGAGTCACGGCTTAATAATACTAGAGTTACGCAAAAATCTGTTTAACTGATTCCTAGCTGTGCTCTAGCTCCGATCTAGTGGAAATGCGAACGCGAAATTTCCTAATTTTTCTGGGATATCAATAGATAT:1 + chr2L 22155850 5' - INE-1 498 1 65.75 ATATATTTTCCCTGTCACATTTTGCACTTTCGCTAGCTTTGACATGGACATTGCCTATAAATCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAAT:1 - chr3L 22052853 5' + mdg1 60 2 57.53 ATCGTGTATGTGAATTGTGGCGTAATGTTGTTGAGCAAATGGGTTCTACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3R 24279338 5' + roo 74 2 71.92 AGCGAGTCAAGGATTGTTTGGTGGCCAAATGGGTGGCAACAGTAAAGCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 - chrX 1690068 5' - 412 7480 2 70.00 AAACTCCTGTCCCATATCATTTATCCACTTGCTCATAACTGTAGAGGGAAATGTGTTCATGGATACTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTG:1 + chr3R 30510301 5' - gypsy12 10175 2 60.00 ACTTCGTGTGCTTGTCCTCGGAACTTGTCTGGATCTTGAGCCTGGTGGCATTCCCATAAATACAAATTAACATAAACTGAGGTGGAGATGCAATGTGACGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGC:1 + chr3L 15005670 5' + F-element 393 1 77.17 GAATGTGTCAGATGATGATGCTTGGCTGGTAGTTTCCGCTGTCACGTGTGTTGCATGGGTTGGATTGCGTTGCCGGAATTACGTAAGGGTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTAT:1 - chr2R 5955065 5' - copia 257 1 63.01 CTATTATGTCCTTTACGATATATGAACAACTATTACATCTTTTTATTGTCATTAGTTTTAATGAGAAAGCTTTTTCTAAAACCATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 - chr3L 16212850 5' + Transpac 4955 2 59.59 CATAAAAATATATATGTGGCACATCTAAGATAGGGTACACAAATCACAGGAGGTTTATGAAAAATATATGGAATGAAAAAAATTTAGAAAAAGTTCAAATACTATTTTCAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAA:2 - chr2L 12658632 5' + Quasimodo 3 2 60.96 GGTCTAGCCATCAACAGTGTTGGCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chrX 12191526 5' - pogo 2049 1 54.11 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTACCAACTTATTCCAGTAGACTAGTTTTAATCAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTAT:1 + chrX 3538815 5' + Cr1a 4026 1 57.53 GCTTAAAAACCAGGTCGTCGTTGACTGTCGGCTTCTATGTTAAGGATATAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chrX 3099165 5' - P-element 2833 1 39.37 TTGGTTGTTTTTAATACGTACTTATGTATTTATAAAATCTATATATCATTTGAGGGTTGCAAGCAAGTCCAGGATTTCACTGCTGGTGAAAATTAACGTAGTGACAATAACTTACTTAATTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCA:1 + chr2R 15800166 5' - F-element 4312 1 43.15 GGATTTCATCGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAA:1 + chr3L 24291969 5' + rover 7013 2 63.01 TTAATTTGTTCTATTTAAAGTATTTACATATGCAATTATATACGAACTAATCTATTAATAACTTATTTTTTAAGGGGGCTTGTCAGTTCGTTTTTTTAAGGGGTACAAACAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGT:1 - chr2R 14746647 5' + Tc3 312 2 66.90 ATTCTATTTCCCTTTCCCCGCCCCCAGTCGGCATTCTCTTTGTTTGACGCGAAATCTGTTCTATTTGTCTGTGGCAGCATTTTGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 - chr3R 11057688 5' - flea 4979 2 62.33 CGTAGCGAACCACTGCGAACCGAGTGGCACGAAGCTGCACGAAGTTGCACGAAGCGTTTGTCGGCGTGCAGCACATGATGAAATAACACAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chrX 14826092 5' - P-element 2862 1 58.82 TCTTGTGGTTTTCCCTCTCTGCTTTGGTATGTGTATCTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTCCGTTTTAGCCGAGAATTGCTTTTTGAATATGTGGGACAGGACACACACACACACACACACATACATAC:1 - chr3L 10144923 5' + Quasimodo 39 2 74.45 GCTTACCAAATCGATTGATATACCCAAAAGGCATTACGGAGATAAACATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAGAACCCTTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTACATATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTG:1 + chr3L 22984057 5' + S-element 1707 1 66.44 GACAGTGCGAGATGTTTTATCCCAAGAGTTGGGGCATACATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTA:1 + chr2L 21951138 5' + Burdock 6215 2 76.71 ACATTACATTATTCCTTTTTTGCATAACAACAACAGAGATTGAACATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACT:1 + chr3L 23986470 5' + opus 16 2 69.86 TAGAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr2R 10695899 5' - roo 9035 1 58.90 ATAGATTTGCTATTAAAAAGTGTCGGAATATTGGAGTAGGAAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAG:1 - chr3R 18873277 5' + copia 81 2 72.60 GATTATCAGTATGTATGCGATAAAATGAGGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAT:1 - chr3L 13374243 5' - pogo 2065 1 56.85 GCACTAGTGCTAATTTTTTATTTTTTCGAATTTTCCTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chr3R 13505470 5' - opus 466 2 63.46 GCAGGGCTTTGGAAAAGCACCGTTATTTCGGAGTGACCAGATGCCATATGGTTGTACACCGATATATGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAA:1 - chrX 14193194 5' + mdg1 437 1 52.17 AAGCGCGCAAAGTCCTTTTGAGGAGCTCGATAATGGTGGGCGGTGTGGCAATGAGTGAGCGTATGGATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 27871007 5' - accord 7032 2 61.18 GGGGGTTGCCAAGGCAGATTGATAATGGGGTTGTGCCCCGTTAACCAGTGGAACCAAGGAATGGGTCTCTTCAGTCAACCATCCATTCACATGTACCCGTTTAAATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chrX 12525855 5' - roo 395 1 76.03 CAACGTAAGCCAAGCTTACTTCTCTCCCGCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTT:1 - chr3R 31058897 5' + blood 7180 2 77.19 GGCTATCCCTATTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTA:1 - chr3R 4177774 5' + P-element 2743 1 22.07 CATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATGCACATTTTAGTTATAAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2R 8305297 5' - roo 332 2 70.55 GCAAGTATTTTTAGTTCAAGTGCCTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chrX 12139022 5' + roo 73 2 68.97 TATGCCATAAAAAATGCCATTATTTCTCAAGGTATAACTGGTTTCCTATCAGCAAATCAATGTTGACTCAAATACCTTGGTGCTTTCTAAGAATTTTCATTGTACTTGTGAACCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTT:2 - chr3R 10831808 5' + Juan 4038 1 73.97 CTTATTTCTAAATAATGGAAACAAGGATTTGTTCCATCGGCTGGATATCTTCGATTCTAAGTTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGACACCCTCTATCTTTATTTAC:1 - chr4 436907 5' + 3S18 36 2 54.10 GTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1 + chr2L 17029596 5' + blood 7078 2 63.01 AAGCCCATAATTAAATGTTTACACTTTCAGATTATTCCCAATTACAAGGCGGCTTTTATCACCGAAGATAAAATTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chr3L 11776653 5' + mdg3 50 2 48.97 GGCGATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1 + chr2R 11763580 5' + Tabor 59 2 56.16 CCATAAACGCCAAGGACTTTGCCCAGCCGAAGGGGGTGGAACGTGCACTTAATTAAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACGGCGCTGGCGTGTAGTATATGCCTATGCAATACTAAGAACAAT:1 + chr3R 22100459 5' + 412 12 2 78.77 CGAGCCTCATTTGACCATCGCCAACGGCACTTGGCCAAAACAAAATTTGCTCCTTCTGCCCACATACTCTTCGATTCTGGATGGAGTTTTGGGTATTTCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chrX 8012390 5' + 297 6595 2 73.10 ACGTAGCCATAATTAGCCAACTCGAGCTACAATGTTACTTGTAGTAGATACAGATACGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr2R 22305984 5' + pogo 32 1 55.65 GGTTGACTGGGATCGGTTATAAACTGGGCATAGTATAGAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3R 24122673 5' - roo 8993 2 73.61 ATTGTGGTTTCTGTTTCTGTTTGCTGTCATTTGCATGAGTCAACCACGAGTGAAAAGAGACAATTTCTAAACAAATAAATTCTATTAAATTCTATGCCATCTTAATGTTTGTTATATCTATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chrX 13531538 5' - roo 407 1 77.40 GGTGAGTAAAAAGTGTTAAAAGAAAGGATTGAATAAAATTTTAAATATTTAAAAGTAAATTGAATTCATTTCATTTTATTAACGGGATAAGTGCATTAATTAATGCATGCAAATGAACACTATCACGTCGGGGTCACCAATGTTT:1 + chrX 10558453 5' - diver2 381 1 48.97 ATATTTCAAGCATGATTCTTATCATAATCACATATTTCAATATCACACAGTACAAACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGAATTAATACAT:1 - chrX 6707852 5' - hopper 1351 1 60.96 GGTTAAATATCAAAACATTTGTTAACTGAAAATACAGTCAAATGGGCGCTATTTAAAGCCCAACATTGAGTGTTTCACATTGAAAAACATACATATTTAATTCATGCATTACAGTTAAATTCAAAATATCGTCGG:1 - chrX 22930379 5' - accord2 330 1 64.44 GATTGAACATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 + chr3L 23986507 5' + opus 7049 4 53.24 GCTGTTTAATTTTACATCTGGCTAACTATGATTATCTAATTTTCCAGACTGCATTCAACTGCTGCAGTAATCGATGTGGTGGCGATGAGCAGAGCGGGCTTAAATGTTAGAAATGAATTTTAA:1 + chr3L 19182373 5' - FB 974 2 54.47 GAATTTGATTCATTTGTCATTTATTTAAATTCTCCACAATTTGCAAGCTAATTTCATTGTCACACTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2L 9472091 5' - roo 9014 2 56.16 GTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTA:2 - chr3L 22400356 5' - 1360 3325 1 60.96 TTCATTATAATCACTTGCAGTATCGCCTTGAGAACGCTTCATGCGCAGACAATCGCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCTCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGGAAAATTCAAGATAAGTACGGCTTTA:1 - chr2R 19059799 5' + Max-element 373 1 62.07 CGTTTTATTTCCACACAAAAACTTTCGTGAAAAGTCATCTCTTAATTGAAAATTAACAGCCACAGAACAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTG:1 + chr3R 24509051 5' + FB 41 1 52.27 AATTTCAGAGTCAATGTCAACCAAATGACCTCGAGACATTCTTGTCCAGAAAATGCCAAACAAAAAATGACGACTTAAAATACAATTTTCATTGGATTAAAATAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr3R 16913311 5' - pogo 2095 1 78.68 GTGCCACTGGCATTGTCTATTTCAATTTCAATATTATGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chrX 4778250 5' - 412 406 2 77.40 GGTTAAGCAAGTGTTAAGGGCTGGTGGGAGGGAAAAATCATCAATCATATTTTCTGCATAGCTGAATCATTTGCGCCGATCAGTTGGGGTTACTTAATGGGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr2L 12553554 5' + 412 7074 2 71.23 AAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAA:1 + chr2L 11574807 5' + Max-element 8278 2 51.85 AATTCTAAAATATTCGTTTGAATACAGAACTGTTAAAGAAACATACAGAAAGAGATTAATTTATGGATGTTGGAAAAAAACCCAGAAATCTTGGAATTATACAACCCATTAAAACAAAATAAAACAAGAGAATGCTATAGTCGAGT:1 - chr2L 21762457 5' - INE-1 576 1 75.34 ATTGCTAAACACATCGTGATATAGTAGGGCAATCACCGTCAGATAGGCAAACAGTTTGCAATGAAAGCCAAGCCAAATGAAAACCAAAAGTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCG:1 + chr2L 10901088 5' - Quasimodo 400 2 67.16 ACTATTGATGTCATAATGTTGTTAAATAACGTATATGCGGCATGTGCCGTGCATTTCTATTTGCTTTTTTAACGCTATTTTTGTTTGTTTTTATTATCAGTGTTTAATTGTGTGTTCGTGTTTTTTTCTTGTTGCCTATCCAATGT:1 + chr2L 18524844 5' - invader3 5003 1 57.53 AGTAAAAGAAAACAAACAAATGTAGGATACTGATTAGGTCTTTACCTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr3L 15612718 5' + roo 8739 2 68.28 CGGGATCCTTGATCTTGCTCCTCCACTCGGCCACTTCTATTTCATACTCGTTCTCCGCCTGCATCCGTATTTTAATCAAGTGCCTTTCGGTTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTTTCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAG:1 - chr3L 15510115 5' + I-element 87 1 63.64 ATGTGGAAGCACTGGAGCTCTTTACACGGGATCTCAGCGTTTTAAGAATGGGATGCCAAAACACTTTATAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 7539423 5' - roo 405 1 75.00 GCAGGGGGTAAAATGCAATTTCAAGTGCAACCGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3L 14553249 5' + roo 8679 2 74.66 TAAAATACAGTTGTTACCATTACAAATATCAACTGCTTTATAAATTTAACAACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 13531697 5' + roo 60 2 63.04 GTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCT:1 - chr3L 12976325 5' + invader4 73 2 72.14 ACTACAACTATCTAAAGTCTATAGAACTTTTACGACCGATCTAAGCAAACAACAAACCAGTTCCATTAACAACGCATCTCGAAATTTAATCAAAAGGATGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTCAAGCAAAAT:1 + chr3L 4149084 5' + Tc1 450 1 70.90 CAAGAACAGGTCCCAAATCACCAGCGGAAAATGTTGCAGAACTTGCCAAACCGAAAAGGGTTACTTCTATTATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr2L 5202603 5' + 297 37 2 58.09 CAATCAATTTTTGTACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3R 4581830 5' + 297 39 2 58.22 ATTATTATATAATCAAACCCAAATGCTTTATTGATGGCCTGACAAGTCTCGCATACGGATACGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr3L 19199624 5' - hobo 2922 1 60.58 GCTGTTATTCTACAATTTATATTTGTATATTGTGTAGGTAGTTAAAGATTGTTTGAAAAATAATGTTTTAAATCTTTAAATCTTTACAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAG:1 + chr3L 698184 5' - roo 8855 2 65.38 AGCCGAAGCAACAAACCAAAGTCGGAATAGTCAACCGCAGAGCGTTGGATGAACACGCCCAGCAAAATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCG:1 + chrX 20066115 5' + opus 8 2 67.92 ACTTCGATTAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAG:1 - chr2L 16089673 5' + 3S18 5830 2 61.43 GAGTGTGTGTATGTACTGCAATATATTTGACTAACGCCCTTCCAGTCGTTGTAGACAGTGTTTACTTCGATGTTGTGGCGCATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr2R 5868406 5' + pogo 35 1 61.38 TACATATAAAAGCCAGAACGTTAAGCTTTATAGTTCCTGAGATATCGACGTTCAAACGGAAACAGGTCAGATCGACTCAGCTATTGATCCTGATCAAGAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2L 20413741 5' + roo 16 2 71.43 AATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCT:1 + chr2L 23299988 5' + invader4 364 1 70.00 GCATACCTTAACACGTTCTTGTTAACTGGTTAATGGTTGCTATAAGTAATACGCAACTATTCTGTTTTAAAATTTAAAATAAAAAGAAAAGGTTTTTTAAAAGTGTGTGTGTGCTGAATCTCAACCTTCTAGTTTTTATAGTTCCT:1 - chr2R 5969175 5' - INE-1 156 1 77.40 GGAGGCTCTGTTGGTAAAGGAAAGTAAGTTTGAGTATTTCTTCTGTATTCATAAAGCGAGGCAGAAATAGTTTCTGTCGACTCAGTCTGGCATGGGCATGAATGGGACGGACAGAGTCCGGTAAAACTCACCACAGGGTGTCTGTG:1 + chr2L 17919044 5' + invader5 3857 2 76.03 AACAAAATAAATAAACCCAATACATATGCAAAGCTTTTATTCTTGATATGTATAAAAAAAAACTTTGGCACAGCAGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chr3R 9351975 5' - Tirant 8464 2 56.85 CAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2L 22015982 5' + Tirant 8120 2 56.76 GTAGTCGGATTTATTTTAAGTTTACACATAAGCTAGTCACATTTAACCAAAAGTTATTTACAGAGAGAAAATATTAAAAAATACTTACAACCTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 + chr3R 25904131 5' - 412 7539 2 76.61 CTATAATATAGGCGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 + chr2R 641864 5' - opus 7484 2 57.89 CGGACTGAGCAATCCTACTAATTTTGACAATCTACGATCTATGGCCACGCGACCGCTTCCCAAATGTTTTAATGTTATTAATATGTTCTACATTTGGTGCACCTAAAAGATTGATGACTTCTTTCGGCAAAACGATTTTTTTATTT:1 - chrX 1253942 5' - transib3 2451 1 63.70 TGCACAAATGGCTCTCGTTCTCCCCTTTCGATTTCAGCAAACTTTGTCCTGCCCGAGTCAACAATTTTGATTCTATTTACACATTATTATTATTATTATTATGGCAAGAGTTTCGCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr2R 18482352 5' - hopper 1412 2 76.55 ACATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAA:1 + chr2L 17240221 5' - hopper2 1539 1 65.52 TCTAAAAAAATATCTAAATTGTATAAACTTAGATCATTTTTACACACATCGTGCTGAATTTGTAATTAGTTATAAAGTATCTCAGCTTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chrX 19537022 5' - roo 9038 1 60.96 AATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chrX 1103691 5' - pogo 2045 1 73.28 GCAATATGAGTTTTTGTTCGTCTGCCTGTCTTCAAAGTGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 10684696 5' - roo 9050 2 69.23 CTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chr3L 7995447 5' - P-element 2816 1 25.83 ATGATTCACATATATTTCAAGCATGATTCTTATCATAATCACATATTTCAATATCACACAGTACAAACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1 - chrX 6707863 5' - hopper 1362 1 54.79 TATCTCTTTTTTGTGGTCTAGAATTTGGATTATCAGTATGTATGCGATAAAATGAGGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:2 - chr3L 13374270 5' - pogo 2092 1 73.97 TGGGTGATCATCATATTGATGTTTGGTCGTGTCATTTTATGAGCAATTCAGCTGAAATTCAACGGAAATTTAGCTGACACTCTGGACTTGGCATATTTCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 17113983 5' - roo 395 1 74.82 AGAAACTGCGAAAAAAAAGATTACATTACGAATTAATTAACAGTAATGCTCGCTTGCAAGTTTGTCTGTATGTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 5825054 5' - Quasimodo 39 3 87.06 TTTTGCCTAGTTTCACGCTTTGGTTTTCCTTAATCGCTTAACCCAACTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr3L 17207835 5' + hobo 65 1 65.00 CCTGTGTCAACCGGCATTGCCAACAACCAAGCATCGGAACAGCGGCGACGTGGCGTTGACGCCTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAA:1 - chr3L 25481786 5' + accord 348 2 53.04 ATGACCGTCATAAAACAGTTCCGCGAAAAGTATCCTATTTAATTCATATTTAGTCTGGTAATTACGATATTTAGGGCTGGATTATAGAGAACGCTGTCCAAACATAACCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 + chr2R 7959911 5' - mdg1 409 2 75.34 TCCCACACAAACAGAGCCCGACGGGCGTCCCATGCCGCCCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAA:1 - chr2R 17320171 5' + Quasimodo 112 2 73.79 TTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACT:1 + chr3R 11750186 5' - Tabor 7249 2 67.81 TAAATGTTAAGATCCTCAATGGGATTCTAATAGAATGAAAGCATTGAATAAAGTACATATCTATATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAAC:1 + chrX 16383993 5' - diver 6055 2 56.16 CTTTCCGTACCGTTAACAAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTTTTCGGCAAACAA:1 + chr3L 23773885 5' - Transib5 2846 1 66.44 GTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTC:1 + chr3L 24213784 5' - invader2 166 2 73.29 GAAGATAGACATGATGTGGCTGTCGTTTCTAATTACGCCAGCAGAGGACGTGAGATATCTTATGTAAATGAAACGAGAGCGATAA:1 - chr2R 2526999 5' + roo 64 2 90.59 CAATGACAGTAATTAAGGAAAGTGCAGAAAAAGTGACTGACACTTGGTAAATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2R 6842854 5' - roo 357 2 57.69 CTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCACAAGAGGGAGAGTAAACAAAACACAAA:1 + chr3L 23933557 5' - Cr1a 205 1 74.82 CGTGAATGGTCAAATACGTACTATGCTTGCAAATAAAAGTCTTTCACTCTTTTATGCTGGTCATAAAAGAAAACACTTCTTTTTGCTTATAAATTTATAGAATATTGGTTTCCAATAGTCTAACTCAAACTACATTTTTTTTT:1 - chr3R 24088610 5' - invader5 3616 1 54.55 ATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTAT:1 + chr2R 1355077 5' - 297 430 1 70.69 AATTGCTTGATTCGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTG:1 - chrX 8027488 5' + Juan 45 1 52.71 TCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACT:1 - chr2L 1260000 5' + Burdock 6210 2 69.86 AAATACATTGCCCAGATAGAAACGCTAACTCACGGATTCCACAAAAAGGTAGCCCATGTGTATATTGTACATACATACATACATATGTACATATGTACATACATACATACATATGTACATATGTACATACATACATACATATGTAC:1 - chrX 6720225 5' + 1731 4390 2 70.55 GTTGGCAGCCAAAATGAAAGTACTGCCGCTTATTCATACATGTCCCTATACATATATATATTTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr3R 11493125 5' + 297 6593 2 67.54 GGTTAACTCGGTTGGTATGTCTGTATCCGCCGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATG:1 + chr3R 27859198 5' - hopper 1328 1 77.40 CCTGTCCCACTGCCGACTTAGAGCCCGATTCAAATTCAAGTGTCATGCTATTTTTGGTCGAGCACACACACACACAAAATTTGTCGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCAGCTTATGTATCAGCGTTAGATCGTATTACTTGAG:1 + chr3L 21453415 5' - Stalker 6996 4 59.59 AGCATATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGAACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTAC:1 - chr2L 17136215 5' - hobo 2873 1 69.84 GCTGCAACTCCCCAAATTCCAGCGAAGCCTGGGTGCGAAAGAGACGGCGCGACGGTGGCAAAGAATGAATGGATAAATGTATCATACATTGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGTG:1 - chr3R 16036693 5' - Cr1a 296 1 42.45 GGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTT:1 - chr3R 15022107 5' + Tabor 6916 2 67.81 GAACAAGACAAAAACTACTTACAAGGTTGAGATATTCCAATTTCTTTTTTGTGTTTGTTTGGATTTTGAAATGCAATATGTCAACCCTTACGGATAATATTTTTATCTTAATTCCAAAATCAAAATACATTTTTGTTAGTTTAAAC:1 + chr2R 7680270 5' - Dm88 4275 1 53.42 CTTTTTGCATTTCTGCGCTAACCCCGCGGCATTCGCATCTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCCAGCGACACCACCCTC:1 - chr3R 28951901 5' + jockey 4748 1 70.63 GCCACACAGCTTTTAAAATTGCGGCAAAGCAGAAGACAGCGGCGCATACCGAAAAATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCA:1 - chr2R 2189825 5' - S-element 78 1 63.01 AAATAAACCTCGTCTTTTAAAAACTTCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAACGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 - chr2R 5531243 5' + 1360 63 1 72.60 CACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATAT:1 - chr2R 8641599 5' + diver 45 2 52.71 TAGGTCCGGGAGTTTGAGTGGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTTGGAGTTGAGTTTGAAATTCTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATATTCCTTTTAGGCTATGAAGT:1 + chr2R 5039324 5' - gypsy11 322 2 69.86 GGACACAGTTTCGATACTGTCCGTTTTAAATGACCCTGTTGGGTTTTAAGTGTCACTATTCGGACTAACGTATCCGTCCCTGTGTGTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATCTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr2L 22592509 5' - mdg1 7423 2 60.27 GGGAGCATAAATAATAGCGACTGTCTGCCAAGTTATGAATAATAATGACAACAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 25387862 5' - roo 338 2 67.81 TATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTA:1 - chr3L 12976348 5' + invader4 2815 2 57.53 AATATAACCTATAATATAGGGGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGTGTTCTCGGCAC:1 + chr2R 641856 5' - opus 7483 2 60.58 ATTGCCCACTCTGAGTCACGAACAAAGTGTACGTGCTTCTACGGGCACATGGAAAACCCATTGCTTAAATCCAATGTTGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAA:1 - chr3L 24152564 5' - HMS-Beagle2 7155 2 56.16 ATGTCGTCCTCTTCTTCAGAAGCAATTCAACTTCAGACCAACGATGGCGTCATTCATACAGTGGACATGCGCTTTGCTCTACAGATATGCCCCGTGCGCAATATGATAATGCCACGTACCACCGACGAAAACGAGAAGCATACAGA:1 + chr3L 3714133 5' + invader1 163 2 75.34 CCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTC:1 + chr2R 641863 5' - opus 431 2 65.07 TGTTGGGTGGAGCAGGGAAGTGGAAGAAAAACGAAAAACCTGACAACCCTGCCAAGTGGGCCATGTTTCGCGTTCACATTCACACTAGACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGTGAACTCGACT:1 + chr2R 22367232 5' + INE-1 562 1 50.00 CAAAGGCTTTGATTCCATGCTTTGTTTGGCCTCTCAATTAGTTGCCTCATTGCATGACCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 - chr2R 20865757 5' - 412 437 2 58.70 GCCATCGAAAAAGTTGTGGATAAACATATAGCCAAATTAGGCTTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chrX 12191548 5' - pogo 2033 1 67.86 GGAGAGCAACGTTTTTCGGCCAGCAGGGGGGGCTATGCCATGAAAATGGCGTGTGGCACGAAAATGTGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAG:1 - chr2L 7559812 5' + mdg3 44 2 48.92 AGTAATGAGCCAAAAAAGAAGGCCAACAAATGTCTGTCGCTGTAAAACGAACATTTGAGGCCATGTTAACAACAGAAGAGGGTCACGTTGTGTTAGAATACACTTCTACGAATGAGATGATAGCACACATTGTGACAAAGAATCTT:1 - chr2R 17216306 5' + 1731 4212 1 48.63 GTAAATACCGTTACATCTATGTATATTGAGCTTATTTAGAAAAAAAAAAGATTAACAGTTACATTCATCAGCGCACTTCTTACACATGTGCAAAAAAAACTGTGGCCCAACTGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCCGTTTTTTTT:1 - chrX 2578151 5' + hopper 8 2 77.93 GAATGTGAAGAACTCAAGTTGAGTACGGTCGTGGCTGTGGTAACCAAACTTTCACCGGAAGTGGGCCAATAAAAAGTATACACAGAGATACACAGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAA:1 + chrX 13426099 5' + BS 22 1 62.07 GATATAGACATGCAGATTCCAGAGTCATAGCCACGCCCACAAACTGCCAAAAACTGCCACTCCTAAACTTTTCAAAATTTGATTAGTAGCGTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTA:1 - chr3L 23027718 5' + INE-1 563 1 81.25 CACCTCACATCCTATTTCCGTTTTGTCTGATCATTGCACTATGGAGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGAT:1 - chr3R 20175768 5' - hopper 1326 1 76.71 TAACAGGGTCAGGCATCCGAAGCTAAGCCAGATCCACTCCTGCTGCATGCTGCAATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATCATA:1 + chr3R 29418642 5' + mdg3 5291 2 54.48 GCTAAGTTAGGTTGTGCAATTTTTGTAGTTATATAGTAAACTTGTTTTTGTTTTGAGTCGAATAA:1 - chr3L 25850483 5' - Tom1 380 1 47.69 TAATTAAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 + chr3R 22100508 5' + 412 59 2 56.25 TTGTGGTACTCCGGATAGGTCTCCATCAGATGCCAGTAGTGGCTGACAATGGTCTTGTACACCTCGTAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAA:1 - chr3L 12130683 5' + Bica 497 1 54.11 GGTAGCACATCATGAGTTGCAAACATATTTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr3L 6775327 5' + blood 7052 2 57.53 ACATAAGACGGCGAACCGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGT:1 - chr3R 9160800 5' - copia 240 1 69.77 CTATGGAGATTAAAGGTGTCTAAAAGTATGCAATGAAAGCTGTCCAAAAGTATGCTGCAAAATGTTTTAATTCTTGCGATATAATACTGTTTACATGCAACCTAAGAAGTTCTCATGCTGAAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr2L 4179560 5' + jockey 7 1 54.48 GTGCGCGCGAGAGTGAGCGCATGACAGGCACACATCACGGATAGTAAGTCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr2R 6632569 5' + P-element 63 1 39.57 CCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 10684754 5' - roo 8989 2 75.34 TTTCAATAAATTTAACACACTCAAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr3L 18467169 5' + hobo 48 1 52.74 AGATAGGTTTCACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr3L 14553088 5' - roo 9035 1 55.88 GGAGAAACATGAAATACTGCACCACATATGAGTTTACGTGTGTAAATAATGTAGTATGTGCCCATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:2 + chr3L 16358669 5' + 412 76 2 68.49 CGTAAGTCTTTTAAGTCTTGGATTCGGCATTTGATTCACGACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2L 9485703 5' + 412 15 2 57.14 CTACGGATCCACGGATCTCGATCTTGGATCTTCGATCTTGAATCTCGGTGCCCACAAATTTCGACTCATGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGA:1 + chr3L 9027468 5' - Ivk 93 1 53.08 AAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATATG:1 + chr3R 10684736 5' - roo 344 2 61.38 TCCTTGTGAATATTTTAGGAAATGAATTGAGTCCTGGCAAGATAAAATGTCTCCGTCCCCGAGTGAAGAATCAAAACCACTAACTCCACTGACTGATGATCCCGGCGGTCCTCCGCTCCTGTGTCTCC:1 - chr2L 4002767 5' - gypsy8 4584 1 56.25 GTAGGCATCCCACACACAGACAATTAGAAACATGAATGCACTGTGAGAAACCAGCTTCGAGCCTATGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chrX 22725643 5' - roo 355 2 54.48 ATTTTGGAAACATACTTATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chrX 12138916 5' - roo 9034 1 55.00 TGGCACTAAATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAAT:1 + chr3R 11750169 5' - Tabor 7268 2 55.56 TATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAAT:1 - chr3L 13827358 5' - hopper 1355 1 59.44 AGCTCACTTGCCTTCTTCGGTGCGCCTAACCTCTTTGTTGACATTTGCTATCTCAAGGAGTTAGCCGCTCCTGCCTTTCGGCCATATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATT:1 + chr2L 2861097 5' + pogo 80 1 62.79 TATAGAGATTGGATAATTTATCAGTGACCATCCACTTTTCGAAATCTTTACCACGTTTGCTTCCGCAATCAGAGCAGAGCAGTTGATTATCTTAATCGCGATATAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 27478445 5' + hobo 17 1 68.49 GTAGGCCCTTTTTAAAGTGCCATACCCCGGACTTTTTCACTGTTTTAGATTTTCGCACAGCGACATGAGGAGGATAATGGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3L 16562969 5' + roo 8705 2 57.53 CTTAATTTTTCTAGACGTAGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 + chr2R 4628375 5' - Transpac 5168 2 63.70 GTGCCATAAGATAATTACATCCGAACAAAGTTTACTATAAGGTTATTCTTTTCGGCAGTGCCTCCACATACCAATCGTTTGAGTTTATTTTAAATTATGGAAAAAAAAGTCAGAGTATGTAAATTATTCGTGAATATA:1 - chr2L 9943926 5' + transib4 291 1 53.62 GCGCCATTCTCACACCGTTGCGTTCTTTTCTTTTCACTTCCTTTTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr3R 23236491 5' - hobo 2894 1 60.53 GTAAAATTAACAGTATAGTGTTGAAAAAAAACAGCTGTAAAGTCAGCTGTTGTAAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAA:1 + chr2R 3338726 5' + Juan 18 1 73.94 TTTGCATATATATATGTATACATGTTAGTAATGATGTGGTACTTGGCCTTACTAAGCTTCGGCAGTGATTATCAGCGATTGATTTCACACAAGTACATGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTT:1 - chr2L 3853683 5' - gypsy4 6648 2 68.57 AAATGTTGTTTCATTTCTATGCACTGCCATCGCAACTGAGTTTTGTCTACTTTTTGGCTTTTTCGGGTTTGCCAGACTGACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGG:1 + chr3R 17495690 5' - Quasimodo 7364 2 77.61 GCCTGGACTTTGACTTGGACTAGGAGCTGCTGGTAGTGGAGCTGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr3R 22100621 5' - 412 461 2 57.69 GCGTTGTTGATGAGTAATATTTCTTTCAGCGAGCTGTAGAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCT:1 - chr2R 4313055 5' - gypsy 421 2 38.28 AATTCCAGAAATGGAAATCTACCAAAAATTGCCACATTCACCATTTCCAATTCAGATCTACTCACATTCCAAATTCATCATTGCTATTATGTTATGTTTGTTGCCTTTGTTAGTTTATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATACG:1 - chr3L 4062933 5' - 1360 3384 2 52.74 TAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCGCCGTCAGCAGGCGACTCGGG:1 + chr3L 15026656 5' + opus 7070 4 68.49 AACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATC:1 + chr2L 18279908 5' + gypsy5 7002 2 70.00 GTCGAGTTTTTTAACCGCATACGTTACTAGTTGAAGTGCTCGCAAGATTTTTTAAATTATTGTAGGTATTTCAATTTCAAGTTTGTAGGCGTTAGAGTTACTAGAATTTGTATTCTGAATCTCAACCATCTAGCTTTTATAG:1 + chr4 995791 5' - INE-1 161 1 72.54 GCAGCAGATGAAAAGAAAACAAGTTCAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGAT:1 + chr3L 5634286 5' + Ivk 5070 1 71.11 AAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGAGA:1 - chr3L 19350012 5' + jockey 60 1 51.05 TTTTAACCCACACAAGTGTCAAGTGCATTATGCTTGTGTGGATGTTTTCGAAAATAAATCAGTTCACTGAAAAAAAATCGCATCTCTCACGGCGAACACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chrX 958088 5' - roo 9049 2 57.53 CACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCC:1 + chr3L 24152461 5' + HMS-Beagle2 81 2 73.29 TATGTATAAAAAAAAACTTTGGCACAGCAGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTATGAAGATTTCCAATAAAG:1 + chr3R 9352021 5' - Tirant 311 2 77.40 GGCCTGCTAAACATTTGCATGGGTATTTCTGCAGGAAATGGCCAAAGTTTGTCTGGGCCAAAAGGGAAAGCGGATGACCGGCGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAA:1 + chr2R 21402537 5' - mdg3 5495 2 79.45 CCTTAAATGCTCACGCAGCCGATCTGCATAGATAATGTGAAAGGTGCTATTTTAAAGGTTGCTATTTTGATGTTTAATGAAAGAAGAGCTTAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTG:2 + chr3L 23571613 5' - Stalker 323 4 75.71 TTGCATACTTTGGCGGGCTTAGCTTTTGTTGGGCCATAGGCAACGAATCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCC:1 - chr3R 22516036 5' + jockey 4625 1 65.00 AATAAGCCCCAGCAGTTCCGAAGGGGGACACACAACAAAGACAACAGCATAAATCTGACACGTTGCCCCAAAATTAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCG:1 - chr3R 18601771 5' + hopper 446 1 73.08 GGTATCACAGCTGGCGACGTGATCGACGATTTTGCATGGGGAGCGTGTAATTATAAGGGAAATCCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 10684864 5' + roo 8678 2 71.54 TTTAAGCTGCCATCTGCTTAATTTTATCTCATGGCACATTAAAACTTTTTCTTCTTTCGATTTTGTATACTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTTGTGGGCGCGCTCAATTTCTTGGTCTTATCCATTATTGTATGTAACGAAAAGA:1 + chr3L 18945582 5' + gypsy12 10098 2 55.48 GAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGC:1 - chr3L 13435601 5' + Doc 99 1 62.33 AAAGACGACGAAACCGGAAGGGAAATACACTTTCGAGGTCGATCTTTAAATAACTTCGAAACATTATACATATATAAGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 - chr2L 14248122 5' + I-element 24 1 62.10 CTGGGCGCTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAACGATCTTGCGCTGCGTCTTTGTTTCTACAATCTTTATGCTGAATCTCAAACTTCTTCAGGAAACTGAGTAATACAAAGGTATTCTTCCATGTCCCTTTTCGGACTCGACTC:1 - chrX 7332397 5' + HB 67 1 60.27 AGAGATCTGGACTTCACTCTGGCCAAGCAAGTATTCATTGTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTT:1 + chrX 21290608 5' - jockey 4910 1 75.00 ATTGCTAGGTAGACTTTAAAATGGCTCGTATTTTTTCGGGACGCCCATCACTTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGGTGACAT:1 + chrX 1278055 5' - roo 338 2 63.70 ATTGTTCATCTAAATTGAGTTACTTTATATACAGCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr2L 9668309 5' - 1360 3370 1 68.66 TGCCTAAGTTTTGCACACAACTGGACTCCGAGAAGCGTATTTCACATACCTGTAATCAATGCTTATTACGGACTTATAATTCTTGGTGATTTAGCAAAGTAATTAAAATTGCTAAGTAATTGGCTAATCTATTCGAATTTGTAAAT:1 + chr2L 10258608 5' + invader6 468 1 70.55 ATATTGATTCGGCGCTCGGTCTGATCTATATTTTATGGGCTGACAATTGGACAAATCGTGGGTTGCCGAAGGGTAGAATTTACTTTAGATCTTTATTTCTTCGTTGTCGGCTTAAGACTGACTGTACAGAGTTTTTGATCGGCTCG:1 + chr2L 7590715 5' - rover 205 2 50.68 GTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTATAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACT:1 + chr2L 18177014 5' - INE-1 542 1 75.38 ATGCATTTCTTCTATCGAAAATCCAAATATATTAGGCCAAATTCTGGTCCAACTCGAATACAATCCCAAATCCTTCTCCCTCGCATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGC:1 + chr2L 2030481 5' + 412 279 2 63.12 GAAAACTGTCAAAAAATCACGTTACTGATTTTTGGGCAATTGAACGAAACGCTTGCATTGCGGCGATTGAGATAAATTACTTTCTTACAAATTAGCAGTGTCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATGTTAT:1 - chr2L 20140828 5' - Tc1-2 1418 1 56.72 CGCCGATCCATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1 + chr3L 27415189 5' - transib2 2816 1 75.42 AAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGAAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3L 13563396 5' - roo 9004 2 65.07 AAAGTAAGAAGCGGCGACGGAAGCGCGACATAGAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATA:1 + chr3L 96527 5' - roo 9010 2 71.19 CGTGGAATTGCGGCTGAATGGATTAAAGCCTCTGAAAACATGAATTTCCTTGCGCCATTATTGCACTGAAGATAAGGATTATGCTAGATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chrX 10567736 5' - roo 9039 1 63.01 CTGCAACTTGCCGTTAAGACTTGATCGGACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1 + chr3L 14550986 5' + P-element 91 1 19.18 CGACCTGGAGCCCGAAAAAGTAAGTAAGAACGGCTTGTGCGGTTGCACCGACGAGCAAACAGAAGTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 - chrX 22610799 5' - pogo 2099 1 74.23 TACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCG:1 - chr3L 12976345 5' + invader4 2812 2 57.86 ACTGCTGTTAATTATGTGGATAGTAAAATTACAACACGCAGAACAGCAGCTAAATAAAAACTATCCTTAATGTTTTGATTGAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 16399434 5' + roo 8703 2 52.74 ATTAGTCAAACACTTTGTTGTGGGTCGTGCTAATAGCTTCCGTTTCCCAAGCCAAAATGCTTAAGCTTGTGATTCAGCCTATAGTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 17114148 5' + roo 22 2 64.12 AAAAGCTCTTGAGGTGACAATAAGTGTAATCTGTTGTTCTTGAGCAATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr3L 14062200 5' + Doc 45 1 53.42 ATGGGAAAGCTCCAAGCAGACCCGATTTCAATGGGGAATCGAAAACGCTAGTCTCAATTTCTTCATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 - 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chr3L 18659007 5' + roo 46 2 54.11 CCTTGTTCATTTGCCGGGCCAGCCATCCGCCACAGCCAGACGGATTGTGTGCCACTTTGCAGGGGTTCACTGTAGACCACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTGTCTTTCCAGCTACGAATAG:1 + chrX 9707118 5' + Doc 37 1 60.74 ACCCAATCCAGAGGCCGTAATATTTGGGTTTTTCCGCCCCTCCATTTCGCGTCCCTTCAAGGTTTATTCTGATCCACCATTCTAACGGTCTTATTTTCCATTCCGTCCTTGGTCGCATAAACCTTTTTCCGGCGGCGTTTATTCT:1 + chr2R 2124704 5' + Max-element 427 1 28.97 GGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATC:1 - chrX 21667969 5' + gypsy2 31 2 67.86 AATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 14553195 5' + roo 8704 2 58.97 GAATTGGTCGATAGTGATTAGCCAAGAAGTGGTTAGCTGTCATATTTCGTACCATAATGGACACTGAGTTGGCCAATGTTTTAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAA:1 + chr2L 4203003 5' + jockey 4977 1 52.74 AGCCTGTTAAGATATGCAACATTTTGGCTATTGATTTTTTTGTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1 - chr3R 22249186 5' - jockey 4917 1 74.66 GCCACACCTAATTTACCCCACATTTACCAGCACTGTACTCTTCAGTTTCGATTCGTGCGTGCTTCTGACATTCGCCCATTTATACATATAATCACTTTTGTGTTTTCGTTTAGTTTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCA:1 + chr3R 17867698 5' - hobo 2934 1 81.51 TTCTTACTAATTCTTTATCTTGACAATGTGGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTT:1 + chr3R 2555477 5' - Bari1 1654 1 53.42 AGATTTGTTGTTGTATGGTTTTTGTTAGGAAGTTTTGTTTTGTATAGAATTTATTCTTAACTTGTTTAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATT:1 - chr2L 22975181 5' + Stalker4 319 4 59.59 CACAATCATAAATGCACACAAAACACACAGGAGACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCG:1 + chr2R 22722978 5' + 3S18 5774 2 76.81 ACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATT:1 - chr3R 9160771 5' - copia 195 2 54.79 ATTTGCACTATTTGCGAAACAGGAAGAATGAGCAAGCGATATAATAGAAGTTCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAA:1 - chr2R 16475302 5' + Quasimodo 7215 2 64.38 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAA:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 81 1 58.90 CAATGGCATATTGACTAATTTTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2L 3890125 5' + jockey 33 1 59.66 AATACGAATAACAATTTATTCAGTCTAACAGGCCTTGATAAAGAATTAATATCCTGTTGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTT:1 - chr3R 4581009 5' + 297 6847 2 46.73 CACTGAGTTGGGGAAGAGTAATCCCTAAAATTGACCTATAATTTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 + chr2L 3762934 5' + jockey 85 1 68.49 AAAACATTAAAACGCATTTAGCAGGCTGTTCTGGGCCTTACAACTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 + chr3L 13634210 5' + 297 6640 2 67.67 TGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTATAGTAAATG:1 - chr3R 16181201 5' - roo 314 2 79.45 TTTGGCTTTTACTACTTTTCCATCAGCATAAGCACAAATTATTGCTCAGCGGGATGGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATCCAATTTCTTCT:1 + chr2R 23497038 5' - 412 7481 2 63.01 ATACAAAGAAGAGGTTTTAAGTGATTGTAGATATTGTATTCAAAATGAATAACCTATGAAATACATATATTTATCAAAGATCTCTCTGTGCTCTTGGGAAAGACAGTTAAACCAAAGACACTAGGATAACAAGATGCGTAACGGTC:1 - chr2L 11453187 5' - 1360 3376 1 69.18 AATGCGCTTCGTCCCTACGTGAAACTACACGGTGCTGCCAACTCGATTAATGATTCTATACCCTCAACGTTGTGAAAACATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr2L 6318874 5' - pogo 2087 1 68.91 ATCAGTTATTTTATTTCACCCTATTGCCCTCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTGTTTAAATCATTTAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr3L 21144008 5' + jockey 4693 1 69.18 GTGGTTTTTTCTGTGACAGTGCGAGATGTTTTATCCCAAGAGTTGGGGCATACATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1 + chr2L 21951124 5' + Burdock 6190 2 64.44 CGGAGTGCCTTCACCCCGAAATTCGTGCTTTTCCTGGTCAAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTAC:1 + chr2L 9237475 5' + blood 13 2 69.23 TCTTTTGCCTCCTGTAACTGACTGATGTTTGGCACACACACTGCCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr3L 17175079 5' + 412 7071 2 72.14 ATTTGATGAAAGTTTGAATGAGGAGGAACAGTCTTCTTTTAGTTCATGCGAGAATATAGTGGAGGCCAATCGTAGGTTGGTCAAAGAAAACTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTGTCGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr3R 12988145 5' + P-element 1 2 62.33 TCGGTAGTCGTAATGTAATCTTAGAACATTAATTAGATACGTAGAATAACAGGTAGTTGGAAGAGTTAGTTGAAAATTTTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr3R 20744124 5' + roo 8671 2 76.71 GCCATTGTACAAATGGGAGCATAAATAATAGCGACTGTCTGCCAAGTTATGAATAATAATGACAACAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 25387876 5' - roo 9016 2 58.22 GGTGTTTGGTATAATAGTGCCTTTAATTGGTCAAATTTACACTTGATTTACACACACCCACACCAGGTGTGATTTCAACATTCCAAACAGCACTGCGAACAACGTACAAAAGGGAGAGTAAACATAACACAAGGACGAAAAATGCA:1 - chr3R 7987658 5' - Cr1a 192 1 64.38 TGTATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chrX 21852449 5' + Tirant 8133 2 56.31 TGTATAGACTATATATATTCTTGATAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAAT:1 + chr2L 13154261 5' + Juan 80 1 70.14 TGCACTTTGGCCCAATTAGTTACCCGAAATGAACTGAGCCGAAAATTGCTTCGCTTTCGGCAAAAGCTTCAATCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCTGGGCCTGTCTAG:1 + chr2R 16688769 5' + opus 77 4 63.03 CGAGTCCCAGTCTCCCACCAGACATGACCAATGCGATCAGCGACCCAGGCCCGAACCCGTGCACCTCACCCACTGGGCGAAAGCGGGGTATCAAAGTGTTTGAAATATCTGAAATCAGAACACTGTGCACGCAAACACA:1 + chr2L 3543095 5' - Cr1a 398 1 75.54 GATTACCATGCCACACCGCCTTTTCTTCCAAATTGTTGTATTCCCAAATTGTAGTCGAAGACATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr2L 3659066 5' + 412 36 2 51.64 CTTAAGGGATTATGCGCACAAATGTGTTGAAATTCGGGTCTTAATGATAGACCAAGTGGCAGCTAACCAGAAAAAAAAAAATGCCAGAATAAAGTACATACATAATACATACATACATA:1 + chr3R 21539242 5' + 412 219 2 78.15 AATTACAGATTGTCGCCTTGAAATTTAATCAAGGTTGAAACTACACTGTGACTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chr2R 19555083 5' - pogo 2093 1 77.40 AGAGAAAATATTAAAAAATACTTACAACCTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAA:1 + chr3R 25904194 5' - 412 405 2 85.00 CCATTTCCATTTCCCCTAATGATTTCCGTTGAGATTTTCGCCCACAGAGCAGGAAACAATATTACGATATATCCACATTTAACGACCTGAGGACAGTCCAAATTCAAAGGTTGGGGACTTATCCAAAAGTCCCTAAGACTTAAGA:1 + chr2R 22145448 5' + Idefix 11 2 66.21 CAGATATAAGTAATTATAGGAGCTTTAACCGAAATACACTTTTAAGCTAATTCTACTAAACCATAGAATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3L 27350460 5' - pogo 2053 1 53.79 ATTCTATTGCGTAAACTGAAATTTAGCCAGTCTGTATATGTAGTTCCGGTTTCCGGATTTGATTGAACTTGGCGGAAGTTGATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCACACCTC:1 + chr3R 29732996 5' - opus 463 2 60.27 CAAAACGTGAAGAAATTGTTAATGGGCTCTCTGCATCTTTTGAAATTGCATTAAAAATGTATCGTAAAAGGACTGGCAAAACAGTTGTACAATAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACA:1 + chr3L 23618534 5' + Bica 437 1 63.41 TAGAGATGAAAAACATGACCATGTAACACATGAACCACACTTTTTCTCGTCACAGCAGTTTTTGTTATTAAACGGAACCCTGGGGCCACATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAAAAG:1 - chr3R 1443505 5' + INE-1 85 1 80.49 AGCCATCTTACCGCAAGGTTATAAATTTTGGTTAAGGTTTTAGACAATATTTATTTGTGTAAGTATAAATATTATAATAGCATTTATGCGGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACACTTC:1 + chrX 22576285 5' - Burdock 156 2 52.74 ATCGGATGGGCGAAGAGAAGCCACCTTGGTTTTATTAGGCCTCGAAAAATGGTCGACTAATTGAAATACTCCAAGGGAAAAAAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAG:1 + chr2L 3894860 5' - jockey 4734 1 66.67 AAGCTCTCATATGCAGTATCTGCCCAAAAGTATGCATTGGATATGACACGAATGCACTGAGTTGGGGAAGAGTAATCCCTAAAATTGACCTATAATTTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr2L 3762880 5' + jockey 14 1 72.31 GAAATTTCAACTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chr3L 10133575 5' - 412 7459 2 76.71 TTAAAGTAAAATGAGAAGCAAGCCATGAAAATAATTGATATTCGACTTTTTTACATTAGTTTTCGCATAAAAATTGTATTGCATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAAT:2 - chr2L 2657351 5' - diver 186 2 55.86 AGCAAGGATCCCAGGCTGGGATTTTCTTATGGCACATGGCATAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATA:1 - chrX 17805722 5' + roo 8890 2 71.13 TTTGGCACTGCAATTTCGATTTCGCCTGTCATCTATTTAATGATTCCGAATCGGAGCAGGCCCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr2L 11951513 5' + pogo 57 1 57.53 GTGGGTTGATGCGTTTTAAAGGGTTAAACGTTATTCAGAGAACTTGAACTCCAAGCTTTAGTATTGAGATTAGAGTTGATGTTGATGCTGTTGCAGTTGTTGTTGCTAAAAGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTACTG:1 + chr2R 14926177 5' - Doc3-element 490 1 58.90 CAAATCCTAGACGATTGCATCGCCCTCCAATCACATACAATTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAATTTACTTAACCAAACGCACTTTTTAAAAAATATTGATCATTTTGGGACTTTACGTTGGTCAAAACCAGACAC:1 - chrX 21083996 5' - HB 226 1 67.81 ATGTTGCCAATTTTCTGTTAGGTTTACGATGTTACCGTTAGCCTTTTAACCACGAAATTGAAAAAGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - 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HB 405 1 69.18 TTCGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1 - chr2L 2276796 5' + F-element 69 1 57.53 GTCGATGCTGCGCCTATCGCGAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGCCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTCATCGTCCCACATCTTATATTT:1 + chr3L 24152399 5' + HMS-Beagle2 6902 2 69.86 CCGTCCATCCGATTAACTGTAAATATGTGGTCATAGCCGCAGATGGTGCTGTTGCTTGCATATTGCTGCAGATACAGTCAAGCAGTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTC:1 - chr3L 3081173 5' + 1360 3148 1 58.90 GCTGACGATGTCCTTGTTCCCATCCTCGTCCTTTGGCCAAAACTCGCTATGTGGTTAACTCGGTTGGTATGTCTGTATCCGCCGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 + chr3R 27859146 5' - hopper 1381 1 62.76 AAAGATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGT:1 + chr2R 7020547 5' - Bari1 1646 1 60.96 CTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 + chr3L 6775360 5' + blood 74 2 67.12 GTGGTTCGTTGTATCTGAGTGTGTTTGTGTGTGAGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCA:1 - chr3R 21942796 5' - accord 7065 2 73.33 ATTCATGTACTCGATGAGGTTTTCGGTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGGTATGGTTATGATTATGTTTATG:1 + chr3L 17890758 5' + 412 7128 2 73.81 GGAAGACGATACGGAGTAGATTACCCCTGAAGTAGATTTGGCGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGT:1 - chr2R 558164 5' - copia 5079 2 69.86 AAATGATTTGAAGCACGTTTGAAAAATCATTCTTTTTAATCTCACCATTTGAAAGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 - chr3L 16496718 5' + jockey 4776 1 63.01 CAAAACTGTGGGTGTTTACTAATGAAGAAATGGAAAAACATTTTACAAAAGTGTGAGCGTGACTTGCGTGGCTGGAATCTGTATGCTTGATCTCAACTCTATAGGCTTCCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr2L 22132453 5' - pogo 2089 1 77.40 ATACATAATAAAGAGCATCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACC:1 + chrX 21772488 5' - gypsy3 6539 1 66.09 GGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chrX 7515742 5' - roo 9033 1 52.00 TCCACTAACATGTCTATATGTCTTGGAAGGGAATTCAAACACCCAATCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTGTCGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3L 14551081 5' - P-element 2856 1 57.93 ACACGTATCTTGGTGTCTGGGACAGCTGGGCTTCCTTTGCTGCGGTCCACATAAAATGCATAAATTATACAGCGTTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 - chr3R 27822307 5' + I-element 46 1 54.11 AGAGCTTTGGTCTGCTGCTGAGAGCCATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2L 245984 5' + roo 50 2 53.47 GAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGAC:2 + chr3L 24152441 5' + HMS-Beagle2 61 2 59.59 GGCAGAAAAATAGATTGGTATCGAATCGCTTGGAATTTGAATAATTTTTCCCATATTTTAACTTTTTATCAAGGCCATGAAAACCAGAATCACTTGAATGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 957923 5' + roo 22 2 67.81 TTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 - chr2L 22015977 5' + Tirant 2 2 63.79 TTTTAATAATATTTATTGCCGGGCCATTCATGTGTCTTTAATGTGCCCCAGACAAGAACGCAGCTCGTGCATAACAAGCGGCTTGTCATTCTGTTAGCCAAGTTAGTAGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTG:1 - chr3R 24981514 5' - F-element 304 1 73.97 AACCCACCGGCGATCGATGGAAAGATGTTAGAGCCACGAACATGGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chrX 17805957 5' - roo 9030 1 59.82 GCAACAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chr2R 10695775 5' + roo 8725 2 58.90 AAGTGTATTGAAACTTGTGTCTCCAATTTACCAAACTAATTCAAAACATAAAGTCTTCTTTTTCAAGTATGAACTTTTGAAAGTGAATAGTAGGCATTGTATTGAAACTTGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 - chr3L 4620934 5' + FB 12 1 58.22 CAGCTGCGAGTGTCGCCGAGCGTGAACGGGTTGGGTTAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3R 17305418 5' - roo 9037 1 60.96 TGAGGCTTTCCTAAAAGTTGAGATGAAATAGTTCATGAATGTAGTTCGAGAACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr2L 17029533 5' + blood 3 2 79.31 TATTATTGGTCTCATGTCAGGAATAGATCTTTAATCGCATTCAAATTGCATATCAAATTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATT:1 + chr2R 8158743 5' + Juan 54 1 45.21 ATTTAACCTGAAGTTCAGCAGGTGGTTAAAATCTACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 + chr2R 8157145 5' + Transpac 40 2 56.85 AATTAATTAAAAAATACAGCGGCAAAGTAAAGAGAAGGCCAAACTCAAGCAACCCGCAAAGGAAAAACTTGAGACACACAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 13563424 5' - roo 394 1 68.60 GGTCGGTGAATTAAAACTCAAGCGCATTTAAAATATGGGTGCTGCATGTAAGCCAAACTGAGAGGGTCCTTTTTCGTAGGGATGCATAAATATGTATATGTGGGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 22869951 5' - accord 186 2 73.68 GGTCCATAAGTCACTTTAATGGGCTTTCAATGAGGTGTGCCCCGGGAAAATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 30634891 5' - roo 388 2 72.54 CTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATGGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCG:1 + chrX 22726201 5' - Helena 1249 1 54.62 AGAATGCACTAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGAT:1 - chr2R 4261978 5' - invader4 239 2 47.86 CTCCATTACGAACCACCAGGCGTATGCCATTGCTGACCATTCAACTCTAGGAACAAACGCTTTTCGTCCGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 + chr2R 558075 5' + copia 4923 2 52.74 CACATACGATTAAGTTTCACCCCTCGTCGGTTGAGCTGAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATA:1 + chr3R 15711794 5' - diver 149 2 71.53 GTTTTGCTATGTTTAATTGAACAATCGTTTTAGTGGACAAACAAAAGCTTAAACCAGAGAACTGCAAAGCTGGCATTTTTTGCCACTCGACTCACACCCAAAAATTTTATGTGCGGGTGCTACCTGCCACGCACATCGCGAGTACT:1 - chr3R 17867842 5' + hobo 72 1 63.01 AGCCGAAAAGGCTTAATGACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATTTGCACTTTGCAACACAAAACGGAAATTTTGACAAAATATGCCCTTCAATTTAGAAGTTCTTGGACTTTAAACCTATATTATTTTTGATC:1 + chr2R 17626515 5' + 1360 251 1 55.48 TTCAAGGGCTTGTCTACTTTTTAAATTCAACTAATATATAAATGATTTGAAGCACGTTTGAAAAATCATTCTTTTTAATCTCACCATTTGAAAGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 - chr3L 16496758 5' + jockey 4737 1 61.64 AAAGTAGCAAAATAAAGGCAATGAAAAAGGACAGCGCTCATAGAAATAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 - chr3R 28728738 5' + jockey 89 1 69.18 GGGGTGGATGGAAGTGTCGACAAAGTGTTTACTCCTCTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr3L 7995393 5' - P-element 2851 1 59.71 AAGTAGTTTGTGACCGCAGATCTGCGTTGGTATAATGCGTTTCAACTGTTTCTCCGTGAACGAATTCACCCAGAAAAAAAGGCGGAACACGAAGGAAAAGTGGGCACATGAAAATGCCAAAAACTATATAAAATAAAATAAAATAA:1 - chr3R 21341590 5' - transib1 1903 1 54.79 CTTTTGAAATTTCAACTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3L 10133580 5' - 412 7505 2 64.76 ACAAATTACGTTGGCTTAAACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 - chr2R 5237922 5' + Doc 56 1 52.05 CTACACTGTGACTGAGCTGTAATCCGATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr2R 19555043 5' - pogo 2053 1 52.74 TTAATGCCTCATAAAATTCAACTAAAAATATTTATTTCTTATCCAGTTTCGTCGATTTTAAGCTATGCATAATAAGCTATGATAATATAAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCA:1 + chr3R 12929158 5' + invader4 2786 2 66.44 TATGTTTTGAATTAGTTTGGTAAATTGGAGACACAAGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCC:1 + chr3L 4620906 5' + FB 85 1 76.71 TATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 7035246 5' - roo 342 2 63.01 CGCGTGCGCATAATTGATTTTTTCGCGGCGATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAAC:1 + chr2R 11763554 5' + Tabor 33 2 63.01 CAAATGAGTTACTACAGAAATTGAGAAATATTATAATATTAGATTATATACATATATGTATGAATTATTAATTTTAAGTCCAAAGGTTTCAAGATGGCATATGTGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTT:1 + chr2L 18149361 5' + Bari1 17 1 39.04 CTCAAAGAGGGTTACGCAAGTCCCCTTGGATAAGCCTATCTTCTATGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr2L 2031040 5' + 412 7127 2 68.28 ATAATATATATAAACTGTTTTGTAATTATAACTAGACTACAGGTAGAGAAAAAGGTTCTCAAAAATTAAAGAAGCTTTCTTTGGGATACGAAGTAAATAATATAATAATTTTTCATATTAATGCATTTTAATTTCAATTTTAACAT:1 - chr3R 10424846 5' - 1360 3042 1 59.59 GTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACT:1 - chr2L 23295910 5' + micropia 23 2 65.71 AAGAAGCGATGAATAACGGCAACACAACTTTTGTTGTCCGAGGACAATGTCTGTGGGGTTTTGGCAACAAAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 12867383 5' + roo 8707 2 54.29 GCAGTTTTATTGTATTGTTCGTCCCGATGTTGGGGCGACTTCCACTTCCATGCTAGTATACACGGCAACCCCTTGACAAACGCAACACGAGCGATTTGAGAAACGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGACCGATAAATTATAT:1 + chr3R 17349282 5' + roo 71 2 68.49 TTCATCAGCGTCATCAGCTCGAGAATGCAGCGAAACGTGTCCACCACATCGTCGATCTTGCGCAGAGCGGCCACTGCTTCGTCCCTAGCTGGTAAGAAGATTAGTTTTTAGCTTGTGCTTAAATTTGATTAAACGCAATTTTTTTT:1 - chrX 5881736 5' + S-element 81 2 63.01 AAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTT:2 + chr3L 24213770 5' - invader2 5038 2 63.70 CATCTATGAGATACGTGAGCCCCTTGGCACACTCACAAGTGCAGTGAGAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGAGGTCTCAATTGGTGGC:1 - chr2L 1886913 5' + blood 7371 2 54.78 ACTTTTACAAAACTTAACTGCAAAGCAAAACTTCGATTCCGAATGCATCTCAAGGACTTGCAATTAACTTGATTTACCCAGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGA:1 + chr2R 19045614 5' - F-element 209 1 56.43 TATAGGTTGCAAAGAGATTGACAGCTTAATTACCTGGAGCCTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chrX 14964569 5' - roo 391 2 71.92 TGACGAAAGAAATGGCACAAAACCATTAAAGAAATTTCATAAAAACTTTAAAGGCAAGTCCCATTTTGATGGATAGCGCGTAGACGTCAAGAAATCAATTTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAA:1 + chr3R 15924534 5' - Quasimodo 7353 2 75.34 CCTGTAACTGACTGATGTTTGGCACACACACTGCCACACACTCACACTCGTCCAGCGACGCCATAATTAATGATGAAAAATTGCTACCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr3L 17175089 5' + 412 34 2 62.33 GTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr3L 15026660 5' + opus 35 4 63.64 ACATTCAAGTTTCTTTGGCTCGCACAACAAAACAGATCGATAGACAAGTGGCCAAGCCAAGTGTAGATGGGAAGCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 13612788 5' + 412 42 2 55.00 GTCTTGTGAGTGAAACTACAGACATGTAAGTGCTTACTTACCAAAAGGCTTTATGAACCCATGGACTTACAAATCATAAAAGTCATGACCCGGCAAGTTCAGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACAC:1 - chr2L 9108715 5' - invader1 4011 2 69.18 TAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACACACGGACATAGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAACAATATACATACTTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATA:1 + chr2L 22036461 5' - INE-1 29 1 90.40 CACTTACACACATTCATGTTTAACATTTGCTTTACACGTGTGTTGATATGCAAAAAAAACATTGCATAGTTTTCAGGGCAAATGAGCATATGAGAGGATGTTTGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 - chr3L 9571780 5' - jockey 4972 1 65.07 ACAATTTGTGTGCCACAGAAAAGAGCGATCGAACTCATTAGAGGAACTCCTAATCCACGTAGAATCGAAGGACATTTTATGCGAAATTAATAAAGCTCAAAGGAAAATCGGAGACAAGAAAAGAAAGAAAACAAAAAAGAAAAAA:1 - chr3R 8527651 5' + mdg3 5088 2 73.79 CTACATAACATTATTGATGACAAAGAAAAGTTCGATTTGACAATTCAACAACAACCACACACAATTATCGGAAAACATATATTCACGAATAATTTACATACTCTGACTTTTTTTTCCATAATTTAAAATAAACTCAAAGTTTGCTA:1 - chr2R 5467581 5' - transib4 243 1 76.03 ACCGCTTCCAAATCTGAAAAGAAGAAACGTGAACAGTAAATATTTTTATGTACATACATAACCCACCCAACTGGTGGTTATAGTTTATTAATTGGGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATT:1 - chr2R 9874905 5' - S-element 385 1 55.48 ATGCTAGTGAATTGGCATACACACTTTTGAAATTTTTAATTTAAATTTTTATGATTATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 + chr3L 23325981 5' + pogo 62 1 67.12 TATTTTACCTGTAAATCTATACATAAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chr2L 13250341 5' - 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chr3L 12723733 5' + I-element 5013 1 62.33 TGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAG:1 + chr2R 12787827 5' - 297 6906 2 75.56 GTATTAATAACCACAAAAAATAACGATCGATTGCGGTTATTAGAGGCAATTTGGCCAGCAACATTTTCTCTCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACT:1 + chr3R 13935539 5' + R1A1-element 5246 1 51.03 AGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:2 + chrX 1103590 5' + pogo 39 1 57.53 GTTAAAATTATTCTTAAGGCAATGGAGTCTATTGACAAGTTGAATGGCAACGTGATTTAAAGACTTGTATTTTGAAATAGGCGAAAAGATCAATTTCTGATAAATGTGCTTTTAAACAACGGCCTATCTAGGACAATGATGCGACC:1 + chr3L 14676829 5' + aurora-element 3967 1 76.03 CCATAGCATTTACATTTAATTGATTTTGTGTAATTGGTGCCATTGAACCAGCAAAAGTCGACCCTTTTGTGAGGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 + chr3R 15702888 5' - copia 240 1 65.18 ACACTTTCAAAAACGTTTACTTATATACGCATTAGAACGTTTCTGGGCCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAAGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGGCAGCGCAGCAA:1 - 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roo 389 2 66.67 AATGCAATCATTTTGGAAACATACTTATACAGGTGGCAACCAATTACCGCTTAATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chrX 12138907 5' - roo 408 1 76.79 ATTTGCTCCTTCTGCCCACATACTCTTCGATTCTGGATGGAGTTTTGGGTATTTCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chrX 8012346 5' + 297 59 2 65.75 ATTCGCCATTGCATACTTTTAGGCTGAGGGCGCAATGGGCGTATGTGTAATATTTCCATGCCACATTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr2L 2004919 5' + jockey 37 1 57.50 GTGAAGTGCTCCTCCGTCTGGATGTGCCACCTGCTAACTCGTTAGCGCTTAGCCGGCCGAATGATATGGCCAATATCAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chrX 4291981 5' + roo 19 2 67.21 GGTCGGGGGTGGATTAAAACAAACACTCCCAAGGAGCAGCTCGCATAAAACCCAACGCCAAAGCATTTTTGAGGACACGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAG:1 + chr2L 8503097 5' - micropia 5036 2 58.22 ACACACACACACACACACAGAAACAGGCGAGACACGCACACATGGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chrX 7978952 5' + hobo 63 1 66.41 TATCTGCAACTTGACTGAGGAAAAGCAGCGATTGCAGTTGGAGAAAAGCAGGCAGGGGATTGGGAGTGGAGACGGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTTTTG:1 - chr2L 4174080 5' - roo 388 2 65.29 GAGTTCAGAATGGGCCAAAATCCGAAGCGGCGGGCCAAATGGCTTTTCCAGCTGCGCCAACAGGGCGTATGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3L 19199734 5' + hobo 12 1 65.14 GAACCACTGCGAACCGAGTGGCACGAAGCTGCACGAAGTTGCACGAAGCGTTTGTCGGCGTGCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chrX 14826098 5' - P-element 2872 1 63.11 AGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGCGACG:1 - chr3L 25401029 5' + Doc 14 1 60.00 ATTCACAGACTTTGGGAGAGAATAAAAAACAAATAAAAAGCCTGCGAAATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr2L 8956702 5' + pogo 29 1 58.90 ATTTGCTAAGGAGATCACTATCACTAAACTATCTTTAGCTAAGCCAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCGTACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 - chr2R 2534687 5' + 1360 69 1 68.57 ACAAGTTTGCTTCCATTTCCTTCTACCTCCAAAGCAAACAAACGGGTCTAAATTGAATTAGAAACAGCGCATAAATCATATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chr3R 23010130 5' + I-element 40 1 58.22 AAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr2L 246017 5' + roo 84 2 76.55 TTTACGATACGATAGTTACGTGGTACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr3L 13868621 5' + 412 49 2 54.23 CATATCAATAGCTGGTAATAAACCTAACCCGTAGGCGGGCACAAAGGCGCATTGATAAGACAAAATAAAAATTTAAAACCTCACATAAAATAAAAATAGCCGAACAGAAGAAATATCTTATGGAAATGAATCGA:1 - chr3R 15865143 5' + roo 8719 2 74.63 CCCACTTTGGGCTGTCATTTTTGCGGTCAACACTCCCACTAAAAACCAAAAGCCCCATGCAAAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 - chr3L 10144754 5' + blood 60 2 63.70 TACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 - chr3L 19350008 5' + jockey 67 1 52.05 AAAATACAAAACTGGAAATGGGGTCAATGGCAAAAGCATTTGAACTCTTGTTTATTTCTGGCGAGTTTGTTTATGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTAATTTTATTTGTAAATA:1 + chr2L 13927697 5' - roo 9025 2 52.05 CTTATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCC:1 - chr2R 5206903 5' + G4 3764 1 60.96 GCAGAGATTGCTATATTCGCGACTATTGGATGTACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTAGACACCATTAGCTTCCAACTGCC:1 - chr2R 6164619 5' + Tc1-2 24 1 46.15 AGAAGAATGTTCGTTTTTGAGAGTTTTTTATTTGAAATATAAATTTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGCCATTTTATCTTTA:1 + chrX 3197082 5' - mdg1 7406 2 61.60 AAAGCACTTACAACTTTTTAAATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAA:1 + chr3R 9190431 5' + Tabor 4 2 45.07 TAACACACTCAAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTGTGTGTGCGGGTGCTACTCGCGAC:1 + chr3L 18467181 5' + hobo 56 1 55.63 CCTGCGTTGTCATTAGCTGGAATTTAAAACCTTTTCGCCGATGGAAAAAGTTTGGGTCAATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr3R 27535524 5' + 412 50 2 56.72 AGATTAATGGACAGTTGCCAGTAAATAATTTTTGTGCAATTAGTGCATTTAAATGTGTTGATTACTAGTTGACAACTAAAGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr3R 5453743 5' + 412 7091 2 59.59 TCCATAAGTCACTTTAATGGGCTTTCAATGAGGTGTGCCCCGGGAAAATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 30634893 5' - roo 9045 1 69.18 AACGTTCGCTGATTTATGGATTCGCATTACAAGTTTTTGGTCCGAAACTTTTATTTTTTTATTTTTTTTTATTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTT:1 - chr3R 31450768 5' - Juan 4155 1 57.53 GCTTGATTCCTGGGGTCTTGGGACACTTTTTCTCTCTGTGGATTTGTTTACTGCCTAATGGTATGTGAGCATTACTTATTTTCATTTTTT:1 + chr3L 16461051 5' - invader2 304 1 84.44 AGACAATTTCTAAACAAATAAATTCTATTAAATTCTATGCCATCTTAATGTTTGTTATATCTATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTA:1 + chrX 13531595 5' - roo 350 2 57.24 CGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr2L 1558704 5' - 412 7505 2 64.81 GTCGCCATAATATCCACAATGGTCATTAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2L 22016020 5' + Tirant 8122 2 70.18 CAGTGAACAATTAAAATTGGAAGAAACGAATTAAATAACAACAGACTGAAGTTGAAAGCATCAAACAACGAGAGCAGCGAAAACAACAACTCCGCAAGGTAATTATATATGTTTTGAATGCCAGGTGCGTCGATTTGAAGGACCAC:1 - chrX 12149095 5' - HMS-Beagle2 6739 1 74.66 ATAATAGTATGCTTAAAAGTTACAAAATATTAATGATTCATCCCACTGAGGTCCTTAAGACGTAGGAGAAATACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCT:1 - chr3L 18897219 5' - F-element 233 1 51.82 ACACTTTCGAGGTCGATCTTTAAATAACTTCGAAACATTATACATATATAAGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTG:1 - chr2L 14248096 5' + I-element 72 1 64.38 AAATGATTTTTCAATCTGTGCACAGATCTGGGGAAAAGTGTCTTTTCCGTGAGAGGGGAAAACGCCGGCCGCCCATGGTAACTTGACTTTGATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chrX 18933485 5' + FB 32 1 63.70 GATTTGTACATATGGCTGGCCATAAAAACAGAGCATGCCCAAAAATTAAGTATACGCACTTGATGTGACTTAATTTAATGACTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr2R 23497156 5' + 412 40 2 56.85 ATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCA:1 + chr3L 17707849 5' + Doc 77 1 77.50 GTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAACATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGA:1 - chr2R 4677355 5' + invader3 61 2 57.53 ATTCATAATACACAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 - chrX 21852446 5' + Tirant 5 2 69.62 AAATACGTGATCTCGCACACATAGCCGCTTCCGAAAGCCGAGGATTCCAAAAGGCTATATATATATAAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACA:1 - chr3R 17495852 5' + Quasimodo 44 2 57.55 AGAGCAGAGCAGTTGATTATCTTAATCGCGATATAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTA:1 + chr3R 27478510 5' + hobo 87 1 76.03 AATAGTACTGGTACTCGTATAGTAAAAGAGTATCTAGTATCATTGAATCTAGTATCATTGAAATGTATTTAGCAGACATAAGGAAACGTTCCCGACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTG:1 + chr3L 26417918 5' - Quasimodo 239 2 68.57 ACGAAGGAGCGGATGCTACGTGCCTGGACTTTGACTTGGACTAGGAGCTGCTGGTAGTGGAGCTGGAGTAGTGGCAGTATCAGAAGGACTACCGCCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr3R 22100642 5' - 412 473 2 69.06 TGCTGTTATTCTAACAAAAGATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATAT:1 + chr2R 7020531 5' - Bari1 1662 1 51.37 GGGGTTTATTTTGGTATTTCGCATTTGGTCCTTTTTCCTGCTCGCAGCTCACAGTTCACAGCTCGTGTTGACAGTTTTTTTTCGCTTTTTATATATATATAAGTTAACGCAAGGTCCACTTGCAT:1 - chrX 20066268 5' - opus 7498 2 80.00 AAACATTTGCAAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chrX 2762589 5' - roo 9029 1 60.18 AATCGGTGAACTTTTATAAAAGACAATTTTTGTGAAATCTCTCTACCTCAAAGTACAAAAGTGTGTACAAAAATTATTCATATCCCTGAAAGTGCACAAATTTTTCTAGAATTGATTACACTGTTTTAATAATATTTTTTTAGAGT:1 + chr2R 25226721 5' + hopper 168 1 68.49 GGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr2R 11133556 5' - roo 334 2 68.97 GGCGCCCTAATGGGGCGAAAAGATTGGATTGGCATGCCAGCGAGAAAAAAAAAGAAGCGAAAAGCAAGAAATATATATATATTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTCTAAGCTTATTCGTG:1 + chr3L 10388846 5' + Cr1a 4043 1 55.00 AACTCAAAGCTAATGTAAATATGGGAGCTCTATTTGCCAAAAGCAACTGTGCGTCGAAATCTAAGCATATATGGAATTTCATAAAATACAAATGTATACTATACATAAATAATTTGTGATTCGATATGTAACTTATATTCATTACA:1 - chr2L 15343150 5' - Doc2-element 4691 1 52.05 ACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chrX 7515715 5' - roo 8985 2 77.40 TGATGAATTTAAAATGGACACTATGGGCAACCAAAAGGAAGTATTCAAGGATAAGAATGAGAGAGGAATGTAGGAAATACCTGGTTGCTTGGCCGAAAATCTGCAACCACCCTGG:1 + chr3L 10503113 5' + G4 3366 1 66.09 TGAAGATACTCGTTTTTAAGTGAATAGATCGGACATATCAGATTGAAAAAGTCATTAGCAAATCCGAATCGATTGATTTTGAAATAAACTTGCACTGCGCCTATGTCTCTAGAATCTTTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTT:1 + chr3R 16309080 5' - INE-1 167 1 57.64 AGCTGGTGTTGTTTTGATTACCGACCGTAATCGTTTCGTTTGAGAATTACACCACAAAGGAACCGACGAAATGATGTTTCTTTGTGTCAAAGGTCACCGATCCGTTAAAGTTAGATAGGATAACTTAATAATAATAATAATAATAA:1 + chrX 21933347 5' + mdg1 7076 9 73.97 AAAATTGAATTATCATTTGCTGGTGCATCACATTTAATTCGTTTTGGCGCTGTACGCGTGCGCACGCAAATCCCCAGTTCCCCAACTGGATACCCCTCTTTATACTCCACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr2L 16458534 5' + roo 8676 2 76.03 TTCCATATCTTTTTTTTTTCTATATATGTACGAATAAGTATTCGATTGGTTGGGCATCTTGTGCCACAATTGTCCATGTGGGAGTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chrX 1689953 5' + 412 7070 2 70.08 AACTAAAAGTATAAACATACAACCTGCGCCTGAAATTCGTAACACTTTTAGATATATATATGTATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 - chrX 15974030 5' - flea 221 2 58.27 ATCGACTATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAATATT:1 + chrY 680451 5' + invader2 44 2 73.29 AGAGATTTGGTGAACTTTAATGGCAGTCAAAATGTTGCCAAAGCCCCAGGGGAAAAGGAAAATCTTTCAACACCCCAAAATGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAAATGGGTA:1 + chr2L 3117045 5' + pogo 325 1 52.74 CAGCAGCAACAACAAGCTCAAACATCAGCCAGCAACGTCAATCCAAATCATAGACTTTGCCCAGACTCAACTGATTATATATGCACCAATGCAATGCATACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chrX 17732116 5' + pogo 19 1 71.23 CGCCTGTTTATGCTCCACTTGCCCCCAAACCATCCACTCCCATCTTCTTCACTCTCTTCTTTCGCCTTTCTCCTCCAGTTAGCGTCCTTTGATAGATGGCCAAAAAAAAAGCAAAAAAAAAAA:1 + chrX 8917437 5' - hopper 147 109 51.22 ATTATTTTCGAACATTTTCGTCTTTAGCCTGGAAAACGAAACCGTTGGCTACGACATAATTATATTTATAATAAACATACGAATCGAGGTAGCCAGCCCAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAA:1 + chr2L 22127502 5' + INE-1 252 1 72.66 CTGATAGTAAAGTGTCCAAAGATTGCAAATTTTACTTTTTGGTACCATTTCTGGTACTTTTTGGCTCATTTCTATCCATACAGTGCACTGTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAA:1 + chrX 3464150 5' - hopper 1377 1 55.48 TGGTCCTCTTAGCAGCCAAAGAGCGAATGAAAATGGGGTGTAAATACGAGCAGGTCAATTTCTATAAAGACTTTAAAGATTTAAATAAGGGGTATATAGTTTCTAATGAAACTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAA:1 - chrX 3996725 5' - Cr1a 4085 1 56.16 AAATATGCAAAATATTTTGCAATATGCGTGTTACACTTTGGAAAGCATTTGGAAACTGACTTTGTTAAATGGAAAATGAAGGGAAAAGCAAAACATTTTTAATTAATGTATGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chr3L 20289172 5' + jockey 4681 1 63.01 AGAATAAAGATGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGATCCCTGCACATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATATATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCAT:1 + chr3R 29288730 5' + BS 5065 1 62.33 AGCTTCTGGAGCCATAACATCTCTTAGTGGGGCAATCAAAACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 + chr2R 5214902 5' + F-element 19 1 76.03 AATGTTCCGTTACACATTCAAAAGGCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr2L 246111 5' - roo 9028 1 57.53 TAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAG:1 - chr3L 27415311 5' + transib2 65 1 61.64 GGCCAAGTTGCCAAAACACTGCTGTTAATTATGTGGATAGTAAAATTACAACACGCAGAACAGCAGCTAAATAAAAACTATCCTTAATGTTTTGATTGAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 16399451 5' + roo 22 2 64.38 CAACATTAATTAAAGTTACATAAAATAGTAGAAGTTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 + chr3L 10133526 5' + 412 7140 2 76.03 ATTAGCGCTAAGTCCGCTTCCATAACAAGAGTGTGAAAGGTTTTGAACTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATAT:1 - chr3R 15702986 5' + copia 75 2 69.18 ATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTG:1 + chr3L 23456282 5' - Gypsy6A_LTR 271 1 71.43 ATTTTTTAATACGTTTATTTCTTTGTTTGATCTTTTATTTCTGCTCGGGTCTTATACACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 - chr2R 641981 5' + opus 39 4 58.90 ACTATTATTGCTACTTCAGTGATATTGGGCATGTGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGG:1 + chr2R 19351982 5' - Burdock 172 2 74.66 AATTCCGCATTGGAATTAATTCAAAGTGGTATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 - chrX 10645068 5' + jockey 69 1 60.69 CATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCT:1 + chr3L 23456270 5' - Gypsy6A_LTR 256 1 68.49 CTTTGTTTGACGCGAAATCTGTTCTATTTGTCTGTGGCAGCATTTTGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAA:1 - chr3R 11057651 5' - flea 201 2 64.06 GGCTTTCAATGAGGTGTGCCCCGGGAAAATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 30634912 5' - roo 9026 1 56.16 GTGATAAGCGCATAAATCAGTCGAAGGACGAAGGGATCCCTTACCCCAAAGCCACGGACTCAACCCAAGACGTAACTCCCCATGTAGAAGATACTTTTTAATTTCAGTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr2R 17121538 5' - blood 7377 2 72.60 TCGGGGTGATATAAAGGAATCGACTTGTAGGACTAACTTTTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr2R 5737220 5' - 1360 3367 1 60.87 CCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAA:1 - chr2R 4206657 5' + 1360 321 1 71.92 GGTGCCCTCTTCAAAGGGAAGGAATCCCACACGTCCACAGTGGCTCGAAAGAGCAGAGAACTGCAGCCC:1 - chr2L 11915593 5' + hobo 2706 1 73.91 AAATTGGAACCTCCACCTCCAATGACTACAATGAATGATGATAGCCTATCAGAAGACGTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCC:1 - chr3R 31814151 5' + FB 65 1 62.33 GCACTTTAACTTTTCATTCTAAACTTTAGTGTATATAAAGTTATTGCCTTTGGAAACCACTGTCCACATAATTTCTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr3L 15026630 5' + opus 7143 4 59.09 AATAAAGAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCT:1 - chr2L 18149520 5' - Bari1 1635 1 67.12 ATATGGGTTTGACATTATTTGCTTCTAGCTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGGTCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACG:1 + chr2L 8959869 5' + Ivk 5108 1 60.96 GGGGCTTTTCATCCTTCTTTTTATTCTTGCCCCCGCAAGTATCACATGGAATTTCACCATTATCATCAATGTGCTTCAAGTTCAACGCTTTCAATGTAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTA:1 + chr3R 25106615 5' + mdg1 105 2 66.21 AGTTAAGCTGCACATCTTATCGTCCGAACTTGTTTCTGTATTTATTTTAATATCGGCTTTCGTTTGTTGAAGTCGATTAAACTATATGCAACGATATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr3R 25904301 5' + 412 24 2 69.18 CGCCCAATCGGAAATCCCCACCCGGTTATTCGCGTAATCCCGGCTTTAGGAATTAAGAAAATTACCAAAATCGCAATATTTCTATGTTACACATATAATAGAGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 - chr3R 11749779 5' - Tabor 465 2 69.86 CTATTTACAACGCGACACGTTGCGTGAACGGTTCATGAGGCGCAAATGCGAGGTTCGCTCTACAACTTGATACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chrX 21196682 5' - roo 358 2 50.34 GCGGTGCAGCTGGGGGGTTGCATCTGCTAGCCAAGCACAAAAACTGGGCCCCCAGCAGATAACAGAAGACCAGTGGCATGAGCGGTGTGTCACACCACCCTCATGACCTC:1 - chrX 2773580 5' + jockey 4756 1 81.82 GTGGACGGGGGATGCTGCTACTACGAGTTGGCTAACAGAGTGGTCCCTTAATCATTGGCCACGATGGCTGCTAGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGT:1 + chr3L 17235644 5' - I-element 137 1 63.87 AAATCCAATCCGAAGCCGAAAAGTGCTTGCTGGCTGTTTAAGTTTCGATCATAATAGACACTTTGTTATTCTTATACTTTTCGTGTGGATGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATATACGTT:1 - chr3L 5631375 5' - Ivk 5012 1 54.48 GATTTTAAAAGCTTCTTTGGCAAGGAACTGGTAAGCCCAGGAAAGTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr2R 19555018 5' - pogo 2080 1 53.19 AAATTGAGTATTATATAAAACTCAGTCCGCGATGGCATAGGAGGTGGTAAACAGAGCTGCGGGCTTTAACAGGCAGAAAGAAGTGTTTCCGACCAAGTCAAGAATATATGTATAGACTTTATCTGGATCACTAGCCAAGTCGATCT:1 + chr2L 5699189 5' + INE-1 97 1 76.03 GCTCAACTTTTAACCCACACAAGTGTCAAGTGCATTATGCTTGTGTGGATGTTTTCGAAAATAAATCAGTTCACTGAAAAAAAATCGCATCTCTCACGGCGAACACCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chrX 958095 5' - roo 393 1 62.33 GGTGGTTGGCAGCTGCCAAAGGGCCACTAATGATGACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 + chr3R 12599048 5' + 412 70 2 72.87 GGTCACCTGACCAAACGCGACTTTAAGGTAAGCCAATAAACTCAAAGAGGGTTACGCAAGTCCCCTTGGATAAGCCTATCTTCTATGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr2L 2031000 5' + 412 7087 2 59.31 AATGCATCATATATCATATTTTTAATGATATATCTATCATATCTACCTATATCTATCTATCTATCATTTAATATATTTTCTATAAAGAAACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCGTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 + chr3L 11257267 5' + 1360 12 1 76.03 AAATATTTATTTCTTATCCAGTTTCGTCGATTTTAAGCTATGCATAATAAGCTATGATAATATAAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATT:1 + chr3R 12929183 5' + invader4 50 2 53.47 CGAGAAGGTGCCCTCTTCAAAGGGAAGGAATCCCACACGTCCACAGTGGCTCGAAAGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chr2L 11915599 5' - hobo 2913 1 53.77 CATCCTTCCTCTCTTTTCATCCTCCTGCTGCTGCATATGCTGAGTGTCCGCCTGTGTGTGTGCACGAGTGTGTGCGTGTGTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 - chr3L 17175237 5' - 412 7534 2 70.94 ATGAATTATGGATTTTCCCCTTATGGCGATGCCAAAGAATGCAAGCAGCGAAAGAGCGAAAATTTGTTTTCATTGTTGAAAAATTCTGTGCAAATTTATTGAATTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATAC:1 + chr3L 1404956 5' - Ivk 5360 1 74.66 TAGGACGGGTTTTTTTGTGGGTGGTATACTCGTAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTAATTGA:1 + chrX 16985877 5' + R1A1-element 126 1 72.03 CTTTAAATATGTCGGGTTGGAAAAGTTCCTTATGACTTTATACATGTCCTTCTATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chr2L 10746703 5' - pogo 2035 1 66.44 GCTATGCCATGAAAATGGCGTGTGGCACGAAAATGTGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCAT:1 - chr2L 7559776 5' + mdg3 5333 2 70.34 CTTAATTAGCAAACATGACCGATTCTAACGTTCACACATGAACACGAACATATTTAAAGACTTACAATTTTCGGTTCAGATCATATCCTACGTAAATGAATCGCGAGCGATAAAT:1 - chrX 12138999 5' + roo 8730 2 66.09 GCCGAAAGGATTGCCACAGCAGTTTCCCAAAGCGGGTTGCGGGTAAAGCCAAATGGAAATGAAAACCCCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTA:1 - chr2L 12340839 5' + diver 55 2 52.41 TTCGCTGATTTATGGATTCGCATTACAAGTTTTTGGTCCGAAACTTTTATTTTTTTATTTTTTTTTATTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAG:1 - chr3R 31450764 5' - Juan 4151 1 60.27 GGAATGGCAGCAGAAACAACACTGTCGACGGGCATATAATAATAACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTA:1 + chr3R 15058933 5' + jockey 168 1 61.40 GCCTTATGACGCATTTGGTTAATCAACTAAATGCGTGGCAATTGCAAAACGGCCTGCAACAAAAGGAGCTCGTTAAAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCG:1 + chr3R 17382354 5' + invader2 4799 1 59.26 GCTAGGTGGTGATTCATCGCTAAAAACGTAATGAATGAAAATACAGGGTACATATAGGTACGTTTGTATGTGTATGCTTAGTACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTACTGATGGAAAGCGCCATGCAATCACATAT:1 + chrX 12567102 5' - baggins 5245 1 60.45 CGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 14553218 5' + roo 46 2 54.79 AAACGGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAG:1 + chr2R 5674652 5' + S-element 37 2 44.52 GGTTGCAAAGAGATTGACAGCTTAATTACCTGGAGCCTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chrX 14964573 5' - roo 9050 2 69.18 GGGTGAGGGGGGGAATGTTTACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chrX 16855356 5' - roo 9031 1 56.55 GCCTGCCGCTTGTCAAATCGATGGAAGCGGGACGTTGATAGTTCTGGGAAATCGGGGCACCACGGTATTAGTTTCCGCTGGCAATGGATAATAGAAGAGCTTATTATTGTTATTTTTTTATTTAT:1 - chr3R 11099903 5' + copia 4826 2 66.40 ACACACACACACGCATGTTGGCGGGGTGGGGTGGGGAGATAGGCAGCGATTTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTTCATTTTTTTGTGTG:1 - chr3R 9276692 5' + pogo 57 1 61.31 AATTGTAAGTATGTACAAGTATTTCGTGCAACGGTGGCAGGAAGTGAATCATGGAAGGGTCCTTTGTGATTCCTCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACCGGATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTCTAAATTGTAGGCTATCCCGAAA:1 + chrX 7621910 5' + Q-element 123 2 64.38 ATTGCATTGGGGGAGCAAATGTTGATGCTGTCTGTTATTACTGCAAAACGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 - chrX 6510095 5' + jockey 4706 1 53.70 ACTCGCTTGCCATTTTCTCGGCTTATAGCTTCATTTCTAGAACTTTGGAGCCAGGGAATGCCAAAAAGTAGAAAAAAAAAAAGGAAA:1 + chr2L 9174642 5' + Doc2-element 245 2 80.46 ATTCCATATGCTGTGACAACTGAGTGAATAAGTATTAGGAAGGGCCAAAAGAAGAAGCCAGTCGATTGGACGAGGCCCGTTCGACTTTACTTCTTGAGTGTACTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGCTTTAAGT:1 - chr3L 22900225 5' - 412 472 2 69.86 AATCTAATTTTAATTGGAAGTGTATAACAAAGCTCTTCGCTCTATTATTATTATTCCATCATAAAAGAATATTGTGTTTCACGTTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTGCTAAACACGATAAGATTTACCG:1 - chr2L 12277336 5' - jockey 275 1 56.55 GAACTGTTTCAATTATTCTTTGTTTTATTATTTCTCTTGCCATCGGTATACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAA:1 - chr2L 22927017 5' + I-element 5059 1 67.12 CGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATCAGATCACCCATTTA:1 + chr3L 11336368 5' + blood 7102 2 78.77 GTACTTAAATATATATTTTTAAAAGTTAAAAAAAATCGATATACATTGTTTTCTAACAGATTTTAAACCACTGTGCCATTAGTATTTGGCATAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAA:1 - chr2R 15134278 5' + pogo 369 1 59.59 GATAGATTTCTTAACAACTTTTTTCAGTACGCCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTATTGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATAATATTT:1 - chr3R 7539507 5' + roo 73 2 70.77 GATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGC:2 - chr3R 11547788 5' + G2 328 1 52.74 ATGCAGCTTTGCTCTTTTTGGGCCTTCTTCGGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 + chrX 14951135 5' + P-element 87 1 23.94 GCATTATATTTTTGACAGATCGTTTCCCTTTACAATTTACAGTTGCAGTCTGCTGAGAGTGAGAGCGGATAAGTGAGAGAGTGCATTCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGCCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chrX 14951232 5' - P-element 2861 1 65.00 CTAAAATTCTTTTACGAGAATTTGAGTAATGATATTATCTTGAAAACTTGGTCTAAGATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 - chr2L 17029724 5' - blood 351 2 61.38 AGGCATAACAAGAAATAGGTTTTTATTCATATGGATGTTGGGTGCAATTTTCTCATTTTTTTCCCCAATATCTATTAAAAACCCAGAAAATTTTTGAAATTTCGGGTTCGCATTACCACTAGCTGAGTAACTGGTATCTGATAGTC:1 + chr2R 5883475 5' + INE-1 549 1 67.81 CAATGAGGCGGTTGGTTGAGAGGGGCTCCCGCAAAGGAGGAGTGGGGCGGGGGTGGGCATTCTGAAATGGGGGACTTTTTAAACGGGTGGCTAAAAAGCTGGGTAGTCACTGAACTAAACTGCAATGTGTGTGTTTGTGTGTGTG:1 - 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roo 349 2 61.64 CCAAGGAATGGGTCTCTTCAGTCAACCATCCATTCACATGTACCCGTTTAAATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGTCGA:1 + chrX 12525908 5' - roo 341 2 60.96 CACAAGTACCAACTTTACTATTACTACTACTAAATTTAACACCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAA:1 + chr2R 12240104 5' - copia 5044 2 73.97 GTTTTTAAGATACATATCAATGAAGTGCAAAATTATTTATTTTTTGATTTGATTTGATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTT:1 + chr3L 1519511 5' - Juan 4135 1 70.55 CAGGAGACGAAACGAGACTGTTTGCATACTTTCAGGCGCCTCTGACAGGGCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGCCTCACACCC:1 + chr3R 19531198 5' + hobo 25 1 66.42 CCATATCTTATTGCCTTATCAACACAACATAACATTTCGTTCGTGCAGTTATTCAATTAAAATCGGCTGCCGAGATAAGATATTAATTTGTTAATTTTTTTTCGCATTCGCAGTTCCACGAGCTGATTAACGGATATCTGATAGTC:1 + chr2L 793623 5' + INE-1 549 1 52.05 AGGCTGTTTAAATTTGGATTTACTATAGTCCCGCATTAAATGAGATTTATTACTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTT:1 + chr3R 20988777 5' - 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chr3R 21001937 5' + 412 7074 2 70.83 ATTCAAGGTTACCGAATGTTAACAAAGGCAGTTACCTTTGCCACACCTTATTAGCCCCCATCCAGTCGATCATCTGCAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTCGTC:1 + chr2L 12079595 5' + mdg3 22 2 62.39 TTTTGAAAAGCCAGTCCAAATTAGTCCTTTGTTGGATTCAAAAATAGAGTCGTCGTTACATGGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCAACTTGC:1 - chr3L 23986681 5' - opus 7500 2 84.72 ACGACTAATTATTGTGTAGGTAAATGATGAAAGATTAATAACAATAGTGGCCAATTACCAATCAATAAACTGCCTAACAAGGGAAAATGAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 6604252 5' + F-element 4686 5 41.90 CCATGGAGACAAGCCTGGCTGCCGAGGAGGAAGCGAATGCGGATGAGGAAGAGGAAAGCGTGCGGGTCGTCGACATAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTCGGGATTTTGAGAGTCCCGACTTGAT:1 - chr2L 6127334 5' + Cr1a 4068 1 52.82 AGAATTATCATAAATTACTTTAGTATGCGATAAATCGTGATAAATTTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCT:1 + chr2L 17250657 5' + opus 5 2 78.77 CAGTGCCCGACATGCCCTACGATCTCTGACCAATCTGACCTCAGGGGAGTTCGAGAGTTGCCTGGAACTCAACATAAGTGTTTGTGCCTTCACCCAAGATTCGGTACCACGGGTCGAGCAGCTATCCAAGACTGC:1 - 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INE-1 158 1 64.38 TTAATTAAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr3R 22100507 5' + 412 60 2 56.16 ATGGTCCACTCTTTCGAGAGTGGAAGGTAAGAACCAAATGCTTTTGGCTTTTAAGGGTGTTGGCTTTTAATGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 - chr3R 28627703 5' + copia 36 2 56.92 ATAAACAAGAAACAACTGTGGTGCACACACAAAATAAAGTGTTAACTAAAAGGCCAAACAAAATTTTATTATATAAGAAAAAAATAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATAC:1 - chr3R 30295226 5' + Quasimodo 31 2 46.58 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGA:1 - chrX 21292604 5' + accord 146 2 58.20 AGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCA:1 + chr2R 11763606 5' + Tabor 6919 2 73.05 CATACAAAGAAGAGGTTCCGTTTTAATTTAAATATTACGTTTTATGCTTTCTGTTGCATACTTTGGCGGGCTTAGCTTTTGTTGGGCCATAGGCAACGAATCATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACA:1 - chr3R 22516097 5' + jockey 4571 1 73.38 ATTGTGTATCTGCTGGAACATCGACATTAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:1 - chr2R 17891008 5' + Tabor 6862 2 65.52 ACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr3R 10684753 5' - roo 326 2 74.66 GCACTGTTATCTTTCATCCTTTCCTCCCAGCAGCTCCACTCGGAGTATCGGAGCACTTATCGCTGGCATGAATTTAAAGGTACAAACGTACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGAAACACA:1 - chr3R 7872130 5' - transib2 398 1 52.05 GTCTTTGTGGACCGCAAAAGTCCAAGTCAAGCATTCCACTTATAGTATCGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 27794866 5' - roo 359 2 60.00 AGATCCCCTGAAGTATGCTACGTTTTTGGCCATCCATTGCGGCGGCTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTT:1 - chr3R 14860233 5' + BS 5007 1 67.62 GGTAACACATCACAACTTCATATTTGGTTGCTTATTATGCGTGATGTTCTAGGACTTTCAAACACACACCGCACTTGAAAGCGCCATCGTGTATTTCAAATAAATTCCCCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATAT:1 + chr3R 15021975 5' - Tabor 471 2 73.97 AGGTTGCAAAGAGATTGACAGCTTAATTACCTGGAGCCTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chrX 14964572 5' - roo 388 2 69.86 CATTGAATAACACCCAGTAGTTATGTACCTTCAGGCAGACAAACCCGTTCTTATTGAAAGGTTCCTGCAACTATTGGGATATTAAAGATAAAAGAAGAAATATTTTTTATTTATTTTTTTTTAATTATTGCTCTTTTAAATATACG:1 + chr2L 21805141 5' - HB 300 1 65.07 GCATGAAGTTAACTATTAAGTCATCGCTCGATTTCAAATTTTCCAAATCAGAATCTTTAGCATCACTCAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 7035233 5' - roo 394 1 66.67 CATGGTCAAATGGGGCTGGAATCAGGTGGGGTAAAGATTTCAGGAAAATGTAAAACAAAGAAAGAGATTATTATTCTTTTATTTATGTTGCCATTAATCACATTTTAACTTTTTAAATTTTAAATTTTTTTATTTTATTTTAACTT:1 - chr2L 7546700 5' - TAHRE 10442 1 66.44 AAGGAGACGCTCAAAGCACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAAT:1 - chr2R 2875229 5' - TLD2_LTR 97 1 62.50 GATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTT:1 + chr3L 24213776 5' - invader2 187 2 64.66 ATACCAGTTAGTTACCAACTTAGCCTGCGAAATCACAGTTAAAGAATGTAAGTTCACTCACAAACGCATACACACTTCAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATCCGCGAGACGCGGCATT:1 - chr3R 4607651 5' + invader3 185 2 62.71 GGTTTAACCGTTTGAATTCGACTTTGCTATTTGTTGTTGGCAAAATATTATTGTGTCAAAATTTAATTTTTGGGAGTCTTTAGGACTTAGTGGCGTTGGCTTTTATCGTCCACACTGCGAGCATTTATATCCGGAGGCAATGAATA:1 - chr3L 14274717 5' + rooA 7179 1 70.55 ATTAAAACGAAAGAAATTTATTATTTGGTTAGAATTTTACAAAATTGCTTGGAGAATTTTTTACTATTCGGTCATCTTAACGATATACCTATTAAATTATAAAACAAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCC:1 + chr2R 13155877 5' - INE-1 556 1 65.75 GTTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTATGCAGAAATGGT:1 + chr3R 5453650 5' - 412 401 2 80.82 TTTCTCGGCTTTTGAAGCTGCTTTCGCAAAGGCTGTTGCATATTTTATGCAACTCAACCGGTGAGTTGTCGGTCTTGTTTGACTTGAATCATCAAAGTTAGCTGCCCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAG:1 - chr3R 28256030 5' + pogo 214 1 64.49 AATTATTTATATGCGATTTGTTTTTTGTGGCTCTTGGCCATGACTTGGTTGGTGGGTCAGGTTTTTTTTTTTGTTGTTTTTTT:1 - 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gypsy3 6567 1 53.76 TTGGATAGAGTACATAATTTAGCCAAGCAGTTGTATCTACTGACTCAGACTGTGGAAAATAAATTCAATGCCAGACGCCAGCTCCCTATTTTACATAAAGTATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:2 + chr2R 12543014 5' + roo 12 2 74.66 AGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGT:1 - chr3R 9190591 5' - Tabor 417 2 63.01 GTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTG:1 + chr2R 3338790 5' + Juan 66 1 61.64 CACAGCAACTTCGGCAATGGCAGCCAAAATTAAATAAGAAGAGATAACAACTAGGCACGGCCCGAGAATTCGAGAGTACGAGAGTACGTGGAACCACAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGC:1 - chr3R 5090621 5' + McClintock 130 2 72.60 AACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2L 15987980 5' - roo 9005 2 65.07 AATTTTTCCCATATTTTAACTTTTTATCAAGGCCATGAAAACCAGAATCACTTGAATGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chrX 957965 5' + roo 44 2 57.94 AATGTGTCTGTTTGTAGCGAAGGAATACATAGGCCAAAAACATAATATCTTAGGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 - 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chr2R 13644550 5' + Burdock 24 2 68.75 TCTGGGGATAAAGAACAATCAGAAATGCTGAAGGGGAGTTCTTCCTCCCAGCCTCCCATCTAGAACCCAACGCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCA:1 - chr3L 15028137 5' + opus 7418 2 58.93 TAGCAGGCGGTCACTTCTTAACCATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCTGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 - chr2L 16458648 5' - roo 8979 2 83.80 TTATTACGTGTTAACTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr3L 13827382 5' - hopper 1376 1 58.90 ATTATGTTGAAAGTTGCTCTGGCAGAGAATCATTTTAAGAATGTTTATTAAGCGCAGCTAATAGGATAAATCGAATAAAGTGTAAGAAAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTC:1 + chr3L 22043579 5' + R1A1-element 4865 1 75.21 ATATTTAAATTTCAAACACATATATATAGAAATTCGTACTATTTTTCTTCAGTGCATCAGTGTCTGCCGTTCCCCCTGGCACTATTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 + chrX 5858870 5' - hobo 2929 1 68.33 ATATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATA:1 - chr3L 12976349 5' + invader4 48 2 54.68 TACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGC:1 - chrX 10161179 5' - micropia 5373 2 71.85 AAGTGTTAGAATGAAGCCTACTTCTGTGCGTTTGCCACCCATCCATTTGGGTGGCAAACACTGTTTACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTTTTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 12867279 5' - roo 9021 2 51.03 GAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCAT:1 + chr3R 11750189 5' - Tabor 407 2 69.86 ACTAAAGTTGCGCAGTATGGCCACACTGATAATTCAAATATTTTGGCACTAAATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATT:1 + chr3R 11750126 5' - Tabor 7309 2 74.66 CTTTTAGATGGAGGTACTAATTAATTGAGTGCTGGGAGCCGCTCCATGGTAGCAAAGAAGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3R 31491028 5' + roo 63 2 60.96 GCCCGTTTGGGTACAGTGGTTCAAAAGGTAATCTATCTGATTGAAATTCAAAACAAATTGAAGTCTGAAGACAAAGCTCTTATTTCAATTAAAGGGATAGCATTAGCATCATCATAGCATCATTATTAAATTTGATTATCTACATT:1 + chr3L 2869101 5' - Penelope 353 1 30.82 GAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATA:1 - chr3R 9160773 5' - copia 197 2 53.42 AGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCCCTATTTTGGTGACGG:1 - chr2L 9668259 5' - 1360 3334 1 67.50 GGAAAGCGGATGACCGGCGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTCATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTT:1 + chr2R 21402601 5' - mdg3 5466 2 46.85 GAAACTTCGAAACGACGTCGGCAGCCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATA:1 - chr3L 22370866 5' + Quasimodo 87 2 80.82 AAGACGGCGAACCGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTT:1 - chr3R 9160796 5' - copia 5089 1 58.90 ATTCTCCATCGTTATTCCGATTTGCGATTAAATCAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCT:1 + chr3R 21276488 5' + BS 5012 1 70.55 GTAGCCAAACACCTCGTCATTAACTACTATAATAGGTAGGCAGTGGTTGCCGACCTCTCATATTGTTCAAAACGTATGTGTTCATATGATTTTGGCAATTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 + chrX 23431004 5' + Transpac 4929 2 74.07 TGATGGTGAGCAGGAACGAGATGACTCGCTGGAAAATATGGATTTTATAGGACTGGCACTTAACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGA:1 + chr2L 1566096 5' - 412 7460 2 55.86 GCCCGCCCACCAGGCAAGTCAAAACGTTTCCAAAGATGTGAAAATTATACGACCAGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAATGCACTGTTATAATAACAGCTGTTAAA:1 + chr2R 18477897 5' - hopper 1273 1 55.65 ATAGTTTTCCACCTGCTCTCGGTTAAAGTTTTTCCCACACAAGGCTTTTGAAATTTCAACTATTTACGGGGTGTATTAAAGTGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr3L 10133624 5' - 412 7514 2 57.14 GGTGCAGCTGGGGGGTTGCATCTGCTAGCCAAGCACAAAAACTGGGCCCCCAGCAGATAACAGAAGACCAGTGGCATGAGCGGTGTGTCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTTACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAA:1 - chrX 2773578 5' + jockey 4794 1 60.27 GCCAGTGCAGACCTCATCCTGCTGGACACCTCATTTGCCACATTGGTCAGTGTGGTCGGCGATAATACATACATACATTTTCCTAAACCTAATCTTTAAACTAAAAATTACGTCATTTACGTTAAGTAAATCTCTTATTGAGTAAT:1 - chr2R 22474611 5' - Circe 7002 1 58.90 GAGGGTGCCGGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr3R 27768790 5' + 297 44 2 52.74 ATTATAGAACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTT:1 + chr3L 2724955 5' + Ivk 22 1 66.92 ACAACACGTAACACTTAGAAGAGTATGCGAAGGCGACTACTATATGTACATCATGCATATGTACATGCAAGCCCAAACATATGAAGGAAGTGTTTCTGACCATATAAAGTATGAATATATATTCTTGATCAGAATCAAAAGCCGAG:1 + chr2L 21646265 5' + INE-1 90 1 56.85 CTATAAATTTAAACTTTATTTCTTAGATCTTCGATGTCAAGGAACCTTGTATTTGTGTTTCGAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2L 13250493 5' + opus 7022 2 72.41 TAAATTGTATAAACTTAGATCATTTTTACACACATCGTGCTGAATTTGTAATTAGTTATAAAGTATCTCAGCTTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 19537008 5' - roo 9024 2 51.37 CGAATCATTGTACAGAGAGAAAAATATTACGTTTCAAGTTTGAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTT:1 + chr3R 26519973 5' - FB 791 3 71.23 TAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr3L 23986547 5' + opus 7038 4 71.59 CATTCAAAAAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTC:1 + chr3L 9909683 5' - Transpac 247 2 57.53 CCTTCATTTATTACAATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr3R 16913462 5' + pogo 58 1 63.45 GAAATGCGAAAACAAACTACAAATTAATTTGAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACA:1 + chr2R 21080818 5' + P-element 2792 1 27.08 GTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAT:1 - chr3R 18994318 5' - accord 7027 2 69.51 AGCTGAGAGCGCGTATTTACCTTTAAACTGGACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGAATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr3L 7962312 5' + blood 7048 2 56.64 TGTGTAATACCTCTGTTGGGAAATGCCTTTCAGCTCGCTCCTCCTTCAATCTGCTCTCGGTCAGAAGCCACTGGGGCAAACAAGTCCGCCCCAATGGGTGTTCACACATGAACACGAACATATTTATAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr2R 6842725 5' + roo 26 2 68.28 GAATTAAATGAGAAAATTATAGGAGATAATTTTCCGATGGCACACATGGACAATGTCTCAGACAAACTTCAGAGTGCAAAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAA:1 + chr3L 24152419 5' + HMS-Beagle2 39 2 57.53 AGTTAATAAATTCATTAACTCAAACCAAAATAGAACTTTTAATGAATTAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAG:1 + chr2R 4312907 5' + gypsy 7008 2 68.97 GACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 - chr3L 7962282 5' + blood 7039 2 50.96 GGAAGTCGCGCCACGTAGCCATAATTAGCCAACTCGAGCTACAATGTTACTTGTAGTAGATACAGATACGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr2R 22305972 5' + pogo 34 1 58.91 GAACCGAACCACAAGGAACTAAGCTTTATAGCTCCTCCACGATTACAAAGTATGAAATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGA:1 - chr3R 9160788 5' - copia 5081 2 53.42 GCTGCTGCCCAGCCACCCCAACCAATTTGCATTTTACTATCGCTGCATTATATAATTAGATGATGAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCACAGTAGCGAGTGAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCAT:1 + chr3L 3967359 5' + rooA 7569 2 71.92 TTATGTGGAAATTTCCCAATGCTGACATGTTCTCCAAGCTCGTGAACCAGATTAACTCCCAAATTGGGCGACAAAGGATGCGCTGCCTAAAAATAGGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chr3L 1630232 5' + jockey 4689 1 70.29 AATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr3L 19349999 5' + jockey 64 1 54.48 CTTCGCTCAGTTTTCCCTTTTCCCATTTCCCATTTCCCCACTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTA:1 - chr3R 28172525 5' - hopper 1338 1 70.55 ATGAAAAACTTTCAAGAGTCTGAAACTAATTAACTTTGTATCCAGGAGATAAGCCTCTTATAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGCAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTTATTTTATCTTCATTTGGTTTTTATT:1 + chr3R 11113176 5' - mdg1 7393 2 56.85 GGAGGTCCTATCTTACCGTTAGCATAAATAGTTTTGTGTCTACGCCATGATGAAATAACATATGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGAG:1 - chrX 4701206 5' - P-element 2807 1 29.45 ACTCAAAGACCAAACTCACCGAAAACCCATCCCAAAAGTCTAACAAAATGTTGGATGAATGAAAGTACGAGTGGCGTGTGCATGTTTATTACCTCGAAGACAGTGGCTAGCTT:1 - chr2R 11236866 5' - BS3 1442 1 63.72 GAAAAGATACATACCTAGGGTTAGGCGTACAATTTATAGTTTCAGATGATTGCCACGCTACTATACTATAGTGCTCACAAACTGTAAAAATTGAACCCCCACACTTAAGTGAAATTTGTGTAATTATATTTGATTTGAATGCCCAC:1 + chr4 1135959 5' + copia 52 2 57.53 ATGACAACAATGTGGTCACAAAGACACTGGAGAAACTCCCACCATTTAGTGGCGTTTTTCTGGGGGTGCTCCGGTGGACAATCGCCCCGAACAGCCGGTGG:1 - chr2L 7560583 5' - mdg3 416 1 65.35 ATTCCGAATCCGATTCGATAAAATCAGAGTGGCCAAAAGGTCACACATTCTGGCTGAAAAGGTCGCCTTATATCGCCGGGAAACACAAGCCGGAATTATTTCGCGCACCACTATAGGCGAAGGA:1 - chrX 3020913 5' - gypsy12 363 2 53.23 TGTTTCGAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 - chr2L 13250438 5' + opus 42 4 68.14 GGACTGAGACTAAAACTGGTGCCTCGACATGAAGTCAGCTCATTGGAGAAATTACATTTACATATTAAAATATGCCAAATGCAAAAGCCAGACACGGCCAGAGGTCTCTCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCC:1 + chr3L 15367108 5' - roo 8709 2 73.97 ATAACATGAAGCATAAATAAAATTGGAAACGCTGGCAAAAAAAAAAACAAGGAAAGAATGCGGGAAAAATATAGCATTCCAGCGTCCGAGTAATACGATCTAACGCTCATACATAAGCCGATCGCGGAGC:1 - chr2L 18404697 5' + Stalker 171 6 55.38 TGGGAATTGGATTTAGATTTGAATTTGGCTGAGTTACATGGCTGTGTGCTTAGACGATTGTGCAAAACAGATTTGAGCTGGGCACAAACAAAAAAAAACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chrX 13395387 5' - roo 388 2 70.34 AACCCTCACACACACACACGTGCAAACAGGTGTGAGCTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chrX 4038860 5' - hobo 2909 1 62.22 GAATTTGGCTGAGTTACATGGCTGTGTGCTTAGACGATTGTGCAAAACAGATTTGAGCTGGGCACAAACAAAAAAAAACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 13395367 5' - roo 395 1 69.49 GATGGTGAGGTGAGGTCTGAAAGGGAAGGGGCATGAAGTGTGGGGCAAGGGGGGGCTTGCCAGTCCATGTTGTCTCGGAGTAGTGAAGGAGGGGTGGAGGGCACGGTAAGTACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCACGTG:1 - chr3L 13267673 5' - G-element 247 1 62.24 TAACGCTTACGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAATCCCTACTA:1 + chr2L 19817844 5' - G4 3758 1 71.92 TTCTGTTTCTGTTTGCTGTCATTTGCATGAGTCAACCACGAGTGAAAAGAGACAATTTCTAAACAAATAAATTCTATTAAATTCTATGCCATCTTAATGTTTGTTATATCTATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chrX 13531546 5' - roo 399 1 71.92 TAGCATACATTTTGGGGCATGTACTACTGTATGTACTGCATGTACCGTAGAAAACTACTTCTATTGCCCGAGGTTGGGTTTTATTATTTACTTGTTAATTGCGCTGTTATGATACTATTACTGCATTGTATGGATTTATCGCTTCT:1 - chrX 20266387 5' + BS 5072 1 76.71 GCACACAGTGGCAATAATTTTTGGGAGAGATCGTTTTTAGAATGTGTGTGAGTGCTATGTGCGTCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chr2R 21076107 5' + P-element 47 1 50.36 AAGTCGGAATCGGATTCAGGCATAACAATTTCCTGTCAATCAGAGCAACGAGTGCGACGAAATCTCCGCCCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3R 31490919 5' - roo 9037 1 56.92 CGTGGTTCATTCGAGGAAAATAATCAACATTTCAAATAAATGTATCCACATTTAAATTGTAATCATCATTGGCATGGGTTTGATTATGTAGATATATAAAAAGAGGCAAGTGGAAGTCAAGCATAAATTACTTAAAATATAAAGCA:1 + chr3R 25831994 5' + copia 5053 2 57.53 GAATAATTTTTCCCATATTTTAACTTTTTATCAAGGCCATGAAAACCAGAATCACTTGAATGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 957961 5' + roo 60 2 60.96 TTTTCAGTTGCGGAGTTGGAGGCACAGTTGCGATTTTGTAATCGTAAGCCAAGTGTAGTTACAGGGCTGCCATACTGTTCCAATTCTAGTCCAAAACCACTATAGTTCCAAAGAATATACAATAACTTAAAAAAGTTAAA:1 + chr3L 18078545 5' + HB 315 1 77.86 ATACCTACGACAAATCCTTGTAAATCAAATAATCAAATCTCGCCTCTATTTCAGTTCACTTTCCCACGGACCGGTCAGCCTCGGGCATACCCTGCAACTTCGAAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTGTAAAAACTTCTA:1 - chr3L 5817676 5' - 1360 234 1 67.81 CTGCGAGGGATGTATGGGATGTGCCATGTTGTTGCTGTTGCTCTTGTCCGTGGGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTT:1 - chrX 5838348 5' + flea 412 1 61.87 CTTAAAAAATAGAACATTTTTTGGTAGCTCTACAAAACTGAGTTATGTGCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCA:1 - chr2L 5601642 5' + mdg3 72 2 64.38 GTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTC:1 - chr3R 15022100 5' + Tabor 84 2 72.60 GGCAACAATAACAGGGCAACCCATTCATTTCAATAATATCAAAAACAACAACCAGGGCAACGAGTATAGCCAACATTAGAAAAACCCCCATCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTCTAGAAAAATCTA:1 + chr3R 11078530 5' + TLD2_LTR 138 1 62.33 CCATAATTTTATTTATTAACAAAAATATTGTATAATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 76178 5' - roo 9049 2 70.55 ATACTGAACGGTTACTTTCGAAACCCAGAACGTGAAATCAGCAATTCTTTCGAAAATATGTTTATTAGAATATAAATAAATTTTGTAAGTACGTATTTCGGAATTTATAGTGTTAAGTCTATCGCAAGCCTGTTCGGATGGGCACG:1 + chr3R 6851097 5' - Fw2 3746 1 71.92 GGGTGCCGGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCACAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 + chr3R 27768792 5' + 297 6626 2 51.72 GTTCGAGGATCTTGCGAAAGTTTCTGTCCCGATGGGGAGGCGAAAATGTACAAGCTATAGTCTAGTTCCCCGTCTATCAGATACCCGTTGCTCAGCTAGTGTGA:1 - chr3L 9457619 5' - INE-1 538 1 52.88 AATATAGTGAGTAAATAATTGTAGCTACAATTAAGCATTAATTAGATGTCCCACACCAACCTACACTATTATCAAAATACTTCATTAAAGTGGGTGTGACACTTTTAGCAAAAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACTTCCATAC:1 + chr2R 23491714 5' - 1360 3372 1 59.59 TATTGAACCGTGCAGCAAAGCTATGTGGTAAAGTTGGTTTCCTAAAAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAAC:1 + chr3R 15884304 5' + I-element 5056 1 68.49 TTGCTACTTTATTTTCATTACGACAGAACCTCTTACACACACATATATAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 - chrX 10974417 5' - opus 442 2 67.91 ATAAAACTGAATATAATTTCAATATGTTTTAATTACACTTTGAAGTACAGTCGAGTCACAAAAGCTATTATACAGTTCGTCTGTGGTATAACTTAATTTCACGCGCTGGTACTATCTCTAGCTGAGAAACGGGTATCT:1 + chr4 423184 5' + INE-1 542 1 77.54 CTGGGGAACGGCGGATTCATTGAAACCTGAAGCCAGAGGGTAAAGTCCCAAATAAGCAGACTTTAATCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 23765381 5' - 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chr3R 4528420 5' + F-element 40 1 55.56 GAATGGAGCAATGAAGGAGAAAAATTTCGTTTGAGCTCGGTCTGATATCTGAAATATAGCAAATATTCATTCTATTATTCCTTTAATTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAG:1 - chr4 1132111 5' - Ivk 5337 1 58.90 AGAAGGGGGTGGAACGTGCACTTAATTAAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr3R 22100486 5' + 412 39 2 60.96 GCAGTTCTGTTCTTTGTAATTTCCTAGGAATGGCTGAAGTTCCGAGCTACCCTTAACCCCTACCCTTTAACCCTTACCTGGGTGTGGGGGTAGCACAACACAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 30635082 5' + roo 20 2 38.36 AACAGAGCAATAAATTGACAAAATGTTCCAAAGAAACTTAAATTGGTGGAATAATTTGAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATAT:1 + chr2R 5917774 5' + I-element 5068 1 64.38 CACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 14553110 5' - roo 9016 2 60.90 CAAATAAAATTTAAAAAAACGTGCCTATTCCTTGGCCTCATTGGATCATAAAATGGGTCAATCTATTACTTGGAGCTTTTTTAAATTTCCGTAAAAATGTGGACTATATATTTTATAAATTACTTATAATGTTTTTTTTTTTGTTA:1 - 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chr3R 20486427 5' + accord 6 2 65.56 TACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAG:1 - chr2L 23084406 5' - accord 7355 2 53.70 ATTTCCGGTGAATTAATAACCAAACTCACCTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 14076307 5' - roo 354 2 54.79 GATGAGCTAATGCCAGATCCTGTCCAGTTCGCCAATTTAATGACGAGCTGCCCACCACCTCCGCCTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGT:1 - chr3R 4328848 5' - 297 6497 1 55.17 GGATCGTTACGAAAATATATGTATGTTGAGTGAACTATTACTACTAACAAATAATAGGTGTCTTAAGCTCAAAACAATATACATAATTATGTACATACAGTTTGTCAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATAT:1 + chrX 4292818 5' + roo 342 2 66.44 CTTTTAAATGTAAAACTAATAAACAGGGAAAAGAATAAATCAAATTTAAGTTTTTTTGATCATCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr3R 17546712 5' - blood 331 2 52.99 CTTTGCTGTCCTTTTTGCATTTCAGAGCGGGGCTTTAAAGTTCATGGTTGATTAACTTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGCCAT:1 + chr3R 24476279 5' - 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chr2R 19352084 5' + Burdock 6173 2 58.62 AAACTAGAAAATGTAATACAGTTTAATTAAGATTAACATTAAAAACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGACCA:1 - chr3R 11750309 5' + Tabor 6864 2 69.18 GTCGAACGTTTGGCAAACTGAAGATCGGACACAATTATCCGGTGGCTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 + chr3R 11057571 5' + flea 4797 2 59.13 ATACGCGTTCTCTGTCTCAGATGTGTTGGCCTTTATGTTTAGAAGGTTTGGGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCTAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2R 4160412 5' - pogo 2033 1 65.97 AACATCTTATCAGAGTTGACATTAGAAATTGAGTTTTAATAGTTCATCAATTACACTCGATAGTACTTAATATTGATTGTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAG:1 + chrX 889886 5' - Bica 98 1 57.53 GGATCGTCTTCGTTAGTTTCCAGTTCACCCAACCACTGATCGTATCGTCCTTTAAAGCTGCTCCCGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr3L 17890867 5' - 412 7539 2 78.36 AAAATGCACATTTTAGTTATAAATGTTGTAAAATCTCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr2R 8305274 5' - roo 403 1 62.26 AAGTGCGTTCCCATCGATTGGGAAAGGCAAAGGTGTGCAGACAAAGGTTGAATAAAGTTGCTCGACTTTTAGATACCCATTACTCAGCCAGTGGAAGTGCGGGAAAGAAAATCTGATAGACAAAGAACTCGACTATTGCATTCTCT:2 - chr3L 21427047 5' + INE-1 574 1 60.96 ATGGCAAATGCATTAATGGCATTTTAATGTTGAGGTATTCCAATGGGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATATTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3R 30634940 5' - roo 334 2 65.07 AATAATTTCTGGCAACTGTTTGGTTACTAGAGAATAACATTATATAAAATTAATTCGATATTTCTGTGTGTTATCTTAATGTAGAATTTAATTTTGTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr2L 8956877 5' - pogo 2079 1 62.33 GCGGTAATCTACACACATTCAATCACTACCGTTTGGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTACAACACCA:1 - chr3R 4562397 5' - copia 5039 2 76.03 ACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr3L 22400288 5' + 1360 52 1 69.72 CAATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 + chr3L 14062244 5' + Doc 89 1 70.55 GCGTCTGCTGCCTGTTGGCATACGCATACACTGAAGAAATATATGTATTTGAAACGAATTTAAATGATTTACTTGCTAGAAAATAGTATAGGTATAATTTCGACAAGATTTTGCTAAGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAG:1 - chr3R 17304396 5' + Cr1a 4240 1 69.18 ACGGCTTCAAGCTGGTGATTACGTCGGTGAAGGATCCCAGTAAGTGCTGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGT:1 - chr3L 11737802 5' - G2 2697 1 63.70 ATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr3L 19349989 5' + jockey 86 1 65.07 TAACCCTTCACAACAACTTCAGCTGGACAAATTAAGAAAATTGAGTATATTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGTAATATCTTCGGTTTATATAGGTGACATG:1 + chr3R 17305454 5' - roo 337 2 63.70 CGCGGAGCTAAGAGGTTTCTTGGCAAAAAACTAGGCCGGGAACATTATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGC:1 + chr2R 4638604 5' - 1731 4551 1 71.03 AATTTCAAGTGCAACCGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3L 14553233 5' + roo 31 2 65.07 CTTCTTACACATGTGCAAAAAAAACTGTGGCCCAACTGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCCGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTT:1 - chrX 2578073 5' - hopper 1331 1 72.60 AGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chrX 12866488 5' - roo 9011 2 60.69 ATCTCAAAAAATTCATCTATCTATTTCATGAATGCATTCTGCTGCATTCATTTTAAATCCGTTTTGAAAGTTTTTGACGGTTTTAAGGTGACAAGACGGTTTTTTTGTTAGTTTTGGCAGTCACAAACAAATAATACAAACCACAC:1 + chr3R 28349568 5' + Transib-N1_DM 225 1 47.26 TTGGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACACATCATC:1 - chr3R 9352115 5' + Tirant 8135 2 63.85 GAAAGCCTTGCATTAACGACACGACATCAGATTAATAGGGATTATCTGCTGCTGCAGAGCATTGGCACACACACACACACGCACACACACACACACACACACACACATGTGC:1 - chrX 20076267 5' + accord 7031 2 68.75 CAGTTTTAGGCCAAATTTTATCACATTGATGTGCCATTCCAAAAAGAAAACAAAGCAAACCAGTTCATACACCTAACAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr2R 8395881 5' - pogo 2059 1 55.48 CCACAGGTGTGCATGTGTGTGTGTCCCCCATTGTTGTTGTTATTGTTGCTGGCGCTTTATTTGCACAGTTGGCCGCTGTTTTTTTTTTTGCGTGTGTTTTATTTGGCGTTCACCTTACTCAAAACAACCGATT:1 + chrX 12498267 5' - F-element 60 1 75.94 TAGTTTATTTTATTGACGTGTTCTTATAGTCCTGACAAGGACCTTGACATGTGATTTGCCTTAATTACAGTGGGACAGGCCCATTTCGGTGGAACACTCAAACCGATATTGCACACAAGAAAAAATGAATATAATATAAATATATT:1 + chr3R 13439540 5' - gypsy7 5066 1 56.16 GCTCTCATATGCAGTATCTGCCCAAAAGTATGCATTGGATATGACACGAATGCACTGAGTTGGGGAAGAGTAATCCCTAAAATTGACCTATAATTTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2L 3762882 5' + jockey 30 1 63.89 ATTTATTACAATATGAGTAAATAATTTTGATATTATTTACAAAATTATTGATTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr3R 16913457 5' + pogo 64 1 67.12 GAATATAGTTGCCGGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 - chr3R 4528449 5' + F-element 14 1 77.48 TGCACCGTCTTGTGTCAAGTAATTTGGGTTCTTTGGGGGATGGTCGGGATATATGTATATATATATGTAAGTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 + chrX 6138610 5' - opus 7463 2 61.03 AATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAAT:1 + chr3L 23456278 5' - gtwin 415 2 66.67 AGGAACAACGCGTCAAGTACGTGGTCTGGGATTCAAATTGGTTTGTTGAGGCATCCACCGTCTATATATATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATC:1 - chr2R 12543174 5' - roo 359 2 53.47 GCTTGCTTTGAAAAGAGCCGAAATCTGAAAAACCCTCATAATTAGAAACTTCCTCAAATAAAAAAAAAAGTTTATTGGTCTTATAAACTTCTGCCGATATAACTTACTGCCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGAC:1 + chr2L 18902705 5' + INE-1 561 1 91.10 CACAAACAATCTTTAATTAATTAAAATTCATTGCAGTCTGTCTGGGCCAGCTCAAAATCACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATG:1 + chr3R 11076879 5' + flea 4717 1 52.80 AGCTAAGCAAATACTTTTTTTCTCTGCGGCAGCATCATGTAGTTAATTATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:1 - chr2R 14047695 5' - mdg1 7375 2 73.29 ATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 - chr2L 22015978 5' + Tirant 8159 2 73.39 CGCCAGTTTGCTTAGCCAAAATGTTAATATACGCCCAGCCCAAACAGAATTTAACCCTGCGGCACTCGCACGGGAAAACGGCAAAGAGGTCCTGCTAAATATTTGATTAAATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGC:1 - chrX 863535 5' - pogo 119 1 73.97 TGCAAGCAGTCGTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTT:1 + chr2R 12787809 5' - 297 6913 2 65.75 ATAGAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTG:1 - chr2L 21403571 5' + G5 4423 1 51.43 AACACTGCTGTTAATTATGTGGATAGTAAAATTACAACACGCAGAACAGCAGCTAAATAAAAACTATCCTTAATGTTTTGATTGAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr2L 16399437 5' + roo 36 2 54.79 GTTAAGGGCTGGTGGGAGGGAAAAATCATCAATCATATTTTCTGCATAGCTGAATCATTTGCGCCGATCAGTTGGGGTTACTTAATGGGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr2L 12553542 5' + 412 31 2 63.89 AAGGAGTTCATCGCCCCAGTGATCTCAAGTGATCACAACTACACTTTGTTGCAATGCCGACTCAGCATTGGATAGGATGTCAATAATAATAAACATATGGAACTGCCGCAACAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTG:1 - chr2R 5400640 5' - Stalker4 7315 4 57.53 CCCAACACTTTCTCCCTCGCTTTTATAAATAAACAAACAACTCTATTTCATTTTTTGTTATTCGGGCTGGATTCGTGGATTTTCTATTTATTTGTTTAGTAAACAGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3R 7035387 5' + roo 8680 2 74.66 AAGAATGCGGTGCAGCTGGGGGGTTGCATCTGCTAGCCAAGCACAAAAACTGGGCCCCCAGCAGATAACAGAAGACCAGTGGCATGAGCGGTGTGTCACACCACCCTCATGACCTCCC:1 - chrX 2773586 5' + jockey 4758 1 81.36 TTATGGTCCACTCTTTCGAGAGTGGAAGTTAAGAACCAAATGCTTTTGGCTTTTAAGGGTGTTGGCTTTTAATGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:1 - chr3R 28627705 5' + copia 50 2 53.42 TGCTGCGGGCATTTGTTGTTTATTGATTGTTGTAGCCTGTCTTGCTTTAAGTCGTTATCATATCTGGTAGGTAAAAAACTTGACACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCAGTGCG:1 - chr2R 12645278 5' - Doc3-element 428 1 52.34 GACTGTGCCTTGCATAAAGGTTTCAATTTTGTTGCACATTTTTTCAATAAATTTAACACACTCAAATTGCACTTCAGCATGAAGAAAACATGAATTTTTTAATAGACCATGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chr3L 18467128 5' + hobo 7 1 79.45 GCTGCCGTGGGAAAAAGTGTTGCATACTTATGAGTGTTGGCAAAGAGCTCCGGAATGAAATGTGAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCT:1 + chr3L 17133800 5' + jockey 4747 1 56.16 CAATGTTGTTTGCCCTGGGGGCAGCGCCTTTGGTAATATTGTCACGTGCTTGGAAACTCTTATATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTATTATGCTATTTTAT:1 + chr3R 22089273 5' - 412 37 2 55.48 TTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGAC:1 - chr4 829117 5' - INE-1 145 1 63.31 GGTGAGTTGTGGTTTTTAAATTAAAAAGAGCTTAAGAAAAAAGTTAATATCCGATTTTGCATACTAAACAATACGAGAGCGGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTTTCGAATTTTTG:1 + chr3L 10332800 5' + 1360 82 1 59.17 AGAAGGATCTACCAGGATAAGCTAGGGATAGAGCACAGAACATTAACTAGTTGCATTAAATTAACCAAAGGCATTAAAAAGAACTTAAACTATTGATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 + chr2R 14047587 5' + mdg1 7066 2 62.33 GATGGGGTATGTGTGGCGTCATTATATAATCAAATCAAATAACAATTTGTACTTTGTTAAATTTCTTGTCGCCCTCGATGGCTGGCTGTCTTTGCCTCGAAAAAATATGCAAATTTCCAGTATTT:1 - chr3R 6014061 5' - hopper2 1558 1 64.80 ATTGGTCTCATGTCAGGAATAGATCTTTAATCGCATTCAAATTGCATATCAAATTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAAT:1 + chr2R 8158747 5' + Juan 58 1 47.95 AAAAGTTCTTTATAGGCTTGGAAACGGTACTAATTTTTACCTTTAAGCCCATCTATATATGTAGAATTTCTTATTTTAAAAGTATACAAGAGAAAATAAAAGTTAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2L 19100643 5' + TAHRE 10441 1 33.33 ACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAATAAGAAGAAGCAAGAATTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCTATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCTC:1 - chr2L 22211545 5' + INE-1 134 1 69.86 GAATCGAAGCCCAAACTCCCATTATATTCTCGGAGCAGTCGCGACAAATTGATCGAGAGAGCCTGGAGCCATCTATAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGT:1 - chr2L 17962851 5' - 1360 6 2 63.64 GACCAGATCCTGACTCTAGAGGACGAGGTGAACGCGGTGGTTAAGCGCAAGACCCAACTTAATCACGACCGCGATCATTTGGAGAGCGAACGCAAGCGCATCTCGAACAAGTTTGCCATGAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGT:1 - chr3R 23187996 5' - Tc3 1631 1 79.45 AAACGCTCCACTAACATGTCTATATGTCTTGGAAGGGAATTCAAACACCCAATCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTGTCGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chr3L 14551087 5' - P-element 2868 1 64.75 AGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCT:1 + chr3L 24213775 5' - invader2 175 2 67.12 TCATTAGAGCATTTAACAGGAAACACGTGACGCTGCATAGCATCCAACATGCCCCTCCCCTTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 16562849 5' - roo 9015 2 57.45 CATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGG:2 - chr2R 1949126 5' - Cr1a 4419 1 74.67 CAATTCAATCAACATCAATCAATGTACCAAACACTAACGAACTACGTATTAACAACTACGGCAACAAGCGCGCTACCAGCAGCAGAATATCTGATGCCATTTGAATGGGATATGATTTTTGTTTCCTTTACTTTGCTTTTATTT:1 - chr2L 8429715 5' - F-element 4671 1 76.39 TTTTGCAGTGACAAAAGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 + chr3L 9907347 5' + jockey 67 1 55.48 ATTGCCGCCACAATTGGAGAAAACGAATGGAACGCACTCTTGTTCCTTATTCGAAAAAGCCCACATAATGCGATGACCTCCTTTTCTGTTTACTTTGTTATTTTATTTTATTTTATTTT:1 - chr3R 23373945 5' + transib1 1898 1 68.07 TAAGTATCTGAACAAAATGCAAAGCTGCCAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chrX 7786605 5' - hobo 2924 1 57.97 GTAAATATATATACAATCTAATGTATAAATATAAACATAACGATTTAACAGAACATAATCAGGGTCAATTCCCTAGAAACTCGTTTATGTTAACAATCATAAAACGTATGTTTAATCATATAAAATGGTTATTTTAAAAAGAATT:1 - chr3R 13353461 5' - Tc1 1495 1 68.97 TGACAACGACAGCCGCAGTCGCAGCAGTCAGTGACATAAGTGGGCGTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTC:1 - chrX 6138755 5' + opus 17 2 71.64 GATGGCTTGTTGAAGTTGGAGGCCTATGCAAAAGCAAAACATATTAGTATCCTTTTCACATATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACGGCCAAAAT:1 + chr3L 4115120 5' - 1360 3327 1 58.90 ACAGCGGCACAACGCACACAACGGTAATCAGTGACTGCTCAGAGAGAGAAAGTAACGTCTGTTTGAAACGAGCGCGCCGTCGCGACTGTCTCAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chrX 8891717 5' - P-element 2857 1 65.07 GCTGCAACTTTAGTCTTTACGAACTTTTAAGTTTGACATTTCCATATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr2L 12349722 5' + F-element 59 1 66.18 CTTCCCTGTACATCTTAGCATACCAACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACT:1 - chr3R 26246904 5' - 1731 260 2 54.29 AGCTTTAGAAATTAGAGGAAAAGCTATTGATAATAAGGGCAAATAACGTTGTTCAAAAAAAGATACAATATCATTGTTTATCAATGTATCCAGTGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTGTCTATCATAAT:1 - chr2R 1343532 5' + I-element 5342 1 59.59 GCCCGGATCCTGCAGTCCAGAGCCCGCTGAGGAACTCGACTTTAGGGTTCTCTCTTCCATTTTTTATGTATTTAACAATTTCAAGGGTACATATTCTTCGATTTGGCGAATATGGCTTTCCTTTTTGTTTTTTTTGTTTT:1 + chr3R 27862915 5' - Doc2-element 224 1 62.86 GAAAGAGAACCATCAAAAATTAAAAAAAGAATCAGACAAAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 19449738 5' - roo 325 2 76.71 TAACATTAAAAACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:1 - chr3R 11750276 5' + Tabor 6895 2 55.56 CACGGTGTACCTAGCACACTGGTATCTCACGCCCGCTCGGGTACAGGGTCAAACCTATTTACCGTTAGATCACGGAGCGTCCTCTTAGTGCGTCTTCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTA:1 - chr2L 22524661 5' - gypsy8 4874 2 50.40 CGAATGAACCCTGTTTCAATCATACAAGCGCACATTCAAAATTCCTAAAAGCGGCACAAAATTTGTTATATCCTTTTAGTAATATTCTTATGTAACAGGTAGAAGGAAGGAAGGATTCGCATTCGCATTTCCACTAGCTGAGTAAC:1 + chrX 22545250 5' + INE-1 534 1 70.55 GGTTTTAAGTTGCTTGTAATAAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr2L 4173935 5' + roo 8694 2 64.58 TGTGCCCTGCCATTCAAAAAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACG:1 + chr3L 9909673 5' - Transpac 5177 2 50.34 AGATCTTCGATGTCAAGGAACCTTGTATTTGTGTTTCGAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTGTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCTGCTCT:1 - chr2L 13250469 5' + opus 33 4 60.00 TATGCTCTACAGAACCATATATGTGGTCTATTAGTTGGGCGACTGTTTAAAACCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chr3L 12224710 5' + 412 30 2 53.27 ATCGCTCTTGGCAGCATTCACAAGTTCAAATAAGCGATAATAAGTATTTATGGGCGGGGCAAGCAGATTCGGTTTCTTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 - chr3L 13634327 5' - 297 375 2 70.00 GTAATTATCAGTTTTGTGTGTTTTTCTGCCTTGGAATTTATTCCCATTATGTAAGTATGTAATAGGCAGAAGGAAGCGTTTACGACTATGTAAAGTATATACAGCTGTGTTAATAAAAGTATCAGTGCTTTGGACCTGAGAGTTTA:1 + chr2L 21917889 5' - HB 1604 1 72.60 AAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGACTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGAG:1 - chr3R 11547807 5' + G2 305 1 62.68 AGTTAGACGTATTTGTAATTTATGCTCCTAAGACCTTTTGCTGATTTAAAGTATCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTT:1 + chr2L 5601557 5' - mdg3 186 2 58.27 AATTAAGTCAAACAAACAAAACAAATTCCCCGAACTTCCCGCATTGAAAAGCCTTACGAAATCCGACAGACGAAAGATGAATGGAGAGGCCCACTTGAGATGATGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 - chr3R 13612945 5' - 412 481 2 75.00 GACTAATACATATGCAAATGTCAACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGCTGAATTGGTGCATCTGACATTTAAAACACGTACGTAAAATTTCAAGTAAATCGCACCACACCCACCCATAC:1 + chrX 22906771 5' - transib3 2744 1 68.57 TCCTTTTCCCCTAACCTTTTCCTTCCCGTACTGTTATTGCTGTTCGCTAATATGTTGGTTGATGTCATAGAGGGGCTACTGTAAAGTTTTGTTCCGACACGGTTCAGTCGCCATCATGCGTTGGAATAGTGAGGAGCTTGCCTTT:1 + chr3L 24258267 5' + mariner2 142 1 63.45 GACCCCGTTTCCGTCAATCAATCAGACAAATAAGAAAATTAAATTCCGCATTGGAATTAATTCAAAGTGGTATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chrX 10645109 5' + jockey 10 1 78.91 GGTTTCCGGATTTGATTGAACTTGGCGGAAGTTGATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACTTCACCTT:1 + chr3R 29733043 5' - opus 458 2 64.42 ATTACACACGTAAGTGGCACAATTAGTTTGACATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chrX 12138960 5' - roo 320 2 79.45 GTATGTGGAAGCACTGGAGCTCTTTACACGGGATCTCAGCGTTTTAAGAATGGGATGCCAAAACACTTTATAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 7539421 5' - roo 9048 2 63.11 AAGTTGAAAAAAAAAATTTTTTCCTCTCAGTCTCCGGAGAAGCAGTTTGAGAGCGCCGCGGGGCAGCACATTGGAGGCTCGAGAGAACCGCAGTAGCCAATGATTCATCAGC:1 - chrX 2386001 5' - X-element 349 1 58.04 GGAATGTGTGAAATGTTACTACTCCAGTTGGGTAACTTCCCAGCTTAAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGC:1 - chr2L 21916942 5' - 1360 62 1 63.43 AGCATAGAAAATCAGCTCATTTGCACATTGGTCGTAAGCTCTGACGAAGTCTGACTTCATAGTCTAGATGTTGTGGGTCACAGAAAATTAAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGG:1 - chr2R 12265269 5' + jockey 4543 1 67.41 TTACATGTCTCATGCGGTTATACTACGCTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAG:1 - chr2R 5737181 5' - 1360 3299 1 80.56 AGGTTTCACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 14553092 5' - roo 9021 2 53.42 ACCAACAAATGCAGAAAGAGAAAGCTCAGTGGTATCATTGGGATCCCCAAGCAGTGTTTCTTCGCATTAATCAAAGAAGTACAAATTTCAGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGTTTTTG:1 + chr3L 25911965 5' + looper1 1515 1 78.77 CATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTAT:1 - chr2R 17890948 5' + Tabor 67 2 69.77 GCAGGAGGGGTGAGGGGACACATATTGGCCACAATACAACATACACTACTCCGGATCTACCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCC:1 + chr3R 31909468 5' + Idefix 183 1 77.40 TTTGATATTGATATTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chrX 4778137 5' + 412 7075 2 69.18 AACCTTTTTGTTCCATCATTTAAGGTTCACTTAAAAAATTACATCAAATACACGACATTCTTCTTCATAGAACTAAATTTTCATTATGTTTATAAGTATGTATATGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGAGAGAAAAGAATGTGG:1 - chr4 116264 5' - ZAM 8118 2 59.59 ATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1 + chr2L 17136152 5' + hobo 71 1 64.38 ACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTACAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATATGAA:1 + chr2R 5214980 5' + F-element 97 1 73.29 CTTTTAAAAAATTAGCATCAGCATATGAAACCAGTGCACTGCAGTGTTTGGTACTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chr2L 17136234 5' - hobo 2924 1 65.96 ATCTGCAATGTTAAAAAGAGATGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTAC:1 - chr3R 9160732 5' - copia 156 2 81.51 GCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATCTTAACGAT:1 - chr2R 6526604 5' - jockey2 3322 1 54.48 ACATAGCCAAACACAATGGTATAATTTGGTGCGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 + chr3L 40513 5' + Tirant 30 2 62.50 CACATTCAAAAGGCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2L 246099 5' - roo 9016 2 56.85 GTCTTGTGTCAAGTAATTTGGGTTCTTTGGGGGATGGTCGGGATATATGTATATATATATGTAAGTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGTATCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chrX 6138616 5' - opus 472 2 56.78 GTGCAGATGAGGCTTATATAGCGACTAAACAGCGCAGGCTAAGGGCTCAAACAGCCAGAGACTTCGGCAACCGAAGTTGTCCACCTTGAGGGGTTTTGATAAGGCAACAGAGACTATTTGGAGGAAGACGGCCAGTTGT:1 + chr3L 16319533 5' + Osvaldo 388 1 77.70 CTATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGA:1 + chr2R 961127 5' - transib2 2674 1 62.59 GTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chrX 14964631 5' - roo 8993 2 76.55 CGTTCCACATCGAAGCGACTTTTCACTCCGTGCTCCTGCTGCCGCCATTGAGTGTCCTCTGATGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTT:1 - chr3R 26520473 5' + FB 48 1 53.73 AATTAAATGCCGCAAATGCCGCGAAAACCTCTGTTGAAGACATTTGTTTGTTTTTCTGCGTGTAGCCCAAAAGTATAGTTTGTTAAACACGAGATTAAGGCAATGCGAAACAAGAATTTTATACATGGTGCCACTTGATCAAAAAT:1 + chr3L 21296676 5' - 1360 263 1 65.75 AACGTAAAAATACAATACACTTAGTAAGAATGTATTAATGTATTAGGTAAAATTTCAAATTTCGCGGCATGTACTGCTTGTGTGTTTGATGCACTGCTTGGACTGCTTGCAAGCATCTGGCGCCAAATTTAAATTTATTTTTAAAC:1 - chr3L 9824516 5' - NOF 3955 1 59.59 CCATATCATGGTTCCATGGCTACCATTTCTTTCGGGTTCGCTTGGTACTTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 + chr2R 11489187 5' - mdg1 355 2 67.63 AATTTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 + chr2L 17250699 5' + opus 7161 4 52.08 CGTTGAATATTACCGCCTCAACAGGCATTGGTACTCTGCTAACGTAAGCAACTAGTGGAAATGAATAGAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAACTTGTACTAT:1 - chr3L 12976355 5' + invader4 2808 2 50.00 AAATTATGAAAAATTTCAAAAAATGGTTCAGAAGTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCGTCAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACAGAC:1 - chr3R 10573661 5' - INE-1 125 1 56.16 GCAAGACAAAAGCCCGTATTAATTACACAACTCATTTGTTTTTCGTGAGCACCGAAACACACCAATGACACAAAATCAATAGGCAGTCCGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr3R 18816004 5' + hobo 32 1 65.75 GCCCCCCTGAACCCCCTTTGAAGGCCAACAAAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 14137485 5' + G2 3076 1 85.71 ATTGTTGAACATTTCTTTATTGTATCTGCGGAAAATGTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chrX 1103758 5' - pogo 2093 1 78.52 GCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAAC:1 - chr2L 1259992 5' + Burdock 6209 2 73.72 TATCCACAGAAGAATACTAATTCTTACTAATTCTTTATCTTGACAATGTGGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTC:1 + chr3R 2555457 5' - Bari1 1674 1 63.01 GGGGCCATGGGGATTGGGGACTTGGAGCTGAGGGTCACTGGACCCTCTGCTGTTTATAATATTTTTTAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAATCTTCT:1 - chrX 14710436 5' + Ivk 442 1 58.77 GAATTCAGAGCATACAGTTTTGGAGCGACTGAAATGTGATAAGAAGCCCGGCTACAGTTTGAGTAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTAT:1 + chrX 15137375 5' + jockey 4555 1 50.00 GGCTTTAATATTTTTATCTAGTTTGTCTATTCATTAAAAAAAAAATGGTTCAAAAATAAAGTGGCCAACTAACAAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 17305564 5' + roo 8710 2 52.74 GATTTACAAGGACACTGTGCAATTGAAGCACTCCTCCATTTTATTCCTTCCCTGTACATCTTAGCATACCAACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACAC:1 - chr3R 26246950 5' - 1731 300 1 69.86 ACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 + chrX 1103618 5' + pogo 56 1 64.44 TCCTTAAAAATCTTAAAAAATAGAACATTTTTTGGTAGCTCTACAAAACTGAGTTATGTGCAAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGC:1 - chr2L 5601653 5' + mdg3 61 2 56.85 AGTCACGAACAAAGTGTACGTGCTTCTACGGGCACATGGAAAACCCATTGCTTAAATCCAATGTTGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAA:1 - chr3L 24152551 5' - HMS-Beagle2 7142 2 55.48 GATTCGCACCCAGTCCAACTTTTACTCAGGGGGACCCTGATTCATTTGAGATTTTCCATCTTAATTCTGCGCGACCTTGAGACACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAA:1 + chr3R 30704840 5' + roo 385 2 56.16 TCTATTGCGTAAACTGAAATTTAGCCAGTCTGTATATGTAGTTCCGGTTTCCGGATTTGATTGAACTTGGCGGAAGTTGATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr3R 29732998 5' - opus 482 2 68.80 CAAATAATTTATAAATAAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGT:1 + chr2L 11574791 5' + Max-element 36 2 59.72 AAGCCCGAGCCCTATGCCACATGCCCCGAAAAGTATGCCACGTTGTTGTCGTTGCAAGTCTCGCCTCTTACGCTTTTTTGTTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 + chr2L 3395662 5' + jockey 4687 1 65.00 AGAACACCAGACAAACAATAAAAGTGGCAAAAGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAGGAAGACGAGCCTGTTATTTTTTTCGACTATTGTATTAATTGTAATGCATTTT:1 - chr3R 9190622 5' - Tabor 7324 2 76.15 GGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3L 23146491 5' + 1360 53 1 65.25 ACAGCCGTTCCCAGTGACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr2R 23442980 5' + G2 3077 4 79.49 GATAAGATTGTAAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGT:1 - chr3L 27415345 5' + transib2 30 1 64.83 GAATCGGGAAGCAGAACATAAATGTGTCTGTTTGTAGCGAAGGAATACATAGGCCAAAAACATAATATCTTAGGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCA:1 - chr3R 15338139 5' - blood 349 2 58.40 ATTTATTTACCATGTTACCATTACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTCCTATAT:1 - chrX 10161200 5' - micropia 398 2 58.22 AAATGCTTAGTTGTTGAAATTGTTAAATACTACGATATATAACTCATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAACACTCTTATCAGCAAAATCTTGAT:1 - chr2L 2698433 5' + I-element 74 1 67.12 CATAACAACAACAGAGATTGAACATTTATAAACATTATTCATAATAATACATTTTTAATACTCGTTTTCGTGATTTCATAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:2 + chr3L 23986492 5' + opus 38 4 54.79 GCTCCAACTGCATTAGCCTGCGGCTGATTGCGGAGATCCCGATTGCAGCATGGACTTGTCTGTGATTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAACAT:1 + chr3L 10092124 5' - 1360 263 1 57.53 GTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 - chr3L 22400325 5' - 1360 3330 1 76.36 TTTGGATTATCAGTATGTATGCGATAAAATGAGGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3L 13374247 5' - pogo 2069 1 59.59 CAGCCATCCGCCACAGCCAGACGGATTGTGTGCCACTTTGCAGGGGTTCACTGTAGACCACATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGA:1 + chrX 9707137 5' + Doc 67 1 63.01 TGGTCTAGAATTTGGATTATCAGTATGTATGCGATAAAATGAGGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAGTCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr3L 13374257 5' - pogo 2079 1 65.07 GGGTGGGTCCTTATCACCTTTGACGGATTGGCTCGCGCCATGCAAGCGCCTTTTCTATTCTTTTGATGCGCGACAGAGAACCGTTACAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGGAGGAGCGGGGGG:1 - chr2R 8713235 5' + invader1 3734 2 76.15 CTGGAACAAAATGGCAGCGGCGGCCAATGACAGTAATTAAGGAAAGTGCAGAAAAAGTGACTGACACTTGGTAAATACCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr2R 6842878 5' - roo 9029 1 57.53 ACACCCGCGCGGTGAATTGATCTGGCTTCTGCCCAAGCAGTTCCGAGTTCAACTCACAGTATTTTGAATTACAATTCGGTTTTTGTTTATTATAATGGGTAACTACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATTATAAAATTTACTTAT:1 + chr2L 5099195 5' + G4 3800 1 61.64 ACCGTCATTGGATCACATTGGAATATTTTATTGGTGCTAACGCAATGAAATCAGAGCAAATACATAAAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 - chr2L 12319349 5' + copia 4913 2 52.90 ACTTGCTAAATAATAGGAAACAAAAAAATATGCTAGTGAATTGGCATACACACTTTTGAAATTTTTAATTTAAATTTTTATGATTATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr3L 23325952 5' + pogo 26 1 66.19 GAATGGCGACTTTGGAGTATGGTAAATAAATTAGCTAAGATTTCAGTCCCTAGAATGGCCACCCGCTAGAGCCTAGAGTTGATTCAATATTTGTGCTCTTTAGGGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2L 685942 5' + roo 18 2 70.55 AGTTCAAAGCGTTTGCGGTGCCACACTTACACATTTCACTGATTTTCATTTATAATAATCACTTTTCCATTGCATGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGTAACACGCCACGTAAAACAAGCTCG:1 + chr3L 9410467 5' + R1A1-element 5313 1 53.24 CTGAATTTGTTGCTCACTCGGTGAGCCCACTTTGGGCTGTCATTTTTGCGGTCAACACTCCCACTAAAAACCAAAAGCCCCATGCAAAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 - chr3L 10144779 5' + blood 7046 2 62.33 AAATTAATGCCTCATAAAATTCAACTAAAAATATTTATTTCTTATCCAGTTTCGTCGATTTTAAGCTATGCATAATAAGCTATGATAATATAAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACTACAGAAATTCCTTCTGTGATT:1 + chr3R 12929155 5' + invader4 2783 2 68.49 AATTCGTTTTCTCTTGACCTTCGTTAAGAATCTCTCTCCCGACGTTCTCCATTTCGTCAGGTTCTCACTCCGAATTAGCGATAATATAGTCATGTATACACTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1 + chr2R 7665721 5' + Transpac 4940 2 68.22 AGTCGCAGCAGTCAGTGACATAAGTGGGCGTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCAGCTCTCGTGTT:1 - chrX 6138739 5' + opus 39 4 57.14 GCTGGAAGTCGCGCCACGTAGCCATAATTAGCCAACTCGAGCTACAATGTTACTTGTAGTAGATACAGATACGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr2R 22305969 5' + pogo 48 1 54.11 AAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCG:1 + chr2L 23299987 5' + invader4 399 1 76.71 CATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTGT:1 + chr2R 16891859 5' - hobo 2888 1 68.57 CTTGTCGCTTTATAGTCAATATTTTTCATATTTCCGAAAGTCTCCTGCTGGCGTGTCCTTTTTCTCACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGCATTTTAG:1 - chr3L 13827368 5' - hopper 1362 1 52.05 ATCTATATCTATCTATATATCTGTCAACAGTTCTAGAGCTGCTATTTACAGTTTGTCGAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGCATTTTTGAAGATGCAACTCATTGTGGGCCTACTTAAAGAAGAAGGTGGCAAATAGG:1 - chr2R 24317467 5' + S-element 1270 1 35.62 AACGAGAAAATCAATTCCAGAATGAGCTGCAGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAA:1 + chrX 4189258 5' - I-element 5018 1 58.67 CAATGCTCGGAAAAACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTA:1 - chr2R 21402693 5' + mdg3 5316 2 58.22 TACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 + chr2R 20673641 5' - mdg1 351 2 63.70 AAATTTTCCAAGAGAGCGACTCGTGCCACTGGCATTGTCTATTTCAATTTCAATATTATGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGTGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 - chrX 4778272 5' - 412 431 2 60.14 TTTTTTTTTTGGCTGGGTGGTTTTTGGAATTCAGAGGCAGCCTTTTATGGGTAAGGAGTTTTCGTTTCCTGTTAAAAATTTGTACAAGAGAAACATTTTGTTGTTAAACAAAAA:1 - chr3L 4002808 5' - transib2 2754 1 84.21 ATCGCTTTCGCTGCGAAAACCTCTTCTTATACCCTTTACTCTTCCAGTGAAAAGGTATGCTGAATTTTTTAATTTCAATGCCAAAAAGATTGTTGAACTTTCTCGTTCGCACTGCTGCCAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCG:1 + chr3R 19113903 5' + INE-1 550 1 51.37 ACTTAATTTTTCTAGACGTAGTTTTTTTCATTGCCAAAACCAGTTGTATATATATTATACAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 + chr2R 4628374 5' - Transpac 262 2 59.70 AAATATTTTCGAGTTCACGATCAAGATCAACGAAAGAGAATACAAACTCGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr2L 1558752 5' - 412 7526 2 68.89 GCCGACGAGATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAAT:1 + chr3L 24272052 5' + gypsy11 65 2 63.01 AGAAAAACGTTCTCAGAAGCACAACGAATGCGAAACACTCTTAATACTTGTTACTGTCTCATTATGTCCTTAAAGAAGTATATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTACCTTAGATAGTATA:1 + chr3R 10968687 5' - I-element 5314 1 60.96 GCAATATGAGTTTTTGTTCGTCTGCCTGTCTTCAAAGTGAAAGAAGCATTTAAAGCGACCTGAAACATGATGACTGTCGGTAATTTATACGAAATGTGCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 10684696 5' - roo 9047 1 67.81 CAGTCGTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACT:1 + chr2R 12787815 5' - 297 363 2 59.63 CATTGAGTGAATTTCACCATTTCGCACCCAATTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGCCTTGCTCTACAATTCTATATTATAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACA:1 - chr3L 8958538 5' + F-element 4283 1 73.23 GTGAGGGGGGGAATGTTTACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chrX 16855354 5' - roo 9028 1 55.48 GAAAACGTAAGAGCTTTATAAAGGCAATAAAGCGCCTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTA:1 + chr3R 13176313 5' - Burdock 6362 2 64.38 ATAAAGTTTTGAAAAATGTCACTGATGGTTTGGGGATGTATCTCCAGCCGTGGAATGGGAACTGGTAAAACTTTTAAAAATTTTATAAAATAATTTAAAAATTTAGGATTAAACTTTGATTTAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTT:1 - chr2R 4659357 5' + S-element 1498 1 52.05 CCTACGCGCCAAAAACAAATGCGAACAGATACACCGAAATAAATAAAGAACGACACGTAGCTCGACAGTAATAAAAAACAGCGAAAAACAAACAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTG:1 - chr3R 21931891 5' + F-element 4361 1 68.57 CCATACCTTAAACTTACATATGTCCTAAAAACCAAAACAATGAAGTCCAACAAGAAACAATCGAAAGAACCCAAGAAACAAAACTAAAAAATACGAATACCTTATAAGTTTATTAAAAGAGAGAGAATAAATAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 8636285 5' + BS 5094 1 76.03 GCAGAAATCACACACATTTACCGTTACTTTTCACACACACATACAGCACCTCTCTCTCTTTAGCTATTGCGTTTTAGATTATTGCTCAGCACGTTTTTGCGTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chrX 4701087 5' - P-element 2868 1 70.55 CGAAAATTCAAATTCCCAACTTTTTCGTAAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chr2L 2276794 5' + F-element 39 1 50.88 GGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chr3R 27768799 5' + 297 53 2 55.48 ATATCCAATTTAATGTTTCGCCACAGAAAACAACAGAACATTTTGTTTTTATCCGCATCTGCATGCACTTCTAATGTTTATAAATAAATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - 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chr2R 17579905 5' + R1A1-element 4912 1 67.65 TTTGCAAACAAATTTCGCCTTTGACTAATTAGCGGGCTTAGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chrX 2762594 5' - roo 327 2 71.23 GATATAAGCCGACAGGAGACGAAACGAGACTGTTTGCATACTTTCAGGCGCCTCTGACAGGGCGTCATATGCAATACACAACAAAGTGCATATGCGTAGCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr3R 19531186 5' + hobo 22 1 70.55 AATGCACTTGAGTTTTAGTTGCATGTCAGACACTTTCTCACACCAACACACCCACACACTAACACACACACACACACA:1 - chrX 5634753 5' + accord 7026 2 76.92 TTGGACAGTACTTATAATGTAAATACGTCACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCG:1 - chr2R 1478213 5' + opus 65 4 77.60 CGATTCTGTTTGGGATTGTAGTCTATATAGCCATATACATACATAAACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAA:1 + chrX 16828944 5' + Quasimodo 65 2 71.23 TGAAGAATCGAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chr2L 23310601 5' + 1360 32 1 60.43 AATTGTGTCCGCTTCTCGGAGGCCATTGTCTTTGGCAGCAGCCGCTGATATGACCGACCTAATAGACTTTAGTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr3R 12599134 5' - 412 457 2 56.06 AACAACTCTAATAGTCCTGGTGAGCCTAGTACATTGGCTCAACCAAAGAATTCCAAGAACACCTATATCCTGATTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAAAATTACTTATGCACATGTGGGCATTGCTTATATTCAACAGCC:1 + chr2R 5998035 5' - 1731 4310 1 50.00 CAGCACAAAGTCAAAATGACAACGACAGCCGCAGTCGCAGCAGTCAGTGACATAAGTGGGCGTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCA:1 - chrX 6138771 5' + opus 11 2 77.78 GGGAAATTTTTCTTCTTGATCACCTTACACAGGTGGCGGTAATCTACACACATTCAATCACTACCGTTTGGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 - chr3R 4562432 5' - copia 5074 2 54.11 TCGAGGGTGCCGGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr3R 27768788 5' + 297 6623 2 54.11 CCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 - chr2L 1558698 5' - 412 412 2 74.83 GTTGATCTTTGTCTTTGTTATTGACGGATAATTTATTCGACTCACAAAAATTAATAACTACGTAAGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATG:1 + chr3R 11762415 5' + rover 6999 2 54.23 TCGGAATATACAAATGAACCCATAAACAGACTCTGTGGGTTTGTGCACTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAA:1 + chr3R 17067828 5' - 297 6903 2 70.55 ACATTATCCCAAATACTCTATTCTAAGCTCCCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGCACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTAT:1 + chr3R 15338057 5' + blood 92 2 77.40 ATATCTTTCTGATCTGGGCAGCACAATGGTCACTGTAGTTAATTAGAATTCCACTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTAT:2 - chr3R 10472761 5' - mdg1 7368 2 78.08 AGTTGCTTGGTGCAACCCTTTTGTTCTAACTAGTAATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTAT:1 - chr2R 4638662 5' + 1731 87 1 74.66 CGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCAG:1 - chr2R 6271495 5' + blood 7221 2 78.10 ATGGTTATGCTGCACACTGTGCAACAGCGTTGAAAACAATAAATTAGCAACTAAAAAAAAAAATTACCCAAGCCATGATGAAATAACCTAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr2L 3465985 5' - P-element 2872 1 66.97 GGCAGAGCATTTTCTTTCGCTTGCACTTTTCCTCGCGTTTTTCATTGAAGCTTTGGCCGCGAAAAGCTTTTTGGTATTTTCAGAAAATGCCTCTCACCGACGCAAAACACGCATAACCAACAAAATACGAAGTTA:1 + chr3L 3139990 5' + Bica 4645 1 71.85 ATATATATATATATGTATATACATTATATTGAAGAGAGGCAAGGCCCCCATTTCCGCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:2 + chrX 3967375 5' + 412 48 2 57.36 CCAACATTTTGCACATTTCGTATTTGTTATCTGTTTAAAGCAATAACATTTTGTAAATGTTTTCAATTTATTGTTTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 20712917 5' - roo 9054 2 73.29 GAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTA:2 - chr2R 17890966 5' + Tabor 66 2 60.96 TAAACTTTTCCTAGGCATTTCCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr3L 17707792 5' + Doc 30 1 60.77 GCCAAATAAGCTGCCAGCCTTAAGCGGTGGATTTTTTTTTGTTGATTTTTTGTTTGCCTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 699718 5' - Doc2-element 251 1 81.16 CATATTTAGACATTCTCCGGGGGGAAAAGTGTACGGCCAGTAGTCGTCTCTCATTTATGCGTTGCAGCTCCAGCTGGGTTCGCTTCGCTAACAGTATTTAAAATTTTGTCCCTTAGCTAGGTCATATATATTCTTGAACAGGATCA:1 - chr3R 3618826 5' + INE-1 81 1 64.38 TTTGGGGTAGCGTGCCCACACTCCCTGCTTTATCTGCGATTGTATTTGTGCAAAAATGCGTCACGGTGTGTGTGTGCGTGTGTGCATGGGCATTTGTGTTGGTGCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr2L 8366469 5' - 1360 3377 1 76.60 CAGGTAGTTGGAAGAGTTAGTTGAAAATTTTAACAAACATTACACGGAAAGAAATCAACTCATTCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:2 - 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roo 9015 2 55.48 AAGGCTTAAATAATGGTCACAAATCATGAAGTAAGACGATTCATAATACCCATAACTGTCCGGTATTTGATGTTGGTGAAGGTGGCATCTGATTGTAAGCATTTGTAACCAGTTATATTCTGCAGCATTTCTTCGTTTGACTAGTG:1 - chr3L 3075497 5' - Chouto 6121 1 54.79 CAGGTGTGAAGGCTTTTAAGTTTTAAATACGAGATGCTGGATCTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATTCCTTT:1 + chrX 21083938 5' + HB 78 1 66.91 TTTCATCACCATATTCACCATGCACTATCCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - chrX 3996560 5' + roo 8755 2 81.51 CCAGCATAGCATAGAAAATCAGCTCATTTGCACATTGGTCGTAAGCTCTGACGAAGTCTGACTTCATAGTCTAGATGTTGTGGGTCACAGAAAATTAAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGA:1 - chr2R 12265276 5' + jockey 4534 1 73.68 GTTAGCCATTAAAACCTTTATATGTACGGTTACATATAGACATACATACATATAGAAACAAAGAAATGCGAAAAAAGTGACATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGCGTTTTCCTTGC:1 - chr3R 13122617 5' - blood 350 2 63.43 CTTTATAAAGGCAATAAAGCGCCTTGTATTTTCCATATTTCGTTTACTTTTACTGTCGCAACATGCAACATATTATATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGC:1 + chr3R 13176326 5' - Burdock 6349 2 55.48 ACAATGTTTGATGACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAACAGCATATGTTTTAGGCGCGCATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCT:1 + chr2R 5542344 5' - 1731 4588 1 52.03 AACGTAGACAAAAAAAGGTTAATCGAATTATGTTTGGCGGGGTGCAAAAACGTTTACCGGGGCCCCCAAAAACGCAAAAGAAAAAAAAA:1 - chr3R 9599657 5' + Doc2-element 238 1 86.52 GAAACAACAGAGGAAAGAGAGGAGCACAAAGCTACATACATACATACATACATACATATGTCTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 - chrX 22858495 5' - copia 228 1 56.85 ATTCAAGCCAATTTCACCCATACCATCACTGAACAATTCGGCAGCTGTGGAAGTTTATTTGGTCTCCCAGTGGGACAACTTTTAAGTCCCTTTCGATAACTCGCTTGCTCACATACCAGGGTAGCC:1 + chr3L 23034135 5' - G5A 2522 1 70.63 AGGGGGGGGTTGCCAAGGCAGATTGATAATGGGGTTGTGCCCCGTTAACCAGTGGAACCAAGGAATGGGTCTCTTCAGTCAACCATCCATTCACATGTACCCGTTTAAATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chrX 12525851 5' - roo 401 1 78.47 TGAAAGTTTAAAACTGTAACATGGTTAGTTGAGAATCATGTGCTGCTCCCATGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAG:1 + chr3L 27178239 5' - F-element 272 1 65.25 GCTTCATTAACTTTATTGTGTGTGTAAGTGGTTTTTTGATAAAGCTACTGAGTTATAGCCAAAGCACTTGTGCCCACGCCCCCTCAAGCCGCCAGCAAATTAATTGCTACGAATTGGGCCGCCCAATCCACACATCAACACTTACT:1 + chr3R 17275599 5' + Ivk 5067 1 81.51 CATTTAGATAAATTTCCCCCGGGACTCTGAAATGGATGGAGTGGCGCAAAGAATGATGTAGTAATTAATGAAATGGAATGTTTAGTAATATTTAGATGATTTGCATTAAGTATGATTTATGTCAAGTTCCGGTCAGACAGGTCTTG:1 - chr3R 6568741 5' - jockey2 3192 1 56.85 GCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACTAGGTGACATGAG:1 + chrX 14964624 5' - roo 335 2 70.55 CAAGCAATTATGCAACTCTTAAGGAAACTAGAAAAGTAGCAGGAAATGACATTATATAAAATGCAAAATCAATTTGAATACCCAGCAATCCAATGAAATATGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATA:1 + chr2L 12477740 5' + 1360 324 1 71.43 GTTTTGCTTTTCCTGGCCTTCCTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGTTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr2R 23116174 5' + jockey 80 1 66.44 GAATCCGATCTGAGCTTCATGAAGGGTGACCGCATGGAGGTCATCGACGACACCGAGTCCGATTGGTGGCGCGTCTCCGACCATATCAAGTATATATATTCTTGATCAGGATC:1 - 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chr2L 9435799 5' + GATE 8304 2 57.78 ATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTGGAATCCAGCTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 + chr3L 24934269 5' + HMS-Beagle2 6916 2 63.01 CATGGGCATAGGGCATCGTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTAC:1 + chr3R 23020796 5' - INE-1 551 1 58.90 GTGTGGGAAAATGAAAAAGTCATTTGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGT:1 + chr2R 4012503 5' + F-element 297 1 60.96 CATTATTTGCTGAGCTGTATTTTGTTTATACCTTGCACACGGCACTCTTATAGAAGTTACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACACATAAACGAAAAAGTGCAAAGAGAACTGTGCAAACAAATTATAAGTGCAAAGCG:1 - chr3R 19447149 5' + gypsy4 375 1 72.92 AGCCTCAAAGTTTAATTTAAATCACACACGAAGGTACTTTTGTTGATCACTGTAAATGTAGGACCACCGACTGAGCCAATAACGAATCCATATATATATACATATAAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chr2R 2830354 5' - opus 490 2 78.08 ACCGTTGTCATTGCCAATTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGA:1 - chr2R 6632617 5' - P-element 2785 1 15.75 CTTTAGTATGCGATAAATCGTGATAAATTTATCGTGATATGATTGCGTGATATTTGCTTCGTATAAACACATCATGTAAAGCTAATGATTAGTTGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTCGCGCTCTTCGTAAGGACTCACTA:1 + chr2L 17250674 5' + opus 21 2 67.59 AATGAGAAAAAATTTAAAATTTGGTCAAAAATGTGGTCGTAGCAGTCTTGGGCGGCTTGTAGGCGTAACAGCGAATCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTGTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGAC:1 + chr3L 24731971 5' - INE-1 133 1 48.63 CATCATGAGTTGCAAACATATTTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 + chr3L 6775334 5' + blood 48 2 52.74 TATTAGATATTGTCTCTTTCTCGAAATAATAACTCTTTGATATGACACTGGCGAGATTCCGACTATCAGATACCCGTTACACAGCAGGTGGAAATGGAAACGCGAAATTTCATAATTTTTTTGGGATATCGATAGATAT:1 + chr4 378925 5' - INE-1 498 1 76.26 AGTTGTCACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATACACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACACAATCATAGAATACC:1 - chr2R 954516 5' + Quasimodo 77 2 81.20 ACCAATACCCATACGTACTCATCTCATCCTATCCGAAGCCCCTGTCGGGCAGATCATTAAATGATCATTAAATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 - chr3L 15100067 5' - copia 242 1 51.05 AAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 14553175 5' + roo 8714 2 75.00 GCGGCAATTGCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGA:1 - chr2R 10865229 5' + blood 80 2 71.23 GATGCAAGAGCAGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2R 11609193 5' - roo 9031 1 55.56 CATGCAATTTACATCTCCGCCTCGCCCAGGGAAACTTAATTTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTC:1 + chr3L 20255159 5' - Transpac 5166 2 68.94 AGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr3L 19350011 5' + jockey 24 1 67.29 ATGCTCTTAACTATAATATCATACTAAAATATATTTCATATTAACACGAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAAT:1 - chrX 16902334 5' + I-element 68 1 65.00 GTCCTTGTTCCCATCCTCGTCCTTTGGCCAAAACTCGCTATGTGGTTAACTCGGTTGGTATGTCTGTATCCGCCGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 + chr3R 27859155 5' - hopper 1371 1 56.16 GAATTAAAAGAGGGCGTGGGTCAGGGACCAACCACCACCCAACTCCCACCGCTCACATTCCACCGCCCAACTGGTCCGGGCAAGTGCAGCCTGCAGACATCTACTTCCCCCCGCTC:1 - chr3R 21090340 5' - invader1 139 2 74.14 TAGTCAACCGCAGAGCGTTGGATGAACACGCCCAGCAAAATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCA:1 + chrX 20066142 5' + opus 166 4 70.16 GAATCATTGTACAGAGAGAAAAATATTACGTTTCAAGTTTGAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTA:1 + chr3R 26519974 5' - FB 636 3 71.92 CAAACTTTTTCATATTAAAAGCACTATATTAATGAGCAGTTATAGCTGCTCCAAACATTTGGAATTCATTTTAGTTTGCTTGTTTCAACTGAGTAAAATTTAAATTGAAACTACAAATCAATTCTGTATTTATTAAAAACTAAAAA:1 - chr3L 6582708 5' + rover 6819 1 58.22 GCAGAGAAGCATAACAAAAATCTGAAAATCTGAACAGAGATGCATATCATTTGGAGCACTAAACAAATAGCAATATACAATTAAACTAAGCATAAAATTTCTCTATTGTTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGG:1 + chrX 4312321 5' + invader2 135 2 71.92 ATAAGTTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACATCCAGGAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTA:1 + chr2L 15834449 5' - hopper2 1547 1 56.85 GTGGAATGTGAATGTGGAGAATATAGTTGCCGGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGCCGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chr3R 4528467 5' + F-element 31 1 71.23 TCCTGTTCGACCTGACAGCCCTTCACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACA:1 + chr3L 23933532 5' - Cr1a 237 1 54.55 ATGCAGAAAAACCGAAATCTCAGCAAAAAGACGACGAAACCGGAAGGGAAATACACTTTCGAGGTCGATCTTTAAATAACTTCGAAACATTATACATATATAAGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chr2L 14248148 5' + I-element 9 1 74.81 GAATAGTTTTTTGGTGGTAGAATTTTACAAGACATTCATATAAAAAGGGAAAAATTACGGACATAGTCAGTTTTACTCAGCTATTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTT:1 - chr2R 12994966 5' + BS 5034 1 55.48 ATAGGGGTATGCAAACTTTTTCCCATCAACAAACTTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:2 + chr3L 22052715 5' - mdg1 396 2 68.49 GGGGAAAAGCCAAATATAATTTGCCAACTCTAATTGCAAGCAGTCGTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 + chr2R 12787775 5' - 297 376 2 72.79 ATGATGCAGCATAATTTTATTATTCTCGGTAATATATGGATATGCTTCAAATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chr3L 19792520 5' - pogo 2035 1 65.75 AAAGATAAGAATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chr3R 22100513 5' + 412 7119 2 60.27 AACATTTTGTAAATGTTTTCAATTTATTGTTTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3L 20712961 5' - roo 346 2 63.70 CGGTGTGAAACTTTCTATGAAGGAGTACCATCTTTTCAGAGATTGTGAAAGATAAAGAATGATGGTCTGTTTGTATTTCTATACCAATTACAACTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACG:1 + chr3L 23512603 5' + GATE 8274 2 64.83 GTATTAATCTTATTAATATTTATACTACGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCGAGAGCGAGAGAGCGCATACAGGGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGC:1 + chr2R 4582160 5' + 1360 174 1 77.40 AAATGCTAAATCACTTTAGTTAACTCTTAATGGATTATACCCAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1 - chrX 12191628 5' + pogo 72 1 67.12 TTCACAAAACCTTTGGTTACGGATGCATTGTATTAATATGTTTTGAACTCCTGTTTGCTGGAGTTGAAATCAATCAGAAAAAAGGGTTTCCGACTATATAATGTATATACATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGAAC:1 - chr4 1121545 5' + INE-1 96 1 52.05 TTTGGACTTGAATGCTTTCGATTGCGGTTTATATTAACAGGTTTCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCTCTCAACTTCTCCTC:1 - chr2L 17172432 5' - I-element 341 1 67.90 ACAAATGCTAAAGAACACAATTTGAATGTCCTAAGTTTTTCAAGGAAATATATGCCTTATCATTTCATAGTACAACCCAAATGGATATTCCAAAATGGCATAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 - chr3L 20255290 5' + Transpac 16 2 74.66 AATAATTATAAAAACTTCATATTTATACTGTACTACTACTATATACTCACTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAAC:1 + chr3L 9713948 5' + G2 2711 1 66.44 ATATGCTGGGCACAACGCATAAACGTCTGCTTATATCGCTTGTGGATAATCAAAGGCAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTCCATATCTTATGT:1 - chrX 12526000 5' + roo 8708 2 53.97 TAAAGCCCCGGAAAAGCAGCCGGAATAGCATCAAGCAGACGGCAAAAACAAACAGGAGGCATCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAA:1 - chr2L 18317544 5' + mdg1 7100 2 60.27 ACATCTTAGCATACCAACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAG:1 - chr3R 26246895 5' - 1731 4558 1 62.07 CTTGTAAATTATAACAAATACCGGATTTCATCGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCT:1 + chr3L 24291947 5' + rover 40 2 58.90 TTTGCATTTCTGCGCTAACCCCGCGGCATTCGCATCTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chr3R 28951898 5' + jockey 4711 1 64.08 GCCATGTCGTGGGATCCGCAAAACACAATACAGGAAATAATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAAT:1 + chr3R 4569523 5' - opus 424 2 73.38 CGAAATCTCAGCAAAAAGACGACGAAACCGGAAGGGAAATACACTTTCGAGGTCGATCTTTAAATAACTTCGAAACATTATACATATATAAGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 - chr2L 14248136 5' + I-element 18 1 68.94 TTCACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3L 14553096 5' - roo 353 2 56.16 GCTTTGAATCTCATTTTTTTGTATTAAAATGTTATTAAATTATTTGTACAAAAAATGTATGTATAATGTATATGTAGTTTACAACATCTAAACCTACAATACATGATTTTATTTCAGATATGTTTTTTTAATTTTTTTTTAATTTT:1 + chr3R 7614303 5' - Doc 4698 2 71.92 AAGAAAAAAATAAATTGAGATGCGTTAATAACAATTGTTTTCACGCCTTTGCCAGTGCTGCCCTATCAAATTAGCGATAGCTAAATTGGGAACCGTGTCATCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCAT:1 + chrX 245784 5' - F-element 4285 1 69.93 TCCGTTTAAAGTCGTTGGCTAATTAAGTTGCGTTCCAAAATGGCAGCAAAGTGGAAAAATGAAGGAGGATGGCTGTAATTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGGCGCAGCAGGC:1 - chr3L 11314836 5' - HMS-Beagle 6916 2 56.92 ATTGTCGTCTGCCTTTTCCCTCCCTTTTCTTCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCCCTACTTCCCCAC:1 - chr3L 13636083 5' + gypsy5 89 2 74.19 CATGTGGTTTCGTCATGTTTCGTAGATCCTTAAATGATTAAGCACCATTTAAAGAACTTTCTTTGAAAATAATTGCATAATTCTTTTTATAACCTTATCCAAAATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr3L 15327502 5' + blood 16 2 73.97 ATTTTTTAAGGGCTTTATTAGACCCTAAGTGGATGATTTAATGATTTCGATTTAACTTTCTTACAATTTATATTTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:3 + chr3L 19482928 5' - pogo 2057 1 55.48 GTCCTTAAATGCATTCGCCTTTGCTGCTGATATGCCGTTCTTCTTCTCCAGGTTGGGTTTCGTCACTCCGTACATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTTAACG:1 - chr3R 11863440 5' - Transpac 442 1 75.34 TGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chrX 12866486 5' - roo 9008 2 62.33 AATAATTGGAATCATTGAGCTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr2L 10184419 5' + Doc 62 1 56.85 GCCAAAAGGGAAAGCGGATGACCGGCGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTT:1 + chr2R 21402593 5' - mdg3 186 2 55.48 ATATAGCCAGCATAGCATAGAAAATCAGCTCATTTGCACATTGGTCGTAAGCTCTGACGAAGTCTGACTTCATAGTCTAGATGTTGTGGGTCACAGAAAATTAAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTACGAAGAATTTCGG:1 - chr2R 12265282 5' + jockey 4541 1 71.23 ACTGATAATTCAAATATTTTGGCACTAAATATACCGTTAGAAACTATACTACCACTACTTACCACTGTTTAGGGAAGCTTAATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCA:1 + chr3R 11750150 5' - Tabor 447 2 58.62 AAGCTGGCACTGTCAATATTAAAGAGTTTCCAAAAATAAATTAAACGTGGCACAGTTTATTCCTCTAGCGGAATATTTATTGAAGTTGAATATTATGTCAGATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAA:1 - chr3L 19349109 5' - jockey 4883 1 72.41 TTGCGTTTTAGATTATTGCTCAGCACGTTTTTGCGTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chrX 4701151 5' - P-element 2883 2 61.54 TAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGC:1 + chr2R 22723035 5' + 3S18 74 2 65.07 ACCTTGGGGCACCCTTGTCATTTACATTTATTTTTTCTTTACGTGTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACACACACACACACACACACACACACTGGG:1 + chrX 5107932 5' + accord 7104 2 75.51 CTCGCTATGTGGTTAACTCGGTTGGTATGTCTGTATCCGCCGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTA:1 + chr3R 27859188 5' - hopper 1338 1 70.55 GAAATGTCGAGATTTACGAGATCAGTGAGGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGT:1 - chr2R 8641633 5' + diver 5888 1 77.12 AACTTTATCCTCGTAGCCCTGTCATCCTTGAGAAGACCCCTTTTTTCCTTTTTTTTTTTAATTTT:1 - chrX 3013049 5' - Doc 4698 3 67.69 CCATGCAGGCGGAAGTGAATTTCATCCGCACGAGAACGGAAAAATTGTTGGAAAAACTTGATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCC:1 + chr2L 17030865 5' + blood 440 1 56.20 CCACAAGCCCCAAAAAAGAAACCACTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 - chr3L 8005102 5' - P-element 2814 1 21.23 GCAAGTCCTTCGTTTTGCTTTGAGTAACGAGTTGCCTGACATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2L 686118 5' - roo 9043 1 66.44 TTACTGTCTCATTATGTCCTTAAAGAAGTATATTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATC:1 + chr3R 10968737 5' - I-element 5264 1 78.08 AACAAGCTCAAACATCAGCCAGCAACGTCAATCCAAATCATAGACTTTGCCCAGACTCAACTGATTATATATGCACCAATGCAATGCATACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chrX 17732106 5' + pogo 16 1 70.68 GGTGTGCTATTTTTACATTACCGTAGCCGAAAGGGGTAGAGCGATGGATAATGAAAGGGGGCTAATGAAATTTTAGTCTGTGTCGATCCATAACTGTAGTTATTAATTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1 + chr3R 2474239 5' - Juan 4197 1 69.18 AGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr2R 11609227 5' - roo 332 2 70.34 TGTGGAGGGAAAAGAAAACAGTGGGAGGTGGGAATGGAGATGCTTAAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGGATTCTGAGTG:1 + chr3R 25880267 5' - P-element 2812 1 34.25 GAATTTACATATATGAGCATTTTGCTGTTTCAATATGTATTAAATATATGTTATATTGAAATGTTTTATATAAATATTCTTGAAATTCTTGAATTTTTTTAATAAATTTTGCTTTTATTTACTGAATCTTCTTGAATAAAAACTAA:1 + chr2R 5374695 5' - F-element 4645 1 58.90 AAATTTGGGTCATCTCGATGTATAAATATAAAACAAACGACTTGGGGGGGAGAAACATGAAATACTGCACCACATATGAGTTTACGTGTGTAAATAATGTAGTATGTGCCCATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr3L 16358621 5' + 412 7081 2 60.96 GTTACGCTACTTTCCACCAATTAAGCGAAGCTGCAAGTCGGATTGGCTGGCTAATTTGGGTTGTATTCGATATGTCGGATATGCAAAAGATGTTTAGCCGCCGCTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 - chr2L 12079735 5' - mdg3 228 2 68.18 AGTGTGTGTATGTACTGCAATATATTTGACTAACGCCTTTCCAGTCGTTGTAGACAGTGTTTACTTCGATGTTGTGGCGCATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr2R 5868405 5' + pogo 36 1 59.31 TTCGGATGTTGTTTTCGACAGGTAAACGAACTACGGAGTGCTATTTAATATTATAGAATGAGGTAAGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 + chr3L 16212713 5' - Transpac 290 2 63.48 ACAATATCATTTCTATTAAATAATTAGATACATACATTTTGTCAAGAAAATGTTTGCACAATGAAAATAAATTGTATTTTTGACTTTCAATGCCTCTTTTAAAAATTAATGAATTTTTTTTATTGATATCTATTTATTCATAGGTT:1 - chr3R 18917841 5' - S2 1610 1 52.74 TATCAAAGTAAGAATGCCGGCATAGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr2L 17136127 5' + hobo 46 1 49.32 AAATAATAAGGAAGAATTGCCTTAACAATAAGTAACACAATATATAACAAGAATGCAACCTATCCAAGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAA:1 + chr3L 24208983 5' + Quasimodo 477 2 56.85 GCACGTCGAATTGCCTTCCTGGGTTCATATTATGATAGAAAACATAGTTCATTTGTAAAAATAAGTTTTAAAATGATATATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr2L 10746562 5' + pogo 7 1 76.71 GCTGCACTTTCTTGGGCAACTAAACAAGCTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:2 + chr2L 15987949 5' - roo 9036 1 61.64 GTATCCGAAGGATACCCAGAGCAGCGAAACGGTAAAATGTATCTGTAGGTGGCAAATGACAGACGAAACTCTGAGAAACTCCCCAAATGAAAGTGAACGGAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATA:1 - chr3L 2413416 5' + Doc 4432 1 71.92 TGTAACCTTTCCTCTGCGAGTTTCCAATATACTTTACTTTGGTCTCATATTTCAGGCAAACTCATTAAAATGCAAAATGAGACCAAAGTAATGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTG:1 - chr2L 912209 5' - accord 6954 2 37.67 TAGGCCGTACAATAAAAACAAAAAAAAA:1 - chr2R 19556022 5' + F-element 4684 1 82.14 AATGCCAATAGCAACTGAATTGGCCCACATTCGAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr2L 9472014 5' + roo 8752 2 77.40 ACTTTCTTGGGCAACTAAACAAGCTTAACAACTATTTTAATGATAAGTTTCCTATGCAATACCCAAACAAAGTGCAATTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2L 15987954 5' - roo 9031 1 58.22 CAGTCCAAATTAGTCCTTTGTTGGATTCAAAAATAGAGTCGTCGTTACATGGGCGAATTTAACATTTCATATGTTTTAAATGTTTAAATACAAATCGATACAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chr3L 23986670 5' - opus 484 2 76.03 CTACATCCACGAGTATCTGCACTGTTTGTCATTGTACTGCACAAATCTTTTGGCGCCCGCAGTGTAATAATAAATGCAATCGGCAACGCGTACAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAG:1 + chr2R 4362488 5' - gypsy 7418 2 64.38 TCCAACATTTTGCACATTTCGTATTTGTTATCTGTTTAAAGCAATAACATTTTGTAAATGTTTTCAATTTATTGTTTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 20712916 5' - roo 9055 2 73.97 GACTAACTGATAAAAGTTGATATATTTATATATGCTAAATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAAGCGTTTCCGGCTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCAATAGCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATC:1 - chrX 19810258 5' + INE-1 132 1 76.03 TCCTAGAGGAATGAAGGAGTGTGTGTATGTACTGCAATATATTTGACTAACGCCCTTCCAGTCGTTGTAGACAGTGTTTACTTCGATGTTGTGGCGCATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chr2R 5868422 5' + pogo 13 1 75.54 GTAATATATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATAGGTAGTCAAGTGTTGTACTATGGAACATATGCTACTATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGT:1 + chr2L 1692707 5' + Transpac 53 2 54.79 AAGCTTCCCTTCCTTCCAATTTCAATTCCAAACAACAAAAGCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr2L 9237514 5' + blood 60 2 68.80 GAATGTAATAATTGGAATCATTGAGCTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr2L 10184413 5' + Doc 49 1 52.52 CTTGTTCGCCTTTTTTCACATTTTTGCTTTCAATTTTTTAGGTTTTTTTTTGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAGTTTCACGCGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGA:1 + chr2L 7559690 5' - mdg3 177 2 58.62 AAGCAGTCGTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATA:1 + chr2R 12787812 5' - 297 336 2 66.19 GACAAATTGCATTAGGAGGACCTTTGTAATAAACCCATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 + chr3L 10144691 5' - blood 358 2 66.15 GCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTGGG:1 + chrX 21772502 5' - gypsy3 6530 1 77.98 ATAGATTTAAACTAAACCCAAGCTGAGGCGGGAAACCGCTGCTTGGAAAAACTAACAACAAAACTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTC:2 - chr2R 17373248 5' + gypsy6 7452 2 58.46 AGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAA:1 + chr3R 19450004 5' - roo 8705 2 55.48 ACTAATCGGGGTCATGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chrX 1103563 5' + pogo 12 1 76.03 AGATATTTTCACTTCAACTTTTCCGCCTGTCTCCGCAATTGTTTTCGGTTTGCAAACATTGCAGCCATTGTTTAAAAACGATTTGTCAATTCGCTGAACTCGAACTTCAATAGCTGGTTCTGCGTTTTTTTATTTTTTTTTTTATT:1 + chr3R 21165348 5' - Rt1a 5078 4 62.33 CGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGT:1 - chr2R 8157267 5' - Transpac 248 2 60.27 CAGGATATAAATGCATTTGAGTTTTTGGAATAAGTTAATAAGTGGAATAAGTTAATAAGTAGAATAAGTTTCCTAGTCGTATATATATATAACACATGCCATGTCCATGTCAGTCAGTCTGTTCGTCCGTATCAACGTCTAGATCT:2 + chrX 21011583 5' + INE-1 133 1 53.42 GTTGTTCTTGAGCAATTCATTTCCTCGAAACATATGTGATAAAAACATATTGCATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 + chr3L 14062232 5' + Doc 77 1 62.33 TTGTACAGCACACCCTGTGGCTGCGAGTAACGGTTCTCGGGAGTCGTTATTTTCTGAGAAGCGCGCAACGTGCACACTGGCAGGCTGATTGAATTTATTAGAAAATGAATAACAAGCTAAAATCACGATCAGCTGAAAGTCACTCT:1 + chr2L 19185988 5' - Gypsy12A_LTR 193 1 63.70 AGAGAGTCAGCGAGGCGCAAACTTAAGCCTGGCAGCCGTTGTTGGGGAACATTCTGGGACTTGCCTAAAACTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2L 15988086 5' + roo 18 2 65.79 TAGCATTATAAATAAGCACAAACAACTCCCAGGGCTCTGCGGTTTAGGTGGCTGCGAAATCTGTTGGTCAGTCGGTAGATCCTCGTGGGGGTCTTCGCCAGCGTCAGCTTCAGCTAAGAAGGCAG:1 - chr3R 19787197 5' - Chimpo 4104 1 73.60 CGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTA:1 + chr3R 18346612 5' - INE-1 544 1 50.00 CTACGAAATTGGCCAAAACTCCCCAAATATGTATGTACATATGTAAATTCGTTTCTTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCACTACATTGTGACACTTTATCATAATA:1 + chrX 3703809 5' + Stalker 6917 4 60.27 AGCAGGACATCGGCCGGATTTTTAATGAAACACAATAATGTTACTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGGATTTTCGTGGTAGGGGTGGG:1 + chr3L 11745286 5' - G2 2758 1 62.30 CAGCGAATGCTGGTTCAGCGCGGTATGTTGCATCCACTAAACGATAACTAGAATTAAGCCCTACATCTTTCTCATCTAAACATTTCTTTGTGTCTTTTTTGCTACTGTACACAGTCTTTGTATATTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTT:1 + chr3R 9991876 5' + hopper 148 110 58.22 GGCTGTGTGCTTAGACGATTGTGCAAAACAGATTTGAGCTGGGCACAAACAAAAAAAAACACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chrX 13395348 5' - roo 9011 2 61.64 GAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTACGCGACGGAGTGCCCGACA:1 - 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transib2 2755 1 65.75 ACATATGTATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chrX 5150284 5' + roo 62 2 62.24 TGGGCCATTGCAATCAAAAATTGCACGCGCAAAATCATGGCGAATGGGGGCTTTCGAGCGGTTTTCGTGGGAAAGTGCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGGAGACATGAGCGCATCTC:1 - chrX 20637485 5' - G2 71 1 56.16 ACGCCCGGAAAACTTAGGAAGAGGTGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTATAAACACACAG:1 - chrX 5858966 5' + hobo 85 1 74.65 AAATGAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAA:1 - chr2L 7530766 5' - hopper 1336 1 76.03 TTCTAGTGTCTTTGATATGACTCTTTCAATAAACAGTTATCATATTTTTAACAGGCATGAACAATTTTATTAATTTTTTTCTATCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAATATGACAATAAGTAAATTTTATAATTATTCT:1 + chr2L 14588754 5' - G4 3798 1 71.23 AATTATATAAAGGAGTCCATAAAACAAGGGTTAAGAAGGAAGTAAGGTATGGAAGGATATCTTTGCAAACGACACGGAGGACAGTACATTTCAATGTCTAATTTTTTAAATAAATATTCTCATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCG:1 - chr3L 15915911 5' + Doc 4503 1 78.08 AATATTTTTTTTTTTAATTCTGTCGCTGTTTAATTCATTTAATGCGCCTCTTAATAAGTGTAATTTAAACTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGCTTTTTTTATG:1 - chr3R 11023945 5' - I-element 312 1 50.36 GGCACGTTTAACAAAAAATAATTATAATAATTGCATTTTGCCATATTGCTCATGGAGAACACTTGTAAATATTTGTTTAGTAGTATCTTAAGTAAAATCAAGAGAGAATGTTATAGTCGAGTTCCCCAATTATCAGATACCCGTTA:1 - chr2L 13573961 5' - INE-1 552 1 80.14 AACTAATATTTATAGATTTTTATATTACTATAATTTCTAATAAGCTCTATACATGTGGGAAGTACCTGAATATAAATTAAGTATTATTTCAAACACAGAATATGTATTCGAGCGATGGTGCATCGCACAGAGCGTCTCTTTCGCTT:1 - chr2L 12077789 5' - Doc2-element 110 1 51.37 AAAAGCCTGCGAAATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chr2L 8956737 5' + pogo 58 1 60.71 GCGGGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 12866466 5' - roo 9021 2 69.03 AAGTCTTACATGGTGACCAATTACCTTAGACAATAAGAATAACTCTTAAGTTCTGTGTATATAGTATAGTATAAAATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 5453601 5' - 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P-element 2823 1 24.78 CTTGGGCACCGAGAGTGGGAAAAAGACAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAACCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3L 18658891 5' - roo 9011 2 60.27 AGTCGTCAGATTGATGCCCTTCTGATATAAAACCGAATACTTCTATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAG:1 + chr2R 12787816 5' - 297 325 2 69.86 GAAACAGGGCAAAAACTTGCCGGGAGGAACAGAAGCAGTGTCAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCACT:1 + chr2L 17029178 5' - blood 372 2 58.49 CCTTGACAAAGCACTGACTATATAAAAACCATGAAATGTAATAATAACTTGACCATTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAG:1 - chr3L 11776759 5' - mdg3 180 2 59.59 TGGTGTTGTTGGAGCAGTACTTAATGGTGGACGCGTAAAAAGGCAGTGGTTGCCGACCTCTCATATTGTTCAAAACGTATGTGTTCATATGATTTTGGCAATTATATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 6991380 5' - roo 394 1 47.95 TTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGT:1 + chr2R 8157186 5' + Transpac 80 2 76.55 AGACTACTTCGCAGAAAACTACTTGCAATCACTTCTCTTCAATTCCAAGCCCCCACAATGCCGGTCATTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACA:2 - chr2L 436566 5' + copia 53 2 52.74 CAAGAACAGGTCCCAAATCACCAGCGGAAAATGTTGCAGAACTTGCCAAACCGAAAAGGGTTACTTCTATTATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr2L 5202603 5' + 297 6628 2 54.11 CCACCCAAATACGTCACTATATACATATACCTGTGTATGCAGAGGACATACATATGTTATGTATACCTTAACCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCGGCGATCG:1 - chr2R 1355077 5' - Stalker2 7418 2 79.17 GGGCGTTCAATTAGCGGGGTCAGGAGCGCTAATTAAATTTTCACTGCAGCCGCAACAATTCGATAAAATGCATAACGCATACGCCCTGGTGTCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATT:1 - chr2R 14696990 5' - Bica 407 1 69.47 GACTGGCTCATTTCGATCCCTGCACTTTATTTCCATGACCAGGAGCGGAGCAGGTGGGTGGGGGGATGGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 23287425 5' - roo 388 2 63.48 CATAAATGTGCGGGTTTCGGGCGAAAATTGAAAAGATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATAT:1 + chr2R 17890894 5' - Tabor 7240 2 77.24 TGTAGGAGGCCCCCAAAAAAAAAAACGTTTAGCTGTTACCGAAAGCAGAACTGTTATATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1 + chrX 3099082 5' + P-element 26 1 57.01 CTTGTAATAAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr2L 4173947 5' + roo 44 2 55.48 ATTTAAATACGGCGTAGCTCAATTGTTACTAAGGTTGTACTTACGGGTTAATTATGATTTGAAAGCATAAAATCAAGTATGTTCCTCTAAATTGGTTTCAAAATAAGTCTACTAAATGATAATGACAATAATAATAATAATAAAAA:1 - chrX 21452885 5' + mdg1 35 4 54.11 AAGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 - chr3R 6388784 5' + jockey 90 1 72.41 GATAACACCGAATCACGACCCATACGCACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCA:1 - chr2R 15829603 5' - invader4 263 2 63.70 AAGTGTTTACTCCTCTGCCATTCTCTGTATATCTCACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATA:1 + chr3L 7995415 5' - P-element 2824 1 42.36 GTTGATGAGTAATATTTCTTTCAGCGAGCTGTAGAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAG:1 - chr2R 4313050 5' - gypsy 7385 2 53.42 AACCGCTGCACGAAGTGATTCTTCGTAAGTCTTTTAAGTCTTGGATTCGGCATTTGATTCACGACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr2L 9485726 5' + 412 7072 2 62.33 GATACTCTGGAAATTGGACTGTCGCGTGCTCTCTTGTTATTATAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCG:1 + chrX 22601918 5' + INE-1 93 1 62.30 ATATAATTACTATCCAATATTCATAAATACAAGCGAAGTGTTCGTAAAAACCCATTACACTAAATTAATTTCACAAGGACAGTGGCTGGCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAA:1 + chr3L 15745048 5' + F-element 319 1 60.96 ATATATGTATTTGTATCTATGTATCTCTACGAGTTCAATTGCGATCGTTTGTTTAGCAGGGCTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGC:1 + chr2R 11656261 5' - jockey 4709 1 52.99 GTAAAGTTTGCTACACGCATAGTGAAACGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTGAAGTAAA:1 + chrX 3996520 5' - roo 316 2 80.82 TAGCACAGATTTTGTTATTTAAATGCTTACATCTAAAAATGTATTACTTTGCGCCTGTAGTTTTAAAAGTTCATTTTTGACATTTAAGCTGTACTATATTCGAAAACATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATAT:2 + chr3L 12976202 5' - invader4 318 2 44.52 GGTGAGGGGGGGAATGTTTACTTTAAACTGTAACAAAAAACTACTCCCTCATAATTGCATCACACACTGCAGCCTGATCAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chrX 16855355 5' - roo 9029 1 56.16 AACAGCGAGGAAAGCAACGAGGGGATAAACACTTGTGCAAGCAAGGGCAAGGCAGAAACGAAATTATTTAATTGACCAGCGTACTTCTTAGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATTTAAACGAATCTGAATATCTAAGTTATTTA:1 - chr4 957429 5' - jockey2 3301 1 62.33 CAATAAAACAATTGGTTAGTCAAGAACAGGTCCCAAATCACCAGCGGAAAATGTTGCAGAACTTGCCAAACCGAAAAGGGTTACTTCTATTATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2L 5202623 5' + 297 11 2 76.15 AGTGTGCGAGAGCGTGATAGGTGGTCGTGCGTCCCTCTCAAACACACACCCTGAATCGGCGCCGACGACGCGTACGCAACAAACGAAAATAATACGACTTCGACTAGGACATAATAACATAACAAGCAAAACATATTTAACAACAC:1 - chr3R 24105514 5' + I-element 5080 1 63.01 CACACAGTTAGTGAACAAGAGGTCCGCAAGTGAGAACGCGCAGAGGCAATGAACAAAAAGGAAAAAAGTATTCAACCCAATAAATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAA:1 - chr3R 845860 5' + FB 20 1 66.93 ATATGCATGCCCACACTATCCATTATAAATAATTCTGTCAGTCTCGTAACACTTATTTATTGTTAATGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2R 23287543 5' + roo 52 2 55.17 CTGGGAGAAAAAGGCCGAGCTAGCAGACCCAAAAGACTGTTAGGCTCAATAGGTCAATACAAGTTAATAATTTCAATCACACTATTGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTG:1 + chr3R 22238219 5' - jockey 4760 1 41.78 ATTGAATTGAATTGAATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 + chr2L 2157852 5' + Doc 28 1 24.21 TATCGTCCTTTAAAGCTGCTCCCGTTTACATACTTAAGAGTATCCCTCATGTACGATGAGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTC:1 - chr3L 17890825 5' - 412 432 2 60.27 GGTTTAATTAATACGATGTTAAAAAAATATTCAGATAGCTTGAAATCCAATTAAGAAGATCAACAGGGAATCCTAAAAGATCAAGTTTTCTTATTAGAAGGTACTGATTAACAGAGTCAAATCAAAGACACTAGAATACCAAGATG:1 + chr4 855645 5' + 1360 3 2 79.45 GCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 + chr3L 2724970 5' + Ivk 34 1 56.69 GAGTTGGGATCGTCTGTCGAACGTTTGGCAAACTGAAGATCGGACACAATTATCCGGTGGCTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCA:1 + chr3R 11057556 5' + flea 39 2 53.49 CAGTAGATATTATCATCCGATAGAGCTAGAGCATACGGATGATGCAAAGATGACATAATCAACTTGCGTTGATTTCCAGTATAATGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGATTAGGGAGGTC:1 - 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chrX 17085391 5' + S-element 1508 1 65.04 GGTGGGAGGGAAAAATCATCAATCATATTTTCTGCATAGCTGAATCATTTGCGCCGATCAGTTGGGGTTACTTAATGGGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr2L 12553532 5' + 412 7090 2 58.57 AAAAACAAATAAAAAGCCTGCGAAATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCCTTTTTTTG:1 + chr2L 8956726 5' + pogo 53 1 53.42 TAATAATAAAATTTAATTTTGCGATTCTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 4472622 5' - gypsy2 406 1 84.21 AGTTTTTACATTATTTTATCTCTGTATTTTCTGGACAAACGTTTTATAGTATATTTTCCCTTGGCATGCCTGGCTCGTTTCATATTTTAAAATGGCAACAATTTGCCAAAAACGTTATTTTATATTTATTTATTTATAAGCGATGA:1 + chr2R 21414333 5' - BS 5083 1 78.77 TATTGCATAGTTTTCAATTTCCATTAAAATGCCAGCATTGCGCCGTCAAGTATGCAACGCGACAGGGATAAACGATAACGATTTTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGT:1 + chr2R 5922922 5' - jockey 4976 1 56.16 CCACACACATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATAT:1 + chr2L 17240215 5' - hopper2 1544 1 61.64 AGTCAGTGACATAAGTGGGCGTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chrX 6138730 5' + opus 40 4 54.55 GCGTCAAGTACGTGGTCTGGGATTCAAATTGGTTTGTTGAGGCATCCACCGTCTATATATATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2R 12543165 5' - roo 349 2 61.38 TAAAGATGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGATCCCTGCACATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATATATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCT:1 + chr3R 29288734 5' + BS 5069 1 65.07 TATACATATATGTATGAATTATTAATTTTAAGTCCAAAGGTTTCAAGATGGCATATGTGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCA:1 - chr3R 31289453 5' + Bari1 48 1 58.02 CAATTTAAAAACGCGTGACAACGTGAACAAATTTTACCAAAAACTTTGCTTCTCGGACAGTGAATACTCAAAGAGTTTTCACGCCAAAATAAAAGGAGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2L 13927849 5' + roo 14 2 75.00 GTCGCTTGTGTTTGTTACCCAGCAGGCGGTCACTTCTTAACCATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCTGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr2L 16458667 5' - roo 8994 2 71.23 GCAATCCACAAGTACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCAT:1 + chrX 8027442 5' - Juan 4131 1 75.17 GCATAAAATTTCATTTCATTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 12866525 5' - roo 9047 1 68.49 AATTGTCATGACTATCCAGAAAAACTATAGAAAATAAAGAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGT:1 - chr2L 18149552 5' - Bari1 1667 1 59.59 GTTACTGCCGCCCACTCTGCCACCCTTATCCCAACTAAACATGTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTC:1 - chrX 6138710 5' + opus 4 2 67.11 CACACACTTTCAAAAACGTTTACTTATATACGCATTAGAACGTTTCTGGGCCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAAGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCA:1 - chr2L 22640240 5' - invader4 283 2 47.59 AAGGGATTTCGTTTATCCGCGCACCCTCGTGGCCACGTCGCCACATCAGGAAATTGTGAGGCGCTATCGCCAAGAGCAGGACTGGTCAGCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCA:1 - chr3L 1242488 5' + invader4 182 2 59.59 CTTTGTGCCGCGTGCGCATAATTGATTTTTTCGCGGCGATTCGCTGGTTGTTCGCTGGTCAGCTGCCTGTGTTCTCCTGCTGCCGTTGTCATATTAATGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTA:1 + chr2R 11763546 5' + Tabor 6851 2 75.19 ATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTA:1 - chrX 8027471 5' + Juan 78 1 69.66 ATTCAGTCCGAGGTGCTAATATTTCAGTGTGTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACGTATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGT:1 - chr3L 16358728 5' - 412 7467 2 77.37 TACCAAAATCGCAATATTTCTATGTTACACATATAATAGAGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAAT:1 - chr3R 11749717 5' - Tabor 7242 2 73.29 CTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2L 76125 5' - roo 332 2 75.34 ACGGTAGCCCTTTAAATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 - chr2R 5237903 5' + Doc 75 1 45.21 CCTAGCCAGGGACTGAATTTAATTGCAATTATCACTAGGCAGGCTTACGGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr2L 2030088 5' - 412 7525 2 57.14 GTGGTCACTACCTACTGGTCGAGATATTTAAGAGTTCGTCTGCTTTTACGCTATTTCGGCGACTTTGTGGCTTAAAGCGATTCACGCAGAACTCTTCAATTTTAATTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCT:1 + chr3L 12414691 5' - G2 3045 1 72.60 CATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 + chrX 1103628 5' + pogo 77 1 71.23 GCAATGGGACTACGAATGCAACCGCGTGTGTCTGACCTGCCGACCATGTCACCCTTGTTACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTC:1 - chr3R 31947464 5' - pogo 1829 1 61.70 TGGGGAGCGTGTAATTATAAGGGAAATGCTGGAAACACTGAAATGAGGCAAAAACGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 10684828 5' + roo 8718 2 59.70 AAGAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTTAA:1 - chr3L 25350812 5' - baggins 5382 1 60.48 ACTTTTTAAATAACAATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 + chr3R 9190443 5' + Tabor 6859 2 43.84 GAGATACATCGTTAAAAGTATCGCATGATAGTGAATATTAGTAACATATGTATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 5150241 5' + roo 8686 2 67.81 AATTAATGAGTAATCCAATGGGGAATAACCGACAGCAGCAGTCGTCGGAGGATGTACCGGACTCCACAGCGACAACAACGTATTCTAGGGTCTTTGGTACAGTGAATAAGATCAAGAATTGAGAGTGCTTGCGACATAAGAATATA:1 - chr2L 15076619 5' - Gypsy12A_LTR 2097 1 43.84 CTGGCAATTAGCTGTGTAATTACACGGTCTTTGTGGACCGCAAAAGTCCAAGTCAAGCATTCCACTTATAGTATCGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 27794892 5' - roo 9047 1 63.78 TAACACACAACATACTTGTACTTCCTCAAAATTTAGTCTTATGAGGTAATCAATTTGTTACTTTATTGCGCTTCTAAAAAAAAAAAGACAAATAAAAAAGCAAACATGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTAG:1 + chr2R 17248176 5' - accord 7102 2 76.92 TCTTAGTGTTGATTTTTTCATTTTTTGAATATTTTTGGTTATTGATATTGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTGGGAAAATTAATCTGATCCCCAAGAG:1 - chr3R 904425 5' - G5 4532 1 57.39 ACAATTAAGGCTTTCATCTTTTGTGTATAACCAAACATAAACAGTCATTAATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 + chrX 3263329 5' + roo 70 2 67.81 CTGCACAAATCTTTTGGCGCCCGCAGTGTAATAATAAATGCAATCGGCAACGCGTACAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCT:1 + chr2R 4362524 5' - gypsy 7408 2 41.78 TGTTCAGTTACCCTTAACCAAAATAAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTACCATACCA:1 - chr3R 17656441 5' + mdg3 5346 2 77.40 GGAGGATGGGGGAATGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chrX 7515742 5' - roo 355 2 56.83 CCATTTAAGTGCGATCTGGCTAGATAAAAAGCAAGAAATGAAAAAGGGAGCTTGACACAAAATGTCAGCTGGATATTTTTTATTACACAATCACAACATACACATGCACACACACACACACATTCACCC:1 + chr2L 11536773 5' + accord 7035 2 72.87 TATGCAAAGTTGGCCATGAGACAAGTGGTACACCGAAAAAAAGTTATTGTTATTATTATAATCGCGCATTTTTTAATTTTAAGTTTAAGTATACCGTATAAAAACGAGAGTTTTGTAATGTGTCAATTGATGTTTTATTTATGTGT:1 + chr3L 10206258 5' - 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chr3R 15924691 5' + Quasimodo 55 2 65.28 GTAAGCGCTACTGCACATTGTACCTAGGTGAGTGGGAGATTCTGCGTATAAAGCTGTTTTAGAGGAAGTATCGTTATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 - chr2R 5923051 5' + jockey 4693 1 64.00 CACAAGCATCGCTCTTGGCAGCATTCACAAGTTCAAATAAGCGATAATAAGTATTTATGGGCGGGGCAAGCAGATTCGGTTTCTTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 - chr3L 13634334 5' - 297 366 2 67.12 CATCCAGGTACAGAAGCAAACAAGAATTAAACGACCCTTAAAAGCGTGCTACGTTTTTTTTGCTAACTAGACAATATGAATTTATGTACACATGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAG:1 + chr3R 6515279 5' + jockey 12 1 78.69 ATTCAGTTGCGCTCCAAATAGTAGTTTTAGTCTTAGCAGAGGAAGTAACTATATATAATCGGCGACCATTTAGTAGATCCTTCTGTTCTCTTTTAAGACGCGATCTTTTAGACGCGATATAAGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAG:1 + chr2L 18858574 5' + Cr1a 4376 1 56.16 AGCCATACACAGTTTTCGGAAAAGCCAAAGAGCTTTGGTCTGCTGCTGAGAGCCATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2L 245956 5' + roo 8687 2 68.28 GCTTACGTATTGGGAGGTTATACAACATTTTGCAAGCCCTTTTAGAGATTCTGAATCCTATATCTATCCGGTATCGGATTCTAAAAAATCATTTACATTTTATTTCATCTGGCATATACACATTAGGTTAAGTTGAGAAGGAACTG:1 + chr2L 16883834 5' + G5A 2795 1 60.96 AAACTGCAATTTGCGCAAATATTTGCAGGGCAAGATCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chr2L 2276766 5' + F-element 39 1 62.79 GAAGATTAAACCAAAACTAGCCAAAGGAATTCCTAATCCGGCTTAATGCTGTCGAATACAAATAACATAGCATACTTTGCACCAATTCGATCACCATAACTACTTGCTAGCTTAAAATCCGGATTTAACTTTTTTAAGTTATTGT:1 - chr3L 18078769 5' - HB 315 1 71.03 GAGGCAGCGCATTGTTCATGCATGCTCAAATTCACCGCGAACCACACAAAAAGGACGAGGGACTGCGAGGGGAGGTTGGCTGAATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 - chr3R 24476426 5' + 412 9 2 78.08 CGCCACAGAAAACAACAGAACATTTTGTTTTTATCCGCATCTGCATGCACTTCTAATGTTTATAAATAAATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chr3R 15885232 5' + I-element 50 1 52.05 ATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr2L 23310622 5' + 1360 38 1 51.61 GTGGGAATCGGATTTCGATTTGGGATCGGGTAATTTTTTGGGTGGCAATGCAGAGAATCGAGCTGGGTGGTTTGGTTTTTACTTTTTTCGTATAAGTTTTTAATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 9099255 5' + hopper 148 105 29.60 TGTTTTGTTCCCCCAAAAATAAAAGTTCACTTTAATTTATGCATTCAGTCCGAGGTGCTAATATTTCAGTGTGTTTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACGTA:2 - 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chr3R 28272537 5' - Tirant 8453 2 60.45 ACAAAATAGAAAAAATGTCTAAGTGAAATATTACTTAAATTTTTTCAGTTCAAGAACTCCAGCTTAAAAATATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr3L 18729824 5' - mdg1 375 2 50.35 AATCATTGCCTACTTTTCTGCGTTTTGCTTTTCCTGGCCTTCCTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGTTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr2R 23116195 5' + jockey 58 1 51.72 CTTGTGTTTCGGCTGCTTGGGTAATTACCCAAACTTATATTGTAATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGTAA:1 + chr2L 10184438 5' + Doc 69 1 67.16 GTGTATTTTTATTATTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGATCAATAGCCATGTCTGTCTGTCCGTATGAGCGCCGAGATCTCAGGAAGTATAA:1 + chrX 22963251 5' + INE-1 145 1 50.39 ATTGGATTGGCTTTGACATGGCAATCAATTTTTGGTAAAGTTATGAAAAAAACTCAATTTCTGCCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 - chr3R 24493177 5' + jockey 4685 1 60.19 GCTGAAAATTCAGACAAATTTCCAACGCAGTGTCACTTCAAATGAAATATTTGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTTTTCTTTT:1 + chr3R 27535431 5' - 412 7478 2 61.64 TTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCC:1 + chr3R 9190522 5' + Tabor 86 2 73.97 AATGTGACCGAATGGTGAACGCATTATCTCCCGAATGCCCTCGCCATACTGGTTGAAGAGCATCAATGGAGTGCCACTCTGATCCGTGGCCACATTCGATTTCAATACACAAATTATAAGAATCTAAGAGTACTTGTA:1 - chrX 12329830 5' + Idefix 7132 2 68.84 TAAATTAGTATTATACACATGATAGTAAATGACTGATAACGAGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAATAGTG:1 + chr2L 15945726 5' + X-element 101 1 71.92 ATACAGCAGGAGCTGGTCTTAATTGGAATGAAATTAAAGACGCACTAATTTTGTTCTGTGCCGACAAGCGAGACGTGCAAGCCCTAATGGCCGAATTATATGGTTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTT:1 - chr3R 2179080 5' - 412 7233 2 74.82 AATTTAATCAGCAGAAAAATGGAAATTTTGCAAAATGCTAAAAGCCGCCTGTCAAGTAAGTAATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATATTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTACAGATCCGT:1 + chr3R 9006097 5' + Cr1a 109 1 58.90 GGTACTAATGAACAGCAGAGCAGTGGAGAGGTATGTGGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAAG:1 - chr2L 6184085 5' - pogo 2019 1 76.03 CGTTCGTTTTTTTCCAATTAACGAGAGTGTGGATATTTATTTAACTCTACTATTAGTATGCACAAACAGCAGGATAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAACAA:1 - chr2R 22306104 5' - pogo 2058 1 54.79 AACCAGTTTTATGATGCATGCCGCAGATGCAAGCGCAGTGCTTTGTGCTTTATTTACGATATCCAAACCTGCAATCACTGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAGAGGTAAGGAACTCAGAGACAGGCCAGCGCCTTTAAGCATCTT:1 + chr3L 284638 5' + roo 497 1 55.17 AGGCGATCAAGCAGCCAATGGTGTAAGCCAACTATATAGCTTCATGTGGCTACTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTA:1 + chr2L 6870667 5' - hopper2 1550 1 58.27 CATAAATTGTGTGATTCAATTAACCCTTGTTGATTAATGCGGGCTGAAATGATACTCGAATGATAAATAATTTGGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTT:2 + chr2L 8168900 5' + FB 48 1 52.05 ACCGGGAACATCTCCTCGGACGAAGAAGTCTTAGAACTCGTACATACGGGTAGTGTCCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTG:1 + chr3L 25878699 5' - 1360 3325 1 70.55 GGCAAAAGCAGAGCGGTAGATGTGTAGTAAAAGAAGACGAGCCTGTTAATTTTTTCGACTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAAC:1 - chr3R 9190597 5' - Tabor 7262 2 58.90 CAGGATGGGAATGGGGATGGTGATGGTGATGGTGCTGATGCTGATGCTGATGATTCGGTGGCAAACATTAATCAGCGAATTATCAATTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATA:1 - chr3L 18433291 5' - mdg1 318 2 50.68 AACAAAAAACGAAAACGCTGGGAAATAATTTGAAGCAAATTTTAATTAATGCCGGCAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAC:1 - chr3R 27859272 5' - hopper 1353 1 58.90 ACTAGTAAGCTGGAACTACATGAGTAATAGCAACTATCTATGGGTACTAGGATTCCATAACTGGCCCTTTGGCATTGTTTGGGATCGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCT:1 + chr2R 22723011 5' + 3S18 5815 2 50.00 ACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTT:1 - chrX 1018150 5' + 1360 245 1 69.18 AACTGAATGGCTGACTATCGTACTACAAGCTTTACTCTCCTCAACGTTGATTTTATATTTCATTCTTATTTCGTAATATTTTATCTTGCCGCGACATTGTTTCCAAGTAATATTTAGTAGTTTAATGAATCTAATTTTATTTTTAA:1 + chr3L 1789223 5' - NOF 3957 1 76.71 AATATATATTTTAAATTATTTAAGTACCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr3L 7962224 5' - blood 7377 2 61.90 CTAAGCCAAATATTTTTGCACAGCTTTGTTGTTTCATTTATCTTATTCGCTTGTAGTTTCAACTAATGTTAGTTATTTCAACATATGTATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTC:1 - chr2L 1260040 5' + Burdock 6170 2 57.53 CAATTAATAAAAATCATTGCCTACTTTTCTGCGTTTTGCTTTTCCTGGCCTTCCTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGTTTTCACATTCGCATGGGAGCTGAGCAATCGAGCGGACGTGTTCACA:1 - chr2R 23116206 5' + jockey 26 1 68.80 GAATTACCCGAGTAACTCCACATTGCAGCGAGATATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCACGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1 - chr2R 17121662 5' + blood 86 2 75.17 AGTGGGCTACAATAATTTGCATGGAAAGCGTGGAGAGAAGAGAAGAGTTGAAAACTGCCTCGTAATTGCCGCTATTCGTCGCGCCTTGAATCGACTCCAGCTCTTGCTGTCATTATTAAATTGGTTGATTGGTTGACTAGCCTTAA:1 - chr3L 12991094 5' + gypsy6 238 2 53.42 GCTGCAAGTCGGATTGGCTGGCTAATTTGGGTTGTATTCGATATGTCGGATATGCAAAAGATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTT:1 - chr2L 12079706 5' - mdg3 5467 2 54.31 GTTTTGCTTTTCCTGGCCTTCCTCGAGGGAATTTTTCGCCTTGGGGTTTTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr2R 23116174 5' + jockey 73 1 64.75 GCTGCAGAGGCAGTGGAAGAGGAATTTAGGTTGCACGCGCCTTGGTGATTAAGTTATCCAGACGCTAGATCAGCCTTTTATTAGCGAGCTAAGTTAGGTTGTGCAATTTTTGTAGTTATATAGTAAACTTGTTTTTGTTTTGAGTC:1 - chr3L 25850577 5' - Tom1 386 1 71.92 CCCCCAACTATAATAGGAATAGTCTCGCATTTCGTAATTACTCACAGAGATAAAAAAAAGTCGATCTTATCTAATGCTCCAAATAGAGCAGTACATAAATTCTAGTAATAAATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chr3R 20988915 5' + I-element 10 1 79.45 GTTGCATACGGTTGACAACGGAATAAGAGCCATAAAAATGCGTTAAAGTTGCTACTTTATTTTCATTACGACAGAACCTCTTACACACACATATATAAATATATAAGTTAACGCAAGTTCGACTTGCATCAGAGTTCT:1 - chrX 10974465 5' - opus 7489 2 73.19 ACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr2L 17029584 5' + blood 54 2 54.48 ACATAAAAATATCTAAAAAGAATCGTTTGGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr3R 9352141 5' + Tirant 8114 2 80.74 CCCCTACAAAACAACATCAGCGAGCTGTTCTCGCTGTTAAACTTTCTGGAACCCTCGCAGTTCTCCTCACAGGAAGAGTTCATGTCTGAGTTTGGAAGTCTTCGCTTTTAGGCTTTGCATGCTTTTTCGTTGAGGATG:1 - chr2L 235578 5' - G2 246 1 76.09 CCAAGATGTTTACAAGCGACCAAAATATGACATCTTTCCAAGGTTAAAATAGCTAAGGCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chrX 18806247 5' - roo 351 2 58.57 AGGAATGGCTGAAGTTCCGAGCTACCCTTAACCCCTACCCTTTAACCCTTACCTGGGTGTGGGGGTAGCACAACACAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 30635057 5' + roo 8685 2 39.34 ATATGTCAAAATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTACGGCTCG:1 - chr3L 23940551 5' - Cr1a 4394 1 67.81 ATGGCCAAAGTTTGTCTGGGCCAAAAGGGAAAGCGGATGACCGGCGGTGGGGAAAAAGAGCAGAAAAGGAAACCACAATACCAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTT:1 + chr2R 21402574 5' - mdg3 5466 2 57.25 ACGAGTGAGTGCACAGAATGCATCGCACACGCGAGCCGATATCAATTATATTTTGGCCGGCAACTAAATGGCGGAAAAGCTTTCGCGGCTTTTAGTTAAAAGAAAATTTTTTCTTTTTTTTTATTTTTTAATTAATTTATTTATTA:1 - chr3R 20467737 5' - X-element 4715 1 72.60 GTCTTTTTTTTACATTTTTTTGAGTGGATTGGGGATTGGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGAGACGGATGTTTAGTCTATCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGG:1 + chrX 340307 5' - Idefix 158 2 78.08 ATAAATGTACTTAAAAAACAATCATAACACAACTTTTCTAATAATCTAACTACTTTTAAAATAACTTCATAATATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCA:1 + chr2R 3202640 5' + gtwin 6929 2 76.71 CCGTTGTGCACAGAAAACTGCAAATTAAGTATATAAAACAAAAATGTGAAGGTAAAAGTAAAAGTTATGAATTTAGAAATTGCAAGCAAATATCAAAACACTTTTTAAAAGTTTTGAGCTCTTGGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGG:1 - chr2L 2936568 5' - INE-1 214 1 51.37 ACAATTTGCAGTGTTGTCTCGCCTGCCAAATTTAACCCGAGGCAGCAGCTTCACTTGTTCGCCTTTTTTCACATTTTTGCTTTCAATTTTTTAGGTTTTTTTTTGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAG:1 + chr2L 7559637 5' - mdg3 230 2 72.60 CTATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 - chr2L 16884903 5' - pogo 2037 1 63.01 TGACATGCCGTTTTATTTGCCGAGCTCTCGTCTAGCCAACGAGCTTGAAATTGAGCTCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAA:1 - chr2L 686082 5' - roo 9013 2 60.00 CTTCACATCCACACACCATTTTCCTTTTCTTTCCGAGTTGCGTTTGTGTGGGTGGTGTGGGATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 - chr3R 15022159 5' + Tabor 6857 2 70.50 TCATTTTTGTGCCACTTTGTTTTCAAGGCAAGCACCATGTTTTGTAAATTTTCCAAGAGAGCGACTCGTGCCACTGGCATTGTCTATTTCAATTTCAATATTATGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chrX 4778317 5' - 412 473 2 70.55 GGCGACGTACTTAATTTTTTTCTATTAATGAAAAATAAACTTATGTAAGAGAAAATTTAGGTAATAAGACTACCAAAATCACTTAAGTGCGCTATTTCCATTTCGCCTTCACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTG:1 - chr3R 2555640 5' + Bari1 11 1 78.08 GCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCTTAACGCCA:1 + chr3L 22400259 5' + 1360 13 1 65.66 GGCCAGCAAAGGGGGCATGGTCGTTGCAGAATCGAGCCATGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAAT:1 - chrX 8755109 5' + transib2 83 1 72.60 GCTCCATAGCATTCATGCACATGCGACTTAGCTTTCGTTCCAGTTCTAAGTGACGGTAGGTTCCTCCCAGATTGTTAGACGCTGATATGGACGGACGGACGG:1 - chr2L 6039571 5' + micropia 5409 2 73.53 ATGGTATCCTATGTCACCAACGATCCATAAAGTACTAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAATTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTGATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTT:1 + chrX 22557857 5' - I-element 222 1 75.34 CATAAATCAGTCGAAGGACGAAGGGATCCCTTACCCCAAAGCCACGGACTCAACCCAAGACGTAACTCCCCATGTAGAAGATACTTTTTAATTTCAGTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chr2R 17121548 5' - blood 374 2 75.59 AATGCCAGACGCCAGCTCCCTATTTTACATAAAGTATACATACATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGACAAATTATATTTAGGAT:1 + chr2R 12543080 5' + roo 8742 2 71.92 AATGGCTTAAAGTCCTTTATTGTGCTTTCATAAATGCTAAAAGGAAAGTGCCTACTGCATACCATATGCTTAATATAAAGTAAATCTAATTTATTACCCAAATATATTAAGATATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 + chr3R 25768721 5' - copia 247 1 70.55 CGCAGCACAGATGCGATAAGAGGTTTCAGCTAATATCAGTTGGCCATTTGCACTTGCACTTGACAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCT:1 - chrX 22605591 5' - pogo 32 1 56.85 AAGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAGGTGTTCACATAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTTTGATCCATCA:1 - chr3R 6388784 5' + jockey 67 1 62.30 ATTTAGGTTCGGTTATTAATGATGAGTTATGGGTTCAGACCTCCTTCGGAGACGAGCGGACCCATCATCATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATT:1 + chr2R 8641492 5' - diver 6059 2 52.05 AAAATCAACTAAATGTATCGTTCCACATCGAAGCGACTTTTCACTCCGTGCTCCTGCTGCCGCCATTGAGTGTCCTCTGATGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 - chr3R 26520491 5' + FB 35 1 59.71 GACTTTCTTTATCTTCTGTTTGTATCTAATGTTTGCAGACAACTAAAGGCCCCTGGAGACTGCAGCTTTTATCACTCCATATAAGTCTATAAAAACGTGTATTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3R 27478625 5' - hobo 2921 1 73.29 GAATCGATTGTTCTCGCTGTCCTTGGGTCAGGGTCAGGGCCCCATTGCCATGAAGATGATAGATGAAGGCGTCAAAATGGGTTTATTAGGCATGGACTGGGCCCATAACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTACTG:1 + chr2L 17519105 5' - copia 241 1 54.79 CACCATACTTTGGACCTCAGCCAGCGTTTGGTTGCTGTCTTACTGAGATGTCCTTTGTAAAGTCTTTCCAACCAAAGGCACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGAC:1 - chr2R 2946094 5' - 1360 3336 1 61.64 CTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3L 14553201 5' + roo 63 2 60.96 GCCACGTAGCCATAATTAGCCAACTCGAGCTACAATGTTACTTGTAGTAGATACAGATACGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCCTTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr2R 22305981 5' + pogo 60 1 58.22 TATGAAGGAGACGCTCAAAGCACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAACTATTTGAATTAA:1 - chr2R 2875233 5' - TLD2_LTR 99 1 64.38 ATACGGCAGAGTGACGAGGCAGACGAAACGCACCAACGGTCGTGGTTTTTTCTGTGACAGTGCGAGATGTTTTATCCCAAGAGTTGGGGCATACATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGACG:1 + chr2L 21951083 5' + Burdock 6151 2 73.72 AATGTAGATGAGTGCTTGAGCACGAAGTGGGCCACATGTTAGTGGAAAAACTGATAAACTACACAAACAATTATCAAACCTTATACCCTCAAAG:1 - chrX 9038722 5' + Porto1 317 1 63.83 ACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCCAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAATTAATCACAAAGTGTAAAG:1 + chr3L 17707843 5' + Doc 89 1 71.77 AATGCTAAATCACTTTAGTTAACTCTTAATGGATTATACCCAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 - chrX 12191627 5' + pogo 61 1 66.42 TATAATAGATTATCATCTCAGAAGAGTACAATGTATTTGATTTTCCTCAGAAGTGTCCAGTTTTTTCCGAACTGCTTATTCTGGGATGTTATGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chr2R 10865120 5' - blood 347 2 57.53 TTCGCCGTGCTGTCAATTCAATTCTTTGGCTAATTTGATTCTCGAATCGGGAAGCAGAACATAAATGTGTCTGTTTGTAGCGAAGGAATACATAGGCCAAAAACATAATATCTTAGGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 - chr3R 15338182 5' - blood 7383 2 78.08 TCTGTATTTATTTTAATATCGGCTTTCGTTTGTTGAAGTCGATTAAACTATATGCAACGATATATAGTGTAGTATGCGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr3R 25904267 5' + 412 46 2 55.97 AGAGTACGGCAGCTCAAAGATGTATCCGATATTTCCACGCTACACAATGCTGAAGGACATGATAAAGGGCATCATGCACGATCCGGACTACATGGATATGCATATTGCTTCTTATATTAATTTGTTTTTCTTTTTCGATTTTTTTT:1 - chr3R 20911889 5' - Doc2-element 234 1 65.75 AACCTGCAATTTATTCAATGCAAGCTGAAAGTTAAAAGTTTTCGGAGGTTTTGGAAAACCTAGATATTTTAGGGCAATATAATATATAAAGAGAATATATAATATATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGA:1 - chr3L 22408786 5' + Ivk 10 1 73.57 CATTAGCGCTAAGTCCGCTTCCATAACAAGAGTGTGAAAGGTTTTGAACTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATA:1 - chr3R 15702987 5' + copia 74 2 68.49 TTTTCTTCTAAGTAGTAAGCAAACATCAGGTTGTTTACGATGGTAAATATTTATTCATTCAATGTTATATTGTCTTCGTGAATAGACATAGATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCT:1 - chrX 16384128 5' + diver 5909 2 69.34 ATAATAAATACATATACATATATTACATATACATACATATACATAATATCAAAGTGGTGACCCAGCATTGGGCCGGATACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACGGCATATTTGCGTTGCCGCTGCGAGTATTTGTCAGCTATAAGAA:1 - chr3R 24088059 5' + Gypsy6A_LTR 130 1 71.03 ACTAATCGGGGTCATGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chrX 1103563 5' + pogo 11 1 75.17 ATGCACGAGCAGCGTCGGCGACAGCTCATCCAAAGTTGAGCCATGCAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr2R 11609194 5' - roo 409 1 72.55 AAAAAAAAAATGGAGAGCGAGCTGTAATAAACCTATATATGCCACCTATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTT:1 - chr2L 9237554 5' - blood 7334 1 75.76 AATGCTAAATCACTTTAGTTAACTCTTAATGGATTATACCCAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1 - chrX 12191627 5' + pogo 72 1 67.59 GGTGGTTTACGTCCATGCTGAAGGTGGGAAACTTCGCTACGAGCTGTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTT:1 + chr3L 22648299 5' + Tabor 6915 2 67.12 AATATAAATAAAGGATGAAAAATGGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGCATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - 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chr2L 76116 5' - roo 323 2 81.51 CGAACCCCCGCATCCCACATACTATGCCATAAAACCAACGCAGGACATCGGCCGGATTTTTAATGAAACACAATAATGTTACTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCGCGAGCTCCTCG:1 + chr3L 11745248 5' - G2 2789 1 65.89 ACGCAGGCCAACATTGCTGATTTGGCCCGGAGAAAAAACATGGAAAACTCGTAAACTGTTTCTTAATATAGGTGTTTATAATAACTTTCGGGCATTTTTGATTAACTTAATTTGACTCAATTTAATTTTTTTTATAAATATGTAT:1 + chr3L 10279945 5' - S2 1623 1 72.41 GTTAGAGGCAGGGCTGCAACAACAACAACCCAAGGACATCATGTTAGCGGCTTTATTTGCACTAATGTCAGTCGAGCTAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTA:1 + chr2R 7723199 5' + I-element 5241 1 60.27 GCTAAATCACTTTAGTTAACTCTTAATGGATTATACCCAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGACTAGAAAATTTGTACGAA:1 - chrX 12191624 5' + pogo 76 1 68.49 GCAGCGAGGATATTATGCCATTTGTGCGAATGTTCACATTGAGAACTCTGTACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chrX 4785161 5' + roo 8713 2 62.90 GGATCCGTTGGTGAGCGCACTAACGTAGGCCAGCAATGTGGTCACATCTAGATTCAGTTCGTTCGACGTCGTGGCGTACATATAAAAATGTGAAAGTAATGAAGTTCCTTATATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTT:1 - 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Ivk 211 1 56.85 GTTTCTGTTTGCTGTCATTTGCATGAGTCAACCACGAGTGAAAAGAGACAATTTCTAAACAAATAAATTCTATTAAATTCTATGCCATCTTAATGTTTGTTATATCTATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chrX 13531550 5' - roo 395 1 69.18 TGAGTTTACATCAATCCCTGAGTGACGAGGTCAATTATAATTATTATTATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATAC:1 + chr2R 5917830 5' + I-element 5124 1 67.81 ACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 16884897 5' - pogo 2033 1 66.67 GAAATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGCTATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr2L 8956747 5' + pogo 60 1 64.39 TTTAGTTTTATGATCGCTTCCGACTCGACACCTAAGCTTCCCCTTAACCCATGTTGTCCAGGATTTAATTTCAATAAACCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTGTGCTCAGCCTAGATACCAAGGTCTTG:1 - chrX 9895335 5' + F-element 4216 1 55.00 AAATCTCTTAATTCAACATTCAATTTCTTGATGATCTTAGTCGGGATTTATGGGGTGACTGTAAGAGCGCCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTT:1 + chr3L 9572962 5' + jockey 4790 1 51.37 GGTAATGGTGCGGACTTTGGACGCGCACAAAGAAGACGCACCGTGAA:1 + chr3R 2533882 5' + gypsy8 4810 4 78.72 CAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCC:1 + chr2R 7727093 5' + BS 4689 1 59.59 GAGAAAAAAATATCAAAGTAAGAATGCCGGCATAGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACTTAGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr2L 17136117 5' + hobo 36 1 62.33 TGCTACGTTTTTGGCCATCCATTGCGGCGGCTATTGAACATTTTAATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGGGGTTTGGTTTT:1 - chr3R 14860218 5' + BS 5008 1 61.54 TATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATATGTAAGCAATGTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCT:1 + chrX 12657099 5' + invader2 74 2 67.81 AAAATTAGTTTTGAATAATTTCTGGCAACTGTTTGGTTACTAGAGAATAACATTATATAAAATTAATTCGATATTTCTGTGTGTTATCTTAATGTAGAATTTAATTTTGTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 - chr2L 8956890 5' - pogo 2098 1 72.86 TAGCAAAACAAAGTCGAGCAGAAAAGTCATTTTCATGTTGTTATGGCCAGAGTGCAGAAATTGTGAAAATCCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTT:1 - chr2R 17890981 5' + Tabor 6890 2 50.68 AACTAATCGGGGTCATGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:2 + chrX 1103562 5' + pogo 11 1 76.71 GCGTGGTCAAATTGTAATGAGCAAACGCAAATCGAAAATGCCAAAAATGCCAAAAGGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 + chr2R 19554928 5' + pogo 63 1 60.96 CGTGCCACTGGCATTGTCTATTTCAATTTCAATATTATGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGA:1 - chrX 4778251 5' - 412 7460 2 76.71 GGGGGCGTGGCATTGAGTGAATTTGACAGTGCGTATTTTTGGGAGAATGACAAACGCGCAGCTTCGTGATTAGAAAATGTTGCAGGTAAATGAATGGTTGCAAAAAAATATATTTTCAAAAAAAAA:1 + chr2L 18424943 5' - hopper 162 1 56.35 TTATTAACAAAAATATTGTATAATGAAACACGAGCGTATCACTTTTTTATTGTCGCTAAACTACTAAAAAATAAAAACATGAACAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr2L 76166 5' - roo 9037 1 62.33 AGAAAGCCATACACAGTTTTCGGAAAAGCCAAAGAGCTTTGGTCTGCTGCTGAGAGCCATCCGCTAAAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2L 245952 5' + roo 20 2 70.55 GTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAA:1 - chr2L 18279959 5' - gypsy5 343 2 70.54 TCGATAGTCGATATATCGATAGGGTGGCTGTGCAATGAATCGAAAGCTGGCGGCAAATTTTAAAAAACAATATTTTGGTCCGCATTAAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr2R 22492157 5' + pogo 32 1 60.96 AGGACTAAATATAGCACCCCCCTTGGCGCTAGAGGGTTAAAACGTGAATTCCGGCCACTAAAAATAAATGAGGGACCAAAGTTGAGCAGTTGGCAAACACAAAATAAGAATC:1 - chr3L 3492852 5' - Cr1a 40 1 78.57 AATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAG:1 - chr2R 5237884 5' + Doc 94 1 58.22 TATCTATGAGCAGGTGTCATCCTGCACACTCACCTCAGAACTATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr2L 16884943 5' - pogo 2077 1 67.81 CAACGCACTTGCAAAAACTGCTATCTAAACCACTCGGCGTATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAA:2 + chr2R 19553198 5' + mdg1 7119 2 71.92 GAAATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAA:1 + chr4 123938 5' + HB 110 1 58.90 TGGAGAACACAAAACCGAGACTGCAGATCGAGTCATAAAGATAAAGACTACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chrX 7515728 5' - roo 9005 2 66.91 GGTGTTGTCTATAGAGATTGGATAATTTATCAGTGACCATCCACTTTTCGAAATCTTTACCACGTTTGCTTCCGCAATCAGAGCAGAGCAGTTGATTATCTTAATCGCGATATAATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr3R 27478436 5' + hobo 8 1 74.66 AGACTGACAAACACGCACTGCGAATGTGTGTGTGAATGTGCGACTGTGTGTGTGTGTGCCTGTGACTGTGACTGTGAAGGACACACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 + chr3L 4001055 5' - hopper 1380 1 43.15 ATAATAGTTCTGCATGGCATATCCATGACATTACTGAACCTCTGTAGATCTGTGTGGCACCACAGCTCGGAGCCATAGGTCCAGATAGGTTTAAAGACGGAGTTGTATAGGAGAGCTTTGAACTCCAGGCTAAGTGGAGAGCGAG:1 - chr2L 22960171 5' - Doc 4227 1 56.55 TTAGAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr2R 10695900 5' - roo 9036 1 59.59 AGTTGTGGGAACGTGCAACAGCATGTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTA:1 + chr3R 17605631 5' - Tabor 425 2 56.16 AACAGTGGGTGTGGCCAAGGTTGTTTTATGTAAATATAGTGCACCACAGTCATTCGAAATCTCATGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 - chr3R 27768917 5' - 297 6922 2 56.16 TGCCACTTTGTTTTCAAGGCAAGCACCATGTTTTGTAAATTTTCCAAGAGAGCGACTCGTGCCACTGGCATTGTCTATTTCAATTTCAATATTATGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 - chrX 4778308 5' - 412 7517 2 64.38 TGGTTTCGGATTGCCAAAAAGGATAATTCGAGGGTGCCGGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGAACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr3R 27768761 5' + 297 15 2 71.23 CACCATACTAAACGCTTTTCAGACGGGTATTGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCC:1 - 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Burdock 232 2 68.49 GAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAGATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr3R 23639129 5' + pogo 47 1 50.68 AAGGACTTAAAAAAGGATTGAAGAGGTACCCTATTTTTGTTTGTTACCTTACTTTACTTTACCTTACCTT:1 - chr3L 9922513 5' - TART-A 13127 3 85.71 CAGGCACATTAAAAAAAATCTTAGCTATAACGTATGTGACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGATTGAAAATTTGTACGAAAATTC:1 - chrX 16787163 5' + pogo 81 1 70.55 GAATTAATAACCAAACTCACCTGATGTCTTCATTTGTTAAGGAGCCACCCCTTAACAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 14076298 5' - roo 345 2 59.59 AACATTTGGTGACCCTGACGTTCGGTAACATTTCTTTATCGTGAACTCAAAAAACAGTTTAACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCA:1 - chr3L 23728645 5' - Gypsy6A_LTR 363 1 76.03 CTTACTAATTCTTTATCTTGACAATGTGGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGT:1 + chr3R 2555479 5' - Bari1 1652 1 54.79 TCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGG:1 - chrX 21667939 5' + gypsy2 6548 2 68.35 CCCCACATTTACCAGCACTGTACTCTTCAGTTTCGATTCGTGCGTGCTTCTGACATTCGCCCATTTTTACATATAATCACTTTTGTGTTTTCGTTTAGTTTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTCCAC:1 + chr3R 17867713 5' - hobo 2922 1 71.33 AAAAAAAAAGACAAAGTTAATTTACTCGATTTGGGGCTCCGCTGCGCAGTTGCCGCGCGATCGCACAAGCAACTGTTTGTGAGCTCAAAGCTTTTCTATCCCAGGGTTCAAGTC:1 - chr3L 18423190 5' + X-element 263 1 75.44 CTTACACACCGGACAAGATTCGATCATCCGGAATTACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCAT:1 + chr3L 24934319 5' + HMS-Beagle2 74 2 75.18 TGAGCCAACGAGGAGTGGGTGCTAAAACTAACGGCACCTAAAACATTTTGCAGCAAATTTCTGGGCAAAAGCATAAGCATAAGCTGCACTTTCACCAAAAATTATGTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr2R 11057207 5' + pogo 13 1 74.66 AACTCAAGTTGAGTACGGTCGTGGCTGTGGTAACCAAACTTTCACCGGAAGTGGGCCAATAAAAAGTATACACAGAGATACACAGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCG:1 + chrX 13426109 5' + BS 1 1 71.93 ATCTGAGATTACTTTCCAAACATACAATAATATTCAAGGTTACCGAATGTTAACAAAGGCAGTTACCTTTGCCACACCTTATTAGCCCCCATCCAGTCGATCATCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 + chr2L 12079564 5' + mdg3 5261 1 76.30 CAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTT:1 + chrY 2346869 5' - micropia 402 2 54.81 TAATTATAGGAGCTTTAACCGAAATACACTTTTAAGCTAATTCTACTAAACCATAGAATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 + chr3L 27350470 5' - pogo 2047 1 59.57 AAATGTATTCCCATTAACTTGACCCGTTTTCATTGAACCGATTGGTAGAAATGTGCTAAACAAAAGACCCAGTGATGGTTCTCAGAATCT:1 - chrX 3397531 5' - F-element 4338 1 74.44 GAATGTGGAGAATATAGTTGCCGGCATTAAATGGCAGCGAGGGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 - chr3R 4528458 5' + F-element 34 1 67.86 ATTGCGGCTATTTTGGGGCCGACTTGAGACACGTGACCATCTCTCGGTCACTACCCACTAAGGTTGGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chrX 23155295 5' + blood 32 2 63.70 GGGGGTAAAATGCAATTTCAAGTGCAACCGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3L 14553246 5' + roo 18 2 73.97 AATGAGGCAGAAAATATTTGATTTGATTTGTAAATCTATTGAATATTTTCACTATTGAATTCACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAATTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 - chr3L 13374220 5' - pogo 2042 1 60.27 GGGTGACCTTGATGTAAAATACTAAAAATCCAAAAAAAAGCATAAAAATAAATTTAATGAATTTTTATTATATGTTTTTGTTAAAACTCATAAATTCAAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAA:1 + chr2R 8363223 5' - flea 4938 1 62.33 CATATATGTAACTCTAGTACTTAATTTACTGCTCTTCATTAGGTATCTTTCAACATCAACAATCAACATCAATACACTAAATAATATTAATTAAGAAAAAAGGATTAACTTAACTTCTGTAAGTACAACGCATATTGGTTACTTAA:1 - chr2L 2925041 5' + gypsy7 401 1 69.18 TAAATATTACATTTTTATTTCAAACCATAGACTCAATTATTTGTTGTATCTATAAAAGAGTGATTATTGTATATTTCGTCCGAAATAAAGTTTTTATTTGTTATACCCGTTACTTGTAGAGTATGAACGTCGATATCTCAGGAACT:1 + chr3L 455848 5' + INE-1 141 1 21.23 ATATAATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 - chr2R 5237888 5' + Doc 88 1 54.86 GGGTGGTGTGGTATTAGAATTTCTATGCAAATGTCCTTGTCACATTTGGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGAC:1 - chr3R 15022110 5' + Tabor 6913 2 65.75 CTTTTTTAGTTGCTGCCGTAGTGCTTCAGTGCTGACGTAGGCATCCCACACACAGACAATTAGAAACATGAATGCACTGTGAGAAACCAGCTTCGAGCCTATGGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - 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chr3L 11826432 5' - INE-1 88 1 66.44 GGACTAGCCTGAAGCTAGAATTAACCCATTGGTGCGGGAAGTTAAGTTCAATTGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGC:1 - chr3L 7962283 5' + blood 7080 2 63.70 GCCTCCGATCCGAACCTGGGCACATTGAACCAAATTGATCCTGAAAGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chr3L 22900098 5' + 412 66 2 67.88 ATATTCGACTTTTTTACATTAGTTTTCGCATAAAAATTGTATTGCATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCCTCATAT:1 - chr2L 2657314 5' - diver 6036 2 67.81 CCGGCAATTGGATTTTCCCGGTCTCACAACACGCAAAAGGGGCACTCGGAGAAAATATTCGCACATCTGTGCATTTCCCGAATAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAAT:1 + chr3R 13360480 5' + jockey 4972 1 61.64 GCATTACACATGCACCACGGGAGCCAACTTTTCGACAGCACTGTGTGCGCCCAGATTTTTCATCAACTTTTTGCGGTTGAGCTGCACACACATAAAGTCTTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCT:1 + chr2L 1841031 5' - Circe 7052 1 36.99 AAGTGGGAAATTAGGAAAGGTAACGATTCCCTGGTAGACTCTTTGTTTCTGTTTGTTGTGCTTGTCCAATTCATTTCTTGTTTTATGTCGTGCAATTTTCTCTAGAATCTCGTTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTC:1 + chrX 21504965 5' - INE-1 158 1 67.12 TTTCGATCCCTGCACTTTATTTCCATGACCAGGAGCGGAGCAGGTGGGTGGGGGGATGGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 23287435 5' - roo 394 1 63.64 GTGGTATGAGTGTCCGCAATCGCTCAATAACATTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:2 - chrX 10645043 5' + jockey 83 1 76.12 GAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATA:1 - chr3L 27415296 5' + transib2 80 1 71.92 ACAGAGAGAAAATATTAAAAAATACTTACAACCTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAC:1 + chr3R 25904190 5' - 412 7458 2 81.94 GATACATCGTTAAAAGTATCGCATGATAGTGAATATTAGTAACATATGTATCTGCGGCTCACACTTTTTTTTATTTTACGTACAATAATTTAATCAATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 5150243 5' + roo 8688 2 66.44 AACAACTACAGCTGAACTACGGACTCGGAACTCTCATTTAACGTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAA:1 + chr3R 13349058 5' - BS 5027 1 68.84 TAAAGCGTGAAACAATAGTGATACTCTTCATTACTCCATTACGAACCACCAGGCGTATGCCATTGCTGACCATTCAACTCTAGGAACAAACGCTTTTCGTCCGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 + chr2R 558042 5' + copia 4890 2 71.23 ATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCAAC:1 + chr2L 22036460 5' - R1A1-element 5281 1 77.98 AAGATTAACATTAAAAACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 - chr3R 11750281 5' + Tabor 6892 2 52.74 ACCGAGAACACTAACACTTTTGATCCTTCCTCTGGTTTCCAACTTACCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 16181221 5' - roo 8998 2 67.12 CGTCAAGTGGCCATTGAATCGGCTCGAGGGTCCTGAATTTTCCGGGGTCTTGGGGATACATTATATATTATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chrX 14551625 5' + 297 4 2 68.52 ATCGCTATTGCTATTGGAGATGTCAAGATGGGGCGGTTGCTGTTTGTTCTTCTGATTTGTTCCCCAATACTGTCATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 - 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hobo 2895 1 56.03 GATATGCGTAGATGGAGCGTCCCCATCGCGGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 11133527 5' - roo 394 1 69.57 GTGGTGTGCAAAAGTTACACTAGGCTACGCAATCAAAGAAGAGTTTTAAGTATGCGCTGAAGGAAATAAAATCGAATAGATTTGCTATTAAAAAGTGTCGGAATATTGGAGTAGGAAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAA:1 - chr3R 18873353 5' + copia 6 2 65.07 AGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3R 21705983 5' + 297 6628 2 58.59 AGGTGGTTAAAATCTACTCCGTTTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTCTTGT:1 + chr2R 8157164 5' + Transpac 53 2 60.00 CACATTGTACCTAGGTGAGTGGGAGATTCTGCGTATAAAGCTGTTTTAGAGGAAGTATCGTTATCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAA:1 - chr2R 5923038 5' + jockey 4727 1 56.16 AGAACGGAAAAATAGTATTTAAAACGACGCCCCCGACGACATTGACACAAAACATACACTCATTTAAACCACTTTTCCTTTGGAACCATAAAGTTAGTTGGTTACACTACTCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAACA:1 + chrX 17483517 5' + gypsy7 5008 1 65.69 GGTATATTTCCAATAAGCATAGATTCTTAAGTATGATCTTAGTTGTATGAATTTTCAAATAAATCTTAACTATATCCCTCTTATTTCTTTTAGGCTTCCTGCAAATCGAAAACATAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCAT:1 + chr2L 19701131 5' + copia 274 1 74.48 CCATGGATTGCCGAAACCGAGCAGACGAAGCGAAAATCAACAACAACAACGAAAAAATCAAAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 + chrX 4453693 5' + G2 3077 5 60.00 ACCACTTCATTAGTGCAATGATATGTTGTAAACAAAACAACTTTTGACCCTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACACT:1 + chr2R 5737086 5' + 1360 34 1 61.64 AGAATTGGAAGTTAAGTCAACTATTGTCATGAATAAGTTAGACTTAGAAAACAACCAATATAATTCATCAGTTTATACGAAAGCAATAAAGAATACTATTGTAAACTATTTATTTATTTAGGTACATGTCTAAAGTTATTATTTAT:1 + chr2R 2948031 5' - mariner2 799 1 68.49 TAGCCCGAAGAGCAACATTAGGGGCTCGAAGTTAACAAATGATACTATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAACCCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 - chr2L 22015994 5' + Tirant 42 2 59.13 ATATCATAGTAACGCTTACGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAA:1 + chr2L 19817835 5' - G4 3767 1 67.81 GTCTGTGCATCAATTAATTGTACTGTTCGGCTATTTATAGATTTTGCGGTAAATTCGCTAATAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2R 21371542 5' - roo 350 2 60.27 TCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chrX 4778171 5' + 412 7109 2 54.79 CGACATCGTGCGGGCACATATGTGCCCCACACAAACAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATT:1 - chr3R 4282035 5' - copia 5064 2 75.34 GGATGGATTGGTGTCCATGAGCGAGTCAAGGATTGTTTGGTGGCCAAATGGGTGGCAACAGTAAAGCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCGGACATATATTTAT:1 - 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297 6969 2 49.26 GGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chr2L 16948729 5' + jockey 4744 1 67.13 AAAGTTCTGCTCGTTTTCGGAACGCATTTGTGCACGAACCTCAAGTGGGACATGTGATTATTTATGTCGCCGTTGATTATGAAGTTTTTATTCGAATGAATTCACTTTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACCCGCATATGACGTGCTT:1 + chr3R 22860552 5' - Stalker3T 240 1 56.85 ATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAAGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATT:1 - chr2R 4261950 5' - invader4 210 2 65.96 AACACAGGGAGTCACGCATTCGGGCTAAAAACAAAAAGCCAAAAGGCTTGTCACACTTGGGTTGTTTCGTTTCATTTCCGGTTAACCACACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr2R 19655911 5' - opus 457 2 78.95 CCCATTTGGTATTTATGCAAATTGCAAGCACACAAATATTGAGTGGAATGGCCCCGGCCAAAATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTACAAACTACAACAG:1 + chr3L 17707812 5' + Doc 59 1 53.96 CAGCGCAGTGGTTGTGATGTAGCTAATTTAGATATTGCATCAGCCAGGATTACATGGGTGTCATATCAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTC:1 + chrX 13395230 5' + roo 8692 2 54.48 GCCGTGCCATGCCACCTGCCTTTGAGCCAGCTTTCGGCATCCCTTTTGCCTAGTTTCACGCTTTGGTTTTCCTTAATCGCTTAACCCAACTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr3L 17207878 5' + hobo 8 1 77.78 TCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr2R 10695782 5' + roo 8727 2 63.83 AAAGAACTGAGTAATTCAAAATATCATACCCCTATTTTCTTTTACATATACAGAGGTGGTCAAAGGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAA:1 - chr2L 18149517 5' - Bari1 1632 1 67.81 ATCAAATAGGAGTCCCTTATTTTGTACAAAAATAATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTTTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTA:1 - chr2L 22581932 5' - 1360 105 1 80.62 AGCGCGTACGTATGTATAAATTTGCAATTTTTATTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr3L 20713034 5' + roo 88 2 83.56 CTAAAAGTTGAGATGAAATAGTTCATGAATGTAGTTCGAGAACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr2L 17029543 5' + blood 7025 2 72.60 GCATTCGGATGTTGTTTTCGACAGGTAAACGAACTACGGAGTGCTATTTAATATTATAGAATGAGGTAAGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 + chr3L 16212710 5' - Transpac 262 2 52.05 AAAATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGGCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGCTG:1 - chr2L 23084410 5' - accord 7333 2 54.48 AATTCGTCCCATAAATCACGACTCCCAGGACACACGCGCCCCTAAACAAGATTTACGACCCCCGCAATGGCCGCCAATGGCTAAGCGCATTGAATTTAGATACGGCACCTTG:1 + chr3R 16811800 5' + G7 200 1 79.46 CAAAACAACAAAATGGCTGTAAAAACGTAAGAAAATGCTAAATTTATTTAAGAGTGGAAAAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTAAAAA:1 - chr3R 31609324 5' + Doc2-element 4763 1 66.97 TACTGCAAATAACTGCAAACTATTTGAAAGCTAAGCGCAATGGATTTAGCAAATATTGATGTATCTTAAATTCTAAATAGATACCCTTTTTGGTCTATCAAGACATCTATCTACCATCAGTTATTTTTTTTTTTCATAACTGCCG:1 - chrX 4067147 5' - HMS-Beagle2 475 1 83.45 GGATTGCCAAAAAGGATAATTCGAGGGTGCCGGAAAACCAAACGAGAAAGGTGCCATTTGCGTTCTGAAGCAACAATACGAGTATCGAACTGTAAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3R 27768768 5' + 297 21 2 68.28 CTTCGATCACACGTTCTTAGGTTTTTGACCCACAAATGTGTTAAGGGCCCAGGAGCTGACGTCGACTCTCTTGCCCACACCTTTACTAGTTTCACAATGACTTCTTAAGCTATAATTGAGCGTTGCCAGATCAAAACATATAAAGC:1 + chr2L 21928719 5' - Copia1_DM 29 1 64.38 ATTCCGATCCTTGCCTGGCACTGTGTTCGTCCACAGTTTCTTCATGAAGAAGACCTGGTAAGTGAACTGTGGATAAAATTCTTTTGAAGTGGTTTCCAAGTTATACTCGACGAAACACAGGGACACGTTAGAACTTTCTGTTAAA:1 + chr2L 15046234 5' - transib2 371 1 49.66 AAAAGAATCGTTTGGACTGTCGGTTTTTTTTCACTGTACGTGAGCATACAAAAATATATGTACGTTAGTATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr3R 9352126 5' + Tirant 8113 2 78.99 CAGCGGTCATTGTTTCGCGTTGAATACTGTGTATCAATTACCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAA:1 - chr2L 3294198 5' - hopper 1337 1 69.86 GTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGATCCCTGCACATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATATATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTG:1 + chr3R 29288741 5' + BS 5059 1 65.89 ATATCTTCAATCAATTTTTGTACGCGATTTGCTACATTTTTTGCTTTGTGTGCATTGACATGACTGACAGTACAGTAAATAACAGAGTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chr3R 4581823 5' + 297 23 2 67.15 ATTTAGATACAGATGGGCTCCGGTTTGGGTTTTATTTTAAAAAGCGGTGACTTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 + chr3R 26191615 5' + hobo 68 1 64.38 GTTTTGTATATTTTCTTTTCGGGGGCAGTAGGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:2 + chr3L 20712989 5' - roo 318 2 81.51 CTAAGGACCGTGAAACCCTACAACTCCATTCGTTATCATCAAAGACATTAGAAATATTTGGTGACGGCTAAATTGACCTCTCCCCGCTCGTGTGAAATTGAGAAAAATCTAAAAATTGAATTTGCGTGCTAGAAGACAATTTTCGG:1 + chr4 430909 5' - 1360 3197 1 73.29 AGGCGGAATACTTTTTTGTAAACAGCGAATGCTCAAGCTTATTCCCGTAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATATATTCTTGACCAGGATCAATAGCCGAGT:1 - chr2R 4886552 5' + INE-1 91 1 61.64 AGTTGCAAACATATTTTGACTGCGAAATCAGAATGGCGAAGCGGACAATGTAAAGCGACAGTGTGTGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 + chr3L 6775341 5' + blood 33 2 56.45 TACAGCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr2L 9668280 5' - 1360 3350 1 55.20 TGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3L 19349997 5' + jockey 57 1 52.80 TTCCACTCCTGGCAATTATTGAGCAATGCCAATGCTCGGAAAAACAAAGACGAGAACTCTGGGATTTACTAGGGCTATCAATTTTCCTGGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 - chr2R 21402722 5' + mdg3 35 2 60.96 GTTGTCGTTGCAAGTCTCGCCTCTTACGCTTTTTTGTTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 + chr2L 3395706 5' + jockey 4745 1 73.13 CTCAGCTATCGGCAATACATTTCTGCAAACTTTATTTTATGTCCAAAAGTGTAGGATCCTTAAAAATTTAAACAACCACTCGCAAATACACTCATAGATCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACAGGCATGCT:1 - chr2L 18722726 5' - Circe 7384 1 60.27 TGGGTTGAGATGTGTAGACTTTGGATAAAATAAACAATATTACGAAAAATAATAAAATGAGAAGAAACTCTCACAACGTCGGCGTCACTAGAAGCTGCACTCCTAATCTATTGCTTTTATAGGCGATATCGACGTTCATGCGGACA:1 + chr2L 20840102 5' - INE-1 132 1 78.77 CACGGAGATTTTTGATGTGGAAGAGGCACGCCACCAGGAGCAGCAACTTCCAGAGCCGGAACTGGAGCTGGATCACTATTACGGCCTCAATTTAAATTTCGAGTTCGCATTCCCACTTGCTGAGTATCTGATGGTCGGGGAACTCG:1 + chr3L 1351374 5' + INE-1 559 1 64.38 TACATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATA:1 - chr3R 21276657 5' - BS 5066 1 56.85 GGGAAACACTGAAAACAGAAACAGTTGATGCCACAAAAGGTAAGTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chrX 7980870 5' - hobo 2921 1 56.67 GCAACAAATGGCAGGCGGCATTGGCGATGACACCGAAATTGCAGTGCAGCAAACACACGCCGAGACCTTGAGCCACAAATCCAGCGCTAAATGTGGCAGAAAGAGCACAGTCATGATTAAAAGAGCCAAATGCTTTACTAAAATCA:1 + chr2R 11045159 5' - Q-element 315 2 76.71 ATTTGTTTGAATTTTTAATTAAAACGCTTTCGTTGACTCATCCTCAAAGAAATCGCGATCGCACATATGTTTTCGGTATTTTTGGATATTCGATTTGTCGATTACATAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 + chr2L 436412 5' - copia 240 1 76.03 TATTTTAGCTTATTGTAAAGCTGATGATAAATTTTAAGTGCAAAATTGGTGTAAATACATTCACATCCTCGCAGATCCTTGTGGTTTCAGGACACTGTGAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCAC:1 - chr2R 10972975 5' + Bica 4624 1 65.07 TGTGTGTGTATACCAAACAGTATACGCTGCGCGTTTTTACTCACCTGCCAGGTGATGGCTATGGGGATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAG:1 - chr2R 5826831 5' - I-element 5067 1 53.85 TAGAATACACATTGGGTCAACTTAACCTAAAATACAATCGCTATCTTACGTTCCGCAGTTTCTCTTCCGGAGTTTTTTGCATGCAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCCTCC:1 - chr2R 2563012 5' - gypsy 7409 2 54.11 AACGTCAGCACAATCGCTCTGCATGGAAAACCATGTGCAATTGACTTGCATCTCATCGAAGAACTCCCCCTCAGTTTTCTATTTTTTTTTTGCGCCCCCTTTTTT:1 + chrX 4758798 5' + Cr1a 25 1 76.19 GGGGTAAAATGCAATTTCAAGTGCAACCGAAGAGAGAAATCTTGCTGAATAATAGCATATAAGAGCAAAAAAGAGAGTTGTGTAATTAGGAAGCCTGAATGCACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAACGACTTACAAT:1 - 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chr2R 8305300 5' - roo 335 2 68.49 GATATTCAATTTCATTTTTTCAAATATTATAATTCATTTCAAATAACTTGAAAAAGTCTATTAAATACGATCAAAGATCTTTTAATATTAAAAATGTGATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3R 17546581 5' + blood 7037 2 66.44 ATTGGAAAATTATCATGTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:1 - chr2R 5237883 5' + Doc 86 1 56.20 AAGGAAATATATGCCTTATCATTTCATAGTACAACCCAAATGGATATTCCAAAATGGCATAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGGGCTAAGCTTTTTGTCTGA:1 - chr3L 20255249 5' + Transpac 4976 2 59.59 TCAGCAATTATTTTATTTATATTGTCATTGCACACATGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTT:1 - chr3L 6775424 5' - blood 7332 1 72.03 GATAAAAAAGTATACTTTATAGAAAAATACTAACCATTAGCGCTAAGTCCGCTTCCATAACAAGAGTGTGAAAGGTTTTGAACTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 - chr3R 15703021 5' + copia 40 2 58.22 TAGTAGTATCTCGACCACTGGTTGCTAAATAAACAAACCCATTCAATTATGATTATTAAGCTTAACAAATGACTAAAGCAGATGACAAGCGCTGTCGCTGCGTTGAAGCTTTAGCATTTGACTGCCTCCCTCTCCGTTTGCGATCT:1 + chr2L 7677656 5' - 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chr2L 2720371 5' - F-element 4278 1 74.66 AAAGTAAAGAGATATTTATGCAGGCATCCAACAATCTGGCTAAGCTGTAGGCCTAGTTTGGTTTATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr3R 25670716 5' + opus 37 4 55.73 ATTAATGAAAAACAAAGTAAAAGCAAAAAAAATGAGAAAAGTAAACACAATAAATTACATTTTATGTACCTTCTACATATATAAACTAAATATATTACACAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAG:1 + chrX 3388853 5' + I-element 439 1 69.86 ACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTATCAATAAGTTTAAAATCTTATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAAT:1 + chr3R 15095980 5' - F-element 4319 1 60.27 CCTCATGGAAAAAACTTAGTCCGCCCACCGTTTTGTGGAGAGGAAAACTCACTCTAACAATATATTTCCGCACTAAAAAAATTCTCACCGCAGGTTAAAATTTTTTCCAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 - chr2R 5022733 5' - copia 244 1 77.08 ATTCGCGAGCAATTGCTGAAAAACTTGCCGAAAAAAAGACTCTGCCTTGTCTACAAATAGTAATTCATATATAATGAATTATTCAAGTGAAACTACTGCGGCTGATAAATCATTGGGCTCCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTT:1 - chr3L 23821899 5' + X-element 391 1 40.41 CTGGAGAAGAAGTCGAAGAACAACATCCAGTGGCGCTGCGGGCAGTCGATGGTCAGCCAGGAGCGTTCTGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTACACCAATAAACACACACTCAAC:1 - 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chr3L 19483082 5' + pogo 8 1 65.75 TAGGATGATAAATTGTAGAGTACAAACGTGCCATGGCAATGGACATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCG:1 - chr2L 16089665 5' + 3S18 5827 2 64.34 ATTAACTAAGCTACTCCGGAGCGGGCTGGAAAGTCTCTGCTGGGCATTGTGGCTCCTCCTATTGCTTGGCACCGCCAAAGAAGAACTTGTACTCCAAAATGTGTTGGCAATGAGTGTAGAGTTAAGAACTACGCGTAATTCGGATT:1 - chr2R 7535653 5' + invader1 3873 2 60.96 AAGTTAATAAATGTAACAGAGAAAGATATTTGAGTTGGTTAAAGAAATTGTTATTACGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGTCTTGATTGGTGGATTAGGCCCACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGG:1 - chr3L 23597302 5' + invader4 2735 1 60.47 GGAAAATCGTGTTAGAATCAAAACACTGTGTGCACTCTTTTAATTGGATTTTTGCTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTAGATGCTTAAGTATTTTGAGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGG:1 + chr2R 12459497 5' - 17.6 7175 2 67.59 GCACTACAGCATTCTACGCTGAATGTTTTAATGCTCTTAACTATAATATCATACTAAAATATATTTCATATTAACACGAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 - chrX 16902364 5' + I-element 23 1 62.40 GTGCGAGATGTTTTATCCCAAGAGTTGGGGCATACATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCT:1 + chr2L 21951142 5' + Burdock 83 2 79.45 TAATGATATTATCTTGAAAACTTGGTCTAAGATATTAACAATTGGATGCATTTTTTTTTTGAACATAAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:1 - 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roo 9051 2 58.88 GTATTTTTTGTTGTTGTTTTGTTGTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCTGGTATGA:1 + chr3L 23797652 5' + Helena 1157 1 56.16 GCTTCGTAACATTTTTTAATACGTTTATTTCTTTGTTTGATCTTTTATTTCTGCTCGGGTCTTATACACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 - chr2R 641991 5' + opus 28 4 66.21 ACTAATAAGCGCCTCATTTCACATGTGAAGGGCCCAATTACACTGGCCAGTATTAAATTATCTGTTAAATTCTTAACAATCAGATAAAAATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTTAG:1 - chr3R 9266862 5' - Juan 387 1 57.53 CGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCCTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3L 22400253 5' + 1360 23 1 60.00 ATGTACATACGTCAACAAGCACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 - chr3R 9352057 5' + Tirant 8138 2 72.00 ATACCAAATTTTCCTATCCAATGATGGCCATTTTTTACCGAAGTGTAAGTGATATGGGAAGAGGGGGTAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - 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chr2L 21762430 5' - INE-1 549 1 56.85 AGTGAAAATTCGAAGCAACAGTGAGCAACGAGTTGAACTTTGCATATACATACATATATATATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACACTTTATCTTTATTCACAGTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCG:1 + chr2R 20489368 5' + 3S18 5827 2 54.48 CTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCACATAAAATAAACTAAATAAAA:1 + chr2L 13792590 5' + F-element 89 1 69.18 AAACTTTTTCCCATCAACAAACTTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 + chr3L 22052727 5' - mdg1 384 2 60.27 GAGATTAAGTCGGCAGAGACAAGACCATTATGCAAAATTCCCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1 - chrX 6481345 5' + hobo 81 1 71.92 GTCAGGCATCCGAAGCTAAGCCAGATCCACTCCTGCTGCATGCTGCAATAACCCACCGAAAGATAGATTGCTAGCAATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 + chr3R 29418649 5' + mdg3 35 2 53.73 TAGATAGGTTTCACTTACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3L 14553087 5' - roo 9026 1 52.74 ATTTATAAATAAAGTTGTGTTAGTTCGTTAGATTTTTTCTTGCAGTCATATAGAGAATTATTAAGGAAGAGCATTGAATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCG:1 + chr2L 11574797 5' + Max-element 24 2 63.49 CCGTATTTTGCGTTCTTCCGTTATCTGGTCACACTACCTTCTCTCGATCGATTGCTTAAGAGCGGCAGAATCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAGTACTCTGTAAGGTTCATGCAACTCATAGT:1 - chr2R 5266513 5' - Cr1a 4167 1 67.12 CTTAGCTTCGTAACATTTTTTAATACGTTTATTTCTTTGTTTGATCTTTTATTTCTGCTCGGGTCTTATACACCGTTTAAAACAGCGTATCTGTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr2R 641995 5' + opus 7141 4 68.49 AAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATA:1 + chr2R 4730085 5' + gypsy8 305 1 79.17 CAAAGAGGAACATAATCACTTTTGTCGGCAACAGTTAAATTAAATCCTGTGAATATGCACAAGCACAAAAACACAAAGTAGCAAGGACCCAAGACCCAAAACATTCTAATTGCAATAAAAAGCAACATTAACTGGCGCCTAACGTG:1 + chr2L 16384449 5' + gtwin 487 1 64.38 GAAGAGATTTTATTGATGTTTAGAGACACAGACCAAACTCCAAGAGGGAAAATGTATTTAAGAGCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGTTTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGGAGAG:1 - 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pogo 472 1 72.31 ACACAAGCAAGGGACTTGCTAAATCACAGATGTTCAACAATTATTGCATACTTTTGGGAGATTCATAAAATTAATGAAAACTCATTGGCATCACATCCTGCTCACCGATGAATTACTTTGACTGGCAGTCCCGGCGAG:1 - chr3L 15362972 5' + Rt1b 4988 1 62.32 CGAATATTGCACAGAGGTAAAGTTTGCTACACGCATAGTGAAACGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chrX 3996504 5' - roo 332 2 71.23 AAGAGACGAAGCAAAGCCTTTCCCGAAGTTCAAAGAAAAAGAATTCCCTGAAAAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAAAATAAATAAATAACAAAAACGAAGATCTCGAAATGGTAATTGAAGACAGCGCAACTAATTCTGCTA:1 - chrX 22404229 5' + G4 140 1 52.74 GTTTTATCATTGTTATATCATTTCACAATTCGTTTCGTTCGTTATGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAAT:1 - chr2R 5237867 5' + Doc 111 1 69.86 AGTATTAATTGGTGATGGGATAAACCTCGTCGAACAAGAATAAGCGACTAAAAAATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCT:1 - chr3R 395237 5' - accord 7372 2 76.03 ATTGACTTTCGATCACACATTATATGTATATATAATATATATTAGGTGGGTTACTTTCATAAGGACCATAGGTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - 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copia 233 1 58.22 ATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCATACTTTTGAGGGCAATAGGGTGAAATAAAATAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGT:1 - chr3L 21144050 5' - jockey 4921 1 63.01 AAAGTACATTAAGTGCTTAATTTCGATTAATTACTTGTCTAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr2L 16884757 5' + pogo 16 1 67.12 GGTTATTTATGCGTCCTGTTTATGATTTTATGTGCTTTCTATGCTAAACAGATCGCCAGCTCTAAGGTGACGTCATTTATTCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGAC:1 + chr3R 30230164 5' + roo 96 2 57.14 AGTAAGTAATTTCGAAATTTTAAAAATACTTTTTATAATTTCCAAACTTTTAAGACAGAGCCAATCATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGC:1 - chr3R 27510179 5' + Bari1 41 1 50.00 AGTGCTCAGTTTATTCCAGGTGCAGCCCAACGTTTAATGAGCTACTAATTCTCGAATCCAATCTTCAATAATGTGCAAATAAATATGCACTTATGTTGTGGGATCTTATGACACTCTTCTAGTATAGCAGCTTTCAGTGCTGCTTG:1 - chr2L 19257736 5' - S2 1303 1 63.70 AATGCACTCATATTAAAGAAAATTCATGTGTATACACTTTATGATCGAAAGCATCGAAATTGTTAACAACTTGATTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTA:1 + chr3R 23648914 5' + INE-1 151 1 70.91 GGCTAAAAGGGCAGCAGTATTGATTAAGTCGGCCGCGATGGCAATCCCTTAAGATTCTAATTTATATCAGCGGCAAAACTTATTTCCTATTTCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr3R 28272181 5' + Tirant 15 2 74.44 GGTTGATATATGCAATTTCCTCAGTGTATATGCAGCTTTGCTCTTTTTGGGCCTTCTTCGGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGCGCACGTTTGCT:1 + chrX 14951106 5' + P-element 59 1 44.06 GACAGGACCTATTATTTAGAACGCTGTTGTAACAACTATCTTGATTGTTAATATAGGAACATGACAAACACATATAATAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCTTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAG:1 + chr2L 65055 5' - X-element 4512 1 56.03 TATATGGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr3R 23639101 5' + pogo 9 1 76.12 AGGCAGATGGAAATGGAAATTAGATGCTTTCACGAGCCACAAACAGTTCACACTTACACACCCACACACACACACTCACACAGTAAAGAAAATGATACCAAGGTGACACAAAATTTAGATGCATATTATTATATAACTTATATTGA:1 + chrX 19416423 5' - Doc2-element 4696 1 73.29 CAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAACCCGGTATAGTAGTAGTATGTGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTAGTAGTATGTCAAAACCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTT:1 - chr2R 5924402 5' - jockey 4736 1 29.45 GTAGTTCGAGAACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAATATTCGTAAGTATACAAAATTCAAATAAATAATTTGTAGTATGCGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr2L 17029573 5' + blood 44 2 54.11 TAATATCAATCAAATCTGTGAACTAAACAAATCAATAAAAAAGTCAAGAGACTTCTATCTGACAACGAATAGTGCGTTGAACTAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCACT:1 + chr3L 18030948 5' + invader4 3 2 76.52 ATAACTTGGATTACTGATATTTGTAATACTTATCAAAATATCTACACGCGTGTTATTTAATAATTTAAATAGTAAATTGTAATAATATTGTTAATAATAGATGCAAACTAAAATATCTTGAATAATGTTAAAGGATGGGCAAAGG:1 + chr2R 14524295 5' - FB 960 3 44.83 TAAAATTTCATTTCATTTGTGTAATGAAAATGAAAGTGAATGGTGTGTGTATGTCTGCGTGGGGATGTATCTATGTCTAAGAATATGGTTCAGCACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chrX 12866522 5' - roo 399 1 75.78 CCCGAGTGTAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAA:1 - chr2L 16948754 5' + jockey 4722 1 51.37 GGAGTGGGAGGGAGTTGCAGAAATGTCGTTGATTCCGTGGTAGTTGTTTGGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAATTGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCG:1 + chr3L 5493278 5' - I-element 161 1 59.38 GCACTGAACGCAAATTCGTTTGAAGTTTATTCAAAAATTACTCTTTAAATGCTTAGTTGTTGAAATTGTTAAATACTACGATATATAACTCATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:2 - chr2L 2698479 5' + I-element 28 1 63.01 ATATCTAAAAAAATATCTAAATTGTATAAACTTAGATCATTTTTACACACATCGTGCTGAATTTGTAATTAGTTATAAAGTATCTCAGCTTGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chrX 19537025 5' - roo 9041 1 61.64 GTCGCCCAGGGAGGTGTCGCTGGACTCCAGGGTCCGCGAGATCGTCAACCGGAACATGATCGAGCCCACGACGCACTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACAC:1 + chr2R 17797482 5' + invader2 4858 1 59.68 AACTGTTAGACTTTTGATATTGATATTGGCCATATAACATATGATATCACCACTATAGATTGCTCATTTTGTCCTTGTTTAAAAACCTACTTGCTCGAAGCTGTGTCAATTTAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:2 + chrX 4778125 5' + 412 10 2 77.40 AGTGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTTTGGTGTTTTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACCTT:1 + chr2R 1879498 5' + Cr1a 267 1 97.74 CACGGTTTGAGGGTCAAAGAGTGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAG:1 + chr3L 7995449 5' - P-element 2788 1 19.86 GCAACACCAAAAGTTATTTTCTTATGAAAAATTAAATCATTGTGCTTATTATAACGAACGTAGAATTAATATCGTCATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chr3L 15026796 5' - opus 458 2 53.42 GTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATAT:1 - chrX 1018155 5' + 1360 240 1 69.18 ATTCCTAATTGCAGGAGACAATCAGAGCTTTAACTATGCAAATTGTAATAACTTGAAGTTAATGTTCAAAAGACATCAAAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAA:1 - chr3L 4582212 5' + roo 8657 1 56.16 GCCAAAGAATTGAAAAATTTAACAACTTGTTGTCAGCTGCTCCTTAACTAGAATTCTTTGGTTTTAATCAAATTTATAATGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3L 18467304 5' - hobo 2930 1 74.58 CGGCAAGATTATGATTAGCACAATTCGAAATGGTTTTGAGGTGTCAATTTCTATAGTCTATGTCTGTTTATAAATAAAACCGCC:1 + chr2L 16089583 5' - 3S18 342 1 71.43 GCTGGAGGAGATCTTCGAACGAATGGAGCGCAACTTGCACCTTGAAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr2L 13792589 5' + F-element 43 1 56.44 GATATGTAACTCTTTCTAACTATAAACTAAATAAAATTAGCCAAAAAATTAAGGAAAAGATTATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCGATGTCTATCACGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCTCC:1 - 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roo 8997 2 71.23 TGGACTACTCACTGAGCTCTGCGCACACATTTGGCGGTATTGATTAGAAGTTGCGACATTGCGAATTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 1523675 5' + jockey 18 1 77.52 ACAAGTTAATTCAACATTAACTGAATTAGCTCATCGCATGTTGGAACTGATTGTCTCGAGCTGCACTTGCGCCGTCTCTTTATAGGCCGCGGGGATCCCGTTATTTCCCCTTTTGCGCACGGCC:1 - chr3R 1320157 5' - gypsy8 304 1 74.19 AATTGTTCCGTATTTATTTTCGTATATTGGTGTCTCTCTTTCGTTTTTTTAATATATACAGGGTGCAGCAGCATAATTTCCTTTTTTCAGAACTCAATGAAAACTATTGTAGGCATCGGAAAATATTTATTTATTTTTATAATG:1 + chr4 649238 5' - mariner2 827 1 76.39 CGTATCCCCACCCCCATGATTGTGAATTGATGTGTGTGCTGTGTGTGTGTGAATGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTG:1 + chr3R 26427335 5' - accord 194 2 60.45 ATAAAGAGTTATTTTTAAAGTATATTGTATAAGAGCAGGGTTTCTGCACTGCTTGCAGTATTTACAGGAAATAATCCACTGTGGCCACCACTGACGGTCTTTTATTCCTCTTTCTCGAAAAACTACCCAATGTTCAACTTTATCAT:1 - chrX 22696159 5' - looper1 1507 1 71.92 ATTCAGCTGAAATTCAACGGAAATTTAGCTGACACTCTGGACTTGGCATATTTCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGCAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 17114028 5' - 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Burdock 6316 2 69.18 CTTGTATAGACTATATATATTCTTGATAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAAT:1 + chr2L 13154259 5' + Juan 80 1 69.18 ATTTCAAATTTGTAGCCGCTTTTAATTTGGTTTTTTAGTGCCCAGTTAGACGTATTTGTAATTTATGCTCCTAAGACCTTTTGCTGATTTAAAGTATCTTGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 + chr2L 5601514 5' - mdg3 5476 2 69.66 TAAATCTAAAATCCATTTATTTACCATGTTACCATTACATAATGGGAATGCTCGAAGGATTTATTTATATACCATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGC:1 - chrX 10161214 5' - micropia 5404 2 55.40 ATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTGT:1 + chr2L 23299989 5' + invader4 385 1 73.85 CTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATCTTCTT:1 + chr3L 2725013 5' + Ivk 107 1 77.24 TACGAGATCAGTGAGGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGCGCTTCAG:1 - 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mdg1 7402 2 56.85 ATGGCACTGTAATTTTAAAAGGACTATTTGATGAAACAACATTTAAATATTTAAAATAATTTAATTTAATTAACTTACAAAGCTGTTTAAAAGTATGCAACAGTACTTTTTCCACTGAAGTTTGGAAATATATATATGTATATATA:1 + chr2R 14443770 5' + 1731 4408 1 83.56 CAATTTTTCAAAAATGCAAGCGTTACACTTTTTATGCGGTTTATTTAAACATTTTTCAAAATGTTTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTTGGAAACATACTAATGCAAAAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTACCCGATTATCAGAT:1 + chr3L 27551 5' - INE-1 560 1 69.18 GCAAATGTGTGCATTTCCAAATTGAAGAACAATTAGTATGCATGATTTGTTTTGGATAATGAAGCCGAAATTTAAATAATATCCACAAGAGAATGCTATAATCGAGTTCCCCGACTATCAGGTACCCGTTACTCAGCTAGTGTGA:1 + chr3R 11470799 5' - INE-1 538 1 58.62 AGAGGAGGAGCAGGAGTGGCTACCTGGGTTAATGGCCTGGGTCATCATCTGTGCGGCGCACATGCATGGCAAATTACTGAATATACAATTACAAAATACATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3R 5925571 5' + roo 80 2 68.49 GGCCCTTTTTAAAGTGCCATACCCCGGACTTTTTCACTGTTTTAGATTTTCGCACAGCGACATGAGGAGGATAATGGAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 16562966 5' + roo 44 2 55.48 TGAATATTATATGTAGAATATTTCTAGATTAATTGCGTCTACCAAAAAGGACATTTTCTAAAACAATGAGCGAGGAAGTTAGAAGTACTTTCTAAGATCTACATACAAAAATTGTGCTCCTTTCCAGTGAAAATTTAAAAAAAAAA:1 - 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copia 239 1 66.44 TGTGTGTGTTTCGTGTGCGTTTTAATAGCTTATGAAAGGACTTTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chr3R 28396612 5' + jockey 88 1 70.55 CTAAGTGGATGATTTAATGATTTCGATTTAACTTTCTTACAATTTATATTTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3L 19482952 5' - pogo 2033 1 67.81 GTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGAGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGACCTGTATGGGCTCCGTGGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGG:1 - chr3L 16047625 5' + Cr1a 494 1 42.75 TAAAAGGAAAGTGCCTACTGCATACCATATGCTTAATATAAAGTAAATCTAATTTATTACCCAAATATATTAAGATATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGT:1 + chr3R 25768758 5' - copia 5079 2 50.68 CGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCC:1 + chr3L 23456268 5' - Gypsy6A_LTR 265 1 65.47 GTGGAGGGGGAGAATCAATATCCAGAAAAGATTTATGTCGCCCGGTAATCGTTGCTAAGGTCAGGACCAGAATCTTTGACTTGCCTCATTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTG:1 - chr3R 31897308 5' + HB 10 1 64.38 GAACCGAAGCGCACTGCAAAAAAATAAGGAAGAGTAGTCACTATGACAGCACTGAGAAAAATCCTTAATAGCCTTAAATCTATGCATTAAATTCAGAAGTTTAAGAGCTCTATTTCATTATATAAAGTAAAGTAAAGT:1 - chrX 16856871 5' + TART-A 13105 1 79.71 ATCATCATCATCGCCATTGCCATCATCGTCGTCATCTTTTTCTTGTGCACCGTCTTGTGTCAAGTAATTTGGGTTCTTTGGGGGATGGTCGGGATATATGTATATCTATATGTACGTATGTACGTTACCGCAAGTTTCACTTGCAT:1 - chrX 8380397 5' - opus 7498 2 76.03 ATATGTAGTTCCGGTTTCCGGATTTGATTGAACTTGGCGGAAGTTGATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 + chr3R 29733031 5' - opus 446 2 63.28 ATCTGTATGTATATGTATATTAATATAACCTATAATATAGGTGACTCGTTGGCAGTCTTTCCAATAAACAGGTATTTTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr2R 641835 5' - opus 459 2 58.90 TGGCACATCTAAGATAGGGTACACAAATCACAGGAGGTTTATGAAAAATATATGGAATGAAAAAAATTTAGAAAAAGTTCAAATACTATTTTCAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 - chr2L 12658616 5' + Quasimodo 19 2 50.00 GAAAATTATGAAAAACTTTCAAGAGTCTGAAACTAATTAACTTTGTATCCAGGAGATAAGCCTCTTATAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGCAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTTATTTTATCTTCATTTGGT:1 + chr3R 11113169 5' - mdg1 7400 2 52.05 AAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAA:1 + chr2R 7727122 5' + BS 4718 1 62.33 GTAAGATATGCGTAGATGGAGCGTCCCCATCGCGGAGGTCAGGCTCAAGTGTCGTCGGGTGTAAATCATATTTACAGTGGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr2R 11133523 5' - roo 9032 1 58.33 AGTCATAAAAATTAATAAACATATATATTTATTATACATATTTCATGATTAAATGATTAAAAATGCACATTTTAGTTATAAATGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr2R 8305333 5' - roo 9032 1 56.85 GAAATGCGAAAACTATACCACCTTAATAAGCAAATCTAAGAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1 + chr2L 8956747 5' + pogo 73 1 68.28 CGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTT:1 + chr3L 2724971 5' + Ivk 22 1 62.28 CATCAATCCTAAAAGATCTAGTAGGTAAACTCCTTAAACTTTATCGCCTCCTTAGGTAAGCTTTTTCTTGAACCCTGATATTTAATGTTCAGTTACCCTTAACCAAAATAAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 - chr3R 17656526 5' + mdg3 5261 1 76.71 ATTTATTGAAATTGAAAATGAAGCAATGCGTCAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAGAGAGGAGGTTTGTTAAAGTTAAAGAGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCA:1 - chr2L 22018850 5' - Tirant 172 2 60.00 CAGTTTATCAAGCACAGTGGCAATTGACTAGCAATAATTTCTACATATCTATGGAAAATTCAATAAGAGAGGGTTCACAGTTTTATTGAGTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTA:1 + chr2L 1259880 5' - Burdock 226 2 60.96 GACTAGTGAAACCTATTCATATTTTACTTAAAACTACATTTAAATTTACCAACTAATTTTTGAAATAAGATAATCCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chrX 10567881 5' + roo 45 2 50.68 AGGTGCCGTAAAACTATTAAAGCAATCAGCAAATCACTTTTCACTACTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 14456488 5' + hopper 146 105 58.57 GGAGTGAAAAAAAGCGAACTATAACAAATGCGAATATACCAAGAACACACACAACTACACACAAAGACACGAGGTACGGGAAGTCAAAGAACCAGAACAACACAAAAAAAAACACACAAAACACGCACATATTCACACATACTGCG:1 - chrX 1623562 5' + accord 197 2 60.96 AAATGTTCCGTTACACATTCAAAAGGCGGTGACGTGTTTGTAATTTTTGCCCAACTAACTTTTGTGGGATGTTTGTTGTTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr2L 246112 5' - roo 9037 1 61.59 AAAGGCGCACAACTATTTTGATTGCCACAATTTGTCACAGAATAAAATAGGTGAGAGGATTTGGCCCGCTGCAATTCAATTTAACGTTTTTGGCTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTA:1 - chr2R 21414509 5' + BS 5073 1 65.75 CTAAATCAGTGAATCTGGCTCCTTTTGGTCATCCGGCCCTCGCTCCCTCTGATTTCCTCCTTCGCTGCTGTTCATTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTA:1 - chr3R 19692406 5' + Juan 4154 1 52.41 ATACAGGAATATTTCCAAGTTGCAAGACAGTTGGTAAATAACAGAGTCATAATCACAGCGTTCGGTAATATATTTAGTTTAACATTAGGTTAAACTAATTTATTGAATAAATAAAGTCTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr3L 19792319 5' + pogo 1 1 60.27 AATCACTTTAGTTAACTCTTAATGGATTATACCCAATTCGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAACATTTGTACGA:1 - chrX 12191620 5' + pogo 75 1 70.21 TGCAACGCCCGGAAAACTTAGGAAGAGGTGCTGAAAATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAA:1 - chrX 5858970 5' + hobo 78 1 72.66 GAAAACAACAGAACATTTTGTTTTTATCCGCATCTGCATGCACTTCTAATGTTTATAAATAAATTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTT:1 - chr3R 15885225 5' + I-element 57 1 56.85 GTGGCTTTCGTCACTTGCCTTGATGTTTTGGGAGCACTTGGGCACCGAGAGTGGGAAAAAGACAAATTAAACTGTTCTGAGTGTATTTGAGTTTCGTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 18658855 5' - roo 9053 2 70.00 GATGATGTGTGAACGTTGGAAACCAATTACGTCGTGAATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAG:2 - chr2R 19352041 5' + Burdock 6217 2 73.29 CATAAATATTTAATAGGCTTGTGGTGGAATCACCAAACCTAGGTATAGATTTACCTAGATATAGATTTATGGTAAATTAAATCTAAAAACAACTAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr3L 4187327 5' - pogo 2077 1 67.81 ATTTAGGTTCGGTTATTAATGATGAGTTATGGGTTCAGACCTCCTTCGGAGACGAGCGGACCCATCATCATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATA:1 + chr2R 8641492 5' - diver 178 2 51.08 GAGGTAAAGTTTGCTACACGCATAGTGAAACGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chrX 3996517 5' - roo 8989 2 79.29 GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGGGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCATGT:1 + chr2L 20360644 5' + micropia 4965 2 67.86 ACAATCATCATAAGACCATCATGCCATCGCCATCCCAGTTGATTATGATGAGCTCTGGAGATCTTTCCAGTCGAGTGCCTGGGCCTTTTTCAACCGAGGCTCTTTACTTTGCACACACTACAACATGGATATAAACACATACT:1 - chr3L 3713507 5' + hopper2 1180 2 72.73 GTACAAGAAATGTCGAGATTTACGAGATCAGTGAGGACAACACAATTCGTTCTACCTTCCGAGAACATTGCTTGGTTGGGAACATGATGACGATGATGATGATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 - chr2R 8641639 5' + diver 5894 2 74.62 