Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score ATAATCGCAGAAATATACGCCATACTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 25751912 5' - roo 9033 1 58.90 GTGTTCGCTTATTGACATTTCTAGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3R 16276310 5' + pogo 44 1 55.48 CTTTCAATATCTCGTGTTTATAGTCTAACCACCAAAGTTGAGGTTACAAATGAAAAGGGCAACTTGAGGCATACAGTATGGGGGTGTCAATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCAT:1 - chrX 9024473 5' - 17.6 7009 2 54.11 GACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATCATTCACATCAA:1 + chr2R 12065606 5' + Stalker2 7332 2 73.61 CAGAACAATGACCGAAATGGCAAATCAAACAAGACTTCGTTTCGTTAGAAAGTTTAAAAAATAAACATAAATTTGTTAACAGCTCCCAAAGAGTGTGTTAAAAAATGAAATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 + chr2R 13761560 5' + jockey 4684 1 69.86 ACTTTCTCGTCCTTAGAACTTCCTCTTTCGCACAGGGAGAACTACCTCGTCTACCTTGTCTTCGCCAGTGATAGTAATACGTAAAAACTAAAATTTGTTGTCTCCGACGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAA:1 + chr2R 5787276 5' + jockey 4659 1 71.92 TAATGTGGCCATCAAGTCGTAATTACGCTCGTTGTTGAAACGATGAAGACATCAAATTGCATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 - 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pogo 2048 1 65.32 TTTTACCATAAGATTTAAAAAAATATAGTTAAATACATAACTAATGAAGGGACTGCATTGGTATCAATTGAGTATAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 - chr2L 10426733 5' - mdg1 374 2 50.68 ACAGTATAGCATTCCTTAAAAGATCCCCTTGTATATGTAACTTTTTAATTTGTTAACTTAAAATATATTAAAACGAAATAAACGCAGTGGTGTTAGACTACCTGCTAAAGGTATGGTGGAACGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTG:1 + chr2L 8939631 5' + roo 8855 2 79.45 CTTTAGATCGGAATTTGACTGTTGTCTGTTGAGCAAATAAAAAAGTCTGAATTTGCTGATGCTTCGATACAATCGTTGTTTTCAAATTAAATATTTAGATATATGTTATATTTGTAACTTTACAAACAATCATTGCATTCTTAATT:1 - chr3L 6401974 5' - 1360 442 1 56.85 GCCCAACAAAATAGTCCTTTCTGCCAGCGATTTTGTTTTTCCATTTGTTTGGCTATTTCATCTCTGACCGGAAGTATGAATAAATCCCTATGTAAGTTATCACTTCGAACGCCGGTGATGGTACTCAGGAATTTCGATTGGGCTCG:1 - chr3R 4497594 5' - Fw2 3608 1 76.03 ATTTATGTATGTGTGCCGATATGCGTACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGACTTTTT:1 + chr3R 1267712 5' + P-element 94 1 23.97 TAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 - 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chr2R 23212671 5' - Tirant 8419 2 76.71 GATTACAAGATGACCCCAAAAAATTTGGAAATGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr2R 6913424 5' + roo 88 2 78.77 ATTTGCACTGAACGTTAATTTTGTGACTTTTTCCTCGAGGTGTATTTCTGTTGGTTTGCTGCAAGTTGTCAAGCTTGCCATGGCAAATTTGCGATCAAGCGACAACAACAATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATG:1 - chrX 7546491 5' - mdg3 100 2 74.48 TTAGGTGGCACATGGCTCCGATGATGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAA:1 + chr2R 22746020 5' + jockey 4779 1 70.55 ACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTG:1 - chr3R 7616830 5' + Stalker2 55 2 58.90 GCCAAGTTTATGCAGTGCGAATCTAATAGAGCTCAAAAGCACGTTGTTGCATCCTCATAGTGAATAATGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 25862565 5' - roo 398 1 69.52 ACATATGACTTATGTACATACATATGCTCATATATGTACATATGTACATATGCTCATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 - 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Transpac 269 2 60.27 ACTCATCAAGCTTAATTTTCATTCATTGAGTTAGTCTCTAATTTACGATAATCCTCGTAGAGTTAATCTCAACTTAATTACACATCCAATGCGATTTAAATGAAAAAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAAACACTTCCGAAGGCAGTA:1 + chr2R 10187560 5' + transib2 2453 1 70.55 GAGTAGCGAGTATGATCGGCGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTT:1 - chr3R 2637695 5' + gypsy5 6978 2 72.94 GACTTCTTCTTCCGCTTGGCGTCCGTTTCGCTGGACGCGACCTTCTTGGGCGCACAAACCTGCCACGCCCACATTTTTGAACTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGCGGGAACGCGACTATAGCATTCTCTCTTG:1 - chrX 19870742 5' + INE-1 578 1 58.52 ATCACACTGCGCTGCTCTTTAATGTTTTTGAAAATAGTTTTTGAAAGTCGACTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGAGAAAGAGACCTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGTGAATGCTATAGTC:1 + chr3R 18346564 5' - INE-1 580 1 74.13 CATTCCGCTCGCTATTTTGAATAGGCTGCAGGGATCAGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 11944906 5' - roo 8989 2 73.29 ACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCGACTCGCCACGC:1 + chr3R 13225481 5' + hobo 58 1 56.25 GAGAGACGACTTATTCTACGAACTGCCTCAAATTCTCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 + chr3R 4576979 5' - mdg1 7374 2 75.86 AATTGAGGAATACTTTTATGTAAGTGCTTTGGAGATACACTCCGTAATAGGTTTGTAATAGGGTTCAATCTAAGCAAATTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTAC:1 - chr3R 15502583 5' - Ivk 5334 1 58.62 ATATTGATGAAGAGGGTAGGATCTTTGCACGGGGTACTCAGGACATGAAATCGGTGGGCACTCAGTATCTAGGAGCGATTCGCCTGCTGAAAGCTAGTGGCTTCCAACCAAAACGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 23098111 5' - roo 401 1 76.03 AAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr3R 18205717 5' + 412 58 2 58.74 ATTTGATTTGTAGCTTTTTGTGCAATTTCCTTCACTTTCCTACGAAGCAGAAAATGCCCCAAAAGAGTTTTCTTTTCGGCTCCGTGCCAGATTTCACTTTTCTTTTGTTTTTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 486665 5' + roo 8674 2 77.40 GAAATCGAAGACATTTCGCTAGGCCTGCGGCCATGCACTGGAAACAAATCTTCAAACGTATTTTCATAAGATGTGGCCGATTTATTAGTTACTTCGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3R 28117110 5' + hobo 25 1 68.28 TTTTTATTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 - chr3R 24564832 5' - opus 434 2 63.70 CTGCACTGAGAAAATAGCATGTTGTCGTATTGACCACGTACTATTTGATACAATAATCAGTACACTTTTTTGATTATAATCTGTGACTTTTTACCATTTATTTTAGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATA:1 - chr3R 12744781 5' + Stalker2 18 2 59.59 ATAATGTTAAGCGAAATTCGAGCGGGCAGGGGCTCTCCCGGGAAACTGGGCACTGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2R 25106128 5' - roo 9017 2 58.52 AGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 - chr3R 8849869 5' + 297 6633 2 56.85 CCGGCGACATAAAAATGGTGCAGGCCAAACGAAGACGAAGATGCTCGGCCAAAAAGGGTTTTCGGCTCACAACACAACAGCCAAAAACACAGAAAAAAGCGCTGAGAACGGTCGGCAAAAACAAACACAACCAAAAA:1 - chr3R 28979092 5' + Tc1-2 495 1 48.91 CGGGGGAACTGCTAGAACTATATTCTAAAATGGGGTACTCCTGCACCAAATGAAAGTTATGTCGAATTTTATCCTTTCTAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTA:1 + chr3R 8017719 5' + mdg1 44 2 55.48 GCCATTTCTCCGGCAGAAGAATCACGCACTGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3R 30264127 5' + blood 34 2 60.87 ATTTATACACAATTTATTGTACTTTATCTCCTTCCCAAAATCGAAGTCCCAAAATTAGGTTATTAAAAACGGGAACAAAGCTGATTATATTAGTTAGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3R 10150107 5' + 1360 26 1 67.81 ACTCTGAGACTGATGCACTTTGAAGAAAGTTTCCTTACTTGCTAGGCATTCTCCTTAGTTCTATAACAACTAAAATAATTTCAATCTATTCATCATAAAAACGTTGTTAGAATAGAAAATACAGAACTTAAAAAATAATTTCGGCT:2 + chr2L 16077556 5' + P-element 2702 1 44.52 AAAAGCGATGCCCGCATAGTTGACTTCACGCACACCCCTGGCATTTTGTTGATTAAATTATAATAAGCGATGGCAGCTCTTCGGAGCGAAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAG:1 + chr2R 11130020 5' + hopper 428 1 61.87 TAAATACCGCCACACCCATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGAACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3R 9125604 5' + Doc 8 1 82.98 AGGTCAGCTTGGCAGCTATGACACACGTTCTATATTTCCGTAGGCAAAGTCAATAACTAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1 + chr2R 21848630 5' + Transpac 17 2 68.49 ACCGGAAAAACAACTGGCCGGCATTCAAGACTAGCCGCGTCGAGTCAAGTCTCTGTCTATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - 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Helena 1250 1 55.65 GTATTATACTTAAACTGTAACTGTTGTTTGGCCCATGTTTATCAATATTGAAGAAGCTATCGGCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 + chr2L 10514232 5' - 1360 3386 2 75.00 ATAGCGAAGTACGGTAGTAAAATGTTGCTTCCTCCTAGCACTTCGCACTTTTTCTACGCTTTATATACGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGCTTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTAC:1 + chr3R 27810005 5' - Burdock 6357 2 57.69 ATATCAATAATATTTGGCTTACGTTTAATTATCCTTAAGTTATCCTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGA:1 - chr2L 19095156 5' + F-element 57 1 61.47 TTTCATTAATGGGCAACCTACAATGAATGTTGAAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGC:1 - chr2L 13332730 5' - micropia 448 2 76.36 AGATAGTGCTTGTTCATTCAGCTTATTCATTTACATATGTTGATTGCTTACTTTGACCTGATTGCTTGTTCAGCGCAAAAAGAATCCGGAATCGGATTAGTGATTACCCCCGCTCCACTAGTGGTTTATTCCTTTTAGTACGCATT:1 + chr3L 9950936 5' - Juan 178 1 48.63 GGCAAACTTTTTTGTTATTAAATATTTACTATCATGTCTACTTTATCTTGATAATTGCCTTTTTTTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr2R 13046478 5' + 412 56 2 54.79 CAGTAATGCGAAAGCTTTTCTGCATACTAAAATAATATAGTCATATGATTTCTGCTAGATTCGTTGAAAAGCATGTAATAGGCAGAAGGAAGCTTTTCTGAACATATAAAGTACATATATTCTAGATCAGGATCAATAGCAGA:1 + chr3R 18084361 5' + INE-1 89 1 52.45 GTTAGGAAATGCATCAATCGGTGAGTTATACTAATACTACTGCTTAAGATATAGAGGGTATTATTGGTTTTATGGAATATATATATATATATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGT:1 + chr2L 10446013 5' - flea 229 2 58.22 AAAAAGATACCCCACAATTCCCATCCCAAACCAATACCATTTTGCCACCCACATTGCAAAAAATCCCGCAAGATACGTTAAAAACTTAAATGGCAAAAAGCCAAGTTCAACAGCCTCAAACAAATAATAATAACGTTTAGGCAATG:1 + chr2L 14311696 5' - 1360 303 1 56.16 ATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGGTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGCAGTGTGAAGATTTC:1 + chr2L 12291857 5' - Tirant 319 2 70.55 GGGAAACGTGGATCCGGCACCGGATAAATATTACCCTTGACCATATGCTGTTTTTCCTTGGTCAGCAGCAGATACTCTCCACGGAATAAATTCTGGCATTTATAGAGTGCATTGGACTTCAGGGATCTTTAAGTCATGAAGGGGTA:1 + chr2L 18972692 5' + baggins 5378 1 58.90 GTATGTGTGGCGTCATTATATAATCAAATCAAATAACAATTTGTACTTTGTTAAATTTCTTGTCGCCCTCGATGGCTGGCTGTCTTTGCCTCGAAAAAATATGCAAATTTCCAGTATTT:1 - chr3R 6014055 5' - hopper2 1558 1 63.03 GGTACGAGCAACATAATCGCAAAGTAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr2L 14239112 5' + 412 35 2 61.64 AGCTCATTTCCTCCTTTCTGGTCAGGAGGAGCTTGGGAGTGGGCTACGTTAGAAAAACCCGCATCCGAAAGTTGCCCCGTGGCCGGTGTGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3L 13690394 5' - hobo 2907 1 63.70 ATTATCACCAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chr3R 14277992 5' - P-element 2854 1 59.09 GACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTTAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 + chr2L 15081096 5' + Doc 79 1 81.40 AATTGAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chrX 388212 5' + 1360 38 1 60.00 GACATTTCAAGTTTAATTCTTGTCACTAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1 + chr3L 17921937 5' - copia 5068 2 55.48 GATAATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTGTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACAT:1 - chrX 22945341 5' + BS 86 1 72.60 CTTCGCGCCCACTGGCCACAACTTTTCCGATGCTAATTAAGCGACGATGCATCAAAGTTGTTCTGGAAAATCCTGCGTTTCGCTGCACGAAAATTCCGATAGGAAATTGTTTTTTTTTATTTATTTTAATT:1 - chrX 7210691 5' - X-element 4719 3 78.63 GGGATTTATAATTGTCTGGATATTAGGATCTGCTATAGCTACATTAACTTTTTTGTTAGAACTATCACTTACATATATTTTAAAACAGAGCAATCTGTTTTTTTATCTTCTTGGTTCCAATTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGT:1 + chr2R 5021455 5' - Porto1 4487 1 65.07 GATATGGCCACTGGCCACCTATGCCACCAATCCACCTAACAACACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGAAAACCCAATCCATTTAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAA:1 - chr3L 19980773 5' + I-element 5182 1 73.97 GATACAACAATCGCGGAGCTAGGATGCGGAGAGTCGGTGCCATGAAGGACGCAGGACGAGCAGACAAACAATCTGTTGGTTTTTATTATTATTAAGTGTGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCT:1 + chr3R 18532858 5' - baggins 5393 1 53.79 GTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGTGGAAGTGTAGCACACTGCATAAGTGCATGGTCAGCAATCCCACGCT:1 + chr3L 24272122 5' + gypsy11 4152 2 69.86 GAGGGAATGCAATAAAAAGTTTTTGATTTTAGATCTTTTATTTGCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 - chr2L 19997149 5' + Tirant 20 2 57.14 GAATAAATAAACTGTCAATTGCAATCAGCCCTTTGGCGCCCCAAAGTATGCAGCAAAATGTGCCGAATTCCCACTCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGAATAGGACACACAAACATAACC:1 - 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roo 9041 1 64.38 AGTGTACAATCAACAAAATTAGTTTCATTTGGGCAAATGGCATGGCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:2 - chr3R 25804246 5' - mdg1 392 2 65.07 GTTTAGCTAATGGCCAGGTAATGAACACATACATATGTACATATACTTTTATGGTTGTATGTGTTTTTATTACTTTTTCCCTGTTTTCTCTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 12379832 5' + roo 29 2 68.49 AATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACA:1 + chr2R 12065567 5' + Stalker2 7295 2 56.16 AGCGAAGGGGTATAGTTTAAGATTTGTACAGCATAGCGATACTTAAGGCCCCAAGGATGGTTAGGACTGCTTTTTTTTTAATTTTGCTTTTATTTATAATTTTATAAATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAATTATTAC:1 + chr3L 17748097 5' - F-element 4617 1 52.05 GTTTGGTTTGTTTGTATTTGGTGTGCGTGAAATGGGTTGAATGGAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3L 15364924 5' - 1360 3344 1 52.74 GCCATCAACTCGATCTCGATCTCAGTAGTTCATCTTTTATAATGCCCACACACACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 + chrX 2295124 5' - Transpac 5185 2 57.03 GGCTAATGACATTGGGTGGGTGGTGCTTGGGAAAACTTTAAATCGATTTCCGAGTTTCCCGGACCCATAAGATATTAATGTTGCAAATTAAAGAAGTTGATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACACAGGACCACAGAA:1 - chr2R 20118651 5' + gypsy5 7317 2 67.81 ATAATTAAACTATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAGTTGCTCTCT:1 - chr3R 6413639 5' - 1360 3319 1 65.07 ATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATAT:1 - chrX 16117257 5' - opus 453 2 64.41 ATTATGCGATAGTTGGGTAATAGCGTATGTACATTTGACTAAACTCACATCAGGAAATTGGGGATACATGGTGCTACACAGGCCTTATCGAATGCAGGAGAAGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAG:1 - chr4 904906 5' + Bica 10 1 74.82 GGAGAGTATCGTCTCTTCGGCACTGTGTCTCCTCTCATTGTCAGTGCAGTGTGTATTTATGTATGTGTGCCGATATGCGTACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 + chr3R 1267658 5' + P-element 29 1 65.93 GCCGAGAGAGCCGCCTGAATTCACAGGGTGTGTGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr3R 18399260 5' + P-element 64 1 29.17 GCTATTTTCGGTATTTCCCTTGCATTTCGCTGATTCTTGAATTAGGCACGGCAGCTAAGATGCTGGGATTATATGATCCTCGAGAATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCATTAATTTAAACAATTCC:1 - chr3L 535791 5' + Idefix 199 1 50.36 GCCTGTTTAATCAACATTTCTTTAAAATGGGTTTGTTTTAAATAATAATTTATTTAAATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1 - chr2L 4346118 5' - jockey 4938 1 59.70 GTGTTTGCGGTTCATTGGATGAATGTGGCGGGGGGGTGGGGGGTGGGAGGGTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCA:1 - chr3L 22237101 5' + Ivk 59 1 56.03 GCATGTGATATGTGTGTGCAAGCTCTTGGATTTTTCGGTGTATTTCAAATCTGTATATAAACAATTAGATCCCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTAT:1 + chrX 20116061 5' - Idefix 433 2 52.00 TTATAAATGTATGTACGTGCAATCTAAATTTACGTGACAAAATCTAGCAAATATTCGAGCAATATTTCAATTAAAACTATATGAAAAGGAATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr2L 4877001 5' + 297 6607 2 68.49 AACGCCTGTTGGACATGTTGTGCTACTTTTCCGTTTTCGTTGTTCTGCTGCTGTGCTCGCAAAAATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - 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chr2R 12128484 5' + INE-1 95 1 84.93 GCAAAATTATTTGCTTTGTCTGATTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACAT:1 + chr2R 13367445 5' + jockey 4620 1 58.22 ATGTAAAATATTTTGTAAGTTTGTTTAATTCAACTTTAAGTGGAAAGTTCTCAATACATTCCCTAAAATTCTTTTAAATATAAGTGTTATTGGGATCTAATTATGTAATAGAAAAGTTAAAGTTAAGTTAAAGTCGATTGCTTTAA:1 + chr3L 26851752 5' - Cr1a 4256 1 54.79 GAAACCCAGCTATGGTGGCCTTCGTTCAAAAATTTTAGATAACGAAGTAGTAATGCATTTTAATTAGATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 - chr3L 9470079 5' + 412 9 2 79.45 AAAAAGATTTAGATGGTCGATATCTTCATTTTCAACCAAAAACTTATGTACACCTCGCAATAACTTGTGTTAACTGGTTAACAAAAACTTACCGTTAAAATCAAGTGCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:2 + chr3L 12964673 5' + hobo 13 1 75.34 ATTCTCGATATCCGCATCTTTGCTGCACAATGCGGCACGCGCTTCAGCAAGCTAGGATAAGTGTAAGTATATGTATATCCTTTGCATTACTTGATTCTATATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAG:1 + chr2L 18669315 5' - roo 8959 2 68.28 TCCAAAGTAACTTGGGTTTTTCTTGACGAAATCTTACGAAAATTCGTATGCTACTCTTTAGCATTAGAAATTCCCAAATTACGTATACATCGTATAAAGTATTCTAGATTCGTTGAAAGGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTT:1 + chr2L 3544762 5' + INE-1 33 1 69.86 CGGTTGGCCTCTCAAGGATTTACTCCGGCCAGCTGATCAACTCGGAGCGTGCGGATCATTCGATTCTGGAGATATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - 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roo 8968 2 51.37 GCGCTTTATCGGCGCACAGCGAGTAAATGAATAATAAACACATGGGCAATGGATATTGAGCCAGTCGAAAGGAGTAGACAACAATGCAGGAAATTTTAATTTTTATTATTTATTGAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAAT:1 - chr3R 20789579 5' - Doc 4655 1 65.07 GCGAATACATTTGTGTAGCACACTTTCGGGCTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGATAAACTGT:1 - chr3L 22339470 5' - hopper 1332 1 73.97 CTTAACTATTAATGTTGGGGAATCCCCAAAAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATAGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTC:1 + chr3R 25543432 5' + G2 200 1 34.56 GTGTTGTAGTTTTTGCTTGTGGAATATATGGGTGTTTAGTATTATAAACCTATAGATAGCATAGAAGTTTTTGTTGTTGTATTCAGTAAAAAATCTGCCAAGTTTCTGTTACTTATCCACCTCTTCTGCTGCTGATCCGTTATTTA:1 - chr3R 20751029 5' - invader3 469 1 79.45 GTATGATAAGTATTTCCCTTCATTTTGGCCATGTTTTGCGTGTGCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCAT:1 + chr3L 13952744 5' + I-element 5134 1 59.59 CATTTTCATTTTTATGGCGGAACCTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chrX 3646996 5' + 412 7111 2 60.87 AATGGAATGGCAAACGAAAACTGCAGCAGCAGTCGGTGGCACAGACTGCTTATTAAATTATGTCGGCGGTGCATGGAGAAAACTTTTGTGCTTGGCCATATTAAAATTGTTGGGAAGGAGATGGAAAATGAGAAAAAAAAATAAAA:1 + chr2R 15647046 5' - INE-1 471 1 77.40 GTCGAAATCCTTTCAAAAATTTATTTGCCGCCGATCAAAATTAACACATTACTCAGACAACGGGCGCATGCATTATTCATATAGCACAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAAAACGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTAT:1 - chr3L 23979580 5' + F-element 372 1 63.01 GATTCGACTGTTTTCTTCACTCAAGTTGTTCGGGAAGTGAGAGATCGGATCGATCGATCGTTTGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr3R 10213022 5' - P-element 2829 1 46.58 CCTCATATTTATTTTTGCAAAATTATTTGCTTTGTCTGATTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAG:2 + chr2R 13367429 5' + jockey 4604 1 52.74 GTCGAAATAGACTAAACGTATCTTTCAGATACATTCGCTTTCCGTTTTTCGTGTCCAGACCATGATGAAATAACATCAGGTGGTCCCGCCGAAAGCAGAAGCTTACCG:1 + chr2L 17260720 5' + P-element 27 1 55.56 AAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGGTAGGCCAG:1 - 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chr2R 22463309 5' - roo 404 1 67.12 CCTCGCTAAATAAGGCGGCTAAGCTGCACATCATTTTGCGCATAGACTTTCTTCAATTTTGTTTACCGCTGCTTATATGTCTCTAGAATCTGTATTCTTAACCTCAACCTTCTAGCTTTTATATATCGACTCAGCTATTGATTCTG:1 + chr4 597886 5' - INE-1 95 1 52.74 AATCCTAATAGACAAATTACGCTACCGACTTTAGATTAATGAAAGTTTAGAGAAAAATAAATGAGTTAATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTATAAAGCCTC:1 + chrX 8977429 5' + I-element 33 1 57.14 TCAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGGGGCAGTTTTCTGCGGTTTGTAGGCGTTATTGAGGGTGTGGCCACATGGGTCAACAAACTTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATCCTGAATCTTAACCTTCTCGCTTTT:1 - chr2R 5212080 5' - INE-1 165 1 74.64 ATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGTAGCTGTG:1 + chr2R 4577096 5' - Chouto 445 1 78.40 TATAGTAATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3L 13678888 5' + hobo 25 1 55.34 CGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGTTTCTCCA:1 - chrX 16117259 5' - opus 7430 2 68.49 ATTAATAGCTTTTGACAATTTCGTGATCTTTTATTTTTAATCATGTATTTAAATAATAATAATGAAATATTTTAATAAATACATAAACATGTTTAAGATGGTTTTAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chr3L 8394740 5' + 1360 18 1 40.41 CAGCGTTTTCCAGGCAATGGCAATTTAATGCCACGCTGCAAGTCATTAGGTGGCGCCTGCACCTCTGACCCGGTGAAAACCTGCCCCTCAACCCAAGACCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 12486286 5' - roo 396 1 78.68 GTGTGTACAATACGTACCTATTCTATTCTATTCAAGCGACCCATTTTAACAAACTGTTACTCATCTGCATCACAAAGTTTTGTTAAGAATCATAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3L 3238366 5' + roo 8683 2 56.93 CAGCATTCTCTCGCGTTTTTTTCTGAGTGCAATCGGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGG:1 + chr2R 22753556 5' - G2 2881 1 67.29 TATGAGTATGAGTCATTCGAAGAATCGCCAGAGAATCGATGTATCTATATGTATATATATACATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTG:1 + chr2R 7720685 5' + Bari1 55 1 67.12 ATTTTACAAATTATGCGATTTTAATGAGCTGGAAAAGTGCAAATCACTGACGGCTTTTCCCGCCATCTGGGAAATGAATATGGTGGCCATATATATCCGCCCGTACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCC:1 - chr2L 4152509 5' + G6 1840 1 71.23 GTGCAAAATCAAAGAACTCATTGAAACCAATTCCATGCACGCTACGCCGTTAAAGAAACCACAACGCGTACGACTACTTGCCCATAAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAAC:1 + chr2R 16920109 5' + jockey 4618 1 41.10 AACACGATATTTTGAATGTGATATGGTACTTTTAATCTTTTGGGAATATTGAATATTTTAATCCTGAAAAATAGCTTTTAGATATCCTCTTATCAACTGCTTGTGCTGAATGTGCTTAAAAAGAAAATACTTTTTAAATCCTAAT:1 - chr3L 14473694 5' + transib4 2557 1 53.10 ACGACCGATAGACCGAAATTTTTGATATAGCGCAGTTTTGTGTAGCCATTGCTGTGATTGAATACGTGACGGGCATGGGAAGTGGGCCAGTTTCGGGCAGGGCAAGGGTTTTTATGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTC:1 + chr2L 7872370 5' - hopper 940 1 78.08 ATCGTAAGTTTTCGTCACTGTTGTGGTAAATAAACTTTGGACCACTAAGTGCCGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTCATAAACCA:1 + chr2L 18987868 5' - blood 387 1 57.39 ATAGCAGGGTTTTATTGGTCAAGCTCATTTTTATCGGTTAAAAAAATGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTA:1 - chr2R 5433984 5' + Transpac 4987 2 67.12 TATGACTTTAATAAACGTGAGACATATAAAGATAAATTTATAGAGGTTTTAACAAGTTGTTTTCATCCCATTACTTATCATTCGTTTTTTTGTCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 3238219 5' - roo 396 1 62.31 GTCAATCACTGGGCTACAAAACATCCAGAGCAGCAGCCCAGAGGTACCTCACGTATAAGATAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGACG:1 - chr3R 27810111 5' + Burdock 6151 2 61.29 ACATACAAATTGTAACAATTGTTATTAAAGATTCATGTTAAGCAAAAAAAAGCCTATTAAAAACGAAGTGGCCTCAAGCTCCGATCCTCAACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTG:1 + chr2R 15857508 5' + I-element 5007 1 66.67 ATTTAGATGGTCGATATCTTCATTTTCAACCAAAAACTTATGTACACCTCGCAATAACTTGTGTTAACTGGTTAACAAAAACTTACCGTTAAAATCAAGTGCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3L 12964679 5' + hobo 19 1 71.23 ATCGGTGGAAGTTTTCATTTGATTTACGATCAAATGTCAGTCGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTTAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr2L 18522318 5' - roo 8992 2 69.18 TGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 + chr3L 3453587 5' + Tirant 30 2 61.42 ATTTAATTATTAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTC:1 - chr2R 4886049 5' - INE-1 580 1 56.16 ATAAGCACTATTTTATGAACATAATACAACATGGGCAAGTGGCAACGATTTCCTAATACATTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr2R 13293348 5' - roo 348 2 58.22 ACCAGAAACCTCATTTGAAAGTCCCGAAAAGAGCAAACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chr2R 18014146 5' + Doc 50 1 50.68 GTTTTTAAAGTGTGTGTTTTTCGTATTCGTTGTTTGCGAGTTCAGAAAGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGT:1 + chr3L 9212084 5' - hobo 7 1 70.55 AGGCCACCAAGAGACGAAAGCTGGCTCTCTCGAAGAATTCATCCTTCAGCTGCAGATCCTTCATGTAAACCACTTCCGGCTTTATGTCGAATATCTCGTTTTCATTTTTTCAACAAAATACATATTTCCATTATTTTTGTCTTATT:1 - chr3L 4537306 5' + S-element 285 1 69.86 GTATTTATTGCCCGGTCGCAGTGATCATCGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 + chr3L 6355621 5' + Tirant 27 2 62.50 ACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAAC:1 - chr2L 12291910 5' + Tirant 8167 2 78.76 ACATTAATTAAATTTTGCTCAGTGCTCTAGTTAACATGCTGTGGCAGTGGCTTCTAAGCCACGAAGAAGCTGAGCTGAACAAACTGAGCCTCGCCATGCCCTGTTTAGCACCTAACTCTCCAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTG:1 - chr3L 15371957 5' - copia 4942 2 82.19 GCAGCACATTTTAATGAGCCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr3R 25795825 5' + jockey 73 1 65.47 AGCGATTTAAAAATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTC:1 + chr3R 7616719 5' - Stalker2 7616 2 54.84 CAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAA:1 - chr2L 12643085 5' - looper1 109 1 63.70 TAATAACGATAACCCAATTTTAAAAGATCGTCAAGAAAATTGGTTTAAAATTGTAGAAGAGAAATGAATTCAACTGATCATGTTGATAAAAATCCAAAACCTGATAGCTAAATATATAGAGTGTATATATTCTTGATTAGGATCAA:1 + chr3L 18269313 5' + INE-1 82 1 72.60 GATAGCTTCTGCTGAGAATACTGAGGAGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACCTCGATGAG:1 - chrX 19820801 5' - Rt1b 4972 1 77.50 ATTGCGTGCCCGAAAAAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 + chr2L 12325004 5' + jockey 4674 1 74.00 GTTTCTCTGCGGACTGAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 9871542 5' + roo 8681 2 41.04 ATTAAACTAATCGCTTTTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr3L 10112267 5' + I-element 30 1 51.49 CGCCAAATTGGTAACTTGCATGCATATCATATATGCATTTTCCCTTGTGAACGTACACACATATGAAAAGTTTGCTCTTATTTGTGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTG:1 - chr3R 7470081 5' + Doc 338 1 62.50 CAACATTTGGTGACCCTGACGTTCGGTAACATTTCTTTATCGTGAACTCAAAAAACAGTTTAACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCC:1 - chr3L 23728646 5' - Gypsy6A_LTR 364 1 76.03 ATGTCATTTTAAGGCCCTTGACTCATAAGCCAATTAAAAACGGCAAAGGACACAGAACTCAAATCATCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 - chr2L 2098765 5' + Doc 66 1 52.86 ATTAGATATATGTAAAGATAAACATCTAAAAAAAACTAGAGTTTATTGGTTGGATCGTATAAAAGGTCTGGGAATCCAGGGCATTTCAAAGTCCAAGCCCCTATGCAATATCGTTTCATTCTAATGATTATTTCTTTCTATTAGT:1 + chr2L 7807290 5' - transib3 2683 1 76.55 ACTTTGTTGAAAAATGAACACGTGCCGCTGATTAGTAAACTAAGAAGGAAGCTGACAATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATAAATAGCC:1 + chr3L 92012 5' + INE-1 87 1 55.79 ATTACAAAATATTTTCAATTATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr2L 9274960 5' + F-element 43 1 63.70 ACCACAAAACTATTTGAATGTCGCAGTAACATAAATAAACTGAGATAATGCAGTTCCGTTTATAGCATTTTGCATAATTACGCGTGGCATTCTTTGGGAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3R 25753345 5' - roo 9041 1 71.23 ACCGTAAAAAAAGAAAATTATATAACATACATTTGTGGACAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr2L 15081020 5' + Doc 14 1 72.86 TTGGACAAACACTTCGACTCTAATGAGGCAACTTAAAGTGTGCTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr3L 13364375 5' + hobo 40 1 61.11 AAAACAACACCAGCTATTCCACTACCCATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGAC:1 - chrX 21933340 5' + springer 7137 3 78.23 TTGAATGAAAAGTCAGTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr2L 7652268 5' - roo 8997 2 71.23 ATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTAT:3 + chr2R 5582144 5' + Cr1a 463 1 62.33 GCCCATAAAATTCTTAGTTGGCACTTCAGATTTTTTAATTGCTAGTTTGGTAGCGCAGCCAATTAGGCACATTAACATTTATCACTTAAATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTA:1 - chr2L 2726682 5' + FB 899 3 59.59 ACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:2 - chr3R 21674887 5' - roo 8985 2 78.08 AAATATCCCCACAGTTGCCATTCCTGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTAGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTACAGC:1 + chr3R 26846775 5' - hopper2 1514 1 77.40 CGGCATACTGTCAGTGTCGTCCTATTCGTCCTTCCCCTAAAAAATTGCTGGCCTGACAATTTTGCTTTGCTAAATCGGGACAATAAAATTTAAAACAAGAGAGAATGCTATATTCGAGTTCACGGACTATCAGATACCCGTTAATC:1 + chr2L 12796250 5' - INE-1 549 1 71.23 CTCAATGCGATGCCGGGTCGTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:2 - chrX 19107459 5' - roo 333 2 71.23 CAAGCGTCGCAATTTTCGTAGCCCTTTGAACGGAGCCGCCGCACTCTGATCCTCGATGATCCAGGACAAACCATGACTACTATAATTTTAAAGTTTTCTAATATTCGTTTGCTAAAATCGCCGCTCGCATTAGCTAAC:1 - chr2R 16166718 5' - 1360 2983 1 51.45 CACACTATTGGTATGACGATCATGGCTTATTACTTTATTGGAGAATATACAAAGATTAACGATTTTTATAATCAAGCGCTAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGTTCCGTTCATATCT:1 + chr2R 11256136 5' + roo 8703 2 55.86 CATAACTCGTGTACCTGCAACGAGACAACCCCGCGAAAAAGGCAGAGAAGGCGGTAGAGAAGAGAGAGACGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTAT:1 + chr3R 10585915 5' - jockey 327 1 51.54 CATTTCCATTTATATTTCCAAAAGATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGCATATGAGAACAAGAGAC:1 - chr3L 21262623 5' + jockey 4570 1 80.82 CAAGCAACTAGCTGGGCAAAGAGATAGAAATTGGGAAGGTAAGTTACATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTT:1 - chr3R 9582247 5' + Juan 4106 1 71.23 AATTAAACTTTGTCCATAGATACTTTCAAACTTCAACAAACTTAGTGATAATAGCTGATATGCAACGGAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAT:1 + chr3R 16425145 5' + jockey 4986 1 53.42 CAAAAAGCAACGGAGCTGGCCCAAAACCCCGATCTACTTTTTTTTCTATGGTAGTCCTATAGTCCTAGGAACAACAACTGCAAACTAAAAAGGACAACGGGCATACAAATATTTAGCGTGGCATGGCACATCCTGTCAATTCCTGG:1 - chr2R 19895980 5' - Helena 7 1 76.03 GTTTATTTAATTGATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTATTAACTTTGTTTAACTTTGCTTTTTTATTTAACTTTGTTTTTTTTTAACTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCAT:1 + chr2L 20766887 5' - TAHRE 10400 1 58.90 CGCTTGTTGCGCAATTTCAGTTGCAGTTGCAGCCAACGTTTCCTGCCCACCGCCACCTGTGTCCTTGTCCTTTCATCCTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGATTACAATAGATGATGGGGTATAACATAGCGTC:1 - chr3R 6495381 5' + Stalker4 6997 4 55.71 TTCTAGAATCTAGATTCAGATAAATTTACATAAAGAAAGTAGTGTTTTCTTAATCATATTACTAGTTCTAGCCGAATTTAAATAGTATAGAGAACACAGCTTAAACTTCGCGAGAGGATTTTCGTGTGCGGCGAG:1 + chr3R 9626073 5' - Doc2-element 4558 1 77.78 ATCGATGGACATGATGCCCACGCTTTGAATAATTTATAAATTTCTTCTTATTTTATTCCCCAATTTCTGTGTATTTCTCATAAAAAAAAAGTTGATATTTGCGTGCGAATTCACACTAGCTGATTAA:1 - chr3L 20033464 5' + INE-1 533 1 47.24 TCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTGACTGA:1 + chr3R 7481521 5' - invader4 3004 2 66.44 AATTATTCTGGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCGCACATATACGCGTTCTCGTCTTTTGTTTTTACTCACACAAACAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCAGCGTG:1 + chr3L 25119403 5' + 1360 3286 1 73.29 AGAATAATCCACATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 + chr3L 17537738 5' + Doc 66 1 62.33 ACATGAGGTGAAATGAATGTATAAATCAATAACTTCATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGA:1 + chr2L 16857863 5' + P-element 85 1 26.90 TATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGAAA:1 + chr4 123942 5' + HB 114 1 56.16 AGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTCTGT:1 - chr3R 7616827 5' + Stalker2 53 2 58.16 CCAGGAGTTTGGGATAAAGCCAGAACTATTATATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCA:1 - chr3R 28406431 5' + opus 166 4 72.17 AATAATCCACATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACACCAGTATAGTGAA:1 + chr3L 17537740 5' + Doc 68 1 62.33 AAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGCGAGCAATGGTGGCCATCACTAACAACTTGGCATAGCGCCAAACCAATGTAT:1 + chr3R 20683399 5' + 1360 3354 1 83.81 ACGCGCTTAAGCACCAGTCATTAAAACTATGTATGTATTTAGTATAAAGCTATCACAAAATATTCCAAAAAACAATGAAAGAGCCTAAAAATAAAAAGAAAATAATTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTT:1 + chr3L 13278662 5' - Stalker2 49 2 70.55 GTTTATAACCGTTGAAGAGCACAGCACGAGGGAGATAAGTCCAGATCTGGTTGGCATCGCATCGGATTGGATTGGAGCCGATCCGATCCGAAACGGGATCCAACTTCTGGGATAAATATCAAAAATGACTTTATATTAGAATAATT:1 - chr3L 6375695 5' + 1360 387 1 74.66 AAATATATATATAATGTTAGACAAAGCAATAAAAAATAATAAACTTGCTATTACATTTAACAAGCTAACAAGTACGCCAAAGTATTTCATATCTTATCAGTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 - chr3L 17922082 5' + copia 21 2 71.23 AGTAGATAGGGACATTCCGACTTCTGAATGGAAGAAAGCTGCGAGGAAAAGGCCAAACGGTGCATGGAAAATGAAGATGAAAACGCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTCAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr2L 1778905 5' - roo 9036 1 63.16 CCTGCGAAAATGGAATTTAATTTGCTAATACGCTTCGTTGAGTGGCAACGGGAGGCGTTTTAGTGGGGGTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGTGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr3R 20934628 5' + 412 18 2 69.18 GAAATATCCACTTTTGAAAATGTTTAGAACCATAATAAATATGTGATTATAATAATGTTGTGATTAAATTTTGTGATTAAAATGACTACGATCTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTACATTTTATAATTAATCTTA:2 + chr3R 7080563 5' - G4 3796 1 60.96 AAATTGCCCCAATTAGCGCAAAACACAACAACTCAATTTATCACGCACAACTAAAGTGAGTCCAATATTTTGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGT:1 + chrX 4033584 5' - transib2 2459 1 59.26 TGAATTTATTGTCAGCAACAAGAATCACAGCACGATGGACAAAAAACAAAATAAAAAAAAACTGAGACTGCAAACAACATTGCGATTTGTTTGCCGATATATGTATTCATACACACATACATACTATATATGTATGTATATATATT:1 - chrX 11541608 5' + 1731 4410 1 80.14 GAGAGCAATCATCGGCATTCGAGCAAGTCGCAAGTGTGTGTGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 + chr2R 8666039 5' - P-element 2809 1 30.82 GTTGCATAAATACGCAAATGTTTACTTAAATTAAAATGCCCATTCGATTTTCTGAACAACTCAATCAATTTGTGACCACACGCAGATATTGATTATTATTCAATAAACTTACAAGCTCAAATATAATCCAAATATAATTCGTAGGC:1 - chr3R 31364451 5' + gypsy7 5426 2 53.42 TAGTTAACAGATGGCCAAGAGCACTCAGTACTAGAGATGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGATTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCG:1 + chr3L 19357540 5' - Doc 324 1 66.97 AGTGCGCCTCCCAGCCAGAAGCGAATGAAGTGGAAAACCCGGCGACAATTGCGAATAATAGAAGATGCCAGTGGCAAGGACCCAACTGACACTTCTTAGCCTGTCGGAAGAGACTAAAATT:1 + chr3R 5231388 5' + diver2 4760 2 66.94 CGTTGCTTTGTATTTTTGAAATACTTTTTATTCAGCTCTCATTCTCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGC:1 - chrX 886996 5' - Quasimodo 6925 2 68.66 ATATATCGTTTTTTACACGCCCCCTTCCGCCGCATCACGTTCCGAAATTGAAACATAATATTGTCAGACATTGATGCCCGCTTCCTTCAACATTCTTGGTGATGAAATAACGTGCCAGAAAGCGTTTCGTTGAGGAAACAGAGG:1 - chr2L 14151392 5' + invader5 290 2 63.19 AAAAGATACATTTGTATCTTTGGTCATGCACTTTGCAGTTACCCCTTCCATTTCCCTACAAAAAAATACGCAGTGTTTTGTTGTGTGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTC:1 + chr2L 9126158 5' + 1731 4459 2 56.16 TAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTG:1 + chr2R 11095737 5' + diver 5947 2 54.79 CACTTTCTCTTGAAACACATTCTCGCAAATTGCATGATACTCGTACATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 17626734 5' - roo 398 1 78.77 ACCTTTTCCAGCGCTTCCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGCTTCTTTCAAGCTACGAATATCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 + chr3R 7585737 5' + Doc 63 1 56.92 GTCGAAGGGTTGTGGGTAGGGGGTATATGAAGCAATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGGTGAGAGGGCCTTCCG:1 + chr3L 7791844 5' - Transpac 301 2 75.71 ATGTACTAGTTTTCACCGTTCATTTCATGATCGTAATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGA:1 - chr3R 12363820 5' + jockey 4726 1 50.34 ATCGTTGGAAGTATGATAAGTATTTCCCTTCATTTTGGCCATGTTTTGCGTGTGCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACAT:1 + chr3L 13952734 5' + I-element 5122 1 67.36 ATTTTGATTGCTTTGTTATGTGGAGAAGTGGGTGCCGAGTGTGGGTGGCAATAAAACGTGAGGATCCCTCCATTCGCTTTCGGGTGGCAGTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATATAGGCAGATCGCAAA:1 + chr3R 24483665 5' + invader2 127 2 51.37 CACTAATTAGATATGAGTAGTAGCTTGTAAAATTATATGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATA:1 - chr3R 7664552 5' + I-element 83 1 75.86 GGATCGTCAAGTCAACCGATTCGACTGTTTTCTTCACTCAAGTTGTTCGGGAAGTGAGAGATCGGATCGATCGATCGTTTGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr3R 10213005 5' - P-element 2872 1 70.83 CTTCGACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCCTTCTTATTATTGGTAGTCGGCCTATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chrX 21669996 5' - mdg1 392 2 61.87 AAATAACCGAAAAAAGGAAATATGCTAGGGAAAACCACTAAATCGTGTTGGTTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGG:1 + chr2L 21875454 5' - Quasimodo 213 2 65.93 GACAAAATCTATTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGATTTT:1 + chr3L 18183068 5' - Tirant 354 2 54.79 GCACGAATATGGAGGCGTCTATCTTTGCTTTATGTATGGCTAATGCCCCACTAAAGCTGCGCACAAATTGCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGGTAGTTG:1 + chr2L 11628884 5' - jockey 184 1 53.85 ATCATAATTGTACTAATTTTATATTTTATCTTAATCCTACATCGTTCATGGTTTTATAATAGTTATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chr2L 16562069 5' + opus 50 4 57.53 ACTGCCAAAACGAATCCATGCAGCACACAATTCCATGTTCATTTACTGCTGCCGCCAGATCGCACCGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGAC:1 + chr3R 10907531 5' + X-element 72 1 59.59 AACCATGGCATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGACGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGT:1 + chr2L 12291840 5' - Tirant 8443 2 60.27 CAAATGAATTATAATTTTGTTAATTTTTTGATAAGAGCAGATAAACAATACTATACTTTGTAAAGCCCCACTTATTCACGTTGAATACAAATTAATTATAATTTTGTTAATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1 + chr3L 17667498 5' + F-element 16 1 76.71 GTTTTTCCTGTGTTTTCGTGCAGGCACCTTATCTATCCGATGCTGTGTGCTTGAGGTATCAAATAAAGAAAAACGTCTGTACTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAA:1 + chr2L 18218909 5' + baggins 5062 1 54.79 CGTAGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGCCAGCACAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAA:1 - chr2R 2308826 5' + McClintock 5989 2 68.84 GGATGTGCTGCACGCGCGGCGACTAATCTACATTTATTTATGGATCCTGGAACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chrX 388370 5' - 1360 3366 1 71.03 TTAATAACATTTATCCTGTACCACCGGGCGTATGCGTAATGCGAAAATTGCTTGCCACGGCACATGAATTGTGGTGATATCATTAATTGCTCTGGCTCATTAATTTGTTTGTCTGATTCCTTGGATTGTTTTTATTTTTTTTTAA:1 + chrX 13246933 5' - transib2 2639 1 51.72 CAGGAAGGGGCGGTTCGGTTTTTCCGTTCGCCAACTTAATAACCGAATCGCCTTAAAAGAAAAGCCAAAACCAAAACCAATAATTAGATCCTACTAACAGTACTATTTAATATAGTTATTTTACAT:1 - chrX 9447445 5' + Cr1a 4312 1 61.90 CGCAGAACCTGAGCATTGGCAATGCCGATTCCAATGGCGATGGACGCGACCTGAGCAGCGACCTGGATGCCGGCAGCACCAGCAGCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAA:1 + chr2R 20936475 5' - roo 104 2 60.00 TCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACT:1 + chrX 15408743 5' + INE-1 562 1 88.15 CCCAATAAGGGAAAACAATGGCGTTGCTGTTTCGTTGGGTGGGCGTTTCGGTAATATAAAACAAGATTTAATAATCTTCTCTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGAGTGATTCTTTCCCTTCGCGAGTGATTCTTT:1 - chr3R 27818106 5' + Cr1a 130 1 54.79 TAATAATTTGAGAACAGCATTGGACAATAAAAACACAATGTTCGGTTCTTAAGTGCACTGGAAAAAAAAACACACAATAGCACACATAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTATGATTATGAAATGAACTTTCCACCTGCAGTAG:1 + chrX 15309992 5' - Tc1 26 1 52.74 TACGTAACGTCACGCCGAAAAGCAGCTGTGCGCACAGTGTGTTAAATATTTCGGGAAAGTTTTGGAAATATTCGTATAAAATTTAATTTCATACGAACAATTTAATAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2L 6601231 5' + roo 14 2 69.18 ATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chr3L 3453597 5' + Tirant 8160 2 55.71 AAGGAACCACACCAATTAATACACAAACGAATTTCCTCTAATTGCCGGATTTCCAACAAGAAGCATCCGCTTTTTGATGGCTATACGGCCGGAAAATACACATAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGT:1 - chrX 14327784 5' - jockey 4764 1 70.55 CAAATAAGCCAGAAACATTTGCCTGCGCGCGTTTCTTGGTATAGTGCCATCAACTCGATCTCGATCTCAGTAGTTCATCTTTTATAATGCCCACACACACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chrX 2295079 5' - Transpac 5218 2 77.14 AGAAATTGATATACGAAACAGGGTAAAGAAGTTCAAATCGAATGCCAAAGCAGTTACAAAGCAGTAGAATGGTTATTTAGCCCAGACGCAAGCCAGGCACCGGAAGTAAAGTAATGTAAAGAAA:1 - chr3R 25194034 5' + TART-A 13117 1 82.26 AAAACAAAAATACTCGACTCGATAAAAGGAGAACAACAAAAGGGCAGGGAAAAAGGCTCAGCCACTCAGGTGAAATCATGAATATATTTCTTGTGCAAATACTTATGCCCACTAG:1 + chr3R 21824589 5' + Tc1-2 1621 1 67.83 ATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chr3L 18253771 5' + blood 7058 2 53.42 ACCGACTCTGCAACAACGACAATAATTGTCGTTATAATAATGGTCACTTTTATAATGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 15295717 5' - roo 351 2 65.00 AGGCAGCCAGCTGGAAAAATGCCCGAACAGAACGACACGAAACGCCAGAGCCGCATCATAATGGCCCAGAGCAAAGACGCATCTCTGGGATTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGCTATAAA:1 - chr3L 14498366 5' + Cr1a 466 1 72.80 AACCACTTAAATTCATTTTAATTCAAGTGAATAGCAAACCGACCTCTTTCCACATCCTTTGCCATATAGCCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr2R 21748228 5' + 1360 50 1 52.05 GTCTGGAAGCCTGGAAGTGAAACGGAACCATTGTGGGGCAGGGTGACAGGATCGCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGACCTACC:1 - chr3R 20473103 5' + accord 6943 2 51.30 AGTGTAAAATTAACAGTATAGTGTTGAAAAAAAACAGCTGTAAAGTCAGCTGTTGTAAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAA:1 + chr2R 3338723 5' + Juan 18 1 74.48 ATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGC:1 + chr2L 12291849 5' - Tirant 343 2 63.85 GGGATTAAAAGGCTTTTTAATTCATTAACATTGATGAGATCGAAGAAAATCGTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr2L 7652130 5' + roo 8664 1 78.77 GATTCAATAGAACTGCTTTTATGTTCAAAAAATAATCTTCGCCCATCGAATCAATTCCATAAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 - chr2L 8574511 5' + Transpac 9 2 76.71 GGAATGCCTCGGGCACCTGCTAAACACGCTAACTGCTTTGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3L 8658799 5' + roo 54 2 68.33 GTATTCGAACGAAAATGCAAATCGATACCAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGT:4 - chr3L 7801342 5' + Transpac 5050 2 63.01 AGCCCAGTGACAATTAATTGCTGAAAATCTCATCTCATCCCATGCAATCCCATACCATACCATATCATACCATTTTACAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACCCTGTCTCCGTACCTCCACCA:1 - chrX 8453149 5' + HeT-A 6048 1 60.00 AAAGTCGACTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGAGAAAGAGACCTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGTGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGCTTGC:1 + chr3R 18346607 5' - INE-1 534 1 47.26 GTCAGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr3L 23146447 5' + 1360 31 1 62.86 CTGGTTGTTTACTGTTTCTTCGGAATAGAAATCTAAAAAAAAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 - 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1360 3323 1 64.38 CTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1 + chr2L 21153497 5' + 1360 80 1 71.92 GAGAGGGGGATTGTTCACGGGAAAATTTATGACAAGTGGTCAAAGTGCGGGCTGACAACGAGGCAATAGAGATGCCAAAAACTAAAAAATTCCAAAGGCAGCTTTTCGAAGTAATCAAATATTAAAAATTGATAAATAAATCGAAA:1 - chrX 886773 5' + Doc3-element 84 1 76.71 TCTTTGATGTTGTTTATCACTTACTTGCCAACCATCGCAAATAAAAGACCCTAAGATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGT:1 + chr2L 15777793 5' - 297 6915 2 62.33 GCACGAATGTCTGCTAATTTGACTGCAATGGCCATCGAATCGATTGCCAACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGG:1 + chr2L 19406981 5' + Doc 5 1 71.23 ATTTTTCTCTTATGGAGTCCCTACAAGGACTAGTTACTAGTTGATTACTTTTCAAAGTAGTGGATGGTAACGAGGTCATAGTCGTCCCTAGCAATCAAGGGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCG:1 + chr2R 4838202 5' - HMS-Beagle2 7066 2 74.22 TTTCAAATATATCACATTGCAAACATAACCAATAAATCACAGGATGTCCATAAGTCAAGCCAACCCGCATTTTTCATCATTTTACTCAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCATCGTCCTG:1 - chr3L 10805894 5' - Tc1 1302 1 52.74 TCTACTTTATCTTGATAATTGCCTTTTTTTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGTACGCA:1 + chr2R 13046514 5' + 412 7134 2 76.30 ATTCACTTGCGATATTTCGGTCACACAGAGCGCTTAACAGCATATCGTGCCAAAATGAGGAGATATATTCTAAAACAGTAAGAGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr3R 20635381 5' - 1360 3355 1 62.33 CATTGTGTGAGGTATATAGAGAAAAGTTTGCCAGAAACAGGAAATTATGTTTATTATTACTTTGGCATATCGATAACAATTTACAAAACTAATAAAAATATGAAAAAATATTAACACGTTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGACAGTTT:1 + chr3L 18458908 5' - INE-1 246 1 58.90 ATCGATGGTTGTAGCCATCCATCCAACACTCTTTTTTTTGGCAATAAATTGGTAATGTATTTTGGTGACAGATAAGACCTCTTGCACATTGTTGTGATAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3L 12836132 5' + 1360 23 1 69.18 ATTCAAAGACTTCGGAGTTGATTAGCAATATTTAATATATTCACAAGTGCTGGCCAACACTGCCGCATTTATTGCGATTTCCCGTTAACTCGCGCACACTACACCCTCACACACACACACACACACACACACATTCACAC:1 - chr3R 22824273 5' + accord 189 2 50.00 ATATATGGTGTTGTTGTTGAGCATCAATTTGCGCGTGCGGTATGGTAAGATGAAGTGGGAAAGGGAAAGGACTAGCGATCTTTGAGTCACCTATGTTTTATTTTGTCGTGGACAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAAC:1 - chrX 7306018 5' + Circe 7006 1 65.75 CGCTTTAAAGAAATCGTTGTGAGTAACTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr3L 9212740 5' - hobo 2893 1 73.47 CCAGCTGAGATGGCTGCCTAAGGCCAAAATCTGTCTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 - chr3L 5069512 5' + opus 39 4 56.52 AGATACTTAGATATTTTTTATCCTCTTCAATCCTTTGTTTTCACCAGCTTTGGTCAATTCGTCCAGCGTTGGACGACTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 - chr3L 25607337 5' - 412 7534 2 76.00 ATGGCTCCCACTTAGTTTTATTAGACACACCGAGGCTTTTGGAGCCACAAAATTGCCCAGCAATTTCCTTTATTATCCTGTAGACCCCACCATGCTCAAGAGTGTGTGTGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr3L 13679032 5' - hobo 2928 1 77.93 AACGGAAGGAGCCAACCAAAGCGCTTAGTACAGCGGCATGTGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACG:1 - chr3R 12520819 5' - Burdock 6311 2 73.29 TTTCAACTGCGAATAAAAAAATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:2 + chr3L 18253751 5' + blood 27 2 67.12 ACTATTTGTAAAGAACAAGTAATAATAAGTACTTATTGGATTACTATTCAATTATTCTTAACCATTTAATATATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGT:1 - chr2L 13139098 5' - McClintock 434 2 58.22 GAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3R 19436085 5' - roo 9009 2 60.96 AACAATTGTTTTTTATTATATATTGCTCGATTTTTCAGTCGTCAATTATTTATATATCGCTAATTTTTTTATTTGTGATATAGAATGCTGAGCTTAGCTTGCTTTGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATATTGAGGCA:1 + chrX 18880510 5' - 1360 486 1 64.38 TTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGA:1 - chr2L 17599965 5' + 1360 474 1 71.43 GTTTATGTCTTCAATATCCTACTGAGCTTCCCATTTACTTCCGGCCATCATTATCCCTTTTCCGTTGCTATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTGAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGATATTATGTATGTGTAC:1 - chr3L 14278492 5' - invader2 4874 2 56.85 ATAAAATACTTGATTCATATTGGAATATTTTATTAGGCTTAAAACAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTT:1 + chr3L 12223143 5' + Transpac 72 2 69.86 CTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATAC:1 + chr3R 907912 5' + gypsy11 4340 2 25.19 TTAAACCTTAGACCTTATGTTTTTAAAATTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTACTT:1 - chrX 7685605 5' - Doc2-element 220 2 64.15 TATCAAATTTCGGTTTGTTCAATTGGGATGGAGTTAGTGTTGGTGGATAGTGTGTGTTTGCATAAGAGTGCCGCCGAGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTGAATGCTTTATTAGAACTGAACTGTG:1 - chr3R 18174470 5' + frogger 64 1 64.75 GGAATTTTTTTTAACTAACGGTGAAGGAGCGGCTGCGAACTGTTTAAGGCGAGCTCAGCGAATTTTGCTGTGCTTTAAACAACACTACTTTATTTTT:1 - chr3R 25518318 5' + copia 37 2 67.01 ATGATTTTATGACTTTTTACGATTTTCCATGGGAGCTGCGAAATATTTTTATTTATTTTATTTATTTATTTTGTGCTTTTTCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTA:1 + chr3R 6015089 5' - Juan 4145 1 63.19 CTGACCCCAATGAAAGTGCGTGCTAATGAGTGTAAAGCGTAAAGAAAGACTTTGCTTAAAATTTTGATATTTTAAAGACCCTACTCTTGTTTATTTTCAACTTCGAAAATGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAA:1 - chr2L 9592176 5' + X-element 4712 1 62.33 GATGTCCACCACCACAACCGCATCCAGTAAGTTTATCCATCGCCAAGGTTTCCAAATAAACAATTGTTGTGCCTAGAACGTAAATATTCTTATGCATTATTCTTATCAATGCATTCATCGGATCTTTTACTTTCAAGCCT:1 - chrX 12760353 5' + transib3 2405 1 60.00 CGTTATGCGAATGGAGGATCACCGCGCCTCCACAGCATGCCGTCGTAATAGAGTTCAAGTATTTTGATATGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr3L 11804077 5' - blood 7339 1 54.17 ACTGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGC:1 - chr3R 30264100 5' + blood 7080 2 65.07 CACCCATCTAGTACTTACTAACTCGCATAACTATAGTTCTAATAAAATAATTCATCGGAGAAAACCACCGTCTTCCACTCCTTGTTCCACGTCATGTGTTCTCAGGCAAATTCTGAAGAGAAGAGATCAGAAACTTTGATATTTAA:1 + chr3R 21076804 5' + Tc3 1603 1 65.75 CGACGTGTCGGTAAGATTTATGTGCGGATTTCCCGGCACTGGTGTTTCGCGTGGGGCATCTCCCTGACTGAAAAATTTTCTGAATAATTATGTTTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chr2R 1923613 5' - pogo 2092 1 77.44 CCTCTGTCATAAAAACGGCGACCGTGGGACATTGTAAATTTTAAAGGTTAACCCTTTTCGCTTCACTTTTATGGAAGAACCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr2R 19843286 5' + jockey 31 1 65.62 GTGAGAGTGTCCAATAAAAATTACGTATACGCAGCGAGTGCCCGAAGCGGCGACCATGCCTCACGAAGCGTGCGGCAATTGGCAAAAGAAACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 20450382 5' + hobo 29 1 64.38 TATGCAAACGGATGTATATTCTAGGGAGATTAACATAGCGCAAGTGTAAGTGCTTAATAAACACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 + chr2L 4637191 5' - mdg1 362 2 56.85 CTATATTTCCGTAGGCAAAGTCAATAACTAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 + chr2R 21848659 5' + Transpac 46 2 50.00 TTTTTTTTGGAATTTGTTATTTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 4526367 5' - Doc2-element 251 1 83.33 AATGCTGTCATTAAAATCCTAATAGACAAATTACGCTACCGACTTTAGATTAATGAAAGTTTAGAGAAAAATAAATGAGTTAATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chrX 8977415 5' + I-element 39 1 58.90 AATGAATAATTCAAATGGAATGCCAGCTTCAGCTTCAGATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACAAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATA:1 + chrX 8219388 5' - opus 7423 2 72.92 TAAAACCAGAGTGGTCTTTATTGTGTCGGAGAAGTCTCCTCTAGCTCTTGGTTACTCAAGTTTTTGGCTGGTCGGGTTGCTTGCGGACAATGTTGCTGTGCAACTTTGTAAGCAAAGTCAGCACTTGGCCGGATGCGGTGCTCCAG:1 - chr2R 5071060 5' - Tirant 75 2 45.21 ATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGGAGCCGGCAACTGGAACAC:1 + chr3L 3453641 5' + Tirant 62 2 79.05 GAAACACCACAAATTTTACAAATCCTTCCATTACTTAAACGGTTCGTAATACCTAAAGTTTACCAAGTTCAATGACATTAGAGTATATCTGCAGTGTTTATGAACATATAGATTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAG:1 + chr2R 5965121 5' + INE-1 90 1 60.27 CATAAATCCATCTGCCGTCCATCCATTTGCATAGTTGAGCCGGATAGTTAAGCTATTTACAGACTTACAATGGTTTCGTTTTTTATTTCCTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGACACCCTTTATCTTTAT:1 + chr3R 25277575 5' + 3S18 5797 2 64.38 AGATCGTCCTTATACTTATTAATAAGGGAGATTTCTTTACAATGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCTTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCA:1 + chr3L 22641986 5' + hopper 81 1 72.60 ATCCCGTTTGGGCCAAAAAACAAAGTGTAAAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2L 12291974 5' + Tirant 8120 2 75.38 CGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCAAG:1 - chr2L 21643102 5' + Tabor 6927 2 74.66 GTACATAAATTTTTTATTGAACATGATATCTCTTTCTTAGCATTTCGAGATTTCTTGGCTTGGTTAAATAAATTTCTCCCTGTGCACGCATCTTTTTCGATGATGGAATCACAAGCAAGGTGTAATGATGCACTCCAATTAAGAAC:1 + chr2L 17431477 5' - 412 489 2 65.07 AAATATAATTACGCTTTAAAGAAATCGTTGTGAGTAACTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACC:1 - chr3L 9212751 5' - hobo 2877 1 70.40 ATTATACTCATGAGTTTCCACACAGTTGAGTGTGCTGGGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 - chr2L 15777927 5' + 297 6611 2 65.07 AATCGGTGGAGCAGGTCGCAGGAGAGAAACGGGGATGTGCTGCGTCATTAGGAATGCCTCGGGCACCTGCTAAACACGCTAACTGCTTTGCATCCTGTGCACACATGATAACGAATATATTTA:1 - chr3L 8658849 5' + roo 8671 2 78.05 GTCATTAGGAATGCCTCGGGCACCTGCTAAACACGCTAACTGCTTTGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 8658806 5' + roo 52 2 64.00 CCAAACGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAATTGATGGCAGACGAGCCACAATTGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATTG:1 + chr3R 178119 5' - Stalker4 423 3 76.47 GTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr3L 27391430 5' - 1360 3373 1 67.81 TTCGGTGGAGTGGACAATGTTTTCCATGATCAAATTAATTATTACTTGTGGGGAAGGGAAATGCACAAAATAAATATAACGAAAATTACATTTATACATTCAACTTCAAGTTTTGCTAAACGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAAT:1 - chr3R 6422978 5' + jockey 8 1 80.14 AAATACCTAAAATAATCGCAGAAATATACGCCATACTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 25751923 5' - roo 388 2 69.78 ATTCACTTTTAAATGTCTTTGTTTTGTGTTGGCCTTCATGAACCATTATTCGCTTAGATGATAACTTTTACAATACAATTAATAATACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAAGCATAATAATAAGTCAACTA:1 + chr3L 14175635 5' + mdg1 73 2 65.07 ATTACTAATCAACAAAATATTTCCATTTGCTATGTGCTCACCAAGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr2R 11256244 5' - roo 9006 2 67.15 TACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3R 14277966 5' - P-element 2861 1 52.53 CGGTGCTTCGTGTCGACACGTATTCAATTCGATTCAATGATTCAATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAAC:1 + chrX 22831908 5' - Gypsy12A_LTR 2240 1 38.36 ATCAAGCATCATGGGTCTAAGCACCACACTTTGCTGCATTTTGAAAACACCATCTGAAAACACCATCAATAGTCGATTTCAATTTCGTTACTGATGGATTTTTGGTCGACAGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 - chr2R 4536741 5' - mdg1 7445 2 76.03 TAATGAGTAGAATTTGGTATTGTTTCAGTTTTGTTTGCTGCTTTAAACACCATAAAGGTTAAAGTAGTAGCATGTGCATTTGCCAAATCCCATGCCCTACCCATAAGCTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr3L 15364759 5' + 1360 11 1 76.03 GTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTCTATT:1 - chr2L 13332695 5' - micropia 399 2 65.60 TTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 + chr3R 11151813 5' - mdg3 178 2 63.01 AAAAAAATATTAGTGAAATGCAGCCACATAATTTGGCAACTAAAATCGAAAAGAACAAAATTATAAATCGTTCAACATGCTATTCAAACACTTATGACATCAAGTGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chrX 