TGGCTTAACTAAATATTTGATGTGTTTTTGTAAATAGAAGTATTTGTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr3R 13122475 5' + blood 7047 2 59.29 CTTAATCTGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGAT:1 + chr2L 17550605 5' - Transib-N1_DM 449 1 78.08 AAAAGGTATTCAGCTATCCAGGCAAATCAGATAATTTAATTATCCATTTACATTAAAAATGTCCAATTTACAAGTTAGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTAT:1 - chr3R 11113288 5' + mdg1 45 2 54.79 ATTCAGCGGAGACGTCATCGGCCGCCAAATCTGTCAGTGCGTCCACTTCCGTTTCGACAACTACCAAAGCCAAGCACACGCCCATTCGCTTCACTCTTAAAAGTGACAACTTGCACCTGCAGCCTTAATCCTGCCCTTTCTTCACT:1 - chr3R 24315801 5' + Chouto 6103 1 72.60 ACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCCTT:1 + chrX 1103618 5' + pogo 47 1 60.32 AGGATAAGCTAGGGATAGAGCACAGAACATTAACTAGTTGCATTAAATTAACCAAAGGCATTAAAAAGAACTTAAACTATTGATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATA:1 + chr2R 14047600 5' + mdg1 40 2 53.79 AAGTGTCCAAAGATTGCAAATTTTATTTTTTGGTACCATTTCTGGTACTTTTTGGCTCATTTCTATCCATACAGTGCACTGTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTTGCTGT:1 + chrX 3464159 5' - hopper2 1562 1 48.28 TTATTCTCTGTAGGGGACTCAGTTGAGGAGGTGATAGCAATTTCAGGTGAAGGAACTACTTTCGCGTGGCCACTTTCCAATCCGTAGATGTTGTCTGGCTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGC:1 - chr2R 5581198 5' + Cr1a 477 1 65.22 AAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2R 10695869 5' - roo 9005 2 65.07 TGCTGACTTAGTTTGCCGTGGGATAGCTGAGGTCCTTCTGTTTGACCTACCGAGAGAAAACAAAAATGCTCAGTATTATCAGAAACTACAATATTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr2R 5868240 5' - pogo 2077 1 66.44 GGAAATGAAAAAAACGAAAATATCACGAGGCAAAAAATTCATCAAGCATCCGCATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 - chr3R 4528417 5' + F-element 61 1 64.29 ATTTGTTTTTGGTTGTATCAAAACAAAAATCCAATCAGCGGGTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 - chr3R 23240289 5' + jockey 88 1 70.34 CACACATACGATTAAGTTTCACCCCTCGTCGGTTGAGCTGAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATTCACTAT:1 + chr3R 15711792 5' - diver 6060 2 63.79 GCCAGGCGGAAAATCGAAAGAGAGAAAGTGAGCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 - chr2R 10865220 5' + blood 89 2 77.40 AGATGGACAAAGTTTCTACCATGAGAAAAAAAAATTCAACAAAAGTTAAAATGGAGAAAAAAGAAACAGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr4 1219145 5' - 1360 3370 1 65.22 ATCTGTTCGCTTTCTGCTTGACTGATTTATGGTCTATATTTATTTTTATACATTGCTTTATTTTTATGATTCCGTTTCGTGTCTCGCTTTTGAGTTTTGAATTACAATTATTTATTTTTGGTTTAGTTTGTCGTTTTTT:1 - chr2R 19534487 5' - gypsy7 5022 1 66.91 TATACTTACTTTACATGATCCTTTAAAGTTTTAAATCCCATTTGGTAAGGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGGTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGAGAAAGAG:1 + chr2L 12349772 5' + F-element 107 1 62.14 GATTTATGCACCCGCACACACCGACATTCGCGCACACACAAAAACACACACACACACACA:1 - chrX 9381204 5' + gypsy3 421 5 66.67 CTAACGCAATGAAATCAGAGCAAATACATAAAAGAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 - chr2L 12319313 5' + copia 42 2 68.00 CAAATTACAACAATTTCCCATACGACGCACAGAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr2R 11609239 5' - roo 320 2 78.62 CTGCACATTAAGTGCACTGCTAACGAAACCAGCTCAAAACCCTCAGGTTAGAAATTTTAAAGAGTTAAGAGATAGCGGATTGATAACTATTATCTCGATTCATTTACATAAGATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAA:1 - chr3R 22118279 5' - roo 25 2 60.96 TGGAAGGAGCAGAGAAATAGAGTGGAGGCGAGATAGAAGAGATAGTGCATTTTCCAATTGATGACGGCCAGAATTGCCCTCTCTTCACTCGCGTTAAATTGGGAGCATAAAAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCATGTGTGAGT:1 - chr3R 9156178 5' - 1360 3256 1 58.22 GCTTGCCGCAACCCTACGCTCCTTTTACTATCCATTTTCCATCCTAGAGCCGTAAAACTCCCCCACCTTCACTATCAATTACTCTCATCAACCATTCGCAACTC:1 + chr3R 23622169 5' + G5A 241 1 78.85 GTAAAATGGGAAATGCGAGATGGAAAGGCGGTATGTGTTAGCTGCCCCCGTTAGTTGCTAGTTGCATTTAACTGCGTTGCTTTTAAATTTAAAAACAAACTTGCCAGGGCCTTTTGATCGAGCATATTCCATCTTTC:1 + chr3L 14919375 5' - Copia1_DM 476 1 53.28 GGACACTGTGCAATTGAAGCACTCCTCCATTTTATTCCTTCCCTGTACATCTTAGCATACCAACTCAGGTGGCAAAAAACAACAAAATCCGTGTGAAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAATCA:1 - chr3R 26246941 5' - 1731 291 1 63.70 CTAAGCCATTCTTTGTTGAGTTATCCTCTGCATTTGCTTGGAATTTAAATGACAGTATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGTGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAA:1 + chr3R 7739443 5' + I-element 66 1 65.75 GTGCACAAAACTTTGCAACAACAACAGCGGACCGCAACAACAAATGCGGCATATAAACGAGCGCATAATGAGCTCAGTAGAACTTCCCGCCATGGATGGATGGATGGATGGATGGGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3L 11336281 5' + blood 3 2 80.00 CATAATTTTCAATGCAGATCCGCTCGCTTTAATCTCTTTGATGTTGTATCCGACTGCCGACAGACTTATTTTCTGGCAGCGACATAATTCAAGCCTCGAAAGCGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAA:1 - 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chr2L 634508 5' + invader5 3869 2 50.00 ATCATGAGATAAAGCCCTCCCGATAAGGGCATAAGCACTGTGATAACCAACAGCAACAAGAGCGTGGAAAAATGGGTCAACAAACTTGTGTCTGTCTCTAGAATCTGTCTGCTGCATCTCAACCTTCTAGCTTTT:1 + chr2L 21329501 5' - INE-1 165 1 54.81 ATTAATGATGAGTTATGGGTTCAGACCTCCTTCGGAGACGAGCGGACCCATCATCATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATT:1 + chr2R 8641506 5' - diver 157 2 61.64 ACAGTTGGCTAGCATGCGGCAAATGGCGACAGGTGTTTCAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGCAATATAGTC:1 - chr2R 13644560 5' + Burdock 6150 2 74.31 GTCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGATCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCC:1 + chr3L 25782375 5' - Stalker 57 4 56.55 GTGTTTGCGCTTTAGCCAAAAGTTGGCGTTGGGCCCATTTTTCTTTGGCTTGTTAGACGTTAGCAACCGAAACGGCGGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACG:1 + chrX 7522454 5' + Bica 312 1 76.79 GCTCTGTCATCGATGATAAATGTTCGCTGCATGTTGCACAAGTCTTTGCAATCGGCTATCAACAATGGACTCTGGGATATGTGAAGAGGGGCGGGGCATGCTACAATGCAACCCATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr3R 28627540 5' - copia 248 1 78.77 AAAGGCTTTGATTCCATGCTTTGTTTGGCCTCTCAATTAGTTGCCTCATTGCATGACCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chr2R 20865756 5' - 412 450 2 54.84 TGTTACCTCTGGTATTCGAGCCAATAAGTTCGGCCACGAATTCGCATTTTATCTTTTGCATTTTTATTATTTTCGATTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGAT:1 + chr3L 11773069 5' - mdg3 5054 1 62.33 GTTGGCAGCTGCCAAAGGGCCACTAATGATGACTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3R 12599052 5' + 412 7101 2 69.90 TGAAACATCGGACTGTATATCGTCGTCTATACTTTTGTGTGAAGATGATGAATGTCAAGATGATAATATTCTTACAGATATAACAGGTAGAAGGAATCGTTTCCGTCCATATGAGGTATATATTCTTGATCAGGATCACTATCCGA:1 - chr2L 21366386 5' + INE-1 89 1 45.89 ACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr2L 9485663 5' + 412 7125 2 70.59 AATCGCCTACTTCTTTTAAAACTTGCTTGTGTTTGTACCGTTATCAAACAGAGAGAATACGATGAGAAATGCAAAAGATTTTTGTTTTGCATTTCCTTAACGTTATTATAATTTAAATATAGCTTAGAAATAGCCGAATCTATGTA:1 - chr3L 24767842 5' + 1360 338 1 50.68 GGACTTTGCTTCGGCTTTTTCTCGGAAAGGATTTTCCCATTGAGGAAATGTAAAGAACTATGTAATGCGATACAACACACGAGGTCGTGAGCATGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAG:1 - chr2R 8788005 5' + invader4 2746 1 60.87 CTGGGCGCCGGGCATTTTGAATTCTTTGTTACAAATATGTATAATGTATGTATCACCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGAT:1 - chr3R 29323266 5' + accord2 135 2 76.40 AATTAACTGCTGATTAGTAGTTCTTCTTTACACTTGACACTGCGCTGGCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3R 22100522 5' + 412 74 2 66.21 ACCTTCGTTAAGAATCTCTCTCCCGACGTTCTCCATTTCGTCAGGTTCTCACTCCGAATTAGCGATAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 + chr2R 7665737 5' + Transpac 4960 2 54.14 CATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCC:1 + chrX 21772471 5' - gypsy3 6571 1 52.04 ACGAATATACCTTTTAGTATACCGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCTGAGAGCGCAAGAAATCTAAAAAT:1 + chr2L 22113016 5' - 1360 3279 1 63.08 ACCGAACAGTGGGTGTGGCCAAGGTTGTTTTATGTAAATATAGTGCACCACAGTCATTCGAAATCTCATGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAA:1 - chr3R 27768921 5' - 297 6926 2 53.42 TATAAAACAAACGACTTGGGGGGGAGAAACATGAAATACTGCACCACATATGAGTTTACGTGTGTAAATAATGTAGTATGTGCCCATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3L 16358647 5' + 412 50 2 52.11 CTTGTGGTCATTTGGCTGCTTCGTATTAACCTCTGAGATTAGCTGGCATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCCGCAGGCGACTCGGGGC:1 - chr3R 19859691 5' + opus 69 4 65.07 AGTTGATAAACGTACCCATAGTAACCCAAATAATTTTTGGACTGAACACCTTATGCACGAGCTATAGACCTTCGATGGTTTAACGCAGTACCAGGTTGGCAGTATGGGAACTTAGTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCT:1 + chr2L 3260771 5' + Burdock 6055 1 53.42 GGCTGTGGTAACCAAACTTTCACCGGAAGTGGGCCAATAAAAAGTATACACAGAGATACACAGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGCGTCGCGCGTATGTATAAGTGATCTATTTTGCT:1 + chrX 13426131 5' + BS 38 1 47.29 ACTTCATTAGTGCAATGATATGTTGTAAACAAAACAACTTTTGACCCTTGCACATAAAAGTGGAGACGCTTGCGCAACACAGTTAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr2R 5737089 5' + 1360 17 1 69.05 AGACCCAGCTGAGTCGATAGGAGGTAAACAAATGTTCTGGCCAGATATGTATGTATATATGTAGTAATAAATATTTAGGATCGTAAATGAATAAAGTATGCTTTTTAGATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACC:1 + chr3R 23859775 5' + jockey 4774 1 76.71 TGTAAATATATATACAATCTAATGTATAAATATAAACATAACGATTTAACAGAACATAATCAGGGTCAATTCCCTAGAAACTCGTTTATGTTAACAATCATAAAACGTATGTTTAATCATATAAAATGGTTATTTTAAAAAGAATT:1 - chr3R 13353462 5' - Tc1 1495 1 69.18 AACCAAAAAAACAAACAGCATAACGAAACAAACGAGAAACCAACAATTTGGCAGGAATAAAAAGTACAAAAAGTGCAAAAAAAAA:1 + chr2L 14178316 5' + Juan 3951 1 62.35 TGACTATAACTAACTGCTATTGCTATTTACGATACGATAGTTACGTGGTACATGGTTGTGGATCTATATGGTATGGTACATATACGTTTCTATATGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3L 13868596 5' + 412 20 2 68.12 AAATTTTGATTACGTGAACTTTTTGAGCGCATCGCACTTCAACTTTGTTGTCCTTATGCAAAAAGTTATGTACATGGGATTATGTTGCTGTGAAAAGTTGTGTACGATGCAAGTTCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAA:1 - chr3L 18709640 5' + F-element 159 1 71.23 AGCGGATTGCAAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGATCTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAA:1 - chr3R 29288816 5' - BS 5078 1 58.33 CTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 + chr2R 10695784 5' + roo 70 2 66.44 GTTTAATAATTATTTGCTCGGATTTGCGCTAGATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:1 + chr3R 13122520 5' + blood 83 2 75.35 AGTGCACCACAGTCATTCGAAATCTCATGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGGTGACTAAGGACAACGCCAAGCAATAAAAAATAGTCTTTAGGAGAAATAGTTTCA:1 - chr3R 27768880 5' - 297 6895 2 75.74 TAGAACAATTCGCGGGGGAGTGGAGATCAAGCATAGGAATCCCATAAAAAATTGCTCGAAACAGCTGGGGGAAATAATTTTGGGCGACACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTG:1 + chr3L 2724959 5' + Ivk 41 1 57.24 TTGTGGGAGAAGCAACTCGTCGCGTGCGTCGTACGCTTGCTGGTGAAAAGTGCGCTGTGAATTAGGTTTTATTATCTGTGTTTTACAGTTTGTGTCCCAGATATGTATGTATTTACAGCTGTGTTCAATAAAATAGCAGTGCGAGG:1 - chr2L 21795428 5' - HB 1422 1 62.33 GCCACCTTAGATGAGATACGACGCATCTACTTCAAACTGGCCAAGTGGCATGCAGTCAGCTTGAAAGTGCAGCATGAGGTAAATTGTTAAAAGTTGTTCACACATGAACACGAACATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 25304691 5' + roo 8683 2 64.93 ATTCTAACAAAAGATCACTTTTGGAATTGGCAAATTATATTCTTTGGTAAGTCAAAGGAGACGGGCGTAAATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCT:1 + chr2R 7020538 5' - Bari1 1655 1 54.79 CGAACTGAACAATCTGCTCTCCCCTTTTTCTATGCCTGTGTGTGTGTATGCAATATGTGTGCTTGGCAACGACGGAGAGCAAGAGTTCGCTCTCTGGTCTTGAAAGGGCTTGAGCGTTTCCGT:1 - chr2R 20617916 5' - Doc4-element 91 1 53.66 AGTTTTGCGCATAGAAAACCATGCATTGACTCTTATCCCATGCATTGATAAGTTTTTTAAGACATATGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAGTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr3L 4115228 5' + 1360 55 1 56.16 AAGGCCATGAAAACCAGAATCACTTGAATGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGG:2 + chrX 957993 5' + roo 8756 2 82.88 TCTGAGATTAGCTGGCATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 - chr3R 19859660 5' + opus 165 4 81.63 CATAAACGGGCTTAGTCCATTAATTGCGACGTCGACGAACGCGTGAGATACGCCAGGCATTGGGCTCCTCGTATGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGCATGTAAACGTAATATGAGAAGCATAT:1 - chr2R 14157031 5' - rover 10 2 50.00 ATACCGGATTTCATCGCGATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACAC:1 + chr3L 24291964 5' + rover 57 2 60.96 GTTGGGAAAGGGGATTGAGGAATGAGGATGGGCTAGATGGGTTATACCGATGGGCTATATAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGC:1 - chr3L 14294444 5' - Quasimodo 197 2 58.62 ATGATTGATTGAAAATTCATACCAATACAGGAAATGATGCTACAGAAACCTATATATTGGGTTATATACAAAATATTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTG:1 - chr2L 11574928 5' - Max-element 8505 2 59.69 GTCGGAATCCTACGACACGCCCGCATAAAAGAGCCGCCCACGGAGAAGGTGAAAAATGCACAGCTTCTTCTTCCGACGTCTGCTTTTGTTTTTGTTTTGGTCGTG:1 - chr2L 17328918 5' + pogo 278 1 76.19 AGCTATTCTTGTGCGCTGCCCTTGTAGGTTTTTCTTGTCTTTCGCCCGTTTTATCCGTGCTCCGTGTCCATGTCCGTTGTTACACGCGTTAGTTGTACAGTAAATGCCGACATTAGAGTAATAATATGCTTAACGCCATACGATTT:1 - chr2L 6875022 5' + 1360 21 1 54.79 CGAGTGTTGTTGTTGACGTCGTTAGCCGGGAAAAGTGTGAAAAGTGCCTAAGAATGATATTCAAGCAGTGGCCCTGGCAGGCCCTCACCGACTTGATTACTCGGCTTAACTT:1 + chr3R 6278654 5' + Cr1a 4083 1 77.68 GATATGTGATTAGGGGACACGGTCCCCTATTATACCCATTGCGCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAAAATTATATTTCGTTCGTATTTCCACTACCTGCGTAACGGGTATTTGATAGTC:1 + chrX 22957861 5' + INE-1 549 1 44.83 GTTTCTGCATTCTTGAATTTCTTTCCCTGTGAATATTGTTTCTAAAACATAAAAAAAAACAGCTTATGATTTGCCTTCGGTTTTTATTTCCGCGTGTTCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAA:1 + chr2L 12319205 5' - copia 231 1 65.07 AAATTCTGCTGCACATCTCCCCCCAGTTTCAGGTCCAACTTTGATTCGCCTTTGTCTTCCTCTTGGCCACTCCGATGTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAG:1 - chr2L 11322071 5' + 1360 98 1 55.40 GAAGTGGTCGCAAGATTATGGCGACATCACCATCTAGTCTGTTCTAGCCAATGATCCTGCCCTCCTTCATCAATCCAATTTGGGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr3R 24041588 5' + opus 7028 4 61.94 GAAGTGTTACAAAGGGACAGAAAAGTTAAAAGGAGATTACCAGTCCAGATCAACCATGAAGATCCAACTAATTGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 16181120 5' + roo 48 2 51.37 CCTTTCTCCTAGCCTGGCCTTTTTTCCTGTCGTTGAAACGTGTGTCCAGCGGAAATGACAACGACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAT:1 + chr2L 13704677 5' - hopper 1359 1 54.79 TATACGATACTAAATATATGAATATGTATGCATATGTACATACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCACAAGCACATTTCGAGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTTACTAAACTTAAATA:1 - chr2R 5412748 5' - Tc1 1561 1 72.60 ATTAACTCAAACCAAAATAGAACTTTTAATGAATTAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAA:1 + chr2R 4312920 5' + gypsy 7022 2 59.59 ACTTGACTTCCATCACTGCTGTCATTGCTTTCAATATAACAAAACATCAGACCAACGTCGACGTTTGTAACTGGAAAATACCCCAAAACCTGAAACTGGGAGAGCGAAAGAGCGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTG:1 - chr2R 5427505 5' - Cr1a 272 1 66.44 AGATCAACGAAAGAGAATACAAACTCGATTGCCGCTAATAAAGCCGCCGAAGATGCTGTGAGAAATAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 - chr2L 1558729 5' - 412 439 2 55.48 GTGATAGCAAAACTAGAAAATGTAATACAGTTTAATTAAGATTAACATTAAAAACCAGATAATTATGATTCGCAACTTTCCAACTAAGAGTTTCTTTGTATGTATATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 - chr3R 11750318 5' + Tabor 6855 2 75.34 ATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTT:1 + chr2R 5617485 5' - invader1 376 2 52.85 GACAGCTTAATTACCTGGAGCCTATAGATTTTGCTAGCATATTGTGATTAAAATCAAATCATTCCTATTCCCTTTGTTTCAACATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chrX 14964588 5' - roo 9035 1 58.90 CTAGTTTCACGCTTTGGTTTTCCTTAATCGCTTAACCCAACTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chr3L 17207829 5' + hobo 63 1 67.42 GGGCAACGAGAATGTATATAAAGGATCATTTAAAACCAGTTACTAAAGTCACTTTTTTTAAGGCATACGGAGTAGCTGAAAACCCCTTTGTCACCTTGGTGACCCCTTTCAGGCCCGCCGGCTA:1 + chr4 353435 5' - BS3 1693 1 58.06 TTCTATCACAACCTGCTATATAAGCAATATAAGTTCTTGAATCAAAACAATCTCAATCTCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 19536896 5' + roo 60 2 62.24 AGAAGAGGCGTAAATCAAGGCGATCAAGCAGCCAATGGTGTAAGCCAACTATATAGCTTCATGTGGCTACTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTAT:1 + chr2L 6870650 5' - hopper2 1560 1 53.42 CAAACTACCTGGATTTTCTGTATGCATAAGTTTGTTCTAAAATTATCTTTAATACTTAATAAAAATTCTCACCTTTTTTTTACTTTTTCCGTTTTTTTTT:1 + chr2L 19648362 5' - Doc2-element 233 1 91.00 ATTTATTATAAAAAATTATTTGTATGAAACTCATGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTT:1 - chr2R 10078037 5' + jockey 4550 1 76.71 GTATCCATGTGGTGTTGTGTTGCTTTTGTTTCTTGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTATTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTT:1 + chr2R 17916355 5' - Quasimodo 6955 2 70.83 AAAAGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr3L 9907359 5' + jockey 72 1 61.87 GTTGACACCCACACACATACGGTTAGATATACACCCATACAGAGGAAGTCTCATAGATGTCAAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTAT:1 + chr2L 17240207 5' - hopper2 1552 1 56.16 GCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATA:1 - chr3L 27415298 5' + transib2 78 1 70.55 ATAAGCGTATTAATAAACATTGGTCACATTCCCATTTCTTTTAAAGTTTATTTTCAAAGAGCTTAGAAACATTTTCAGGTCATATCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 + chr3R 9190458 5' + Tabor 35 2 43.84 AAGACCCTTTTATTGTGCTTGTATTTTATTTGGTTTCAAATATGTTGTTTTGTTATCTTATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCACGAAATA:1 - chr3R 4581957 5' - 297 6924 2 56.12 ACTTGACTGAGGAAAAGCAGCGATTGCAGTTGGAGAAAAGCAGGCAGGGGATTGGGAGTGGAGACGGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTGATTTTATTTGGTAATATCTTCG:1 - chr2L 4174072 5' - roo 355 2 51.37 ATGGATGGATGGATTTGCAAAAAAACTTTTTTCCACTTTTGTTAGAGTACTAAAGCCGCCAAACCGGTCACGCCCACATTTTTGAACACTTTTAAAATTTTGTCACATTTTCTTTCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTA:1 - chr3R 27184784 5' + INE-1 503 1 59.59 CGGCATTTGATTCACGACGACTCACTGCCGATGTCTCACGAAGTAGTATGTGTAGTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATCA:1 - 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chr2R 8157248 5' - Transpac 242 2 70.68 GAAACCCGAGGCAATCACTCTGCGGCTTTCCAAATACCGGGCTATATGGCTATGTATGTATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGC:1 + chr3L 16870161 5' + FB 63 1 60.27 GTTTACGCTTAATTGGTCTACGCTTACATCGGATCAGGAGCACATGGTCACCAGCAAAAGTTCCCAGTCCCAACCACCCACACTTTTTGATGTGATCAGCACAAAGTTGCTCATTGTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTT:1 - chr3L 9907499 5' - jockey 4990 1 76.03 GAATTGGGTGTCTTAAATGGGTACGTTACGATGAGTTTGAGTACACTGAAATTGATCAAAGTTAAGATATGAAAAAGGGCTTCTGTCAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr2L 17250850 5' - opus 7471 2 56.16 GAGTGTCGGTGGGGCTGTGGTCGCATATGTATGTGAATGTGTGTCTGAATGCATGTCCTTTTTCTGCTCTGCTTGAAGCGGGTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGC:1 - chr3R 11388968 5' - Stalker 7139 4 56.43 GGAACCGCCTATCGTGTATTGACAACCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGCCTACATGCAAATTATTCATAAGCAGAGCAAATAAACTAAGCTTGGGTTGGCACGACAAAAAATCA:1 - chrX 1122926 5' - Q-element 684 2 52.50 GAAAAAGCAGTTTTCGTCCGATTTTGTCGCATATCCGAAAAGTATCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAACCATTTGCGCAGATCG:1 - 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chr3L 12976376 5' + invader4 28 2 53.42 TTTATTATCTCTTTTTTTATTTGCAAGCTTTTTTATTTAACAGCTCTTTCAGGTGGATTTTTTTAAAAGATGTATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTA:1 - chr3L 8855982 5' - rover 303 2 50.68 ATGGAATTATATGGCTTAAATAGCTGGCATTCCAGGAAAACACTTCTGATTGCTATCACTAATAGGTGGGTAATTTAATCAATAAGCTATTAGCTTTAGGATTCACTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr3R 23639094 5' + pogo 14 1 74.66 GCAGATTGATAATGGGGTTGTGCCCCGTTAACCAGTGGAACCAAGGAATGGGTCTCTTCAGTCAACCATCCATTCACATGTACCCGTTTAAATATTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chrX 12525868 5' - roo 9045 1 67.12 GCAGCTGGGGGAAGGTCTAATTGAATTAGAGTACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr2R 11133614 5' + roo 8752 2 78.47 TTTTGTGAATCACGTATTAGATAAAAAATATATATATTTTTGATCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATAATATATTCTAGGGTCTTTGATCTAGCCGTGTCCGTATGTCCGTATGCACGTCGAAATCT:1 + chr2R 5744280 5' + INE-1 133 1 69.18 TATGTATCCTTAATCATAGTTAAGAGTGCCGGAAAGCCAGCCCTACCGTAAGGTATTCATTTAATAATTTCCTACTCTGAAAGCGTATTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGAAGACTATAATTTGAAATGGATAAT:1 - chr3R 9026059 5' - hopper2 1361 2 60.96 CAGCTGGGCTTCCTTTGCTGCGGTCCACATAAAATGCATAAATTATACAGCGTTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr3R 27822285 5' + I-element 41 1 56.30 GTGCAACAGCATGTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAG:1 + chr3R 17605643 5' - Tabor 7252 2 64.38 ACTTTCGCTTAAATGGGGCAGCAGATCGCTTAGATTTGCCCCTCTTTGTTTATTTCCCTGATTCCAATGTTATTTTTTAGCACGAATAGATTCGTGCTTATAATTGTTTTGCATTTCTTTTTTTTT:1 + chrX 10575238 5' - gypsy2 408 1 65.08 CCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACAT:1 - chrX 21667965 5' + gypsy2 6518 2 67.41 TAAAAGAATACTTTTAAATGTAAAACTAATAAACAGGGAAAAGAATAAATCAAATTTAAGTTTTTTTGATCATCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr3R 17546722 5' - blood 329 2 50.00 TTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGG:1 - 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P-element 2876 1 78.08 ATGCTAGTACTTACACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCACAGAGATCGGTT:1 - chrX 20999643 5' + BS 4 1 76.55 AATCGCAACTATGTGAAATTGCAAATAGCCGATACGTCATCGGTGCAAAGCATTTCAAAGCAGTTCGTTGATCTCCCAAAAAAAAAATGGAGAGCGAGCTGTAATAAACCTATATATGCCACCTATTGAGAACACGTGTT:1 - chr2L 9237631 5' - blood 7370 2 70.00 TGCTTGTAATAAAATTGCTCCAAGGACTTGGGAAAAGTGCAAAAATGAAGTGCACAGATGCTTATCAACTCGGTCTCTGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr2L 4173945 5' + roo 8706 2 56.85 ATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGGATGGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr3L 19350031 5' + jockey 26 1 71.32 AGCTCTTTAAGTTAGGTAACTATGTTTTGATATCGAAAGAAATCGCTGCACTTCAAGAACTTTCCCATATACTTATTTTAATTATTTCCACTAATTCAATTTTTTTTGAGCACGAGTCTCGCGGCCACACCTCTCGCCCAACCGAC:1 + chr3R 5316705 5' - Cr1a 4425 1 56.16 GAAATATAAATAAAGGATGAAAAATGGGTGTAAACCTTACAGATATTAAATCACTGTATACTTTTGGGCATTTGATTTAAGCCGCGTTGAGTGCAAGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATTGAGTGGACG:1 - chr2L 6717239 5' + jockey 18 1 71.21 GTGCAACAGGACCAAACTGAAGCTGAAGACCAGGAAACCTTAGGATGGAAGGCAAAGTAATAATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGT:1 - chr2R 7020653 5' + Bari1 20 1 61.90 GATGCTTTAAATAGATTGGTTCAACATCCATGTGTGAACGTGCACTCCATTCAGATTTTCGTTGAGGTTGAAACTCACCTGCTTATCCTCGCCGGTGAAGAGATTATCGAATGCAAATTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGG:1 + chr2L 7852879 5' - mdg1 7332 2 74.66 AACCAATAAAATATTATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACGCACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAAT:1 + chr3L 24207119 5' + Quasimodo 74 2 80.43 TTCAGAGAAAAAACAATTATCAAATTCTGTTACTCAATTGGATTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCT:1 + chr2L 2052695 5' - blood 7318 2 69.06 TTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTGCTCTCCACAGTTATTAACTATTCATAACTTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATG:1 + chr3R 9160679 5' + copia 4912 2 49.32 AAACTGAGTCTGCAACAAGCGAAAGGTACACACAACAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr2L 246018 5' + roo 86 2 77.40 ACAACATATTTGAAACCAAATAAAATACAAGCACAATAAAAGGGTCTTAACAACACATATAAAAACAAATCTTAATGAACCAAACCTCTCACGAGGATTACTAGCAGGTTTTGGGAGGGCTGGACGATTAACGAATCGTCTTGCTG:1 + chr3R 4581931 5' - BS4 593 1 69.86 CTTCTTTGCTGTGCAACTATTCCAGATTTCCCAGAAAGACATAGCCAGCTGTAAGCTTACATATATAAGCATCGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr3L 22978648 5' + 1360 38 1 58.27 GTTTAATCCAGAAATAAAAATTCTAAGAGCATTGCTTCTAATTGTTTTATTTGTTTCCTTGTTTATAACGTTGTCCTTTCCATAAGTCAATATGTACAATGTAAATTCATTTCCTCGTGTAAATTCGTCTTCTAGCACAACACGCA:1 - chr3L 25469018 5' + 1360 3204 1 59.59 ATTAATTAAAGTTACATAAAATAGTAGAAGTTCCTGTAGTATGCGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3L 10133530 5' + 412 7103 2 68.57 GAGTTAGCTTTCGGTTGAAATGGACTCAACTTAATCCAAACGAGAACTGTGTCAATTCTGGCTGCATGAGAATTGAGATGGTTTTGGTTCTAGCTGCACTTTTAATGTTATTTACTTGCACAAGCAAGCAAGTTCTATTTTAAGAT:1 + chr2L 1538699 5' + 1360 3267 1 75.34 ATGTGAAATTGCAAATAGCCGATACGTCATCGGTGCAAAGCATTTCAAAGCAGTTCGTTGATCTCCCAAAAAAAAAATGGAGAGCGAGCTGTAATAAACCTATATATGCCACCTATTG:1 - chr2L 9237621 5' - blood 370 2 74.58 ATTAATTTGTTTTGCAGACCACTTTAATAAGCTGTCACGCCCACACTTTTAAACAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTCCCCAATATCTTTCGATATCCAGAAAAATGATTAAATTTCGCGTTCGCATTAACACTAGCTGAGT:1 - chr2L 22759909 5' + INE-1 531 1 77.40 CTAGGCGACAGGAAATATTGGTGGTCACATTCACACGCAACTCGGTTCCAGTGAGGCTGGAAAGGACTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTG:1 + chr2L 10492444 5' - Doc 307 1 51.56 CGGGTTCTTGGCCTAAAAATATTTTCTGCCTTCCACGACCTGCCTAACTGCATTTTGGCCAGAGCGCGACCAACTCCTTAGCCATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1 + chr3R 9160649 5' + copia 4907 2 60.00 CATTATCAACTTTCTCTCGAAACGCCGCGAATATTGCACAGAGGTAAAGTTTGCTACACGCATAGTGAAACGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chrX 3996477 5' - roo 9023 2 52.74 AGTTAATTTTCTGTGAACTTTCAGGAGTCTTAGGCTAAATGAAAACAAAATTAACTGGGGAGCGAATTACCCGAGTAACTCCACATTGCAGCGAGATATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr2R 17121725 5' + blood 18 2 70.71 AAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCGAGACATGTCTGTTCTG:1 + chr2R 5617524 5' - invader1 3936 2 79.84 AATTTATTTTATATAATGTTTTATTCAAATTCTTATTACAAGTTGCAAATATTGTTTTAATATTTATCGAATACTATTATTTAATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chr2L 16399293 5' - roo 9035 1 50.68 GGAGAAAGCTTTAGCTGCAACAAATGAGAGAGCGAGATTAACAATCGGAGGCAGCGACGACGACTTCGGCAGAAGGACAATGACCATAAGGCAACACCCCGCACACACACACACACACATAC:1 - chrX 8694320 5' + accord 183 2 57.38 CCCACTCGGCCAAGTCCTTGGAAAATGGAAATTCTTTAAAGTCTGGGTAGTGGAATATTACGTCTGGAGAAACCAAACTGCTCTTCAATTTCTTAAAGAGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr3R 25538047 5' + Doc 34 1 48.63 CTGGGGGAAACACTGAAAACAGAAACAGTTGATGCCACAAAAGGTAAGTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chrX 7980874 5' - hobo 2905 1 57.27 TGGCGTTGAAATGTGTGCGCATTAATCTGTGAAATTGACAGCAACAAAAACGAGCGTAGCAAGTTTGCATAAATGTGCGGGTTTCGGGCGAAAATTGAAAAGATGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACT:1 + chr2R 17890827 5' - Tabor 7306 2 70.55 TAATAAACTTTTTCTTGTAAAATTTAACCCGAAAATTTTAAATACTGAACTCGGCTTGTGTTTCTCCGCACATAGGGCACCTAAGGGGCCATTGGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGACATAGGTAGGGTAGGGCAATCTGCGAA:1 - chr2R 12293843 5' + Gypsy12A_LTR 1961 1 77.40 AACGTTTCAGCTTTTTGTTAATTTTCATCAGTAGAACCACAAAATGAGTGGGTCCAAAAGGGAGGGCTTCAGAGATAGGCAGAAAAGTCACAAAAAAGGACACCACGAATCATATAAATAAAAACCAAAAACAAAATTGACCGAAA:1 + chr2R 11608226 5' + transib2 110 1 71.23 GTAATTTCTGTCGTCGAGTCGGTTGCCACCATCAAGCTACCGCCATTTTGGAAGCAAAATGTGCTGTTATGGTTTGTGCAGATCGAATCAAATCAAGCATAAGAACCAATTTTAAACATAAAAGGAGTTAAAATATGTATATA:1 + chr2R 22382710 3' + Chimpo 315 1 59.44 TACTTATAAGCTAGCATTAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCTCTCTTTTGAAAGAGCATAAGAAAAGAATGCGAATGCGGGCGTCCTTCGTCCTGCGTCTCTGTTTCCGGGCCTC:1 - chrX 21226261 3' + invader3 110 2 61.48 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACGCTTTACTGTTGCCACCCATTTGGCCACCAAACA:1 + chrX 1690054 3' + 412 410 2 80.42 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTACGCAAATTGCAGTTTACGAAAAAGTTGGGAATTTGAATTTTCGAATTTGCTGTTAATTGAACACTCGAGCT:1 + chr2L 2276822 3' - F-element 42 1 57.93 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATCTAACCGTATATGTGTGGGTGTCAACGCCCCTCTGTGGGCGTGGCGG:1 - chr2L 17240186 3' + hopper 1387 1 63.31 TGGAGTGGCCGCTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGAATTTGCATTTATCAGAATAAAGAGCGGCAGCTCATCAAGTGTCCTGCGGTCGGTCAACTGACATAGCCAGCCAGCCATGACAAATGA:1 + chr2R 20599155 3' + gypsy6 118 2 64.49 CAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTATAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATATCGTTTTCACAATGGCCAGGACATAATCTAATTTCG:1 - chr3R 30951049 3' + 1360 272 1 74.13 TATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTAGATCCAGCATCTCGTATTTAAAACTTAAAAGCCTTCACACCTGAATATCTTCAACATCTACTTCAATTTCTGGAAAAAAAACCAACATAATCCATCTAA:1 - chrX 21083882 3' - HB 29 1 62.33 ATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCCATTCATGCGGTAGAACATTCAAATAACCCGCCATA:1 - chrX 14450352 3' - jockey 4824 1 69.84 CTCCACCTATTGGTAAAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCATTTGGGAGAGAATCGGAATGAAATACAAAAACGAACGAGCGGGCGAGGCGACATAGGAATAACGACACGCAGTCCAGCAAC:1 + chr3L 11292249 3' - R1A1-element 278 1 52.74 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTGCTGTGGCAATCCTTTCGGCTGCTTATCGTTTTTGC:1 + chr2L 12340855 3' - diver 5928 2 58.22 AGGCTTTCCAGGTTTGTGAATCATGGAAATAATACCGAGCTTCCACTGTGGAGGGAAGTATTGTCCATTTCGATTCGCCGGCCAGAGTTATTGAACCCATCATCGGAAATGTGCGGAAAATGCCTGCTTATAATTTAGTATCATTT:1 + chr2R 11947130 3' - BS3 394 1 56.85 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCCTCAACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACGTACTTGACGCGTTGTTCCTGCCGCTTCCTTTATTTCC:1 + chr2R 12543192 3' + roo 391 2 69.47 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGC:1 + chr3L 7962270 3' - blood 71 2 70.37 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCA:1 - chrX 14964603 3' + roo 9020 2 57.53 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAATTCTTTAGTTGTCAACTAGTAATCAACACATTTAAATGCACTAATT:1 + chr3R 5453706 3' - 412 7128 2 74.66 GTCGGAGTTGACGAGCTGCCGATCTTTATTCTGATAAATGCAAATTCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAATATGAAACTCATAGCGGCCACTCCAACGGTTTAATTAACTTAATATTTTTTTCCCCGTGTGTAGCGAATTGGCGA:1 - chrX 12923643 3' - Gypsy6A_LTR 196 1 68.49 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTGTTGCG:1 - chr2L 4106292 3' - jockey 4796 1 54.78 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATTTAATATTAAT:1 + chr2L 14201495 3' - roo 8701 2 54.79 TTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCTGCTGAACCAGGAACAAGCGTATTTCCCTGGCAACCATGTGTTCCGC:1 - chr2L 13792542 3' - F-element 40 1 61.38 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATACTTGCC:1 + chrX 12139023 3' - roo 8737 2 68.49 TGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGG:1 + chr2L 1558686 3' + 412 7462 2 82.09 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTTCTTTGATTCGAAGCGCTTGAACTTATCGCCGGGGTGTAGCTCGAAAAAAATGAATGCGAATCTAATTGTTTTACAAGCACGCC:1 - chr2R 7953616 3' + roo 9037 1 60.96 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATAGGTGGCATATATAGGTTTATTACAGCTCGCTCTCCATTTTTTTTTT:1 + chr2L 9237554 3' + blood 308 2 78.95 GACGAGCCGGGAACGCTGAGGAAGAATTCTTAAACCGCCACCACACGGGACGACTGTTTGTGCTTGGCCACCCACTTTGTTCAATTTCGTAGTGCAAATTTTAACATAAAATTGATAGCACAAACATGGACAAGCGACAAGGAAAA:1 - chrX 5016046 3' - Rt1b 4868 1 55.48 AGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTGGAATCTCTGGGGAAGTCCTAATT:1 + chr2R 21402742 3' - mdg3 5267 2 74.66 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCCGTCTTATGTTTTAGCAATTAGTT:1 + chr3R 9160814 3' + copia 240 1 72.73 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGAGCAATTTTTTATGGGATTCCTATGCTTGATCTCCACTCCCC:1 - chr3L 2724973 3' - Ivk 40 1 53.08 AATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGATATAGATATGTACTTTATTCAATGCTTTCATTCTATTAGAATCCCATTGAGGATCTTAACATTTAAGAG:1 - chrX 16383989 3' + diver 171 2 53.42 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCAT:1 + chr2L 22016002 3' - Tirant 8155 2 57.36 GAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATATATAAATGTAATGACCAAGAGACCAGCACCGATTAGGATGTAGGTCCCTATCCGCGCTTTTTGCCACGATGCACCA:1 + chr3L 5346061 3' + Stalker4 7145 4 55.48 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACTTCTGTTGGTAATTTTTAAAATTCTTGGTAAGACTTTTCGGAAGGATTTTCTATTGTATCTTTATCAAAAGTTCA:1 - chr2L 3339927 3' - FB 47 1 53.42 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGCTAAGACCAAAGACGCTCCTGCCACATGCGGTAATTGTGGAGAGGCGCACACTGCGTCTTAGCAAG:1 - chr3L 26645881 3' + 1360 3366 1 51.82 ATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGC:1 - chr3R 9160690 3' - copia 73 2 69.78 CGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGAGCAATTTTTTATGGGATTCCTATGCTTGATCTCC:1 - chr3L 2724980 3' - Ivk 62 1 54.48 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATAAGAGGGGGAAACCACTGCGCCCCGCTGCGAATTATTAACTTTGGAATGGGGTTGG:1 + chr3L 2885329 3' + S-element 1675 1 57.60 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGAAAAGGAAGGGAAAAGAAAAGAACGCAACGG:1 + chr3R 23236477 3' + hobo 2930 1 48.44 TATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAG:1 + chr3R 10030775 3' - BS 5081 1 65.07 ACTGGACGCAATGTGCAGTATGCTCTTGCCATGGCCATATTCTTGACAGTTCGCACATTGGACTGGGCCTTTGCGCTTTTGTGGTTCTTCTACAGTAATTCTATGACTTCTGAATAAATTAAAGAACCTAGTTACTTGTTCATTCG:1 + chr3R 8227672 3' - Fw3 499 1 71.92 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTGGCATTGAATTTATTTTCCACAGTCCGAGTCAGTAGATACAACTGCTTGGCTAAA:1 - chr2R 12543031 3' - roo 8693 2 63.01 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGC:1 + chrX 13395326 3' + roo 325 2 76.71 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCA:1 + chr2L 246118 3' + roo 399 1 76.47 TATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAATAAGACGTTTTATTGTTGTAA:1 - chr2R 8641472 3' + diver 191 2 62.33 TTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTGGTCGAGGAATAGGGAAATAACAGAAAACAAGAAAGAATGCCATAGTCCAGTTCCCCGACTATCAGATACGCGTTACTCA:1 - chrX 15903342 3' - 1360 3145 1 45.21 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATATGATTTATGCGCTGTTTCTAATTCAATTTAGACCCGTTTGTTTGCTTTGGAGGTAGAAGGAAATGGAAGCAAACTTGTT:1 + chr3R 23010131 3' - I-element 38 1 59.31 GATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGG:1 - chr2L 12340758 3' + diver 139 2 73.97 AAAATTTCTCTAGACAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATATAATTATGAAGTATTATGGTATTATAAAGTATCCGATTCCACAAAACATTAGAGAGCTTCAAAGTTTTCTAG:1 + chr2R 2879965 3' + TLD2_LTR 138 1 91.72 TAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCACTTTTTTCCTCCTTTATTGTTGCT:1 + chr3R 8709856 3' + jockey 4934 1 58.90 TTCTCGACTATCAGATACCCTTAATTCGACTAGTTTTTCTTTATTCTCTTGGCATTCTTTTTGTGTGTGTGGCAATTGAATCAAGCAAAAGGACGGACGGACTCACTCGTCTAGTGAGTCTGGTCAAGAATATATATCCTTTATAT:2 - chr2R 8443974 3' - INE-1 554 1 61.64 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAGTCAAAATATGTTTGCAACTCATGATGTGCTACCAGTTTTCAGCATTTCTGCCGCT:1 - chr3L 6775305 3' - blood 7030 2 72.60 AAGTAAATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATTGTATGTGATTGGAGGGCGATGCAATCGTCTAGGATTTGGGGAATTGTCGCGCTCAT:1 + chrX 21084014 3' + HB 291 1 55.56 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACT:1 + chr2L 14201453 3' - roo 79 2 75.34 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAATGAACAAACGAGCGGGTGCCATCCAGGGACCAAAGCCAGGCAGGACCACGGCCAGGACTTCTTCTGGCTC:1 - chr3R 13607595 3' + I-element 5340 1 68.89 GCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATGGTATGCGCCTGTCTTCCATAAACATTCCCGGAGAGAAGTCTCGCCTC:1 + chr3L 17630798 3' + invader2 5028 2 69.18 AGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGGTTCACAAGTACAATGAAAATTCTTAGAAAGCACCAAGGTATTTGAGTCAACATTGATTTGCTGATAGGAAACCAGTTATACCTTGAGAAATAATGGCATTTTTTATGGCATA:1 + chr3R 10831808 3' - Juan 4037 1 74.48 AATGAAGAAACGCTGGGACAAAGACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTGTTACCGCAACTGTACATATACACAAAGCACAACAAAAGTCGATAATATTCAAGTTGAACAAGAGAGAATGCTAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTT:2 - chrX 15903347 3' + Tc1 1602 1 41.10 GATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTGGGTTGGACGGCATCAATGGCACTATCTGCAAGGAAGTCTGGCGCGTCATACCTGGGCACCTAGCATCATTGTTTTCCCGAAGTATTATTATTATTTATTAGAAATAATGGAATA:1 + chr3L 10757837 3' - F-element 4392 1 51.37 TATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGAT:1 + chr3R 24729630 3' - Juan 4174 1 82.88 CGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCAAATATTTCATTTGAAGTGACACTGCGTTGGAAATTTGTCTGAATTTTCAGCCCCAAAATTGGGGGCATTTAAATGTGGCCCAT:1 - chr3R 27535399 3' + 412 457 2 60.27 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTAGTTGTTTTTAGATTTAATTTACCATAAATCTATATCTAGGTAAATCTATACCTAGGTTTGGTGATTCCACCACAAG:1 + chr3L 4187310 3' + pogo 2060 1 56.16 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGACGACTGCTTGCAATTAGAGT:1 - chr2R 12787801 3' + 297 6925 2 59.15 AGGCATTGTGCAAAGCACTCGAGGCAGCTAAGTGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTC:1 - chrX 12191554 3' + pogo 2078 1 51.69 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTGGCATTGAATTTATTTTCCACAGTCTGAGTCAGTAGATACAACTGCTTGGCTAAATTATGTACTCTAT:1 - chr2R 12543018 3' - roo 8680 2 71.92 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGATTAAATTGTCTGCCTATCTGTAGATCAGATAAGGTCGTAATTCATTGAATTGGCCACTTCAGAACTGGGACTCATCTAAACCACT:1 + chr2R 23000168 3' - mdg1 19 2 69.23 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCCGTCTTATGTTTTAGCAATTAGTTACTAAGAC:2 + chr3R 9160822 3' + copia 245 1 76.71 AGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTAGTTCAACGCACTATTCGTTGTCAGATAGAAGTCTCTTGACTTTTTTATTGATTTGTTTAGTTCACAGATTTGATTGATATTAGATCTTGGTATGCTGGTATCCTTGTGTGCG:1 - chr3L 18030918 3' - invader4 2762 2 81.38 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACAATGAAAGCGATGGAGAGAGAACAGGAAAGCCAGGCTAAACTGATTTAACTACGCACAGATGTGGTCATCTG:1 - chr3R 25387757 3' - roo 8697 2 61.07 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTT:1 + chr3R 9352124 3' - Tirant 8136 2 65.71 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGGGGCAACCTGTAACATTTATTATACAAATTGATAT:1 + chr3R 21706112 3' + 297 6945 2 64.38 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAG:1 - chr3R 22100528 3' - 412 7132 2 70.14 TTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAAACCATTAGCGCCGCGCGTCATTAAGTTGTTTCCGCTTCGCACACTTCTCGCTCTGTTTTCCCTT:1 - chr2L 15538486 3' - Stalker4 6971 4 51.85 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGTATTTATAAGCTTTCATTTCTTTCCGTGTGATGCGGTTTCTGTATGTTTTGGTTGAATGAGTTTA:1 + chr3L 13868736 3' + 412 444 2 55.00 GGCTGATCAGTACTCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAGCCCATATAACACTAAACAGACAAGATCGGATATGTATATATACATATATATGTACATATACGTACTTGTGCATTCGAGGAAAAACCATTTGCACTAC:1 + chrX 14614910 3' + Quasimodo 253 2 39.04 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTTATGTATAGATTTACAGGTAAAATACATTAAATTTA:1 - chr2L 13250330 3' + opus 7460 2 57.53 AAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTCAAACTTGAAACGTAATATTTTTCTCTCTGTACAATGATTCGCAACGTCGGACTCTTTGTGTCGAGAAGGAAAGTGCGTTTATGATTCAATTTTATTTTCTCTTT:1 - chr3R 26519913 3' + FB 700 2 65.07 AAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTAATTTGCAAATTAACTGATATTCAATGTTAGTTATGCCTTTTCATTTGAAATATCGTACATAAAACTACTTAATTAAGACAAT:1 - chr3L 7995937 3' + P-element 409 1 55.48 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGAAGCGTCTTAGACCATATATAGTATATACATACATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAG:1 - chr2L 21737998 3' - hobo 54 1 57.24 TATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCATTAAAAGCCAACACCCTTAAAAGCCAAAAGCATTTGGTTCTTAACTTC:1 + chr3R 28627681 3' - copia 4943 2 69.86 GAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAACTAGAATTGCTCTCACAGAAGTTGTCGCCCCACAAAAAAATAAAAAATAGAAAACCGGAGCAACTCGGTCTGCCAACAGCTGTTGATG:1 - chr2L 7572092 3' + mdg3 5051 1 65.00 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTTTGGCCCAG:1 - chr2R 21402589 3' + mdg3 5485 2 61.54 TCATGAATGTTGCCCTTAGTCAGTGAGCATCAGAAACGTCAATCTTTAGTTGGCAAAGGCTTCTGGCAAGAGCTTTAGTTCAACCTCACGGACGATACACCTTGTGGCCCCACCACTATAACATCC:1 - chr3L 25842432 3' - Fw2 303 1 70.63 GCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTCCGCTCTTAGCGTAAGCGAGCCGGACATAGGGCAATTTTGATTGTCACCAAAAAAGTGGGGCTGCATAGTGCATAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTG:1 + chr2R 1982172 3' + 1360 3266 1 82.27 CATCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGCACTTTCCCACGAAAACCGCTCGAAAGCCCCCATTCGCCATG:1 + chrX 20637450 3' + G2 36 1 71.23 TTTTTCTATCAGTTCGGTAATAATCGGACATTATTGTTAAAAAAAAGAACATTCTAATTTGAGTAATTGGTTCTTAGGAATTATAGTTCTGATTTATGTTTAAACGGACTCACGCCCACAAAATCGTGCAGGTGGAAAGTGTCGCA:1 - chr2R 7119639 3' + Circe 439 1 65.75 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTATTGGCTTAC:1 - chr2L 2031027 3' - 412 7115 2 59.59 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGATTAAATTGTCTGCCTATCTGTAGATCAGATAAGGTCGTAATTCATTGAATTGGCCACTTCAGAACTGGGACTCATCTAAACCACTCATGTGCAGATAAGATAGAGTCT:1 + chr2R 23000191 3' - mdg1 7050 2 77.40 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTT:1 - chr3L 18658913 3' + roo 325 2 76.71 AGTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAAAAAAAATTATATAACGTGTGAAAAACTTTTATGGCCCTCG:1 - chr3R 6244517 3' - Doc 60 1 66.67 AGATATTTGAACTTGATTTCGTTTTGCTTGTCATTATTTAGAGATATATATAAATGAAAATATATATTTTAATATATGATAACTTTTATATTCTACTGAGTTCTTCTTTCACTTCACAAGTTTGCAACAATTGATGAAAAAGGACG:1 - chr3L 16257813 3' + accord2 7239 1 78.08 AGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTGGACACAAATGGT:1 - chr3R 460071 3' - F-element 132 1 52.74 GTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTAAAAAAAAAATATGTATACATTCTCAATTTCAGCACACAAAAGATTGAAGTATCTTTTAATG:1 - chr2R 8642901 3' + Doc2-element 4696 1 63.70 TGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAATCTT:1 + chrX 22900318 3' + Tc1 1556 1 71.53 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTCGTGTTAATATGAAATATATTTTAGTATGATATTATAGTTAAGAGCATTAAAACATTCAGCGTAGAATGCTGTAGTGCATTTGTAATGCGTGGGGTCACCCAA:1 + chrX 16902389 3' - I-element 19 1 70.55 ATGACAAATATTCTAATATAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGAGATATTATGAATTGGCTATTACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTAGAGCTTGCCACAAGTTTGTGGTGTCTCAAGGACCCAGCACTCG:1 + chr3R 18998342 3' - 1360 392 1 46.27 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAACTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATTTTTGTTAATAA:1 + chr2L 76166 3' + roo 9037 1 62.33 CGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCGCACCAACACAAATGCCCATGCACACACACACACACACACGGA:1 + chr3R 27499999 3' + 1360 3310 1 70.55 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGCGAACAATGTGCCATCCTTTCTCTACCTCGGTG:1 + chr3L 22648403 3' + Tabor 449 2 58.27 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTATCCCATTTATAATCTGGAGGACAATTTTCAAAACTTTAATTACACCACAAGCGAACAAAAAACGATTTATTTAAATAAACAATGCAAACAAAATGAAAATGAGAGAAA:1 - chr3L 14122541 3' - 1360 11 1 76.55 AGCTGAGTAACGGGTACCTGTTTTTTATTTAACCATTTTTTATTGAAGTAACACCCGATTTTTTTTGCCTAGGTTCACAGTTCTTTTGTAGTTTTTCATATATGTAAGTTATTACTAATTATAAAAGAGTTCGAGAACCAAGTTCG:1 - chr3R 17250127 3' + INE-1 545 1 57.53 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGGGGAGCTGCTCCACATGTGTCTGTGCGTGTGTGAGTGAGGCGGCGTGTGTGTATGTGTGGGTGTGTGCGAGTGTGTGTGTTTGTAATAAAAGCGATGAA:1 + chr3L 4001236 3' - hopper 3 2 78.46 TGTCAGCTTAAGACTGACTGTACAGAGTTTTGATCGGCTCAAAGTGAGTCGTGAGAAACGAGAATGTCTAGTCAGTATATGTGTACAAAAAGAACGATAAAAAAAACGTGCAAATAACTCAACTCCCGGGATAGGGACAAACACG:1 - chr3R 8507941 3' - rover 225 2 63.45 AATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAGCTTTGTCGCTTATTAAAAGAAGCTTATCGCCGCAGCCAGCAGCTCGAGA:1 - chr3R 27510026 3' + Bari1 1690 1 71.23 AGGTATCGGAAAATATTTATTTATTTTTATAATGTTTTTATTTATATATTTTTTAAGATGAAATCTGATAGGTGACTGAGAATGGTGGTCATTCTCCATACATTGCGTAACCCTTCACCCTCGTCACCTCCTTCCCGTTAGAGGTG:1 - chrX 18685894 3' - mariner2 839 1 74.66 ACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAATAAAATAATAGAGGAACCTACCTTTGCAGGACTTGTCGTGTAGTTCGCGATCATC:1 + chrX 17419460 3' + Juan 4148 1 65.00 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAAAAGGCCAGTGGAGGCAGGAGGCAGGGGGCAGACGCAAGGCG:1 - chr3R 22671440 3' - FB 55 1 67.77 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGTGTTGCCACAACAGCGACACGAGGCG:1 - chr3L 776719 3' - hopper 58 1 64.75 AAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAGCTTTGTCGCTTATTAAAAGAAGCTTATCGCC:1 - chr3R 27510044 3' + Bari1 1672 1 59.59 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAGCCCCAATTTCGGCGGTTTGTATCTCTACCAGTTGTGGGCTACACTTGAGGGG:1 - chr3R 21705923 3' - 297 6586 2 77.40 TAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTAAAAAAAAAATATGTATACATTCTCAATTTCAGCACACAAAAGATTGAAGTATCTTTTAATGCTGTTGCAAAGTATGCAA:1 - chr2R 8642883 3' + Doc2-element 4714 1 52.05 AAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACGCGTGAAACTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACAAAAAAAAACCTAAAAAATTGAAAGCAAAAATGTGAAAAAAGGCGAACAAGTGAAGCTGCTGCC:1 - chr2L 7559677 3' + mdg3 190 2 51.03 AAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTG:1 + chr3L 15276709 3' - hopper 59 1 73.55 AAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGA:1 + chrX 8027477 3' - Juan 70 1 65.03 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCATTTTT:1 - chr2L 4173985 3' - roo 76 2 73.57 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTCCCACTCTCGGTGCCCAAGTGCTCCCAAAACATCAAGGCAAGTGAC:1 - chr3L 18658864 3' + roo 9052 2 67.42 AAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGTTGATTTGCAGTATTTGCGTAACGTACAGAACACAGCACTGCCCTAC:1 + chr3R 29930875 3' - accord 363 2 61.16 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCGTAGGCCAATCGTTAATTTCACTCTCTAAAGAAGGTCATTTGGTTTCTATAGAATCGGTGCTCACTTTTAGGCGGAAAATTGAAAAAAGTAGGTTTCATGTAATGGA:1 - chr2L 3294064 3' + hopper 1404 2 75.34 CGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGG:1 + chr3R 20175766 3' + hopper 1341 1 76.74 GAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTAAATTCCCTTGTAGTTCTACAATTAAATTATTCAAAGGAAAGCATACACTAATTAATAATTGTTTAAATTTACTGTGA:1 - chr2R 7727109 3' - BS 4705 1 53.42 GCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACTCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACT:1 - chr3L 24272067 3' - gypsy11 4056 2 58.90 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTATATATGTGTGTGTAAGAGGTTCTGTCGTAATGAAAATAAAGTAGCAACTTTAACGCATTTTTATGGCTCTTAT:1 + chrX 10974443 3' + opus 472 2 60.77 ATTTAAAAAAAAAACGAAACAAAATATAAAAAGCCC:1 + chrX 17539012 3' + transib2 2637 1 88.89 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTGTGTGTCTCAAGTTTTTCCTTTTCGGGTTGCTTGAGTTTGGCCTTCTCTTTACTTTGCCGCTGTATTTTTTAATTAATTTGGCATTTATTGGA:1 + chr3L 13563438 3' + roo 9046 1 67.81 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATCATCTCAAGTGGGCCTCTCCATTCATCTTTCGTCTGTCGGATTTCGTAAGGCTTTTCAATGCGGGAAGTTCGGGGAAT:1 + chr3R 13612921 3' + 412 481 2 69.83 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTGCTATACTTTTAATATGTTTGTTTTAAATTATTGTACCCATTACTCGTAGAGCAATGAAGCGTTTCCGATCATGTAAAATATAAATATTCTTGATCAGCAT:1 + chr4 572598 3' - 1360 19 1 72.60 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTGGCATTGAATTTATTTTCCACAGTCTGAGTCAGTAGATACAACTGCTTGGCTAAATTATGTACT:1 - chr2R 12543022 3' - roo 8673 2 75.56 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTATGTTCCTTATTAAACACATTTCAACGGGTATATAAGTTTTGTTAAGGGGTAACTGTAAGCCGGACCCAT:2 + chr2L 8542060 3' - pogo 46 1 53.42 ATCTCAACCTTCTAGCTTGTATAGTTCCTGAGATCTCGAAGAATATATGTATATACGAATGCATATATGTAAATTAAATGGCTATGGAACATTCATCGATACGTTTACATTTTTATACGCATTAAGTTTTATGACATTTCTGCCTT:1 - chrX 22961570 3' - INE-1 163 1 58.22 GCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAAATAAAATTAAATTGGTGGTTTCTTTTGCTAGTCGTACTACGTTGTTGGCTTAAGCTCGCTGCGTTAACTCTGCTGC:1 - chr3L 21907505 3' + Quasimodo 391 2 52.05 TTAGAGGCGTGGAGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTTAATTGATTTCTCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCA:1 + chr3R 23947648 3' - Tirant 18 2 60.00 ACCAGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTGCACCATATATTTAATTAATTGGCGCTCAACTAGCGGGAAATACGCACCCGTCCATATCATACATAATAAACAAAATAATTACAGA:1 - chr3L 27396714 3' + gypsy6 7767 4 46.34 ATTTGTTTAGACATGATAAGTAGTAAAAAGAGCAAGGTTATTCGACTTCATTCCATAAGTACGGAGATGAGCATTGCCTCGCAGATCTGTGACTCGGTGCCGAACGAACGCAAGGAGTTGTATAATGCGGAAGCATTTTCGATTAG:1 - chr3R 3610565 3' + rooA 7245 2 69.86 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCGATGTGGAACGATACATTTAGTTGATTTTTCACTGGGAGCAGAGCA:1 + chr3R 26520508 3' - FB 12 1 75.19 CCCGGTTTTTTTTTTGTGTTTGCCTGTTGGCCGAAAAATGTTGCGGCCAATCAAATTGCATGCAGGCC:1 + chr3R 21989965 3' + Cr1a 37 1 73.53 ACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGAAAAGTTTTTGAAGCTTCCCGCATAATCAACTCTGTGCCTTGGACTTTTTGCAAGGATAAGGACTCCATGA:1 - chr3R 17656338 3' + mdg3 220 2 69.86 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGTGATATCATATGTTATATGGCCAATATCA:3 - chrX 4778145 3' - 412 7083 2 63.70 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCATAGGCCACAAATTAATCCCATCCAACGG:1 - chr3L 17890692 3' - 412 7070 2 72.39 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGCCATAAACAGAGAAACAAACAAATATAAG:1 - chr3L 27350426 3' + pogo 2087 1 74.48 AAAATAAAAGCAAAATTATATAAAAATAAATAAGAAACAAAAAATTAATTGCAGAACTTGATATAAATATTCTGGGCTGAAAAAATTGTGTGCACTACATTTTTTTGAAAAGTAATGAGGTAAAAGTAATGAAAGTAATAACA:1 - chr2R 14923991 3' + HeT-A 326 1 77.62 CTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGTTCTAGTGCATTCTGGGCTATGGAGTGTTACATCAGGGGAGCTCAAACAGGAATCTGTGCCA:1 + chr2R 3152474 3' + invader4 282 2 79.31 ATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGTCTGTATTGCACATTTTTCATGTCACTAAAAAGGTTTCCTCGATTTTCCCCTCGAACCAAAATGCCATTGCACAAGCCTGCCTGCTAGTGGATAACAATTTACCC:1 + chrX 4180315 3' - I-element 4948 1 77.40 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAAAGCCCATTAAAGTGA:1 - chr3R 30634901 3' + roo 9037 1 63.70 GATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGACTCAGAGTGGGCAATACGAACTTTTGTTTGTATCGT:1 + chr3L 24152585 3' + HMS-Beagle2 293 2 69.18 GAGCGCTTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTAAATTAACAGATAACACTTTAGTGTATGGGTATTTATTATGCGACTGTGCGAGTTCTTATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGCTGAATATAAAG:1 - chr2L 2405113 3' + baggins 5258 1 58.45 GCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTCGTGTGGTGAGCATCTATAAGACTTTGC:1 + chr3L 5590333 3' - BS 5030 1 40.41 ACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATATTTATTTAAAAAGAATTTAAGAACAGCTTTTGATAATAATAA:1 + chr3R 25768853 3' - copia 78 2 76.71 ACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTTACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAACCAATTAAGCCGATCGACTGCATCGTTGGCCATGCTTGAGTAA:1 - chrX 14695742 3' + Idefix 110 2 75.34 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGACGACTGCTTGCAATTAGAGTTGGCAAATTAT:1 - chr2R 12787790 3' + 297 6932 2 57.53 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAACAAAAAAATCAATAGCCAAAATGTTGCATATCTTAACAGGCTATACCATATATTATGGCTGACTAGGTCAATCCCAAAAACTGAGTCCAGAAAAGGGA:1 + chr3R 22249242 3' + jockey 4973 1 61.64 TTCTGTCAGAAATTGTCAGAAAATAAGTAATACTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAGTACCAATGTTGTTCTTCCAGGCACACAGATCAGGTATTTACATATTTTACAAAATCTCAC:1 + chr2R 7834261 3' - transib2 422 1 54.48 ATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTTGGCTTTGGTGGCCATGGAAACGAATACGGCAACGTATCCTTTAAATGTTTTTTGGCCA:1 - chr3R 19447269 3' + 412 7075 2 54.96 AACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTACATTCGAAATGTTTTTATTGAACGCATATCGCATTTGACAGTTAATTTGTTTGCATT:1 + chr3R 18106130 3' + pogo 1853 1 60.96 CTCTAGAGCCACGGCAAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTAT:1 + chrY 311343 3' - 1360 55 1 56.55 AATTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTAACATCCACATCTGCAATTTTTGTTCGTTTTAAGAGTTTTAATTGTATCGGATTTTGTTTATTCAGAAAGGCATGCTAAAATAATGCCCGTGATCGGGTGCCACTCGAAATCTCTATA:1 - chrX 15875407 3' - I-element 463 1 57.53 TAATTAAAATAATAATAACAATAATAACAGCTGCCACTTGAATCTGCAAGATTATCTGCAGAGCCTCGCACTTTTCACAGTGAAAGAAATTTGGCAAAAGTTGCCGACTATGGAAAAGGAAAAAA:1 - chr2L 7126038 3' + mdg1 7056 2 76.00 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAAACGTTTATGCGTTGTGCCCAGCATATACATACATATACCATACACGT:1 + chrX 12526021 3' - roo 8707 2 54.79 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACAAGTTAATCAACCATGAACTTTAAAGCCCCGCTCTGAAATGC:1 - chr3R 24476295 3' + 412 7491 2 64.71 ATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGGAGGCAGCGCTGAAGAGGACGTGGGTGTGGATGACTAGGCGAAGCAGGTCCTGACGCTT:1 + chrX 2759269 3' + roo 290 2 54.26 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAG:1 - chr3L 6775360 3' - blood 74 2 67.12 AGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTATAA:1 + chr2R 5206902 3' - G4 3765 1 60.96 ATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCGCATGGAATCGCTGATTCCATGGCCCAGTGCAATCAGCACTA:1 + chr2R 15829655 3' + invader4 315 2 77.40 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCAT:1 - chr2L 4173989 3' - roo 86 2 77.40 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTT:1 + chr2L 5202556 3' - 297 6636 2 74.77 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAGTAGGCCGCATCCTTAAATA:1 - chr3L 22978525 3' + 1360 3336 1 56.16 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACGCAAAAACGTGCTGAG:1 - chrX 4701169 3' + P-element 2784 1 15.07 CGAGTCGCTTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATGAAATCACGAAAACGAGTATTAAAAATGTATTATTATGAATAATGTTTAT:1 - chr3L 23986519 3' - opus 178 4 62.33 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACAAGTTAATCAACCATGAACTTTAAAGCCCCGCTCTGAAATGCAAAAAGGACAGCAAAGCCACCAGCACTAACCGCACTCGAGACCCAATAATGAATTTGCATTT:1 - chr3R 24476233 3' + 412 7526 2 70.55 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACCGGGGAGTTTTGTTTGGCTGCAAAGTGGGATTTGCGAGCAAATTCCTTAAGCCCGGTGGATG:1 + chr3L 905888 3' - 412 57 2 57.53 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGACCCAAACTTTTTCCATCGGCGAAAAGGTTTTAAATTCCAGCTAATGAC:1 + chr3R 27535516 3' - 412 7123 2 65.75 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTTTTGTTAAACAACTGTATTCTAAGGAAGAATATGTTATG:1 + chr3L 9909825 3' - Transpac 4924 2 78.79 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAACCGCAGTTTACTGATG:1 - chr2L 17210236 3' + jockey 4964 1 64.29 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAATTTAATAGAATTTATTTG:1 - chrX 13531609 3' + roo 335 2 68.49 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCC:1 - chr3L 22400271 3' - 1360 52 1 60.32 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGGCGGAGGTCAGGCGGAGGTCAGGGGGCGGACGTGAATGATGGACGTGAACGGGGCCATGCCACTGCT:1 - chrX 8755022 3' + transib2 2809 1 66.67 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGA:1 - chr3L 14553125 3' + roo 8988 2 76.03 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGCACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAA:1 - chr3L 27415228 3' + transib2 2790 1 58.10 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTG:1 - chr3R 21705998 3' - 297 62 2 68.75 AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCTAAAAAGCATACTTTATTCATTTACGATCCTAAATATTTATTACTACATATATACATACATATCTGGCCAGAACATTTGTTTACCTCCTATCGACTCAGCTGGGTC:1 - chr3R 23859776 3' - jockey 4775 1 76.03 CTTTAAATTTGAAAAATATATTAAAAAAGCTAACTCTAACCGCAGTCTAAGCTAAGATCAGGCGATATCTCTAAGTTATCCCGCTGGGCAACTCGTTTACTTGTTCTTTTGCATATTCATGCGGCACATGCGATGGCTATTCACCG:1 - chr3L 3258943 3' - copia 4670 1 78.77 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAACCCTGACTTCAAAGGTCTGCAGACGAGACA:1 - chr2R 11489139 3' + mdg1 7446 2 73.13 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTCTGTTATTTACTGTACTGTCAGTCATGTCAATGCACACCAAGCAAAAA:1 - chr3R 4581860 3' - 297 6624 2 60.00 TGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAATTATGACATATTTAAATGGCATACAACAGGCAACAGGCTGGCTGGCTGGATGGCTGGTT:1 - chr2R 8050220 3' + Burdock 251 2 79.56 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTAGATTTTAACCACCTGCTGAACTTCAGGTTAAATT:1 - chr2R 8157144 3' - Transpac 39 2 57.53 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTTCATGCTTTCGATTTAAGCTAATTTGCTTTCATTGC:1 - chr3R 7035203 3' + roo 9049 2 69.86 GCAGTCACAAACAAATAATACAAACCACACTCAATAAAACTCATTTTGCAGAATGAGGAAAAACGGAATAAATCAACTGCGAGTTGAAAGTGCGAGAAAGTGAAAGGAAGACGGGAGAAATTGCATTCATTTTGGGGAAGAAATGG:1 + chr3R 15669714 3' + Transib-N1_DM 217 1 56.85 ATTGATACTGATCAATAATATATATGCTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGTCTGTTAAATACTTTTCAACGAATCTAGTAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAACAGGTTTGAAATAAAAGTATTACTACT:1 - chrX 11907794 3' - INE-1 83 1 69.18 GGACAAAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTGTTAGGAGGTGTTACACCTTGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAAGAAAAGTTGAGAACCTTTTATTTATATGGTATC:1 + chr2L 15031251 3' - G2 367 1 74.81 CCTCTAATTGAGATAAGGCGCTCTGAAAAATGTGTCCCTTTAAAAAAGCCATCGATGCTCTTGAAGTGTGTGCTGTTGCATCGTCTTGAAGATCATCATGAAGAATTCTTCTCAC:1 - chr2R 4802893 3' - mariner2 528 1 76.52 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATTGATTAAATTATTGTACGTAAAATAAAAAAAAGTGTGAGCCGCAGATACATATGTTACTAATATTCACTATCATGCGATACTTTTAACGATGTATCTCACAGTATAGCAGC:1 - chrX 5150228 3' - roo 9 2 75.34 GAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGACCAAGTCACACAACTCCGTCAACGGGCACGTGCTCAAAAACTATCTTTGTGGGCGTGATGCAAATGCAGAACAACATT:1 + chr3R 12931981 3' - invader4 2754 1 60.96 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCC:1 - chr3L 6775375 3' - blood 7100 2 77.40 TAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTCCATTGT:1 - chr3R 28627601 3' + copia 192 2 62.41 TGTCCGTATGAACGTCGAGATCTGACGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCCACGCCCACTCTAACGCCCACACTTCTGAACCATTTTTTGAAATTTTTCATAATTTTTTTAGT:1 - chr2R 13706296 3' + INE-1 132 1 56.16 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTAT:1 + chr2R 18482487 3' - hopper 75 1 72.60 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTGATAAGAAGTGGGATCTAGTTAAAGATTATATATATTTTTGCCTCCCTGGGAAACGAAGCGCTCTGGAAAAGTGGAGTCCTTCGTCCTCTCCTCTGCTTCGTTTTTCAATCGC:1 + chr3L 11675557 3' + S-element 1710 2 50.00 CTTTGTATTTATTTTTAATTATCATCACGCTTACATTTTGTTTGCATTTTTCAGCTTTTTTTTTGTTGTTGTTTCGTGTAGTGAGTTCTGTGTTCTGTCTAAAATGACATTTTTGTTTCTGCCCGTTTGGTTGTCATGTT:1 - chr3R 16406625 3' + transib4 250 1 70.00 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATTGCCTCATTTTGAAGATAATTGCTTGTTATTAATACATTTTGCACCTTAATTTGATTTAACCTTAAGATTTTCCATTGTTAAGGAATTGAACAGAACATGGTCACAATTTTGT:2 - chr2L 12658394 3' + Quasimodo 7361 2 70.55 GTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACGACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAAACAAAGACAAAGGAAATGCCGACGAGATTAAGAATTGAAATTTGTTTGGGTTGGATAACTTGCACACGTATGTTCATGCACA:1 - chr3R 3346319 3' - Cr1a 253 1 58.90 CATGAAGATCAACCTGACAGATCTCTAAGAGGTGAGCTTCTTTACCTCCATCTGATTTCTGGATTCTATTTAACGACTTGGTTAGCTCGTATATAATAACGGTACTGCGTCTTGGAAATTGCAAATGTTTGTCAATGGGCGTGGG:1 + chrX 13752766 3' + Bica 146 1 62.07 ATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGG:1 + chrX 21947741 3' - mdg1 24 2 64.15 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACA:1 + chr3L 7995473 3' - P-element 80 1 21.71 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGCAGACGAACAAAAACTCATAT:1 - chr3R 10684699 3' + roo 9044 1 65.75 GCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCGTTGACTCCTTTTTCTTTGAGAGCTCGTCTGCATAATGAGGAATGAGGACTTGGCATCCTGGATCAAAAACCGGTAGTCGGTCGTCGCAAGGT:1 + chrX 459626 3' + Max-element 8269 2 64.83 GATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGCAATTAAATAAGTACCTAAATAAATAATACTTACTT:1 - chr3R 3922949 3' - Cr1a 77 1 67.86 TGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCTTAT:1 + chr3L 23702292 3' - G4 26 1 63.70 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACCGCAAAATCTATAAATAGCCGAAC:1 + chr2R 21371518 3' + roo 9002 2 74.63 AATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAAATAACC:1 - chr3R 21706012 3' - 297 21 2 69.86 TTTTTTTTCTTTTTTTAAATTTAGAATTCCATATTATATGAAGGTTTGTTTTTATAACAACCCATCAAGGATCAGTATTTATAAAACCTTCCTTAAGGTTTGTAGAAAACTTTATTGAATAACGCATATCCCCACTGTTTAAAG:1 - chr3L 18038252 3' - TART-C 11097 1 80.56 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCCTCAACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACGTACTTGACGCGTTGTTCCTGCCGCTTACTTTATTTCCATC:1 + chr2R 12543195 3' + roo 400 1 73.60 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGTGTATTATGTAT:1 + chr3R 27822316 3' - I-element 18 1 69.29 CAATGTTATTATATCTTAGTTAAGTTAATATCTAATTTGCTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCTTGTTTTGTTTTCGTTTTTTTTCAGTGTGTTCGGATTTGGTGAGTTCACGAAAAGTGAGGTTATTTTT:1 - chrX 10004046 3' - I-element 5257 1 60.71 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAG:1 + chr3R 17656452 3' - mdg3 83 2 72.60 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTCAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTT:1 - chr3R 22100498 3' - 412 7104 2 53.42 CCCCCCATTTTTTTTTTTATTTTTTCACCACGGTCGCACAGCTCCCTCTTCTTCT:1 - chr3R 23319087 3' + hopper 137 1 92.73 CTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGCGAACAATGTGCCATCCTTTCTCTACCTCGGTGACTACCGAA:1 + chr3L 22648412 3' + Tabor 452 2 62.07 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCTGCCC:1 + chrX 4785163 3' - 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pogo 35 1 60.56 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCTTCTTTGCTACCATGGAGCGGCTCCCAGCACTCAATTAATTAGTACCTCCATCTAAAAGGGGAAAGGGG:1 + chr3R 31491038 3' - roo 8699 2 54.69 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAGGATGC:1 + chr3L 17133879 3' + jockey 4967 1 54.17 AGGCATTGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTACATTAATTAAAAGTAATCTTCTGGAATAGGGAGGTAATATACCTTGAATATAAGCTCCTGTGTATTTTTGCTACATACTGGTTTGCCGCTTGATTTATAGAAAAAGTTGCAGCC:1 - chrX 8818352 3' - Cr1a 4012 1 50.68 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAGGTTTTCCTTCCGACCGGAGCTCCTTTTTCCTCTATTCTCGGGCATCAAATGAAAAACTCAAATAGAAAGAACCGAGGGATTT:1 + chr3L 13562660 3' - roo 38 2 47.26 AATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGA:1 - chrX 1287808 3' - jockey 4851 1 66.44 TTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGCTGCTTGATATTCGAAAATGTAGCTCCTGAGTGTATACCACATTGT:1 - chr3R 2555499 3' + Bari1 1632 1 68.49 GCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGATTCAATTTATGATCAATTTTTTCATTTTCGAAAGGCATCAAAATATGAAAAAAAAATTTAAAAAAT:1 - chrX 1777627 3' - F-element 4270 1 53.57 CGTTGTTATTATTATTTACCAAACTTAAGGCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTCGTCTGTCTGTATATTTTTTAACATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACATAAGGGATTTCACACAAAAGACACAATAAATGATAACACATAAAT:1 - chr3R 18936293 3' - G4 3657 1 75.34 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCTTTTTTAAATACTTGATATGCCTCTTGGGCGTGGGAATTAAT:1 + chr3L 15612784 3' + roo 327 2 73.29 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTCCATTCCCCCATCCTCCCTTCCACTCACTCGAAATTCTGGGTATTGCCTTTTCATAG:1 + chrX 7515782 3' + roo 9052 2 71.92 CATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTCATTTCTTTCAGTGCCATTTACAATGTACACAAACAAGCA:1 - chr2L 2698373 3' + I-element 5274 1 78.77 AGTTATTTTGTTGTGTTTTTTTTTTCTGCTGCCTATGCGGCGTATGAGTGATGCTGAATTTAGGTCTCACCTCAGCCACTTCCTCGGGGAATTGCAACGCCAGTGATTCACTTGGACATAAATCGATAGCTGACATTTGCCTCGAT:1 - chr2R 14414353 3' - gypsy11 3935 1 60.96 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCAACACTGTCGTTTAACTATTTCATATTAAGTTAATTTATTTATTATTGTTG:2 - chr2R 16441770 3' - I-element 24 1 68.97 AAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAAATGTATTTTAA:1 - chr3L 24934255 3' - HMS-Beagle2 19 2 72.60 AAAAAAAAAAATGAAATTAAAATTAAA:1 + chr4 46381 3' + P-element 2635 2 85.19 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAGTCAAAATATGTT:1 - chr3L 6775348 3' - blood 62 2 58.90 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGTTCGCCGTGAGAGATGCGATTTTTTTTCAGTGAACTGATTTATTTTCGAAAACATCCACACAAGCATAAT:1 + chrX 958062 3' + roo 359 2 54.79 CCCTTTTTTCCCTTTTTTTTTTGCCATTGGAGGGGCCCCAAGATTCGTTGTGTTATTTTTCTAGGCTTTCCATTTTTCGCAAGCGTTGCTGTTTTTTTGCTTCGCCCGGAGTGGACTCCAATGAATTC:1 - chr3R 19500839 3' - Bica 342 1 78.91 TAAGTCTTTAAATATATTCATGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGAATTATTTATAATGGATAGTGTGGGCATGCATATGTATATCATATCTAATAGACATTGAAGGACTCCCGAAC:1 + chr2R 23287581 3' - roo 15 2 71.23 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAACAAAAAAGCGTAAGAGGCGAGACTTGCAAC:1 - chr2L 3395712 3' - jockey 4763 1 79.45 ATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTAACATTATTGTGTTTCATTAAAAATCCGGCCGATGCCCTGCGTTGGTT:1 - chr3L 11745280 3' + G2 2784 1 52.94 TACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATACGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAACACACTGAAATATTAGCACCTCGGACTGAATGCATAAAT:1 + chr3L 16358736 3' + 412 7466 2 73.29 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAATATGTTCCGTAAATAAATTTTAAGGGTATTATTTCTGCAAGGCACGCATTTTCTGCGATGTGCGAC:1 + chr2L 13327035 3' - mdg3 5331 2 56.16 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGTATTTATAAGCTTTCATTTCTTTCCGTGTGATGCGGTTTCTGTATGTTTTGGTTG:1 + chr3L 13868726 3' + 412 428 2 63.70 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAACTCAGCCAAATTCAAATCTAAATCCAAT:2 + chrX 13395382 3' + roo 9046 1 66.90 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTAAGGGCCATATTGACCAAAAATAAATATAAAGATGGCTATTTTTAAACCAAAAAGCCTCGTATCCGATCTTCAAT:1 + chr3L 96623 3' - roo 37 2 62.33 ACAAACACACACACACACATACACAGCCAGACGAACCACACACTCTCAGACCAAAAACAGAAGCCAATAGCGAAACACTAACAGCCATGCCAATTGGTGCTGTTATTATGGGTCAGTTTGGTCTAAACACACAATCACCAACCGC:1 + chrX 10044020 3' + Quasimodo 35 2 60.69 ACAATTCGACCAATTTCAGCGTAGGTTTTACATTCAGAGATCATGTTCGGTATCTAGGCGTTCGAGTGCCGTTTATTTGATATAGAAGTAAGTTAATGTAAAATGCCATGGATTTACACTTATTAGAGCTAAGCAGCTTGTTGGCT:1 - chr2R 5410368 3' - Tc1 432 1 71.92 ATGACCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATTACTTATAGATTACTAATATATATATTACATACTTTGCAATGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAAGGCGTATAAAAACTATTAACATGAGAAGAATTACTGCATAG:1 + chrX 14815841 3' - INE-1 103 1 78.08 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAAATGCCTAGGAAAAGTTTAT:1 - chr3L 17707791 3' - Doc 45 1 54.79 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTA:1 - chr2L 9485602 3' + 412 442 2 59.06 GACAAAAGAAGTGCAAAACAAAATCAAGCCATAATATAGCCAATTGTTAGGCTCATTGTTATAGCGCTGGGAAGGTTTTTCTTATAATCTGACACAATAATAAGCTTTATTAGCTTTGTTTATCATACAAACTACTTTTCAATATA:1 + chr3L 6625248 3' + gypsy2 410 1 50.00 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGTTTGGGATCCAGCTAAAAAAAGCCGAGGCAGACAAGGCAAACGAATA:1 - chr3L 13827225 3' + hopper 1406 2 76.56 GGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGACCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTAAATCTACAACCAATGTAACAGCTAGAAGCAAATAATGTCAA:1 - chr2L 8959877 3' - Ivk 5116 1 55.48 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCCAAATTATAGGTCAATTTTAGGGATTACTCTTCCCCAACTCAGTGCATTCGTGTCATATCCAATGCATACTTTTGGGCAG:1 - chr2L 3762899 3' - jockey 29 1 59.52 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAATTACATTGTTGCATGACACAAATAGTGTTGCCTACAACAAGGGGAACAACAATTGCTGAGACATGGGGGCAAGCTAAAGGATAAAAAGGGGAAAGTAAATGGG:1 + chr2L 13704831 3' - hopper 13 1 75.34 GATGATTTAAATTATAGTATACAAAAGAATTTAACTCTTTACAACCACGAGGTCAAACCAAGTCAAAAGTGCCTGATATATTGACGCACAATCGCCGGATAACGAGAAA:1 + chr2R 12280118 3' - Tc3 396 1 63.30 CTTTGTACATTTTATAGTTAAAACTTACATAGAACATATATATTTTCCTACGATATATTCATTTGGTTTTGGATATAGAGAGTAATACCCTTAAGCTTTTCACACTTTTCAAATTAAATTATCTTATTTGAAGTTCGGAAGCCACT:1 - chr3L 6869857 3' - transib2 2760 1 66.44 ACATATTAAATTATATTATATTTCGGTGTAGGCTTTAACTATCTTTATGCATACCACTGTTCAAACTGGCTTAGTTTATTATACGTTTTTCCCATTTCGCGAGTGCCTACTGTAGAAAATC:1 - chr2R 16096779 3' - TAHRE 435 1 81.82 AATTAAAAAAAAAAAGGGAAAAAAAATGGAAGTTTAGAAGGGAAAAGTTG:1 + chr2R 9105694 3' + Bica 337 1 80.00 ACTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTTTTTTACGATGCTGTTTATTTTGCACTCAAGTCACTGAGAGAAATCCAACCGAGTTACACGCAGACTTGCAGCAAAGTGG:1 - chr3R 31639552 3' - diver2 366 1 60.27 GGATTCATCGGATCCTTTACTTTCAAGCCTAAATATAAACAAAAGATCGTCTCAAAATAAAAAAGTCGCTTTGCCAAACAATTCATATGTCTGCATCCTTTATATCTCCGCTAACGGCTGGATTTATCGTCACACAAGAGGGAAA:1 - chr2R 2521436 3' + transib3 2397 1 51.72 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCC:1 + chr3R 27822288 3' - I-element 24 1 57.14 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAG:1 - chr3L 17175129 3' - 412 62 2 63.43 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTTCCTAGAGTCGTACACCCATGGACTGTTTGAGA:1 + chr3R 25304842 3' + roo 9031 1 58.22 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTATGTATATGTACACAAAGGATGTCACACGAAATATATTTAAAATTCTTCCAAATAACTATTATCAAAACGATTCCTGT:1 - 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flea 25 2 67.59 AGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTCTTGTAAATTTCTATAGATTTGCAAAAAAACTTTTTGCCACGCCACTCAAACGCCCTAAAGCCGCCAAATCGGTCACCTGATCCTGGCCGTGACAATCGTCATGTACCGCTACT:1 - chr3L 15048815 3' + INE-1 156 1 71.53 CAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAGGCTCATTTCAGGCGCTATTCATCAGCGCGGGTCGCTGC:1 - chr2L 7343331 3' - Transpac 101 2 73.29 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAAT:1 + chr3L 19350038 3' - jockey 36 1 67.81 ACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAACACCCTGCGTATGTCTTAGTGCATTAGACCATATGCTGAGCCGTCCGTCCGTGTGCATTCAGTCGAAACTATCATG:1 + chr3R 12181717 3' - GATE 407 1 51.37 CTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTAGATCTATTATGTGTATAATGCGACCCAGTTCTATGTCTTTGTGCCCTGTGTTTAATTCATTAAAAGTTCTATTT:1 - chr2R 4312934 3' - gypsy 7036 2 50.00 TACATAGCGACCACCCCGGTAGCAGTTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAGGAGTGCTTGCCCTTGCTGAGGAACATCTGCGTAGAAATAAAGATCGTGCGCGTCAAC:1 + chr3R 7186331 3' - R1A1-element 5179 1 53.77 GGATGAGACTCCTGTTTGGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCG:1 + chr2R 15829604 3' + invader4 3081 2 70.45 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAAATGTCAGAACGATCACCAACGTGTAAAAAGTTTTAAGTTCTACCGATCTTATAAATATTTATACTTTTTTAAAATTTCGATGTTTTTATACGG:1 - chr3R 7981437 3' - jockey 32 1 67.81 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATGATCCTGCCTGCGCAAAAGTTTTGTGAAGCAGAAACATATAAAAAATGTTGCATATTTTTGGGCATGTGGGAAACTGGGCGGACAAAGTGGGCGT:1 - chr3R 8707344 3' - jockey 4696 1 39.04 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACTAATACTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAA:1 - chr3L 27350473 3' - pogo 61 1 61.64 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCATTAGACATGTAAAAGTTAGTCCTACAAGTCGATTCCTTTAT:1 + chr2R 5737210 3' + 1360 3346 1 57.94 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAATTGCTCAAGAACAACAG:1 - chr3L 14062230 3' - Doc 72 1 60.14 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATAGGCAACGAATCAGCACAGTAAGCGCCAGCTGTGCGTGGAAAGAGAGATGGTATATGGTATATGGCACTATATATGGCAAATGGTAGTATACGATGGTAAGTGGCAAGCAGAG:1 - chr3R 22515908 3' + jockey 4983 1 73.29 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGGGTGAGTGTGTGGCAGTGGGTGTGCCA:1 - chr3L 17175108 3' - 412 19 2 60.71 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCAT:1 - chr2R 21402610 3' + mdg3 5491 2 55.84 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATACTTGCCCTTTCATTTATTTGAATTATAGAATAGAAAAT:1 + chrX 12139055 3' - roo 41 2 59.59 GAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATCGACAATCACGTTTTACATTTTTTTTAAGATGCGAATT:1 - chr3R 9228132 3' - 297 6908 2 73.97 GCTTGTACAGATACGTTTTCGCTACAGACATTAATAAATATTAGAAGTGCCTAAGAAATAATTGGACTCGTACCGTTCATCAGTCTTCAGTCGTCACTGCTCCACAAGCTCGTAAACAATCATAAAACAATTGGGAAGTGTTTTGA:1 - chr2L 22562823 3' - Gypsy12A_LTR 2153 1 72.60 GTTACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGGAATGTGACCAATGTTTATTAATACGCTTATTGTTATTTAAAAAGTTGTAAG:1 - chr3R 9190437 3' - Tabor 14 2 43.84 GTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCT:1 + chr3R 10030784 3' - BS 5041 1 49.57 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGACCGA:1 - chrX 12191524 3' + pogo 2051 1 52.74 TTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTC:1 + chr3R 16913443 3' - pogo 78 1 73.97 GAGTGTGTTGGGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAAGTTGTTTTCGTGAAGCTCCTGCATGAACTCTTCTGGGCCGATGGCTGTGTCAACATATATGTAACATATATATATATATATATA:1 - chr3L 16725555 3' + Circe 198 2 75.19 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACAACTAATCATTAGCTTTACATGATGTGTTTATACG:1 - chr2L 17250733 3' - opus 7160 4 67.89 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTCACATACGTTATAGCTAAGATTTTTTTTAATGTGCCTGGGAAAAGTGTGCAGTAACCCCGCTGTTTATTTGCAGAAAATTCTGCG:1 + chrX 16787210 3' - pogo 33 1 60.27 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATAGCGAGTTTTGGCCAAAGGACGAGGATGGGAACAAG:1 - chr3R 27859158 3' + hopper 1376 1 57.25 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATACTTGCCCTTTCATTTATTTGAATTATAGA:1 + chrX 12139046 3' - roo 8712 2 54.17 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAGGTCATGCGAGGTCAAGATGCATCATGATAATAGACAGAAATTTGGCCTAACTTAACCATTAAAT:1 - chr2R 16403363 3' + copia 237 1 72.60 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCCGCTCATTTCGTTTGTTGTTCTTGTTGCCGCTGTTGTTAATTGACGACAGTGAAAATACGACACTTTGCGCTCTGCGATCGGTTAGTTAAGTTGGCTTAGT:1 - chrX 5679880 3' + P-element 2881 2 80.00 ATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGATATAGATATGTACTTTATTCAATGCTTTCATTCTATTAGAATCCCATTGAGGATCTTAACATTTAAGAGAATATTATTTAC:1 - chrX 16383977 3' + diver 6071 2 57.53 ATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTCGACCATGGCTAGTACATCGAAGCCTTTAGACCCGATGTCGAACCGTAG:1 + chr2R 914569 3' + R1A1-element 29 1 62.31 AGATATATAAGATATATACAAGAATATATTTAAAAAATGTTAAATCGTTATAATTGCATTTCCGAAAACATATGTTACTTGTATAGCAATCATTTCCAACAATGCGACTTAATTTAGTTTTTTTTTAAGTGTAAGAAAGAGCAAAA:1 + chrX 10438242 3' + 412 266 2 71.92 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAG:1 - chr3R 21276557 3' - BS 5071 1 72.06 AAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAG:1 + chr3R 26520441 3' - FB 81 1 77.78 AAATACACACACACATACACACTGCCGCACATGGAGTCATCCAATAAAGCATCCAGTGTTTTGTGGATTTGTGTAAATTTCTGGCTGAGGGCCAAGGGCGGAACACGCGTAATTCCAATCACGTGCCAGCCCAGAAAAGAAAAGTT:1 - chr3L 11361705 3' + accord 7100 2 67.12 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGGATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAACCCTGACTTCAAAGGTCTGCAGACGAGACAAAACATA:1 - chr2R 11489132 3' + mdg1 403 2 71.92 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCA:1 + chr3R 16181239 3' + roo 352 2 54.79 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAAAAAATACAATAGTTGTGCCGAATAATGAGCATTCTATTTTAAACAGTTCGGAGCCCATTTTATTAGAAATATTTATTTGTAATTTACCCATAAAATGT:1 + chrX 3263468 3' + roo 387 2 67.81 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACATATAGGTGGGCAGCATGGTCATCAGCGTTTCAT:1 - chrX 4785096 3' + roo 321 2 77.40 CAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAGTATCCATGAACACATTTCCCTCTACAGTTATGAGCAAGTGGATAAATGATATGGGACAGGAGTTTACAAGGCCCTGTGTCGAGTCAA:1 - chr3R 30510279 3' + gypsy12 10169 2 63.77 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACATATAGGTGGGCAGCATGGTCATCAGCGTTTCATAGCCATAATTGTGCCCGGCATGGGACACCAGAATGGCATAGAAGGGTGGCGATTTGGCAA:1 - chrX 4785036 3' + roo 9047 1 63.89 AATCTACCCTATGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATTCTTGGCCGTGTCAAACAATTAAGCATAATTGCTGTGAGGCAGGCAACATGGAGTG:1 + chr3L 18095926 3' + Stalker 17 4 60.27 AAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCTATTTTCCAGCATTCGAACCTCCGCGCAGATTCCAATTGCGTCGACGGGTTCTTGGTCTCTTTTTGAAGAAACCTTTAATAACGGCAG:1 + chr3R 8261181 3' - Tirant 8359 2 73.98 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTGAATAAATGAATAATAATGTGACCAATGTAACGTTTTCGATAACGTATCGTACATCTTATTCAGTTG:1 - chrX 16787067 3' + pogo 2062 1 51.11 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACAAAGCTGTGCAAAAATATTTGGCTTAGTATAAAAC:1 + chr2L 1260048 3' - Burdock 26 2 63.01 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAAATGGGTGCCAATGTAAGTGAAACCTATCTATTCAATGGTGATTAAACGATTTATCTTAATTTTTCACAA:1 - chr3L 14553042 3' + roo 402 1 58.90 GTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTATAATCAATAGGACACTAATAAATTTGACCCTCTACTCGGGTCGCCAATTGGTGGTCTACG:1 - chr3L 7994612 3' - P-element 2802 1 59.17 CATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGCATGTATCTTTGGTGTTAGTTCT:1 + chr3R 21276674 3' + BS 5084 1 68.97 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCAAGAACCCGATCACGC:1 - chr3R 9160642 3' - copia 4885 2 72.31 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCC:1 + chr3L 25401034 3' - Doc 35 1 52.74 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTTTATCTTCGGTGATAAAAGCCGCCTTGTAATTGGGAATAATCTGAAAGTGTAAACATTTAATTATGGGCTTACACTACCA:1 - chr3L 11776644 3' - mdg3 5283 2 57.04 ATTCGATATAGCTCTTTGGCGGCTGCATGACCCAAGAGTCTATTAGCAGCCTGGGATTCTCAAAATAAAATGTAGCGCAAGGTGGTAAAACCTAAGCTTCAGCTTGACGCTTAATTGTGAC:1 + chr2L 22216610 3' + diver2 4786 2 80.99 GCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGATTTACTTGCGTTAAGTTTTTGAAACTCCCTAAACTTTGGTATAATATCGTTATCGTGTTGATCAATATCTAATGTCTCGAGATAGACG:1 + chrX 16684805 3' - jockey 80 1 60.96 GGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTTTAGGCATTGGCAAATATTTCCAAAATGCGGGCATAATGTCCAGCTGAAAGCCCA:1 - chr3R 10435752 3' - opus 381 2 62.33 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGCAGAGATACATAACAGTATGATTTGCCATTAGTCAGTAACCAAAATCAAGCTACGAGCTGAGAAAGCAAATTATTTGCTGACAACAGTGAATACACATATCCAAGGAATC:1 - chr2R 23412468 3' + mdg1 411 2 74.66 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGC:1 + chr2R 5923008 3' - jockey 4757 1 76.71 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATA:1 + chr3L 13827358 3' - hopper 45 1 50.00 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAA:1 - chr3R 7035241 3' + roo 9011 2 59.59 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTGATCAGGCTGCAGTGTGTGATGCAATTATGAGGGAGTAGTTTTTTGTTACAGTTTAAAGTAAACATTCCCCC:1 + chrX 16855348 3' + roo 9033 1 55.56 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGTATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTG:1 - chr2L 9237513 3' - blood 7062 2 65.81 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGGCTACAGTTTTTTAGTCCGAGCGCGATCGAACATGTTGGCTGCCTGGCAACAAGTTCGATGCG:1 + chrX 5680027 3' + P-element 2881 2 71.88 ATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTCAAACTTGAAACGTAATATTTTTCTCTCTGTACAATGATTCGCAACGTCGGACTCTTTGTGTCGAGAAGGAAAGTGCGTTTATGATTCAATTTTATTTTCTCTTTTTATTATTTT:1 - chr3R 26519903 3' + FB 710 2 71.92 TTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATATCTCGCTGCAATGTGGAGTTACTCGGGTAATTCGCTCCCCAG:1 + chr2R 17121671 3' - blood 7089 2 70.55 ACTTTTGTTAGCCGGCGGGCCTGAAAGGGGTCACCAAGGTGACAAAGGGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAAGTGACTTTAGTAACTGGTTTTAAATGATCCTTTATATACATTCTCGTTGCCCCAAA:1 - chr4 353431 3' + BS3 1685 1 58.82 GGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGACGATATTAATTCTACGTTCGTTATAATAAGCACAATGATTTAATTTTTCATAAGAAAATAACTTTTGGTGTTGCAAAATTG:1 + chr3L 15026803 3' + opus 465 2 56.85 CTGAGAACTCGACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCAATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGG:1 + chrX 21587767 3' - INE-1 136 1 48.95 CGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGGCTGCATTTCGCGGCTATTAAAAA:1 - chr2L 18279853 3' - gypsy5 6963 2 66.91 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACACACACACACACACACACTTGATATGACACCCATGTAATCCTGGCTGATGCAATATCTAAATTAGCTACATCACAACCACTGCGCTGATAAGAGAA:1 - chrX 13395221 3' - roo 20 2 60.27 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAACGACTGGAAGGGCGTTAGTCAAATATATTGCAGTACATACACACACTCCTTC:1 + chr2R 5868410 3' - pogo 32 1 63.70 ACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGACCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAATCAATGACTTGCCATCATTGGCCATAGCCAAAATTGG:1 - chr3L 10783673 3' + roo 8881 2 73.29 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAGCTG:1 - chr2L 22015918 3' + Tirant 389 2 60.76 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGGACGAAAAGCGTTTGTTCCTAGAGTTGAATGGTCAGCAATGGCATACGCCTGGTGGTTCGTAATGGAGTAATGAAGAGTATCACTATTGTTTCACGCTTTAC:1 - chr2R 558041 3' - copia 4882 2 75.54 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGG:1 - chr3R 17897142 3' - hopper 29 1 63.10 TTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTTATACTTAAAAAAATTAGATTTATAAAG:1 + chr2R 4029406 3' + 297 346 2 53.47 GCTCACACTTTTGAAAAATGTTTACATTTTTTCTCATTTGTTTACCCAATATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAG:1 + chr2R 5321181 3' + INE-1 256 1 57.34 CGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTT:1 + chr2R 5674736 3' - S-element 70 1 63.01 ATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATGTTAAAATCATTTCCTGCACATTTCTCAC:1 + chr3R 10472818 3' + mdg1 403 2 69.23 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGC:3 - chr2R 19554926 3' - pogo 61 1 59.59 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGCACGAATTTCGGGG:1 - chr2L 9237488 3' - blood 51 2 54.23 GGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTGTTGCGTGGCCTTCTTGGCGACCATTTTCATG:1 - chr2L 4106266 3' - jockey 4774 1 69.75 GTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGACACACCGCTCATGCCACTGGTCTTCTGTTATCTG:1 + chrX 2773525 3' - jockey 4841 1 75.00 AATAATAATTAAAAAAAAAAACAAACAACCCATTTCAAGGGGCAAAAATAACAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 16736405 3' + Doc 4694 1 76.47 CCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTCAAACTTGAAACGTAATATTTTTCTCTCTGTACAATGATTCGCAACGTCGGACTCTTTGTGTCGAGAAGGAAAGTGCGTTTATGATTC:1 - chr3R 26519930 3' + FB 843 2 56.12 CAAACATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACAGTAAATTAATTAAAAGTAGCCTACTGGAATACGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCCGCAAGGCAAAAAGTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATT:1 + chr3R 15095976 3' - Cr1a 4013 1 76.71 GTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCACTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATCCAGGATACATGCCATTCAGTTG:1 + chrX 1018185 3' - 1360 210 1 70.63 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTC:1 - chr3R 20175673 3' - hopper 24 1 64.12 GTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTAATCCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCACCACTGCAGCTGCTCTTGGTCAACCCAAG:1 + chr2L 11258807 3' + Bica 196 1 76.23 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATCTAACCGTATGTGTGTGG:1 - chr2L 17240215 3' + hopper2 1554 1 58.82 TCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTTAATTTTCTGTGACCCACAACATCTAGACTATGAAGTCAGACTTCGTCAGAGCTTACGACCAATGTGCAAATGAGCTGATTTTCTATGCTATGCT:1 + chr2R 12265274 3' - jockey 4531 1 75.00 AACGAAAAAAAAAAACAAAAAAACACAACAGAGCCCGCTGT:1 - chr3R 29088237 3' + gypsy7 5013 3 75.61 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCATAGGCTCCCAGCTGGTTTCTCACATTGCAGTCATGTTTCTAATTGTCTG:1 + chrX 22725627 3' + roo 9026 1 59.02 TAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTT:1 + chr2L 16089696 3' - 3S18 5796 2 58.91 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAGTCACCGCTTTTTAAAATAAAACCCAAACCGGAGCCCATCTGTATCTAAATTTCTATAGCATAGTAATGCGAGGATAATGCCCAAGATATA:1 - chr3R 26191575 3' - hobo 28 1 60.96 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTA:1 + chr3R 21001876 3' - 412 84 2 76.03 GCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTCTCTATATGACTGCAAGAAAAAATCTAACGAACTAACACAACTTTATTTATAAATTATTTGTATATG:1 - chr2L 11574785 3' - Max-element 8246 2 73.60 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAG:1 + chr2L 14201479 3' - roo 8717 2 57.53 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGCAGA:1 - chr3R 10684716 3' + roo 9028 1 54.48 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGGCCTACA:1 - chr2L 10089748 3' - opus 47 4 66.09 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACAAAGCAGGGAACCGAAAAGGAAAGGACTGGACTGAACTGGGCTGGAGGGTTGTGCTGGAATTGGAATGGGAAGGAA:1 + chrX 17806060 3' - roo 8670 2 75.00 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTACCACGTAACTATCGTATCGT:1 - chr3L 13868624 3' - 412 7109 2 57.53 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCATGAAAAGCACGA:1 - chr2L 9237497 3' - blood 7075 2 61.64 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCTGTTAAATGCTCTAATGATGGGTATTAGGCCAGACTAAGTGCCACTCATAAGTGCCGCACACGCACCTGTCTC:1 - chr3L 16562794 3' + roo 406 1 80.28 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGAT:1 - chr3L 22900105 3' - 412 7113 2 70.16 AATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGAGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGGAAAAACTCTAATAAATGTGCTTGTGATACTCTGCTGCATCTAC:1 + chr3L 7995555 3' + P-element 142 1 37.06 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGCATTTTTTTTTTCCATTTATGTAGCAATTGAAACGAGATCCC:1 + chr3L 16580374 3' - 412 7 2 73.58 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAA:1 - chr3L 27415200 3' + transib2 2778 1 53.79 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAAAAATGTAGAAAACTTTTGACATGTGCACGAACACAAGTCATCTGCTATAGTATGATGCACTATTCAGGATGCCGT:1 - chr2L 5202466 3' + 297 354 2 56.16 ATCATAACAGCGCAATTAACAAGTAAATAATAAAACCCAACCTCGGGCAATAGAAGTAGTTTTCTACGGTACATGCAGTACATACAGTAGTACATGCCCCAAAATGTATGCTACAAAATTGATG:1 + chrX 20266398 3' - 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chrX 8786064 3' + gypsy4 47 2 56.85 ATAAGATAAGATAAGATAAGAAATATAAATAACTATATAAGTATCCAAACATTAAACCTGCTATGTTATTAAAGCGGAAATCTTAATGTATTTCCTTTTTAAACAAAATTCTTAAATTTACAAATATCTATCAGTGAAAGGCTTGA:1 - chr3R 15768155 3' + Stalker3T 206 1 78.08 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCA:1 + chr3L 25401025 3' - Doc 43 1 46.90 AGACGCGTGAAACTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACAAAAAAAAACCTAAAAAATTGAAAGCAAAAATGTGAAAAAAGGCGAACAAGTGAAGCTGCTGCCTCGGGCTAAATTTGGCAGGCGAGACA:1 - chr2L 7559651 3' + mdg3 218 2 62.50 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTTTTATCTCTGTGAGTAAT:1 + chr3R 20988879 3' - I-element 46 1 54.79 TGTAAATTTAAAAAAATTCATAGCATTTCTTTTGTGGGTGTGTGGCATGCAGTCAATAACATATACTGCTAAGAAGTTGTGTTGGTTAATGCACTGTTAAAACTTGCATTAGTACCGTGCACAAGTAGAGAAAGGCTACGTTTCTT:1 - chr3R 16300276 3' - S2 86 1 73.97 TATCATTGCGACTTACGCCGATGATATTGCGGTTCTTTACAGATCCAAATGCCGTATTGAAGCTGCAAATGGGTTACTTTTGAGTGTTGTGAACTTGCAATCACTGGATGAGATAGCACTGCCCAACACTTACTGATCTGCTTAG:1 + chrX 9965150 3' + BS4 174 1 51.72 AAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATA:1 + chr3R 11113248 3' - mdg1 7123 2 80.14 GATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGG:1 + chr3R 14860228 3' - BS 5053 1 56.16 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATA:1 + chr3L 17890825 3' + 412 7512 2 52.94 TATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCGCAACCGCA:2 + chr3L 11400022 3' - Quasimodo 46 2 53.10 GCAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAATAATATAAGACATCTGATCAATCACGGCGGATCAGTTGGTGGTGCCATCGGCGGAGGGAGCAGCTGCTGCCAAGG:1 + chr3R 10292587 3' + S-element 169 2 53.85 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCAC:1 - chrX 14964631 3' + roo 8999 2 75.54 GCAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTCTGCAACAC:1 + chr3L 23678144 3' - Osvaldo 32 1 74.40 CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCCATTTAAGACACCCAATTCCCGCTGCCAATTCACAACTGCAAT:1 + chr2L 17250874 3' + opus 492 2 71.23 AGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGAT:1 - chr2R 5917843 3' - I-element 5137 1 76.71 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGACATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCT:1 - chr3L 16562866 3' + roo 8993 2 69.18 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAGCTGTTAAAAACC:1 + chr2R 6632666 3' + P-element 2834 1 47.95 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCACGAGTG:1 - chr3R 29418676 3' - mdg3 74 2 65.75 GGACGGTGAACTAACGGTATCGCTCTGAAACTTGGACTCCAGCAGCTCCGGGGCATTCATGGCAGACGGGAAAGGACCCAAAAACAAAAACGGGAAATAAAAAGGAAGAGGGAGAAATTCTATACGTATG:1 - chr2R 17291876 3' + gypsy8 171 2 66.15 GACATTTAAAAAATATTTATTTATTGTATATGCTTGCAATCAAAATGAAGAGAAAATGAAGTTTTTCTTTCAAACAGTTAGAGGTGCAATTAATTTAAAAGGATGGATCT:1 - chrX 16220444 3' + Transib5 2726 1 45.45 GTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAA:1 + chr3L 13827347 3' + hopper 1342 1 67.59 TCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAGTCAAAAT:1 - chr3L 6775353 3' - blood 67 2 62.33 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTCACATACGTTATAGCTAAGATTTTTTTTAATGTGCCTGGGAA:1 + chrX 16787167 3' - pogo 60 1 69.23 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCATTAAAAGCCAACACCCTTAAAAGCCAAAAGCATTTGGTTCTTAACTTCCACTCTCGAAAGAGTGGACCATAAAACTGGCTTACATATCGCGCAACATCTAAAAATGAT:1 + chr3R 28627741 3' - copia 4883 2 78.08 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTACCACGTAACTATCGTATCGTA:1 - chr3L 13868623 3' - 412 7108 2 56.85 TCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACG:2 + chr2L 2276769 3' - F-element 96 1 76.03 TTTCTCTTTTTTTTTGTTTTTGGGGTGCCCCCTTGCCAGCCGTTTTCCATTTTTTTTTTGTTGTTGTTCCCTGCTGGTGAACAACACAAAAATTATGTCATAAAAATGTGGCTGCTAATGTTGAGCACATGTACACGCAGCAAAAT:1 - chrX 3088722 3' - gypsy7 5000 1 73.29 TTCTTGATCAGGATTAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGAACGTCGAGATTTTAATAAAATTAAAATATCGATCAACAGCGGTG:1 - chr2R 25240197 3' + INE-1 87 1 61.00 CGTTCATACGGACATACGGACACGGCTAGATCAAAGACCCTAGAATATATTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGGTTATTGATCCTGATCAAAAATATATATATTTTTTATCTAATACGTGATTCACAAAAATATGGGCA:1 - chr2R 5744271 3' - INE-1 124 1 58.90 ATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACATAA:1 - chr3R 3922966 3' - Cr1a 79 1 77.60 AATGCATTACAATTATTACACCTCTATTATATGTGTAACATAGAAATATTGCGATTTTG:1 + chr3R 11749714 3' + Tabor 487 1 64.41 CTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGAGTCGGTGTT:1 + chr2R 15829600 3' + invader4 287 2 57.98 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTTTTGTTTTTTGTTGAGACTAGGGGAAGTCCCTTGCCGGCCATCTCTTTCCTGCATCTGCATCCGTCCCTGTCGCACCTTTCCCAC:1 - chr3L 2885196 3' - S-element 3 2 70.59 GTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACGAGTATATGTCGACAATGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGAAA:1 - chr3R 17495750 3' + Quasimodo 7330 2 63.89 GGATCTTCCCAATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAA:1 + chr3R 26246910 3' + 1731 277 1 52.71 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGGGAGCTTAGAATAGAGTATTTGGGATAATGTACGAGTAGCTGAATCGAATGCCGTAGCAAGTGAATC:2 - chr3R 15338021 3' - blood 7067 2 56.16 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGCAGAGATACATAACAGTATGATTTGCCATTAGTCAGTAACCAAAATCAAGCTACGAGCTG:1 - chr2R 23412518 3' + mdg1 361 2 59.59 AAAAAGATAGAATGCTATAGCCGAATTCCCCGACTATCAGGAACCCGTTACTCACCTGTATTTACTTAAAATATCCAAACACAAAAACCTTTGCATACTGCATATCT:1 + chr4 497898 3' - INE-1 580 1 53.27 AACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTATTGTGGCATTTCGTTGAATAGAATAGAAACAGAGTCTCATCGCCTTTAAAATTGAGGAAAAGCTTCTCTGGCGGAC:1 + chrX 19281821 3' - opus 7042 4 58.90 GCGAGAGGTATGTTTTGCTTTTTACCTTTTCAATTTTCCTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACAACAAAGACCTTCGAGAGCCAACGAAGCGTGGCTTGGATACGGATGAATTCCAGACAAATTCCAAACGATTACCATGGAA:1 + chr2L 19244418 3' + Tc1-2 125 1 52.05 AACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCATGTACTTGTGTGAAATCAATCGCTGATAATCACTGCCGAAGCTTAGTAAGGCCAAGTACCACATCATTACTAACATGTATACATATATATTTGCTTTGTGATG:1 + chrX 21783569 3' + gypsy4 6648 2 60.96 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACA:1 + chr3L 7995471 3' - P-element 99 1 17.81 TATTTTTATGAACACAGCTGTATGTCAGCGGTAATTTAATTTCTCTTTGTGAGTTGAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGTTTTGAAATGATTCACGACGCTAAAGTTTTCGCTCTTTGGCATACATTCATTTTCATAAATTATGTT:1 + chrX 8461072 3' - HB 4 1 56.16 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCTAGGTACAATGTGCAGTAG:1 + chr2R 5923044 3' - jockey 4709 1 54.48 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGTGCAACAAAATTGAAACC:1 - chr3L 18467146 3' - hobo 25 1 67.12 CATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTT:1 - chr3R 19589894 3' - BS 5037 1 53.42 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTACGACTTTTAGGGGCAGTCCGCCCCGCCCATCTCCAACCATTCCCCCCAACCCTCGCAACCAGAAAGTGCGCTGGAAAATTTTTATGCGTA:1 + chr2R 11057391 3' + pogo 2077 1 60.96 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGCCTAGCGATCCTGTTTAAGAATATATCCATTTCAGCTGTTACATAATTCTCAACGAATC:1 - chr2L 21902491 3' - Ivk 23 1 69.23 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGGCCTACAGCCTTGTTGTCCATAAAAACGCACCCATATGCACCTCTTC:1 - chr2L 10089708 3' - opus 38 4 58.90 GGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAGCATCGACGCTTTTTCCCACC:1 - chr3L 24152386 3' - HMS-Beagle2 6 2 80.14 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAAC:1 + chr2L 16458658 3' + roo 321 2 76.03 CTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGA:1 - chr3R 9190524 3' - Tabor 88 2 75.34 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGAAGGAGC:1 - chr2L 12340735 3' + diver 174 2 54.48 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGGCAATTGCCGCAAATAGGTCAG:1 + chr2R 10865240 3' - blood 7050 2 54.31 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCAAATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCC:1 + chr2L 17250832 3' + opus 458 2 50.00 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAACGCAACTCGGAAAGAAAAGGAAA:1 + chr3R 15022140 3' - Tabor 6876 2 58.27 CATATACTGATCAGATCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGTTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATATTTATATAAAATTAAAAAAAAAATTG:1 + chr2L 20596078 3' - invader4 376 1 60.96 TATGGATGATATAATATTCTTTGTTATAATCAGGTTGAACTTATTCCACTTGTGCTATTAAATTATCGTTAAGTTCGCTAAAAGCTTTACCAGCTGGGTCATATAACTGTATTGTAATTTTTGCAGACA:1 - chr3R 3480986 3' + TLD2_LTR 45 1 79.07 ATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTTAAAAACAAAATTTAATTAAGCTCTCATTTGTCAGCAGATTGTACAATCTATGAATC:1 + chr3R 15227518 3' - flea 4658 1 60.96 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCAAACGGTAGTGATTGAATGTGTGTAGATTACCGCCACCTGTGTAAGGTGATCAAGAAGAAAAATTTCCCAGTACCAGATATTGAGAAGCGTCTCC:1 + chr3R 4562458 3' + copia 243 1 78.36 AGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTACTAGTCTCCTGTGTGTTTTGTGTGCAT:1 - chr2R 22722989 3' - 3S18 5793 2 65.07 CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAGATGTTATTATCTTTCTATTTTCCTGAATAACGCTTTGGGAGTATTAATTTATTTGTG:1 + chr3R 4569601 3' - opus 7068 4 65.75 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTAAGATTTTTATTGATTATAGATTGTTTATATTCTGCAGTTGAATTTGAAAGCATTCTGTAGCTTTGGAATGTATACATATTTCAAGAATTTTTTATT:1 - chrX 22725494 3' - roo 20 2 71.92 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCAAGCTGACTG:2 - chr3R 25304743 3' - roo 83 2 80.14 GTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGATGGGCAAATTAACAATTTCAGTTTGATTTGCCTGAGTTAATTTGAACGAACGCA:2 + chr2L 22747354 3' + transib2 2756 1 63.70 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGATACCA:1 - chr3R 24122658 3' + roo 342 2 63.70 GTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATATATTCTTATATATATTCTTAGTGCCGAACTACACCTGGTCTTCCAGTGCTGGGCATGAATATCGCATAATTATATTTATTGTAGATAGCTATGAAAACGTGTCATGGATTAACACAA:1 + chr3L 8397909 3' + Tc1-2 1620 1 69.18 AATCGATAGAAATTTATAAGACTAAGATCCTTTTACTCTACGAGTACCAGGTATAATAAAAAAATCGAAATCACTTTATTGATAACCTTGATAACGGCATTGAAATGAAATATATATATAAAAAGAACTAGAAATCTCCCTTTTA:1 - chr3L 25255414 3' - INE-1 301 1 65.52 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTATCCCATTTATAATCTGGAGGACAATTTTCAAAACTTTAATTACACCACAAGCGAACAAAAAACGATTTATTTAAATAAACAATGCAAACAAAATGA:1 - chr3L 14122553 3' - 1360 24 1 67.81 TTATTAATTTTATTATTTTTATATCCAAATAGCTTATACTAGAGTTTGACATTGAAGATGTTATGGAGATTATTAAATCTTTGGGTATAGTGAATTAATTTTAGTAATTTATAAAAATATAATATTTTATTATTACAATGAAAATG:2 + chr3L 17988452 3' - mdg1 7076 2 19.18 CCTTAGAGAAATTTAATGTTTTATGTTCACTTTCTGTAACATTCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGGTTTTTTCGGTTTGTACTCGATTTATTTTTTGGAACATAAATTGGGATAGCACCTTAAAATGGCAGAGTTCTG:1 - chr2L 14954660 3' - I-element 472 1 53.42 AAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGAGAAAGACGCAGAAGTTTATTGACCAATCTTGCCACGCCCACTCTAACTCCCACAAAACTGCCACGCCCACATCTTCCCCAGAAATCCGCAATCCCAGC:1 - chr2R 8828165 3' + INE-1 174 1 79.23 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCACAATGAATACTTGCTTGGCCAGAGTGAAGTCCAGATCTCTAAGCACGCGGTTTCGGCGATATTTGCTGACAATTCCAATCCCGACAGCGGCATATTTGCTGCGCTCC:1 - chrX 21290541 3' + jockey 4972 1 73.79 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACCTGACGGCAGATTCAGATACACCTTTCAACTTTAAACCATTGGCAACGTGCGTAAACCAATGGCAAT:1 + chr2R 12240191 3' - copia 4924 2 53.42 GAAATATATATATGTATATATATATATTGTGTTGTGTGTTGTTTCACTTATTGAAGATTATAGTAGATTCAAGTTAAGTAAGAAACAGAGACTTCACTTTGATCGCGTTCCAGTTACTAAAGTTCGACTGTATTTGGCATGCGGA:1 + chr2R 14443991 3' + 1731 4408 1 66.90 CGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATACTTACATATATATATACATATATCCCGACCATCCCCCAAAGAACCCAAATTACTTGACACA:1 - chrX 6138620 3' + opus 7480 2 60.55 CGAAAGAAGTCGTCAATCTTTTAGATGCATCAAATGTAGAACATATTACATAGCGACTCGGATTCGGATCACGATGATCAATTTTCTATGCATTTGGACGTAGAAAATTTTGATTAATATAATAGTATAATTATATGTATATTAAA:1 - chr4 253187 3' + transib3 2471 1 82.19 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATTAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTAT:1 - chrX 4778179 3' - 412 63 2 58.62 GTGCATCAATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTGTACACATATACTGGTTAGACATTGCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATAACATTATTAAGATTTCACCACTGAGAATAAACAACGATTTCCGATATTGATTATCGAT:1 + chr3L 14559938 3' + rover 126 2 55.48 TACACACACACACATACATACCCATATCTATGTATACATATCTACTCCTCCTGTTTTAAAAGGCTTGTCAATTCCCATTCGCAGCCAGTGGAACCCCGAGGCGGTATCCTTATGCCCCCCAACCCCTTTT:1 + chr2R 16064446 3' + Quasimodo 40 2 60.77 GCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATCAACTTCCGCCAAGTTCAATCAAATCCGGAA:1 - chr3R 29733046 3' + opus 7442 2 73.33 CACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATAAGATTTGAGCAATAAATAAACTGAAAATTGCAGCAATATTTAAGTCATTCTGACCTACGTATGTTTATTTGGTTTCGATACATTTTCCTCTATGCTTTCCCATAATTA:1 + chr3L 14677049 3' - 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chrX 8891758 3' + P-element 2843 1 45.38 AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGCCTTTAAAAACGGATTGGCAGTGGACACAGTTTCGATACTGTCCGTTTTAAATGACCCTGTTGGGTTTTAAGTGTCACTATTCGGACTAACGCATCCGTCCCTGTGTG:1 + chr2L 22592573 3' + mdg1 360 2 74.66 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTCCCACTCTCGGAGCCCAAGTGCTCCCAAAACATCAAGGCACGTGACGAA:1 - chr3L 18658861 3' + roo 9041 1 60.27 TACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGTACTCCCTCCCTTCAGTGTAGTCCATGGAGGCTCCTCCTGAATATCAATGTTAATTTCAACATTTCTAT:1 - chr2L 15773744 3' - Rt1b 5034 1 76.92 GTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGGCTTTCGAATCATGGAATGGATTGGAGAATGGG:1 - chr3L 20045552 3' - hobo 203 1 73.39 ATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGATATAGATATGTACTTTATTCAATGCTTTCATTCTATTAGAATCCCATTGAGGATCTTAACATTTAAGAGAATATTATTTACTACATTTAG:1 - chrX 16383968 3' + diver 6080 2 63.70 AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACAGCGTAACATTAACACACATTACTAAC:1 + chr2R 17392109 3' - BS 5045 1 53.57 TTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCTG:1 + chrX 21947748 3' - mdg1 26 2 65.22 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTAC:1 + chr3R 9190574 3' + Tabor 400 2 74.66 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCG:1 - chrX 1287799 3' - jockey 4795 1 58.59 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATACGATCAGTGGTTGGGTGAACTGGAAACTAA:1 + chr3L 17890855 3' + 412 7542 2 78.15 ATAACATATGTATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATGTCGGAGCACAATTATTATTTTCCATTTCGCGCAGCGAGTTTCGAACGCACCGAAGATTAAATTGCAATTAAATCACAAATCATATATGTCTAAAATATGTAAT:1 + chr3L 23529724 3' + Stalker2 7478 2 67.12 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAATCTCCATTTCGATAACT:1 - chr2L 19068037 3' + pogo 2053 1 54.17 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATTGATTGCCATGTCAAAGCCAATCCAATCCATTCAGTGTACCCTGCGCTTGGTGCAAAATATTTCCCAATGCCGTACAATTTT:1 + chr3R 24493232 3' - jockey 4673 1 77.40 ATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGAACACGTACACGAGCAAGCACGCACACCGGCGC:1 - chr2L 5325536 3' + 1360 412 1 75.94 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGGAATTTTGCATAATGGTCTTGTCTCTGCCG:1 + chrX 6481335 3' - hobo 79 1 76.87 TTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTAAAATCAATTACTTCCGCTATCAAGACGTATAGATCACAGCGCTCTATGTACTTAATAACAGCTTTTCAAAGTGCAGTTAACAGC:1 + chr2L 12660178 3' + Quasimodo 326 2 61.19 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATTTTCAGCACCTCTTCCTAAGTTTTCCGGGCGTTGCACGTTGCCTATTGCAGCCATTACTCAAGCGACAGCAACGGGCGG:1 + chrX 5859013 3' - hobo 42 1 52.74 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCTGTGTATCTCTGTGTATACTTTTTATTGGCCCACTTCCGGTGAAAGTTTGGTT:1 - chrX 13426140 3' - BS 34 1 54.31 ATAGTGCCAAACTAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCTGTATATAAAGTAACTCAATTTAGATGAACA:1 + chr2L 9668307 3' + 1360 3356 1 61.64 ATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTG:1 + chr2R 4677352 3' - invader3 5249 2 59.31 GATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTTGCCGACGCT:1 - chr3L 25232762 3' + accord2 154 2 56.80 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGGATAGTGCATGGTGAATATGGTGATGAAATGTGCATGAAATTACATTCGAACAATCGATGGAGTGTACTTTA:1 + chrX 3996603 3' - roo 8712 2 52.05 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGC:1 + chr2R 10695888 3' + roo 360 2 53.42 AAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGAC:1 + chr2L 23372626 3' + Gypsy6A_LTR 277 1 54.11 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCTTCTTTGCTACCATGGAGCGGCTCCCAGCACTCAATTAATTAGTACCTCCATCTAAAAGGGGAAAGGGGCACGGATAGTGGACAGTTCCAAGCCGAATCTGCTGGAGCG:1 - chr3R 31521489 3' - roo 4 2 78.83 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGCATGCATGTGCTTTTAGCCTATTCTTCT:2 - chr2R 19554875 3' - pogo 10 1 77.40 AGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAACATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAG:1 - chr3R 9160674 3' - copia 56 2 57.97 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGG:3 - chrX 14964601 3' + roo 9022 2 56.16 TTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCA:1 + chr2L 686065 3' + roo 9012 2 68.55 ATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTAACATTATTGTGTTTCATTAAAAATCCGGCCGATGTCCTGCGTCGGTTTTATGGCATA:1 - chr3L 11745270 3' + G2 2761 1 57.04 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAGTCACCGCTTTTTAAAATAAAACCCAAACCGGAGCCCATCTGTATCTAAATTTCTATAGCATAGTAATGCGAGGATAATGCCCAAGATATACAAATTC:1 - chr3R 26191568 3' - hobo 14 1 67.63 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGTGTACATTATAAATTTGATTAAAACCAAAGAATTCTAGCTAAGGAGCAGCTGACAACAAGTTGTTAAA:1 + chr3L 18467287 3' + hobo 2926 1 63.81 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTA:1 + chr3R 9352090 3' - Tirant 8176 2 63.01 GCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCGAACCGCCTTCAAGTTCACTGCACCGCGATTGCGCCTACCGGCGTGCAAGTGCAGGGGCACGAGTG:1 - chr3L 22642825 3' - hobo 2708 1 77.27 GTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCAC:2 + chr3L 7995466 3' - P-element 104 1 14.38 AAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGATAAGGGCTGCGAAAGAGACGGGTGGACGGCGGAAGGTGAAGGAAGAAGAGAGCTTAAGCCAAAAC:1 - chrX 21260905 3' - Cr1a 289 3 47.13 GAGTCGGCGCTCGTCTTGCTCTTTTTGCCGCTGAACGCGCAATTCGCGTTGGCTCATTTTATAACGATCGATTTGTTCTTTGTCTATATTTACCGATTTGGTATTTGGCATTCGAGCGAGCTAC:1 - chr3L 10394422 3' - Doc3-element 256 1 63.71 CTAGTAAGACCTCACTTTAGTGTGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAATACCCAAATCAATCTGAGCTCCAAGTCTACGAACCCCATTTGGAACCCACGAT:1 + chr3R 30510395 3' - gypsy12 71 2 63.70 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGCTGGCTTTCATTTTATTATTGCTTTTCATAATATAATCTATTTAGATATTGCAAAATCGTCATA:1 - chr2R 22492017 3' + pogo 2047 1 56.85 CGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAACGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTCATCATCGACAGGCTCATCATCTTTACTTTTATTTTCGTTTT:1 - chr2R 14541804 3' - P-element 2734 1 15.86 AGTGACCTATATAACAATTGATTTAAGGCAGTAGCCCCTCTTGAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACGCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTTCATGTGTAGGTGTCATGTG:1 - chrX 21585238 3' - mariner2 268 1 76.55 TCTTATTTGGGATTTTACATATTAATATTGGCTAAAGAGTTATGTAATTACAATTCCATCAACAACGAAGTGATCAAAGTATTGTATTGCTTGGAAGAAGCTTTAAAATTCCCGTCATTGTTCTTTTCCAATCGTTTTTAGAATCT:1 - chr2L 14201306 3' + roo 411 1 69.18 TACACACACACATACACACTGCCGCACATGGAGTCATCCAATAAAGCATCCAGTGTTTTGTGGATTTGTGTAAATTTCTGGCTGAGGGCCAAGGGCGGAACACGCGTAATTCCAATCACGTGCCAGCCCAGAAAAGAAAAGATCTC:1 - chr3L 11361702 3' + accord 7103 2 67.81 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACC:1 + chr3R 16181233 3' + roo 9010 2 58.90 GCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTATGTTTAGGATAAAAGCTTTATACTGAAATTATTTCACAGCATTGTGAAATTGAAATTTTCTGACTGGTGTTTACTTTAAGTTTGGTTATTTATCTGC:1 - chr2L 21657087 3' - 412 7425 2 67.81 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTTTGGCCCAGACAAACTTTGGCCATTTCCTGCAGAAATACCCATGCAA:1 - chr2R 21402551 3' + mdg3 229 2 69.86 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAGCTAGCTCGCTCGCTCGCACACATACAAACAACCACAGAGTCGCAGGCACAGGATCCTTGCTTCATTTTTGTAGTGCATACTT:1 - chr3R 13628539 3' - hobo 30 1 63.04 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATC:1 + chr2L 14248082 3' - I-element 85 1 73.79 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGGAATG:1 - chr3R 9190497 3' - Tabor 61 2 56.85 AACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCCGGACCAAGTGATCGCAATGATATTTCCAACTGCAGCCATTTCACG:1 + chr2L 21943736 3' - opus 7431 2 68.49 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCAC:1 - chr3R 12599044 3' - 412 83 2 73.29 ATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTGAAAGCGTAAATGGTAACATTTAGCT:1 + chr2R 1007696 3' + Ivk 5295 1 77.40 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTTTTAATGTTTTTTAAACTTTTGCCCTGCTCTC:1 - chr3L 13634189 3' - 297 6600 2 65.79 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTTTGAATTCAATTTTAGCAAGTCCTTGTCGTCCTTCCACACCCGGATCCAATCAAGAAATTCCCCCCGGATAGCA:2 - chr2L 2272443 3' + copia 242 1 52.74 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTTGTTAGTTGGCCACTTTATTTTTGAACCATTTTTTTTTTAATGAATAGACAAACTAGATAAAAATATTAAAGCCTCATATATAAGCCTCATAATAAATAGTTACCTAAC:1 + chr3R 17305599 3' - roo 11 2 76.71 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAAGGTATATCTACATAAATGAACTAATATTTTGCTTGGAACTCCACACCGCCTCACATAAATATTTA:1 + chr3R 29645786 3' - jockey 32 1 42.86 TATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAATGGGTCGGTAATAC:1 + chrX 21667985 3' - gypsy2 6509 2 76.03 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCTTTAGTCCCTTAAAAATGGAGGCTCTTCGCAGTGGGTATTCTCGGGTTAC:1 + chr2R 9873712 3' + roo 9014 2 61.94 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATA:1 - chr2R 641865 3' + opus 7453 2 60.80 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCA:1 + chr3R 27822290 3' - I-element 63 1 60.96 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTG:1 - chr3R 31490955 3' + roo 8991 2 73.57 GCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACAAAGCTGTGC:2 + chr2L 1260023 3' - Burdock 6187 2 54.11 CATAATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAAGGCTGACCAAAGGAAATGATAGTTGATATGGCGGTCGACAAACTGCTTATACTAAGAA:1 - chr3L 26375180 3' + HMS-Beagle2 6927 2 60.00 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTGGGGCGGACTTGTTTGCCCCAGTGGCTT:1 - chr2R 6842789 3' - roo 8729 2 75.83 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGCTTATCCCTGTCG:1 - chr2R 5922981 3' + jockey 4935 1 67.97 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGAAATATGCCAAGTCCAGAGTGTCAGCTAAATTTCCGTTGAATTTCAGCTGAATT:1 - chr3R 17114027 3' + roo 343 2 60.27 CACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAAAATGGAGGAGTGCTTCAATTGCACAGTGTCCTTGTAAATCTGTGAAGC:2 + chr3R 26246958 3' + 1731 4620 2 75.34 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTTACAGTTCGATACTCGTATTGTTGCTTCAGAACGCAAA:1 - chr3R 27768824 3' - 297 6616 2 59.22 ATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGCCAAAATTTAATATTTTTCATGTTCCCTTTTTTGCAGCTGCGTCTGTTCTGTTTTTTTTTCTTTTTGGTAGTAATTAAAAAGCGTTGTTT:1 + chr3R 19356566 3' - 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blood 7068 2 66.67 CCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAGTTGGGTTAAGCGATTAAGGAAAACCAAA:1 + chr3L 17207817 3' - hobo 68 1 75.20 TTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGGCGTGGCCGGGTCACATCGAATAGCGAGCTTAGGGCACATGAGAAATACG:1 - chr3R 8556706 3' - G2 148 1 64.94 ACCTCTAGAGCCACGGACAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGCCTTGTCCTTCACGCAATTTACATAATGGTCG:1 - chr3L 4008022 3' - 1360 57 1 73.29 TAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAAATGGATCGGCGTTAA:1 - chr3L 27415185 3' + transib2 2793 1 64.14 ATTAATACCATATGATTCCACATATATTTGTAAAAACATACAACTTTAACTTTGGTGATTCGTTGTGCCATACAAAAGTAATATTCCACAGAACACTAGAACGTTAGTTAGTCTCTTGATTGAACGTAATCATTTTTCGCGAGCTT:1 + chrX 19070750 3' - transib4 476 1 76.71 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAA:1 + chr3R 27822271 3' - I-element 45 1 65.14 GATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGAAGGAGCTCTAATCAGAGAAATGCTGTTGA:1 - chr2L 12340712 3' + diver 185 2 57.53 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAAACGCACAGAAGTA:1 - chr3L 12867297 3' + roo 392 2 48.39 AAAGTAAAAAAAAAATATATTAAATTTAAGTGCGAAATGCAAATAGCAAGTGCTCATTTACTCAAAATAGTTGCCCGTTGGCAATTAGAATTTTACAAGCTGACCTCCTCCTCGAGCGGCTCGC:1 - chr3L 18782033 3' + transib1 34 1 75.81 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTTTTCACAACGTTGAGGGTATAGAATCATTAATCGAGTTGGCAGCACCGTGTAGTTTCACG:1 - chr2L 6318891 3' + pogo 2043 1 60.27 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCAGGAGTGGATCTGGCTTAGCTTCGGATGCCTGACCCTGTTATTTACTTTTGTATCTTTTG:1 - chr3R 29418623 3' - mdg3 5257 1 75.38 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGAC:1 - chr3R 12599036 3' - 412 7105 2 61.79 TGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATATATTATATATTCTCTTTATATATTATATTGCCCTAAAATATCTAGGTTTTCCAAAACCTC:1 + chr3L 22408742 3' - Ivk 59 1 60.69 ATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACAGTAAATTAATTAAAAGTAGCCTACTGGAATACGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCCGCAAGGCAAAAAGTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTAT:1 + chr3R 15095975 3' - Cr1a 4008 1 77.14 AGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGC:4 + chr3R 13349117 3' - BS 5069 1 67.12 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACACGCGGAAATAAAAACCGAAGGCAAATCATAAGCTGTTTTTTTTTATGTTTTAGAAACAATATTCACA:1 - chr2L 12319232 3' + copia 204 2 53.42 AATAAAAAAAAAATTAAAAAAACGCAGAACCAGCTATTGAAGTTCGAGTTCAGCGAATTGACAAATCGTTTTTAAACAATGGCTGCAATGTTTGCAAACCGAAAACAATTGCGG:1 - chr3R 21165380 3' + BS 5102 4 51.75 GAATCGAGCCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGA:1 + chr3L 23940546 3' + Cr1a 4390 1 64.83 AGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATT:1 - 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blood 7100 2 83.56 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGCCTTTAATCATCTGATTTTTTTCCAGCGTTA:1 - chr2L 76022 3' - roo 44 2 59.59 CTGAATCTCAACCTTCAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACATGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCTTCTGCTTTTCCTACTTTTCCTGCTTTTCACCATTTTTCCCTATTGCT:1 + chrX 20575266 3' - INE-1 167 1 64.38 CCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCTTTTATATTAGAAGTTTTTAAAAGACGAG:1 + chr2R 5531235 3' - 1360 56 1 76.34 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATTTTAATGGAAA:1 - chr2R 5922939 3' + jockey 4970 1 48.15 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTTATAATGATTGAATCGACAAGAGCATTCATGAATGAAACGGCAGTTTTGAATTGGCCGCGACTACGAGCAGAGC:1 - chr3L 23042011 3' - pogo 22 1 63.28 AGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCA:1 + chr2L 11951614 3' + pogo 2032 1 64.38 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACCGGGGAGTTTTGTTTGGCTGCAAAGTGGGATTTGCGAGCAAATTCCT:1 + chr3L 905873 3' - 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chrX 4701128 3' + P-element 2825 1 40.41 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTTTCAACTTTAATTTAATTA:1 - chr3R 19589883 3' - BS 5026 1 59.59 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCAC:1 - chr3R 10684732 3' + roo 9011 2 60.27 ACTATGTAAATTCATTTCTTCGACCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGATATTGACCAACTTGATCATGTCTTTGAACTATTTAAAGTA:1 + chr3R 2208379 3' + 1360 3157 1 68.15 AGCGGCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACTAACGCAGAAAATCAGAGTATCAA:2 + chr3R 435970 3' + 1360 2996 1 52.05 AGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTATAACGTCACACGCTAGAAGTCTATAAATGGAAGGCTTCTTAAACACAGCCGCAGG:1 + chr2R 1921505 3' - mdg1 7110 2 62.33 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATG:1 + chrX 20999605 3' - BS 40 1 51.05 ATATTATTATATATACTTATATACTCATATTTAAATTTAAAAAAAAACAGCCTATGTTCCTAATATGTTGGCCTTGTCTGTGCATCTACATGTGTGTCTTTTTAGGTGGCAGTCCCGTATGTCACCAAAATGTCAAAAGCCAAGGA:1 - chr2L 5459867 3' - Dm88 22 3 69.86 AGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTAGTTCAACGCACTATTCGTTGTCAGATAGAAGTCTCTTGACTTTTTTATTGATTTGTTTAGTTCACAGATTTGATTGATATTAGATCTTGGTATGCTGGTATCCTTGTGTGCGA:1 - chr3L 18030917 3' - invader4 2762 2 81.51 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTGCCCAAGAAAGTGCAGCACACTCT:2 - chr2L 15987942 3' + roo 9043 1 66.44 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATGTGCAGTCT:1 + chrX 7515711 3' + roo 8987 2 79.29 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATCAAATCAAATCAAAAAATAAATAATTTTGCACTTCATTGATATGTATCTTAAAAACATA:1 - chr3L 1519508 3' + Juan 4138 1 68.49 CATTTCCACTAGCTGAGTAACGATGAGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGATTATATCATTCACTCTTGTTTTGCTTAATATGGGGAATACGAAATAAAACTCCATTTACTAAAAATAATATGAAAACTAATCA:1 + chr2L 17988176 3' + INE-1 535 1 71.43 GACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAATATATGAATTTTAAATATAAACCCATATGAGTGTAGTGTGCTTG:1 + chr2L 16837531 3' + R1A1-element 26 1 69.86 TATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGAAAAAGCCAAAAAGTAGACAAAACTCAGTTGCGATGGCAGTGCATAGAAA:1 - chr3R 17495703 3' + Quasimodo 7358 2 75.59 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAATGTTATTGAGCGATTGCGGACACTCATACCACT:1 + chrX 10645044 3' - jockey 78 1 74.62 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATGTGTACATAAATTCATATTGTCTAGTTAGCAAAAAAAACGTAGCACGCTTTTAAGGGTCGTTTAATTCTTGTTTGCTTCTGTACCTGGATGGAGTATTTTGTGTGGTTATTT:1 - chr3R 6515258 3' - jockey 15 1 80.14 CTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTACACTCAAGAAGTAAAGTCGAACGGGCCTCGTCCAATCGACTGGCTTCTTCTTTTGGCCCTTCCTAATACTTATTCACTCAGTTGTCACAGCATATGGAATAATAAAATTTAT:1 + chr3L 22900237 3' + 412 484 2 78.08 AAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAATGCAAGTTGGCTCGCTAAAATATTTTGTAAAAACAGCCCAAAGGCCAGACAAA:1 + chr2L 1581422 3' + mdg3 5040 1 63.01 CGGGGACTAATTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACATGCATCCGTTTTCCGCTGGTCAAGCGACCCAATAACGGC:1 + chr3R 14313078 3' + roo 282 2 71.92 CGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAATTATGGTTTTGTAATTGGCATATCGCTGTCTCTATCGCCAAACA:1 - chrX 12860243 3' - 297 353 2 69.86 ATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACAT:1 + chr2R 4261950 3' + invader4 2975 2 64.44 GTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGATGGGCAAATTAACAATTTCAGTTTGATTTGCCTGAGTTAATTTGAACGAACGCAAAG:1 + chr2L 22747357 3' + transib2 2759 1 61.64 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCCATTATCCTCCTCATGTCGCTGTGCGAAAATCTAAAACAGTGAAAAAGTCCGGGGTATGGCACTTTAAAAAGGGCCTACGGTTTTCACACC:1 + chr3L 16562981 3' - roo 5 2 78.69 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGTCTAATA:1 - chr3R 17605592 3' + Tabor 7303 2 70.55 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGC:1 - chr3R 10684750 3' + roo 329 2 72.60 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACAACTAATCATTAGCTTTACATGATGTGTTTATACGAAGCAAATATCACGCAATCATA:1 - chr2L 17250711 3' - opus 7062 4 60.96 GACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTTCT:1 + chrX 23108324 3' - BS3 1435 1 50.00 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAAAATAGTTAAAAAATTATTAGCTAAAAATCTGATTCATTTACTGGAATAATGGCTAGATATTAATAGAAGTGCTTTAAATTATATCCCCCC:1 - chr3L 13374078 3' - pogo 19 1 66.19 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGCCATAAACA:1 - chr3L 27350446 3' + pogo 2077 1 65.19 TGGGTTTCAAAACGGAGTTATATAAGAGGACATTGTACTCCAGTCTTAGGGGAGAGCGAACGTTTATAAGCCAGTGTTTCTTTTCGTGCACACATACATTTGAAGAAAGTTGTTTTTTTCACATCTTAACTAGTTTAATCTATTTC:1 + chr3L 15062474 3' - Doc3-element 4297 1 52.74 GTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACATAATGTTCCCGGCCTAGTTTTTTGCCAAGAAACCTCTTAGCTCCGCATGTGAAGTCTATGACTTTTTTAATCACAAATGGTGAAACTTTTTCAAAATTTTTCCCA:1 - chr2R 4638546 3' + 1731 296 1 71.92 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCA:1 - chr3R 30634948 3' + roo 396 1 59.74 AAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGAAAAAGCCAAAAAGTAGACAAAACTCAGTTGCGATGGCAGTGCATAGAAATGAAA:1 - chr3R 17495698 3' + Quasimodo 7345 2 69.66 AACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCAACTCG:2 + chr2L 686091 3' + roo 9016 2 55.48 AATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATACGATC:1 + chr3L 17890830 3' + 412 495 1 77.27 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTATT:1 - chr2L 2031034 3' - 412 69 2 64.38 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATAGCGAGTTTT:1 - chr3R 27859184 3' + hopper 1401 1 60.92 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGATCGGAGGCCTAGTGGCG:1 - chr3L 22900089 3' - 412 35 2 53.91 GAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAAAATCGATGGAAATTTACAAGAATGTGAAAAATATCAACACATTTTTGAAAAGTTTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCTGTTTGTGGGCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATAGGTCA:1 - chrX 14770553 3' - INE-1 558 1 58.22 TACGCATAATTCTGATTTTTTTTAGAGTTAAGAACTACGCATAATTCTAATTTTGTGAAAAGAGATATTCGCCAGCCAATTTGTTGTGTGGGCAATTTTTCCTTTTATTGTTGACATTTTGATTAGCCCACCTCCAATATATAAAA:1 + chr3R 9352367 3' + invader1 269 2 58.90 GGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCAC:1 - chr2R 5917819 3' - I-element 5113 1 60.27 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTCGAAACCAAGTTAGCAAAATACATTGCATACTTTACAACGTCC:1 - chrX 6707768 3' - hopper 75 1 69.86 ATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTCTGTTATTTACTGTACTGTCAGTCATGTCAATGCACACAAAGCAAAAAATGTAGCAAAT:1 - chr3R 4581849 3' - 297 6601 2 61.11 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATTTCACAGGTTGTAA:2 - chr3L 25406595 3' - 1360 2 2 60.96 AAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGTGTGTTACTCAGGATGCTAGATTAAGAGTGCAATAAAACAGCTCCCAAAATGTCTCTTGCTGTTGACCCATCTCCAATCTCACCCAGGCCTTCCT:1 - chr2L 1524738 3' + Cr1a 183 1 67.81 TATTTAATAGAAAACAAAACGGTTGCATATCACTTCACGCTTTAATAACCAAATAAAAAGTATATTTTTTTAATGTTTTCAAAATTCTGATTTTAATATTAGTTTTACCTCAATTGTGACCACATTTTTTCACGGTGCATGGGCTG:1 + chr3L 9489946 3' + McClintock 325 2 51.37 GAATAAATTCTGTTTTATTTTTGTCCTTTTGAGCGAAGAAAGCGTAGACAAGGGCGTTTGGTAATGGGCATTGAAACGAAATAAAATGTCTCAGCCATATTGATATTTCATCCAAATTGCAAATATTTGCTCCGGGCG:1 + chr2L 1591673 3' - McClintock 334 2 76.81 TCTCAACCTTCTAGCTTTAATAGATTCTGACATATAGATTTACACTCGGCTGTTGATCCTGATCAAGAATATATGCTTTAAAATTTGTCCCTTGGAAGGAATAAAGTCTGTTGACAAAAATGAGGCTGACCAAGAGCCAAAAAGAC:1 + chr3R 19448134 3' - INE-1 162 1 53.42 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTATCCTGCTGTTTGTGCATACTAATAGTAGAGTTAAATAAATATCCACACTCTCGTTAATTGGAAAAAAACGAACGAAAAAA:1 + chr2R 22306110 3' + pogo 2077 1 64.66 CCTCCAACGGGGGGAGGATGTTTGGTCCCAGCGAGCAATACATTGCTCTGTGCAGCAATAGATTTTGCATTCCCCTTTGTGCTATGTCCCTCTCTCTCTCAATAAAGAGCGAGCACAGCTGTTTAAATCTTAATTTTG:1 + chr3L 24895166 3' + diver2 4515 1 62.32 CAAAAACTAATAACTAAAGTGTTTACTCAAAACTGTTATTAAATTGATGTTAATGAAGCAAAGCGCGTCCGTTTTCTGTGTGTTTGTTTGTTTAGATTATGGTCTTTGTTCAAGGTGAATATAATTAACTAAAGATTA:1 + chr3L 9845586 3' + transib3 440 1 59.42 CGTAGCGGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAGTAAATTAAATCATATACATATGAAAATTAATATTTATTATGTGTATA:1 + chr2L 14683585 3' - G-element 76 1 66.21 TGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAATTTATACTCCAGAAAATGTAAGGCTTTTAAGTTCACCTCGGTCTACTCAGAGAGTAAATCGTTTGACCATCTCTTAAAACCAAGTAGAATCAATAAAAAACGTTGGCCCAACAATTATTAGT:1 - chr2L 6273765 3' + FB 226 1 82.19 GAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAAGATCGTTTTTCCAAATTTATATCATTAATACAATAT:1 + chr2L 5239167 3' + 1360 401 1 76.71 TAATAAATATTGAAATATGTAAAAGATACATCCTTGTAAATTTGTAAATATATTAAATGTTATATTTAATACAATAATATAACTAATTCATATTCATCACAGTATATAATTGGTTCAGCTGTCTTACTATGTCTGTACTATGTGCA:1 + chr2R 14434690 3' + Penelope 156 1 75.34 AGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAG:1 - chr2R 5070925 3' - Tirant 6 2 24.06 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATT:1 + chr2L 76155 3' + roo 9026 1 54.79 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTCCATTCCCCCATCCTCCCTTCCACTCACTCG:1 + chrX 7515756 3' + roo 9030 1 55.63 CAGGGCCACAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTTACGTCAGCCCGACTGCAACTAAGTCGCTATTACTATATGGGTGGGGGTATATGAAGGTACAAGTTAACTTGAAGCAACTTTAACTGCAAATGGAGAG:1 - chr2R 13342185 3' + gypsy4 6583 2 56.16 GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGT:2 + chr3L 17133858 3' + jockey 4920 1 76.71 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATATCGTTGCATATAGTTTAATCGACTTCAACAAACGAAAGCCGATATTAAAATAAATACAGAAACAAGTTCGGACGATAAGATGTGCAGCTTAACTCTTTAC:1 + chr3R 25904307 3' - 412 7071 2 73.29 ACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTTTGGCCCAGACAAACTTTGGCCATTTCCTGCAGAAATACCCA:1 - chr2R 21402556 3' + mdg3 246 2 78.23 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGG:1 + chr3L 7995498 3' - P-element 63 1 38.69 AGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGAATTCAGATTAGAGCTCTTCCCCCTTTCCAGAGTGTTGTCTGCCCATTCTGCCAGTTTTGCTTTTTTTATTGAAATACAAAATTTTCTGAATTGGCTCCTCGTCCT:1 + chr2R 5177094 3' + INE-1 149 1 69.86 TGGGTCGTGGTTATGGTGTTGGTAACATCTGCGTGCGAATTGTTGCAGGGCTTGCTCCAGTTATTTTTTTCATCTCCTTTAGCTTTTTCTCTGGATAGGGAGTGAATCACAGTTTTATTGTAAATTAATAAATCTATAAAAACGTC:1 + chr2L 18632446 3' - jockey2 276 1 38.36 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAGCTGTTAAAACCCTGGTTTCCAGGCTTTTGCAAAATGAAAA:1 + chr2R 6632694 3' + P-element 2874 1 74.63 GTTGGTAAATGCAGCCGACTTTTATTCTTAAATCTATTTTTGAGGCCTATGACCAGTGACATGTTTATTGCTGCCCATAAATATAACATATTTATAGTTTGTCTAAACATATATTTTGTTTAAATTCTGGAACAAATTAACGGTAT:1 - chr2R 5018809 3' - rooA 7441 2 36.30 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCTGTTAAATGCTCTAATGATGGGTATTAGGCCAGACTAAGTGCCACTCATAAGTG:1 - chr3L 16562813 3' + roo 389 2 69.29 ATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCG:1 - chr3L 25232767 3' + accord2 7557 2 65.97 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGGAATTATACGTGCAATAATTTGGATTCGTGAGTATAGACTTCAACTATTAAACTATTGAATTATATTTCTCGAGGTGCAGTGGGAGAT:1 + chr2L 2052810 3' - blood 7044 2 55.17 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCA:1 - chr3R 24122680 3' + roo 8984 2 78.77 CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCATTGCACAGAGACTTGTTC:2 + chr3R 13176445 3' - Burdock 6199 2 62.33 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGTGATATCATATGTTATATGGC:1 - chrX 4778153 3' - 412 7091 2 58.22 CGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAATTAAGAAAAAATATAGAAAAATCACCAGATGAGGGGCACTGACTGAACAGATTTTCGATGAATGATAATTTGTGCCGTAAATTGAATG:1 - chr2L 7337517 3' - INE-1 298 1 64.35 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTAACTTTTCTGTCCCTTTGTAACACTTCCGCAAAGCGAAAAGAAGGCACTATTTGGGTAGAATAATTTTATC:1 - chr3R 16181076 3' - roo 8668 2 79.45 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACACACGCACACACTCGTGCACACACACAGGCGGACACTCAGCCTATGCAGCAGCA:1 + chr3L 17175212 3' + 412 435 2 57.25 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGAATGAGTTGATTTCTTTCCGTGTAATGTTTGTTAAA:3 + chr3R 20744047 3' - roo 8748 2 78.77 AAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGACACGGACCAAACACGCATTTGCC:1 - chr3R 20486339 3' + accord 7357 2 51.52 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGGTTTTAGAAAAAGCTTTCTCATTAAAACTAATGACAATAAAAAGATGTAATAG:1 + chr3L 16212821 3' - Transpac 4982 2 63.89 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACATATAGGTGGGCAGCATGGTCATCAGCGTTTCATAGCCATAATTGTGCCCGGCATGGGACACCAGAATGGCATAGAAGGGTGGCGATTTGGCAATGCCCAGAA:1 - chrX 4785027 3' + roo 391 2 69.18 CAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAACCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGA:1 + chr3R 11547770 3' - G2 344 1 64.58 GTATGGGCGGTATGGGTGGGTGTGGTGCGATTTACTTGAAATTTTACGTACGTGTTTTAAATGTCAGATGCACCAATTCAGCTTTATTATTGGACTTTATGCCAGTGTGCAGTAAAATAGCAGCGTTGACATTTGCATATGTATT:1 - chrX 22906775 3' + transib3 2735 1 71.72 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCTGCTGA:1 - chr2L 13792583 3' - F-element 56 1 58.33 AGTTCTTAGACTTTAAACCTATATTATTTTTGATCCGTTGGCACCATTTAAAAAATTATTGTTTTGCATTGCCTTAACTTTATTATTACTTAAATATAGCTTAGAAGTAGTAATGCCAGGATCACCGCCAAGGCGGCACACAGGGC:1 + chr2R 19091117 3' + 1360 238 1 78.08 GTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAATTCAATAAATTTGCACAGAATTTTTCAACAATGAAAACAAATTTTCGCTCTTTCGCTGCTTGCATTCTTTGGCATCGCCATAAGGGGAAAATCCATAATTCATGCAT:1 - chr3L 1404952 3' + Ivk 5365 1 73.79 AAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTTTTTGCACAATGCATAAGAGGTCAA:1 + chr2R 5674774 3' + S-element 1684 2 67.12 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTAAGGCGTTACGCATCTTGTGATTCTAGTGCCTTTGGCTTAACTGTGTTGCGCAAGCGTCTCCACTTTTATGTGCAAGGGT:1 - chr2R 5737132 3' - 1360 46 1 66.07 CTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAATAACA:1 + chr2L 22224620 3' + Rt1c 5421 1 66.43 CTCGACGTTCATACAGACAGACAGATGGACATGGCCAGATCAACATGGGTCAATATATCATTTATAAGGTCGGAAAAGCTACCTTCTACCTGTTACATACTTTCTAAAGAATCAAGTATACCCTTGATAGAAAACTAGCTTAAATT:1 - chr3L 11104237 3' - INE-1 129 1 47.26 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGGTTGTAAGTATTTTTTAATATTTTCTCTCTGTAAATAACTTTTGGTTAAATGTGACTAGCTTATGTGTAAACTTAAAATAAATCCGACTACCGCAGGTAT:1 - chr3R 25904122 3' + 412 473 2 71.23 GTACCCCGTTCAGCCCTAGTGGCTTGTTCGGGGCTATGTGGGCAAACAGCGAGGCATGGGAGTTGGGGCACAGTTAAATCATTAATATGATAAAATTAGTCCAAACATTTTTTGTTTTAATTTTAAAACATTTTTTATGT:1 - chr3R 21679410 3' + Rt1b 4690 1 71.43 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCA:1 + chr3R 30635052 3' - roo 8708 2 50.71 AGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCCAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGCGATGCAAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGATTTCACAAGTTTTCAGTGGCACGAAC:1 + chr2R 12588586 3' + R1A1-element 96 1 77.93 GTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAAT:1 + chr3L 9571722 3' + jockey 4912 1 72.60 CTGGAGTTCCGTGCCTTCGACGGTCACCCAGCGCGCACATGCCCGCCTCGCATTACGCTGACCCTTGCACATCGCTTTCGCTAAACAAAGCCAGAAAAGTGCGCTCGATCTCGTCGAGATGTTC:1 - chr2R 8802400 3' - gypsy10 176 2 68.55 CCATGAGGGCTCCTCCTTCTACCTTTTACATACTTTTCAACGATATAATATTCACAGAAATTATTATATGGGACCACAGTGAATATGTTGTTTTAGTATTAAGCATTTATTAATTTTTTGCCATGTAACATAATTTTGATAGCA:1 - chrX 22633192 3' - Rt1b 4908 1 65.97 CAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCGAACAA:1 - chr2R 11763593 3' - Tabor 54 2 60.16 GTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATACATGTACATCTCTCTGTTAAATGCTTTTAAATCACTGAAATGAGTTTTGAAATAATAATAAGTACA:3 + chrX 22901592 3' - Quasimodo 35 2 47.26 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTACTCTAATTCAATTAGACCTTCCCCCAGCTGCCCA:1 + chr2R 11133617 3' - roo 8751 2 76.71 GCCCTAATTAACATAATAAAAAGAAAAACTATGTTAGTTCTAATCAATGTTAATTCTGAAACAAAAAAGGAAGTCACGCTACGAAATGGATTGTAAGGAATTGTCGAACAATTAATGTGATTGGCGATACTGGCCTCAAAGAGGCA:1 + chr3R 4564068 3' + HB 1351 1 73.97 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTAACTTTTCTGTCCCTTTGTAACACTTCCGCAAAGCGAAAAGAAGGCACTATTTGGGTAGAATAATTTT:1 - chr3R 16181079 3' - roo 8671 2 77.40 CAATCCCGAAAAACAAAAGTTTATGAAAAATATATGGAATGAAAAAAATTTAGAAAAAGTTCAAATACTATTTTCAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACAT:1 + chr3L 13306248 3' + Idefix 7090 2 48.63 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTTTATAGTATATTTAGATTTGCATAAAGCTAACTTCGTAATTTGC:1 + chr3R 23639283 3' + pogo 2079 1 65.75 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAACACACA:2 - chr3R 28396614 3' - jockey 90 1 71.92 CGCTGCGGCGAAGCTGTTGACCGCTTGCCATTCCGCATCACCCTGCAGCATGAATGGGACTAGGTTATCCGCAGTCAGTCTGCTGCCACTTCGGAGCGCAGTCCATCCTGCCGCCCATGCTCACCCATGCCACATCCTCTTCAGAA:1 + chr3R 24610156 3' - Rt1c 5235 1 58.90 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGATCGGAGGCCTAGTGGCG:1 - chr3L 22900089 3' - 412 30 2 53.64 TAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGAGGTCTAGGCGTGCGAAGAATTTAGCCTCTTTGAGTCTGGTTATAAAGCAGTCGAAAGTTGGTAATG:1 + chr2R 4851118 3' - F-element 4264 1 56.00 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCAC:2 + chr3R 26520444 3' - FB 68 1 73.60 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAGCCCTC:1 - chr2L 23310610 3' - 1360 48 1 51.37 AATTGGCACCATGCAAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAATCGTTTCCTGTCCCAAAAGAGCGTGTGGTTCGCCTGGTCTGGATCGCTTTAAATCGTTGACGAAGTTC:1 + chrX 5962474 3' + 1360 273 1 52.74 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGAATTATTTATAATGGATAGTGTGGG:1 + chr2R 23287534 3' - roo 54 2 59.42 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTG:1 - chr2R 11609215 3' + roo 400 1 64.44 AAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGACAGCTCGTAGCGAAGTTTCCCACCTTCAGCATGGACGTAAACCAC:1 - chr3L 22648300 3' - Tabor 6890 2 60.83 GTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATATGCCAGCTAATCTCAGAGGTTAATACGAAGCAGCCAAATGACCACAAGATTAACGCACTTGAGAGCCACCGAAAATCAATACGTCACGCTGAGAAA:1 + chr3R 19859739 3' - opus 15 2 74.29 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAACGAATGGCTGGCTGGCTTCCGAAG:1 + chr3L 19785350 3' - FB 55 1 81.73 ATTTTTGGGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCAGCTTTGCAGTTCTCTGGTTTAAGCTTTTGTTTGTCCACTAAAACGATTGTTCAATTAAACATAGCAAAACGATTTATCCATATATGTTCGAATATATCTATAGAGAG:1 + chr3R 17867879 3' - hobo 31 1 62.68 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTCAGATTGGCTTATTATTTTATGAGTTGATATCGCTTAAACTTAAATTGGTTAC:1 + chr3R 21793453 3' - roo 8743 2 67.81 GGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAGTTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTTCCTTGAATTCCCCATTAATCACAATTAGTTATTTTATTAATAATAAATGCG:1 + chr3L 14776450 3' - F-element 195 1 63.01 ACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAGCTG:1 - chr2L 22015918 3' + Tirant 8440 2 68.15 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGCATGGATGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCCGTATAGCATGAGCCC:1 + chrX 21994003 3' - 297 18 2 64.60 GCCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCAATTTAAGTGCCAGTTTAGTCCAGAATTACAACACAACTTTAAAAG:1 + chr2L 3383545 3' + G2 2863 1 68.49 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCACGAAAAA:1 + chr2R 19553298 3' + mdg1 7450 2 67.26 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGTCATGGAAATAAAGTGCAGGGATCG:1 - chr2R 23287438 3' + roo 9024 2 57.36 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAATTGCTCAAGAACAA:1 - chr3L 14062233 3' - Doc 70 1 60.87 TTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATATATTATATATTCTCTTTATATATTATATTGCCCTAAAATATCTAGGTTTTCCAAAACCTCCGAAAACTTTTAACTTTCAGCTTGCATTGAATA:1 + chr3L 22408775 3' - Ivk 27 1 63.01 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCC:1 - chr3R 31490937 3' + roo 9018 2 58.02 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACATTATGCTACTTACTTTTCCGAAATTAACCCTTCGCAGCACCTTAAATCAAGTAATACTCAAACAAACAGTA:1 - chrX 16579234 3' + roo 354 2 52.74 TTTGATTGTGCTCGCTGTATGATTTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCATTGCCATACCGTCGATTTATCATCCTGTGTAATTTCGTTAAAGCGATCGTGGTGCTCCTCT:1 - chr2L 8538 3' - F-element 4317 1 56.85 ACAACGTGACCCTCTTTCATGACTTCTCTAATGAAATGATATCGAATGTCGATGTGCTTCGTCCTAGAGTCAAGAGTACTCCTTTCCAAGTAGCCCCAGCTCCGCGTCCGGCAGGCCGTAC:1 + chrX 19522528 3' - 1731 4157 1 57.85 GGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCAGAAAGAATAGTAATGATAATATTAACTTAAATAGTCAATCAAGGTGTACTGTTAGGATTAAACAAAACACCTTGAATTAGACAAATAT:1 - chr2L 19736773 3' + I-element 162 1 63.19 TAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTT:2 + chr3R 9160768 3' + copia 192 2 56.85 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTAACATAACATATAATGGATATTATATATAGGCAAGTGATTCAGAACAGAACAGAACAGAACAGCGGTTTTTATCGTGGGTT:1 + chr3R 9393053 3' + S-element 1681 2 60.96 CATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTAATCAACAAGGACAACAAGGCTGGCAAGAGCCAGGCAGCCACAACTGCAGCAA:1 - chr3R 16167488 3' + Ivk 91 1 64.38 GAATTTTTGACCATGCATCCTGCACAACTTGCCAAAGCTGTGCCTCAGACGTCGGGGAAATCTTCGACACATATTTTTTAATGTTTCCCACAGATTTTCAATCTGTAAAATTTAAAGCATCCTTGGTATCTTTGACAGGGCACATC:1 - chr3R 21104355 3' - HB 1240 1 70.55 AATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCAT:1 - chr3L 24152455 3' - HMS-Beagle2 6958 2 69.18 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGTTATGCCATTTTGGAATATCCATTTGGGTTGTACTATGAAATGATAAGGCATATATTTCCTTGAAAAACTTAGGACATTC:1 + chr3L 20255267 3' - Transpac 28 2 63.70 ACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATATTGGACGGAACGGAAGAAGCGGAGTACCTGAAGCGAACGGAAACTG:1 - chrX 2012938 3' + roo 8672 2 62.60 GCATCCACTCAAGCTGTAACCAAAACCCAGTCACTCGGCAGGTAGGCACGTAGTACATAAGAAATCTTTTTCCATATGTATGCACATTAGCATGAGCAAGAAGCGCTTCTGAACGCTAATGGATCGTTTATGTAAATATTGTGTA:1 - chr3L 16576455 3' + Tom1 107 1 75.86 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTGTGTGTCTCAAGTTTTTCCTTTTCGGGTTGCTTGAGTTTGGCCTTCTCT:2 + chr3L 13563394 3' + roo 9002 2 66.44 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCG:1 + chr2R 5237902 3' - Doc 76 1 45.89 CGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAATTA:1 - chr2R 13644421 3' + Burdock 188 2 66.90 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGGAATGTGACCAATGTTTATTAATACGCTTATTGTTATTTAAAAAGTTGTAAGTGCTT:1 - chr3R 9190432 3' - Tabor 6848 2 43.84 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGGCCTGCTCCGATTCGGAATCATTAAATAGACGACAGGCGAAATCGAAATTGCAGTGCCAAAGTTGCCGC:1 - chr2L 11951505 3' - pogo 39 1 57.35 ATATTAAGTGTCTGAAATTAACCAATAAATCAAACTAAACAGTGACACTGGCGTGTTTATTTATGAAGACTTCTAACTGCAACTGTTGCTGCTGGCTGAAGGTTGTTGTGTCTTACACAGTTAGGCGCACAATTAACTGACTGCGG:1 + chr3L 14673532 3' + 3S18 293 2 54.79 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATA:1 + chr3R 16181258 3' + roo 9041 1 62.86 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAATTTAATAGAATTTATTTGTTTAGAAATTGTCTCTTT:1 - 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chr3L 22054986 3' + mdg1 6986 1 61.81 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCGCCTTTATTCTGCGACCTGGGAAATATGATCCACGGACAGATAGAAGGTGTGGGGTTGGGGGCTACGTTT:1 - chrX 20480362 3' - accord 183 2 79.57 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCTACTGCCCCCGAAAAGAAAATATACAAAACAATAAATTGAAAACATTTACAAAATGTTATTGCTTTAAACAGATAACAAATACGAAATGTGCAA:1 - chr3L 20712925 3' + roo 9046 1 67.81 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACATATATACACACAGCCAGCCGAGCGGGCCGATATACA:1 + chr3R 17067903 3' - 297 53 2 74.80 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCAGCTGTCA:1 + chr3R 16181269 3' + roo 9046 1 67.81 CAAACATATGAATTTGATATCGCATAAAAAATGCAGTGTTGCAACTTAAATGTTTTTAAATCTCGTGCTACTAAGTTTCCAAACTCATCTTGTTTAATGGAAAGTGGTGGCAACCTAACCAGCGAGGTGTTTGAAGTATTCTCATG:1 + chrX 6227554 3' - transib3 153 1 67.12 AGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGT:1 - chr3L 22054968 3' + mdg1 7029 1 59.66 GTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCATTTAATTCAAATGGCTTCAGGCATCCATTTAGTGACTGCTTATC:1 - chr3L 15709315 3' - Quasimodo 7051 2 66.92 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCAAATATTTCATTTGAAGTGACACTGCGTTGGAAATTTGTCTGAATTTTCAGCCCCAAAATTGGGGGCATTTAAAT:1 - chr3R 27535408 3' + 412 448 2 54.11 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCGAAGAAGGCCCAAAAAGAGCAAA:1 - chrX 14951142 3' - P-element 76 1 21.77 GATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCAAATACCGAAAAATATTTAAATGTTTCAGCGCATTAAGCTATGTAAACTGTTGTCGTTGCCGCTGTCCGGGGACTGACACGCACTTTCC:1 + chr2L 17729600 3' - 1360 235 1 66.44 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAG:1 + chr3R 10030798 3' - BS 5036 1 56.45 CAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGTGTATACCCTAACAGAGAACATTTTTTTTCAGACAGAAGCTTGCA:1 + chr3L 19483020 3' - pogo 70 1 72.60 GTCTAAAGTCCATATTGGAAAAGCTCGAAACCGAAAAAGTTTTGTAATCATTACTAAAGTTCTTTAACTTGTCTTCTCAATAAAATAGTTAATAAAATAGTGGAAATGTGCCTGAGCATCTATGGCATCACTCATACGCAGTGTGG:1 + chrX 13354527 3' + Idefix 406 2 54.11 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAACACACACACGCACTCACTCGTTGTGTGTCAT:1 - chr3R 28396589 3' - jockey 65 1 54.79 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTAC:1 - chr3L 22052760 3' + mdg1 374 2 59.35 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGACATAATATCCTCGCTGCCCTACCTGGCCATGTGGATTCTGGCCATTGTGTTT:1 + chrX 4785196 3' - roo 8679 2 70.40 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAAAGCCCATTAAAGTGACTTAT:1 - chr3R 30634896 3' + roo 401 1 79.03 CAAGTTGTCAATAGTATTTTCACATGTTTATTGCGCTTCAAAAGTATTTTCACTCAACTTAATTTAGTAAATTTAATTTAAATAATACGTTAAAACAATTATTACATAAAGCATACTTTATTAACGCTACTTTTTCCGGCTTACTG:1 + chr3R 18002876 3' - Bari1 1506 1 56.16 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGGAGTAAACACTTTGTAGACACTTCCATCCACCCCCTTGAATTCTCTATAAAATGATGCAT:1 - chr3L 7995367 3' - P-element 6 2 76.30 GAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATCGATCTATCGATTACTAATTCTTAGCCCTTACAGAGATTTTTCCTTG:1 - chr3R 23720701 3' - mdg1 157 2 67.81 CTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGGTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTTCTTAACTTAATTAGCCACTTCATGAAAAAT:1 + chrX 23108352 3' - BS3 1441 1 53.42 ACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATTTATTTTTGAATCGAGCTGAACCGTGGAGATCTGAGCCTGACATCTGGGCCGCAACTACGATTC:1 + chr3L 14132199 3' - R1A1-element 5273 1 53.78 AAAAAAACAAAAAAAAAACAAAAGGCTTGCAGTCAAGGGCTT:1 - chr3R 13172241 3' - hopper 148 106 76.19 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTTGTTAGTTGGCCACTTTATTTTTGAACCATTTTTTTTTTAATGAATAGACAAACTAGATAAAAATATTAAAGCCTCATATATAAGCCTCATAATAAATAGTTACC:1 + chr3R 17305595 3' - roo 8673 2 77.14 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTGTTGCGTGGCCTTCTTGGCGACCATTTTCATGGCAAG:1 - chr2L 4106261 3' - jockey 4796 1 60.27 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCC:1 - chr2R 6632595 3' - P-element 69 1 24.37 CCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAATTGGGTATTTAAAATATGTACAAAATGTATGGCGGCCTCTAATGGAAAACGGATATTGTGGCGTTCGTCTTAGTTAAGGCAATGCC:1 + chr3R 21916690 3' + hobo 2681 1 50.69 GCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTAGATTTTAAC:1 - chr2R 8157169 3' - Transpac 4983 2 66.44 ATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATGTTGAAACACAGATCTCCCATAAAAAAAA:1 + chr3R 23021016 3' - INE-1 569 1 46.58 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATTTTGGATAAGGTTATAAAAAGAATTATGCAATTATTTTCAAAGAAAGTTCTTTAAATGGTGCTTAATCATTTAAGG:1 - chr3L 15327529 3' - blood 7054 2 55.48 GTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGACTGCGTTGGTCAGCTCTGCGAAAACCCATAAAACTGCACAACTTCAATTAATTTTCACATATGGCGATATGGTGG:1 - chr2L 13617117 3' - F-element 4456 1 58.40 CATTGCTCTGTAAAAGACATCGTACTTAGAGCGATTAAACTTGTTGCTGATAAAAAAAAGGTAGGTTGAGGACGAAGGCGGCTTTCTTAACGCTA:1 - chr3L 23183245 3' + hopper 375 1 80.00 TACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAATAAAAAAAAATAAAAAAATAAAAGTTTCGGACCAAAAACTTGTAATGCGAATCCATAAATCAGCGAACGTTTAATGTAAACCGTATTTTCTTTTATTTCGACGGCC:1 + chr3R 31450803 3' + Juan 4190 1 58.22 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGA:1 - chr2L 17029610 3' - blood 7092 2 72.60 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAAATAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGACCCCATTTCCAGTTTTGTATTT:1 - chr2L 13927698 3' + roo 9031 1 53.96 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGAGGCCATTCAA:1 + chr2R 18482522 3' + hopper 1408 2 75.22 GAGCCATAGGTCCAGATTGGTTATAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCTAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGTTAATCCGTGCCGTTTTTATAGCCAGTAAGTAGATGG:1 + chr3R 6868557 3' - F-element 4257 1 74.48 ACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAA:1 - chr2L 22015930 3' + Tirant 8437 2 75.40 TGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGCGTATTTCCCT:1 + chr2L 14248104 3' - I-element 64 1 58.90 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGGGTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 3466037 3' + P-element 2825 1 19.23 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCCTCAACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACGTACTTGACGCGTTGTTCCTGCCGCTTCCTTTATTTCTATCG:1 + chr2R 12543196 3' + roo 9047 1 65.49 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAGTCCAGTTTAAAGGGAAATACGCG:1 + chr3L 7962303 3' - blood 7034 2 60.00 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGCATTTTTTTTTTCCATTTATGTAGCAATTGAAACGAGATCCCAC:1 + chr3L 16580376 3' - 412 7098 2 54.79 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATGGGCACATACTACATTATTTACACACGTAAACTCATATGTGGTGCAGTATTTCATGTTTCTCCCCCCCAAGTCGTTT:1 - chr3L 16358655 3' - 412 62 2 58.90 ATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTATTGTAACGACCTTAGACACATCTACGAAGACATGCATTAAACACGGCAAACACTTTTAACCAAACACATGTAAAGTGGTGTTGTCTCTCTGCCTCTTTCAATGTGTCGCCTG:1 + chr2L 14057510 3' + I-element 470 1 54.79 TCAGGCAAAAACTCTGAGGAAGATTACAGGCTCTCCGTGGTACATGAGGATCAGAGATATCGAACGCGATCTGAATGTGACACAAATTGGAGACAAGATTCAGGAAATTTCTTCATATGGAACTTTTTTTGTGGTTTAGGTTACCG:1 + chr3R 4511241 3' + jockey2 2966 1 73.97 TAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGATTTATATGACAACAGCTGGGCGAAAGAATGTCATTCGCTTTACATGCCTTTTAGCATACAGCCGCCATATCAGAATCTATATCT:1 + chr3R 12562480 3' - G2 3024 1 58.90 ATTTATTAATTTATTTTTGCTGGATTGTGTTTCACACGATTTTTTCTGTGAATGGAGGGCGAGGCGTTTTGTTGCATTGAATATTTTTGTTGCTTTGAGTCCATTGCAAAAATATTTATTTGGACAATTTTTCATTTGATTGTTGA:1 - chrX 18949392 3' - HeT-A 304 1 59.59 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCAGG:1 - chr3R 29418680 3' - mdg3 5294 2 58.18 AATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCACTCCATTCCGAGCGATTTTCCCTCGCATGTTAGCCAGCCA:1 + chr3R 20486406 3' - accord 83 2 76.03 TATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGGCTATAGATTCATTCTTTCTTGTTAGAGATGGATAAATGTTTTGTTGTCCGCCACTGATTTCGTCCCTGGCGAAA:1 + chr2R 5439249 3' + INE-1 503 1 67.12 AAAAGAAACAAAAACACAAAAAAAAAAACATACATCAATAAAAATATCCAATCAATGTGTAAAATTTAAATGATTCTTTTTCTTGCGGCTCATACATTAGATCTTTAAAAAGATGTCAAGATGATGAATTAATCGAGTGG:1 - chrX 21061807 3' - pogo 301 1 72.14 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGC:1 - chr3R 12599033 3' - 412 56 2 61.54 CACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTGGACACCTTGTGCTCCGCCAGCGACTTTTGTGGG:1 - chr3R 8259421 3' + Tirant 254 2 74.65 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTGCCCAAGAAAGTGCAGCACACTCTTTGCCACTTGCCAGAAAAT:1 - 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chr3L 2724970 3' - Ivk 11 1 69.23 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTATGGGCTGAATCACAAGCTTAAGCATTTTGGCTTGGGAAACGGAAGCTATTAGCACGACCCACAA:1 + chr3R 17114131 3' - roo 54 2 56.16 GTGTGCACCCGTATGCTCATGAATTGTAAATTTCAACAACGACTTTTTTTGCGTGTACGATGAATGGAGTCGAAAGAAAGGGTGCAAAAGCTGTTAAAGCATTGACTAACTGC:1 + chrX 22694495 3' + 1360 180 1 75.22 AAAATATAGATTAAAACAGAAATTCTGGTGTTCAATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATTGTAACAAAATTCAACTTGACTCAAATGGAAGCTCTTCATCGCAGATTGCTCTTACCAGATGTTATTGCACCGATATATCCACATC:1 + chr2L 11955249 3' - HB 1464 1 45.89 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGTAATGTTGTT:1 + chr2R 13644521 3' - Burdock 6176 2 52.67 ACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGATATATTGGAATTCTAATTAACTACACATCTCCCGCCCGCCAGTGACACATCCTTGGTCTCCTTG:1 - chr2L 18317468 3' + mdg1 345 2 71.53 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGGGAAAAAC:1 + chr3L 7995518 3' - P-element 52 1 50.00 AATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAGTAAATTTCAAAAAAAATGCAGGTAATAACGGCTGGG:1 - chr2R 18480188 3' + 1360 309 1 77.67 GATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTAGTTGGGCCCCCCCCTTTTGCTGCTGGACTGCGGTAGTATTCTCGCCC:1 - chr2R 9103948 3' - R1A1-element 4941 1 61.45 ATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGAAGGTGGATTGAGACACCAGAGACCGACCTGATCCACGGGGTAAAGTGAGAAGTGAGGAACAAACATCTTATCCCCTGAGAAGTGAAACTTCTCCGCAATTG:1 - chr2L 242458 3' + roo 8736 2 74.66 ATAACAACAATAATAATAATAATCAAAAATTGAAAAGGTAAGCCTTATTTAAAGAATGTGCATAAGATATATTTAATATAATAAATACGTGGAGGGGGGGGTGTTGTTAGAGAGAGCAGGACAATAAATTAATATTAGCACAGGG:1 + chr3L 411485 3' + mdg1 29 2 60.00 GTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGGCAGGCAGCGGGGTCAGAGGTTAGCCATAAATATGTACGTGTGCC:1 - chrX 6417683 3' - accord 7025 2 81.60 TTTTTTTTTTATTTTACATATTCTGACACCTTTAATAATTACAATTATAATTTGTGGACCCTCTGAAACCCTTTGGCCAATTTAATTTCACCGCCGTGGTTGTTGTTGCCTTTGTGTTTTCCACACAAAT:1 + chr3R 18879664 3' - TART-B 10630 1 51.54 AATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTAAAAAAAAAATATGTATACATTCTCAATTTCAGCACACAAAAGATTGAAGTATCTTTTAATGCTGTTGCAAAGTATG:1 - chr2R 8642886 3' + Doc2-element 4712 1 53.79 AAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTATCTTGCAAATAAAATGCAGCAACACCGATCAAAAGCAAAGCAAAGAAAGCGATTTTCCGATG:1 + chrX 4963287 3' + S-element 1509 1 56.85 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGCA:1 - chr3R 13582188 3' - BS 5019 1 62.02 AAAACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCTCTC:1 - chr3L 24565350 3' - hopper 4 2 54.13 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTATGCATTGCATTGGTGCATATATAATCAGTTGAGTCTGGGCAAAGTCTATGATTTGGA:1 + chrX 17732075 3' - pogo 60 1 63.01 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGTTGTTAAATTTATAAAGCAGTTGATATTTGTAATGGTAACAACTGTATTTTAGATTGATTCCCCATAAATAGAAGCCTAAAAAAGTTAAAATAAATCATCATAT:1 + chrX 13531751 3' - roo 8680 2 65.75 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGA:1 + chrX 5150388 3' + roo 9018 2 56.16 CTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAAGAATATTTGCCCCGACTTTCTTCTACTAACCACACACAAAAGTCAAGCTAGCAAGTTGATAATCCGCAGT:1 - chr3R 27598867 3' - 297 6808 2 51.37 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTAGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCCCAAACCTTCTAAACATAAAGGCCAACACATCTGAGACAGAGAACGCGTATGCTG:1 + chr2R 4160416 3' + pogo 2035 1 63.70 AAAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATGGGTTTATTACAAAGGTCCTCCTAATGCAATTTGTCATTTTCGCATTTTGTTTCTCTGGCTCTCTGGCTTTTGTCTCAAATGCAATTTTTGGCATTCCGTTCACATAAATTAG:1 - chr3L 10144614 3' + blood 354 2 69.18 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGTCCTTTTAGGCGCTTTTTACTTTCTGTTATTCTCAAAATCAAACAAACTCATTTACAACAGCCTTGAGTTTATCTTGTTCTCTCATTAACCGAAT:1 + chr3R 14439189 3' - transib2 23 1 63.45 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCGCACCAACACAAATGCCCATGCACACACGCACACACACACCGTGACGCATTTTTGCACAAATACAATCGCAGATAAAGCAGGGAGTGTGGGCACGCTACCCC:1 - chr2L 8366472 3' + 1360 3378 1 76.64 ATTCTTGGTCATGATCAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGA:1 + chr3L 11826430 3' + INE-1 86 1 66.44 AATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACAGCGTAACATTAACAC:1 + chr2R 17392098 3' - BS 5062 1 63.01 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAATATTTTTTAAGAGACCTAAATAAAGTTTAGGTTTTTTTTTTGTGTCAGCATTCCGAAAGAAATAACCCTATGCTGTCTT:1 - chr2L 5694109 3' - copia 36 2 47.86 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCA:1 + chr3L 7962274 3' - blood 7083 2 68.57 ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACACATATAAACGTTTATTGTAGTGGAAATGCCGATTTTCTTAATTTATTTATGTAACTCGCACAAATATTTTAAATATTTT:1 - chr2L 19024535 3' - Tabor 41 2 57.53 GCATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACGTCTTCTGATAGGCTATCATCATTCATTGTAGTCATT:1 + chr3R 31814131 3' - FB 59 1 70.00 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGGGGAGCTGCTCCACATGTGTCTGTGCGGGTGTGAGTGAGGCGGCGTGTGTGTATGTGTGGGTGTGT:1 - chr3R 27499992 3' - hopper 29 1 54.47 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTCGTGGTAATATGAAATATATTTTAGTATGATATTATAGTTAAGAGCATTAAAACATTCAGCGTAGAATGCT:1 + chrX 16902357 3' - I-element 51 1 50.68 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTTTCGAGCCACTGTGGACGTGTGGGATTCCTTCCCTTTGAAGAGGGCACCTTC:1 + chr2L 11915596 3' + hobo 2919 1 55.67 GCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAAC:1 + chr3L 19349995 3' - jockey 80 1 60.96 CTGTGTTTTAATAACCGAGCATCCGCTTGAAAAGTATGCCTCAACGGCAAAGGCACGCTCCTCACATTTAACTGAATGGCGCGCCTTTTTTATGTTTCATTCCGAGCAAAACGCACACAACTACTCGGAAAAGTGGCAAGTTGGTT:1 + chr3R 22892797 3' - mariner2 190 1 60.96 ACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAGAAAAACACAAAAACAATTAAGAATATTAATAGACACAGGAGCCACATCTCGCTATATCAAAAAGGGGATCTATGAAAATAAA:1 + chr2L 22780962 3' - HMS-Beagle2 36 2 60.96 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGT:1 - chr2R 23287462 3' + roo 345 2 74.17 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGAGATTGAGATTGTTTTGATTCAAGAACTTATATTGCTTATATAGCAGGTTGTGATAGAACATTT:1 - chrX 19536891 3' - roo 48 2 56.62 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATTTAATGATCATTTAATGATCTGCCCGACAGGGGCTTCGGATA:1 + chr3L 15100038 3' + copia 5079 2 71.23 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAGTGTCGATTACTGGCATACTCGTTGGTTGCATATCTGTAGGCTCAATTACACGG:1 + chr3L 22642946 3' - hobo 44 1 56.16 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTGTTGATGGGAAAAAGTTT:1 - chr3L 22052727 3' + mdg1 384 2 60.27 AAAATAGCTGAAATATATCAAATTTCGCGTAGAACTGTCTACTACTTAATAAAAAAGTTTGATACAGTTGGCACATTAAAAAATAAAAAAAGACATTTGATCTATATAATGTGAAGAAGTAGTTAACATTATATAATATTTCAGTA:1 + chr2R 13825679 3' + Bari1 457 1 63.70 AACAAAAAAGAAAAAAAAAACTTTCAGTTTTTGAAGGCATACAAAAGAAAACACAATATTGAGGTAGGTCGTAATTTGGGCATGTTAACCATAAACCAATGCGGAATAATCTTAA:1 + chr2L 18418096 3' + HMS-Beagle2 489 2 60.00 CTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGTGTTTGTCTGGC:1 + chr3R 11547814 3' - G2 302 1 65.75 TTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGATGACGAGGATAGCAACGTGGAGCTACCACCGCCTTCAATTTGGCTCTACTACACGGACGACATAACAATTGCTTGATCTTGATTACTATTCTCCCTATG:1 + chr2L 4353815 3' - accord 7010 2 67.81 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAACGCAACTCGGAAAG:2 + chr3R 15022131 3' - Tabor 53 2 51.37 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGCATTT:2 + chr3L 16580337 3' - 412 7137 2 74.66 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAAT:1 + chr3L 19349989 3' - jockey 58 1 56.78 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGT:1 + chr2L 9485663 3' - 412 82 2 72.60 CAAATTCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAG:1 + chr2L 18279973 3' + gypsy5 349 2 58.39 ATTTATTAAGAAAGAAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAATATTAATAGAATTACTTAAAATATATAATGTATAATTTGTTATTAAGTGAGCCTTTATTAAAAACTTACTTTTAATGCTACATCCTATGGAAGTATTTCTCTT:1 - chr3R 18873153 3' + copia 238 1 54.79 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAG:1 - chr2R 5214947 3' - F-element 64 1 54.11 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAGTCACCGCTTTTTAAAATAAAACCCAAACCGGAGCCCATCTGTATCTAAATTTCTATAGCATAG:1 - chr3R 26191602 3' - hobo 54 1 55.17 TCAACGCTTTACAAGCAGCGTAACTCAAAGCAGTAGCGTCACCACAACAACGGTGACATTTACTAGTGCCAATAACAGCACCATATATACAATGGCAAATGCCGCACACAGCGCCCAACCACCTATTGCACGTGCAACACAACAAC:1 + chr3R 23971058 3' + BS 460 1 72.60 TGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGGCCATTCACTTGCAACATAGTTGATTCGACATGGCAAGTTATGTATATTC:1 - chr3R 27900257 3' - I-element 180 1 65.75 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTC:1 - chr3R 28627607 3' + copia 5053 2 67.13 GCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCACCCGGTTAACTTAGTTAACTTATAGCCTGACAGTTTTGTTGTTAGTTTTTCCAAGCAGCGGTTTCCCGCCTCAGCTTGGGTTTAGTTTAAATCTAT:1 + chr2R 17373248 3' - 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diver 87 2 75.34 GTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATTGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAGTAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGTTCCAGAACTTAAGCCATTAGATTAATAATAGAGTC:1 - chr3L 19215768 3' + F-element 38 1 72.60 TATCTTAAGGCACAAAGTGCGGACACAAGCACTTAACAAACATTGCTTTATTATTTTTTTACACGTCGCAATCTGAATACTCTAATGATGTTACAACTACGAACTTCCACCTGACGACAGGCGAGTGCTTCCCCAGATATCCGAA:1 - chr3R 30678314 3' - 1360 476 1 59.31 CTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATACATGTACATCTCTCTGTTAAATGCTTTTAAATCACTGAAATGAGTTTTGAAATAATAATAAGTACAACATTTCTATCACAGGATGATTAGAAAAATTATATAGTGGCGTA:1 + chrX 22901633 3' - Idefix 3 2 67.14 TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCG:1 - chr3L 17890741 3' - 412 7130 2 69.66 ATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAATAAGACGTTTTATTGTTGTAAACCAAATTGAATTC:1 - chr2R 8641458 3' + diver 205 1 71.92 CAATGATTATTTTGTTTTTTAGTTTTAAGTAAATACAAGCAATACAAGATGTGAGGCTTATGATTGATACTTTTATACAAACTGTGATATTATTATTTGATATTAATTGCGCTGTAGGGATGGTTGGTAAACATGAGACATGAAAT:1 - chr3L 9280841 3' - rover 6834 1 73.29 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATGGCGCTTTCAAGTGCGGTGTGTGTTTGAAAGTCCTAGAACATCACGCATAATAAGCAACCAA:1 - chr3R 15021998 3' + Tabor 7288 2 60.00 GATGGAGGTATGGTTGTCAGATTTGGGGCCTGGCTTGCGACAGCCAAATTCGCCGCATTAACGGAGCCGCCCGCAAGAATGTGTTGATGAAGTCCACCTCGATGCCGTCGCGTCGATGGAGAGAG:1 - chrX 3484123 3' + BS3 1302 1 49.60 CTACGTAATAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTTCAGTCCTTGCACGCTTACCGGAACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGATGAGCATCGCATTCCTTTCGTTGCTTTCACCCACGCACACCATCACACTGGC:1 - chr3R 27820577 3' - Rt1b 5035 1 65.41 GTTGCCCTACCCTACCTATGACCACATTCCTTAAGAGGATGGATCTAGTGGCCCCTTTAAAAATAAAATTTTTAATAATCTTTGAAATATTATTTTTTATTTTTTTTGATGGAATGTCTGCCATGTATACATTACACGTTTCGCGT:1 + chr3L 22348151 3' - Gypsy12A_LTR 1954 1 60.96 CGACTCTTATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCTGCTGGTTGAATATGTAAACCCTCCCCTTCTAAGAAGAAGGCTGTCCACAGACTTCTTGAGAAGCACCCCACACACTCTTCGATTGCGAATGGGGTATA:1 + chrX 4672727 3' - gypsy7 5282 2 76.03 TGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAACTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAATTTGTCTGCTCAGCAAATGAAATGCGCCACGTGAGACTCTTAAATTTTTGCCAAAATATTA:1 + chrX 7669045 3' - 1360 3115 1 54.48 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTACACTCAAGAAGTAAAGTCGAACGGGCCTCGTCCAATCGACTGGCT:1 + chr3L 22900170 3' + 412 7470 2 67.12 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTTTTATCTCTGTGAGTAATTACGAAATGCGAGACTATTCCTATTATAGTTGGTG:1 + chr3R 20988914 3' - I-element 10 1 77.93 ATTTTAAATATAAAAAATATCAGCTTTAATTAACACATTAACTTACAATAAAGTGTATGTGAATAGGATAATATACCCAAGGAGCCAGCGAAATGCATTTGAACAAGGAGCAAAACTGAGAACATTACCGGATATCCTTCCCAG:1 - chr2L 17104610 3' + transib4 2577 1 27.08 TATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTTCGATGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 46 1 67.81 AATAATAATCTTATTAATAATAATTATTGATGGTCCCTCGGAATTAAATTTAAAATCGGTTAAGTCAAGTAGAGGGGCTTAGTGCGGCTTAGTCTCTGTCTGGCG:1 - chr2L 9660580 3' + mdg1 7078 2 62.86 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGG:1 + chr3R 17656453 3' - mdg3 5333 2 71.72 CCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTAGATCCAGCATCTCGTATTTAAAACTTAAAAGCCTTCACACCTGAATATCTTCAACATCTACTTCAATTTCTGGAAAAAAAACCAACATAATCCATCTAAACATGTAAACACT:1 - chrX 21083869 3' - HB 16 1 71.23 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTCCATTCCCCCATCCTCCCTTCCACTCAC:1 + chrX 7515753 3' + roo 9040 1 58.91 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATGGCGCTTTCAAGTGCGGTGTGTGTTTGAAAGTCCTAGAACATCACGCATAATAAGCAACCAAATATGAAGTTGTGATGTGTTAC:2 - chr3R 15021976 3' + Tabor 7309 2 73.29 TCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGAATCAAGCAATTCGCATGAATTGCATGTTCAAGTC:1 + chrX 8027511 3' - Juan 11 1 65.31 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATTTAAACGGGTACATGTGAATGGATGGTTGACTGAAGAGACCCATTCCTTGGTTCCACTGGTTAACG:1 - chrX 12525893 3' + roo 356 2 54.79 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGT:1 + chr2L 76137 3' + roo 9008 2 67.12 ATAAAATATATAAAAATATATTAAAATCACCCATTTCGTATGTAACTTGAGTTCAAAGTCCCGATTGTGTTTGTCCAGAAACGCAAGTGGCAAAAAATCGGGCGCCATGCATAATAAATGGCATCACTGTCCCATCTGAGAGATCA:1 + chrX 16198403 3' + transib4 2280 1 71.23 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACG:1 + chr3L 17890822 3' + 412 429 2 62.33 AGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATAT:1 - chr2R 7020574 3' + Bari1 1624 1 78.72 GAAGCCCTTTACCTCTGGAGGATTCCGGACGACAACGATCGCAAGACGGTGCCCTTCATGACCTAATTCTAAAACTCTATTGCGCAGTCCTTCTGGGATGATTAACCGTGAGACCCTCAATAAAATTGTACCAAGCATTG:1 - chr2R 2923205 3' + Gypsy6A_LTR 348 1 62.86 GGAACTATAAAAGGTAGAAAGTTAAGATGAAGCATGCAGACTCTAGTGGCGCCTAAATGGGTATCTGATAGTCGATCTGAACTCGACTAAAGCATTCAATCTTGTTTGCACATAAACATATGCATACCAGGCGTTCAAATA:1 - chr3L 13896355 3' + INE-1 157 1 75.89 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAAATGGGTGCCAATGTAAGTGAAACC:1 - chr3L 14553093 3' + roo 9021 2 53.79 AAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAA:1 - chr3R 21276546 3' - BS 5070 1 66.44 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATGTGTACATAAATTCATATTGTCTAGTTAGCAAAAAAAACGTAGCACGCTTTTA:1 - chr3R 6515317 3' - jockey 75 1 65.75 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGC:1 + chr3L 16580333 3' - 412 7135 2 76.43 CTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATAT:1 + chr3R 22516066 3' - jockey 4609 1 51.37 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGCAGAGATACATAACAGTATGATTTGCCATTAGTCAGTAACCAAAATCAAGCTACGAGCTGAGAAAGCAAATTATTTGCTGACAACAGTGAATACACATATC:1 - chr2R 23412477 3' + mdg1 7441 2 69.66 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGTGCAACAAAATTGAAACCTTTATG:1 - chr3L 18467140 3' - hobo 15 1 73.24 AAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGC:1 + chr3L 22400337 3' + 1360 3318 1 71.64 GAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGACTTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCA:1 - chr3R 17605636 3' + Tabor 7259 2 59.59 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACACC:1 + chr2R 13644529 3' - Burdock 47 2 53.42 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATATCTTAATATATTTGGGTAATAAATTAGATTTACTTTATATTAAGCATATGGTATGCAGTAGGCACTTTCCTTTTAGCATTTATGAAAGCACAATAAAGGACTTTAAG:2 - chr3R 25768726 3' + copia 242 1 68.49 ATATTTCCAAATAAAATCAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAGTTGCAG:1 + chr2L 4174077 3' + roo 360 2 52.05 AGAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCCATTGTATTACCAAATCAATAAATATAAAAAAAACACACAACCAAAAACATTATAAAATGTAAGGTGTTGGAGATTTATCTCTATCAGTAACATGCCAAAGAATGTGGACGCTACCA:1 + chr2R 6161468 3' + Tc1-2 430 1 52.74 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTCATATTGTAATAAATGAAGGAATACCACAAAAATATTTTCTTAACATGCT:1 + chr3R 16913492 3' - pogo 29 1 65.07 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTGACACACCGCTCATGCCACTGGTCTTCTGTTATCTGCTGGGGGCCCAGTTTTTGTGCTTGGCTAGCAGATGCAACCCCCCAGC:1 + chrX 2773572 3' - jockey 4757 1 79.61 CCTTTATTTTGTCGTGGATAAGCAAAATTACTCAATAAGATATTTCCTTAACGTAAATAACGTAATTTTTAAATTAAGTGAAAGCTTGACAGGCAACGGATTTTCCGGGAAACACGGAAAATGGGAAAGAGGGTGGGAGCAGTGGG:1 - chr2L 1764662 3' + Circe 6976 1 48.63 CATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGTATAACTTGACCAGACTCCAAGGTGAACAAGTCTTTATTATATCAAGCGAAGACTATGAGGCAGTTAAAAATTCAGGTGGAAGCATATCAGAAAATAAAATCACCTGTAAAGCAAGTCA:1 + chr2R 4972831 3' - Ivk 4926 1 74.66 AATACATAGATATAAGCAATGTATGTGTGTGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGAAGAATTTAACTAGTTGTCCAAAGATTTCGATGAGTTTTTGAACTCCCCTCGCTGTGTG:1 - chr2L 1449762 3' + Stalker 275 4 60.27 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGATATAATACACGTTTTTATAGACTTATATGGAGTGATAAA:1 + chr3R 27478558 3' + hobo 2903 1 62.89 GTAACACTGGCGGTTTTATTTTTAAACAGTTATTATACAATATTATAAATTTCAGACAGAAGGATTTACAGGTAATGGCGGAGCCCCGGTTGAAAAAAGTTTTTT:1 - chr4 436792 3' + 3S18 6099 2 70.48 GGATAAAGTCTATTATAGGCCGATATTATGTTCTGCCTATAATAGACTTTATCCTATTATGTAAGGGGATATTAGGTAACAAAGACCTGGCTGCACAGGTGCC:1 - chr3R 2559767 3' - Cr1a 4203 1 65.05 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGTGTTAATTCTAGCTTCAG:1 + chr3L 7962275 3' - blood 7022 2 55.00 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATTGCCTTTGCCTTGCATTATTGTATGTGCAGTATGTTGCAATATGCCTTTGGGGC:1 + chr3L 7994309 3' + P-element 2838 1 49.17 ATATATATACATATATATATTTCCAAACTTCAGTGGAAAAAGTACTGTTGCATACTTTTAAACAGCTTTGTAAGTTAATTAAATTAAATTATTTTAAATATTTAAATGTTGTTTCATCAAATAGTCCTTTTAAAATTA:1 - chr2R 14443779 3' - 1731 4409 1 80.43 CCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGACGCACATAGCACTCACACACATTCTAAAAATGATCTCTCCCAAAAATTAT:1 + chr2R 21076094 3' - P-element 69 1 36.99 CTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGGAATGTGACCAATGTTTATTAATACGCTTATTGTTATTTAAAAAG:1 - chr3R 9190444 3' - Tabor 21 2 43.84 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAA:1 + chr2L 9472087 3' + roo 352 2 57.14 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGG:1 + chrX 4785144 3' - roo 88 2 80.14 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGACTCCCACATGGACAATTGTGGCACAAGATGCCCAACCAATCGAATACTTATTCGTACATATA:1 - chrX 1689975 3' - 412 51 2 53.96 GTCACCAATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGT:1 - chr2L 15987981 3' + roo 340 2 64.38 AGTAAAATAAATATTGTTTAATAATATTTCATAAAAAAATAGCTTTTTCAATCCGGTCTAAGCTGAAGCGCCAATCTTTTTCACATTTTCGAGATAAATCCGTACCCGTCATGGCCCCCGCACTTCCGGTGTAAATATGCCACCA:1 - chrX 22563125 3' + S-element 1604 2 75.17 GTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCAC:1 + chr2R 5923024 3' - jockey 4741 1 65.75 TATCTATTGATATCCCAGAAAAATGAAGAAATTTTGAGTTCGCATTTGTACGGGTATCTAATAGCGGGGAACTCGACTGTAGCATTCTCTATTGTTAATTAAGTAAAACAACCCCATACACCAACTTATGCCAAC:1 + chr3L 27974567 3' + INE-1 499 1 85.19 AGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATTTAACGTGTAGAATAGCTAAAAATACAATA:1 - chr2R 10555843 3' - blood 245 2 72.48 ACAATATTGGTATTTCGTGAGAGCATTGCTATTGGATTCTTAAGATTAGGAGAAGATTCCTAGAGAGCAGTCAAATCTGTTTAGGCCAGGCTATAGGATGAAATAATTGAAATGTCCGGTTTGGATCACCCAAGTACGCCACTATA:2 - chrX 22901643 3' - 297 215 2 66.44 AAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATATGAAAAATATCCAACAAATTTTAAAAAACGTCGCCATGCATTAAAAATCGAAAGTCCATTCAACTCGCCATAAAAAATACTAACGGAGATTCCCTAGAAAAGATCTGTGTTC:1 + chr3L 8764626 3' - INE-1 302 1 62.33 ATAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGACCAATCCGCTTAAGGCTACCCCAGATTTCCTTGTAAACTGATT:1 + chr3L 16973516 3' + S-element 1707 1 76.03 TTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATGTTTTCGAATATAGTACAGCTTAAATGTCAAAAATGAACTTT:1 - chr3L 12976256 3' + invader4 254 2 69.66 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAATGTTATTGAGCGATTGCGGACACTCATAC:1 + chrX 10645040 3' - jockey 85 1 78.20 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGCATGTCTGCTATCATTTAGTGAAGCAAACGAAATGGAATCGCAACGCACC:1 - chr3R 12598984 3' - 412 7 2 75.38 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAAGGTATATCTACATAAATGAACTAATATTTTGCTTGGAACTCCACACCGCCTCACATAAATATTTATGCGTGTTAATGCTGCAACAAACTAATAAAAAC:1 + chr3R 29645819 3' - jockey 26 1 55.48 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCTCTATTATATGTGTAACATAGAAATATTGCGATTTTGGTAATTTTCTTAATTCCTAAAGCCGGGATTACGCGAATAACCGGGTGGGGATTTCCGATTGGGCAAAACA:3 + chr3R 11749784 3' + Tabor 7309 2 73.97 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGAATGAGTTGATTTCTTTCCGTGTAATGTTTGTTAA:1 + chr3R 20744046 3' - 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chrX 22610634 3' - pogo 9 1 69.86 GATTAGTCGACTTGACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCATTAGAATCTATATCTTGGGATTGCGCGAAGAAGAGATCTGTCGGAAGTTGCAATTGTGTTCGACTGGATTCAAAGCGGATTCGGAAGTCCAACAAGGACTGGAAGATT:1 + chr2L 22731696 3' + Cr1a 4087 1 67.81 AAATAAATAATTAAAATTAAAAACTTTGTATAAATAATTTTTAGCTATATGCATTATGTTGTAGTTATTAGAATTTTGGATATTTAGTTATTGAAGAACTTCAACACAAAAGGACACGATCTACAAA:1 + chr2L 16588563 3' + Doc 4686 1 44.88 AGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAGGAGAAACTGAAGCCTGAACCTTAGGAGACAGCGACTAAAGTGGTCAACAACAAACGGAACTAATGCACAACATGCAAAATGGAAACCATA:1 - chr2L 15999795 3' + Bica 85 1 65.28 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAAATTTCAAGAGGCCAGCACCCGGCACTCTAACGCCCATGTCCCCCTTGCCCATTAAGTTCCCCCACCATATTTGAACCG:1 - chr2R 21371415 3' - roo 8702 2 57.93 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTT:2 - chr2L 246019 3' - roo 87 2 78.08 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCATTGGCCGCCGCTGCCATTTTGTTCCAGAGCTCTTGTGAATTTGCAGTCATCAAA:1 + chr2R 6842905 3' + roo 393 1 76.03 GTGTATACTTCGGAAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTGATCATGGCGTAGACACAAAACTATTTATGCTAACGGT:1 + chrX 4701192 3' - P-element 37 1 34.83 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAAGCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCCTTTTTGTGTGG:1 + chr3R 24476385 3' - 412 29 2 56.80 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACCGGGGAGTTTTGTTTGGCTGCAAAGTGGGATTTGCGAGCAAATTCCTTAAGCCCGGTGGATGGACTTTCTT:1 + chr3L 905897 3' - 412 7101 2 51.37 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATATGTGCTTTACTTACTACTATCGGACTGATCATCGTCACCTTTGAGGCTGTCCTTGTTGTCCTCGTCGTCCGTT:1 + chr3R 6711541 3' + pogo 2076 1 63.78 AGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAATTGGCCTCCAGGTGGAGCCACGCGGCTGCACAAATACCGCCAGGTGGCGTAGTTTTACCCCTACATGTTG:1 + chr2L 20121121 3' - Stalker 6991 4 51.37 AATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGTTCCAACTATGTACTCTCGATCTCTTTCGCTCTTTCCCAGTCGGTGCGGTAATTATTAATAAATGCCTG:1 - chrX 7578678 3' + 1360 13 1 55.94 TTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGG:1 - chr3R 9160681 3' - copia 4938 2 64.58 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCAGCAG:1 + chr3R 16181266 3' + roo 398 1 73.44 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTT:1 - chr3L 18658912 3' + roo 8990 2 76.03 TCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCTTTCAAATGGTGAGATTAAAAAGAATGATTTTTCAAACGTGCTTCAAATCATTTATAT:1 + chr3L 16496722 3' - jockey 4772 1 60.27 GGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTTAATTTTCTGTGACCCACAACATCTAGACTATGAAGTCAGACTTC:1 + chr2R 12265224 3' - jockey 4583 1 65.38 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTAAATGATTTAAACAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCATACTTTTGAGGGCAATAGGGTG:1 - chr3L 21144024 3' - jockey 4709 1 58.22 TTATTCAAGAAGATTCAGTAAATAAAAGCAAAATTTATTAAAAAAATTCAAGAATTTCAAGAATATTTATATAAAACATTTCAATATAACATATATTTAATACATATTGAAACAGCAAAATGCTCATATATGTAAATTCGATCATA:1 - chr2R 5374688 3' + F-element 4652 1 63.70 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTGAAAATAGTATTTGAACTTTTTCTAAATTTTTTTCATTCCATATATTTTTCATAAACCTCCTGTGATTTGTGTACCCTATCTTAGAT:1 + chr2L 12658610 3' - Quasimodo 25 2 45.89 CAAGTGCTTTACTAAAGTCAGTTATGACATCTGCTTGAAGACTATTTTTGAAGACCTGTATGACGAAGGAAGTTAGCTCCAAAAGGTTGTCTGCACCTACAAAGGTGAGGTTTTCAAATTTATGGAATTGTGCAAGCAAGCACATA:1 - chr3R 14296233 3' - Q-element 313 2 81.51 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTATGCCCCAACTCTTGGGATAAAACATCTCGCACTGTCACAGAAAAAACCACGACCGTTGGTGCGTTTCGTCTGCCTCGTCACTCTGCCGTATGAATAAATGTC:1 - chr2L 21951072 3' - Burdock 13 2 76.71 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTGCACAAACCCACAGAGTCTGTTTATGGGTTCATTTGTATATTCCGATTTCGAACGC:1 - chr3R 17067818 3' + 297 332 2 63.70 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTCTATTGTTGATAGCCGATTGCAAAGACTTGTGCAACATGCAGCGAACATTTATCATCGATGACAG:1 - chr3R 28627543 3' + copia 245 1 75.34 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTT:1 - 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chr2R 19553136 3' - mdg1 6 2 78.20 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAAGAAACCGAATCTGCTTGCCCCGCCCATAAATACTTATTATCGCTTATTTGAACTTGTGAATGCTGCCAAGAGCGATGCTTG:1 + chr3L 13634332 3' + 297 364 2 65.75 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAACTCAGCCAAATTCAAATCTAAATCC:1 + chrX 13395379 3' + roo 9042 1 64.38 CATGCACGCACACACACACACACACGCACACACAAAAATGCCAGAAAAATACCAGTAGAGCTTAAATAATTTCCAAGCTTACTTCTAACACTGCAGGCAGGCAGCAACAACAACAGCTTAATGATATTATATTAAAAGTTATAGTA:1 + chr2L 19073825 3' + accord 180 2 67.81 ATCGCTAAAAACAAAAAACAAAAAAAATAAGGAGCGTGAGCTATAAAAGTGAGTGTAAATTAGGAAACGGAACAACAACACTCTGGCTGGTATCAACCTTTACAAATAATTTTTCATTTTATTACACGCTTATACAACTCTGCG:1 + chr2L 20625564 3' + G-element 4322 1 54.86 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCCTTTTTGTGTGGTTCGCGGTG:1 + chr3R 24476394 3' - 412 10 2 71.30 TCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGAATGGTGTAGAAATGGAACGCATTTGTAGTTGCACCTTAAAACCGGTTTTAAAATGCTAAACTA:1 - chr3R 15806581 3' - mdg1 204 2 56.85 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGGCCACTTGAGAAAATCAGTGCTTCGATACATTTCGTAGCGAGCGGTTGAGTTTGT:1 - chr3L 16580262 3' + 412 430 2 60.69 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGGCCAATTAATTT:1 - chr2L 3890150 3' - jockey 78 1 68.84 ATTATGTTCGTATATACTACAAAACTGTGATAGGCATGCTAACTGTACTGTTACTTTGAGCTCAGCTGTGGGCGTGTGTGTATGCCACGCACGAAATAAGCATCATTA:1 + chrX 3197194 3' - mdg1 7038 1 71.30 ACGCGTATATGTGCGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATACTGATCGAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTACACAGCAGGCTTCGCTTCTGCGAAAACCATAGGTGCTTTAATTAATTTTTATCATT:1 - chr2R 20117002 3' - 1360 3217 1 61.64 GTGCCAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGCTTAAACTAAACGAAAACACAAAAGTGATTATATGTATAAATGGGCGAATGTCAGCAGGACGCACGAATCGAAACTGAAG:1 - chr3R 17867737 3' + hobo 2933 1 70.37 GCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTCTGCCCTACTTCGACTTTGATGTGCCGCGCAACTTGACCGTAA:1 + chr2R 20726134 3' - roo 8773 2 70.55 ATATCCACAGCTTGGTATAGTCTGTACCAAAACGTGTTTAAAAGGTGATAGACGCTAAGAGAGGGTATATTTTTTATTAATTTATTATAATTTTCTGGGCCAACTGTATGGGCAGTGGAGTG:1 + chr2R 10921986 3' + Tc1-2 1299 1 77.05 TGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGT:1 + chr3R 29487012 3' - flea 4827 1 73.10 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCT:1 + chr3R 16181234 3' + roo 9037 1 53.33 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAATACACGTTTTTATTGACTTATATGGAGTGATAAA:1 + chr3R 27478558 3' + hobo 2894 1 67.92 ATATTGGATTCACATTCTGATTCCGATTCGAGTTCAGATTCGGAAATTTATAATGTAGAAGAAGAAGAATATACACAATTTTATTTAAAAATCGACTGCGTTGGCCCGACATTTGGCCAAGTCTCGTCTGGCCAAACAACTTTACT:1 - chr2L 19201896 3' + transib2 2526 1 62.33 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCAGTTTTTTCGCAGCCGCGCTTGGCTGCCGC:1 + chrX 8891817 3' - P-element 14 1 50.00 AACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCACTTATGTCACTGAC:1 + chrX 6138729 3' - 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chr2R 3338794 3' - Juan 70 1 64.38 ACTACATATACTTGCACACACACACAGACACACACATACATTATAGCAACACATAGCAACAGCCATACACCAAATCAAAAGGGAAAGAAAATAAGGTTAACAAGGGACCCAAAACAGACACACACACACACACACACACACAAAT:1 + chrX 7978952 3' + Quasimodo 26 2 51.72 GATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTAACATTATTGTGTTTCATTAAAAATCCGGCCGATGTCCTGCGTTGGTTTTATGGCATAGTATGTGGGATGCGGGGGTTCGCTGGTTCATTTGCATGCCACGATGTCCAG:1 - chr3L 11745219 3' + G2 2801 1 78.08 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGTAATTCGTGTGGAAATACAAATATA:1 - chr3R 13582165 3' - BS 5013 1 71.92 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTA:1 + chr2R 18482490 3' - hopper 72 1 70.55 GGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGCAACGGCATACGGATACGGAAGCTGCCAAGATGGCCGCCGCCCACAG:1 + chr2R 19179728 3' - roo 8837 2 57.27 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCGAAGAAGGCCCAAAAAGAGCAAAGCTGCATATACACTGAGGAAATTGCATATATCAACC:1 - chrX 14951106 3' - P-element 62 1 43.15 CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAACAACAAATGAGTTGTGTAATTA:1 + chr3R 18815985 3' - hobo 35 1 57.69 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAAC:1 + chr2R 5955016 3' + copia 208 2 70.55 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATAAAATAATAGAAGTAACCCTTTTTG:1 + chr2L 5202552 3' - 297 6608 2 70.67 ATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGTCCATTCTACACCCACAACTTCCCAACCACACACTATTGTAAACAATCACAGACA:1 - chrX 22252741 3' + diver 6046 2 60.96 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAG:1 + chr3R 9352129 3' - Tirant 13 2 75.19 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACGTCTCGTTCGGCTAACGTGCACAAACATTTCATTGGGCTGAACTATATATGAATAGAACCCCTTAACTATA:1 - chr3R 21001761 3' + 412 478 2 68.61 GAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCGTCGTCCTGGCATGGAGTCCACCAAGTCCTGGCACGTTCAATGATTATTCCATACTTTAAATTGTAATTATCAATGTCGAG:1 + chr3L 24924988 3' - Tc1 1338 1 64.62 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTGGCATACTTGAC:1 - chr2R 5922966 3' + jockey 4949 1 56.59 AGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAA:1 - chr3L 24934294 3' - HMS-Beagle2 6941 2 59.59 GGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTCAATATAGCGTCATAGCGGGTCATATAGGGTCATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAA:1 + chr3R 29534664 3' + Stalker4 6951 2 77.40 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGT:2 - chr2L 246020 3' - roo 88 2 78.77 AGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACATGACCAGTTCGACT:1 - chrX 14061526 3' - INE-1 557 1 56.56 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCCGTCTTATGTTTTAGCAATTAGTTACTAAG:1 + chr3R 9160820 3' + copia 243 1 75.34 CAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGCCGAGTAAAACTGACTATGTCCGTAATTTTTCCCTTTTTATATGAATGTCTTGTAAAATTCTAC:1 + chr2R 12994950 3' - BS 5049 1 57.24 TTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCGTTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTACTCTATTAATTATATGCAGCAAACTTCCCCGAAAATAATTA:1 - chr2R 15129226 3' + GATE 359 1 71.92 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGGAAACTACCAGCCAAGCATCATCATCTGACACATTCCA:1 + chr2R 5955067 3' + copia 244 1 74.02 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTTTGAATTCAATTTTAGCAAGTCCTTGTCGTCCTT:1 - chr2L 2272483 3' + copia 5071 2 79.45 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGGCAATTGCCGCAAATAGGTCAGTTCAGATGGAGGTTACTGAACTCTCTCGCCCGCCGGCCAAATGTATTTATGGAA:1 + chr2R 10865294 3' - blood 15 2 73.97 ATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATACGCCGAGTGGTTTAGATAGCAGTTTTTGCAAGTGCGTTGTATTTACTAAGAACTTGAAAACTCCTGTATATC:1 - chr2R 19553165 3' - mdg1 48 2 52.74 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGT:1 - chr2L 15987967 3' + roo 354 2 56.16 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACAAAGCAGGGAACCGAAAAGGAAAGGACTGGACTGAACTGGGCTGGAGGTTTGTGCTGG:1 + chrX 17806042 3' - roo 8723 2 60.14 TTAATATATTAAAAATAAAAACAAACAGCTATTTTACATTTTGAAACCTGAACAGATTAGATACCTACTTCTTTTGCTAGGTTCAATCAAAGCTCATTTACGGTTGACAATGTCCGTGTTAATTCCCCAAGAATTAAATGATAACA:1 + chr2R 14803073 3' + HB 1358 1 50.00 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAAT:1 + chr2L 9472084 3' + roo 9024 2 55.81 CTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGC:2 + chr3R 9160766 3' + copia 190 2 58.22 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGCGGTGGGGCAG:1 + chr3L 15276718 3' - hopper 53 1 66.94 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGAAGCGTCTTAGACCATATATAGTATATACATA:1 + chr2R 13979149 3' - hobo 54 1 74.11 AACCAAGCAGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAACAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTA:1 - chr2R 4260435 3' - micropia 5212 1 48.85 GTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAAGATCTCAATCTAGGAAATGGTGACTTCAAACTCAAAATGCCTCAAAAGGGCAGAG:1 - chr2L 11073263 3' + Stalker 7078 4 62.33 ACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAGC:1 - chr2L 22015920 3' + Tirant 8437 2 69.85 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGTTCCTCTATTACGGCTGCACTCCTGCTATAATACGTCTTTCACTTGAATTGCTTTTGAAAGCTGTACATTTCTAATG:1 - chrX 17419366 3' - Juan 4030 1 72.38 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCTAAGATAAATGATGCACACGTTGAAATCCCTTCATAATAAGGGATTAATATTACAAGATTGTACGCAATTAGTGGCCAGATAG:1 + chr3L 15327672 3' + blood 7352 2 56.85 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGTAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTAAATATTCTGGGTTTTTTTTTATTAAAATTGCATCCCACTCTACAGTGCACTGTTGGTCGCGATTTTTATTGTTGATATTATTATCGTCACA:1 - chr2L 21943882 3' + opus 475 2 68.49 AAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACGCAGTAAGTCCGAACTGCA:1 + chr2R 4313072 3' + gypsy 420 2 40.41 CTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAGTACAACAAATTTTTTTATG:1 - chr3L 27356034 3' + Tc3 1684 1 76.55 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGGCTACAGTTTTTTAGTCCGAGCGCGATCGAACATGTTGGCTGCC:1 + chrX 5680008 3' + P-element 2818 1 35.71 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCTGCTGAACCAGGAACAAGCGTATTTCCC:1 - chr2L 13792561 3' - F-element 55 1 49.65 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTTGGCAA:1 + chr2L 5202561 3' - 297 48 2 71.43 CACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGTTTTTTTTGGTAATCAGACACACAGAATTTGTTGTGACCTTGTG:1 + chr3L 1988829 3' - roo 8910 2 63.93 CTTATTTACAATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAAT:2 + chr2R 5532317 3' - G4 3833 1 71.23 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCT:1 + chr2R 5923026 3' - jockey 4739 1 64.38 GTATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATTTCTACACAGTTTTAAAAACAAAACTCAAAGAACTCAAAACTAAAAACCACTAAAGAACAACCATAACCGGAGCTTGGTAACGAAAATCCAAAGAG:1 - chr2L 16084216 3' + 3S18 5763 1 65.07 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATGTGTGCAATGACAATATAAATAAAATAATTGCTGACATAAATAAA:1 + chr3L 6775434 3' + blood 303 2 70.55 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTATATCCTTAACATAGAAGCCGACAGTCAACGACGACCTGGTTTTTAAGCACGAAGCTGCCTTCGTTTCACTTCGTTTAAATTTAGTACAAAATGCTAGCA:1 + chrX 3099216 3' + P-element 2865 1 69.18 CGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATA:1 + chr3R 9160738 3' + copia 162 2 77.40 TTTTGTTTTTTGTTTTTATTTAAAGATCGACTCTATTCAGGCATAATAACTTATATAGTTTTAGAGAATATCGGGCTCTAAATGAAGAACTAAAACCATATGAAAATATGAACATCTTGCTGAAGGAGCAGCTGACTCAGTTGAGT:1 - chrX 19350978 3' - transib2 100 1 47.26 GATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGTAGTTGTTAATTAGCTTATGATTACTGTTGAGTAAAATGGAAACCTTTTTTAAACGCTTAAGGGTTCAA:1 - chr3R 13348997 3' + BS 5080 1 73.29 AATTCTCAAGCTTTTCCTCCTGTTCTAGAACCGTTCCCTTTCAGAAGGTATTCATTTGCTTCTTTCGATTTTGTATACTAGCTCCTTCATGTTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGTGCGG:1 + chr3L 20934651 3' + Gypsy12A_LTR 2013 1 68.22 TTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTCTTCAAA:1 - chr3L 9497740 3' - jockey 4823 1 54.79 GGGGATCGTTGAGTCATGAAGGGAGCGAGAGAGAGAAAGGAGCACTTAAATTGCACATTCGCTGCTGTTTGTCCGCCGCGATGCAGCCCTACAATGTGCG:1 + chrX 1041109 3' + baggins 5374 1 81.00 ATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGACATGTGGGCATTGCCTATATTCAATACATTACTAGTTAGAACAAAGGGGTTGATGCAAGCAACTAGACTATTGACTTT:1 + chr2R 4638676 3' - 1731 4344 2 47.62 AGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATTATATATTAAAATTATTCGTTTATTATCTCTGCTTCCCTTGCCATGCACTTCGTTTCGAATTTAAAATTTCCCCC:2 - chr3L 8855840 3' - rover 40 2 57.53 ATTCGTGCTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATAGAATTCCAGAATGTTGGCTCTAGGGTGGCCGCCAATCGTACTTCG:1 - chr2R 5108714 3' - Doc3-element 4612 1 62.50 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTATATATGTGTGTGTAAGAGGTTCTGTCGTAATGAAAATAAAGTAGCAACTTTAACG:1 + chrX 10974425 3' + opus 7441 2 65.07 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGTGTATTATGTATGCGGCTGGCACATTT:1 + chr3R 27822331 3' - I-element 22 1 70.55 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTT:1 + chr2R 18482497 3' - hopper 65 1 65.75 CAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTAATAGCTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACCAGAAGATTCGATGCATAATAGTAAAGAAAAATAAAAAAGAAATACACACATAATACTATGCTGCCA:1 - chr2L 21013330 3' + F-element 4580 1 65.52 CAATAAATAACGCAATAAGTTTAAAAAAAAAATATGTATACATTCTCAATTTCAGCACACAAAAGATTGAAGTATCTTTTAATGCTGTTGCAAAGTATGCAATGCTTTTTTAAAGGAAAAGTATATATTCAATTTAACAATAATAT:1 - chr2R 8642839 3' + Doc2-element 4758 1 76.71 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGGTTTTAGAAAAAGCTTTCTCATTAAAACTAATGACAATAAAAAGATGTAATAGTTGTTCATATATCG:1 + chr3L 16212835 3' - Transpac 4970 2 54.79 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAGCTCACACCTGTTTGCACGTGTGTGTGTGTGAGGGGTGCTGTCTGTGTGAGTGAGTGCAAGTGCGCATAAAACGCGCCG:1 + chr3R 13628689 3' + hobo 2926 1 51.30 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGACTTTACACTTATCTAGCATAATCCTTATCTTCAGTGCAATAATGGCGCAAGGAAA:1 - chrX 10567780 3' + roo 8995 2 67.12 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCC:2 + chr2L 9472093 3' + roo 9016 2 54.79 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGAATTTAATTAGCAAGCGTGCAAGTTATCCAACCCATAAACATAGCACCCTTCCACCGTTTATAAACAAAT:1 - chr2R 4160305 3' - pogo 49 1 54.79 AATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAAAAATAATTTATGATTTTTGAGGAATCTACCCCAAAGTGCTTATAGTAATGGTTTGAGCTTATAGTCCTTATATTGAATAAA:1 - chr3L 10133454 3' - 412 3 2 74.66 ACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGCACCGAAACGTCCATTTCCAGGGCTGCAATTTCAGCTTAGCGGCGACTCCCACCCACTTCCAATGTGCTGTGGTG:1 - chr3R 31221168 3' + copia 4798 1 53.96 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATATCTCGCTGCAATGTGGAGTTACTCGGGTAATTCGCTCCCCAGTTAATTTTGTTTTCAT:1 + chr2R 17121687 3' - blood 62 2 59.59 TATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGGGTTC:1 + chr3R 17656457 3' - mdg3 5318 2 66.42 GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCC:1 - chr3R 28627614 3' + copia 174 2 72.60 ATCAGTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTGCAGAGTTATTAGTTTATCCTATTATCCGTAATCTTGACTCTCTGCCATTACATTCCACAAGTGTTGCTCTTCATTTACGGATGAAAAGCTATTTTTTGTTCCATTTATA:1 + chr2R 16683634 3' + Cr1a 4152 1 56.85 GTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTCTTACAAGTGCTCTATGAATCGCGATGAAATCCGGTATTTGTTATAATTTACAAG:1 - chr3L 24291947 3' - rover 20 2 68.25 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAACAAAAAAATCAATAGCCAAAATGTTGCATATCTTAACAGGCTATACCATATATTATGGCTGACTAGGTCAATC:1 + chr3R 22249217 3' + jockey 4948 1 53.42 CGTGAAACTATTTCTCCTAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAA:1 + chr3R 21706061 3' + 297 312 2 78.08 GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATAATATGTTGCATGTTGCGACAGTAAAAGTAAACGAAATATGGAAAATACAAGGCGCTTTATTGCC:1 - chr3R 13176335 3' + Burdock 213 2 54.74 TTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACGAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATACATTTCTCCTTTGTACAGGTATGTTTTTCACACTTATTTAATGCATTTCTGGACCGGATTTG:1 + chr2L 12175535 3' + mdg3 5383 2 55.86 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACAAAAAATGTTAAAAAAACAGTAAACTAATAAAAAATTGATTTTGTGGTTGGCTTATT:1 + chr2L 17177953 3' - blood 76 2 61.64 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAAAGCCCATTA:1 - chr3R 30634907 3' + roo 9031 1 59.59 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCCGGTTTCGTCGTCTTT:1 + chr2L 14248122 3' - I-element 46 1 52.74 ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCAAGAACCCGATCACGCTAATGACGATGATGCTA:1 - chr3R 9160625 3' - copia 15 2 76.03 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCACTTTTTTCCTCCTTTATTGTTGCTGTTGTTGGCCCGCTTTTGGTTTGTGGCCAGGCTTTT:1 + chr3R 8709892 3' + jockey 4984 1 73.48 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCACCATCCATTGGCCATAGCAA:1 - chr3L 22400257 3' - 1360 23 1 58.56 AGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATAAGAGTTACTACATGTAATGGAGAGTTCAGTTTCATCACATTATTCAGCTCAAAAC:1 + chr2R 6636227 3' - P-element 2809 1 44.83 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGATATTGGCCATATCATTCGGCCGGCTAAGCGCTAACGAGTTAGCAG:1 + chrX 4291951 3' - roo 8735 2 70.83 GTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCGCAACCGCAACATTTC:2 + chr3L 11400029 3' - Quasimodo 40 2 57.53 ACGACCTTTACATTAACGAAGGTTATTGAAGGTTATTAATGACAAATAGATGCATAAAAAAGACGAAGTTTTTGGCGACTTAGAGTTGGCTGACAAGGATTTAATTGGCTGTACGGCGTGAAGGGAATG:1 + chr3R 28161920 3' + gypsy7 443 1 66.67 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCCATTATCCTCCTCATGTCGCTGTGCGAAAATCTAAAACAGTGAAAAAGTCCGGGGTATGGCACT:1 + chr3L 16562954 3' - roo 56 2 57.53 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATA:2 + chr2L 76148 3' + roo 9019 2 59.59 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCAGTTTTTTCGCAGCCGCGCTTGGCTGCCGCGGCGCTGCC:1 + chrX 8891826 3' - P-element 48 1 37.17 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGC:1 + chr2L 246087 3' + roo 9004 2 65.07 GCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTTTGTGGCAGGAGATACAAAATACATTACGCATACGC:1 + chrX 4753136 3' - accord 185 3 72.86 TTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATAGGGCTCTTTAAAGTATTAGTTTTATTGCATATTATTATATTTTCTACAAACTTGCAAAAAGGTTGTTCACACAGG:1 - chr2R 15829482 3' - invader4 40 2 56.85 ATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGGCCAGCTTGAAGAACGTGGCTCAGTTTAAAGATGTGGTCTCTATTAAAACGTGCACTTTACCAAAGGAAAAACTGTCCAAGTCTG:1 - chr2R 19435439 3' - Stalker4 7169 4 58.90 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAGCCCTCGATTCTTCACGACTTCTAGACGTTTTCC:1 - chr2L 23310582 3' - 1360 15 1 74.47 CGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACAGAAGTAGAATGGTGATTGAGATAAAAGTAATTTTGT:1 + chr2L 3340013 3' - FB 86 1 75.34 AAAAAACGATAAAATAATTATTATTAATAATTACTACAATACTATCATGAATAATATTATTGATTTTATTCTATAAATTTGTAACTGCACATTAAGCATACATATTGCATCTTAAGGTCACTACAACTGCGTTGTCGAAATAAAAG:1 - chr3L 20931730 3' + gypsy11 3938 1 77.40 GGCATTCCCTCGTCGAAGGTCAGGAATCCGGATTGGATAACCTTTGGATAAACATCTGCTCCTAAGACCATGGAGACGGTAGCAGACCTTTGTATGACAAAATATAGAACTATAAAACTTATGAGAGGTTTTCCTAAAAAGTGAAA:1 + chr2R 17010627 3' - GATE 8116 1 58.22 AGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTATTGCAAGTTGTTATGACTGAAAAAAAAACGAACTATATATTTTAGAAGGGTATTTAAAAAGGGCACTCAAAGTTCTCTCTTCACACCCGGGTCCTTGCTGTTGTTGCTGCTGT:1 - chrX 17306223 3' - G2 3054 1 80.69 GAAAATTAACTTTAGAAACTTTTAACTTTTATAAAAAAAAAAATTGGGGCGGAGTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTTCTGGGGGCATGTGTCCAAACCTTTACGCTGTTCAGTCACACTTGGTTATAATAGGCCTAGCTT:1 + chr3L 17868628 3' - hopper2 11 1 63.70 ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTGTTATTATTATTATTATTTTTTCAGTTTATTT:1 - chr3R 556379 3' + Juan 4150 1 61.64 ATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAAAG:1 + chr2L 21738001 3' - INE-1 253 1 57.53 TAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATTAAAAATACAGGTTCTCAGTCCATCCTTTGTAAATATTTAAGCG:1 - chr2R 8649204 3' + invader4 2835 2 68.57 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTTATAATGATTGAATCGACAAGAGCATTCATGAATGAAACGGCAGTTTTGAATTGGCCGAGAC:1 - chr3L 23042023 3' - pogo 52 1 57.53 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACTTTTAAATGGTTGGAAACGCTTCGCTCTGCCTTTTAAATACTGTTTA:1 + chr3L 24241889 3' + roo 8999 2 71.23 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACAGAGGGAAAAATAAAAGATTGCTATTTTAGGAAACATGAAGAGATCGCAATCATTATTTACTTTAGTGTTAACTTACTCAACTGC:2 - chr3R 10472665 3' - mdg1 7074 2 60.96 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAAATTTCAAGAGGCCAGCACCCGGCACTCTAACGCCCATGTCCCCCTTGCC:1 - chr2R 21371444 3' - roo 57 2 65.19 ACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGCTTCCTTCGCTGGCTACTCTGGGGAGCACAGGTTATTAGTTACGTTGAGAGGAACAATCCTCTTTAAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGATAGAGTAAGTAAAAATAAAAATATGTTT:1 + chr3L 18438817 3' - Gypsy6A_LTR 365 1 50.68 TATCATTAGCGTCCAGGTCATGAGAGGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAGATTGGACTTATTTATGAACAATACTAAGATTAATGATTATGCACAAGAAACAATCAATATATCTCTAAT:1 - chr2R 18703895 3' + R2-element 3267 1 58.22 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGCTAAGACCAAAGACGCTCCTGCCACATGCGGTAATTGTGGAGAGGCGCACACTGCGTCTTAGCAAGGC:1 - chr3L 26645879 3' + 1360 3356 1 50.82 TTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGTGTTAAATTTAGTAGTAGTAATAGTAAAGTTGGTACTTG:1 - chr2R 12240106 3' + copia 181 2 73.91 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGAAAGCACTATCGTAGAGATGGGGCGCCAGTGCTTG:1 + chrX 14826178 3' - P-element 82 1 28.08 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCA:2 - chr3L 17890720 3' - 412 57 2 55.48 ATGCATTGCTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTATGCCCTGCAATGGATTCTCCTCGGCTCCG:1 + chr2R 19369994 3' - Doc 270 1 73.04 GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGC:1 - chr2R 21402617 3' + mdg3 5431 2 68.22 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACTATAAACTGAAATTAAAAAGTATCTTCTACATGGGGAGTTACGTCTTGGGTTGAGTCCGTGGCTTTGG:1 - chr2R 17121583 3' + blood 371 2 69.47 CGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCCTAAGATATTATGTTTTTGGCCTATGTATTCCTTCGCTACAAACAGACACATTTATGTTCTGCTTCCCGATTCGAGAATCAAATTAGCCAAAGA:1 + chr3R 15338160 3' + blood 349 2 64.38 GTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACTACAAAAATTGCACAACCTAACTTAGCTCGCTAA:1 + chr3L 25850490 3' + 297 310 2 79.45 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATCAAGTTGTAGAGCGAACCTCGCATTTGCGCCTCATGAACCGTTCACGCAACGTGTCGCGTTGTAAATAGAATTTGTGCATAATAAAATTATGCATTCATAAAGCAGTTG:1 - chrX 21196642 3' + roo 9061 1 78.08 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGCAG:1 - chr2L 13792601 3' - F-element 64 1 70.91 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATCTAGCGCAAATCCGAGCAAATAATTATTAAACAAATACTTCTATTTACAAAAACACATCAAATATTTAGTTAAGCCAAAATGACGCG:1 - chr3R 13122465 3' - blood 31 2 64.14 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGCGTATATGAGCTTGAAGAGGAATATAGGGAAACCTTCGACTTGTATGCAGGTCCGTTATTTCATTGCTCT:1 - chrX 21554359 3' + 297 6927 2 54.11 GTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGAGGCTTATCGAGCAGCATATCGCCAAATATTTCGCGACAATAGTTGGCAATTTTCGCCTGTTGAAGGTGCCAAGTGAGGAAATAAGTGATGTGACATAATGTAGTG:1 - chr2L 339158 3' - G2 2677 1 75.86 ACTGCACGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTTTCAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTTTTTACCTACCAGATATGATAACGACTTAAAGCAAGACAGGCTACAACAATCAATAAACAACAAATGCCC:1 + chr2R 12645272 3' + Doc3-element 407 1 60.14 TTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGTATCTGTATCTACTACAAGTAACATTGTAGCTCGAGTTGGC:1 - chr2R 22305999 3' - pogo 77 1 71.72 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAATTCGGGTGGGCGTCGAGTGTAAACGC:1 - chrX 2762533 3' + roo 392 2 73.43 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGT:1 - chrX 12191539 3' + pogo 2050 1 59.09 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGCCTTTAATCATCTGATTTTTTT:2 - chr2L 76031 3' - roo 8717 2 54.11 TACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGG:1 - chr3L 27415204 3' + transib2 2775 1 52.78 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATAT:1 + chr3R 16181259 3' + roo 9036 1 60.96 GCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCTT:1 + chr3L 23702290 3' - G4 28 1 62.33 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACAGCAAAATCTATAAATAGCCGAACAGTACAATTAATTG:1 + chr2R 21371532 3' + roo 340 2 67.12 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCA:1 - chrX 14964603 3' + roo 9021 2 57.24 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAATTGCTCAAGAACAACA:1 - chr3L 14062231 3' - Doc 76 1 61.64 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAGTCACCGCTTTTTAAAATAAAACCCAAACCGGAGCCCATCTGTATCTAAATTTCTATAGC:1 - chr3R 26191606 3' - hobo 55 1 57.04 GCTCACTTACCAGGGTAGCCCAGATGCATGTCGTGCCGCTCGCGATTGTATTACTCTAAGACCAGTTGATTTGATATCGCGTTTCAATCGGGTTCAGGGCTGCGGAAGAAGATGAGTTTTCCAAATATGGCTCATAGTAACCCCA:1 + chr2L 18675982 3' - G5A 2520 1 58.62 CAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTGTAATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGATAGGAATACTTTCGGTCCAAATGCCCGTATTGTTTGAGATTTAATTTCAATCTCGATTTATTCAGACAGAGGACTTGCATTTAATGTGTA:1 - chr3R 13821199 3' - hopper 1135 1 66.21 TCATACGTTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCTCTGAAAATGTCGTACGTGATTCAATTATAAAATGCGGTCTCTCAAATCGTTGCAAAATTTATGTATTTCATTTTAT:1 + chr3R 28272341 3' + Tirant 361 2 59.59 TATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATACATGTACATCTCTCTGTTAAATGCTTTTAAATCACTGAAATGAGTTTTGAAATAATAATAAGTACA:1 + chrX 22901592 3' - Quasimodo 34 2 47.59 TTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGATTTATATGACAACAGCTGGGCGAAAGAATGTCATTCGCTTTAAATGCC:1 + chr3R 12562444 3' - G2 3060 1 66.44 TTCTGGGATATCGATAGATATTGGGAAATAAAATGGAAAAAGATTCAAAAATTGTTTAAAAGTGTTTGCGTGACAATTTGGGCGTATTGTAGGTGAAAGTTATCTTAGTGTGTAATTAAAACAAACATAATTATTTCGGTATAATA:1 + chrX 4663889 3' - INE-1 497 1 66.44 GTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTTTTATCTCTGTGAGTAATTACGAAATGCGAGACTATTCCTAT:1 + chr3R 20988903 3' - I-element 22 1 71.23 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATATGCCAGCTAATCTCAGAGGTTAATACGAAGCAGCCAAATGACCACAAGATTAA:1 + chr3R 19859696 3' - opus 64 4 63.01 ATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGAC:1 + chr3L 13827365 3' + hopper 1359 1 55.48 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGCAGACGAACAAAAACTCA:1 - chr3R 10684702 3' + roo 9048 2 66.91 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTATGTTCCTTATTAAACACATTTCAACGGGTATATAAGTTTTGTTAAGGGGTAACTGTAAGCCGGACC:1 + chr2L 8542057 3' - pogo 49 1 55.48 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGCCATAAACAGAGAAACA:1 - chr3L 27350438 3' + pogo 2074 1 65.75 CTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATCGCTAATTCGGAGTGAGAACCTGACGAAATGGAG:1 - chr2R 7665767 3' - Transpac 75 2 75.18 TAAGTTCAGTTTGATTTTGTACTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTCAATCAACTCCAGCTACTGCTGTTATCATTGAATTGGTTGGCTAGCCTTAATCAATTTATGCAACCATCCGACAGCAATTCGCCTTTAATGTCAGGC:1 + chr2R 15298966 3' + gypsy6 7574 2 66.43 GTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAAT:1 + chrX 23280894 3' + R1A1-element 5293 1 44.83 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCATTTTCTGCAGCTGTGTTTTGCGGGAAAATAAAGGAGAAGAAAATTGCCGAAACTAAAACCAGAACGC:1 + chr2L 11951680 3' + pogo 2099 1 76.71 GGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACAGAACAGATGTCATTGTGGTTTTGGTCTGATAGCGTCT:1 + chr3R 24509130 3' - FB 85 1 75.34 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTCATGTTTACCGAGGTCAGAATGCGAAAAGATATTAGTTCTTAAATTTTAACATCTCTTTCTCTTTTTTATACATGTATG:1 - chr3L 14076179 3' - roo 40 2 59.31 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGTACCGCAAGTTATGCAGTTAAAAAAAAAAACGGAGAATTTTTCACGCACACTTTGGTGGGGGCATCATGCATTTTTTCTATGCTG:1 + chrX 5145542 3' - hopper 34 1 57.93 TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAAAGCGATACATTCGTTGTTCGTGAGTCAGTGGAAGAACTCCA:1 + chr3R 4197302 3' - P-element 71 1 34.06 GATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGGTCATTTAATTATTTCTTTTATAATAAGAAATTAAAACGAATTGTTTTTTTTACAAGTCGAGCAGTGAAGTAAGTAAAACCTTTTGTAAACTATAATTCTTCAT:1 - chr2R 1515855 3' - Juan 20 1 73.97 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAATTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGAATTCAATAGTGAAAATATTCAATAGACTTACAAATCAAATCAAATATTTTCTGCCTCAT:1 + chr3L 13374219 3' + pogo 2041 1 60.96 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACGGAATGCACTCTCTCACTTATCCGCTCTCACTCTCAGCAGACTGCAACTGTAAATTGTA:1 + chrX 14951202 3' + P-element 2825 1 39.73 CGATTATCAGATACCCGTTACCCAGATATAGGTAGTGCGCGGAAGGTGGAGGCAAGTATTAATGTAAAATGGTAACTGGTCATCTGAGGCGTCATTTGGGTCTGGCTCGGGGTTTGTCGATTGCATTAGTAGTCT:1 - chr2R 5734463 3' - INE-1 550 1 64.44 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTCCATTCCCCCATCCTC:1 + chrX 7515741 3' + roo 347 2 59.59 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTT:3 + chr3L 19350012 3' - jockey 63 1 50.00 GTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTTAAGATTTTCTGGTATATCGATAGATATTTGGGAACAAAATGAGAAAACATTGCAAATTGTTTTTTTTTAATGTGGGCGTGTCAACATGGGTC:1 - chrX 14770554 3' - INE-1 534 1 65.62 CATAAATTGGATGTTACACAACACAAAAACAGTACAACTACACATATATTAACTAAATACGTTAAAAACACAATTGATATAATATAGCAAGCATAGTGTGAAAAAATCCTGTTTTCGTTTTTTGAGATCACAGAAAATTTAATCT:1 + chr2L 17883764 3' - transib2 344 1 51.03 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACT:1 + chr2L 17250811 3' + opus 446 2 62.79 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAAAA:1 + chr3R 20293116 3' + P-element 2853 1 30.59 AGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATG:1 - chr3L 23456270 3' + Gypsy6A_LTR 256 1 68.49 TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCCATTTAAGACACCCAATTCCCGCTGCCAATTCCCAACTGCAATT:1 + chr2L 17250875 3' + opus 493 2 73.29 TAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATCAAAATGAACTAATCTGTCTTAAGGACAAAATAATTGATAGCTGGGCCGGAGTAAATAT:1 - chr3R 2914313 3' + Circe 7024 1 68.66 CTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCAAGCCAAAGAGCTACCAAAAAAAAAACCAAGGCATATACAATAAAAAAAAA:1 - chr3R 14765787 3' - 1360 103 1 64.22 GCGTTATCTACGTGTCGATCGTGTATTATTTCACTTCACAACCTTGGGAGCTATTCCGCTTTTCCATGTTCAGTTCTTCCAGCGTGGTAATAGGTGATTTAAAATGGCAGTAAGTCTGGAAGCACCTAAGTTTCTCCCGTCCGTAA:1 + chr2L 123297 3' + McClintock 6102 2 54.11 CGTGAAACTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACAAAAAAAAACCTAAAAAATTGAAAGCAAAAATGTGAAAAAAGGCGAACAAGTGAAGCTGCTGCCTCGGGTTAAATTTGGCAGGCG:1 - chr2L 7559656 3' + mdg3 223 2 64.93 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGAAGAAATTGAGACTAGCGTTGTCGATTCCCCATTGAA:1 + chrX 1061603 3' + 412 7480 2 70.77 AATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGTGCAGTT:1 + chrX 22574708 3' - 17.6 102 2 45.89 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATGTAATCGACAAATCGAATATCCAAAAATACCGA:1 - chr2L 436484 3' + copia 5037 2 77.40 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTTATGTATAGATTTA:1 - chr2L 13250352 3' + opus 7438 2 69.18 GTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATT:1 - chr3L 27415221 3' + transib2 2756 1 65.07 AATTAATTATTTTATTAATTGATTTACATATGGTTTGATCTCAAATTTCTTAACATTTTTATTTTTTCTCAATCTACTTCAACTTTTTTTTTTTCCTTTTTATTCTCTCTCAGCCGTCATTTTTTGCTGATACTCCTTTG:1 + chr2L 10673325 3' - TAHRE 57 1 45.71 CGATTCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAATCTTGTACCCATTTGTTCTATTCTTTAAGAAATGTGATGAAATTCAT:1 - chr2R 11636669 3' + Doc3-element 4629 1 67.81 CGGATGTTCGGTTATTAAACCACAGCGTGCATTTCGGAATCGCTTTAATTTAGCCCCGTTGGCTCCCGTCCTAGACCGAAAATCAATTGTTACATTGTGTAAGCATTTTTTGTTATTTAGTGAGCACAA:1 + chr2L 7677469 3' + mariner2 187 1 75.97 GGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATTTATTGGGTTGAATACTTTTTTCCTTTTTGTTCATTGCCTCT:1 + chr3R 845819 3' - FB 65 1 70.23 AGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTCGACTCGAGAAATATAGCAATTTCTCTTGTCGATTTTGTAATAAAGGCAGAAATCCTATGTGAGCCAGAACGCTATCATGTTAAATACTCTTCAGTTAAATACTTTTA:1 + chrX 22784154 3' + INE-1 545 1 69.01 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAAAGCCCATTAAAGTGACTTA:1 - chr3R 30634897 3' + roo 9054 2 72.93 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACCACACGCCAGCCAGCGCGAATGCAACAGCGAATTCGAATTCAACAACGCCGACGCCAGCACCAGCGCCGCATCCTCATCACTTTATAAACCTCCTGTGGCCTTGGCAGCAC:1 - chr3L 20236228 3' + 412 484 2 77.40 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCGTTTTT:1 + chr3R 3320519 3' - 1360 72 1 70.00 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTTACAGTTCGATACTCGTATTGTTGCTTCAGAACGCAAATGGCACCTTTCTCGTT:1 - chr3R 27768808 3' - 297 6640 2 60.84 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATTTGTTGTT:1 - chr3L 11336316 3' - blood 27 2 60.45 GGGGTAGCCGATTAAGGCAACTCCCTGGACGCACGACGACAACCTTTTATTCGCAGTCCTAGGGCGACGGCAGGGGCAACTTGCGCTGGAATGACTCTTAAAACGTATCCAAACTATAAATTGGGTAGTTATTTGGGC:1 - chr3R 25817324 3' + aurora-element 72 1 67.39 CAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTGGCGCAGCCGGACTAGAACTAAAAGGATTAACATATGTATCTATATGGAGGTCGAGCCAAACAGGCAG:1 + chr2L 12972197 3' + accord 499 2 72.66 TTTTGCCGTGGCTGGCTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTCCAAACAAAGCAACTTTTATTTTTT:1 - chrX 3382101 3' + hopper 414 1 79.17 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAGTAGGCCGCATCATTAAATATGTATGTTAAGCTGATT:1 - chr3L 22978508 3' + 1360 3353 1 60.27 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTA:1 - chr3R 11750196 3' + Tabor 7239 2 74.66 CAAAACAAAGTTAAAAAAAAAAATAAATTAAAAAGAAAA:1 + chr3R 26034020 3' + gypsy2 423 1 84.62 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTGTTGATGG:1 - chr3L 22052737 3' + mdg1 398 2 63.93 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTTCAT:1 - chr3R 7035235 3' + roo 353 2 55.48 TACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGGAATGTGACCAATGTTTATTAATACGCTTATTGTTATTTAAAAAGTTGTA:1 - chr3R 9190439 3' - Tabor 6851 2 45.07 CGAACAGCAGTGCTTTGCGGATCATTTTGTTTCAGCAACCGACAATGCCAGTTACACCCTAAAAAGTGCCAGCCAAGAAAGAAAGGAAGATGACTCGGAG:1 + chr2L 16659954 3' - Tc1 473 1 53.00 CGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGTTTCAGTGTAGCTGGATCTCAACGGAAAGTGACACAGAACTATGCGTATGGCGCATACTTCCGCC:1 - chr3L 12331996 3' - I-element 141 1 56.85 CATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAGCCACATGAAGCTATATAGTTGGCTTAC:1 - chr2L 6870689 3' + hopper 1328 2 73.97 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACACGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATACTGTCATTTAAATTCCAAGCAAATGCAGAGGATAACTCAACAAAGAATGGCTTAGATCG:1 - chr3R 7739439 3' - I-element 62 1 63.01 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGT:1 - chr2R 641862 3' + opus 433 2 64.14 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCTGTTAAATGCTCTAATGATGGGTATTAGGCCAGACTAAGTGCCACTCATAAGTGCCGCACACGCACCT:1 - chr3L 16562799 3' + roo 409 1 81.34 CACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATTTAGATAACACAAAAGGGACAGTACGAATTTCTGTATGTGCCCTTTGGTATTACAAACTCACCTGCAGTTTTTACTCGTTTCATAATGGCAGTC:1 - chr2R 3052906 3' + I-element 5099 1 69.53 TGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACAAAGCGAAACAAAACAAAACAACAACATCGAAAATAAAGCCCCAACTCGAAGTCGAGCCACGCCCACCCAAGTGGGTCAATGTG:1 + chr2R 22544944 3' + Quasimodo 10 2 60.43 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAATCTCC:1 - chr2L 19068049 3' + pogo 2039 1 63.01 AAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATG:1 - chr2R 22723029 3' - 3S18 5833 2 60.96 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCCATTTAAGA:1 + chr2L 17250840 3' + opus 458 2 49.32 GGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTACTACCACCCCCCAAAATCAAGCCC:1 - chr2L 10618540 3' - F-element 4460 1 77.14 AGTGTGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAAACCGTCTTGTCACCTTAAAACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTTTGAGA:1 - chr3R 28349569 3' - Transib-N1_DM 226 1 47.95 AATGTTTAAATATCTTTTAAACGACAAAGGTTGAAGGCTTAACAAGATTTATTTTACCGAGAAACA:1 - chr3R 24571095 3' - Transib-N1_DM 287 1 50.00 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAAATAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGACCCCATTTCCAGTTTTGTATTTTTTTTATTATTATTTCGCCGATCGGCTTAGAGATG:1 - chr2L 13927663 3' + roo 396 1 75.34 AATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAAGTTAAAACTCGCCGACGAAATAAAAATACAATGGCAGTGGGTCTCGGAATGGGAATGATTGGAGTGGCTGTGGAGCAATGCTGGAAATACTTG:1 + chr3L 19353429 3' + jockey 4869 1 71.23 GGGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAAGTGACTTTAGTAACTGGTTTTAAATGATCCTTTATATACATTCTCGTTGCCCCAAATAAAACAGCTGACTATAATTTCTTCTTAAAATTCCGCATAATTCCGTATAATAGTA:1 - chr4 353375 3' + BS3 1742 1 76.71 AACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTTTGGCCCAGACAAACTTTGGCCATTTCCTGCAGAAATAC:1 - chr2R 21402559 3' + mdg3 221 2 64.38 ACAATAACTTAAAAAAGTTAAATCCGGATTTTAAGCTAGCAAGTAGTTATGGTGATCGAATTGGTGCAAAGTATGCTATGTTATTTGTATTCGACAGCATTAAGCCGGATTAGGAATTCCTTTGGCTAGTTTTGGTTTAATCTTCA:1 + chr3L 18078770 3' + HB 315 1 71.23 ATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGAAAGGTATACCGGATAAAATTGCCCTAAGAACTGGTATTTAAAATCCGATCATGAAACTTTTGGTCATGTCAAAGCTGATTTTT:1 - chrX 14514515 3' - F-element 154 1 49.32 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATTTAATATTAATGCCAG:1 + chr2L 14201500 3' - roo 31 2 58.62 ATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCATTCTCTTGTTTTATAATTTAATAGGTATATCGTTAAGATGACCGAATAGTAAAAAATTCTCCAAGCAATTTTGTAAAATTCTAACCAAATAA:1 - chr2R 13155897 3' + INE-1 536 1 52.05 ACCGAAGAAATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAAATGGGTGCCAATGTAAG:1 - chr3L 14553100 3' + roo 353 2 56.34 AAAAAGAAACAAAAACACAAAAAAAAAAACATACATCAATAAAAATATCCAATCAATGTGTAAAATTTAAATGATTCTTTTTCTTGCGGCTCATACATTAGATCTTTAAAAAGATGTCAAGATGATGAATTAATCGAGTGGATTGC:1 - chrX 21061802 3' - pogo 302 2 72.60 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAACACTTATTTTTTACACCTAATTTATCAATTTATATTTCTTTCATGATGGTCGTTAGTAAATTACATAGCTATTG:1 + chr2L 18193135 3' + mdg1 377 2 50.00 ATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATGTTTTCGAATATAGTACAGCTTAAATGTCAAAAATGAACTTTTAAAACTACAGGCGCAAAGTAATACATTTTTAGATGTAAGCATTTAAATAACAAAATCTGTGCTAGT:1 - chr3L 12976200 3' + invader4 3079 2 45.89 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAAT:1 - chr3L 14062246 3' - Doc 91 1 71.92 GAATAAATTCGGTTTTGGTTTTTATTAAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTTCAAATGCTCCTCATCGCCTTATCTGTGCTCTCTGCCCATATTCGCTCTACTGATTGGCAAA:1 - chr2R 20438343 3' - McClintock 6286 2 62.33 GTAAAATAACTATATTAAATATTTGTTGTTAGCATGAAGGTGATCGTTGTTTTGAATGACAATTGATCTGTTGTGTAACTGTGGGAATGTTGAGTACATTTGCGATGTCCACATTTCTCG:1 + chr3L 23854188 3' - Cr1a 4310 1 75.00 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGACTCTTCGCTGATTTTAGTG:1 - chr3L 7093015 3' + hopper2 1560 1 73.20 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAACTACCATTAGCTGGGTAGATTTTTAAATTTTTAATGTTCTTTGGATTTTCTTTGCTTTGTACATTTGGTAAGATTTGCTCAAAGAATTTTACATACATCTA:1 - chr2L 19525365 3' - FB 19 1 71.23 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCG:1 - chr3L 17890741 3' - 412 78 2 69.86 TAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGC:1 - chr3R 19589930 3' - BS 5073 1 69.18 AGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTGAGTTTTCTTAAAATATTAGTTCCCTCCTTTTTTCGCCCG:1 + chr3R 15711849 3' - diver 83 2 72.60 AACCAGAAGCTTCTTTCTCTTATTGTGAGACTCTCTGTAACTTGTAAGTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAATATTGTACTCTACCTACCCCCCCGAGGAAATCCGCC:1 - chr3L 5799351 3' + Dm88 87 2 77.14 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCGATGGGGACGCTCCATCTACGCATATCTTACGCACATATTTGTG:1 - chr2R 11133510 3' + roo 9055 2 72.39 CAATGTATGGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCACGGCCAGCTTTACAGCCAGACAAACAGCAACAAATGTCTGGCACACCCACAACTCATTCCACTCGAATCATGAAAACGGACATACAGTGCCAATATCA:1 + chr2R 19726976 3' + 1360 3368 1 71.53 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTG:1 - chr2L 17210295 3' + jockey 4917 1 79.69 GCAATAAAAAAGAAAAAAAAAACGTGCCGCATACTTTTCTGCGCAAGCAGCGTCGAATATCCTTGTTCCAAAGCTGACCGCGTCATGTAATGGTGTGTGTGTCCTTTAAGCCATTCGCCTTTTGGCATTTAATTAACTTTCTCGGT:1 - chrX 2561399 3' + gypsy7 5005 3 51.37 AAATTTTAGGCGTACAGAAAATTACTTGCGGCCGATCGTTGCCTGTGCGTCCACTAAAACGATTGTTCAATTAAACATAGCAAAACGATTTATCCATATATGTTCGTATATATCTATAGAGAGACATGTATG:1 + chr3R 17867888 3' + hobo 2687 1 63.64 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAAATGCCTAGGAAAAGTTTATTAA:1 - chr3L 17707788 3' - Doc 42 1 56.85 GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTT:1 + chr3R 13349119 3' - BS 5066 1 65.52 GAGTAACGGGTATCTGATAGTTGAGGTATTCGTCAGCTGCTCGCATTCTAATCCAAGACGGCGACGGCT:1 + chr2L 20375096 3' + INE-1 549 1 59.42 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCATGGCTCGATTCTGCAACGACCATGCCCCCTTTGCTGGCC:1 + chrX 8755109 3' - transib2 38 1 65.35 TTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTGTGTATTGGGGGTGCGTGTTTAATTTCCACTTGTCG:1 + chr3R 20175812 3' + hopper 1377 1 57.55 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGACCGAAAT:1 - chrX 12191521 3' + pogo 2054 1 54.11 GCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATTCCCATCGATTATCTGTTAAAGCTCTGCCAGCG:1 - chrX 6481296 3' + hobo 2866 1 75.97 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGCTACGCATATGCACTTTGTTGTGTATTGCATATGACGCCCTGTCAGAGGCGCCTGAAAGTATGCAAACAGTCTCGTTTCGTCTCCT:1 - chr3R 19531199 3' - hobo 23 1 67.16 TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGGCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACA:1 - chr2L 23310616 3' - 1360 54 1 54.79 CAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCGAACAACCAGCGAATCGCCGCGAA:1 - chr2R 11763575 3' - Tabor 6893 2 52.74 TTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAATTTCACAGATTAATGCGCACACAT:1 - chr2R 17890837 3' + Tabor 457 2 63.70 CTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCCAAAATATTTGAATTATCAGT:1 - chr3R 11750150 3' + Tabor 446 2 58.22 TCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAATAAAAAAAAAGAAAAAATTTTCTTTTAACTAAAAGCCGCGAAAGCTTTTCCGCCATTTAGTTGCCGGCCAAAATATAATTGATATCGGCTC:1 + chr3R 20467705 3' + X-element 4702 1 58.27 AGGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGCTAGCCATGGA:1 - chr2R 11489199 3' + mdg1 7374 2 76.03 TATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGTAGTTGTTAATTAGCTTATGATTACTGTTGAGTAAAATGGAAAC:1 - chr3R 13349022 3' + BS 5055 1 56.16 TCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATGTATGCATCCTTCCTACATTGATCGGATTACGAACTGGAAACGGGGCAAATGCTC:1 + chr3R 29733128 3' - opus 174 4 65.07 CTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACACATGCCCAATATCACTGAAGTAGCAATAATAGTACAAAGACATTCCCGCCAGGCACAAACTCAATGGGAATGCAAATG:1 - chr2R 19351937 3' + Burdock 6352 2 57.53 AAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGGT:1 - chr2R 982341 3' + rooA 7480 2 45.89 GAATATTGAGGTCTTTATGAAGTGTGGAGTTACGTTCATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAA:1 - chr3L 23797687 3' - Helena 1192 1 54.11 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTCAGGTGTAATGGTGTGCGAGGATATATCTATATATATATGTATATATACATACACACACATACACATACAAAAATATAGAAAGGACTGATTTAAAATGCAAATGCTTTAATT:1 - chrX 5145353 3' + hopper 1409 2 79.45 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAGAAGGACATGTATAAAGTCATAAGGAACTTTTCCAACCCGACATATTTAAAGGCACATCG:1 + chr2L 10746711 3' + pogo 2043 1 60.96 AAACCGAAGAGAGCTTTAGGACCCTTGCAAAATACTTAAACTAAAACAATAAAAACTACTACACCTATCAACTGAAAAGTAGCAAGGGCCCTTATGTCGTTCTAATGATCGAAGACAGTTGCTTTTCCTTGATGATTAGCCAGGAG:1 - chr2L 11742822 3' + Fw3 114 1 71.92 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGCATG:1 - chr3R 12599030 3' - 412 68 2 63.45 CGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGG:1 + chr2R 8157277 3' + Transpac 5177 2 53.42 TAGGTAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTACAACGAGCACCGGCAACCATTTTAAATTACAGTAAAAGTTCCCTAAGGCGAAAATTTGTGTCATAAATATACCTTAAGCACTTTTTAGTTATGACGGATCCCTTTGCTCAAAGGTGTCAT:1 - chr2R 11928801 3' + TART-A 13127 2 53.42 GTATTGGCGATCTTCGTTTAATTTTTTGCTCTGCTCTCGGTTTTTCTGGCTGCTGTTAAATTATGCATTAAGAACCCCAAGCCCGCACAAAGGCGAAAGTGAATGCAAAGAAATGGAAATGGTTTAAAAAT:1 + chr3R 19413417 3' + accord2 146 2 68.70 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGCACGAATTTCGGGGTGAAGGCACTCCGAAAGAATATCAGTCAAA:1 - chr2L 9237458 3' - blood 8 2 75.97 AGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGA:1 - chr3L 2725014 3' - Ivk 98 1 76.30 AATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTTTGTTTGCAGTTTTTGTGTGGGAACGAAAAAACAGAAATAAATGGGAA:1 - chr2L 9134898 3' - I-element 221 1 71.92 ACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAATTGCTCA:1 - chr3L 14062240 3' - Doc 85 1 67.81 GAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATATACATTTGCAGTATAGTATCGCAGTAATCTGTGATGGAAATCCT:1 + chr3R 29418814 3' + mdg3 5490 2 75.37 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTTTCCGCAGATACAA:1 + chrX 1103739 3' + pogo 2081 1 67.97 ATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGACTGGGACTTGTTTGGGCTATAAGGAAAGCTAAAAGTTAAGCCATCGGTTTATTTTGCTCCAATTCTGCTGGCATTTCAAAA:1 - chr3L 11526038 3' - F-element 338 1 58.90 CTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTACCGCTC:1 + chr3R 9190587 3' + Tabor 413 2 65.75 TATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACACATTGTAAATAAGAAGAGAGAGAAAAAAATATATATATATAAAGTATACA:1 + chr3R 6171175 3' + G4 3730 1 72.60 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAA:1 - chr3L 14553117 3' + roo 8996 2 70.55 CCTTTGCCCATCCTTTAACATTATTCAAGATATTTTAGTTTGCATCTATTATTAACAATATTATTACAATTTACTATTTAAATTATTAAATAACACGCGTGTAGATATTTTGATAAGTATTACAAATATCAGTAATCCAAGTTATC:1 - chr2R 14524294 3' + FB 652 3 44.52 GATACTTTTGTTTTTCGGGATTTCGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGACGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGTCGCATCATCAGCCAATCGCTCGTCCATTC:1 - chr3L 18720536 3' - Idefix 274 2 76.30 TATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACATCAC:1 - chr3R 907900 3' - gypsy11 4339 2 31.51 AATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACAGCGTAACATTAACACACAT:1 + chr2R 17392102 3' - BS 5058 1 60.27 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTGCTTATTTGGGACTTTACACTCTGGCTTCAGGTTTCAATGAATCCGCCGTTCCCCAGAGATAACCTTCCC:1 - chr3R 23765368 3' + roo 336 2 63.19 GTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCCACGTAGACTACATCGATGCCCTCGTTCATGATTATCG:1 - chr2L 1368762 3' - G2 2855 1 61.22 GCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTTTATATTATCATAGCTTATTATGCATAGCTTAAAATCGACGAAACTGGATAAGAAATAAATATTT:1 - chr3R 12929183 3' - invader4 52 2 52.74 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCTTCTTTATAAGTACCACTGTGCTGACAGATTCTGGAGACAAAGACAACGAAACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGCCACTCCCACA:1 + chrX 14770554 3' - copia 4899 2 64.83 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTATCCTGCTGTTTGTGCATACTAATAGTAGAGTTAAATAAATATCCACACTCTCGTTAATTGGAAA:1 + chr2R 22306094 3' + pogo 2048 1 56.85 TTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAGATAGCCAAATCTATGTACATATAGGAGTCCACACATAATGCCACCGACTTATCGGACAGGACAGACAA:2 + chrX 19455528 3' + 1360 266 1 68.49 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTCACATACGTTATAGCTAAGATTTTTTTTAATGTGCCTGGGAAAAGTGTGCAGTAACCCCGCTGTTTATTTGCAGAAAATTCTGCGTATTCCTTTTCC:1 + chrX 16787222 3' - pogo 21 1 68.49 AATGGTGTCTAAATAGCTATGCCCACTAGTGTACATGTATGTACATCCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTACATCCAATAGCCGCGAATATAGAAATCTCTGCGATAATAATTAACTTCGG:1 + chr2R 6164637 3' - Tc1-2 10 1 34.33 CACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTTATGTTCAAAAAAAAAATGCATCCAATTGTTAATATCTTAGACAAAGTTTTCAAGATAATATCATTACTCAAATTCT:1 + chr2L 17029708 3' + blood 7353 2 52.52 CAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAACGACTGGAAGGGC:1 + chr2R 5868371 3' - pogo 70 1 68.97 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATTAATGACTGTTTATGTTTGGTTATACACAAAAGATGAAAGCCTTAATTGTTTATGGCTGTTTATGTTAGTACT:1 - chrX 3263306 3' - roo 37 2 57.35 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTTTTCACAACGTTGAGGGTATAGAATCATTAATCGAGTTGGCAGCACCGTGTAGTTTCACGTAGGGACGAAGCGC:1 - chr2L 6318877 3' + pogo 2057 1 54.11 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTATGTTCCTTATTAAACACATTTCAACGGGTATATAAGTTTTGTTAAG:1 + chr2L 8542037 3' - pogo 57 1 66.42 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGCGTA:1 + chr3R 27822308 3' - I-element 19 1 65.00 CGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1 - chr3L 23112570 3' - R1A1-element 32 1 68.91 ATAAGAGTTTTGGGCTTACACGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATACTGTCATTTAAATTCCAAGCAAATGCAGAGGATAACTCAACAAAGAATGGCTTAGATCGAAA:1 - chr3R 7739436 3' - I-element 59 1 60.96 GAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGATTTATATGACAACAGCTGGGCGAAAGAATGTCATTCGCTTTAAATGCCTTTTAGCATACAGCCGCCATATCAGAATCTATATCTTGATATGTATATTCCGCTCTGGTCGGCAT:1 + chr3R 12562509 3' - G2 2995 1 78.77 GGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGCCTCCAAATGGATTCCGTGGAAGCCGTTTTGCCTCTTTTAGCCAAATGATGCGTAGGCCAT:1 + chr2L 3659170 3' + 412 7514 2 55.46 GTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACCTTACCAAATGGGATTTAAAACTTTAAAGGATCATGTAAAGTAAGTATATGGAAATGTCAAACTTAAAAGTTCGTAAAGA:1 - chr2L 12349735 3' - F-element 80 1 54.86 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGCA:1 - chr2L 17136156 3' - hobo 75 1 67.12 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCACGCCGACAAACGCTTCGTGCAACTTCGTGCAGCTTCGTGCCACTCGGCTCGCAGTGGTTCGCTACGAACCGCC:1 - chrX 14826085 3' + P-element 2860 1 59.38 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATAAATATACAATACATATGTGCTGGACCATTCTGTGTAACAAATCGCTTTGATGAAAGCTGTCACT:1 + chr2R 12787917 3' - 297 56 2 62.33 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAGTAGGCCGCATCATTAAATAT:1 - chr3L 22978524 3' + 1360 3356 1 56.69 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCTCTATTATATGTGTAACATAGAAATATTGCGATTT:1 + chr3R 11749712 3' + Tabor 7239 2 76.39 GATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTG:2 - chr2R 22723041 3' - 3S18 5845 2 69.18 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGTATCTGTATCTACTACAAGTAACATTGTAGCTCGAGTTGGCTAATTATGGCTACGTGGCGCGACTTCCAGCGGAGC:1 - chr2R 22305964 3' - pogo 12 1 71.30 CTACCACCAATAAGTTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACATGCGGAGTGGAAAATTCGCAATAATTAGTTTTAGCTTTTTTCCGAAATTCATAAAAAAAATATTTGCCCGCAAAGTGCAAAC:1 - chr2L 7963985 3' - R1A1-element 222 1 56.16 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATAATGACCGGCATTGTGGGGGCTTGGAATTGAAGAGAAGTGATTGCAAGTAGTTTTCTGCGAAGTAGTCTATAGTGAAGGTTTATCGTCTAATAACT:1 + chr2L 436593 3' - copia 4895 2 67.12 CGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATGGTATATAAATAAATCCTTCGAGCATTCCCATTATGTAATGGTAACATGGTAAATAAATGGATTTTAGATTTAATTTCTCATATATATTTTATAGCTTTGCCAAGCTG:1 + chrX 10161249 3' + micropia 449 2 78.32 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAATTCTTTAGTTGTCAACTAGTAATCAACACATTTAAATGCACTAATTGCACAAAAATTATTTACTG:2 + chr3R 5453725 3' - 412 56 2 61.64 GAAGTGGCTGGGTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATTACTCTGTTATTTACTGTACTGTCAGTCATGTCAATGCACCCAAAGCAAAA:1 - chr3R 4581861 3' - 297 6595 2 57.78 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTG:1 + chr3R 27822285 3' - I-element 68 1 64.38 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGGTTTTAGAAAAAGCTTTCTCATTAAAACTAATGACAATAAAAAGATGTAATAGTTGTTCATATATCGTAAAGGACATAATA:1 + chr3L 16212849 3' - Transpac 4956 2 58.90 ATTTAATTTGCTTTATTTGATTTTATTTGCTTCAGATATATCAAAAATGCATTATACTACATTCTAATGGCTTTTGCATTTTAATTAACATACTTAAATCAAAATGCTAATATGTTGATCTATCCATATATGTGTTAAAATTAAGT:1 - chr3L 18321785 3' - TAHRE 35 1 67.12 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCCAAAGGACGCAGGACACAGGACGGGCGGGGGCGAGCCCAGG:1 + chr2L 2054117 3' - hobo 28 1 56.99 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGCGATGCAGCAGGCCTTAACAACTTATTCCTTTGCCGGTTTCTAGCACTAGCCTGATTGTATA:1 - chr2L 15834413 3' + hopper 1390 1 68.49 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATGTCACTTTTTTCGCATTTCTTTGTTTCTATATGTATGTATGTCTATATGTAACCGTACATATAAAGGTTTTAATGGCTA:1 + chr3R 13122615 3' + blood 7348 2 56.85 AAATCTTAAATATAATTTACCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACAAAGCAGGGAACCGAAAAGGAAAGGACTGGACTGAACTGG:1 + chrX 17806024 3' - roo 8744 2 70.55 ACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCTTTGGGCCTTTTGAACGATTTCATAAGAACTAAACATTTTTCACGTGGCTCGACGGGGCGTATACGCGATAAGTCAATCTGACGCTATCTCTGCTCGCTT:1 - chr2R 21075124 3' - P-element 187 1 69.86 CGTGTTCATGTGTGAACAATATTCAATCAAAACATTAAGGATAGTTTTTATTTAGCTGCTGTTCTGCGTGTTGTAATTTTACTATCCACATAATTAACAGCAGTGTTTTGGCAACTTGGCCATACACCCAAATAAATA:1 + chr2L 16399468 3' - roo 8661 1 80.43 ATACAGTGACAGATTACTGAGCCACAGCCATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTGTCCACCCTGTGATGTTAAGAT:1 - chrX 22726172 3' + Helena 1251 1 48.63 AACGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGTCATTTGGTTTTTTATGTGTATTTAAAAATTGCACAACTGTTTCGAAGCTGTTACTGAACTCCTTATC:1 + chr3L 3934680 3' + Stalker 176 4 53.12 AGTCAAACTTAATTAATAGTGAAGAATAAGTAAGTAAATAAAATTCAAAGTTGCAAAACTTTTGATGTCGGGGAGATAGAGACGCCAGTAGAGTTCTTCTATTTAATATTTACTCCGGTTTTTGTGCATTTCACAAATCGGTGGCA:1 - chr2R 21464046 3' + looper1 323 1 69.18 CCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGATCCCTCACCAGAATCAGATCCCGAGATCAGTCAACTAACCGCCTACATAAACAACTCCATACCTGA:1 + chr3L 6934157 3' - F-element 4254 1 52.86 TTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATACGCCGAGTGGTTTAGATAGCAGTTTTTGCAAGTGCGTTGTATTTACTAAGAACTTGAA:1 - chr2R 19553179 3' - mdg1 62 2 58.90 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCGGGTGGCACTGCCGACATCTATTTGTGCG:1 - chrX 1287771 3' - jockey 4800 1 65.15 ATAGTTCCTTAGAACTCGACGTTCATAATATGGTCGGAAACTCTACGAAGAATGGGTAGAAAATGGGAACTTATTAGACGGATCCATTAAGAGTGTTTATTCAGTGCGACTCCGGTCTAAAGGCACAAACAGCTAGCCAAGGCCA:1 - chr2R 5866578 3' - INE-1 143 1 50.34 GAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTATAAATTTCTGCTGCAGCCCAGAGTGGGACGTCCTTCGACACGCACACTGTGGTCCAGGCAATGCTAATG:1 - chrX 7372681 3' + micropia 5055 2 49.25 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATAGATGAAGTGATAGGTACGGTGATAGCTGGCATAAATGGACATTTCTATAACTAACTAATTTCTAACTTTTTAAACGATTTTTAAG:1 + chr3L 14122713 3' + 1360 3353 1 52.05 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGGATAGTGCATGGTGAATATGGTGATGAAATGTGCATGAAATTACATTCG:1 + chrX 3996580 3' - roo 8735 2 67.81 GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTGGGTATAATCCATTAAGAGTTAACTAAAGTGATTTAGCATT:1 + chrX 12191627 3' - pogo 73 1 67.81 TAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGGTTCACAAGTACAATGAAAATTCTTAGAAAGCACCAAGGTATTTGAGTCAACATTGATTTGCTGATAGGAAACCAGTTATACCTTGAGAAATAATGGCATTTTTTATGGCAT:1 + chr3R 10831807 3' - Juan 4039 1 73.29 CTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGTGCCAAGCTGCTAAGTTGGCAAAAATTTACGCTAATC:1 + chr2R 7083394 3' + 1360 391 1 74.66 ACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGAATTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATC:1 - chr3L 22400275 3' - 1360 45 1 60.00 TGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGGGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTACGGGCTA:1 + chr2L 22015994 3' - Tirant 8159 2 60.80 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGCTTTGTTTACCAGGCAACAGGTTATTGACTGATACTACGGAAACGTC:1 - chr3R 5208092 3' + hopper 1390 1 68.49 ATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAAGCAGGGGTACTTTCCATAATGAAACAAGGCGAAACTTTCATGCTCTCGGTGCGAAACGGAAAAGT:1 + chr2L 1260887 3' + Burdock 273 1 55.48 TGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAG:2 - chr2R 1921438 3' + mdg1 7375 2 72.60 CGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGAGATTTTACCAACTCTCTAAGCCTAA:1 + chr3L 16462385 3' + opus 7137 2 79.13 GTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTTCGCCTTATTAACACAGTATTTTTTGTGAAGTTTCTTAAATTGTGTG:1 + chr4 978256 3' + mdg1 7125 2 71.23 GTTCAGTCGCCATCATGCGTTGGAATAGTGAGGAGCTTGCCTTTGCCGTTGAGGCCTACCTTTCAAGCCAGTGTTAGAAATCGTTTCATTTGGCGAATCCCTGCAGTTACATTCACATTCTTAATTTATTCCAAATAATAACTTTT:1 - chr4 647106 3' + mariner2 120 1 53.42 AACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATG:2 + chr2R 5206897 3' - G4 3770 1 57.53 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATAC:1 - chr3R 20175708 3' - hopper 74 1 69.18 TGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCA:1 - chr3R 29418682 3' - mdg3 5332 2 69.86 TTTAACAAAAATAAGAGGAATAAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTATTAATTAGTTTCCCTCGCAATGCTATTTTTCTGAACACGGCTGTACATACCATTTTATGTAATATTCAATTTTTATATGTATACATGATCCAATTTC:1 - chr2R 6989079 3' - HB 91 1 73.29 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGAATGCACTCTCTCACTTATCCGCTCTCACTCTCAGCAGACTGCAACTGTAAATTGTA:1 + chrX 14951202 3' + P-element 2825 1 41.78 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGAAATATGCCAAGTCCAGAGTGTCAGCTAAATTTCCGTTGAATTTCAGCTGAATTGCTCATAAAATGACACGACCAAACATCAATATGATGAT:1 - chr3R 17113989 3' + roo 9045 1 67.81 GTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTCGACATTTCTTGTACAACCTATTCGAAGCG:1 + chr2R 8641654 3' - diver 3 2 78.87 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCACGCTCGGCGACACTCGCAGCTGGAGAAACATAAAGATGAAAGCCGGACAA:1 - chr3R 17305390 3' + roo 402 1 78.77 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACGCGTTGCCGCCACTAAGAATTTGTTTGTCCATTTTTTTCGCT:1 + chr2L 17240343 3' - hopper 31 1 65.07 CATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTAGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCAACAAGTTCCCACAGCTTATGCTAGTCAAACAGTCGGCGTTTTTATACCTTTC:1 + chr2R 22490350 3' - pogo 1691 1 58.14 TCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGA:1 + chr3L 13827353 3' + hopper 1347 1 63.70 AGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTCGTTATCAGTCATTTACTATCATGTGTATAATACTAATTTAAAGGACATTGTGTAAGTGAAGATGATTTTTTATTCTTAATA:2 - chr2L 15945685 3' - X-element 60 1 56.85 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGACACACCGCTCATGCCACTGGTCTTCTGTTATCTGCTGGGGGCCCAGTTTTTGTGCTTGGCTAGCAGATGCAACCCCCCAGCCGCACCGCATTCT:1 + chrX 2773585 3' - jockey 4787 1 63.70 TCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCAGACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTAAAAGGACAGGACCTGGGAGCCCACACGACTCAGTTCGCAGCGCTCGTCT:1 + chr3R 30170477 3' + 1360 3176 1 63.08 GGTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTTTGTGTGGGGTAGCTGTGCTCAGTAATATATAAACAGCTGTGCTGTTCGTACCAGAACGCACTCAACG:1 + chr2R 7665858 3' + Transpac 262 2 51.72 TTTTTAAAAAAACAAAAAAAAAGCAGCTTGACTTCTTGTTACCTGCTAATGATGTCATTTCGGAGTATATATATATTTCATTATAATCACAAAACTGTAGAGTACGAACCTTATAAATGTTGAGCGTTAACTTT:1 + chr2L 19846363 3' - hopper 154 3 47.76 ACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGGACGCAAGCTGGGGTAATTATATTTTCCACTTAAAGCATTTTTGAGACTGAACACTGGCAGTTGTATATATATATTGTATACAATGTGCT:1 - chr2R 20401562 3' - G2 2962 1 66.21 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTGTTGATGGGAA:1 - chr3L 22052734 3' + mdg1 7415 2 55.48 GCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTAGTTCAACGCACTATTCGTTGTCAGATAG:1 - chr3L 18031002 3' - invader4 72 2 72.31 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAATCCACGCCATGAAAATGTAATTCCAAATAGCGTGCCGAATCAGTCAGCCCTTTCAATTTAAATTCCTGGCTGCCC:1 + chr3R 21254930 3' - F-element 25 1 66.96 ACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAAAAGAAATAGACTATAGAAATTGACACCTCAAAACCAT:1 - chr2L 16089612 3' + 3S18 6073 2 58.43 TTTTTTTAGTTTTTTTAAATATTAGTTTTGTTATTTACATATTTGTATATAAGTCATAGTTCATATGAAAAAATTGAATACACATTTGTAATGAAGCTTAGAATATGTTAAAAATTTGTTTCATTTTCACTATCTAGCTATTTAAA:1 + chr2L 14944320 3' - TART-B 10631 1 75.34 TTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTCTTCTGCTTCTGTTTTCGCCTTTTTGTGCACCGAATGCATAACG:1 - chr2R 18060828 3' + R1A1-element 80 1 66.67 AAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTTGCCGACATATATATATTATAACTATATAATAATAGTTATAACTAATTCGCAGACCTGATAGTTTTGCCGCCGGCTATTTCCAGCTATAATTTATGATATTTAT:1 + chr3R 12929328 3' + invader4 313 2 73.08 ATAACAAGATGGGTAACGCCCTTCGATATTTTGCACACGATTTCTTCGTGCTGGCTAAAAAGCTGGTTTCAGGCTCTCTCGAAGACCTCTATAGCAATCCCAGTCAAAAGTGTCGAGGGAAAGAATTATTATAATGCGCTTCTTTT:1 - chr3L 23250403 3' + 1360 14 1 76.71 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGATTAGTTCCTTGTGGT:1 + chr3R 9160781 3' + copia 205 2 47.95 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATGTGAAAAGGATACTAATATGTTTTGCTTTTGCATAGGCCTCCAACTTCAACAAGCCATCGATTGGCCCCAAGGAGGCCGACAAGA:1 - chr3L 4115094 3' + 1360 3376 1 58.54 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTCTGA:1 - chr3R 20175670 3' - hopper 24 1 64.93 TAACATTTTCAAAAATTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACC:1 + chr3R 8049019 3' - Q-element 139 2 63.70 TGGGAATAACGGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTATGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTATGTTATACTTGAATTTATGACGGTCCGACGAAGCGGTGATACAGGACAGATTTA:1 - chr3R 4012692 3' - Quasimodo 194 2 74.81 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAGTTGGGTTAAGCGATTAAGGAAAAC:1 + chr3L 17207813 3' - hobo 67 1 77.50 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAGCACATGACAACATGCACATGCACACAGGTCACACTCCACA:1 - chr2R 6632524 3' - P-element 25 1 68.49 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAAAAACAAATGAGTTGTGTAATTAATACGGGCTTTTGTCTTGCCATAATG:1 + chr3R 18816011 3' - hobo 25 1 70.55 GTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTAATCATTTTTTGTTTAGAGATCCTAAGATCTTGCGGTCCACAGCACTCACCTGAGCATATTATCCTTGGA:1 + chr2R 13156074 3' - INE-1 556 1 75.59 GCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCCGAACCCCCTTCAAGTTCACTGCACCGCGATTGCGCCTACCGGCGGGCAAGTGCAGGGGCA:1 - chr3L 22642831 3' - hobo 2708 1 75.61 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACAAGTTAATCAACCATGAACTTTAAAGCCCCGCTCTGAAATGCAAAAAGGACAGCAAAGCCACCAGCACTAACCGCACTCGAGACCCAATAAT:1 - chr3R 24476245 3' + 412 7514 2 62.33 TATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTCCAATTTCGTAGCAATATGATGGGGTATGTATGGTAAAAGTTCGTGAAGGTGACAATAAAAAGTTTCAAGTAGATCCAGTAGGCAATTTAA:1 - 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chr3L 16973305 3' + S-element 175 2 78.77 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACAACTAATCATTAGCTTTACATGATGTGTTTATACGAAGCAAATATCACGCAATCATATCACGATAAATTTATCACGATTTATCGC:1 - chr2L 17250683 3' - opus 23 2 64.49 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAAAGCCCATTAAAGTGACTTATGGACCGGTTCCTGGC:1 - chr3R 30634881 3' + roo 394 1 77.40 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGC:1 - chr3R 12599040 3' - 412 78 2 70.34 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACGTCTCGTTCGGCTAACGTGCACAAACATTTCA:1 - chr3R 21001800 3' + 412 442 2 60.00 GTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCCTCATCGCCACTCCCGCCACGCCCACTTTCCCCTTGCGCCAGCAACCACACACACCTTTAGCCATCGGCTTGCC:1 + chrX 20065048 3' - opus 7330 2 66.67 GGGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGATCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAAGTGCAAG:1 + chr3L 25232920 3' - 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roo 62 2 61.38 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGGTCATGCAATGAGGCAACTAATTGAGAGGCCAAACAAAGCATG:1 + chr2R 20865742 3' + 412 414 2 71.23 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGTTTTAGGCAAGTCCCAGAATGTTCCCCAACAACGGCTGCCAGGCTTAAGTTTGCGC:1 + chr2L 15988072 3' - roo 58 2 61.43 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATC:1 - chrX 4778182 3' - 412 66 2 62.07 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCCACATACCTCTCCACTGCTCTGCTGTTCATTAGTACCCCATTTTGGTTG:1 + chr2L 6184097 3' + pogo 2043 1 65.67 TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAA:1 - chr3R 22100524 3' - 412 7130 2 67.81 GTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACGAAACGAGGCAACGAAAACAATAATAAAAGGAAAGGAAAGGAGCAGATGTTCACATGTTACAAACGCGGCCTTTG:1 - 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chr2L 973094 3' + R1A1-element 220 1 76.22 GTGTGGTCAAGGATTCATGGAGCAAGTTAGTCTGTCTTGCCCTATGCCTTTGGAGATAGCAAAATCCAGGAGGTCGGGCAGCAAGGAAGGGTTTGAAGGCCATTTGATTTACCATTTCCGAACATTGAAAATTATAAATAAAAATG:1 + chr2R 10077005 3' + Tc1 1236 1 58.22 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCCAAGCGTTTACCTTTTACTTAAGAAATTACACTCGGGCAAACAGAATTTG:1 + chr2L 16948767 3' - jockey 4709 1 58.90 AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAGAAATTATGTGGACAGTGGTTTCCAAAGGCAATAACTTTATATACACTAAAGT:1 - chr3L 15026652 3' - opus 7179 4 67.12 CCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTA:1 - chr2R 641860 3' + opus 7437 2 63.01 GTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTGGGTATAATCCATTAAGAGTTAACTAAAG:1 + chrX 12191615 3' - pogo 85 1 76.03 GTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGTGCTACTGACTGTTGTATGGGGAATGTCG:1 + chr2L 22746512 3' - 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chr2R 12543074 3' - roo 8736 2 69.18 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATAGCGAGTTTTGGCCAAAGGACGAGGATGGGAACAAGGACATCGTCAGCAGCCAGCCGC:1 - chr3R 27859136 3' - hopper 11 2 76.52 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATGAGTCACCAGGAGAAAG:1 - chr3R 19859639 3' + opus 7471 2 78.08 GAAAAATACCTTTGTATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTAGATCCAGCATCTCGTATTTAAAACTTAAAAGCCTTCACACCTGAATATCTTCAACATCTACTTCAATTTCTGGAAAAAAAACCA:1 - chrX 21083897 3' - HB 43 1 52.41 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAGTTGCAGATACTTTTGCTATGATTTAACCG:2 + chr2L 4174100 3' + roo 9046 1 67.81 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAGTGTGATTAGACAAGTAATTAATCGAAATTAAGCACTTAATGTAC:1 - chr2L 16884760 3' - pogo 19 1 65.07 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACATATATACACACAGCCAGCCGAGCGGGCCGATATACATACATATGCGCAAATG:1 + chr3R 17067919 3' - 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chr2L 21335371 3' + INE-1 498 1 64.38 GGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGAGAATAGTGACTTTTGTTAACG:1 - chr3L 23773895 3' + Transib5 2869 1 75.22 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGAAAGAGTGTTGGTGGTGATGTGGGTGTGGGTAAGTTGTGTCTGTGTTAGCCAGG:1 - chr2L 11915508 3' - hobo 52 1 62.79 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAACCCTGACTTCAAAGGTCTGCAGACGAGACAAAACATATA:1 - chr2R 11489130 3' + mdg1 7443 2 73.29 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGA:1 + chr3R 31959305 3' - Ivk 46 1 67.68 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGCTACGCATATGCACTTTGTTGTGTATTGCATATGACGCCCTGTCAGAGGCGC:1 - chr3R 19531233 3' - hobo 57 1 59.70 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTTGCTCCCCCAATGCAATGTAATGGATACATATATACATTTACTAAGAAAATATAGGTT:1 + chrX 6510136 3' - jockey 4703 1 63.01 AGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGTTAACTGTGTATAAATGAAAATATGGGTATGATATGTGTTTATTTACACTTTTTTTCTGTGTACGAGAATGGTTAGAT:1 + chr3R 13686668 3' - FB 45 1 55.48 CATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACGCATTGGTTAGCCATTTTTGATATTTTTGTAATGAGTGCGGATGACGTGTGTACAAATTTAAAAGTGCATACTACAAAAATTATAACGTGT:1 + chr2R 5542471 3' - 1731 33 2 63.01 AACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAATGTAGGCAATAACTTGGCAGCCAACTAAGGCCG:1 - chr2L 13605050 3' - F-element 4604 1 77.40 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTGTGAGCGGTGGTGTTTGCAACTGTAGGGTTTAATGAGGAGCGGGAGGTCGGTAGGCG:1 - chrX 7980768 3' - hobo 26 1 61.72 AAATACACACACACACACATACAGACAAACTTGCAAGCGAGCATTACTGTTAATTAATTCGTAATGTAATCTTTTTTTTCGCAGTTTCTTCGCTCTCCACACTTTTCATTTTCTTTCTCATTTTTTGTTTTGAATAG:1 - chrX 5825012 3' + Quasimodo 35 2 83.21 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCT:4 + chr2R 21402675 3' - mdg3 5334 2 70.55 TCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACTTAATGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAAAACATGGAAAAAATAAAGAGGGCAGTAGCTGGATGGATCCCCCACCAAAGA:1 - chr3L 12285744 3' + Doc3-element 4633 1 76.71 GACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGGATTCAATGGGAAGAAGGAAACTTTTGCCATCCTATTTTTTCTCTTTCCTTTTTTTTTTTGCCAAATTGTT:1 + chr3L 10304125 3' - accord2 7349 1 64.17 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAAATCGCTGCCTATCTCCCCACCCCACCCCGCCAACATGCGTGTGTGTGTGTGTGCGTATCGTGTAAAGTATATAATTAACGGTAATGCACATACGAGT:1 + chr2L 14095705 3' - pogo 19 1 73.97 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCC:1 + chrX 1103718 3' + pogo 2042 1 60.27 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATAAGATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAATATAGTCATTTTGTTCGTTTTACGTTTTTTTTACACAACTACAAAAT:2 + chr2L 21951248 3' + Burdock 6357 2 60.96 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGCAGAGATACATAACAGTATGATTTGCCATTAGTCAGTAACCAAAATCAAGCTACGAGCTGAGAAAGCAAATTAT:1 - chr2R 23412504 3' + mdg1 7415 2 51.39 TAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTACTAGTCTCCTGTGTGTTTTGTGTG:1 - chr2R 22722992 3' - 3S18 31 2 63.01 GAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGAAAAT:4 + chr2R 17890953 3' - Tabor 6918 2 69.86 ATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTAGTTCAACGCACTATTCGTTGTCAGATAGAAGTCTCTTGACTTTTTTATT:1 - chr3L 18030981 3' - invader4 2819 2 58.99 AAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTG:1 + chr3L 27415331 3' - transib2 45 1 54.79 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGCTACCATCTCTTCCATCTTTCTGT:1 + chr3R 19531287 3' + hobo 2897 1 78.02 AGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTG:1 - chr3R 17605646 3' + Tabor 7249 2 66.44 GTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAA:1 - chr2R 8641507 3' + diver 167 2 59.26 TAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATTATATATTAAAATTATTCGTTTATTATCTCTGCTTCCCTTGCCATGCACTTCGTTTCGAATTTAAAATTTCCCCCATCTTGCCTAATCACT:1 - chr3L 8855824 3' - rover 24 2 68.49 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACGTTTTGTAGACGGCAGCAAACAGCCAACAAAACAACAACTATATTTCACCGCAGTTCCTTTGT:1 + chr3R 10266223 3' - 1360 11 1 78.77 TATTATTGCTATTATTGTTATTATTGTTTAACAGGCATTTGTTTGTGTTTGTGTGTGTGTATGGGTGAGTGTGTGTTTAAGCCAGTTTTGTGGGCCTGTAAGGCAATTAACGTGGAACCCCACACCCAAAGTGCTGCGGTAAAATA:1 + chr2L 8587430 3' - mdg1 7069 2 63.70 ATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTTGTCCTAGATAACGCACAAGGCAAACACACAGAACGCA:1 - chr3R 28857553 3' - BS 5010 1 73.61 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCCAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTAT:1 + chr2L 6318991 3' - pogo 19 1 58.76 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAATAACATTCCGAGAA:1 + chr3R 13349150 3' - BS 5036 1 54.11 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAAAAATGCATGTTTCTGGTATGGTGGTCAGTTTTTATTAGAT:1 - chrX 8027369 3' + Juan 4203 1 71.23 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATGGGTTTATTACAAAGGTCCTCCTAATGCAATTTGTCATTTTCGCATTTTGTTTCTCTGGCTCTCTGGCTTTTGTCTCAAATGCAATTTTTGGCATTCCGTTCACATAAATTAGGCCCGAC:1 - chr3L 10144607 3' + blood 7373 2 73.97 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCAACTTGATCTCGT:1 - chr2R 912940 3' + mdg1 7397 2 56.16 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATATTTGCTTCGCAGACAAAAACATCAACTACCCCTAAAAGTAGGCAATTCTTACTGAGCAACAGCTACGTTGAGTCATTTTTCGTGTGCGCACACTTATAAT:1 + chr2L 13215759 3' - jockey 4779 1 69.18 CTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTAAAACGGAACCTCTTCTTTGTATGTATGCCCAGCTA:1 + chr3R 22516109 3' - jockey 4566 1 78.08 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCAGCTGTCAAGGTCGTTTG:1 + chr3R 16181279 3' + roo 401 1 78.99 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTTT:1 - chr2L 17029587 3' - blood 7069 2 56.85 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCGTATCCGTATGCGAGACTTGTCAGGCCATCAATAAAGCATTTGGGTTTGATTATATAATAATAATTCGTTTCT:1 - chr3L 19199613 3' + hobo 2913 1 59.68 AAAACTTCCACGCCCACACTTTTGCGAAAGTCGGCGGAGAAAAAATGGTGCATACCGCCAGGCGCCCGAAACATTCCCAACATTTTTCGTAGTGGTAATAAAAGTTTTTATCGCTTTAAATGAAA:1 - chr2L 2317612 3' + INE-1 245 1 77.60 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGG:1 - chr3L 7995426 3' + P-element 2811 1 35.62 GGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAGCATCGACGCTTTTTC:1 - chr3L 24152391 3' - HMS-Beagle2 6888 2 80.00 GTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTATTTTTTTCTTATATAATAAAATTTTGTTTGGCCTTTTAGTTAACACTTTATTTTGTGTGTGCACCACAGTTGTTTCTTGTTTAT:1 + chr3R 30295226 3' - Quasimodo 31 2 46.58 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTT:1 + chr2R 13644486 3' - Burdock 39 2 71.58 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTC:1 - chr3L 18658933 3' + roo 9036 1 82.28 ATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATGCATATTCATACGGACAGACGAATATATGTCCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTTAACGAACGTTGTATAATGTATGGTGCTAGTAGAGCCCTTGGGCGAAGACAATTTCGCCACAT:1 + chr2L 21580582 3' + INE-1 163 1 64.38 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCA:1 + chr2R 5923019 3' - jockey 4746 1 69.18 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGATTTCTTTTGTTAAACAACTGTATTCTAAGGAAGAATATGTTATG:1 + chr3L 9909825 3' - Transpac 4938 2 69.86 GACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCGGCTGTACTAACGCCAGATGATCTGTAAGTCATAC:1 - chr2R 14947168 3' + Tirant 8209 2 78.62 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGCGGAAAATTGCGCATACGACGC:1 + chr2L 17240303 3' - hopper 45 1 64.17 AGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGAGATAGTCGGTGACTGACAAATATTAATTGTACCCTATAATGCTTTAGTAT:1 - chr2R 1007659 3' - Ivk 98 1 77.78 TGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCTCTGTCCGTATAAAGGTCGATATCTCAGGAACATTAAAGGCTGGAATGTTGGCATTCATCATACAGATTTCAGAGACAAATACGCAGCGCAAGATTGCCACGCCCACAAACCGCA:1 + chr4 670183 3' + INE-1 91 1 72.60 GTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATTCACGACGTAATTGGTTTCCAACGTTCACACATCATCACTCATAC:1 + chr2R 19352049 3' - Burdock 6209 2 67.81 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGTCATGGAAATAAAGTGCAGGGATCGACATGAGCCAGTCCTCCT:1 - chr2R 23287420 3' + roo 9043 1 59.38 GACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTGATCTATATTGCATTAAACTCTCTTTTTAAACATATTCTATTGTTTC:1 - chr3R 30295097 3' + Quasimodo 7300 2 68.49 AATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGCTGTTGCTGCTGATGACATTTTTCAGCTAATTTCCACTCCTTTTCCTACATTTTTTCTTTTTCGCCTGTTATTGGCAGTGCAATTTATTTCCACCTCTCTCTATCGCATTT:1 - chr2L 7151746 3' - F-element 373 1 72.60 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCCAAAGGACGCAGGACACAGGACGATGGCGATGGCGATGACGATGACGACTATGAGGACGACAGCTGATGAAAATCGCGAAAGCGGGCGC:1 + chrX 7786700 3' - hobo 32 1 63.45 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCCATCCCGCTGAGCAATAATTTGTGCTTATGCTGATGGAAAAGTAGTAAAAGCCAAACTACTAACCACACAGGACGAGCTCAGTGAGTCA:1 - chr2R 23497005 3' + 412 461 2 61.64 AGGTTTTATAGTTCCTCAGATCTCCACCTTCATACGGACGGACATGGAGAACGAAAACTAGGAAGGACAGGAATAACAGGAGGATGAAGGCCCCGGGGCTTGCCTTTCGGTATTTTCACGTAG:1 + chr3R 10532829 3' - INE-1 150 1 60.98 GTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCCATTACAAGCAAACTGGAAACTTCAGTC:1 + chr2R 16403476 3' - copia 4960 2 78.77 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATTACAATATAAGTTTGGGTAATTACCCAAGCAGCCGAAACACAAGCTCAATGATTCCAATTA:1 - chr2L 10184421 3' - Doc 64 1 59.59 CGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCACGACATATAGACATGTTAGTG:1 + chr3L 14551079 3' - P-element 17 1 62.02 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGT:1 - chr3L 17175112 3' - 412 7089 2 54.40 ATGTTTAATTTAGTTTATTTTAGTTCCAAAAATAAATTAAAAATTTTTCAGTGATACATTTGTTTAAATAAACCTTAAGTCGGTAATGGGTGTAAGCTTACTAATAACTTTAAAAAAAATGCATTGTTTTATCACAATTGAAGCCA:1 - chr2R 14932572 3' - F-element 92 1 61.64 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTATATCGCGATTAAGATAATCAACTGCTCTGCTCTGATTGCGGAAGCAAACGTGGTAAAGATTTCGAAAAGTGGATGGTCACTGATAAATTATCCA:2 - chr3R 27478454 3' - hobo 26 1 62.33 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACG:1 + chr2R 6632615 3' + P-element 2783 1 14.38 GCAGCATATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCTCAGCGACTCCTGGTGTTCTGTTTTAAGTTGCATTTGTTTGTAAAAGGATATAGTAGGAGCCATGCCGTCAAACTGCATGTCAGC:1 - chr3R 11377185 3' - blood 187 2 60.69 TATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTC:2 + chr3R 9160773 3' + copia 5066 2 53.42 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCTATGTTTTTCCATCTCCATATCGATTCGCTATTATTTTGCTCGCCACTGTG:1 + chr3R 6413782 3' - FB 68 1 70.42 TAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTT:1 + chr3R 9160782 3' + copia 5075 2 49.32 CTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAG:1 + chr3R 26246891 3' + 1731 4553 1 65.07 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATACTGTCATTTAAATTCCAAGCAAATGCAGAGGATAACTCAACAAAGAATGGCTTAGATCGAAACAGAGAAGGAGGTAAATCTTATGGTA:1 - chr3R 7739410 3' - I-element 29 1 63.38 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCATACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCAAAGTGTAACA:1 + chr3L 20289144 3' - jockey 4709 1 43.84 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATTTTGGATAAGGTTATAAAAAGAATTATGCAATTATTTTCAAAGA:1 - chr3L 15327561 3' - blood 75 2 70.55 CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTAAAAAATTTTTTT:1 - chrX 12441595 3' - copia 4931 2 68.46 ATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGG:1 - chr3R 27510087 3' + Bari1 1630 1 69.66 CATTCTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTAATATTACACATGTCATACGCCGAAGAAAAATT:1 + chr3L 15767351 3' + R2-element 3175 1 77.78 GAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCCGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAA:1 + chr2R 5206895 3' - G4 3766 1 57.14 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACGGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCAGTTGGGCCACAGTTTTTTTTGCACATGTGTAAGAAGTGCGCTGATGAATGTAACTGTT:1 + chrX 2578095 3' + hopper 1353 1 57.53 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATAATTAACTACATGATGCTGCCGCAGAGAAAAAAAGTATTTGCTTAGCTTTCTTCACTACAAGGATACTAAGCCATCGAGCTGTTGACGTCAATTAGAAAACAACGTAGGTGTTTCGCCTCTC:1 + chr2R 14047769 3' + mdg1 7449 2 72.60 AAAGTTTTTTAGTTTTAAAGCTAAAAAAAAAGAAAAGAAATAAAAATATAAGATCAAAAAGGCAGAATAATTTATCTAGATATTTAAATTTTCAATGTTTCTTTGATCAGCATTTCCTAGTCAAAGAGCCCGAAATGAGTGTTATA:1 - chr3L 6837582 3' - 1360 3025 1 50.68 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAA:1 + chr3L 23042118 3' + pogo 2069 1 62.63 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGTTAAGGGGTGGCTCCTTAACAAATGAAGACATCAGGTGAGTTTGGTTATTAATTCACCGGAAATTGTGTTTAGCTATACCCAGTTCTTGGTAGCTAGTTTGGATAGTATGTCCCTC:1 + chr3L 14076359 3' + roo 407 1 78.77 CAAATATTTATTGTGACTGATCTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAGGCAGCCAAATCACACGCTAAAGAGGATAACACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTCCATAGTGTAAATAAACAACGGGAAGTTACGTGGAAGACAGCAA:1 + chr3R 4570646 3' - Dm88 168 2 67.12 CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCCATTTAAGACACCCAATTCCCGCTGCCAATTCCCAACTGCAAT:1 + chr2L 17250874 3' + opus 492 2 72.60 CATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCTACCTGAGTT:1 + chr3R 26246880 3' + 1731 4545 1 72.03 ATATAAATATACATATATACACATGTATATTATGTGCACCCGGACAACCCGAGAACTAAGTACTGCGTGCCACAAAAGCCATCAATCATTTTGAGCGAAAGGGGCAAGCGGTAGATGAGTATCTGAGTCCAGTACATACATGTATG:1 + chr2R 21503732 3' + Stalker 6940 4 78.77 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCT:1 + chr3R 16181217 3' + roo 330 2 69.86 AGTGCCCCACAGCTGAATCCCATAAGTCCAAATTGGCTTCAGGATGGCCTTGTACAGGGTCGAGGGCATCCAGCTGGCTTTGAATGATGGCTGATGCTTTGCCAACTAGCATAATGCATCG:1 - chr3R 11291844 3' - G-element 3919 1 47.93 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGTTCAAAACCTTTCACACTCTTGTTATGGAAGCGGACTTAGCGCTAATGGTTAGTATTTTTCTATAAA:1 + chr3R 15703006 3' - copia 4 2 73.68 CAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCC:1 + chr3R 29418754 3' + mdg3 174 2 65.07 AAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGTCTAATACCAGGCGCACAG:2 - chr3R 17605580 3' + Tabor 7315 2 78.08 AGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAAGCCGATTCTCCAAGCGGTGATCTGGAAGCAGGGATGGCAGT:1 + chr3L 21688694 3' - I-element 5325 1 71.53 CGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATCTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAA:1 - chr3R 23639168 3' - pogo 86 1 75.34 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTGTTGCGTGGCCTTCTTGGCGACCATTTTCATGGC:1 - chr2L 4106264 3' - jockey 4782 1 65.89 GAGGGGCCTCTATGAGTTACAGTCAGTAGGTTTAATGGTCTGATGCTATCATACTACTACCATCCATATTCACAAACCACAAAGGTCACAAAACAGTTGT:1 + chr3R 26581453 3' - McClintock 6180 2 51.00 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTGTGTGTCTCAAGTTTTTCCTTTTCGGGTTGCTTGAGTTTGGCCTTCTCTTTACTTTGCCGCTGTATTTTTTAATTAATTTGTCATTTATTGGAAAAGGGTTTCCCGA:1 + chr3L 13563452 3' + roo 397 1 76.03 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAAATGTCAGAACGATCACCAACGTGTAAAAAGTTTTAAGTTCTACCGATCTTATAAATATTTATACT:1 - chr3R 7981465 3' - jockey 61 1 56.16 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACACAA:1 + chr3L 25401042 3' - Doc 27 1 56.85 CAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACCAAA:1 - chr3L 22861728 3' + S-element 1696 1 66.44 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTTGCCCGACGATTCAGATCCGATCGTTGGAGCAGCAAGTGAGAGTACGTCTCTTTTGAGAGC:1 - chr3R 4197221 3' + P-element 2849 1 50.81 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGC:1 + chr2R 19555028 3' + pogo 2038 1 63.01 TTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACCTTACCAAATGGGATTTAAAACTTTAAAGGATCATGTAAAGTAAGTATATGGAAATGT:1 - chr2L 12349763 3' - F-element 104 1 60.27 TTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATAAGCCACCAGAGACCTCATTAGATACGCACCCCCCGCTTGTTCGT:1 - chrX 7296250 3' + Quasimodo 7110 2 71.23 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCTATTTTCACTTGCCATTAAGACAAGCCAATAACATTTTCTTTATTTCAGCATAATGATGTTATTTAAATATATATATTATGAGAAAAATAT:1 + chrX 21973955 3' + pogo 2073 1 64.38 CACACACACATACACACTGCCGCACATGGAGTCATCCAATAAAGCATCCAGTGTTTTGTGGATTTGTGTAAATTTCTGGCTGAGGGCCAAGGGCGGAACACGCGTAATTCCAATCACGTGCCAGCCCAGAAAAGAAAAGTTCTCAA:1 - chr3L 11361700 3' + accord 259 2 70.55 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCAGG:1 + chr2L 246120 3' + roo 395 1 74.40 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAA:1 - chr3L 13634227 3' - 297 6644 2 76.67 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGGGGCGGACTTGTTTGCCCCAGTGGCTTCTGACCGAGAGCAGATTGAAGGAGGAGCGAGCTGAAAGGCATTTCCCAA:1 - chr2R 6842740 3' - roo 8678 2 71.19 GCCAATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTGGTGTTGCTGTGTGGGTGGATTGGGCCGAAAAAGTGGGCGGACAGCACGAGACACAATGAGGCATTGCGTATGGTTTAAGCTTTATTTATTTGCGGCCATAAATAACGCTTAACG:1 - chr2L 11632341 3' - accord 187 2 53.47 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGG:1 - chr3L 11336367 3' - blood 7067 2 73.21 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAA:1 - chr3R 17305460 3' + roo 344 2 69.17 AACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTGAAGGCGAAATGGAAATAGCGCACTTAAGTGATTTTGGTAGTCTTATTACCTAAATTTTCTCTTACATAAGTTTATTTTTCA:1 + chr3R 2555612 3' - Bari1 39 1 59.59 TTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTCTCACTCGCACTCATTGCATGCATACGTCACGAGGATGTGT:1 + chr2L 21326479 3' + P-element 2732 1 15.00 AGGTTTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTCTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATATATTATAAAATCCATTTTTGTGATAGAACGTTGTCTACCGACATTTTTTTTTTGCTTTCGCTTT:1 + chrX 14254490 3' - copia 56 2 54.11 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAATTTACATACATAAAAACAAGAGATTATGCTATAGTTGAGTACCCCGACTATCAGATACCCGTTACTGAGCTAGTGTAACTCGACTATAGCATT:1 + chr2R 5354800 3' + roo 9034 1 59.59 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTATATAGTTTTACATATGTATGTATGTATATATATATATACTCCCTATGTGTAGGCCATATAAGCTGGGGAATACAACTAAAATGTACAGACTAACCGACTA:1 - chr2R 18959340 3' + blood 7370 2 68.97 ACCAAAGACACTAGAATAATTATAATTATTCTAGGGTCTTTGCTAAAACTTTGTAAGTAAGGGACATGATTCAATTTTTGGTACAGTGTCGAGGCAAATTCGGAATTTGTTTGGAATGTGGTCAATATAACTACGATTAT:1 + chr3L 23024566 3' - Tc3 312 2 70.00 AATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACG:4 - chr3L 24213783 3' + invader2 167 2 72.60 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATAC:1 - chr3L 17707820 3' - Doc 66 1 60.87 CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAACGCAACTCGGAAAGAAAAGGAAAATGGTGTGTGGATGTGAAGGGAGGGGGGCAAGGG:1 + chr3R 15022174 3' - Tabor 6849 2 77.40 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGGTAAAGACCTAATCAGTATCCTACATTTGTTTGTTTTCTTTTA:1 - chr3L 15612720 3' - roo 8741 2 69.66 GTGGCATATATTGGTTTATTACAATAAACTGAAATTAAAAAGTATCTTCTACATGGGGAGTTACGTCTTGGGTTGAGTCCGTGGCTTTGGGGTAAGGGATCCCTTCGTCCTTCGACTGATTTATGCGCTTATCACGCAGGCGTCGC:1 - chr2R 17121527 3' + blood 376 2 80.14 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCATGAGACATGTAAAAGTTAGTCCT:1 + chr2R 5737192 3' + 1360 3354 1 65.00 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAAAGCAAAGCAAAACCAAAACCAAAGCCCCAAAAAAACAAGCCAAGCCACCGACAAAGTGTTTCCGACTTTTTCGTAGATTTTTGCTGCCAGATTTTTATTGGC:1 - chrX 7515595 3' - roo 8679 2 75.17 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTC:1 - chr2L 2031046 3' - 412 7072 2 52.38 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCAGCTC:1 + chr3R 22100598 3' + 412 456 2 54.46 TTTTACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTTTATATTATCATAGCTTATTATGCATAGCTTAAAATCGACGAAACTGGATAAGAAATA:1 - chr3R 12929190 3' - invader4 59 2 57.53 ACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATTGCCTCATTTTGAAGATAATTGCTTGTTATTAATACATTTTGCACCTTAATT:1 - chr2L 12658455 3' + Quasimodo 7301 2 64.14 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACAC:1 - chrX 12191542 3' + pogo 2035 1 64.58 TTTTTTTTTCATTTTTAATTTCAATGGATTCTGATTGACAACTTGTTGTCGAAATATATGAGATTCTAAATTCAGTTTAGTATATCAAATAAATGCTTTGTTAGGACAAACTTTTTTCTCAGATTGTATAATGCAGAATTCCAACA:1 - chr3L 13102174 3' - P-element 2647 1 83.56 GTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAGCCACCGGATAATTGTGTCCGATCTTCAGTTTGCCAAACGTTC:1 - chr3R 11057574 3' - flea 4798 2 61.06 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATATCTTAATATATTTGGGTAATAAATTAGATTTACTTTATATTAAGCATATGGTATGCAGTAGGCACTTTCCTTTTAGCATTTATGAAAGCACAATA:1 - chr3R 25768738 3' + copia 230 1 60.27 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGATATTGGCCATATCATTCGGCCGGCTAAGCG:1 + chrX 4291936 3' - roo 87 2 81.38 ACACATAAATAAAACATCAATTGACACATTACAAAACTCTCGTTTTTATACGGTATACTTAAACTTAAAATTAAAAAATGCGCGATTATAATAATAACAATAACTTTTTTTCGGTGTACCACTTGTCTCATGGCCAACT:1 - chr3L 10206265 3' + 297 388 2 50.36 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGCATGGATGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCCGTATAGCATTAGCCCATATCACAGAGT:1 + chrX 21994015 3' - 297 6619 2 57.24 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCT:1 + chr2R 2427617 3' - Doc 65 1 63.01 TAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATTTAATCGCAAATCGGAATAACGATGGAGAATGTT:1 - chr3R 21276485 3' - BS 5009 1 72.60 GCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATATCGCTTTTAATATCTATAAGTTAGTTTGGTAAATCGAT:1 - chr3R 19137084 3' - Bari1 71 1 97.60 TGAAACCGGATCAAAATAATTCGCGACAAAAGAAAATAACGGTGAAATCGTTTTATATAAACATATAAACCAAAACAACAACAAGGAAAAACAAAAAATAAAAAACCCTAGTGCAACTGCACTAGGCGAGTGAAAAACAAAAACCA:1 + chr2R 18524581 3' + gypsy9 363 1 57.53 GAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATAC:1 + chr3R 15022100 3' - Tabor 84 2 72.60 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGTTTTAGGCAAGTCCCAGAATGTTCCCCAACAACGGCTGCCAGGCTTAAGTTTGCGCCTCGCTGACTC:1 + chr2L 15988083 3' - roo 16 2 66.06 GTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGATCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTTGCAATCCGCTTTTAAAACATTGT:2 + chr3R 29288829 3' + BS 5053 1 48.63 GGCTGCACCCGCTCACGCTCTGACTGTCAGAGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACAAAAGCTACTAGCAGCAG:1 + chr3L 21429126 3' + F-element 470 1 86.36 GGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCG:1 + chr3R 26520463 3' - FB 64 1 62.86 TAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTTATACTTAAAAAAATTAGATTTATAAAGGAGTGTTTAGTGTTTAGACATAATAATCATTATTTTA:1 + chr2R 4029443 3' + 297 6962 2 76.71 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAAAAACAAATGA:1 + chr3R 18815973 3' - hobo 63 1 59.59 TTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATGTCAACATGACTTGCATATGTGCTTCGTTACACATAATTCAAAAGTATCAAAATTGTCTATCAG:1 + chr2L 7497658 3' + copia 4730 1 55.86 TTTTTAAAAAAACAAAAAAAAAGCAGCTTGACTTCTTGTTACCTGCTAATGATGTCATTTCGGAGTATATATATATTTCATTATAATCACAAAACTGTAGAGTACGAACCTTATAAATGTTGAGCGTTAACTTTCTCAGTAACTGA:1 + chr2L 19846375 3' - hopper 154 3 43.84 TATCGATATCCCAGAAAAATAATCATGTTTCGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAAAGATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATTGCTTTCTCTCTTGTTTTGACTTTGAAAATTTACAATTATGTAGATGACAGAAAATCGTT:1 + chr2R 4929334 3' + INE-1 503 1 61.64 AATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGTACCAATGCC:1 + chr3L 12976332 3' - invader4 50 2 62.90 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATATATGGTTCTGTAGAGCATAAGGGAAATACACACAAACACATTTTCTCGGCATTGCCGTTACAG:1 + chr3L 12224754 3' - 412 7077 2 69.66 GTGTGTGTGTGTGTGTGTACATCTCTCTGATTTCTTTTTGTTGATTTTTATGTTAGCATTAAAAATCGAAGTTTTTGTTTTTTGGTTATTCTTTTTTGTTTGTTTTCCCTTTTTTTTTTTGTTTAGTTGCGTT:1 + chr3L 9177415 3' - accord 7027 2 55.64 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGG:1 - chr3R 9160677 3' - copia 67 2 62.33 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGAAAGCACTATCGTAGAGATGGGGCGCCAGTGCTTGCGATAGCCCAATCGATATATCGTATATCA:1 + chrX 14826207 3' - P-element 37 1 53.85 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATTACAATATAAGTTTGGGTAATTACCCAAGCAGCCGAAACACAAGCTCAATGATTCCAATTA:1 - chr2L 10184421 3' - Doc 60 1 58.45 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAATGAACAAACGAGCGGGTGCCATCCA:1 - chr3R 13607640 3' + I-element 5284 1 65.75 ATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGACTCTTCGCTGATTTTAGTGCTTTAGTGCTGTTGGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTG:1 + chr3L 13524042 3' + hopper2 1546 1 58.22 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGAGGCCATTCAAGTCTTTATGTAAGGCCCAGGGA:1 + chr2R 18482544 3' - hopper 17 1 73.79 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACATATAGACATGTTAGTGGAGCGTT:1 + chr3L 14551086 3' + P-element 2861 1 61.38 GGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAGCTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCCCACACCCCCCCTCGGAATACCACGCCCACTTGCCAACTGCATCCC:1 - chr3L 10376596 3' + Doc2-element 400 1 67.12 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATGCCTCCTGTTTGTTTTTGCCGTCTGCTTGATGCTATTCCGGCTGCTTTTCCGGGGCTTTACACGCCGCACTCAGTGCTACGG:1 + chr2L 18317566 3' - mdg1 24 2 66.15 ATAAGGGATTTCCTTAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATCAAAATGAACTAATCTGTCTTAAGGACAAAATAATTGATAGCTGGGCCGGAGTAAAT:1 - chr3R 2914315 3' + Circe 7010 1 72.60 GAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGG:1 + chr3L 23678165 3' - Osvaldo 29 1 67.21 AATATCTCCAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGGGGCAGTGGGGCATGTTGCAAATGTGTCTGCGCTG:1 + chr3L 15276747 3' - hopper 44 1 54.86 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTGTCATTATTATTCATAACTTGGCAGACAGTCGCTATTATTTATGCTCCCATTTGTACAATGGCCAGAAGCCACCCTTTAACTCCCCTTTCGCCCCAATCTCACCCCCACAC:1 + chr3R 25387924 3' + roo 401 1 80.14 GACCCAACAATTACTCTCAGCACAGAAAAGGACTGATCAACCAAAAAAAATAAAAGAAAAAAAAACTCATAAATATTCAAACTTTCTCGCTGCCATCGTTTATTTTTTGTCAAAGCCATTATTTATTTTTATTACATTG:1 + chr2R 13693645 3' + Porto1 377 1 57.55 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGAATTCAATAGTGAAAATATTCAATAGACTTACAAATCAAATCAAATATTTTCTGCCTCATTTTATCGCATACATACTGATAATCCAAATTCTAGACCACAA:1 + chr3L 13374260 3' + pogo 2082 1 67.12 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGGCGGAGGTCAGGCGGAGGTCAGGGGGCGGACGTGAAAGATGGACGTGAACGGGGCCATGCCACTGCTT:1 - chrX 8755021 3' + transib2 2798 1 59.17 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATA:1 - chrX 4778178 3' - 412 63 2 59.59 GGGGTCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTTCATAGCTGTTGCGGAGCTCGGGAATCAATAGGTAAACGGCTATGGTAAGCATCATGAAGGGAATGGAGAACATCATGGCTAGTGCAAGGAATTTCGGTCGGATTAATAAAATG:1 + chr3L 335871 3' - diver2 375 1 72.60 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAATAGATACAGAATGTGTATCCGCATCTGCAGCTGTACCAGCAAAATGTATCTGCATCTGCAAATGGATCTGTATCTGTATTTGTAAATGTGGCCGCTTGGCACGCAGCA:2 + chr2R 11609360 3' - roo 8677 2 77.40 TATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTGTGCAAACAAAAGATGAGCCTCTGCAAAGGTAACAAAAAATATGGTTTCCACTCTA:1 - chr2R 17899380 3' - FB 749 3 61.64 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGACCGCAAAAATGACAGCCCAAAGTGGGCTCACCGAGTGAGCAACAAATTCAGACCAGCTCTCGGTTAT:1 + chr3L 10144795 3' - blood 7018 2 79.85 CGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTAAATTCCCTTGTAGTTCTACAATTAAATTATTCAAAGGAAAGCATACACTAATTAATAATTGTTTAAATTTACTGTGACATTT:1 - chr2R 7727104 3' - BS 4700 1 53.42 AATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAACTTAGAATCGAAGATATCCAGCCGATGGAACAAATCCTTGTTTCCATTATTTAGAAATAAGCAAAAAAAAATAAACACAGTG:1 + chr4 436928 3' - 3S18 39 2 59.59 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTGTATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTGG:1 - chr3R 16913356 3' + pogo 2040 1 64.38 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGTTATGCCATTTTGGAATATCCATTTGGGTTGTACTATGAAATGATAAGGCATATATTTCCTTGAAAAACTTAGGACATTCAAATTGTG:1 + chr3L 20255275 3' - Transpac 31 2 64.38 GTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGATTTCCTTTGGGGGCGATGGGAACTGCGAGCTGGCATAAAAATTGAATAAAGCGCAATTTCAACTGGACAGC:1 + chr3L 15708263 3' - copia 4759 1 69.09 AAAAAAATTCCCCACAGTTTTTCAGCCGCTTCCGTGTTGTTTATGGCTATTTGTCAATAATAATGAATGAATGATTGAATGAATGGATGGATGTTTGGTATTCCTGGTCGGATAAACAG:1 + chr2R 22365986 3' - INE-1 386 1 78.99 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACAGCGTAACATTAACACACATTACTAACGCTGTGTCAGCATTTCATTTGAGTTTGCT:1 + chr2R 17392138 3' - BS 5022 1 65.07 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGCAAGCACTATCGTA:1 + chrX 14826157 3' - P-element 93 1 11.76 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTGCCCAAGAAAGTGCAGCACAC:1 - chr2L 15987945 3' + roo 9047 1 67.63 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGGGTGTGTG:1 - chr3L 17175111 3' - 412 7109 2 54.11 AAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACA:1 + chr2L 16089689 3' - 3S18 5811 2 50.36 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAATTTCACAGATTAATGCGCACACATTTC:1 - chr2R 17890834 3' + Tabor 7299 2 65.75 GGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGT:1 + chr2R 4677364 3' - invader3 5238 2 51.37 CGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGATAACGTTGATATATGGATGGCACCTAGTGCTTTAAGCTTATATTGTTCAAATCACTTGGATTATAACCCAAAAGTATATAGTTAGATAACTAAATTTATCATTAGTTACACCGAA:1 + chr2L 8960306 3' - Ivk 5181 1 75.34 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGGGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTTGTGCGAATTCGTTTGCTAACCTTGGAATCGAGTTCTAATGAGTCAGGAGTATCTTCATCTATGGGAACTATTTTGGAGCATAAGTTTT:1 + chr3L 13666324 3' - 1360 31 1 56.16 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCAACTCGTTACTCAAAGCAAAACGA:1 + chr2L 686109 3' + roo 9061 1 73.95 GTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAGGAAATTATGCTGCCGCACCCTGTATATACTTTGTATGCTCGGCAATGCTCCCCCCAATCCTCAAGAAACTTAAACCCTATTTGATATCCAAGCCGCATGAAGCTTAACTAAAGACT:1 + chr3L 13940374 3' + mariner2 867 1 53.96 AGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACAGAGGCATTGCTACCCTCAGAATGTGATTACACTGACCATTTATGCTAAAGCA:1 + chr2R 4362641 3' - gypsy 7026 2 58.62 CGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACTCAATAAAACTGTGAACCCTCTCTTATTGAATTTTCC:1 - chr2L 1259932 3' + Burdock 6311 2 73.97 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGG:1 - chr3R 9190502 3' - Tabor 6905 2 60.27 AAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATAATAGCAGCATTTCTTCACAAAGATGTGCTCATCTATTCGGTTGGACGTACATAGA:1 + chrX 994416 3' - blood 497 1 63.03 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGGTAAAGACCTAATCAGTATCCTACATTTGTTTGTTTTCTTTTACTAGTATGAATCATTATTA:1 - chr3L 15612701 3' - roo 48 2 53.33 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGCGATATCATATGTTATATGGCCAATATCAATATCAAA:1 - chrX 4778137 3' - 412 15 2 71.22 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAGCTAGCTCGCTCGCTCGCACACATACAAACAACCACAGAGTCGCAGGCACAGGATCCTTGCTTCATTTTTGTAGTGC:1 - chr3R 13628545 3' - hobo 21 1 65.85 TTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCCG:1 + chr2L 14248108 3' - I-element 22 1 60.19 GTGGGGAAGTTGATGTAGATGAGGCAACAGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGCCCCATCAGACTCAATCAGGACACACGACTGCGCTCAAAATTATAGTAGAGCTGGTCACATCG:1 - chr3L 5977434 3' - gypsy5 6947 2 37.67 ACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:1 + chrX 706056 3' + Juan 11 1 77.88 GAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGCAAAGTTTTTGAA:1 - chr3R 17656396 3' + mdg3 5414 2 73.29 GGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAG:1 + chr3R 11547768 3' - G2 329 1 61.42 TTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTAGCGTTTGCGTGCCACCAATGTGTAGGATTCCTTGTGTGTATTCGTTAAATATTTCATTTTGTTTGAGATCAGTTCTGAGATT:1 + chr2L 7544060 3' - mdg3 5339 2 59.59 GTGCTCGAGAGGTTCCTCCAGGAGTATAAATGACTGCATCAGCAGTGGAGATCGCGTCCAGCATCGAAAAGCCTTTCCGGA:1 + chr2R 4932442 3' - G7 113 1 53.09 ATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGGGGATGTGGCAAGGGGGCGGGGCGAAGTGACGACGTCAGCAGCGATTTATTTCGCGACAGTTTGTCGTTCATCTTT:1 - chrX 18002111 3' - accord 7031 2 80.00 CCAACAATTTTTCAAAAATGTGGGCTTGACACTTTGAAGATTGCAAACTCCGTAAAGCAAACTTTCCGTATTATGGAAAAAAGATGAAGATTCGGACTATTGAGTAAACAATCGAAATGAGTATTCAGTAACAAAGTGGAACGTGA:1 + chr3L 23635783 3' - INE-1 376 1 62.33 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAG:1 + chr3R 27822282 3' - I-element 35 1 55.45 CGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTT:1 + chr2L 18279967 3' + gypsy5 355 2 63.20 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGAAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGT:1 - chr2L 17210254 3' + jockey 4949 1 51.09 GTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATAATTGTTTGTTTCCCATTCGCAGGCTCGACTCGGCCG:1 + chr3R 30298016 3' + R1A1-element 407 1 62.86 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCTACTGCCCCCGAAAAGAAAATATACAAAACAATAAATTGAAAACATTTACAAAATGTTATTGCTTTAAACAGATA:1 - chr3L 20712944 3' + roo 9027 1 54.79 GAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGACATTACAGTCCCTATAATATGGGAGAGCAAATGAGAGGCAATCTAAATATCTTGCTCTCTCTGTCGTGCATTGTCATTTTGGATTTGCGGTAATATAAGACAGAGAATGAGAGGCAGTCATTA:1 - chrX 22383372 3' + roo 9063 1 76.71 AAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTTGCCGACATATATATATTATAACTATATAATAATAGTTATAACTAATTCGCAGACCTGATAGTTTTGCCGCCGACTATTTCCAGCTATAATATATGATAT:1 + chr3R 12929324 3' + invader4 3056 2 64.08 GCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGATTGGCTCTGTCTTAAAAGTTTGGAAATTATAAAAAGTATTTTTAAAATTT:1 - chr2L 19134790 3' - Bari1 71 1 65.07 ACGTACACACACACACACACACACACACAAACGGGCGCGCGAGCGCAGCAATGGAAATATGGGAAAATACGAGTGCAGACACACACAACCCACACACACACTCTCACACGGACAACTCAATTTGCACTTCATCTGTTGATGTGAGT:1 - chrX 20940751 3' + Quasimodo 35 4 67.12 AATATAAGCAAAAAAATGTTATGCAATTAATTAAAAAAAATCTCGTGAATGTCAAACAGTTTATATACAATTTTAATTAAACGTATGTTAAAGCACTAAACGGAGACAGTTAATATAAGCAAAAAAATGTTATGCAATTAATTA:1 + chr3R 11838412 3' + Stalker2 7178 1 66.67 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGC:1 + chr2R 21402695 3' - mdg3 5296 2 50.78 ATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATATACCTTCCATCTAGCATGTTTGCCAACCGAATTATAAT:1 + chr2L 13733020 3' + 1360 155 1 73.29 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAAAGATCTTGCACATTTCCCC:1 - chr3R 21705987 3' - 297 19 2 55.21 CTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAG:1 + chr3R 26246878 3' + 1731 4553 1 71.43 TTAAATAATTGAAAATAGATTTGTGTCATTTTTTCTCTTCGTGTATGTTCAGATTCAGGCGGCCGCTAAG:1 - chr3R 29651565 3' + Transib5 259 1 60.00 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATACGATC:1 + chr3L 17890830 3' + 412 7490 2 56.85 ATGCTGAGTCGGCTTGCCGCTCATGTCTTGGTGGCGCGATGCATTGTCGCGTATGGTAAACTAAGCAAAGAATATTGTCTTTACTTTTAGTTCTCTGGCTTGCTGCTCATTCATTTGGGTGATATACGGCGCCC:1 - chr2R 5748040 3' + gtwin 7080 2 73.13 GGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACATAGGAACTTTTTTTAAGATTAGCTATTATTATTATTA:1 - chr3R 6413718 3' - FB 65 1 70.31 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAAATG:1 - chr3L 17707807 3' - Doc 61 1 54.11 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAGTCACCGCTTTTTAAAATAAAACCCAAACCGGAGCCCATCTGTATCTAAATT:1 - chr3R 26191614 3' - hobo 60 1 61.87 GTTTTTAATTTCGGGGAAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATGATAAAACACAATGACGTTGTGAAACTTATATCAAAAAATAATACCATATTTGATATTGTCATAA:1 - chr3R 929285 3' + Max-element 244 2 53.42 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCATTGTTGTTGCTGCCGAGCGGAATTGTGTGCGGGTATATAGGTGGCACCCGCTCTCTAT:1 - chr2L 14095550 3' + pogo 2074 1 58.68 CCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCAGCAGCAACACCAATGTTATACTACGTTTTTGTAATTTATCTAATTTATCAAACAAATTTCAAA:1 - chr3R 7981015 3' + jockey 449 1 67.12 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAGTCATTAAATTAAGTCACATCAAGTGCGTATACTTAATTTTTGGGCATGCTCTGTTTTTATG:1 + chr2R 23497136 3' - 412 7113 2 57.53 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCA:1 + chr2R 5923009 3' - jockey 4742 1 73.48 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGTTCAAAACCTTTCACACTCTTGTTATGGAAGCGGACTTAGCGCTCATGGTTAGTATTTTTCTATAAAGTATACTTTTTTATCGTT:1 + chr3R 15703024 3' - copia 37 2 58.90 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTGAAAATAGTATTTGAACTTTTTCTAAATTTTTTTCATTCCATATATTTTTCATAAACCTCCTGTGATTTGTGTAC:1 + chr2L 12658598 3' - Quasimodo 37 2 48.63 CTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTGCTGTCGCAATCCTTTCGG:1 + chr2L 12340838 3' - diver 15 2 63.46 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGT:1 - chr3R 7035244 3' + roo 9008 2 61.64 TAAATATCATATGTTTTAAACAGCTTAAAGAATTTGTATCAATCAAGTTGACTATGAATACTACAAAACTGTGATTCATCACAATCGAATTTATAATTGAATCTTTCGAAATCTCTCTCGCAGGAATACAAATGGAATGGATGAGA:1 + chrX 19542142 3' + Cr1a 91 1 77.40 AATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAAAAAATTATCAAATTGTACTGAATCGAGTTCATGTAACTTTTCACTAGC:1 + chr2R 16441880 3' + I-element 5281 1 68.97 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAACGAAGCAAAACGAAACCGCAAATGAACTCCTCCCAGAAGTAGC:1 - chrX 1531678 3' - jockey 4815 1 68.97 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACAATGAAAGCGATGGAGAGAGAACAGGAAAGCCAGGCTAAACTGATTTAACTACG:1 - chr3R 25387775 3' - roo 53 2 60.15 TATTGAATAAAAATTAGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAACAAAAGAGTTAACAGTTGAGGCCCGGGCTGGTATTGTTGCTTGTTTACATTGCGCGGACGTGGCTCCACAGCACCCCCCTCCAA:1 - chr2R 11248019 3' + Bari1 327 1 72.60 GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGA:1 - chr3R 13582218 3' - BS 5066 1 65.07 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATAACAATCGACCGGATCCCGAACATCCCCTGATGA:1 - chr2R 1921396 3' + mdg1 379 2 56.16 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCGTATCCGTATGCGAGACTTG:1 - chr3L 19199664 3' + hobo 2900 1 73.81 AATAAAAAAAATAAAAAAACAAAGAAGAAAAAACAAAACGAGCTCGCCTCATTTCGATTGTAATTTGTTCGGTGGAAATTGGTGGGAAAAATAGGGGGTAGGGGCAGTGGTGCATGAGCCATGAAGCGACAAAATCAAATTGCGT:1 + chrX 20706742 3' + BS 5102 7 67.59 TATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGCGATGGAAATAATTAAATTATGATTTCTGATATCCACTTTTCATTATC:1 - chr3L 20244088 3' + Transpac 311 1 66.90 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATTTAAACGGGTACATGTGAATGGATGGTTGACTGAAGAGACCCATTCCTTGGTTCCACTGGTTAACGGGGCACAACCCCCTTATC:1 - chrX 12525875 3' + roo 9040 1 61.81 CAGGCACACACACACACACACATTTGTGCAGACTGAAACACACACAGCAACACCGAAACACAGACACC:1 - chrX 10730570 3' + accord 180 2 51.47 TATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTATGTGTGGGTGGGTGGAAAAGAGGCAACAGTTTTTCCTGATTTTTGT:1 - chr3R 15711752 3' + diver 6070 2 54.11 GTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCCTTTCCGACTATATAAAATATATATATTCTTAATCAGGATTAATAGCTGAGGTATCTCTAAAAATATACACGAAAATGTTCACACACACGCCAACTCATACACACACACACACACACACACG:1 - chr3R 9418241 3' + INE-1 28 1 51.72 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCAAGAAAAAATGATATGGAGAATAAGATAAGAAACCCAGCCTAGAG:1 + chr2R 19553335 3' + mdg1 7454 2 77.40 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTACATTATAAATTTGATTAAAACCAAAGAATTCTAGTTAAGGAGCAGCTGACAACAAGTTGTTAAATTTTTCAATTCTTTGGCCAAAGGCAGAATACTTAAATGTAT:1 + chr3L 18467328 3' + hobo 2926 1 76.71 AAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAATTTGTGCTCGCTCCTTACCAATTCCACTTTGCCATTACTTCGATTCCCCGGCCAACG:1 + chr2R 6899134 3' - pogo 1717 1 58.99 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCGAAGAAGGCCCAAAAAGAGCAAAGCTGCATATACACTGAGGAAATTGCATATATCAACCAAGGTACGCTCACATATGTC:1 - chrX 14951086 3' - P-element 26 1 63.85 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAACGGTTGAACTAGGACATTCAAGTACCCAATATCGATAT:1 + chr3L 23042156 3' + pogo 2060 1 56.16 AACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTCCATAAAGTTGATATATTCTATGAACGTCGAGATCTTAGTACCTCCATTTTTATTGGTCTTGTGAATTTCTATCGCTTTGTCACGCCCATGAGTACTTTTTTTCTTATTTAATATTAAT:1 - chr3R 18377269 3' + INE-1 34 1 59.59 ATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACAGAGGCATTGCTACC:1 + chr2R 4362603 3' - gypsy 78 2 72.60 AAGACGTTTTATTCTTTAAGAATTTAAGCTCTTGATAACATATAACTCATCCGCCATGTTGGTAAGGGCAATTTCACTTCGATTTGGACTTCAACTTTTTACCTTCTTTACCCGCATTGGATATTTTGCCTCTCTGTTATGCAGTT:1 - chr3L 10619165 3' - aurora-element 4 1 58.22 TTTTTTTTTTTGTACTTTATTAATCTGTGCAACACGTAATGAGAGGTATTCAACCTCTACATTGGTTTATAAAAAGAACACCAGAAAAAAAAACTCCAGTTTTTGGTAGT:1 - chr2L 19677402 3' - BS3 1768 1 71.82 TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCGCAACCGCAACATTTCCCAGAGTTTCCTAGAATTCTCT:2 + chr3L 11400051 3' - Quasimodo 18 2 72.60 CAATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCAC:1 + chr2R 5532314 3' - G4 3825 1 68.89 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTAAATGTTTAAAAACATTTAAACCAAAACTGCATAAAATCTATGTGTGACCCACAGTCTAAGAAATTCTGTAGAGCTCGTAAG:1 + chr2R 8396030 3' - pogo 35 1 61.64 ATTCACACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTTGTTTTATTTTGTTTTAATGGGTTGTATAATTCCAAGATTTCTGGGTTTTTTTCCAACATCCATAAATTAATCTCTTTCTGTATGT:1 + chr2L 21762417 3' + INE-1 536 1 52.74 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCA:1 + chrX 5150385 3' + roo 9015 2 58.22 TTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCCATTACAAGCAAACTGGAAACTTCAGTCCTTTGCCAGGATGTCATAAACAT:1 + chr2R 16403499 3' - copia 68 2 63.01 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCATTGGCCGCCGCTGCCATTTTGTTCCAGAGCTCTTGTGAATTTGCA:1 + chr2R 6842896 3' + roo 401 1 79.07 AAATATAAACATTTATTCATTTAAGATTTTTTCATCGATTTGAGCAGTTACTTACAGTTTTGAGTTGGACGTTACGCAATGCGCAGCAGTTAGTATCAGATCTAAAAACAAGAAATCCATATAACCATCAGGCAATCAATCATATA:2 - chr2L 14768916 3' - Tc1 59 1 42.47 ATCCAGTAAACTGGTAATTAATCAGATCAGCTGCATCAGACAATACAGCTGATAGCATTGCCAACCTTTCGCAGTCGACGAGCTGGTAAGTCTGGCGTTGCCAGATGTGATTTATGGTTTTTCATTCGAGACCTGCCTGTTTTTTC:1 - chrX 20688806 3' + Rt1a 163 1 72.60 TACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATATTTTTGTAT:1 + chr3R 17605724 3' - Tabor 70 2 63.01 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATCAAGTTGTAGAGCGAACCTCGCATTCGCGCCTCA:1 - chrX 21196717 3' + roo 322 2 74.66 TGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAACAAAAAAGCGTAAGAGGCGAGACTTGCAACGACAACAACGTGGCATACTTTTCGGGGCATGTG:1 - chr2L 3395679 3' - jockey 4721 1 54.01 ATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAATAGAGTGCCCCGCATTGTAGGTTAATAATCATAAATGTTATGGTAATAG:1 - chr3L 13632802 3' + R1A1-element 31 1 66.44 AAGGAGGTGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGATTTTAATATACCTGGTATTACGTGGTCCAAAAATGAAAAATAAAATATCCTTCTCAATGGAGCAAATGACGAATCGTAACGTATCCGACAGTCAATAAACTTCG:1 - chr2R 5451507 3' - transib4 2407 1 71.92 ACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGTGCTACTGACTGTTGTATGGGGAATGTCGATATTGAAAATGACGGGATATCGGTGAAGGTAACCGAAGCTGATCATTTGGTAATATGGAATTCT:1 + chr2L 22746577 3' - R1A1-element 4992 1 65.75 TGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGGAATTATACGTGCAATAATTTGGATTCGTGAGTATAGAC:1 + chr2L 2052757 3' - blood 7094 2 71.92 CAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGCTATCTGTGGACAACCGCCTGCAGTAAATGGCAATGAT:1 - chr2L 3694646 3' + 1731 4326 2 73.97 ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGAAAATGACTTTTCTGCTCGACTTTGTTTTGCTAATGTCGA:1 + chr2R 17890988 3' - Tabor 6883 2 52.74 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAA:1 + chr3R 24476351 3' - 412 7104 2 68.14 GAATATGAAATATTTTTATTCAAGTTATCAGTGAAGTGAGTCCATTGCAAGGGAAAATAAAGCAAGTTCAATAGAATTTAAACGAATGCATGTTTAAGATCTTAAAGTGAATGCTCAAGTCCCTGGAACCCAAGG:1 + chr3R 8457224 3' - looper1 1667 1 68.15 TTTTTATCAATTTAAATGAATGCAATATAATATTTTTTTTGGATTTTACGAAAAGCGTAAAAGCCTTCATTGCAGACTGGACTCACTAAATGTATGTATCTTACTTTATACGAAACATTTTTCCGCAATAGTTTATGCTCTTCAA:1 - chr2R 19951942 3' - Transib5 2593 1 51.03 AATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCTGTTAAATGCTCTAATGATGGGTATTAGGCCAGACTAAG:1 - chr3L 16562828 3' + roo 9038 1 58.99 AATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGTCCTTCTCGATTCTTTCCTCCTGTGGCTCCTGTTCCACACAAGA:1 + chrX 14619064 3' - Doc 4321 1 57.28 AAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACCTGACGGCAGATTCAGATACACCTTTCAACTTTAAACCATTGGCAACGTGCGTAAACCAATGGC:1 + chr2R 12240188 3' - copia 4927 2 55.48 ATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACATTAT:1 - chr3R 4160056 3' + invader2 197 2 52.05 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTCCATTGTTGATAGCCGATTGCAAAGACTTGTGCAACATGCAGCGAACATTTATCATCGATGACAGAGC:1 - chr3R 28627540 3' + copia 250 1 79.86 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAACGGTTGAACTAGGACATTCAAGTACCCAATATCGATATTGTGCTTTTGAGCTGATTTA:1 + chr3L 23042176 3' + pogo 2087 1 73.38 GCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCTGAGGTGAGTGTGCAGGATGACACCTGCTCATAGATAAATCAGTC:1 + chr2L 16884951 3' - pogo 16 1 73.29 TCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCACATATGTCTTAAAAAACTTATCAATGCATGGGATAAGAGTCAATGCATGGTTTTCTATGCGCAAAACTCAATACTTTGATCCTTAGACCGTATTATCAACTTAAG:1 + chr3L 4115265 3' - 1360 18 1 68.49 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTG:1 - chr3L 10133526 3' - 412 87 2 76.03 ACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGTACCAATGCCTGTTGAGGCGGTAATATTCAACGCAAGTACC:1 + chr3L 12976363 3' - invader4 20 2 52.00 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTATATCCTTAACATAGAAGCCGACAGTCAACGACGACCTGGTTTTTAAGCACGAAGCTGCCTTCGTTTCACTTCGT:1 + chrX 3099191 3' + P-element 2847 1 54.68 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATTTATTTATAAACATTAGAAGTGCATGCAGATGCGGATAAAAACAAAATGTTCTGTTGTTTTCTGTGGCGAAACATTAAATTGGA:1 + chr3R 15885247 3' - I-element 34 1 60.69 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCTAGGTACA:2 + chr2R 5923033 3' - jockey 4732 1 59.59 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCTACAACTTTTTC:1 - chrX 12191554 3' + pogo 2047 1 67.50 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTACAGATACGCTGTTTTAAACGGTGTATAAGACCCGAGCAGAAATAAAAGATCAAACAAAGAAATAAACGTAT:1 + chr2R 641973 3' - opus 160 4 53.42 GGGCATAAGTATTTAGACACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCATATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAGGAGTGCAATAACAGTTACACGCTATATAGAACAACTATCATCCTCTTGCATTCCTGCGAATAT:1 - chr3R 27114534 3' + Tc1-2 8 1 71.92 GCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATAAACAAATTAGCAATAAGTGATATTTTCACATAATCAGTACTTT:1 + chr3L 25482994 3' + accord 7347 2 54.69 ACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAACAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTCCTTCGA:1 + chr2L 13250434 3' - opus 7081 2 77.93 AAAGACAACAACTCTTTCGAAAGGACATCACCATTTATCCTAAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGGTGAGGGATGCAAGCGAACAAGAGACGGCGAATTCTACAAGAACTAAAACCACAAAAAGTAAC:1 - 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chr2R 16810225 3' - Quasimodo 99 2 74.66 TGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAACAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTCCTTCGAAACACAAATA:1 + chr2L 13250444 3' - opus 7172 4 68.42 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTT:1 - chr3R 7035250 3' + roo 338 2 65.75 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATGAAATCATTGAACCGGAAACCATAATTATTG:1 - chr3R 27794799 3' - roo 8750 2 78.77 GGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAACATAGGAACAGTCAACGAAACTGTTAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACTGCATTTACAGGGTGCTTGTGCTGTGAATACCGATGATGATTACTTAAT:1 + chr3R 22780302 3' + Porto1 4372 1 63.97 CGATGAATCAATACAATGCAGAAACAGTAACATAACAGCGCAGTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAG:1 - chr3R 13582219 3' - BS 5067 1 63.01 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATC:1 + chrX 5150375 3' + roo 343 2 64.58 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAATTATCT:1 + chr3R 11750262 3' - Tabor 6905 2 64.29 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGT:1 + chr2R 10695909 3' + roo 9045 1 65.75 GACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGCCTCCAAATTTTAAATATGTAGATATGTAGAGTATCATCATCACCTTGCGGTGAAAAATGTGTATTAAAAATGTATTATAATCCC:1 + chr3R 10155431 3' + 412 458 2 55.48 GCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCGAACAACCAGCGAATCGCCGCGA:1 - chr2R 11763576 3' - Tabor 6894 2 53.42 GAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAAC:1 - chr3L 24213784 3' + invader2 166 2 73.29 GACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTGAAGGCGAAATGGAAATAGCGCACTTAAGTGATTTTGGTAGTCTTATTACCTAAATTTTCTCTTACATAAGTTTATTTTTCATTAATAGAAA:1 + chr3R 2555622 3' - Bari1 29 1 66.44 TCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTTATATATATATAGCCTTTTGGAATCCTCGGCTTTCGGAAGCGGCTATGTGTGCGAGATCACGTATTTGA:1 + chr3R 17495854 3' - Quasimodo 49 2 58.22 AGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACATAATGTTCCCGGCCTAGTTTTTTGCCAAGAAACCTCTTAGCTCCGCATGTGAAGTCTAT:1 - chr2R 4638592 3' + 1731 271 2 56.80 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTT:1 - chr3R 17305455 3' + roo 352 2 64.62 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTAAATGTTTAAAAACATTTAAACCAAAACTGCATAAAATCTATGTGTGACCCACAGAC:1 + chr2R 8396005 3' - pogo 60 1 63.01 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGCGATGCAGCAGGCCTTAACAACTTATTCCTTTGCCGGTTTCTAGCACTAGCCTGATTGTATAATCTACACTTTTGCA:1 - chr2L 15834398 3' + hopper 1405 2 78.77 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAGACATATGTATGTATGTATGTATGTATGTAGCTTTGTGCTCCTCTCTTTCCTCTGTTGTTTCATGAAATTC:1 + chrX 22858504 3' + copia 238 1 51.37 AAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTATGCATTGCATTGGTGCATATATAATCAGTTGAGTCTGGGCAAAGTCTATGATTTGGATTGACGTTGCTGGCTGATGTTTGAGCTTGTTGTTGCT:1 + chrX 17732112 3' + pogo 2089 1 74.07 GTATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCATAGGCCACAAATTAATCCCATCCAACGG:1 - chr3L 17890692 3' - 412 29 2 66.44 CCTGAGATCTCGACGTTCATACCGACAGACGGACATTTCCATATCGTCTCGGCTATTGATCCTGATCGAGAATATATATACTTTATATAATCGGAAACGCATACGCACGGCCAAATATTCAATTAAAGCTGAAAC:1 + chr3R 11540602 3' - INE-1 137 1 74.07 ATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTCCATGTCCCTTCTTCATCATATTCTAAATTTGCATACGAAAATACTAGGGTAATCAACC:1 + chr3L 27381317 3' - invader4 298 2 76.71 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGGAAACTACCAGCCAAGCATCATCATCTGACACATTCCAG:1 + chr2R 5955068 3' + copia 247 1 76.00 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATAATGTGTAAATAGAATCAAAATTGTTGACTCGGGCAGGACAA:1 - chr2R 18482395 3' + hopper2 1567 2 48.57 TGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAGAAAAACACAAAAACAATTAAGAATATTAATAGACACAGGAGCCACATCTCGCTATATCAAAAAGGGGATCTATGAAAATAAAGAAGAATTGCCA:1 + chr2L 22780974 3' - HMS-Beagle2 24 2 69.18 AATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCGCAGGGAATCG:1 + chr2R 15829624 3' + invader4 3073 2 68.97 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATATAACTTGTATTTGTGTCTAAATAAATGTCTCAGAAAAATAAATGTATATGCAAAACAAACGTCGAACGTTGAAAGTTGTCTTGATTCCCAAGTGTGGGCGGCTAAACTA:1 + chr2R 18959531 3' - blood 7022 2 76.71 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTAATTAAGCTGTCAATCTCTTTGCAACCTATATA:2 - chrX 14964567 3' + roo 393 1 73.29 AAGCACTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTATGTCAGCGGTAATTTAATTTCTCTTTGTGATGAAATGTAATAGAAGTACATAGTACACACACACACACACACACAAGCACACTTGCTCGCTGAGCAGCATATCCCCCTAATATCC:1 + chrX 1598403 3' + HB 1620 1 50.00 GCTGCTTCGAGCACTGGGTTTTTTGCGCTGATAACACGCACACTCGGGTGTGCGATGGTGTTAGTGCGAACTACCGTTAGGTACGTTGGCTGGGCCAATTTAATCAGTGCTGGCAAACAATTCTAGTTTGGTGTACAACAACTTTG:1 - chr2L 10041006 3' - G6 203 1 67.81 AAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATAGGATGAGATGAGTACGTATGGGTATTGGTCCTCCGCAGTACCAGGTCCCATC:1 + chr3L 15100090 3' - copia 4820 1 64.38 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTTTAAATTTATCGAAACAATCGATGAGAAATC:1 - chrX 18512683 3' - S-element 74 1 77.44 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATAATGTGTAAATAGAATCAAAATTGTTGACTCG:1 - chr2R 18482405 3' + hopper 1358 1 56.85 ATGATCATTAATTTAAATTAATAAAAATTGCAGCAATTTAACATTTCCTCACTTTGTCATTATGGATTCGGAGACACATATATTTGGAACAAGTCCGCCATTGAAGACTTTTGAGCCTCATATGTCGCTTAGCAGTATGGGAGATT:1 + chr3L 23771246 3' + Transib5 2588 1 63.01 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTGTCGCCGACGCTGCTCTTGCATCCGCAAAAT:1 - chr2R 11609185 3' + roo 9037 1 60.27 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGTTTTTTTTGCATATCAACACACGTGTAAAGCAAATGTTAAACATGAATGTGTG:1 + chr3L 9571774 3' + jockey 4966 1 62.33 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAACCGCAGTTTACTGATGAGGGCGGACCG:1 - chr2L 17210225 3' + jockey 4981 1 75.37 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAATAAAAATTGCAAATTTATACATACGTACGCGCTTTCTAAAAACAATAAAGTAACAAATGTCTTAGGATACATACATTTTGTCTATTTCTCATA:1 + chr3L 20713094 3' - roo 28 2 67.12 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAGTTTGAGTAGCCACGGTTAAAATTGGTTAAGGTTTACAGCCACTGGATCGCCATTACCAATGCCATAAA:1 + chrX 15137477 3' + jockey 4941 1 51.37 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAACAAAAAAATCAATAGCCAAAATGTTGCATATCTTAACAGGCTATACCATATATTATG:1 + chr3R 22249201 3' + jockey 4944 1 61.19 ATCACAATTGCGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTGCACTCAACGCGGCTTAAATCAAATGACCAAAAGTATGCA:1 + chr2L 6717185 3' - jockey 61 1 61.67 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGCTTTGTTTACCAGGC:1 - chr3R 5208124 3' + hopper 1358 1 56.85 TGTACCCAAGAACAGCAAAGTGAATTCATTCGAATAAGCCTCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTACAAAAATACCACATAACCTTGAACCTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTA:1 + chr3R 1047980 3' + Stalker3T 262 1 70.55 CTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCA:1 + chr3R 11547765 3' - G2 351 1 68.49 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCGTATCCGTATGCGAGACTTGTCAGGCCATCAATAAAGCATTTGGGTTTGATTATATAATAATAATTCGTTTCTGGAGATGCTGGGAAATAACTTGCATCATAATACTCGGTATAT:1 - chr3L 19199571 3' + hobo 2933 1 78.08 CATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACC:1 - chr3R 27859198 3' + hopper 1328 1 77.40 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAACCCCAAGGCGAAAAATTCCCTCGAGGCAGGCCAGGAAAAGCAAAACGCAGAAAAGTAGGCAATGATTTTTATTAATTGATAAGCATTTGCAACAAGTTGCACAGACACACG:1 + chr2R 23116239 3' - jockey 12 1 79.86 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCTGTTTACTAAACAAATAAATAGAAAATCCACGAATCCAGCCCGAATAACAAAAAATGAAATAGAGTTGT:1 + chr3R 7035351 3' - roo 8716 2 56.85 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTATTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCATT:1 + chr2L 4174067 3' + roo 9015 2 55.86 GGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGAATTTACATATTTGGAGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAACTGGAATATAAAAAAAAAATGAATATGAAAAACAACTGAATCTAATGTGCATTTTAAATTATAAAAT:1 - chrX 11451798 3' - 1360 3176 1 82.19 AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCCTCCTTTTTGGAGCGTGCGCCCTTTTCGCCTCTCCAATGACAATC:1 + chr2R 7723143 3' - BS 5014 1 73.97 GGAACTAAAAAAGGTAGAAGGTTGAAATTCAGCATACAGACTCCAGGGACGAAGACGCAGCAGACATAGTTGCCAGCGTTCCAGAAAGTACCCCATAAAATCCCATAAAAGCATTCCAAAATAAGGAAAAGTGCTGCTAAAATAGC:1 - chr3R 4588902 3' + INE-1 157 1 58.22 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTTATA:1 + chr2R 4029382 3' + 297 321 2 70.34 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTCTGCTAAGTTTTTCCTTTTTCTTCG:1 - 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Ivk 28 1 61.81 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGTTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCA:1 - chr2L 4106320 3' - jockey 4831 1 78.69 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTAA:1 - chrX 14964598 3' + roo 9025 2 54.11 CAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACACACGCACACACTCGTGCACACACACAGGCGGACACTCAGCATATGCAGCAGCAGGAGGATGAAAAGAGAGGAAGG:1 + chr3L 17175234 3' + 412 7528 2 66.67 ACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCACTCCATTCCGAGCCATTTTCCCTCGCATGTT:1 + chr3R 20486397 3' - accord 59 2 76.99 GTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAG:1 + chr3R 9352093 3' - Tirant 54 2 57.46 CTTTTTCTCTTCACGATCAGAACCCTAAAGTCTAAAGTCCATATCAGAAAAGCTCGATACCTAGGCTTGAACGTCAATCAAATTAGAATAATTATCAGAGTTCATTTTCTCAAATAAAAATTTTGTAATCATTTTGTGAAATA:1 - 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Cr1a 207 1 64.58 GATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCTACATCTGAAC:1 + chr2R 4677355 3' - invader3 51 2 54.41 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAATCTCCATTTCGATAACTCCTGAACTTCGGTTTCCGGTAATTCGAACCGTGCAGGTGAAC:1 + chr2L 19074109 3' + pogo 2097 1 57.04 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGTTAAGGGGTGGCTCCTTAACAAATGAAGACATCAGGTGAGTTTGGTTATTAATTCACCGGAAATTGTGTTTAGCTAT:1 + chr3L 14076320 3' + roo 9031 1 57.53 ATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGGTTGCCAATAATTTTAACTTTCTATTGTATGTGGCTTTTTTCAATTCCATCAGCCAGACAACAACAAACACAATGTGCGCAAGAATTTGCC:1 + chr3R 23859365 3' - jockey 4986 1 59.59 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCATTAAAAGCCAACACCCTTAAAAGCCAAAAGCATTTGGTTCTTAACTTCCACTCTCGAAAGAGTGGACCATAAAACTGGCT:1 + chr3R 28627713 3' - copia 4911 2 58.90 AGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCATACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATT:1 + chr3L 20289118 3' - jockey 4755 1 73.97 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTACCGCTCTGCTTTTGCCACTTTTATTGTTTGTCTGGTGTTCTGCG:1 + chr3R 9190625 3' + Tabor 451 2 61.64 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGC:1 - chr3R 22100530 3' - 412 7136 2 71.92 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAGTCATTAAATTAAGTCACATCAAGTGCGTATACTTAATTTTTGGGCATGCTCTGTTTTTATGGTCAGCCATATGTAC:1 + chr2R 23497151 3' - 412 45 2 52.05 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTA:1 - chrX 14964622 3' + roo 337 2 70.55 ACTCATTAAGTGTACGCCCAAGTTTAAAGTGTGAACACAAATTAATGTTACTATTTGCTTACATAAAAGAAAGGAAGTTTTGTAAGTACTAGCTTGTAAATGTTGTAACTTAATTCCGGCAATCGTTTTAAAGCGAACCCAGATCC:1 - chr3R 17237855 3' + rooA 350 2 74.66 CTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACACTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTATTGTAGTATATCCTCTTACTCTACGAGTAACGAGTATACAAATTTG:1 - chr4 705935 3' - INE-1 90 1 89.63 TAATCCTTCTAGCTTTTATAGTATTCCTGAGATCGAGGCGTTGATACGAACAGATCGACTCGGTCAGTGATTCGGATTAAGAATATATATACTATATTTAAACGCCAGCGAAACGCGTGCGAAACGTGACG:1 + chr3L 16981350 3' - INE-1 160 1 61.83 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCAGAATCCAA:1 + chr2L 9485686 3' - 412 56 2 55.94 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAACCGGTACGTTGGTACCAATACAATGGCA:1 - chr3L 22400228 3' - 1360 29 1 65.75 CAAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACA:1 - chr2R 19554940 3' - pogo 54 1 62.40 ACAAAAAACGAAAAAAAAAAACGAAGCGAAGAGGGGGCGAAGAAACCGAAAGAGAGGCGGCCA:1 - chr3R 29791017 3' + gypsy7 5007 4 79.37 ATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAATATTGTAGTTTCTGATAATACTGAGCATTTTTGTTTTC:1 - chr2R 5868295 3' - pogo 79 1 71.92 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACAGCGTTTATGCTGCTGGGCTGCTCCTGCAGCATT:1 - chr3R 27822225 3' + I-element 5296 1 70.00 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACATTATGCTACTTACTTTTCCGAAATTAACCCTTCGCAGCACCTTAAATCAAGTAATACTCAAACAAACAGTAAAGAT:1 - chrX 16579229 3' + roo 360 2 53.10 AGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTGAGTTATTCAAGTGAGTTGTATATTTGACTAACTCTACATTCGAACAAATGCAATCTAAAGAGATTTCGTTGACAGCAATGAGAGC:1 - chrX 4215184 3' - mdg3 5133 1 53.42 CCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACTTACCTCATTCTATAATATTAAATAGCACTCCGTAG:1 - chr3L 16212743 3' + Transpac 5150 2 72.92 AAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAAAACGTTTCTTGCTACCTGTTGCGTACTTTCCAAAGAATACCGTATACCCTGTTAGTAGGCAGGAACCGTCTCTAGTGCAGTTTTTCTTTTTGCTCCTTGTCGGTTT:1 + chr2R 6526632 3' + jockey2 3349 1 73.29 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATT:1 + chr2L 9472090 3' + roo 349 2 56.85 ACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGCCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACAAAATG:1 - chr3R 1875806 3' + Rt1b 4735 1 39.05 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGGGACTGGGAACTTTTGCTGGT:1 + chr3L 9907450 3' + jockey 4941 1 50.00 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCCAAGAAATTTGGGATTTCTTCTTATAACACGAGCACTTTAAGGATCAATTTTTTCCATTTTCAATGGACTGTACGTAGGATCTCTCAC:1 + chr2L 19068181 3' - pogo 22 1 66.91 ACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGACAGCTCGTAGCGAAGTTTCCCACCTTCAGCATGGACGTAAACCACCGTCGATATATCGACTCCTGAGAGCCCTTGATCAAAGCACAGAAGTTC:1 - chr3L 22648252 3' - Tabor 6850 2 73.44 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATGTGAAAAGGATACTAATATGTTTTGCTTTTGCATAGGCCTCCAACTTCAACAAGCCA:1 - chr3L 4115122 3' + 1360 3378 1 47.31 ACTAGGGAGTCAACGAAATTTCCCCGTTTCTCCGGTTACTGAGTTGCATTGTTGCATTGAAAACCAACATATACGCTTTTGAACAACACTTCCCTTGACCTATAAAACTATGCATAATAAGATATTGACTACCATAC:1 + chrX 20906911 3' - transib2 2660 1 59.85 TGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTT:1 - chr2R 3338782 3' - Juan 52 1 54.29 TATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATGCGCGCCTAAAACATATGCTGTTATGCGGTTTAACCTATCTGAATGTCATCAAACATTGTCAGTGACATTTAACGTAAATTGGGTAACCAGAGTAG:1 - chr2R 5542308 3' + 1731 4601 1 68.49 GACTTTTTAGTCCACTTATTTTTGTAGAGGGTAGAGGACAGCACTGCTCTCAGGAGAAATGAATAACAATTCTTAAGCTTAGAAAGGAAGGAAAACAATTGGATGTGTCTAAACTGTTATCGTTTCACTCACATAAAATGGCAACT:1 - chr3R 16325963 3' + HB 84 1 65.07 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGGATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAA:1 + chr2L 22015977 3' - Tirant 63 2 76.47 ACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTC:1 - chr2R 8158763 3' - Juan 49 1 50.41 TGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTTTGGCCCAGACAAACTTTGGCCATTTCCTGCAGAAATACCCAT:1 - chr2R 21402555 3' + mdg3 231 2 70.00 AAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAA:1 - chr2R 8641493 3' + diver 170 2 52.74 GGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTC:1 - chr2R 23287467 3' + roo 8989 2 80.00 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGTTTAAGTTTAGTTTGACAATTGATTGATTGGC:1 + chrX 14964687 3' - roo 8751 2 80.82 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACTTTTAAATGGTTGGAAACGCTTCGCTCTGCCTTTTAAATACTGTTTAACGAATCTAGTATAAATAAAAAAATAAATAATAAAAATACCAGTCCAGCGTACTATATTGACAACTGGGTG:1 - chr2L 20413505 3' + roo 407 1 33.56 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGAAAGCACTATCGTAGAGATGGGGCGCCAGTGCTTGCGATAGCCCAATCGATATATCGTATATCAGCTGGTGTGATTTTAAATCCTATTATCAGCGTT:1 + chrX 14826240 3' - P-element 20 1 70.55 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGAACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCGATCCATGGC:1 - chr3L 11336369 3' - blood 7069 2 73.21 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAATTCGGGTGTGCGTCGAGTG:1 - 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chr2L 1259860 3' + Burdock 246 2 74.66 CTTTTGGACGCAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTGGTATATCAGATGTTGATTAAGTCTGAAGCCGAGGTGCCGCAGCAGTTG:1 + chr3R 28397731 3' + Transpac 5196 2 55.45 AATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAACTATTTGTTGGATAAAGCCAGCTTGTAGTACTTACATATATCAG:1 - chr2R 16673765 3' - R2-element 3209 1 68.35 ATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGTTCTAGTGCA:1 + chr2R 4261974 3' + invader4 2988 2 50.68 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCACTTTTTTCCTCCTTTA:1 + chr3R 8709848 3' + jockey 4982 1 58.89 AGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACAGACGCAGGGCAAGTTTGACCTACGTTGCCATGCCCACAAACCGTGGGAACCTGTCACGATCACACTTTTAAAAAATACGAACTCCCCCTTTGTGTCCACGACCGACCACA:1 - chr3R 6969878 3' + INE-1 172 1 77.40 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACTTACCTCATTCTATAATATTAAATAGCACTCCGTAGTTCGTTTACCTGTCGAAAACAACATCCGAATGCGAAAAAATGTTCAAAAATAA:2 - 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rover 181 2 60.96 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTACCGCTCTGCTTTTGCCACTTTTATTGTTTGTCTGGTGTTCTGCGA:1 + chr3R 9190626 3' + Tabor 7293 2 63.19 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACTTGTGTCTCCAATTTACCAAACTAAT:1 - chr3L 4620916 3' - FB 23 1 67.57 TTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGAGTAAAAGTTTCAATGACATTGGGGAACAATGAGGCGG:1 - chr3R 11024751 3' + F-element 4461 1 67.27 TGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGAAAATGACTTTTCTGCTCGACTTTGTTT:1 + chr2R 17890976 3' - Tabor 6895 2 54.11 ACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGTACGCGTTGCCGATTGCATTTATTATTACACTGCGGGCGCCAAAAGATTTGTGCAGTACAATGACAAACAGTG:1 - chr2R 4362507 3' + gypsy 7426 2 51.72 TATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGTCCATTCTACACCCACAACTTCCCAACCACACACTATTGTAAAC:2 - chrX 22252752 3' + diver 6035 2 68.49 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATTTAATGATCATTTAATGATCTGCCCGACAGGG:1 + chr3L 15100028 3' + copia 200 2 78.08 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTATGTTCCTTATTAAACACATTTCAACGGGTATATAAGTTTTGTTAAGGGGTAACTGTAAGCCGGACCCATTTAGCTTA:1 + chr2L 8542068 3' - pogo 32 1 47.14 GAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGG:1 + chr3L 22648360 3' + Tabor 399 2 73.97 ATTGTGGAGTGAGAAATGATTTTGCCAACTTGTGCCAAAAACTAATAACTGATGTGTTTAATTAATTCGATGTTAGTAATGCCTTTTGCCTTATGCTCTTTATAAACAGATTAAGAACCATATAAATCGTTCAAAGTTGC:1 - chrX 15138169 3' + transib3 404 1 72.86 ACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTT:2 - chr3R 18346608 3' + INE-1 540 1 50.00 AAATATATATATAATATGTATGTCCCATTTAGCACCATTTCTTGCAATTTAGTTCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGTCACCGAATCGATGAGACGCACGAAAATGTCCTGCTCCTGGCGA:1 + chr2R 14793532 3' + Dm88 7 2 62.86 ACAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATCCATTTCTAAGTGGAAATGTTCCGGCTGTTCTAGCTCCAACTGATGATAAGCAGTTTTAGGTATAATCGTGTGGAGTACTTTACTCCGCTTAATTTCTTCA:1 + chr2R 490614 3' + Bica 141 1 62.33 CTCCGCCCCCCTCCCCCCCCCCCGGAAAATTCGTATTTGAGTGG:1 - chrX 3554534 3' + accord2 223 1 52.27 AGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAAT:1 + chrX 16384072 3' - diver 5973 2 73.10 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGTGTCCTTCACAGTCACAGTCACAGGCACACACACACACAGTCGCACATTCACACACACATTCGCAG:1 - chr3L 4001072 3' + hopper 1365 1 54.17 GCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGGGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTACGAGTGAAGTGTGGTGAATGTTGCCGGTGGTTGTGCTGCTGCAGCGTCA:1 - chr2R 8807449 3' + Quasimodo 7092 2 63.16 AAATAAAATCAAATAAAGCAAATTAAATAAGTAACATCCAATCTAAGTATTGAACTATAAAAATATATTAGTTATATGCGAAGATAACTAAATACTTCCAGTGCATCTATGGATTGGGACCCAAAGAATGGTTGATGCCGATGCAG:1 + chr3L 18322052 3' + TAHRE 29 1 54.79 AGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATATTTTATGTGTACATAGGTCGAGGGGAACCAACCGAACGTGTCAAACAAAGCCAACGTGAATATAAAAA:1 + chr2R 20489476 3' - 3S18 5815 2 54.86 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTTGGCAAGTTCTGCAACATTTTCC:1 + chr2L 5202578 3' - 297 6632 2 60.80 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGA:1 + chr3L 10144728 3' - blood 84 2 81.25 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCAGTTCTCTGACTTACACCCCACTTATTTAATTTGACAATCATCAAGTCCCGTACAATT:1 + chr3R 26191691 3' + hobo 2924 1 50.59 TAGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTACGACTTTTAGGGGCAGTCCGCCCCGCCCATCTCCAACCATTCCC:1 + chr2R 11057350 3' + pogo 2031 1 67.12 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTAACTTTTCTG:1 - chr3R 16181137 3' - roo 65 2 63.01 TTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTC:1 - chr2L 13792593 3' - F-element 79 1 69.92 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGGCCAATTAATTTCGTAAAATTAGTCAATATGC:1 - chr2L 3890130 3' - jockey 66 1 56.85 CGTCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAGCTATTGAGCTAGAAAGTTGAGATTAAGCACACATATACTAGATACACTATAGATGCCATTTACCGTGCCCATCATGGGACGTCCTGAATCGGTTTTTAAATTTCAATCGCATGCTGC:1 - chr3R 3852396 3' + INE-1 132 1 58.90 ATAGAACTCTAGGGAACTGCCAGTAAATCCCTTTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGTTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAACAACAAGTGCAGAATCGGAGCGCAACAAAATCGAAAACTATC:1 + chr3L 14225850 3' + Porto1 4281 1 71.03 AGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTAGAATGCATGATTTTGCCATGTGAATCGGATAATATGA:1 - chr3R 25521065 3' - Doc 285 1 73.04 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAATTAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGACCCCATTTCCAGTTTTGTATTTTTTTTATTATTATT:1 - chr2L 13927684 3' + roo 9047 1 63.50 AGGTGGCATATATAGGTTTATTACAGCTCGCTCTCCATTTTTTTTTTGGGAGATCAACGAACTGCTTTGAAATGCTTTGCACCGATGACGTATCGGCTATTTGCAATTTCACATAGTTGCGATTGCGTTT:1 + chr2L 9237637 3' + blood 374 2 80.00 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGCACGAATTTCGGGGTGAAGGC:1 - chr2L 9237481 3' - blood 48 2 51.37 GCTGGTGAGACCTGACGAAGAGCGCAAGAAGGGGGTTCTTAACTTATATTACAGATACGCTGTTTTAAACGGTGTATAAGACTCGAGCAGTAATAAAAGATCATACAAAGAAATAAACGTATTAAAAA:1 + chr2R 641979 3' - opus 23 2 60.94 ATAATAATAATATAATAATATCTTCATCTAAACATTCGCATAACTGCCAAACTACCGCCTGCAAGAGTATTTCCAACTTCCCAACCCGATTATATCCTTTCTTAATACATTTTTTTTTACTTCCGGAAGTGCGTGCGCCTC:1 + chrX 13977314 3' + invader3 5049 5 73.76 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAACCCTGACTTCAAAGGTCTGCAGACGAGACAAAACATATAGTTCAGG:1 - chr2R 11489123 3' + mdg1 412 2 78.08 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAGATGTTATTATCTTTCTATTTTCCTGAATAACGTTTTGGGAGTATTAATTTATTTGTGCGTCCACAGGCACATTCTCTAG:1 + chr3R 3320930 3' - opus 7023 2 65.04 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTCATATTGTAATAAATGAAGGAATACCACACAAATATT:1 + chr3R 16913479 3' - pogo 28 1 62.12 ATTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAACTTTATTGCTCCCATTCTAGCAGAGTCCCGTTTATAGATAAATTCATCTATTTCGAGTTCTGTTTGTTGTTTTTGCGGCCAGAATCGCATCT:1 + chrX 5126085 3' - micropia 5217 2 70.45 ATATGTGTTAGCGTCTTTTCGCTTTTATATGATGCTTGAATTAAGGCTTGAATTTTTCACTTAAACTTCGATATTAACTGTAGCTCTGTTAAAAACACGTCCGTCCATAGAGACCATCCTTAGCATGGTCTTCATGGGCGCAGAAG:1 + chr2R 6883739 3' - Porto1 102 1 71.92 CTCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTT:1 - chr2R 21402597 3' + mdg3 221 2 51.85 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGGGGCGGACTTGTTTGCCCCAGTGGCTTC:1 - chr2R 6842788 3' - roo 8717 2 72.48 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTAT:1 - chr2R 11057279 3' - pogo 60 1 74.38 ACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAA:1 - chr3R 9190518 3' - Tabor 82 2 71.23 GCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATACATGTACATCTCTCTGTTAAATGCTTTTAAATCACTGAAATGAGTTTTGAAATAATAATAAGTACAACATTTCTATCACAGGATGATTAGAAAAATTATATAGTGGCG:1 + chrX 22901631 3' - Idefix 11 2 63.01 TAGTATATTTGTATATTTATACAAGGTACCGCGGAAAATTTTTTTGTTTTTTTTTTGCTTTATTTAACTTTAAAAGGAATTCACAAAAGGGTAATTTTTTGGGGGAAATTTAAATGCAAGTGCTAGCATCCAACAAACTTATT:1 + chr2L 14828261 3' - Stalker 91 4 84.62 GTTGCATGCATTGCCTCATAGTTGACATCCATATCTCCATATTGGTTTCAGAACTGTGTTGTATAACAGCACCTGTAGTCGAAACTTAGTGGAGAGCGTGAGTTGCTAAGTTATTATCAAAACTCCATCAAGGATTCAAATGAACC:1 - chrX 5897238 3' - Doc4-element 2616 1 75.34 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCGAAGAAGGCCCAAAAAGAGCAAAGCTGCATATACACTGAGGAAATTGCATATATCAACCAAGGTACGCTCACATATG:1 - chrX 14951088 3' - P-element 44 1 55.48 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTTAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCCAAAATATTTGAATTATCAGTGTGGCCATACTGCGCAACTT:1 - chr3R 11750130 3' + Tabor 7305 2 70.55 AGTGTGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAAACCGTCTTGTCACCTTAAAACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTTTGAG:1 - chr3R 28349570 3' - Transib-N1_DM 226 1 48.28 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATATCTTAATATATTTGGGTAATAAATTAGATTTACTTTATATTAAGCATATGGTATGCAGTAGGCAC:1 - chr3R 25768768 3' + copia 5069 2 57.53 ATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTGAATCAGGAACAATACAACTTTCTACTACTTTTATGCATCACTGTCTCTTGTTTAATTTTAGATCTTAGAGTAA:1 + chr3L 24191367 3' + 17.6 7271 2 49.32 GAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACGCAG:1 + chr2R 4313057 3' + gypsy 405 2 50.68 AATTTGCGCAAGAATGTAAATAAAAAAGGATAACATGAAAAGCTAACGGGATTTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGT:2 - chr4 123994 3' - HB 173 1 76.03 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTAGAACCCATTTGCTCAACAACATTACGCCACAATTCACATACACGATAAGTTTAATTCAAACTAAAACTTTTTATCTTTGAATTAGTCAAGTA:1 - chr3R 24279292 3' - roo 8692 2 65.07 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATTTAATGATCATTTAATGATCTGCCCGACAGGGGCTTCGGATAGGATGAGATGAGTACGTATGGGTATTGGTCCTCCGCAGT:1 + chr3L 15100077 3' + copia 249 1 55.48 TATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGGGGATTGGGAGAAATTGGATGGTGGAGCGG:1 + chr3R 27606484 3' + jockey 4574 1 75.00 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAATACACGTTTTTATAGACTTATATGGAGTGGTAAAAGCTGCAGTCTCCAGGGGCCTTTAGTT:1 + chr3R 27478585 3' + hobo 2910 1 55.56 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTTTTGTTCTCGAACTACATTCATGAACTATTTCATCTCAACTTTTAGGAAAG:1 - chr2L 17029538 3' - blood 7020 2 76.03 ATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATATTTTATGTGTACATAGGTCGAGGGGAACCAACCGAACGTGTCAAACAAAGCCAACGTGAATATAAAAAGCG:1 + chr2R 20489479 3' - 3S18 5803 2 56.30 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATTCACTTTCAT:2 + chrX 12866493 3' + roo 351 2 57.53 GCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTCGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTA:1 - chr2R 22723016 3' - 3S18 55 2 52.05 GATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTTTTCGGCAAACGATATATTCTTCCCCCCGTAGAGGTTCCCATCCCTCCGAAGGCTGAATGCATTTAACTCTCACCAAATAAGAGTAATTAAAATGTTTGCAAGCTGAATAAATTCGA:1 + chr2L 18330611 3' - Transib5 2861 1 58.16 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGGCTAATACCA:1 - chr3R 17605589 3' + Tabor 7306 2 71.23 GAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCTTATAGTATGTAAAGGCATGCTTGTTT:2 + chr3L 23702315 3' - G4 3 1 79.45 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACA:1 + chr2R 10695880 3' + roo 352 2 58.90 CAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGTACCAATGCCTGTTGAGGCGGTAATATTCAACGCAAGTAC:1 + chr3L 12976362 3' - invader4 2793 2 46.38 TTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAG:1 - chr2R 641879 3' + opus 415 2 76.03 AGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGGTTAATAGGGGAATAGATATTTCGTATTGAAATGGAGATGATTG:1 - chr3R 4546466 3' - Quasimodo 148 2 68.35 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTGTTTACA:1 + chr3L 27415337 3' - transib2 39 1 58.90 CCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCATCATTTCACGGAGTATTGGGTTCTTTTGTCGTCAAGCCATTTTGCAAGTTTAAAGATTTCCACGAGCATAGC:1 - 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chr2R 5917847 3' - I-element 5141 1 79.45 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATAATGTGTAAATAGAATCAAAATTGTTGACTCGTGCAGGACA:1 - chr2R 18482396 3' + hopper 1390 1 52.85 CGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGGTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGAAAACCACGTGTGCAAATTGAGTCTCTTGCGACGGGTGATGATGGCGTTGGACCAGCCACGACCAGCGACTTCTTCTCCTCTACTTTCT:1 + chr2L 11043131 3' + transib2 2667 1 50.68 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAATATAGGATTGTTGCAGAAAAAAAAAATAAATTGAAGTG:1 - chr2R 10695751 3' - roo 8701 2 60.27 GTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGATACTTTAAATCAGCAAAAGGTCTTAGGAGCATAAATTACAAATACGTCTAACTGGGCACTAAAAAACCAAATTAAAAGCGGCTACAAATAT:1 - chr2L 5601519 3' + mdg3 219 2 64.83 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGA:1 - chr3L 17175136 3' - 412 79 2 70.83 GCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTCCTTGTATTCCCAGATTCTGTGTGAGTGGCCTGCCTGCTGTTATTTT:1 - 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mariner2 249 1 53.42 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTCAGTTAAGCTTTCTTTTATCTTATCGGTTAATGTCTG:1 + chr3L 18658968 3' - roo 8736 2 75.19 GGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTTGTTTTGCTTCTTATGAAACCTTTTTCTTCTCCACTTTTAATTTTCCATTCTTGTTTG:1 + chr2L 18622250 3' - roo 424 1 63.01 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATA:1 + chr2L 16884902 3' + pogo 2037 1 63.45 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCAGG:1 + chr2L 246120 3' + roo 393 1 73.23 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAAAAAAAATTATATAACGTGTGAAAAACTTTTATGGCCCTCGAGTGCAGTTGAGCGCTAAAATTTGTTTGCGAACACACATGCAGCAAACGGGGCACCGCC:1 - chr3R 6244458 3' - Doc 24 1 67.12 AACGACCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGATGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGTAAACTAATAAACAAACAATTAATGTAAATTGCGTGAAAAAGCAAGCAAATACT:1 + chr3R 23818166 3' - 1360 3361 1 63.01 AAATGCTGCTAATACGGCCGATTTGATTTAAGAATTCGAAACAACAACAAGTGTGAGAGGCAGGGGTTGCCTGACGTAATTTAAAAGGGGACATGCAGCGTTTCCAGTAATATTAATATTTTGAACACTCCTTCTCCAAGCTGTAT:1 - chr3L 24000390 3' + blood 443 1 56.16 TTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAATTCAATAAATTTGCACAGAATTTTTCAACAATGAAAACAAATTTTCGCTCTTTCGCTGCTTGCATTCTTTGGCATCGCCATAAGGGGAAAATCC:1 - chr3L 1404965 3' + Ivk 5351 1 68.49 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTC:1 + chr2R 8641607 3' - diver 54 2 52.74 GAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTCTCTATATGACTGCAAGAAAAAATCTAACGAACTAACACACCTTTATTTATA:1 - chr2L 11574800 3' - Max-element 47 2 51.37 GAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATC:1 + chrX 22900311 3' + Tc1 1547 1 76.71 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACAATGAAAGCGATGGAGAGAGAACAGGAAAGCCAGGCTAAACTGATTTAACTACGCACAGATGTGGTCATCTGAATAGGTTTCTTAAAGTTT:2 - chr3R 25387738 3' - roo 8693 2 67.81 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGAC:1 + chr2L 16458667 3' + roo 8995 2 71.03 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGTGTTGCGCAAGCGTCTCCACTTTTATGTGCAAGGGTCAAAAGTTGTTTTGTTTACAACATATCATTGCACTAATGAAGTGGTCAATACT:1 - chr2R 5737079 3' - 1360 27 1 66.44 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACAGCGTTTATGCTGCTGGGCTGCTCCTGCAGCATTTGGTGGCCTGATCCTATTCCTGGTCCTTAACCAAAAACGCAAGGGCAGGGCCATTCGTGTGACAGG:1 - chr3R 27822159 3' + I-element 5342 1 79.29 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAAAGCCCATTAAAGTG:1 - chr3R 30634902 3' + roo 9043 1 66.19 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAACCCTGACTT:1 - chr2R 11489160 3' + mdg1 7413 2 54.11 TTTTTTATATCGCGTCTATATATTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATTTAATTAAAAACAGTATGTCTTTATTATTGATGATAGTGCTTAATTCTAAAAATTCGTACATATGTTCGTCGGATAATAATTGTATCTCTTGACTCTCTA:1 - 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BS 66 1 67.12 TTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTCGTTACGATATGTAATGTATATGGAGATGTATATGTATATGTATGTA:1 - chr3L 1117397 3' - S-element 73 1 70.55 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGCATTTTTTTTTTCCATTTATGTAGCAATTGAAACGAGATCCCACCATGACGATACTGACTCTTTAA:1 + chr3L 16580398 3' - 412 7076 2 69.86 AATCGCAATAACATTGTTTGCCAAACTTTGCCCACCCTGTAGATTTTTGAAAAATATGTTTGTTTTCATCATTTAACAACTGCGATTCCATCTAAAAATCAATTAGAAACTACCCAAAGACGTTTGACTTGATCGCAAAAGGGTTA:1 - chrX 19500436 3' + FB 198 1 63.70 ATAAATTTAAAAAATTAAAAAATGTTGAATTCATTTTTAAAACAAAAACAACCAGTTTGCATTGTCACGCCAAGTCACAAAATTACTTCTAGACCATAAATATTCTGTTGACAACTCGTCCGGAACTAGCTTTTCCATTTTCACTT:1 - chr2L 21318005 3' + HB 318 1 70.55 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTCATGTTTACCGAGGTCAGAATGCGAAAAGATATTAGTTCTTAAATTTTAACATCTCTTTCTCTTTTTTATACATGTATGTACATTAT:1 - chr3L 14076171 3' - roo 8697 2 64.38 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATGCCTCCTGTTTGTTTTTGCCGTCTGCTTGATGCTATTCCGGCTGCTTTTCCGGGGCTTTACACGCCGCACT:1 + chr2L 18317555 3' - mdg1 17 2 66.96 GTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATGGTATATAAATAAATCCTTCGAGCATTCCCATTATGTAATGGTAACATGGTAAATA:1 + chrX 10161197 3' + micropia 5388 2 60.14 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGT:1 + chr3R 9160781 3' + copia 205 2 48.63 ACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCAAACGGTAGTGATTGAATGTGTGTAGATTACCGCCACCTGTGTAAGGTGATCA:1 + chr3R 4562416 3' + copia 189 2 64.38 GAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTATGGGTTTTTTGCCTAATTAAACGCATTTTATTTATAACTTATCGAAACTGGTGCGAGGACCAGGATGCATAGACACCCTGATGGCCACCACAGTGCCGGGTCGTAGAT:1 - chr2R 21317193 3' - S-element 1685 2 51.37 CAAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAAACGATAAATACGAGCGTAAAAATGGATACAAATGCTAAAACATCCTAATGAGTAAAAACAAATCATGAAGAACCACTCCTAAAAATTAAATGTATATTATAAGCAACCAAATAA:1 - chrX 10794182 3' + G2 3077 5 70.55 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAAATATAAATTGTAAGAAAGTTAAATCGAAATCATTAAATCATCCACTTAGGGTCTAATAAAGCCCTTAAAAAATAAGAATATTTTCGAAAGAATAA:1 - chr3L 19482906 3' + pogo 2079 1 70.55 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCA:1 - chr3R 9160657 3' - copia 4898 2 61.72 ACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCTATTTATAATTTTATGTAAATAAAAG:1 + chr2L 21570284 3' - Dm88 43 2 56.16 GGCTGGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTGTATAAACATTAAGATGAATTTAATTTTAGCACTCTGTTGGTTGTTCACACTTGCTGGAGGATCTTTATGTGATTTTTGGCTGACGTCCGACTTTATT:1 + chr3R 22334110 3' + invader2 4866 2 62.07 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACCTGACGGCAGATTCAGATACACCTTTCAACTTTAAACCATTGGCAACGTGCGTAAACCAATGGCAAT:1 + chr2R 12240191 3' - copia 4897 2 59.66 GGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTCTTGACCGTTTGGTTAGCGTTTTTTTTTGTTATCCACCTTCTGTCATCTCGCTCGCACACTT:1 + chr3L 16769983 3' + Circe 7198 1 68.00 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATACTTACATATATATATACATATATCCCGACCATCCCCCAAAGAACCCAAATTACTTGACACAAGACGGTGCACAA:1 - chrX 6138607 3' + opus 7456 2 61.64 ATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAAACAACACACACCGATAATAATAATTACTCGAAACATTGTAATCCTCTTA:1 - chr3L 9908306 3' + jockey 4820 1 66.44 GTGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTAAAATGCGAAATATTTTTTTTGAAATACTTTTAATGTTAAATGACTTAATTTCACGTGTGTGCCTATGCAAATGAGGCACTTGAGC:1 + chr2L 3309692 3' - 1360 3215 1 74.10 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTCGTTTCGACCAGGCTAATGCATAGCGCAACAAAATCCGCCCACAGATAA:1 - chr3L 19785301 3' - FB 46 1 62.18 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAA:1 - chr3R 19589891 3' - BS 5034 1 55.48 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGTGTCTTTTAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTG:1 + chr3L 7093064 3' - hopper 30 1 56.57 GTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTATCTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTCTGAGTCCAAGAAGATTAGCAGTGACAACAAGACACGTAAATGTTTCAAGTGCGGTAAT:1 + chr3R 1326602 3' + Cr1a 4109 1 59.59 AGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAGAAATTATGTGGACAGTGGTTTCCAAAGGCAATAACTTTATATACACTAAAGTTTAGAATGAAAAGTTAAAGTG:1 - chr3L 15026631 3' - opus 144 4 57.04 TAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTATCAAGAATATATATAGTCTATACAAGTT:1 - chr2L 13154257 3' - Juan 78 1 67.81 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTATCCTGCTGTTTGTGCATACTAATAGTAGAGTTAAATAAATATCCACACTCTCGTTAATT:1 + chr2R 22306089 3' + pogo 2043 1 60.27 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATGAAATCACGAAAACGAGTATTAAAAATGTATTATTATGAATAATGTTTATAAATGTTCAATCTCTGTTGTTGTTAT:1 - chr3L 23986493 3' - opus 147 4 56.03 GATACAGCTTGCCGTCTTCCTCCAAATAGTCCGGGAATTTTTGCGGCTGCTGCTTCCTTCGCATCAAAACTATTCAAAGTAAATATAAA:1 - chr3L 186453 3' - Osvaldo 391 1 65.17 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGC:1 + chr2L 4174053 3' + roo 9001 2 65.52 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATT:1 + chr3L 19349999 3' - jockey 76 1 58.22 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAAATTTCAAGAGGCCAGCACCCGGCACTCTAAC:1 - chr2R 21371462 3' - roo 8750 2 80.14 GAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTTGAAGACGAGGTCAACTCATACTTTCAGCGCATCTACAACCACCAGCCG:1 - chr2R 9573441 3' - 412 484 2 60.80 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGCATG:1 - chr3R 12599030 3' - 412 7122 2 63.70 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCTTTAGTCCCTTAAAAATGGAGGCTCTTCGCAGTGGGTATTCTCGGGTTACCCGAAGTACCTAAAGTGGAAAGCCGACCCCCCGCTTATATTT:1 + chr2R 9873754 3' + roo 9044 1 64.83 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAA:1 - chr3R 10684744 3' + roo 335 2 68.49 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAGAAGTAAAAAATGTGTCAGGCCGAGGAACGATTC:1 + chr3L 22978678 3' - 1360 15 1 74.66 GTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGTTTTTCTGCAGGGAAATAAAA:1 + chr2R 10695929 3' + roo 9065 1 78.08 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAACCCCAAGGCGAAAAATTCCCTCGCG:1 + chr2R 23116153 3' - jockey 85 1 78.46 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTTAGGTATATTGTTGTATGTAAG:1 - chr2L 14185962 3' + pogo 2065 1 44.52 AAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATAACAATCGACCGGCTCCC:1 - chr2R 1921412 3' + mdg1 7455 2 69.57 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCGGGTGGCACTGCCGACATCTATTTGTGCGCCTGACCTTGGGG:1 - chrX 1287758 3' - jockey 4801 1 67.81 GGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAGGTCATGCGAGG:1 - chr2R 16403416 3' + copia 251 1 67.09 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAATTTGTGGGAATCTTTTCATTTAA:1 + chr2R 5237940 3' - Doc 38 1 64.38 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGATCGGAGGCCTA:1 - chr3L 22900095 3' - 412 70 2 67.36 ATTATAAATTGTTATAAATTATGTTATGTAAATAAGTCAAACATATATTTCCTATTAGTCATGGTTAAAAAACTTCTAAAATGTAGTTTTCCATTTTTTTATATTATTTTTTTGGCATTACTTTATAGTGACATTTCTTACATAC:1 + chr3L 12639196 3' + S2 1455 1 87.59 AATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGT:1 - chr3R 21276556 3' - BS 5058 1 68.55 GCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGTGTTTGTCTGGCGTACAAAATTACAGCA:1 + chr3R 11547830 3' - G2 285 1 77.24 AAGTAACCAAGACACATTGTAGAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAATAAAATGTCATTATGCGCTCCCAAAAGTATGCA:2 + chr2L 3890196 3' + jockey 4910 1 79.45 AGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCCTAAGATATTATGTTTTTGGCCTATGTATTCCTTCGCTACAAACAGACA:1 + chr3R 15338115 3' + blood 305 2 69.18 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTATATTATAATTTATGGCGCGTATTCCGTTAAATCTACGAGACACTC:1 + chr3R 12568935 3' - hobo 67 1 67.39 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTGTGGCAAAGGTAACTGCCTTTGTTAACATTCGG:2 - chr2L 12079606 3' - mdg3 5314 2 56.85 TAATTTTAATTTAATTTTAACTACTGTGACAATGATCGTGGAAAACTTAATTGGAAAACTTAGTTAATGATATAATCCATTGAGGAATTTAATATATAATTATTTTAAGGTGGACTGAATACTTAATACAAATAAGAAGAACACAA:1 + chr2R 3536097 3' + Rt1b 123 1 63.01 TAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATT:1 - chr2R 19554937 3' - pogo 48 1 59.84 TAACAATAATAAATTTAGGTTCTATCTCCGCGTTCAAATTTCTGCATATTTGTGTCTTTTAATCGCCATTTTATTCGACTAGACATAATTAGTTTGATTTTATTTAAGTGTGCGGTTTTATATTTGAACCCTTTTATTATTGTTTA:1 + chr3R 18550081 3' - I-element 247 1 65.07 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAGTGTCGATTACTGGCATACTCGTTGGTTGCATATCTGTAGGCTCAATTACACGGTAATCCACAC:1 + chr3L 22642956 3' - hobo 25 1 65.69 ATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATTGTATGTGATTGGAGGGCGATGCAATCGTCTAGGATTTGGGGAATTGTCG:1 + chrX 21084007 3' + HB 297 1 55.81 ACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGCTTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTC:1 + chr3R 13176425 3' - Burdock 77 2 75.00 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAATAAATAAATAGTTACGTGATGATGTTACCCTGACTGAGTCAGTGACTGTGATGATTTTCGTGTGCGAATTGGGAA:1 - chr2L 7825194 3' + I-element 5305 1 54.11 ATATTTCAAAAAAAGAAAAAAAAAATGGCAAATACCCTCTAAAGGTAGCTCCTTTCCAAAGTTTATGTACTTTACGAATGAATTCTTCTTGTGCTTCACTTACTTACTAAACCTTTAATTTGTTTAATGTTTTATGTACATTTTCC:1 + chrX 5717108 3' + TART-B 10631 1 60.27 TATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTGTGG:1 - chr2L 12079635 3' - mdg3 5343 2 76.71 TGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGGACGATAAGCGTTTGTTCCTA:1 - chr2R 558122 3' - copia 4920 2 77.08 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTCGGACAACA:1 + chr3L 12867352 3' - roo 8723 2 69.60 TTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCGATGTGGGACGATACATTTAGTTGATTTTTCACT:1 + chr3R 26520496 3' - FB 11 1 71.67 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATCAAAGTCAAGTTACCATGGGCGGCCGGCGTTTTCCCCTCTCACGGAAAAGACACTTTTCCCCAGATCTGTGC:1 - chrX 18933504 3' - FB 22 1 63.25 ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTCCATTG:1 - chr3R 28627602 3' + copia 5055 2 64.38 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTACAGCTCGTATTTCGACAAATTGATTTCACACACAATTCAG:1 + chrX 4186745 3' + I-element 5335 1 68.55 CAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTCGGCGGAAACGGAAGCTGGCAAAACAAGGAACGTTGGGCGACAAAAACAAAAGGAAAAACAGGGGAGTGGAAAAGCTGCAGCTGCAA:1 + chr2L 20594633 3' + I-element 5102 1 62.50 TACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGGCAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATCGCTAATTCGGAGTGAGAACCTGACGAAATGGAGAA:1 - chr2R 7665765 3' - Transpac 81 2 73.79 TGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGTCATGTCCGTCCGTATGGATTCCCTGGAAACTACAGAATGGCCGACCAAAATCGAAGTCTAAACCAACGGACAACAGCAAGAGTGCAACCGCAGAGCGAGAACTTAGAAGGAGACA:1 + chr3R 12320087 3' + INE-1 91 1 41.10 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAAGGTATATCTACATAAATGAACTAATATTTTGCTTGG:1 + chr3R 29645757 3' - jockey 89 1 73.29 GCCTCTGGCAGGACACCAGATGCCTCATGGCAGAGCTGGGTCCATCATACCAGACCAATTCACCAAACAAGTAGGTTACTTATTCTTAATTAGCCTTCCAATTTTCATATGATCTCAACATGTCTGAGAAAACGCAC:1 + chr2R 5149303 3' - R1-2 3125 1 51.82 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACA:1 + chr2L 22016021 3' - Tirant 8118 2 72.97 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAA:1 + chr3L 19349988 3' - jockey 87 1 65.75 CGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTGAGTAATTGCACAGCAAATAACCTCCAAACTTTAATTGCGTTGCTTAATATATTTTTGCCCCACCT:1 - chr3R 6111279 3' - Idefix 7068 2 54.79 AAAAAAAATATTTTTTAAATTTCATTCTAAATTAAGATGAAAAGCTGCGAGTTTTTAAATTGTTTAAACTGTTAAAAACTGTTTAAAATGCCACTATACATTTCATTATTTATATGTCGATATTATTTCTCTCTGTGCAGCCCTA:1 + chr2R 18695102 3' - Transib5 2727 2 53.10 CAGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTTACGCCCCGAC:1 - chr2R 4260422 3' - micropia 5205 1 41.61 AATAAATAAATCGCATAAATGGCCAATACTCTTTCTATTTTTTCGCACCCACCACATAAAAGTGAATCGAATTGAAATTGTTTATTTTTAAATTGATAGGAAGTACACGCCAAAAAAGCTTCAAAGTGGCAAGACACGATGTATTT:1 - chr3R 25933474 3' + G3 352 1 70.55 GAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAGCAAATGACCCATAGACAATAACATTGGAATAAGTGCTCAATC:1 + chr2L 13551878 3' + micropia 5276 2 70.55 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATAATGACCGGCATTGTGGGGGCTTGGAATTGAAGAGAAGTGATTGCAAGTAGTTTTCTGCGAAGTAGTCTATAGTGAAGGTTTATCGTCTAATAACTT:1 + chr2L 436594 3' - copia 4894 2 67.81 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTTTGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATCAACGAATTTAATTATTATAAATAAAAAACAATTGGAAAATGATTACATTTTAACAA:1 - chr2L 21367218 3' - Doc 70 1 60.27 ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTATTTATATACAACGGCCCATGGGCCGCAAATAAACGAACAACAGGCGTCGATG:1 + chrX 14559357 3' + 297 334 2 65.75 GAATGATGTCAATATTGCTATTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTTGGCCTAGAACGCTCAACTAGAAGACTTAAAGAAAAATCCAGGAAAATGCAT:1 - chr2L 12821655 3' - F-element 4301 1 64.38 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGTAGACACAAAACTATTTATGCTAACGGTAAGATAGGACCTCCTCTCTCTCTCTCTCACCCACACACACACAC:1 - chr3R 6067031 3' - P-element 33 1 54.26 AAAGAAAAAAACTTTTAAAGTGCGCTCGTAATGATAACTATGCCAAAAAACAGATTTGCTCATTTGTTTTGTGATATCACCCCAGAATGCTAATTAATTTCAACTATTTAGACGAATTTATTTATTTTTGCGTATGTTATAAGCGA:1 - chr3L 12951980 3' - FB 877 1 58.90 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAGTCACCGCTTTTTAAAATAAAACCCAAACCGGAGCCCATC:1 - chr3R 26191626 3' - hobo 51 1 65.25 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCT:1 - chr2R 5922955 3' + jockey 4950 1 51.80 TGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTATTTTTTTCTTATATAATAAAATTTTGTTTGGCCTTTTAGTTAACACTTTATTTTGTGTGTGCACCACAGTTGTTTCTTGTTTATGGCCATCGTCG:1 + chr3R 30295237 3' - Quasimodo 20 2 50.00 AGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAAC:1 + chr3L 11257382 3' + 1360 20 1 50.53 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGACCCACTTGGATTTGTCT:1 + chrX 5150405 3' + roo 9038 1 61.54 TGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAATTATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCCGGCATTAATTAAAATTTGCTTCAAATTATTTCCCAGCG:1 + chr3R 27859257 3' - hopper 77 1 66.44 TAATAACAACACATAATAAAAACCTAAAGATTGATTATCTATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTTGACAACATATATTACATATATGTACATATATTATTTGGTATTCATTGAAAAGTTCTTCGGTGCTT:1 + chr2R 5308312 3' + hopper 1124 1 54.79 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTCTGATAAGTTTTTCCTTTTT:1 - chr3R 20175654 3' - hopper 17 1 72.03 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACATA:1 + chr3L 14551065 3' + P-element 2839 1 46.58 CCAAGAACAGCAAAGTGAATTCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCAGAGAGAGCGACTCGAAACTCCAGCCCAAATGACGGATACGGGTTTGACAACGAATCAAG:1 + chr3L 3984555 3' + Stalker3T 267 1 60.53 GCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATGGTATATAAATAAATCCTTCGAGCATTCCCATTATGTAATGGTAACATGGTAAATAAATGGATTTTAGATTTAATTTCT:1 + chrX 10161220 3' + micropia 424 2 59.29 GTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCATACTTTCATTTGACTTTGGTCACGATACAAAACGTTTATTTTG:1 + chr3R 17897200 3' + hopper 1342 1 64.83 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGTTTTTTTTGCATATCAACACACGTGTAAAGCAAATGTTAAA:1 + chr3L 9571762 3' + jockey 4954 1 54.11 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTTCCCATCTACACTTGGCTTGGCCACTTGTCTATCGATCTGTTTT:1 - chr3R 13612816 3' - 412 76 2 67.81 AAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAATTTGTTTTTTGGCTCATTTAAATTTATTAAGC:1 + chr3R 9135668 3' - mdg1 7275 2 78.08 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACCCATTAAGTAACCCCAACTGATCGGCGCAAATGATTCAGCTATGCAGAAAATATGATTGATGATTTTTCCCTCCCACCA:1 + chr2L 12553533 3' - 412 41 2 57.24 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAACCGTGATATATTGACACGCAGCCCA:1 + chr2L 16458700 3' + roo 9038 1 57.78 ATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAATGGTCAAGTTATTATTACATTTCATGGTTTTTATATAGTCAGTGCTTTGTCAAGGGGCGTTGACAAATCATAGTACAAATTCGCGA:1 + chr3L 11776790 3' + mdg3 5463 2 58.90 TAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTGATTTTCTTGTGTTTATATCT:1 - chr3L 96454 3' + roo 403 1 78.52 TTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGA:1 + chr3R 11547798 3' - G2 318 1 54.79 ACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATTACCGATCTCTGGTGCTTAATATCCACAGCAAGAATG:1 + chrX 16858167 3' + Tirant 8247 2 70.16 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCATACTACTAACTAATGCTACATGACCCCG:1 - chrX 1103569 3' - pogo 18 1 71.92 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCCCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCA:1 - chr3R 19589929 3' - BS 5072 1 67.12 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCAACACTGTCGTTTAACTATTTCATATTAAGTTAATTTATTTATTATTGTTG:1 - chr2R 16441770 3' - I-element 25 1 68.49 GCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTTACGCTGAGAGAAATATAGAAATAGAATCCATTGGATGCATTTCTGATGGACATTTGGCTTCTGTTT:1 - chr3L 1915559 3' - 1360 3365 1 64.38 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACCGCAAAATCTATAAATAGCCGAACAGTACAATTAATTGATGCACAGACACAGTTTGGCATTGCGTGTGTGAGTATCT:1 + chr2R 21371571 3' + roo 9043 1 66.44 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTGAGAGGGGCAGTTCAGGTTCAATGCTGCAAATTATACGCGTTTTTGCGGCG:1 + chr3L 7093114 3' - hopper 27 1 67.12 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAAACGCACAGAAGTAGGCTTCATTCTAACACTTAACATGCTCGTTAA:1 - chr3L 12867265 3' + roo 9052 2 53.91 AGTGGAAGTGGCTGGTTTGGGCCACCCCAAAACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTC:1 - chr3R 21705982 3' - 297 18 2 58.00 AAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGCAGGCAGAGATATGAGAAGGCACATAGATATAATTTCAGATTTAGTAGACTAAAT:1 + chr2L 21584372 3' - Transpac 5075 2 54.17 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAGCTGTT:1 + chr2R 6632659 3' + P-element 2827 1 44.52 GCGTATACAGGGGGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAATTGGCCCAGTGCCCCAACCCGACCCAACTCG:1 + chr2L 16089729 3' - 3S18 8 2 76.98 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGC:1 - chr2R 19554902 3' - pogo 30 1 63.31 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGAATGCACTCTCTCACTTATCCGCTCTC:1 + chrX 14951172 3' + P-element 2811 1 24.62 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATTTTCAGCACCTCTTCCTAAGTTTTCCGGGCGTTGCACGTTGCCTATTGCAGCCATTACTCAAGC:1 + chrX 5858998 3' - hobo 50 1 52.52 TATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATATTTATTTAAAAAGAATTTAAGAACAGCTTTTGATAATAATAAG:1 + chr3R 25768854 3' - copia 4943 2 75.52 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACCATTTAACACTTAGCTTAAATTCGATTGCATCCGCTAGATTGTTCGCGGGATGTTATCGAACTATCGATGGCTC:1 + chr3L 19836537 3' - pogo 41 1 57.53 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCATACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCAAAGTGTAACACGCATATTGCAAA:1 + chr3L 20289157 3' - jockey 4696 1 52.74 GGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTCGCTCGCATCATGTCTTTGACAGGCACAGAGTTGATTTAATGAGGTTTGCAACTTATTATTGAAAAACAAGCCGTTCCCAACTTCTTAAATGG:1 + chr2R 4716628 3' - Quasimodo 6974 2 63.70 AACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAAAATGTATCTGAATCCGAGTATCCGCGTCTGTATGCAGACGCCTATTGCATTACT:1 + chr3L 22400553 3' - F-element 4563 1 62.33 CCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCCTTCTGATATACTCACTTGGTTATGGCCGGGGAGGTAACGAATCCGGGCAATT:1 + chr3L 18158036 3' + Ivk 4921 1 62.14 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTCGGACAACAAAAGTTGTGTTGCCGTTATTCATCGCTTCTTAAAGCGGCTAAA:1 + chr3L 12867395 3' - roo 8701 2 60.27 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCACATTTTCGTGCCACACGCCATTTTCA:1 + chr2L 7559767 3' - mdg3 75 2 73.85 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAGCGGTAATTGGTTGCCACCTGTATAAGTATGTTTCCAAAATGATTGCATTTAATTAACGTGGCAGCTTAT:1 - chrX 12138887 3' + roo 394 1 72.60 GTTATCTCTGTGTGTGTGTGTGTGCGCTGGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGGGTCATGTCAACCACTTGTTATTTGATATAGTCCGAGAAGCATGTCCTCGTGTCCAGAGCTTAACTGGGAAAACAATAAAATATC:1 - chr3R 22861983 3' - Quasimodo 40 2 51.11 CATTAATTAAAAAAAAAAACTTGCTTATTAGTTTCATATTTATACGTTCGGCTCGAATTTTAAACAAAGGGTCTATAAATCTGGAAAGGGGTAATCTGGTTTTTATATGAATTTTGATCATTGTATAATTTCGATATAAAATTTAT:1 + chr2L 13948258 3' + Doc 4588 1 81.51 AGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTAAAATATCACCTTGGCAAAACGGATAAGTTGGTATTGAATTTGGACTTAGGTAGTATTGGTATTGGTAGCACTTGCTGCGTTTCCCTCCGTATAATCT:1 + chr2R 1344744 3' - I-element 5047 1 70.23 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTCCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGAAGAAATTGAGACTAGCGTTTTCGATTCCAC:1 + chrX 1061597 3' + 412 7479 2 72.80 TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGT:1 - chr2L 2031053 3' - 412 77 2 75.56 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCCTATTTTTAGGCAGCGCATCCTTTGTCGCCCAATTTGGGAGTTAATCTGGTTCACGA:1 + chr3L 1630193 3' - jockey 4736 1 61.64 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTGCTTATTTGGGACTTTACACTCTGGCTTCAGGTTTCAATGAATCCGCCGTTCCCCAGAGATAACCTTCCCGACAACGTGGGCATTTATAAATAAACTA:1 - chr3R 23765340 3' + roo 9026 1 56.85 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAAACG:1 + chr3R 9352106 3' - Tirant 8123 2 66.06 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTG:1 - chr3L 17175131 3' - 412 76 2 67.81 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGTGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCAT:1 - chr2L 15987993 3' + roo 8995 2 72.03 CCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGACACGGACCAAACACGCATTTGCCATGCCAAAGGGACTG:1 - chr3R 20486324 3' + accord 7378 2 70.97 CATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAAT:1 + chr3R 14860244 3' - BS 5037 1 56.16 ATGCAGTGTGCTTCATAAGTGGGCGATCATATAACACTTCCACTTGAACATTATTGTTTATGCTACTTTCTGTAAAAAATCTCGAACAGTTCATGATGTCACTTTGTCAATGTTTGTGCCGTAAATTGAAAACTAATTTATAATG:1 - chr3R 26923967 3' - gypsy11 150 2 51.72 GATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAAT:1 + chr2L 16089699 3' - 3S18 27 2 61.72 CACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTT:2 + chrY 311341 3' - 1360 58 1 58.22 AGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACTGAGTCTCTCCGATTCGGTTGCATTCCATGCATTTCCAAGACTTTTCAAAAA:1 - chr2L 21093404 3' - 412 7506 2 73.29 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGAGTGTGTGCATCGAAATTATACCGAATTTCGATATACACAAGATTAGC:1 + chr2L 8366601 3' - 1360 70 1 66.21 GCGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATGGGTTTATTACAAAGGTCCTCCTAATGCAATTTGTCATTTTCGCATTTTGTTTCTCTGGCTCTCTGGCTTTTGTCTCAAATGCAATTTTTGGCATTCCGTTCACATAAATTAGGC:1 - chr3L 10144612 3' + blood 361 2 73.05 AATCAAATCAGGATAATTATCAGACTTCAGTTTCAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGTTTTGTAATCATTTACAGCAAGAGGGACAGCTGAATTATAACCAAGCACTTGATAAGCTGCATTTCGTTT:1 - chr2L 453255 3' + Idefix 452 2 62.33 TTTGTTGTATTTTTTTCTATATTCCCAACGAATAGATAGATATGGTGACAAAAAGTCAACGAACAGCGAAACAACGTGCACTTCAAAAAATTAAAAAAAAAAACCAAATGAATCTAAAAAAAGAACACTTCAATAATTTGAGAAAA:1 + chrX 5002908 3' - gypsy11 3929 1 52.74 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAATTTGCTCTCTC:1 + chr3R 23765439 3' - roo 59 2 67.72 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCGTGAATATTAGAAAAGGTCAGCCCATAACCATTACATATTTTAAAAATAGCTAGACAATTACATTTTTTTTTTAAATAGACGGATATATAGATATCCT:1 - chr3L 4187149 3' - pogo 21 1 68.97 TTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTAGTTTGAAGATATCGAAATCTCCAGAATTCGAAGGCATAGACGCTGCACC:1 - chr3R 3697427 3' - G4 90 1 68.49 GTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGA:1 - chr2R 16403428 3' + copia 172 2 75.34 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGTTTATGTATGTATATGGCTATATAGACTACAATCCCAAACAGAATCGGAGACATACAAATGGGTGGGCTTTGGAATATGATACATCTTGGCCG:1 - chrX 16828898 3' - Quasimodo 16 2 73.43 TTTCGCTCGGCTCTCAGTAGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGGGCACACCAAGGAACAGCTACGCTGATACCATCAGCCTGCACGCAATCTACTGCTTCGTACGTTTCTTTATTTTCGCCTCACTTGGG:1 - chrX 4438408 3' + accord2 168 2 64.38 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGCATGTCTGCTATCATTTAGTGAAGCAAACGAAATGGAATCGCAA:1 - chr3R 12598990 3' - 412 7082 2 64.38 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCGTGAATATTAGAAAAGGTCAGCCCATAACCATTACATATTTTAAAAATAGCTAGACAATTACATTTTTTTTTTAAATAGACGGATATATAGATATCCTTAGATAA:1 - chr3L 4187142 3' - pogo 15 1 73.29 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTTATGTTCAAAAAAAAAATGCATCCAATTGTTAATATCTTAGACCAAGTTTTCAAGATAATATCATTACTCAAATTCTCGTAAAAGAATTTTAGCAACTATCT:1 + chr2L 17029733 3' + blood 7371 2 67.12 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAAA:1 + chr2L 9485694 3' - 412 7104 2 51.37 CTTGCAGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGCACGTCTTCGTGAAGTCG:1 + chr3L 23678163 3' - Osvaldo 35 1 69.84 ACTAAGCACATAGATATCAAGTATCATTTTACCAGAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTATCTTTCCACAGATTTACATTATTGTAAGCCGGCTTGCAGGCCTCTAAGCGCCAATTTTCAACAC:1 - chr3R 6631121 3' + Copia1_DM 4124 1 65.93 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTGGAGTATAAAGAGGGGTATCCAGTTGGGGAACTGGGG:1 - chr2L 16458605 3' - roo 8743 2 72.54 AAACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAAACAGAAACGAAAGATAAATAAGCCAACACATACACACGCATTCC:1 - chr3R 2239374 3' - invader2 4668 1 63.29 CACACACACAAACACACAGATAGGCGGCAGCAATGGCGGTGGAGCTCCCAACGGAGCTAGATAATCATCCTCGGGGTGTCCAGGTTTTCTTGGCCTTCCCGGACCCGGA:1 - chr3L 16718980 3' + gypsy3 425 1 77.98 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGA:1 - chr3R 24122663 3' + roo 9001 2 67.12 AGGCGACATGGGCGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATACAAGGAATCAATAAAATTCTTTATGATTACGAAACAGCTACACTCATTGATTG:1 + chr3R 19448839 3' + roo 8775 2 61.81 AAAATTAAAAAAAAAAATTAAAACAATTTTTAGAAAAATTTCTTTTAATTTAGTTCGTTAGTTTCTAACAGCGTTTCATTCAGTTAACGAAATTCAGAAATTGGTCGCCCTGGAGAAGCTGAACATCGAACAACATTATTATCTAG:1 - chr3L 18073123 3' + Doc 4698 2 80.14 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATCAAATCAAATCAAAAAATAAATAATTTTGCACTTCATTGATATGTATCTTAAAAACATAATTAAAATTTTAAGTATTTGAACTATGCTTATTATTTGATAGTAGCTCAGTTAATAGCA:1 - chr3L 1519449 3' + Juan 4197 1 66.44 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGGCAATTGCCGCAAATAGGTCAGTTCAGATGGAGGTTACTGAACTCTCTCGCCCGCCGGCCAAATGTATTTAT:1 + chr2R 10865290 3' - blood 8 2 77.04 ATTACAAAAAAAAATTAAGTTAAGTTAATCGTTTTAATATTATTATTAATTTATTCAAATTTATTCTTGGGCTTATTTTTAAAATGTTAGCAAATGTAAAATGTTACTAGAGTTTGTAAGGTTCGAAGCCGAATCTGATTTCCGGT:1 - chr3L 6071655 3' + pogo 2030 1 71.23 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGGA:1 - chr3L 7995425 3' + P-element 2812 1 36.30 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGAATGCACTCTCTCACTTATCCGCTCTCACTCTCAGCAGACTGCAACTGTAAATTGTAAA:1 + chrX 14951204 3' + P-element 2844 1 48.84 ATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTAGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGT:1 + chr3R 10030788 3' - BS 5052 1 52.31 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTG:1 - chr3L 22052744 3' + mdg1 369 2 54.17 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAGCAACAAACATTTTCATTCGTTTTCGCATCGTCGAAGCGTACGGTGCATAGGAGGAACGGAACGAAG:1 - chr3L 14550920 3' - P-element 2 2 74.80 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGACAGCTCGTAGCGAAGTTTCCCACCTTCAGCATGGACGTAAACCACCGCCGATATATCGACTCCTGAGAGCCCATGATCAAAGCACAGTA:1 - chr3L 22648256 3' - Tabor 6872 2 60.27 GCACTTGCACGTCATTATGTTTCAATAACTTTTTATTTAATTTCTTATTTCACCACTCACTACTAAAATCCCCACAACAACTTCGCTCACATGTTCATCACCTCTTAAGATTATCTTTTTTAATGGGGGATTTCATGTGTCATCTT:1 - chr2R 20156405 3' + accord2 7281 1 76.71 GAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATA:1 + chr3R 26246909 3' + 1731 259 2 52.74 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGAAATATGCCAAGTCCAGAGTGTCAGCTAAATTTCCGTTGAATTTCAGCTGAATTGCTCATAAAATGACACGACCAAACA:1 - chr3R 17114002 3' + roo 9043 1 63.70 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTG:1 + chr2L 16458669 3' + roo 332 2 69.86 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGCA:1 + chr2L 9472103 3' + roo 9026 1 54.11 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACCCTCGCTATCCAGTCAAAAGTAAAAGCGCTCAAAATGAACGGTCAACATTTCACGGAACTCG:1 + chr3R 21001943 3' - 412 17 2 73.97 AAGCAAATTCTATTTTTAAATTTACGCAAGTTTACGCGAGCGGGGAGAGATCAATTTCGGACGTCACCAAAAAAGGGTCTGAATAGTGCAAAACCAATGTATGGCCGTTTGTGGGTGATTGCCAAGGAATTTCGGCGTG:1 - chr3R 19565421 3' + 1360 3268 1 78.42 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCCTTTTTGTGTGGTTCGCGGTG:1 + chr3R 24476394 3' - 412 7092 2 56.94 AAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATTTCGCATCTGCTTCTGCTCCTAGTTGTCTGGATGCTTTTTTCAGCACCCAGGGGTTTTTA:1 + chr2L 1561078 3' + 1360 372 1 59.31 TGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGTTTCTTTGTTCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTATGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3L 11720529 3' - Doc 264 1 59.40 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATA:1 + chrX 4785151 3' - roo 38 2 65.05 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGCCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAGCCCC:1 - chr3R 21705971 3' - 297 6617 2 53.49 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTAACTTTTCTGTCCCTTTGTAAC:1 - chr3R 16181125 3' - roo 8705 2 51.49 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTTCTACCCCCTTC:1 - chr3R 22100487 3' - 412 7086 2 62.59 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTATTGGCTTACCTTAAAGTCGCGTTTGGTCAGGTGACCTCTGGAGACCTTGAA:1 - chr2L 2030985 3' - 412 7073 2 69.18 CAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTATAAGCA:1 + chr2R 5206905 3' - G4 3762 1 61.64 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTCCTGACATGAGA:1 - chr2R 8158752 3' - Juan 61 1 50.69 AGTAGCATATGGGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTACACACACACACGGACATACTTTACCACATTGCAACAGCCATACATCAAATAGCTCAGGCCTTTTCTTCTAATGCTTTTCGAGCTCGTCAACGCACTATAAAA:1 - chr2L 17143686 3' + Quasimodo 1 2 63.01 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAGTGTCGATTACTGGCATACTCGTTGGTTGCATATCTGT:1 + chr3L 22642930 3' - hobo 60 1 58.90 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACACGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATACTGTCATTTAAATTCCAAGCAAATGCAGAGGATAACTCAACAAAGAATGGC:1 - chr3R 7739447 3' - I-element 68 1 68.06 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTTCCTAGAG:1 + chr3R 25304817 3' + roo 343 2 64.83 AATATAAAATTTAACTTATTTTTATTCACTCCTATAAACTATCTTAGCAGTCTAACTTTTGAAATGTACATTTAAGTCTTTCAAAATCTGAGGATCTGTATACAACACAGGATCACAGGATCCGTTCAGATTATGATTGAATATGT:1 + chr2L 11016855 3' - 297 467 1 54.79 AAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTTTGGCCCAGACAAACTTCGGCCATTTCCTGC:1 - chr2R 21402567 3' + mdg3 5466 2 57.93 TAAAGTTTTTTAGTTTTAAAGCTAAAAAAAAAGAAAAGAAATAAAAATATAAGATCAAAAAGGCAGAATAATTTATCTAGATATTTAAATTTTCAATGTTTCTTTGATCAGCATTTCCTAGTCAAAGAGCCCGAAATGAGTGTTAT:1 - chr3L 6837583 3' - 1360 3026 1 50.00 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATTTGTTGTTGCGGTCCGCTGT:1 - chr3L 11336304 3' - blood 7026 2 69.40 TAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAACATATTGACTAT:1 + chr3L 13827357 3' + hopper 1357 1 59.29 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCGTAGGCCAATCGTTAATTTCACTCTCTAAAGAAGGTCATTTGGTTT:1 - chr2L 3294125 3' - hopper 72 1 67.81 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCCGTCTTATGTTTTAGCAATTAGTTACT:1 + chr3R 9160817 3' + copia 240 1 73.29 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAATCCGATTCCGACTTCTTTTTAACCCGTTC:1 - chr3R 31490904 3' + roo 9052 2 66.92 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTAGTTGTTTTTAGATTTAATTTACCATAAATCTATATCTAGGTAAATCTATACCTAGGTTTGGTGATTCCA:1 + chr3L 4187303 3' + pogo 2053 1 55.48 ATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGATCGCCTTGATCTTTTTTTCCTCCGCCTGGCGTTGCATATTCTTGC:1 - chr2L 191503 3' - Stalker4 7004 4 66.67 GAGAGGCAGTCTCTTCACTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGTAGAGAGAGAGAGCAAGCGAGAGAGCGGCCAGGATCAAGCACCGCCTCCTTGCGAAAAGAGATGAGTGCACAGTGGGCGGAACAGGGAAA:1 + chr3L 5881601 3' - Doc 423 1 66.17 CCGGGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAGATATTTT:1 + chr3R 9352136 3' - Tirant 8119 2 77.04 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGGTAAAGACCTAATCAGTATCCTACATTTGTTTGTTTTCTTTTACTAGTATGAATCATTATTAGTACAAAAATGATATTACATTGAGATTCTAAAGGCGATCA:1 - chr3L 15612661 3' - roo 8683 2 73.29 GACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAATTTGTAATGCTTGAGATGAGAATTTGCAAGAGTTTCCTTTAGTTCTCGAGGGTAA:1 + chr2R 8530551 3' + opus 7337 2 58.02 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGACACACCGCTCATGCCACTGGTCTTCTGTTATCTGC:1 + chrX 2773526 3' - jockey 4832 1 72.73 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGTATCAATCATTCTCTTGAGATGAAACTTTCTTGAATTCGAGACAAAAACGATCTCAA:1 - chr2L 10468668 3' + roo 361 2 55.91 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCTGCCCTACCTGGCCAT:1 + chrX 4785174 3' - roo 8722 2 59.59 GCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCCGCTGCCTTCTTTAAAACGCTTAGTCGTTTCGGGTGTCGTTTGGTCGGTCG:1 - chr2R 2948925 3' - 1360 2980 1 55.56 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGGGGCAGTGGGGCATGTTGCAAATGTGTCTGC:1 + chr3L 15276743 3' - hopper 24 1 62.50 GTTTTTTTTTTTGATTTATCAATCATTTATATTTGGCCAATTTCAAGCAGCTTACCCTTGAGAAAAACAGTATTCAAGTTCAAATATTGAGCTAACAAA:1 - chr2L 10803755 3' + Tc1 1475 1 65.66 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAAAGCACATTAAAGTGACTTATGGAC:1 - chr3R 30634892 3' + roo 399 1 76.92 GAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAACCCATGATATTACTCACTAACATTGC:1 - chr3R 4504012 3' + INE-1 549 1 73.29 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTTAGCG:1 - chr2L 246013 3' - roo 69 2 71.64 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTCGACATTT:1 + chr2R 8641632 3' - diver 5916 2 62.07 AGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCCTCCGCTTTCCCTTTTGGCCCTGACAAACTTT:1 - chr2R 21402580 3' + mdg3 5468 2 53.08 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTCTTCGACTACACTTTGGGAATACAACAATTTGG:1 - chr2L 3659093 3' - 412 7139 2 75.86 AACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACTAACGCAGAAAATCAGAGTATCAACCCCGAACACCAAAGA:1 + chr3R 435986 3' + 1360 3012 1 63.01 GCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCG:1 + chr3R 28797987 3' - BS 5050 1 53.42 GAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCCCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTTTCCAGCGAGTCTGTGGCACAACTAAATTTAGTTTGTTG:1 - chr3R 26521817 3' - F-element 378 1 71.92 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTACGACTTTTAGGGGCAGTCCGCCCCGCCCATCTCCAACCATTCCCCC:1 + chr2R 11057352 3' + pogo 2064 1 58.26 GCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAATCTAGTAGAATGATTTTGGGGCAAGGACTTTA:2 - chr2L 9485560 3' + 412 7518 2 63.70 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGTCGGTCATATCAGCGGCTGCTGCCACAGACAA:1 + chr3R 12599109 3' + 412 430 2 64.18 CTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAG:1 - chr3L 27356057 3' + Tc3 1663 1 62.94 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCCGCTCATTTCGTTTGTTGTTCTTGTTGCCGCTGTTGTTAATTGACGACAGTG:1 - chrX 5679929 3' - P-element 45 1 47.20 AGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTCACATCAGCGAAATAACTAACCTCTTCTAGCCACAAATTTGACTTTACGAGTGCCCACTGTTTAT:1 + chr2L 1557247 3' - 412 7245 2 49.59 GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCCATAATTTTATTGGTGTTGCAAATTTCTATCGATTTGC:1 + chr2L 21761883 3' - F-element 93 1 73.97 GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCTTTCAAATGGTGAGATTAAAAAGAATGATTTT:1 + chr3L 16496696 3' - jockey 4798 1 78.08 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCGTATCCGTATGCGAGACTTGCCAGGCCATCAATAAAGCATTTGGGTTTGATTATATAATAATAATTCGTTTCTGGAGATGCTGGGAAATAACTTGCATCATAATAC:1 - chr3L 19199580 3' + hobo 2924 1 70.55 ATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATT:1 - chr2R 5917823 3' - I-element 5117 1 63.01 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGTGTATTATG:1 + chr3R 27822313 3' - I-element 40 1 58.22 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTACCACGTAACTATCGTATCGTAAATAGCAATAGCAGTTAGTTATAGTCAATATGGATAG:1 - chr3L 13868586 3' - 412 7 2 77.04 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTGTATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTGGACAAGAATG:1 - chr3R 16913347 3' + pogo 2049 1 58.22 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTTACAGTTCGATACTCGTATTGTTGCTTCAGAACGCAAATGGCACCTTTCTCGGTT:1 - chr3R 27768807 3' - 297 6621 2 54.40 ACTGCACCGGAACGACCAACCAGCTCAGCGTTAAATTTGTTATGCCACTCATCACGAATCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGCTTAGAATAAGCACATTCTCATGCACGACTTTTTGGCGGAAAAATTTTTTGGAAATTGCAT:1 - chr2L 2261144 3' + Doc3-element 4575 1 64.38 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATATCTAAGTTTTTTACAAAGATTATATGAATTTCCGAAAAAGTGTTGTAAATTGCCAGACAAATGACTGGCCAAGGTGTTAATATTGATCA:1 + chrX 7354639 3' - Stalker2 7265 2 48.46 AAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACGCGTTGCCGCCACTAA:1 + chr2L 17240317 3' - 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1360 207 1 68.55 GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGT:1 - chr2R 5922978 3' + jockey 4920 1 69.86 GCGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATGTATGCATCCTTCCTACATTGATCGGATTACGAACTGGAAACGGGGCAAATGCTCGTG:1 + chr3R 29733131 3' - opus 7152 4 55.65 CGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAACAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTCCTTCGAAACACAAATACAAGGTTCCTTGACATCGAAGATCTAAGAAATAAAGTT:1 + chr2L 13250482 3' - opus 7147 4 64.38 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTTCATGCTTTCGATTTAAGCTAATTTGCTTTCATTGCACGGACT:1 - chr3R 7035196 3' + roo 393 1 74.66 AATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAACTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAAGTAGAATTTTAAATAGAATTTCAATTACAAACTACAGCCATT:1 - chr2L 14456071 3' - GATE 441 1 70.55 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATCTAACCGTATGTGTGTGGGTGTCAACGCCCCTCTGTGGGCGT:1 - chr2L 17240191 3' + hopper 1375 1 58.22 TGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAGCTTTGTCGCTTATTAAAAGAAGCTTATCGCCGCAGCCAGCAGCTCGAGATCATT:1 - chr3R 27510021 3' + Bari1 1695 1 74.66 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATATTGAC:1 - chr3R 20175681 3' - hopper 31 1 56.92 ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATATATTATAAAATCCATTTTTGTGATAGAACGTTGTCTACCGACATTTTTTTTTT:1 - chr3L 15099962 3' - copia 4935 2 64.14 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGACCCACTTGGA:1 + chrX 5150398 3' + roo 9028 1 55.48 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGGAATTATACGTGCAATAATTTGGATTCGTGAGTAT:1 + chr2L 2052753 3' - blood 7097 2 74.48 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGGTCATGCAATGAGGCAACTAATTGAGAGGCCAAACAAAGCATGGAATCAAAGCCTTTGCCACG:1 + chr2R 20865762 3' + 412 7487 2 57.53 ATTTGACAAAATATGTCCTTCACCTTCAAAGTTATTTGACTTTAAATCTATATTATACCTAAAGAATAACAAAATAAATGAAGAAGAGAGGGTTGTGACAAGAAGTTAGGTTACCTAATTTGTATCTTTAAGCTGGGGTTTTTAAC:1 + chr2L 7741916 3' + 1360 209 1 56.16 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATGTGTAATATATTATTCTATTCTCCGGGTAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCCTGGTTTCGTTATTCCATCA:1 - chr2L 18931089 3' + roo 9032 1 47.26 ACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTACAATTCCC:1 + chr3R 14860248 3' - BS 5033 1 58.90 TATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTTTATATTATCATAGCTTATTATGCATAGCTTAAAATCGACGAAACTGGATAAGAAATAAATATTTTTAG:1 - chr3R 12929179 3' - invader4 2807 2 53.42 AGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGAATTACTCAGTTCTTTATTTTCTATAGTTTTTCTGGATAGTCATGACAATTGGGTTT:1 + chr2L 18149558 3' + Bari1 1673 1 63.70 ATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGTGAGTATATAGTAGTAGTACAGTATAAATATGAAGTTTTTATAATTATTTATC:1 - chr3L 9713944 3' - G2 2684 1 56.91 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTCTTCGACTACAATTTGGGAATACAACAATTTG:1 - chr2L 3659094 3' - 412 7131 2 75.00 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGGACTAAAATGAAGTTTCATTGAAAACCCATACGCAGATTATTAGTTCGCGTGC:1 - chrX 22610690 3' - pogo 66 1 61.64 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTG:1 - chr2R 5922976 3' + jockey 4922 1 68.49 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATCAAGTTGTAGAGCGAACCTCGCATTTGCGCCTCATGA:1 - chrX 21196714 3' + roo 8989 2 72.60 AATTTGCTTTATTTGATTTTATTTGCTTCAGATATATCAAAAATGCATTATACTACATTCTAATGGCTTTTGCATTTTAATTAACATACTTAAATCAAAATGCTAATATGTTGATCTATCCATATATGTGTTAAAATTAAGTAAAA:1 - chr3L 18321781 3' - TAHRE 31 1 69.86 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATGTTAAAATCATTTCCTGCACATTTCT:1 + chr3R 10472815 3' + mdg1 7423 2 60.00 AACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACGCAG:1 + chr2R 4313057 3' + gypsy 7393 2 50.34 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTG:1 + chr3R 14049433 3' + transib2 2764 1 58.90 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACCCTCGCTAACCAGTCAAAAGTAAAAGCGCTCAAAATGAACGGTCAACAT:1 + chr3R 21001930 3' - 412 30 2 63.70 GGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTCAATATAGCGTCATAGCGGGTCATATAGGGTCATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAA:2 + chr3R 29534665 3' + Stalker 6845 2 77.40 AATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGTCTA:1 - chr3R 17605595 3' + Tabor 7300 2 68.49 GCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATGTATTTAACCTTTTTTGAGTCACGAAATGCAAATGCCTATCTGGTTATTTTTTTTTTATAAAAATAATAATTTATTGGTTT:1 - chr2L 12874453 3' - F-element 204 1 50.00 AATTAAAAAAAAATTAAAAAAACATATCTGAAATAAAATCATGTATTGTAGGTTTAGATGTTGTAAACTACATATACATTATACATACATTTTTTGTACAAATAATTTAATAACATTTTAATACAAAAAAATGAGATTCAAAGC:1 - chr3R 7614303 3' + Doc 4700 1 72.92 TAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAATGAACAAACGAGCGGGTGCCATCCAGGGACCAAAGCCAGGCAGGACCACGGCCAGGACTTCTTC:1 - chr3R 13607601 3' + I-element 5323 1 59.59 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTGCACTCAACGCGGCTTAAATCAAATGCCCAAAAGTATGCAGTGATTTAATATCTGTAAGGTTTACACCCATTTT:1 + chr2L 6717219 3' - jockey 23 1 65.81 GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGT:1 - chr3R 13582232 3' - BS 5066 1 71.97 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAACCCCAAGGCGAAAAATTCCCTCGAGGAAGGCCAGG:1 + chr2R 23116163 3' - jockey 66 1 68.60 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGGGGAGCTGCTCCACATGTGTCTGTGCGTGTGTGAGTGAGGCGGCGTGTGTGTATGTGTGGGTGTGTGCGAGTGTGTGGGTTT:1 + chr3L 4001219 3' - hopper 5 2 72.17 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTACAAATATTTTATTATCTTTTGAACCAAAACATTTTTGTATTCTGCAAAATTGAATTATCCACATCTCTCCGACCCGGCGACTGTCCC:1 + chr2R 4930639 3' - Ivk 15 1 67.72 ACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCACAATTATAAAGGCCGATTAGATAACCAGAAAGGAACCCCGCCACCACCGTCCATCGTCCATCGC:1 - chr3L 15221685 3' - hobo 2616 1 50.77 TTTATTCAATTTCTTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTTTCTTTTCGCCAGTTTCGATCTTCTCTG:1 - chr3R 21653497 3' - Stalker4 499 1 77.34 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATACGATCAGCGGTTGGGTGAACTGGAAACTAACGAAGA:1 + chr3L 17890861 3' + 412 487 2 76.38 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATT:1 - chr3L 18467177 3' - hobo 56 1 56.85 AAAATTTAATTTAAAAATTTAAAAACTCAAAACACTTTTCTTTAATAAAGACCTATTATAAAGGAAATTTCTTTTATAACGAAATCAGATTCTGTGCAACCCGTATGAAAATAATATCTTTTTCTTGTTTTTTATCCTTAAAAACA:1 - chr3L 15304998 3' + 1360 3047 2 66.44 CTTATGATAACTCCTCCCTTAGTTAAGCGAGGGCCGTCCTCGGGTCTCTGCAGAGCTGTCTCTGGTTCGATTAGAATTTGCCAATATTTTGCTGTCCAGATAACGGACA:1 - chrX 4060853 3' - gypsy9 5004 1 67.89 AAGATAAGATAAGATAAGAAATATAAATAACTATATAAGTATCCAAACATTAAACCTGCTATGTTATTAAAGCGGAAATCTTAATGTATTTCCTTTTTAAACAAAATTCTTAAATTTACAAATATCTATCAGTGAAAGGCTTGAAA:1 - chr3R 15768153 3' + Stalker3T 208 2 79.45 GGATTTGAGTGAAGCGGTTCTTCACGGGGTCGGGGATGTAGCTGTCTTTAGTTATTGCCTTGCGAGTCATTTTCGTTCTTTGATTGTTACAGATTTCCTTTTCTGAGCAATACCAGACTATATCCGGAACCGGATGCGCTTCCAAA:1 - chr4 729355 3' + aurora-element 4010 1 76.03 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTTACACCACACTTATTTAATTTGACAATCATCAAGTCCCGTACAATTGATCGATTTGATATTTT:1 + chr3R 26191708 3' + hobo 2904 1 53.28 GAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTCTCTATATGACTGCAAG:1 - chr2L 11574835 3' - Max-element 8317 2 71.92 ACTTCACCGTCGTGTCAGACACTTTCTCACACCAACACACCCACACACTAACACACACACACACACAATAAGCTGCTGTCTATGAAGAGGCACCCAAG:1 - chrX 5634676 3' + Doc3-element 300 1 66.33 ATATATATATATATTTCCATATAATATATCCCCCCTGCGTTGGGCGTTTGCGTGAGGAGTGGG:1 + chr3R 19751404 3' - G3 4507 1 84.13 TAAAAACCATATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTAT:1 + chr2R 19553276 3' + mdg1 357 2 59.59 ACACACACACACACGTACATATATTCTGCGGCCTACGCACTTAGTTTCCTTTCGCCTGCTGTTGTTATTGTTGCTGCTGTGCAAGCAAACAGCAAAGGTGAATTTCAGTAGGGGGTTTTCATGGCACG:1 + chr2R 14568470 3' + Quasimodo 39 2 58.59 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACA:1 + chr2L 246109 3' + roo 9026 1 56.16 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATT:1 + chr2L 14201485 3' - roo 47 2 53.42 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAGCATCGACGCTTTTTCC:1 - chr3L 24152390 3' - HMS-Beagle2 6893 2 77.40 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAAAGCAAAGCAAAACCAAAACCAAAGCCCCAAAAAAACAAGCCAAGCCACCGACAAAGAGTTTCCGACTTTTTCGT:1 - chrX 7515623 3' - roo 44 2 54.11 AGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGACAAGGACATCCAATTGCGTGTTTAAAGCTTCAATTTACTTAGCGTCACTCTTTCCAATTCAGTTATAACTTTTTCGA:1 - chrX 22857527 3' + copia 4970 2 54.79 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTAATTAAGCTGTCAATCTCTTTGCAACCTA:1 - chrX 14964571 3' + roo 9052 2 70.55 AGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATTTGCCAATTCCA:1 - chr2R 7020559 3' + Bari1 1635 1 68.97 GTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAGTGACACACCGCTCATGCCACTGGTCTTCTGTTATCTGCTGGGG:1 + chrX 2773531 3' - jockey 4841 1 69.18 AGATAAGAAGTGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAAATGCTATTATAATATTTATACTTACACAAATAAATATTGTCTAAAACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCGGTAAG:1 - chrX 22576291 3' + Burdock 6286 2 48.63 GATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAGCCACCGGATAATTGTGTCCGATCTTCAGTTTGCCAA:1 - chr3R 11057580 3' - flea 80 2 73.97 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCGTAGGCCAATCGTTAATTTCACTCTCTAAAGAAGGTCATTTGGTTTCTATAGAATCGGTGCTCACTTTTAGGCGGAAAATTGAA:1 - chr2L 3294087 3' - hopper 26 1 64.49 TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGCGAACAATGTGCCATCCTTTCTCT:1 + chr3L 22648394 3' + Tabor 433 2 50.68 AAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAGGTCATGCGAGGTCAAGATGC:1 - chr2R 16403407 3' + copia 193 2 60.96 TAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGCGGGTGGTGTTGGTGGGGCAGTGGGGCATGTTGC:1 + chr3L 15276731 3' - hopper 28 1 52.68 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTTTGGCCCAGACAAACTTTGGCCATTTCCTGCAGAAATAC:1 - chr2R 21402559 3' + mdg3 5473 2 64.38 GGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATAA:1 + chr3R 11547748 3' - G2 357 1 78.52 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTTACAGTTCGATACTCGTATTGTTGCTTCAGAACGCAAATGGCACCTTTCTCGTTTGGTTTTCCGGCACCC:1 - chr3R 27768792 3' - 297 16 2 64.66 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAACTCAGCCAAATTCAAATCTAAATCCAATTCCCAGCAGCCTTA:1 + chrX 13395396 3' + roo 396 1 76.03 ATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGTCCCTTACAGATTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAAAATACATAAAGGAAGTCGAACACGTTCCATGGCACTGTGAAGTAGTG:1 - chr2R 24913905 3' + Cr1a 4152 1 70.55 AAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGCACATCTCACAGAGAGCCGCGACCCAAATAGGGAGTAACGA:1 - chr3R 9392944 3' - S-element 78 1 71.92 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTATATATGTGTGTGTAAGAGGTTCTGTCGTAATGAAAATAAAGTAGCAACTTTAACGCATTTTTATGG:1 + chrX 10974436 3' + opus 449 2 57.53 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATAATGACCGGCATTGTGGGGGCTTGGAATTGAAGAGAAGTGATTGCAAGTAGTTTTCTGCGAAGTAGTCTATAGTGAAGGTTTAT:1 + chr2L 436581 3' - copia 4897 2 63.24 AAAGAATACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACGAAAGCGAGAGTAAACGAAATACAAAGACAGAAAAGCAAACTAACTAGTTAACTAAAATGAGAAACAATTTAATCTTTCGGTTTGTCCAGGATGTGAGTATAATGGATAACG:1 - chr3R 22844506 3' - Cr1a 242 1 71.72 TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCTT:1 - chr3L 9907361 3' - jockey 81 1 65.07 AAATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGGGAGTTAATCCGATCTGAAATATCTCCATGGATCACTTCCTTTGTCGTTGTAGAGCTTATTGGAGATAAACTGCTTTCAACTTCTTCTTGCACAGCTGTTGTAT:1 + chr4 863928 3' - Cr1a 4127 1 68.49 AATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGCCATGGCAACATCAATAACAACGAAACGGCAGAAACAGCGACTCGAAATTCGATTAAGCGCCAAAATATACATATTTCT:1 + chr3L 25332115 3' + F-element 251 1 61.48 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGCGTATTATGTATGCGGCTGG:1 + chr3R 27822324 3' - I-element 29 1 64.38 ACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTGTGGTTCCACGTACTCTCGTACTCTCGAATTCTCGGGCCG:1 + chr3R 5090564 3' - McClintock 6138 2 72.41 TTTTTTTTTTTCATTCGGCGTTTCTTTGTTGCCTCATCGCTGGCAGTTAAATTTTTGTTGGTTTTCCAACGTGACGCCTGT:1 - chrX 4460675 3' - Bica 330 1 64.20 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTATATTAATATACATATACATACAGATGCGGTTTG:1 - chr2R 641827 3' + opus 7470 2 64.38 TAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAGTAAATATATAAATTGAGATTTGCGAATACGGACCACGCCC:1 - chr2R 18187196 3' + BS 4995 1 79.45 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGNNNNGAGCTCCAGTGCTTCCACANACCTCTATCGA:1 - chr3R 7539412 3' + roo 391 2 64.80 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAGCGGTAATTGGTCGCCACCTGTATAAGTATGTTTCCAAAATGATTGCATTTAATTAAC:1 - chrX 12138899 3' + roo 9045 1 63.01 CAAGAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGAGTCATGGACTTCGT:1 + chr3R 3320515 3' - 1360 82 1 71.92 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGGAAACTACCA:1 + chr2R 5955039 3' + copia 242 1 51.11 AAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGCTCATGCAACTCCTAACTATGAGTCTACAACGATTTAAGATAAGGAGCATATAAATTCTAATGAAGTCGGGACTCTCAACTTCACTAATAATAATAAGCTTACAAATAA:1 - chrX 16677446 3' - Cr1a 4199 1 48.63 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACAGCGTTTATGCTGCTGGGCTGCTCCTGCAGCATTTGGTGGCCTGATCCTATTCCTGGTCCTTAACCAAAAACGCAAG:1 - chr3R 27822182 3' + I-element 5313 1 60.27 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGG:1 - chr3L 14553126 3' + roo 8987 2 76.71 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGA:1 - chr3L 7995446 3' + P-element 2833 1 30.77 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATGTGTGCAATGACAATATAAATAAAATAATTGCTGACATAAATAAATTCAAAACTCTTGTAGACAGTTTTTTTTTTTGTGGTTTTATTTTTGGTTTTT:1 + chr3L 6775483 3' + blood 372 2 74.22 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGTGATATCATATGTTATATGGCCAATATCAATA:1 - chrX 4778142 3' - 412 7079 2 66.21 GCCGTGTATCGTACTGCTCGATTCGCGAGAAGATAGAAGCGATATAGAAAAGGGAACAGAAACGAGGAAAGGAATAGGAAACGCTATTTTTGTTTTGTCTTGTTGTTTTATTTTACTTTTTG:1 + chr3L 16467010 3' - Cr1a 4392 1 62.30 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGGTTTTGTAGTAATGTGTCTCTCTATTCCTATTGGTGATTTTATAATGGTCTTCGTCAGTTTGTTCGACGTTCTTTGTTAATTTAAAAGGGTTTTCTAATTTTCCT:1 - chr2R 2127178 3' + roo 393 1 78.77 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAATCTCCATTTCGA:1 - chr2L 19068042 3' + pogo 2046 1 58.22 AGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:1 - chr2L 20360645 3' - micropia 5082 4 47.97 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTAC:1 - chr3L 13868643 3' - 412 7128 2 70.55 CGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTATAATATATATACAACTGGTTTTGGCAATGAAAAAAACTACGTCTAGAAAAATTAAGTGTTTGACACATATACACAAAAATAATGAAACAGTTATCCT:1 - chr2R 4628334 3' + Transpac 5209 2 71.23 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTTTCCTGTGTGAGTGCGGTGTCCTCTTCTCTGCGGGATTACATCGGCTTAGCTTGTCT:1 + chr2R 16891955 3' - hobo 13 1 63.01 AAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATGTACACAGATTAGGCAACTGCCATTTCTCAGCTATTTTTAAAAATGAATAGAGATAATGTATCCACCACTCCATCCCCATTCGATGTATCCATTCATTGCCGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 11147928 3' - 1360 372 1 64.38 TGTATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATA:1 + chr3L 13827358 3' + hopper 1352 1 60.27 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTACGGCG:1 + chr2L 22016018 3' - Tirant 24 2 62.81 GGGGAGAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTATTATTGATGTCACGATAAAGCATAACAAAGTCCAACATGTTGGCCAAGTATAAAATGAAAGCCATGATAATATTCACAGC:1 + chr2R 22389226 3' + Max-element 8228 1 46.58 ATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTTGTTTCACGAATCGAGTTACAACAAAAGAAACATAGGAAATAGAAACGCACACGAAGCAATTATATAGAACTTTGT:1 + chr2L 4028070 3' + Stalker 6791 2 52.05 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAAAGCAAAGCAAAACCAAAACCAAAGCCCCAAAAAAACAAGCCAAGCCACCGACAAAGTGTTTCCGACTTTTTCGTAGATTTTTGCTGCCAGATGTTTA:1 - chrX 7515600 3' - roo 8679 2 72.86 TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAAT:1 - chr3L 14062246 3' - Doc 74 1 68.22 ATGTTTTCGAACGCGCCTCTTTAAATTTATTGGTGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAATTTTATTTCTTGATTCTGCAGCCACGTTCTAAAAATAGGTTGCTTCACATCGAAAAATAATCTAAATTAAAAATA:1 - chr2R 5246179 3' + hopper2 156 1 69.86 ATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGTACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAAAAAGTTGAAAGAGAACGAAGCGAGGAGCAAAAAAAATTTGCAAACACTCGGCCAACTT:1 + chr2R 19554084 3' + mdg1 7118 2 58.90 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGA:1 - chr3R 10684724 3' + roo 9019 2 54.79 GAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTAATAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTTTTAGTACTTTCCGCAGGGGTCAACGTGTCATTTGCATGTTGCAGTGCAGTTCTACGTACTGATTGCTT:1 - chr2L 20077626 3' + invader2 5011 2 56.85 GAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAAAATGGAGGAGTGCTTCAATTGCACAGTGTCCTTGTAAATCTGTGAAGCCGAGT:1 + chr3R 26246963 3' + 1731 4626 2 79.31 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCATACTACTAACTAATGCTACAT:1 - chrX 1103576 3' - pogo 25 1 67.12 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATAT:1 - chr2R 8305227 3' - roo 8741 2 73.29 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGAAGAAATTGAGACTAGCGTTTTCGATTCCCCATTGAAATCGGGTCTGCTTGGAGCTT:1 + chrX 1061623 3' + 412 458 2 51.26 AGAGAGAGAGAGAGACAGCCTAGGTCAATTCCACTTCCAATTTCCAGCATTCCCTTGCAGTTGGTGCATTCTACCCATCCCACTCCCACCCACGGCAGCTGTGCGAGCTGACATGATGAGCGATTTTAACACTTGTACGGCAATAG:1 + chr2L 14949691 3' - blood 165 2 66.44 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGGCCAATTAATTTCGTAAAATTAGTCAATATGCCATTGGATTAATAAGTTCTAATTTCTCTAC:1 - chr2L 3890100 3' - jockey 9 1 78.33 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCT:1 - chr3L 11336359 3' - blood 56 2 68.33 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAACC:1 - chr2L 23310613 3' - 1360 43 1 50.72 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTGGCATTGAATTTATTTTCCACAGTCTGAGTCAGTAGATACAACTG:1 - chr2R 12543041 3' - roo 8696 2 60.43 CACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCATTGTGGCGGCAGTGAAGCAGACGCCTGATC:1 - chr2L 22975407 3' - 1360 163 1 75.97 GGGCTGCAGTTCTCTGCTCTTTCGAGCCACTGTGGACGTGTGGGATTCCTTCCCTTTGAAGAGGGCACCTTCTCGGAGGCACTCCACTTTACCTCGGCCCTGCTG:1 + chr2L 11915629 3' - hobo 2706 1 80.95 CATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACA:1 + chr3R 435929 3' + 1360 2962 1 71.94 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCAAGAAAAAATGATATGGAG:1 + chr2R 19553309 3' + mdg1 390 2 60.96 AACGCTTATACATAAGCCGATCGCCGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTTAAGGTATACATAACATATGTATGTCCTCTGCATACACAGGTATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 + chr3R 846553 3' + Stalker2 7401 6 75.71 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAATTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGAATTCAATAGTGAAAATATTCAATAGACTTACAAATCAAATCAAATA:1 + chr3L 13374206 3' + pogo 2043 1 66.41 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAACCGCATATTTATCCCTAATTACCTGACATAGGTCATACACTGACTTCTGCACCAATGTCTTAAAAAAGGAATGAAAATAGACACA:1 - chr3L 25684956 3' + roo 9033 1 58.90 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATATATATCTAGTAGATTCAATAGTACAAGCACATTCTCAAGTTTCCGCAGCTGAACTCCACACTTATTATTATCTTAAAACTATGCTTAATTTAATATATA:1 + chr3L 22587576 3' + 297 379 2 76.03 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATATATGGTTCTGTAGAGCATAAGGGAAATACACACA:1 + chr3L 12224725 3' - 412 7107 2 52.74 AATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTATTT:1 + chr3L 11257426 3' + 1360 13 1 51.37 AGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTCGTGTTAATATGAAATATATTTTAGTATGATATTATAGTTAAGAGCATTAAAACATTCAGCGTAGA:1 + chrX 16902352 3' - I-element 56 1 54.11 TATTATTAATATTGTTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCTCATATTTAATAATTTTTTCAATTGATATGTATATTATATTTCCAGGATAACGACAAACTCACATCCCTGCCCGGTCGAAT:1 + chr3L 18729957 3' - mdg1 7078 4 56.16 CGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGACACACTAAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGCTTAACCAATTTGTGCATATCTCGTGTTTGTAATGAAATTCA:1 + chr3L 5718796 3' + Chimpo 38 1 72.86 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATTATCTGATTTGCCTGGATAGCTGAATACCTTTTTTAAACAATGCACACCAATCATGACCTCAGGGA:1 + chr3R 11113321 3' - mdg1 7050 2 77.40 ATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTGTAGCTCTTGAAATTACCAAGCAAATACGTAAGAGGTCCAATCTAAGTAAAAACTCCAACGGAATAAGCGGCAAAATCATTCATTTCATTTTGCAAAGTGTA:1 - chr3L 17133985 3' - jockey 4862 1 65.75 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACACGCGGAAATAAAAACCGAAGGCAAATCATAAGCTGTTTTTTTTTATGTTTTAGAAACAATATTCACAGGGAAAGAAATTCA:1 - chr2L 12319218 3' + copia 5087 2 56.16 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAA:1 - chr2R 5214959 3' - F-element 76 1 62.33 AGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATTTGCCAATTCCAA:1 - chr2R 7020558 3' + Bari1 1635 1 68.49 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAACCGCACAGAAG:1 - chr3L 12867299 3' + roo 338 2 65.97 GTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACTAGAACTGCACCGCATCCCCTAATAGACAGCGCATC:1 - chr2L 12414911 3' - pogo 85 1 76.03 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTT:1 + chr3R 20988859 3' - I-element 63 1 59.59 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGTATCTGTATCTACTACAAGTAACATTGTAGCTCGAGTTGGCTAATTATGGCTACGTGGCGCGACTTCCAG:1 - chr2R 22305970 3' - pogo 8 1 74.29 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCGAATGCTGTGAAAACTCGAG:1 + chr3L 22052895 3' - mdg1 18 2 71.92 CTAAGATCTTGACGTTCATACGGATAGACGCACTGTCGGACAGATGGACAGATTGACAGACGGAAATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTTGAGTAACGGGGCTTTTTGCATAATCTACAACAAATTTATTACTTTCCTTT:1 - chr2L 12395299 3' - INE-1 136 1 72.41 TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTACAGC:1 + chrX 4186709 3' + I-element 5277 1 68.49 AGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGTAGGGAACTTGTAAGTTTTTGTATCCGCCTCATGATCGA:1 - chr3R 22165741 3' - roo 8939 2 76.03 ATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAAT:1 - chr2R 13644423 3' + Burdock 6321 2 68.49 ATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGC:1 + chr3R 26520436 3' - FB 71 1 79.17 AATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACGACACCACAAACGCATTTTATAGC:1 - chr3R 19589920 3' - BS 5062 1 62.07 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAACAAAAAAGCGTAAGAGGCGAGACTTGCAACGACAACAACGTGGCATACTTTTCGGGGCATGTGGCATAGGGCTCGGGCTTAACCGCAGAACAAGGCGA:1 - chr2L 3395644 3' - jockey 4669 1 78.33 CAAAAAAAAAGTTTTTATTATTTATATGTTTTAAGCAAAATATTTATTTCAAAGGGCAATAAATAAATACTAAAGAAATTCATTGAATCATGATCTAGTTCACTTTAATGCTTGCCTTTTTTTTTCAGTGTACCAATATCATGTGA:1 + chr3L 10784888 3' - looper1 1620 1 40.41 AGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCGCACCAACACAAATGACCATGCACACACGCACACACACA:1 - chr2L 17470575 3' + 1360 3312 1 72.86 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAACACTTATTTTTTACACCTAATTTATCAATTTATATTTCTTTCATGATGGTCGTTAGTAAATTACATAGCTATTGC:1 + chr2L 18193136 3' + mdg1 378 2 50.68 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCAGGCGTCGAACTCGGAGCAGAGGGCTGTGTGGCGGCCAGTTGCTTCTGGGGAATGGGTCGGAGCTTTTACTTATAAAGCTTTTTGCTGTT:1 - chr3R 8262014 3' - Tirant 5 2 54.78 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTCCCACTCTCGCTGCCC:1 - chr3L 18658894 3' + roo 344 2 63.70 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTTAGCGGATGGCTCTCAGCAGCAGAC:1 - chr2L 245993 3' - roo 61 2 60.27 CCGCAGGTCATTTTTTGTACTCATAAAATTTGTATGGGTGGCGGTCGTGACGGTCTAAGAAATGAAGGGTGAACGAGAATCAATGGGGGCCACCCATTTCGAACACAAAAAACCGATCAAAATACCGAAATCGAAGAGGAAATATC:1 - chrX 20933104 3' - hobo 2728 1 54.11 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGGACGAAAAGCGTTTGTTCCTAGAGTTGAATGGTCAGCAATGGCATACGCCTGGTGGTTCG:1 - chr2R 558083 3' - copia 43 2 51.97 GTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATA:1 - chr3L 22054975 3' + mdg1 7008 1 50.38 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCTCATATTTAATAATTTTTTCAATTGATATGTATATTATATTTCCAGGATAACGACAAACTCACATCCCTGCCCGGTCGAATCTGCA:1 + chr3L 18729962 3' - mdg1 7072 2 60.00 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAACC:1 - chr2L 17210250 3' + jockey 4944 1 52.05 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACATATAGGTGGGCAGCATGGTCATCAGCGTTTCATAGCCATAATTGTGCCCGGCATGGGAC:1 - chrX 4785070 3' + roo 9011 2 59.59 TTTAGTCGAGTTCCCCGACTATTCCGTTTATTTTTTGCAAGTACATACTTTTTAACGAATCTAGTATACTCTTTAACTCTACGGGTATAATTACGTGAGCAGTAGTGTATGGGAGGATTTAAAGC:1 + chr3R 20126113 3' - INE-1 565 1 56.80 TACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAAATATAAAACCCTCGGTATAACCAGTACGATCACAAATTCATTAACAATATTCAAATATTTATAAGCAACTACAGTTTTTCCCTGCA:1 + chrX 19192478 3' - INE-1 13 1 80.00 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAACT:1 + chrX 13395356 3' + roo 9019 2 56.16 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTAATGCGGACCAAAATATTGTTTTTTAAAATTTGCCGCCAGCTTTCGATTCATTGCACAGCCACCCTATCGATATA:1 + chr2R 22492146 3' - pogo 43 1 53.42 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGCACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTC:1 + chr2R 8641625 3' - diver 22 2 61.36 GTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATACCTTTGGAGAAGTCATCAGCGCCTTCAGCTGCAACAGCAACTCGTGCACAGTGCATCCAGCGG:1 + chr2L 16827538 3' + opus 224 2 52.99 AAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAATTATCTGGTTTT:1 + chr3R 11750268 3' - Tabor 6904 2 61.38 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCCTCAACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACG:1 + chr2R 12543155 3' + roo 9002 2 68.49 GTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGGCTG:1 - chr2L 18279873 3' - gypsy5 6962 2 61.74 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGTAAA:1 - chr3R 7539443 3' + roo 338 2 65.75 CTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTATTACTAAAACGTGCATCCCTTGTCATTCGTCAAGGACTAAAACTCTTGGCCCCAAACGAATGGAAATCTCTGCCCATCC:1 - chr3R 11134313 3' + mdg1 7154 2 65.04 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGCATGCCTGCTATCATTTAGTGAAGCAAAC:1 - chr3R 12599005 3' - 412 7086 2 57.04 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGTTAACTGTGTATAAATGAAAATATGGGTATGATATGTGTTTATTTACACTTTTTTTCTGTGTACGAGAATGGTTAGATTACTCCCCTTCCTCGTTTTG:1 + chr3R 13686688 3' - FB 24 1 69.66 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCATAGGCCACAAATTA:1 - chr3L 17890706 3' - 412 7081 2 63.36 GCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCACTTATGTCACTGACTGC:1 + chrX 6138732 3' - opus 7033 4 58.87 CAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGCAATACAATTTTTATGCGAAAACTAATGTAAAAAAGTCGAATATCAATTATTTTCATGGCTTGCTTCTCATTT:1 + chr2L 2657343 3' + diver 209 1 64.04 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGGGTTCAAGAAAAAGCTTACCTAAGGAGGCGATAAAGTTTAAGGAGTTTACCTACTAG:1 + chr3R 17656509 3' - mdg3 24 2 67.36 TATATTGAATATATTTCTTTGCTCTGAATGAACAAATAAATTTATATTTTATCTTGTATCTACTTCTTTTGCAAATTCGTAGATCAATCTCCCAGCTAGCTCCTTTCTTTTTTCTTCGATCAAGTATAAATCTGTAGACCTATTTT:1 - chr2L 3820959 3' + Tc1-2 1601 1 65.07 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTGAGAG:1 + chr3L 7093068 3' - hopper 26 1 52.53 ATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAG:1 - chr3L 27356053 3' + Tc3 1680 1 66.15 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACAAGTTAATCAACCATGAACTTTAAAGCCCCGCTCTGAAATGCAAAAAGGACAGCAAAGCCACCAGCACTAACCGCACTCGAGACCCACTA:1 - chr3R 24476247 3' + 412 461 2 60.42 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTATCTTAGCTTCGAACTCTTTTACCACCATACTATCCGGCCAAAAATCACCCGAACATATGGTCGACAAGCTCGTGGCTTATTGAAATATCACGTTGGC:1 - chr3L 23909060 3' + copia 243 1 73.33 TACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCGTTGTCATTTCCGCTGGACACACGTTTCAACGACAGGAAAAAAGGCCAGGCTAGGAGAAAGGGAGAAAGCA:1 - chr2L 13704668 3' + hopper 1368 1 52.05 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTC:1 + chr3R 26520462 3' - FB 27 1 52.94 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTCATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACA:1 + chr3L 7995481 3' - P-element 81 1 26.09 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAGCTGTTAAAACCCTGGCTTCCAGGCTTTTGCAAAATGA:1 + chr2R 6632691 3' + P-element 2859 1 65.07 AATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGGGAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCACACTATATAAATAAAACCCATATTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCGTGG:1 + chrX 23280891 3' - Stalker4 319 4 63.01 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGTCGGTCATATCAGCGGCTG:1 + chr3R 12599096 3' + 412 7497 2 68.22 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATTTAATATTAATGCCAGTAGT:2 + chr2L 14201504 3' - roo 8692 2 60.96 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTTCCACCCCCTTCGGCTGGGCAA:1 - chr3R 22100477 3' - 412 29 2 68.28 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATATTTATTTAAAAAGAATTTAAGAACAGCTTTTGATAATAATAAGCAAGTT:1 + chr3R 25768860 3' - copia 71 2 71.92 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTATGTATGTATATTGAATGTTTTAATAAGAATAGATCTGTCTTAAAAAGACA:1 - chr3R 29460935 3' - accord 7029 2 69.33 ACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCTGCTGAACCAGGAACAAGCGTATTTCCCTCGC:1 - chr2L 13792557 3' - F-element 10 1 72.00 ACATCTAGTAAGACCTCACTTTAGTGTGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAAATATTATTTTATTATAGGTGCCAAACATATTCATTCAATCTTATCTCGA:1 + chr3R 30583861 3' - gypsy12 75 2 68.49 TGGACACACACACACACACACAAGATTCTGGCCATATAGGTAAAGAAAGCAAGTAACCATTATCTTTGTGACAAATTCACTTCCTCGCCTTGCGGGCAAGAAAATACATATATATGCCACT:1 + chrX 11517342 3' + accord 182 2 89.26 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGAGCAATTTTTTATGGGATTCCTATGCTTGATCTCCACTCCCCCGCGAATTGTTCTATAATTTATGATTTTTGTGGTTTTTGAT:1 - chr3L 2724932 3' - Ivk 15 1 75.34 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAATTTAATTAAAAAAGGACGCTTGAATCAATTTTTCGATTTTCTATCGCACCATGC:1 + chrX 13786961 3' + pogo 2051 1 58.21 GCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATTTGCCAATTCCAAAAGTGATCTTTTGTTAGAATAACAGCATAGACCATATAAGAAATCTCAAGCACTATTAACTCA:1 - chr2R 7020495 3' + Bari1 1698 1 76.03 AATAGCCGAGTCGATCTGACCATGTCGTCAATAATTGTTTGTGGTTTGGTTAAATCGTCAGCAAGCTACGTTTTGCAGATTCATCCCCTAGATACATATGTAGATGTCTCTCGACGCTGACAACAA:1 - chrX 15903801 3' + INE-1 102 1 73.81 CCCGAAAATTGTCTTCTAGCACGCAAATTCAATTTTTAGATTTTTCTCAATTTCACACGAGCGGGGAGAGGTCAATTTAGCCGTCACCAAATATTTCTAATGTCTTTGATGATAACGAATGGAGTTGTAGGGTTTCACGGTCC:1 - chr4 430913 3' + 1360 3196 1 75.52 TGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCGAACAACCAGCGAA:1 - chr2R 11763585 3' - Tabor 38 2 50.83 GTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTT:2 + chr2R 21402680 3' - mdg3 77 2 67.12 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCGTTTTTGTCTT:1 + chr3R 3320524 3' - 1360 62 1 68.15 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCCAAAATATTTGAA:1 - chr3R 11750158 3' + Tabor 7277 2 52.74 TTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATG:1 - chr2R 982343 3' + rooA 7478 2 45.21 TAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATGAGGCGCGTATGGGTGCAGGGTGCCTAGATGCTCTCACATCC:1 + chr3R 30921277 3' + Juan 4062 1 71.23 ATATGTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGACTACTGTTCTAGGCAACTGATTTATTTTGATTGAACTTTGCATGCAAGCAGCGGAGGCAACAG:1 - chrX 17988450 3' - 1360 201 1 53.33 AATATCTATCGATATCCCAGAAGAATAAAAAAATTTCGCATTCGCACTCCCACTACCTGAGTAACTGGTAGTAAAGAACTCGACTATAGCGTTCTGACATATTTATAAGTGGTGAGCGTTTGTT:1 - chr3R 3623859 3' + INE-1 497 1 65.32 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTGAT:1 - chr3L 96472 3' + roo 9037 1 61.64 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCAGCTGTCAAGGTCGTTTGGTT:1 + chr3R 16181282 3' + roo 397 1 77.24 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTC:1 + chr3R 26520462 3' - FB 24 1 54.55 CAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGCTAGATATTGGGAAATAAAATGAG:1 + chr3R 3321690 3' + INE-1 544 1 77.86 AGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAAATGATTGCAACGATTTTTCTTCTGTTTTCGCTTTGTGGTTGAAGGTTTGCATACATACATATATAGAGAGAAGTTTGTTCTC:1 - chr2R 6964136 3' - 1360 3154 1 54.79 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAA:1 + chr3L 19350037 3' - jockey 33 1 69.01 CCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCTGCCTAATACCATTTCAATATTTGCCGGGGCAACG:1 - chr3R 28172462 3' - hopper 83 1 72.60 CTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCCCGCGCCTCTGAAAATGTCGTACGTGATTCATTTATAA:1 + chr3R 28272295 3' + Tirant 8501 2 52.24 AAACCCAATCCATTTAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAACTAAATTGCAAACAAAAAAAAAACAAATAAACCCGAAATCTAGTTGGAATGAATTTAGCTAATTAATAATTAAAATATTTCAAATTAACATTATAT:1 + chr2R 21513651 3' + I-element 5124 1 56.25 CAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACTTACCTCATTCTATAATATTAAATAGCACTCCGTA:1 - chr3L 16212744 3' + Transpac 228 2 73.97 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCATGAGACATGTAAAAGTTAGTCCTACAAGTCGATTCCTTTATATCACCCCGACACGCGCCGATATAATAATTTTGATGACAGTGTGG:1 + chr2R 5737255 3' + 1360 3371 1 71.92 GCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGGCAGCGCAGCACAGATAAAGGAGTGCGTATCTACCGTATCTCCCGC:1 - chr3L 449347 3' - micropia 5048 1 63.49 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGCGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTG:1 + chr2R 13644519 3' - Burdock 57 2 58.90 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAAC:1 + chr3R 15022118 3' - Tabor 6905 2 60.27 ATTGATCCGGATCCAGAATATATACATACGTTTGATCGTTCAAAAGTATATCAAAAGTATTCAATAGTATCTATCCTTTTACTCAACGAGTAACGGGTATAAAAAGCATATCTAAGCGCATATCAAGCTATCTAGTTACCTTGCCA:1 + chrX 10445939 3' - INE-1 83 1 80.82 CTGCCTAAGTCCTGGTAGGTATTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCTAGTGACTTTAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAAGACCACACCTCCGTTTGTTGTGTACGAGTATCTACCAACGCCGCGGCTCAC:1 - chr3R 7729275 3' - baggins 5028 1 68.57 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTACACTCAAGAAGTAAAGTCGAACGGGCCTCGTCCAATCGAC:1 + chr3L 22900165 3' + 412 7479 2 67.42 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAAT:1 - chr3L 18658920 3' + roo 325 2 80.58 GCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAACAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTTACGCCCCGAC:1 - chr2R 4260422 3' - micropia 5201 1 35.34 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCCGTCTTATGTTTTAGCAATTAGTTACTAA:3 + chr3R 9160819 3' + copia 242 1 74.66 AAACGGAATAAGTGCATTAATTAATGCATGCAAATTAACTGCCGCCCAAGGCGAAGAGCACTCCCGAGCCGGACTACGAGATCATCGAGTTCTCCGGCCAGCAGTACTCCAACGAACCGATGAAGACCACAGTGATCAGAACCAAG:1 - chr2L 6770342 3' - diver2 425 1 71.23 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCATCTATCCACTTTAAAACATCTTTATTAAATATTCAAAAAGAAGAAAAAACTGTGTGAACTGCTT:1 - chrX 8012228 3' + 297 6924 2 55.48 AATTAAAAAATAAAAAAAAAGAAAAAATTTTCTTTTAACTAAAAGCCGCGAAAGCTTTTCCGCCATTTAGTTGCCGGCCAAAATATAATTGATATCGGCT:1 + chr3R 20467704 3' + Doc 4700 1 73.00 GCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAACATTTATATTTCTACTTAATTATTGCCTTATAGGCACCAATTGATTAACGAATTAAAT:1 + chr2R 10781228 3' - FB 63 1 62.33 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCACTTATGTCACTGACTGCTGCGACTGCGGCTGTCGTTG:1 + chrX 6138752 3' - opus 7148 4 63.70 CGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTT:1 + chrX 21667944 3' - gypsy2 6533 2 67.44 ATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGACTCTTCGCTGATTTTAGTGCTTTAGTGCTGTTGGTGTG:1 - chr3L 7092996 3' + hopper2 1537 1 67.63 ACTTAAACAATTCGAAAGACTATGTGTACCAAATAATTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTCGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTAGCATGTTGGTAATAATTTGAACAAATTTTAAAGA:1 + chr2L 11409064 3' - Ivk 5203 1 81.38 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGAACCCATTTAATATGAGCTACTGGAGTGATACCTTTAATAACCACCGAAGAGCACGTGAACAGAGACTTGGGACACAGCCATAATGACTCAGTTGACACA:2 + chr2R 20673773 3' - mdg1 7059 2 69.18 CCGCGGTGGGTTCAGGATTTGCAATCCATTACTGTTACATTGTTATTTACTTTAATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATT:1 + chr2L 22224548 3' + Rt1c 5351 1 77.86 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACAAGTTAATCAACCATGAACTTTAAAGCCCCGCTCTGAAATGC:1 - chr3R 24476295 3' + 412 7464 2 70.55 ATGTTTATTGCCTCGGAGACAGTGGCTATCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGTGTTTCTTACGTACCATTCACAGCCGGCAATCGTCCTGGCGATTTTGGTTTGGGCATTTTTATTTGCTCATTTAATTTCTGAATTTCTGAAAT:1 + chr2L 11230565 3' - BS3 1452 1 73.10 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAAAAGACTTACGAAGAATCACTTCGTGCAGC:1 + chr2L 9485722 3' - 412 17 2 62.14 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAGTCCAGTTTAAAGGTAAATAC:1 + chr3L 7962300 3' - blood 52 2 52.05 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACCGCAAAATCTATAAATAGCCGAACAGTACAATTAATTGATGCACAGACACAGTTTGGCATTGCGTGTGTGAGTATCTATGTACATATA:1 + chr2R 21371582 3' + roo 9054 2 73.97 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTGAATAAATGAATAATAATGTGACCAATGTAACGTTTTCGATAACGTATCGTACATCTTATTCAGTTGTTCCAGTACAACACTGCTAGGCAGCAATTTC:1 - chrX 16787036 3' + pogo 2082 1 65.75 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCC:1 + chr3R 27822279 3' - I-element 74 1 68.49 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACTGTTTCTTTTTTCTCCATTTTAACTTTTGTTGAATTTTTTTTTCTCATGGTAGAAACTTTGTCCATCTTTTTTCCATCTACTGAGCTTGATAT:1 - chr4 1219120 3' + 1360 3364 1 68.49 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCGGCATCCTTCATCTCGCATTCTGCCTCTTATACATTTT:1 + chr3L 27415319 3' - transib2 57 1 56.16 AATACACACACACATACACACTGCCGCACATGGAGTCATCCAATAAAGCATCCAGTGTTTTGTGGATTTGTGTAAATTTCTGGCTGAGGGCCAAGGGCGGAACACGCGTAATTCCAATCACGTGCCAGCCCAGAAAAGA:1 - chr3L 11361711 3' + accord 7101 2 66.19 ATCATATATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGATCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTT:1 + chr3R 29288806 3' + BS 5030 1 56.16 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAAGCAATATTTTGCTGAGCGAAGCCAGTGTGACCGCAGTGTGCCAGTGCGAACATGCTAGCTGCAGTGCAGCA:1 + chr2L 3466105 3' - P-element 48 1 51.37 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAA:1 - chrX 2762559 3' + roo 9042 1 60.77 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAATCTAGTAGCATGATTTTGGGGCAAGGACTTTAATTTTG:1 - chr2L 9485554 3' + 412 7536 2 72.39 GGCACGCACACACACACACACACACACACTCGCCCACCCATCCACCCACACACGCACGGGCAGGCAGAGACAGAGACAGAGATAG:1 - chrX 22461694 3' + accord 7024 2 80.00 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAG:1 + chr3R 9126053 3' + mdg1 7389 2 68.35 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCAC:1 + chr2R 10695894 3' + roo 9033 1 56.64 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAAT:1 - chr2L 19068053 3' + pogo 2036 1 65.52 CCAAATATTACTGCCTAAACATTCCATTTCCTTTATACTCTTAATCATATAATCTTTGTAAACAACTTAAAGAAGTGTTTAGAAACATCGAGCGGAAACAGTGAAATGTAGTGAACGTAAGTAAAGTTTAGTTATCTAGCTTTTTT:1 + chr3R 25085032 3' + jockey2 3243 1 58.90 GTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGTGTTT:1 + chr3R 11547807 3' - G2 309 1 60.96 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGGAATTATACGTGCAATAATTTGGATTCGTGAGTATAGACTTCAACTATTAAACTATTAAATTATATTTCTCGAGGTGCAGTGGGAGATATGACCCAAACA:1 + chr2L 2052822 3' - blood 21 2 64.83 TGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCTTAATTTAATGTGCATATATATATGTGATACGATCAGACCAGGATTAGC:1 - chr3R 13608805 3' - I-element 4943 1 69.18 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTAATATTGGCTAAAGAGTTATGTAATTACAATTCCATCAACAACGAAGTGATCAAAGTATTGTATTGCTTGGAAGAAGCTTTAAAATTCCCGTCATTGTTCTTTTCCAAT:1 - chr2L 14201320 3' + roo 397 1 56.85 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGTGGCCATTCTAGGGACTGAAATCTTAGCTAATTTATTTACCATACTCCAAAGTCG:1 - chr2L 685948 3' - roo 8687 2 66.90 TGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCC:1 + chr2R 21402685 3' - mdg3 5324 2 63.70 AAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCGATGTGGAACGATACATTTAGTTGATTTTTCACT:1 + chr3R 26520496 3' - FB 14 1 71.54 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGTG:1 - chr3L 18467162 3' - hobo 41 1 57.53 AGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAACCCATGAT:1 - chr3R 4504030 3' + INE-1 545 1 67.42 GTCTCTTCCGACAGACGAAGAAGTGGTAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGAACAGGCCACCGAGCATGCCAATAACCGAGTTCAGTTTGGTCAAAAACTAAAGAACTA:1 + chr2R 19306248 3' - diver2 221 2 54.31 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTACGACTACGCTTGAATGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTCTCGGAAAACTAGTTCTTTTTCGCAC:1 - chr3R 17897070 3' + hopper 1405 2 75.91 TAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAAAATTTGTGCGTGGGCGTTCGAGATGCGTTTTTTAGCCCCTTCTGCCGCCATTGCCCACCC:1 - chr3R 18508248 3' + G2 3003 1 60.27 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGCTACCATCTCTTCCATCTTTCTGTCCCTCTTACACTTCGTCCTCTATCTCCATCTCTTT:1 + chr3R 19531322 3' + hobo 2907 1 52.59 TAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCA:1 + chr3R 10472787 3' + mdg1 357 2 60.00 GGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACT:1 - chr2R 5917850 3' - I-element 5113 1 76.52 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGCATGGTTATTTCCCCCTGTCTACAATTGATTGGCAGTCGCGTTGAGTGGCGACTCCATATGAGGCAGGGATAAGTTGG:1 + chr2L 12415011 3' + pogo 2091 1 71.30 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCCTGTCGTTTAATATCCCAGTCGTAGCTATGAAATAACTAGCAAAATAACTCATTCGATGTTTTTCCAAAAGGCCTTGGCATTAACGGC:1 - chrX 1061494 3' - 412 32 2 59.59 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTGTATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTGGACAAGAATGTCTCG:1 - chr3R 16913342 3' + pogo 2055 1 54.48 CTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATGTAATCGACAAATCGAATATCCAAAAATACCGAAAACATATGTGCGATCGCGATTTCTTTGAGGATGAGTCAACGAAAGCGTTTTAATTA:1 - chr2L 436427 3' + copia 228 1 67.13 GTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCG:1 + chrX 16384091 3' - diver 67 2 61.64 CATAAACATTGTTGCAAAAGGGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACTATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACT:1 + chr3R 17605710 3' - Tabor 6907 2 69.23 TTTTGCACTTATGTTTTTTTTTTAGTCTTTGGTTCTGTCTGACGGCATTATTGAAATTTCTTCTATCACAGAATACCGTCCATGTTTTCAACTCGATCGTGTTTTTACATATTATTTGATTTTTTTTTT:1 - chr2L 3119163 3' - gypsy2 406 1 64.34 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCTAAAAAGCATACTTTATTCATTTACGATCCTAAATATTTATTACTACATATATACATACATATCTGGCCAGAACATTTGTTTACCTCCTATCGAC:1 - chr3R 23859787 3' - jockey 4786 1 68.49 ATAAGTACGAAATCTCCATACCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAGGGTCGAACATCCAATTTCGTTCAATTTGCTGTCAGATTTATTGTCAGATCTAACGGATTTCTCCGATATCTGCATGGTGCGACATCTGTTGGAGTAAAG:1 - chr3R 4830747 3' + GATE 337 1 77.40 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATGTTAAAATCATTTCCTGCA:1 + chr3R 10472808 3' + mdg1 7415 2 54.79 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGGGAA:1 + chr3L 7995514 3' - P-element 56 1 47.26 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGC:1 + chr3L 19350004 3' - jockey 71 1 54.79 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCAACACTGTCGTTTAACTATTTCATATTAAGTTAATTTATTTATTATTGTTGATT:1 - chr2R 16441767 3' - I-element 22 1 70.55 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTGTTGATGGG:1 - chr3L 22052736 3' + mdg1 378 2 55.24 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCACACAGAATTGTTTTAATTTTAAAATTATTGTCATTAATTGATTTTTGATACAGAATGTAGAGCGCTGTT:1 + chrX 7518982 3' - roo 37 2 52.74 GAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTTTGTATGAGAACATACATACATACATAGAATACTCCGCACCGGATGAGATAGCAGTCTGCAACTTGGCCTCCATTGCCCTCAACATGTTTGTAACGCCGGAGAAGACGTA:1 - chr2L 10326123 3' + 1731 33 2 58.62 TTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACGCATGCCACGGCATTCCGTTCCCCAATCAGTCCCCTTCCATCCCGATATGCCACCATATCCCCCATATGCCCGACTTCATTGTTTCAAACTGCAGCGAGCAATAAA:1 - chr2L 9198221 3' + S-element 1704 1 74.66 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGGAAACTACCAGCCAAGCATCATCATCTGACACATTC:1 + chr2R 5955065 3' + copia 240 1 71.32 CTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCCCAAATTTTCGCGATTCAAATACATATAGTATTGTACAATCTGCCGCAGCGAATATTCTAGCTG:1 - chr3L 8729184 3' + R1A1-element 42 1 63.20 TACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAAT:1 + chr3R 11547778 3' - G2 338 1 59.59 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACCCATTAAGTAACCCCAACTGATCGGCGCAAATGATTCAGCTATGCAGAAAATATGATTGATGATT:1 + chr2L 12553519 3' - 412 56 2 54.11 AATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATACGCCGAGTGGTTTAGATAGCAGTTTTTGCAAGTGCGTTGTATTTACTAAGAACTTGAAAACTCCTGTATATCTTTTC:1 - chr2R 19553160 3' - mdg1 43 2 56.16 TAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCGTAGGCCAATCGTTAATTTCACTCTCTAAAGAAGGTCAGTTGGTT:1 - chr2L 3294126 3' - hopper 69 1 67.61 CTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGACTCACTAAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGCTTACGGCATAGTGTGCTTCCGGTAGTGCCTCGTTA:1 - chr3L 3652778 3' + Chimpo 26 1 81.51 TACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGCTTACAGCGGAAAGATTCAGAATATCACAATTTCACTAGCGGGCGATTTTCTGTTCCTAGTTATATGCATTCTTTACACATAAAAAACAACAAAC:1 - chr4 49226 3' + 1360 3255 1 65.07 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCTGCCCTACCTGGCCATGTGGATTCTGGCC:1 + chrX 4785187 3' - roo 45 2 55.48 GGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTAAAAACAAATACAACAAAGCAATAATCGTAAAATATAACACATTGAGCATGGAACGGCAAATACAATCGATTAAAATTAA:1 + chr3R 21786262 3' + roo 8892 2 51.37 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAAAGCCCATTAAAGTGACTTA:1 - chr3R 30634897 3' + roo 400 1 78.23 TGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGGCGCACAAACCGGATTTGAAAAAGCCTTTGATATATTTTAAAATTATATTAATATTGTACATTTTAGCCATTTGCAAAAAAACG:1 + chr3R 1342632 3' + invader4 3022 2 68.47 AGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAAGTTATTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTA:1 - chr3L 20095766 3' - BS 4844 1 74.66 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAGCTCACACCTGTTTGCACGTGTGTGTGTGTGAGGGTTGCTGTCTGTGTGAGTGAGTGCAAGTGCG:1 + chr3R 13628675 3' + hobo 2909 1 47.46 GTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTCAAACTTGAAACGTAATATTTTTCTCTCTGTACAATGATTCGCAACGTCGGACTCTTTGTGTCGAGAAGGAAAGTGCGTTTATGATTCAATTTTATTTTCTCTTTTTATTATTTTTGCTT:1 - chr3R 26519898 3' + FB 992 3 75.34 ATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGGGGATGTGGCAAGGGGGCGGGGCGAAGTGACGACGTCAGCAGCGATTTATTTCGCGACAGTTTGTTGTTCATCTTTTTTTT:1 - chrX 18002106 3' - accord 7031 2 79.17 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATCCCGTTCACTGCCTGAGCTCCATGAGCAGCAGCTGTTGATCCCGCAGAGTGGAC:1 + chr2L 10697499 3' + mdg1 7407 2 58.46 CATAAACATAAACATAAACATAGCAATAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTATTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATATATGGTTCTGTA:1 + chr3L 12224703 3' - 412 75 2 67.59 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCAAGAACCCGATCACGC:1 - chr3R 9160642 3' - copia 21 2 69.63 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTTTAGGTGCCGTTAGTTTTAGCACCCACTCCTC:1 - chr2R 11057216 3' - pogo 21 1 68.97 AAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTGGACAA:1 + chr2R 2879480 3' + Stalker4 7051 4 49.65 TTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAA:1 - chrX 13531627 3' + roo 317 2 80.82 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATATAAAAACTGGTATAATTGAGTGGAGCTTCGTTC:1 + chr2L 20884227 3' + 297 6941 2 77.40 TATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTT:1 + chr3L 11399999 3' - Quasimodo 70 2 68.49 AGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAAGACAATACAATAAATAATAAGCTAATTGGCTAGGCAGGGGTATTAAATCCT:1 + chr3L 16809976 3' - accord 172 2 53.10 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACC:1 - chr2L 2031049 3' - 412 7137 2 74.66 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACAT:1 + chr3L 19350019 3' - jockey 56 1 54.79 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGAAATACCCAAAACTCCATCCAGAATCGAAGAGTATGTGGGCAGAAGGAG:1 + chrX 8012341 3' - 297 6620 2 62.81 TCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATTCACGACGTAATTGGTTTCCAACGTTCACACATCATCACTCATACGCACTGTGGCCGCTGGCAGC:1 + chr2R 19352069 3' - Burdock 6185 2 52.82 GCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTAAATTCCCTTGTAGTTCTACAATTAAATTATTCAAAGGAAAGCATACACTAATTAATAATTGTTTAAATTTACTGTGACATTTTATTACATTTGACTTTGGTAC:1 - chr2R 7727083 3' - BS 4679 1 66.44 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGTGTTAAATTTAGTAGTAGTAATAGTAAAGTTGGTACTTGTGGTACAAAAGGTTTAAGCAGTTAGAAAGTCAATACACCATTGTTTTGCCGTATTTAATATTGGTTTTAGCCTTTC:1 + chr2R 12240997 3' + copia 249 1 38.36 AACAACGCCGAAGACTGCGCAGGACGGCCGCTTAGCGTAGGAATAGCTCAAGAAAGGCAAGTTAAGGGAGAGCAGGACTGTCCGCAATTGGTTC:1 - chr2R 3463296 3' + G7 1027 1 78.72 ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGGGTTCAAGAA:1 + chr3R 17656462 3' - mdg3 5309 2 61.54 GCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATTATTACTTTGCCTTCCATCCTAAGGTTTCCTGGTCTTCAGCTTCAGTTTGGTCCTGTTGCACGTGCTGGTAGCAAAAAAGATTGTTAAAAACCACTTGATC:1 + chr2R 7020692 3' - Bari1 22 1 71.23 CAGCTAACTTTTGTTAGCCGGCGGGCCTGAAAGGGGTCACCAAGGTGACAAAGGGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAAGTGACTTTAGTAACTGGTTTTAAATGATCCTTTATATACATTCTCGTTGCCCCAAATAAA:1 - chr4 353427 3' + BS3 1679 1 58.90 GTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCA:1 - chr3R 14860147 3' + BS 5025 1 65.07 TTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTTTGTGTGGGGTAGCTGTGCTCAGTAATATATAAACAGCTGTGCTGTTCGTACCAGAACGCACTCAACG:1 + chr2R 7665858 3' + Transpac 5180 2 53.42 ACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACATGGTCACTTAAGCCTGTAAAACAATAATAAAAAGAAATATATAAAAGTTAAAATGCGAACAGTGACCATAGACCTCAATCAGTTTTTGTGCCTTGT:1 - chr2L 16950312 3' + Tabor 7321 2 80.00 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCCGTAAGCCTGCCTAGTGATAATTGCAATTAAATTCAGTCCCTGGCTAGG:1 + chr2L 2030088 3' + 412 440 2 59.23 CGCAGACGGATTGCATTTGGCTAGCTTGGACTCTTCTAGACCAAGTACAAGGCAGTCGTAAAGGAGTCGTCAAATGTCCGTATAAAGGAAAAATCGCAAAATTTACTGCAAATTGGAATTTTGCGCAATTGTAGAAGGCAGAAAAA:1 - chr3R 10524048 3' + Tabor 7142 2 50.68 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCC:1 - chr2R 11133564 3' + roo 325 2 74.66 ACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAATTTAAATAATTAAGGAAAAAACAACCACTAAGTAGGGCCCAAATTGAGGTTAAGTTTACGGAGAGTTATAAAGTGATTGGTAGTCCGAAATGGACA:1 + chrY 380970 3' + G6 2002 1 64.14 AAAATTAAAAAAAAATTAAAAAAACATATCTGAAATAAAATCATGTATTGTAGGTTTAGATGTTGTAAACTACATATACATTATACATACATTTTTTGTACAAATAATTTAATAACATTTTAATACAAAAAAATGAGATTCAAAG:1 - chr3R 7614304 3' + Doc 4698 2 71.72 CAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTG:1 + chr2R 8641597 3' - diver 64 2 59.59 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGCCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGATTATGAG:1 - chr3R 19589873 3' - BS 5015 1 65.52 TAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGAAGAAATTGAGACTAGCGTTTTCGATTCCCCATTGAAATCGGGT:1 + chrX 1061610 3' + 412 418 2 69.18 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGACC:1 + chr3L 10144730 3' - blood 7095 2 80.14 TTTTTTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGGTTCACAAGTACAATGAAAATTCTTAGAAAGCACCAAGGTATTTGAGTCAACATTGATTTGCTGATAGGAAA:1 + chr3R 10831767 3' - Juan 4073 1 47.86 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTTGGCAAGTTCTGC:1 + chr2L 5202568 3' - 297 21 2 56.47 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTGATTTTCTTGTGTTTATAGCTTC:1 - chr3L 96452 3' + roo 394 1 75.34 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCAG:1 + chr2L 246119 3' + roo 392 2 72.44 CTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAATTATCT:2 + chr3R 11750262 3' - Tabor 6911 2 65.75 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGTATCTGTATCTACTACAAGTAACATTGTAGCTCGAGTTGGCTAATTATGGCTACGTGGCG:1 - chr2R 22305980 3' - pogo 38 1 54.40 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAATATAGGATTG:1 - chr2R 10695779 3' - roo 8729 2 63.01 AGCAGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCATTTTCT:1 + chr2L 11951620 3' + pogo 2051 1 56.39 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCCACTTATTTATTAATTACTCAACAGGCTGGAATCTCTGGCCAGAGCCCGTCACTTTGAGCAATCCATAT:1 - chr2R 20865651 3' - 412 7106 2 56.85 CAAAAAAAAAAAGAAAAAAAACAGGCATATTAACTCGAACAGCG:1 + chr3R 5623592 3' + R2-element 3585 9 90.91 CTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCTGCTGTGCCAAAGTTTTTTTTTATACATATCAAGAATAAAAGC:1 - chr3R 9352007 3' + Tirant 8448 2 65.38 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTATGTTCCTTATTAAACACATTTCAACGGGTATATAAGTTTTGTTAAGGGGTAAATGTAAGCCGGACCCATTTAGCTTACC:1 + chr2L 8542070 3' - pogo 25 1 48.89 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCCGGCATTAATTAAAATTTGCTTCAAATTATTTCCCAGCGTTTTCGTTTTTTGTTTGTGTTAACCAGCCAGCTGCCTCTGCTTGGCAAACAAAATTTGTTTGACTTGCTAAT:1 + chr3R 27859329 3' + hopper 1410 2 80.14 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGGGGCAGTGGGGCATGTTGCAAATGTGTCTGCGCTGTAGGCAGC:1 + chr3L 15276755 3' + hopper 1413 2 79.09 CCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCACTTATGTCACTGACTGCTGCGACTGCGGC:1 + chrX 6138744 3' - opus 13 2 71.43 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATGGGCACATACTACATTATTTACACACGTAAACTCATATGTGGTGCAGTATTTCATGTTTCTCCCCCCTAAGTCGTTTG:1 - chr3L 16358654 3' - 412 7114 2 58.22 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAGGA:1 + chr3L 17133876 3' + jockey 4938 1 64.38 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAA:1 - chrX 14964617 3' + roo 9006 2 67.12 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTCGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGGAGTAAACACTTTGTCGACACTTCCATCCAC:1 - chr3L 7995396 3' + P-element 2841 1 53.42 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTGGAGTATAAAGAGGGGTATCCAGTTGGGGAACTGGGGATTTGCGTGCGCACGCGTACAGCGCCAAAACGAATTAAATGTGATGCACCAGCAAATGATAATTCAATTTTT:1 - chr2L 16458533 3' - roo 11 2 76.71 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGAGATTGAGATTGTTTTGATTCAAGAACTTATATTGCTTATATAGCAGGTTGTGATAGAACCTTTTTCTTATCTCGGCGCCTCAT:1 - chrX 19536871 3' - roo 8702 2 58.22 ATATAAACCAAAACAACAAAAACGCAAAACAAAAAATAAAAAACCCCAGTGCAACTGCACTAGGCGAGTGAAAAACAAAAACCACGGCCGGTTTATATGTAACATATATAACGAAAACGCACAGCAACAGCAACAACAACAATACA:1 + chr2R 13630172 3' + gypsy9 449 1 41.78 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCCGGCATTAATTAAAATTTGCTTCAAATTATTTCC:1 + chr3R 27859252 3' - hopper 32 1 60.42 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGATAAAGGCCCGATCAGGTGCATACATAATAACACTGCTGGCCGCATGAAAATTAAGCGACATTGTTGCAGCAATTTTCATCGTTAGGCGAGAGAACGCCGCGCCAC:1 + chr2L 166381 3' - mdg3 5294 2 75.18 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTACAAACGGACACTCGCAAAACGCTGGGCTAAAAGTTTTTCCTTGTCTCACACAATGCAGCAAGAAAAAGGATGCAGAAA:1 - chr3R 15810872 3' - mdg3 55 2 54.07 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATCCCGTTCACTGCCTGAGCTCCATGAGCAGCAGCTGTTGATCCCGCAGAGTGGACGGCATCTACTCCAGATCCAGTTGCTCCTAGCACTCCATGGGCAGCCTG:1 + chr2L 10697373 3' + mdg1 409 2 69.57 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGGGGCGGACTTGTTTGCCCCAGTGGCTTCTGACCGAGAGCAGATTGAAGGAG:1 - chr2R 6842765 3' - roo 8717 2 59.85 AAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAATGCAAACACCTACTGCTTAACAGGGATAATATCGTTTTGTT:1 - chr3R 19223072 3' - FB 81 1 76.03 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTAT:1 - chr3R 31490940 3' + roo 9000 2 64.38 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCCACCACCGCACCCG:1 - chr3R 12599041 3' - 412 80 2 71.23 GTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTATGTGTGGGTGGGTGGAAAAGAGGCAACAGTTTT:1 - chr3R 15711765 3' + diver 175 2 52.14 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAACGGTTGAACTAGGACATTCAAGTACCCAATATCGATATTGTGC:1 + chr3L 23042161 3' + pogo 2069 1 61.27 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGAATGCACTCTCTCACT:1 + chrX 14951161 3' + P-element 2790 1 15.71 AAATGCTGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACAGGGCAACGCATACAATCCCATATACATACTTATAAACATACTCATACTTTCCGACGTTGTCGTAAATTACGAATAAACCACAAATCACACATTATTACAGC:1 - chr2L 19846621 3' + ZAM 145 2 58.21 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTCAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACATTGAACTCATTCAACCGGAAACCATAAT:1 - chr3R 27794804 3' - roo 64 2 74.79 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGGAGAAGGGAAATGTGCTGATCAAATAGTATTAGTAACACTAATAGTAATATTTAAAATCTTAAAATATTTTATATA:1 - chr3R 20743953 3' + roo 9027 1 54.79 TGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAATTATCTGGTTTTTAATGTTAATCTTAATTAAACTGTATTACATTTTCTAGTTTTGCTA:1 + chr3R 11750314 3' - Tabor 6859 2 72.60 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGGGCACTTACCCTTTTTTAGCTCTACTTTACTTTAAGCTACTTGCTGTTACTTTAACACACTCACACATTCCTTCCCCAGCGGGCGAGCATTGAAAATCGATGGCA:1 - chrX 6312608 3' + 412 478 2 69.86 GTTATACCCAATCATTTATTGTTTTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTGATAAATATTTGCCTTGCCCAAAAAAGTATGCTACACATTTTGCTCACCACGGAGTATGAAATATTCGAGGCATTTTCCGGATT:1 + chr2L 1839286 3' - Stalker 6882 4 60.27 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCCATGTTCGTGGCTCTAACATCTTTCCATCGATCGCCG:1 - chrX 17805964 3' + roo 9055 2 55.00 CCACGGCCAAAAACTCGTGTGCCATAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACGTTTTG:1 + chr3R 10266166 3' - 1360 47 1 52.80 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTAATTAAGCTGTCAATCTCTTTGCAACCTATATAAA:1 - chrX 14964565 3' + roo 395 1 74.66 CTGGCAGTACCCCAAAGCTGTATACCATAAGTGGTTATTTTCCAGAGTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGGTAATCTTCAACCTTTTATTGATTTATGTAGATTCGACTTTCGGATGTGTGTGAAAAGTTTTGATTTTCG:1 - chrX 5037361 3' - G4 3442 1 68.49 GGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCCATGTCATGGAAATATGACAATACAGATATACAAATGACTTTTTCATTT:2 - chr2R 4012511 3' - F-element 305 1 66.44 CGGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGATATATTGGAATTCTAATTAACTACACATCTCCCGCCCGCCAGTGGCACATCCT:1 - chr2L 18317479 3' + mdg1 325 2 79.45 TTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGAAGTTCATACGGACAGATGGACAGATGGACAGACGGACATGGCTAGATCGATTCGGCTATTAATCCTGATCAAGAATATAATAGTCGAAAACGCTTCCTTTTGCTCT:1 + chr3L 19058058 3' - INE-1 154 1 75.74 ATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAACCTTCTCTTGCTGGTTAACTCCCGTTTAAAGCCCACACGTTTGATAGATATTCCACTTCGAATTAAGCTCTAAGCTCTACATAGA:1 - chr2L 20241260 3' + Ivk 397 1 56.85 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGCGATGCAGCAGGCCTTAACAACT:1 - chr2L 15834452 3' + hopper 1378 1 51.26 GGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTATGATGATGCCCGTTGCCACAGTCATCTGAGGCAAATTCACTAGCAGCAA:1 - chr2L 21870065 3' + roo 8876 2 63.97 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTGAATAAATGAATAATAATGTGACCAATGTAACGTTTTCGATAACGTATCGTACATCTT:1 - chrX 16787076 3' + pogo 2042 1 60.96 CCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTCGTGATATTTTCGTTTTTTTCATTTCCCTCGCTGCCATTTAATGCCGGC:1 + chr3R 4528439 3' - F-element 44 1 58.02 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTAAGTCTTAAGTCGAAAAAAACTTCCAATGGCAACCGCTGATTAAGCTAATTTATCTTGTTTTT:1 + chrX 18409573 3' + jockey 4928 1 61.64 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGCAAAATCTATGCCGGCATTCTTACTTTGATATTTTTTTCTCAGAACTAATCAG:1 - chr2L 17136105 3' - hobo 24 1 64.38 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGACCG:1 - chrX 12191525 3' + pogo 2050 1 53.42 CAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCT:1 + chr2L 12340809 3' - diver 5957 2 69.77 TATCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCACAACTTTCTTGTATAAACTAATAAATTAATATTACAACTATTATTCTTGTCAACCTCCTAATCATAACATATCTAACTGAGGGAAGTTGGACTGTAT:1 - chr2L 8371337 3' - 1360 2969 1 66.44 AAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATACATCTTTTAAAAAAATCCACCTGAAAGAGCTGTTAAATAAAAAAGCTTGCAAATAAAAAAAGAGATAATAAAAG:1 + chr3L 8855984 3' + rover 7256 2 49.32 TTTTTTTTTTTAAATCGGCATACAATAAAGATTTACAAAAACATTGGGTTTCAAAATTTTGAAACTTTCATTGCTTTTT:1 - chr3L 18350026 3' + FB 186 1 87.34 ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGATCAATCAGCGCTGAACAAAAAGTGAGCGATGGCCAAGTGGAAATTTAAACGAGTT:1 + chr3R 15924715 3' - Quasimodo 33 2 63.70 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAATTCTTTAGTTGTCAACTAGTAATCAACACATTTAAATGCACTAATTGCACAAAAA:1 + chr3R 5453715 3' - 412 7119 2 68.49 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACATAACGAAAGATGTCGGTGGCGTTGGCGTCGACCCGCACCGTTGACCGTTTCTTTTTGAACACATTGGCTG:1 + chrX 3433588 3' + S-element 1702 1 69.03 CAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATA:2 - chr3L 24152413 3' - HMS-Beagle2 33 2 61.64 TTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAATGGGTCGGTAATACCC:1 + chrX 21667987 3' - gypsy2 6507 2 77.40 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGTGTCCTTCACAGTCACAGTCACAGGCACACACACACACAGTCGCACATTCACACACACATTCGCAGTGCGTGTTTGTCAGTCTAACTGTGTGCTCAG:1 - chr3L 4001041 3' + hopper 1394 1 41.10 AAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATATCGCTTTTAATATCTATAAGTTAGTTTGGTAAATCGATGAATTTAAACT:1 - 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chr3L 11776683 3' - mdg3 73 2 68.12 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGCGAATCATAAATATGCAGCTGTCAAGGTCGCTT:1 + chr3R 16181278 3' + roo 9055 2 71.23 AGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTGCGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTGCACTCAACGCGGCTTAAATCAAAT:1 + chr2L 6717170 3' - jockey 101 1 77.93 AAATTATTAGGGCCGTCTAATCATAGAACAGGTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATATTACTATGTGGCACCCATTTGTACTC:1 + chr2R 12657552 3' + F-element 4552 1 80.82 TTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGT:1 - chr2L 9485626 3' + 412 7459 2 77.86 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGGCCTGCTCCGATTCGGAATCATTAAATAGACGACAGGCGAAATCGAAA:1 - chr2L 11951526 3' - pogo 48 1 60.48 AACCACCACAGATCTCCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTCTTTAGAGCGCTTCGGTGGATATACGGGAGCACAGGAGCGGCGG:1 - chr2L 9792930 3' + HMS-Beagle2 6791 1 60.22 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATTTATATATCCGGAAACTATTCCTTTTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTAAGTCTACGAGTAACGGGTTAACGGTAACGGGTAAGTAACGG:1 - chr2R 2317350 3' - HMS-Beagle 6815 2 75.34 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACCCTCGC:1 + chr3R 21001887 3' - 412 73 2 68.49 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCA:1 - chr3R 29418685 3' - mdg3 5327 2 70.29 CTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTTCAGACTCTTGAAAGTTTTTCATAATTTTCGCTATTACCTTTGTTAAGTGCTTGAATGAACCACCAT:1 - chr3R 11113132 3' + mdg1 7437 2 69.86 AAATGTAAATTAAAATTTTAATAAAATTTCAAATAAAACACATTAACACATTAATTGTTTAAACAGATTTTTGATGCTTATATGATCGCTTTAAGTACATATATTCCCAATTAAGATCAGAAGTACCCGGTATGTTTAAAATAAT:1 - chr2L 7579162 3' + 1360 3048 1 62.07 ACTTAGTAGTTTGAGGTGTGAAATGAGAATAATAATGAATTCTTTATTACAAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCCCCACGCCCAATCAGCGCCTGTCAATAAACATTACTCAT:1 - 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mdg3 5312 2 55.48 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACGTCTCGTTCGGCTAACGTGCACA:1 - chr3R 21001809 3' + 412 438 2 65.38 GAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGCAATACAATTTTTATGCGAAAACTAATGTAAAAAAGTCGAATATCAATTATTTTCATGGC:1 + chr2L 2657330 3' + diver 164 2 59.59 GAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTAATCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATCCATGTAAGAGAAATGGTTATCAATAAATTTCTAATAATCAAATAACTGAAGCATGAATAATGCATT:1 + chr2L 14836565 3' + Stalker4 7160 4 53.79 AAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTCGGGAGGTATTTAGTCTAATGCTTTTCGAAGCAGCTATTACGCGTCCAAATGGATTCAGCATGAATATGTTT:1 - chrX 22853367 3' - FB 50 1 51.37 GCGGCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACTAACGCAGAAAATCAGAGTATCAAC:1 + chr3R 435971 3' + 1360 2997 1 52.74 AGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTT:1 + chr2L 23372630 3' + Gypsy6A_LTR 281 1 51.37 ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGTGTTAAATTTAGTAGTAGTAATAGTAAAGTT:1 - chr2R 12240114 3' + copia 186 2 77.60 ATACTATCTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGTTTTTGGCCAAATTATAAGCAGTCGCGGGATGACTCTATAAAATTAACATTTATCAATGTGAAACACTCAATGTTGGGTTTAAAATAGCGCCCATTTCACTGAATTTTC:1 + chrX 22938837 3' + Transib-N1_DM 444 1 72.03 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTGTCGCCGACGCTGCTCTTGCATCCGCAAAATGTACA:1 - chr2R 11609180 3' + roo 9053 2 68.89 GTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGCAATAACAGACAGCATCAACATTTGCTCCCCCAATGCAATGCAATGGATAC:1 + chrX 6510106 3' - jockey 4730 1 57.34 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGTAGACACAAAACTATTTATGCTAACGGT:1 + chrX 4701192 3' - P-element 92 1 21.53 GCTGTGAAAATTAATCTGATCCCCAAGAGGTAACTTTCAGATCTCCTTCGCAGGCCCAGGGTGCGCTCTGTGTTCCTTAGCTGGATTTCTATTGTCTCTGTCCGGTTCGTTCACTCTCAGCTGCCCGC:1 - chr3R 902782 3' - G5 4539 1 63.28 GGATCTGTCGCATTTGAACTTGGCACAAATTTCCTGTTTGTCCAACGAAATGATATGAAAAGCTCGGCATTTCAATCATAATGTTCATCACGATTTTTTCCTGTTTTCCTTTGGGGTGGCATAGAGATGATGGTGGTGACTTATTG:1 - chrX 12233877 3' - pogo 438 1 73.97 CTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTATGCTCTTAGCGGGTTTAACTAATACAAGTATATTTTATTTACAGTACTTGTTGGATTTTTATAGGGACTTTTAAACGTAAAGCAAATCGAGGGATTTA:1 + chr3R 31938998 3' + 1360 3247 1 58.22 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCAAGAACCCGATCACGCTAA:1 - chr3R 9160639 3' - copia 29 2 66.44 CCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAATGTGATCATGATGTATATGATTCATGACTTTTC:1 + chr3L 12059193 3' - 412 479 2 77.40 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTGCGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTGCACTCAACGCGGCTTAAATCAAATGCCCAAA:1 + chr2L 6717177 3' - jockey 95 1 73.97 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCAGCTGTCAAGGT:1 + chr3R 16181273 3' + roo 388 2 71.03 GCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGATCCGCTACTGAGCTGACAAGAGAGCTTCTGTGAGTCGTGCTCACAGAAGTAGAACATGCATTGCCAATTAGCGAGAAAGTGGAGATGTACGGGGGCGAG:1 - chr3R 2831904 3' - Tabor 6 2 79.07 ACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGCGAACAATGTGCCATCCTTTCTCTACCTCGGTGACTACCGAATCAGCGGATCCTTCCAC:1 + chr3L 22648429 3' + Tabor 480 2 78.36 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAA:1 + chr2L 11951601 3' + pogo 2070 1 61.05 TGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGATACTTTAAATCAGCAAAAGGTCTTAGGAGCATAAATTACAAATACGTCTAACTGGGCA:1 - chr2L 5601552 3' + mdg3 184 2 56.85 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATTTGAAGCATATCCATATATTACCGAGAATAATAAAATTATGCTGCATCATACATACAATCGG:1 + chr3L 19792532 3' + pogo 2047 1 57.53 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCAACTCGTTACTCAAAGCA:1 + chr2L 686103 3' + roo 9028 1 56.16 GTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATTTATATAAACGCAATGAACAATACAGTAAAAGATGTAATTACTAAAAATCTCCCAGACAGACTCTACATGCAATTAGCTAGGTTTGACATAACA:1 + chrY 1738415 3' + rover 320 2 67.12 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACGTCT:1 - chr3R 21001828 3' + 412 7473 2 79.84 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAATTATCTGGTTTTTAATGTTAATCTTCATTAAACTGTATTACATTTTCTAGTTTTGCTATC:1 + chr3R 11750316 3' - Tabor 6853 2 74.65 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCAATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCG:1 + chr3L 22052876 3' - mdg1 4 2 76.11 GAGCATGTAGTAGGGATTAATGGATAACAACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATATATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGGAAAAAATAATAATAAAAAAAGTTTATACGTA:1 - chr2L 19817851 3' + G4 3751 1 76.71 AATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTTTA:1 + chr2R 4206661 3' - 1360 317 1 74.66 AATTATTTTATTTTATTGACTAACGTACTATTACCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATTTTAACGATTCTTATTATTTAAGTTATTTATATTTCCATTCCGACCTTATGGCCACCAGGGGAATTTCGTCCCACGCT:1 + chr2R 5837401 3' - jockey2 3377 1 67.12 ATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAATAAAAAATTTAATAGCTAATTATTTAACTAAATAACAGCGCTAGAAATATTTGACTTTACATAAGATCTTTTTTACAACTTAAGATTAATAGATATTGAATCGTGAAACTGTTGG:1 + chr3R 13582347 3' + BS 5081 1 74.66 GACAGTTCTAGAAGAGGAGGAAAAGCATGAGAATTTGTTGCCAGCGAAACACCGGTGTCATTGTGTTCGCGGTTTGCCCTACCCTTCCTACCCACTTTCCTTCAGAATGCCCATGGTACAATACATCAAACATGCTTCTCTTTTGT:1 - chr2L 9691589 3' - Gypsy12A_LTR 2026 1 72.60 ATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGCCTTGCGAAGAGGAAAATTCGTG:1 + chr2L 18279986 3' + gypsy5 7292 2 55.48 ATTATTTTCACTCAACTTAATTTAGTAAATTTCAGCTTAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTTATCTTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTATTGTAT:1 - chr2R 545173 3' - Bari1 1464 1 51.37 TATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACGTTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCTCTGAAAATGTCGTACGTGATTCAATTATA:1 + chr3R 28272294 3' + Tirant 314 2 76.71 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACACACACACACACACACACTTGATATGACACCCATGTAATCCTGGCTGATGCAATATCTAAATTAGCTACATCACAACCACTGCGCTGATAAGAGAAA:1 - chrX 13395220 3' - roo 8671 2 66.42 CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGAAAATGACTTTTCTGCTCGACT:1 + chr2R 17890970 3' - Tabor 6901 2 58.22 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGGGCACTTACCCTTTTTTAGCTCTACTTTACTTTAAGCTACTTGCTGTTACTTTAACACACTCACACATTCCTTCCCCAGCGGGCGAGCATTGAAA:1 - chrX 6312618 3' + 412 480 2 68.66 CTATGTCCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCCAATGGCCCCTTAGGTGCCCTATGTGCGGAGAAACACAAATAAGCGTACAATTTACGTTTTCGGAGGCAAAATACTCACGCCTC:1 - chr2R 12630557 3' - Gypsy12A_LTR 1939 1 60.53 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTA:1 - chr3R 19589883 3' - BS 5025 1 61.38 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATGAGTTATATATCGTAGTATTTAACAATTTCAACAACTAAGCATTTAAAGAGTAATTTTTGAAT:1 + chr2L 2698451 3' - I-element 32 1 52.46 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATG:1 + chrX 20999605 3' - BS 43 1 51.37 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTTAATGCGGACCAAAATATTGTTTTTTAAAATTTGCCGCCAGCTTTCGATTCATTGCACAGCCACCCTATCGATATATC:1 + chr2R 22492148 3' - pogo 40 1 55.17 GGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTC:1 + chr3R 9160735 3' + copia 5028 2 79.45 AGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTT:1 + chr3R 9190569 3' + Tabor 422 2 73.11 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATACAATACATATGTGCTGGACCATTCTGTGTAACAAATCGCTTTGATGAAAG:1 + chr2R 12787909 3' - 297 52 2 66.42 ACTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATGAACGTCGAGATCTTACGAACTATAATAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGACTGTAGTATTCTTTCTTTAAAAGTATAAAAATGTTGAATAGCAAAACTCTTTGACT:1 + chrX 19329481 3' + INE-1 86 1 67.81 CAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATAATGTGTAAATAGAATCAAAATT:1 - chr2R 18482414 3' + hopper 1349 1 63.01 TGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGTTAACAATCAGTCCACTATTTCGTTATCTGCACGGCGAAAATCAATGGAGAAGTGTGTGAAATAATGTGCGAG:1 - chr3R 13686543 3' - FB 45 1 53.52 GCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCAAGAACAAATGTAGTGCAGCCAAAATTTGTGGAAATTAAAATAAATGAAATAAGCAAGAAAAGTAAAGAAATATCAGAAGTGACGCAGCAGTTTTTCCGTATCATTTTGTTTTTTTTT:1 - chr2L 23317447 3' + 1360 452 1 28.08 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGTTTTAGGCAAGTCCCAGAATGTTCCCCAACAACGGCTGCCAGGCTTAAGTTTGCGCCTCGCTGACTCTCTATCTATTTGGTTAATTAACGCA:1 + chr2L 15988108 3' - roo 8681 2 71.85 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTCAATCAAAACATTAAGGATAGTTTTTATTTAGCTGCTGTTCTGCGTGTTGTAATTTTACTATCC:1 + chr2L 16399417 3' - roo 8720 2 58.90 TTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTATCTCATGAATTCTTTCCGCAGATTGTGCAATTAATCAAGAGCTGAAAATGTGGAAA:1 - chr3L 19204558 3' + opus 425 2 60.96 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTAGTTGTTTTTAGATTTAATTTACCATAAATCTATATCTAGGTAAATCTATACCTAGGTTTGGTGAT:1 + chr3L 4187299 3' + pogo 2049 1 58.22 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGACGCACATAGCACTCACACACATTCTAAAAACGATCTCTCCCAAAAATTATTGCCACTGTGTGCGTGTCTTTTATCA:1 + chr2R 21076120 3' - P-element 36 1 58.99 ATAAATAAATAATATTATATATTTTATTAAAAATGTGGGTGGAAAATTTCACATTTCATTCTCGCCTCGTCGCTAGGAATTTCCAAATGAAATATTTGACTTTTAGTCTAAAAAGTCAGCAGAAAAGATGGCCAAACAGACTGCG:1 - chrX 4836660 3' - Tc3 259 1 73.10 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTTTTGTTAAACAACTGTATTCTAAGGAAGAATATGTTATGGAAAAAG:1 + chr3L 9909832 3' - Transpac 12 2 76.03 ATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTGCCGGCGGCCTCCTGCTTCTATTTT:1 + chrX 21947758 3' - mdg1 7062 2 67.48 ATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACAAAGCTGTGCAAAAATATTTGGCTTAGTATAAAACCCATTAGCTAGTCGAATA:1 + chr2L 1260066 3' - Burdock 8 2 75.34 ATCGAGGCATTGCGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGCATGGTTATTTCCCCCTGTCTACAATTGATTGGCAGTCGCGTTGAGTGGCGACTCCATATGAGGCAGTGATAAGTTGGGG:1 + chr2L 12415013 3' + pogo 2074 1 64.18 AAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATT:1 - chr2R 7020570 3' + Bari1 1681 1 61.36 AGGAATACGCGATACGCGGCATTCGGCGGCGTGAGCTAGACGGCAAAACAATGTCGATTGGAGCCGGCGAAGGGTGCAGGAAATGATGGCCAAAGGGGGAACC:1 + chr3R 7820013 3' + invader3 184 2 62.14 GGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGTTGTAATTGGTATAGAAATACAAACAGACCATCATTCTTTATCTTTCACAATCTCTGAAAAGATGGTACTCCTTCATAGAAAGTTTCACACCGAAAATAAT:1 - chr3L 23512595 3' - GATE 8267 2 69.86 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGACTTTATTTATTCAATAAATTAGTTTAACCTAATGTTAAACTAAATATATTACCGAACGCTGTGATTATGACTCTGTTATTT:1 - chr3L 19792354 3' - pogo 36 1 44.52 TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCGAACAACCAGCGAATCGCCGCGAAAAAATCAA:1 - chr2R 11763567 3' - Tabor 6870 2 60.31 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTATGGGCTGAATCACAAGCTTAAGCATTTTGGCTTGGGAAACGGAAGCTATTAGCAC:1 + chr3R 17114122 3' - roo 8726 2 62.07 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGGCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCTTTCAAATGGTGAGATTAAAAAGAATGATTTTTCAAACGT:1 + chr3L 16496704 3' - jockey 4790 1 71.23 GCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCTGTGTATCTCTGTGTATACTTTTTATTGGCCCACTTCCGGTGAAAGTTTGGTTACCACAGCCACGAC:1 - chrX 13426126 3' - BS 37 1 49.62 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTTTTAATGTTTTTTAAACTTTTGCCCTGCTCTCGCCAACGCTTTC:1 - chr3L 13634177 3' - 297 6608 2 63.43 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTGACTAGTTAACTTCACATTTGTGTCCAGGGACCTTTTAATTTTTTTTCCAGCAGTATTGTCTGC:1 - 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chr4 436830 3' + 3S18 6077 2 58.43 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTACTCTAATTCAATTAGACCTTCCCCCAGCTGCCCAGCCAATGACAACAAGCGTGAATAAAAGGGAATTTAATTGTACATATCGGGGGGCATATTTGATTCTTTTAGCTGC:1 + chr2R 11133690 3' - roo 11 2 66.21 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTCTGTTATTTACTGTACTGTCAGTCATGTCAATGCACACACA:1 - chr3R 4581867 3' - 297 6642 2 68.70 AAATTATTTGCACAATGGAAATTAGTTTCG:1 + chrX 4757947 3' + S2 13 2 90.00 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGGGCACTTACCCTTTTTTAGCTCTACTTTACTTTAAGCTACTTGCTGTTACTTTAACACACTCACACATTCCTTCCCCAGCGGGCGAGCATTGAA:1 - chrX 6312619 3' + 412 467 2 62.33 ACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCTGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTTTTTTGTTTATTTT:1 + chrX 7781363 3' - F-element 249 1 54.11 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCAC:1 + chr2L 14201470 3' - roo 8726 2 63.70 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCATTTTCTGCAGCTGTGTTTTGCGGGAAAATAAAGGAGAAGAAAATTGCCGAAA:1 + chr2L 11951665 3' + pogo 2084 1 66.44 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAATTACATTGTTGCATGACACAAATAGTGTTGCCTACAACAAGGGGAACAACAATTGCTGAGACATGGGGGCAAGCTAAAGGATAA:1 + chr2L 13704812 3' - hopper 32 1 62.33 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGGCTACAGTTTTTTAGTCCGAGCGCGATCGAACATGTTGGCTGCCTGGCAACAAGTTCGATGCGAACTGTTCTATTGATCTAAGAAATCGGCGTTCT:1 + chrX 5680060 3' + P-element 2884 2 79.37 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATCTAGCGCAAATCCGAGCAAATAATTATTAAACAAATACTTCTATTTACAAAAACACATCAAATATTTAGTTAAGCCAAAATGACGCGCAGCATT:1 - chr3R 13122458 3' - blood 7036 2 68.49 GTGAGAGCATTGCTATTGGATTCTTAAGATTAGGAGAAGATTCCTAGAGAGCAGTCAAATCTGTTTAGGCCAGGCTATAGGATGAAATAATTGAAATGTCCGGTTTGGATCACCCAAGTACGCCACTATATAATTTTTCTAATCAT:1 - chrX 22901627 3' - 17.6 7187 2 55.48 CGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGTGCTACTGACTGTTGTATGGGGAATGTCGATATTG:1 + chr2L 22746518 3' - 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FB 63 1 62.33 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGCATGCATGTGCTTTTAGCCT:1 - chr2R 19554883 3' - pogo 18 1 71.92 AATATACCAATTAATATTAATTTATTAGGACTTTTATTTAGTTCTTCGGTACTTTGGAAGAGTTATTACTAAAGTTTCTTTTTTGTTTATTTAATTGAAATAAATCAAAGTACTTGTGGCTTGTACCTGCAGATCTTCGTTTGATG:1 + chr2R 23402640 3' + HeT-A 370 1 71.92 CTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTTCTTAACTTAATTAGCCACTTCATGAAAAA:1 + chrX 23108351 3' - BS3 1441 1 53.10 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGCACATCTCACAGAGAGCCGCGACCCAAATAGGGAGTAACGAGAGCATCATGGGCTTCTCATCAGCCCTCCAAAGTCGCGCCGCCCACG:1 - chr3R 9392897 3' - S-element 31 2 63.01 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGACCGCAAAAATGACA:1 + chr3L 10144742 3' - blood 41 2 64.35 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTGTTGCGTGGCCTTCTTGGCGACCATTTTCATGGCAAGTTTGGCCTTATTTTTGCGTGCGCTC:1 - chr2L 4106236 3' - jockey 4771 1 76.03 ATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCAC:1 + chr3R 10030804 3' - BS 5052 1 52.05 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGACTTTACACTTATCTAGCATAATCCTTATCTTCAGTGCAATAATGGCGCAAGGAAATTCATGTTTTCAGAGGCTTGAATC:1 - chrX 10567756 3' + roo 9023 2 49.30 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATCAATAGTTTAAGTTCTTTTTAATGCCTTTGGTTAATTTAATGCAACTAGTTAATGTTCTGTGCTCTATCCCTAGCTTATCCTGGTAGATCCTTCTGTGTCCGATCAAGT:1 - chr2R 14047573 3' - mdg1 7052 2 71.92 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGT:1 - chr3L 22900126 3' - 412 7093 2 80.72 TAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTC:1 + chr3R 8709831 3' + jockey 4909 1 76.03 ATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACACCTGTCGCCAT:1 + chr2R 13644538 3' - 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3S18 5789 2 66.91 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAAGCAATATTTTGCTGAGCGAAGCCAGTGTGACCGCAGTGTGCCAGTGCGAACATGCTAGCTGCAGTGCAGCATAGGTGTGACCACTACCTCGAACAGCTG:1 + chr2L 3466133 3' - P-element 16 1 72.54 CATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATACAGTGCACTGTATGGATAGAAATGAGCCAAAAAGTACCAGA:1 - chrX 3464199 3' + hopper2 1521 2 73.29 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGCTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAAGTGCTTTAAATCAAGTTGAACCACAAATCGTACAAATCGTATTAATTCCGAG:1 - chr2R 23000046 3' + mdg1 356 2 61.38 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGC:1 - chrX 12191532 3' + pogo 2055 1 54.48 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCCTGTCGTTTAATATCCCAGTCGTAGCTATGAAATAACTAGCAAAATAACTCATTC:1 - chrX 1061527 3' - 412 65 2 61.64 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTACCACGCAACTATCGTATCGTAAATAGCAATAGCAG:1 - chr3L 13868609 3' - 412 36 2 57.45 ATAAGCATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTC:1 + chr3R 24476360 3' - 412 74 2 67.59 AGAAGATTATTCAAAACCACGGCTGGTTTGACAAACACAAAATAAAAATCGGGGCTCAAAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATAGACCAATTTTCAAATGCGTTCATATTGACAACAAACAAATGAATAAATATAA:1 + chr3L 14217743 3' - Cr1a 68 1 73.29 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGCTCTTAACTTATATGTATGTATGCATCCTTCCTAC:1 + chr3R 29733090 3' - opus 7045 4 83.15 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTCACATTCCTTAAATTTAACAAGCGGCGACATTTTGCCAGCCCCTCATCCATCTCTTT:1 - chr3R 11498854 3' + jockey 4942 1 54.40 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCC:1 - chr3R 21705987 3' - 297 13 2 61.11 GGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACAATTAAATGATCTGCGACATATACATATTCTTCATCAGGATTAATAGCGAAAGCTTGGAAAGGCATTCTATAAGGAGCCCGATTCATTAA:1 - chrX 20763001 3' - invader1 3642 2 71.11 CCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTA:1 + chr2R 8157250 3' + Transpac 5150 2 71.92 ACTATGCTTGGATTAGTCTTTATTTGTAAGCTCATTGGTGGTGATGTTGAGAGGCCCGACTTGATTAGTCTGTGGTCGCCGAAAAAAAATCAAATTAAGCACT:1 - chr3R 1192895 3' + Cr1a 4025 1 67.96 CAGGCACACACACACACACACACACACATGCTCATACACGTGCACAAACACCCGCACAACCGACCAAACACTCACACACACATATGTCGTTAAGGCCAAAGCTGTCTGTACACAGTTTGACTTTTATT:1 - chrX 9955465 3' + accord 180 2 67.19 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTGTATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTG:2 - chr3R 16913357 3' + pogo 2039 1 65.07 ATATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATTAAATTTCGCGTTCGCATTCACATTAGCTGAGTAACGGGTACCTGATGGGGGATAGGTAGGGGAACTCGACTATAGCATCCTTTCTTGTTTTTACATTACAAAAGATTTACAAAGAT:1 - chr2L 21335372 3' + INE-1 498 1 64.83 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCCACATACCTCTCCACTGCTCTGCTGTTCATTAGTACCCCATTTTGGTTGGGCGACTCATT:1 + chr2L 6184108 3' + pogo 2055 1 57.14 ATCTAGACGTTCATACGGATAGACGGACAGTCGGACAGACGGACATGGTGAAGAATGGTGAAGAATGTATATACTTTTTATAGTTGCTAAAGTGCAATTACAAAAAGTACTGCGGTCTCCAGTTAAAATTGCACCGAAATCCTATC:1 - chrX 22741559 3' - INE-1 131 1 45.89 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAA:1 + chr2L 9472078 3' + roo 9001 2 65.07 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTTGGCAAGTTCTGCAACATTTTCCGCTGGTGATTTGGGACCTGTTCTTGACTAACCAATTGTTTTATT:1 + chr2L 5202622 3' - 297 6588 2 78.40 ATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTG:1 + chr2R 18482476 3' - hopper 86 1 80.14 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTGTATATAACAACGATCTAATCTTCAATGAAATGCCAAAAAAAAGATAATTTGCTTTTTGTTAAATAGGAACGATAATGTAGGATTAAAAATTTAAAGTATTT:1 + chr2L 7188661 3' + pogo 2087 1 78.08 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTTTCCGCAGATACAATAAAGAAATGTTCA:1 + chrX 1103753 3' + pogo 2077 1 69.18 TCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCTAGGTACAATGTGC:1 + chr2R 5923039 3' - jockey 4726 1 55.48 AACGGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCAGTTGGGCCACAGTTTTTTTGCACATGTGTAAGAAGTGCGCTGATGAATGTAACTGTTAATCTTTTTTTTTTCTAAATAAGCTCAATATACATAGATGTAACGGTATTTACAAGAGCAT:1 + chrX 2578159 3' + hopper 1413 2 81.51 TTGTTTACGAACAAACGTTCTAGTACTCTGTGGAATATTACTTTTGTATGGCACCAAGAAGCACCAAGGTTAAAGTTGTAGACACCATCAATTAGAGCAACTGCTTTCGCTCTGCTTTTGACAGAGTTCGTGAATAAAAGGCAAT:1 - chr2R 4551566 3' + transib4 379 1 53.79 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTCATATTGTAATAAATGAAGGAATACCACAA:1 + chr3R 16913472 3' - pogo 38 1 57.04 TTTTCAAAATTGTGGGCGTGACGGTTCATTATTCATTAAGATTAGGTTTTTTTTTAATATTTCTACATATTCGCCTATTTAATGTAGCAATGGTCAAATCAGGAAATTAAAAAATTTATGTTTTCAAATTATGAAATCATATAAC:1 - chrX 21283263 3' - INE-1 251 1 75.17 GTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGAACTACAAGAAAACGCCATCCGAGCGAAAAACGCTGGTCTTCATTGCCAAAAAATGG:1 - chr2L 20264102 3' + accord 7064 2 56.15 CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAA:1 - chr3R 9160672 3' - copia 4931 2 58.90 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCATAGGC:1 - chr3L 17890715 3' - 412 7103 2 51.39 GACACGGTCTAGTTGCTATGGTGGTAGTGCTCAACCTATTGGTAAAGTGCACTAAGTTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGAAAAAATTATGTTTACCATCTTGTCTTTTTCTTGTTTTGTTAATAATAAAAACATTGGCTTG:1 + chr2R 19529442 3' - R1A1-element 305 1 51.37 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACAAAGCAGGGAACCGAAAAGGAAAGGACTGGACTGAACTGGGCTGGAGGTTTGTGCTGGAATTGGAATGGGAAGGAAAACGAGTGCAGCCCCCGTTC:1 + chrX 17806080 3' - roo 8681 2 74.10 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGACCGAAATGG:1 - chrX 12191519 3' + pogo 2056 1 55.48 ACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGACAAAACAAACAAAACAAAAAACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTGCTGCACAAAGCACAAAAGAAT:1 + chrX 12082246 3' - Cr1a 240 1 77.24 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACAC:1 + chr2L 246079 3' + roo 8996 2 70.55 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTTGCTCCCCCAATGCAATGTAATGGATACATATATACATTTACTAAGAAAATATAGGTTCAGCAAAACCCAGTCACTGTGG:1 + chrX 6510158 3' - jockey 4680 1 77.24 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATATCTCGCTGCAATGTGGAGTTACTCGGGTAATTCGCTCCCCAGTTAATTTTGTTTTCATTTAGCCTAAGACTCCTGA:1 + chr2R 17121705 3' - blood 44 2 54.11 TCATTAATTTTTTTTATTAATATCTATTTATTCATATGTTTTTTATCAATATGTATAAAAATAATAAAACTATTAAGCTTTGAATAATAATTGAACCGCCGATGCATTTGTATTTATAGACGAAATTTTCGTTGGCCCATTGTCTC:1 + chr3R 6696308 3' - S2 1628 1 52.05 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTA:1 + chr2R 19555024 3' + pogo 2034 1 65.75 GTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCACATTTCATTCCGGAGCTCTTTGCCAACACTCATAAGTATGCAACACTTTTTCCCACGGCAGCGGGCGT:1 - chr3L 17133794 3' - jockey 4741 1 52.05 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAGGTCATGCGAGGTCAAGATGCATCATGATAATAGACAGAAATTTG:1 - chr2R 16403383 3' + copia 217 2 58.90 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTT:1 + chrX 5150360 3' + roo 8990 2 75.34 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGAAAAGTTTTTGAAGCTTCCCGCATAATCAACTCTGTGCCTTGGACTTTTTGCAAGGATAAGGACTCCATGAAACAGCAAAAG:1 - chr3R 17656327 3' + mdg3 232 2 77.93 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATATACTTAAATATATGTATATTGTTAAATCCCTACTACAAACCTTAGTTGTTAATCCATGTCCTTTCACGAGTTTTT:1 + chr3L 2878546 3' + 412 7525 2 63.93 TGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTACTTCTGTTTGCTCGTCGGTGCAA:1 + chrX 22610757 3' + pogo 2051 1 73.79 CTGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTGGAATC:1 + chr2R 21402724 3' - mdg3 33 2 62.33 GAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATGGCTGCCACCTTTTAACTATTATTTAGCGGCTA:1 + chr2L 21630181 3' + G2 2614 1 77.08 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACGCGTTGCCGCCACTAAGAAT:3 + chr2L 17240321 3' - hopper 53 1 58.22 TACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTCAAAGAAATGGGAATGTGACCAATGTTTATTAATACGCTTATTGTTATTTAAAA:1 - chr3R 9190446 3' - Tabor 6851 2 45.93 CTCAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGGTTATGTTTGGACAGCGTTCTCTATAATCCAGCCCTAAATATCGTAATTAC:1 - chr2R 7959968 3' + mdg1 7390 2 64.38 CTCTCAATTCAGCGCAACAACGTGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCACGCAGCAGACGGCGATCACTGTAGTATTCCTTTCTTGGAGTCAAGTGCAG:1 - chr2R 5213934 3' + F-element 246 1 54.81 AAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTTTATCTTCGGTGATAAAAGCCGCCTTGTAATTGGGAATAATCTGAAAGTGTAAACATTTAATTATGGGCTTACACTACCATTTTGAATTGATTACAGCATATAAAGTTCT:1 - chr3L 11776614 3' - mdg3 5264 1 73.29 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACGAAAAAGTTGGGCATTTGAATTTTCGAATTTGCTGTT:1 + chr2L 2276805 3' - F-element 33 1 56.30 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACT:1 - chr3L 11336356 3' - blood 7090 2 71.92 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCTGTTAAATGCTCTAATGATGGGTATTAGGCCAGACTAAGTGCCACTCATAAGTGCCGCACACGCACCTGTC:1 - chr3L 16562796 3' + roo 401 1 77.24 AGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGACATAGACTATAGAAATTGACACCTCAAAACCATTTCGAATTGTGCTAATCATAATCTTGCGGGGAGATATTAACCCTAATAAATTACTTTGTTTGTAAAGTCTATAAGCTTAAG:1 - chr2L 16089531 3' + 3S18 333 2 77.24 ACAAAAAAAAAGCAAAAAAAACTTTAAAATGTGTTTGCACATATATGTCTCTCTTTTTTAAGCTTCATTTAAATAATTGCTAGAATTGTGCTTGATGTTAGTGTGCTATGTTTTTCAGTGTAGCTGCTTGCTGGATAG:1 - chrX 5850611 3' + gypsy7 5005 1 81.16 ATGATCAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTA:1 + chr3L 11826427 3' + INE-1 96 1 66.17 ATTACACATAAATAATTATCAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTACTAGGGCGACGTAACACTATTGGGAACATTTGAACTAAAATAAATAAA:1 - chr3L 14928882 3' + 1360 2940 1 64.38 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACACGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATACTGTCATTTAAATTCCAAGCAAATGCAGAGGATAACTCAACAAAGAATGGCTTAGATC:1 - chr3R 7739440 3' - I-element 63 1 63.70 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAACCCTGAC:1 - chr2R 11489162 3' + mdg1 403 2 66.38 CAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACACACGCACACACTCGTGCACACACACAGGCGGACACTCAGCATATGCAGCAGCAGGAGGATGAAATGAG:1 + chr3L 17175227 3' + 412 7523 2 60.17 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACGGAGGCCTCAAAATGTCGCAGATACAAAGGCAAAATCTGATCATTATCATTCATAATATCA:1 + chr3R 5208266 3' + hopper 1407 2 74.62 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCAC:1 - chr2R 19554930 3' - pogo 65 1 62.33 ATTGTTATTATGTTTGTATATACTACAATATTCTTTCTTTCAGTTCTGGGCGGCCTATGTCCCCTGCGAGGCTCAACATCGAGATGCAGTGCAGCTGACTCTGGAGCAGATCGATGTAATAAAGCGCCTGAC:1 - chr2L 18192976 3' - mdg1 6 2 76.52 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTCCCACTCTCGGT:1 - chr3L 18658898 3' + roo 9004 2 66.44 GTACGTCTTTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTCGAGAAAATGCTACCAAAACTTAAAGAAACGGTTGCTCGTGTTGTGGACAGTTGTGTGGAGTGTATTGTATTTAATTCGAAAGCTGGAAGAAAGAAGATTTCTT:1 - chr3R 28309655 3' - Bica 234 2 61.64 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGAATTATTTATAATGGATAGTGTGGGCATGCATATGTATATCATATCTAATTGACATTGAAGGACTCC:1 + chr2R 23287576 3' - roo 8684 2 69.18 GCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGTAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTTTGTTTTAATATATTTAACAATCTTTTTCTCTGATTTGTGACAGCCCCATGGCCCAGAGACCTCCATGCCGCGCCC:1 + chr3L 11685755 3' + INE-1 546 1 72.09 GATAGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACACACACACACACACACACAGGCACACTCACACACACACACCTACCAACCGGAAGTGGAAGCGCGAG:1 + chrX 15280037 3' + Porto1 340 1 51.35 CTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGT:1 - chr3L 17175146 3' - 412 91 2 78.08 GGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGTTCAAAACCTTTCACACTCTTGTTATGGAAGCGGACTTAGC:1 + chr3R 15702980 3' - copia 64 2 69.77 AGAAAAGAAGGAAAAACATAAAAGGACATTAAAAAAACTCTTGAATGTGCTGCCAAAATGGTATCCAATACCATTAAATATGAATGGAAGCCCAGCAAACAACTAATTAACCCGAAAGGCA:1 - 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chr3L 22648317 3' - Tabor 6916 2 76.74 TACTCAGCTAGTGTGAATGTGTGGGCGTGACCGTTTTTGGCGGTTTGTAGGCGAAAGTAGGGGCGTGGCCACAGTGCATTTTGTCCCCTGGGTGCCGCATGTGTGTGCTTCTGTC:1 + chr3R 23808413 3' - INE-1 532 1 40.87 AATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAG:1 - chr2R 8158771 3' - Juan 81 1 64.14 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGAAGAAATTGAGACTAGCGTTTTCGATTCCCCATTGAAATCGGGTCTGCTTGGAGCTTTCCCATT:1 + chrX 1061630 3' + 412 7532 2 63.81 AATAAAATCATACTAATATGTAACTACTACATACTACTACTACACGGTATACTTCAGATGTCAAGCACATACGCAGATTAACTAGGGTATTTATGCATCGAATCCAAAAATTCGGTTCGTGATCGCCGACTTTCCGAGGCGACTTC:1 - chrX 15597001 3' - transib1 1886 1 71.23 GTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTTTGTCAATGCTTCAATCGAAATAGTCAGCTTTGGGTTCTCTATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCGAATGCTGTGAAAAATCGAGGGAAATATTTATGGTTCGA:1 + chr3L 22052914 3' - mdg1 3 2 43.84 CTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTAAAATTATCCCACCAATTTACGTTTCTTTGGAAC:1 - chr2R 5917798 3' - I-element 5091 1 45.52 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAG:1 + chr3L 7962280 3' - blood 65 2 64.03 GTCTTGTAAATTTCTATCGATTTCTACACCCCTTAAACCACCAACCCGAACTCGCCAACACTTTTTAACAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTTTTCCCAATTTCTATCCAGAAAATATCAAAAAAATGATTAATTTTCGCGCTC:1 + chrX 12922754 3' + INE-1 301 1 37.93 CTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGTATGCGAACAAGCAAGTTTCATCATTTTTCTGGGATATGGACATTTGGGAATAAAATGAGAAAAAATTGTTGAAAAGTGTGGGCGTTAGAGTGGGCG:1 - chr3L 22511717 3' - INE-1 566 1 70.55 AGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGA:1 - chr2R 13644438 3' + Burdock 6306 2 78.08 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCTGTGCAATATTCGCGGCGTTTCGAGAGA:1 - chrX 3996489 3' + roo 9011 2 60.96 TTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACGTTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCTCTGAAAATGTCGTACGTGATTCAATTAT:1 + chr3R 28272293 3' + Tirant 316 2 76.92 GGAGTGGCCTAGCAACAGCCACGATGCAAGGCGGCCAGGGCAAAGCGGAGAGACCGTGAATTAACGGTAGCCCGGTAGGCCCTGCGTCCTCTTTGCGTCCTCC:1 - chr2R 1119190 3' + gypsy8 4689 2 78.64 AAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACAGCG:1 + chr2R 17392086 3' - BS 5070 1 70.42 CTGTAGATCAAACTATGAGTTGCAAGACCCCTACAGAGTATTATGTTCTGACTAATAGAACAGAATAAACTTAATCCGAGGGACTACAATCTCTTTTTCGCCTCGCCACTGAGGGCAGTGC:1 + chr3R 19676460 3' + Cr1a 4156 1 63.64 AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATAATTAACTACATGATGCTGCCGCAGAGAAAAAAAGTATTTGCTTAGCTTTCTTCACTACAAGGATA:1 + chr2R 14047713 3' + mdg1 7393 2 60.96 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCT:1 - chr3L 6775370 3' - blood 7095 2 73.97 GTCCGGGAGACCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTTTGGATTTTTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTACCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTGGA:1 - chr2L 8776804 3' - G4 3698 1 42.47 ATTAAACCCTACTACATACCCTACTCATATTATGTTTTAATACTTAAAACCTGCCGATTGCCCGATAAACTTGTTGGGGCATCTCAACGCCAATTAAGCGGTCTACAAAGTGACTGGGCTGG:1 + chr3R 6684311 3' - G4 3750 1 63.11 AGTAAATATGTATAAGAAAATTTTAATATTTTTTGTTGACAACTGTTTACTTGTAAGATTTTATTTTTGTCGTACATAATCAGGTTAACAAATTTTAGGTTATTTTAATAAAACGTTAATCACGATCTGTGTATCGCTTCTTCGC:1 + chr3R 31976597 3' - TART-B 10184 1 74.48 AGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACAAACAAAATGGCGACGGACGAACGAGATGATAATATATTCAAATTGCTGCTAATC:1 + chr2L 5721 3' - G6 17 1 64.49 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAATTACATTGTTGCATGACACAAATAGTGTTGCCTACAACAAGGGGAACA:1 + chr2L 13704776 3' - hopper 68 1 63.70 ATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAGAGATACACAGATCTACAGCCACCGAATGCCCCCAGTCGCCAGTTCACTTTGCCTAATGCGATTATGCGGGTCTGGAATGTAGGTCCTTTGTCCTTGCTT:1 + chrX 13426261 3' + BS 5072 1 73.94 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATATATGGTTCTGTAGAGCATAAGGGAAATACACACAAACACATTTTCTCGGC:1 + chr3L 12224741 3' - 412 7091 2 60.27 AATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAA:1 - chr3R 3617314 3' + micropia 5124 2 71.92 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTTCTACCCCCTTCGGCT:1 - chr3R 22100483 3' - 412 36 2 62.33 GCGCCGTCGATGCATTGCTTATATCCATTTTTTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATAATGTAGGGGTACTATAAGTTCATTTCATTCGTTTACATCTACTCGTACACAGAG:1 + chr2R 18457444 3' - invader2 315 1 71.31 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAA:1 + chr2R 10695860 3' + roo 332 2 72.60 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAAGGTATATCTACATAAATGAACTAATATTTTGCTTGGAACTCCACACCGCCTCACATAAATAT:2 + chr3R 29645783 3' - jockey 63 1 55.48 GATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATCATCTTAAATATGATTGCGTTTATAAGTTCTTCAGCATTTGACGTTAACT:1 + chr2R 17260544 3' + F-element 4223 1 64.03 GTTAACTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAACGGTTGAACTAGGAC:1 + chr3L 23042133 3' + pogo 2048 1 60.00 GACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGG:1 + chr2R 15829584 3' + invader4 257 2 74.44 GAAGAAAAAAAAACCAAAAATATTAACAAACTTTTTGCCAGAGCAGATGCAAAACAAAAATGTCGCACAAAGAGGAAAACTTGCAGCATTTCGAGCCACAAGGAAATCGTTTTATTTACTTAGATTAAGCTGTAGTGATACAGAAT:1 + chr2L 4748639 3' + mdg3 5103 1 63.01 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGACGCACATAGCACTCACACACATTCTAAAAACGATCTCTCCCAAAAATTATTG:1 + chr2R 21076096 3' - P-element 51 1 44.62 TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATATCGTTGCATATAGTTTAATCGACTTCAACAAACGAAAGCCG:1 + chr3R 25904248 3' - 412 77 2 73.97 TAATTATAAATATAAAAATAAAAAATTCAAATTTTAAATTATCTGTAGGGCATCACTCAGATTTTAGAACAAAAAGTCTTGCCCCCTTTGCCACACCCATGCACTCATTGCGAATGGAAATGGACGTGTT:1 - chr2L 4727000 3' + transib4 2575 1 83.08 TGAACACACACACACACACAGTGAAAAGGGCGGGCAGGAAAAGGAAAAGGAAAAGTCCTTAAAGCTTAAGGAAAACTCAACCAAATGGAATCCTTGTACTAAATTATTATTCATCGTTATCGCAACACCTGGTTTCCATCAGTCAT:1 + chr3L 3975370 3' + accord 182 2 63.01 ACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAGCTTTGTCGCTTATTAAAAGAAGCTT:1 - chr3R 27510050 3' + Bari1 1667 1 56.55 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGGCGTACTGAAAGAAGTTGTTAAGAAATCTATCAAATTGAA:1 + chr3R 7539515 3' - roo 81 2 73.97 ATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGAATCAAGCA:1 + chrX 8027485 3' - Juan 60 1 58.87 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTATGCATTGCATTGGTGCATATATAATCAGTTGAGTCTGGGCAAAGTCTATGATTTGGATTGACGTTGCTGGCTGATGTT:1 + chrX 17732096 3' - pogo 38 1 57.93 AATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTACCACATTTGGATTCGCGCCAACGTGGTGCAGGAGTTAGCCACTTGCTG:1 + chr3L 8800347 3' - I-element 5231 1 67.12 GGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGTTGGGGTGGAGCATGGGCAGGGAAAGTCAATTCACAAGTCAGCATAAATCGCATAATGCATACGCCACGTGGGACCGGGACA:1 - chr3L 21980164 3' + Quasimodo 401 2 54.79 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTA:1 - chr3L 18467175 3' - hobo 44 1 52.21 ATTTTTAAGTAAAATAAATTTTAAATATGTACATTATCAAAGTTGTGCCCGAAAGGAAAATGCAAGAAAATGTAGGAAAATAGCGAGCCAAATAAAAGCAAAGACCGAAATTGAAAGCTCATTAACTGGCGAGTGCGAA:1 - chr2R 11105806 3' - S-element 119 2 66.91 TGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGAGCGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATTTTCCGGTGGCTATCTCTGACATATACGAGCACTTGTGAATTACGGCATAATAAATGGGGCTCCGTAGCAA:1 + chr3R 27104749 3' - 1731 4525 1 51.37 ATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTT:1 + chr2L 17250802 3' + opus 7424 2 73.10 AAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGAACAGCG:1 - chr2R 11763598 3' - Tabor 77 2 68.49 AAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAACATTCGTGGCAAGCTTTTGACGAAGC:1 + chr2L 18280004 3' + gypsy5 7326 2 64.62 ACCTCAAACAATCCCACCCAAATTTGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAAACTTGCTTCGCTATCGCAAATGGAAACATAAACAAGCGCCAAGTACGACCATAAAAAAGTTTTAATTTCCGGACGCTGAAGTGGGCCCCAGACAT:1 + chr3L 22915489 3' + I-element 4891 1 36.30 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACGATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATATAAG:1 + chr3L 19350051 3' - jockey 23 1 75.34 ACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACCTCCACAGTTACATCCACAACAGAACCAAGCTCGTCTACCACTCTGGAACCTACTTCAACTACATCTTCCTCTACCACTTCACAACCAACTTTATCAAC:1 + chr3L 12886754 3' + F-element 235 1 71.23 AGAAATGTGGTCACAGAACAGATAGTTGTTGGTCTTAGGGTGGTCCTTGATTTCTGAAAATAGTTTATTGTAGGTTTCCTTGTTTGTGTTTGAAGATGAAGCCGTTTTCGACTTTGAGGTGCGGTAAGTTATTTCCATTGTTTACA:1 + chr3L 24939296 3' + Helena 962 1 63.70 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAGACATATGTATGTATGTATGTATGTATGTAGCTTTGTGCTCCTCTCTTTCCTCTGTTGTTTCATGAAATTCTTTGGG:1 + chrX 22858510 3' + copia 250 1 47.14 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATCTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGAGATAGCAATCAG:1 - chr3R 23639139 3' - pogo 57 1 56.16 CGAAGGGACATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACA:1 + chr2R 4261949 3' + invader4 220 2 63.08 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGC:1 - chr2L 15834474 3' + hopper 1329 2 73.97 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGAAAAAGGTAATACGCCCACACTCCGCACTCTGAGTTTGAGGAAAAGCCAAAG:1 + chr3R 15678857 3' + pogo 2034 1 67.12 ATAAAAATTAGAAGAAAAAAAAAACAAATTCGGGGCGGGCGAAAAATCTCGGAAAACCAA:1 - chr2R 20092190 3' + Doc 4695 1 85.00 TTGGTAGTTTTTTTTTTTCATTTTTCC:1 - chr2R 11625298 3' - Doc 4592 1 92.59 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAGGATGCCATTTCAGGATAAGAGCCATGACGGAG:1 + chr3L 17133906 3' + jockey 4968 1 50.68 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAAAAATGTCACAAAAGTGCTCCATTTGGTTTTTTTCGGGTCAGATAGTTTGCATTCTGTGGGTACTACGATTAATGGGTGGTCTTCTGAATATCAGGGCAAAATTA:1 - chr2R 11491300 3' - mdg1 18 2 64.38 AGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCTTTTGCATATCCGACATATCGAATACAA:1 + chr2L 12079675 3' + mdg3 171 2 75.78 AGATATTTCGAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGTCATG:1 - chr2R 23287458 3' + roo 9022 2 66.67 TTTTACTTTTATACTTAATAATTTGTAACCCTTAAATTTATATGGTAACTTTGGAACTATTTGCCTGTAATACGTGCAAATAAATACTTCTTGGAACGATGACAGTCCAAATTCTTTTTATAGGTCATCGGCAAGTCACGTAAGCC:3 + chr3L 19014156 3' + G5 4723 1 65.07 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTG:1 - chr3L 22052744 3' + mdg1 367 2 54.79 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTTATATTTTAGAATTCGGAATTTCCGTGAAAAGTCCTGAAAAGCTTTGTCACTGCCAACCCG:1 - chrX 21234437 3' + 297 335 2 61.64 GTGTGTGTGTGTGTGTTTTCATTCCACCCCTCTCTCCGCCGCCCCACAAATAGATTTTGGACACGTGCTAAAAGCTGGTCAATCGACAATATAGCTACCATGTTCTTATATCGGATATAAAA:1 - chrX 12427158 3' - accord 7027 2 57.38 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAGACATATGTATGTATGTATGTATGTATGTAGCTTTGTGCTCCTCTCTTTCCTCTGTTGTTTCATGAAATT:1 + chrX 22858503 3' + copia 237 1 52.05 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCACGCTCGGCGACACTCGCAGCTGG:1 - chr3R 17305417 3' + roo 9038 1 61.64 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTT:1 + chrX 12525979 3' - roo 8742 2 74.82 CACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGATTGGCTCTGTCTTAAAAGTTTGGAAATTATAAAAAGTATTTTTAAAATTTCGAAATTACTTACTGGATTTGAAAG:1 + chr3R 27510190 3' - Bari1 46 1 48.63 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTCATATTGTAATAAATGAAGGAATAC:1 + chr3R 16913467 3' - pogo 54 1 60.27 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTATTGGCTTACCTTAAAGTCGCGTTTGGTCAGGTGACC:1 - chr2L 2031000 3' - 412 35 2 58.90 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTATATTAATATACATATACATACAGATGCGGTTTGGGCGGTTAG:1 - chr2R 641818 3' + opus 7485 2 73.57 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTCTGATAAGTTTTTCCTTTTTC:1 - chr3R 20175653 3' + hopper 1413 2 80.62 AATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGCACGCTGAGCATGCAAGTGTTCAATGCCTTTTGCACGTGGGGGCAATGGCCTTACGCCGGGCGAGGCTG:1 + chr3L 6484952 3' + Stalker2 7391 6 69.37 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACCCATTAAGTAACCCCAACTGATCGGCGCAAATGATTCAGCTATGCAGAAAATATGATT:1 + chr2L 12553512 3' - 412 56 2 56.83 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAGGTCATGCGAGGTCAAGATGCATCATGATAATAGACAGAAATTTGGCCTAACTTAACCATTAAATGTTCAAGAG:1 - chr2R 16403354 3' + copia 246 1 78.77 AGACTTCAAGCAGTTATTGATGCCAAAGGTGGTGTTACAAAATATTAGTATTGTATTTATATAAAATAAAGAAATTCTTATGTTGAAATTAGATGTTAATTGTTAGCGTGAATTTGTTCAATTGAAACGCAATGCCA:1 - chr2L 18149940 3' + Bari1 1351 1 72.26 GGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTT:2 - chr2R 5070919 3' - gypsy5 26 2 26.03 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTAATTAAGCTGTCAATCTCTT:1 - chrX 14964580 3' + roo 9043 1 64.38 ATATAAATATTTTAATATTTTTTATTATAATTTTCTAATTATTGGGTTAGTAGCCGAATGATACGTAAAACAAAACCCATGATATGAGCACAAATCATTTTTTCTGCAACTGCCAGCCCATTTGCCCTAATGTCCAATTGATGGCA:1 + chr2R 8755203 3' - Transib-N1_DM 292 1 62.33 TCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACG:1 + chr3R 9352088 3' - Tirant 8165 2 60.90 TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGCCGAGTAAAACTGACTATGTCCGTAATTTTTCCCTTTTTATATGAATGTCTTGTAAAATTCTACCACCAAAAAA:2 + chr2R 12994960 3' - BS 5040 1 52.74 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTC:1 - chr3R 17605608 3' + Tabor 448 2 59.59 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAATTTGCTCTCTCATGCTCAAAAAAA:1 + chr3R 23765452 3' - roo 8690 2 56.07 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTGTACGGTAGACTTGTGCAAGCCTCTACTGAAACTGTTGACCTTATCCCTCAATTTATTATTATTCTTTTTGAAAATAAATCATTTCTATGCCTCAATTCTTATATAAAA:1 + chr3L 18972020 3' + 1360 3376 1 58.90 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTCGAATGTGGGCCAATTCAGTTGCTATTGGCATTGGGATCGGGTCGATTGTTATGTCTGACAGCGACAAATGTCAGAATGCCAAATCACTGGGCATATACA:1 - chr2L 9471947 3' - roo 8680 2 73.76 GTTCCTGAGAACTCGACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCAATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTT:2 + chrX 21587754 3' - INE-1 140 1 35.07 ATGGCATTTCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTATATAATATGAGAAAAACATTCAGGAGCAGCATCATCTTTCGCTGCCACTCGAAACTTTTACAATAATTTCAG:1 - chr3L 4632894 3' - gypsy10 28 2 57.72 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCATAACAGTAAAAACATTAAAAGAAAACGCCCTTAAGGTATGTTACACATTTTCCAACTGAGCCTCAAGTAT:1 + chr3L 5538111 3' - jockey 4719 1 52.05 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAGTCAAAATATGTTTGCAACTCATGATGTGCTACCAG:1 - chr3L 6775325 3' - blood 39 2 58.90 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCATTTTTGCACTTTTCCCAAGTCCTTGGAGCAATTT:1 - chr2L 4173956 3' - roo 8717 2 54.79 GATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAATATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCTTACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTCCGTATCTGTCTCGCTGTTGTTCTTGGCCATAATA:1 - chrX 10575169 3' + pogo 25 1 73.29 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAG:1 + chr3L 17133874 3' + jockey 4937 1 65.52 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGACTTTACACTTATCTAGCATAATCCTTATCTTCAGTGCAATAATGGC:1 - chrX 10567789 3' + roo 322 2 73.29 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCC:1 - 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roo 14 2 75.34 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCACCTAGTGCATATAATCTAG:1 - chr2L 9485587 3' + 412 439 2 53.79 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTTTTGTTTTTTGTTGAGACTAGGGGAAGTCCCTTGCCGGCCATCTCTTTCCTGCATCTGCATCCGTCCCTGTCG:1 - chr3L 2885208 3' + S-element 1679 2 52.48 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACAAAATGCTGCCACAGACAAATAGAACAGATTTCGCGTCAAACAAAGAGAATGCCGACTGGGGGCGGGGAAAGGGAA:1 + chr3R 11057681 3' + flea 4981 2 61.31 GCACTATACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATAT:1 - chr3L 17707847 3' - Doc 92 1 77.37 GCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCATGCCTTTATTGCAACCACAACGAGGACTGGCAAACAAACGGGGAGCCATACAAACACGCATGCGAAGCCCGT:1 - chr3R 27487674 3' + hobo 2483 1 53.42 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTAT:1 + chr3L 13827357 3' + hopper 1388 1 55.96 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGATATTGGGCGCTGCTTCGACTGGAGCCAATGTCGTTCATTCCGCCGGATCCGCAGCTGCCAATCACGGAGCTCAGGCTGCCCATGGAGTGCTAGGAGCAAC:1 - 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P-element 86 1 26.21 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAGTCACCGCTTTTTAAAATAAAACCCAAACCGGAGCCCATCTGTATCTAAATTTCTATAGCAT:1 - chr3R 26191604 3' - hobo 44 1 52.63 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCACTTTTTTCCTCCTTTAT:1 + chr3R 8709849 3' + jockey 4944 1 58.91 AAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGAG:1 - chr3L 2725013 3' - Ivk 107 1 77.24 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCG:1 + chr2L 22016018 3' - Tirant 8117 2 72.90 TAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATATTTATTTAAAAAGAATTTAAGAACAGCTTTTGATAATAATAAGCAAGTTGTTAAGTTGCATAAATTTTACAAAAGTATGAGTTATGTATGAGTTAAGTGAATT:1 + chr3R 25768913 3' - copia 17 2 65.07 GTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATAC:2 + chr3R 9160739 3' + copia 163 2 76.71 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACACCT:1 + chr2R 13644530 3' - Burdock 6162 2 62.70 CCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTCCGCCATTGCCATTCTCATGGCGGCTCTGCGAAAAGATGGAAAACAAACAAAGCAGACA:1 + chr3R 16091102 3' + F-element 214 1 53.60 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACGAAAAAGTTGGGAATTTGAATTTTCGAATTTGCTG:1 + chr2L 2276803 3' - F-element 42 1 53.17 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTGGTCTACAGTGAACCCCTGCAAAGCGGCACACAATC:1 - chrX 9707160 3' - Doc 78 1 76.87 GCAGGCACACACACACACACACACACACATGCTCATACACGTGCACAAACACCCGCACAACCGACCAAACACTCACACACACATATGTCGTTAAGGCCAAAGCTGTGTGTACACAGTTTGACTT:1 - chrX 9955470 3' + accord 179 2 65.32 GAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATGGCGCTTTC:1 - chr3R 15022051 3' + Tabor 7248 2 74.24 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACGCATGCCACGGCATTCCGTTCCCCAATCAGTCCCCTTCCATCCCGATATGCCACCATATCCCCCATATGCCCGACTTCATTGTTTCAAAGTGCAGCGAGCAATA:1 - chr2L 9198223 3' + S-element 1702 1 71.92 CATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCA:1 - chr3L 7995456 3' + P-element 2781 1 15.07 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGC:1 - chrX 12191532 3' + pogo 2044 1 57.93 ATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCAGGAGTGGATCTGGCTTAGCTTCGGATGCCTGACCCTGTTAT:1 - chr3R 29418641 3' - mdg3 28 2 59.26 TTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTTTTTTCCTGTGGGTACTTTCAGAATTTTGTGACGCGTTGCGTCGTGTAAAACAAAA:1 - chr3R 14673504 3' - I-element 163 1 56.30 GGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATACATGTTTGGATGCTGCTATTGTATTTGCAACATAAATTCCATTATGTATTTCCT:1 - chr3R 25872481 3' - gypsy 67 2 64.38 GAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGT:1 + chr2R 4261963 3' + invader4 2977 2 58.22 AGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTTAAACAATAGACTTGGGCACTCGCATTCACCCAAGAACA:1 - chr3L 22054928 3' + mdg1 7042 2 76.03 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTT:1 + chr2R 19553283 3' + mdg1 371 2 53.96 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTT:1 - chr2L 17210267 3' + jockey 4928 1 62.76 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCG:1 + chr3L 22052876 3' - mdg1 24 2 66.17 GTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCATTGCACAGAGACTTGTTCGGAATGC:1 + chr3R 13176452 3' - Burdock 56 2 57.53 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATTACAATATAAGTTTGGGTAATTACCCAAGCAGCCGAAACACAAGCTCAATGATTCCAATTATTACATTCGGTTCAC:1 - chr2L 10184406 3' - Doc 49 1 54.79 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCA:1 + chr2L 246118 3' + roo 393 1 72.80 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCATTTTCTGCAGCTGTGTTT:1 + chr2L 11951632 3' + pogo 2051 1 53.10 GTCTAGTATTGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTCCACATATATCAGATACCC:1 - chr2L 22121314 3' + I-element 5330 1 54.79 AAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGCTGCTTGATATTCGAAAATGTAGCTCCTGAGTGTATACCACATTGTCAAGATAAAGAATTAGTAAGAATTAGTA:1 - chr3R 2555471 3' + Bari1 1660 1 53.42 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCAGG:1 + chr2L 246120 3' + roo 396 1 75.00 AAAAAAAATAAATAAATATTTTTAAATTTTGTTTGATATTTTTAATAGAAGATGTTTAGATATAATATGTTTTGCATGACTTTTATTCCATAAGTGCCTAGCTTATCCTTTATCTCTTATTTTTCCCATCGATCCGACAACGCTCG:1 - chr2R 14432427 3' + mariner2 830 1 52.74 ATGATAATAAAAAAAAATAAAATGCAGTACAGATTTATTACTCAATAAAGTCAAATGTTTCCCCTTCGCCAAAATTGGATCATAAAAGTTGGCAGAAGGAAGTCACAAAACTTCAGATATGTTCAATATCAATCATCGGGCACTTA:1 - chr3R 31067431 3' + Rt1a 5073 1 59.59 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCATAGGCTCGAAGCTGGTTTCTCACAGTGCATTCATGTTTCTAATTGTCTGTGTGTGGGATGCCTACGTCAGCACTGAAGCACTACGGCA:1 + chrX 22725666 3' + roo 401 1 75.61 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTAGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCCCAAACCTTCTAAACATAAAGGCCAACACATCTGAGACAGAGAACGCGTATGCTGAATATTGAAAACATAAAT:1 + chr2R 4160434 3' + pogo 2053 1 53.42 AAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTGGGCGAGGTGCACAGCCTCCTGTGCACCTGTGAACAGGCGAGCTTTATGATCAGGTATTCCCATTTCGCAATCTGTCGACCGAAG:1 - chr3L 22976451 3' - 1360 3189 1 54.11 AAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTTAAACAATAGACTTGGGCACTCGCA:1 - chr3L 22054942 3' + mdg1 7028 1 66.44 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGAGGCCATTCAAGTCTTTATGTA:1 + chr2R 18482533 3' - hopper 27 1 66.67 ATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATCGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGACTTTAATTCACTC:1 - chr3L 16973315 3' - S-element 1551 2 71.92 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATACGCCGAGTGGTTTAGATAGCAGTTTTTGCAAGTGCGTTGTATTTACTAAGAACTTGAAAACTCCTGTATATCTTTTCCTGCGTATCTCGTG:1 - chr2R 19553146 3' - mdg1 29 2 64.38 ATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATATTCAAAGTCAATTGTAATTTTTATGGCAAAGTGCTACGCAATATGAATTACATCGACCATAC:1 + chr3R 30678289 3' - accord 7261 2 57.53 CTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCA:1 + chr2L 16089684 3' - 3S18 5825 2 56.16 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTG:1 - chr3L 96474 3' + roo 9036 1 60.69 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGGCGTACTGAAAGAAGTTGGTAAGAAATCTATCAAATTGAAAG:1 + chr3R 7539517 3' - roo 57 2 67.74 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTATGTATATGTACACAAAGGATGTCACACGAAATATATTTAAAATTCTTCCAAATAACTATTA:1 - chrX 22560021 3' - Transpac 4972 2 56.16 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCCTAAGATATTATGTTTTTGGCCTATGTATTCCTTCGCT:1 + chr3R 15338104 3' + blood 7334 1 70.94 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATGACAGTATTGGGGAACAAATCAGAAGAACAAACAGCAACCGCCCCATCTTG:1 + chr3R 7739522 3' + I-element 5288 1 65.07 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGTTAGCACCAATAAAATATTCCAATGTGATCCAATGACGGTTTTCATGTGTTCCTCATAGCACC:1 + chr2L 12319372 3' - copia 29 2 64.38 GCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATGTATGCATCCTTCCTACATTGATCGGATTACGAACTGGAAACGGGGCAAATGCTCGTGATTCACTGACG:1 + chr3R 29733142 3' - opus 46 4 55.17 ACAAAAAAAAACAAAAAAATAAAAACAAAATAAAAAAAACAAAAAAAGATTACAAATAAATGTCCGCATTTAAGCATCTATAATAAGAAAAAAAAATATGCATAAAATGAATTAAAAGGTTTCCTACAGCACAGATGAAGCATTTC:1 - chr3L 20853331 3' + G2 3076 6 65.07 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAGCTGTTAAAACCCTGGTTTCCAGGCTTTTG:1 + chr2R 6632683 3' - P-element 7 2 76.07 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTCTTCAAAATCCATAGCATACCTT:1 - chr3L 9497724 3' - jockey 4801 1 57.14 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATAGCGAGTTTTGGCCAAAGGACGAGGATGGGAACAAGGACATCGTCAGCAGCCAGCCGCCAG:1 - chr3R 27859133 3' + hopper 1393 1 71.23 AGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCTGTGTATCTCTGTGTATACTTTTTATTGGCCCACTTCCGGTGAAAGTTTGGTTACCACAGCCACGACCG:1 - chrX 13426124 3' - BS 30 1 52.34 TTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATCGCCACGAACCCCTAAGGCAACTAAAAAAATTTACATTTTTATTAAA:1 - chr3R 13546689 3' - Tabor 465 2 67.81 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGATTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAG:1 - chrX 4778177 3' - 412 51 2 55.56 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACATATATACACACAGCCAGCCGAGCGGGCCGATATACATACATATGCGCAAATGAATACCACACAAATACAGAA:1 + chr3R 17067939 3' - 297 13 2 69.75 AGGAGGAACTGACTTCTGGGCATGTACATATGTAGTCCCAATTGCAGCCCAGAACCCCAATAAATGCATGCCCAGAACTCCAGGAAAACCAAGGTCTTCTTATGCGTATACATGTACATACACTCACTTTCATGTGCCGCCGTATA:1 - chr2L 4001233 3' + baggins 5272 1 43.84 AAGAAAGTTTGTTTATTTTAAGATACTGTATACGGCTAGGGCCGACAACGAGCTATTGACTCATCTGTAACTTGGGCAACTTCACTGCAAATCGTCGACTTAGATTCGGCCATC:1 + chr2R 1318723 3' - diver2 314 2 51.75 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCCTGTCGTTTAATATCCCAGTCGTAGCTATGAAATAACTAGCAAAATAACTCATT:1 - 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chr3L 1400922 3' - invader1 75 2 66.44 ATAAAAAAATAAAAAAAAATAATTAATTTATGTCGATGGAAAAAAATATCATTTCCATTTAGATTGGTATTATTTTAATTAAATCTGGATTGCATTTATGGCTCGTAAAAGCTGTTTAATTGAAT:1 + chr3L 10328000 3' + Rt1a 5079 10 65.60 CGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACTTACCTCATTCTATAATATTAAATAGCACTCCGTAGTTCGTTTACCTGTCGAAAACAACATCCG:1 - chr3L 16212715 3' + Transpac 258 2 53.79 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTGTTAGCG:1 - chr2L 246013 3' - roo 81 2 73.97 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTT:2 - chr3L 96486 3' + roo 9023 2 52.05 TTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCAAATATTTCATTTGAAGTGACACTGCGTTGGAAATTTGTCTGAATTTTCAGCCCCAAAATTGGGGGCATTTAAATGTG:1 - chr3R 27535405 3' + 412 493 2 78.85 AGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTGGAATCTC:1 + chr2R 21402726 3' - mdg3 31 2 63.70 ATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTAGGTACTCACATCCTGCCCTTTTCGATTTACATGCAGCATGCATTAAAAATAGAACCTTCGGAAAAGTTTCGTGAATACT:1 - chr3L 23027513 3' + INE-1 565 1 63.85 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACG:1 - chr3R 21001831 3' + 412 421 2 81.60 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCCAAATTATAGGTCAATTTTAGGGATTACTCTTCC:1 - chr2L 3762945 3' - jockey 96 1 76.03 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTCATATTGTAATAAATGAAGGAATACCAC:1 + chr3R 16913470 3' - pogo 51 1 58.22 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCAT:3 - chr2R 19554912 3' - pogo 47 1 53.42 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACATATATATATATTTTAGTGGGTAGAGGAAAG:1 + chr2L 21252400 3' - I-element 75 1 75.20 TGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAC:1 + chr3L 16973453 3' - S-element 72 1 70.55 AAATAAAACAAAAAGGAGTTGACAAAAAAAAGGAAGAAACCCAA:1 - chr3L 16176306 3' + Bari1 1660 1 65.91 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTGTTAGGTGTATGAACTGGTTTGCTTTGTTTTCTTTTTGGAATGGCACATCAATGTGATAAAATTTGGCCTAAAACTG:1 - chr2R 8395881 3' + pogo 2077 1 63.28 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATCAAAGTCAAGTTACCATGGGCGGCCGGCGTTTTCCCCTCTCACGGAAAAGACACTTTTCCCCAGATCTGTGCACAGATTGAAAAATCATTTGGAAATTTAATATCTTC:1 - chrX 18933468 3' - FB 15 1 75.34 TTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCC:1 + chr2R 8641605 3' - diver 5944 2 54.11 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGGTTTTAGAAAAAGCTTTCTCATTAAAACTAATGACAATAAAA:1 + chr3L 16212810 3' - Transpac 76 2 71.23 