8349832 5' - roo 393 1 75.34 CATTTGGCCGGATGTGCTGCACGCGCGGCGACTAATCTACATTTATTTATGGATCCTGGAACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chrX 388379 5' - 1360 3374 1 76.71 GATGCACACCATCTCGCCTTTGCCTGTAGGGTGCGGAAAGCATTAAAATTATAAGTGCGGAATTGTGGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr2R 21690452 5' + 412 7105 2 54.17 CATTGAAGACCGTTCGTCGAAAATCGGATGAGGTACACACATTTAACTTACTTAAGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTAT:1 - chrX 14137295 5' + 3S18 5809 2 54.10 AATTCTTCAAAACAAGTCATAATTCAAGCCAAGTCACCCCATTTTCGACTGCAGCCCTTTCACTTGTCGCCCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACTCATTCGCAAGGGAGATGCGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 7885532 5' + jockey 15 1 80.82 AACGGTTCGCCATGCACTTTAGAGCTGTGAATCGGTGAATATTTTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATCCACACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - 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412 475 2 58.90 AACCAACCGGTTTACCTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATA:1 - chr3R 7089525 5' - P-element 2783 1 14.38 GAGTGACCGGCAGCGGCTGCGGCTCATATGACAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCT:1 - chr3R 31141061 5' + Burdock 6176 2 53.44 CCAGAAAAATTATGAAAATTCCCATTTTCCCTTCCACTAGCTGAATAACGGGTATCTGATAGTCCGGTAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCGTAGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:2 + chr3R 24579962 5' + pogo 30 1 65.07 TACACGTCCGTTCGTTAGCAATGATGAATAAATAGTGAGTTGAATGCTGAAAAATGTCTTTGTCTTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATG:1 - chr3R 443321 5' + flea 44 2 53.24 TACTTAGCACAAAAAAAAAGAACAAATCTTCATGTGAAGCCCTCAGATAGGAATAGTTTATTGTAGGGCGCCTCATCGTAAACTATCTTGTAGATTCATGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAG:1 + chrX 8506130 5' - F-element 4234 1 67.12 CTACATTTTGTTATTGTTAAATATGCTACGGTTTGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 - chr3L 2216599 5' + jockey 95 1 75.34 GCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGTAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTATAGTAGGCA:1 - chr2L 14969164 5' - 412 7462 2 71.72 GGTAACGATCACAGCATATATAAGCCACAACCACATAATAGAATTTTATTTATATGCCACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTT:1 - chrX 4032233 5' - transib2 2764 1 60.27 GGTTTTATTTTTTCAGTCGCTGCTGTTATTTCGATCTTGTGCGATTCTCGGGAATCGAAACTGAAGCGAAATGCTCTAAATGAAAGGCCCTTGGACTCAAGGAGCTCCGTTAAACTAAGAAAGGAAGGAAAAACATTTAAGGACAT:1 - chr3L 20669623 5' + HB 412 1 74.66 GAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 + chrX 1103610 5' + pogo 59 1 60.27 AGATTAACATAGCGCAAGTGTAAGTGCTTAATAAACACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 + chr2L 4637217 5' - mdg1 7374 2 74.66 CAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTGAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCGTCTGATA:1 - chr3L 20224223 5' + Chimpo 69 1 67.38 CACATATTATAGATACGATGCTAGGGACACATGTCCTAAAAACGCAATATGCAAAACTTTTTGGGTCGCATTATGGGCGTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 - chr2R 14135381 5' + copia 4913 2 54.11 GAAGAAGATCTAGCATATTCTGGAGGCTTGCTTCAGAAGATTGCCACGCCCATTTAAACGCTCCCAATTTTCCCCTAGATTGTTTAGCAAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTG:1 + chr2L 22192797 5' + G2 2641 1 60.96 GCCACGAATCGCGTGGCACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGGTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATGAGACCATTGGGAACAATCAC:1 - chr2R 10910329 5' + Tabor 6878 2 54.17 GCGGCTCTCTCTTTGACTCTCTCTGCCTCTATAGCTCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr2R 8666097 5' + P-element 64 1 32.54 CCCAGTCCGGATCCCACAGCCTAAGCCGAACGCTAGCCCGAAACCGAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3L 19581013 5' + roo 30 2 65.03 ATTGGACTTAGTTATATGACCGTGCCGGTCCGATACCATATAAAACCATATATACATATATTATATATTAAATCAGAGGGATTGCCATGTCGGTCTGACCATGGCGATACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGATCTTATTTTA:1 - chr3L 7939186 5' - R1A1-element 5322 1 71.92 TGATTCGATTGTGTGAGAAGTCAGTGGAAAATCCATTTAGCAGCGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGT:1 - chr2L 13330869 5' + micropia 319 2 67.14 ATCTGAAAACACCATCAATAGTCGATTTCAATTTCGTTACTGATGGATTTTTGGTCGACAGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1 - chr2R 4536690 5' - mdg1 356 2 59.59 CAATTGATAACGGGTCGCCAAATGGTAAATAGTACAAACAATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTG:1 - chr2R 18689225 5' + Burdock 69 2 69.63 ACCAATAATAATAGATAGCCGAAACGTTAATCAAATATGTTGTAGTAGTTGTTAACAGAATCCCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGCCAAATTTACAA:1 - chr2L 17548200 5' - 1360 203 1 58.90 TGTTAAATTTAGCACGTGCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAACAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGGGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGAT:1 - chr2R 5754558 5' - P-element 2784 1 19.18 AGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCT:2 - chrX 388313 5' - 1360 3308 1 72.60 AGACTTTAAGCGCTTTTATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCC:1 - chr3R 21395247 5' + G2 446 1 57.14 AAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTTACGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr2L 17295853 5' + Doc 57 1 58.20 ATAGAAATACTGTTTACACTAAGCAATGGGCACTTAAACAGACTTTAAGCGCTTTTATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCAT:1 - chr3R 21395286 5' + G2 420 1 78.77 GTTTGTGCTTGCAAGCCGCAAAAGAAAACCAATTAAAATGGCAGAGAAACAGAAGTCAGAAATTAGACGAAAACTATATGGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATACATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 - chr2R 21859135 5' - copia 215 2 50.00 ATTTCGACTCTGTAACAAATAAGCCAGCATCGATTTTAAACTGTTGACTGGCCGAACTTTGGCAGTTGGGAAAAGTTTTTTCATTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr2R 12202376 5' + Tirant 27 2 65.47 AATCAATAAATTTACATAATCATTGTGCAAAAGGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr2R 22463162 5' + roo 8751 2 78.77 GTCCGTTTGAGTGAGTGTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGGTGCGGTGGTGCAGAGGTAAGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGATTTTTTTTTT:1 + chr3R 13437155 5' + hopper 61 1 56.85 AATGATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAATTAGTATCATCCTACCGACTGCGC:2 - 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chr2L 18612314 5' - INE-1 220 1 58.22 AATTATGCGCAAAACATGCAAAACGCAGCTGGGTAAAAAAAAAAACTAAAATGGTCACTGGGACTACATACATGCCCAGGAGTCTCTTCCTCCTGATGGAAAGCGCCAT:1 - chr2L 18872748 5' - baggins 5257 1 57.80 AGTTTCTCAAGATCTAAAATGTAAATTTGTGTGGGGATCTCCAGATATCGTAGTCATTCAATTGGAACAGAAACCCTACGTAGGCTTAAATGAAATATGTACAAAGAATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAAT:1 + chr2L 9418443 5' - rover 335 2 72.60 GGCTAGTCAGCCACCCGTTGTGTCTAATTTGTTTTCCCGTGGGGTTTGCTTTTAAATATTTATTTTTATCTTATTCTATCAACGAATCTAGTATATCCGTTTATTTAACGGGTAACGGGGATAAAAAAAGAGAGAAAGCTATAGCC:1 + chr4 814249 5' - INE-1 580 1 58.22 TATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAA:1 + chr3R 9125682 5' + Doc 50 1 60.95 GTATGCCAACGGCGAGTTTACAACTAGGCCAACACCATTAGCTTGTCGTTGTTGGCCGCCTGCTAGCGATAACTGTGAATAATGATTGCACTGTGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAAT:1 - chr2R 15182301 5' - diver2 4589 2 64.44 AAATTTCCCAGCGAAGCGTATGAAAATGTCGTGAAGGGCGAAAGTGGAACCTATTTGGATTTCGAATATTTATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chr2R 11263970 5' + jockey 4703 1 56.59 AATAACTAAAATACCTAAAATAATCGCAGAAATATACGCCATACTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 25751931 5' - roo 9052 2 71.92 TCTTCATTATGGTCTATCTATCTACAAATGTACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTAAAACGTTGTAAAAAGATATATACAATCCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTCA:1 - chr2L 22750393 5' - Tc3 1629 1 74.66 ACCCGCTAAACACCGGGTGTCTAGGTGATCGGCACACACGACGCAGAGTCCCGAATTGATTCGGGTGCGCAAACACCCGGGAGCTTGCCTGCACATGCAGATTTTGACTGGGTGTTCGTAAGTACCCGC:1 - chrX 22765923 5' - hobo 85 1 78.29 GCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 + chr2L 14969108 5' + 412 82 2 73.97 CGTGCAACAAGAGGAATTAATGTGCGTGCGTGTCCCTGTCAAAGTGTTGGTAACTGAGTGGTTGCTTATGTGTGCGTGTGTTTCTGAGTGCGTGTGTTTGTGTGTGGTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr2R 23671728 5' + hobo 14 1 65.75 CATAAGTAAGATAAGTAAAGTCGCCATCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGA:1 + chr3R 7481495 5' - invader4 3031 2 50.34 GTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTT:1 + chr3R 14049325 5' + transib2 55 1 54.11 CCTACTTTACCGCACTAGTTGAGCGCAGCTGTTAGTTGAGGTTTTTTGAAAAGTTGATATTACGATTTTGTGCTGCATACTTTCGGGCTTTAAAGTTTCCGAATGACTTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAA:1 - chr3R 11568727 5' - BS 5082 1 73.29 GCCGGAGGCATTCTCGCTCTATCTGAAGGCATGTTTTTGCTGCCTATGCTGGGACATGGAAAACTTGGAGGGAACCCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACCGCGAAC:1 - chr3L 1435524 5' + 1360 118 1 58.59 AAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACT:2 - chr2L 21643140 5' + Tabor 50 2 52.05 TGGGAATTCAAAAGATAGCTATCATAATTAAATCGGCAAAGGACAGGGTTTAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGCATCCAGGC:1 + chr2L 11296160 5' + 1360 67 1 60.56 ACCATGTTCGACTTTGGCACCTCTCTAAAACATTTACTCGAACTTTTGCTATTCATCACATATAATTTTTCAATGTGCCGCAGTGGTACGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3L 12964848 5' - hobo 2907 1 62.33 ATAACGTAATAATAACATGATAATTTATTTCTTTGGTTAACATAAAAATGACACCTTTTAAGATCTCATATAAAAAATTAATAAACAATATACCCTTCCTTAGCGTCTATCACCTTTTGGACACGTTTTGGTACAGACTGTACC:1 + chr3L 16573050 5' - Tc1-2 1312 1 52.78 ATAAATACAAAAATTAAATCAACCAACAGAGCTATACAGTGGTCTTTAGATAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr2L 17626551 5' + roo 30 2 65.75 GAATTTATATGCATTTTCAAAAAGAGCCACGTTAGCGTTTTTTTCCCAACAATCTGGTCATTTTATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 - chr3R 26486128 5' - 412 439 2 54.79 AACCAACAAACTCCCGAAATGGATTGGGTCAAAATATTTGGTAGATGTTGTGACGACTTGAGATCAGCGATATTAACTTAGACTCTAGTTTCAGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGACGGTG:1 + chr3L 217403 5' - Doc 334 1 65.25 GAGTTTCCACACAGTTGAGTGTGCTGGGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - chr2L 15777916 5' + 297 41 2 57.53 GTTGCGCAATTTCAGTTGCAGTTGCAGCCAACGTTTCCTGCCCACCGCCACCTGTGTCCTTGTCCTTTCATCCTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTG:1 - chr3R 6495376 5' + Stalker4 52 4 51.37 ATAGACGCGTATGCCTGGGCTGTCGAACCGGGCTTAACATTTCCCACGGGAGCAAAGCCAAGTTACAAGCCGCAATTCAGAAATTCAGCACCATATTGGCCATATTAATTTTTTTAATACAAAATTAGATACTACTAACAATAATA:1 - chr3R 20151582 5' + Cr1a 4291 1 69.86 GCAGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:2 - chr2L 21910221 5' + Doc 79 1 72.60 GAATCTGGACCACGCCTCGTTGTGGGTTTTAGCTTTCTGTGCCGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAGATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGAT:1 - chr3R 17099979 5' - Tirant 322 2 69.86 ATACAAAGAGCCAGTCTTTTTTATCCTCTAACATTTTATCGCTTTTCTTGTTACATCGACTTTCAATTTTATCCACTGTAATCATTTTCAACGTGTCCAAATATTTACAAATAAAATGAAACATAAAGGTCAAGGTATGATTAATA:1 - chr2L 22320243 5' + transib3 280 1 49.32 AAGGGGCGTGGTCATGGCTCACAAAGGTATATTATATCTCACGTTGGCATTAATCATGTGACAATTGAGCCGATAGGCGAAATGAGATCGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTC:1 - chr2L 1432271 5' - Stalker 412 1 64.66 TAATTGGTATCTGAAATTTTAAAGTAATGTATTAAAAAGCCCAGTTTTTGTTATTATACAAAAATTTAAATATTTAGATGGCCAGAAATGGTGTTTAGAATTGGGTAAGCACTTCTGCTAATCGAGTAACGGGTATCTGATAGTCG:1 + chrX 17816552 5' + INE-1 550 1 76.71 TCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGGATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 19436076 5' - roo 356 2 61.90 GTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTA:1 - chr2L 5792058 5' + blood 91 2 78.08 AAAAAAAAACAATAGCACCCTCGGGACTGACATCAATAAGAAGCTCACACGCGTTCATCCGAGAATTGAAGTCACGTTCTGAAAGTTTCTCCACTATTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACA:1 + chr3R 3470089 5' + 17.6 7285 2 66.44 ATAAACTTGCTATTACATTTAACAAGCTAACAAGTACGCCAAAGTATTTCATATCTTATCAGTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTA:1 - chr3L 17922044 5' + copia 4928 2 58.22 CTCAGTAGTTCATCTTTTATAATGCCCACACACACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTG:1 + chrX 2295144 5' - Transpac 5147 2 73.97 CTTTATTTTCAATTCTAGAAAATTCAATTATTTTCAAATTATATTAGTGATACATCGTAGTTGCATTTTAGTCATGCAACAGCATATATGATAAAGAAACCTGATCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATT:1 - chrX 3676202 5' + roo 403 1 62.33 ATTTTAGATTTTAGATGTGTATTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATC:2 - chr2R 1000442 5' + HMS-Beagle2 6909 2 69.18 GTGAACAATGCAGTATTATTTAGTTTGCGCTGGCCATTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGCG:1 + chrX 18239121 5' + jockey 90 1 71.92 TATTCGATATCAAAGTAAATAACCACTACAAAATCGAAATATTTATCTTAGATTTCTTTTTAATGCTTTTGCAATTATGAAACTTTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTACTCGCGACGTCCTCGT:1 + chr2R 21432970 5' + accord 276 2 52.78 TGGGGGTGGGGGTGGAGCTGTGGCCCGCAGCACAAATCAATTGGATTAGAAAATTGTCAACGAAAACGTTGAAGGGAGGGTCCTTTTTCCCGAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGGTACAGAAATAAAGAATAG:1 + chrX 7794656 5' - McClintock 6167 2 67.81 GGATAAAATAAACAATATTACGAAAAATAATAAAATGAGAAGAAACTCTCACAACGTCGGCGTCACTAGAAGCTGCACTCCTAATCTATTGCTTTTATAGGGGATATCGACGTTCATGCGGACACACGG:1 + chr2L 20840124 5' - INE-1 127 1 75.97 GAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATATAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 + chr3R 26486038 5' + 412 7117 2 64.12 GAAAATTATATATCATACATTTGTGGACAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr2L 15081032 5' + Doc 32 1 64.38 GGCTTCTCGCCTTATCCGCTCCTCTTACTGTTCTTTCCGCGCGCGCTGCGAAAAACAGAGTGAATTGGAATTGAATTGAACGAATGAGCTCCGATAGCGATAGTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACAC:1 - chrX 5085769 5' + accord 7015 2 70.55 GCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 11164490 5' + roo 48 2 67.80 ATAAAAAAATTATACAATATTTTTAAAGCAATATCGATGATCATATAGTAATCTTAAAAGCAGCAATATTATAAAAAGTAATAGAATTTAAATCATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - chr3L 5630480 5' + I-element 32 1 62.76 ATTGCCTTAACCTATTAGTGTTTTTATTGTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTAACAT:1 + chrX 15965902 5' + Tc1 1475 2 53.70 TTTCGTTTAAACATACGTATCACCCAGCAGCCGCAAAAACCTGAATGGCAAAACATAAAATGTAACAAGAGAGAATGCTATAACCTTGTTCCCCAACTATCAGATAGCCGTTACTCAGCT:1 - chrX 22838772 5' - INE-1 545 1 62.50 GGGGCAAAAAGGGGGCGGGGCCGGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 + chr3L 3453562 5' + Tirant 8117 2 78.03 AATTTGCAGTGTATTTATGGTGGCCTTATGTTTGCATGTTCGTAATTTCATTATCCTTTTGTTTCTAGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGC:1 - chr2R 19534571 5' - I-element 5224 1 54.11 GATAGAAAAATTATATTGTATAAAGAGTAAATAGTCGACTTACGAAGTGCTGGGTTGGAGGGCCCATAGAAGACGCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTA:1 + chr3L 23072145 5' + 17.6 7102 2 54.68 ATATTCGCCCTAAAGAGATGATTGCCCTTTTTGTAAGCTTTCGATTACGGAAATAAACGATTTTTAAATGAAGTTATTTTTGTTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 + chr2L 5791962 5' - blood 7354 2 60.69 TCTAGGGAGATTAACATAGCGCAAGTGTAAGTGCTTAATAAACACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:2 + chr2L 4637210 5' - mdg1 343 2 69.86 GTTAAGAATGATTGGAAATGGGAAAAGGATATGAACTGTTATAAACTAGCTAAATAATAAGAAAACCACATTTATTTAGTTACACATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2L 6601403 5' - roo 396 1 38.21 CCAAGTTGGTGTGTTGGTGGTTGTGGAGCATTGATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr2L 3960153 5' + jockey 20 1 71.54 AGACACGCATCGAGAAAAATATGCCCACATCAAGCCAAAATTGCACAAACAAGCCAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACA:1 - chr2R 11146143 5' + Quasimodo 44 2 58.22 AAATGAAGCTGGTGTCGACCTATTGGTTTTATTGGCTGGGACTAAAATTTGAGATTATAAGATAAAATTTTAGTATCTGGGGAATTATTCTATACATTCTATACATACATAAAATAAAATAATATCTTAT:1 + chr3R 17835846 5' - transib1 1895 1 55.38 GTGAAAGTGTTAGGTGGAGTTAAAGGATCTGCAAAATGGAGGACAAAACTGGCACGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAG:1 + chrX 14981115 5' - hobo 2674 1 52.29 ATGATCAATGTTCCTGCGGTCACACTAAAACTGAATCACTATCAGCCACTCTTTATTTCAAAGCCGCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chr2R 5754496 5' + P-element 21 1 60.71 CTAAACTGTATTCGTTTAAAAAAATATATCGCTAAATAAGCATGCCCAAGAATTAAATCAAATTGTTTCATAATAATACTGCAATTATACTAGGTAGTTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAA:1 + chr3R 9583248 5' + Juan 4050 1 68.49 CTGTCTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGAGCCCCGTCAG:1 - chr3L 5069482 5' + opus 54 4 65.85 ATAAAGCAAAGAATGCGTTTGAGTTTCGCTGCGTAGTGGTTTATTTTCGATTGGCAACATTAATCAGCAAATGCAAATCAGCATTTTAATCTGTCAAAGTGTAAAAACCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2R 11163132 5' - roo 9046 1 71.92 AGTAGGTAATCCTGTTTACAATATTTTATTCCGCTATAATGCATATAAGTTAACACGAGCAAGTCTTCGGGTGCGCTTAGTCGGCGCCTCGTGCCGTCTG:1 + chr2R 2872832 5' - gypsy10 5837 2 39.00 ATTGATATGGAGCATGGCAAATAGTTAAACCAGAAATTCGTCATCCCCACTGCTATCAGCCTTAAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAAC:1 - chr3R 25705054 5' + flea 4798 2 53.96 CTTGAGGGGCTCTCTTTTTGTATGCCAGTTAAGTGTAATGATGAACTCCCATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGG:1 + chr3R 15920228 5' - 412 7455 2 76.71 ACTGGTTGCAACATTGACCACAACAAAAGGAGTCGAGAGACTTGCATTGTTAGTCCCTTCTATGTATATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAAC:1 - chr3L 14302296 5' + Quasimodo 40 2 58.90 TCTCATAAATTGAGTTTACTCTTTTCGACAGCTTTGTTTGCCTTGCTATCGCAGCACACCCCCATCTTCATCTAATTTTAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTACATACTGTATGCATAACATGTTT:1 + chr2R 15411173 5' - G4 3735 1 55.71 GAATGTATCAAATAGGATACATAGAATATTAAGGATACAATTGCACTTAAAATTTATAAAGTAATAAAAAGTATGTAACAGTCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAATTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCA:1 - chr2L 21691052 5' + INE-1 102 1 54.79 CTTGCCTTTTATTCGCTCTTCTATTATTTGCCGTACTAGGCTTTCGTTTTTGGCTTCTGTATGGCAAAAGTAGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3L 12874855 5' + jockey 56 1 54.11 GGAGTTTCATTAGGGCCGCGTGTTAGTAAGAGGCTCTTCTTTTTGATCGAAGCATACATTAATTGATTTGTTTCGTAACCGAAATTAGGTAATTCGAAAAAGCGAAGAAGCATTTTTTGCAAGAGGATTTGGATGTG:1 - chr3L 8366958 5' - Doc3-element 4523 1 80.29 CTTTACAGTAATTTGTGGCTGTGGGGCCGCAGCAGCTATTGCTGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCC:1 - chr2R 14913528 5' + X-element 4416 1 44.87 AAAAAAAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:3 - chr2L 21643145 5' + Tabor 6884 2 55.48 AAAAACATCGCACAGAATTAACTATTTATATTCAATAGTTTTTCAAATACATATGTATTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACA:1 + chrX 5773011 5' - jockey 4927 1 61.64 AGGGAGGGGAGTCCAAAAAATAATAATCGTAAAGAAAATCCAGGAACGACATGCTGATCTCTATCGGGCGAAAGTCAAAACAATTTAATGCATGAATAAAAAATAATCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATA:1 - chr3L 18434496 5' + accord 7095 2 73.29 AACAAAGAGCGCAGCATTGCTCGATTGGAAATCTTTTGCACTGGAGCAAGCCCTGCAACAATTCGCACGCAGATGTTACCAACACCATAACCACGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr2R 14760633 5' + 1360 23 1 36.17 CACTTGTTTGTGTAGTCCTCGGACGAAATCCGAACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 3231974 5' - roo 9019 2 52.74 CTTTAAGCCATGCCACGCTGTAAATTCTCTTATCCTCTGAATCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGG:1 + chr3R 5756346 5' - flea 35 2 67.69 AGCAACTTTGGCCAATAGCAAACCACTTAAATTCATTTTAATTCAAGTGAATAGCAAACCGACCTCTTTCCACATCCTTTGCCATATAGCCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr2R 21748208 5' + 1360 30 1 61.64 GAATACGAAATGCCAAACATTAGTAACCGGTTCGGCGTAATACGTCACAGATAGAAGATAACTAACTCTTAAATTTTTTGGTATTTTTAGATTCACCCAATTCCAACGTCTCGCAGATCAAAATTGTGACTGACTTCAGCTT:1 - chr2L 84346 5' - 3S18 5995 2 76.06 GGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chrX 1103705 5' - pogo 2076 1 54.55 GGGGGGATATCGGATCAATAATAGTTTCATGTGTTCGCTTTATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chr2R 9607116 5' - pogo 2036 1 70.37 ATGTATTGTATATAAACCTATATACATATATATATGATATATATGTAAATGTGTGTATTGGAATATTATTTGTACGATTATTTCGCATCAAGCAATCTTTGAGTTATCCTACCGACTGCGCCAGTTAAATAGTTTTTAATT:1 - chr3L 12429313 5' - McClintock 481 1 56.03 GTAGTAGATTCAAGTTAAGTAAGAAACAAGTTGGACTGTATTTGGCATGCGGATGCGATTCGCAAGGTCTGGGTGCCCTGGATTGTAGTTGCCGGCTACCTGGGAGCACCAGCCCCTCTCAGTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 14443927 5' - accord 186 2 74.29 CGTTTCTCTGTTCCAGCACTTTTGTTGCTTCAATTCATCGACTAATTGCTTGAGTTCGCTTCAATTAGACTGGCCGTTCTTCTAACAATTCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACG:1 + chr3L 11396924 5' + I-element 355 1 63.19 GTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTT:1 + chr3L 7791909 5' - Transpac 5190 2 60.00 AAATTCGAGTCTTGTGTGGACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3L 21013937 5' - roo 8997 2 69.86 GGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCC:1 + chr3R 24750959 5' + G6 66 1 59.59 CATGGCTTATTACTTTATTGGAGAATATACAAAGATTAACGATTTTTATAATCAAGCGCTAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2R 11256156 5' + roo 8724 2 60.96 ATTTATCAACTGCTACAGTTTTTAGCCAGCCCCCTCCTAATCCCCCACTGCCCAAGAAGCATTTTACTTGGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCCCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAA:1 + chr3R 21685510 5' - 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Gypsy6A_LTR 331 1 70.09 AAAGTTGGACTTTCATACTATCTGCACTGTTTCGCCATTTGAAGAGTAAACACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3L 1358530 5' + 412 7122 2 64.38 CACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTA:1 + chr2R 10910218 5' - Tabor 415 2 65.52 GAAATATTATCTCACCGACTGCACACTATTGGTATGACGATCATGGCTTATTACTTTATTGGAGAATATACAAAGATTAACGATTTTTATAATCAAGCGCTAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2R 11256115 5' + roo 8683 2 69.86 AAGCGGAAATGCAGTCGCTGCTGCCATTTCTCGATAACTGCCGCCATTGTTGTAAATTCCTGTGCGTGTATATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chrX 12273174 5' + jockey 4709 1 54.07 AACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTTACTTCGCGATTTTGTGCGCCAGCGCAGCAA:1 + chr2L 21325090 5' - invader4 3038 2 72.39 ACGAAACAAACACGTCATTGTAAATCAACGTAAGTACACAGACGAAGTGAAACCAGCTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTCCAATTCTATA:1 - 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INE-1 81 1 64.38 GTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGGGTGCGGGTGCTA:1 + chr3R 13225518 5' + hobo 48 1 73.20 GTTCGCCAGGGACAAAAAACTTTTTGCTCAGTTTCCAAATTGCCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTAACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATAGAT:1 - chr3L 22043109 5' - invader4 2669 1 67.59 AAATAGCAGCGTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCAATACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATCTCTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATTTTGGCCAG:1 - chrX 22906784 5' - Transib-N1_DM 27 1 67.81 GGATGATACACCTAACTTATAAAAATTTCTGCACATGATTCCGCTTTATTTCTTTATGACCGTGTGTGAGTTCTACTTGGAAATTCATATCTCTGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chrX 21403356 5' - roo 9044 1 65.07 AGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGAATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 + chr3L 18253796 5' + blood 61 2 62.22 GTGTATTAATTATGTTCACTAATCGTAGAAACATATGTGTGAAAAATGTATTGATACTCCTTCATTAACCTATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:2 + chr3L 18381933 5' - copia 205 2 53.42 TGTAATGTGATTTGGTTAATTGGAAAATATTTGGTCTTAACCATCATGATTAGGCGGCCATTGAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 - chr2L 5792143 5' + blood 7017 2 81.51 CCGCACAATTTGAATATATAAAGCCCGGCCTTTAAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGC:1 + chr3R 7778225 5' - transib2 2795 1 64.03 GTGTCGTTCGCTCGCTGGCTGGCTCCACGTACATAAATGGCGACAAAAGTCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr2R 6798232 5' + jockey 80 1 67.12 GTCTGCTTAAAAATAAATCTATGTAAATGCATTTAACGTGGTCGGAATGGGCGGATTAATTGAGTTGCCACTCGGTGGCAGTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTT:1 - chrX 21236647 5' + Cr1a 4051 1 75.45 CTTCCCAGTGACATGCAGAAGCTAACTGCCTTGGATCTGATCGGAAAAGTGAATAACTTTTGGATACAAGATGCCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGAC:1 - chr3R 25221152 5' + Doc 415 1 59.85 AATCACATTTATTTTTGACACACTTAACCATTCGAGCATTAAAAGTTTGAAAGCCATGCTCTGCATAAATGTGTGCATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAAC:1 - chr3R 25714142 5' + flea 41 2 59.59 GAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:2 - chr3R 7616832 5' + Stalker2 53 2 57.53 GAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 - chr2R 17332198 5' + jockey 95 1 76.03 GGAATGTAAACAGAGTTTTTAAAAATAAATGCATGTTTAAGGCAGAGCCACACAACAAATGACAGCGATGAGCCGTAATAAGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACAT:1 + chr3R 15283270 5' + Stalker 7077 4 54.48 GGGATCTTATGAAATGCTGGTAAAGCGTTTCGAGGGAGAAGGCGCGCGAGTTCCCACCCCACCCCCCAAAGCCCCACGCCTCT:1 + chr2R 9294325 5' + Tirant 8123 2 55.42 GTTTTCATTTGATTTACGATCAAATGTCAGTCGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTCTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTTAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAATGTA:1 - chr2L 18522308 5' - roo 318 2 71.92 AAAGGCAGCCCCGATTATGATAAGTAAATGGTTAATGCCGTGGGTATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCAAAAAACCGTGTTGACACGGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTGCAAATGAAG:1 + chr3L 23907404 5' - Q-element 166 1 52.05 AGGAAATATTCAATAGGACAGAGGATATTTTGGTTTTTATAGCTTTCATTTTAATATTTTTGGTAATGTATTAAAATGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTC:1 - chr2L 9879228 5' - jockey 430 1 52.74 CGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACA:1 - chr3R 15790113 5' + flea 4742 1 62.33 GCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACAAATTCAACAACACCAACCCTCTTCCTGGGGGAATGCTGCATCTTTC:1 + chr3L 23909060 5' - aurora-element 465 1 79.13 ACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr2L 19407030 5' + Doc 21 1 48.67 CCATTTTCAGTTGCGGCTTCCACCTGTAAAGAAAAGTTCCCTTTTTCCACCTCGTTGTAGTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 - chr3R 15294782 5' - roo 8980 2 58.96 GCAGCGGATATAGTCATGTCAGCTGCCTATAAATAACCCCAGCCTGACATCAAATAATCATGAAGGTGTCAGCTTTGACTACATTTAGAAACTGTAATTGTTTTAAAAAATGTGACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTT:1 + chr3R 14911913 5' - Stalker4 7338 2 64.79 GTTAGAGTGGGCGTGGAAACATGGGGTTTGTCTCTATAATCTGTATGCTTAATCTCAACATTCTAGCATTTTAGTTCCTGAGATCTTGACGTTCTTACGGACAGACGGACATGGGTAGATCGACTAGGCTATTGGTCCTGATCAAG:3 - chr4 71479 5' - INE-1 89 1 69.18 TATCCGTAAGCACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTTGGTTTAAATA:1 + chr3L 19031227 5' - roo 9010 2 55.86 GGAGAAAGTTGTTATGTATGTTCGATAAATTGTTTGCTAGTGCATTGATGTGTAAAGAAATCATAGGATATTTAAGCATTTATTACATTAGTTTAAATATTTGTTGTTTTATAATATTGCTACATGTTGGCCAAACGTTTTTTGTT:1 + chr3R 21898512 5' - FB 344 1 56.85 ACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 - chr2R 10910312 5' + Tabor 7 2 66.32 ATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chrX 7756423 5' - roo 318 2 79.45 TCCTGCTAAAGTTGAGTTCTCCATTTGCGGGTCCTATATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGATGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chr3R 9300763 5' + 297 6642 2 73.72 AATGATTTCTAGGACAGCCACATTTGTGTTTAAAAAATTATTCATAACGCCATTTCGAAATCGACAATGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAATACAGCTGAGTTTATATG:1 - chr2R 6115075 5' - pogo 1847 1 54.11 CGGTTCACGAAACACATAGAACTATAATTAGAAACCAACAAACAAGTTTAGGCAAAGCAAATAGTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGAC:1 + chr3L 19778477 5' + I-element 4926 1 58.47 ATGCTGATTGCCCCGTTAATTACTATTTTACGAACAGCAGCAAGGCCGCATCATTTCCAGAATTTTTACTGACACGATAATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGC:1 - chrX 22945416 5' + BS 11 1 78.77 GCAAGCTCTGGAATTCGTTTACTCGAACTCTGAAAACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCAATTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAA:1 + chrX 23183433 5' + Idefix 7159 2 74.66 GTCGCGTAAAAAAGTTGTGAGTAAACAATTGGGGCCGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGG:1 - chrX 7706814 5' + P-element 74 1 29.63 GTTTACGAAAGCTAATTGATGGCAATTCCTAAATTTATACTTTGTAGATAAGCCAACTTTGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 - chr2L 22319412 5' - Transpac 294 2 74.66 ATGCTATCAGCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr2L 4929792 5' + blood 55 2 56.16 AGAAAAACGAGACCAAATGCCGCACATTAAAAGCGATTTAAAAATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCT:1 + chr3R 7616688 5' - Stalker2 7625 2 67.81 CTGGAGATAATATACATATGCCCTGTGTGTGCAAGTGTGCGCCGAGTCCTGGATCGTGCGCTTGTATAAGTGGGTGGCAGACAGGAGGCTTGCATCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCC:1 + chrX 883467 5' + Rt1b 4982 1 75.20 AACGTTTTCTGAAGTTTTATAAGGTCGGATGGAAGACTTATCGGGATCCACTGATACCATAAAATAGAGATGCCAGCGCTGTTGCCAGCTGGATCGAAAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCA:1 + chr3L 6325622 5' + P-element 2778 1 41.04 AAAAAGGCTAAGCTAGAAACTGGATTTAGTTACCATTTTAAACTAATTTACCACAAACACGATATTATCCTTCATGGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGATGA:1 - chr2L 19140492 5' + Max-element 9 2 78.08 TGGCTGACACACACACACAGTTATCTGCTTAGAAATGCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACTGTAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 + chr2R 7982381 5' + P-element 62 1 34.40 AGTGAGTTAGGTCCCATTAAGCTATCCATGGGTGGGTCTAAGCTTTTCGAGCAAAATACTAAAATTCCAGAATCTGTCCTTGTACATTCAGAAAATGAGCCCACTAAAAACAACAAACCGTACAAAACTGCCACGCCCACACTTTT:1 + chr2L 21366159 5' + INE-1 246 1 73.97 CGGTGCACCCCTAGTTGATAACAGAGCTGATCACTTTTTAGCCCAAGATTATAAATCAGACTTTATAAATTTCATAAAAATATGATAACTAAAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCG:1 + chrX 7778765 5' - 1360 477 1 54.61 AGTTGGTGTGTTGGTGGTTGTGGAGCATTGATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr2L 3960156 5' + jockey 27 1 66.93 GGTGGGTGGTGGACGGGTGTTGGTTGAAGGGGTTCTGCACCAGAAAAGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGAC:1 + chr2R 16490683 5' + Rt1b 5081 1 60.50 AGAGTCCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACG:1 + chr3R 24750946 5' + G6 12 1 73.33 ATATAATACTATGTATTGGCCTTTAATAATAAGAGTATATTCTTTTAGGCGATGGAAAAGATTCTTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTCCCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGA:1 - chr4 855867 5' + Cr1a 4108 1 56.16 GAATATAAAAAGTATTCAATAATTCATAAGCTTAACAGATTATGGACTAAGCTTTTCAATACATTTTTTTGTATAGTTAAAAAGTATCTCTCTAATTTAAAAATGTATCTTTCAAGTTTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr3L 10302750 5' - pogo 2091 1 65.07 CCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGGGC:1 + chr3R 24750964 5' + G6 15 1 65.56 ACCATATTAAGCGCGGGGTCGGCTGACTGGCCATATGCCAACGTCTGTTTGGGCCACTCCCCTTACAAACATATAGTGGGCCAATTAAATCGAGGATTGGGGTGTGTAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 - chr3L 2704896 5' - blood 365 2 75.34 AACTAGAAATGTAGCTTTGCACTTTTGTATAAAAATCTATGATAAATAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 - chr3R 11151953 5' + mdg3 15 2 73.97 ATTGGTAGATCGAGCGATGAGTCCAAGCGACCCATCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr2R 21820700 5' + Doc 50 1 51.05 ACCTATTCTATTCTATTCAAGCGACCCATTTTAACAAACTGTTACTCATCTGCATCACAAAGTTTTGTTAAGAATCATAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 3238351 5' + roo 8707 2 46.58 CAGACGACAGAAGAGTATAAATAGCAGGTAAGGAGGATTTAAGAGCCACCGCGATTAAACCCATTTGATTTTGCGCCAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGCTATCTGCATTATT:1 + chr3R 11870047 5' + pogo 39 1 57.53 AGAAATAAATGACCAGAAAAAACCATATTAAATGGCAATTTACATTTAAGCAGCACAGAAATGTGAAAATGCATTTGTTCCAAACATCTCAAATGGCAGTGGAAAAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 17258224 5' + 412 7069 2 69.18 AGAGCTACCAATATTTTCAGCATTAAGTCACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACACTTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAG:1 - chr3L 21665292 5' + 1360 55 1 71.56 ATTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAGACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTACTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3L 16015366 5' - 1360 3368 1 63.70 CCGCGACCCGGTTTTCAGACCACCCTTCATTTAATGTGGCCATCAAGTCGTAATTACGCTCGTTGTTGAAACGATGAAGACATCAAATTGCATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chrX 6633079 5' - P-element 2864 1 69.86 TAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAA:1 - chr3R 25804200 5' - mdg1 7391 2 65.47 GGTCAAAATAATAGGAGCAAAAATATATTCAGTATGATTTTGCTGGGCTACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACT:1 - chr3R 17492893 5' + jockey 4828 1 63.01 AAACAGAACCAGATAGATCCGCCAGTGAGCAAGTCAGTGAGGCGTGCGCCCGGAAAAATAATGTCTAATCAGCATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGTAAA:1 + chr3L 22230706 5' - rover 7048 2 57.53 GCTTGCGTATACTATTACCAAAAAACAATTACTATCTACTAAACTGGGTGGTAAGTTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCC:1 + chr3L 11795454 5' + 1360 68 1 65.07 CTTTCCTCCAGGTTCCTCTGATCACTGCGGTGACAGCTTTAAATGAAAATAGACGCGATATAGAAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGTTTATAAAGTAAAATAACTCTAATAATTATTAGTGTTAGTAGGATTTAATTATGTACT:1 + chr2R 1982689 5' - Cr1a 4282 1 67.12 CCAACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr2L 19407027 5' + Doc 51 1 54.11 ACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3L 23146456 5' + 1360 46 1 54.11 TAGATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTA:1 - chr3L 9470015 5' + 412 7126 2 66.44 GTACCGTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 - chr2R 2427630 5' + Doc 52 1 54.11 CATTACCATTATGCATTTGTTTATTCCTCTTCGTTTTCTTCGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATT:2 - chr2L 13629148 5' - Tirant 321 2 72.41 ACACGAGAAGGACGCCGGCTGTCTGTGTTTGTCGAGGCTCGAAAATATTTTAATAATAAAATACAATATACACTGCTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAAAAAGATTGGTATATGATCCTTGAAAATGGAAAAAACCC:1 + chr3R 8430738 5' + Idefix 6954 2 58.22 GCAGGAGAGAAACGGGGATGTGCTGCGTCATTAGGAATGCCTCGGGCACCTGCTAAACACGCTAACTGCTTTGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3L 8658832 5' + roo 8689 2 63.71 AGAGTTCGGGGAACGTTTGGGCAATGGAACGCCACACAAAAATTCCGCAACGAAACGAGGAAATTTTCTTCAAGACCCTAATTGTTAAAAAAATAAACGGGAGAATATTTTAAAAAAGAGGGGAGGTGTA:1 - chr2L 9176851 5' + blood 6994 1 79.23 GAAAAACAATTGGCAGTGAAATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATGCATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 + chr2R 11095716 5' + diver 30 2 60.14 TATCTTCTACGAATAAAAATGCACTCCATTTTTGCAAAAATTAATATTTTTGGTCCACCTATTCCGTGGTATTCACATCTTTGCGGTTTCAATTTCATAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 - chr2L 21559268 5' + FB 26 1 67.81 GCAAGGGTTTCTCGTAACAATAATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:2 - chr3L 14375708 5' + roo 71 2 69.86 CAGAAAACACAAAGAACAGAAAAACGAAATTAGTTGAGCTTAGCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAA:1 - chr3R 7778336 5' + transib2 68 1 67.39 TTCAAGTGCATATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAA:1 - chr3R 10030774 5' + BS 5082 1 65.75 AGTTGCAGCCAACGTTTCCTGCCCACCGCCACCTGTGTCCTTGTCCTTTCATCCTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCAT:1 - chr3R 6495357 5' + Stalker 64 4 62.59 AAATATTTTGAAAATAAATAAAATATTTGCATTTAATAAAACGACTTCAACAACCTCATTCAAGTGTACCAAAAAGTGTAAGACAAATAGTTCCTTATTTTAACCTGGATGCTAAAAAATCTTTATTAAATATTAATTAATATTAA:1 + chrX 12386625 5' + Tc3 268 1 68.49 GGAAACTGAACTTCATAAAGTTGGTTAGCTGAAGAATGAGGCCATTATGTAAGGGATGACCTTTCCATTCTGTGGAACTTACATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:2 + chr2L 21691787 5' + 297 6610 2 65.07 GAATTTAATAAAGATAGTTTCAAAAAAAGCCAGTTCACTTTTTTTGCAGTAACTGACACAGCTGCTGCTCTCACATAAATGAATATTGAGTACACACACACACATGTGCACGGCAAACAAAAATTAATACCTCCTAAACTAT:1 + chr3R 22341075 5' + hopper 34 1 77.46 GGATAACTTTATAACTCGGGCTAACTTATTTTTTGCCACTCGAACGCTTTGCTTTGGCTTCGAGCACCTGGCCAAAAAAAATCCTAAACCCACTTGAGTTTTCAACTTTACATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 - chr2L 17839525 5' - blood 366 2 77.40 ACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr2L 17626609 5' + roo 88 2 82.19 GTGTGAAGATAAGCCAATTCAAATGCCCTTAATTTTGGTTTTATTACTTTTCTCCCCCGCATTCTGGCAAGCTGAGTAACGGGTATCTG:1 + chr3R 20343302 5' + INE-1 543 1 92.13 CATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr3R 9125620 5' + Doc 14 1 78.63 TAAAGTAGTTTTAAAATACATTTCTCTCTCTGTTGAAGGACCGCCAGGAGCAACAGTCGGTCGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr3L 2704744 5' + blood 7055 2 52.67 CTCTACGCACTCACTTTACATTTGACATTTTTAAGTTATACTTTTTTTTACCTTACATGCTACTAGAAAGTATGCAGTGGAATTTTAACACCTCATTGCTCAGCCAAAAATAAGCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 + chr2L 13842220 5' + jockey 4678 1 75.34 CGTTAAAATTTTTATAAAAAGATATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTA:1 + chr2L 7822252 5' + Juan 78 1 68.97 GAAATAAAAAGTTTAAAATTGAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chrX 388196 5' + 1360 23 1 70.55 CTCGACTAAAATAAATTTCTGTGTTTCTTGATTGTTCAACGTTGTTTGCCTTGTGGCAAACACATAGTTAGATTAAATAATAAATTATGTTTAAAGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTG:1 - chr4 237685 5' - baggins 5321 1 71.23 AGTTGGCCGGCAAGTAGGCAGCGGATTGAGGAGCTTGCCGGCTCGGGATCTGGACGGTCCCAGTTATCGGAACCGGAATAGGAATCGGAGCGGAGCGGATCCCTTGCCTTGTTTTTTATTTACTTTTTTT:1 - chr2R 8054334 5' - gypsy7 5009 1 76.15 GCGCCCGAATTTTTCGTGCTTTTCCCTTGTTTTCCCTGTGGGCCAGCGTTTCGCTGCTGCTCGGACTCGGTTTGGGCCAACACATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCC:1 - chrX 19887175 5' - P-element 2881 2 76.15 AAAGTAAAGAACAATAGAAAACACTCGATAAATGGGAACAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:2 - chr3R 8849912 5' + 297 9 2 80.14 CTCAAATGGAGATGAGCACCTGCCTCCCTCCTCATCTTGGGGTCACATCAATTTGAATGTTTCGCCTTGTGTTCACACATGAACACGGATATATT:1 - chr2L 1807067 5' + roo 8669 2 69.47 GGAGCAAATTGTGAAGTGGAGAAAGAATTCCCAAATTTGTATTTCTATTATTTGTTCGTACACAACAGATATGTTGAACTTACCAATGCTTTGGAACACATGACGCAATGTTTCTTCGTCTCCTTTTTGTTATGGCGGCAGCTTGT:1 - chr2R 18063001 5' - HeT-A 238 1 72.60 GTAGACATAATTTCAAAGTCCCAAAGGACTTAAAAAAAAAACTAATACATTTACTCAAATTTGGTATATAGAATAAGTTAACATATTTTTATTATCTAACTAGCCAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATT:1 - chr3R 6816829 5' + Juan 409 1 70.55 CAACCACAAAGACCCTTTCGCAGATCGATAAAATTATTGAGGAAACCTATGCCACAACTCGCAGTATGTTGACTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACACTGGTTTGGCA:1 - chr2L 11143206 5' - 1360 3360 1 58.06 CAAAAAATAATCTTCGCCCATCGAATCAATTCCATAAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 - chr2L 8574486 5' + Transpac 34 2 60.96 CCTGGTTTCACCTGCTCTGCTTTTGGGCAATTGCTGTCCCTGTTTCTCCACATGTGTCACACGCCTTGGGGGAAAAGAGATGGCGACGAAAAATAATAATAAAAAAAAAAACCAA:1 - chrX 4445046 5' + Rt1a 5074 1 73.91 TTACTCAAAATATTGCTCCATTTACCACATAAGGTACTAAGTACTAGGGGTTCAATTCTCCATATTGATGAATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTATT:1 - chr2L 2895667 5' - Burdock 224 2 57.81 ACGATCCCTTAAATGATAGTCTTTGGGGTTGAGCAATTGAGTGTGTCCTTCGTTTGGTTTATTTACGGGGTGTGGGGATTTATTTGATGGTTGGGTAATAAAATAAATATTGTTTAATTATATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAAT:1 - chr3L 14965850 5' - S-element 84 2 66.44 GCGCTAGCTGTATATATATATGTAACAACAATATAAATGTGGTTGTTGTTTGTATTTGAGTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTAT:1 - chr2R 497227 5' - Bica 408 1 58.90 CGGGCAATTCATTTTTAACGGTTCGCCATGCACTTTAGAGCTGTGAATCGGTGAATATTTTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATCCACACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTT:1 - chr3L 19031356 5' + roo 8696 2 62.33 TGAACGAAAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTG:1 - chr3R 7616833 5' + Stalker2 52 2 56.85 AAATGCTGGAAATAATTGCGGCCCGTAAATAAGTTGGCAGTGAATGGGAAAATAAAAATAGGCGCCTACGGCAGGGGGAAATCAGGGTACGCTTTATATGTATCTATATACATTTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTTCATAT:1 + chrX 18220522 5' - Burdock 248 2 70.55 GTTATTTTGTTGTCATTTAGCTATTTTTCTAAAATATTTTCAATATTTAATGGCAGTTATGGCCTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr2L 7771911 5' + jockey 64 1 54.79 CTTAGCTGCTCACGAAGCTTATCTGTATAGATAAATCTGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACA:1 - chr3R 2689475 5' - diver2 4476 1 76.55 CGCTACTTCGTGTGCTGTCGGCGGGCATCGTCGCAACTTCGGTCCCACGACACGAACGGTTTCGTCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGCGTG:1 - chr2L 17260821 5' - P-element 2833 1 48.63 GTCCGTTTGAGTGAGTGTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGGTGCGGTGGTGCAGAGGTAAGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGTGATATTTGGATGAATTTTTTTTT:1 + chr3R 13437155 5' + hopper 61 1 58.22 AAATAAATCAAATAATTCAATTTTAAGCTAAACTTATTTTCGTATTAAAAATGAAAATCAAATAGAAGATAAAAAAGGATCAAGCTGTGCTACGAAATGCTCTTATGTGTCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAA:1 + chr2L 16965744 5' - I-element 497 1 73.97 CATTTCTTATTTCAGCCTTTGTCGCAAAATTATTACTCGTAGAGACCCTATACTGTAGATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAT:1 + chr3R 20872098 5' - 297 337 2 64.38 TGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 + chr2L 9275010 5' + F-element 72 1 68.80 CATTTTTATGGCGGAACCTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chrX 3646990 5' + 412 7103 2 61.29 ATATGAAATAATTCCTGGGATATTTCTTTCTGTGTACCATATCCTTGGACAAACACTTCGACTCTAATGAGGCAACTTAAAGTGTGCTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3L 13364419 5' + hobo 34 1 63.01 GAGCGTCAAATGGCAGACGCGGCGGCTACTTGACAAACCCCAACTCACAGGACTCGTCCTGGCGAACTGTGAGTGTGTGGTGTGCTGTCTGCAGTGGGATGTGTTTAGGGTTAAATTATATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAA:1 - chr2L 1251254 5' - hobo 480 1 79.17 ACACATTCGACACTAAAAAAAAAGGTCTTATTTGTAGATTTCAAGACTTTTCTTGCCAAGGTAAGGTGCTTGGCACTCGAACCCAAGCTCAAGCTTGAATGTGAAAAGAACAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGA:1 + chr3R 32020610 5' - INE-1 252 1 69.78 GTGGGTAGGGGGTATATGAAGCAATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr3L 7791855 5' - Transpac 5213 2 69.85 TCATAAAATTGTACCTAAAATTCCAATAATGCTATATTCAATATTTCATATTCAACAACAATTTACAACTAATAAGTTAAGTTAATTAAATTAACAACTTAGGGGTATCTGATAGAAAAAAAGCTTATTTTAAAGGGTGGGCAAAC:1 - chr2R 4821510 5' - FB 715 6 67.81 CAATTTATTTATTTATTTTATGATATTAACTATTTACTTCATTAGTTATTATTATTATTATTATCATTGTACGGAGCTCGATGATAACACATCTGTTCACTTGAAATGCCACAGAGAAAAATTCTAATGACAAATATTCTTATATA:1 - chr3R 26843969 5' - 1360 394 1 44.52 ATATATCATGTTTGCATTTAAATACGTTTATATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 + chr3L 12433445 5' - roo 8983 2 80.14 GTTGGTGGGGTTTATGCCGAGGGATTTCAAGAACAAGTTCAAGAATTTATGTTATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 - chr3L 12223244 5' - Transpac 290 2 64.35 TTTAGAGTCTGATGGCGAAACCATGGCATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 + chr2L 12291822 5' - Tirant 8461 2 54.79 CCCACTTAGTTTTATTAGACACACCGAGGCTTTTGGAGCCACAAAATTGCCCAGCAATTTCCTTTATTATCCTGTAGACCCCACCATGCTCAAGAGTGTGTGTGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3L 13679026 5' - hobo 2921 1 73.29 AAGCTTTTAAAGTTGATCAATATATTGTTACCGTTAAAATTTTTATAAAAAGATATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACA:1 + chr2L 7822221 5' + Juan 40 1 44.93 GTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTT:1 + chr2L 15081093 5' + Doc 72 1 80.00 GCTCACCTGGGGAAAGGTCTTCTCCATGTCCCAGCACCAGTTTTGATTGACATACCGGACGAAGAGGGCGCGCAGAAAGCGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGAGGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTT:1 - chr3L 9611293 5' - opus 5 2 60.31 GGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTT:1 - chr2R 5173228 5' - Stalker 7205 4 53.42 GGTGCCGATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGACTACATACATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr3R 18635221 5' - opus 480 2 52.87 ATAGTAAAAGGGAGCACATCTCCAAATATTATTAGTTCGAATATAATCAAGAAGGGAATTTTAATTACGTCATTACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTG:1 - chr3R 15582351 5' - hobo 278 1 51.37 ACTCACCCACACACATGCTATGCAATATATGTGTGCGCCACTTGTCTAGCAGACGAAAAGTTGAAAAGTCTCTGAAGAAATGGCCCCACCACACAAGTCATTTGGAATGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCCAGGCAAACACGTG:1 + chr3R 26826375 5' + blood 7356 2 70.55 CAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 - chr3R 15790062 5' + flea 4770 2 76.42 CGGGCCAAAAAGTGCTCCATAGAAAACATATTGTGGAATTTGTCAACATTCCTGGGGCGAAAGCGTCCCTCTGCTCCACAGGCGGACGAATATTTCAGTGAGCGTCTTTATTCTAAAACTGTCAGCTTAAGACTGTCTGTACAGAG:1 - chrX 871504 5' - rover 7171 2 57.53 AGTGTACCCACAGACAAAACAGTTTTGCGGTGGATACGTGTGCTGAAGCTAAGAAATGGGGAGGGGGAAGGAATGTAACAGGATGCTACGCATTAAATGCTTTAGTCAAGTTCCCCGCCTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTG:1 - chr3L 21863223 5' - INE-1 541 1 73.29 GGGTAAGTTCAAGGACGTAAAATGCGGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:2 + chr2R 15075567 5' - mdg1 7404 2 54.11 ACTTGAGGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGATTAGAAA:1 - chr2R 1373197 5' + pogo 65 1 60.27 ATTTAATTTTTACACTGTCTATCATTTCCGATAAAGAAAATTGAATGGTTGTAAGTAATATTAATTCTAAGGAGCTAGTTTGGATATACATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCACT:1 + chr2L 21976671 5' - Idefix 7359 2 64.38 TAGGTACTTTCATTAATGGGCAACCTACAATGAATGTTGAAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGATAAGAATATCAGAGGCCTCGCC:1 - chr2L 13332737 5' - micropia 5432 2 77.12 AAGTGTTAGATAGAAAAAACTTATGTAAGCTTAAGAAATATAAAATAAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGC:1 - chr2R 5023340 5' + rover 7019 2 66.44 ACATCACTTCCACAGGTGACACATTCGGCAAGCGATAGAAAAATGGAAGTATATTTTTAAATGCCGCATAATGACATCACTCAACTCCTACAAGCCAAACAAGACATATTCAACATCACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACC:1 + chr2L 7703254 5' + I-element 5107 1 64.38 AGACCATACATTTTCTTTCGTTAAAAGCCTTAACTAGCAATTGCATTAAATGTATTTACATTTTTACCTTCTTGCAGTGTAAAATGCAATTTAAAGCTTAAAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATC:1 - chr2L 13095531 5' + R1A1-element 5008 1 76.87 TATCCTAACAATGTTTTGGCTAAGATCGAAAAAATCAATTCACTAAGAAGACTTTATCAATTTAACAATATCATAGCTTTGATCTCATTAAAAAAAATGAAGAAGAATTTATTTTGATTATTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCG:1 - chr3R 18372354 5' - Doc 52 1 61.64 GAGCTGCGCTGAGCGTTATCTGCATAACTCATACGCACTGTGGCCGCCTAGTTTATTCGAGTGGGCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGC:1 - chr3R 17261268 5' - 412 7153 2 57.69 TGAAGATTGACTAATTCTCTATCTACAACAAACAGTCCTAATGTACTTCTCGGTCTTAGTCCCGTATACTAGAATCGTTTTCGACTATGTAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCATTAGCCGAGTCGATCTGGCCA:1 - chr2L 21268623 5' + INE-1 102 1 53.96 GGGGGGACTTAACCGTAATAGGAGGCAGGCGGAGCGGAGGAGCTCGGCTTGATAAACTATAAGCCACAAATTTGCATGAAGCCGCCGCCTTCGACTACAAATTTCTTTTCGCTCCGACAGGGCAACGCATACAATTCCA:1 + chr2L 16089953 5' + ZAM 8138 2 71.22 ACAGACACAGCCGCAGAATATATGTATAAATGGGCAAACCGGCGACACATATAAGTAAGTGTGATAGGAATCGTATCTCTCACCTCATTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTT:1 - chr3R 8821912 5' + Transpac 213 2 59.59 GTGGGTGTTGTTTTGTTGGCTTTGCTTCGCCTATTGCTTGTTTTTACTAGGACCTTAGTTTCGTGGATGCTGCCCTTTTTTGGGGGTATTATGTGGAAGTTGTCTTTGCCAACAAGTTAAATTATTTTGTTT:1 - chr3R 28686391 5' - Fw3 25 1 70.45 ATTACCGTCCTGGCACAAACTCAGCGTTTTGAATAATTATTCCATAAGGTTGCTTTACAGCAGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 10469479 5' + roo 15 2 71.64 GAAGATTATATATTAATGGTTGAATTACCAATCTTAACCATTTAAGTAGTAAGTTCCTTTGATATCCGGTTCTTCGGCTTGATGACCCTTGTCTATCGCTTTCGCTAAAGCGAAATGCTG:1 - chr2L 15788644 5' - gypsy10 5744 2 67.50 ATTGTTAATGAATTTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTATATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGACAGAAGATATACATATATTCTTGATCTGGATCAA:1 - chrX 19192440 5' + INE-1 82 1 78.77 AAGAACCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACAAACTTA:1 - chr3R 31146726 5' + gypsy7 5017 1 74.29 ACATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAGTATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAATTTGGTGCTATG:1 - chr3R 18205721 5' + 412 7110 2 52.74 TCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTA:1 + chr2L 17295872 5' + Doc 46 1 67.39 GCCGAAGTACGCTGGCAGCACTCAGAGCACTAAACAGGCTGAGCGGAGCCACTAGCACTCCCGATCCGATCAGGTAAGTCTCAGTCCATACAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 - 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chr3R 16276440 5' - pogo 2049 1 59.59 GCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:1 + chr2L 4929801 5' + blood 7074 2 62.07 TGGTGAATCAAATAAATTTTGCTTAATTAATTGATTTTAAACATGCATAAAGCAATTTGCAGTATTTGCGTTTAAGTTTTGTGTGCATATTTAAAACGTCCATCTCCCTCGTGTTGGGATCAGATGTATATGCCACTTTGAT:1 + chr3L 13316481 5' + Max-element 8061 1 69.01 GGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATA:1 - chr3R 24454863 5' + F-element 302 1 64.83 GACTATCAGATACCCGTTACTTATTATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGTCCAAAACTCCAAATATTGTACATCTGTCCGACAGTGCGTCTATCCGTATGAACGTCAAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTGGAAGGT:1 + chr3L 22753753 5' + INE-1 157 1 58.90 CATTCCAATTACTCATACGACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAACGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTGTGGTCTG:1 - chr2L 18689253 5' - Gypsy6A_LTR 255 1 71.23 ACAATCAAGCCCAAAAGTCGGCACACTCAGAAATGCCAGAGGCAATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGA:1 + chr2R 17544113 5' + gypsy5 29 2 64.14 GTAATAGCAACTGGAAACAATTGCAACATTAATGTTCAGCCACCGTTCTCACCCAAAAGTATCTACCCCAACCCGGAGAACCGAGTCTTTTGTTGTCTTCGACGTCTAGCCGGCTCATTAGGCGTAATTTATGGATGCGTAGTAGC:1 - chr2L 1441462 5' - transib2 240 1 54.79 CTTATTGAATACGCAAAACATGAACAGCCCAATAAAGCAGCACTAAGGCAGCTCGGCAACGCTGGCTCTCCCCTCAGCCTGGATCATAAGGTCTTACTCTATAATTCTGTATTGAAACCCATCTGGACCTATGGCGCACAGCTATG:1 - chr3L 10550210 5' + F-element 4266 2 61.64 GGTAAGTACAATTAAGTCAGTTTGCTTTAATAAAGCGATGATATTGTAGTTCATTAACCCACTGATAGTATAAGTAATAAGTACTTAGTTATTAAACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 19691197 5' - roo 385 2 67.12 GTGGAACATAGTTTTAAACCGATATATAACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 18528268 5' - roo 9014 2 56.85 TTTGCCAAAAAAATTGGGTTGGAGGATCCCACTCACATGTTTTTATGAGCTCTATTAGATGCCTAAAACAAAATCTTAGGCTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACT:1 - chr2L 22983957 5' + Transib5 2977 1 58.52 TATTAAAAGGGAGATTTCTAGTTCTTTTTAGATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTATAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCGA:1 + chr3L 25255411 5' + INE-1 299 1 68.49 CGAACAACTCCCTAACATCCTTCCACCATTGCACGAGACCCTTGATATCCTTGCGGCCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAATAAAAACCAATTATATCACAAACTCTGAAAACAAAACAGGCAATT:1 - chrX 15998069 5' + I-element 5191 1 61.64 AAAAGTTTAAAATTGAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chrX 388202 5' + 1360 29 1 66.44 AGTAGATTCGTTGAAAAGTATGAGAAGTAAGCGTTGTAACTCTTACCGATTTCAAAATGTTATTATATATTATATATTTTATGGATTTTTTAATTTAGCCGCTGAGTAATGGGTATCTAATAGTCGACTATAGCGTTCTCTCTTGT:1 + chr3R 19440218 5' + INE-1 579 1 51.37 AAATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAA:2 + chr2R 11095734 5' + diver 5944 2 52.74 TGGCAATTTACATTTAAGCAGCACAGAAATGTGAAAATGCATTTGTTCCAAACATCTCAAATGGCAGTGGAAAAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACGTT:1 - chr3R 17258192 5' + 412 7101 2 50.00 AATCTAAAAAAAAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGAATCAAATCAGA:1 - chr2L 21643151 5' + Tabor 22 2 65.89 AACCGAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3L 19580972 5' + roo 8712 2 63.33 GTATTCTTGTTGTTTCTTAATAACAACTGTTTCCGCTATTCTTATCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATAGGCTTTATTTTTTGTTTTCATCTGCACGAATATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 - chr3R 19446792 5' + F-element 29 1 70.55 GGTAAATAAAATTCTTGTCCTTTTGAAGTAAAATAAAACGAAGAGACAAAACAAGATAGGCTCGAAATTGATACATTTTGTGATGAAGGAAGAACATTGTCTACAATCTGCAAAAATATACTACAATATAATAAAAATAAATATAT:1 - chr2L 12811534 5' + TAHRE 435 2 64.38 GATGGCTTGGAGCTCACCAACAAAATGGGGATTCGCACCCTTTACTCAAAGATTTTTGCAGATAGCAAATGAAAGCGGCTTAAGCTTGTTTAAAATGATTAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCA:1 - chr2R 22011190 5' - 1360 276 1 67.81 GCTTCTGAGCGAGCGAGCGCTGTGGAAAATTATTTCCATATTTGAGAAGACAAGATTCATATTTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATA:1 + chr3R 10598821 5' - roo 8754 2 56.85 ACTTTTCACGCTGCCATCTCTGTGTATAGGTAGCCCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAA:1 - chr3R 24499569 5' - blood 292 2 76.71 GTTGTAAATATATATATATATATATATATATATATAAACATAAATCTAACAGAAGTCTATATATACGATATATGAAAAGTGTAATAAAATAAAAACGTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATACAAA:1 + chrX 8441181 5' + Idefix 7323 2 64.38 GCTATAGCGGCTACTTATGCAAACGGATGTATATTCTAGGGAGATTAACATAGCGCAAGTGTAAGTGCTTAATAAACACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr2L 4637176 5' - mdg1 7415 2 53.42 CGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAACCAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 7870202 5' - roo 9018 2 69.75 TTTTCCAGCTCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACA:1 + chr2L 4420504 5' + gypsy5 7000 2 59.29 AAGATTGAGAAATCGGTTTCTAAATCTAGAAAATAATGCAATCTTCTTAGTAGGAATACTGTACTAGCATATGAATTAGTAACTGACCTGAATTTAAAAAAGAACTTTTAGCATGGCTTCGTTACCATAGAATAAATAAATAAATC:1 - chr2L 16948513 5' + Doc3-element 80 1 76.03 AATTTTCCCCTTCGCAAGGTCGATTATCAATCAACATTTTCCACCATGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTAT:2 - chr3R 23235322 5' + BS 45 1 51.37 ATAAATTAGCACATTTGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 19436129 5' - roo 389 2 71.23 TAAAGAGCAAAAACGAAAGGTTCGGCCAGTGATTGACCCAATTTTTCGGTCATTTATGTCGAACAAGTGATTTCAATGAATAGAAGTTTTTGGTTTGCAAAACGGATTCTAAACGAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATA:1 - chr3L 14167492 5' + mdg1 7 2 80.82 TAATTCGTTTAATTCTTAAAAGTTGCCGTAATCAGAACACATTTTGTTGATTTTACGCATTTGATTTATTTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAAT:1 - chrX 14836289 5' + invader4 2806 2 52.05 TCTTTAATGAAATCGTATTTGTATCATTTATTTTGCAAGCCCCTACCATTGGGGGTTTGAACTCGACTAGAAAGTCTAGAAATATCGTTTGATGCATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATG:1 - chr3L 9864414 5' - Stalker 7056 4 63.01 AGTTTTGGTCGTGGCAACTTTTCTCCTTAGACGAAAGCAAAGACTTTTCACAGAAACCGGTTTCCATCGATCAATAGATAGACGGTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chrX 4673577 5' - roo 9036 1 60.96 ATTTATAAAATAAACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCC:1 - chr3R 24454890 5' + F-element 276 1 52.74 ATTATTTAATTACAATATATAATTTTTCGGCATCCTTTTGGGTCTGTGTAAAATCCCTGCTCTATTCGAGTGTTTGTAAGTCATATCCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGA:1 + chr2L 16966219 5' + Transpac 314 1 62.33 GTCGCGAATAACCTCATCCTTGGATTTTCCTCTATACTCAACGCACTTCTGCATATTATTAGCAATATCATCTAGATTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTG:1 - 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chrX 20880670 5' + invader4 15 2 63.16 CCGGATAGTTAAGCTATTTACAGACTTACAATGGTTTCGTTTTTTATTTCCTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGC:1 + chr3R 25277614 5' + 3S18 5826 2 60.29 GCTTCGTCTTTCATTGGGACGTTAAACGATAACTGTTACTCAATCGCATTAGTAACTAATTAATTTATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGTTAGCTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr2L 22724073 5' + pogo 50 1 52.74 AAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATCAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGATTTTTAAGTTTCAGCAGATAGT:1 + chr3L 18183086 5' - Tirant 8443 2 61.64 AGGGGAAATCCTTTTGTGGAAACTCACCACTCGAGAGCACCTGAATTAGTTACGCATACGCCTTAAAAATAATTGGTTAAACAAAAAAACCTTCAAATTCAGGCGGTAACAATAATAGCACTGCTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTA:1 + chr2R 16901741 5' - Tc1 1419 1 56.85 CAGGGGGCAGATGGGCGGAAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGATCTAGAAAGCCTTAGTTTTA:1 + chr3L 7837133 5' + jockey 4792 1 60.27 CACTTGGGAAACTCTTTAATATCCGACAAAAGCGAGAGAATATTATGAGAAACCGTGTTAACCACAAGCGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAGGTCTTGTACCCGTCAGACCACTGTGCACGGAAACACAAAATCAAAACTTT:1 + chr2R 4026137 5' - Cr1a 385 1 74.29 CTCGGTAAGAGGTGCATTACCACGAAGTTTGTTCTGGTACCTGAAAACGAAATATTTGCAGCACGTTACAGCATTCCAACAGGGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 + chr3L 19999144 5' + 1360 35 1 61.64 GTAATAATAATTGAACAAAATAGAAATTGGATACTGCATTTTAGGAAATATTGAATATTGATAAATATTAATAGGAGAGGGTCCAAGCTAAGGCAGAACCACAAAATCCTGGTGTACAAGGCAATTCTCAAGCCCATCTGGACCTA:1 + chr2L 21870676 5' + G2 2647 1 50.00 GATTTATGTTTAGATTTCAGTGTCACGTTTTGATCCACTTTTCGGCCTAATTCATACCAAACAAACAACAACTACAACAAGTGGGTCAGCACTTTAACGTTATGATATTATATTTCGTGCACTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTG:1 + chrX 6075239 5' - Gypsy6A_LTR 14 1 61.64 ATTGCTAAAAAGCAATCTCGATATTCATGTTTTGCACAAAGTCATATAAAAGATTGTGACTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACT:1 + chr2L 5234515 5' + Doc 334 1 60.27 ACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3L 16015337 5' - 1360 3365 1 58.33 CATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGAC:1 + chr3L 17537749 5' + Doc 13 1 62.20 ACCAAAACCATTTACTTGTGCTTCATACAACAGGGCTTAACAAGGCTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCA:1 + chr2L 11554494 5' + roo 8815 2 68.49 GGGTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAA:1 - chr2L 23034072 5' - FB 379 1 43.36 CCCCGAGCAAGGAGTATAAGTTGTTAAAAACTTAAAATACCGACGCTTAAATAGTTACCCTTATATAACTTATTTAAAGAACTTATGTGGGTCTTTAGATATGTTTATGTTTAATGTGTATGTTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTT:1 - chr4 1013307 5' - INE-1 165 1 63.01 CGGACAGACGGACATGTCTATATCGACTTGGCTATTATTGAGCAGCTTCTTTAGAGCAAAAGTACAGACAATATTCCTTGCTTAGTCTACCCTACGCGACAATGCATTGCGCCACCCAGACATGAGCGGCAAGCCGACTCAGCATT:1 + chr2R 5879015 5' - gypsy 156 4 68.49 ATAGTTTATGTTGATAAACCAGAAGTGCTTCCAATCTTTTAACACTTTCAAAAAAACTGGTTGGATAAATTGTAGTTAATTGTTTACAATGAAAGTGGATACAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chrX 15454815 5' + 1360 20 1 71.92 AGGAGTTGCGCTGTCGTCTGCCATCTTCATTTCCTGTTGCTACCTTCCGGTTGCCATTACACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 + chr3L 9906078 5' - mdg1 359 2 59.59 TATGGCATAATTCGCCACACACTATGATAATAGCACCCCCATGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATA:1 - chr3L 21260962 5' + jockey 4819 1 71.23 TTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 - 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412 7472 2 77.62 GGCTAATCTGTTGCCCGCTGTTCACCACATTGTTGTTATAATTCGCTGGCCCAGGATATCCTGATATCCACAGTGGTGCTTCGGTGGGTAGCTCACAGAGTGGCTCTTATGTACACCCCAACAGCCTAGCACGGAAGCTAGGAAC:1 + chrX 14329119 5' + jockey 4683 1 71.03 GTTGTCTTTTTACACTGAGTCTGCTTCACCTTTTCAGTATTCGTAGTGCAAATGGAATTCAATACATTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTT:1 + chr2R 19421840 5' - 1360 3264 1 54.79 CCTGGAGCTGCCACATGTTCTGGTCCAGCCGAGCTCCCTGTGTGCCAAGAAAACGGGAGCGGGTCCTTGTGCCAGCGATGGTTGTAATGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 14218548 5' - roo 9036 1 58.99 ATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGC:1 - chr3R 19449982 5' + roo 8833 2 70.55 ACATTTGTTATTGCCACGAATCGCGTGGCACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCCTACATATCGAATAAGCACTGCA:1 - chr2R 10910341 5' + Tabor 6851 2 71.32 TGATATACTGATACAGTGACCCGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCAGGGGAGATGAGCAATCGCGTGGACGTGTTC:1 + chr2L 3960184 5' + jockey 23 1 57.89 GGAATATGTGAACGGACGGACACATGTCTGGTGGAAAGTTAATTTTCCCCTTCGCAAGGTCGATTATCAATCAACATTTTCCACCATGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTT:1 - 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chr2R 17288650 5' + mdg1 39 8 79.41 CGCAAGTGTGTGTGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATG:1 + chr2R 8666067 5' - P-element 2781 1 13.01 ATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:2 + chrX 1103629 5' + pogo 78 1 71.92 TAGTAATATTTGCGCTATATTTTGTTTCTGGATTATTTATAAAAAGTGCCGTACAAAAAAATTACGTATTAATTTTATAAAATCAATTTACTAGAGCTGTAATATATTTAAATCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGC:1 + chr2R 10765354 5' - Cr1a 4096 1 73.97 TTGCAAGTGAAGGTTACACTCTAAAATAGTTCTAAAGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chr2R 23409042 5' + opus 43 4 56.00 GGACTTCAGGAATATGGAGAATATCAATTTCGAGTAATAGCAGTAAACAAAGCCGGACTTTCGCCCCCATCAGATGCTAGTGTTCCCCAAATAGTGTGTTAAAAAATCTTATGGTGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTG:1 + chr4 751361 5' + 1360 3388 2 66.21 GACTTCAACTTCTCCTGCGCTGACCTTCAATCAAGAGTTCGCTTTGGCCAGGCGAATTAGAATTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGGTTTTAAGTTTCAG:1 + chr3R 16240889 5' - 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I-element 5344 1 76.71 GAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr2L 17295832 5' + Doc 34 1 50.00 AAAACGTATGTACTTACATATGACTTATGTACATACATATGCTCATATATGTACATATGTACATATGCTCATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chrX 2295260 5' + Transpac 4960 2 47.95 ATTCGAGCGGGCAGGGGCTCTCCCGGGAAACTGGGCACTGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr2R 25106113 5' - roo 347 2 67.46 GTTTTGAAATTTTTGCTAAGTGCATAATCGGCTTACTAGTGGTGTAGAACTAATTGCAAACAATTAGGCGAAAGATGCGTACTCCTCGATTTTCCGCCCAACATGTGTGTCTGTGTGCTTAGATTTATTTTATTTTAGTTTATTTT:1 + chr2L 16847552 5' + transib1 1898 1 54.79 ATTGCCGTCTTGATGTTTATTTACATTCAAAAAGTCTTTCACAGACAGGTGTCAACCCTAGTTTTTATAACTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTATGATTAGGTAGCGTTGAAAGAG:1 + chr3R 29063522 5' - 297 173 2 50.68 AGGGGCACATTAAAATAAACACGAGGCCAGGACCCCCGAAAGAAAGCGTACCAGGACCCTTGTTGGCACATTATTAATGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTGTATTACATGGCGACCG:1 - 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BS 4984 1 71.23 TTAACACTCACCACCCACCGCATAGGCCGCAGAGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATCTTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2L 12486448 5' + roo 8684 2 64.62 AAATAAAAAATAAAATAAAATTCACTTGTACAAAAACTTGTAGTAAAGGTGGAAATCATTCAAGGAAATAAAGACTAAGCCATTACATAATTTAGGGTAATAACAAAGACACTAGAATATTCTATATATATTCTAGTGTCTTTGGT:3 - chr3R 19792049 5' + Tc3 312 1 69.18 CAGCCTTTATCGCCGCAACTATCTGCCAACAAAGAAGGCCAAAATGTCGGCCATTTCGCAGAGCCAACAAAAAGGAGCTTGGAATGCCATGGGTAGCAGAGGAGATCTCCCGCTTCAGCGAGAGATACGTTAAACGACTGGACAAC:1 - chr3R 11517066 5' + G-element 4092 1 51.37 TATCTATATCTATATCTGTATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATGTACGTATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTA:1 - chrX 4610244 5' + 1360 425 1 66.44 AGAACAAAGTTGCCATCTGAACCCCATTTAAAGTAGAAAAATGAACGCAAAATATGGATTTTCTTTTGTCATGTTTTTTTTTATTTTTTCTTGCTGTTTGCTGGTAACATAAATATCTCTAAAGTGCTGCCATACGTTAATATGCT:1 + chrX 3653753 5' - 412 44 2 63.70 TTATTATGTAATACGTATTTAGCTTAAGTTAGAATTTAAGCTTGGCAAATAAACTACAAAGAAATAAGCGAGTCAAAGGTCTTTTACGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATAT:1 + chr2L 12508435 5' - R1A1-element 5257 1 60.27 TAATCGCAGAAATATACGCCATACTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3R 25751911 5' - roo 9032 1 58.22 TATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCTACTTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTA:1 + chr3R 7616756 5' - Stalker2 7556 2 73.29 TTGTACTAATTTTATATTTTATCTTAATCCTACATCGTTCATGGTTTTATAATAGTTATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGTGC:1 + chr2L 16562076 5' + opus 7049 4 57.78 GGATCGATAAGTTTTTGCTTACATAACCATCCGACATCGAATGACAAACATATATGTCAGCGTCAGGGAAAAAATCCTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTG:1 + chr3L 10180762 5' - roo 8594 1 51.37 GGGCACATACATATGTTGCTCGTTGTGGGGAACTGGTGGATTGGGGGCTGTACGTCCAATTGGGTAGCCTATGGCTAATGACGACTGACAGGCGGGGGTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTCTTTCT:1 - chr3L 7825085 5' - Doc2-element 227 1 74.19 TTTCATTAATGGGCAACCTACAATGAATGTTGAAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATA:1 - 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Dm88 25 2 70.55 ACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:2 + chr2L 17295858 5' + Doc 86 1 72.60 ATGGGCGGAAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTA:1 + chr3L 7837143 5' + jockey 4802 1 54.79 CTATTTAGTAGAATTTATTTCGTTTTTATTTGCGGCATAAAAAGATCATAAAAAGAAGTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGTGTGTGTTTAACACAATTTGCTGCTATTTAAGTTAACGCACGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 - chr3R 19171576 5' - opus 7485 2 71.23 AGGCTTAACATACCCAATCTCATTTGTTTCGCACCACCTTCCACCTTCCAGTTCCCATCTCCAAGGTGCCATAAAAATTCGCCAAGCCGCAACATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAG:1 - chr3L 22226144 5' + jockey 4787 1 63.70 AAATCGTGGGTAAGTCATTTGCTCAAGTATTATGAATAATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTC:1 + chr3L 465991 5' - Juan 4133 1 73.79 AATGTTCTTTATTACCGTCCTGGCACAAACTCAGCGTTTTGAATAATTATTCCATAAGGTTGCTTTACAGCAGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:2 + chr3L 10469469 5' + roo 17 2 72.60 CACACCCATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 + chr3R 9125614 5' + Doc 23 1 74.66 CTCCTCTCCCACTTTCTTCGTGGCGAAGAAGAGTTAATATGCAGCTGCCCTCTCTCTTTCACTCACATTCCTCCCACGCTCTCCCCTCTCTAAAATTTCTGACTGCTCTCTTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTT:1 + chr3L 2824822 5' + Cr1a 362 1 54.81 CATACATATATTGTTTTGATTTTGTCCAACATATTTAGTTAGAAAAAATGTATGTATGCATTTAAAAAAAAATATTTGTTTTAATAGTAAAAAAAAGTAAAAGCATGAGAAATTTGTTGCTAGCGAAACACCGGTGTAGTTGTGT:1 - 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accord2 7363 1 55.81 CACACAACTGGCAGCCAGCGATCAATGTGATCAATCGCGCTTAAATTTTTCTTCTTTTCAAAGAAGAAAGAGATTTGGTTTGCTGGTGATGAGCGCAGGGGTTGTGTTTTTCTTTCTTTTTTTT:1 + chrX 7617297 5' - gypsy7 5008 1 69.35 TAATTCAATTAGGCTTAGTTTTTGTATAAATTATTTTGTAACGCTTACCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTTATATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCA:1 - chr3L 25709005 5' - F-element 142 1 61.60 CGCCATGTTGGGCCTGAACCGAATGGCCTCCTGCAGGACCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATA:1 - chr2L 953472 5' - Stalker4 255 4 73.29 GAAGATTATATGCCCTTAAAAACCATTTCCGATCGATCTTAGAGGAGATTTGGAGTTGCATAATGTATGCTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:1 - chr3L 785982 5' - I-element 5304 1 52.05 AAGTTTAGCAAATTGAAAAGGAAAAAAAAAGAGAGAAGAGCTACAAAAAAGCATTCTGGCATTCAAATGGGCGGCAATTTGCTTAAAAACGCCGCGGGGATCCAACTCTCCTTTTGACTTGACCGCGCGTTCTCACTTCCGAACTC:1 - chr3L 16528630 5' - gypsy8 438 1 69.18 ATATTTGTTTACCGAAAAAATGGGGATTCGTTTTATAGTTTGAGCGGCTCTTTGTTGGCATACTTTTTGAGATGGGTACAATCTAATAAGAAAATATATATATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTTCAGTCCT:1 - chr2R 18775155 5' - Rt1b 5016 1 31.51 TTTTATCTCAGCTCGATCATTTAAGGTTCCAAAACTGTGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTG:1 + chr3R 26026776 5' + R1A1-element 78 1 74.66 ACTTAGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr3R 13225557 5' - hobo 2923 1 52.56 GTTGAATACAAATTAATTATAATTTTGTTGATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCT:1 + chr3L 17667577 5' + F-element 94 1 71.92 CTTTTCGCATCGGTTGATTGTTTTTGGGTACGGATCAGTGTGACCGCCCCTATAAAATACTAACTGGCTACTAAATAGATACCAGTTCATTGTCGGTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACAT:1 - chr2L 6852367 5' + jockey 4905 1 64.38 CACCAGTCTCTTCGTCGGGAACAAAGGTCACATACAAAGTCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:2 - chr3R 23098245 5' + roo 81 2 75.34 CATGCCCAGATGACCACCAGTCTCTTCGTCGGGAACAAAGGTCACATACAAAGTCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - 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gypsy11 3933 1 56.25 AGCAAGGACATTCAAAACAAGCTGGAGCAAAATATGTGAGAAGCAATCGACTTGGGGATACCATAGAATTTCGAAATTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTAT:1 + chr3L 4081557 5' + mdg1 7083 2 53.42 TCGGCAACTGGGCTCCAAGTTCCCGAGCGCCAAGGCAGCGCAGTCGGCGTCGCTGCCAGCGCTGCTTCTTCTACTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3R 31724964 5' - P-element 2881 2 74.76 GGAGCAACTTTGGCCAATAGCAAACCACTTAAATTCATTTTAATTCAAGTGAATAGCAAACCGACCTCTTTCCACATCCTTTGCCATATAGCCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr2R 21748206 5' + 1360 28 1 63.01 TAATAATAATTGAACAAAATAGAAATTGGATACTGCATTTTAGGAAATATTGAATATTGATAAATATTAATAGGAGAGGGTCCAAGCTAAGGCAGAACCACAAAATCCTGGTGTACAAGGCAATTCTCAAGCCCATCTGGACCTAC:1 + chr2L 21870677 5' + G2 2648 1 50.68 ATTGGTAAATAGTTTAACCACTGTCTGAAAAATACTTTGAAGTACGATTTGGGATTTGGAAATAATTTGATACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATACATTTTTTCAAAATTC:1 + chr2R 13738150 5' - FB 239 1 50.71 AAGGGATCGGAACATGCCATCAACTTCCAGCGCTACGACGTGGAAATGCACATCGTTCATAAGAACACCATATATGAGTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATAT:1 + chr3R 31263276 5' + roo 8604 1 52.05 TCTCGTAACAATAATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr3L 14375699 5' + roo 80 2 76.03 GTCTTCATAAATTGGGAAATCCACAAATCAGGTATGCCACATATTTTATGAAAGGGACAGTTCACTTAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATT:2 - chr3R 28450812 5' + roo 8669 2 78.08 GTGACATGGCCAACCACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chrX 16117136 5' + opus 27 4 62.24 ACACGAAGCATACCAATGGCCAAAAGGGAAAGGCTGTCAAATACATGTCCAGACATGTACACAAACTCGCCCACTCATAGGCACGTAACGTAGTAGCGCTGCGAGCTTTTTTAGTGACGGCCAAAATGGCTCTCTTTCCGCTCG:1 - chrX 15912096 5' - 1360 3310 1 75.69 ATAATTATTCCATAAGGTTGCTTTACAGCAGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3L 10469511 5' + roo 8721 2 58.33 ACTCACATTTGTCAATACAAGTGCAATTATTTCAACATGCTAGTCAATGATAAACATTATCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTA:1 - chr2L 10514368 5' - 1360 3325 1 62.33 GAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATT:1 + chrX 21087539 5' + mdg3 5281 2 63.01 TTTCTTCTACAAAAAAGTATAGTAATATGTATATATCATTAAAGATTGATAAATTTCCATCACACTATTTGGGTTCAGCCGTTTAGTAGCTGAGGCTAGTTAGATAATTTATTTATTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATA:1 + chr3R 6816653 5' - 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Tabor 465 2 71.23 ATATCAATGTAAATCACTTAAAGGCATAATTAAAACAATATGTTGCACGGAAAATGCGTTATATATAATAACGGGTAATTTAAAAAGTAAGCTGAAATATGCTGGGCATAGCAGCGATAAAAATAATAACTTGAGGTAATTCTTAT:1 - chr3L 14888429 5' - S2 1436 1 80.82 GGAGGGAAAGGAAGGTCCTTGCCGATGCGTAGGTTATTTACAATGGGTATTTTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTT:1 + chr2L 15869456 5' - Doc 4403 1 66.44 GGAAAACACTCAGAAAAAATTGTTAGCTAGGTCTCACTCAAAGCAAAAAAAGTTAATTTGCATATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCAACGACCAGCCGAAATGCCATCCAACACCGGATGTGCCAACAAC:1 + chr2R 2873992 5' + gypsy10 51 2 65.22 GCCTTAGATGCTCACGCAGCCGATCTGCATAGATAATGTGAAAGGTGCTATTTTAAAGGTTGCTATTTTGATGTTTAATGAAAGAAGAGCTTAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTT:1 + chr3L 23571612 5' - Stalker4 7274 4 76.03 GCCGATCTGCAGGATGTCTACTACGGTAAGTTCAAAGTTCTGGCCATTTTGACTGCTAATTAAGCACACAGCCAGAATTGGGGTTCTTATGGGATACTTGAATTTATGACTTATAACCTACGGCATTCT:1 - chr3L 18930594 5' - Quasimodo 91 2 55.04 TAAAAATAAGAAAATCAACACCAAGAAGGAAGGAATAATAAAGTAAAACACAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAACGACAAAGCAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACA:1 + chr2R 1845401 5' + Doc3-element 272 1 45.38 AACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTT:2 - 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BS 4965 1 58.22 AATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTT:1 + chr2R 17544156 5' + gypsy5 6982 2 56.90 AAAGATTTCTATAAAATACTTGATTCATATTGGAATATTTTATTAGGCTTAAAACAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTA:1 + chr3L 12223133 5' + Transpac 62 2 63.01 CCCTGGGAGATTGCCTTCTCAATAAAGTGGGAAAATAATAAAAACGTTATCATAGTTTCGTTGTTATACCCGTGACTCGTAGAGTAAATGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGGATGTAAC:1 + chr2R 5694495 5' + INE-1 15 1 73.55 GAATAACATTTGGTTAGGACGGCATCAAGTTGGCCTTTATTTATTTAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3R 18528405 5' + roo 28 2 63.01 CGAATCTCAAAGTGAATGTCAAATGGTGGGGTTAAAGCCAAGTTTATGCAGTGCGAATCTAATAGAGCTCAAAAGCACGTTGTTGCATCCTCATAGTGAATAATGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 25862529 5' - roo 393 1 74.66 TTTGAGAAAGTTATCCGACAGATGACTCAGTGAAGCAGCCACATCACGTGATATCATGTCACGTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAC:1 - 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Stalker 244 4 62.07 ATCTGGTTTGGTTTGTTTGTATTTGGTGTGCGTGAAATGGGTTGAATGGAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr3L 15364929 5' - 1360 3350 1 56.55 CACCAACCCACTCATAACCTTGGCAGTTTTTCCCACGCACTCTTATCAGCGGGCGTATAAAGAAAATTTCATCGATCGATGGCGCTCAGTTCGCAGGGAACATTAAAAAAATATATAAATAAAAACTTCAGACATGTACCTAAATT:1 + chr2L 15490352 5' + mariner2 809 1 69.86 GAGTTTTAAGGCCGAGTACGCATCACAAGCTCTAAAGAGAGAAGCTTAGTAATAGTACAAGCCAAAGCATATTATGAAAAGCAAGATAAAGAATTTTTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTA:1 + chr3R 3520046 5' + Tc1 1545 1 78.23 GGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1 - chr2R 1373191 5' + pogo 70 1 64.83 ATTCATCAAAATTGTGTGCATGTACTAGTTTTCACCGTTCATTTCATGATCGTAATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 - chr3R 12363839 5' + jockey 4708 1 60.96 GCTAAAAGTATTCCGTGAATCTGGCTTGCATGTATGTGTGTATGTATGGCATAGCTGGGGGCAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCTG:1 + chr3L 18182475 5' - Tirant 89 2 58.06 AAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr2L 17295833 5' + Doc 61 1 55.48 TAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 - chr2R 15070172 5' + 412 7116 2 60.96 GCCGGGCCTGTCCAATGTGGTGACCTCTGGACCGCCGACTGAGGTTCTTTGCTTGCTCAACATGGTCACGCCCGATGAACTGCGGGACGAGGAGGATTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGT:1 - chrX 16357074 5' - invader2 4983 2 65.75 TCATGGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCG:1 - chr2L 19140421 5' + Max-element 68 2 67.16 AATTGTCGTTATAATAATGGTCACTTTTATAATGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 15295740 5' - roo 322 2 82.19 CAATTAGCCAATAAATCATACTTGTCATGGGCATATAAGCAAGTTCATTTATATCAAAAACACATCGTGTACATACATACATACATATGTACATATGTACATTTACATTTCCGTTTGTAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACA:1 - 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chr3L 10660222 5' - invader1 461 1 69.86 AAGCGAAATACGTTGCGACTTTCCTCAATAAAAGCAGCACGCAAATCATCGTCAAAAGCTCCGTAGTGATTGTTGAATAGGCAGTCGATTAAGTCAGTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATG:1 - chr3R 11680733 5' + baggins 5079 1 52.74 TGATGAATCAAATAAAAATATATATTTTTTCTTAATTCTAGCAAGTGCAATCGATAGCAGGAGCGTCGACTTCCTTAAAAAGGGCGGCCAGGACAAAGCGGAGAGGCCGTGAATTAACGGTGCCGCACTGGACCTTGGACTCCAGC:1 + chr3L 14068151 5' + gypsy8 4750 2 53.42 AGGCATGTAGCCTACTTCTTTCGCTCTTACACCTTATTACACATTACATCCTTCGTTTTTTTATTGCTTTGAATCTGATTACCAATGAAATCTAAACATAGATATTGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAAT:1 - chr3R 4416016 5' + 1360 254 1 74.66 CACGTAATGCCGTTGCTAACAAGCCAGGAGTTTGGGATAAAGCCAGAACTATTATATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr3R 28406454 5' + opus 7154 4 56.91 GCTGGGGAGCGTAAGTGGAATACTCAATTGGTCGGACACTACATAGTGTTACTGTAAAATAATTCATAAACTCAAGAACTACTTTAAGACCGGTTTCTTGTTATTAAAATAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATA:1 + chr3R 16870346 5' - F-element 135 1 77.40 GCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr2L 10514294 5' + 1360 58 1 71.07 CTACACGTACGAGCACTAAATGTGCCCCACATATTATAGATACGATGCTAGGGACACATGTCCTAAAAACGCAATATGCAAAACTTTTTGGGTCGCATTATGGGCGTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 - 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chr3R 16276429 5' - pogo 2038 1 67.12 ATTGTAAATTTTAAAGGTTAACCCTTTTCGCTTCACTTTTATGGAAGAACCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr2R 19843316 5' + jockey 80 1 64.38 CAATGCATATGCAGGCGCTGAAAAAATTCAACATTTCTTACAAGACTCTTCTTTGATATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr3R 20203971 5' + 412 12 2 77.40 ACTTATTCGGTTGGCTATTAGGTTTTTTTTTAAATACTTATATGCACTCTATAAAATTACGAACAATCATTTATGGACTATCAATATCCCAAAACCCCCAACCCTATACGAATACTAAGCAAATACGTGGTCAGTGCTATTTATGT:1 + chrX 15901421 5' - Tc1 212 1 80.14 TAGTACTTACCAATTTAGTGCTTGCAGTCTAGATGTCAAATATTTAGCCGAAGTTACCATGTCCTCCTTTCAGTGATTTTATATTCAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGAATCGACTCCAGCTCTTGCTGTCATTATTAAATTGGT:1 + chr2L 339972 5' + gypsy6 217 2 52.74 TGCAATCTAAATTTACGTGACAAAATCTAGCAAATATTCGAGCAATATTTCAATTAAAACTATATGAAAAGGAATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr2L 4876984 5' + 297 43 2 56.85 GTTGATCAACTGTGATTTTTGGTGGAAAGGTCCGAAATGGCTAGCTATTATTTTAACATGAGGTCCTACTTTATTATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATTTTTGTTTACACTT:1 + chr3R 19446510 5' + rover 7039 2 44.03 TTAGTTTATTTATTTAGCACTATTTGCACCAGCAAATAAGTTGGAATTATGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3R 25751800 5' + roo 8736 2 70.55 AATATTGTATATAGAACCCGGCGACTTTCTCAAATTGTTTAAATGAAGGCAAAAATTATTTGTGTATTTATGTGCAAAAGAAACAAGAGAGTAGGCTATAGTCGGATACCCGTTATAGTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1 + chrX 22806237 5' - INE-1 546 1 53.79 GTAAATTCGAGTCTTGTGTGGACTCGCGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3L 21013939 5' - roo 399 1 67.47 TATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCT:1 - chr2R 5045659 5' + invader6 4565 2 68.49 CCTAATGGTCGAATAAAGACACGAAAGATTGGAGACTGATTGCTAATTTAACTGATATGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chrX 4400397 5' + roo 52 2 60.00 AGCTAGTGGAAGTAAAAGAAAGAAATTTCAAAAATCATTTCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATATTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTAAGCTGGTGGAACTTGAATATAGCATTCTCTCTTGTT:1 - chr2L 21942386 5' + INE-1 580 1 79.85 ATTTTGATAGAAGAGGGATTTTAATAGTGCACAAAATGGGCAACGTCCTTTGTTATTCTTATATATTGTTAACTTAGATGGGTTTCCACAAAAATCGTAATATCAGCACATTTATCTTATTTTATTCTTTAATTATAATGTATACA:1 + chrX 7045311 5' - G5A 2741 1 87.67 GCCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCT:1 + chr2L 19310314 5' + Juan 4124 1 52.05 ACCTCGTGTTCGCTTATTGACATTTCTAGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr3R 16276305 5' + pogo 39 1 58.90 ACTTCGCTTTCGATTATCCACGTAATTACGAAACGATAGTACCGACAATTACAATTACGATTACATTGGCATTTTGTATGGGAATATACCCCATGGCATATATTGTACTAAACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3R 24673499 5' + roo 8672 2 76.03 GCCCAGCCAGACTCAAGAATTAATCAAACTTGAAATGGAGCCCTCAACACGCATTGGGGCGAAGTGAATGTCCTTCGGATTGTCAAACATACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTG:1 + chrX 18746721 5' - Doc2-element 4434 1 71.20 AGCTGTGCCGATTGATTAGTGTGAAGTTTACTCCATTTGGCACGGTTTGCGTTGATAAACGAAAAAATGCCGAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGT:1 + chr2L 22020322 5' - jockey 4773 1 50.68 CAACAAAAAAGCGCCATTCCCAAAAACCCATCATAGTCAACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTCAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTTG:1 - chr3R 20934752 5' - 412 417 2 68.57 AATTCACGAGTCCCCTTAAATATTTCAACACGAAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTCCAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTATTACATTGGAAATACGTTAAACTGTTA:1 - chrX 15559553 5' - hopper 1330 1 76.71 GATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTG:1 - chr3R 15790079 5' + flea 4776 2 67.81 GGGGCAGATGGGCGGAAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAA:1 + chr3L 7837136 5' + jockey 4795 1 58.22 GTTTAAAATTGAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chrX 388206 5' + 1360 16 1 72.09 ATTGGTGTTTTGTTAATTCAGTATCCATTACAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTTGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACATT:1 + chrX 22915138 5' + BS 87 1 75.34 ATTTTTCATGACGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCAACTGTCTTCGAG:1 - 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chr3L 1358536 5' + 412 7116 2 58.90 ATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTG:1 - chr2L 19310367 5' - Juan 4128 1 77.08 ATTTATTCCCGATTGTCACTTTTAACCGGTTAAAACTGTTTGTGTATTAGATAACGAAGTTTGTACCCTTTGTAGCATACTTTCGGGCATAATTTTCTTTCATTTACTTTTTTGTTTTGTCTTATAAATTTTTATATTTATATTTA:1 + chr3L 16741806 5' - Stalker 88 4 58.22 CCAAGGCCTTGATCTGTAGGATAATGAGAAGTCTGAGATACACTTGATGCAATATTAATATATTATTATCAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCA:1 - chr3R 17586938 5' + Max-element 8287 2 53.42 CAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr2R 4939195 5' - 1360 3363 1 34.25 GCAGGCTTAACATACCCAATCTCATTTGTTTCGCACCACCTTCCACCTTCCAGTTCCCATCTCCAAGGTGCCATAAAAATTCGCCAAGCCGCAACATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTT:1 - chr3L 22226146 5' + jockey 4785 1 65.07 CGAAAATTTCCACAGGGGTGCCCATGTCGTGAAGTGCACCACGGCATCCAAAGCGGGACCTCTTAGGCTAGACTTGAGGTGTTGAAGCTTCTCCATGTCGCAACCAACAACAAATTACACACAAACTCCGTTAACCATTGTAGGCA:1 + chr3L 25952085 5' + Doc4-element 223 1 67.81 GACTGGCCGAACTTTGGCAGTTGGGAAAAGTTTTTTCATTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 - chr2R 12202331 5' + Tirant 48 2 63.48 ATATTGGTGTTTTGTTAATTCAGTATCCATTACAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACA:1 + chrX 22915136 5' + BS 85 1 75.34 TATTTATTGCCCGGTCGCAGTGATCATCGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 + chr3L 6355622 5' + Tirant 8170 2 74.78 TAATCAAAAACGTATGTACTTACATATGACTTATGTACATACATATGCTCATATATGTACATATGTACATATGCTCATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 - chrX 2295266 5' + Transpac 4949 2 41.84 GTAGCTGCATACCTTATTTAAACATTCTGCGTTATATAAAATATACAAATACTTTATCAAGACCATTGGCAGAGTCGATCAGGCTTGTCCGTCCATATTAACGTCGAGTTCTCAGGAACTAT:1 - chr3L 25977709 5' + INE-1 143 1 71.31 ACTTGAAGTTTCACTAGTTCTCAATGTGGCCCATACAATTTTTGCTCATTTGCTTCAACATAACGATGAAATATCAATAATAAAAAAACCCTAACAAGAGTATATCATATATGTATGTATTCTTTTAATCATAGAACAGTTGGAAA:1 - chr2R 23246667 5' + F-element 4568 1 80.14 TGATACCAAATCATCTAACTATTTTTCACATGTCGGTAAAAATTTGTTTTATATTTTTTACGGTTTTATTGACTTAGTAATAACAGTTGAATATCCAGACCTCATTTAAATTTATTGTAAATATATTTCAAATTCAAATTCAAATT:1 + chr3L 14920325 5' + Rt1a 310 2 54.79 GCATGCATGCAAATCGTTGGAAGTTTTCATTTGATTTACGATCAAATGTCAGTCGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTTAATAGGTGAC:1 - chr2L 18522330 5' - roo 340 2 60.96 CATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATT:1 - chr2R 1000393 5' + HMS-Beagle2 6958 2 69.86 TAGTTTATTGCATTTTAAGTTTCAACGTAAACAAATTATGAGTTATTCGCAAATAGTGTAACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGT:1 - chr2L 14969228 5' - 412 7525 2 65.07 GTGGCTGTGGGGCCGCAGCAGCTATTGCTGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCG:1 - chr2R 14913514 5' + X-element 4414 1 53.23 AAACACTCGATAAATGGGAACAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr3R 8849894 5' + 297 27 2 67.81 CCTGGCCATAAAACATAAGAGATGGTCAGAGCAAAGTGCAGCCCCAAAAAAATCGCATATGTGGTATATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chr3R 15152606 5' + opus 7166 4 55.48 CTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr2L 17626673 5' - roo 9000 2 69.86 ATTAGAAAAAATTGAAAAGGTCAAATTTTTGATTTTTTAACATTTTTGATTTTGATGTTGAGCTCTTATGTACACATAAACTAACGGAGAATCTAATTGTCTGTTAGCATGGTACAATAAGCAGTACCAAAGACACTAGAATAACA:1 - chr2R 5311572 5' + Tc3 240 1 65.75 TACTTTTGGGAAAGTATCAACAAGTTTACTCTGAAACGGACAAGGCTATATCGACTTTGCTGTTGATCAAGAATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAACGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3R 6461720 5' + 297 41 2 58.22 GGAAGGTAAAAAATGAAAATCGAGGTTGGCTAGAAAGTGTAAGTGAAAACGTACAAACAAAGAAATTAGAAAACGAGTGGAGGTCCTACATATCTCGAAATACATATATACATTCTTGGTGATGAAATAAAGAGGGATAGTCATGC:1 - chr3R 19555029 5' + invader5 254 2 62.33 GCTCCGTGCCAGATTTCACTTTTCTTTTGTTTTTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr3L 486743 5' + roo 8752 2 80.14 ATACAACTTTCGTCTGAATAACATTTGGTTAGGACGGCATCAAGTTGGCCTTTATTTATTTAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3R 18528420 5' + roo 8677 2 73.29 TGATTGTCTGCTGAAAATGTCTGAAGTTTTTCCGACCGGAAAAACAACTGGCCGGCATTCAAGACTAGCCGCGTCGAGTCAAGTCTCTGTCTATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chrX 4673738 5' + roo 19 2 69.78 CCCATTGAAGACCGTTCGTCGAAAATCGGATGAGGAACACACATTTAACTTACTTAAGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTCTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1 - chrX 14137297 5' + 3S18 5818 2 54.89 GAAAGACAAAAAATGCTGGAAAATTATTTTACGGCTAGTGTATGCGTTGTGAAATTATTATGAGCTAAGGGTTCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:2 - chr2R 21748351 5' - 1360 3343 1 52.08 ATGTGTATTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAAC:2 - chr2R 1000428 5' + HMS-Beagle2 40 2 60.27 ATCACATGTATTTGGCTTTCTGATAAATGAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAG:1 - chr2L 16857905 5' - P-element 2796 1 22.76 ACAGCGCATGACCGCAGTGGTAGCTTTGACGTCATAGCAAAGATTAAAGCGGCACAAAAAGTTGCTCCCAATTTTGGTCTAAAACTAATCCTGTATATATTTAATAGTGCCCAACAGAAGTCTTAAATAAATAATAAATATTAAAA:1 - chr2L 5956323 5' + Doc 4686 1 75.34 AAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 - chr2R 18014107 5' + Doc 62 1 66.39 GGTTACACTCTAAAATAGTTCTAAAGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCC:1 + chr2R 23409053 5' + opus 7186 4 68.79 GTTCCTACGTTTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTT:1 - chr2R 20453792 5' - accord 183 2 82.35 AATCGAAGATAACTTTCACCGCACATTTTTGATGTTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTT:1 - chr3R 13349624 5' + Ivk 23 1 68.49 AAAAATATGGGAGCCTTGTTTTTCATACACATACTGACCAGGAGGAAAAAAGAGTATGCTAACATAAAAATCAACAAAAAGAAATCAGAGAGATGTACACACACACACACACA:1 + chr3R 11096943 5' + accord 180 2 65.49 GACAGTTTCATTGATTTGAGTATTAAATAGACAACTATTAAATTTTTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3L 16015163 5' + 1360 8 2 55.48 AATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 + chrX 7756422 5' - roo 8983 2 78.77 AAGAACTATTTGCTATGTGTTTCCAATTACGCGCAGAATCTATTTTAGTCTCTTTTCTGTCACACATATATACATATTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCC:2 + chr2L 13138954 5' + McClintock 35 2 62.33 AGTCAGATAAAGTGAGACTGGATGGTTTGAAACCACGCTAACTAAAATATCATATCAATGCAACTGAGTTTTGAAAGGATCTAAAGTTATATTGTATAAGTATTGTTATCAAGATTGAATTAAAAGTTTATTAATTACAATAGGGC:1 - chr3L 13228410 5' - Burdock 6349 2 77.40 GGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTT:2 - chr3L 7801304 5' + Transpac 167 2 57.64 GCCAAAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr2L 13629070 5' + Tirant 37 2 55.26 GCTTATCTAATTAGGTCAGCTTGGCAGCTATGACACACGTTCTATATTTCCGTAGGCAAAGTCAATAACTAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTC:2 + chr2R 21848618 5' + Transpac 4924 2 76.71 AGCTTTAATGCTTTAAATTCGAATTATTTTTAAAACGCCCATTTTTTACACTTTCTATTCTTAATTTGTTAGACTCTCCGCACACTTGGCTAATTTACGAAAATAGGTGACATGAGAATCACATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCA:1 + chr3L 14718677 5' - roo 305 2 61.64 AACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTG:1 - chr3R 7616831 5' + Stalker2 52 2 57.64 CAAGTCTAAATATACATTTTATTATGTCAAGGCATTGTTTACTCAAAATATTGCTCCATTTACCACATAAGGTACTAAGTACTAGGGGTTCAATTCTCCATATTGATGAATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTT:1 - chr2L 2895705 5' - Burdock 244 2 75.34 ACGTAGCTATAAGCCAGCTAAATGCCCAACACTGGCGAGGGAACAACTTCCTTCTGGCGCTGAAATCATTCTCCTCGCTATAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGC:1 + chr3R 30222540 5' - 17.6 274 2 58.22 CCCAGATAAGCTAACCAGATAAACAAACCCCCAGGAAACAAACTAACCTTCAGATAAACTAACCCTCAGATAAACTGCGGTGTCTCCCAAAACTATTACTGTTAAAATAAAGGACATGGATCGGCCAAAGACACTAGAATAATTAT:1 - chr2R 12180438 5' - Tc3 311 2 80.14 GTCAGACACTTGCCTTGACAAAAAAGATAAATTAAAAATAAATGAATACAGCTATCAATATAAAATGAAATGTGGTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr3L 18253932 5' - blood 7374 2 71.92 ATAAGTAATCTCAATGCGATGCCGGGTCGTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chrX 19107468 5' - roo 9039 1 56.64 CCGCCAAAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 + chr2L 13629068 5' + Tirant 50 2 58.91 AACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGT:1 - chr2L 21643108 5' + Tabor 82 2 71.92 TATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCG:1 - chr3L 7801281 5' + Transpac 5091 2 69.84 TAATTAAAATTACTTTCAGATAGATTAAAGGAGTTAAAGTTAAAGGAGTTCAGATTAAAGGAGTTAAACGAGCACAACGATTATGACTTGAATAACCATATACCGATCGTTGTTGAGGACCTTTGTTACTATATAAGGTCCTT:1 + chr3R 11501534 5' - Bica 4736 1 65.03 ATCCCAGTTAAAGCTACTGTGGAACATAGTTTTAAACCGATATATAACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:2 + chr3R 18528250 5' - roo 9032 1 55.48 GGCGTTTTAGTGGGGTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chr3R 20934681 5' + 412 71 2 65.07 ATATGTTTGGCCCTTAAAAATATAATTACGCTTTAAAGAAATCGTTGTGAGTAACTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCACCCC:1 - chr3L 9212768 5' - hobo 2892 1 55.91 GCCTCCTTTTGCCAAATATGACACACTGAAATATATGGTCGCGATTTACGGCACAGCTCAAATGAAGCTGAGTTGAGCAGCTGAAGCTGAAGCATAAATAAAAATGCTAAGTAAACACAATTTTTTTTGCATTCAAAAATGCAAAT:1 - chr3L 18936123 5' + TAHRE 10326 1 48.63 TGCTCCTCGCTGACCACATGGCCACGATAGATGGTTAGACTGTCGAAACCACAATTTCTGCTGGACTCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr3L 11803960 5' + blood 7065 2 53.42 CATTTCTTTATTGTATCTGCGGAAAATGTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chrX 1103749 5' - pogo 2073 1 66.44 GTATTCAAATTTAGGATAAGTGGTAACTAATTCTACGATTTTGAGGTTATTATTGATAGGGCTGATTGGTTTTTTTTTAACAAAAGCGGTGGTCGACCTGTACCTTACATTTTATTCCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCC:1 - chr2L 8367030 5' + FB 731 2 74.48 TGAGGCTTATTTATGTGGAGCGAAACAATCAACCACTAATTAGAAATTCTTTCGTGCGCAATTAAGGCAGCCAATACGGCCGGTATTGCTGATATACATACATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2L 973970 5' + pogo 18 1 71.23 AATTTATTGAGTTTTTGCATGACACCACCAAAACGACAGCAGCTGCAGCCTGGAACACCTTTGACTTACTTTAGTTCGTATTTATTTTTCTACTTATTTACTTTATTATGTACTTATTTATTTAGTTATAAATATTGGTATTAATT:1 + chr2L 8592876 5' + gypsy12 9765 3 60.96 TCCACTTTCATTATTTGCGTTTAACTCACGCAAGTCTCGCACCACACACACACACACACACACACACACACACACCGGAGACACACACACATACACACACATATACAC:1 - 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chrX 20685977 5' - Ivk 5355 1 67.13 GACTTTACTCACTTAACTCTTAGTTCTTTTCCATGGCTCCTCCACTCCACTTGCCACTTACCAGCGCCAGCTTTTCATTTTCCAAGCCCACAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACACA:1 - chr2R 21439557 5' + jockey 28 1 66.42 CACCCACCCACGTTCTTAAATTCTAAGCGCACGCTTTTCGTGCCTCGGTCTCCTGTCTTTTTTGCACAAGCAAACTAAATTTTGCTTCAGTTCAATGTACATCCACTCTCTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATA:1 - chr2L 133845 5' - Rt1b 4775 1 67.81 CTGCTGGCAGTTGGTCAATAATTGGCATAGATTTATTTTGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3L 4523949 5' + roo 48 2 71.43 CATGATGCCCACGCTTTGAATAATTTATAAATTTCTTCTTATTTTATTCCCCAATATCTGTGGATATCTCAAAAAAAAAAAGATGAAATTTGCGTTCGAATTCACACTAGCTGATTAACGGCTAT:1 - chr3L 20033455 5' + INE-1 540 1 56.80 AGTGCAAACGTCGAACGGCAAGTCGGAACTCCAATCAGATGAACTTAAAGAACTAGGCTTGCTGGCACATAGTTGGAGAAGGTTCAATCCCTTCATTAAAAAGAGACAATGCTAAAGTCTAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTT:1 + chr3L 19491933 5' - INE-1 553 1 68.49 CTCTAATTTGTTTGATTAAGTATACATATTTCGTATAGAACGGGAATTATTTATCTGCATTTAAGAATGAAATCGATATACGAAATGTATTAATATAATTTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAG:1 - chrX 17033227 5' - F-element 4638 1 64.38 CAAGGTGAAATGGCAAATGCTCATCACTCTCGCCCTCTCGTCTGCCTCACTGTTTGCTCCTGCGACTATTATGGGTAATGCCTTTTGTGTAGGTCGTCGGCATTGCGTTTTCTGGTCTTACATATTTCCTTTTTTTTTTATTATTT:1 + chr3R 23866731 5' - Rt1b 5148 2 62.33 CAGTCCGCGATGCGATACAGGAAGTCCGCACATCGCTGTCAAAACTAAAGCCCCCAAATGCCAGCAATTGAAAGCGTTCGCTAATCAAAATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAACTATA:1 + chr3R 30531043 5' + X-element 4615 1 61.64 AATATAAAATGATCACTTTTCTATCTTATTTTTGTCGATTTTCATATTGTTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTACACGTCTCAAGTTTAAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTGAATTGTG:1 + chr3L 18063846 5' - Porto1 4455 1 67.12 TTAGGAGTGCAGAAGTATATTTGTTTTTATACAACAATGGGGAAGTAAAAAGATCGCTAAACAAGATCTGTCAACTTCCTGTTAGCGAAGCAAAACCAGCTGGAGCTGCAACGCATAAATGAGAGACGACTACTGGCCGTACTCTT:1 - chr3R 4802972 5' + rooA 7208 1 78.08 CTCTTCTTTGATATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3R 20203926 5' + 412 7104 2 55.71 CGCCCTCTGTCATAAAAACGGCGACCGTGGGACATTGTAAATTTTAAAGGTTAACCCTTTTCGCTTCACTTTTATGGAAGAACCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2R 19843283 5' + jockey 25 1 69.60 AATAATTATATCGTATTAATAACGTTAAAATCATAAAGAGAAACGGATATTTAATGGAATTTAAGTGACTACAATTTAAAAATCTGTTGATAAATTACTTTTATAACTATACGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAATCA:1 - 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chr3L 9466812 5' - hopper 1139 1 69.86 AGTCGAAACTGTTGCCACCGCTCCATGGCATGACAGCTGTTGCCGGACAGGATCAATAGCAGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCATATCAACGTTTCAATCTCAGGAACTCTAAAAACTAGAAGGTTGAGATTCAGCATA:1 + chrX 22782551 5' + INE-1 171 1 67.59 AAACATTTCCACGTTGCCGGACAACAATCCACTTCGCAGTGCCACGGCTCCTTCATCCGATGAGTGAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGAG:1 + chr2R 16737292 5' - Tirant 8383 2 52.11 ACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATC:1 - chr3R 24454877 5' + F-element 275 1 50.76 AAAACCCCATGAAAAAAAGGAGAAAGGGAACCGCTGGCATGGCTGCATGAAATATTGGGACTGTTGGTCGAAAGGTTTGGCATTAGTTCTGTCATCCAATTAACCGCGTTAATCACCTCCCGCGTGGTTATATCTCTTGACACTTC:1 + chr3L 14719298 5' - rooA 7368 2 63.70 AAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 + chr3L 7791890 5' - Transpac 5184 2 53.08 GCTGACTTTGTGTTTACTTTAAGTTCGGTTATTTATCGGCGGCTAAATTGGGATACAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTTATTAATTTACCGTCCC:1 + chr3R 4139550 5' + Cr1a 3989 1 66.07 TCAGTCGCTTTGTTGTTTTCTCTTGGCGTCGTAGGTGCCACCATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGC:1 - chr3R 19557292 5' + invader1 3641 2 60.71 TAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr3R 28450746 5' + roo 71 2 70.55 GCGTCCAGCGTTAGATGTGATTCACGTTTGTTACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr2L 23049732 5' - opus 7473 2 56.36 GCGGTGTTTCCAAATCAGAAAACGGGAGAACTGCTTCAAGAGAATGGGAAACGACCCTATAAAGAGACTCTACATGGGGAGAACTAAAAATACAAAATATAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 + chr3L 2192238 5' - jockey 4966 1 58.90 GTTGGTTTTGATGTTGCTGCTGCAGACGTTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGCCGTTGTTGATTTTGTGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAA:1 - chr3L 15304584 5' - I-element 331 1 71.72 TTCGTAGCTACAAATTATAAAAATAAAAAATTATACCAAAAAAATTGTTCCCAAAACTACGAAGATTTTTTTTTAATATCGTTATTAGTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAG:1 + chr3L 13987132 5' + diver 5915 2 48.20 GTTCTTGCAGAAAGTACCATTTTCACTGAAGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - 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chr3R 12363858 5' + jockey 4689 1 73.97 GCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chr2L 14239157 5' + 412 80 2 70.55 CGTTAATTTGGTCATATCCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGGATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTAGGATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGA:1 - chrX 21587784 5' + INE-1 121 1 45.52 ATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTG:1 + chr3R 1875807 5' - Rt1b 4700 1 50.68 GAAGCCACGTTTTTTAATGCTTTTTTAATTGGAAATGCACAGCAGCACGCTGATGACGCCCCAAACAGCAAGTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTC:1 - chr3R 13864693 5' - Rt1b 5011 1 51.41 ACAAGACTCTTCTTTGATATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 20203932 5' + 412 42 2 54.01 TAGGAAACTGGATGATCTACAAAACCTATGAAATCATCGAGAAGAACATCCTATGACATCAGCTAAATCTTTAAAACGATTGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr3L 25607243 5' + 412 40 2 58.22 GATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 + chr2L 17295865 5' + Doc 69 1 71.31 ATAGGACACAATGCACATGGCCAGATGCTCGTGCCTTGAACACGGACGAACCAATCCCGCAGACCAGAAGATAGAATGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAG:1 - 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chr3L 18801889 5' + I-element 31 1 59.70 AGTGCTGAAAAGTATGCTACACTCTGTCAGACATGCGATTGATCGATTTTCTGGACAAATTGTAGTAGTTTTGATTCCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTAT:1 + chr3R 16582472 5' + BS 5017 1 52.05 TAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCGTGTCCGTCCGTCTGTCGGTCCAGATTCTAGAGATTTTAGCGCACTTTTGTTGACCCATGATGCCACGCCAACTAACTGTCCAAAACTGTCACGCCCACACTTTTAAAAAATGTTTTG:1 + chr3L 21773110 5' + INE-1 259 1 46.58 AGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 - chr2L 21910212 5' + Doc 88 1 78.77 CATCCTCTGCAGATGTCAAATGATGTATACACTTGGTGCATGGTAATGGATTACCAACTAAGTAGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAGACCTTAAGAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 + chr2L 1090939 5' + 412 70 2 43.15 TAGTCCTTAATGAACAAGTTACAATTTGGGCGAGAGCTGGCCCAACCCTCACCCATGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chr3R 28406299 5' - opus 490 2 77.40 GATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATT:1 - chr3R 7616844 5' + Stalker2 7289 2 57.53 TAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGTAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 - chr2L 14969166 5' - 412 7472 2 70.07 GGAAAGTAAACACAAAACTAAATTACGACTCTTACTCTCGTCCTTTTCGCCTCTCAGTAAAAAGTATTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCT:1 - chr3L 18035601 5' - mdg3 191 2 52.05 AAATCGGATGACGCCCACAATAAACAATGCATACAGATATACGGATTTGAAGGTCTTCATTGCCCAGACTTTGTTTAAACTTTATTTAATAATGATCCATCAGACAAAATATTGGATTTACATTCTGATTCTGATTCG:1 + chr2L 14191474 5' + transib2 2534 1 66.67 CTCCTCCACTCCACTTGCCACTTACCAGCGCCAGCTTTTCATTTTCCAAGCCCACAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACACAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr2R 21439521 5' + jockey 74 1 59.59 CAATGTTCCTGCGGTCACACTAAAACTGAATTACTATCAGCCACTCTTTATTTCAAAGCCGCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGGTTGCTT:1 + chr2R 5754501 5' + P-element 60 1 44.52 ATCAATTTTACATAACTGCCGAAGATAATGGCTTCGATAGAATATTCCCCCCCTCCCCCACCCCATAACTAGATATAAATGTACCTAAACGTACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATT:1 + chr3R 25713983 5' - flea 235 2 66.43 ATAATAATGAATTTCAACTATAAATCTTTCATAGAAATTTACAAGACTAATCAAAATGTGAATAAATATCGTCTGTATCATACGGCCAGACGGACATAGCGAGATCGACTCGGCTATCGATCCTGATCAAGAATATAC:1 - chr2R 5693135 5' - INE-1 82 1 78.26 GTAAGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 - chr2R 8688158 5' + F-element 72 1 66.92 TATGAACATAATACAACATGGGCAAGTGGCAACGATTTCCTAATACATTCATTGTAAAATCTCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr2R 13293361 5' - roo 8999 2 65.75 GTTGTTGTCGGTGGCTTCCTAGCTTTTTTCCAGCGTGTTTTTCTTTTTAACCCCGTTTTGCTGGAAATTAAAAATTCAAAAAGTCAAAGGCGCAAGCTAGAGATTTGTGATTATTCTGACCATTTTCGATTGCGTTCGCTGAATA:1 + chr3R 31724637 5' - Porto1 4322 1 69.66 GGGATACCATAGAATTTCGAAATTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATA:1 + chr3L 4081611 5' + mdg1 7169 2 69.18 ATAATTAAAATGGGTTAAGGAGTAATGTTTCTGATTTAAGCTTAAATACACTGTTTTCATTAACAGAAAAAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2L 19691346 5' + roo 8714 2 54.11 GCTGGAAATAATTGCGGCCCGTAAATAAGTTGGCAGTGAATGGGAAAATAAAAATAGGCGCCTACGGCAGGGGGAAATCAGGATACGCTTTATATGTATCTATATACATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTT:1 + chrX 18220526 5' - Burdock 6380 2 75.34 AAACCAAAACAAATCTCTTTGAATGGCCAGCAATTCTAAAGGCGATGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTG:1 + chrX 6632959 5' + P-element 77 1 32.88 ATTTGTTGTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCAT:1 + chr3L 27356043 5' - Tc3 1680 1 68.57 GTTTAAAAAAATATATCGCTAAATAAGCATGCCCAAGAATTAAATCAAATTGTTTCATAATAATACTGCAATTATACTAGGTAGTTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAA:1 + chr3R 9583261 5' + Juan 4043 1 69.05 TATAGAATTCTTACGCCATTTGATTTGATTTACTTCAAATGCCATTTAAAAATTTTGAGGTATGCAAGAAATTCTTGCACAATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chr2R 23409189 5' - opus 7466 2 44.52 CCTTGATAGAGCATTGAAAGAAAAAGCATGCCAAATATCCCCACAGTTGCCATTCCTGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chr3R 26846743 5' + hopper 13 1 64.95 AATGCCCCACGTTGGGCGCCAATCATGAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 + chr3L 17439101 5' - Tirant 8479 2 53.40 AAATATGTTTTCAAGTGTCATTATCTGTTGTCAAGACTGTTTGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr2L 14501146 5' - 1360 3342 1 63.72 GTCAGCGCACCCGGTTTTCAATTGTCTGCCTCATGTAAATAATGATACAAAATAATTACTCATTATTTAGCCTTAGAAAATTGGGATTTTTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATT:1 - chrX 12477595 5' - I-element 387 1 70.42 AGCGCAAAGGATGCGAAATGGCCAAACGCAAAAATTATGTAAATGAATTTCCTGTTGCATGTGGTGCCGATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGTCTACCTACATACAAGCTAACGCAAGTGGCACTTGCATCAG:1 + chr3R 18635159 5' - opus 7495 2 78.83 AAAACTAATCTATGCTGCTAATGGCTTGCATAAAAATATTGGTCTAACACACACACACACACATATTCTCTATTCTCTTTTCCGAAAAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGT:1 - chrX 4838587 5' + 1360 389 1 77.39 CGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGA:1 - chr3R 7616840 5' + Stalker2 45 2 54.79 ATGTGCTGCACGCGCGGCGACTAATCTACATTTATTTATGGATCCTGGAACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chrX 388368 5' - 1360 3363 1 69.18 AGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1 - chr2L 21643136 5' + Tabor 6893 2 52.74 CTATTTGATGGCCCGGCGATCGCGCACAGATAAAGATACAGAGATAGAGATACAGATACAGTCCCAGTCATGATTCAATGCCAATTTGACACTTGTGAGGAGTTTGAGATGGCGGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 + chr2R 23212539 5' + Tirant 6 2 78.77 ATGGCAATTTAATGCCACGCTGCAAGTCATTAGGTGGCGCCTGCACCTCTGACCCGGTGAAAACCTGCCCCTCAACCCAAGACCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr2L 12486302 5' - roo 9033 1 62.33 GAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3R 25751885 5' - roo 9006 2 65.75 AGGATGAGGAAGTGGCCGCCAGGCAGCCATGTTTGTTTGTATTTATGTCGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3L 7460573 5' + 412 20 2 71.92 ATTATTATCAATTTATTTATTTAACCATTAATGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chr2R 13293421 5' + roo 90 2 81.51 AGGCTTTCGTTTTTGGCTTCTGTATGGCAAAAGTAGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGGAGATCGTGTGCTT:1 + chr3L 12874892 5' + jockey 93 1 73.97 TAATAGTAATAAATACAATGTAAGAATATTACGTATAAGCAGATGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCT:1 + chr2L 1360945 5' - Stalker2 325 2 68.49 CCACTCTGCTTGCAAGTGGCTTGACTTTTGGACCGCAGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 - chr2L 21910255 5' + Doc 4 1 74.29 GGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAGGCGAGTGTACAT:2 + chr2R 15075592 5' - mdg1 7379 2 69.18 TTGCTCTTAACACCTGATTCAAGGATACTGCCACTTAGCCACTTGTTTGTGTAGTCCTCGGACGAAATCCGAACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:2 - chr2L 3232013 5' - roo 395 1 73.97 TTTTCCATTTGTTCTTCTTAGTTGATTTTTGTATGATTGCTGATTGTCATTTGACTGTGGCAGCGTTTGTTGTTTGGTTTTCTTTGTTATTTTTTTTTTGCTTTTT:1 + chr3L 1074280 5' - gypsy7 5011 1 67.92 GTAATAATATTATATATACCCCTTGATAGAGCATTGAAAGAAAAAGCATGCCAAATATCCCCACAGTTGCCATTCCTGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTT:1 + chr3R 26846723 5' - hopper 1393 1 65.87 AGATTACAATCCCCGAGCAGGCTTAACATACCCAATCTCATTTGTTTCGCACCACCTTCCACCTTCCAGTTCCCATCTCCAAGGTGCCATAAAAATTCGCCAAGCCGCAACATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:1 - chr3L 22226162 5' + jockey 4769 1 76.03 GCCGCAATTGACTCTATCTGCACGCCCTGTTTCAGGATCGAGTGAACACTGTAGGCCTGGTGCATCTTGGCCAAGTGGAAAAACTTCGGTCTCCTCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAA:1 + chr3R 18274289 5' + G2 2960 1 69.23 GAACTGTGCCAACTAAATGCTGTTTACAGAAAGTCTTACACGCTAACTTAGATACATCATCATTATTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 15295824 5' + roo 53 2 55.48 AGTACCAATTATATGCGGTCGAAAAGTGCGAGGTTGGAGCCCAAAGTCGAACTTTTTAAAGCTATTCTCATAATTAAGTGAAATTGGTAACAAAAATAAGAGAATTACTGCACTCTTCATACGTCTTTTCAAATGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 2415078 5' + FB 175 1 67.81 ACTTTAACACTTCAAGAGCCTGTGAATCACATACACTGCAAGAAAAGCAGTTTTTAAATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTT:1 + chr2R 12678109 5' - 297 397 1 60.27 AAATATTTAGTGACAAGGACGAGCCCAATAAAGGACTCCACTCCCACTGCAATCAAACGAAAGTCTCCCTTAACTCTTAAAAACCGATGCAGAGTTTATCTGAATACGGCTTCTGGCACTTGGCTTTTCACATTCTGATTCGTCTG:1 + chr3L 72125 5' + INE-1 284 1 60.96 TTTATCACCAGTGCCACATTTACCGCATTTTGAAGTGATTACCCAACTGCGGTTGCCATTTAATGTGTTTAAAATATTTCGAATTAAGCCGCTTTGTATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGT:1 - chr2R 11095876 5' - diver 208 1 71.74 TTAAAATGTTAGAAACCCCTTCTGAAAATAACAATTCCTTTTTTAATACTTGTATTAACCAAGATAATATTAAAAATATGAAAACAGTTTTGTAAAAATGTGGGCGTGGTACGTCACTTTCACTTCACAATTTCCTCATATATGGA:1 + chr4 857106 5' + Q-element 31 2 78.08 AGTCCATCCACTTCCATATCGCCCCATCCCAGTGGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCG:1 - chr3L 15856104 5' + accord 7110 2 64.95 CTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGAT:2 + chr3R 10437049 5' - BS 5030 1 59.59 ATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1 + chrX 1103622 5' + pogo 71 1 67.12 GAATCGGAATCGTTATTGAATTAGACGAGAAAATAGTGGTGGAGAAACATCGATGTTTCCGATTTGGCGAAAAATATCGAAGTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAACTGGCCATGTCCGTCTGACCGTATGA:1 + chrX 646805 5' + INE-1 121 1 59.85 GATTTACATATGTACATAAATGTGTGTACAATACGTACCTATTCTATTCTATTCAAGCGACCCATTTTAACAAACTGTTACTCATCTGCATCACAAAGTTTTGTTAAGAATCATAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2R 13830282 5' + roo 7 2 58.22 AAGTTTCTGCCAACTTCTCAGCGAGTGTGAAAGAGGAGAAAAGTTTTTACTTAAATTTTTTATATTATTTTTGCTTGGTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGATTTTGGAAGATTAGAAGCGTCGGT:1 - chr2L 17056444 5' + Burdock 145 2 54.11 