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCAGGCGTCGAACTCGGAGCAGAGGGCTGTGTGGCGG:1 - chr3R 8258860 3' - Tirant 8170 2 73.73 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCTAGGTACAATGTGCAGTAGCGCTTACTTGTTG:1 + chr2R 5923057 3' - jockey 4708 1 58.90 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTT:1 + chrX 1103708 3' + pogo 2068 1 56.36 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATTTGAAGCATATCCATATATTACCGAGAATAATAAAATTATGCTGCATCATACATACAATCGGATTTAT:1 + chr3L 19792538 3' + pogo 2053 1 53.42 TGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATAATGACCGGCATTGTGGGGGCTTGGAATTGAAGAG:1 + chr2L 436532 3' - copia 65 2 72.58 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGGATTATCTTATTTCAAAAATTAGTTGGTAAATTTAAATGTAGTTTTAAGTAAAATATGAATAGGTTTCACTAGTCTTATGTGCCCAATTCATTACAAGCAT:1 + chrX 10567907 3' - roo 8683 2 68.49 CGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGCCGAGTAAAACTGACTATGTCCGTAATTTTTCCCTTTTTATATGAAT:2 + chr2R 12994933 3' - BS 5067 1 69.18 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAAAAGACTTACGAAGAATCACTT:1 + chr2L 9485714 3' - 412 31 2 54.11 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCCACATACCTCTCCACTGCTCTGCTGTTCATTAGTACCCCATTTTGGTGGGGCGACTCATTCGTTT:1 + chr2L 6184113 3' + pogo 2047 1 57.53 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATTCACTTTCATTTTCAT:1 + chrX 12866499 3' + roo 357 2 53.42 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTT:1 + chr3L 27415319 3' - transib2 57 1 56.16 ACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATACAGCCCGGTAGATGATATATAGCAAGTCAAAACCAGCCGCGAAACTGACTTAAGAGTATTCAAC:1 - 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hopper 79 1 75.34 GTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTTCGATGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 47 1 68.49 CATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAG:1 + chrX 21667940 3' - gypsy2 6551 2 69.23 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGTTTTTTTTGCATATCAACACACGTGTAAAGCAAATGTTAAACATGAATGTGTGTAAGTGAATATGTGCAAGGG:1 + chr3L 9571794 3' + jockey 4986 1 74.66 CAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACGCAAAAACGTGCTGAGCAATAATCTAAAAC:1 - chrX 4701155 3' + P-element 2798 1 24.66 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGGCAATTGCCGCAAATAGGTCAGTTC:1 + chr2R 10865243 3' - blood 7064 2 57.89 CAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCA:1 - 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chrX 16787070 3' + pogo 2048 1 55.48 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATCATGTGTAAATAGAATCAAACTTGTT:1 - chr2R 18482411 3' + hopper 1364 1 57.46 AATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGCGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGCTTAATACTGTCGGGAAGGACTTTTTCTTTTGTTATTTCTTAT:1 + chr3L 19161422 3' - S-element 65 1 68.15 GTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACGCGCATGAATGTATCGACGGCCTGAAGAATTTCAGCTTCC:1 - chrX 11545331 3' + R1A1-element 5321 1 74.16 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATAT:1 + chr3L 12224692 3' - 412 87 2 75.34 CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTATGTATGTACATACTGTGAACTTACATATATAGAAACGTACATATGTGCATATGA:1 + chr3L 16870249 3' - FB 58 1 63.24 TCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTTATATATATATAGCCTTTTGGAATCCTCGGCTTTCGGAAGCGGCTA:1 + chr3R 17495831 3' - Quasimodo 72 2 73.97 GTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGACGCACATAGCACTCA:1 + chr2R 21076059 3' - P-element 104 1 14.38 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCTGTTAAATGCTCTA:1 - chr3L 16562853 3' + roo 9006 2 61.64 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCTGAGGTGAGTGTGCAGGATGACACCTGCTCATAGATAAAT:1 + chr2L 16884946 3' + pogo 2080 1 69.86 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACCTTCCAATATTCTATAGGATCTGTATTTTCCTCTGAGTGCTTCAGATTAAAATACATTAAAACATTTTTCAATGTCCTACGAGATGGA:1 - chr2R 11969149 3' - pogo 30 1 63.70 GAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCA:1 - chr3R 17605636 3' + Tabor 7259 2 59.59 AGCAAAGCAGTTGTAGTCGGAAAGGTTGCAACGTTGTTTCCGACAGATATGTAAAGTTTGGCAGAGTTCCTCGTACAGATTGGCCGTCTCCTGCTTCACCTTG:1 + chr3L 2723379 3' - Ivk 371 1 47.57 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCCATTCATGCGGTAGAACATTCAAATAACCCGCCATATCGGTCCGAACACCCCATGCCATCACACCCACATTCCATCCATCGAGTCCCAGCAGGAATTTATGAC:1 - chrX 14450285 3' - jockey 4777 1 73.29 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGCTGGCTTTCATTTTATTATTGCTTTTCATAATATAAGCTATTTAGATATTGCAAAATCGTCATATAT:1 - chr2R 22492014 3' + pogo 2050 1 54.79 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAACAAAAAAATCAATAGCCAAAATGTTGCATATCTTAACAGGCTATACCATATATTATGGCTGACTAGGTCAATCCCAAAAACTGAGTCCAGAAAAGGGAAT:1 + chr3R 22249244 3' + jockey 4975 1 62.33 GAATAGCAGTGTCTGGTTTTGACCAACGTAAAGTCCCAAAATGATCAATATTTTTTAAAAAGTGCGTTTGGTTAAGTAAATTCGATAATTGGGCGGGAAATTGGCATCGGGCGTTGGGCGGTAAAA:1 + chrX 2819330 3' + HB 218 1 63.49 AGTAGGATCTAATTATGTAATAATAAAGTTAAAATTGACTGCATTAAAAGCGGCAGAGAGCCAATTATAGCCAGAATATAATACTCTGTAAGAGTCATGCAACTCATAGTTTCGCCAAAGCCGCTGAGTAAGCATCAATTGCATCC:1 - chr2R 18153036 3' - Cr1a 4281 1 74.66 GTGGTTGTAACCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTTGTCGGTGCTCTTGTTTGTTGTCGCTTCTTTTTTCTGTTTGGCATTTTGTTTGCTACAAACAATTGCATACTTGTGCAGGCTCTAGACATTT:1 + chrX 13789748 3' + R1A1-element 5287 1 68.84 AGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTCGCACATCATCGCTGGAAATTTGTTTAACTTGTAGTATGTTGTTTTCGATATAAAAATAGTTTGTACAAATTGATTTCG:1 - chrX 11473648 3' - jockey 4842 1 57.53 GCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTACG:1 + chr2R 4206651 3' - 1360 326 1 68.28 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCTTTTTTAAATACTTGATATGCCTCTTGGGCGTGGGAATTAATCCAGTACGTGTTGAGGCACTCATAGCTACTATTAAAATAAGCTTTAAATATCAAACTAAACTAC:1 + chr3L 15612848 3' + roo 392 2 70.55 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGTATTTATAAGCTTTCATTTCTTTCCGTGTGATGCGGTTTCTGTATGTTTTGGTTGAATGAGTTTAAATGC:1 + chr3L 13868741 3' + 412 444 2 53.10 GAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAGTAATCATCTTATTCTTGTTCTGAATGAACTGACAATTATTTAATTTGTCTAATTTGGT:1 - chr3R 12593025 3' + flea 4954 1 61.64 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCTATTTCTATGAGCGCTGTCCTTTTTCATTGCCTTTATTTTGCTACTTTTTATATACGT:1 + chr3R 28728748 3' - jockey 79 1 62.33 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTCACAGTGTAGTTTCAACCTTGATTAA:1 + chr2R 19555059 3' + pogo 2069 1 60.96 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTCTTCAAAATCCATAGCATAC:1 - 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chr3L 18658860 3' + roo 9042 1 63.70 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTAAGATTTTTATTGATTATAGATTGTTTATATTCTGCAGTTGAATTTGAAAGCATTCTGTAGCTTTGGAATGTATACATATTTCAAGAATTTTTTATTGCTA:1 - chrX 22725490 3' - roo 8680 2 74.66 TAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAAATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATATATGTATGTAAGCGTATTACCGGTGGAGTTCTTATATGTGATTAAATACTTGTATTTTTTCATATGTT:1 + chr3L 23635039 3' + 1360 445 1 52.05 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCATTGGCCGCCGCTGC:1 + chr2R 6842865 3' + roo 352 2 54.79 CTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCG:1 + chr2R 15829579 3' + invader4 3021 2 76.42 AATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAA:1 + chr2L 22224615 3' + Rt1c 5409 1 60.27 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAGATATTTTTATGTAATTATT:4 + chr3R 9352148 3' - Tirant 8118 2 79.45 CCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAGTTTGAGTAGCCACGGTTAAAATTGGTTAAGGTTTACAGCCACT:1 + chrX 15137452 3' + jockey 4916 1 68.49 ATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACATTGAAGAACATAAATAATTTGTTACACTTATAAGCTCTACTAATTGTTTAATA:1 + chr3L 25634715 3' + R1A1-element 5240 1 62.68 GGCTATCCCAAAGCTTTTTAAAAATGTTATCACTCCCCTCATTGGCAACACATTTGTAGGTCAATTTTGTCACCATATCAGCACGGTTTTATGAAACGCAGATCAGCAACCACACACACTCCCATGCAGAGCAGTCAACACAATAG:1 + chr2L 10871659 3' + Q-element 132 2 74.66 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGTGGCCATTCTAGG:1 - chr2L 685990 3' - roo 8709 2 56.00 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATAACAATCGACCGGATCCCGAACATCCCCTGATGAGGCGTGCC:1 - chr2R 1921388 3' + mdg1 7436 2 66.67 CTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGCTTTGTTTACCAGGCAACAGGTTATT:1 - chr3R 5208113 3' + hopper 1370 1 54.48 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAA:1 - chr2R 11057252 3' - pogo 27 1 55.65 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTCCACTTTAATACACCCCGTAAATAGTTGAAATTTCAAAAGCCTTGTGTGGGAAAAACTTTAACCGAGAGCAGGTGGAAAAC:1 + chr3L 10133621 3' + 412 452 2 52.74 GTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATAATATGTTGCATGTTGCGACAGTAAAAGTAAACGAA:1 - chr3R 13176364 3' + Burdock 176 2 76.03 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTACAACAGCTTTATACGC:1 + chr2R 5923008 3' - jockey 4746 1 74.81 TGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTCTTACAAGTGCTCTATGAATCGCGATGAAATCCGGTA:1 - chr3L 24291965 3' - rover 7009 2 61.64 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTGATCAGGCTGCAGTGTGTGATGCAATTATGAGGGAGTAGTTTTTTGTTACAGTTTAAAGTAAACATTCC:1 + chrX 16855345 3' + roo 9020 2 52.41 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACCCATTAAGTAACCCCAACTGATCGGCGCAAATGATTCAGCTATGCAGAAAATATGATTGATGATTTTTCCCTCCCACCAGCCCTTAACA:1 + chr2L 12553543 3' - 412 26 2 66.43 AACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATACAGTATATATATTCTTGATCAATAGCCAAGTCGAGATCTCAGAAACTATCAAGGGTAGAACCAAGCTTTGTGGCAAATCTCCGCTTTGGTCTATTCCAACTAGCCAAAGCCAG:1 + chr3R 20236487 3' + INE-1 34 1 59.31 CATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAACCTTCTCTTGCTGGTTAACTCCATGATTGACTCATTTTTAAGTTCTAAAACTCCAT:1 - chr2R 10648251 3' + Ivk 368 1 77.40 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAGCTTTTCTCTATTTGGACCGTGGCTTAGATATCTTGCCTTAAAATTTTCCGCCTTTCCTTATTTTTTTCACATTTTATTGAAAGGAAAAATTCGATTTGCAGC:1 - chrX 12866344 3' - roo 16 2 74.66 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGTTTTAGGCAAGTCCCAGAATGTTCCCCAACA:1 + chr2L 15988047 3' - roo 89 2 80.14 AACAACAACAACGAAAAAATCAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAATGCTGTCCGGGGAGAGGAACTGAACGGAACGG:1 + chrX 4453769 3' + gypsy9 460 1 76.32 AGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' - micropia 4982 2 57.45 GAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTGCCTAGCAATATGATAAAATAAAAAAAAATTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTAGTAAATTCTGTTACGTTCGACTTACCG:1 - chr3R 4607166 3' - 1360 3172 1 77.24 AAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTAAAATGTTTCAAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTA:1 - chr3R 9190512 3' - Tabor 6916 2 67.81 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCTGCTGAACCACGAACAAGC:1 - chr2L 13792570 3' - F-element 67 1 56.25 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTG:1 - chrX 2762602 3' + roo 387 2 59.49 GGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTCTGTTTGTTGATCTCGTACTCGGACTTCTGGCCACCGAACTGGGGATGATCTGGCTTCTT:1 - chrX 6811352 3' - Quasimodo 447 2 54.55 ACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCAAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCCATTAATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTTTGAAGTGATATGACAGTGGTCGTTTAGCTTTTGGCTATATAG:1 - chr2R 5516705 3' - 1360 398 1 48.63 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTATTTTTTTCTTATATAATAAAATTTTGTTTGGCCTTTTAGTTAACACTTTATTTTGTGTGTGCACCACAGTTGTTTCTTGTTTATGGCC:2 + chr3R 30295230 3' - Quasimodo 27 2 45.21 TTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATGTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATGAAAGTTGCCGTGAAAGTGTCGCAGTCAACACAATCCAATCCACACAATGTTCAGGAG:1 + chr2L 10344643 3' + FB 224 1 60.27 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTTTTCACAACGTTGAGGGTATAGAATCATTAATCGAGTTGGCAGCACCGTGTAGTTTCACGTAGGG:1 - chr2L 6318886 3' + pogo 2065 1 54.26 AAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTAATGACCTTCATTATTTCTACCCT:1 + chr3L 5627346 3' + diver 6048 2 60.69 TATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACA:1 + chr2R 17392083 3' - BS 5077 1 73.29 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCTTTTGCATATCCGACATATCGAATACAACCCAAATTAGCCAGCCAATCCGACTTGCAGCTTCGCTTAATTGGTGGAAAGTAGCGTAACCGTTCCGGCCACG:1 + chr2L 12079748 3' + mdg3 232 2 73.05 GCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGAAGGAGCTC:1 - chr2L 12340733 3' + diver 196 2 55.26 ATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTACAGAGCTCTAAAGAAACCACATCGAGACCAGATCGAAGCGAACCGAATTGGA:1 + chr2R 7362937 3' - pogo 301 1 64.38 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACGCACATAGCACTCACACACATTCTAAAAACGATCTCTCCCA:1 + chr2R 21076086 3' - P-element 26 1 47.37 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTATATATGTGTGTGTAAGAGGTTCTGTCGTAATGAAAATAAAGTAGCAACTTTAACGCATTTTTATGGCTCTTATTCCGTTGTCAACCGTATGCAACAAACAACAACAGCAGA:1 + chrX 10974481 3' + opus 7497 2 80.14 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTC:1 + chr3R 24476373 3' - 412 62 2 60.27 CGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGATCGCAATCAAAAATGCTCAGATTGAGATACAAATTCGAATAAATGCCAAACGCAACAGGAGGCAA:1 + chr2R 22266480 3' + Porto1 4273 1 64.52 AATTAAGATATAATAACATTGTAAATTAATATAGCCGTAAGCCCCGTAGCCAATGCTATAGTGTGGAAGACGTCTAGGCTGTTGCTATTGTTGCTGTTTGACGTGGCGCCATCCTCGAAGTCCTCGTCGTCTTCGTCTT:1 + chr2R 12148803 3' + I-element 5258 1 56.12 CACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATA:1 - chr2R 1921429 3' + mdg1 346 2 66.44 AAATTGTATTTTGAATTTAACTATATTGTCGTGGAACGGATAAGTTGGCTATCGATAAGAAGTAAAGTAATTTGTCACCGATAGAGGGCACTTTAATGTATGCGTTTTTATCGTAATTGTAATTGGTCACT:1 - chr3L 23062901 3' + transib3 51 1 79.39 AATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAGCCAAAAACGTTAAATTGAATTGCAGCGGGCCAAATCCTCTCACCTATTTTATTCTGTGACAAATTGTGGCAATCAAAATAGTTGTGCGCCTTTTCGGGATGATGAAAA:1 + chr2R 21414524 3' - BS 5058 1 76.03 AATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAATGGTCAAGTTATTATTACATTTCATGGTTTTTATATAGTCAGTGCTTTGTCAAGGTGCGTTGACAAATCATAGTACA:1 + chr3L 11776781 3' + mdg3 5462 2 57.25 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCACGCCGACAAACGCTTCGTGCAACTTCGTGCAGCTTCGTGCCACTCGGTTCGCAGTGGTTCGC:1 - chrX 14826096 3' + P-element 2853 1 54.03 GAGCGCGACTCTTCGCATTCCAAAAATTCCTTCTCCTGGCAGGAAAAATTGGAGTTGTCATGGTATGGGGCGCAGTATCCTATTATGGCCCCTGAGAATTACAG:1 + chr2L 23072660 3' + invader4 6 2 68.27 GAGGAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAATTCCATCTTTTTTGTTCTTGCAGGTATCGTGCGAATTGCAAAGATCGAACAACGCCATTTCACTCCAAACCCCAAAT:1 + chr2R 17703276 3' + HMS-Beagle2 6880 1 48.63 GTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTTTCTGTATAGATCTAAGTGCTGGTTTAAATTTGGCGCCCGTTGGCAGTCTGATTGCGG:1 - chrX 14910270 3' - Stalker 6930 4 59.72 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAGTCCAGTTTAAAGGTAAATACGCGCTCTCAGCTCCGATAAAA:2 + chr3L 7962321 3' - blood 7042 2 61.64 TAGCTGAGTAACGGCTATCTGATTGATTATTATTATAATTGGAATTCAAATAACAATTCTAGGAACCAGAACGATGCAGGTAGATAGTTTCATATTGAGCCAAAATCGGAATAATAGTTACTATCTATTAATTACTATCATCAAAG:1 + chr2R 3515303 3' + INE-1 544 1 75.34 TTTCATTTGTTTTTTATTTTTTTTTCCCGATTTCCCTCTTGCTTATACTTACTTATTACTTTATGCGCTTATTCCTTATAAGTTAGACTGTAGTTCCTTTCACATAGAAGTAATAAAAAATTGCTGATGGTGCAGTGGGAAATGGT:1 - chrX 10248459 3' - Porto1 169 1 71.92 GCGATATAGAAAAGAGAACAGAAACGAGGAAACGAATACAATGTAAAATAACTCTAACTCTAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTAGTTAATTGAATTTGCCTTTTTGATATGTATGTCACATTGATGTTGACGCCGCAGTAC:1 + chr3L 22200299 3' - Cr1a 4352 1 60.69 ATGGTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATATATTTTCAAGTAATAATAAAGTTAGGGCAATGCAAAAAAGAATTTTTCGCATAGTGCCAATTGAGCAAAGGATATCAGAAAAGAGTATTTTATTAATAATTCCCTAAACAATA:1 + chrX 22534339 3' - 1360 346 1 61.64 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATGTGGCATGGAAATATTACACATACGCCCATTGCGCCCTCAGCCTAAAAGTATGCAATGGCG:1 - chr2L 2004922 3' - jockey 65 1 59.72 ACAAAGAGAAAAAAAAAATGAAGCAAAATGATTGCCCGCCTGCTTTTTGGTTCGCCACTGTTCGAAATATTCTAAATATAAAGCGTAAGATGAAAATAAAAGTTTAGAAAGAGTATTAAGCTTTTGTTGTTTTGGATTCAACAACA:1 - chr2L 5225691 3' + invader2 292 1 69.18 AGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAAT:1 + chr3R 11750257 3' - Tabor 75 2 68.75 GCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTG:1 - chr2L 9485599 3' + 412 465 2 50.47 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAGATGCAGATACTTTTGCTATGATTTAACCGAC:1 + chr2L 4174102 3' + roo 9048 2 67.81 ATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAG:1 + chrX 21667940 3' - gypsy2 6543 2 68.89 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAACACTTATTTTTTACACCTAATTTATCAATTTATATTTCTTTCATGATGGTCGTTAGTAAATTA:1 + chr2L 18193124 3' + mdg1 7404 2 56.16 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTGT:1 - chr2R 11609214 3' + roo 350 2 60.00 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATAGCAGCTGTAG:1 - chrX 2762562 3' + roo 9033 1 54.41 CGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chr3L 20988181 3' + Stalker4 192 4 74.66 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAAAAGACTTACGAAGAATCACTTCGTGC:1 + chr2L 9485719 3' - 412 26 2 57.53 AACTATAAAAGCTAGAAGGTTCTATCATACAGATTCTAAAGACAACGACGCATCGCAAGTTTGTTCACCAATGTGGCCATAAAAAGTATTTATAAATATCTCACCATTGTAATAAAAATAAGTCTGCATGACGACATAAGCTTTGC:1 + chr3L 23025421 3' + INE-1 159 1 54.11 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACG:1 - chr3R 21001831 3' + 412 444 2 77.45 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATAATGTGTAAATAGAATCAAAATTGTTGACTCGG:1 - chr2R 18482404 3' + hopper 1359 1 56.16 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGTTCAAAACCTTTCACACTCTTGTTATGGAAGCGGACTTAGCGCTAATGG:1 + chr3R 15702988 3' - copia 42 2 59.13 GGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGTGACGTATTTACATTATAAGTACTGTCCAAAAAATAAGAATATG:1 + chr2R 1478227 3' - opus 183 4 70.83 ATCGGAGAGACTCGGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATACGTCAGCCCGACGGCTGTGCTGTTTTGTCGTGTGGTGATGAGTTCCTTACTGGTTTATT:1 - chr2L 1373814 3' + 412 367 2 67.38 AATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGCTGCTTGATATTCGAAAATGTAGCTCCTGAGTGTATACCACATTGTCAAGATAA:1 - chr3R 2555491 3' + Bari1 1640 1 63.01 CAATACCAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTTTGTTTTGGGCATTTTATTTAATAACTGTAATAGGAAACTCTTTATTGACTTTATTTATTTTCATCAATTTATTGTTTTATTTTTTTTTTTCAACTAAAATTTAATCATAAGA:1 + chr3R 7722326 3' - Bari1 403 1 51.37 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTT:1 - chr2R 11057247 3' - pogo 38 1 52.67 CGTGTGCCAACAAATCGTATGGCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTAATCTAGCCACGCCCACAAAACTGCCGCACTTTTCAAAAAGGTATTGCTATTTTTTCACATTTTTAATAGTCTTGTA:1 + chr2L 22063442 3' - 1360 32 1 53.49 TGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCATAGATATTTTTTGTGCCAATTTCTAT:1 - chr2R 5212867 3' + F-element 193 1 72.63 AAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACCGCAAAATCTATAAATAGCCGAACAGTACAATTAATTGATGCACAGACACA:1 + chr2R 21371545 3' + roo 9036 1 55.91 GAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTCACTGTTAACGTTATGAAAAGCCCATAATTTCGCAGCCACCCCGAGAGTTGTGCTCCGGTTTCTCT:1 + chr3L 1918431 3' + baggins 4999 1 52.59 CTCTTATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAACTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTATGATAGCAAAAA:1 + chrX 22913193 3' - gypsy7 44 2 72.58 AATTTGTATTTTGTTTATTTTTTTTACAAAACTAAAATACTATATTGGACTGATTGAATAATTGAATGAATGCATTAGTGAATGGGATTATATTCATGGTCAGCAACACAAAGGGAGTAGATATAAACAAGCTTTTAAGCCATTGT:1 + chrX 15902725 3' - transib4 2540 1 79.45 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTCGGACAACAAAAGTTG:1 + chr3L 12867359 3' - roo 69 2 68.31 GTGGTGATGTTGAGAGGCCCGACTTGATTAGTCTGTGGTCGCCGAAAAAAAATCAAATTAAGCACTGCACTGCTGCCGCTGTTCCGCCAATTTCTCGCTTTGCTTGC:1 - chr3R 1192854 3' + Cr1a 4062 1 69.16 AAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAGTTGCCCCCCCGTAAAGGGATAAATTTGAACGTCTAATTGGGCATGG:1 + chr2L 8294473 3' - hopper 148 105 92.86 AGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAGCTTTGTCGCTTATTAAA:1 - chr3R 27510058 3' + Bari1 1658 1 50.68 GTGTTTGTGTGTGTTGTTCTGCCCTCTCAACAACATTTTTTTAAGGGGGTCATAACCAAAGCCCGAATCCTTAGGATTCCTTAGTGCGTCATATGGTGCACTGGGAAGGTGAGTTACTTTTCAATTTGGCTGGCCG:1 + chrX 3982203 3' - gypsy3 418 1 88.24 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTGTTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACTTTTGCGGTCCACAAAGACCGTGT:1 + chr3R 27794871 3' + roo 343 2 60.96 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAAATAGTGCCAGGGGGAACGG:1 - chrX 5858938 3' + hobo 2915 1 67.65 GCATAAACACACACACATCATTGCTATTGTGTGTAAACAGTTTGGTTACCGGTGCAAATACAGTGCTTGTAAAACTGTTTACCGGATCCTTCGTTTGACTTGGCTCACGATTCCCTGGAGGAACTGGATCTCAGTCAAA:1 - chr3L 25412360 3' + G3 44 1 49.64 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAGACATATGTATGTATGTATGTATGTATGTAGCTTTGTGCTCCTCTCTTTCCTCTGTTGTTTCATGAAATTCTTTGGGGATAAACTAAACGAGAATT:1 + chrX 22858529 3' + copia 242 1 63.91 ATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTG:1 - chr3R 21276553 3' - BS 5065 1 68.66 TGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATGAGTCACCAGGAGAAAGATGTTAGTAAATTGCGCGATT:1 - chr3R 19859618 3' + opus 416 2 74.66 TTTTGTTTTTATTTTTATTATTTTGTTTATTTATTTTTTAGCACACCAAGCGTACCTTCCACGACGCCCAAAACAAAGTGCGCCGTCAGGAATCTGGTTACTTCATTATGCCCC:1 + chr2R 19361448 3' - Doc 4691 4 69.30 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCAT:1 - 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chr3L 17707800 3' - Doc 42 1 52.99 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAATAAAATGTCATTATGCGCTCCCAAAAGTATGCAAACGATTTTTCGCTTTGAATGCTGGGTACTT:1 + chr2L 3890227 3' + jockey 4941 1 59.59 AGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTTAAACAATAGACTTGGGCACTCGAAT:1 - chr3L 22054941 3' + mdg1 7029 1 65.75 GAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAAT:1 + chrX 16384072 3' - diver 5974 2 73.29 GCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACACATGCCCAATATCACTGAAGTAGCAATAATAGTACAAAGACATTCCCGCCAGGCACAAACTCAATGGGAATGCAAATGTCTACTCTATTTATATTCACC:1 - chr2R 19351916 3' + Burdock 238 2 71.72 ACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCGGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACG:1 + chrX 21667931 3' - gypsy2 64 2 65.93 GTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTACTCCCCATCACATTAAAAATGGGCGTCCTCGTCCATGTCTATGTTATCCCAAACAATAAAGTGAATTGATCAACTCCTTATTACCAATGTATTACAACTATGGGTTT:1 - chr2R 18206381 3' - Chouto 15 1 59.03 ATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTGGGTATAATCCATTAAGAGTTAACTAAAGTGATT:1 + chrX 12191620 3' - pogo 79 1 72.41 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTAAGGGCCATATTGACCAAAAATAAATATAAA:1 + chr3L 96579 3' - roo 8745 2 74.66 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTC:1 - chr2L 4173991 3' - roo 8752 2 78.77 AAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCA:1 - chr2R 11763609 3' - Tabor 65 2 71.54 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCCATTTAAGACACCCAATTCCCGC:1 + chr2L 17250854 3' + opus 7477 2 59.72 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATTAAATAATAGTATTCGATAAATATTAAAACAATATTTGCAACTTGTAATAAGAATTTGAATAAAACATTATATAAAATAAATTCATATTTATCTAACTTAGCATCTTTAAGTACAA:1 - chr2L 16399260 3' + roo 405 1 71.23 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCAAGCTGACTGCATG:1 - chr3R 25304739 3' - roo 73 2 76.43 AAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTTACGCAACAGCTATTAAAAAAGCTCAATAGCTGAACAGTGTGAATCCTAAAAATGTATTGCTTTTCTAAGCGAACTAATAATAATTTTTTTTACTTTT:1 + chrX 13287874 3' + diver2 300 2 54.79 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGTGCAACAAAATTGAAACCTTTATGCAAGGC:1 - chr3L 18467134 3' - hobo 13 1 75.34 GTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAATGAACAAACGAGCGGGCGCCATCCAGGGACCAAAGCCAGGCAGG:1 - chr3R 13607621 3' + I-element 5303 1 52.74 AAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTA:1 + chr3L 13827371 3' + hopper 1365 1 51.37 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGGA:1 + chr3L 27391421 3' + 1360 3365 1 64.14 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATAATCATAAAAATTTAAATTAAAAATTTCAAAAGTGTGTATGCCAATTCACTAGCATATTTTTTTGTTTCCTATTATTTAGCAAGTGCTCATACCGGCGATCAAAC:2 - chr3L 23325932 3' - pogo 13 1 76.71 GTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATACAGCTGCTAACTCTCACTTGCGTTCTAAAAATATTCCAATTAAAAATTCATATGGAGCAATTCGGGCTGGCAGGGTT:1 + chr3L 22335225 3' - Stalker 6994 4 52.74 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTGCACTCAACGCGGCTTAAATCAAATGCCCAAAAGTATGCAGTGATTTAATATCTGTAAGGTTTACACCCATTTTTCATCCTTTATTTATATTT:1 + chr2L 6717238 3' - jockey 32 1 66.21 CTGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACGCAG:1 + chr2R 4313057 3' + gypsy 7398 2 47.14 TATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAATATTTATGGACAAAAAAAAAAACGGAATAAATAAATAAATAAGTGCAATATTATTTTCGTATATATTACATCATCGAGTATTTACATTAT:1 + chr3R 15721458 3' + diver 147 2 70.14 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAATAAAATAATAGAGGAACCTACCTTTGCAGGACTTGTCGTGTAGTTCGCGATCATCCTCGAGCAGCGTCTGGAACTTG:1 + chrX 17419482 3' + Juan 4164 1 51.37 GTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTCACAAAAGGGTCGACTTTTGCTGGTTCAATGGCACCAATTACACA:2 - chr3R 15702914 3' + copia 180 2 69.86 ATGAGGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGCAATACAATTTTTATGCGAAAACTAATGTAAAAAAGTCGAATATCA:1 + chr2L 2657316 3' + diver 6038 2 65.07 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACG:1 + chr2L 17240302 3' - hopper 23 1 56.70 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCT:1 + chr3R 9190580 3' + Tabor 407 2 70.34 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATTTTTGTTAATAAATAAAATTAT:1 + chr2L 76176 3' + roo 400 1 77.69 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATTTCA:1 - chr3L 25406605 3' - 1360 12 1 67.81 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATTAATGACTGTTTATGTTTGGTTATACACAAAAGATGAAAGCCTTAATTGTTTATGGCTGTTTATGTTAGTACTAATGTGTTAAAGAAGAAGAAAAATCTGGTAAAG:1 - chrX 3263273 3' - roo 14 2 76.03 AGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAA:2 - chr3L 24213788 3' + invader2 162 2 76.03 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAACATTTGGAAATTATTGTATAATTTTTTAAA:1 - chr3R 13631379 3' - 297 31 2 73.03 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCT:1 - chrX 3996516 3' + roo 320 2 79.45 GATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGAAAAAGCCAACAAGTAGACAAAACTCAGTTGCGATGGC:1 - chr3R 17495715 3' + Quasimodo 7336 2 59.85 AATTATTATTAATAAGATTATTATTAAGTTGTCAAAGGGTATCGTACAGTCGAGCAATTTATATAAGTTTCTACTTCACACATTTTTCACAGTTGCAACCTAAAGTGGCTTTTAGTTTTCCCGTATGCTTAAGTATAATTTACTGT:1 + chr2L 9660770 3' - mdg1 43 2 57.53 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAGCCCTCGATTCTTCAC:1 - chr2L 23310600 3' - 1360 28 1 62.50 AATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGTAGATGGAGCGACTTACAAAATGCTCTTTCAATGTTCGTTGTAATTCAGCCAAAAAC:1 - chr3L 5286051 3' - jockey 4851 1 60.96 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCCAAGAAATTTGGGATTTCTTCTTATAACACGAGCACTTTAAGGATCAATTTTTTCCATTTTCAATGGACT:1 + chr2L 19068163 3' - pogo 50 1 53.42 ATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTTTAAATTTATTCAAATGATTA:1 - chr2L 10970696 3' - G4 3823 1 65.07 ATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACATCACA:1 - chr3R 907899 3' - gypsy11 4338 2 32.19 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAACCGCAGTTTACTGATGAGGGCGGACCGGAAAAGTG:1 - chr2L 17210217 3' + jockey 4981 1 76.76 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGATACCAGA:1 - 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chrX 7515589 3' - roo 8674 2 78.77 ATTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATTGAT:1 + chr3R 24493154 3' - jockey 4751 1 69.18 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTATATCGCGATTAAGATAATCAACTGCTC:1 - chr3R 27478516 3' - hobo 71 1 76.61 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACTTTCTCTTT:1 - chrX 8891759 3' + P-element 2822 1 36.69 CACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTA:1 - chr3L 22052765 3' + mdg1 7384 2 69.18 AAATATATTTATATTAATATTCATCTATCATAATTTCTTTTTTTTTAACCACGAAATAGTTTTCAGTGCACTGATGAAGTGTGTAATGTGAAACACGCAGCGTGTGTAAGAAAAAGAGACAGAAAGTGTGACAAAAAATCAATCGA:1 - chr2L 12141124 3' + Tc3 299 1 65.75 AACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATTTATTGGGTTGAATACTTTTTTCCTTTTTGTTCATTGCCTCTGCGCGTTCTCACTTGCGGACCTCTTGTTCACTAACTGTGTG:1 + chr3R 845860 3' - FB 39 1 58.22 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTA:1 - chr3L 23146441 3' - 1360 30 1 64.83 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATAAGATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAATATAGTCATTTTGTTCGTTTTACGTTTTTTTTACACAACTACAAAATTACGAAATTTCATCA:1 + chr2L 21951263 3' + Burdock 236 2 71.23 CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAATAAAATAATAGAGGAACCTACCTTTGCAGGACTTGTCGTGTAGTTCGCGATCATCCTCGAGCAGCGTCTGGCA:1 + chrX 17419478 3' + Juan 4160 1 54.11 AATATCCATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCATAAATTTCGATTTGAAGGTCTTTAGACGCACTT:1 - chrX 22900421 3' + Tc1 1507 1 70.40 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAACCGGTACGTTGGTACCAATACAATGGCAAAACCAGCATGC:1 - chr3L 22400216 3' - 1360 17 1 73.97 GGCCGCCTGGCCGCCAAATCCTAGCTTCGACTGGGTCAGTTGTGGCAGACGGCAACATGTGTTCCTTGCTCGAAGTTCTAATGAGAGTACTCTCCTTTTGGGAGATCATGTCATG:1 + chr3R 30510943 3' + gypsy12 456 2 73.91 CCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATTATTACTTTGCCTTCCATCCTAAGGTTTCCTGGTCTTCAGCTTCAGTTTGGTCCTGTTGCACGTGCTGGTAGCAAAAAAGATTGTTAAAAACCACT:1 + chr2R 7020687 3' - Bari1 27 1 67.81 GGTTTGGACCACCCAAATAGGTCACTATATATTCTTGATTTGCCTATAAAGCGTCTTCCGTTTGAGTAAAAACATTTATTTGCATAAAGTCAACCAGTCGGAGTAGGAATGAGACAGCTATTGAC:1 - chr2L 12802656 3' - 297 5 2 50.40 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACC:1 + chr2R 19553290 3' + mdg1 377 2 50.00 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAACTCAGCCAAATTCAAATCTAAATCCAATTCCCAGCAGCCTTATCAG:1 + chrX 13395400 3' + roo 402 1 79.86 CTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGA:1 - chr3L 9571681 3' - jockey 4530 1 72.58 GAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACAC:1 - chr3R 13582215 3' - BS 5063 1 63.01 GAAATCCATATCATGGTGCCTGGAGTAGTCAAAATATTGAACATTGGATAGGGAGTAGAAAATGAATTTGTATAAAATTTGGGGTTATAGATTGGTAGGTATCAGGGAGATGAATTCCTAATCTAATTGGTTTTGTCATGTTGGCC:1 - chr3L 22907944 3' + invader2 4669 1 50.00 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAACGACTGGAAGGGCGGTAGTCAAAT:1 + chr2R 5868382 3' - pogo 60 1 61.64 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTCACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAGCGGTAATTGGTTGCCACCTGTATA:1 - chrX 12138932 3' + roo 9012 2 58.90 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAATCTAGT:1 - chr2L 9485586 3' + 412 439 2 53.42 GAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCTTATCGAGGAGTTCGCGAGTTTGGCCCTGCGCGTGTCAACTTACATATATATTGGCTTTGTGA:1 + chrX 21783567 3' - gypsy4 6649 2 90.16 GATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCAC:1 + chr2L 18279959 3' + gypsy5 7305 2 63.21 ATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATAAT:1 - chr3L 16260409 3' + hopper 1329 1 76.71 ATAATTATAATAATAATAATAATGATAGTAGTTGGTTTTTTTACTGCGGCCGTGTTGTTGTTGAT:1 + chr3L 22933642 3' + mdg1 7067 9 78.46 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAAATG:2 - chr3L 14553114 3' + roo 335 2 68.49 TGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATGTTTTCGAATATAGTACAGCTTAAATGTCAAAAATGAACTTTTAAAACTACAGGCGCAAAGTAATACATTTTTAGATGTAAGCATTTAAATAACAAAATCTGTGCTAGTG:1 - chr3L 12976199 3' + invader4 321 2 45.89 AAAAAAAGAAAAACAAACACAAACCAAACAAAGAAAGGCAAAAACAAACCCCCGAGGGTTGCGATCAGATCCCTTTAGGCAGCTGACCTTCTCCCCCTTTCTGGGCCCTGCCCAT:1 - chrX 4440230 3' + gypsy7 5009 1 77.39 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATTGCTTTTTCAGAAG:1 + chr2L 6319007 3' - pogo 36 1 56.15 AACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAAAAAAGTACGGGGGCGTCGAGTTTGTCAAAGCCAGATCAAGAATAGCCAAATGACAAAATGCCATAAATAGCACACCGACATATGTATGAAAAT:1 + chrX 3256598 3' + Transpac 344 1 72.18 TTTTATGTTTAACATTGTTATAAAGAAATAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATTTATATATATATATGCAA:1 + chr3L 5309458 3' + pogo 1985 1 69.18 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTG:1 - chr2R 5922968 3' + jockey 4930 1 63.01 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTATTGTGGCATTTCGTTGAATAGAATAGAAACAGAGTCTCATCGCCT:1 + chrX 19281790 3' - opus 177 4 68.57 ATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTGTGTATTGG:1 + chr3R 20175785 3' + hopper 1376 1 56.64 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAATAAAAATTGCAAATTTATACATACGTACGCGCTTTCTAAAAACAATAAAGTAACAAATGTCTTAGGATACATACATTTTGTCTATTTCTCATATGTA:1 + chr3L 20713098 3' - roo 8688 2 69.86 TTGTGTTGCGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACCCTCTTGTATGTGCTCCTTGCACAGTCCAAAGTCCGTAAGCTTCACGTGTCCCTGTGCATCGAGCAGTATGTTCTCGGGCTTCAGA:1 + chr3L 5806597 3' - Circe 130 2 71.77 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGCCTCCAAATGGATTCCGTGGAAGCCGTTTTGCCTCTTTTAGCCAAATGATGCGTAG:1 + chr2L 3659165 3' + 412 445 2 54.62 TGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCG:1 + chr2L 14248089 3' - I-element 79 1 69.18 ATAACATATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAACTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTGTTTTCAACACTTTGTTTATCGTACTGTGCATTTTTTGCATGTTTTCTTGCTTGTACACTCATTTGTTCTCTATCGACTGCACT:1 - chr3L 26847617 3' + hopper 1337 1 73.97 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGACAAAAATCATTATGAGAATTGTAGAGAATG:1 - chr3L 20594152 3' + roo 8983 2 78.08 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTCGTGATATTTTCATTTTTTTCCCCTTATTTAAATCG:1 - chr3R 4529645 3' - F-element 71 1 62.76 ATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGACATATT:1 - chr3R 13582204 3' - BS 5052 1 55.48 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTG:1 - chr3R 31490959 3' + roo 8988 2 76.26 GCATTCAAACCATTGACGCGGTGCCCAAACACCCACGCCCCCATTTCACAACCCCTTTCCAGTGCCGCCAACCC:1 + chrX 12191370 3' + HMS-Beagle2 6764 1 66.22 ATTTGCGCAAGAATGTAAATAAAAAAGGATAACATGAAAAGCTAACGGGATTTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTT:1 - chr4 123993 3' - HB 172 1 75.34 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAACCCTGAC:1 - chr2R 11489162 3' + mdg1 376 2 53.85 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCG:1 + chr2R 558158 3' + copia 204 2 73.97 ATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACATGAATTTTTTACATGGTGCCAATTGATCAACAATTATAGAGATTTAAATGTAAAAAGTTAAACACTTCCCTTGCAAATGCCAGGAGAACACGCAATCCACCGGTCCAAAAACATTT:1 + chr2L 8837624 3' - 1360 304 1 53.42 TATATAATATATATAAAATATTTGATATTTATATTGAGTGAACCCATAATACGCCTTCCTTCCAAGCTACCAAGAAAAAATCCCAAAAACCAAAGCAATCTCTTCCCGATCGGTTAGATCCACTTTCGGGC:1 - chrX 7529419 3' + transib1 1923 1 74.81 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATT:1 - chr3L 24152420 3' - HMS-Beagle2 40 2 56.85 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAAAAGACTTACGAAGAATCACT:1 + chr2L 9485713 3' - 412 32 2 53.42 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTGTGGCAAAGGTAACTGCCTTTGTTA:1 - chr2L 12079614 3' - mdg3 70 2 62.33 ATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATAACTGTAGTTGAAACCCATTTTTCGTTTTGTATTCTATTTATATTCATATTCAGTCATTCTTTCATGCCCACATCGAGACCAGC:1 + chr3R 2211132 3' - Juan 4009 1 58.90 TCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGGATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTGTCCTCGTTGCGAACAAGAGGTACCAGGGCATGCGACAAATAACTTGAAATCGAAATGA:1 - chr3R 31887710 3' + HB 1567 1 77.14 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCAACACGTATGCTACGCTTTTGTCACTGCAAA:1 - chr3L 9907348 3' - jockey 68 1 56.16 ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGGACGAAAAGCGTTTGTTCCTAGAGTTGAATGGTCAGCAATGGCATACGC:1 - chr2R 558094 3' - copia 66 2 64.03 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCAACACTGTCGTTTAACTATTTCATATTAAGTTAATTTATTTATTCTTGTTGATTTT:1 - chr2R 16441765 3' - I-element 20 1 70.55 GTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCGCAACCGCAACATTTCCCA:1 + chr3L 11400032 3' - Quasimodo 35 2 60.42 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCG:1 + chr3R 23765425 3' - roo 74 2 78.91 GGAAGAGCATGAGAGAGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTTGGTGAGTGAACGATGAAATCAACGAACTTAAGCAACGATGGTCCAAACGGCATGCTTGCAGCAACAGAATCTTATCTATAATTTGACT:1 - chr3R 16283576 3' + Bica 9 1 48.63 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATCGGAGGACTCCAAGGACTGAAGGCAGCGCCATAGTCTAACCCCCAACCGGTACGCATCACAGGACCCCGAGTAGATACTGAAGCAAAAAGCATGACA:1 - chr2L 22747224 3' - transib2 20 1 63.83 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACACGG:1 - chr3L 14553126 3' + roo 329 2 75.71 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCATAGGCCACAAATTAATCCCATCCAACGG:1 - chr3L 17890692 3' - 412 7082 2 66.44 CCTGCAGACATCTACTTCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGGATAGACTGCGTGTAGAGGTAATATGCTTTGCGGCAATCCTTTGCCCGC:1 + chr2R 14231199 3' - invader1 144 2 68.61 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAAACGCACAGAAGTAGGCTTCATTCTAACACTTAACATGCTCGTTA:1 - chr3L 12867266 3' + roo 9033 1 46.58 ATATATATACATATATATATTTCCAAACTTCAGTGGAAAAAGTACTGTTGCATACTTTTAAACAGCTTTGTAAGTTAATTAAATTAAATTATTTTAAATATTTAAATGTTGTTTCATCAAATAGTCCTTTTAAAATTACAGTGCCA:1 - chr2R 14443771 3' - 1731 4409 1 82.88 TCCTGAGAACTCGACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCAATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTT:1 + chrX 21587754 3' - INE-1 138 1 35.61 CGCTTCCTTGTGCCTGTTACATAGTATTCAACAAATCTAGTATACTCTACGAGTAACTGGTATAAAAACACATTTCTTGCTATTTAAAGTATGTAAACGGTATGAATATTTTTGGAGGTTATAATAACATGTATGCTCATTTAAAT:1 - chr2L 20923045 3' - INE-1 30 1 44.52 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAACAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chr2R 12679704 3' + P-element 2791 1 15.75 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTCATTTCTTTCAGTGCCATTTACAATGTACACAAACAAGCAAGTTACTAAAACTGCTGTAGCCGATGACCTCGC:1 - chr2L 2698340 3' + I-element 5307 1 56.16 ATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTT:1 + chr3L 23702259 3' - G4 59 1 54.79 AAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAATATTAAGATCATTTTATAAGGGAAAAAACAGGGCTTATCACAGGTTGGCATCATTAGGCGGGCGGTAATTAGGTAAGGCCCTGATAAGGTACCAAAAACTATGCGTAATCAT:1 - chr2L 8956385 3' + pogo 337 1 76.71 TATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGATCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTTGCAATC:1 + chr3R 29288812 3' + BS 5036 1 56.16 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTAGAT:1 - chr2R 8157175 3' - Transpac 70 2 70.55 GAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGTTCAGATTAAGAATCTGGGTTCTGCTGCTGTTTCACAACTGTTTATCCTTTAATGTTTTTTTGTTGGCATTTTGCAGATATTGTGTGATTTTCTTCTGATAGCATTATCTTACATTTGGCC:2 - chr2L 21739404 3' + INE-1 549 1 78.77 AGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACTGTGTTGCGCACGCGTCTCCACTTTTATGTGC:1 - chr2R 5737138 3' + 1360 3308 1 63.91 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTGCC:2 - chr2L 15987963 3' + roo 358 2 53.42 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACGAAAAAGTTGGGAATTTGAATTTTCGAATTTGCTGTTAATTGAACACTCGAGCTTG:1 + chr2L 2276824 3' - F-element 25 1 67.69 ATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTAACATTATTGTGTTTCATTAAAAATCCGGCCGATGTCCTGCGTTGGTTTTATGGCATAGTATGTGGGATGCGGGGG:1 - chr3L 11745252 3' + G2 2776 1 58.70 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCC:1 + chr2R 21402712 3' - mdg3 45 2 54.11 TCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTGCTGTGGCAATCCTTTCGGCTGCTTA:1 + chr2L 12340845 3' - diver 50 2 51.37 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAGTTGCAGATACTTTTGCTATG:1 + chr2L 4174091 3' + roo 397 1 73.17 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATGACAGTATTGGGGAACAAATCAGAAGAACAAACAGCA:1 + chr3R 7739508 3' + I-element 5296 1 70.16 TCTTGAATACTCATAATCATATAATCTTTGTAAATAACTTAGATATTCAGATTCGTTTAAATTGATACCGATTAGATTAAGTTGTCTAAGAAGTACGCTGGTCAATTTTTTATTGTCAAATATTAATAGTAATTTTCGTGTACAGA:1 + chr4 620233 3' + jockey2 3271 1 73.29 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAAT:1 + chr2L 9472089 3' + roo 349 2 57.24 TATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAGAAACGAATTTACATATGTACATACATATTTGGGGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGAATATGATGAAATTGCGCGCTGTTTAAGATATCAAATTGGAATATAAAAAA:1 - chr3L 18229127 3' - Stalker 6866 4 73.29 AGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACG:1 - chr2R 3338789 3' - Juan 65 1 60.96 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAACCACTGTAAATATGATTTACACC:1 - chr2R 11133580 3' + roo 402 1 64.81 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAACAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAAATGGGTGCCAATGTAAGTGAAACCTAT:1 - chr3L 14553090 3' + roo 9023 2 52.05 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTCCGAGCAGAAATAAAAACCAT:1 + chr3L 19349998 3' - jockey 63 1 54.55 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATGATCCTGCCTGCGCAAAAGTTTTGTGAAGCA:1 - chr3R 8709796 3' - jockey 4760 1 77.40 GTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTT:1 + chrX 21667943 3' - gypsy2 25 2 63.89 TATAAATAAAAAACATATAAAAAACACTCTTTCCCTTAACTAAACATTTTGATTACACAAATATGAGCTGAAGCAATTCTTGATAATTTCAAGCATTTCCTCTATTCCAGATGCCAATCGACCTATTGTCCAGCAATAATCTTTTC:1 + chrX 7797798 3' - Circe 425 1 79.45 TATATATATATATGTACATATTTACATTTTAAAATCCGATTTTTTTCGAGCATGCTCAAACTCTTCCTCAAAATCGTTGAAAAGTTGTTGCACTCTCTCCTCTTGTCTTCCTCAATTTCATTCGCTTTGTTTCTGTTAAACATTTT:1 - chr2L 16496247 3' - G3 4506 1 62.33 GGAAAATAAACCCCAAGGTATGTTGTTTGTTTAGTTAATGGATGTGTAGTTGTGCTGTTTTTGTTTTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTTGTCGAGTAATCTTTGCCCCGGCAAAAGTGCAATTTTCCATTTAAATATTTGATTATGT:1 - chr3L 4634038 3' + transib2 273 1 65.75 AAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACCGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTATGATAAGCGGGATGCGTTGAGCCTGGAGTTCCTTGCCACACTTCCGGACTTTGCCTTCTC:1 + chr2R 12374980 3' - 412 7439 2 53.73 AAAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTT:1 + chr3R 11547753 3' - G2 363 1 76.71 TGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCAGGTGCTGAGACCCAGAGATCATTCACCCAAGTCGCGTTTAACTGACACGAGTGC:1 - chr2L 14567951 3' + R1A1-element 5017 1 71.77 CAAATTTCAAAAATTCAATTTTTCTGAATCCAGCTTTTTTGAGCTAATACCAATTTATCTACATAATTTGGAGTTTTGTCGAATTTCGATGCAAAACTTCAAGTGCACATTAGCGCTAAGCATTCCAGCATTTTGTTACCGCTTTT:1 + chr2L 9851234 3' - FB 24 1 69.86 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTC:1 - chr3R 20175673 3' - hopper 38 1 57.93 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCCAAGAAATTTGGGATTTCTTCTTATAACACGAGCACTTTAAGGATCAATTTTTTCCATTTTCAATGGACTGTACGTAGGATCTCTCACCTGTTCCAGCTCGTGCATGTT:1 + chr2L 19068202 3' - pogo 9 1 77.78 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAAC:1 - chr2L 17210251 3' + jockey 4964 1 60.00 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGC:1 - chr2L 9237501 3' - blood 68 2 64.38 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTATTCAGCAAGATTTC:1 + chr3L 14553210 3' - roo 54 2 58.22 GGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGGGAGCGACTAC:1 - chr3R 17897130 3' - hopper 79 1 69.86 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCATAGGCTCGAAGCTGGTTTCTCACAGTGCATTCATGTTTCTAATTGTCTGTGTGTGGGATGCCTACGTCAGCACTGAAGCACTACGGCAGC:1 + chrX 22725668 3' + roo 401 1 76.00 ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTATGCCCCAACTCTTGGGATAAAACATCTCGCACTGTCACAGAAAAAACCACGACCG:1 - chr2L 21951119 3' - Burdock 60 2 63.70 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTATATTATAATTTATGGCGCGTATTCCGTTAAATCTACGAGACACTCGGCGAAGGCCACACACACACGATTTTTCTGCTTTC:1 + chr3R 12568970 3' - hobo 26 1 64.39 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTCGTGATATTTTCGTTTTTTTCATTTCCCTC:1 + chr3R 4528420 3' - F-element 55 1 60.98 GTTAACTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAA:1 + chr3L 23042118 3' + pogo 2048 1 67.50 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGTTGTTAAATTTATAAAGCAGTTGATATTTGTAATGGTAACAACTGTATTTTAGATTGATTCC:1 + chrX 13531707 3' - roo 58 2 58.22 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCATGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGGGAAAAACTCTAATAAATGTGC:1 + chr3L 7995532 3' - P-element 38 1 58.22 GGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATGTAATCGACAAATCGAATATCCAAAAATAC:1 - chr2L 436487 3' + copia 165 2 79.45 GGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCC:1 + chr2R 21402685 3' - mdg3 72 2 63.01 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAAGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGACAATCAGTTGGTGTGCTATTTTAAATAAATTTATTTCAAAAGCATAACAT:1 + chr3R 11925216 3' + pogo 2033 1 63.70 TTAATATAGAAAATAAAATAAATTGGGTTGGAGAACAAATAACTTATTCCTTTGAATAGCATTCAAGACATCTGCAAGTGAAGTCTACTGAGCTTACTCACCTGTTAACTTAGCCCAAAAGGGTTGTTACCAAACTAATTTCAGG:1 - chr2L 12203291 3' - transib1 1907 1 60.00 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGACGCACATAGCACTCACACACATTCTAAAAACGATCTCTCCCAAA:1 + chr2R 21076088 3' - P-element 61 1 37.88 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCATGATGTAGTGAATACGACTTAAAGCGCTTGTGTTTCCGTCTCTCTTTTCGTGGCACGCTTCGATTACCGCACTCGGAGG:1 - chr2L 9668162 3' - 1360 43 1 54.11 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTG:1 - chr2L 12079638 3' - mdg3 5302 2 69.61 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTACAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTGC:1 - chr2L 15987964 3' + roo 9023 2 53.47 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCATGATGTAGTGAATACGACTTAAAGCGCTTGTGTTTCCGTCTCTCT:1 - chr2L 9668196 3' - 1360 22 1 59.34 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAG:1 + chrX 12525974 3' - roo 8732 2 75.81 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCACGCTCGGCGACACTCGCAGCTG:1 - chr3R 17305418 3' + roo 9038 1 61.38 TTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGGTTCACAAGTACAATGAAAATTCTTAGAAAGCACCAAGGTATTTGAGTCAACATTGATTTGCTGATAGGAAACCAGTTATACCTTG:1 + chr3R 10831781 3' - Juan 4065 1 55.48 GAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCATCTTGAAGGATCTGTGGGGCAGGTGGCGGAACCTATGCGAC:1 + chr3R 11586658 3' + Tabor 20 2 73.13 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATC:1 + chr2L 4174051 3' + roo 8998 2 67.12 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACAATGACCGCTGATAATACACACCCATTTACATGACTACA:1 + chr2L 3294226 3' + hopper 1388 1 57.72 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCAAACGGTAGTGATTGAATGTGTGTAGATTACCGCCACCTGTGTAAGGTGATCAAGAAGAAAAATTTCCCAGTACCAGATATTGAGAAGCG:1 + chr3R 4562453 3' + copia 226 1 68.49 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCGGGTGGCACTGCCGAC:1 - chrX 1287784 3' - jockey 4785 1 70.19 ATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATAT:1 + chr3L 13827341 3' + hopper 1355 1 67.46 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTAGATTTTAAC:1 - chr2R 8157169 3' - Transpac 63 2 66.21 CCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCATACGACTAAATTGTGAATTTATTTACATTTAATTGCATCTAAGTTA:1 - chr2L 21039236 3' + jockey 372 1 66.91 GGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCG:1 - chr3R 20486367 3' + accord 7343 2 76.47 TTTGTCAAGAAACTGATTACACACTGTGACTTAAAAGCTAAAACTTAAGGGTTCTTTGCTTAATTATGTAGTTGTATTTTGACCCAAATGAAAACAAAATTTTGTTGAGGTTATTGTTGTTGCCGGTGGGAGGGTTTTCTTCGGTA:1 - chrX 6762323 3' - S-element 1712 2 69.18 GTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTATGTATTATAGATTCATTTTATGCACTTTTTAACTTTTTTTGTCTGACGTCTCAGGGCTTGAGACTCTCCAGACCGACAGCCCAAAATGAAATG:1 + chr3R 11361960 3' + Cr1a 4233 1 71.92 ATAGTCTCTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAATTACCGAGTATCTTATAACATAAATTATGTATCTTCAATTAAGGATAAAATATTTTG:1 + chr2L 17123909 3' + Ivk 5202 1 60.96 GTGGCGCAGTCGGTAGGATGATACTAATTGATGCGATATTAAACATATTCAATTCTCTGTGTATCATCCGCTAAAGAACTACAACTACAACTACAACTTCCATATCTCGCGTCGGTAAATCGGTACAATCACTTCAAAATTAAATC:1 + chr2R 4122892 3' + rover 366 1 79.45 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTTATTAGCGGCAATCGAGTTTTTATTCTC:1 + chr2L 1558717 3' + 412 443 2 60.77 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGGTTGTAAGTATTTTTTAATATTTTCTCTCTGTAAATAACTTTTGGTTAAATGTGACTAGCTTATGTGTAAA:1 - chr3R 25904151 3' + 412 444 2 56.85 AGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCCATGTTCGTGGCTCTAACATCTTTCCATCGATCGCCGGTG:1 - chrX 17805961 3' + roo 328 2 71.23 TAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATAATGTAAAATATTAGTCGGCTTAATTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTGGAAACTATATACCCCTTATCTTATGCCAGAGGATTGGTTGCTGCCAGAGGATTG:1 + chr3R 17158776 3' + Cr1a 4272 1 40.41 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCAAATATTTCATTTGAAGTGACACTGCGTTGGAAATTTGTCTGAATTTTCAGCCCCAAAATTGGGGGCATTTAAATG:1 - chr3R 27535407 3' + 412 449 2 54.79 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGACCCACTTGGATTTGTCTCA:1 + chrX 5150407 3' + roo 9037 1 61.64 CCTCACTTTTGATAAATGTGTTGATATTTTTTCACATTAGTCTTGAAAATCACTCTAACACCCTAAAACCGACGAGCCGGTCACGCCCACGCATTGGCACTGTTCGGTCGCCAGTACAGGCAGTTAACAATAA:1 + chr2R 5109792 3' + INE-1 258 1 75.19 CTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGACAGCTCGTAGCGAAGTTTCCCACCTTCAGCATGG:1 - chr3L 22648311 3' - Tabor 6927 2 75.34 TAGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACAACGGGCGT:1 + chr2L 22016029 3' - Tirant 8119 2 74.17 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGAGGAAAATTCGAAAAAATAAAAAATTAGCACTAGTGCTGCAAAGGAGTAAGCAAACCCGCAGCAACAACAAACAAGCCCAATAAACATTAAAGCGAAAACTTTA:1 - chr3R 13505403 3' + opus 7494 2 78.08 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCCTGTCGTTTAATATCCCAGTCGTAGCTATGAAATAACTAGCAAAATAACTCATTCGATGTTTTTCCAAAAGGCCTTGGCATTAACG:1 - chrX 1061496 3' - 412 33 2 58.62 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACGCATGCCACGGCATTCCGTTCCCCAATCAGTCCCCTTCCATCCCGATATGCCACCATATCCCCCATATGCCCGACTTCATTGTTTCAAACTGCAGCGAGCAATAAATGA:1 - chr2L 9198218 3' + S-element 1707 1 76.71 CAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATTATTACTTTGCCTTCCATCCTAAGGTTTCCTGGTCTTCAGCTTCAGTTTGGTCCTGTTGCACGTGCTGGTAGCAAAAAA:1 + chr2R 7020670 3' - Bari1 44 1 56.16 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGA:1 - 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roo 38 2 81.25 TGCCTCCTGTAAGCGATCTTGAGGCGACAGGTTTCTGAATTTGGCGGTAGCCAGCAACCAAACTGAACACACAATAGCAATGATGTGTGTGTGTTTATGCACACAGTAAATTTTCGGTTACAGCCGATGATGATTGCAATTAGCCC:1 - chrX 14885055 3' - G3 122 1 76.71 ATTATTCTTAATATTATTATCATTTAATTATTGATTATTAAACTTTCACAAATACATATTTCGAATTTTTTCCTTTGACTCTTTCGACTCTGTGAGGTTCCACTTCACTCTCCGCCCCCACTTCGAGCATACTTGCTTACAACTTT:2 + chr3L 14361383 3' - mdg1 42 2 49.32 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGG:1 - chr3L 27350455 3' + pogo 2057 1 54.11 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATCTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATCCACTTTC:1 + chrX 12866491 3' + roo 9020 2 55.40 AGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGTTGTAATTGGTATAGAAATACAAACAGACAATCATTCTTTATCTTTCACAATCTCTGAAAAGATGGTACTCCTTCATAGTAAGTTTCAC:1 - chr3L 23512607 3' - GATE 35 2 62.77 AAGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTCTTACAA:1 - chr3L 24291995 3' - rover 7039 2 79.45 GAGACCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTTTGGATTTTTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTACCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTGGAAACA:1 - chr2L 8776800 3' - G4 3692 1 38.89 GAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATAACAATCGACCGGATCCCGAACATCCCCTGATGAGGCGTGCCATAGTATCAGATATCTCG:1 - chr2R 1921370 3' + mdg1 7454 2 80.00 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTGATTTTCT:1 - chr3L 96467 3' + roo 9043 1 65.52 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCA:1 + chr2R 21402713 3' - mdg3 5288 2 57.97 TATGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATACATGTACATCTCTCTGTTAAATGCTTTTAAATCACTGAACTGAGTTTTGAAATAATAATAAGT:1 + chrX 22901589 3' - Quasimodo 38 2 47.26 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGTGCAACAAAATTGAAACCTTTATGCAAGGCACAGT:1 - chr3L 18467129 3' - hobo 7 1 79.31 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCAGCTCCTAGTCCAAGTC:1 + chr3R 22100610 3' + 412 7503 2 51.54 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGTGT:1 + chr3R 27822307 3' - I-element 46 1 54.11 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGTAATTCGTGTGGAAATA:1 - chr3R 13582173 3' - BS 5021 1 66.44 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAGCAAAATATATTATAAAATCCATTTTTGTGATAGAACGTTGTCTACCGACATTTTTTTTTTGCTTTCGCTTTAAGTTACTACATAAATACATAC:1 - chr3L 15099930 3' - copia 34 2 60.27 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAAC:1 + chr3R 25304803 3' + roo 8992 2 74.66 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGACTCTTCGCTGATTTTAGTGCTTTAGTGCTGTTGGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGAGATAGTTTTTTGTTGCCCATAAACTTTATG:1 - 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chr2L 12156841 3' + INE-1 536 1 46.58 CATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACGCATTGGTTAGCCATTTTTGATATTTTTGTAATGAGTGCGGATGACGTG:1 + chr2R 5542429 3' - 1731 4387 2 65.75 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATA:1 + chr2L 76130 3' + roo 337 2 71.92 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACCC:1 + chr3R 21001883 3' - 412 7129 2 71.03 ATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGAATAACTGCAACCAAAAGGCGAAAATAAAGCCAACTGACGAGAAGAGTCGTCTT:1 - chrX 3683394 3' - mdg1 201 2 63.70 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGCGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGA:1 + chr2L 22015998 3' - Tirant 36 2 54.87 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACTCATTATCTATTCCAAGAATTATGATTATCAACTATTATGTATTAATGTAATCAGTTTAAATATTGGTTTTAAAGTGTTTATTT:1 - chr2R 20673607 3' + mdg1 7423 2 60.27 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTCATATTGTAATAAATGAAGGAATACCACAAAAATATTTTC:1 + chr3R 16913482 3' - pogo 39 1 59.59 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCATCGCTG:1 + chrX 4785160 3' - roo 66 2 67.86 ATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAACCTAATTCCGTACGGGCTTACCTCATAGCGCGCCTCAT:1 - chr2R 12315003 3' - R1A1-element 4954 1 73.08 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCTGC:1 - chr2L 13792586 3' - F-element 85 1 67.81 CAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCCCAGACACACTGCTCGTATTTATTTGCTTTGCCACAGGCTTTGACTGTTTAATGAAACGGAAATATAACATTTTAGTTTGTGGTCAAATATTGTATAATTTT:1 + chrX 9843110 3' - BS 4713 1 77.54 ATCTGAACCTTCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTAGGCGTTTATGGGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCAAGAATATGTATACTTTATGCTGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAATGAATCTAG:1 + chr2L 22211544 3' - INE-1 163 1 71.23 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGGAATGTGACCAATGTTTATTAATACGCTTATTGTTATTTAAAAAGTTGTAAG:1 - chr3R 9190437 3' - Tabor 6853 2 43.84 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAAATTTCAAGAGGCCAGCACCCGGCACTC:1 - chr2R 21371466 3' - roo 8746 2 81.88 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGAAATGAACTAGATAAATGTATAATAATTTGTACTAAATGAAACCATTTGTTTTGTTAGATAATGTAC:1 - chr3R 11925109 3' - pogo 50 1 55.17 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTCTTAGATTTGCTTATTAAGGTGGTATAGTTTTCGCATTTCGCAGGCTTTTTATTT:1 - chr2L 8956732 3' - pogo 59 1 58.90 AAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTCCTTCTTCGACCGGCTGCCACTTCCACTACCAGTTT:1 - chr3R 23049124 3' - R2-element 3287 1 70.00 TCGCTGGGCCACCTCTCAGCCGTTTGGGATGGGCCTCACGTGATCATCATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATAT:1 + chr2L 5069689 3' + Rt1a 4643 1 67.81 GGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAACAATGCAAAACAAAAGAAATCGAACATAGGAAAATTCTCATGCCCAAAGAACATATATTTATAGATAGTGTACAAGTTCTATATGCCTAGATATTTGTTCCATTGC:1 - 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chr2L 20400465 3' - roo 328 2 78.77 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGGGTTCAAGAA:1 + chr3R 17656462 3' - mdg3 5325 2 65.75 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGCAGCCCAGTTGCAAGTTCGACTTGTCTCAGCCAA:1 + chr2L 16458727 3' + roo 401 1 78.68 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGG:1 - chrX 12191549 3' + pogo 2042 1 66.15 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCC:1 + chrX 4785154 3' - roo 78 2 73.29 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATGTTAAAATCATTTC:1 + chr3R 10472803 3' + mdg1 372 2 51.37 TTTGTGTTTTTAAATGGTTCTTTTATTAGAGTCAACTGATCTGAATTCTCGTCTGTTACGAATGGTATTGGCAACTAATCAACTAAGGATCTAGAGGAGGATTACGAGAATACTCGCTCACTAGAGCAATGAAGC:1 - 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chr3L 17133833 3' - jockey 4762 1 75.78 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAGTAATAAATCTCATTTAATGCGGGACTATAGTAAATCCAAA:1 - chr3R 20988789 3' + I-element 5272 1 76.03 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTCAAACAGCTTTAT:1 + chr2R 5923004 3' - jockey 4748 1 77.44 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTCGTGATATTTTCGTTTTTTTCATTTCCCTCGCTGCCAT:1 + chr3R 4528428 3' - F-element 70 1 61.64 AAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATCGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGACTTTAAT:1 - chr3L 16973321 3' + S-element 163 2 69.72 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAAGTGCTTTAAATCAAGTTGAACCACAAATCGTACAAATCGTATTAATT:1 - chr2R 23000051 3' + mdg1 7390 2 65.97 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGTTAAGGGGTGGCTCCTTAACAAATGAATACATCAGGTGAGTTTGG:1 + chr3L 14076288 3' + roo 335 2 67.81 TTCCGCTTTTCCCTTTTTTTTCAATTGCCTTTGCCATTCTATCTATCTATCTATCACTCT:1 - chr3R 7295005 3' - Bica 343 1 68.33 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCGCACCAACACAAATGCCCATGCACACACGCACACACACACCGTGACGCATTCTGGCACAAATACAATCGCAGATA:1 - chr2L 8366499 3' + 1360 3369 1 62.18 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACCCTCGCTATCCAGTCAAAAGTAAAAGCGCTCAAAATGAACGGTCAACATTTCACG:1 + chr3R 21001936 3' - 412 7068 2 73.72 TTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGGCGGAGGTCAGGCGGAGGTCAGGGGGCGGACGTGAATGATGGACGTGAACGGGGCCA:1 - chrX 8755032 3' + transib2 2761 1 59.59 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATTTTTGTTAATAAATAA:1 + chr2L 76170 3' + roo 9041 1 65.07 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAAT:1 - chr2R 5922958 3' + jockey 4967 1 46.22 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGTGATATCATATGTTAT:1 - chrX 4778158 3' - 412 43 2 54.79 AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTACTAGTCTCCTGTGT:1 - chr2R 22723002 3' - 3S18 5806 2 56.16 AAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGATTTATATGACAACAGCTGGGCGAAAGAATGTCATTCGCTTTAAATGCCTTTTAGCATACAGCCGCCATATCA:1 + chr3R 12562468 3' - G2 3034 2 52.78 AAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAAAAAGAATTGGATGTGGACTGCGACAAGGCAACCTCCTTCTAC:1 - chr3R 24900379 3' + invader2 5063 2 46.58 TCAGTCGCTGTTGAACGAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAATGGTCAAGGTATTATTACAATTCATGGTTTTTATATAGTCAGTGCTTT:1 + chr3L 11776752 3' + mdg3 5425 2 64.38 GGCAAACGTGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGTTCTGTGGCTGTTAATTTTCAATTAAGAGATGATTTTTCACGTAAGTTTTTGTGTGG:1 - chr3R 24509061 3' - FB 64 1 57.93 ACACACACATATACACGCATACACAGTGCCAACCGGGCTTAATCCAAGTGCTGTCTCTGGCATATTCATTAGTGTTCATTAGTGGTTTTTAATTTAATTAGCACTCAATTTGCCAGCCTCTCACATTTTGCGTCTGTGTGTGCTCA:1 - 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S-element 75 1 83.45 GTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGTACGCGTTGCCGATTGCATTTATTATTAC:1 - chr2R 4362551 3' + gypsy 394 2 60.27 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTGGTCTACAGTGAACCCCTGCAAAGTGGCACACAATCCGTCTGGCTG:1 - chrX 9707150 3' - Doc 62 1 67.97 ATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAGGTATTCGTATTAACAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTTTTCTTTATTTTACTATTCCCTACGGATTTCGAAACAGGCTCTACGGTATTCTAAATATA:1 + chr3L 23848162 3' - I-element 4892 1 65.75 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGGCTGCATTTCGCG:1 - chr2L 18279864 3' - Tirant 10 4 64.52 ACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTAGTTCAACGCACTATTCGTTGTCAGATAGAAGTCTCTTGACTTTTTTATTGA:1 - chr3L 18030979 3' - invader4 2803 2 52.80 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAAAGCAAAGCAAAACCAAAACCAAAGCCCCAAAAAAA:1 - 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chr3R 23639096 3' - pogo 15 1 73.79 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGGAAGCCTATAGAGTTGAGATCAAGCATACAGATTCCAGCCACGCAAGTCACGCTCACACTTCTGTAAAATGTTTTTCCATTTCTTCATTAG:1 - chr2L 22132471 3' + pogo 2076 1 65.96 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAATTATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCGGCATTAAAACCTCCGAGCAACAACTCGAATATTAGCTTAA:1 - chr3R 27868375 3' - hopper 68 1 64.75 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAACAGACTTA:1 + chr2L 9485701 3' - 412 7097 2 46.58 AAAAAAATATCCAACAATTTTTCAAAAATGTGGGCTTGACACTTTGAAGATTGCAAACTCCGTAAAGCAAACTTTCCGTATTATGGAAAAAAGATGAAGATTCGGACTATTGAGTAAACAATCGAAATGAGTATTCAGTAACAAAG:1 + chr3L 23635773 3' - INE-1 386 1 55.48 ATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATC:1 - chr2R 8158768 3' - Juan 58 1 56.00 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCCGGCATTAATTAAAATTTGCTTCAAATTATTTCCCAGCGTTTTCGTTTTTTGTTTGTGTTAACCAGCCAGCTGCCTC:1 + chr3R 27859295 3' - hopper 39 1 59.59 ACACGTATTCACATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTTAAAACCGGAATTCATATATATTAACGAAGACAAACGGCTCATAAAATAAGTTTTAGTAATATTTAACAAATGCAGAAGCGTAGGCAACTCGGTTTT:1 + chr3L 20533897 3' + 1360 186 1 66.44 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGAAAGCACTATCGTAGAGATGGGGCGCCAGTGCTTGCGATAGCCCAATCGATATATCGTATATCAG:1 + chrX 14826208 3' - P-element 43 1 51.82 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTAT:1 + chr3L 19350046 3' - jockey 27 1 73.79 TTTTACTTTTATTATTTATTTATGTAAAAAGTTGGATTACAATTTGTTTTTCACAATTTTTGAGAAGACAATTTTTCTTATATACATGTATGTATCTTCGCTGTTGTCTAGCACAGTTTAGAACACGACGGATGTAAAAAAACGAC:1 - chr2L 21653181 3' - BS 5093 1 57.53 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGGGAAAAACTCTAATAAATGTGCTTGTGATACTC:1 + chr3L 7995543 3' - P-element 27 1 67.12 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAGAAGTAAAAAATGTGTCAGGCCG:1 + chr3L 22978667 3' - 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copia 53 2 62.31 AGAGAGAATGCTACAGTCGAGTTCCCCCGACTATGAAAGCGAACGCGATAGATATGTGAGGAAAATATGAGAATCTCGTTAATTTGCATTAAAGCCTTGGGAGGGAGGCATGTATGTATGTAAACTCCTTG:1 - chr3L 23288838 3' - INE-1 576 1 55.73 TTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATAGGGCTCTTTAAAGTATTAGTTTTATTGCATATTATTATATTTTCTACAAACTTGCAAAAAGGTTGTTCAGACAGG:1 - chr2R 15829482 3' - invader4 40 2 58.22 TGGGCATTGCCTATATTCAACAAAGAGCCTATGAAAAATGCATTTTTTTCAGAAATATCCGAGACTGAATGATCGAGTAATGACCCTTTGGAATACATCTTTTAAAATAACTCGCGGAATAAATGTATGCAACTTCTAGA:1 - chr3R 26246776 3' - 1731 1 2 58.57 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAAAATAGTTAAAAAATTATTAGCTAAAAATCTGATTCATTTACTGGAATAATGGCTAGATATT:1 - chr3L 13374107 3' - pogo 39 1 54.62 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAAAAATAATTTATGATT:1 - chr3L 10133508 3' - 412 69 2 63.70 TAGCCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATG:1 + chr2L 23373500 3' + Tc1-2 1535 1 76.03 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATTTTAAT:1 - chr2R 5922944 3' + jockey 4971 1 46.51 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAATAAAATGTCATTATGCGCTCCCAAAAGTATGCAAACGATTTTTCGCTTTGAATGCTGGGTACTTAAAACGCTC:1 + chr2L 3890236 3' + jockey 4950 1 53.42 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGCAGA:1 - chr3R 10684716 3' + roo 9027 1 54.11 ACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGATAAAAGAAAATTAGGCTGTATATTATCAGGACACTAGCCGAGTCGCGATTCTCTGCCTATCTAATGTTT:1 + chrX 21585888 3' + mariner2 861 1 90.32 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAATTT:1 + chr2R 5237920 3' - Doc 58 1 50.68 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGCAG:1 - chr3R 10684717 3' + roo 9042 1 60.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTGCTTATTTGGGACTTTACACTCTGGCTTCAGGTTTCAATGAATCCGCCGTTCCCCAGAGATAACCTTCCCGACAACGTGGGCATTTATAAATAAACTATGAGATGAGTG:1 - 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chr2L 685976 3' - roo 52 2 52.74 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAGTGTCGATTACTGGCATACTCGTTGGTTGCATATCTGTAGGCTCAATTACACGGGAATCCACACTCACACTC:1 + chr3L 22642964 3' - hobo 26 1 68.49 CATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAG:1 + chr3L 11399986 3' - Quasimodo 75 2 76.09 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAACAAAAAAGCGTAAGAGGCGAGACTTGCAACGACAAC:2 - chr2L 3395706 3' - jockey 4751 1 74.29 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGTGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGACGGTCATATCAGCGGCTGCTGC:1 + chr3R 12599100 3' + 412 444 2 63.96 ATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAATA:1 - chr2R 8641491 3' + diver 181 2 52.55 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAAAAAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATGGGTTTATTACAAAGGTCCTCCTAATGCAATTTGTCATTTTCGCATTTTGTTTCTCTGGCTCTCTGGCTTTTGTCTCAAATGCA:1 - 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chr2L 16496240 3' - G3 4507 1 71.23 CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACAACTAATCATTAGCTTTACATGATGTGTTTATACGAAGCAAATA:1 - chr2L 17250724 3' - opus 7070 4 68.79 AACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGATATAGATATGTACTTTATTCAATGCTTTCATTCTATTAGAATCCCATTGAGGATCTTAACATTTAAGAGAATATTATTTACTACATTTAGCAAGAAT:2 - chrX 16383961 3' + diver 6087 2 68.49 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGG:1 - chr2L 3890161 3' - jockey 97 1 78.08 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAA:1 - chr3L 27350500 3' + pogo 2068 1 70.00 GTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATATACTTCTTTAAGGACATAATGAGACAGTAACAAGTATTAAGAGTGTTTCGCATTCGTTGT:1 - chr3R 10968707 3' + I-element 5294 1 57.53 AGAAGAGCCAACGACCCAAAGTCCAGGTGTTCGACGTCGACAGTGGAATACTGCAAAGGAGGATCATTATCTCGCTCCATTTTCCATCTTTTTTTTTTGTTCT:1 - 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chr2R 22492005 3' + pogo 2059 1 56.16 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAACCCCAAGGCGAAAAATTCCCTCGAGGAAGGCCAGGAAAAGCAAAACGCAGAAAAGTAGGCAATGATTTTTATTAATTGATAAGCATTTGCAACAAGTTGCACAGACAC:1 + chr2R 23116236 3' - jockey 17 1 79.45 ATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGAGATAGTCGGTGACTGACAAATATTAATTGTACCCTATAATGCTTTAGTATTCA:1 - chr2R 1007656 3' - Ivk 96 1 75.86 TTTCAAAACAGATGTTTGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTAACATTATTGTGTTTCATTAAAAATCCGGCCG:1 - chr3L 11745296 3' + G2 2724 1 76.71 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTCAGCATATGCGCGCACTTTGCATAAATTCGCAATG:1 - chrX 1523731 3' - jockey 92 1 73.29 ATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCACGAGGGGCTCACTCGGCCATGTCTTACAGAATTATAATATCCTTGGCATGCTCTTTTGCCCAGCAATTCAACTCCATTG:1 + chr3L 1680270 3' + 1360 318 1 53.42 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGTGCAACAA:1 - 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chr2L 23372505 3' - gtwin 33 2 56.92 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATGAGGTCTTGAGTGGGTTATACGGGGCAGGCAGTTAGCCAACATGCAAAGCACATCCAGAGAGAGATGCCATGTTTGGGTGTGGATTTCGGCTTGGG:1 - chr2R 7840085 3' - Quasimodo 37 2 78.15 CTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGTACGCGTTGCCGATTGCATTTATTATTACACTGCGGGCGCCAAAAGATTTGTGCAGTACAATGACAAACA:1 - chr2R 4362510 3' + gypsy 7418 2 58.06 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGCGAACAATGTGCCATCCTTTCTCTA:1 + chr3L 22648395 3' + Tabor 7305 2 64.04 CGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAAAAACAAATGAGTTGTGTAATTAATACGGGCTTTTGTCTTGCCAT:1 + chr3R 18816007 3' - hobo 29 1 67.81 ATCATTTTTCTGGGATATCGATAGATATCGGGGAATAATAAGAGACATTTTAAAAAACGTAAGTATACCTAACTAGAACATCGAAAATAGGGTTTCAGAGAAGAAACCGATGGAGTACACATGGACGTGGTTTTAACCACTAGGCT:1 - chr3L 23278602 3' - INE-1 504 1 60.27 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCCCCCAAATACGTCACTATATATACAACTCAAACGCCAAAAGCCTTGTTGTTGTTCTCTTATTTGTGCGTGCTGAGGAAA:1 + chr3R 8977665 3' - 297 6599 2 60.78 AGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGATCTAGTTAATTAATTGTCTTTCATAGCAGTCCT:1 + chr3L 13703517 3' + invader1 182 2 77.40 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGTCATG:1 - chr2R 23287458 3' + roo 9011 2 71.31 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTTCTTTGATTCGAAGCGCTTGAACTTATCGCCGGGGTGTAGCTCG:1 - chr2R 7953657 3' + roo 342 2 66.42 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATATACATTTGCAGTATAGTATCGCAGTAATCTGTGATGGAAATCCTTAT:1 + chr3R 29418817 3' + mdg3 5481 2 71.23 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTATCAAGAGAGAGATAACAATCGACCG:1 - chr2R 1921418 3' + mdg1 7441 2 58.00 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACAAGTTAATCAACCATGAACTTTAAAGCCCCGCTCTGAAATGCAAAAAGGAC:1 - chr3R 24476286 3' + 412 420 2 65.07 AATTAAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTCGGGCCTAATACTTGGTTGACATACCCGAACCAATAAAAGTCCTCGACGAGATTATTTCCGAATTTGAGGAGGCAGCAACGAAACCA:1 - chr2L 21672361 3' - HB 1385 1 50.72 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATCAGTCAGTTA:1 - chr3L 17175093 3' - 412 38 2 59.59 GGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGGCTGCATTTCGCG:2 - chr2L 18279864 3' - gypsy5 9 2 72.73 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACATATAGACATGTTAGTGGAGCGTTTGTAATGTTATCAGAATGGTATAT:1 + chr3L 14551110 3' + P-element 2884 2 73.29 ATAAACCCTGAGCAGCCAAAAATTACTTGTTGGCTATGTGATAGAATAGTGCATACCATTATGGCCGTACAACTGATGACCTAGCAAAGGGTAAAAATCTAAATGGAACCCAGATTGGCAGTGGATCTGCTAGATGGGAG:1 + chrX 14621114 3' + Cr1a 483 1 74.29 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAAT:1 - chr3L 17707849 3' - Doc 65 1 76.85 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTGA:1 + chr3L 7093065 3' - hopper 70 1 68.57 ACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACGCGCATTCATTATTTTCGCCACTTTCTAATTATACGCAAAATTTTATGCCAACAAAAGCTGCACACGCACACGCACATACACAT:1 - chr3L 22361154 3' - micropia 5111 2 56.16 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTGCACAAACCCACAGAGTCTGTTTATGGGTTCATTTGTATATTCCGATTTCGAACGCGTGTCGGTCGGGCCAATAACA:1 - chr3R 17067797 3' + 297 353 2 57.53 CTGGAAACAGGATCTTAGTAAGGTCATGTATCTGCTAATCGTCGTAGCTGGCTAATCGTAGCTGGATCTGGATCTCTTTAAATTTCCAGACTGAGAAGCCGCTGTTGTTGTCAGGAAAAAAAAAAATTTCAAAATCAAATAATA:1 - chr2L 23076636 3' + baggins 113 1 61.11 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTTATATTTTAGAATTCGGAATTTCCGTGAAAAGTCCTGAAAAGCTTTGTCACTGCCAACCCGTCCTTTGTGTGT:1 - chrX 21234425 3' + 297 347 2 53.42 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGAAATACCCAAAACTCCATCCAGCATCGAAGAGTATGTGGGCAGAAGGAGCAA:1 + chrX 8012344 3' - 297 13 2 60.20 ATCTATCAAGATCCCAGAAAAATAATTCAATTTGAGTTCGCATTCACACTAGCTTTGTTTTACTTGTGTTCCCATAAGCTGAGTATCTAAGTCGATCACTTGAACCAAATGATTTTTATTTCCTTGCTGTTTTTGGCGCTACCATC:1 - chr2L 7900426 3' + INE-1 500 1 74.66 AATATGGGCGGTATGGGTGGGTGTGGTGCGATTTACTTGAAATTTTACGTACGTGTTTTAAATGTCAGATGCACCAATTCAGCTTTATTATTGGACTTTATGCCAGTGTGCAGTAAAATAGCAGCGTTGACATTTGCATATGTAT:1 - chrX 22906776 3' + transib3 2734 1 73.10 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCA:1 + chrX 12866482 3' + roo 340 2 65.07 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTTTCCGCAGATACA:1 + chrX 1103738 3' + pogo 2073 1 63.70 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCCG:1 + chr2L 14248108 3' - I-element 38 1 52.42 GTGCCAGGACCTGGTTGACTCCATCCCAAAGCGTTGCGCCCCTATTATTGCTAATAAGGGATGGACTACCAAATATATACATATATTAGTGGGATGGACGCAGTTTTAATAGGCAATTTAATATGCGTTTTTTTATGAGGTAGTT:1 - chr2R 8106980 3' + Tc1 1276 1 55.86 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAACTAAAGCCCCTTAATATAATCCAAAGTGTGGGATAAAGACGGGGATATTCAAACACTTGA:1 - chr3R 24729536 3' + Juan 4203 1 58.96 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCACTTATGTCACTGACTGCTG:1 + chrX 6138734 3' - opus 7031 4 60.48 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTCGGACAACAAAAGTTGTGTTGCCGTTATTCATCGCTTCTTAAAGCGGCTAAAAACTTTCGCCTGTTA:1 + chr3L 12867410 3' - roo 8686 2 70.55 AAACTTATCTAGAAGTCGCGAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTTTTAAATATTTAAAATACATAGCGCGCTGTTGTTGAAAAGAAATGTATGTGTAGAAAG:1 - chr2L 15832303 3' + Tc1-2 1228 1 60.00 AATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAAGTAAAAAAAAAATATTATTAAAAAATCGGAATTATTATCATACACCGTTTTGTGGGTAATACACTAGAAATTTTTTTCCGTAATCGTTTTTCTAGTAACCAGTCGAATTT:1 + chr3L 23064258 3' + HB 296 1 73.97 CTATCGATATCCCAGAAAAATGATTAAATTTCGCGTTCGCATTCACATTAGCTGAGTAACGGGTACCTGATGGGGGATAGGTAGGGGAACTCGACTATAGCATCCTTTCTTGTTTTTACATTACAAAAGATTTACAAAGATCTGTG:1 - chr2L 21335367 3' + INE-1 502 1 60.27 CAAGAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCGT:1 + chr3R 3320515 3' - 1360 82 1 71.92 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAGTGTCGATTACTGGCATACTCGTTGGTTGCATATCTGTAGGCTCAATTACACGGGAATCCACACTCACACTCAGC:1 + chr3L 22642967 3' - hobo 23 1 70.55 GCCTGCACTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCCGTTATTTGAATAAAGATTATATTTTTTATCTAATAAATTACCGTGGTGTTTTTGGGATAGCCGTGAAGAGCTGCCTTGTTTTTTGCTTGAGCCAGGACTACTGGAT:1 - chr2L 19220629 3' + Quasimodo 6894 2 57.53 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATATTTGCTTCGCAGACAAAAACATCAACTACCCCTAAAAGTAGGCAATTCTTACTGAGCAACAGCTACGTTGAGTCATTTTTCGTGTGCGCACACTTAT:1 + chr2L 13215756 3' - jockey 4760 1 79.84 ATTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATGCCAAACAATGACGAAACAATGATGAAGACGTAAGGTACGATGCAAACTAGTGTTGACCGGGACGAGATACGCTAAAACGGAAATTCCAGTTAAGTATCCGATGCTTCGTGCAGTG:1 - chr3R 7640071 3' - HB 1542 1 65.07 TGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACAGAAGTAGAATGGTGATTGAGATAAAAGTAATTTTGTTTACCAATTTCCATTTC:1 + chr2L 3340030 3' - FB 69 1 64.38 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:1 - chr3R 29487012 3' + flea 4952 1 62.33 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGT:1 - chr3L 17175118 3' - 412 7116 2 58.90 TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAATTGCTCAAGAACAACAGA:1 - chr3L 14062229 3' - Doc 74 1 60.27 CAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAA:1 - chr3L 24213789 3' + invader2 5019 2 76.71 GAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGCTGCTTGATATTCGAAAATGTAGCTCCTGAGTGTATACCACATTGTCAAGATAAAGAATTAGTAAGAATTAGTATTCTTCTGTGGATA:1 - chr3R 2555457 3' + Bari1 1674 1 63.01 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACCATTTAACACTTAGCTTAAATTCGATTGCATCCGCTAGATTGTTCGCGGGATGTTATCGAACTATCGATGGCTCATCGCATTTTTTCGCCC:1 + chr3L 19836554 3' - pogo 18 1 72.14 GCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTG:1 + chrX 21667956 3' - gypsy2 6538 2 71.23 GTATATGTGTGCGTATTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCTAAATCAATTCTAATCCAAGAAACGCATTTACATACTATGGGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATTGCGCGATGAAAAACTGAATATAAAAAAC:1 - chrX 12592426 3' - 1360 3213 1 73.29 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGCCATAAACAGAGA:1 - chr3L 27350442 3' + pogo 2070 1 63.01 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTC:1 - chr2R 6632583 3' - P-element 84 1 28.08 ACTCGCTTAATAAAAACCAAATGAAGATAAAATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAAT:1 - chr3R 11113204 3' + mdg1 347 2 72.22 GGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAACGCGCTCCTGCTTTGGATGCTGTTGGTGCTTTAGAGGTTACTGATGTAAATTACCCGGCTGCCCTTATTTC:1 - chr3L 25412029 3' + F-element 316 1 54.40 AGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTAGGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAACTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGACAGCTACAA:1 + chr3L 15099689 3' - G4 3809 1 58.04 ATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACGATTAAAACAGCGG:1 + chr3R 24729657 3' - Juan 4147 1 64.38 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGTCACGATATAAGATTTTTTCAAATGGCTCAACTTTAATTCTCCATGACACATGTGATGTAGCAAAGT:1 - chr2L 21662126 3' - 412 7123 2 54.11 GAGAAAGGGAAACGCTTGGTTTTGGTCATTCTTGGTGATGAAATAAAGAGGGATAGTCATGCGACGTGCGTGTAGGAAACGTTCACAAAACGGAACCGAACTGAATGCCATAGGATCCGCCGAACAGTG:1 + chr3L 1443800 3' + invader5 214 2 52.71 AGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGTTGTAATTGGTATAGAAATACAAACAGACCATCATTCTTTATCTTTCACAATCTCTGAAAAGATGGTACTCCTTCATAGAAAGTTTCACACCGAAAAT:1 - chr3L 23512598 3' - GATE 35 2 67.81 GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGACACACCGCTCATGCCACTGGTCTTCTGTTATCTGCTGGGGGCCCAGTTTTTGTGCTTGGCTAGC:1 + chrX 2773555 3' - jockey 4798 1 51.18 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATAC:2 + chr3L 17890826 3' + 412 7486 2 59.59 ATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATACAGTGCACTGTATGGATAGAAATGAGCCAAAAAGTACCAGAAATGGTACCAAAAAGTAAAATTTGCAATCTT:1 - chrX 3464168 3' + hopper2 1552 1 52.05 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGCAGACGAACAAAAACTCATATTG:1 - chr3R 10684697 3' + roo 9047 1 67.59 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTC:1 - chr3L 17890734 3' - 412 7124 2 65.07 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTCCCACTCTCGGTGCCCAAGTGCTCCCAAAACATCAAGGCA:1 - chr3L 18658870 3' + roo 9033 1 57.24 TGAACTTTAGGCTAACAATATAAAAACCCGTCGGAGATTTTGGTGGATCCCACTATAAATTCTCTTTAATTCGCAGAAACAACCCAGAATTTCCTTTTTTAAATTTACTCTTAACATAAATTACTTTTCCCAGCTGACACTTTTGT:1 - chr3L 6231346 3' - gypsy6 141 2 63.70 CTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTCTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATAGTTTATTTTATTTGGCGTTCTGTTTTGCAGCACTAACTTTCCGATTTCTTTCGATTTGGCCTGGCG:1 + chr3R 9637332 3' - F-element 197 1 63.20 CTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCG:1 + chr2L 16089669 3' - 3S18 54 2 61.60 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTGTATCGATTTGTATTTAAACATTTAAAACATATGAAATGTTAAATTCGCCCATGTAACGACGACTCTATTTTTGAATCCAACAAA:1 + chr3L 23986654 3' + opus 7471 2 65.07 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATTGACATTAATTTGCGACTCAACTGGGTCGAGCCGGCATTTTTCTCTATGGCCGCAGTGAAAGTGCTGTGAAAAGTT:1 - chrX 4291845 3' + roo 9028 1 55.48 CCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCCACTTATTTATTAATTACTCAACAGGCT:1 - chr2R 20865692 3' - 412 96 2 83.80 ATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATAATATGTTGCATGTTGCGACAGTAAAAGTAAACGAAATATGGAAAATACAAGGC:1 - chr3R 13176346 3' + Burdock 194 2 63.70 AATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTAC:1 - chr3R 17605628 3' + Tabor 7267 2 54.11 TACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTATATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTGGACAAGAATGTCTCGAGGTCATTTGGTTGACATTGACTCTGAAATTTGAACATT:1 - chr3R 16913303 3' + pogo 2093 1 77.40 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAAATCGGTGGTTTATGTATATTTTTTTCTCTG:1 - chr3L 3534369 3' - 412 7140 2 77.40 GCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACCCATTTTAGTATCTTATTATGCTTTTAAAGCCTCAATGGATTATGATTC:1 + chrX 18512753 3' - S-element 71 1 67.12 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCAT:1 - chr2R 19554944 3' - pogo 48 1 64.35 AACTTAAAAACCTTCATACGTTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCTCTGAAAATGTCGTACGTGATTCAATTATAAAATGCGGTCTCTCAAATCGTTGCAAAATTTATG:1 + chr3R 28272328 3' + Tirant 8455 2 53.42 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTTTAGGTGCCGTTAGTTTTAGC:1 - chr2R 11057227 3' - pogo 33 1 60.96 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCGTTGTCATTTCCGCTGGACACACGTTTCAACGACAGGAAAAAAGGCCAGGCTAGGAGAAAGGGAGAAAGCATTAAAGATATTGCAGGG:1 - chr2L 13704651 3' + hopper 1412 2 78.15 AAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAACATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAGCTTTGTCGCTTATTAAAAG:1 - chr3R 27510056 3' + Bari1 1660 1 52.05 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGCCTTTAATCATCTGATTTTTTTCCAGCGTTACATTC:1 - chr2L 76017 3' - roo 39 2 63.01 ATGGGTGTATATGTGTGTGTGTGTGGCGTTATTTGCATGGGGGCGTGCGTGTGTGTTATTCAAGGGCGCGACTTTCCCTTGATTGCGTTACTTGTTCATTATGATTCACT:1 + chrX 12805167 3' - accord 191 2 50.91 CTCTCACTCTCTCGCTCTTTCGCTCTTCCAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTCGCATCAATGGCACCAATGCACCCAGCTATGGGCAGATTTCGGA:1 - chr3L 15905739 3' + Cr1a 292 1 46.73 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATACTTACATATATATATACATATATCCCGACCATCCCCCAAAGAACCCAAATTAC:1 - chrX 6138628 3' + opus 470 2 67.59 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAATTCTTTAGTTGTCAACTAGTAATCAACACATTTAAATGCACTAATTGCACAAAAATTATTTACTGGCAACTGTCCATTAATCTGAA:1 + chr3R 5453746 3' - 412 7088 2 61.64 TCGACTCAAAACAAAAACAAGTTTACTATATAACTACAAAAATTGCACAACCTAACTTAGCTCGCTAATAAAAGGCTGATCTAGCGTCTGGATAACTTAATCACCAAGGCGCGTGCAACCTAAATTCCTCTTCCACTGCCTCTGCA:1 + chr3L 25850575 3' + Tom1 384 1 70.55 CAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACAGCGTAACATTAACACAC:1 + chr2R 17392100 3' - BS 5054 1 60.00 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGAAAGCACTATCGTAG:1 + chrX 14826158 3' - P-element 86 1 17.69 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAATAAAAATTGCAAATTTATACATACGTACGCGCTTTCTAAAAACAATAAAGTAACAAATGTCTTAGGATACATACATTTT:1 + chr3L 20713080 3' - roo 42 2 57.53 GTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGA:1 - chr3L 15276649 3' + hopper 1335 1 72.60 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAA:1 - chr2L 17210283 3' + jockey 4917 1 72.86 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACG:1 + chrX 12866465 3' + roo 323 2 76.71 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCTATGTTTTTCCATCTCCATATCGATTCGCTATTATTTTGCTCGCCACTGTGTATCTTTGAGGTGCTTCGGCATCCGT:1 + chr3R 6413808 3' - FB 46 1 54.79 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCGAATGC:1 + chr3L 22052881 3' - mdg1 32 2 63.70 ACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGC:1 - chr3L 24934278 3' - HMS-Beagle2 6919 2 59.29 GGAACATACATACATACATATGTATGTACATATATGTACGTATATGCATATAGTAGTCTGCATGGCTCTGTGCTAATTTATAAAAAAAAACACATTCTACCCTGTTTATTAGTGAACAGGTACACAGAATTAATTTTTTAATATCC:1 - chr3R 6928363 3' + 1731 75 2 58.90 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTCAGCATATGCGCGCACTTTGCATAAATTCGCAATGTCGCAACTTCTAATCAA:1 - chrX 1523714 3' - jockey 75 1 61.64 TTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGTTATTACTATACCCCCGTTACTCTGACGATTGTAGTTATTACTCGGACGATTTTCAT:1 - chr3R 1683049 3' - 412 326 2 55.24 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGTCGGTCATATCAGCGGCTGCTG:1 + chr3R 12599099 3' + 412 425 2 70.54 TAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATAATTATGTATATTGTTTTGAGCTTAAGACACCTATTATTTGTTAGTAGTA:1 - chrX 4292856 3' - S-element 66 1 68.49 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCATTTTTGCACTTTTCCCAAGTCCTTGGAGCAATTTTATTACAAGCAACTTAAAACCCAACCCTCCCACATT:1 - chr2L 4173920 3' - roo 8681 2 73.97 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATC:1 + chr2L 14248082 3' - I-element 63 1 69.11 TCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTTTATT:1 + chr2R 4206663 3' - 1360 315 1 76.03 GCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTGGTATGAGTAATTGGAAT:1 + chr2L 18689252 3' + Gypsy6A_LTR 266 1 78.36 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGAATGAGTTGATTTCTTTCCGTGTAATGTTTGTTAAAATTTTCAACTAAC:1 + chr3R 20744060 3' - roo 63 2 68.12 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGA:1 - chr3L 9907372 3' - jockey 92 1 72.60 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGC:1 + chr3R 25304800 3' + roo 8989 2 76.71 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCT:1 + chr3L 25401032 3' - Doc 26 1 55.56 ACAATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGAT:1 + chr2R 5532320 3' - G4 3826 1 69.01 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAATTGCTCAAG:1 - chr3L 14062238 3' - Doc 83 1 66.44 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAAGCAATATTTTGCTGAGCGAAGCCAGTGTGAC:1 + chr2L 3466065 3' - P-element 85 1 25.87 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGTCATGGAAATAAAGTGCAGGGATCGAAATGAGCCAGTCCTCCTGAG:1 - chr2R 23287417 3' + roo 9028 1 55.48 AGGGCAATACGCAAACACGATTCCACCTGTGCTTCGCAGGCGACAAAATTCTCTAGCTTTTCCTCCTGTTCTAGAACTGTCCCCTTCAAAAGGTATCGGAACGAATATCTCCATAATTTCCAAGGAATTAAGCCCGTTCGACTATG:1 + chrX 17832095 3' + Gypsy12A_LTR 1968 1 65.75 ATCCGCTCGCTTCGCGAGTTATTCCTTATGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTTTTTTGTTTACTCTCCTTGAGTATAGTGCTTGTAGTTATGTTTTTAGTTGTAAGCGCACTT:1 - chr2R 20906246 3' + Cr1a 125 1 69.18 GGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACCATAGCATTCTCTATTGTTTTGAGCACGAAACATTTGTTATGCGTTGCGCCTTTTAGGAGTATACTTTGAACATAGAACGTTTAAAAT:1 - chr3L 13428177 3' + INE-1 556 1 39.13 TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACAGC:1 + chr2R 17392085 3' - BS 5075 1 71.92 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGTGTTGCGCAAGCGTCTCCACTTTTATGTGCAAGGGTCAAAAGTTGTTTTGTTTACAACATATCAT:1 - chr2R 5737103 3' - 1360 43 1 55.80 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCATGAGACATGTAAAAGTTAGTCCTACAAGTCGATTCCTTTATATCACCCCGACACGCGCCGATATAATAAT:1 + chr2R 5737239 3' + 1360 3366 1 65.93 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACATATAGGTGGGCAGCATGGTCATCAGCGTTTCATAGCCATAATTGTGCCCGGCATGGGACACCAG:1 - chrX 4785065 3' + roo 9038 1 50.00 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCAGCTCCT:1 + chr3R 22100600 3' + 412 7505 2 55.08 CTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTTTTTGCACAATGCATAAGA:1 + chr2R 5674768 3' + S-element 1699 1 73.60 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACACGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATACTGTCATTTAAATTCCAAGCAAATGCAGAGGATAAC:2 - chr3R 7739462 3' - I-element 85 1 78.77 GTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCC:1 - chr3L 26852646 3' - 1360 16 1 53.42 TAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATCTGAATCCGAATCGGGCTGTGAATATCTGAAAGTCGAGAATGTGATTGCCAGTGCGAGTGAGTGAGTGGTTGGGTGGCTGTTCCG:1 - chr3R 27819925 3' - I-element 5159 1 69.63 CTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATTGATTGCCATGTCAAAGCCA:1 + chr3R 24493170 3' - jockey 4735 1 59.59 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATATCTCGCTGCAATGTGGAGTTACTCGGGTAATTCGCTCCCCAGTTAATTTTGTTTTCATTTAGCCTAAGACTCCT:1 + chr2R 17121703 3' - blood 7055 2 53.47 AGCCTAACTAATTAGAATAAGCATCAGTGTAAAATCTAACCACGCTGAATAAACATACGCCCGGTCGCGCCCGCGCAATTACGAAAAGTCTAGTGTTCGCTTTCCTTCGAGTGTTTCGAACCGAAGCCCAAGGCAATGTGACTGCG:1 - chr2R 21890238 3' + GATE 111 2 79.45 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTTCTTTGATTCGAAGCGCTTGAACTTATC:1 - chr2R 7953673 3' + roo 8990 2 78.10 GAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCTAGAAACCATATGTGCTTGAGTTTAGATAACGTAAACAGAATAATTTTAACAGCTAACAGTTGGCGCGCAACTA:1 + chr2R 23355092 3' - roo 8877 2 52.05 GTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGTACTTGATTTTGTTCGTTTCTTTTGTTTTATTTGCACTTGCACGTCATTATGTTTCGATTTTTCAGTTTCTTTTTCTCGTTTTTAGCTTGTCAGTTCTTCGATTCTT:1 + chr2R 8064872 3' + accord2 7215 1 65.71 CGGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGG:1 - chr2L 18279897 3' - gypsy5 55 2 60.16 TTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCAAACGGTAGTGATTGAATGTGTGTAGATTACCGCCACCTGTGTAAGGTGATCAAG:1 + chr3R 4562418 3' + copia 5060 2 63.01 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTCTACATGCCTATGAATCTAGTATACCATTGCACTATGGGTAAATATAATTAATGAAAGCACACTTGATATTTACAATTTTTGCACCACACAGAAT:1 + chr3L 1909827 3' + 1360 3369 1 39.29 AACAGGCCAAATGCCCCATACAGTGCACTGTATGGATAGAAATGAGCCAAAAAGTACCAGAAATGGTACCAAAAAGTAAAATTTGCAATCTTTGGACACTTTACTATCAGAGAATATATAT:1 - 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chr2L 22322729 3' + Gypsy6A_LTR 375 1 60.96 ATTAATTACAACACATAATAAAAACCTAAAGATTGATTATCCAATTTAAATTATACTCTCCCTCGCTGACCCCTCGTCCACACAGACTCCTTATACCGCCTGTCAGCCA:1 - chr3R 17897798 3' + hopper 1122 1 52.29 GGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTTAGCATCGCTGCCGGTGCTGCCGTCTTTG:1 - chr3L 10318299 3' - opus 470 2 77.52 GCTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAATTCGCTGAGTATGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAA:1 + chr3R 433128 3' + 1731 230 1 72.60 GTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCA:1 + chr2R 5923009 3' - jockey 4744 1 73.88 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACACACACACACACACACACTTGATATGACACCCATGTAATCCTGGCTGATGCAATATCTAAATTAGCTACATCACAACCACTGC:1 - chrX 13395234 3' - roo 11 2 60.48 GGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATT:1 + chrX 22574691 3' - 17.6 7040 2 47.86 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGTGG:1 - chr3R 2772201 3' - 1360 61 1 94.17 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACAAAATGCTGCCACAGACAAATAGAACAGATTTCGCGTCAAACAAAGAGAATGCCGACTG:1 + chr3R 11057664 3' + flea 211 2 54.96 AAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGTAAAGAGCTCCAGTGCTTCCACATACC:1 - chr3R 7539420 3' + roo 9036 1 57.78 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAGCCACATGAAGCTATATAGTTGGCTTACA:1 - chr2L 6870688 3' + hopper 1329 2 74.66 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCGTTGTTGTTGTTGCCGAGCGGAATTGTGTGCGGGTAT:1 - chr2L 14095572 3' + pogo 2062 1 61.26 ATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTTATTTATATAGGCTTAGGCCCCCTCGCTGCACTTTGGCCTACGCCCCTGCCTTTGCTCTT:1 + chr3L 3060880 3' + jockey 4816 1 58.90 TTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACA:1 + chrX 16384097 3' - diver 61 2 57.53 GTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGG:1 + chr3L 23678165 3' - Osvaldo 27 1 66.67 GATTTATCACCCTCTTCCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCAACCGGCAAATCATCGGAGACTGCAGCGAGGGACCCCCCTGCACACGCTCTAATAAATGGTTCAATAATAAATTACCTCCCGGTTCAGGTTCACCTCCAGG:1 + chr3L 7609419 3' + gypsy3 6869 2 58.04 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTAACAAAAGACCAAGTTGGAGTCTGAGTTTCCAGGGGAGGCCTTAATAACCCACTAGCAAACACACTAATTTGCACTTGAGACCAATA:1 + chr2L 15986562 3' + roo 326 2 61.64 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCCAGTTGCAGCAACAAACATTTTCATT:1 - chr3L 14550969 3' + P-element 2881 2 55.13 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGCTCAAGTGCTTCCCTTGCGAGCGCGTTGTTGCCCCGACTATTGGCTATATA:1 - chr3R 14844456 3' - 412 7123 2 65.75 CCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTTATATATATATAGCCTTTTGGAATCCTCGGCTTTCG:1 + chr3R 17495821 3' - Quasimodo 82 2 80.82 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCGTTTTTGCCTCATTTCAGTGTTTCCAGCATTTCCCTTATAATTACACGCTCCCCATGCA:2 + chr3R 10684832 3' - roo 8726 2 60.27 AAATTTAATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGCGAACAAGGGGTACC:1 - chr3R 31887744 3' + HB 1532 1 60.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATT:1 + chr3R 30635054 3' - roo 8712 2 54.11 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGA:1 - chr3R 12599037 3' - 412 7129 2 68.49 TTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGTATTTAAGGCAGTAAAGTTTTTAATAAGCAAAACTACCCATTCCATGTTGCATACTTACAATGAAGTATG:1 - chr2L 15385646 3' - 297 6757 2 52.05 GTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGACTCTTCGCTGATTTTAGTGCTTTAGTGCTGTTGGTGTGTGT:1 - 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chr2R 4024133 3' - Doc2-element 451 1 59.26 GCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGAAAAGTTTTTGAAGCTTCCCGCATAATCAACTCTGTGCCTTGGACTTTTTGCAAGGATAAGGACTCCATGAAA:1 - chr3R 17656336 3' + mdg3 222 2 71.23 TTCACTCTCCCCTAAGCTTGGAGTACAAAGTCCTCTTATATAACCCCTTTTTATGACGTCAGCACGCATATTACAATGTTTAGCAGATTAATTTTTTACTTACAAGATTTAATATCAGGTCAATATAAAGCGAAACTGTACATACC:1 - chr2R 17295834 3' + Doc3-element 4259 1 68.49 GGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTTACTCGAATTATGTCCATCTTCGTTGCAACCAAAACATTTT:1 + chrX 22574748 3' - 17.6 34 2 58.22 AGAAGTTACAATTTCACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTACCGCTCTGCTTT:1 + chr3R 9190593 3' + Tabor 7258 2 60.27 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAGAAGTAAAAAATGTGTCAGGCCGAGG:1 + chr3L 22978670 3' - 1360 17 1 72.14 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATTGCTTTTTCAGAAGTA:1 + chr2L 6319009 3' - pogo 50 1 55.48 CTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTACTATCCTA:1 - chrY 680441 3' - invader2 24 2 63.97 TAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTATTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGATGTAAGGTTCATATCAGCGGCCAAGGCACTAAAAC:1 + chr2R 4955150 3' + 1360 10 2 76.03 GGGCTAGTTGCTATGGTGGTAAAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGTTGTTCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATTCAGACCGATGCATTGCTGCGTTCATTATAAAGGGTCTAATATTTAACTA:1 + chr2L 16810888 3' - R1A1-element 300 1 61.70 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATGTCACAAAGAACTTATATTTCGCAATAGAGATGCACTTTCACTATCAATGCGCACTTTCTCGAAAATTGAATTGAAAATGTATCGAGTTCATAACTCACCATTTGTATTC:1 - chr2L 6183958 3' - pogo 8 1 40.41 ATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTATGTGTGGGTGGGTGGAAAAGAGGCAACAGTTTTTCCTGATTTTTG:1 - chr3R 15711753 3' + diver 181 2 53.42 AAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCACTTAGCA:1 + chrX 20999584 3' - BS 64 1 65.75 TTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACAGAGGGAAAAATAAAAGATTGCTATTTTAGGAAACATGAAGAGATCGCAATCATAATTTACTTTAGTG:1 - chr3R 10472682 3' - mdg1 53 2 52.05 GTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTG:1 + chr3R 20175777 3' + hopper 1335 1 71.92 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATGTGACGTGAATCACGAAAACAACAATTGCCAATTTAAAAAGTTGTACTATATGCAAACTGCATCCCACATGAACACTATTGAAAATTACTATGAACACCGC:1 - chrX 22901425 3' + Quasimodo 7361 2 76.87 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTTTGAATTCAATTTTAGCAAGTCCTTGTCGTCCTTCCACACCCGGATCCAATCAAGAAATTCCCCCCGGATAGCACGGCGATCCCAGA:1 - chr2L 2272430 3' + copia 255 1 61.64 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTATTCAGCAAGATTTCTCTCTTCGGTTGCACTTGAAATTGCATTTTACCCCC:1 + chr3L 14553246 3' - roo 8682 2 73.97 TGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGACTCAGAGT:2 + chr3L 24152557 3' + HMS-Beagle2 7148 2 51.37 CTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCTGCGGAGAGACGGGTAGCCGTGGACACCCCAGAGCCTCGGGTCAGTGT:1 + chr3R 8258920 3' + Tirant 324 2 69.18 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCA:1 + chr2L 4174042 3' + roo 326 2 73.10 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAACTCGTGTGCCATAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACGTTTTGTAGACG:1 + chr3R 10266172 3' - 1360 62 1 55.48 CTACAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAGAAAAACACCGAACATCGTTATTTCGGAGGCAAGCCAATTCAATACTTCTTTTGACCATACCTATTTTATTGAACACAACTGTATGCGTTTGGTTGGTGTGAATGAGTGGAGATGAGGCAAG:1 + chrX 3425257 3' + G2 3074 1 63.70 CGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTACAGACAAATTCCCCCGTTTGC:1 + chr3L 13770533 3' - G2 300 1 74.12 ACAGCTAACTTTTGTTAGCCGGCGGGCCTGAAAGGGGGCACCAAGGTGACAAAGGGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAAGTGACTTTAGTAACTGGTTTTAAATGATCCTTTATATACATTCT:1 - chr4 353443 3' + BS3 1678 1 64.89 GGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCACCAATTTAAGTTTCTTTGGAACA:1 - chr2R 5917797 3' - I-element 5085 1 52.14 AAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTACTAGTCTCCTGTGTGTTTTGT:1 - chr2R 22722995 3' - 3S18 5799 2 60.96 TTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCC:1 - chr2L 20360644 3' + R1A1-element 144 1 71.00 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGGCCTGCTCCGATTCGGAATCATTAACTAGACGACAGGCGAAATC:1 - chr2L 11951530 3' - pogo 42 1 60.53 AATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATCTAACCGTATGTGTGTGGGTGTCAA:1 - chr2L 17240208 3' + hopper2 1551 1 56.85 TATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAACCTCCAGATTAGCTGCCACCAAATGTACCTGAAAAACAAAAACAAAAATTAA:1 - chr3L 23648785 3' + TAHRE 10359 1 68.49 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGTGCCCAGCATATACATACATATACCATACACGTGTGTGGC:1 + chrX 12526028 3' - roo 8700 2 60.96 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTAGCCATTTAAGACA:1 + chr2L 17250842 3' + opus 460 2 49.32 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGC:1 + chr3L 27415327 3' - transib2 49 1 52.05 CGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACAGAGGCATTGCTACCC:1 + chr2R 4362604 3' - gypsy 7057 2 70.50 ACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTAAGCTCTTTGCGGCCATGTTGTTTGAGTGACAGATGTAAAATCCAGTGCGTCTCCCAAACCACCATGGTAGTTTACAGTGCCGAGCAGCACGTGCAAAAC:1 + chr2R 2264089 3' + 1360 3260 1 74.63 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGCATGCATGTGCTTTTAGCCTATTCTT:1 - chr2R 19554877 3' - pogo 10 1 77.08 GAAGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAACAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTCCTTCGAAACACAAATACAAGGTTCCTTGACATC:1 + chr2L 13250461 3' - opus 7055 4 58.22 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATG:1 + chr3R 10472790 3' + mdg1 7404 2 56.12 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGTTAAGGGGTGGCTCCTTAACAAATGAAGACATCAGGTGAGTTTGGTTATTAATTCACCGGAAATTGTGTTTAGCTATACCCAGTGGGAACACAATTCTTT:1 - chr3L 14077437 3' + roo 391 2 58.22 ATATCGAAAAAGCAAAAACAACAACCGCATATGTAGTTCGCCGGCTATTGTTGTTGTTATTTCTGCTTCAGCTCCTCATTGTTTGCCATACCCGGTTTTAAGAGAAAAAGTAGATAGGCATAAAGTAATTAAAAGCTCA:1 - chr2L 9387229 3' + Penelope 545 1 67.63 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGCAA:1 - chr2L 17136155 3' - hobo 74 1 66.44 GTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTGAAAATAGTATTTGAACTTTTTCTAAATTTTTTTCATTCCATATATTTTTCATAAACCTCCTGTGATTTGTGTACCCTATCTTAGATGTGCC:1 + chr2L 12658615 3' - Quasimodo 19 2 49.66 AGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATTATGGAACATCCAAATTAGAAGTGTTCTAGTGCATTCTGGGCT:1 + chr2R 4261983 3' + invader4 247 2 51.09 GGCCGGGGGTTTATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGTGGTAGAAGAAATGTGAGTGGGCGGGAGAAGTAAAAGTGGGAGAAGGAAAAGAGTAAAAGTGGGAGACACAAGGTGTTTCTTGTTAAGAGTTTTCCACATCTAAAAATTA:1 - chr3R 30270269 3' - G-element 4208 1 73.29 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGTAATTCGTGTGGAAATACAAATATAT:2 - chr3R 13582164 3' - BS 5012 1 72.60 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATTCCTA:1 + chr3R 30635058 3' - roo 8708 2 51.37 CATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAGCTGTGGTAGCTATAATGAGTGC:1 - chr2L 22015899 3' + Tirant 362 2 53.60 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTTTGAATTCAATTTTAGCAAGTCCTTGTCGTCCTTCCACACCCGGATCCAATCAAGAAATTCCCCCCGGATAGCA:1 - chr2L 2272443 3' + copia 250 1 55.80 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAAAAGTTTAAAGAATGTAAATAATATCAGTTATATATATATA:1 - chrX 8011459 3' - 297 48 2 68.22 AAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACCATATTGGTGATCTCGGTTGCGAGGACTATGAACTGCAGGTGCGACTGAAGCCGGCGCAGCG:1 + chr3L 11213200 3' + Chimpo 147 1 56.30 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCGGTACTTGGTACTTGGTACTCAGTTCTCACTACTCAGTACTCATCGTGTGCCACGCCCGTGGGCGGAATAAACA:1 - chr2L 16106085 3' + hobo 2921 1 58.62 CTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATATCTTCAGGATTTATTCTCAAATAGATAACTTACTGTAGGCGGCGCAAGGTATTCCCGTGTAGGCATGAGCCGCATGGAGACA:1 - chr3R 27369551 3' - F-element 4278 1 71.17 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCAAGAAC:1 - chr3R 9160652 3' - copia 42 2 57.53 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCACTTTTTTCCTCCTTTATTGTTGCTGTTGTTGGCCCGCTTTTGGT:1 + chr3R 8709876 3' + jockey 4976 1 65.32 GCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAACAAAAAAGCGTAAGAGGCGAGACTTGCAACGACAACAACGTGGCATACTTTT:1 - chr2L 3395690 3' - jockey 4736 1 63.12 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGACAATGCCAGTGGCACGAGTCGCTCTCTTGGAAAATTTACAAAACATGGTGCTTGC:1 + chrX 4778290 3' + 412 7499 2 52.05 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGCTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGTGGATCTGCCCCT:1 + chr3R 14860239 3' - BS 5042 1 50.00 GTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTGAAAATAGTATTTGAACTTTTTCTAAATTTTTTTCATTCCATATATTTTTCATAAACCTCCTGTGATTTGTGTACCCTATCTT:1 + chr2L 12658606 3' - Quasimodo 29 2 44.52 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTAAGGGCCATATTGACCAAAAATAAATATAAAGATGGCTATTTTTAAACCAAA:1 + chr3L 96600 3' - roo 8722 2 59.72 TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAAAAAGTGGACACAGAAAG:1 + chr3R 10030829 3' - BS 5016 1 73.33 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGGGGAGCTGCTCCACATGTGTCTGTGCGTGTGTGAGTGAGGCGGCGTGTGTGTATGTGTGGGTGTGTGCGAGTGTGTGTGTTTGTAATAAAAGCG:1 + chr3L 4001231 3' - hopper 24 1 66.44 AACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACTTCTGTTGGTAATTTTTAAAATTCTTGGTA:1 - chr2L 3339972 3' - FB 60 1 76.32 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAAATGCCTAG:1 - chr3L 17707802 3' - Doc 34 1 55.65 ATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGGAATGTGACCAATGTTTATTAATACGCTTATTGTTATTTAAAAAGTTGTAAGTGCTTTAAAAAA:1 - chr3R 9190425 3' - Tabor 2 2 43.84 AACTAAAATGTTTTTAAATATATTTATAACGAATTTTACAATCCATTTAGAAAGCATGTGCGTTTGGGCGAATTCAACGTGAAAACTGAACCCGACTGCATCGAG:1 - chr3R 30242389 3' - transib3 111 1 75.24 GTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTC:1 - chr3R 5208147 3' + hopper 1335 1 72.60 AGCCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGACATATAC:1 + chr3L 23940553 3' + Cr1a 4396 1 69.18 AAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCAAGAGGTATGTTTTGCTTTTTACCTTTTCAATTTTCCTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACTTGCTGCTGCTTTTGGTTTTTCGGCTCTCTTTTG:1 + chr2R 18690146 3' + Tc1-2 79 1 75.34 GAGGTAAATTGCCAGCTATTGCAGCCCGCTTAAGGGTATAATTTTGGTCAAGTTGTATATTTTGATGGCGGTCCCGTAAAATGATATATCGACTGCTCCATATCTTCCAAATGTTATAAATTCGCTGGTAAGCGTTG:1 - chr3L 14838751 3' - BS 407 1 75.18 GAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAGAAAAACACAAAAACAATTAAGAATATTAATAGACACAG:1 + chr2L 22780918 3' - HMS-Beagle2 80 2 73.29 ATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTGAAGGCGAAATGGAAATAGCGCACTTAAGTGATTT:1 + chr3R 2555565 3' - 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chr3R 19531249 3' - hobo 29 1 56.67 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACA:1 + chr3L 7995471 3' - P-element 92 1 18.71 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGTTTGGGATCCAGCTAAAAAAAGCCGAGGCAGACAAGGCAAACG:1 - chr3L 13827229 3' + hopper 1409 2 77.69 AGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAG:1 + chr3R 9160730 3' + copia 155 2 82.76 TGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTCTTACAAGTGCTCTATGAATCGCGATGAAATCCGGTATTTGTTATAATT:1 - chr3L 24291953 3' - rover 6997 2 54.79 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTACAGCTCGTATTTCGACAAATTGATTTCACACACAATTCAGACGGTCGGTCGGTTGGTTGG:1 - chr3L 17004706 3' + I-element 5335 1 72.92 ATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAATTATCTGGTTTTTAATGTTAATCTTAATTAAACTGTATTACATTTTCTAGTTTTGCTATC:1 + chr3R 11750316 3' - Tabor 18 2 73.97 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTGTCGCCGACGCT:1 - chr2R 11609204 3' + roo 9024 2 52.86 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAATATAGGATTGTTG:1 - chr2R 10695776 3' - roo 62 2 60.96 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCGTTTTTGCCTTCA:2 + chr3R 3320526 3' - 1360 71 1 66.44 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATTATCTGATTTGCCTGGATAGCTGAATACCTTTTTTAAACAATGCACACCAATCA:1 + chr3R 11113309 3' - mdg1 7062 2 69.18 ACCAACAAGGATCGCCGCACCTCCGTGTTGACTGTCATCCGGATGGTTGGCAGTATGTAGGTCAATATTTTAATAATGTAATAAGTAATATAATTTAACAGTGATAATCTGGAATTGAAGCAATACAATAAAAAAAAAGGGATGAA:1 - chr3L 7498780 3' - G5A 210 1 43.84 AATAACAAGATGGGTAACGCCCTTCGATATTTTGCACACGATTTCTTCGTGCTGGCTAAAAAGCTGGTTTCAGGCTCTCTCGAAGACCTCTATAGCAATCCCAGTCAAAAGTGTCGAGGGAAAGAATTATTATAATGCGCT:1 - chr3L 23250409 3' + 1360 13 2 75.89 TACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCTATTTTTATTTATTTTTTTTAAACAGAGCCCACTTCACAGCCAGACGCTCCACATACATACA:1 + chrX 12526946 3' - roo 8613 1 57.53 GTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGTGTTTGTCTGCAGTACAAAATTACAGCAGTTTTAAT:1 + chr3R 11547838 3' - G2 278 1 79.45 CACATAAATAAATATAAAAATACAGTCTCTTTGAGAGCTAAGTAATTTGGAAAAGTGCAAATCCCAAGTCGAATTTCTTCAAAGCTGTCTGGATCGCGCCAATAGGGTTAATTCCCCACAGGAACAAATGCAGTACGTTGTTGAAT:1 - chr2L 8143697 3' + Tc1-2 479 1 69.18 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTTGTTAGTTGGCCACTTTATTTTTGAACCATTTTTTTTTTAATGAATAGACAAACTAGATAAAAATATTAAAGCCTCATATATAAGCCTCATAATAAATAGTTACCTAACTGGGATA:1 + chr3R 17305606 3' - roo 8668 2 81.51 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAA:1 + chrX 12139013 3' - roo 8747 2 75.34 AAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGTGTTGCGCAAGCGTCTCCACTTTTATGTGCAAGGGTCAAAAGTTGTTTTGTTTACAACATATCATTGCACTAATGAAGTG:1 - chr2R 5737088 3' - 1360 36 1 60.27 ATTTTCATATTACAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAACAAAAGAGTTAACAGTTGAGGCCCGGGCTGGTATTGTTGCTAGGTTTAAAGCCAGTAATGGCAAGCACTTCCCCTTCAGATTATCAACTTGGAAATGATCTCGAGCTGC:1 + chr3R 27510015 3' + Bari1 352 1 58.90 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTTAGCGGATGGCTCTCAGCAGCAGAC:1 - chr2L 245993 3' - roo 8679 2 62.00 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATTATCTGATTTGCCTGGATAGCTGAATACCTTTTTTAAACAATGCACACCAATC:1 + chr3R 11113308 3' - mdg1 8 2 77.52 TAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATTTTACGGCTTCATTTCGGCATACCCAAGCCAGAAA:1 + chr2L 9198353 3' - S-element 66 1 74.62 TCACGGTCGCCATGTAGTTAAATAGGAGTCAAAACGCAATCGGTCATATTTATCTTTATTTGGTTTTTATTCAGCATGTGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGTAG:1 + chrX 21907829 3' - mdg1 433 1 56.16 GCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGCGTCGACCTAAGTCGCTTTGGTAACTCGCGCGTCAGG:1 - chr2L 23372502 3' - gtwin 46 2 52.05 TCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATATAACAGTTCTGCTTTC:1 - chrX 3099123 3' - P-element 67 1 24.07 GTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTGTCCATTGGCTTGTACATACATATGCACGCTGAAGTAGAAAGCAATTAAGTTTTTAAACAATGAAATTGTCTCATTCC:1 + chr2L 8960045 3' + Ivk 5365 1 67.81 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAATGAACAAACGAGCGGGTGCCATCCAGGGACCAAAGCCAG:1 - chr3R 13607626 3' + I-element 5331 1 54.87 TACGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCCCAAAATATGACTTTTGCAATAAACAGTTTTCATATTTTTATTTATTTTATAAGTTTTTATTTTTTATCGCACGCGCGCACTCACAACCGCCAGCACC:1 - chrX 18534683 3' + 1360 448 1 74.29 ATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTAAATTCCCTTGTAGTTCTACAATT:1 - chr2R 7727163 3' - BS 4711 1 85.71 GAACTATAAAAGGTAGAAAGTTAAGATGAAGCATGCAGACTCTAGTGGCGCCTAAATGGGTATCTGATAGTCGATCTGAACTCGACTAAAGCATTCAATCTTGTTTGCACATAAACATATGCATACCAGGCGTTCAAATATCCAAT:1 - chr3L 13896349 3' + INE-1 158 1 77.40 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCCGGTTTCGTCGTCTTTTTGCTGAGATTTCGG:1 + chr2L 14248137 3' - I-element 20 1 68.15 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAAAGCGATACATTCGTTGTTCGTGAGTCAGTGGAAGAACTCCACGTTTTGCTGAACGCTCAG:1 + chr3R 4197321 3' - P-element 60 1 45.21 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATGTGTACATAAATTCATATTGTCTAGTTAGCAAAAA:1 - chr3R 6515336 3' - jockey 82 1 76.30 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTACGACTACGCTTGAATGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTCTCGGAAA:1 + chr3L 5159335 3' - hopper 16 1 68.80 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGGAGAAGGGAAATGTGCTGATCAAATAGTATTAGTAACACTAATAGTAATATTTAAAATCTTAAAATATTTTA:1 - chr3R 20743957 3' + roo 9023 2 53.42 ACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAGTCTGTGATCAATCATTGCGCATATCAGACATTCCTCGCTCAGTCGCCAGAAAACGTTGCGCAGACAACGAGAATAGTGATTTGAAAGAAGGGCGTCCTGATGACTCTTCGACAC:1 - chr2R 4284687 3' - 1360 6 2 75.34 TCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGC:1 + chr3R 11547763 3' - G2 352 1 69.66 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGCCATAAACAGAGAA:1 - chr3L 27350441 3' + pogo 2076 1 65.96 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACCTTGATGTTTATTTTTAAATA:1 - chr3L 96509 3' + roo 9033 1 55.75 ATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAGCTTTGTCGCTTATTAAAAGA:1 - chr3R 27510055 3' + Bari1 1662 1 53.10 AAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTG:1 - chr3L 24152459 3' - HMS-Beagle2 79 2 71.92 AACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCATCCTGCTGTGCAAACTTTGTGCATTTGCTGTTTACACTTCCCT:1 - chr2R 13115819 3' - opus 493 2 69.72 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTAAATGTTTATCTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCCCTCCCACAACGGAACTTCTATTGTTTTTATGT:1 + chr3R 25880355 3' + P-element 2860 1 47.26 GTGCTGCCCCGCAGCGCTTTTAAAAAATCCAGCGAAAGTCTCGTGTTTCTCCAGAGACTAACAAGAAAAAATCGAAATCCAATATCGGCAAACAAGGTGAAAGCCCTTCGTCAACACAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chrX 14317418 3' + X-element 392 1 63.01 TAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTG:1 + chr3R 11547754 3' - G2 362 1 75.34 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAGTCATTAAATTAAGTCACATCAAGTGCGTATACTTAAT:1 + chr2R 23497112 3' - 412 78 2 72.86 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGAAAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAACCGAAAGGCACTTGATTAAAATACGGATGCAGGCGGAGAACGAGTATGAAATAGAAGTGGCCGAGTGGAGGAG:1 + chr3L 15510098 3' - I-element 85 1 59.68 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATATTTGCTTCGCAGACAAAAACATCAACTACCCCTAAAAGTAGGCAATTCTTACTGAGCAACAGCTACGTTGAGTCATTTTT:1 + chr2L 13215739 3' - jockey 4787 1 61.94 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCCGCTCATTTCGTTTGTTGTTCTTGTTGCCGCTGTTGTTAATTGACGACAGTGAAAATACGAC:1 - chrX 5679919 3' - P-element 37 1 54.33 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCCTTTTTGTGTG:1 + chr3R 24476384 3' - 412 12 2 67.29 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCCTCAACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACGTACTTGACGCGTTGTTCCTGCCGCTTCCTTTATTTCCAT:1 + chr2R 12543194 3' + roo 9041 1 63.70 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATACATACATAGCCATATAGCCCGGTATTTGGAAAGCCGCAGAGTGATTGCCTCTGGTTTCACAGTGTCAAAATAAAAAGAACGGAGCA:1 - chr3L 16870133 3' - FB 35 1 58.90 ACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCTTTTCGCGCTGGAAGTGGCCTAACCCAGTGCTACT:1 - chr2R 19667302 3' + roo 8603 1 76.03 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCAAATATTTCATTTGAAGTGACACTGCGTTGGAAATTTGTCTGAATTTTCAGC:1 - chr3R 27535431 3' + 412 425 2 63.01 TACATGGCGCCCGAACAGGGACTCTTAGCACGGAAGTTGCTCATCGGGCGCCAGTGGACCACTAGAAATGTGACCCAGCTTACCTGCCAGATGCTGCCATCGC:1 + chrX 6124755 3' + HMS-Beagle 262 2 80.58 AATTGTTGTCTGTTAATTGGCGCCCACGGCACTGACATTGTTGCTGGAACACTTTCTTGCCGATATGTTCAACAAACACAATAACGAAGAACAGTCCGCTCTGCT:1 + chr2R 1247361 3' + gypsy4 265 1 69.52 GTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATTCACGACGTAATTGGTTTCCAACGTTCACACATCATCACTCATAC:1 + chr2R 19352049 3' - Burdock 67 2 66.43 GTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACAGTCAAACAGCCAGCTCAAAAAACAATGAGGGTAAATAATATCAGCGAGGGCCATTTTTTAGATCAGCACACTACAGAGGAA:1 + chr2R 613297 3' + F-element 4373 1 59.59 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAGCAACAAACATTTTCATTCGTTTTCGCATCGTCGCA:1 - chr3L 14550951 3' - P-element 34 1 49.19 GTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTGCGTCTTATTTAATAATATTGTAGCATTTGTCTAATATAAATTATTTAGCGATCTTGTCAAATTGTGTTGTCAATTACAAATATTTTAAAAAGCATATTAATA:1 + chr2R 1339262 3' - 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Ivk 27 1 63.19 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACCGGGGAGTTTTGTTTGGCTGCAAAGTGGGATTTGCGAGCAAATTCCTTAAGCCCG:1 + chr3L 905881 3' - 412 43 2 56.00 AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCAGCGGGAAAAGGATGAGGGTTTCCTCAAGGAAGTCGGAAATAGAAGTGGTT:1 - chr2R 14801319 3' - jockey 4825 1 65.71 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCGATGGGGACGCTCCATCTACGCATATCTTACGC:1 - chr2R 11133521 3' + roo 9033 1 59.31 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATTTTCAGCACCTCTTCCTAAGTTTTCCGGGCGTTGCACGTTGCCTATTGCAGCCATTACTCAAGCGACAGCAACGGGTGGTCAC:1 + chrX 5859017 3' - hobo 38 1 56.85 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTCATGTTTACCGAGGTCAGAATGCGAAAAGATATTAGTTC:1 - chr3L 14076219 3' - roo 81 2 74.66 ATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAAT:1 - 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hopper 27 1 62.96 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGTTCAAAACCTTTCACACTCTTGTTATGGAAGCGGACTTAGCGCTAATGGTT:1 + chr3R 15702990 3' - copia 4940 2 66.44 AAACACGAAAAAGAAAAAAAAAGGAATTCAGAGGGATCGGGAGAAAGGAATGCCCGGGGCAAAGATTAACCAGCTGAGCTGGCTCTT:1 - chrX 4020916 3' + Doc2-element 238 1 89.66 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTTAAGCATCTCCATTCCCACC:1 - chr3R 25880293 3' + P-element 2786 1 16.44 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCTG:1 + chr2L 16884908 3' + pogo 2042 1 59.59 ACATGTAGCTGTATGAAAAAAATTTCAACTTTGAAAAGAGCTACAAAAACTTGTTCAGTAAGTGTTGTAGTGTGAGAAGGGCAGGCATGTTTAATTTACAATAAGACAGCCTCAAGGATCGGATTCAGAGATCAATTG:1 - chrX 17989388 3' - hopper2 1246 1 52.17 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCTTTTTTAAATACTTGATATGCCTCTTGGGCGTGGGAA:1 + chr3L 15612779 3' + roo 349 2 71.43 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTACTTCTGTTTGCTCGTCGGTGCAACCGCACAAGCCGTTCTTACTT:1 + chrX 22610778 3' + pogo 2050 1 62.40 AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATATATTATATATTCTCTTTATATATTATATTGCCCTAAAATATCTAGGTTTTCCAAAACCTCCGAAA:1 + chr3L 22408747 3' - 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Bari1 83 1 72.60 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAACAAAAAAGCGTAAGAGGCGAGACTTGCAACGACAACAACGTG:1 - chr2L 3395700 3' - jockey 4714 1 63.30 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATT:1 - chr3L 25406608 3' - 1360 15 1 69.86 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACCCTCGCTATCCAGTCAAAAGT:1 + chr3R 21001902 3' - 412 58 2 58.22 AGAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAATAAAATGTCATTATGCGCTCCCAAAAGTATGCAAACGATTTTTCGCTTTGAAT:1 + chr2L 3890216 3' + jockey 4930 1 65.75 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACT:1 + chr2R 6842847 3' + roo 345 2 64.44 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTATATCGCGATTAAGATAATCAACTGCTCTGCTCTGATTGCGGAAGCAAACGTGGTAAAGATTTCGAAAAGTGG:1 - 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X-element 390 1 36.36 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAAT:1 - chr2L 9485591 3' + 412 434 2 56.85 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGATCGGAGGCC:1 - chr3L 22900097 3' - 412 7101 2 62.50 CATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACTATCAAAGGAAAAGCGAAGTCAAAAGTTCTCTAATAGGAATTTTAAGCATTTCCTTCGGGACATAAAATGTTTCAAA:1 + chr3L 15276281 3' + hopper 1328 1 58.22 TTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATG:1 + chr3R 26246894 3' + 1731 4574 2 57.81 GAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCACTGTGTGTTTGCTGTTGTTGATGTTGCAGCGTTGGGTTCATTAACATTTGCACC:1 - chr3L 3452678 3' - F-element 4442 1 60.96 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGG:1 - 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chrX 6637560 3' + hopper 1317 1 49.32 GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGTTTTTTT:2 + chr3L 9571730 3' + jockey 4920 1 67.12 AAAAAAAAAAATTGAGAAAAGCTGGTTGAAAAAAGTGCTGGCGATTGCATCGCATGGCGAGGTTGTTTCGCATGCCCTTGCCC:1 + chr2R 16387308 3' - FB 172 1 78.31 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTGTGAGCGGTGGTGTTTGCAACTGTAGGGTTTAATGAGGAGCGGG:1 - chrX 7980781 3' - hobo 28 1 58.12 TGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGTTGTGATCCTAGAAGCGTTCTTGGTC:1 + chr2R 4677389 3' - invader3 5185 1 80.51 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTATAATATATATACAACTGGTTTTGGCAATGAAAAAAACTACGTCTAGAAAAATTAAGTGTTTGACACATATACACAAAAATAATGAAACAGTT:1 - chr2R 4628339 3' + Transpac 285 2 67.81 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACCT:1 + chrX 16384101 3' - diver 5945 2 54.79 AAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGTCCATTCTACACCCACAACTTCCCAACCACACACTATTGTAAACAATCACAGACACACATTAATGTC:1 - chrX 22252729 3' + diver 6058 2 52.74 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAATTTAATAGA:1 - chrX 13531618 3' + roo 326 2 74.66 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACCCATTTTAGTATCTTATTATGCTTTTAAAGCCTCAATGGATTATGATTCTTTTACCTTTCCGCCAAGTATCTAAGAAATGACAATTC:1 + chrX 18512791 3' - S-element 33 2 63.01 ATGAGAAAGGGAAACGCTTGGTTTTGGTCATTCTTGGTGATGAAATAAAGAGGGATAGTCATGCGACGTGTCAGAAAGCGTTTCTCTTGTAACGAGGAGTCTACAGACCTTGGATCG:1 - chrX 22705724 3' + invader5 212 2 71.79 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGC:1 + chr2R 10695888 3' + roo 9028 1 52.82 AATCATTTTCCTATTACAGTTATTTCTCATCATACTGAAACTTTTGACCCGCCATCTCCGATAGCGACTATATGTATTTTGTATTTTGTGTTTTGTCTGGCACTGCCTTTTGGCTCCGTTCCGTTCCGTTCCTTTCTC:1 - 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chr2L 18149350 3' - Bari1 6 1 46.58 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGCATGT:1 - chr3R 12599029 3' - 412 7109 2 59.70 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATATCGTTGCATATAGTTTAATCGACTTCAACAAACGAAAGCCGATATTAAA:1 + chr3R 25904256 3' - 412 68 2 68.28 TAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAAATGTTCTATGCTTCAGCATCTGAACTAAATTTTAAATTTATTAA:1 + chr3L 8254004 3' - jockey 4883 1 69.18 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATAGCGAGTTTTGGCCAAAGGACGAGGA:1 - chr3R 27859168 3' + hopper 1358 1 56.85 AATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATCACCCACCCCGACTTGTCGTGCAGAGTCGCCCTGCCCGTCATTCAGTCTGAACGTGTCGATAACGCGTTCACT:1 - chr2R 12435815 3' + F-element 90 1 50.00 CCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATG:1 + chr3R 11113244 3' - mdg1 88 2 82.76 GCAAATTCAATTTTTAGATTTTTCTCAATTTCACACGAGCGGGGAGAGGTCAATTTAGCCGTCACCAAATATTTCTAATGTCTTTGATGATAACGCATGGAGTTGTAGGGTTTCA:1 - chr4 430919 3' + 1360 3270 1 74.78 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTT:1 - chr3L 96488 3' + roo 357 2 51.37 GTGTTCTCAATAGGTGGCATATATAGGTTTATTACAGCTCGCTCTCCATTTTTTTTTTGGGAGATCAACGAACTGCTTTGAAATGCTTTGCACCGATGACGTATCGGCTATTTGCA:1 + chr2L 9237612 3' + blood 7375 2 68.10 AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGTAATTCGTGTGGAAATACAAATATATATGTGATAAA:1 - chr3R 13582154 3' - BS 5002 1 78.08 CTACATCTAGTAAGACCTCACTTTAGTGTGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAAATATTATTTTATTATAGGTGCCAAACATATTCATTCAATCTTATCTC:1 + chr3R 30583859 3' - gypsy12 77 2 69.86 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGTTATGCCATTTTGGAATATCCATTTGGGTTGTACTATGAAATGATAAGGCATATATTTCCTTGAAAAACTTAGGACATTCAAATTGTGTTCTTTAGCATT:1 + chr3L 20255287 3' - 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chrX 3263325 3' - roo 66 2 65.07 CTGAGATCTCGACGTTCATACGGACACACGGACATAGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAACAATATACATACTTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTTATCGAATCTAGTATACCCTTT:1 - chr2L 20491469 3' - INE-1 136 1 88.36 ATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTTAATTTTCTGTGACCCACAACATCTAGACTATGAAGTCAGACTTCGTCAGAGCTTACGACCAATGTGCAAATGAGCTGATTTTCTAT:1 + chr2R 12265266 3' - jockey 4557 1 60.27 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTGAATAAATGAATAATAATGTGACCAATGTAACGTTTTCGATAACGTATCGTACATCTTATTCAGTTGTTCCAGTACAACACTGCTAGGCAGCAATTTCCAG:1 - chrX 16787033 3' + pogo 2085 1 67.81 CGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCTTTTGCATATCCGACATATCGAATACAACCCAAATTAG:1 + chr2L 12079685 3' + mdg3 5419 2 71.13 AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTT:1 + chr3R 9190569 3' + Tabor 7245 2 76.30 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTGCTGTGGCAATCCTTTCGGCTG:1 + chr2L 12340841 3' - diver 5942 2 51.37 ATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCG:1 + chr3L 24208212 3' - Quasimodo 57 2 61.64 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCCTGTCGTTTAATATCCCAGTCGTAGCTATGAAATAACTAGCAAAATAACTCATTCG:1 - chrX 1061526 3' - 412 7108 2 58.39 GCTCAAATTCGCAAGCTAACATTTGAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATGGATAGCACGAACCATCGCC:1 + chr3R 24937741 3' + hopper 269 1 79.80 AAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATGGCGCTTTCAAGTGCGGTGTGTGTTTGAAAGTCCTAGAACATCACGCATAATAAGCAACCAAATATGAAGTTGTGATGTGTTACCAAAAC:1 - chr3R 15021970 3' + Tabor 7315 2 77.40 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTCCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCAT:1 + chr2L 76144 3' + roo 351 2 62.33 CGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGACTCAGAGTGGGCAATACGAACTTTTGTTTGTACCG:1 + chr3L 24152584 3' + HMS-Beagle2 7175 2 69.86 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAACATCGTGCTCCTAG:1 + chr2R 558209 3' + copia 255 1 61.64 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATGGGCACATACTACATTATTTACACACGTAAACTCATATGTGGTGCAGTATTTCATGTTTCTCCCCCCCAAGTCGTTTGTTTTATATTTATACATCGAGATGACCCAAATTTCCCTTCCTCCAT:1 - chr3L 16358609 3' - 412 7069 2 67.81 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCA:1 - chrX 14964632 3' + roo 327 2 77.40 AGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGATTTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGGATGTATCGCGGTGTATATTACTCTAAGTGAATTCAATAGTTCTTACTAACTATAATCAAAAATATGGTCTAGATGCCACATCAGCAATT:1 - chr2L 16871024 3' - Max-element 379 1 46.58 CCTCTAAACCACCCCGCCTACACAAGTAGAGACATCGAACCGGGAAGCTTTAAAAACTTAGAGCGGCAAACTTTAAACTACAACCTCCAAAATCAGAATTCCTAAGGAGTAAAAGCAATGACACAGAATTGCTCCATTGATAAGGT:1 + chr2R 3293740 3' + ZAM 7998 2 73.97 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGCCGAGTAAAACTGACTATGTCCGTAATTTTTCCCTTTTTATATGAATGTCTTGTAAAATTCTACCACCAAAAAACTATTCTCTCTTGT:1 + chr2R 12994974 3' - BS 5026 1 62.33 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCC:1 - chr2L 17210288 3' + jockey 4935 1 71.79 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGGAAACTACCAGCCAAGCATCATCATCTGACACATTCCAGATCT:1 + chr2R 5955072 3' + copia 241 1 73.33 AAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGGGGAAATAGGAAAACTGTTGTGGAGTCCGAACGCATAGGTCAAGCTACCACGGCTAGTGGGTTCGG:1 - chr3L 26288172 3' + 1360 399 1 54.79 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAATTTGTGGGAATCTTTTCATT:1 + chr2R 5237937 3' - Doc 41 1 62.33 ATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTAGGCAGGCTTTACTTCATTGTATTGCAAACTATAATTTTAATTAAATTGTAAC:1 + chr2L 17876881 3' - F-element 161 1 62.32 TGTACTCATAAAATTTGTATGGGTGGCGGTCGTGACGGTCTAAGAAATGAAGGGTGAACGAGAATCAATGGGGGCCACCCATTTCGAACACAAAAAACATTTGAAATTAACGACGACATTTGTTGATTTTTTAATAAAAAATAGG:1 - chr2L 13803041 3' - hobo 2681 1 44.14 ACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATCATCTCAAGTGTGCCTCTCCATTCA:1 + chr3R 13612868 3' + 412 401 2 77.78 AGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCT:1 + chr3R 11547756 3' - G2 360 1 74.66 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACAT:1 + chr3L 14551064 3' + P-element 2838 1 45.89 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTTAGCGGATGGC:1 - chr2L 246007 3' - roo 8723 2 66.15 AAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAAACGATAAATACGAGCGTAAAAATGGATACAAATGCTAAAACATCCTAATGAGTAAAAACAAATCATGAAGAACCACTCCTAAAAATTAAATGGATATTATA:1 - chrX 10794195 3' - hopper 146 109 66.67 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTATAATATATATACAACTGGTTTTGGCAATGAAAAAAACTACGTCTAGAAAAATTAAGTGTTTGACACATATACACA:1 - chr2R 4628356 3' + Transpac 268 2 56.16 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAAACGCACAGAAGTAGGCT:1 - chr3L 12867293 3' + roo 9043 1 51.38 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCCGCTCATTTCGTTTG:1 - chrX 5679966 3' - P-element 103 1 15.07 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAAT:1 + chr2L 76118 3' + roo 8989 2 80.14 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACAACTAATCATTAGCTTTACATGATGTGTTTATACGAAGCAAATATCACGCAATCATATCACGATAAATTTATCACGATTTA:1 - chr2L 17250687 3' - opus 148 4 58.22 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACAC:1 + chr2L 16458660 3' + roo 329 2 75.00 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGTTCGCCGTGAGAGATGCGATTTTTTTTCAGTGAACTGATTTATTTTCGAAAACATCCACACAAGCATAATGCACTTGACACTTG:1 + chrX 958076 3' + roo 9038 1 49.66 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTGTATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTGGACAAGAATGTCTCGAGGTCATTTGGTTGACATTGACTCT:1 - chr3R 16913317 3' + pogo 2079 1 69.18 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTTTGTGGTCGGTCTACTAACAATCGATGCTAGTTGAGCATTGATTTTCGC:1 + chr3R 30630732 3' + roo 9006 2 62.33 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATACAATACATATGTGCTGGACCATTCTGTGTAACAACTCGCTTTGAT:1 + chr2R 12787904 3' - 297 23 2 60.00 ATCGACTCGGCTTTTGATCGTGATCAAAATGTATATATATTCGGGAACTCTTCCTGCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTTTAACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAAGAGACATGAATATACTGACAGC:1 - chr2R 5323884 3' - INE-1 95 1 61.48 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGT:1 + chrX 12525989 3' - roo 75 2 69.18 AAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCG:1 + chr2L 1259993 3' - Burdock 75 2 73.57 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCGTTCTGATACTGCC:1 + chr3R 22100570 3' + 412 7485 2 78.70 AAAAATTTGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATCGAATATGGCAAACAGTTAGCGTCGCAGGAC:1 - chr3R 13565203 3' - hopper 129 1 78.77 ACACACTAAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGCTTACGGCATAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAATTAGCCCGATTTTACGCTTTCGGCCCTTTTTCAATTCGAACTTCGTAGAGTTTGGATCACTTTCA:1 + chr3R 24979206 3' + Chimpo 103 1 54.86 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGGCCTACAGCCTTGTTGTCCATAAAAACGCACCCATA:1 - chr2L 10089719 3' - opus 151 4 55.56 GTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAAAACCAAAAACAAAATTGACCGAAAGCTTCACTGGATGGGCGAAAGTGGGCGGTGGTGGTGGGCAGAAGTGGGTGCATTTCGCCAGGACTTTTCACACAC:1 + chrX 15283528 3' + transib2 61 1 54.11 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATCAGTCAGTT:1 - chr3L 17175094 3' - 412 39 2 58.90 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATTAATGACTGTTTATGTTTGGTTATACACAAAAGATGAAAGCCTTAATTGTTTATGGCTGTTT:1 - chrX 3263317 3' - roo 8722 2 59.59 GTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCAAAATCATATTTTTTCTTTTAATGATTTATCGGCATTTAAGTGTGGCATGGGCCAAGTGACGCATCGTAAAG:1 - chr3R 7587161 3' - 1360 3242 1 54.23 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCCGCTCATTTCGTTTGTTGTTCTTGTTGCCGCTGT:1 - chrX 5679947 3' - P-element 44 1 38.68 CATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAGAGATACACAGATCTACAGCCACCGAATGCCCCCAGTCGCCAGTTCACTTTGCCT:1 + chrX 13426216 3' + BS 5032 1 58.39 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCA:1 - chr2R 19554925 3' - pogo 47 1 54.89 ATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATATTTTATGTGTACATAGGTCGAGGGGAACCAACCGAACGTGTCAAACAAAGCCAACGTGAATATAAAAAGCGAACCGCTTAATTAAATTGTTTGC:1 + chr2R 20489502 3' - 3S18 26 2 67.81 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGCTTTGTTTACC:1 - chr3R 5208128 3' + hopper 1354 1 59.59 GAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGAACGGCTCACCCACACGCACTCGCCCATACACACACACACACACACACACACTCACTCTCAC:1 + chr2R 20415626 3' - R1A1-element 5064 1 58.22 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATTTTAATG:1 - chr2R 5922943 3' + jockey 4983 1 51.69 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACGCAAAAACGTGCTGAGCAATAATCTAAAACGCAATAGCTAAAGAGAGAGAGGTGCTGTATGTGTGTGTGAAAAGTAACGGTAAATGTG:1 - chrX 4701099 3' + P-element 2856 1 62.33 TATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCGATGGGGACGC:1 - chr2R 11133543 3' + roo 346 2 60.27 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAGATATTTTTATGTAAT:1 + chr3R 9352144 3' - Tirant 8120 2 77.78 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACGTCTCGTTCGGCTAACGTGCACAAACATTTCA:1 - chr3R 21001800 3' + 412 434 2 62.24 ATTTTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGAATAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAAGCTTAATTAAGTGAAGTTTCATTCGAGCTCTC:1 + chr2R 4339522 3' + G5A 2790 1 79.82 AATATCTCCAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGCGGGTGGTGGTGGTGGGGCAGTGGGGCATGTTGCACATGTGTCT:1 + chr3L 15276741 3' - hopper 44 1 53.62 CGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACCTGATGTTTGCTTACTACTTAGAAGAAAATACTGTTTACCCAAATTTA:1 + chrX 16384147 3' - diver 5899 2 78.08 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTCTTCAAAATCCATA:1 - 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chr2R 2309772 3' + hopper 1362 1 71.13 CTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGGCAAGTGACTAACCCCGGGAAAACCTGGCATAATTATGGTCGAGCTCGTATTCCTACAGTTGTGCGGCATGC:1 - chr3L 905759 3' + 412 473 2 63.87 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCA:1 + chr3R 16181228 3' + roo 9005 2 62.33 AATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAGC:1 - chr2L 22015920 3' + Tirant 8428 2 71.72 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTTCGCAAATGTCCGGGATATATTTTAAATATAAAGTAATTCTATTTTTCATCAAACAATTATGCATACACACACATATTCTGTACCTTTTTA:1 + chrX 8093760 3' + copia 245 1 60.96 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTATTCAGCAAGATTTCTCTCTTCGGTTGCACTTGAAATTGCATTTTACCCCCTTCTT:1 + chr3L 14553251 3' - roo 8677 2 77.40 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGTGCAACAAAATTGAAACCT:1 - chr3L 18467145 3' - hobo 23 1 68.28 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATCATCTCAAGTGGGCCTCTCCATTCATCTTTCGTCTGTCGGATTTCGTAAGGCTTT:1 + chr3R 13612898 3' + 412 7499 2 53.49 TGAAACTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACAAAAAAAAACCTAAAAAATTGAAAGCAAAAATGTGAAAAAAGGCGAACAAGTGAAGCTGCTGCCTCGGGTTAAATT:1 - chr2L 7559665 3' + mdg3 5477 2 63.41 GAGGGTCTCAAGTTTGCGGTGAAACCATAAACGGATTCGGACAGGTGTCCCCCAAGCCAATGCCCTTTTCCTTTTAATATACAACGCATTCACAGCATCCATAATGGCAGCCACATACGC:1 + chrX 17245551 3' + G7 443 1 19.17 GTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCACCAATTTAAGTTTCTTTGGAACATTTTGTCAATTTATTG:2 - chr2R 5917781 3' - I-element 5075 1 59.59 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGTGAGGTCATGAGGGTGGTGATCTAAAAAGCATACTTTATTCATTTACGATCCTAAATATTTATTACTACATATATACATACATATCTGGC:1 - chr3R 23859814 3' - jockey 4802 1 54.07 CGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCG:1 - 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chr2L 246018 3' - roo 8744 2 76.43 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATCATGTGTAAATAGAATCAAAATCGTTGACTCGGGCAG:1 - chr2R 18482400 3' + hopper 1376 1 48.87 TTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCC:1 - chr2R 4730087 3' - gypsy8 302 1 78.26 GTAGTTTGATATGTGGGTGAATGGCGTTTTTAGTCGTCGCTGCAGTGCATATTCCACGTTTCAACAGCTGTTTAAACAAAGTTTTTGTTTTGAAAGTACACCATGTGATGTAGTCGGAGTATAGAAAGTATGTTATGAATATTA:1 - chr2R 21235942 3' - Porto1 285 1 77.78 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAG:1 - chr3L 7995427 3' + P-element 2848 1 47.22 CATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGATGCACTTTGCACTTTGCAGTTCAAGTGGTCAAGCTACACATAACATATGCATGCCTTCTGCATAAATATATATATGTCGAAGTGTTATTCCGTTCTACGAGGCCTTGGCTAAGTCGCAGCC:1 - chr2L 23352180 3' + Stalker4 7130 7 73.29 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAACTCGTGCGCCATAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGCGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACGTTTTGTAGA:1 + chr3R 10266170 3' - 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chr2R 3339148 3' + accord2 484 1 70.50 AATGAGTACTAGCTAGGGGGCCTTCGACTCGAGATTTATTGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGAAAATTTTTACGATATTTCCACAGGATGGGTTTTGAGTTTCTCGTGCTCATTGTTCTCCAG:1 - chr3L 6876036 3' - Ivk 5321 1 78.77 GTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGAATTACTCAGTTCTTTATTTTCTATAGTTTTTCTGGATAGTCATGACAATTGGGTTTGAGG:1 + chr2L 18149562 3' + Bari1 1677 1 66.44 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCCAAAATATTTGAATTATCAGTGTGGCCATACTGCGCA:1 - chr3R 11750134 3' + Tabor 462 2 69.18 ATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGC:1 + chr3R 11547781 3' - G2 335 1 57.53 AATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAATGCCCTCCTTGTAACCCCATCCCATTCCAAGCGATCCCATCCCACCCAAAGCCCCTACCAATTAAGCGGTTTTTTCCG:1 - chr2L 6542797 3' + G2 3009 1 56.12 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTGGTCTACAGTGAACCCCTGCAAAGTGGCACACAATCCGTCTGGCTGTGGTGGATG:1 - chrX 9707141 3' - Doc 54 1 61.24 CCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACAAAACATCAAAGCCGGTGAAAGGCGCCGCCAAGGACGAGGGC:1 + chrX 6512324 3' + accord 7010 2 73.42 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTTAATTTATGATGGCAGTTTGTTATGCCGCGCCCGTCACAACAAAAACAAACAGCTTATAGCTAGAGGACGCAAAAAGTATATATACTATATTAACAAGAA:1 - chr2L 12353887 3' - jockey 4677 1 71.43 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGGAATTATACGTGCAATAATTTGGATTCGTGAGTATAGACTTCAACTATTAAACTATTAAATTATATTTCTCGAGGTGCAGTGGG:1 + chr2L 2052806 3' - blood 38 2 53.42 ATAGTGTAATGAATATAAGTTACATATCGAATCACAAATTATTTATGTATAGTATACATTTGTATTTTATGAAATTCCATATATGCTTAGATTTCGACGCACAGTTGCTTTTGGCAAATAGAGCTCCCATATTTACATTAGCTTT:1 + chr2L 15343145 3' + Doc2-element 4687 1 48.97 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGT:1 + chr3R 24476365 3' - 412 70 2 65.75 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAAAAAGTGGA:1 + chr3R 10030820 3' - BS 5036 1 61.64 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGGAAACTACCAGCCAAGCATCATCATCT:1 + chr2R 5955056 3' + copia 248 1 56.85 AATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAGGATTACAAGTTATCATCTGTATTGGATAAAGTCTATTGTAGTCGAAACATTAAACTCTACAGAGTCCCCCGACTCCTTCAAGTCCTGGCAACGACACGAG:1 + chr2L 22327117 3' - Cr1a 4245 1 81.25 GCATTGTATGGATTTATCGCTTCTAAATAAATAAAGAAATAAAAAAACTTCTATGGCCCCACATTTAACAATTTAAGTTCATGTTGTCATTTATATAAATAATACATAAGTGGAATCTATCTGGAAAATGGGCAAGCTGACA:1 - chrX 20266119 3' + BS 5070 1 50.00 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAAGAAACCGAATCTGCTTGCCCCGCCCATAAATACTTATTATCGCTTATTT:2 + chr3L 13634300 3' + 297 332 2 65.75 GTGGTCCGCTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCCCTTAATAATAAAACATTCGCGTGTACCCGTCTTCCGCGGCCACTCGGAACGGCTAGTCTTCCACCGGCACTTCCTTCCACCGCTGATCGTCC:1 + chr3R 2894740 3' + Q-element 506 2 50.00 AGGAACCCCCTGTTACCTGCAATCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTGCACCATATATTTAATTAATTGGCGCTCAACTAGCAAAAAATATCCTTTAGTTTTAAGTTGATATAGTAACTGTCTGGGAAGTTCCTATCGCTGA:1 + chr3L 6212530 3' + springer 7470 2 47.26 GTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGAAAAGCGCGCAAGTTGTTAACTGATTTTACAGCCCACCTTTGGTGCCTCCAGTTACCAGTTGCCAGTTGGCTGCCCATTAGCGACGGCAC:1 + chr3R 12898434 3' - Cr1a 253 1 65.52 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAACAAAAAAATCAATAGCCAAAATGTTGCATATCTTAACAGGCTATACCATATATTATGGCTGACTAGGTCAATCCCAAAAACTGAGTCCAGAAAAGGGAATATTTAA:1 + chr3R 22249250 3' + jockey 4981 1 66.44 GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGATCCGCTACTGAGCTGACAAGAGAGCTTCTGTGAGTCGTGCTCACAGAAGTAGAACATGCATTGCCAATTAGCGAGAAAGTG:1 - chr3L 23608484 3' - Tabor 6878 2 58.33 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGAACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGGGCACTTACCCTTTTTTAGCTCTACTTTACTTTAAGCTACTTGCTGTTA:1 - chrX 6312663 3' + 412 7475 2 65.07 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAGAAGTAAAAAATGTGTCAGGCCGAGGAACGATT:1 + chr3L 22978677 3' - 1360 16 1 73.97 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTTTTGTTCTCGAACTAC:1 - chr2L 17029573 3' - blood 7055 2 54.11 GTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGATTTCAATTATATTTACTATGTGCGTAGCTTTGTTTCTCAGAATTAGGATTTTAATTCAATTAAGTTGAAT:1 - chr3R 11999899 3' - 412 7314 2 51.03 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGCCATAAACAGAGAAACAAAAAA:1 - chr3L 27350433 3' + pogo 2081 1 68.75 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAAT:1 - chr3R 22100523 3' - 412 7121 2 65.22 TTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGATTGTAATCATTAAGTGGTTTCTCTGTGGTATGAATATTGTCGTTTGGTTGTTCTAAATGAAAGGTAAAACCCGCTGTGCCATCCAATGTTTTAATGTC:1 + chr2L 23382067 3' + Idefix 482 2 64.83 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGA:1 - chrX 4778196 3' - 412 80 2 71.72 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTGCCCAAGAAGGTGCAGCACACTCTTTGC:1 - chr2L 15987938 3' + roo 404 1 78.57 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACC:1 + chr3L 25401039 3' - Doc 13 1 63.57 CTATACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGC:1 - chr3L 17707835 3' - Doc 89 1 70.55 ATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAGGGTACAGTGTGCAAATAATTTTATTAACTTTCATAATTGTGTTGTTGATGTGGTATTTAAATGTTGAAATGAATGCAAGTCGCGCGACTGACATTAGCTTTAAAAACGGATTACGCGGC:1 - chr3L 1503345 3' - Juan 3741 1 63.01 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATATCGTTGCATATAGTTTAATCGACTTCAACAAACGAAAGCCGATATTAAAATAAATACAGAAACAAGT:1 + chr3R 25904274 3' - 412 51 2 56.16 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCAAGAAAAAATGATATGGAGAATAA:1 + chr2R 19553314 3' + mdg1 398 2 65.73 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGA:1 + chr3L 13827393 3' + hopper 1398 1 71.85 GTATAGATGTAATAGATTTGGTTTTGGAGCTCAGAGCCTCTGCTCTGTTTGAATCGGTTTATTCGAATGAATTCATATTGCTGTTCTTGTTTTCCTTGATACCTATACAAATAGTTTACTCGTACAGTAAAAGGAGTATGTAACAG:1 + chrX 129836 3' - 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Ivk 65 1 59.59 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGGGACTGGGAACTTTTGCTGGTGACCATGTGCTCCTGA:1 + chr3L 9907466 3' + jockey 4958 1 53.79 ACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCT:1 + chr3R 9160767 3' + copia 216 2 48.76 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTAAATTGTATTGACATTTGAAAGAGTAGGTTGAACGACATTGTCGTCGAGCATCGGCGATTGTTATTGCTCTGCTGGCCGCTCTT:1 - chr3L 12224591 3' + 412 7511 2 60.27 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGCCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTCACTAACCGTTTAATGATCTTGCACATT:1 - chr3R 21705992 3' - 297 7 2 58.23 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAAAAAGTGGACACAGAAAGG:1 + chr3R 10030830 3' - BS 5020 1 71.43 GCGGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACACTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTATATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCTCCCGAA:1 + chrX 22576492 3' - 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Quasimodo 59 2 64.38 ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATTAATAACTACAGTTATGGATCGACACAGACTAAAATTTCATTAGCCCCCTTTCATTAT:1 - chr3R 2474286 3' + Juan 4150 1 63.01 TTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACCTTACCAAATGGGATTTAAAACTTTAAAGGATCATGTAAAGTAAGTATATGGAAATG:1 - chr2L 12349764 3' - F-element 104 1 60.69 GGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTTAAACAATAGACTTGGGCACTCGCATTCAC:1 - chr3L 22054937 3' + mdg1 7033 1 69.86 AATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAATGGAATCGTAAACAATAACATGCATCGGCAGCCATGTCATTGCATCTGGAGAAGATTTGGGTCACTTGCAGCACTTT:1 - chr2L 8168801 3' + FB 90 1 54.11 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCACTTTTTTCCTCCTTTATTGTTGCTGTTGTTGGCCCGCTTTTGGTTTGTGGCC:1 + chr3R 8709884 3' + jockey 4981 1 70.08 GGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTC:1 - 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chrX 4778156 3' - 412 41 2 56.16 GCTTATTTACTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAAAATTACTTATGCACAGGTCGCATGTCCTACCAAAGTAAATTAATTGCTGGATATACCTCCTTGATCCTGCTTGGGACCTGCTC:1 + chr3L 7419820 3' - 1731 4421 1 53.42 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTTACAGTTCGATACTCG:1 - chr3R 27768846 3' - 297 6620 2 78.82 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGGAATTATACGTGCAATAATTTGGATTCGTGAGTATAGACTTCAACTATTAAACTATTAAATTATATTTCTCGAGGTGCAGTGGGAGATATGACCCAAACATCGAGCCAATGCTTT:1 + chr2L 2052837 3' - blood 7 2 73.29 AAGAGTTTTGGGCTTACACGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATACTGTCATTTAAATTCCAAGCAAATGCAGAGGATAACTCAACAAAGAATGGCTTAGATCGAAACA:1 - chr3R 7739434 3' - I-element 57 1 59.59 GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTGAGTTTTCTTAAAATATTAGTTCCCTCCTTTTTTCGCCCGGTTTTCCTTCTTTTTTTTTTTGTCCTGCCTTTGTTTGGGTCGTGGCTGTGG:1 + chr3R 15711905 3' - diver 20 2 67.16 CTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATGGCGCTTTCAAGTGCGGTGTGTGTTTG:1 - chr3R 15022033 3' + Tabor 413 2 64.38 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATCAATAGTTTAAGTTCTTTTTAATGCCTTTGGTTAATTTAATGCAACTAGTTAATGTTCTGTGCTCTATCCCTAGCTTATCCTGGTAGATCCTTCTGTGTCCGAT:1 - chr2R 14047578 3' - mdg1 7057 2 68.49 AACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTTTCTTAAATAATAAAACTATGAGTCATCGCCGGATTTCGATTCGAATTCGGGGCTCGGGTATGATTTAT:1 + chr2R 21532658 3' + F-element 99 1 70.14 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATTTTTGTTAATAAATAAAATTATGGTAACG:1 + chr2L 76183 3' + roo 391 2 73.97 TGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGAAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATA:1 - chr2L 17029613 3' - blood 7094 2 73.10 ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAATATTTTTTAAGAGACCTAAATAAAGTTTAGGTTTTTTTTTGTGTCAGCATT:1 - chr2L 5694136 3' - copia 66 2 66.90 GAGTAACGGGTATTTGATAGTCGTGCAGCAAGCCTAGTGTTTGTTTAATTTGCCTTTGCCGCCTTTGTTTCAATCAAAGAAATATTGAGCCTTTGTTGATTTTCCACCTTTCCACCTACACACCTACCCAGCAACACCAC:1 - 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chr3R 8262012 3' - Tirant 8115 2 52.50 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAAGGTATATCTACATAAATGAACTAATATTTTGCTTGGAACTCCACACCGCCTCACATAAATATTTATGCGTGTTAATGCTGCAACAAACTAATAAAAACACTGACAGT:1 + chr3R 29645828 3' - jockey 17 1 61.64 CTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGACTCAGAGTGGGCAATACGAACTTTTGTTTGTACCGTTTG:1 + chr3L 24152588 3' + HMS-Beagle2 7179 2 72.60 TGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATG:1 + chrX 20999575 3' - BS 73 1 71.92 TTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACAGAGGCATTGCTACCC:1 + chr2R 4362604 3' - gypsy 7064 2 71.92 CAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGGCTATAGATTCATTCTTTCTTGTTAGAGATGGATAAATGTTTTGTTGTCCGCCACTGATTTCGTCCC:1 + chr2R 5439241 3' + INE-1 514 1 70.87 AAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGCTGCCTGCTCCTCGCCATGGCGTCGTGTAAATCAGGCTAAG:1 - 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412 37 2 60.27 ATCCTGATAAAGAATATACAGGATGCGGCAGCATAACTTTCTTTTTTTAAAGCGCACCATACAGTTTCTTGATATCATAGCGGAGCGCTAGGTGTCGCGATCATCCTTCAATCCCAAGGGTAACACTAATACCAACAACAGTGCTA:1 - chr2R 671232 3' - INE-1 79 1 70.55 GCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAGGGCAAAAGGATGGTGTGCCAATAGAAAGGAACGATAGCC:1 + chr3L 23015467 3' - 1360 3006 1 73.29 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCGTGACCGTGGCAACGAAT:1 - chr2R 19726883 3' - 1360 26 1 79.10 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTCGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAACTCAGCCAAATTCAAATCTAAATCCAATTCCCAGCAGCCTTATCAG:1 + chrX 13395400 3' + roo 400 1 77.40 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCC:1 + chrX 1103694 3' + pogo 2064 1 66.00 CTATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGACAATGCGAACGCGAATTTATTTTTAATGTTTGTTTGTTTTTTATTATTATTTAACCACTAGGTGAGTTGAGGGGTATCTTACAGTTCTATAACTCGATCATAGCGTTCATAGCT:1 + chrX 21290992 3' - INE-1 547 1 49.65 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCAGG:1 + chr2L 246120 3' + roo 9038 1 64.14 AATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTTTGGGCGAAAACTTTGCCTTTTTCTAGCTTTTTGAC:1 + chr3L 2725052 3' + Ivk 5294 1 75.34 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCAAGCTGACTGCATGC:1 - 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chr2R 12406709 3' + INE-1 156 1 64.38 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAATATTTTTTAAGAGACCTAAATAAAGTTTAGGTTTTTTTTTTGTGTCAGCATTCCGAAAGA:1 - chr2L 5694128 3' - copia 61 2 61.64 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGGTCATGCAATGAGGCAACTAATTGAGAGGCCAAACAAAGCATGGAATCAAAGCCTTTGCCACGTGATTTCCTCCTAATCCATGCAGGCTAGCGTGTAGG:1 + chr2R 20865795 3' + 412 7523 2 65.07 GACTAATCAAGTCGGGACTCTAAACATCCCCACAAATAAACTTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 - chrX 3538813 3' - Cr1a 4073 1 72.03 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCTGCCCTACCTGGCCATGTGGATTCTGGCCATTG:1 + chrX 4785191 3' - roo 8683 2 68.55 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTATTGGCTTACCTTAAAGTCGCGTTTGGTCAGGTGACCT:1 - chr2L 2030999 3' - 412 34 2 59.59 GTTAATTGCGCTGTTATGATACTATTACTGCATTGTATGGATTTATCGCTTCTAAATAAATAAAGAAATAAAAAAACTTCTATGGCCCCACATTTAACAATTTAAGTTCATGTTGTCATTTATATAAATAATACATAAGTGGAATC:1 - 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chrX 4305776 3' + gypsy12 10164 2 51.69 ATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAAC:1 + chr2R 4261948 3' + invader4 2962 2 68.49 TCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGA:1 + chr3L 24934394 3' + HMS-Beagle2 246 2 64.38 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACAAATGACAAACGGTGCACTGGGGTTTCAGTTTTCCCGATTTATCTGTGACAGTTTCAACGCACCAGCGCCAGATACGAACAGATAATTGTTATTTA:1 + chr2R 7953781 3' - roo 8677 2 75.37 ATTAGAGTATTCATCTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAATGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATATGTGTGCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCC:1 + chr3R 4571527 3' + 1360 412 1 74.66 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACAACGGGCGTCTTCG:1 + chr2L 22016034 3' - Tirant 8109 2 81.74 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCTGCCCTACCTGGCCATGTGGATTCTGGCCATTGTGTTTGGCATCCTGGCGGATTGCCTCATCCG:1 + chrX 4785222 3' - roo 10 2 79.45 GGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGTGCTACTGACTGTTGTATGGGGCATGTCGATATTGAAAATGACGGGATATCGGTGAAG:1 + chr2L 22746541 3' - R1A1-element 5002 1 51.67 TTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATAAATCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTCACGAGGTAAGCAGAAATTTAACTAAAACTAT:1 + chr3R 25301458 3' + roo 317 2 74.29 GTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGAAAATGACTT:1 + chr2R 17890958 3' - Tabor 6913 2 66.44 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGCGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGCATGGTTATTTCCCCCTGTCTACAATTGATTGGCAG:1 + chr2L 12414969 3' + pogo 2039 1 67.20 GACTATCAGATACCCGTTACTCAGGCAGTAAGTTATATCGGCAGAAGTTTATAAGACCAATAAACTTTTTTTTTTATTTGAGGAAGTTTCTAATTATGAGGGTTTTTCAGATTTCGGCTCTTTTCAAAGCAAGCCAATGCACCTC:1 - chr2L 18902694 3' - INE-1 549 1 91.03 TAGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTTACAGTTCGATACTCGTATTGTTGCTTCAGAACGCAAATGGCACCTTTCTCGTTTGGTTTTCCGGCACCCTC:1 - chr3R 27768790 3' - 297 6597 2 65.25 ATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAAATATTATTTTATTATAGGTGCCAAACATATTCATTCAATCTTATCTCGAGTAATGCTTTCTTGTTATTGATGCCTTCGAACCAAAAAATTTACTTCCCACA:1 + chr3R 30583913 3' - gypsy12 23 2 69.18 GTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGATTTCTGCCCACAGGAGGGGGGCTGGCGGCATTGCAG:1 + chrX 4560191 3' - Stalker4 7010 4 56.96 GTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAATGTAATTCTTCATGTCTGGCCACGTACCGGGCCGCG:1 + chr2L 11021496 3' - 1360 481 1 76.03 ATTTTGTTCGTGAAAAAGTAGAATGTAATGAAATAATTCTTGAATATGTACCCACTGATAAAAATGTTGCAGATGCACTAACGAAAGGCTTGTGTAAGCAAAAGCAATAAAATAACAAAAACTAATCAAAGCATAGAAAACATAAA:1 - chr2L 14687483 3' + Copia1_DM 4149 1 71.92 AACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAAAGTTTAGCATACATATATATTAATACAACCTATTTG:1 - chr2R 5617465 3' + invader1 3985 2 59.44 ACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTATTATGCGTGTTTGAACTTGAACTATCATGCTG:1 + chrX 9498864 3' - opus 7463 2 77.14 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATCATCTCAAGTGGGCCTCTCCATTCATCTTTCGTCTGTCGGATT:1 + chr3R 13612886 3' + 412 7481 2 62.96 ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAACGCAACTCGGAAAGAAAAGGAAAATG:1 + chr3R 15022143 3' - Tabor 41 2 57.53 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTT:1 + chr2R 21402668 3' - mdg3 85 2 74.65 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGT:1 + chr3R 16181226 3' + roo 339 2 63.70 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTACACTCAAGAAGTAAAGTCGAACGGGCCTCGTCCAATCGACTGGCTTCTTCTTTTGGCCCTTCCTAATACTTATTCACTCAGTTGTCACA:1 + chr3L 22900214 3' + 412 7514 2 62.33 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGA:2 + chrX 12525975 3' - roo 8753 2 78.77 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGC:1 - chr3L 96480 3' + roo 9033 1 57.75 AGGCCACAACGGCAAAGGCGCGCTCCTCACTATTCCAACGCAAGATGGCGACTGAACCGTGTCGGGACAAAGCTTTGCAGTAGCCCCTCTTGATTTCCTACCCAAACTATTTTTCATCT:1 - chr3L 6713083 3' - mariner2 155 1 78.15 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACT:1 - chrX 12191541 3' + pogo 2092 1 67.05 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGTAATTCGTGTGGAAAT:1 - chr3R 13582174 3' - BS 5022 1 65.75 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATTCCTAGGAAATTACAAAGAACAGAACTGCT:1 + chr3R 30635083 3' - roo 8683 2 39.04 CTTTAGTCGAGTTCCCCGACTATTCCGTTTATTTTTTGCAAGTACATACTTTTTAACGAATCTAGTATACTCTTTAACTCTACGGGTATAATTACGTGAGCAGTAGTGTATGGGAGGATTTAAAGCCTGAATGGTCAATATTAAC:1 + chr3R 20126132 3' - INE-1 566 1 62.07 AACAGAGAAGTTTAGCCGACTAACCAATTCGGGATTATCAGCGAGATCTTAAAGAGTAAGTCGTTTGTATTGGGTTGATACGACAAAAGGTCATAAATCTACGCTTGGAGCCATTGAAAGCTATCCAGATCTGATCTTTAGTCCAA:1 + chr3R 1561736 3' - Cr1a 4090 1 73.29 CCTCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCAAGAAATTAAAGAGGAATCTCTGAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTCCAGCATTTGCCAAACAATGGAGGATCTTTTAAACGAAGTTGTACCACAAGAAGATTT:1 - chr2R 5604714 3' + Q-element 70 2 64.75 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTTATGTTCAAAAAAAAAATGCATCCAATTGTTAATATCTTAGACCAAGTTTTCAAGATAATATCATTACTCAAATTCTCGTAAAAGAATTTTAGCAACTATCTTGTAATATAATATTTC:1 + chr2L 17029749 3' + blood 375 2 78.08 CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCATGATGTAGTGAATACGACTTAAAGCGCTTGTGTTTCCGTCTCTCTTTTCGTGGCACGCT:1 - chr2L 9668182 3' - 1360 56 1 63.31 ATAAAAAAAATGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACACACTGTATATTTAGCTGAAGATACTAGTATTTTAATCGTTTTGCCTTG:1 - chr3R 29705996 3' + S-element 1634 2 76.03 CATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTATGTGTGGGTGGGTGGAAAAGAGGCAACAGTTTTTCCTGATTTTTGTCGCTGGGTGCTACGC:1 - chr3R 15711737 3' + diver 204 1 67.63 TGCATATATATATGTATATATGTATGTATGTGTATATGCGATTCAATTACCGAATCACACCCACGCAACTGGTAACTGCGATCCTAACTGCCAATTAATGGCCCAAACAATGACGGCCAACTGATGGACAGAGAGTGTCACAAA:1 - chr3R 30255059 3' + Stalker4 245 5 53.47 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTATATTAATATACATATACATACAGATGCGGTTT:1 - chr2R 641828 3' + opus 7469 2 63.70 GAATGAAAATGTTTTCGTTACGAAAATGGATGTTTAATGGAGGCTATCGCATTTCTGTTTGCCATTTTCCCAATTAGTGACAATTAGCACATGCCTTTAGTTGCAAATAGACGAAGTGGTCAAAGGCAGGTTTTCAACTCGCTTAT:1 + chrX 5736856 3' - X-element 154 1 57.53 AAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAG:1 - chr3L 9571667 3' - jockey 4538 1 67.12 AGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGACAAGTAAACGTTATTTAAGCAACTTTCCAACCGCAGAGGCCGAGAGCACGCTCTCCAACGTCACCTCGAT:1 - chr2L 6720803 3' - jockey 341 1 52.05 AAAACAATAATAATAATAATAATAATGCCATTAATCTAAGATCCCCTGCAATTCCACACAGAATTTCCCCGGAATCCGTAGCAACTACAAACTCTTCAAACGTAAGTTTCTGCAATGGAAATTGTGATACAAAATGGCAAATAAAA:2 - chr2R 21785650 3' + mdg1 7058 6 73.97 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTT:1 + chr2L 14248100 3' - I-element 68 1 61.64 CCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAATGCTTTAAATTGTCCCTATCTACGCGCATG:1 + chrX 23406393 3' + R1A1-element 5220 1 77.78 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCACTTATGTCACTGACTGCTGCGACTGCGGCTGTCG:1 + chrX 6138749 3' - opus 21 2 68.18 AGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCAGCAGCAACACCAATGCAAGTGTTACCTGCACTATTTTCAAAGTAAGAGTATATTCCCACTTAAAACGCTGAGGATCAAGGCACGTTATCGCCAGCTTTT:1 - chr3L 1438631 3' + jockey 485 1 56.85 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAAGTGCTTTAAATCAAGTTGAACCACAAATCGTAC:1 - chr2R 23000065 3' + mdg1 7374 2 76.03 TAATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGCGAACAAGGGGTACCAGGGCATGCGA:1 - 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chr3R 9160679 3' - copia 4928 2 61.03 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCATTTTTGAAATGCAATTAAATTAGAAAGAACATCCTAATGCGTTCTACACACG:1 - chrX 13786863 3' - pogo 60 1 63.57 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAGCGGTAAT:1 - chrX 12138949 3' + roo 9013 2 67.97 AAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTCTTACAAGTGCTCTATGA:1 - chr3L 24291984 3' - rover 7028 2 71.92 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATATATGGTTCTGTAGAGCATAAGG:1 + chr3L 12224713 3' - 412 66 2 60.96 GTTTTTTTTTTTGTTAAATACTAATAAAGTTCCCATTTAAGCTGCATTTTGTTAAAACTTTTTTCGAAAACTTTCCATGGCCCATATATGATCTTGAATAAAATC:1 - chrX 1203735 3' - TART-B 10509 1 77.14 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGCAGCCCAGTTGCAAGTTCGACTTGTCTCAGCCAAACGAAATCGA:1 + chr2L 16458737 3' + roo 401 1 80.14 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACCTGATGTTTGCTTA:1 + chrX 16384113 3' - diver 5933 2 54.79 ACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATACAGTGCACTGTATGGATAGAAATGAGCCAAAAAGTACCAGAAATGGTACCAAAAAGTAAAATTTGCAATCTTTG:1 - chrX 3464166 3' + hopper2 1554 1 50.68 GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAAT:1 + chr2L 2276758 3' - F-element 66 1 77.14 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACCATTTAACACTTAGCTTAAATTCGATTGCATCCGCTAGATTGTTCGCGGGATGTTATCGAACTATCGATGGCTCATCGCATTT:1 + chr3L 19836546 3' - pogo 32 1 63.70 CCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATGAGAATATTTATTTAAAAAATTAGACATTGAAATGTACTGTCCTCCGTGTCG:1 + chr3L 15915842 3' - Doc 4566 1 62.86 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTCTTAGATTTGCTTATTAAGGTGGTATAGTTTTCGCATTTCGCAGGCTTTTTATTTGTTTTTTATTCTCTCCCAAAGTCTGTG:1 - chr2L 8956705 3' - pogo 32 1 56.85 AAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGGTCATGGTCAAAATTAATGAAATAAACCAATTTAAAAAGTTCAAAAACTAATTTTGCGCTTAGTTTGTCTGATAAAAGAAGACGACGA:1 - 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chr2R 12543024 3' - roo 22 2 67.81 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGCACTTGAT:1 + chr2L 9472109 3' + roo 9032 1 58.22 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAAT:1 - chrX 13531626 3' + roo 8982 2 80.14 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTTATTAGCGGCAATCGAGTTTGTATTCTCTTTCGTT:1 + chr2L 1558724 3' + 412 7496 2 57.66 GTCTATTGATCCTGATAAAGAATATATATACCTTATATGGTCGGAATGTCATCCTTCTACCTGTTACATACTTTTTAACGAATCTAGTATACCCTGGTATAATTATGTTAGTTTTAAATATTGCTATTCCCTGAGAAACCCAGGAA:1 + chr3L 21613755 3' - INE-1 87 1 65.07 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCA:1 + chr3R 24476363 3' - 412 7125 2 67.12 GTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACTTACGTAGTTATTAATTTTTGTGAGTCGAATAAATTATCCGTCAATAACAAAGACAAAGATC:1 + chr2R 3146375 3' - rover 7006 2 57.53 TCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGGGCCGGCGATAGCCTAATGTTTTGTTTGTTCTCGTGATTAGTTTGTAATTAACTTCGGGTCCCATATCGAAGATCGCCGTCCAGAGAT:1 - chr2L 5468557 3' - Doc 305 1 61.64 AGTTACATTTTGTTTACTTAATTTCTATCTTATATTATTATTTGTTTCTTATGAAATAACAGTTTAGGGATAATGTTTAGTTTACTGGCTAATGGCTATCGACTACTTTATTTACGTAAACAATTGCACACAATTACACACACACG:1 - chr2R 6611137 3' + accord2 427 1 81.51 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTT:2 + chrX 6510079 3' - jockey 4760 1 76.71 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCAGCTGTCAAGGTCGTTTGGTTGC:1 + chr3R 16181284 3' + roo 399 1 78.62 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCC:1 + chr2R 21402662 3' - mdg3 83 2 77.61 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACCGGGGAGTTTTGTTTGGCTGCAAAGTGGGATTTGCGAG:1 + chr3L 905864 3' - 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roo 8738 2 73.38 TATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCGTTCACACAAGCTGAGTAGGCTAGAAGGTCCGACAGACAGACAGACAGTGAATTAGAACGCGCGGAGGAGTCACTGAAGAGCAAACTGCGCA:1 + chr2R 2110009 3' + INE-1 509 1 61.60 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATAC:1 + chr3R 22100566 3' + 412 7483 2 82.08 ATTATATACTTGAAAATAACTTCATGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGC:1 - chr3L 22054993 3' + mdg1 6983 1 65.71 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTCATGTTTACCGAGGTCAGAATGCGAAAAGATATTAGTTCTTAAATTTTAACATCTCTTTCTCTTTTTTATACATGTATGT:1 - chr3L 14076178 3' - roo 8704 2 59.59 ATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGG:1 + chr3R 14860229 3' - BS 5052 1 56.16 ATGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACAACTAATCATTAGCTTTACATGATGTGTTTATACGAAGCAAATATCACGCAATCATATCACGATAAATTTATCACGATTTATCGCATACTAAAGTAATTTATGATAATTC:1 - 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diver 13 2 72.60 AGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTAGATCTATTATGTGTATAATGCGACCCAGTTCTATGTCTTTG:1 - chr2R 4312967 3' - gypsy 7069 2 71.92 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAGCACATGACAACATGCACATGCACACAGGTCACACTCCACACAAGCGCAATA:1 - chr2R 6632513 3' - P-element 14 1 76.03 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAAAAAGTGGACACAGAAAGGCG:1 + chr3R 10030832 3' - BS 5013 1 75.56 GGGGAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTAAAATACATACAAATTAAAATTGTTATAATTAATTTTTATTTTATTATAATGTAATTTTAATGTAATGTAATGTAATAAAAGCAATAAAAGCTTTATGATGAAATTATTTCAC:1 + chr3L 24999028 3' + INE-1 571 1 61.64 CGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTGGCAGCAGTGCGAACGAGAAAGTTCAACAATCTTTTTGGCATTGAAATTAAAAAATTCAGCATACCTTTTCACTGGAAGAGTAAAGGGTATAAGAAGAGGATTTCGCAGCGAAAGCGAT:1 - chr3R 19113903 3' - INE-1 550 1 51.37 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATTATCTGATTTGCCTGGATAGCTGAATACCTTTTTTAAACAATGCACACCAATCATGACCT:2 + chr3R 11113315 3' - 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chrX 6707730 3' - hopper 37 1 58.90 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCCAAGAAATTTGGGATTTCTTCTTATAACACGAGCACTTTAAGGATCAATTTTTTCCATTTTCAATGGACTGTACGTAGGATCTCTCACCTGTTCCAG:1 + chr2L 19068190 3' - pogo 16 1 71.94 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCCACTTATTTATTAATTACTCAACAGGCTGGAATCTCTGGCCAGA:1 - chr2R 20865676 3' - 412 78 2 73.97 ATTCCCCAGAGTTCCATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTCATTCCTGTTGTCCCGCTTGTGGGTGTATGTGTGTGCGTGTGTTGCTGTCG:1 + chr2L 2097832 3' - Porto1 4276 1 48.28 ACTTAACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGATACCCGTTACTTAGTTAATGGGAATGCGAACGCGAAATTTCGTAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGG:1 - chrX 23078696 3' + Cr1a 4237 1 54.11 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATT:1 + chr3R 24493151 3' - jockey 4742 1 70.15 AATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTG:1 - chr2R 17890868 3' + Tabor 7267 2 59.03 CAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACT:1 - chr3R 21276535 3' - BS 5059 1 58.90 AGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAG:1 - chr2L 12340753 3' + diver 6054 2 65.32 GGCCGAAAAGTTGCATTGAACCCAAGACTGCAGACACATTATTGGAGTTGTACTCAGTAATCCCACCATTAGGGTAGGATTAGTTTCTGATCCTGTTTGTTTTATAGAGGTGGAACTTGTACTAGTTAGCAATCCACCGACACTTG:1 + chr4 900194 3' + Bari2 427 1 54.11 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTCGGGAGGTATTTAGTCTAATGCTTTTCGAAGCAGCTATTACGCGTCCAAATGGATTCAGCATGAATATGTTTGGG:1 - chrX 22853364 3' - FB 46 1 51.03 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTCGACATTTCTTGTAC:1 + chr2R 8641639 3' - diver 5910 2 66.44 TAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGTACGCGTTGCCGATTGCATTTATTATTACAC:1 - chr2R 4362549 3' + gypsy 399 2 59.44 CATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGATTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCAACTTCTTTTCGAAAATCCTGTCAGTGAATAATCGATTTGGCCTTTGCTATTTAATAAACTTTTAGCTCAATGATGGAGGAGGATGGAG:1 - chr3L 26834348 3' + invader1 11 2 62.33 GTGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCACATTTCATTCCGGAGCTCTTTGCCAACACTCATAAGTATGC:1 - chr3L 17133821 3' - jockey 4748 1 64.29 CATAAATAAAAGTCTCAAGTGCGTGCACTTTGTTATTGAAAGTGTAGTCAGATGTCTTCTGATCTGCTGAAAGAAGGCTCATAAAAAATAAGCTGCATAAATCGGAAGGATTTACTCACAGCTCAAGCATTAAAAGAGAATTTATG:1 - chr3R 31563655 3' + blood 7078 2 73.97 TGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCGTAGGCCAATCGTTAATTTCACTCTCTAAAGAAGGTCATT:1 - chr2L 3294131 3' - hopper 78 1 71.23 GTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTC:1 + chr2L 16948717 3' - jockey 4741 1 72.66 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACAC:1 + chrX 12866478 3' + roo 9000 2 67.81 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAGTT:1 + chr2L 4174073 3' + roo 356 2 52.05 TTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTCCTGACATGAGACCAATA:1 - chr2R 8158746 3' - Juan 57 1 47.26 ATGACTGATTTATTCATACATACAAATTTATTTCGGAAATACATTTGAAGCCATCTTGTATTGCCAGTACTTAGCAGATATATTCCGTAATCTTCCAATGATCAGATATC:1 - chr3R 3059108 3' + Tc3 1628 1 68.18 TTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACC:1 - chr2R 11763602 3' - Tabor 60 2 66.40 AGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAATTTAATTAAAAAAGGACGCTTGAATCAATTTTTCGATTTTCTATCG:1 + chrX 13786953 3' + pogo 2031 1 67.12 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACGTTTTGTAGACGGCAGCAAACAGCCAACAAAACAACAACTATATTTCA:1 + chr3R 10266208 3' - 1360 4 2 80.65 AACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCATCATTCTGTCTTGCTTTATAGTGCAGATTGGATAAATAATGGTATGTTGAGTCACTTTTTTATTTTTTTGGTCATTTTAAGTGTATTACTTTACTTTATACAGATGAATTTATTGTAC:1 + chr3R 9160019 3' + INE-1 553 1 66.44 AAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCAACGACATATATATATATATATATATATAAATATGTTGACACCAGTAAATCTACCCGAG:1 - chrX 10161110 3' - micropia 129 4 70.43 AAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTATCTAGGGACTAGTAAAACAAAACCATAAGCCAGAGGCACAGGGTCGGAGCAACTGAGGCAAAAGATT:1 - chr3L 15468076 3' - Cr1a 4066 1 59.29 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTAATTAAGCTGTCAATCTCTTTGCAACCTAT:1 - chrX 14964570 3' + roo 9053 2 71.23 CGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATCGATTTTTCCCAAGATTTCCCGGCATGCTAACAATGTCACGGCGG:1 - chr3L 9690862 3' + invader3 193 2 59.09 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACGTCTC:1 - chr3R 21001827 3' + 412 427 2 78.05 GCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGCTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGGTGCTTATTAATTTTATAGCCCGTGATTCGATGACT:1 + chr3R 7158176 3' - F-element 123 1 42.61 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGTTCAAAACCTTTCACACTCTTGTTATGGAAGCGGACTTAGCGCTA:1 + chr3R 15702984 3' - copia 4940 2 69.29 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCATTTTCTGCAGCTGTGTTTTGCGGGAAAATAAAGGAGAAGAAAATTGCCGAAACTAAAACC:1 + chr2L 11951673 3' + pogo 2094 1 72.92 TTCCGTTGCAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTCTGCAACACGAAC:1 + chr3L 23678148 3' - Osvaldo 39 1 75.00 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATTTGTTGTTGCG:1 - chr3L 11336313 3' - blood 7043 2 59.15 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGACGACTGCTTGCAATTAGAGTTGGC:1 - chr2R 12787797 3' + 297 344 2 57.53 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTC:1 + chr2R 21402674 3' - mdg3 5335 2 71.23 TCGGGGAATTCGACTATAGCATTTTCTTTGGTTTTAATTATGTTTTATTTTATTTGACATAATCCATGAGGAACTCTGCAGGAAAGCTTAGCGAATCACTTTTTTCGCCAGTTCTTTTCGCAGTACTTGCCCGATGACAGATAAAT:1 - chrX 21564938 3' + INE-1 569 1 65.75 AGTGGATTGCGCATGGATACAGATCAGCAAAGTTTGAAATACGTGGAAAGTTTTGATCCGTGAAGGCAGTCACACAGGCTACGAGAGCCAATATCACAAGGGTCAACTTCATCTTTGGTCCTCTCGCTGCTATTCTTTGGTTCCTC:1 - chr3L 66481 3' - Quasimodo 408 2 54.79 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCATACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCAAAGTGTAACACGCA:1 + chr3L 20289148 3' - jockey 4705 1 46.58 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCC:1 + chrX 12866461 3' + roo 319 2 79.45 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATATAAGGG:1 + chr3L 19350053 3' - jockey 21 1 78.08 TTGGCCAAAAAAAGGGGGCACAGCTAAAAAAAAAATTGTTCTGTACTGCTAATTAAAATAGCCAACTATCCCCCATTCTTTTTTTTTTATTTTCAACGGTGGTGTCAGGTGTGGAAACCGGAAGAGACAAGCAA:1 - chrX 13019001 3' + Transib-N1_DM 481 1 82.09 TCTCAGGAACTGTAAAAGCGAGAAGGTTAAGATTCAGGATACAGATTCTAGAGACATAGACGCAAGTTTGTTGACCCATGTGGCCACACCCTCAATAACGCCTACAAACCGCAGAAAACTGCCCCGCCCACACTTTTGAAAAATGT:1 + chr2R 5212075 3' + INE-1 152 1 71.92 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACCTGACGGCAGATTCAGATACACCTTTCAACTTTAAACCATTGGCAACGTGCGTAAACCAATGGCAATGGACC:1 + chr2R 12240196 3' - copia 50 2 52.05 CGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTTTGCGACCCACTAGGACAACCCTTAGCACATTTTTCC:1 + chr3R 21962013 3' + G2 2837 1 69.42 GTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCACCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGA:1 + chr3L 19349975 3' - jockey 100 1 74.66 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACAA:1 + chr2L 22016022 3' - Tirant 4 2 78.10 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAGGTCATGCGAGGTCAAGATGCATCATGATAATAGACAGAAATTTGTCCTAACTTAAC:1 - chr2R 16403371 3' + copia 229 1 65.75 AGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCTGTGTATCTCTGTGTATACTTTTTATTGGCCCACT:1 - chrX 13426158 3' - BS 38 1 65.69 ATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATAAACTAACAAAGGCAACAAACATAACATAATAGCAATGATGAATTTGGAATGTGAGTAGATCTGAATTGGAAATGGTGAATGTGGCAATTTTTGGTAGATTT:1 + chr3L 4062919 3' + 1360 3370 1 62.33 CGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAATGGTCACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCAGCATTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAGAAGACGGGCTACTTCTATAAATTAAAAAAATTGTTGATCAAATATAAATA:1 - 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copia 4909 2 44.52 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTA:1 - chr3L 96531 3' + roo 315 2 80.69 GCCACGCCCACACTTTTGAAAAGTTTTCGAATTTGTTTTTTGTGTGTTTGGATTTGTTTTCTGTTTATTATTTGCCTTGCCTTAGCACGATATATTCAAATTTTTTGTTGCCTTCCGCCCCCGAGGACAGCAAATTTTTATTTGAC:1 - chr3L 17437935 3' + INE-1 251 1 55.48 TTTTGCCACTCGACTCACACTCAACAATTTTGAGTGCGGTTTTGAGCCCCATCAATATAGAAACCCATTAAAGATGTCAAAAGAAGCAGACAGAATACCTGAACGCACTTAAAACTTCTCGCCATATATCCCTCG:1 + chr3R 15156602 3' + hobo 25 1 74.81 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAATATATATATATATATATTAGTATATATAGAGCGATGTGACCAATACCTATACCATAGCCATCAT:1 + chr3R 11493236 3' + 297 6924 2 67.12 CTCTAGAGCCACGGCAAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATC:1 + chrY 311344 3' - 1360 55 1 56.16 AATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGG:1 + chr3R 26246901 3' + 1731 4563 1 58.22 ATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGATTATAATTCCAATTCGGTTATCCAATAATAAGTGGAAGTGAAATACGGGGCTTGGTGATAAGCTTTTGCGCTCTCTCGCACTATAATT:1 - chr2R 22312259 3' + 297 484 1 71.92 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACACGCGGAAATAAAAACCGAAGGCAAATCATAAGCTGTTTTTTTTTATGTTTTAGAAACAATATTCACAGGGAAAGAAATTCAAGAATGCAGAAACAAATCATTAAGA:2 - chr2L 12319193 3' + copia 243 1 73.29 AAAAAAAGAAAATTTGAAAGAACAAGACGCCATGAATTAACGTATTAATTTGAATATTTTAATGGGTTAGCGCCAGAAGTTTTAGTGTTCAATAACATACATGGTGCTGTGTTGCAAAATGTATATTTCTATACAACCAAGCTGGT:1 + chr2R 15339624 3' - FB 174 1 80.82 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGCCTTTAATCATCTGATTTTTTTCCAGCGTTACATTCCAAAGTTTAACATCTC:1 - chr2L 76001 3' - roo 8687 2 73.97 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGACCCACTTGGATTTG:1 + chrX 5150402 3' + roo 9032 1 58.22 TTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTAC:1 - chr2R 5214961 3' - F-element 78 1 63.70 AGAGGGATCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGC:1 + chr3L 25232907 3' - GATE 35 2 50.00 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAG:1 - chr3L 17175129 3' - 412 74 2 66.44 AAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGCTGCTTGATATTCGAAAATGTAGCTCCTGCGTGTATA:1 - chr3R 2555508 3' + Bari1 1623 1 74.66 GTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGGCATATATTGTAAAAATAATGTAATTACA:1 + chr3L 23069269 3' - Stalker 226 4 80.14 AGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGCACATAACTCAGTTTTGTAGAGCTACCAAAAAATGTTCTATTTTTTAAGATTTTTAAGGATACTTACGAAATTATTTCAGTGCACATCAATTGCTAATATTAGT:1 + chr2L 5601697 3' - mdg3 5269 2 71.23 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCCTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTAT:1 - chr2L 2031035 3' - 412 70 2 65.07 AAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAATACTATTGACAACTTGCATGCATATTTTCTTTTGCTTTAAGCTTTGTATAAAAAGTAAATGTACTTCAGTAAGCCATAATATTGATTTGTCACCAAAATTTT:1 + chr3R 20283279 3' + Bari1 1468 1 63.01 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACG:1 + chr2L 17240302 3' - hopper 27 1 58.42 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTGATTTTCTTG:1 - chr3L 96465 3' + roo 9044 1 66.44 CCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTAAGCGAAACCGAAATCGAGACGAGCATCAAGG:1 - chr3R 18821030 3' - hobo 230 1 65.59 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAATTTAATTAAAAAAGGACGCTTGAATCAATTTTTCGATTTTCTATCGCACCATGCTTTG:1 + chrX 13786965 3' + pogo 2056 1 57.89 GAGGAATCAATCGCTCTGTTGAAATTCACATGATCAATTTTCTCTTAGAAAATAATTGCTAAAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAACGAATTCTGACTTACTAGCTATTTGGGAAAAGATTAATGC:1 + chr3L 14951351 3' - transib2 2377 1 78.77 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGCATGTCTGCTATCATTTAGTGAAGCAAACGAAATGGAATCG:1 - chr3R 12598993 3' - 412 32 2 62.33 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAAT:1 - chr3R 10684743 3' + roo 336 2 67.81 GAACCCGAAAGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTCCAAATGGTGTCAAGTTCTTAAGCCACCAGGGCCCCGTAAGGCATCACTTGCTACTCTTAG:1 - chr2L 21911072 3' + Doc3-element 419 1 70.48 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGAAAGCACTATCGTAGAGATGGGGCGCCAGGGCTTGCGATAGCCCAATCGATATATCGTATATCAGCTGGTGTG:1 + chrX 14826216 3' - P-element 26 1 60.16 ATAATTAAAATATTTTATATTTATCTAGCTCTATATGAGATATATTAATAAATATTTCTAACTAGAGCAGGGTCATAAATTTACGTAAGTATAGGCGTTATGATTTACATATTAATAATAAATTTTCCGTTCAATATGCTGATTTT:1 - chr2L 11462968 3' + NOF 345 1 29.45 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAAAAATAATTTATGATTTTTG:1 - chr3L 10133504 3' - 412 65 2 60.96 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACAATGACCGCTGATAATACACACCCATTTACATGACTACACTTGTGGAGCCCAATCTGCGTATTATAATAGAAGTTA:1 + chr2L 3294263 3' + hopper 1402 1 73.97 TAAGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATGATTATTTAGTTCATTATTTTCTAGGGCTAG:1 + chr3L 26817435 3' - rover 7040 2 76.55 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAATTTAATAGAATTTATTTGTTTAG:1 - chrX 13531604 3' + roo 340 2 65.07 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAAT:1 - chr3R 31490946 3' + roo 330 2 68.49 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGCCATAA:1 - chr3L 27350449 3' + pogo 2063 1 58.22 ACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAACAAAAGACAGCCGCGCATTTTTCGCAACTG:1 + chr3R 20242456 3' + Idefix 41 2 77.17 CACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGAGCAATTTTTTATGGGATTCCTATGCTTGATCTCCACTCCCCCGCGAATTGTTCTATAATTTAT:2 - chr3L 2724951 3' - Ivk 34 1 62.33 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAGCTGTTAA:1 + chr2R 6632661 3' + P-element 2835 1 47.86 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCATTGTTGTTGCTGCCGAGCGGAATTGTGTGCGGGTATATAGG:1 - 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jockey 4668 1 56.85 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGGCCACTTGAGAAAATCAGTGCTTCGATACATTTCGTAGCG:1 - chr3L 16580277 3' + 412 414 2 71.23 AATTTTAAATATAAAAAATATCAGCTTTAATTAACACATTAACTTACAATAAAGTGTATGTGAATAGGATAATATACCCAAGGAGCCAGCGAAATGCATTTGAACAAGGAGCAAAACTGAGAACATTACCGGATATCCTTCCCAG:1 - chr2L 17104610 3' + transib4 2576 1 26.90 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTAC:1 - chr3R 22100538 3' - 412 7139 2 76.60 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGGTCATGCAATGAGGCAACTAATTGAGAGGCCAAACAAAGCATGGAATCAAAGCCTTTGCCACG:1 + chr2R 20865762 3' + 412 440 2 55.71 GCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGGGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGTAGAGCTACATATCAAGATAATAATAAAT:1 + chr2R 10916655 3' - GATE 48 3 75.00 GGTCACTATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTCGTTATCAGTCATTTACTATCATGTGTATAATACTAAT:1 - chr2L 15945729 3' - X-element 104 1 73.97 CGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTATAATATATATACAACTGGTTTTGGCAATGAAAAAAACTACGTCTAG:1 - chr2R 4628385 3' + Transpac 5171 2 67.67 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAATTCTTTAGTTGTCAACTAGTAATCAACACATTTAAATG:1 + chr3R 5453698 3' - 412 7136 2 80.14 AGTAGTTCCTCCCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTTCAAAGCTATTAGCATGTCGATGCCTCAACCTGAGCGGATGTCCATGTCCTCTCACC:1 - chr2R 13688960 3' - Osvaldo 28 1 55.81 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGGAGAAGGGAAATGTACTGATCAAATAGTATTAGTAACACTAATAGTAATATTTAAAATCTTAA:1 - chr3R 20743966 3' + roo 9014 2 59.59 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGCCTCCAAATGGATTCCGTGGAAGCCGTTTTGCCTCTTTTAGCCAAATGATGCGTAGGCCA:1 + chr2L 3659169 3' + 412 7486 2 56.85 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTGCTGTGGCAA:1 + chr2L 12340829 3' - diver 5928 2 50.83 TTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTGCTGAAGTGCTAGTCATGCGCAGTGTTCGACATAATTTTTTTTGTTTTTGCTGATTTTGTTTGACATGTAGTAC:1 - chrX 14997293 3' + copia 77 2 56.55 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATACTTGCCCTTTCATTTATTTGAATTATAGAATAGAAAATAGCTAAAAGCACGAAC:1 + chrX 12139071 3' - roo 25 2 70.55 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGTTCGCCGTGAGAGATGCGATTTTTTTTCAGTGAACTGATTTA:1 + chrX 958034 3' + roo 8995 2 73.97 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAACACACTGAAATATTAGCACCTCGGACTGAATGCATAAATTAAAGTGAACTTTTATTTTTGGGGGAACAAAACAGGAAGTCATGGGCATTCTGATAGAGCACGCAACGCA:1 + chr3L 16358806 3' + 412 7536 2 74.66 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGTACTTAAATAATTTAAAATATATATTCTCTTTTTAGGCTAAAGTTACACTGATTTCAAGGATTAAAAATATTTCATTTTATATTTTTTTTTCTA:1 - chrX 18405644 3' + blood 7362 2 36.99 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCACA:1 + chr3R 16181203 3' + roo 332 2 76.92 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAACATCGTGCTCCTAGGTCTC:1 + chr2R 558214 3' + copia 242 1 73.08 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTAAATGTTTAAAAACATTTAAACCAAAACTGCATAAAATCTATGTGTGACCCACAGTCTAAGAAATTCTGTAGAGCTCGTAAGTGATGAGT:1 + chr2R 8396038 3' - 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pogo 55 1 65.83 GTGTGTGTGTGTGTTCTTGTGTGTCTGTGTATGTGCCTATGACGATATAGGATCGAAGGTGGGTGCTGTGGTCGAGTGCTGGGTATTGGTGTGCTGGGGTGTTGGTGTGTTACGAATAGA:1 + chr3R 29499439 3' - gypsy3 418 1 65.00 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTATATCGCGATTAAGATAATCAACTGCTCTGCTCTGATTGCGGAAGCAAACGTGGTAAAGATTTCGAAAAGTGGATGGTCACTGATAAATTATCCAATCTCTAT:1 - chr3R 27478446 3' - hobo 18 1 67.81 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGTATTCA:1 - chr2R 5070906 3' - Tirant 8107 1 34.25 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTC:1 - chr2R 16891835 3' + hobo 2902 1 52.17 TTTTTTTTTTGTTGTATATTTTTTTTTTGTTGCTGCCTTTGGTTTGCATTTAAAAAGTTACGAACCCGCAAAAGTGCGCTAATC:1 - chr2L 5599999 3' - TART-A 13403 1 88.10 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTT:1 + chr3R 16181243 3' + roo 9021 2 51.72 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGCCATAAACAG:1 - 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accord 184 2 78.99 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTAACACGAGAAGGATAAGTGTATGGATGGCAATCAATTGAGAAAATATAAATATTTATAATAATAAGTGATTTGTATACGA:1 - chrX 16902234 3' + I-element 5313 1 56.85 AATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTTCCAAAATATTATAAGCCTTATGGCATCAGCTTGCTGAATTACCCAAAAGCAAACTAACGAAA:1 + chr2L 18539844 3' - 297 360 2 54.35 GAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGCATATGAAATTGTCTGTCAAAATTTTGCACGAGTCCGAGCCAAAAATAATATATTTTTTATGGAACTAAG:1 - chr3R 11027492 3' - F-element 4483 1 54.79 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAAT:1 - chr2R 19554923 3' - pogo 58 1 57.53 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCA:1 - chr3L 17890727 3' - 412 64 2 60.27 CCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAATTCAATAAATTTGCACAGAATTTTTCAACAATGAAAACAAATTTTCGCTCTTTCGCTGCTTGCATTC:1 - chr3L 1404992 3' + Ivk 5324 1 60.27 AATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTCTTACAAGTGCTCTATGAA:1 - chr3L 24291983 3' - rover 75 2 71.03 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAAGCGCATACTTGTATCCCAAAGATACATATTTGTGTGGGCTGTTTGCATACCTCCACCTAATCCCACTGGCAATAAGTGCG:1 - chr3R 20168970 3' + hopper 1412 2 60.00 AGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCATACTTTCATTTGACTTTGGTCACGATACAAAACGTT:1 + chr3R 17897193 3' + hopper 1334 1 69.86 TACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTAAACAGTTTTCTAAATATCTCACATCAAAGATTTTTGCTGAAGGAGCGCTAACCTGGTG:1 - chr3R 4562700 3' + copia 4976 2 71.11 GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCATGATGTAGTGAATACGACTTAAAGCGCTTGTGTTTCCGTCTCTCTTTTCGTGGCACGCTTCGATTACCGCACTCGGAGGCGGCTGG:1 - chr2L 9668155 3' + 1360 3385 2 75.44 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATCAGTCAG:1 - chr3L 17175096 3' - 412 7081 2 63.16 ATTATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGCAAATATGCCAAAGCTTGCAGAGACAACAAACAGGAAGTACGCATTTCCTGCACTTGAGAAA:1 - chr2L 12212225 3' + gypsy4 398 1 57.02 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTT:1 - chr3L 17890731 3' - 412 62 2 61.43 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAATCCGATTCCGACTTATTTTTA:1 - chr3R 31490912 3' + roo 9029 1 55.86 CAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGTTTTGGCTATTTCAAATCTATTATCAAATAATAATAACGTTAAGGGGAAGAAAGATTTTTGTCACTATCATTTAGTCTTAAGCTGATA:1 - chr3R 3788269 3' - 1360 388 1 70.55 TGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGCTTTTACTAATCAGGTGTGATAGGTTCAACAAGTAGGACGGTATTTTGGTAGTTGATGAA:1 + chr3L 24104319 3' - Tirant 8116 2 47.37 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTG:1 - chr2L 17210264 3' + jockey 4930 1 60.96 AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGTAATTCGTGTGGAAATACAAATAT:1 - chr3R 13582166 3' - BS 5014 1 71.23 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAATTTCACAGATTAATGCGCACACATTTCAACGCCAAAG:1 - chr2R 17890824 3' + Tabor 7309 2 72.60 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAATTTGCTCTCTCATGCTCA:1 + chr3R 23765446 3' - roo 8735 2 67.12 CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCATGATGTAGTGAATACGACTTAAAGCGCTTGTGTTTCCGTCTCTCTTTTCGTGGCACGCTTCGATTACCGCACTCGGAGGCGGCTGGGTAA:1 - chr2L 9668151 3' + 1360 3384 2 73.95 TATAATTATGATAATCGTTGTCAACCCTAGAGCCGAGTGTCCGCGTGCCGTGTGGAAAATCAAGTTATTAATGTGTACCTTGTTATTTTTCTAAACGCGCTGATGTGGCGATCCGATTTAAGGAAGTGCAGGAACTCCG:1 + chr3R 5182706 3' - rooA 7149 1 65.47 AGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACATCTCCGATATTTTGCGGTTAAGTGGGGGGAGTGGTTCCGGGGGCCAGCCCCTCCTCCACTTGGAGG:1 + chrX 19024196 3' + I-element 5121 1 54.79 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAACCCTGACTTCAAAG:1 - chr2R 11489155 3' + mdg1 7418 2 57.53 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTG:1 - chrX 2762602 3' + roo 327 2 75.36 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGTCGGTCATCTCAGCGGCTGCTGCCAAA:1 + chr3R 12599104 3' + 412 7499 2 62.83 GGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACAC:1 - chr3R 20175714 3' - hopper 80 1 73.29 CATAAGCTTCCCTTTTAAAGGGAGGGAAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATTTTTGCTTACATGTCCTTGATTCGTTGATTAAATACTAATGCGTTACCAGTTATACTATACTTTTGTATATTAAGCATGACATA:1 - chr2R 7550340 3' + rover 6925 1 50.00 ATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTATGTGTGGGTGGGTGGAAAAGAGGCAA:2 - chr3R 15711772 3' + diver 162 2 58.90 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATTTTTGTTAATAAATAAAATTATGGTAACGTCA:1 + chr2L 76186 3' + roo 394 1 76.03 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTGTATCGATTTGTATTTAAACATTTAAAACATATGATCAACGTTCCATTCTTTTCGGTTATGGGGATCATTTGTTGGGTACTGCATGACTATTCATTCGCT:1 + chr3R 24306933 3' + opus 483 2 44.52 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAAAAAGTGGACACAGAAAGGCGA:1 + chr3R 10030833 3' - BS 5021 1 71.53 ACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTG:2 - chr3L 17707829 3' - Doc 83 1 67.81 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACTTTTGCGGTCCACAAAGACCGTGTAATTACACAG:1 + chr3R 27794881 3' + roo 355 2 54.86 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAACAAAAAAATCAATAGCCAAAATGTTGCATATCTTAACAGGCTATACCATATATTATGGCTGACTAGGTCAATCCCAAAAACTGAGTCCAGAAAAGGGAATATTTAAA:1 + chr3R 22249251 3' + jockey 4982 1 67.12 AACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATTTATTGGGTTGAATACTTTTTTCCTTTTTGTTCATTGCCTCTGCGCGTTCTCACTTGCGGAC:1 + chr3R 845839 3' - FB 60 1 59.59 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAGTTGCAGATACTTTTGCTATGATTTAA:1 + chr2L 4174097 3' + roo 9043 1 65.75 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCT:1 - chr3R 31490936 3' + roo 9004 2 61.64 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCCGGTTTCGTCGTCTTTTTGCTGAGATTT:1 + chr2L 14248134 3' - I-element 22 1 66.42 GGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCC:1 - chr2L 18279920 3' - gypsy5 6948 2 55.56 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTA:1 + chrX 12525981 3' - roo 73 2 72.79 GCTCGGCTCTCAGTCGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGC:1 - chr3L 25232763 3' + accord2 172 2 50.00 ATAAGAAGTGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAAATGCTATTATAATATTTATACTTACACAAATAAATATTGTCTAAAACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCGGCAAGAT:1 - chrX 22576289 3' + Burdock 6288 2 48.63 GTGTTGCAGTTGTAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAAT:1 + chr3R 9160747 3' + copia 172 2 69.66 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATG:2 + chr3R 16181260 3' + roo 9037 1 61.64 GAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGGGATAAGATATTAAGATATTATTAACAGTCCAAGTATTTTAGAAGTCAAAAATTTGAAGATCAAAGAT:1 - chr2L 23372940 3' - Idefix 7054 2 53.42 ACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTTTTGTTATTTTTGGTCCCCGAGCCCCAGTGTTTTTCCCCATTCGCCATTCTATTT:1 - chrX 19435541 3' + accord 213 2 61.27 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCATATCAGAAAGCTATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATG:1 + chr3R 10472790 3' + mdg1 380 2 51.20 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCCAAAATATTTGAATTATCAGTGTGGCCATACTGCGCAAC:1 - chr3R 11750132 3' + Tabor 464 2 70.55 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATATCTTAATATATTTGGGTAATAAATTAGATTTACTTTATATTAAGCATATGGTATGCAGTAGGCACTTTCCTTTTAGCATTTATGAAAGCACAATAAAGGACTTTAAGCCATTAAG:1 - chr3R 25768718 3' + copia 250 1 72.60 AACTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAACGGTTGAACTAGGACATTCAAGTACCCAA:1 + chr3L 23042147 3' + pogo 2051 1 53.42 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTCACTAAGTCTAACTCGCCAACGTTGTAGAACAAGAACAACAAATATAACATCATGAATGTTGCAACTTTGACACGCGACGCAGACGTTGGCCC:1 + chr2L 14711314 3' - 412 27 2 39.04 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATA:1 + chr2L 76119 3' + roo 8990 2 79.45 GCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCTTCGGATGTAAAACAGGCCCCCCTATCTGATACTATACATTTCGACCTGCTATATGATCTAAAATAATCCTTTAACGCTAGAATCACTTCCTTTGTGTTTGTGGTTTTTGTT:1 - chr3L 1718190 3' - micropia 5184 1 78.08 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGACACTTAGTAAAAAATAAAAAATCACAGTTTTTATGGGTTTTGCTT:1 - chr2R 9873636 3' - roo 8740 2 76.71 GTGTGTGTGTGTGTGTTGGTGTCCTGGCGGGAAAACGGGTGAAAGGGGGGTGTTGCCAAAGGACACGCC:1 + chr3L 10189568 3' - gypsy3 420 1 89.86 AAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCCAAAATATTTGAATTATCAGTGTGGCCATACTGCGCAACTTTAGTCTACGA:1 - chr3R 11750120 3' + Tabor 476 2 78.77 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTGCCCAAGAAAGTGCAGCACACTCTTTGCCACTTGCCAGAAA:1 - chr2L 15987925 3' + roo 397 1 76.71 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCT:1 + chr2R 5923026 3' - jockey 4696 1 53.40 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGCACGAATGTCG:1 - chr2L 9237491 3' - blood 7063 2 55.71 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAG:1 - chr2L 16884804 3' - pogo 56 1 61.87 GAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCCAACAGTCGATTTTTTTTGTGTGCTTAAAGTTAGGTGTACAGCTCCTCTCCATCGGG:1 + chr3R 17807659 3' - Doc 281 1 62.00 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAATCAACCCGCAACAACAATAAAATTCCCTCAAAAAAAAAAACAAGCATAGCAATAAACTCAGAAATACCGCATTTTAAATCAATGAATATTT:1 - chrX 16855198 3' - roo 8694 2 65.07 GGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACCAAATTATTTATCATTCGAGTATCATTTCAGCCCGCATTAATCAACAAGGGTTAATTGAATCACACA:1 - chr2L 8168907 3' - FB 54 1 56.55 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAG:1 - chrX 2762568 3' + roo 9017 2 53.42 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACCCGTTGCTCTGATTGACAGG:1 - chr3R 31490950 3' + roo 9001 2 68.89 GATTAGTCTTTTACATTTCTATCGATTTCTAAAAAAAAACTTTTTGCCAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTCCGACACCCACATTTGTAAAAAATTGTTATTATTTAACTTACACATTTCTAAACATTTCATGGACTGTACTCTT:1 + chr4 55729 3' + INE-1 296 1 68.49 AACAGTTTAAAGTATTTCCAATAAACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATACAGTGCACTGTATGGATAGAAATGAGCCAACAAGTACCAGAAAT:1 - chrX 3464196 3' + hopper2 1524 2 69.86 TGTCCATGAATGCTGATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAGGTCCCGTGTAAGGAGGCTCGAGTGGTACCGAGGAGCAGGAGCAGGAGCTAGCCGTGCATTTC:1 - chrX 18606302 3' - Chimpo 4050 1 68.33 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCTTTTTTAAATACTTGATATGCCTCTTGGGCGTGGGAATTAATCCAGTACGTGTTGAGG:1 + chr3L 15612800 3' + roo 9007 2 62.33 GCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCATTTTAGTCCTAAAGTTTTAACACATTCATTTTCGATAATATTGAGAACCTTATTGTCCCCTGTGTCCTCCAC:1 - 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roo 8736 2 67.12 ATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTATCCCTTTTTGTGCGTTACGTTTCTTTGCCGTTTGTAAATAAATCTGCGGGAAATGTTATAATTATGCAACCGACAGTCGAGATGCCGATGGAAGAGCCGCTG:1 - chr2R 3526003 3' + Cr1a 179 1 39.73 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATTCACTTTCATTTTCATTACACAAATG:1 + chrX 12866509 3' + roo 9031 1 57.53 GCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCAATATAGAAAACAGAACAGAAACGAGAAAATGAATATAATGTAAATAATATTTAGTGATTTCGAGGGATTTCTAAAGATTGCCAGGGGAAAGGCTCAGGGAAAAAAGAGGGTAAGAGGGTA:1 + chr3L 20906571 3' - Cr1a 4377 1 50.00 CTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTCGTTATCAGTCGTTTACTATCATGTGTATAATACTAATTTAAAGGACATTGTGTAAGTGAAGATGATTTTTT:1 - chr2L 15945695 3' - X-element 70 1 50.68 ATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAATCATTTATAGTAAAATCGGAATAAAAAAAAAGGGAAAGAATACAACG:1 + chr2R 17331022 3' + roo 8746 2 66.67 AAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTAGATCTAGAACGCCTTCTCTCATTTTGTTCCCTTGGCC:1 + chr3R 24815478 3' + 297 204 2 73.97 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAGCTTTTCTCTATTTGGACCGTGGCTTAGATATCTTGCCTTAAAATTTTTCGCCTTTCCTTTTTTTTTTCACATTTTATTGA:1 - 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hopper 77 1 69.86 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGG:1 - chr3L 11336367 3' - blood 74 2 76.92 TAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCGTTTGCGCTTACTACCTTCGTGAAT:1 + chr2L 22150646 3' - S-element 62 1 83.10 GTTTTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTCAATTAGCGCGAAATCCATATCAAGATGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAAGCATAGAGTGTGGTTCTTGGAAATCGAAATACAAATCGTTTG:1 - chr3R 27666831 3' + invader2 4631 1 71.23 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAAAAGACTTACGAAGAATCACTTCGTG:1 + chr2L 9485718 3' - 412 27 2 56.85 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAATCCG:1 - chr3R 31490929 3' + roo 347 2 56.85 TGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTGAAAATAGTATTTGAACTTTTTCTAAATTTTTTTCATTCCATATATTCTTCATAAACCTCCTGTGATTTGTGTACCCTATCTTAGATGTGC:1 + chr2L 12658614 3' - Quasimodo 20 2 47.59 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAATGGACTGCTTGTGTCAGTTTGACAACCACTGTGCGTGGCAATAACCAAAGCCGCGCTCAAATGAAAACGCAATAGGC:1 + chr2L 4998219 3' - FB 36 1 59.12 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCCGGTTTCGTCGTCTTTT:1 + chr2L 14248123 3' - I-element 4 1 74.29 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATCGCTAATTCGGAGTGAGAACCTGACGAAATGGAGAACGTCGGGAGAGAGATTCTTAACGAAGGTCAAGAGAAAACGAATTCTCAATAATATGTTATGATAGTG:1 - chr2R 7665698 3' - Transpac 4934 2 76.03 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTA:1 - chrX 14964612 3' + roo 9011 2 63.70 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGAGGTATGGGTG:1 + chr3R 20175777 3' + hopper 1392 1 56.18 TATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTACCTTATTACACAAACACTAAGTACCTACATATAAAAGCAGGCAGAGTACAAATAAAAGCCTGCTTATAAGGAATTTGTAATGCAAATGCTA:1 - chr3R 31444955 3' + Juan 3854 1 69.18 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAGCTGTTAAAACCCT:1 + chr2R 6632667 3' + P-element 2835 1 50.00 ACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGAGCAATTTTTTATGGGATTCCTATGCTTGATC:1 - chr3L 2724983 3' - Ivk 66 1 56.85 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCCTCAACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACGTACTTGACGCGTTGTTCCTGCCGCTTCCTTT:1 + chr2R 12543186 3' + roo 9033 1 58.22 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGGTGGACGCCATGTGGGGCCTGTTGTGGGTGCAGTTGCACTATGAGTT:1 - chr3R 17902551 3' - hobo 52 1 60.66 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGGCAGGCAGCGGGGGCAGAGGTTAGCCATAAATA:1 - chrX 6417695 3' - Quasimodo 37 6 76.52 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTTTTTGCACAATGCATAAGAGGTCA:1 + chr2R 5674773 3' - S-element 33 2 66.44 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCATTGGCCGCCGCTGCCATCTTGTTCCAGAGCTC:1 + chr2R 6842883 3' + roo 393 1 70.16 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGACATGTTACTATATATATATATATATTCTTTTTTATATAATCTTAATATTGTTAGTGTTGTTCTTAGTTTGATGTGTTTTTGTGTTTGATG:1 + chrX 22252864 3' - diver 5920 2 63.45 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATATCTTAATATATTTGGGTAATAAATTAGATTTACTTTATATTAAGCATATGGTATGCAGTAGGCACTT:1 - chr3R 25768766 3' + copia 202 2 55.48 TAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGTATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGC:1 + chr2L 22224607 3' + Rt1c 5408 1 56.83 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGCGTATATGAGCTTGAAGAGGAATATAGGGAAACCTTCGACTTGTATGCAGGTCCGTTATTTCATTGCTCTACA:1 - chrX 21554356 3' + 297 6930 2 55.48 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAAC:1 - chr2R 11489168 3' + mdg1 7406 2 55.86 CAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGCGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGG:1 + chr3R 27822261 3' - I-element 72 1 76.19 GTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTTTCTTGTTTATTTTAAAGAGGGTCATGATAGTTTGCAGTTTCGGGCATTACAAGATTCCCAAACAA:1 - chrX 20344051 3' + INE-1 125 1 71.92 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATTTCAC:1 - chr3L 25406604 3' + 1360 3379 2 66.90 CCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACCCAATTAATAAACTATAACCACCAGTTGGGTGGGTTATGTATGTACATAAAAATATTTACTGTTCACGTTTCTTCTTTTCAGATTTGGAAGCGGTTTAAATATGATCGCAC:1 + chr2R 9874921 3' + S-element 407 1 52.86 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCATAGGCCACAAATTAATCCCATCCAACGGAAGATCCTGCGGCAA:1 - chr3L 17890677 3' - 412 14 2 76.71 GTTGTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAAATTTGTTTTTTATTTCATTTCGTTTATTTAGAATGTGCTGTTTTCATGTAAGTTTTCGTCAACAACGAGATCCAAGACCAAATATTAATGTTGTCAAAAGTAAGTTCTTTTGGATT:1 - chr2R 3523079 3' - Porto1 4188 1 56.85 ACTTCAGGGGGCTCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACGATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAAATAATAGCACTGCGAGGTAGATAAGATTTTTCGCATTGATATTGTCTCGCGCCATA:1 - chr3R 24259356 3' + baggins 5367 1 64.14 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGTTAGCACCAATAAAATATTCCAATGTGATCCAATGACGGTTTTCATGTGTTCCTCATAGCACCCTG:1 + chr2L 12319375 3' - copia 4895 2 66.44 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTATTCAGCAAGATTTCTCTCTTCGGTTGCACTTGAAATTGCATTTTACCCCCTTCTTTGT:1 + chr3L 14553254 3' - roo 10 2 79.45 CATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACGAGCGATCTGTCTGTAGACCACACCAAGTTCAGTTATGAATCAGGAATAGATCAGGAATATTTACACGCACACTCACAACTGCATCCACCCACCCACACTGG:1 - chr2L 2337661 3' + mdg1 240 2 69.18 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAGTCCAGTTT:1 + chr3L 7962288 3' - blood 7062 2 56.39 ACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTA:1 - chr2R 2492932 3' + invader2 5041 2 61.64 CTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTTTCAAAAA:1 - chr3R 18346601 3' + INE-1 547 1 54.79 AATAAAACAACAATTTTACTATATATATAAAAATGTAGAAAACTTTTGACATGTGCACGAACACAAGTCATCTGCTATAGTATGATGCACTATTCAGGATGCCG:1 - chr2L 5202467 3' + 297 395 1 77.88 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAGAAGTAAAAAATGTGTCAGGCCGAGGAACGATTCAAATG:2 + chr3L 22978683 3' + 1360 3379 2 78.08 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTT:1 - chr2R 11057273 3' - pogo 55 1 69.67 TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCGGGTGGCACTGCCGACATCT:1 - chrX 1287780 3' - jockey 4822 1 53.10 GCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAAAGATATTTTTGACATTATTATTAAATGGAGAAAATGGGAATTTGTTGTTTCGGCAGACATTGAAAAGATGTACCGACAAATTAAAATAGATAATAATGATCAAAAATAT:1 + chr3R 19445421 3' + Quasimodo 7045 2 79.31 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAATTTCA:1 - chr2R 17890856 3' + Tabor 438 2 51.37 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCAT:1 + chr3L 27415323 3' - transib2 39 1 54.55 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCGATGGGGACGCTCCATCTACGCATATCTTACGCACATATTTGTGG:1 - chr2R 11133509 3' + roo 9044 1 67.12 GATATATAAGATATATACAAGAATATATTTAAAAAATGTTAAATCGTTATAATTGCATTTCCGAAAACATATGTTACTTGTATAGCAATCATTTCCAACAATGCGACTTAATTTAGTTTTTTTTTAAGTG:1 + chrX 10438227 3' + 412 7320 2 69.23 AGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTCTCTATATGACTGCAAGAAAAAATCTAACGAACTAACACAACTTTATTTATAAATTATTTGTATAT:1 - chr2L 11574786 3' - Max-element 33 2 62.33 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACT:1 + chr3R 27794848 3' + roo 320 2 78.08 ATCCAATTATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCCGGCATTAATTAAAATTTGCTTCAAATTATTTCCCAGCGTTTTCGTTTTTTGTTTGTGTTAACCAGC:1 + chr3R 27859285 3' - 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hobo 4 1 76.42 TTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGG:1 + chr3R 26520446 3' - FB 70 1 72.87 AAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATCCCACATTTTTGTTTCTTCGGCTGCCATTTAGCTAAAATATTTCATATCCGAATTGCATCGCCGTCTCGAGCCTTCGCTCCTTCGTCTTCGT:1 + chr2L 21796580 3' + pogo 1869 1 66.44 AATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAATAAATAAATAGTTACGTGATGATGTTACCCTGACTGAGTCAGTGACTGTGA:1 - chr2L 7825218 3' + I-element 5281 1 68.49 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAATATTGTAGTTTCTGATAATACTGAGCATTTTTGTTTTCTCTCGGTAGGTCAAACAGAAGGACCTCAGCT:1 - chr2R 5868264 3' + pogo 2053 1 58.22 AAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCGCAACCGCAACATTTCCCAGAGTTTCCTAGAATTCTCTA:1 + chr3L 11400052 3' - Quasimodo 17 2 73.29 ATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTTAATTTTCTGTGACCCACAACATCTAGACTATGAAGTCAGACTTCGTCAGAGCTTACGACCAATGTGCAAATGAGCTGATTTTCTATGC:1 + chr2R 12265268 3' - jockey 4555 1 61.64 AATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCAAGCTCCGCCTTGCCATCCACCCCCCCTC:1 - chrX 11776286 3' + roo 8621 1 80.14 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGGGTTCAAGAAAAAGCTTACCTAAGGAGGCGATAAAGTT:1 + chr3R 17656490 3' - mdg3 5296 2 53.79 ACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATAATTTTTCAACTTTTCCCGTCCGAGTTCGAAACCAAACTGTCCAACACA:1 + chr2L 19363213 3' + BS 4950 1 66.44 CTTACACGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATATGACCAAGAAATTATTCGGAATGGCCAACGACGGCAGCATCCCAGAAAATTCAGTCA:1 - chr2L 17903067 3' - I-element 45 1 53.54 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAG:1 + chr3L 7962269 3' - blood 76 2 71.94 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGGTCATGCAATGAGGCAACTAATTGAGAGGCCAAACAAAGCATGGAATCAAAGC:1 + chr2R 20865752 3' + 412 7477 2 64.38 GATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTGATGTAGTTCGTTCTTTTTGGTTCAGTTTTCCAAGCTACAAGTTGGTCTGCGGTCGAAAGCTTTTGCGATATATCGTGATA:1 - 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blood 25 2 69.18 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAAT:1 + chr2L 9485675 3' - 412 70 2 64.38 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCCATTTAAGACACCCA:1 + chr2L 17250846 3' + opus 464 2 53.42 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGCATGCATGTGCTTTTAGCCTATTCTT:1 - chr2R 19554877 3' - pogo 12 1 76.03 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATACAATACATATGCGCTGGACCATTCTGTGTAACAAATCGCTTTGATGAAAGCTGTCACTTGCAACAGTTGTGCCAG:1 + chr2R 12787934 3' - 297 7 2 69.30 ATATGTAAATATGTATGTACATATGAGCATTAAGTTATATCAGTTACATATATGTAACTAGTAACTTTTTTTTACTCTTACTTCTTGTTATTACACTAATTGTTGTTTATTTGTGTTTTTACATTTACCAGACACTTCTAGTCGCT:1 - chr3R 21593428 3' + G3 4507 1 64.38 TATTGTGATTATGTATCGTGTATTGTGTTTGTGTTAAAAAAAACAAAAAACCACATTTTGTGCCTATTATATCGTTTCCATCTACGAGGATCCCGTTCAGCCCCAGCAGGCCGCTTCCGTGGTAGAGAAACTTGGAG:1 - chr2L 5973603 3' + Stalker2 474 1 49.64 GTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTTCCCTCCCTTTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCCACTCCTTCTTTTGCTTTTGGTAGAGTCATTTTAGTGTATTTAATGATAATTTTAATTTTAGT:1 + chr3L 26658802 3' - rover 31 2 63.70 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCAGGCGTCGAACTCGGAGCAGAGGGCTGTGTGGTGGCCAGTTGCTTCTGGGGAATGGGTCGGAGCTTTTACTTATAAAGCTTTTTGCTGTTTGGAGCTTAAATATAATTGAA:1 - chr3R 8261993 3' - Tirant 14 2 42.07 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTACTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGCAT:1 + chr3L 16580335 3' - 412 7139 2 74.66 GGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAACCGCAAACGGTGACGGGCGTGCTCACGGGCAGGATGTTCGTCTCCTC:1 + chrX 6372693 3' + Quasimodo 401 2 67.12 TAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATTCTGGTTATATGAGGCATTTGTTCTCATTTCTTTCTGGGGTGGTTGACTTACGTTT:1 - chr2L 22780838 3' + HMS-Beagle2 7138 2 59.71 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTT:1 - 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chr3L 24934276 3' - HMS-Beagle2 40 2 58.22 CGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTTTATATTATCATAGCTTATTATGCATAGCTTAAAATCGACGAAACTGGATAAGAAATAAATATT:1 - chr3R 12929184 3' - invader4 2812 2 53.42 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTGGAGTATAAAGAGGGGTATCCAGTTGGGGAACTGGGGATTTGCGTGCGCACGCGTACAGCGCCAAAACGAAT:1 - chr2L 16458570 3' - roo 8681 2 65.22 ATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCAC:1 + chr3R 15022112 3' - Tabor 6906 2 63.12 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATCAGTCAGTTATAGG:1 - chr3L 17175089 3' - 412 34 2 60.96 TATAGTTCTTGAGATCTCGACGTTCGTACGGTTACTCTACGAGTAACGACATCTCACATTCACACGACTAATAAAAAATATCCAACCAATTTTCAAAAATGTGGACGTGGCAGTTGTGGCAGGTATTTCAGAAACACTGTTTATCC:1 - chr2R 5438595 3' - INE-1 144 1 43.15 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGACTCCCACATGGACAATTGTGGCACAAGATGCCCAACCAATCGAATAC:1 - chrX 1689990 3' - 412 7126 2 66.44 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGGT:1 - chrX 8891787 3' + P-element 2848 1 27.06 ACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGAATACGGACAGCAAACCTGTAT:1 + chrX 1013247 3' - Juan 47 1 44.36 ATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTTCGATGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:4 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 45 1 67.12 TTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTCAGTGGAGATACTTTTGGAACGGAAATGGCAATTTTCAAAGTGAAATGGCAAACGACGACGTCGGCTGAGACGACAAACGCAACTG:1 + chrX 22674234 3' - mdg3 5171 1 56.10 CAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATGCGCGCCTAAAACATATGCTGTTATGCGGTTTAACCTATCTGAATGTCATCAAACATTGTCAGTGACATTTAACGTAAATTGGGTAACCAGAGTAGGAGCAGTTC:1 - chr2R 5542299 3' + 1731 298 1 74.66 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGA:2 + chr2R 23287506 3' - roo 8754 2 80.82 GCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGCCATCCGC:1 - chr2R 21402606 3' + mdg3 192 2 59.06 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTAAGGGCCATATTGACCAAAAATAAATATAAAGATGGCTATTTTTAAACCA:1 + chr3L 96598 3' - roo 62 2 61.64 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTTTCGAGCCACTGTGGACGTGTGGGATTCCTTCCCTTTGAAGAGGG:1 + chr2L 11915589 3' + hobo 2914 1 50.53 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGGGGCGGACTTGTTTGCCCCAGTGGCTTCTGACCGAGAGCAGATTGAAGGAGGAGCGAGCTGCAAGGCA:1 - chr2R 6842748 3' - roo 8 2 71.15 CACTAAAAAAGTAGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTACGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTCCTACCCAGGATAATCATTCC:1 - chr3L 23241893 3' + 1360 3338 1 75.79 GATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTCAATGTTGAAATATTATTCGTTATCGTAATCCTTTCTTAAAGGGGTCAGTGCCTTTTCCAAATTGCTCTCGGTG:1 - chr2R 3141737 3' - accord 7310 2 52.86 ATTTTTTTGGGATATCGATAGATATTGGGAGTAAAATGAGAAAAAATGTAAAAATTGTTAAAAGGTGTGGGTGTCACCGTTTTGGGAGTTTTGTAGGTGAAAGTAGGTCGTTGCCACAGTGTTTTTGGCCCAAAGTGGGCGGATTA:1 + chr3L 23689201 3' - INE-1 501 1 52.74 CAAGAAGTAGCTAGAATATACCAGACTGGGTGCAAACCTTATTAGCTGCACCCGATAAGGTTGGTATAATTCGGTTATGGTGTTGGTGGTGTCCAGCTGCCGATGCCGACGTCG:1 + chr2L 20689516 3' + gypsy12 99 2 66.67 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTCCATTGTTGATAGCTGATTGCAAAGACTTGTGCAACATGCAGCGAACATTTATCATCGATGACAGAGCTCA:1 - chr3R 28627537 3' + copia 251 1 79.45 GTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTTTTTTTTTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATTTTATACTATCCTCCGGTTGTTGTAAAATGTTTAACAGGCATATGCTTCCGGTTT:1 - chr3R 21413503 3' - G5 4748 1 68.49 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGTGCCCAGCATATACATAC:1 + chrX 12526006 3' - roo 58 2 57.53 AAGTATATAATTTTCTAATTTGTGAGGTTGAAAAATGAAATAAATGAAAAGAGTTTAAATGTAATAAATATCAATATATAAGTAAAAATTAAATGTCAGTAAGTTGAAAATTAATAATATTATTCAAATTGGACATTTCAGTCCAA:1 + chr3R 12881951 3' + looper1 354 1 67.81 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTAACATAACATATAATGGATATTATATATAGGCAAGTGATTCAGAACAGAACAGAACAGAACAGCGGTTTTTATCGTGGGTTATGTTTTCGTTTTTTGATAT:1 + chr3R 9393073 3' + S-element 1701 1 74.66 AAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTGGACAAAAA:1 + chr2R 2879483 3' + Stalker4 7051 4 48.63 CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACGGAGGCCTC:1 + chr3R 5208214 3' - hopper 64 1 70.15 ATCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTTTCTTGTTTATTTTAAAGAGGGTCATGATAGTTTGCAGTTT:1 - chrX 20344076 3' + INE-1 125 1 66.12 TCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAAACTGCGGAAAAGCTCGTGCTCTTTCCC:1 - chr3L 9571652 3' - jockey 4523 1 56.85 GAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGACCAAGTCACACAACTCCGTCAACGTAATAACAATTTCTTTAACCAACTCAAATATCTTTCTCTGTTACATTTATTAAC:1 + chr3L 23597300 3' - invader4 2754 1 67.81 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTTATTAGCGGCAATCGAGTTTGTATTCTCTTTCGTTGATCTTGATCGTGAACTCGAAAATATT:1 + chr2L 1558751 3' + 412 461 2 63.01 AGGCACGTTGATTTATCTGGATGAAGCCGACAACGAAGATAAAATTGCCAAACAGCTTTTAGCAATTATTAATTATGATTCTTATGAGCAAGCTCCCCTCATGGTTGATTACAGAGCTTTTCGTCATAATAGTCCATTGCCAGCTA:1 - chrX 6647869 3' - diver 337 1 71.23 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAAT:1 + chr2L 22015996 3' - Tirant 48 2 61.79 GTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTAGTACCTATGTGTTTCAAGAAATATAAAACCATA:1 - chrX 913917 3' + blood 7301 2 76.03 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAATTCGGGTGGG:1 - chrX 2762549 3' + roo 9036 1 60.96 ACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTCCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGAC:1 + chr2L 18279965 3' + gypsy5 7321 2 52.08 AAGCAAGACCACCACACCCATTGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAGTATCCATGAACACATTTCCCTCTACAGTTATGAGCA:2 - chr3R 30510330 3' + Gypsy12A_LTR 2171 1 74.66 TAATAAAAACCTTAAGGCAATGCAAATCAAGAATTTTTTTCATGGTGTCAATCGACCAAAAATCCTGGTCAAATCTTAAGCCACCCTCAGGGAATTCTGGTCATTCAGATAGGATCTTCCAAAGACTGTATGCCGACTATTTAGGA:1 + chr2L 23033563 3' - 1360 303 1 63.01 AGATATTATAGTTCCTGAGATCTCGACGCTTATAACAATAACATCAAGTAATTGAGAATCAGATAGCGACCGGAGAGTGCCGCAGTGAAAAATATATTACATATGAAGACTGCATTTTGATCTTTAACTATATATTTACCTTGTTC:1 - chr4 264664 3' - INE-1 150 1 66.44 ACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCAAATTTTAAACTTCAATCAATATGGCTGACATCTGTTTTACTGATTT:1 + chr2L 10184111 3' + Doc 251 1 64.93 ATTTTAAAAATAAATGTAAAAAATAAATGTTCAAAATGGTGTTTGAATGGCATTTGAAATAGAGTTGCATTTTTCGTTCAGTGCTGGAAATGTCTTCTCTTTTTTAATAATTCATGCTATAGAAGTGGAGTGTGTGCTCCTTCGAT:1 - chr2R 16690635 3' + looper1 1806 1 64.38 TAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGACACACCGCTCATGCCACTGGTCTTCTGTTATCTGCTGGGGGCCCAGTTTTTGTGC:1 + chrX 2773546 3' - jockey 4826 1 61.64 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGAACCCATTTAATATGAGCTACTGGAGTGATACCTTTAATAACCACCGAAGAGCACGTGAACAGAGACTTGGGACACAGCCA:1 + chr2R 20673754 3' - mdg1 40 2 56.16 AAGAAGATGCGTAACGGCCATACATTGTTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCGCTCTGTCCGCTGGCGTACGCTGAGTAACATCAATGTAATGACATTAAGCATAGACCAAAATAGACCTAATGAT:1 + chr3R 10965681 3' - 1360 3373 1 66.44 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGAATGAGTTGATTTCTTTCCGTGTAATGTTTGTTAAAATTTTCAACTAACTCTT:2 + chr3R 20744064 3' - roo 8731 2 67.12 AAAAAAAAAAGGAAAAATAAAACTAAAAATTGCCGTAGATGGGGCAATTAGTTGTTGCCAAGAAAGCGTGCAGAAATGGAAAGAGAGAGTAGAGCTCCATATGGAAGTGGAAATG:1 - chr3L 7547860 3' + Doc2-element 233 1 73.04 ACAGTCAGTCTTAAGCTGACAGTTTTAAAATAAAGACGCTCGCTGAAATTATTCGTGTTTCAATTTATAATGAGCCAAGTGCTGGCCAAACTGCACTGCTGAAGTGTTTATTCGCCTTTTCGCTAGCTGGTAAAAAAGTGGAGCT:1 + chrX 7741618 3' + rover 226 2 51.72 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAAT:1 + chr2R 10695865 3' + roo 337 2 69.18 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAAAAGACTTACGAAGAATCACTTCGTGCAGCGGT:1 + chr2L 9485725 3' - 412 19 2 62.07 CTTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAAT:1 + chr2L 16089654 3' - 3S18 5853 2 75.69 GCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAATTAAAATTAAAATAAAAATTAAAAGCTACAGCTGAAAATCAAGAAGCAAACGTCAAAGCCAAAAGCGCGAAGCTGTCGTC:1 - chr3R 22098814 3' + 412 108 2 70.73 TTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGATCTTTGGTATAGAGAATAATTTTTTGATTGAGAATGGCACTG:1 - chr3R 6124641 3' + hobo 2508 1 70.00 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTG:1 - chr3R 10684728 3' + roo 351 2 61.64 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAG:1 + chr2L 16458663 3' + roo 326 2 73.97 TAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAACTTAGAATCGAAGATATCCAGCCGATGGAACAAATCCTTGTTTCCATTATTTAGAAATAAGCAAAAAAAAATAAACACAGAGCTTT:1 + chr4 436932 3' - 3S18 5800 2 60.96 GTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCCGGTATACACGGCTGCCTCTTCCAGGCTAAAGCCGAGCGAGATC:1 - chr2L 23298676 3' + Stalker4 7208 4 69.86 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATGTGGCATGGAAATATTACACATACGCCCATTGCGCCCTCAGCCTAAAAGTATGCAATGGCGAATGTTGGGCGACAGAGCAGGA:1 - chr2L 2004900 3' - jockey 17 1 73.95 CCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTCATTCTTGAGAATATGAATAGATCTTTATTTACTGGAACAATAGTAACTTTGAGCAGGATATTCAGGAGTTTATTTTAATGCACAACATCACTCCTCACGTTACCACTGGG:1 + chr2R 3292244 3' - Idefix 163 2 71.23 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCACGAGATTTTTTCGTTCGTTTTTTGCGTTTTCGCCCACAGAAACAGAACATCGAGTGGTTGGG:1 - chr3R 23236385 3' - hobo 56 1 54.11 TCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATNNNNAATCCTAAAAATGAATGGGAGAATTTATTTTAGAGTGTGAATAATACTTAAATTCTCCTTNANANNNACTCTCAAGATACTTGTNANAAAGGCGTAATAATCATGGCAAATAAATCA:1 - chr3L 5286388 3' - jockey 4900 1 69.18 AATTTTTTTTTGCAAATTTTGACGAGCAAACGCCAAAATTTTGAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTAAGTCGCCCGAAAAGTGACGGCGATCATCACCTTTTGTAATTATAACGTTAAATGTGTTATTTATTTAGTTTT:1 - chrX 5264706 3' - HMS-Beagle2 398 1 35.51 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTTTTCACAACGTTGAGGGTATAGAATCATTAATCGAGTTGGCAGCACCGTGTAGTTTCACGTAGGGACGAAGCGCATTGAGCTGGGTGCAAAAACTT:1 - chr2L 6318855 3' + pogo 2079 1 69.18 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACACAAAATTAAATTCTACATTAAGATAACACACAGAAATATCGAATTAATTTTATATAATGTTATTCTCTAGTAACCAAACAGTTGCCAGAAATTATTCAA:2 + chr2L 8956880 3' + pogo 2082 1 63.01 TCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGAAATGAACTAGATAAATGTATAATAATTTGTACTAAATGAAA:1 - 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chr3R 24476272 3' + 412 448 2 50.76 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTATGGGCTGAATCACAAGCTTAAGCATTTTGGCTTGGGAAACGGAAGC:1 + chr3R 17114113 3' - roo 8736 2 68.49 CTGAAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAAGTGCTTTAAATCAAGTTGAACCACACATCGTAC:1 - chr2R 23000065 3' + mdg1 336 2 74.66 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGAAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGGTAACACGCGAATTTAAAAATATTTTTAAATA:1 + chr2R 4995025 3' - F-element 85 1 96.75 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACA:1 + chr2L 1260014 3' - Burdock 6183 2 56.39 AGCTGTGACAAAGAAACGAAAGTGCAAAGTGAAGCATTTTTTCCGATTGCACTTGGTCACGCCACATATATGAGTGCTGGAAAAGCTATAAAAAAAAAGTAATAATAAACAGAGAATCCATAACATTTTAAAGTGCTGCACGCAAA:1 + chr3R 24672513 3' + gypsy4 332 2 69.18 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATATGACTTATGCGCTGTTTCTAATTCAATTTAGACCCGTTTGTTTGCTTTGGAGGTAGAAGGAAATGGAAGCAAACTTGTTTGCCGCT:1 + chr3R 23010138 3' - I-element 32 1 62.33 TCTTTTACTATGTTTTGTTATTCTTTCAGCAATCTTATGACTTTACGCCAATTCTATATGAATCCAGCGATCCTTAGAAACACATTCATTTTTGTGGGGAACGGGCGCATAAATACAACCAACAAATTTTCAATTACTTGTT:1 + chrX 22581757 3' - G4 3590 1 65.49 GTGCAAACTATTTGTGACTTAACAACAAAATGTACAAAGTTTATAGTCTGTAGCTCAATTTAATAAAAATCTAATTCTGGACCACAGTGCACTGAGAGAGCGGCAGAGTTCCAGAAAATTCATTGTCAGTTTCTCTTAGTCGTCCA:1 + chr2R 2121302 3' + transib2 2743 2 60.96 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGTGG:1 - chr3R 2772201 3' - 1360 63 1 94.29 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGCGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTCGGGTGGATAGGAATACAGT:1 + chr2R 8157294 3' + Transpac 5215 2 69.60 AAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAGCATCGACGCTT:1 - chr3L 24152395 3' - HMS-Beagle2 13 2 75.00 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGTTTTAGGCAAGTCCCAGAATGTTCCCCAACAACGGCTGCCAGGCTTAAGTTTGCGCCTCGCTGACTCTCTATCTATTTGGTTAATTAA:1 + chr2L 15988104 3' - roo 13 2 73.23 GGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAATTCTTTCGAAAGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTGGGTAGTGTTGGTGGGTTCTGTTTGTGT:1 - chr2R 25111133 3' - I-element 315 1 66.44 CTTTCATAAACATAAACATAAATCTTCCATAAATCCTTAATAACATGAAGTGTAGTTTACAGAACAGAAATCCTTAGAAAAGAACCATTTTTTCTTTTTGCAAGTGTACATAGAGAAAACAGTGGGGTATAATGACCATTCATACC:1 + chrX 13795598 3' - 412 79 2 72.60 CCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGAGTGTGTGCATCGAAATTATACCGAATTTCGATATACACAAGATTAGCGCTTTGCGAAAAAATTACTATTATCAATTA:1 + chr2L 8366632 3' - 1360 41 1 56.85 GTTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGGTTTTATGTTTTATGCGGTTTGTGGCAACATGGGTATGCCTAATCTCAATCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAACTGGCAGCATATGTACTCAGGATTTTCAATTGGATTTTTTGCGG:1 + chrX 22904322 3' - INE-1 253 1 50.68 GGGATAATTTCTTTATCGTAAATAGAGTGACTTTCAGCTGATCGTGATTTTAGCTTGTTATTCATTTTCTAATAAAATCGTCGTAAAGTCAAGTCGAGAAAAGTTCGTTTTGTTTGGACCGGACAAGTGCGGCAAAGATGTGACAA:1 - chrX 12178001 3' + Gypsy12A_LTR 170 1 78.08 ATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTG:1 - chr3L 24934323 3' - HMS-Beagle2 74 2 77.44 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACTTTCTCTCTCTGAGCAGTCACTGATTACCGTTGTGTGCGTTGTGCCGCTGTTACTAAT:1 - chrX 8891710 3' + P-element 2865 1 70.34 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAA:1 - chr3L 14553117 3' + roo 9055 2 54.02 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACCTTACCAAATGGGATTTAAAACTTTAAAGGATCATGTAAAGTAAGTATATGGAAATGTCAAACTTAAAAGTTCGTAAAGACTAAAGTTGCAGCTGCTTTTAAAGTC:1 - chr2L 12349709 3' - F-element 56 1 70.55 ATCACAATTACGCTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGATACTTTTCGGATATGCGACAAAATCGGACG:1 + chr3R 6388774 3' - jockey 61 1 69.81 GACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATTATCTGATTT:1 + chr3R 11113265 3' - mdg1 68 2 69.86 GATATGATGTGTAAACGTATGAAGGTTTTTAATTTTACTTTATATCTATAATATTTATATAGCTTGTTTTTAGAACATTTTTT:1 + chr3R 28272115 3' - Tirant 8468 2 66.27 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCCTCAACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACGTACTTGACGCGTTGTTCCTGCCGCTTCCTTTATTTCCA:1 + chr2R 12543193 3' + roo 9040 1 63.01 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAA:1 + chr3L 19350037 3' - jockey 34 1 68.53 AGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAAAATTCGTGGC:1 + chr2L 18279988 3' + gypsy5 7294 2 53.42 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCA:1 - chr3R 10684756 3' + roo 323 2 76.71 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCTAGGTACAATGTGCAGTAGCGCTTACTTGT:1 + chr2R 5923055 3' - jockey 4703 1 60.43 AAATTAAAATTATATTTTTTTCTTAATAAATTACCGTGGATTCGTTATTATACATATGTATTTCAGTTTTTATTTATATGTATATGGTAAAAAATGAAATATATATATTCCAGTTTGGCGCTGCGAATAAAATGAAAATGTACTCG:1 - chr2R 8789203 3' + Idefix 7363 2 75.34 ATTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTGTTGATGGGAAAAAGTTTGCATACC:1 - chr3L 22052720 3' + mdg1 7429 2 65.07 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGG:1 + chr2R 5955030 3' + copia 223 1 60.69 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCACGAGATTTTTTCGTTCGTTTTTTGCGTTTTCGCCCACAGAAACAGAAC:1 - chr3R 23236399 3' - hobo 49 1 57.60 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATAAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACCCA:1 + chr3L 25401041 3' - Doc 28 1 56.16 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATTTTAATGGAAATTGAAAACTA:1 - chr2R 5922929 3' + jockey 4969 1 51.37 CGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAAATATTTTGTATATAACCCAATATATAGGTTTCTGTAGCATCATTTCCTGTATTGGTATGAATTT:1 + chr2L 11574916 3' + Max-element 241 2 56.16 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCAAGCTGACTGCATGCCACT:1 - chr3R 25304734 3' - roo 31 2 63.11 GTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTCGATTGATTTTGGGATGATTACCTGCCTTATTGTTTTGAGGGCTGAGCTTTCTCTTGATTTGGATGTAGCAACTTTATGAACTTCTAGTATTACTTATTCCTTCGATTGGAATCTGTT:1 - chr3L 1587179 3' - Juan 6 1 50.00 CCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTATTTAGAACCTTATATCAATTTAATGAGTTTCGCACATCTCTTCTCCAAAAAGAACGAAAGCAACACATGTATCCTTTGCCAAATAGGA:1 - chr3R 15885271 3' - I-element 472 1 62.33 ACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCA:1 - chr3L 22052772 3' + mdg1 7383 2 72.86 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAG:2 + chr2R 6632654 3' + P-element 2822 1 41.10 ATAGACCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATGAAGATAAAATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAG:1 - chr3R 11113201 3' + mdg1 7368 2 72.60 CAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGTGTTTGTCTGGCGTACAAAATTACAGCAGT:1 + chr3R 11547832 3' - G2 284 1 78.08 CAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCAC:1 - chr3L 24934308 3' - HMS-Beagle2 6954 2 68.97 GTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCACCAATTTAAGTTT:1 - chr2R 5917807 3' - I-element 5084 1 48.84 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGTGATATCATATGTTATATGGCCAATATCAATAT:1 - chrX 4778141 3' - 412 26 2 66.44 CGGCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACTAACGCAGAAAATCAGAGTATCAACC:2 + chr3R 435972 3' + 1360 2998 1 53.42 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCTTTAGTCCCTTAAAAATGGAGGCTCTTCGCAGTGGGTATTCTCGGGTT:1 + chr2R 9873710 3' + roo 357 2 60.80 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCACACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCAAAGTGTAAC:1 + chr3L 20289143 3' - jockey 4710 1 43.15 ATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACACATGCCCAATATCACTGAAGTAGCAATAATAGTACAAAGACATTCCCGCCAGGCACAAACTCAATGGGAATGCAA:1 - chr2R 19351940 3' + Burdock 6386 2 74.31 ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAAACTGAAATTAAAAAGTATCTTCTACATGGGGAGTTACGTC:1 - chr2R 17121606 3' + blood 7330 1 67.20 TATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTTTGGGCGAAAACTTTGCCTTTTTCTAGCTTTTTGACAATGCCAGGGCAATGGCAATAAATGTCGAGAGGCAGCTGCGAATGGGAGGAGCA:1 + chr3L 2725106 3' + Ivk 5361 1 71.43 TATGAATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGT:1 - chr2L 17550624 3' + Transib-N1_DM 430 1 79.45 ATATATAAGATATATACAAGAATATATTTAAAAAATGTTAAATCGTTATAATTGCATTTCCGAAAACATATGTTACTTGTATAGCAATCATTTCCAACAATGCGACTTAATTTAGTTTTTTTTTAAGTGTAAGAAAGAGCAAAAAC:1 + chrX 10438244 3' + 412 7321 2 73.29 TACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAA:1 - chr3R 9190506 3' - Tabor 6909 2 63.01 TAGACTCGCGTAAGCGACTTCGCTGTCGGCTATCATTCCAATCGTTATAATTCCATCCTGCTTTTTTCCAGTTGTGCTTTTTTTTGTGGGCAGCTCTAGTTTTCACTTG:1 - chr2L 5929538 3' - Doc2-element 4583 1 77.06 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTTATTAGCGGCAATCGAGTTTGTATTCTCTTTCGTTGATCTTGATCGTGAACTCG:1 + chr2L 1558743 3' + 412 7518 2 62.69 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGTACTGTGTGATATTGAAATATGTGATTATGATAAGAATCATGCTTGATATATATGTGAATCATCA:1 + chrX 6707865 3' + hopper 1364 1 53.42 ATTAGATTAAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAAAACGTTTCTTGCTACCTGTTGCGTACTTTCCAAAGAATACCGTATACCCTGTTAGTAGGCAGGAACCGTCTCTAGTGCAGTGTTTCTTTTTGCTCCTT:1 + chr2R 6526624 3' + jockey2 3341 1 66.44 ATTTTATTTTATTTTATTTTTTTTGGCATCCAGGGGATTATAGTGTCAATGAACTGGACGCAAGGCACATTGCCTTACATTTCCGATGGTGTGGCATCGTTTATTTTTTTTCCTTTTTCATTTCTTTGCTCCTCGCTGGTCGGGAC:1 - chrX 5640842 3' + transib1 1900 1 73.29 GATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAAGCTTCTATTCAAATATTAAGAAACATTTTTCAAGAAAATCGAAC:1 - chr2R 21752777 3' - mdg1 7308 2 69.18 GCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAG:1 - chr2R 13644437 3' + Burdock 171 2 78.08 ACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGGTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCG:1 + chrX 22386757 3' - hobo 86 1 65.98 AATAAAATAAAAAAAAAAACAAAAACTGTTTACATTTTTACTCAGCTCCGTTTCAATGCGCATAAATGTTTCTGCCACCGCCACCATTGCCATCACATATATGCATTTTTATTAATATTATATAAATTCCCAACAAGTTAACAGAG:1 - chr3L 10001524 3' + Rt1a 5078 8 72.60 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGCTACAGCTTTCCAAGTGTTTACCTTTTACTT:1 + chr2L 16948737 3' - jockey 4678 1 65.88 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCATGGCTCGATTCTGCAACGACCATGCCCCCTT:1 + chrX 8755101 3' - transib2 53 1 75.00 ATATCACGCTCACTTGAAACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGACCG:1 + chr3L 10144731 3' - blood 76 2 76.98 AATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAATTGGCCCAT:1 + chr2L 16089707 3' - 3S18 5798 2 61.27 AAACATCATAAAAATAAAATAAAGTTAAATAATTCAGCTATTAAAAACAGGACACTAATAAATTTTACATTTACGTAAATTGGTAGAGCCGAACACATCGCAATCATTTGACAGGAATATTCTTTCCTTTAGGAGAACCTAACC:1 + chr3L 14603200 3' + jockey 4999 1 55.56 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGTTGTTAAATTTATAAAGCAGTTGATATTTGTAATGGTAACAACTG:1 + chrX 13531690 3' - roo 75 2 69.86 GGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACAT:1 + chr3R 17656442 3' - mdg3 93 2 78.77 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGAATTATTTATAATGGATAGTGTGGGCATGCATATGTATATCATATCTAATTGACATTGAAGGACTCCCGAACCGCTCC:1 + chr2R 23287587 3' - roo 8668 2 79.43 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAAATGGGTGCCAATGTAAG:1 - chr3L 14553100 3' + roo 356 2 56.83 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCCATTTAAGACACCCAATTCCCGCTGCCAATTC:1 + chr2L 17250863 3' + opus 494 2 71.43 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCCATGTTCGTGGCTCTAACATCTTTCCATCGATCGCCGGTGGGTTCT:1 - chrX 17805955 3' + roo 337 2 67.13 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAGGTTTTCCTTCTTTCCGTTTTTGCTCCTTTCTTTTTTTCTTCCCTTTATATATATATATATCTATATATATGTAT:1 + chr3L 16731387 3' - roo 8680 2 64.66 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTAT:1 - chr2L 23372630 3' + 1360 3333 1 71.92 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAGTGTCGATTACTGGCATACTCGTTGGTTGCATATCTGTAGGCTCAATTACACGGTAATCCACACT:1 + chr3L 22642957 3' - hobo 14 1 71.65 TTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAATCAAGAAGATAAACCCCAATGCATCCATCACGCTGTTCCCGCTGCACCTTAAGGAGGTTTT:1 + chr2L 1078378 3' - copia 5058 2 62.94 AATAAAAATGAAATAAAAAAAAAGACTGAATGCTATGGTCGAGTGCTTCGACTATCAAATACCCTTTACTCGACTTTACGGTATCCGCTGACTTTTGTTGTCTCGCTGAATGTTAAACGAAAAAATGTTTTATAAATTT:1 + chrX 14345247 3' + Doc 4694 2 58.27 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGCGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGCATGGTTATTTCCCCCTGTCTACAATTGATTGGCAGTCGCGTTGAGTGGCGACTC:1 + chr2L 12414988 3' + pogo 2039 1 58.33 CATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTTTATGGTCCTCCCGCCTCTCCCAGGAGACCTCAATTGAGGCCAGGATATTGGAAGCTGATTTTTACGATAATGTAGA:1 - chr2L 5698054 3' + copia 4954 2 57.53 CGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTTGCTCCCCCAATGCAATGTAATGG:1 + chrX 6510102 3' - jockey 4737 1 60.96 CAATTATCTCCAATAGTTTAGGAGGGATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCCGGCATTAATTAAAATTTGCTTCAAATTATTTCTCAGCGTTTTCGTT:1 + chr3R 27859265 3' - hopper 46 1 55.28 GGTGGGCAAACATGGGCGAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAAAACTGTACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCGAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAA:1 + chr2R 1522953 3' - FB 68 1 63.71 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGCAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTGCCCAAGAAAGTGCAGCACACTCTTTGCCACTTGC:1 - chr2L 15987931 3' + roo 9054 2 71.23 CCTACTGGACAATACTGAACAACGCCGTCGAAAATTTGTATTTTTAATTACAATAGCTATAATAATTTCTTTTGTATTTGCCTTAATTATTTATGTAAATATCGAAATCGTAGCTTGGACGAGCATAATCCCGATACTCTCGGTCG:1 - chr3L 16721457 3' + G7 1010 1 69.86 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTCGGGAGGTATTTAGTCTAATGCTTTTCGAAGCAGCTATTACGCGTCCAAATGGATTCAGCA:1 - chrX 22853378 3' - FB 61 1 58.90 TAGTCTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCA:1 + chr2L 246118 3' + roo 9041 1 65.00 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCATACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTT:1 + chr3L 20289119 3' - jockey 4736 1 69.53 ACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCTGTGCATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTGTGGCATGCCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAACACACAGACA:1 - chr3L 28063317 3' + Stalker 6969 4 77.40 ATTTTTCCGACCCCGGCTTCTTTGAGCTCACAAGTTTCAATACAATGCCTACTATTCACTTTCAAAAGTTCATACTTGAAAAAGAAGACTTTATGTTTTGAATTAGTTTGGTAAATTGGAGACACAAGTTTCAATACACTTCCTTT:1 + chr3L 4620939 3' - FB 7 1 61.64 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACA:1 + chr2L 16948711 3' - jockey 4735 1 75.00 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGACTTTACACTTATCTAGCATAATCCTTATCTTCAGTGCAATAATGGCGCAAGGAAATTCATGTTTTCAGAGGCTTTAATCCATTCAG:1 - chrX 10567749 3' + roo 9032 1 56.43 AGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGACAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGTTCTAGTGCATTCTGG:1 + chr2R 4261980 3' + invader4 3006 2 50.00 TGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACAACAGCTACAGAATAGCCGACGTCCAACTGTGGAGTG:1 + chr3R 7887407 3' + hobo 2572 1 74.66 TCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCCGTAAGCCTGCCTAGTGATAATTGCAATTAAATTCAGTCCC:1 + chr2L 2030080 3' + 412 416 2 69.18 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCCTATTTTTAGGCAGCGCATCCTTTGTCGCCCAATTTGG:1 + chr3L 1630174 3' - jockey 4748 1 73.38 ACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAGCTAGTGTCATAATTTCTGGGAAACCGATAGTTATTAGGGAATAAAATTAGAAAAAATTAAA:1 - chr3L 23948107 3' - X-element 4593 1 57.53 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTCCACTTTAATACACCCCGTAAATAGTTGAAATTTCAAAAGCCTTGTGTGGGAAAAACTTTAACCGAGAGCAGGTGGAAAACTATCGTTCA:1 + chr3L 10133630 3' + 412 461 2 58.90 GTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGAATTACTCAGTTCTTTATTTTCTATAGTTTTTCTGGATAGTCATGACAATTGGGTTTGAGGTAAT:1 + chr2L 18149566 3' + Bari1 1683 1 70.14 CTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGAATCGAAATATTTATGTAATTTCTTTGAGTGCAGCCAAATTTGCATCTCTGTCTGTAACTCCGCCGATGCCCCTGCAACC:1 + chr2L 4178115 3' + jockey 4848 1 56.85 GTAGGAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCACATTTTCGTGCCACACGCCATTTTCATGGCA:1 + chr2L 7559772 3' - mdg3 5253 1 59.02 GAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCATTGTTCGGCAGTGTTTCGGTTATTTAGTTTGTCATTCTGTTTATTTGCATTTGGCCAATTCTATTTCGCG:1 - chrX 23019788 3' + Tc1 1608 1 70.37 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGTTAAGGGGTGGCTCCTTAACAAATGAAGACATCAGGTGAGTTTGGTTATTAATTCACCGGAAATTGTGTTTAGCTATAC:1 + chr3L 14076322 3' + roo 9033 1 58.22 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTTCATGCT:1 - chr3R 7035232 3' + roo 356 2 53.42 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAATAAAATGTCATTATGCGCTCCCAAAAGTATGCAAACGATTTTTCGCTTTGAATGCTGGGTACTTAAAACGCTCAATCATTGCAACATTATAAACAAAT:1 + chr2L 3890261 3' + jockey 4975 1 65.75 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGCAGAGATACATAACAGTATGATTTGCCATTAGTCAGTAACCAAAATCAAGCTACGAGCTGAGAAAGCAAATTATTTGCTGACAACAG:1 - chr2R 23412491 3' + mdg1 388 2 59.59 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTTGCCCGACGATTCAGATCCGATCGTTGGAGC:1 - chr3R 4197251 3' + P-element 2819 1 28.23 AAAAATAGAGAAAATCCAAAATCCAGAGGCAAATCCCTTAAAAGCCAAGCCTAAAGACTCCGGAGTCAAACTTTTTTTGTAACTGTTAGAAAGGCCAACAAGATTGCGTATATGA:1 + chrX 14988627 3' + transib4 2540 1 65.22 ACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAAT:1 - chr2R 17890860 3' + Tabor 7273 2 54.11 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTAT:1 - chr2L 17029605 3' - blood 7087 2 69.18 ACTCCCTATTCAATGTTTAATATTTTCACTACTTCAGATACCGTGATATGGATTGAAAACCTTCAACATCTTCATTTGAAACAATTTGTGACGCCATCTTTGAATGAACCGTTGCCCGCACAATTGAGTGCAAATTTGCAGCTACA:1 - chr3L 25073247 3' - invader2 4703 1 55.48 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTGCCGCGAGTATATCACGAACTTAGGGCCCTCTCGAGTTGTGCGACCCATAAAATGGTCAACAAAATAATTTCCTCAACGCTTCCCAGGCCATAAATTCA:1 + chr2L 6870803 3' - hopper 20 1 71.53 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGCATGCATG:1 - chr2R 19554895 3' - pogo 30 1 63.70 ATTCTTGATCAGGATCAATCGCCGAGTCGATCTCGCCCATCCCCATGGTAGCTGAAACTCCCCCACAATCCGTGGCCCCGACCGCGAACTCAAGCCGTCCAAGTGCAA:1 - chrX 1146820 3' + INE-1 86 1 55.56 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATTTTGGATAAGGTTATAAAAAGAATTATGCAATTATTTTCAAAGAAAGTTCTTTAAATGGTGCTTAATCATTTAAGGATCTACGA:1 - chr3L 15327521 3' - blood 35 2 60.96 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCGCAACCGCAACATTTCCCAGAGTT:1 + chr3L 11400037 3' - Quasimodo 31 2 63.45 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTTCCTAGAGTCGTACACCCAT:1 + chr3R 25304829 3' + roo 9018 2 56.85 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGC:1 + chr3L 13827395 3' - hopper 26 1 67.81 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGACTTTACACTTATCTAGCATAATCCTTATCTTCAGTGCAATAATGGCGCAAGGAAATTCATGTTTTCAGAGGCTTTAATCCATT:1 - chrX 10567752 3' + roo 359 2 52.05 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTCCACTTTAATACACCCCGTAAATAGTTGAAATTTCAAAAGCCTTGTGTGGGAAAAACTTTAACCGAGAGCAGGTGGAAAACTATCGTTCAGCTTA:1 + chr3L 10133635 3' + 412 7519 2 62.33 GTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTGGTCTACAGTGAACCCCTGCAAAGTGGCACACAATCCGTCTGGCTGTGGCGGATGGCTGGCCC:1 - chrX 9707133 3' - Doc 13 1 69.79 AACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTT:2 - 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chr3L 11336282 3' - blood 7014 2 79.86 CAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATATTTTTGTATAAGTTAAATAACTTTTTACTTTTGTTAATTACCAGTTTTATT:1 + chr3R 17605766 3' - Tabor 6867 2 65.07 ATGAGGGGGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGGTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTTTCTCC:1 + chrX 6510084 3' - jockey 4750 1 73.05 TTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTATGAGGTTGCACTTGCATTTGGAAATATTTTGTTTATTGAACCGGTTGAAAAATATTTCGCAAGCTTTTGCATCTATTTTGTAAT:1 - chr2L 14246911 3' - I-element 5150 1 60.96 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGACCCACTTGGATTTGTCTCAGCCGTCGTGTTTC:1 + chrX 5150420 3' + roo 387 2 70.55 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCGTATCCGTATGCGAGACTTGTCAGGCCATCAATAAAGCATTTGGGTTTGATTATATAATAATAATTCGTTTCTGGAGATG:1 - chr3L 19199606 3' + hobo 2935 1 74.31 GAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACCTGATGTTTGCTTACTACTTAGAAGAAAATACTGTTTACCCAAATT:1 + chrX 16384145 3' - diver 5901 2 76.71 ATTGTTATTATGTTTGTATATACTACAATATTCTTTCTTTCAGTTCTGGGCGGCCTATGTCCCCTGCGAGGCTCAACATCGAGATGCAGTGCAGCTGACTCTGGAGCAGATCGATGTAATAAAGCGCCTGACGGA:1 - chr2L 18192973 3' - mdg1 6 2 77.04 CCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTAACATTATTGTGTTTCATTAAAAATCCGGCCG:1 - chr3L 11745296 3' + G2 2752 1 72.88 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATTTTAATG:1 - chr2R 5922943 3' + jockey 4955 1 45.89 CGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTGTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTT:1 - chrX 1103633 3' - pogo 74 1 71.74 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGG:1 - chr3R 9160681 3' - copia 71 2 65.07 ATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTATAATTGAGCGTTGCCAGATCAAAACATATAAAGTATCTGTTTCGTTTGGGGTTGCTGGTTTTCTTTTTCGTCGGCGACGCAATCGTTGTCGCTTGC:1 - chr2L 14062008 3' - Copia1_DM 85 1 55.00 GCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGCGCTAGTAAATACTTTAAGTTCATATAGTTTTTAACTGCAGACTTGT:1 + chr2L 13839970 3' - 1360 3293 1 70.34 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTATATCGCGATTAAGATAATCAACTGCTCTGCTCTGATTGCGGAAGCAAACGTGGTAAAGATTTCGAAAAGTGGATGGTCACTGATAAATTATCCAATCTCTATAGACAACACCACCTT:1 - chr3R 27478431 3' - hobo 3 1 78.08 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCA:1 + chrX 13395341 3' + roo 9011 2 64.75 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTGAATAAATGAATAATAATGTGACCAATGTAACGTTTTCGATAACGTATCGTACATCTTATTCAGTTGTTCCAGTACAACACTGCTAGGCAGCAATTTCCAGC:1 - chrX 16787032 3' + pogo 2086 1 68.49 GTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTTTACTAACATATATGCCGGGTATAAAAATTAAACTACGAGTAAAAAAAAAAACCAAAAACCAAACCAAAAATCCATTGATTTTCTGCCCAGTACCTGGCAATTT:1 + chrX 3765881 3' - INE-1 15 1 83.85 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATATAACAGTTCTGCTTTCGGTAACAGCTA:1 - 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roo 8742 2 72.60 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACCCAC:1 + chr2R 5923024 3' - jockey 4699 1 51.92 GGGGAACTCGACCATAGCATTCTCTTGTTTTATAATTTAATAGGTATATCGTTAAGATGACCGAATAGTAAAAAATTCTCCAAGCAATTTTGTAAAATTCTAACCAAATAATAAATTTCTTTCGTTTTAATCTTATAGGTTCTCCG:1 - chr2R 13155862 3' + INE-1 571 1 76.03 GGCTTTATGGCGTGATGCATTGGAGCCACAGTAGATTTACATTTTCATATTCTTTTGTATTCAGTCTTAAGCCAGAGCTTTAATAAATGATTAGGTCGAGGCGTGACCACCATATTAATGGTTTAACTGGCATTGAAACTGAATTA:1 + chr2L 56433 3' + gtwin 7104 2 59.59 ATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGTATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAGCGTCATTATATCCTTCACCCGTGCGTTATTAGCCTGCAAGGATCAACTCCC:1 + chr2R 7574818 3' + Idefix 8 2 55.93 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATGTAATCGACAAATCGAATATCCAAAAATACCGAAAACATATGTGCGATC:1 - chr2L 436468 3' + copia 5053 2 66.44 GAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGACTGGCAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGCACGCACAACAAAGTAGTTTCATTTTTAAACCAAAGCTAATTAAAAAGATTATTAGCTCAATAATGACTGAAA:1 + chr2R 2049449 3' - Ivk 255 1 60.94 AATTACCGTAGAAGAACACGTAGAACACACTAGCGCAAAGGGTCAGTCCAATGCAGGAACTGTCAAGAATATGTCCATATGCAATATAATGAACTGTAAACCGGTAAACTGTCATCACTGTCTCTGCCGTCCTTACATATTGCCAT:1 + chr2L 1485263 3' + Fw3 414 1 52.74 CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACAGAGGGAAAAATAAAAGATTGCTATTTTAGGAAACATGAAGAGATCGCAATCATTATTTACTTTAGTGTT:1 - chr3R 10472680 3' - mdg1 7089 2 50.68 AGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCAATGTGTGCCAT:1 - chr3L 24152455 3' - HMS-Beagle2 58 2 65.12 CAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTAAAACGGAACCTCTTCTTTGTATGTATGCCCAGCTACA:1 + chr3R 22516111 3' - jockey 4551 1 87.22 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAGTCACCGCTTTTTAAAATAAAACCCAAACCGGAGCCCATCTGTATCTAAATTTCTATAGCATAGTAATGCGAGGATAATGCCCAAGATATACAAATTCAAATAACAG:1 - chr3R 26191559 3' - hobo 12 1 70.55 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATTTATACCGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTTTTAATGTTTTTTAAACTTT:1 - 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HMS-Beagle2 6919 2 72.60 ATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCGGCAAGATTACCACTCCGGTCCCGCGTCACTCTTTTTGTTAGGGTTAAGGCCGTATTATTTGACATTATCTGCCCCCTTC:1 - chr3L 23144336 3' - 1360 435 1 74.29 AAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAAACTCGTTGCATATTCATTCGAATTCGGAGGGCCGAGGTAGGCATCGCCTGCCTGT:1 + chr2L 10182326 3' + Doc 253 1 64.83 ATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCACCCAAATGGAATCTCTAATTTTATTCTGTCAATCATTTCGGTTCTTTCCTTTTTTGAATGGCAGGGCACAGGGAATTTCAAGGACTTC:2 - chr3L 9909655 3' + Transpac 5194 2 61.64 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCACATTTTCGTGCCACACGCCATTTTCATGGCATAGCCCC:1 + chr2L 7559779 3' - mdg3 5331 2 68.49 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGGAGTAAACACTTTGTCGACACTTCCATCCACCCCATTGAATT:1 - chr3L 7995385 3' + P-element 2852 1 60.96 CAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGACAGGACAATGAATTTCTGAAAGTGCCCAATGTAGAATA:1 - chrX 18741781 3' + blood 7315 2 77.40 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTACAGCCACCCGCACATGACGCGCTTAAGACTACGTGTTTGTTATCTTATCTTATCTTATCTTAATCACTTGAGCTGCTAGGTGT:1 - chr2R 8562343 3' - 1360 28 1 66.67 CTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGG:1 + chr3L 23678165 3' - Osvaldo 20 1 74.63 ACGTTTGCTATATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCCGCCGTTTCGGTTGCTAACGTCTAACAAGCCAAAGAAAAATGGGCCCAACGCCAACTTTTGGCTAAAGCGCAAACACA:1 - chrX 7522453 3' - Bica 313 1 76.32 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACAAGGGACCGCGCAGTCCTGTAACCTGAAGCGTTGTCCT:1 + chr3L 22400394 3' + 1360 3379 2 75.38 AAATGCTGCTAATACGGCCGATTTGATTTAAGAATTCGAAACAACAACAAGTGTGAGAGGCAGGGGTTGCCTGACGTAATTTAAAAGGGGACATGCAGCGTTTCCAGTAATATTAATATTTTGAACACTCCTTCTCAAAGCTGTAT:1 - chr3L 24000390 3' + blood 443 1 57.53 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCC:1 + chr2L 9472094 3' + roo 353 2 54.11 TGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCCAAAATATTTGAATTATCAGTG:1 - 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I-element 40 1 58.22 CTGATCTCACCGTTGATCTGGCAGCCCCTCAAGATCACCCACTGCGGCAGAAAAGCGGAAGTGTCTCCGTGGGAAGTGCATCGAAAACGCTTTACACGCTAA:1 - chr3L 10129911 3' - Rt1b 44 1 52.94 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGGGGCATATATTGGTTTATTACAATAAACTGAAATTAAAAAGTATCTTCTACATGGGGAGTTACATCTTGGGTTGAGTCCGTGGCTTT:1 - chr2R 17121585 3' + blood 7366 2 55.45 AAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCATGTTTAAATATCCTTCAGATACAATATCTTCAGCATGACCTT:1 + chr3L 12655769 3' + Stalker 224 4 71.23 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTATAATATATATACAACTGGTTTTGGCAATGAAAAAAACTACGTCTAGAAAAATTAAGTGTTTGACACATATACACAAAAATAATGAAACAGTTATCCTG:1 - chr2R 4628333 3' + Transpac 298 2 75.54 CAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGTGCTACTGACTGTTGTATGGGGAATGTCGATATTGAAAATGACGGGATATCGGTGAAGGTAACCGAAGCTGATCATTTGGTAATATGGA:1 + chr2L 22746572 3' - R1A1-element 4997 1 62.33 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACAGAGGGAAAAATAAAAGATTGCTATTTTAGGAAACATGAAGAGATCGCAATCATTATTTACTTTAGTGTTAACTTACTCAACTGCAAA:1 - chr3R 10472662 3' - mdg1 7071 2 63.01 GTTCATCTCAACACAAAAGCCACGCCCATTTTCCCTGAGCAAGTCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTGTACTGTGAACGAAGACCACCACCAAAATATAAA:1 - chr2R 13947191 3' + Circe 7347 2 71.83 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAAT:1 - chr3R 7035263 3' + roo 8995 2 73.57 ACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAA:1 + chr2R 8641590 3' - diver 70 2 64.14 TAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACC:1 - chr3L 17707819 3' - Doc 73 1 62.33 GGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATGAGTATTGGAGTATGCGGACTAGAACACTTTTAGTAAAATTCAATAACTGTCCGCAGTGCGAAACATGAATTAAT:1 - chrX 2157978 3' + invader1 146 2 60.00 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATTATTTCCTGTATTGTGTTTTGCGGATCCCACGACATGGCGTTGTGAGGCAAGC:1 - chr3R 4569509 3' + opus 449 2 60.16 AGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGACTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATATCTTGGAACCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCC:1 + chrX 21668947 3' + gtwin 6931 2 79.45 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAGCGGTAATTGGTTGCCACCTGTATAAGTATGTTTCCAAAATGATTGCATTTAATTAAC:1 - chrX 12138899 3' + roo 9047 1 65.28 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACAACGGGCGTCTTCG:1 + chr2L 22016034 3' - Tirant 8119 2 75.20 ACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAA:1 - chr2R 8158772 3' - Juan 83 1 65.07 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAGATATTTTTATGTAATTATTG:3 + chr3R 9352149 3' - Tirant 8117 2 80.14 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAATTTAATAGAATTTATTTGTTTAGAAATTGT:1 - chrX 13531597 3' + roo 9011 2 60.27 ATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAATTTCACAGATTAATGCGCACACATTTCAACGCCAAAG:1 - chr2R 17890824 3' + Tabor 7310 2 73.10 ATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAAGGTCGTGAGTACAACAAAACAACAACAAAAAATACT:1 - chr3L 23797651 3' - Helena 1155 1 57.24 TTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTG:1 + chr3L 25232867 3' - accord2 7454 2 58.33 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGC:1 - chr2R 6632575 3' - P-element 74 1 34.03 AAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATACTTACCCACACATACATATGTATACATAGAACTTGAAAAA:1 + chrX 3230548 3' - micropia 5083 4 76.42 TTTTTTTTTTTGGTTTTTATTAACAGGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTCACCAACAGCTGAAGAGGAAGCGGAGGAGACGAGACCGCGAAGCAGTACAGCCAGGAGC:1 + chrX 2595845 3' - BS 5101 5 59.59 ACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTCACATAATTTACTACTTTTTACTTGTACGTTTTTTATAAGTTCACTATCTTCAAACAAGCCATC:1 + chrY 536750 3' + rover 7115 2 66.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCACGCTCGGCGACACTCGCAGCTGGAGAAACATAAAGATGAAAGCCGGACA:1 - chr3R 17305391 3' + roo 401 1 78.08 CGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCAACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCACTTATTTGGTACACATAGTCTTTCAATTTCTTTGGCTACCTGGGAGTTTAAGCTTTCTGCCGTATC:1 - chr2L 21365427 3' + Ivk 5122 1 65.91 AACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTACAAAGGCGCCGCCATATTACCCACCGTTCTCCTTTCACACTCATTCGTGAAAATTTCTATGTCCAAATTTCCGAATATATTTAAATATTAATCCAG:1 - chr3R 20005368 3' + GATE 436 1 74.19 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATTTATAACTAAAATGTGCATTTTTAATCATTTAATCATGAAATATGTATAATAAATATATATGTTTATTAATTTTTATGACTTTTGATTATTTAGCTAGTTTTTCTAAT:1 + chr2R 8305360 3' + roo 396 1 75.34 AAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTAGTAGGAGACAGAAAAACTGTAGCGGGAAATGTGGCGATAATAGCAAGTAGCGGGCAAAGCACCGAT:1 - chrX 5303093 3' + invader2 5031 2 52.50 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATACGATCAGTGGTTGGGTGAACTGGAAACTAACGAAGACGAT:1 + chr3L 17890865 3' + 412 472 2 70.55 TCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTTCAGCGATTTGCTGTTTCAAAATGGGAATAATATT:1 - chr4 123940 3' - HB 112 1 57.53 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAAAAACAAATGAGTTGTGTAATTAATACGGGCTTTTGTCTTGCCATAATGGCAGG:1 + chr3R 18816016 3' - hobo 14 1 77.14 GTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTTTGAATGGCGGACAGAGATGGAGATGGGTAAAAATTGAAATGCAAATTGAGACA:1 - chr3L 5737926 3' + 1360 160 1 63.01 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAG:1 - chr3R 31490951 3' + roo 325 2 71.92 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAATCCGATTCC:1 - chr3R 31490924 3' + roo 352 2 53.42 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGAATG:1 - chr3L 15276646 3' + hopper 1389 1 54.74 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTCCCACTCTCGGTGCCCAAGTGCTCCCAAAACATCAAGGCAAGTGACGAAAGCCACGTTGACCTCA:1 - chr3L 18658845 3' + roo 400 1 77.14 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCAGG:1 + chr2L 246120 3' + roo 403 1 79.49 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATAAACTAAAACCTTACGTAAACATAAAAAAGATGTTCACAAAATACACAAAAAAGGTTAAATCAAATATAATTACACAAAAAATATTAAATCAATAAAAAAAACGTGACA:1 + chr2L 22187634 3' - S-element 7 2 80.82 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTATATCGTACTATTTCATGGC:1 - chr2R 8305203 3' - roo 53 2 56.85 AAATAAAAGTGAAACATTTGTTAAATTATTTGAAATTTAATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTT:1 - chr3R 31887770 3' + HB 1500 1 58.22 TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGAGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCG:1 - chr2L 22015925 3' + Tirant 8477 2 60.44 GGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAAT:1 + chr3R 11547778 3' - G2 329 1 56.93 GAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGACAATGCCA:1 + chrX 4778243 3' + 412 7452 2 82.19 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAA:1 - chrX 4778191 3' - 412 76 2 68.49 ATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTAGGAAAACACACAGATACACACACGCTAACTTGCATACACTTTACTTACTTTTATTTTCAATAAGCCTACTTAC:1 + chr2R 14016047 3' + I-element 4912 1 59.59 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAAATGTCAGAACGATCACCAACGTGTAAAAAGTTTTAAGTTCTACCGATCTTATAAATATTTATACTTTTTTAAAATTTCGATGTTTTTATACG:1 - chr3R 7981438 3' - jockey 33 1 67.12 GTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTA:1 + chr3L 24934391 3' + HMS-Beagle2 243 2 66.44 TATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATGGTATATAAATAAATCCTTCGAGCATTCCCATTATGTAATGG:1 + chrX 10161183 3' + micropia 5382 2 67.69 CTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATCATATATGTACGTACTCGTACGCAATGCTTGCGCAAACACTGTGCGAAAAAAGGGGGGATCAAAAAGAAGAGACTACAATCAC:1 - 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chrX 16579260 3' + roo 9005 2 67.67 ATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACTCATGCAACAGTTAGCAAATGGGACTGAC:1 - chr2R 11777568 3' + mdg1 7368 2 80.82 ATTTAAATGTATTTAAGCAAACAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGCGAGCTTCGCACGAAGTTTTGCAAATTGGGTCCCCGATCTAGGTAACGCTGCTGCTCCT:1 + chrX 11571973 3' - Bari1 305 1 59.31 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATAATTATGTATATTGTTTTGAGCTTAAGACACCTATTATTTGTTAGTAGTAATAGTTCACTCAACATACATATATTTTCGTAAC:1 - chrX 4292823 3' + S-element 1683 2 63.01 ACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAGTAAACATAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGA:1 + chr2R 2949115 3' + Doc2-element 4502 1 72.60 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCACCCGCTGATTGGATTTTTGTTTTGATACAACCAAAA:1 + chr3R 23240283 3' - jockey 95 1 74.66 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCTCATATTTAATAATTTTTTCAATTGATATGTATATTATATTTCCAGGATAACGACAAACTCACATCCCTGCCCGGTCGAATCTGCAA:1 + chr3L 18729963 3' - 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diver 51 2 50.68 ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACAGCGTAACATTAACACACATTACTAACGCTGTGTCAGCATTTCATTTGAGTTTGCTTAC:1 + chr2R 17392141 3' - BS 5005 1 74.24 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCTGAGGTGAGTGTGCAGGATGACACCTGCTCATAGATAAATCAGTC:1 + chr2L 16884951 3' + pogo 2086 1 73.79 AATATTAAGAATTATTATTAAGACAATGGATGAGAACAATTCTCATGACACCCAGCTTTTAAATAAGCAGAGTAACCATAGAACAATGTTCTCAATAGCTGGCAAATCCGGAGTTTCCTTGCATTTCGTGTATTCGCACTGGTGAG:1 + chr3L 19081069 3' + BS 316 1 72.60 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATAATGACCGGCATTGTGGGGGCTTGGAATTGAAGAGAAGTGATTGCAAGTAGTTTTCTGCGAAGTAGTCT:1 + chr2L 436566 3' - copia 27 2 59.17 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCTGCCCTACCTG:1 + chrX 4785169 3' - roo 63 2 63.01 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTTTGAATTCAATTTTAGCAAGTCCTTGTCGTCCTTCCACACCCGGAT:1 - chr2L 2272471 3' + copia 214 2 71.23 CGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTAAAACGGAACCTCTTCTTTGTATGTATG:1 + chr3R 22516101 3' - jockey 4574 1 72.60 TCTAAGCTTAAGAATTAACATTCTTTTCTCCGATCACAGCGACGATGATATCCAGTGCAATCGATTCGTCAAGCTCTTGATAGCCACCATGGACGAGGCTGCCTCCGAGATCCATCAGACCACGA:1 - chr3R 5383124 3' - HB 386 1 79.20 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTTCATGCTTTCGATTTAAGCTAATTTGCTTTCA:1 - chr3R 7035207 3' + roo 9045 1 67.12 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCAAGCTGACTGCATGCCACTTGGCCAGTTTGAAGTAGATGCGTCGT:1 - chr3R 25304708 3' - roo 8712 2 56.16 CTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGAGAGCGAGAA:1 - chr2L 22015930 3' + Tirant 8438 2 75.20 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAGCCACATGAAGCTATATAGTTGGCTTACACCATTGGCTGCTTGATCGCCTTGATTTACGCCTCT:1 - chr2L 6870653 3' + hopper2 1557 1 51.37 ATATTATTATATATACTTATATACTCATATTTAAATTTAAAAAAAAACAGCCTATGTTCCTAATATGTTGGCCTTGTCTGTGCATCTACATGTGTGTCTTTTTAGGTGGCAGTCCCGTATGTCACCAAAATGTCAAAAGCCACGGA:1 - chr2L 5459867 3' + Tc3 283 3 68.49 AAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTTAATGAGCAAGTTAATGCCTTGTTATGATGATTATTATGTGTGCGG:1 - chr3R 7035723 3' + roo 110 2 58.93 TCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGACAATGCAA:1 + chrX 4778243 3' + 412 407 2 81.16 AAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAACTATGAGAGTTCAGTTTGAGACATAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAACTAAAAAGTTTTGGGTGGTGGGTGGTGGTATGCGTGGGGTGCACCCAATTA:1 + chr3L 14938353 3' + Idefix 7242 2 73.97 CAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGCTAAGATTCAGCATACATATTCTAGAGACAAAGACGCAACGCAAAATTGTTGACCCATGTTGCCACGCCTAATCTAGCGCCCTAAACAATCATTTAAATTGTTTCTCATTTTATT:1 + chr2R 12202640 3' + INE-1 155 1 84.06 TGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGC:1 + chr3R 9160758 3' + copia 182 2 63.70 ATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTAGATGTACTCCACTTACGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAACTATTTTTTTTTATTCTATTTATT:1 + chrX 2425979 3' + G2 2953 1 81.82 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTGTGG:2 - chr2L 12079635 3' - mdg3 79 2 74.63 ATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTGCTGTGGCAATCCTTTCGGCTGCTTAT:1 + chr2L 12340846 3' - diver 5926 2 56.30 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGA:1 + chr2R 18482512 3' - hopper 44 1 53.57 CAACGAACAAAAATAAAAAAAAAAGGAAAGACGGAAAATGGAAAACAATTTAAAGCGTTTAAGCAAAGTACTGAAAAGTAAGGGAAGCACGAGAAGGTGAGGGGGTGGGGGTGGGTGCTGGTAATTGCACGTGTGTGCGTGTCTAT:1 - chrX 3123052 3' + gypsy2 395 1 72.60 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCATTT:1 - chr2L 4173987 3' - roo 84 2 76.03 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGCTTTCTTGACCATTTTCTGCAGCTG:1 + chr2L 11951627 3' + pogo 2046 1 56.55 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTT:1 + chr3R 25304810 3' + roo 8999 2 69.86 CAATGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATCTCTTTTCGTTACAGACAACAATTAATAAGATTAAGAAATTGAGCGTGCTTGCAACAACAACAAAATGAAGGAGCCAGTAATCCAAGTCCCACCCACGATCCTCGGCCGACCGTC:1 + chr2R 20509509 3' - 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Quasimodo 29 2 62.02 AAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGG:3 - chr3R 9190501 3' - Tabor 6904 2 59.59 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGCACTTGATTTTGTGT:1 + chr2L 9472116 3' + roo 9039 1 63.01 CAATAAATTTAAAAAATTTAAAAACATGTCTTCTGTAACTTTTAATAGTTGATAAACAAAACTGTGTCCACTCTATTCTTGGATCAAATCAAATCAAAAAATCCAAATTTTTTGACACGGTGACACTGTGACACTTAGAGTCCTTC:2 + chr2L 22001760 3' + HB 316 1 54.79 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCG:1 - chr3L 17890733 3' - 412 62 2 62.32 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAATTTAATAGAATTTATTT:1 - chrX 13531610 3' + roo 8998 2 69.18 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTACAGCTCGTATTTCGACAAATTGATTTCACACACAATTCAGAC:1 + chrX 4186747 3' + I-element 5317 1 60.42 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATTGATTGCCATGTCAAAGCC:1 + chr3R 24493169 3' - jockey 4700 1 49.09 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATT:2 - chr3R 30634919 3' + roo 355 2 52.05 ATTTGTATTTATTTAAATATTTAATTTCCGCTGCTTCCTACAATGTGAATATAATTTATATTGCAGCTGCTTAATTCTTAACAATACAAATAATCTATTTTGTATATATTCAATCTTTTTTCCGAACAGACATCACGTATACGAGG:1 - chrX 16975838 3' - transib1 1938 1 56.85 GTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTAACCTCATCGACAGCTACCACGTCTACGTGGACGGCGTGCTC:1 + chr3R 15387286 3' + hobo 64 1 64.71 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGACACATCGTGCTCCTAGGTCTCCAAACAGGGGCTTCT:1 + chr2R 558229 3' + copia 241 1 73.97 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCGCACAACCAGC:1 - chr2R 11763588 3' - Tabor 6905 2 61.38 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCCTAAGATATTATGTTTTTGGCCTATGTATTCCTTCGCTACAAACAGACACATTTATGTTCTGCTTCCC:1 + chr3R 15338134 3' + blood 7335 1 56.16 GACTAAGGTGTCATTCGACCCGTGCCGAGAGTCTGCCAGGCTGAGGTCCCGGGAAACAACTAGCCCAGTCGCTAACGGAGTAGCCCGGAAATTGTATTAAAATTATTTTC:1 + chr3R 31944482 3' + baggins 217 1 72.73 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGACCG:1 - 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roo 67 2 65.75 CACTATACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATA:1 - chr3L 17707848 3' - Doc 91 1 77.78 AGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGCTCTGCGCATTGGATGATTTATTTTGTAATAATTTACTTATTTAATGGGTGGATAGCTCTAATTCTATTTGCATTCATTAGGAATG:1 + chrX 14457897 3' + springer 38 2 50.00 AAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTATGTGTGGG:1 - chr3R 15711790 3' + diver 6048 2 67.69 ATTAATATTATTAATTTAAGCTCCAACCGTTTGCAAATCACCTAAATTTAGTAATCATGGCATTTTCTGTGACTTCTTATTCAAACTTTTCGCTTTCAATGGTCGTTTTTGCTGATTTGAATAAAATAATTATATTTAGCTATCAA:2 + chr2L 2633992 3' - transib3 2663 1 52.74 GGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAA:1 - chr3L 24934285 3' - HMS-Beagle2 6932 2 53.42 AACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGACTTTACACTTATCTAGCATAATCCTTATCTTCAGTGCAATAATGGCGCAAGGAAATTCATGTTTTCAGAGGCTTTAATCCATTCAGCCGCAATTCCACGCCTTGCACCTCGGCCACGCAG:1 - chrX 10567715 3' + roo 9060 1 77.40 AAAGAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCGAGGGGGAGCATCACTGACTATGGATTTACAAATTTCCCACATACTTTCGTTGCACAAAAAAATTTGTTCGTGCGCAAAACTATTTTAGCGAA:1 - chr3R 19497841 3' + transib2 2429 1 43.15 CTTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAGCTAACTAAATATCATTTTATGAAATGATTCGTGATGTGTGGCATAAGCAGACTAAAGGGAAATTATACAATTTTATGCTGTTTTAAGTAAGTTCCAATCT:1 - chr2L 22039747 3' - Doc3-element 4684 1 63.01 TTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAATTGGCCCATTGCCCCAACCCGACC:1 + chr2L 16089722 3' - 3S18 5776 2 75.56 TAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGACACACCGCTCATGCCACTGGTCTTCTGTTATCTGCTGGGGGCCCAGTTTT:1 + chrX 2773541 3' - jockey 4826 1 63.83 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATTTGTTGTTGCGGTCCGCTGTTGTTGT:1 - chr3L 11336298 3' - blood 7032 2 67.81 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGGTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATCATTACTTATATCT:1 - chr3L 27350461 3' + pogo 2051 1 54.79 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGTCGGTCATATCAGCGGCTGCTGCCAAAGACAA:1 + chr3R 12599109 3' + 412 7500 2 59.83 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGGTTTTGTAGTAATGTGTCTCTCTATTCCTATTGGTGATTTTATAATGGTCTTCGTCAGTTTGTTCGACGTTCTTTGTTAATTTAAAAGGGTTTTCTAATTTT:1 - chr2R 2127181 3' + roo 9053 2 77.40 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTACTTCTTATCTTTAATTAAGTG:1 - chr3R 22100504 3' - 412 7110 2 54.11 AATTTTAAAAATTAAAAAAAAATATTTTTGAACAACCAAATGAAATAAAATTATTCTAGTTCCTTGCCTTAAATGCGAATTAAATTTCGATTTTAAAAGTTTCCCCTTTGGACCAAAATTTATGTGTTTCTGGGTCAGTTCAACAA:1 + chr3L 5412119 3' + Doc 4691 1 53.42 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATACTTACATATATATATACATATATCCCGACCATCCCCCAAAGAACCCAAATTACTTGA:1 - chrX 6138624 3' + opus 447 2 71.11 AATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCACAACACCGATAAAGCACACACGCTTTGGCTTAGTTAAATTAACATTATTAATTGTGTTTTTAT:1 - chr2L 2009698 3' + jockey 4837 1 56.85 GTACAGGTTCCCTTGTCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACACCGCCAGGCCACCTTTCTTCAGGA:1 + chrX 21175369 3' + Gypsy12A_LTR 2234 1 91.55 GTTATTATGTTCGTATATACTACAGATGCCTCCTGTTTGTTTTTGCCGTCTGCTTGATGCTATTCCGGCTGCTTTTCCGGGGCTTTACACGCCGCACTCAGTGCTA:1 + chr2L 18317563 3' - mdg1 7041 2 78.30 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGTAGACACAAAACTATTTATGCTA:1 + chrX 4701187 3' - P-element 82 1 20.16 TTTGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAG:1 + chr2R 21402688 3' - mdg3 5310 2 57.04 AGCAAGAACCCAAAAACAAAAAGAAAAAGGAAAAGGAGCAAGCGAACGAAAGACAGATATGCGTAGAGGATCCAGAGGAAAAAAGTAATTGAAAACAAAAGTCAAAGAATTTACATATTTATTTGACG:1 - chr3R 30078185 3' - Tc1 164 1 60.16 TCAATAGTATTTTCAAATATTTAAATTTTAAGATTTTTTTTAAAGAGTAAAAAGATGTTCTTTTGAGAAAAGACTATTTTTTTCTGTAAATTATGATTTTACTTGTGATCTATGATACACTTAAGATTCCAAATTCCTACAACA:1 - chr2R 18831386 3' - Bari1 1499 1 71.53 CATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATG:1 + chr2R 17890948 3' - Tabor 6907 2 70.00 ATTTCAATAACTTCTTGTGGAAGATTAATAAGTGATCCGTGTTATCAGTTTTTGTTTTTATCATTAAATGTTACATACAACCCAATTGTCGGACAGAGAAGGTGTGTTTGAACTAACGATGCGGATGCGGTGGCCCATGGCATG:1 + chr3R 5465805 3' + hopper 289 1 50.69 CTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTTTTGTTTTTTGTTGAGACTAGGGGAAGTCCCTTGCCGGCCATCTCTTTCCTGCATCTGCATCCGTCCCTGTCGCACCTTTCCCACCGGGCACGTG:1 - chr3L 2885186 3' + S-element 1704 1 68.12 CACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAG:1 - chr2R 3338795 3' - Juan 48 1 58.54 TTTATGTTATTAACTATTTACTTAACTAAATGAAGTGATTTTATACGGAGCTCGATAAAAACACGTCTGTTCACTCTGAAGGTTCAGGGCCGCGTCGAAGGCTCAAGTTGTTTGTTGTCTGCGCGCCGATTATG:1 + chr3R 23147325 3' - Doc3-element 65 1 64.18 CTTCCTGAGATCTCGACGTTTATAAGGACAGGTTCTGATCTTGAGCTAGAAAGTACATATTTCCTTTTTTCGGGTCGAAACTTTTTTTATAAACTACTACCTACTATCTACTACTACTTAAGTATTTTCAATCGATTAGGGTTGTA:1 + chr3L 10097486 3' - INE-1 140 1 56.85 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTTTTCACAACGTTGAGGGTATAGAATCATTAATCGAGTTGGCAGCACCGTGTAGTTTCACGTAGGGACGAAGCGCATTG:1 - chr2L 6318873 3' + pogo 2062 1 57.24 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGGAGTAAACACTTTGTCGACACTTCCATCCACC:1 - chr3L 7995395 3' + P-element 2846 1 57.04 GGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTT:1 - chr3L 24152432 3' - HMS-Beagle2 6933 2 52.78 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATTACAATATAAGTTTGGGTAATTACCCAAGCAGCCGAAACACAAGCTC:1 - chr2L 10184435 3' - Doc 69 1 67.15 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACGCGTTGCCGCCACTAAG:1 + chr2L 17240318 3' - hopper 44 1 56.72 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTC:1 + chr2R 5923022 3' - jockey 4736 1 65.47 GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTACTAGTCTCCTGTGTG:2 - chr2R 22723001 3' - 3S18 5805 2 56.85 TATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTTAAACA:1 - chr3L 22054961 3' + mdg1 7010 1 53.79 CCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAATAAGACGTTTTATTGT:1 - chr2R 8641477 3' + diver 202 2 66.15 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTCTTCGACTACAATTTGGGAATACAACAATTTGGAAGAAAAGGCGGTGTGGCAT:1 - chr2L 3659073 3' - 412 7111 2 59.85 TATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAA:1 + chr3R 934273 3' + Rt1b 4724 1 49.31 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTGGTCTACAGTGAACCCCTGCAAAGTGGCACACAATCCGTCTGGCT:1 - chrX 9707151 3' - Doc 42 1 62.62 TTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGACCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTGTGTATTGGGGGTGCGTGTTTAATTTCCACTTGTCGGG:1 + chr3R 20175814 3' + hopper 1377 1 58.16 GATAGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAACACGAACTCTAGATAAGTCACCCATTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAAAGAAATAGTAATGCACCAACCCTCCTGTCAAAGGACACAGAGAAAGTGCTAGTGC:1 - chrY 388276 3' + Idefix 125 2 62.33 AATAAACCCGCCAGTGTTACTGTTTAGTTTGATTTATTGGTTAATTTCAGACACTTAATATTAATTAATTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTTGCAGATCAAAAATCGAGTGGTTTGCAGAGGAGGCCCGTCGC:1 - chr3R 25626024 3' - 3S18 332 2 79.26 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGAATTATTTATAATGGATAGTGTGGGCATGCATATGTATATCATATCTAATTGACATTGAAGGAC:2 + chr2R 23287573 3' - roo 23 2 67.12 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGAATGAGTTGATTTCTTTCCGTGTAATGTTTGTTAAAATTTTCACCTAACTCTTCCAACTACCTG:1 + chr3R 20744075 3' - roo 35 2 53.60 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTCGTGATATTTTCGTTTTTTTCAT:1 + chr3R 4528413 3' - F-element 85 1 71.92 GGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTAT:2 + chrX 22574698 3' - 17.6 7039 2 45.89 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTCCATTGTTGATAGCCGATTGCAAAGACTTGTGCAA:1 - chr3R 28627573 3' + copia 5084 2 57.53 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATATGATTTATGCGCTGTTTCTAATTCAATTTAGACCCGTTTGTTTGCTTTGGAGGTAGAAGGAAATGGAAGCAAACTTGTTTGCCGC:1 + chr3R 23010137 3' - I-element 33 1 63.01 AACACCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGGACAAGATTGGCATTGCAGACAGTAACCAGCTGGAGTGCCTGGCCGTCAACTTCTGCAAC:1 + chr3R 29497706 3' + baggins 5113 1 71.67 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTTAATTTATGATGGCAGTTTGTTATGCCGCGCCCGTCACAACAAAAAC:1 - chr2L 12353940 3' - jockey 4742 1 68.28 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACTACTTTTTAAT:1 + chr2L 16089699 3' - 3S18 21 2 63.11 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAAAAATAATTT:1 - chr3L 10133514 3' - 412 75 2 67.81 ATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTCTTAGATTTGCTTATTAAGGTGGTATAGTTTTCGC:1 - chr2L 8956752 3' - pogo 79 1 71.92 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTGTTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAAGTGCTTTAAATCAAGTTGAACCACAAATCGTACAAAT:1 - chr2R 23000061 3' + mdg1 7408 2 64.66 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTGAATAAATGAATAATAATGTGACCAATGTAACGTTTTCGATAACGTATCGTACATCTTATTCA:1 - chrX 16787071 3' + pogo 2047 1 57.53 TGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGAAGGTTGAAGTGGTACTGAGATCGTTGAAGATAATGAGATGTGTGCCACGTAGATAGACTTCTGTTCCATTGTCCACCGTATACCTGGCTGGCCGGTCATTGATGATGATGATTCCCTCCGC:1 - chr3L 7937071 3' - I-element 21 1 63.01 GTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTGAAAGCGTAAAGGGTAACATTTAGCTCATACCTTATGCATGTTCGCAAATATCTATTAGTATCGGCTGAGTTCCA:1 + chr2R 1007745 3' + Ivk 5360 1 63.08 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATTTTCAGCACCTCTTCCTAAGTTTTCCGGGCGTTGCACGTTGGCTATTGCAGCCATTACTCAAGCGACAGCAACGGGTGGTCAC:1 + chrX 5859017 3' - hobo 38 1 55.48 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTGTATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTGGACAAGAATGTCTCGAGGTCATTTGGTTGACAT:1 - chr3R 16913324 3' + pogo 2072 1 64.38 TACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATTTCACAGG:1 - chr3L 25406601 3' - 1360 7 2 64.83 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAGCCCCAATTTCGGCGGTTTG:1 - chr3R 21705956 3' - 297 6590 2 70.09 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATGTCACTTTTTTCGCATTTCTTTGTTTCTATATGTATGTATGTCTATATGTAACCGTACATATAAAGGATTTAAT:1 + chr3R 13122610 3' + blood 331 2 52.05 ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACA:1 - chr2L 17210271 3' + jockey 4923 1 65.75 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGAC:1 + chr2R 5955025 3' + copia 5086 2 64.38 GGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGGAAGCCAAAAGACGAGGAAGCAGCTAGCAAGCAAATATTGAGCGAAAAGGCAGCAACAATAAAATCGGGCCAACAAATACAACAGCACACACAGTTAAAGA:1 + chr3L 4001470 3' - hopper 1406 2 80.92 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATACGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAACACACTGAAATATTAGCACCTCGGACTGAATGCATAAATTAAAGTGA:1 + chr3L 16358744 3' + 412 421 2 67.81 AGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCAATGTATTTAATTTTGGGTTTTATGATTATGAGAAAACATGCTTTTGCATTTAGCTCAGCACT:1 - chr3L 10150586 3' + blood 7140 2 52.74 AGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAA:1 - chr3R 4504039 3' + INE-1 550 1 67.80 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACT:1 + chr2L 16089692 3' - 3S18 5789 2 61.02 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCATCTTTATCTTATTATTAATTAACTATATTGTGATAGGTTCAACAAGTAGTACGG:1 + chr3L 24104300 3' - Max-element 8266 2 52.73 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCGTTTTTGCCTTC:1 + chr3R 3320525 3' - 1360 72 1 67.12 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTG:1 + chr2R 13644519 3' - Burdock 6179 2 54.55 AGCCGGCGGGCCTGAAAGGGGTCACCAAGGTGACAAAGGGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAAGTGACTTTAGTAACTGGTTTTAAATGATCCTTTATATACATTCTCGTTGCCCCAAATAAAACAGCTGACTATAAT:1 - chr4 353412 3' + BS3 1694 1 51.37 ACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACATACGTCATAATCTGCAAAAACCGATTTCGCCCACGCGTCTCTTCTCACTCCACCACAATCAACATCACTTTCTCCATCTCTCTTTCTCTC:1 + chr3L 20104788 3' + Doc3-element 4458 1 61.43 GCCCACACTTTTAAAAAATCTGTTGGAAAGCTTTTTTCCACGCCCATATAACGCCCTTAAACTGCTGAAAACTGCCAAGCGATTTTTTTTAACATTTTAGTGTGTGTGTGAGCAGCATCTTGTGGTCAGCTTGGTGTT:1 - chr2L 17321555 3' + INE-1 256 1 71.01 CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAAAAACAAATGAGTTGTGTAATTAATAC:1 + chr3R 18815989 3' - hobo 35 1 60.45 AGACCTCACTTTAGTGTGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAAATATTATTTTATTATAGGTGCCAAACATATTCATTCAATCTTATCTCG:1 + chr3R 30583860 3' - gypsy12 65 2 66.67 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACA:2 + chr2R 19555026 3' + pogo 2036 1 64.38 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGTACTGTGTGATATTGAAATATGTGATTATGATAAGAATCATGCTTGAAATATATGTGAAT:1 + chrX 6707860 3' + hopper 1359 1 56.85 ACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAATACAAACCTGTAGATTGATTATCCATTTTATTCAAGTATTAAAATGTTTTCTCTTTTCAGAATGACATCAGCCGCTT:1 - chr2R 11898622 3' + hopper 1071 2 66.44 GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCTTATCTTCATTA:1 - chr3L 25782378 3' - F-element 93 1 74.66 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATC:1 + chr2L 9485683 3' - 412 7114 2 58.62 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAGAAGTAAAAAATGTGTCAGGCCG:1 + chr3L 22978667 3' - 1360 19 1 70.50 TTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTC:1 + chr3R 10030778 3' - BS 5078 1 63.01 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAA:1 - chr2R 8305225 3' - roo 8739 2 71.92 ATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATT:1 + chr2R 21402692 3' - mdg3 65 2 58.90 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGGGTTCAAGAAAAAGCTTACCTAAGGAGGCGCTAAAGTTTAAGGAGTTTACCT:1 + chr3R 17656504 3' - mdg3 31 2 61.64 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCGAATGCTGTGAAAAATCGAGGGAAATATTTA:1 + chr3L 22052906 3' - mdg1 7045 2 80.82 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAGTATCCTCGCTGCC:1 + chrX 4785162 3' - roo 8734 2 67.81 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATGATCCTGCCTGCGCAAAAGTTTTGTGAAGCAG:1 - chr3R 8709795 3' - jockey 4724 1 69.37 TTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATAAGATAACAAAACAACATATTTGAAACCAAATAAAATACAAGCACA:1 + chr3R 4581944 3' + 297 323 2 68.49 AAGTAAACAATAAGTTACAAACAAATATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATATATTCTTATATATATTCTTAGTGCCGAACTACACCTGGTCTTCCAGTGCTGGGCATGAATATCGCATAATTATATTTATTG:1 + chr3L 8397873 3' + Tc1-2 1576 1 48.28 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCGATGTGGAACGATACATTTAGTTGATTTTTCACTGGGAG:1 + chr3R 26520501 3' - FB 3 1 79.49 CAGCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGTAAAAAAA:1 + chr2R 3104469 3' + Gypsy6A_LTR 340 1 69.86 AAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGGGGAGCTGCTCCACATGTGTCTGTGCGTGTGTGAGTGAGGCGGCGTG:1 + chr3L 4001184 3' - hopper 59 1 67.16 AGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGATGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGTGCCGAGCACGTGGCTGCACTGAGAAAAACTATTCACAAGTTAGGCAATGCAG:1 - chrX 6913926 3' - F-element 441 1 59.23 GGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGTGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGATGGCCATTCGATATGGCGCGTAATGGGCACCATTAAATTGGCCCCGTCTGC:1 + chr3L 10595406 3' - G-element 4242 1 65.07 AGTTGTGTTCAGATTAATAGCACTGCCATTTAGTTAGTTCTTGATTCTAAGACAAGCAGATCTTAGTCTTGGGCTAAATTAGTTGCACAGGATGTAGGAGTAGTAGTAGGAGCATGCATCTTCGTCTTTTCTAAGACACAAAGTA:1 - chr3R 25239176 3' - HB 1626 1 51.72 GTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTAAAACGGAACCTCTTCTTTGTATGT:1 + chr3R 22516098 3' - jockey 4577 1 70.55 AGGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAAAATTCGTGGCAAGCTTTTGACGAAGCAGCGCATTAGCAAC:1 + chr2L 18280018 3' + gypsy5 7337 2 73.68 AAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATCAAAGTCAAGTTACCATGGGCGGCCGGCGTTTTCCCCTCTC:1 - chrX 18933535 3' - FB 82 1 75.34 AAAGAAAGAAAAAAAACAACAAAAAGAAAAAGAAGAAGAAAGAGAGGAGCTCCCGAAAAATGGGAGTAATTGGAGAATCCTGAGAGGATTGTGCGGGAAGTTTTTGTTATTTCAG:1 - chr3L 26003590 3' + gypsy7 5009 1 66.09 GATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTGATATTATTTATGTTTATTATAATTTATGTGATAATTTTATAATCATAATATTTATTAAAATATTCTCATACTT:1 + chr3R 17794938 3' - Stalker4 7120 6 71.23 TATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTTTACCTCTCCGTAACTCTACCGGAAACTGGTCTCGCAGTGTGGGTTAACTTTTGAGTGGCGG:1 - chr2L 15234657 3' - 1360 15 1 78.22 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCATTAAAAGCCAACACCCTTAAAAGCCAAAAGCATTTGGTTCTTAACTTCCACTCTCGAAAGAGTGGACCATAAAACTGGCTTACA:1 + chr3R 28627717 3' - copia 38 2 61.64 ACCATTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATGTGTAATAGTCGGTACCGAAACTAAGTTTCTACGTTTAATTTACAAAAGAACATCGAACAACTGAAGTAGAACATATTCGTTTATAAACTATACATGA:1 + chr3L 8313755 3' - 1360 2964 1 53.42 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACAC:1 - chr3R 30634925 3' + roo 9013 2 56.16 GCAGGCACACACACACACACACACACACATGCTCATACACGTGCACAAACACCCGCACAACCGACCAAACACTCACACACACATATGTCGTTAAGGCCAAAGCTGTTTGTACACAGTTTGACTTTTATTAT:1 - chrX 9955463 3' + accord 7025 2 68.70 GCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCA:1 - chrX 20999489 3' + BS 5050 1 53.10 CCCATGAGCAATCCACTCAAGAGGGCATCCAATCCAACTGACATTAAAAATTCCAACCGGACAAAAAAGCCCATAAAGGATCAAGGGCCAAGAAATGTTGACAAACTGACTCATTGAAATAACTAACTACACCGACGCACAGACTG:1 + chr3L 26386100 3' + Quasimodo 413 4 71.23 TATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTAT:1 + chr2L 10507868 3' - FB 934 3 92.86 GGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATCATACAAACATTATTTCTTCATATAAATCTTTAAAAAGGCAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACAAATTGCCAGAAACTGTTGGC:1 + chr3L 24934431 3' + HMS-Beagle2 283 2 67.81 GGCATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCGTTCTATCTTGCTTTAATTCTATACCAAAGATTCCTATTGAAGAAAAACACATAAACACATAAGGCATAAACAAACTAAGCGACGCCTCTCCC:1 - chr2R 3587222 3' + INE-1 557 1 52.00 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGA:1 - chr2R 12787821 3' + 297 6901 2 73.29 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATCAATAGTTTAAGTTCTTTTTAATGCCTTTGGTTAATTTAATGCAACTAGTTAATGTTCTGTGCTCTATCCCTAGCTTATCCTGGTAGATCCTTCTGTGTCCGATC:1 - chr2R 14047577 3' - mdg1 7056 2 69.18 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAGAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCCACATACCTCTCCACTGCTCTGCTGTTCATTAGTACCCCATTTTGGTTGGGCGACTC:1 + chr2L 6184105 3' + pogo 2050 1 58.52 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAGCATCG:1 - chr3L 24152401 3' - HMS-Beagle2 6900 2 71.83 TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGCCGAGTAAAACTGACTATGTCCGTAATTTTTCCCTTTTTATATGAATGTCTTGTAAAATTCTACCACCAAAAAACTATTCTCTCTTGTTT:1 + chr2R 12994976 3' - BS 5024 1 63.70 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATA:1 + chr3R 16181254 3' + roo 9031 1 57.53 CGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACA:1 + chrX 21667911 3' - gypsy2 77 2 77.34 CACACACACACACATACATATTGGTTTAACATTTAGCCACTTGGCTCGAATGCAACGGAAATGTTTAGGGCATCGTTCGCATTCACCTCGATTTCCATCGATTGT:1 + chr2L 12363524 3' + Quasimodo 40 4 60.95 AAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAAAATTCGTGGCAAGCTTTTGA:1 + chr2L 18279998 3' + gypsy5 7315 2 59.26 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATCAGTCAGTTACAGG:1 - chr3L 17175089 3' - 412 7087 2 62.33 AGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCT:1 - chr3R 11750188 3' + Tabor 422 2 65.91 GAGCGAGAGAGTTAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGTAGAGTAAATTGGTGGCATGTTGTTGTGTCTGTAGCATGTGTAAGTAGTATTCGA:1 + chr2R 23756666 3' - Cr1a 287 1 65.47 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTATTTATATACAACGGCCCATGGGCCGCAAATAAACGAACAACAGGCGTCGA:1 + chrX 14559355 3' + 297 6913 2 67.12 GAGATTTCGACGTTCATACGGACATACGGACACGGCTAGATCAAAGACCCTAGAATATATTATCCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGGTTATTGATCCTGATCAAA:1 + chr2L 21737999 3' - 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roo 8884 2 67.18 ATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGAC:2 + chr3L 22648362 3' + Tabor 401 2 72.60 ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCATTGCACAGAGACTTGTTCGGA:1 + chr3R 13176448 3' - Burdock 60 2 60.27 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAG:1 + chr3R 9160757 3' + copia 5053 2 63.64 AAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCGAAATTGCTCTCTTCTATTCTGTCTGGTCATTGTTATACGA:1 - chrX 13320254 3' - 1360 3370 1 73.27 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTTTGCAAAACGAATATATTACATACATACATATGTATGTCGCAGATCATTTAAATGTA:1 - chr2L 22762324 3' + Transpac 5169 2 60.96 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCGTGACCGTGGCAACGAATATCGACAAGCTGTTGGGCGCTCTTCCCGTGTGGAAACATTTTTGGCTATTTTTTTCGCCAAAAATTTACATAAAAATCGCATTA:1 - 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Rt1a 196 1 79.71 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGACAAAAATCATTATGAGAATTGTAGAGAATGAAGTTCATAAAGCGATGGAGAAGTACCAAATAGTTCTTAGTTTCAAACACAATA:1 - chr3L 20594098 3' + roo 389 2 68.70 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATTGCTTTTTCAGAAGTAATCG:1 + chr2L 6319013 3' - pogo 46 1 54.11 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCT:1 - chr3L 9907384 3' - jockey 76 1 76.27 GGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTATTTTTTTCTTATATAATAAAATTTTGTTTGGCCTTTTAGTTAACACTTTATTTTGTGTGTGCACCACAGTTGTTTCTT:1 + chr3R 30295220 3' - Quasimodo 41 2 51.37 GCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACACACGCACACACTCGTGCACACACACAGGCGGACACTCAGCATATGCAGCAGCAG:1 + chr3L 17175213 3' + 412 465 2 54.13 GCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGTTAACATGGGAGAAAGCTTTCTCCGCTGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGTGCGCCTGAAATGGCAACACACACAAACTCATTTG:1 - chr3L 14594060 3' - I-element 225 1 60.96 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGAAAGCACTATCGTAGAGATGGGGCGCCAGTGCTTGCGATAGCCCAATCGATATATCGTATATCAGCTG:1 + chrX 14826211 3' - P-element 49 1 50.68 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAAATCGCTGCCTATCTCCCCACCCCACCCCGCCAACA:1 + chr2L 14095643 3' - pogo 49 1 68.42 TTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTATTTATATACAACGGCCCATGGGCCGCAAATAAACGAACAACAGGCGTCGATGGCACAG:1 + chrX 14559363 3' + 297 342 2 61.11 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCCTTTGTTGTTGCG:1 - chr3L 11336313 3' - blood 15 2 65.60 GTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTGTGGGTTCCTGGAGTTGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGG:1 + chrX 21907826 3' - springer 460 1 71.57 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAAC:1 - chr3R 17605620 3' + Tabor 437 2 51.72 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCAACACTGTCGTTTAACTATTTC:1 - chr2R 16441799 3' - I-element 54 1 53.42 CTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTCGAAACCAAGTTAGCAAAATACATTGCATACTTTAC:1 - chrX 6707775 3' - hopper 82 1 73.97 GTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGGCGGAGGTCAGGCGGAGGTCAGGGGGCGGACGTGAAT:1 - chrX 8755052 3' + transib2 2741 1 73.29 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACAAGTTAATCAACCATGAACTTTAAAGCCCCGCTCTGAAATGCAAAAAGGACAGCAAAGCCACCAGCACTAACCGCACTCGAGACCCAATAATGAATTT:1 - chr3R 24476239 3' + 412 7520 2 66.44 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTG:1 - chr3L 17175113 3' - 412 7111 2 55.48 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACACACGCACACACTCGTGCACACACACAGGCGGACACTCAGCATATGCAGCAGCAG:1 + chr3L 17175213 3' + 412 7506 2 50.41 GTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTAAACGATATTGCAGTCCAGCCCCATTGCATATTCAA:1 - chrX 22690218 3' + R1A1-element 23 1 75.34 AAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATATATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATGTGCAGGGATCTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACATCTTT:1 - chr3R 29288735 3' - BS 5070 1 65.75 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACC:1 + chr3L 25401039 3' - Doc 30 1 56.16 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACTTTCTCTCTCTGAGCAGTCACTGATTACCG:1 - chrX 8891738 3' + P-element 2853 1 57.36 AATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAATCAGGGCGCGAATTTTTAAATTTATTTATTGCTACGAAATTGGCCAATCCATATACTCGAATCAGAATTAAGCATCCTTAGACAGGGACGTATGACCATTACAGAATTTTACAACG:1 - chr3R 4149974 3' + 1360 3016 1 50.69 AAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTAAAAAAAAAATATGTATACATTCTCAATTTCAGCACACAAAAGATTGAAGTATCTTTTAATGCTGTTGCAAAGTATGCAATGCTTTTTTAAAGGAAAAGTATATATTCAAT:1 - chr2R 8642852 3' + Doc2-element 4745 1 67.81 ATTAAGTTAACTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAACGGTTGAACTAGGACATTCAA:1 + chr3L 23042139 3' + pogo 2043 1 58.90 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGGCAATTGCCGCAAATAGGTCAGTTCAGATGGAGGTTACTGAACTCTCTCGCCCGC:1 + chr2R 10865273 3' - blood 7046 2 60.00 TTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAA:1 - chr2R 5917835 3' - I-element 5129 1 71.23 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATCTAACCGTATGTGTGTGGGTGTCAACGCCCCTCTGTGGGCGTGGCG:1 - chr2L 17240187 3' + hopper 1393 1 67.42 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAAC:1 + chr2L 3294180 3' + hopper 1411 2 55.56 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACAATGAAAGCGATGGAGAGAGAACAGGAAAGCCAGGCTAAACTG:1 - chr3R 25387786 3' - roo 8726 2 67.94 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAAGGTATATCTACATAAATGAACTAATATTTTGCTT:2 + chr3R 29645755 3' - jockey 91 1 74.66 GGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATGGTATATAAATAAATCCTTCGAGCATTCCCATTATGTAATGGTAACATGGTAAATAAATGGATTTTAGATTTAATTTCTCATATATATTTTATAGCTTTGCCAAGCTGT:1 + chrX 10161250 3' + micropia 447 2 77.40 GATAACAACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATATATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGGAAAAAATAATAATAAAAAAAGTTTATACGTAAGCGTTACTATGATATATG:1 - chr2L 19817832 3' + G4 3773 1 65.73 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTTGGCAAGTTCTGCAACATTTT:1 + chr2L 5202576 3' - 297 18 2 57.78 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGGTTTTAGAAAAAGCTTTCTCATTAAAACTAATGACAATAAAAAGATGTAATAGTTGTTCATATATCGTAAAG:1 + chr3L 16212840 3' - Transpac 4964 2 53.10 ATCGTGTGGCGTTACACATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAATACCCTTGCAACTAGTCAGCCAGTAACATGGCTATGCATGAAACTTTTCCCTAACATGAAGGAGGAGGCCGCCCATTAAACTCCGCTTTTATGATGCTGTTT:1 + chr2L 3467256 3' - 1360 19 1 67.81 TGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGGTAAGAAATATTTTGGGGACATTTGTTATCATTGAACAGCTGTTCATAGTATGCCCACAGCCGAAC:1 - chr3R 11749632 3' - Tabor 56 2 56.16 TGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCA:1 - chr2R 5917820 3' - I-element 5114 1 60.96 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATATTTTATGTGTACATAGGTCGAGGGGAACCAACCGAACGTGTCAAACAAAGCCAACGTGAATATAAAAAGCGA:1 + chr2R 20489480 3' - 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chr2L 22132473 3' + pogo 2069 1 63.70 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACCCTCG:1 + chr3R 21001886 3' - 412 74 2 69.18 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCACCATTTGCTC:1 + chrX 6510083 3' - jockey 4745 1 71.85 CCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGAAGGAGCTCTAATCAGAGAAATGCTGTTGAAATAAATGTTCACACC:1 - chr2L 12340696 3' + diver 6089 2 68.49 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGCC:1 - chr3L 27350453 3' + pogo 2059 1 55.48 AGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCCTCGATTTGGTCCTCGAATGGATGCGATAGAGAAGAAAAAAAATACGGGGTGCCCGCGGCAGTGGGACAATG:1 - chr2R 14816133 3' + G2 2813 1 63.28 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCAGTTTTTTCGCAGCCGCGCTTGGCTGCCGCGTCGCTGCC:1 + chrX 8891826 3' - P-element 19 1 52.38 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTGTGGCCGAATTATGTAGCGATAGTTGTGTGACGAATTTTTGAATATTATATGCATTTTTCGCTAGTCCTTCCAGAGTGCTCTGTTTTTGAAAGCTGTGGCTTTG:1 + chr2R 6843014 3' - roo 38 2 73.79 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAGTCATTAAATTAAGTCACATCAAGTGCGTATACTTAATTTTTGGGCATGCTCTGTTTTTATGGCCAGCCATATGTACAAATCGCAAATTGGGCCGCATAATATC:1 + chr2R 23497178 3' - 412 7071 2 71.92 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTTGCCCGACGATTCAGATCCGATCGTTGGAGCAGCAAGTGAGAGTACGTCTCTTT:1 - chr3R 4197228 3' + P-element 2865 1 57.43 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAAAGCAAAGCAAAACCAAAACCAAAGCCCCAAAAAAACAAGCCAAGCCACCGACAAAGTGTTTCCGACTTTTTCGTAGATTTTTGCTGCCAGATTTTTATTGGCAG:1 - chrX 7515593 3' - roo 8678 2 76.03 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAACTACCAAATGG:1 - chr3L 17707813 3' - Doc 64 1 57.34 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGGCGTACTGAAAGAAGTTGTTAAGAAATCTATCAAATTGAAAGCAGTAAAGATCTGAACTATCCCACCTCACAGTACGCTTT:1 + chr3R 7539556 3' - roo 40 2 58.90 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTTCATGCTTT:1 - chr3R 7035230 3' + roo 358 2 52.05 AAAATTTTTATATTTAAATTAAGGGCTTTCTATGGAATTTTCCTTTTGATTCCAGAGAGTTTTAATTCTCAGCGTTAAAATTTACTTTAAAACCAGCGAATGAACGTTATATATGGCT:1 - chrX 6141683 3' + 1360 3039 1 88.14 CTCGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGC:1 - chr2R 16891858 3' + hobo 2849 1 77.93 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAATTTGT:1 + chr2R 5237922 3' - Doc 56 1 52.05 AACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCAT:1 - chr3L 24152464 3' - HMS-Beagle2 6881 1 65.00 CATTATTGACTCCCATCACATCAGTCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTGGCGCAGCCGGACCAATTTGTAAATATTTTTTTTT:1 - chr2L 9230544 3' + accord 7315 2 80.80 CGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAA:1 + chr3R 934282 3' + Rt1b 4732 1 55.17 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGGATTATCTTATTTCAAAAATTAGTTGGTAAATTTAAATGTAGTTTTAAGTAAAATATGAATAGGTTTCACTAGTCTTATGTGCCCAATT:1 + chrX 10567895 3' - roo 31 2 60.27 AAGATTTTCCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGTGAGGCTTTGAGTAACTACTATTATGCCATTACAGTAAATGAGTGTGGTTTTTAGTTCTATCACGACCATGAATATTCGATTCGAGTGGAGTGGGTCTGTTAATGAAAC:1 - chr2L 6868762 3' - I-element 71 1 49.32 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAGCGGTAATTGGTTGCCACC:1 - chrX 12138938 3' + roo 9006 2 64.38 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTTCTACCCCCTTCGGCTGGGC:1 - chr3R 22100479 3' - 412 7070 2 72.52 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCGGAACAGCTCGCTTATCGCCACTAACCTTCCGACCAATT:1 - chr3R 18815898 3' + hobo 2902 1 63.37 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCAAGCTGACTGCATGCCACTTGGCCAGTTTGAAGTAGATGCGTCGTATCTCA:1 - chr3R 25304702 3' - roo 42 2 58.22 GAAAATCGTCTTCTAGCACAAGTACGCACACATATACACTTTCACGTTTAAACGTTACTCACACAAGCAACCAAAGTCTATTATTTTACGCTCTCAAATTTATAGAATTTTAAATTAACTACGAAGACATCGAGAAATCATCATTA:1 + chr2R 10815511 3' + 1360 3199 1 66.44 AGACAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATATAATTATGAAGTATTATGGTATTATAAAGTATCCGATTCCACAAAACATTAGAGAGCTTCAAAGTTTTCTAGGCCTCGCCGGCT:1 + chr2R 2879977 3' + TLD2_LTR 149 1 91.78 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCT:1 - chr3L 17890749 3' - 412 86 2 75.34 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTATGGGCTGAATCACAAGCTTAAGCATTTTGGCTTGGGAAACGGAAGCTATTAGCACGACCCACAACAAAGTGTTTGACTAATTTTCCAAAAATGTTAAATAATCT:1 + chr3R 17114171 3' - roo 8678 2 76.03 CTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATATACACATTTCGTCGAATCTGGAGAGCCAGATATGCCAGAAAACCGGAGAGCGCAGAGAG:1 + chr2L 13419139 3' - ZAM 22 2 59.09 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATTACAATATAAGTTTGGGTAATTACCCAAGCAGCCGAAACACAAGCTCAATGATTCCAATTATTACATTCGGTTCACATTTTAATTTAAAACTCAACTTTTTG:1 - chr2L 10184380 3' - Doc 23 1 72.60 CTTTAAGTAGGTCCACAAATTTTCAATGGGGTTCAGATCAGGACTCTGAGGGGGCGTATCGATCACTTTACCACAGTTATAAGGGCGCCAGGTGCGTACAATTTCATATCCTTGGAGTGTTTACTCCTGAATCCTCGCTAATTTAT:1 + chr2R 21489980 3' - S-element 1252 1 68.49 AAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGAGCAACTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAGTACGGTTTTATGAAATGTACAATCAAGCGGCAATCAACAACAGCATTAGCGAGATGCCAA:1 + chr2R 24552997 3' + Q-element 142 2 70.31 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCC:1 + chr3R 24476374 3' - 412 61 2 59.59 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGAAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGACTTATT:1 + chr2R 23287516 3' - roo 8744 2 72.60 CCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTACCCCGGATCACTCAGTTGGCCGAATCAAAGTCGACGTGTCCACACGTCGTCGAAGGTGTTGCATTTGGCTAATGGCTAAATCTGAATATAAATCCTG:1 + chr2R 11143830 3' + I-element 109 1 68.49 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGTTTGGGATCCAGCTAAAAAAAGCCGAGGCAGACA:1 - chr3L 13827238 3' - hopper 40 1 58.22 AAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAGAAAAACACAAAAACAATTAAGAATATTAATAGA:1 + chr2L 22780913 3' - HMS-Beagle2 6968 2 76.03 AAGTCACGACAAACGCAAGAAATCGGTTTATAGCTAAACGGGGGACGTCACCTATCAGATTTCATCTTCAAAAAAATTTAAACTACTGGATGCACCATTATATTTTTTTTTAACTAAATCAGCAAAGGAATAAAGTTTTATGTAA:1 + chrX 23035857 3' + mariner2 714 1 52.41 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCTTTCAAATGGTGAGATTAAAAAGAATGATTTTTCAAACGTGCTT:1 + chr3L 16496708 3' - jockey 4782 1 69.01 AAATGCGTGCCAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTGCCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTCCAAACGGAGCACCACGTTACGTATAACATTGATCTGATATTGCAGAAGCATGCACTCATCAT:1 + chr3R 10323188 3' - diver2 4639 2 56.55 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAACCGCACACGAAACACAC:1 - chr3R 28396615 3' - jockey 91 1 72.60 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATCTAGCGCAAATCCGAGCAAATAATTATTAAACAAATACTTCTATTTACAAAAACACATCAAATATTTAGTTAAGCCAAAATGACGCGCAGCATTTTA:1 - chr3R 13122455 3' - blood 7027 2 73.57 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGACAGCCCATTA:1 - chr3R 30634907 3' + roo 9033 1 59.03 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTT:1 - chr3R 7035238 3' + roo 350 2 57.53 AATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGGCATATTTGCATACATTCTACTACTTCATAATGCCCAAAACGCATTGTATTACAGTCG:1 + chr2R 22723118 3' + 3S18 288 2 56.39 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCT:1 - chr3R 19589900 3' - BS 5043 1 49.32 ATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAA:1 + chr3R 15022117 3' - Tabor 67 2 60.96 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACAGAACAGATGTCATTGTGGTTTTGGTCTGATAGCGTCTGCCAATTGGTATATATTATACACATTATATTAATTCAAAAACACTCGGGTACG:1 + chr3R 24509183 3' - FB 32 1 59.59 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTCGGACAACAAAAGTTGTGTTGCCGTTATTCATCGCTTCTTAAAGCGGCTCAAAACTTTCGCCTGTTAGC:1 + chr3L 12867412 3' - roo 8683 2 71.03 TATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCAAGAAAAAATGATATGGAGAATAAGTTAAGAAACCCAGCCTAGAGGCAG:2 + chr2R 19553339 3' + mdg1 7458 2 81.51 GTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGTTATATCTCTAAAAGCTCACATCGGGGTTTTAACAGGGTGTGGAGTGCTCTAGGTCGGCAGAT:1 - chr3R 3737945 3' - HMS-Beagle 6850 2 55.04 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGT:1 + chr3R 27822305 3' - I-element 48 1 52.74 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCT:1 - chr3L 27350461 3' + pogo 2051 1 54.79 CACCCCATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGAATTAGCTAACTACCCAACACTTGCATAGAACAACCGATATTTCCGAGCTACCATCTCTAGCTGCACA:1 - chr3R 24917830 3' + accord 7007 2 58.14 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTCAGCATATGCGCGCACTTTGCATAAATTCGCAATGTCGCAACTTCTAATCAATACCGCCAAATGTGTGCGCAGAGCTCAGTGAGTAGTCCATT:1 - chrX 1523673 3' - jockey 27 1 72.86 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCT:1 + chrX 4785159 3' - roo 8733 2 69.01 GCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAAGGTGGTCTTCCCATTAAAAAATGACCTGGTGTTAAAACTTCTTGT:1 - chr3R 19447731 3' + roo 8921 2 68.31 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTC:1 - chr3L 17890737 3' - 412 74 2 67.12 CCTGAATGTAGTGACCTATATAACAATTGATTTAAGGCAGTAGCCCCTCTTGAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGACTGCTGCTGCACGCTGTACTTACTTAATAGC:1 - chrX 21585273 3' - mariner2 277 1 63.87 ACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATAATTATGTATATTGTTTTGAGCTTAAGACACCTATTATTTGTTAGTAGTAATAGTTCACTCAACATACATATATTTTCGTAACGATCCTGTAAA:1 - chrX 4292812 3' + S-element 1698 1 72.54 TCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAAAAGGTTTTAAGCGGAAGTGCGCAGAGTTGCAGCGACA:1 - chr3L 12955425 3' - invader4 2745 1 74.66 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATTTTAATGGAAATTGAAAACTATGCAATAG:1 - chr2R 5922921 3' + jockey 4977 1 56.85 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTATGGGCTGAATCACAAGCTTAAGCATTTTGGCTTGGGCAACGGAAGCTATTAGCACGACC:1 + chr3R 17114126 3' - roo 58 2 59.31 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATAATGACCGGCATTGTGGGGGCTTGGAATTGAAGAGAAGTGATTGCAAGTAGTTTTCTGCGAAGTAGTCTATAGTGAAGGTTTATCGTCTAATAACTTT:1 + chr2L 436595 3' - copia 20 2 70.42 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACTCATTATCTATTCCAAGAATTATGATTATCAACTATTATGTATTAATGTAATCAGTTTAAA:1 - chr2R 20673630 3' + mdg1 362 2 57.53 ACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATAGGGCTCTTTAAAGTATTAGTTTTATTGCATATTATTATATTTTCTACAAACTTGCAAAAAGGTTGTTCAGACAG:1 - chr2R 15829483 3' - invader4 2779 2 67.20 TTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATAAGATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAATATAGTCATTTTGTTCGTTTTACGTTTTTTTTACACAACTACAAAATTACGAAATTTCAT:1 + chr2L 21951261 3' + Burdock 234 2 69.86 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGAATGCACTCTCTCACTTATCCGCTCTCACTCTCAGCAGACTGCAACTGTAAATTGTAAAGGGAA:1 + chrX 14951209 3' + P-element 2833 1 46.90 TTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTACCTTTTGTGCCTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAAATCTACTTCACCCGCCCCACTAATCAACAAACGCGTTAACGCCACTTTA:1 + chr2R 8495037 3' + Cr1a 190 1 64.75 TATATAGCAATATATTAATTTTAAAAATTTAAATGGAATCGCAAAACATAATCACATATTGCTTAATACAGTAACTTTATCACATATTGTTCTATTTACCCAGCTGATCGGTTTTTATTTATCAATTCCTGATGACTGATTTGGCA:2 + chr3L 4733420 3' + Tc3 292 1 80.14 CATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCCCCTTCTTCATCTGCCCGTTCCTCCAGTTTAGCGGGTTCTTTCTGATGGAGAAGGACGCTCCGGTGTTTTTGCGCTG:1 - chr2L 3295588 3' + hopper 1135 1 63.11 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACAGAGGGAAAAATAAAAGATTGCTATTTTAGGAAACATGAAGAGATCGCAATCATTATTTACTTTAGTGTTAACTTACTCAACTGCAAAC:1 - chr3R 10472661 3' - mdg1 30 2 64.58 AAAAAAAATAAAAAAAAAAGTGTGGGGAAGAAAAAATCCCTCGTTGAGCTTTGCATTTAATTGAAATGACCGCTAACGGTCGACAGAGGACACATCAAATGGCCTGA:1 - chr2L 8627415 3' - hopper 142 3 82.24 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGACACACCGCTCATGCCACTGGTCTTCTGTTATCTGCTGGGGGCCCAGTTTTTGTGCTTGGCTAGCAGATGCAACCCCCCAGCTGC:1 + chrX 2773575 3' - jockey 4770 1 71.43 TTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGTTAAGGGGTGGCTCCTTAACAAATGAA:1 + chr3L 14076270 3' + roo 8981 2 80.14 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAGTGTCGAT:1 + chr3L 22642900 3' - hobo 63 1 74.79 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGGAGAAGGGAAATGTGCTGATCAAATAGTATTAGTAACACTAATAGTAATATTTAAAATCTTAAAATATTTTATATAAAGGTTTCGAA:1 - chr3R 20743942 3' + roo 9038 1 62.33 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACAAAGCTGTGCAAAAATATTTGGCTTAGTATAAAA:1 + chr2L 1260047 3' - Burdock 6163 2 62.33 GGGGAACTCGACTATAGCATCCTTTCTTGTTTTTACATTACAAAAGATTTACAAAGATCTGTGATGCCCGACAGATGAGAGAGTAAATGAATTGAGTTTTTGTTAGGTGGTTCAACACGTAGAACCTATTCTGACCAACA:1 - chr2L 21335290 3' + INE-1 571 1 65.00 TTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTC:1 + chr3L 23702242 3' - G4 70 1 65.00 GTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGTTGTGATCCTAGAAGCGTTCTTGGTCTTTGGTCTT:1 + chr2R 4677398 3' - invader3 5204 2 71.23 CAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGGTTTGTATGTGAAAAAGGAGGCGACAAAAAAGATGCACACTAGCATG:1 - chr2L 10109437 3' - 17.6 98 2 76.39 AAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGAGCACT:1 - chr3L 2725009 3' - Ivk 104 1 74.66 AGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATATACATTTGCAGTATAGTATCGCAGTAATCTGTGATGGAAATACTTATTAAATTTG:1 + chr3R 29418825 3' + mdg3 237 2 75.34 GTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTC:1 - chr3R 28627622 3' + copia 5035 2 78.08 GCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTGTATTTAATAAAATGCCTGGAAAGTAATTTCTTTTCCAGAATTAGTATAAATGTTTCCTGTATCCCGTAAAATAATCAAACACAAAGAACGCCAGAGAGAGA:1 - chr3R 30544461 3' + S-element 348 1 78.08 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAACATTTGGAAATTATTGTATAATTTTTTAAAGTCTCTTAATAGCAGTTAAGAAAAGAA:1 - chr3R 13631352 3' - 297 6642 2 65.07 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCCTGTCGTTTAATATCCCAGTCGTAGCTATGAAATAACTAGCAAAATAACTCATTCGATGTTTTTCCAAAAGGCCTTGGCATTAACGG:1 - chrX 1061495 3' - 412 26 2 61.87 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACGCGTTGCCGCCACTAAGAATTTGTTTGTCCAT:2 + chr2L 17240333 3' - hopper 41 1 58.22 GCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAAC:1 - chr3R 17660025 3' + micropia 5409 2 55.88 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAACACACTGAAATATTAGCACCTCGGACTGAATGCATAAATTAAAGTGAACTTTTATTTTTGGGGGAACAAAACAGGAAGTCAT:1 + chr3L 16358779 3' + 412 7509 2 56.16 ATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGCGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATTTTCTGTTTACGTTTATGACAGTTTTTCATACCCATTTCCATTCCGCTGCC:1 - chr3L 9426152 3' - gtwin 7389 2 60.16 AAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTTAATTTTCTATGACCCACAACATCTAGACTATGAAGTCAGACTTCGTCAGAGCTTACGACCAATGTGCAAATGAGCTGATTTTCTATGCTATGC:1 + chr2R 12265273 3' - jockey 4550 1 63.70 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGCATTTTTTTTTT:1 + chr3L 16580344 3' - 412 7116 2 66.67 CAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGACTCA:1 + chr3L 24152553 3' + HMS-Beagle2 7144 2 54.11 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCTGTGCAATATTCGCGGCGTTTCGAGAGAAAG:1 - chrX 3996486 3' + roo 350 2 58.90 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAA:1 + chr2L 9485669 3' - 412 7129 2 68.49 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTA:1 + chr3L 7962279 3' - blood 72 2 66.21 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATT:1 - chr3L 6775372 3' - blood 86 2 75.34 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGC:1 - chr2L 76062 3' - roo 8748 2 75.34 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACATAAATATAAATATGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAA:1 + chr2L 21307777 3' + copia 5074 2 57.66 GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTACTAGTCTCCTGTGTGTTTTGTGTGCATTTATGATTGTG:1 - chr2R 22722978 3' - 3S18 5782 2 72.60 CAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTATAATATATATACAACTGGTTTTGGCAATGAAAAAAACTACGTCTAGAA:1 - chr2R 4628383 3' + Transpac 5168 2 67.39 CTTCGTGGTCGGCTTCATCCAGATAAATCACCGTGCCTACGTTTTCTATCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCAGCATACGCAATCAAAACTGAACTCCACAAAGGAAAA:1 + chr3L 11369667 3' + diver 321 1 75.00 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGTGTTGCGCAAGCGTCTCCACTTTTATGTGCAAGGGTCAAAAGTTGTTTTGTTTACAACATATCATTGCACTAATGAAGTGGTCAATACTTGAT:1 - chr2R 5737075 3' - 1360 23 1 69.18 AATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTATTTTGGTAGCAGAACTGCACAACTGTTTTATTTATTGACTACACGTAGCAC:1 - chr3L 13829827 3' + hopper 1097 1 66.44 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCGATGGGGACGCTCCATCTACGCATA:1 - chr2R 11133529 3' + roo 360 2 53.42 GCAGAGAGTCAAGATTACAGAAATTAGTCTATAAAAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTGGAACAGAGAAGTTAAGCCGACTAACCATGTCAACACGCGCCAAAATGTTGCAAGCGACTGAGCAAAA:1 + chrX 17047808 3' - Cr1a 4229 1 74.66 TGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGTTTGGGATCTAGCTAAAAAAAGCCG:1 - chr3L 13827247 3' - hopper 27 1 59.68 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCCAAATTATAGGTCAATTTTAGGGATTACTCTTC:1 - chr2L 3762946 3' - jockey 97 1 76.71 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCGGGTGGGACTGCCGACATCTATTTGTGCGC:1 - chrX 1287770 3' - jockey 4806 1 61.15 ATATATAATAATATAATAATATAACTACGTATAACTACAATAACTAAACTGGCAACTACACCCTTAACTAAATTGAATGTTTCTATAAATCTGTTTATATCTGTAGGCGTCGTTATCAAAAATTTTATTAAAAATAACAAAAGGCT:1 + chr2L 9053562 3' + Tc3 291 1 65.75 GTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAGTGAAGGGCTGTCAGGTCGAACAGG:1 - chr3L 23933533 3' + Cr1a 238 1 54.62 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAACATCG:1 + chr2R 558200 3' + copia 246 1 55.48 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATGGGCACATACTACATTATTTACACACGTAAACTCATATGTGGTGCAGTATTTCATGTTTCT:1 - chr3L 16358671 3' - 412 7110 2 64.80 TAATAAACTTTAAAAATATATTAGGAAAAATAATTACTCATGTCAAATGTGCTTCGAGTCTCGAACTATCCTAATTTCTCCTCCCGATAAAGTTCTGCCAATTCCACTGTGCCAGTCTACAAAAAAAGACAGCAACTGTGGAGTTG:1 + chr3L 13922607 3' - hopper 174 1 65.75 TATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCACTTTGGTAACTCGCGCGTCAGGGCCAACGTCTGC:1 - chr2L 23372490 3' - gtwin 19 2 67.94 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTCACAAAAGGGTCGACTTTTGCTGGTTCAATGGCACCAATTACACAAAATCAATTAAATGTAAATGCTATGGGCCTAGACAAAATAAAATCAGGCTGCAAGTCT:1 - chr3R 15702856 3' + copia 242 1 73.94 GCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTTTGTGTGGGGTAGCTGTGCTCAGTAATATATAAACAGCTGTGCTGTTCGTACCAGAACGCACTCAACGATTGAAA:1 + chr2R 7665865 3' + Transpac 269 2 55.86 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAAATGCGTTCTTATTTATTGAATATTTTGCATCAGTTTCA:1 + chr2L 14307554 3' - Tirant 69 2 69.35 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCCATTATCCTCCTCATGTCGCTGTGCGAAAATCTAAAACAGTGAAAAAGTCCGGGGTATGGCACTTTAAAAAGGGCCTACGGTTTTCACACCCGAAAAGGATTTGTCA:1 + chr3L 16562997 3' - roo 8677 2 76.71 TTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTGCTGTGGCAATCCTT:1 + chr2L 12340834 3' - diver 5949 2 56.16 CGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTATGATTGAAATGTCTCAACTTGAGAAACTTTAGGAGTCTATTCCATAAAATTGGAGCTTATTCATTTCATTGATG:1 - chr3R 20280055 3' - invader4 3030 2 51.72 AGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTC:1 + chrX 20999612 3' - BS 30 1 57.14 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTC:1 - chr3L 9497746 3' - jockey 4801 1 50.85 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTACACTCAAGAAGTAAAGTCGAACGGGCCTCGTCCAATCGACTGGCTTCTTCTTTTGGCCCTTCCTAATACTTATTCACTCAGTT:1 + chr3L 22900208 3' + 412 7511 2 59.44 CAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTAAGCTCTTCTTTCATTAAACATCAAAATAGCAACCTTTAAAATAGCACCTTTCACATTATCTATGCAGATCGGCTGCGTGAGCATTTAAGG:1 - chr3L 23571613 3' + Stalker 7166 4 76.71 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACGTCTCGTTCGGCTAACGTGCACAAACATTTCATTGGGGTGAACTATATATGA:1 - chr3R 21001780 3' + 412 7506 2 54.86 TATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTTAAACAATAGACTTGGGCACTCGCATTCACCCAAGAACAACA:1 - chr3L 22054925 3' + mdg1 7046 2 78.62 TATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGG:1 + chr3R 14860204 3' - BS 5077 1 71.92 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATTGCTT:1 + chr2L 6318998 3' - pogo 61 1 63.01 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTACTAGTCTCCTGTGTGTTTTGTGTGCATATATGAT:1 - chr2R 22722982 3' - 3S18 21 2 68.49 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGCATGGTTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCCGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGCTGGTGTGCATAT:1 + chrX 21994042 3' - 297 6586 2 79.14 GGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGAC:1 + chr3L 24208228 3' - Quasimodo 41 2 55.48 AGGGGCGGTAAAATAATTAAAAGTAGTATACTAGAATAAGGAGGCAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCCCCGCAACGCCAAAATAATTACTTTGATAGTATACTTAATACACAAATATTGAAA:1 + chr2L 15607686 3' - Cr1a 3990 1 57.81 CGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCC:1 + chr2R 21402662 3' - mdg3 94 2 78.62 AGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTTAAGCGTCTAATTAAATCAGAGTAAACCAAAGGGAGGCTCAGCAATGTCACAGACTTGACATAACCCA:1 + chr2R 20390852 3' + Quasimodo 7047 2 51.08 AGTGATGTTATCGTAAGATACCTATAGTCACCGATCGTGGCCACTACCTGGTCCTGATCCACACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAATCTTTTTTTGTTTTTGAGCCAACACACTTCACATCATTGGCAAAATCATA:1 - chr3L 6290228 3' + Chouto 158 1 65.75 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATT:1 + chr2R 6632627 3' + P-element 2795 1 22.60 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGATATCTAAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACATATTTTTGGAGACGTCCAGTTCATGTTCACCGACATTTTTGTC:1 - chr2L 21688492 3' + INE-1 92 1 73.29 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGCGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTG:1 + chr3L 7093064 3' - hopper 70 1 69.06 GAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGG:1 + chr3R 11547802 3' - G2 314 1 57.53 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAAATAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGACCCCATTTCCAGTTTTGTATTTTTTTTAT:1 - chr2L 13927691 3' + roo 9031 1 56.16 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTTGCCCGACGATTCAGATC:1 - chr3R 4197264 3' + P-element 2784 1 15.07 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCA:1 + chr2L 11951614 3' + pogo 2039 1 64.03 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCAACACTGTCGTTTAACTATTTCATATTAAGTTAATTT:1 - chr2R 16441784 3' - I-element 38 1 59.31 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACTAGAACTGCACCGCATCCCCTAATAGACAGCGCA:1 - chr2L 12414913 3' - pogo 55 1 72.81 ACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAATTTAAATAATTAAGGAAAAAACAACCACTAAGTAGGGCCCAAATTGAGATTAAGTTTACGGAGAGTTATAAAGTGATTGGTAGTCCGAAATGGA:1 + chrY 380968 3' + G6 2002 1 61.81 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAGCTCACACCTGTTTGCACGTGTGTGTGTGTGAGGGGTGCTGTCTGTGTGAGTGAGTGCCAGTGCGCATAAAACG:1 + chr3R 13628684 3' + hobo 2930 1 49.06 ATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATCATCTCAAGTGGGCCTCTCCATTCATCTT:1 + chr3R 13612872 3' + 412 404 2 75.17 ACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAA:1 + chr3L 13827338 3' + hopper 1332 1 73.97 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTG:1 + chr3R 16181247 3' + roo 360 2 52.74 CATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGTGCTACTGACTGTTGTATGGGGAA:1 + chr2L 22746507 3' - R1A1-element 5026 1 78.18 AATTAATTATAATTAATTAAATAAAATATCGTTAAAAAAAATAATATTCATGTTACCTTCTATTTGGTTTTGGGTAACCTTTTTTGTCTTCCTGTAATTAGTGAAAAATCAATTACT:1 + chr3L 19873422 3' + HeT-A 378 1 71.79 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTCCATT:1 - chr3R 28627603 3' + copia 5054 2 65.07 GCAGATTCGCGACAACACAGAGCCATACATAATACTTGATTCTCCTTTGTAATAAGTCAGTCTTAAGCTACACTCGAGGAGAGTGAGATCTAAATAAAATCACAACCTTAAAGGGATTCCGCCAAATCGAAAACAGTCTAAAACCC:1 + chr3L 15423322 3' + gypsy5 7159 2 78.08 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCAC:1 - chr3L 17890726 3' - 412 7116 2 59.59 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACAAAGCTGTGCAAAAATATT:1 + chr2L 1260032 3' - Burdock 42 2 52.05 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCG:1 + chr3L 7995489 3' - P-element 60 1 35.20 GCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGTAGTTGTTAATTAGCTTAT:1 - chr3R 13349047 3' + BS 5050 1 57.14 GCATTCCCAGTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAACCCATGATAT:1 - chr3R 4504028 3' + INE-1 534 1 62.76 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGTACTGTGTGATATTGAAATATGTGATTATGATAAGAATCATGCTTGAAATATATGTGAATCATCAAGAGTGATATTAAAGATACC:1 + chrX 6707885 3' + hopper 1384 1 64.38 AAATTTTAAAAATTTTTAATTAGCTCTGGGCAAAGCATTTTTTAAATAATATTCCACGCATTTATCTAACAGATATAATAGCAGTTTACATTATTTATTATATTATTTTTTTTTTGCTAAACATTTTAATAAATAACTTTTCAGAG:1 + chr3L 12964200 3' - 1360 3032 1 60.27 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATGTCACTTTTTTCGCATTTCTTTGTTTCTATATGTATGTATGTCTATATGTAACCGTACATATAAAGGTTTTAATGGCTAACGCT:1 + chr3R 13122620 3' + blood 361 2 69.84 AAGATAAAATATTAAAAAAAAAAATTTGATGAATATCGGAGAAAATGTTTTAAGCAATTATAGTTAGTTAGTTCTGAAGCCATTTGCTCCAAATTTCATACATAAAGTTATTTTTCAGTGTGCACTAAGCCAACATTCCTTGACGC:1 - chr3L 2312720 3' + BS4 728 1 80.82 TACATACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAAAAGGT:1 - chr2L 22113024 3' + 1360 3255 1 55.48 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTGTGGCAAAGG:1 - chr2L 12079629 3' - mdg3 5327 2 70.59 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCTGCCCTACCTGGCCATGTGGATTCTGGCCATTGTGTTTGGCATCCTG:1 + chrX 4785205 3' - roo 6 2 79.20 CGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTAATTCCACTTGTGTAGCTTATGCCACGCCCACGC:1 + chr3L 10486784 3' - I-element 344 1 76.71 TCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACCAAAGATCCGACTGGGCCGCAGGACACATACAAACCCACTTACTAATAATAATCATCGGCGATCAATTCATCGGCCGGC:1 - chr3L 24259127 3' + baggins 5343 1 94.29 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGCGATGCAGCAGGCCTTAACAACTTATTCCTTTGCCGGTTTCTAGCACTAGCCTGATTGTATAATC:1 - chr2L 15834410 3' + hopper 1393 1 70.55 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAAATGC:1 - chr3L 17707806 3' - Doc 51 1 50.36 GAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGCTTTAAATGTTAGTTTCTGCACTTAAAATTCATAGTTATTTCATAATAA:1 + chr3L 5608522 3' - jockey 4585 1 66.21 AAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTGCCTTTGAGAAAAGCTGACAGTTCTTTAAGCTGCTTGCCGTTGCGGGTTTTTGCAGGCAGTCCTACAATCGCATTAATGGCC:1 - chr2L 4272797 3' + roo 9032 1 55.48 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATGTTAAAATCATTTCCTGCACATTTCTCACAA:1 + chr3R 10472820 3' + mdg1 7434 2 66.19 TGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAA:1 + chr2L 16089685 3' - 3S18 53 2 54.29 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGAAATATGCCAAGTCCAGAGTGTCAGCTAAATTTCCG:1 - chr3R 17114045 3' + roo 8991 2 72.22 TTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCATCTATCCACTTTAAAACATCTTTATTAAATATTCAAAAAGAAG:1 - chrX 8012249 3' + 297 322 2 69.86 TGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATGTTTTCGAATATAGTACAGCTTAAATGTCAAAAATGAA:1 - chr3L 12976260 3' + invader4 3008 2 72.60 ATTTTAATTTAAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAAGGGTACGGAGATGACTTCATATGCTAAAATGCTATTAAGAGCTATTCGTAACAAGATTGAGGGTAAGGCAAATGA:1 - chr2L 23389660 3' - 1360 3042 1 51.85 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACTCATTATCTATTCCAAGAATTATGATTATCAACTATTATGTATTAATGTAATCAGTTTAAATATTGGTTTTAAAGTGTTTATTTTATGCGGATATCCA:1 - chr2R 20673593 3' + mdg1 399 2 68.49 GTTGATATCTCAGGAACTATAAAAGTCAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAACGTTCATAAACCTCACAAAACTGTCACTCCCATACTTTGCCCAGTGTTGATTAACAGCTAATTAATGGGGCAGGGCTTTAAAGTCGCA:1 + chrX 21000166 3' + INE-1 145 1 58.90 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACATATAGACATGTTAGTG:1 + chr3L 14551079 3' + P-element 2853 1 56.16 ACTAGCTGCGTAAAGGGTATCTGATGGTCGGTGAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTGATCAGGATTACCTTCCAAACTAGAAAATTTCGTCTTTGAACTGAGAGAAAGAAACAATTTAGATCTGTTCTGATATAAAATGA:2 + chrX 20527499 3' + INE-1 542 1 78.77 AAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATGGTATATAAATAAATCCTTCGAGCATTCCCATTATGTAATGGTAACATGGTAAATAAATGGATTTTA:1 + chrX 10161208 3' + micropia 406 2 54.79 AATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAAT:1 + chr2R 8641622 3' - diver 39 2 54.79 ATTACATAATTAGATCCTACTAACACCTAACTAACTACTACTAACATAACTACTAATATTTAATATAGTTATTTTAACTGCAGACCATTTATCCAAAGATGCGAAGATTCTCGGAAGTCTCTGGCACCGCCAGTCCCAGAATACCA:1 + chr3R 12573453 3' + Cr1a 4282 1 51.37 ATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATCTTGGCTCGACCGTAAGGCCGTGAGTATATAGCGAGCAAAAGAAATTTTTCACCCCACCGGCATGCA:1 - chr3R 4561631 3' + copia 4931 2 71.00 TATTGATCCTGATCAAGAATGTATATATGTTTATATGTATAGTATACCCTATTAATTTACGAGTAACGGGTATAACAATCCGAGTCGAAATCATAATTTTTATAAAATAAGTTTAATTCCTGATTAGCAACATAGACTTTAGATTT:1 - chrX 15903125 3' - INE-1 84 1 73.29 GCATGTTGGTCGCGCCGACCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTAAATCTACAACCAATGTAACAGCTAGAAGCAAATAATGTCAAACCCATATTGAATTCAGCCTGCAT:1 - chr2L 8959853 3' - Ivk 5092 1 71.92 ATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTCA:1 - chr3L 24272063 3' - gypsy11 76 2 56.16 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCAAGCTGAGATACTTTATAACTAATTACAAATTCAGCACGATGTGTGTAAAAATGATCTAAGTTTATACAATTTAGATATTTTTTTAGATATTTTAAGCTATGAGTGCTTGTTT:1 + chrX 19537047 3' + roo 400 1 76.71 ACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATGTGCAGGGATCTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACATCTTTATTCTTATCATTATTACCATTCCTTAACTCCATTTTTCTCAGCTTCATACCACTTCCCTCCCTATTCCC:1 - chr3R 29288666 3' - BS 5000 1 69.66 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTATATTAATATACATATACATACAGATGCGGTTTGGG:1 - chr2R 641825 3' + opus 7478 2 68.57 AATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGTACGCGTTGCCGATTGCATTTATTATTACACTGCGGGCGCCAAAAGATTTGTGCAGTACAATGACAAACAGTGCAGATACTCGTGGATGTAGGTTTGCCCAGTG:1 - chr2R 4362476 3' + gypsy 7432 2 73.61 GTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAG:1 - chr3L 27415224 3' + transib2 2759 1 65.71 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTTTTATCTCTGTGAGTAATTACGAAATGCGAGACTATTCCTATTATAGTTGGGG:1 + chr3R 20988914 3' - I-element 11 1 78.77 CGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAGTTCTACATCATCAGCATTCATGGACAAGAGAAGGCCATATCAGTCGATCTCCTCAAGCCTGCCTTCTTAAGTCTTTTGTCGTAGCTCTATTAGAAATGTAAAGTTAAAAACACCAACCA:1 + chr2L 3752674 3' + Chimpo 4019 1 65.75 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAAATAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGACCCCATTTCCAGTTTTGTATTTTTTTTATTATTATTTCGCCGATCGGCTTAGAGATGCG:1 - chr2L 13927661 3' + roo 398 1 76.71 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACATATATACACACAGCCAGCCGAGCGGGCCGATATACATA:1 + chr3R 17067905 3' - 297 40 2 73.21 GAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTTGCAGATATCTTTTACAGAGCTATTGGGTCTTTTAATTTCCTTATATACTGAGGTCGTGCTAACT:1 + chr3L 27412802 3' - hopper 459 1 67.12 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATA:2 - chr2L 17136166 3' - hobo 85 1 73.97 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAATC:1 - chr2L 9485590 3' + 412 444 2 53.28 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACTTTTGCGGTCCACAAAGACCGTGTAATTAC:1 + chr3R 27794877 3' + roo 9031 1 52.34 AATCAGGAATAGACCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATGAAGATAAAATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAG:1 - chr3R 11113209 3' + mdg1 322 2 78.08 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATCTAACCGTATGTGTGTGGGTGTCAACGCCCCTCTGTGGGCGTGGCGG:1 - chr2L 17240186 3' + hopper 1381 1 62.07 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCCAAATTATAGGTCAATTTTAGGGATTACTCTTCCCCAACTCA:1 - chr2L 3762937 3' - jockey 88 1 70.55 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTC:1 + chr3L 12867344 3' - roo 8752 2 79.45 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGAAAATGACTTTTCTGCTCGACTTTGTTTTGCTAATGTCGATGTTCCAGCAGATACACAATCTTTTCAGTTTATG:1 + chr2R 17891022 3' - Tabor 9 2 75.17 CTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTCAAACTTGAAACGTAATATTTTTCTCTCTGTACAATGATTCGCAAC:1 - chr3R 26519969 3' + FB 641 3 68.49 CGGCAGTTGGAAGCTAATGGTGTCTAAATAGCTATGCCCACTAGTGTACATGTATGTACATCCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTACATCCAATAGTCGCGAATATAGCAATCTCTGCGATAATAATTAACTT:1 + chr2R 6164634 3' - Tc1-2 25 1 68.49 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCT:1 - chr3R 10684749 3' + roo 9029 1 63.06 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGCACTCA:1 + chr3R 21001873 3' - 412 7140 2 78.08 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATTCACTTTCATTTTCATTACA:1 + chrX 12866503 3' + roo 361 2 53.42 GCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCGATACACAAAAGAGAACAGGAACCAGGAAATGAATATAATGTAAAATAAATTACAATAAAACGCATTTTCAAAAGTGGAAACTAATTTTCTGCCGCTTGCAGCTATCTCAGAATA:1 - chr2R 5267254 3' - Cr1a 4377 1 51.43 CCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGTTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATATTTATATAAAATT:1 - chr2L 23299977 3' - invader4 389 1 69.86 ATATAATCAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACATGTTGCTGGAGTTTTTTTTTTTGGGCAATTTCCTTAAAACGCATGAGCTGAAAAGTTGCCCCATGTATG:1 - chr3R 6123450 3' + S-element 107 2 52.74 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAATATTGTAGTTTCTGATAATACTGAGCATTTTTGTTTTCTCTCGGTAGG:1 - chr2R 5868285 3' + pogo 2038 1 71.43 AGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGGTTGACGATGGACGTGTT:1 - chr2R 5277128 3' - opus 110 2 75.90 TAAGTGCAGACCGCACAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATAATATGTTGCATGTTGCGACAGCAAAAGTAAACGAAATATGGAAAATACA:1 - chr3R 13176350 3' + Burdock 196 2 63.57 AAACCTTTAGTAAAATTTTTTTTCAAAGTTATGGGAAATTATTGTACACGCATCTAGGTGGAATTCAAGTAAGTCTGAAAATCAGTATTGCTTGATTATCCACATGCTGCTTGAATCTTCTGAAATTTTTCCTAGTGCACCCACGC:1 - chr3R 28783899 3' + FB 403 1 76.71 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATC:1 + chr2R 6632645 3' + P-element 2864 1 53.68 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATATGATTTATGCGCTGTTTCTAATTCAATTTAGACCCGTTTGTTT:1 + chr3R 23010095 3' - I-element 75 1 67.81 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCT:2 - chr3R 13582224 3' - BS 5072 1 69.18 AATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAAAATGGAGGAGTGCTTCAATTGCACAGT:1 + chr3R 26246937 3' + 1731 287 1 60.96 GTTCCACCTCGGCTCTGTTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATAC:1 + chr3R 11547796 3' - G2 309 1 57.78 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTA:1 - chrY 495740 3' - Doc 76 1 74.10 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTAAATGATTTAAACAAACAAAAGGCATAGCGAGCAAATGGAA:1 - chr3L 21144066 3' - jockey 4751 1 72.60 AATTATTAAGTAGTATTATTATTAAGTAGGAATCAACAAATTATGTTAAGTCAATTAAAAAAATATTCCACGGAAACATGAAAACATAAGCAACTTATTTAATGGTTGTTTTGTTTAACTAATTCTCATTAAAGATAATTTTTGAT:1 - 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chr2L 12349717 3' - F-element 64 1 65.07 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGTGATATCATATGTTATATGGCCAATA:1 - chrX 4778148 3' - 412 33 2 61.64 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGGGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGGCGGTCTCTGGCGAAAAGGAAGTGAAAAGAAAAGAACGCAAAG:1 + chr3R 23236476 3' + hobo 2894 1 59.60 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGACCCACTTGGATTTGTCTCAGCCGTCGTGTTTCTGCAGA:1 + chrX 5150426 3' + roo 393 1 74.66 CTGGTTTTGACCAACGTAAAGTCCCAAAATGATCAATATTTTTTAAAAAGTGCGTTTGGTTAAGTAAATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATTGTATGTGATTGGAGGGCGATGCAATCGTCTAGGATTTGGGGA:1 + chrX 21084000 3' + HB 230 1 65.07 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAAATGGGT:1 - chr3L 14553111 3' + roo 9041 1 54.21 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGC:1 + chr2L 686076 3' + roo 9033 1 57.89 ATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAGAATTTTCTGCGGTTGGTATGTTGTTAAAAACGCCA:1 + chr2L 21806369 3' + pogo 116 1 73.13 ATGAAATAAAGAGGGATAGTCATGCCACGTGCCACAAAGCGTTTCGTTAAGGAAACAGAGAAAGACTCTTGTAACGAGGAGTCTACAGACCCTGGATCGCCATATACATTCCAAGCGACGATTAATGAAACACGGGGAAATTAATG:1 + chrX 17377243 3' + invader5 3937 2 78.77 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTATATGTGCTTTACTTACTACTATCGGACTGATCATCGTCACCTTTGAGGCTG:1 + chr3R 6711517 3' + pogo 2038 1 65.96 ACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATGCCTCCTGTTTGTTTTTGCCGTCTGCTTGATGCTATTCCGGCTGCTTTTCCG:1 + chr2L 18317536 3' - mdg1 7105 2 65.03 ATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATATTTGCTTCGCAGACAAAAACATCAACTACCCCTAAAAGTAGGCAATTCTTACTGAGCA:1 + chr2L 13215717 3' - jockey 4821 1 60.27 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAATCTCCATTTCGATAACTCCTGAACTCCCAGTTGGTATTTCCCAAATTGGTGGCAA:1 - chr2L 19067999 3' + pogo 2089 1 76.03 ATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTGCGCCACGAACGGTCAGCAACAGCAATCGGACACCCCTTATCCGGGGTACCGAGCTATGTTGCATAAGCCTGTTAGACAGTAATATCTAATA:1 - chr3L 6558646 3' + gtwin 64 2 80.00 TTTCTCACTCCACAATAGACGAACACTTTGGTTAGATTTTGCCTAAACTAAGACAACAACAATTACAACATGGAACACGATAAAACCAAATATACAAGTTATATTGTAAAAAAACGAAATTTATGACAAATATTTCAACGGTATAT:1 - chr3R 26949723 3' - transib3 398 1 58.90 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATAATTTCAAAATCACATATTTAGAAGGTAAACCTAATCAAATGAAGAAAACATGGTAGGCGAAAAAGAAAATATTTCAACAGCAGCAACAATACACAGTTCATCAGAAAG:1 - chr3L 26658929 3' + 412 484 2 79.17 AAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGA:1 + chr2R 17890949 3' - Tabor 78 2 71.63 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGGGTTCAAGAAAAAGCTTACCTAAGGAGGCGATAAAGTTTAAGGA:1 + chr3R 17656496 3' - mdg3 36 2 58.74 CGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTTTTGTTAAACAACTGTAT:1 + chr3L 9909804 3' - Transpac 40 2 58.22 AGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAAGTATATACATTGTGACACTTTGTCACATAAATTATAATAAACATAAATAATATCAAAAGACTCCCTGCCCAAAAAATTTATGGCTGGGCTCTAGTTCTC:1 - chr3L 22420299 3' + Stalker3T 4 1 73.97 CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCT:1 - chr2R 11763606 3' - Tabor 62 2 69.11 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGATACCAGATCTTGGTGCTGATGAACCTAGCCCCTTGCAATTTCCACTCACGCCGGCTGCAAATGC:1 - chr3R 24122599 3' + roo 402 1 78.08 GCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATATAGAAGCGATATAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATTTATATAATGTAAAATAACTATATCCGCTTTCACTGCGATTAGAACTCATTTTCACTGGACGCG:1 + chr3L 5522975 3' - Cr1a 4395 1 71.22 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGATTAAATTGTCTGCCTATCTGTAGATCAGATAAGGTCGTAATTCATTGAATTGGCCACTTCAGAACTGGGACTCATCTAAACCACTCATGTGCAGA:1 + chr2R 23000178 3' - mdg1 9 2 76.92 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAACACACACACGCACTCACTCGTTG:1 - chr3R 28396597 3' - jockey 65 1 57.97 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATGCCTCCTGTTTGTTTTTGCCGTCTGCTTGATGCTATTCCGGCTGCTTTTCCGGGGCTTTACACGCCGCACTCAGTGCTACGGAAAAGCTACGCCACCGAATCCCGTCCCGTCC:1 + chr2L 18317597 3' - mdg1 9 2 80.14 ACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAGCACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGC:1 + chr3L 22648371 3' + Tabor 7265 2 60.77 GCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGATCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTTGCAATCCGCTTTTAAAACAT:1 + chr3R 29288826 3' + BS 5050 1 48.63 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAAACGCACAGAAGTAGGCTTCATTCTAACACTTAACATGCTCGTTAAATGCCAAGTGGAAAGTTGCTGGTAAAGTCAATGA:1 - chr3L 12867231 3' + roo 405 1 70.55 ACCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAAT:1 + chr3L 7995484 3' - P-element 85 1 26.90 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTGGAGTATAAAGAGGGGTATCCAGTTGGGGAACTGGGGA:1 - chr2L 16458604 3' - roo 8746 2 72.60 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGATACTTTTCGGATATGCGACAAAATCGGACGAAAACTGCTTTTTCAATTT:1 + chr3R 6388793 3' - jockey 66 1 62.31 GGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTAATCAAGAATATATATACTTTATAGAGTCGGAAACGTTAATCCGCTTTTCTTTTACATTAAAAGATATTTTCATGTAATTCTTGTAATTTTTAAAACACTCAAGTGTATCAAAAGTAAT:1 - chr2R 18939160 3' - INE-1 101 1 53.42 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGTTTATGTATGTATATGGCTATATAGACTACAATCCCAAACAGAATCGGAGACATACAAATGGGTGGGCTTTGGAATATGATACATCT:2 - chrX 16828904 3' - Quasimodo 25 2 67.81 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATATACATTTGCAGTATAGTATCGCAGTAATCTGTGATGGAAATCCTTATTAAATTT:1 + chr3R 29418824 3' + mdg3 236 2 76.03 ATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACC:1 + chrX 16384100 3' - diver 5939 2 53.24 AGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAACGAAATGGATTAGACTCTTGCCTCGCCGACATATAAATGGTAAATAATCAACAAGTTATGGGCCCAGAAACGCT:2 + chr2L 22640202 3' + invader4 3006 2 68.53 CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCCTAAGATATTATGTTTTTGGCCTATGTATTCCTTCGCTACAAACAG:1 + chr3R 15338112 3' + blood 302 2 71.23 AGAACTACGCATAATTCTGATTTTTTTTAGAGTTAAGAACAACAACAACAACAATAGCCCATCCACCCATAACAACAACAACAATAACAATTCGGTGAGCAACAACAACAGGACATCGCCATCGAAGCCGCCATACTTCGACTGGA:1 + chr2L 20771852 3' + invader1 264 2 74.66 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCAGGAGAGGATCTGGCTTAGCTTCGGATGCCTG:1 - chr3R 29418651 3' - mdg3 49 2 48.63 AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGATCTTAACTTATATATGTATTGTGGCATTTCGTTGAATAGAATAGAAACAGAGTC:1 + chrX 19281781 3' - opus 63 4 71.54 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATTGATTAAATTATTGTACGTAAAATAAAAAAAAGTGTGAGCCGCAGATACATATGTTACTAATATTCACTATCATGCGATACTTTTAACGATGTATC:1 - chrX 5150243 3' - roo 24 2 66.44 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCAGTTTTTTCGCAGCCGCGCTTTGCTG:1 + chrX 8891813 3' - P-element 83 1 21.48 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACTGTGATAGGCATGCTAACTGTACTGTTACTTTGAGCTCAGCTGTGGGCGTGTGTGTATGCCACGCACGAAATAAGCATCATTAGGCGCTTGGCAGGCGC:1 + chrX 3197210 3' - mdg1 7060 2 63.70 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTATGCATTGCATTGGTGCATATATAATCAGTTGAGTCTGGGCACAGTCTATGATTTG:1 + chrX 17732073 3' - pogo 57 1 63.12 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGCATG:2 - chr2R 19554899 3' - pogo 34 1 62.33 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAGAAGGACATGTATAAAGTCATAAGGAACTTTTCCAACCCGACATATTTAAAGGCACATCGAACGCGCCGTATTGACTTTTTCTATTAGTTATA:1 + chr2L 10746744 3' + pogo 2076 1 55.48 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAATATAGGATTGTTGCAGAAAAAAAAAATAAATTGAAGTGAATCACTTTTACTGAGCGCC:1 - chr2R 10695731 3' - roo 8680 2 74.48 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGACAA:1 - chr3L 14553116 3' + roo 8998 2 69.66 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATATGTGCTTTACTTACTACTATCGGACTGATCATCGTCACCTTTGAGGCTGTCCTTGTTGTCCTCGTCGTCCGCTTTC:1 + chr3R 6711544 3' + pogo 2082 1 66.13 AGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAA:1 + chrX 16384071 3' - diver 87 2 73.97 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTACTCTAATTCAATTAGACCTTCCCCCAGCTGCC:1 + chr2R 11133615 3' - roo 8753 2 78.08 TTTAAATTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGAATTCAATAGTGAAAATATTCAATAGACTTACAAATCAAATCAAATATTTTCTGCCTCATTTTATCGCATACATAC:1 + chr3L 13374235 3' + pogo 2060 1 52.45 AAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGAGTGTGTGCATCGAAATTATACCGAATTTCGATATACACAAGATTAGCGCTTTGCGAAAAAATTACTATTATCAATTAATTGCAATTAT:1 + chr2L 8366643 3' - 1360 23 1 68.12 TCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGAGCAATTTTTTATGGGATTCCTATGCTTGATCTCCACTCCCCCG:1 - chr3L 2724971 3' - Ivk 35 1 55.91 AATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAA:1 - chr3R 3922962 3' - Cr1a 96 1 76.03 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAGCAACAAACATTTTCATTCGTTTTCGCATCGTCGAA:1 - chr3L 14550951 3' - P-element 23 1 55.75 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATTTAAACGGGTACATGTGAATGGATGGTTGACTGAAGAGACCCATTCCTTGGTTCCACTGGTTAACGGGGCACAA:1 - chrX 12525885 3' + roo 9028 1 55.48 CTGAACACGGGAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATACTTGTTACTAGTCAAAGAAATCAGACAAATAAAAAAATTCTCTTGTATAATCCTTATAAGCTCAACT:1 + chr3R 12202022 3' + invader2 177 2 54.11 AATTTTGATTTTATTTTAATTTTTTTAGTTGTAATGCCAAAACATTTTAACGCCCACAAACAACATTAAGCGCACGATTTCGAAATAAAGCGATCAGCATAACAATATCTCTTTTACGTTATTTAAAATGATTAAAATTGTTGAAC:1 + chr2L 16146367 3' + Rt1b 124 1 47.95 CCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTACAGCTCGTATTTCGACAAATTGATTT:1 + chrX 4186731 3' + I-element 5300 1 53.10 TAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTAACATAACATATAATGGATATTATATATAGGCAAGTGATTCAGAACAGAACAGA:1 + chr3R 9393026 3' - S-element 62 1 62.33 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGT:1 + chr3R 8709830 3' + jockey 4914 1 75.71 ACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAATGCTAAATGGCAGATAGATATATAGAACTATTCCCCAACTGC:1 - chr3R 21971058 3' + 17.6 6940 1 71.23 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAACACACACACGC:1 - chr3R 28396609 3' - jockey 34 1 52.08 GAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCATATCAATCATATGGACAGATGGACGGACATTTCCAGATCAACACTGCTTGTCTTGATAAATTTATA:1 + chr4 831226 3' - INE-1 558 1 37.67 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACT:1 + chr3L 19349977 3' - jockey 91 1 71.94 AATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAG:1 + chr2R 2875211 3' + TLD2_LTR 75 1 50.00 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTGGAGTATAAAGAGGGGTATCCAGTTGTGGAACTGGGGATGTGCGTGCGCACGC:1 - 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chr3R 22154794 3' + Cr1a 290 1 62.33 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAAAGCGATACATTCGTTGTTCGTGAGTCAGTGGAAGGACTCCACGTTTTGCTG:1 + chr3R 4197312 3' - P-element 68 1 37.93 ACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGAAGGTGAATATTTGAAATTGATTCGAACTCCACGAAGA:1 - chr3L 1516204 3' - Juan 3909 1 74.66 AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTTGCCGACATATATATATTATAACTATATAATAATAGTTATAACTAATTCGCAGACCTGATAGTTTTGCCGCCGACTATTTCCAGCTATAATTTATGATATTTATTCCAACAC:1 + chr3R 12929336 3' + invader4 305 2 71.92 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTGTCGCCGACGCTGCTCTTGCATCCGCAAAATGTACAAGTATC:1 - chr2R 11609174 3' + roo 9055 2 71.22 TTTTTTTTGGCAAATCGATAGAAATATGATAAGCTATCAAAGCATTTTTCATAAGTGTGGGCGTGGCAATTTTGCGGTGAGTAAACGGAAATAATGTACATATAAATATAAATTAGGGTGCACTGTGGAAAATTCACGCACTTTTT:1 - chr2R 5792118 3' - INE-1 313 1 54.11 TATTGGAATTCTAATTAACTACACATCTCCCGCCCGCCAGTGGCACATCCTTGGTCTCCTTGCCATTTTCCTAGTCCTGTTAGTCCTTCTGCTCCAGAAACACTCTATTCTCCACATGTGATGGCTGCATCACAACGGCGATGGCC:1 - chr2L 18317384 3' + mdg1 7458 2 81.51 CCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGAT:1 + chr3R 11547771 3' - G2 345 1 64.38 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATACTTACATATATATATACATATATCCCGACCATCCCCCAAAGAACCCAAATTACTTGACACAAGACGGTGCACA:1 - chrX 6138608 3' + opus 452 2 62.33 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGAGTGTGTGCATCGAAATTATACCGAATTTCGATATACACAAGATTAGCGCTTTGCGAAAAAATTACTATTATCAATTAATTGCAATTATGGGTATACGTCTTTATCCGCT:1 + chr2L 8366664 3' - 1360 10 2 78.77 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCATTTTTGCACTTTTCCCAAGTCCTTGGAGCAATTTTATTACAAGCAACTTAAAACCCAACCC:2 - chr2L 4173929 3' - roo 26 2 67.81 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGACAATGCCAGTGGCACGAGTCGCTCTCTTGGAAAATTTACAA:1 + chrX 4778276 3' + 412 438 2 57.86 ACAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGCGCAAAAGGGAAAAAGGGGAAAACTTCTCGGGCGAGAAGCCGCCGAATCCTTGGGCCGGTGGTCCAAGTGGCAAAGTTTTGGCTG:1 + chr2R 16373041 3' + G2 3076 3 64.04 AAAGAAAATTATGCTGCCGCACCCTGTATTAATGTGCATCGATGTGCATTACAAAAATATATTAAAATGTTCTTGTAAAAAGAACATGAGAAAAATCAAGAAAGGAATCTAGTTTTGGCATGCCGAAGCTTATATACACTTGCAGT:1 + chr3L 10465831 3' + mariner2 887 1 29.45 GGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCGACATGCATATGGCAATAGCATGCCAATCACAAAGCAGAACTACTACCTTTTATCTGATGTGTCATATGTGAGCT:1 + chr2L 10935159 3' - X-element 4456 1 51.80 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGAGATTGAGATTGTTTTGATTCAAGAACTTATATTGCTTATATAGCAGGTTGTGATAGAACC:1 - chrX 19536894 3' - roo 8725 2 61.64 GTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCA:1 - chr3R 29418682 3' - mdg3 77 2 69.23 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTTTAGGTGCCGTTA:1 - chr2R 11057235 3' - pogo 31 1 59.56 GGATCAATACGATGAGTGATATTTTGCACAGAGCGATTGATTCCTCGGTCCCTCTATTATCAACACCAGAAGATAAAAATTCAATAAAACTCGAAGAAATGTAGATTCTTTCAAAATATTTAAACGTATATTTAACCTCGATTAGA:1 + chrX 22562585 3' + transib2 2353 1 54.79 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATTCACTTTCATTTTCATTA:1 + chrX 12866501 3' + roo 9023 2 52.05 AATGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATCTCTTTTCGTTACAGACAACAATTAATAAGATTAAGAAATTGAGCGTGCTTGCAACAACAACAAAATGAAGGAGCTATCATTCTTTGACAAATTATTTAATGGTCTTTAATTAAT:1 - chr3L 14596561 3' - Gypsy12A_LTR 2171 1 73.79 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGG:1 - chrX 12191533 3' + pogo 2064 1 54.03 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTTGTTAGTTGGCCACTTTATTTTTGAACCATTTTTTTTTTAATGAATAGACAAACTAGATAAAAATATTAAA:1 + chr3R 17305561 3' - roo 48 2 52.41 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGT:3 + chr3R 9160771 3' + copia 195 2 54.79 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTATTGGCTTACCTTAAAGTCGCGTTTGGTCAGGTGACCTCTGGAGAC:1 - chr2L 2030991 3' - 412 7079 2 65.07 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAAATAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGACCCCATTTCCAGTTTTGTATTTTTTTTATTATTATTT:2 - chr2L 13927683 3' + roo 9039 1 61.64 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAAC:1 - chr3L 22400255 3' - 1360 17 1 64.49 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCCATTCATGCGGTAGAACATTCAAATAACCCGCCATATCGGTCCGAACACCCCATGCCATCACACCCACATACC:1 - chrX 14450315 3' - jockey 4805 1 52.08 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACATAGGAACTTTTTTTAAGATTAGCTATTATTATTATTAGTCTTTTTGTTTAATAAATTTTACATCTATCAGACTAAT:1 - chr3R 6413679 3' - FB 44 1 55.48 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCAAACGGTAGTGATTGAATGTGTGTAGATTACCGCCACCTGTGTAAGGTGATCAAGAAGAAAAATTTCCCAGTACCAGATATTGAGAAGCGTCTCCAGGAGGC:1 + chr3R 4562465 3' + copia 238 1 76.71 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACACGCGGAAATAAAAACCGAAGGCAAATCATAAGCTGTTTTTTTTTAAGTTTTAGAAACAATATTCACAGGTAAAGAAATT:1 - chr2L 12319220 3' + copia 220 1 53.52 TATTAGTTCCGCTTTTGTGCCGGAAGTCTGGCGTCCAAGAGCTTCCAACCACTTCTTTAGTTGGGGCACTGAGAATTGATTCCATTTAGTGTCAGGCATAGTCGCTCGCTAAGAGAGAGGGTAAGCGCTCTTTCTCTCGCTCTCTT:1 - chr2L 15745721 3' - invader3 401 1 69.86 ACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTAGCCTCGCTGGACACCCTCATTGCTTTCGGAATGAACCAAAAGCAGACATTGGAGTACTCGT:1 - chr3L 20356186 3' + 1360 151 1 58.90 AGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTG:1 - chr3L 22400267 3' - 1360 68 1 63.01 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACCGCAAAATCTATAAATAGCCGAACAGTACAATTAATTGATGCACAGACACAGTTTGGCATTGCGTGTGTGAGTATCTAT:1 + chr2R 21371573 3' + roo 9045 1 67.81 AAGTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGACCGTCGCCACTTACCAGCAGTCATAGCCTTGTAGGGCTCCTCCGATTCCAGAGGTTCACTCAGACCAATCTCGATCTTCGCGAATATGCGAATAATGTACTCGTG:1 + chr3L 2040845 3' - HMS-Beagle2 490 2 78.46 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTAAATTGTATTGACATTTGAAAGAGTAGGTTGAACGACATTGTCGTCGAGCATCGGCG:1 - chr3L 12224618 3' + 412 7505 2 52.80 AGTTAGCTGCATTTTTAAATTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGAATTCAATAGTGAAAATATTCAATAGACTTACAAATCAAATCAAATATTTTCTTCCTCATTTTATC:1 + chr3L 13374225 3' + pogo 2047 1 56.85 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGTGCCCAG:1 + chrX 12525995 3' - roo 69 2 65.07 AGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTTACTGCTAAGGTTTGTATCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACGAGCAACTAAATGGATACAGGGAACAAGAG:1 - chr3L 5327531 3' + R1A1-element 218 1 66.00 GGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTCAGGATACATGCCATTCAGTTGGT:1 + chrX 1018187 3' - 1360 205 1 75.00 GGGTTTTAAAACGGAGTTATATAAAAGGACTTTTTACTTCAAGCTTAGGGGAGAGTTAACGTTTATAACCACACAAACGTGTGGGAACTTTAAGTGCTGCCCCTCGTCACAAGGAGTCATCTAAT:1 + chr3L 15422111 3' - Doc3-element 4296 1 54.40 GAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTATCTGTTTACGGACTCTCATAAAAACTTGAATTTTATTTCAAACGC:1 + chr2R 13370407 3' + opus 315 2 63.41 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACA:1 - chrX 8891776 3' + P-element 2804 1 25.71 ATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAG:1 - chr3R 27510075 3' + Bari1 1641 1 61.64 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCATTGGCCGCCGCTGCCATTTTGTTCCAGAGCTCTTGTGAATTTGCAGTCAT:3 + chr2R 6842901 3' + roo 389 2 73.29 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAATTCGGGTGGGCG:1 - chrX 2762547 3' + roo 9038 1 62.33 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACAGCGTTTATGCTGCTGGGCTGCTCCTGCAGCATTTGGTGGCCTGATCCTATTCCTGGTCCTTAACCAAA:1 - chr3R 27822190 3' + I-element 5307 1 55.56 GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGCGAACAATGTGCCATCCTTTCTCTACCTCGGTGACTACCGAATCAGCGGATCCTTCTAC:1 + chr3L 22648429 3' + Tabor 468 2 73.29 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCG:1 + chr2L 17250822 3' + opus 440 2 59.59 AATCTTGTAGGGTTCTTGGAGAGTTCACATAAACACGGGATTTCAAAAAACACAATAGAAACCATACATTTTTTAAAGTGCTTACTTGGGGGCCCCGCAGATAACACCTTCGCGAAGCTCTGGGGATTGGGGCTATGCTACTGCGG:1 + chr2L 2044982 3' - mariner2 638 1 58.90 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACAATGACCGCTGATAATACACACCCATTTACATGACTACACTTGTG:1 + chr2L 3294232 3' + hopper 1379 1 55.80 GATCACGTAGCGACTTGATATGCGGAAGAACATTCAACCGCCAACTGTAATGCCAAGGTACCGGTATTTATCAACGTGCCTCCTATGGCTGTCTAACTATCGAGAGGCGGGAG:1 - chr3L 24168607 3' - R1-2 2948 1 71.68 TATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATTTATTTATAAACATTAGAAGTGCATGCAGATGCGGA:1 + chr3R 15885199 3' - I-element 83 1 74.66 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAAATGCCTAGGAAAAGTTTATTAAAAGCA:1 - chr3L 17707783 3' - Doc 37 1 60.27 CCACAAAGAGAAAATAAAAAACTCACCAACAAAAACAACAACTACAAATGTATCCTGCTTCAACTTTTCCTTCCTACCTCCGACTGCAACTACAACAACTATAACAACAAAATGTGTTCCTTTGTTTGTTTTTACCAATATTCTCC:1 + chr3L 5668534 3' + I-element 109 1 76.03 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGGGAGCTTAGAATAGAGTATTTGGGATAATGTACGAGTAGCTGAATCGAATGCCGTAGCAAGTGAATCAAAATTACATCTACATGTATATATATATATAATCGCTTGGA:1 - chr3R 15337982 3' - blood 8 2 75.54 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGACAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAGCCCCAATTTCGGCGGTTTGTATCTCTACCAGTTGTG:1 - chr3R 21705939 3' - 297 10 2 70.37 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCT:1 + chr2R 6632619 3' + P-element 2809 1 20.16 CCTACTGGACAATACTGAACAACGCCGTCGAAAATTTGTATTTTTAATTACAATAGCTATAATAATTTCTTTTGTATTTGCCTTAATTATTTATGTAAATATGTAAATTCGTCTAAATATATAGCATAAATTTAATACGTAACACA:1 + chr3R 28473526 3' + G7 1010 1 78.77 TATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAA:1 + chr3L 13827360 3' + hopper 1354 1 58.90 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAGTTGCAGATACTTTTGCTATGATTT:1 + chr2L 4174095 3' + roo 394 1 72.31 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATTCACGACGTAATTGGTTTCCAACGTTCACACATCATCACTCATACGCACTGTGGCCGC:1 + chr2R 19352062 3' - Burdock 6182 2 54.55 TACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAAAAGGTATAT:1 - chr2L 22113020 3' + 1360 3259 1 55.48 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTG:1 + chr3R 8709823 3' + jockey 4946 1 73.27 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGGTCATGCAATGAGGCAACTAATTGAGAGGCCAAACAAAGCATGGAATCAAAG:1 + chr2R 20865751 3' + 412 7495 2 59.84 AAGTGAAATAAAATAAAAAAAAAACAAGAAAAAAGGAGAAGCTGGAACACAATTATATAGCTACACAGTGTGTGTCTATGTGTGTGTGGTGTGTGTGTCTGTGAGCGCGGAAAATGTTGTGCAAAATGCTTTGTACGTGCTTCGGC:1 - chrX 8792330 3' + F-element 4682 1 76.71 ATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATCTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCC:1 - chr3R 23639161 3' - pogo 79 1 70.55 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACCCT:1 + chr3R 21001884 3' - 412 7129 2 70.55 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAGTTGGGTTAAGCGATTAAGGAAAACCAAAGCG:1 + chr3L 17207820 3' - hobo 47 1 68.22 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCCTGTCGTTTAATATCCCAGTCGTAGCTATGAAATAACTAGCAAAATAACTCATTCGATGTTTTTCCAAAAGGCCTTGGCATTAAC:1 - chrX 1061497 3' - 412 7079 2 61.31 AAAGAAATTGAAATTTGCTAAGCTCTTCAGTAAAATAAGTAAAGAAAATACAAAATCAAGTTTATTGACAATAAATTAGCAATCAAACTTTCAAACTTTCCCTTCTTCAATCAACAGTTACTTGATTGGAAGCTTTTTAATTTAAT:1 + chrX 13023212 3' + NOF 435 1 60.96 GAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATCTGCGAGAGAGACAGAGAGAGTGATAGCAAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr3L 16155023 3' - Idefix 244 2 61.54 ATAATTTAAAAATTTAGGATTAAACTTTGATTTAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAACCTTAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTAAAGCGATTTTTATTTTATTTGTTTTCCCAGCGTT:1 + chr2R 4887286 3' + S-element 1463 1 78.08 GAGTGATATTTTGCACAGAGCGATTGATTCCTCGGTCCCTCTATTATCAACACCAGAAGATAAAAATTCAATAAAACTCGAAGAAATGTAGATTCTTTCAAAATATTTAAACGTATATTTAACCTCGATTAGAA:1 + chrX 22562586 3' + transib2 2366 1 60.45 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGTTTAAGTTTAGTTTGACAATTGATTGATTGGCAGTTAATCATTTTAAATTCCCAATA:1 + chrX 14964712 3' - roo 8726 2 63.70 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATAACAATCGACCGGATCCCGAACATCCCCTGATGAGGCGTGCCATAGTATCAGA:1 - chr2R 1921377 3' + mdg1 7436 2 69.18 GGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGTGCTACTGACTGTTGTATGGGGAATGTCGATATTGAAAATGACGGGATATCGGTGAAG:1 + chr2L 22746541 3' - R1A1-element 5002 1 51.67 GAAGATAAAATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTTCAGACTCTTGAAAGTTTTTCATAATTTTCGCTATTA:1 - chr3R 11113162 3' + mdg1 7407 2 49.32 AACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGAATCAA:1 + chrX 8027482 3' - Juan 68 1 62.33 AATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTAT:1 - chrX 4778179 3' - 412 3 2 69.41 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCCAAAGGACGCAGGACACAGGACGATGGCGATGGCGATGACGATGA:1 - chr3R 27033847 3' - hobo 51 1 63.33 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGA:1 - chr3L 18467171 3' - hobo 50 1 52.74 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAA:1 + chr2L 9472087 3' + roo 9037 1 52.94 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTA:1 + chr2R 19553275 3' + mdg1 380 2 54.10 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCAGCTGTCAAGGTCG:1 + chr3R 16181275 3' + roo 396 1 75.54 CTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTAAAACGGAACCTCTTCTTTGTATGTATGCCCAG:1 + chr3R 22516106 3' - jockey 4568 1 76.55 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACG:1 + chr2R 5237914 3' - Doc 63 1 46.90 GGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTCCAAAGGGCCTGCTAAACACTTTCACTTGCACGCACACACGCACACATATCGTCGAATACCC:1 - chrX 7603985 3' - Ivk 340 1 60.27 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGGGGCGGACTTGTTTGCCCCAGTGGCTTCTGAC:1 - chr2R 6842784 3' - roo 75 2 74.81 GCTATTGATCCTGATCAAGGATATACATATATACTTAATATAGACGGAAACGCTTTATTCTGCCTGTAACATACTTTTCAACGGATCTAGTATACCCCTTTAAGAGTAACGGGTAAAAATTAATCGAACTAATTAATAATAGGTCT:1 + chr2R 4726554 3' - INE-1 86 1 81.51 AGCCATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTGTCCACCCTG:1 - chrX 22726184 3' + Helena 1276 1 54.13 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCCGTCTTATGTTTTAGCAATTAGTTACTAAGACT:1 + chr3R 9160823 3' + copia 246 1 77.40 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAAAATAGTTAAAAAATTATTAGCTAAAAATCTGATTCATTTACTGGAATAATGGCTAGATATTAATAGAAGTG:1 - chr3L 13374097 3' - pogo 32 1 54.89 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCTGTTAAATGCTCTAATGAT:1 - chr3L 16562848 3' + roo 401 1 66.67 TAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACCAAAATATAAGTAACGAAATGGG:1 - chr3L 22861709 3' - S-element 1 2 79.45 ATAGTCGGGGAACTCGACTATAACATTCTCTCTTTTTTTTAATTCAAAATATTTCATGCATTTTTTTTTCTACCACACTATTGGTAAAATTAAATAGCTTGCATTTGAAAATTTTCCTTTCATGCAATATGATTTCTCTTAAGCAG:1 + chr3R 6607869 3' + INE-1 565 1 50.68 AACTAAGTAATACAAAGAAAGATTACCCTATCTCGCACAAATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGAATTCTAAAGTTGAGTGCATTCTTATAGGCGCAACTGTCAAAGATGCAGTAAGCAATT:1 + chr2R 24427656 3' - Chouto 115 1 60.27 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGCCTTTAATCATCTGATTTTTTTCCAGCGTTACATTCCAAAGTTTAACATCTCCT:2 - chr2L 75999 3' - roo 21 2 75.34 AAAAAATAAAAAAAATAAAAAACACCCCATCCAACCTTTCTAGCTCGAAAGAACAAAAAAAAAACTTTTTCTTGGCATTTGTTGAGCAGGAAACGAGCCAGGGACGGGGTGGTTTGCCAGAGTTTCGGGTGGTCTTGGGGATTCAG:1 + chr2L 14123392 3' - hopper 144 108 62.33 CAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATCGGATGGCCTATAACTTATTCCTCAACGGACCTGCGGTCTCTATAAGTATTTCCCATTAGGTGTATGAAATTTGCTCAAGAC:1 + chr3R 26152730 3' + Tc3 1606 1 54.79 CCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTCCGAGAAAGAAGTACACCATTTAATGACC:1 + chr3R 13349172 3' - BS 5004 1 75.74 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCAAGAAAAAATGATATGGAGAATA:1 + chr2R 19553313 3' + mdg1 407 2 69.92 TTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATGTATGTACATCATTAGATATGGATTTTTTCGAGTTTGGAAAGTTGGGTGAGCTTACCGTGTCCAATTTGACAAGGTTCATGT:1 - chrX 19593780 3' - hobo 2668 1 60.27 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAAATATAACGT:1 - chr3L 24228597 3' + copia 210 2 71.23 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTATGCATTGCATTGGTGCATATATAATCAGTTGAGTCTGGGCAAAGTCTATGAT:1 + chrX 17732070 3' - pogo 65 1 66.44 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATTCACTTTCATTTTCATTACACAAATGAAATGA:1 + chrX 12866515 3' + roo 395 1 72.00 GAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTT:1 - chr3R 27510092 3' + Bari1 1625 1 73.10 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCACATTTCATTCCGGAGCTCTTTGCCAACACTCATACGTATGCAACACTTTTTCCCACGGC:1 - chr3L 17133803 3' - jockey 4750 1 58.22 GCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAACCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGACCCGAAACACGAGCTGAGTATGTTTTGCTATATTTGAAAGCGACGCCGTGGC:1 - chr2L 67952 3' - 1360 3313 1 64.38 AGGGAAAGCATAATGGATTTATGAAAATGTTAAATTTGTTTTAATTTTTGTAAACATGTTGGCATTGAGGAAGGCTTTCAGGGAGCTCAACTTGCCTGCTGTTTTAAATATGATTTAGGGATTACGCTTGCGGTACAAGCCATCGC:1 + chr3L 22977694 3' + 1731 4238 1 52.05 GGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTAACGG:1 - chr3L 23773894 3' + Transib5 2869 1 77.19 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTCAGTTAAGCTTTCTTTTATCTTATCGGTTAATGTCTGCCTTTAAGTCGTAAATTATATGCACTTTTGCAGGGTAAACTAATATTGCAA:1 + chr3L 18659019 3' - roo 8687 2 67.41 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTAAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAAC:1 + chr3R 24476352 3' - 412 7104 2 65.79 AACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAA:1 + chr3R 9160764 3' + copia 188 2 59.59 ATGCAACTAAGGGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGGACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTA:1 - chr2L 17029594 3' - blood 7054 2 51.61 ATGGCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATGGCGTAGGATGACTCTCGCAACTACAGTATATATGTGAACAAGCCGAGTCGCCAGGAGACGCAGCC:1 + chr2L 6381923 3' - 1360 14 1 55.24 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATGGGCACATACTACATTATTTACACACGTAAACTCATATGTGGTGCAGTATTTCATGTTTCTCCCCCCCAAGTCGTTTGTTT:1 - chr3L 16358651 3' - 412 7111 2 56.16 CATTCTTTCCGCTGTTATCGACCAGCTAAAGTGCAATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTGGCCGCTGACGGCTTCGTGATAACGCAGTATAGTTCGAACAAATCCACGTCCCTCAGGTTCCTGATAACTACATATC:1 - chrX 16883982 3' + HMS-Beagle2 93 2 55.88 ATTCGTGTTCATGTGTGGACAATAATCTTTAACCTGGTTTCCCTTTGTTCGAAATTCTCGACACACTCACACATACACAAATACACGCACGCACACACACAATGAGCCCCAGAACGGAATTCCCCAAGTGGTTTT:1 + chrX 16579405 3' - roo 8664 1 46.67 TTTTCACTTTTTTTTCTTTTTTTTCCTGTTTTGTTTTGTATAATATTATAATTTGTTGAATGCTACAATTTCGTACATAACCTCGAAACTTGTTATATAATATATTTTTATTAACTATTTGTAAAAAGACATATGGTTGAAAAAAT:1 + chrX 15313435 3' - Porto1 170 1 35.62 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACAATGACCGCTGATAATACACACCCATTTA:1 + chr2L 3294216 3' - hopper 54 1 57.14 CACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTA:1 + chrX 20999598 3' - BS 7 1 64.08 CATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATAGGGCTCTTTAAAGTATTAGTTTTATTGCATATTATTATATTTTCTACAAACTTGCAAAAAGGTTGTTCAGACAGGGTG:1 - chr2R 15829479 3' - invader4 2796 2 60.27 AAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATGTAATCGACAAATCGAATATCCAAAAATACCGAAAACATATGTGCGATCGCGATTTCTT:1 - chr2L 436458 3' + copia 194 2 59.59 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCAC:1 + chr3R 16181232 3' + roo 345 2 59.59 GGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACGTCTTCTGATAGGCTATCATCATTCATTGTAGTCATT:1 + chr3R 31814131 3' - FB 85 1 76.03 AATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCTTTGTCCTGGATCATTTTGTCAAAGTACGTGTTCTTGCTTCTACTTATCCGCATCATTGTCCTGACCCCACGATTCGA:1 + chr3R 509524 3' + G6 1939 1 64.17 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATCAGTCAGTTACAGGAGGC:1 - chr3L 17175085 3' - 412 12 2 74.22 AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGCCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGTATATCCCCTCACTTATGTGT:1 - chr2L 4106298 3' - jockey 4833 1 67.12 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACTTTTAAATGGTTGGAAACGCTTCGCTCTGCCTTTTAAATACTGTTTAACGAATCTAGTATA:1 - chr2L 23075091 3' + roo 355 2 60.00 TATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAAGAGTAGATGGTGCCATAAAATGTGCTAATAAGCTAAGGATTTGT:1 - chr2L 17156049 3' + Cr1a 95 1 65.62 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGGGATGAAACATAAATTTAACTGCAAACTCATGGAGCCGTGTGGAAAAGAAGAATGATGACGGGGCACGTTACCTTTGGTTCTGCCATAGCTGTCGGG:1 - chr2L 14748007 3' - Quasimodo 37 2 55.65 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTAC:1 - chr2R 11489173 3' + mdg1 362 2 59.59 AAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAACATTTATATTTCTACTTAATTATTGCCTTATAGGCACCAATTGATTAACGAATTAAATATAGAAAACGCAC:1 + chr2R 10781241 3' - FB 50 1 53.42 AGTTTTCCGACTACCAGATACCCGGTGGGGTCTTAGTAGCGATGGAGCATGTGCTTAGAGGAAGAAGAGTTCCTCTTTCGTACGTGGTATATTTTATATCTCCTGGGTACTTAATTACCTTTC:1 - chr3R 29015527 3' - INE-1 557 1 78.05 GTAATTTTTAACAACAACTTTTTTTCGAGTGTCTCTCCATCGTGCGCTTTTACTGTTCCGCTCGGCCCCTTTCTTCCCCGCTTTTCACGGCACCACCTCCCCCACTTCTCATCCCC:1 + chr2R 15479446 3' - NOF 3909 1 69.83 TAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACAGCGTTTATGCTGCTGGGCTGCTCCTGCAGCATTTGGTGGCCTGATCCTATTCCTGGTCCTTAACCAAAAACGCAAGGGCAGGGCCATTCGTGTGACA:1 - chr3R 27822161 3' + I-element 5341 1 78.42 AAATTTACAATGCATGAGCATACCATACAGTTGTCGGCTGTTACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTATAGCTTTCCTCTCTTTAAAAAAAATTCGATAGATCCATGATTGCTAAGTTTAGAATATGTATGGAATGTTTT:1 + chr2L 19012386 3' - 1360 191 1 72.60 TATGAAAATTTCTCTAGACAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATATAATTATGAAGTATTATGGTATTATAAAGTATCCGATTCCACAAAACATTAGAGAGCTTCAAAGTTTTC:1 + chr2R 2879962 3' + TLD2_LTR 134 1 91.78 AATAAATTAATTAAAAAATAAAAAAAAAGAAAAAATTTTCTTTTAACTAAAAGCCGCGAAAGCTTTTCCGCCATTTAGTTGCCGGCCAAAATATAATTGATATCGGCTC:1 + chr3R 20467705 3' + jockey2 3405 1 67.89 ACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGTACCAATGCCTGTTGAGGCGGTAATATTCAACGCAAGTACCGTCAAGAGAAAGTGTTTAAGA:1 + chr3L 12976384 3' - invader4 2779 2 58.90 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCATAACAGTAAAAACATTAAAAGAAAACGCCCTTAAGGTATGTTACACATTTTCCAACTGAGCCTCAAGTATTCCGTAGT:1 + chr3L 5538119 3' - jockey 4710 1 57.93 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCG:1 - chr2R 11133553 3' + roo 9032 1 59.65 TGAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTT:1 - chr3L 22054989 3' + mdg1 7027 1 50.00 GTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTG:1 + chr3L 11257421 3' + 1360 26 1 54.69 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACGAAAAAGTTGGGAATTTGAATTTT:1 + chr2L 2276792 3' - F-element 71 1 59.72 ACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGTTAGTCGAAGACTATCAAGAATATATATAGTCTATACAAGTTAAATGCAGGATCATTGGTTCTTAAGTTCTCT:1 - chr2L 13154226 3' - Juan 47 1 45.21 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCTTTTGCATATCCGACATATCGAATACAACCCAAATTAGCCAGCCAATCCGACTTGCAG:1 + chr2L 12079705 3' + mdg3 5484 2 63.27 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCTGTATATAAAGTAACTC:1 + chr2L 9668293 3' + 1360 3346 1 53.52 GCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAGTGTCGATTACTGGCATACTCGTTGGTTGCATATCTGTA:1 + chr3L 22642931 3' - hobo 58 1 57.93 AACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACGGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCAGTTGGGCCACAGTTTTTTTTGCACATGTGTAAGAAGTGCGCTGA:1 + chrX 2578081 3' + hopper 1339 1 67.12 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTTGTTAGTTGGCCACTTTATTTTTGAACCATTTTTTTTTTAATGAATAGACAAACTAGATAAAAATATTAAAGCCTCATATATAAGCCTCATAATAAATAGTTAC:1 + chr3R 17305594 3' - roo 8680 2 73.29 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTACCA:2 - 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chr3R 20292424 3' + Fw3 92 1 66.44 CAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACAATGACC:1 + chr2L 3294194 3' + hopper 1333 1 72.60 GACCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATGAAGATAAAATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTT:1 - chr3R 11113198 3' + mdg1 7371 2 70.55 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGTGGCCATTC:1 - chr2L 685994 3' - roo 8722 2 61.94 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGACAACGCCATCACCATTGCCGTCGCCAGCCGAGAAGCCTAAAGAATTATACTTTCCGTGCTCTGCGGCAGGGACACCATCTACATATCCCGACCCATCTTCCCTGC:1 - chr3R 27799445 3' + roo 397 1 73.97 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATATATGGTTCTGTAG:1 + chr3L 12224704 3' - 412 63 2 64.18 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATCTAGCGCAAATCCGAGCAAATAATTATTAAACAAATACTTCTATTTACAAAAAC:1 - 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chr2R 18482358 3' + hopper 1405 2 71.92 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGTTTTACCAACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAA:1 - chr3L 14553124 3' + roo 9023 2 63.06 ATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTT:1 + chr2R 4206655 3' - 1360 323 1 70.55 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTGTTGCGTGGCCTTCTTGGCGACCATTTTCATG:1 - chr2L 4106266 3' - jockey 4791 1 61.03 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATTTTTGTTAATAAA:1 + chr2L 76167 3' + roo 9038 1 63.01 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGCGTATATGAGCTTGAAGAGGAATATAGGGAAACCTTCGACTTGTATGCAGGTCCGTTATTTCATTGCTCTACAATAGA:1 - chrX 21554351 3' + 297 6941 2 61.43 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTG:1 - 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chr3R 27478481 3' - hobo 36 1 49.61 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATTCCTAGGAAATTACAAAGAACAGAACTGCTTTAA:2 + chr3R 30635087 3' - roo 8679 2 41.78 GGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCAGGAGTGGATCTGGCTTAGCTTCGGATGCCTGACCCTGTTATTTACTTTT:1 - chr3R 29418633 3' - mdg3 31 2 60.27 GACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCTTCAACCTCTCACACTGACCCTCCTCCCATCAAAGTGTGTAATTAATGATGCTGAGAGGAAAAAATAGAAGAAAAGGACAATTTACATCC:1 - chr2L 18418551 3' + F-element 234 1 65.07 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAA:1 - chrX 2762581 3' + roo 340 2 62.33 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAACTC:1 + chrX 13395357 3' + roo 9020 2 55.48 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTC:1 - 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chr2R 21443925 3' + 412 455 2 59.59 GAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAAGTGCTTTAAATCAAGTTGAACCACAAATCGTACAAA:1 - chr2R 23000062 3' + mdg1 339 2 73.97 AAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGAAGAAAGATGCCCTGCCATAGTGCTGCTCTCCTCCGAATCAGCAAC:1 - chr2L 16486881 3' + invader2 188 2 66.67 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACG:1 + chr2L 2276769 3' - F-element 70 1 70.83 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAA:1 - chr2R 11489170 3' + mdg1 7404 2 57.24 ATGTCAGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGAAATATATAATATGTTTGAAGATACAATATGTAAAATGTGCTTTTAGGATCATATTTGGTCGTAACTCTCAGT:1 - chr2R 19877543 3' + INE-1 123 1 51.37 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGGGGCAGTGGGG:1 + chr3L 15276723 3' - hopper 49 1 63.20 ACGGCCAAAAACTCGTGTGCCATAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACGTTTTGTAGACGGCAGCAAACAGCCAACA:1 + chr3R 10266189 3' - 1360 45 1 55.48 ATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCCTTCGTCTTAGAAGGGGAGGAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGCTGTGCCGACAACAATTTCGACGTCCAATTCAACGCAAATTAT:1 + chr2L 56105 3' + Burdock 6070 1 69.18 ATGTTTATTCAGCGTGGTTAGTTTTGACACTGCCTGGTTATTCTAATTAGTAAGGCTCTCCCAAGCGCAGCGGAGACCAGCAAACTCATGAAATTATGCAAAACTTTGTCATTAAATATGGCACATGGGGGGTC:1 + chr3R 22914371 3' - GATE 145 2 57.46 ACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGAATTACTCAGTTCTTTATTTTCTATAGTTTTTCTGGATAGTCATGACAAT:1 + chr2L 18149551 3' + Bari1 1667 1 59.31 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAACGATCATCTCCAGTAGTTCGTATCTTGCAGCTATCTAATGACTACCTAAGTTAAGATTCATTCAATTGCAGG:1 + chr2R 15691419 3' + blood 7335 1 71.03 GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACCTGATGTTTGCTTACTACTTAGAAGAAAATACTGTTTAC:1 + chrX 16384138 3' - diver 20 2 71.92 GCAGCGGATATGCCGACAGACTTATCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATGATCTTGTCGGCCCTATTTCCCTCCGACGTACTTATCAACCACCCCTTGCCCCT:1 + chr3R 4199754 3' + G5A 2603 1 75.00 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTC:1 + chr2L 22015985 3' - Tirant 8150 2 66.36 CGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTAGTTCAACGCACTATTCGTTGTCAGATAGAAGTCTCTTGACTTTTTTATTGATTTGT:1 - chr3L 18030974 3' - invader4 53 2 53.96 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTAATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATG:1 + chrX 20999605 3' - BS 43 1 51.37 CTCTGCCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTGGTATGAGTAATT:1 + chr2L 18689247 3' + Gypsy6A_LTR 249 1 72.60 GTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTC:1 - chrX 1103636 3' - pogo 85 1 76.71 TAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACGCGCATTCATTATTTTCGCCTTTTGGTTTCTAAAAATATCCAAAGAACTCAAATATAGGTAAACGACTAAAGAAATCTAAACTGGGCATCGTCGGCGTAAAAAAAAA:1 - chr2L 1516062 3' - micropia 5002 4 61.64 CCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACACAGCTTAAGTTCTCGGCTGATCAGTATCCATGCGCGGTCCATGAATACGCGATTAGCTTGCACAAACTTTATTAAAAAATTCCGACAATCCGCGTTGGGTAGC:1 + chr3R 26181667 3' + Quasimodo 213 2 52.71 CACACTAGCTGCGTAAAGGGTATCTGATGGTCGGTGAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTGATCAGGATTACCTTCCAAACTAGAAAATTTCGTCTTTGAACTGAGAGAAAGAAACAATTTAG:1 + chrX 20527478 3' + INE-1 539 1 74.22 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATGTGTGCAATGACAATATAAATAAAATAATTGCTGACATAAATAAATTCAAAACTCTTGTA:1 + chr3L 6775449 3' + blood 7343 2 56.06 GAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAATCAGGGCGCGAATTTTTAGATTTATTTATTGCTACGAAATTGGCCAATCCATATACTCGAATCAGAATTAAGCATCCTTAGACAGGGACGTATGACCATTACAGAATTTTACAACGA:1 - chr3R 4149973 3' + 1360 3015 1 50.68 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGACACTTAGTAAAAAATAAAAAATCACAGTTTTTATGGGTTTTGCTTGGGCGTTTCTTTATTTCCATTTTATGTACAAAACTTATGACAGAAACGGACGAATTTGAGCGTCCG:1 - chr2R 9873570 3' - roo 8674 2 79.45 AATTATTTTTAGGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCATCTGTACGTATAATACGTTTATCTGCTTTGTTCCATTACATTCAGTTTTTCGATTTTAAGGACGGTAATCAACGAGTTGTAGCAAGCACT:1 + chrX 16361639 3' - Tc1 41 1 76.71 CATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGTTC:1 + chr2R 4261967 3' + invader4 2987 2 53.57 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATTCCTAGGAAATTACAAAGAACAGAACTGCTTTAAA:1 + chr3R 30635088 3' - roo 14 2 42.47 TTAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGC:1 - chr3R 29418693 3' - mdg3 86 2 75.18 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACTAGAACTGCACCGCATCCCCTAATAGACAGCGCATCCGCTACACTCTGAATCATGCACTCAAAAAAATAGTGCAAAAATAAATAAA:1 - chr2L 12414861 3' - pogo 35 1 58.90 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATTCCTAGGAAA:1 + chr3R 30635063 3' - roo 8703 2 45.21 AGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATGTTGAAACACAGATCTCCAATAAAAA:1 + chr3R 23021013 3' - INE-1 572 1 45.89 TATGCTATATATATGTGATGTAAAACGAAAATTTATATTAATCCAAGCAACTTAGCAAAATTCTGTTGCTTTTGCTTACACAGGCTGTTAGTCAGCAATTCAGTTGGTTCCCGGGTCCCGAAGTCACTCAGCC:1 - chr3R 6917786 3' - Copia1_DM 4298 1 61.65 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAGTCAAAA:1 - chr3L 6775354 3' - blood 7073 2 61.43 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATGTGTACATAAATTCATATTGTCTAGTTAGCAAAAAAAACGTAGCACGCTTTTAAGGGTCGTTTAATTCTT:1 - chr3R 6515300 3' - jockey 58 1 54.11 AGATAAGGGGTATATAGTTCCTCGTGAATCTACGTGGGACAGAGAAGTTAAGCCGTCTAACCAAGTCGGGACTCTCAACTTCACCACGTGACGAACGAGCCACCTAAATATAGACACAAATCACA:1 + chr3R 29348136 3' - Cr1a 4127 1 70.40 ATTATTATTATTGTCATTATCATTTAGTAGACTTATTTTGAAACCAATTTAGAGGAACATACTTGATTTTATGCTTTCAAATCATAATTAACCCGTAAGTACAACCTTAGTAACAATTGAGAGGAAATGCCGGAGCGCGACGGTT:1 - chrX 21453625 3' - mdg1 27 2 44.14 CAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCATGAAGCAATGAAATTAACTCTGCAAATTTTGAACTCAGGAGAAACTAATTTTTCTT:1 + chrX 22594475 3' + pogo 408 1 65.75 ACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTA:1 + chrX 4186705 3' + I-element 5273 1 71.23 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCAGG:1 + chr2L 246120 3' + roo 398 1 76.23 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTGATTT:3 - chr3L 96470 3' + roo 9039 1 63.01 GATGGTAACCTTCTCCTGCTGGTTAACTCCAGGGAATTAAGTGACAAATTTATCAACGTGACCACTTTACCTAATGCGATTGAACATAATTTACACTGAAAATCTCGTAAAACTTCAGCCATATCTAAAATGAAATTGTATGAAGA:1 + chrX 10608840 3' + Ivk 450 1 54.79 CATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGAAGGAGCTCTAATCAGAGAAATGCTGTTGAAATAAA:1 - chr2L 12340706 3' + diver 204 1 67.67 AGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATGAGAATATTTATTTAAAAAATTAGACATTGAAATGTACTGTCCTCCGTGTCGTTTGCAAAGATATC:1 + chr3L 15915856 3' - Doc 4558 1 54.79 ATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATGGCGCTTTCAAGTGCGGTGTGTGTTTGAAAGTCCTAGAACATCACGCATAATAAGCAACCAAATATGAAGTTGTGATGTGTTACCAA:1 - chr3R 15021973 3' + Tabor 473 2 75.34 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCCTTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCA:1 - chr3L 17707834 3' - Doc 56 1 64.91 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATATACTTAAATATATGTATATTGTTAAATCCCTACTACAAACCTTAGTTGTTAATCCATGTCCTTTCACGA:1 + chr3L 2878540 3' + 412 7495 2 51.37 AAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAATCGAAGGTACCTTTCAGTATAGTCCTTCAGTATATACTTACCTA:1 + chr3L 21432821 3' - R1A1-element 5193 1 65.91 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCG:1 + chr3R 28797987 3' - BS 5043 1 51.08 AAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACAATCAGCATTGAACGCTTGCTTAGCAAAACAACAATGAAATTCCGTTTGGTAGTATCA:1 - chr3R 23817736 3' + Juan 4023 1 60.96 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATCTAGCGCACATCCGAGCAAATAATTATTAAACAAATACTTCTAT:1 - chr3R 13122508 3' - blood 75 2 67.81 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAAGAAACCGAATCTGCTTGCCCCGCCCATAAATACTTATTATCGCT:1 + chr3L 13634295 3' + 297 6908 2 69.18 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGGGGCGGACTTGTTTGCCCCAGTGGCTTCTGACCGCGAGCAGA:1 - chr2R 6842774 3' - roo 8740 2 69.86 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAATTGCTCAAGAACAACAGATTACACTTATTGTCACCTCAAGAGCTTTTGTCT:1 - chr3L 14062196 3' - Doc 41 1 56.16 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGGAATTATACGTGCAATAATTTGGATTCGTGAGTATAGACTTCAACTATTAAACTATTAAATTATATTTCTCGCGGTGCAGTGGGA:1 + chr2L 2052807 3' - blood 7024 2 63.11 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATGGCGCTTTCAAGTGCGGTGTG:2 - chr3R 15022039 3' + Tabor 407 2 68.49 AAAAAGAAATCGAAAGCGAAAGAAATCTATTTGGAGGATTAGACCCAATACTTCGGCCATCCATGGTTTTGTCTTTAAGATAGCATACATTTTTAATTGTATTATTGATATACAGTTCAACGAGCTGCCATAGCGCTCAGAATTGT:1 + chr2R 14498637 3' + Doc2-element 97 2 72.60 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTT:1 - chr2R 11057247 3' - pogo 48 1 55.32 GTCAGCATAATTAGCATGCGCGACTGCTCGATCTTTATGTGCACATGACTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTGCCAAAGTTAAGTACATAAGAGCAAAGCAACGTCAGCTCCACCAACTCAGCGACTGGTTGGACCTGGGTGGG:1 + chr3R 16095936 3' + Tabor 7011 2 73.97 GGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATTTTCAGCACCTCTTCCTAAGTTTTCCGGGCGTTGCACGTTGCCTATTGCAGCCATTACTCAAGCGACA:1 + chrX 5859002 3' + hobo 250 1 46.58 GGGCTACTTCATATTAAACTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTTAAAAACTTATCAGAACGCGCATAGTCGCATAATAAATCGCAATACACAACGAACATAATAGAGCTCAGCGCTGCTCCATTGATTATATAATCGTTTTACCTCTT:1 - chr4 92196 3' + gypsy4 6748 2 60.96 GTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTATGCAGAAATATTCGTTGGGTATCAACCAATTTGAGGATGTATCAGTGACAAGGCAATTAGGGAACTATCAATTTCA:1 + chr3L 4657001 3' - 1360 166 1 55.71 CTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGATATGGCAAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATGTATGTATACATTATAAGGCCGGAAACGCTAACTCCTATTTTTTTTACTCAATGGGTAATA:1 - chr4 62549 3' - INE-1 136 1 62.59 TTTTTTTTTTTGCAGATTTTCATGCATACTACACTGGCATTACGCATTACGCAAGTGAAGGTGAAATTTGAAAAAAAAAACAAAATACTAAAAAAATACAAATGCAAACAAATTAGTGAAAAGAGCGTAGAAGAA:1 - chr3R 10133452 3' - TART-A 13401 1 80.00 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATCTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAATTC:1 - chrX 2762556 3' + roo 9040 1 59.26 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCCGGTTTCGTCGTCTTTTTGCTGAGATTTCGGTTTTTCT:1 + chr2L 14248144 3' - I-element 24 1 67.81 GCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACA:1 + chr3L 16973454 3' - S-element 71 1 69.86 CGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTCATGCCACAGCG:1 + chr2R 17392086 3' - BS 5067 1 69.78 CTTAATTGGAGTTCATCATTACATTCCACTTTAATACACCCCGTAAATAGTTGAAATTTCAAAAGCCTTGTGTGGGAAAAACTTTAACCGAGAGCAGGTGGAAAACTATCGTTCAGCTTAACTTTTAATCTGTAGCCAACTATAGA:1 + chr3L 10133661 3' + 412 7545 2 80.14 AAAAAAAAAACAAACAAAAAATAAAAATAAACAAATAAAAAATGAAGCACGGATGCAAAATGGATTTGGCCAGTCGAGAAAAATAACAAAAAAAAAATAAAAGAAAAACAGCGAAGCCAAGCCGAAAAAAGCACACACTTAA:1 - chrX 9750821 3' - hopper 143 8 50.70 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCACGGCCAGCTTTACAGCCAGACAAACAGCAACAAATGTCTGGCACACCCACAACTCATTCCACTCGAATCATG:1 + chr2R 19726950 3' + 1360 3354 1 58.33 TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAAT:1 - chrX 13219900 3' - Doc 74 1 53.23 ATCACTTTATTTTAGTGAGGTAAATAGAATATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGATAGAGAAAGAGTGAATCGGAAAAGTGGCAGTCGCAGAGAGAGATGGCTATCGAAGTCTCCACAAAAGCT:1 + chr3L 22642143 3' + Doc3-element 47 1 51.45 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACCAAAATATAAGTAACG:1 - chr3L 22861716 3' + S-element 1708 2 74.66 TAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCTGTCT:1 + chr3R 9160795 3' + copia 5088 2 56.85 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGCC:1 - chr2R 23287461 3' + roo 9026 1 69.23 AAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAATGGTCAAGTTATTATTACATTTCATGGTTTTTATATAGTCAGTGCTTTGTCA:1 + chr3L 11776756 3' + mdg3 5465 2 50.91 ACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGATATGACCACGCGGGAGGTGATTAGCGCAGTCATAGGCCTCGAAAACGAGAAGAACAACGCAGAACTAGTCGCGATACAAACTAAAA:1 - chr3R 25847384 3' + rooA 7346 2 62.30 GTTATTATTATTGTTATTATGTTTGTATATACTACAATATTCTTTCTTTCAGTTCTGGGCGGCCTATGTCCCCTGCGAGGCTCAACATCGAGATGCAGTGCAGCTGACTCTGGCGCAGATCGATGTAATAAAGCGCCTGACG:1 - chr2L 18192975 3' - mdg1 15 2 70.42 ACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGGAATGTGACCAATGTTTATTAATACGCTTATTGTTATTTAAAAAGTTGTAAGTGC:2 - 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chr3L 14550942 3' - P-element 46 1 49.66 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAAATATAAC:1 - chr3L 24228599 3' + copia 208 2 72.60 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTAATTAAGCTGTCAATCTCTTT:1 - chrX 14964579 3' + roo 9044 1 65.07 TCTTTTTTTTTAAGTTTATTTTATCAAAGCAAAGATAATTAAATATGTTCAGCCACACAAGTACACGTGCGAATATCAAACTAATTAGTTTTTTTTATAGAAATGGGTCCGTGTGACAGGAACCTCTTTACCACATTTCAGATATC:1 - chr2R 12590489 3' - gypsy2 424 1 56.16 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATACTTACATATATATATACATATATCCCGACCATCCCCCAAAGAACCCAAATTCCTTGACACAAGACGGCGCACAAGA:1 - chrX 6138605 3' + opus 455 2 60.27 TGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAGCCACCGGATAATTGTGTCCGATCTTCAGTTTGCCAAAC:1 - chr3R 11057578 3' - flea 4835 1 72.60 TGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGTATTTGTTTTTTTTTATTTTGTTGTGGCTCAGCATGGGTGTGG:1 - 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chr3L 905727 3' + 412 7531 2 73.97 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAATTTGTGGGAATCTTTTC:1 + chr2R 5237934 3' - Doc 43 1 60.69 CGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAAGAAAAACCAGCTAAAAAGCAAGCCTCAAAAAGATTGGTATCTCGATGGCATACAAAAGGGCAGAACAACTCAATTCGAGGGATAATCGGTGTATATTCCTTTTGTTGGCACCAA:1 + chr2R 16725772 3' + invader2 473 1 78.77 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTCTTCAAAATCCATAGCATACCTTGAGGTGCTTTTG:1 - chr3L 9497712 3' - jockey 4795 1 63.01 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGTTTT:2 + chr2R 10695912 3' + roo 9048 2 67.81 TATAGACATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAAT:1 + chr2R 4261940 3' + invader4 196 2 73.79 ATTAGTCTTGTAAATTTCTATCTATATATCATTCTCTCTTGTTTCATGAATTATTTTAACAAAATCGAAGGGGGAAAGCCCAAAAGTATGCCATAGTTATTTCAACTATAATACTAAGACCATAATATTCTTTAGTTTTTTGTTAA:1 - chr2L 9547412 3' + INE-1 297 1 46.58 GATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAG:1 - chr3L 24152406 3' - HMS-Beagle2 26 2 66.44 ATTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTAAATGATTTAAACAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCAT:1 - chr3L 21144059 3' - jockey 4724 1 61.90 ATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAAAGTATATAGTTAGATAACTAAATTTATCATTAGTTACACCG:1 + chr2L 8960304 3' - Ivk 5275 1 71.92 AGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACTTGTATTTGTATAATATATGTGTGTTCAGTATCTATGTGATTGGTGTGTATTGCATCTGTGTATATATGTGTGTGTGTGTGTGGTCTTGTATTATAGAGCTTTATC:1 - chr3R 15400367 3' - accord 297 2 71.92 ACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATTCGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTCTAAACAAATGCGAAAACAAGAAAAATTCCA:1 + chr3L 5127008 3' + R1A1-element 305 1 74.81 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGCTGGCTTTCATTTTATTATTGCTTTTCATAATATAATCTATTTAGATATTGCAAAATCGT:1 - chr2R 22492021 3' + pogo 2043 1 59.59 CTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTTTTCTGCGAACATAGAATATATCTAAGAGATCCATTTGGTCCT:1 - chr3L 7120975 3' - F-element 316 1 71.23 GAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAAGATTCAACTTCAGAAAGCATT:1 - chr2L 18282523 3' + gypsy5 7300 2 50.00 GTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCCAGTCATTGCAGATTGTGCAGGGCGAGGGATCCCAGCACCTAGTGAAAGTACTGTGCCCCACCTACAGACCACCGAGTGCGGCGAAAC:1 + chr2L 13791810 3' - F-element 334 1 71.54 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGCGCACACCTCATTGAAAGCCCAT:1 - chr3R 30634909 3' + roo 9044 1 63.36 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAGGATGCCATTTCAGGATAAGAGCCATGACGG:2 + chr3L 17133904 3' + jockey 4966 1 49.32 ATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTG:1 - 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chr3R 19589937 3' - BS 5080 1 73.97 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTACATTATAAATTTGATTAAAACCAAAGAATTCTAGTTAAGGAGCAGCTGACAACAAGTTGTTAAATTTT:1 + chr3L 18467291 3' + hobo 2907 1 58.59 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATTAAATAATAGTATTCGATAAATATTAAAACAATATTTGCAACTTGTAATAAGAATTTGAATAAAATATTATATAAAATAAATTCATATTTATC:1 - chr2L 16399283 3' + roo 9045 1 54.79 AACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAAAGTTTAGCATACATATATATTAATACAACCTATTTGTGC:1 - chr2R 5617462 3' + invader1 376 2 60.27 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTTACAGTTCGATACTCGTATTGTTGCTTCAGAACGCAAATGGCACCTTTCT:1 - chr3R 27768812 3' - 297 52 2 60.61 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATA:1 + chr2L 76153 3' + roo 360 2 56.16 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACAATGACCGCTGATAATACACACCCATTTACATGACTACACTTGTGGAGCCCAATCTGCGTATTATAAT:1 + chr2L 3294255 3' + hopper 1409 2 76.34 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATTATTTCCTGTATTGTGTTTTGCGGATCCCACGACATGG:1 - chr3R 4569524 3' + opus 7440 2 71.20 ATTAATTTACCTTTCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGTCTTATTCGTGGTGTCTGTCTGTCATCCTTTGAATTTGACTGACAACGACTTTCTGCTTTAGAAAAGTCTCTTTGGCGGG:1 - chrX 9426973 3' + Cr1a 3995 1 51.43 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCCATTACAAGCAAACTGGAAACTTCAGTCCTTTGCCAGGATGTCATAAACATAAATAATCATTAAAACTAGACATAAATTGCA:1 + chr2R 16403530 3' - copia 37 2 60.27 ATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGATTTTGTGTTTTTTCATTCGATAAAAATATCTATTTTCTGTCCCAGCA:1 - chr3R 32021126 3' + Stalker4 107 4 68.49 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTG:1 + chr2R 13644522 3' - Burdock 6183 2 54.68 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTATGCTAAGTGATTTTCT:1 - chr3L 96467 3' + roo 9043 1 64.14 CTTATTTACATTCTTGAGTAAAATCACAACTTTTAAGCTGTTAGCAGTGTCTGGTTTTGACCAACTTAAAGTCCCGAAATTATCAATACAATATTTTCTATCAATAAAGGTTAGAAAGTTGGTCTTTTCGTCTACTTGAAGTGCAT:1 + chr2R 19421457 3' + HB 171 1 68.49 ACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGATATATTGGAATTCTAATTAACTACACATCTCCCGCCCGCCAGTGGCACATCCTTGGTCTCCTTGCCATT:1 - chr2L 18317463 3' + mdg1 347 2 68.57 ATATTATTATATATTGTATTATAATTATTGTATTACATTGATCGACGTTTGTGGAGGCTATATATAGCCATGCCTTTTTTTTGTTGTACTCACGACACCAACTCTATGTTTTTCCATTGACTGCCTTATCGTTTGAAGTGATTTTC:1 - chr3L 661763 3' + Tc3 283 1 76.71 CCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGGACGG:1 + chr3L 27391424 3' + 1360 3378 1 76.30 CTTGATAAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCCGCCCGTATGAACGTCGATATCTCAGGAAATATAAAAGCTAGGCTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGCGATCCGGATGAAGTCCTTGTACAGGTTGTACG:1 - chr3R 19911422 3' + INE-1 89 1 73.29 ATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTAACATAACATATAATGGATATTATATATAGGCAAGTGATTCAGAACAGAACA:1 + chr3R 9393024 3' - S-element 64 1 63.70 TGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCATTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTTTTTTTTTTATCTTTAATACGCTCGCAAAC:1 + chrX 13736221 3' - Quasimodo 328 2 78.57 CCTGTCCGGGAGACCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTTTGGATTTTTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTACCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTT:1 - chr2L 8776807 3' - G4 3701 1 43.84 GAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGC:2 - chr2R 22723019 3' - 3S18 58 2 55.48 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAGGTCATGCGAGGTCAAGATGCATCATGATAATAGACAGAAATTTGGCCTAACTTAACCATTAAATGTTCAAG:1 - chr2R 16403356 3' + copia 244 1 77.40 GGACCACCCAAATACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTTGACAGCTCGGAAGGCCAAAACAAACGCAGCAGGTGGC:1 + chr3L 21158140 3' - 297 6581 1 73.79 TACAAATATATGTATATTAAATGAAATGAAAATAATTAAATGAATATTAATTAAAATACGGAAAACTTTTGATATAACTTTCAATATCTGAGTAAAGTTATTAATGTGCTGTCCACCACTGTTTGTCATAATACTAAATGGTTGAA:1 - chrX 11320347 3' + transib3 2622 1 60.27 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGTTAGCACCAATA:1 + chr2L 12319321 3' - copia 71 2 70.80 CATAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGTGCTTAAAGGGAAAAGTCGAATAAAGGCATTGTGAAATTATTTAAAGGATTGAGTACATTGTTGGGCTCAAGTCCATGGAGATAACATAAAAATCG:1 - chrX 17798994 3' + invader3 173 2 74.29 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGTTCAGCCTTGATAGATCCCCGTATGCCATAGTTGCT:1 + chrX 11471512 3' - jockey 4758 1 73.10 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAGTCAAAATATGTTTGCAACTCATGATGTGCTACCAGTTTTCAGCATTTCTG:1 - chr3L 6775310 3' - blood 20 2 71.13 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGGAAACTACCAGCCAAGCATC:1 + chr2R 5955049 3' + copia 242 1 52.41 CGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACGCAGTAAGTCC:1 + chr2R 4313064 3' + gypsy 412 2 45.21 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTG:1 - chrX 1103607 3' - pogo 56 1 59.59 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTAT:2 + chr3L 19350009 3' - jockey 66 1 51.37 GGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAGATATTTTTATGTAATTATT:1 + chr3R 9352148 3' - Tirant 8118 2 79.45 GCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAATAAGACGTTTTATTGTTGTAA:1 - chr2R 8641472 3' + diver 222 1 79.13 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGCCATAAACAGAGAAACAAACAAATA:1 - chr3L 27350430 3' + pogo 2082 1 71.23 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATATACATTTGCAGTATAGTATCGCAGTAATCTGTGATGGAAATCCTTATTAAATTTGCC:1 + chr3R 29418827 3' + mdg3 5491 2 78.08 GGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGACTATATTCTTTCTCAGCTCAGCTATTAACAATTTTTCGAATCAGATTGTA:1 + chr3R 15482453 3' + R1A1-element 4979 1 54.55 AAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTG:1 + chr2L 18279962 3' + gypsy5 350 2 67.20 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAG:1 + chr3L 17890810 3' + 412 417 2 70.55 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGCGAACAATGTGCCATCCTTTCTCTACCTCGCTGACTACCGAATCAGC:1 + chr3L 22648417 3' + Tabor 7306 2 68.89 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTAAGGCTGTGCTAGCTAACAAAGGCTATCCAACCAAGTATTATGCCGTAATTAACATATTAAAAAGAAAAAGAATTTCTGCCTATTAT:1 + chr2L 12075101 3' - 1360 26 1 65.22 CTCTAACGCATCGTCGAACCGAGGCTATGTAGAACAGAGCAAAATCCGTTAAACTCGCAAAACGGAACATAACGGAACGGGAATCGGAACAGTACGTAGGCAAATAAACAAGCAGTCGAAGCGGAAGGAACTAACGGCTGAAAAA:1 - chr3L 10560365 3' - invader6 4666 2 59.31 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTT:1 + chrX 12525979 3' - roo 85 2 76.03 TGAAAATTTTTTCAAACACCTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATAAAAAACAAGGCAAAAAATAAAAGCAGCACACAATCAGCGGGTGTAAGGAACAACGCAAACA:1 - chr3L 10726158 3' + hopper 1037 1 58.26 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAG:1 - chr2R 641864 3' + opus 7440 2 64.03 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATCGCTAATTCGGAGTGAGAACCTGACGAAATGGAGAACGTCGGGAGAGAGATTCTTAACGAAGGGCA:1 - chr2R 7665735 3' - Transpac 4953 2 56.25 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGG:1 - chr2L 3890161 3' - jockey 76 1 74.40 TAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGCCTCCGAAGGAGGTCTGAAC:1 - chr2R 8641524 3' + diver 6061 2 66.07 ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAGC:1 - chr3L 24152405 3' - HMS-Beagle2 10 2 74.81 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACGCGTTGCCGCCAC:1 + chr2L 17240314 3' - hopper 29 1 57.39 TATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCACCAATTTAAGTTTCTTTGGAACATTTTGTCAATTTATTGCTCTGTTG:1 - chr2R 5917773 3' - I-element 5067 1 65.07 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCCGCTGTAG:1 - chrX 2762562 3' + roo 396 1 67.27 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCAGCTGTC:1 + chr3R 16181268 3' + roo 393 1 72.59 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCCATCCCGCTGAGCAATAATTTGTGCTTATGCTGATGGAAAAGTAGTAAAAGCCAAACTACTAACCACACA:1 - chr2R 23497024 3' + 412 443 2 54.48 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACATATATACACACAGCCAGCCGAGCGGGCCGATATACATACATATGCGCAAATGAATACCACACAAATACAGAATACGCGACGCC:1 + chr3R 17067950 3' - 297 8 2 75.20 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTTTGAATTCAATTTTAGCAAGTCCTTGTCGTCCTTCCACACCCGGATCCAATC:1 - chr2L 2272465 3' + copia 226 1 65.71 CATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGC:1 + chr3R 22516024 3' - jockey 4636 1 73.38 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTTATATTTTAGAATTCGGAATTTCCGTGAAAAGTCCTGAAAAGCTTTGTCACTGCCAACCCGTCCTTTGTGTGTTTTTTTTTTCGCTTGGTGGCTTTTTTATTTTTCCT:1 - chrX 21234391 3' + 297 6963 2 69.18 ATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGACACGGACCA:1 - chr3R 20486353 3' + accord 7225 2 76.71 GCTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTACCGTTAATTCACGGTCTCTCCGCTTTGCCTAGCTGTTTTTGGCGCTCGCCGTAGGTGCAGTTGCAGGTGTTATTGTTCGGTTTGCGGTTTCGGACCAGCCGCG:1 - chr2R 8651424 3' - gypsy8 4750 2 57.36 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGCTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCA:1 - chr3R 22100502 3' - 412 39 2 55.38 ATTTCAAAAAAAGAAAAAAAAAATGGCAAATACCCTCTAAAGGTAGCTCCTTTCCAAAGTTTATGTACTTTACGAATGAATTCTTCTTGTGCTTCACTTACTTACTAAACCTTTAATTTGTTTAATGTTTTATGTACATTTTCCAC:1 + chrX 5717110 3' + TART-B 10633 4 61.64 ATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTCTTTATCAAAAATGTACAGACCTAAATCGTTGCATCTCTTATTTAAATGATAATC:1 - chr3R 4671049 3' - pogo 2037 1 62.33 CAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCATCATAGACGAGGACATCTATCCCAACGAAGCGCAGGCCTTTGCGGACGAGCACTGCGTGGTGGAGGGCTGCGAGGCATCCAAGGAAC:1 - chr2L 19750378 3' - diver2 4671 2 56.16 GCATTGTGCAAAGGACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGACCGAAATGGAAAAACGG:1 - chrX 12191511 3' + pogo 2080 1 68.46 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGACGACTGCTTGCAATTAGAGTTGGCAAATTATATTT:1 - chr2R 12787786 3' + 297 6964 2 74.58 TATATTCTTGGTCATGATCAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTA:1 + chr3L 11826427 3' + INE-1 83 1 67.81 AGCCGAGAACTTGAGCTGCGTTAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGAGAATGACGGATTCGGCAGTAAGATTTGAGCTAATTTCAGTTTGTTTAAGGGGGCGTATGAGCAATGTCAGCAGCAGGAGAAGCACGTG:1 - chr3L 11048118 3' - Quasimodo 6963 2 53.03 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAATTTGCTCTCTCATGCTCAAAAAAAATTG:1 + chr3R 23765456 3' - roo 8677 2 65.31 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTAAATTGTATTGACATTTGAAAGAGTAGGTTGAACGACATT:1 - chr3L 12224635 3' + 412 7478 2 68.89 GTATGAACGTCGTGATCTCAGGAACTGTACAGGTTTGTATATAAATTTTCAAACTTTTATATATTCCACACTGGTAGTGGACAACAAAAATAAAAGTTGCAAAAGTCCAATAGGGGTCAAAGATTAAAAATAGTATTGAAAACTTT:1 - chr2L 21998633 3' + INE-1 137 1 62.33 ACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGAC:1 + chrX 20999617 3' - BS 15 1 65.38 GTGTTCGTCTATTGTGGAGTGAGAAATGATTTGTGCGTGTCAGTTAAGATGGAATATAGTGGGTGAGCAGGGGGTCTTAAAATGTTGAGGTGGGTGTCTTTCAATCATACAAAAGCCGGCGAAGAGAAAAAATCCTTTTGACAATG:1 + chr3L 14091077 3' + transib3 394 1 76.71 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACACACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACACAGGCTAGCT:1 - chr2R 5214950 3' - F-element 67 1 56.16 AAGCACTCGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAAATGTCAGAACGATCACCAACGTGTAAAAAG:1 - chr3R 7981500 3' - jockey 93 1 78.32 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGAAAAGTTTTTGAAGCTTCCCGCATAATCAACTCTGTGCCTTGGACTTTTTGCAA:1 - chr3R 17656355 3' + mdg3 228 2 70.25 ACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACGCAGTAAGTCCGAACTGCAAGGTAAGACAACTGTTCTATCCTGTCAAACGGAACGAGATATGCC:1 + chr2R 4313117 3' + gypsy 439 2 68.49 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATACGCCGAGTGGTTTAGATAGCAGTTTTTGCAAGTGCGTTGTATTTACTAAGAACTTGAA:1 - chr2R 19553179 3' - mdg1 7069 2 54.78 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTATTGGCTTACCTTAAAGTCGCG:1 - chr2L 2031015 3' - 412 50 2 51.37 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGTTTTTTTTGCATATCAACACACGTGTAAAGCAAATGTTAAACATGAAT:1 + chr3L 9571769 3' + jockey 4961 1 58.90 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCAAGAAA:1 + chr2R 19553296 3' + mdg1 7415 2 52.05 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCACTTTGAGTGTGTTAAATTTAT:1 - chr3L 18467174 3' - hobo 51 1 54.17 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGATATTGGCCATATCATTCGGCCGGCTAAGCGCTAACGAGTTAGCAGGTGGCACAT:1 + chrX 4291960 3' - roo 64 2 65.07 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAGTAATAAATCTCATTTAATGCGGGACTATAGTAAATCCAAATTTAAACAGCCTTCAACAAACGAATTGCTGT:1 - 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Quasimodo 27 2 45.21 AACTGGAGCACCGCATCCGGCCAAGTGCTGACTTTGCTTACAAAGTTGCACAGCAACATTGTCCGCAAGCAACCCGACCAGCCAAAAACTTGAGTAACCAAGAGCTAGAGGAGACTTCTCCGACACAATAAAGAC:1 + chr2R 5071047 3' + Tirant 73 2 45.19 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATC:1 + chr2R 8641623 3' - diver 32 2 57.86 CGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATATGCCAGCTAATCTCAGAGGTTAATACGAAGCAGCCAAATGACCACAAGATTAACGCACTTGAGAGCCACCGAAAATC:1 + chr3R 19859720 3' - opus 8 2 74.56 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCCAAATTATAGGTCAATTTTAGGGATTACTCTTCCCCAACTCAGTGCATTCGTGTCATATCCAATGCATACTTTTGGGCAGATACTGCATATGAGAGCTTATCACTA:1 - chr2L 3762873 3' - jockey 23 1 67.81 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGAATGCACTCTCTCACTTATCCGCTCTCACTCTCAGCAGACTGCAACTGTAAATTGTAAAGGGAAACGATCTGTCAAAAA:1 + chrX 14951224 3' + P-element 2847 1 56.85 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTTGTATATAAATTCGCTAAACGGTCTTAAATATATTTCATAAATCCGCTAATTTGAAATCGATTTTCTCCCC:1 - chrX 2934461 3' + S-element 1671 1 54.79 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGT:1 - chr2L 686002 3' - roo 57 2 65.60 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCC:1 - chr3L 17890736 3' - 412 7111 2 62.60 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTTTATCTTCGGTGATAAAAGCCGCCTTGTAATTGGGAATA:1 - chr3L 11776685 3' - mdg3 5335 2 71.23 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGCATTTTTTTTTTCCATTTATGTAGCAATTGAAACGAGATCCCACCA:1 + chr3L 16580378 3' - 412 26 2 63.57 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTGTATAATAATTCTGTATATGTATGTATAATAATTCTTTGATTTCTTAGTTTATTTTTTCAAAGTGAATTACCTCTT:2 - chr2R 9874764 3' - S-element 36 2 60.96 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGCAGCCCAGTTGCAAGTTCGACTTGTCTCAGCCA:1 + chr2L 16458726 3' + roo 9053 2 72.60 GCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCG:1 + chr2R 15829614 3' + invader4 286 2 53.73 GCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTATGTATGTACATACTGTGAACTTACATATATAGAAACG:1 + chr3L 16870232 3' - FB 84 1 77.24 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAATAAAAATTGCAAATTTATACATACGTACG:1 + chr3L 20713030 3' - roo 8744 2 83.58 TATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTGACAACTGACAAACGTGAATCACATAT:1 + chr2R 954536 3' - Quasimodo 70 2 71.92 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACCTTACCAAATGGGATTTAAAACTTTAAAGGATCATGTAAAGTAAGTATATGGAAATGTCAAACTTAAAAGTTCGTAAAGACTAAAGTTGCAGCTGCTTTTAAAGTCAAATGC:1 - chr2L 12349703 3' - F-element 50 1 74.66 CTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATCATTTGTATAAGATACTGTAACTTCGGAAAGATTCATTTCCCCACATCCAGTCGAGTCTATTATTCAAATTTTACAGCAAATTATAAGCTGACATTTTTTAAATT:1 + chr4 1174124 3' + Cr1a 4245 1 77.08 AAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGA:1 + chr3L 9909763 3' - Transpac 4992 2 68.12 CATGTTTTAATACTTAAAACCTGTCAGGGAGGTCTAGCACGTAAAATCTTTTAAGTCTTCTGACGTTGTTATTATTACTTACCAACCGGTATCGAGTGCGACATTTGTCTGAACAGCATGGGCTTTTGCAATACAAATCTGCTCAA:1 - chr3R 7084209 3' - G4 3720 1 52.74 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATTTAATATTAATGCCAGTAGTCTGCTCAAAGGCACTCAAAAAGGT:1 + chr2L 14201528 3' - roo 4 2 76.03 ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTC:1 - chr3L 9497752 3' - jockey 4818 1 58.14 GCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATGATAAAACACAATGACGTTGTGAAACTTATATCAAAA:1 - chr3R 929313 3' + Max-element 240 2 67.21 TACACAAAACACTAAATCGAAGTTTAATCCTGAATTTTTAAATTATTTTATTAAAATTTTAAAAGTTTAAGATAGATGTTCAAATAGCATATAGCACATAGCTGTTCAGCCCGTTAAGAATCCACGAGGTGATCGCACTGGAGACA:1 + chr2R 20653234 3' - S-element 1487 1 54.11 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTATATCGTACTATTTCATGGCTTAAATTTTATTTGACGCATTTT:1 - chr2R 8305180 3' - roo 8694 2 65.07 AAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' - Tabor 6917 2 68.49 ACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATGGTACATATCGCATCGATGCACAATCTCGTTCGCTTACACCAATAAAATCTTATCGTTC:1 + chr2L 22340038 3' + F-element 4355 1 51.79 TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCTGCGGAGAGACGGGTAGCCGTGGACACCCCAGAGCCTCGGGTCAGTGGCAACAACAAGCTAGTAAGCTCCAT:1 + chr3R 8258944 3' + Tirant 8477 2 58.06 GCTTGGCCGAAAATCTGCAACCACTCTGGAAAATAAAAAAAAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTAACTGGGGCTTTGCTTCGCATCCC:1 - chr2R 16691679 3' + G4 3359 1 75.27 TATTTCCCCTTTAGCGCACGGCCCGTTCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTTATTATGTAAGCGGCTAAGGCTCAATGTTTCGGAATATCGTGCAAGTCAAGATG:1 - chr3R 8778079 3' - gypsy8 305 1 52.29 TCTTGAAAGGTTATTTTTCCAAATTTCGGATGATTAAGATCGGGAAAATACGTTTATCTGAGCTCTAATGAAACTCTTTAGCAATTTGTTTGCCAACGTTCTGGGATCAGAAAATCCCAACAAGCAGAATGCGGCAATTTGCGACA:1 - chr3R 10319508 3' + S2 1362 1 49.32 TTAGATTAAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAAAACGTTTCTTGCTACCTGTTGCGTACTTTCCAAAGAATACCGTATACCCTGTTAGTAGGCAGGAACCGTCTCTAGTGCAGTTTTTCTTTTTGCTCCTTG:1 + chr2R 6526625 3' + jockey2 3342 1 68.49 CATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGACTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAGGACGGAAATCCACTGAGCAGCGTGCCCGAAGGCGCCTTCGC:1 + chr2L 1601785 3' + 1360 423 1 65.89 TTTTTTTTATTTTTTGTTTTGAACTTACCGCGGCGGCGGATCGGCTTGAATTTCGCACACAACCTCAACATTTGATTAAGGGCTTAATTCCGTTGATT:1 - chr2L 14914540 3' - R2-element 3584 2 71.43 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGACCGAAATGGAAAAA:1 - chrX 12191514 3' + pogo 2061 1 58.90 CTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGGTTAACCATGAATATTTCAGGTTGGAGATTAATTCCGGCAG:1 + chr3R 13624323 3' - copia 81 2 71.23 GTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTAGTTCAACGCACTATTCGTTGTCAGATAGAAGTCTCTTGACTTTTTTATTGATTTGTTTAGTTCACAGATTTGATTGATATTAGATCTTGGTATGCTGGTATCCTTGTGTG:1 - chr3L 18030920 3' - invader4 2 2 81.69 CCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGCCTTAGCTATTTTAACCTTGGAAAGATGTCATATTTTGGTCGCTTGTAAACATCTTGGAGTATATTATATAATATTTAT:1 + chrX 18806268 3' + roo 9030 1 54.11 ATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCCTGATTAAACTCTTTCACCTCCCCAGGCCCATATTA:1 - chr2L 21950438 3' + Burdock 257 1 74.47 GGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAACCACTAGTGTATACATATAAAAAGTGAAAAACCGCTAAAACAACGATTTTGTGTCGAGAACGTATTATATTTAATAATACCTATTA:1 - chr4 221348 3' + Quasimodo 6949 2 63.04 ATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTACTATCCT:1 - chrY 680442 3' - invader2 4893 2 67.12 GATCGGACCTCACTCAGCTGTAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAAAAAATTATATATATTCGTCCAGCACATGCAT:1 + chr3L 9220110 3' - invader4 2877 2 77.70 GAGTAAAGTCTTCTTTTTTGGGATTTTACAGTACATATAGGTGGGCAGCATGGTCATCAGCGTTTCATAGCCATAATTGTGCCCGGCATGGGACACCAGAATGGCATAGAAGGGTGGCGATTTGGCAATGCCCAG:1 - chrX 4785029 3' + roo 400 1 73.33 TATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACTCAATAAAACTGTGAACCCTCTCTTATTGAATTTTCCATAGATATGTAGAAATTATTGCTAGTCAATTGCCACTGTGCTTGATAAACTGCCAAGTAAATACTGTATCTCTAC:1 - chr2L 1259857 3' + Burdock 6385 2 76.71 GAACAGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTTAGAAGAACTGTGTAATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATGCCA:1 + chrX 23078697 3' + F-element 4577 1 64.38 CGACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTTGACTCGACTCATGGTCCTACCGGTTGTATTGATATAAGCAAAGGATAAATCGCAGAACTCACTAAAGCATTGAACTGGAAAGAATTTTCATCTACCAGTGGGGCAGCTAAAAGTAAGCT:1 - chr3L 22980570 3' + INE-1 579 1 57.93 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTGATCAGGCTGCAGTGTGTGATGCAATTATGAGGGAGTAGTTTTTTGTTACAGTTTAAAGTAAACATTCCCCCCCT:1 + chrX 16855351 3' + roo 9036 1 57.78 GATATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTACTTCTGCCTGATACATACTTTTCAATATCCAAATATTTGTTCCACTTTTTTCCGATTTTCTTTTTTTTATTTTGTTTTGCGGTTTTGGCCTTTT:1 - chrX 20783680 3' - INE-1 86 1 56.16 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTGGCATTGAATTTATTTTCCACAGTCTGAGTCAGTAGATACAACTGCTT:1 - chr2R 12543038 3' - roo 33 2 60.84 AAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGTTCCTCTATTACGGCTGCACTCCTGCTATAATACGTCTTTCACTTGAATTGCTTTTGAAAGCTGTACATTTCTAATGAATCTGAGTATAGAATGTTTATCTTTTGAGTCT:1 - chrX 17419333 3' - Juan 4038 1 72.60 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAA:1 + chr3R 23765428 3' - roo 89 2 79.45 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGCGTATATGAGCTTGAAGAGGAATATAGGGAAACCTTCGACTTGTATGCAGGTCCGTTATTTCATTGCTCTACAATAG:1 - chrX 21554352 3' + 297 353 2 58.22 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCCGCTCATTTCGTTTGTTGTTCTTGTTGCCGCTGTTGTTAATT:1 - chrX 5679939 3' - P-element 56 1 38.89 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGACTTTACACTTATCTAGCATAATCCTTATCTTCAGTGCAATAATGGCGCAAGGAAATTCATGTTTTCAGAGGCTTTAATCCATTCAGCCGCAATTCCACGCCTTGCACCTCGGCC:1 - chrX 10567721 3' + roo 391 2 73.29 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCAGCTCCTAGTCCAAGTCAAAGTCCAGGC:1 + chr3R 22100621 3' + 412 465 2 59.52 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGATGATCAAAAAAACTTAAATTTGATTTATTCTTTTCCCTGTTTATTAGTTTTACATTTAAAAGTATTCTTTTATATAT:1 + chr3R 17546727 3' + blood 7346 2 46.58 GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAATTATGACATATTTAAATGGCATACAACA:1 - chr2R 13644396 3' + Burdock 6349 2 56.25 AGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTATGTATATGTACACAAAGGATGTCACACGAAATATATTTAAAATTCTTCCAAATA:1 - 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chr3R 20175707 3' - hopper 72 1 68.28 AAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAGTGGGCTTCAACGTGTAAACTGATTGGAGCAGTAATTTTTTAAAAGATTGAAGCTGACTCCGGTACTCCGGTCATCCGAAATTTATTTGGG:1 - chr2L 19861795 3' + invader2 4786 1 65.75 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGT:2 + chr3R 9160744 3' + copia 168 2 73.29 AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCT:1 + chr3R 9190580 3' + Tabor 7245 2 70.55 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATAACAATCGACCGGATCCCGAACATCCCCTGATGAG:1 - chr2R 1921395 3' + mdg1 380 2 56.85 GACAGACTTTGCGCCCACACGAACACGATGGCGAATGATCTTGTTGACTCTATTTCCCCTCGACGTCTGAAGCATAGCATAATCTCTCCACGGTACATTCCAGAGCTTTATCTGCCTTTAAGCTGATTTCCTTTGCG:1 + chrX 7771823 3' + G5A 2617 1 72.99 AAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATAAGAGGGGGAAACCACTGCGCCCCGCTGCGAATTATTA:1 + chr3L 2885311 3' - S-element 80 2 76.03 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAACCCCAAGGCGAAAAATTCCCTCGAGGAAGGCCAGGAAAAGCA:1 + chr2R 23116170 3' - jockey 84 1 69.18 CATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATGCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTTTTTTAAAGCTCTTCTTTTTCACATGCCCATGCG:1 - chr2L 4580150 3' - 1731 88 1 73.91 GATTAGTCGATAAGTTTCTCGCAGAATTTTCCTGCATTTCCTGCGATTTTCACGCCGCAATGCAGCTGCCAATT:1 - chr2R 21403724 3' - mdg3 5374 2 74.32 GCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGTGTGTAAGAATTAAAGACTTTGAGACAATTGAATGTTTTAATCAAAAGAGTATTTCAGCAAATTGTGTGTGCGCCCCGAGGGCCAGCAATG:1 + chrX 7783724 3' - INE-1 19 1 71.92 TATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATTATATATTAAAATTATTCGTTTATTATCTCTGCTTCCCTTGCCATGCACTTCGTTTCGAATTT:1 - chr3L 8855852 3' - rover 52 2 60.96 ATTCACACTAGTTGTGTAACGGATATCTGATAATCGGGTAACTCGACTATAGCACTCTCTTTTGCATTAGTATGTTTCCAAGCCAATGTGACAATGGTAACATTAAACATTTTGAAAAATGTTTAAATAAACCGCATAAAAAGTAT:1 - chr3L 27575 3' + INE-1 536 1 51.37 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATTCCTAGG:1 + chr3R 30635060 3' - roo 8706 2 47.26 ACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTAGGTACTCACATCCTGCCCTTTTCGATTTACATGCAGCATGCATTAAAAATAGAACCTTCGGAAAAGTTTCGTGAATAC:1 - chr3L 23027514 3' + INE-1 554 1 58.57 AGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACG:1 + chr3L 23678149 3' - Osvaldo 30 1 77.57 AGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCG:1 - chr3L 15276650 3' + hopper 1334 1 73.29 ACCATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAATGCAAACACCTACTGCTTAACAGGGATAATATCGTTTTGTTATATGTATTGTTAGTTAGACG:1 - chr3R 19223051 3' - FB 60 1 60.27 CTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACAACTAATCATTAGCTTTACATGATGTGTT:1 - chr2L 17250739 3' - opus 7057 4 74.34 GCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTTGCCGACATATATATATTATAACTATATAATAATAGTTATAACTAATTCGCAGACCTGATAGTTTTGCCGCCGACTATTTCCAGCTATAATTTATGATATTTATTCC:1 + chr3R 12929331 3' + invader4 3061 2 69.44 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCCTGTCGTTTAATATCCCAGTCGTAGCTATGAAATAACTAGCAAAATAACTCATTCGATGTTTTT:1 - chrX 1061518 3' - 412 56 2 55.48 GCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGATTGGCTATTAAAATGAATTAAATAAATGAGTTTTACATCACTGTTTAAAAAACTTTTATAAGAGTGTTCTAAGTTTTAGTTAAGTAATCCAG:1 + chr2R 5255438 3' + Stalker 7139 4 62.33 CAAAGATAACAATTTTAAACTGAAATGTATTGCCAAAGAAATAGTTGCAACAAAGTACTAACTGTGGATTATTATTTTTTTTTAATATTTTCCACCGTTGAGTTGAAAATCCTTAGTAAATATTGAAAAAATATAGCAAACGAC:1 - chrX 20919808 3' + looper1 1404 1 77.78 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAG:1 + chr3R 22100580 3' + 412 7479 2 73.39 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTCGTGTTAATATGAAATATATTTTAGTATGATATTATAGTTAAGAGCATTAAAACATTCAGCGTAG:1 + chrX 16902351 3' - I-element 57 1 54.79 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGTTGTTAAATTTATAAAGCAGTTGATATTTGTAATGGTAACAACTGTATTTTAGA:1 + chrX 13531699 3' - roo 8730 2 63.70 ATATATACATACATATATTCCAGGACCCCTTCATGTCCCAAAATCGTTAAATGAACTAAATAATCGCATTATTCTCCGTGCAGGGTGACAATCCCCAAATAAAAGTGATTGTTCCCTTTAGTCTCAAAACAAAAAATGGAAGAAAA:2 + chr3L 8657101 3' - 1731 4407 1 76.03 AGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATGTTTAACATTGTTAGCCATGAGGCTAGCCAATAAATTGGCCAAATATACGCCA:1 - chr3L 13376532 3' + pogo 1898 1 77.40 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACATATATACACACAGCCAGCCGAGCGGGCCGATATACATACATATGCGCAAATGAATACCACACAAATACA:1 + chr3R 17067936 3' - 297 6603 2 64.00 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGG:1 - chr3L 17707812 3' - Doc 66 1 57.53 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAA:1 + chr2L 76151 3' + roo 9033 1 56.30 GGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAAAATTCGTGGCA:1 + chr2L 18279989 3' + gypsy5 356 2 53.42 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTTTTGTTCTC:1 - chr2L 17029580 3' - blood 50 2 51.72 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCCGGTTTCGTCGTCTTTTTGCTG:1 + chr2L 14248128 3' - I-element 33 1 59.71 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTA:1 + chr3R 9352061 3' - Tirant 8153 2 73.40 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTCT:1 - chr3R 20175672 3' - hopper 36 1 59.03 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCACTTCGCCATTCTGATTTC:1 - chr3L 6775364 3' - blood 7070 2 65.35 ACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACACATGCCCAATATCACTGAAGTAGCAATAATAGTACAAAG:1 - chr2R 19351976 3' + Burdock 178 2 70.55 CGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCTGGTTAACTGAGTATTATTGGATTTCCTTAGTCCATTTCCATCCATTTCCGTC:1 - chr2R 941366 3' - Tirant 117 2 61.54 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGTGATATCATATGT:1 - chrX 4778161 3' - 412 7099 2 52.74 GCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGACATAATAAATTGTTGCATTCTTTTA:1 - chr3R 13582220 3' - BS 5068 1 66.44 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACAAAGCAGGGAACCGAAAAGGAAAGGACTGGACTGAACTGGGCTGGAGGTTTGTGCTGGAATTGGAATGGGAAGGAAAACGAGTGCAGCCCCCGTTCAGAGTTACG:1 + chrX 17806089 3' - roo 8679 2 76.71 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGGGGAGCTGCTCCACATGTGTCTGTGCGTGTGTGAGTGAGGCGGC:1 + chr3L 4001181 3' - hopper 74 1 71.23 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATGTGGCATGGAAATATTACACATACGCCCATTGCGCCCTCAGCCTAAAAGTATGCAATGGCGAATGTTGGGCGACAGAGCAGGATGCGCACAGGCATTTAAGTAGTGC:1 - chr2L 2004878 3' - jockey 19 1 75.17 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAG:1 + chr3L 17890810 3' + 412 7497 2 63.87 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTA:1 - 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chr3L 2724987 3' - Ivk 57 1 55.64 GATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTT:1 - chr2R 1921442 3' + mdg1 7371 2 75.34 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACAACGGGC:1 + chr2L 22016027 3' - Tirant 40 2 59.59 GCCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGACATATAC:1 + chr3L 23940553 3' + Cr1a 4397 1 69.66 AAGTGATTTTATACGGAGCTCGATAAAAACACGTCTGTTCACTCTGAAGGTTCAACGAAACTTCGAACGCATTGCATCAAACTCGTGGGCAACACATACTGAAACATGCAGGCACGGGGCATATATACACAGTATATAT:1 - chr3L 12968226 3' - Doc3-element 32 1 70.50 CCCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACCAAGATGGGGAAATAGTAAACAAAAACAGCATTAGGGAAAA:1 - chrX 20575274 3' + gypsy7 5004 4 81.54 TGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTC:1 + chr2R 5923022 3' - jockey 4743 1 67.12 GGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAAGTGACTTTAGTAACTGGTTTTAAATGATCCTTTATATACATTCTCGTTGCCCCAAATAAAACAGCTGACTATAATTTCTTCTTAAAATTCCGCATAATTCCGTATAA:1 - chr4 353380 3' + BS3 1743 1 76.43 AGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAGCTTTGTCGCTTATTAAAAGAAGCTTATCGCCGCAG:1 - chr3R 27510040 3' + Bari1 1676 1 61.64 AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATCATATATGTACGTACTCGTACGCAATGCTTGC:1 - chr3R 23010044 3' + I-element 5269 1 77.40 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGCACATAACTCAGTTTTGTAGAGCTACCAAAAAATGT:1 + chr2L 5601629 3' - mdg3 5335 2 72.92 GGAAAACTGAAAGATCAAGTTTACGGAATAAGTTTTTATCATTAGTTAGTGTTTAGACAGATATCGTAGAGGTTTGTATGGCGGTTCAATCGAAACTTTGATACTTGGCTTGG:1 - chr2L 9804514 3' - Q-element 364 2 61.95 AACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATTTGC:1 - 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chrX 17419350 3' - Juan 4055 1 61.64 GGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCACCAATTTAAGTTTCTTTGGAACATTTTGT:1 - chr2R 5917791 3' - I-element 5085 1 53.42 AATTAATCAGGAAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTATTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATACCAAACGAACCTCCGCCTGCACAACGCACAAAC:1 + chr2R 7126508 3' + 1360 442 1 77.40 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACGCTTTACTGTTGCCACCCATTTGGCCAC:1 + chrX 1690048 3' + 412 465 2 73.17 GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTA:1 + chr3R 13349120 3' - BS 5066 1 65.07 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACCCATTAAGTAACCCCAACTGATCGGCGCAAATGATTCAGCTATGCAGAAAATATGATTGATGATTTTTCCCTCCCACCAGCCCTTA:1 + chr2L 12553540 3' - 412 35 2 61.64 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATGTGTACATAAATTCATATTGTCTAGTTAGCAAAAAAAACGTAGCACGCTTTTAAGGGTCGTTTAATTCTTGTTTGCTTCTGT:1 - 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412 38 2 55.30 AAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACGATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAA:1 - chr2R 8641493 3' + diver 6058 2 51.37 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTTCCTAGAGTCGTACACCCATGGACTGTTTGAGATGCCACATGTCCTGAATGATCCCTTT:1 + chr3R 25304868 3' + roo 394 1 76.03 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAAC:1 + chrX 13395355 3' + roo 9018 2 56.85 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTATAATATATATACAACTGGTTTTGGCAATGAAAAAAACTACGTCTAGAAAAATTA:1 - chr2R 4628377 3' + Transpac 265 2 60.16 GAGGGATCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAAGTGCAAGTTCTTTAGGA:1 + chr3R 3905859 3' - GATE 8269 2 59.84 ATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTTGACGTTTTTTTTCGTGTGTTCTTTAGTGTTGATCCAACGCGAGGAAGAAGAAGAATTG:1 - chrX 8891592 3' - P-element 259 1 64.55 TTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCATTGCACAGAGACTTGT:1 + chr3R 13176443 3' - Burdock 6201 2 63.70 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACCTTACCAAATGGGATTTAAAACTTTAAAGGATCATGTAAAGAAAGTATATGGAAATGTCAAACTTAAAAGTTCGTAAAGA:1 - chr2L 12349735 3' - F-element 64 1 60.16 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATGCCTCCTGTTTGTTTTTGCCGTCTGCTTGATGCTATTCCGGCTGCTTTTCCGGGGCTTTACACGCCGCACTCAGTGCTACGGAAAAGCTACGCCACC:1 + chr2L 18317581 3' - mdg1 10 2 77.10 AACGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAGAAGTAAAAAATGTGTCAGGCCGAGGAACG:1 + chr3L 22978674 3' - 1360 19 1 71.92 GCAGCCGAAGGTTTTGCGGCAAAATCGGCCCTAGTAATATACGTCCTAGAACACAACGCAACCAGGAAAGAAAAGATTAAGCGATATACACACAAAGTTGCACAACGGTTTTAAAAGAAACAAACTGAAGGTATAA:1 + chrX 5326864 3' + Osvaldo 1342 1 55.88 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGTGTATTATGTATGCGGCTGG:1 + chr3R 27822324 3' - I-element 15 1 72.73 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGCCTTTAGTCATCTGATTTTTTTC:1 - chr2L 76030 3' - roo 8716 2 53.42 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATG:1 + chr2R 5955012 3' + copia 204 2 73.29 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATCACATTTTTAATATTAAAAGATCTTTGATCGTATTTAATAGACTTTTTCAAGTTATTTGAAAT:1 - chr3R 17546616 3' - blood 7072 2 58.22 TAGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCAT:1 + chr3L 23702252 3' - G4 66 1 58.22 AGGAATCAATCGCTCTGTTGAAATTCACATGATCAATTTTCTCTTAGAAAATAATTGCTAAAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAACGAATTCTGACTTACTAGCTATTTGGGAAAAGATTAATGCC:2 + chr3L 14951352 3' - transib2 2376 1 78.77 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGGGTAATTTTTTTTTTTAGTTGCTAATTTATTGTT:1 - chr2L 3466019 3' + P-element 2819 1 30.47 AGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCGATAAATAATGAGAGAGAGCGTGGCGAAATCCACCCTTGAACCATGTGGACTTTTTGGCTCGAGTTGATCAGATGTTAGTTTTCCCAAAAGCCGTACTGTATATA:1 + chrX 460558 3' - accord 7360 2 77.08 GGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATAGTGGCAGATCGGAAACGGAGAGGAAGTCAGTCTTAAAATTCAGCGATTAACTAAGCAGCAGCAGCAGCATCAGCAGCAAC:1 - chr2L 1382388 3' + invader2 84 2 63.08 CTACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCTTTCGTGTCCTGGCTGTCTAACATTGTCCGTTCATTGTCTTGCCATGGCCTGTTTT:1 - chr3L 3619186 3' + Stalker 6869 4 60.27 TGGCGTTACGCATCTTGTTATCCTAGTGTCTTTGGTTAGATCGACTCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATATATGTATATACTTATTATGGTCAAAAACATTCTACAAAATATACGATTCGATAGCAAAGTCCGCCGCGAAA:1 + chr2R 11783850 3' - 1360 13 1 76.76 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTTCCTAAGCGGATCCACCGAG:1 + chr2R 8157314 3' + Transpac 5214 2 74.66 ATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATGCATG:1 + chr4 829130 3' + INE-1 151 1 34.93 TTTCAAAAGTGTTGGCGTGGTAGTTTTGAGGCTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCG:1 - chr3L 22511717 3' - INE-1 250 1 84.91 GAGTACGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATTTTCGAAAGGCATAGACCCCCATTTTACTGGGAATGTCACCAGTTGTGGCA:1 - chr3R 26553274 3' + baggins 4973 1 66.15 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTAC:1 - chr3L 96530 3' + roo 8979 2 80.14 AATAACGTTAAGGCAATGCAGGACAATTGATTGAAAAACCATTTTAATTGATCACAAATAAAATGGATTTAAAGTCTAAGAACTTATCGAAAATCCCAACGTAGTTGGTCTGGCGTTAAATGAGATATTTAAGTCATTCGGATGCT:1 + chr2L 1627144 3' - 1360 299 1 58.22 TCAATAGTATTTTCAAATATTTAAATTTTAAGATTTTTTTTAAAGAGTAAAAAGATGTTCTTTTGAGAAAAGACTATTTTTTTCTGTAAATTATGATTTTACTTGTGATCTATGATACACTTAAGATTCCAAATTCCTACAACAAT:1 - chr2R 18831384 3' - Bari1 1499 1 71.92 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGCACTTAACTCGCCCCCATTCATAAATGGCCGCAAAATGTTCAAC:1 + chr3R 28272512 3' + Tirant 8487 2 54.67 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCCCATCGATTATCTGTTAAAGCTCTGCCAGCGACACTTGGGTCATTATTCAATAATTAAGATATTTGGCCCGGG:1 - chrX 6481254 3' + hobo 2929 1 65.74 AGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATCTAACCGT:1 - chr2L 17240225 3' + hopper2 1534 1 68.49 AACGTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTCCGAGGCATTTTTGGACTTGGTCCTGGTCGTGGATTGCTTCTCAGTCGGCTGGCC:1 + chr3R 20154129 3' - G2 2987 1 56.19 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAACATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGCTTGGGATCCAGCTAAAAAAAGCCGAGGCA:1 - chr3L 13827242 3' - hopper 44 1 52.74 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCTGTTTACTAAACAAATAAATAGAAAATCCACGAATCCAGCCCGAATAACAAAAAATGAAATAGAGTTGTTTGTTTATTTATAAAAGCGAGG:1 + chr3R 7035373 3' - roo 12 2 74.22 ATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATTATATATTAAAATTATTCGTTTATTATCTCTGCTTCCCTTGCCATGCACTTCGTTT:1 - chr3L 8855859 3' - rover 7010 2 65.75 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACATAGGAACTTTTTTTAAGATTAGCTATTATTATTATTAGTCTTTTTGTTTAATAAATTTTACATCT:1 - chr3R 6413690 3' - FB 55 1 54.79 ACAACCCTAAAAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTGTGGCAAAGGTAACTGCCTTTGTTAACATTCGG:1 - chr2L 12079606 3' + mdg3 332 1 49.32 GTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACCTTACCAAATGGGATTTAAAACTTTAAAGGATCATGTAAAGTAAGTATATGGAAATGTCAAACTTAAAAGTTCGTAAAGAC:1 - chr2L 12349734 3' - F-element 80 1 54.48 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATACTTGCCCTT:1 + chrX 12139026 3' - roo 8734 2 66.44 ATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGTACCAATGCCTGTTGAGGCGGCAA:1 + chr3L 12976346 3' - invader4 2770 2 48.48 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAATTCGGGTGGGCG:1 - chrX 2762547 3' + roo 386 2 67.41 AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGG:1 + chr2R 10865219 3' - blood 90 2 78.08 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCATCTATCCACTTTAAAACATCTTTATTAAATATTCAAAAAGAA:1 - chrX 8012250 3' + 297 6902 2 70.55 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAAAAGAC:1 + chr2L 9485698 3' - 412 7100 2 48.63 AAGTCTTTAAATACATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTATGGGCTGAATCACAAGCTTAAGCATTTTGGCTTGGGAAACGGAAGCTATTAGCACGACCCACAACAAAGTGTTTGACTAATTTTCCAAAAATGTTAAATAATCT:1 + chr3R 17114171 3' - roo 8678 2 76.03 ACATAAGCGACTATCTCTTCCACCTTTTCCAAAATATTCCTGGGGGCATGTGTACCCCATTAAAAAAAATCATCAAAATATGTCTCTTAGTTTAGGAGTTATTAATTTTTGTTAAATTGGCTTCTTTGTTTAACTTTTGCACTGCT:1 + chr3R 14751364 3' - hopper 306 1 79.45 TGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAATGGACTGCTTGTGTCAGTTTGACAACCACTGTGCGTGGCAATAAC:1 + chr2L 4998187 3' - FB 56 1 65.60 GCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGCAGATGTTGTGATCCTAGAAGCGTTCTTGGTCTTTGGTCTTTGTTCCTTGCCGG:1 + chr2R 4677411 3' - invader3 5 2 78.77 AATGAATGGCCGTTACGCATCTGGTTATTTTAGTGTCTTTGGTGCTGGGGTATTTTAATTTTTATAAGGTGTTGAAACGAGATGAAATCGTCTTTACACCAAACTAAAGTTTCTGGCGTAGTCAGAGATAGTAAAATTTTCTTTT:1 + chr2R 1114501 3' + 1360 3369 1 57.24 TATCATATATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGATCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTT:1 + chr3R 29288805 3' + BS 5029 1 56.16 GGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACGGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTGTATCATAACAGTTTAACGTATTTTTTTCGGTTCTTTATTGAATTCAATTTCAATTTTCGATTTGTGTGCCA:1 - chr3L 5167295 3' + hopper 1250 1 67.12 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATTTAAACGGGCACATGTGAATGGATGGTTGACTGAAGAGACCCATTCCTTGGTTCCACC:1 - chrX 12525901 3' + roo 397 1 63.27 AAATTTAAAAATAAAAAAAGAACCTTAAATTTCTGACGGTACAGAAAAAGATTAAATACTCGGTTGCAACTCGGTTAGAAGCCATGAAGCCAAAAAGAACTATTGAGAAAGGATATTTAAGGATAACTTCAGCTGCCACTGCAAAT:1 + chr2L 10899803 3' + TART-C 11097 1 71.92 TCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCTAG:1 + chr2R 5923028 3' - jockey 4726 1 60.00 GACTATAATAGGCTTTATCCTATTATCTGTAATCTTTACTCTTTGCCGCTCCTAACCTAAGAAATTCTATCTTTTTTCAGACATAAATACTAATATTTATATTTATTACATTTATTTAACTACATCCTGCACTCCAGCAGCCAGA:1 - chr3R 5714287 3' + Cr1a 4205 1 81.38 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTTCTTTGATTCGAAGCGCTTGAACTTATCGCCGGGGTGTAGCTCGAAAAAAATGAATGCGAATCTAATTGTTTTACAAGCACGCCA:1 - chr2R 7953615 3' + roo 9038 1 61.64 AAATCAAATAAAGCAAATTAAATAAGTAACATCCAATCTAAGTATTGAACTATAAAAATATATTAGTTATATGCGAAGATAACTAAATACTTCCAGTGCATCTATGGATTGGGACCCAAAGAATGGTTGATGCCG:1 + chr3L 18322046 3' + TAHRE 34 1 54.81 ACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGAAATTAAGTTTCCCTGGGCGAGGCGGAGATGTAAATTGCATGCATAGGTGATTAC:1 - chr3L 20255146 3' + Transpac 5208 2 64.08 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGT:1 + chr3L 9571724 3' + jockey 4914 1 71.23 CAACGAGTAACGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTACGCTTGTTTAGTTGCCCAAGAAAGTGCAGCACACTCTTTG:1 - chr2L 15987939 3' + roo 396 1 73.68 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGCGTGAACAGGTATTGATTAAATTATTGTACGTAAAATAAAAAAAAGTGTGAGCCGCAGATACATATGTTACTAATATTCACTATCATGCGATACTTTTAACGATGTATCTCACA:1 - chrX 5150238 3' - roo 8681 2 70.83 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTT:1 - chr3L 17890744 3' - 412 80 2 71.72 TGCATCAAGCCTCCGACAAAGTATGGCATGTATTTTAAAGTCATATCTGGAAGGACGAAGTAAGGTGCAGGCCGCGTATGTAATATTTCAATTAATACACTTTAATATATAACGTGGCAGCCAAATTTTAAAGAATCTTCAAATAG:1 + chr3L 19064204 3' + Helena 401 1 39.73 GAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCC:1 - chr2R 5917821 3' - I-element 5088 1 52.94 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCATTTTTGCACTTTTCCCAAGTCCTTGGAGCAATTTTATTACAAGCAACTTAAAACCCAA:1 - chr2L 4173932 3' - roo 8693 2 65.75 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTATTCA:1 + chr3L 14553200 3' - roo 62 2 61.81 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTATTGTGGCATTTCGTTGAATAGAATAGAAACAGA:1 + chrX 19281778 3' - opus 27 4 64.84 CTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAACACTTCCCGGATATTGTATTGTCCTGGCCCATCC:1 - chrX 4305804 3' + gypsy12 10151 2 65.05 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAATATTGTAGTTTCTGATAATACTGAGCATTTTTGTTTTCTCTCGGTAGGTCAAACAGAAGGACCTCAGCTATCCCACGGCAAACTAAGTCAGCA:1 - chr2R 5868240 3' + pogo 2077 1 66.44 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTT:1 + chr2L 17250793 3' + opus 7427 2 77.44 TTTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTATTGCAAGTTGTTATGACTGAAAAAAAAACGAACTATATATTTTAGAAGGGTATTTAAAAAGGGCACTCAAAGTTCTCTCTTCACACCCGGGTCCTTGCTGTTG:1 - chrX 17306233 3' - G2 3065 1 73.29 TTATAACTCATTGTTTACTTAATGGGAAATTGTTTAATAATTTTCGTATATATGTAGAATATACATATACACAAAACTGTGGAGGGAGGAGCATAAATAAATGGGCGTTAGGGACTAGCAGGTGTACGGGGTTGG:1 - chr3L 22242964 3' - 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chr3L 22400285 3' - 1360 38 1 63.27 CTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCAAGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCTCCAAGTCGTGTGAGTAAACTGCATTAGCTGT:1 + chr2L 343730 3' + G2 2692 1 74.10 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATCTAGCGCAAATCCGAGCAAATAATTATTAAACAAATACTTCTATTTACAAAAA:1 - chr3R 13122499 3' - blood 7077 2 61.64 AATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCTAAAAAGCATACTTTATTCATTTACGATCCTAAATA:2 - chr3R 23859846 3' - jockey 4845 1 76.03 CATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAAC:1 + chr2L 686073 3' + roo 9001 2 67.13 AAAAAGAAAAAAAAAATGGCAAATACCCTCTAAAGGTAGCTCCTTTCCAAAGTTTATGTACTTTACGAATGAATTCTTCTTGTGCTTCACTTACTTACTAAACCTTTAATTTGTTTAATGTTTTATGTACATTTTCCACTTG:1 + chrX 5717113 3' + Doc2-element 245 2 64.79 ACACTAGCTGAGTAACGAGTATCTGATAGTCGGGGAGCTCGACTATTGCATTCTCTCTTGTCTGAATTGGTTTCGCTTTCGCAAGCGGCAAAATTTATTGATACGTAACCTGCGTAGGCATATTATTTTAATTAGTCGACACT:1 + chr3L 10952862 3' + INE-1 540 1 46.85 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAATCTCCATTTC:1 - 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TART-A 13337 1 71.92 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACGTTTTGTAGACGGCAGCAAACAGCCAACAAAACAACAACTATATTTCACCG:1 + chr3R 10266211 3' - 1360 12 1 76.30 GTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATA:1 + chr2R 21402706 3' - mdg3 30 2 58.40 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTG:1 + chr3L 10144727 3' - blood 7087 2 80.74 TAAGTTAACAGTTTTTTTTTTTATTTTTTCCTAAATGAAATCACCTAAGATATTAAAA:1 - chrX 9505046 3' + accord2 343 1 53.45 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAGTCATTAAATTAAGTCACATCAAGTGCGTATACTT:1 + chr2R 23497109 3' - 412 7138 2 75.69 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATACGATCAGTGGTTGGGTGAACTGGAAACTAAC:1 + chr3L 17890856 3' + 412 469 2 67.14 GCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATACTTATATGGTCGGAAATAATTCTTTTGATAAATATGTCAGTTTATATTTTTCTTCATTGTTTAAATGGCCTAGCGGTATGTAGGGTCTGAGTTAATGTCATTGTTCCGTGCGTACTT:1 - chr2R 550912 3' - INE-1 86 1 68.49 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATTGCTTTTTCAGAAGTAA:1 + chr2L 6319010 3' - pogo 49 1 54.79 AAGTGGCTGGGTTGGACCCCCCAAATACGTCCCTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTTTTAATGGTTTTTAAACTTTTGCCCGGCTCTCG:1 - chr3L 13634188 3' - 297 6594 2 66.06 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAACTCAGCCA:1 + chrX 13395362 3' + roo 9025 2 52.74 AAAAAAACAAGTGAAAACAATAAACAAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTTAAAAGATTTCGTTTCTGGAAGGCACTTGCCCTTTTTCGCAGATCAGTTGCGTCTGGTATTTTCTAAGAAGCAGACGCTATTTTAATTAAGT:1 - chr3L 24940307 3' + Porto1 175 1 72.60 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATTTAAACGGGTACATGTGAATGGATGGTTGACTGAAGAG:1 - chrX 12525921 3' + roo 400 1 60.00 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAA:1 + chrX 5150372 3' + roo 9002 2 67.12 ATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAGTTAGCAAATGCCAATGGCTCATGTTCGCAGCGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAA:1 - 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chr2L 4173923 3' - roo 8684 2 71.92 ATTTATAGTTTGCCTACTTATCATGTCTAAACACATACAGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACACAATTATAATTGCGACAAATTGAACGCCGCCG:1 - chr2L 1962022 3' - rooA 24 2 77.93 GGTATCTGATAGTCGGGGAGCTTCCACTTCCTAGGTGGAAACTGTACAAATTAAATTTAACTCTTGTTCACATGCCTTACGGAAATTGTCTCAAAAGTGGACTGCACGC:1 - chrX 20464246 3' + INE-1 557 1 77.06 GAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTT:1 + chr2L 17250802 3' + opus 7434 2 71.11 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTTCCTACTCCAATATTCCGACACTTTTTAATAGCAAATCTATTCGATTTTATTTCCTTCAGCGCATACTTAAAACTCTTCTTTGATTGCGTAGCCTAGTGTAA:1 + chr3R 18873339 3' - copia 20 2 56.85 CAATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCATCTCGTCCCCGTACATCTCCACTTTTTCGCTGAGCTTCGCATATAGCATAAATCATAAACATTATAAGAAGAAGGGGGAATGAAAACCACAGCTCTTTTGC:1 + chr3R 9175246 3' + 1360 3386 2 60.45 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTCACAGTGTAGTTTCAACCTTGATTAAATTTCAAG:1 + chr2R 19555067 3' + pogo 2077 1 66.44 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCCATGTTCGTGGCTCTAACATCTTTCCATCGATCGCCGG:1 - chrX 17805963 3' + roo 349 2 69.92 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGTGTATTATGTATGCGGCTGG:1 + chr3R 27822324 3' - I-element 29 1 65.75 ATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTCGTTATCAGTCATTTACTATCATGTGTATAATACTAATTTAAAGGACATTGT:1 - chr2L 15945715 3' - X-element 90 1 64.38 CCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGACTCTTCGCTGATTTTAGTGCTTTAGTGCTGTTGGTGTGTGTG:1 - chr3L 7092992 3' + hopper2 1541 1 64.75 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGGCGTACTGAAAGAAGTTGTTAAGAAATCTATCAAATTGAAAGCAGTAAAGATCTGAACTATCCCACCTCACA:1 + chr3R 7539547 3' - roo 8697 2 59.23 GAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAAAATTTTGGGCTCTGGTGTTCTTTTATTTAATTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGTATTTTTGGGTTCTTTTTTCGTCGTTCTGGTTCTGTTTCTGCCGC:1 + chr3L 24514788 3' - F-element 369 1 69.86 AAAATTTTGCTTTAAGTAAACAATAAGTTACAAACAAATATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATATATTCTTATATATATTCTTAGTGCCGAACTACACCTGGTCTTCCAGTGCTGGGCATGAATATCGCATA:1 + chr3L 8397860 3' + Tc1-2 1563 1 57.24 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTAACTTTTCTGTCCCTTTGTAACACTTCCGCA:1 - chr3R 16181116 3' - roo 8708 2 53.42 GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAACGCAACTCG:2 + chr3R 15022126 3' - Tabor 6878 2 52.76 AATTTAGTTTATATCTAATTTGCTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTATGAGGAAAAGTATAACCAGGGTTACCGATTGGTGCCCTTTGGCGATCATCT:1 - chr2R 931317 3' - I-element 5240 1 72.60 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATTTGTTGTTGCGG:1 - chr3L 11336312 3' - blood 7046 2 58.22 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCAT:1 + chr2R 6842852 3' + roo 9003 2 63.70 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCA:1 + chr3L 16973451 3' - S-element 74 1 70.55 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTAATTAAGCTG:1 - chrX 14964590 3' + roo 9033 1 57.53 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGGACGAAAAGCGTTTGTTCCTAGAGTTGAATGGTCAGCAATGGCA:1 - chr2R 558099 3' - copia 52 2 62.50 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCA:1 - chr3L 9907378 3' - jockey 96 1 76.39 AACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATTGCCTCATTTTGAAGATAATTGCTTGTTATTAATACATTTTGCACCTTAATTTGATTTAACCTTAAGATTTTCCATTGTTAAGGAATTGAACAGAACATGGTCACAATTTTGTTATGA:1 - chr2L 12658389 3' + Quasimodo 7366 2 73.97 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTT:1 - chr2R 11057261 3' - pogo 67 1 66.44 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGTAATTCGTGTGG:2 - chr3R 13582178 3' - BS 5026 1 63.01 CCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGACATATACCT:1 + chr3L 23940555 3' + Cr1a 4398 1 70.55 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGTTTAAGTTTAGTTTGACAATTGATTGATTGGCAGTTAATCATT:1 + chrX 14964698 3' - roo 8740 2 73.29 ACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTCTATTAGATGGCTGTTTATTTTTGGAACTGTTCGAACACGACCACATCAACAGCTGGCCAGCGGCCAAAAGAAATATG:1 - chr3L 22989790 3' + 1360 29 1 71.56 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTCCATTGTTGATAGCCGATTGCAAAGACTTGTGCAACATGCAGCGAACATTTATCATCGATGA:1 - chr3R 28627546 3' + copia 242 1 75.34 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCCATTACAAGCAAACTGGAAACTTCAGTCCTTTGCCAGGATGTCATAAACATAAATAATCATTAAAACTAGACATAAATT:1 + chr2R 16403527 3' - copia 4909 2 58.22 TATAATATCATTAGGTATTTAATGCCAAACAATGACGAAACAATGATGAAGACGTAAGGTACGATGCAAACTAGTGTTGACCGGGACGAGATACGCTAAAACGGAAATTCCAGTTAAGTATCCG:1 - chr3R 7640086 3' - HB 1535 1 66.13 AAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAAATAAAGCATGAATCATCCAAATTGATTCCATCACTTTTACAAAAAAAAACAAAAGAATTTGACCATTTTTCCCTAGTACTGAATACAGAAATGCAAC:1 - chr2R 7665316 3' + Transpac 482 1 63.01 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTT:1 - chr3L 11336336 3' - blood 40 2 51.97 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCCTCAACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACGTACTTGACGCG:1 + chr2R 12543166 3' + roo 9013 2 60.96 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCAAGTCTAACATCCATAGAACTCATTACG:1 + chr3R 21001878 3' - 412 82 2 74.66 CCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATTTATATATCCGGAAACTATTCCTTTTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTAAGTCTACGAGTAACGGGTTAACGGTAACGGGTAAGTAACGG:1 - chr2R 2317350 3' - HMS-Beagle 17 2 76.39 CAACAAAAGAATTTTTTTTTAATTTTAGAATGTATTGCAATGTTTAAACATATCATTAATCAAATTTTGAGGCCGAAGAGGAAGTTTTCCTCATCGCAAGGAACAGGAGAGTGGGGGGGTCATCAAATACAGTTTCATGCTTAATT:1 - chr2L 9023437 3' + gypsy11 3944 1 58.22 GCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATTCCCTTCACCTTAAAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTAACACCATGCGAAACCATATTTTGAAGCGTCTGTATGGATTTTCGTTTCTAATTTAGGATTGT:1 + chr2R 4214426 3' + 1360 194 1 66.44 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACATAACGAAAGATGTCGGTGGCGTTGGCGTCGACCCGCACCGTTGACCGTTTCTTTTTGAACACATTGGCTG:1 + chrX 3433588 3' + S-element 1680 2 57.78 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACA:1 + chr2L 16458661 3' + roo 8990 2 75.00 CTTTAAAAATATATTAGGAAAAATAATTACTCATGTCAAATGTGCTTCGAGTCTCGAACTATCCTAATTTCTCCTCCCGATAAAGTTCTGCCAATTCCACTGTGCCAGTCTACAAAAAAAGACAGCAACTGTGGAGTTGACAGCAC:1 + chr3L 13922614 3' - hopper 167 1 67.12 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGGTTGACGATGGACGTGTT:1 - chr2R 5277128 3' - opus 7037 4 59.17 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGACAATTGCGCATAC:1 + chr2L 17240298 3' - hopper 70 1 72.86 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTGTCATTATTATTCATAACTTGGCAGACAGTCGCTATTATTTATGCTCCCATTTG:1 + chr3R 25387867 3' + roo 343 2 64.38 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTTTTTGCACAATGCATAAGA:1 + chr2R 5674768 3' + S-element 1678 2 63.01 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAGGATGC:1 + chr3L 17133879 3' + jockey 4941 1 62.33 TAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATCCACGCCAAAGTCAAGAAACACCTTGAGTCGAGCCGGCACCGCTATGACAAGCAAGCCCGC:1 + chr2L 23338517 3' + Idefix 7132 2 62.33 TTTTTTTTTTATTATTTGTAGCCCTTTGAAGTTGAAATGTATAATTTCTTCATCAAATAGTTCTTTATTTTCTAAAGAGGAAATATAAGTTGAAAAGAAGTACATGGATTTTTACTTTGT:1 + chr3L 15885910 3' - G2 3073 1 83.33 TTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTT:1 + chr3L 24208234 3' - Quasimodo 35 2 59.59 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTTTTAATGTTTTTTAAACTTTTGCCCTGCTCTC:1 - chr3L 13634189 3' - 297 6630 2 55.56 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACAACTAATCATTAGCTTTACATGATGTGTTTATACGAAGCAAATATCACGCAATCATATCACGATAAATTTATCACGATTTATCGCATACT:1 - chr2L 17250678 3' - opus 139 4 64.38 CGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAA:1 + chr3L 13827379 3' + hopper2 1566 2 56.85 GTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGT:1 - chr3L 23773900 3' + Transib5 2866 1 73.87 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATTTAAACGGGTACATGTGAATGGATGGTTGACTGAAGAGACCCATTCCTTG:1 - 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chr3L 12036158 3' + transib3 65 1 72.60 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGGACGAAAAGCGTTTGTTCCTAGAGTTGAATGGTCAGCAATGGCATACGCCTGGTGGTTCGTAATGGAGTAATGAAGAGTATCACTATTGT:1 - chr2R 558053 3' - copia 13 2 73.23 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGAATTATTTATAATGGATAGTGTGGGCATGCATATGTATATCATATCTAATTGACATTGAAGGACTCCCGAACCG:1 + chr2R 23287583 3' - roo 8677 2 73.97 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACC:1 + chr2R 5237901 3' - Doc 76 1 46.21 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGTTTGGGATCCAGCTAAAAA:1 - chr3L 13827253 3' - hopper 37 1 54.69 TTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCTGCTGAACCAGGAACAAGCGGATTTCCCTGGCAACCATGTG:1 - chr2L 13792548 3' - F-element 13 1 72.32 AGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCCAGATAAGTTTTCGACAGTTGCTGACGAGTATTTTTCAATTTTGTCCATTCGATTCGTTGCTTGAAGA:1 - 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chr3R 13607653 3' + I-element 5288 1 71.32 TGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCATCAAAATGG:1 - chr3R 15924594 3' + Quasimodo 7293 2 72.60 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCACGAGATTTTTTCGTTCGTTTTTTGCGTTTTCGCCCACAGAAACAGAACATC:1 - chr3R 23236396 3' - hobo 60 1 59.71 TGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCCAAGTGTTTACCTTTTACTTAAGAAA:1 + chr2L 16948743 3' - jockey 4733 1 58.22 GAATCGGTTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGTGAAGCTTTCTTCTAGCTGTTACGTACTTTTCAACGATCTACTTACCCCTACTTAGCGAATAACGGCTAAAAGGAGCATAACAATTAATATGTAAAG:1 - chr3L 23020927 3' - INE-1 92 1 67.81 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTGTTTACAATCTTATC:1 + chr3L 27415345 3' - transib2 31 1 64.38 CGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTACACTCAAGAAGTAAAGTCGAACGGGCCTCGTCCAATCGACTGGCTTCTTCTTTTGGCCCTTCCTAATACTTATTCACTCAGCTGTCACAGCATATGG:1 + chr3L 22900222 3' + 412 7533 2 71.85 AATACAAAAAAAAAAGGGAAACGAGGTTGGCAAGCTGCTAAAAGCCGAAAC:1 + chr2R 15014457 3' + Bica 337 1 90.20 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACCCATTAAGTAACCCCAACTGATCGGCGCAAATGATTCAGCTATG:1 + chr2L 12553498 3' - 412 55 2 62.90 AAATAACATAACTCTGGACCTTCTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGTACGCGTTGCCGATTGCATTTATTATTACACTGCGGGCGCCAAAAGATTTGTGCAGTACAATGACAAACAGTGCAGATA:1 - chr2R 4362501 3' + gypsy 7431 2 55.48 GCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACACCTATATCCTTTCCCTCTATCTGTCTGTAAGCTTGTGCAATAAAAATGAATTATATGCAATGAAGCAGCAGCCGGCACTGACAAAAATAGTCCACTTA:1 - chr2L 16090446 3' - 3S18 6088 2 68.06 AACGCACTGAGAGCGTCTCTTTCAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTTTTTACCTACCAGTACAGCAATCACGACATCTACTGCTTTCCTCTAAGTACCATTAATGCAGTTTTTCTGCAACTAGTAGAAAATATAACTA:1 - chrX 1116598 3' + Doc3-element 426 1 62.33 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGTCTAATACCAGGC:1 - chr3R 17605586 3' + Tabor 7309 2 74.66 GAGCGGAAAGAGAGCAATGTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATGGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGGACCTTATTAGAAATGAATTCATAAT:1 + chr2R 12702170 3' + 1360 3311 1 76.74 CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATATATTATATATTCTCTTTATATATTATATTGCCCTAAAATATCTAGGTTTTCCAAA:1 + chr3L 22408737 3' - Ivk 65 1 63.01 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTCAATCAAAACATTAAGGATAGTTTTTATTTAGCTGCTGTTCTGCGTGTTGTAATTTTACTATCCACATAATTAACAGCAGTGTTTTGGCAACTTGGCCATACACCCAAATAAATA:1 + chr2L 16399468 3' - roo 5 2 76.03 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTTGTTAGTTGGCCACTTTATTTTTGAACCATTTTTTTTTT:1 + chr3L 1437985 3' - roo 8745 2 74.66 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTACTCTAATTCAATTAGACCTTCCCCCAGCTGCCCAGCCAATGACAACAAGCGTGAATAAAAGGGAATTTAATTGTACATATCGGGGGGCATATTTGATTCTTTTAGCTGCCGATGCTCGG:1 + chr2R 11133700 3' - roo 8666 2 72.60 AAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTATTTTTTAAGTCGAACAAATGATCCGTATTTACCTCAGACTCCACAACTATTTGCTCAGAGGGTTCACTGCTTACTTCATCTTCGGGCAGAGCAAC:1 - chr2L 5169129 3' - McClintock 450 2 56.16 TGGGCACTTGCTGCAAAAGTGCACGAAATGAGGCTGGCAGAAATCGATCCGAGTAATGAAATGGGCTGCTCAGTCACCCGACTTGAATCCAATCGGACGTGAATAAAATTGTCCAAGATGAGTGAGGAAGCAAAAAGAGGAGGGGG:1 + chrX 17527184 3' + Tc1 174 1 73.97 AATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAACGACTGGAAGGGCGTT:1 + chr2R 5868374 3' - pogo 68 1 67.12 GAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTGTATCGATTTGTATTTAAACATTTCAAACATATGAAATGTTAAAT:1 + chr3L 23986608 3' + opus 7434 2 69.23 TAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTT:1 + chr2R 5237905 3' - Doc 73 1 43.84 CATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATCATTTTCCAGCCATTTCGTCATTTCACAAAAGT:1 - chrX 6345002 3' - Doc 226 1 74.36 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTATATTAATATATTTTTCGTGCTATAAGTAGAACAT:1 - chr3L 761983 3' + opus 468 2 48.63 GCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACGGAGGCATTGCTACCCTCAGAATGTGATTACACTGACCATTTATGCTAAAGCAAC:1 + chr2R 4362643 3' - gypsy 38 2 58.22 GCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCAGAGATGATGATCAATGGACTGGGCTCCAGCGTGTGCCAGATCGACGGAAGGGGG:1 - chr2L 19513951 3' - flea 4859 1 61.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGTCATGGAAATAAAGTGCAGGGATCGAAATGAGCCAGTCCTC:1 - chr2R 23287422 3' + roo 387 2 63.87 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTAT:1 - chr2L 17136167 3' - hobo 79 1 73.38 CGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTGGAATCT:1 + chr2R 21402725 3' - mdg3 5284 2 63.01 CACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATTATTACTTTGCCTTCCATCCTAAGGTTTCCTGGTCTTCAGCTTCAGTTTGGTCCTGTTGCACGTGCTGGTAGCAAAAAAGATTGTTAAAAACCACTTGATCGAAAACATTTT:1 + chr2R 7020703 3' - Bari1 11 1 78.77 AGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTAGATATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGATATTCACTTTTTACCCAAGCACCAAATTGTGTCATCAGGGATTCTTTTTTTCACCTGCCTACTTT:1 - chr2L 14069305 3' - pogo 244 1 59.59 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGTTCGCCGTGAGAGATGCGATTTTTTTTCAGTGAACTGATTTATTTTCGAAAACATCCACACAAG:1 + chrX 958056 3' + roo 354 2 58.62 ACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCA:1 + chrY 3648870 3' + Transpac 5149 2 76.71 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGACTCCCACATGGACAATTGTGGCACAAGATGCCCAACCAATCGAATACTTATTCGTACATATATA:1 - chrX 1689973 3' - 412 7107 2 54.17 TGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACACCTGTCGCCATTTG:1 + chr2R 13644541 3' - Burdock 24 2 66.67 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGCCTTAGCTATTTTAACCTTGGAAAGATGTCATATTTTGGTCGCTTGTAAACATCTTGGAGTATATT:2 + chrX 18806255 3' + roo 9017 2 54.79 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGC:1 - chr2L 9485598 3' + 412 7495 2 57.25 TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGAAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGGGTAACACGCGAATTTAAAAATATTTTTAAATACGA:1 + chr2R 4995028 3' - F-element 89 1 96.92 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAAAAAATACAATAGTTGTGCCGAATAATGAGCATTCTATTTTAAACAGT:2 + chrX 3263409 3' + roo 335 2 67.12 CGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCTCCATCTGTTGGTAGTCGTTGTGTTAAAGATATCTTTATCTTTAAAGATATGTGATGAGAGCAATAGTAGTTAGTGATATTTCTCCGAATTTATTCACTTACTCACT:1 + chrX 20996721 3' + INE-1 108 1 71.92 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCCGGTTTCGT:1 + chr2L 14248115 3' - I-element 52 1 51.03 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTC:1 + chr3L 24208238 3' - Quasimodo 31 2 62.33 AAAAAAGAAAATGAAAATAAAAATAAAAATAAAAGCAAAGTTGGCGCACAGATGTGTTGCAATCGTGTCTTTAACCAATTAACCTGTTCCAACCCCAAGTCGCATCCCGAATGATGTGCTTATTGTATATAATTTATTTGCAATAA:1 + chr3R 18613759 3' + Doc2-element 251 1 51.37 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACGCAAAAACGTGCTGAGCAATAATCTAAAACGCAATAGCTAAAGAGAGAGAGGTGCTGTATGTGTGTGTGAAAAGTAACGGTAAATGTGTGTGAT:1 - chrX 4701093 3' - P-element 9 2 74.62 GTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTTAAACAATAGACTTGGGCACTCGCATTCACCCAA:1 - chr3L 22054933 3' + mdg1 5 2 75.71 AAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGAAGG:1 - chr2L 12340738 3' + diver 6048 2 60.00 AAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCAT:1 - chr2R 8641510 3' + diver 153 2 64.38 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCACGCCGACAAACGCTTCGTGCAACTTCGTGCAGCTTCGTGCCACTCGGTTCGCAGTGGTTCGCTACGAACCGC:1 - chrX 14826086 3' + P-element 2874 1 68.14 CTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGAC:1 - chr3L 25232765 3' + accord2 7594 2 53.21 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTATTTCAAGAAGAAAACTGTGGGAAACTAACTGACTCAAATGAAAAT:1 - chr2L 12553426 3' + 412 419 2 67.81 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAAT:1 + chr2L 16089699 3' - 3S18 5787 2 64.23 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTTCATGCTTTCGATTTAAGCTACTT:1 - chr3R 7035215 3' + roo 9037 1 60.27 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTAT:1 - chr3L 27350465 3' + pogo 2047 1 57.53 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACTGTTTCTTTTTTCTCCATTTTAACTTTTGTTGAATTTTTTTTT:1 - chr4 1219170 3' + 1360 3340 1 65.83 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTATATCGCGATTAAGATAATCAACTGCTCTGCTCTGATTGCGGAAGCAAACGTGGTAAAGATTTCGAAAAG:1 - chr3R 27478479 3' - hobo 51 1 51.37 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACATAACGAAAGATGTCGGTGGCGTTGGCGTCGACCCGCACCGTTGACCGTTTCTTTTTGTACACATTGGCTGG:1 + chrX 3433589 3' + S-element 1713 2 74.76 GTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCTTGAAAACTATGCAAT:1 + chr3L 9571722 3' + jockey 4912 1 72.60 TTTTGTATTTTCCTTTTTTTTTGCCTTTTTGACCATTGACTCTGCCCATAAACTCAGCAAGTCGCAAAACTTTGGTGCCTCCTTTTCCAGGGCGTTTAGTTACCAGCACT:1 + chr3R 28138354 3' - Doc2-element 253 1 72.73 ATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGACAGGGCGCGAATTTTCTCAGAAGACTTGTTGTTCGATGTTTAATAATTTATGTATTTCCGATTTATGTCCGCGCATTTTTCGTTACACCACCCACTTCCTGTTT:1 + chr3L 13198915 3' + 1360 3003 1 58.22 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAGCAAACAATATCCATTGAATGCTCTCCATCCGAATCACGGAAAACTATACACAATTTCCCG:1 + chr2R 11411653 3' - 1360 36 1 59.66 AAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATCAAAATGAACTAATCTGTCTTAAGGACAAAATAATTGATAGCTGGGCCGGAGTAAATATAAAAAAGAAATTGCTGGAAAAAGAATGATAGATGCCTGT:1 - chr3R 2914274 3' + Circe 7068 1 62.31 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACA:1 + chr3L 7995481 3' - P-element 42 1 36.36 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGTAAAGAGCTCCAGTGCTTCCACATACCTCTATCGATTCGATTTTGACTCTCCC:1 - chr3R 7539394 3' + roo 9052 2 71.72 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTA:1 + chr2L 246113 3' + roo 9031 1 59.31 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGCAGAGATACATAACAGTATGATTTGCCATTAGTCAGTAACCAAAATCAAGCTACGAGCTGAGAAAGCAAATTATTTGCTGACAACAGTGAATAC:1 - chr2R 23412484 3' + mdg1 395 2 64.38 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACC:1 - 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chr3R 28172420 3' - hopper 41 1 58.90 TAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGG:1 + chr3R 21706078 3' + 297 330 2 66.44 CACGTCGATATCTCAGGAACTATTAATGCTATTCGTCGAGATTCAGGAATTATAAATGACACTCCCACAAGTATTGCCAACATTTTTTTCTTACGTTAATAAATAATTAAGTTGTTTCGAATTTAAGATTAAATTTAAATCAGCAG:1 - chr3L 23118576 3' + INE-1 142 1 54.11 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATACCTATCAGTAAATAGTTCTGAGGTGAGTGTGCAGGATGACACCTGCTCATA:1 + chr2L 16884939 3' + pogo 2073 1 63.70 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTGCATATCATTTCGACCAAAGATGTCTTATTAATACGAAATTCAGTAATCGCAAGATAGAAACTTAC:1 + chr2R 8158834 3' + Juan 4164 1 51.37 AGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCGTGGTAGCCAGCTAG:1 + chr3R 2533964 3' + gypsy8 164 2 57.27 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGTTTGGGATCCAGCTAAAAAAAGCCGAGGCAGACAAGGCAAACGAAT:1 - chr3L 13827226 3' + hopper 1414 2 81.51 GTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAACGAAATGGATTAGACTCTTGCCTCGCCGACATATAAATGGTAAATCATCAACAAGTTATGGGCCCAGAAAC:1 + chr2L 22640199 3' + invader4 267 2 65.00 AGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACAAACAAAATGGCGACGGACGAACGAGATGATAATATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAA:1 + chrX 22383293 3' - G6 17 1 66.44 TTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTCGTGATATTTTCGTTTTT:1 + chr3R 4528408 3' - F-element 74 1 72.31 ATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATGCCTCCTGTTTGTTTTTGCCGTCTGCTTGATGCTATTCCGGCTGCTTTTCCGGGGCTTT:1 + chr2L 18317543 3' - mdg1 7101 2 60.96 TAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGGACGAAAAGCGTTTGTTCCTAGAGTTGAATGGTCAGCAATGGCATACGCCTGGTGGTTCG:1 - chr2R 558083 3' - copia 60 2 57.64 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGTGGCCATTCTAGGGACTGAAATCTTAGCTAATTTATTTACCATACTCCAAAGTCGCCATTCCAAAG:1 - 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412 7111 2 60.96 AATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATAGGGCTCTTTAAAGTATTAGTTTTATTGCATATTATTATATTTTCTACAAACTTGCAAAAAGGTTGTTCAGAC:1 - chr2R 15829485 3' - invader4 42 2 56.55 AATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTACTAGTCTCCTGTGTGT:2 - chr2R 22723000 3' - 3S18 5804 2 57.53 GTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACG:1 + chr2L 17240270 3' + hopper2 1535 1 66.90 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGGCCTACAGCCTTGTTGTCCATAAAAACGCACCCATATGCACCTCTTCCGCTCCCGGGAGCTAGA:1 - chr2L 10089691 3' - opus 21 2 69.18 ATCAAAAAAAAACAAAAAAATAACCAAATGGAAAAATAGTGGCTT:1 + chrX 5377965 3' + R2-element 3583 1 75.56 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTGTCG:1 - chr2R 11609212 3' + roo 9016 2 58.57 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAGTAGGCCGCATCATTAAATATGTATGTTAAGCTGATTAA:1 - chr3L 22978506 3' + 1360 3362 1 64.75 ATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGG:1 + chr2L 22015990 3' - Tirant 8184 2 71.92 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGTACTGTGTGATATTGAAATATGTGATTATGATAAGAATCATGCTTGAAATATATGTGAATCATCAAGAGTGATATTAAAGATACCACCTGAAACTAC:1 + chrX 6707897 3' + hopper 1397 1 73.10 GCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACTAACGCAGAAAATCAGAGTATCA:1 + chr3R 435969 3' + 1360 3000 1 53.19 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTTCAGCATGAGAACTTCTTAGGTTGCATGTAAACAGTATTATATCGCAAGAATTAAAACATTTTGCAGCATACTTTTGGACAGCTTTCATTGCATACTTCTAGACACCTTTAATCTC:1 + chr2L 4179555 3' - jockey 13 1 54.11 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAGTCAAAATATG:1 - chr3L 6775350 3' - blood 64 2 60.27 TTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAGCAACAAACATTTTAATTCGTTTTCGCATCGTCG:1 - chr3L 14550953 3' - P-element 13 1 58.42 AGATATTTGGGAGATACATTTATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAGCTACTCAGTCGTTTTTTTGTAAGCTTTCCTCCCTTTTTAAATACATCAAGGAATGCCGCATATAAGATAAG:1 + chr3L 24722589 3' - accord2 7539 2 69.18 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCTTTCAAATGGTGAGATTAAAAAGAATGATTTTTCAAACGTGCTTCAAATCA:1 + chr3L 16496715 3' - jockey 4779 1 65.07 AAAATCAAATAAAGCAAATTAAATAAGTAACATCCAATCTAAGTATTGAACTATAAAAATATATTAGTTATATGCGAAGATAACTAAATACTTCCAGTGCATCTATGGATTGGGACCCAAAGAATGGTTGATGCCGATGC:1 + chr3L 18322050 3' + TAHRE 33 1 55.71 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGACGCACATAGCACTCACACACATTCTAAAA:1 + chr2R 21076073 3' - P-element 90 1 23.97 CAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATATCTTCTTATGAAGTTTATGTTGGAGGGCGTGACTTTGCCCTCTTTTTGGGGATGAGCGAGTGTTCGCATAAGGAAAGTCTATAAAAATC:1 - chrX 4226705 3' - gtwin 7350 2 68.35 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTACGACTTTTAGGGGCAGTCCGCCCCGCCCATCTCCAACCATTCCCCCCAACCCTCGCAACCAGAAAGTGCGC:1 + chr2R 11057372 3' + pogo 2059 1 49.66 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGCGG:1 + chr3L 7995492 3' - P-element 78 1 30.82 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCCAAAGGACGCAGGACACAGGACGATGGCGATGGCGATGACGATGACGACTATGAGGACGACAGCTGATGAAAATCGCGAAAGCGGGCGCCTCACCTC:1 + chrX 7786708 3' - hobo 13 1 73.13 AGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCA:1 + chr2L 18279950 3' + gypsy5 7327 2 61.33 AACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGAACAACCTGTCGTTTACGTTTGGATCGACCACATCCAAATCCGCAAAAGGCTGTGGCTGCCGCCGAGGCGGGCCCATAATGCTACAGTAAAA:1 - chr2R 20145856 3' + Bica 119 1 73.02 GATGAATGGTGACATTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTTAGTTTTTTAACTGGTGAGAAATGTAAATGTAATTCACTTCAACTGAATGGGAATTTGAGTAG:1 - chr3L 21882814 3' - I-element 291 1 64.38 GGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCA:1 - chr2R 5917848 3' - I-element 5142 1 80.14 TCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGTCCAAATGTCTGCTGTGCCAATGGAGTTTTATTTATGGTGTCATTAAAAGGTCCGTTCATGTAGTTTATGCGT:1 + chr3L 27720139 3' - R1A1-element 74 1 50.68 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATTACAATATAAGTTTGGGTAATTACCCAAGCAGCCGAAACACAAGCTCAATGATTCCAATTATTACATTCGGTTCAC:1 - chr2L 10184406 3' - Doc 42 1 57.55 CACTGTTTTAGTATTATTTAGCATTTAATATGGCTACCATTGTTTTTTATTACTTCAAA:1 - chr3L 27358490 3' - Tc3 1440 1 33.90 CGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGAGTTACCATTCGGGCCGAATGATGGGAGGTGAATATAACAGCAGTAAAGATGTGAGCCATTAAAACCATAAGCGCATGTATCCCATTAAAAAGTGAACAAATTTACATATAATA:1 - chrX 3177503 3' - F-element 380 1 42.47 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATGGGTTTATTACAAAGGTCCTCCTAATGCAATTTGTCATTTTCGCATTTTGTTTCTCTGGCTCTCTGGCTTTTGTCTCAAATGCAATTTTTGGCATTCCGTTCACATAAATTAGGC:1 - chr3L 10144612 3' + blood 356 2 70.55 ACGCCTACACTTTTGAAAAATGTGTTGACAATTTTTCACATTTCTATTAGTCTTGTTGTAGAATTTCTTCATCTTAATCAAACTACAAGGATACAATGAAAATAGTATAGGTGCTATTGGAAGCCACTTGGTTAGGGAACGAGGAA:1 + chr3R 23560251 3' + INE-1 254 1 60.96 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTCGTGTTAATATGAAATATATTTTAGTATGATATTATAGTTAAGAGCATTAAAACATTCAGCGTAGAATGCTGTAGTGCATTTGT:1 + chrX 16902370 3' - I-element 38 1 57.53 GCGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGCACATAACTCAGTTTTGTAGAGCTACCTAAAAATGTTCTATTTTTTAAGATTTTTAAGGATACTTACGAAATTATTTCAGTGCACATCAATTGCTAATATTAGTATTTAA:1 + chr2L 5601703 3' - mdg3 5263 1 73.97 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATCAGAGAGACTCGGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATA:1 - chr3L 19045000 3' - 412 7080 2 56.85 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGAAATACCCAAAACTCCATCCAGAATCGAA:1 + chrX 8012321 3' - 297 6623 2 75.96 CAGAACATAAAACTCTATAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTAGAATGAGCAAACGAATAAGCGAATGAATATGATTGCCAGGCAGATTTACAATGACAGACCGACTATAAAACGGGGCGTATACGAATTTATTACAATGGG:1 - chr2L 18232832 3' - Cr1a 4184 1 67.81 GACTCCCATCACATCAGCCTGGACAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCTGACACCAATGCCAGTGAGAGGAGGATGAAACTTATGCACCTGTGGAAATGTATTTTT:1 + chr2L 23084411 3' + accord 476 2 58.90 AGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTATAAA:1 - chrX 15408732 3' - INE-1 562 1 86.30 GACTATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGCCCGACCATAATTCACCGTGACAAGCAAAAAACCATTAGTAAAGGAAATAAAAAT:1 + chr2L 14444158 3' - accord 7031 2 69.00 GTGTGTGTTTGTAAGTACTCGCGATGTGCGTGGCAGGTAGCACCCGCACATAAAATTTTTGGGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCAGCTTTGCAGTTCTCTGGTTTAAGCTTTTGTTTGTCCACTCAAACGATTGTTCAATTA:1 + chr3R 17867829 3' - hobo 85 1 71.92 CCTAATATGGGCGGTATGGGTGGGTGTGGTGCGATTTACTTGAAATTTTACGTACGTGTTTTAAATGTCAGATGCACCAATTCAGCTTTATTATTGGACTTTATGCCAGTGTGCAGTAAAGTAGCAGCGTTGACATTTGCATATGT:1 - chrX 22906778 3' + transib3 2731 1 74.66 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCT:1 + chr3L 19350011 3' - jockey 64 1 50.00 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTATATTAATATACATATACATACAGATGCGGTTTGG:1 - chr2R 641826 3' + opus 7488 2 73.64 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCACGCTCGGCGACACTCG:1 - chr3R 17305424 3' + roo 399 1 72.17 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGAAGCGTCTTAGACCATATATAGTATATACATACATGTATATTCTT:2 + chr3L 11264316 3' - hobo 75 1 71.23 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCCATTCATGCGGTAGAACATTCAAATAACCCGCCATATCGGTCCGAACACCCCATGCCATCACACCCAC:1 - chrX 14450320 3' - jockey 4810 1 51.39 CGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACGTAAAATAAAACAAAGGAAATCCTGCGCAAATTACTGGCATATGGAAATATAACTTCAAAACGAGTGTACCTCAA:1 - chr3R 17899620 3' + hobo 2543 1 51.37 AAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAAGCTTTACATTTAATAAGGCAAAGTCGGTAAAAAATGTGGGAGTATATTATAGAACCATTAT:1 - chr3R 23420872 3' + Juan 4092 1 60.96 TTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGGTTTTATGTTTTATGCGGTTTGTGGCAACATGGGTATGCCTAATCTCAATCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAACTGGCAGCATATGTACTCAGGATTTTCAATTGGATTTTTTGCGGT:1 + chrX 22904323 3' - INE-1 252 1 51.37 CTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTAAATTATTCAAATGGATAAGTAATCTCTTGGTAGTCTTTCAGAG:1 + chr3L 12947962 3' - roo 157 2 69.06 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTGCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTT:1 - chr3L 18658918 3' + roo 341 2 75.20 TAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTTTGGGCGAAAACTTTGCCTTTTTCTAGCTTTTTGACAATGCCAGGGCAATGGCAATA:1 + chr3L 2725073 3' + Ivk 5328 1 57.14 AAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTGGCACCGCTTGACATGACTAATTGAGAAATGGAGATCTGGGAAAAATGATTCTAAACACTAGGAAAACGC:1 - chr3R 30297643 3' + Quasimodo 159 2 52.05 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGG:1 - chr3L 25406615 3' - 1360 22 1 74.66 AAATGGAAAAATAATGCAGATCTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAG:1 - chr3R 23639136 3' - pogo 48 1 52.14 AGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAA:1 + chr3R 11113249 3' - mdg1 84 2 79.45 CATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTAATTTTTTCTATTTCGAATTCAGGGGCTGTTTGCTTTTTTCAATTTCAGTTGGTTTTCAGTTGATT:1 + chrX 3189217 3' + hopper 142 2 84.27 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCCATCCCGCTGAGCAATAATTTGTGCTTATGCTGATG:1 - chr2R 23497058 3' + 412 7479 2 75.00 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACGCAAAAACGTGCTGAGCAATAATCTAAAACGCAATAGCTAAAGAGAGAGAGGTG:1 - chrX 4701131 3' + P-element 2835 1 45.11 AAGGAGTTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAATGGGTGACTTATCTAGAGTTCGTGTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACTATCTTATTCTTATCTTTGGAAGTTCGAGGTTGGGTTGTCGTATCTAACGACG:1 + chr3L 24238919 3' - Idefix 7018 2 74.66 GCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGA:1 - chr2L 17029623 3' - blood 94 2 81.51 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTACTTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTTC:1 - chr3R 22100497 3' - 412 7082 2 61.60 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAAT:1 + chr2R 21402705 3' - mdg3 5304 2 50.00 ATTCGCTCAGTTTCTTTGTTTCCCCCATGTTTAACAAATTTATGAATGAAATAAAAGTAGGTAATAACACGTTATCAAGAACGGCGGAATTGTTTGTTGTTGCGGCTAATTCCTCCAGAAATGAAA:1 + chr2L 23506336 3' - Tc1-2 362 1 60.32 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCTATGTTTTTCCATCTCCATATCGATTCGCTATTATTTTGCTCGCCACTGTGTATCTTTGAGGTGCTTCGGCATCCGTTGCTGT:1 + chr3R 6413814 3' - FB 40 1 58.90 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGG:1 - chrX 1287809 3' - jockey 4814 1 55.56 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGTACTGTGTGATATTGAAATATGTGATTATGATAAGAATCATGCTTGAAATATATGTGAATCATCAAGAGTGATATTAAAGATAC:1 + chrX 6707884 3' + hopper 1385 1 64.58 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATGAGTTATATATCGTAGTATTTAACAATTTCAACAACTAAGCATTTAAAGAGTAATTTTTGAATAAACTTCAAACGAATTTGCGTTCAGTGCACTCACATTCCCATAGG:1 + chr2L 2698496 3' - I-element 11 1 74.66 GTTTGCCTACCAATTAGTTTTTTAAATGAATATCAACAACGTTCTGTATATGAATAAACTGATCTAGGTAAAAATGAAAACGAAGAAAAATTAAATCAGAATTATTGGTATCTTTGTGTTATAAGAATGAATATGGCAGCATTCTG:1 + chrX 15945919 3' + FB 79 1 72.60 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTTGATTGCCCCACTAAGAGATGTTAT:1 - chr2R 5214915 3' - F-element 25 1 70.50 ATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAA:1 - chr3R 3617314 3' + micropia 170 2 72.41 AGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAAAGTAACCTTAAAAAGTATGGATTTTTGTTTGTTAGATCCCTATGTCAATTGTGCATCAGCATTCCATCTTGCCGGACTTGGTTTGGGATCAGCTGA:1 - chr4 51894 3' - 1360 3279 1 65.75 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCATTGGCCGCCGCTGCCATTT:1 + chr2R 6842870 3' + roo 392 2 67.86 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTG:1 - chr2R 11609224 3' + roo 355 2 63.20 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCG:1 + chr2L 14248083 3' - I-element 84 1 73.10 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACATATAGACATGTTAG:1 + chr3L 14551077 3' + P-element 2856 1 56.74 AAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACA:1 + chr2L 1259989 3' - Burdock 85 2 77.40 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGTTAGCACCAATAAAATATTCCAATGTGATCCAATGACGGTTTTCATG:1 + chr2L 12319356 3' - copia 4914 2 54.79 GCGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGCATGGTTATTTCCCCTAATAGACAGCGCATCCGCTACACTCTGAAAAGTTACATTTTTAACTTTTCTTAATTAAGATTTTAACAATATTTTTCTCGCTGTGTA:1 - chr2L 12415772 3' + pogo 2085 1 38.36 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTGAGTTTTCTTAAAATATTAGTTCCCTCCTTTTTTCGCCCGGTTTTCCTTCTTTTTTTTTTTGTCCTGCCTTTGTTTGGGTCGTGG:1 + chr3R 15711899 3' - diver 17 2 67.20 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCCACTTATTTATTAATTACTCAACAGGCTGGAATCTCTGGCCAGAGC:1 - chr2R 20865674 3' - 412 7129 2 72.60 ACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTAACATTATTGTGTTTCATTAA:1 - chr3L 11745307 3' + G2 2755 1 79.81 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACACACACACACACACACACTTGATATGACACCCATGTAATCCTGGCTGATGCAATATCTAAATTAGCTACATCACAAC:1 - chrX 13395240 3' - roo 8703 2 48.63 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAAATGCCTAGGAAA:1 - chr3L 17707798 3' - Doc 46 1 52.14 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTA:2 + chr3L 24208241 3' - Quasimodo 27 2 64.83 ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCATTAATATTTT:1 + chr2L 23295906 3' - micropia 4989 2 60.27 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTCGGACAACAAAAGTTGTGTTGCCGTTATTCATCGCTTCTTAAAGCGGCTAAAAACTTTCGCCTGTTAG:1 + chr3L 12867411 3' - roo 8685 2 71.23 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATTTAATATTAATGCCAGTAGTCTGCTCAAAGGCACTC:1 + chr2L 14201520 3' - roo 8676 2 71.92 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGTTTGGGATCCAGCTAAAAAAAGCCGAGGCAGACAAGGCAAACGAATAAAAGCCGGCAC:1 - chr3L 13827214 3' - hopper 16 1 74.66 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATTTG:1 - chr3L 11336321 3' - blood 7039 2 58.46 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAAATGTCAGAACGATCACCAACGTGTAAAAAGTTTTAAGTTCTACCGATCTTATAAATATTTATACTTTTTTAAAATTTCGATGTTTTTATACGGA:1 - chr3R 7981436 3' - jockey 25 1 71.43 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGGGGTCGGTTCGTAATCCCCACAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTT:1 - chr2R 16891839 3' + hobo 2903 1 53.64 TGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTA:1 + chr2L 17250809 3' + opus 427 2 68.49 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTATATCCTTAACATAGAAGCCGACAGTCAACGACGAACTGGTTTTTAAGCACGAAGCTGCCTTCGTTTCACTTC:1 + chrX 3099189 3' + P-element 2838 1 49.32 CAATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGT:1 + chr2R 5532325 3' - G4 3825 1 63.70 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCATGAGACATGTAAAAGTTAGTCCTACAAGTCGATTCCTTTATATCACCCCGACACGCGCCGATATAATAATTTTGATGACAGTGTGGCAAGAAATA:1 + chr2R 5737264 3' + 1360 3380 2 78.08 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTGTGGCAAAGGGAACTGCCTTTGTTAACATTCGGTAACCTTGAATATTATTGT:1 - chr2L 12079587 3' - mdg3 5295 2 54.11 TGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAG:1 - chr2R 16403427 3' + copia 5042 2 74.66 GGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGGCTGCATTTCGCGGCTATT:1 - chr2L 18279858 3' - gypsy5 11 2 72.88 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGACAAAAATCATTATGAGAATTGTAGAGAATGAAGTTCATATAGCGATGGAGAAGTACCAAATAGTTCTTAGTTTCATACACAATACACATCGAGTAGCTACACTTGAGATG:1 - chr3L 20594072 3' + roo 400 1 73.97 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGATCGGAGGCCTAGTGGCGGTAGCG:1 - chr3L 22900083 3' - 412 39 2 52.80 TATAAATTATAAATTACAACAGAAATATTAATAGAATTACTTAAAATATATAATGTATAATTTGTTATTAAGTGAGCCTTTATTAAAAACTTACTTTTAATGCTACATCCTATGGAAGTATTTCTCTTTTATCGATTTTTATATTA:1 - chr3R 18873135 3' + copia 256 1 67.12 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCAT:1 + chr2L 76144 3' + roo 9015 2 62.33 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACGCGTTGCCGCCACTAAGAATTTGTTTGTCCATT:1 + chr2L 17240334 3' - hopper 40 1 58.90 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAACAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTCCTTCGAAACACAAATACAAGGTTCCTTGACATCGAAGATCTAAGAAAT:1 + chr2L 13250476 3' - opus 7153 4 60.27 TGTGTAAACTTGGAATTTGTTTTTTATTTTCTTGTATATTTCACATTTTCAAATAAGCGTAAGAGTTTAAATTGGTTTTTAGTAGCTTAACATTTAAATTTGAACACTGGCTTTTTTTGAAGATCGCGAATTCGGTGCTGTGGAT:1 + chr2L 13785798 3' + S-element 1534 1 73.79 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAATGTAATCTTATCATGTTCAGCCACACATCCCCAATCAACCTGATACAGTACTTTAAATATGA:1 - chr3L 19836406 3' + pogo 2047 1 63.01 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAATACGTCACCGC:1 + chr2L 246087 3' + roo 9004 2 65.07 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTTTTGTTCTCGAACTA:1 - chr2L 17029574 3' - blood 7056 2 54.11 TGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGCTTTGTTTA:1 - chr3R 5208130 3' + hopper 1352 1 60.96 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAAAAATAATTTATGATTTTTGAGGAATCT:1 - chr3L 10133496 3' - 412 7109 2 55.17 CAAAATTCAAGCCCAAGTGCAACCATCATATAATCCATAATCCCGCCAGGAAATTCCCCCAAAAGATTCTGTTATCGCATGTGAAGACCAAGCCATCAA:1 - chr3R 24823246 3' + Porto1 67 1 65.66 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGGAAACTACCAGCCAAGCATCATCATCTGACACATTCCAGATCTACC:1 + chr2R 5955075 3' + copia 245 1 76.12 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCTGTGCAATATTC:1 - chrX 3996505 3' + roo 9037 1 60.58 ATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGAAAAACAAGAATTTTCCATACGCCTTTTGCCTTTTGTTGTTTCTTGTTGGCCATCGCGCGACATGCGACAAAATAAAATGTAAT:1 + chrX 21022673 3' - 1360 343 1 52.74 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTA:1 + chr3L 14553196 3' - roo 68 2 64.38 CAAAAGGGAAACCTTAAAGATCAAGTTTTCTTATTAGAAGGTAATAATTAACAGAGTCAAACGCTTTACTAAAAACGAGGGAGTAGAAAGGAATTTAATTGCACTTCCTTGCCCTATCGGACTGATTTCCTTTTGTTGCATGTCCT:1 - chr3L 1982341 3' - Q-element 370 2 50.68 GAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTCTCTATATGACTGCAAGAAAAAATCTAACGAACTAACACAACTTTATTTATA:1 - chr2L 11574800 3' - Max-element 47 2 52.74 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAACATCGTGC:1 + chr2R 558203 3' + copia 249 1 57.53 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAACGACTGGAAGGGCGTTAGTCAAATATATTGCAGTACATATACACACTCC:1 + chr2R 5868407 3' - pogo 35 1 60.27 GTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTTGAACTGGTATTTATCCTTTGGCTTTCTGAACTAGCTTTATT:1 - chr3L 17786262 3' - F-element 281 1 71.23 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGC:1 + chr3R 22100581 3' + 412 421 2 73.85 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGTCATGGAAATAAAGTGCAGGGATCGAAATGAGCCAGTC:1 - chr2R 23287425 3' + roo 356 2 53.42 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCCTATTTTTAGGCAGCGCATCCTTTGTCGCCCAATTTGGGAGTT:1 + chr3L 1630179 3' - jockey 4750 1 71.23 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTAAGGGCCATATTGACCAAAAATAAATATAAAGATGGCTATTTTTAAACCAAAAAGCCTCGTA:1 + chr3L 96610 3' - roo 49 2 53.79 CACTGTCAAGAAATTGTTTGCACAAAGTACTTTAGCTATCTTAAACTTATAGTTCATAAGAAATTATAATAACTTGAGGTCGATTGGTGCACCTCTTTCCGGGAAACGCAGTTCTCATTAGGCAGATCCACTTCCATAAATGGCAA:1 + chr3R 18923726 3' - S2 1503 2 50.68 TGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAAAATG:1 + chr3R 26246914 3' + 1731 264 2 49.32 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTCCACTTTAATACACCCCGTAAATAGTTGAAATTTCAAAAGCCTTGTGTGGGAAAAACTTTAACCGAGAGCAGGTGGAAAACTATCGTTCAGCTTAACTT:1 + chr3L 10133639 3' + 412 7523 2 65.07 CTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAAAATGGAGGAGTGCTTCAATTGCACAGTGTCCTTGTAAATCTGTGAAGCCG:2 + chr3R 26246960 3' + 1731 4622 2 76.71 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTTAAGCATCTCCATTCCCACCTCCCACTGTTTTCTTTTCCCTCCACATGTTTGTTCAGTTGTTTTTCTTTTGCTTCTGTCTCTTCCTGTCTCTCTTT:1 - chr3R 25880217 3' + P-element 2876 1 75.76 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATTTAATATTAATGCCAGTAGTCTGCTC:1 + chr2L 14201510 3' - roo 16 2 67.86 AGCGGGCGATCTGGAGAGGGAGGCGTTGCCAGATCAACCGTGTGATCAGTGTTGTGTTGCGACAGTAGAGCGCGAAATTCAAAATTAAACTTAACGAACCGGAACCTCAGCCGGCGCCCACGGAATTGA:1 - chr2L 15425176 3' + Rt1b 17 1 72.87 AATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTTTAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGATTATTTCAAATTTTGAGCATTTACTCTTTTACCATATAAGAC:1 + chr4 106603 3' + G5 4742 1 75.34 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCAAGCTGAGATACTTTATAACTAATTACAAATTCAGCACGATGTGTGTAAAAATGATCTAAGTTTATACAATTTAGATATTTTTTTAGATATTTTAAGCTATGAGTGCTTGT:1 + chrX 19537045 3' + roo 398 1 75.34 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTTTTATCTCTGTGAGTAATTACGAAATGCGAGACTATTCCTATTATAGTTGGG:1 + chr3R 20988913 3' - I-element 6 1 81.43 AGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAAGTTTTAATGTTTAATCAGCTGATCTAACAACATGGTAAAGATTGGTGCTCAAATAGAAGGTACAAGCGGCTTTGAACCG:1 + chrX 16420257 3' - P-element 2869 1 51.03 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATATCGTTGCATATAGTTTAATCGACTTCAACAAACGAAAGCCGATATTAAA:1 + chr3R 25904256 3' - 412 69 2 68.49 TTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCC:1 - chr3R 28627613 3' + copia 5044 2 71.92 GCCATAAAAATATTTATCTTACCAAAGAAAAAAAAATTGTGTATCTATATTTAATTAAATATTTTACTGATATTATATACAGAAAATCAAATAAAATAAAAGCGAACCACCTGACAGAAATTCCATGGACTGCGCCCTTGAGATGG:1 + chr3L 8756750 3' - transib1 1980 1 69.18 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTTTTATCTCTGTGAGTAATTACGAAAT:1 + chr3R 20988887 3' - I-element 38 1 60.27 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGACACACCGCTCATGCCACTGGTCTTCTGTTATCTGCTGGGGGCCCAGTTTTTGTGCTTGGCTAGCAGA:1 + chrX 2773558 3' - jockey 4814 1 53.42 ATTGTTTCAGTCTTAAGCTGATATTCAATCAATAAAAGCGTTGATCTTAGTTCAAATAAGGATCATTTATTCGACTCAAAACAAAAACAAGTTTACTATATAACTACAAAAATTGCACAACCTAACTT:1 + chr3L 25850480 3' + Tom1 276 1 43.75 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAG:1 + chr2L 4174071 3' + roo 354 2 53.42 CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACGCG:1 + chr2L 17240304 3' - hopper 64 1 68.57 ATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATAT:1 - chr3L 27415241 3' + transib2 2736 1 78.77 AGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGACACGCTCAACATATTCGGACTATCCAAGAATGTATTTAATATTGATTTTGTTTTCAAT:1 - chr3R 5292847 3' - F-element 360 1 57.64 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTTAGCGGATGGCTCTCAGCAGCAGACCAAAGCTCTTTGGCTTTTCCGAAAACTGTG:1 - chr2L 245963 3' - roo 8680 2 70.23 GGGGGGTCACTATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTCGTTATCAGTCATTTACTATCATGTGTATAATAC:1 - chr2L 15945733 3' - X-element 108 1 76.71 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCTAGTTGCAGCAACAAACTTTTTCATTCGTTTTCGCATCGTCGAAGCGTAC:1 - chr3L 14550945 3' + P-element 2878 2 61.90 AATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGATTACGATCTGCGAATATGAAATTCGATTACTTCGGGTTCCAGGAATAATTGCCATT:1 - chr3L 6052149 3' + micropia 105 1 61.38 TGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGAGTGTAAGC:1 - chr3L 24934318 3' - HMS-Beagle2 6890 2 57.75 AAACCAAATGAAGATAAAATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTTCAGACTCTTGACAGTTTTTCATAATTT:1 - chr3R 11113171 3' + mdg1 7398 2 53.42 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGGATAGTGCATGGTGAATATGGTGATGAAATGTGCATG:1 + chrX 3996568 3' - roo 83 2 76.03 GGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAA:1 + chr3R 11547760 3' - G2 356 1 71.92 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTG:1 - chr3R 13582233 3' - BS 5081 1 75.34 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTCGAAACCAAGTTAGCAAAATACATTGCATACTTTACAACGTCCTATCACGGCCCATTGGAACATACATACGATTTCATAGCCTGCGCTTAAAGTTAATTG:1 - chrX 6707711 3' - hopper 5 2 74.44 AGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATCATCTCAAGTGGGCCTCTCCATTC:1 + chr3R 13612867 3' + 412 398 2 78.77 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGCATGGATGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCCGTATAGCATGAGCCCAT:1 + chrX 21994005 3' - 297 6594 2 68.18 CATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAAAAATTGGGCTTAGGTCGGGATTGAGTGTCGGCAC:1 + chrX 18726387 3' - roo 8806 2 76.71 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCT:1 - chr2L 9485624 3' + 412 7506 2 67.37 TAATTTTTAACAACAACTTTTTTTCGAGTGTCTCTCCATCGTGCGCTTTTACTGTTCCGCTCGGCCCCTTTCTTCCCCGCCTCCTTCCGCAGGCACACATACATACACACATGCGGAGTGAGCGCCACTC:1 + chr2R 15478777 3' - NOF 3908 1 73.08 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCATTTTTGCACTTTTCCCAAGTCCTTGGAGCAATTTTATTACAAGCAACT:1 - chr2L 4173942 3' - roo 39 2 58.90 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTT:1 + chrX 1103707 3' + pogo 2059 1 60.17 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTTGGCAAGTTCTGCAACATTTTCCGCTGGTGATTTGGGACCTGTT:1 + chr2L 5202599 3' - 297 13 2 69.44 ATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACCGCAAAATCTATAAATAGCCGAACAGTACAATTAATTGATGCACAGACACAGTTTGGCATTGCGTGTGTGAGT:1 + chr2R 21371567 3' + roo 9039 1 63.70 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGCCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCTTTCAAATGGTGAGATTAAAAAGAATGATTTTTCAAACGTGCTTCACATCATTTATA:1 + chr3L 16496721 3' - jockey 4748 1 51.24 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGATATTGGCCATATCATTCGGCCGGCTAAGCGCTAACGAGTTAGCAGGTGGCACATCCAG:1 + chrX 4291964 3' - roo 8717 2 60.43 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCTGCCCTACCTGG:1 + chrX 4785170 3' - roo 40 2 55.65 GCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAGCCACATGAAGCTATATAGTTGGCTTACACCATTGGCTGCT:1 - chr2L 6870676 3' + hopper 1380 1 55.56 CAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTAGTTTTACGATACTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACTCCAGCTTCCCAAATGCTAAAATAGGAATAATTTTATTGTTTT:1 - chr2R 4375212 3' - diver2 367 1 73.97 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCATATGCCACAAA:1 - chr3L 17890709 3' - 412 7097 2 54.17 TAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTACGTTGGTACGTTGGTCGGTTGGTGGGTTGGCAAGGTGACAGGGAAATGCAAAAGGGGGAATCTGGGATG:1 - chr3R 31625762 3' - F-element 4462 1 56.62 TAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAAACATTTAGAA:1 + chr2L 22684620 3' - transib3 48 1 59.44 TAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATA:1 - chr3R 4160067 3' + invader2 5049 2 58.16 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGACTATATCAAAATGGCGTTAAATGCAATAATTATATAATTATATATTTCTAAGTAAGCAGATGTTACATAGTTTTGTAATTATTTCTAAAAGCTGT:2 + chr3R 24122783 3' - roo 24 2 62.33 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATAGC:1 - chr3R 27859191 3' + hopper 1385 1 58.33 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGCACGAATTTCGGGGTGAAGGCACTCCGAAAGAATATCAGACAA:1 - chr2L 9237459 3' - blood 26 2 65.07 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACTTTCTCTCTCTTAGCAGTCACTGATTACCGTTGTG:1 - chrX 8891733 3' + P-element 2847 1 55.00 TATACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCA:1 - chr3L 17707834 3' - Doc 88 1 69.86 GACTATCAGATACCCGTTACTGAGCCAGTGGGAATGCAAACGCGAAATTTCATTATTTTTCTGGGATAAAGAATAAAATGAGAAAAACTTTAAAAATTGTTTAAAAGTATACAATGGGTAGAAGGAAGCATTTCAGTTCATATATA:1 + chrX 192187 3' - INE-1 549 1 73.97 ATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTATTTTATAGAGTGTTAGCCATGGCCGAGGGTTTCGACCTGTTTTGCATGCCTGGGAGTGTGACAAGTGTGCCATGTTGCAGATAATTGCTGGCTGCGTGTGTGCGTGTG:1 + chr2R 20710165 3' - mdg1 7077 8 68.97 GTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAATAAACGACTAAAATTTTTTTAAAATCTCTTGTCATTTTAGTGCAA:1 + chr2R 5924659 3' + jockey 4901 1 69.18 AGAGTCCCGATTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGCAAGCTTCCAAGCGAGAGGGGCAAATCTCGTCGCTACATCAGAAAACGGGGG:1 + chr3R 1954492 3' + Cr1a 4074 1 62.04 GATAGATAATAAGTAAACAAAATGTAACTTTAGCATTAGATGTAACGTTTGTATACACAACACTCATGTTTAACATTAAGATACCTTGTTGGCCGCTCACGCTAATACCGGATTCTCTTTTACATTTTGCAGATTTAAGAATACT:1 + chr3R 31658570 3' - accord2 434 1 58.62 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACCATTTAACACTTAGCTTAAATTCGATTGCATCCGCTAGATTGTTCGCGGGATGTTATCGAACTATCGATGGCT:1 + chr3L 19836536 3' - pogo 13 1 70.94 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGTACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATA:1 + chrX 12139017 3' - roo 8743 2 71.23 AACAAGAAAAAAAAAAACAAAAATAGTTTCAAAACTCACCGTTTTCATTACTACTTTTATTATTCAATTGAAACTTAAATACATAAATCCTTAACACATTCATAACACATACATAAACTAAAAAAATTGCATAGCTAAATACTAAA:2 + chrX 8668674 3' + gypsy7 5011 2 70.55 AATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGTACCAATGCCTGTTGAGGCGGTAATATTCAA:1 + chr3L 12976353 3' - invader4 24 2 47.90 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCCACATACCTCTCCACTGCTCTGCTGTTCATTAGTACCCCATTTTGGTTGGGCGACTCATTC:1 + chr2L 6184109 3' + pogo 2043 1 60.27 CATGTTGGTCGCGCCGACCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTAAATCTACAACCAATGTAACAGCTAGAAGCAAATAATGTCAAACCCATATTGAATTCAGCCTGCATT:1 - chr2L 8959852 3' - Ivk 5091 1 72.60 CTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGT:1 - chr2R 22723028 3' - 3S18 60 2 58.99 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGACCCACTTGGATTTGTCTCAGCCG:1 + chrX 5150411 3' + roo 9041 1 64.38 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATATCTCGCTGCAATGTGGAGTTACTCGGGTAATTCGCTCCCCAGTTAATTTTGTTTTCATTTAGCCTAAGACTCCTGAAAGTTCACAGAAAATTAACTTTCTTGCTTAC:1 + chr2R 17121736 3' - blood 13 2 75.34 GGAGGCACAAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATANNNGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTG:1 - chr3R 4604451 3' - 1360 471 1 66.19 GCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTC:1 + chr2R 5237879 3' - Doc 99 1 61.64 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAATGAACAAACGAGCGGG:1 - chr3R 13607649 3' + I-element 5275 1 71.92 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACGTCTTCTGATAGGCTATCATCATTCATTGTAGTCATTGGAGGTGGAGGTTCCAATTTAAT:1 + chr3R 31814154 3' - FB 61 1 60.00 GGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACA:1 + chr2R 17890946 3' - Tabor 6925 2 74.66 ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTT:1 - chr3L 24152424 3' - HMS-Beagle2 6911 2 60.77 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTACACTCAAGAAGTAAAGTCGAACGGGCCTCGTCCAATCGACTGGCTTCTTCTTTTGGCCCTTCCTAATACTTATTCACTCAGTT:1 + chr3L 22900208 3' + 412 7514 2 60.71 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCCATTCATGCGGTAGAACATTCAAATAACCCGCCATATCGGTCCGAACACCCCATGCCATCACACCCACATTCCATCCATCG:1 - chrX 14450307 3' - jockey 4782 1 65.89 GTGATAGTTTTTTTTTTTCGTTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGCACAGCCCCACATTTTGATTCCCTCCTCGATTTCTCGTTGGCTCCCT:1 - chr2L 12954352 3' - Doc 4592 1 55.86 TAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATATGATTTATGCGCTGTTTCTAATTCAATTTAGACCCGTTTGTTTGCTTTGGAG:1 + chr3R 23010104 3' - I-element 58 1 59.42 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACACAAAATTAAATTCTACATTAAGATAACACACAGAAATATCGAATTAATTTTATATAATGTTATTCTCTAGTAA:1 + chr2L 8956854 3' + pogo 2056 1 52.05 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGAAAGAGTGTTGGTGGTGATGTGGGTGTGGGTAAGTTGTGTCTGTGTTAGCCAGGTGACAGAGTAAGCGCCTTAAGCCGCCTCAG:1 - chr2L 11915478 3' - hobo 23 1 61.54 GGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTT:1 - chr3L 24934298 3' - HMS-Beagle2 62 2 62.33 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTGCTTATTTGGGACTTTACACTCTGGCTTCAGGTTTCAATGAATCCGCCGTTCCCCAGAGATAACCTTCCCGACAACGTGGGCA:1 - chr3R 23765355 3' + roo 9037 1 56.67 