GAGCCTGAAACGTCGTTAACAGCCACGTTTGCGTGTGTGTGCGCTTGTGTGTTTGAATGTGGGCAAACATTTTGAAAAATGATTGAGAAATATCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCTAAGAGAGCGGG:1 + chr2L 9740322 5' - F-element 384 1 41.10 GGTATGGCACTGCATTTAAAATTATATCGGTATTGGGACAGCCAATGTTATAATTATAGTTGCAAATGTACGTGTATTAGCTTGAATTCGGAAAGGCTTTGATTGCTTCCGTTCGAGACTGCGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTT:1 - chr3L 18559463 5' - opus 7299 2 71.92 GTTCAGAGTGGCACAAGCTCTCACACATAACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATA:1 - chr3R 20899032 5' + Quasimodo 111 2 80.49 TACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAAAAGGCAGAAGGAAGAATTTCCGACCATATAAAGTATATAAAGTATATATGTATATATCTTGATCAGGATATCCGTATGAACGTCGAGATTTCAGGAACTATAAAAACTAGAAGGTTGAGA:1 - chr2L 22211546 5' + INE-1 162 1 47.95 GGCAAGACAGTCGAAGCGACGTCGAGATGCATGTCCTCGAGGGCCGGAATCGGTGGGTTATATACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 19435978 5' + roo 28 2 56.56 AACTCCCAGCCTGGTGTGCTGGTCAATATGCAGATGGCCAGCTCAGCGAGCATTAAACGCTACAAGCCTGAGCTATTGGCCTGGTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAA:1 + chr3L 10341004 5' - roo 8955 2 57.53 GGCGGCCAGCTGGTCACTGCAACACATCCAATTAATGAATGACAGTGGAGGAGCGTACGAATTCTTGAGATTACATACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCTTGATGGCAAGCGCCATGCAATCACATATAATATGTGCAGAGCTCTC:1 - chr3R 9291525 5' - baggins 5227 1 55.48 GAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGC:1 + chr3L 3453631 5' + Tirant 8179 2 77.60 ATCGAAAGATTCCAGATCAACAGAGCGACAGTTAAAGAGGGTTACACTTAACGTACATGGGCCATGTGTTGTGGGTGTGTGTGTGTAACTTTAAGCGAGCCACAATAATAGTAATAATAACAATA:1 + chr3R 9548952 5' + mdg1 19 2 68.80 ATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:1 - chr3R 14049409 5' - transib2 2739 1 74.66 GAACTACCCGACGTAGGTTACCAGACCGAGAAAACTCAGTGTTTCGTCTTTGTTCTTTGGGTCTCTGAAAGATCGTATGACGTAATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTT:1 - chr2R 2944651 5' + R1A1-element 5041 1 69.67 GTATATGCTACATATACCATGATATGCTACATATCTATGATACATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr2R 17169282 5' + hobo 56 1 67.74 CTGACCGCCACTGTAAGTTTTTTGTTTCTAAAAGAATTCCCACATCGAAGGCGGTCAACGGAAATGCAATTGAAAACTTTAAGAGTTTCAATGAACTTTTTAGATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTC:1 - chr3R 14849838 5' - hobo 2573 1 71.23 GTATTTTCTTATATACATTTTTGGTGAACTTTAGAAAACTTAGCTATTAATTATACTTCGATTTTTACCTTAAACATAGAAGGTAAACAACTGTATTCACATCTATTATTCATAAACGGGATAAGTGCATTAATTAAGGCATGCAA:1 + chr3R 16909105 5' - diver2 414 1 71.92 ATATTAAATAAATAAAAAAAAGCTAACAGCCATTTTTTTGCATGCTTTTAGGGAGCATTATTTTCCACAACATACTTTTACCAAGTTACGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chr3R 31749055 5' + jockey 71 1 58.22 TGTTGGCAATTTGTTGGATATAAAAATTACAACGCACCCGCCCCTCCACCAACGTCTGAGCAATGAAATATTGTAATTAACTTTTCTGCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAA:1 + chr2L 12144166 5' + transib2 14 1 72.87 TTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATA:1 + chr2R 5582145 5' + Cr1a 464 1 61.64 AGTGCCATCAACTCGATCTCGATCTCAGTAGTTCATCTTTTATAATGCCCACACACACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 + chrX 2295121 5' - Transpac 5170 2 58.22 ACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCC:1 - chr3R 24454877 5' + F-element 277 1 51.49 TTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTTTAAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCT:1 - chr3R 545851 5' - TAHRE 10409 1 74.66 CAAGTCACATTTATGATATTGACATGACTAATCACATTTTGCTTCCTTTGCGGACTCGATATTATACCAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 + chr2R 12371047 5' - I-element 5306 1 51.37 CTGCTTCAAGAGAATGGGAAACGACCCTATAAAGAGACTCTACATGGGGAGAACTAAAAATACAAAATATAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTCAACTTATTT:1 + chr3L 2192268 5' - jockey 4936 1 46.58 AATGCAAACGGATATCCCGGTTGATAAATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAG:1 + chr2R 23106589 5' + jockey 4566 1 80.00 ATGCTAATTACTTTCTCCATGACGCGCGCCACTTTCAGGTTGATGCGCAACGTGCGAGCGTATTCGTAGTGTCCAGTGTGCCCAGCTCTTCTTGTTTGCGATCTCAGAGCTTTTCTATCCCAGGGTTCAAGTCTTTGCTAGAA:1 + chr2L 1170806 5' + X-element 273 1 50.35 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCACCTTTCTGCTGGAAAAATTAAGGAAAAATGCGGTGTAAATGCTAGTGTGGCAACGGTAAAAGGAAGGAGGAAGACAATTTAGTGACACTGGGACCCTAGTTGAAGCAA:1 + chrX 14768478 5' + Tc3 1310 1 76.71 CATGGCCACGATAGATGGTTAGACTGTCGAAACCACAATTTCTGCTGGACTCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 + chr3L 11803976 5' + blood 70 2 64.38 ATGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATTTCATTTGGAAATATCT:1 + chr2R 9870971 5' - roo 9022 2 52.14 AAAAAGAAAATTATATATCATACATTTGTGGACAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr2L 15081027 5' + Doc 27 1 67.81 CCTTGGCTATTAGTTTGCAAATTTCCAAGTAAATACGACGAATTTGGCGAATCAGCGAATCACTCGCTTCCCATGCTGCGGCACACACTCACACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAG:1 + chr3R 14031944 5' + hobo 2703 1 70.55 GTTGCAGCTCCAGATTAGAAAGCTTAAGTCCCTGGTAAGAACACACATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr3R 18205765 5' + 412 12 2 74.48 AACTAATGCGTGAACTCCTGCAGCTTGGCTTATTTTCATGCCCTGTTTATTGCTGGTAAGATTCGGCTGTGGTGCTGTCTTGGATTCGAGATGAGGTGATTATGTGTAGTTGCGAGCCGGAGGCCAGCAAGGTGCGATAAGGAACC:1 - chr3L 24888101 5' - G3 448 1 65.07 GCAGGGTTTTATTGGTCAAGCTCATTTTTATCGGTTAAAAAAATGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGTTTTATTT:1 - chr2R 5433981 5' + Transpac 71 2 67.81 CAGGTGTGTTACCTTTTAGTGTGTTTAGTGCTGCTGAAAATTCTAGATATGTTAAGGTTTTTAATTTTCTTAAATGTTGTTACGTGAAGTTAGTTTTCGCAGTAAAAACTTATGGACAAGTCCAGAATACTGGCACATAT:1 - chr2R 5617096 5' + X-element 90 1 67.86 AAAAGCTGCAAGACAAAAAGCGAAAAAAAAAAATACGAAAAAGGTAAACGAGTTGCCAACTAGGGACGCAACTAAGGCCAACGAAAGAGATCTAGGAATAAGGGATAGTGTATTAGGAAAATGGATGAAGAAATATAACGAAAAGA:1 - chr3R 9534901 5' + Bari1 1654 1 60.27 TGGAAAGTTAATTTTCCCCTTCGCAAGGTCGATTATCAATCAACATTTTCCACCATGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTG:1 - chr3R 23235331 5' + BS 36 1 54.11 TGCGAAGTGGAGTGCTCCTCCGCTATCTACCTTGGATGAATCTCTGTACTACACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr3R 23597056 5' + jockey 60 1 52.05 GCGTGGCATTTGAATATAATAATAAACACAACTAAGGCCCGTGGAGCTAACGAAGTTGGGTGTTGTTTTAATGACGCATCTGTAAGTACAACGCATATTGGTTACTTAATAAAATCTCTAACTTTCATAACGACCTTTACATTAAC:1 + chr3L 7293981 5' + gypsy7 438 1 52.05 GACTCCGAAGACGGCTTGGATGCTGTGTATTTGTTCTCGTCTTGTTTCACTTAAATGACACTTTGCATTCTTGTATGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCA:1 - chr3L 12599208 5' + Tirant 8270 2 63.56 AAGGGACAGTTCACTTAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3R 28450761 5' + roo 8720 2 60.27 ATTTAAGCGCTGCCAGAAGTAACATTTATTTAAGCATCAACATTGCTATAACCACATACCCAAGGTGATTTTAACTAGTTAAGTTTTATATTAATGGGTAGGTGATGAAGTTATACTGATAATTTTTGGTGTTTTTGAAGAAATAA:1 - chr4 57163 5' + Tc3 1556 1 58.22 CATTTAATTTACAAAGCAAAGTGCACGCTTTCCCAAAAAATCCAAATATAGGTACAACAGTGAAAATCTGGTAAAATGAGAGCATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGCTGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGT:1 + chr2L 1458071 5' - roo 8603 1 56.16 CCTGCTCTAGTTGGCCAACTAAGTTATGAATAATATCCGGCCATTTTTCTACCCTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGA:1 + chr2L 18630405 5' + G-element 11 1 79.45 CATCTTTAGCAAGTACAGGTACTACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGA:1 + chr3R 8217962 5' + P-element 65 1 23.21 GATATCTTCATTTTCAACCAAAAACTTATGTACACCTCGCAATAACTTGTGTTAACTGGTTAACAAAAACTTACCGTTAAAATCAAGTGCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTTCCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3L 12964691 5' + hobo 31 1 63.01 GCCGGCAACGTGCAACCAGCAACATGCAACTTCGATCTGCTGACGTTGCACTTGTCGCGATTTCACATCAGTTTTTTTTCTGCTGTTATTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATC:1 + chr3R 19380879 5' + Tc1 1591 1 59.59 TGCTCCATTCCTCCAGCGCGAGTGTACAATCAACAAAATTAGTTTCATTTGGGCAAATGGCATGGCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 - chr3R 25804266 5' - mdg1 412 2 78.77 ATCATTTACAATAAACCATCTTCAAAGCAAATGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAA:1 + chr3R 17099919 5' + Tirant 59 2 75.86 TAGGCTTAATGCCGGACAGAGATTGCATTTTAGTATGCACCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAG:1 - chr2R 23212677 5' - Tirant 8431 2 71.43 GAGCAAGGCAAACTGCTACTATATAAATATACGTGTATATATAAATCGAAAAACTGCAAGATTCTTTTTACCTTATTCATTAACTACCTCCCCTTAGTAATAAAACATTCGCGTGTACTTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATT:1 + chr3L 3439851 5' + Q-element 578 2 58.22 GTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chr3R 23601760 5' + jockey 79 1 65.07 CAACTAGAAATGTAGCTTTGCACTTTTGTATAAAAATCTATGATAAATAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTAC:1 - chr3R 11151954 5' + mdg3 5266 1 74.66 GGTTTTGGCCTAATGACAGATTAAACACATTCTCAAGCGATTTGACAAGATCGCCAACGAAAATTGCGCCGAATCCTAGAAGTAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCACGAAAG:1 - chr2L 6706464 5' + F-element 346 1 48.63 GCTCTAAGTGTAGCGGTAAAACTAAACCCCCGACGTCGAGCACTAAGAATACAGTTTTTTTTTCTTTGTTTTTTCGCCAGCCACCTCTTGACTATAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chrX 3646868 5' - 412 477 2 68.15 CCCCAGAAACCATTTTAATTTATAGACGCAAAACACTATTTGCCATTGTCACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 28450614 5' - roo 389 2 71.23 AAAGCGTTTATTGAAATCGAAAATACATGCCAATAATAATCACTTGCTGCATTTAAAGAATATTTCTAAATTCTGCCAGCACTTCAAAACATATTTAAGTAGTAAAAGAAATTAATAAGTTCTTGGGAAACTCGACTATAGCATTC:1 - chr2L 3963550 5' + INE-1 571 1 76.03 ATTTATGCATAGAAAATGATATAGAATTCTTACGCCATTTGATTTGATTTACTTCAAATGCCATTTAAAAATTTTGAGGTATGCAAGAAATTCTTGCACAATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chr2R 23409208 5' - opus 7487 2 44.44 CTCTCAGATCAGGACAAATGTTAAAATTACCTTGGTATGGCATAGTAGTGTGCAAGTAAAAAGGTAAGATCACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCT:1 - chr3R 4972188 5' - roo 8694 2 53.42 TTTGTTTGTATTTGGTGTGCGTGAAATGGGTTGAATGGAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 - chr3L 15364918 5' - 1360 3346 1 51.45 TCTTTATTTAAGGTATTTCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTATTATT:1 - chrX 20880678 5' + invader4 2809 2 57.25 TTTAACGCTGAGAAAATTCAATCATATTCCAATTAATTCATTTTCACATCAGCGGAAATAACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr3L 4641004 5' + jockey 69 1 59.59 TTTGGACGTCAGCGGTTCAATCGCCCAACTGTCGCCACATTAATAAATCAGTTTAATTTAATTCAGTTGACAGCTTTAAGTCAATATTGTTGATTAATTGTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 - chr3L 11396053 5' + I-element 21 1 71.92 TATAGGGTAAATGTGAAATTAAAAAAAAAAACACTCAGTACTAAAATAGAACGCCATAGCAAAACTTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAA:1 - chr2L 21698350 5' - 297 345 2 57.24 AGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATTTAATTTTATGCAACTGTGC:1 - chr2L 13332697 5' - micropia 5365 2 71.92 GAAATAAGTTTATATCCTTTTTAAAGAATATACTCTTAAAAAATAAATTTAAAAAGTTGGGCATTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCGAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAG:1 + chrX 22596288 5' - INE-1 577 1 80.14 ATGAAATTGGTGTTTTAAGCATATAATCCTCGTCAAGAGCCAATCGAATGCCGATTGCTGACCCATTTGGCTTAATCCACACATTTGCAATACTTCGTTCTCGATTTCTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAAC:1 - chr3R 18210881 5' + Tirant 8504 2 51.05 CCTAGCATTTAATTGGATTTCTGTTATAGCCATTGTCAGTTGTTGTTGTAGTTTTTGTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGGCGTTTGCCGCTGCGAGAGGAGCG:1 + chr3R 9601015 5' - Doc 451 1 39.72 GAAAATCGGTCATCATCTTTTTCACAATTTTCATCATTGCTACATCATTTTCATTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 + chr2R 5237694 5' + Doc 19 1 59.57 TTCAGACCCGTCCTTTTATGTTTTTTTCTCAATTCAGACGCAAGCTTTTCCAGCTCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACT:1 + chr2L 4420459 5' + gypsy5 6940 2 80.80 AATCATTGTTTGGAGGAAGCGCCAGATTCTCTCACACATAACTAAATACATGCACGAATATGCTGCCGTTACGTGTAATCAAGAAACAAGAGAGAATGCTATGCCCGACTATCAAATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAATGCGAA:1 + chr2R 25196957 5' - INE-1 531 1 55.48 AGAATGAAAACTTAGAAAAAGAATCGCAAAGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTAT:1 - 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297 6916 2 68.49 CTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCT:1 + chr2L 18630458 5' + G-element 47 1 54.26 ACTTTTGCGGTGGCAAACTCTGGCACGAACGCTCCGATTTCATTCCAGGTCCAGAGACCACATAAGAAATACCAAAGACCAGAGGACCAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAT:1 + chr3R 16820869 5' + roo 395 1 60.96 TGTGTCTCCCGTTTTGTTAATAGCGCTGGGTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGA:1 + chr2R 19852169 5' + Transpac 88 2 78.08 GCTGCTTTGTCGTATTCAAATTTCCCAAAACGACGCAAGAGAGGGCGGAGCCAGCCATTGGGTGGGAAAAGTCATAATTTTCTTTTTTCGAAAATGAAAAATATCTACTGCCAATGAATTATGGAAATAATACCAAGCTTCCACTG:1 - chr3L 13781622 5' - BS3 368 1 78.08 GGAACTAAAAAAAATAAATCTAAAAACTAAAACTTGATGGACCTGTGTCAAATAAAAAAAAACCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACA:1 + chr2R 4728548 5' + F-element 4223 1 54.55 GGTGCCTTCCATTTGTGGGGCATGACCATTTCCTACACAAATCTCTCTAATGTGGTAGTGAAAATATCGCAGAAGAGTTCACCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAAACGCAGCGGCTACTCTATCTAGG:1 + chr2R 19364678 5' + R2-element 339 1 56.64 CCAAACACCAAAACATAGGAACCAAAAACCCGAATGGGGCGCTTATATATTATATATATGTATATATTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr3R 24564723 5' + opus 148 4 63.08 GTGTTGGTGGGGTTTATGCCGAGGGATTTCAAGAACAAGTTCAAGAATTTATGTTATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGATGCCTCCAGAA:1 - 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chr3L 15364891 5' - 1360 3311 1 71.92 ATTGTTCAGATCCGCTGTGGAGCAGGGAGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:2 + chr3R 23161232 5' + 412 7082 2 64.38 CAAATTGATTTAACCGACATTGCTTGTTCAGTACGAATAACCAACGTACGAATAACCAACAAGTCAGGTGTCAAACTTAAATAATAAAACAAAGACAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGCCAGACTGGACACA:1 - chr3R 2785293 5' + Chimpo 86 1 67.12 AAAATAGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTTAATAGTGATCTGTCCGTCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGGA:1 - chr2R 10547831 5' + INE-1 138 1 71.72 GCAACGAAAAGAATGAAATCAAATTAGCAACACACTCTGCGAAATTGGCACTAATGCAAACTGTTTTTAATGCTTTTATCTCATGAAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 + chr3L 20251887 5' + copia 4905 2 60.96 CACTGCAATTTCACTTGCCCATTGGTATTTGGCCCCCAGAGCGAGTTGTATAACTATTTATGTGAGATCGTGTATATAGACCAGGCGATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAA:1 - chrX 7707148 5' + BS 5075 1 59.31 TGTCGAAACCAAGCCAAATGGAAATGCGGTGAGCTGGCCATCTGGCATTTGGTCAATTGGTTTTTATGGAGCACAATAAGTCGCATGCCACTGTTAGCAGCACGACCTACTCTTGCAGCG:1 + chr3R 25535877 5' + Chimpo 3883 1 50.83 TAATAGCTTAACCGGATCATCTTATTTCTAGTATGGACGTAATGCAGCGCTACGTATCGCCCGTGAAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 - 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hopper2 1543 1 58.90 GACTGCGACTGCGATTTCCCGAATAACCGGCAGAGAAGAGGACGTGAGAAAAACGCGTCTTTCCGCTTCGACTTCTAAAATTTGACTGTTACGCGTCTGTAAAGCATAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACA:1 + chr2R 11106730 5' - Ivk 38 1 71.92 CAAACAGAATGGAGAGAGAACTATTAAGTCCGATTGCCAACTTTCACTGATAATGCCAGCAATTATGTATTGCTCCAGTTAAAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACTCCGCGTCGCGTGATCTT:1 - chr2R 14124768 5' + G6 91 1 56.16 CGGCTAAATAATTTCTGCGGCTACCGTGCGTTCCCCTCCATTATAAAATATAGCGATTCGTATTAAGTTTTGCACTTTAGATTCGATTAAAAGGAAAATTAAGTGATATCAAAGTAACGCTTCATCATATTACTGATA:1 - chr2L 17018987 5' - Rt1b 4766 1 79.71 GATCAAAATATAAGAAAAAGGAATTATTAATTTAACATACATACACTGGCATACACTGCCAGAAAACGTTGAAAAGTTTTTAACAGTCAAAAGCGTTTCCGACCATATAGAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAG:1 + chr3L 27171027 5' + INE-1 90 1 65.52 ACTTAACAAAATTAAATATATTGTAGTATACAATAGGCTACGGAGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTACTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGTTACTTAA:1 + chr2L 3813589 5' - Ivk 5219 1 69.86 CTGTTAAACCGCTCAGTAACGAAGGACACCAGACGATCATTGCTGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGCTTTTTTTGACACCCTACTCGC:1 + chr2L 17380634 5' - 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Burdock 220 2 53.33 GGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 5422935 5' - roo 330 2 69.86 TTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAACGTTAAACA:1 + chr2R 5237754 5' + Doc 77 1 68.49 AATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 + chr3L 16015244 5' + 1360 73 1 69.93 CGTTAGGGTACCCCACTCCCATTCGTATCCACCAGTTGGTGGCTTAGGCCGAAAATCTGCAACCACTCTGGAAAATAAAGTCCGTTTATACAAAGCTATAATAAAGCCCGTGTGGACTTATGGCATACAGCTTTGGGGTACTGCC:1 + chr2L 16813702 5' + G4 3440 1 69.66 GCTGAGTCAAGTGGCAAATGTCCGTCCGTTAAGTTTTGGGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 5422984 5' - roo 9050 2 67.63 AGCGGAGAGGGGTTTCCATACAAGCGGTAAGGTACTATATACTATAAACATACATATTATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCACTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - 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Cr1a 191 1 58.22 AATAGTAAAAAAAAAAATGAATAATAAACCTCCTTATTATGACTGCATAACTTTCTTAAATCCGTTAAACATTTCAACTAAAAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTT:1 + chr3L 5167995 5' - roo 372 1 54.79 ATCACCAAGAAAAATTGAATATTTCCGGGAGAAATGCAATTTTCAATTAAGATATTTCAATCGAGAGTGATGACATTAAAGTAGAGGATAGAATAATATTTCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2L 19674049 5' + roo 15 2 45.89 CACACTTCTCACCGCAAATTGAATTTGCACTAAGGATAACCAAGCCAATATTAACTATCTCTCTAAATGTACATTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTA:1 - chr2L 5645668 5' + jockey 4786 1 51.37 GTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGATTCTGACCATATTAAGTATATATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 + chr3L 19471447 5' + mdg3 5292 2 56.72 ACATTTTTCATATTTTAATAAGCTAAATTTTCATTTTAGCTTCGGCGTTTGAAAGTCATATTGAAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chrX 20975848 5' - copia 233 1 55.48 TGTTGCATGCATAGAAGATACAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAG:1 - chr2R 18611966 5' - P-element 2788 1 17.24 AATAAACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAG:1 - chr2R 4206663 5' + 1360 314 1 76.55 CTTCTCTATCCTTCGTTACGAGTAGCGAGTATGATCGGCGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGATCGTTGGCCCACATCTGACCACATC:1 - chr3R 2637714 5' + gypsy5 63 2 65.62 CCTTTTGCACTTTGCTGTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3L 10469633 5' - roo 9030 1 56.85 CCGCTTGCTGCATAACCAGTCGGTCCAGGACAATGTCCATGGCCTTCACCCACATCACTGGTTGTACAAAGTATCTAAAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAG:1 - chr3R 16997517 5' + G6 9 1 79.45 CAGCGCGAGTGTACAATCAACAAAATTAGTTTCATTTGGGCAAATGGCATGGCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 - chr3R 25804253 5' - mdg1 7437 2 69.86 ATAATGTAAATTTAATTCCTAAACATTTCATGTTAAGAAGTAGAACAAATAAATATTATGAATATGTGTGTATATAACATTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAA:1 + chr3R 18420275 5' - Transpac 214 2 57.97 GAGAGGAGACACAGTGCCGAAGAGACGATACTCTCCAATAGAAACAAAATAAATAAAACAATTCCGAAAACAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTA:1 - chr3R 1267672 5' + P-element 2713 1 52.74 GTAATTTGCATTTTTAAAGCTCTGTGTGATTTTTAATGCCTGTGCTTGCGAAGATTAATTACACCAAATTAAAAGGGCATTTGAACACTTTGTGTATTTTTAACAGAATCACAAAGTTGAGTAAAAGTTTCGCGCCAATTTTGCTT:1 - chrX 12202803 5' - transib3 190 1 46.58 AAGTAATAATAAGTACTTATTGGATTACTATTCAATTATTCTTAACCATTTAATATATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTATTT:1 - chr2L 13139082 5' - McClintock 418 2 66.44 GGGTAGGGGGTATATGAAGCAATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chr3L 7791857 5' - Transpac 299 2 73.64 ATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGGGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAGAGATCGTTGCCTCC:1 + chr3L 7791915 5' - Transpac 265 2 60.00 AATGCGGTCTGAATGCCCCCGCCTTCCAAAACTTTTGGTAATTTCCCGTCAGCCACAATGCACTGAGGAAAAGCACTTCATAGACAAGAAATATACTATCCTCCGGGTAGGGAGATCG:1 + chr3R 16564070 5' - 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chr3L 19031331 5' + roo 57 2 57.53 CATCGGAACCCATTAGCGTGAATTGGCGAGTGACCGGCAGCGGCTGCGGCTCATATGACAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 - chr3R 31141088 5' + Burdock 6164 2 66.44 GTCTAGTGGTCAGTTTTTGAGTCAATCTGTAAAACTTATAACTGAAAGTATTGTGTATCTGCGTAGAGTTGCAGAAGTGAGGACCGCGTCTGGAGTAATAATGCGGGCAGTGAACAAGCTGTGTCTGCTT:1 + chr3L 22771739 5' + diver2 4465 1 50.77 AAATGGCCAAACGCAAAAATTATGTAAATGAATTTCCTGTTGCATGTGGTGCCGATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGTCTACATACATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chr3R 18635174 5' - opus 468 2 65.07 GGTGGCACATGGCTCCGATGATGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAG:1 + chr2R 22746023 5' + jockey 4781 1 68.97 GACTGCCGCAAGAAACACTCAAGTTATAAAGACACGAGTGGATTCGACTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAA:1 - chr3R 10213113 5' + P-element 71 1 36.99 CGTGAAAAACGATTGGAAAACTATCTTTCTCTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 + chr3L 18484400 5' - hopper2 1558 1 65.14 GGTCCAGGACAATGTCCATGGCCTTCACCCACATCACTGGTTGTACAAAGTATCTAAAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGC:1 - chr3R 16997496 5' + G6 30 1 65.07 AAATCTAAAAAAAAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGCATCAAACCAGAACATTGGGA:1 - chr2L 21643152 5' + Tabor 6870 2 61.87 TTAGTGTCTGGCAACAGTGGCTATTAAAGTCTTAAAAGGCGTGGTCAAATCGTGGGTAAGTCATTTGCTCAAGTATTATGAATAATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATAT:1 + chr3L 465945 5' - Juan 4191 1 67.67 GAGCTGCAAAGAATGAAGGCTAATGTATTGCCGTGTACTCTGAGATGAGAATGAATAGAACGAAATTAACGTCTCGCAAAAGAGGGCTGGTTAATCTAAATTAAGGCTATAGTAGATTGTAATAATTAACATTAATATTATTATTA:1 - chrX 7374291 5' - mdg1 7080 2 72.60 AGTAGCATGTGCATTTGCCAAATCCCATGCCCTACCCATAAGCTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 + chr3L 15364824 5' + 1360 74 1 70.14 TACGAGCAACATAATCGCAAAGTAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr2L 14239114 5' + 412 7090 2 60.27 GTCTTTGGACCACGCCGCAATAGGACGATAAGAAGGAAGTTTTTCATCGCGGGGAGGAGCGGGGGGGAAGTAGATGTCTGTCAGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAAAGCGGGGTGCATAAGTA:1 - chr2R 5043845 5' + invader1 184 2 56.45 GAAATATTCATATACCAGAGCTGAGCAGAAGATGTTCAATTAAGATCTAATACGTGGGTGTGAAATTTATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAA:1 + chr3R 16538349 5' + G2 2620 1 54.96 GCCCAGCTGTTTGCTGCAATCAGTAGCTGATCCAAAGTAACAAAACGCCCGACTTAGATACTAAAGATAACAGTATACAAAATTCGCATTAAGTGTTCATACCCAAAATCCACCATAACCAGAAACAAATATAAACAAAGTGAGGA:1 + chrX 11882288 5' - Transib5 2633 1 71.23 GCTTATATAGCGCAATATACAATGGGCTTTATTTTCTTTCCTTCTGCCTGTCACATTCTTTTCAACGATACCCTTTTACCAATGACACTAGAATAACAAGGTGCGTAACGGCCATAGATTGGTTTTGCATTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3L 26043392 5' - 1360 3343 1 75.34 ACGTTAAACAAAGATATAAATTATTTGCTAAGCTTACAACACTATTTAAAGGGATTACTATCCCTCGTTTAAAAGATTGATCGCACCGTCTTGCGATACTTTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGC:1 + chr3R 26772467 5' - Gypsy6A_LTR 338 1 54.11 TAATGTAAGAGTATCGGAGCTTTCGGGAGAAGAGCTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATATAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGTGTCGGTCATCGCCAC:1 - chr3R 15139340 5' + Burdock 6290 2 75.78 GTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr2L 14239139 5' + 412 62 2 58.22 AAAGTGTAAAACTTGGTAATACTCTGGCAGGCCAAAAGATACACTGAGTTCCCGAATCCGTTGTATTAGTTGAAGAGAAAGAAGAATGATCATATACTAAATAAAAACCAAAAACAAAATTTACCGAAAGTTTCACTAAATCGTTT:1 + chr3L 21846284 5' + transib2 127 1 59.59 TAACTCATTTTCGGGGAAGTGAAGACTCCGGAAAGTAAACACAAAACTAAATTACGACTCTTACTCTCGTCCTTTTCGCCTCTCAGTAAAAAGTATTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTG:1 - chr3L 18035614 5' - mdg3 221 2 55.48 CCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 28450729 5' + roo 8750 2 81.94 GAGCCAAATTGATGGGGAGATTGAGCAAATTGCTGGGAGGACTGAGGACATTTGGTCCTTTTTATAGGGCTACTTGGCATTGCCCCATAACTGTG:1 - chr2L 12526911 5' - F-element 4278 1 77.89 AAATAAAACAATTTAATAGAAAAACATACATGTTGCCGATAGAAATTGGCATGACAAACAATAAAACAAAGAAAAATAAAAACAAGAGAGAATGTTAATTCTTAAGCTAAGAAAGGAAGGAAAAACATATAAGGACATTCAAAAAC:1 - chr2L 22095408 5' + HB 420 1 65.07 TTTTTGCTATATGCTTTAGTATAGGAAAACCTACTTATCATGCTTCACTTTGCAGACAATCAGTACATCGTTGAAAAGGAAAAAGAAGACCCTTCATATATAAAACAAAAAAAGGCGTGCAAACTTATCTAGGAG:1 + chr3R 26051553 5' + Tc1-2 1221 1 68.15 ATAATCCGTCAGAAAATGTATAAGATATGTAAGGAACAAAGTGTCGAATTAGTCATGCACACGAGTTTTCGTCTTTACATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr4 916274 5' + roo 8706 2 56.85 AGAAAACAAACACCTTTGGGATGAAAAATTAAATTCCGTCTCCGACAAACAAGTCGTGACTTGGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGT:1 + chr3L 14956292 5' + transib2 2772 1 56.85 ACTCACATGTTTAAATTTCTTATCAGCAGGACCCTTATCTAATCGTCGGAGGGAAACGCAGTTGTTCATCATATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAAC:1 - chr2L 170545 5' - R2-element 3367 1 53.10 AATGAATGCTCAGCAGAATGCTGTGTATTTTGATTTGAGCTTATTTGCAGAAATATTACATTTTAAACTAGTTCTCTTAAATATTTTTTTTTAATGAATCGCACGGGTCCCACGGCTACACCTCCCGCCCAACCGACC:1 - chr3L 25435940 5' - Cr1a 4424 1 75.36 TTTCACAATTTTCATCATTGCTACATCATTTTCATTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr2R 5237713 5' + Doc 34 1 47.45 CCCTAACTACAATACGTGTGTATTATTTGTTAAATTTTGTAAAGAATATTGTTATATTTAAGCACTCCTTTACTTTGATCGCACGATTGTAATATTTTACAAGCGTTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 11944781 5' + roo 15 2 76.71 AAATAGTTTAACCGTAAAAAAAGAAAATTATATATCATACATTTGTGGACAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2L 15081010 5' + Doc 8 1 79.17 CGTCATTGCAACTCCGGTAAAACGCAAATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 + chr2R 18689118 5' - Burdock 6354 2 60.27 GAAAATGCACTTCCATTCGGGTTTAGTCCAATGCAAACGGATATCCCGGTTGATAAATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTT:1 + chr2R 23106560 5' + jockey 4538 1 60.27 ATTTGACATTTTTAAGTTATACTTTTTTTTACCTTACATGCTACTAGAAAGTATGCAGTGGAATTTTAACACCTCATTGCTCAGCCAAAAATAAGCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 + chr2L 13842239 5' + jockey 4697 1 62.33 ACCCACCCCACTGCTTTAGCCACCCACCGCCCACCTCCTCCACAGTCAGCCAGCTCAGTTGACTACATTTTTTTGTTCTCTCTTTTTTGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTCAGCGTTCGCTGAATTAGCTGT:1 - chr3R 21965816 5' - Porto1 4316 1 67.12 GGTGCAGCTGCCGTGGCAGCATCATTAGCTCTGATTTGCCATGTGCACATGAACTGGCTACATACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr3R 12609289 5' + 297 42 2 55.71 ATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCATCAGGCGTGGCATCCAGTACACGG:1 - chr3R 21395218 5' + G2 477 1 65.19 TATGAAAATGCAAATGTGCTCGTCGTGCCATCTCTTTCTGCCCATGTGGCCCCATCTCTTTCTCCGCACAGTGTGCGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTGTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr2L 16615738 5' + hobo 27 1 63.49 GTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3L 10469617 5' - roo 9030 1 55.81 CTTTCCTACGAAGCAGAAAATGCCCCAAAAGAGTTTTCTTTTCGGCTCCGTGCCAGATTTCACTTTTCTTTTGTTTTTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 486699 5' + roo 44 2 54.11 TGCCAGGATACACCTACTCATCCTGCTTTTTCCTGTGCCGCAGAGTAAATTATGCTAATGTCAAAATAATGCATATTCGATGAAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCT:1 - chr3L 10312354 5' + roo 174 2 56.85 GAAGGGATTGTGGCAAACGTATTGAAATGTAACGCATTTATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAG:1 + chrX 7480721 5' + Bica 338 1 74.64 ATGCTATCAGCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr2L 4929792 5' + blood 29 2 58.33 GAGGTTGGCAGGAAAGAAGGAGAGTACTGGGTAAAAAAAAAGGAAGAAAGGAACAAAAAAAAAAAGGA:1 + chr2R 12971694 5' + Doc2-element 224 1 91.18 GCTGTGGTGTGCGTGTGTGGATGTGTTATGTGGGTGGGTTTATGCAATCCAGGGGTACAAAATCACACTATGGTAACTAAAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACA:1 + chr3R 10095227 5' - 1360 460 1 52.05 TGGGTGGCAAAGGTGTATTTTTCATACCAAAACCATTTACTTGTGCTTCATACAACAGGGCTTAACAAGGCTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr2L 11554469 5' + roo 90 2 62.73 TAAAAATCACATTTATTTTTGACACACTTAACCATTCGAGCATTAAAAGTTTGAAAGCCATGCTCTGCATAAATGTGTGCATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAG:1 - chr3R 25714146 5' + flea 37 2 62.33 GGGCCAACTGTTTCGTCATCCACAATACGCACACCGCTTAGTTTCATGACCAAATTCAGGTGGACCGTATCCATTTCCTTTAAAGAATACTTTCCTTCCGCCTAGGTGTAAGGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGA:1 - chr3R 18648339 5' - 1731 304 1 66.44 AGGTGGCACATGGCTCCGATGATGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAG:1 + chr2R 22746022 5' + jockey 4781 1 69.18 GTTTTTTAAAAATTAGTTTTCACTGCAGTTTTTAACCAGATTAAGTAAGTAAATGTTGTATAAAAGCCTTCTATTTAATAATTAAACGGCCTTCCTTATCTATGTATTTTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAG:1 - chr2L 18458149 5' - Stalker2 7493 6 67.12 GATGTGTGGTCTGTTGAATGAAAAGTCAGTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2L 7652281 5' - roo 9010 2 62.33 GAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATG:1 - chr3L 7801286 5' + Transpac 187 2 70.55 GCATGATACTCGTACATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr2L 17626703 5' - roo 9030 1 57.53 ATGCATTCCATTAAGTCTCGCGGCCTCAGCCTTCAGCCATGCATCATTTCCGCGGATGTTCGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAACGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATACCAGACATCT:1 - chr3L 22439406 5' + 1360 154 1 56.92 TTACATATGAACATGACTGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACA:1 + chr2R 4577057 5' - Chouto 474 1 51.85 CGCCATACTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 25751895 5' - roo 9016 2 58.90 AGCTATATTGTAATATAAACTTAAATGCAATTTGATAGATATATATAACTATATATATATAGCTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 - chr2L 16562157 5' - opus 446 2 63.45 ACACTTGCCTTGACAAAAAAGATAAATTAAAAATAAATGAATACAGCTATCAATATAAAATGAAATGTGGTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1 - chr3L 18253927 5' - blood 357 2 68.49 CACTTAAACTCGAGGGCAATTCAATTAGATGTCGGGGCTTTAAAGAACTGAAACTCAAGCAAACAAATCACCAAAACAAAATCAAATAACTATAATTCACCTGGGGCTTTCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGC:1 - chr3R 10928718 5' - F-element 4424 1 75.34 ACAAAGGTATATTTGAAATTCTGAGATGTGATTTAACAACGAAAATCTACAAATCATGAGACGCACATTCAAGGGCATTAAATTTAAATTGCTTATACACTTTTTGTCGGTTTCTGGTGGTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTTTGT:1 + chr3R 7860398 5' - 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chr2L 18364951 5' - Bica 466 1 54.11 CAAAACACTTTTGAATGCATGACAACTTGTTCCACTTGTCACAGGTTGCGAATCCACTTGTAACGGTATTTGCATTTTGAAATACTCTGCGCCTGCGCTGAAGGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 3427075 5' - accord 186 2 78.33 TATGACTTTGAATTGCGTGCCCGAAAAAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTCCCAACAGCCTAGCAAGGCAGCTAGGAACTGCAGCTGT:1 + chr2L 12324993 5' + jockey 4692 1 65.89 ATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGAAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGAT:1 - chr3R 20203906 5' + 412 7104 2 60.83 CAGCTAAAGGTAGAAATAAATAACCAGAAAAAACCATATTAAATGGCAATTTACATTTAAGCAGCACAGAAATGTGAAAATGCATTTGTTCCAAACATCTCAAATGGCAGTGGAAAAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 - chr3R 17258235 5' + 412 5 2 75.34 ATCATCAGATGATAACTACCCACTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTACTTC:1 - chr2L 4418833 5' + gypsy5 84 2 80.00 AGAAAGTTATCCGACAGATGACTCAGTGAAGCAGCCACATCACGTGATATCATGTCACGTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - 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chr3R 28450741 5' + roo 8684 2 55.56 TTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr2R 11164478 5' + roo 8752 2 82.19 AGACTTTCGGAATGTGTCATTGTGAGTGCGAAATATCGTTATGTAGGACAACTTTATTTACCCGTTTAAGTGCTCTGATGGCAACTGATTTAATTCAATTGAGTTTGCTTTACATACATAATGGTTAATGTTTTTTTTTTAAT:1 + chr2L 14378625 5' + Circe 72 1 51.05 GCAACAATATAGTGGGATGGCGACTTTTGTCCTAAAAGTGTTTTGTATTGCTTTTGTTGCAACCATTTGTTATTCGTACATGATTTTATCAAAGACACTAGAATAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr3L 10821171 5' - 1360 3351 1 55.56 AGCGCCACTGTTAAACCGCTCAGTAACGAAGGACACCAGACGATCATTGCTGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr2L 17380627 5' - hobo 2937 1 68.35 CTAAAAGTAGAAGAGATATTTTGACCAAAGAAATATAAATAACGGAGCCGCAAAATATGCTTCATAAATATTCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAG:1 - chr2R 11264084 5' - jockey 4943 1 53.79 GTTTACGCCGCTTGCACGTGTCTGGAAAATTAAAAGCTCTGCTGCTGCAACTCTGCCTCGAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCA:1 - 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chr3R 27026139 5' + P-element 169 1 23.97 GAGTATATTAATCGTAAATTCGAGTCTTGTGTGGACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGTAATATCTTCGGTTT:1 - chr3L 21013952 5' - roo 351 2 57.34 CGGTGGAGCAGGGAGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr3R 23161246 5' + 412 36 2 56.12 AAATTAGAATGAAATTGTGACAAAATGACCAACATCTTTCGGCAATTTAACATAATTATTACTATTATTTGTTTATGCTTATTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGA:1 + chr2L 7342706 5' - flea 162 1 51.37 GAGGTTTCAACTGCGAATAAAAAAATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr3L 18253747 5' + blood 23 2 69.86 AATAAATGATTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATAATCAATCTTAAAGAGGCAGTAGTTATTCATTAATCTCTACTAAATACTCTATGCATAACATGTTTTAATACCT:1 + chr3L 24232799 5' - G4 3727 1 84.25 AATACCTTTTTATGTAGCTCTTTTTTCACTCACTTATCAATTAATATGATATTTTCATTTGGGTATGCACAAACTTTTACTTTTCTGTCTTTGTGTTGTGTTCTCAGTCTTTCGTGCGATGTCCGCAGTGCTGCTTTGTGTTGTTT:1 + chr2L 5688071 5' + Cr1a 242 1 50.00 GTTCTGGGCGGGATTTGACCAGCTTCTCCCAACATCTAACCACTTGTCACAGCGCAAAACCACGCCAAACGTAATGGCATATGGCATGCATCATATGTGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 + chr3R 12520700 5' + Burdock 6160 2 67.81 GTATATGGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCG:1 + chr3R 10437030 5' - 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chr3L 12231445 5' + Transpac 61 2 69.18 GCCATCCAGCATTCGAACCCCTGCCACACCCCCGTGCGCCACCGCCTCCTTGTGGAAAATCCAGATTGCAAGGAGCATTATTTGGAATGCTAACGGTCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCA:1 + chr2R 17500131 5' + G2 330 1 51.37 TATACAAAGATTAACGATTTTTATAATCAAGCGCTAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATGTTATGTAAATGAATCGAGATCGATAATTTATATTTAGGATTTT:1 + chr2R 11256181 5' + roo 8745 2 73.24 AAAGCGATTCGGATAAACTATCGTGTATGCGTTTCTGCCGAAACGCTTATTTTCGTGCCATATATGGCCATATATATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTTATCCA:1 + chr4 914975 5' + Quasimodo 6986 2 50.68 GAGGGGGTGGCTAGTTAAATGTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 24673701 5' - roo 399 1 77.62 GTAAATGGAGACCCAACTGCAGCGAAAATTAAAGTCAAAGTCAAAGTCGTGGCCGGCAGCAGCCCCTCAGCTTTAAGCAAGAGATCTGCACTGGCTTATAAAAGTTCGCTCTCCCCTAAGACTGGAGTACAAAGTCCTCTTATATA:1 - chr3R 10474842 5' + Doc3-element 4279 1 52.05 TAAATTATTTTTTATTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGCTATGACA:1 - chr3R 24564840 5' - opus 449 2 54.68 ATAGCAAACCGACCTCTTTCCACATCCTTTGCCATATAGCCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2R 21748258 5' + 1360 63 1 68.99 CCGCAGGTAACGGGGGTTGCTTATGTGTGTTCGCTCGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 + chrX 8271546 5' + P-element 53 1 34.21 ATGTCGAAAAATTTTGAAAAGATTTCTATAAAATACTTGATTCATATTGGAATATTTTATTAGGCTTAAAACAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:2 + chr3L 12223116 5' + Transpac 45 2 54.79 CTTGGCATTAACGGCTGCTAAGGTATGGTTTTGCCGTGTCCTTCAATCGAAACCTCTATTTAGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAG:1 - chrX 1061487 5' + jockey 4566 1 57.53 ACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAACGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAG:1 - chr3L 23678161 5' + Osvaldo 20 1 65.14 TACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAA:1 + chr2R 5582162 5' + Cr1a 481 1 50.00 ACTTCTCCCCGTACGCTCATATTTTACACAAGATATGGGCGTGTCGTTTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAA:1 - chr3R 14912028 5' + Stalker 75 4 67.59 TTTCACAAGTGCAAGTAACATCATGACTGACGTGAAAAACGATTGGAAAACTATCTTTCTCTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATT:1 + chr3L 18484370 5' - hopper2 1551 1 53.42 CATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2L 17626689 5' - roo 9016 2 58.90 GTGTTCTGCTTTTCAGCTCCATCGCTCGGCATTCAACAGTTTTCGCTTTGTGCACTAAAAGTATTAAATTTCTTCAAATATTCTCGGTACACGTGTTTGTATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAG:1 + chr2R 23353931 5' + gypsy 18 2 73.29 TAAAGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chr2R 23409074 5' + opus 7046 4 75.27 GTATGTGAATTTAAGAGCTATAAATTCTATTTAATATTATTCAGAAAGAATTACAATTTACTGTTAATTGCAAGAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTCTCTTGGCTTTGGTCATATCTTGA:1 - chr2L 15798264 5' - 1360 490 1 54.62 AAAGTCCTTGCAACCGGATGTTGTGCAATAAAAATGCAAAGTGCGCCAAAGTTGCCGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr3R 7470899 5' + Doc 46 1 73.97 CCGAGGGATTTCAAGAACAAGTTCAAGAATTTATGTTATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCT:1 - chr3L 12223228 5' - Transpac 5162 2 63.70 GCCGTCCGACGTCCTACGTCGTTCCACCAGCAAATGCCAAATTGAAAATTGATGAATACCCCTGATTGAATCTGTATGCTGAATCTCCACCTTCTAGCTTTTATAGTTCATGAGATATCGACGTTCTTACGGACAGACGG:1 - chr2L 14893231 5' - INE-1 127 1 52.14 AGCCTAAAAACCACAAATAGCTTATGGTACTTAATATTTAATAGCTGTTCGGTTTCTAGGTAAACGATATTAAAGGCTATACATGAGGTTGACCAAAGATAAACGAATGCTGCGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAG:1 + chr2R 9442899 5' - 297 63 2 58.90 GTAGGCTGTCTCACATTTGTTATTGCCACGAATCGCGTGGCACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1 - chr2R 10910353 5' + Tabor 6853 2 71.33 GTATCAAATGATCATGTCCGAAATAAGCATAATATTGGGCAGACGAGCGAAAAAATAGGCCCAACTCGGACTTGGATCACTTCGCAAGCGAATCCCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAACTTGGACCAG:1 + chr3R 14708069 5' + I-element 4900 1 62.24 CTGTGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTA:1 - chr3R 7616856 5' + Stalker2 28 2 66.21 CCCATTCAGAAGAACCAAAAGACATCACAATTTGTTTTTAACATTTTGTAGAAGCCAATCCATCATTGTCCCGTCAACTTTATTTAAACGATTTATTAAAGGAATAGAATCTTATATGGTTAAGATTTTAAAACTCATTGTTAGTT:1 + chr2R 15752832 5' + F-element 4629 1 73.97 AAGGAGAAATGAAGGTGCTGCCGGTGGTGTGACTTTGTACCCCGAATCCAGTTTACCAGAAGCCCCAGAATCCTCTGGGTACTCGAAGGAAAAGTTCAACAATACACAAACACTAAGTACCTACATATAAAAGCAGGTGTACAAAA:1 - chr2R 18535871 5' + Juan 3937 1 66.44 GAGAGTGATGACATTAAAGTAGAGGATAGAATAATATTTCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2L 19652604 5' + roo 8715 2 67.50 ACTTTTGCGTCGTGAGCGGAAGGAAGTGCCGCAAACATTTCACAAACACAATCTCCAGCACCACCACCACTTCCACTTCCGGTCGAGCCCTTCGCTCACCTTGAGACAGCGGCAGAGAGCCACGATTACAGATAATAG:1 - chr3R 15066194 5' - Cr1a 4224 1 73.19 AATCCAAAAGCTCTAGTTCTTCCTTTATTGGAATTAATAAAAACGTTTAATAATACATAAAAAAGCTACTTGTGTTCTTTTTTTTATAAAACTTTCGGTCCGACTTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGTCCTTCT:1 - chr2R 4103368 5' - invader1 396 2 57.53 TATTGATTATGTACGTCCTGTTCCTCTAATACACAACTCATTTGTTCGTTCGCTTCCTCTCTGTCGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:2 - chr2L 22690063 5' + Tabor 6878 2 59.59 TTTGTGATTCTGTAAAATATCACCTTAAAAGGATAATATGCAATATAATAAAATTATACCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3L 19864038 5' - roo 347 2 63.70 CGTCACTCATACGCCGTGTGTGCCGCGGCAGACTTTAGACTGACCATGAAAATGGCGCTGCTGGCACGGCTTAAAGCCTAATCCTGCAGCTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTG:1 + chr2R 23779764 5' - accord 180 2 66.39 TTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1 + chr2L 9275017 5' + F-element 91 1 76.64 GGGGATTTACACCTGCTCGTTCTCTTAGATCAAGTTAATTTATTGGTTATACAAACATACACTTAGATATTGCACTTATGAATCGGTTTATTCGAATGAAATCATATTGCTGTTCTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTGCTT:1 - chrX 13077538 5' - Stalker2 7538 2 60.96 GCCCCTGCACTTGTGTATCTCTTATTCGATCAACCTTCCTTTCTTGGCTTGACTCTTTCGGTTCGTTTTTCAAACAATGCCAAGCTGGCAAAGCTACCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCC:1 - chr2L 13055141 5' + R1A1-element 4965 1 77.69 GGGGCAAAAAGGGGGCGGGGCCGGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 + chr3L 3453562 5' + Tirant 8123 2 74.64 ACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGC:1 + chr3R 24750963 5' + G6 70 1 62.33 CATTCGACTTTCGCACAAAATGAAACGGCCTTGAAATTGCAAGTACTAACCCTATCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3R 6413551 5' + 1360 51 1 58.21 CTATAAAAAACTGAGTAAGACTTAAAAAACTTCGTAAGGTGTCTAAAAGTATGCAGCACAAAATTATTGCATAGAATAATACGCATGTTATATGTGTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chrX 18179917 5' + jockey 32 1 54.11 ATTATAGTTGTCCCGCTTTAGGAGGCAAATTCAAAAGTGGCTCCCAACTTCAAAGATAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chr2R 9607205 5' + pogo 60 1 60.69 ATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATA:1 + chr2R 5260087 5' + transib2 64 1 60.27 TAGTGTGGCTGCCTGTGTGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCACCGCAGATTTCTCTCACCATCATACATAGCATCACACCCGCACTTGCACACACACACACACAC:1 - chr3L 6015096 5' + Quasimodo 35 2 70.64 GATGATTTTAAAACTATTCAAATGTTGTTTTATAACTATATAGACATATTACCTTAAGGTGAAATCTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr2R 10160500 5' - hobo 2895 1 50.37 CATCAGGCTCTTGGGTTTATGGAACAATTTTTCCATTTACTGAGTCGACTAACTCTACAATAAGATCCATTGGTATGCAGTAATTGGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAG:1 + chrX 21098364 5' - mdg3 5268 2 58.22 CAAATGCGCTCGGAAGTGAAGTTAAACCACCAAGTGCATTTAATCCAGTCGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTG:1 + chr2R 7599158 5' + diver 5947 2 61.19 AAAATTAAAAACAACCAATATTTTAAAGTATTATAGCAGGGTTTTATTGGTCAAGCTCATTTTTATCGGTTAAAAAAATGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 - chr2R 5434016 5' + Transpac 36 2 56.85 GGGGGCGGGGCCGGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr3L 3453572 5' + Tirant 8141 2 63.70 GGCTTGGCTTGGCAGTTGCACACTCGGATTACCAGTTGCAACACCCATTTTGTATCTCCCCCTCATCCGTCCCTCTCCCACTGGCTCATGCTCTTTGCCAGATTTTCCCGATTTTCCCACTTTTTTTTTTATTTTTTTATTATTCT:1 - chr2L 14223916 5' - Rt1a 5073 1 60.27 CGGATGCTCTTTTGCCAACTGTTTGCCGCAAACTATTGCATAATCCTTATGAAATTCGGTATCACAAATCAAATACCTTAATACCCAAATCAGCAGATATGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAA:1 + chr2L 12857620 5' + invader2 4688 1 67.81 TCATACCGGCTACAACCACATAGTGACCCACCTCCTTGTCCTTCAGACGCTCCAACACTGACAGTGAAATCTTAGCCTTCTTATTTCCGTACAAGGAATCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATGTATATTATTTTTGAT:1 - chr3R 10701385 5' + 1360 250 1 65.75 GCATTGAGTTGCATATCCTAAGTTAAATATAATATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chr3R 23161339 5' - 412 7459 2 78.08 CTACGTAGAAATCCTCTAGCAAAGCAGCCGATCCAATAGGATAAGTAGAGCCTTGTAACGTGTAACAAAATAAAGGGATGGAAGACGAGAGTACCTGTACTTGCTGGTGCACGCTTTAGAGGCC:1 + chr2R 1530582 5' - gypsy12 10148 2 54.84 CAAAGCGGGTAAAACAAGGAATGGCAACAAGCGAACAACAACAGTTCAAATGACAAAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGA:1 - chr3R 6778407 5' + 297 6561 1 60.29 GGTGCTGAAGATACGGCAATAAGTCAGACGGTTGGTTTATGCCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2L 19652536 5' - roo 349 2 64.57 ATTCTTAACTGCTCTTAACTTCTCAAAAGTATCATATTATATTTTATTCATAATATTTTTTTATTTGAAAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCTTACAGCTTACTCATTGCCACTAAGTTCCCATACTGCCAACTTGGTA:1 - chr3L 13723699 5' - Burdock 6019 1 58.22 AAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr2L 9274982 5' + F-element 49 1 54.62 GTAATTACTGCAGTCAGAATAAATGACATTTTGAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 12379724 5' - roo 322 2 79.17 TATATAACGAAATATAAGAATAAGGAACGAAATATTTGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAA:1 + chr2R 5503691 5' - pogo 2020 1 72.60 ACACAAAATAATATGAGATTATAAGATGATATCAAAACCTTCATTGCTCAACTGATAGCCACCACACATACCGATGTATGTACGTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 + chr4 540442 5' - flea 4979 2 60.96 CTTGAGTCCCGGCCGCTTCTCGCTGGCTATGTGACGGCGTAGTAGTGGCTGGGGTTTGGTTACAGTTTGATTGGATGCGCAGTATCGAGAAATGTTTGT:1 + chr3R 12074648 5' - Tom1 86 1 74.75 GATGAGGAAGTGGCCGCCAGGCAGCCATGTTTGTTTGTATTTATGTCGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3L 7460575 5' + 412 7074 2 71.03 GGATAAATTACAGCAATTTCGCTTTTGCGCCGTTGCCGTTTCAGCAACTGAAAATTGCCTCCCATCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATAC:1 - chr2L 1118384 5' - pogo 3 1 56.16 CTAATACGCTTCGTTGAGTGGCAACGGGAGGCGTTTTAGTGGGGTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 20934652 5' + 412 42 2 55.48 CATCAGTCGGGACGCCTTCAACGATTACTTCCGGATACTTGATTACACGTCCGGGGTGCTCTACTTTCTCTCCACATGCATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACAAACGAACGAACATAAACG:1 + chr3R 13343677 5' + Ivk 5004 1 66.67 ACACCATACTCAGGCATGCTCACACTTTTACAGACAGAAAAAAGTGACCAAATTGTTAATGAAATCGTGTGGGGTCTGTCATTGCAAGTTAAATGCCTTGGATTTCCCGCCGCTTTTCTTCTGCCTTTTCCCATTTTTTTTTTTCT:1 - chr2R 10452795 5' - Bica 338 1 52.05 ACGGGATAGCGTATTGAATAATCCGAGTCAGGATTATATCCAGCAGGCAACGTCGCAGCATACGTTGCGTTATCCTCCATCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACACTCACCTTCAACTAACT:1 + chr3R 16301946 5' + Doc 327 1 61.83 AATTTTATATATTTTTCTCATAATATATATATTTAAATAACATCATTATGCTGAAATAAAGAAAATGTTATTGGCTTGTCTTAATGGCAAGTGAAAATAGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chrX 21973963 5' - pogo 2082 1 64.83 TAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGATTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATT:1 + chr3L 18183101 5' - Tirant 321 2 71.92 GTTTATTTGTGATTCTTTAGTTACGTTCTCTGGCCATTAAAAGCAACCTCGAACTTCTGTGTATCAGAACATTTTTCAAAAATGTTGGCGTGGCAGTTCTGGGCGGTTTGTTTGTTTGTTTTTAACGCATAAAGTGATAGCAGACA:1 - chr2R 18327556 5' + 1360 151 1 58.22 AAAATGTCTCCAAAAATGTTTCAAATATGTGGGAGTCACAGTGGGCGTATCAACCTTCCTGTTAATTTTGTTCGTCAAAACTGCAAGATCTTTAAGATATTTTAGAGAATTAAAAAAGCCTCCGCTCTCTCTCCTCTCCTTGTCAA:1 - chr2R 5490086 5' - Rt1a 4939 1 56.16 TCCGCATGCTTATCTCTTTCCTTCTCATCATATGTATGTATGCAAATAATACGTATGAATTTGCAGTAGCCTCCTCCCACATCATATTTAACGCCCTAATATCACAATTTGCTCAATTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTG:1 + chr2L 14614415 5' - Doc 4432 1 66.44 CACCGCCTCCCGTCCGACAGAGCTTTCCACGCCGCCTTTCGCCTTCAATTATGTCCTGGACCCTTTGTCCTTCGCCTTCTGTATGGTTTTTCGATGATGGAATCACAAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 + chr3R 20203553 5' - 412 7540 2 72.54 CGGGGCCGGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 + chr3L 3453577 5' + Tirant 16 2 71.54 AGTCGAAGCGACGTCGAGATGCATGTCCTCGAGGGCCGGAATCGGTGGGTTATATACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 19435986 5' + roo 60 2 60.96 CAACTGCCAATTACAAAATATTTTCAATTATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 + chr2L 9274951 5' + F-element 33 1 70.34 ACTGGTTGAATATTTTTTCGATATTTTTTCAGACCTTTTCCAGCACTTCCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3R 7585705 5' + Doc 36 1 61.48 AGCAAAGAAAATGCCACGGAAAATGTCGGCAGAAATCTCGATGCCCTCCGACACTCCTGGCCGCAGCAAAGAAAAGCCGAAAAAAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATACACTATTTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATG:1 + chrX 10675997 5' - invader2 4879 2 60.96 TATATATGTAAGCATGGATGAGCTTAGCGATCGATCCTATCCTTATGATCTCATATATCAATACCAAGAAGGCTGAAGTTACTAAATACAATAGAAGCGTTTATTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 - chr3R 18153699 5' - copia 238 1 74.66 GCAGGAAGTGAAAATCCACCAAGGAGCCATTCGCAGTAAGCTGGTGATATTTACAAAAAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAAT:2 + chr2L 2120328 5' + I-element 4921 1 70.55 AAACTAGTTAAAAGTATATAACAAACGCAAAGGAGACACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATT:1 + chrX 8967352 5' + HMS-Beagle2 29 2 65.75 TCTGCTTGTAATTTGTTTTAAGCAAACAACTGACGAGAATCCTGCCGCCTCTCAACAGGGGTTACATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chrX 7741983 5' + hobo 57 1 56.85 TAGAAAGCTTAAGTCCCTGGTAAGAACACACATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr3R 18205750 5' + 412 7081 2 63.70 AATCGAAGTCCCAAAATTAGGTTATTAAAAACGGGAACAAAGCTGATTATATTAGTTAGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGG:1 + chr3R 10150145 5' + 1360 47 1 56.59 TGTCACCTCAGACTTAGGCACTCCATAGATTGCTCATACGCCACGTCTCCCGCGGTGCAGTCACCACAATCTTTGGGCTTCTTTCTTTTTTTTTTGTTTTATTATTATGT:1 - 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Bica 336 1 84.83 GCCGTCTGCGTGATGGTCACGGTGCCCACGGAAGCCGAGGAACTGAAACTGTGCCCCAAGCCGCTGGTTGGCACATCATATTGCTCCAGCTTTTAAAAAAAAATAAATAAAAAA:1 - chrX 22811772 5' - hopper 151 4 78.07 GGAAAAAGGACAGAAAGAGAGAGCGCCTATGACAGCTAGAAAATACACTAGCCAACACAATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGCACCCAACAGATACCAGATAAGAAAAAGATTGTTATA:1 - chr2L 16365583 5' + Idefix 113 2 60.00 TATGTTTGGGGACAAGGGTAATCAGTTAGTATGTAAAAGGTAATTAGTTCGCTACTACTTCAAAGGCGTTCGGGAATTTAAAACTCCAGTAGATACATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCTAAACCGGCCACT:1 + chrX 22738514 5' + 297 12 2 79.86 AGTCAATTATCGTCAATCACTGGGCTACAAAACATCCAGAGCAGCAGCCCAGAGGTACCTCACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATTTATAGATCGAG:1 - chr3R 27810122 5' + Burdock 6186 2 53.96 GGCGTGGTCAAATCGTGGGTAAGTCATTTGCTCAAGTATTATGAATAATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTA:2 + chr3L 465982 5' - Juan 4141 1 67.81 GTTCCGAGTGGATTCTGATGCTTAGACTGTTGTTGCTGAAATTTGGAATTTAGATGTATTTTTCAGGAACAGAAAACACAAAGAACAGAAAAACGAAATTAGTTGAGCTTAGCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTG:1 - chr3R 7778405 5' + transib2 7 1 79.45 GGAATCTGGTTATCTGGACAAATCTCTTCGAGGCATTTCACATTAGTCCCAACTCGGTTTCCACCGGCCAGCAGCGGATTTTTGGTTTTCATTAATGCCGGTCATATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCG:1 - chr2L 15493053 5' - jockey 275 1 68.49 TCCAGCGGTGGGTCGACATCTTTGAACTGTGCCAACTAAATGCTGTTTACAGAAAGTCTTACACGCTAACTTAGATACATCATCATTATTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 15295847 5' + roo 8686 2 67.39 CGTCCGTTAAGTTTTGGGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3R 5422962 5' - roo 9021 2 51.37 ATTGTGTTGTTTCATTCATTTAGCAGATACATCTGCTTGTTTGTACAGAGATACAAAAATATATATATGCGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGT:1 - chr3L 3453714 5' - Tirant 349 2 53.42 AGGAATTAATGTGCGTGCGTGTCCCTGTCAAAGTGTTGGTAACTGAGTGGTTGCTTATGTGTGCGTGTGTTTCTGAGTGCGTGTGTTTGTGTGTGGTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr2R 23671739 5' + hobo 25 1 58.22 CACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGCCGTAAACTGCTACAA:1 + chr2R 2666331 5' + Rt1a 70 1 58.62 ACTCTCCTCCACTTTCCACTCATTTGGGGCGAATTTATGGCGCTTTTGATCGCCCGACTGCCGCAAGAAACACTCAAGTTATAAAGACACGAGTGGATTCGACTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3R 10213168 5' + P-element 10 2 77.86 GCACCTCTGACCCGGTGAAAACCTGCCCCTCAACCCAAGACCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr2L 12486344 5' - roo 327 2 73.29 ATAGGGAAAAAGAGGCTGTTAAAAAGCCACACATCACAACTACTTCAACGACAACAACAACCTCAACAACCAGCACAGTAAAGCCCAATTCTAGATAAGTCACCCAATGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCC:1 - chr2L 7155794 5' + Idefix 199 1 59.59 GATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:2 - chr3L 10469602 5' - roo 335 2 70.55 CTAGTTAAATGTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 24673691 5' - roo 9049 2 70.55 CGCCGCTTATCGGATGAACTGAGAGCCGGATGGGCAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACA:1 - chr3L 3308815 5' - R1A1-element 5268 1 72.80 CAGCAAACTGTCGTCATCGTCGTTGACTGAAACCCAATATGTTTGAAATGAAATTGTAACAATGAACCCAGATATACAAACACGCTTAATAGGCGTAGCTGTCCCCCATT:1 + chr3L 5290350 5' + Doc4-element 2366 1 75.45 TTTTTTTTTTGTGTGTTGTCCACCACTTGCTGACCTGCATCCATTTGGAGTTATTTCATTCGGTTTTTGTAATTTCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTATGTA:1 - 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INE-1 543 1 63.70 CTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGC:1 + chr2L 18630478 5' + G-element 72 1 70.90 ACACACATGCAAGCTAATATTCCGGATTGACAGCCAGTTGCAAATTGGTCAATGTCTGAGGAGGGTTCAATCAGTTTCCAGTAATATTTCACTTTCCATTCTTTGCCTACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTT:1 + chr2R 10160820 5' - transib2 2820 1 77.70 CACAAAAATAAAAAAATTATACAATATTTTTAAAGCAATATCGATGATCATATAGTAATCTTAAAAGCAGCAATATTATAAAAAGTAATAGAATTTAAATCATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 - chr3L 5630487 5' + I-element 26 1 67.12 AAGTTGCCGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAG:1 + chr3R 7470947 5' + Doc 94 1 56.85 TTTCCACTATGCATGCGCCAAGTGAAAAGTTTTCAACGAGCCGTAATTTAAGCTACCAACCATATGAACGCATGCTGAATAAATATGCTACGGGTATGAAACTTCGATTAACGCTTTTTGTTGTTGGCCAAATGCCGACACCGCAC:1 - chr2R 21461054 5' - BS 122 1 69.18 GGAGTTGAGTCGGCCGGTGCGTGAGTTACCACTACACATTCACCACTCCCCTGAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGACAACGGCATCAAGGGCCACAACTCAGTAGTCCACATACATAAAGAATCTCTAAATTGTCGGCTATCCC:1 + chr2R 5174870 5' + Q-element 119 2 65.07 CATTTGACAACAAAAGCAGGCATCAAAAGATGGATTGGCCAATTTGGTTTTCGCAGTGTTTACCCTGTAGCTGGCATGGCCTTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr3L 13690243 5' + hobo 37 1 60.96 TCGGGCTGTAAACCAAATTAAATAGATTTCATTTCGGGCCTCTTTCGGCCGTCAGTTGGGCGTTGCGATAAAAATCAGTCCATGCGGCTACGCTTGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTC:1 - 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aurora-element 4028 1 50.34 TGATTGATATAATTAGTTCATTTTTAATTACCAATTGTGTTACAAGCTTTAACATGGCTTAATGTATCAGCTCTAGAAATATTCATATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chr2L 2120488 5' - I-element 5322 1 57.53 GATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:3 + chr3L 14375592 5' - roo 9037 1 58.90 TATTCACATTCTAGCCCCCTACTTTTACACTTCCCAGTGGCTGTCAAACTGCTAGTGGCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATA:1 + chr3L 2425876 5' - hopper 1354 1 57.93 AATCGATTTATTGTAAGAACTTAAATATATCCAATAGTTAATAAAGCTTAATATTTTAGGAATATCATAGCTACTCGTGGTTTTTAAAACCCTGTAATACGAAAGAAGTTAACTCCAAGAGGTT:1 + chr2R 10236886 5' - Q-element 244 2 65.32 GGTGCCATTGGTGGAGTGAGTCACAATCAAGCCCAAAAGTCGGCACACTCAGAAATGCCAGAGGCAATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCTCCAC:1 + chr2R 17544091 5' + gypsy5 6947 2 78.77 AATTGAACAAAATAGAAATTGGATACTGCATTTTAGGAAATATTGAATATTGATAAATATTAATAGGAGAGGGTCCAAGCTAAGGCAGAACCACAAAATCCTGGTGTACAAGGCAATTCTCAAGCCCATCTGGACCTAC:1 + chr2L 21870684 5' + G2 2648 1 53.24 CCCATCCCCTCGCCGCATAGCTCATTGTAGTAAAAATAATGAAAATGAAACACGCATGTTATATTCGGAATAGAATTTCGGCTGCAGGTTACATAAGATCTGGGTAGGTATTATTTCGTTTTTCTTTTTTTGGTTAGATT:1 - 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chr2R 18068204 5' + Quasimodo 34 2 85.94 TTTTGGCAATAAATTGGTAATGTATTTTGGTGACAGATAAGACCTCTTGCACATTGTTGTGATAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 - chr3L 12836095 5' + 1360 58 1 57.53 ATGCCCACAATACGTTATGCGAATGGAGGATCACCGCGCCTCCACAGCATGCCGTCGTAATAGAGTTCAAGTATTTTGATATGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTAGGGTGCAGC:1 - chr3L 11804089 5' - blood 7349 2 57.53 AATGATCACAAATTGCTGCGGGGGCCAGCAATAAATAAGTACAATACTTTTGCCTACATAAATGTGTAATGTATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACATTGGCCTCATATGGTCGCTTGACAT:1 - chrX 3144044 5' - Bica 4834 1 55.28 AGCGGGGGTTAAAGTAGGCAATGCCCTCCATGCTAATGAAATTAAAAATTGATGCTTTGGGGCCAGCGGCGCACCAGTTTTGTGTGTAAAGAAATCTAGGCGAAAATGCTAAGATGCTGAGCATGCACCTAGCAGCTCAAGTGATT:1 + chr3R 19576120 5' + Stalker3T 181 1 76.03 ATTTTCCCAATAGCACCTTTTGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr2L 14969060 5' + 412 34 2 54.79 ACACTTGTTTTATTTTTGATATATTTGGACCAATGAATTTGTTCTATTTGAACTCCCACATGGTCAGACACTCTTTGTTTAAATTAGGGGACGGGTGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCT:1 + chr2R 3015772 5' - Idefix 6983 2 64.52 GAATGGTAAGAAATAGTATTTTCCAGATCCGGATGGTATAAATGATCAATGTTCCTGCGGTCACACTAAAACTGAATTACTATCAGCCACTCTTTATTTCAAAGCCGCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 + chr2R 5754455 5' + P-element 14 1 76.03 ATTGCCTGCGCCCAAGGGCGTCGCCAGGGTAGAGCCTAATTTTCTGCCTATTACGTAAGAGTCGAGACTCTTCGCTACCAAAGCTGAACACAGCTAATAGATTCGTTGAAAAGGATGTAACAGGCAGAAGGAAC:1 - chr3R 3859260 5' + INE-1 28 1 57.46 AACGCAAAGGAGACACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAA:1 + chrX 8967375 5' + HMS-Beagle2 52 2 54.11 GTGTGCTACATGGATGGATAAATTTCATAAATTTATTACAAATTAATAATATTCCAATAATAATTAACAAGAAAGTAAGTAAGATTGTATGCTAGATTCGTTGAAAAGTATATGTATATATATTGTTGATCAGGATCAATAGCCGA:1 - chr3L 11887884 5' + INE-1 89 1 79.45 GCCCAGCTTATCTCTTTTGGCCCAAAAAGTCGCCAAATGAAATGAAATAAAGACAACTGCATATTGGCCAAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3R 16241014 5' + Tirant 8122 2 68.70 AAGGGGTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAA:1 - 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chr3L 20252006 5' - copia 188 2 64.38 ATAGAAACAACGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATAGGTGACATG:1 + chr3L 7870192 5' - roo 9001 2 67.12 ATACGTATCATAAATGATCTTATCCATCAAATAAAGACAAATAGGATATTCGATAAAATAATAAGTATATTAATTTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAA:1 - chrX 20145640 5' - Juan 4165 1 58.22 GGCTATTCTGTTTCGAAAATCCTTGTGAAATTCAAAGTTTCCGACTGATTATTATAAATACGTAGAACGTTAAATACTAGGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTA:1 - chr3R 25277722 5' - 3S18 297 2 60.27 GTCAACAAGTTGTCAACTTTTTATGATTATTTTCTGGTTTTGTTTTTTGTGGCTTTTGTTTGGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTAT:1 + chrX 10108420 5' - mdg3 44 2 65.60 TAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTGAATGCTTTATTAGAACTGAACTGTGTACATAACTTCGTA:1 + chr2L 22315579 5' + frogger 78 2 77.40 CCTACAATGAATGTTGAAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCT:1 - chr2L 13332714 5' - micropia 418 2 55.20 CATATTGTGTATTGGGCAACATTAACGCCAACTGTCAGTCTTGCGGGCCAATGACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTT:1 + chr3L 10528376 5' + FB 61 1 60.71 CACCTCAATAAAACATCATTATTTTACTGATTGTTCAGTTCTGCGTAAATAGCATACATTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAG:1 + chr3L 785883 5' + I-element 62 1 58.90 ATTCATTCGTTTCATTATAGATTAAAAAATCGCCTCATATAAATCTTACTTAATTCCTCCCATTTTGTTTCATTTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 - chr3R 9963295 5' - I-element 5302 1 52.74 CTCGAATAAAAATACATAATATTACAAACAGCGATATAAAACAATCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chr3R 2649253 5' - 412 417 2 70.34 GATTTAAAAATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTCTGGTCCGTTTGTAT:1 + chr3R 7616722 5' - Stalker2 354 2 48.89 ATAGTTTAACCGTAAAAAAAGAAAATTATATATCATACATTTGTGGACAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2L 15081012 5' + Doc 8 1 78.87 GCATATATTTCGCAGCAGCTCTACGGGTTTCTTGTTGTTGCCTGCATGCTGCTACGGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGCTAAGGGTTTTG:1 - chr2L 16810473 5' - I-element 69 1 54.11 AAATTTATTATGCTGTCACTGTATGAACTTCCCTGAAGTAACATATGGCGCCCCATGTGGGGCACTCATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGG:1 + chr3L 21093134 5' - Ivk 5324 1 54.11 AGTCGTAGAAATGTCAAATGACAAAAAACTCATGACCAGTATTAAAAAAATATAATTGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTA:1 - chr2R 25221538 5' + 1360 3273 1 64.38 CTTTACGTCTGGGAAAAGCTTACCAAGTGCATAGACATATGTGTGAGTGAGGTGTAGGTGCATGTCGTTTGCATCTGTGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chrX 5805779 5' + roo 8722 2 54.11 CGTCGTGCCATCTCTTTCTGCCCATGTGGCCCCATCTCTTTCTCCGCACAGTGTGCGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chr2L 16615758 5' + hobo 67 1 63.70 AAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 + chr3L 7791890 5' - Transpac 5179 2 54.81 TGATACCCGAGTTACATAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 26486030 5' + 412 7100 2 56.56 CCATCCACAAATAAATTACTTCAATTTTGTGCTTCAATTCAATTGTTATTCAATTCGATTGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCATAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCACATAAAATAAACTAAATA:1 + chr3L 26741222 5' + F-element 86 1 68.49 AAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCACG:1 + chr2L 12325019 5' + jockey 4735 1 55.48 ATGTTATTCACATTCTAGCCCCCTACTTTTACACTTCCCAGTGGCTGTCAAACTGCTAGTGGCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTGGAAGTATTTTAGTATTA:1 + chr3L 2425872 5' - hopper 1357 1 54.11 ATTCACTTGTAACTATTTTTTAAAAATTTGCTGATTCCGATGTTTACTTGATTGACTTAACGATTACTTAGGTAGCAGACTGGATGCAATTACAGAGGAACCTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTAAAAATGTTATCAC:1 + chr3L 23532529 5' + Q-element 143 2 51.37 AAATGTCCGTCCGTTAAGTTTTGGGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAA:1 - chr3R 5422969 5' - roo 9028 1 54.11 GTGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACG:1 - chr3R 7616854 5' + Stalker2 7279 2 64.38 CGACAAATAAACCTCGTCTTTTAAAAACTGCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTAAGATGCACCATTTGCAACTACGGTTGGACCAAAGAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr2R 5531247 5' - 1360 3366 1 54.41 GCTCGCGAACCTGATACTCTGTGATATGAGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATAT:1 - chrX 21994030 5' + McClintock 5976 2 67.12 GAAAACCAGGGTCACAAATATATAAGGTAATATACATAAGGTAAAAAGTAACTGTCAGAAATAGAGTACCTTGTTCACACCAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGACTCCCCGAGTTCCCCACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGT:1 - chrX 15946754 5' + INE-1 579 1 76.71 CTCTAAATTATCGCTCACAAACATTCAATTCTCGTTTGAGAAACTAAAATATGCATTCTAAAGAAACATTTCAGTTTAATACGTTCATACGGACACACGGACATAGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAACAATATACA:1 - chrX 4526655 5' - INE-1 81 1 52.05 GTTCGCGAGCTAATTTGAAAATGTTTTGCCTCCACTTTAGTTAACTTTGTGCTAGTTCTGCCTTCTGCAAATATTTGTTAGATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr2R 10160633 5' + hobo 41 1 51.37 GTGGAAGAGGAAATTTGAGCAAACAATTTATAAAATAAACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTAC:1 - chr3R 24454915 5' + F-element 251 1 69.86 AGGGCGACAACAAAAGGGAGTAACAGGATAATGAGGAATGCAGCGCGGCTGAAAGGAGTTAGCGACTGCAAAACAAATTCTGAAATGGGCAGCACAAAAGATGAAATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATGAAGG:1 - chr2L 16996001 5' - Ivk 5037 1 71.23 ATTTATTGCGATTTCCCGTTAACTCGCGCACACTACACCCTCACACACACACACACACACACACACACATTCACAC:1 + chr3R 22825139 5' + accord 189 2 77.63 GGGCCGAAAAAGTATTATTTATTATTTCATAAAAAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAAC:1 + chr2L 8574381 5' - Transpac 225 2 79.45 CCCTAGAGAAAAACTAACAAACAAAAATTATGTGGGACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:2 + chrX 7706707 5' - P-element 2872 1 71.85 ATCTTATCTTGGCCACGGGTGCAGGTAAAAGTGTTATACTGCAGATAGGTACACTAAGAAAAAATATAGACAACAAATTAGGGGAAAAAACAAATGTCAATATATATAAATTTAATTTAATATTTTAAACTTAATTTGCTTTAATT:1 - chr3L 5954122 5' - TAHRE 39 1 71.92 CAGCTATGACACACGTTCTATATTTCCGTAGGCAAAGTCAATAACTAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chr2R 21848642 5' + Transpac 29 2 60.27 ATCTAGCCATTGGGTTTTGCCATCAAACGATTTTTAATTCCATTTCCCTCATGCTCCTTGATTTGCAGGGGAGTGGAGAAGTGGAATGCCATTTGTAACAGAGACATTGTTCTGTTTTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGAAT:1 + chr3R 15561170 5' - hopper 1367 1 76.03 GATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 3960185 5' + jockey 35 1 52.83 ATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGATCTAGATCGATTTCA:1 - chr2R 1234692 5' + Q-element 638 1 76.52 GTGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAC:2 - chr3R 7616854 5' + Stalker2 30 2 64.83 TTTCACTTCAAAATTTTAACAATCTCTTGGCATTTGAAAACAAATATCGATCCAAGCTTTTATTAGACGATTCTTCAAAATTGGTTTAAAAGGTTATTTATATATAATAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 - chr3L 18801919 5' + I-element 13 1 73.97 CATTTCCATTTAAATGTGCTCTACTCCCTCTTTTGCGAATATGTGGATGTGCGGTCTCAAAATCAAATTAGTCAGACGGCGCGTAGTTGGGTGAAATATTCCTTCTTTTCTATTAATTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTA:1 - chr3R 12787782 5' - X-element 4635 1 67.81 TGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATTCGAGCGGGCAGGGGCTCTCCCGGGAAACTGGGCACTGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACA:1 - chr2L 16331031 5' - roo 9044 1 42.02 GGCCTTTATTTATTTAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 18528374 5' + roo 33 2 52.50 CACTCTATCAGCGTGGAAAATCGTGTGTGCGCGGTCTTTTCCCTTTTCACGTGGCATGAAAATGTGGGCGTGTGGTCAGAGTCTTGCCACAGCCATTTTATTCCGGCACAAAAGCGGAACTAATAGTGCGTCTGCAGGCCATTTCC:1 - 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chr3R 20447106 5' + hobo 2548 1 66.44 AAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATT:1 + chr3R 7470981 5' + Doc 128 1 80.14 AAAAATGTCTCCAAAAATGTTTCAAATATGTGGGAGTCACAGTGGGCGTATCAACCTTCCTGTTAATTTTGTTCGTCAAAACTGCAAGATCTTTAAGATATTTTAGAGAATTAAAAAAGCCTCCGCTCTCTCTCCTCTCCTTGCCA:1 - chr2R 5490087 5' - Rt1a 4940 1 54.11 AATTGTTTTAAAATTAGACAAAAAGCTAAATATCTTTACACATTGATCATCAAACAGACTAACAAGTATCTCAAAAAATAAAATTAATTCAGATCACAACACTTACACACGGAGGAAAAAGAAAAAAAAAACATATAAAACCAAAA:1 - chr2L 2123985 5' - Circe 419 1 51.37 ATTTAATCTTGTTTAGTATACACTTAGTACATTTTGAACAGATCACAGCACGGTTGGTTAATTCTATATCTAACTGGATTAAAATATAATAAAAAAGAAAAACTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTC:1 - chr4 778702 5' + accord2 154 2 69.86 GCATAGAAGGGCGAATACTTTTGAAGACTGGTTACGAAGTTGGATTATTGGATATGATATCCAAAAAATTTACGAATGATGAAAAATATATTGTTAAAAAAAAAA:1 - chr2L 12188775 5' - hopper 161 1 69.52 TAATTCGGCGAGTTTTACATGCAGCAGCCAGGACACACGAACACGGCACCCCGGGAACCGAACCACAGGCACCCTGAATCATGTAAGTGGGATTCTCAACTTAAACACTACTC:1 - chr3R 15589220 5' + springer 455 1 67.26 AATCGATTGCCAACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr2L 19407018 5' + Doc 29 1 50.38 ACGGATGCCAGCGACTATGGGCTGGCCGCGTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGGGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCCGAACGCAGCGGAGAGG:1 - chr3L 23678135 5' + Osvaldo 21 1 69.52 GGATCTTAAAGGCACACAGAGGGAACATTTTTAGCTATCTTATCATCTTCATTTTCAAATGTTTTTTCGTTTTGTAGATCGCAAGCGATCGTTTATAATAAATGATTATTTGAAACTGAAACTAACATACACAATATTTCCCTAAG:1 - chr2L 1560118 5' - HMS-Beagle2 7110 2 56.16 AAAATGCTTCATTATATAATTTCCTGCCCATATTGTTAGTTTTTTTTTATCCTTAAACTTTAACCAACAAATAGGAAATCATTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATAACAGACATGCCTCGCTCAAG:1 - chr2L 16371229 5' + invader1 3938 2 54.11 GCAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAATAAAGAATGAGCAGA:1 - chr3L 23583085 5' - looper1 81 1 52.74 ATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr3L 3453597 5' + Tirant 8148 2 53.12 GTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACAC:2 + chr2R 12065582 5' + Stalker2 62 2 58.90 AGGTGGAGAACGAGATGGAGATAAAAGTGCATGGGGAGATGGGAATTACGATTACGATTACGATCTGAGATTAAAAATCGAATTAGGGACGACCTTTGCACTGGATTTAGGTAGATTACGTTGGAGGGCTTGACTTCG:1 - chrX 17506541 5' - gypsy 7346 2 59.42 ATTTTGATAGCTCGGATTTGATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTCA:1 + chr2R 15070087 5' - 412 7471 2 67.81 ACCACCCCAGCGGTCCACGATATGAACTGTAAAACAATTCTTATTTTGTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGAACAATAGACGAGTCCAATTAGCCATGTCCGTTTGTCCGTATGACCGTCGAGATCTCAGGAACTATAA:1 + chr3R 15648753 5' + INE-1 145 1 65.52 GGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCA:1 - chr3R 24454852 5' + F-element 314 1 72.60 ATCTCCCCGAAAACTGTGGATAACATTTTAATGGAATTTTTCGCATAAAAAATTCATAAAATTAAAAAGTTTTTGACATACCGTATATATGTATATTCTTGATCAAGGAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGA:1 + chr2L 18159001 5' + INE-1 153 1 61.19 GCTTGCAAGTGGCTTGACTTTTGGACCGCAGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr2L 21910248 5' + Doc 39 1 53.38 ATCGACAACAACAACAACCGAAACAGTCTCTTCAACTCAACCGATTCAGTGAACGACCTTACCGGCTTTTGCATTGCAGGCAAAACAATTAACAGCTACAATTACCAATTTACGTCAGTCAAAGAGCAAT:1 - chrX 7740689 5' + Doc4-element 420 1 74.62 GATTAATATTTACCGTACATTCATCTGATCTAAATCTTCACCAATTCCAGAAACTGTAGCTGTACTTGGGTAATTGCAAAGTGTAGTTGAGAGCCGGAGCAAGGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTC:1 + chr3L 25936819 5' - accord 7374 2 78.42 ATGTTACGAAACATTGTAAACTAACTCTAGTATCTGTCTTAGTCCAATGAAACTAAATCTAAACCTCATTACTACAAACTCAATGATTATAAAATGAACTAGATGAAATATTTTTACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTAC:1 + chrX 19020619 5' - jockey 296 1 60.96 GCGAAGGCGCCCGAATGTATGCCACGTTTTCTGACGTGTCGTTCGCTCGCTGGCTGGCTCCACGTACATAAATGGCGACAAAAGTCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGGCGCGG:1 + chr2R 6798197 5' + jockey 36 1 63.77 TTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAG:1 + chr3R 16276335 5' + pogo 69 1 69.86 GATAATAAATTATATAAAATGGAATTTTCTTTCTTAAAAGTGAACTAGAGATTTTTTCTTAATTTTGCTGCTAACCCGAAATGCGGTTGTGCAACTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTG:1 + chr3R 18477143 5' + 297 214 2 52.74 CTGCGTATACGTAACGTCACGCCGAAAAGCAGCTGTGCGCACAGTGTGTTAAATATTTCGGGAGAGTTTTGGAAATATTCGTATAAAATTTAATTTCATACGAACAGTTTAATAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2L 6601224 5' + roo 8671 2 67.12 GACATTGAGGTGGCCAACCAGACGGGCGGCCAGAGCGGTCAAGTGAGTAGTTCACATAGAAACTAACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGT:1 + chrX 4895019 5' - hobo 95 1 57.39 GGAAAAGATACTTGCTACACAGGGTTATGGTATGGAGAAAAACTAAAATAAAAAAAAAATAATAAAAAAAAAACGGAGAGCAAAAGCTGTTGCACATACTCGCTTGAATATCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGG:1 - chr2L 13565712 5' + INE-1 537 1 78.10 ATCCCCAAAAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATGGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGA:1 + chr3R 25543453 5' + G2 208 1 39.02 ACGGTGAGAGTTGCATGCTGGAAAACCTTTGCCAGCAGCTTAACCCTTGATCCGTAATTAACCCATTAGGGTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 - chr2L 14239249 5' - 412 7495 2 52.74 GAAACAAAAAAGGATGCAAAACCTCAAAACAAACACGCGCAGACCAACAGACCAACACAGATATGCACTGACCCACACATCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAAC:1 + chrX 22817456 5' + Ivk 169 1 57.78 AAATTCCTCCAAATGTATTTTGCTTTGTCCCATTACTAATCAACAAAATATTTCCATTTGCTATGTGCTCACCAAGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 11256275 5' - roo 9054 2 65.83 TACAATTTTTTAAGATAATCAAAAACGTATGTACTTACATATGACTTATGTACATACATATGCTCATATATGTACATATGTACATATGCTCATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 - chrX 2295281 5' + Transpac 4939 2 50.00 GAGGTAAGAGAATGCTCGAAAAGTGGCTGGCCACGCCCAATTTCGGGGCCCCAGCCTCAGTGGGTTATATCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGACATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCA:1 + chr3R 6618364 5' + roo 9039 1 49.24 CATTCACATGAATGTTATAAGTTACATTAAGCTATTGTAGGTCCATTTCATTTTCAGTGATAGAATGGTGCGATGTTTGCGTTGTCTTCTTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCTATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGC:1 + chr2R 22402997 5' - I-element 4885 1 67.13 TTGAATTATCACCTCATCCTAGCAAAATTCCAAGTGAAATGCAAAGCAATTTCGAATCAATTTCTCCTGTCAATAAGGGCAAACAGCGAAGCACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 - chr3R 31067351 5' + Transpac 49 2 60.96 ACATACCCAATCTCATTTGTTTCGCACCACCTTCCACCTTCCAGTTCCCATCTCCAAGGTGCCATAAAAATTCGCCAAGCCGCAACATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAA:1 - chr3L 22226137 5' + jockey 4794 1 58.90 GTTTAAAAATTTATAGTAATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr3L 13678877 5' + hobo 57 1 57.53 CATTGTTTACTCAAAATATTGCTCCATTTACCACATAAGGTACTAAGTACTAGGGGTTCAATTCTCCATATTGATGAATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCT:1 - chr2L 2895673 5' - Burdock 212 2 54.79 AGCGGGACCAGGGCAAACGGAGCCAGATAACTAGCGTGCAAAGTGAGGGACGGCTCAGAAATTCATTTCATTTCATTTCCTTTGTATACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTGCTTTAT:1 + chr2L 2686953 5' - Ivk 5287 1 65.12 CACCAATGCACCGTGGGCCGAAAAAGTATTATTTATTATTTCATAAAAAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:2 + chr2L 8574367 5' - Transpac 239 2 69.86 CATTCGTATGCGTTAGTATGCGTGTGTGTGAGCTGCATTGTTTGCATTTCAAATTGAATTCCTTTACATTTTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chrX 19788897 5' + hobo 49 1 52.74 GAGAACAATCAAATATATATTACACCAATAAACAAATTTTAACACCGCCTTCTAACGTTGATATACAACCAAATACAACAAAGTTTACAGTACAAGACAAGAGAGAATGATGTAGATGAGCTCCCCGACTATCAGATACCCGTTGT:1 - chr4 48793 5' - INE-1 551 1 68.49 GAGCATTGATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGCTAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2L 3960178 5' + jockey 69 1 58.22 ATTAAGCCTTACACTAAACAAAATTATATAATATTTTACTTAGTTTGATTCATAGCCAATCTATGAAACAACTTTATGCAGTCAAATTAATTTCAGTCAGAAACTTTGGCCCAGCCCTTTTGGATTCATTCTTTTTTTTTGTTTTT:1 - chr3L 12019439 5' - transib2 2641 1 56.16 GCTTTTGATTGTTAGTCAGGTGGAAACATACACCTGGCATTCGGGACATACTTTTGCCACCCCTGCTTCATTCATCTTTTCTCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 1832089 5' - Bica 341 1 58.51 GTAATGTAATAATATTATATATACCCCTTGATAGAGCATTGAAAGAAAAAGCATGCCAAATATCCCCACAGTTGCCATTCCTGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACATAAATGTGTTTTTCACAAGTATTC:1 + chr3R 26846718 5' - hopper 1380 1 61.11 AGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr3R 9125648 5' + Doc 14 1 72.82 AAAGTGTGGGCGGGGCAGTTTTCTGCGGTTTGTAGGCGTTATTGAGGGTGTGGCCACATGGGTCAACAAACTTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATCCTGAATCTTAACCTTCTCGCTTTTACAGTTCCTGAG:1 + chr3L 23331452 5' - INE-1 153 1 74.07 CACACTGCCAAAACGAATCCATGCAGCACACAATTCCATGTTCATTTACTGCTGCCGCCAGATCGCACCGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGAGAAATTAGTTTTCGCGGTCATAAACTTATGGACA:1 + chr3R 10907528 5' + X-element 68 1 54.48 ATCGCCTCCACAGCTCCCAATTGCCATCCACATTCTTCTCCTTTTGCATTTTTGGTGTATTATTCGATCTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGAGG:1 - chrX 14745928 5' - FB 782 3 47.26 CCTGTTCGGTTTGTATATATAATCTTTCTACATGGTTGGACTTTATTTTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTA:1 + chr2L 4876871 5' - 297 6910 2 67.13 AGAAAACACACCGTCATCGCCCATTGCGTCATATAGTTTTCCAATGCGTCCTTGCCAGTGGGAGATAATCATATGCTGCCGCTCAGCGTCCAGTTCCAAGCCCAGTAGATGTATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAAT:1 + chr3R 14113518 5' + Quasimodo 7152 2 74.66 GCGGGTAAGTTCAAGGACGTAAAATGCGGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAAGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr2R 15075565 5' - mdg1 369 2 51.03 GGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 - chr2L 21910208 5' + Doc 70 1 78.23 TTTGCATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:2 + chr2L 17295809 5' + Doc 37 1 56.85 ATTACTTTCATGGGGGAAAGTCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTAT:2 + chr3R 14049298 5' + transib2 28 1 66.44 ATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAA:1 + chr2R 12065579 5' + Stalker2 59 2 56.85 TATTACCAAAAAACAATTACTATCTACTAAACTGGGTGGTAAGTTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr3L 11795466 5' + 1360 59 1 69.60 GAGTCATAATTGTTTATATTGCCTTGCATTAATCTAATTGGATTGCCATGGGAGTGCTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTG:1 + chr3R 15514212 5' - Ivk 4961 1 60.95 GGCAGATGGGCGGAAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATT:1 + chr3L 7837138 5' + jockey 4797 1 56.85 AAATGCAAATGAAATACTATATTCGGTGGGTGGCCCGGCGAGTGGTCCTCTGTATCCTGTGTCACGGGTGCAAGTGGCAAACTGCCCACATTCGCCGGGGCCAAAGGAGTCCGATTATTAATTTAAAATGGCAAATATA:1 + chr2L 4268150 5' + accord 7258 2 79.86 GAAAACTCCATTCTCGCACCTGTTTTGCCTCCTTTGCGTAGTCCTGCTGTGCTGCTCTTGCGGTATCGCGCCTATCACAAGCAGACTGCTAACGACTTCTACATTTGCCGACAACACAGCGATTTTAAGTCGATCCAAATGTCCTC:1 + chr2R 4231763 5' + Fw3 2968 1 52.05 CGTTGTTGAAACGATGAAGACATCAAATTGCATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chrX 6633019 5' - P-element 2833 1 35.90 AACCTATTTTCTTCTCCTTGCTAAATTTAGCCCATGAAGTATATACAGACTTTCCAACACTTGTTGCCAGTTTGTGTTGGTGGTAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTC:1 + chrX 4224531 5' + accord2 7577 2 56.85 GGTGCGCCAGTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGGTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 - 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chr3R 21674909 5' - roo 9008 2 62.76 CCCTTTCACTTGTCGCCCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACTCATTCGCAAGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3R 7885586 5' + jockey 70 1 59.59 CAGGCGCTGAAAAAATTCAACATTTCTTACAAGACTCTTCTTTGATATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chr3R 20203960 5' + 412 13 2 75.00 AAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chrX 388232 5' + 1360 53 1 56.43 CTGTTTCCACCTGTTTCTGATTGAAAGTGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAATTATTGTAGGGTCTTTGGGTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr2L 17432132 5' - 1360 3340 1 56.85 GTTATGTCTCCATTACTGCAAGTTGTTTTCATTTTCATTTTTATGGCGGAACCTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chrX 3647025 5' + 412 7090 2 58.90 CATATGTATATAATATATATTCAAATTTGGAACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACG:1 + chr3R 13225213 5' - 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chr3L 785406 5' + I-element 463 1 66.90 CGTGTGGCTGACTTTTGTGCGTTAGTTTTGGCGCTGTTCAATTAGCCGTCGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTTGCTCTCTGTTGTTATTTTTTGACACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 8153544 5' + roo 33 2 39.73 AAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chrX 1103599 5' + pogo 48 1 54.11 CTTCGCAGGTAACGGGGGTTGCTTATGTGTGTTCGCTCGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 + chrX 8271544 5' + P-element 83 1 28.77 CGGGAGCATTATTTCAATTTGTATATATCGATCTGCTTGTAAAGTTAAAAAACAATTTTACTTTAGGGCTAGAAATCAATCTTGGCAAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGG:1 + chr2L 21231119 5' + R1A1-element 4963 1 72.27 GGAATTAGGCGACATGTGCCGAGGGGAAAAAAACCGAAATTCAAATATTTCCAACCGAAATTTAAGTATGCGAGCTCGAATGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTGTATATGAGAGAG:1 - chr3L 11438256 5' - blood 179 2 61.94 ACGATGTGGCCACCATGGAAACTGACCAGCTCAAAGCGCCCAGCAGTTCTGTTGTAAGGAGAAATTAAGCCCGTGAGAAAAATGAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAAAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGA:1 - chr2L 3748632 5' + hopper 945 1 48.63 AGCACAACATGGAATTTGGCTGGGGAAATAATGTAAAAAACGGTGTATCGATTATCCAATCCGGATTCCTGACCTTCGACGAGGGAATGCCGGTCGCTCAGAAAACTGTTTTTGGGTGGATCGTGTCCGGTGCCTGCAGCCTGCCG:1 + chr3L 18329821 5' + GATE 8171 1 65.07 CTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTTGTCTTCGTTT:1 - chr2R 5045648 5' + invader6 4576 2 76.03 ATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chr3L 17537756 5' + Doc 84 1 74.66 CTCGCAAATCCACCTCACATACATACCATTCTATCTCAAATAGTGATGAAATGGCAATTTCTTGGGAAGTTATTTTTCGGACACGTTGAATTCCTCTGGCGATGGTGTTCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 - chr2R 14310991 5' + FB 6 1 80.58 ATAGGGTAAATGTGAAATTAAAAAAAAAAACACTCAGTACTAAAATAGAACGCCATAGCAAAACTTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 - chr2L 21698349 5' - 297 6945 2 59.20 AGCGGAGATTTCCATCCTGGTTGGGGGCACAAACAGCGCACAAGTGAGCAGTAGACAGCATATTTGAATAGAAATTGGTCCAAAAAAATTCCTCGTTTTTGCCTTATACCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTT:1 - chr2R 12702951 5' + Cr1a 3986 1 47.10 GTAACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGTAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 - chr2L 14969171 5' - 412 7468 2 68.49 AAAAGTAATAATATAAATAAAAATCATTTACTTTCCCTTTATGTTGTTGCCAGCGAAACACCGGTGTCATTGTGTTCGCGGTTTGCCCTACCCTTCCTACCCACTTTCCTTCAGAGCATGGCTCCAGTGGGCCCT:1 - chr2L 21667292 5' - Gypsy12A_LTR 1920 1 67.41 TGTGTATTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACA:1 - chr2R 1000427 5' + HMS-Beagle2 41 2 60.27 AGCTTTGGGGAATACAACTAGCAGCACATTTGCCGTATGAGATCATCGGCTGCCACAGGGATGAGTGTTTTTACTCGTTACTCGTTTCTCGTAGAATAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGGAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAG:1 + chr2L 8024312 5' + INE-1 28 1 58.22 TATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 + chr3L 3453640 5' + Tirant 3 2 59.57 AAGAGCCACGTTAGCGTTTTTTTCCCAACAATCTGGTCATTTTATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 - chr3R 26486107 5' - 412 424 2 67.86 ATACGACTTCTCGCACCACAAACGACTGAATAGAAATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:2 + chr3L 14167357 5' - mdg1 7374 2 75.34 CACATATTCCAGTCTCTGTAAATAATCCGTCAGAAAATGTATAAGATATGTAAGGAACAAAGTGTCGAATTAGTCATGCACACGAGTTTTCGTCTTTACATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:2 + chr4 916253 5' + roo 21 2 71.23 GGTTATTAAAAAAATTAATTGATGCTGCTGTGTAACCTGTTGCCGCCTCATGAAGGCAGAAATTTCCATCGGTTTGCCCGTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 - chr2L 12144316 5' - transib2 2782 1 55.48 TGCTTAATTTGACTGTGGCACCACCTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr3R 18635328 5' + opus 34 4 59.29 AATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3L 8658746 5' - roo 318 2 78.08 ATTAGTATTTTAAAAATTCCTTAAATATTAGCAACATTTAAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:2 + chr3L 8658702 5' - roo 9026 1 49.32 GTTGCACCTGCCACGACCATTGTTAGCCTTCTGCCGCTCATCAGCAGCGGCAACAGCAACAACAACAGCAACAACAACAACATTGTCAAAATTTTTCTGGGATATCGAT:1 + chrX 13653414 5' - INE-1 504 1 76.15 AATTAATTAACTATATTTAGTTATATAGTTTTCATTTTATGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:2 - chr3L 16692101 5' + Doc 89 1 78.77 CGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTA:1 + chr2R 11095749 5' + diver 5959 2 63.01 GAAAGCTAATTGATGGCAATTCCTAAATTTATACTTTGTAGATAAGCCAACTTTGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 - chr2L 22319406 5' - Transpac 5210 2 72.03 GTATGGCTATGGTCCCCTCTATAATGTTGCTACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGC:1 + chr4 311156 5' - 1360 3377 1 74.63 AAATGTCAATATTTAAATATAATGACATTCAAAATATTTGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGT:1 + chr2R 17171611 5' - 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hobo 2937 1 77.68 GGCGGGAAGGGTCAGTGGGTGGGTCTGGTATATTGCTCATCGTTTGTCATCGTGACAATGATGGTTGCCATAGTTGAGCATCACGCATTTTTATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGG:1 + chr2R 10163239 5' + transib2 388 1 68.35 ACATGCGCGGACTTCCCTACACTTCATTTGAAAACGACGTTTTTAAGGTGGGTTTAACAATAACGAACTTGTTAAGAAGGAATATTCAACTTACTTAAAATCACAATAATTTTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:1 - chr3R 11815866 5' - accord 182 2 76.71 GCCCAACCATTCCATCCCGACTTGTGTGTGTGTGTGTGGGCCCAAATGTGTCTGTCCGTCTGGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGACATACCTTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr2R 15528557 5' - 1360 3334 1 54.11 ACACGAATGCGAGGCATGCAAATTCATTGAGCGCTTGAAATTCTCAATTTAGCAATTCGCTTTGCTGCAACTCAAAGAATGCAAACATGGGGCATCAAGGAATCAACCTTCTAGGCTTTATACTTCCTGAGATCTTGACGTTCATA:1 + chr2L 17749444 5' - INE-1 138 1 69.86 AGTTTTTTGTTAATGGAATATAGTTTGGTTTCATAAGTTTTTAGTTTAAATGGAATTCGTACTAACCACAGCGCAAGTAAACAGAAAAAGTTGTACTGTATCTTCTGTTTTGGAAGTGAGAATAAATAATAAAGATTAAATAAAAA:2 - chr3L 2325937 5' + Doc 4691 1 76.71 TCCTAGTTACCTTTTTTAATAACGACGAAGTTAGGCAAGAAATATAATATCACTACCTCATAAAAAAACGCATATTAAATTGCCTATTAAAACCCTTATTAGCAATAATAGGTGCGCAACGCTTTGGCATGGAGTCAACCAGGTCC:1 + chr2R 8106930 5' - Tc1 1282 1 61.64 ATTAGATAAGACACCTCAATAAAACATCATTATTTTACTGATTGTTCAGTTCTGCGTAAATAGCATACATTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 + chr3L 785872 5' + I-element 50 1 51.03 ATTATATAGATAAATGTTATGTTAAGATATTACATGTATTATTTAATGTAATTTTATTAAGATATTAATAGTTTGCAATCAGCTAAAAGTAAGTTGTTCTTTTCGTGGGCTTCGCCATTTATTCATTCTTACATC:1 + chr2R 9068879 5' - rooA 281 2 76.30 GTAGCTTAGAAGACCGAAGCTTCGAAGATTCGATAGCAAATATCTTAAACTATTAGAAAGAAGAGAGTCTCTTGAAGCTAAAAGATTGGCATTGCAGACAGTAAACTTTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAG:1 - chr3R 29287306 5' + baggins 5208 1 60.00 CAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3R 21674897 5' - roo 331 2 71.23 AGGTATGTACGCAAATGCAACTAATATATTTGGATTCTCTATTAAATTGACCTTGTATGTAGATACCCACAGCTTGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTCTTATATATTTTTATGCAGCTGTGC:1 - chrX 15932502 5' - micropia 380 2 54.79 GTTCCCATTTCCCAACAGTGGCGAATATTTTTATGGCTAGCCGGGGGCTGAGTTCACAAGTTTTAGAAAAAAGTTGTATTTAAAATAAGCTAGTTGAATTTATTCATTTATTATTAAAAAAGAAAACAAA:1 - 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chrX 9244888 5' + accord 7035 2 59.69 GATTAAACGTTACAACTTAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3L 14375564 5' - roo 402 1 78.08 CAAGGTCTTGGTATCGGTCCTCTCCCCGTCCTGGGAAGCCATATCATATGCCACTTGGGGAAGGGAGAGTACCGAATTAGAAATGAAAATTAAGTAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3L 22594102 5' + 297 6605 2 66.44 ATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCC:1 - chr3R 15790123 5' + flea 4732 1 67.81 CTTCTGCTCTTTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCA:1 - chrY 3648924 5' - Stalker4 7156 4 58.22 GGTTTTTGTGTTTTTATTGCGCAAAGCGCACATGCCAACGACCTTGACCATCACAATTTATTTTCATTTTACTTTTTGCCTCCCTCTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTT:1 + chr3L 18033885 5' - mdg3 5191 1 60.27 ATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATACAA:1 + chr3R 907903 5' + gypsy11 366 2 29.45 CGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3L 7870202 5' - roo 327 2 75.34 GGCTAGTTTCGCTACTTTGATAAAAAAAAAAGGGAAAAAAACACAGGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTAACAATCTCTTTATTTGACTTCTCACTTCA:1 - chr2L 5890561 5' - invader3 221 2 62.50 TACAATTAGTTTTACCTTAGAAAATTATTTGAAAACTATATGGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTG:1 - chr2R 21870247 5' - copia 5047 2 73.10 ACCGTCTGCTGAAAAGAGAACTGTCGAATCTCATGACGCAGATTGCAAAGAATTCGGCCGACCATCGCCATCAGCATGATTAAAATTAAACCGTTGAATTTTAATTTAATTTTAATTTTGATT:1 + chr2R 23802068 5' + Rt1b 129 1 64.23 TCCCCATTTCTGCAGTTCCCCAACCTTTTGCACTTTGCTGTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 10469656 5' - roo 390 2 72.60 CTCTAGCCGTTCTCTGCGACTTTGAGCCACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAG:1 - chr2R 1320481 5' - Transpac 5151 2 76.87 CCACTTTCCACTCATTTGGGGCGAATTTATGGCGCTTTTGATCGCCCGACTGCCGCAAGAAACACTCAAGTTATAAAGACACGAGTGGATTCGACTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGC:1 - chr3R 10213160 5' + P-element 15 1 73.72 ATTTAGTATATTTATTAAATCATTTGACCTAATATAATGTAACATTACCATTAAAAGTGTTTCAAAAAAAATATTTCGCTTTTAAAAAATTGTCAGATGAAAGACAAAGAAAAACACACGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTA:1 + chr3R 25504189 5' + 1360 3000 1 71.23 TAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAGGCGAGTGTACATTCCAGATCTAT:1 + chr2R 15075603 5' - mdg1 7368 2 76.71 CACTACCAACGAACGAAATGGTGAATTCATCCCAAGTCTTTATCGTTGCCTTGCTGGGTCTTAATCTAGCTTTGGGCACCTCTTAAAAGTTTTTTTTT:1 + chr3R 32023047 5' + FB 875 1 64.29 CAGTTGATTCGGAGTTATATGGGTTAAATGCTATCAGCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 + chr2L 4929765 5' + blood 7039 2 66.44 ATAATCAAACAATCAAGCTGATGACAGATGTACAGGGCGCTCGAACAATTTTTATTTTCTCTTTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTCCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAAACTGAGTGGCA:1 - chr2R 19931214 5' - I-element 34 1 66.90 AATCGCTATGCGTTGCCAAACTACCTAGTATTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCATTCATCTGAAATATT:1 - chr3R 9583343 5' - Juan 4121 1 76.71 AATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 - chrX 1103715 5' - pogo 2075 1 57.27 TAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr2L 13629086 5' + Tirant 38 2 64.65 TGTGGTGCCGATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGTCTACATACATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGCGGTTCTCCAA:1 + chr3R 18635218 5' - opus 426 2 70.83 CAAATGTTTGGCAATTACATCTGTTTGTTCGAGATAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 + chr3R 11151775 5' - mdg3 5468 2 65.07 GCTTATATTTCTACTGATAACAAAATTATTATAGTTCAAGCGAAATCATGTTGCACATGAACAAAATTGAACAGATTTTAAATATGTTTTCAAGTGTCATTATCTGTTGTCAAGACTGTTTGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 + chr2L 14501066 5' - 1360 3388 2 82.88 ACGGGTTGAGGGTGTGGGCCATTTGCAAAGTGTTTGACTTAACGGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr3L 18183241 5' + Tirant 8115 2 80.69 TATGTCTGGGGGAAATGCAACTGAAACGCATTTATCAGTCTAACGAGCTTTGCCAAAAATCATCCTCAAGGTCAGGGCGTCTCAGCCGAAAATGCATTTTGCATTGATCATATCTTCACAAAAGGCTCAACCCTCGATCACGGACT:1 - chr3L 10537682 5' + Tirant 8500 2 73.29 GCCACCAATCATTTAAGCCCATATTTCTGAGTCAGCGACATTCCCTTGAAGCTCTTTCTCATCCCAGTCTCATCATTCCCAGCTTCCAAAGTGCGATGGTGCATCGCACAGTGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTTGTTTGTAT:1 - chr2R 9674675 5' - Doc2-element 91 1 64.38 ATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTA:1 - chr3R 13349567 5' + Ivk 92 1 69.18 ATGATGAGATGAGTTGGAGAAAAGGGAGTTGGCAAGTTTTCCAGTTTGTTTGCAGTCCAATAAAATTGCAAATGCTTTTCTAGGATTTTTTTTTCTCTTGTTTTTTTTTT:1 - chrX 8508841 5' - Porto1 172 3 42.73 CGACAGCTTAATTATGTACGCTCCCATCCATCCATCTATCCCTGTGTATGAGTGTGCCAAACAATAACCCACGAGCAAACATATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGA:1 - chr3L 13070881 5' - gypsy4 6462 1 55.48 ATACTTGAGGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr2R 1373199 5' + pogo 63 1 60.27 CAACACAAAATATTACAAACAGCAACCAGACCCAGTCGCATACAAAACTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGGGCCCAAATTAG:1 - chr2L 5646963 5' + jockey 4601 1 55.17 TACCATATTTTGGTGAATGGATACAAATGCTCCTTGAGATCTATTAATAATATATATTTTCTGATATATGCAACACGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTAACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCAT:1 + chr2R 14804767 5' - Stalker 7082 6 48.63 GCGTAATAATGGGTTGGTTAATCTATAAGTTTTTACAAATAAGCTTTTTATGGCCAGGAGAGAATGCGTCAGGTAGCAAATTAGCAAAGCATTTTTTAACTTCCACGTTTACAGACTATATGTATTTATAATTAATTTAATTATTA:1 - chrX 21049403 5' - flea 4990 2 57.53 ATCCACTTTCATGTGGGGCACTTACCACTTGGCGGTGGTTTCCAGATGCAGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGCCAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCA:1 + chr2R 17014924 5' - flea 4797 2 58.06 ATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3L 13678895 5' + hobo 25 1 52.08 AGAAAAATGTTCTGAAAAATCATTGTTTGGAGGAAGCGCCAGATTCTCTCACACATAACTAAATACATGCACGAATATGCTGCCGTTACGTGTAATCAAGAAACAAGAGAGAATGCTATGCCCGACTATCAAATACCCGTTACTC:1 + chr2R 25196940 5' - INE-1 549 1 67.59 AGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 + chr2L 13629097 5' + Tirant 8155 2 75.51 GCTTATCCCTTTCTTCCCACGTAGCAGATAATAATATTGTGAGTATATTAATCGTAAATTCGAGTCTTGTGTGGACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 21013992 5' - roo 389 2 74.66 AACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCA:1 + chr2R 5582156 5' + Cr1a 475 1 54.11 AATATCAGTTCGCGAGCTAATTTGAAAATGTTTTGCCTCCACTTTAGTTAACTTTGTGCTAGTTCTGCCTTCTGCAAATATTTGTTAGATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr2R 10160640 5' + hobo 26 1 59.42 ACCCACGAATTAAAAGCAGGCAGCACGTAATGCCGTTGCTAACAAGCCAGGAGTTTGGGATAAAGCCAGAACTATTATATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr3R 28406477 5' + opus 7154 4 59.59 GCTTTGGGTTTATTTTAGTCTAATTTTAATGTGTGTTCGACAGCAATAACAGAATTTTTACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTT:2 + chr2L 15644856 5' - transib2 2764 1 58.90 ATTCACCAGTGCTGCCCAGCATTAGTACGCCCATAGATGACTACATATAATCGAGTCATCGACTTATCGATAAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACAT:1 - chr2R 7669077 5' + F-element 4296 1 50.68 CAATACCTAAACACAGTAAAAGTACGCGTCCTGTGGAGCACAAGGAGGAAGAAAGCTCTCAGGCATCTCATACCTTTTATATAAATTTCTTGTATACACTGTGTTCAATTAAATAGCAGTGCAAGGGAAACTAAGAAATACAAAGG:1 + chr2R 1735241 5' + HB 35 1 74.66 ATCTGCTTACAGATGGCTAACGTAGTTTTATATTTTCGGGAATTATTGTAGATCATGTCCATTTAATGTTGATTATGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATT:1 + chr3R 10743617 5' + FB 47 1 50.68 GGAGGATTTGCCGAGTTGTGTGTGCACGAAGTAGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 + chr3R 31724882 5' - P-element 2798 1 24.66 GAATAGGCATCTCTGCTTCCATAGGCATACTTAGGCAAAGATTTGCCTTCCACAATGACTGCCTTGTGTTTGTCGGCGATAGTTTCTCAGTATACCAACGATGTTCTAAAACCAATATGGACATATAGATGTCAACTATGAGGCAA:1 - chr3R 3190562 5' + Doc4-element 2606 1 69.86 AACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGCAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCC:1 - chr2L 12291930 5' + Tirant 8180 2 68.49 GAATGGGAGAATGTGAGAAAGGGAGAGTGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 19580880 5' - roo 351 2 56.16 GAAGAAGTTGAAGAAAGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chrX 4400307 5' - roo 338 2 67.12 TAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3L 14375638 5' - roo 327 2 72.60 TGTGGCAAAAGTTTGCTACTTTCTTTTTATCTTTTAAAGGGGTATATAATTTTATGATAGAGATTCGCTAGTCAGAGAAAAGAGAGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 4651524 5' - roo 393 1 72.59 CCTCCTTCTTGGCAATTCCTTGCACTACGCTCTGTTTGCTGGTTGCTGTTTGTTATTTGTTATTTTTACTGTACACATGACAATAACGCCGGCGGCAGGCATATGGCTATTAAAAGTCGCCACACTTTCACTTGCCAACACTTAAT:1 + chr2L 2678787 5' - G5 124 1 66.44 AAATGGCCAAAATGGCTGTAGTTCTAAGGGATATTTGCAGTGCCATGGAGACCCTCAAAATGTCCGATTTGTTGACGACAGTGTCCAGCAAGAAAAAGAAGCCTATAAATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTG:1 - chr3L 19593058 5' - F-element 4226 1 74.66 AATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 + chr2R 18689144 5' - Burdock 6354 2 55.00 ACTCCTCGCTCTTTTTTCAAGACCTTCTGACGTCAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 - chr3R 25050065 5' + P-element 83 1 28.77 GAACCTGATACTCTGTGATATGAGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCAAACTCATCACG:1 - chrX 21994024 5' + McClintock 7 2 74.80 CTACAATGAATGTTGAAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATTTA:1 - chr2L 13332713 5' - micropia 397 2 60.69 CATGACGCTTTATGCTTTATCCACTTGAACTCTTTCAGTTTTTTATCTATTAAATCATGATTGGCTACAATTTACACCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCA:1 + chrX 5269671 5' - R1A1-element 24 1 52.74 AAAACAATAATTCATAAGAATTCTCACAGTTGTAATCGATCACATTTCATTTTATTTAACTTAAAACAAGAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGTGAATGC:1 + chrX 15934389 5' - INE-1 534 1 54.55 TTTGTTGTAACGACGCTGCCTCTGCCGGCGTCGTTGGAACTCGAAAAAGGAAATCACAAAAGAGCATCGAGGAAGAGGCTAAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAAC:1 + chr3L 4252102 5' + Bica 474 1 73.11 AATGTATTTTGCTTTGTCCCATTACTAATCAACAAAATATTTCCATTTGCTATGTGCTCACCAAGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2R 11256264 5' - roo 9017 2 55.48 ACTTTCGCACAAAATGAAACGGCCTTGAAATTGCAAGTACTAACCCTATCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr3R 6413557 5' + 1360 63 1 64.29 CAGCACACCGCGAGGCCAAAGGTGTAGGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAAGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 + chr2L 22319248 5' + Transpac 4960 2 53.85 AGACAGCTAAAGGTAGAAATAAATGACCAGAAAAAACCATATTAAATGGCAATTTACATTTAAGCAGCACAGAAATGTGAAAATGCATTTGTTCCAAACATCTCAAATGGCAGTGGAAAAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1 - chr3R 17258238 5' + 412 2 2 78.77 AAAAAGCGAGGTGTTTCAATTTAATTAAAATATAAACACACGCCGAAGGCCTTTGCTAATTAAATAATATGCAATATGCGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTACTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATA:1 - chr2R 7599265 5' - diver 6068 2 54.79 CTTAAAAGGCGTGGTCAAATCGTGGGTAAGTCATTTGCTCAAGTATTATGAATAATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGT:1 + chr3L 465975 5' - Juan 4148 1 63.01 CGGTAACGCGGAGCAAGCAACGGACAGCACAAAACCACCAACTCCTGCAGGCAGCGACGATGAGCAGATGGACAAAACTTCAGTGAACGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCAAGA:1 - chr3R 24637046 5' + F-element 214 1 70.00 AAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 - chr2R 18014093 5' + Doc 58 1 74.26 CAGTTGACAGCTTTAAGTCAATATTGTTGATTAATTGTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATAT:1 - chr3L 11395990 5' + I-element 84 1 75.34 AAATGCAAATCGATACCAATTAGGTTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCA:1 - chr3L 7801330 5' + Transpac 125 2 60.94 GTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGA:1 - chrX 22824238 5' - Gypsy12A_LTR 2256 1 52.78 AAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 - chr3R 30264090 5' + blood 79 2 71.92 CTCTTACTTCCCTGTTTATATTTACATCTTATTTAGATATATTCTGACGATCTAGATAAATATCAGAATAAGCATAAGTTATATTTCAACAGTCCTAAACATGTAAATATATACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAAC:1 - chr3L 6906115 5' - jockey 4983 1 74.66 AATGTTGTCTGAGCCGAAAATACGGCAGGCAGAATATTTTGTAACCAAATAAAAAACATAGCATCAATGAAAATTGTTTGAGAAAAAAAA:1 - chr3R 16692905 5' + HMS-Beagle 426 1 74.44 GACGGGGCAGCGGGCCCGCTTTGAGGGCGGTGTAGGGGCGACACATGCAAAACACAGCAATAGAAAAAACAACAAAGACTAAAATTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCCGTAAACAATTCGCAAAATAAACA:1 + chr3L 15268974 5' + diver2 4820 2 50.00 AGCTGCCTATAAATAACCCCAGCCTGACATCAAATAATCATGAAGGTGTCAGCTTTGACTACATTTAGAAACTGTAATTGTTTTAAAAAATGTGACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGT:1 + chr3R 14911933 5' - Stalker 358 4 50.00 GGGGAGAGTCTCTAACAGCAAGTGTGGATCACCCATATGTTGTTTAGTTTAGTCCACGTCCCACTCGACTGCAGCTAAGTGGTTCGAACATCCTCGGCCGACCCTATTTTGGAGAGTACTTCCTT:1 + chr3R 9608051 5' - gypsy3 6517 1 72.00 TTGGATAAATTGTAGTTAATTGTTTACAATGAAAGTGGATACAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1 - chrX 15454755 5' + 1360 80 1 72.60 CCTGCAGGCGTCTAAAGACTTTCGAAATAAAGCGATACGTGAACTGAATATGAGAAGCCAAAGGTTTAAGCCTTTAAGTGATGTGGCACCCCATTGGCTTTAGCTACAAGTTGAAGCCTTTTTT:1 + chr3L 9758789 5' - S-element 1389 1 70.97 TTTTAACACATATGACAGAAGGATTATTAAATTAGTTAAATCGTTTCCATATTGATTTTGATTTTTTTAAATTTTACAAGGTAATTTCCACTTCGTTGGCTTCATACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3L 2320565 5' + roo 16 2 69.86 TCTATCTCTGTATATTTTTATAACCATTACTCGTAGATTCTGTATAAAGTGTATATATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCA:1 + chrX 15408716 5' + INE-1 515 1 67.81 TATGAATGGGATGACGTTTGGTTTGGGCTGTTGGTACCAAGATGCTGATTCCTAACAAGAAAATGTGCACCTCCTTGGTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATACAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAG:1 + chr2R 5532130 5' + 412 371 2 53.42 TAATGATTTGTTGCCAGGGCTAATCTGTTGCCCGCTGTTCACCACATTGTTGTTATAATTCGCTGGCCCAGGATATCCTGATATCCACAGTGGTGCTTCGGTGGGTAGCTCACAGAGTGGCTCTTATGTACACCCCAACAGCCTAG:1 + chrX 14329102 5' + jockey 4667 1 80.82 AGAACATTTTTTAGATCCTGTGCAACATAAGGCGTTTTTTTTTTAAGATTTCTGAAACTGCAAACTAAGTGAAAATGTTCTATTTATGGGCTACAATAAACATGTCACCGGACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTG:1 - chr4 339815 5' + rooA 7331 2 56.16 CAGGATGCGATTTGGGGCAGGCACAAAAAATCAAATAAATATTTTAGCTTGGAAACATTTTCCAGCATTTTCCTCACTCCTTGTCCAGGTTTCTGATATGTACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTAT:1 - chrX 887444 5' - Quasimodo 7359 2 76.43 ATTTAAATGATCTCATTGCTATTTGTGCGACAGATTCCACGAATGTGAACTTTAATTGATAGCAATAATGAAGAAAAATTGCAGAATTAGCCAACACTGGGACTTTCCCTGTTTTTCATTTTGTTATAAAAAAAAAAACAAAAAAT:1 - chr2R 21472907 5' + gypsy11 3930 3 51.37 TACTTACTTTCGGATCTAAAACTGTTATGGAACCAGAAATGGAAAAAATACCGACTTGTTTCAAAAATGTAGTTGTAACAGTTTTGTGCATTAGCGATTGCATAGCAACGTTCTCAAACAATTATAGTAACTTATGTAGTTACCGC:1 - chr2R 6647887 5' - Chimpo 184 1 56.85 AAATCAAACTGATGGGATCTTATGAAATGCTGGTAAAGCGTTTCGAGGGAGAAGGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 + chr2R 9294312 5' + Tirant 5 2 71.76 ACCGTACAGGCCATTTGAGGTCTTGCCCAAATGCACTCCAGAACCCAGAAAAGCCCATCCACTGAGATTTGTTTGTTCCGATTCCGAATTTGGTTGCATCGAGAGTGGTCGCTTGACATCACGTTACAATAGCGTCGCTGAGCAAC:1 - chr3R 26901398 5' - Bica 4807 1 69.18 ACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGT:2 + chr2R 5582141 5' + Cr1a 460 1 64.38 CTACAGCCCAACTATGGCCATAAGCCGCCGACGGAGCGCGGATTTCAAGACGCTCGAACGCCGACGACGCCGTCAACAAACAGTTGGCATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTA:1 + chr2R 12493323 5' + jockey 4867 1 61.87 GCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATT:1 - chr3L 27415305 5' + transib2 71 1 65.75 CGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGAC:1 - chr3R 24454871 5' + F-element 271 1 51.64 ACTGGATTATGTCATACCGGACGAAGATCTGCTCCAGTACCTTGGCCTGATGACACGTTTCTGCAATTTTGTCATAGAGGTGAGGGCATATTTTTTCAAATTTACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACAGATGTCTGCTA:1 + chr3R 21217075 5' - 1360 164 1 58.90 CAATGCACCGTGGGCCGAAAAAGTATTATTTATTATTTCATAAAAAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGT:1 + chr2L 8574370 5' - Transpac 237 2 71.72 GTCTTTAAATCATTACAGATTTTACAATTCCCTTCTTCTTATTCCTTCTTATAGTATAGTCCTTCTTATTTTATAATTTACACCAGCTTTTCATAAATGATATAGTCGATAGTCGAGTTGCCCGAATATCAGATACTCGTTACTC:1 + chr2R 4695746 5' - INE-1 549 1 71.03 CCTGATGAGTGGAAGTTCCAAGAAGGAGTCACCTATGTCGACCTACCTGGATGGGCCAGCGTCTTTATGATCCGGCCCGGTTCTCCTTCTCTAAATCTGCAAAGCGAACGCTCAGCAAACCTTTG:1 - chr2L 11075219 5' - Quasimodo 7234 2 74.40 ACGGCCATCCATAGCTCCACCAAGGTGGACGACACCATACGCTATCTCAGCCTGCACGACAACAAATATCTGCGCTCACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCA:1 + chr2L 8374761 5' - R1A1-element 16 1 52.05 ATGTGGACAGTCATCATACCCATGTCACGCCAACCAAATAACATATCGCCAGTAGCACCGCGTAGACGAACAGGCGCTTGTGTGCCATTAATTTTTCTTTTAAATAGGTAGACTATCGTAGTTAAATTAGGTAACATAAACATATG:1 - chr3R 5355251 5' - Tc1-2 1504 1 65.75 CGCATCAACGTACCCAACTCCTGGGGCTTGCCTTTTATTCGCTCTTCTATTATTTGCCGTACTAGGCTTTCGTTTTTGGCTTCTGTATGGCAAAAGTAGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3L 12874829 5' + jockey 29 1 71.92 GCCATTTAATGTGTTTAAAATATTTCGAATTAAGCCGCTTTGTATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCTAATAAGAATCATATATACACTATATAACTTCATTTATTTCTTCATA:1 - chr2R 11095822 5' - diver 149 2 67.13 GATGCTGGGCGAGGCATTGACAGCTGATTGCGAAAGTCCATTAAGGGACTCCGGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTT:2 - chr2L 21976382 5' - Idefix 6968 2 63.70 GATGCCACGCATCGTGTCGCCTACAATGTGGCAACATAAAACTATTACCGCGACGACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3R 28454321 5' + roo 77 2 62.33 TAGTTTGGGTACACTAATTAGATATGAGTAGTAGCTTGTAAAATTATATGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAA:1 - 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chr3L 7827864 5' + Doc2-element 235 1 67.12 CCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAACAAGCAGATGGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGAGTGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTA:1 + chr3L 3453662 5' - Tirant 8357 2 67.67 GAAGCGCATTATAATAATTCTTTCCCTCGACACTTTTGACTGGGATTGCTATAGAGGTCTTCGAGAGAGCCTGAAACCAGCTTTTTAGCCAGCACGAAGAAATCGTGTGCAAAATATCGAAGGGCGTTACCCATCTTGTTATTCGA:1 + chr3L 23250407 5' + 1360 3379 2 76.71 CATGATTCAATGCCAATTTGACACTTGTGAGGAGTTTGAGATGGCGGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCG:1 + chr2R 23212607 5' + Tirant 8181 2 67.12 CAAGTGCTAACAAAGTGCTTAAGTTATAATTCGCTGGCGAAACAATGTGTCACAGTCATAATCCTCAGAGTTAGAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chrX 10580013 5' - pogo 2057 1 55.48 AATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGA:1 - chr3R 15790128 5' + flea 4727 1 71.23 CATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAG:1 + chr2R 21848700 5' + Transpac 5006 2 76.71 TATTATCCTGTAGACCCCACCATGCTCAAGAGTGTGTGTGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chr3L 13678962 5' - hobo 2886 1 70.94 AAGATTTAGTTAGATAAACATAGGAATGGTTAGACTAGTAGTTGCTTTGATTGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGGCACAAAGTTATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAA:1 + chr2R 1373329 5' + pogo 369 1 70.55 TACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAATAACGAATGAGCAG:1 - chr3L 23583086 5' - looper1 82 1 50.68 GGCGGCTCAATTATAACTGACAAATAGAACTTATTGTTCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAA:2 + chr3L 15099517 5' - G4 3805 1 73.29 AATCATCGTTGTCAGTTTCGACATTTTAAATTGGTAGCCAGCAAATGATGCCCAAAACTGCATTCTGTTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:1 - chr3L 20252020 5' - copia 5071 2 54.79 TAAAGCCCCACTTATTCACGTTGAATACAAATTAATTATAATTTTGTTAATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAATGCAAAATAAAA:1 + chr3L 17667558 5' + F-element 75 1 57.53 TTGGCATTGCAGTCGCCAGTGCCAAGTGCTGGAATGAAATTATGATGCCAAATGGAATTACAGGCGGTTAACTCGACTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGATTTTTAAGTT:1 + chr2L 1305234 5' - Tirant 348 2 61.98 CCATTCGACTTTGCAAAATACTGCCTACAAGGCCGCCAACAAAATGATTTGTTTGAAGTTTGATAAGCGGATGTATCTGTATCTGAGCCTGGGCACTGGCTGGGACTAAAAAACAAAATAATCATTGAATCACAAGATGCAAATC:1 - chr2L 11379822 5' + rover 6852 1 49.66 ATAATGACAAATTTAATGGAACAACAATTGTACAATTTAAAAGTTGCTTTGGGTTTATTTTAGTCTAATTTTAATGTGTGTTCGACAGCAATAACAGAATTTTTACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr2L 15644811 5' - transib2 2809 1 75.34 TGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACA:1 - chr3R 7616805 5' + Stalker2 7328 2 76.03 GTACTACTTGTTGAACCTATCACACCTGATTAGTAAAAGCCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCTAACGTTGTCGGACACCGAACCGGGAAGGCGAACAACTAGAGCACCGCATCCGGCCAAGTGCTGAC:2 - chr3L 24104298 5' + Tirant 8190 2 71.92 GGTGGTGGTGCGGGTCGAGCGGTATTCGAATTGGGACGGGAACGGGAAGAAGATGCCGCTGCTATTTACGGGCTTCAACGCATTTGGTGCCGGTTTTCGCTTTATCTCGCTCGGCTCTGTATGCGAGGGGCTTCCCTCGCTGCTGG:1 + chr3R 21887455 5' - G6 404 1 54.11 CGAAAGCATTTATAACCGACAACATGCTGTGAACTTGAAGTCAAAGCGAATCCAATTGTCACGCGAGCAGCACACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATG:1 - 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chrX 13752788 5' - mdg3 5262 1 79.43 AGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACA:3 - chr3R 7616814 5' + Stalker2 7319 2 69.86 AATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAAT:1 + chr2R 11095743 5' + diver 5945 2 56.52 CACACACATAGGCACAGGCACATACACATACACGCAGATACACAGGAAAGGTCCTGCGATGTTGGGAGCTGTGGGTTCTGGAAGGAGGGCAAGGGATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chrX 4745621 5' + roo 8703 2 80.34 GATAAAGACTCTCTCATTCCATATCGCAACCGAAACTGACTAAGCATATATCTTCTCTCCAAAAGCTTTCGATGGATCGCTTTATTTAGTTCTCCCCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 - chr3L 2192388 5' + jockey 4701 1 63.45 GTATTATATGTGGCTTATAAGATGTGTTGTAATAGAAACATGGCTAGTTATTTTTATATTTGAAGAAAACTTACTGTATGCTGAATCTCCATCTTCTGTCTTTTATAGATCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACG:1 - chr3R 6855430 5' - INE-1 128 1 52.48 GAATGGCCAGCAATTCTAAAGGCGATGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGCTGTGTGCGGAC:1 + chrX 6632979 5' + P-element 86 1 20.74 TACCGCAGACATTAAATTCGCTCGGCTCTCAGCGCAGCCTTTCTAATTTCAATTGTCTTTTAGTTTCTGCAATTGTTGTGCAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTAATTTGGCAAACACAAA:1 - chr3R 13993554 5' - Cr1a 49 1 65.57 TAATTGAGGAATACTTTTATGTAAGTGCTTTGGAGATACACTCCGTAATAGGTTTGTAATAGGGTTCAATCTAAGCAAATTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTAC:1 - chr3R 15502584 5' - Ivk 5334 1 58.90 AGTAAGAAAGTTTATAACTGTTTCGCTTTTGTTTCGCTCGCTTATTATTATGATTTCCATGCTCATTGCCATTTCGGGTGTGGTGTTACTCTTGTTTGCCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGA:1 + chr2R 12202207 5' - Tirant 8483 2 69.86 GTTGCATACTTTTGTGGGTGGAATGCAGTGAGCAGCATCACTTGGAGAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCAT:1 - chr2L 3323190 5' + jockey 4750 1 70.55 GTTTTGTTTGCGCGCACTTGCTAGACTAAATTTTTCTAATGGGCTAAATAACCTTTTATAAGTAATCTCAATGCGATGCCGGGTCGTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chrX 19107525 5' - roo 401 1 77.24 GTCGAGTCGTGAAGCAGTTAAATTGAATTTGTTTGCTTTGGCTGAAGGAAAAGAAAACTACTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAA:1 - chr2L 10155677 5' - Transpac 4990 2 58.90 GGTGATATTTACAAAAAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTA:1 + chr2L 2120370 5' + I-element 4963 1 56.85 AGTATTACGCGGACCACGGCGGTACGTGCTTTTTACGACACCCACTGTGGCGTCAATTATAAAGATATTTAAGTACAGTTAGCATGCAATTAGACGGAGTTGACTGTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCG:1 + chr3L 7938988 5' + R1A1-element 5313 1 73.29 CACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chrX 16117150 5' + opus 7047 4 55.48 TTTTATTCATATGAGTTTTTAATGTATAGCTATCCTCTTCTGGAAATTATAAGTATGCCTTTAAGTATTTTAGTTCTTATGGTTGAGCTGTCATAGAGGTTAGGCAAAAGTATATTTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGT:1 - chr3R 14954130 5' + jockey 4767 1 40.41 GTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3L 16015250 5' + 1360 56 1 69.17 TGGATAAGCGAAGAAAAACGAGACCAAATGCCGCACATTAAAAGCGATTTAAAAATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGAGCAATAG:1 + chr3R 7616677 5' - Stalker2 390 2 76.39 GGAGCCACCTTCTACGTGTCCTTTAGTGTAAGTTGATAGAATTTGGGATCAATAGCATGTTTCCGATCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 + chr3L 6095461 5' + transib2 52 1 54.11 AGAAGATACGAAAGAGATTTATAAATAATGAATGGGCGCATACATATATACGTATTTGAGGTTTTAAAGTTTCGATTGATCAAAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAG:1 + chr4 495938 5' + I-element 497 1 57.53 GCAATGATGCTGCTGCTCAGGATCGTTTCCTTCATTTATATGTTTGACCATAAACATTATGCGTCGATTACATCGTTCTCTCTTGTTATAGTCGTTACTCGTAGGGTAAAAGTGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGG:1 + chr3R 23417271 5' + INE-1 18 1 56.85 CAAAAGACAAAACAAACAAAACAAAAAACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTGCTGCACAAAGCACAAAAGAATCACTCACGAAGCGAACGG:1 + chr3R 30486950 5' - Cr1a 127 1 72.18 GTAAGGAGTTTCGGAAGATGAAAGGGAATCCTTCTTGAAATTTGACTATGGAGGCGCTTTGTGGGCGTGGCAAGAGTTTTTTGGCAGATCGATGGCAATTTACAAGACTAATAAAAATATAAAAAAAAAA:1 - chr3L 23236366 5' + BS 5101 5 60.00 GTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTAGAATGCTTAATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTTATACGGACAGGCGAACTTGGCCAGATCGACTCGTCTACTGATCCTGATCAAGAATA:1 - chrX 14770553 5' - INE-1 85 1 62.59 ACAATGTTGCCTAGCACTTTTAACCTTTTGCCTGGTCGGCTCTCAAAAGTATGCTACGCCAAGAGTCGTGGGAAGTGGGCCGCACTGAAGGTCACTAATTGATTAATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr3R 14986222 5' + jockey 4683 1 76.98 ACAGGAAACTAGAGAAGAGACTAAACGAACTGATACCCTACAACGATTGCTTCTACAGGAATCTGTACCGGCACGACTATCTGGTCAACGTGGATGTGGATGAGGAACCCAGCTGGAGCTGCAACGCATAAATGAGAGAGGACTA:1 - chrX 1174933 5' + rooA 7194 1 71.03 AGTACAGAAAGGAGTTGAACTCTGGGGAAGATGGGAGCTTGGTGGAAAAACTTTAACACCTCGTTGCAACTGGAGGCACGTTGTCCTGGCACGTGTCCTGGCATTTTACAGTTCCTGAGATCTCGATGTCCATACG:1 - chr2L 14962688 5' - INE-1 136 1 76.47 AATGGCAAGCTGAAAGCTGAACTTCCATTTAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGG:1 - chr2R 19852217 5' - Transpac 238 2 76.92 CAAGGAGCCATTCGCAGTAAGCTGGTGATATTTACAAAAAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACAC:1 + chr2L 2120347 5' + I-element 4940 1 57.53 GTTTACAGAAAGTCTTACACGCTAACTTAGATACATCATCATTATTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3R 15295803 5' + roo 74 2 71.23 CCATCTAAATGAACCATAAAATCCAAATTAATTCAATTGAATTCAAATGGCCGGGCAGACCTCGAAAAACCCACGACGACATCGTGTTCTTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTT:1 - chr2L 14673789 5' - F-element 59 1 61.81 ATTAAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 21674904 5' - roo 338 2 66.44 ATTTGGTTAATTGGAAAATATTTGGTCTTAACCATCATGATTAGGCGGCCATTGAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 - chr2L 5792134 5' + blood 7025 2 75.86 GTAGAGGATATTTGACCCTATCTGCCAAATGCGAGCAACGTGCACCACTTAAAACTTTCCCACCACTTAACTCACCCCCTCGAATAGCCCACCCCCCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCC:1 - chr3R 11095922 5' + hopper 26 1 66.44 TATTCCAAATGAAAAATCCGCTACGCTTTGAGGGTTTTTTACTGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2L 16330961 5' + roo 27 2 56.84 GACAAAATCTATTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGAGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGATTTT:1 + chr3L 18183068 5' - Tirant 8461 2 54.79 GTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 28450731 5' + roo 8750 2 80.82 ATTAATTAAATAAATGCATTATATACATTTAATATACATAACATACATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACATGT:1 + chr2L 13332624 5' + micropia 74 2 78.77 AAACAATTGAGAACTATTTTCGCCAAAAATTAACCCCCATTAAAGTTTAAATATCCTACTGGACATTGCTCGTTACGAGATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr2L 17839355 5' + blood 42 2 56.85 GCATATTAATGATCGTATCGTTTTCTTGAGAAATGCCACAATTAAACATATTGAAAGAGTTTACAATTTAGTTCATTAAAGCTCCTTCCTTTTGTTGTTCTTGTAAGCATGGTCAATTTCTTGATCTTAT:1 + chr2R 21868886 5' + gypsy12 10074 2 60.77 AATAGTAAAAAAGCTAAACAAACTATGAGAACACACACATTTGTGCACACATGGACACACATGCGTTTGCCCGAGAAATACGAAATCGTTGTTATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCC:1 + chr2L 1627989 5' + accord 6965 2 63.77 ACATATAAAGATAAATTTATAGAGGTTTTAACAAGTTGTTTTCATCCCATTACTTATCATTCGTTTTTTTGTCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCT:1 + chr3L 3238240 5' - roo 9022 2 48.63 GGTTTCTTTAGTTGGAATTCCATAATGAATGACACAGTGAAACATTTTTGAAGGTTTCAACTGTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2 + chr2R 11164358 5' - roo 9057 1 66.44 ACAAAAGGAGGGTGAATGGTGAATGGTGAATGGCCGGGTAAACAACACTTCAAGAGCAAAGTCCAAAGCCAAATAACAAATGATACAATTGAACATTACACTAATTATATTCAAATAATTAATATATTACAAAAAGCAAATATGAA:1 - chr3R 22914488 5' + TLD2_LTR 118 1 50.00 GACCGAAATGGCAAATCAAACAAGACTTCGTTTCGTTAGAAAGTTTAAAAAATAAACATAAATTTGTTAACAGCTCCCAAAGAGTGTGTTAAAAAATGAAATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr2R 13761569 5' + jockey 4693 1 63.70 ATTTGATTGTTATTTTTCTCAGCGAGGAAAATGAAATCCGTAGCAGGCCTACAAGAATCAAATTCAAAACTGGAAAAGCAAAAAGGCGAATAACAAAAAAAGTGGCTGCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTA:1 - chrX 19364852 5' + 1360 3379 2 61.64 AAAAATATGAGAAAACTCGCAGTTGCCTCTGTGGCATTTTTAGTTCCTTCAGCGCGCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTA:1 - chr2L 18112583 5' + transib2 2616 1 61.64 AAAGAGGTTCCTTCTATAAATATACATTTCTAGCAGTATTAGAAACTTTCACTCAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 + chr3L 1358443 5' - 412 7480 2 60.27 TTATATGTATAAGTGAAAAATATTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTATTATAGAGAATATTTTAGAATTAAGATAGGCTAGCATTTCACTTATATCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGTCTTAGCAGAATCAGTTGC:1 - chrX 13127661 5' - G4 146 1 58.90 AAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 8658741 5' - roo 395 1 52.00 GGCATAGGGCTTGCTTGAGGGCTCGCTCGGATCGCCAGGCAACACCTGCCAATGATCGAAGACACATTGAGGGAAGGCCTGTCCTCCGGTATTAGGCCCGAATTAACATATTAAAAAGAAAAACT:1 + chr2L 21678389 5' + HB 1359 1 76.00 ACCCACTGTGGCGTCAATTATAAAGATATTTAAGTACAGTTAGCATGCAATTAGACGGAGTTGACTGTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCAT:1 + chr3L 7939027 5' + R1A1-element 5331 1 56.00 GAATCCCACACACGCCGCCTGCACCACATCGAGGGGCATCAAACGGGATTCCTCGGAAAAGGGAAGCTCATAAAAAAAAGAAGAGAGAATGCTACAATCGCGTTCTCCGGCTATTAGATATCCGTTACTTAGCTAGTGTGAATGCG:1 - chrX 667520 5' - INE-1 533 1 60.27 AATTAAACGATATTTTCGCAATTGTCGCACGGATCGATTCATTTGCGGGCAGCGCAAAAATACCTTAAAGCGGCATTAATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTTTTGT:1 - chr2R 22463273 5' - roo 9050 2 48.82 GTTCGAAAAGGATTCCGAAATATGAAAAAATGCAAAAAGATTTTTGTAATTAAAAATTGAGTATACGCCGTGTTACCCGTTCTTTAAGGTTATATGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1 - chr3L 17823924 5' - Burdock 6366 2 67.12 CCACCTGTGTCCTTGTCCTTTCATCCTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1 - chr3R 6495329 5' + copia 4883 2 61.64 TAAGACCTTACCTGTTCAGTCATCTATTATTATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACNNNNNNAGTATAGCATTAGCNNNNNNGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATT:1 + chr3L 18801805 5' - I-element 5269 1 67.12 ACAAAGTCCCCATGTATTTGGTAACAGTTTCCCCTTTTTTCAATTCTCACAGTGCCAAATTGACAACTAACCACCAACCCATTTAAATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chrX 7756325 5' - roo 406 1 51.72 ACAGACCTACAGAATATCGCTGCCTTAATGGTCCTACATAGACAATGTTGTTACGAAACACCTTTATACAAAAGACTGTCGCACTGGCACCGTATTTGCACATCGTTTTGTGTTTATTATTTATTTACAATTTTTTTAT:1 + chr3R 31998010 5' - I-element 5267 1 73.38 CCTCCGTCTTTTGCTGAACGAAGCGTTTGAATGGAATTATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr3R 19171445 5' + opus 7038 4 66.67 GGGGGTATATGAAGCAATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 + chr3L 7791862 5' - Transpac 282 2 63.83 CCGATGGCCGCCCGGGGAGTGCTTTGGCATAATCTGCATGAGCCGTTGGCATTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAAT:1 + chr2R 14441898 5' - jockey 4925 1 65.07 GAATGAGTTAAGAAAAACTATATTATCGAATGATCTTAATAAATCCTACATCAATCAGTGAAAATAACTTAAACTAAGAAAGCTTAGAACTTATTTTACAAACCAAAGATTAAACAAAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTCCCCGAC:2 - chrX 22672491 5' - INE-1 568 1 52.05 AGAGCTATACAGTGGTCTTTAGATAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGCTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr2L 17626578 5' + roo 56 2 57.93 ACCGAGTCGGCTGTATTAGTAATACTGGGGGTTATGGTTGGGCCAAAAGCTCGCCGGATACCCCTGCCACCGCAGTTTGTGGCGCCCACGAGCGCTTTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGGCAAAACCAGGTTAGGG:1 - chr3R 22470012 5' - jockey 4777 1 65.75 GTGGAGCAGGTCGCAGGAGAGAAACGGGGATGTGCTGCGTCATTAGGAATGCCTCGGGCACCTGCTAAACACGCTAACTGCTTTGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 8658844 5' + roo 8684 2 69.47 GTTTTGAATAATTATTCCATAAGGTTGCTTTACAGCAGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 10469504 5' + roo 8700 2 56.15 AAATATGTATGTAAATTTGTTTTTTGGATCTGAATTAATTTCGGCTTGAAAAAAGTCGTTTAGCACAACACTCACAAATATACACGTTCTTGTCTATTGTTTGTACTCACGCAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGC:1 + chr3L 21385065 5' + 1360 3276 1 72.60 CTTCGTTCAAAAATTTTAGATAACGAAGTAGTAATGCATTTTAATTAGATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr3L 9470060 5' + 412 28 2 66.44 ATAGTGCCATCAACTCGATCTCGATCTCAGTAGTTCATCTTTTATAATGCCCACACACACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 + chrX 2295119 5' - Transpac 253 2 58.90 AAACACTGCAAATAATGCTGACTTTGATGGCTTATTTTTCTATGCTCCTATGACACTAGGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGGTTGAATTAACTCATAATATTAATTA:1 - chr3R 18398027 5' - P-element 2723 1 28.08 ATTAGTTAAATCGTTTCCATATTGATTTTGATTTTTTTAAATTTTACAAGGTAATTTCCACTTCGTTGGCTTCATACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 2320595 5' + roo 42 2 52.11 GGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr3L 2330157 5' - roo 8984 2 77.24 CAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTT:1 + chrX 388252 5' + 1360 79 1 71.92 TCATGGAAGGAAGGATAGTGTCCCATTTTCATGTTGCCCTTATCAGCAATGGCAAATAAATCAATTTACATTGATGTACATGTGACGTTGAACATGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCG:1 - chrX 16161707 5' + opus 7285 2 63.01 GCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3L 21910454 5' + pogo 29 1 59.79 TTTAATTTTTATTTTTTAATTTTGTATAAAGTCTGGACTTTATGGGACAATGCATGCAACAGCAACATCAATGAAATAATACAACGAGCATAATCAAAAATCCTGCGAACAATAACGGATGCGCCTTGGTACATCCGGAACGCGAA:1 - chr3R 7081427 5' + Doc4-element 2699 1 71.23 TAATTGAAGTGTTAAACATCTCTGCTGCTCTGTATTACGGATATTCGTTATGTATTTTATTTTCTTAAGTTTCGGGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTG:1 - chr3R 9994498 5' - I-element 4961 1 65.00 TTTTTTGTTTACAATGGAACGCTCGCACACACCCACTGGTAAACGGGTCACTCACACGCACACAGCATAACCTTCATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAA:1 - chr2L 21237763 5' - jockey 4926 1 49.32 AGTATTCGAAATAATAATAGTAATAAATACAATGTAAGAATATTACGTATAAGCAGATGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATG:1 + chr2L 1360931 5' - Stalker2 339 2 58.90 TATTGTTAATTAAATAGCCTATGTTTCTTATAATCGAAATCAAATGCTTATTTTGAATAGATTCAAATGTTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATT:1 - chr2L 16456864 5' - BS 5044 1 55.48 GCAACACTGACATTTCTCTTTCACGGCATTCTTTTCAGTCGCGCAGTTCTAATGACCTATCATCAAATTGTAATTACTGCAGTCAGAATAAATGACATTTTGAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 12379655 5' - roo 9054 2 73.10 GTGCTCATATGTAATCATTCACATGTTATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACA:1 - chr2L 19310429 5' - Juan 4188 1 65.07 CTGCCCCATCCGAAATTATAATACGGTCGTTCGGTCGGTTGGTCCGTTGGTCCCCTGGTGGCCTTGCTCCATTCCCCAATGGTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCT:1 + chr3L 13551106 5' + S-element 307 1 56.16 ACTGCCTTTCATTTTGTCCCGCAGTTTTATTTCATTTCACTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAAAAGGTATTTCCCTTTAAGGTTGTGATTTTATTTAGATCTCACTCTCATCGAGTGTAGCTTAAGACTGACT:1 + chr2L 4418293 5' - gypsy5 7213 2 71.92 TAGAGCGAGCGAGCGAGCGAGCGGAGAGCTCTACATCGATCAGCTCTTTTCTACGCATAAAGTGTCAGCCGACAACTGTATGTGTGCACATGGATACTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCATCCTAGAAGTTCT:1 - chrX 1990048 5' + 1360 222 1 75.86 GGGAACAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:2 - chr3R 8849879 5' + 297 6623 2 57.53 GCTTATGTTTATGTCCTTTTGAAGTGGTTGCGGAATACATTAGTATATGCTATATATAAAGGTTCCGAATCGCCCATTCCACTTACCAACTCAACGTGCCGACTTCTATGACTTTAGGGAAAAAATAAAATAAAATAAAA:1 + chr2L 2330571 5' - transib1 1901 1 75.71 ATTGCCTCCAAACTCCTGAACACCGGAACAGGAAATGGAAATGGAAAGCAGTGGTGCACTGCTTGGCCAACGGAAGGAGCCAACCAAAGCGCTTAGTACAGCGGCATGTGCACATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTAT:1 - chr3R 12520881 5' - Burdock 6378 2 73.97 AACGTCATTAAGCCCACTCACCTGCACCGAAACAGAACAGAACACAAAATGCCTGGCCAGAAATGTTGAATGTGGCGAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCATGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGT:1 - chr2L 19879341 5' + hopper 1263 1 45.65 CGACGTGTTAATGTTTTGCACTCAGCTTAAAGTGCGGCAATCGAAAGGCCCAGCATGAATTTCAGTCGAAAGTATCTATCTATGTATATATGTAGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 + chr3R 8849722 5' - 297 6952 2 68.49 GGGTGGCTAGTTAAATGTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 24673697 5' - roo 392 2 73.97 AAAATATCCAAGGGAGCGCCACTGTTAAACCGCTCAGTAACGAAGGACACCAGACGATCATTGCTGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGCCCACCCGATAAACAC:1 + chr2L 17380613 5' - hobo 2911 1 57.14 GAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGC:1 - chrX 388311 5' - 1360 3313 1 74.10 AGAGTATGCCTGGTTTACCTTTTTATCCGTAAGCACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3L 19031204 5' - roo 9032 1 58.90 GCTCGGATTTGATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1 + chr2R 15070096 5' - 412 428 2 71.65 CACTTAAACAGACTTTAAGCGCTTTTATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCA:1 - chr3R 21395256 5' + G2 447 1 59.44 CAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATT:1 + chr3L 7837186 5' + jockey 4845 1 70.55 TGGTGTAATTTTATAGTATTTTTAGCTTTGGCAAAGAGTGATTCTAGATACCAACCAGAAAATATAAATATTTCTCATTCTCATTTGTTTACGTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTA:1 + chr3R 5772434 5' - Stalker 153 4 65.75 ATGATAGACGGTCTTGGTGTGTGACCAGAGTGATTGACAATTACCAAATATATTAATTATTTTAAATGTTGTTTATTTTTGAATTGATCACTAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCAC:1 - chrX 15853426 5' - Quasimodo 7303 2 62.33 GTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGCGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTT:1 - chr3R 23235275 5' + BS 53 1 64.41 GTTATCGGGAGTCGGATGTCTGGCCCCGGCATTAAGCTTAACACTAAGCCCAATGCAGGGCCCGGAATTATTTTTTAATGTGCCAACTGTATCAAACTTTTTTATTAAGTAGTAGACAGTTCTACGCGAAATTTGATATATTTCA:1 + chr3R 12831724 5' - Bari1 465 1 53.79 CAATTAAACCAGCTCCAATTGCTATTGCCACTTCCATTTCCACTTTCGATCCCATGTGGCTGCCTTGGCAATGAATAATTCAAATGGAATGCCAGCTTCAGCTTCAGATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGGTC:1 + chrX 8219319 5' - opus 7490 2 77.40 ATACATTTTGTGCATTTAAGACTAATTCAGTAAGAATTAGAATACACGTAAAGAATATACAGTTTCAGAGTGTTTATAATATCCAATAAATAAAATAAATTTAAATAATCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCA:1 - chr2L 12080832 5' - flea 4775 2 75.17 AATGGAAAGCAGTGGGCAGTGGGGGGAACCGGGGGCCAGGAACACCCATTGAAACACATTTCCTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTACAAC:1 - chr3L 921402 5' + Doc 57 1 55.26 GGCAAATATTTGCGTCCGTTTGAGTGAGTGTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGGTGCGGTGGTGCAGAGGTAAGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGG:1 + chr3R 13437142 5' + hopper 47 1 50.34 ACTATGAAAATGCAAATGTGCTCGTCGTGCCATCTCTTTCTGCCCATGTGGCCCCATCTCTTTCTCCGCACAGTGTGCGGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr2L 16615736 5' + hobo 22 1 66.67 TATGCTACATTTTGTTATTGTTAAATATGCTACGGTTTGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 - chr3L 2216603 5' + jockey 84 1 71.22 TCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAG:1 + chr3R 14049318 5' + transib2 48 1 52.74 GAGGGCGCTACTTCGTGTGCTGTCGGCGGGCATCGTCGCAACTTCGGTCCCACGACACGAACGGTTTCGTCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr2L 17260826 5' - P-element 2848 1 55.88 CAAGGCCTTGATCTGTAGGATAATGAGAAGTCTGAGATACACTTGATGCAATATTAATATATTATTATCAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGC:1 - chr3R 17586937 5' + Max-element 11 2 67.31 CAACTAAAGCTAGACTTAAAGTATTTTCGGATAGAGAGGGAAAGAGTGAAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAA:1 - chrX 10045222 5' + I-element 5221 1 66.44 AATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTAGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTG:1 - chrX 1018147 5' + 1360 248 1 67.81 TAATTAAACTATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTT:1 - chr3R 6413638 5' - 1360 3318 1 67.12 GTGAGTGTATATAGCTGGAAGACCCGAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr3R 16276463 5' - pogo 2089 1 71.32 ATGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chrX 1103576 5' + pogo 22 1 68.53 TAGTTTACGAAAGCTAATTGATGGCAATTCCTAAATTTATACTTTGTAGATAAGCCAACTTTGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 - chr2L 22319414 5' - Transpac 296 2 76.03 AATTTCGCCTTGATGGCGTGCTTACAAAATGGCTTCAACTGATTTATGCTCCACTCCGATTCGAATGCCCATTCCCCACACGAGTGGAGGCGTTAGCCTGGTTTTTATGTTGTGTGACATCCAATTTATGTGTATTTTAACAGAAA:1 + chr3L 4847956 5' + transib2 360 1 69.18 TCATTGGTTGAATGAAATGCGAACTATTAAAATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTA:1 + chr3R 31483677 5' - I-element 5261 1 78.77 TCTGATTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCTCAAAAATATATGGA:1 + chr2R 13367463 5' + jockey 4638 1 69.18 AGGCGAAACCATGGCATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAG:1 + chr2L 12291834 5' - Tirant 8451 2 56.94 AGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 - chr2L 21910219 5' + Doc 81 1 73.97 TGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAA:1 - chr2R 1000413 5' + HMS-Beagle2 54 2 55.86 AGAGGACAAATAAGCCAGAAACATTTGCCTGCGCGCGTTTCTTGGTATAGTGCCATCAACTCGATCTCGATCTCAGTAGTTCATCTTTTATAATGCCCACACACACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chrX 2295073 5' - Transpac 299 2 78.08 CGCAGGTAACGGGGGTTGCTTATGTGTGTTCGCTCGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGAC:1 + chrX 8271547 5' + P-element 86 1 26.71 TGAAAGAAAACAAATCGCGCACAATCGACAAACAAAACGAGGCGAGAAAATACACATGTATAGCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCT:1 + chr3L 8867364 5' + 412 7500 2 50.81 GGGCAACTAATGAGCGGAGTTATATACCCAACCAGGAGTCGTAACTGCAAGGCAAGGACACCCGGGGACACCCAACTGTTTATAATTTTTACGAAAATGCGAAAGTTTCTGAGATCTCGTCGTTCATCCGGACA:1 + chrX 7354262 5' - INE-1 132 1 77.61 ACACAAAACATGACGAGCAGGGGAAAAACAACGACGTCAAAGCCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr2R 15528468 5' + 1360 58 1 66.93 AAGCGGCCAACACTTGTTCCATAATGACTTTTGTACCATCAGACGACACGCCCTCAAAAAATGAGACCATGTATGCTCAAAGTGTGTGTGTAACATGTGTATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chr2L 18249244 5' + 1360 18 1 43.75 AATTAAAAAAAAAAACACTCAGTACTAAAATAGAACGCCATAGCAAAACTTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAG:2 - chrX 17565258 5' - 297 6909 2 68.49 AACGGAAGTGGTGCGGGAGGCGCAAGAGGAACAGGAAGAGGAAGAGAGCAGAAGGAGCATAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACAAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chrX 18136743 5' + opus 148 4 50.43 AATATATCTGGCTTACGAGTATATGAACTACTTATCGTTATGCATCTTTACAAGATGTTGTACCAATAAAGCAATGAACCTTTAATTACTTTCCCATTGAACTTCTAAGGTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTA:1 - chrX 20685993 5' - Ivk 5368 1 76.71 CATCGCCTCCGCCAACGACCTCTGCACGATTGTGAGCAAAACAAAAACTAAACAATTTAGCTTGGCAAATTGAAACTGGTGAAACACATATTACAGGCTTTTGACGACTGCGAGTACTCCAACGCTGTCTTTATAGATATGCAACA:1 - chr3L 20612445 5' + Helena 386 1 49.32 ATATGGGGGGAAGAAACATGGTGGGGCAGAACGAAATAAACCAATGCATGAAGGACAACAATCGCTGAACTATTCAAATATATACATATATAGTGGCTAAGTATAGAATGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chrX 11008458 5' + hobo 8 1 75.34 GTTGCAAACAAAACCGCATACTAATGAATTTGTTAAACTAATTCATATTAAACTAACCCAACCGACTGAGAGGCGCTGCCGTGCATCGTACGGCTCAATTCGCGAGAAGATAGACGCGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATACAAT:1 + chr3R 21692363 5' - Cr1a 4332 1 61.64 CTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTTTGTTTATGTTTTTGTTTATGCACGCAGTTAG:1 + chr2L 14969113 5' + 412 86 2 74.48 TTCATTAAACGTTGACTTTACTCACTTAACTCTTAGTTCTTTTCCATGGCTCCTCCACTCCACTTGCCACTTACCAGCGCCAGCTTTTCATTTTCCAAGCCCACAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr2R 21439570 5' + jockey 24 1 71.23 CTCTTGGGGTGGTGCCAGTGGTGGCTTTTCCCAAATGGCAAGCTGAAAGCTGAACTTCCATTTAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACT:1 - chr2R 19852250 5' - Transpac 5174 2 56.85 GTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAAC:1 + chrX 15408747 5' + INE-1 556 1 87.20 ACTGGGCGCCACAAAATAGGCAACAGTATCCAATGGACATTACCTTAACCTGGTCATAAGCTACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr2L 6388159 5' + jockey 59 1 52.86 ATCGGAGGAGGAGCAATGCTCCTTGGCTGGCTGCTATAACAACATTTTCCATAATGTACGATGAAAGCAAAAGAAGCGGACCAAGATGGCTCCCTTGTGGGACATAGGATGTG:1 - chr2L 6304675 5' - Q-element 477 2 66.37 ATGAACTATTTCGCGTCCAGCGTTAGATGTGATTCACGTTTGTTACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:2 - chr2L 23049744 5' - opus 446 2 58.90 CATAAAATATGCCCGCTTATAAGACGTTGTGATAGGATTTCGAAAAGCCCAAATATATTTGTATGCTTAAAATACGCTGGTCCCTGCTCGGGC:1 - chr3R 27996479 5' - HMS-Beagle 270 2 31.18 CACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACAAAGTGTATAGTGCAGTTT:1 + chr2R 21820744 5' + Doc 97 1 75.34 AACATTACCAAAATATGAATAATCTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTCAAATTAGACATTTTTTTTTTAAATAATCTATTCTAGATATTTATTTTGGATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGT:1 - chr3L 14944641 5' - G5 4780 1 50.68 ATCAATTAACCCATAGCGCCATTTCAGCCAGTTTTTTTTTGTTTCTTTTCGACATTTGTAAATTTTACGAATGGGTGCGGCAGCATCCCTTCCATTTTTTCAAATGCGCGCCATTCAGTTATTTGATATCATAGCGGAGCGCTAGT:1 - chrX 22819373 5' + mariner2 54 1 74.66 GTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACG:1 + chr3L 7791894 5' - Transpac 258 2 57.14 ATGTTTATCAATATTGAAGAAGCTATCGGCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr2L 10514266 5' + 1360 55 1 56.85 ATTTGGTAACAGTTTCCCCTTTTTTCAATTCTCACAGTGCCAAATTGACAACTAACCACCAACCCATTTAAATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 7756340 5' - roo 390 2 41.10 GAAGGGAGAGTACCGAATTAGAAATGAAAATTAAGTAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chr3L 22594161 5' + 297 6642 2 71.77 CATTGATTGATTATAAGGACTTCTTCGAATAATGTTAAATTGTGACTAGTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATTGTGGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGT:1 - chr3R 8017823 5' - mdg1 7385 2 67.12 ATTTTCGAAATTGACTTTAAAACGGAAAACCAAATAAGTATAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 + chr3R 21216857 5' + 1360 81 1 78.77 GGAAAGCCTAGATAACGCTAGAATTTATTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTTCTAAAAAAGTATGACAATAAGTATATTTTATAATTAATCTTAAATGAACAGAGGCAGTAGTCATACTCTATGCATAACATGTTCTA:1 - chr2L 8777089 5' - G4 3733 1 67.12 TCGATAATCTAATCGATCTTCTAATGTGTCTTCTGCGTAATCGATATGAATATATACGGGCGAACAGCTGACTCGTTCCATCTTTAGCAAGTACAGGTACTACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chr3R 8217884 5' + P-element 21 1 69.86 ATGCAGTGGAATTTTAACACCTCATTGCTCAGCCAAAAATAAGCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAATCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCA:1 + chr2L 13842291 5' + jockey 4749 1 68.49 TTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTG:1 - chr3L 21093213 5' + Ivk 41 1 64.76 ATATTGTAGTTCATTAACCCACTGATAGTATAAGTAATAAGTACTTAGTTATTAAACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2L 19691237 5' - roo 9009 2 60.96 GGCAACATTCTCTTCATTTTTCATGTGTGGGAAACAAACACTTTCTCTAGCGCGCAAAGTGGAATGAATTTAAAACAAGAGAGAATTCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTC:1 - chr2R 25218143 5' - INE-1 552 1 60.98 CCTATAAAGAGCTTGCGGTTTAAGTTTCACAGAATGGGCAAACTTTAATTGAAATGCTAAAGTAAAGTGGCTGCTGTTTTTTTCTTTATTAAATCTGTTGCCTGGCAACTTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 - 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chr3L 11396007 5' + I-element 67 1 63.70 GAAAATGACTAAGGCTAGCATTTAAATCTCCCACAACAGAAAACGAAACAGCTGAACCCAAGTTTGATTTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATT:1 - chr2R 7617436 5' + jockey 4851 1 52.74 TTTGCCTCCATTTTCGTGGTGCGCGGGGTCCAAATGTATTTTGCATCATTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGATTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2R 16413153 5' - roo 335 2 64.38 ACACGTTTCTTGCCCTTTTTTCTTCTTGTTTTTGGATGCGAAATTGGAGCAAGTTGTTCTTGTGGTTTTTGTTTTGGAACTTTTGTGTTTAGAAGGGTTTGTGAGGGATACTATCAATTATTTTTTTGTTTTTTT:1 - chr3L 5194479 5' + Tc1 1394 1 53.33 GTGGCCAAAGTGTTTTTTGGAATACCTACAGAAATTAACAAGACAAACAATAAAACGTATAAAAATTAAAACCTTATTCAAAAGTGTGGGAGCTTGTAGCCGTTAAATTGGGTTTGGGAACATTCTAGCTCTTATAGTTCCTTAGA:1 - chr2R 5296434 5' - INE-1 152 1 71.23 CATAATTTTTAACTCGAATTTCTTTTCGTTACAGGTATGTATTTCCTCCATCAGCTTGAGATGAGTGAAAAGCTTCCTTTCACTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATA:1 + chr2L 18347701 5' + Doc 482 1 54.79 CCTGACCAGCTCGGTGACCAGCGGAAACATCACCATCGGAGCGGCCCAGTCGCTGCTGACGTCACCGCGCTCCCAGACGGCCATTTGATCAATTGGCACTATCCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTT:1 - 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chr3R 16736560 5' + Circe 7003 1 56.16 ATTTGGTATTTTTTTAATTATCGGACCTTACTTATCTAATCTAACCATAATTATTCCCAGAGTTTTAAATAACAAGTAAACACTCCGAGCTGCAATTTGTATTACTTATTATATGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAAC:1 - chr2L 1361085 5' + Stalker2 7253 2 69.86 ACTTAATGTCGGCTCAACTCAATATCAATTATTTTTTGAAATACTTTGGGTGGCAAAGGTGTACTTTTCATACCAAAACCATTTACTTGTGCTTCATACAACAGGGCTTAACAAGGCTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr2L 11554403 5' + roo 80 2 62.33 GGAGAGTGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3L 19580901 5' - roo 8994 2 69.18 ATCTCGAATAAAAATACATAATATTACAAACAGCGATATAAAACAATCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1 - chr3R 2649255 5' - 412 418 2 69.18 AGCTGCATTTTTCGGTACGTAGTTCTCACCGACAAATCTGGAATTATTTTGTGAATTTTTCCGACTTTCATTGTGTATCACGTGCGGTTTCCCAGTGTGTGTGAATGACAGAGTTTATATGCGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGGAT:1 + chr2L 8612031 5' - accord 7027 2 58.90 TTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACACA:1 - 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mdg1 393 2 66.44 TTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACGCTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 + chr3L 18253794 5' + blood 70 2 63.70 AAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chr2L 15081060 5' + Doc 60 1 60.27 CAGAAGGAAATAAAAAGTTTAAAATTGAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chrX 388190 5' + 1360 17 1 74.66 GATGCAATCCTAGTGGAGTTGGAGTTCCTTTTTCCAAAATGGCTATGCTTCATCACATTCCTTCTTATTTCACTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAG:1 - chr2L 191914 5' - R1A1-element 5083 1 56.25 ATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATT:1 + chr2R 11095736 5' + diver 5946 2 54.11 AACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGATAATCGCATCTTAGAGTAA:1 - chr3R 24673623 5' - roo 8981 2 77.40 GTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr3L 21013865 5' + roo 67 2 70.07 AGTACCATTTTCACTGAAGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTCGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3R 21216897 5' + 1360 3 2 74.49 GCTAAGGTAACAAATAACAGAAATAGCCGCTAAACTGGGCGCCACAAAATAGGCAACAGTATCCAATGGACATTACCTTAACCTGGTCATAAGCTACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2L 6388192 5' + jockey 10 1 78.40 AAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTT:1 + chr3R 7778265 5' - transib2 2748 1 73.97 GTCCCAAAGGACTTAAAAAAAAAACTAATACATTTACTCAAATTTGGTATATAGAATAAGTTAACATATTTTTATTATCTAACTAGCCAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTTT:1 - chr3R 6816812 5' + Juan 426 1 60.27 AACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTACAAACTACAACA:1 + chr3R 9125651 5' + Doc 58 1 50.00 CATTAGTCAGCTGAGGACGCTCCCGAATTCATAATACAAAATTAGCACCTGAGAGCCATTGCTAAATTTCACTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCG:1 - chr3L 13951272 5' - I-element 5096 1 49.32 CGTTTGGGCCAAAAAACAAAGTGTAAAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chr2L 12291970 5' + Tirant 29 2 66.20 AAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAA:1 - chr3L 7801296 5' + Transpac 177 2 63.70 AGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGCTATCTGCATTATT:1 + chrX 1103590 5' + pogo 39 1 57.53 TCCCGACCAAAGATCCTTGGATTGTTCAAACCTTACGAAATTGTACATAAATAACCGTTGAAATTAATAAATAATTTTTACAATATGTTACTTATGTCAACATTATCCAAACATTAATGTTTAATTAAACATTTTTTAATTTTAAA:1 - chr2L 3657934 5' - 1360 3028 1 59.59 AAGATATTTATTTTGGTAACAAAAGTAAATATAAGGGGCGGTGTCACGCCCACAATTTTTGGTATCATATAAGATATGATACAAAAAAAACAGAAACTATATATCTCTCTCCGTTTTGATGCTATTAATTTTGGCCGCAAAAAG:1 + chrX 15567851 5' - Transib-N1_DM 21 1 50.69 TTTCTTCAGCCATTTCTCCGGCAGAAGAATCACGCACTGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - 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Transib5 48 1 54.79 AGCTATGACACACGTTCTATATTTCCGTAGGCAAAGTCAATAACTAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr2R 21848643 5' + Transpac 4949 2 59.59 CAAAAATTGTTTAAATTTGACTATTTTGGTTATTAAAGTAAGTTTAAAAACATAATGATTTAAAACATTCAAAAAGAACTGGACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTATGCCAGAGATATCGAACGCGATCTGA:1 + chr2R 4887632 5' + jockey2 3018 1 73.29 ATTAACCCTGATGACTGATAGGCCAAGTGGAATAAGCGACACTTGGCTAATGTGCTTATAATGAGGGTAAAGTTGCTCGGATGCTTAGAGAGAGCAGGGAAATCCGTTTAGGCTTTGGAACTTGTTTACATGAATGGCTAAATGCC:1 + chr3L 5370928 5' - 17.6 7116 2 51.37 CAAACAATTCTTCCATATGTAAAAAAAAATGCCACAAAATTGATTTATTTCTATTTCCATCCACAAATAAATTACTTCAATTTTGTGCTTCAATTCAATTGTTATTCAATTCGATTGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 + chr3L 26741167 5' + F-element 28 1 59.72 GATTTTTCCAGTTTGAGGAATAGAATTAATACTAGCTTGGTGAATAATACCATCGCGATCGCGTTGAACTTGACTAACGGTACTTCTTTTGATGCGCGGCAGAGTAACGGTTCTCTTCTGCCGAACGTATTCTGGTCGCGGGTTGG:1 + chr2L 38564 5' + invader1 3725 2 57.53 CAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 + chr2L 10514295 5' + 1360 84 1 76.71 CCTAGATTTAAATCTACCTGGAACCACGAGATTCACAGATGAAAATCAAGTATTCTCTTTATAAAAAACGCGAGTGATTAAAAACTAGCCAAATCCAAATCTGGCTGTCTTTCCGTATGAACGTCGATATCTCAGGAACTATAAAA:1 + chr2L 22315354 5' + INE-1 147 1 63.70 TAAATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chr3L 16059351 5' + 297 6635 2 63.89 AAAATACTAAATACGACAACGTCTCGGTCTCCATCCTGATTTGAATATTTAGCATTGGGAGAATTCTTTCAGCCACCATTGCCATTTGCTATGCCTTGTCTTCAATGTCTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr3L 20865828 5' + 297 58 2 75.34 ACCCGCTGTCGTTAGGCAATCACAATGCCTAATAAAAGGGAATTTTTTCGTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 12180961 5' - gypsy11 3933 4 73.44 TTCCATTCTTTCAAATTGAAGAAGAAGTTGAAGAAAGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chrX 4400290 5' - roo 406 1 70.71 AGACGCAGCCTGAGGTTCACGGTTCTGGGCGTACACTGTAAGAAATATACGACACCTAATAACTTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAAT:1 + chr2L 15396896 5' - Quasimodo 7268 2 56.16 GTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAG:1 - chr3R 934249 5' - Rt1b 4705 1 47.26 AAGAAAATAAATAGTTCTTGATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCATGGGCCGTTTCGTCTTGGGTTTTTCACTTGCTTTTTTTTTT:1 + chr3L 16184106 5' - Porto1 171 1 60.15 GGCTGACGATATGGAAATGCATATGGCAAATGAGATGTGGGTGTTCTATCATCTACTTTGTCAATGCATTTGGCACAAATCCTTTCAAAAATCGCGGCTTAGCTGCCACCAATTTTCATGGGTTTTTCCGTTTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3L 7829071 5' - Doc2-element 233 1 65.75 CGAACTGATGGGCATCATACCGCGCAATTCAAAATGGCAGAGAAATGTGCAAAACACCAACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 + chr3L 11796325 5' - 1360 3348 1 54.33 TAATTATGGAAGGTTGATTTTTCGGAACTGCACCACTGGAACGATGTCGATTTGTGCCCGAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chr3R 23601832 5' + jockey 9 1 76.43 AATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAAT:1 + chr2R 22746065 5' + jockey 4824 1 60.27 CGGCTAGTGTATGCGTTGTGAAATTATTATGAGCTAAGGGTTCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCACCTTTTT:1 - chr2R 21748320 5' - 1360 3343 1 62.83 TTTAGTGTGTGACAAAAGACGAAGAGAAAACTTGGACCGAGTGCATAGAAGGGCGAATACTTTTGAAGACTGGTTACGAAGTTGGATTATTGGATATGATATCCAAAAAATTTACGAATGATGAAAAATATATTGTTAAAAAAAAA:1 - chr2L 12188817 5' - hopper 162 1 76.03 TAAATGGGAACAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3R 8849884 5' + 297 37 2 60.96 GTTGTTGTGTTTTCGTATGTCGCTTTAGTTGCTATTATTGTAATTGATGGTTACATTTTGAAGACTGTATTTTATACGCGCATATGTGTGAGTGTGGTTGCACATTCAACCGCCAACTGTAATGTCAAGGTACCGGTATTTATCAA:1 - chr2L 7596684 5' - R1-2 2892 1 69.86 AATATGAAATACTATTTAACCAAGCAATCAACATTTACGTAAGTACTTAGTGCAGATACGTAAACGATGCTAAGATACCTCTTATCTGTTGTATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAG:1 + chr2L 6515302 5' - invader3 5203 2 60.00 AGAATCTTAAGAAAAGACATTATTTAGTGTCTGGCAACAGTGGCTATTAAAGTCTTAAAAGGCGTGGTCAAATCGTGGGTAAGTCATTTGCTCAAGTATTATGAATAATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:1 + chr3L 465922 5' - Juan 4201 1 77.40 CTTCGGTCCCACGACACGAACGGTTTCGTCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGA:1 - chr2L 17260785 5' - P-element 2797 1 23.97 TTTCGCCAAAAATTAACCCCCATTAAAGTTTAAATATCCTACTGGACATTGCTCGTTACGAGATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 + chr2L 17839372 5' + blood 59 2 56.16 GATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2L 17626685 5' - roo 9014 2 61.11 ATTTGTATTGACATGTCACGGTAATCGGATATGGGGCACAAATGATTGCCACGATGACTTGTTGAATGATTGAATTTGCCCAATTTACGCCTATGCTTATTTTACTCGCCATAAATCTTGACTTACAAAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr3L 3779308 5' + gypsy7 5005 1 51.37 TGCGTCCCACATATCGAGTGGCATTTATGGAATAGTTGCGTTTATTGTGTTGTTTCATTCATTTAGCAGATACATCTGCTTGTTTGTACAGAGATACAAAAACATATATATGCGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGC:1 - chr3L 3453757 5' - Tirant 393 2 80.00 TATAGGCTTTCCATTCAATAAATGTATTCAAATGGCTCTTAACGCTACCCTGATAAGCGTTTGAACACCTTAACCCATAAATATTTGACAGGGCACAGTTTATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr3L 12835953 5' - 1360 3368 1 69.86 AACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:1 + chr2L 9274999 5' + F-element 40 1 51.92 GCTTAAGTTATAATTCGCTGGCGAAACAATGTGTCACAGTCATAATCCTCAGAGTTAGAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 - chrX 10579997 5' - pogo 2041 1 60.27 TCCGACAAGTTTGTCCCCAGCCAAGTTGCTCTTGGCCGGGCTAACCCAGCCCCATGAGCTAAGACGCCATTTTGTCCTGCCGTACTCACTCACACATTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGG:1 + chr2R 8375175 5' - 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copia 70 2 77.39 AATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAA:1 + chr2R 10910202 5' - Tabor 7269 2 54.79 TTCGTTCGCTTCCTCTCTGTCGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTT:1 - chr2L 22690019 5' + Tabor 83 2 71.92 TAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACA:1 + chr2R 12065600 5' + Stalker2 80 2 71.23 CAGCCCATCCGTTCTAACATCCGTCTTGCCAGTTACCAAGGCGACTGATCAATAAATAAGTCATTATAACAAGGATAATAGCACTGAGATAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAT:1 - chr3R 6136102 5' + mdg1 32 2 64.14 ACAGTTACACTCGAAGAAATGCCGTCCCGTACAAGCAATTAACAAACGATTCGTGGCTATGATTCTCCCGTTCGTCCCCAAAGCCAACACCACCACCCATCCGCCCACTCGATGGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 - chr3L 3693943 5' + blood 7176 2 80.00 AACATACAAATTATAGACATAAATTAATGCATCTATAATTACAGTTCTACACGAGGACTATTAATCCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGCAATATAGAATGGTAGAGCA:1 + chrY 511666 5' - F-element 4236 1 51.16 AACTGCAAATTATCCCCAAAACCGATTGTTTTTCATTTGGCGAACTTGTCGCTTTTGTAAACAGAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATAT:1 - chr2R 19181850 5' + I-element 5247 1 55.56 GCATAATGGTCAGATGCTTCAAGATACAAATCCAGTTCTATTATATTTCTCAATGTAATCTTTATTATATTTGATTGTACTATGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCG:1 + chr3R 12744628 5' - Stalker2 7618 2 51.39 ATTCAGTGCTTTGCTTGCGATAATCTGTTTTCATTTACATTCTGAATAATAATAATGATTAAATCATAAGTAGTTTAATCCGTGCCAACATAATAAATTGGTAGATAACTGACTGGCGTTACAACAAAGTAAAATAAAAATAAATA:1 + chr3R 8214980 5' + F-element 4680 1 61.64 ATCATTAAGATCACAAGCCGCGCCACGTTTCATTTGGTGGTGGCTCTTGCCCTGTACCATGCGAATCTGGACCACGCCTCGTTGTGGGTTTTAGCTTTCTGTGCCGCGCTAGTTAAGTCTGTGATCGAGGGCGGAGCCTGTTGTGA:1 - chr3R 17100041 5' - Tirant 8491 2 73.97 AGATACACTTGATGCAATATTAATATATTATTATCAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACG:1 - chr3R 17586903 5' + Max-element 54 2 70.80 AAGAAAACTGGGCTAAGCGGCTGGAAAAGTAGCTAAATAAGGGAGCAGCACATGCATATGCGAAATTATACGAATAATCATGAGCGGGAAGGCAGGTTACAACCTTTTAATGAATAAGATCGAGAATTGAGCGGG:1 + chr3R 10986163 5' - Gypsy12A_LTR 2116 1 75.56 GTTTGGTAAACATCAATAATGATTTTATTGAGCGCTTGGTATACTTTCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAAGAATTTGTATTAATCTCAATATTTGAGTTGCTGGCAGTACCATAGAGCTGTATGCCATAAGTTCACACGGG:1 - chr2L 12140460 5' - G4 3423 1 72.41 ATATGCGTGCAAAAGTTACGGCTTCCAATTTGAAATTACTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:2 - chr3R 12379776 5' + roo 83 2 76.71 GTTATATTTAAACCACAAACATTCTCTTGCTCCACCCACCCATAAATAATGTTTATAACTCTTCTTATCACTAAACGGCATATCGTATTGCCTAACAATTCGTTCACCCGGACCTGCAAACTCACTCACACACACACACACATAC:1 - chr2R 21952505 5' + Quasimodo 35 2 76.55 TCCATATGCAAATTTCGAAAAAATTACTTAATAGTACACTTATTTGTTAATTCTATCAGTTTCTATTAGTGCACTAATATTTTCCAATTTGATTTGATAAATCCCTTACTTATGTATCGCTCAGCATTTGACTTTATTTCGTCTTT:1 - chr3L 14197386 5' - G3 4349 1 58.90 CGCAGCTGGATTAAAGCTGGATATACCGCGGATAGAGACGATCAAAAAGAACAGGACAACGCAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGA:1 - chr3L 27392165 5' - invader4 2748 1 73.91 TTCATTTCTTCCATTTCTCTTATTTAGTCGATAATTTACTTTTGCATAAGTAACACTCACCCAATATCACCCAATATAACCCCGAAAATGAAATGATGAAATATCGCGTTCGCATTCACAATAGCTGAGTAACGTGTATGTGATAG:1 - chr3L 25971495 5' + INE-1 547 1 64.38 ATGTTTCACTTCATCAGGTTGCAAGTGGAAAAGTGATAACTATTATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAA:1 + chr2L 2895564 5' + Burdock 72 2 71.23 TAAAAATTTGACTCTTCAGCTTTTTTCTTGTTTGCATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGG:1 + chr2L 17295779 5' + Doc 6 1 75.17 CCTAAGTTTCCAGTTCATTACCCAGATGGCACTTGGGCAAAATCGCCACAGGACAGAGCTGAAGAGTTTGCCAGAAATCTTGAGAAAATATTTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGTAGGCATCGGCAGCGA:1 - chr3L 27338840 5' - HMS-Beagle2 7056 2 60.27 CTTACTCTGGCGTATATTTTTAATGGCTTTCTTAGAATTAGAGACAAGCTGGCATTTTTTGGCACATTTAATTTGATGCATTGCAGTATTGTTTTTCTTTCACTAAACAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAA:1 + chr3R 10149085 5' - 1360 264 1 78.77 GAAATACCTAACCAAGATGAAAAAAACTTGGTTTCAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCA:1 + chr4 195457 5' + I-element 4985 1 76.03 GGAGGCAAATGACAAAGCGACATAGACGCATAAGCACTTTATGTGAATGACGCCCCCAGGCATAAACTAGAATTATTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAG:1 - chr2L 17617061 5' + Doc 406 1 52.05 TATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGATTTTTAAGTTTCAG:1 + chr3L 18183080 5' - Tirant 344 2 56.94 GTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 + chr3R 20934695 5' + 412 7134 2 73.94 CACAATGTACCACTGTGCCAGTGCATGGTTTACGTTAGATATAAGAATTACATTGTCATCTCGATCCTACCTATTAGCCCAGCATTAAGCAATAAGAATGTAGTGACTCATGTTACAATTGATTTGCAGT:1 - chr2R 2932301 5' - mariner2 261 1 78.46 GAGTTCTACTTGGAAATTCATATCTCTGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGG:1 + chrX 21403423 5' - roo 8977 2 78.77 CTTTTTTAATGTAGCGGACATGGTGTCAACCTCGGAACCCTGCAGCCACATGAACGGGAGCTGGAACATAAACACATACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCGAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGT:1 + chr3R 7598866 5' + hopper 1042 1 52.74 ATAGGGCTGCACAGAGAGAAATAATATCGACATATAAATAATGAAATGTATAGTAGCATTTTAAACAGTTTTTAACAGTTTAAACTATTTAAAAACTCGCAGCTTTTCATCTTAATTTAGAATAAAATTTAAAAAATATTTTTTTT:1 - chr2R 18695103 5' + Transib5 2727 2 47.95 ATTAAAAATGTTTCGATATTTTATTATACCGCCCAGAACTCCAACGCCCACACTTATAAACATTTTTTTCTGCCTATTATGTCGTTTTAATCTTTATTTTCGAAACTATTGAACAAATAAAACTGAAACATTTGTTGAATTGTTTG:1 - chr2R 5767160 5' + HB 1510 1 54.11 AGGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTT:1 - chr2R 1373192 5' + pogo 69 1 64.14 TCTTCTAACACACAAAAATAAAAAAATTATACAATATTTTTAAAGCAATATCGATGATCATATAGTAATCTTAAAAGCAGCAATATTATAAAAAGTAATAGAATTTAAATCATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 - chr3L 5630497 5' + I-element 16 1 73.97 AGTTCACTTAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3R 28450754 5' + roo 8727 2 65.07 TTGACATTATTATTAAATGGAGAAAATGGGAATTTGTTGTTTCGGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAACTATCTTCGGT:1 + chr3R 19445342 5' - roo 353 2 53.40 CAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTAGGT:2 + chr3L 14375612 5' - 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Stalker2 317 2 73.97 ATTTTCGGAGTCTGCATGTTTTTGGCATTGCATTAATTGGGCAGCTTAATTATGGTGCTTGGGCCTCATTGGTTGAATGAAATGCGAACTATTAAAATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 + chr3R 31483612 5' - I-element 5326 1 65.75 GCATGCCCAAGAATTAAATCAAATTGTTTCATAATAATACTGCAATTATACTAGGTAGTTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGAC:1 + chr3R 9583287 5' + Juan 4089 1 58.22 ATAGACTGTAATGAGGATTTGATTATATTATATTATTATTATAAAAGTTATGTCAACTAAAGTCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr2L 11143094 5' + 1360 58 1 58.90 TCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTGGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTTAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr2R 15070142 5' + 412 69 2 76.23 CGGTTGGGCGTTGCGATAAAAATCAGTCCATGCGGCTACGCTTGAATTAACGAGTCAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTCTTGTTTCTTCCCGATTTTAATT:1 - chr2R 17544226 5' - gypsy5 346 2 65.89 TATGTACAGGCATGAGCTGTATGAGGCATATCAATTAAAAGAGTTTATAAATTAAATGCTTAACTAACTAAATTGTAATTGTGTGTGTGCGCTGGGGATGGTTATAGCTAAAGTATACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTG:1 + chrX 2498773 5' + BS 4723 1 78.08 CAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACTCATTCGCAAGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 + chr3R 7885613 5' + jockey 97 1 78.08 AGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2L 17626686 5' - roo 9014 2 60.69 ACTCCAATATTTACCAAATACCAAAGGGCCACCAAGTGCACTTTGTTCAGCACTTGGCCAGCAGTCGAAAAGTCAAGTCTGGTTTTGGGATTTCAACATTTAAATCAGAACAATAATTCCTAAGAATCAATTACTCAAATTAGAA:1 + chr3L 8671672 5' - Circe 490 1 67.59 AAGAACAATAGAAAACACTCGATAAATGGGAACAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3R 8849906 5' + 297 15 2 76.03 GAACTCCGGTGTTCCCAACTCGGAGCTTAATTCCGATAGCAATTGATTTACCATCTCTGGGAATTCAAAAGATAGCTATCATAATTAAATCGGCAAAGGACAGGGTTTAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr2L 11296103 5' + 1360 14 1 74.66 CCGGTGAACCAAGTGACCTCTTCATTACCTCACGGCGATAATCTTGGCGGGGCTGTTTTATGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGGCTCAACTTGGGACTCTCAACCTTCTAGCTTTTAT:1 - chrX 15693509 5' - INE-1 163 1 75.81 CAGAGCTTAAAGTGATGGAGTTGGAATGTATGGCGTCAAACAGAAAGAACGTACCATACCCAGACGGAAATAGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGAGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACCGCTAAGG:1 + chr3L 21415136 5' + R1A1-element 234 1 46.67 TCACATTCTAGCCCCCTACTTTTACACTTCCCAGTGGCTGTCAAACTGCTAGTGGCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAT:1 + chr3L 2425879 5' - hopper 1367 1 55.04 GTTTTCTTCTTCATTCCCGTGGTCTTCAACATCTTCCTCAAAGCTTTCTAGACGAGCCAGTATTTTTGTTTCTTTTTTTTTTCATCAGTGTCCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGT:1 - chr3R 10335413 5' - blood 492 1 60.96 GACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 + chr3R 28406355 5' - opus 434 2 67.12 GTTTTATTTTTGAGATGTGAAACTAGGTTAACAGTGGTCGAAATATTTGCTGCAATGAGGGAGAGAATGGGAAATGGGAGATGTTTACTCTACCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAA:1 - chrX 12635759 5' + Cr1a 257 1 56.16 GGTCGAGATCGCAGGCGCTCGGCACGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 16937541 5' - roo 396 1 42.20 ATGGCGCGAAATTTAAAATTTGATTAGTAGTGGAAGTGTTATGTATAAATATGATGAAAAATAAACAAAATAAATGCATGTATTACTTTAAGCAATTGCATTTATCAGAATAAAGAGCGGCAGCTCATCAACTCCGACTAAGCGTC:1 - chr2L 2193229 5' + Gypsy6A_LTR 204 1 65.07 ACGCCGAAAAGCAGCTGTGCGCACAGTGTGTTAAATATTTCGGGAAAGTTTTGGAAATATTCGTATAAAATTTAATTTCATACGAACAATTTAATAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2L 6601242 5' + roo 25 2 61.64 CAAGTGAGTGCGAGTGTTGGTGGGGTTTATGCCGAGGGATTTCAAGAACAAGTTCAAGAATTTATGTTATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 - chr3L 12223259 5' - Transpac 290 2 68.46 TCTTTGGACCTGGAAATGGCGCAACCAAACAAGAACACGGCATTTTAACGGACCTATATACGCTTATCAGCGTTTGATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGC:1 - chr2R 5173342 5' + accord2 7261 1 57.53 CTGACAGCTGTGAACTGTGGAATTACAAAAATCGATGTGTATTCGATAGCAAAGCTATTCGATACTGGAAATGCCGTGCATACCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAG:1 - chrX 11368427 5' - F-element 382 1 57.34 ATATGCCCTTAAAAACCATTTCCGATCGATCTTAGAGGAGATTTGGAGTTGCATAATGTATGCTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCT:1 - chr3L 785975 5' - I-element 5297 1 56.85 AAACACCTCTTGGCCAACTTTTTATTAGCCACATCATGCGCCGGGTAACGAGCTCGTAAACAAGAACCGAACCTTATTTTTAGTTTGTGGGAAAATATTTTAATAATAAAACATTCGCGTGAACTTATGTACACAGACTATGTTAA:1 + chr3R 19965643 5' + Q-element 572 2 63.01 GGTGCAAATAAGTAGTTTCATAATTAACGTTTTCAAGTTAATAAATTCTACGTAGTGACGAAACGCACCTGAAAATTCCGCCTTGTTACGTTTGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1 - chr2R 21848857 5' + Transpac 4982 2 66.90 AATAAACAATTATTATCCCTCATTGATGATTAACTTAGCTGTGAACGTTCATCTGTTCAATTGCCAGACAATGGGTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr3R 20285373 5' + opus 25 4 53.96 CCCATTCCGCTCGCTATTTTGAATAGGCTGCAGGGATCAGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3R 11944908 5' - roo 333 2 70.71 CAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr2L 12486406 5' + roo 8736 2 73.91 CCCACACAAAGGCAACCTGCTCACACAGATACTTACACACCCACACTAGCAAGTAGCGAGAAAAGCCGCCCCGACAGGCAACATGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 - chr3L 6626215 5' + Transpac 4955 2 55.48 ATTATCAGTGTGATACTTGAGGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr2R 1373211 5' + pogo 51 1 52.05 ACAGTTTCCCCTTTTTTCAATTCTCACAGTGCCAAATTGACAACTAACCACCAACCCATTTAAATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 + chrX 7756348 5' - roo 9045 1 37.67 GTCCAAAAAGCTTACTTTGCTTGTCTACATGGACACAGATAATTGACACTAACATAGACAGTACGACACCCTCACACATATGCACTGACCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chrX 17982735 5' + hobo 33 1 63.01 AATGAATAAGTATGCTCGTTTTGTGCGCGTGGCATTGCAATGCATTGGAAATGCACCAATTAAGAGCCTGAAAGTATGCTACGAAATAATTTCTCTCAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGT:1 - 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flea 229 2 68.49 AAGGTGGACCAGGTGGGCCAGGTGGTGCAGGGGCACACTCTTAAAAGCCAAGTTAGCAGCCCGCGGCTATTGATCCGCTTGAAATCAAAATTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTAT:1 + chr2L 18768758 5' - Quasimodo 307 2 67.16 GTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:2 - chr3R 19436070 5' - roo 330 2 71.23 CCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGGAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 9469992 5' + 412 7119 2 75.86 CAGAAACTATGAAAATGCAAATGTGCTCGTCGTGCCATCTCTTTCTGCCCATGTGGCCCCATCTCTTTCTCCGCACAGTGTGCGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTCCAATTTTGTGTGC:1 + chr2L 16615731 5' + hobo 40 1 59.59 ACCCGTTTCGTAACGAGCTCTCAGCTCCTTTTTAGGAAAAACCGTAAAGTCTTTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGACGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr2R 2945274 5' + 1360 38 1 55.08 GTTGGATTTGGCCTGGCCTCCATTTAGAGTCTGATGGCGAAACCATGGCATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATG:1 + chr2L 12291800 5' - 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chr3L 25607355 5' - 412 422 2 64.38 CCTTAATTTGCGGCTAATTTGCATATTGTATATTTCGCTTGTTGCGCAATTTCAGTTGCAGTTGCAGCCAACGTTTCCTGCCCACCGCCACCTGTGTCCTTGTCCTTTCATCCTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATA:1 - chr3R 6495416 5' + Stalker 6861 4 77.40 GGGTTGTGGGTAGGGGGTATATGAAGCAATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 + chr3L 7791850 5' - Transpac 5208 2 68.49 GATACTAGCTGAGTCAAGTGGCAAATGTCCGTCCGTTAAGTTTTGGGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGCGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 5422991 5' - roo 388 2 68.28 AGTGCTAACTTTTTTGGTATTTCAATTTTATTGCCATTCAACAGCTTCAAATAAAGTTCTTTATTTATTGCATTCTATTTTGTATGATTTTTGTACTCTTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATCGGTTTT:1 - chr3L 2326025 5' - Doc 4279 1 40.41 ACTCGCCCAGAGCCAGATCAGATGCATCTGGACGCAAATACACTGGCCAACAGCGGAACACGAACTGTGGTTTCGGCCCAATGCCATTCTGTACATCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTCTCTG:1 - chr2R 20071974 5' - Doc3-element 4449 1 69.34 TTTGTTATTAATGCGAGTCATCATCGCATAAATCTGCAAGGCGGTCATAATTGCAATTATTCATTAATGAAATATTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr3L 21910350 5' - pogo 2057 1 58.90 AATGAATACAGCTATCAATATAAAATGAAATGTGGTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1 - chr3L 18253892 5' - blood 333 2 53.33 TTTTGACATATGACAAATGGTCGCTCTTGGGCGGCCTATGCACGTGAGCTATCGATAACAAGCAGTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCG:1 + chr2R 6673357 5' - BS 5049 1 51.11 AAACAGCCGTGCACACCAATACACAGGAAGCACACACAGACGTGGGCATTTGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2L 9879698 5' + jockey 69 1 66.67 GCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGTGTACATTC:1 - chr3R 25804192 5' - mdg1 339 2 72.41 CTTATAAATGTTGTACTTACCTAACTTCAACAATTTGTTTAATATGTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACA:1 + chr2L 22315513 5' + frogger 20 2 59.03 GGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATC:1 - chr2L 5792059 5' + blood 7009 1 64.81 AAGCAAAACAATATTTAACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3R 26486010 5' + 412 50 2 51.03 AATTTCCTTCACTTTCCTACGAAGCAGAAAATGCCCCAAAAGAGTTTTCTTTTCGGCTCCGTGCCAGATTTCACTTTTCTTTTGTTTTTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3L 486688 5' + roo 33 2 61.64 CTCAACAATGCCGAATGCCGAATCTATCGTACAAAGGCCAGTTAATATCCAAGCCAACAGTCATTAAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAACTAAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 21674966 5' - roo 401 1 76.03 AGCTATGGTGGCCTTCGTTCAAAAATTTTAGATAACGAAGTAGTAATGCATTTTAATTAGATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3L 9470072 5' + 412 16 2 72.60 ACGTGTTTTGCATAATTAAATTTTTGCGCTTTACAGTAATTTGTGGCTGTGGGGCCGCAGCAGCTATTGCTGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGG:1 - chr2R 14913556 5' + X-element 4410 1 68.00 AGATACGATGCTAGGGACACATGTCCTAAAAACGCAATATGCAAAACTTTTTGGGTCGCATTATGGGCGTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 - chr2R 14135371 5' + copia 54 2 52.74 CTAGAAATGTAATTTTAATCTTTTCACTTTTGATGACTTCATTAATATTTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTA:3 - chr2L 9418584 5' + rover 7022 2 67.12 ATAAGGACTTCTTCGAATAATGTTAAATTGTGACTAGTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATTGTGGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGTGTACATTCCAGA:1 - chr3R 8017811 5' - mdg1 335 2 73.29 GAGTAAATAAACTGATGTGATTACGGGATGATGCGGGGAAAGTGGAATGCGATCCGTGATCATGAGTTGGCAGTTCCTCAAATTGCACAGCCTCAAATTGGCTCATTCCTTTATGGTCCACCCGAACCGACTGGCAAATATCCTA:1 - chr2L 1888775 5' + G5 4593 1 73.10 AGTACCGTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr2R 2427631 5' + Doc 40 1 54.81 CTTTGGCCAGCCAGCATTTTCGAGCTGCATCATCGGTAGTTGCGAAGGGGATGGCCTTCGATGTCAGCACATAATAGTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCT:2 - chr3R 5773255 5' - Stalker 7211 4 53.42 CAATGGTCAATCGCGAACCATGCTTACCATCATTAACAAAATAACCAAAAAACAGTAGTTCTATCATTACTCTTGCCCAGTTGGCTCCCATCCCAGACCGCAAATCAATTGTTACATGGGTTATAACATTCAGGCAAACTGCAAGT:1 + chr3L 23071927 5' + mariner2 289 1 50.68 CTTAGTTCGGTAGGAGATCTTGTTTACCAACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGTGCCTTTGACAAAGTTAAGAGTGTTGTGGAGCTTGCACTCGATATCGCATAAGCCAGGCAAAGAAGTCACTTTGATAAATTTGTCACTAAT:1 - chr3L 21093274 5' - Ivk 486 1 63.01 ATACTTGATTCATATTGGAATATTTTATTAGGCTTAAAACAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTC:2 + chr3L 12223148 5' + Transpac 4996 2 73.29 ATTAATTATAATTTTGTTAATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr3L 17667588 5' + F-element 59 1 72.00 AGATCCGCTGTGGAGCAGGGAGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr3R 23161239 5' + 412 36 2 59.59 AAGATAGCCTCAAAATTAGTTTATTGCATTTTAAGTTTCAACGTAAACAAATTATGAGTTATTCGCAAATAGTGTAACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:2 - chr2L 14969244 5' - 412 488 2 74.66 TCAGCCGCAGATGCTGTAAAAACTCAGCTGGAATTGCGCCTTCGCAAGAGTGCAAATCGTTGGGAAAGGGGGTGGCATAGGGCGAGGAATCAGGGGAGTAATCACTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTCCGCTCTCACT:1 + chr3R 6796696 5' + Cr1a 278 1 70.55 CTTTAAATATATTTCGGACTACATACCAACCACAAAGACCCTTTCGCAGATCGATAAAATTATTGAGGAAACCTATGCCACAACTCGCAGTAAGTTGACTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr2L 11143232 5' - 1360 3365 1 68.97 GAATTGCGGCTATTTTGGGGCCGACTTGAGACACGTGACCATCTCTCGGTCACTACCCACTAAGGTTGGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTTTAAGTACACAGC:1 - chrX 23155297 5' + blood 7039 2 65.97 AGGACACCTAGGAATTGCTTAATTTGTGCAGCCTGATTTAATGACTGTTCTTGCACAGCGCTTGCTTCCAGAGCCGAAGTGCTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCA:1 - chr3L 22667227 5' + 297 6860 2 55.48 AGACAAAGCAATAAAAAATAATAAACTTGCTATTACATTTAACAAGCTAACAAGTACGCCAAAGTATTTCATATCTTATCAGTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 - chr3L 17922064 5' + copia 39 2 58.90 AAAAAGAAAGAAAAAAAAAAACTGTTTGTAAACCAACAACATATCCGAAACCACAGAGTGATTGTGAAAGTGAACAACTGGTGGATGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATT:1 - chr3R 28634170 5' - HeT-A 6023 1 56.00 ATTGACTGTCTTATTATAGAAACCAACCCATTAATCGAATCGCTATGCGTTGCCAAACTACCTAGTATTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGT:1 - chr3R 9583380 5' - Juan 4159 1 52.41 GGCATTTGCGGCTGCCAAAAAAGGAAAATTCATCCCCATCAGCATGCTGTACAGCTTTCTGCTATCGAAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTA:1 + chr2R 19646604 5' + 1360 394 1 53.42 TTTCATTACTCCTCGAATTGAAATGGGTGTACCATATTGGTTGAAAAGTGCTGAGAACTTAGATTCGAAGATAAGGATCCACAGCCAATTCGGTCTGGCCATGTCCTTCTGTCCCAATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAA:1 - chr3L 21482954 5' + INE-1 147 1 50.00 TGTAGGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAAGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 + chr2L 22319270 5' + Transpac 4960 2 54.55 GTTCGTTAGCAATGATGAATAAATAGTGAGTTGAATGCTGAAAAATGTCTTTGTCTTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGT:1 - chr3R 443312 5' + flea 4806 2 58.52 AGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATC:1 - chr3R 30264087 5' + blood 82 2 73.97 AGTTTTAAATAACAAGTAAACACTCCGAGCTGCAATTTGTATTACTTATTATATGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAA:1 - chr2L 1361025 5' + Stalker2 64 2 60.69 TTTCCATGGCTCCTCCACTCCACTTGCCACTTACCAGCGCCAGCTTTTCATTTTCCAAGCCCACAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACACAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 - chr2R 21439530 5' + jockey 65 1 53.42 AGCCGCCCCTTGACCCCGCCCACTCAGAAGCAAAACCCCAAAAAGCGGTTGAACTGTGATAAAAACCCCAAGGCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 + chr2L 11472670 5' - Transpac 235 2 56.15 CACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 + chr4 311227 5' - 1360 3329 1 79.28 TATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGC:2 - chr3R 6413629 5' - 1360 3309 1 73.29 GTAAGCACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3L 19031232 5' - roo 9010 2 59.29 GTGTTGAAATGGCTTTTCTTGTTGTGCGTTTAACACTCACCACCCACCGCATAGGCCGCAGAGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2L 12486477 5' + roo 7 2 77.40 GGCCATAATTAAGCTTTGCATATGCGAACCGCATATGTGAGTGACTAGCTAAAGTTGGCAAATATGGCAAACTGAGACCGCACAACACGACGGCATGTGGGGAAATAAGACGGCAGTGGTTGTGGAGATTTTATTAGTAAGTGGTG:1 - chr3R 19436463 5' - accord2 7333 1 73.97 GTTTTCTGTGTCTAATATATTTAATTAAAGTCCTAGTTAATTGAAAAGCCCCACACGCTAGATTATTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCG:1 + chr2L 4143151 5' - I-element 59 1 51.13 AAATTTATAGAAACAACGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3L 7870186 5' - roo 9007 2 64.38 TCTTAAATCCGCTGAAAATGTAGTTACAAGAATGCATTTGATTTCATCAAAGGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr3L 2330092 5' + roo 8733 2 66.44 GTGGGGAGCTATCTCAGATCTGATTTTCTGCAGAGCTTAAATTATTAAAAGCCTGGTCCAAAACTTAAGGCTTCTTCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTG:1 + chr3R 10974599 5' - Stalker 6959 4 52.05 AGAAGGAAAGACAAGTGGTTTAAAACTGGCCACAATCAGCCCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTAT:1 + chr3L 18378678 5' + copia 210 2 71.92 TATTTTTTCGATATTTTTTCAGACCTTTTCCAGCGCTTCCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr3R 7585715 5' + Doc 34 1 60.98 TCTGCAAACAAAGAGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chr2R 17332214 5' + jockey 79 1 65.07 TTTCGCACACCAATTCGCGAAAGCTTGCATCATAGACACACACACGCACAGACACACACACACACACACAGGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chrX 12905413 5' + Tirant 8 2 72.38 CCGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGATGATCTTCAAGACGATGCAACAGCACACACTTCAAGAGCATCGATGGCTTTTTTAAAGGGACACATTTTTCAGAGCGCCTTAACTCAATTTGAG:1 + chr2R 4802882 5' + mariner2 527 1 69.60 GCTTGTTTGTACAGAGATACAAAAATATATATATGCGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAAT:1 - chr3L 3453680 5' - Tirant 8422 2 76.71 GCATCGAAGACGACCGTGGGCTGGTCCTTCACCTGAGTGGGAGTCAGCTCCTTGCCCAGCTCAATACCCAGTACTGCAACTAAGAGCCGAGCGAAAGATCAACG:1 - chr3R 22466218 5' - accord2 160 2 59.62 GGCACAATTGAGTGGAAATGAATTATGTATTAGTTGTTATTATGAAATGGAATGTACTCAATAGCTTGGCTTATATGGTATTACAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTGGCAGTTGGGTGC:1 - chr2L 4929922 5' - blood 7352 2 58.62 ACCCAAGATGCGGCAATTGTGCACCTGCGGCCGCCAGCAGCGTGCGGCAAAGTGTGTGAAATGTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGC:1 + chr2L 6179427 5' + pogo 2060 1 64.00 ACAATTACAACCATTTAGGCAGCTTACAATAGTTTTCGAATTTTACCTTTCCAGCAGCAAATAGGTGCTCAGAATTTCCTGCATTTGGCGGCGCAGATCGGAGTTCTTCATGATTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAA:1 + chr2L 10487016 5' - Transpac 5088 2 76.71 ATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTC:1 - chrX 388301 5' - 1360 3307 1 79.26 AGAGAAAAATGTTCTGAAAAATCATTGTTTGGAGGAAGCGCCAGATTCTCTCACACATAACTAAATACATGCACGAATATGCTGCCGTTACGTGTAATCAAGAAACAAGAGAGAATGCTATGCCCGACTATCAAATACCCGTTACT:1 + chr2R 25196938 5' - INE-1 550 1 68.49 GTTATACAGCGAAACAAGAACTATAGATTTCTTTAAGCATGGAGATGGCATATCCAGAGCCATTCCATTAAATATTCCCCCTCTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTC:1 + chr3R 6645295 5' + blood 35 2 61.64 CTTCAGCGGAAAATTAACATTAATGCGACACACCCAAACGGACACACGCACACAGGGAAAGCCCGAAAGCCGGGAATCCAAATAGCTATTTCGTTACGTTACGTTTTACCCAATTAATAAACTATAACCACCAGTTGGGAAAATC:1 - chr3R 26536922 5' + S-element 450 1 73.10 CAAGAACAAGCAAAAGAACGGCTTCACGGCCTCCCACTCCACGGGTACGATGGTGTTAGTGCGAACTACCGTTAGGGACGTTGGCTGGGCCAATCAAAACGCGCGACAAGATCACGCGACGCGAA:1 + chr3R 24747729 5' - G6 95 1 60.80 GGGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGCTTTCTATATTATAAGTTTTTATTTCAGCATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3R 15054239 5' + 297 37 2 56.85 GGTGCCAGTGGTGGCTTTTCCCAAATGGCAAGCTGAAAGCTGAACTTCCATTTAGCATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr2R 19852240 5' - Transpac 5201 2 54.13 TCGGCGATCACTCTTTGTTTGCATATTTTGACGCTGCCTGTGTGCAGCAAGTATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATT:1 - chr2L 23400151 5' - HMS-Beagle2 7153 2 55.00 GTGGGGACGGAGACAAGAGTGGAATATTTTATTATTATAAAGCACAAACAAGCTGGTGGCGAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAATGCAC:1 + chr3R 21343051 5' - hopper 1295 1 57.93 CGTCGATAGAATTTCATTAACAACAGACTGGTTGGGATTGAATCTGAATGATGTTTCCGAGAAGCTATAATTGCCCAAGATAGTAGTTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTCTTGAAATAGAGAT:1 + chr2L 22689914 5' - Tabor 7289 2 61.64 CCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr3R 18528354 5' + roo 79 2 73.29 CTGGGTCTGATCCAATATAGGATTGAGGCGTACCAATGCAGAATCAGCCAATGGGGGCTCCACCAGCGAGTACTTCAAACGGAAACGCACGGGATATATATGCAATGCTAGCTCGCTTAAACACAGCCACTATCACCGAAGTCA:1 + chrX 13217374 5' - diver2 497 1 58.33 AAAGGATGAGGAAGTGGCCGCCAGGCAGCCATGTTTGTTTGTATTTATGTCGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr3L 7460571 5' + 412 18 2 73.29 GAGTATTATACTTAAACTGTAACTGTTGTTTGGCCCATGTTTATCAATATTGAAGAAGCTATCGGCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr2L 10514230 5' + 1360 19 1 65.07 CACAAGTGGAAGCATTCAAAGAATTAACCATCCTACCAGGACTTGACTGTTGTGAACCCCTAGATATAATAAAATCTGTAGTAGGCTAGAGGTACATATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTA:1 + chr2R 2725158 5' + invader2 49 2 52.05 AATCTGGCTGGAATGTAAATAAATAAAGTGTCTGCGTGCATGTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chrX 11008324 5' - hobo 2902 1 63.55 CTATAGCGGCTACTTATGCAAACGGATGTATATTCTAGGGAGATTAACATAGCGCAAGTGTAAGTGCTTAATAAACACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chr2L 4637177 5' - mdg1 7414 2 52.74 GGAAGGGTGGTTAGGGGCGGGGGTTTACCAACCAGGAAAACCGGTATGTCTGGGGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGACCGTTTTTAGTT:1 + chr3L 9469936 5' - 412 471 2 50.52 CTAGCAGTATTAGAAACTTTCACTCAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 + chr3L 1358472 5' - 412 426 2 75.42 GTGAGAGTGTCCAATAAAAATTACGTATACGCAGCGAGTGCCCGAAGCGGCGACCATGCCTCACGAAGCGTGCGGTAATTGGCAAAAGAAACACACCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 20450382 5' + hobo 17 1 71.64 GGCGGGCGGTTTTATTTGGCAGCCTGTGCGCAAAAAGCAAACAATCCGCCGCTTATCGGATGAACTGAGAGCCGGATGGGCAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAAATTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGG:1 - chr3L 3308861 5' - R1A1-element 5298 1 58.16 GTTACGAGTAGCGAGTATGATCGGCGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCACACATCCGACCACATCAGCAGTCCACG:1 - chr3R 2637700 5' + gypsy5 74 2 74.40 CCTAAATATGCTGGTCAGGCCAGCTGAGATGGCTGCCTAAGGCCAAAATCTGTCTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 - chr3L 5069531 5' + opus 28 4 66.44 CCACCCACGCGAAAGAGAAGGGTAAACTGTGTGCTGTGGGCGCCACTTGAAAACTTTGGACTTTCAAAAGGCCGGCAAATGAAAAAGAGCATTCACAGAGATTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTAC:1 - chrX 17120072 5' + 1360 339 1 69.18 GTTGTTGTCCTCGTCCTCCAGGGGCAGAGATGCGGATGAGCATCGCTTTCGGTTCCCCCCGGAAGGATTACCTACCGCCTGACTCCCGGTCATAATAGATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTGTTT:1 + chr2R 7494402 5' + Cr1a 4344 1 75.00 TTTTTCTTATAAATTAGCACATTTGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 19436137 5' - roo 397 1 75.34 GGGTACTCCTGCACCAAATGAAAGTTATGTCGAATTTTATCCTTTCTAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATA:1 + chr3R 8017751 5' + mdg1 7114 2 68.49 ATCGGCTAATAGGGCAGCCAACCCAACGTACACGTTGCCATCATTAATAACGCTCAAAGTGACGTCAAGTAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCCTCCCTCTTACCAGCGAACAAATTATAAG:1 + chrX 7556102 5' + GATE 315 1 47.26 ATACACAGCCAAAATGTTTAGTCGATTTCGTGTATTAATTATGTTCACTAATCGTAGAAACATATGTGTGAAAAATGTATTGATACTCCTTCATTAACCTATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:2 + chr3L 18381904 5' - copia 234 1 59.59 CAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr2L 17295859 5' + Doc 61 1 67.50 GATGACACCTTCATTGCAAGTGAAACAATGGCTGCCGCTTGTGTGTTGTGGTGTGTGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTC:1 + chr3R 20069755 5' - F-element 4378 1 61.64 CGTGTTGGTGACAGGTAACAGCAGTGCGTTATACAGCGAAACAAGAACTATAGATTTCTTTAAGCATGGAGATGGCATATCCAGAGCCATTCCATTAAATATTCCCCCTCTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr3R 6645268 5' + blood 8 2 80.14 GCGATGCGGCATGGGCAACAACAAAACAGAGAGCGAAACGCTACAAAGAGAGCTTGAGACACCTGCATGGCCAAGTCATTGTTGTTGCCATGCTGATTAGCGGTATGTGGTGGGATTATTTATATTTTTTTGAAGATGAAATCTG:1 + chr2R 18133708 5' - mariner2 777 1 79.31 AGCCAAGAAACCTGAGAAACAAAACAAAGAAGAAAAAATATGCAAAAGTAAGCCAGCGAACTGCCTTCAACCCAGACTTTTAAAGACCCTTATAGCTATTAGTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGAAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 - chrX 2653245 5' + FB 21 1 71.92 GTCGGTCAGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGA:1 + chr3L 23146443 5' + 1360 33 1 63.01 AATTTCCAATGAAATAGGTAACTTTATTTGCAAGAGAACGGGAGTTCATCTTATAGCCACTTGATTTTGAAAAGCACATTGATTGTTTTCACACAGCCGGCAGGCATAAAGCTATTACGCTTACACACACACATATACACACACAC:1 - chr2L 5902476 5' + accord 7039 2 56.85 TTAGAAGAAAAGGAGGAAAACCTAACAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCTGACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTGTTAGCTTTAAGCAGTTCGTTTTGGACACTCATAAAATAAAGA:1 + chr3L 11389080 5' + gypsy3 6711 2 68.79 CGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3L 7870202 5' - roo 328 2 75.17 CACAATGCGGCCACAGGCGAGAGCTGAGGTTTGAGCTGCTTGGCTGCGATGGAATTGGATTTGCCCTTTGTGCGAGTGTGTCAATATGTCAGTCAACTCTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATCTATTTATTAGCGTA:1 + chr3R 31140912 5' - Burdock 6371 2 71.92 AATAAAAATATTACACCTGGTCGCCGATTTGGCATCTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATGTTTGAAATTGATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTTTTTCTAATCT:1 + chrX 395061 5' - 1360 334 1 75.34 GCTTTGCATTAGGTTTGCGTTGTGCCCACTTGATTTCATTTGTCATGCCGAGCCATAAATAACTAAAGGCTAAGAAGAGGCGCCAAACGTTAATCACAGCAAGTGGAGGAAATCAAGAATGAAGGGGCATTTTGCCCAGAGTAGGC:1 + chr3L 2993622 5' + R1-2 2831 1 78.77 ACGGCAAAAGGATCCATCCCAAGTTCCCAAGTGTTGTCAGAAAAGTAAAATAAAAAAAAAA:1 + chr3L 4652119 5' + F-element 4679 1 81.97 ATAGACGCCAGCAGGTAAAGAAGTTATAAACCGTGGCAGCAACCAATCCGAAAACCTCACACCGCTTCCTACCTAAATGTCGATAGATATTGATGAACAAAATGACTAGAATGGCTATATCTAGTCGGCTATTGATCCTGATCAAC:1 + chr3R 22789343 5' - INE-1 89 1 51.37 TAGAATCAAGTGCGGAAAGAATGAAACTTTTCGATCTTAAAATAACAATCCGTAATGGGAAACTTAATAATGCAATATACTCACACCTCCATATTTTCCCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAAT:1 - chr3L 18484517 5' + hopper 20 1 71.23 CTCGTACATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2L 17626695 5' - roo 9022 2 54.79 TTATAATATCTGGAATCTGAAAGGGTTGTCCAATAATTGCTCGAAATTAACATGGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chrX 16994586 5' + roo 8730 2 65.75 GAGTTCTTGAAACGTTTACCGATATATCAAAAAAATTTGAAAGCAGCCAATTTCCTACGATTCATTTCATTGAACACCAGAATTTCTGCCTGTTATGTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTCAAGAAATGAAAGTGAAACA:1 + chr3R 4513625 5' + HB 1494 1 57.53 AATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGCC:1 + chrX 388233 5' + 1360 60 1 57.53 AGTATAAACCGAAAAATTGCGAATCGGCAGTGAAAAATTATTTCTGCTTGTCAGGATGCTGAAGATACGGCAATAAGTCAGACGGTTGGTTTATGCCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 19652482 5' - roo 385 2 67.81 ATAACGCTAGAATTTATTTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTTCTAAAAAAGTATGACAATAAGTATATTTTATAATTAATCTTAAATGAACAGAGGCAGTAGTCATACTCTATGCATAACATGTTCTAATACTTAATAC:1 - chr2L 8777078 5' - G4 3722 1 65.07 CTGGCCGCCTGTTTGTTTTCGTTATCCTGGCTGTTTACGCACTTCGCTTTTTGCATTTCTGCGCTAACCCCGCGGCATTCGCATCTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGGGG:1 - chr3R 28951947 5' + jockey 4694 1 66.67 AACGCACCCGCCCCTCCACCAACGTCTGAGCAATGAAATATTGTAATTAACTTTTCTGCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1 + chr2L 12144196 5' + transib2 61 1 58.90 TATATATTTCTGTTCTTTTGTTGTATACACATACGTGTACATGTAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCC:1 - chr2R 15619080 5' - HMS-Beagle2 232 2 72.60 TAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 + chr2L 13629086 5' + Tirant 8123 2 54.55 CTTCCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGC:1 + chr3R 7585750 5' + Doc 92 1 73.29 AGGATAAGGATGTGTGGTCTGTTGAATGAAAAGTCAGTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 7652289 5' - roo 9019 2 56.55 TGAAATGCATGCAACATTTTAATGAATATAGGAAACTGGATGATCTACAAAACCTATGAAATCATCGAGAAGAACATCCTATGACATCAGCTAAATCTTTAAAACGATTGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr3L 25607215 5' + 412 12 2 77.40 GGTGGCGAAGTGAAACGCATTTCGGATAAGTTTCGAATGCTGAGTTCCCTATAAAAACAATCGCAGAACTTGATGAAATAGAAGCCAAATAAATTTCATGGGAAGAACGCACAAGCTCTCTGTGTTCACACTATAAACTTGTGCAT:1 + chrX 19595975 5' - rooA 363 2 60.27 ATACGACATCTTTAATGTCGGAATAGAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCTACCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGC:1 - chr2L 21403593 5' + G5 4408 1 64.38 CGTACGATCGTGTTCACCCTTGCCACCCAGCCTATACTAAGCTTAGCCTATCGCTATCAGATAGTCGGGGAAGTGACGTATTTGGGAGGTCCAAACCGGCACCTTCAATTATTTCTAAGAAAACAGTAATGC:1 + chr2R 4131496 5' + 297 6621 2 56.06 GTGTGTCGCGAAGCGTTAATGGAACTTTAATTGAAACTCCGGACTGATTGGGATCTTAAACCAAAACAAATCTCTTTGAATGGCCAGCAATTCTAAAGGCGATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAG:1 + chrX 6632902 5' + P-element 20 1 70.55 ATCCCTTGACTCCCAGTATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 - 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chr3R 27323154 5' - 297 346 2 60.94 ACCCCCGCTCCATTTTTATCGATCTAGGGTCTAGGGTTGCATTTTAATCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAATCTGT:1 - chr3L 24153183 5' - baggins 5279 1 61.22 ATCCACATCTGCAGCTATTGTTGAATAAAAGAATAAATTCAAAGTGTCTTATAATTAATTTTAGGGACTTTAGATAGGCCCAAATAAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr2R 21844067 5' + pogo 29 1 65.75 CGAGAATCCTGCCGCCTCTCAACAGGGGTTACATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - chrX 7741950 5' + hobo 77 1 77.44 AAAGGTAGAAATAAATGACCAGAAAAAACCATATTAAATGGCAATTTACATTTAAGCAGCACAGAAATGTGAAAATGCATTTGTTCCAAACATCTCAAATGGCAGTGGAACAAGTTGTAGTATGCGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 - chr3R 17258230 5' + 412 10 2 71.92 TGTAACGAAAATTACATTTATACATTCAACTTCAAGTTTTGCTAAACGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 - chr3R 6422904 5' + jockey 83 1 65.75 ATATGGCGTGGTTCTGGGCGGGATTTGACCAGCTTCTCCCAACATCTAACCACTTGTCACAGCGCAAAACCACGCCAAACGTAATGGCATATGGCATGCATCATATGTGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGT:1 + chr3R 12520690 5' + Burdock 13 2 75.17 GATTGGAAATGGGAAAAGGATATGAACTGTTATAAACTAGCTAAATAATAAGAAAACCACATTTATTTAGTTACACATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - 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Transpac 5188 2 57.53 GGAAACGCAAGACGGTTATAAAAAGTATGTAAAAACCGTCTTTGATTTCATTTGTACCATATTAAAGCATCAATTATTGCAGCTCAATACTCCTTCCCATATTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr2L 7474297 5' - roo 9012 2 68.49 TCCACACTTTTGACCAAGTTTAAAATTTGTTCTTATATTATTCCCCAATATCTATTGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCACACTACCTGAGTAAGGGGTATATGATAGTCGGGGAACTC:1 + chr2L 11186941 5' + INE-1 558 1 75.97 ATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGCCGTA:1 - chr3R 973196 5' + Rt1a 59 1 53.47 CATTTGAACGATCTTTTTCTGAAAATCGGTCATCATCTTTTTCACAATTTTCATCATTGCTACATCATTTTCATTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 + chr2R 5237674 5' + Doc 4 1 71.23 CACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTAGTTGGAAATATCT:1 - chr3R 19436098 5' - roo 358 2 50.00 AATAAGCTCAGGTGTCGGGATTTCTTACTCTTGGGGTGGTGCCAGTGGTGGCTTTTCCCAAATGGCAAGCTGAAAGCTGAACTTCCATTTAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 - chr2R 19852277 5' - Transpac 303 2 75.20 AGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3L 14375640 5' - roo 8989 2 73.97 CTTGCGGTTCTGCACTGGATCGTCAAGTCAACCGATTCGACTGTTTTCTTCACTCAAGTTGTTCGGGAAGTGAGAGATCGGATCGATCGATCGTTTGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCACGAGACATCCAC:1 + chr3R 10212989 5' - P-element 2862 1 69.18 CATAACCAATGTGCTGCACTGTCTCACGAACAACCTTCTGGTAGTCGACCACAGCCTTAGACGTGATCTCGCCGCACAGCAGATTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTT:1 - chr2L 110841 5' + Ivk 5260 1 56.85 TATGTATATATATTTATTAAAACTCGCAATCATTTTTCTTACATTTCTTATTTCAGCCTTTGTCGCAAAATTATTACTCGTAGAGACCCTATACTGTAGATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 + chr3R 20872057 5' - 297 378 2 77.40 GATGCATATCGTGTTACCTTCATCTTGTGTCTGCATCAAATTTCACAGTTGTGTGAACCTAAACCGACAGTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTTAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCA:1 + chr2L 14429917 5' + invader2 86 2 50.68 GTAATTCTTCGACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCCTTCTTATTATTGGTAGTCGGCCTATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chrX 21669990 5' - mdg1 394 2 64.34 CAAAGTCAAGCGATCGCCCCGCATACCAATAAAGAGACCCCCTATTCGTATACGAATATGTACTCGTGTGTTTACGAGACGGCCGGCATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr2R 7982482 5' - P-element 2865 1 67.42 AACCCTAGAGAAAAACTAACAAACAAAAATTATGTGGGACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chrX 7706705 5' - P-element 2870 1 71.22 ATACCAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTT:1 - chr3L 7801318 5' + Transpac 5074 2 48.63 AAATCCGTTTATTTGGGTTTTTTCATTGCAGAAAATGTGTTCACCAAATGCTGACATTGCGCTTCACACGCTCCGGGCAGTAGAATGTTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGGGTCATATTTCGCGAATTAGTTGCAGTTGCGCTGAC:1 + chr3L 26370983 5' - gypsy4 64 2 67.12 GAAAGCAAAGACTTTTCACAGAAACCGGTTTCCATCGATCAATAGATAGACGGTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chrX 4673609 5' - roo 9004 2 66.44 CTCTGAATAAGTTCTTAGTAGTTACGCCACGCGGAACAGTAGCTGTCGGCACAAGAATAACAACAAGAGTTTTCTGAAACTGGGTTAATTGTTTCCCGGTCCCCCAGCCTGGCAGACTCTCGGCATGGGTCGAATGACACCTTAGT:1 - chr3R 445474 5' - baggins 218 1 54.11 AAACGAATATTCGCCCTAAAGAGATGATTGCCCTTTTTGTAAGCTTTCGATTACGGAAATAAACGATTTTTAAATGAAGTTATTTTTGTTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chr2L 5791956 5' - blood 7359 2 64.38 CAAAGTTCTTAAATATTTCATTGGTTGGCTTATTAGCAAAAAAGCGCAAACTATGTGAAGAAAAAGGTGGAGAGTTTAGTATTCGTATAAATACAGGGTGCGGCAGGATAATTTCCTTTTTTCAT:1 + chr2R 2950810 5' - mariner2 881 1 59.20 ATTTCATAAGATTTCTTCCAAGGAATTTATATGCATTTTCAAAAAGAGCCACGTTAGCGTTTTTTTCCCAACAATCTGGTCATTTTATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 - chr3R 26486150 5' - 412 7520 2 66.43 GTGCCCAGTCGAGCCGCTCTTAATCCAATTAAAGTATGGATTTATGAACTACTGTAATAATATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTCTTATTTCTTCTTA:1 + chr3R 30264018 5' - blood 7321 1 61.15 GATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chrX 7706773 5' - P-element 2846 1 34.41 ACACCTCCGGAGATCACTCCCCGCAGCACCCAAACGTCCTGTTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 14218423 5' + roo 8706 2 52.63 ATTATAATAATGTTGTGATTAAATTTTGAGATTAAAATGACTACGATCTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTACATTTTATAATTAATCTTATATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTACATACTC:1 + chr3R 7080608 5' - G4 3751 1 67.12 GCTGAAGAATGAGGCCATTATGTAAGGGATGACCTTTCCATTCTGTGGAACTTACATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 + chr2L 21691814 5' + 297 6637 2 63.01 AAAAACGGTGAGAGTTGCATGCTGGAAAACCTTTGCCAGCAGCTTAACCCTTGATCCGTAATTAACCCATTAGGGTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 - chr2L 14239253 5' - 412 446 2 54.11 ACAAGGTTTTTCCATTCTTTCAAATTGAAGAAGAAGTTGAAGAAAGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGTTGCATGTAAAATTCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chrX 4400281 5' - roo 403 1 69.37 TTCCAAATCAGAAAACGGGAGAACTGCTTCAAGAGAATGGGAAACGACCCTATAAAGAGACTCTACATGGGGAGAACTAAAAATACAACATATAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 + chr3L 2192245 5' - jockey 4966 1 56.83 ATATTCTTAAATCTCCTAATGGTCGAATAAAGACACGAAAGATTGGAGACTGATTGCTAATTTAACTGATATGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chrX 4400411 5' + roo 8712 2 53.10 TAATACATTTTTTATTTTATCAAATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTAAACATAACGCAAACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCT:1 - 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chr3R 18635334 5' + opus 33 4 61.38 ATAATATCCTGAGAAAGGAGGTAAACGTGATTGAGAATGACAAACTCCTTTATTTTTATGTTGGAAGCTATTCCAAAAGCGTTATAATAACACGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGACATTCTTTCGAAAGAG:1 - chr2L 15790324 5' - I-element 285 1 59.03 GTATAAAACTAGTTAATTCTGAATATGCTAGTATTATAATTCTACATCTTGACTTTGATCGTTCTACTATATTCATAGAAAAGTATGTAACATACAGAAGAAAGCGTTTCCGACTATATAATGTGTATATATTCTTGATCAGGATC:1 - chr3R 11833360 5' + INE-1 80 1 72.60 AAGTTTGTAAGGTGGGTTACAAACACACTGGTACACACACACACGCACACACACACACACTGGTAACACCTGCTTAAAGAGCCGCAAAAAGAAAAGAAAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATT:1 + chr2R 8177685 5' + FB 13 1 68.38 GTAACTGATTAAATGAATGTTGCGCTCAGAATTTGAATAGAATGTAATGAAGCAAATAGAGTTGTTGCGAAACCCCCCTACCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGAGGATGTTGAGAG:1 + chr3L 24810131 5' + Cr1a 4056 1 51.72 AATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr3R 9125625 5' + Doc 16 1 76.56 ACACCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1 - chr4 311583 5' + 1360 80 1 71.92 GCACATTTGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 19436121 5' - roo 9054 2 70.59 GTTGCCAGTCAATGCGCTTCAAGAGATTGCTGATAGCTATGACCATTGTAGGACACGACATGATCTCGAAATAGATTCGTATATAGTTTTTACTTTTTGAAACAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATA:1 - chr3L 16064155 5' - 297 439 1 79.45 GTAAATGTACATTTTTAAATGACCTAAATTATTGAAATAAAAAAAAAACCAAAACCCGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3R 20840061 5' - roo 344 2 64.38 GTACTTAAAGAGCATGCTGTTGTGGGATCACTCTCCGGCGTAAGTGAGTTATTATCAATAAACTATGCAAGGTAATTTCCACTTCGTTGGCTTCATACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGG:1 - chr2L 1559189 5' + roo 25 2 44.52 GGACCCGCATTTTGTGTAGGCAAAAGGGGGGCAAGTGTTCTGTATTCCAGGGGAATTGGGATTGGGTGTAATGGCATGATTCCAAGTGGGCAGCATCATCATCTCCTGGCTCTCGTCAATGGGGACCGTATGGTGAGGTCCCTCGG:1 - chrX 8967287 5' - BS3 1574 1 62.33 GGTGCATCCAAAAACCCACCCACGCTATCCATGCAACCAGCCAACGTGCAACCACCCAACGTGCAACCACCCAGTTCCACCTGCCTCGTGCTCGAGTAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAG:1 - chrX 5583309 5' - roo 59 2 61.81 TCTCTTGTCTCGCTTGTTGCGTACAATTCTTTTCTCTGCGTGCAGTAAAAATTCTTTGTTTTTACTTCTCTCCGTACTAAAAACTTTTCGTTTCAACTTTTCTGCGGTGGTCCGCCCACAAGACCCAACCAAACCCAACCAAACCC:1 - chr2L 2599925 5' + G2 103 1 50.68 GCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCTTTGGACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAAATAAAATAGGCAGAAATTCTGGTGTTCAATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATTGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTGGTTT:2 + chr2L 21675229 5' - HB 1376 1 60.96 TAGATGTGTATTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTA:1 - chr2R 1000431 5' + HMS-Beagle2 6920 2 61.64 GGGAGGACTTCTCGGATCCCTCGGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAG:1 + chr2R 10910178 5' - Tabor 454 2 63.70 CTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGT:1 + chrX 15408744 5' + INE-1 567 1 88.49 CAGCAGCTCGTCGCTGAAAATCGCTTAATTGTCATCGCCACAACAAGGAATTTAACCCGCCTCCCGTTGGCCATTACCATTATCATAATTAAGCCATTACTATAATTATGCACTTAAAGTTTGCATTTTAAACTTTATTTTGCTAA:1 - 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I-element 5296 1 61.94 ATCTGTATGCGCGTTCTGCGTTGTTTAATTTTTTGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTC:1 - chr3R 16540997 5' + G2 2871 1 76.71 GATTAACGACCCAGTAAGCTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCACACCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCACCAGGAGTGGCGTCCAGTACACG:1 - chr3R 21395199 5' + G2 476 1 70.43 ACTTAGCTACAGAAGTAACGATGCACACGGTTAATGCTTGTTTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAA:1 - chr2R 6673433 5' + BS 5074 1 68.50 ATACATACATGAAAACGGAAGAGGGAATGCAATAAAAAGTTTTTGATTTTAGATCTTTTATTTGCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr2L 19997169 5' + Tirant 40 2 54.96 CGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAG:1 + chr2L 18630465 5' + G-element 34 1 52.29 GAATTATATGGCTTTCGATGGGATGTGAAAAAATGTGATGTGTGCCAAGGGCTATAAGTTAATACTATAAGTGGGTACATTTGAATCTATTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGC:1 + chr2L 16456726 5' + BS 5028 1 44.52 AAATTTTAATTATGTAAACATAGGGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr3L 16015237 5' + 1360 52 1 61.24 ATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACACA:1 + chr3R 9125687 5' + Doc 81 1 72.52 GATTTAGTATTTTAATGTATGCGTTTTTATTGTTAATGTAATTGGTCACATTGGCGCGTCAGATCAGTTCGTCTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr3R 1869762 5' - 1360 3341 1 52.05 CCTGATGCTGTGGACTCCCCAGTGAGAGTGGATAAGATAAAAGAGGAGGTGGCCTATGTCATCCTCCGTCTATTACATAAGGTAGTTTTATGGGATGCACCTTGGGATTTATTTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTT:1 - chr2L 20927363 5' + INE-1 580 1 71.23 ATGCTACATTTTGTTATTGTTAAATATGCTACGGTTTGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATACAT:1 - chr3L 2216602 5' + jockey 65 1 63.87 GGCGGAATGGACAAAAGAAAATGCGCGCTCACACACACACACACACACACACACACACAGCACACACACACACACATAT:1 + chr2R 11604504 5' + accord 183 2 70.89 GCAAGCCTTAAAATAAATACAAAAATTAAATCAACCAACAGAGCTATACAGTGGTCTTTAGATAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2L 17626539 5' + roo 18 2 73.97 GTTAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr2R 15070174 5' + 412 41 2 53.17 AATATACATTATCAAATATAGATTTGACCCTGGCTTTATCAGTTTGACTTGACCCCCCATTCAGAAATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGC:1 + chr3L 14543015 5' - Burdock 6307 2 54.79 AGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGGTCATGCTTTGTAAATTTGACAAAATATCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTT:1 - chr4 184017 5' + 1360 224 1 76.03 GAAATTAATAACGAGATCCAATAAGTTGAAAAAATCAAAACTTGTCAGAATTTTCATATCCCAGAAATAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTTTAATAGCAAAGTTTCTGATCTCTTAAATTTGTTTTTATATCATT:1 + chr3R 4583767 5' - Tc3 1579 1 56.85 TATTCCAGTGTCTTTGGTTAAACCACTTCTGATGTTGTAAACGGTGCTAAAGTCGTGATGCTCTGTTTAAACTAATTTATTGTATTTAAACGACCTTTCTCGGCCACACACACGGACAATGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACA:1 - chr2R 1621924 5' - Tc3 313 1 51.37 AATTGCACGGACTTGGTGAACTGAAAGGGGAGCGAAACGTTTATGAAATTGCATGCAGAATTAAAGCCGCCAGGCGAATGCCGAGCGAATCCTTTATCCTTTGTCAAGTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAA:1 - chr3R 18955538 5' + P-element 2635 1 73.29 GATAGAAGTGGGTTAGAAAATGCATTTTTTGGTTTAGATCCAAATCTCCAAAACGAAGAAACCCCTGAGTTCTTAAAATGTTTTATATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr2L 13255411 5' + pogo 31 1 60.27 TAGTGTGTGGTTGGGAAGTTGTGGGTGTAGAATGGACATGTTACTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAA:1 + chrX 22252760 5' + flea 4811 2 65.62 CAAAACACGGTATTTATACACCCGCTGATACCCAAATACACGCAAATGTACCCGAATTGGTGTTGGTTAAAACACAGTGCTCGCTAAATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chr3R 25049957 5' - P-element 2858 1 64.38 GCTAGTTTAAAGGAGTTTATTAGTTATAATAAGATAAGTGGCATAAGTTAAACTTCAGACAGTCTTATCAGTTTGGAAAAACAGAGATCTGCACAGATGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCT:1 - chr2L 10199771 5' - roo 8879 2 67.91 ATTTAGATTTTCAAAAAACACTAGATAAATACAGCTGAAACTCAATTGATGATTATGCGCCATAAATATTTTTGAATGCAAACAATAAGCAAGACTGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACAT:1 - chr3L 17763966 5' - roo 139 2 65.07 ATAATACAACATGGGCAAGTGGCAACGATTTCCTAATACATTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr2R 13293368 5' - roo 8992 2 71.92 AAGCTCATTGCCTCAACATTTGGTGACCCTGACGTTCGGTAACATTTCTTTATCGTGAACTCAAAAAACAGTTTAACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTGTCGTC:1 - chr3L 25996038 5' - Gypsy6A_LTR 378 1 80.69 AAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATAC:2 + chrX 21087564 5' + mdg3 5292 2 52.05 ACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3R 18528296 5' - roo 322 2 76.03 CGAATCGCGTGGCACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1 - chr2R 10910325 5' + Tabor 6884 2 52.05 GGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2R 11164489 5' + roo 76 2 74.48 TGTGCATGTACTAGTTTTCACCGTTCATTTCATGATCGTAATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 - chr3R 12363825 5' + jockey 4707 1 58.78 GTTTTTTTGATGATACTTGCTCTTTGTAACCTTGGGATCAAAAACCACTTCGTACATGTAAGACATAATCTATAACAATATTAATACATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCC:1 + chr3L 21222655 5' - flea 4783 2 68.25 CGACATTTGGCTAAAGCGAACTGCGTTTTGGCCGCATTGCAAGCTGAAGAGATTTATTGAGTGAGTCAAAGGGAAGAAAGATGCAGAGAAACTTTCAATATATACAGTACAATAAATATAAAGATATTTTTAAAAAAGATAAATTA:1 - chr3R 18467040 5' + TART-C 11038 1 74.66 GAGTGCAAGGATGTCTTAATCATCCTCTGCAGATGTCAAATGATGTATACACTTGGTGCATGGTAATGGATTACCAACTAAGTAGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAGAACTTAAGAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr2L 1090919 5' + 412 7103 2 55.48 CATAAAGTTGGTTAGCTGAAGAATGAGGCCATTATGTAAGGGATGACCTTTCCATTCTGTGGAACTTACATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr2L 21691800 5' + 297 6623 2 56.16 TTTCACATTTGATTTCGACTCCCGCACAATTTGAATATATAAAGCCCGGCCTTTAAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr3R 7778204 5' - transib2 2809 1 75.34 AATTTCCTCATCGCTCTTCTTATGTCGTTTTCCCATTCTTCTCCTGATTCCTTTGTTTTATTTCTTTCCTATGCTTGTGCAGCCATGACAGAGTATACTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATGCGATTTTTTTG:1 + chr2L 20146265 5' + 1360 26 1 60.96 CCAGAGTGTTTGTATCATTAAATTTTTATGCAAGAAAGCAAGCCAACTCTAACGCCCAAAATCGCACAAAACTGCATCGCCCACACTTTTTAACCTTTTTTTTAAAATGTTTTCTATAATTTTATTAGTCTTTTAAATTTCTATCG:1 - chr2L 21786587 5' + INE-1 298 1 50.68 GCGTGCGTACGTCATTGCAACTCCGGTAAAACGCAAATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATT:1 + chr2R 18689109 5' - Burdock 227 2 66.44 CATTCGGGTTTAGTCCAATGCAAACGGATATCCCGGTTGATAAATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTG:1 + chr2R 23106573 5' + jockey 4551 1 69.18 CAAGGATTATCGAGAAGCAGCTGCAGCGCAAAGGCGGAAAACTGAGCGATGTGGGCATCAAAACCAAAACAGAGGACGCACCTCCGCCGCAGAAGTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 + chr2L 13812510 5' - opus 7458 2 60.96 GTCTTTGTTAATTTCTCAGAAAAAAGAAAACCAGTTCATTCCGTGAAACTCACTCACGCTTTTTCTAAATGGCTTAATTTGAGTCCACCAAGTCCTGGCACCGTTATTAAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTTGAC:1 + chrX 22898700 5' - Tc1 1241 1 61.03 AACTAACATATTGAAATACCACCACTCAGAAGGTGTAGTTAACTCCGCTTCTTTTGTTCTAATATGCAAAAAATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATA:1 + chr3R 32017536 5' + Stalker2 7321 2 57.94 TAATTAATTAAATAAATGCATTATATACATTTAATATACATAACATACATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACAC:1 + chr2L 13332622 5' + micropia 72 2 78.77 CGCTTTCAATTTATTTATTTATTTTATGATATTAACTATTTACTTCATTAGTTATTATTATTATTATTATCATTATACGGAGCTCGATGATAACACATCTGTTCACTTGAAATGCCACAGAGAAAAATTCTAATGACAAATATTCT:1 + chr2L 11219886 5' - 1360 400 1 43.84 CACTGAGAAAATAGCATGTTGTCGTATTGACCACGTACTATTTGATACAATAATCAGTACACTTTTTTGATTATAATCTGTGACTTTTTACCATTTATTTTAGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAT:1 - chr3R 12744778 5' + Stalker2 21 2 57.53 AAGCCGCAAGCCTTAAAATAAATACAAAAATTAAATCAACCAACAGAGCTATACAGTGGTCTTTAGATAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2L 17626534 5' + roo 8677 2 77.40 TAAATCAATATGTATTATATTGTATGTAACTAAATATATGAAAGACTATTGATCGATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGT:1 + chrX 14836173 5' - invader4 3024 2 60.96 AGTGACGCGGCTGCAGGACGCCTCCTTGAGTTTTTCCTTTGACAATTTCTCTCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTACTACATTGGA:1 + chrX 15559483 5' - hopper 1347 1 63.70 ATGCAGTGCTGAGCTGCAAAAGAAAAGCAAAATGCGCCATAAAGACGAGAATGGGGAAACACAAGTGAAAACAGAAACAGACGTCACAGCATCAGTTATTAGTTTTTGGCACAAGTTGGCACACATCATTTCTCACTCCACAACAG:1 + chr2R 15045967 5' - transib3 402 1 61.64 GTTGGAGCTTTGGCACACGCACGGATTACCCATCTCTTTGCACATTTATCAGAGCGTATGGCCATATATATATTTTCATTTTAAATGCAGGCTGCGTACGCCAATATAATGTGAACATTTTCGTCCTTTCGAGAAATTCTGTTGTT:1 - chr3R 11278574 5' + rooA 394 1 71.23 GTGTGCATGTACTAGTTTTCACCGTTCATTTCATGATCGTAATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 - chr3R 12363826 5' + jockey 4721 1 53.42 ACTGCATAACTTTCTTAAATCCGTTAAACATTTCAACTAAAAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chrX 16994507 5' - roo 8995 2 70.55 GCGGGCAATTTGAGCTGCCTGTCAGTTAGTTGTAAGCGCATCGCGAAACGTTTTGGTTGTCGCTTTGTTTTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCCGTTCGCATTCCAGACGACTAGGTGTAGCTTTAATTGCAT:1 + chrX 14929678 5' - G6 1605 1 47.95 AAGAGGTTGCGGCAGGGGTAAATCAAAGGCAGAGTCGGTTTTATATTTATTTTAAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chr2L 20713168 5' + TART-C 11099 6 54.29 AGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:2 - chr2L 21643131 5' + Tabor 59 2 56.16 AAAGACGCTCTGCTCAAATCCGAGTGGAAGATGACAGCAATGTAAGCATATTCGAGCTGCTCGAGCAGAAGCGAACGCTTAGCAAACCTTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGT:1 + chr3R 7152204 5' - Quasimodo 474 2 57.26 ACAAATATTTAGAAATTTGAAAAGCAAAGTGTTTAATAGTGGTTATCAAATAGCAAACATCGTCAATTATTAATGTTTATTTAAATGGTCATTAATTATACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATG:1 + chr2L 13958768 5' + roo 8983 2 67.12 TGGGACAGTTCACTTAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr3R 28450760 5' + roo 57 2 60.96 AACAGACTTTAAGCGCTTTTATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGG:1 - chr3R 21395250 5' + G2 439 1 61.24 GGAGCATTCCAGAACTGTATGAACTCTATGAGGGGGCCACAGAACACGTCGACTCAGTTAGCCCCCAAGAACGGTACGACACAGGGACAGGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTC:1 + chrX 3040024 5' - roo 8734 2 58.90 GAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAA:1 + chr3R 10437037 5' - BS 5042 1 52.74 TGCCATTTAATGTGTTTAAAATATTTCGAATTAAGCCGCTTTGTATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATA:1 - chr2R 11095823 5' - diver 147 2 69.86 GACTCTTCTTTGATATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr3R 20203928 5' + 412 7107 2 55.86 AAAAGCAGCTGTGCGCACAGTGTGTTAAATATTTCGGGAAAGTTTTGGAAATATTCGTATAAAATTTAATTTCATACGAACAATTTAATAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 6601248 5' + roo 8686 2 61.31 TATGACAACCCTAGAGAAAAACTAACAAACAAAAATTATGTGGGACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chrX 7706699 5' - P-element 2885 2 80.77 GTAACAATAATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr3L 14375695 5' + roo 8748 2 78.77 TGGTCTGAAAACTTTTCGTTGCGGTTGTGTTGGCACCTTGGCCACAGAGTTGCATTTGCCCCTGTTGGAGTTTCGATTCACAATGTGTTGTTGCCTTTGTGCTTGCCACACAACCCATGTGAACGGCTATAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr2L 16201520 5' + G2 3072 2 66.44 GACATCGGTGTGCTAGTGTGGCTGCCTGTGTGTGAATGTGTGTGTGTGTGGGTG:1 - chr3L 6015109 5' - accord 7032 2 72.22 ATAATTACCTGCCGTAGTTTGTTGTTGGCCCTTTTGAGAACAAACATACAGTTTGTCAAGAAATAAATTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGAGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTATTATAAAATATAATTAAA:1 - chr3L 25610057 5' - S-element 1620 2 72.60 AAGGGATTTAAGTTTCAGTTTCAGTACGGCTTCTAAAGTTCTAAAGTTAAATATTGCATATCAAAGTTTGAAATATTCTTGAAAATATTCTATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGAT:1 - chrX 3632610 5' - jockey 4829 1 59.59 TCTGTTCTGCTGTTTGTGTAAATATCTATTAAGTCTGCGCTTAAAGTTATTGCAGAAATAAAATTCGTTGAACCACCAAATACCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATT:1 - chrX 3040185 5' - invader2 442 1 43.84 AGTTGAACAAGTTGCAAAGGGAGGACTTCTCGGATCCCTCGGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTATTCTTTATA:1 + chr2R 10910160 5' - Tabor 472 2 76.03 CGAGCGAGTGCAGCAAATCGATCAGCTGGGACGTCGACGGGGGCAGAAAGTTTGGCCAAAAGAAAAGGTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3L 20497721 5' - P-element 2867 1 62.61 AGCTTAGCGATCGATCCTATCCTTATGATCTCATATATCAATACCAAGAAGGCTGAAGTTACTAAATACAATAGAAGCGTTTATTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTAT:1 - chr3R 18153679 5' - copia 5087 2 60.96 AGAAGCAGTATATTTTCCATTATAAAAATCACGAAATTTACGAAATAATACTTTTTTTCTTTAATCAAATATGTGTCATTACGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTA:1 - chr3L 14377307 5' + opus 7374 2 54.11 AGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr3L 3453609 5' + Tirant 8145 2 55.75 AGGGGGTGATGGAGAATTAGGGGCGGGGCAACCAAAATGCTTTTGTCTAACTTGAGTGAATTATGGTCAGCGGTCGGTCGGTGGTCGGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAACATTAATACCTCCTCAACTATT:1 + chr3R 21341293 5' + hopper 35 1 59.59 TCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 + chr3L 18253792 5' + blood 61 2 61.87 GAAGCCTGTGTTATCGAGCTTATTAGTGGTATCCTCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATT:1 - chr2L 5643526 5' + jockey 4825 1 75.34 AAAATTGAATATTTCCGGGAGAAATGCAATTTTCAATTAAGATATTTCAATCGAGAGTGATGACATTAAAGTAGAGGATAGAATAATATTTCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2L 19674039 5' + roo 8673 2 43.85 GGAGGAGCTTGGGAGTGGGCTACGTTAGAAAAACCCGCATCCGAAAGTTGCCCCGTGGCCGGTGTGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3L 13690370 5' - hobo 2921 1 63.89 AAGTCAAACTGTGTACAAACAGCTTTGGCCTTAACGACATATGTGTGTGTGTGCGGGTTGTGCGGGTGTTTGTGCACGTGTGTGAGCATGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 9955470 5' - accord 7034 2 50.00 GACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATGTATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3R 20203909 5' + 412 7127 2 68.49 AGTATACGCTAAATCACAATACAATAGAATCACATTTAAAAAATAAATTATATACAAATTCGTAGACAAAAACTTCTTGTGTTACATCCACACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATT:1 + chr3L 7733287 5' + I-element 5012 1 64.38 AGGCGCGAACAAACCGACAGTAATAGCCACATCCCTGAGGCGCCTGGTTAATCCCAATGCCAATCGCAGCGGATTGAGTACGGCATCTGGAGATTGTTTACTTTTGCACGTAGTACGA:1 - chr2L 7805347 5' + transib2 216 1 76.27 GAAATGAAATAAAGACAACTGCATATTGGCCAAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chr3R 16240976 5' + Tirant 8175 2 72.31 AGTCGTAAAAAGGGGATTTCATTTTAATTACATACGAATTTCTTGTTTTTTTTGTTTTTTTGGCCTCAGATTCAGATACGGATTCAGATTCAGATTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAA:1 - chr3L 11318732 5' - 297 266 2 65.07 ACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3L 14375584 5' - roo 9046 1 64.83 ATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:2 + chr2L 14969110 5' + 412 7137 2 75.34 GCCACCAATGCACCGTGGGCCGAAAAAGTATTATTTATTATTTCATAAAAAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 + chr2L 8574365 5' - Transpac 241 2 68.49 TAAGAATGATTGGAAATGGGAAAAGGATATGAACTGTTATAAACTAGCTAAATAATAAGAAAACCACATTTATTTAGTTACACATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr2L 6601401 5' - roo 9034 1 44.52 ATATATTTCCCCAGAAACCATTTTAATTTATAGACGCAAAACACTATTTGCCATTGTCACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:2 + chr3R 28450606 5' - roo 397 1 76.71 AGAGGCAATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATT:1 + chr2R 17544150 5' + gypsy5 6974 2 50.88 ACCAGGGATATGAATTTCGAATGCAATTGTTTTTGTCAGTTTGGCTTTATATATATTTATATCGGCGCGGTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATT:1 + chr3R 851662 5' - F-element 293 1 56.16 GGTTTGGATTTAAATATACTCCGATATGCATTCAGTTATCTTGAAGTTAAGATATTAAGATACATATACATATATTGTTCATCGAGAACTTTCATAAACCCATTATGCTTTCCCTTTGAAAGATTCTTTGTCATAATGTCTGCTAT:1 - chr3R 21186230 5' - 1731 4207 1 64.38 TCGGAACACCCCTCCGCGACCCGGTTTTCAGACCACCCTTCATTTAATGTGGCCATCAAGTCGTAATTACGCTCGTTGTTGAAACGATGAAGACATCAAATTGCATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chrX 6633092 5' + P-element 10 2 78.08 GATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTT:1 + chr2L 3960193 5' + jockey 84 1 68.49 CAGGAAGTGAAAATCCACCAAGGAGCCATTCGCAGTAAGCTGGTGATATTTACAAAAAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACT:1 + chr2L 2120329 5' + I-element 4903 1 80.31 GATCTCCGTGAAGGGATCGTCGCGGTGACGCACTGCGTACTTGCCGCAGGCATATTGAAAGTAGGTGCCGCACGCACTGGAATCCTCCGCCACGTAGCTGATAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACC:1 + chr2L 6385312 5' - jockey 153 1 71.74 ATTATTTTACGGCTAGTGTATGCGTTGTGAAATTATTATGAGCTAAGGGTTCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAA:1 - chr2R 21748329 5' - 1360 3328 1 65.69 ATCGAATTAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATC:1 - chr3R 15790132 5' + flea 4723 1 73.97 ATTTCGGATTCAAAGAACTTAACTATTAATGTTGGGGAATCCCCAAAAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATAGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAG:1 + chr3R 25543415 5' + G2 192 1 44.14 GGAAGAGGAAATTTGAGCAAACAATTTATAAAATAAACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTT:1 - chr3R 24454913 5' + F-element 253 1 68.49 AATTTGGGGGATTGCTGACGTTATTTTGGGTAAGGGTAGCTTTTAGTGTATATAGGTTCACTCAGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGG:1 + chr2R 5112110 5' - mdg3 5274 2 56.16 CAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAAC:1 - chr3L 7801314 5' + Transpac 159 2 51.37 CGCTTTGATTTGGACGCTGAAAAGACCGAGCGATTCGTAATTTTCTTGTGCCTTTTAAAGAGCATTTTATACATCCGACCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCAAGAGG:1 + chr3R 7469795 5' - Doc 455 1 58.02 TTATAAATATTGAACAAGTACAGGCAGACAATTTCGGGTAAAGGCGATTATATCAGTGTAAGCAAGCATGCACAGCATGTTGATATTTAAATCTATGAACATACAGAATGATTTAAGATTAGGGGTATGTAGTTTCTAGTGAATAT:1 + chr4 1179598 5' - Cr1a 4118 1 69.18 AGTTTGGCCAAAAGAAAAGGTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAG:1 + chr3L 20497769 5' - P-element 2788 1 17.81 GGATGGGCATATGGGTCTGTGATCCGTATCTAAAGATATGTATGTATGTATGTGCACTGGATGCCACATGCCGACAGGCAGCACATAATACATTTTTTATTTTATCAAATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTA:1 + chr3R 16892272 5' + 1360 3136 1 55.48 ATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 - chr3R 20203914 5' + 412 7118 2 64.79 CAACGGGGCAAGAGCAGAAGTAAAGACAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAG:1 - chrX 6632002 5' + P-element 328 1 23.29 ACCGCCACCTGTGTCCTTGTCCTTTCATCCTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAA:1 - chr3R 6495333 5' + copia 9 2 62.07 TTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2R 11164517 5' + roo 12 2 69.72 CCGGAAAGCTAGAAGCCGAAGCTCAATGTTGAAACATTTGTTTAGTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chrX 21403477 5' + roo 18 2 54.44 AAACAGCGGAAGAAAAATCGGCAGTGAATAAAGTCCAAATCGGAGGCAAAACCAAATCCAAATCCCAATCCCAATCGCCATCAAAATAATAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTC:1 + chr3L 17534392 5' - opus 7371 2 68.46 CGAGCCAGATCGTAAACAGGATTGGCCTCCGATCGATTGCGGGGATACAGGCCAGTTAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAG:1 + chr2R 21826911 5' - Doc 4227 1 54.31 CATGTCACCGAAAAAAAAAGGAAAATGTAATGCCTTTCCACCGCGGCTGCCACATTGCAAATGGAATTGAGCAATGCAACAACATCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTAGTCTCCCACTAAGGGACT:1 - chr3R 6957280 5' - roo 8865 2 56.16 ATGAGCTGCTGTTTGACCAAAATACGCCTATACTCTAATTTGAATGAGTGGATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1 - chr3R 12762442 5' + 1360 64 1 61.54 AGGCAATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCAC:1 + chr2R 17544152 5' + gypsy5 60 2 60.58 ATCCGCACTCGCATCCACACGCCCATCCCCACCAGAGCCTCGGCTATTACGTCCACCACGCCCCCGAATTCATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTT:1 + chr3R 6792740 5' + Quasimodo 7313 2 51.45 ATGAGTTATGCTTGCAATAAATACTATTTGTAAAGAACAAGTAATCATAAGTACTTATTGGATTACTATTCAATTATTCTTAACCATTTACTATATATATATAGTTACATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTA:1 - chr2L 13139120 5' - McClintock 6408 2 67.81 AAAAATTTCTGCACATGATTCCGCTTTATTTCTTTATGACCGTGTGTGAGTTCTACTTGGAAATTCATATCTCTGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 21403376 5' - roo 9024 2 51.37 AAAGAAAATTCAATATAATCAACAAAAGATAGCAAATTAGTTATCGACCGCGACCCCAAAAACATGAAAATGATGGATTTAAAAAGAGTGATTAAAATAAAGAAACCGAGCCAAAAAAAGAGAAAAAGTATCATTTATGTAAAC:1 - chrX 6123199 5' + P-element 458 1 70.14 ACTAATTGCGATCTCTTCGCCCTCGAACATTCGCTTTGATGTCATAATGGCCACCGATGAGGAGTGACCTCTTTGGGTGGTCCTAAGCTGCCGTCTTTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr2R 9340080 5' + 412 7076 2 68.49 TTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr3R 24564826 5' - opus 470 2 54.81 GCTTATAGGTGCGTTTGCGTTTCATATTAAGGTATACTTTTAGACTGTCCTAAAGTATATGCTACATATACCATGATATGCTACATATCTATGATACATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chr2R 17169336 5' + hobo 24 1 66.44 TAGAATCTTAAGAAAAGACATTATTTAGTGTCTGGCAACAGTGGCTATTAAAGTCTTAAAAGGCATGGTCAAATCGTGGGTAAGTCATTTGCTCAAGTATTATGAATAATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:1 + chr3L 465921 5' - Juan 4202 1 76.71 ATTTGCAGCCATAAATAATGGACCAAAAATTGGAATGTAAAAAACAAGCATTCTTGCTCAACGAAGCAAAAGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 2320725 5' - roo 359 2 53.42 GATACTGCATTTTAGGAAATATTGAATATTGATAAATATTAATAGGAGAGGGTCCAAGCTAAGGCAGAACCACAAAATCCTGGTGTACAAGGCAATTCTCAAGCCCATCTGGAC:1 + chr2L 21870705 5' + G2 2644 1 61.40 CGCGGAGAGAACCGACCAAACACCAAAACATAGGAACCAAAAACCCGAATGGGGCGCTTATATATTATATATATGTATATATTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr3R 24564708 5' + opus 147 4 61.11 AAGACCATCAAACTAATCGTTTCTATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTT:1 + chr2R 961105 5' + transib2 2615 1 66.06 CAAGTTGGCCTTTATTTATTTAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - 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Porto1 208 1 62.33 ATATGTATAAATCTAGTGTATATTATGTAAAATGTTGCATTTTCCTGCTCAAAAATCCACCACCCCCACCAACTTGTTGTTGTTTATGATAATGAGCATTTCGCTCATGTGTATAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCT:1 - chrX 20624541 5' - G4 3762 1 77.08 AAAATAATCTACATGGAAACTGAACTTCATAAAGTTGGTTAGCTGAAGAATGAGGCCATTATGTAAGGGATGACCTTTCCATTCTGTGGAACTTACATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr2L 21691773 5' + 297 14 2 75.17 TTGATAGAAGAGGGATTTTAATAGTGCACAAAATGGGCAACGTCCTTTGTTATTCTTATATATTGTTAACTTAGATGGGTTTCCACAAAAATCGTAATATCAGCACATTTATCTTATTTTATTCTTTAATTATAATGTATACAAAT:1 + chrX 7045314 5' - G5A 2738 1 86.30 GAGCAGAAGATGTTCAATTAAGATCTAATACGTGGGTGTGAAATTTATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAATACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTA:1 + chr3R 16538371 5' + G2 2647 1 63.24 GTATATTCTCTTTTTAATAATGAGCCACAATATCATTTGACATATCATATCATACTAGTTAGTATGTCCTCATGGCTTTTCCAATGTTTACGAAAGTATATCTTATCAATAGGTGGGTAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGC:1 + chrX 9038947 5' - F-element 143 1 78.08 CAGTCTCTGTAAATAATCCGTCAGAAAATGTATAAGATATGTAAGGAACAAAGTGTCGAATTAGTCATGCACACGAGTTTTCGTCTTTACATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr4 916262 5' + roo 29 2 65.52 GTTTTGGGGAAATGGGGAGTGAGCGCAGGATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTGTATTTATTTACAATGTTATTATAT:1 + chr3L 10112219 5' - 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diver2 114 2 62.33 AAACTAAAATCCTTTAAGTCCTTCGACACACCAGATTAGCAATTCCGAAAAGCCAAATAACGAAATGAAACGAGCGAGTAAGTGCAAAGAAAAGCTCTAAATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAG:1 - chr2R 15106666 5' + R1A1-element 355 1 69.57 CAGCCATTAACGGCTATTATTGGCATAAAAGAGTTAAAGACGATAATGATCTCTACCTTAAAAGGGTTTGACAATATAGAAACGTTTCATTTCACTTAAGAAAAGGTCTGATCAACCTCAAAACAAAAAAAAAATCATAAAAAAAA:1 - chr2L 3935676 5' + jockey 4994 6 51.37 CTGCATCCTTAAATATGTATATATGAAATAATTCCTGGGATATTTCTTTCTGTGTACCATATCCTTGGACAAACACTTCGACTCTAATGAGGCAACTTAAAGTGTGCTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3L 13364439 5' + hobo 14 1 76.71 CGTAAAATGCGGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAGGC:1 + chr2R 15075582 5' - mdg1 351 2 62.33 AGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3L 19580907 5' - roo 8989 2 74.48 GCGATGAGTCCAAGCGACCCATCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 + chr2R 21820713 5' + Doc 66 1 58.22 AAGGTTTATTTCAAACAGATATTAGTCCAGATTATTATAATTTTCTTTTGCACTTGCCTGCTGTGAAACCCTAAAAGTGAGCCAAGAAAACTTCTTTCATAGTTCTGCTTCTCACTAAATTAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCA:1 + chrX 7446138 5' + jockey 4669 1 56.55 TATGCAAATTCAAAAATGCAACTTCGTTTCATTATGCTTGAATAATTGTGAGTGGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCT:1 - chr3L 2422872 5' - hopper 1094 1 63.01 