AATAATTAATATTTTACAATAAGCACATATGAAAATTTCTCTAGACAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATATAATTATGAAGTATTATGGTATTATAAAGTATCCGATTCCAC:1 + chr2R 1873418 3' + TLD2_LTR 107 1 91.78 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTGATCAGGCTGCAGTGTGTGATGCAATTAT:1 + chrX 16855305 3' + roo 8979 2 80.14 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTGGAGTATAAAGAGGGGTATCCAGTTGGGGAACTGGGGATTTGCGTGCGCACGCGTACAGCGCCAAAACGAATTAAATGTGATGCACCAGCAAAT:1 - chr2L 16458548 3' - roo 8684 2 69.29 CAAATTTTCGCGAATTAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTAATTGACAACTCGCAGATAATTGCCTATGTTGGTGTGTATGCTGCACATGTGTAGTTGCATATATTCACTAAGTTTCAGATTGACAGAACAAAGGTGACTATCAGATTC:1 - chr2L 15003216 3' + R1A1-element 105 1 72.60 ATATAAAAGATGAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTCCGAGCAAGAAGTACACCATTTAA:1 + chr3R 13349167 3' - BS 5019 1 65.75 GTGCGATGGAAACTAAGAAATACAAAAGTATTTTTCCAAGTCCCTTTTCGAAATCGACGCTTTATTCCACATGTGTAGATAGGAAAAAATACTTGGTCATGGTTAACAAGGTCAGGATTGAACAGGG:1 - chr2L 21700320 3' + HB 29 1 42.52 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTC:1 - chr2L 23310630 3' - 1360 62 1 62.86 GAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGAACCATGAACCCCAATATTCTTCAGAGCTCTTTTCGACTTGGCCACATATCATATTCAGTTTGAACGAGACAAGTTGGCCAT:1 + chr3R 30509256 3' + baggins 5274 1 51.16 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGGGTTCAAGAA:1 + chr3R 17656462 3' - mdg3 55 2 60.94 TCCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCCAATGGCCCCTTAGCTGCGCCATATGCAATTAGTCGGACTGTTTTATGTTCTAGTTGCGACGACCTAAG:1 + chr3L 23773793 3' - Gypsy12A_LTR 1934 1 60.64 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATACTTACATATATATATACATATATCCCGACCATCCCCCAAAGAACCCAAATTACTT:1 - chrX 6138626 3' + opus 453 2 70.87 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCATTGGCCGCCGCTGC:1 + chr2R 6842865 3' + roo 9028 1 52.99 TGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCCATTTAAGACAC:1 + chr2L 17250843 3' + opus 7499 2 67.57 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCACAATGAATACTTGCTTGGCCAGAGTGAAGTCCAGATCTCTAAGCACGCGGTTTCGGCGATATTTGCTGACAATTCCAATCCCGACAGCGGTATATT:1 - chrX 21290552 3' + jockey 4961 1 64.83 GGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACC:1 + chr3R 9352105 3' - Tirant 8114 2 73.74 GATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAATGCAAACACCTACTGCTTAACAGGGATAATATCGTTTTGTTATATGTATTGTTAGTTA:1 - chr3R 19223055 3' - FB 58 1 62.14 TCGGCTATTGATCCTAATCAAGAATATATGTATATACATTATATAGTCGGAAACCCTTTTTTCTGATTGATTTCAACTCCAGCAAACAGGAGTTCAAAACATATTAATACAATGCATCCGTAACCAAAGGTTTTGTGAAACGTCAT:1 + chr4 1121552 3' - INE-1 89 1 52.05 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGT:1 + chrX 12525989 3' - roo 8735 2 68.31 AGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTTGCTCC:2 + chrX 6510084 3' - jockey 4755 1 73.29 GCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATACGGCTTGCATCCCAATATAGGCGTAAATGAAGTGACAATATCCACTAAGCCATTTTACGAAAGTAATACGTATATATTCGTGTAT:1 + chr2L 9145632 3' - Cr1a 3993 1 55.40 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTTCAAACATTTT:1 + chrX 1103727 3' + pogo 2051 1 54.11 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTTTTATCTCTGTGAGTAATTACGAAATGCGAGACTAT:1 + chr3R 20988897 3' - I-element 28 1 67.12 CACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATAT:1 - chr3L 17707847 3' - Doc 84 1 77.52 ATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATATTTTTGTATAAGTTAAATAACTTTTTACTTTTGTTAATTACCAGTTTTATTATTATTATTT:1 + chr3R 17605776 3' - Tabor 6857 2 71.92 ATGCATGCCTTCTGCATACATATGTATAAATAAGAATACATAGATATAAGCAATATATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACATCAGCACACATTGGGTTGATGGACATTAAAGGCTCATCCTCTGGCGGTGGCTGCCACATTGGCGG:1 - chr3R 30216806 3' + Stalker2 237 2 65.75 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTCCGAGAAAGAAGTACACCATTTAATGACCTC:1 + chr3R 13349174 3' - BS 5012 1 71.92 AAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTATAGTTAGTTTGTAAATTGGAAAAGTCTCCTAGTCGTAGATACTAAGATTGTTATTATGTCCTATCTTTAGTTCTCCG:1 + chr3R 4883378 3' - X-element 4694 1 45.21 AGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGCAGAAGCACGTACACTTTG:1 + chr3L 24152542 3' + HMS-Beagle2 250 2 61.64 AGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCACCAACGCAGTAAGTCAGAACTGCAA:1 + chr2R 4313073 3' + gypsy 7408 2 39.73 GTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCACAAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACACATACGAGTTCTCATCTATTGTTTGTACTCACACCAGCAAGCCCCATTCATTGCCAGACCTTTGCTCAGAAGGCAAA:1 - chr3L 12045522 3' + 1360 3162 1 63.45 ATTTAAGTAATTTATATTCTATATTCTCTATTCTTACATGCAGCCGAGAAAACTCTCGCACACTCTGATACCCTGGCATAAATATTCATGCGACCAATAGTAGCTGGCTGGCTGTCGATCCTGGGCGAAAGACTTGAACCCGACCC:1 - chr2L 4237818 3' + blood 6926 1 67.81 TTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGGAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGGTTC:1 + chrX 22386755 3' - hobo 91 1 67.00 ATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACGGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCAGTTGGGCCACAGTTTTTTTTGCACATGTGTAAGAAGTGCGCTGATGAAT:1 + chrX 2578086 3' + hopper 1344 1 63.70 GGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATATATTATATATTCTCTTTATATATTATATTGCCCTAAAATATCTAGGTTTTCCAAAACCTCCG:1 + chr3L 22408744 3' - Ivk 58 1 59.59 GAAGACGCACCGTGAACTAACGGTACCGCTTTGGACTTTAGACTCGAAAGAGGATGCACGTGAC:1 - chr3L 23105700 3' + gypsy8 165 2 90.62 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTATGCATTGCATTGGTGCATATATAATCAGTTGAGTCTGGGCAAAGTCTATGATTTGGATTGACGTTGCTGGCTGATGTTTGAGCTTGTTGTTGCTGCTG:1 + chrX 17732116 3' - pogo 19 1 71.23 ACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGG:1 - chr2L 23295818 3' + micropia 5367 2 77.50 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTCCATTCCATTCTATACTTTTAGATACTGGCGGTCTCTCTC:1 + chr2L 16176588 3' + pogo 2092 1 51.05 AATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATATTATTTATTATAAGAAAATAAAACCTTCCCCTCTA:2 - chr3L 23688541 3' + Quasimodo 7290 2 78.77 GAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGA:1 + chrX 16384070 3' - diver 5970 2 75.00 CAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACAT:1 - chr3R 28627618 3' + copia 178 2 73.91 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGCAAAATCTATGCCGGCATTCTTACTTTGATATTTTTTTCTCAGAA:1 - chr2L 17136113 3' - hobo 31 1 59.31 AACTTCAGCACACTTTGATCATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTAAGCTCTTCTTTCATTAAACATCAAAATAGCACCACTCATGCTATTGTTTGGCTGCGGCCCTAATCATAAAAATAATATCCAATAAACGTTT:1 - chr3L 27124441 3' + Stalker 318 4 60.27 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTATGGGCCATATTGACCAAAAATAAATATAAAGATGGCTAT:1 + chr3L 96588 3' - roo 72 2 67.81 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGT:1 - chr3L 17890732 3' - 412 69 2 63.70 GAGTGGGAAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATACTTATTAAACGGTCCTCACATCGGC:1 - chr2L 6361157 3' - 412 150 2 77.87 ATATATAAAATAAATAAAATATATAAGACTTATTTGTAATTTTCCATCTTTCGTTAAACCAATTCAAAAGAATTCCAAGACTCTTTCATGATTTCCTGTTTTTAGATGCCCACCGTGC:1 + chr3L 22540483 3' + transib1 1922 1 33.05 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATT:2 - chr3R 22100522 3' - 412 75 2 66.44 TACCAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTTTGTTTTGGGCATTTTATTTAATAACTGTAATAGGAAAATGATTAAATCTAATTTTTATTCAATAATTTAAATTAGAGTGAGAAACTCGTTTCCTATCCAACTACTCGCAATGGAA:1 - chrX 22550879 3' - Bari1 400 1 70.55 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGTGGCCATTCTAGGGACTGAAATCTTAGCTAATTTA:1 - chr2L 685968 3' - roo 8708 2 52.74 ATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTTTATTAA:1 + chr2R 2875251 3' + TLD2_LTR 117 1 73.97 GTTTAGGAGGGATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGTACCGCAAGTTATGCAGTTAAAAAAAA:1 + chrX 5145483 3' - hopper 31 1 61.90 GAGATATAAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTTTTTTCAAAATTTTTTTTTTTAAATCGCAATTGCCCTTGAACCGACTAACTAGGAAATGTGGAAAATAAAAGACCATGTATTTTCAATCAGC:1 + chr2R 17235920 3' + FB 121 1 56.85 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAAT:2 + chr2L 9472097 3' + roo 356 2 52.05 GAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGAAAAGTTTTTGAA:1 - chr3R 17656396 3' + mdg3 5414 2 73.29 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACTCATTATCTATTCCAAGAATTATGATTATCAACTATTATGTATTA:1 - chr2R 20673646 3' + mdg1 361 2 64.89 GTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAATGGTGGGCTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAA:1 + chr2R 1522952 3' - FB 774 3 68.49 AGAGAGCCTGGAGCCACCCCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGGCGTCGTCGACCTTTC:1 - chr3L 26852647 3' - 1360 72 1 68.75 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTGTTAGGTGTATGAACTGGTTTGCTTTGTTTTCTTTTTGGAATGGCACATCAATGTGATAAAATTTGGC:1 - chr2R 8395890 3' + pogo 2050 1 54.11 ACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAACTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCATTAAACACACACATAGTCAGCGGGCGGGAAAGAGACGG:1 - chrX 13516773 3' + flea 4945 1 71.92 GAGCTAATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGAAACATTGAATTCTTCCAGAATAAAACGTGTCCTACTACCACGGATTAGTCTGCCCTTTCTTTCGGGAACCAATGTGTGGGGTAGCTTTTTTTTGCGCTGGTCATGTTCACAATT:1 + chr3R 26225034 3' + aurora-element 4220 1 78.77 GGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCATGGTTAGAGGAACCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTACGACAAGCAAGACAGCTGCAATTTAGAAATTAAATTTGCCATGCAACATTAAAAGAACT:1 + chr2L 9200901 3' - R1A1-element 4902 1 60.80 ATCTATCGACATCCCATAAAAATTATTAAACTTCGCGTTCGCATTCACTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGGAACTCGACTATAGAATTCTCTCTTGTTGTTGAATAAACTGTTTTTAACTGAGTTAGAATACTTTTTGAT:1 + chr3L 25761922 3' + INE-1 500 1 71.03 CAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTATTGACCGCGATCAGAGATCATTGGCCCAAATCGGCAATCTGCAACTTATCACTGTTCCGTTTCATGACGCAACGCG:1 - chr3R 8363867 3' + roo 8905 2 50.68 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTCACAGTGT:1 + chr2R 19555041 3' + pogo 2051 1 54.11 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAA:1 - chr3L 10133523 3' - 412 84 2 73.97 CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACAACTAATCATTAGCTTTACATGATGTGTTTATACGAAGCAAATATCACGCAATCATAT:1 - chr2L 17250710 3' - opus 7061 4 60.27 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTCGTGATATTTTCGTTTT:1 + chr3R 4528407 3' - 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jockey 4770 1 75.34 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATCAAGTTGTAGAGCGAACCTCGCATTTGCGCCTCATGAACCGTTCACGC:1 - chrX 21196703 3' + roo 9033 1 54.87 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCGTTTTTG:1 + chr3R 3320520 3' - 1360 70 1 69.06 AAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTCAAACTTGAAACGTAATATTTTTCTCTCTGTACAATGATTCGCAACGTCGGACTCTTTGTGTCGAGAAGGAAAGTGCGTTTATGATTCAATTTTATTTTCTCTTTT:1 - chr3R 26519912 3' + FB 701 2 65.75 GAAATATAAAATTCAAAATGAAAACTGCCCAAAAATTTCAAAAGATTAACCATAAGGTTATTGATCATAATATTTGATTTCAAATCATGCAGTTTTATTGCTTCTGCTCGTACAGTGCACTTAATTCGTGATTTATTGCGATATTA:1 - chr3R 15653467 3' + Transpac 4803 1 79.45 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGGCTACAGTTTTTTAGTCC:1 + chrX 5679982 3' + P-element 2799 1 18.05 CAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCTTACTGCTTACTCATTGCCACTAAGTTCCCATACTGCCAACTTGGTACTGCGTTAAACCATCGAAGGGAATTTCATGACTAGTAAATTATGTAAAAGTGGAA:1 + chr2R 1774890 3' - Burdock 6069 1 78.08 GGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTTAAACAATAGACTTGGGCA:1 - chr3L 22054948 3' + mdg1 7033 1 67.41 CGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACACATGCCCAATATCACTGAAGTAGCAATAATAGTACA:1 - chr2R 19351979 3' + Burdock 175 2 72.60 GTCTAAGATTTTCTCACACCAATTGTTTCAGTCTTAAGCTGATATTCAATCAATAAAAGCGTTGATCTTAGTTCAAATAAGGATCATTTATTCGACTCAAAACAAAAACAAGTTTACTATATAACTACAAAAATTGCACAACCT:1 + chr3L 25850475 3' + Tom1 255 1 39.58 TCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTTAGCGGATGGCTCTCAGCAGCAGACCAAAGCCCTTTGGCTTT:1 - chr2L 245976 3' - roo 8662 1 77.00 CAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATCAAATCAAATCAAAAAATAAATAATTTTGCACTTCATTGATATGTATCT:1 - chr3L 1519518 3' + Juan 4128 1 75.34 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCC:1 + chr3R 24476358 3' - 412 7129 2 70.34 GTCGCTGTTGAACGAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAATGGTCAAGTTATTATTACATTTCATGGTTTTTATATAGTCA:1 + chr3L 11776745 3' + mdg3 5428 2 66.91 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTACATATATACACACAGCCAGCCGAGCGGGCCGATATACATACATATGCGCAAATGAATACCACACAAATACAGAA:1 + chr3R 17067939 3' - 297 6620 2 57.24 ATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCTTAGAACAGTTGGAAAAATAAATACGTCCAAGGAGTCTGGGTAAGACTGGCC:1 + chr3L 3585043 3' + F-element 4496 1 74.62 GCGATTACCTCAAACAATCCCACCCAAATTTGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTTTGTGATAATTAACTCACATTATTTTGCCAAGTAAAAAACGTGTGACAGCCATGACGTCACAGAACCAAGTTCGT:1 - chr2L 8269906 3' + I-element 4885 1 53.79 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATC:1 - chrX 14964614 3' + roo 9009 2 65.07 GATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGG:1 + chr2R 15829584 3' + invader4 270 2 71.67 ATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGCTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAATAAAAAATTTAATAGCTAATTATTTAACTAAATAACAGCG:1 + chr3R 13582272 3' + BS 5006 1 76.03 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGG:1 + chr2R 5237895 3' - Doc 83 1 50.68 TATTATTATATATACTTATATACTCATATTTAAATTTAAAAAAAAACAGCCTATGTTCCTAATATGTTGGCCTTGTCTGTGCATCTACATGTGTGTCTTTTTAGGTGGCAGTCCCGTATGTCACCAAAATGTCAAAAGCCAAGGAA:1 - chr2L 5459866 3' + Tc3 284 3 70.55 CATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCACTTTGGTAACTCGCGCGTCAGGG:1 - chr2L 23372501 3' - gtwin 6961 2 53.42 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAACATTTGGAAATTATTGTATAATTTTTTAAAGTCTCTTAATAGCAGTT:1 - chr3R 13631362 3' - 297 6643 2 70.07 AAAAAAAAAACAACAAAAAAAAATGAAAAGTTGAAATTTTCACAATAATAAGTACACGCAGTCCGAAAAAATGAAGCAGAAAATGGCGCCCAAAACTAAATAAACGCAAGCATTACAACAATTAGTGTAGTTGTCCAGTG:1 + chr2R 17246714 3' + gypsy11 3934 112 72.86 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAAATGCACGTACCAAAAACAATAGCAGGAAAAAGTACAAATCGAAGGAGAAAG:1 - chr3R 21704569 3' + 297 379 2 60.16 ATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACATTATACCCCTCCAAATAACTTGAGATTGATGTCGAATAAGCCTCCACATGTGAACAGGAGCTTTAAGTGCTGCATTTGCAGGATATATTC:1 - 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chr2L 17395968 3' + F-element 4323 1 65.00 AAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACAAAGCTGTGCAAAAATATTTGGCTTAGTAT:1 + chr2L 1260043 3' - Burdock 6167 2 59.59 TATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTCTTACAAGTGCTCTATGAATCTCGATGAAATCCGGTATTCGTTATAAT:1 - chr3L 24291954 3' - rover 34 2 56.39 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAATTACATTGTTGCATGACACAAATAGTGTTGCCTACAACAAGGGGAACAACAATTGCTGAGAC:1 + chr2L 13704790 3' - hopper 53 1 53.79 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCCAAGAAATTTGGGATTTCTTCTTATAACACGAGCACTTTAAGGATCAATTTTTTCCATTTTCAATGGACTGTACG:1 + chr2L 19068168 3' - pogo 38 1 56.12 GAGTCGATCTAGCCATTTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTATAAGGTTGGGATTCAGCATACAGATTCCAAATCTCTTATCTCGAGTTTGGCCTTGCAG:1 - chr3L 19018088 3' + INE-1 109 1 77.87 ACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGATGGGCAAATTAACAATTTCAGTTTGATTTGCCTGAGTTACTTTGAAC:1 + chr2L 22747347 3' + transib2 2749 1 68.49 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAGTCCAG:1 + chr3L 7962285 3' - blood 7037 2 53.33 AAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGCCGAGTAAAACTGACTATGTCCGTAATTTTTCCCTTTTTATATGAATGTCTTGTAAAATTCTACCACCAAAAAACTAT:1 + chr2R 12994964 3' - BS 5007 1 69.23 GAGAGCGGAGAGCGCTACATCGAACAGTTCTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTTGCCGGGTTCTTTTTCGGCTTTTACTGGTA:1 + chr2L 19870416 3' + 1360 115 1 72.97 CTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGTACCCATGCCTGTTGAGGCGGTAATATTCAACGC:1 + chr3L 12976356 3' - invader4 7 2 54.29 AATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTACC:1 + chr2L 22150637 3' - S-element 75 1 83.56 ACCAGCCTTGTGGTCTGGTAGAGTAATTAATACAAGTATGTTTTGCGACGAACAGTCGGAGTGATAATGTAGACGAGCAACCGCTCTTTATTAAAGTCAAACATATCCGGACACTCTAGCCAGGCGGTTCTCTCT:1 + chr3R 24944816 3' - Gypsy6A_LTR 250 1 77.78 CGGGCCTAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCAACGTTTGGGAGGAATTTTTCGAGTTGAATCGAATCCATCAACAAGTCAATCGTAAG:1 + chr2R 7422207 3' - HB 1334 1 72.46 AATAACAAGATGGGTAACGCCCTTCGATATTTTGCACACGATTTCTTCGTGCTGGCTAAAAAGCTGGTTTCAGGCTCTCTCGAAGACCTCTATAGCAATCCCAGTCAAAAGTGTCGAGGGAAAGAATTATTA:1 - chr3L 23250418 3' - 1360 3376 2 74.24 ATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGAAGGAG:1 - chr2L 12340736 3' + diver 6071 2 51.61 CGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTAGATCCAGCATCTCGTATTTAAAACTTAAAAGCCTTCACACCTGAATATCTTCAACATCTACTTCA:1 - chrX 21083916 3' - HB 63 1 55.48 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGGCTACAGTTTTTTAGTCCGAGCGCGATCGAACATGTTGGCTGCCTGGCAA:1 + chrX 5680014 3' + P-element 2847 1 47.86 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATATATGGTTCTGTAGAGCATAAGGGAAATACACACAA:1 + chr3L 12224726 3' - 412 53 2 52.05 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTT:1 + chr3R 10472783 3' + mdg1 352 2 63.01 ATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAA:1 - chr2R 7020572 3' + Bari1 1621 1 78.08 GTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAAC:1 + chr2R 4261948 3' + invader4 2990 2 61.02 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTGTATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTGGA:1 - chr3R 16913355 3' + pogo 2041 1 60.96 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGCTAAGACCAAAGACGCTCCTGCCACATGCGGTAATTGTGGAGAGGCGCACACTGCGTCTT:1 - chr3L 26645887 3' + 1360 3330 1 57.86 ATGTGGTGTCGTCTTATTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAACATTTGCTAACTAAACACAGTTTGTTCCTCTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 9418239 3' - BS 4859 1 60.71 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTTATAATGATTGAATCGACAAGAGCATTCATGAATGAAACGGCAGTTTTGAAT:1 - chr3L 23042033 3' - pogo 62 1 64.38 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAATGTTATTGAGCGATTGCGGACACTCATACCACTTTGAATTAATTCCAATGCGGAATTTAATTTTCTTATTTGTCTGATTGATTGAC:1 + chrX 10645097 3' - jockey 13 1 74.79 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAATCCGATTCCGACTTATTTTTAACCC:1 - chr3R 31490908 3' + roo 9032 1 58.22 GTGCATTCGATATAGCTCTTTTTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCGAAATAAACAGTATCGTAATATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACATTTCCCCAGCAAATTGGATGCCAAAGTGGGGAGCATCT:1 + chr3R 9974079 3' + diver2 4782 2 73.97 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGCATGTCTGCTATCATTTAGTG:1 - chr3R 12599013 3' - 412 7084 2 56.80 GCTGGGACAAAGACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTGTTACCGCAACTGTACATATACACAAAGCACAACAAAAGTCGATAATATTCAAGTTGAACAAGAGAGAATGCTAGTTCCCCGACTATCAGATA:1 - chr3L 23747151 3' + Tc1 1613 1 41.86 ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAAATAAAAAAAAGGACATTTAAATTGTGCCAAATTTAGCTGGGGATTTTGTTCTCAATGCGTATATAAGTATGCATCTACATAACAAAAGCAGCAACAAAATGCTGTTGCCAG:1 - chr2R 20709700 3' + mdg1 38 8 73.29 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGGCCTGCTCCGATTCGGAATCATTAAATAGACGACAGGCGAAATCGAAATTGCAGTGCCAAAGTTGCCGCCTGCTGT:1 - chr2L 11951498 3' - pogo 41 1 58.62 GGAGTGCATGTTTATTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTAT:1 + chrX 23108317 3' - BS3 1459 1 62.02 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATTTATTTATAAACATTAGAAGTGCATGCAGATGCGGATAAAAACAAAATGTTCTGT:1 + chr3R 15885218 3' - I-element 62 1 61.11 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCGTTTTTGCCTCATTTCAGTGTTTCCAGCATTTCCCTTATAATTACACGCTCCCCATGCAAAATCGTCGATCACGTCGCCAGCTGTG:1 + chr3R 10684859 3' - roo 19 2 69.23 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAAAAACAAATGAGTTGTGTAATTA:1 + chr3R 18815985 3' - hobo 51 1 52.74 TCAACCGGTGGATCCGGAGGTGTCTTCCCTGGTGGACTGGCGTGGGAGCGAAGTGAGGACACAAGATGCAAAAACTATTATTATGATAACATTCTTTTCGAAATATACATTAGTATT:1 + chrX 10809800 3' - transib4 2376 1 69.23 ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCACTTTTTT:1 + chr3R 8709839 3' + jockey 4923 1 69.29 ATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGAACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGT:1 - chr3R 27510096 3' + Bari1 1621 1 74.48 CAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGACCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTAAATCTACAACAAATGTAA:1 - chr2L 8959900 3' - Ivk 5139 1 51.37 CCGGCAGTTGGAAGCTAATGGTGTCTAAATAGCTATGCCCACTAGTGTACATGTATGTACATCCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTACATCCAATAGTCGCGAATATAGCAATCTCTGCGATAATAATTAACT:1 + chr2R 6164633 3' - Tc1-2 26 1 68.49 ATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACATTACTAGTTAGAACAAAAGGGTTGCACCAAGCAACTAGACTATTGAATTTATAGA:1 + chr2R 4638681 3' - 1731 68 2 61.64 TTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCTACTGTTAGTGTTAAGGTAGTTGTAATTTACCAGTGCGTGAATAAAGAACGAAAAAGAATGAAAGAAAGAACGGAGAATTCATTTAATTTATTCTAAAGATTAGATATTCATT:1 - chr2L 11557599 3' + Max-element 8376 2 58.45 ACACACACACACACACACATTGTTTACAGTTAATCGCCCATAAGGAATACTTCCCTACTAAACCTATAATATTATAATGATGTTACCCAGATATCACTTGAAAAGTTCGTACTTGATTTCATTCATTAATATCGTTAAATCTGCAG:1 + chr2L 2014225 3' + accord 7031 2 73.29 CGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATGTATGCATCCTTCCTACATTGATCGGAT:1 + chr3R 29733101 3' - opus 43 4 76.24 AAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCA:1 + chr3R 26520443 3' - FB 49 1 69.52 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAGAAGTAAAAAATGTGTCAGGCCGAGGA:1 + chr3L 22978671 3' - 1360 22 1 69.86 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAATTTGCTCTCTCATGCTCAAAAAAAATTGTATAAGACACTTATTCCGAGTA:1 + chr3R 23765478 3' - roo 39 2 58.90 GGCTTATGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAACATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGTACACAAATGTAGGTACATACATTTAAAAATACTTGTTGAATCTATATGTACATGAACATCAAACAATCCACGC:1 + chr2L 12436039 3' + G5 4577 1 52.74 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTTATAATGATTGAATCGACAAGAGCATTCATGAATGAAACGGCAGTTTTGAATTGGCCGAGACTACGAGCAGAGCTGAAAGTCTTTTTCGAC:1 - chr3L 23041994 3' - pogo 23 1 68.49 AAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCTGTAGTCCGGCTGCGCCAGTTACAATCCTGTGGTCGAGGGAGGAAAGGAAAAAAAAGAACTGAGCAGTTTAGGGTATGAAATGATGTTGCAAGCAATTTGCGCAATGGTAGCGAGC:1 - chrX 4843865 3' + accord2 7390 1 78.08 ACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACTTGTGTCTCCAATTTACCAAACTAATTCAAAACATAAGATCTTCGTTTTCAAGTATGAACTTTTGAAAGTGAATAGTAGCCAT:1 - chr3L 4620859 3' - FB 38 1 52.74 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATTCTATGGTTTAGTAGAATTAGCTTAAAAGTGTATTTCGGTTAAAGCTCCTATAATTACTTATATCTGAAGGGC:1 - chr3L 27350454 3' + pogo 2059 1 55.17 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGAAGAAATTGAGACTAGCGTTTTCGATTCCCCATTGAAA:1 + chrX 1061604 3' + 412 412 2 73.29 ATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCCAACAAACTC:1 + chr3R 435934 3' + 1360 2967 1 68.35 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGAAGAAATTGAGACTAGCGTTTTCGATTCCCCATTGAAATCGGGTCTGCTTGGAGCTTTCC:1 + chrX 1061626 3' + 412 7511 2 51.64 TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATGACAGTATTGGGGAACAAATCAGAAGAACAAACAGCAACCGCCCCATCTTGACATCTCCAATAGCAATAGCGATCG:1 + chr3R 7739547 3' + I-element 5319 1 55.00 TACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAGCCACATGAAGCTATATAGTTGGCTTACACCATTGGCTGCTTGATCGCCTTGAT:1 - chr2L 6870663 3' + hopper2 1547 1 57.53 CGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTGGACTTAAAGCCCCGCGAGATTTATACCACCAAAGGGCGCAATATATTCCGATATGATTAAT:1 - chr2L 5257576 3' - blood 167 2 79.76 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGGCCAATTAATTTCGTAAAATTAGTCAATATGCCATTGGATTAATAAGTTCTATTT:1 - chr2L 3890107 3' - jockey 17 1 71.90 CATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCAAAGAGGACAATTTGGTTGGCGTTCGTCTCGAAGTTTTCGAGTCGCCGTTGGATAGGTAATTTTCGCTGTTGGTATTTAATTTAT:1 - chr3R 22496453 3' - opus 7425 2 58.22 ACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAACTTTCTACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCAGCGCTTTCGAATTGGGTATCAGCAAAGGAAGCCACCGAATTGCAGGCTGCCGACTCCTCTG:1 - chr2R 17863038 3' + gypsy4 6649 2 54.81 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTATCCCATTTATAATCTGGAGGACAATTTTCAAAACTTTAATTACACCACAAGCGAACAAAAAACGATTTATTTAAATAAACAATGCAAACAAAATGAAAC:1 - chr3L 14122550 3' - 1360 20 1 69.66 CCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTTTTCGGCAAACAATATATTCCTTCCCCCGTAGAAGTATGCAACATTGGTGAGCGAGCAAGAAGGGTATATTCAAGGGTATGCTCGACCAG:1 - chr3R 22369075 3' - Transib5 2922 1 56.16 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTT:1 + chr2L 14248105 3' - I-element 59 1 57.04 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTTTTGTTAAACAACTGTATTCTAAGGAAGAATATG:1 + chr3L 9909820 3' - Transpac 24 2 67.81 GAATAGTATATTCCAACACGCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAAAAGGCAACTTGTGCTCCCCATTCGAGACGGCGTGTTCCCTCAGTTGCCTTTCATTACTCTGACTTGCAATCTAATTGAACTGA:1 + chr3R 28621512 3' - copia 4866 1 59.15 GCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTTACATTGTACATTTATATAGTTTTTTTGGGCACGAGTTATGGGAAATTGGTAATTGCAGATATGAAAATCATTTATTTTTGGACACACTGCTTCC:1 + chrX 3448966 3' - 1360 3194 1 64.38 ACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAG:1 + chr3R 9160765 3' + copia 189 2 58.90 GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTTTATCTTCGGTGATAAAAGCCGCCTTGTAATTGGGAATAATCTGAAAGTGTAAACATTTAATTATGGGCTTACACTACCATTTTGAATTGAT:1 - chr3L 11776632 3' - mdg3 30 2 60.96 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATTTTCAGCACCTCTTCCTAAGTTTTCCGGGCGTTGCACGTTGCCTATTGCAGCCATTACTCAAGCGACAGCAACGGGTGGTCACAGCCTCCTCCG:1 + chrX 5859028 3' - hobo 14 1 70.68 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACCTTACCAAATGGGATTTAAAACTTTAAAGGATCATGCAAAGTAAGCATATGGAAATGTCAAACTTAAAAGTTCGTAAAGACTAA:1 - chr2L 12349731 3' - F-element 62 1 59.23 ACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTAT:1 + chr2L 16089658 3' - 3S18 5850 2 73.10 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAA:1 - chr3L 18467194 3' - hobo 73 1 68.49 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGTACTGTGTGATATTGAAATATGTGATTATGATAAGAATCATGCTTGAAATATATGTGAATCATCAAGAGTGATATTAAAGATACCACCTGA:1 + chrX 6707891 3' + hopper 1393 1 69.93 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCTGTGCAATATTCGCGGCGTTTCGAGAGAAAGTTGATAATGGTGAAAGATTGATGGGTTTGG:1 - chrX 3996456 3' + roo 9044 1 65.07 GCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTC:1 + chr3R 15022094 3' - Tabor 90 2 76.71 TGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAATCTAGTAGAATGATTTTGGGGCAAGGACTTT:1 - chr2L 9485561 3' + 412 464 2 63.01 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAGTCAAAATATGT:1 - chr3L 6775349 3' - blood 7056 2 53.91 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCCACATACCTCTCCACTGCTCTGCTGTTCATTAGTACCCCATTTTGGTCGGGCGACTCATTCG:1 + chr2L 6184110 3' + pogo 2051 1 57.55 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGGGAAAAACTC:2 + chr3L 7995520 3' - P-element 50 1 51.37 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGACGCACATAGCACTCACACACATTCTAAAAACGATCTCTCCCAAAAATTATTGCCACTGTGTGCGTGTCTTTTATCACAACAAGAGAAACACGCG:1 + chr2R 21076138 3' + P-element 2878 2 76.92 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTTGATTGCCCCACTAAGAGATGTTATGGCTCC:1 - chr2R 5214909 3' - F-element 25 1 71.72 AGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAAAACTTTAAACAATTAAACAAAATATAAACACGTTTGTGCCCTTAAAAG:1 + chr2L 17783476 3' + Idefix 7078 2 67.12 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATTGATTAAATTATTGTACGTAAAATAAAAAAAAGTGTGAGCCGCAGATACATATG:1 - chrX 5150285 3' - roo 66 2 63.70 ACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACACTCGCTTCTGCTCCTCTAAGTGGCATCTGTCGTCTTGTATTTGTGTCACTCACTCACACTCGC:1 + chrX 869356 3' + hobo 2620 1 56.85 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGTTTTAGGCAAGTCCCAGAATGTTCCCCAACAAC:1 + chr2L 15988049 3' - roo 75 2 76.87 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACGCAAAAACGTGCTGAGCAATAATCTAAAACGCAATAGCTAAAGAGAGAGAGGTGCTGTATGTGTGTGTGAAAAGTAACGGTAAATGTGTGTGAGTTCTGCATATGTCTTCTGT:1 - chrX 4701074 3' + P-element 2881 2 78.08 AAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATATATATGTGTCACTATGATGCAAACGTTAAAAAAAACAAATGCTGTACATCGAC:1 + chr3R 5090046 3' + McClintock 6370 2 67.12 TGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTATTTTTTTCTTATATAATAAAATTTTGTTTGGCCTTTTAGTTAACACTTTATTTTGTGTGTGCACCACAGTTGTTTCTTGTTTATGGCCATCGTCGATTTTTGTCAGT:1 + chr3R 30295249 3' - Quasimodo 8 2 56.85 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAGTCCAG:1 + chr3L 7962285 3' - blood 7072 2 60.71 ATATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGCACAGCGAAAAATTAGCGCACCTACTTGAGGACA:1 - chr2R 20488153 3' + 3S18 5763 1 77.40 GCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGTGCAAATACTTCTGACAACTGATAAAGATCTCTTCATTTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTTTTTCAATTTAGTGAGGGATGAAGTAGGTGAGGGACATCCA:1 - chr2R 11139956 3' - Bari1 239 1 78.08 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCGTTTTTGCCTCATTTCAGTGTTTCCAGCATTTCCCTTATAATTACACGCTCC:1 + chr3R 10684825 3' - roo 8732 2 64.83 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATTGATTGCCATGTCAAAGCCAATCCAATCCATTCAGTGTACC:1 + chr3R 24493191 3' - jockey 4710 1 53.52 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATC:1 + chr3R 16181251 3' + roo 9029 1 55.86 CCGAAAAAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTAACGGTAC:1 - 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chr3L 2401765 3' - Tc3 1634 1 74.55 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGAGGAAAATTCGAAAAAATAAAAAATTAGCACTAGTGCTGCAAAGGAGTAAGCAAACCCGCAGCAACAACAAACAAGCCCAA:1 - chr3R 13505426 3' + opus 468 2 63.70 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACTTTTGCGGTCCACAAAGACCGTGTA:1 + chr3R 27794872 3' + roo 9008 2 61.64 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATTCCTAGGAAATTACAAAGAACAGAACTGCTT:1 + chr3R 30635084 3' - roo 8682 2 39.73 AGTACATTCGGGCGCTGCTTCGTGCGGTGTCGGCATTTGGCAAAAAAGTTATAAAAGTCTTATAAATATATTTGAGCATCTCAAAAGTCCACCTACTTTCCTCTTCCTCTCCTCAAGCCACTCAAATCAGCTCAAGAGGCGGTAAG:1 - chrX 13422475 3' + BS 101 1 78.08 ATTTTGTAAAAATATTATAATTTACTTAAATTTGACTATGAGTCGAGCACTTCTTTTTAAGCACTTAATCTCATCGAAGTGCATTAAATTTTTAAATGTTCCTCGTTATCATAACACATTCGAATTTATTGCACTTAAACGTCATA:1 + chr3L 9875470 3' - Juan 433 1 72.60 AATCAAAATAATTAAAATATTTACTTAGTTCAGCAAATATAAAAAATTTTCCATATTTATATAACTGAACAATCAAAATTTAAAAATCGTTCGTTTGTTCGCTTGTATTGTCTCGAATTTATGCTAATGTGTTGACGCTTATATTC:1 - chr3R 17647238 3' + S-element 1456 1 58.22 GAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTATTGGGCTCTGTACCTTTGTGAATTTTTACCTCCGTACCGCTGCCTCTGGC:1 + chr3L 3980114 3' + Tabor 409 2 65.75 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAA:1 + chr2R 10695864 3' + roo 9000 2 69.86 AAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGACAAAAACCTAACACGAAGATGTAAAGGCAAAGCGTAGGACAAGTTCTTCTCTTTTCGTTAAAGAGGA:1 + chrX 7375244 3' + Bica 226 1 56.85 ATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAACTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTATGATAGCAAAAA:1 + chrX 22913193 3' - gypsy7 5274 2 71.43 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAGTAGGCCGCATCATTAAATAT:1 - chr3L 22978524 3' + 1360 3359 1 58.06 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACACAAAATTAAATTCTACATTAAGATAACACACAGAAATATCGAATTAATTTTATATAATGTTATTCTCTAGTAACCAAACAGTTGCCAGAAATTATTCAAAACTAATTTTTTA:1 + chr2L 8956893 3' + pogo 2095 1 71.92 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACCTGACGGCAGATTCAGATACACCTTTCAACTTTAAACCATTGGCAACGTGCGTAAACCAATGGCAATGGACCA:1 + chr2R 12240197 3' - 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chr3R 28627595 3' + copia 5077 2 54.96 GGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAAAATATATTCTTGATCACATCAGAATAGATTAGTCCAACTAACTTTGAACCAAAATTCGATGCATTCCTTTTAGGTTACAATGTTATTGGTTAAGTAAGGCCTATG:1 + chr2L 13154351 3' + Juan 4206 1 60.27 ATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATCATCTCAAGGGGGCCTCTCCATTCATCTT:1 + chr3R 13612872 3' + 412 404 2 75.17 CCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAGCCACCGGATAATTGTGTCCGATCTTCAGTTTGCCAAACGTTCGACAGACGATCCCAACTCGCATTCTACTTAGCGCTACGAAGGGGGCAAATTA:1 - chr3R 11057522 3' - flea 21 2 69.66 GTAGATTCACTAGAAACTATATATCCCTTATCTTAAATCATAGTAGATGTAACTATGAGATGCAAGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATATACTTCAGTATGCTCATTGTCTCAAGAAGGATAAGAGCTTTATTATC:1 - chrX 14403285 3' + Cr1a 4116 1 71.23 TTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTGACAACTGACAAACGTGAATCACATATAAAGACGCGAAATAG:1 + chr2R 954551 3' - Quasimodo 39 2 56.92 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACA:1 - chrX 12191562 3' + pogo 2064 1 67.37 GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGTTGAATTTTTTGTCTCGTGATATT:1 + chr3R 4528399 3' - F-element 93 1 76.43 GTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAATGTTGGAGACCCATAGCTGGATAAATCGCAGCG:1 - chr2R 25227465 3' + pogo 1649 1 77.40 ATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAATAACGTTTTTGGCAAATTGTTGCCATTTTAAAATATGAAACGAGCCAGGCATGCCAAGGGAAAATATACTATAAAACGTTTGTCCAGAAAATACAGAGATA:1 - chr2R 21414349 3' + BS 5067 1 69.18 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCGTAGTGCAGTGCAGTGGGGAAATGGGAAATGGGAAAAGGGAAAACTGAGCGAAGAGGATGAGTCTCGGGCTGGCT:1 + chr3R 28172546 3' + hopper 1393 1 61.61 GCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTACTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTTGCGATGTCTGTGATTTTTTCGACGTCTCACTTGTTAATTGCTTTATTATTGGCCAATACGATTTTGCTTACA:1 + chr2L 16381457 3' - Porto1 4299 1 56.85 AAGAAAAAAAAAATCAATATAAAAGTCTATAAATTTAACCACAAATTTAAAACAAATGGTCGATTGGGTATACGTACGATATCTCTGTCAAATTTAATTTGTTTGAATCGGTTTGAACTTCGAATGCGGATAGTAAACTGTTTGG:1 + chr3L 15149038 3' + invader2 297 1 67.59 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGGCCTACAGCCTTGTTGTCCATAAAAACGCACCCATATGCACCTCTTCCGCTC:1 - chr2L 10089703 3' - opus 26 4 65.47 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTT:1 - chr2L 17210262 3' + jockey 4933 1 59.31 ATATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACACA:1 - chrX 21852454 3' + gtwin 7321 2 67.14 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATAGGTGGCATATATAGGTTTATTACAGCTCGCTCTCCATTTTTTTTTTGGGAGAT:1 + chr2L 9237561 3' + blood 7308 2 76.52 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGC:1 - chr2R 11763610 3' - Tabor 66 2 72.36 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAAC:1 + chr2R 13644526 3' - Burdock 50 2 54.11 CGATTTCTAATTTGATTTTCAGGTGTCTGTGTATGTTTTCGTTCCTGGTTTTTGGAGGTTGTTTATTGGCGTGGGAGGTGCCATTTGTAAGAATTTTTTTTGTTGTTTCTTCTTGTAAAGGTATAACACACAGATTATTAGAAGGC:1 - chr2L 22974958 3' - Doc 4424 1 69.18 AAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAAGCAATATTTTGCTGAGCG:1 + chr2L 3466052 3' - P-element 94 1 17.27 AAATGAAGATAAAATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATCCAAAGTTAATTAGTTTCAGACTCTTGAAAGTTTTTCATAATTTTCGCT:1 - chr3R 11113166 3' + mdg1 7403 2 50.00 TATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGTCTAATACCAGGCGC:2 - chr3R 17605584 3' + Tabor 7311 2 76.03 AGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCTTTTTTAAATACTTGATATGCCTCTTGGGCGTGGGAATTAATCCAGTACGTGTTGAGGCACTCATAGCTACTATTAAAATAAGCTTTAAATATCAAACTAAACTACAAAAGCCG:1 + chr3L 15612856 3' + roo 401 1 76.55 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAATATATGTTCTTGCTTTTGGCCAACGAAACAGTTATCTTTCCGTGCAGTG:1 + chr2R 8978542 3' + I-element 5284 1 65.07 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTGGTCAATGCGGTGGCCCCAGAAATAACCAGCAATTTGGAGTTTAGCAAAGTAAAAATATCACAGCTTCTTAATACAAACACTATAATATCTTACGTTTTTGTCA:1 - chr2R 12691737 3' - 412 7071 2 73.29 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTA:1 + chr2L 17250829 3' + opus 7466 2 49.23 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTCATATTGTAATAAATGAAGGAATACCACAAA:1 + chr3R 16913473 3' - pogo 48 1 56.16 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGACGACTGCTTGCA:1 - chr2R 12787809 3' + 297 333 2 65.52 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATTTTGGATAAGGTTATAAAAAGAATTATGCAATTATTTTCAAAGAAAGTTCTTTAAAT:1 - chr3L 15327548 3' - blood 44 2 56.25 ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCGAACAACCAGCGAATCGCCGCGAAAAA:1 - chr2R 11763572 3' - Tabor 44 2 53.24 ATCGATAGAAATTTATAAGACTAAGATCCTTTTACTCTACGAGTACCAGGTATAATAAAAAAATCGAAATCACTTTATTGATAACCTTGATAACGGCATTGAAATGAAATATATATATAAAAAGAACTAGAAATCTCCCTTTTAAT:1 - chr3L 25255412 3' - INE-1 300 1 65.75 ATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGCAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCTC:1 - chr2L 17210287 3' + jockey 4925 1 71.88 GATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTAAATTCCCTTGTAGTTCTACAATTAAATTATTCAAAGGAAAGCATACACTAATTAATAATTGTTTAAATTTACTGTGACATTTTATTACATTTGA:1 - chr2R 7727092 3' - BS 4688 1 60.27 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCGCACCAACACAAATGCCCATGCACACACGCACACACACACCGTGACGCATTTTTGCACAAATACAATCG:1 - chr2L 8366505 3' + 1360 3336 1 52.74 AAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCA:1 + chr3R 8709832 3' + jockey 4910 1 75.34 CAAAGCACCTCTGATTTAGCTGACTTTGCGCGCTGTTTGGTATTCGGCTGTATGTAAGAGTTCCAAATGCCGGGGCGGGGACTGTTTCGGGGGAGTGGCGG:1 + chrX 22509493 3' - transib4 165 1 74.26 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAACACACAC:1 - 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chr2L 3294092 3' + hopper 1413 2 77.06 TACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCCTGAGTGTGCCACATCCCGCTCCTGCACCCGTTTTTGCTCCC:1 - chrX 10215060 3' + F-element 4417 1 71.23 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGGATAGTGCATGGTGAATATGGTGATGAAATGTGCATGAAATTACATTCGAACAATCGATGGAGTGTACTTTAAAATGCCCATTGATAC:1 + chrX 3996619 3' - roo 8678 2 71.09 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAACATCGTGCTCC:1 + chr2R 558206 3' + copia 244 1 72.50 AATTCAAAAAAAAAAGAAAAAAAACCACCGAAAACATAGCACAATTACACTTGGCTTGGCGATCGATTCAAATGCTTGAGATCCCGGAGACTATGGCCAGTG:1 - chr2R 16575614 3' + Doc 4700 2 80.39 CTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCC:1 - chr2L 17210287 3' + jockey 4907 1 76.71 ACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTTTCAATCCCTTAATAAGGCGCTCCTAGCAGGTCCTGTCATACAACCTAAGCTGACATTTTACATTTTAATGAAATTTTGATCATTTGCAGCTGCTC:1 + chr3L 24149998 3' - hopper2 1201 2 68.49 CGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTTTATATTATCATAGCTTATTATGCATAGCTTAAAATCGACGAAAC:1 - chr3R 12929203 3' - invader4 2830 2 66.21 AACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCT:1 + chr3R 9160759 3' + copia 5057 2 61.70 GGCGTTGGCGTGGTGTCCAGCGATGAGACTATAATTGACGGCGGCGACGAAAGTTGGTTACTATCATCCGACGAGATAGATAGTACTGTTTGCCTATTCATAATGCTGTCTCTGCACAATGAAGTGCAACAATATGAAACATAAAC:1 + chr3R 25570436 3' - TART-C 10694 1 61.64 CTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAATCTAGTAGAATGATTTTGGGGCAAGGACTTTAATTTTG:1 - chr2L 9485554 3' + 412 7526 2 68.75 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCAAGAAA:1 + chr2R 19553296 3' + mdg1 7436 2 60.80 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTGATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTG:2 - chr2R 12886107 3' - Ivk 46 1 52.05 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCGATGGGGACGCTC:1 - chr2R 11133541 3' + roo 9028 1 55.38 TCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACAGAGGGAAAAATAAAAGATTGCTATTTTAGGA:1 - chr3R 10472718 3' - mdg1 89 2 76.71 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCACGCCGACAAACGCTTCGTGCAACTTCGTGCAGCTTCGTGCCACTC:2 - chrX 14826113 3' + P-element 2816 1 34.72 AAAAAAAAAAATAATGAAATATATTTTTCCGTTCTGGAGTTATAAGCCACAAAAAATAAACCCCATTGCGAAAATTATCTTAATATCTCTCTATTTGTAAAATTAGTTATACATTCTCAGCTACGATCACGATCATACTATTCATT:1 + chr2L 22108199 3' + transib2 2645 1 56.16 CCTCATTTCGGGCGCTTTTGCAGCAAGTGCCCAATAACAAAAAGAACCGTTCCATTGAGAGAGTACAAATTTCTTGCTCAGATAGCCAACATATTGTACTTATTATTCATGACTCTCTCAAGCTTCTCAACTCTCTAGCTTCTATA:1 + chr3L 27985863 3' - Tc1 185 1 76.03 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATGTGTACATAAATTCATATTGTCTAGTTAGCA:1 - chr3R 6515340 3' - jockey 97 1 80.82 GAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTGATTTTCTTGTGTTTATAGCTTCAGCTCG:2 - chr3L 96446 3' + roo 400 1 79.45 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAATTCTTTAGTTGTCAACTAGTAATCAACACATTTAAATGCACTAATTGCACAAAAATTATTTACTGGCAACTGTCCATTAATCTGAAGTGTAACTGCTCAG:1 + chr3R 5453760 3' - 412 7074 2 71.23 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACGGAGGCCTCAAAATGTCGCAGATACAAAGGCAAAATCAGAGCATTATCATTC:1 + chr3R 5208257 3' - hopper 32 1 62.07 ATTGTATAGCAGGGGCCAAATTTCACCAAATTTCACCGCAAACTTGCGACCCTCGAGGAAGGTCTTCAGAAACCGTACTTCAAGGCTAGGGCAGATTTCTTCTGATGACGCCGAGACAGCTTGAGTGGTGCAAGGTGCGGCACCTG:1 + chr3R 17783833 3' - G7 495 1 77.40 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCTGTTAAATGCTCTAATGATGGGTATTAGGCCAGATTAAGTGCCACTCATAAGTGCCG:1 - chr3L 16562810 3' + roo 407 1 76.80 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAGACATATGTATGTATGTATGTATGTATGTAGCTTTGTGCTCCTCTCTTTCCTCTGTTGTTTCATGAAATTCTTTGGGGATAAACTAAA:1 + chrX 22858521 3' + copia 255 1 52.74 GCCGACTATCAGATACCTGTTACTATAAATAAGTAAATATAAATTTTATTTTATACCCGTTATAACTAGTGGGTAATTTTACATGTACACGTTTTCTGCTTGTTACTGCTTTAAAACTGCTTGATGGCGCT:1 - chr2R 13043255 3' - INE-1 552 1 57.25 GTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTACATTATAAATTTGATTAAAACCAAAGAATTCT:1 + chr3L 18467255 3' + hobo 2880 1 71.43 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATCATCTATCCACTTTAAAACATCTTTATTAAATATTCAAAAAGAAGAAAAAACTGTGTG:1 - chrX 8012236 3' + 297 6916 2 60.96 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCTGTGCAATATTCGCGGCGTTTCGAGAGAAAGTTGATAATGGTGAAAGTTTGATGG:2 - chrX 3996462 3' + roo 9038 1 62.33 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTCTTAGATTTGCTTATTAAGGTGGTATAGTTTTCGCATTTCGCAGGCTTTTTATTTGTTTTTTATTCTCTCCCAAAGTCTGTGAATAACAGCAAAT:1 - chr2L 8956692 3' - pogo 17 1 66.67 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGCTTTGTTTACCAGGC:1 - chr3R 5208124 3' + hopper 1382 1 55.74 CTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAACGAGGGTATTTATTACTTCTGCTCTTTAGCCTTAAGTTCACTTCTCTCCAGTTTGTTATTGAATTTTTTG:1 - chr3L 15281662 3' - hopper 391 1 54.11 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACA:1 + chr3L 14551063 3' + P-element 2875 1 61.11 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCTCCTTTTATTTTGGCGTGAAAACTCTTTGAGTATTCACTG:1 + chr2L 13927792 3' - roo 8744 2 71.72 GGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAGGTGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAATTTTAGAACTTGGCACGAAACATGTTTCTATGTATATTTTGTGTTGTGCACATATAAACACGTAGCATGTACTT:1 + chrX 12574585 3' + 1360 46 1 52.41 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACTTTCTCTCT:1 - chrX 8891759 3' + P-element 2851 1 48.18 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGGGAAAAACTCTAATAAATGTGCTTGTGATACTCTGC:1 + chr3L 7995546 3' - P-element 24 1 69.18 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTCAATCAAAACATTAAGGATAGTTTTTATTTAGCTGCTGTTCTGCGTGTTGTAATTTTACTATCCACATAATTAACAGCAGTGTTTTGGCAA:1 + chr2L 16399444 3' - roo 8693 2 59.59 CCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATGAAGATAAAATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTTCA:1 - chr3R 11113196 3' + mdg1 335 2 69.86 AAAAAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGATTAGTGACTTTTGTTAACG:1 - chr3L 23773895 3' + Transib5 2856 1 67.46 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGGGTTCAAGAAAA:1 + chr3R 17656464 3' - mdg3 5323 2 64.38 CATGCCACCTACGGACCGTAGGTGGTATCTTTAAAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAACTAATAAACTATATACTAATAATACTTGCAGGATCTTTTGGATGCGGACAATCAGTTCCGGGACGATGATGTCA:1 - chr3R 10321540 3' + Rt1b 5087 1 52.74 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACC:2 + chr3R 16181230 3' + roo 343 2 60.96 GTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATGTCTTCATAGCACTCATACATACAAGCTAATTTAGTTT:1 + chr3L 25107153 3' + F-element 4369 1 72.88 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATGACAGTATTGGGGAACAAATCAGAAGAACAAACAGCAACCGCCCCATC:1 + chr3R 7739519 3' + I-element 5285 1 67.12 AGAAGGAAACAAAAAATATTTAAGAATTTACTCATGCACGGGCAAGAATTATTTCATATAATTATTTACACAGGCGGAGGTAGGAATTTTAAAATTAGAGAATAAAACCGAAATCAATATACACTAGATGTTTTAACCACATTTTG:1 + chr3L 21576941 3' - Juan 75 1 76.03 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCG:1 + chrX 12525985 3' - roo 76 2 71.33 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACACGCGGAAATAAAAACCGAAGGCAAATCATAAGCTGTTTTTTTTTATGTTTTAGAAACAATATTCACAGGGA:1 - chr2L 12319228 3' + copia 208 2 50.68 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCT:1 - chrX 3996518 3' + roo 331 2 78.95 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCATAGGCCACAAATT:1 - chr3L 17890707 3' - 412 33 2 60.74 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCTAAAAAGCATACTTTATTCATTTACGATCCTAAATATTTATTAC:1 - chr3R 23859838 3' - jockey 4837 1 70.55 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAGATGTTATTATCTTTCTATTTTCCTGAATAACGTTTTGGGAGTATTAATTTATTTGTGCGTCCACAGGCACATTCTCTAGAAATAATCG:1 + chr3R 4569632 3' - 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chr3R 13582188 3' - BS 5036 1 56.16 ATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACATTGAAGAACATAAATAATTTGTTACACTTATAAGCTCTACTAATTGTTTAATAAAAA:1 + chr3L 25634719 3' + R1A1-element 5240 1 60.96 GGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGA:1 + chr3R 11750249 3' - Tabor 85 2 74.66 AAAAGAATGTTAAATTTTAAGCTTAGAAAAGAAGGAAAAACATAAAAGGACATTAAAAAAACTCTTGAATGTGCTGCCAAAATGGTATCCAATACCATTAAATATGAAGGCAGCCCGGACCCCAGTCAACGGCCAAGAGAGGTCTC:1 - chr2R 25091476 3' + HB 381 1 78.08 AGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATA:1 - chr3L 24934268 3' - HMS-Beagle2 32 2 63.70 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCACATTTCATTCCGGAGCTCTTTGCCAACACT:1 - chr3L 17133832 3' - jockey 4779 1 78.08 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCA:1 + chr3R 10472779 3' + mdg1 348 2 65.75 CTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGGCCAGGGATTTAAGTTCGACAAGTAAGTGATATGCAACGTTTACTGGCCAAG:1 + chrX 3559414 3' + opus 12 2 57.38 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCACGCCGACAAACGCTTCGTGCAACTTCGTGCAGCTTCGTGC:1 - chrX 14826118 3' + P-element 2820 1 33.33 GGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAATACTCCACCGTATTAGAGATTATCTCGCCGGGTTGCTCCATTAGATGTTGGACATGGCGTTGATACTCC:1 - chrX 6553219 3' - hobo 2705 1 52.08 ATGCCCGCCTCGCATCACGCTGACCCTTGCACATCGCTTTCGCTAAAGCTAAATTACATGTTTGGTACTTAAATTGCACGTTATCAGATACTATGACTTACGGCGTACCAAATGTCGTTTTTTTTCGCATCAGCACCTACCTAAAA:1 - chr3L 14175840 3' - gypsy10 5780 2 76.71 GCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATGTGCATAAAT:1 - chr3L 17707822 3' - Doc 76 1 63.01 GAGTAACTGGTATCTGATAGTCGGGGAAGTGACGTATTTGGGAGGTCCAAACCGGCACCTTCAATTATTTCTAAGATATTAAATACCTAAATATTCCATTGGCGCAGGCGGTAGGATACCGAAAAG:1 + chr2R 4134135 3' + INE-1 549 1 60.32 ATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAATTAAGGCGCCTCGCAAAAGGACGACACTTCCAGATGTCCACCTCGGTGGCCAGGCACTTGCG:1 - chr2R 21718618 3' - Stalker 140 4 57.53 TCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCC:1 + chr3R 11547764 3' - G2 307 1 55.45 TCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAA:1 + chr2R 4313036 3' + gypsy 7371 2 65.07 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCA:1 - chr3R 22100502 3' - 412 7108 2 52.74 GCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTCTCTATATGACTGCAAGAAAAAATCTAACGAACTAACACAACTTTATTTATAA:1 - chr2L 11574799 3' - Max-element 8280 2 53.79 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCA:1 + chr2L 686086 3' + roo 9038 1 54.62 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATG:1 + chr3L 19350042 3' - jockey 26 1 73.57 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGTTGAATGATTATAAAAAGTTACGAATATATTAAGACTGTAATTGATGGAATGAACCTTTGCATTTATTGATTGTTTCCT:1 + chr2R 1533832 3' - 412 43 2 56.16 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTCCGGAACAGCTCGCTTATCGCC:1 - chr3R 18815917 3' + hobo 2909 1 73.33 AACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGACACGGACCAAACACGCATTTGCCATGC:1 - chr3R 20486335 3' + accord 7337 2 57.72 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTAC:1 - chr3L 22052757 3' + mdg1 370 2 59.23 CTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGAGTAAAATTGTGGACGTGGCCGTTTTGTAGGTGAAAGGAAGGGCGTGGC:1 - chr2L 21580871 3' - INE-1 530 1 50.37 AATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCG:1 + chr2R 15829604 3' + invader4 3076 2 66.67 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAGGTCATGCGAG:1 - chr2R 16403417 3' + copia 183 2 67.81 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCTCCTTTTATTTTGGCGTGAAAACTCTTTGAGTATTCACTGTCCGAGAAGCAAAGTTTTTGGTAAAATTTGTTCACGT:1 + chr2L 13927829 3' - roo 8708 2 56.16 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTTACAGTTCGATACTCGTATTGTTGCTTCAGAACGCAAATGGCACCTTTCTCGTTTGGTTTT:1 - chr3R 27768801 3' - 297 6636 2 56.85 TAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTACTAGTCTCCTGTGTGTTTT:1 - chr2R 22722997 3' - 3S18 35 2 60.00 GTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGG:1 - chr2R 8641531 3' + diver 167 2 72.07 GCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAG:1 + chrX 21667940 3' - gypsy2 57 2 69.34 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATTTAAACGGGTACATGTGAATGGATGGTTGACTGAAGAGACCCATTCCTTGGTTCCACTGGTTAACGGGGC:1 - chrX 12525889 3' + roo 9042 1 60.16 AATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGGCATATTTGCATACATTCTACTACTTCATAATGCCCAAAACGCATTGTATTACAGTCGAACTTTCCTAAAA:1 + chr2R 22723131 3' + 3S18 288 2 51.37 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAATACACGTTTTTATAGACTTATATGGAGTGATAAAAGCTGCAGTCTCCAGGGGCCTTTAGTTGTCTGCAAACATTAGATAC:1 + chr3R 27478604 3' + hobo 2922 1 69.35 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTA:1 - chr3R 9160662 3' - copia 50 2 51.39 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCGCTGCGCATTTAAGGCAAACGTTTGCTTAAAGAGTTTCGCAGTTTCTACTTGTTGAATGGGAACTCAAAACGCAGCTTAAATTAT:1 + chr3R 23295830 3' + hopper 1398 1 58.90 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTTCAGCATGAGAACTTCTTAGGTTGCATGTAAACAG:1 + chr2L 4179463 3' - jockey 95 1 79.45 TGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATT:1 - chr3L 27415221 3' + transib2 2757 1 64.83 GTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGGCGGGAGATTGAGTTATAGACGTGTCCTGTAGTTTAACCGTTGGAAGAGTTTTGGGCTTCTCCTCAGGGAGAAATTGCAGTTCTG:1 - chr3L 27363211 3' - R1A1-element 47 1 60.45 ACCGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTTTTAAAGTTGAAGTTTTAAACAGCTGATTGAGAGAATGCAAGGAAAGGCGCCCGAGAAATTCACATAGGAATAAGCGCGCGGCAAAGGAGGAAAAATCAATAATAAATAAACAC:1 - chrX 8756661 3' + transib2 125 1 53.42 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCACGCCGACAAACGCTTCGTGCAACTTCGTGCAGCTTCGTGCCACTCGGTTCGCAGTGGTTCGCTA:1 - chrX 14826094 3' + P-element 2870 1 63.30 GAGGGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTAAAAATTAAAATTATTATTTAAAATTACTACCCTAATATGTACCAAGCCGCTCCAGATAGTTTACGCAAGGTTTGCGACTGCGACACACGAATTTTGTTGAG:1 + chr3L 27132834 3' + 1360 2995 1 45.14 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTTATTAGCGGCAATCGAGTTTGTATTCTCTTT:1 + chr2L 1558720 3' + 412 7514 2 53.04 TAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTTAATGTCTATTGGCAACACGCTTTTATGCCATTGTGTAACCG:1 - chr3L 4862897 3' + jockey 4698 1 69.12 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGC:1 - chr3L 11336352 3' - blood 7075 2 66.67 TTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCACTCCATTCCGAGCCATTTTCCCTCGCATGTTAGCCAGCCATTTTTCCCGCCAC:1 + chr3R 20486419 3' - accord 64 2 65.71 CTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAATTTGTGGGAATCTTTT:1 + chr2R 5237933 3' - Doc 239 1 59.59 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACTTTCTCTCTCTGAGCAGTCACTGA:1 - chrX 8891744 3' + P-element 2851 1 54.40 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTCTTGATCAGGATCAATAGCTGAGTCGATCTGACCTGTTTCCGTTTGAACGTCGATATCTCAGGAACTATAAAGCTTAACGTTCTGGCTTTTATATGTATTG:1 + chr2L 20413744 3' - roo 8680 2 72.03 CTTCGACGAGGGAATGCCGGTCGCTCAAAAGACCGTGTTTGGGTGGATCGTGTCCGGTGCCTGCAGCTTGCCGTAGGATGCTATTTTAATTACAGCCATTAGCCTATGGCCCAAAAATTGATCCTTAATGGCCATATACATATGTA:1 + chr2R 13325056 3' + GATE 8120 1 56.85 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGCGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGCATGGTTATTTCCCCCTGTCTACAATTGATTGGCAGTCGCGTTGAGTGGCGACTCCATAT:1 + chr2L 12414993 3' + pogo 2063 1 52.80 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGAAATACCCAAAACTCCATCCAGAATCGAAGAGTATGTGGGCAGAAGGAGCA:1 + chrX 8012343 3' - 297 40 2 62.90 CCATGACCACTCTAACGTCCACAAATTTCAAACCCCTTATTAAACATCTAGCTACTTTTGTTGATGGATTTTCGCCGCGGGACCAATAAAATATGGTCAATTGCAAAGTGAAAAAAAAA:1 - chr2R 8544804 3' + INE-1 214 1 57.14 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGGGCAGCCTACTACAGTTTTTCACATTTTCGTGCCACACGCCATTTTCATGGCATAGCCCCCCCTGCTGGCCGAAAAACGTTG:1 + chr2L 7559806 3' - mdg3 40 2 48.84 AGAGTTTTGGGCTTACACGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATACTGTCATTTAAATTCCAAGCAAATGCAGAGGATAACTCAACAAAGAATGGCTTAGATCGAAACAG:1 - chr3R 7739433 3' - I-element 56 1 58.90 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAA:1 - chr2R 11489169 3' + mdg1 7404 2 56.85 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTGCATATCATTTCGACCAAAGATGTCTTATTA:1 + chr2R 8158799 3' + Juan 4129 1 75.34 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATT:1 + chr3R 9352121 3' - Tirant 8119 2 74.17 ATATAAACACATACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAAGAGGTATGATACCCCCCCTTTGAGATGTAGGTACCTTTCAGTAAATGTTTCTCGCAGTGCACTTCGTTGGCAG:1 + chr3L 4008769 3' + hopper2 1187 2 57.89 ACTTAAAACGGACTTGTGCTCTTAATTGGAGTTCATCATTTATGAACTTGTACTACAGTACTATATTCTTAGAAAAATATTTGACAGATAGATTCTGACGAACGATATCTTGGAAACTATAAGGGATTACCTTGCAAGTACAATAT:1 + chr2R 24453415 3' + 412 472 2 59.59 ATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAACCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGTTCTGTCAACTTAATCACACAAATTATGCAGAGCACAGCTC:1 - chr3L 9176156 3' + Idefix 7092 2 71.33 ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGTTTATGTATGTATATGGCTATATAGACTACAATCCCAAACAGAATCGGAGACATACAAATGGGTGGGCTTTGGAATATG:1 - chrX 16828912 3' - Quasimodo 33 2 53.42 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTG:1 + chr3L 10144727 3' - blood 84 2 81.82 AAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAAAATAGAAGGGTTTGCCCTGTTCGCGCAGTGTTAGA:1 + chr3R 9266384 3' - roo 8851 2 75.00 TATTATGTTCGTATATACTACAATGCTCATATTTAATAATTTTTTCAATTGATATGTATATTATATTTCCAGGATAACGACAAACTCACATCCCTGCCCGGTCGAATCTGCAATTTTCCACGCGAAACGTGAATGCGAATGTCAAT:1 + chr3L 18729996 3' - mdg1 1 2 81.51 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTCCATTCCCCCATCCTCCCTTCCACTCACTC:1 + chrX 7515755 3' + roo 9029 1 54.93 GCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCACAACTTGGCCACTAGCCACGCCCCAGCCCCCTGACCGCCGCCCTTTGACCTCCTGC:1 - chrX 20087825 3' + Ivk 4960 1 60.00 CTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATT:1 - chr2R 19554937 3' - pogo 69 1 66.43 TATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTTTGGAAGCTGTCTATAAATATAAAATACTAAGAGTACACGGTGTATAAATATAAAATACTAGCTAACACTTATAT:1 - chr2R 1264081 3' - accord2 7520 1 54.11 GTTCGCTATAGCGCTCTCCGCTCTTGAACAAAAATTCGAGAGAGCCAGGGGAGCTACCTCTAGAGCCACCCCGAAAAAATCGTGTGGCGTTACACATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAATAC:1 + chr2R 19502070 3' - 1360 118 1 77.60 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAAATCGGTGGTTTATGTATATTTTTTTCTCTGTATATAACTATTCTGAGTATATAATCATTTTATTTGTGGTACCAAAGAA:1 - chr3L 2878406 3' - 412 7091 2 43.84 GGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCATTGCACAGAGACTTGTTTGGAATGCCTGACAACAT:1 + chr3R 13176462 3' - Burdock 6171 2 57.04 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATTTAATGATCATTTAATGATCTGCCCGACAGGGGCTTCGGATAGGATGAGATGAGTACGTATGGGTA:1 + chr3L 15100062 3' + copia 234 1 54.79 TTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCTTGTGGTCCAGGCTGAGGGGAGAGCCAGCGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCATTGAGTTGAGGCCTCATCTGCTTTCGTATCTTTTAAAATGGAGAGAATAAATTAAGACTCAAA:1 + chr4 478881 3' - Tc3 235 1 73.94 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACGTC:1 - chr3R 21001829 3' + 412 7501 2 75.00 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACCAAAATATAAGTAACGAAAT:1 - chr3L 22861712 3' + S-element 1712 2 77.40 TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCTCTATTATATGTGTAACATAGAAATATTGCGATTTTGGTAATTTTCTTAATTCCTAAAGCCGGGATTACG:1 + chr3R 11749747 3' + Tabor 7272 2 52.74 AACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACA:1 - chr3L 27415229 3' + transib2 2748 1 70.55 ATAGTAACAAAGGTCCTCAACAACGATCGGTATATGGTGGAAGATCTGCCAGACCACAATGTTACTCAGCTTGCTTTAATTAAATGTTTAGTAAATTACTATTCAAAACGAGTCACACAACTGGTCTCCTATAGAATTTCACTGTG:1 - chr2R 14013809 3' + Bica 4747 1 52.05 ACACACACACATACATACCCATATCTATGTATACATATCTACTCCTCCTGTTTTAAAAGGCTTGTCAATTCCCATTCGCA:1 + chr2R 16064399 3' + Quasimodo 43 2 40.00 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAATAGATACAGAATGTGTATCCGCATCTGCAGCTGTACCAGCAAAATGTATCTGCATCTGCAAATGGATCTGTATCTGTATTT:1 - chr3L 18171564 3' - roo 8696 2 62.32 CCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAACACTTCCCGGATATTGTATTGTCCTGGCCCATCCCAGTGGATGTCTGCTGG:1 - chrX 4305787 3' + gypsy12 10150 2 56.20 CTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCG:1 - chr2R 11763598 3' - Tabor 6885 2 60.00 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCAACTCGTTACTCAAAGCAAAACGAAGGACTTGCCCGG:1 + chr2L 686122 3' + roo 9059 1 75.37 AAGAAGAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTCAAGATCAAACAACACCACACAGCCACACTAGCTTCCGGTAGCACCGCCATCAGCATCAACTACGAATGTG:1 + chr3L 278680 3' - diver2 135 2 51.37 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCTCATATTTAATAATTTTTTCAATTGATATGTATATTATATTTCCAGGATAACGACAAACTCACATCCCTGCCCGGTCGAATCTGCAATTTTCCACGCGAAACGTGA:1 + chr3L 18729982 3' - mdg1 7051 2 72.92 ACAAAAGCCGAATGGTACATTATAAACGAAGATATACATAATGACTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAAAATTATGGCGCTTTGGCAAAGTCGAGCAAAGGGTGGCGCACTTCACTTATGGATTTGGAAGAG:1 - chr3L 23436280 3' + Porto1 4359 1 52.63 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAGTAGGCCGCATCATTAAATATGTAT:1 - chr3L 22978520 3' + 1360 3341 1 52.74 GACCAACGTAAAGTCCCGAAATTGTCAATATTTTCTAAAAAGTGAGTTTGGTTAAGTTAATTAGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATCAAATTTAGGTATGTGCTTGTGCGCGAGTGTGTGTGATTGTG:1 + chrX 11270094 3' + HB 238 1 72.26 TAATAACGGTGCCAGGACTTGGTGGACTCCATGCCAGGACGATGCGCGGCTGTCATTGCCAACAAAAGGTCACGCAACCAAATATTAATTGCAGTTTACTCTTGTGTTTTTACTCTTGTATTTATTTCATATTCAATTGCTCTATT:1 - chr2L 11355868 3' + Tc1 1268 1 60.27 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAA:1 + chr3R 9352100 3' - Tirant 8136 2 58.62 GAATGTGTGTGTGTGTGTGTGGGATATCCTTAATGCTTGCCAGTTCGCGAGTTGACGGAAATGCGTCTTGGCATTAAATAGATGCAGAAACCTAAAAGCCTGCCACCGTTTGTTTTTTTTTTTGACATTTAATTCATCTGCTGTC:1 + chr2R 19215401 3' - accord 185 2 42.76 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCATTGTTGTTGCTGCCGAGCGGAATTGTGTGCGGGTATATAGGTGGCAC:1 - chr2L 14095561 3' + pogo 2053 1 58.78 GGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGC:1 + chr3R 22516020 3' - jockey 4625 1 73.39 ATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGC:1 + chr3R 10030776 3' - BS 5080 1 64.38 CAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTGATCTATATTGCATTAAACTCTCTTTTTAAACATATTCTATTGTTTCGCCACAAAAAAAAAAGGTCCATGCCATTTTTTCTTTCAG:1 - chr3R 30295049 3' + Quasimodo 7339 2 41.78 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCATTGGCCGCCGCTGCCATTTTGTTCTAGAGCTCTTG:1 + chr2R 6842886 3' + roo 9037 1 61.64 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTCAGTTAAGCTTTCTTTTATCTTATCGGTTAATGTCTGCCTTTAAGTCGTAAATTATATGCACTTTTGCAGGGGAAACTAATATTGCAAAGTGTATGTTCTTGCAAA:1 + chr3L 18659037 3' - roo 8680 2 73.29 CAAAAGAAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTTATTAGCGGCAATCGAGTTTGTAT:1 + chr2L 1558713 3' + Stalker4 499 1 65.07 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTACGACTTTTAGGGGCAGTCCGCCCCGCCCATCTCCAACCATTCCCCCCAACCCTCGCAACCAGAAAGTGCGCTGGAAAATTTTT:1 + chr2R 11057384 3' + pogo 2076 1 58.57 TAAGTAAACAATAAGTTACAAACAAATATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATATATTCTTATATATATTCTTAGTGCCGAACTACACCTGGTCTTCCAGTGCTGGGCATGAATATCGCATAATTATATTTAT:1 + chr3L 8397871 3' + Tc1-2 1575 1 49.31 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCATGAGACATGTAAAAGTTAGTCCTACAAGTCGATTCCTTTATATCACC:1 + chr2R 5737216 3' + 1360 3336 1 58.45 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATATCGTTGCATATAGTTGAATCGACTTCAACACACGAAAGCCGATATTAAAATA:1 + chr3R 25904259 3' - 412 66 2 64.38 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAATTTCACAGATTAATGCGCACACATTTCA:1 - chr2R 17890833 3' + Tabor 462 2 66.90 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGCAAA:1 - chr2L 17136154 3' - hobo 73 1 65.75 GTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGATGATCAAAAAAACTTAAATTTGATTTATTCTTTTCCCTGTTTATTAGTTTTACATTTAAAAGTATTCTTTTATATATCGGCCTCTTAATCCTTGCAGACGAACATGCCTTGAAGATCAG:1 + chr3R 17546769 3' + blood 7388 2 69.18 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATACTTGCCCTTTCATTTATTTGAATTATAGAATAGAAAATAGCTAAAAGCACGAACAATGC:1 + chrX 12139076 3' - roo 8684 2 73.97 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACC:1 + chr3R 25304804 3' + roo 8993 2 73.97 ACACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTTAAGTCACCTTTAAGTCTGACTGCCTTAACGTTATTATTTCCAGACGCCCAGTTTGTGTCTGAAACTTTGACTTTTCCACATAACAAC:1 + chr2R 15540546 3' + 1360 184 1 45.21 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCACGAGATTTTTTCGTTCGTTTTTTGCGTTTTCGCCCACAGAAACAGAACATCGAG:1 - chr3R 23236393 3' - hobo 52 1 55.97 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTGGCAGCTTTGCATTTT:1 - chrX 7786618 3' + hobo 2922 1 72.41 AAACAAAAAGAACCGTTAAATTGAGAGTGTAAAAATGTATTGCTCATAACATTTAATAATTATTTTTAGGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCATCTGTACGTATAATACGTTTATCTGCTTTGTTC:1 + chrX 16361582 3' - Tc1 151 1 50.68 ATCGCCGATGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAATGAGAATAATTACAGGCTTAGGTGCGAGAAAGGGGAACTTA:1 + chr3L 25331224 3' + F-element 19 1 72.26 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAG:1 + chr3R 10472769 3' + mdg1 338 2 72.60 AAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCT:1 + chr2L 4174054 3' + roo 9041 1 52.38 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTGCCCAAGAAAG:2 - chr2L 15987955 3' + roo 9030 1 57.53 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAATTATGTTAAAGCTGAACAATTACTTCAGAAAATCACAGCAATACTGCCCACTGTGGGGCAGGAGGAAGGA:1 + chr2R 5917918 3' + I-element 5324 1 56.06 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAACACACACACGCACTCACTCGTTGTGGGT:1 - chr3R 28396592 3' - jockey 56 1 52.99 GCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTACACTCAAGAAGTAAAGTCGAACGGGCCTCGTCCAA:1 + chr3L 22900160 3' + 412 7476 2 70.00 GTTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATTTATAACTAAAATGTGCATTTTTAATCATTTAATCATG:1 + chr2R 8305290 3' + roo 8990 2 73.79 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTACCGCTCTGCTTTTGCCACTTTTATTGTTTGTCTGGT:1 + chr3R 9190617 3' + Tabor 443 2 56.16 ATCAATACGATGAGTGATATTTTGCACAGAGCGATTGATTCCTCGGTCCCTCTATTATCAACACCAGAAGATAAAAATTCAATAAAACTCGAAGAAATGTAGATTCTTTCAAAATATTTAAACGTATATTTAACCTCGATTAGAAT:1 + chrX 22562587 3' + transib2 2355 1 56.16 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAAAATGGACGTGCAACCGCGAATTCCCCTACAATGGCGATAGACCCAGAACA:1 - chr3R 1465021 3' - F-element 85 1 67.12 AGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTCGTGTTATTTTCGTTTTTTTCATTTCC:1 + chr3R 4528417 3' - F-element 81 1 69.18 CTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCAACTCGTTA:1 + chr2L 686094 3' + roo 355 2 53.42 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTC:1 - chr2R 981624 3' - 1360 58 1 68.75 ACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACACCTGTCGCCATTTGCCGCATGCTAGC:1 + chr2R 13644553 3' - Burdock 16 2 73.38 AATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACCCAATTAATAAACTATAACCACCAGTTGGGTGGGTTATGTATGTACATAAAAATATTTACTGTTCACGTTTCTTCTTTTCAGATTTGGAAGCGG:1 + chr2R 9874904 3' + S-element 393 1 53.28 GAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTAACATTATTGTGTTTCATTAAAAATCCGGCCGATGTCCTGCGTTGGTTTTATGGCATAGTATGTGGG:1 - chr3L 11745261 3' + G2 2790 1 62.61 CACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGT:1 + chr2R 2879466 3' + Stalker4 7075 4 51.43 CGAATGTTTGAAGTAATTAAAAACAAGGGTGGCCATACCAAATCCTAAATAATGCTAAAACACGAGGATGGGCTGGGCAGGAATGTGGATCCAGAACAGGAGCCCATTCCCTGACTGGCGTTAAGACTAG:1 - chr2L 188278 3' + Tc3 1397 1 52.31 TCTTAAAATAAATAAAATAAAAGAAAAAGTAATAAATCTGATATCTCAAATATATCGAAATATCTCCTTATCTACCTTTGCTTGCAACTTGTCTTTTGATCCGTACAATAGGAAAATAAAAACAAGCCCCATCTTTCCAAA:1 - chr3R 21860418 3' + G7 1144 1 79.43 ACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGT:1 + chr3L 12976323 3' - invader4 65 2 71.54 ACACACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGCCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGATAAAACCAGCAAAGTTAAAATACAAAGTCAATAAAAATA:1 + chr3R 22793978 3' + HeT-A 5998 1 75.40 ATAATAAAAATTCATGTATTTTGGCTCAAAATATATAAAGCAAAGTCAAAGCTACACATTTGAATATCTAATTAAAAATGAATAAAAACATGCATACATTTTAAATAATCAAATCAAAGCAAATTAGTTCTTGATGTTTTAGTATA:1 - chr2L 10302136 3' + S2 1633 1 63.70 AGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCACATTACATTGTCCATAAAAAGCGTTTCAGAAAGCGGAGTGTGTGT:1 - chr2L 18279888 3' - gypsy5 67 2 60.42 TTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAACGAGCACGTCCT:1 - chr2R 3338785 3' - Juan 57 1 57.04 AATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATATTTTATGTGTACATAGGTCGAGGGGAACCAACCGAACGTGTCAAACAAAGCCAACGTGAATATAAAAAGCGAACC:1 + chr2R 20489483 3' - 3S18 45 2 54.79 CACACACACACACACACTGAGTATAAATAAAAATGTCCTTTGGCGCAAGTGGAAAGCCTTCGAAACTTCAGCGAATTTAAATGGAAAATAAAACTAGTTAAATTATAAAGAAGACTGTTGTTATTTCGAGAAATAAATCTAATTCG:1 - chr2L 4137978 3' + accord 259 2 74.66 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAGCTGTGGTAGCTATAATGAGTGCAGCAAAGGTGTG:1 - chr2L 22015887 3' + Tirant 8487 2 66.39 ATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCTTAGTTATCAGCAGCTATTTTCTGTTATTATTTAATATGTGCGCTGA:1 - chr4 437081 3' + Idefix 62 2 67.81 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCAT:1 + chr2L 17250820 3' + opus 438 2 60.96 AGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGCTGGGTAAGGACGAAGGACGAATGACGCTGGATGGTGTGTATGAGCAATTTGCATTATGCACAGTTTAGCATGCAAAATGCCACTGGGATGCGAACGGGCACTCCG:1 - 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FB 27 1 56.76 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATAACATTTAAATTTTAAATTTAATTACGAACTCAGCGAGGTATTCAGACAATTATTTTTAAAG:1 - chrX 13057293 3' - F-element 60 1 54.81 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATT:1 - chr3R 22100509 3' - 412 7104 2 54.07 CCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAATGAACAAACGAGCGGGTGCCATCCAGGGACCACAGCCAGGCAGGACCACGGCCAGGACTTCT:1 - chr3R 13607603 3' + I-element 5321 1 56.85 CTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTAGATCCAGCATCTCGTATTTAAAACTTAAAAGCCTTCACACCTGAATATCTTCAACATCTACTTCAATTTCTGGAAAAAAAACCAACATAATCCATCTAAACATG:1 - chrX 21083877 3' - HB 24 1 65.75 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGT:1 - chr2L 17240237 3' + hopper2 1522 2 76.71 GTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTTAAACATCCAATCATTTTAGAAAAATGCCACCTAACAAGCTTATTAATAAAAAATGCTCATAAGGAAACATTGCATGGAGGGATAAACCTA:1 + chr3R 19447029 3' - jockey 4956 1 65.75 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACCTGACGGCAGATTCAGATACACCTTTCAACTTTAAACCATTGGCAACGTGCGTAAACCA:1 + chr2R 12240183 3' - copia 63 2 58.90 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCTTTAGTCCCTTAAAAATGGAGGCTCTTCGCAGTGGGTATTCTCGGGTTACCCGAAGTACCTAAAGTGGAAAGCCG:1 + chr2R 9873737 3' + roo 396 1 69.91 CATATGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGAATATTATTGTTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCGTTTTGTTTAATCCCTTTTCATTATCTCGTTAGTTGGGTCTGCCGTTATGCTTCTTCTGTTTCCACTGTCATATAATTGT:1 + chr2L 11795893 3' + invader3 5245 2 52.05 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATAGGTGGCATATATAGGTTTATTACAGCTCGCTCTCCATTTTTTTTTGGGAGATCAACGAACTGCTTTGAAA:1 + chr2L 9237579 3' + blood 7318 2 65.47 AAGACCGACCGCGGTGGTCCGCCGTATTGATTTCCCGTCAAATAAACAAATATTTCTCGATATTGCGCATCCACTCAAAACGTAAACAAAATCCAGC:1 - chr3L 1519217 3' + Tom1 41 1 70.10 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAACTCGTGTGCCATAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACG:1 + chr3R 10266161 3' - 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FB 32 1 58.59 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGGCAATTGCCGCAAAT:1 + chr2R 10865233 3' - blood 7086 2 68.28 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAAAAAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATGGGTTTATTACAAAGGTCCTCCTAATGCAATTTGTCATTTTCGCATTTTGTTTCT:1 - chr3L 10144672 3' + blood 7320 1 65.93 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCAT:1 - chr3L 17890719 3' - 412 56 2 54.79 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAATTTGTGGGAATCTTTTCATTTA:1 + chr2R 5237939 3' - Doc 38 1 64.14 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAACCATTTAACACTTAGCTTAAATTCGATTGCATCCGCTAGATTGTTCGCGGGATGTTATCGAACTATCGATGGCTCATCGCATTTTTT:1 + chr3L 19836549 3' - pogo 9 1 76.19 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGGATAGTGCATGGTGAATATGGTGATGAAATGTGCATGAAATTACATTCGAACAATCGATGGAGTGTACTTTAAAATGCCCATTGATACGTACGTAAGGCATTGGAGCA:1 + chrX 3996639 3' - roo 12 2 74.66 ATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAAAAGGGCGTAGGCCAGGGCTAAGGATAAAAGGTCGACAAGTTGCGCTCTAGACACGCGATGGCTTGTACCGCAAGCGTAATCCCTAAATCATATTTAAAACAGCAGGC:1 - chr3L 22977663 3' - 1360 3257 1 73.97 TTAATTAATTTAATTAATTTAATCACCTATAGAAAATCTTATCGGGGCTCTGGAAACTTTACTACCCAGTTCCATTTGTTAAGAGAACTCTCACCTGTTGGTCTCCGATGTGAACGCCTCGCAGAGCTGTGC:1 + chr3L 11209852 3' - transib3 2666 1 81.82 AAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTACACTCAAGAAGTAAAGTCGAACGGGCCTCGTCCAATCGACTGGCTTCTTCTTTTGGCCCTTCCTAATACTTATTCACTCAGTTGTCACAGCATATGGAATCATAA:1 + chr3L 22900230 3' + 412 7530 2 71.92 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTCCCACTCTCGGTGCCCAAGTGCTCCCAAAACATCAAGGCAAGTGACGAAAGCCAC:1 - chr3L 18658855 3' + roo 9051 2 69.01 CCGCAATATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTAGTTCAACGCACTATTCGTTGTCAGATAGAAGTCTCTTGACTTTTTTATTGATTTGTTTAGTT:1 - chr3L 18030968 3' - invader4 2813 2 52.05 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTTCAGCATGAGAACTTCTTAGGTTGCATGTAAACAGTATTATATCGCAAGAATTAAAACATTTTGCA:1 + chr2L 4179494 3' - jockey 64 1 58.22 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATACGATCAGTGGTTGGGTGAACTGGAAACTAACGAAGACGATCCCCTGGG:1 + chr3L 17890873 3' + 412 481 2 76.55 TGGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTGTGAGCGGTGGTGTTTGCAACTGTAGGGTTTAATGAGGAGCGGGAGTTCG:1 - chrX 7980775 3' - hobo 27 1 60.66 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCA:1 + chr2L 9485685 3' - 412 60 2 57.53 CCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGATTTATATGACAACAGCTGGGCGAAAGAATGTCATTCGCTTTAAATGCCTTTTAGCA:1 + chr3R 12562452 3' - G2 3052 1 60.96 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTCGTGTTAATATGAAATATATTTTAGTATGATATTATAGTTAAGAGCATTAAAACATTC:1 + chrX 16902344 3' - I-element 38 1 50.83 GGCTATTGATCCTAATCAAGAATATATGTATATACATTATATAGTCGGAAACCCTTTTTTCTGATTGATTTCAACTCCAGCAAACAGGAGTTCAAAACATATTAATACAATGCATCCGTAACCAAAGGTTTTGTGAAACGTCA:1 + chr4 1121551 3' - INE-1 87 1 52.45 TTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAACCACTTTGTATGTG:1 + chrX 14811627 3' + P-element 2598 1 19.18 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGACACTTAGTAAAAAATAAAAAATCACAGTTTTTATGGGTTTTGCTTGGGCGTTTCTTTATTTCCATTTTATGTACAAAACTTATGACAGAAACGGA:1 - chr2R 9873586 3' - roo 26 2 68.49 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCAG:1 + chr2L 246119 3' + roo 400 1 77.31 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGCTGCTTGATATTCGAAAATGTAGCTCCTGAGTGTATACCACATTGTCAAGATAAAGAATTAGTAAG:1 - chr3R 2555479 3' + Bari1 1654 1 54.17 ATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCTGTGAATCTCCCTCCTACCCGCTGGCCAGATGACCAATGGCGAATAGAT:1 - chrX 305514 3' + roo 24 2 65.00 TAAATAAATAATAAATAATAAAATAATAATTTGTCTAAGTTTGAGTAATTATAGGTGCACCCTAACCCTCTGAGGCTGCAAAATATTTTACCTGCATATTTTTTTAATATCAAATCCGTTTTATGTGTTTGGTTTTTCATCCCCAG:1 + chr3L 19112447 3' - INE-1 422 2 73.29 AATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATAATTCCTCCTAATACATTTTTAAGCGCCATT:1 + chr2L 44991 3' + roo 8621 1 78.08 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTCCATTGAACCCAATTGAGCCCCGATAAGCAGTACAAATGCTAGGCGATGTGAGTGCAGATTTAATTTATTGATTTAGGCCCATCGTATGTGTTAGCATTTCCCGCATTT:1 - chr2L 4998058 3' - FB 13 1 75.34 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGTGCAACAAAATTGAAACCTTTATG:1 - chr3L 18467140 3' - hobo 19 1 71.23 TTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATCAAAATGAACTAATCTGTCTTAAGGACAAAATAATTGATAGCTGGGCCGGAGTAAATATAAAAAAGAAATTGCTGGAAAAAGAATGATA:1 - chr3R 2914283 3' + Circe 7042 1 50.68 AAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACC:1 - chr2R 11133559 3' + roo 351 2 65.32 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCGCACCAACACAAATGCCCATGCACACACGCACACACACACCGTGACGCATTTTTGCACAAATACAATCGCAGATA:1 - chr2L 8366499 3' + 1360 3342 1 53.42 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAATTTGCTCTCTCATGCTCAAAAAAAATTGTATAAGACACTTATTCCGAG:1 + chr3R 23765476 3' - roo 5 2 76.36 GACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCAGCATATTGAACTTGTCAACATGACAGTGGAGCGGAACCGAAGCCAAGGAAAATGAATGAATGAGTGAGTGAGTGAATGGGTAGCGGGGTGCGAGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 8821225 3' + 412 7266 2 76.55 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAG:1 - chr3L 14550986 3' - P-element 78 1 21.05 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATACAGTGCACTGTATGGATAGAAATGAGCCAAAAAGTACCAGAAATGGTACCAAAAAGTAAAATT:1 - chrX 3464177 3' + hopper2 1543 1 58.22 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGGAGTAAACACTTTGTCGACACTTCCATCCACCCCATTGAATTCTCTATAAAATGATGCATCTCCGCCC:1 - chr3L 7995359 3' + P-element 2878 2 78.77 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTAAGGGCCATATTGACCAAAAAT:1 + chr3L 96570 3' - roo 8742 2 79.10 GCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACAAACCTCCTCATCGAGTCAAGCGCTTCCTTCGAAGAATGATTTACCGT:1 + chr3L 329700 3' + 1360 3270 1 69.18 ACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTAA:1 + chr2R 6271498 3' - blood 216 2 75.34 CACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTTCTCCCATTCGGTGTTTCCCTCTATTTCTGGTTGTGGATATGGATGTG:1 - chr2R 9226916 3' + accord2 7218 1 66.67 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGG:1 + chr3R 20175766 3' + hopper 1390 1 65.00 CAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACA:1 + chr2L 16089681 3' - 3S18 5816 2 55.22 CAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGTG:1 + chrX 21852436 3' - Tirant 81 2 72.41 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACATAACGAAAGATGTCGGTGGCGTTGGCGTCGACCCGCACCGT:1 + chrX 3433559 3' - S-element 76 1 73.29 TCGCAGGAACTATAAAAGCTATTTGAGATAAAAGCTAGAGGGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGAACTCGACTATAGCATACTCTCTTCTTTTTTTATATAATTTTCCATACATTCTTTAACAGATTTTACGAAAATATTAA:2 - chr2L 15004793 3' + INE-1 152 1 82.88 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACGCTTTACTGTTGCCACCCATTTGGCCACCAAACAATCCTTGACTCGCTCATGGACACCAATCCATCCTGCTTCCCTAAGCCCTACATCCTCACCCTAG:1 + chrX 1690118 3' + 412 471 2 69.86 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTC:1 + chrX 4186702 3' + I-element 5270 1 73.29 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCA:1 + chr2R 5923023 3' - jockey 4735 1 64.75 ATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAATGGGTCGG:1 + chrX 21667979 3' - gypsy2 6508 2 75.54 GGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGTCCATAACAACA:1 + chr2R 17890946 3' - Tabor 86 2 74.66 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAGCCCCAATTTCGGCGGTTTGTATCTCTACCAGTTGTGGGC:1 - chr3R 21705936 3' - 297 6583 2 76.92 GAATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATA:1 - chr2L 17550621 3' + Transib-N1_DM 433 1 79.45 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGACGACTGCTTGCA:1 - chr2R 12787809 3' + 297 6913 2 65.75 GTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAGAAA:1 - chr3L 9571679 3' - jockey 4524 1 70.00 GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAGCCAAAAGCGTTAAATTGAATTGCAGCGGGCCAAATCCTCTCACCTATTTTATTCTGTGACAAATTGTGGCAATCAAAAT:1 + chr2R 21414495 3' - BS 5066 1 64.00 TTGTTTAATTAATGTAATAGTAAGTGTTTTTTATTTGGAATAAAAAATAATTAATTCGTGGGACATATGTTTTTCGAATTTGATTAATTAAAATGATGAAAAATCCCGTTTCCAAACTGTCAATTAACCGATGTTAATCAAGTTTT:1 - chr2L 10891825 3' - Juan 337 1 49.32 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATAACTTTTTCGTTGTTTGCTGCTCAGCGGCAACTTCCGTATCTAACGCTCTATTTCGCTGAAAACCTCCCAACACTCATTTTA:1 - chr3L 8091858 3' + Burdock 6357 2 51.37 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAATACACGTTTTTATAGACTTATATGGAGGGATAAAAGGTGCAGTCTCCAGGGG:1 + chr3R 27478576 3' + hobo 2919 1 54.55 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAATCCGATTCCGACT:2 - chr3R 31490920 3' + roo 9020 2 50.68 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCT:1 + chr2L 14248104 3' - I-element 61 1 58.04 GCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATTTATAAGCGTTAAGTCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTAATATATTTCTGCTAGTGCTTGCAAGTGTTTGCTCGTGTTGCGGTTAAGTAGGAACTACGCCAACTTATGAGG:1 - chrX 4310795 3' - Stalker4 186 4 50.00 CGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCCATGTCATGGAAATATGACAATACAGATATACAAATGACTTTTTCATTTTCCCACACGTATATTATGTATATTATATATATTTATATTTCTCACGATTTCAAAAGATT:1 - chr3L 11819146 3' - F-element 246 1 67.81 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATGTTTCTGATGTTTGTTGTGTGCGGCT:1 - chr2R 10781167 3' - FB 40 1 72.53 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTTTAGTTGCCGTTAGTTTTA:1 - chr2R 11057229 3' - pogo 35 1 58.22 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAAATAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGACCCCATTTCCAGTTTTGTATTTTTTTTATTATTATTTCGCCGATCGGCT:1 - chr2L 13927671 3' + roo 9052 2 70.34 CCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAAAGCATATAAATTCATTGCTTTTGATTATT:1 - chr3R 12568880 3' + hobo 2867 1 75.00 AAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTACTCATATACACCTATGATTCACTGTAGTATAAGTTATAAATAGTAACAGTTGTCTAAAAAATAAAAATAAGCACT:1 + chr3L 25008181 3' - X-element 61 1 47.95 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTCTGATAAGTTTTTCCTTTT:1 - chr3R 20175655 3' - hopper 15 1 72.86 GATTAGGATCAATAGCCGAGACGATCTGGCCCTGTCCCTCTATTCGTATGATCGTTTTGATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAGAGTTGCAGACTCAGCAGATGGGAATGCTAGGGAGGAATCTGAAAATTATGATATAAAATGAA:1 - chr4 536719 3' + INE-1 92 1 65.75 CAATACATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTTAATCAAATTAAGAGTTACATATTCCCACTAAATTGGAATTACTATTAATACAACATTTGTTCTTTTATCACAGTGAA:1 + chr2R 10377727 3' + Cr1a 4262 1 53.42 CGACTCGGCTATTAATCCTGATCAAGAATATATAAACATTATATAGTCAAAAACGATTCCTTCAGCCTTTTACATACTTTTTTTTTACTTTGCTCTCCGAGTAACGGGGAATGTTTCACAGATAGGACTTTCC:1 + chrX 20806503 3' - INE-1 93 1 81.20 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAGGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAATCAACCCGCAACAACAATAAAATTCCCTCAAAAAAAAAAA:1 - chrX 16855256 3' - roo 8731 2 68.94 AAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTTTATTAAATTTCTA:1 + chr2R 2875258 3' + TLD2_LTR 124 1 78.77 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCATAGGCTCGAAGCTGGTTTCTCACAGTGCATTCATGTTTCTAATTGTCTGTGTGTGGGATGCCTACGTCAGCACTGAAGCACTACGGC:1 + chrX 22725665 3' + roo 9041 1 61.38 TTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGC:1 - 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X-element 4675 1 52.80 AGACTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAAGGAGTCCGATTAGTTTCAGCTAATGAAATAGATATTCAAACTAAAGCTATAGGAAATAAAATAATTAAAAATCATATATAAACTTGATAAAAAAAAAAATAA:1 - chr3L 12252823 3' + Doc 4635 1 29.66 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGAATTCAATAGTGAAAATATTCAATAGACTTACAAATCAAATCAAATATTTTCTGCCTCATTTTATCGCATACATACTGATAATCCAAATTC:1 + chr3L 13374250 3' + pogo 2072 1 61.64 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAGC:1 - chr2R 6632563 3' - P-element 37 1 51.26 ACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCATTGCACAGAGA:1 + chr3R 13176438 3' - Burdock 70 2 67.12 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGAAATATGCCAAGTCCAGAGTGTCAGCTAAATTTC:1 - chr3R 17114047 3' + roo 8991 2 73.24 CGAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAATCAGGGCGCGAATTTTTAAATTTATTTATTGCTACGAAATTGGCCAATCCATATACTCGAATCAGAATTAAGCATCCTTAGACAGGGACGTATGACCATTACAGAATTTTACAACG:1 - 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chr2R 23000038 3' + mdg1 7401 2 57.53 TTAATTAATTTGTTATATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCACTTTGGTAACTCGCGCGTCAG:1 - chr2L 23372503 3' - gtwin 6950 2 57.14 TACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAGCTGTGG:1 - chr2L 22015915 3' + Tirant 8439 2 66.91 AAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGTGAAAATTACATGATCGATATAAAATTGTAACATTATAATTATAAAGCCAT:1 - chr2R 20598828 3' - Doc 336 1 65.07 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGTCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGA:1 + chr2L 9485668 3' - 412 7123 2 66.19 ATTAGGATCTTCCCAATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGG:1 + chr3R 26246901 3' + 1731 273 1 50.81 AATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACTAACGCAGAAAATCAGAGTATCAACCCCGAACACCAAAGAAATT:2 + chr3R 435990 3' + 1360 3016 1 65.75 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTATGTATATGTACACAAAGGATGTCACACGAAATATATTTAAAATTCTTCCAAATAACTATTATCAAAACGATTCCTGTCATAATGTTCAAAATAA:1 - 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FB 27 1 51.52 TTAGTTTTTAAGATAGTTTTAATAAGCATAGTTTTAAACAATTAGTTTTTAAACAATTTAATTTTATCGGATCGGGTTTTCGCGTGATACATAGCAATCAATAAATAATTCTATTAAGATATGCTACATTGATATTGAAAGATTAA:1 - chr3L 23583375 3' + Juan 4003 1 65.07 GGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCACAAGTATGCAGCGACAAAATAGTCATTTACTCCGTGC:1 - chr2R 16891830 3' + hobo 2877 1 58.62 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGCTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAACCGCAGTTTACTGATGAGG:1 - chr2L 17210233 3' + jockey 4961 1 62.33 GCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACAGAGGCATTGCTACCCTCAGAATGTG:1 + chr2R 4362614 3' - gypsy 7051 2 64.34 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTT:1 - chr3R 19589894 3' - BS 5025 1 58.21 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTTTCGAGCCCCTGTGGACGGGTGGGATTCCTTCCCTTTGAAGAGGGCACCTTCTCGGAGGCACTCCAC:1 + chr2L 11915611 3' + hobo 2927 1 62.50 GATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACCTGATGTTTGC:1 + chrX 16384110 3' - diver 5936 2 52.74 ATATTTACAATGTTATTATATCATAATTAAGTCAATTTCTAATTTCCTAACTAATTGCTGGCTTTTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTGTAATATAAGGTGAATATCCATAGGTGTTGCTCCTACTATTCCCATT:1 + chr3L 23847915 3' - I-element 5264 1 69.18 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGTACTGTGTGATATTGAAATATGTGATTATGATAAGAATCATGCTTGAAATATATGTGAA:1 + chrX 6707859 3' + hopper 1358 1 57.53 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCAGCT:1 + chr3R 22100597 3' + 412 434 2 62.41 ACATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCGTCTAATTGAATATTGAACGAGGCTTTTAGTGTTGACT:1 - chr3L 9324633 3' - Quasimodo 39 2 70.13 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATTTAATATTAATGCCAGTAGTCTGCTCAAA:1 + chr2L 14201513 3' - roo 19 2 67.12 GACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGCCACGCCCACTCCATACATGTTCACATATGTACATGTTTTCATTTTATTAATTTTAATGCCAATT:1 - chr2R 17876892 3' - Transpac 54 2 54.79 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTATATCCTTAACATAGAAGCCGACAGTCAACGACGACCTGGTTTTTAAGC:1 + chrX 3099165 3' + P-element 2814 1 34.25 CAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGG:1 + chr2R 4261945 3' + invader4 246 2 59.00 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATTGATTGCCATGTCAAAGCCAATCCAATCCATTCAGTGTACCCTGC:1 + chr3R 24493195 3' - jockey 4692 1 62.50 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCTCAATTTGGCACTTGATTTTG:1 + chr2L 9472113 3' + roo 405 1 76.32 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGCAAAATCTATGCCGGCATTCTTACTTTGATATTTTTTTCTCAGAACTAA:1 - chr2L 17136109 3' - hobo 28 1 61.64 CGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGCATTTATAAGCTTTCATTTCT:1 + chr3L 13868692 3' + 412 457 2 77.11 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTGCTTATTTGGGACTTTACACTCTGGCTTCAGGTTTCAATGAATCCGCCGTTCCCCAGAGATAACCTTCCCGACAACGTGGGCATTTATAAATAAACTATGAGATGAGTGCAC:1 - 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Bari1 86 1 75.17 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATTTATAACTAAAATGTGCATTTTTAATCATTTAATCATGAAATATGTATAATAAATATATATGTTTATTAATTTTTATGACTT:1 + chr2R 8305334 3' + roo 9033 1 57.53 TATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTTAAACAATAGAC:1 - chr3L 22054955 3' + mdg1 7044 2 71.79 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCTAGGTACAATGTGCAGTAGCGCTTACTTGTT:1 + chr2R 5923056 3' - jockey 4702 1 61.15 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGCCTTTAATCATCTGATTTTTTTCCAGCGTTACA:1 - chr2L 76020 3' - roo 33 2 64.96 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCGAACAACCA:1 - chr2R 11763590 3' - Tabor 37 2 52.63 ACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTAAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTCCATTTACATCTAAATTTATACAGATTCCACTTGCGGACATTCCA:1 - chr2L 19518273 3' + flea 4945 1 66.44 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTTTTGTTAAACAACTGTATTCT:2 + chr3L 9909807 3' - Transpac 4956 2 60.27 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACA:1 + chrX 13395343 3' + roo 342 2 65.07 TACTTCTCGCCATCAAACGGCTTAATATTACGTTTAGCCTTGTCCATTTTTCACTCAAATTCCACGAAATTCAGAACACATTGACCTAGGCTCTAATAACTAATAATAGTGGCGG:1 + chrX 7167544 3' - copia 457 1 60.00 ATACCATCACAAAATAAATTTCAAAAATGACTATATTAGAATATTTGACATAAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATAAAAAAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCTTTTCGTGAATTTAATTATTCGCTG:2 + chr2R 2498593 3' + 1360 361 1 80.82 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAATTTAATAGAATT:1 - chrX 13531615 3' + roo 8993 2 72.60 CCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGTATAAGATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAATATAGTCATTTTGTTCGTTTTACGTTTTTTTTACACAACT:1 + chr2R 24602103 3' + Burdock 214 2 56.16 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATACTTACATATATATATACATATATCCCGACCATCCCCCAAAGAACCCAAATTACTTGACACAAG:1 - 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chr3R 6776604 3' + Dm88 389 1 75.76 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAACATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCAT:1 - chr3R 30634920 3' + roo 354 2 52.74 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGCACGAATTTCGGGGTGAAGGCACTCCGAAAGAATATCAGTCAAA:1 - chr2L 9237458 3' - blood 25 2 67.12 GATATATAAGATATATACAAGAATATATTTAAAAAATGTTAAATCGTTATAATTGCATTTCCGAAAACATATGTTACTTGTATAGCAATCATTTCCAACAATGCGACTTAATTTAGTTTTTTTTTAAGTGTAAGAAAGAGCAAAAA:1 + chrX 10438243 3' + 412 7320 2 72.60 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAGAAATTATGTGGACAGTGGTTTCCAAAGGCAATAACTTTATATACACTAAAGTTTAGAATGAAAAGTTAAAGGGCACAGATTGGTATCCTCTTAAAGAATGAACCTTTT:1 - chr3L 15026596 3' - opus 7 2 75.34 TAATATATGTTTTTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGTGTGTGTGTGTGTTAGGTGTGTTGGGTGTGTCTTGATGGCAACCTGGACCTACTG:1 - chrX 8440755 3' + BS4 665 1 50.51 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTGTTGCG:1 - 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chr3R 12391348 3' + hobo 345 1 53.15 GTGTTTTAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCATGTTGAGCAGAACCGTCTGGTTGTTGTTCGAGTAGGCGGCAGCCCACTTGTTATCTGGACTCAGGACCAATTGCTGCATAATGCCCTCGATGCCG:1 + chr3R 16063165 3' - 297 6804 2 80.47 TTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCA:1 + chr2R 17392081 3' - BS 5079 1 74.66 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGTTAAGGGGTGGCTCCTTAACAAATGAAGACATCAGGTGAGTTTGGTTATTAATTCACCGGAGATTGTGTTTAGCTAT:1 + chr3L 14076320 3' + roo 9039 1 59.42 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACTATGACCTAATCATATTTATTTATAAAATATGCTAGCCTTACATTTTCGTGAGAAAACTTGTGCTTATCTAAAAA:1 + chr3R 14047811 3' - roo 45 2 53.42 TATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGGGCGGAGTAATCTTCTTGAGCTGTACAAATATGGAATTTTG:1 + chr2L 17209067 3' - jockey 4819 1 71.23 ATTCTTAAGCTAAGAAAGGAAGGGAAAATATATAAAGGACTGTTTTGTTTTGACAAAATGGTATCCAATGCCGTTAAATATAGCACTCTGCCCCAGTTGATAAACAAATTTCAAACTCCAATCTCAGCAGTAATTCCTTTGTCCGT:1 - 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hobo 75 1 74.81 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACCTGACGGCAGATTCAGATACACCTTTCAACTTTAAACCATTGGCAACGTGCGTAAACCAATGGCAATGGACCACT:1 + chr2R 12240199 3' - copia 41 2 56.43 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTTAGCGGATGGCTCTCAGCAGCAGACCAAAGCTCTTTGG:1 - chr2L 245980 3' - roo 48 2 51.37 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGTTCGCCGTGAGAGATGCGATTTTTTTTCAGTGAACTGATTTATTTTCGAAAACATCCACACAAGCATAATGCA:2 + chrX 958065 3' + roo 9026 1 52.74 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCCTTTTTGTGTG:1 + chr3R 24476384 3' - 412 44 2 51.80 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTTTTAATGTTTTTTAAACTTTTGCCCTGCTCTCGCCAACGCTTGCCCTTAAATATTTAAGTATA:1 - chr3L 13634158 3' - 297 9 2 78.52 ATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCGTGGAGGAGAAGAGCTCTGCACATATTATATGTGACTGCATGGAACTTTCCATCAGGAGGATTTTTATTTATATACTTTTAGTGGTTAGGTCTTTAGCTTTTATTAATTTTCA:1 + chr3R 21406740 3' + baggins 5185 1 58.90 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGA:1 + chr2R 21402665 3' - mdg3 85 2 76.26 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATGCATAGCTCGTAAATAGAATTGCAAAATGATTTTTGGTGTCATCTCATTAAATTTAAATGATTTAC:1 + chrX 21234551 3' - 297 6626 2 55.71 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCGATGTGGAACGATACATTTAGTTGATTTTTCACTGGGAGCAGA:1 + chr3R 26520505 3' - FB 15 1 72.93 TGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGCGAACAATGTGCCATCCTTTCTCTACC:1 + chr3L 22648397 3' + Tabor 7275 2 51.37 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAGAAGGACATGTATAAAGTCATAAGGAACTTTTCCAACCCGACATATTTACAGGCACA:1 + chr2L 10746708 3' + pogo 2040 1 63.01 ATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACTCAATAAAACTGTGAACCCTCTCTTATTGAATTTTCCATAGATATGTAGAAATTATTGCTAGTCAATTGCCACTGTGCTTGATAAAC:1 - chr2L 1259882 3' + Burdock 6360 2 59.59 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATG:1 + chr3L 19350039 3' - jockey 34 1 68.97 TCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCA:1 + chr3R 15022111 3' - Tabor 73 2 65.07 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTGGCATTGAATTTATTTTCCACAGTCTGAGTC:1 - chr2R 12543055 3' - roo 53 2 56.16 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGTTCAGCCTTGATAGATCCCCGTATGCCATAGTTGCTTATAGTCAGTTAT:1 + chrX 11471525 3' - jockey 4735 1 61.48 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATCAAGTTGTAGAGCGAACCTCGCATTTGCGCCTCATGAACCGTTCACGCAACGTGTCGCGCTGTAAATA:1 - chrX 21196683 3' + roo 9020 2 51.37 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTTGTTAGTTGGCCACTTTATTTTTGAACCATTTTTTTTTTA:1 - chr2R 14644649 3' - roo 58 2 69.35 ATCGCGAGCGTCACGACATGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTAAGCAACCGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCATTGGGAGACCAAATAAATTCCCGAAAAGTGAATTAAACCTAACCAAAGGAAGATAACACATC:1 - 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chr2L 19068025 3' + pogo 2063 1 58.22 GTGTGTGTTGTTGTGTGTTTCTTTCTAGGTTTCTCGATTTATGATTGGTATTAGGTATTGGGCTTCGATTGCCAACTTATAAAGCGACGATTTTTGGGAGAAGAATCGAGGATAAATCATATATCACTAGCTCTTAAAAAG:1 - chrX 6235525 3' - gypsy3 412 1 65.96 ATTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATG:1 - chr3L 11336344 3' - blood 64 2 62.24 TTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAGCAACAAACATTTTCATTCGTTTTCGCATCGTCGAAGCGTACGGTTCATAGGAGGAACG:1 - chr3L 14550928 3' - P-element 12 1 68.80 GTGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTATGCATTGCATTGGTGCATATATAATCAGTTGAGTCTGGGCAAAGTCTATGATTTGGATTGACGTTGCTGGCTGATGTTTGAG:1 + chrX 17732100 3' - pogo 35 1 60.27 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCACGACTTA:1 + chr2L 9485692 3' - 412 7100 2 50.71 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTAAATTTATGCGTACGTATTTTTGGCCATGCGCGTCTCCAATTTTTTATATCATTTCGTTTTCTATTTGAGTAAGTGACTGAGCATTATCCT:1 + chr3R 22892001 3' + pogo 2089 1 62.79 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAAT:1 + chr3L 13827380 3' + hopper 1376 1 58.33 TGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAACGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATCATTCCCACCACGACTACATGGCGTTCTGTCGCAGCTTTTC:1 + chr2L 11183580 3' + Stalker 194 4 70.55 CCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACAACTAATCATTAGCTTTACATGATGTGTTTATACGAAGCAAATATCACG:1 - chr2L 17250719 3' - opus 179 4 66.21 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTGTCGCCGACGCTGCTCTTGCATCCGC:2 - chr2R 11609190 3' + roo 9032 1 56.85 ACAGAAGACAGCTGAAGGACCTTATCATACGGCCCCCCTTGACGAGAACCAGGAGATGATGATATTTGGTTCGACACAGCACGGTTGCAAGGATCACGGTTGGCTACGATTCGTTTTCACTGAG:1 + chr3R 25661131 3' + BS3 1563 1 53.23 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGCACTTGATTTTGTGTCTACAAATATGGCAACTTGTCA:1 + chr2L 9472138 3' + roo 398 1 78.08 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAAGGTATATCTACATAAATGAACTAATATTTTGCTTGGAACTCCACACCGCCTCACATAAATATTTATGCGTGTTAATGCTGCAACAAACTAATAAAAACA:1 + chr3R 29645820 3' - jockey 23 1 56.94 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGTTCTCGT:1 + chr2R 8641618 3' - diver 5916 2 56.49 TTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGCGAACAAGGAGTACCAGGGTATG:1 - chr3R 31887736 3' - HB 60 1 68.15 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCAAGAACCCGATC:1 - chr3R 9160646 3' - copia 36 2 61.64 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTG:1 - chrX 2762602 3' + roo 8995 2 74.63 CCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCT:1 + chr3R 9352084 3' - Tirant 8164 2 62.50 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTGAGAGGGGCAGTTCAGGTTCAATGCTGCAAATTATACGCGTTT:1 + chr3L 7093106 3' - hopper 32 1 62.94 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGTCCCTTTGGCAGCTGCCA:1 - chr3R 12599054 3' - 412 7099 2 70.71 GTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGGGAGTATATAGTAGTAGTACAGTATAAATATGAAGTTTTTATAATTATT:1 - chr3L 9713948 3' - G2 2711 1 66.44 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGGACTAAAATGAAGTTTCATTGAAAACCCATACGCAGATTATTAGTTCGCGTGCTAATTAATA:1 - chrX 22610681 3' - pogo 57 1 55.48 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGC:1 - chr2R 11609217 3' + roo 9019 2 59.85 CTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATATACAATTACTACTACTACTACTACAGCTCGGCCATCCTGATAATTAGGATCTCCTGGTCCTCTCCGCTCTACTTCTTGTAATCATTAATCATTTGCTTCATGTTCGTTACTT:1 + chr3R 2981888 3' - I-element 5226 1 76.39 ATGTATTCTTAATTACATCTATACAAATTAAACCTAATACGTTTGTATTATTATATGGTTCTTTTATTAGAGTCAACTGCTCTTAACTAACTGTGTGCACTTGGCCACGCGATGAGCAGC:1 - chrX 16439068 3' - Stalker4 7216 4 71.67 GATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTAAATTCCCTTGTAGTTCTACAATTAAATTATTCAAAGGAAAGCATACACTAATTAATAATTGTTTAAATTTACTGTGACATTTTATTACATTTGACTTTGGTACTTTTA:1 - chr2R 7727078 3' - BS 4668 1 72.86 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAACTCAGCCAAATTCAAATCTAAAT:1 + chrX 13395377 3' + roo 396 1 72.44 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTTTTGTTAAACAACTGTATTCTAAGGAAGAATATGTTATGGAAAA:1 + chr3L 9909830 3' - Transpac 14 2 74.66 GTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTATATAATATGAGAAAAACATTTAAAATGGCTAATATTTTTATTATTTTAAAGATTTAATTCGTAAGAGGCCAGCGCATTGGCACGAAAATATACGAAAATGCAATTAGCAA:1 - chr3R 14343252 3' - gypsy10 5655 2 60.96 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTGTTGCGTGGCCTTCTTGGCGACCAT:1 - chr2L 4106273 3' - jockey 4787 1 60.80 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATATAACTTGTATTTGTGTCTAAATAAATGTCTCAGAAAAATAAATGTATATGCAAAACAAACGTCGAACGTTGAAAGTTGTCTTGATTCCCAAGTGTGGGCG:1 + chr2R 18959522 3' - blood 15 2 73.05 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATCTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATCGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAA:1 - chr3R 23639143 3' - pogo 53 1 56.52 AATAATATAAATTAATAATTAGTTGAAATTAAATCGTGCTCTTAAAAATAACAAAATAACAGAAAGAAAAAAATAGAGAGATGTCTTGCAAAAATGTCTTGAAATTTTATTTAGTTTGGAGCCTGTTTTTAATTACAGCGC:1 + chr3L 18855410 3' - Tc3 269 1 79.43 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATCGCTAATTCGGAGTGAGAACCTGACGAAATGGAGAACGTCGGGAGAGAGATTCTTAACGAAGGTCAAGAGAAAACGAATTCTCAATAATATGTTATGATAGTGG:1 - chr2R 7665697 3' - Transpac 4933 2 76.71 GTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGATCCAGGACAAATATACTTTTTCTGTGGGTCACGTAAATTATAC:1 - chr2L 22016407 3' + Tirant 8293 2 67.59 ACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGCCTTTCTATAAATGAAAAAAAGTCGCAGCACTGTAACTTCTCAATGAGAGGATTGGATTCATGACGTAACTA:1 + chr3R 1136462 3' + 297 6824 2 50.34 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATAGGTGGCATATATAGGTTTATTACAGCTCGCTCTCCATTTTTTTTTTGGGAGATCAACGAACTGCTTTGAA:1 + chr2L 9237578 3' + blood 7320 1 64.96 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTTTTGTTCTCGAACTACATTCATGAACTATTTCATCTCAACTTTTAG:1 - chr2L 17029543 3' - blood 7025 2 72.60 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAGCTTTTCTCTATTTGGACCGTGGCTTAGATATCTTGCCTTAAAATTTTCC:1 - chrX 12866396 3' - roo 62 2 63.31 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATTTGT:1 - chr3L 11336320 3' - blood 37 2 55.00 TGATTGATCTACAAAGGTGCTTCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTAATTTGCATGAGTTAGCGCCTGCTGGTCATCCTTGTCTGCAGTGAAGGACATGCTTCTACGAGTAGTACAGTACAGTTGAGCCGTTACACAA:1 + chr2L 22180430 3' - Q-element 175 2 69.18 ATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGACTCAGAGTGGGCAATACGAACTTTTGTTTGTACCGTTTGACATTTC:1 + chr3L 24152595 3' + HMS-Beagle2 7186 2 77.40 AAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAAAATTCGTGGCAAGCTTTTGACGAAGCAGCGC:1 + chr2L 18280009 3' + gypsy5 7326 2 65.93 ATTTCCAGCCAAAAGCAGTGTTGTCCATCGAACGGGGCGGCTACTTAATATCTACTGGGGTACCGTCCGACTTCTTTCAGTGGGTATATCCTTTGATAGCATAGAGTAGTACAGTTAGGCAAA:1 + chr2R 23297014 3' + Transib5 92 1 77.24 GGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAAAAATGAATAAAATATATTTCGCTTAAAAGACTTTACATTAACGTGAAGTTTCAGCATCAAATAATATTTATTTCTTCCT:1 - chr2L 15146369 3' + Ivk 215 1 56.16 AGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAGAAAAACACAAAAACAATTAAGAATATTAATAGACACAGGAGCCACATCTCGCTATATCAAAAAGGGGATCTATGAAAATAAAGAAG:1 + chr2L 22780966 3' - HMS-Beagle2 32 2 63.70 AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCACTTATGTCACTGACTGCTGCGACTGCGGCTG:1 + chrX 6138746 3' - opus 6 2 76.32 CAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAATCGAGTTAGTGACCAACAAAGTGGTTTGTTTGGTCATTGTTTGCTTGCAACACCCTTCTGCTCCGAATCCTCTCTACCACCCACA:1 - chrX 19972842 3' + pogo 350 1 53.08 CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGG:1 - chr2L 10089754 3' - opus 170 4 72.27 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTTATTAGCGGCAATCG:1 + chr2L 1558704 3' + 412 7491 2 67.21 AGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTT:1 + chr3R 10030780 3' - BS 5076 1 61.64 TTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATG:1 + chr3R 14860199 3' - BS 5082 1 75.34 TTTGTTATATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCACTTTGGTAACTCGCGCGTCAGGGCCACCGTCTGC:1 - chr2L 23372490 3' - gtwin 26 2 63.04 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTATATCCTTAACATAGAAGCCGACAGTCAACGACGACCTGGTTTTTAAGCACGAAGCTGCCTTCGTTTC:1 + chrX 3099184 3' + P-element 2835 1 47.92 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAGCGGTAAT:1 - chrX 12138949 3' + roo 8995 2 71.92 GCTTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCAAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATATGCTTGCAACTCAAACTTGCTCGTACTAATCCCA:1 + chr2R 6882878 3' - Stalker3T 300 1 76.71 ACGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTATTAAATTATTTTCCTATCCATGTTTTAATTTTTTTCTTGATTTTACATATTTCTATTCTCTCTTATTTTTAATTTCTTCTAT:1 - chr3R 2527711 3' + INE-1 544 1 46.58 ACCTATTTAAACAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTG:1 + chr2L 16458680 3' + roo 343 2 62.33 CTTACGTATGTTATCGACAATCAGCTGTCTTTGAGAGGTCGACGATAAGCCAGTTTTGCGTAAAAAAGTAAAAATCGACTTTTTATCTAATAATCAACTTTCGAGCGATTGTTTTTAGATCTGCAGCCGTTACTCAGGCT:1 + chr3R 23316769 3' - transib1 170 1 66.43 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACACACGCACACACTCGTGCACACACACAGGCGGACACTCAGCATATGCAGCAGCAGGAGGATGAAAAGAGAGGAAGGATGA:1 + chr3L 17175238 3' + 412 7542 2 75.45 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCC:1 - chr3L 17175109 3' - 412 49 2 51.06 GTATCGTACCGATGTGGTTATACGGGATCGAGATTTGGGGAATTGCAGCCAAATTTATTTATAAACGTATTCATGTATCAAATTGCTATCGCTAATTTTTATATATTGTCAAATTATTTAAATCATTAAGCCAAAGC:1 - chr2R 19858386 3' + Helena 1055 1 53.28 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGCCTCCAAATGGATTCCGTGGAAG:1 + chr2L 3659132 3' + 412 7495 2 74.00 GTTAACTGCATCTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAACGGTTGAACTAGG:1 + chr3L 23042131 3' + pogo 2048 1 59.40 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATA:1 + chr3L 25401022 3' - Doc 17 1 56.03 TATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTCATAGAAACGATTA:1 - chr2R 961118 3' + transib2 2697 1 76.80 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAAAATAGTTAAAAAATTATTAGCTAAAAATCTGATTCATTTACTGGAATAATGGCTAGATA:1 - chr3L 13374109 3' - pogo 57 1 60.96 AATCTGATGGGTCAGCAGATTCGCGATCAGCAAGCAGAGTATACATATATTATCATGTTCCTATATTAGAGTCAGTCTTAAGTTAACTTCGGTTGGAAGAGTTGGTGAAGGTTGTTCTTTGGCCGGCATTTAATGGTTTATCAAAC:1 + chrX 4972801 3' + gypsy5 7145 2 69.18 TCTTGACACTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGAAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTGATATATTGAATTTTAAACTTAATAACAAATGTTTGCGTATTAAAACTACGCTACCTTAATATATTTATGGTAGTGTATCCATTATA:1 - chrX 21100501 3' + S-element 1516 1 53.42 GAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACTAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGGTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTCTCTATAT:1 - chr2L 11574844 3' - Max-element 8326 2 74.66 AAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGACCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGAC:1 - chr2L 8959930 3' - Ivk 5169 1 71.92 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTCACAGTGTAGTTTCAACCTTGATTAAATTT:1 + chr2R 19555063 3' + pogo 2074 1 64.14 CATGCGGAGTGTGATTCAACAACGGGGCTTTTGCAAAAGCTTCTCGTGCGCATAATAATGCCTTAAAATTTGTTGATGACATTCATTCAGTGCAAACAATAGTTGTCCGCCTGGCGCAACTAAAAAAAGAGTAAAAAAAAAGAGGA:1 + chr3L 3649713 3' + 3S18 496 1 78.77 GACTGGGTCGCAGTACACATAGAAACCCACTTAATAATAATAATATTAATTGATAATAATATAATAATACCGACGGTAGTTGCCTCAAAGGTTATTGCCTGATTGATTACGCACCTTGCAACGGTTTGTTTCGCATTCGCCGCATG:1 + chr3L 21862874 3' + baggins 5413 1 52.74 GAAATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTTAGTCCAGGGCGCATATGAGTTTCAGTAATTAGCATGATGTCTATAGAGTGGGCAATAAGAAACAACTCTAGACAAACTCAAATTTCATACAGAACAAGA:1 + chr3L 26820174 3' + mdg3 226 2 74.66 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTATGCATTGCATTGGTGCATATATAATCAGTTGAGTCTGGGCAAAGTCTATGATTTGGATTGACGTTGCTGGCTGATGTTTGAGCTTGTTGTTGCTGC:1 + chrX 17732114 3' - pogo 10 1 75.56 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTATGTATGTACATAAATGGCTTATGCTTTGGCAAACTTGCAAATTGCTGTCCACTTTTCATGCTGTCCTCGCCATGTG:1 - chrX 22858389 3' - copia 23 2 61.60 GGAAATATCTTATTGAGTAATTTTGCTTATGCACGACAAAATAAAGGAAAAATAAAACCTATATTGTAAGATTAAAGGCTTTTTAAATTAAAATTCGTACATCTAAGTTTTATAAATATGCTAGATATAAGAGGTAATACCTTATC:1 + chr3L 26015083 3' - Circe 7001 1 66.44 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCT:1 - chr3R 12599039 3' - 412 46 2 61.40 GTTATATCTATATTAATCATACCTTAGCCTTTATGTTCCATTTTATTTGTAAATATTCGGACAAGTGGTGTATTTTTAACAGAATCACATAATCGCATAAAAACTTCAGCAAAGAGGTGGCAAGGTCAAGCCAAATCAAACGGTTA:1 + chr3R 20911037 3' - transib3 290 1 74.66 AATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTCTGACGACGGTCACTAA:1 + chrX 21947717 3' - mdg1 7069 2 52.81 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACAATGACCGCTG:1 + chr2L 3294198 3' + hopper 1353 1 66.15 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATCTTCCGCAGATACAAT:1 + chrX 1103740 3' + pogo 2090 1 71.67 AGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCT:1 - 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chr2L 3890121 3' - jockey 57 1 51.37 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCATACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCAAAGTGTAACACGCATATTGCAAAATATTTTGCATA:1 + chr3L 20289169 3' - jockey 4684 1 60.96 CGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAACAGACTCCCGAATGTTTGTCCAATCAATGATCATGTGCAAA:1 + chr2R 12163595 3' - roo 432 1 70.55 TTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGCGCAGCATGCC:1 - chr3R 17656410 3' + mdg3 5495 2 54.90 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAA:2 - chr3L 17707810 3' - Doc 64 1 56.16 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGGGCGTTGTTCAAATAATAAAAACATCATCTTAAGTCTTAAGTCGAAAAAAACTTCCAATGGCAACCGCTGATTAAGCTAATTTATCTTGTTTTTCGCTG:1 + chrX 18409578 3' + jockey 4955 1 47.58 AGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTGAGTTTTCTTAAAATATTAGTTCTCTCCTTTTTTCG:1 + chr3R 15711845 3' - diver 5975 2 75.34 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTC:1 - chr2L 686010 3' - roo 86 2 76.03 ATAACAAGAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACT:3 + chr3R 3320511 3' - 1360 86 1 73.97 GTACCTCTAGCCTACTACAATGACATTATTAAGACTATTTAGACTGCTAATTTGTACCGTGTGTTGTGTGTGTATCCCCAATTTCGCTGCACATGACTTTTGACTTCCTTTGAATGTCAGTCAACATTTTCACCAATTAATGATAA:1 - chr2R 18993289 3' - invader2 4856 1 53.42 ATGTACTATATATATATATGTATATACACACAGCGCATTATCAGAATATCACAACTCCCCAAAAAACAGTCGGTGCACAGAAAAAAATATATATA:1 - chr3R 27302367 3' - gypsy11 3988 2 41.05 CGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTCGAGCTACGTGGAAACTTTGGAACTGTAAGCAGATCTCATTCCGCTGAAAGCTAAACTATCTTTACTTTTCCTAATAATATATATTAT:1 - chrX 17770006 3' - Quasimodo 7157 2 53.85 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAATTTGCTCTCTCATGCTCAAAAAAAATTGTATAAGACACTTATTCCGAGTATCCGCCTTGCAGGCCCACAGGA:1 + chr3R 23765500 3' - roo 16 2 74.48 CTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAGCTGTGGTAGCTATCATGAGAGCAGCAAAGGTGTGATCGAT:1 - chr2L 22015881 3' + Tirant 359 2 55.48 ATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGCGCTCTTAATAGTATGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCACTTTGGTAACTCGCGCGTCAGGGC:1 - chr2L 23372500 3' - gtwin 44 2 54.11 ACCACACACACACACACATATGTTCCTGTTGGGCTAACCTATTTTTAATTTGTATTTGTTTTTATTATTATTCGATGGTCCTCTTTGGTCGAGGCTCCACTGTAGCTTCCTCTTCCCCATAAGACTGCAATTAAAGTGCAGAAT:1 - chrX 14209390 3' + accord 7030 2 81.25 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGTCCTAGTAAATCCCAG:1 + chr2R 21402664 3' - mdg3 67 2 73.33 AATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACTTCCAGTTTTTGAGATATTCGACCCAGGGCAGTTTGGCCTACGTTTTGCAGACATTTTTCTTTTGGC:1 - chrX 17382089 3' + FB 31 1 66.44 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGT:1 + chr2R 21402718 3' - mdg3 5291 2 58.22 ATTGATACCGATTAGATTAAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAAAACGTTTCTTGCTACCTGTTGCGTACTTTCCAAAGAATACCGTATACCCTGTTAGTAGGCAGGAACCGTCTCTAGTGCCGTT:1 + chr2R 6526608 3' + jockey2 3331 1 57.86 CACGCTCACACTTTTGAAAAATGTTTACATTTTTTCTCATTTGTTTACCCAATATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAG:1 + chr2R 5321181 3' + INE-1 253 1 58.22 TTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAATGGGGCAAGTGGAGCAGAGTCCGCTGCTAA:1 + chr2R 16724512 3' + gypsy4 6573 2 78.42 TTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTTATACTTAAAAAAATTAGATTTATAA:1 + chr2R 4029404 3' + 297 342 2 55.48 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAA:1 + chr2R 10695900 3' + roo 9037 1 60.00 AGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGTGCTGACCGCCGCCGGCGGGTTTTCCACTTCATCCACTTTGCCTGCGCACTGCGTGCACTTTTTGCCTGTCACATTTGTGTCGCAAACAGG:1 + chr3R 27367645 3' + F-element 4396 1 71.32 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCATTGTTGTTGCTGCCGAGCGGAATTGTGTGCGGGTATATAGGTGGCACCCGCTCTCTATTTACAACAACTACT:1 - 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roo 8686 2 69.57 GACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAAC:1 - chr2R 641882 3' + opus 417 2 77.30 CTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGGCCTGCTCCGATTCGGAATCATTAAATAGACGACAGGCGAAATCGACAT:1 - chr2L 11951525 3' - pogo 69 1 64.38 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGG:1 - chrX 4778174 3' - 412 58 2 56.55 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACATATAGGTGGGCAGCATGGTCATCAGCGTTTCATAGCCATAATTGTGC:1 - chrX 4785082 3' + roo 335 2 67.81 GTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATTTTAAGTGTGTTTCTGTTTTTGCAGCAATTTACTCAATATTTTTTTTTGTTTTTGCTGTACTTTCTTTTATTGTGTATATTTTTATATGGTAATTAACGAATGATTACATGATGATTAATTGCA:1 + chr2R 17199644 3' - accord 7027 2 65.07 GATTATGTTGGAGGGCTTGATTTCGCCCCCTTAGTGGTTGTCTCTAGCCTTGTGGCGTAGAGATTTGATTGTAATAAGAAGAATCCCCCATTCAGCCGCTTTTATTGTGGCTCGCAATTAGCGTTGTCCATT:1 + chr3L 21911991 3' - gypsy 7349 2 60.61 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATATCTCGCTGCAATGTGGAGTTACTCGGGTAATTCGCTCCCCAGTTAATTTTGTTTTCATTTAGCCTAAGACTCCTG:1 + chr2R 17121704 3' - blood 45 2 53.42 ACAGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTTAGAAGAACTGTGTAATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATGCCAGA:1 - chr2L 9778712 3' + F-element 4579 1 67.12 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTTCCCATCTACACTTGGCTTGGCCACTTGTCTATCGATCTGTTTTGTTGTGCGAGCCAAAGAAACTTGAATGTTTTGCGCATTTGAATAGTCGTCCGGAGAAA:1 - chr3R 13612758 3' - 412 14 2 75.35 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTTCCACCCCCTTCGGCTGGGCAAAGTCCTTGGCGTTTATG:1 - chr3R 22100460 3' - 412 13 2 79.45 ACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGGCTGCATTTCGCGGCTATTA:1 - chr2L 18279857 3' - gypsy5 6977 2 59.59 ACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATCGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGACTTTAATTCACTCCAAT:2 - chr3L 16973311 3' + S-element 169 2 74.66 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTT:1 - chr3R 21705999 3' - 297 6600 2 55.95 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATT:1 + chr2L 14248099 3' - I-element 69 1 62.33 AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATATATTATATATTCTCTTTATATATTATATTGCCCTAAAATATCTAGGTTTTCCAAAACCTCCGAAAACTTTTAACTTTCAGCTTGCATTGAATAAATTG:1 + chr3L 22408780 3' - Ivk 22 1 66.44 TATCGTTTTGGTGTCCCTAATGGATGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGTTTAGCGGATCTTTTGTCACGTTCTGCGTTAATTCTGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGT:1 + chr2L 22684577 3' - transib3 93 1 68.28 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTAACTTTTCTGTCCCTTTGTAACACTTCCGCAAAGCGAAAAGAAGGCACTATTTGGGTAGAATAATTTTA:1 - chr3R 16181078 3' - roo 6 2 78.08 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCATTTTCTGCA:1 + chr2L 11951623 3' + pogo 2050 1 56.93 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACCGCAAAATCTATAAATAGCCGAACAGTACAA:1 + chr2R 21371525 3' + roo 8999 2 71.53 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGG:1 - 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chr2L 11072324 3' - Porto1 4474 1 74.47 CCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGAGTTCCTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGACAA:1 + chrX 4778238 3' + 412 402 2 81.88 GTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCA:1 + chr2R 5532369 3' - G4 3777 1 52.74 CAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCCGCCATGGAGCTATACAACAACATTCTGGTCTTTATCGTATCCG:1 - chr2L 864233 3' + 1360 3158 1 67.16 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATAAGAGGGGGAAACCACTGCGCCCCGCTGCGAATTATTAACTTTGGAATGGGGTTGGCATGACACCTAGCTACTGATTACAAGTGCTGAAAATGTTAAGGGGTGAACCTTCG:1 + chr3L 2885387 3' + S-element 1710 2 75.86 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACAAGTTAATCAACCATGAACTTTAAAGCCCCGCTCTGAAATGCAAAAAGGAAAGCAA:1 - chr3R 24476281 3' + 412 425 2 61.64 CTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCTAAAATATTTGAATTATCAGTGTGGC:1 - chr3R 11750145 3' + Tabor 7291 2 60.69 TAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAA:1 - chr3R 4160062 3' + invader2 191 2 56.16 GGAGATATTTGGATGATTTTTTTTTAGTGGGTTACACATGCCCCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGCTTTGGCCATTCCTAAGAAGAGTGGTTGGCAAACGCTTGTGCTTAAAAATAATCCAGGCAAGCGTAAGGAACCACCTAAT:1 - chr3L 26646232 3' + hopper 57 1 59.59 GTATGCTAGTCAATAAAATAAAATAATTTCGTTAACAAAAAAAAAGAATTAATAATATTTTCTGAAAGCTCTGTTTCCGGCTCTATTACAAATTTTTTGCCTACCTTATGGCGTCTGAATTGAAAAATTTATTTTCGTTTTGGATT:1 - chr3R 25087318 3' + jockey2 3371 1 56.16 AGAACTCGACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCAATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGA:1 + chrX 21587773 3' - INE-1 133 1 45.89 GATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTCCGAGAAAGAAGTACACCATTTAATGACCTCG:1 + chr3R 13349175 3' - BS 5011 1 72.60 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGTGACGTATTTACATTATAAGTACTGTCCAAAAAATAAGAATATGCTGAGTGGCAAAAAAACCAAACAAACCACAACCACTTTTGTATACAATCAATATCCCAAGTGAGC:1 + chr2R 1478291 3' - opus 7 2 78.08 GCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCAACGACATATATATATATATATATATATAAATATGTTGACACCAGTAAATCTACCCGAGAGTTTGGACTTTACGGGGTACTACA:1 - chrX 10161085 3' - micropia 4971 2 68.14 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCAAGCTGACTGCATGCCACTTGGCCAGTTTGAAGTAGATGCGTCGTATCTCATCTAAGGTGGCGTCCCGATCCCGCAGCACAATGTAACCCA:1 - chr3R 25304662 3' - roo 2 2 82.88 GCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACGATTA:1 + chr3R 24729648 3' - Juan 4156 1 70.55 TAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTG:1 + chr2L 18279946 3' + gypsy5 349 2 77.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACCGCAAAATCTATAAATAGCCGAACAGTACAATTAATTGATGCACAGACACAGTTTGGCATTGCGTGTGTGAGTATCTATGTACA:1 + chr2R 21371578 3' + roo 9050 2 71.23 TGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGACATGTCTGGTTCGATTGAAGGCAATGCGCTGCAGTCAGTACCAGTCCTGCAATGACATTTTATAAT:1 + chr2L 14782829 3' + Q-element 128 2 54.11 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTCTTAGATTTGCTTATTAAGGTGGTATAGTTTTCGCATTTCGCAGGCTTTTTATTTGTTTTTTAT:1 - 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invader4 2810 2 58.52 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCAC:1 - chr2R 6632569 3' - P-element 54 1 42.31 TTCCCTGGAGTTAACCAGCAAGAGAAGGTTACCATCCCGAAGATTAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACATTGGCTTTGGTTTCGAGCTCAGCCTTCACTTCTCGGCCAAG:1 + chr2R 17985583 3' - Ivk 464 1 69.63 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATTTATTTATAAACATTAGAAGTGCATGCAGATGCGGATAAAAACAAAATGTTCTGTTGTTTTCTGTGGCGAAACATTAAATTGGATATCC:1 + chr3R 15885252 3' - I-element 30 1 63.70 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGACCAATCCGCTTAAGGC:1 + chr3L 16973489 3' + S-element 1680 2 57.53 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCGAAGAAGGCCCAAAAAGAGCAAAGCTGCATATACACTGAGGAAATTGCATATATCAACCAAGGTACGCTCACATATGT:1 - chrX 14951087 3' - P-element 43 1 56.16 ATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGTTCAAAACCTTTCACACTCTTGTTATGGAAGCGGAC:1 + chr3R 15702975 3' - copia 4955 2 75.34 ATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTCCGTTCACTTTCATTTGGGGAGTTTCTCAGAGTTTCGTCTGTCATTTGCCACCTACAG:1 + chr3L 2413374 3' - Doc 4474 1 63.01 GATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGACTTTTTACAATTGCCAAATCTATTTGAAAGCGGATAAAATATAAATAATAACAATGGTTTTCGAAAGTATTATAAATTTAAGTCACGAA:1 - chr3R 6130856 3' - Burdock 6128 1 58.21 AATAATAATAATAATAATAATAATTTGCTTTTTCTATCCACAATATAAAGTATCTTGCGCTCTGTTTTCCTAGCCGAAAATGCTCC:1 - chr3R 14976530 3' + mdg1 31 10 45.35 CAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCAGAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGTACCGATCCGCTGTTCAAGTCAAGAAATCCCATGACAAGTGCTTAG:1 + chr3L 11145492 3' - copia 5074 2 67.12 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTATTGTGGCATTTCGTTGAATAGAATAGAAACAGAGTCTCATCGCCTTTAAAATTGAGGAAAAGCTTCTCTGGCGGACTGCT:1 + chrX 19281825 3' - opus 35 4 60.27 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTGTCGCCGACGCTGCTCTTGCATCCGCAAAATGTAC:1 - chr2R 11609181 3' + roo 9041 1 63.01 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGGAGTAAACACTTTGTCGACACTTCCATCCACCCCATTGAATTCTCTATAAAA:1 - chr3L 7995375 3' + P-element 2870 1 71.74 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCTGTGCAATATTCGCGGCGTTTCGAGAGACAGTTGATAATGGTGAAAGTTT:1 - chrX 3996467 3' + roo 9037 1 59.15 CAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACACATATCGGTGAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACACAAGC:1 - chrX 21852451 3' + gtwin 7349 2 59.13 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGCAGC:1 + chr2L 16458697 3' + roo 9024 2 52.74 GAACTCGACCATAGCATTCTCTTGTTTTATAATTTAATAGGTATATCGTTAAGATGACCGAATAGTAAAAAATTCTCCAAGCAATTTTGTAAAATTCTAACCAAATAATAAATTTCTTTCGTTTTAATCTTATAGGTTCTCCGTGC:1 - chr2R 13155859 3' + INE-1 574 1 78.08 GGGAAAAGATACCGCTTAAATATGACCTCCAAAAACTTATCTATTCCAAAAAAAAAACTTGACGGGTGCTACCAAAAAATCAACATTTATATACTGATTGGAAGCTAATACCCTTATAACCTTTATACTCTTTCTAAG:1 - chr3L 27269742 3' + S-element 1338 1 49.28 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACTCATTATCTATTCCAAGAATTATGATTATCAACTATTATGTATTAATGTAATCAGTTTAA:1 - chr2R 20673631 3' + mdg1 7399 2 58.22 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTGGC:1 - chr2R 12543083 3' - roo 81 2 75.34 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACAATGAAAGCGATGGAGAGAGAACAGGATAGGTGGGTCAGGTCAAGAAGGCGATCAATAATTTATTGCGACATGGGAAGGGGGGAAAC:1 + chr3R 25389630 3' - roo 8696 2 44.14 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAAC:1 - chr3R 7035240 3' + roo 9012 2 58.90 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGAC:2 - chr3L 17175138 3' - 412 7136 2 72.60 GCGCAAGAATGTAAATAAAAAAGGATAACATGAAAAGCTAACGGGATTTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCT:1 - chr4 123989 3' - HB 168 1 73.29 AAAGAACAAAAAAAAAATGGGGGGATTTGTGAACTAGCAACATTCTGCGTCTGTTGCTGCAGCTGCAGCGCATTAACCTCGTTCGTTGCGTCTCTCGTCTCGTAAGAGTCCGAATCCGAATCCAAAAACTCCTCCTTCTCCGACTC:1 - chr3L 10975875 3' - hopper 139 1 81.51 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATT:1 - chr3L 11336323 3' - blood 46 2 50.68 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTTCCTAGAGTCGTACACCCATGGACTGTTTGAGATGCCACATGTCCT:1 + chr3R 25304855 3' + roo 399 1 76.56 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGCAG:1 + chr2L 246119 3' + roo 396 1 74.80 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTATCAAGAATATATATAGTCTATACAAGTTAAATG:1 - chr2L 13154252 3' - Juan 73 1 64.38 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGACCGCAAAAATGACAGCCCAACGTGGGCTC:1 + chr3L 10144757 3' - blood 7068 2 61.64 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGCGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGCATGGTTATTTCCCCCTGTCTACAATTGATTGGCAGTCGCGTTGAG:1 + chr2L 12414979 3' + pogo 2059 1 55.65 GAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCAC:1 + chrX 6138716 3' - opus 17 2 60.00 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTG:1 + chr3L 15276706 3' + hopper 1414 2 63.33 TCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAGTAATCATCTTATTCTTGTTCTGAATGAACTGACAATTATTTAATTTG:1 - chr3R 12593036 3' + flea 4943 1 69.18 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTAACTTTTCTGTCCCTTTGTAACACTTCCGCAAAGCG:1 - chr3R 16181111 3' - roo 8664 1 77.57 CTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCAACAGAGCAACCCTTTTTAAATTAACTGCCTGCTTACGCACTTGGCCAAGATGTGGGCGGTAAA:1 - chrX 9706634 3' + Doc 332 1 67.00 CAAGAGAAACACAAAGCTTTTTCTCTTCATGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCACATTAGAAAAGGTCGATCTCGGCGTATTCCTTTAGGCTAATCGTAGTGCTCATCGTGTTATCCTTCGGATTCTGGTCCATTCCCGCA:1 - chr2R 23559133 3' + Idefix 361 2 51.39 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCACTTATGTCACTGACTGCTGCGACTGCGGCTG:2 + chrX 6138746 3' - opus 7025 2 66.92 ATTTTAATTAGATTTTAATTTTTTAATTTTAATTTTAATTAAGCGATTGGCCGAACTCAAATTGATGGCCAATACAAGCGGTCTGCCAGCTAGTTGCACTTTGTGTGTTTGACCCATGGCTCATAATATATTTGGTTAATTACTTT:1 - chr3R 9922523 3' + Rt1b 125 1 73.29 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATATATGGTTCTGTAGAGCATAAGGGAAATACTCACAAACACATTTTCTCGGCATTGCCGTTACAGCTACACGAACAT:1 + chr3L 12224766 3' - 412 13 2 76.03 AATTTGAAAGATGGAAACGTTTGCCCATTTAGTTCTTTTTCCACGTCCAATTTTCAATAATGCTGCTCTCTCCTGGTGGCATTCCCTTTTTTTTTTATTGAAAAATGTATAAGTATAAATAGAAGCGCCCTCAGCTCAAACACCT:1 - chr2L 23025930 3' + FB 40 1 62.07 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATGTGGCATGGAAATATTACACATACGCCCATTGCGCCCTCCGCCTAAAAGTATGC:1 - chr2L 2004929 3' - jockey 62 1 61.94 AAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAAGAAGGATCTCTTAACGGATTCCAAGTGATCGAACACTCCACCCACCA:1 + chr3L 10087500 3' - 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chrX 12191543 3' - pogo 69 1 67.81 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATTTTAATGGAAATTGACAACTATGCAATAGTTGGAGAA:1 - chr2R 5922913 3' + jockey 4986 1 61.38 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCTGCTG:1 - chr2L 13792584 3' - F-element 46 1 55.05 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACATATAGGTGGGCAGCATGGTCATCAGCGTTTCATAGCCATAATTGTGCCCGGCATGGGACACCAGAATGGCATAGAAGGGTGGCGATTTGGCAATGCCCAGAAAGGGTATCC:1 - chrX 4785018 3' + roo 402 1 76.39 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAAAAGACTTACGAAGAATCACTTC:1 + chr2L 9485715 3' - 412 30 2 54.79 AAAAACTACCCAATGTTCTACTTTATCATAATGTTGTGACACTGAAGGATTTGTCTGAAATTTGTACTTCTTTGATTAATGCGAAGAAACACTGCTTGGGGATCCCAATGATACCACTGAGCTTTCTCTTTCTGCATTTGTTGGT:1 - chr3L 25911965 3' - looper1 1514 1 78.62 CTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGATCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTTGCAATCCGCTTTTAAAACATTGTTTCTCCTTAGAAACTGATATTTTCAAAGTTCTATAAATT:1 + chr3R 29288868 3' + Tc1-2 478 1 73.29 TCCAAAAGGTTAGTGGTTATTGATCTGCATTTTATAGAACCGTGCTGACACGGTGATATGATTGATCTACAAATGTGCTGTGGAGGAGAAAAATGGGAAGAGCGGGGAAAGGAGGCGCCG:1 - chr3L 3736088 3' - Q-element 233 2 68.33 TTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCAT:1 + chr2R 2875232 3' + TLD2_LTR 98 1 63.70 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGCACGACTTTCGG:1 - chr2L 9237490 3' - blood 57 2 56.85 GGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCGCATGGAATCGCTG:1 + chr2R 15829627 3' + invader4 3081 2 76.58 AAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTAAAAGGATTTACACAAAAGATAAGTAAATAATGTGTTAAAGGAACTAAACAAATGATAAGTTAATTATGTGTAAAGGGAACTACACAAATGATAAATTAATTATCG:1 + chr3R 1568204 3' + HMS-Beagle2 300 2 76.03 GCAGCAAAAAACACACAAATCATCTACTTAGCCACCAAAACTCAACACTATGTGCAGAACATAGTTCATTAGAATTCATGCTAACTCGTCCCTGCGTTGTACGACGATGGAGCTGGAAGTTGAGTTAGGAAAACACCGACACA:1 - chr3L 23434653 3' + Porto1 4442 1 67.13 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGTACCGCAAGTTATGCAGTTAAAAAAAAAAACGGAGAATTTTTCACGCACACTTTGGTGGGGGCATCATGCATTTTTTCTATGCTGCTCACTTTTTTACA:1 + chrX 5145556 3' - hopper 21 1 67.12 TGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAATTGGCCCAT:1 + chr2L 16089707 3' - 3S18 37 2 59.59 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCGCACCAACACAAATGCCCATGCACACACGCACACACACACCGTGACGCATTTTTGCACAAATACAATCGCAGATAAAGCAGGGAG:1 - chr2L 8366489 3' + 1360 3369 1 68.22 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGGCGTACTGAAAGAAGTTGTTAAGAAATCTATCAAATTGAAA:1 + chr3R 7539516 3' - roo 80 2 73.29 ATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTT:2 - chr3R 3617310 3' + micropia 173 2 74.66 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTTTTGTTTTTTGTTGAGACTAGGGGAAGTCCCTTGCCGGCCATCTCT:1 - chr3L 2885235 3' - S-element 69 1 67.12 GAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATGC:1 + chr4 829127 3' + INE-1 148 1 67.12 ACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGAAAAGTTTTTGAAGCTTCCCGCATAATCAACTCTGTGC:1 - 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chr4 509546 3' + INE-1 500 1 73.68 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGTTAAGGGGTGGCTCCTTAACAAATGAAGACATCAGGTGAGTTTGGTTATTAATTCACCGGAAATTGTGTTTA:1 + chr3L 14076315 3' + roo 9026 1 54.11 ATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCTTTTAAAATCATTAGTTTCGCGATTACAGAG:1 + chr2L 13845742 3' + F-element 91 1 78.57 CTATAGTCGAGTTCCCCAACTATCAGATACCCATTACTCAGCCAATGGAAAAGCGGGTGCACCTTAAAAGGCGGGACAAAGGTGCAGACCACAAGATGATTTCAGAGACCTCAAACCTCCCCTGAGCTTCC:1 + chr2L 22018624 3' - INE-1 566 1 64.12 CTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTCTGAGTTCTATATATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCGTGAATCTGAATGACTGAAGAACTGTTTGAATTAATCCACCTTGGGATTCGAATATTCTCT:1 - chr3R 19446069 3' - gypsy4 434 2 62.33 CTGTAGAGAAAAGGTATCTCTACGAGCAAGACCACCACACCCAACGCCATGTCCAACCTTTGACACATAAGTGAGTGGTTTTTACAACCCATTCTATTTGAAAGTATAACCATTTTTTTTTTGTTAACCGCAGAACTTTCATCAAC:1 - chr3R 30169694 3' + Gypsy12A_LTR 2148 1 69.86 TGTCTTTCTTTTTTTTTGTTATTTTTTTTTTCTTAAAACCCCTCAGTTTTACGACCATTTATGTATGTGCCACCCTCAATGGGTTAATGGTGCCGCAGGGAAAGAGATCAAAAGAGTGTCACTTGCATTCTTT:1 + chr3L 7573287 3' - gypsy7 5002 1 74.44 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTATTTCAAGAAGACAACTGTGGGAAACTAACTGACTCAAATGAAA:1 - chr2L 12553428 3' + 412 452 2 59.46 GCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTTTTTTCAGATTTTTTGGATTAATTTGTGATTTTTGAGGAAAAGAATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATGGGGGCTGACCGCTTAAACATCA:1 - chr2R 5948536 3' - I-element 5204 1 70.34 GATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGAGATAGTCGGTGACTGACAAATATTAATTGTACCCTATAATGCTTTAGTATTCACAA:2 - chr2R 1007653 3' - Ivk 94 1 73.97 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAATTGCTCAAGAACAACAGATTACACTTAT:1 - chr3L 14062219 3' - Doc 57 1 51.08 ATCTAAGCTCTTTCATAATATATAGTTAAATTCAAAATACAATTTACAAAAGTTTTTGACATTATGCCAAAAAACAGGGAATCTGGCCCAGTGTGCACTGGAAGGAATCGCTGTCTCTCTTTCTGTTTTTGTTC:1 - chr3R 447119 3' - transib3 74 1 61.19 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCATTGTTGTTGCTGCCGAGCGGAATTGTGTGCGGGTATATAGGTGGCACCCGCTCTCTATTTACA:1 - chr2L 14095545 3' + pogo 2059 1 53.90 CGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCC:1 + chr2R 21402661 3' - mdg3 83 2 77.44 ATAAAATAAAATACATAAATAATTATTTTTTTTTTTGGGTTACGTACCCTAGTTTTAATAAAACGTCGCATAGTTTTTTAAACATTTTTCAAAACCTGCTTTACTCGAAAGAAAAACGCAACCGGCAACTTTGAGTGCCAGCCAGC:1 + chrX 7760053 3' + Doc3-element 77 1 60.96 TAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATCC:1 - chr3R 24729574 3' + Juan 4154 1 60.96 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCCAT:1 + chr2L 17250834 3' + opus 7455 2 51.37 AAAAATTGCGTTTAATTAATCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACGCATGCCACGGCATTCCGTTCCCCAATCAGTCCCCTTCCA:1 - chr2L 9198287 3' - S-element 78 1 74.66 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCTGCTGAACCAGGAACAAGCGTATTTCCCTGGCAACCATGTGTTCCGCACTCTTCTCCTGCTTC:1 - chr2L 13792526 3' - F-element 21 1 73.94 CTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTACAATTGGCGCCCAACGTGGGGCAGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTGACAACCGAGCTTCCCGTTCTCCATGCGATATATCCGGCCAGATATGTTTTGATACAGTGTTTTTTT:1 + chr2R 20959609 3' + Circe 220 1 67.12 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGT:2 + chr3R 13349114 3' - BS 5072 1 69.18 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGTGATATCATATGTTATAT:1 - chrX 4778156 3' - 412 33 2 59.42 AATCGTTAAAATTGATACCGATTAGATTAAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAAAACGTTTCTTGCTACCTGTTGCGTACTTTCCAAAGAATACCGTATACCCTGTTAGTAGGCAGGAACCGTCTCTAGTGC:1 + chr2R 6526604 3' + jockey2 3321 1 54.11 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTCGATTAGTTTCGGATCTAGGTGGATGTAGATCAGCTTACATACATAAATACGATCCCTTCGGT:1 - chr2R 6594620 3' + roo 9006 2 56.85 ATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTAGTTCAACGCACTATTCGTTGTCAGATAGAAGTCTCTTGACTTTTTTATTGATTTGTTTAGTTCACAGATTTGATTGATAT:1 - chr3L 18030950 3' - invader4 2795 2 58.90 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACACACACACACACACACACTTGATATGACACCCATGTAATCCTGGCTGATGCAATATCTAAATTAGCTACATCACAACCACTGCGCTGATAAGAGAAAAATCAAGTT:1 - chrX 13395211 3' - roo 8674 2 67.12 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAG:1 + chr2R 10695883 3' + roo 9020 2 56.55 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGG:1 - chrX 1103619 3' - pogo 67 1 66.21 CAATGCTTATGACTGCACGAAATAAACCCGAACGCATGAAACAAAAAAAAGAAAAAAAAAATCGCATGGAAAATGGCAAAGAATGGTAGGTGGAACCTGTGAAGAGAAAGTAGATTTTAATATCTTAGGTGATTTCATTTAGGAAA:1 + chrX 9505056 3' + Doc3-element 396 1 45.21 GTTTTTACTTGGACCTTAGTTTCGTGGATGGTGCCCTTTTTTTGAGGTATTATGTGGAAGTTGTCTCTAATGGTTATCTACTAGATTCTTCGCCTTCGATCCGCATCTCCGCCAGCGGCATCTAC:1 + chr3L 8942719 3' - Fw3 96 1 52.00 GTTATTATGTTCGTATATACTACAATCAATAGTTTAAGTTCTTTTTAATGCCTTTGGTTAATTTAATGCAACTAGTTAATGTTCTGTGCTCTATCCCTAGCTTATCCTGGTAGATCCTTCTGTGTCCGATCAAGTACCTGCTGCA:1 - 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jockey2 3245 1 75.86 CCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGAATTAACTTAACATTTGTGTATGTACATACTTCGCGTCATCCGTTGAGGC:1 - chrX 13749222 3' - Circe 7144 1 59.43 CTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACATAATGTTCCCGGCCTAGTTTTTTGCCAAGAAACCTCTTAG:1 - chr2R 4638611 3' + 1731 4543 1 76.03 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATCATCTCAAGTGGGCCTCTCCATTCATCTTTCGTCTGTCGGATTTCGTAAGG:1 + chr3R 13612894 3' + 412 425 2 60.27 CACACGTCGGCGATCGAATTAAAATGGACGTGCAACCGCGAATTCCCCTACAATGGCGATAGACCCAGAACAACTCAAAGCTGTAATACAGGCAGTGGTAGCCAATACTTTAGCGGACGAGGC:1 - chr3R 1970343 3' - F-element 11 1 78.86 GCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTGCTGTGGCAATC:1 + chr2L 12340831 3' - diver 5941 2 54.81 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGAATGCACTCTCTCACTTATCCGCTCTCACTCTCAGCAGACTGCAACTGTAAATTGTAAAGGGAA:1 + chrX 14951209 3' + P-element 2850 1 53.12 GAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCGC:1 + chr2R 15829615 3' + invader4 309 2 65.18 TCTGAGATCTCGACGTTGATACGGACAGACGGTCATGGGCAGATCGACTCGAGTATTGTTCCAGCAGCGCTGGTTGCCCCTTTGGGCAACTTTCATGGTGTCTGCCTTACATGTGGCTGCATAAATTTT:1 - chrX 7802051 3' - INE-1 137 1 55.81 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGTTAGCACCAATAAAATATTCCAATGTGATCCAATGACGGTTTTCATGTGTTCCTCATAGCACCCT:1 + chr2L 12319374 3' - copia 27 2 65.75 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCGATGTGGAACGATACATTTAGTTGATTTTTCACTGGGAGCAGAGCAAC:1 + chr3R 26520510 3' - FB 23 1 69.86 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCATGAGACATGTAAAAGTTAGTCCTACAAGTCGATTCCTTTATATCACCCCGACACGCGCCGATATAATAATTTTGATGACAGTGTGGCAAGAAA:1 + chr2R 5737262 3' + 1360 3379 2 77.24 AAATAAAACAACAATTTTACTATATTTATATTTTAGAATTCGGAATTTCCGTGAAAAGTCCTGAAAAGCTTTGTCACTGCCAACCCGTCCTTTGTGTGTTTTTTTTTTCGCTTGGTGGCTTTTTTATTTTTCCTTTCGCTTC:1 - chrX 21234383 3' + 297 394 1 76.76 TTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCATGGCTCGATTCTGCAACGACCATGCCCCCTTTGCTGGCCGTCGGGCGG:1 + chrX 8755118 3' - transib2 68 1 68.57 ATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACAGAGGCATTGCTACCCTCAGAATGTGATTACACTGACCATT:1 + chr2R 4362629 3' - gypsy 7039 2 55.48 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGTTTGGGATCCAGCTAAAAAAAGCCGAGGCAGACAAGGCAAACG:1 - chr3L 13827229 3' - hopper 20 1 69.63 GCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTCACATGAAAAAAAAATAATAATAA:1 - chr2L 15234316 3' - micropia 5008 4 54.11 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTT:1 + chr2L 246090 3' + roo 343 2 63.01 TTTCTCACACCAATTGTTTCAGTCTTAAGCTGATATTCAATCAATAAAAGCGTTGATCTTAGTTCAAATAAGGATCATTTATTCGACTCAAAACAAAAACAAGTTTACTATATAACTACAAAAATTGCACAACC:1 + chr3L 25850474 3' + Tom1 264 1 41.79 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCTGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCGATGTGGAAC:1 + chr3R 26520472 3' - FB 55 1 56.43 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATACGCCGAGTGGTTTAGATAGCAGTTTTTGCAAGTGCGTTGTATTTACTAAGAACTTGAAAACTCCTGTATATCTTTTCCTGCGTATCTCGT:1 - chr2R 19553147 3' - mdg1 29 2 64.14 AGATCGATTCGGCTATTGATCTCCTGTTCAAGAATATATTTGCCTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACGAATCTATTATACCCTTTTACTCTTCGAGCAACGGGTAGTAATATAATAAATAAAATACAGAT:1 - chr3L 23942444 3' - INE-1 97 1 66.44 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAATGGACTGCTTGTGTCAGTTTGACAACCACTGTGCGTGGCAATAACCAAAGCCGCGCTCAAATGAAA:1 + chr2L 4998208 3' - FB 24 1 61.40 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGT:1 - chr3R 13582232 3' - BS 5080 1 74.66 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGCACTTGA:1 + chr2L 9472108 3' + roo 9031 1 57.53 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACCCATTAAGTAACCCCAACTGATCGGCGCAAATGATTCAGCTATGCAGAAAATATGATTGATGATTTTTCCCTCCCACCAGCC:1 + chr2L 12553536 3' - 412 39 2 58.90 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAGCTGTTAAAACCCTGGTTTCCAGGCTTATGCAAAATGAAAATGC:1 + chr2R 6632697 3' + P-element 2872 1 72.66 GAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCACGAGACATGTAAAA:1 + chr2R 5737183 3' + 1360 3307 1 78.26 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTAAGGGCCATATTGACCAAAAATAAATATAAAGATGGCTAT:1 + chr3L 96588 3' - 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F-element 447 1 71.43 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTCGGCAGGTC:1 - chr3R 9160685 3' - copia 41 2 58.04 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTCCTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGAC:1 + chr3R 27822263 3' - I-element 21 1 58.44 ACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACCAAAAT:1 - chr3L 22861726 3' + S-element 1698 1 67.81 TATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTAAATGAAAGGAAAGGGGAAATCACTACCAAACTCAAACTTCCTAAAGTCGTATATTCCGTAACTACA:1 + chr3R 30850213 3' - 412 7474 2 54.79 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGCACGAATTTCGGGGTGAAGGCACTCCGAAAGAATATCAGTCAAAGGATTAAGTAAACATCAGA:1 - chr2L 9237439 3' - blood 6 2 78.77 GAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGTCTAATACCAGGCGCACAGCA:2 - 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G4 3653 1 66.92 ATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGCTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTACTATCCTA:1 - chrY 680441 3' - invader2 4860 2 55.26 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGAACCCATTTAATATGAGCTACTGGAGTGATACCTTTAATAACCACCGAAGAGCACGTGAACAGAGACTTGGGACACAGCCATAATGACT:1 + chr2R 20673762 3' - mdg1 32 2 61.64 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTGGTGTGTGGCTTGTAATGAAATGCACATTATGACCTTTTTAAATGCCGGCTGCTGGTGGTCAAATAAAATCGTGATAA:1 + chr2L 8169029 3' - FB 42 1 50.68 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCGATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAATATAGGATTGTTGCAGAAAAAAAAAATAAA:1 - chr2R 10695759 3' - roo 45 2 53.42 AAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCTACTAAGAAGAAAAGACTGGCGGCACTCGGCGCTAAGGACAA:1 + chr3L 4375632 3' + mdg3 5093 1 70.00 ATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCCTAATTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCA:2 - chrX 9909334 3' + P-element 286 1 14.38 GAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACCCACCCGTACTGATGTAAAGTTTATAAAACAAATCAAGCGAAACACAGAGACAAGTTAGCAACCCA:1 + chr3R 5809949 3' - accord2 204 1 54.79 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTCGGACAACAAAAGTTGTGTTGCCGTTATTCATCGCTTCTTAAAGCGGC:1 + chr3L 12867391 3' - roo 40 2 57.93 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATT:1 - chrX 14964639 3' + roo 320 2 82.19 GACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGGCGGAGGTCAGGCGGAGGTCAGGGGGCGGACGTGAATGATGGACGTGAACGGGGCCATGCCACTGCTTCCAACAACATTC:1 - chrX 8755009 3' + transib2 2807 1 69.11 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGTCGGTCACATCAGCGGCTGCTGCCA:1 + chr3R 12599102 3' + 412 422 2 69.63 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGCAGACGCACAAA:1 - chr3R 10684708 3' + roo 394 1 68.55 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGACTCCCACATGGACAATTGTGGCACAAGATGCCCAACCAATCGAATACTTATTCGTACATATATAGAAAAAAAAAAGATATGGAAATA:1 - chrX 1689950 3' - 412 7086 2 63.01 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATGTAATCGACAAATCGAATATCCAAAAATACCGAAAACATATGTGCGATCGCGATTTCTTTGAGGATGAGT:1 - chr2L 436447 3' + copia 5074 2 52.05 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGAATGCACTCTCTCACTTATCCGCTCTCACTCTC:1 + chrX 14951178 3' + P-element 2817 1 28.46 GCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGAATTACTCAGTTCTTTATTTTCTATAGTTTTTCTGGATAGTCATGACAATTGAGTTTGAGGTAATTGCTAT:1 + chr2L 18149572 3' + Bari1 1687 1 71.92 GAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACATTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAATGCGAAAAAAACTTCATAAATTCTAGGATCTGTTCAAAATCACTTGGAACCAAATAAATATCGGTTCG:1 - chrX 3713723 3' - 17.6 385 2 52.05 AAATTAAAATGTTAACATTATATTTAACGAGTGCTCCCTGTACAGGAAAACCAATTAGCAGAGATAAGAAATTCGAGAGCCG:1 + chr3R 8930435 3' + 1360 3054 1 90.24 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGATATTGGGCGCTGCTTCGACTGGAGCCAATGTCGTTCATTCCGCCGGATCCGCAGCTGCCAATCACGGAGCTCAGGCTGCCCATGGAGTGCTAGGAGCAAC:1 - 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pogo 1981 1 56.16 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATTAATGACTGTTTATGTTTGGTTATACACAAAAGATGAAAGCCTTAATTGTTTATGGCTGTTTATGTTAGTACTAATGTGTTAAA:1 - chrX 3263295 3' - roo 8698 2 61.81 TCATAATTAAAATATTTTATATTTATCTAGCTCTATATGAGATATATTAATAAATATTTCTAACTAGAGCAGGGTCATAAATTTACGTAAGTATAGGCGTTATGATTTACATATTAATAATAAATTTTCCGTTCAATATGCTGATT:1 - chr2L 11462970 3' + NOF 343 1 28.08 AGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGAA:1 + chr3L 25232869 3' - accord2 7462 2 55.08 TTCTAACCAAGCAGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAACAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTTACGCCCCG:1 - chr2R 4260424 3' - micropia 5216 1 46.58 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATATATTATAAAATCCATTTTTGTGATAGAACGTTGTCTACCGACATTTTTTTTTTGCTTTCGCTTTAAGTTACTACATAAATACATAC:1 - chr3L 15099930 3' - copia 4903 2 60.27 GCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTCGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAGTATTTCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAATATTTTGCTTCTTTTATTTTTGTTTACCGTCTCTTACATTTCGTGGG:1 - 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chr3R 11750163 3' + Tabor 7272 2 52.05 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCG:1 + chr3R 9160789 3' + copia 5082 2 54.11 AGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGCATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGC:1 - chr2R 21402617 3' + mdg3 191 2 64.96 CAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGGAACCACGAGTATAATAATCAAAAAGTAAGCGAACAAATAAATTAAAATATAAATTGTGCATATTACTTATGTGCATACATGTAC:1 - chr2L 7992030 3' + 1360 18 1 54.79 CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCAC:2 - chr2L 17029599 3' - blood 70 2 65.07 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTCTGATAAGTTTTTCCTTT:1 - chr3R 20175656 3' - hopper 22 1 69.18 CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAGAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAA:1 - chr3L 24934271 3' - HMS-Beagle2 6918 2 60.27 ATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGGTAAGAAATATTTTGGGGACATTTGTTATCATTGAACAGCTGTTCATAGTTTGCCCACAGCCGAACAGCTGATTTGGCCTAGATTTTAAACTCGAGCATCCTACCTCAAATTA:1 + chr3R 26140391 3' - Tabor 2 2 57.55 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAACTTAGAATCGAAGATATCCAGCCGATGGAACAAATCCTTGTTTCCATTATTTAGAAATAAGCAAAAAAAAATAAACACAGTGCTTTTTTCATTACCTTT:1 + chr4 436945 3' - 3S18 22 2 71.23 AATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGTACCAA:1 + chr3L 12976328 3' - invader4 31 2 58.42 AAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCG:1 - chr2L 20360643 3' - micropia 24 2 60.00 TTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCTCTATCTTCGATAGCTATTAAGTAATCAATTTACATGATGCAGCA:1 - chr2L 15949274 3' + R1A1-element 5301 1 61.90 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTAT:3 + chr3R 9160761 3' + copia 5054 2 61.64 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACAC:1 + chr2R 13644528 3' - Burdock 46 2 53.47 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTATATCGCGATTAAGATAATCAACTGCTCTGCTCT:1 - chr3R 27478510 3' - hobo 79 1 74.64 ATAATATATAATAATAATTGTTCCCCAACTGAAATGTTTTACCTTCGGTCAAAATTAAATCCCGCCTAAAACTATGCAACGCCTGGCCAATAAAACCAAGCAACAACAGTCAATTTTGAATGCAGCACTTAAGA:1 + chr2R 11930287 3' + Tc3 256 1 61.94 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGA:1 - chr3R 12599037 3' - 412 7127 2 68.06 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTCCCACTCTCGGTGCCCAAGTGC:1 - chr3L 18658888 3' + roo 350 2 59.59 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAA:1 + chr2R 10695900 3' + roo 9036 1 59.59 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCGAATGCTGTGAAAAATCGAGGG:1 + chr3L 22052897 3' - mdg1 7054 2 74.66 AAAGCTGCTCATATTTTTCAAGGTTGGATGTCAACGCCTGTTATTTCGGCAAATGCCTCATAGTTATATAGAACTACCGAATCCGCCTAGTTTTGGTTGATCAACCTTAAGCGATAGTTTTTCCCAAAACATTCGCTGGATGC:1 + chr2L 20169312 3' + hopper2 441 1 51.05 CAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTATGTATATGTACACAAAGGATGTCACACGAAATATATTTAAAATTCTTCCAAATAACTATTAT:1 - chrX 22560020 3' - Transpac 4971 2 55.48 GTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTGTGTGTGGGGGTGTGACTTTTGACTTTTGATTGTAGGTTGCTGCTGCTTGAGACTTGGTCGGAGTTCAAGGTTGCT:1 - chr3R 19275569 3' - Doc 4496 1 74.78 ATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTATGCCCCAACTCTTGGGATAAAACATCTCGCACTGTC:1 - chr2L 21951138 3' - Burdock 38 2 67.62 TCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTTATACTTAAAAAAATTAGATTTATAAAGGAG:1 + chr2R 4029409 3' + 297 347 2 53.42 CACATACAAATATGTGTTAGCGTCTTTTCGCTTTTATATGATGCTTGAATTAAGGCTTGAATTTTTCATTCCAGCGTGGCCTATTCCAGATCCCGATCCTGTTCCAGATCCTGGAAGGGAAGCCGACC:1 + chr2L 17383682 3' - Porto1 111 1 53.12 ATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGAATTACTCAGTTCTTTATTTTCTAT:1 + chr2L 18149526 3' + Bari1 1641 1 63.01 AGTATTGCAGTCTCACAATAGCCTTGAATAACAACGTAATGTAGAGGATCACACATCTCGGTAGTGTCTTTACGGTGGAGTTGCAGATAGTATAATGACCTGGAGCTTTTTTTTGTATATATATTGTCGCAACATCAGTCAGGATT:1 - chr2L 15838115 3' - BS3 338 2 76.71 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCTGTGCAATATTCGCGGCGTTTCGAG:1 - chrX 3996492 3' + roo 9030 1 56.45 AGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGTTCAGCCTTGATAGATCCCCGTATGCCATAGTTGCT:1 + chrX 11471512 3' - jockey 4755 1 72.54 GCCGACTAATGAAGTCGGGACTCTCAACTTCACCACGAATAAGCTTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGAAGTATACTGGAATAAGGAGGTAAGTTAGCCTGCTTTTTGTCACTTGGGCATGAAAATTAAAATGGA:1 + chr2L 2265690 3' - Cr1a 4076 1 70.55 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGGATAGTGCATGGTGAATATGGTGATGAAATGTGCATGAAATTACATTCGAACAATCGATGGAGTGT:1 + chrX 3996597 3' - roo 54 2 56.16 ACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGAAAATGACTTTTCTGCTCGAC:1 + chr2R 17890969 3' - Tabor 6902 2 58.90 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTTTCGAGCCACTGTGGACGTGTGGGGTTCCTTCCCTTTGAAGAGGGCACCTTCTCGGAGGCACTCCACTTT:1 + chr2L 11915614 3' + hobo 2936 1 71.43 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCATACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCAAAGTGTAACACGCATATTGCACAATATTT:1 + chr3L 20289163 3' - jockey 4689 1 55.86 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTA:1 - chr3L 13868644 3' - 412 76 2 71.23 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCAACACTGTCGT:1 - chr2R 16441810 3' - I-element 61 1 59.86 ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTC:1 - chr3L 24152419 3' - HMS-Beagle2 28 2 62.22 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTTTAGGTGCCGTTAGTTTTAGCAC:1 - chr2R 11057225 3' - pogo 31 1 62.33 TTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATA:1 - chr3L 9497766 3' - jockey 4849 1 72.60 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGTTTTTTTTGCATATCAACACACGTGTAAAGCAAATGTTAAACATGAATGTGTGTAAGTGAATATGTGCA:1 + chr3L 9571790 3' + jockey 4983 1 72.41 AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTGT:1 + chr3L 27415332 3' - transib2 44 1 55.48 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATTCACTTTCATTTTCATTACACAA:1 + chrX 12866506 3' + roo 9029 1 55.86 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACC:1 + chr3R 21001882 3' - 412 78 2 71.92 AGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATT:1 + chrX 22574691 3' - 17.6 118 2 46.21 GCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAAACAGATACTGGGCAGTTGGATTTCATACGTAACGAATACGATCGCCAGCTGGACACC:1 + chr3R 26449957 3' + 17.6 309 2 51.69 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACATTATGCTACTTACTTTTCCGAAATTAACCCTTCGCAGCACCTTAAATCAAGTAATACTCAAAC:1 - chrX 16579242 3' + roo 346 2 58.22 CAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATATATTATATATTCTCTTTATATATTATATTGCCCTAAAATATCTAGGTTTTCCAAAACCTCCGAAAACTTTTAACTTTCAGCTTGCATTGAATAAATTGCAGGT:1 + chr3L 22408785 3' - Ivk 16 1 70.34 TAAGCATTTGACTCTGTTAACCATTACATCTAGTAAAAAAACTTAATCTTTTAGGTTTACCTTTTGATCTTCTAAATTGGATTTCAAGCTATCTGAAAGGCAGGTGTGTATTCGGAAAAATCCCTAATGAAACTGAGCGCGAAACT:1 + chr2L 17685770 3' + Q-element 325 2 71.23 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAAT:1 - 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chr3L 905811 3' + 412 443 2 68.22 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATATCCAAACATTTT:1 + chrX 1103727 3' + pogo 2078 1 61.34 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAG:1 + chr3R 20988836 3' - I-element 85 1 75.17 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCC:1 - chr3R 12599042 3' - 412 64 2 68.22 GCACTCTGCACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACGTGTCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTACCTACCCTGCACATACCCTGGTCAGTGCCCTTTC:1 + chrX 22495826 3' + Chouto 429 2 74.64 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGACCGCAAAAATGACAGCCCAAAGTGGGCTCAC:1 + chr3L 10144759 3' - blood 7042 2 58.20 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTCGTGATATTTTCGT:1 + chr3R 4528404 3' - 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Bari1 137 1 63.01 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTTAATTTATGATGGCAGTTTGTTATGCCGCGCCCGTCA:1 - chr2L 12353950 3' - jockey 4732 1 71.20 AATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTT:1 + chrX 22574708 3' - 17.6 102 2 45.89 AAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGCACATCTCACAGAGAGCCGCGACCCAAATAGGGAGTAAC:1 - chr3R 9392946 3' + S-element 1636 2 73.29 TTGCAGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTT:1 + chr3L 23678153 3' - Osvaldo 34 1 75.65 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGCTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAA:1 + chr2L 12340816 3' - diver 5942 2 61.98 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGCACTTG:1 + chr2L 9472107 3' + roo 9031 1 57.24 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAAAAAAAATTATATAACGTGGGAAAAACTTTTATGGCCC:1 - chr3R 6244520 3' - Doc 70 1 72.31 AAACATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACAGTAAATTAATTAAAAGTAGCCTACTGGAATACGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCCGCAAGGCAAAAAGTTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATT:1 + chr3R 15095976 3' - Cr1a 4012 1 76.55 TAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTTATTATACAATATTATAAATTTCAGACAGAAGTATTTACAGGTAATGGCGGAGCCCC:1 - chr4 436810 3' + 3S18 297 2 54.03 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTGAATAAATGAATAATAATGTGACCAATGTAACGTTTTCGATAACGTATCGTACATCTTATTCAGTTGTTCCAGTACAACACTGCTA:1 - chrX 16787048 3' - pogo 31 1 57.53 GCTGTTTGGTGTTGTTTATTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCGCTCTCACTCTCACTCTTCGCCAGAACTTTCGTGACCAACAT:1 + chr2L 13782797 3' + Cr1a 247 1 82.00 CTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAG:1 - chr2L 22015921 3' + Tirant 359 2 62.26 GTCTCGACGTTCATACGGACCGACGGAAGAATATATATACATTTTATGGGCAGAAACCCTTCCTTCTGCCTGTGACATACCTTTCAACGAAAAACTTTATTGCACTGTAGGAAATCATTAT:1 + chr2R 25214309 3' - 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Tirant 32 2 58.59 TGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAGTGAAGGGCTGTCAGGTCGAACAGGAGTTGGTTGACCTTGGACCTCAGCAAAGCGG:1 - chr3L 23933502 3' + Cr1a 253 1 56.85 CTCGACTATAGCATTCTCTTGTTTTATTTTGTTTTAATGGGTTGTATAATTCCAAGATTTCTGGGTTTTTTTCCAACATCCATAAATTAATCTCTTTCTGTATGTTTCTTTAACAGTTCTGTATTCAAACGAATATTTTAGAATTA:1 + chr2L 21762458 3' + INE-1 577 1 76.03 GTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGTTTACCCCCGCCGCCATGTACGTATCGGGATTATCATGCATCTGCGCTGATCCCCC:1 + chr3L 11747315 3' - G2 2912 1 70.65 TAGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAGATATTTTTCTGT:1 + chr3R 9352141 3' - Tirant 12 2 76.43 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCTTCTTTGCTACCATGGAGCGGCTCCCAGCACTCA:1 + chr3R 31491003 3' - roo 88 2 78.08 TGGAAAAAACGAAACTGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGACCATAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 12649915 3' - Max-element 413 1 81.43 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAAAAAATACAATAGTTGTGCCGAATAATGAGCATTCTATTTTAAACAGTT:1 + chrX 3263410 3' + roo 9014 2 62.88 CGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAA:1 + chrX 21667936 3' - gypsy2 6547 2 68.15 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAA:1 + chr2L 76124 3' + roo 8995 2 76.03 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTCGAAACCAAGTTAGCAAAATACATTGCATACTTTACAACGTCCTATCAAGGCCCATTGGAACATACATACGATTTCAGAGCC:1 - chrX 6707729 3' - hopper 36 1 59.59 GGATGATATAAAAATCTTTTCAAATACAATTGAACATCATTATACTGATCTAATTCAAAAAATTTATATTTTACAACAAGCAAATATGACTGCCACTATCTATAGAATCTCTGGAAAAAGTTGGAATTTTTTCTGTACCA:1 + chr3L 4571432 3' + TLD2_LTR 48 1 63.57 AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATGTAATCGACAAATCGAATATCCAAAAATACCGAAAACATATGTG:1 - 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chr2L 2030990 3' - 412 7078 2 65.75 CACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACCTGATGTTTGCTTACTACTTAGAAGAAAATACTGTTTACCCAAATTTATT:1 + chrX 16384149 3' - diver 5897 2 79.45 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCAAGAACCCGATCACGC:1 - chr3R 9160642 3' - copia 4887 2 71.21 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATCAGTCAGTTACAGGAGGCAAAAGACCATTAGGACA:1 - chr3L 17175068 3' - 412 6 2 80.58 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACTTTCTCTCTCTGAGCAGTCACTGATTACCGTTGTGTGCGTTGTGCCGCTGTTAC:1 - chrX 8891714 3' + P-element 2878 2 76.56 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTCGTGTTAATATGAAATATATTTTAGTATGATATTATAGTTAAGAGCATTAAAACATTCAGCGTAGAATGCTGTAGTGCATTTGTAATGCGTGGGGTCACC:2 + chrX 16902386 3' - I-element 22 1 68.49 CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATTGATTGCCATGTCAAAGCCAATCCAATCCATTCAGTGTACCCTGCGATTGG:1 + chr3R 24493201 3' - jockey 4671 1 76.11 TGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGACAAAATTTTGTAACGTAATCAAAATGCTATTAAATAAAATAAAACCAAAACTGGACTGCAATGCACCAACACCCACACACTGACCCCTGAACT:1 - chr2R 12580680 3' + F-element 72 1 73.10 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTCCATTCCCCCATCCTCCCTTCCCCTCAC:1 + chrX 7515753 3' + roo 9030 1 53.24 TTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATACAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGTCAGTACAGTGCACAATTTTGGGTGGAG:1 - chr2R 7342302 3' + invader2 81 2 75.81 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTACCACGTAAC:1 - chr3L 13868635 3' - 412 67 2 65.07 TGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAACGCAACTCGGAAAGAAAAGGAAA:1 + chr3R 15022140 3' - Tabor 6877 2 57.86 ATTGGCGGCATATATTGGTTTATTACAATTATATAGTTTTACATATGTATGTATGTATATATATATATACTCCCTATGTGTAGGCCATATAAGCTGGGTAATACAACTAAAATGTACAGACTA:1 - chr2R 18959348 3' + blood 372 2 78.05 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACGCAAAAACGTGCTGAGCAATAATCTAAAACGCAATA:1 - chrX 4701149 3' + P-element 2851 1 42.42 TATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTTAAACAA:2 - chr3L 22054960 3' + mdg1 7010 1 54.11 GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCACTTTTTTCCT:1 + chr3R 8709842 3' + jockey 4920 1 68.49 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACAATGAAAGCGATGGAGAGAGAACAGGAAAGCCAGGCTAAACTGATTTAACTACGCACAGATGTGGT:1 - chr3R 25387763 3' - roo 8718 2 55.48 GTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAAT:1 + chr3L 13827348 3' + hopper 1342 1 67.12 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAGCTTTTCTCTATTTGGACCGTGGCTTAGATATCTTGCCTTAAAATTTTCCGCCTTTCCTTATTTTTTTCACATTTTATTGAAAGGAAA:1 - chrX 12866359 3' - roo 8684 2 69.63 AATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAGAAGTAAAAAATGTGTCAGGCCGAGGAACG:1 + chr3L 22978674 3' - 1360 15 1 73.94 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGACTCCCACATGGACAATTGTGGCACAAGATGCCCAACCA:1 - chrX 1689999 3' - 412 70 2 70.15 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTGAGTTTTCTTCAAATATTAGTTCCCTCCTTTTT:1 + chr3R 15711842 3' - diver 57 2 70.80 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTC:1 + chr3R 16181227 3' + roo 340 2 63.01 TCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAACGACTGGAA:1 + chr2R 5868367 3' - pogo 75 1 71.92 GGAAAATATCGCTCATCGTATTGATCCGACTATTTTTCCTTGCATGTGATAATCGGTCCCTTTTGTAAAGTTTATTCCGGGCTTCACTCGCATTTTCGCCTAGAACTGAGTTTGATTCGTGGGCACCGAATAGAGACTAATCGATT:1 - chr3L 14866374 3' - transib2 2358 1 70.55 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGCACATCTCACAGAGAGCCGCGACCCAAATAGGGAGTAACGAGAGCATCATGTGCTTCTCATCAGCCCTCCAAAGTCG:1 - chr3R 9392908 3' + S-element 1675 1 54.48 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAATGTTATTGAGCGATTGCGGACACTCATACCACTTTGAATTAATTCCAATGCGGAA:2 + chrX 10645066 3' - jockey 72 1 62.33 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCC:1 - chr3R 17605607 3' + Tabor 7288 2 60.27 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACAAAGCTGTGCAAAA:1 + chr2L 1260027 3' - Burdock 6183 2 51.37 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGACGACTGCTTGCAATTAGAGTTGGCAAATTATATTTGGCTTTT:1 - chr2R 12787779 3' + 297 6943 2 65.07 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTACCGCTCTGCTTTTGCCACTTTTATTGTTTGTCTGGTG:1 + chr3R 9190618 3' + Tabor 449 2 58.87 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCACCTCGTTACTCAAAGCAAAACGAAGGACTTGC:1 + chr2L 686118 3' + roo 9056 1 71.43 GATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGAACCCATTTAATATGAGCTACTGGAGTGATACCTTTAATAACCACCGAAGAGCACGTGAACAGA:1 + chr2R 20673737 3' - mdg1 7093 2 54.86 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGCTGTTGGTAAATATACAAAAATATAGGATATATGTATGCATGCGTGTGTGTGTGTCGT:1 + chr3R 5972044 3' - hopper 65 1 58.22 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCACCCGCTGATTTGATTTTTGTTTTGATACAACCAAAAACAAATACAAGAAGA:1 + chr3R 23240298 3' - jockey 66 1 60.61 CTAATATTATTTTTCAGCACTAGCTAAGGGCAACTTAATTCTTAGGATGCTGGACATGTGACGTCACAAAATCAGAAATGCGCCACCCTGAAGCACACATGGAACAATCGATATATATCGAAAACATGTGACTCACTTGAGTTATG:1 + chr3R 31146624 3' - Gypsy12A_LTR 348 1 80.14 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTTTTGTTCTCGAACTACATTCATGAACTATTTCATCTCAACTTTTAGG:1 - chr2L 17029542 3' - blood 7024 2 73.29 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGAGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCATCTTTGGATGAGCTGTCGCCGAT:1 - chr2R 11609207 3' + roo 358 2 53.24 TAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAAGATAACAATATCGTGCGATCCATAGACGAGGGTCGGTTGAATATAAATATAGAGGTGGCCCCAGAGGCAAAAGCACGAAA:1 - chr3R 20484436 3' - accord 124 2 61.79 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAAATGGGTGCCAATGTAAGTGAAACCTATCTATTCAATGGTGATTAAACGATTTATCTTAATTTTTCACAAATC:1 - chr3L 14553039 3' + roo 405 1 58.90 ACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATACTTACGTAGTTACTCGAATCGAGTCGAATATATTGATCCGTCTATGACGAAGACAAAGATCAACGCTGAAGCCAATTATAAATTGAAACACGAATAAT:1 - chrX 18918809 3' - gypsy 19 2 72.22 GGGTATCTGATAGTCGAGAAACTCGACTCGAGAAATATAGCAATTTCTCTTGTCGATTTTGTAATAAAGGCAGAAATCCTATGTGAGCCAGAACGCTATCATGTTAAATACTCTTCAGTTAAATACTTTTAAGCTGTTACTAGAGG:1 + chrX 22784169 3' + INE-1 556 1 59.59 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCAAGAAAAAATGATATGG:1 + chr2R 19553307 3' + mdg1 7427 2 60.00 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAATAGTCAATATATTTAGACATGTTAAAGTTTTTTTTTAATAGCCTTTGTCTTACTTCTAACTACGTCAAAGTCACATAAATTTGGAATTTTAAGTTT:1 + chr3L 9497865 3' + jockey 4969 1 52.05 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGTTAAGGGGTGGCTCCTTAACAAATGAAGACATCAGGTGAGTTTGGTTATTAATTCACCGGAAATTGTGTTTAGCTATACCCAGTTCTTGGTAGCTAGTTTGGATAGTAT:1 + chr3L 14076352 3' + roo 400 1 73.97 GCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGTGCTACTGACTGTTGTATGGGGAATGTCGATATTGAAA:1 + chr2L 22746521 3' - R1A1-element 5048 1 73.97 ACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTTATTATACAATATTATAAATTTCAGACAGAAGTATTTACAGGTAATGGCGGAGCCCCGTTT:1 - chr4 436806 3' + 3S18 308 2 54.70 GGCATATATTGGTTTATTACAGCATGTGTGCGATGACAATATAAATAAAATAATTGCTGACATAAATAAATTCAAAACTCTTGTAGACAGTTTTTTTTTTTGTGGTTTTATTTTTGGTTTTTTGAGTTGTGCGTGG:1 + chr3L 6775497 3' + blood 378 1 78.68 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTTTAGGTGCCGTTAGTTTTAGCACCCACTC:1 - chr2R 11057219 3' - pogo 25 1 66.44 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTACCACGTAACTATCGTATCGTAAATAGCAATAGCAGTTAGTTATAGT:1 - chr3L 13868598 3' - 412 29 2 63.45 CAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTGAGTTTTCTTAAAATATTAGTTCCCTCCTTTTTTCGCCCGGTTTTCCTTCTTTTTTTTTTTGTCCTGCCTTTGTTTGGGTCGTGGCTGTGTG:1 + chr3R 15711906 3' - diver 18 2 66.92 GTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTG:1 - 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transib2 2560 1 59.29 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGC:1 - chr3R 12599033 3' - 412 7125 2 65.75 TCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTCTTAAAT:1 - chr3L 27356076 3' + Tc3 1641 1 63.70 ATATTACTGCTCGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGATAACACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGATGACTTTTAGGCAAAAGAGAAATATTTGGTTAAGAAAATGCTTTGCTCG:1 - chr2L 19226521 3' - Dm88 4497 2 66.41 GATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTGAACTAAAGAATATTCCACCTCTATATTGGCGTGAGTGGCAATCTGTTGATTCTGTCTTAGGTGGCATAATTGCTCTAGAGAAATTTTTA:1 + chr3L 27386655 3' + 1360 494 1 63.01 CATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACCAAACACTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACC:1 - chr3R 1546406 3' - Tabor 6907 2 62.07 ATGTTTAGGCAGTAATATTTGGAAGATTTTAATTAATAAGATTTGATTTATGTCAATTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGATGTTGGTGAGAAAATCTTAAACTCTGCCAAAACTTCTGTGTTAGTTTTAAAATGTTTTTAAGATGCAG:1 + chr3R 25087686 3' - 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P-element 84 1 28.08 GGAGTTGCAGATAGTATCATGTCCTGGAGCTTTTTTTTGGGGGGGTTTTGTTTGGCGATGACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCATCA:1 - chr3R 1418285 3' - BS3 262 1 65.75 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTACCGCTCT:1 + chr3R 9190588 3' + Tabor 451 2 53.21 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCTCATATTTAATAATTTTTTCAATTGATATGTATATTATATTTCCAGGATAACGACAAACTCACATCCC:1 + chr3L 18729944 3' - mdg1 24 2 58.97 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCGTGAATATTAGAAAAGGTCAGCCCATAACCATTACATATTTTAAAAATAGCTAGACAAT:1 - chr3L 4187186 3' - pogo 60 1 60.69 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGGCTGGATTTTCTTGTAAGGCCTCTTGCAGCGTCGGCAAGTCCCTCTGTTTGGCGGGCACAGTCCATATTATTATTATTATTATTAA:1 + chr3L 16260407 3' - hopper 13 1 71.20 ATGCTATCTTACGTGTAGGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAATAGGGTCGTAATGCCACCGACGAGGGGTCTGAAGTCTGAAGGTTCTGCGCTCTGCAATTTGACAGGGAGCGCACCCGTC:1 + chr2R 16420832 3' - G5A 2707 1 49.64 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCGATGGGGACGCTCCATCTACGCATATCTTACGCACA:1 - chr2R 11133518 3' + roo 9036 1 61.38 GATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATATTTGCTTCGCAGACAAAAACATCAACTACCCCT:1 + chr2L 13215692 3' - jockey 4838 1 76.09 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTGTGTATTGGGGGTGCGTGTT:1 + chr3R 20175796 3' + hopper 1357 1 58.04 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATGAAATCACGAAAACGAGTATTAAAAATGTATTATTATGAATAATGTTTATAAATGTTCAATCTCTGT:1 - chr3L 23986502 3' - opus 7051 4 52.05 ATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGGCATATTTGCATACATTCTACTACTTCATAATGCCCAAAACGCATTGTAT:1 + chr2R 22723110 3' + 3S18 6039 2 64.03 AGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGGCTGCATTTCG:1 - chr2L 18279866 3' - gypsy5 6952 2 69.64 GGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAAAATGGAGGAGTGCTTCAATTGCACAGTGTCCTTGTAAATCTGTGAAGCCGAGT:1 + chr3R 26246963 3' + 1731 313 2 78.77 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACCTGACGGCAGATTCAGATACACCTTTCAACTTTAAACCATTGGCAACGTGCGTAAACCAATGGCAATGGACCACTA:1 + chr2R 12240200 3' - copia 4915 2 54.79 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAG:1 + chr3L 25401026 3' - Doc 42 1 47.59 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTCATGTTTACCGAGGTCAGAATGCGAAAAGATATTAGTTCTTAAATTTTAAC:1 - chr3L 14076207 3' - roo 69 2 66.44 GCTGTCCCAAGACACAAGCCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGTTTCTCACAGCTGTTCGAAAAAAGCAACAGGCCACCATTTAAGCAATGTTATCAATCAAATCC:1 + chr3L 9418097 3' - R1A1-element 252 1 57.01 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACTAGAACTGCACCGCATCCCCTAATAGACAGCGCATCCGCTACACTCTGAATCATGCACTCAAAAAAATAGTGCAAAAATAAATAAATATATTAAGAT:1 - chr2L 12414850 3' - pogo 24 1 66.44 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAAT:1 + chrX 12139016 3' - roo 8744 2 73.29 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATAGGTGGCATATATAGGTTTATTACAGCTCGCTCTCCATTTTTTTTTTGGGAGATCAACGAACTGCTTTGAAATG:1 + chr2L 9237581 3' + blood 334 2 55.26 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTTTTCACAACGTTGAGGGTATAGAATCATTAATCGAGTTGGCAGCACCGTGTAGTTTC:1 - chr2L 6318894 3' + pogo 2041 1 62.07 GGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGCAATACAATTTTTATGCGAAAACTAATGTAAAAAAGTCGAATATCAATTATTTTCATGGCTTGCTTCT:1 + chr2L 2657338 3' + diver 195 2 55.28 GACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAAC:1 - chr3R 17660025 3' + micropia 421 2 57.14 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCGA:1 + chr3L 22052877 3' - mdg1 14 2 71.77 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGTTT:1 + chr2R 10695911 3' + roo 9047 1 67.12 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAGCACATGACAACATGCACATGCACACAGGTCACACTCCACACAAGCG:1 - chr2R 6632518 3' - P-element 13 1 75.71 CGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTT:1 + chr2L 11951606 3' + pogo 2051 1 63.87 TATATATACATACATATTATTTATTTGTGGGTATCTTTAAACATAGAAAATCTTTTTTGTTGTAGATTTTGAGTAACAATATATCTGAATTTAATAAACCAATTCTTATTGTTAGGCAGCCAAACAGACACCTTCAAAAAATTGTT:1 + chr2R 5884195 3' - Dm88 4375 2 76.03 GAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATGGCGCTTTCAAGT:1 - chr3R 15022047 3' + Tabor 399 2 73.97 TATTTGTTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAGACATATGTATGTATGTATGTATGTATGTAGCTTTGTGCTCCTCTCTTTCCTCTGTTGTTTCATGAAATT:1 + chrX 22858503 3' + copia 237 1 47.95 GGAATAGACCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATGAAGATAAAATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATCGGAATTCTAATTAACTATCAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAAT:1 - chr3R 11113204 3' + mdg1 327 2 73.29 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTC:1 - chr3L 6775371 3' - blood 7055 2 64.76 CCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAACAACGACAGAACCAACAACAACCACAGAGACCACAACAACCACAGAACCAACAACAACCACAGAGTCTACTACAACCACA:1 + chrX 12969130 3' + Doc 444 1 57.25 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCCATCCCGCTGAGCAATAATTTGTGCTTATGCTGATGGAAAAGTAGTAAAAGCCAAACTACTAACCACACAGGA:1 - chr2R 23497021 3' + 412 445 2 52.74 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCACGCTCGGCGACACTCGCAGC:1 - chr3R 17305420 3' + roo 9036 1 60.00 ACAGTTGTGTTCAGATTAATAGCACTGCCATTTAGTTAGTTCTTGATTCTAAGACAAGCAGATCTTAGTCTTGGGCTAAATTAGTTGCACAGGATGTAGGAGTAGTAGTAGGAGCATGCATCTTCGTCTTTTCTAAGACACAAAGT:1 - chr3R 25239177 3' - HB 1628 1 50.68 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGTGCAACAAAATTGAAACCTT:1 - chr3L 18467144 3' - hobo 23 1 68.49 AAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGAT:1 + chr2R 18482503 3' - hopper 59 1 61.64 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACCCTGTTATTTACTGTACTGTCAGTCATGTCAATGCACACAAAGCAAAAA:1 - chr3R 4581860 3' - 297 6629 2 60.80 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAA:1 + chr2R 558195 3' + copia 242 1 52.41 AGGCCCTCCAACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATACATCTGGATCAATTGGAATTTATATAATTTAT:1 + chr2L 3423163 3' + gypsy 366 2 78.77 GCTGAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGGGATAATAATTTGAGAGCATGTTCCATTTTTTTTTTATTGCCCTCTCTTTCCATGCAGCCC:1 - chrX 1100081 3' - invader6 394 1 73.03 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACCTTCTCTCTCTGAGCAGTC:1 - chrX 8891749 3' + P-element 2857 1 53.51 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAAC:1 - chr3L 17175105 3' - 412 50 2 51.37 TCTCATGAACTATAAAAGCTAGAAGGTGGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGGCGCAGCGCAAGTTAGTTTACCCTTGTTGATACGCCCATTTCTGGTCATATTATGAGTGATACGGGTGGGACACCTGGTACCATCAGTTCGGC:1 - chr3R 8298790 3' + INE-1 152 1 64.38 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGATACTTTTCGGATATGCGACAAAATCGGACGAAAACTGCTTTTTCAATTTCGTGGTTAAA:1 + chr3R 6388803 3' - jockey 72 1 59.59 AGGAATCAATCGCTCTGTTGAAATTCACATGATCAATTTTCTCTTAGAAAATAATTGCTAAAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAACGAATTCTGACTTACTAGCTATTTGGGAAAAG:1 + chr3L 14951343 3' - transib2 2376 1 77.37 TAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCAATTGTTCCAATCGGCCGCCAACTGCTC:1 - chr3R 7401453 3' - Rt1b 5117 1 73.96 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAATTCTTTAGTTGTCAACTAGTAATCAACACATTTAAATGCACTAATTGCACAAAAATTATTTACTGGCAACTGTCCATT:1 + chr3R 5453738 3' - 412 43 2 56.16 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTT:1 - chr2R 11057247 3' - pogo 53 1 56.85 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTGTGTATTGGGGGTGCGTGTTTAATTTCCACTTGTCGGG:1 + chr3R 20175814 3' + hopper 1388 1 63.08 CGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGTAATTCGTG:1 - chr3R 13582181 3' - BS 5029 1 60.96 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTATATATGTGTGTGTAAGAGGTTCTGTCGTAATGAAAATAAAGTAGCAACTTTAACGCATT:1 + chrX 10974429 3' + opus 457 2 58.02 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGATGGGCAAATTAACAATTTCAGTTTGATTTGCCTGAGTTAATTTGAACGAACGCAAAGTTTCAAAAAAAA:1 + chr2L 22747369 3' + transib2 2771 1 54.79 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATATTTGCTTCGCAGACAAAAACATCAACTACCCCTAAAAGTAGGCAATTCTTACTGAGCAACAGCTA:1 + chr2L 13215724 3' - jockey 4814 1 55.48 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCACGCGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAAT:1 - chr3R 22100523 3' - 412 76 2 67.12 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGTATTTATAAGCTTTCATTTCTTTCCGTGTGATGCGGTTTC:1 + chr3L 13868711 3' + 412 7467 2 73.79 TTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGATTTCTATGTCACGATTTTCATCATATTTATAAGTGAATGGCGTAAGATTTTTAATTTGATTATCTAACTGACATACATTTCGGAGCATCAGACAATTGACAGTTGATAATGCATTT:1 - chrX 9538388 3' - transib2 2573 1 69.18 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTTCCTAGAGTCGTACACCCA:1 + chr3R 25304828 3' + roo 9048 2 61.74 AAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCG:1 + chr2L 12340807 3' - diver 5976 2 74.66 GACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTTCAGACTCTTGAAAGTTTTTCATAATTTTCGCTATTACCTTTGTTAAGTGCTTGAAT:1 - chr3R 11113142 3' + mdg1 397 2 66.67 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTTAGCGGATGGCTCTCAGCAGCAGACCAAAGCTCT:1 - chr2L 245984 3' - roo 8716 2 54.11 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGAAAGCACTATCGTAGAGATGGGGCGCCAGTGCTTGCGATAGCCCAATCGATATATCGTATATCAGCTGGTGTGATTTTAAA:1 + chrX 14826224 3' - P-element 25 1 64.44 ATACATGCACACACACACACATATCCACACGTACACTTGGCTCACACATGGACACACGCAGTCATGGAGAGTGAAAATTATTTAAAATTATTTATTTCACAACAATTTTC:1 - chr3L 6620554 3' + Quasimodo 33 2 62.73 GTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGTGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTGTGAGTGTGCGGCAAGTGTGTTCATCAGACGTCTCGTGACTTGCTCG:1 + chr2R 12273445 3' - accord 254 2 60.27 AAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTACATATTATGTCTATGTATGTTCATCATCATCATATAAGTAAGTGTACACGTGTGCAATCGA:1 + chr3L 22734221 3' - HB 67 1 61.64 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATACGACGCGTTGCCGCCACTAAGAATTTGTTTGTCCATTTTTTT:1 + chr2L 17240339 3' - hopper 35 1 62.33 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACAATGACCGCTGATAATACACACCCATTTACATGACTACACTTGTGGAGCCCAATCTGC:1 + chr2L 3294245 3' + hopper 1384 1 61.64 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAGGT:1 + chr2L 246055 3' + roo 9038 1 76.25 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCA:3 + chr3R 17656451 3' - mdg3 5336 2 73.29 CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGCCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATT:1 - chr3R 19589884 3' - BS 5027 1 58.90 GCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATGAAATCACGAAAACGAGTATTAAAAATGTATTATTATGAATAATGTTTATAAATGTTCAATCTC:1 - chr3L 23986505 3' - opus 25 4 55.83 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTA:1 + chrX 12525981 3' - roo 8730 2 71.32 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAAT:1 - chr3L 17707832 3' - Doc 67 1 66.93 AAGGCTCTAACCTATTAGGCGGTCAGCAAAAAAATGATCGGGGATCACCCCTTCCCATCGATTGACAGCAGCCGCACATAAACCAAAACCCTACGATTTGTATTTAATTTAA:1 - chr2L 22568469 3' + Gypsy12A_LTR 485 1 64.29 AAATTTAAATTTAAAATTTAAAAATTTTATAAATTATTAAAAATGTGATTATTTTTTTAAATACATCTTGACTTTTAATCTGCTTACTTGCTGCCTTGAATTAAAATTCGGAAATAGCCAGCAATGCAATATAT:1 + chr3L 18077231 3' + 1360 3048 2 73.13 TAAAAGATTTTAATTTTTCTACCGTAAGTCGAATAAAATAAAAAAATAAAAACACCGGAGCATTAATGACATTACCAACTCGTCGTAGCGGCTGATAACAAAGAATTCACCCGTGTTTTTATAGCGGCGATAGGTGATAACGCGAT:1 - chr2L 12620902 3' + Rt1b 5118 1 80.14 AAATGTGTGGGCGTGACAGTTTTAAAAGGTTTGAGGGCATTAGAGTGGGAGAGGCATTCTTTTACAAGAAACTTGTACAAAATTTGTGTTGATTACATATTTTCTTGAAGTAACTAAAATTATAAACCATCATCCAGATGATCGGC:1 + chrX 22664004 3' - INE-1 246 1 54.11 ACGCTCATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGAACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACTTGAGACTGTGCTCAATACTTTGAGCTGCTTCG:1 - chr3L 12078566 3' + Stalker 165 6 74.07 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATTTAAACGGGTACATGTGAATGGATGGTTGACTGAAGAGACCCATTCCTTGGTTCCACTGGTTAACGGGGCACAACCCCATTAT:1 - chrX 12525876 3' + roo 9037 1 61.64 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCTACTGCCCCCGAAAAGAAAATATACAAAACAATAAATTGAAAACATTTACAAAATGTTATTGCTTTAAACAGATAACAAATACGAAATGTGCAAAATGTTG:1 - chr3L 20712918 3' + roo 9053 2 72.60 GAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGTACCAATGCCTGTTGAGGCGGGAATATTCAACG:1 + chr3L 12976355 3' - invader4 2776 2 50.00 AGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCACTCCATTCCGAGCCATTTTCCCTCGCATGTTAGCCAGCCATTTTTCCCGCCACCGGGCAGCCCCCTTTTCTGCATCGCTGACATTTTAATTGCATTCGGACAAGGCAGC:1 + chr3R 20486475 3' - accord 7 2 76.98 AAAAGTTAAAAATAAAAAAAAAAGCAGTACAAATTTTGAAATCCTAACATATAAATGTATTTGCCATTTTTTATAAAAGGGAATATTCCTTGTGTTATTTGGGTTTTATTAACTATTCATAAAGAAATACACAACTTTTTAAAATA:1 - chr2L 19100424 3' + Doc 4697 3 54.11 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCG:1 + chr2L 17250822 3' + opus 457 2 54.26 GTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTGTCCATTGGCTTGTACATACATATGCACGC:1 + chr2L 8959997 3' + Ivk 5355 1 54.63 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTT:2 + chr3R 9352124 3' - Tirant 35 2 63.01 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCCTGTCGTTTAATATCCCAGTCGTAGCTATGAAATAACTAGCAAAATAACTCATTCGATGTTTTTCCAAAAGGCCTTGGCATTAACGGC:1 - chrX 1061494 3' - 412 12 2 69.05 TCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACAGAGGCATTGCTACCCTCAGAATGTGATTACACTGACCATTTATGCTAAAGCAACGAACAGA:1 + chr2R 4362650 3' - gypsy 7018 2 64.38 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACCCAAC:1 + chr3L 25401043 3' - Doc 25 1 59.31 TTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGTTTTGTAATTTGTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCACTTCCAGGATGACCTAATTAAATA:1 - chr2L 8541988 3' + pogo 68 1 56.85 AATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCAGCTGTAGTATTTACTTTTGCATCTGCAGACCCGC:1 + chr2L 15763142 3' + mdg1 49 2 75.71 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTTCAGCATGAGAACTTCTTAGGTTGCATGTAAACAGTATTATATCGCAAGAATTAAAACATTTTGCAGCATACTT:1 + chr2L 4179502 3' - jockey 56 1 52.74 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACCGCAAAATCTATAAATAGCCGAACAGTACAATTAATTGATGCACAGACACAGTTTGGCATTGCGTGTGTGAGTATCTATGTACATA:2 + chr2R 21371580 3' + roo 9052 2 72.60 AGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGATCAAAGTAGTGTTGTAGTTTTGCTTTTCGTAATGTACCAAACTCCAAACCCCTTATTGAGAAAGTCCCATTCCTACCCC:1 - chrX 16504392 3' + mdg3 5071 1 57.53 GTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACGTACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTTGTTTTGAATGGCATAAATTGTCATTAGATAAAGTTTATGACTCA:1 + chrX 17338155 3' - 1360 210 1 69.18 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCTGCCCTACCTGGCCATGTGGATTCTGGCCATTGTGTTTGGCATCCTGGCG:1 + chrX 4785208 3' - roo 8681 2 73.38 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGTTATGCCATTTTGGAATATCCATTTGGGTTGTACTATGAAATGATAAGGCATATATTTCCTTGAAAAACTTAGGACATTCAAA:2 + chr3L 20255270 3' - Transpac 4955 2 60.96 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCCTCAACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACGTACTTGACGCGTTGTTCCTGCCGCTTCC:1 + chr2R 12543183 3' + roo 9030 1 56.16 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAGCACATGACAACATGCACATGCACACAGGTCACACTCCAC:1 - chr2R 6632525 3' - P-element 26 1 67.81 ATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTTTTGTTTTTTGTTGAGACTAGGGGAAGTCCCTTGCCGGCCATCTCTTTCCT:1 - chr3L 2885230 3' - S-element 64 1 63.70 GCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGGTATCGCGTGGCTCCG:1 + chr2R 15829614 3' + invader4 3045 2 52.24 GTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGACGAGGCATTTGGCTATTTTTTTTTTT:1 - chrX 10842015 3' - R1A1-element 21 1 69.18 CGAAAGTTTGGGGATAATTTGGTTATCGTAAATAGTGACTATCAGCTGATTGTGTTTTTCGTCGATGGTCTTGATTTCAATTAGATGATTGTTAGAATGTGAGGATATTTTTATGGGGGCGCACATCAGAAGAGCTGATGATGTC:1 - chr2L 1372421 3' + Gypsy12A_LTR 160 1 50.34 CAGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTG:1 + chr3R 9352095 3' - Tirant 8119 2 67.02 TCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCTGCTGAACCAGGAACAAGCGTATTTCCCTGGCAACCATGTGTTCCGCACTCTTCTCCTGC:1 - chr2L 13792529 3' - F-element 15 1 76.69 GGGGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCTCCGTGGAGTCCGGGGAGCAGAAGTGTATTTTTTACGTTGAGAGGATTGCATTAATGCTTAAAAACGTATTAGGACCGGCATATTCGCCTACCTGACTAATATTTATACTTAT:1 - chr2R 23090227 3' - Gypsy6A_LTR 339 1 50.36 GAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATATTAAGAATCGTTTAAATTGATACCGATTAGATTAGGTTGTCTAAAAAGGGCAAAAGGTACGCTAATCCGTTAAATAATTTTGTTTAATAAATTA:1 - chr3R 16865922 3' + Stalker2 376 2 60.27 ATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAATAAGACGTTTTATTGTTGTAAA:1 - chr2R 8641471 3' + diver 192 2 63.01 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTG:1 - chr3R 31490955 3' + roo 8996 2 72.59 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATGTGGCATGGAAATATTACACATACGCCCATTGCGCCCTCAGCCTAAAAGAATGCAATGGC:1 - chr2L 2004923 3' - jockey 21 1 63.00 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGAGATTACATTCAGACTATAAAAACCATTCTATATTCCAT:1 - chr3R 31092860 3' - roo 8743 2 75.00 CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATATCTCGCTGCAATGTGGAGTTACTCGGGTAATTCGCTCCCCAGTTAATTTT:1 + chr2R 17121679 3' - blood 70 2 65.07 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAAGGTATATCTACATAAATGAACTAATATTTTGCTTGGAACTCCACACCGCCTCACATAAATATTTATGCG:1 + chr3R 29645790 3' - jockey 56 1 50.68 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACAT:1 - chr3R 21705993 3' - 297 6634 2 65.32 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGCAGAGATACATAACAGTATGATTTGCCATTAGTCAGTAACCAAAATCAAGCTACGAGCTGAGAAAGCAAATTAT:1 - chr2R 23412504 3' + mdg1 375 2 50.68 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGGGCACTTACCCTTTTTTAGCTCTACTTTACTTTAAGCTACTTGCTGTTACTTTAACACAC:1 - chrX 6312652 3' + 412 7486 2 58.90 ATTACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTCCTCACCTCACATACATATACATAGTATACATA:1 + chr2R 2789326 3' - Porto1 321 1 77.40 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCT:1 - chrX 14964613 3' + roo 346 2 64.38 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACACCTGTCGCCATTTGCCGCATGC:1 + chr2R 13644549 3' - Burdock 6163 2 67.12 CATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTTGTGTTTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTTTACTTTTCTTTTATATAGTCACCTCACACTAACACTTAATTT:1 - chrX 22968506 3' + Cr1a 98 1 73.97 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTG:1 + chr2R 21402719 3' - mdg3 5261 1 73.50 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTACCAACCGAAATCTTCTGTTTTCACTCTCCGCGTCCCTGTCACCTGATAAAATCCATAGGGAATAGTGAATATATTTAGAATACCGTAGAGCCTGTTTCGAA:1 - chr3L 23848152 3' + 1360 3380 2 67.39 AACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATAAGTGACAATACTTCAGGATTCAAAGACTCTCTGAATATTTTAAAGAATGTTTTCATTTAATTTGTTACTGATTCAAATCAG:1 - chr3R 1549142 3' + invader1 3875 2 56.85 ATATAATATATATGTATATATAACGTATGTGGTCAGGCGTTAACGAATTAGGCTCAGACTTTCCCGACTAAAAATCGAACTCACAACCATAAGAAGAAGCTAAGTAACTAACAAGAAGGCGTTGGAC:1 - chr3L 2507847 3' + Dm88 15 2 57.48 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTAACATAACATATAATGGATATTATATATAGGCAAGTGATTCAGAACAGAACAGAACAGAACAGCGGTTTTT:1 + chr3R 9393043 3' + S-element 1671 1 54.11 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGTGATATCATATGTTATATGGCCAATATCAATATCAA:3 - chrX 4778138 3' - 412 7076 2 68.49 AGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCAAATGGAGTGGGAACCTGCGACGGGCAGGTTGGGATGACGACGAAGGCGAGCGAGTGGGCGACGAGACAAGGCAGGGCG:1 + chr3L 1418568 3' + 412 7164 2 60.94 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACC:1 - chr3R 19589938 3' - BS 5081 1 74.66 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTATCCCATTTATAATCTGGAGGACAATTTTCAAAACTTT:1 - chr3L 14122611 3' - 1360 79 1 73.24 GGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCATGCAAGTTGTCAATAGTATTTTCACATGTTTACAAGGAACTTTTCCCCCTTAGCCGAATCGAAGAGACCACGAACTAGTGA:1 + chr2R 10510684 3' - Bari1 1547 1 59.17 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATCCCAGTGTCTTTTGTGCGGTTATAGTTGCAGAGCTGTTGCCAACTTCTTCAGGGGAAATACATATCTACAAGCATATGGCTGCCATAA:1 + chrX 22921390 3' - 1360 19 1 68.70 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCCCGAATTGGTCATTTAAGATCTCAAGAGCCAGCTCTGTATCTGCAGAATGGCTAGATTTCCCAC:1 + chrX 22853478 3' - FB 7 1 68.42 TTTAAAAATTGGCCCCCTTAAGATACCAGCATGGAATTCAAAAGGGGCCTCCTTGAAGACCAATGAGTTCCTTGCTCTTATTGAGCTTCACGACATAGACATTTTCCTGTTGTCAGATAACATTGGAGTGCTAAAGTTTTTGGGGC:1 + chr2L 4088212 3' + G5A 9 1 78.77 TAATTAATATTTTACAATAAGCACATATGAAAATTTCTCTAGACAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATATAATTATGAAGTATTATGGTATTATAAAGTATCCGATTCCACA:1 + chr2R 1873419 3' + TLD2_LTR 109 1 91.72 TAATTGCTGCACACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTTTTCTATAAGCCACAAACTCGTTTATGAACGACTTTTGGGCCACCACCAGGCCAATTGCTTGACAATCGTGCCACGGC:1 - chr2R 9084249 3' - pogo 1739 1 59.09 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAATGTTATTGAGCGATTGCGGACACTCATACCACTTTGAATT:1 + chrX 10645051 3' - jockey 87 1 72.60 TAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCTCTTGTCTGGAAAATATAAATAGATTTCCAAACAGTTTGGTAGATATTAGAATGTTTTTTTTCTCTTCCTAAATAAACATGTATGTAAATGTAAGGCCAGCTTATGTTCGCATTCATAA:1 - chr2L 12156833 3' + INE-1 544 1 52.05 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGT:1 + chr2L 246100 3' + roo 9039 1 58.87 AGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTATATCAGCTTTCAATTCCGTGAGTTTTATACTCAAATGTCATACGTAAAACTTCCGATTTTTATTTTTTTCCCACTATAATTTGCCTCTCACTCGACTCTTCGGGCTTGGTTTACTTGAC:1 + chr3L 19021653 3' + BS 4891 1 38.36 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACATA:1 + chr3L 14551065 3' + P-element 2877 2 62.96 GTGGACCCTCCTGGCTCTCTTCATCGCTGCGACGAAGCTGTTGACCGCTTGCCATTCCGCCTCACCCTGCAGCCCAAGGAGGAAAAGCTCATCCAGCAGGAGGCCAAGTTCAAGCGACAGCTCTTCCTGCGCAACGTCAATAGACT:1 + chr2R 18772832 3' - Rt1c 5280 1 56.16 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGCGCATCTCACAGAGAGCCGCGACCCAAATAGGGAGTAACGAGAGCATCATGGGCTTCTCATCAGCCCTCCAAAGTCGCGCCGCCCAC:1 - chr3R 9392898 3' + S-element 1685 2 61.38 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAACGACTGGAAGGGCGTTAGTCAAATATATTGCAGTAC:1 + chr2R 5868394 3' - pogo 48 1 53.42 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTTTAC:1 + chr3L 13827404 3' + hopper 1398 1 73.97 TGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTTACA:1 - chr2R 3338776 3' - Juan 52 1 52.05 ATTTACTTAACCAAACGCACTTTTTAAAAAATATTGATCATTTTGGGACTTTACGTTGGTCAAAACCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGCCTAAAAATTGAGGGTTATGTGATTTCAGAATGTTATTAAAAAATGGTATAATTC:1 + chrX 21084562 3' - HB 277 1 76.71 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGGACGAAAAGCGTTTGTTCCTAGAGTTGAATGGTCAGCAATGGCATACGCCTGGT:1 - chr2R 558089 3' - copia 4898 2 53.27 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACAGCGTTTATGCTGCTGGGCTGCTCCTGCAGCATTTGGTGGCCTGATCCTATTCCTGGTCCTTAACCAAAAACGCAAGGGCAGGGCCATTCGTGTGACAGGTGAATTG:1 - chr3R 27822152 3' + I-element 5343 1 73.29 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAAAATAGTTAAAAAATTATTAGCTAAAAATCTGATTCATTTACTGGAATAATGGCTAGATATTAA:1 - chr3L 13374105 3' - pogo 39 1 53.79 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGAATGAAAGTGGACGGCTTTTCTTTTGAATGCCCTTTCTTTGGAAGC:1 - chr3L 15276604 3' + hopper 1380 1 60.96 ATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATA:1 - chr2L 4106315 3' - jockey 4850 1 80.14 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTCACAAAAGGGTCGACTTTTGCTGGTTCAATGGCACCAATTACACAAAATCAATTAAATGTAAATGCTATGGGCCTAGACAAAATAAAATCAGGCTGCAAGTCTAATC:2 - chr3R 15702852 3' + copia 242 1 74.66 GGACATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAG:1 + chr2R 4261959 3' + invader4 225 2 57.78 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTC:1 - chr2R 6632579 3' - P-element 80 1 30.82 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAAT:1 - chrX 2762573 3' + roo 9020 2 54.35 AATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCCATTACAAGCAAACTGGAAACTTCAGTCCTTTGCCAGGATGTC:1 + chr2R 16403491 3' - copia 4945 2 68.49 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATTAATGACTGTTTATGTTTGGTTATACACAAAAGATGAAAGCCTTAATTGTTTATGGCTGTTTATGTT:1 - chrX 3263312 3' - roo 49 2 54.93 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTTATGTTCAAAAAAAAAATGCAACCAATTGTTAATATCTTAGACCAAGTTTTCAAGATAATATCATTACTCAAATTCTCGTAAAAGAATTTTAGCAACTATCTTG:1 + chr2L 17029735 3' + blood 7373 2 67.12 CCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGTTGTAATCGATCAATTAATTGGGCCAA:1 - chr2R 21265190 3' - R1A1-element 353 1 71.58 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGCACATAACTCAGTTTTGTAGAGCTACCAAAAAATGTTCTATTTTTTAAG:1 + chr2L 5601642 3' - mdg3 5323 2 64.14 TATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACAAAGCTGTGCAAAAATATTTGGCTTAGTATAAAACCCATTAGCTAGTCGA:1 + chr2L 1260063 3' - Burdock 6147 2 73.29 AACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTTTGGCCCAGACAAACTTTGACCATTTCCTG:1 - chr2R 21402568 3' + mdg3 5497 2 73.45 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGATATTGGCCATATCATTC:1 + chrX 4291923 3' - roo 8697 2 82.05 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACATATAGA:1 + chr3L 14551069 3' + P-element 2843 1 49.32 AAAAAAAAAACGAGTGTAAACATATGAGATGGTTACAATTGTTGAAAAAAGAATCTTAAGTTCACAAAAGCTTTGGATGATGTTCCGGAATTTAAGCAGTGCAGTGCCAAATTGCTTGCTGGGTTACCTAAACTGTTTGTCGCTAA:1 - chr2R 20162631 3' + Porto1 172 1 67.12 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATAGCGAGTTTCGGCCAAAGGACGAG:1 - chr3R 27859170 3' - hopper 1 2 73.86 CACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGT:1 - chr3R 17605648 3' + Tabor 481 2 64.38 CGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTACGCTCTCACCGCCGACACCCGCACTTCAAGCAACAATTATCGAA:1 - chr3R 4743068 3' + R1A1-element 5333 1 69.86 ACCAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGCACTTTCAATTATTTTGAATAATTCCTATCCGATTTGGCG:1 - chr2L 10627214 3' + R1A1-element 314 1 72.60 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAACCGCAGGTTACTG:1 - chr2L 17210239 3' + jockey 4956 1 58.62 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACTTACCTCATTCTATAATATTAAATAGCACTCCGTAGTTCGTTTACCTGTCGAAAACAACATCCGAATGCGAAAAAATGTTC:1 - chr3L 16212698 3' + Transpac 274 2 60.27 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGTTGAATGATTATAAAAAGTTACGAATATATTAAGACTGTAATTGATGGAATGAACCTTTGCATTTATTGATTGTTTCCTA:1 + chr2R 1533833 3' - 412 35 2 59.71 GTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACAACACTGACAAGGACTATATCAATGTG:1 + chr3L 11257421 3' + 1360 9 2 33.10 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTGATT:1 - chr3L 96471 3' + roo 9038 1 62.33 CTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGAT:1 + chr2R 4206653 3' - 1360 325 1 69.18 TTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATCAAAATGAACTAATCTGTCTTAAGGACAAAATAATTGATAGCTGGGCCGGAGTAAATATAAAAAAGAAATTGCTGGAAAAAG:1 - chr3R 2914290 3' + Circe 7041 1 53.57 GCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCATTTTATGGCATAAATGCCAAAGTTTCAGTGAGGCTGGCAAAAAAAGAGGGAATAT:1 + chr2L 12652860 3' + Quasimodo 7204 2 61.27 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGGATAGTGCATGGTGAATATGG:1 + chrX 3996552 3' - roo 8678 2 68.85 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGGGTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 3466037 3' + P-element 2811 1 16.95 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCCGTAAGCCTGCCTAGTGATAATTGCAATTAAATTCAGTCCCTGGCTAGGTATATTAT:1 + chr2L 2030096 3' + 412 7485 2 58.22 ATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACATAACGAAAGATGTCGGTGGCGTTGGCGTCGACCCGCACCGTTGA:1 + chrX 3433562 3' - S-element 64 1 69.34 CTGAGATTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGACGACAGTTGGAAGACGTGTACACGAAGTGCTTTGGCATGTCATGTCACATAGTGTGTT:1 + chr3R 4693356 3' - Quasimodo 483 2 58.27 AACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTT:1 + chr2R 4029379 3' + 297 317 2 72.60 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGTGGCCATTCTAGGGACTGAAATCTTAGCTAATTTATTTACCATACTCCAAAGTCGCCATTCCA:2 - chr2L 685940 3' - roo 8680 2 71.23 AATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTCAGGAAGTTAGGGAAAGTTGGGCCATTGCTGCAGCTT:1 + chr3L 15674160 3' - Burdock 254 2 73.57 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCGGGTGGCACTGCCGCCAT:1 - chrX 1287782 3' - jockey 4797 1 61.86 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCTATTTCTATGAGCGCTGTCCTTTTTCATTGCCTTTATTTTGCTACT:1 + chr3R 28728736 3' - jockey 59 1 62.28 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCG:1 + chr3L 22052876 3' - mdg1 7072 2 61.54 TAATATATATTTTAAACATAATTATTTAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGTATATATATATATGTATGTATTCTAT:1 + chr2L 289929 3' + Cr1a 95 1 76.19 AGATGTTTGAGATTAGTCTCCAACGCCATCCCTTAAAATTCCTTAAATAAAATCTTATAAAACACCTAACATTTTCATTTCTATTGCACATAGTTTGTTCTTAAAGTAATTTGTTTTATTTATTTAAATCGTAATGAAAAAGCCAT:1 - chr3L 11746462 3' + G2 2733 1 74.66 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGCAGTAGAAA:1 - chr3L 14553117 3' + roo 8996 2 70.55 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCATTGCCCGCCGCTGCCAT:1 + chr2R 6842868 3' + roo 9019 2 52.74 AGTGAAACATTTGTTAAATTATTTGAAATTTAATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTC:1 - chr3R 31887763 3' + HB 1507 1 53.42 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGGCAATTGCCGCAAATAGGTCAGTTC:1 + chr2R 10865243 3' - blood 7055 2 54.84 ATCAAAACATCATAAAAATAAAATAAAGTTAAATAATTCAGCTATTAAAAACAGGACACTAATAAATTTTACATTTACGTAAATTGGTAGAGCCGAACACATCGCAATCATTTGACAGGAATATTCTTTCCTTTAGGAGAACCTAA:1 + chr3L 14603198 3' + jockey 4995 1 53.42 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTCGGGAGGTATTTAGTCTAATGCTTTTCGAAGCAGCTATTACGCGTCCAAATGGATTCAGCATGAATATGTTTGGGCTCATGCCATTGA:1 - chrX 22853351 3' - FB 34 1 59.59 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTCACAGTGTAGTTTCAACCTTGATT:1 + chr2R 19555057 3' + pogo 2067 1 59.59 ATGAGAGCTATAGAGCTGTTGCTGGACGTGGCCACTTACGCTTCTTGTTTAGATTGAGAAAGCGACATCATTATAAGTGATATGGATGGACAGACGGACGATGAGGCTCCTGATCGCTTTCGGTCGGGCCAGTG:1 - chr2R 20807240 3' + micropia 5184 1 84.33 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTT:1 - chrX 14964643 3' + roo 9046 1 72.50 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGGAAACTACCAGCCAAGCATCATCATCTGACACATTCCAGATCTA:1 + chr2R 5955073 3' + copia 242 1 74.07 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTG:1 - chr2R 11609224 3' + roo 335 2 68.28 AAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCGTAGGCCAATCGTTAATTTCACTCTCTAAAGAAGGTCATTTGGTTTCTATAGAATCG:1 - chr2L 3294114 3' - hopper 59 1 59.72 GCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGTGATTGACCACGTGGCCAAGCGACTGCCCGACATCCAGA:1 - chr3R 12208473 3' - R2-element 3491 1 70.45 CAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGCTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTCGACATTTCTTGTACAAC:1 + chr2R 8641642 3' - diver 18 2 67.59 AGCGGGTGGACGTAGAGTGCCAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTTAAACTAAACGAAAACACAAAAGTGATTATATGTATAAATGGGCGAATGTCAGAAGCACGCAC:1 - chr3R 17867752 3' + hobo 2917 1 59.63 TTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTACTATCCTAAAC:1 - chrY 680438 3' - invader2 4879 2 61.76 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTG:1 - chr2L 4106297 3' - jockey 4832 1 67.81 AGGTTTAGTATTGTTTACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTCTAGCTATTCTAGCGTCTTTGATCTAGCCATGTCCGTTGTGGTTCGAAAAACTAAAATAGATGGAAAGTTGAGATATTTGTATTTGTATTTATTT:1 - chr3R 13572024 3' + Ivk 5353 1 54.79 AAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTGATGTGTGTGTGTCAATGTTTCAGCTTGTAAACAAACGGCGAGCAAATAATGACAAAGTCG:1 - chr3L 17485594 3' - Ivk 386 1 58.22 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGTGC:1 - chr3L 18467161 3' - hobo 40 1 58.22 ATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAG:1 - chr3L 9571682 3' - jockey 4536 1 74.42 TGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGTCAAGTCGGTAAACATGTCGTATGCGCAATTTTTGAGCGGAATGCTTTGGCTCTCCCTTTGTGAATATTTA:1 - chrX 16992260 3' - Ivk 133 1 51.37 GTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCATTTGCGCTGCTTGGTTTGAAAGGAAGGGCCCGAGTTAATAGTGATAAGGAGCGTATAAATCAAGTGG:1 - chr3L 9691567 3' + micropia 5139 2 67.12 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAAAAAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATGGGTTTATTACAAAGGTCCTCCTAATGCAATTTGTCATTTTCGCATTTTGTTTCTCTGGCTCTCTGGCTTTT:1 - chr3L 10144655 3' + blood 7340 1 52.27 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAATCCGATTCCGACTTATTTTTAACCCGTTCCCATC:1 - chr3R 31490899 3' + roo 9042 1 64.83 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGC:2 + chr2L 16458694 3' + roo 9021 2 54.11 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACACCATTGCACAGAGACTTGTTCGGA:1 + chr3R 13176448 3' - Burdock 6190 2 58.57 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAACATGATAATTTTCCAATTATATTTAAAGGGCTACCGTTTAAGCCAACGTAATTTGTGGGAATCTTTTCATTTA:1 + chr2R 5237939 3' - Doc 39 1 63.70 GTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGTGGAATTCGAACCGCCAATCGCTTATCAGATACATTCGGAAGGTTTTGTGAGTTCCAATATCATTTTATTAGTCGACGATTTCTTGCCAACTCGTTATT:1 + chrX 2745522 3' - roo 139 2 70.55 ATGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGTTGTGATCCTAGAAGCGTTCTTGGTCTTTGGTCTTTGTTCCT:1 + chr2R 4677405 3' - invader3 11 2 76.03 ACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTCTGGAACTGGAACTGGGCTTCGACCGGAGAAC:1 + chr2L 19327551 3' - hobo 153 1 71.43 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCAAGCTGACTGCATGCCACTTGGCCAGTTTGAAGTAGATGCGTCGTATCTCATCTAAGGTGGCGTCCCG:1 - chr3R 25304685 3' - roo 8689 2 68.49 CCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGAAGGAGCTCTAATCAGAGAAATGCTGTTGAAATAAATGTTCACAC:1 - chr2L 12340697 3' + diver 201 2 68.28 TGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATACGTACGGAGAGTCCTTTACAGAACTTTGCACATTTGAGTTTGTTTGACTGGCTGGAATGGGTTGAAGGTAGG:1 - chr3R 12824891 3' - 1360 195 1 50.37 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCAT:1 + chr3R 16181240 3' + roo 353 2 54.11 AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCTCTATTATATGTGTAACATAGAAATATTGCGATTTTGGTAATTTTCTTAATTC:1 + chr3R 11749730 3' + Tabor 7255 2 64.38 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTTGCT:1 + chrX 6510082 3' - jockey 4748 1 72.99 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTGTATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTGGACAAGAATGTCTCGAGGTCAT:1 - chr3R 16913335 3' + pogo 2061 1 56.85 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACACCTGT:1 + chr2R 13644532 3' - Burdock 43 2 55.86 TATAATTATAATCATATTGTTCGGGCTACTATATAATTAATATTTTTCATATCTCAGTTAAAAAGACAAATACATATTTCATAGCATTCAAGAAAATACGAATTGTTAATAAGGGAATTTTCCTCATTAATGAATAGTTTTAAATT:1 + chr2L 3608261 3' + Transib5 2566 1 71.92 CTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTTAATTTTCTGTGACCCACAACATCTAGACTATGA:1 + chr2R 12265213 3' - jockey 4609 1 76.55 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTATAATATATATACAACTGGTTTTGGCAATGAAAAAAACTACGTCTAGAAAAATTAAGTGTTTGACACATATACACAAAAATAATGAAACAGTTATCCTG:1 - chr2R 4628333 3' + Transpac 291 2 71.92 ACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAAAATGGAGGAGTGCTTCAATTGCACAGTGTCCTTGTAAATCTGTGAAG:1 + chr3R 26246957 3' + 1731 307 2 74.66 CAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAA:1 + chrX 16384094 3' - diver 5952 2 59.59 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGATATAGATATGTACTTTATTCAATGCTTTCATTCTATTAGAATCCCATTGAGGATCTTAACATTTAAGAGAAT:1 - chrX 16383986 3' + diver 6062 2 51.37 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAATCCACGCCATGAAAATGTAATTCCAAATAGCGTGCCGAATCAGTCAGCCCTTTC:1 + chr3R 21254909 3' - F-element 65 1 58.96 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAATATTGTAGTTTCTGATAATACTGAGCATTTTTGTTTTCTCTCGGTAGGTCAAACAGAAGGACCTCAGCTATCCCACGGCAAACTAAGTCAGC:1 - chr2R 5868241 3' + pogo 2076 1 65.75 CAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTTACTTTCCGCTTTTGTTGCTGCCGC:1 - chr3L 17223236 3' - Doc 4525 1 82.35 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATGTTAAAATCATTTCCTGCACATTTCTC:1 + chr3R 10472816 3' + mdg1 7423 2 60.27 CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAG:1 + chr3L 13827394 3' + hopper 1396 1 71.01 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAA:2 - chr2R 11057254 3' - pogo 60 1 61.64 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAATTCTTTAGTTGTCAACTAGTAATCAACACATTTAAATGCACTAATTGCACAAAAATTATTTACTGGCAACTGTCCATTAATCTGAAGT:1 + chr3R 5453748 3' - 412 7086 2 63.01 CATAACGCAGGAAAGGGAGCCGAGGCTGCCCAAGGCGTTGTTCGACGAAAAGAAATGTAAATCCTCGAACTATAAACATATAAAAACCACGCACTCACGCAAATGTATATAAATTCATATATGTGGGGGTGCGATAACAT:1 - chr3L 11758999 3' + Osvaldo 1098 1 67.86 TCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTTCGATCAGTGTAATTGGGGACAGTGTGTGTGCGTAAACGGCACTCTAATGCTCTTGCCATGGCTCGGCAATTCAA:1 - chrX 954411 3' + mdg3 5147 1 51.37 AGGTCTTAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATTATTTTAAGGCTCCCTTTCGAAGTTCCTTAATGAAATTAATTAAGTGCTAACACCACACATTTATTGTTTA:1 - chr3R 18566137 3' - Idefix 7287 2 52.05 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATTTGAAGCATATCCATATATTACCGAGAATAATAAAATTATGCTGCATCATACATACAATCGGATT:1 + chr3L 19792535 3' + pogo 2050 1 55.48 AAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATCTAACCG:1 - chr2L 17240226 3' + hopper2 1533 1 69.18 GTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAATGGGTCG:1 + chrX 21667978 3' - gypsy2 6510 2 74.29 AATAAACTGTAATTATTTACTGGCGCCCGAACAGGGGCCAGCGAATAACGCGTACGACAGACAAAATTCTAAGTCGCGAAGCTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGCGAAGACCAATCAAA:1 + chrX 21014871 3' + HMS-Beagle2 312 1 57.34 ATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCACGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAAC:1 - chr3R 23020787 3' + INE-1 560 1 63.70 ACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAATGTCTTCCTGCACCGCTTTTCGCTAATATGAACACGGACGGCCGCC:1 + chr3R 11587546 3' + roo 454 1 61.34 AGCAAGACCACCACACCCATTGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACATATTTAAGAAACGCGTGGCAATAATACGACTTATCTTA:1 - chr3R 30583799 3' + Gypsy12A_LTR 2172 1 74.66 CGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGGGCGTATTGTTAGACACGAACCTACTCATATACACCTATGATTCACTGTAGTATAAGTTATAAATAGTAACAGTTGTCTAAAAAATAAAAATAAGCACTGTTTAAAGAAATA:1 + chr3L 25008194 3' - X-element 48 1 42.47 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAGTAGGCCGCATCATTAAATATGTATGTTAA:1 - chr3L 22978515 3' + 1360 3346 1 55.48 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATT:1 + chr2L 6318994 3' - pogo 65 1 65.75 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCTGTGCAATATTCGCGGCGTTTCG:1 - chrX 3996494 3' + roo 9006 2 64.38 AGGATCAATAGCCGAGTCGAGATGGCCATGTCCGTCTGTCCTTGACCCATGTTGCCACGCCCACACTTTTAATATTGCTTTTTTATATTGCTTTTACATTAAAAAATATTTTTTTTCATTGAGGTATAAACAAACTCCATATCAAA:1 + chr2R 25204545 3' + INE-1 96 1 51.37 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATTATCTGATTTGCCTGGATAGCTGAATACCTTTTTTAAACAATGCACACCAATCATGACCTCAG:1 + chr3R 11113318 3' - mdg1 15 2 75.34 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGACAAAAATCATTATGAGAATTGTAGAGAATGAAGTTCATAAAGCGATGGAGAAGTACCAAAT:1 - chr3L 20594121 3' + roo 9014 2 56.85 AGAATGTAACAGGCAGAAGAAAGCGGTTCCGACCGCATAAATTATATAAATTCTTGATCAGGATCTATAGCCAAGTCGTGCATTCGTCTGTCCGTATTATAGTAATGTAAATGTTTGAATTTTTGCAATGCACAAATGACA:1 + chr2L 20906570 3' + INE-1 27 1 64.54 AATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGAATTACTCAGTTCTTTATTTTCTATAGTTTTTCTGGATAGTCATG:1 + chr2L 18149546 3' + Bari1 1661 1 55.48 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTATTGGCTTACCTTAAAGTCGCGTTTGGTCAGGTGACCTCTG:1 - chr2L 2030996 3' - 412 7084 2 61.64 AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATGAGTCACCAGGAGAAAGATGTTAGTAAATTGC:1 - chr3R 19859624 3' + opus 432 2 75.00 TTTTTAAAAAAACAAAAAAAAAGCAGCTTGACTTCTTGTTGCCTGCTAATGATGTCATTTCGGAGTATATATATATTTCATTATAATCACAAAACTGTAGAGTACGAACCTTATAAATGTTGAGCGTTAACTTTCTCAGTAACTGA:1 + chr2L 19846375 3' - hopper 154 3 42.47 ATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATTATTAGTAGACGCAGGGCTTCCCTTCAAGCAAACAATGCTGACATAGTTTTGTTTTTGCAAAGAAATGCTTGGATTAAGTAATTTAGTTCCTT:1 - chr3L 24291219 3' - rover 26 2 65.75 AAATTCAAACTAAAACTTAAAATGATTCCTTTAGCTAACAAAGACTCGCAGCGGCCACGCACTGTGCAGCAGCAAAAGGAAGCACGGCGGGGATATGCCAACGAGAAATGCACCTATGCACTGGAAAAAATTATTAAACTTCAGCC:1 - chr3R 12932168 3' - Gypsy6A_LTR 155 1 56.16 CTAAGGGACTATTTTAGGAGACGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAAGTTTGAACGACATAATGTGGGTTGGGCCACGAGT:1 + chr3R 19445306 3' - roo 8853 2 75.34 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGATACCAGATCTTGGTGCTGATGAACCTAGCCCCTTGCAATTTCCACTCAC:1 - chr3R 24122614 3' + roo 387 2 67.81 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGTATCAATCATTCTCTTGAGATGAAACTTTCTTGATTTCGAGACAAAAACGATCTCAA:1 - chr2L 10468668 3' + roo 9006 2 61.64 ATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTAATAACGATAAAATTGTGCGATTGTTGGTTTTGCCCTTAATCTGTTGGGATAACAATA:1 + chr3R 27321079 3' + diver 6074 2 43.84 CAGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTTAGAAGAACTGTGTAATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATGCCAGAA:1 - chr2L 9778711 3' + F-element 4580 1 66.44 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATG:1 + chr3L 19350042 3' - jockey 32 1 70.55 AATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTTAATTTTCTGTGACCCACAACATCTAGAC:1 + chr2R 12265208 3' - jockey 4599 1 77.69 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAAATGTCAGAACGATCACCAACGTGTAAAAAGTTTTAAGTTCTACCGATCTTATAAATATTTATACTTTTTTAAAATTTCGATGTTTTTATACGGAATGCTGAGTATGATG:1 - chr3R 7981421 3' - jockey 16 1 78.77 TTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATG:1 - chr3R 15022059 3' + Tabor 7263 2 76.15 TAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGC:1 - chrX 1287800 3' - jockey 4843 1 60.96 TTTTTTTCTTTTTATTTTATTATTTTGTGCCGGCGCGCGTTTTACTGACCCACTTATCACGCGGTGCGGCATCAGAATGAAGGGCCAAGGGGTAGATTGCACGGCAACTTACCCTCATCACTGGATCG:1 - chr3R 17630941 3' - Rt1a 5077 3 68.75 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCT:1 + chr2L 246089 3' + roo 9006 2 63.70 AAATATGTATTTTTTTTTATAAAAACTACTGCTTAATAAAATAACATCGTCGCAAATCTTTTTAATACCAATTTAACCCCCTGCCCTTCTCCTTCGCCAGGGGTGTTGACTTTATTGAACCATTTTTTCCATCGAACCTGATTG:1 - chr2R 8503095 3' - mariner2 829 1 49.31 GCCTTAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTCTTCGACTACAATTTGGGAATACAACAATTTGGAAGAAAAGGCGGTGTGGCATGGTAATCGTTCTATGAAATGCCTAAAT:1 - chr2L 3659046 3' - 412 7093 2 56.85 CTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCAATAATTTTTATCTTCTATGGATAATTCCTGATCCCATTCACTTTTATTTATCCAAAGTTTTTGAATAAAAAGTTTTCCTGAAACCGTGACTGGTGCCAACCAT:1 - chr3R 19445934 3' - gypsy5 376 2 74.66 AGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTGAAAAATTAAAAGTGTTAATAACGTCCGATCCCATATTAATACACCTAGATTTTAAAAAATCAAATTAAATGAATTTAATATCATATCA:1 - chr2L 16471305 3' - Doc 4497 1 63.70 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTATTTATATACAACGGCCCATGGGCCGCAAATAAACGAACAACAGGCGTCGATGGCACAGTTTG:1 + chrX 14559367 3' + 297 6925 2 58.90 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGCTCATTTTTGGATGACCCAATTTGGCCCAACAGTTAGTAAGAGT:1 + chrX 2934567 3' - S-element 75 1 73.97 GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAA:1 + chr3R 29418759 3' + mdg3 179 2 61.64 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCATACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCANNNNNNAACACGCATATTGCAAAATATTTTGCATA:1 + chr3L 20289169 3' - jockey 4684 1 56.85 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTAAACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGATACCAGATCTTGGTGCTGATGAACCTAGCCCCTTGCAATTTCCACTCACG:1 - chr3R 24122613 3' + roo 388 2 67.12 CCTCAGAGTTTTTTCATGAAGAACCCAAATTTTCTTCAGGTGCGTTTTGGCTTCGTTGTTTTTTATTTCAATGTCTTCTGGTAACGACTCAATATCGCTTTCGATTTCAATGTCGATATCACCTTTAGACTCCTCAAGATTTTGTA:1 + chrY 3630479 3' - jockey2 2963 1 68.49 AATTGTGACATAAGAAGACAGAAAACTAACATGCCCATGGGCCATTACGAGTAGATCCATTGCCTTGGTGCGCAATTCCGCAGATCCGTTTATATTCACGTCCTTAAGCTGCACGAGATGTCCGTTAT:1 + chr3R 4497190 3' + Fw2 92 1 71.88 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTTTACTCACAAAGTTTCTTGTGCCTCAATTCGAAGTTCTATTTTGCACTGCAGAATTTT:1 + chrX 3018094 3' - BS 34 1 54.03 TTATTTAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTAAAATTTAATACACCATTGTAAAATGGTAGTGTGTCTTAAAACCATTTGATCTTAGTGAATGTCTTAAGTTTGATGCAATGTCTTATTTTGGACTACTTTTTAATTAGTTGAAAGCTT:1 - chr3L 17189928 3' + HB 319 1 76.03 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTAGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCA:1 - chr3R 25304752 3' - roo 8740 2 81.54 TGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTCGTTATCAGTCATTTACTATCATGTGTATAATACTAATTTAAAGGACATTGTG:1 - chr2L 15945714 3' - X-element 89 1 63.70 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTT:1 - chrX 1103601 3' - pogo 33 1 56.59 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCATACTTTCATTTGACTTTGGTC:1 + chr3R 17897178 3' + hopper 1353 1 74.11 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACACACACACACACACACACTTGATATGACACCCATG:2 - chrX 13395282 3' - roo 81 2 77.40 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTTCCTAGAGTCGT:1 + chr3R 25304821 3' + roo 9010 2 62.33 GCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGCACATAACTCAGTTTTGTAGAGCTACCAAAAAATGTTCTATTTTTTAAGATTTTTAAGGA:1 + chr2L 5601653 3' - mdg3 61 2 56.85 ACATTTTTGGTTAACTTGGCTGCGGTTATGCGCGCATTTAAATTTAACATTACTAGGAGAAATAGTTTGTGAAGCCCGCTTTGATCCTCTTAAACCAATTAAGGCCGACAGCGCCGACTTGAGCATGCTC:1 - chr3R 13804482 3' - TART-C 10920 1 53.08 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGAAATACCCAAAACTCCATCCAGAATCGAAGAG:1 + chrX 8012324 3' - 297 14 2 64.56 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGCCTTTAATCATCTGATTTTTTTCCAGCGTTACATTCCA:2 - chr2L 76015 3' - roo 8701 2 64.38 AAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCACGCACGCACTGAGCTACGTCATCGACGCAATATCGCGCGATCTTGATTTGTTTTTGTTTTTGCCTCGCACACTC:1 + chr2R 24515061 3' - Rt1b 5097 1 62.30 CTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGTGGTCACTGAGCGGCGCTTCTTCTGCTGCGAGGAGGAGTTCGATGATCCCGAGGAGGATGTGAAGGGCGCTGCTGTGGTG:1 + chr3L 16502714 3' + jockey 4907 1 57.53 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAGATATTTTTATGTAATTATT:1 + chr3R 9352148 3' - Tirant 11 2 79.45 AATATATTTATATTATATTCATTTTTACTTGTGTGCAATATCGTTTTTAGTGTTCCCCCGAAATGGGCCTGTCCCACTGTAATTAAGGCAAATCACATGTCAAGGTCCTTGTCAGGACTATAAGAACACGTCAATAAAATAAACTA:1 - chr3R 13439540 3' + gypsy7 5066 1 56.16 TACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTTTATTAAATTT:1 + chr2R 2875255 3' + TLD2_LTR 121 1 76.71 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGC:1 - chr3R 13582229 3' - BS 5076 1 72.41 ATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAA:1 + chr2L 17240286 3' - hopper 88 1 79.45 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATGGGCACATACTACATTATTTACACACGTAAACTCATATGTGGTGCAGTATTTCATGTTTCTCCCCCCCAAGTCGTTTGTTTT:1 - chr3L 16358650 3' - 412 7110 2 55.48 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATAC:1 + chr2L 76131 3' + roo 9009 2 69.78 GGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCACCTTTCCGGTTCTTTGTATACCGGGCTGAAGATCTGTTCCAGCCAAACACTTATAACAGGTTTTTAGGTACGTAGCAAAAAATAAGTTTTAATATAATCA:1 + chr2R 5440817 3' + jockey 57 1 69.18 GTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCG:2 - chr3R 14860152 3' + BS 5020 1 68.49 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAATGCAAACACCTACTGCTTAACAGGGATAATATCGTTTTGTTATATGTATTGTT:1 - chr3R 19223060 3' - FB 61 1 65.94 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTCTTAGATTTGCTTATTAAGGTGGTATAGTTTTCGCATTTCGCAGGCTTTTTATTTGTTTTTTATTCTCTCTCAAAGTCTGTGAATAACAGCACATCGTTG:1 - chr2L 8956687 3' - pogo 14 1 66.44 ATACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATGTATGCATCCTTCCTACATTGATCGGATTACGAACTGGAAAC:1 + chr3R 29733115 3' - opus 151 4 63.64 GGAAAGTAAAGGATCCGATGAATCCATGGATGGTTTGCTTTAATACAAAGCAGTATCGCCCATTTTTTCCTTTTTCTGAAATTATTTTCTTTTTGGGTGAGAACACAATTGTGGGAAAGTTCTCATTTAGTAAGAAGCCCAATTCT:1 - chr2R 9010423 3' - transib3 2400 1 56.16 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATCTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATA:1 - chr3R 23639147 3' - pogo 65 1 61.64 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGACCGCAAAAATGACAGCCCAAAGTGGGC:1 + chr3L 10144755 3' - blood 7051 2 57.48 GTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTGGAATCTCT:1 + chr2R 21402727 3' - mdg3 30 2 64.38 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGAAAGAGTGTTGGTGGTGATGTGGGTGTGGGTAAGTTGTGTCTGTGTTAGCCAGGTGACAGAGTAAGCGC:1 - 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baggins 203 1 55.86 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATTGACATTAATTTGCGACTCAACTGGGTCGAGCCGGCATTTTTCTCTATGGCCGCA:1 - chrX 4291866 3' + roo 355 2 59.70 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTAGGATGAGCTGTCGCCGACGCTGCTCT:1 - chr2R 11609199 3' + roo 9034 1 53.33 ATATCACGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAAAGGGGGAGTTTAGTATGAACCG:1 + chr2R 1949131 3' + Cr1a 4367 1 79.55 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGAATGAAAGTGGACGGCTTTT:1 - chr3L 15276630 3' + hopper 1354 1 59.59 CATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCACTCCATTCCGAGCCATTTTCCCTCGCATGTTAGCCAGCCATTTTTCCCGCCACC:1 + chr3R 20486420 3' - accord 28 2 53.33 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACGAAAAAGTTGGGAATTTGAATTTTCGAATTTGCTGTTAATTGAACACTCGAGCTTGGCTTGTTTGC:1 + chr2L 2276834 3' - F-element 31 1 67.12 TTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGATTTATATGACAACAGCTGGGCGAAAGAATGTCATTCGCTTTAAAT:1 + chr3R 12562441 3' - G2 3063 1 68.49 ATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTGTGGCAAAGGTAACTGCCTTTGTTAACATT:1 - chr2L 12079609 3' - mdg3 5317 2 58.90 CCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTATGCGTTTGCAGAAAAGGAAGGAAGTAACATGGGATGGGGGTAGCGAAAAGCAAAAAAAAAAGGACGTACCAAAATGAAGGGGGTGCTTGCTGGCA:1 - chrX 5261006 3' - INE-1 18 1 66.44 GCACACACACACACACATATATATGTACATGCACCCACACACTCACAGCGACTGGAAAGGGCTTTTATTAGCCGGAGCTTTTTGAAGAGTTTTCCGACCCCTAAAGCTTTCCGAGATCAGTCCGATCATC:1 + chr3L 7139388 3' + accord 183 2 56.15 GTATAATAAATTATTTAAAAAATAAAATCTTATACGAATTTTCTGTTTATTTGTTTAATTGTTTATTGTTTCATGCAATACACCCTGCTTATAAAGTTTATTTATAAAATTTAAGTTATGCGTGCGACAAGTTTCTTACTTTTTGT:2 + chr3R 28046162 3' + jockey2 3401 1 67.81 CGCTTTAGCTGCATACTCGAATAAGATTTCTTGCAAGAGGATTTGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGAATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTTTCTTTGAATGTTT:1 - 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chr3R 17605594 3' + Tabor 7301 2 69.18 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGCACTTGATTTTGTGTCTACAAATATGGCAAC:1 + chr2L 9472132 3' + roo 393 1 74.48 GTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTATTTTTTTCTTATATAATAAAATTTTGTTTGGCCTTTTAGTTAACACTTTATTTTGTGTGTGCACCACAGTTGTTTCTTGTTTATGGCCATCGTCGATTTTTGTCA:1 + chr3R 30295247 3' - Quasimodo 9 2 55.86 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTATTTATATACAACGGCCCATGGGCCGCAAATAAACGAA:1 + chrX 14559342 3' + 297 347 2 70.34 AACGATCGGTATATGGTGGAAGATCTGCCAGACCACACTGTTACTAAGCGACGCTATTGTAACGTGATTTTTCATTTCTTTTTAGTTTTTTCTCCAGATTCATGTAACGAGCTATCGCTTGTTTCTTTGAATCT:1 - chr3R 19445052 3' + Bica 4768 1 50.00 TATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCTGCTTCTATTCTGTCACCGCTCTTTG:1 + chrX 21947772 3' - mdg1 7042 2 76.98 AAAAAAAAAACTTTGAAAATAACAGCAAGAGGAGGGGGCGCCCTTAGGTTTCTAGTTCTGGTT:1 - chrX 11429806 3' + P-element 2694 1 90.48 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGG:1 - 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chr3R 7035209 3' + roo 9043 1 65.75 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGGAATTTTGCATAATGGTCTTGTCTCTGCCGACTTAATCTCATGACGATCGTTTTGTCGAACGCCCCCAGTCGCAAAACCCCAATTCCCCGGGCAAAAACTTTTT:1 + chrX 6481409 3' - hobo 10 1 75.54 ATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCTAACAGACGAACCCGAACTACCCAACTTTGCAAATCTTTGTGAT:1 - chr2R 17881933 3' - R1A1-element 5257 1 68.35 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAATAATACGCTTGAAACAAATCCCTGATCAATGAAGATTATTATTAAATCCTTAG:1 + chr2L 13251005 3' + opus 7427 2 67.12 TCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCTGCGGAGAGACGGGTAGCCGTGGACACCCCAGAGCCTCGGGTCAGTGTCAACAACAAGCTAGTAAGCTCCATAGATCAGCC:1 + chr3R 8258953 3' + Tirant 381 2 68.03 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACATTATGCTACTTACTTTTCCGAAATTAACCCTTCGCAGCACCTTAAATCAAGTAATACTCAAACAAACAGTAAAGATTCTATTAACAAATTTTTAAGGACGAGTTTTA:1 - chrX 16579198 3' + roo 9054 2 73.97 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGTAAAGAGCTCCAGTGCTTCCACATACCTCTATCGATTCGATTTTGACTC:1 - 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chr3L 14984917 3' + Tc1-2 1407 1 52.45 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTT:1 - chr2R 17890875 3' + Tabor 419 2 64.38 GACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACG:1 + chr2R 4313054 3' + gypsy 7389 2 52.74 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATCAAGTCGTAGAGCGAACCTCGCATTTGCGCCTCATG:1 - chrX 21196715 3' + roo 8988 2 73.29 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATGTATGCATCCTTCCTACATTGATCGGATTACGAACTGGAAACGGGGCAAATGCTCGTGATTCACTGACGATTTTTTCTT:1 + chr3R 29733152 3' - opus 36 4 59.31 TCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTT:1 + chr3L 7962272 3' - blood 80 2 71.23 AGCTAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAGCAATTTTTATAAAGCAGACAACATTTATTCGGCAGACCCAACTCATGACCATATGCAACCCTGCCGGC:1 + chrX 11699591 3' - Cr1a 496 1 63.72 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGATACCAGATCTTGGTGCTGATGAACCTAGCCCCTTGCAATTTCCACTCACGCCGGCTGCAAATG:1 - chr3R 24122600 3' + roo 401 1 77.40 GGTAATTTGCCAGCTATTGAGAACATTGTTCTATGGTTACTCTGCTTATTTAAAAGCTGGGTGTCATCAGAATTTGCCTTCGCCAGGGCCAAAGTTGTTGGCGCTTTCAAGGACATTTACACTATTTGCACTTGCTCTCT:1 + chr3R 15938472 3' - BS 405 1 52.86 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCCATCCCGCTGAGCAATAATTTGTGCTTATGCTGATGGAAAAGTAGTAAAAGCCAAACTACTAA:1 - chr2R 23497031 3' + 412 7488 2 59.59 CACTAGCTCAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGTACTCAACTATAGCATAATCTCTTGTTTTTATGTATGTAAATTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTCAAAAACAAACATCTGTGGTTG:1 + chr3R 19448671 3' + INE-1 541 1 47.26 AAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTGAAAATAGTATTTGAACTTTTTCTAAATTTTTTTCATTCCATATATTTTTCATAAACCTCCTGTGATTTGTGTACCCTATCTTAGATGTGCCAC:1 + chr2L 12658617 3' - Quasimodo 17 2 51.03 ACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTAGGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAACTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTACA:1 + chr3L 15099688 3' - G4 3803 1 61.76 CGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTACTCATATACACCTATGATTCACTGTAGTATAAGTTATAAATAGTAACAGTTGTCTAAAAAATAAAAATAAGCACTGTTTAAAGAAA:1 + chr3L 25008192 3' - X-element 50 1 41.10 ATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTTCAAGATAGGTATATAAACCTCACGAGGCACGGA:1 + chr2L 2244615 3' - Idefix 7230 2 75.54 CTATTCTACCTATCATAATAAGTAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAAAGAATTTCCACATATATCAGATACCCTTTCAATATATTGAA:1 - chr2L 22121299 3' + I-element 5345 1 52.05 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGA:1 - chr3L 22900106 3' - 412 7117 2 71.65 CGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTCCCGGCACACCCAGCGAGTCCACAGTTTTGTGGATACCTATCCTGGTGCGGATT:1 - chr3R 5190572 3' + 1360 106 1 59.38 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGTGTATTATGTATGCG:1 + chr3R 27822319 3' - I-element 26 1 65.94 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCAAGCTGACTGCATGCCACTTGGCCAGTTTGAAGTAGATGCGTCGTATCTCATCTA:1 - chr3R 25304698 3' - roo 8670 2 78.07 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAGCCACATGAAGCTATATAGTTGGCTTACACCATTGGCTGCTTGATCGCCTTGATTTACGCCTCTTCTACCAGAAGAGCGGGCTTTGG:1 - chr2L 6870630 3' + hopper 1387 1 67.12 GATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCTGTGTATCTCTGTGTATACTTTTTATTGGCCCACTTCCGGTGAAAGTTTGG:1 - chrX 13426142 3' - BS 29 1 53.21 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACAATGACCGCTGATAATACACACCCATTTACATGACTACACTTGTGGAGCCCAATCTGCGTATTAT:1 + chr2L 3294252 3' + hopper 1398 1 69.78 GGCAGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGTTTTTTAATCACACTTTCCATGGCTAAAAGGGTCGTTGCGAGTTGTTGCCTTGTGGGAGTCGCTTT:1 - chr2R 20167282 3' + 1360 3332 1 53.28 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCAGTTTTTTCGCAGCCG:1 + chrX 8891803 3' - P-element 80 1 17.21 CACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTAAATTGTAATGAATCAAAAAATATAAATAAGCGCGTTGTGTTATCAACGCTAGCAAAAATATTTGATCCGTTAGGATG:1 + chr3R 19445915 3' + BS 5003 1 54.48 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACA:1 + chr2R 5955019 3' + copia 5080 2 68.49 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGACTGCTCATCTCCCATGCTATTTCTATGAGCGCTGTCCTTTTTCATTGCCTTTATTTT:1 + chr3R 28728730 3' - jockey 97 1 73.29 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCAACTCGTTACTCA:1 + chr2L 686098 3' + roo 359 2 52.74 TTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGAATTACTCAGTTCTTTATTTTCTATAGTTTTTCTGGATAGTCATGACAATTGGGTTTGAGGTAATTGC:2 + chr2L 18149569 3' + Bari1 1684 1 71.23 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGTGCCCAGCA:1 + chrX 12525997 3' - roo 8731 2 63.70 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGCGATGCAGCAGGCCTTAACAACTTATTCCTTTGCCGTTTTCTAGCACTAGCCTGATTGTATAATCTACACTT:1 - chr2L 15834403 3' - hopper 15 1 73.97 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGACAATGCCAGTGGCACGAGTCGCTCTCTTGGACAATTTACA:1 + chrX 4778275 3' + 412 7484 2 60.27 GCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATGTATGCATCCTTCCTACATTGATCGGATTACGAACTGGAAACGGGGCAAATGCTCGTGATTCACTGACGATTTTTTCTTATCGAACCA:1 + chr3R 29733161 3' - opus 138 4 66.43 AAAATATAATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATCGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGC:1 - chr3L 16973376 3' + S-element 104 2 67.81 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATCACATTTTTAATATTAAAAGATCTTTGATCGTATTTAATAGACTTTTTCAAGTTA:1 - chr3R 17546624 3' - blood 7080 2 65.07 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAGAAATTATGTGGACAGTGGTTTCCAAAGGCAATAACTTTATATACACTAAAGTTTAGAATGAAAAGTTAAAGTGCACAGATTGGTATCC:1 - chr3L 15026616 3' - opus 7143 4 63.01 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTAGTTGTTTTTAGATTTAATTTACCATAAATCTATATCTAGGTAAATCTATACCTAGGTTTGGTGATTCCACCACAAGCC:1 + chr3L 4187312 3' + pogo 2062 1 57.53 AAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGATATAGATATGTACTTTATTCAATGCTTTCATTCTATTAGAATCCCATTGAGGATCTTAACATT:1 - chrX 16383995 3' + diver 165 2 57.53 TGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCT:1 + chr2R 8641624 3' - diver 5925 2 56.16 AAGTCTGTGGACAGCCTTCGTCTTAGAAGGGGAGGAGTTAACACAATCACCAAACAGACGAAATATAGTCGTTCCATGTTTCGCCTGCTTATTGATGAAGCCATTTAAACGCACGAAGGCAATTTATTATGCC:1 + chrX 7748742 3' + Burdock 6102 1 54.14 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATGTGTACATAAATTCATATTGTCTAGTTAGCAAAAAAAACGTAGCACGCTTTTAAGGGTCGTTTAATTCTTGTTTGCTTCTGTACCTGGATGGAGGATTTTGTGTG:1 - chr3R 6515265 3' - jockey 10 1 80.60 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAATCTCCATTTCGATAACTCCTGAACTCCCAGTTGGTATTTCCCA:1 - chr2L 19068011 3' + pogo 2077 1 67.81 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCGATGGGGACGCTCCATCTACGCATATCTTAGGAACATATTTGTGGGGCCAGAGGTCATA:1 - chr2R 11133495 3' + roo 398 1 75.52 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTGCTTATTTGGGACTTTACACTCTGGCTTCAGGTTTCAATGAATCCGCCGTTCCCCAGAGATAACCTTCCCGACAACGTGGGCA:1 - chr3R 23765355 3' + roo 9011 2 54.79 ACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACCCGCAATCCCGAAAAAAACACGGAATCGAGGCAAATAAACAATGGAGAATGGAGC:1 + chr3L 4859109 3' + Idefix 180 1 73.97 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGTCGGTCATATCAGCGGCTG:1 + chr3R 12599096 3' + 412 7487 2 70.94 AAAACCAATATGGACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGATCGCAATCAAAAATGCTCAGAAAAAGCACAAAAGTCTAATGGTTGGGGTTTGGCACTCTGGCGCTGCAAGTCA:1 + chr2R 13620829 3' + Porto1 4259 1 79.45 ACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGGCATTACACCCCAATGACAATTCTTAGCCAGTGCCTAGGACAACACGG:1 - chr3L 5821777 3' - Transpac 131 2 65.47 ACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAATGGTCAAGTTATTATTACATTTCATGGTTTTTATATAGTCAGTGCTTTGTCAAGGGGCGTTGACAAATCATAGTA:1 + chr3L 11776779 3' + mdg3 5452 2 51.37 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGGTTGACGATGGACGTGTT:1 - chr2R 5277128 3' - opus 155 4 61.72 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATC:1 + chr2L 17250797 3' + opus 7444 2 71.67 AAAGAACAAAAAAAAAATGGGGGGATTTGTGAACTAGCAACATTCTGCGTCTGTTGCTGCAGCTGCAGCGCATTAACCTCGTTCGTTGCGTCTCTCGTCT:1 - chr3L 10975921 3' - hopper 139 1 77.00 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCTGCTGCTGTCACTTTTTTCCTCCTTTATTGTTGCTGTTG:1 + chr3R 8709860 3' + jockey 4983 1 64.36 TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGTTTTTTTTGCATATCAACACACGTGTAAAGCAAATGTTAAACATGAATGTGTGTAAGTGAATATGTG:1 + chr3L 9571788 3' + jockey 4980 1 70.55 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCCACATACCTCTCCACTGCTCTGCTGTTCATTAGTACCCCATTTTGGTTGGGCGACTCATTCGTTTAAG:1 + chr2L 6184116 3' + pogo 2069 1 58.27 GTGAAACTATTTCTCCTAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATA:1 + chr3R 21706060 3' + 297 313 2 78.47 AAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTC:1 + chrX 1018148 3' - 1360 247 1 69.18 GACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTAATTTATTACCTTTTTCGCATTGAATTCCTCTCGCGCCAACCGACGAAGTGTCTTTCCATTGGGATTGGCTGGTAGTTTATCCGTAAACTGGACGCCAGC:1 + chr2R 12419894 3' + INE-1 580 1 69.60 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTCGAATGTGGGCCAATTCAGTTGCTATTGGCATTGGGATCGGGTCGATTGTTATGTCTGACAGCGACAAATGTCAGAATGCCAAATCAC:1 - chr2L 9471959 3' - roo 33 2 63.01 CTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACACAGCAGCAAATACCAAAAACACACAAGGAGGCAGCTCACAAAGCTCAATTTTCAAAAATGAATAACGTACTGAGACTTATTTAATCTGAGATTTT:1 + chr2R 16927364 3' + Tirant 8141 2 70.55 AACTACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTCAAACAATGGCAGAATCACAAAACACACCCTATGGGGCCCATA:1 - chr2L 11693386 3' - X-element 4583 1 70.55 CTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAAAATGGAGGAGTGCTTCAATTGTACAGTGTCCTTGTAAATCTGT:1 + chr3R 26246953 3' + 1731 310 2 74.10 TAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACAT:1 + chr2R 4261950 3' + invader4 2964 2 67.12 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCAGCTCCTAGTCCAAGTCAAAGTCCAGGCACGTAGCATCC:1 + chr3R 22100632 3' + 412 477 2 68.80 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCGATGGGGACGCTCCATATACGCATATCTTACGCAC:1 - chr2R 11133519 3' + roo 399 1 72.88 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGTTAACAATCAGTCCACTATTTCGTTATCTGCACGGCGAAAATC:1 - chr3R 13686573 3' - FB 55 1 65.57 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTGCATATCATTTCGACCAAAGATGTCTTATTAATACGAAATTCAGTAATCGCAAGATAGAAACTTACGCCCGAAGGTGCAAATTTGCCAAGAAGAAAAATTACG:1 - chr2R 13737714 3' + Juan 4201 1 58.90 AATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGGAAAAAATAATAATAAAAAAAGTTTATACGTAAGCGTTACTATGATATATGTAAGAATGTATGTAAAATATACCTTTGAATAAAAAAATATTA:1 - chr2L 19817790 3' + G4 3811 1 71.92 CATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTAC:3 + chrX 4186706 3' + I-element 5274 1 70.55 CAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATA:1 - chr3R 13582206 3' - BS 5054 1 56.85 GGGTCCACGAGTGAGCAAATCCTTGTCGCCCTCGCGAAGCAATGCTTCACGGCCGTACCGCGGGGGGTCCTGGATTTAGAACAAACAATGACGACGATTCGGCGTACATAATTGAACTCGACAAAACTTTATAA:1 + chr3L 7069390 3' + Rt1c 5294 1 54.48 GATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATTATGCCTACATATTAAATCACGAGGAGCACGCAAACGTGCGGGTATTCCGAGGATTTTGG:1 - chr3R 6172442 3' + 1360 3286 1 60.96 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATAATATGTTGCATGTTGCGACAGTAAAAGTAAACGAAATATGGAAAATACAAGGCGCTTTATTGCCTTTATAAAGCTCTTACGTT:1 - chr3R 13176316 3' + Burdock 6359 2 62.33 CACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCTGTGCATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTGTGGCATGCCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAACACACAGAC:1 - chr3L 28063318 3' + Stalker4 7075 4 76.71 GTATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACATGGCCTGAATGACGACGAGTGTCACTTGCATCCTACATAATTGGTACTCTTTAGGTGTGTCCT:1 - chr3L 18306855 3' - blood 7181 2 65.71 GGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGGCTGCATTTCGCGGCTATTAAAAA:1 - chr2L 18279853 3' - gypsy5 6945 2 77.12 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAACGACTGGAAGGGCGTTAGTCAAATATATTGCAGTACATACACAC:1 + chr2R 5868402 3' - pogo 39 1 58.62 ACTTATGTGTTTACTCAAAACTGTAATTAAATTGATGTTAGTAACGCCTTTTGCCTAAACTCATAGGCAAATTTAGTTTATATTTTGCCTGATGCGATGCGATGTGATGGTGATGGTCAATGATGAAGTGGATGAAAGTG:1 + chr3L 11051869 3' + transib3 452 1 60.71 CAGTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGGCGAATAAACGATTATGTATGTAAACCCATGATATTACTC:1 - chr3R 4504023 3' + INE-1 541 1 64.34 AGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCG:1 - chr2R 5070917 3' - gypsy5 24 2 26.71 ACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATATACATT:1 + chr3R 29418767 3' + mdg3 187 2 56.16 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAATAAAATAATAGAGGAACCTACCTTTGCAGGACTTGTCGTGTAGTTCGCGATCATCCTCGAGCAGCGTCT:1 + chrX 17419474 3' + Juan 4174 1 50.78 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACATATAGACATGTTAGTGGAGCGTTTGTAAT:1 + chr3L 14551092 3' + P-element 2866 1 65.07 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTC:1 + chr2R 19555030 3' + pogo 2040 1 61.64 GACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATATGCCAGCTAATCTCAGAGGTTAATACGAAGCAGCCAAATGACCACAAGATTAACGCACTTGAGAGCCACCGAAAATCAATACGTCACGCTGAGAAATTATGGGAAT:1 + chr3R 19859749 3' - opus 10 2 78.62 TCCATTTAACAAAAATAAGAGGAATAAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTATTAATTAGTTTCCCTCGCAATGCTATTTTTCTGAACACGGCTGTACATACCATTTTATGTAATATTCAATTTTTATATGTATACATGATC:1 - chr2R 6989086 3' - HB 95 1 69.93 CATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGG:1 + chrX 6138700 3' - opus 84 2 79.45 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTG:1 - chr2L 4106297 3' - jockey 4815 1 63.57 AATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACCCATTTTAGTATCTTATTATGCTTTTAAAGCCTCAATGGATTATGATTCTTTTAC:1 + chrX 18512759 3' - S-element 65 1 63.01 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAGCTG:1 + chr2R 6632657 3' + P-element 2825 1 43.15 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAACCGCAGTTTACTGATGAG:1 - chr2L 17210234 3' + jockey 4968 1 66.67 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCAC:1 - chr3L 96505 3' + roo 9042 1 52.78 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGCTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAGCGTATATGAGCTTGAAGAGGAATATAGGGAAACCTTCGAATTGTATGCAGGTCCGTTATTTCATTGCTCTACA:1 - chrX 21554356 3' + 297 351 2 54.86 TTTGATTATTCTAATGCATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGCCAAAACCCGGTTAGGGAATGCCATTGAGATGCAGGCAGTACATATGGAATCTGTATCGATGGCGGAGG:1 - chrX 1287806 3' - jockey 4813 1 48.18 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAAT:1 - chr2R 17890860 3' + Tabor 7314 2 66.67 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTT:1 + chr2L 1558690 3' + 412 7484 2 77.39 AGATTAAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAAAACGTTTCTTGCTACCTGTTGCGTACTTTCCAAAGAATACCGTATACCCTGTTAGTAGGCAGGAACCGTCTCTAGTGCAGTTTTTCTTTTTGCTCCGTGTC:1 + chr2R 6526627 3' + jockey2 3344 1 68.49 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAA:1 + chr2R 10695878 3' + roo 350 2 60.27 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATCTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAG:1 - chr3R 23639139 3' - pogo 55 1 55.56 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATATAAGG:1 + chr3L 19350052 3' - jockey 22 1 77.40 TCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTAAAACGGAACCTCTTCT:1 + chr3R 22516090 3' - jockey 4569 1 73.08 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAATCCGATTCCGACTTATTTTTAACCCGTTCCCATCGATGAAGAGATCTGA:2 - chr3R 31490884 3' + roo 393 1 74.66 GTTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAGATATTTT:1 + chr3R 9352136 3' - Tirant 11 2 77.61 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATTTTAATGGAAATTGAAAACTATGCAATA:1 - chr2R 5922922 3' + jockey 4976 1 56.16 CAAGTAAACAACACACTAACCCAGTACGTCTAAGATTTTCTCACACCAATTGTTTCAGTCTTAAGCTGATATTCAATCAATAAAAGCGTTGATCTTAGTTCAAATAAGGATCATTTATTCGACTCAAAA:1 - chr2R 3146353 3' + Tom1 228 1 61.24 GGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACGCTCACAGGAATAAAAAAAAATAGGAATAAAAATAAAAGAAAACCAAGCAGCAAGTACATTGAAAAGAAGAGGG:1 + chr3R 9164934 3' - copia 4779 1 56.93 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACC:1 - chr3R 17305446 3' + roo 9009 2 62.33 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCGTAGGCCAATAGTTAATTTCACTCTCTAAAGAAGGGCATTTGGTTTCTATAGAATCGGTGCTCAC:1 - chr2L 3294106 3' + hopper 1412 2 70.83 ATTCATATTATATTATTATTATTCTTCATTATCGCTTATTATTCAATGACACTGGCAAATGCTGTAATGTGAATGTAAATCTGGCTCCGACTCTGACTGAATGTGACCTGCGGGGCCAGCCTCGCTTAGAAACTCGAACCTTAAG:1 - chr2R 17399161 3' - invader3 5049 6 73.79 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATACATACATAGCCATATAGCCCGGTATTTGGAAAGCCGCAGAGTGATTGCCTCGGGTTTCACAGTGTCAAAATAAAAAGAACGGAGCATAAACTGACTAAAA:1 - chr3L 16870119 3' - FB 21 1 69.86 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCTGTATATAAAGTAACTCAATTTAGATGAACAATTTA:1 + chr2L 9668312 3' + 1360 3361 1 65.07 AAAAAATAAAATAAAATAAATTTACAACAGCTGCTATGGGATTTTTAACCCGGATTTTAGTTCCACGCCATTCTTATAAGCTTAGTTAATAATCCCATCCACTTTGCTTGGCTGATTTCGCATTTATATGCGCAGTTTGTTTGGGC:2 - chr2L 1849339 3' - transib1 1900 1 63.70 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGGAGTAAACACTTTGTCGACACTTCC:1 - chr3L 7995402 3' + P-element 2843 1 53.62 GTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTATGACTGCTTTGTCTCTAGATTTATGCCAAATTTATGGGATT:1 - chr3R 30182801 3' + Burdock 6312 2 73.29 AGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGACCATGTCGTCAATAATTTTGAATTTTTAATTTTATTATTTTTTTTCTCCCAATTTCTACCGATATTCCAAAAAAATATTAAAATGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGTACTTATTTGAT:1 + chrX 15903358 3' + INE-1 96 1 89.04 GCTGCGAGTGGTTTGTGCGAAACACCACCCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCACCACTTCAATCTGATGCCCGAGGAGCTCTGTTCCTATTTGCTGTAG:1 - chr3L 1962530 3' + X-element 4327 1 65.41 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCCAAAATATTTGAATTATCAGTGTGGCCATACTGCG:1 - chr3R 11750136 3' + Tabor 460 2 67.81 TATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTAACGGTACGGAAAGCGCTTCCC:1 - chr3L 23773877 3' + Transib5 2860 1 75.00 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGCCTTTAATCATCTGATTTTTTTCCAGCGTTACATT:1 - chr2L 76018 3' - roo 40 2 62.33 ATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAACAAAGTGGCTGGAGGGCCTTAATTACCTGAGATGGGGAAAAATGAGGAAGAAATTCCGCAGTTCTGCTGGGAAATTATTATTATT:1 + chr3R 25946727 3' - FB 232 1 58.22 AATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTATGTGTGGGTGGGTGGAAAAGAGGCA:1 - chr3R 15711773 3' + diver 6049 2 59.59 ATAGAGTGACTTTCAACTGATCGTGATTTCCGCCAATGGATTTGAGTTTCCGTTCTATTTAATTTCTAATAAAATAGTTTTGGAACGGAAGGCCGGAGGATGAGGTCGATGAGCCGGCGGAGGTGAGATTGTGCAACCTTTGGGCG:1 - chr3L 9334704 3' + Gypsy12A_LTR 191 1 57.53 GTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACAGAGGCATTGCTACCCTCAGAATGTGATTAC:1 + chr2R 4362619 3' - gypsy 7049 2 61.64 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAGTTTGAGTAGCCACGGTTAAAATTGGTTAAGGTTTACAGCCACTG:1 + chrX 15137453 3' + jockey 4917 1 67.81 GAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTTATGTATAGA:1 - chr2L 13250356 3' + opus 7434 2 71.92 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCATTTTCTGCAGCTGTGTTTTGCGGGAAAATAAAGGAGAAGAAAATTGCC:1 + chr2L 11951661 3' + pogo 2080 1 63.70 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCC:1 - chr3R 21705987 3' - 297 6601 2 56.70 AATAATAATAAACAATCTTACATATATACAAAATGCTGCCACAGACAAATAGAACAGATTTCGCGTCAATAAAAAGCCTCTTTTGTTTTCCGGACTATTTATATTTGCTTAAAGTAATCAAATCAAATGTGAATTGAAAACAAAC:1 - chr2R 9620960 3' + flea 5013 2 51.03 AAAGCACAAATAAATAAAATAAATAAAATAATAGAGGAACCTACCTTTGCAGGACTTGTCGTGTAGTTCGCGATCATCCTCGAGCAGCGTCTGGAACTTGTGCTGCAGATTGGAGGCCGC:1 + chrX 17419502 3' + Juan 4210 1 76.67 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGTGGCCATTCTAGGGACTGAAATCTTAGCTAATTTATTTACCATACTCCAAAGTCGCCATTCCAAA:1 - chr2L 685938 3' - roo 3 2 77.78 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCCTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACC:1 - chr3L 96507 3' + roo 9043 1 50.48 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGCAGCCCAG:1 + chr2L 16458701 3' + roo 393 1 68.64 ATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAAAATAGTTAAAAAATTATTAGCTAAAAATCTGAT:1 - chr3L 13374135 3' - pogo 83 1 76.03 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTTAGCGGATGGCTCTCAGCAGCAGACCAAAGCTCTTTGGCTTTTCC:1 - chr2L 245973 3' - roo 8704 2 56.55 GATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATT:1 - chr3L 9497755 3' - jockey 4838 1 65.07 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACACTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATTACCTAATAATAATTAATTATTTTCTCTTCAAGCGGTTTGAAATGGAATAACTGTAAAAATCTCTTACCAGCTATGCTGCAATG:1 + chrX 4292983 3' - S-element 33 2 63.01 ACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAATTAGTAACAGATCTAATGGATATTTTAAAAATAATTAGTAAAACAAAAGAAAATATTGGGACGATAGATAGTGGAAACTTTCGAAAACAAGGCGACTTGAAAATTGTT:1 - chr2R 3124298 3' - Tc1 1540 1 58.99 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTGGCATTGAATTTATTTTCCAC:1 - chr2R 12543065 3' - roo 8727 2 63.01 AGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTGCCCAAGAAAGTGCAGCACACT:1 - chr2L 15987944 3' + roo 378 1 65.07 AAAAAAAATTAAGTTAACTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAACGGTT:1 + chr3L 23042123 3' + pogo 2036 1 67.88 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATCTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTG:1 - chr3R 23639150 3' - pogo 66 1 63.19 TATACGCAATTTTTTTTTGAAATCTAAGAAAATCATTTTCTAGCGGAGACATTAAAAAAAAATTGATTTGTTTCTTCATTCATATACATACATAAAGCAAACACCTAATCACTTATAAAATACTTACGCAATTATGCTCTAATTCA:1 - chr3R 25154710 3' - S-element 1630 2 89.73 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTCGGACAACAAAAGTTGTGTTGCCGTTATTCATCGCTTCTTAAAGCGGCTAAAAACTTTCGCCT:1 + chr3L 12867406 3' - roo 14 2 73.88 TTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTCCATTG:1 - chr3R 28627602 3' + copia 5060 2 63.12 AACGAGCGAGAGCCGGATTCTAAGTTGAGTACCGAAACTACAGATACCTTAGGAATCAAAACACTTCTCCTACCGGTACACGTTACAAATGATGGTTAGAGGAGGCCTAAATAGACAAG:1 + chr2L 22356901 3' + Gypsy12A_LTR 2196 1 50.42 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATTATCTGATTTGCCTGGATAGCTGAATACCTTTTTTAAACAATGCACACCAATCATGACCTC:1 + chr3R 11113316 3' - mdg1 17 2 73.97 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTTATAATGATTGAATCGACAAGAGCATTCATGAATGAAACGGCAGTTTTGAATTGGCCGTGACTACGAGCAGAGCT:1 - chr3L 23042010 3' - pogo 36 1 57.34 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTT:1 + chr3R 9352126 3' - Tirant 8117 2 76.42 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAACGACTGGAAGGG:1 + chr2R 5868370 3' - pogo 57 1 66.41 AGTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTGCTCCCATCATGAAGAAACCTCAGGACAAAAACGAACCGAACAAGTAAATTTTATGGTAATTATAAACTTTATGGTTTCATTAAAACATATTGAAGAGAGAAGAGAGCCGGAAAA:1 - chr3L 5711371 3' - HMS-Beagle2 489 1 68.61 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGGTTGACGATG:1 - chr2R 5277136 3' - opus 35 4 63.72 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCAGG:1 - 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chr2R 23000061 3' + mdg1 7378 2 73.29 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACT:1 - chr2L 17029595 3' - blood 66 2 62.33 TATCATATACCCGTTACTCAGCTAGTTGAAATTGCGGCAGTTTTGGGCGGCTTAAGGCGTTAGACCGGATTCTTTATCGCGTTAAACGAAGATGAAAAAGCAGCTGTAAGTCTGGAAGGTTTTTTTCGCTTACTTGAACTCTGAAA:1 - chr2R 1069813 3' - INE-1 546 1 56.16 GCTGCACCCAACTGCAAAAAAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATGGGTTTATTACAAAGGTCCTCCTAATGCAATTTGTCATTTTCGCATTTTGTTTCTCTGGTTCTCTGGCTTTTGTCTCAAATGCAATTTT:1 - chr3L 10144638 3' + blood 337 2 53.57 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCATTTTTGAAATGCAATTAAATTAGAAAGTACATCCTAATGCGTTCTACACACGATTGTGTTACTAAAAAAATTGGTTTTCATTGAAAATATTTGGTTTAATTGGT:1 - chrX 13786810 3' - pogo 14 1 71.23 AGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGTAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCTTCAGATTAGTTGGTAAAATTCCTTGAGTGAGTGGTGCTCAATGGACTCAAAATGAAGGGAATGAAAGGATTTGGAAAATGAATAATATTTCAT:1 - chr3L 4563041 3' + Bica 22 1 68.49 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAATTGCTCAAGAACAACAGATTACACT:1 - chr3L 14062222 3' - Doc 66 1 55.17 AAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTTTATTAAATTT:1 + chr2R 2875255 3' + TLD2_LTR 127 1 80.00 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACG:1 + chr2L 16458693 3' + roo 9020 2 54.79 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGTTTTAGGCAAGTCCCAGAATGTTCCCCAACAACGGCT:1 + chr2L 15988053 3' - roo 83 2 76.03 GCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCATTGCACAGAGACTTGTTCGGAATGCCTGACAACATTTTAATAATGTTGCGAGGACATTTTC:1 + chr3R 13176488 3' - Burdock 6156 2 71.92 CCTAAGATCTTGACGTTCATACGTTCATACGGACAGATGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGAGCAAAAATATATATACTTTATACGATCGGAAACGCTTCCTTCTGGGTGTTACATACTTTTCAACGAATCTATT:1 - chrX 16116152 3' - INE-1 137 1 84.93 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGCAGAGATACATAACAGTATGATTTGCCATTAGTCAGTAACCAAAATCAAGCTACGAGCTGAGAAAGCAAATTATTTGCTGAC:2 - 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Cr1a 458 1 76.12 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTGCCGCGAGTATATCACGAACTTAGGGCCCTCTCGAGGTGTGCGACC:1 + chr2L 6870750 3' - hopper 75 1 65.75 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGA:1 - chrX 12191528 3' + pogo 2067 1 57.14 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAA:1 - chr2L 17029616 3' - blood 7098 2 76.71 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCCATT:1 + chr2L 17250835 3' + opus 7456 2 50.68 TATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGGCGCAGCAATGTATACGCACATATAATAATTTTGCTTGAACCATTAATTTATTACAGTGTATAATCAAACA:1 - chr3L 5187640 3' - HMS-Beagle 6980 2 56.85 AATTCTTGATCAGGATTAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGAACGTCGAGATTTTAATAAAATTAAAATATCGATCAACAGCGGTGGTAACGAGCTCCAACCCTTAGTTTGG:1 - 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P-element 27 1 44.83 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGCACTTGATTTTGTGTCTACAAA:1 + chr2L 9472123 3' + roo 9046 1 67.81 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGAATGAGTTGATTTCTTTCCGTGTAATGTTTGTTAAAATTTTCAACTAACTCTTCCAAC:1 + chr3R 20744069 3' - roo 8726 2 63.70 AAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCA:1 + chr3L 9571720 3' + jockey 4910 1 73.97 AGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGCGTGAGTACAAACAATAGACAAGAACGTGTATATTTGTGAGTGTTGTGCTAAACGACTTTTTTCAAGCCGAAATTAATTCAGATCCAAAAAACAAATTTACATACATA:1 - chr3R 21604484 3' - 1360 3279 1 71.23 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAAAAAATACAATAGTTGTGCCGAATAATGAGCATTCTATTTTAAACAGTTCGGAGCCCATTTTATTAGAAATATTTATTTGTAATTTACCCATAAAATGTGGTTAATAAAATAAATG:1 + chrX 3263485 3' + roo 404 1 79.45 ACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTATCAAGAATATATATAGTCTATACAAGTTAAATGCAGGATCATTGGTTCTTAAGTTCT:1 - chr2L 13154228 3' - Juan 49 1 47.95 CAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATGGCCATATCCCTTTCACAAAACCGACTCCAATTAATAAAGCCAATTGAGCAAA:1 - chr3L 2878219 3' + 412 61 2 63.70 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATG:1 + chrX 20999605 3' - BS 34 1 53.28 GAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCGCATGGAATCGCTGATTCCATGGCCCAGTG:1 + chr2R 15829643 3' + invader4 3068 2 72.14 AGATAAGGCGCTCTGGAAAGTGTTAATGCTCTTAAAGTGCACCGTCTCGAGAAACAAGTCGTATATTCTAGTCTAGTATAGTCTGATCGAGGTATTGCTTTTACATTGTTGGCGTTCGTGGAGTATTGTGAGTTAAGCAACAT:1 + chr3L 25846884 3' - mariner2 518 1 76.22 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGAATT:1 + chr2R 23287513 3' - roo 8747 2 76.03 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATGAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAACATCGTGC:1 + chr2R 558203 3' + copia 249 1 57.53 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCG:1 + chr2R 558153 3' + copia 5069 2 77.24 AATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACATAAAGTTGCCAGCCCCCTGTAAAGCCCCGCTCAGAAGATGAGTGCCGAAGCATTGATGGTTAGGAGGCTAGGATCCTGCTCCCTTCGTATCCTGCCGTCCAC:1 + chr3L 13826629 3' + hopper2 1165 2 76.30 ATTTTTTTGTATTCTTGGCTTTTAGACAGTAACATGGACTGGTAACATTAACATATAGCAAGGCTTGTTTACATTTAACAATTTAAATTAATTTACAAAAAACATTTTTTGATTGCTCTGGCTGCTAAATTTTTGGAGAGGTAATG:1 - chr2R 12723911 3' - HeT-A 5884 1 69.86 GATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGATCAAT:1 + chr3R 15924665 3' - Quasimodo 67 2 81.54 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTT:1 - chr3R 16181148 3' - roo 8735 2 69.50 ATGGACAGATTTTAAATTAATAAATAGATCGTTAAATCAAAAAACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGAAAAACCAATGTATTTTGGGCTTTCGTGTACAAATTGAAACTTTATGTTTGTTTGCCAAGGGGGCTGCGGACC:1 - chr3R 17161471 3' + G-element 4295 1 57.55 TTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTGTGTATTGGGGG:1 + chr3R 20175788 3' + hopper 1346 1 64.38 GTTCAATAAGTCTTAAACCGATATTCAATAAAACGATAAAACGAATACAAGTTGTGTGTATTGATTAATAAGAAAATTGGATAAGAGAAAGATAAATATTAAACCATTTGGTGGGGAAGTATAGAGTGAAAGTGTTTCTAGAAGAA:1 - chr2R 4287648 3' + McClintock 6256 2 74.66 ATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAA:1 - 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Tirant 45 2 60.83 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATAATTTAAGAGTGAGCATTTTT:1 + chr3L 13827401 3' + hopper 1400 1 74.47 GAACCCACACACACACACACACATACACTCACGCACTGCGTGCTTAATAAGCAGGAACAGAAAAAGGATCGACAAGGAGTTGCGCCCAAAGGATTCGTGGCACAAAAGATTGTCCGCTTCATG:1 - chrX 5286288 3' + accord 7098 2 57.72 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCTCCTTTTATTTTGGCGTGAAAACTCTTTGAGTATTCACTGTCCGAGAAGCA:1 + chr2L 13927803 3' - roo 8692 2 53.85 ATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTATGCTAAGATGTACAGGGAAGGAATAAAATGGAGGAGTGCTTCAATTGCACAGTGTC:2 + chr3R 26246940 3' + 1731 290 1 63.01 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAGTCATTAAATTAAGTCACATCAAGTGCGTATACTTAATTTTTGGGCATGCTCTGTT:1 + chr2R 23497130 3' - 412 59 2 59.71 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTC:1 - chr3L 17890734 3' - 412 70 2 64.83 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAGCAACAAACATTTTCATTCG:1 - chr3L 14550967 3' - P-element 64 1 34.06 AGTAACGGCTATCTGTTAGTCGAATTTTTCTTGTTAACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATATTAGAATAGCCGGGTCGATCTGAATATGTCCGTATGAACTTCGAGATTTCAGAACTATTAAAGCTAAAAGGTTAAGATTTA:1 - chr2R 5492220 3' + INE-1 550 1 75.34 AGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGAAAAGTTTTTGAAGCTTCCCGCATAATCAACTCTGTGCCTTGGACTTT:1 - chr3R 17656361 3' + mdg3 5449 2 54.11 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTTCCACCCCCTTC:1 - chr3R 22100487 3' - 412 40 2 60.96 GTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGCAATACAATTTTTATGCGAAAACTAATGTAAAAAAGTCGAATATCAATTATTTTCATGGCT:1 + chr2L 2657331 3' + diver 177 2 55.22 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCCATCCCGCTGAGCAATAATTTGTGCTTATGCTGATGGAAAAGTAGTAAAAGCCAAACTACTAACCACA:1 - chr2R 23497026 3' + 412 7499 2 54.29 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAATTTAATAGAATTTATTTGTTTAGAAATTGTCTCTTTTCACTCGTGGTTGACTCATGCAAATGACAGCAAACAGAAACAGAAA:2 - chrX 13531545 3' + roo 400 1 72.60 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTTTTAATGTTTTTTAAACTTT:1 - chr3L 13634201 3' - 297 6616 2 53.39 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATATGATTTATGCGCTGTTTCTAATTCAATTTAGACCCGTTTGTTTGCTTTGGAGGTAGAAGGAAATGGAAGCAAACTTGTTTGCCGCTTTTAATTATGCGAG:1 + chr3R 23010152 3' - I-element 18 1 73.29 CTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAACCCATGATATTACTCACTAACATT:1 - chr3R 4504014 3' + INE-1 547 1 71.92 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAATTATCTGGTTTTTAATGTTAATCTTAATTAAACTG:1 + chr3R 11750291 3' - Tabor 43 2 56.85 GTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGATCAATCAGCGCTGAACAAAAAGTGAGCGATGGCCAAGTGGAAATTTAAACGAGTTTTTCCACAGTCA:1 + chr3R 15924727 3' - Quasimodo 21 2 71.92 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTGTTAGGTGTATGAACTGGTTTGCTTTGTTTTCTTTTTGGAATGGCACATCAATGTG:1 - chr2R 8395902 3' + pogo 2069 1 52.17 TAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCTAGATCTAGGAGGTCCGGTATCCTATCAGGGTCGCTGGGTGCAGATTGCAGCCCAACTCTCTAACGCACTTCAGCAGAGCGCTGCCCTTGGG:1 - chr3L 23724392 3' + 1360 15 1 65.49 ACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGCAATCAACACCCAAATGCAAAAACTAACCCAGCCTGCAACCGAATCACCCGA:1 - chr3L 15081142 3' + Tirant 408 1 52.29 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGATCGGAGGCCTAGTGGCG:1 - chr3L 22900089 3' - 412 40 2 55.83 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGC:1 - chrX 2762570 3' + roo 351 2 54.79 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTAAATTGTATTGACATTTGAAAGAGTAGGTTGAACGACATTGTCGTCGAGCATCGGCGATTGTT:1 - chr3L 12224612 3' + 412 438 2 55.17 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCATAG:1 - chr3L 17890717 3' - 412 7087 2 57.14 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTACTTCTGTTTGCTCGTCGGGGCAACCGCACAAGCCGTTCTTACTTACTTTTTCGGGCTCCAG:1 + chrX 22610795 3' + pogo 2052 1 54.29 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGACAGCTCGTAGCGAAGTTTCCCACCTTCAGCATGGACGTAAACCACCGTCGATATATCGACTCC:1 - chr3L 22648282 3' - Tabor 15 2 64.71 CTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGTGTCCTTCACAGTCACAGTCACAGGCACACACACACACAGTCGCACATTCACACACACATTCGCAGTGCGTGT:1 - chr3L 4001065 3' + hopper 1370 1 50.00 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTACTTTTGCAAATCCCATAAATCAAG:1 + chrX 5150387 3' + roo 9034 1 52.71 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATTGATTGCCATGTCAAAGCCAATCCAATCCATTCAGTGTACCCTGCGATTGGTGCAAAATATTTCCCAATG:1 + chr3R 24493220 3' - jockey 4685 1 71.92 CGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGTGTTTGTCTGGC:1 + chr3R 11547814 3' - G2 300 1 66.67 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAGGTCATGCGAGGTCAAGATGCATCATGATAATAGAC:1 - chr2R 16403392 3' + copia 208 2 52.74 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCA:1 + chr3R 26520443 3' - FB 67 1 73.98 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTAGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:1 + chrX 23439059 3' + P-element 2495 1 60.27 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACTTGTGTCTCCAATTTACCAAACTAATTCAAAACATAAGATCTTCGTTTTCAAGTATGAACTTTTGAAAGTGAATA:1 - chr3L 4620867 3' - FB 44 1 49.31 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACATATAGACATGTTAGTGGAGCGTGTGTAATGTTATCAGAATG:1 + chr3L 14551104 3' - P-element 9 2 71.92 GCACTCTACCAATAGGTGGAGCTATACCATAGCAACTAGCGCCTGACAGCGAGCAACTATTAAGGCGAACTGTAATAGTGTCCCCGTTCAGCCCACCAGCTCCTGCTACTTTGCTACTACCACCA:1 + chr3R 7427922 3' + R1A1-element 279 1 70.40 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACGAAAAAGCTG:1 + chr2L 2276778 3' - F-element 85 1 69.44 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGGTCATCATTACACCACACACGCACACACTCCCGCACACACA:1 - chr2L 3178484 3' + 412 420 2 74.19 GTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATACGCTCTATGTTTTTAGTGAGCTTCCCGCTGCCACAGCTCAATTCATTGCAA:1 + chr2L 20523526 3' - Doc 206 1 65.07 CATGCACACACACACACACTCATACACAGCCACGCACACACACACGCACACCAAGTAGGGGGAAATGGAGGTTTGAAACAAAGCATGGATTAAAACAAACATGGCTCTAACCAC:1 + chrX 6949489 3' + accord 7026 2 53.51 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATCTAGCGCAAATCCGAGCAAATAATTATTAAACAAATACTTCTATTTACAAAAACACATCAAATATTTAGTTAAGCCAAAATGACGCGCAGCATTTTAATTAAACAAC:1 - chr3R 13122445 3' - blood 12 2 77.40 GCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCACCACACCATGCACTTACCACACGAAATATCACAGCCTGGAGAAACGCTTGAATCTGTCTCGCATCATGCCGAAGAACG:1 + chr3L 23703781 3' - micropia 5094 4 55.94 GTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATC:1 + chr2R 15829603 3' + invader4 267 2 62.68 AGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGAGCAATT:1 - chr3L 2725008 3' - Ivk 103 1 73.97 GGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTAGAAATAACAAACAAATTTGTGGGTAAAATATCTG:1 - chrX 15029051 3' - McClintock 215 2 73.88 AAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGGAAGAGCGAAAGAGCGAGAGAGTGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAAACAATTTTCGAATAGAAATGCATATTTTTAAGGATGGTGA:1 - chr2R 5422157 3' - Cr1a 384 1 51.67 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTCGCTGCCCTACCTGGCC:1 + chrX 4785172 3' - roo 8723 2 60.69 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTCATGTTTACCGAGGTCAGAATGCGAAAAGATATTAGTTCTTAAATTTTAACATCTCTTTC:1 - chr3L 14076198 3' - roo 8724 2 60.27 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCA:1 + chr3L 25401025 3' - Doc 34 1 50.00 ATGTATAACTTCATTGTTGATTTTTAAAAAATTACGTTTTTACCAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTTGCATACGAATCGAATGTGTTTGGTGTTGTCATTTCGTAGCTCATTTAAATTTCTAGTCGTTTAAA:1 + chr3L 12494673 3' - Tc1-2 1485 1 52.05 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCAGCTCCTAGTCCAAGTCAAAGTCCAGGCACGTAGCATCCGCTCCTTCGT:1 + chr3R 22100642 3' + 412 7519 2 65.75 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAAGTTGTTTTTTGTAGTTATATAAGTTATAAATAAAAGCATTTTGTCCACCCCCCACTCTAACGCCCTTAGACCGTCTAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGCAACATGTTTTGATATTT:1 - chrX 22902351 3' - F-element 20 1 39.04 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTATATCGCGATTAAGATAATCAACTGCTCTGCTCTGATTGCGGAAGCAAACGTGGCAAAGATTTCGAAAAGTGGATGGTCACTGATAAATTATCCAATCTCTATAGACAACACCACC:1 - 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Circe 425 1 78.57 AGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTGAGTTTTCTTAAAATATTAGTTCCCTCCTTTTTTCGCCCGGTTTTCCTTCTTTTTTTTTTTGTCCTGCCTTTGTTTGGGTCGTG:1 + chr3R 15711898 3' - diver 5909 2 64.84 GGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGGTGATGGGTGGTGCTGGTCGGGCTCAAGTTATCCTCCACGTGGCACACGAGGCGGCTGCAGG:1 - chr2R 24703802 3' - GATE 268 1 52.33 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACAAAGCAGGGAACCGAAAAGGAAAGGACTGGACTGAACTGGGCTGGAGGTTTGTGCTGGAATTG:1 + chrX 17806047 3' - roo 8676 2 69.31 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTCACAAAAGGGTCGACTTTTGCTGGTTCAATGGCACCAATTACACAAAAT:1 - chr3R 15702910 3' + copia 184 2 67.12 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAACCCCAAGGCGAAAAATTCCCTCGAGGAAGGCCAGGAAAAGCAAAACGCAGAAAAGTAGGCAATGATTTTTATTAATTGATAAGCATTTGCAACAAGTTGCACAGACA:1 + chr2R 23116235 3' - jockey 17 1 79.31 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGACCGCAAAAATGACAGCCCAAAGTGGGCTCACCGAGTGAG:1 + chr3L 10144767 3' - blood 20 2 66.39 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTTGCT:1 + chrX 6510082 3' - 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chr4 330592 3' - Doc 52 1 30.34 GAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGACCAAGTCACACAACTCCGTCAACGTAATAACAATTTCTTTAACCAACTCAAATATCTTTCTCTGTTACATTTATTAA:1 + chr3L 23597299 3' - invader4 2754 1 68.28 ACAAAAGGCAATTAAAGGAAATTACTATCTATTATCCATTTTCACGGGCGCCGCCATATTACCCACCGTTCTAAATTCTAAGTTCCATTTTCCCACAATCCCAGAGGAGAATCAATTATAAGCATAATTAATTT:1 + chr2R 9200912 3' + GATE 450 1 69.40 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACTTTATTCCTTCCAAGGGACAAATTT:1 - chr3R 19448090 3' + roo 8998 2 69.66 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGCCTCCAAATGGATTCCGTGGAA:1 + chr2L 3659131 3' + 412 7486 2 76.85 TTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTATGTATGTACATACTGTGAACTTACATATATAGAAACGTACATATGTGCATATGAGTGGCT:1 + chr3L 16870255 3' - FB 4 1 65.91 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGG:2 + chr3R 17656453 3' - 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gypsy2 6520 2 66.91 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTTGACCACCCAAATACGCCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTC:1 + chr2L 5202551 3' - 297 6625 2 73.63 CACAGTTTTGGCGGCTGCATGGCCCAAAATCAAAAAGTTTACAATTTTAGAACTGGTTG:1 + chr3L 24862152 3' - diver2 4540 2 89.83 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGGGAAAAACTCTAATAAATG:1 + chr3L 7995529 3' - P-element 38 1 58.74 GGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTCTGTTATTTACTGTACTGTCAGTCATGTCAAAGCACACAAAGCAAAAAATGTAGCAAA:1 - chr3R 4581850 3' - 297 6596 2 61.76 TCGTATTACTTAGTTCTGAACTGAAAGCCGAAATAAAGAGACGTAATTGTAAAAAAACTGCTGTTCGTGAGTGGAGCAGGTCTTTCCAAGCTACCCGGATTTTTACCAACCTTCGAAAGGCGAATCCCGCTTTCGTACGTAAATAT:1 - chr3L 7082056 3' + Chouto 122 1 59.59 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATCATCTCAAGTGGGCCTCTCCATTCATCTTTCGTCTGT:1 + chr3R 13612880 3' + 412 7464 2 69.86 GATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACCATTGATTGTCATGTTTTCTGCCTTCAAGGCTTATCATGTAGTT:1 - chr2L 15612261 3' + accord 166 2 69.86 ATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTTTGGGCGAAAACTTTGCCTTTTTCTAGCTTTTT:1 + chr3L 2725049 3' + Ivk 5295 1 76.76 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATACGCCGAGTGGTTTAGATAGCAGTTTTTGCAAGTGCGTTGTATTTACTAAGAACTTGAAAACTCCTGTATATCTTTTCCTGCGTATCTC:1 - chr2R 19553149 3' - mdg1 7070 2 63.01 GTGTTTAACGGCAATGAGCCGGAGCAAGCTGTGGTTTATTTCGACACAAGATTTGAACTGAGTAGAAGACAATATTGAAAACTAAGCCGGTAATATGGACGCCAATGATGGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCA:1 - chrX 21668963 3' - gypsy 7262 2 59.86 GTTGGAGCAAGTATGGCTTTGATTAAAAGAGCCTTAGAGCTCATTTGTAGTTTACTGGAGTGGAAGAGCCAGTCGAGCTTTTTTAGTTTCGCCAGTGACTTGAATTTGACCTACCCGATGGTAGGACCAGATGAAGTGCCCCTGAA:1 - chr4 117413 3' - G5 4361 1 76.03 GTGCTGATTGTGAAGAGGAAGACGACTGTGAAATTTTATATAGTATTAAAATTGAAAATTAACTTTAGAAACTTTTAACTTTTAAGCTCGTCTTTTTCCATTTCCCATTTGTGGTTTTTACATAAACGACAACATAAATATCGTTC:1 - chr3L 13071330 3' - hopper2 64 1 58.22 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAATGGTCAAGTTATTATTACATTTCATGGTTTTTATATAGTCAGTGCTTTGTCAAGGTGCGTTGACAAATCATAGTACAAATTCGCGATTGCGTATCACTGCCC:1 + chr3L 11776806 3' + mdg3 5479 2 69.86 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAGAAATTATGTGGACAGTGGTTTCCAAAGGCAATAACTTTATATAC:1 - chr3L 15026660 3' - opus 7074 4 72.60 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGTCGGTCATATCAGCGGCTGCTGCCAAAGACAATGGCCTCCGAGAAGCGGAC:1 + chr3R 12599128 3' + 412 7511 2 54.40 AATTATTCAATGGATAATAAAATAGAGTTATTCTCTTACTAATAATACAAACGAGTTAAATGCTTCTTACTTTTATTTTTTTGATTATTAAATATATTAAATTTGACAGAATCATTACAATTTCGCATATTTTGTGATCTAAACAT:1 + chr2R 11653288 3' + Fw2 62 1 74.66 CAATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACT:1 + chr3L 13827355 3' + hopper 1349 1 62.33 AGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATGAATGAATGAATGATAAAAAAGTGGCATATACCCCTTGAAATCTCCGAATCAGA:1 - chr3L 18295493 3' - F-element 81 1 62.33 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTTATGTTCAAAAAAAAAATGCATCCAATTGTTAATATCTTAGACCAAGTTTTCAAGATAATATCATTACTCAAATTCTCGTAAAAGAATTTTAGCAACTATC:1 + chr2L 17029732 3' + blood 358 2 66.44 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATTAATAACTACAGTTATGGATCGACACAGACTAAAATTTCATTAGCCCCCTTTCATTATCCATCGCTCTACCCC:1 - chr3R 2474271 3' + Juan 4198 1 61.06 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTT:3 + chr2R 21402682 3' - mdg3 75 2 65.75 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACACAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACA:1 + chr2L 246074 3' + roo 8991 2 73.97 ATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATC:1 + chr3L 11399995 3' - Quasimodo 74 2 71.23 GATTTGCTTGCAATACAAAAGCCGGTGAGGTCGTTAACAGAATCGTTTGAGTTGAAGAGACTGGTGTGGTTAATGTTTTTGTCGTACTGCGCATCGTCTTCGATGAACATCTTGCTGCCTTTTCTCTACTTGTCCGATCTATGAAT:1 - chr2R 8674813 3' - Doc4-element 376 1 57.53 CAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCTGTGTATCTCTGTGTATACTTTTTATTGGCCCACTTCCGG:1 - chrX 13426153 3' - BS 36 1 61.90 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTTGGCAAGTTCTGCAACATTTTCCGCTGGTGATTTGGGACCTGTTCTT:1 + chr2L 5202602 3' - 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chr2L 7231153 3' + INE-1 87 1 59.26 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTGGA:1 + chr2R 21402721 3' - mdg3 35 2 60.69 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTT:2 - chr2L 17029588 3' - blood 59 2 57.53 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATATAACTTGTATTTGTGTCTAAATAAATGTCTCAGAAAAATAAATGTATATGCAAAACAAACGTCGAACGTTGAAAGTTGTCTTGATTCCCAAGTGTGGGCGGCTAAACTATC:1 + chr2R 18959533 3' - blood 9 2 78.08 ACTATACTGTTGTAGTTTTTTTGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATCAACGAATTTAATTATTATAAATAAAAAACAATTGGCAAATGATTACATTTTAA:1 - chr2L 21367221 3' - Doc 65 1 60.14 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTTTTGTTAAACAACTGTATTCTAAGGAAGAATATGT:1 + chr3L 9909821 3' - Transpac 4941 2 68.97 CGGCTATTATATATTATATTATATACTTATGTTAAGAGAGTTGAGAGAGAATGCTATGTGTGCACATTGTGTACAAAGCGGCATTTGGTTATGCAGATAACGAAGTAACCATGGTTACCAATCCAA:1 + chr3L 15692601 3' - gypsy11 4242 2 72.22 CTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTCCATTTCGGACCTTTCCACCAAAAATCACAGTTGATCAACTGGT:1 - chr3R 19446506 3' - Juan 4155 1 64.80 GCGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCGGTTGCATGTGTATTGGAATCCGCTGTCCGTATAGGTTTTCCCACCACCCACTTTTCCA:1 + chr2R 12093611 3' - accord 7031 2 75.00 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTATAGGGTAGGGGGTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATTCCTAGGA:1 + chr3R 30635061 3' - roo 5 2 72.73 TTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGACTTTGATTGCTTTCGCCAAGGTAAACTTTTTTAATTATGAAAATTAAGTGCAGCGACGACGGCTGCAGCATAAGAACGGCAAAGAGATGAAGAAGCGACACCAAA:1 - chrX 18944006 3' - FB 11 1 66.19 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCCATTATCCTCCTCATGTCGCTGTGCGAACATCTAAAACAGTGAAAAAGTCCGTGGCATGGCACTTTAAAAAGGGCCTACGGTTGTCACA:1 + chr3L 16562979 3' - roo 8695 2 58.90 AAAAAATCCTATGATTTACAGTTTTAGTGGGCAATTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATGCCAAACAATGACGAAACAATGATGAAGACGTAAGGTACGATGCAAACTAGTGTTGACCGGGACGAGATACGCTAAAACGGAA:2 - chr3R 7640104 3' - 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chr3R 19531239 3' - hobo 71 1 66.20 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCTAGGTACAATGTG:1 + chr2R 5923038 3' - jockey 4707 1 53.17 GTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTATTGCAAGTTGTTATGACTGAAAAAAAAACGAACTATATATTTTAGAAGGGTATTTAAAAAGGGCACTCAAAGTTCTCTCTTCACACCCGGGTCCTTGCTGTTGCTGCTG:1 - chrX 17306227 3' - G2 3058 1 73.79 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTG:1 - chr3R 22100504 3' - 412 7110 2 54.11 GTTACATATCATGATTTTTCAATAAATTCAACGTCCATGCCGCACTTTGCTCATTGAATTTTGAACAGCGATCTCGTCGAAGTTGGGTGGCATTGGGCATTGGGCA:1 - chrX 2513426 3' + Chouto 6223 1 78.30 AGAATGTCTAAATATGTGTTTAGACATGATAGGTAGGCACTGGACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAATGCCTTATCTGCTTTCGTCATATTTTCCTGGATCCGTGGTTATATTTCTGCTAAAAATATTT:1 - chr3R 13204032 3' + rooA 7232 1 52.67 ATGCGCAGCTGTCATTGCCAACAGCTATCTGTCAGCCAGAAATAAGTACAAAGTATGCAAACACACACTGAGACAGCCAGACAAATAATAATAATTTTACATACTTTGGCAGTCATATAACGCAATCGTAAAATGTAT:1 - 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jockey 90 1 67.81 GGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTAAAACGGAA:1 + chr3R 22516082 3' - jockey 4593 1 59.59 AAAGTGTGCACTCGCAAGTACAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGT:1 + chrX 22824235 3' + gypsy12 10155 2 54.86 ATTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTTATACAAGAAAAAACAAAAGCCGATAATATAAAAATGAAAAATTTAACTTCTTACGCTAGGGATTCTCCGTAGTTCAGGGAATTGAAGC:1 + chr3L 18155416 3' - gypsy4 6573 2 75.22 CCTCTCTTCGGTACTACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTCTGCCAGAGGTTCAAATACTAACACTTAATGAACTTAACTTTCCAACAACATCA:1 - chr3L 15190430 3' + R1A1-element 4930 1 57.97 GTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGG:1 - chr2L 18279876 3' - gypsy5 6970 2 56.67 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTTAAGCATCTCCATTCCCACCTCCCACTGTT:1 - chr3R 25880283 3' + P-element 2859 1 40.96 ATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGATCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTTGCAATCCGC:1 + chr3R 29288815 3' + BS 5039 1 54.11 GTAGAACTATGCTTGGATTAGTCTTTATTTGTAAGCTCATTGGTGGTGATGTTGAGAGGCCCGACTTGATTAGTCTGTGGTCGCCGAAAAAAAATCAAATTAAGCACTGCACTGCTGCCGCTGTTCCGCCAATTTCTCGCTTTGCT:1 - chr3R 1192857 3' + Cr1a 4020 1 51.37 ACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGTTCCTCTATTACGGCTGCACTCCTGCTATAATACGTCTTTCACTTGAATTGCTTTTGAAAGCTGTACATTTCTAATGAATCTGAGTATAGA:1 - chrX 17419352 3' - Juan 4057 1 60.27 GCTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATTGCCTCATTTTGAAGATAATTGCTTGTTATTAATACATTTTGCACCTTAATTTGATTTAACCTTAAGATTTTCCAT:1 - chr2L 12658431 3' + Quasimodo 7324 2 49.32 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTC:1 + chrX 7515726 3' + roo 337 2 68.79 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTGTATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTGGACA:2 - chr3R 16913353 3' + pogo 2043 1 62.33 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTATATTCATAACATATACATTAATATATACATTGCAAAATATATCAAAATATTTAGGTAGATATACGTTGGTGTCAGAGAAAGAAAGAAAGAATTTAAAGACTAAGCG:1 + chr2L 5694274 3' + copia 241 1 62.33 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAGGATGCCATTTCAGGATAAGAGC:1 + chr3L 17133896 3' + jockey 4958 1 50.68 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGATACTTTTCGGATATGCGACAAAATCGGACGAAAACTGCTTTTTCAA:1 + chr3R 6388790 3' - jockey 85 1 68.49 ATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACAGCGTTTATGCTGCTGGGCTGCTCCTGCAGCATTTGGTGGCCTGATCCTATTCCTGGTCCTTAACCAAAAACGCAAGGG:1 - chr3R 27822180 3' + I-element 5315 1 61.64 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCAACACTGTCGTTTAACTATTTCATATTAAGTTAATTTATTTATTATTGTTGATTT:1 - chr2R 16441766 3' - I-element 21 1 71.23 TTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTAGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCCCAAACCTTCTAAACATAAAGGCCAACACATCTGAGACAG:1 + chr2R 4160401 3' + pogo 2020 1 73.29 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTTCCCATCTACACTTGGCTTGGCCACTTGTCTATCGATCTGTTTTGTTGTGCGAGCCAAAGAAACTTGAATGTT:1 - chr3R 13612787 3' - 412 47 2 53.42 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCT:1 - chr3R 31490936 3' + roo 356 2 56.92 TGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGCACTTAACTCGCGCCCATTCATAAATGGCCGCAAAATGTTCAACAAATGTGC:1 + chr3R 28272520 3' + Tirant 8424 2 75.34 TGGGCGCGCTGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATAGAATTTCAAAATTATTGTATGCAATTTTAAAAGAATTTATTAATGGAACAGTTTCATTACAAATCTGGGGCAA:1 + chr3R 16799852 3' - X-element 4632 1 61.64 CTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCCGATTAAAATGTTAAGCTCGGTACACAGGGAACACCACGTGGATGCCGTTGTGTTACA:1 + chr4 1167256 3' + Cr1a 4231 1 53.97 AATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATAC:1 - chr2L 17550620 3' + Transib-N1_DM 434 1 79.45 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGTACTGTGTGATATTGAAATATGTGATTATGATAAGAATCATGCTTGTAATATATGTGAATCATCAAGAGTGATATTA:1 + chrX 6707877 3' + hopper 1376 1 57.53 AAAAAACAAAAAAAAAAACACTTTAAAAA:1 + chr2L 12054881 3' + HMS-Beagle2 489 1 89.66 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAA:1 - chr3L 24228606 3' + copia 5073 2 76.92 CTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTACAAAATTTAGAATGGCTTAACCTTCATTTGTTGCAGTT:1 + chrX 13340938 3' + Stalker4 162 6 67.23 TAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTTTTAAATTTATCGAAAAAATCGATGAGAAATCGCTTCCTCTCTAGTCCACTATCTAA:2 - chrX 18512658 3' - S-element 62 1 62.33 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGGGAAAAACTCTAATAAATGTGCTTTTGATACTCTGCTGC:1 + chr3L 7995549 3' - P-element 21 1 69.86 ACCGACTATCTCTCTTTGAGTGCGGACGACTGTGTTTTCCAATTGTGTGCGCTTTACTTATCGCGGAATTACCATCGCCCAGCTTATCGCCGTTACATTGATTAAGTTCGCCATCGTACTCCGATTAAAGTTCGTATCCATTAAAC:1 - chr3L 338234 3' + Ivk 6 1 69.86 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAGTGTGATTAGACAAGTAATTAATCGAAATTAAGCA:1 - chr2L 16884770 3' - pogo 29 1 58.22 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAA:1 + chr3R 9352116 3' - Tirant 41 2 58.33 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCA:1 + chr3R 24476350 3' - 412 85 2 76.03 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACTACAGAAATGATCAGACGTATACAT:1 + chrX 5150358 3' + roo 8991 2 76.22 ATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTT:1 + chr3L 10144726 3' - blood 88 2 82.88 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATATACTTCTTTAAGGACATAATGAGACAGTAACAAGTATTAAGAGTGTTTCGCATTCGTTGTGCTTCTGAGAA:1 - chr3R 10968696 3' + I-element 5305 1 54.79 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAACCGCAGTTTACTGATGAGTGC:1 - chr2L 17210231 3' + jockey 4986 1 75.61 AGGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGCCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAGGCAGCTGTGCTGTTTGCAT:1 + chr3R 22694972 3' - Ivk 288 1 79.31 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGGCCAATTAATTTCGTAAAAT:1 - chr2L 3890142 3' - jockey 71 1 63.31 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACAAAGCAGGGAACCGAAAAGGAAAGGACTGGACTGAACTGGGCTGGAG:1 + chrX 17806031 3' - roo 8733 2 67.61 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTG:1 + chr3R 16181213 3' + roo 326 2 72.60 ATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATC:1 + chr2R 8641614 3' - diver 5935 2 49.32 AATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAACAACTCAACAAATAATAATTTTACAAACTTAGAAACAATGCGATTTCTTTTCATATGCATCATCTTAAATTAGTAATAATAGGAATTTAAAAATCAGTGAGATCGGT:1 + chr2R 5338968 3' + Doc2-element 4726 1 75.34 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGCATTTTT:1 + chr3L 16580339 3' - 412 34 2 60.20 AACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTT:1 - chr2R 2492933 3' + invader2 182 2 61.64 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACCTGATGTTTGCTTACTACTTAGAAG:1 + chrX 16384124 3' - diver 25 2 66.42 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCGGGTG:1 - chrX 1287795 3' - jockey 4815 1 50.41 TGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGATCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTTGCAATCCGCT:1 + chr3R 29288816 3' + BS 5040 1 53.42 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCAGGCGTCGAACTCGGAGCAGAGGGCTGTGTGGCGGCCAGTTGCTTCTGGGG:1 - chr3R 8258844 3' - Tirant 8122 2 60.47 ATTTGGAGACAAGTTGGTTACTTTATGGCTCGAGAGAGGAGTTGCCAGCCCTGGCTCAAGAGAGGAGTTGCCAGCCC:1 - chrX 22575245 3' - Transib5 61 1 64.94 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACAC:1 + chr3L 13827375 3' + hopper 1375 1 56.43 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAAT:2 - chrX 4778183 3' - 412 7121 2 63.01 ATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTT:1 + chr2L 16089695 3' - 3S18 38 2 55.56 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTATGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTG:1 - chrX 2762602 3' + roo 8996 2 75.19 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCTATGTTTTTCCATCTCCATATCGATTCGCTATTATTTTGCTCGCCACTGTGTATCTTTGAGGTGCTTCGGCATCCGTTGCTGTG:1 + chr3R 6413815 3' - FB 32 1 62.59 TATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACAAAAAAAAACCTAAAAAATTGAAAGCAAAAATGTGAAAAAAGGCGAACAAGTGAAGCT:1 - chr2L 7559683 3' + mdg3 5493 2 67.42 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGAGGCCATTCAAGTCTTTATGTAAG:1 + chr2R 18482535 3' - hopper 27 1 67.12 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCGA:1 + chr3L 22052877 3' - mdg1 7074 2 60.96 GTAGGGATTAATGGATAACAACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATATATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGGAAAAAATAATAATAAAAAAAGTTTATACGTAAGCGTTACT:1 - chr2L 19817842 3' + G4 3760 1 70.55 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCATAGAAGATAGGCTTATCCAAGGGGACTTGCGTAACCCTCTTTGAGTTTAT:1 - chr2L 2031035 3' - 412 7123 2 65.07 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCCGCTGCTGTCACTTTTT:1 + chr3R 8709838 3' + jockey 4928 1 68.66 ATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGCCGAGTAAAACTGACTATGTCCGTAATTTTTCCCTTTTTATATGAATGT:1 + chr2R 12994935 3' - 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roo 25 2 67.12 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCCTTTTTGTGTGGTTCGCGGTGAATTTGAGCATG:1 + chr3R 24476406 3' - 412 7075 2 67.63 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATATATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATGTGCAGGGATCTGATTTATAAATCTATCAATGCT:1 - chr3R 29288746 3' - BS 5081 1 73.29 AAGAGAGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAAGATGTTTACAACAACGGCTGAGTGCCGCTGCCAAAGAGTTCTTTATTAAAAACGGATGCTGCGCAGCTGGGATAAATTATATTCTCAAGTTAAATACTCTTCTGATGGCC:1 - chr2L 3189745 3' - 297 6737 2 73.29 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGGCAAGTGACTAACCCCGGGAAAACCTGGCATAATTATGGTCG:1 - chr3L 905799 3' + 412 417 2 68.28 CTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTCTTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATA:1 - chr2R 10572710 3' - F-element 4639 1 62.33 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATATGTATGCCCCAACTCTTGGGATAAAACATCTCGCACTGTCACAGAAAAAA:1 - 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F-element 64 1 68.70 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATCACATTTTTAATATTAAAAGATCTTTGATCGTATTTAATAGACTTTTTCAAGTTATTTGAAATGAATTATAAT:1 - chr3R 17546606 3' - blood 50 2 51.03 CAAAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGATTGGCTCTGTCTTAAAAGTTTGGAAATTATA:1 + chr3R 27510146 3' - Bari1 90 1 78.08 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCTAAGACGGAAATAACTGGGTACCAACCAAATGATAAGACAAGAAATGTGGGTTAATAGCAACGGAGCAGAGCTAAGCTCTTACG:1 - chr3L 22670348 3' + Tabor 448 2 63.01 AAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTATCCTGCTGTTTGTGCATACTAATAGTAGAG:1 + chr2R 22306060 3' + pogo 2014 1 79.45 AGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACACCTGTCGC:1 + chr2R 13644535 3' - Burdock 22 2 66.14 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGTTTTAGGCAAGTCCCAGAATGTTCCCCAACAACGGCTGCCAGGCTTAAGTTTGCGCCTCGCTGACTCCCTATCTATTTGGTTAAT:1 + chr2L 15988101 3' - roo 4 2 76.52 AAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGACTCAGAGTGGGCAATACGAACTTTTGTTTGT:1 + chr3L 24152580 3' + HMS-Beagle2 301 2 73.68 GGCAGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGGTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAAGTATTCTAGTGTCTTTGGCTA:1 + chr3R 31959303 3' - Ivk 65 1 70.69 AGGCCGCGGGTATCCCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTC:1 - chr3L 25340834 3' - gypsy8 323 1 76.42 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTATGCATTGCATTGGTGCATATATAATCAGTTGAGTCTGGGCAAAGTC:1 + chrX 17732064 3' - pogo 71 1 69.18 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACACACACACACACACACACTTGATATGACACCCATGTAATCCTGGCTGATGCAATATCTAAATTAGCTACATCACAACCACTGCGCTGATAAGAGAAAAATCAAGTTTTCTTG:1 - chrX 13395205 3' - roo 8668 2 71.23 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTCTCTATATGACTGCAAGAAAAAATCTAACGAACTAACACAACTTTATTTATAAATTATTTGTATATGA:3 - chr2L 11574784 3' - Max-element 8266 2 63.70 CGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGCCTTAGCTATTTTAACCTTGGAAAGATGTCATATTTTGGTCGCTTGT:1 + chrX 18806236 3' + roo 9019 2 62.40 AAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTT:1 + chr2L 14147250 3' - transib2 2590 1 69.44 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCC:1 + chr3R 22100584 3' + 412 439 2 67.83 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGTTTTTTTTGCATATCAACACACGTGTAAAGCAAATGTTAAACATGAATGTG:1 + chr3L 9571772 3' + jockey 4964 1 60.96 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACGAAAAAGTTGGGAATTTGAATTTTCGAATTTGCTGTTAATTGAACACTC:1 + chr2L 2276817 3' - F-element 26 1 65.32 GACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGATTCGCATATCGTTAGTAACGGCAAAGACCAAGGGAAATCG:1 - chr2L 18255063 3' + G2 2830 1 71.13 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGCTGGCTTTCATTTTATTATTGCTTTTCATAATTAATCTATTTAGATATTGCAAAATCGTCATATATTTATTTCATTTTGCTT:1 - chr2R 22491998 3' + pogo 2074 1 63.50 TTTGCACAACCAAAACGACACGAATTTGCCTGTAGGAAAAGAAGACACCGAAAACGGTGGAGA:1 + chr3L 23911918 3' - G3 7 1 87.30 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAGAAATTATGTGGACAGTGGTTTCCAAAGGCAATAACTTTATATACACTAAAGTTTAGAATGAAAAGTTAAAG:1 - chr3L 15026633 3' - opus 7047 4 54.11 AATAATAAATAATAAAATAATAATTTGTCTAAGTTTGAGTAATTATAGGTGCACCCTAACCCTCTGAGGCTGCAAAATATTTTACCTGCATATTTTTTTAATATCAAATCCGTTTTATGTGTTTGGTTTTTCATCCCCAGTCCG:1 + chr3L 19112451 3' - INE-1 416 2 77.08 GGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATG:1 + chr2R 15829583 3' + invader4 274 2 71.30 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCCGTCTTATGTTTTAGCAATTAGTTACTAAGACTAAA:1 + chr3R 9160826 3' + copia 249 1 79.45 ATTAATATTATTAATTTAAGCTCCAACCGTTTGCAAATCACCTAAATTTAGTAATCATGGCATTTTCTGTGACTTCTTATTCAAACTTTTCGCTTTCAATGGTCGTTTTTGCTGATTTGAATAAAATAATTATATTTAGCTATCA:1 + chr2L 2633991 3' - transib3 2663 1 53.10 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCCAAGTGTTTACCTTTTACTTAAGAAATTACACTCGGGCAAACAGAATTTGCGTGCCCACAAATCCCGAGTCGG:1 + chr2L 16948790 3' - jockey 4686 1 76.03 AAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAATGCACTGTTATAATAACAGCTGTTACAATACGCACGAATACGCTGAATACTTAAAATTGTCAATCA:1 - chr3R 25052787 3' - hopper 1358 1 71.92 ATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAAAATATATTCTTGATCACATCAGAATAGATTAGTCCAACTAACTTTGAACCAAAATTCGATGCATTCCTTTTAGGTTACAATGTTATTGGTTAAGTAAGGCCTATGAA:1 + chr2L 13154353 3' + Juan 4208 1 61.64 CTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAGATACATTGTATTGATAGAGTAGTGAATTTGTCCCGGTGTCATATAATACTATATAATACTGTCTCAAACAGAAACGACGGATG:1 + chr3R 7961623 3' - copia 5028 2 58.22 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGACATCATGATTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACT:1 - chr3R 10684731 3' + roo 9028 1 54.62 AACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATATTACCATGGATACCTGGTCGGCCAAAACATTAATTACTTTGCAGTG:1 - chr2L 422771 3' + 17.6 7349 2 69.18 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGCATTTTTTTTTTCCATTTATGTAGCAATTGAAACGAGATCCCACCATGACGATA:1 + chr3L 16580386 3' - 412 35 2 61.64 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGAATGAGTTGATTTCTTTCCGTGTAATGTTTGTTAAAATTTTCAACTAACTCTTCCAACTACC:1 + chr3R 20744073 3' - roo 8722 2 60.96 AAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATTTGCCAATTCCAAAAGTGATCTTTTGTTAGAATAACAGCATAGACCATAT:1 - chr2R 7020521 3' + Bari1 1672 1 58.22 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAAAGCCCATTAAAGTGACTTATG:1 - chr3R 30634895 3' + roo 9043 1 67.81 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCA:1 + chr3R 16181262 3' + roo 9039 1 63.01 GAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTCTCTATATGACTGCAAGAAAAAATCTAACGAACTAACACAACTTTATTT:1 - chr2L 11574803 3' - Max-element 8285 2 50.68 CAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGAC:1 + chr3L 24152550 3' + HMS-Beagle2 7144 2 55.24 AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCG:1 - chr3L 24152409 3' - HMS-Beagle2 12 2 72.87 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAAATAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGACCCCATTTCCAGTTTTGTATTTTTTTTATTATTATTTCGCCGATCGGCTTAGAGATGCGTT:1 - chr2L 13927659 3' + roo 400 1 78.08 CACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGTTCAAAACCTTTCACACTCTTGTTATGGAAGCGGACTTAGCGC:1 + chr3R 15702982 3' - copia 4948 2 71.23 TGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCT:1 - chr2R 5214977 3' - F-element 35 1 57.47 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCACGCTCGGCGACACTCGCA:1 - chr3R 17305422 3' + roo 9033 1 58.22 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCCTATTTTTAGGCAGCGCATCCTTTGTC:1 + chr3L 1630163 3' - jockey 4739 1 78.15 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGACAAAAATCATTATGAGAATTGTAGAGAATGAAGTTCATAAAGCGATGGAGAAGTACCAAATAGTTCTTAGTTTCAAACACAATAAACATCGAGTAGCTC:1 - chr3L 20594083 3' + roo 9054 2 72.92 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAAATCGCTGCCTATCTCCCCACCCCATCCCGCCAACATGCGTGTGTGTGTGTGTGCGTATCGTGTAAAGTATATAATTAACGGTAATGCACA:1 + chr2L 14095698 3' - pogo 26 1 67.81 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATAGGTGGCATATATAGGCTTATTACAGCTCGCTCTCCATTTTTTTTTTGGG:1 + chr2L 9237557 3' + blood 7332 1 72.12 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATGAAATCACGAAAACGAGTATTAAAAATGTATTATTATGAATAATGTTTATAAATGTTCAATCTCTGTTGTT:1 - chr3L 23986498 3' - opus 157 4 50.68 CGAGATCTCAAGAACTATAAAATCTAGAAGGTTAAGCTTCAGCATACAAATTCTAGAGACAAAGAAGCAGCGCAAATTCGTTGACCCATGTTGACACGCCCACTCTAACGCCGAGAAGCCGCACAAAACTTCCACGCCCACACTTT:1 + chr2R 5509663 3' + INE-1 147 1 76.03 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCT:1 + chr3L 12867343 3' - roo 85 2 79.58 TTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTCTTCAAAATCCATA:1 - chr3L 9497733 3' - jockey 4816 1 50.00 GCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATGATAAAACACAATGACGTTGTGAAACTTATATCAAAAAATAATACCATATTTGATATTGTCATAACGCTTATTGTCT:1 - chr3R 929273 3' + Max-element 8507 2 61.24 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATGTTAA:1 + chr3R 10472794 3' + mdg1 7401 2 55.48 GCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATATACATTTGCAGTATAGTATCGCAGTAATCTGTGATGGAAA:1 + chr3R 29418810 3' + mdg3 222 2 66.44 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCT:1 + chr2R 558168 3' + copia 5083 2 67.12 ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTGTATCGATTTGTATTTAAACATTTAAAACATATGAAATGTTAAATTCGCCCAT:1 + chr3L 23986616 3' + opus 7439 2 64.38 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACACAAAATTAAATTCTACATTAAGATAACACACAGAAATATCGAATTAATTTTATATAATGTTATTCTCTAGTAACCAAACAGTTGCCAGAAA:1 + chr2L 8956872 3' + pogo 2074 1 58.90 AGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTGTTCGCTTCAATGCGCTGCTATTCTATAATTGCCTTATGCAATTCTGCAGACTTTCTGACAATGTCA:1 - chr2L 4998484 3' - FB 56 1 51.82 CTGATAGTCGGGGAAGTCGACTATACCATTCCCTAGTGTTTATGCTGCTATCTTTAAATCTTTCTGTCGTAGAATTCTCTAATTTTTTTGACAACTCAGTATTATCTAAAACTTCGTGTAAAATAGGAGAAACTGCGTTTGGACTC:1 + chr4 920871 3' + INE-1 562 1 68.49 ACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGTAATTCGTGTGGAAATACAAATATATATGTGATAAAGT:1 - chr3R 13582152 3' - BS 5000 1 79.45 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAAAAAAAATTATATAACGTGTGAAAAACTTTTATGGCCCTCGA:1 - chr3R 6244516 3' - Doc 82 1 72.60 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAACGACTGGAAGGGCGTTAGTCAAATATATTGCAGTACATACACACACTCCTTCATTCCTCTAGGAGAAGAC:1 + chr2R 5868428 3' - pogo 14 1 76.03 AAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAATTGGCCCATTGCCCCAACCCGAC:1 + chr2L 16089721 3' - 3S18 23 2 69.18 AGGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCAT:1 + chr2L 21070683 3' - FB 57 1 56.16 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAACCAGACGTTA:1 - chrX 8891769 3' + P-element 2812 1 29.50 GTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTGGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATGCCACCATTTGTCGTTATTGTTTGGCCCAAATATTTGGCAATGCCTC:1 + chr3R 23532395 3' + invader2 4801 1 67.59 AAATAAATTGTTTTGTTAATTATTTATGGTTGGTTTAATGAGTGTGTGCCGTTCGCTGTGTGTTTACTGTACTCAGTGTTCGCTGGCGGTCTGGGACGTCGACTTCCATGTAGCTGATGCTGATTCGCAGACCAAGAGAATTTTTC:1 + chr3L 19197083 3' - TAHRE 58 1 76.03 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAACACACACACGCACTCACTCGTTGTGGG:1 - chr3R 28396593 3' - jockey 68 1 57.24 AGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTTTTTGGTCCTTCAACTTTAGATTCTTCAAATCCTGTTTCTCTGTGATCTGATATTTTAGCTTTTGTTCCTTCAGCATT:1 - chr2L 16677907 3' - hobo 351 1 52.05 TTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCGGGTGGCACTGCCGACATCTATT:1 - chrX 1287777 3' - jockey 4820 1 54.79 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAAACGTTTAACGAT:1 - chr3R 21706002 3' - 297 58 2 71.67 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCCACATACCTCTCCACTGCTCTGCTGTTCATTAGTACCCCATTTTGGTTGGGCGACTCATT:1 + chr2L 6184108 3' + pogo 2042 1 60.96 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGCGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATATCTGGTTCTGTAGAGCATA:1 + chr3L 12224710 3' - 412 69 2 61.64 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAGCTTTGTCGCTTAT:1 - chr3R 27510062 3' + Bari1 1654 1 52.74 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATTAATGACTGTTTATGTTTGGTTATACACAAAAGATGAAAGCCTTAATTGTTTAT:1 - chrX 3263325 3' - roo 54 2 61.94 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAGAAGAGGCGAATGCTG:1 + chr3L 22052883 3' - mdg1 30 2 65.07 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGTAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTATATATGTGTGTGTAAGAGGTTCTGTCGTAATGAAAATAAAGTAGCAACTTTAACGCATTTT:1 + chrX 10974431 3' + opus 7469 2 54.03 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTCCAGCT:1 - chr2L 13792588 3' - F-element 59 1 61.86 GTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGT:1 + chrX 22574693 3' - 17.6 117 2 45.89 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATTCCTAGGAAATTACAAAGAACAGAACT:1 + chr3R 30635080 3' - roo 8680 2 38.57 CAGATCAATTTTCACAGCAGCCGTTATGTCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAATCAACTAGCAAACACCCTAGGTATAAAAAGTCAAGTCAAGCTATCCTTTTACAAAAAAAAAAAGAGTTAAAGAATCTACGTAATATGTTATT:1 - chr4 701823 3' + G5 4543 1 56.55 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATGTTAAAATCA:1 + chr3R 10472799 3' + mdg1 373 2 50.35 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTG:1 + chrX 6138698 3' - opus 154 4 72.28 CAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATT:1 + chrX 1018147 3' - 1360 248 1 69.18 AAAATATACATATATGTATATAATATATGGTAGATCTTCGATTCGATTTGCATATGTACATTTTACATATGGATATAGTCATGTCTGTGTATTTGGACATATATCAAATATTGATAGCTGCTCAAAATGACGAAACGATC:1 + chrX 17697030 3' - INE-1 69 1 79.29 CTCATGTCACCTATTTAAACAGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACA:1 + chr2L 16458672 3' + roo 335 2 67.81 TTAGATTCAAAAACCCGAATTGAACTCATTAAGTGTATGCACAAGTTTATATCCCCTGGAAGCTGTGGGTAGCAACCGAGCATTCTTTAGGAGTGACACGACGCTCCCACGGGAATCTTAGCCT:1 + chr3L 23455176 3' + rooA 327 2 66.94 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACATATAGACATGTTAGTGGAGCGTTTGTAATGTTATCAGAATGGTATA:2 + chr3L 14551109 3' + P-element 2883 2 73.29 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTGATCAGGCTGCAGTGTGTGATGCAATTATGAGGGAGTAGTTTTTTGTTACAGTTTAAAGTAAAC:1 + chrX 16855340 3' + roo 350 2 56.16 GAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAA:1 - 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chr2L 2698329 3' + I-element 5318 1 58.22 GCCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTTTCTTCGTATGTATGAACGTTGAGATCTAAGGAACTATAAAAGCTAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGAGTAAATCTTCAGATTCGAGACTTGTTAAACAAAAAGGCC:1 - chr2R 1337691 3' + INE-1 106 1 60.27 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTTTAGGTGCCGTTAGTTTTAGCACCCACTCCTCGT:1 - chr2R 11057214 3' - pogo 20 1 69.86 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGATATATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGAT:1 - chr3R 24122662 3' + roo 9002 2 66.44 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCTAAAAAGCATACTTTATTCATTTACGATCCTAAATATTTATTACTACATATATACATACATATCTGGCCAGA:1 - chr3R 23859810 3' - jockey 4807 1 53.47 AATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAAATTTCAATAGAAGCGAGGGGGCAGTATCTGTCGGATACTAGCGTGTC:1 + chr2R 9883156 3' - S-element 367 1 68.00 CATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATGGTATATAAATAAATCCTTCGAGCATTCCCATTATGTAATGGTAACATGG:1 + chrX 10161191 3' + micropia 5374 2 65.75 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCAGCTCCTAGTCCAAGTCAAAGTCCAGGCACGTAGCATCCGCTCC:1 + chr3R 22100637 3' + 412 463 2 63.19 AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTGTGTATTGGGGG:1 + chr3R 20175788 3' + hopper 1350 1 63.38 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGTCATCATTAGTGGCCCTTTGGCAGCTGCCAACCACCGCACCCGCTGACCGCATGTCTG:1 - chr3R 12599026 3' - 412 61 2 59.86 CCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTATGTGTGGGTGGGTGGAAAAGAGGCAACAGTTTTTCCTGATTTTTGTCGCTGGGTGCTACGCAAGTG:1 - chr3R 15711732 3' + diver 6090 2 67.81 CTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTAGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATTTTTCGAACTTTTTGAAGTAAATACAACTGAAGACTTAAAACAAATAAATCTATTTAAATTCATATTTTT:1 + chr2L 8883986 3' - F-element 4326 1 50.68 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAAGGTATATCTACATAAATGAACTAATATTTTGCTTGGAACT:1 + chr3R 29645761 3' - jockey 85 1 70.55 CGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGAAATTGTACAAGCCAAAAGGAGGAAAAATAGGCCCGAGGAAAAGCCTGACATGTGGC:1 - chr3R 17900629 3' + hobo 172 1 51.28 AGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGATTAAGTGCAGAGTTCATGTTTATCTAAGCTAAGTCAACGAAGTGCACTTTCCCT:1 + chr3L 20034959 3' - Stalker 7149 4 65.07 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATTATCTGATTTGCCTGGATAGCTGAATACCTTTTTTAAACAATGCACACCAATCATG:2 + chr3R 11113311 3' - mdg1 7060 2 70.55 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAAAAATAATTTATGATTTTT:1 - chr3L 10133505 3' - 412 7119 2 61.64 GGAAGGGGCTGGTTTGGACCCCCCAAATACGTCACTATATTACTCTGTTATTTACTGTACTGTCAGTCATGTCAATGCACACAAAGCAAAAAATGTAGCAAA:1 - chr3R 4581850 3' - 297 6596 2 63.73 AAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATATCGATCACTCGTGCCGTAATGCAATCCTCCTCCAATCTCTCCGCTGCGGCC:1 + chr3L 18292593 3' + 412 180 2 61.36 GAATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCTTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAAAAGAGCTTTTTTTTAAATTTTATTTTTATTTCTTGTATATTACAAAACAAATTAAA:1 - chr2L 22133363 3' - S-element 84 2 60.96 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACCAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGCCT:1 - chr2L 76050 3' - roo 8736 2 67.12 AAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGAAAAAGCCAAAAAGTAGACAAAACTCAGTTGCGATGGCAGTGCATAGAAATGAAA:1 - chr3R 17495698 3' + Quasimodo 7344 2 69.18 CGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATGTCACAAAGAACTTATATTTCGCAATAGAG:1 - chr2L 6184029 3' - pogo 86 1 77.78 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGGGGCAACCTGTAACATTTA:2 + chr3R 21706096 3' + 297 6929 2 55.48 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTACTCATCTCCCATGCGAATAAGAATTTAGTGTGGAATATTAAATAAATAAAAAAAAGCTAA:1 - chr2L 4350538 3' - jockey 91 1 79.45 CGATTGCCTACCTTTTAAAACTAAAAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 - chr2R 1522957 3' + FB 621 3 53.38 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAAAAAAAATTATATAACGTGTGAAAAACTTTTATGGCC:1 - chr3R 6244521 3' - Doc 49 1 67.59 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAAATGTCAGAACGATCACCAACGTGTAAAAAGTTTTAAGTTCTACCGATCTTATAAATATTTATACTTTTTTAAAATTTCGATGTTTTTATACGGAATGCTGAGTATGAT:1 - chr3R 7981422 3' - jockey 17 1 78.08 CATTTTTCAAAAGTGTAGGCGTGGCTGAGAAGAGCGCTTTCAATCCAACATTTATAATTTGCCCAAGACGATGATGGTGATAAT:1 - chrX 19377633 3' - INE-1 254 1 73.81 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTTGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCACGAGATTTTTTCGTTCGTTTTTTGCGTTTTCGCCCACAGAAACAGAACATCGAGTG:1 - chr3R 23236391 3' - hobo 41 1 49.60 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATGTCACAAAGAACTTATATTTCGCAATAGAGATGCACTTTCACTATCAATGCGCACTTTCTCGAAAATTGAATTGAAAATGTATCGAGTTCATAACTC:1 - chr2L 6183971 3' - pogo 21 1 40.41 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTATGTATATGTACACAAAGGATGTCACACGAAATATATTTAAAATTCTTCCAAATAACTATTATCAAAACGATTCCTGTCATAATGTTCAAAATAAGAAATCTGTGTAATT:1 - chrX 22559973 3' - Transpac 4924 2 70.55 GTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAATCCGGACTCTCAACATCCCCACGAAATGCAACAAGTAGAGGAATCGGGTCTAAAAATCAGAGGAATGCGAG:1 + chr3R 23482999 3' - Cr1a 4111 1 61.67 CTCACTTATGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTTAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCAGGCGAAAAGCAATTAGTTTCCTTTGACTAATAATTAATGGGTAAAGAGTAAGACCA:1 + chr3L 15672093 3' + R1A1-element 5262 1 58.90 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGGCGTACTGAAAGAAGTTGTTAAGAAATCTATCAAATTGAAAGCAGTAAA:1 + chr3R 7539524 3' - roo 63 2 65.69 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGGCCTGCTCCGATTCGGAATCATTAAATAGACGACAGGCGAAATCGAAATTGCAGTGCCAAAGTTGCCGCCTGCTGTTGTGGC:1 - chr2L 11951492 3' - pogo 36 1 62.33 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATGAGTTATATATCGTAGTATTTAACAATTTCAACAACTAAGCATTTAAAGAGTAATTTTTGAATAAACTTCAAACGAATTTGCGTTCAGTGCACTCACATTCCCA:1 + chr2L 2698492 3' - I-element 15 1 71.92 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACAATGAAAGCGATGGAGAGAGAACAGGA:1 - chr3R 25387802 3' - roo 72 2 79.20 GAGTCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTAGTTGTTTTTAGATTTAATTTACCATAAATCTATATCTAGGTAAATCTATACCTAGGTTTGGTGATTCCACCACAAGCCTATTAAATAT:1 + chr3L 4187322 3' + pogo 2072 1 64.38 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGATACCAGATCTTGGTGCTGATGAACCTAGCCCCTTGCA:1 - chr3R 24122626 3' + roo 9038 1 59.59 GGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATGAGAATATTTATTTAAAAAATTAGACATTGAAATGTACTGTCCTCCGTGTCGTTTGCAAAGATATCCTTCCATACCTTACTT:1 + chr3L 15915872 3' - Doc 4542 1 54.11 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCCAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGAAACAAAAAAGCGTAAGAGGCGAGACTTGCAAC:1 - chr2L 3395712 3' - jockey 4763 1 75.34 CGTGAAACTATTTCTCCTAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGG:1 + chr3R 21706057 3' + 297 312 2 80.28 GGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCACGAGGATCGTATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACTATTTTAACGAAAGCTTTTAGTTTCACCTAAAGTGCGGGAATGCCTGCGTAGAGTGGAACGG:1 + chr2L 6117948 3' - Idefix 158 2 53.24 TAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAATTCAATAAATTTGCACAGAATTTTTCAACAATGAAAACAAATTTTCGCTCTTTCGCTGCTTGCATTCTTTGGCA:1 - chr3L 1404985 3' + Ivk 5332 1 55.17 AGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCAGTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTT:1 - chr3R 19589926 3' - BS 5069 1 66.44 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACA:1 + chr2L 246078 3' + roo 331 2 71.23 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATGATCCTGCCTGCGCAAAAGTTTTGTGAAGCAGAAACATATAAAAAATGTTGCATATTTTTGGGCATGTGGGAAAC:1 - chr3R 8707364 3' - jockey 4699 1 40.31 ATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATGAGTCACCAGGAGAAAGATGTTAGTAAATTGCGCGATTAAAGG:1 - chr3R 19859613 3' + opus 421 2 71.23 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGTAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTAAATATTCTGGGTTTTTTTTTATTAAAATTGCATCCCACTCTACAGTGCACTGTTGGTCGCGATTTTTATTGTTGAT:1 - chr2L 21943897 3' + opus 460 2 58.22 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTCATATTGTAATAAATGAAGGAATAC:1 + chr3R 16913467 3' - pogo 40 1 56.06 GGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTTAATTTTCTGTGACCCACAACATCTAGACTATGAAGTCAGACTTCGTCAG:1 + chr2R 12265229 3' - jockey 4594 1 65.75 CTGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGCGCGTGTGTGTTTGTGTGTCTG:1 - chr2R 16080733 3' - accord 187 2 71.43 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGCGATGCAGCAGGCCTTAACAACTTATTCCTTTGCCGGTTTCTAGCACTAGCCTG:1 - chr2L 15834421 3' + hopper 1382 1 63.01 AGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAAT:1 + chr3R 934288 3' + Rt1b 4737 1 58.90 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAATATTGTAGTTTCTGATAATACTGAGCATTTTTGTTTTCTCTCGGTAGGTCAAACAGAAGGACCTCAGCTATCC:1 - chr2R 5868260 3' + pogo 2057 1 55.48 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGATAGAATCATTCGAATTGTTCCAATTTCAAATGGCAGTTGCCACTGTAAGAGAACTCGGAAAATCTACAGTTGTGTTCCGGACTAATCAGTTGAGCCATAAACATTTAGCTGGT:1 + chrX 3577248 3' - roo 6 2 68.49 ACAAATTGGGAGACACACAAGTCGATACAGTGACAGATTACTGAGCCACAGCCATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTAT:1 - chrX 22726196 3' + Helena 1227 1 58.22 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGCTTTGTTTACCAGGCAACAGGTTATTGACTGA:1 - chr3R 5208107 3' + hopper 1375 1 58.22 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACCATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCC:1 - chr3R 21705987 3' - 297 6597 2 58.06 ATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGCTGGAAGTTAATCTATTTGAAAAGTTACCCAGGCAGTTCGAAATTAA:1 + chr3R 9155329 3' - F-element 4320 1 63.85 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAG:1 - chr2L 12079641 3' - mdg3 5327 2 77.42 AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCATTAAAAGCCAACACCCTTAAAAGCCAAAAGCATTTGGTTCTTAACTTCCACTCTCGAAAGAGTGG:1 + chr3R 28627698 3' - copia 4926 2 58.22 GTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGTAGTTGTTAATTAGCTTATGATTACTGTTGAGTAAAATGGAAACCTTTTTTAAACGCTTAAGGG:1 - chr3R 13349002 3' + BS 5075 1 69.86 TAACTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAACGGTTG:1 + chr3L 23042124 3' + pogo 2050 1 63.71 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACACAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCAAGAAAAAATGATATGGAGAA:1 + chr2R 19553311 3' + mdg1 7430 2 60.96 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAATAGAAAAAAAAAAATATCCGAAAAGTATGCTTTAAATATGATATCTTTTTTATACCAATTCCTCGTGGAGTAAAATGTTAT:1 - chr3R 6388712 3' + jockey 4949 1 53.42 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACCCATATAAAAACATTTAACTTTTGAGAACAAGAAAAACATTTATT:1 - chrX 18806163 3' - roo 76 2 71.92 CGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGTGAGTATATAGTAGTAGTACAGTATAAATATGAAGTTTTTATAATTATTTATCAAATTA:1 - chr3L 9713938 3' - G2 2701 1 59.59 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATCAAGTTGTAGAGCGAACCTCGCATTTGCGCCTCATGAACCGTTCACGCAACGTGTCGCGTTGTAAATAGAATTTGTGCATAATAAAATTATGCATTCATAAAGCAGTTGCA:1 - chrX 21196640 3' + roo 9063 1 79.45 AATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTATTTTTTAAGTCGAACAAATGATCCGTATTTTTAATCACTTTTCCAAATATTTATGTTTTATTATTGTACGTGAAGGCGAAGAAGTGATTTATGTCC:1 - chrX 18943320 3' - McClintock 6401 2 54.79 ATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCAGGACTTGGACCGATCGTTTTCAAGGTACCACAGCGTCCAGACATTCATGAGCGGG:1 + chr3L 9400747 3' - Doc 481 1 62.96 CCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:1 - chr3R 29487012 3' + flea 213 2 59.59 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACTGACTTTACTGCACTTGACAGTTGGATAATGATTGCAGCAATTGTCTGCTCATTACTTATAAGATTCCTTGCATTGCCCTTAAGTTTAGTTTTTATAGGGCTTA:1 - chr3L 6082046 3' - Doc 25 1 68.49 AAAAAATTCATCCAATTATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTGCCGGCATTAATTAAAATTTGCTTCAAATTATTTCCCAGCGTTTTCGTTTTTTGTTTGTG:1 + chr3R 27859276 3' - hopper 58 1 54.79 AGAAGAAAAACAAAAAAAAAAAGCGGGGAAAAAAACATTCCGCATTGAAAT:1 + chrX 5547892 3' + Porto1 158 2 88.24 AGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAATGGGTGACTTATCTAGAGTTCGTGTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACTATATTATTCTTATATTTGGAAGTTCGAGGTTGGGTTGTCGTATCTAACGACGGAGTAGTTCTTCACATG:1 + chr3L 24238936 3' - Idefix 184 1 60.27 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATGAAATCACGAAAACGAGTATTAAAAATGTATTATTATGAATAATGTTTATAAATGTTCAATCTCTGTTGTTGT:1 - chr3L 23986496 3' - opus 7158 4 52.05 CGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTCGGGAGGTATTTAGTCTAATGCTTTTCGAAGCAGCTATTACGCGTCCAAAT:1 - 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chrX 1103571 3' - pogo 20 1 70.55 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAAGTGCTTTAAATCAAGTTGAACCACAAATCGTACAAATCGTATTAATTCCTAGTGCTAAACCTTCCCATCAACTGT:1 - chr2R 23000023 3' + mdg1 378 2 54.11 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAGCTAGCTCGCTCGCTCGCACAC:1 - chr3R 13628600 3' - hobo 52 1 76.77 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAA:1 - chr3R 30634916 3' + roo 9033 1 57.78 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATTGCT:1 + chr2L 6318997 3' - pogo 62 1 63.70 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGACTTTATTTATTCAATAAATTAGTTTAACCTAATGTTAAACTAAATATATTACCGAACGCTGTGATTA:1 - chr3L 19792368 3' - pogo 50 1 54.11 GGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAATTGGCCCATTGCCCCAACCCGACCCAACTCGC:1 + chr2L 16089730 3' - 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chr3R 9160637 3' - copia 26 2 68.28 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCACGAGATTTTTTCGTTCGTTTTTTGCGTTTTCGCCCACAGAAACAGAACATCGAGTGGTTGGGGGTCAC:1 - chr3R 23236379 3' - hobo 39 1 45.93 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACCC:1 + chr3L 25401040 3' - Doc 18 1 61.48 AATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATATATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATGTGCAGGGATCTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACATCTTTATTCTTAT:2 - chr3R 29288727 3' - BS 5062 1 60.27 CGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTTATTATACAATATTATAAATTTCAGACAGA:1 - chr4 436837 3' + 3S18 6032 2 76.38 GAATTTTGTTACTAATTTTTCATAGCACTGCTATTTCATTGAACACCAGAATTTCTGCCTATTATGTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTGAATAAATAATTGCCTTGTCTATCCCTCAGGACTCGCTT:1 + chr3R 9354912 3' + HB 1402 1 78.36 GGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGAGATAGTCGGTGACTGACAAATATTAATTGTACCCTATAATGCTTTAGTATTCACAACACAAG:1 - chr2R 1007647 3' - Ivk 64 1 67.16 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCGGGCCAAAATGCAGTTAGGCAG:1 - chr3R 9160688 3' - copia 4902 2 56.44 TGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTCGACATTTCTTGTACAACCTATT:1 + chr2R 8641647 3' - diver 14 2 71.92 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAAAACCCCAAGGCGAAAAATTCCCTCGAGGAAGGCCAGGAAAAGCAAAACGCAGAAAAGTAGGCAATGATTTTTATTAATTGATAAGCATTTGCAACAAGTTGC:1 + chr2R 23116228 3' - jockey 25 1 73.97 ACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACAAAACGCAACCAGGCGAGCAACAAAGTGTTAAGCTGAAGCCAAGGCGGCAAGGCGATGAAGTTGTGTA:1 - chr2L 15315251 3' - Tabor 6984 2 56.16 ATTTTGTGTGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACGAAAAAGTTGGGAATTTGAATTTTCGAATTTGCTGTTAATTGAACAC:1 + chr2L 2276815 3' - F-element 41 1 57.66 CAAGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTTCCTGACTATCAGATACCCGCTACTCAGCTAGTGTGAATGCCTGTTACATACTCTACTCTACTCTACGAGCAAAGGGGATAATTATTTATGCTATCTACTTGTCAGTCAT:1 - chr2L 5120242 3' - INE-1 578 1 56.30 TTTATAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACAAAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCTTATAATAACGGTAGCACAATTTCACAAGCAACAAGAATAA:1 + chr2R 18024261 3' - Cr1a 446 1 71.92 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAATCTCCATTT:1 - chr2L 19068045 3' + pogo 2043 1 60.27 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTATATATGTGTGTGTAAGAGGTTCTGTCGTAATGAAAATAAAGTAGCAACTTTAACGCATTTTTATGGCTCTTATTCCGTTGTCAACCGTATG:1 + chrX 10974461 3' + opus 7477 2 66.44 GGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTTCACATTTGCAGTAATCTCGGCTACTTCTATTCATACTTTTGGTTGCTGCATATAGAAAAATGATCGCTTAGTTA:1 + chr2R 18076169 3' - F-element 4457 1 55.64 GTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATTGCATATATATTCTCACTGAAAGAAAAGCATTCATA:1 - chr3L 11399922 3' + Quasimodo 7294 2 78.08 TAGAGTGCCAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTTAAACTAAACGAAAACACAAAAGTGATTATATGTATAAATGGGCGAATGTCAGAAGCACGCACGAATCGAAACTGAAGAG:1 - chr3R 17867735 3' + hobo 2929 1 71.93 CAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACATAATGTTCCCGGCCTAGTTTTTTGCCAAGAAACCTCTTAGCTCCGCATGTGAAGTCTATGACTTTTTTAATCACAAATGGTGAAACTTTTTCAAAATTTTTCCCATC:1 - chr2R 4638544 3' + 1731 298 1 73.29 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACTGTGATAGGCATGCTAACTGTACTGTTACTTTGAGCTCAGCTGTGGGCGTGTGTGTATGCCACGCACGAAATAAGCATCATTAGGCGCTTGGCAGGCGCGCCT:1 + chrX 3197214 3' - mdg1 18 2 66.44 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAGTTGGGTTAAGCGATTAAGGAAAACCAAAGCGTGAAACTAGGCAAAAGGGATGCCGAAAGCTGGCGC:1 + chr3L 17207855 3' - hobo 44 1 52.52 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGTATAATATATATACAACTGGTTTTGGCAATGAAAAAAACTACGTCTAGAAAAATTAAGTGTTTGACACATATACACAAAAATA:1 - chr2R 4628350 3' + Transpac 295 2 70.40 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTTCATGCTTTC:1 - chr3R 7035229 3' + roo 397 1 69.72 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTACAGATACGCTGTTTTAAACGGTGTATAAGACCCGAGCAGAAATAAAAGATCAAACAAAGAAATAAACGTATTAAAAAATGTTAC:1 + chr2R 641986 3' - opus 7143 4 65.47 TCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGGTCATGCAATGAGGCAACTAATTGAGAGGCCAAACAAAGCATGGA:1 + chr2R 20865744 3' + 412 7469 2 69.86 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCAATGTATAATCAGCAAGTACCCAAACTACTTTTCCCACAGCTTAATACGATCAATTAGCCAAATGGCCGGCAGAGTCGTAAAG:1 - chr2R 8643737 3' - diver 5913 2 64.44 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTGCCGCGAGTATATCACGAACTTAGGGCCCTCTCGAGTTGTGCGTCCCATAAAAGGGTCAACAAACTAATTTCCTCAACGCTTC:1 + chr2L 6870787 3' - hopper 38 1 55.48 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCCGTAAGCCTGCCTAGTGATAATTGCAATTAAATTCAGTCCCTGGCTAGGTATATTATTATCCCTCGGCTG:1 + chr2L 2030109 3' + 412 7499 2 53.10 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAACA:1 + chr2R 558197 3' + copia 245 1 54.17 CTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTATTCACCAAAACA:1 - chr2R 4673557 3' + Quasimodo 7313 2 59.59 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTCATTTCTTTCAGTGCCATTTACAATGTACACAAACAAGCAAGTTAC:1 - chr2L 2698367 3' + I-element 5280 1 74.66 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGTAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGTATCTGTATCTACTACAAGTAACATTGTAGCTCGAGTTGGCTAATTATGGC:1 - chr2R 22305989 3' - pogo 55 1 60.15 GTCTACCTATTTACTAAAATTATCTAAAAATTTTGCTTTAAGTAAACAATAAGTTACAAACAAATATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATATATTCTTATATATATTCTTAGTGCCGAACTACACCTGGTCTTC:1 + chr3L 8397835 3' + Tc1-2 1537 1 73.29 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAAAAGGTATATCTACATAAATGAACTAATATTTTGCTT:1 + chr3R 29645755 3' - jockey 78 1 72.18 AAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATTTGCCAATTCCAAAAGTGATCTT:1 - chr2R 7020548 3' + Bari1 1671 1 53.33 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTTAACAATTTACCTCATTCTGCACTTTCAAGCTGACTGCATGCCACTTGGCCAGTTTGAAGTAGATGCGTCGTATCTCATCTAAGGTGGCGTCCCGATCCCGCAGCA:1 - chr3R 25304674 3' - roo 8678 2 71.92 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCAACTCGTTACTCAA:1 + chr2L 686099 3' + roo 9025 2 53.79 TAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGGTGGTAAAAGAGTTCGAAGCTAAGATCAAAAGATCACGAGCACTGCACCATCCGCCTCTTCATCTTCTTC:1 - chrX 13710585 3' + diver 6061 2 53.42 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATTGCTTT:2 + chr2L 6318999 3' - pogo 60 1 62.33 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAGTGTGATTAGACAAGTA:1 - chr2L 16884788 3' - pogo 47 1 52.74 ACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATAACAATGACAATAACAATAATTACAATAAAAAATTTAGTATTGTATTAAAAAATGTAAAAATATAGTATTAATCGTAAAACGTCATTATGTTCTACCAT:1 - chr2L 23028113 3' - Bica 263 1 63.01 CCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTTCAGAGAAGAAACCGATGGAGTACACATGGACGTGGTTTTAACCACTAGGCTGTTGATGTATATACTTTATATGGCCATAATGGC:1 - chr3L 23278569 3' - G2 187 1 60.69 AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGCCTAGCGATCCTGTTTAAGAATATATCCATTTCAGCTGTTACATAATTCTCAACGAAT:1 - chr2L 21902492 3' - Ivk 22 1 69.50 TATTTATTTGTTTTTATAATTTAGGTACATGGATATTATTTAAGTGTAGTCTAATTCCTTACCGATGTCAGAATGGTGCGGTTCACGCGGCACAATCCGCAGGCGGA:1 + chr2R 7391170 3' - mariner2 826 2 74.77 TTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCAT:1 + chr3R 13176428 3' - Burdock 6216 2 73.97 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATAATGACCGGCATTGTGGGGGCTTGGAATTGAAGAGAAGTGATTGCAAGTAGTTTTCTGCGAAGTAGTCTATAGTGAAGGTTTATCGTCTAATAACTTT:1 + chr2L 436595 3' - copia 24 2 68.49 AAAAATTAAAAAAAAACACAAATATAAGTAAATAAAGTTTGGACAATGTGGTTTATGTATAATATACTGGAACTTCTAACTCAAGTTTGTGCTGAGTACTTAAAACGATCTCGAATAAAATGAGTTGTATAAAATACGTTTGATAT:1 + chr3R 7494402 3' + Doc 4697 1 57.53 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCGAATTGGGTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTA:1 - chrX 12191530 3' - pogo 63 1 64.38 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCATTAAAAGCCAACACCCTTAAAAGCCAAAAGCATTTGGTTCTTAACTTCCACTCTCGAAAGAGTGGACCATAAAACTGGCTTACATAT:1 + chr3R 28627720 3' - copia 35 2 63.70 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACCCTCGCTATCCAGTCAAAAGTAAAAGCGCTCAAAATGAAC:1 + chr3R 21001921 3' - 412 7092 2 58.90 AGTTCAAATAAGGATCATTTATTCGACTCAAAACAAAAACAAGTTTACTATATAACTACAAAAATTGCACAACCTAACTTAGCTCGCTAATAAAAGGCTGATCTAGCGTCTGGATAACTTAATCACCAAGGCGCGTGCAACCTAAA:1 + chr3L 25850553 3' + Tom1 362 1 56.85 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCCTAAGATATTATGTTTTTGGCCTATGTATTCCTTCGCTACAAACAGACACATTTA:1 + chr3R 15338121 3' + blood 7335 1 61.65 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTCAATCAAAACATTAAGGATAGTTTTTATTTAGCTGCTGTTCTGCGTGTTGTAATTTTAC:1 + chr2L 16399412 3' - roo 61 2 62.33 AATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATCGTATCCTCGCTGTGCGATAGTTGCATCACTCCGCGCCTGCTCGTTGGCATCCT:1 + chr3R 22515059 3' + jockey 4840 1 61.97 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCAAGAACCCGATCACGCTAATGA:1 - chr3R 9160636 3' - copia 26 2 68.49 AATCGATAGAAATTTATAAGACTAAGATCCTTTTACTCTACGAGTACCAGGTATAATAAAAAAATCGAAATCACTTTATTGATAACCTTGATAACGGCATTGAAATGAAATATATATATAAAAAGAACTAGAAATCTCCCTTTTAA:1 - chr3L 25255413 3' - INE-1 301 1 65.75 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGTCGCCCAAAATTATTTCCCCCAGCTGTTTCGAGCAATTTTTTATGGGATTCCTATGCTTGATCTCCACTCCCCCGCGAATTGT:1 - chr3L 2724963 3' - Ivk 46 1 54.11 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCCACATACCTCTCCACTGCTCTGCTGTTCATTAGTACCCCATTTTGGTTGGGCGACTCATTCGTTTAAGGTGCATTTCCTT:1 + chr2L 6184128 3' + pogo 2063 1 59.31 AACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGGGTGTGTCTTGGTTAACGGC:1 - chr2L 18279875 3' - gypsy5 6978 2 51.94 ACTTAGCACGACGCGACTGCGTTAGTTCTTTTGTGGATAATAATTGAAGAATTGAATAGGGTTATGTGGGTGATCTGCCTGTGATTCCACCACCCTCCACTGGCCTGGGACGTGAGCAAACCTCCAAGGAGACCTCCGAT:1 + chr2L 8183353 3' - rover 448 1 57.86 CGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCT:1 + chr3L 23702289 3' - G4 29 1 61.64 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGTGCCCAGCATATACATACATATACCATACACGTGTGTGGCACATACTCATGCACGATTG:1 + chrX 12526047 3' - roo 8681 2 73.97 CAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGATACACGTAAAAGGATATGCGAGGAGCAAGGACTGCGTGGCCAAATTGTTTACACAAGTCATACG:1 - chr3R 30652342 3' + Doc 4432 1 56.16 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCCGCTCATTTCGTTTGTTGTTCTTGTTGCCGCTGT:1 - chrX 5679947 3' - P-element 84 1 28.08 TATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTGAAAATAGTATTTGAACTTTTTCTAAATTTTTTTCATTCCATATATTTTTCATA:2 + chr2L 12658577 3' - Quasimodo 58 2 63.01 GTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTGAACTTGCTACCCTGTGGCGTGCATTGAGTTTCATGACGTCATTAGCGTT:1 + chr2L 3393925 3' - G2 2926 1 62.96 ATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATTAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGATCCTCCTGCACAGCCTGCGCT:1 + chrX 2154935 3' + micropia 5109 2 52.74 AGACTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCGTCGACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACGTACT:1 + chr2R 12543159 3' + roo 406 1 67.47 TTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTAGACTCTTCGCTGATTTCAGTGCTTTAGTGCTGT:1 - chr3L 7093003 3' + hopper2 1529 1 72.86 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGCCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACTTTCTCTCTCT:1 - chrX 8891757 3' + P-element 2843 1 44.17 AGTTAGAGATTTTATTAAGTAACCAATATGCGTTGTACTTACAGAAGTTAAGTTAATCCTTTTTTCTTAATTAATATTATTTAGTGTATTGATGTTGATTGTTGATGTTGAAAGATACCTAATGAAGAGCAGTAAATTAAGTACTA:1 + chr2L 2925027 3' - gypsy7 415 1 78.77 GGTACCGTTCAAGAGGGGCTACTGCCTTAAATCAATTGTTATATAGGTCACTACATTCAGGCACCTGAGAACATTGAAGTGGGTGAGAGCGTCAATTTCTGTCCTTTGACTATGCGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGAT:1 + chr2R 4802892 3' + mariner2 76 1 29.66 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATAGGTGGCATATATAGGTTTATTACAGCTCGCTCTCCATTTTTTTTTTGGGAGATCAACGAACTGCTTTGAAATG:1 + chr2L 9237581 3' + blood 7348 2 54.46 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGACAAAAATCATTATGAGAATTGTAGAGAATGAAGTTCATAAAGCGATGGAGAAGTACCAAATAGTTCTTAGTTTCAAACACAATAAACA:1 - chr3L 20594094 3' + roo 9041 1 64.38 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCATTAAAAGCCAACACCCTTAAAAGCCAAAAGCATTTGGTTCTTAACTTCCACTCTCGAAAGAGTGGACCATAAAACTGGCTTACATATCGCGCAACATCT:1 + chr3R 28627732 3' - copia 23 2 71.92 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTT:1 + chrX 12525980 3' - roo 8748 2 75.34 ATTGACAGAGTCAAATGCTTTACTAACATAAGTGTAGAAGATTATTTTTGAACAACTCCTTTTGCCGTTTCCATCTCGCAAAATTCCAAAAATCATAACAAGAGGAAAACAGATCAAAGTAGATTTGATAAATGGCGAAGTAAGGG:1 - chr2R 11436783 3' - Q-element 324 2 50.00 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTAC:1 - chr2R 11489179 3' + mdg1 356 2 63.70 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCG:1 - chrX 8891789 3' + P-element 2790 1 16.31 AGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGGCATATATGCGCCTACGCTCTCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCT:1 + chrX 12649915 3' + blood 129 2 87.88 CATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAATTATCTGGTT:2 + chr3R 11750266 3' - Tabor 6907 2 63.01 GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTGACAGGGCAAACAATGCGGCGGCTTAGTACGCACACACACGCACGCACGCACGCAATGACTATATTCGCCTTACATATATAAACATTATGTAC:1 - chrX 8640879 3' - blood 167 2 60.00 AATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGATTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTTCACACGGATTTTGTTGTTTTTTGCCACCTGAGTTGGTAT:1 + chr3R 26246885 3' + 1731 4563 1 65.38 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGA:2 + chr2L 9472061 3' + roo 8984 2 76.71 GATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATGTTTTCGAATATAGTACAGCTTAAATGTCAAAAATGAACTTTTAAAACTACAGGCGCAAAGTAATACATTTTTAGATGTAAGCATTTAAATAACAAAATCTGTGCTAGTGAA:1 - chr3L 12976197 3' + invader4 3082 2 46.58 GCTGAGTTGTATAAAATATCACGTAAAACTGTGAACAATTTAGTTAAAAAAAAGGACACACTGGGAAATTTGGAAAATAAAAAGAGAACTGGCCGAAAAGAAACAAAATATTTAGATAGCAAACGAACATATATATACACGCCAGG:1 - chr3L 6532618 3' + Bari2 339 1 64.38 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCTAGTAAATTATGTCCGACAAAGCAAACATATTGACAATTGTCAAATTAGTACCACATAAAAAAACAA:1 + chr2R 2843402 3' + 1360 3345 1 72.86 GCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTCGACATTTCTTGTACAACCTA:1 + chr2R 8641645 3' - diver 5904 2 70.55 AGTATAAAATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGAAAACATTTTTTTCCTTTTCTACTCAATAATTAAGAAATCGAAGTGAATGATGATCTGGATGTAGATGAGTCATTTGCATCCGTAACATCTAATAAGGTG:1 - chr3R 2999185 3' + G5 4680 1 56.20 ATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCC:1 - chr2R 11133564 3' + roo 338 2 72.18 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCAGTTTTTTCGCAGCCGCGCTTGGCTGCCGCGTC:1 + chrX 8891820 3' - P-element 76 1 28.15 CAGGGCGGTTGCCGCAGACCTCTTCTCCTAGATTGGGAGATATGGTGGGAGAACCTCTCTCCGTTGTTGACTGCCTTGAATTATTATTCATGAGAGCTTTAATTTATGCTGCAGTTAGAATTAGTGCGCTTTGCATTTTT:1 - chr2L 14864801 3' - springer 7434 4 52.14 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGTAGACACAAAACTATTTATGCTA:1 + chrX 4701187 3' - P-element 99 1 17.81 GTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTATTAAATTATTTTCCTATCCATGTTTTAATTTTTTTCTTGATTTTACATATTTCTATTCTCTCTTATTTTTAATTTCTTCTATTTT:1 - chr3R 2527708 3' + INE-1 551 1 50.00 GCTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTACTTATAATTAATATCTTATCTTATAATATCTTATACTTATACTATACTGGCACAAATGCTACTATATATATATATCTTTAGATTTACTTAGTATTGTTTCAAATCTAGCGAGAAA:1 + chr2R 4673654 3' - Quasimodo 26 2 37.67 TTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGC:1 + chr3L 13827362 3' + hopper 1356 1 57.53 AAAAAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTA:1 + chr2L 22150632 3' - S-element 80 2 83.56 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATGTTTCTATAAACTTAAAAATCCTTTACTCTCATTAGTAAAAAAAA:1 - chr3L 6803553 3' - mdg3 79 2 68.49 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTTTTCACAACGTTGAGGGTATAGAATCATTAATCGAGTTGGCAGCACCGTG:1 - chr2L 6318901 3' + pogo 2045 1 64.18 AACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAACG:1 + chr3R 15022119 3' - Tabor 64 2 59.31 GACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCG:1 + chr2R 15829614 3' + invader4 328 1 78.26 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTATGTTCCTTATTAAACACATTTCAACGGGTATATAAGTTTTGTTAAGGGGTAACTG:1 + chr2L 8542046 3' - pogo 46 1 59.09 ATATTGGTATATATATATTTATATATTGACTGATCCACCAAGAATTCCATCTCGCCTGCTAAAAATCTCTTCCTTATATCCCAATCTTGTAAGGTCCCATCGTTTCACATCATTTCAGCTACTGTGCAT:1 - chr3L 5622416 3' - Stalker4 7043 4 62.79 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCTGCCTAATACCATTTCAATATTTGCCGGGGCAACGTGGCGTATACGTTATGCTTACATACACACAAAT:1 - chr3R 28172429 3' - hopper 50 1 52.74 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTC:1 - chr3L 11336339 3' - blood 62 2 60.27 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTGTATCGATTTGTATTTAAACATTTAAAACATATGAAATGTTAAATTCGCCCATGTAACGACGACTCTATTTTTGAATCCAACAAAGGACTAATTTGGACTGGCTTTT:1 + chr3L 23986676 3' + opus 7493 2 80.14 AGTTACCCGGAACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCCAACAATTTCCACCCCTTTTAATTGCATAATTGATAATTTCACCTAACGACCGTCAGTT:1 - chr2R 10620020 3' - Doc 468 1 57.64 TTTGGCGATGACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCAT:1 - chr3R 1418287 3' - BS3 217 1 61.70 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGTAGACACAAAACTATTTATGCTAACGGTAAGATAGGACCTCCTCTCTCTCTCTCTCACCCACACACACACAC:1 - chr3R 6067031 3' - P-element 50 1 47.95 AAAATAAAAATGAAATAAAAAAAAAGACTGAATGCTATGGTCGAGTGCTTCGACTATCAAATACCCTTTACTCGACTTTACGGTATCCGCTGACTTTTGTTGTCTCGCTGAATGTTAAACGAAAAAATGTTTTATAAATTTAAGTG:2 + chrX 14345252 3' + Tc3 1571 1 58.90 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTT:1 + chrX 1103726 3' + pogo 2073 1 60.16 AACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAAT:1 - chrX 13219900 3' - Doc 96 1 60.27 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATATGATTTATGCGCTGTTTCTAATTCAATTTAGACCCGTTTGTTTGCTTTGGAGGTAGAAGGAAATGGAAGCAAACTTGTTTGCCGCTTTT:1 + chr3R 23010141 3' - I-element 22 1 69.06 ATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGTAAAGAGCTCCAGTGCTTCCACATACCTCTATCGAT:1 - chr3R 7539411 3' + roo 9034 1 59.59 CACATTTTTGTTTGTTTATTTTCGATCACTCCCCCTGCAGGGAGTGCAACTGGAATATGGCTTGGATATGACAGCATTTCAGGGCCATATAAAGATATTTTATTGTTGCCCAATTCC:1 + chr3L 15763780 3' - Fw3 3058 1 78.63 ATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATATACATTTGCAGTATAGTATCGCAGTAATCTGTGATGGAAATCCTTATTAAATTTGCCTCA:1 + chr3R 29418830 3' + mdg3 242 2 80.14 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGTTCTGTGGCTGTTAATTTTCAATTAAGAGATGACTTTTCACGAAAGTTTTTGTGTGGAAATAAAACGTTTTGT:1 - chr3R 24509045 3' - FB 33 1 57.69 AACGCCCTAAAACCGCCCAAGACTGCCACGCCCACATTTTTGAATTCGTTTATTTTTGGTTTGTTATTTCGGTTAGTTAGTTGGCTAGTTGTTGAATATTTATTCTGATTTTAGTGCGCGAGTGAATAATTTGTAGTTTCCAATAT:1 - chr2L 3145876 3' + INE-1 344 1 71.23 AAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACATAGGAACTTTTTTTAAGATTAGCTATTATTATTATTAG:1 - chr3R 6413717 3' - FB 82 1 73.29 AACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGCGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATTTTTGTTAATAAATAAAA:1 + chr2L 76172 3' + roo 397 1 73.64 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTG:1 + chr2R 21402719 3' - mdg3 5260 1 74.14 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCATTTTTGCACTTTTCCCAAGTCC:1 - chr2L 4173968 3' - roo 59 2 61.43 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGCGATGCAGCAGGCCTTAACAACTTA:1 - chr2L 15834450 3' + hopper 1381 1 53.39 GTTGCTAGCGAAACACCGGTGTAGTTGTGTTCGCGGATTGCCCTACCGTACCTATTTCGTTAAGGAGCATTAGCCGAGTTCAGTATTTAAATTTTTAGATGTTCATTTCTGTATTAATTTTGGTGACTAATAATTAATAACAATAT:1 - chr2R 4774815 3' - Gypsy12A_LTR 1990 1 44.52 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAG:1 - chr2L 15987968 3' + roo 9019 2 56.25 ACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGCGAT:1 - chr2L 15834471 3' + hopper2 1525 1 71.92 ATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATGCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAAAGAGCCTATGAAAAATGCATTTTTTTCAGAAAT:2 + chr3R 28083109 3' - 1731 91 1 76.71 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTCAGTTAAGCTTTCTTTTATCTTATCGGTTAATGTCTGCCTTTAAGTCGTAAATTATATGCACTTTTGCAGGGTAAACT:1 + chr3L 18659009 3' - roo 44 2 55.48 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCA:1 - chr2R 11057255 3' - pogo 61 1 62.33 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCCAGAATCAGCAAAACACCGAGTTGCTGCTCCAGAAAAGCTCTGTG:1 - chr3L 9372551 3' - P-element 52 1 34.15 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAATAAAATGTCATTATGCGCTCCCAAAAGTATGCAAACGATTTTTCGCTTTGAATGCTGGGTACTTAAAACGCTCAATCATTGCAACATTATAAACA:1 + chr2L 3890258 3' + jockey 4972 1 63.70 GGAAATAAATATAATGTTAAATTTTAAAGTATAGCCCCAAATAAATTCAAGTGAACATGGAATAGAAGTCGAGAAGTGTACTCAAATATATCACAGTACAATGTTGTCACATAGATTCTGGCGAATTTTCCGCATGAATTCTTCGG:1 - chr3L 4561170 3' - Cr1a 4325 1 60.96 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAATTGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAGATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTC:1 + chr2R 10695897 3' + roo 9033 1 54.79 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACAGCGTAACATTAACACACATTACTAACGCTGCGTCAGCATTTCATTTGAGTTTGCTTACCCACCA:1 + chr2R 17392147 3' - BS 5013 1 69.86 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGGCCTACAGCCTTGTTGTCCATAAAAACGCACCCATA:1 - chr2L 10089719 3' - opus 32 4 58.14 GATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATTTGTTTTTGCGGTCCGC:1 - chr3L 11336307 3' - blood 7009 1 77.19 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTCAATTTAACTGCCAGTCTAAAATCCATAGAACTCATTACGAACCCTCGC:1 + chr3R 21001887 3' - 412 7104 2 62.90 AATTAATAACATCAGAACGGAGAGAGATATATAGTTTCTGTTTTTTGTATCATATCTTATATGATACCAAAAATTGTGGGCGTGACACCGCCCCTTATATTTACTTTTGTTACCAAAATAAATATCTTTAAAGTAATACGAAACGA:1 - chrX 15567833 3' + Transib-N1_DM 35 1 58.22 ACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGACCAGAACAATTAAGCCTGGAAATAAAGTGCATAGTGAATAAGTAATTTAGTTGGAGCAAACAAAG:1 + chr2R 12044840 3' + Tabor 78 2 59.59 CTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTTGCCGACATATATATATTATAACTATATAATAATAGTTATAACTAATTCGCAGACCTGATAGTTTTGCC:1 + chr3R 12929293 3' + invader4 3021 2 60.96 CGGACTCGTATATGTCGAAATTCGCGCAGCGCAGAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACA:1 - chr2R 2666337 3' - Rt1a 49 1 56.78 AACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCC:1 + chr3R 9160791 3' + copia 5084 2 55.48 CTCACAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTCGACTCGAGAAATATAGCAATTTCTCTTGTCGATTTTGTAATAAAGGCAGAAATCCTATGTGAGCCAGAACGCTATCATGTTAAATACTCTTCAGTTATATACTTT:1 + chrX 22784152 3' + INE-1 539 1 71.23 GCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAGGATTTAAGCCATGTTTCGCCTGCTTATTGATGAAGCCATTTAAACGCACGAAGGCAATTTATTATGCCA:1 + chrX 7748743 3' + jockey 4706 1 75.51 ATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAACAGTACACCTACTAGCCCATGTTAATAATAATAAATAAAAGGACCGTATTACAAATGCCGGACCTCAAAATCGGGCTG:1 - chr2R 20214509 3' + baggins 5389 1 71.20 CTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACACAAGCAC:1 - chrX 21852449 3' + gtwin 7360 2 54.72 AATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCTGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGAGCAGAAGCGATTTCTTTTAACTTTGAGCTCGTTGACTCACGCCAACATCTAAGAAGCA:1 + chr3R 5365188 3' + Stalker 275 4 67.12 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGCGAACAATGTGCCATCCTTTCTCTACCTCGGTGACTACCGAATCAGCGGATCCTTC:1 + chr3L 22648426 3' + Tabor 466 2 71.72 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAATATATGCCTCAAAGGTGGGCGACGAGGGGGAGTGGGTGATTGAAGGTGCAGGACCAGGTGATAAGCCACAAAAGGTAAAGACTTGGCGCACTC:1 - chrX 17731933 3' + pogo 2077 1 69.18 CGACTATCAGATACCCGTTACATTTTTCTGGGACATCGATAGATATTGGGGAATAAAAGGGGAAAAAAGTTGGCAAATGTATGCAAATATCTATCGCAGGCGCTG:1 + chrX 22637304 3' - INE-1 550 1 67.62 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGATACCAGATCTTGGTGCTGATGAACCTAGCC:1 - chr3R 24122633 3' + roo 9031 1 54.79 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCAGGCGTCGAACTCGGAGCAGAGGGCTGTGTGGCGGC:1 - chr3R 8258859 3' - Tirant 48 2 69.23 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGAATGCACTCTCTCACTTATCCGCTCTCACTCTCAGCAGACTGCAACTGTAAATTGTAAAGGGAAACGATCTGTCAAAAATATAATGCTACTTAAAATGATCTCAAATTG:1 + chrX 14951254 3' - P-element 10 2 77.40 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAATTACATTGTTGCATGACACAAATAGTGTTGCCTACAACAAGGGGAACAACAATTGCTG:1 + chr2L 13704786 3' - hopper 58 1 56.85 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTCGGACAACAAAAGTTGTGTTGCCGTTATTCATCGCTTCTTAAAGCG:1 + chr3L 12867389 3' - roo 43 2 56.16 CTAGCTGAGTGACGGGTATCTGTTTTCTTAACATTCAAGTATATTGTATTGCTATTGAAAATCTTTATAGTTACATAAACTTATATATAAATCTTTATTATTATAGGCATACTCGTTGGGGTAATAAACCCAAATGGGTAAATAAA:1 - chr2R 10801812 3' + INE-1 543 1 53.42 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAGGTAAAGACCTAATCAGTATCCTACATTTGTTTGTTTTCTTTTACTAGTATGAATCATTATTAGTACAAAAATGATATTACATTGAGATTCTAAAGGCGATCAA:1 - chr3L 15612660 3' - roo 16 2 75.00 TATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATTGGGTTGTTTTAGGTGGCTTGGGAGGATTGGGGAGATTGGAAAGCGGAGGGATTTGGAATGCAAGATGCCAGACGGTGTAAAATTTG:1 - chr2L 20631926 3' + Ivk 184 1 74.40 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATGAGTTATATATCGTAGTATTTAACAATTTCAACAACTAAGCATTTAAAGAGTAATTTTTGAATAAACTTCAAACGAATTTGCGT:1 + chr2L 2698472 3' - I-element 35 1 58.22 CTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGTTGTGATCCTAGAAGCGTTCTTGGTCTTTGGTC:1 + chr2R 4677396 3' - invader3 5189 2 79.07 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGCAGCCCAGCTG:1 + chr2L 16458704 3' + roo 9031 1 56.16 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTCAATTCTTATCTTTAA:1 - chr3R 22100511 3' - 412 7117 2 58.90 CATCAGAAGTGGTCATTACCCACTATGCCTGACACTAAATGGAATCAATTCTCAGTGCCCCAACTAAAGAAGTGGTTGGAAAGCTGTATGCAGATGTATATACAGACATATATATATGTGTATGGATAGGGCCAATAAGTGCCAT:1 - chrX 16079280 3' + invader3 300 1 55.86 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGGCCTGCTCCGATTCGGAATCATTAAATAGACGACAGGCGAAATCGAAATTGCAGTGCCAAAGTTGCCG:1 - chr2L 11951506 3' - pogo 47 1 53.85 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGAGTGCTTGCAATTTGCATA:1 - chr3L 17707825 3' - Doc 51 1 58.47 AATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGCG:1 + chrX 20999615 3' - BS 33 1 55.48 GCAAGAATGTAAATAAAAAAGGATAACATGAAAAGCTAACGGGATTTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTG:1 - chr4 123987 3' - HB 166 1 72.60 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTCACAAAAGGGTCGACTTTTGCTGGTTCAATGGCACCAATTACACAAAATCAATTAAATGTAAATGCTATGGGCCTAGACAAA:1 - chr3R 15702877 3' + copia 217 2 58.90 GCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTGCGTGTGTCCGTGCTTAAATAACTGGATGAGGCCTACAGCCTTGTTGTCCATAAAAACGCACCCATATGCACCTCTTCCGCTCCC:1 - chr2L 10089701 3' - opus 113 3 80.87 GAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCCGTCTTATGTTTTAGCAATTAGTTACTAAGACTAAAAT:1 + chr3R 9160828 3' + copia 252 1 81.38 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAGTCCAGTTTAAAGGT:1 + chr3L 7962294 3' - blood 31 2 53.78 CTTACAGCTAATTCAGCGAACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATTTAATTACATTTAATACATTTAAACATAGAAATCTTATCCATCATTCGTCCTTTGATCCTGGGGCATCAGCACTCCACACGAGTT:1 - chr3R 22708794 3' + Porto1 4313 1 63.70 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAACACACACACGC:1 - chr3R 28396609 3' - jockey 85 1 68.49 GGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTTATTCAGCGAAGGCAATCAAAAATGGTCAGAATAATCACAAAAGCCGATAAGTGGCAGAACAAGAACCTTCAAAGATTTAAGGACAGTCGCTCAAACAATAT:1 - chrX 13347378 3' + Porto1 4278 1 63.01 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAGTAGGCCGCATCATTAAATATGTATGTTAAGCTGATTAAGA:1 - chr3L 22978504 3' + 1360 3357 1 63.01 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTACAGCTCGTATTTCGACAAATTGATTTCACACACAATTCAGACGGTCG:1 + chrX 4186752 3' + I-element 5331 1 68.15 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGTG:1 + chrX 12525990 3' - roo 74 2 68.49 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTCCATTCCCCCATCCTCCCTTCCACTCACTCGAAAT:1 + chrX 7515760 3' + roo 9032 1 57.64 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTT:1 - chr3L 96485 3' + roo 9024 2 52.74 AATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACGTACATATTATGTAATCATTTAATAATATTGATAATACCGAAACA:1 + chr3L 18189505 3' + S-element 1670 1 68.07 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATATAACGGCATGTCAGGCAACTCGTTACTCAAAGCAAAACGAA:1 + chr2L 686110 3' + roo 9035 1 59.59 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTATTCAGCAAGATTTCTCTCTTCGGTTGCACTTGA:1 + chr3L 14553229 3' - roo 35 2 62.33 GCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTA:1 - chr3R 13582220 3' - BS 5068 1 66.44 ACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATAT:1 - chr3R 13582207 3' - BS 5055 1 57.53 GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATAATTAACTACATGATGCTGCCGCAGAGAAAAAAAGTATTTGCTTAGCTTTCTTC:1 + chr2R 14047701 3' + mdg1 343 2 69.18 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTAAATTGTATTGACATTTGAAAGAGTAGGTTGAACGACATTGTCGTCGAGCATCGGCGATTGTTATTGCTCTGCT:1 - chr3L 12224601 3' + 412 7511 2 58.82 TTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACAAGTTAATCGCCTCCGTCTTTGTCTTGATTTTATGGTTAGTTCAGATGCGGTTAGTTTCGAGTGACAAGGGAGTG:1 + chr3L 14516150 3' + 297 6861 2 75.65 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATAAACAAACAAATTTCGGTACGATGGG:1 + chr2R 10920525 3' - roo 8723 2 79.09 TAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGTTCCTCTATTACGGCTGCACTCCTGC:1 - chrX 17419417 3' - Juan 4121 1 80.82 TTTTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTTAGTTTCTTGGGGGGCGTGTGGGGGAATGCCGCAACGGTTATTGTTTATGCTCACTGGCCAACTGGCGTTTG:1 - chr3R 23460029 3' - Rt1a 5079 10 82.35 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTC:1 - chrX 1287804 3' - jockey 4797 1 55.21 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTG:1 - chr2L 15987965 3' + roo 9020 2 54.79 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTC:1 + chr3R 4528391 3' - F-element 71 1 82.73 TTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAGCATC:1 - chr3L 24152402 3' - HMS-Beagle2 6905 2 69.18 AAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTTCAAACGGTGTCAAGTTTTTCATCAACCTAGCTACATAAAGCCCAAACAATCCACCTGCCTCGCATAGC:1 + chr2R 1008148 3' + Doc3-element 419 1 63.72 TTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTT:1 + chr3L 23702240 3' - G4 78 1 67.81 CAAATAAATGAAATAAAATATTCAGAAACTGGCTCATATTTTGGAATGTGAAAACATCTTAAATGCCTTTGAAATGATGCCACATCGCCAGACTTAGTTACGCGGGCTGGCATCGCCGTGCAGCACATGTGAACCTAAACTGGTTC:1 - chr2R 9398746 3' + G7 1148 1 65.07 AGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTG:1 + chr2L 12340820 3' - diver 75 2 65.75 GGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGCATACCCCAGAACTCCCAGGGTATTTTCCAACTGGTTGAACAGCTCCACGCTTTCTTTTCATTCTTTGCATTTTTTTTTTGCTACTCAATACGCGGCGGC:1 + chr2L 11494032 3' - G2 356 1 66.43 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATCACATTTTTAATATTAAAAGATCTTTGATCGTATTTAATAGACTTTTT:2 - chr3R 17546631 3' - blood 7087 2 68.49 TACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAACTGCACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTCAACTCTAAAACCGAGCCAGCAAATTTCGCTTGTCTCTGTAGTCCACATATA:1 + chr3R 22378609 3' + Copia1_DM 93 1 64.38 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCA:1 + chr2R 558171 3' + copia 218 2 64.83 GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGAATTTAATTAGCAAGCGTGCAAGTTATCCAACC:1 - chr2R 4160342 3' - pogo 73 1 75.94 GTTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAAC:1 - chr3R 24122674 3' + roo 326 2 73.29 ATAGCCTGGATCCTTTTTATTTGGCTGTCGCATGCCAAGACCCAGATTTGGCACCCATACTTCCAGTTTGGTGCTAATATCTGTTTGTAAATTGTCTATCTAACCCGCTTTCCTTTCGGGGGGCAGTGACAGTGTTGCCTGCTGGG:1 + chr3L 6078543 3' - X-element 4276 1 65.75 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGCACTTGATTTTGTGTCTACAAATATGGCAACT:1 + chr2L 9472133 3' + roo 393 1 74.66 AATCTATCGATATACCAGAAAAATGAAGAAAATTTCGCGTTCGCATTTCCACTAGGGTATCTGACAATCGAGGAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTGATCAGGATTACTGTCCAAACTAGAAAATCTCGCCTTTTAACTG:1 + chrX 20446211 3' + INE-1 499 1 55.48 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGAC:1 + chrX 5150389 3' + roo 9019 2 55.48 TATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAGAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAGCT:1 - chr2L 22015919 3' + Tirant 338 2 65.89 GCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCGGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGTTCATTTGTGCATTTTTTTAATCATACACC:1 + chr2L 8979221 3' - F-element 487 1 75.00 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACGTCTTCTGATAGGCTATCATCATTCATTGTAGTCATTGGAGGTGGAGGTTCCAATTTAATCGTAA:1 + chr3R 31814159 3' - FB 57 1 56.85 GGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCACTCCATTCCGAGCCATTTTCCCTCGCATGTTAGCCAGCCATTTTTCCCGCCACCGGGCAGCCCCCTTTTCTGCATCGCTGACATTTTAATTGCATTCGGAC:1 + chr3R 20486467 3' - accord 6 2 76.15 GGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCACCAATTTAAGTTTCTTTGGAACATTTTG:1 - chr2R 5917792 3' - I-element 5086 1 53.42 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCG:1 + chr2L 76113 3' + roo 8984 2 83.56 ATCTTCAAACAGACGTCATCTACACCGACTTTAGTAAAGCATATGACTCTGTTAATCATTACCTTCTATTAAGAAAACTAGAACTAGAAATGCAATGTCTTAGTTTATATACAGGAACTTAGAAGGTATCAAAGGACACGACACGA:1 + chr3R 16928525 3' + Q-element 290 2 63.01 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTA:3 - chrX 14964599 3' + roo 360 2 54.79 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGAT:2 - chr3R 21276519 3' - BS 5043 1 52.05 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATCAGTC:1 - chr3L 17175098 3' - 412 43 2 56.16 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGAAAATGACTTTTCTGCTCGACTTTGTTTTGCTAATGTCGATGTTCCAGCAG:1 + chr2R 17890999 3' - Tabor 33 2 60.27 TAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAAAATTGCTATAGTCAAAGCCTACATCTATTATTGCATTCATACAAAACCCACTCACCC:1 + chr2R 17735219 3' + I-element 5295 1 72.26 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTCACAGTGTAGTTTCAACCTTGATTAAATTTCAAGGCGACAATCTGTAATTA:2 + chr2R 19555084 3' + pogo 2094 1 78.08 ATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGCTTGGCTGTCAAGTCGTACAGCACCCTCGAGATTCCATCCAGCTTGGATATATCGCGTACAATTTGATTTAGGACCTTTGAGCAGG:1 + chr2L 21174965 3' + 1731 4472 2 71.77 ATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAAGCACATCCCGACCCGGGCCCATATTGATCGACCCACTTCGAG:1 + chrX 1715339 3' - roo 106 2 70.55 CAACTTATAAGATAAGTACGAAATCTCCATACCCTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAGGTTCGAACATCCAATTTCGTTCAATTTGCTGTCAGATTTATTGTCAGATCTAACGGAATGCCGTTGTCCTTATGCTGTTCTGCTGTTG:1 + chr3R 16563499 3' + GATE 326 1 80.14 TTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTCTTCAAAATCCATAGCATACCTTGAGGTGCTTTTGAA:1 - chr3L 9497710 3' - jockey 4793 1 64.38 GGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCAT:1 - chr3L 24152464 3' - HMS-Beagle2 84 2 74.66 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTATTTATATACAACGGCCCATGGGCCGCAAATAAACGAACAACAGGCGTCGATGGCACAGTTTGTACTCGTAAACATTTAAATGCCTTGC:1 + chrX 14559393 3' + 297 382 2 74.63 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTCGCATATTTTTGC:1 - chr2L 76052 3' - roo 73 2 68.28 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACTTTCTCTCTCTGTG:1 - chrX 8891754 3' + P-element 2837 1 43.41 TGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCGAACAACCAGCGAATCGCCGCGAAAAA:1 - chr2R 11763572 3' - Tabor 40 2 54.81 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCAACACTGT:1 - chr2R 16441813 3' - I-element 68 1 63.01 ATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACGCATTGGTTAGCCATTTTTGATATTTTTGTAATGAGTGCGGATGACGTGTGTACAAATTTAAAAGTGCATACTACAAAAATTATAACGTGTTATTTCCTAAAAATT:1 + chr2R 5542486 3' - 1731 17 2 73.79 AGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCACCAATTTAAGTTTCTTTGGAACATT:1 - chr2R 5917795 3' - I-element 5089 1 51.37 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATA:1 + chr3L 24208225 3' - Quasimodo 28 2 60.00 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGAAAAGTTTTTGAAGCTTCCCGCATAATCAACTCTGTGCCTTGGACTTTTTGCAAGGATAAGGACTCCATGAAACAGCAA:1 - chr3R 17656330 3' + mdg3 228 2 75.34 ATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAGGACA:1 - chr3L 27356049 3' + Tc3 1668 1 67.12 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAGCTTTTCTCTATTTGGACCGTGGCTTAGATATCTTGCCT:1 - chrX 12866407 3' - roo 8726 2 68.75 GGGAGAGCGAACTTTTATAAGCCAGTGCAGATCTCTTGCTTTTAGTCTGAGGTGCGTCGTCTTGGCCTCTATGTGTTTCCGCCAGGTGAGCCGCTTGTTTTATTTCTTGCAAGTGAAAGGCTGTACAAAGAGAAAAGAGCAGTAAA:1 + chr2L 7652628 3' - Doc3-element 4248 1 67.12 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCTACAAAAGTAGGCAACAATTTCTG:1 - chr2L 17210264 3' + jockey 4935 1 59.57 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGAAGAAATTGAGACTAGCGTTTTCGATTCCCCATTGAAATCGGGTCTGCTTGGAGCTT:1 + chrX 1061623 3' + 412 7505 2 53.60 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGA:1 - chr2L 22015924 3' + Tirant 8484 2 56.47 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTTTTGTTTTTTGTTGAGACTAGGGGAAGTCCCTTGCCGGC:1 - chr3L 2885242 3' - S-element 76 1 71.92 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATTTAATGATCATTTAATGATCTGCCCGACAGGGGCTTCGGATAGGATGAGATGAGTACGTATGGGTATTGGTCCTCCGCAG:1 + chr3L 15100076 3' + copia 248 1 54.79 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCACGAGATTTTTTCGTTCGTTTTTTGCGTTTTCGCCCACAGAAACAGAACATCGAGTGGTT:1 - chr3R 23236388 3' - hobo 43 1 50.77 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACA:1 - chr2R 6632566 3' - P-element 29 1 53.70 GAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTTCAGACTCTTGAAAGTTTTTCATAATTTTCGCTATTACCTTTGTTAAGTGCTTGAATGAACCA:1 - chr3R 11113136 3' + mdg1 395 2 67.12 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAATAAG:1 - chr2R 8641489 3' + diver 174 2 50.68 GCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGACGCGTCAATAGTGCCATAAACATAAATCTGCCGGTTAATGGGCAGGAAGGGGCACC:1 - chr2L 15277298 3' + opus 232 2 49.54 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGTAAAGAGCTCCAGTGCTTCCACATACCTCTATCGATTCGATTTTGAC:1 - chr3R 7539400 3' + roo 389 2 70.50 AAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCTCTATTATATGTGTAACATAGAAATATTGCGATTTTGGTAATTTTCTTAATTCCTAAAGCCGGGATTACGCGAATAACCGGGTGGGGATTTC:1 + chr3R 11749769 3' + Tabor 7315 2 74.40 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACAATGAAAGCGATGGAGAGAGAACAGGAAAGCCAGGCTAAACTGATTTAACTACGCACA:1 - chr3R 25387771 3' - roo 8726 2 60.96 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGAATGAAAGTGGACGGCTTT:1 - chr3L 15276631 3' + hopper 1366 1 56.39 GCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGATATCATTGCAAAAATTGTTGAATTAGATAATGTTCTATGCTTCAGCATC:1 + chr3L 8253980 3' + jockey 4599 1 66.21 GTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATC:1 - chr3R 24729575 3' + Juan 4153 1 61.64 CCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTATGTATGGCATTTTCCTAGAGGGTGCACGATGGGATCGCACTGGAA:1 + chr2L 17525170 3' - R2-element 3389 1 66.42 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAA:1 + chr3R 14860209 3' - BS 5072 1 69.86 ATTGACCTTACCAAAGTTTGTGCAAATTCTAATGTCAATTTGGACCAAATCTCCGCTATTTCAATACAAACAACAAAAATGTATTCCCTATAAAGCATATATAAAGCATAGTTTGCCTTTTTTTGAACTTACTCCTTTCGAACCGC:1 + chr3R 30513492 3' - Bari1 1322 1 44.52 AATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATGATAAAACACAATGACGTTGTGAAACTTATATCAAAAAATAATACCATATTTGATATTGTCATAACGCTTATTGTCTTTGTTCT:1 - chr3R 929266 3' + Max-element 8497 2 58.90 ATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTCATGTCAAGAAATGTTCTTTAAGAACTGACCAAT:1 + chr2L 22153187 3' - S-element 74 1 58.90 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAGCACATGACAACATGCACATGCACA:1 - chr2R 6632540 3' - P-element 8 2 74.34 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTTATGTATAGATT:1 - chr2L 13250354 3' + opus 7436 2 70.55 TTCAATAACTCGGTTCCTCACATACCAGGGTAGCCCAAATGCATGTCTTGCCGCTCGTGATTGTATTACTCTAAGCCTATTGACAGTCCACAGCCACAGCAGTGGGCTTCGAGCCGCCCTTCATGTTCAG:1 + chrX 9361906 3' - G5A 2535 1 62.31 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTTG:1 - chr2R 5214938 3' - F-element 55 1 51.37 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTTTTATCTCTGTGAGTAATTACGAAATGCGAGACTATT:1 + chr3R 20988898 3' - I-element 27 1 67.81 GTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCG:1 - chr2R 21402615 3' + mdg3 5434 2 66.41 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATTACAATATAAGTTTGGGTAATTACCCAAGCAGCCGAAACACAAGCTCAATGAT:1 - chr2L 10184429 3' - Doc 65 1 63.31 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATTTTCAGCACCTCTTCCTAAGTTTTCCGGGCGTTGCACGTTG:1 + chrX 5858975 3' - hobo 79 1 70.34 ACATCCGTCTCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACCCACAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATGTCAATAATTAAAGTTCCAATTTATTTGATTTGGCCGCTC:1 - chr3L 9916786 3' + Idefix 193 1 78.08 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATCAAAGTCAAGTTACCATGGGCGGCCGG:1 - chrX 18933549 3' - FB 55 1 79.05 AAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATCGCTAATTCGGAGTGAGAACCTGACGAAATGGAGAACGTCGGGAG:1 - chr2R 7665756 3' - Transpac 67 2 67.86 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTACTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAGCACATGACA:1 - chr2R 6632555 3' - P-element 43 1 51.88 CAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTTTGGATTTTTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTACCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTGGAAACAAGAATCG:1 + chr2L 7401342 3' - G4 3686 1 35.17 GTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGGGGCAGTGGGGCATGTTGCAAATG:1 + chr3L 15276736 3' - hopper 31 1 56.67 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATGTCACTTTTTTCGCATTTCTTTGTTTCTATATGTATGTATGTCTATATGTAACCGTACATATAAAGGTTTTAATGGCTAACGCTACAAACT:1 + chr3R 13122627 3' + blood 348 2 65.07 AGATCGCAGGAACTATAAAAGCTATTTGAGATAAAAGCTAGAGGGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGAACTCGACTATAGCATACTCTCTTCTTTTTTTATATAATTTTCCATACATTCTTTAACAGATTTTACGAACATAT:1 - chr2L 15004796 3' + INE-1 149 1 81.51 ATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCATAGGACCAAGAGGGTCGCAAGGTCATTCCGGAGGAGACGGAGTTGCACGCCTCAAAAACCACCGTGGATTTGGGGGAGGATAAGGC:1 - chr2L 1858919 3' - jockey 4835 1 60.96 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGTGCCCAGCATATACATACATATACCATACACGTGTGTGGCACATAC:1 + chrX 12526034 3' - roo 30 2 65.07 ATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATCAGTTTTCTTGCGAGGGGATGAGAATATTTATTTAAAAAATTAGACATTGAAAT:1 + chr3L 15915824 3' - Doc 4589 1 75.17 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTATTCAGCAAGATTTCTCTCTTCGGTTGCACTTGAAATTGCATTTTACC:2 + chr3L 14553243 3' - roo 21 2 71.92 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATTGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACATCTGTCG:1 + chr2R 13644534 3' - Burdock 42 2 54.11 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGCCTCCAAATGGATTCCGTGGAAGCCGTTTTGCCTCTTTTAGCCAAATGATGC:1 + chr2L 3659161 3' + 412 7478 2 62.33 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGACTACTCACTAAAGAACCACGGAT:1 - chr2L 76076 3' - roo 8696 2 73.75 ACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACNTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGAT:1 + chr3R 14860202 3' - BS 5033 1 62.00 AATATGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACGAATTTCAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCTGGTCGTGATTTTTTAATAATTATTTTATATTACAAAAGCATATTGTAAATAGTTGCATACGTTTTTTTTC:1 - chr2R 9520555 3' + 1360 2972 1 69.66 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGGAATTTTGCATAATGGTCTTGTCTCTGCCGACTTAATCTCATGACGAT:1 + chrX 6481353 3' - hobo 23 1 53.12 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTGCGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTGCACTCAACGCGGCTTAAATCAAATGCCCAAAAGTATG:1 + chr2L 6717183 3' - jockey 89 1 69.86 AAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTAAAAGGATTTACACAAAAGATAAGTAAATAATGTGTTAAAGGAACTAAACAAATGATAAGTTAATTATGTGTAAAGGGAACTACACAAATGATAAATTAATTAACGTGTTAA:1 + chr3R 1568210 3' + HMS-Beagle2 7189 2 81.51 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACTTACCTCATTCTATAATATTAAATAGCACTCCGTAGTTCGTTTACCTGTCGAAAACAACATCCGAATG:1 - chr3L 16212711 3' + Transpac 302 2 71.43 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGGAGTAAACA:1 - chr3L 7995418 3' + P-element 2841 1 46.77 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACATATAGGTGGGCAGCATGGTCATCAGCGTTTCATAGCCATAATTGTGCCCGGCATGGGACACCAGAATGGCATAGAAGGGTGGCGATTTGGCAATGCCCA:1 - chrX 4785030 3' + roo 9052 2 67.59 AAATAATGGAAGTGGCTGGCTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTATTAATGTTTTTTAAACTTTTGCTCTGCT:1 - chr3L 13634192 3' - 297 6603 2 59.65 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTCAGTTAAGCTTTCTTTTATCTTATCGGTTAATGTCTGCCTTTAAGTCGTAAATTATATGCACTTTTGCA:1 + chr3L 18659000 3' - roo 32 2 57.60 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGG:1 - chrX 1287809 3' - jockey 4805 1 51.52 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTGGACTTAAAGCCCAGCGAGATTTATACCACCAAAGGGCGCAATATATTCAGATATGATT:1 - chr2L 5257579 3' - blood 166 2 82.50 AATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATGCTTGTGTAAGCGTAATATTTGAAGCATATTATGATACTATATACGTGAGAATGTATCTGTATCTGTATATATGCATCTGCATCTGCATCTGCATCTACAT:1 + chrX 14702027 3' - rover 7020 2 65.07 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTT:1 - chr2L 17210262 3' + jockey 4938 1 57.86 TTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATATATTTATTTAAAAAGAATTTAAGAACAGCTTTTGATAATAATAAGCAAGTTGT:1 + chr3R 25768862 3' - copia 68 2 70.34 TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCAT:1 - chr3R 13582227 3' - BS 5075 1 71.23 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGTTCAGCCTTGATAGATCCCCGTATGCCATAGTTGCTTATAGTCAG:1 + chrX 11471521 3' - jockey 4750 1 67.12 TGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTAGCAACATAGCAACATAAGTGCAATTATAAACTATAAACCTAAAAATCAAGATGAATGT:1 + chrX 6717989 3' - hopper 1087 1 63.01 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGGCGGAGGACAGGCGGAGGGCAGGGGGCGGACGTGAATGATGGACGTGA:1 - chrX 8755041 3' + transib2 2787 1 54.95 TAGATGTATTACGTCATTTCTTTAAAAAAGGAGGTGTAGCATATCTACCCCACCTATCAAATAAAGAATGGGTACAACTTTGCATAAATACATTGTGACACTTTTTCAGAAAATGGCAGTCAAGTTGGGGTGGGCAGAGT:1 - chr3L 19661265 3' + Stalker4 6923 2 74.29 TGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAATAACGTTTTTGGCAAATTGTTGCCATTTTAAAATATGAAACGAGCCAGGCATGCCAAGGGAAAATATACTATAAAACGTTTGTCCAGAAAA:1 - chr2R 21414359 3' + BS 5057 1 62.33 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGGACGAAAAGCGTTTGTTCCTAGAGTTGAATGGTCAGCAATGGCATACGCCTGGTGGTTCGTAATGGAGT:1 - chr2R 558074 3' - copia 4921 2 51.72 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGTCATGGAAATAAAGTGCAGGGATCGAAATGAGCCAGTCCTC:1 - chr2R 23287422 3' + roo 9053 2 65.52 AAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAACTTTTTCCAATTCAATTACCCTCGCAAATCACTGGCAAATTGACCAAAA:1 - chr3L 3824164 3' - Doc 280 1 66.44 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATAGCGAGTTTTGGCCAAAGGACGAGGATG:1 - chr3R 27859166 3' + hopper 1377 1 55.04 AGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGTAATGATTGGGTGATTTAGATTTACTGAAGCAATACTTTGTGGTAGAAAATTAATTTCACCATATTGAAAATATAAAAAAAAAGGAAATGACTGAAT:1 + chr3L 17993144 3' + I-element 317 1 70.97 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCGTTTTTGCCTCATTTCAGTGTTTCCAGCATTTCCCTTATAATTACACGCTCCCCATGCAAAATCG:1 + chr3R 10684838 3' - roo 56 2 56.16 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAGTAGGCCGCATCATTAAATAT:1 - chr3L 22978524 3' + 1360 3369 1 63.16 GTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCATACT:1 + chr3R 2526466 3' - gtwin 6957 2 57.53 GGAAAAATAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGTAAAAATGTAAACTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGGTTGTATTAAAATTGGCCAATCACTTTAAGGATATTAAGTAATAATGTGTGTTGTA:1 - chr3R 25096908 3' - rover 7079 2 65.07 GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAATTATGACATATTTAAATGGCATACAACAG:1 - chr2R 13644395 3' + Burdock 6349 2 56.55 CATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTGTCAGAGACAAGTCGAAACGAGGAGACTAAGTCGCGATTAATGGCTTTTAAG:1 - chr3L 18093347 3' - Tirant 8204 2 60.31 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTAAGGGCCATATTGACCAAAAATAAATATAAAGATGGCTATTTTTAAACCAAAAAGCCTCGTATCCGATCTTCAATTGCAAGAGCGCAAATAGAAGTT:1 + chr3L 96645 3' - roo 15 2 77.40 TATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACACGCATACCAATCGGCAGAGCAAGAGCAGCAAACTG:1 + chrX 15543781 3' + F-element 173 1 73.10 CAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATGTTTTCGAATATAGTACAGCTTAAACATTTTAACAATGCCTATTTCGTTTGGGCCACTTTATTGTTACCAGTTTGTTGCATAGG:1 + chr3L 12974684 3' + invader4 3054 2 45.21 AACTGAACAATTCCTACTGACTAATGAATAATAATAAATGACTTTAACCTTTTTTTTGAGTTTGCTATATGTCTTAATTTCCCGTTTTTTTTGCCTTGCTTGCTCAAGTCTTCGCATTTTTGCTTGACTCAGCTTGGTTTCACTTA:1 - chrX 19668552 3' + G5A 2812 1 74.66 CGCGACTTCTGTGAACACGTNCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAA:1 + chr3L 19349987 3' - jockey 35 1 51.06 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTGTTTTTTTTTGTTTGTGCCCAGCTCAAATCTGTTTTGCACAATCGTCTAAGCACACAGCCATGTAACTCAGCCAAATTCAAATCTAAATCCAATTCCCAGCAGCCTTATC:1 + chrX 13395398 3' + roo 398 1 77.40 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACTTTTGCGGTCCACAAAGACCGTGTAATTACACAGCTAATTGCCAGCTG:1 + chr3R 27794895 3' + roo 9031 1 57.53 AGTTACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACACATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAACTGTGCAAACAAATTATAAGTGCAAAGCGAATTATTGGATACTACAAACAAACATTGAAAATAACTATAACCAACCTTTGGGTTC:1 - chr2R 8152076 3' + gypsy4 306 1 65.75 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCAC:2 - chr3R 17305439 3' + roo 352 2 57.53 CCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAGTCCAGTTTAAAGGTAAATACGCGCTCTCAGCTCCGATAAAAGCAGGGAAATCATTTGGAAAGCCCCCTC:1 + chr3L 7962349 3' - blood 7014 2 80.82 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCT:1 + chr2R 19555029 3' + pogo 2039 1 62.33 AATGGGTTAATAGCTTTATATAATGATGTTATGTAATTCAGTTGAGTACAATTAGCATAAATAATTAGCTAAAGCGAGTGGCTTAAGGCAGATGTGGAAAAGTGGGGGGGGATGGAATGTTAGGGGGTTGGCGAGGCGAC:1 - chr3L 10826957 3' - Ivk 5284 1 71.43 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTTTTATCTCTGTGAGTAATTACGAAATGCGAG:1 + chr3R 20988892 3' - I-element 33 1 63.70 CAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTTGTTTTATTTTGTTTTAATGGGTTGTATAATTCCAAGATTTCTGGGTTTTTTTCCAACATCCATAAATTAATCTCTTTCTGTATGTTTCTTTAACAGTTCTGTAT:1 + chr2L 21762436 3' + INE-1 555 1 60.96 GCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGTATCCATGTGCACACATACAGTTGTCGGCTGACACTTTATGCGTAGAAAAGAGCTGATCGATGTAGAGCTCTCCGCTCGCTCGCTCGCTCGCTC:1 + chrX 1990046 3' - 1360 203 1 76.61 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACATGTTATTGAGCGATTGCGGACACTCATA:1 + chrX 10645039 3' - jockey 87 1 76.12 ATGGATGATATAATAATCTTTTCTAATACAATTGAACAACATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAATAAGCACATATGAAAATTTTTCCGGCCGGCGGCAAAATGACACAACACCTGGAGCAGCTCGAGTTGGG:1 - chr3L 11818480 3' + TLD2_LTR 46 1 66.44 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAAATGTTATTGAGCGATTGCGGACACTCATACCACTTTGAATTAATTCCAATGCG:1 + chrX 10645063 3' - jockey 75 1 64.38 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATAGAAGGACATGTATAAAGTCATAAGGAACTTTTCCAACCCGACATATTTAAAGGCACA:1 + chr2L 10746708 3' + pogo 2052 1 59.70 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATTCACTTTCATTTTCATTACACAA:1 + chrX 12866506 3' + roo 9034 1 57.86 ATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACAAGTTGAATAACTTGTTGTCAATGACAATATTGAGTTTTAACAAATATTATATTTCTTATAAATTTACAAATACAAAAAGGATGTTCT:1 + chr4 299971 3' + 1360 336 1 61.38 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGG:1 + chr2L 22016007 3' - Tirant 27 2 59.29 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGACACTTAGTAAAAAATAAAAAATCACAGTTTTTATGGGTTTTGCTTGGGCGTTTCTTTATTTCCATTTTATGTACAAAACTTATGACAGAAACGGAC:1 - chr2R 9873585 3' - roo 25 2 69.18 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCG:1 + chr2L 17240293 3' - hopper 10 2 60.00 CCAACATAACGGCCCTCTTCCTACTGGACAATAGTGAGCAACGCCGACGCTGTTACGTCCCACATTTCCGATCCTCGCTAATTGAGCAACTGATTTTC:1 - chr2L 14656812 3' + G7 991 1 54.08 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGGCCAATTAATTTCGTAAAATTAGTCAATATGCCATTGGATTA:1 - chr2L 3890120 3' - jockey 56 1 52.05 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCCATTCATGCGGTAGAACATTCAAATAACCCGCCATATCGGTCCGAACACCCCATGCCATCACACC:1 - chrX 14450323 3' - jockey 4815 1 54.11 TTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCATGGCTCGATTCTGCAACGACCATGCCCCCTTTGCTG:1 + chrX 8755106 3' - transib2 86 1 76.71 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATTTGCCAATTCCAAAAGTGATCTTTTGTTAGAA:1 - chr2R 7020539 3' + Bari1 1654 1 55.48 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTCCC:1 - chr3L 18658907 3' + roo 8995 2 72.60 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCGTAGGCCAATCGTTAATTTCACTCTCTAAAGAAGGTCATTTGGTTTCTATAGAATCGGTGCTCACTTTTAG:1 - chr2L 3294100 3' - hopper 45 1 52.78 ATATTGTAAGCCGAATTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGCCCACAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCGATGGATGTGTAGGTCCACACGCAC:1 + chrX 1817959 3' + diver2 4587 2 76.32 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACA:1 + chr2L 3294188 3' + hopper 1353 1 71.67 GGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCAGAGGTTTATTGGTAACTGAATTCAAATTATGTATACTTGCTGCACACAGGCAGTAAGTAAGTAGCGAAAACACTCATACAG:1 - chr2R 6362053 3' + F-element 4458 1 73.21 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACATATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATAATGTGTAAATAGAATCAAAATTGTTGACTCGGGCAGGACA:1 - chr2R 18482396 3' + hopper 1367 1 49.32 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTACCACGTAACTATCGTATCGTAAATAGCAA:1 - chr3L 13868615 3' - 412 7100 2 52.74 CATTTATTAAAATAAAAAAAAAAGACAATTAAATTCTAACATACTTTCATACATGTTAGAATAATACCTTTAATTTTATACCTTTCCCATTTTTGAACAACCTCTGGCAAAAATATGCAAGGCCAGCCCATCGTTAGTGTAAAAAG:1 - chr3L 15430614 3' + HMS-Beagle2 478 1 65.75 ATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAATTGGCCCATTGCCCCAACCC:1 + chr2L 16089718 3' - 3S18 5791 2 67.12 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTAATTAAGCTGTCA:1 - chrX 14964587 3' + roo 9036 1 59.59 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGCAAAATCTATGCCGG:1 - chr2L 17136143 3' - hobo 48 1 53.79 ATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTCAAAATATAAAGCTTCGCATTTTCCTCTATGTATTTATTGGATGAACTTCTAGCTTTGTCGCTTATTAAAAGAAGCTTATCGCCGCAGCCAGCAGCTCGAGATCA:1 - chr3R 27510023 3' + Bari1 1693 1 73.29 ATCTGATAGTCGGGGAACTTGACTAAGCATTCTCTTTTGACCACCTCTGTATATAGTTAGGTAAGGATATTTCGCTTCGTCATGCTTTGTTTGTCCCTTTTTCTTTTGTTCGCCTTACGATTTACATCCTCGAAAAGTCCGCTTGT:1 - chrX 5913125 3' + INE-1 560 1 43.84 GGGAAACAATTGCAGCCCTGAACCTCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTTAGGGGGATCTGTAAGTCATTAAGGGGTATAAGGCGGTCCATTTGCCATTCGTTTGCTACCTGCGTTGGCTCATAAATTTCATT:1 - chr3L 788921 3' + baggins 5309 1 60.96 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTCGAAACCAAGTTAGCAAAATACATTGCATACTTTACAACGTCCTATCAAGGCCCATTGGAACATACATACGATTTCAGAGCCTGCGTTTAAAGTTAATTGAAG:1 - chrX 6707708 3' - hopper 14 1 74.48 CAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATATATGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCA:1 + chrY 3648870 3' + Stalker 122 4 59.59 CGTTTTCTGGCCAAAATTAATAACTTCAGAACGGGGAAAAATATTTTTGCAAATGTCCCTATGTGTGTGTTTGTATACGAATACAATACAAAAGCCTATTGATCTGTAAGAGCAAAGAATATGACTAATACATATGCAAATGTCAA:1 + chrX 22906773 3' + Transib-N1_DM 21 1 69.86 AAAACAAAATTATAAAAAAAAAAACATGATGAGCAATTTCCTTTTTGCTCGCTATAAGCATTAATGCAAAAAAAGTGAGTTGAATAATAT:1 - chr2R 13096782 3' - Tc3 77 3 80.00 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATATAGACGGTGGATGCCTCAACAAACCAATTTGAATCCCAGACCACGTACTTGACGCGTTGTTCCTGCCGCTTCCT:1 + chr2R 12543184 3' + roo 9042 1 61.48 GAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTA:2 - chr3R 11750187 3' + Tabor 409 2 68.49 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTGATTTTCTTGTGTTTATAGCTTCAGC:1 - chr3L 96449 3' + roo 397 1 77.40 CAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGTGTTTGTCTGGCGTACAACATTACAGCAG:1 + chr3R 11547831 3' - G2 284 1 76.55 ACTATATTTAATATTAATGTTAGTAGGATCTAATTATGTACTAAAAAAGTTAAAATTTATTGCTTTACGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATACGCTTGGCAACCCGTTTTAACGGGACAACGCTCCATAAAACACCAGC:1 + chr3R 8356056 3' - Cr1a 4302 1 67.81 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGCATTTCATCACACATGCTGTTG:1 - chr3R 17605646 3' + Tabor 7258 2 64.23 TACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACACCTGTCGCCATTTGCCGCAT:1 + chr2R 13644547 3' - Burdock 17 2 71.64 TTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTGTACAAATATTTTATTATCTTTTGAACCAAAACATTTTTGTATTCTGCAAAATTGAATTATCCACATCTCTCCGACCCGGCGACTGTCCCCTAGTCA:1 + chr2R 4930646 3' - Ivk 27 1 63.70 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGTGTTAAATTTAGTAGTAGTAATAGTAAAGTTGGTACTTGTGGTACAAAAGGTTTAAGCAGTTAGATTTTTACATCATTTTAC:1 - chr2R 12240072 3' + copia 216 2 48.63 GTTGGTTGTCATATCAAGGGGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGGTAAATTACATACTTACATATATATATACATATATACCGACCATCCCCCAAAGAACCCA:1 - chrX 6138634 3' + opus 7446 2 69.77 GAATGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCGGCCGCGTCCGCCGAGATTGCTAAGGAGGCCGCTAAAC:1 - chr2R 1248300 3' - gypsy4 6665 2 95.96 CTACTCCGGGACAACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCCAACCATCACCATCCCCCTTCCTGTCATGCAATTTAATTACCCGGCCATCGATTTATTTGGCCCAACGCTATGCTAC:1 + chrX 20601583 3' + G-element 307 1 70.18 ATGACTTTATATTAGAATAATTGTGATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGTGTGAAAACTAGAAAAAAATAAAAAGGGAAAAAGAAAAAATAAAAATAATAGGGCAATGATTGTTCAGTGTTTTATTTTTTATTTATTTTATAAATAT:1 - chr2L 21745535 3' + 1360 387 1 80.82 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCTGTGCAATATTCGCGGCGTTTCGAGAGAAAGGTGATAATGGTGAAAGTTTGATGGGTTTG:1 - chrX 3996457 3' + roo 9052 2 68.61 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAAC:1 + chr3L 22400352 3' + 1360 3322 1 63.45 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGCGCAAAGTGCTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGCATGGTTATTTCCCCCTGTCTACAATTGATTGGCAGTCGCGTTG:1 + chr2L 12414977 3' + pogo 2056 1 56.03 TGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACTTGTGTCTCCAATTTACCAAACTAATTCAAAACATAAGATCTTCGCTTTCAAGTATGAACTTTTGAAAGTGAATAG:1 - chr3L 4620866 3' - FB 45 1 49.32 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTTTGTTGCCAAAACCCCACAGACATTGTCCTCGGACAACAAAAGTTGTGTTGCCGTTATTCATCGCTTC:1 + chr3L 12867381 3' - roo 45 2 52.86 GTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAATCTTGAG:2 + chrX 22900321 3' + Tc1 1557 1 69.86 CGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTAAATAAGTCGATTGGCTACATCGGGAAAAAGAAGA:1 + chr2L 22079730 3' + FB 201 1 72.81 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGAGTTTGTGTCATTGGTG:1 + chr3R 18815945 3' - hobo 75 1 78.46 TCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCTGCGGAGAGACGGGTAGCCGTGGACACCCCAGAGCCTCGGGTCAGTGTCAACAACAA:1 + chr3R 8258929 3' + Tirant 8502 2 70.24 GAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAA:1 + chr2R 3104457 3' + Gypsy6A_LTR 344 1 66.15 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTACATATCAGGG:1 + chr3R 17656454 3' - mdg3 5333 2 71.23 GTCACATCCGGTGTCCCACAAAGGAACCACCTTGGTCCGCTTCTTTTTACCTTACACAAACACACAACAACCAACTAATAAAAATTACAATAACAATTATAACACGAACTGACAAAAGCAAGGGAACAGTTACAGGGACAGCGA:1 - chr2R 4634438 3' + Q-element 475 2 61.11 CTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGTACGCGTTGCCGATTGCATTTATTATTACACTGCGGGCGCCAAAAGATTTGTGCAG:1 - chr2R 4362524 3' + gypsy 440 2 45.67 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGC:1 + chr3R 9352083 3' - Tirant 8144 2 56.07 ACATTTCTCAAAAGTGTGGCCGTGAACGTTTTCGGCGTTTTGTAGTTGTGGGGCGTGGTTGAGGTGTGGGATACTGATAGAAATTGGCAAGACAAACAATAAAACCAAGAAAGATCCCGTCAATACCGGTTTTATGTTGTTAATTT:1 - chr2R 2953886 3' - INE-1 255 1 52.05 CTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTGAAGGCGAAATGGAAATAGCGCACTTAAGTGATTTTGGTAGTCTTATTACCTAAATTTTCTCTTACAT:1 + chr3R 2555598 3' - Bari1 53 1 53.42 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATTTGTTGTTGCGGTCCGCTGTTGTT:1 - chr3L 11336300 3' - blood 7023 2 71.85 GGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAA:1 - chr3R 9190521 3' - Tabor 85 2 73.29 ATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGCGAAC:1 - chr3R 31887754 3' + HB 1555 1 68.52 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCATTGTTGTTGCTGCCGAGCGGAATTGTGTGCGGG:1 - chr2L 14095575 3' + pogo 2037 1 69.92 GTAAACACATCAGGTTTTAGTTTTTGGCACAAGTTGGCACAAATCATTTTTCACTCCACAATAGACGAACACTTTGGTTAGATGGTTATAAAACAAATAAATAAGCGAGGGCCTGTTTGTTGCTGTCGTCGATGTT:1 + chr2R 15084574 3' - transib3 444 1 70.59 ACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAATGCAAACACCTACTGCTTAACAGGGATAATATCGTTTTGTTATATGTATTGTTAGTTAGACG:1 - chr3R 19223051 3' - FB 38 1 54.84 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTACATTATAAATTTGGTTAAAACCAA:1 + chr3L 18467247 3' + hobo 2891 1 74.00 GAGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCAT:1 + chr3R 9160737 3' + copia 5030 2 76.71 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAAT:1 - chr3R 31490932 3' + roo 9020 2 55.22 CAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCAC:1 + chr3R 26520444 3' - FB 62 1 72.27 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCTGTATATAAAGTAACTCAATTTAGATGAACAATTT:1 + chr2L 9668311 3' + 1360 3360 1 64.38 ATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAATCGCGGAGGCTAATGACCGAAGTCTCAATTTGAAATGTCTGTGGCACTTGGCAAATATTTATGTACACATGTATGGGATGGGTGGCGTTGGAAGTGCTAATAT:1 - chrX 16385958 3' - diver 163 2 72.60 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGAAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTTATGGGAAACGTGTAAACGAGAACACGGCGCGCGAAGGGAATGGCAATGGAAAAGCACAACCAAAC:1 + chr3L 20688607 3' + copia 223 1 49.59 AAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCAT:1 - chr2R 22723050 3' - 3S18 68 2 71.20 GGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCATTGCACAGAGACTTG:1 + chr3R 13176442 3' - Burdock 35 2 54.78 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGCACGAATTTCG:1 - chr2L 9237491 3' - blood 7042 2 54.62 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGT:1 - chrX 2762564 3' + roo 9022 2 51.03 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCGATG:1 + chr3R 26520466 3' - FB 12 1 63.74 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAATTTGCTCTCTCATGCTCAAAAAAAATTGTAT:1 + chr3R 23765459 3' - roo 8722 2 58.22 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATAATATGTTGCATGTTGCGACAGTAAAAGTAAACGAAATATGGAAAATACAAGGCGCTTTATTGCCTTTATAAAGCTCTTACGTTTTCCTGATATGAA:1 - chr3R 13176303 3' + Burdock 236 2 71.23 CATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATCTGCTTGTG:1 + chrX 20999630 3' - BS 18 1 67.12 TATTATTATTATTATTATTATTATATCTCGAATCATATTGTAAGTTAGTAAGTGCTACAACTACTGGCTTTCAAAAGATTTTCCCTGGGTTTTTTCTCGCACATACCATCTGGCTGCTTCATGCCGGGCGTCATGCTTGTTAG:1 - chr2L 7183629 3' - mdg1 7066 10 76.22 AAGCGTACAGAAAAGTGCGGTGTGCACTAGTGCGGACTGGAGTGGGTCTCCAAAATGTGTGGATGGCCTTTGGAAGCTACAAAGGCTGGAAATAGTGGTAGGCGATGTGCCAATATTTGGCGCAT:1 + chr2L 21657936 3' + invader1 3783 2 49.60 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCATTGTTGTTGCTGCCGAGCGGAATTGTGTGC:1 - chr2L 14095578 3' + pogo 2037 1 71.54 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGACCTGGTGTCGGTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTG:1 - chr2R 16891831 3' + hobo 2927 1 59.57 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTCTGTTATTTACTGTACTGTCAGTCATGTCAATGCACACAAAGCAAAAAATGTAGCAAATCGCGTACAAAAAT:1 - chr3R 4581836 3' - 297 18 2 66.39 ATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGACCAGAAGTGCAGAGTCAGCATAATTAGCATGCGCTAAGAATCAGCCACTTATTACTCTCTCCGTGTGC:1 + chr2L 21637930 3' + Tabor 81 2 76.71 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGACGACTGCTTGCAATTAGAGTTGGCAAATTATATTTGGCTTTTCCCC:1 - chr2R 12787775 3' + 297 366 2 67.81 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATATTAAGCCTTAAAGTTTGAGATTGTTCTCAT:1 - chr3L 16531325 3' + roo 8983 2 80.82 TGTCACGTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTA:1 - chr3L 14553121 3' + roo 339 2 69.63 CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCCATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGCAAAA:1 - chr3L 24934271 3' - HMS-Beagle2 35 2 58.90 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTT:1 + chr3R 26520461 3' - FB 36 1 54.55 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCACATTTCATTCCGGAGCTCTTTGCCAACACTCATAAGTATGCAACACTTTTTCCCACGGCAGCGGGCGTTTTTG:1 - chr3L 17133789 3' - jockey 4699 1 70.64 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGCCAGAAAAAGAGAGAGAGAGA:1 - chr2L 9705338 3' + P-element 2789 1 14.38 CTATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGTATAACTTGATTCGACTTTTTTGGTCTGGCATTTTGGTTTCGTTGTTTTTTATTTCAATGTCTTCTGGTAACGACTCAATATCGCTTTCGATTTCAATGTCGATATCACCTTTAGACT:1 + chrY 3630464 3' - Ivk 4927 1 67.81 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAAAAATAATTTATGATTTTTGAGGAAT:1 - chr3L 10133498 3' - 412 7112 2 56.85 AAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTAGATATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGATTCAAGTCAAACAAGACCGACAACTCACCGGTTGAGTTGCATAAA:1 + chr3R 28255987 3' - pogo 264 1 69.86 GATTAACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCTAATTCTAAAGAGGTATTGAACATGTGCAACTTAGGCACTATTGCCAATTAGAACATGATATGGAAAATAAGGAGAACGCAGTTAAATAAATGCATACTACAGAATTAATG:1 + chr3L 21820519 3' - accord2 7391 1 56.74 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTGTCATTATTATTCATAACTTGGCAGACAGTCGC:1 + chr3R 25387846 3' + roo 8986 2 78.77 GTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGGACGG:1 + chr3L 27391424 3' + 1360 3380 2 72.18 GTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGAAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATAG:1 + chr2R 21402710 3' - mdg3 5282 2 58.14 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCAACACTGTCGTTTAACTATTTCATATTA:1 - chr2R 16441793 3' - I-element 46 1 53.47 CGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTATATAGTTTTACATATGTATGTATGTATATATATATATACTCCCTATGTGTAGGCCATATAAGCTGGGTAATACAACTAAAATGTACAGACTA:1 - chr2R 18959348 3' + blood 349 2 65.75 GGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCG:1 + chr2L 686062 3' + roo 325 2 74.31 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTCTTCAAAATCCATAGC:1 - chr3L 9497731 3' - jockey 4814 1 51.37 ACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAAATATAAAACCCTCGGTATAACCAGTACGATCACAAATTCATTAACAATATTCAAATATTTATAAGCAACTACAGTTTTTCCCTGCATT:1 + chrX 19192480 3' - INE-1 12 1 80.14 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTATCCTGCTGTTTGTGCATACTAATAGTAGAGTTAAATAAATATCCACACTCTCGTTAATTGGAAAAAAACGAACGAAAAAAGGCATG:1 + chr2R 22306116 3' + pogo 2070 1 63.01 AGGGATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTAA:1 + chr3L 25350825 3' + baggins 5374 1 56.55 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCCAGTGTCGATTACTGTCATACTCGTTGGTTGCATATCTGTAGGCTC:1 + chr3L 22642936 3' - hobo 54 1 54.79 ACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACGCGCATGAATGGATTATTCCAGTCAACACGATTAATGTTGATCAGAACAAATGGAAGAACTTTAAATTAGCC:1 + chr3R 19444689 3' + R1A1-element 5326 1 51.72 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATT:1 + chrX 20999593 3' - BS 43 1 55.97 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTATTTTAATCCAATGAAAATTGTATTTTAAGTCGTCATTTTTTGTTTGGCATTTTCTGGACAAGAAT:1 - chr3R 16913348 3' + pogo 2048 1 58.90 ACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGGCATATTTGCATACATTCTACTACTTCATAATGCCCAAAACGCATTGTATTACAGTCGAACTTTCCTAAAAAACCATAGCTCAGCA:1 + chr2R 22723146 3' + 3S18 6102 2 75.89 ATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAGTAAAATTCACTCCATACTTAAACTTTTTTAACTGGCACCTGGTGTAATTTTACTTT:1 + chr3R 12894268 3' - BS 5061 1 60.27 AGAAGGGACATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGT:1 + chr2R 4261965 3' + invader4 220 2 56.85 ACAAAAAAAACAAAAAAAAAACACGCTGGTCAATCTTTAGCCCAGAAATTGATTTCCGCTGAAGGAACTCACTTCATGCTGGCCAGGGACATGCTGGAGGTGCTCGCACTCAC:1 - chrX 20461556 3' + HMS-Beagle2 488 6 68.14 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTGGAGTATAAAGAGGGGTATCCAGTTGGGGAACTGGGGATTTGCGTGCGCACG:1 - chr2L 16458590 3' - roo 12 2 63.33 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCATTTTTGAAATGCAATTAAATTAGAAAGTACATCCTAATGCGTTCTACACAC:1 - chrX 13786864 3' - pogo 67 1 65.75 ATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTATATATATGGCTAACAATTTCACTCAATTGGGAAGTGATG:1 + chr3L 5411496 3' + Bica 106 1 73.29 TTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCAGGCGTCGAACTCGGAGCAGAGGGCTGTGTGGCGGCCAGTTGCTTCTGGGGAATGGGTTGGAGCTTTTACTTATAAAGCTTTCTGCTGTTTG:1 - chr3R 8262012 3' - Tirant 8117 2 48.36 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCAGGCCCGTCACAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAACCGGTACG:1 - chr3L 22400248 3' - 1360 35 1 54.55 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGC:1 - chr3R 10684719 3' + roo 360 2 55.48 ATTATATAATAATAATAATAAGCTATCAATTATTTTGATTACACTTATCTGTAATAAATTTAGTAATATTTGAGTTATAGATTTTTGGAAATCTTGCAATTCATTACAGCAACATCTTGAGTTTGGAAATCTGAGATAAAGA:1 - chrX 15298418 3' + invader3 5055 2 71.13 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAATTTAATTAAAAAAGGACGCTTGAATCAATTTTTCGATTTTCTATCGCACCATGCTTTGATAAAAAGCTAGATAAATGTCATCCCCCGTA:1 + chrX 13786996 3' + pogo 2074 1 65.07 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAGGAGTAAACACTTTGTCGACACTTC:1 - chr3L 7995403 3' + P-element 2840 1 52.14 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTTCCACCCCCTTCGG:1 - chr3R 22100485 3' - 412 7091 2 62.33 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTTTATATATGCCAGCTAATCTCAGAGG:1 + chr3R 19859662 3' - opus 162 4 77.32 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTGTCGCCGACGCTGCTCTTGCATCCGCACAATGTACAAG:1 - chr2R 11609178 3' + roo 9044 1 63.70 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCACTTATGTCACTGACTGCTGCGACTGCGGCTG:1 + chrX 6138746 3' - opus 7140 4 65.91 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTCACA:1 + chr2R 19555037 3' + pogo 2047 1 56.85 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCTGTTAAATGCTCTAA:1 - chr3L 16562852 3' + roo 9007 2 60.96 GCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTTATGTATAGATTTACAGG:1 - chr2L 13250348 3' + opus 439 2 66.44 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCAT:1 + chr3L 27391406 3' + 1360 3365 1 60.00 GTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCATCACTTCAATGCATTTCAAAGCCAGACTTTGGTTTTTTGAGTATTTGTCTTTCTGTTGTTGCTCGCGTCGTGTCTATTTGTTTTCGAATGTTGAATGAATGATATT:1 + chr2L 22012931 3' + Tirant 306 2 75.34 ATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGATATATTGGAATTCTAATTAACTACACATCTCCCGCCCGCCAGTGGCACATCCTTGGTC:1 - chr2L 18317474 3' + mdg1 330 2 77.40 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGCAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACCGCTGGCGTACTGAAAGAAGTTGTTAA:1 + chr3R 7539497 3' - roo 8717 2 75.00 ATAGTCTACCTATTTACTAAAATTATCTAAAAATTTTGCTTTAAGTAAACAATAAGTTACAAACAAATATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATATATTCTTATATATATTCTTAGTGCCGAACTACACCTGGTC:1 + chr3L 8397832 3' + Tc1-2 1534 1 75.34 AAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCCGCTATCAGGAAAAGCGTTTGCCTGACGTTG:1 - chr2R 19051626 3' - pogo 1746 1 78.77 AATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACATTCATGAGCTAGGCTTCACTTAATTGATGGCGACTGACCCCACGCATGATTAAAT:1 + chr2R 9922307 3' + Burdock 6377 2 62.33 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAGCAACAAACATTTTCATTCGTTTTCGCATCGTCGAAGCGTACGGTTCATAGGAGGAACGGAA:1 - chr3L 14550925 3' + P-element 2879 2 71.77 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAATTTACATACATAAAAACAAGAGATTATGCTATAGTTGAGTACCCCGACTATCAGATACCCGTTACTGAGCTAGTG:1 + chr3R 17733317 3' + roo 9032 1 53.08 CTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATAGTTTACCTGCTTCTCTGACAGTTTGGCACGGTGTTTTTACAAAACCTTTT:1 + chrX 10764192 3' - flea 134 2 65.07 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATTTTAAAATACTTAGTTTGTAATTGCTATTTTTCCAGTGATTTGTTACTGTTAGTTGGCTTTAGATGCGGTT:1 + chr3R 13631469 3' + 297 6929 2 54.79 GTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATA:1 - chr2R 8641505 3' + diver 175 2 55.81 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCCACTTATTTATTAATTACTCAACAGGCTGGA:1 - chr2R 20865689 3' - 412 66 2 79.34 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTGAATAAATGAATAATAATGTGACCAATGTAACGTTTTCGATAACGTATCGTACATCTTATTCAGTTGTTCCAGTACAACACTGCTAGGCAGCAA:1 - chrX 16787040 3' + pogo 2078 1 63.01 AATTCTTTTTAATTTTTGTAAACTATCCGATTTTCAGTGGATGAGTTTTCGAGGATTTTCGAAATGCAATTTTATTATTATTGGCGAAAATTTAATTATTTATCGTAATCAATTAGGCGG:1 - chr2R 17470210 3' + 1731 4270 1 82.50 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAGCAACAAACATTTTCATTCGTTTTCGCATCGTCGAAGCG:1 - chr3L 14550948 3' - P-element 27 1 55.00 AAAGAAGAAATTGAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGGTTGTAAGTATTTTTTAATATTTTCTCTCTGTAAATAACTTTTGGTTAAATGTGA:1 - chr3R 25904167 3' + 412 7479 2 67.12 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAAACGCACAGAAGTAGGCTTCATTCTAACACTTAACATGCTCGTTAAATGCCAAGTGGAAAGTTGCTGGTAAAGTCAA:1 - chr3L 12867234 3' + roo 402 1 68.49 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGAGGCCATTCAAGTCTTTATGTAAGGCCCAGGGAA:1 + chr2R 18482545 3' - hopper 17 1 73.97 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAGCACATGACAACATGCACATGCACACAGGTCACACTCCACACAAG:1 - chr2R 6632520 3' + P-element 2877 2 77.04 GAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATATATGATTTTGTTCTCGAGCTCTCGAAATCTGATACTCTCATACACATTCT:1 + chr2R 5710245 3' + HMS-Beagle2 233 2 63.70 TTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATAGGGCTCTTTAAAGTATTAGTTTTATTGCATATTATTATATTTTCTACAAACTTGCAAAAAGGTTGTTCAGACAGGG:1 - chr2R 15829481 3' - invader4 2798 2 58.90 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGGTTCGGTTCGCCGTCTTATGTTTTAGCAATTAGTTACTA:1 + chr3R 9160818 3' + copia 241 1 73.97 GAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTAAGCACATCACAAGGGAGGGGAGTAAAGACTTCTCCAGGGAAATGCATTTCAAGTGGGTTTTCCCCTTTCTTTTCCATT:1 - chr3R 10211707 3' - G2 2968 1 54.11 CAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCACTCCCATTCTCACCGCCCAAAAATAGTTTTTTTTTGTAGAACATCAATACTTTGAAATGCTCTACAAT:1 + chr3R 5766680 3' + G2 2828 1 55.48 GCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCAT:1 + chr2L 16089661 3' - 3S18 61 2 66.13 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGACTATATCAAAATGGCGTTAAATGCAATAATTATATAATTATATATTTCTAAGTAAGCAGATGTTACATAGTTTTGTAATTATTTCTAAAAGCTGTCAGTG:1 + chr3R 24122788 3' - roo 19 2 65.75 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCATGTGTACATAAATTCATATTGTCTAGTTAGCAAAA:1 - chr3R 6515337 3' - jockey 94 1 78.77 GCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGTAAAAAAAACCAC:1 + chr2R 3104474 3' + Gypsy6A_LTR 351 1 68.57 TTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTAAGGCTATATTATAAAGCGTGTAAAGTCTAGTCCCTTGACTG:1 - chr2L 21942414 3' + 1360 3175 1 67.48 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCCGGTTTCGTCGTCTTTTTGCTG:1 + chr2L 14248128 3' - I-element 29 1 61.48 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGAAAATGACTTTTCTGCTCGACTTTGTTTTGCTAATGTCGATGTTCCAGCAGATAC:1 + chr2R 17891003 3' - Tabor 6868 2 63.01 TGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATTAGATATTTATGCTAATGATAAGAATTTTTGGATATGTAAACTAGACATATGAAACGAGCCACAACAAAAGCACTAATTAT:1 - chr3L 10207414 3' + accord 104 2 58.90 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGACCAATCCGCTTAAGGCTACCCCAGAT:1 + chr3L 16973499 3' + S-element 1707 1 72.87 CAACTGACGGGATATTAGTTCGACTCAAAAATAATAATAATACAACGAAAAGCACTACCATGTCATCGAGTGTGCTGTCCACCAACGACACGTTTCCAACGACCATCAATACGGCAACGACGATCTTTCGTTATCAGC:1 + chrX 396270 3' + 297 366 2 76.81 GTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCTTTTGCATATCCGACATATCGAATACAACCCAAATTAGCCAGCCAATCCGACTTGCA:1 + chr2L 12079704 3' + mdg3 182 2 58.90 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAGCATCGACGCTT:1 - chr3L 24152395 3' - HMS-Beagle2 15 2 73.97 AGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGCCAGAGGTGAGATGACTCATTGCCCTTCGAAGGAACCCTTCTGACAC:1 + chr3R 13058263 3' + Quasimodo 165 2 66.43 GACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTCATAGAAAC:1 - chr2R 961123 3' + transib2 2671 1 62.33 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTGTATCGATTTGTATTTAAACATTTAAAACATATGAAATGTTAAATTCGCCCATGTAACGACGACTCTA:1 + chr3L 23986631 3' + opus 459 2 57.25 AGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAAGATACTTTAAATCAGCAAAAGGTCTTAGGAGCATAAATTACAAATACGTCT:1 - chr2L 5601561 3' + mdg3 175 2 63.01 AGTAAGGAGTATCTGATAGTCGAAGTTCTAAACTGTAGCGTACTATCTAGTTTTTACTCGACTCATTTGAATATTTTTTCTCACACTTTCCTATTCTGTTTACACTTTTTTAACGATTTCCGTATAATATTTAAAATATTTGTGTT:3 - chr3R 18321216 3' + INE-1 550 1 89.73 TCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTAGGTACTCACATCCTGCCCTTTTCGATTTACATGCAGCATGCATTAAAAATAGAACCTTCGGAAAA:1 - chr3L 23027527 3' + INE-1 561 1 57.50 ACTTTACTTTACTTTATATAATGAAATAGAGCTCTTAAACTTCTGAATTTAATGCATAGATTTAAGGCTATTAAGGATTTTTCTCAGTGCTGTCATAGTGACTACTCTTCCTTATTTTTTTGCAGTGCGCTTCGGTTCCCGTTTTT:1 + chrX 16856879 3' - TART-A 13105 1 80.82 GAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAGGCAGAAGGAAGAAGCATCTCCGACCATATAAAGTGACATATTCATTTTCCGTATGAAAAACTTTAACCAAAGCTTCACTCTTCGGTTC:1 + chr3L 26002825 3' - 1360 3156 1 61.38 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATT:2 - chr2R 5922949 3' + jockey 4949 1 50.00 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCC:1 - chr3R 30634957 3' + roo 8999 2 75.00 TGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGG:1 + chr2L 22015990 3' - Tirant 8173 2 69.63 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGTGAGGCAGCAGTGCATGGCAGGCACAGTGGGGATAGCTATTGCCTACTTTTAGGATGCCTCAAATGGGCAGTAGGACCAAACCAAAAGAGGACTTCTTAAAATC:1 + chrX 19121094 3' - jockey 12 1 64.93 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTCGAAACCAAGTTAGCAAAATACATTGCATACTTTACAACGTCCTATCAAGGCCCATTGGAACATACATACGAT:1 - chrX 6707738 3' - hopper 45 1 53.42 TTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATTGATCAGGCTCAATAGCCGATTCGATCTAGCCATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTC:1 - chr3R 4487815 3' + HMS-Beagle 7004 2 55.97 GTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCTTGAACTTATGTGTGCAAGTTATCCAACCCATAAACATAGCACCCTTCCTCGCTAGTAGTGGCTTTACATAGTCATTCTCTACATGAAAAACTTAAAGCGATCTTT:1 + chr3L 25340191 3' - 1360 210 1 58.70 GTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAA:1 + chr3R 11547761 3' - G2 355 1 71.23 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATG:1 - chr2R 5922957 3' + jockey 4941 1 55.48 TATTCTTAAATCTATTTTTGAGGCCTATGACCAGTGACATGTTTATTGCTGCCCATAAATATAACATATTTATAGTTTGTCTAAACATATATTTTGTTTAAATTCTGGAACAAATTAACGGTATTCTTCAAGCTACAGATTTGTC:1 - chr2R 5018788 3' - rooA 184 2 42.07 AAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAAAC:1 + chr2L 22684612 3' - transib3 59 1 51.37 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTC:1 - chr2R 6632577 3' - P-element 68 1 34.56 AAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACAAAGCTGTGCA:1 + chr2L 1260024 3' - Burdock 6169 2 52.71 GGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGGAGCGAGATCGCCTTAAAGCTGTTCTTACTGAAATTTCGATCGAAACGTTCTG:1 + chrX 4252667 3' - Max-element 106 2 60.45 ATTTTCGATTGCGTTCGCTGAACTAGCTGTAACTGGGATTTACTGGCAGTTCCCTAGAGTTATATTCCATACGTCCATATTAGTTTTATTATCGCCTTGTATTTTGCAACCGATTTTTAAATCTGTATGTGTATTGTGTACCTCA:1 + chr3R 29734860 3' - Porto1 4324 1 72.41 CTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTTCGTGTGTGACAATCAGTTTGATATTTTAGGTTAGGTTTCTGTGTTGCTT:1 - chr4 866583 3' + Cr1a 4301 1 60.00 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCATAGGCTCGAAGCTGGTTTCTCACAGTGCATTCA:1 + chrX 22725611 3' + roo 322 2 76.71 AAGATTTAAAGAAAAAAAAAACGTGTATATTTTATGCGAACATGTGTGTACATATGTGTGTTGAATTCAAATTGCTACCGACATTTTCTTTTGAATTTAGTGCATGGTCTGCATTTCTCGCAGTGCATTTGAGCTCATCTGTG:1 - chrX 14073628 3' + TART-B 10509 1 53.85 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAAACGCACAGAAGTAGGCTTC:1 - chr3L 12867291 3' + roo 344 2 60.96 GTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATATATATGTGTCACTATGATGCAAACGTTAAAAAAAACAAATGCTGTACATCGACAGAAACGCGCATGGAAAT:1 + chr3R 5090064 3' + McClintock 443 2 53.96 ACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAACAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATAC:1 + chr2R 4261952 3' + invader4 3017 2 49.47 GTGTGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAAACCGTCTTGTCACCTTAAAACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTTTGAGAT:2 - chr3R 28349568 3' - Transib-N1_DM 225 1 47.26 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATATACATTTGCAGTATAGTATCGCAGTAATCTGTGATGGAAATCCTTATTAAATTTGCC:1 + chr3R 29418827 3' + mdg3 5492 2 78.62 CTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAATTCAATAAATTTGCACAGAATTTTTCAACAATGAAAACAAATTTTCGCTCTT:1 - chr3L 1405007 3' + Ivk 5309 1 70.55 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGAATTATTTATAATGGATAGTGTG:1 + chr2R 23287532 3' - roo 8712 2 58.46 TTTATATCCGGAGGCAACGCATAAATGAGAGACGACTACTGGCCGTACACTCAAGGGAATGCCTTAATATGTGTTTAGATTACATTCTGACAGAGGGCGATAAGGCCCAGCCATCGC:1 - chr3L 22269139 3' + rooA 7178 1 68.38 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCA:1 + chr3R 22100594 3' + 412 7495 2 61.48 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTA:2 + chr3R 30635002 3' - roo 8751 2 78.08 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCACATATGTCTTAAAAAACTTATCAATGCATGGGATAAGAGTCAATGCATGGTTTTCTATGCGCAAAACTCAATACTTT:1 + chr3L 4115237 3' - 1360 46 1 51.37 TACGCATCTTGTTATTCTACGGTCTTTGCTTGTACAACAATCACAGTTTAGTTTCTTTATAGAAAATATATTAAATGATAGATAGATAGATATAGGTAGATATGATAGATATATCATTAAAAATATGATATATGATGCATTATAT:1 - chr3L 11257263 3' + 1360 3382 2 79.31 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACATAGATATAACAAACATTAAGATGGCATAGAATTTAATAGAATTTATTTGTTTAGAAATTGTCTCTTTTCA:1 - chrX 13531588 3' + roo 9021 2 53.79 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCCAAAGGACGCAGGACACAGGACGATGGCGATGGCGATGACGATGAC:1 - chr3R 27033846 3' - hobo 28 1 54.08 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGA:1 - chr3L 17175130 3' - 412 72 2 66.43 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAGGGGTTAAGGGTAGCTCGGAACTTCAGCCATTCCTAGGAAATTACAAAGAACAGAACTGCTTTAAATGACCATA:1 + chr3R 30635096 3' - roo 4 2 48.61 CTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTTTGTTTCTGTTACATTTAATACCGCACTCGGAATTAAGAACTACCCTTAGTTAAAGGGAATGTTTGTGCACTTAACACTTTGTTTTCAGTTAATGGCAAAATATT:1 - chr3R 25371652 3' + R1A1-element 4971 1 71.23 AAAATAGATTAGAAATAGCCAAAACTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGTTTTTATATATGAACATATAAAATGAAATAAAAACAAATATTTTGACAACAATTATGACTAAATTGAACGAGATCTTAGCTCAC:1 - chr2L 8564417 3' + 1360 329 1 52.05 AAGCGTAATATGTGAAGCATATTATGCTACTATATAGTAAAATATCCATTCTACACCCAGAACTCCCCAACCGCACACACTATTATAAACAATCACACACGCATTCAGTTGGCCCGTTTATTTAGTGAAAAATCGAGGAAAATCGG:1 + chrX 6190425 3' - rover 6961 2 67.12 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCA:1 + chr2R 5923009 3' - jockey 4756 1 76.03 GTTTTTTAATAAATAAAATAAAATATATTATTCGTAAAAAATAGTTATAATTGGCAATGTAATAGAAAGTGTTGGTATATATATTATTTTTTTTTTAAAAGCCTAATCAACTTGTCATTTATAACTTATCGATT:1 + chr3L 12660266 3' + G7 1143 1 63.43 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACAACGGGCGTCTTC:1 + chr2L 22016033 3' - Tirant 11 2 75.61 AAAAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTT:1 + chr2L 22150631 3' - S-element 79 2 83.33 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTTGCTCCCCCAATGCAATGTAATGGAT:1 + chrX 6510104 3' - jockey 4735 1 59.59 AGCTGTGGTGTGGTACAGAGTGTGGTCTAACTCAAATATTAAGGATATTGGGTACATCAATACTAATAAAATATGCAATTCTGAATATCTAAAATATAAGAAATAAATCAAACAATACATGATTTAGCCCTGACACCTTCACAAAT:1 + chr2L 870144 3' - Chouto 430 1 80.14 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAAAAACAAATGAGTTGTGTAATTAATACGGGCTTTTGTCTTGC:1 + chr3R 18816004 3' - hobo 14 1 75.00 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAGATAACTTACGGCTTTATTTAGACAACGAAATTGAAAATTCGTTTCGTTACTCTTTTGTTTTCCTTTCGAGCTATCTCGTGGTCCCTTTC:1 + chr2R 21402944 3' - mdg3 5260 1 74.60 CATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAAT:1 + chr3R 24729636 3' - Juan 4168 1 78.77 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTAAATGTTTAAAAACATTTAAACCAAAACTGCATAAAATCTATGTGTGACCCACAGTCTAAGAAATTCTGTAGA:1 + chr2R 8396021 3' - pogo 44 1 55.48 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGTGGCCAT:1 - chr2L 685996 3' - roo 72 2 66.44 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACATATAGGTGGGCAGCATGGTCATCAGCGTTTCATAGCCATAATTGTGCCCGGCATGGGACACCAGAATGGCATAGAAGGGTGGCGATTTGGCAATGCCCAGAAAG:1 - chrX 4785025 3' + roo 400 1 74.10 CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTGAGAGGGGCAG:1 + chr3L 7093074 3' - hopper 64 1 62.94 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCGATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTCGATTGATTTTGGGATGATTACCTGCCTTATTGTTTT:1 - chr3R 7598810 3' - Juan 61 1 61.43 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACA:1 + chr3R 27822294 3' - I-element 59 1 58.22 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATACATATATGATTGGTTGTACAATAACATTTAAGAGTTGGTTAGCTTTATACATTATATTATATT:1 - chr3R 6711411 3' - pogo 52 1 59.59 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCTATTTCTATGAGCGCTGTCCTTTTTCATTGCCTTTATTTTGCTACTTTTTATATACGTGTATATGTTGC:1 + chr3R 28728759 3' - jockey 64 1 53.52 AGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTGTTCTACGCATACAGTGATTTGGGGGCTTTAGTTTTGACAGCGATGTGCGGACTTCCTG:1 - chr3R 30531060 3' + 1360 85 1 66.67 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTATGTTCCTTATTAAACACATTTCAACGGGTATATAAGTTTTGTTAAGGGGTAACTGTAAG:1 + chr2L 8542050 3' - pogo 56 1 60.27 AAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACTAACGCAGAAAATCAGAGTATCAACCCCGAACACCAAAGAAATTTGGAT:1 + chr3R 435995 3' + 1360 3021 1 69.18 GATCTCAACGTTCATACAGACAGATCGACTATACCTAATATGGTATGGAAGCGCTTCCTTCTACCTGTTACACATTTTGCATCTAATATTGAATACCTTATTACCATATTAGTAACTGGTATAGTTATGACATTATAATTATTTTA:1 + chr2L 22098042 3' - INE-1 132 1 76.71 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGTCGGTCATATCAGCGGCTGCTGCC:1 + chr3R 12599101 3' + 412 7512 2 59.79 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGCTGCTTGATATTCGAAAATGTAGCTCCTGAGTGTATACCACATTGTCAAGATAAAGAATTAGTAAGAATT:1 - chr3R 2555475 3' + Bari1 1657 1 51.72 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCGTTGTCATTTCCGCTGGACACACGTTTCAACGACAGGAAAAAAGGCCAGGCTAGGAGAAAG:1 - chr2L 13704678 3' + hopper 1358 1 55.48 GACCGGCCACACCTTTCAGCAAACCCTGCACCATCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCATTTGGCCACAGGCCACGGGCCCAATGAATCCG:1 + chr3R 4769003 3' + G2 5 1 73.64 AAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTAACTTTGGTTAGATGACCTAGCTGTTAAAGCTTTTAACGAACT:1 + chrY 382981 3' - 1360 81 1 71.94 AAAAAAAAAAATGAAAAAAATGAATCATTTGTTGTGAGTGTGAGCCGAGGTAACTGGATAAGATAGGCAATTCCTCGATGGGGTA:1 - chr3R 17978871 3' - hopper 142 2 92.94 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCATTGCACAGAGACTTGTTCGGAATGCCTGACAACAT:1 + chr3R 13176462 3' - Burdock 40 2 56.43 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGACCGAAATGGAAAAACGGCACAGCATCA:1 - chrX 12191501 3' + pogo 2074 1 67.81 TGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCACTTTTCACTGAATTAAGAAATCAGATGGAAGAAAAGGTAAATCG:1 + chr3R 31409326 3' + opus 7430 2 76.92 CCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATATGCCAGCTAATCTCAGAGGTTAATACGAAGCAGCCAA:1 + chr3R 19859680 3' - opus 66 4 71.21 ATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTC:1 + chr3R 14860224 3' - BS 5057 1 59.59 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGATCATAAAATTTTTTCTGCT:1 + chr3R 8709822 3' + jockey 4946 1 74.00 GTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGACGGAATCTGTCTTAATTAAATCAGCGAAAAGAGGAGGGAGTTTGGCTATTATGGCT:1 + chr2L 19025770 3' - invader1 3 2 58.52 AGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGATTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAAACGTAGGCTGGGAAAAGGTATAAAAGGTGTAAGCAGCACGGACAC:1 + chr3R 16058079 3' - F-element 357 1 72.86 AATAAAAGTGAAACATTTGTTAAATTATTTGAAATTTAATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTT:1 - chr3R 31887769 3' + HB 1501 1 57.53 TGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTAAAAC:1 + chr3R 22516078 3' - jockey 4595 1 57.64 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAGCGGTAATTGGTTGCCACCTGTATAAGTATGTTTC:1 - chrX 12138922 3' + roo 9022 2 53.42 GCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGATCTGGTCTACCGCTGGGCATTTGCCGTAGATCGAAATAATTCTATCGTGGGAGTCATTGATGGTAAACG:1 + chr3R 11652180 3' - copia 5026 2 62.70 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACG:2 + chr2L 76132 3' + roo 9003 2 70.55 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTTCATGCTTT:1 - 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hopper 56 1 67.50 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGGAATTATACGTGCAATAATTTGGATTCGTGAGTATAGACTTCAACTATTAAACTATTAAATTATATTTCTCGAGGTGCAGTGGGAGATATGACCCAAACATCGAGC:1 + chr2L 2052828 3' - blood 7026 2 67.59 GGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAATCTACTCGTTTGCATTGCGAGTGGGTCCTTGCATGGCCAAGAGCGAAGTTAACATTAT:1 - chr2L 18362390 3' + F-element 4358 1 60.27 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAAATAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGA:2 - chr2L 13927720 3' + roo 9002 2 64.38 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACACACGCACACACTCGTGCACACACACAGGCGGACACTCAGCATATGCAGC:1 + chr3L 17175208 3' + 412 7540 2 65.85 AAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATACAGTGCACTGTATGGATAGAAATGAGCCAAAAAGTACCAGAAATGGTACCAAA:1 - chrX 3464187 3' + hopper2 1533 1 65.07 GAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAATAAAAAATTTAATAGCTAATTATTTAACTAAATAACAGCGCTAGAAATA:1 + chr3R 13582281 3' + BS 5015 1 71.23 AATAATAATAATAATAATAATTTGCTTTTTCTATCCACAATATAAAGTATCTTGCGCTCTGTTTTCCTAGCCGAAAATGCTCCAATGGCAAACAGTTAAGCAAAAGGTTAAGCAAACCCCACAAAAAACTTGTATATTTGTATTTG:1 - chr3R 14976469 3' + mdg1 7081 2 61.64 AAACGGTCGCTTGCTATTTACAAAACAAAAGGAAAATAACTGTAATTATTAACCCGCCCGAATTATTGGTTTGGGCATGACCGCTGAGCTGTGCATTTTTAATTTGTATTTAATGTTAAAGAAATATGGAAAAGTTGGCATTAA:1 + chr2L 17808407 3' + HMS-Beagle2 7162 2 55.56 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAA:1 + chrX 12139012 3' - roo 84 2 76.03 TAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAGTAATTTGCATTTTCCAGCCGAGAAATGGCCGAAATGG:1 - chr3R 12662889 3' - hobo 2627 1 73.39 TGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATCTAACCGTATGTGTGTGGGTGTCAA:1 - chr2L 17240208 3' + hopper 1389 1 59.13 GTTGCAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTC:1 + chr3L 23678154 3' - Osvaldo 35 1 73.19 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTCACAGTGTAGTTTCAACCTTGATTAAATTTC:1 + chr2R 19555064 3' + pogo 2074 1 64.38 TCCCAAAATGATCAATATTTTTTAAAAAGTGCGTTTGGTTAAGTAAATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATTGTATGTGATTGGAGGGCGATGCAATCGTCTAGGATTTGGGGAATTGTCGCG:1 + chrX 21084009 3' + HB 251 1 55.22 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCACACAAAATATTCAATGAAAAAT:1 - chrX 8027405 3' + Juan 4167 1 50.00 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACCGGGGAGTTTTGTTTGGCTGCAAAGTGGGATTTGCGAGCAAATTCCTT:1 + chr3L 905874 3' - 412 71 2 67.12 GCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGTTGTGATCCTAGAAGCGTTCTTGGTCTTTGGTCTTTGTT:1 + chr2R 4677402 3' - invader3 14 2 73.97 CAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAGCCACATGAAGCTATATAGTCGGCTTACACCATTGGCTGCTT:1 - chr2L 6870675 3' + hopper2 1542 1 64.03 AATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCTCTATTATATGTGTAACATAGAAATATTGCGATTTTGGTAATTTTCTTAATTCCTAAAGCCGGGA:1 + chr3R 11749742 3' + Tabor 428 2 56.16 TGTATGTACATATGTATACATACATATATTTATGGAAATATAAAAATATTAATATCAAAATTAATTTACCTTGTGCTCTGTAATTTGCTGAAAATTGAATAAATTTCAGAATGGTATAGCTATGGTATGGTATGGTATGGTATAGC:1 - chrX 5714937 3' + invader3 5087 1 76.71 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTTTCGAGCCACTGTGGACGTGTGGG:1 + chr2L 11915568 3' + hobo 2928 1 56.67 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGTGGCCATTCTAGGGACTGAAATCTTAGCTAA:1 - chr2L 685972 3' - roo 48 2 50.00 GCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCTACGATTAACGGGTACAA:1 - chr2R 4750372 3' + 1360 3296 1 69.92 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTATGATCATGTCTGCGCAAACGTTTTGTGAAGCAG:1 - chr3R 8709795 3' - jockey 4747 1 74.63 TTTTATAAAAAAAATGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTAT:1 - chr3L 22861801 3' - S-element 86 2 76.71 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTATGTGTGGGTGGGTGGAAAAGAGGCAACAGTTTTTC:1 - chr3R 15711763 3' + diver 6060 2 52.41 ATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTACCGCTCTGCTTTTGCCACTTTTATTGTTTGTCTGGTGTTCTGCGAAACAAGCCACATAACTAAA:1 + chr3R 9190645 3' + Tabor 471 2 75.34 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCTAAGATAAATGATGCACACGTTGAAATCCCTTCATAATAAGGGATTAATATTACAAGATTGTACGCAATTAGTGGCCAGATAGCTTGTGGATTTTTCAT:1 + chr3L 15327688 3' + blood 356 2 66.44 AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATATCTTAATATATTTGGGTAATAAATTAGATTTACTTTATATTAAG:2 - chr3R 25768789 3' + copia 5048 2 71.23 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTTTTGTTCTCGAACTACATTCATGAACT:1 - chr2L 17029562 3' - blood 33 2 60.96 ATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGATGCCAATGATAGAGACACGAGAAGGATAAGATTGTACAGTTGCCATTCTTGTTTCCTCGAGCCAAGCCACTGGCTCTGCGCCCCAACCAGCTCC:1 - chr3R 18598414 3' - Stalker 7073 4 55.40 CTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTA:1 + chr3R 22516074 3' - jockey 4601 1 54.11 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACAGAGGGAAAAATAAAAGATTGCTATTTTAGGAAACATGAAGAGATCGCAATCATTATTTACTTTAGTGTTAACTTACTCAACTGCAGACTTAACCCTAATA:1 - chr3R 10472649 3' - mdg1 20 2 70.55 ATTACAATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGTAGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTTTATATTATCATAGCTTATTATGCATAGCTTAAAATCGACGAAACTGGATAAGAAATAAATATTTTTAGT:1 - chr3R 12929178 3' - invader4 47 2 54.11 GCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGACTCAGAGTGGGCAATACGAACTTTTGTTTG:1 + chr3L 24152579 3' + HMS-Beagle2 7170 2 66.44 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCACTAATGAGTGAAGGTCCTCGGGCGATACTTATTGAGGTCATGCGAGGTCAAGATGCATCATGATAATAGACAGAAATTTGGCCTAACTTAACCATTAAATG:1 - chr2R 16403362 3' + copia 238 1 73.29 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATTGCTTTTTCAGAAGTAATCGG:1 + chr2L 6319014 3' - pogo 45 1 54.79 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTAACTTTTCTGTCCCTTTGTAAC:1 - chr3R 16181125 3' - roo 8717 2 54.79 AAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAACCTAGCGGAGCCGTAACTGCAACTTATGACTACTAA:1 + chrX 4658720 3' - FB 676 2 75.34 ACACATTTTAAATACTAAATAAATGACTGCATTTGCTGAAATTTGTTCCGCTACATGTTTTGGCCACTATTGCCTTGAACATATGTAGCTGTTTCTTATTGAGTTCTATTTAGGCAATCTTCACCGTAC:1 + chr3L 11092097 3' + G2 3048 1 37.21 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATGCCTCCTGTTTGTTTTTGCCGTCTGCTTGATGCTATTCCGGCTGCTTTTCCGGGGCTTTACACGCCGCACTCAGTGCTACGGAAAAGCTACGCCAC:1 + chr2L 18317580 3' - mdg1 9 2 77.52 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATTTAATGATCATTTAATGATCTGCCCGACAGGGGCTTCGGATAGGATGAGATGAGTACGTATGGGTATTGGTCC:1 + chr3L 15100069 3' + copia 241 1 51.37 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAG:1 + chr3L 22978645 3' - 1360 16 1 68.42 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGC:1 + chr2L 686059 3' + roo 320 2 77.40 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGACAAAAATCATTATGAGAATTGTAGAGAATGAAGTTCATAAAGCGATGGAGAAGTACCAAATAGTTCTTAGTTTCAAACACAATAAACATCGAG:1 - chr3L 20594089 3' + roo 9046 1 67.81 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTAGAACCCATTTGCTCAACAACATTACGCCACAATTCACATACACGATAAGTTTAATTCAAACTAAAACTTTTTATCTTTGAATTAGTCAAGTAATATAACA:1 - chr3R 24279284 3' - roo 20 2 70.55 TACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGACTCAGAGTGGGCAATACGAACTTTTGTTTGTACCGTTTG:1 + chr3L 24152588 3' + HMS-Beagle2 297 2 73.10 GTCACGGTCGCCATGTCTTATTTAGGTTGCCATAATAATTTAAAGTTTTGAATTCTCAACTCCAGATTTTTTGATGCAGCAGTGTCGCTACTGAACGTAGGCCATTCCATAACGTGAGCAAAGTTGGGGAAATCGGATCTGAACTT:1 - chr2R 291263 3' - gypsy11 444 1 50.68 AAGTGCATGGTCAGCATTCCCACGCTAACCAAATGCCGCTATATACAAACTGTGCGCACAAAGCATTTTCGCTCAACTCTTTTAACATACATACAGTTTGTATTCCAAATTAGTTTCGAAGGGTGGAAGGAATTT:1 + chr2L 16368393 3' + gypsy11 172 2 73.33 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATCAATAGTTTAAGTTCTTTTTAATGCCTTTGGTTAATTTAATGCAACTAGTTAATGTTCTGTGCTCTATCCCTAGCTTATCCTGGTAGATCCTTCTGTGTCCGATCAAG:1 - chr2R 14047574 3' - mdg1 7053 2 71.23 TCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGTT:1 + chr2L 12319311 3' - copia 4953 2 77.86 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAAC:1 + chr2L 246103 3' + roo 356 2 54.11 AGAGTTAATATGTAAGTAAGCAAAAGACCACCAACACTTACATGAACACTCCAGCTTCCCACTGTCTCGTCCCTTGGCAGCTGCCCTC:1 + chr3R 4967607 3' + Stalker3T 64 1 63.64 ATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTTTTAATGTTTTTTAAACTTTTGCCC:1 - chr3L 13634196 3' - 297 20 2 62.96 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGAC:1 + chr3R 9352108 3' - Tirant 10 2 72.38 ATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTAAAAAAAAAATATGTATACATTCTCAATTTCAGCACACAAAAGATTGAAGTATCTTTTAATGCTGTTGCACAGTATGCA:1 - chr2R 8642884 3' + Doc2-element 4713 1 52.74 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGAGGC:1 + chr2R 18482515 3' - hopper 47 1 53.42 AATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAAGACATCTCCACTGGGCGGAAATCGAGGAGGAGGCGTTGCCCAGCTTCCCACCTCGCCAACAATTTCCAAATAGATCGTTGGCAATGTTGAT:1 + chr3R 24217235 3' - invader4 2634 1 56.16 TCTTCGCCGTGTTTCGTTCTTTTCGACAAACAGCAGTGCTTTGCTGATCATTTTGCTTGAACAACCAACATTGCGCCTTTTTGCTTTCATCGCTTATTTTTTTTTTGTGGGTTTATTTTTGTTTTGTGGCCTGTTGTTTT:1 - chr3R 31368864 3' - Tc1 499 1 54.29 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAATCTAGTAGAATGATTT:1 - chr2L 9485576 3' + 412 7502 2 52.74 GAAAATAAAAGGAAATAAAATCGAAGCCAACAGAAATAACAATTATGGAACATACCAAAAAAGCTCACAATTGTGGGCAATCAATCATGGAAATATAATGTAGATGGGCACATTATGCAATTCTA:1 + chr3R 9475431 3' - transib1 1899 1 75.20 GGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCT:1 + chr2R 15829611 3' + invader4 3081 2 72.63 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATATCTCGCTGCAATGTGGAGTTACTCGGGTAATTCGCTCCCCAGTTAATTTTGTTTTCATTTAGCCTAAGACTCCTGAAAGTTCACAGAAAATTAACTTTCT:1 + chr2R 17121729 3' - blood 7031 2 70.55 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCATTGGGGCGGACTTGTTTGCCCCAGTGCCTTCTGACCG:1 - chr2R 6842782 3' - roo 8748 2 75.34 CACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGA:1 - chr3R 19449964 3' + roo 8669 2 80.14 ATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAG:1 - chr2L 9237526 3' - blood 7099 2 80.85 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACAA:1 + chr2L 22016022 3' - Tirant 8 2 75.23 TAAGCAGAGCAAATTAAGTTGCCGCATGGGCAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTCAGTCTTAAGTCGAAAAAAACTTCCAATGGCAACCGCTGATTAAG:1 + chrX 18409555 3' + jockey 4944 1 60.71 GCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGACCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTAAATCTAC:1 - chr2L 8959911 3' - Ivk 5150 1 58.90 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTATTCAGCAAGATTTCTCTCT:1 + chr3L 14553215 3' - roo 8713 2 54.79 TCTTAAAACAATGCATAATTTATATTCAGAAAGGAACTAGAGTCATCTTATGATGCATTATTTAAGTTACGATGCAATATACAATACATATACGTAAGCAATCGTAAATAAATACCCTTTGAATGGAGCCCTTTTTTCGCTCAGTG:1 + chr3R 22656616 3' - Transib5 437 1 59.59 CGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACTTTGGTCACAAAATCAGTTCCTAATGTGGGAATCACGTCGCCCAGCAGTGAATGGTGACGAAGAAAATAGCAACACACTTAATTCACGACGTATTTATATACA:1 - chrX 3739404 3' + Tabor 19 2 80.00 ATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGAAAGGCAGCCACAGCAAAGCCTACACATGTCGGGGG:1 - chr3L 11739115 3' - G2 2764 1 74.62 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCCTAAGATATTATGTTTTTGGCCTATGTATTCCTTCGCTACAAACAGACACATTTATGTTCTGCTTCCCGATTCGAGAATCAAATTAGCCAAAGAATT:1 + chr3R 15338163 3' + blood 352 2 66.44 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTCATATTGTAATAAATGAAGGAATACAACAAAAATATTTTCT:1 + chr3R 16913483 3' - pogo 38 1 58.90 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAGGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTTGGCAAGTTCTGCAACATTTTCCGCTGGTG:1 + chr2L 5202585 3' - 297 6626 2 55.56 GAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTA:1 + chr3L 23702278 3' - G4 40 1 55.48 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATACAATACATATGTGCTGGACCATTCTGTGTAACAAATCGCTTTGATGAAAGCTGTCACTTGCAACAGTTGGGCCAGATATTCGAGACGAAA:1 + chr2R 12787949 3' - 297 6588 2 79.07 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTGGCAT:1 - chr2R 12543081 3' - roo 8743 2 73.97 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTGAGAGGGGCAGTTCAGGTTCAATGCTGCAAATTATACGCGTTTTTGCGGCGACTGCG:1 + chr3L 7093120 3' - hopper 21 1 71.23 GTGAAAATTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGT:1 + chr2R 2879459 3' + Stalker4 7027 4 61.64 ACAGAGTCAAATGCTTTACTAAAATCAGTGTGGATGACATCTGTTTGAAGAATTTTTTTGAAACCCTGTATTACAAAAAAAGTTCGCATATATATGGCCCATGAAGAAAATATTTTTTCTTAAATTTACATTCGCTTTCCTTTCCA:1 - chr3L 20057074 3' - Q-element 320 2 59.59 GATAGGGTAATCTTAAGCTTTCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTGAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATATTATCGTAAGATACTTGCCGTGAATATCAATCTGGAGGAGATCAACTACAAGCTCACCTATGAGGACCAAACACTG:1 - chr2L 3504250 3' + Chouto 95 1 68.49 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGTGCC:1 + chrX 12525992 3' - roo 70 2 66.67 CATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAATGAACAAACG:1 - chr3R 13607655 3' + I-element 5274 1 75.18 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTTCCTAGAGTCGTACACCCATGGACTGTTTGAGATGCCA:1 + chr3R 25304847 3' + roo 9036 1 61.64 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGTGACGTATTTACATTATAAGTACTGTCCAAAAAATAAGAATATGCTGAGTGGCAAAAAACCAAACAAACCACAACCACTTTTGTATACAATCAATAT:1 + chr2R 1478280 3' - opus 7022 2 71.23 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAATTTCACAGAT:1 - chr2R 17890851 3' + Tabor 443 2 54.11 GTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATG:1 - chrX 7978949 3' - accord 193 2 61.60 GAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTGGCGCCCAACCAACAATCTGAATACCTGACCGTTTTCCTGGAATTACTAGGTTCTCCGAAAGACTCTGCTG:1 - chr3R 19448977 3' + gypsy 443 2 51.09 GGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGATTTATTTTTTTTTCACCATTGGTTTAATTCAAATTATTCAGAAAATACCTAAGGC:1 + chrX 14710984 3' - 1360 261 1 61.27 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCGAAGAAGGCCCAAAAAGAGCAAAGCTGCATATACACTGAGGAAATTGCATATA:1 - chrX 14951112 3' + P-element 2819 1 39.04 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTACTAACAGACAGCATCA:1 + chrX 6510073 3' - jockey 4747 1 77.95 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTCTGATAAGTTTTT:1 - chr3R 20175661 3' - hopper 27 1 65.75 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAAT:1 - chr2L 17029608 3' - blood 7090 2 71.23 CTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATTTTTTATGCGAAAAATTCCATTAAAATGTTATCCACAGTTTTCGGGGAGATTGAATTTTTCTGT:1 - chr2L 18158988 3' - INE-1 152 1 65.07 GCTTCGCGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTGTACAAATATACAAAGAATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTCTTTCGTTTACTCTCCCTTTTGGTAGGGCGGAAATATCAGGAGCGATAGCAGTTGGGCACTGCAGGTG:1 + chrX 21477863 3' + Cr1a 133 1 68.28 GACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTATAAAAATATACAGAGAT:2 - chrX 15408719 3' - INE-1 549 1 86.30 ATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAAT:1 - chr2R 8641506 3' + diver 6069 2 54.10 CTAAAACCAAAGACACTAGAATAATTATAATTATTCTAGGGTCTTTGCTAAAACTTTGTAAGTAAGGGACATGATTCAATTTTTGGTACAGTGTCGAGGCAAATTCGGAATTTGTTTGGAATGTGGTCAATATAACTACGATTA:1 + chr3L 23024565 3' - Tc3 317 1 67.36 ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAACATGAAAATGACTTTTCTGCTCGACTTTGTTTTGCTAATGTCGATGT:1 + chr2R 17890991 3' - Tabor 41 2 54.79 AAAAATAAATAAAATATTGCAAGCTGAATCAATGATATATCAATGATATCAATGATATAGTGGAAAAAGATTTCCAATTTATAATGATCACTCAAAACGTTATGTTAAGGATGGAAAGGGTCGGGAAAGCTGAGAATCAAAACGAA:1 - chrX 3840267 3' + P-element 145 1 75.34 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCCTGTCGTTTAATATCCCAGTCGTAGCTATGAAATAACTAGCAAAATAACTCATTCGATGTTT:1 - chrX 1061520 3' - 412 58 2 56.85 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAAATCGCTGCCTATCTCCCCACCCCACCCCGCCAACATGCGTGTGTGTGTGTGTGCGTATCGTGTAAAGTATATAATTAACGGTAATGCACATAC:1 + chr2L 14095701 3' - pogo 22 1 71.72 TTATGAATGCATGCATTTACAATAATATTATATTAATCTACCGACTTTCATAAAATTGGATTTGGCCATAAAAAGTGGGTAATTTTCCAATAGTGCTGTGGAACGGGGAACATGGAGGGAAAAGAGGACC:1 - chrX 22791160 3' + Transib-N1_DM 425 1 73.85 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTAGTTGTTTTTAGATTTAATTTACCATAAATCTATATCTAGGTAAATCTATACCT:1 + chr3L 4187287 3' + pogo 2037 1 66.44 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCGGGTGGCCATTCTAGGGACTGAAATCTTAGCTAATTTATTTACCATACTCCA:1 - chr2L 685954 3' - roo 19 2 67.41 TGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAA:1 + chr3R 9352116 3' - Tirant 8128 2 67.74 ACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATGTACTTTTTATAGTCCGAAACTTTTCAACGAACCTAGCATACCCTTTCACTCTACGAGTAACCCGGTCTACTATCGAGAGAAAGATTGCTTTGGCTTATGTATGTGTGGGTCTTT:1 + chrX 22789283 3' - INE-1 91 1 45.89 CTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTATCAACAGCACTAAGCGGCATATTAAATGCCATCCATTGAGTAGGCAATTGAGGCACTCTCTTCCAGCC:1 + chr2R 21896754 3' - roo 207 2 53.42 ACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACATATTTAAGAAACGTGTGGCAATAATACGACTTATCTTAAAATTTTTAGTCTGTTCAAGAACCCTTAAGTTA:1 - chr3R 30583766 3' + gypsy12 10164 2 55.56 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGACCAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGT:1 - chr2L 4173998 3' - roo 80 2 80.15 CTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACTCTATGATACCCTTTTCTGCATCCTATAAATAGCTTCGAATTTCTGATACCCCAAATGCCTTGCCGCCGCGCCTTTTGTTTGTCTTCTGTGTTAATTAACATGAGTAGTTTACTTAAT:1 + chr2L 19847871 3' + diver2 4891 2 67.12 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCATGGCTCGATTCTGCAACGACCATGCCCCCTTTGCTGGCCGCCGGG:1 + chrX 8755115 3' - transib2 49 1 65.25 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTGCTTATTTGGGACTTTACACTCTGGCTTCAGGTTTCAATGAATCCGCCGTTCCCCAGAGATAACCTTCCCGACAACGTGGGCATTTATAAATAAACTATGAGATGAGTGCACCTTGAG:1 - chr3R 23765320 3' + roo 9046 1 69.18 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATATCTTAATATATTTGGGTAATAAATTAGATTTACTTTATATTAAGCATA:1 - chr3R 25768785 3' + copia 5052 2 69.18 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTCCGAGAAAGAAGTACACC:1 + chr3R 13349161 3' - BS 5025 1 63.01 GTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAATTACAAATTGGTTTTAAATGTTTAATAATGTTGGTGACACACTCATTGTTTATTTCTTTATTTTCGTTATTGTAAACTTTATTTTCTCTTT:1 + chr3L 27972879 3' + 17.6 437 2 72.46 CTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTCGACATTTCT:1 + chr2R 8641634 3' - diver 27 2 63.01 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCAT:1 - 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roo 49 2 60.80 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACCGGGGAGTTTTGTTTGGCTGCAAAGTGGGATTTGCGAGCAAATTCCTTAAGCCCGGT:1 + chr3L 905883 3' - 412 62 2 60.96 AAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATACCAACGTATCCAAGAGCAGCTAAACATGCGAAACTGGTCTCAAATAGATTGCGGTTCTGTCGA:1 - chr2R 13975015 3' - blood 7108 2 56.85 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTTTCCGCAGATACAATA:2 + chrX 1103741 3' + pogo 2065 1 60.96 CTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTCGGCGTTAGAGTGGGCGTTCCAAAAAGTTTTTTGGTAAATGTATAGAAATTGACACAACTAATAAAATGAGAAAAAAATTAA:1 + chr3R 2552888 3' - Doc3-element 4576 1 69.37 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAAT:1 - chr2R 19554938 3' - pogo 20 1 55.91 TCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCCACATACCTCTCCACTGCTCTGCTGTTCATTAGTACC:1 + chr2L 6184085 3' + pogo 2018 1 76.03 CGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGTGAGTATATAGTAGTAGTACAGTATAAATATGAAGTTTTTATAATTATTTATCAAATTAGAGAGTGCCTCTGTTCCAAGTGTAGAATTCAGGTGTGTTGGGGGAATACCC:1 - 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BS 5074 1 73.05 AAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAATTAAAAAAAAAATTTTCCCCTCTTTCCTTATCCGCATTCACTGCCTGTTGTTTTTCCTCTCAATCTGGTGCGTAACTCTTTGTGTGCATTGTGCTGCCAGCTTTTCC:1 - chr3R 13241043 3' + Doc 4675 1 66.42 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAATAAAAATTGCAAATTTATACATACGTACGCGCTTTCTAAAAACA:1 + chr3L 20713045 3' - roo 76 2 75.86 GCTTCCATTCATATTTAATGGCATTGGATACCATTTTGGCAGAATATTCAGGGGTTTTTTGAATGTCCTGAATCCCACTACAACTCTGCACGTGTATAGAAGCTTCGCTCCCAGCAAATAAATTG:1 - chr2L 21908853 3' - HB 474 1 55.20 AGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATTTGAAGCATATCCATATATTACCGAGAATAATAAAATTATGCTGCA:1 + chr3L 19792516 3' + pogo 2031 1 67.81 GCTCATCTCCCATGCGAATGCTTCAGCATGAGAACTTCTTAGGTTGCATGTAAACAGTATTATATCGCAAGAATTAAAACATTTTGCAGCATACTTTTGGACAGCTTTCATTGCATACTTTTAGACACCTTTAATCTCCATAGAAT:1 + chr2L 4179563 3' - jockey 5 1 54.11 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAGCTAGCTCGCTCGCTCGCACACATACAAACAACCACAGAGTCGCAGG:1 - chr3R 13628575 3' - hobo 3 1 68.00 AACTTCTAACTCCCTTCCAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGTTTTTGATCTGCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAACTAATTAATATTAAGTGTCTGAAATTAACCAATAAATCAAACTAAACAGTAACACTGGCGG:1 + chrX 20383272 3' + 3S18 5921 2 67.12 AAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACAGAACAGATGTCATTGTGGTTTTGGTCTGATAGCGTCTGCCAATTGGTATATATTATACACATTATATTAATTCAAAAACACTCGGGTACGGCTTAAGAATGAAGTTAT:1 + chr3R 24509201 3' - FB 14 1 71.92 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTCACATACGTTATAGCTAAGATTTTTTTTAATGTGCCTGGGAAAAGTGTGCAGTAACCCCGCTGTTTATTTGCAGAAAATTCTGCGTATTCCTTTTCCCAGTC:1 + chrX 16787227 3' - pogo 16 1 71.92 GTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTGAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCG:1 + chr2R 5532324 3' - G4 3821 1 65.25 AAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGA:1 - chr2L 12340741 3' + diver 6044 2 62.33 TAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTT:1 - 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chr3R 27535435 3' + 412 7481 2 63.31 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGGTCATGCAATGAGGCAACTAATTGAGAGGCCAAACAAAGCATGGAATCAAA:1 + chr2R 20865750 3' + 412 422 2 65.75 AAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAAAATTCGTGGCAAGCTTTTGACG:1 + chr2L 18280000 3' + gypsy5 7337 2 71.30 AATTAGGATTTAAAAAGTATTTTCTTTTTAAGCACATTCAGCACAAGCAGTTGATAAGAGGATATCTAAAAGCTATTTTTCAGGATTATAATATTCAATATTCCCAAAAGACGAAAAGTACCATATCACATTCAAAATATCGTGTT:1 + chr3L 14473694 3' - transib4 2558 1 53.42 TATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACA:1 - chr2R 5214960 3' - F-element 77 1 63.01 AATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAG:1 - chr3L 9571682 3' - jockey 4537 1 74.62 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGCTACCATCTCTTCCATCTTTCTGTCCCTCTT:1 + chr3R 19531294 3' + hobo 2875 1 77.50 TAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTAT:1 - chr3R 13582199 3' - BS 5046 1 51.72 GCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAGTGAAGGGCTGT:1 - chr3L 23933546 3' + Cr1a 247 1 57.41 CTTTTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCC:1 + chr2L 18279954 3' + gypsy5 7279 2 72.44 AGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCCATTAATGGTCAACCTACAATGAATGTTGAAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTT:1 - chr2L 13332678 3' + mdg1 7164 2 51.37 TAAGCTAGATTAAGATTTGAATACTTAATGCTTTTAATACTAAAACAAAGGGAAGATTCAAAAAATAATATATTATATGTAAATAAAATAAAATGCAGATAAGAAAAATTATGAAGAAAAACAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAA:1 + chr2R 2868549 3' + Doc 4629 1 64.38 ATCACATACACGTTACTCAGCTATTGTGAATGCGAACGCGATATTTCATCATTTCATTTTCGGGGTTATATTGGGTGATATTGGGTGAGTGTTACTTATGCAAAAGTAAATTATCGACTAAATAAGAGAAATGGAAGAAATGAAAT:1 + chr3L 25971497 3' - INE-1 545 1 63.01 ACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAATACCCAAATCAATCTGAGCTCCAAGTCTACGAACCCCATTTGGAACCCACGATGACCGGGCAGCCGGTGTGCAGGGAACCCATATG:1 + chr3R 30510428 3' - gypsy12 38 2 59.59 TAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGACCAAT:1 + chr3L 16973478 3' + S-element 1669 1 53.42 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTCCCACTCTCGGTGCCCAAG:1 - chr3L 18658891 3' + roo 9011 2 61.64 AGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTATCGGAAGGACACTTTAGTGGCCGGTAATTCTTTGGGATTGTCCGTCAGCTATTATGACTGTGGTATTTAATAAGGTCCACTCCAGTGCACGCAGCATGTGCTACCTAAAAATCGACT:1 - chrX 17624892 3' + INE-1 567 1 35.86 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAAT:1 - chrX 2762558 3' + roo 9038 1 59.26 CAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATACATACATAGCCATATAGCCCGGTATTTGGAAAGCCGCAGAGTGATTGCCT:1 - chr3L 16870169 3' - FB 62 1 63.50 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGAGGCCATTCA:1 + chr2R 18482521 3' - hopper 34 1 60.43 TATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATCTTATTATATAACTTATATTACATACATAGAATGTATACATATTGAACGTATTAATTAAAACAAGAAGCTGGAATTATGATTTAAATTT:1 + chr2R 8642978 3' - Doc2-element 4753 1 53.42 ATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACCTGATGTTTGCTTACTACTTA:2 + chrX 16384120 3' - diver 5926 2 59.59 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTTTGAATTCAATTTTAGCAAGTCCTTGTCGTCCTTCCACACCCG:1 - chr2L 2272474 3' + copia 5088 2 71.74 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTATTCAGCAAGATTTCTCTCTTCGGTTGCACTTGAAATTGCATTTTACCCCCTTCTTTGTCTG:1 + chr3L 14553257 3' - roo 8671 2 80.14 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAACACGGTCGCTCGATGTGTTGTAGTTGGTGCAAAAAATGAGAGAGTACCGGACAGTGTTCGGCAATGATTGCACTCACTAATTTCCGTCTCACAC:1 + chr3R 15580368 3' + 1360 3380 2 73.44 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCT:1 + chr2L 16089664 3' - 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chr3L 8788410 3' + micropia 450 2 63.28 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTTATTACTAGAATTTATGTACTGCTCTATTTGGAGCATTAGATAAGATCGACTTTTTTTTATCTCTGTGAGTAATT:1 + chr3R 20988880 3' - I-element 44 1 55.86 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCATTTTTGAAATGCAATTAAATTAGAAAGTACATCCTAATGCGTTCTACACACGATTGTGTTACTAAAAAAATTGGTTTTCATTGAAAATATTTGGTTTA:1 - chrX 13786816 3' - pogo 19 1 67.59 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTGTCATTATTATTCATAACTTGGCAGACAGTCGCTAT:1 + chr3R 25387849 3' + roo 342 2 73.64 GTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTAAACTGGGCAGGGAGGATTGGCTCAGAGGGGAGGGTACTATTCGATTGGGATTCACTCTTTTTT:1 - chr3R 27188585 3' - I-element 5200 1 56.16 AACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCACACAAACTC:1 + chr3R 435934 3' + 1360 2960 1 69.86 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACAC:1 + chr3L 7995480 3' - P-element 90 1 23.97 GGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGAGGAGAAGAGGCTGAAGAGGAACGCAAAGTTAAGCAGCGACTAGAAGATGAAATGCGACAGGCAGAA:1 + chr3L 21422951 3' - F-element 4523 1 53.51 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGTTATGCCATTTTGGAATATCCATTTGGGTTGTACTATGAAATGATAAGGCATATATTTCCTTGAAAAACTTAGGACATTCAAATTGTGTTCTTTAGCAT:1 + chr3L 20255286 3' - Transpac 4939 2 71.92 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGGATTATCTTATTTCAAAAATTAGTTGGTAAATTTAAATGTAGTTTTAAGTAAAATATGAATAGGTTTCACTAGTCTTATGTGCCCAATTCATTACAAGCA:2 + chrX 10567906 3' - roo 8684 2 67.81 ATACATTTAGTTGATGTCATAGCAGCGCGCAGTGGTACCGTTCAAGAGGGGCTACAGCTAAGTTTTGTTACGGTTCAGTCGCCATCATGCGTTGTAATAGTGAGGATCTTTCTGTCGTTTCGTTGTTGTTGCTGATGCC:1 + chr2R 1248228 3' + mariner2 42 1 77.70 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATTTAATATTAATGCCAGTAGTCTGCTCAAAGGCACTCAAAAAG:1 + chr2L 14201526 3' - roo 8670 2 71.92 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAAACACACTGAAATATTAGCACCTGGTTGCGCACGCCTTCATCGTGGACGCGTTGAAGATGAAGCGACTTGGCCGCAGCCACTTC:1 - 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chr3L 23608500 3' - Tabor 51 2 52.14 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTC:1 + chr2R 21402684 3' - mdg3 5325 2 64.38 CGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTCTCTATATGACTGCAAGAAAAAATCTAACGAACTAACACAACTTTATTTATAAATTATTTGTATATGACTGACAC:1 - chr2L 11574777 3' - Max-element 8259 2 68.49 GACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGGAAACGCTATGCATATGGGTGAACTTTACACATGGAGAAATTATCAC:1 - chr3R 26274880 3' - 297 6926 2 59.48 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTATATTATAATTTATGGCGCGTATTCCGTTAAATCTA:1 + chr3R 12568925 3' - hobo 85 1 76.03 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCTTATATATGTATAATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACATCGAAAGTGTATTT:1 + chr2L 14248100 3' - I-element 68 1 61.64 GTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAA:1 + chr3L 9571711 3' + jockey 4901 1 80.14 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAGTTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTATATTCATAACATATACATTAATATATACATTGCAAAATATATCAAAATATTT:1 + chr2L 5694221 3' + copia 221 1 65.07 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCGCAACCGCAACAT:1 + chr3L 11400026 3' - Quasimodo 45 2 55.48 GATCCTGATCAAGAATATATGTACTTTTTATAGTCCGAAACTTTTCAACGAACCTAGCATACCCTTTCACTCTACGAGTAACCCGGTCTACTATCGAGAGAAAGATTGCTTTGGCTTATGTATGTGTGGGTCTTTTTCGTGGGCTG:1 + chrX 22789294 3' - INE-1 80 1 42.47 GGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAAGGTCGTGAGTACAACAAAACAACAACAAAAAATACTTATACG:1 - chr3L 23797645 3' - Helena 1149 1 61.38 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCTTCTTTGCTACCATGGAGCGGCTCCCAGCACTCAATTAATTAGTACCTCCATCTAAAAGGGGAAAGGGG:1 + chr3R 31491038 3' - roo 40 2 52.63 AATTGTGTAAACTTGGAATTTGTTTTTTCTTTTCTTGTATAATTAATATTTTTAATTTCTTACCTTTAAAATCAAAAATTCAACCTATTTCACAGTGTGTAAAAAGTTTTTTGACAAACTGTACATACTGTCAGTATCGAAGGAAC:1 + chr4 976795 3' + S-element 1531 1 59.59 ATCAACACGTTTTTCAAAAGTGTGGGCGTTGTAATTTTGTAGGCGTGGCAACATGGGTCAAAAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTT:1 + chr2R 1751259 3' - INE-1 261 1 92.25 CATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACATTACTAGTTAGAACAAAAGGGTTGCACCAAGCAACTAGACTATTGAATTTATAG:1 + chr2R 4638680 3' - 1731 4365 2 57.69 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTGTTTGGGATTTTACACTCAAGCTGAGATACTTTATAACTAATTACAAATTCAGCACGATGTGTGTAAAAATGATCTAAGTTTATACAATTTAGATATTTT:1 + chrX 19537016 3' + roo 9032 1 56.85 ATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATACA:2 - chr2L 17550619 3' + Transib-N1_DM 435 1 79.45 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTTTTGTTCTCGAACTACATTCATGAACTATT:1 - chr2L 17029559 3' - blood 30 2 63.01 TGAATCTCAACCCTCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATTTTTTATGCGAAAAATTCCATTAAAATGTTATCCACAGTTTTCGGGG:1 - chr2L 18159005 3' - INE-1 166 1 55.94 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAGCCAAAAACGTTAAATTGAATTGCAGCGGGCCAAATCCTCTCACCTATTTTATTCTGTGACAAA:1 + chr2R 21414479 3' - BS 5071 1 59.65 AAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATGCATATTCATACGGACAGACGAATATATGTCCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTTAACGAACGTTGTATAATGTATGGTGCTAGTAGAGCCCTTGGGCGAAGACAATTTCGCCACATGG:1 + chr2L 21580584 3' + INE-1 167 1 62.50 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCATGAGACATGTAAAAGTTAGTCCTACAAGTCGATTCCTTTATATCACCCCGACACGCGC:1 + chr2R 5737227 3' + 1360 3343 1 52.74 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGTACCGCAAGTTATGCAGTTAAAAAAAAA:1 + chrX 5145484 3' - hopper 65 1 73.11 ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCCTAAGTAATTCGTGTGGAAATACAAATATATATGTGAT:1 - chr3R 13582157 3' - BS 5005 1 77.40 TTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAATAAAAAATTTAATAGCTAATTATTTAACTAAATAACAGCGCTAGAAATATTTGACTTTAC:1 + chr3R 13582292 3' + BS 5026 1 63.70 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACGCAAAAACGTGCTGAGCAATAATCTAAAACGCAATAGCTAAAGAGAGAG:1 - chrX 4701136 3' + P-element 2822 1 39.01 TGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTGCCGCGAGTATATCACGAACTTAGGGCCCTCTCGAGTTGTGCGACCCATAAAATGGTCAACAAAATAATTTCCTCAACGC:1 + chr2L 6870784 3' + hopper 1404 2 72.41 GTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATGACAGTATTGGGGAACAAATCAGAAGAACAAACAGCAACCGCCCCATCTTGACATCT:1 + chr3R 7739528 3' + I-element 5294 1 60.96 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGACAATGCCAGTGGC:1 + chrX 4778248 3' + 412 410 2 77.86 GATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATTCTGGTTATATGAGGCATTTGTTCTCATTTCTTTCTGGGGTGGTTGACTTACGTTTCCAGTTGCTTTCCTTTTTAATGGGATTTGCGGTTCAGGTTTTTGC:1 - chr2L 22780793 3' + HMS-Beagle2 7176 2 72.60 TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATATACTTCTTTAAGGACATAATGAGACAGTAACAAGTATTAAGAG:1 - chr3R 10968724 3' + I-element 5277 1 69.18 CCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGGCTTGAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGTTCTATAAGTGATTTATTTGTTTAATTTATAATATTTCCA:1 - chr3L 16167315 3' + 1360 225 1 71.03 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATA:1 + chr3L 23456279 3' + 1360 3353 1 53.08 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACC:1 - chr2R 21402619 3' + mdg3 5491 2 50.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACAATGAAAGCGATGGAGAGAGAACAGGAAAGCCAGGCTAAACTGATTTAACTACGCACAGATGTGGTCATCTG:1 - chr3R 25387757 3' - roo 48 2 54.79 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCATACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTTCATTTTCCATTTAACAAAGTCAGTTTCCAAATGCTTTCCAAAGTGTAACACGCATATTG:1 + chr3L 20289153 3' - jockey 4689 1 54.07 AAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGT:1 - chr2R 961133 3' + transib2 2661 1 55.48 TAACAAATTATTTAAAAAAAAACATTCTTTGGAATTGCATGAAGATATAACTCACTCTGGCACAGATTCTGCACGGATTCGTCGGAGTTGTCGCCGCAGTGGTTGATGCCATCGCAGAGGAGATCGGGAT:1 + chr3L 11737639 3' + jockey2 3404 1 73.08 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAAAGCGATACATTCGTTGTTC:1 + chr3R 4197280 3' - P-element 40 1 29.41 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATGCCTCCTGTTTGTTTTTGCCGTCTGCTTGATGCTATTCCGGCTGCTTTTCCGGGGCTTTACACGCCGCACTCAGTGCTACGGAAAAGCTACGCCACCGA:1 + chr2L 18317583 3' - mdg1 12 2 76.30 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGGCGCTTCGATGTGGAACGA:1 + chr3R 26520474 3' - FB 42 1 51.16 AAGGACAGACCGTTTTCTTCCTCCAGTGACTTAAGTAAGCCCCATACTAATTGGGTGCGGGCCCAATTAGAAGGTTTCTTTTTTGATTTGATTTTTTTTATTATTTGTGATCTTTTATATATTTTCAAATGCGCCTGCGTGCGTAG:1 - chr3R 24958922 3' - baggins 5000 1 51.37 ACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATAGGTTCAAGAAGTAATACGGTATTTAGGTAGTTGACTAGACTCACAAAATAAGCAACATGTTAAAAACTATGTGTTTTTTACTTATACTTACACTTAA:1 + chr2R 5647180 3' - Stalker 428 1 59.59 AGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGACATAGACTATAGAAATTGACACCTCAAAACCATTTCGAATTGTGCTAATCATAATCTTGCGGGTAGATATTAACCCTAATA:1 - chr2L 16089564 3' + 3S18 299 2 55.48 AAAAAGCTTAAAAATTACAAAAATTGGTTAAATTAGTTATGCTAATTTCTAAGCTATTTTTAATAATTGTAATAATTGTTAATGAAAATTTACCCTAAGTCGATTATATTAAGCTTTAGTTTCCTTTTCTTCTTTCTCACTGGGCA:1 - chr3L 14578443 3' + 1360 3021 1 64.38 ACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAGAAATTATGTGGACAGTGGTTTCCAAAGGCAATAACTT:1 - chr3L 15026667 3' - opus 7081 2 77.40 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAATAAATAAAATAATAGAGGAACCTACCTTTGCAGGACTTGTCGTGTAGTTCGCGATCATCCTCGAGCAGCGTCTGGAACTTGTGCTGCAGATTGGAGGCC:1 + chrX 17419500 3' + Juan 4199 1 69.77 CATGACTATCCCTCTTTATTTCATCACCAAGAATGACCAAAACAAGCGTTTCGTTAAGGAAACAGAGAAAGACTCTTGTAACGAGGAGTCTACAGACCCTGGATCGCCATATACATTCCAAGAATTCCTATGATTCCCAAAGATAT:1 + chr2R 2009050 3' - invader5 253 2 70.55 CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTACAGATACGCTGTTTTAAACGGTGTATAAGA:1 + chr2R 641932 3' - opus 57 4 74.78 TCAACCTTCTAACTTTTATAGTTCCTAAGATCTCGTCGTTCATATGGACAGACGGACATATCCAGATCGAATCTATTGATCCGGATCCAGAATATATACATACGTTTGATCGTTCAAAAGTATATCAAAAGATTTCAATAGTATCT:1 - chr3R 30990394 3' - INE-1 160 1 65.75 ATTGTTATATAGGTCACTACATTCAGGCACCTGAGAACATTGAAGTGGGTGAGAGCGTCAATTTCTGTCCTTTGACTATGCGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGATGATCTTCAAGACG:1 + chrX 21585430 3' + mariner2 272 1 41.13 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAACAAAAAAATCAATAGCCAAAATGTTGTATATCTTAACAGGCTATACCATATATTATGGCTGACTAGGTCAATCCCAAAAACTGAGTCCAGAAAAGGGAAT:1 + chr3R 22249244 3' + jockey 4975 1 60.96 ACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATTTGC:1 - chr2R 7020567 3' + Bari1 1627 1 74.48 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACCACCAGCA:1 + chr3R 22100594 3' + 412 444 2 60.83 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGTTAGCACCAATAAAATATTCCAATGTGATCCAATGACGGT:1 + chr2L 12319349 3' - copia 52 2 53.42 ATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACACAAGCAC:1 - chrX 21852449 3' + gtwin 415 2 62.22 ACATCAACATACACACACACATCTGAGCAGAAGCGGCAACATATCGATAAGGATGTATAAGGACATGTTTGTGGCCCACACACACACACACACAGATACAAAGGCACTGGAAAAAATAATGGATTAGAAATGTACGGTGTCAAAAA:1 - chr2L 17705222 3' + accord 248 2 63.01 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGC:1 + chr3L 25401031 3' - Doc 38 1 50.68 CTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATAACTTAGAATCGAAGATATCCAGCCGATGGAACAAATCCTTGTTTC:1 + chr4 436890 3' - 3S18 65 2 64.18 AGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGTAAGGCAGA:1 - chr3R 9160673 3' - copia 4925 2 57.55 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGTAATACCTCAACATTAAAATGC:1 - chr3R 30634958 3' + roo 319 2 80.42 CGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGAT:1 + chr2R 4677362 3' - invader3 5229 2 53.33 ACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGT:1 + chr2R 8157249 3' + Transpac 230 2 72.60 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGT:1 - chr2R 1857485 3' + 1360 3380 2 62.96 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAAAAAGT:1 + chr3R 10030817 3' - BS 5039 1 56.85 GATAAATCAGCGGAATTTACGGTTACTGTGAACGGACACCCACAGGTCCTCACAGGCGCAGCGTTAGCATTCTGGACGTTGTGGCGTGAGAAGTCACGAGGCGCAACGTTGACAGAAGTGCCGCTATAAATATTTGAATATGAAAT:1 + chr2L 224842 3' + gypsy9 69 2 81.51 ATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGCAATACAATTTTTATGCGAAAACTAATGTAAAAAAGTCGAATCTCAATTATTTTCATG:1 + chr2L 2657328 3' + diver 6050 2 60.96 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTCTTCGACTACAATTTGGGAATACAACAATTTGGAAGAAAAGGCGG:1 - 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Tabor 82 2 71.23 CTTAATTGGAGTTCATCATTACATTCCACTTTAATACACCCCGTAAATAGTTGAAATTTCAAAAGCCTTGTGTGGGAAAAACTTTAACCGAGAGCAGGTGGAAAACTATCGTTCAGCTTAACTTTTAATCTGTAGCCAAC:1 + chr3L 10133655 3' + 412 492 2 79.29 GACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTTTCAAAAACTATTTTCAAAAACAGCGCAGTGTGATCATATTGCCA:1 - chr3R 18346554 3' + INE-1 580 1 78.08 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAATTCGGGTGGGCGTCGAGTGT:1 - chrX 2762539 3' + roo 399 1 76.15 TACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAATAAAAAATTTAATAGCTAATTATTTAACTAAATAACAGCGCTAGAAATATTTGACTTTACATAAGATCTTTTTTACAACTTAAGATTAATAGAT:1 + chr3R 13582326 3' + BS 5060 1 60.27 AGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACAGAGGCATTGCTACCCTCAGAATGTGATTACACTGACCATTTATGCTAAAGCAA:1 + chr2R 4362642 3' - gypsy 39 2 58.90 AGCGGAAGTTGTTTTTTTTTTTCTTTATTATCCATTACAGCGCACGTACGTTCTGCGTTGAATTGATTTAATTGGAGTAGTTGTTTGTTTGGTTTTTTATTATGCAGATTAGGGCAAG:1 + chr3R 18960395 3' - TART-B 10516 1 78.81 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCC:1 - chr3L 22400271 3' - 1360 66 1 64.29 TATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGTTGCTGAAAGAGTAAAAAGTTCGAAAAGACAGAACGGAAACCTCTGTCA:1 - chr2R 5954949 3' - copia 4943 2 68.49 CGAGATCTCAGGAACTATATAAAGCTAGAAGGGTGAGATTCAGCATTCAGATTCCAGAGACAAAGACGCAGCTCAAGTTTGTTGACCCATGTTCTAGCTTAAATAACACTCTTTCAAAGCAATACCATAAACAATAATTACAAG:1 - chr3R 18514017 3' + INE-1 147 1 64.58 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAAAAACAAATGAGTTGTGTAATTAATACGGGCTTTTG:1 + chr3R 18815998 3' - hobo 18 1 71.43 TAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTATCGCTAATTCGGAGTGAGAACCTGACGAAATGGAGAACGTCGGGAGAGAGATTCTTAA:1 - chr2R 7665744 3' - Transpac 4981 2 60.27 AAGAACAAATGTTCAAATGATCTAAAAAAGTCAAAAATTTGATATTCATCGAACAACAGATCAATGCGAACTAATTAAATGTGATGTCTAAATAATAAATTTAGATAATTGCATCACGAGCACAAAGAGTGTGAATAT:1 + chr4 972408 3' - 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F-element 60 1 56.39 ATCCTGCACAACTTGCCAAAGCTGAGCCTTAGATGTCCTGGAGTTCTTCGACACATACTGTTTTATGCTCCCCCACATGGTTTCAATCGGGTTTAAAATCTCGGATCTGAACAAAAATAGCCAGCAACCCATATAAACAGATTCAT:1 + chr2L 12482191 3' - HB 1224 1 66.44 ATATATAACATATAAATAATTTTACATCTATAGACGAGACAATATCTTCTAATGTAGATACAATTTCTTAGTTCTATATATATTTTTTTGAGCCATAAAAAAATTCAAAAAATATACCTCATAAGCCCAAAATGCTCAACTACCTT:1 + chr3R 11082012 3' + Tc1-2 1414 1 70.55 GGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTCGACAT:1 + chr2R 8641630 3' - diver 5 2 73.33 GGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATAGGGCTCTTTAAAGTATTAGTTTTATTGCATATTATTATATTTTCTACAAACTTGCAAAAAGGTTGTTCAGACAGGGTGCTTCGCTTCAGAGATCTTTCAAA:1 - chr2R 15829456 3' - invader4 2773 2 76.03 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATAATGTGTAAATAGAATCAAAATTGTTGACTCGGGCAGGACAAAGTTTGCTGAAATCGAAAGGGG:1 - chr2R 18482373 3' + hopper 1390 1 61.64 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTGTGTGTCTCAAGTTTTTCCTTTTCGGGTTGCTTGAGTTTGGCCTTCTCTTTACTTTGCCGCTGTATTTTTTAATTAATTTGGCATTTATTGGAAAAGGGTTTCC:1 + chr3L 13563449 3' + roo 400 1 78.57 GAAGATATTTCCAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGTAAAGAGCTCCAGTGCTTCCAC:1 - chr3R 7539425 3' + roo 9020 2 53.42 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCTGTATATAAAGTAACTCAATTTAGA:1 + chr2L 9668301 3' + 1360 3350 1 57.53 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTATATTAATATACATATACATACAGATGCG:1 - chr2R 641832 3' + opus 483 2 71.20 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATTCCAGTGTGCGTATCTAAGAGCGCCCACTTGATATG:1 - chr3L 20099495 3' + 297 6956 2 79.45 AAGGCTATAGTCGAGTTTCACGACTATCAGATACCCATTACTTCGATTGGGGGTGTGCAAGTTGGAGAAGTTGGGAGATATTATAGCAATGCTTTTCCCATTGTTATGCTCGCTAAGGATGTGTAAAGTT:1 + chr3R 3624040 3' - INE-1 570 1 79.23 ATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCCCATTCCCACTAGTTGAGTAACGGGTATTTGTAAGTCCGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTAATTAACATCAATATCCTAGTCGATCTGGCCATGTCCGTC:1 - chr2R 6241630 3' + INE-1 504 1 71.23 GGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATG:2 + chr2R 4677363 3' - invader3 5239 2 52.05 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGAT:1 - chrX 2762576 3' + roo 9009 2 58.90 GAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAACAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAAACTGGTAAAATAGGTGCATGGAACGAGGAAATGTGGAGATGAATCTAAAAATGGGTA:1 + chr2L 17013332 3' + 1360 121 1 60.96 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAATGAACAA:1 - chr3R 13607658 3' + I-element 5270 1 77.46 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGTTTAAGTTTAGTTTGACAATTGATTGATTGGCAGTTAATCATTTTAAATTCCCAATAGCAGTCATACTCTTCAATTTTAAGCGCACTTA:1 + chrX 14964744 3' - roo 29 2 65.52 TGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCACCAATTTAAGTTTCTTTGGAACATTTTGTCAATTT:1 - chr2R 5917785 3' - I-element 5079 1 56.85 TGTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACA:1 - chr3R 907904 3' - gypsy11 365 2 29.17 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCTAGGTACAATGTGCAGTAGCGCTTACTTGT:1 + chr2R 5923055 3' - jockey 4689 1 67.20 TTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTGCGAATCATAATTATCTGGTTTTTAATGTTAATCTTAATTAAACTGTATTACATTTT:1 + chr3R 11750302 3' - Tabor 32 2 64.38 TTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCTGCGGAGAGACGGGTAGCCGTGGACACCCCAGAGCCTC:1 + chr3R 8258910 3' + Tirant 8432 2 74.07 TAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAGGCG:1 + chr2R 2875242 3' + TLD2_LTR 109 1 68.97 GTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAATGAAACAACAAAGC:1 + chr2L 1260018 3' - Burdock 56 2 57.53 TTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGTGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCACCTGACTGAGGTCCGATTAAGTTTTTTTAAATATTTTTTTAAAGATGTATCACTTTGACATACTATTG:1 + chr4 909735 3' + invader4 2810 2 60.43 CCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATTC:1 - chr2L 11574851 3' - Max-element 8290 2 75.73 GCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGTGGGGTGTTCACTAGTTTAGAACTAATCATTTCACCAATCAT:1 + chr2R 7159504 3' - 412 274 2 71.23 TTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATGCGGATGCTTGATGAATTTTTTGCCTCGTG:1 + chr3R 4528394 3' - F-element 78 1 81.67 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCCATTCATGCGGTAGAACATTCAAATAACCCGCCATATCGGTCCGAACACCCCATGCCATCACACCCACA:1 - chrX 14450319 3' - jockey 4789 1 58.87 TTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACACATATGCCATCTTGAAACCTTTGGACTTAAAATTAATAATTCATACATATATGTATATAATCTAATATTATAATATTTCTCAATTTCTGTAGTAACTCATTTGGTAGCATGAC:1 - chr2L 18149351 3' - Bari1 7 1 45.89 GTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCACTTTGGTAACTCGCGCGTCAGGGCCA:1 - chr2L 23372498 3' - gtwin 41 2 55.86 AGTGCAACTGATTTTGCTAAGCCCCCACCTATCTTTCTCTCTGACGTCAATGGTATAAGTGAAAAGCTAACCTATCTTAAAACTAAAATTAAGAGAGAACTTTTTTATTATAAGATAGAATTATCGCTTGAACTCTGCCACTTTGA:1 - 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chr3L 14062244 3' - Doc 84 1 69.50 TATTTGAACATTCTCGCTGAGCCAAAAGGCCAGCGATCGACAAAGAGGGCAAAGTCACGCCCTCCAACATAAACTTCATAAGAAAACAAAGTAAAAGTTTTTCACAATTCACCGAAACGTGAAAATCTTACACAA:1 - chr3L 18095060 3' + gtwin 7236 2 62.22 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTTGGCAAGTTCTGCAACATTTT:1 + chr2L 5202576 3' - 297 6607 2 53.06 AAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATCTATGTCTATTCACGAAGACAATATAACATTGAATGAATAAATATTTACCATCGTAAACAACCTGATGTTTGCTTACTAC:1 + chrX 16384117 3' - diver 5929 2 57.53 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAAAAAAAATTATATAACGTGTGAAAAACTTTTATGGCCCTCGAGTGCAGTTGAGCGCTAAA:1 - chr3R 6244498 3' - Doc 41 1 52.85 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTTATTAGCGGCAATCGAGTTTGTATTCTCTTTCGTTGATCTTGATCGTGAACTCG:1 + chr2L 1558743 3' + 412 453 2 57.53 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATAGATGAAGTGATAGGTACGGTGATAGCTGGCATAAATGGACATTTCTATAACTAACTAATTTCTAACTTTTTAAACGATTTTTAAGAAG:1 + chr3L 14122716 3' + 1360 3356 1 54.11 ATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCATAACGAACGAAACGAATTGTGAAATGATATAACAATGATAAAAC:1 + chr2R 5237867 3' - Doc 111 1 69.86 ATCGACTATAGCATTCTCTATTGTTAAATATTGTCTCATTATATTCCCTAATATCCATTCATATCCCAGAAAAATTATGATGATGATTCCGAAAAATAAAACAAAAGTCATTGCTAAAACCTGACCACAGAGTACATTAATAATTA:1 + chr2R 4886046 3' + INE-1 577 1 54.11 GAAATATAAATTATAAATTACAACATAGACATATGTATGTATGTATGTATGTATGTAGCTTTGTGCTCCTCTCTTTCCTCTGTTGTTTCATGAAATTCTTTGGGGATAAACTAAACGAGAATTCAATGCCGGCCAATATTGCATTG:1 + chrX 22858552 3' + copia 252 1 72.60 CAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGTGAAGTACCAAATAAACCAATGAGGCCAACTCCCTTCAAAGAGTTCCTGGTAGAGCTTAAGCGAGCCTGTTTTCTTATAGTCCTGTACCTCCAC:1 - chr2L 21660379 3' + invader2 145 2 54.81 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCCACAGCGT:1 + chr2R 17392087 3' - BS 5072 1 70.34 CACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTAGATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAACACACAGGGACGGATACGTTAGTCCGAATAGTGACACTTAAAACCCA:1 - chr2L 22592548 3' + mdg1 7384 2 67.12 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAA:1 - 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chr2L 8525201 3' - HeT-A 1 1 69.18 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAAAAAATACAATAGTTGTGCCGAATAATGAGCATTCTATTTTAAACAGTTCGGAGCCCATTTTATTAGAAATATTTATTTGTAATTTACCCAT:1 + chrX 3263461 3' + roo 9043 1 63.01 ATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATACAACATTGGATTTAAGCAATGGGTTTTCCATGTGCCCGTAGAAGCACGTACACTTTGTTCGTGACTCAGAG:1 + chr3L 24152556 3' + HMS-Beagle2 7147 2 52.05 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGGGAAAAACTCTAATAAATGTGCTTGTGATACTCTGCTG:1 + chr3L 7995548 3' - P-element 22 1 70.55 AGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAATTTAACTTCAAAAAAACTTTCACAACTTTAGGATGGCAGCATCTCTT:1 + chr2L 9400824 3' - 1360 222 1 67.81 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAGGATGCCATTTCAGGA:2 + chr3L 17133889 3' + jockey 4951 1 55.48 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATGGGTTGCATTGTAGCATGCCCCGCCCCTCTTCACATATCCCAGAGTCCAT:1 - chr3R 28627604 3' + copia 5065 2 62.69 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCGAAGAAGGCCCAAAAAGAGCAAAGCTGCATATACACTGAGGAA:1 - chrX 14951122 3' - P-element 78 1 32.19 TAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGGCGGAGGTCAGGCGGAGGTCAG:1 - chrX 8755067 3' + transib2 2762 1 78.18 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGGCAATTGCCGCAAATAGGTCAGTTCAGATGGAGGTTACTGAACTCTCTCGCCCGCCGGCCAAATGTATTTATGGAAAATT:1 + chr2R 10865298 3' - blood 9 2 77.78 GGCCAAATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGACAGTCCAATTTCCAGAGTATCAGATACTAACAGGAAA:1 - chrX 22601902 3' - INE-1 101 1 55.48 GAGGAATTAAAAAAAAAAACAAAAAATAAAAAAGAAGAGGGTAAAACGCTGACGGGAGCAGGCATTCCGACACGTGTGTGGGTGGGCCAAAGGTTGAGCCCCATATTCCTTTTAGCCCCAAATATTTCGCTTTCTACATACATACG:1 - chr3R 18579975 3' + Osvaldo 1519 1 50.00 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATGAGTTATATATCGTAGTATTTAACAATTTCGACAACTAAGCATTTAAAGATGAATTTTTGAATAAACTTCAAACGAATTTGCGT:1 + chr2L 2698472 3' - I-element 35 1 54.11 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTACA:1 + chrX 4186707 3' + I-element 5275 1 69.86 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGTGCCCAGCATATACATACATATAC:2 + chrX 12526012 3' - roo 8716 2 53.42 TTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAATCTTG:1 + chrX 22900319 3' + Tc1 1555 1 71.23 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACTTACCTCATTCTATAATATTAAATAGCACTCCGTAGTTCGTTTACCTGTCGAAAACAACATCCGAATGCGAA:1 - chr3L 16212707 3' + Transpac 265 2 54.11 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATTTT:1 + chr2L 76157 3' + roo 9028 1 56.16 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTTAGCGGATGGCTCT:1 - chr2L 246004 3' - roo 8727 2 65.69 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCC:1 + chr3L 17133870 3' + jockey 4932 1 68.49 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTTTTAATGTTTTTTAAACTTTTGCCCTGCTCTCGCCAACGCTTGCCCTTAAATATTTAAGTATACTTTTAGG:1 - chr3L 13634150 3' - 297 11 2 78.62 GGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGTTAGCACCAATAAAATATTCCAATGTG:1 + chr2L 12319336 3' - copia 4933 2 62.07 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCAAGTCGTTTTTCTGCTGTATTTTGCGTGTGTATTTGTATTGGCCTTTTTGGCCGGCATAAAATATTTTTGAAATAAGACG:1 - chr3R 10266055 3' + 1360 3363 1 64.62 CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAGAAATTATGTGGACAGTGGTTTCCAAAGGCAATAACTTTATATACACT:1 - chr3L 15026657 3' - opus 7173 4 68.15 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCGAAGAAGGCCCAAAAAGAGCAAAGCTGCATATACACTG:1 - chrX 14951127 3' - P-element 82 1 28.97 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATA:1 - chr2L 22015937 3' + Tirant 8460 2 75.00 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGTTGTGTGTACCTTTCGCTTGTTGCAGACTCAGTTTT:1 - chr2L 246017 3' - roo 74 2 74.81 TGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATTCAATGCTCTTCCTTAATAATT:1 - chr2L 11574852 3' - Max-element 52 2 75.76 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCTGAGGTGAGTGTGCAGGATGACACCTGCT:1 + chr2L 16884935 3' + pogo 2069 1 62.33 AAATAATGAAAATAAAAAAAGAACCTAAGTTTATTCATAGAATAAATATTTAATAACTTTGCCATCAATTCTATATATATTCTATATATATTTTAATAATGAAAATAAAAAAAGAACCTAAGTTTATTCATAGAATAAATATTTAA:1 - chr2L 10747842 3' + Doc2-element 256 1 42.47 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCAAGTCGTTTTTCTGCTGTATTTTGCGTGTGTATTTGTATTGGCCTTTTTGGCCGGCATAAAATATTTTTGAAATAAGACGCGG:1 - chr3R 10266052 3' + 1360 3350 1 59.59 ACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGATATATTGGAATTCTAATTAACTACACATCTCCCGCCCGCCAGTGGCACATCCTTGGTCTCCTTGCCATTTTCC:1 - chr2L 18317459 3' + mdg1 7383 2 67.12 TTTTAGATTTCTTACGCTTTCAGCGTAAGCGAGCGGAAGAGATCAATTTTGACCGTCACCAAAATACTTATACCATAGTGCTGTTTGCGCTTAAGAAGTTCGACTGTTTTCATTCCACTTTTGAATTTTCCTCATTTTCTCGGCTG:1 + chr3R 18703527 3' + 1360 3281 1 51.37 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCGCAACCGCAACATTTCCCAGAGTTTCCTA:1 + chr3L 11400042 3' - Quasimodo 27 2 66.44 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCGCAACCGCAACATTTCCCAGAGTTT:1 + chr3L 11400038 3' - Quasimodo 31 2 63.70 GAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATACATTAACTTTTTTATTCGCTTTTAATGTTTTTG:1 - chrX 8893260 3' - P-element 2812 1 27.27 TGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCT:1 + chr3L 24208239 3' - Quasimodo 30 2 63.01 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGG:1 - chr3L 11336370 3' - blood 7092 2 79.85 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTCTTCGACTACAATTTGGGAATACAACAATTTGGAAGAAAAGGCGGTGTGGCATGGTAATCGTTCTATGA:1 - chr2L 3659057 3' - 412 45 2 51.43 TCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATAATGTGTAAATAGAATCAAAATTGTTGACTCGGGCAGGACAAAGTT:1 - chr2R 18482391 3' + hopper 1372 1 49.32 ATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAAATTCGTACTGCCCACTT:1 - chr2R 4193271 3' - 1360 2 2 76.26 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGATAATGTTAGTGAAATTAGAGACTTGAAAGAAATTAGAAGAAAAGGATCGGAATCGCAATTAAAAGCACAGAGGAATAATGAAAAAAGATATAATAATAAGAAAAAAGAAA:1 - chrX 3752368 3' + 1360 3380 2 78.08 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAGTCAAAATATGTTTGCAAC:1 - chr3L 6775342 3' - blood 56 2 54.79 AAGTGTGGGCGTGACAGTTTTGTGCGGCTTGTGGGCGAGGCATTATAGGTTATAGGTCGCACCTTCTAGCTTTTGTAGTTCCTGAGATCTCGACGGTCATACGGACATGGCGAGTATGTCAGAATGTCTATTGGATGATTTTGTTT:1 - chr2R 12953348 3' - INE-1 244 1 78.08 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAGTTGTAAGGCCCAGAACAGCCTGCTAAATGCGTTTTAATGTTTTTTAAACTTTTGCCCTGC:1 - chr3L 13634193 3' - 297 6613 2 57.72 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTTATAATGATTGAATCGACAAGAGCATTCATGAATGAAACGGCAGTTT:1 - chr3L 23042038 3' - pogo 67 1 67.81 GTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTATAAGGTTGGGATTCAGCATACAGATTCCAAAGACATAG:1 + chr2L 10986815 3' + R1A1-element 5293 1 61.54 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCCATTATCCTCCTCATGTCGCTGTGCGAAAATCTAAAACAGTGAAAAAGTCCGGGGTATGG:1 + chr3L 16562950 3' - roo 19 2 61.90 AGGGTCATGCAACTCACAGTTGGATCTACAATGATTTCAGATAAGGGGTATATAGTTACTAGTGAATCTAGCGGGACTCTCAATTTATTAAAATGCTATACACACATAAACGGAGGGGGCGTGGTCGCTGGGGAGGGGCGGCAGAT:1 + chr2L 17307336 3' - Cr1a 4165 1 56.85 TTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGACTTTGATGTCGGCGGATCAATGTGGATCAACTTTTTCATAAGCAGCACACGTAGACAAATT:1 - chr2R 23312335 3' - jockey 4840 1 57.53 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATATCTTAATATATTTGGGTAATAAATTAGATTTACTTTATATTAAGCATATGGTATGCAGTAGGCACTTTCCTTTTAGCATTT:1 - chr3R 25768752 3' + copia 5085 2 45.89 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTAGAACCCATTTGCTCAACAACATTACGCCACAATTCACATACACGATAAGTTTAATTCAAACTAAAACTTTTTATC:1 - chr3R 24279309 3' - roo 8709 2 53.42 AAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCGTTAGAGTGGTTTTAGCAAATCGATAGAAATTAACAAGACTAATACAAATGTGAAAAAATATCAACTTTCCTCTGCTCAAGTTTAATACTTTGATACACGAC:1 + chr3L 23772143 3' - Transib5 2946 1 75.34 TATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACGTTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCTCTGAAAATGTCGTACGCGATTCAATTATA:1 + chr3R 28272294 3' + Tirant 8421 2 76.71 ATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCAGGAGTGGATCTGGCTTAGCTTCGGATGCCTGACCCTGTTATTTACTTTTGT:1 - chr3R 29418631 3' - mdg3 5280 2 62.07 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAGCACATGACAACATGCACATGCACACAGGTCACACTCCACACAAGCGCAAT:1 - chr2R 6632514 3' - P-element 15 1 75.34 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGAATTATTTAT:1 + chr2R 23287519 3' - roo 8733 2 70.29 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTATGCTATTTAATAAATTAATTTTTACAAAAATTAAAAAAAACGCTAAATAGACATTCCTTTTTTATATATATATAATATTTGGTACCCGTATTTA:1 + chr3L 23124138 3' - pogo 3 1 77.69 CTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTCCCATAAGAGAAGGATACTATTACTTGCATGGCTGGACCCTAGATGCGAA:1 + chr3L 22648374 3' + Tabor 7252 2 64.38 ATGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTA:1 + chr3R 15022096 3' - Tabor 88 2 74.66 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTACTCTGTTATTTACTGTACTGTCAGTCATGTCAATGCACACAAAGCAAAAA:1 - chr3R 4581860 3' - 297 6626 2 59.02 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCAATATATAATAATAGAAGTAACCCTTTTCGGTTTGGCAAGTTCTGCAAC:1 + chr2L 5202571 3' - 297 6603 2 53.93 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACTTTTGCGGTCCACAAAGACCGTGTAATTACACAGCTAATTGCCAGCTGTTGTGGCATTTAAACTAG:1 + chr3R 27794913 3' + roo 386 2 69.86 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACC:1 - chr3R 21706012 3' - 297 6642 2 76.99 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTAATTTAATTAAAAAAGGACGCTTGAATCAATTTTTCGATTTTCTATCGCACCATGCTTTGATAAAAAGCTAGATAAATGTCATCACCCGTATT:1 + chrX 13786998 3' + pogo 2077 1 65.52 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAATCTCCATTTCGATAACTCCTGAACTCCCA:1 - chr2L 19068025 3' + pogo 2064 1 58.62 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACAACATATATGGTTCTGTAGAGCATA:1 + chr3L 12224710 3' - 412 68 2 62.76 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGGGACTGGGAACTTTTGCTGGTGACCATGTGCTCCTGATCCGATGTAAG:1 + chr3L 9907477 3' + jockey 4968 1 60.96 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGTTTTTTTTGCATATCAACACACGT:2 + chr3L 9571745 3' + jockey 4937 1 55.48 AGCGCCAATTAAGAGGGGAGAAGGTACTACCCTACAATCGATTCTTTCACATCTTGTGTGTTGATACTATGCATTGTATGTAATTCCAGATGCCGCAACAAGATACACAAGGAGCATGTGGACAAACACGACC:1 - chrX 16626751 3' + HMS-Beagle 6776 1 58.65 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAACTGTAGGGCCAATTAATTTCGTAAAATTAGTCAAT:1 - chr2L 3890134 3' - jockey 70 1 59.59 CACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTACTGCACTATCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAACAAAAATGCTGGGTCGACCTGGCAGCGTGAATAGCAAAAATGTCCATCAAAC:1 - chr3R 22196873 3' + F-element 475 1 76.03 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGGAGAAGGGAAATGTGCTGATCAAATAGTATTAGTAACACTAATAGTAATATTTAAAATCTTAAAATATT:2 - chr3R 20743960 3' + roo 9020 2 55.48 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCCTTTT:1 + chr3R 24476378 3' - 412 7109 2 56.55 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTGGCATTGAATTTATTTTCCACAGTCTGAG:1 - chr2R 12543057 3' - roo 8706 2 53.38 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAATACACACACGCACTCACTCGTTGTGGGTCATAAAATGTAG:1 - chr3R 28396580 3' - jockey 56 1 49.32 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAATCTAGTAGA:1 - chr2L 9485583 3' + 412 443 2 51.03 GATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGACCTCGCCCACCAAGAAGGCTCAATAGCTGGAAGAAATAGTTAGAAAACAACTAAAGATTAGCTTGAAAAATTCACACA:1 + chr3R 1267551 3' + X-element 4414 1 61.19 ACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATT:1 - chr3L 17707831 3' - Doc 85 1 69.18 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAGCCCCAATTTCGGCGG:1 - chr3R 21705960 3' - 297 20 2 62.90 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAGGATGCCATTTCAGGATAAGAGCCATGA:1 + chr3L 17133901 3' + jockey 4963 1 47.26 ATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATATGTACATATTGATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAAAAAAGTAGCAAATAACACAAAAAATAAACCAAAAGCAGTGTATGCGAAATTTGAAATGAA:1 + chrX 3449844 3' + Porto1 4356 1 60.27 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAAATAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGACCCCATTTCCAGTTTTGTATTTT:1 - chr2L 13927697 3' + roo 9036 1 56.30 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTAAGTCTTAAGTCGAAAAAAACTTCCAATGGCAACCGCTGATTAAGCTAATTTATCTTGTTTTTCGCTGCGTAATTGCAGA:1 + chrX 18409590 3' + jockey 4945 1 50.00 AGATCAACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATGTACTTTTTATAGTCCGAAACTTTTCAACGAACCTAGCATACCCTTTCACTCTACGAGTAACCCGGTCTACTATCGAGAGAAAGATTGCTTTGGCTTATGTATGTGTGG:1 + chrX 22789277 3' - INE-1 97 1 48.63 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAAT:1 + chr3R 16181250 3' + roo 9029 1 55.56 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTC:1 - chr2L 76064 3' - roo 8750 2 76.71 TTTGTATATGAGGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGCAATACAATTTTTATGCGAAAACTAATGTAAAAAAGTCG:1 + chr2L 2657309 3' + diver 6031 2 71.23 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAAT:1 + chr3L 19349989 3' - jockey 32 1 53.76 ATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTAGATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAACACACAGGGACGGATACGTTAGTCCGAATAGTGAC:2 - chr2L 22592560 3' + mdg1 7372 2 75.34 GTGCTAGAAGACGATTTTCGGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATTGTACATCTGAATCATAAAGCCATTAGGAGTTTAACAAAAACCCTGAAAATTTGATTTCATTGCCTTTCTTACAAATAAATCAACCA:1 - chr4 866320 3' - 1360 3196 1 52.05 ATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 + chr3L 5685500 3' + Doc 160 1 65.52 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGGTTGTAAGTATTTTTTAATATTTTCTCTCTGTAAATAACTTTTGGTTAAATGTGACTAGCTTATGTGTAAACTTAAAATAAA:2 - chr3R 25904140 3' + 412 7508 2 58.90 AAAAAATGGATTTTAGGAGAAACACAACTATTAACGATCTCCGAGTTTTTGAGATGCCAAAACAGTTGGTGGGTGTAGGTGTTTTTAGTTTGGTTACAGGAAGCAAGCAGTTAGATCGAGGAATTTCCACAAGCAGTCAT:1 - chrX 17095567 3' - 297 322 2 52.86 ATCATTATCATCTCTTGGCTCTTGCCCACCTTTTTTTTTCGTCCGTTTTTTTT:1 + chr2R 19038612 3' - BS3 1607 1 83.02 GCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTGGAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGATTTTCGGGCCGAAATAAACTTGAAAAAAATTAAGAACATAAATAAGATATAAGATACAACTGCTAAAG:1 - chr3L 10156272 3' - 1360 3283 1 65.75 GGAACCATAGGTCCATATGGGTTTCAAAACGGAGTTATATAAGAGGACATTGTACTCCAGTCTTAGGGGAGAGCGAACGTTTATAAGCCAGTGTAGCGTTAGATTCTGCGAAGATATCAATATGAGAGTGTTCATAGCTCTAGCGG:1 - chr3R 27019703 3' - Doc3-element 4314 1 65.75 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACTCATTTCTTTCAGTGCCATTTACAATGTACACAAACAAGCACGTTACTAAAA:1 - chr2L 2698362 3' + I-element 5285 1 71.23 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGTTCGCCGTGAGAGATGCGATTTTTTTTCAGTGAACTGATTTATTTTCGAAAACATCCACACAAGCATAATGCACTTGACACTTGTGTGGGTTAAAAGTTGA:1 + chrX 958093 3' + roo 9054 2 60.96 GTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAAGAAAAAAAATAAGCGGCCACGGGCGACCCCTGGAAATACTGCAGGTCCAAACGACCAGGAAATCGAAGACGCCCGTTGTCG:1 - chr2L 22016038 3' + invader2 276 1 62.86 AATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTAAGGAACAATAAGTTCTATTTGTCAGTTATAATTGAGC:1 - chr3L 15099521 3' + G4 3811 1 75.74 ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAGAAAAACACAAAAACAATTAAGAATATTAATAGACACAGGAGCCACATCTCGCTATATCAAAAAGGGGATCTATGAAAATAAAGAAGAATT:1 + chr2L 22780970 3' - HMS-Beagle2 6911 2 66.44 AGGGCATGTTTTGTCAAATTTACAATGCATGTCACTGGCATGCCTATAAAAGAGCTGTTCGTTGTAGAGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTTAAACAAAAATTCGAGAGATACTGCACTGTTTGTATGTTATAAACAAGCGTGGTTGCC:1 - chr3R 7473745 3' - 1360 206 1 76.71 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCAGCTGTCAAGGTCGTTT:2 + chr3R 16181278 3' + roo 392 2 73.97 TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGGGGTTGAAGTGGTACTGACACGTAACTATTTATTTAATTTATTTGTTATACGTGTA:1 + chr2L 7825267 3' - I-element 86 1 73.97 CTTTTTCTTTTTACTTTTTTTTTATATATTTTCATTAAGGGATTGTGACCCATTATAACTGAGTAAATTCATCTTGATTTAAAGGTGTGGCTTGAATTTAATCAT:1 + chr2R 17618468 3' - Doc2-element 235 1 87.62 AGTGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAAATGCTATTATAATATTTATACTTACACAAATAAATATTGTCTAAAACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCGGTAAGATGGCTGA:1 - chrX 22576283 3' + Burdock 6294 2 54.11 AGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAAAATTCGTGGCAAGCTTTTGACGAAGCAGCGCATTAGCAACT:1 + chr2L 18280019 3' + gypsy5 7342 2 76.74 TAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTACAGCTC:1 + chrX 4186711 3' + I-element 5289 1 64.71 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCATTGTTGTTGCTGCCGAGCGGAATTGTGTGCGGGTATATAGGTGGCACCCGC:1 - chr2L 14095557 3' + pogo 2065 1 52.85 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAGATATCAGGGTTCAAGAAAAAGCTTACCTAAGGAGGCGATAAAGTTTAAGGAGTTTACC:1 + chr3R 17656503 3' - mdg3 31 2 61.38 GAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTCCTGACATGAG:1 - chr2R 8158753 3' - Juan 64 1 52.05 GTTTTGAGTGTTGTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAAATTTGTTTTTTATTTCATTTCGTTTATTTAGAATGTGCTGTTTAATGCTGCATGGCCCGAAAATCGGTACACGAAAAACACTGTGGCCCCTCCTTTCACATATGTAC:1 - chr2R 3555341 3' - Porto1 4197 1 56.16 GGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTG:1 + chr2L 18279968 3' + gypsy5 357 2 62.10 CATCAGTGTAAAAACTAACCACAGCGAATAAACATACGCCCGGTCGCGCCCGCGCAATTACGAAAAGCCTGGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTGTCTTTTCAGCATATTTATATTAAGCCATTACTCAACTTGATTCA:1 - chr3L 8900108 3' + GATE 8367 2 76.81 AAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTTACTCTTTGCCATCTGCTCATTTCGCATTTTTTTTTTATCCAGATACTAATGCAACAAAAGCTTTGTGTCGTTTCCTTG:1 + chr3L 7992030 3' + P-element 33 1 56.85 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATTTAATATT:1 + chr2L 14201492 3' - roo 40 2 52.74 TGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTACGACTAC:1 - chr3R 17897124 3' - hopper 73 1 66.44 ATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAATACCCAAATCAATCTGAGCTCCAAGTCTACGAACCCCATTTGGAACCCACGATGACCGGGCAGCCGGTGTGCAGGGAACCCATATGATC:1 + chr3R 30510431 3' - gypsy12 19 2 69.23 ATTTGTTCTTGATAACGTGTTATTACCTACTTTTATTTCATTCATAAATTTGTTAAACATGGGGGAAACAAGTTTGAAACTGAAATTTATTTTACTAAACTGCTTGGCGTTGATCTAATTAGACAATTCATTAAAAATACAGCCAT:1 + chr2L 20434280 3' + Tc1-2 298 1 53.42 TTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAACAAAAAAGCGTAAGAGGCGAGACTTGCAACGACAACAACGTGGCATACTTTTCGGGGCATGTGG:1 - chr2L 3395678 3' - jockey 4722 1 53.96 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTATGCTATTTAATAAATTAATTTTTACAAAAATTAAAAAAAACGCTAAATAGACATTCCTTTTTTAT:1 + chr3L 23124109 3' - pogo 47 1 59.31 CCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGTTCAGCCTTGATAGATCCCCGTATGCCATAGTTGCTTATAGTCAGTTATGCTACCCGTCAGTTCTGAATCCTTCAGAGGATGGTGTGTTGAATCAATCAC:1 + chrX 11471576 3' - jockey 4694 1 61.38 CAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTCAGCTCAACCGACGAGGGGTGAAACTTAATCGTATGTGTGGGTGGGTGGAAAAGAGGCAACAGTTTTTCCTGATTTTTGTCGCTGGGTGCTACGCAAGGGGCCGTCATCAAATTCA:1 - chr3R 15711716 3' + diver 218 1 77.40 ACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTCCTGACAT:1 - chr2R 8158756 3' - Juan 67 1 54.11 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCATGAGACATGTAAAAGTTAGTCCTACAAGTCGATTCCTTTATATCACCCCGACACGCGCCGATATAATAATTTTGATGACAGTGTGGC:1 + chr2R 5737256 3' + 1360 3372 1 72.60 ATTGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAAATGTATTTTAATCGAAAAC:1 - chr3L 24934247 3' - HMS-Beagle2 11 2 78.08 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGCTACGCATATGCACTTTGTTGTGTATTGCATATGACGCCC:1 - chr3R 19531245 3' - hobo 72 1 69.34 GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTG:1 + chr3L 22978603 3' - 1360 67 1 78.05 TTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTATTTTATAGAGTGTTAGCCATGGCCGAGGGTTTCGACCTGTTTTGCATGCCTGGGAGTGTGACAAGTGTGCCATGTTGCAGATAATTGCTGGCTGCGTGTGTGCGTGTGAC:1 + chr2R 20710167 3' - mdg1 7067 8 69.86 AGATGCGTTCAGTGTTGGTGCACGCATGTTTATGGAAGATGGTTTCAGGAGAGTCCGTGAAACCTGAGGTTGATACTGGAGGTGCTTGGCAATCCCAATGGGAAATGGAAAATGGGTTTTGGGAATGGGACTGGGAAC:1 + chr3L 2802562 3' + 1731 492 1 71.01 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGCAGACGAACAAAAACTCATATTGCTGTTGT:1 - chr3R 10684690 3' + roo 391 2 72.41 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGCGCATA:1 + chr2L 17240297 3' - hopper 54 1 69.92 AATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTGGTTCCGAACGTACCACGGTGCCCCACTGATGGTTTTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTAAGATGTCAAAATATGTCACCATGGAGAACTCATGTAAGTTTCACGATGAATATGCCA:1 - chr2R 13445523 3' - F-element 4387 1 69.18 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATCAGTCAGATACAGGAGGCAAAA:1 - chr3L 17175081 3' - 412 26 2 66.44 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGCTTTTGTTGTTTGGAATTGAAATTGGAAGGAAGGGAAGCTTGACCAGGAAAAGCACGAATTTCGGGGTGAAGGCACTCCGAAAGAATAACAGTCAAATGATTAAGTAAACA:1 - chr2L 9237444 3' - blood 7021 2 75.86 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGT:1 + chr2L 76139 3' + roo 9010 2 65.75 TGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCCAAAATATTTG:1 - chr3R 11750160 3' + Tabor 7275 2 51.37 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCCACTCACCTAGGTACAATGTGCAGTAGCGCT:1 + chr2R 5923048 3' - jockey 4709 1 55.80 CTACACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACGAGCAAAAGTAAAGCCGACACTTTCCTGACTGGCTGG:1 + chr2L 3428528 3' + G2 3074 1 48.44 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCC:1 + chr2R 558165 3' + copia 211 2 69.18 AATTAGCATCGATATAGAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTG:1 + chr2R 8641602 3' - diver 58 2 54.48 AAGAGGGAGCGGAGAGCGGGGGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGTAGTGCTACATATCAAGATAATAATAAATATTGATTCCAGTTGCCATATG:1 + chr2R 10916676 3' - GATE 36 2 57.58 CCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTGGGCTGCTTCCTTGAACTTGTATTTAGCGCATACATCAACTTCTTTTGGTTTTTGCTGTTTGTTGATTTTCTTGCACATTG:1 - chr3R 7063590 3' - invader1 3576 1 58.90 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTATATTAATATACAT:1 - chr2R 641847 3' + opus 7450 2 54.11 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAGGTTTTCCTTCTTTCCGTTTTTGCTCCTTTCTTTTTTTCTTCCCTTTATATATATATATATATATATATATGTATTTCTATCTGCGTGTGTTTGCGTTGTATTT:1 - chr3L 13563258 3' - roo 17 2 72.60 TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATCTAACCGTATGTGTGTGGGTGTCAACGCCCCTCTGTGGGCGTGGCG:1 - chr2L 17240187 3' + hopper 1386 1 64.03 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTACCG:1 + chr3L 11400014 3' - Quasimodo 45 2 55.15 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAAATATAACGTTAACAATTTC:1 - chr3L 24228587 3' + copia 220 1 64.38 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATCAACTTCCGCCAAGTTCAATCAAATCCGGAAACCGGAACTACATATACAGACTGGCTAAATTTCAGTTTACGCAATAGAATGC:1 - chr3R 29732994 3' + opus 7475 2 64.75 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACTCAATAAAACTGTGAACCCTCTCTTATTGAATTTTCCATAGATATGTAGAAATTATTGCTAGTCAATTGCCACTGTGCTTG:1 - chr2L 1259888 3' + Burdock 6354 2 55.48 ATTGACTCGGCTATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCG:1 + chr2R 3333935 3' - INE-1 95 1 69.57 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGAATTGTGGTCAATCTAATGAAGCACAGAGACTCGCGAAAACGGTTGAACTAGGACATTCAAGCACCCAATATCGATAT:1 + chr3L 23042156 3' + pogo 2060 1 54.79 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATCCCGTTCACTGCCTGAGCTCCATGAGCAGCAGCTGTTGATCCCGCAGAGTGGACGGCATCTACTCCAGATCCAGTTGCTCCTAGCACTCCATGGGCAGCC:1 + chr2L 10697371 3' + mdg1 405 2 67.14 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTTAATTTATGATGGCAGTTTGTTATGCCGCGCCCGTCACAACAAAAACAAACAGCTTATAGCTAGAGGACGCAAAAAGTATATATACTAT:1 - chr2L 12353898 3' - jockey 4701 1 58.90 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTG:1 - chr3L 17175113 3' - 412 7110 2 55.17 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATATGATTTATGCGCTGTTTCTAATTCAATTTAGACCCGTTTGTTTGCTTTGGAGGTAGAAGGAAATGGAAGCAAA:1 + chr3R 23010125 3' - I-element 45 1 54.79 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAACATTTGGAAATTATTGTATAATTTTTTAAAGTCTCTTAATAGCAGTTAAGAA:1 - chr3R 13631357 3' - 297 6624 2 62.60 CGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACGCAGTAAGTCCGA:2 + chr2R 4313066 3' + gypsy 7401 2 43.15 AGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCG:1 + chrX 6138702 3' - opus 7191 4 76.98 AAAAAAAACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCTCTC:1 - chr3L 24565350 3' - hopper 8 2 52.21 CATTGCCTTATTAATTTTTTACACTACTCCAAGACCCTGCG:1 - chr2R 1410834 3' - 1360 436 1 58.54 CTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTTATTTTGGTTAAGGGTAACTGAACATTAAATATCAGGGTTCAAGAAAAAGCTTACCTAA:1 + chr3R 17656475 3' - mdg3 5312 2 56.85 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGAAAGCACTATCGTAGAGATGGGGCGCCAGTGCTTGCGATAGCCCAATCGATATATCGTATATCAGCTGGTGTGATGTTAAATCCTATTATCAGC:1 + chrX 14826237 3' - P-element 12 1 72.59 GAGCTATTGATTCCTCGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTAAATTTAGCAACCCACACTGAAATTGTACCAGTTTCATTAGAATTC:1 - chr2L 2532949 3' + transib2 2383 1 68.49 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATATGATACAAGGAACCCATAAATTCGAAAGGAGCACGCTTGCTTCTAGATCTAGACTGTATCATAAACAATTTATTGTTTTCTTCAAGTT:1 - chr3R 19448486 3' + roo 8984 2 68.49 ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAAAT:1 - chr3L 24934264 3' - HMS-Beagle2 6911 2 66.44 ATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGACATAGACTATAGAAATTGACACCTCAAAACCATTTCGAATTGTGCTAATCATAATCTTGCGGGTAG:1 - chr2L 16089579 3' + 3S18 6060 2 50.37 GACTTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTTACATATATCTTTGCTTTGTGATGTAGTA:1 + chrX 21783574 3' - gypsy4 6635 2 96.52 CCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCA:1 - chr3R 20175717 3' - hopper 83 1 75.34 AGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGAC:1 - chr2R 11763603 3' - Tabor 75 2 70.50 AAGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCCCTAGTGGTCCCTTAAGCACCCTACGTCCGGAGAAACATCAGCCGAGTCATGTGCTAATTAATCGTTGATGAAGCTAGGAGTTATGTGGCCCTATTTGTCAATTGGCCAACACTATACCG:1 - chr3R 6292978 3' - gypsy12 9891 3 54.79 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACGCAAAAACGTGCTGAGCAATAATCTAAAACGCAATAGCTAAAGAGAGAGAGGTGCTGTATGTGTGTG:1 - chrX 4701118 3' + P-element 2847 1 54.48 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGGCCTGCTCCGATTCGGAATCATTAAATAGACGACAGGCGAAATCGAAATTGCAGTGCCAAAGTTGCCGCCTGCTGT:1 - chr2L 11951498 3' - pogo 11 1 73.91 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAACCATGTACCACGTAACTATCG:1 - chr3L 13868630 3' - 412 7115 2 61.64 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCCGTAAGCCTGCCTAGTGATAATTGCAATTAAATTCAGTCC:1 + chr2L 2030079 3' + 412 7468 2 69.86 TAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCG:1 - chr3L 11336368 3' - blood 91 2 80.14 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAA:1 + chr2R 10695876 3' + roo 348 2 61.64 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGAGATTGAGATTGTTTTGATTCAAGAACTTATATTGCTTATATAGCAGGT:1 - chrX 19536906 3' - roo 73 2 69.86 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCAC:1 - chr2L 4173994 3' - roo 8755 2 80.82 TTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAAATTGATTTCTTGACGTCTACGCGCTATCCATCAAAATGGGACTTGCCTTTAAAGTTTTTATGAAATTTCTTTAATGGTTTTGTGCCTTTTCTTTCGTCAT:1 - chr3R 15924533 3' + Quasimodo 7354 2 74.66 CAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATA:1 - chr3R 27859193 3' + hopper 1333 1 73.97 AAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATCGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGACTTTAATTCACTCCAATAC:1 - chr3L 16973309 3' + S-element 171 2 76.03 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCTACTGCCCCCGAAAAGAAAATATACAAAACAATAAATTGAAAACATTTAC:1 - chr3L 20712969 3' + roo 9002 2 69.18 TAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTCAGGATACATGCCATTCAGTT:1 + chrX 1018184 3' - 1360 214 1 69.86 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATCAGTCAGGTACAGGAGGCA:1 - chr3L 17175084 3' - 412 29 2 64.38 ACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATC:1 - chrX 1103638 3' - pogo 87 1 78.08 CGAGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTAACGGATATAAAAGAGTGCAAATTATGAACCAGTTCTTATGAAAATAACTTAATATTTTGCAATCATAATACTATAGCTATTTCTTTCTCTATTTTTATTAAATTTT:1 + chr3R 4093912 3' - INE-1 559 1 76.71 AGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGACACGTGGTATAAGTTCTGGGGCGCGTATCTCTGGCTACCTGGCTGTCGTAACATTTAAT:1 + chr2L 18500619 3' + hopper 1220 1 60.71 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCCGTAAGCCTGCCTAGTGATAATTGCAATTAAATTCAGTCCCTGGCTA:1 + chr2L 2030086 3' + 412 7475 2 65.07 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAGTCACCGCTTTTTAAAATAAAACCCAAACCGGAGCCCATCTGTATCTAAATTTCTATAGCATAGTAATGCGAGGATAATGCCCAAGATATACAAATTCAAATAACAGTCTTAACATG:1 - chr3R 26191549 3' - hobo 2 1 77.40 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTTGATTGCCCCACTAAGAGATGT:1 - chr2R 5214918 3' - F-element 21 1 71.97 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATCAAGTTGTAGAGCGAACCTCGCATTTGCGCCTCATGAACCGCTCACGCAACGTGTCGC:1 - chrX 21196693 3' + roo 9010 2 58.22 GATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGT:1 + chrX 1018160 3' - 1360 235 1 69.18 AGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGCTATTGATGCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGCCGGAAACGCTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATTTAGCATATATAAATATATCAACTTTTATCAGTTAGT:1 + chrX 19810257 3' - INE-1 133 1 76.71 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGT:1 - chr3L 22052747 3' + mdg1 7402 2 56.85 AGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGGTTTTAGAAAAAGCTTTCTCATTAAAACTAATGACAATAAAAAGATGTAATAGTTGTTCATATATCGTAAAGGAC:1 + chr3L 16212843 3' - Transpac 4961 2 55.17 GAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTCATAGAAACGATTAGT:1 - chr2R 961116 3' + transib2 2678 1 67.12 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAAATGCCTAGGAAA:1 - chr3L 17707798 3' - Doc 52 1 50.00 GGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCATCTGTACGTATAATACGTTTATCTGCTTTGTTCCATTACATTCAGTTTTTCGATTTTAAGGACGGTAATCAACGAGTTGTAGCAAGCACTTTTTAATAAAG:1 + chrX 16361650 3' - Tc1 30 1 72.60 AGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAGTGTAGTTCCTAAGTTCGAGAAATAATCTAAAGTCTAGCTTTAATTTGCCGAGATTTAGATTAGAAGTTCGATTTGAACGATGTACAAATTTCCAGTTTAGTGAATC:1 - chrX 5074269 3' - Tc1-2 21 1 67.81 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTGGAGTATAAAGAGGGGTATCCAGTTGGGGAACTGGGGATTTGCGTGCGCACGCGTACAGCGCCAAAACGAATTAAATGTGATGCACCAGCAAATGATA:1 - chr2L 16458544 3' - roo 8685 2 69.66 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTGAATAAATGAATAATAATGTGACCAATGTAACGTTTTCGATAACGTATCGTACATC:1 - chrX 16787078 3' + pogo 2040 1 62.33 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGC:1 + chr2L 9472102 3' + roo 9031 1 55.71 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCCGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTAC:1 + chr2L 2276768 3' - F-element 55 1 66.35 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATTTTACGGCTTCATTTCGGCAAACCCAAGCCAGAAAAGA:1 + chr2L 9198356 3' - S-element 74 1 77.30 GTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAACTTCTGTCCAACCGTACATTGTAAGTTTATGCTTAAATA:1 - chr3L 6563200 3' + Stalker4 7208 4 72.60 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGTCTTCGACTACAATTTGGGAATACAACAATTTGGAAGAAAAGGCG:1 - chr2L 3659082 3' - 412 65 2 65.93 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGATATATTGGAATTCTAATTAACTACACATCTCCCGCCCGCCAGTGGCACATCCTTGGTCTCCTTGCCATTTTCCTAGTCCTGTTAGTCCTTCTGCTCCA:1 - chr2L 18317434 3' + mdg1 7411 2 48.95 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAATAAAAATTGCAAATTTATACATACGTACGCGCTTTCTAAACACAATAAAGTAACAAATGTCTTAGGATACATACATTTTG:1 + chr3L 20713081 3' - roo 16 2 68.60 GCTTTTATAGATTCTGAGATCTTGACTTTCATAAGGACAGACAGACGGACAGGGCTAGATCGACTCGCCTATTGATCCTGATCCTGATCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAG:1 + chr3L 25245594 3' - INE-1 149 1 65.00 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGATACTTTTCGGATATGCGACAAAATCGGACGAAAACTGCTTTTTCAATTTCGTGGTTAAAAGGCTAAC:1 + chr3R 6388811 3' - jockey 64 1 54.11 AACAAAAAAAAAAAGGAAAAGAAAATGAAACGTATTACCTTAATGAAAACAAGGACCAGGAAACATTCCA:1 - chr2L 8502786 3' + Doc2-element 248 1 84.29 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCATTATATAAATATACAATACATATGTGCTGGACCATTCTGTGTAACAA:1 + chr2R 12787893 3' - 297 9 2 61.33 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATA:3 + chr3L 19349990 3' - jockey 85 1 64.38 CGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAG:1 - chr3R 13582219 3' - BS 5067 1 65.75 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAAATGCCTAGGAAAAGTTTATTAAAAGCATA:1 - chr3L 17707781 3' - Doc 35 1 61.64 AGGTGGCATATATAGGTTTATTACAGCTCGCTCTCCATTTTTTTTTTGGGAGATCAACGAACTGCTTTGAAATGCTTTGCACCGATGACGTATCGGCTATTTGCAATTTCACATAGTTGC:1 + chr2L 9237627 3' + blood 374 2 78.33 GGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAATTTTTTCTATAGATCTCAAACGGATGGAAATTAAACTCGAATCAAACACCTATACCAAAC:1 - chr3L 234457 3' + roo 8931 2 58.90 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTATGTTCCTTATTAAACACATTTCAACGGGTATATAAGTTTTGTTAAGGGGTAACTGGAAGCCGGACCCATTTAGCTT:1 + chr2L 8542067 3' - pogo 27 1 47.01 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACAC:1 - chr3R 30634925 3' + roo 9029 1 53.08 GTTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCGCCGCCATATTACCCACCGTTCTCCTTTCACCCTCTGAGTATATGACGAACTGAGTCTCGAAATCTTGGAAAACCAGCCACAGGATGTAGGACACATGACAGACCAGATGGACT:1 - chr3L 25354484 3' + GATE 403 1 58.90 TCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATCAAGTTGTAGAGCGAACCTCGCATTTGCGCCTCATGAACCGTTCACGCAACGTGTCGCGTTGTAAATAGAATTTGTGCATAATAAAATTATGCATGCATAAAGCAG:1 - chrX 21196645 3' + roo 9058 1 74.66 GGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATTGACAAAATCGATAAAAACCTTGAAATATCTTTGCGTATTTCAATAATGACACTTTGCATTCG:1 - chrX 9011326 3' - I-element 4908 1 56.85 AGATCGACTCGGCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAAAAATATACTGACAGAATTTATAGACT:1 - chr2R 5296808 3' - INE-1 97 1 70.55 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTGAAAATAGTATTTGAACTTTTTCTAAATTTTTTTCATTCCATATATTTTTCATA:1 + chr2L 12658577 3' - Quasimodo 45 2 59.40 GACGACAGTATCGCAAGACGCTGCGATCAATCGTTAAATAATTTACACACAAAAGTGCACCGAAATTAGTTAAACTGTTTTTTGAGTTCACGATAAAGAAATGTTACCGAACGTCAGGGTCACCAAATGTTGAGGCAATGAGCTTT:1 + chr3L 25996039 3' + Gypsy6A_LTR 378 1 80.82 TCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACG:1 + chr3R 5208206 3' - hopper 84 1 75.34 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCGATGTGGAACG:1 + chr3R 26520473 3' - FB 55 1 56.03 AAAATCCAAATTGATGATCCGGCAAGATATTGCCTTGTGTTATAATGTCGTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATAGTAAATAATTAAATTGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGAATTC:1 + chr2L 21718528 3' - Helena 280 1 61.64 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTA:1 - chr3L 22052765 3' + mdg1 7411 2 62.18 TATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTAGGTTCACAGAGTGGCAGTTGACACAATCAAAAAATAGGCAAATCAAAATTAATACT:1 - chr3L 23152030 3' + copia 197 2 60.71 TATCACATACACGTTACTCAGCTATTGTGAATGCGAACGCGATATTTCATCATTTCATTTTCGGGGTTATATTGGGTGATATTGGGTGAGTGTTACTTATGCAAAAGTAAATTATCGACTAAATAAGAGAAATGGAAGAAATGA:1 + chr3L 25971494 3' - INE-1 546 1 64.58 ATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTGTAAATGTGGCCGCTTGGCACGCAGCAAACTGTCTAATGTATCTCGCAGATGCATGGACGGC:1 + chr2R 11609395 3' - mdg3 121 2 50.79 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGCATGGATGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCCGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATC:1 + chrX 21994018 3' - 297 10 2 73.33 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCAGTAGCCACATGAAGCTATATAGTTGGCTTACACCATTGGCTGCTTGATCGCCTTG:1 - chr2L 6870665 3' + hopper 1388 1 57.27 TCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTAGATCATTCTCTCTTGTTTCCTCACAAATTTCTATTTACAAAATATTTAAAAAAATGTTGAGCAGAAATTCAGTGCGAAGGACCAGAGCACGTAGGCCAC:1 + chr2R 5792807 3' + INE-1 538 1 71.92 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTCTGATAAGT:1 - chr3R 20175665 3' - hopper 31 1 63.01 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCATAAATATGCAGCTGTCAAGG:1 + chr3R 16181272 3' + roo 386 2 69.86 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCAT:1 - chr2L 9485596 3' + 412 429 2 58.90 CAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCTATGTTTTTCCATCTCCATATCGATTCGCTATTATTTTGCTCGCCACTGTGTATCTTTGAGGTGCTTCGGCATCCGTTGCTGTGG:1 + chr3R 6413816 3' - FB 17 1 70.40 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATACTCAATAAAACTGTGAACCCTCTCTTATTGAATTTTCCATAGATATGTAGAAATTATTGCTAGTCAATTGCCACTGTGCTTGATAAACTGCCAAGTA:1 - chr2L 1259873 3' + Burdock 6369 2 65.75 GATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGGTGAGATTCAGCAACCAGATTCTAGAGAAAATGACGCAGCGCACCCATGTTGCCACGCCCCCGAACTGATCACGCCCACACTTTGGAACAGTTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTCC:1 - chr4 809185 3' + INE-1 150 1 59.59 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTGCACATAACTCAGTTTTGTAGAGCTACCAAAAAATGTTCTA:1 + chr2L 5601633 3' - mdg3 81 2 70.55 TGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAG:1 + chr3L 22642893 3' - hobo 61 1 79.09 ACATAATACAAGCCTGTAGATTGATTATCCATTTCAAATTTTATTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAAGTTCTAACACTTTAAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAATGCAGCCACGTGGTGTAGTATTGTGATTACAAAACGCCCG:1 + chrX 3466966 3' + hopper2 1338 1 78.08 GCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTGCATATCATTTCGACCAAAGATGACTTATTAATACGAAATTCAGCAATCGCAAGAT:1 + chr2R 8158824 3' + Juan 4176 1 50.81 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAATTACATTGTTGCATGACACAAATAGTGTTGCCTACAACAAGGGGAACAACAATTGCTGAGACATGGGGGCAAGCTAAAGG:2 + chr2L 13704808 3' - hopper 36 1 59.59 GTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAATTATAGTAGCTGCATGGTTTTGACTCCTCAAGGATCTATCCCCCAGTTCGCAGCGCGTGTGACAGTCACTTAA:1 - chr2L 17723263 3' + blood 31 2 51.75 ATGGCGCTTTCCATCAGGAAGAAGAGACTCCTGGGCTTGAACCTTGGCTGGCGGTAGAGCTCTACTAACTGGGGAGCTCTACCCACTCCACTACC:1 - chr2L 22298922 3' + baggins 5257 1 58.95 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCAC:1 + chr3L 12224688 3' - 412 7117 2 73.11 TGTGCATAAAAATCGTATGGCGTTAAGCATCTTGTTATTCATAATTCATATTAAAATATGACAGATTTAAAGGAAATTTGACTTTGAATTTGTGAGCCTGCTATCTACAACTACATACATATAACAATAATTATGACCATTCAAAA:1 + chrX 1138685 3' - 1360 30 1 77.40 TGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGACCG:2 + chr3L 10144731 3' - blood 7094 2 79.45 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAACAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTCCTTCGAAACACAAATACAAGGTTCCTTGACATCGAAGATCTAAGAAATAAAGTTTAAATTTA:1 + chr2L 13250490 3' - opus 23 2 69.86 ATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATACATCTTTTAAAAAAATCCACCTGAAAGAGCTGTTAAATAAAAAAGCTTGCAAATAAA:1 + chr3L 8855967 3' + rover 288 2 60.96 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCGGGTG:1 - chrX 1287795 3' - jockey 4809 1 52.99 AGTGTCTTTGGTTTTACATTGTCCGTGTGTGTGGCCGAGAAATAAATACAATAAATTAGTTTAAACAGAGCATCACGACTTTAGCACCGTTTACAACATCAGAAGTGGTTTAA:1 - chr2R 2906082 3' + Tc3 322 1 46.02 AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAATCCAATTGAGTAACAGAATTTGATAATTGTTTTTTCTCTGAATCAAGAAAAGGGTATAAT:1 - chr2L 2052677 3' + blood 7329 1 58.22 ATCGATATCCCACAAAAATTATGACATTTTGCCTTCGCATTCACCCTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGCACTCGACACGTGCCTGTGTGTGCGTGTTTGTGTGCTCGCGAACTCTAGAACGAAACTAGCCTGAAAGC:1 + chr2R 11614125 3' + INE-1 504 1 58.90 ATGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGCTACAATGTGCCAGAGCTGATTGAGCATATTGATTAGGGGTGGTTGCATGTCATACTTTTT:1 - chr3R 28601380 3' - ZAM 177 2 58.22 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTATATTATAATTTATGGCGCGTATTCCGTTAAATCTACGAGACAC:1 + chr3R 12568933 3' - hobo 65 1 67.91 CATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCAGAACGCGCATGCACTGAAAGAAACTGGAATATGAGTTTCGAAGAGAAAAGGTTGCCATTTTAAATAACTTCTATAATTTGCAAAGTTTTTCAAGAACAAAAC:1 - chrX 6429799 3' + gypsy4 187 2 66.44 TCTGATAATCGGGTAACTCGACTATAGCACTCTCTTTTGCATTAGTATGTTTCCAAGCCAATGTGACAATGGTAACATTAAACATTTTGAAAAATGTTTAAATAAACCGCATAAAAAGTGTAACGCTTG:1 - chr3L 27567 3' + INE-1 561 1 65.89 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGACGACTGCTTGCAATTAGAGTTGGCAAAT:1 - chr2R 12787793 3' + 297 348 2 55.48 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGGGAGCTGTTAAAACCCTGGTTTCCAGGCTTATGCA:1 + chr2R 6632685 3' + P-element 2853 1 58.90 GAGGCATTGCGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGCATGGTTATTTCCCCCTGTCTACAATTGATTGGCAGTCGCGTTGAGTGGCGACTCCATATGAGGCAGTG:1 + chr2L 12415002 3' + pogo 2077 1 62.50 AACAAAGAGTGCAATTATATTTACACGCGAGAGGTATATTTTGCCGTTTACCTTTTCAATTATCCTTCTGATTAGAAAGGATATCACAAAATAGTTGTTTTTGATCATTATGTGGTTTTTTTTTTATATTTATAAGCTTTATTACT:1 - chr2R 5497487 3' + Tc1-2 99 1 50.68 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAATTACGTGGGAAAAAAGGCGAATGAACAAACGAGCGGGTGCCATCCAGGGACCAAAGCCAGCCAGGACCACGGCCAGGAC:1 - chr3R 13607607 3' + I-element 5346 1 67.52 GTTTTTTTTTTTAATTTTTTTTTGGGCGCCTGTTAATTGCAAAGAGAGGTTTGGCTGCACGGCCCAGTTAATTCAA:1 + chrX 11394041 3' - Doc 4694 9 86.84 AGCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGTAAAAAAAA:1 + chr2R 3104470 3' + Gypsy6A_LTR 341 1 69.86 TCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGT:1 - chr2R 11489186 3' + mdg1 7387 2 68.49 CGCAAGTACAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATA:1 + chrX 22824249 3' + Gypsy12A_LTR 2229 1 46.58 GCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTAAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGTCTTCTGAAATGCGTTCGGTGTGATAGGGG:1 - chr2R 5260668 3' + 1360 3270 1 78.10 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTGTGTTGTGCTACCCCCACACCCAGGTAAGGGTTAAAGGGTAG:1 + chr3R 30635010 3' - roo 8717 2 66.67 ATTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATG:1 - chr3L 23456281 3' + Gypsy6A_LTR 245 1 76.03 CGGTAGATAAGAAAGATGATGACCAGGGTTATTGAGGCTGTGGAGGAGACAGAGCAAAAGATCCAGGTGTTGCCTGATGAGACGGCCGACTAACACTGGACCGCGTGAGTGGCGTGTTGTGCTGCCTACTTACA:1 - chr2R 10002589 3' - gypsy10 5558 1 58.96 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTTCTTTGATTCGAAGCGCTTGAACTTATCGCC:1 - chr2R 7953670 3' + roo 326 2 76.43 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTTTTTTAAGATTTTTATTGATTATAGATTGTTTATATTCTGCAGTTG:2 - chrX 22725550 3' - roo 8740 2 71.23 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGGGTAATTTTTTTTTTTAGTTGCTAATTTATTGTTTTCAACGCTG:1 - chr2L 3466009 3' + P-element 2877 2 61.25 CGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTGGCCAGCTCGATTC:1 - chr2L 22601730 3' - gypsy8 308 1 78.10 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTTTTCACAACGTTGAGGGTATAGAATCATTAATCGAGTTGGCAGCACCGTGTAGT:1 - chr2L 6318897 3' + pogo 2037 1 64.38 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGGAATTTTGCATAATGGTCTTGTCTCTGCCGACTTAATCTCATGACGATCGTTTTGTCGAACGCCCCCAGTCGCAAAACCCC:1 + chrX 6481386 3' - hobo 24 1 63.08 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGTATTTATAAGCTTTCATTTCTTTCCGTGTGATGCGGTTTCTGTATGTTTTGGTTGAATGAGTTTAAATGCGGT:1 + chr3L 13868744 3' + 412 7499 2 51.37 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGC:2 + chr3L 25401027 3' - Doc 42 1 47.95 CGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTCGACATTT:1 + chr2R 8641632 3' - diver 29 2 61.64 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTGTATCGATTTGTATTTAAACATTTAAAACATATGAAATGTTAAATTCGCCCATGTAACG:1 + chr3L 23986622 3' + opus 7464 2 56.69 CAAAACTAAAACTTGAAACAAATACCGATGACAGTTGGAACCAAGAAGATTAAACAAAGTTCTCGACGCTGTGCATCATGACGTCGATGGCCTCGATCTCCTCTACGTCGCTCATGTGCTTCTTGATAGCGGCCAGG:1 + chr3L 20154354 3' - Juan 3990 2 61.31 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTCTTAGATTTGCTTATTAAGGTGGTATAGTTTTCGCATTTCGCAGGCTTTTTATTTGTTTTTTATTCTCTCCC:1 - chr2L 8956715 3' - pogo 36 1 53.57 GCATACAGTGATAGCAGACAACTAGAGCTGCAGAGCGCCGGCGTTGTTGGGTGACTTGGACGATGAGGACGACATGGATGAGGACAACGATGAAGAGG:1 - chr2L 10284476 3' + 1360 153 1 76.53 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATT:1 - chr3R 24122668 3' + roo 8996 2 70.55 ACTTAACTATATATTATGAAAGAGCATACATTAGGGGCACCAAAACTTTACAATCGCTGTAAATAAATAGGAGCCGCAGATCAAAGGCCTATCAATTAGCACCCATTTCGATTATGCTGCATGCTGCATATGCAGCACTTGCACTG:1 + chr2L 2446224 3' + transib3 65 1 68.49 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGATC:1 - chr3L 22900104 3' - 412 7118 2 70.77 AAGTTTTGGTATAATTTGGTTATCGTAAATAGAGTGACTTTCAGCTGATCGTGATTTCCGCCAATGGCCTAGACCCCGGCTTGAGTTTCCGTTATACATTTTGCATTTTGTCCACAATGCAAACTAAACAATTCGAGTGGCGGCCC:1 + chrX 1124501 3' + Gypsy12A_LTR 163 1 65.75 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACACGCGGAAATAAAAACCGAAGGCAAATCATAAGCTGTTTTTTTTTATGTTTTAGAAACAATATTCACAGGGAAAGAAATTCAAGAATGCAGAAACAAATCATTAAGAAAAATA:2 - chr2L 12319187 3' + copia 249 1 77.40 CGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTTCAGACTCTTGAAAGTTTTTCATAATTTTCGCTATTACCTTTGTTAAGTGCTTGAAT:1 - chr3R 11113142 3' + mdg1 389 2 63.01 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTGAATAAATGAATAATAATGTGACCAATGTAACGTTTTCGATAACGTATCGTACATCTTATTCAGTTGTTCCAGTACAACACTGCTAGGCAGCA:1 - chrX 16787041 3' + pogo 2098 1 72.80 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGC:1 - chr3L 11336326 3' - blood 7039 2 56.80 GTGACTGACCACGGTTTCGTTTCCAGGTGCACTGCCCTCTTGAAAGCGGCTGGGGAGAACACCTATCGAATTTTAATGACTTCCTGAGCAGCGTC:1 - chr4 1073749 3' - R1-2 349 1 73.68 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCTGCTCCCCTACCAGCAGCTCCTAGTCC:1 + chr3R 22100605 3' + 412 7497 2 55.73 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAATAGTCAATATATTTAGACATGTTAAAGTTTTTTTTTAATAGCCTTTGTCTTACTTCTAACTACGTCAAAGTCACATAAATTTGGAATTTTAAGTTTTAAATA:1 + chr3L 9497871 3' + jockey 4975 1 56.16 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACACCGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACA:1 + chr2R 6632642 3' + P-element 2812 1 31.94 CTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATCTTTTGCATATCCGACATATCGAATACAACCCAAATT:1 + chr2L 12079683 3' + mdg3 5445 2 65.79 TTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATAGAAGTATTCGGTTTTATATCAGAAGGGCATCAATCTGACGACTGCTTGCAATTAGAG:1 - chr2R 12787802 3' + 297 339 2 60.96 CCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACA:1 + chr3R 9352109 3' - Tirant 50 2 52.74 AGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGGAGGACGAAAGATAAAGGCCGCATCCTTTCGTTGCGAGCA:1 - chr3R 11321892 3' - Porto1 312 1 61.54 GCGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATACTTAAAAACGAACGAACAACCAAAACGATTTTGGAGGAGCAGAACAAGGTCACAGCAGTTAGTCGAGTCCATAAAACCAGATCCTAT:1 + chr2R 8637215 3' + diver 135 2 70.87 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTA:1 + chr2L 246113 3' + roo 9030 1 58.90 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAAAGTTATGAATAGTTAATAACTGTGGAGAGCAGGAGGATGTTATGGGAATGTGTACGGAGGCAAGTGGC:1 + chr2L 2272565 3' - copia 4895 2 58.82 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTA:1 + chr3R 9190581 3' + Tabor 451 2 56.86 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTATGTATATGTACACAAAGGATGTCACACGAAATATATTTAAAATTCTTCCAAATAACTATTATCAAAACGATTCCTGTCATAATGTTCAAAATAAGAAATCTGTGTAA:1 - chrX 22559975 3' - Transpac 4926 2 69.18 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGCCGAGTAAAACTGACTATGTCCGTAATTTTTCCCTTTTTATATGAATGTCTTGTAACATTCTACCACCAAAA:1 + chr2R 12994958 3' - BS 5042 1 52.05 TTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATTTTACGGCTTCATTTCGGCAAACCCAAGCCAGAAAAGAGCGGAGAAGC:1 + chr2L 9198366 3' - S-element 63 1 70.00 ATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTGCACACACACACAGACACACACATACATTATAGCAACACATAGCAACAGCCATACACCAAACTGACATATGGCCAGCGTTTTGTATGCTCATC:1 - chr3R 27855900 3' + Quasimodo 7 2 73.85 TGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCATTGTGGCGGAAGGGAAGCAGACGCCTGATCAGCGG:1 - chr2L 22975402 3' - 1360 119 1 60.00 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCAACTTGATCTCGTTT:1 - chr2R 912938 3' + mdg1 361 2 54.79 ATCTGATAGTCGGGAAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAAT:1 - chr3R 23020833 3' + INE-1 560 1 53.00 AGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATATCTTCTTATGAAGTTTATGTTGGTGTGCGCCGTGCCCGCAAGAGAATCACATCATTCGGAATGTTCAAGTAAGTTACAATTAATTATGAATGTTAAT:1 - chr2R 6517187 3' - gtwin 430 2 53.85 TGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAAGAAACCGAATCTGCTTGCCCCGCCCATAAATACTTATTATCGCTTATTTGAACTTG:1 + chr3L 13634307 3' + 297 356 2 55.81 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATCTAGCGCAAATCCGAGCAAATAATTATTAAACAAATACTTCTATTTACAAAAACACATCAAATATTTAGTTAAGCCAAAATGACGCGCAGC:1 - chr3R 13122461 3' - blood 28 2 66.44 ATGTTTTTTTTTTTAATTTTTACGATGCGTCTAGCATCAGAGGTAAAGA:1 + chr3L 16976028 3' - Doc 4696 1 87.76 GTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCGTTCCTTTTAATATCGACTCGATCTCCATGGTCTAATAGATTGGT:1 + chr2R 5111317 3' + mdg3 5252 1 71.23 TAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGCAGAGATACATAACAGTATGATTTGCCATT:1 - chr2R 23412548 3' + mdg1 7369 2 80.14 CATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGCAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGCAATGTAAGGTTTCCCTTCATCCCCTCCATATGTCCGTATGTAGCACTTCGTAT:1 - chr2R 1596635 3' - Cr1a 4049 1 65.75 AAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGCGATGCAGCAGG:1 - chr2L 15834463 3' + hopper2 1533 1 66.44 TTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTAGATTTGGCCTCGCTCTACTTGGAAATTCTATTCCCCT:1 + chr2R 19786017 3' - I-element 5252 1 71.30 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTTATGTATAGATTTACA:1 - chr2L 13250350 3' + opus 7440 2 67.81 CAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATGTTGAAACACAGATCTCCAA:1 + chr3R 23021007 3' - INE-1 578 1 41.78 TGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTTCTGGGGGCATGTGTCCAAACCTTTACGCTGTTCAGTCACACTTGGTTATAATAGGCCTAGCTTAATTTAATAATCTAAACTAATTTTAACATCGAATAATCTCCAGCACGCTTAGTT:1 + chr3L 17868682 3' - hopper 111 1 70.55 GAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATATTGTTAAATGTATCTGCAGTGCAATCTAGACA:1 - chr2L 8271630 3' + Doc 4383 1 78.08 CTAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCTTCAAACAGATGTCATCTACACTGACTTTAGTAAAGCATTTGACTCTGTTAAGCATTACCAGAGCTGATTGTAGCAAAATGTAGCAAATGTAGCA:1 + chrX 18455095 3' + Q-element 256 2 71.97 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATAATCATAAAAATTTAAATTAAAAATTTCAAAAGTGTGTATGCCAATTCACTAGCATATTTTTTTGTTTCCTATTATTTAG:1 - chr3L 23325957 3' - pogo 38 1 59.59 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTT:1 - chr3L 96484 3' + roo 9039 1 59.09 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGACTTTATTTATTCAATAAATTAGTTTAACCTAATGTTAAACTAAATATATTACCGAACGCTGTGATTATGACTCTGTTATTTACCAACTGTCTTTCAACTTG:1 - chr3L 19792334 3' - pogo 16 1 48.63 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTAGGATTTTACAATTCCTACTGCCCCCGAAAAGAAAATATACAAAACAATAAATTGAAAACATTTACAAAATGTTATTGCTTT:1 - chr3L 20712953 3' + roo 9018 2 56.85 ATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGT:1 + chr2L 12319310 3' - copia 4944 2 77.69 ATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAAAAGTTTATCGGAAAATAAAAATATTCATAAATTAAATCATGAAGCAGATTTTAACTATTATACGTTAATGGCATAGTAGTGAGTAAACACTC:1 + chr3R 27604274 3' + jockey 4577 1 65.07 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAGCACATGACAACATGC:1 - chr2R 6632549 3' - P-element 39 1 55.56 CGGCTATTGATCCTAATCAAGAATATATGTATATACATTATATAGTCGGAAACCCTTTTTTCTGATTGGCACATACTTTTCAACGTATCTAGTAGGAGTACGAGTAACTGGTATAAATATATAAATATCCTATTTCTAGATCTTG:1 + chr4 1129419 3' - INE-1 88 1 50.34 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATGGGCACATACTACATTATTTACACACGTAAACTCATATGTGGTGCAGTATTTCATGTTTCTCCCCCCCAAGTCGTTTGTTTTATATTTATACATCGAGATGACCCAAATTTC:1 - chr3L 16358620 3' - 412 7080 2 61.64 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTCAATCAAAACATTAAGGATAGTTTTTATTTAGCTGCTGTTCTGCGTGTTGTAATTTTACTATCCACATAATTAACA:1 + chr2L 16399429 3' - roo 8708 2 50.68 GAAGTGAACTGTGACAAGCAAATTATAAGTGCAAAGCTAATTATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAATTTTCTGGCTCTCTACTTTAGATTCCAATGCTTTTGTC:1 - chrX 11030197 3' + gypsy4 359 1 73.97 GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAAT:1 - chr3R 19589885 3' - BS 5028 1 59.59 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATATATTATAAAATCCATTTTTGTGATAGAACGTTGTCTACCGACATTTTTTTTTTGCTTTCGCTTT:1 + chrX 14254490 3' - copia 54 2 56.25 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAACCGCAGTTTACTGATGAGGGCGGACCG:1 - chr2L 17210225 3' + jockey 4986 1 78.29 ATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTGGAATCTCTGG:1 + chr2R 21402729 3' - mdg3 28 2 65.75 CAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCATGATGTAGTGAATACGACTTAAAGCGCTTGTGTTTCCGTCTCTCTTTTCGTGGCACGCTTCGATTACCGCACTCGGAGGCGG:1 - chr2L 9668159 3' - 1360 40 1 56.16 TGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGC:1 - chr3L 24934287 3' - HMS-Beagle2 6934 2 54.79 AGTAGGGATTAATGGATAACAACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATATATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGGAAAAAATAATAATAAAAAAAGTTTATACGTAAGCGTTAC:1 - chr2L 19817843 3' + G4 3759 1 71.23 TTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCACCTAGTAATTAACAAACATCATGCATTATTGTGCTCATACTGCTATTTAAATTGTTATTGCCTAAACG:1 + chrX 3284518 3' - F-element 166 1 51.77 AATCAGTTGCACTGTCTTCATTTACCATTTCGAGATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGACAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAAATTCATTTACGCCCGTTACCAAAGGTATACCAAAGTTTTT:1 + chrX 8330754 3' - G4 134 1 73.72 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAATCTAGTAGAATGATTTTGGGGCAAGGACTTTAATTTTGCTGATTCTTAGCTTAAAA:1 - chr2L 9485536 3' + 412 489 2 78.77 GCTGCATTTTTAAATTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGAATTCAATAGTGAAAATATTCAATAGACTTACAAATCAAATCAAATATTTTCTGCCTCATTTTATCGCAT:1 + chr3L 13374229 3' + pogo 2052 1 53.79 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTC:1 + chr2R 8641607 3' - diver 45 2 49.64 CCGATATTTAATAAAAAACAAAACCGAATTTATTCAGTGTTTAATTTATTTCGGAGTTGATCCTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGACTTGTTAGTCTCTTAACACAAAGAGAAGATTCAATAATTAATAAAAAATTAAAAAA:1 + chr3L 4318620 3' + McClintock 321 2 64.38 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAATCAATAATTTTGTAAATAATATCAAAATTATTTACTCATATTGTAATAAATGAAGGAATACCACA:1 + chr3R 16913471 3' - pogo 50 1 57.53 TTATAGTTCCTGAGATCTCGACTTTCATACGGACAGACGTACATGGCCAGATCGGCTATTGATCCTGGATAAGACTGTTGTTAAAAATAGATTTACTTTTAAATTTGTTTAGTTGTGAAGATCACAAACATAATC:1 + chr3R 4338527 3' - INE-1 145 1 57.04 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGACAATGCCAGTGGCACGAGTCGCTCTCTTGGAAAATTTACAAAACATGGTGCTTGCCTTGAAAACAAAGTGGCACAA:1 + chrX 4778311 3' + 412 7520 2 66.44 TAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATGTAATCGACAAATCGAATATCCAAAAATACCGAAAACATATGTGCGATCGCG:1 - chr2L 436465 3' + copia 5056 2 64.38 ATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGAGATAGTCGGTGACTGACAAATATTAATTGTACCCTATAATGCTTTAG:1 - chr2R 1007662 3' - Ivk 54 1 73.39 ACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAAAATTCGTGGCAAGCTTTTGACGAAGCAGCGCATTAGCAACTTTTAC:1 + chr2L 18280024 3' + gypsy5 7333 2 72.73 AATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAGGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGA:1 - chr2R 1921435 3' + mdg1 340 2 69.18 CTTTAAATTTGAAAAATATATTAAAAAAGCTAACTCTAACCGCAGTCTAAGCTAAGATCAGGCGATATCTCTAAGTTATCCCGCTGGGCAACTCGTTTACTTGTTCTTTTGCATATTCATGCGGCACATGCGATGGCTATTCAC:1 - chr3L 3258945 3' - copia 4670 1 78.47 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATATCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCAT:1 + chr3R 16181253 3' + roo 9030 1 55.48 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAACACTTATTTTTTACACCTAATTTATCAATTTATATTTCTTTCATGATGGTCGTTAGTAAATTAC:1 + chr2L 18193125 3' + mdg1 367 2 55.48 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCACATTTCATTCCGGAGCTCTTTGCCAACACTCATAAGTATGCAACACTTTTTCCCACGGCAGCGGGCGTTTTTG:1 - chr3L 17133789 3' - jockey 4696 1 72.64 TCATATTATAATTATTCTTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATATTACATCTCCCTCCTGTTTGTTTTTGCCGTCTGCTTGATGCTATTCCGGCTGCTTTTCCGGGGCTTTACACGCCG:1 + chr2L 18317551 3' - mdg1 7090 2 58.22 AAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACGCAGTAAGTCCGAAC:1 + chr2R 4313068 3' + gypsy 7403 2 43.15 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGACTTACTATCCGTGATGTGTGCCTGTCATGCGCTCACTCTCGCGCGCACACAAG:1 - chr2R 6632564 3' - P-element 40 1 49.59 ATATAATATATATAAAATATTTGATATTTATATTGAGTGAACCCATAATACGCCTTCCTTCCAAGCTACCAAGAAAAAATCCCAAAAACCAAAGCAATCTCTTCCCGATCGGTTAGATCCACTT:1 - chrX 7529425 3' + transib1 1924 1 76.61 GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAGCCAAAAACGTTAAATTGAATTGCAGCGGGCCAAATCCTCTCACCTATTTTATTCTGTGACAAATTGTGGCAATC:1 + chr2R 21414490 3' - BS 5066 1 64.17 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGTTTTAAACAGTCGCCCAACTAATAGACCACATATATGGTTCTGTAGAGCATAAGGGAAATACACACAAACACATTTTCTCGGCATTGCCGT:1 + chr3L 12224749 3' - 412 12 2 75.00 AGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTGCACAATGACAAAGCTGTCGTCGCCTGTCGC:1 - chr2L 7301990 3' - HMS-Beagle2 148 2 64.77 TTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATACACCACCTGTTCACAGTGAGCATCGATATTGATTATTGTAATATGCAGAGTATTG:1 + chr3R 16267181 3' + FB 864 2 62.33 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCCATTACAAGCAAACTGGAAACTTCAGTCCTTTGCCAGGATGTCATAAACATAAATAATCATTAAAACTAGACATAAATTGCAAACTTT:1 + chr2R 16403536 3' - copia 30 2 64.83 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTTCCACCCCCTTCGGCTGG:1 - chr3R 22100481 3' - 412 7075 2 70.90 GAGCCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGACAT:1 + chr3L 23940549 3' + Cr1a 4395 1 67.83 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTCAGGTGTAATGGTGTGCGAGGATATATCTATATATATATGTATATATACATACACACACATACACATACA:2 + chr3R 26751575 3' + hopper2 1560 1 50.68 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAGCCACCGGATACTTGTGTCCGATCTTCAGTT:1 - chr3R 11057586 3' - flea 49 2 70.64 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTC:1 + chr2R 8641604 3' - diver 57 2 54.79 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTACATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTTATACTTAAAAAAATTAGATTTATAAAGGAGTGTTTAGTGTTTAG:1 + chr2R 4029423 3' + 297 363 2 62.50 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCGTTTCACTATGCGTGTAGCAAACTTTACCTCTGTGCAATATTCGCGGCGTTTCGA:1 - chrX 3996493 3' + roo 9007 2 63.70 TGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGTACATGGTTCAACAGATGCTGCGACTATGTCTCGGGAAGCTGTGACCCTTATCTCAACAGGATGCACCCAATGTTATT:1 + chr2R 14354704 3' - INE-1 219 1 78.10 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATATAACTTGTATTTGTGTCTAAATAAATGTCTCAGAAAAATAAATGTATATGCAAAACAAACGT:1 + chrX 4940515 3' - blood 45 2 55.64 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTA:1 - chr3R 16181146 3' - roo 74 2 69.18 ACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTGTCCATTGGCTTGTACATACATATGCACGCTGAAGTAGAAAGCAATTAAGGTTTTAAACAATGAAATTGTCTCATT:1 + chr2L 8960043 3' + Ivk 5369 1 65.71 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAG:1 + chr2L 9485687 3' - 412 7098 2 51.88 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGAAAATAGTGCCAGGGGGAACGG:1 - chrX 5858938 3' + hobo 2894 1 73.03 AATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGATTGTTCCAAGCATCAGCTGCCATCAGGGTTGGGCGGTAAACAGGGGGCGTGGCAGATGCCTTTG:1 + chr3R 31350617 3' - Cr1a 4069 1 55.26 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCACGTTGCAGCAACAAACATTTTCATTCGTTTTCGCATCGTCGAAGCGTACGG:1 - chr3L 14550943 3' + P-element 2880 2 65.71 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCGGAACATCTACGCCGAAGAAGAATGCATTTCAGAAATCCTTAAACCCTGTCTTCTGTTTTTCTGTATG:1 + chr3L 21942411 3' - hobo 53 1 53.10 CTTGAGTAAAATCACAACTTTTAGGCTGTTCATAAGAAAAGCAGTGTCTGATTTTGATCAACGTAAAGTCCCGAAATTATCAATATTTTCTAAAAAGCGATGCGCGCCCAGAAGGAAGAAGCCGGAGAAGCCCGCAGCTGAGGAGG:1 + chr2R 24017610 3' + HB 183 1 66.44 CTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGGCTATAGATTCATTCTTTCTTGTTAGAGATGGATAAATGTTTTGTTGTCCGCCACTGATTTCGTCCCTGGCG:1 + chr2R 5439246 3' + INE-1 502 1 65.97 GAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTG:1 - chr2R 961134 3' + transib2 2660 1 54.79 TTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTTCAGACTCTTGAAAGTTTTTCATAATTTTCGCTATTACCTTTGTTAAGTGCTTGAATGAACCACCATTC:1 - chr3R 11113130 3' + mdg1 401 2 71.23 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGCGGAGGTCCAGCGGGT:1 - chrX 1287796 3' - jockey 4806 1 53.98 TTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCAAGAACCCGATCACGCTAA:1 - chr3R 9160639 3' - copia 8 2 77.60 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATT:1 + chr2L 6318994 3' - pogo 61 1 64.79 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTTGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTAT:1 - chr2L 17136167 3' - hobo 73 1 69.92 GGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAACATTATCTCCTAT:1 - chr3L 24152437 3' - HMS-Beagle2 6933 2 54.68 TGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGAAGGAGCTCTAATCAGAGAAATGCTGTT:1 - chr2L 12340714 3' + diver 195 2 61.19 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTCGTTGTCATTTCCGCTGGACACACGTTTCAACGACAGGAAAAAAGGCCAGGCTAGGAGAAAGGGAGAAAGCATTAAAGATATTGCAGGG:1 - chr2L 13704651 3' + hopper 1406 2 74.40 ATTTTTGGGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCAGCTTTGCAGTTCTCTGGTTTAAGCTTTTGTTTGTCCACTAAAACGATTGTTCAATTAAACATAGCAAAACGATTTATCCATATATGTTCGTATATATCTATAGAGAGACA:1 + chr3R 17867882 3' - hobo 31 1 64.83 ATATGCATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCAACGTAACAATTTATTATACAGCCTCGATGTTAGTAGAGATGTGAAACCGGATAAGGTACTGCCGCA:2 - chrX 16543383 3' + Stalker4 7204 4 53.42 AGTCGGAGAACTCGACTATAGCATTTTTTGTTTTATCAACATCGCGGCCTTTTCCTAAACAGTAATACATTTTGTTGGTCCCCATGAGAGGAGTTATTTCTTAGCACATCGTAAGCAATCACATATCTCGTTTATTCATTGTTTCC:1 + chr2L 21268096 3' + INE-1 567 1 53.42 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGAAATACCCAAAACTCCATCCAGAATCGAAGAGTATGTGGGCAGAAGGAGCAAATTTTGTTTTGGCCAAGTGCCGTTGGCGATGGTCAAATGAGGCTCGCAGGAATGTTAG:1 + chrX 8012402 3' - 297 6583 2 80.69 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGTATCTGTATCTACTACAAGTAACATTGTAGCTCGAGTTGGCTAATTATGGCTA:1 - chr2R 22305987 3' - pogo 25 1 58.10 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAAATTTCAAGAGGCCAGCACCCGGCACTCTAACGCCCATGTCCCCCTTGCCCATTAAGTTCCCCCACCATATTT:1 - chr2R 21371421 3' - roo 8685 2 63.93 TACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTTTGGGCGAAAACTTTGCCTTTTTCTAGCTTTTTGACAATGCCAGGGCAATGGCAATAAATGTCGAGAGGCAGCTGCG:1 + chr3L 2725093 3' + Ivk 5335 1 56.16 CTTGGATTGCTCTTTGACTGACGTAAATTGGTAATTGTAGCTGTTAATTGTTTTGCCTGCAATGCAAAAGCCGGTAAGGTCGTTCACTGAATCGGTTGAGTTGAAGAGACTGTTTCGGTTGTTGTTGTTGTCGAT:1 + chrX 7740689 3' - Doc4-element 425 1 71.85 GGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGTTTAAATTTATAGCTAGCAGGAATTGACCTAGTCGAAAAAAT:1 + chr2L 13250522 3' + opus 7282 2 71.23 TTGGCGCCCACGGCACTCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAATGGATAAGACTCGTCTCGCGCCGACATACATATATATAAAATCAAGTACAGGATTATCACAGATAC:1 + chr2L 23310026 3' + gypsy4 281 1 52.17 CTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACGGACACAGTAACATTATTGTGTTTCATTAAAAATCCGGCCGATGTCCTGCGTTGGTTTTATGGCATAGTATGTGGGATGCGG:1 - chr3L 11745255 3' + G2 2765 1 53.42 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGGCAATTGCCGCAAATAGGTCAGTTCAG:1 + chr2R 10865245 3' - blood 7073 2 59.72 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGAGACAGTCGCGACGGCGCGCTCGTTTCAAACAGACGTTACTTTCTCTCTCTGAGCAGTCACTGATTACCGTTGTGTGCGTTGTGCCGCTGT:1 - chrX 8891717 3' + P-element 2857 1 65.07 TAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTTGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCACCAATTTAAGTTTCTTTGGAACAT:1 - chr2R 5917796 3' - I-element 5090 1 49.32 GTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAAACATCATTACTGTTGTGGCCGAACCAACTACCGCGCGAGTTAACATACCCCCTC:1 - chrY 3609355 3' - X-element 86 1 67.81 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGAAATATGCCAAGTCCAGAGTGTCAGCTAAATTTCCGTTGAATTTCAGCTGAATTGCTCATAAAAT:1 - chr3R 17114016 3' + roo 9018 2 52.74 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCACGAGATTTTTTCGTTCGTTTTTTGCGTTTTCGCCCACAGAAACAGAACATC:1 - chr3R 23236396 3' - hobo 51 1 56.92 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGAC:1 + chr2L 9485689 3' - 412 56 2 54.79 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACGTAACTCACGCATGCTGGGCCGGTGCTCCAGGATAGCGAGAATCGCGACAGCTGTGGTAGCTATAATGAGTGCAGCAAAGGTGTGATCGATTACG:1 - chr2L 22015877 3' + Tirant 8481 2 65.93 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACGTCTCGTTCGGCTAACGTGCACAAA:1 - chr3R 21001807 3' + 412 7477 2 67.81 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGA:1 + chr3R 27822275 3' - I-element 55 1 65.85 CAACTTAATTTAGTAAGTTTAAAAAAAAAGGTTAATATGTATGATTATAATTACGTTTTTCTTTGTTTAACTTAGTTCTCTGAGTTTATCTTCAAGTTTTTGGTTCGGTCAGTCCGCATGCATAAATGTTTCATTAGCAGAACACA:1 + chr2L 755674 3' - Bari1 1452 1 82.88 TATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAG:1 + chr2R 21402666 3' - mdg3 91 2 76.71 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACTTAATTTATGATGGCAGTTTGTTATGCCGCGCCC:2 - chr2L 12353954 3' - jockey 4745 1 76.12 CGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTA:1 - chr3R 19589924 3' - BS 5067 1 65.07 GTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTT:1 + chr3L 24208234 3' - Quasimodo 35 2 59.59 AACAGCTGTTATTATAATGATGCGCTGTTAAATTAACTTTTGCGGGCTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATATTTCATTTAGACCTCTCTTTTTGGCAGAATCTCTTACACACGCTCTTCAGGGTCTGGCAT:1 - chr3R 25719584 3' + hopper2 1469 1 58.90 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTGATCAGGCTGCAGTGTGTGATGCAATTATGAGGGAGTAGTTTTTTGTTACAGTTTAAAGTAAACAT:1 + chrX 16855342 3' + roo 9028 1 51.49 AATATCTCCAATAGTTTAGGGGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTCGAAACCAAGTTAGCAAAATACATTGCATACTTTACAACGTCCTATCAAGGCCCATTGGAACATACA:1 - chrX 6707744 3' - hopper 44 1 51.80 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACTTTTGCGGTCCACAAAGACCGTGTAAT:1 + chr3R 27794874 3' + roo 9023 2 56.39 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTC:1 - chr3L 11336339 3' - blood 7039 2 51.79 ACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATACATACATAGCCATATAGCCCGGTATTTGGAAAGCCGCAGA:1 - chr3L 16870179 3' - FB 75 1 71.43 GCAATATTGACGCTCTCACTGCTTCAATGTTCTCTCTCACAGGTCGAGGGACTGAAGTTCTTCGTTTTGTCGCACTTGCAGTTTGTCTGAATGTAGTGACCCATGTAGGGATTATGTTGAGGAGTTTCTTTACAATTTGTAAATT:1 - chr3L 384735 3' - mariner2 368 1 73.79 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTC:1 + chr3R 9352112 3' - Tirant 8111 2 77.67 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACACACGCACACACTCGTGCACACACACAGGCGGACACTCAGCATATGCCGCAGCAG:1 + chr3L 17175213 3' + 412 7500 2 52.76 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCACATTTCATTCCGGAGCTCTTTGCCAACACTCATAAGTATGCAACACTTTTTCCCACGGCAGC:1 - chr3L 17133800 3' - jockey 4747 1 56.16 CATACATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGGCTTGTCGCTCGCTGTGTGTGTGAAT:1 - chr3R 24408246 3' + Stalker2 7499 2 64.00 CGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATAGGGCTATGTAAAGTATTAGTTTTATTGCATATTATTATATTTTCTACAAACTTGCAAAAAGG:1 - chr2R 15829495 3' - invader4 53 2 59.59 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAGTAGGCCGCATCATTAAATATGTATGTTAAGCTGA:1 - chr3L 22978510 3' + 1360 3362 1 63.70 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTTTGCATGGGGCTTTTGGTTTTTAGTGGGAGTGTTGACCGCAAAAATGACAGCCCAAAGTGGGCTCACCGAGTGAGCAACAAATTCAGACCAGCT:1 + chr3L 10144786 3' - blood 7039 2 67.12 CGTGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTCGTTATCAGTCATTTACTATCATGTGTATAATACTAATTTAAAGGACATTGTGTAAGTGAAGATGATTTTTTATTCTTAATACGATTTCAAA:1 - chr2L 15945675 3' - X-element 50 1 62.33 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTACTTCTGTTTGCTCGTCGGTGCAACCGCACAAGCCGCTCTTACTT:1 + chrX 22610778 3' + pogo 2049 1 62.70 GTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGGGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTTTTGTTTTTTGTTGAGACTAGGGGAAGTCCC:1 - chr3L 2885250 3' + S-element 1686 1 66.30 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTGTGTGTCTCAAGTTTTTCCTTTTCGGGTTGCTTGAGT:1 + chr3L 13563382 3' + roo 8990 2 74.66 AACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTCCTGACA:1 - chr2R 8158757 3' - Juan 68 1 54.79 ACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCACTCCCTCTTACGCTCTCCACCATCCTGTGCCCCATAATCCGTGGAATGTGCAACATGTGTGGCACTAGCACCAGTGTGCTCCCTCTGTTGCAGCAATTAAAC:1 - chrX 5806370 3' + GATE 37 2 64.66 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTTGGAGAAGGGAAATGTGCTGATCAAATAGTATTAGTAACACTAATAGTAATATTTAAAATCTTAAAATATTT:1 - chr3R 20743959 3' + roo 9021 2 54.79 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGCAATCAGAAGTGTTTTCCTGGAATGCCAGCTATTTAAGC:1 - chr3R 23639107 3' - pogo 27 1 65.75 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAATTTGCTCTCTCATGCTCAAAAAAAATTGTATAAG:1 + chr3R 23765462 3' - roo 44 2 52.59 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTATTGAAAAAATGT:1 - chr3L 18467163 3' - hobo 42 1 56.85 GTCATAGACTGGTATCTCTGGAATATTTCAATGTTGGAGTTGCTTATATTACATGAAATACAAAACTGTACCGCTCGTTTAGCTTCCCATAGCTTCGAATGATGGGAACTTAAATTAAGAGATTTTAATTCCAATGAACAGTGCAA:1 - chrX 293584 3' - G3 4251 1 65.75 GTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTACGGTTAG:2 + chr3L 24208248 3' - Quasimodo 21 2 69.18 GCATTCACACTAGCTAAGTAAGGGGCATCTGATAGTCTATCAGTCAGCTCTATCCGGAAAAAGTATTCATTTCTTTCCCATTAAAATAGCCAAATTATGCAATAAGTGTTCTAAATCTGTGATTTTAAAATATGTTCCATCCAAGA:1 - chrX 7532619 3' + INE-1 534 1 56.16 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACTCACAAAAGGGTCGACTTTTGCTGGTTCAATGGCACCAATTACACAAAATCAATTAAATGTAAATGCTATGGGCCTAGACAAAATAAAATCAGGCTGCAAGTCTAATCGAATGTTA:2 - chr3R 15702844 3' + copia 250 1 80.14 AATAAATAAATAATAAAAATTAGAATAAAAGGTAATTAGTTAAGATAATTAAAGCGTAGGCACAATGTATCTACGTTAGTATTTCTATTATACGAAAGGTTTCCTAAAATTGAGCTTAGCTTAACATTTTAAAAACATGACCTAGA:1 - chr3L 12110875 3' + Doc 4683 1 78.77 GCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGTCGATTA:1 + chr3R 24729648 3' - Juan 4156 1 70.55 AAAAAAAAAAAGAAGGAAAAACGAACTCAACCCACACACGAACTGGGCGAGTAAGCGCACATGGCCACACAATCAGATATATGTATATGTATATTCTCCACGTACACGGGAAGTCAATAAACCCGGCGTGAAGGCAACTCGCACCC:1 - chrX 10754461 3' + Doc2-element 229 1 56.85 GAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTGCGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTGCACTCAACGCGGCTTAAATCAAATGCCC:1 + chr2L 6717174 3' - jockey 98 1 76.03 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTTCCTAGAGTCGTACACCCATGGACTGTTTGAG:1 + chr3R 25304841 3' + roo 9032 1 58.33 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCCC:1 + chr2R 5923018 3' - jockey 4747 1 69.86 CAGCAACCAAACTGAACACACAATAGCAATGATGTGTGTGTGTTTATGCACACAGTAAATTCTTTTTGCACAGCCAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAAAGAATAACAATTATCATTTAATTATGTCAACTGTAACTTAATT:1 - chr3R 14601142 3' - G3 71 1 73.29 ATTTGCTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTATGAGGAGTTTTCTTGATGCCGTCCAGTGAAACTAGAATTTCATTCTGCGTTTGACATCTTTGTTGGCA:1 - chr3L 22510451 3' - I-element 5223 1 56.16 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATTTGAGTGTGTTAAATTTAT:1 - chr3L 18467174 3' - hobo 47 1 52.86 TTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGTAGTTGTTAATTAGCT:1 - chr3R 13349050 3' + BS 5027 1 65.07 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCA:1 + chr3R 25304801 3' + roo 8990 2 76.03 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCGAAAGCACTATCGTAGAGATGGGGCGCCAGTGCTTGCGATAGCCCAATCGATATATCGTATATCAGCTGGTGTGATTTTAAATCCTATTATCAGCGTTA:1 + chrX 14826241 3' - P-element 12 1 74.82 ATTGTGTTTGTGTTAAAAAAAACAAAAAACCACATTTTGTGCCTATTATATCGTTTCCATCTACGAGGATCCCGTTCAGCCCCAGCAGGCCGCTTCCGTGGTAGAGAAACTTGGAGATTATCTGATTACTTGCGG:1 - chr2L 5973584 3' + Stalker2 495 1 63.70 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACAC:1 + chr3L 7995472 3' - P-element 90 1 19.57 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTGTGTATTGGGGGTGCGTGTTTAATTTCCAC:1 + chr3R 20175806 3' + hopper 1390 1 61.67 AAAAAAAATGAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGAGGTTTTGGGGGCAGGGGAGTAGATGTAGGTACTGCTGATGTGGTAACTCGAGCGACAGAGCTACTTTGGCCGA:1 + chr3L 24995310 3' + transib2 2651 1 56.25 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTTTATAG:1 + chr3R 23639245 3' + pogo 2043 1 62.50 TGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGC:1 - chr3R 5208138 3' + hopper 1352 1 64.49 GTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTAC:1 - chr3R 17897130 3' - hopper 78 1 69.66 GACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCA:1 - chrX 2762569 3' + roo 352 2 54.11 GCACTGCCAAAATTCTGCGCTGACAGCGCTGGAGCAGATCCATCTGCATGGTGCACCACCGTGGATTTAATCCTTGCAGATAATTCCGGACCCCCGAAACCTCTACCTCCTGACCAGGCATTCATTCACTGTGAGTCAGCCACA:1 + chr2L 939901 3' + invader4 494 1 58.33 ATCAGATACCCGTTACTCAGCTGTAAGTGTAAAAGATTTCAATACTTTCTCTAACCCTACAACAACCACAGAAACAACAACAACAACAATAACAACCGCAGCACCTTTACTTCCTTAAAAGAAAGTCAATCAATAAATATATCAGG:1 - chr3R 29589042 3' - INE-1 545 1 60.27 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCAACTTGATCTCGTTTAGGTCATCGTTGTTGGA:1 - chr2R 912921 3' + mdg1 384 2 57.14 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACATTATGCTACTTACTTTTCCGAAATTAACCCTTCGCAGCACCTTAAATCAAGTAATACTCAAACAAACAGTA:1 - chrX 16579234 3' + roo 9031 1 54.14 TATGAGGGAACACTTTCCAGAGCGCCTTATCTCAATTAGAGGATTATAAAGCGAACAATATTTTATCGCTTTAACAATTCAACGTAATAAAATCATGGGAGCAGCACATAATGCTCTAACTAACCATGGTACAGTTTTAACCTTTG:1 - chr3R 2651311 3' + mariner2 508 1 71.23 AGCAAAAAAAAAGAAGAAAAAACAATAAAGCCCGGAAATTTTCCAGGTCTCTAGCGCCATCAAATGCGGAGGCAA:1 + chr3R 25199261 3' + gypsy7 5004 1 84.00 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCAACTCGTTACTCAAAGCAAAACGA:1 + chr2L 686109 3' + roo 9047 1 66.17 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTACAGCTCGTATTTCGACAAATTGATTTCACA:1 + chrX 4186735 3' + I-element 5303 1 51.37 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATACGCCGAGTGGTTTAGATAGCAGTTTTTGCAAGTGCGTTGTATTTACTAAGAACTTGAAAACTCCTGTATATCTTTTCCTGCGTATCTCGTGT:1 - chr2R 19553145 3' - mdg1 7062 2 66.90 GATGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAGTGAGAACTCAAACCCTATCCAAATCGCGAACCAAAATAAAGACACACACCAATAGCGAAAACG:1 - chr3R 3374344 3' + invader2 474 1 59.81 GGGGAAGGAATATATTGTTTGCCGAAAAAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTT:2 - chr3L 23773899 3' + Transib5 2832 1 67.12 ACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTGTCTTGTATATAAGACAAAAGATTACCCTCTTCTTTGCGACGACGCTTAAAAGGTTTTCTTTTATCTAAAGAAACTTTGTTGCGATCAAATATTGTGGCTAACTCTAACCAAAGTATTGTCTG:1 - chr2R 4756902 3' + INE-1 581 1 73.29 ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGACAGGCGCAGC:1 - chr3L 24152405 3' - HMS-Beagle2 6908 2 65.75 GTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGTGATATAGAAAAGCAATCTCCAAACCCAAACCCAAACCGAAACTGAAACGCGAAAAAGTTCCCACATGTTCACAATTTCGTACACATTACGTTTAT:1 - chr3R 4884621 3' - Cr1a 4382 1 70.40 GTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAAACCCCAATAGGTGGCGGATGGAAGTGCTTGGCCAAATGGCCAAATCGTTAACCGAAAGCAGACTCACTTACTGGGGCGGGGATTTTATGTCCTGCTGACT:1 - chr3R 19742212 3' - 17.6 233 2 71.94 TAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAG:1 + chrX 20999582 3' - BS 65 1 66.90 TGGAAAAATAATGCAGAAATCTTGCCGAAGCAGCTAACTATCTATGCAGCTACGGCAACAAGACGGTATAAGCACATAGAACATATACATATACACAGCTGT:1 - chrX 14589694 3' - pogo 45 1 45.10 CAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGCTATAATTACGGATCTAATATCACCTTCGATACCGCTAATAACCTACTCCACAATTAATTCAATTGAA:1 + chr3R 12593140 3' - flea 4805 2 53.42 CGTAGAACTATGCTTGGATTAGTCTTTATTTGTAAGCTCATTGGTGGTGATGTTGAGAGGCCCGACTTGATTAGTCTGTGGTCGCCGAAAAAAAATCAAATTAAGCACTGCACTGCTGCCGCTGTTCCGCCAATTTCTCGCTTT:1 - chr3R 1192860 3' + Cr1a 4019 1 52.78 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAAAAAAAAATTATATAACGTGTGAAAAACTTTTATGGCCCTCGAGTGCAGTTGAGCGCTAAAATTTGT:1 - chr3R 6244492 3' - Doc 51 1 52.52 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTTTTGTTTTTTGTTGAGACTAGGGGAAGTCCCTTGCCGGCCATCTCTTTCCTGCATCTGCATCCGTCCCTGTCGCACCT:2 - chr3L 2885203 3' + S-element 1679 2 54.11 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCACGCCGACAAACGCTTCGTGCAACTTCGTGCAGCTTCGTGC:1 - chrX 14826118 3' + P-element 2825 1 34.62 AATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACCCAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTAAGAACGAAATGGAGATGGGAAAAATCGAAGCAGC:1 + chrX 12825932 3' - invader2 418 1 75.86 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAGGCAGGTCGTGGAAGGCAGAAAATATTTTTAGGCCAAGAACCCGATCACGCTAATGACGATGATGCTAG:2 - chr3R 9160624 3' - copia 14 2 76.71 AACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTTATTATACAATATTATAAATTTCAGACAGAAGTATTTACAGGTAATGGCGGAGCCCCGTTTGAAAA:1 - chr4 436801 3' + 3S18 6101 2 73.40 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATATAGTGACGTATTTACATTATAAGTACTGTCCAAAAAATAAGAATATGCTGAGTGGCAAAA:1 + chrX 22895038 3' - opus 59 4 60.96 TGGTCTCTTGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCAAAACGGGAGTCTCATCCATATTCCAAATGTTTTTGTGAGCTCGTTTATCTGTTCGATTGGTTGCTCGATGAGTTGAG:1 + chr2R 9626328 3' - invader4 359 1 51.26 CATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACCCTAATTTGAACAGTCTATCAAAAACGTCT:1 - chr3R 21001828 3' + 412 7456 2 82.19 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGTTCAGCCTTGATAGATCCCCGTATGCCATAGTTGCTTATAGTCAGTTATGCTACCCGTCAGTTCTGAATCCTTCAGAG:1 + chrX 11471554 3' - jockey 4706 1 51.11 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCACTCTTTGACCCTCAAACCGTGAGATATACAGAGAATGGCAGAG:1 - chr3L 7995427 3' + P-element 2810 1 34.93 ATCTAAATTCTTTAAATTAGAGACAGCATTTCTTGGTTATTTTTCCACAAATTTCCACAATTATGAAGTATCCGATTCCACAAAACATTAGAGAGCTTCGAAGTTTTCTAGGCCTCACCGGCTA:1 + chr2R 2879978 3' + TLD2_LTR 155 1 96.77 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGCTTAACGATCTTGCACATT:1 - chr3R 21705992 3' - 297 8 2 60.00 GTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATGAGAATATTTATTTAAAAAATTAGACATTGAAATGTACTGTCCTCCGTGTCGTTTGCAAAGATATCC:1 + chr3L 15915857 3' - Doc 4557 1 54.11 CTGACGTTGTCATTATTATTTTCCAAACTTAAGGCTAGGTTATTTTCATGTGTTCTTAGTCTATCTATATATTTTCCCGGTGACACTTGCCTAATTGAAACCCATCAGAATCACACTCTATTAACTCGGCCACCT:1 - chr3L 18371032 3' - G4 3661 1 55.56 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATG:1 - chrX 17678734 3' - flea 22 2 70.55 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACATCAGCACAGCGCGGCCCACACGTTAAAGTCCCACGACGGCGATGCGTGCTCGAAAATC:1 + chr2R 5322558 3' - jockey 4748 1 55.26 TGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTATTTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATACGCTGATATTTTCGTTTTAAAGACTTAGTCCTTGGTCCAGCTTTTGGACAAGTACTTCGACGATAATGCCCAATCCGC:1 - chr3L 26350093 3' - Porto1 264 1 58.90 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATAAATATAATATTATAATAAGTATACAGCGTATTTTCCAAACCTAACTACCTTTATAGTATATTTAGA:1 + chr3R 23639255 3' + pogo 2055 1 54.93 AGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACAC:1 + chr3R 29418745 3' + mdg3 171 2 70.00 CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGC:1 - chr3L 22400265 3' - 1360 47 1 55.91 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATTACAATATAAGTTTGGGTAATTACCCAAGCAGCCGAAACACAAGCTCAA:1 - chr2L 10184433 3' - Doc 76 1 67.81 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCTCAACTTTGGATGAGCTGTCGCCGACGCTG:2 - chr2R 11609203 3' + roo 355 2 54.11 GTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGGAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTTTGGGCGAAAACTTTGCCTTTTTCTAGCTTTTT:1 + chr3L 2725049 3' + Ivk 5307 1 73.08 AAATGTTTAAATATCTTTTAAACGACAAAGGTTGAAGGTTTAACAAGATTTATTTTACCGAGAAACATCTATTAATTGGACTAAAAATTTGATTTATGATCATGTTTGAACTTAATGGTTCAAACAGTCGAAAGAAATATTTGTAG:2 - chr3R 24571016 3' - Transib-N1_DM 288 1 78.08 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGGGTAATTTTTTTTTTTAGTT:1 - chr2L 3466033 3' + P-element 2834 1 26.26 ATAAATATAAATATAAAAATAAAATATAAATATAAAATCATTTGGAACTCACTATTCCTTTTAGTTTTCCCTCTTAAAAACTCTTCTTAAGATATAGAAATGCGATTTGAAACGGCTCACGATCACGTTTTCTAATGATTGAAGAA:1 - chr3L 9852703 3' + Stalker 6936 4 61.64 TGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAATCCAATTGAGTAACAGAATTTGATAATTGTTTTTTCT:1 - chr2L 2052700 3' + blood 7306 2 73.97 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATTACAATATAAGTTTGGGTAATTACCCAAGCAGCCGAAACACAAGCTCAATGATTCCAATTATTACATTCGGTTCACATTTTCATTTAAAA:1 - chr2L 10184392 3' - Doc 28 1 66.19 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGCAGCCCAGTTGCAAGTTCGACTTGTCT:1 + chr2L 16458720 3' + roo 9047 1 68.49 GCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGA:1 + chr2L 23372625 3' + gtwin 431 2 50.37 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 1202714 3' - 1360 85 1 77.88 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTCACAGTGTAGTTTCAACCTTGATTAAATTTCACGGCG:1 + chr2R 19555070 3' + pogo 2080 1 65.07 TAATAAAGTATAACCACCAGTTGGGAAAATCTTTTCCAGAATTAGTATAAATGCCAGTACGATGGGAGAGATCCATAAACTTGGACCCATAACTGGTTCGATTATGTCACGTTTAATGGCTTCCTCCAGCTAGCTGCAGCTCAGCA:1 + chr3L 25729859 3' + S-element 441 1 67.81 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTTGAAAATGTCCAGCAAAGTTGACCAGCTGAAGTGATTGATCCTTTTCCTGCCACTTAC:1 + chr3L 11400012 3' - Quasimodo 23 2 59.82 TAGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCATTGTTGTTGCTGCCGAGCGGAATTGTGTGCGGGTATATAG:1 - chr2L 14095568 3' + pogo 2031 1 66.44 CCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACCCTGAGACCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTGGATAAGCCCAATAGTCGACATCTAATAATTTGTCTTTCTATTATTTAAACTGTGACTTTGCTTTATAGTTATTCTCTC:1 + chr2R 5403421 3' - 1360 3312 1 45.14 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGGAGTGAAAAGTCGCTTCGATGTGGAACGATACATTTAGTTGATTTTTCACTGGGAGCAGAGCAACGGC:1 + chr3R 26520513 3' - FB 20 1 71.92 ATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTTCTGTTTACTTTGTTATTTTATTTTATTTTATTTTCGTTTTGTTTTTGTTTGCAATCGTGTCGAGGCGATATCGATATTGGTGATAATGCC:1 - chrX 581055 3' - 297 6523 1 66.42 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGACTCCCACATGGACAATTGTGGCACAAGATGCCCAACCAATCGAATACTTATTCGTACATATATAGAAA:1 - chrX 1689969 3' - 412 52 2 52.05 GATATGAACGGGGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCATTTTTGCACT:1 - chr2L 4173980 3' - roo 8702 2 58.88 GGAGAGCGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGGGAAAAGCG:1 + chrX 5593262 3' - Cr1a 298 1 83.67 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCCAAGAAATTTGGGATTTCTTCTTATAACACGAGCA:1 + chr2L 19068128 3' - pogo 62 1 73.17 TACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCTCTATTATATGTGTAACATAGAAATATTGCGATTTTGGTAATTTTCTTAATTCCTAAAGCCGGGATTACGCGAATAACCGG:1 + chr3R 11749758 3' + Tabor 7283 2 56.16 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAGCATCGACGCTTTTTC:1 - chr3L 24152391 3' - HMS-Beagle2 6894 2 76.71 GAGTGAACGTTTATAAGCCAGTGTAGATCCCTTGCTTTTAGTCTGAGGTGCGTCGTCTTGGCCTCTATGTGTTTCCGGCTCCAAGCAAATAAAACTGCAGCCAAATGACACGTACAACTGCCACAGATTCGAGGGAAAATGAGGGA:1 - chr3L 20878793 3' - Doc3-element 4244 1 54.79 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCAATTTGAATAGGATTCCATTTCGTGATGAACATATCACCGGGAACGGAAAACATCCATGGGGGGTGGGAGGGCG:1 + chr3L 8826135 3' - Doc 78 1 51.75 ACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTGTGTATTGGGGGTGCG:1 + chr3R 20175792 3' + hopper 1361 1 58.52 ATATATATACATACATATATGTATTCCTTCATAAATCACTAAGGCTAATCCATATCCAATTCAATGCCAATTGTTGGAATTCCTCACAAAATAAACACGAGAAACTCCCAAGATCAATATCCATTCAATTGAAATCGATCAGGAAA:1 + chr3R 19815965 3' - 1731 4409 1 69.18 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTGCCGCGAGTATATCACGAACTTAGGGCCCTCTCGAGTTGTGCGACCCATAAAATGGTCAACAAAATAATTTCCTCAACGCTTCCCAG:1 + chr2L 6870791 3' - hopper 34 1 62.33 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAATATACAATACATATGTGCTGGACCATTCTGTGTAACAAATCGCTTTGATGAAA:1 + chr2R 12787908 3' - 297 6620 2 63.33 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCTAAGATAAATGATGCACACGTTGAAATCCCTTCATAATAAGGGATTAATATTACAAGATTGTACGCAATTAGTGGCCAGATAGCTTGAGGATTTTTC:1 + chr3L 15327686 3' + blood 7366 2 66.44 CGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTCTTAGATTTGCTTATTAAGGTGGTATAGTTTTCGCATTTC:1 - chr2L 8956747 3' - pogo 74 1 68.49 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAACCGCAGTTT:1 - chr2L 17210243 3' + jockey 4951 1 56.85 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCATAAACAAACTCGCCAGAAATAAACAAGAGTTCAAATGCTTTTGCCATTGACCCCATTTCCAGTTTTGTATTTTTTTTATTATTATTTCGCCGATCGGCTTAG:1 - chr2L 13927668 3' + roo 391 2 71.92 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATCTAGCGCAAATCCGAGCAAATAATTATTAAACAAATAC:1 - chr3R 13122514 3' - blood 7092 2 71.92 AAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACT:1 + chr3R 435933 3' + 1360 2979 1 65.87 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTGATTCTGGTTGGCTGCAAATATGAAATAAACTCCATTGCACAGAGACTTGTTCGTAATGCCTGACAACATTTT:1 + chr3R 13176465 3' - Burdock 43 2 54.79 AGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAATCAATTGCAGCCCTAAACCCCAATAAAATTCTGACATTTATACAGTGCATTGGAGAGGTGAGAGGCTGACCAAGACACCACCACCCAAATATTTA:1 + chr2R 5451060 3' + baggins 5281 1 67.97 GAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGT:1 + chr3R 10030793 3' - BS 5063 1 54.11 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAAT:1 - chr3R 31490932 3' + roo 344 2 58.90 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAAATGGATCGGCGT:1 - chr3L 27415188 3' + transib2 2790 1 62.07 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACTCTTACAGCT:1 + chrX 4186710 3' + I-element 5278 1 67.81 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATCAAGTTGTAGAGCGAACCTCGCATTTGCGCCTCATGAACCGTTCACGCAACGTGTCGCGTTGTAAATAGAATTTGTGCATAAGAAAATTATGCATTCATA:1 - chrX 21196651 3' + roo 389 2 70.55 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGC:1 - chrX 2762570 3' + roo 9036 1 54.40 CATTATTATTATTATTATTATTTGATAATATATAGCAGCTGTTCAAATCATCAACAAGTATAAAATTGAAAATGTTAAAAATTGAAGCAGTCTTGTTTTTGCCTGCAACATGTTGCTGCCGATCGTTAGATGTTGCTGCTGCATGT:1 - chrX 15626624 3' - mdg1 7075 12 58.22 ATGAAGAAGGGACATGGAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGGACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGGCAATTGTTCTCGTCCTGCCAACTGC:1 - chr2L 5392123 3' + invader4 216 2 75.22 TGATCAGGATTAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGAACGTCGAGATTTTAATAAAATTAAAATATCGATCAACAGCGGTGGTAACGAGCTCCAACCCTTAGTTTGGAGGATAATCAAGT:1 - chr2R 25240158 3' + INE-1 91 1 50.37 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATATATTATAAAATCCATTTTTGTGATAGAACGTTGTCTACCGACATTTTTTTTTTGCTTTTGCTTT:1 + chrX 14254490 3' - copia 4924 2 56.55 CACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCCCTCTGTCCCCTCATTTGGTTGAAAAGACAGTTCCTTCAGTCGGTTCTTTTGGCGAAGAGGCTGCATGATTTAATTTTTAACGTTGAAATAGATATAGAAGAAGAATA:1 + chr3L 27331189 3' - 1360 3340 1 65.75 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCGACAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAGATTGGGTGTTTGAATTCCCTTCCAAGACA:1 + chr3L 14551063 3' + P-element 2837 1 45.21 CAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGTGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGACAC:1 - chr3R 20486359 3' + accord 7348 2 68.18 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCGAAGAAGGCCCAAAAAGAGCAAAGCTGCATATACACTGAGG:1 - chrX 14951124 3' - P-element 80 1 30.82 AATTATTATTATTTTTTAAAAAGATTTATGGCCTATGAGGGCCTAAGTTTCTACTGACAAATTCTTTGCCAGCTATCAGTCATAAAATAGTAATTTTAGAAAAACTCTTGGCATTTCTTTGCGCTTCGTTTGAGGCGGAAAATGCG:2 + chr3R 18053736 3' + Porto1 4638 1 69.86 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCCTACTGCCCCCGAAAAGAAAATATACAAAACAATAAATTGAAAACATTTACAAAATGTTATTGCTTTAAACAGATAACAAAT:2 - chr3L 20712938 3' + roo 9033 1 58.90 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATATGTGCTTTACTTACTACTATCGGACTGATCATCGTCACCTTTGAGGCTGTCCTTGTTGTCCTC:1 + chr3R 6711531 3' + pogo 2047 1 56.85 TATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAATAAGACGT:1 - chr2R 8641485 3' + diver 6066 2 53.42 ACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACGATGCTTATATATGTAAGCTTACAGCTGGCTATGTCTTTCTGGGAAATCTGGAATAGTTGCACAGCAAAGAAG:1 + chr3L 22978648 3' - 1360 45 1 55.48 ACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTCCTGAC:1 - chr2R 8158758 3' - Juan 67 1 54.86 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCA:1 + chrX 4186699 3' + I-element 5286 1 71.65 GGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATATTTGAAACGAATAAAATTAATGAATTGAATGAAGTAATAGAAGTAGTCAATATTGGTCACATATCTAATTGATTTACACAGTTGAGTGAGAGTACAA:1 - chr2L 21068231 3' + Dm88 4497 2 67.81 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAAT:1 - chr3R 7035270 3' + roo 318 2 79.45 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGCTCACTTTCTCTCTTTCGATTTTCCGCCTGGCAATTGCCGCAAATAGGTCAGTTCAGATGGAGGTTACTGAACTCTCTCGCC:1 + chr2R 10865270 3' - blood 39 2 57.53 TGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAG:1 + chr3R 9160757 3' + copia 5051 2 64.14 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGTAATGTTTTTTTTGCATATCAACACACGTGTAAAGCAAATGTTAAACATGAATGTG:1 + chr3L 9571772 3' + jockey 4971 1 62.59 AACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTACACTTCTCCTGCGACCTATTAAAGCAAGGAATCAACATGTTACTGTATAAA:1 + chr2R 7385034 3' + HMS-Beagle2 6925 2 69.86 AAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACTTTTGCAATAAACAATTTTCAAAGATTGATAAAATATTTTAAATAAAAGTTTAAAAACATAATAAAAATGACTCAAACACTCCAAAACGAAG:1 + chr2L 847292 3' + 1360 449 1 51.03 GAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTGAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGAACGAACTTTGCACGGTGATGGAACATATTCAGAAATGGAA:1 + chr2R 8178876 3' - FB 724 2 71.92 GCTTTAAACCTAGCAACAATACCAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTTAGTTTTGCCAGTTATTTAATATTGATTAACAAATCGAAGCATAATTATTGCTCAATTTCCGACATATATGTATGTACAAATTGTATTG:1 + chrX 7804389 3' - Bari1 419 1 62.32 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGCATGCATGTGCTTTTAGCCTAT:2 - chr2R 19554881 3' - pogo 16 1 73.29 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCATT:1 + chr2L 11951616 3' + pogo 2045 1 61.48 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGGCCACTTGAGAAAATCAGTGCTTCGATACATTTCGTAGCGAGCGGTTGAGTTTGTAGGATAACGGAATTTT:1 - chr3L 16580246 3' + 412 7498 2 54.11 AATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGAAGAATGACAGCAAATAAAAGTTTATGGCACCATCGTA:1 + chr2L 12081324 3' + invader4 2630 1 73.97 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGTGGTCTACAGTGAACCCCTGCAAAGTGGCACACAATCCGTCTGGCTG:1 - chrX 9707150 3' - Doc 76 1 71.13 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGCAAGTTTTGTCAGCTGCAAAG:1 - chr3L 22978544 3' + 1360 3355 1 60.19 ACCCTAATACAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTAAAAGGATACCACTAAACTAACTATTTGTTAAAAGAAAACGTTAATATAACCATATGATTTTTGATCATTCTGCTTGACG:1 - chr3L 1682607 3' - Circe 7156 1 50.00 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGA:1 + chr3R 9352107 3' - Tirant 8108 2 78.95 ATTTAGCTAGTGTGAATGCGAAAGCGAAATTTCATCATATATTCATATCATATCATATTAATATCATTAGATATTGGGAACTAAAATGAGAAAATAATTTAACTTACTTACGTGCCAGCATTTATCCGGCAGAATGTTATGGCTAA:1 + chr2R 16537446 3' - INE-1 531 1 69.86 AATAGGTTTGAAAAACCTATCTAAAAGTTTGTCCATTCACATTGTTTGACTTTCCTATTTCTTTGACCGCGTAATTAAAAAGAGTTGAACTATTCAGCTTTTAAAATGCGATTTGTATTCGATTGTTTCATTTTCGTTTGCAGGG:1 + chr2L 12359581 3' + Tc3 17 1 74.48 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTAAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTTCTTTGATTCGAAGCGCTTGAACTTA:1 - chr2R 7953675 3' + roo 315 2 79.45 AAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAGTTGTAATTGGTATAGAAATACAAACAGACCATCATTCTTTATC:1 + chr3L 25208158 3' - GATE 52 3 69.86 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGTTTTCACAACGTTGAGGGTATAGAATCATTAATCGAGTTGGCAGCACCGTGTAGTT:1 - chr2L 6318896 3' + pogo 2055 1 58.91 GTGTGGTCCAGTCGAGAGCTGCACGTCACGCATCTGGGCTCCCCTGGTACGTGACGAACAAGGTAATCGAAAGAGATCTGAAAGTTACCCCTCTTGAAGAACAATGAAAATTGAATTTACATGTTGCAGATAATTTTTCAAGTGGT:1 - chr2L 7312247 3' + G5 4442 1 65.75 ATGCGGTTGACTGTGGATCTGTCGCATTTGAACTTGGCACAAATTTCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTGAAGCTTTTCCTTTAGTGTTAATTTTTATACGAAGAATTGGTAATCTTGATGAGCGTTTCA:1 - chrX 8521187 3' - pogo 452 1 72.60 AAATAAAAGAAGTCTACTGGAATTATGAGGTAATATAAGGCTTGCATCCCCGGGAACAACAATGTATAGAAAGAAAAATATATCAAAATAAAGTGGGATTGATATTAAATTATAATTAAATGTGCTTATCAAACGATTTATGAATT:1 - chr3L 24131460 3' - Cr1a 3976 1 69.18 AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTAATTCGCGATAGGCGCAGCATCGACGCTTTT:1 - chr3L 24152393 3' - HMS-Beagle2 6895 2 75.86 AAGAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCGTT:1 + chr3R 3320516 3' - 1360 81 1 71.92 ATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACAAAATGGAAAAAACGGAAAAAAATGCAATTGATGTAACCCCTATTAACAAGTGAAGCACCCACTCCACGT:1 - chr2R 24523619 3' + I-element 401 1 52.74 CTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAACAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTCCTTCGAAACACAAATACAAGGTTCCTTGACATCGAAGATCTAAGAAATAAAGTTTAAATTTATAGCTAGCA:1 + chr2L 13250499 3' - opus 12 2 77.08 GCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTAAATTGTATTGACATTTGAAAGAGTAGGTTGAACGACATTGTCGTCGAGCATCGGCGATTGTTATTGCTCTGCTGGCCGCTCTTTTGAAAT:1 - chr3L 12224584 3' + 412 465 2 65.07 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACTGTTTCTTTTTTCTCCATTTTAACTTTTGTTGAATTTTTTTTTCTCATGGTAGAAACTTTGTCCATCTTTT:1 - chr4 1219142 3' + 1360 3342 1 53.42 CTTTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTGGATATTAGGCACAGGAAAGTTTTCTTTTTTTGTCAGCTTGTTTAATCGTCGATAGTCGATACAGAGTCGA:1 - 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Stalker 6916 4 64.38 AACACACAACAACACACACAAACACACAGATTATGTAAGTGAGCGCCTATCTCCAAACCCCAACTGCATTTAAACAATAGCCTTATACTCCAAATTAATTTTA:1 + chr3R 8256237 3' + gypsy3 415 1 74.76 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGACCGAAATGGAAAAACGGC:1 - chrX 12191510 3' + pogo 2080 1 67.18 ATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTTACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAACCAGCAAACAAAGTGAAAACAAGAATAATGTGTGTGTTGGTTGCTCGTATTT:1 + chr3R 18448391 3' + gypsy4 415 2 81.95 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGGTTGACGATGGACGTGTTT:1 - chr2R 5277127 3' - opus 42 4 61.24 GCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGAATTCGTTTTAGCACCACCCCTTGGCACCCTTGGTCTATTATAGTAATAATTTAA:1 + chr2L 2190128 3' - Ivk 183 1 57.26 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGATTA:2 - 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chr3L 10183388 3' + mdg3 5474 2 57.34 GTGATTTTTGTATATGAGGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGCAATACAATTTTTATGCGAAAACTAATGTAAAA:1 + chr2L 2657303 3' + diver 6025 2 75.34 AGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATAGGGCTCTTTAAAGTATTAGTTTTATTGCATATTATTATATTTTCTACAAACTTGCA:1 - chr2R 15829501 3' - invader4 18 2 62.86 AGTAACAATAATAATAACAACAAGCCAAGCCAAGTCAACTCAAGCCAACCGAAACTGCAACGTCTGCTGACCGTTTCTTGGCTTT:1 + chr2L 7861152 3' + mdg1 19 2 55.29 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTATATCGCGATTAAGATAATCAACTGCTCTGCTCTGATTGCGGAAGCAAACGTGGTAAAGATTTCGAAAAGTGGATGGTCACTGATAAATTATCCAATCTCTATAGACAA:1 - chr3R 27478440 3' - hobo 12 1 71.92 TCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATGCGCGCCTAAAACATATGCTGTTATGCGGTTTAACCTATCTGAATGTCATCAA:1 - chr2R 5542351 3' + 1731 4559 1 62.76 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTGACCAGCGAACAA:1 - chr2R 11763593 3' - Tabor 61 2 62.22 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAGTACACTCAAGAAGTAAAGTCGAACGGGCCTCGTCCAATCGACTGGCT:1 + chr3L 22900170 3' + 412 425 2 65.22 ATAAGGATCATTTATTCGACTCAAAACAAAAACAAGTTTACTATATAACTACAAAAATTGCACAACCTAACTTAGCTCGCTAATAAAAGGCTGATCTAGCGTCTGGATAACTTAATCACCAAGGCGCGTGCAACCTAAATTCCTCT:2 + chr3L 25850560 3' + Tom1 369 1 60.27 CTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACATAATGTTCCCGGCCTAGTTTTTTGCCAAGAAACCTCTTAGCTCCGCATGTGAAGTCT:1 - chr2R 4638594 3' + 1731 4560 1 64.38 GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGTGACGTATTTACATTATAAGTACTGTCCAAAAAATAAGAATATGATGAGTGGCAAAA:1 + chrX 22895038 3' - opus 168 4 61.27 AATAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGGCAAGTGACTAACCCCGGGAAAACCTGGCATAATTA:1 - chr3L 905805 3' + 412 427 2 67.44 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAATTACATTGTTGCATGACACAAATAGTGTTGCCTACAACAAGGGGAACAA:1 + chr2L 13704777 3' - hopper 67 1 63.01 ATTATTTAATTAAATACAAATATTTTTCACAAGATCCTCATTCTTAAAGTAAATAAGTTGACCACATTTTTTAGTAATATACATGCAGTTTCTTGGATCTTATAGTCGAAACAATTGAATTGAATATAACTAACATTTGGTAATAA:1 + chr3R 18862693 3' + transib1 1939 1 63.01 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTACAGATACGCTGTTTTAAACGGTGTATAAGACCCGAGCAGAAATAAAAGATCAAACAAAGAAATAAACGTATTAAAAAATG:1 + chr2R 641982 3' - opus 7039 4 60.42 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTT:1 - chr3R 10684729 3' + roo 9014 2 62.33 AGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATT:1 + chr2L 9668270 3' + 1360 3319 1 67.12 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATTGCTTTTTCAGAAGTAATCGGAACCGTGTAATGAATG:1 + chr2L 6319030 3' - pogo 29 1 65.75 ATAGTCGGGGAACTCGACTAAAGTATTCTCTCTTGTTTTTCTTCTATTTTTTTAAAGGCCAGAGTGATTTTGTTAATTTTGCCAAATAAAATGCCCAATATACAGCAATCAAGGAAACGGAATAAATCACTATCTATTTAAATTGT:2 - chr3R 20125959 3' + INE-1 565 1 41.78 GCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTATTGTGGCATTTCGTTGAATAGAATAGAAACAGAGTCTCATCGCCTTTAAAATTGAGGAAAAGCTTCTCTGGCGGACTGCTCTTC:1 + chrX 19281829 3' - opus 25 4 65.71 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGAATGAGTTGATTTCTTTCCGTGTAATGTTTGTTAAAATTTTCAACTAACTCTTCCAACTACCTGTTATTCTACGTATCTAAT:1 + chr3R 20744093 3' - roo 38 2 59.59 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATACGATCAG:1 + chr3L 17890832 3' + 412 480 2 66.67 AGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATG:1 - chr3R 29418687 3' - mdg3 83 2 72.22 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAAAAAT:1 - chr3L 10133519 3' - 412 7133 2 71.23 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTGGAGTATAAAGAGGGGTATCCAGTTGGGGAACTGGGGATTTGCGTGCGCACGCGTACAGCGCCAAAACGAATTAAATGTGATGCACCAGCAAATGATAATTCAATTTTTT:2 - chr2L 16458532 3' - roo 8674 2 77.40 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATGTTAAAATCATTTCCTGCACATT:1 + chr3R 10472812 3' + mdg1 7419 2 57.53 ATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGCCAAAGGGCCAGTTATGGAATCCTAGTACCCATAGATAGTTGCTATTACTCATGTAGTTCCAGCTTACTAGTCTCCTGTGTGTTTTGTGTGCATTT:1 - chr2R 22722987 3' - 3S18 5791 2 66.44 CCGTTGCAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTCTGCAACAC:1 + chr3L 23678144 3' - Osvaldo 37 1 75.38 ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTGAGAGGGGCAGTTC:1 + chr3L 7093077 3' - hopper 63 1 61.38 AATTGCGCTGTTATGTTACTATTACTGCATTGTATGGATTCACTTTGAGCCAAATGTGCCGAGTGCCTCAGGACTCTGGATTCAGGATTCAGGTGCACTGGACAAAGGCCAAAAAGCCGGGGC:1 - chr3R 12339901 3' + BS 5044 1 65.04 AGATGAAAGAAGAATTGAAAAAATAACTGTTCCTATGCGCAAGGAAGAGGCAAATGAAGAGATCTTTTTTATAAACTGTATGCCGATATAAAGTAAATAGTTTATTTAAAAACTTTTCAACATTGTCCATATGTGTTTAAATTTAT:1 + chr2L 14662660 3' + Bari1 135 1 54.79 GGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGACAACAGAACGCATTAAATTTTTCTTACCAATCATAAAAATGCGTCATATAATTGAAGCTGG:1 + chr3L 7995208 3' + P-element 2755 1 45.89 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAG:1 - 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chr3R 17605620 3' + Tabor 7275 2 51.37 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACACGCGGAAATAAAAACCGAAGGCAAATCATAAGCTGTTTTTTTTTATGTTTTAGAAACAATATTCACAGGGAAAGAAATTCAAGAATGCAGAAACAAATCA:1 - chr2L 12319199 3' + copia 237 1 69.18 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGGTGGACGCCATGTGGGTCCTGTTGTGGGTGCAGTTGCACTATGAGTTTTCCACCACAGTT:2 - chr3R 17902538 3' - hobo 25 1 54.63 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCAGCTCCTCG:1 + chr3R 22100602 3' + 412 467 2 51.43 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCACATTTCATTCCGGAGCTCTTTGCCAACACTCATAAGTATGCAACACTTTTTCCCACGGCAGCGGGCGTT:1 - chr3L 17133793 3' - jockey 4736 1 51.41 TTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCTGCTGTGCCAAAGTTTTTTTTTATACATATCAAGAATAAAAGCTTTGCATATGTATTGGGTTT:1 - chr3R 9351987 3' + Tirant 368 2 57.72 TTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGATATAGATATGTACTTTATTCAATGCTTTCATTCTATTAGAATCCCATTGAGGATCTTAACATTTAA:1 - chrX 16383992 3' + diver 168 2 55.48 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCGTTGCCACTCAGCATAGGCCACAAATTA:2 - chr3L 17890706 3' - 412 43 2 56.85 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATTTTTGTTAATA:1 + chr2L 76165 3' + roo 9036 1 61.64 TGGAGCATTAACAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGGTAGCGTTGTGAAATCTCTATATTTGAGTTGCTGGCAGTTTGGAAATCTTAACAATGTATCCTTAATTCCGCACTTTCAAAGCTTATTATTAACTTGCACACTTCAAAAT:1 - chr2R 19873059 3' - G4 3509 1 51.37 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGTGTGACAATGAAATTAGCTTGCAAATTGTGGAGAATTTAAATAAATGACAAATGAATCAAATTCCCCAATTTGGCACTTGATTTTGTGTCTACAAATATGGCAACTTGTC:1 + chr2L 9472137 3' + roo 400 1 79.02 CTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTTCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATTTATTTAAACTTTGTTCGTATAAATGAAAAATGTCTGATTATGTGTG:1 - chr2R 13097874 3' - Stalker 205 4 69.66 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGGCTAGACCGAAATGGAAAAACGGCACAGCATCAATTGCA:1 - chrX 12191495 3' + pogo 2086 1 75.00 AAATATAAATATAAATATATACGTGTCACAATTGGGTGTCAAAAATAAACAAGACACAAAGCGGGACAGACAGCGGGACAGACAGCGGGTGTACCAATGTGAGTGTAACTTTTATTCAAATAATATGCATATTTGATAATATTTTT:1 - chr3L 6691184 3' + Stalker4 7045 4 55.48 ATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGGT:1 - chr2R 982341 3' + rooA 247 2 46.53 TAATAGGTCAGGATGGCCGTGTCGCAGATCATACAAATGTAACGACATTTCTAGCAAATACAAATACAAATTCGATCGACGACGTGTGAAGACGTTTTTATTAATCTAGAAACTGTATAAAATCCCAAATAATTCCTTTCCAAA:1 + chr3R 11260303 3' + invader1 3591 1 70.14 ACAAAAAAAACAAAAAAAAAACACGCTGGTCAATCTTTAGCCCAGAAATTGATTTCCGCTGAAGGAACTCACTTCATGCTGGCCAGGGACATGCTGGAGGTGCTCGCACTGACGCTAATGGAAGCGG:1 - chrX 20461542 3' + G2 3076 6 73.23 ATCAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTT:1 + chrX 12525980 3' - roo 8748 2 73.97 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCA:1 - chr2R 19554925 3' - pogo 60 1 58.90 TTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAATGTTGGAATACCAGATGTAAAATGCGTACTGTGTAAAAAAAATTGGCGTACAAACCAATTAATTCTATGTATTT:1 - chr2L 21731870 3' - copia 5037 2 50.68 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGGTTTTAGAAAAAGCTTTCTCATTAAAACTACTGACAAT:1 + chr3L 16212806 3' - Transpac 76 2 73.24 CAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACTTACCTCATTCTATAATATTAAATAGCACTCCGTAGTTCGTTTACCTGT:1 - chr3L 16212730 3' + Transpac 242 2 64.38 TACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTAGATCTATTATGTGTATAATGCGACCCAGTTCTATGTCTTTGTGCCCTGTGTTTAATTCATTAAAAGTTCTATTTTGGTTTGAGTTAATGAATTTA:1 - chr2R 4312913 3' - gypsy 28 2 64.38 ATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGGAAGGAGGAAAAAGCGAGGAAAAGGATACCCAGGATACCCAGAATACCAAGGAGCCAGAGACAAAGCTGGAGTCGCA:1 + chr3R 27796815 3' - roo 9004 2 68.91 TTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACTCATTATCTATTCCAAGAATTATGATTATCAACTATTATGTATTAATGTAATCAGTTTAAATATTGGTTTTAAAGTGTTTATTTTATGCGGATATCCACATAA:1 - chr2R 20673588 3' + mdg1 404 2 71.92 AGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATAAACTAAAACCTTACGTAAACATAAAAAAGATGTTCACAAAATACACAAAAAAGGTTAAATCAAATATAATTACACA:1 + chr2L 22187602 3' + S-element 1677 1 58.90 TTATTAATTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCTTGTAAGACGCTGCAGTCTGCGTTGGTAAATGTGTTAAGAAGTCGTGTGATACCTGTAAGCTCATTTATATGAATGCTTTCTATTCTATGTTTGGTT:1 + chr3R 3619558 3' - rooA 7511 2 55.48 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATTGATTAAATTATTGTACGTAAAATAAAAAAAAGTGTGAGCCGCAGATACAT:1 - chrX 5150288 3' - roo 8733 2 65.75 AAAAAAAATTACATTAAAACAATGCCAACGGCATGGACCAAAATAAAAGAAATAACTTACGAAAATGCAAGGGTATAAACAAGGTTTTTGCAATGTGATAATATTTTCCAGATAAACGTTAAATAAGAACAAGGTTTTTACTTGTA:1 + chr3L 8026716 3' - transib4 27 1 55.48 GTCAAGGTATGCTTAATGTAGATATAACTTACTGATTTAGAATTATGGACATGGAACACATGTTGTAATTGTTGTTGTCTTTGTTTACGTCTTAGTTCAGGCATTTCACTTCAGCCTCCATTCCGGGAAATTCGACGTGCGAGATA:1 + chrX 22903479 3' + transib3 284 1 67.81 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCG:1 - chrX 12191553 3' + pogo 2058 1 63.64 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTCTATACTATGCCCAGTTTATAACCGATCCCAGTCAACCCCATTAGAGATACCAGATCTTGGTGCTGATGAACCTAGCCCCTTGCAATTTC:1 - chr3R 24122621 3' + roo 9043 1 63.01 GTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGATTTATATGACAACAGCTGGGCGAAAGAATGTCATTCGCTTTAAATGCCTTT:1 + chr3R 12562447 3' - G2 3056 1 64.14 CGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACTTACCTCATTCTATAATATTAAATAGCACTCCGTAGTTCGTTTACCTGTCGAAAACAACATCCGAATGCGAAAAAATGTT:1 - chr3L 16212699 3' + Transpac 5192 2 59.59 ATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTAAAAAAAAAATATGTATACATTCTCAATTTCAGCACACAAAAGATTGAAGTATCTTTTAATGCTGTTGCAAAGTATGCAATGCTTTTTTAAAGGAAAAGTATATATTCAATTTACCAAT:1 - chr2R 8642844 3' + Doc2-element 4755 1 70.83 GTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTAT:1 - chr3R 13582199 3' - BS 5047 1 52.05 TTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTTATTGAATAATTGATCCTAATTTTTCCAACACAAGACGTGGATCAAATCAACTAGATTGCG:1 + chr3R 15618484 3' + Cr1a 4218 1 58.22 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGTTAGCACCAATAAAATATTCCAATGTGATCCAATGACTGTTTTCATG:1 + chr2L 12319356 3' - copia 45 2 53.42 CCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGTTAAGGCAAAGTTCCATAATTTCTTCTGGGATATATATATATATTGGGGATAATAAAATAAGAGAAAATTTAAAAATTG:1 - chrX 21452475 3' - INE-1 551 1 75.21 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTACGGTTAGGTCTT:1 + chr3L 24208253 3' - Quasimodo 16 2 72.60 AAAAAGAAAAAAACAAACAAAACAAAAATACAACAAAACAAAACAAAGCTGCAAAAGGAAACTGGCAAGGAGACCAGTGGGCAGAGGTCCTTTCTGGGTGCGATGCGGAGCAAACTGGAG:1 - chr2L 2095887 3' + gypsy7 5011 2 57.50 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGCTAAGACCAAAGACGCTCCTGCCACATGCGGTAATTGTGGAGAGGCGCACACTGCGTCTTAG:1 - chr3L 26645885 3' + 1360 3363 1 52.29 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGAATTTAATTAGCAAGCGTGCAAGTTATCCAACCCATAAACATAGCACCCTTCCACC:1 - chr2R 4160319 3' - pogo 56 1 62.59 AATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCT:1 + chr2L 9668277 3' + 1360 3326 1 63.70 CCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAATAGGATAGTTAAATTACATTTATATTTATATTTATATACTGTATATGTTTGTCTACGCGTGAGTAACTATAAAATACAATCACAA:1 + chr2R 7942157 3' + R1A1-element 5022 1 58.22 ACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTACGACTTTTAGGGGCAGTCCGCCCCGCCCATCTCCAACCATTCCCCCCAACCCTCGCAACCAGAAAGTGCGCTGGAAAATTTTTATGCGTA:1 + chr2R 11057391 3' - pogo 9 1 67.94 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGTGCCAAACATC:1 - chr3L 17175102 3' - 412 7100 2 53.42 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAAATACCAAATGGGAAATGCCTAGGAAAAGTTTATTAAAAGCATAGCC:1 - chr3L 17707778 3' - Doc 32 1 63.70 TAAGAGTTTTGGGCTTACACGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATACTGTCATTTAAATTCCAAGCAAATGCAGAGGATAACTCAACAAAGAATGGCTTAGATCGAAA:1 - chr3R 7739436 3' - I-element 58 1 60.69 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTATTTCAAGAAGAAAACTGTGGGAAACTAACTGACTCAAATGAAAATGAAATGAAAATTTACCTGGAGATGATTTTCAAAATATTAAAAGAGTTT:1 - chr2L 12553378 3' + 412 467 2 65.75 GGTGAAGGGCATATTTTGTGCATGAGCATACGTGTGCAGACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCCTAGAAAGAACTGTTCGATGTATCTTTTATTAGCATAATGAAGTCATAAACATTGCAGTAGTTAACCCGCAAAAGTCA:1 - chr2L 15859881 3' - 1360 211 1 61.64 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATACTTTATGTAAAATAGGGAGCTGGCGTCTG:1 - chr2R 12543085 3' - roo 83 2 76.71 TTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATAATTATGTATATTGTTTTGAGCTTAAGACACCTATTATTTGTTAGTAGTAATAGTTCACTCAACATACATATATTTTCGTAACGATCCTGTAAACTGGCTTAGC:1 - chrX 4292802 3' + S-element 1704 1 77.40 TAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAATTGGCC:1 + chr2L 16089704 3' - 3S18 25 2 64.12 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATATTGCTTTTTCAGAAGTAATCGGA:1 + chr2L 6319015 3' - pogo 44 1 55.48 ATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGATCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTTGCAATCCGCTTTTAAAACATTGTTTCTCCTTAGAAAATGATATTTTCAAAG:1 + chr3R 29288857 3' + BS 5081 1 67.12 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCATAGGCTCGAAGCTGGGTTCTCACAGTGCATTCATGTTTCT:1 + chrX 22725618 3' + roo 8995 2 72.92 AATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATTATGTGTGAGTTGCCTGCATAAATCCAAACATTTACAATATTTTGCTAATTAGCAAAATATGTGTG:1 - 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Tirant 24 2 70.55 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCTCCTTTTATTTTGGCGTGAAAACTCTTTGAGTATTCACTGTCCGAGAAGCAAAGTTTTTGGTAAAATTTGTTCACGTTGTCACGCGTTTTTATAT:1 + chr2L 13927847 3' - roo 8686 2 69.01 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGAGCCACCCTTGCAGCTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTGTGCCGCGCCCAAGTGTCG:1 + chr3L 22642898 3' - hobo 39 1 65.59 ATCTACCGTTTGAAAGCCAAACGTCAACAACCATCTAAGACTATTAAATCCGGGGACGAATTCATCTTAAGACAAGGAGGAGTTAACACGAGCAAGTTAGAGGGGTGCACATATTTTTTATTCACATATGTATGAATCCCCACAAG:1 - chr3L 23515297 3' + gypsy10 5572 1 68.49 GAACTCGACGTTCATACGGACATAGGGATATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCAATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGAC:1 + chrX 21587774 3' - INE-1 132 1 45.21 GTTTAGACATGATAAGTAGGCAAACTATAAAAATGTTCTATTTATGGGCTACAATAAACATGTCACCGGACAGCATAAGAGGTCATCTTTTCGAGTATATTATCTTCATCGCCTCCCGAGCTGTTT:1 + chr3L 4752916 3' + rooA 14 2 59.52 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGGTAAGAAATATTTTGGGGACATTTGTTATCATTGAACATGACATTTTTTTAAGAACAGTCTCAACACCA:1 - 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HMS-Beagle2 74 2 68.28 GTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATA:1 + chr3R 29418761 3' + mdg3 182 2 60.00 CACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTATTGTCTTTGCACCGACAATATCCAGGGAATGCCTTAAACGCTCATTGGCTTACACAAATGAAGATGGTTTT:1 + chr3L 23062719 3' - 1360 58 1 68.09 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCTTGTGG:1 + chr3R 9160780 3' + copia 204 2 48.63 AACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTACTTTCACATTTTTAGGATTTTGCATCTAATGTCTTAACAAATAACAATCTTATATATCGAACAAAATCGATCACGTTTTCCTCCAGCCTTAGCCTCT:1 - chr2R 22717141 3' - hobo 2473 1 72.41 TGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAATACTTAATGTCTTAATGATACGGTATCTACAACTTGAGG:1 - chrX 7534258 3' + Stalker 7100 4 73.29 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAACACACACACGCACTCACTCGTTGTGGGTCAT:1 - chr3R 28396589 3' - jockey 61 1 53.52 CAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATGGCGCTTTCAAGTGCGGTGTGTGTTTGAAAGTCCTAGAACA:1 - chr3R 15022019 3' + Tabor 7266 2 54.79 GAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATTTAATCGCAAATCGGAATAACGATGGAGAATGTTCT:1 - chr3R 21276483 3' - BS 5007 1 73.97 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTACAGATACGCTGTTTTAAACGGTGTATAAGACCCGAGCAGAAATAAAAGATCAAACA:1 + chr2R 641958 3' - opus 175 4 62.33 ATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGATTTATATGACAACAGCTGGGCGAAAGAATGTCATTCGCTTTAAATGCCTTTTAGCATACAGC:1 + chr3R 12562458 3' - G2 3046 1 56.85 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCACCCGTAAAAGCCAATTTAATATTAATGCCAGTAGTCTGCTCAAAGGC:1 + chr2L 14201516 3' - roo 8669 2 74.81 ATCTTGTTATTCTAGTGTCATTGGTATTAGAGTATAAACAAACCCGACTAAAGTGACAGCGATAGTTTTTAGTTGGACAGCAGGTATTATGTACTCTACACTATTCACAATGCCTTATCTTCTTGTTGCTCACTATCATAATGTTT:1 - 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roo 14 2 74.19 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACAACATGCCTGCCAACGGGGACTGATCAAGACTGAGAGGTACATATAAATATAGGTACATATAAATTAAGAAGAGTAAGCGCCGCAGGGGATCCCTCGCTGCAGTCACTGG:1 - chr2R 2215933 3' - Doc 47 1 39.58 AAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATTTAATATTTGATTTGAAACATTTTTAATTTTTAAGCTACCTAAAATATAGCTATCT:1 + chr2L 11882637 3' + I-element 269 1 61.64 CTAGCTGCGTAAAGGGTATCTGATGGTCGGTGAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTGATCAGGATTACCTTCCAAACTAGAAAATTTCGTCTTTGAACTGAGAGAAAGAAACAATTTAGATCTGTTCTGATATAAAATGAA:1 + chrX 20527500 3' + INE-1 543 1 78.77 GGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGTTCAGATTAAGAATCTGGGTTCTGCTGCTGTTTCACAACTGTTTATCCTTTAATGTTTTTTTGTTGGCATTTTGCAGATATTGTGTGATTTTCTTCTGATAGCATTATCTTACATTT:1 - chr2L 21739408 3' + INE-1 545 1 76.03 AAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTGTCCTGCGCTTTAACAATTCACGTAGTGACAT:1 + chr3L 19481247 3' + pogo 1827 1 78.08 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTCTTTTATGTATTTGCTCTGATTTCATTGCGTTAGCACCAATAAAATATTCCAATGTGATCCAATGACGGTTT:1 + chr2L 12319351 3' - 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Transib5 96 1 75.95 AAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGGAACATCGCTCGAATTCGCTGTTCCGTCAAACTAGTGGAACATTTCT:1 - chr2R 18990460 3' + Stalker4 95 4 65.19 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATTTGATAAGCTTTAGTATTAATATCATATCTTAATTACTAGTTTCA:1 - chr2R 16441820 3' - I-element 75 1 67.81 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAAGTGCTTTAAATCAAGTTGAACCACAAATCGTACAAATCGTATTAATTCCGAGTGCTAAACCTTCCCATCAACTGTTTGT:1 - chr2R 23000019 3' + mdg1 395 2 63.91 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATAACACTTATTTTTTACACCTAATTTATCAATTTATATTTCTTTCATGATGGTCGTTAGTAAATTACATAGCTATTGCTTAAAATA:1 + chr2L 18193144 3' + mdg1 386 2 56.16 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTTATGTTCAAAAAAAAAATGCATCCAATTGTTAATATCTTAGACCAAGTTTTCAAGATAATATCATTACTCAAATTCTCGTAAAAGAATTTTA:1 + chr2L 17029723 3' + blood 7363 2 61.11 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCTCGTGTTTCATTATACAATATTTTTGTTAATAAATAAAATTATGGTAA:2 + chr2L 76181 3' + roo 9052 2 72.60 GTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATACGCCCGTGGGAGCGACGTTATGACAACGATTGCTAATGCAAATTACGTATACGCATGGTGGCACGCTGGCACGCTGGTAAGGGGGGCG:1 - chrX 2852936 3' - gypsy2 6558 2 53.42 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCG:1 + chrX 1103688 3' + pogo 2069 1 68.54 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAATATTGTAGTTTCTGATAATACTGAGCATTTTTGTTTTCTCTCG:1 - chr2R 5868290 3' + pogo 2048 1 72.00 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCTAAAAAGCATACTTTATTCATTTACGATCCTAAATATTTATTA:1 - chr3R 23859839 3' - jockey 4837 1 71.03 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATAA:1 - chr3L 17707824 3' - Doc 54 1 59.02 ACGCAGAATGCGGCGTCTTACAAGCGCTGCATTATACAATTAGATAATAAGAACCTATGTAAGATACCGTAAATAGGTTATCAACATTTCAGCAACAGCTGAAAATGCCCAATTTTGGTATTTCACCATTTGCACGGCAATTTTAA:1 + chrX 21071636 3' + rooA 7461 2 56.85 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTATAAAGTGTTTTGGCATCCCATTCTTAAAACGCTGAGATCCCGTGTAAAGAGCTCCAGTGCTTC:2 - chr3R 7539428 3' + roo 9017 2 55.48 TTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGCCTTTGGTTGGAAAGACTTTACAAAGGACATCTCAGTAAGACAGCAACCAAACGCTGGCTGAGGTCCAAAG:1 + chr2R 2946087 3' + 1360 3329 1 66.44 GTATTTTTTTTTTTATTTTTTTATTTTTCACCGCTTTGTTGGATTTTGTCTTATTCCAATAAGCAAACA:1 - chrX 5086411 3' - HMS-Beagle2 488 7 84.06 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAAC:1 - chr3L 13868650 3' - 412 76 2 74.29 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACAGCGTTTATGCTGCTGGGCTGCTCCTGCAGCATTTGGTGGCCTGATCCTATTCCTGGTCCTTAACCAAAAACGCAAGGGCAGGGCCATTC:1 - chr3R 27822169 3' + I-element 5326 1 69.18 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATTAAGCTTCCCTAAACAGTGGTAAGTAGTGGTAGTATAGTTTCTAACGGTATATTTAGTGCCAAAATATTTGAATTATCAGTGT:2 - chr3R 11750148 3' + Tabor 448 2 59.59 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAATGATGTATTGCCGCCTGTGGTGGTTGATTCATGATTTCCTGGCATGATATACAATTCTTGTAGTTTACTCGATTATAGCATCGGGCCACCAAA:1 + chr3L 23182122 3' - 1360 64 1 68.89 AGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCATGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTTGTACTCTATTGATTTTATCCTATATCATTGTG:1 + chr3R 5027282 3' - Chouto 92 1 97.26 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATGAAATCATTGAACCGGAAACCATAATTATT:1 - chr3R 27794800 3' - roo 64 2 75.61 AAAAAAACATTTTAATTTGAGTAATTGATTTTTAGGAATTATAGTTCTGATTTAAAGTCGGTTCTATACCAGGATTTCACTATTTCCGAAAGACGGTCACAGTTTGCTGACTGCCGCTTGCCAACACTGCAATTGGTGGGCCAAAA:1 - chr3R 16133823 3' + Circe 481 1 57.53 ATTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATT:1 - chrY 680450 3' - invader2 4899 2 72.22 ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAACGCAACTCGGAAAGAAAAGG:1 + chr3R 15022137 3' - Tabor 6880 2 55.71 TAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACG:1 + chr3L 23678149 3' - Osvaldo 29 1 76.42 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATATAATCTAGTAG:1 - chr2L 9485584 3' + 412 7494 2 52.05 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCACGCTCG:1 - chr3R 17305434 3' + roo 9021 2 54.11 ACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCAAACACCCATCTGCCCTTGGACTCTTCGATCGTTCTGTGAGGAGAATTCTTCATGATGATCTTCAATTTCATCC:1 + chr2R 7394617 3' + accord 7338 2 54.11 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGAAGCGTCTTAGACCATATATAGTATATACATACATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTTGCCATATCCGTCTGTCCG:1 + chrX 19550817 3' - hobo 29 1 65.07 ATGCAAAGCTTTTTCTCTTTCCCGCTCTTTGTTACGTTGAATGTTTTGAAAGCTGTTGCAATAATTTCGCCTATTCTCAGTTGGTTACATTTTTAGTTGGCCCCCTAAAAGTAAATCCTACCTTGTATAATCCAGCAAAAGTCGGA:1 - chr2R 24113576 3' + Idefix 369 2 50.00 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAATCACCACAGATAGGACGAAATTGCACATACGCCTCGTAGGCTGGGTAATTATCGCCTTTGTTTACCAAGAAAAAATGATAT:1 + chr2R 19553305 3' + mdg1 7424 2 58.22 TGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACCAAATTATTTATCATTCGAGTATCATTTCAGCCCGCATTAATCAACAAGGGTTAAT:1 - chr2L 8168918 3' - FB 66 1 64.38 ACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGAC:1 + chrX 20999617 3' - BS 25 1 60.71 CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGGGACGTATTTACATTATAAGTACTGTCCAAAAAATAAGAATATGCTGAGTG:1 + chr2R 1478234 3' - opus 7060 4 64.49 AAAAAATAAAAATAATATAATAGAAGAAGGTGTATATTTCATTAGTCAATGTTAATTAACGGACTCAAAATATACCTAATCTTTGAATTATCCCATTAAAAGATAGTGAGGGGTGTATCTTTCTTATAGTATAGTCCGTATGGTCT:2 - chr2L 1303804 3' + Tc3 1569 3 76.71 CTGTTATAGTTCCCGAGATCTCGGCTATTGATCCTTATCAAAAAGAAGGAAAGTGAAGCGTTCTCTGTGCCCCTGAATAACTGCGAAGAATTAAGTACGCCAGTAAGTGGAGAGCACACACGCGCCCATGTGTGGAG:1 - chrX 19370203 3' - INE-1 148 1 69.34 ATACTTTGTATACTTGTATAAATTTTTCATCATCGCTTTTAAGGATTCTTCACTCAGTTTT:1 - chr3R 21257834 3' - Cr1a 168 1 90.16 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACAACGGGCGTCTTCGA:1 + chr2L 22016035 3' - Tirant 8112 2 79.83 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTATATTCTTAGAAAAATATTTGACAGATAGATTCTGACGAACGATATCTTGGAAACTATAAGGGATTACCTTGCAAGTACAATATTTTTCGT:1 + chr2R 24453422 3' - 412 7082 2 64.38 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTACATTATAAATTTGATTAAAACCAAAGAATTCTAGTTAAGGAGCAGCTGACAACAAGGTGTTAAATTTTTCAATTCTTTGGCCAAAGG:1 + chr3L 18467310 3' + hobo 2908 1 63.01 CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGGAATGTGACCAATGTTTATTAATACGCTTATTGTTATTTAAAAAGTTGTAAGTGCT:1 - chr3R 9190433 3' - Tabor 10 2 43.84 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTTCACTACCAGC:1 + chr3R 22100593 3' + 412 7478 2 66.67 GCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGTTGTGATCCTAGAAGCGTTCTTGGTCTTTGGTCTTTGTTCCTTGCCGG:1 + chr2R 4677411 3' - invader3 5 2 80.14 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTTTCGAGCCACTGTGGACGTGTGGGATTCCTTCCC:1 + chr2L 11915578 3' + hobo 2909 1 59.55 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCACTGTAAATATGATTTACACCCGACGACACTTGAGCCTGACCTCCGCGA:1 - chr2R 11133552 3' + roo 359 2 62.10 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAATCCGATTCCGACTTATTTTTAACCCGTTCCCATCGATGAAGAGATC:1 - chr3R 31490887 3' + roo 391 2 73.10 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAAACGCACAGAAGTAGGCTTCATTCTAACACTTAACATGCTCGTT:1 - chr3L 12867267 3' + roo 9032 1 45.89 ATGAATATAAACAATGCATCGACGGCGCAATTAAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTTCAAACATCTATATAAATATAACAATTTATGATGGCTCT:1 + chr2R 12816067 3' + invader2 309 1 73.29 GTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAGAGCTAGACGATCGAGATTCAGCATACAAATTCTAGAGAGAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGGCCCACAAACATTTCATATTTTTTCACATTTTTATTAGTCTTGTA:1 + chr2L 22063442 3' + INE-1 129 1 60.27 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAAGGGGAGGGGCATGTTGGATGCTATGCAGCGTCACGTGTTTCCTGTTAAATGCTCTAATGATGGG:1 - chr3L 16562845 3' + roo 350 2 56.16 GGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATCTCGAGCGCTACAGCGCACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTAGTAGCAGACAACTGTATGAATTACTACTTCGTTGGTTATGAAAACCAAATGCGGCTGACGAG:1 + chr2L 14289632 3' + 1360 76 1 63.78 CAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCACTCCATTCCGAGCCATTTTCCCTCGCATGTTAGCCAGC:1 + chr3R 20486404 3' - accord 69 2 74.62 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAG:1 - chr3L 9497778 3' - jockey 4815 1 72.00 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATTATCTGATTTGCCTGGATAGCTGAATACCTTTTTTAAACAATGCACACCAATCATGACCTCAG:1 + chr3R 11113318 3' - mdg1 9 2 78.57 GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGT:1 + chr3R 9160750 3' + copia 174 2 69.18 AAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTAATTCCGGATGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGCAACAATTGCGGAAAAAATAAA:1 - chr3L 24934266 3' - HMS-Beagle2 6913 2 65.07 ATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTTACTCGAATTATG:2 + chrX 22574720 3' - 17.6 90 2 45.89 GCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCG:1 + chrX 6138702 3' - opus 182 4 75.94 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCATAGGCTCGAAGCTGGTTTCTCACAGTGCATTCATGTTTCTAATTGTCTGTGTGTGGGATGCCTACGTCAGCACTGAAGCACTACGGCAGCA:1 + chrX 22725669 3' + roo 9044 1 65.75 GGATCACCTGGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAAGATATAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCGGCAGCAAAAGGTTCGAGATTCTCGACCTCTCATCTTTCCCAGCAAGTGGATGAAGTCGTC:1 + chr2L 6851054 3' + GATE 290 1 67.12 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTT:1 - chr3R 19589913 3' - BS 5034 1 50.00 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTGAATGTCAACCTAAATTTCTGCCTGCCTCGGCATTTTTTTTTTCCATT:1 + chr3L 16580349 3' - 412 72 2 66.44 TTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGAGTGGAAGCAAAAATGTGAAGCATATTATGCTTCTATATATATTATATTATATTATATTGTTGCTTATAAAAACCACAAGAATAGGACTTTTGCATCCCCGCAGCATGTG:1 - chr3R 2679204 3' - rover 7147 2 48.95 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTGTGGCAAAGGTA:1 - chr2L 12079627 3' - mdg3 83 2 71.23 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGACCAATCCGCTTAAGGCTACCCCAGATTTCCTTGTAAAC:1 + chr3L 16973511 3' + S-element 1702 1 72.60 GATTTTTGTATATGAGGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGCAATACAATTTTTATGCGAAAACTAATGTAAAAAA:1 + chr2L 2657305 3' + diver 6027 2 73.97 CTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGAAATCCACTCTATTCAAGGTCAGAGCCCAACCTTTTCAGAGGCTTTAGTTAAAAATGTTTAGCCTCAG:1 - chrX 9035001 3' - opus 418 2 50.74 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTGTCGGTGCTCA:1 + chr3R 18815959 3' - hobo 66 1 66.67 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAA:1 - chr3R 17605617 3' + Tabor 439 2 53.42 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAATGCAAACACCTACTGCTTAACAGGGATAATATCGTTTTGTTATATGTATTGTTAGTTAGACG:1 - chr3R 19223051 3' - FB 48 1 58.21 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATTTTAAT:1 - chr2R 5922944 3' + jockey 4966 1 44.78 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCACGCCGACAAACGCTTCGTGCAACTTCGTGCAGCTTCGTGC:1 - chrX 14826118 3' + P-element 2837 1 38.14 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATG:2 - chr3R 29418687 3' - mdg3 5337 2 73.29 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGAAGCGTCTTAGACCATATATAGTATATACATACATGTATATT:1 - chr2L 14934838 3' - hobo 56 1 68.55 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTG:1 + chr3R 20175777 3' + hopper 1354 1 70.87 AACATCGTCTGCGTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATGTTTACTATAGTTATTTCATTATAATTAATTATTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTCTATATCGCGTCTATCTCACGGTTTGATTGCTCTTT:1 + chr2R 4517335 3' - Q-element 570 2 78.77 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACGAGGTCCATCAAACGGATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGAGCAG:1 + chr3L 23398234 3' - 1360 14 1 76.03 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGT:1 + chr2R 4029377 3' + 297 6896 2 74.66 AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATCATCTACGAGTATATATCTGTCCGCACTCGGCACT:1 + chrX 4186701 3' + I-element 5269 1 73.97 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGAGATTGAGATTGTTTTGATTCAAGAACTTATATTGCTTATATAGCAGGTTGTGATAGAACCTTTTTCTTATCTCGGCGCCTCATAATTA:1 - chrX 19536866 3' - roo 8697 2 61.64 GTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACGCATTGGTTAGCCATTTTTGATATTTTTGTAATGAGTGCGGATGACGTGTGTAC:1 + chr2R 5542434 3' - 1731 70 2 62.33 GAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACATTGTTTTTGGCCATTGTAAATTGCCGGGAAAATTTAGCTTTTCATTGTCGTGTAAGAGTTGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCA:1 - chr3L 23909059 3' + aurora-element 4109 1 67.81 CGGGAGAGCAAGAGCGCGCTCATTCTTGATTTGTTGGTACAAGAAGGTTCGTTGGGGTATGGGTTATTGGCCTCTCGTTGTCTGCGTTTGAGTTGAAAAGTACGGTTATACGCCGTAAGCACTCAGAAATTTTGTGAATAATAGTG:1 + chr2R 9412533 3' - F-element 366 1 71.92 CAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACTATTTAAAGCTGCAGAGTTGCTCGTATATTGCCCCCACATAATTAGTTGCGCTTAAAGTTTGGTG:1 + chr2L 1554296 3' - 412 444 2 53.79 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGACAATGCCAGTGGCACGAGTCGCTCTCTTGGAAAATTTACAAA:1 + chrX 4778277 3' + 412 7514 2 53.39 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTTATTAGCGGC:1 + chr2L 1558699 3' + 412 7463 2 74.66 TAAAAAGTGTGTTTGGTTAAGGTAATTCATATATTTAAAAGAGCAATAAATAAAAAAATCTATTTTCAAGATTAATTTGATCAGCGAGGTGGGCGGTTGAAACCTGAGCACTGAACTTACCGCTTCCACAGGTTACAGAGCACTG:1 - chr2L 21704579 3' + HB 273 1 63.45 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTATGAAATCACGAAAACGAGTATTAAAAATGTATTATTATGAATAATGTTTATAAATGTTCAATCTCTGTTGTTGTT:1 - chr3L 23986495 3' - opus 7043 4 53.10 TTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATATAATATGTTGCATGTTGCGACAGTAAAAGTAAACGAAATATGGAAAATACAAGGCG:1 - chr3R 13176345 3' + Burdock 195 2 63.01 GCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAATAAAAAAAAAGAAAAAATTTTCTTTTAACTAAAAGCCGCGAAA:1 + chr3R 20467657 3' + X-element 4649 1 76.52 GATATTTCCAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTATTAGCGAATTTACCGCACAATCTATAAATAGCCGAACAGTACA:1 + chr2R 21371524 3' + roo 9023 2 66.39 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATCTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGTGAATCCTAAAGCTAATAGCTTATTGATTAAATTACCCACCTATTAGTGATAGC:1 - chr3R 23639145 3' - pogo 63 1 60.27 CATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCTTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAA:1 + chr2R 4261947 3' + invader4 202 2 69.18 GGTAGCACCCGCACATAAAATTTTTGGGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCAGCTTTGCAGTTCTCTGGTTTAAGCTTTTGTTTGTCCACTAAAACGATTGTTCAATTAAACATAGCAAAACGATTTATCCATATATGTTCGTA:1 + chr3R 17867864 3' - hobo 50 1 52.05 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATGTAATCGACAAATCGAATATCCAAAAATACCGAAAACATATGTGCGATCGCGATTTCTTTGAGGATGAGTCAACGAAAGCGTTTTAATTAAA:1 - chr2L 436425 3' + copia 227 1 67.12 GTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGCCATCGGAAAATTATCTCCTATAATTTTCTCATTTA:1 - chr3L 24152423 3' - HMS-Beagle2 42 2 55.17 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTCTTCAAAATCCATAGCATACCTTGAGGTGCTTTTGAAACCGG:1 - chr3L 9497705 3' - jockey 4788 1 67.81 GAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATATGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGCTG:1 - chr2R 11763605 3' - Tabor 6923 2 73.29 TTCTGTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTGTTGTGCAGAAATGCATTTACGTGCGTTATTTACAGAAGCCAGCAAGTGAAGTGACGGCTAATAAATAACCGGTTATTGATAAGTATTCACTTGCATCGAATCACAGCGGACAGCTTC:1 + chr2R 7477794 3' - gypsy7 5014 1 59.03 AGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTTACAAAAAATTTGTTTTAATCTTGTTGTTAGTTTTTATTCAAGAAGATTCAGTAAATAAAAGCAAAATTTATTAAAAAAATTCAAGAATTTCAAGAATATTTATATAAAACATTTCAATATA:1 - chr2R 5374746 3' + F-element 4581 1 71.23 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTCCATTGAACCCAATTGAGCCCCGATAAGCAGTACAAATGCTAGGCGATGTGAGTGCAGATTTAATTTATTGATTTAGGCCCATCGTATGTGTTAGCAT:1 - chr2L 4998069 3' - FB 24 1 67.81 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGTTTATGTATGTATATGGCTATATAGACTACAATCCCAAACAGAATCGGAGACATACAAATGGGTGGGCTTTGGAATATGATACATCTTG:1 - chrX 16828902 3' - Quasimodo 23 2 69.18 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTGAGAAAAAGGACACGCCAGCAGGAGACTTTCGGAAATATGAAAAATATTGACTATAAAGCGACAAGTTAACACGTAATA:1 + chr3L 13827381 3' + hopper 1375 1 58.22 TTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATT:1 + chr2R 21402698 3' - mdg3 5311 2 54.79 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGTACTGTGTGATATTGAAATATGTGATTATGATAAGAATCATGCTTGAAATATATGTGAATCATCAAGAGTGATATTAAAGATACCACCTG:1 + chrX 6707890 3' + hopper 1389 1 67.81 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACATTAATAAGACAACGGCAGCAGGAGAACACAGGCAGC:1 - chr2R 11763607 3' - Tabor 6900 2 69.42 GGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGACGGTCA:1 - chr2R 21402611 3' + mdg3 168 2 67.81 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTAATTGCACTTTGTTTGGGTATTGCATAGGAAACTTATCATTAAAATAGTTGTTAAGCTTGTTTAGTTAC:1 - chr2L 15987964 3' + roo 9032 1 54.07 AAAGTTGCACAGCAACATTGTCCGCAAGCAACCCGACCAGCCAAAAACTTGAGTAACCAAGAGCTAGAGGAGACTTCTCCGACACAATAAAGACCACTCTGGTTTTAAACTCGAA:1 + chr2R 5071068 3' + Tirant 8239 2 64.35 TTGAAAATTTTTTCAAACACCTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTAGCAAATGTTGGCCTCGTATGTAGGCACCATACGTGCCTACTTTGACACACACGGCCCGCGCAGCGATAATTTAAACAATAT:1 - chr3L 24149440 3' + hopper 1036 1 67.69 AAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATTTTACGGCTTCATTTCGGCAAACCCAAGCC:1 + chr2L 9198348 3' + S-element 1636 2 79.86 CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGATCCGCTACTGAGCTGACAAGAGAGCTTCTGTGAGTCGTGCTCACAGAAGTAGAACATGCA:1 - chr3L 23608505 3' - Tabor 62 2 57.53 ATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCTCTATTATATGTGTAACATAGAAATATTGCGATTTTGGTAATTTTCTTAATTCCTAAAGCCGGGATTACGCGAATAACCGGGTGGGGATTTCC:1 + chr3R 11749770 3' + Tabor 456 2 64.38 TGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATCAGAGGACACTCAATGGCGGCAGCAGGAGCACGG:1 + chr3R 26520446 3' - FB 87 1 76.03 AACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGACTCTTCGCTGATTTTAGTGCTTTAGTG:1 - chr3L 7093007 3' + hopper2 1519 1 76.71 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAG:1 - chrX 12138956 3' + roo 324 2 76.71 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGGATTATCTTATTTCAAAAATTAGTTGGTAAATTTAAATGT:1 + chrX 10567846 3' - roo 8744 2 73.97 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAATTTCACA:1 - chr2R 17890854 3' + Tabor 7279 2 52.05 GTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACT:1 + chr3R 435947 3' + 1360 2977 1 59.86 ACTATTATCAACAATTTGTCTAAATGAAAAAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAAACACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCATCGCGCTTGGCCAAGCACAGTGGCACATCCG:1 - chr2R 14350690 3' + transib2 2405 1 78.77 CACAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTCGACTCGAGAAATATAGCAATTTCTCTTGTCGATTTTGTAATAAAGGCAGAAATCCTATGTGAGCCAGAACGCTATCATGTTAAATACTCTTCAGTTAAATACTTTTA:1 + chrX 22784154 3' + INE-1 541 1 69.86 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATTATCTGATTTGCCTGGATAGCTGAATACCTTTTT:1 + chr3R 11113289 3' - mdg1 34 2 59.56 ATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATGTTTTCGAATATAGTACAGCTTAAATGTCAAAAATGAACTTTTAAAACTACAGGCGCAAAGTAATACATTTTTAGATGTAAGCATTTAAATAACAAAATCTGTGCTAG:1 - chr3L 12976201 3' + invader4 320 2 45.52 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCACAGAGGGAAAAATAAAAGATTGCTATTTTAGGAAACATGAAGAGATCGCAATCATTATTTACTTTAGTGTTAACTTACTCAACTGCAAACTTA:2 - chr3R 10472658 3' - mdg1 7067 2 65.75 AACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAG:1 - chr2R 3338793 3' - Juan 68 1 63.45 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCATATAGAAACGTATATGTACCATACCATATAGATCCACAAC:2 - chr3L 13868650 3' - 412 82 2 75.34 AATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAATTATCAATATTATTTTTAATATTTTATAAATATAAAGGATTATATTTATTGCCAGTCACTAAGCTTTTATATAGCG:1 - chr2L 15918478 3' + X-element 4667 1 50.00 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGA:1 - chr3L 25406614 3' - 1360 21 1 73.97 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAAAGGAAGCGTCTTAGACCATATATAGTATATACATACATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 - chr2L 21738000 3' - hobo 48 1 56.20 GGTAGTATAAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGAATATTATTGCTATCTCGCTCTTACTTATAATCTAAGTGACACAATTATCGATTAATCACTA:1 + chr4 732392 3' + invader3 5190 2 72.60 CCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTG:1 - chr3R 17897139 3' - hopper 83 1 75.18 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGTTTTTCTGCAGGGAAATAA:1 + chr2R 10695927 3' + roo 9063 1 76.71 AGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCTCTCAGCAATCATTGCCTCATTAATTTTTCACACGTTGCAAGCTGAATACTAATTCTAATATATTTCCCAGTTGAGTATATATGGTACAAATAAATATGAGTTTATTTAAA:1 - chr3R 9154360 3' - 1360 481 1 65.75 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTT:1 - chr3L 18658918 3' + roo 320 2 80.14 GTCAAAACCAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGGTGCGACGATACAGCTATAGCTCTGAAGATTCTCCCTTTCATTCACTCGCACCCATGAACCCATC:1 - chr2L 3891075 3' - jockey 4773 1 49.19 AGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCATCATCGTCATCATGTTCCCAACCAAGCAATGTTCTCGGAAGGTAGAACGAATTGTGTTGTCCTCACTGATCTCGTAAATCTCGACATTTCTTGTACA:1 + chr2R 8641640 3' - diver 5909 2 67.12 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGCAGCCCAGTTGCAAGTTCGACTTGTCTCAGC:1 + chr2L 16458724 3' + roo 394 1 74.29 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTGAGAGGGGCAGTTCAGGTTCAATGCTGCACATTATACGCG:1 + chr3L 7093103 3' - hopper 32 1 60.71 CTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGTACAAAACACAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTACAATATATGATATCCTATTATGCGCATGCAAACGTGCGCCAAGGAGGAAAAAAACTTTGCCAAGGA:1 + chr2R 14569944 3' - Cr1a 165 1 61.64 AAAGTGTTTTAAAAACTATGATAGTTATAAGATATTGTATCAAAATCCTAAGTCCTGTAGCCAGTATAGTGTATTTGAAGGCACAAACAGTCATTTTAAAAAATAATATAAAATATTTTCTAGATTTCATGTTATAGTTTTTCGAA:1 + chr2L 1005856 3' - Juan 3777 1 43.84 AGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATTCACGACGTAATTGGTTTCCAACGTTCACACATCATCACTCATACGCACTGT:1 + chr2R 19352056 3' - Burdock 6166 2 51.82 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCCGTAAGCCTGCCTAGTGATAATTGCAATTAAATTCAGT:1 + chr2L 2030077 3' + 412 430 2 67.44 ACCAACATAATTAGTTTAATTGGCGCTCAACTAGCGGGAAATACGCACCCGCCCACATCATACAGAACATGTACATCTTCGACACAAACCATAGTTTCAGACCAGTGTTACAATGCTTATTATCGAAAAGTAGAAACGTCTAGATA:1 - chr2L 21285737 3' + gypsy6 387 1 73.97 GGTTTCATTTAAAGTGTTCATATTGAAGTGTGCACCAAATCACCAGGGTTCTAGCCAAAACTTGAACCCTGGGATATTTCCCTGCAAATAAACAATTGTGCTGCTGTCGCACTGCCA:1 + chr3R 17295637 3' - X-element 321 1 64.96 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGAAATATGCCAAGTCCAGAGTGTCAGCTAAATTTCCGTTGAATTTCAGCTGAATTGCTCATAAAATGACACGACCAAACATCAATATGATGATCAC:1 - chr3R 17113986 3' + roo 9048 2 69.86 ATTTCAACAAAAAAAAAAACAAGGCCCATCGCATTTCATCAAGGGGTGTCAAAAAATCCTGAAACATATTGGTAGTACAACAAAAAAAAAAGTCCTAAAATCTTGAATATCTTGCGGCACAGACTGATTTTCCAA:1 - chrX 11965201 3' + transib2 2637 1 68.15 CGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGACCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTAAATCTACAACCAATGTAACAGCTAGAAGCAAATAATGTCAAACCCATATTGAAT:1 - chr2L 8959864 3' - Ivk 5102 1 64.83 ATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTCTTTAAGCCCAGTTTGTTTGCCTGTGATCGGTCCCTACACAAACAGGGACCTAAAATGACACGACATTAAATGTCAGCTGGAGTACCCCCACTTTTTTGTCAGCCAA:1 + chr2L 14625455 3' + INE-1 560 1 65.07 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTTGCTCCCCCAATGCAATG:1 + chrX 6510096 3' - jockey 4742 1 64.83 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTACGACTTTTAGGGGCAGTCCGCCCCGCCCATCTCCAACCATTCCCCCCAACCCTCGCAACCAGAAAGTGCGCTGGAA:1 + chr2R 11057377 3' + pogo 2064 1 51.72 ATATGAATATATGTATATATATATAGATTTATATGTGTTGGTGGTACTCGAATATACATATACACACACTGTATGTTTCATGTGCAAATTGAAC:1 - chr2R 22063105 3' + G3 4507 1 68.09 TCTCACGAATCGAGCCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGAT:1 + chr3L 23940541 3' + Cr1a 4384 1 60.96 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATA:1 + chrX 4785151 3' - roo 63 2 71.88 GGGCAAAAAATGGGCAAACTATTCAAGCTTTTAAATTTTAAAAATTAGATTTTTCTGAACACAGCTTCTTTGAACTGACTTTTAAGATTTTTGTAGACAGGGCATCCGCTCTACTTAAGGGTATTACAGCTAACTGATACTGCTTA:1 + chr2R 12130848 3' - FB 55 1 73.29 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGGCAGGCTCATACATTTTTTTCTGCTGCTGCTGTAACTTTTT:1 + chr3R 8709838 3' + jockey 4948 1 63.16 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGAC:1 + chrX 4778236 3' + 412 7507 2 77.38 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGTATTTACCAAGTGTCAGTCACTTTTTCTGCACTTTCCTTAATTACTGTCATTGGCCGCC:1 + chr2R 6842860 3' + roo 347 2 58.22 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATATCGTTGCATATAGTTTAATCGACTTCAACAAACGAAAGCCGATATTAAAA:1 + chr3R 25904257 3' - 412 7121 2 67.81 GAATGTCTTTTGGTTCAAGCTGTACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCATCGAGAGCGCCAAGCGCCAAATGCCCGAGGAGGCAGCCATGCAAATGATCCACG:1 + chr2L 9427655 3' - hopper 485 1 61.15 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATAATGACCGGCATTGTGGGGGCTTGGAATTGAAGAGAAGTGATTGCAAGTAGTTTTCTGCGAAGTAGTCTATAGTGACGGTTTATC:1 + chr2L 436582 3' - copia 37 2 58.22 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATAAGAGGGGGAAACCACTGCGCCCCGCTGCGAATTATTAACTTTGGAATGGGGTTGGCATGACACCTAGCTACTGATTACAAGTGCTGAAAATGTTAAGGGGTG:1 + chr3L 2885379 3' - S-element 8 2 73.38 AGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGAAAAGTTTTT:1 - chr3R 17656399 3' + mdg3 5411 2 75.34 ATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAACAAATAGAGCGACAGCAGCTGCGACCCGC:1 + chr2L 12608457 3' + G2 2658 1 75.21 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCGAAGAAGGCCCAAAAAGAGCAAAGCTGCATATACACTGAGGAAATTGCATATATCAACCAAGGTACGCTCACATATGTCG:1 - chrX 14951085 3' - P-element 40 1 57.93 TATATTCCTGATCAGGATCAATGTCTGAATCCGAACGTCAATCCTTATGACCGCCTTGATCTCAGAAACTATTAAATGAACTGTATTGCAGAAAAACGCGAAATTTACTTTATTGCAATTATTGACGTTCTTACACAATATGGAG:1 - chr4 1192717 3' + INE-1 83 1 55.17 GCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGGCATATTTGCATACATTCTACTACTTCATAATGCCCAAAA:1 + chr2R 22723100 3' + 3S18 6023 2 72.41 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACTCATCGTACATGAGGGATACTCTTAAGTATGTAAACGGGAGCAGCTTTAAAGGACGATACGATCAGTGGTTGGGTGAACTGGAAACTAACGAAG:1 + chr3L 17890860 3' + 412 7520 2 67.12 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATAAATAAATTTCTTTTACTGCTGCCTGGGCCAGATAGCGAAAAAC:1 - chr3R 15885147 3' + I-element 5280 1 71.92 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCG:1 + chr2L 9485679 3' - 412 66 2 61.64 GTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAATAAGACG:1 - chr2R 8641486 3' + diver 6065 2 52.74 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAGCAACAAACATTTTCATTCGTTTTCGCATCG:1 - chr3L 14550956 3' - P-element 16 1 57.43 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAATGTGGCATGGAAATATTACACATACGCCCATTGCGCCCTCAGCCTAAAAGTATGCAATGGCGAATGTTGGGC:1 - chr2L 2004912 3' - jockey 32 1 62.30 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGAGGCCATTCAAGTCTTTA:1 + chr2R 18482529 3' - hopper 21 1 68.66 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAACTTTTATGAAATTAAATGTTATAGAAAGTAACTGTAATCGATCAGAAGTATA:2 + chr2L 6318992 3' - pogo 67 1 67.12 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGTTTTTCTGCAGGGAAATA:1 + chr2R 10695926 3' + roo 9062 1 76.03 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCGAGTGTGTGCATCGAAATTATACCGAATTTCGATATACACAAGA:1 + chr2L 8366596 3' - 1360 65 1 67.41 AATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTACATAAGTACCTAAAT:1 - chr3R 3922964 3' - Cr1a 74 1 72.95 AAAGTGTTCATATTGAAGTGTGCACCAAATCACCAGGGTTCTAGCCAAAACTTGAACCCTGGGATAGAAAGCTTTAAGCTCTCAAACATTGTGAACTCTCCGACATGGACCGCATAACCTTGTCTGCTGGAGGAAGCGTG:1 + chr3R 31560594 3' - X-element 311 1 62.86 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGGGCCTGCTCCGATTCGGAATCATTAAATAGACGACAGGCGAAATCGAAATTGCAG:1 - chr2L 11951520 3' - pogo 48 1 57.69 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTAAACATTTTTTTTGCACTATCAGATCAATCAGCGCTGAACAAAAAGTGAGCGATGGCCAAGTGGAAATTTAAACGAGTTTTTCCA:2 + chr3R 15924721 3' - Quasimodo 27 2 67.81 AATAAGGGATTTCCTTAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATCAAAATGAACTAATCTGTCTTAAGGACAAAATAATTGATAGCTGGGCCGGAGTAAA:1 - chr3R 2914316 3' + Circe 7009 1 73.29 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAAAGCCCATTAAAGTGACTTATGTACCGGT:1 - chr3R 30634888 3' + roo 9050 2 71.23 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTGTATCGATTTGTATTTAAACATTTAAAACATATGAAATGTTAAATTCGCC:1 + chr3L 23986613 3' + opus 7436 2 66.44 GCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAGAGATACACAGATCTACAGCCACCGAATGCCCCCAGTCGCCAGTTCACTTTGCCTAATGCGATTATGCGGGTCTGGAATGTAGGTCCTTTGTCCTTGCTTAG:1 + chrX 13426263 3' + BS 5070 1 73.29 ATATAAAAATATTAATTAATTATTTTTGTTATGTTGCTGTTACTCGGCATTTGAAAATAATTAAAACTTGTCGCAATCAACAAAAACCAAACAAGCGTCGCGAGCCAAACAGTAAAGCAAAGTGCTGAAAAATCAACAATTGGACG:1 - chr3R 18691601 3' - Tc3 273 1 63.01 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCTATTTCTATGAGCGCTGTCCTTTTTCATTGCT:1 + chr3R 28728722 3' - jockey 89 1 77.69 ACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTAACTGACATTTCAACATGGCCAGGACACGTACTGAAAGTTC:1 - chr3R 20061696 3' - Bari1 45 1 62.62 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTCCATTATCCTCCTCATGTCGCTGTGCGAAAATCTAAAACAGTGAAAAAG:1 + chr3L 16562938 3' - roo 59 2 65.41 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAG:1 + chr2R 19555027 3' + pogo 2078 1 56.19 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGAACACGCGGAAATAAAAACCGAAGGCAAATCATAAGCTGTTTTTTTTTATGTTTTAGAAACAATATTCACAGGGAAAGAAATTCAAGAA:1 - chr2L 12319214 3' + copia 222 1 58.90 TCTTTAATTTTATTTGTTAATTATTTCCAGCTCATGACTGAATAATATTACGAAAAGCCCTTTTCGCTTTCTATGACAAATTTGGCCAAAATGATTTTCAGTTTCAGCCGCTTAA:1 - chr3R 9914099 3' - HeT-A 315 1 71.30 TGAAGAATTTTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTGTGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTTACGCTATTTTACACCGCTTGACAAATAAACTA:1 + chr2R 20133119 3' + hopper 252 1 74.82 TGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATGCGCGCCTAAAACATATGCTGTTATGCGGTTGAACCTATCTGAATGTCATC:1 - chr2R 5542353 3' + 1731 4556 1 64.38 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACACACACACACACACACACACTTGATATGACACCCATGTAATCCTG:1 - chrX 13395274 3' - roo 8695 2 60.58 AAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTAGATCCAGCATCTCGTATTTAAAACTTAAAAGCCTTCACACCTGAATATCTTCAACATCTAC:2 - chrX 21083920 3' - HB 67 1 58.22 ACAAGAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCG:1 + chr3R 3320514 3' - 1360 83 1 74.66 CACACCAACACACACACACACACACACCTAGTCGCACACACCCACACAACAGGCAATTAATCCCAATATAATGCTTTTTATTGCTATAAAGTGATTTGAAAAGTAAATATATATTACAAGACATTTATTTATATACCATTTCGTAT:1 - chr2L 16863357 3' + gypsy3 419 1 50.68 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGATACTTTTCGGATATGCGACAAAATCGGACGAA:1 + chr3R 6388776 3' - jockey 67 1 71.93 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACCCTTACGTAATTCCGGCAACGCAATCCAACCCATGCAACACACGTGACAGCGGAAACAACCAGCCAAGC:1 + chr2R 5955046 3' + copia 240 1 49.31 GTCGGTCGTCGCCACGCAGACATTGATTATTATTCAATAAACTTACATGCGGCAATCCAGCAGTTGTAGGCATTCTGAAAAAATTTACCTTGCATTAGCAGACGTATGTGTACATATGGTTGTTGTAAAAAGAGAACATACCTGAT:1 + chr2R 4187743 3' + gypsy7 5371 2 70.55 GTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGTGGGGCGGCTGAAGGAGCTCTAATCAGAGAAAT:1 - chr2L 12340720 3' + diver 6065 2 52.05 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATGTTGAAATAACTAACATTAGTTGAAACTACAAGCGAATAAGATAAACGAAACAACAAAGCTGTGCAAAAATATTTGGCTTAGTA:1 + chr2L 1260042 3' - Burdock 6168 2 57.53 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAATTTTATCTTCGGTGATAAAAGCCGCCTTGTAATTGGGAATAATCTGAAAGTGTAAACATTTAATTATGGGCTTACACTACCATTTTGAATTG:1 - chr3L 11776634 3' - mdg3 32 2 59.59 AGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATAACGGAAAAATCGCTCGACAATTGATGGTTTGCCCATCGACAAAAGTGAATGATTGAACAGTAGACTGATTGAGTGGCCTTGCACTGGGCCAAAATGCATCGAAAGGG:1 - chrX 10064213 3' - S-element 307 1 70.63 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGGACTAAAATGAAGTTTCATTGAAAACCCATACGCAGATTATTAGTTCGCGTGCTAATTAATAATTCGAAGACTACGAACATTCAAAAATATTTCGAGTAGCATCCT:1 - chrX 22610638 3' - pogo 13 1 67.12 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTGCGGCATCAAATTTCACGCACACACACACACAAATAAGCGGGGGATGGGAAAATCGAGTGGG:1 + chr3L 7995511 3' - P-element 24 1 59.46 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTATTTATTTGAATTTTGTATACTTACGAATATTAAATATGAATTATTTGCACTACTACTACTTTTGTTCTCGAACTACATTCATG:1 - chr2L 17029566 3' - blood 37 2 58.22 TCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTATAACGTCACACGCTAGAAGTCTATAAATGGAAGACTTCTTAAACACAGCCGCAG:1 + chr2R 1921504 3' - mdg1 7090 2 56.80 ATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTAATGGTGAATTAGAATATGAAAAGAGCATGTTCATTTTTTTGCACTTAATTTTTCAGTATCAAGAATTAGGTTGACAAAGAGCTAT:1 + chr3L 23038899 3' - pogo 1969 1 61.64 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAA:1 + chr2L 686067 3' + roo 9048 2 56.67 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAGTCCAGTTTAAAGG:1 + chr3L 7962293 3' - blood 7070 2 56.85 CTTATGTGCATACATATGAAAAAGAATTCTTATGTGCTACGTGGCTATGTGCCTGCCAGTGCACTATGGTCTAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATA:1 + chr3R 27036955 3' - Tom1 178 1 60.96 ACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGTAGGGGGGGGGTTTAGGACTCTATCTACTTGTATGGTTGGAG:1 - chr2L 7400419 3' + I-element 363 1 71.23 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGC:1 - chr2R 19554902 3' - pogo 37 1 60.27 ATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGACTTACTCAGTTCT:1 + chr2L 18149515 3' + Bari1 1630 1 70.55 GAAGCAGACACAGCTCATTCACTCCCCGCTTCGTGAATCCTGTTGGTGTCCTCAGCACAGCAACTGGAGCGACTCCATCTCTTCCAGGCAGCAGCTCAAATACTCTCGCTAACGGCCACTTCACGGCC:1 - chr3R 2689349 3' - diver2 4466 1 50.78 TGCAAACTGCACTATACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATT:1 - chr3L 17707846 3' - Doc 100 1 78.08 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAAACGCACAGAAGTAGGCTTCATGCTAACACTTAACATGCTCGT:1 - chr3L 12867268 3' + roo 9031 1 45.21 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAAGAAATTATGTGGACAGTGGTTTCCAAAGGCAATAACTTTATATACACTAAAG:1 - chr3L 15026653 3' - opus 177 4 67.81 TTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTAGCACACATAGATACATCTCTAGTGGAGTTTGAAAACAACAATGCACGAGCACCTCGACTACCGGATACCCATAAATATTAAAGTTTCATCTAAATATTTTACATTTTTATT:1 + chr3R 8812162 3' - I-element 4916 1 75.00 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATACGCCGAGTGGTTTAGATAGCAGTTTTTGCAAGTGCGTTGTATTTACTAAGAACTTGAAAACTCCTGTATATCTTTTCCTGCGTATCTCGTGTACT:1 - chr2R 19553142 3' - mdg1 7063 2 67.12 CCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTA:1 - chr2L 17210278 3' + jockey 4916 1 70.55 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTGAGAGGGGCAGTTCAGGTTCAATGCTGCAAATTATAAGCGTTTTTGCGGCG:1 + chr3L 7093114 3' - hopper 27 1 65.75 CCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGATGAGAGGATGGGGAAAAATTTGAAATAACGAG:1 - chr3L 9571682 3' - jockey 4531 1 72.58 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATATATTATAAAATCCATTTTTGTGATAGAA:1 - 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copia 63 2 59.59 AGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTGCTGTGGCAATCC:1 + chr2L 12340832 3' - diver 63 2 57.53 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAATTCTGAATCATTTGCATGATTTTTTCCTTTTAAAACTTGTGTAAAATAATCTCCATTTCGATA:1 - chr2L 19068040 3' + pogo 2049 1 56.55 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCTAAAAAGCATACTTTATTCATTTACGATCCTAAATATTTATTACTACATA:1 - chr3R 23859832 3' - jockey 4831 1 66.44 TATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACGTTCCTCTATTACGGCTGCACTCCTGCTATAATACGTCTTTCACTTGAATTGCTTTTGAAAGCTGTACATTTCTAATGAATCTGAGTATAGAATGTTTATCTTTT:1 - chrX 17419339 3' - Juan 4042 1 70.14 AGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCCATCGGTCGTAGAGTTGGTTTTGCTGATATGACAGAAATGTCGGAAATCGATGAAATTGGAATTAACCAAAATCTAAACGTTCGGTACAACA:1 + chr3R 835456 3' + Bica 4892 1 67.12 GTATTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTATCCCTTTTTGTGCGTTACGTTTCTTTGCCGTTTGTAAATAAATCTGCGGGAAATGTTATAATTATGCAACCGACAGTCGAGATGCCG:1 - 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I-element 41 1 57.53 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCATCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGACAAAATGAGCAATCTATAGTGGTGATATCATATG:1 - chrX 4778162 3' - 412 47 2 50.68 GTGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATAATGACCGGCATTGTGGGGGCTTGGAAT:1 + chr2L 436525 3' - copia 4962 2 79.31 ATGTACATATGTATGAATAATGATGTAAGATGAAAAGTTATCTTGAATAATCGTTTCTCTCAAGCTAAGATTCCGAAACGGGTAATTCGACGGGCCTATAAATCCACCCGC:1 - chrX 11624260 3' + invader3 5090 1 72.07 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTCAAATTTCAAGAGGCCAGCACCCGGCACTCTAACGCC:3 - chr2R 21371459 3' - roo 8747 2 78.08 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACAAAATGCTGCCACAGACAAATAGAACAGATTTCGCG:1 + chr3R 11057641 3' + flea 4933 1 75.17 AGGTAAAAAATACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTTAAACAAAATGATCCAAAAAAAAATAATCAAAAAAAAAATCCAAACAGATTTTTCCGTCCGCTTACCGCTGGGGAAATTCAAGTGTTCAGGTATAATCCCATTTA:1 - 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chr2L 6184012 3' - pogo 69 1 65.97 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTCTGTGCGTCGTATGGGAAATTGTTGTAATTTGCATGGCT:1 - chr2R 11609232 3' + roo 8990 2 73.97 TTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAGGGATTCGTATTCGGACTTCCAAAGGAAGCAGGAAGCTACAGAGACATGGGGCATGCAAGCATTTGAGCATGACTCACTCA:1 - chr3R 8129514 3' - I-element 4911 1 53.96 ACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTAGGGCGATATACTCGTCCGCCCGCGGGA:1 - chr3R 20486362 3' + accord 7350 2 66.27 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACTAAGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGCAAAATCTATGCCGGCATTCTT:1 - chr2L 17136136 3' - hobo 53 1 52.78 CCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACATATTTAAGAAACGTGTGGCAATAATACGACTTATCTTAAAATTTTTAGTCTGTTCAAGAACCCTTAAGTTAAAGTGT:1 - chr3R 30583760 3' + gypsy12 10150 2 52.05 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTTCACGAGATTTTTTCGTTCGTTTTTTGCGTTTTCGCCCACAGAAACAGAACATCGAGTGGTTGGGGGTC:1 - chr3R 23236381 3' - hobo 23 1 48.72 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAAATGGGTGCCAATGTAAGTGAAACCTATCTATTCAATGGTGATTAAACGATTTATCTTAATTTTTCAC:2 - chr3L 14553044 3' + roo 400 1 58.90 TTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCTAACTTGTAAATTGGACATTTTTAATGTAAATGGATAATTAAATT:1 + chr3R 11113256 3' - mdg1 77 2 74.66 AAAAAATTAAAAACAAAAAAAAAACCAAAAATATTAAAACTTGGTGGTGTCGCTTCCTATTTGTATGGTGGGCGCTTAGTTTCATTAAAATTTAAGCGAAACTCAATGGACCCCAATCCGCTGGGCTTTTGTTCAATTTGTACAGT:1 - chr3L 11849662 3' + Doc 4696 3 71.23 AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCGCATGGAAT:1 + chr2R 15829622 3' + invader4 3064 2 65.04 ATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACAGAAGTAGAATGGTGATTGAGATAAAAGTAATTTTGTTTACCAATTTCCATT:1 + chr2L 3340028 3' - FB 71 1 65.75 AATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATTCTGGTTATATGAGGCATTTGTTCTCATTTCTTTCTGGGGTGGTTGACTTACGTTTCCAGTTGCTTTCCTT:1 - chr2L 22780823 3' + HMS-Beagle2 7146 2 52.05 AGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGAATTACTCAGTTCTTTATTTTCTATAGTTTTTCTGGATAGTC:1 + chr2L 18149543 3' + Bari1 1658 1 53.42 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGACCAATCCGCTTAAGGCTACCCCAGATTTCCTTGTAAACTGATT:1 + chr3L 16973516 3' + S-element 1708 2 76.55 TGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAGGATACGGGAGTAGCAGGCAAAGGGGGAATTAGAGAGAAGGATAGTCCGGTCCGAAGCTCCGGCGAAGTTTCAAACAGTTGCTCC:1 + chr3R 8541263 3' + G2 2992 1 77.50 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTTTGCTCTTATATGCTATTATTCAGCAAGATTTCTCTCTTC:1 + chr3L 14553217 3' - roo 38 2 57.66 AAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTACAGGAGAGTCACATAAATTGGATGCTGCTTATAAAGGACCTTATATATTTGATGAGAAAACTCATTGATTT:1 + chr3R 32021969 3' + Bica 4661 1 78.76 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGTTTGGGATCCAGCTAAAAAAAGCCGAGGCAGACA:1 - chr3L 13827238 3' - hopper 23 1 65.89 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATTCACTTTCATTTTCATTACACAAATGAAATGAAATTTTAT:1 + chrX 12866523 3' + roo 9045 1 67.12 ACACACACTTACACACACACACACACACACTTCACACACAGAGAAAGCATCACAAATTGTTGTTGGCCAAG:1 - chr2L 9382343 3' + Quasimodo 29 2 91.55 TTGCATGCATTGTCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGGTTTTAGAACTGTGTTATCTAACAGCACCTTGTAGTCCAAACGTGAGCGTAAGTTGATAAGCCAGTGAATGCAAACACAAATGGACAGTTGTGAAGAACATC:1 - chr2L 16179167 3' - Doc4-element 2615 1 77.24 AAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAGCCAAAAACGTTAAATTGAATTGCAGCGGGCCAAATCCTCTCACCTATTTTATTCTGTGACAAATTGTGGCAATCAAAATAGTTGTGCGCCTTTTCG:1 + chr2R 21414512 3' - BS 5070 1 67.81 CAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTGACTCTTGTTTCTGAGCTGTTGTTATTCTCATTTGTTTTCAATGCGTTCGTAATTAAT:1 - chr2L 11000675 3' + roo 489 1 59.29 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTAACGCAT:1 - chr3L 23146435 3' - 1360 24 1 68.97 ACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCCCTCGCTGAGTTTTCTATATTTATCCAGATCTAGAGTTACATCATGCCACCCACCGAAGATGTTTTCCGAAGCGAGCTA:1 - chr3R 30204167 3' - Doc 4451 1 52.74 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCTGAGGTGAGTG:1 + chr2L 16884917 3' + pogo 2051 1 53.42 TCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTGCACAAACCCACAGAGTCTGTTTATGGGTTCATTTGTATATTCCGATTTCGAACGCGTGTCGGTCGGGCCAATAACAAAGTGAGAAACA:1 - chr3R 17067785 3' + 297 365 2 65.75 CGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCC:1 + chr2R 21402685 3' - mdg3 72 2 63.01 TGTAGAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAATAAAATGTCATTATGCGCTCCCAAAAGTATGCAAACGATTTTTCGCTTTG:1 + chr2L 3890213 3' + jockey 4927 1 67.81 GTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCA:1 + chr2R 4313048 3' + gypsy 7383 2 50.68 CAAGTCGATACAGTGACAGATTACTGAGCCACAGCCATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTGTCCACCCTGTGATG:1 - chrX 22726179 3' + Helena 1244 1 47.95 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAGATATTTTTATGTAATTAT:1 + chr3R 9352147 3' - Tirant 8118 2 79.31 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGGGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTTATATATGTGTGTGTAAGAGGTTCTGTCGTA:1 + chrX 10974399 3' + opus 460 2 72.45 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACTTTTGCGGTCCACAAAGACCGTGTAATTACACAGCTAATTGCCAGCT:1 + chr3R 27794894 3' + roo 9041 1 61.48 TGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAAATGTCAGAACGATCACCAACGTGTAAAAAGTTTTAAGTTCTACCGATCTTATAAATA:1 - chr3R 7981473 3' - jockey 69 1 61.64 ACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCCGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCATTTCTTTGAGTTTTTTATTTTATTTTAAATAACGTTTATGGTGCAAATATTA:1 - chr3L 8924628 3' + Stalker3T 97 1 63.01 CTTGGACCCTTAAAATAGTATTGAAGATTATTGATGTATAGATTATCACTTGTATAGGTAAAACCAACTAGATACCTTTGGCACTTTTCAGATGGTAGGTATAGTAAAATTAAATTTTAACAGTTTCATTTTAAATTTAATTTTGG:1 + chr2L 16459120 3' - Helena 85 1 54.79 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCATAACAGTAAAAACATTAAAAGAAAACAGGCCTTAGTTATTTCATTAGCATTTATTAAATTATTAACTGGAAATGTTATTTTTATAGAAGACG:1 - chr3L 5536917 3' - jockey 4677 1 56.35 TGTGGCTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGGCGGAGGTCAGGCGGAGGTCAGGGGGCGGACGTGAATGATGGACGTGAACG:1 - chrX 8755038 3' + transib2 2755 1 62.33 TAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACGCAGTAAGTCCGAACTGCAAGGTAAGACAACTGTTCTATCCTGTCAAACGGAACGAGATATGCCGACACTAC:1 + chr2R 4313125 3' + gypsy 447 2 73.97 CGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCTCTGAACAAAGTCGAAGATATTTCTTCCTTCTATTC:1 - chr3L 6339807 3' + 412 115 2 75.17 CACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATATTTTTGCTAGCGTTGATAACACAACGCGCTTATTTATATTTTTTGATTC:1 - chr3R 19445869 3' + F-element 4354 1 70.34 CCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGCGAAACTCTTGCCATAATAATAATAATAATAATGTGTAAATAGAATCAAAAT:1 - chr2R 18482415 3' + hopper 1348 1 63.70 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAACAATGTGGATGAAATAATTTAGTTTTGCCATTCGAAACAAACACAAATTCGCCCGAAATATACATTTGCAGTATAGTATCGCAGTAATCTGTGATGGAAATCCTTATTAAATTTGCCTCAATT:1 + chr3R 29418833 3' + mdg3 247 1 83.33 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTCGTGTTAATATGAAATATATTTTAGTATGATATTATAGTTAAGAGCATTAAAACATTCA:1 + chrX 16902345 3' - I-element 63 1 58.90 AGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCTACTAAGAAGAATAAATAGATGGCCGGAGTGAGCAAGCTGGCGGGGTAATCCTTATCCCGATCGATAAC:1 - chr3R 25474370 3' + mdg3 5090 1 59.23 CAGCAAAATTTCACAGGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATAACGGAAAAATCTAGTTCGTTCTAAGAAAAAGTTGTTTTAAATCACAAAACGCTCTAACTCAATAAACTCCCG:1 - chr2L 22144985 3' - S-element 344 1 73.79 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGA:1 + chr3L 23456282 3' + 1360 3343 1 53.85 AACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATCTGCTTGTGTAAGTACTAGCATT:1 + chrX 20999644 3' - BS 4 1 76.71 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGTTATTTATTTTTGTGACGATGGCCGACGAAAAAATATAAC:1 - chr3L 24228599 3' + copia 5087 2 70.59 CCTCCCCTCCACCCCCCCCCCAAAAAAAAGGGGGCAAAATGAATTTTTTATTGCCCGCGC:1 + chr2L 12745961 3' + accord2 225 1 81.67 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATGTGAGGTGGTATGGGTGTGTATTGGGGGTGCGTGTT:1 + chr3R 20175796 3' + hopper 1354 1 58.90 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCTGTATATAAAGTAACTCAATTTAGATGAACA:1 + chr2L 9668307 3' + 1360 3356 1 61.64 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAACGATTCTTTTTAGATATTTTTATGTAATTAT:1 + chr3R 9352147 3' - Tirant 8117 2 79.86 AAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTAT:1 - chr2R 8158765 3' - Juan 76 1 60.27 ATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTA:1 + chr2R 17392076 3' - BS 5084 1 76.71 GCACAGTTCTACGGTTATCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTAGAAAAAAGAAGATCATAAAGGTCGTTATCAGAAAATTGTTCGCCCAAATGCAGATTGGTAAGTCGTTTTAAAAAATGTGGTGCCCCATCTAAT:1 + chr3L 25753488 3' - Cr1a 4010 1 67.12 AAATAAATAATTAAAATTAAAAACTTTGTATAAATAATTTTTAGCTATATGCATTATGTTGTAGTTATTAGAATTTTGGATATTTAGTTATTGAAGAACTTCAACACAAAAGGACACGATCTACAAATGGAAAATCAAATACATAG:1 + chr2L 16588587 3' + Doc 4686 1 50.68 AGTTCATCAATAAACCAAATAGAAAAACTTGATGATGAGAACTACAGTGCGTGGGCGTATTACTATCAGAGGGGGGCGTGGCATCG:1 + chr3R 9161349 3' + Dm88 320 1 65.12 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAGTGTCGATTACTGGCATACTCGTT:1 + chr3L 22642916 3' - hobo 50 1 62.30 CAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTAAAAGAAAATAGGGGTATGATATTTTGAATTACTCAGTTCTTTATTTTCTATAGTTTTTCTGG:1 + chr2L 18149537 3' + Bari1 1653 1 55.17 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATTGATTGCCATGTCAAAGCCAATCCAATCCATTCAGTGTACCCTGCGATTGGTGCAAAATATTTCCC:1 + chr3R 24493216 3' - jockey 4689 1 69.18 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCTAAAAAGCATACTTTATTCATTTACGATCCTAAATATTTATTACTACAT:1 - chr3R 23859833 3' - jockey 4832 1 67.12 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCATTTTTGAAATGCAATTAAATTAGAAAGTACATCCTAATGCGTTCTACACACGATTGTGTTACTAAAAAAATTGGTTTTCATTGAAAATATTTGGTTTAATTGGTT:1 - chrX 13786809 3' - pogo 13 1 71.92 AAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAG:1 - chr3L 27356053 3' + Tc3 1666 1 59.72 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATACTTGCCCTTTCATTT:1 + chrX 12139032 3' - roo 63 2 62.07 AACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACACCAGACACACACACACACATATACACGTATGTAAGAACACGCACATCAATGCAAGAATCATAATATCT:1 - chr3R 18331073 3' + Stalker 52 4 52.74 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTCATATAACTTGGTAGATTTTTGAATATTCTCCACACACACACACAGAGAGCATAAACAACAAGCCTCTTGTTCATTTG:1 + chr3R 9120268 3' - mdg3 45 2 46.58 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGCAGCCCAGTTGCAAGTTCGACTTGTCTCAGCCAAACGAA:2 + chr2L 16458732 3' + roo 396 1 76.71 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTAAATTGTATTAACATTTGAAAGAGTAGGGTGAACGACATTGTCGTCGAGCATCGGCG:1 - chr3L 12224618 3' + 412 434 2 58.74 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGCTGTCCCAGACACCAAGATACGTGTATTATGTATGCGGCTGGCACATTTTTT:1 + chr3R 27822334 3' - I-element 19 1 72.60 GGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTAACGGTACGGAAAGCGCTTCCCTGTC:1 - chr3L 23773873 3' + Transib5 2869 1 80.74 TGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAAATATTATTTTATTATAGGTGCCAAACATATTCATTCAATCTTATCTCGAGTAATGCTTTCTTGTTATT:1 + chr3R 30583880 3' - gypsy12 49 2 53.24 TTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGACCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTAA:1 - chr2L 8959917 3' - Ivk 5156 1 63.01 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCGGAATTTGCTCTCTCATGCTCAAAAAAAATTGTATAAGACACTTATTCCGAGTA:1 + chr3R 23765478 3' - roo 20 2 67.72 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGATCGGAGGCCTAGTGGCGGGAGCGGTAACGCAGACGGC:1 - chr3L 22900069 3' - 412 32 2 58.33 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAGAAACACAAGCGACATATTTAGATGCAAACTGGGAAATGTCTTATTTTTGGGCATTCGGAGATATCGCTTGGTCAAATTT:1 + chr2R 11706792 3' - pogo 39 1 46.58 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATACTACACATACTACTTCGTGAGACATCGGCAGTGAGTCGTCGTGAATCAAATGCCGAATCCAAGACTTAAAAGACTTACGAAGAATCACTTCGTGCAGCG:1 + chr2L 9485723 3' - 412 7075 2 60.27 TTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTCAAACTTGAAACGTAATATTTTTCTCTCTGTACAATGATTCGCAACGTCGGACTCTTTGTGTCGAGAAGGAAAGTGCGTTTAT:1 - chr3R 26519935 3' + FB 986 4 50.00 AGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAG:1 + chr2R 21402714 3' - mdg3 5267 2 68.64 ACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGTAGTTTTCTTATTTAAGGCAAATCTGTTTTCTATTTCCAATCAAAGATTTTTTGTTTTTCGTATTGAGGAATCAATTTTCTATTC:1 + chr3L 6549179 3' + invader2 4876 2 57.53 AATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATTCTATTCATTTCCACTAGTTGCTTACGTTAGCAGAGTACCAATGCCTGTTGAGGCG:1 + chr3L 12976342 3' - invader4 2809 2 58.21 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTAAGGATTTACTTTGAGGCCATTCAAGTCTTT:1 + chr2R 18482528 3' - hopper 34 1 62.33 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTTTGGCCCAGACAAACTTTGGCCATTTCCTGCAGAAATACCCATGCAAATGTTTA:1 - chr2R 21402544 3' + mdg3 239 2 76.22 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAAACATCCTCTCATATGCTCATTTGCCCTGAAAACTATGCAATGTTTTTTTTGCATATCAACACACGTGTAAAGCAAATGTTAAAC:1 + chr3L 9571763 3' + jockey 4955 1 54.79 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATAACATCCCAGAATAAGCAGTTCGGAAAAAACTGGACAC:1 - chr2R 10865168 3' + blood 7323 1 72.31 ATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCCTAATTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTTAAAGTGTAGCTAAATTTTCTT:1 + chr3L 14550841 3' + P-element 338 1 15.33 TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATCATATATGTACGTACTCGTACGCAATGCTTGCGCAAACACTGTGCGAAAACAGGGGGGCTCAAAAAGAAGAGACTACAATCA:1 - chr3R 23009991 3' + I-element 5319 1 55.48 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAGTGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGGCACTATATGTACTTACAGTTCGATACTCGTATTGTTTCTTCAGAACGCAAATGGCACCTTTCTCGTTT:1 - chr3R 27768807 3' - 297 40 2 48.00 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCTCCTTTTATTTTGGCGTGAAAACTCTTTGAGTATTCACT:1 + chr2L 13927791 3' - roo 8746 2 72.60 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCAAGTCGTTTTTCTGCTGTATTTTGCGTGTGTATTTGTATTGGCCTTTTTGGCCGGCATAAAATATTTTTGAAATAAGACGCGGCGGAACTGAAATATTGTGCT:1 - chr3R 10266032 3' + 1360 3370 1 73.29 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACAAAATGCTGCCACAGACAAATAGAACAGATTTCGCGTCAAACAAAGAGAATGCCGACTGGGGGCGGG:1 + chr3R 11057672 3' + flea 204 2 54.11 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACCGGGGAGTTTTGTTTGGCTGCAAAGTGGGATT:1 + chr3L 905858 3' - 412 87 2 78.08 CGAAAAAAAAATTGTGTTAAAATAGGCACTAACCAACTGACTCACTAATGAATACACATGAATACACATCACTTGTCTCTCACCCACACACAAAATAGCTGCTCGAGAAGCGGATCGAGAAGGTTA:1 - chr3L 2136030 3' - FB 407 1 50.00 GGCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTACAACAACAATTACCTGTTCTGTTACAGCAAGCCCAAACAAACTCATTCGACTTCACTAACGCAGAAAATCAGAGTATCAACCC:1 + chr3R 435973 3' + 1360 2999 1 54.11 TGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCCTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTCATAGAAACGATTAG:1 - chr2R 961117 3' + transib2 2677 1 65.07 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAAATGTCAGAACGATCACCAACGTGTAAAAAGTTTTAAGTTCTACC:1 - chr3R 7981486 3' - jockey 82 1 70.55 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTATATTAATATACATATACATACAGATGCGGT:1 - chr2R 641830 3' + opus 7483 2 70.00 AAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAGGTGTACACGTTCGATAATCACAGAGCTACTAGTGATATCGACGTGACAATCGTCCCCTCCACACCACCGCCCGTTTCAC:1 + chrX 12370343 3' + F-element 365 1 49.18 AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAAAAAGTGGACACAGAAAGGCGACGCCACGAG:1 + chr3R 10030842 3' - BS 5014 1 76.71 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCACGTTCCACCCCCTTCGGCTGGGCAAA:1 - chr3R 22100476 3' - 412 29 2 68.49 TATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGTATAAAAAAGGCAAACAAAACGTGGTCGCTGATGCGCTTAGTCGAATAGAACCAAATTCCAAGAAGTACTCACAATCTCAACATCTCCTAGCGGGTCTAGAT:1 - chr3R 19448288 3' - gtwin 6937 2 41.10 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGGGGCAACCTGTAACATTTATTATACAAATTGATATTGCCACTAGGCC:1 + chr3R 21706124 3' + 297 376 2 72.60 AAGAAGATTCAGTAAATAAAAGCAAAATTTATTAAAAAAATTCAAGAATTTCAAGAATATTTATATAAAACATTTCAATATAACATATATTTAATACATATTGAAACAGCAAAATGCTCATATATGTAAATTCGATCATAGGTATA:1 - chr2R 5374682 3' + F-element 4658 1 67.81 GTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGACTGTCTATCTCCGGGTGTCACGTACAATTTTTGTTTCTTTTTTTAATTGACTTTGGACCTGGACGAAGTTTATTAGTTGAGGGCGACTTTTTG:1 - chr3R 17659148 3' - mdg3 236 2 65.75 ATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCACTGCCGCGAGTATATCACGAACTTAGGGCCCTCTC:1 + chr2L 6870737 3' - hopper 88 1 74.66 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAA:1 - chr3R 20175700 3' - hopper 65 1 63.45 AAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACCCCAAAACTGAACTTTGCCAATCAAGATTGGAGGAGGAGAAGAGGGGCGGCTGAAGGAGCTCTCATCA:1 - chr2L 12340727 3' + diver 170 2 52.74 GAAGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACAAGTTAATCAACCATGAACTTTAAAGCCCCGCTCTGAAATGCAAAAAGGACAGCAAAGCCACCAGCACTAACCGCACTCGAGACCCAATAATGAATTTGCATTTTCTA:1 - chr3R 24476229 3' + 412 478 2 73.79 TTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACGTAACTATTTATTTAATTTATTTGTTATACGTGTAAAAGAAAAC:1 + chr2L 7825276 3' - I-element 77 1 69.18 GTCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGGCGGTAGTCCTTCTGATACTGCCACTACTCCAGCTCCACTACCAGCAGCTCCTAGTCC:1 + chr3R 22100605 3' + 412 7507 2 50.41 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAA:1 - chr3R 20175699 3' - hopper 65 1 63.01 TAGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACACAGACGCAGCACAAGTTGCCACAAGGCGCCTTATATTGCTACGGCAATTTAATTTAATTTCCGCGATAGGATTGATAGGATCTCCACAAAAAAA:1 - chr3L 22982400 3' + INE-1 156 1 47.26 GTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGATAACAAAAACACAGGACGAAGGGAAGGAAAGCATCATTCCGTTGTTCTCGAATTCCCTTG:1 + chr3R 20039558 3' - I-element 5124 1 58.22 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAAAGTAATTGTTCTTCTTCTAATAATATGAATTTTTATCAGCAACCAGAGTTCCTAGAGTCGTACACCCATGGACTGTTTGAGATGCCACATGTCCTGAATG:1 + chr3R 25304860 3' + roo 386 2 70.55 ATCGTTAAAATTGATACCGATTAGATTAAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAAAACGTTTCTTGCTACCTGTTGCGTACTTTCCAAAGAATACCGTATACCCTGTTAGTAGGCAGGAACCGTCTCTAGTGCA:1 + chr2R 6526605 3' + jockey2 3322 1 54.79 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAATTGGCAATGACAACGGTCTGGAAAATTACACACGTACACACAATCACATGG:1 + chr2R 6632651 3' + P-element 2819 1 39.04 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGATACTTTTCGGATATGCGACAAAATCGGACGAAAACTGCTTTTTCAATTTCGTGGTTAAAAGGCTAACGGTAACATCGTAAACCTAACAGAAAATTGGCA:1 + chr3R 6388843 3' - jockey 31 1 68.49 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGGCTACAGTTTTTTAGTCCGAGCGCGATCGAACA:1 + chrX 5679997 3' + P-element 2801 1 26.71 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACACCATTCACTTTCATTTTCATTACACAAATGAAATGA:2 + chrX 12866515 3' + roo 9037 1 61.64 ATAGTCTTTAATATTTGTAATTTAAAAGGTGAAAATGAATTGTAACTTCTTTAAGAGATCGCATCTTATACATGTTCCAAGAACAATGTCTGAATGAATCCATTCACCAGGTCATTCTCTACTCTTCCAAGTGACACATCTGCCCA:2 - chr3L 1320686 3' + gypsy7 5093 1 86.30 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGCTCAGGTGTAATGGTGTGCGAGGATATATCTATATATATATGTATATATACATACACACACATACACATACAAAAATATAGAAAGGACTGATTTAAAATGCAAATGCTTTAAT:1 - chrX 5145354 3' + hopper 1408 2 78.77 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCACGCCGACAAACGCTTCGTGCAACTTCGTGCAGCTTC:1 - chrX 14826122 3' + P-element 2834 1 35.04 GGCCGGATCGGAGCAAGGTGATTAGGCGGCGTGTTCTTTGTTTCCCGGTGCTTAGTATATGTCGTTCTTGTAGTGCTGCTGTGCTTCTATTCACCTTGGAAAAGTCCGAAACCAGTGC:1 - chr3R 22917002 3' + accord2 275 1 49.15 GGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATGGAGTCTATCGATTAAGTTCTCTGCGGATTGCAGTCGCTCGATTGTGGGCGGACCG:1 - chr2L 14632078 3' - Idefix 230 2 61.64 ATAAGCTTGCTGCCGAAAGAGTATTTTTAAGTAGAGCATTGCCAGTTAGGGACGAAGCTGGCCTGATTCCCGATCACCAGTTTGGTGGGGAGGTTTGCCTTCATAATTGGTACAAATTTCAGTTCGAAGTTGGAAAAG:1 - chr3L 15690798 3' + G7 292 1 60.14 TTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAACTGGGTGGGCGGTGTGTGTCCCGTGAAGTGGGCGTGGCCAGTTGATGGGCTCCAAGACCAATGCCGACATTTGTATCTACTAAGCCCGACG:1 + chr3R 8377778 3' - I-element 233 1 65.47 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTTTAG:1 - chr2R 11057244 3' - pogo 22 1 61.02 ATCAGATTTAATATTCAAAAAAATATAAATACAAACTTTAGACATGTACGTAACTATGTAATAAATAAATATTCGGGTAAATTGACGATTTGAATATTTACATAAACGATTCTGATTACAATTGAATTTATTATTTAGAGCAGCTA:1 + chrX 9500891 3' + mariner2 775 1 50.00 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTATTTCTCACAGCATCTTCGGCGGCTTT:1 + chr2L 1558690 3' + 412 447 2 75.76 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACATGGTCTATTAAAAAATTCATGTTTTCTTCATGCTGAAGTGCAATT:1 - chr3L 18467192 3' - hobo 71 1 67.12 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTACTTAT:1 - chr3R 19589882 3' - BS 5025 1 58.22 AGCTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGGGTAATTTTTTTTTTTAGTTGCTAATTTATTGTTTTTAACGCTGT:1 - chr2L 3466008 3' + P-element 2812 1 32.88 CGTGGAGTACAAGGTGGAACATGAAGGTCAATCCTTTAAAAACATTGAATTCATGTTTCACACTTAAAAGCTTGCTACACCAGCAATACAATTTGAAGGTGTTGCTCTATTGTACGCACGTTTATGGTTTTGATAATACAAAAACC:1 + chr2L 8002090 3' + BS4 275 1 69.86 TTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGC:1 + chr2L 18279969 3' + gypsy5 348 2 64.18 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTACCACTCT:1 - chr3L 18658902 3' + roo 358 2 63.71 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAACGCAAC:1 + chr3R 15022123 3' - Tabor 61 2 56.85 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTT:1 - chr3R 13582223 3' - BS 5071 1 68.49 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACCATCCCCCCACCCACCTGCTCCGCTCCTGGTC:1 - chr2R 23287461 3' + roo 8985 2 77.93 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTT:1 - chr3L 96514 3' + roo 8995 2 69.18 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCATACTCACAAACACTAGCAAGTATTCAGATACGCACACACATACGTACAGAAAGCCATTCGCCATTTTGACTGTCTGTCTGATAAGTTTTTCCTTTTTCT:1 - chr3R 20175652 3' - hopper 18 1 71.92 TTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGTGCACAAACCCACAGAGTCTGTTTATGGGTTCATTTGTATATTCCGATTTCGAACGCGTGTCGGTCGGGCCAATAACAAAGTGAGAAACAAGTGCCGCTCTTTATTTGA:1 - chr3R 17067766 3' + 297 384 2 78.77 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGT:1 + chr2L 16884897 3' + pogo 2047 1 63.08 AGATTCAACACGAATCCATCGTTCATCATCTGCAAACAAAAATACCAACAACAACAAAAACAAAAAACAAGTACGCTAGGCAAAAAATTAAATTGTTAAGAACATATAACTTTAACTGCTAACATACTAATTGCTTTGCGTGCTCA:1 - chrX 8832443 3' + gypsy5 476 1 73.97 ATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGCAATACAATTTTTATGCGAAAACTAATGTAAAAAAGTCGAATATCAATTATTTTCATGGCTTGCTTCTCATTTTACTTTAAGTTTCCCTGTCGCACAGAGA:1 + chr2L 2657371 3' + diver 205 1 69.18 CAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTCCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAGTTGCAGATACTTTTGCTATGATT:1 + chr2L 4174094 3' + roo 9040 1 62.33 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCATTAACAATAAATAAGTGTTACGAGACTGACAGAATTATTTATAATGGATAGTGTGGGCATGCATATGTATA:1 + chr2R 23287548 3' - roo 48 2 52.74 CTGTATGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGTTATATTATCGCCTTGTATATTGCAATTTAAAGACATTTATTGTTTCTGGGAACTTTTAATGTTTTTATAGCAGGCGAGTGAGACTGCAA:1 - chrX 359008 3' - Porto1 4298 1 58.22 ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAATAAACTTTAAAAGAAATGGGAATGTGACCAATGTTTATTAATACGCTTATTGTTATTTAAAAAGTTGTAAGT:1 - chr3R 9190436 3' - Tabor 13 2 43.84 GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAACAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTCCTTCGAAACACAAA:1 + chr2L 13250442 3' - opus 7171 4 69.23 CTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAACGGACCACAAATCAGCAACAACACTAACCTAAACCGAAACGCAGAGCCTCACCAACTCAACGAGGTCAAAGAACAACAAGAATAAACTCCCTCCAAGACTCCAACATCATAC:1 + chr2R 4580107 3' + hobo 2674 1 80.14 TGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCCAAATGTGACAAGGACATTTGCATAGAAATTCTAATACCACACCACCCACACAAACG:1 + chr3R 15022119 3' - Tabor 59 2 57.86 GATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGTTCATTATGGGATCCCCCATTTAAACTCAGATATTTCAGCTGAACTCCAAACATTCCTTTAGTTCGGATTTCGAGCGTTAG:1 + chr3L 14223680 3' + Ivk 129 1 55.48 GAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGAGTGGTCGCGGGTTGGAGCGGGGGCACGATGAAATAACATAACATAACATAACAT:1 - chr2R 4878989 3' + invader1 92 2 56.47 CAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGCTGTTCTTATGTAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCATATGTAGTGAAAGCGAGTGTCAACATTTATATAAAGTCA:1 + chr3L 20264302 3' + Transpac 348 1 72.54 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTAAATGTTTAAAAACATTTAAACCAAAACTGCATAAAATCTATGTGTGACCCACAGTCTAAGAAATTCTGTAGAGCTCGTAAGTGATGAG:1 + chr2R 8396037 3' - pogo 28 1 66.44 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAGCGGTAATTGGTTGCCACCTGTATAAGTATGTTTCCAAAATGATTGCATTTAATTAACGTGGCAGCTTATCA:1 - chrX 12138885 3' + roo 396 1 73.97 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTAAATTGTATTGACATTTGAAAGAGTAGGTTGAACGACATT:1 - chr3L 12224635 3' + 412 7479 2 68.66 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTATGACGACAGGCAGACGAACAAAAACTCATATTGCTG:1 - chr3R 10684694 3' + roo 9053 2 68.31 GAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTCCATTCCCCCATCCTCCCTTCCACTCACTCGAAATTCTGGGTATTGCCTTTTCATAGAGCAGATAATT:1 + chrX 7515793 3' + roo 400 1 79.45 TTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACACATATGCCATCTTGAAACCTTTGGACTTAAAATTAATAATTCATACATATAT:1 + chr3R 13780718 3' - Bari1 68 1 65.75 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATACTTGCCCTTTCATTTATTT:1 + chrX 12139036 3' - roo 53 2 57.55 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTAAATTGTATTGACATTTGAAAGAGTAGGTTGAACGACATTGTCGTCGAGCATC:1 - chr3L 12224622 3' + 412 7502 2 55.65 GTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTATGTTCACCTAATTGTGCTTGTTGCTGTTTTGTTTCTTATTTATTCCATTTTAATTAGTTATTGAGTTTTGTTTCGCTCGATTCATAATTAAGCATTGGATTCGATTTGACGT:1 - chrX 12657167 3' - I-element 264 1 67.12 ACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATCATCAAAAGAGAGAATTTGTTCTTTGAAAATAATAATACTAATAATAATTGAA:1 + chr3R 6471285 3' - diver 70 2 63.70 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATATCGAATGAAAATGATTACAGTGGATAAAATTGAAAGTCGGGCAATGGGGCTGGTGGTGGGACCATGCTTTG:1 - chr3L 15194526 3' - F-element 55 1 48.55 CGGTCACCAGAGCCTCTGCTTAGGCACCAGCACGGAGACAAGAGACAGGTCTGTCCGCGACCTTTTTGCCCTTTTCCGAAGGAACCAGTATCAAATTAAATCTAACGATTTAAAATTAAATTTAATTTTGAATT:1 + chr3R 17922341 3' - Rt1b 244 1 31.34 AGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGTAAAACAATTTGAAAACAATTTGGATTTTAATTATTCACAGCCCTCGAATGAGAGAGTGAATAGTGAATGAATATT:1 + chr3L 10104218 3' + jockey 4687 1 47.95 AGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATAGCCAAATGCCTCTTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTA:1 + chr3L 23112568 3' + R2-element 3196 1 54.11 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAATCAACTCTAGGCTCTAGCG:1 - chr2L 686005 3' - roo 81 2 72.60 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTTCAAGGTGCAAGTTGCGCTCCATTCGTTCGAAGATCTCCTC:1 - chr2L 13792593 3' - F-element 64 1 66.10 TTACATGGCGACCGTGACAGGATTCACGTGTGCATGAAGTTAACGATTATAATAAAAGCATGAAGTGTCCGTGGCCAAAAGAAATAAAATGAATAAATTCAAACATTACATGGATATAAATAGCAATTTAAAGCATCGCACACACA:1 + chr3L 7835490 3' + Stalker4 426 2 72.60 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATGCAATATGTTTTTATCACATATGTTTCGAGGAAATGAATTGCTCAA:1 - chr3L 14062239 3' - Doc 84 1 67.12 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGATACTTTTCGGATATGCGACAAAATCGGACGAAAACTGCTTTTTCAATTTCGTGGTTAAAAGGCT:1 + chr3R 6388808 3' - jockey 67 1 56.16 AGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTAGGTACTCACATCCTGCCCTTTTCGATTTACATGCAGCATGCATTAAAAATAGAACCTTCGGAAAAGTTT:1 - chr3L 23027523 3' + INE-1 550 1 54.07 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCCAAGAAATTTGGGATTTCTTCTTATAACACGAGCACTTTAAGGATCAATTTTTT:1 + chr2L 19068147 3' - pogo 64 1 63.89 TAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAAAATTTGTGCGTGGGCGTTCGAGATGTGTTTTTTAGCCCCTTCTGCCGCCATTGCCCACCCTTGGCGCCCTGATTTCT:1 - chr3R 18508231 3' + G2 3044 1 62.30 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACGGAGGCCTCAAAATGTCGCAGATACAA:1 + chr3R 5208232 3' - hopper 52 1 58.57 CTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAATCCTCGCCATTAATATGGGATTATTTTCGATG:1 + chr2L 8196761 3' - Quasimodo 299 2 78.08 AGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCGATCTTGCCCTGCAAATATTTGCGCAAATTGCAGTTTACGAA:1 + chr2L 2276771 3' - F-element 94 1 74.66 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCAAATAAAACGGCATGTCAGGCAACTCG:1 + chr2L 686091 3' + roo 9022 2 55.00 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTATATCCTTAACATAGAAGCCGACAGTCAACGACGACCTGGTTTTTAAGCACG:1 + chrX 3099168 3' + P-element 2860 1 51.46 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTGGAATTATACGTGCAATAATTTGGATTCGTGAGTATAGACTTCAACT:1 + chr2L 2052764 3' - blood 7087 2 67.12 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCCACTTATTTATTAATTACTCAACAGGCTGGAATCTCTGGC:1 - chr2R 20865680 3' - 412 7086 2 64.95 GTATATGTGTATGTATGTATGTGTGTACGCTGAACCTCCATCAGCGAGAA:1 + chr3R 18895983 3' - 1731 78 2 86.00 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGATACTTTTCGGATATGCGACAAAATCGGACGAAAACTGCTTTTTCAATTTCGTGTTT:1 + chr3R 6388800 3' - jockey 75 1 61.64 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGAACCCATTTAATATGAGCTACTGGAGTGATACCTTTAATAACCACCGAAGAGCACGTGAACAGAGACTTGGGACACAGCCATAATGACTCAGTTGACACACCG:1 + chr2R 20673776 3' - mdg1 6 2 77.61 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGAACCCATTTAATATGAGCTACTGGAGTGATACCTTTAATAACCACCGAAGAGCACGTGAACAGAGACTTGGGACACAGCCATAATGACTCAGTTGA:1 + chr2R 20673769 3' - mdg1 7063 2 66.44 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCCTCCTCCAGCGTCCCCTTCCCTTATGGTTCCCACCAAGTTTTCTTGACCATTTTCTGCAGCTGTG:1 + chr2L 11951629 3' + pogo 2047 1 55.48 AACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGACACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATAGCGAGT:1 - chr3R 27859187 3' + hopper 1339 1 69.86 GTAAACTTGGAATTTGTTTTTTCTTTTCTTGTATAATTAATATTTTTAATTTCTTACCTTTAAAATCAAAAATTCAACCTATTTCACAGTGTGTAAAAAGTTTTTTGACAAACTGTACATACTGTCAGTATCGAAGGAACGCGGTG:1 + chr4 976801 3' + S-element 1537 1 63.70 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGT:1 - chrX 1103618 3' - pogo 67 1 65.75 TGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGTGTGTCGAAGAAAATATCTTCTCATTGGGTTGGATCGGGTGCATTTAGAAAAAGTTAGTACAACCAAAGAGCTACAGCAAGTTAAGGAAAGGATTATGATTTTT:1 - chr3R 4733243 3' - Quasimodo 6990 2 75.34 GCACACACACACACACACATTTTATGCGGGTTGTGGGTTAGTTTTGGGTTGAATGTGGGTGTGTGTGTGTGTGG:1 - chr3L 9695488 3' + accord 7029 2 35.14 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCCCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGTTATGCCATTTTGGAATATCCATTTGGGTTGTACTATGAAATG:1 + chr3L 20255230 3' - Transpac 76 2 72.60 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAG:1 - chr3L 17175135 3' - 412 72 2 68.84 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTGCTGAACCATATTCTTAGACATAGATACATCCCCACGCAGACATACACACAC:1 + chrX 12866480 3' + roo 9005 2 65.73 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATATGATTTATGCGCTGTTTCTAATTCAATTTAGACCCGTTTGTTTGCTTTGGAGGTAGAAGGAAATGGAAGCAAACTTGTTTGCCGCTTTTAATTAT:1 + chr3R 23010147 3' - I-element 23 1 69.86 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGCAGACGTTTATGCGTTGTGCCCAGCATATACATACATATACCATACACGTGTGTGGCACATA:2 + chrX 12526033 3' - roo 31 2 64.38 GTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGACCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTAAATCT:1 - chr2L 8959913 3' - Ivk 5152 1 60.27 AAAGATAAAATGACCAACTGCTTTGCGCCTTTTTCTTATTGCAATTTTTATTTGTAAGACTTTCATGATGATAAAATTCTTATTTATAGGACTTCTTCATAGACGATCATTGGAGTAAACTTCCAGGGAATTGGCAAAAGCACTTA:1 + chr2R 7956671 3' + mdg1 369 2 82.19 AGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATTT:1 - chr2R 7020569 3' + Bari1 1624 1 76.03 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGAACCCATTTAATATGAGCTACTGGAGTGATACCTTTAATAACCACCGAAGAGCACGTGAACAGAGACTTGGGACACAGCCATAATGACTCAG:1 + chr2R 20673765 3' - mdg1 27 2 64.58 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAATACCTGAAATCTTTTTTAAGCTAAGTGATTTTCTTGTGTTTATATCTTCAGCT:1 - chr3L 96448 3' + roo 398 1 76.71 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATTGATTAAATTATTGTACGTAAAATAAAAAAAAGTGTGAGCCGCAGATACATATGTTA:1 - chrX 5150282 3' - roo 63 2 61.64 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGGTTAAGAAGTGACCGCCTGCTGGGTAACAAACACAAGCGACTGACATAATCGTGATATATTGACACGC:1 + chr2L 16458694 3' + roo 392 2 66.07 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTACAGAGTTCTCAATGTGAACATTCGCACAAATGGCATAATATCCTC:1 + chrX 4785156 3' - roo 8740 2 71.92 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTCAATCAAAACATTAAGGATAGTTTTTATTTAGCTGCTGTTCTGCGTGTTGTAATTTTACTATCCACATAATTAACAGCAGTGTTTTGGCAACTTGGCCAT:1 + chr2L 16399453 3' - roo 17 2 67.13 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGT:1 - chr3L 11336337 3' - blood 12 2 61.22 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCCCTAAAGAGCACAAATATTGAAT:1 - chr2L 686023 3' - roo 45 2 76.09 AACAACACACACACACACACAGAGGCACCCACACAGGTGCATAGTCAAATACTTGCACACTGATCCGATTGGAGGACGAATAGCAACACAAACAACAAAACTGGGGTAGTGTCAGCGTGTTGCACTAGTGTTTGTATTTG:1 + chrX 10283882 3' + gypsy3 422 1 59.29 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTGG:1 + chr2R 21402720 3' - mdg3 36 2 60.00 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAATAAAATGTCATTATGCGCTCCCAAAAGTATGCAAACGATTTTTCGCTTTGAATGCTG:1 + chr2L 3890220 3' + jockey 4936 1 63.89 AGCTGCTAAACAAGTTTAGCATTACCGGGAACCACCACGAGGAGGTTTTGAGTCGACTTGAGTAAAGGAGTAGGTGGAACTTGCATTTCATCGATGCCTTCAGCTGCTGG:1 + chr3R 22232391 3' - R2-element 157 1 61.82 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTTTCCTGTGTGAGTGCGGTGTCCTCTTCTCTGCGGGATTACATCGGCTTAGCTTGTCTCAGCT:1 + chr2R 16891960 3' - hobo 2 1 69.29 AGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATGGTATATAAATAAATCCTTCGAGCATTCCCATTATGTAATGGTAACATGGTAAATAAATGGATTTTAGATT:1 + chrX 10161212 3' + micropia 411 2 51.72 GTAGCTCTGACTTGATATTCACGGCAGGTATCTTACGATAAAATCACTTTATTTCGGCTGTCAGTTAACCCAAATGTCACGGGAACAAAATCCTTGACCCCTTCCACTGGCA:1 + chr2R 19686347 3' - Chouto 184 1 55.36 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCTTTT:1 - chr2R 21402596 3' + mdg3 5480 2 55.88 GATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGGTCGTGATCAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACA:1 - chr2L 12893452 3' - accord 156 2 57.66 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAAGTACCAAGCGAACCCGAAAGAAATGGTAGCCATGGAACCATGATATGGTCTATTACCATTACTAAACCC:1 - chr2R 11489166 3' + mdg1 369 2 54.79 GAGATTTATTTATTTATTATGCATTTTAATATCTAGGACACAAACAAATATAAATTTCTGACAGTGTAGAGGCCTGAAAAGTTGAAACTATGCCGCGTAGGCGACGTGGCAATGGCATCTGCCCTTTCCCTGGATTTTGCGCATCC:1 + chr2L 1615543 3' - G3 344 1 66.44 ATAAGTAATAAATATTGTTATACAAAAGACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCACCATCGCCCCAAAGAATCGCGCATCCATCAACACGTCAAAAGGGCGGGCACAGCTGCCGCCACTTGGAGTGCCAATA:1 - chr3R 16556996 3' + Juan 4061 1 50.00 AAAAACAAAAAAAAAAATGGGGACCGCCAAAAAGAGCAACATCCGTTGCATTCGAGGACCCCGCGTATCTTGGCAACGAGAATATATAAAAGGGGAC:1 + chrX 16167665 3' - hopper 139 1 76.29 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATTACAATATAAGTTTGGGTAATTACCCAAGCAGCCGAAACACAAGCTCAATGATTCCAATTATTACATTCGGTTCACATTTTAATTTACAAC:1 - chr2L 10184391 3' - Doc 23 1 68.89 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGAAT:1 - chr3L 15276647 3' + hopper 1353 1 67.69 AATAGCTTTTTTTTTCACATTCTTGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGGAATGTGTACGGAGGCAAGTGGCAAAGGGGCCAGTAAGACATTGTAACTGAGTGAAAGTTTCCGGTGAATCGTTTTGGAATAT:1 + chr2L 2272625 3' + copia 373 1 58.22 AGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTAAAACAGATCCTGCGAAAATTTCCACAATTATGAAGTCAGCTATACAGAGGAAAGTCATTGACTCTAACAACATTATGA:1 + chr2R 6779551 3' + TLD2_LTR 149 1 69.86 AGTTCTTATACAAGAAGATTAAAAAAAATTTTCTTTCTTTCGTTTATAGTGGGGCATAATATAAGATTCGACTTAGCATGCGAATGGGTCTGGATGGTCTGCAGTATGTGGACAAGAATGGCAAGCCCGTACTGCCGATG:1 - chrX 17450816 3' + F-element 4647 1 54.29 GAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAATGCCATTGTGATGCAGGGAGTACATATGGAATCTGTATCCATGGC:1 - chrX 1287811 3' - jockey 4854 1 68.49 GTGCGTGCATAGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTCTTACAAATTCCATTTTAAAACGGTTACTTA:1 - chr3L 11728400 3' - invader4 434 1 77.04 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGCCTTTGATTATCCACAAGCGATATAAGC:1 + chrX 12525972 3' - roo 78 2 78.79 TATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGGTCATTTAATTATTTCTTTTATAATAAGAAATTAAAACGAATTGTTTTTTTTACAAGTCGAGCA:1 - chr2R 1515895 3' - Juan 59 1 57.93 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCATACATTAATTAAAAATGTTTTGCTTTTCCCTT:1 + chr3L 20289114 3' - jockey 4745 1 74.24 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGCAG:1 - chr3R 10684717 3' + roo 9032 1 55.71 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGTTTCTTTGATTCGAAGCGCTTGAACTTATCGCCGGGGTGTAGCTCGAAAAAAATGAATGCGAATCTAATTGTTTTAC:1 - chr2R 7953625 3' + roo 9028 1 54.79 CTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATGTACATAGATTTGGCTATTTCCAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAACCAATGAGCCAAAAGACAATTGACCAAAGAAATATTCGCAGATCGTGATGGATGCTA:1 - chr2R 20293294 3' - 1360 380 1 67.12 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACCCATTAAGTAACCCCAACTGATCGGCGCAAATGATTCAGCTATGCAGAAAAT:1 + chr2L 12553506 3' - 412 69 2 63.01 AATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAA:1 - chr3R 19589934 3' - BS 5062 1 68.70 ATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGATGATCGACTGGATGGGGGCTAATAAGGTGTGG:1 - chr2L 12079635 3' - mdg3 5342 2 76.55 GTGTGCAAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTAAAGTGTCTTTGATAAACCCACTCCGCGATATTCATTGTGTTTATGTAGATAGCCACGTAAAAAGCGTGTAAATAACTATAATCAAATAGTGCCACACAT:1 - chr3L 3966239 3' - 1360 31 1 52.86 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTCCATTCCCCCATCCTCCCTTCCACTCACTCGAAAT:1 + chrX 7515760 3' + roo 9030 1 56.85 CATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGGGTTTTCATTTCCATTTGGCTTTACCCGCAACCCGCTTTGGGAAACTGCTGTGGCAATCCTTTCGGC:1 + chr2L 12340839 3' - diver 5940 2 51.41 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGTTTTCCTGAAACCGTGACTGGTGCCAACCATCCTAA:1 - chr3R 19445929 3' + roo 9034 1 70.71 TATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTG:1 - chr3R 13582230 3' - BS 5077 1 73.10 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCCTTTTTGTGTGGTTCGCGGTGAAT:1 + chr3R 24476397 3' - 412 38 2 58.22 TGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGTCAATAATTTTTATAAAAGCAGCCAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACCACTAGGCTAGGAAATTGCGGCTATAACAGACTGAACAAGACCTTTTTGCGCTGCGAAGAGC:1 - chr3R 14669462 3' - Cr1a 479 1 58.90 AAGAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAACCGTCTAAAAAGCAGCAGGAATAGCAAAACACCACCACCACACCAGCTCGGGGCCAATCAGAAAATATTTCTTTAAGCCCATCA:1 - chr2L 10800733 3' + Doc2-element 226 3 73.64 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTT:1 - chr2L 9485622 3' + 412 7479 2 71.77 GTGAACACTCAGAATAATGTCTTACTTGTCAGATAGATTAAGTTGCCTTAATTGAGTTAAAAATGTCTGGACATGGTAAAAATCTCACCATGATTTCTTCTCGAAATGCACACCGCATAAACATTGCCCATGCCACCTTATTATTC:1 + chr2L 3437292 3' - frogger 308 1 45.21 ATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATCAGGTAAGTTTTTGTGAGTTCTGGGTGTTAAGGAGGTTAAGGTTAAACACGTAGG:1 + chr2L 11652600 3' + roo 8736 2 60.96 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATGTTTAAGTTTAGTTTGACAATTGATTGATTGGCAGTTAATC:1 + chrX 14964695 3' - roo 8743 2 75.34 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATACCGGGGAGTTTTGTTTGGCTGCAAAGTGG:1 + chr3L 905854 3' - 412 82 2 79.56 ACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGACAGTCCAATTTCCAGAGTATCAGATACTAACAGGAAATACGAACGAT:1 - chrX 22601892 3' - INE-1 91 1 50.68 CGGTTGATCGAAAGGAAAAAGAAAGAAACAACGGTAACGGAAAAAAAAGGGTATACATACAAAGCCACAAAGGGTACAGGTATAGAAGGAAAATAGAGAGAGCAACGTAGACAAAATAAACACTTAATTTATGCCAGAACTCACAA:1 + chr3L 19410238 3' + Bica 495 1 73.97 CACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCATACGGGACCGAGTACGGGACCGAGTACGTGACCGAGTACGGGAC:1 - chr3L 18592070 3' + F-element 4362 1 68.57 TGTAATTTGTATGTATATTTAAGGAAGATTATTTGCGACACACTTAAGAAATCAAATTGCAATCAAGCTTAAGTTTTCGAATCGTATTTATATCAATATCAATATATTCAATCAATACTAATTGAGTTTTAAATGAATAAGTAACG:1 - chr2R 10563763 3' + Dm88 16 2 39.73 ACAAAAGGCAATTAAAGAAAAGTACTTATCATTAAGTATATATCTCATTCGTGAAAATTTCTAAGTCCAAATTTCCGAATATATTTAAATATTAATCCAGTCCGAATAGTGCAAAATTCCAAATGTGAAAAAGTGAAAATAATTTG:1 - chr2R 18496820 3' + GATE 450 1 70.55 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGATTGTTCCTGGAGTAAATAAGCAATGTTTAAAAATAGTGATGATTGACTTGTGTTTCAGATTTACGATAAGGGTGAGAAATGATTCCCAT:1 + chr3R 14653109 3' + roo 9040 1 64.38 TATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTCGTTATCAGTCATTTACTATCATGTGTATAATACTAATTTAAAGGACATTG:1 - chr2L 15945716 3' - X-element 91 1 65.07 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTAGTCTTTATCTTTATGACTCGATCTGCAGTCTCGGTTTTGTGTTCTCCATTCCCCCATCCTCCCTTCCACTCACTCGAAATTCTGGGTATTGCCTTTTCATA:2 + chrX 7515781 3' + roo 388 2 71.23 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCACATATGTCTTAAAAAACTTATCAATGCATGGGATAAG:1 + chr3L 4115192 3' - 1360 80 1 77.86 GTACATATTATCACAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTGTATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTATTTATGGTTTTACAGTTTATGGTGCCTTTTCTTCCTTTCTTTTTTTAATTGATTATAAATAATCAGCCCTGCT:1 - chr3L 27992788 3' + 1360 357 1 53.42 GAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTGCACGAAATATAATATCATAACGTTAAAGTGCTGACCCAGCATCGGACCGGAAACCCGTGCGCTTTCTTGGCATGTTTTAGTGACCAATTTTTGTTTTCAATGTTAGCTCTTCTTGTTGTTGT:1 - chr2L 18385824 3' + Gypsy6A_LTR 18 1 58.62 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACAACATGCCTGCCAACGGGGACTGATCAAGACTGAGAGGTACATATAAATATAGGTACATATAAATTAAGAAGAGTAA:1 + chr2R 5019816 3' - Doc 82 1 47.26 CTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATATACATACAAAGAAACTCTTAGTTGGAAAGTTG:1 + chr3R 11750246 3' - Tabor 6927 2 76.71 AGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCATTTTATTTTTTACAGTTTCCAAGTTCATTTTTTCAATGTTGGCTCGTGTGAATTTTATTTATAACTTTTCTATTTACAGTTTCGTGTAGA:1 - chr3R 25858664 3' + jockey 4911 1 61.64 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGGATTATCTTATTTCAAAAATTAGTTGGTAAATTTAAATGTAGTTTTAAGTAAAATATGAATAGGTTTC:1 + chrX 10567874 3' - roo 52 2 54.79 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGGGCGGAGATTTCGTCGCACTCGTTGCTCTGATTGACAGGAAATTGTTATGCCTGAATCC:1 - chr3R 31490930 3' + roo 9026 1 52.31 CAGAATCAATAGCCGAGTCGAACTGGCCATGTCCGCCTCAACCTATGAGGATTGGTGATGAAGTTAATGTTGATGTGGTTCTTCCTTTTTGGTAATAGGTGTAGAAAACTTAGTTAATTAATGCATCTGTTCTATTGCGTTTAAAA:1 + chr4 395188 3' + INE-1 95 1 67.12 CACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATTATTACTTTGCCTTCCATCCTAAGGTTTCCTGGTCTTCAGCTTCAGTTTGGTCCTGTTGCACGTGCTGG:1 + chr2R 7020660 3' - Bari1 46 1 52.17 CGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCAGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGATTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTGGCTTTATGTCTTGGAATTTTTATGTCTAATGCATGCAGAGGGCTGACTT:1 + chr3L 14354267 3' - I-element 180 1 65.07 AGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCGATAGTGCAATGCTTGACATCTATGAGACTTCCTCTGTATGGGTGTATATC:1 - chr2L 17240232 3' + hopper2 1527 1 71.92 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAGGATGCCATTTCAGGATAAGAGCCATGACGGAGATGAAGCAAAATATATG:1 + chr3L 17133923 3' + jockey 4985 1 62.33 AAAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATATCGCTTTTAATATCTATAAGTTAGTTTGGTAAATCGATGAA:1 - chr3R 19137081 3' - Bari1 89 1 97.95 CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGATCGGACGGGCAAGGAGATGAAAATCCTTGCCTGGCATTTCGTATTTAATTATTTA:1 + chr2R 18482498 3' - hopper 64 1 65.07 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGCTTCCCATCTACACTTGGCTTGGCCACTTGTCTATCGATCTGTTTTGTTGTGCG:1 - chr3R 13612808 3' - 412 68 2 62.33 GCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGTATGTAAACTTACTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGCGAAAACGAGTGTCTACTTT:1 - chr3R 20119225 3' - Porto1 393 1 60.42 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAACGCTGTATAATTTATGCATTTTATGTGGACCGCAGCAAAGGAAGCCCAGTCTTTATTACAATAACTTACCAATGCTCGGGCG:1 - chr3R 19613631 3' - I-element 17 1 43.20 CGTTTTATGAGCTTTTAAAGGTGAAGGGTTAAACAGCTGATGGGAAACCGAGTCTGGAACGATTTGATTTACAAGAAAACATTGCTTAATCATTTATAGTTATAAGAACTGGCAACTCAAGATTCGCAACTCTCTATCTTCTTTGT:1 + chr2L 22344441 3' + transib2 144 1 73.29 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAGTTGCAGATACTTTTG:1 + chr2L 4174086 3' + roo 387 2 66.41 ATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTACTTTCACATTTTTAGGATTTAAAATGTGTAACCATAACAGGAAGTGTGATCCATTGGGAGAAAAACTTCGAACATAGGTTGCAG:1 + chr2L 22535499 3' - hobo 2487 1 56.16 AGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATATATATGTGTCACTATGATGCAAACGTTAAAAAAAACAAATGCTGTACATCGACAGAAACGCGCATGGAAATTGAAATAGTTATAACG:1 + chr3R 5090080 3' + McClintock 6337 4 61.64 ATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGTCCATTGCCATGGCACGTTTGTACTCTACAATTTATCATCCTAATCGAAGTTCACAACAGCAATACAACTTTTTAAT:1 + chr2L 16089699 3' - 3S18 38 2 56.83 AAATTTAATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGCGAACAAGGGGTACCAGGGTA:1 - chr3R 31887738 3' + HB 1532 1 61.64 AAAATACTGCACTTTGCACATTTCTATGAATTATATATCCCTTTTTTTAGCCTATAAAACTAATTAAAAACTAGTATAATACTAATTTCTTATGAAACTTTTGAAAATTCGACAATTCTTTACATTTCTCCAAGTGTAG:1 + chr2R 8722667 3' - gypsy4 452 1 71.94 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTACGACTTTTAGGGGCAGTCCGCCCCGCCCATCTCCAACCATTCCCCC:1 + chr2R 11057352 3' + pogo 2057 1 60.66 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTG:1 + chr2R 8157276 3' + Transpac 270 2 54.89 AGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAGACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTATGAAGTATTATGGAATTATGAAGTATCCGATTCCACAAAACATTCGGGTAGTGGACTCGGAGTGGGCGAGTGGCCCTA:1 - chrX 804695 3' + TLD2_LTR 149 1 78.08 AAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTTTGCACTCTGAAGTTTGTCTGAGACATTGTCCATGTGTGC:1 - chr3L 24152458 3' - HMS-Beagle2 6961 2 71.23 GATGAGACCACTAAATATCTCGGGTTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTTTTTTAATTATGTTCATTAATTTATGAATATACTGTATACTAGATTCGTTGACAGGTATCGAGGC:1 - chr3R 4673559 3' - Ivk 328 1 56.16 GGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGCGGTAATATACGGTTTGCATTCCAATTTAGGCGCCGCAAGGCAGATTCACCCCCTCATCATACCATCAAGTTGTCGTAATTTATTGTAGACGGCAAT:1 + chr3R 18484415 3' - Cr1a 3998 1 63.01 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTAA:2 - chr3R 16181145 3' - roo 73 2 68.49 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTGACAGAAGCCCTTTTTCATATCTTAACTTTGATCAATTTCAGTGTACTCAAACTCATCGTAACGTACCC:1 + chr2L 17250832 3' + opus 7453 2 52.74 AGTTACAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTAAATCCTATTCAGTTGAACGGCACTGTATAACTATTTAAAAGTATAACTATACTTTTGGAAATAGTAGTTATAGCCATCCGGTCCATCGATGTTGAACTTCTTTTCATCAGAGAA:1 - chr2L 22749691 3' + Tc3 1687 1 58.22 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTATTACCC:1 - chr3R 13582194 3' - BS 5042 1 52.05 CAACGGGGGGAGGATGTTTGGTCCCAGCGAGCAATACATTGCTCTGTGCAGCAATAGATTTTGCATTCCCCTTTGTGCTATGTCCCTCTCTCTCTCAATAAAGAGCGAGCATAGCTGTTTACATCTTAATTTTG:1 + chr3L 24895166 3' + diver2 4519 1 61.19 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCATTTTTGAAATGCAATTAAATTAGAAAGTACATCCTAATGCGTTCTACACACGATTGTGTTACTAAAAAAATTGGTTTTCATTGAAAATATTTGGTTTAATTGGTTG:1 - chrX 13786808 3' - pogo 9 1 74.13 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACTTTTGCGGTCCACAAAGACAGTGTAATTACACA:1 + chr3R 27794880 3' + roo 353 2 55.86 GTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTG:1 - chr2R 17890871 3' + Tabor 423 2 61.64 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCACGCTCGGCGACA:1 - chr3R 17305428 3' + roo 391 2 66.39 GCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTGAAGGCGAAATGGAAATAGCGCACTTAAGTGATTTTGGTAGTCTTATTACCTAAATT:1 + chr3R 2555587 3' - Bari1 50 1 56.82 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGACCCACTTGGATTTGTCTCAGCCGTCGTGTTTCTGCA:1 + chrX 5150424 3' + roo 391 2 73.29 ATATTAAGTGGTTCAGTTACCGTTGCCAGTCGCTTGTCCACACCTATGCTTGCCATAGATGCTTGGATTCGATCTGGAATCGACTTCGGCAGCTGGCTTGC:1 + chrX 17377326 3' + R1-2 448 1 71.29 GCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTAATCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAAAACTTGAATTTTTCTATTTGAATTTGAGGCTCTTTGAAATGCCTACATTAAAAACGTGGGAATGCTGCAGAT:1 + chr3R 26531135 3' + Stalker 7050 4 50.00 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCATCTTTTCAATTTTCGCCCGAAACCCGCACATTTATGCAAACTTGCTACGCTCGTTTTTGTTGCTGTCAATTTCACAGATTAATGCGCACACATTTCAACGCCAAAGTCGGC:1 - chr2R 17890819 3' + Tabor 475 2 76.03 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAAAG:1 - chrX 23282940 3' - HMS-Beagle 6827 2 56.80 AGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTGAGTTTTCTTAAAATATTAGTTCCCTCCTTTTTTCG:1 + chr3R 15711845 3' - diver 79 2 73.91 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGC:2 - chr2L 17210258 3' + jockey 4936 1 56.85 AGATAAGATAACAAACACGTAGTCTTAAGCGCGTCATGTGCGGGTGGCTGTACCCAAGAACAGCAAAGTGAATTCGTTCGAATAAACCGATATGTGCGATGAATCCATGACGGAATTGAATTTTCAAACGGCTGTTTGTTCTGCAG:1 - chr3L 18543871 3' + Stalker3T 214 1 59.59 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCTTGCACTCAACGCGGCTTAAATCAAATGCCCAAAAGTATGCAGTGATTTAATATCTGTAAGGTTTACACCCATTTTTCATCCTTTATTTATATTTCTATGATTAAATACAAAACTTTT:1 + chr2L 6717261 3' - jockey 10 1 78.77 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTTCAGACTCTTGAAAGTTTTTCATAATTTTCGCTATTACCTTTGTTAAGTGCTTGA:1 - chr3R 11113144 3' + mdg1 7425 2 61.64 GAACTCGACTATAGCATTCTCTTGTTTTATTTTGTTTTAATGGGTTGTATAATTCCAAGATTTCTGGGTTTTTTTCCAACATCCATAAATTAATCTCTTTCTGTATGTTTCTTTAACAGTTCTGTATTCAAACGCATATTTTAGA:1 + chr2L 21762454 3' + INE-1 574 1 72.41 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGCCAGCGCAGTGTCAAGTGTAAAGAAGAACTACTAATCAGCAGTTAATTCTTATCTTTAATTAAGTGCAC:1 - chr3R 22100501 3' - 412 28 2 62.50 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTGGAGTATAAAGAGGGGTATCCAGTTGGGGAACTGGGGATTTGCGTGCGCACGCGTACAGCGCCAAAACGAATTAAATGTGATGCACCA:1 - chr2L 16458554 3' - roo 8696 2 62.33 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCAAGCTGAGATACTTTATAACTAATTACAAATTCAGCACGATGTGTGTA:1 + chrX 19536982 3' + roo 8998 2 68.49 TATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTATGCGCCACAACATCGAAGTAAACACTGTCTACAA:1 + chr2R 5868358 3' - pogo 84 1 78.08 AATAAGATAAGATAAGATAAGAAATATAAATAACTATATAAGTATCCAAACATTAAACCTGCTATGTTATTAAAGCGGAAATCTTAATGTATTTCCTTTTTAAACAAAATTCTTAAATTTACAAATATCTATCAGTGAAAGGCTTG:1 - chr3R 15768156 3' + Stalker3T 200 1 77.40 ATAGATATAAAATATCATTATATAAGAGAACTGTATAAGAACAATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGATTATAAAATATGTTACTTATTTTCCTTTGGTAGTTTT:1 - chr3L 12741205 3' + Dm88 4130 1 74.66 GTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAAGCATAAAACGTAATATTTAAATTAAAACGGAACCTCTTCTTTGTATG:1 + chr3R 22516097 3' - jockey 4577 1 70.34 GACTATTGATCCTGATCAAGAATATATATATGAAGAGTAGAGTTGGACGTCGATATTTATCAACGCGGCTGCTAAGCAATAGTATACGATATTATGGAAGTAACATCAAAAACACAAAGCACTTAAATAATATAACAACACACTCT:1 - chr3L 25501993 3' - INE-1 87 1 73.29 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGGCGTCAAGCCACAAAAATTTGCCAGTCATCCAGCCAGCCAGCTGGTTTGGGATCCAGCTAAAAAA:1 - chr3L 13827252 3' - hopper 54 1 56.16 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAAGTGCTTTAAATCAAGTTGAACCACAAATCGTACAAATCGTATTAATTCCGAGTGCTAAACCTTCCCAT:1 - chr2R 23000030 3' + mdg1 371 2 52.05 AAATAAAAAAAATAAAAGAAAATCAATTTTAAATTTAGTAAGAAATATACTTCATTTGGATTGGAAAATGTATTATAATCACTTGCAATCACTTCATTCAAATACTAGAGCCTATCGGGATAGCCCTTCAATCGGCGG:1 + chr2L 6119679 3' + F-element 4687 3 76.09 GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACAGCGTTTATGCTGCTGGGCTGCTCCTGCAGCATTTGGTGGCCTGATCCTATTCCTGGTCCTTAAAC:1 - chr3R 27822193 3' + I-element 5303 1 53.10 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTAAGGGCCATATTGACCAAAAATAAATATAAAGATGGCTATTTTTAAACCAAAAAGCCTC:1 + chr3L 96607 3' - roo 53 2 55.48 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGGAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGGGCTCTGGCCGGAATT:1 + chr3R 23765430 3' - roo 8744 2 75.54 GTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTAGTCGAAATACGAAATTTCATAATCTTTCGGGAAATCGAAAGATATTGGGGAATAAATGACGAAATTTTCTTTGGCGAGACTGAACTAAACGAATCAAATCGCTA:1 + chr4 729019 3' - INE-1 556 1 78.26 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATTTTGGCCGGGGCCATTCCACTCAATATTTGTGTGCTTGCAATTTGCATA:1 - chr3L 17707825 3' - Doc 45 1 56.25 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAA:2 + chr2L 246107 3' + roo 9024 2 54.79 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGCGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGCATGGTTATTTCCCCCTGTCTACAATTGATTGGCAGTCGCGTTGAGTGGCGACTCCATAT:1 + chr2L 12414993 3' + pogo 2042 1 55.48 GCTATGTGTGTGTGTGTGTGTTATTGCATGTGTGTTCGTTACGCCATTTAACCCCTCCTTCAAATTATCCTGCTCTGTTTTACTTTTATGTTCCGGTGGATGGCTTTGGTTTGGGCTCTTACATTTGGCATATTGGAGCCGAAAAT:1 + chrX 16993349 3' - accord 7030 2 55.48 ATTGAGAGAATGCAATTCCCGCCAAATTATTTGTTTACTTTTGCACGTAGTACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATCGGAGGACTCCAAGGACTGAAG:1 - chr2L 22747299 3' + transib2 183 1 49.64 TGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATAACAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTCCTTCGAAACACAAATACA:1 + chr2L 13250446 3' - opus 7059 4 67.41 ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCGGCGGATACAGACATACCAACCGAGTTAACCACATAGCGAGTTTTGGCCAAAGG:1 - chr3R 27859175 3' + hopper 1351 1 61.64 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGATATATTGGAATTCTAATTAACTACACATCTCCCGCCCGCCAGTGGCACATCCTTGGTCTCCTTGCCATTTTCCTAGTCCTGTTAGTCCTTCTGCTCCAGAAACACTCT:1 - chr2L 18317424 3' + mdg1 7418 2 54.11 ACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACCGCTGCCTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATACCTGTGCTGAACAATAAACAAGTCCTAGAATTAATA:1 - chr2L 23001063 3' - Circe 7185 1 71.32 GCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTC:1 - 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chr2R 22738782 3' + invader1 178 2 53.42 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACA:1 + chr3L 22400357 3' + 1360 3352 1 55.00 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTAAATTGTATTGACATTTGAAAGAGTAGGTTGAACGACATTGTCGTCGAGCATCGGCG:1 - chr3L 12224618 3' + 412 454 2 52.03 TATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATACGCCGAGTGGTTTAGATAGCAGTTTTTGCAAGTGCGTTGTATTT:1 - chr2R 19553193 3' - mdg1 76 2 68.49 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCCGAAAAGTTTTTGAAGCTTCCCGCATAATCAACTCTGTGCCTTGGACTTTTTGCAAGGATAAGGACTCCATGAAACA:1 - chr3R 17656334 3' + mdg3 232 2 76.81 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGACAAAAAACCGACAGTC:1 + chr3R 9352112 3' - Tirant 8143 2 57.78 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAACTTCTACTATTTTATGTAACTTTAATTAATGTTGAAAAAATAATTTATGATTTTTGAGGAATC:1 - chr3L 10133497 3' - 412 58 2 56.16 GGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATGTTGGTAGTTGGGAGCTGGGGTCTCTTCTCTCAACTTGAAGCTGCGG:1 + chr3L 4741395 3' - F-element 4522 1 50.53 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCAATCCAATTGAGTAACAGAATTTGATAATTGTTTTTTCTCTGAATCAAGAAAAGGGTATAATGTATAGTTATTTTTCCGAGTGATCAAACACACCCCGTTCCGACCAGCCAAGCG:1 - chr2L 2052624 3' + blood 370 2 73.29 AAAAATCCTATGATTTACAGTTTTAGTGGGCAATTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATGCCAAACAATGACGAAACAATGATGAAGACGTAAGGTACGATGCAAACTAGTGTTGACCGGGACGAGATACG:1 - chr3R 7640115 3' - HB 1576 1 52.99 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCACATTTCATTCCGGAGCTCTTTGCCAACACTCAT:1 - chr3L 17133829 3' - jockey 4735 1 66.67 CTTGCAGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCACCACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGGGC:1 + chr3L 23678167 3' - Osvaldo 35 1 67.69 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCAGAGACCGAGTTGATAAGCATCTGTGCACTTCATTTTTGCACTTTTCCCAAGTCCTTGGAGCAATTTTATTACAAGCA:1 - chr2L 4173945 3' - roo 8695 2 61.48 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCCTGAAAAAAAGGTATAGGGCATTCCTGACGACAAGGAAGTAGAAAATGGGTGCCAATGTAAGTGAAACCTATCTATTCAATG:1 - chr3L 14553080 3' + roo 9033 1 57.53 TACATGGATTTGGCTATTTCTAATCTGTTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGATTGGCCAGGCGAAGTCAAATGCTTTAAATAGCCATTGACAGTGGAGAACTGATGGTGCCGGGTGGTG:1 + chr2R 19232229 3' - 1360 338 1 54.79 TTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTCAAACTTGAAACGTAATATTTTTCTCTCTGTACAATGATTCGCAACGTCGGACTCTTTGTGTCGAGAAGGAAAGTGCGTTTATGATTCAAT:1 - chr3R 26519927 3' + FB 686 2 55.48 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGTTTTCCTGAAACCGTGACTGGTGCCAACCATCCTAACGGATCAAATATTTTTGC:1 - chr3R 19445911 3' + roo 9031 1 60.83 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAG:1 + chrX 5150387 3' + roo 9028 1 53.33 CGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTCGATCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTAT:1 - chr2L 23069853 3' - Stalker 7016 6 74.10 TCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATGATTCGTTGCCTATGGCCCAACAAAAGCTAAGCCCGCCAAAGTATGCAACAGAAA:1 + chr3R 22516042 3' - jockey 4605 1 56.35 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTCTTTTTC:1 - chr3L 18658909 3' + roo 331 2 73.61 TACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTTCGATGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1 - chr3L 23112570 3' - R1A1-element 34 1 65.91 CAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTTGCCATAAGGTGATGCATACGGAGCTCTCCCACAAACAGCATCGATCATCAG:1 - chr3L 10643675 3' + 297 6880 2 61.48 CCACTCGCAGCCGGTCATGAGTCATGCGACCTTATTTTGGATAGCCTGGATCCTTTTGATTTGGTGCTCGTTCGGCTTGCCCGTTT:1 + chr3L 23796205 3' - X-element 4316 1 74.42 AATAATAAAACATTCGCGTGTACTTATTGTAGGGGTATTATATATCCTCCTAGTTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTCCACGCCCCCAGTTCTGTTCGGCTTTCGGGCCAAATTGAAGTGGCTGAACAGACGTCTAGAC:1 + chr3L 13242055 3' + Q-element 549 2 43.36 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATATATATATGTATATAAAATATACGATTCCGATTCCATCGGAGTGTTTTATGAGTTCATAAAATGGGTGTGT:1 + chr2L 10089840 3' + opus 7477 2 53.49 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAACTTTCCTGGGCTTACCAGTTCCTTGCCAAAGAAGCTTTTAAAATCGGATTACAGCTCAGTCACAGTGTAGTTTCAACCTTGATTAAATTTCAAGGCGAC:1 + chr2R 19555072 3' + pogo 2082 1 69.86 AAAATGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATT:1 - chr3L 22861784 3' - S-element 76 1 69.18 TCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTCATTTTTGACTTATGCATGTCGACAGTGGCAT:1 - chr2L 1552604 3' - Bica 272 1 78.08 GACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAAACTTTGCGAGGTGGAGAACGATTCTTGCAGTGGTGGAACGAGGACCTGGGGGGGTTGCAAGGGTCAGTGGCGTCTGTGG:1 + chr2R 5634012 3' + 1360 213 1 64.60 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACAAAGGGGCATTGTTGTTGCTGCCGAGCGG:1 - chr2L 14095588 3' + pogo 2049 1 75.00 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGCACGCCGACAAACGCTTCGTGCAACTTCGTGCAGCTTCGTGCCACTCGGTTCGCAGTGGCTCGCTACGAACCGCCGACG:1 - chrX 14826081 3' + P-element 2872 1 66.67 AGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGGCTTTGATATGTGAAAAGGATACTAATATGTTTTGCTTTTGCATAGGCCTTCAACTTCAACAA:1 - chr3L 4115126 3' + 1360 3321 1 63.01 ACTGTAAATACCTAATTATACTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAAAATATATTCTTGATCACATCAGAATAGATTAGTCCAACTAACTTTGAACCAAAATT:1 + chr2L 13154302 3' + Juan 4150 1 59.59 GAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCAATAATTGCCAGGAGTGGAATCTCTGGGGAAGTCCTAAT:1 + chr2R 21402741 3' - mdg3 16 2 73.97 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATATATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATGTGCAGGGATCTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAAC:1 - chr3R 29288741 3' - BS 5076 1 69.86 CCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTCGCAATGATTTACGGTTTCGCATAGGGGAAAATTGC:1 + chr2L 17240292 3' - hopper 76 1 76.43 CAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAAT:1 + chr3R 13349128 3' - BS 5054 1 58.45 TTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTATGGACCATAGTGCCATTGCTCGATTCTGCAACGACCATGCCCCCTTT:1 + chrX 8755102 3' - transib2 51 1 69.16 CATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTCATAGAAACGATTAGTTT:1 - chr2R 961114 3' + transib2 2682 1 69.44 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATTTATTTATAAACATTAGAAGTGCATGCAGATGCGGATAAAAACAAAATGTTCTGTTGTTTTCTGTGGCGAAACATTAAATTGGATATCCTATTTGGCAAA:1 + chr3R 15885263 3' - I-element 19 1 69.86 TATGTATATAAATAAGTAAATAATTTTTGTTTAAACATTTTGTTAGCATAATTCAAGCAAGAAGCAAAATACAAGCAATTTGAATATGGAAATATTCTTCGACCAACTCATATTACTACATATACATGCAGAATGTGTATAATACA:1 - chr3R 7410451 3' + 1731 4418 1 43.15 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTATGTATGTACATAAATGGCTTATGCTTTGGCAAACTTGCAAATTGCTGTCCACTTTTCATGCTGTCCTCGCCATGTGATCCCT:1 - chrX 22858383 3' - copia 4907 2 56.85 TAAGGTCCCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTGAATATGTCAC:1 - chr3L 25008287 3' - 297 361 2 77.40 TGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATACTTACATATATATATACATATATCCCGACCATCCCCCAAAGAACACAA:1 - chrX 6138633 3' + opus 427 2 79.45 TAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATCAAAATGAACTAATCTGTCTTAAGGACAAAATAATTGATAGCTGGGCCGGAGTAAATATAAAAAAGAAATT:1 - chr3R 2914301 3' + Circe 7024 1 63.01 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTGAGTGATGCTAAAGATTCTGATTTGGAAAATTTGAAATCGAGCGATGACTTAATAGTTAACTTCATGCTTTCGATTTAAGCTAATTTG:1 - chr3R 7035213 3' + roo 9039 1 63.01 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAATTCGGGTGGGCGTCGAGTGTAA:1 - chrX 2762537 3' + roo 9052 2 71.13 GGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATTCACGACGTAATTGGTTTCCAACGTTCACACATCATCACTCATACGCACTGTGGCCGCTGGCAGCG:1 + chr2R 19352070 3' - Burdock 36 2 54.62 GGTCTGGTCAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTCAATAACGGTGCCAGGACTTGGTGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCATAAGATATAATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTATTTTTTTGGTTAGTT:1 + chrX 16578166 3' + Tc1 1235 1 80.14 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTA:1 + chr3R 9190581 3' + Tabor 7246 2 69.86 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGT:1 + chr2R 13644520 3' - Burdock 47 2 55.47 TAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCA:1 - chr2L 15834478 3' + hopper 1325 2 76.71 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACCGTCTCCACTCCCAATCCCCTGCCTGCTTTTCTCCAACTGCAATCGCTGCTTTTCCTCAGTCAAGTTGCAGATACTTTTGCTATGATTTAACCGA:1 + chr2L 4174101 3' + roo 9047 1 68.49 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGATATTGGGCGCTGCTTCGACTGGAGCCAATGTCGTTCATTCCGCCGGATCCGCAGCTGCCAATCACGGAGCTCAGGCTGCCCATGGAGTGCTAGGAGCAACTGGATCTGGA:1 - chr2L 10697356 3' - mdg1 12 2 77.40 AAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCGCATG:1 + chr2R 15829618 3' + invader4 296 2 59.38 ACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGA:1 + chr3L 16973473 3' + S-element 1664 1 56.85 AAAAAAAAACAAGTGAAAAAACGGAAATATACATACAGCACAACATACACATGTCTATACATATGTAAATTGTAAATGGTATACTATAACGAGATATATAAAAAGAACACAAACAACTCGATAGACCCGTTAACGTTTTGGGTTA:1 - chr3L 9164685 3' + Porto1 173 1 56.55 ATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATACAGCACATCAATTCATGGCTGATCACAGAGGCATTGCTACCCTCAGAATGTGATTACACTGACCATTTATGCTAAAGCAACGA:1 + chr2R 4362645 3' - gypsy 7023 2 60.96 CCCAGACCGCAAGTCAATTGTTACATGGGTCACTTCATTCAGGCAAACTGCAAGTGCGACAAAACTTACCAATTGGTCCACCTGAAATAAAACAGTTTAGAATGCGGCCAATAGAGGCGGATACATTCAAGCTACGTGATCAATTA:1 + chr3R 4543071 3' + mariner2 256 1 56.16 ACTATAAACTTGTGCATACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTTTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCCTCGCATTTTATACAGACAGTTCCATGGCAGCCACTCAC:1 + chr3L 5885822 3' - rooA 7593 2 76.11 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGTCGAAAAAATTAACAGGCTCGTCTTCTTTTACTACACATCTACCGCTC:1 + chr3R 9190587 3' + Tabor 419 2 64.29 CTTGATCAGGATTAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGAACGTCGAGATTTTAATAAAATTAAAATATCGATCAACAGCGGTGGTAACG:1 - chr2R 25240191 3' + INE-1 89 1 56.73 AACGGGTATCTGATAGTCGGCGTACTCGACTATAGCGTTCGAGAAAGAGAGAGATACAGAGGCGTGGAAAGAGATAGACAGATGGTGTGTGTGTGTTTCAATGTGAAAGAGATACATGAGTATTTACAAAACGCAGTAGCTATTAG:1 + chrX 17867961 3' + INE-1 553 1 76.71 CTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGAGGTAAGAAATATTTTGGGGACATTTGTTATCATTGAACAGCTGTTCATAGTTTGCCCACAGCCGAACAGCTGATTTGGCCTAGATTTTAAACTCGAGCATCCTACCTCAAATTAAATT:1 + chr3R 26140395 3' - Tabor 5 2 54.79 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCCTTCCGCGGTGATAGTGTTGTAATCCGTCTTTTAAAATACAACGGCAACTAGTGCATA:1 - chr2L 9485595 3' + 412 430 2 58.22 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTTGTAATCGTGGAGGAGCTATAAAGCTTAGTTCCT:1 + chr3R 9160775 3' + copia 200 2 51.72 TAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAATTCAATAAATTTGCACAGAATTTTTCAACAATGAAAACAAATTTTCGCTCTTTCGCTGCTTGCATTCTTTG:1 - chr3L 1404988 3' + Ivk 5328 1 57.53 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGGATAGGAATACAGTTCCTAAGCGGATCCACCGAGTTGCTTG:2 + chr2R 8157321 3' + Transpac 5221 2 79.45 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAA:1 - chr3R 28396620 3' - jockey 96 1 76.03 GCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGAAATTAAGTTTCCCTGGGCGAGGCGGAGATGTAAATTGCACGCATAGGTGATTACTG:1 - chr3L 20255144 3' + Transpac 269 2 55.20 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGCAACTGCAATAACTGCAATATAATTGCATTTATGCC:1 + chr2R 17392080 3' - BS 5080 1 75.34 TGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATGGATTTTCACAATTTCTGCACTCTGGCCATAACAAC:1 + chr2R 17890945 3' - Tabor 87 2 75.34 CGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATAATCATAAAAATTTAAATTAAAAATTTCAAAAGTGTGTATGCCA:1 - chr3L 23325993 3' - pogo 74 1 70.55 GGCAAATCGATATAAAGTTACAAGACTAATAAAATTACGAAAAAAATATCCAACAATTTTTCAAAAATGTGGGCTTGACACTTTGAAGATTGCAAACTCCGTAAAGCAAACTTTCCGTATTATGGAAAAAAGATGAAGATTCGGAC:1 + chr3L 23635734 3' - INE-1 440 1 68.49 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGGTCTGCCATGATTGTTGGTTAAGGTCTTGAGCCCGGGCAAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGGTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAA:1 - chr2R 1740237 3' + Tabor 7309 2 73.29 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTATGTTCCTTATTAAACACATTTCAACGGGTATATAAGTTTTGTTAAGGGGTAACTGTAAGCCGGACCCATTTAGCTTACCACCCAATATGGTAGCACTGG:1 + chr2L 8542090 3' - pogo 3 1 66.17 AGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTTACGCCCGTCTCCTTTGACTTACCAAAGAATATAATTTGCCAATTCCAAAAGTGATCTTTTGTTAGAATAACAGCATAGACCATATAAGAAATCTCAAGCACTATTAACTCAA:1 - chr2R 7020494 3' + Bari1 1699 1 76.71 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTATTTAAAAATACCAATTGATCGATTGTAGATATTAAACTTTAAGAGCCCATAGCAACCGTAAAAGCCAATTTAATATT:1 + chr2L 14201492 3' - roo 14 2 62.50 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCCTTTTTGTGTGGTTCGCGGTGAATTT:1 + chr3R 24476399 3' - 412 25 2 64.44 ATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGCCAAAAATGAAAAGTAGTAGGTATGGGTTGAGTAAAATACAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 24905581 3' + hobo 406 1 55.20 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTGGTATTGTGGTTTCCTTTTCTGCTCTTTTTCCCCACCGCCGGTCATCCGCTTTCCCT:1 - chr2R 21402599 3' + mdg3 224 2 52.43 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATGTATTATAAGACATATAAATTAATAGACTTTCTTTTCATAAATATAATTATATCGTACTATTTCATGGCTTAAATTTTATTTGACGCATTTTATGTGATACTCG:1 - chr2R 8305168 3' - roo 18 2 71.92 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGAAATAGGAAATAAGTTTTGCCGCTGATATAAATTAGAATCTTAAGGGATTGCCATCGCGGCCGACTTAATCAAT:1 - chr3R 28272199 3' - Tirant 8120 2 71.68 GTGCTCTTAATTGGAGTTCATCATTTATGAACTTGTACTACAGTACTATATTCTTAGAAAAATATTTGACAGATAGATTCTGACGAACGATATCTTGGAAACTATAAGGGATTACCTTGCAAGTACAATATTTTTCGTTCTAATTT:1 + chr2R 24453430 3' + 412 487 2 69.86 AGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCATGAGACTGCTAAAGAATCCAAAAGAAATGTATAGCTGTTCGAGGAAACAAGATAGAAATTCTGGTACTCTGAACATCATGACTTTCATGTTGATTTAATAGT:1 + chrX 12192363 3' + pogo 454 1 67.81 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATTGCTAGCAATCTATCTTTCGGTGGGTTATTGCAGCATGCAGCAGGAGTGGATCTGGCTTAGCTTCGGATGCCTGACCCTGTTATTTACTTTTGTATCTTTTGCCGCATCCTTGGCCTC:1 - chr3R 29418607 3' - mdg3 5257 1 78.08 ATGTTTAAAAATAAATTTAAATTTGGCGCCAGATGCTTGCAAGCAGTCCAAGCAGTGCATCAAACACACAAGCAGTACATGCCGCGAAATTTGAAATTTTACCTAATACATTAATACATTCTTACTAAGTGTATTGTATTTTTACG:1 + chr3L 9824514 3' + NOF 3953 1 60.27 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGACTAAAGTCTATTAGGTCGGTCATATCAGCGGCTGCTG:1 + chr3R 12599099 3' + 412 7493 2 67.54 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAGCGTAGTATAACCGCATGAGACATGTAAAAGTTAGTCCTACAAGTCGATTCCTTTATATCACCCCGACACGCGCCGATATAATAATTTTGATGACAGTGTGGCAA:2 + chr2R 5737258 3' + 1360 3374 1 73.97 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTTCTTGGTTTCGGTTCCTCATTGCCACTCAGCATAGGCCACAAATTAATCCC:1 - chr3L 17890701 3' - 412 7091 2 58.90 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATACATACATAGCCATATAGCCCGGTATTTGGAAAGCCGCAGAGTGATTGCCTCGG:1 - chr3L 16870166 3' - FB 68 1 63.70 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGGAGTCCTGTTTGCCGCGCCCAAGTGTCGATTACTGGCATACTC:1 + chr3L 22642913 3' - hobo 46 1 62.61 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGCTACGCATATGCACTTTGTTGTGTATTGCATATGACGCCCTGTC:1 - chr3R 19531241 3' - hobo 50 1 61.34 ACTATTCTGTCTATCATAATAAATTAATAAAATTGCAACTGTATTTTTTTCTTTGTTTTACACGTAAAACTTTTGTTTAATGTCATCGATTTTGTTCACATTTCCTAAATCCCTTTACTCTGCGAGGTCCGGGTATAATTAAAAAA:1 + chr3L 27670272 3' + I-element 5344 1 56.85 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAAAAACAAATGAGTTGTGTAATTAATACGGGCTTTTGTCTTGCCATAAT:1 + chr3R 18816010 3' - hobo 10 1 78.46 GCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGATGATCAAAAAAACTTAAATTTGATTTATTCTTTTCCCT:1 - chr3R 18496036 3' + blood 296 2 73.29 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGGGAATTTATTTGAAATACACGATGGCGCTTTCAAGTGCGGTGTGTGTTTGAAAGTCCTAGAACATCACGCATAATAAGCAACCAAATATGAAGTTGTGATGTG:1 - chr3R 15021980 3' + Tabor 7305 2 70.55 GAAAAATAAGAAGAGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACATATTTACATATTTTTATCTATTTCTAAAAATATATGGCA:1 + chr3L 271991 3' - invader1 58 2 75.00 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACTTTTAAATGGTTGGAAACGCTTCGCTCTGCCTTTTAAATACTGTTTAACGAATCTAGTATAAATA:1 - chr3R 32031698 3' + roo 9017 2 58.90 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAACCGAAAACCTCATCGAGTACATGAATCATTGTT:1 - chr3L 17890751 3' - 412 80 2 75.36 GTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATAGGCAACGAATCAGCACAGTAAGCGCCAGCT:1 - chr3R 22515990 3' + jockey 4901 1 78.77 CTATAGTCGATTTTCCCAACTAGCATATACCCTTTACCCAGTTAATTGTAATGTTTATGCTTAGCGCCATACTAGAAGGCTATAATCAGAGGTCTGATCTGGAATATACTCGTACATATATATCCAG:1 - chrX 11770224 3' - INE-1 566 1 18.11 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGCACTTAACTCGCGCCCATTCATAAATGGCCGCAAAATGTTCAACAAATGTGCCTCAGGCGACAGGGCTTTAAGAGAGCAAAA:1 + chr3R 28272550 3' + Tirant 375 2 60.17 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGTAAGTTGGAAACCAGAGGAAGGATCAAAAGTGTTAGTGTTCTCGGTCATGTCACCACCTCAGCATGTTAGTGAATCAT:1 + chr3R 16181253 3' + roo 9034 1 58.45 GTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTGATCGGAGAAGATGCCATTGGCCACCACCTTGGCATCGCCGATATTGACATTGGCATTCAG:1 - chr2L 13249684 3' + roo 479 1 53.17 GGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTAACAAAAATTCTATGTATAATGGTACTAAGGTTTTTACCGATTCTATTGGTAAATTAATAAATGCTTAACG:1 + chr2L 19136149 3' + R1A1-element 2 1 57.26 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATCGGAGGACTCCAAGGACTGAAGGCAGCGCCATAGTCTAACCCCCAACCGGTACGCATCACAGGATCCCGAG:1 - chr2L 22747250 3' - transib2 39 1 52.24 ATAACATTAAATATACAAAATATTGCTCAAATAGTGATAACAACTGAACTTGTTTTTTTTTATAACAATAACAATATATACACACAAAAGGAAATACAAAAAATTTTTATGGGATAAACAAAACTGCAATTTATGAAACGTACGCA:1 - chr3L 8902055 3' + Juan 341 1 72.60 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACC:1 - chr3L 22052770 3' + mdg1 350 2 70.80 AATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCC:1 + chr2R 15829613 3' + invader4 314 2 67.62 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAAC:1 + chr2L 246103 3' + roo 9031 1 56.30 ATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATATTTGTTCTCGGTGTGGAGTAGAGGGTGGGCTCTACGC:1 + chrX 960871 3' - roo 402 1 73.97 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGAGCTCAATTTCAAGCTCGTTGGCTAGACGAGAGCTCGGCGAATAAAACGGCAT:1 + chr2L 686078 3' + roo 9037 1 55.36 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAGTCATTAAATTAACTCACATCAAGTGCGTATACTTAATTTTTGGGCATGCTCTGTTTT:1 + chr2R 23497132 3' - 412 7112 2 58.87 ATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGGACGAAAAGCGTTTGTTCCTAGAGTTGAATGGTCAGCAATGGCATACGCCTGGTGGTTCGTAATGGAGTAATGAAGAGTATCACTATTGTTTCACGCTTTACG:1 - chr2R 558040 3' - copia 4879 2 77.37 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACACATAATTTTTGGTGAAAGTGCAGCTTATGCTTATGCTTTTGCCCAGAAATTTGCTGCAAAATGTTTTAGGTGCCGTT:1 - chr2R 11057236 3' - pogo 41 1 55.17 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACTTTCAGGATCAATTTGGTTCAATGTGCCCAGGTTCGGATCGGAGGCCTAGTGGCGGTAGCGGTAACGCAGACGGCGCACAG:1 - chr3L 22900063 3' - 412 7082 2 62.96 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAACGAAAAAAAACGAAAACGATGAAATGTGAGCATTGATAGAAAGTTTGACAAATGCCAAAGGATGCCATTTCAGGATAAGAGCCATGACGGAGATGAAGCAA:2 + chr3L 17133915 3' + jockey 4977 1 56.85 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCCCGAATTGGTCATTTAAGATCTCAAGAGCCAGCTCTGTATCTGCAGAATGGCTAGATTTCCCACATCCGCAGAGTCAGAAGGTCAGCATCGGGCGTGAGACCG:1 + chrX 22853517 3' - FB 3 1 80.00 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTAATTTGTC:1 - chr3L 18658915 3' + roo 323 2 78.08 TGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGATATGACCTGAAAATGTTTCTAAGCTCTTTGAAAA:1 - chr3R 9190521 3' - Tabor 80 2 72.34 CCCACTTATGAAGCACACTGCATAAAGTGCATGGTTAGCATTCCCAGGCTAACCAAATACCGCGTTCTCTCTTAACATAAGTATATAATATAATATGTAAAAGCCGCTTCTCTGAAGTAATCGTGCATTGCTCCCTCTCTGCTGC:1 + chr2R 6610971 3' + gypsy11 149 2 76.55 CAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATT:1 + chr3R 11547772 3' - G2 344 1 63.70 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAATATTTAAACGGGTACATGTGAATGGATGGTTGACTGA:1 - chrX 12525925 3' + roo 8988 2 76.71 GCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTAT:2 - chr3R 13582202 3' - BS 5050 1 54.11 CTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGGTGTTAAATTTAGTAGTAGTAATAGTAAAGTTGGTA:1 - chr2R 12240110 3' + copia 169 2 78.08 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTCCAAATATTGACATTAATTTGCGACTCAACTGGGTCGAGCCGGCATTTTT:1 - chrX 4291879 3' + roo 352 2 65.32 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGATGTGAATTTCGAACTAGACATTGATCATTTATTTCTCGAATTTGGCAACACTAGCTAATCACTAATCACTGTGTAATTCTTGTATTTTGAACACCAAAATATAAGTAAC:1 - chr3L 22861717 3' + S-element 1708 2 74.48 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTTGAGAGTATGAAATAATGGTTGATTCAGGATATCCCCTCACTTATGTGTGTTGCGTGGCCTTCTTGGCGA:1 - chr2L 4106277 3' - jockey 4786 1 60.00 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGAATGAGTTGATTTCTTTCCGTGTAATGTTTGTTAAAATTTTCAACTAACTCTTCCAACTACCTGTT:1 + chr3R 20744077 3' - roo 8718 2 58.22 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACATAATATTGAAATTGAAATAGACAATGCCAGTGGCACGAGTCGCTCTCTTGGAAA:2 + chrX 4778268 3' + 412 7477 2 65.07 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATG:2 - chr2R 19554905 3' - pogo 40 1 58.22 TCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCTAAGGAGTTGGTCGCGCTCTGGCCAAAATGCAGTTAG:1 - chr3R 9160692 3' - copia 4951 2 71.23 TATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCATTGTGGCGGAAGTGAAGCAGACGCCTGATCAGCGG:1 - chr2L 22975402 3' - 1360 144 1 68.70 CATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATTATTACTTTGCCTTCCATCCTAGGGTTTCCTGGTCTTCAGCTTC:1 + chr2R 7020635 3' - Bari1 70 1 67.88 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCGACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGGGCACTTACCCTTTTTTATCTCTACTTTACTTTATGCTACTTGCTGTTACTTTCACACACTCAC:1 - chrX 6312648 3' + 412 445 2 52.17 GCTTGGGATCAAAGGCGAGCTTAAGAAAGAAGAGCAGAGCAAATTGGATCATCGAACGCGTCGGGAATCGAAATGGCATCGAGTGTGCAGCACACATCTTTGCTGGGAAATCAATTGGAAATTTAGA:1 - chr2R 17961934 3' + gypsy7 5312 2 52.76 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTTGCGTCTTCGATTTGGACATTGATTGCATACAGAATTGATGGAAACGCTGCCATTCGCTGCTCCTACCT:1 - chr3R 11498242 3' - jockey 4783 1 63.33 CAGGCACACACACACACACACACTTGTGCAGACTGAAACACACACAGCAACACCGAAACACAGACACCCCCGCAGACGAAAAGCCTAAACCGAAACACACGCACACACTCCGCCAAACACAGCCACACCTCAGCACACACACAT:1 - chrX 10730505 3' + accord 7026 2 68.75 AGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGATAGATGCAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATTCCGTTTTTGTCCCTCCTCCAAAGTCACTCGACGCAGGCGCGACC:1 - chr2R 21039635 3' - Circe 103 1 68.97 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGCACACACTGTCGCTTTACATTGTCCGCTTCGCCATTCTGATTTCGCAGTCAAAATATGTTTGCAA:1 - chr3L 6775343 3' - blood 57 2 55.48 ACCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTTTGGATTTTTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTACCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTGGAAACAAGAAT:1 - chr2L 8776795 3' - G4 3689 1 36.30 ACATTTAAAAAATATTTATTTATTGTATATGCTTGCAATCAAAATGAAGAGAAAATGAAGTTTTTCTTTCAAACAGTTAGAGGTGCAATTAATTTAAAAGGATGGATCTCAAAAAACAGACCCACAATTTACAGATGAGCTCTATA:1 - chrX 16220407 3' + Transib5 2727 1 59.59 ATATATATACACACACACACACACACACTCACTTCTGTGTTTGTGTACCTTCAATGGGCACACACACACATTTGGAATGTTGGAATGGCTCAGGCTTTTTGTGTTTGT:1 + chr3L 12874741 3' + Quasimodo 31 2 75.00 GAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAATAAAAAAAAATAAAAAAATAAAAGTTTCGGTCGAGAGTTCGATTTTTGG:1 + chr3R 7968403 3' + Juan 4133 1 72.60 TTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATAACAACTACAAACAACGGTCA:1 + chr3R 21933297 3' - X-element 4543 1 79.49 TTATATTTAATTTATTTATTATTGAATTTGTGTTTATAACATTTTTAACTTTATTTTAAAATTAGTTTTAGTTGGCTTTTTATCTTATTCGCACTGGATTTTTTTTTGATCTCTGTGTACCAAAAAAACGGAGGCTTGTCACTTTG:1 + chr2L 7595522 3' - X-element 4714 1 71.92 ATTAACAATGAACGAGAAAAACTACTAAATCCAAGTTTGCACAGATTCGACACTGTCAAGAAATCATCAAGCATTCCTGTGCGGTATAAATTAAAAATTTGAAATCTAAATAACGAAAATAATTCGTTTCCCTTTTATATTTCGCG:1 - chr2L 3351223 3' + S2 160 2 54.79 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGGCAAGTGACTAACCCCGGGAAAACCTGGCATAATTATGGTCGAGCTCGTATTCCTACAGTTGTGCGGCATGCT:1 - chr3L 905758 3' + 412 447 2 52.74 CGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATACATGTTTAGTTGGGATAAGGGTGGCAGAGTGGGCGGCAGTAACGCCCACTTATGTCACTGACTGCTGCGA:1 + chrX 6138737 3' - opus 1 2 78.00 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCGATACTATAAGTGGAATGCTTGACTTGGACTTTTGCGGTCCACAAAGACC:1 + chr3R 27794867 3' + roo 339 2 65.07 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGC:1 - chr2R 19554914 3' - pogo 27 1 61.29 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACCTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGC:1 - chr3R 30634943 3' + roo 353 2 62.90 GGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCATTCTCTTGTTTTATAATTTAATAGGTATATCGTTAAGATGACCGAATAGTAAAAAATTCTCCAAGCAATTTTGTAAAATTCTAACCAAATAATAAATTTCTTTCGT:1 - chr2R 13155883 3' + INE-1 556 1 64.29 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACTCATAAATAGCGAGTGTTGGCACATCCTATTCAGCCAACCTCCCCTCGCAGTCCCTCGTCCTTTTTGTGTGGTTCGCGGTGAATTTGA:1 + chr3R 24476401 3' - 412 7081 2 63.57 CTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTG:1 + chr2R 4206656 3' - 1360 319 1 72.73 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGACTTTATTTATTCAATAAATTAGTTTAACCTAATGTTAAACTAAATATATTACCGAACGC:1 - chr3L 19792376 3' - pogo 41 1 54.26 TAGTTATTTTTCATTACATTCAGTATGCAGTGGCTGTAAAATATAGATTTTGTCATAGGCTGCAATGAAAGATGAAAGAAAGAGTCATTCGATTGAATGGCAAGAAGCTTGCCTTTTTGG:1 + chrX 13035596 3' + Cr1a 4320 1 52.50 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTTGAAACAAAGGGAATAGGAATGATTTGATTTTAATCACAATATGCTAGCAAAATCTATAGGCTCCAGGTAATTAAGCTGTCAATCTCT:1 - chrX 14964581 3' + roo 9042 1 63.70 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGAAATGAACTAGATAAATGTATAATAATTTGTACTAAATGAAACCATTTGTTTTGTTAGATA:1 - chr3R 11925115 3' - pogo 31 1 55.00 CTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATTGAAGTTGTGAAGTACCAAATGAAACTCAAACATATATTCAAACACAGAAAAAATCCTGGCCCCTCTTCCCACTGTTTGGGCCCTGGAAT:1 + chrX 17786281 3' + Tirant 493 1 74.66 TTATTAATTTTATTATTTTTATATCCAAATAGCTTATACTAGAGTTTGACATTGAAGATGTTATGGAGATTATTAAATCTTTGGGTATAGTGACTTAATTTTAGTAATTTATAAAAATATAATATTTTATTATTACAATGAAAATG:1 + chr3L 17988452 3' - mdg1 7076 2 19.18 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGCTGGCTTTCATTTTATTATTGCTTTTCATAATATAATCTATTTAGATATTGCAAAATCGTCATATATTTATTTCATTTTGCT:1 - chr2R 22491999 3' - pogo 36 1 60.27 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGCTAAGCCCGCTAATTAGTCAAAGGCGAAATTTGTTTGCAAATGTTTGTCGCAAATAGATAATTGCAGCTGTAGAAATTC:1 - chrX 2762556 3' + roo 9045 1 63.08 ACACACACACATACACACTGCCGCACATGGAGTCATCCAATAAAGCATCCAGTGTTTTGTGGATTTGTGTAAATTTCTGGCTGAGGGCCAAGGGCGGAACACGCGTAATTCCAATCACGTGCCAGCCCAGAAAAGAAAA:1 - chr3L 11361708 3' + accord 7104 2 68.35 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGCTTGTTGACGTATGTACATACTAACGTACATATATTTTTGTATGCTCACGTACAGTGAAAAAAAACCGACAGTCCAAAC:1 + chr3R 9352117 3' - Tirant 9 2 75.22 ATTGAAGGTTATTAATGACAAATAGATGCATAAAAAAGACGAAGTTTTAGGCGACTTAGAGTCGAGTTTGAATAGGTGGCGAGAACATTTACAAAAAACGTGAGTTGAATGGCAAAATGTACTTTAATTTACT:1 + chr2L 20763249 3' + gypsy7 467 1 72.18 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCGTTTTGCAGTAATAACAGACAGCATCAACATTTGCTCCCCCAATGCAATGTAATGGATACATATATAAATTTA:1 + chrX 6510119 3' - jockey 4701 1 57.48 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGTAATTGATACACAGTATTCAACGCGAAACAATGACCGCTGATAATACACACCCATTTACATGACTACACTTGTGGAGCCCAATCTGCGTATTATAATAGAAGTTA:1 + chr2L 3294263 3' + hopper 1408 2 77.14 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGCGGAGTCTTTAAGTGCCAGTGTGTGGGTATTTTTTCGTATCTGTGAGAGGGGCAGTTCAGGTTCAATGCTGCACATT:1 + chr3L 7093096 3' - hopper 27 1 60.94 TTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCATGGCTCGATTCTGCAACGACCATGCCCCCTTTGCTG:1 + chrX 8755106 3' - transib2 82 1 76.06 AATTTAAATTGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTGTAATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAAGAATGACACAATAAGAAAATGATCACAGTCTGAAACCCACCAAGTATCCAGAACTTGAAAAG:1 - chr3R 5124033 3' - hopper2 1356 2 53.47 GTGGGCGCCAATTTACAGACAACAATTTTTTGTATTGAGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAATCGCCAAGTGTAAATAGAGTAATAAAAAAATGTAGGGAAATGAAACAG:1 + chr3L 11196978 3' - gypsy4 270 1 67.12 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGGCTACAGTTTTTTAGTCCGAGCGCGATCGAACATGTTGGCTGCCTGGCAACAAGTTCGATGCG:1 + chrX 5680027 3' + P-element 2857 1 57.50 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCAGTTTTTTCGCAGCCGCGCTTGGCTGCCGC:1 + chrX 8891817 3' - P-element 52 1 32.41 ACATAATTATTAAAGATCCGTTTGCTGCGCGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTACAACCGTTTCTGTTGGTGTCTGTAGGTAAGTTATGACCTTATCATTTAAATTAAAATAATACT:1 - chr3L 26763133 3' + Cr1a 110 1 75.34 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTCGAAGTACGCAAACACACACACACACATCTTTCAGATACAAGATACTAGATATGAGATAGCGACCGGTGATCTTTGGCTGCCTATTGTTTTTTTCGTTCTCGAAGTACACAAACACACACACA:1 + chr3L 7344644 3' - accord 183 2 67.81 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGTTTA:1 - chr3L 18658922 3' + roo 9006 2 79.17 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCATCATCTCAAGTGGGCCTCTCCATTCATCTTTCGTCTGTCGG:1 + chr3R 13612883 3' + 412 7468 2 67.59 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAACAAAAAAGCGTAAGAGGCGAGACTTGCAACGACAA:1 - chr2L 3395707 3' - jockey 4750 1 74.64 ATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTAACAAAGACATCTCCAATTTACATATCAATTGGCGGTGGCTATATCTGGCACGGATTAGAAGATTTTTAATGTGCCTTCTTA:1 - chr2R 5249738 3' - invader4 2649 1 63.70 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTTGCCCGACGATTCAGATCCGATCGTTGGAGCAGCAAGTGAGAGTACGTCTCTTTTGAGAGCAGAGAGCTAAGGAACGCATACATATCGATAATGAAA:1 - chr3R 4197185 3' - P-element 24 1 67.81 GATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTTACTCGAATTAT:1 + chrX 22574719 3' - 17.6 7018 2 45.89 AGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGAATTCTCTCCTGATTTGATATGTGTTAGTTTATATCGTAAATTTATTTATGCAATTTTATCTCAATTTCATTAATCTGTTTTGCTTTGTTTTGCTTTGCTTTGCCTTTTAGTTT:1 + chr2L 17549033 3' + INE-1 556 1 62.33 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCCATCCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATGACTT:1 + chr3L 19349978 3' - jockey 97 1 72.60 ACCAATGCGTGGGGTAGCCGTTTAAGGCAACTCCCTGTGACGCACGACGAGTGCCAGCAATTAGCGATAAGATAAGAAACCGCTGATTATGGGTCTCTACCGCTGGATTGTGCAGCTGCCAGGGCAAACCGAGCTGCCCTTTAAT:1 + chr2L 2055086 3' + aurora-element 62 1 53.10 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTGAAATACCCAAAACTCCATCC:1 + chrX 8012312 3' - 297 6629 2 84.16 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAACAAAAAAATCAATAGCCAAGATGTTGCATATCTTAACAGGCTATACCATATATTATGGCTGACTAGGTCAATCCCAAAAACTGAGTCCAGAAAA:1 + chr3R 22249238 3' + jockey 4969 1 58.22 ATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCGTCGTAAGCGAGCGGAAAAAGGGTAATTTTGCCCGTCACCAAAAATGTGTCGAGAGGACCCAACTGAGCATATCTTATTACCTCTGCAGAGAAGAGTGGGGAAT:1 - chr3L 14253486 3' + 1360 3279 1 56.69 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCCGCTCATTTCGTTTGTTGTTCTTGTTGCCGCTGTTGTTAATTGACGACAGTGAAAATACGACACTTTGCGCTCTGCG:1 - chrX 5679904 3' - P-element 23 1 65.62 TTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATGATGATGGGTCCGCTCGTCTCCGAAGGAGGTCTGAACCCATAACTCATCATTAATAACCGAACCTAAATAAGACGTTTTATTGTTGTAAAC:1 - chr2R 8641470 3' + diver 193 2 63.70 GACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAAATCACAAAAAGTATCCGAATAAAGAACCTGAAGAGTGTGCACTTACGGTGGAATAGAGTCAGCTGCAGGTG:1 - chr3R 1446273 3' + 297 6952 2 56.70 GTAACCGCAAATTTCGCTGATTTATCATAATAGATTCGGACTGGATACTGTCTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATGAAATATTATTGTATTT:2 + chr2R 16660292 3' - gypsy9 73 2 54.79 ACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGATCAGACAAAACGGAAATAGGATG:1 + chr3R 20175761 3' + hopper 1340 1 80.00 TATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAAATATATTGACAAACGCAAAAATCGAGCTTTATAAAATATGAAGTTAATTCTCATGGTCTTCAAAATCC:1 - chr3L 9497736 3' - jockey 4819 1 52.05 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGCATGCATGTG:1 - chr2R 19554893 3' - pogo 28 1 61.64 ATCTGATAGTCGGGAAATCCGACTTCTTTAGCATATTACCTTGTCATTCAACACTTACATATCATCTTTCGAAGTCTGTCAGAACCCATAAGTAAACAATTTGGCCGTATCATTGTTATTATTTGTATTCGACACTCTTTTTCTG:1 + chr4 846464 3' + INE-1 560 1 72.41 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTGTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCTAGCTCAGAGAGTTTTGATTGCCCCACTAAGAGATGTTATG:1 - chr2R 5214914 3' - F-element 31 1 67.81 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTCGTGTTAATATGAAATATATTTTAGTATGATATTATAGTTAAGAGCATTAAAACATTCAGCGTAGAATGCTGT:1 + chrX 16902359 3' - I-element 49 1 50.00 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCAATTAGTTGGATCTTCATGGTTGATCTGGACTGGTAATCTCCTTTTAACTTTTCTGTCCCTTTGTAACACTTCCGCAAAGCGAAAA:1 - chr3R 16181107 3' - roo 8699 2 59.59 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTTTCCGCAGATACAATAA:1 + chrX 1103742 3' + pogo 2076 1 66.18 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGAGGAAAATTCGAAAAAATAAAAAATTAGCACTAGTGCTGCAAAGGAGTAAGCAAACCCGCAGCAACAACAAACAAGCCAAATAAACATTAAA:1 - chr3R 13505415 3' + opus 479 2 69.86 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGATAACGATACTTCCTCTAAAACAGCTTTATACGCAGAATCTCC:1 + chr2R 5923017 3' - jockey 4748 1 70.55 TGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATTATATCGCGATTAAGATAATCAACTGCTCTGCTCTGAT:1 - chr3R 27478507 3' - hobo 84 1 73.97 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACAACGGGCGTCTTC:1 + chr2L 22016033 3' - Tirant 8119 2 75.00 AGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTAAAATTATATTCGCTTAATAATATGCAACGTTTGACAAAAAAATGTTTTCAAAATTAAAATTGACAAATACATTCACGAAAAAATCTTTAAAGCATGTGTTT:1 - chr3R 10120123 3' + jockey 4823 1 71.92 CCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTAC:1 + chrX 21852424 3' - Tirant 57 2 74.31 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCC:1 + chr2R 558167 3' + copia 213 2 67.81 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGGTAGCAATTTTTCATCATTAATTATGGCGTCGCTGGACGAGTGTGAGTGTGTGGCAGTGTGTGT:1 - chr3L 17175112 3' - 412 7110 2 54.79 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTGTTGATGGGAAAAAGTTTGCATACCCCTATTTTCATTT:1 - chr3L 22052707 3' + mdg1 407 2 75.52 TAATGTAGATAATCAAATTTAATAATGATGCTATGATGATGCTAATGCTATCCCTTTAATTGAAATAAGAGCTTTGTCTTCAGACTTCAATTTGTTTTGAATTTCAATCAGATAGATTACCTTTTGAACCACTGTACCCAAACGG:1 - chr3L 2869103 3' + Penelope 352 1 29.66 ACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCCGATAGCTAGACTTGCAAGCCGAGGGGTTGGAAATACTACTTGTTTGCTTTCCGTGGTGGGG:1 + chr3R 13182689 3' + Burdock 6061 1 60.17 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATGTGAAAAGGATACTAATATGTTTTGCTTTTGCATAGGCCTCCAACTTCAACAAGCCATCGATTGGCCCCAAGGAGGCCGACAAGAACGTG:1 - chr3L 4115089 3' + 1360 3358 1 51.37 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATACTGTCATTTAAATTCCAAGCAAATGCAGAGGATAACTCAACAAAGAATGGCTTAGATCGAAACAGAGAAGGAGGTAAATCTTATGGTAGGAACTGAA:1 - chr3R 7739401 3' - I-element 24 1 67.81 TGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCACAATGAATACTTGCTTGGCCAGAGTGAAGTCCAGATCTCTAAGCACGCGGTTTCGGC:1 - chrX 21290591 3' + jockey 4927 1 62.86 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATACTTGCCCTTTCATTTATTTGAATTATAGAATAGA:1 + chrX 12139051 3' - roo 8709 2 56.85 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAACTCCCAGAGGTCTCGGCTTTGTTTTTCCGAGCATTGGCATTGCTCA:1 + chr2R 21402703 3' - mdg3 54 2 51.37 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAGACTTTATTTATTCAATAAATTAGTTTAACCTAATGTTAAACTAAATATATTACCGAACGCTGTGATTATGACTCTGTTATTTACCA:1 - chr3L 19792350 3' - pogo 32 1 41.78 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCTTTAAAAAGCAACAGACAACTTTGC:1 - chr3L 22978564 3' + 1360 3333 1 77.27 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATTTTCAGCACCTCTTCCTAAGTTTTCCGGGCGTTGCACG:1 + chrX 5858972 3' - hobo 62 1 68.00 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAAGCCTAATTTGGCTATATGTTTATCCACAACTTTTTCGATGGCCAACACTGTTGATGG:1 - chrX 12191533 3' + pogo 2048 1 57.14 GTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACTGTGATAGGCATGCTAACTGTACTGTTACTTTGAGCTCAGCTGTGGGCGTGTGTGTATGCCACGCACGAAATAAGCATCATTAGGCGCTTGGCAGGCGCGCC:1 + chrX 3197213 3' - mdg1 3 2 73.85 ATGTACAGCCTAAAAGTTGTGAATTCGTTCAAGAATGTAAAGAAAATAAGTCTAACGTGAAAAACTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACG:1 - chr3L 23909054 3' - HB 194 1 55.48 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACATATGTATTTGCCAATCAATCTTATCGATCTTATACATTTTTGAGGCATTTCAATCGAACATTT:1 + chrX 4300177 3' - opus 165 4 60.27 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGACTCTTCGCTGATTTTAGTGCTTTAGTGCTGTTGGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGAGATAGTTTTTTGTTGCCCA:1 - chr3L 7092970 3' + hopper 1381 1 50.00 ATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTCCCTTGAGGCAGCTCATCAATTTTGCAAGAGACCAGGATGCGGCACTCCGGGCATC:1 - chr2R 17569274 3' - accord 7277 2 60.00 TTTTTAAAGTCAGATTGCATGAATAATAAGTACCATATGTTGGCTCTCTGAGCAAGAAATTTATGGTCTCTCAATACTCACACACACACACACACCGTTGGCGGGGGGGGCATTTGAAATATAAAACTA:1 - chr3R 29188585 3' + Tc1 79 1 58.14 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGAATGAGTTGATTTCTTTCCGCGTAATGTTTGTTAAAATTTTCAACTA:1 + chr3R 20744058 3' - roo 8731 2 70.00 GGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGTTGCTGAAAGAGTAAAAAGTTCGAAAAGACAGAACGGAAACCTCTGTCACAG:1 - chr2R 5954946 3' - copia 64 2 64.75 GGACTCGTATATGTCGAAATTCGCGCAGCGCAGAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAATGATCT:1 + chr3R 973198 3' - Rt1a 48 1 48.89 CTGCACGAGATTTGTGGGGAGTTTTATGACTCCTTACATCTCCCCCTTCCTTCGGAATTTTGAAAAAGACTGATGATCCGGCAGCTTCATTGTTCTTTCCACCTTCTCCTTCTGTTGTCCTGCATTGTCCTGATCTCAGCCTTGGC:1 + chr3R 3665886 3' - gypsy8 15 2 52.05 ATATATGCACATACTACACTACTCCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGCGGGAAGTTCTACTGAGCTCATTATGCGCTCGTTTATATGCCGCATTTGTTGTTGCGGTCCGCTGT:1 - chr3L 11336304 3' - blood 7008 1 80.17 GAGTGCCAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTTAAACTAAACGAAAACACAAAAGTGATTATATGTATAAATGGGCGAATGTCAGAAGCACGCAC:1 - chr3R 17867752 3' + hobo 2931 1 68.42 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAGTGGAATTCTAATTAACTACAGTGACCATTGTGCTGCCCAGATCAGAAAGATATTTGCTAAGCTAAACTGCACCTTCGCAATGTTAAAA:2 + chr3R 10472796 3' + mdg1 365 2 54.11 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTCGGGAGGTATTTAGTCTAATGCTTTTCGAAGCAGCTATTACGCGTCCAAATGGA:1 - chrX 22853385 3' - FB 68 1 63.70 AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATCCCGTTCACTGCCTGAGCTCCATGAGCAGCAGCTGTTGATCCCGCAGAGCGGACGG:1 + chr2L 10697501 3' + mdg1 7393 2 61.64 TCCTGAGAACTCGACGTTCATACGGACAGGGCCAAATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGACAGTCCA:1 - chrX 22601932 3' - INE-1 138 1 75.17 TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAAAATCGTTATCGTTTATCCCTGTCGCGTTGCATACTTGACGGCGCAATGCTGGCATTTTAATGGAAAT:1 - chr2R 5922938 3' + jockey 4974 1 50.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGTAAACAGTGTTTGCCACCCAAATGGATGGGTGGCAAACGCACAGAAGTAGGCTTCATTCTAACACTTAACATGCTCGTTAAATGCCAA:1 - chr3L 12867258 3' + roo 387 2 55.47 GTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATAATAATAATTATAATTGACCTCGTCACTCAGGGATTGATGTAAACTCAAATTATTCCACCAATTTAAGTTTCTTTGGAACATTTTGTC:1 - chr2R 5917790 3' - I-element 5084 1 53.42 TGTATGTACATATATATACATATGTATGCTTTTTCGAAACAATATTGTGTTCCAAATAGATACATATGTACCTAGACCTCTGATTGCTTGCTTCATTTAAGTGCAAACAAAATTTGTATATTGTTACTATATTTCTACC:1 + chrX 3763510 3' + invader3 5087 1 56.12 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGTGCATTCAGGCTTCCTAATTACACAACTCTCTTTTT:1 + chr3L 14553177 3' - roo 86 2 76.71 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACCAATTGAACTTAACTTCCCGCACCAATGGGTTAATTCTAGCTTCAGGCTAGTCCAGTTTAAAG:1 + chr3L 7962292 3' - blood 60 2 57.53 GCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACCAGGAAAATTGATAGCCCTAGTAAATCCCAGAGTTCTCGTCTTTGTTTTTCCGA:1 + chr2R 21402687 3' - mdg3 5313 2 59.85 GTGGCAAAAAGGTATCTGTACAAGCAAGACCACCACCGGATTCTAAAGTGTGCACCCGCAAGTACAGGTTCCCTTGCCATTAATTTATTTCGTTCAATATTATATTCGAATTCGGTCGTGTGCTCATGTGTTTACACTATGAAAAA:1 + chr2L 18477514 3' + Gypsy12A_LTR 2150 1 71.23 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATTTGTTAGTTGGCCACTTTATTTTTGAACCATTTTTTTTTTAATGAATAGACAAACTAGATAAAAATATTAAAGCCTCATATA:1 + chr3R 17305571 3' - roo 38 2 57.93 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGAGTATCAGGTAAGGGCCATATTGACCAAAAATAA:1 + chr3L 96572 3' - roo 8750 2 79.17 ATAACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTATAAGAGGCTTATCTCCTGGATACAAAGTTAATTAGTTTCAGACTCTTGAAAGTTTTTCATAATTTTCGCTATTACCTTTGTTA:1 - chr3R 11113153 3' + mdg1 7416 2 55.48 GTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTATTTTTTTCTTATATAATAAAATTTTGTTTGGCCTTTTAGTTAACACTTTATTTTGTGTGTGCACCACAGTTGTTTCTTGTTTATGGCCATCGTCG:1 + chr3R 30295237 3' - Quasimodo 19 2 50.34 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGGCCAATTAATTTCGTAAAATTAGTCAATATGCCATTGG:1 - chr2L 3890124 3' - jockey 59 1 52.41 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTACTACTCACTAAAGAACCACGGATTCTGATAGACTC:1 - chr2L 76064 3' - roo 80 2 75.71 CTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATACATCTTTTAAAAAAATCCACCTGAAAGAGCTGTTAAATAAAAAAGCTTGCAAATAAAAAAAGAGATAATAAAAGAAAAGATATAAAGAAGTCTGAAGGTAAGATGCATATAAAA:1 + chr3L 8856024 3' + rover 345 2 72.60 AGTGCCCCCGACCGCAATGACCGCTTCAGTAGGAGTGGTAGGTTATCGAGGGTTAAGAGGTTAAGAGGAGTTGGAATCCCAATCCGACGCTCCAGAATGAGGACCTGCAGGGCATCCTGG:1 + chrX 16753439 3' + Rt1a 461 1 44.17 GAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGATGCCGAGAACTTCTCCTTCGCCGACCTCGAGTTGAGGGATGAAAATTGGAGCGCC:1 + chr3L 3169879 3' - Quasimodo 6989 2 61.64 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTCCGATCAAGTCTTAACGGCAAGTTGCAGCAACAAACATTTTCATTCGTTTTCGCATCGTCGAAGCGTACGGTTCATAGGAGGAACGGAACGAAGCGGGGAACGCGACG:1 - chr3L 14550906 3' + P-element 2883 2 77.70 CAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACCATTTAAAAAGTGCAGCATGCTGAAAAGTTTTTGAAGCTTCCCG:1 - chr3R 17656388 3' + mdg3 170 2 67.81 ATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATGGCCATTACAAGCAAACTGGAAACTTCAGTCCTTTG:1 + chr2R 16403481 3' - copia 86 2 75.34 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAACAACAAACATCCCACAAAAGTTAGTTGGGCAAAAATTACAAACACGTCACCGCCTTTTGAATGTGTAACGGAACATTTATGGC:1 + chr2L 246117 3' + roo 9047 1 67.67 TTATATGATTAAGAGTATTAAAGAAATGAAATGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTTTAATTAAGTAGGATCCTTTTTGCCAGCCAGTTTTGTTTTTGTTGTCGTTGCTGTTGCTGCCGCTGCGACGACGACTGCAGGATCGAT:1 + chr2L 18884977 3' - jockey2 3273 1 51.37 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGAATTCAATAGTGAAAATATTCAATAGACTTACAAATCAAATCAAATATTTTCTGCCTCATTTTATCGCATACATACTGATAATC:1 + chr3L 13374243 3' + pogo 2074 1 60.58 TTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAATTTATTTATAAACATTAGAAGTGCATGCAGATGCGGATAAAAACAGAATGTT:1 + chr3R 15885214 3' - 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P-element 85 1 27.40 ACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATACCCGTCTGAAAAGCGTTTAGTATGGTGCGTATGGGTCGTGATTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCGCATGG:1 + chr2R 15829619 3' + invader4 3053 2 58.78 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACTAAATGTTTAAAAACATTTAAACCAAAACTGCATAAAATCTATGTGTGACCCACAGTCTAAGA:1 + chr2R 8396010 3' - pogo 55 1 59.59 ACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAATGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAACAAAAAATAGGCAACACTATTAGCCAACTCATCGCCAAAGTCATTGGAGACGGCTTTTAGC:1 - chrX 12094121 3' + F-element 484 1 61.64 TTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCATATTCATCGTTTTCATTCAAACTTTTGCAACCTTTTTCTCTCTTGCCGATTTTCCACTTCT:1 + chr3L 10473066 3' - micropia 388 2 58.22 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAATTGTTATACCAAAGAAATGATCAGACGTATACATTTGTCCTTTTGCAAATCCCATAAATCAAGACCCACTTGGATTTGT:1 + chrX 5150403 3' + roo 9033 1 58.90 TGCATAGTGCATAACCAATGTAGGGCCATTACGCATCTTGTTATTCCAGTGTCTTTGGTTAAACCACTTCTGATGTTGTAAACGGTGCTAAAGTCGTGATGCTCTGTTTAAACTAATTTATTGTATTTATTTCT:1 - 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copia 227 2 57.53 TGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGAAGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGCCCTAAGGCGCTTTGGTAACTCGCGCGTCAGG:1 - chr2L 23372502 3' - gtwin 6917 2 70.30 GGTCCCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTGAATAT:1 - chr3L 25008292 3' - 297 358 2 78.26 GGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGATTTATATGACAACAGCTGGGCGAAAGAATGTCATTCGCTTTAAATGCCTTTTAGCATACAGCCGCCATATCAGAATCTATATCTTGAT:1 + chr3R 12562484 3' - G2 3020 1 61.64 ATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAATTCAATAAATTTGCACAGAATTTTTCAACAATGAAAACAAATTTTCGCTCTTTCGCTGCTTGCATTCTTTGGCATCGCCATAAGGGGAAAATCCATAATTCATGCATTCG:1 - chr3L 1404949 3' + Ivk 5367 1 76.03 AGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGATGATGATATATGTACATATGTATGCTTCTAGGATGCACTAATAATTGATACCCTTTAAA:1 + chr3L 14476299 3' - I-element 231 1 59.59 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGAAATGAACTAGATAAATGTATAATAATTTGTACTAAATGAAACCATTTGTTTTGTTAGATAATGTACAGATTTTTTGGTTGGCTTTCTTATGGCCTAAAC:1 - 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chr3R 13582188 3' - BS 5036 1 54.79 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATATTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAA:1 + chr3L 22052825 3' - mdg1 7057 2 53.25 GACTATAGCATTCTCTATTGTTAAATATTGTCTCATTATATTCCCTAATATCCATTCATATCCCAGAAAAATTATGATGATGATTCCGAAAAATAAAACAAAAGTCATTGCTAAAACCTGACCACAGAGTACATTAATAATTAAAT:1 + chr2R 4886049 3' + INE-1 580 1 56.16 ACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCACAATGAATACTTGCTTGGCCAGAGTGAAGTCCAGATCTCTAAGCACGCGGTTTCGG:1 - chrX 21290592 3' + jockey 4921 1 64.83 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGAATCGGTCATGTTTGCTAATTAAGGCACTTGAACTAAAAATACT:2 + chrX 12139019 3' - roo 8740 2 71.03 TTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATAAATTGGAATTTGGATAAATCACATCGTATTACCTCATTTAACACGTTTTGTTTCTCGTTATTTCCCAGTATTTTC:1 - chr3R 9169183 3' + copia 5044 2 54.11 ATTTAATTATTGTCCACATGGACAGATTTTAAATTTATAAATAGATCATTAAAATCGATAAAATTCTTTAAATTCCGCCCACGGACAAGGTGTTTATGATGAATCTGGATCAGTCGGAATTCGTTGGCT:1 + chr2R 16942767 3' + G-element 4278 1 56.59 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAAAATACCTGTTTATTGGAAAGACTGCCAACGAGTCACCTATATTATAGGTTATATTAATATACATATACAT:2 - 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gypsy5 7342 2 64.23 TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATTTA:1 - chr3R 21276516 3' - BS 5040 1 54.11 AACAAGAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTC:2 + chr3R 3320513 3' - 1360 84 1 71.92 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGTCAAACTAATTGTGCCACTTACGTGTGTAATTAAGCGGTAATTGGTTGCCACCTGTATAAGTATGTTTCCAAAATGATTG:1 - chrX 12138911 3' + roo 9038 1 58.16 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGCTACGCATATGCACTTTGTTGTGTATTGCATATGACGCCCTGTCAGAGGCG:1 - chr3R 19531234 3' - hobo 25 1 54.46 ATCACACACACACACATACATACCCATATCTATGTATACATATCTACTCCTCCTGTTTTAAAAGGCTTGTCAATTCCCATTCGCAGCCAGTGGAACCCCGAGGCGGTATCCTTATGCCCCCCAACCCCTTTTATGCTTTCG:1 + chr2R 16064455 3' + Quasimodo 38 2 62.41 ACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAAT:1 - chr3L 15276653 3' + hopper 1332 1 75.17 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGCACATTTCGTATAAATTACCGACAGTCATCATGTTTCAGGTCGCTTTAAATGCTTCTTTCACTTTGAAGACAGGCAGACGAACAAAAACTCATATTGCTGTTGTAAAGCG:1 - chr3R 10684684 3' + roo 396 1 76.03 GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAG:1 - chr3L 27415224 3' + transib2 2781 1 59.32 AAAACATATTTTTATTTTTTTTTTATTGATATATATAATTCATTCTTGATACTTGAGAACACCTTAAGTTTTTATGCATTATTTTGAGCAAATGTCGTCGCAAATTGAGCCACTAACACACACAGGCAGCAAATCAAACCTTCATT:2 + chr3L 7835825 3' + INE-1 463 1 72.60 AAATCCTATGATTTACAGTTTTAGTGGGCAATTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATGCCAAACAATGACGAAACAATGATGAAGACGTAAGGTACGATGCAAACTAGTGTTGACCGGGACGAGATACGCTAAAACGGAAATT:1 - chr3R 7640101 3' - HB 1574 1 47.26 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCCATTGGAATACGTCAACATTAAAATGCCATTAATGCATTTGCCATTTTCCCGGGGCACACCTCATTGAA:1 - chr3R 30634916 3' + roo 358 2 52.05 TTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTTATGTTCAAAAAAAAAATGCATCCAATTGTTAATATCTTAGACCAAGTTTTCAAGATAATATCATTACTCAAATTCTCGTAAAAGAATTTTAGCAACTATCTTGTAATATAATATT:1 + chr2L 17029747 3' + blood 373 2 76.71 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGGCAGAAATTGAGTTTTTTTCATAACTTTACCAAAAATTG:1 + chr3R 24493152 3' - jockey 4742 1 69.63 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCGTGAATATTAGAAAATACAGCGCACCAGGTCATCGTGCGGTTGCTTGGTGAACAGGAT:1 + chr3L 4186681 3' - pogo 56 1 60.71 AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGTACTGTGTGATATTGAAATATGTGATTATGATAAGAATCATGCTTGAAATA:1 + chrX 6707851 3' + hopper 1350 1 63.01 AACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCTGCGGAGAGACGGGGAGCCGTGGACACCCCAGAGC:1 + chr3R 8258907 3' + Tirant 348 2 70.64 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCGGACTGCCTATTGATTTTGTGTCATTGGTGTGTTTCGGTGCTCACGAAAAACAAATGAGTTGTGTAATGAATACGGGCTT:1 + chr3R 18815995 3' - hobo 19 1 68.55 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACCTTACCAAATGGGATTTAAAACTTTAAAGGATCATGTAAAGTAAGTATATGGAAATGTCAAACTTAAAAGTTCGTAAAGACTAAAGTTGCAGCTGCTT:1 - chr2L 12349717 3' - F-element 55 1 69.34 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATATTTGCTTCGCAGACAAAAACATCAACTACCCCTAAAAGTAGGCAATTCTTACTGAGCAACAGCTACGTTGAGTCATTTTTCGTGTGCGCACACTTATAATTCCCA:1 + chr2L 13215764 3' - jockey 4759 1 80.92 ACGTCTAAACACCTATTTAGACAACAGGTTTTTCTTTTTTCCAAAGTATTTGGTATTTTTGAATTTGCGTGTGCTTTTGTGTGCCTTGCCAATTGAATATGCAGTAATTGCCTTTCTTCATTTTTGGCCATGATTTTTTGCTCGTG:1 + chr3R 21498257 3' - rooA 7237 2 55.48 TAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGT:1 + chr2R 13644520 3' - Burdock 55 2 57.93 TTTCGATTTATTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTCAGTAAAAAAAACAACCGATTTTATACGAGGCTCGATGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGAACACTCAGAATAGTATTGTAAGTCAATAGAATTATTAAGAA:1 + chr2R 5348420 3' - Doc2-element 90 1 70.55 TAAGTTTCTGATCTCTTAAATTTGTTTTTATATCATTTTTATTTTTTTTTTCAAAAGTGTGGGCATACACGTTTGCGTTAATTTTCGAGGTGACAAACTGGAATTCGCAAGTTCCATAA:1 + chr2R 2557180 3' - Tc3 1594 1 61.34 CATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTTGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATCCGCTGGCACTGAAGCTCGACTGAATTGGAAGCTCG:1 - chr3L 21657804 3' + rooA 7490 2 73.72 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACAAGTTTCAATACAATGCCTACTATTCACTTTCAAAAGTTCATACTTGAAAAAGAAGACTTTATGTTTTGAATTAGTTTGGTAAATTGGAG:1 + chr3L 4620914 3' - FB 23 1 47.45 AAATATCAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTCGTGCGGGTTTTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCATGAAACTCGTCTGGTAGCTTTTGGGTTT:1 - chr2L 21766361 3' - INE-1 265 1 70.87 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGG:1 + chr3L 27391403 3' + 1360 3349 1 53.15 ATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGGCTATAGATTCATTCTTTCTTGTTAGAGATGGATAAATGTTTTGTTGTCCGCCACTGATTTCGTCCCTGGCG:1 + chr2R 5439246 3' + INE-1 500 1 65.07 GTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACCATCTCTTTTTAACATTGCAGATTTCATACTTT:1 + chr3R 9160742 3' + copia 5035 2 74.66 GAAATATTATCTTTATCTTCAATCAAAATGAACTAATCTGTCTTATGGACAAAATAATTGATAGCTGGGCCGGAGTAATTATAAAAAAGAAATTGCTGGAAAAAGAATGATAGA:1 - chr3R 2914281 3' + Circe 7077 1 61.40 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGAACGAAACTCAAATACACTCAGAACAGCTTAATTTGTCTTTTTCCCACTCTCGGTG:1 - chr3L 18658897 3' + roo 352 2 62.96 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACCTTTTGGCATTTTTGGCATTTTCGATTTGCGTTTGCTCATTACAATTTGACCACGCGCAATTTGCATAGCATATGTATGTGCATGCATGTGCTTTTAGCC:2 - chr2R 19554884 3' - pogo 19 1 71.23 CCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGCTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATG:1 - chrX 17678734 3' - flea 52 2 63.24 GAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTGAGTTTTCTTAAAATATTAGTTCCCTCCTTTTT:1 + chr3R 15711842 3' - diver 84 2 76.43 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCGTTCACGCTCGGCGACACTCGCAGCTGGAGAAACATAAAGAT:1 - chr3R 17305403 3' + roo 389 2 69.86 AAAATGCGGTGTGCATTAGTATTGATGTGTGTGGACTGGAGTTGGTCTCCAAAATGTGTTGGCAATGCGTGATATAGGCGCTATTGGGAGAATAACGTTGCACGGGCGAAACGGAGGCGT:1 + chr2R 22730894 3' + invader1 185 2 59.17 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGGCTTTTAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGAGAAAGTTGCGATAAGCTGAGCTCTGGCCG:1 + chr3R 23765425 3' - roo 8735 2 75.20 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACTCTATGTCGCGCTTCCGTCGCCGCTTCTTACTTTGATGTTTATTTTTAAATACCACAAAA:1 - chr3L 96501 3' + roo 344 2 60.27 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAATATACTCAATTTTCTTAATTTGTCCAGCTGAAGTTGTTGTGAAGGGTTAACCCAACCCG:1 - chr3R 17305444 3' + roo 9026 1 56.49 TTGCAGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTG:1 + chr3L 23678157 3' - Osvaldo 34 1 73.11 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGAAAGTCCTTTCATAAGCTATTAAAACGCACACGAAACACACACACGCACTCACTCGTTGTGGGTCATAAAATGTAGCATACATTCGGGCGCCACTCGCC:1 - chr3R 28396557 3' - jockey 32 1 66.44 TGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTAAATTGACACAGCTTCGAGCAAGTAGGTTTTTAAACAAGGA:1 - chrX 4778196 3' - 412 81 2 71.92 AAAATATTTTATTTTAGTTATTCTCTAAAGTTTAGCCATAATTTTTTGAGAATGCTGTTTATTATTTAAATATTCTATTTTATATTCTTCTATTTAGTTAATTTCTTTCGAAATCGATAGCTTTTACAAGTTTTCCCTGTAATTTA:1 - chr2R 15253887 3' - G7 1150 1 87.67 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTACATTATAAATTTGATTAAAACCAAAGAATTCTAGTTAAGGAGCAGCTGACAACAAGTTGTTAAATTTTTCAATTCTTTGGCCAAAGGCAGAATACTTAAATGTATCAGAA:1 + chr3L 18467333 3' + hobo 2931 1 80.14 AAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCCCGAATTGGTCATTTAAGATCTCAAGAGCCAGCTCTGTATCTGCAGAATGGCTAGA:1 + chrX 22853470 3' - FB 14 1 60.64 GGAAGAGAAGTGCATGATGGCGAGAAAGGAGGTCGAGCTCACAGCAAATGGATGTAAACACATGAACAAGCAACTAGTGGCATGGTGGGAGCAGGATACCACAGCCAGTTTGTTCTGGGCCTTCTGCATCAGGTG:1 + chr2L 1150416 3' + R2-element 489 1 57.04 ATCACTCGCGACGCGAACGAATCTTTAATAATTATGTTTACGATATATGATAATAAAAGAGAATTAATGAAAAACTAAAACACTTTAACAGATCAAATTTAGTTGCCACATAGATAAAAAACCTCCTTAAATCAATAATAATAATA:1 + chr3L 23772714 3' - Cr1a 125 1 59.59 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATGTCACAAAGAACTTATATTTCGCAATAGAGATGCACTTTCACTATCAATGCGCACTTTCTCGAAAATTGAATTGAAAATGTATCGAGTTCATAACTCACCATTTGTATT:1 - chr2L 6183959 3' - pogo 4 1 41.84 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCGTGAATATTAGAAAAGGTCAGCCCATAACCATTACATATTTTAAAAATAGCTAGACAATTACATTTTTTTTTTAAATAGACGGATATAT:1 - 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