AGCCGATTCGATCTGGCCATGTCGGTCTGGCCGTCCAACCATATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAT:1 - chr2L 21256473 5' + INE-1 148 1 89.04 GGTCCTCTCCCCGTCCTGGGAAGCCATATCATATGCCACTTGGGGAAGGGAGAGTACCGAATTAGAAATGAAAATTAAGTAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr3L 22594117 5' + 297 1 2 75.93 ATTGCTCACACAGTGGGTTAAGAATGATTGGAAATGGGAAAAGGATATGAACTGTTATAAACTAGCTAAATAATAAGAAAACCACATTTATTTAGTTACACATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2L 6601419 5' - roo 389 2 43.15 GTCCTCGGACGAAATCCGAACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2L 3231960 5' - roo 9005 2 62.33 ATTGCTACGCCACAAGGCTAGCAATATAACTAAGGGCTCAGCATTCCTTGTGGCGCAGCGCAACACTCCAAATGGGAAGTGTCTGATTTCCAGCACCGAACGGTCTCAGCACAGAGCGCTGAACCAAAGATCCTAGAATAACAAGA:1 - chrX 3428593 5' + 1360 1 2 50.00 AGTCTGGCTAATTGAGGAATACTTTTATGTAAGTGCTTTGGAGATACACTCCGTAATAGGTTTGTAATAGGGTTCAATCTAAGCAAATTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTA:1 - 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roo 397 1 71.23 CACGGTGCAGCTGCCGTGGCAGCATCATTAGCTCTGATTTGCCATGTGCACATGAACTGGCTACATACATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chr3R 12609292 5' + 297 13 2 67.54 TCTGGCCTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCACGATATCTGCA:1 - chr3L 21910486 5' + pogo 34 1 59.70 ACAATAAGATTGAGATTCAGAAAATAAGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:2 + chr3R 7507132 5' + Doc 58 1 58.22 ATGAAACAGGAGGTGCAGAGCGTGATTAGCGAGGATGTTTATGTTTACATTAGGGCAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAAAATTGGGGGTCTTATGGAATACTTGAATTTATGACTTATATCCTAAGACATTCTATGATTTGGTG:1 - chr3R 20327158 5' - Quasimodo 80 2 76.71 AGGGTTAATGACTTAACTACAGCATTTCATTCCAGACTTGCTTACCTTTGCTTTCTGTAGTCCCATGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGA:1 - chr3R 7055162 5' + invader4 215 2 55.48 CTTGAATATGTTTATCAACCGTATAGTTATGCTACGTAAGATATAAAAATTGTAGACACACTCTGATTAATATATTGACTTGAACAACATTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATAT:1 + chr3R 14104843 5' - P-element 2611 1 60.96 ATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 - chr2L 12291921 5' + Tirant 65 2 72.87 GGTGAGATTTGCGTGGGAAAAGCATAACTTTGGTTGGCTTTCGAGTTATAACTCGTACACGAGGAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAAT:1 - chrX 12277521 5' - jockey 4864 1 56.16 AATAATTCAAATGGAATGCCAGCTTCAGCTTCAGATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCATGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAG:1 + chrX 8219392 5' - opus 414 2 76.03 TGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATT:1 - chr3R 19436114 5' - roo 374 1 60.96 GAGGCTCGTGTTGCAAAAAACCGGAAAGCAAGAAGCCGAAGCTCAATGTTGAAACATTTGTTTAGTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chrX 21403497 5' + roo 8718 2 56.16 ATTTGCAAAGTGTTTGACTTAACGGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACACATCATCG:1 - 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Transpac 293 2 70.55 ACTAGCACTCCCGATCCGATCAGGTAAGTCTCAGTCCATACAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTG:1 - chrX 18220663 5' + Burdock 6212 2 72.60 CTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGT:1 - chr3R 24454869 5' + F-element 297 1 60.96 GGGGCCGGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr3L 3453578 5' + Tirant 8144 2 60.84 GGGGGAGTCGTATATTAATAAGATTATGGCGATTTATTAATAATATGCTGGCGATTTAAGGTTTCTAAAAATAAATTACTAAACACAAAGAAAAAGGCCAATAATAATGACACTTAAAAAGTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCC:1 - chr3L 457207 5' + Ivk 307 1 74.66 GAGAGCTGGCCCAACCCTCACCCATGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:2 + chr3R 28406330 5' - opus 459 2 56.16 ACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTC:1 + chr2L 18630468 5' + G-element 42 1 57.02 TCTGTGATTGTTTACAATAGTGTGTGGTTGGGAAGTTGTGGGTGTAGAATGGACATGTTACTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTG:1 + chrX 22252743 5' + flea 4805 2 56.12 GTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCT:1 + chr2R 5070935 5' + Tirant 16 2 30.83 TGGGTGCAGTTGATTCGGAGTTATATGGGTTAAATGCTATCAGCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 + chr2L 4929759 5' + blood 17 2 73.05 CAGCACGTTACAGCATTCCAACAGGGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCT:1 + chr3L 19999202 5' + 1360 51 1 72.12 GCCCAGCTTATCTCTTTTGGCCCAAAAAGTCGCCAAATGAAATGAAATAAAGACAACTGCATATTGGCCAAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - 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mdg1 365 2 66.40 AAGTACAAATTCTTGGCTCGACGACATATTTTAAACAACGGGAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 2330201 5' - roo 9028 1 54.48 CCCAGCGACACCGTGATTCTTTGGCTTGGTGCAACATGGAAGTTTTCTAGTCGTACTCTTGGTAGCACGCGTTGTCAAAGGTTTTTGGGTGGTAGTCTTGCCGATTGGAGGCTTACTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCA:1 - chr3L 7451760 5' + 17.6 286 2 76.03 GGCGTCTGTCTATCCCAGAATTTTTCCCCATAAATTGATGGCAGCTTAGGGACTTATTTTACGTGGGCCACCAAACACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTAGGGTTCAGGG:1 + chrX 10176733 5' - baggins 5324 1 53.57 GAAGTATAACTACCCTTGCGGTAATCATTTGTTGATGTGCATACAAAAAACTAAAATGTAAATTCAGAGACAAATATCTTTTCGATTATTTGTAAGCTTATTCGTTGAGAATGATGTTGAGAATCCCGACTTGATAAGTCGGCTTA:1 + chr2L 17076294 5' + Cr1a 4079 1 58.22 AAATAAACCAAAAGCAACACTCCATGACAACCAGAAAATCAAACTCAGCAGGCAACGCAGGAAAAACAAATCCCATCCACAGTTTACACGTAACCAATTACCATGTTTATAGTCATGAGTGTTGCTTTTGGTTTATTTGTTAATTT:1 - chr2L 15066635 5' - HeT-A 314 1 76.03 ATGAACAATATTTGAAATAAAACATCTATTTTATAGAATAGAAGTTTTAGAATCCGACTTATGACAAATATTATAATATAGTAATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAG:1 + chr3L 23346816 5' - 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Stalker2 7586 2 59.59 ATTTTGACATTTCAAGTTTAATTCTTGTCACTAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:2 + chr3L 17921932 5' - copia 204 2 52.05 ATAGATACTCTAATTAAAAAATGATTTTGCACCTGTTAGACCTATTATGAAATCGTCCACATTAAAAGACACTGACCAAAAATCTCAGATTATGTTTAACATTGTTATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAT:1 + chr4 102828 5' + pogo 2022 1 60.96 CAAAATGTTTAGTCGATTTCGTGTATTAATTATGTTCACTAATCGTAGAAACATATGTGTGAAAAATGTATTGATACTCCTTCATTAACCTATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 + chr3L 18381913 5' - copia 225 1 53.42 ATGCAAGCCATGGCAACACCATCAATCCGTTTTGGGCCAAGAATTTTATATATACATGTTCATCCTGCTAAAGTTGAGTTCTCCATTTGCGGGTCCTATATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGATGGTCCAAACCAGC:1 + chr3R 9300699 5' + 297 6589 2 75.34 AAATAAAATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAAT:1 + chrX 17446519 5' + gypsy11 98 2 71.92 GTATAAATCAATAACTTCATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAAC:1 + chr2L 16857881 5' + P-element 104 1 16.44 CCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chr2L 14239159 5' + 412 80 2 71.53 GAGTCCCGATAGAAGAGCAAGTATGGTGCCCATTCAAACCATCGATCATTGAGTAGGTCAATCCAACTCTCGCCAGTTATTTTGTTTCTTTCCAACAGCTGAGCAGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGT:1 - chr3L 12191846 5' - F-element 4386 1 72.41 CCTCGGCATAAACCCCACCAACACTCGCACTCACTTGGCGGATGTGAGTGAGTGAGCGAGAGAGTGAACCAGAAATACCTAACCGACACTTGGCATTGTAATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCC:1 + chr3L 12223244 5' - Transpac 306 2 71.92 CTAATGGCGAGAAATTTGTTGAGTTGGATTTTTATTTGCGCAGCTAGCTCACTTGTGTTTTCAGTTTTCATTTATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 7486953 5' - Porto1 171 1 77.65 AGAAAGTGTTACAATTGTACTTGTTTATACTTTATACTTGTTTATTTTGGTATATATATCGTTGCGGCCACCTCTCGCCTCCTCTTTCACCCTTCCTTTATTGCCGCGTCTCTTTCGCTGTTTTTTTTTTATTATTTAT:1 + chr2R 9275325 5' - BS 5096 1 55.40 TGAAAAATCGCGAAAAGCAACAATAAAAGTGACCTGGCCAACGTATCTAAAATGCACTAAAACATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGATAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 + chr2R 19198307 5' + FB 49 1 53.68 AAATGGCTGTTGGCTGGCCGTGGTGAGTATTTGCCGCAGTTTAACAGGCCTGAAATTTGGATTTCCAAATCACCCTTACCAAGAGAATGTCCGTTTTGAGGTGCACTTTGTCCAACTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTACA:1 - chr3R 9340827 5' - invader2 4689 1 77.40 TAGTAGCTTTGAGCTATATTGTAATATAAACTTAAATGCAATTTGATAGATATATATAACTATATATATATAGCTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 - chr2L 16562168 5' - opus 7470 2 52.59 TGCAGCTCCAGATTAGAAAGCTTAAGTCCCTGGTAAGAACACACATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGTAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3R 18205763 5' + 412 15 2 71.23 GAATTGTTTTTATTTGACTTTTGTGTATATATTTTGTTAACAAGAACAATACTTCATGAAAGTTAGTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAA:1 + chr2R 19725996 5' + Juan 4083 1 58.90 AACTCATTGTGTTTATGGCATAAATTTGCATGTTTTGCACGTAAATTTTTCAATTTGAATGGGCGCTGAAATGTACACGGGGCACTTATGTTTGAAAACTCTGAGAAAGCAGACGCGTGAATATGTCGCAACCGAGGAAGTGTACG:1 - chr2L 4167958 5' + invader6 318 2 54.79 TTTATTTCAAACAGATATTAGTCCAGATTATTATAATTTTCTTTTGCACTTGCCTGCTGTGAAACCCTAAAAGTGAGCCAAGAAAACTTCTTTCATAGTTCTGCTTCTCACTAAATTAAAGTACACCCCAACAGCCTAGC:1 + chrX 7446142 5' + jockey 4668 1 55.71 CAGAACACAAACTATGAATGAAACTAACCATGTGCTTGATCGTCGTATTTGTAAATTAAAGCTAATGACTTGTACAAAAACCATAGAAAAAGAGACCTTTGGCATTTTATTTAATAACTGTAATAGGAAAATGATTAAATCTAATT:1 + chr3R 8925730 5' - Bari1 338 1 64.38 AAGTAAGCTGAATTTATACTGCATTAAGGTACTTCTCAAATCAAATTTCCTATAAATTGTTTCGGTGTCTGGCTAAATTTGGTGTTTTTTTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAA:1 - chr2L 15070306 5' - Doc 4645 1 63.01 AAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTCTGTT:1 + chr3R 7616739 5' - Stalker2 364 2 55.56 GCTTGGGTTCATTCAACTGTCAAAAAAGCACTATACACACACGTGGAAAGGGGCAGAGATAGACAAATAAAAAGAGAGAGGAATAAACAAGATCGAAGCGCACGACGTGCATACATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAA:1 - chr3R 6410309 5' + Cr1a 155 1 78.77 TTGTGCGTTTAACACTCACCACCCACCGCATAGGCCGCAGAGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACGTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2L 12486456 5' + roo 17 2 66.67 TATTATTTCACATATTTTTGAGATATTCAATATTGTTGATATAATTATAGTTTATTCTCTAAGAGTTTCTCTCACTTTTCACGCTGCCATCTCTGTGTATAGGTAGCCCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 - chr3R 24499642 5' - blood 7376 2 74.66 GCAAATGTGCTCGTCGTGCCATCTCTTTCTGCCCATGTGGCCCCATCTCTTTCTCCGCACAGTGTGCGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2L 16615747 5' + hobo 40 1 54.62 AATTGTTTCTGTCGACTGTGGAATCGTGCAAGCACCGGCGACCCATCAATTTAATGGCATTTTCGCGTGAAGCGCGCCAAAAACCAAAATAAATAAAATTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTC:1 - chr3R 24482111 5' - jockey 31 1 72.59 ATTCTCACAGTGCCAAATTGACAACTAACCACCAACCCATTTAAATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chrX 7756367 5' - roo 9026 1 49.32 GCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAA:1 - chr3R 15790120 5' + flea 4735 1 67.12 AGGAAGGTTGATTGCAAACGCCAGAACAACACACACACCCACACGCAGGAAGGGGAGAGCAATCATCGGCATTCGAGCAAGTCGCAAGTGTGTGTGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chr2R 8665989 5' - P-element 2863 1 64.38 TGAGAAGCAATCGACTTGGGGATACCATAGAATTTCGAAATTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTA:1 + chr3L 4081593 5' + mdg1 7111 2 73.19 AAGAAAGTTGTTATGTATGTTCGATAAATTGTTTGCTAGTGCATTGATGTGTAAAGAAATCATAGGATATTTAAGCATTTATTACATTAGTTTAAATATTTGTTGTTTTATAATATTGCTACATGTTGGCCAAACGTTTTTTGTTT:2 + chr3R 21898513 5' - FB 343 1 57.53 ATTTTTATTATTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGATCAATAGCCATGTCTGTCTGACCGTATGAGCGTCGAGATCTCAGGAAGTATAAAAGCTTGAAG:1 + chrX 22963255 5' + INE-1 155 1 44.44 AGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAC:1 + chr2L 18112474 5' - transib2 2781 1 54.79 CTTTTTTTGTGAGTTAATGTTTTCTCCCAGTATCTCAGTCTCAATTGACATAGAAATTCGTTTGCATTTCTCTTTCAACTAATTCATCAGTACACAACATACTTAGTTACATAATGGCGCCCAACAAAAAAGAAGAAAAAAAAAAC:1 + chr3L 19218581 5' + gypsy7 5006 1 72.60 AACCAATAATAAACAAATGTATTACAGGAATATTAAATCAAATACCAACAGAATGCAGATATTCAAAAACACATAACAATATTGGAATAACTTATGTAGAACCAAACATTTAAAACTAAAGTACAATTTCACATTCAGATATTTAT:1 - chr4 816222 5' - gypsy9 210 2 74.66 ATTGTACTAATTTTATATTTTATCTTAATCCTACATCGTTCATGGTTTTATAATAGTTATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 + chr2L 16562075 5' + opus 7058 4 61.38 GTACGTGCTTTTTACGACACCCACTGTGGCGTCAATTATAAAGATATTTAAGTACAGTTAGCATGCAATTAGACGGAGTTGACTGTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATAC:1 + chr3L 7939009 5' + R1A1-element 5333 1 60.69 CGAGTTGTGTGTGCACGAAGTAGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCATGAGACATCCACTTAACGTATGCTGGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTGTGAGTTAGACAGC:1 + chr3R 31724893 5' - P-element 2787 1 17.12 TTCGTATCGAGCATTAACATTCTTATGCCTAATAAACACAGCCATTATTATCAATTTATTTATTTAACCATTAATGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 13293464 5' + roo 30 2 62.79 CTTATTGACATTTCTAGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr3R 16276317 5' + pogo 51 1 57.53 CTGATGAAAACACCAAAATTATTTTTGAAAAGGACTCGAAAATCACAAGTGCAGACGTAAAACACGCACACTTATATGATGGTTGGGCTTGGGCTTGAATTTTGCACCTAAACTTCGATATTAACTGGAGCTTTGTTAAAAACACG:1 + chr2R 21158140 5' - Porto1 25 1 51.37 GGTCTATCTATCTACAAATGTACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTAAAACGTTGTAAAAAGATATATACAATCCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTTAAAT:2 - chr2L 22750383 5' - Tc3 1619 1 77.40 TTTCACTTAGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAA:1 - chr3R 13225561 5' - hobo 2859 1 69.86 TGTTGCATGTGGTGCCGATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGTCTACATACATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr3R 18635211 5' - opus 461 2 61.21 AAAATCAATTGTCAGCAGGAAGGTTGATTGCAAACGCCAGAACAACACACACACCCACACGCAGGAAGGGGAGAGCAATCATCGGCATTCGAGCAAGTCGCAAGTGTGTGTGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr2R 8665973 5' + P-element 7 2 75.86 GAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGGAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAA:1 - chr3R 7616826 5' + Stalker2 59 2 61.64 CTCATCTGTTCGCCGTCTGTCTGATTATTATTAGTTTTTTTCTCAATTCGTTTGTTACCTCACAAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACGGACACAAGCACTCAACA:1 - chr3R 10149726 5' - 1360 460 1 58.62 TTCGACTCTTAGATTCGACTTAAACATTTCGGTGGCAATCAAATCGTATCGCGCTTTTCCGAATTAGTTCTTTGTTTTTTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCA:1 - chr2R 22386616 5' + invader2 4968 2 52.82 GCGTTAGAGTGGGCGTGGAAACATGGGGTTTGTCTCTATAATCTGTATGCTTAATCTCAACATTCTAGCATTTTAGTTCCTGAGATCTTGACGTTCTTACGGACAGACGGACATGGGTAGATCGACTAGGCTATTGGTCCTGATCA:2 - chr4 71481 5' - INE-1 91 1 66.44 CAGACAATGGCTAGTGCCTCAACTGCTATATACAAACACAAATATGTACACTGAAAACATATGTATGTATGAATGAATGCGCTGTTGCTGTACCATTTTCGGAAGCAAAACACCGGTGTAATCTACCTATGACTACTTTCCTTAAG:1 + chrX 22820909 5' - Gypsy12A_LTR 1941 1 70.55 AAAATCTGAAAATGGCTGGAGCAGCAATGATATGAAGTAAATAAAGTTGAGAGTGTGTGGGCACTGAGAAAAAATTATTTAAAGGAGCAATAAGCTAATAAGCTTTTAATCTAACAACGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCG:1 - chr3R 28259421 5' - INE-1 506 1 77.40 GAGCATAAAGCACATATTTACTAAAAGTTTTTTTTTTGGTTTTTT:1 - chrX 7169641 5' - HMS-Beagle2 491 1 75.56 GTTCAATAAATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr3L 16059357 5' + 297 48 2 59.72 AATTCCATTAAATCCTGTTAAATTAAATTCCTCTAACACGAACTGCCTTAAGCATGCAATTATTAAAAGTTAATCCCCAGCTGATTTTATTGCACTCGTTTCCCGAGGGTTTTAAAAGTTTTTTATTAATCAAAAACTTAAGCGA:1 - chr3R 29953883 5' - Quasimodo 7322 2 45.52 CAATTAATTAGGATTTAGGGATGCGTACGGTAGCTTCAATATGTTGATACAAAATATATTAAGCATTATTATAAAGACTCGACTAAATAACATAAGAGTACGCTATAGTCCAGTTCCCCGACTATTAGATACCCG:1 - chr2R 5950004 5' - INE-1 555 1 48.15 GCAACAATCCCCTCCAATTTAAATGGTCCAACCTAACCAATTGATCCACTCATCAATTGAGCTGAATAGCTAATAAAGCCAAATTTTTTCCAATCAACCCAGAGACACAATTAAAATTATGTTTACATTTAAGAACCTATGTACTC:1 + chr3L 15470968 5' + Tirant 199 2 76.03 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAG:1 + chr3L 25232765 5' - accord2 178 2 50.00 GAGTCTATCAGAATCCGTGGTTCTTTAGTGAGTAGTAGCTGTTCATGTTTTTATTTTTTAGTAGGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGACTCGCGTAAGCGACTTCGCG:1 + chr2L 76064 5' - Doc2-element 4581 1 58.18 GGCCCGCTCGCCATCACCCATACGCCGTGTGGTACCAGTACCAGCAGTAACAACACGGCAAATGGCAAATACAGTAAAGCTTCACACTGAGTGTACACTACTACATACCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAAACTTGTCGG:1 + chr2L 9564507 5' - G4 3715 1 66.44 GCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTATT:1 + chr3R 10736026 5' - McClintock 419 2 60.96 GAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCC:2 + chrX 388216 5' + 1360 43 1 56.85 GCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACTCATTCGCAAGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATC:1 + chr3R 7885612 5' + jockey 96 1 77.40 AATGCGTAGATCTGAAAACATCGCCCCGTATTTATAAGGCGTCAGAATTTTTGTTCTACAAAAATTTAGCCGCCAATTTCAACTCAGACAAGTGTCATTTATTTTCTTAGCTTTGGGGCTAGAGCTGAGACTGGC:1 - chr3R 6488727 5' - Ivk 231 1 77.78 CGTACTTGCTTAGTTGTAATTAGGTATTTACCCATTTGCCACAATGCGTACACGTAATTTTGAAAAATCGTATAGTTAATCTTTAATAAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTATTGCCCAGTAAGTACTCTATGCATAACATGTTTT:1 + chr3R 21924266 5' - G4 3734 1 56.16 GGCAGGGGCTCTCCCGGGAAACTGGGCACTGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2R 25106104 5' - roo 8988 2 77.14 GAGAAACGGGGATGTGCTGCGTCATTAGGAATGCCTCGGGCACCTGCTAAACACGCTAACTGCTTTGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3L 8658826 5' + roo 8681 2 66.36 CCTGGCTTAAGTATCGCGGTCATTTGGATAATATATCAAATAACATGTTCATTGGGGCAACAAATGCCGAAAACAATGAAATGATATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTT:1 + chr3R 11139050 5' + 1731 4458 2 57.53 ATCAATCCGTTTTGGGCCAAGAATTTTATATATATACATGTTCATCCTGCTAAAGTTGAGTTCTCCATTTGCGGGTCCTATATATATATATATATATATAGAGACGTATTTGGATGGTCCAAACCAGCC:1 + chr3R 9300719 5' + 297 6590 2 72.09 AGCCGTGCCCAGTCGAGCCGCTCTTAATCCAATTAAAGTATGGATTTATGAACTACTGTAATAATATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCT:1 + chr3R 30264014 5' - blood 7323 1 60.28 GCAAGTAACATCATGACTGACGTGAAAAACGATTGGAAAACTATCTTTCTCTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGG:1 + chr3L 18484380 5' - hopper2 1541 1 60.27 ACACTTTCGCCCTGGGAGAAATGGTGAAAGTGGACGGGGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGATTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACG:1 - chr2L 5460197 5' - Doc 302 1 71.64 TTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCACTATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGTCAGCCCTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 + chr2L 14969120 5' + 412 7131 2 75.38 ATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCA:1 - chr3L 21093224 5' + Ivk 59 1 64.18 GAGATCGAAGAAAATCGTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 7652165 5' + roo 8699 2 54.79 TACTGTGGAACATAGTTTTAAACCGATATATAACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGG:1 + chr3R 18528264 5' - roo 9018 2 52.74 ATAGTCATGTCAGCTGCCTATAAATAACCCCAGCCTGACATCAAATAATCATGAAGGTGTCAGCTTTGACTACATTTAGAAACTGTAATTGTTTTAAAAAATGTGACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAAC:1 + chr3R 14911922 5' - Stalker4 7325 2 56.85 CTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACC:1 + chr2R 12065609 5' + Stalker2 89 2 77.40 GGAGTGGTTGCAACTTGACTTTCCCTCTTTCCCCTTTAGGTTAACCTCTCTATTCCCCGACAACTGAGATATTCGTGTTCTTAGCAGCATTAGCATCTCAAACAAGGTGTAAAACCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTCAGTTT:1 - chr2L 1776229 5' - roo 9054 2 73.29 AAGCGATAGTAAATCACTTAGAATCCAGAGGAAAATGCTGGAAAAGATGTGGGCTGGTAGTTTGAATAGAATGGGTATTGTGTTCCTTGGAAATATATGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAAAGGACAAGTTGGTATTGAAT:1 + chr2L 3535796 5' - I-element 4996 1 58.22 GCTGTATTTTGCCAGGCGAAATTGAACTGTGCCATTGGCAGGCCCAGGAGGGCTTTATAAGTTTTGTGCATTGCTGTTTTTGGATTTTCCTCGACCTTCTCTTTTACCTTTTTTTTTT:1 - chr3L 19406696 5' - Bica 342 2 50.00 ATACTCGCTGCCATCCGAACCGAACTGAAGTCCAAGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAAC:1 + chr3R 25050322 5' + P-element 110 1 29.50 ATAGGATTAGCATTGGCCGACACAAAACATGGACATCGACATCGAGAAATCGCTTAATTAAGTTAATCAAAATATGGCGATTATGGGGCTAGTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATA:1 - chr2L 1260505 5' + 412 7386 2 63.01 TATATTCGCGACTATTGGATGTACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTAGACACCATTAGCTTCCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCAA:1 - chr2R 6164608 5' + Tc1-2 51 1 59.59 GAAATATTTGCAGCACGTTACAGCATTCCAACAGGGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr3L 19999192 5' + 1360 63 1 69.05 CCGCTTTCCGTGTTTTATGAATATTTTTCTCCACTCTGCTTGCAAGTGGCTTGACTTTTGGACCGCAGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATATGGATTCGGCATTCCACAGTCTTC:1 - chr2L 21910285 5' + Doc 3 1 80.60 GGCCAAAGGTGTAGGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAAGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 + chr2L 22319261 5' + Transpac 56 2 55.86 TAAATTGAATAAATTAGGGATATTGTGATCATGGACATTTTGCAACATTTTTGTAGAACAACAAACAAACCTAATACTAAAAGTAAGACCATTGTTAAAATAAATCTTACGAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTCATTT:1 + chr3R 14379511 5' - Tc3 1626 1 71.23 CTAATTGAGTTTGGTTATGTCTCCATTACTGCAAGTTGTTTTCATTTTCATTTTTATGGCGGAACCTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - 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BS 5049 1 50.37 AAAGGACTTAAAAAAAAAACTAATACATTTACTCAAATTTGGTATATAGAATAAGTTAACATATTTTTATTATCTAACTAGCCAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTTTACCAA:1 - chr3R 6816807 5' + Juan 431 1 56.85 TCAATATGAAACTATCTACCTGCATCGTTCTGGTTCCTAGAATTGTTATTTGAATTCCAATTATTATTTTATCCAAAGTTCCCGTTTGGCGGCCAATTGTTATATTATCGCCTTGTATATTGCAATTTTATTATGTAATTCTAGTT:1 - chr2R 3515255 5' - Porto1 4216 1 69.18 ATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 - chr3R 12363785 5' + jockey 4762 1 74.66 AATATGGCAAATCAATGGTTTTTTCCAATTCGCTGGGTCTATGCAAAAAGCAATAAATAACAACAACAACTAGAAATAAAGCAAAGCATAATTGATTTTAAATCCCGGCTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCT:1 - chr2L 3197085 5' + R1A1-element 5192 1 73.97 AGTTGGAGGTGAGCCTAGGAATACAGCGAGTGGAAAGTCCCAGGAAAGAGATCAATCCAGAGGTAAAACTAAAGAAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCA:1 + chr3L 5585191 5' + roo 8797 2 50.00 ATGCATAATGCAATATGCATACCATTACATAAGCTTGCCTAAGTGCAAGTTTTCTCTTCTCCTCTTTGCTCAGACATCAGGTGTACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr3R 1267800 5' - P-element 2851 1 62.50 ATAAGTTTTAGAGCCGGCACCCATGGGGATTTGGTTACCTTGTGACCCGAATGGGGGTTGGCAACACGAAATAATGTAGGTGAAAATTGCAGAAAGGGCAAACAGCTCAAACAATTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAG:1 - chrX 11256393 5' + HB 24 1 75.34 ATATGCAAAAATGGCTGGGCATGATGGCCATTAAAGGAGCAGCTGGAGACTTGGCCCTGCGCCAATTAGAAGTACTTTTCAAGGTTATAGTGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTAT:1 - chr2L 4637322 5' + mdg1 7083 2 63.70 TATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGC:1 - chr3R 21395231 5' + G2 434 1 57.14 AGGTAATTTCATACTATATCACATAATCATTTAAAGTTTGTTAAAATATGTAAGGTCTATGAAAAATGTAGTAGTAGTAGCCTCAAATATGTAAACATCCCTAATTTTTTGTACATTATTCCATTTTTTAAATAAAATATTTTTAA:1 + chr2L 18603508 5' + hopper 165 1 80.14 GCAGCTCCAGATTAGAAAGCTTAAGTCCCTGGTAAGAACACACATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr3R 18205762 5' + 412 12 2 73.94 GTCGGGGTCGCGGCCATAAAAGTAATCATTTGTCATTGTCAAACGTTGTGCACGCTGCAGCCAATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTACCACATTTTATATTTCAACATC:1 - 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chr2R 12819343 5' - R1A1-element 5223 1 55.48 GCATCATTTCCAGAATTTTTACTGACACGATAATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTGTATTGTTGCAATTTCTTGG:1 - chrX 22945369 5' + BS 58 1 53.42 TTTCTCTGGTCCTAAAGTTTAACACTCATACGCAGGGTGGCCTTTGCTTAAATACTCATCGCTTAAGCAGTTAATACATATGGCATTATTTTTTTTGGGATATCGAAGGATATTGGGAAATAAAATGAGAAAAAAGTTTAAAA:1 + chrX 6140273 5' - INE-1 471 1 52.45 GGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGATTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGGCTGCACTCAATGAGA:1 + chr2R 18689150 5' - Burdock 190 2 62.24 TATTTATATAACGAAATATAAGAATAAGGAACGAAATATTTGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAA:1 + chr2R 5503687 5' - pogo 2024 1 69.86 CAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTT:1 + chr3L 14375622 5' - roo 351 2 59.42 AGAAGAGTAAGTAGCCAAGGTCGGAAACTGGGTTGGTTATTTGAATTTGTTGACTGTGATCCGTGGTGAATATTAGAAACAATGAAGCGAAAATAATGGACAGCCCTATTGGAGTTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTTCGC:1 - 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chr3L 2330158 5' - roo 320 2 75.34 GATGTTAAGTTGTTTGTTTGTTGTGGGCACTTCGGAATCGACCCTGTTTGGATTACTGATAATACCAATCAAAAATATTAAGACAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAAGGCAAGTATCCATAAAAACTTAGGAATCCCC:1 + chr2L 18799800 5' + G4 3554 1 57.53 GCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAAACT:1 - chr2L 12291917 5' + Tirant 35 2 65.26 GGGGATTTATTCGTCATAAGTTGCATGGAATTTGGCCATTACTTAGCCGACCAAAACGTACCTGAATAAAATTCGGGTTCTTCAGGCAAAAACTCTGAGGAAGATTACAGGCTCTCCGTGGTACATGAGGATCAGAGATATCGAAC:1 + chr2R 6110574 5' + jockey2 3009 1 65.75 AAAACGTTTAATAGCTTTGTGTTTTTCACTCCATCTCGTTTCACAAAGCTTGGATATATTGGGAATTATCTTCCTCCTCATAACTGTTCATGGGCTAAAAATAGAAGCATTGAACTGATCCTTGTCTGTTGTCAAAAGTATTTACA:1 + chr3R 4568819 5' + Bari2 68 2 57.53 GCCGGGTGTGACATGGCCAACCACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chrX 16117129 5' + opus 23 2 65.75 CTTATAGCGACTAGCAAATGCACATGACCTCAGTTGCCTCTGATTCAGGTTATTCGTATAGAACGCTCGATTACATTGGTGACTCAATTGTGCATAATATGTATGCATAATCTCTACCTTCTTGCTTTTATAGTTCCT:1 + chr2R 7709715 5' - INE-1 156 1 66.67 ATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chr3R 28406359 5' - opus 466 2 60.00 GTGCGTGCGTGTCCCTGTCAAAGTGTTGGTAACTGAGTGGTTGCTTATGTGTGCGTGTGTTTCTGAGTGCGTGTGTTTGTGTGTGGCGACCAGAGACCTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr2R 23671749 5' + hobo 27 1 52.90 CAGTCCAGAGGTCTTCCTTCTTATTATTGGTAGTCGGCCTATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1 - chr2R 1243239 5' - mdg1 346 2 69.93 TTGCACTCTCCGCCGAAAACAAATGAAAACTATTTTAAGCCGATTGTCTGTCGAGTGGCAGGCCGGTGTGACTGAAACTTTGTCGGGACACTGAGAAAATATAAATGGGTAAACGGTAGCTAAT:1 - chr3L 15675401 5' + 1360 2971 1 76.61 GCCTGCGAAAGGAATACAAATTAACGTAATGTAATTTGACACTTTTGCCTGTCAAATTCAAGTGAAACTTTTCCAATCGTTTAATGAATTGCAAAAAGAGACGAGAACTCGTAAAAGTGTGTGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTC:1 - chr2L 15795622 5' - 1360 3199 1 63.70 ATATATTTATGGCCGCAATTAAAGGTAAATGTCTTTGGTGGGCCACCTGAAAGTAGGCAGCACATTTTAATGAGCCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr3R 25795881 5' + jockey 23 1 71.92 CTACATTTTGTTATTGTTAAATATGCTACGGTTTGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 - chr3L 2216599 5' + jockey 93 1 75.00 ATGCCACCTATGTATGTGCATGAGGATGACCTTTCACAAGTGCAAGTAACATCATGACTGACGTGAAAAACGATTGGAAAACTATCTTTCTCTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCA:1 + chr3L 18484339 5' - hopper 1389 1 68.49 CATGTCATTGGTCGCAGGTTGGTAAGCGTAAGTATCTTTTCATGCCGATGGATGTGGAATTTTATAACCCCGGGACGGGCGTTTGGCGCTGC:1 + chr3R 16870231 5' - Doc 461 1 73.91 TGGCTCTTAACGCTACCCTGATAAGCGTTTGAACACCTTAACCCATAAATATTTGACAGGGCACTGTTTATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTCTTTT:1 + chr3L 12835985 5' - 1360 3342 1 51.43 CTGCATACATATGTATATGTATAAATAAAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGTGTAATAGGTTCAAGGTTATACGGTATTTAGGTAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCT:1 - chr3L 17307313 5' - Stalker3T 313 1 56.16 AGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTC:1 - 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roo 329 2 73.97 ACGTAACATTTATGGGTATTTAAATGTATATTTTGAAAACACTTCTTTATTTTCAGTTTAACTAAACTTTTAAATGCAACTTAGATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3L 4651685 5' + roo 35 2 54.79 ATTCAGACGCAAGCTTTTCCAGCTCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCC:1 + chr2L 4420490 5' + gypsy5 6943 2 74.23 ATAGTAAAAATTTTAAAAATTCTGAATTCGAAACAAATAATTTCATACAGTTTTCTGAAAAGCTTTTAAAGTTGATCAATATATTGTTACCGTTAAAATTTTTATAAAAAGATATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1 + chr2L 7822162 5' + Juan 9 1 78.77 AAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 - chr3R 30264088 5' + blood 7090 2 72.92 CACCCACCGCATAGGCCGCAGAGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2L 12486437 5' + roo 8711 2 52.74 AAATAAATTGAAATATTCATATACCAGAGCTGAGCAGAAGATGTTCAATTAAGATCTAATACGTGGGTGTGAAATTTATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTAT:1 + chr3R 16538340 5' + G2 2626 1 55.48 CTAACGCTCAAACTGCAGGACTCCCTGGACCAATACGAACGTTACACAGAAACGCCGCTGCACACCAACTTCTTTAAGTTGATGGTTCGCGATGTTGTCAATTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 + chr3R 8826831 5' - jockey 4971 1 77.69 CGCTTGATTTTTTGAATATATTGTTTTCAAATGCACGGCGAACAATAAGATTGAGATTCAGAAAATAAGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 + chr3R 7507091 5' + Doc 17 1 73.29 AAATGTTGTAATGTAATAATATTATATATACCCCTTGATAGAGCATTGAAAGAAAAAGCATGCCAAATATCCCCACAGTTGCCATTCCTGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAG:1 + chr3R 26846711 5' - hopper 1385 1 63.70 ATGCCATTTAAAAATTTTGAGGTATGCAAGAAATTCTTGCACAATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chr2R 23409129 5' - opus 463 2 60.19 TAATGTGTTTAAAATATTTCGAATTAAGCCGCTTTGTATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAAT:1 - chr2R 11095816 5' - diver 140 2 74.66 CACAAAATAAATATAACGAAAATTACATTTATACATTCAACTTCAAGTTTTGCTAAACGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 - chr3R 6422915 5' + jockey 72 1 58.22 AATATCGATGATCATATAGTAATCTTAAAAGCAGCAATATTATAAAAAGTAATAGAATTTAAATCATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAG:1 - chr3L 5630451 5' + I-element 62 1 56.85 CTGACATTTCTCTTTCACGGCATTCTTTTCAGTCGCGCAGTTCTAATGACCTATCATCAAATTGTAATTACTGCAGTCAGAATAAATGACATTTTGAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 12379661 5' - roo 9047 1 68.49 AATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAG:1 + chr2R 17544156 5' + gypsy5 65 2 63.77 CTGCGACGAGGTTTTAATGTTCGTTTTGGCCAAAGAAATGCGACGAACATTAAAAAAAAATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr2R 13686339 5' + 297 28 2 60.48 ATATTCTGCGAATATTTGCAGCCATAAATAATGGACCAAAAATTGGAATGTAAAAAACAAGCATTCTTGCTCAACGAAGCAAAAGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3L 2320738 5' - roo 9036 1 62.33 GTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 10469541 5' + roo 53 2 72.73 TATATCATGTTTGCATTTAAATACGTTTATATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3L 12433446 5' - roo 318 2 80.82 TAACAAAACAAAATATTTAAAATCCCAAAAGTGTTCGGCAAAAAAATTTAACCTTCTCTTTGTAATGTCGATATAAAGTCGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAG:1 - chr4 1147705 5' - Doc 267 1 55.48 TGGGCGGAGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTCCTATGCGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTATGACGTTATCACTGATGACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAA:1 - chr3L 5498517 5' + Doc2-element 249 1 63.45 AATACTCAAACAATTCTTCCATATGTAAAAAAAAATGCCACAAAATTGATTTATTTCTATTTCCATCCACAAATAAATTACTTCAATTTTGTGCTTCAATTCAATTGTTATTCAATTCGATTGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 + chr3L 26741161 5' + F-element 24 1 63.01 TTGTATTTGGTATTTTTTTAATTATCGGACCTTACTTATCTAATCTAACCATAATTATTCCCAGAGTTTTAAATAACAAGTAAACACTCCGAGCTGCAATTTGTATTACTTATTATATGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTA:1 - chr2L 1361089 5' + Stalker2 7249 2 72.60 ACTGTCGCCACATTAATAAATCAGTTTAATTTAATTCAGTTGACAGCTTTAAGTCAATATTGTTGATTAATTGTTTTCAGTACCACTTCAACCCCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 - chr3L 11396026 5' + I-element 48 1 53.42 TAGCACTCCCGATCCGATCAGGTAAGTCTCAGCCCATACAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTT:1 - 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chr2R 21870275 5' - copia 205 2 54.11 GATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCT:1 - chr3R 2689437 5' - diver2 4473 1 66.36 GAGCAAATGCCTCAAAATCGGCGGGATATAGGCACGTCTAGGTACATATACATATGTGTATATTTTCTATATATATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 + chr3L 16059224 5' - 297 361 2 61.59 ATAGCTCTTATCGTTGGAAGTATGATAAGTATTTCCCTTCATTTTGGCCATGTTTTGCGTGTGCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCACTCCAG:1 + chr3L 13952725 5' + I-element 5115 1 72.60 GGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACC:1 - chrX 22386786 5' + hobo 84 1 50.00 TATTTATATTTATATAACGAAATATAAGAATAAGGAACGAAATATTTGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTA:1 + chr2R 5503681 5' - pogo 2032 1 66.67 GGGAGCTACATTATGCATCAGCACAAACTTTTGTATCTCCTCCTTATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTTATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTC:1 + chr3L 25725781 5' - 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Fw2 3517 1 58.70 GAGATATGATATTCTTTTTCCATTGCATTTGATTAAATAATATCCAAATTGATTGTTGCTGACATGAGGCGCAGTCATTGCCTTAGTTTGGGTTTGACACAAACGTACAAAATTTTTATTCCTCCATTTAAAAAATTTTTTGACTT:1 - chrX 12984144 5' - transib3 34 1 53.42 AATTGAGAACTATTTTCGCCAAAAATTAACCCCCATTAAAGTTTAAATATCCTACTGGACATTGCTCGTTACGAGATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTGTAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 + chr2L 17839359 5' + blood 7051 2 56.43 AAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAATACAACAGTATAGT:1 + chr2L 17295854 5' + Doc 65 1 64.34 GGGTAGAAAAGTTGGACTTTCATACTATCTGCACTGTTTCGCCATTTGAAGAGTAAACACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:3 - chr3L 1358537 5' + 412 62 2 59.59 TTTCTAGTTCTTTTTAGATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTATAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCGATTCGCAAAAAAAA:1 + chr3L 25255425 5' + INE-1 312 1 68.28 CCAAAAAGCTTACTTTGCTTGTCTACATGGACACAGATAATTGACACTAACATAGACAGTACGACACCCTCACACATATGCACTGACCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chrX 17982737 5' + hobo 34 1 62.07 ATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3L 16015224 5' + 1360 56 1 56.85 GGATGATTAAATGTTTCACTTCATCAGGTTGCAAGTGGAAAAGTGATAACTATTATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 + chr2L 2895554 5' + Burdock 6198 2 64.38 TGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACT:1 + chr3L 7837169 5' + jockey 4828 1 58.90 TACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAG:1 - 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chr3R 18528385 5' + roo 48 2 52.05 AATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGACCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGT:1 - chrX 4797163 5' - INE-1 143 1 54.11 GCGGCCTAATTACGCAATTAAATTATATATTTCGAGTGGCATTTGGAGTGAGAAAAGTTCAGAGACCACAAAAAAGAAAAAAGACGGAAGAGCAGCTTAAGATGAAATAACAAGAGAGAATGCTATATTCGAGTTACCCGACTATC:1 - chrX 17553181 5' - INE-1 564 1 56.16 ACTGCTTGAACTTCTCGATCTTAGACATTGGTGGTAAATCCATTATTGGATTCAATAATGCCAATTTTGTTTGCTTCTGGCCCAAGTTGTTCTTAGACGTAAACTTGTGCTGTGAAGTGTGAAGTGTAAAGTTATGACCTTTT:1 + chr2L 22736589 5' + Q-element 671 2 74.13 GCAGTGGGCTCCAAAACTCCCCAGACGACAGAAGAGTATAAATAGCAGGTAAGGAGGATTTAAGAGCCACCGCGATTAAACCCATTTGATTTTGCGCCAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr3R 11870026 5' + pogo 17 1 72.41 TTTTCATGACGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAG:1 - chrX 23108350 5' + BS3 1441 1 54.17 GTAATCGTTTTTGTGTTCGTGTGTACTCCTCGCTCTTTTTTCAAGACCTTCTGACGTCAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGACAGCCGAAGC:1 - chr3R 25050089 5' + P-element 21 1 61.11 TTCCTGTCTCTCTGGTCGATAGATCTATTCGCCGATCCATCGATCTATCTTTATTACCGAACCAAAATCAAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTC:1 - chr3L 14302458 5' + Quasimodo 354 2 54.11 ACTGTAGAAATATTTTAGTTTCGTAATTAGAATCTAGTCACAAACAGTTTATTTTGATTAACTAAAATATTGTACTTCCTTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTT:1 - chr2R 21709103 5' + 1360 407 1 49.32 ATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGCTTAACATTTTATATATCGAT:1 + chr2R 11095736 5' + diver 5939 2 50.36 ACCCAGTTCTTAATCATACTAGTTCTAATAGTTAATTAGTCGACATTCTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr2L 2494801 5' + Doc 41 1 56.16 ATTCGAAAGAACACTAAAATGATTTAGCAAATTTGTATGAGCAATGCGACAAAAGAGAAAATGCCAGAAATATTTTCTCAGCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATACA:1 + chr3R 18007369 5' + Porto1 4225 1 58.22 CGCCAGGATATATTCCAGCTTCGAGAATACCCCGCCTCACGATCCGATTAGCTGGCCTGCCTTTTTTTGCACACACTTTTAAACAATTTTTACATTTTTGTCATTTTATTTCTCAATATCTAACGATATCCCAGAAAA:1 + chr3R 20907367 5' + INE-1 499 1 55.07 AAATAAACGATTTTTAAATGAAGTTATTTTTGTTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAA:1 + chr2L 5792012 5' - blood 292 2 78.77 AGCGAGCAGCCAGGCAAACACTTTTCGGCAGTGCACTTTGTTGTAGAATGCAAGCCATGGCAACACCATCAATCCGTTTTGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCGAAACCAGC:1 + chr3R 9300652 5' + 297 6589 2 55.63 AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:5 - chrX 23439059 5' - P-element 2495 1 60.27 CTGCTCTTTAATGTTTTTGAAAATAGTTTTTGAAAGTCGACTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGAGAAAGAGACCTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGTGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACT:1 + chr3R 18346575 5' - INE-1 567 1 65.52 CACACTCAAGCACACACACATGGACAGCAGCTGCGGCACTATAAAAATTAAATGCTTTCTGCTGCCTACTTTCCGGGGCTGTCGAGCTTTTATTTCATTGCAGTTGGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 + chr2L 11226614 5' + jockey 4686 1 72.60 CCGATAGTTGTCTCTCTTGAAATTCATTCAAATTTATTGCTTTGTTTTCTGGAGTATAGCGTAATAACCCAGTGTGGAGTGAGAAATGATTTGTGCCAATTTGTGCCAAAAACTAATAACTGATGTGTTTACTCAAAACTTTAATT:1 - chr3R 7445189 5' + transib3 458 1 50.68 CAATAACTTGTGTTAACTGGTTAACAAAAACTTACCGTTAAAATCAAGTGCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chr3L 12964730 5' + hobo 67 1 62.94 ACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 - 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Tc1 1609 1 52.41 GATGAAAGATTTGAAAACGGAGATCCTAGTGAGCGGCGGCCTGCCGAAACTGGAGACCAGCAGGGTAAGTTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr3L 9212667 5' + hobo 53 1 51.37 GCAATTAATTAGGATTTAGGGATGCGTACGGTAGCTTCAATATGTTGATACAAAATATATTAAGCATTATTATAAAGACTCGACTAAATAACATAAGAGTACGCTATAGTCCAGTTCCCCGACTATTAGATACCCGTTAG:1 - chr2R 5950005 5' - INE-1 551 1 49.29 ACTGTATTCGTTTAAAAAAATATATCGCTAAATAAGCATGCCCAAGAATTAAATCAAATTGTTTCATAATAATACTGCAATTATACTAGGTAGTTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATAT:1 + chr3R 9583252 5' + Juan 4054 1 65.75 CGGAAGTAAACTTCAACGTCAGCTGGCGCTACGTATCCAACTCAACTACTTTATTACGAACAAATGTACCTGTTACCGAGATATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCAC:1 + chrX 15353839 5' + INE-1 134 1 58.99 CTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3R 28450728 5' + roo 67 2 79.84 AAAGGCCATGAACCAAATCTAAATATATATATTTTAACAGTCTTTCATTTAGAACAAACCCTTTTTTGGTAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 21674804 5' + roo 48 2 50.68 AGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGAC:1 - 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chr4 379861 5' + INE-1 155 1 53.68 TAATGACCTTTTTAAGGATATCGTTTTGGTAAGGATCAATGACCTCTATGGTTAATCATCTTAGAAAACTTCTTGAAGCTTCAAGATACTAAATGTATCTGAGGACTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chr3R 6135927 5' - mdg1 406 2 71.92 GAGTCCAAGCGACCCATCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGT:1 + chr2R 21820718 5' + Doc 71 1 61.64 GCAGCGCAGGTAAATCAATAAATTTACATAATCATTGTGCAAAAGGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATTTA:1 + chr2R 22463150 5' + roo 8738 2 68.97 ATTAGTTTCTAGAAATGCAATTGCTTACTAAGTAGTAAACAATTAATCCTAAATTTATGCAATCCATCTTCAATGAAGTGTAAAATAATAAAACATTTAAGTCAATTGGAAAACAATTGAATGGAAATCAACTTTCCACATGCAGT:1 - chr3R 20929459 5' - Tc1 28 1 76.71 GTTGGGCAGAATTACCTCAGTGGAGCTGTCTAATCGGGGCCAAATCAATGGGGATAGTGGCTGCAATCAATTGGAATCGGCCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATAATTCTGATGTAGTT:1 + chr3R 25804650 5' - mdg1 406 2 57.53 CAAGTCTGTCCAGTTCCTTCATCCCCATTCCGCTCGCTATTTTGAATAGGCTGCAGGGATCAGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTT:1 - 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chr3R 19446764 5' + F-element 34 1 62.60 GTAAATAATCCGTCAGAAAATGTATAAGATATGTAAGGAACAAAGTGTCGAATTAGTCATGCACACGAGTTTTCGTCTTTACATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr4 916270 5' + roo 38 2 59.59 AGTTAATATCCAAGCCAACAGTCATTAAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 21674927 5' - roo 9047 1 58.06 AATCGCTTTTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATA:1 - chr3L 10112259 5' + I-element 75 1 70.29 ACGCTTATAAATGTTGTACTTACCTAACTTCAACAATTTGTTTAATATGTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGAC:1 + chr2L 22315510 5' + frogger 19 2 60.27 ACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTTACTTCGCGATTTTGTGCGCCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACG:1 + chr2L 21325091 5' - invader4 3025 2 65.75 TTTTTGCGCTTTACAGTAATTTGTGGCTGTGGGGCCGCAGCAGCTATTGCTGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATC:1 - chr2R 14913536 5' + X-element 4425 1 50.53 ATATACCTAATTTTCATGCACATCTTCTCGACCCAATTTAATGGAGTTTGCCAAAGCAGCACAGCAATTATATTTTCCAACTTTTTTTTACCAAACAGCAGTTTCAGTAGCTGTGTGAGTAATAGTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chr2L 8621929 5' - HMS-Beagle2 492 1 76.06 CATCTTTGTTTATTTGTGAAGAAAAATGTGGATTTGCAAGCATTGAGTTTTCAATAAAAATCTATTAAATGTAATGTATTAAATTGTATCGTATACATTAATAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3R 5149397 5' + pogo 23 1 69.66 GTTAAAATAATTAGAGACTATGAAAAGGGGGGATATCGGATCAATAATAGTTTCATGTGTTCGCTTTATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chr2R 9607090 5' - pogo 2051 1 54.79 ATTACATGCGTATTAATTTGTACTACTGGAATGACTATATTGATACAAAGGAATTTTTAAAATTTAACCGAAGTTCCGCATTCTTGTCCTAACATTTCGTGTTTTACCACCCTACCTGTAAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATA:1 + chr4 696510 5' - Circe 7169 1 72.60 AAATCGGTCATCATCTTTTTCACAATTTTCATCATTGCTACATCATTTTCATTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 + chr2R 5237696 5' + Doc 26 1 56.16 ACCCACTGTGGCGTCAATTATAAAGATATTTAAGTACAGTTAGCATGCAATTAGACGGAGTTGACTGTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAG:1 + chr3L 7939027 5' + R1A1-element 5316 1 63.64 GGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGAT:2 - chr3L 7801287 5' + Transpac 186 2 69.86 ACATTCCCTTCCCTATGTTTATCTAACAAAAATACCAAATTGCTACCTCTTATTATGCGTGAGATATCCCTGACGAACAGACAGATTTTAAGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTT:1 - chr3L 26223067 5' - Bica 51 1 63.70 ATCTGATTTCGTGAGTGGCCACATAATTGGCGATGGAAGTGGTCGTCCATTTCAATGTCCAATCTTTAACAAACTTTTGATTTATTAACAAGCATTTGTTCTATATCTTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAA:1 - chr2L 16694051 5' - Transpac 4988 2 69.18 ATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTA:1 + chrX 21087561 5' + mdg3 37 2 50.00 TATTTTTCTGAAACTTTTCTATTTCACGTAACATTTATGGGTATTTAAATGTATATTTTGAAAACACTTCTTTATTTTCAGTTTAACTAAACTTTTAAATGCAACTTAGATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2R 7420288 5' + roo 10 2 67.81 ATTTATACACAATTTATTGTACTTTATCTCCTTCCCAAAATCGAAGTCCCAAAATTAGGTTATTAAAAACGGGAACAAAGCTGATTATATTAGTTAGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3R 10150107 5' + 1360 20 1 70.71 AAAAATTTTAAAAATTCTGAATTCGAAACAAATAATTTCATACAGTTTTCTGAAAAGCTTTTAAAGTTGATCAATATATTGTTACCGTTAAAATTTTTATAAAAAGATATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGT:1 + chr2L 7822167 5' + Juan 14 1 75.34 CCCCGGGCCATAAATTATTTAGTTGTATAACTAATGGCGAGAAATTTGTTGAGTTGGATTTTTATTTGCGCAGCTAGCTCACTTGTGTTTTCAGTTTTCATTTATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 7486983 5' - Porto1 171 1 82.61 CACAAAATAAATTTTGCGCGTGCAAAATATACATACATGAAAACGGAAGAGGGAATGCAATAAAAAGTTTTTGATTTTAGATCTTTTATTTGCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr2L 19997197 5' + Tirant 27 2 68.49 ATATCGAATAGTCAAATGGAAAATATAACTTTTTTGTTGCTTTGCCTTTTGTTTGCTACGCGATACTTCTTTGATAAATATTTAAAGCATATATTTTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTA:1 + chrX 8453694 5' + mdg3 100 2 63.01 CATGCTCAACAACTTTATGTGTATGCGTATGCGCGGCTGGCATAACAATAAGTTTTATTGCAACAATTCTATCAATATCGAGACCTCCATGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATTGCTGTTGCTGGCATTGCCC:1 + chr3R 18915608 5' - F-element 4288 1 59.59 TATCGATATACCGCACTACACATATATACGTCCCACTCGTATTCGTAATCGTTTTTGTGTTCGTGTGTACTCCTCGCTCTTTTTTCAAGACCTTCTGACGTCAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGC:1 - chr3R 25050133 5' + P-element 15 1 75.34 AATTAAAAAAAAAAACACTCAGTACTAAAATAGAACGCCATAGCAAAACTTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 - chrX 17565258 5' - 297 351 2 62.60 AGAGGGCGCTACTTCGTGTGCTGTCGGCGGGCATCGTCGCAACTTCGGTCCCACGACACGAACGGTTTCGTCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr2L 17260827 5' - P-element 2858 1 60.63 AAATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAG:1 + chr4 123939 5' + HB 111 1 58.22 GGCTGCCTAAGGCCAAAATCTGTCTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCGCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 - chr3L 5069501 5' + opus 142 4 57.26 AGGCAGCGGGGGATCCCAGATAACAAATGTTGCCAGGCGGCATCATCGAGAGAAGAAATTACCAAAAAAGGAAGCCGGAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATATGATAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 - chr3L 14662478 5' + FB 44 1 54.11 CCTTCTCCGAAAGTCGCGAAAGAATAAACCGAAGATTATATGCCCTTAAAAACCATTTCCGATCGATCTTAGAGGCGATTTGGAGTTGCATAATGTATGCTTTTATTTATTTATTTCTTATGATAGATAGAATAGT:1 - chr3L 786012 5' - I-element 5344 1 74.26 GTACATAGTTGCTTTTCATAACAACTACAACTACTATAACTTTTGAAACCTAACCGCGTTTACAATCTGTTGATATATAGGTAGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr3R 8218045 5' - P-element 2851 1 61.11 CAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr2L 12291927 5' + Tirant 10 2 63.75 AAGTGTAAAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr2L 12291952 5' + Tirant 39 2 56.72 AGAGTGCTACAATGTGCTTGTATATTATGAATACATTTAGGTACAGTGGTTAACCGATATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAAACGATCGACACGTAGATAACGC:1 - chrY 668653 5' - McClintock 6102 2 58.22 ATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGAAAATCCCGTTAGCTTTTCATGTTATCCTTTTT:1 + chr4 123980 5' + HB 150 1 65.94 GATAAATAAAAAGCAGTTCATCAATCTTAAATCCGCTGAAAATGTAGTTACAAGAATGCATTTGATTTCATCAAAGGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3L 2330068 5' + roo 8709 2 51.37 AGAAGATGCCCAATTCGGAATTCTTGTAGGGGGGGCAATTCTTGCATGACATATCGATGGTGGATGGCTTCTGCTGGAGTGACGGGGTAGGAACTAACTTAATTATTAAGATTCTACACCGCTAC:1 - chr3R 15744818 5' + G4 3473 1 68.80 GGTTTCATTGAATCAAATTTGTGCAAGACCCATTAAATATAGTCGAGACATTCAGCATAAATGTGTACTAAATAATTAGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTCTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr3R 17047790 5' - 412 450 2 55.17 AGCTGAAAACGCCGTGGAAGCTGACTCCTGGCGTCAGGCCATAAAAAAAGGTAAAACAAACAAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTC:1 - chrX 10111106 5' - mdg3 5437 2 60.96 GCTCCAAGTCCACTGTACTTGATTAATTTGAACAAGTTCGTTTGAAAAGGGGGCCACCAGCAGCTTTCCCCCGCTTTCCCTCGCTTGCTATAACACTCTAACGCACATAAACCGCCCAAAAATGGCACGCCCACATTTTTGAAAAA:1 - chrX 13478467 5' + INE-1 252 1 58.90 CGTCAGTATCGGCTTAAAAATATCAATTTTGTTTATTAAAAACTGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 - chr2R 6885422 5' - flea 228 2 56.16 AACTTAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 14375577 5' - roo 389 2 69.18 CCCCATGTATTTGGTAACAGTTTCCCCTTTTTTCAATTCTCACAGTGCCAAATTGACAACTAACCACCAACCCATTTAAATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 7756332 5' - roo 398 1 46.58 AAATATGTATATTTTGACATTTCAAGTTTAATTCTTGTCACTAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTA:1 + chr3L 17921922 5' - copia 225 1 61.48 CACCTGCAATTGATAACGGGTCGCCAAATGGTAAATAGTACAAACAATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACT:1 - chr2R 18689231 5' + Burdock 74 2 67.81 AAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:1 - chr3R 14049413 5' - transib2 2743 1 71.92 CTAGAAATGTAGCTTTGCACTTTTGTATAAAAATCTATGATAAATAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 - chr3R 11151951 5' + mdg3 5269 2 72.60 CGGTACGTGCTTTTTACGACACCCACTGTGGCGTCAATTATAAAGATATTTAAGTACAGTTAGCATGCAATTAGACGGAGTTGACTGTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATA:1 + chr3L 7939007 5' + R1A1-element 5332 1 61.64 AAGTAACGGGTATCTGATAGCACGCATAACATAGCACGTTTTCACATGTTTTTATGAACTCTATTAGATGCCTAAAACTAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCGCTGCTCCATACAAGCGGAGCC:1 - chr3R 29588495 5' + Transib5 2974 1 58.87 CATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAA:1 + chr3R 24750965 5' + G6 33 1 54.21 GTTACAAGTTTTCTTTTTCCGCTACGTAATTTAATTAGACGAAGAAATATTCAGTATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTC:1 - chr2R 5045713 5' + invader6 19 2 71.92 GAATCGCAAAGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:2 - chr2L 16331048 5' - roo 350 2 59.59 GGGATATTTGGGCGGACAGACAAACGGACAGGACCAGATTGGCTCGGCTATGGAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATAT:1 + chrX 179836 5' - I-element 5286 1 62.33 ATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTACATGTATGTTTCTTTTTTTTTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGGCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACTCTCAGC:1 - chr2L 5069689 5' - Rt1a 4997 1 64.93 AGGTGAGCCATCAAAAGCAGGGATATATACTATATATAAAAGGAGGCTTCAGTTTGCAATTTCTCAACTGTACACTGCGGCCCCCTAAATTCCTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATATTA:1 + chr3R 25804084 5' + mdg1 31 2 61.64 GATTTTTCTTGTAGTCAATGATTCTCATCAGCAATACAAATTTGATAAGGATACAAGTGCTAATTTTTATTATTTGTTATAATTTTTTTTTTATTTATCACATCTAAATGGATCCGTTAAATGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAG:1 + chr2R 16602185 5' - jockey 475 1 45.21 CCAGAGACGTGACTCTTGTTCGTCGGACGCAGGGGGGATTGTTGGAGTAGATAGGGGAATACGTATTACAGGTGAGTCAGGTAAAACCAACATACACACACACACACATACACAT:1 - chr3R 18006549 5' + Quasimodo 39 2 50.43 ACCATCAACTATTGTATCTGTCAAGACTTCAGAATTAAAGCTTATAAGCTTACTTAGCATATCAAGAACTTCATCTGTCATCCAATAAGATCATAATTTTTAAAACAATTTTTAATCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGG:1 - chr2L 17987217 5' + Juan 3812 1 54.79 AGACCCGAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr3R 16276444 5' - pogo 2090 1 68.81 TGTGATGTGCTCTAGGCAAATATTGCACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTA:1 - chr3R 14049474 5' - transib2 2805 1 71.23 ATTTATGAAATGTTGCCAAACAAAAAAAAAATCATCGTTACGAAGTAGCGATTTATCTATCAGTAGAAAATAATCTGTTAATGTGGCATGAGAACTATTTTCACGGTTAAACAGCAAGAATATGTAAGCAATTACAGAGGGATCTC:1 + chr2L 3755787 5' + Q-element 101 2 72.60 TTCCACCCGATAACGTTGTCATCGTCTTTGGCGGTCTTCTCGTCCTTTTGCGTCCTTGTTTCGCATTCCTTTGAGACTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 + chr3R 17258062 5' - 412 449 2 55.17 GCTACAGCCGAAAAACAAACTCCTGACCACCGAGGAAATCCTTCGTCTAGCTCGAATTTTCGTGGAGCAGGGAGTGCTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCC:1 + chr3L 11071590 5' - Idefix 7083 2 76.24 TCATTGGCTGCTTCCGGTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTAAACAGCCTGTTGACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 21013869 5' + roo 18 2 53.57 AGCTTGGACTGTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGCGGTTGTGTAGCAGGCTGCTCGTTCTACCCTCTTCCTTTCCTCT:1 + chrX 21087527 5' + mdg3 5269 2 69.18 AACCATTTCCGATCGATCTTAGAGGAGATTTGGAGTTGCATAATGTATGCTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTT:1 - chr3L 785962 5' - I-element 5284 1 65.75 CCAACTGTCGCCACATTAATAAATCAGTTTAATTTAATTCAGTTGACAGCTTTAAGTCAATATTGTTGATTAATTGTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTATAA:1 - chr3L 11396029 5' + I-element 29 1 62.31 ATTTTTGCAAAATTATTTGCTTTGTCTGATTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCA:2 + chr2R 13367439 5' + jockey 4614 1 54.11 CAGAAATGTGAAAATGCATTTGTTCCAAACATCTCAAATGGCAGTGGAAAAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - 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1360 28 1 57.53 GCAAATTAGGAAATCTGGAATGTATTATTGCGTGACACTTTAATTATATTTTCGGTTGTGAAATCAATGAGAGCAATAGCGTTTATAAGGCCATATTTACCCTTCAATCTACCCATAGTCGTTCTATGTACATAATATCCGCACAT:1 - chrX 20811982 5' + gypsy11 211 2 69.18 GTGAGACGACGGGGAGAACTGAGGTCTCATCTTCTCCACCCCACTCGAGATTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACT:1 + chr3R 9153597 5' - invader4 2692 1 54.81 CAGACGCAGAGTCCGCGCCAGAAGCAGCGGCGCAGTGGTGCGGCGGTCACAGCAGTTGGCGGCACCACCATGCTGGTTTAAATGTTATAAATTGAAAAAAAAGTCAACTACAAAATTATGATAAATTAATAAAAAATATAGCCTCC:1 - chrX 18306624 5' - Tc1-2 1358 1 52.05 TCTAGCCACTGCCACTAGCAAACACCATTCTTTTGGCCAAAACGCCTGCTGTTGTGCTCAGCTTTTTGTTTGGCTAGTTGAAAGCAGAAAGCAGCTGGGGCCGACGAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCC:1 - chr2R 14118874 5' - diver2 234 2 62.68 CACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr2L 17626675 5' - roo 9002 2 68.49 CCACTCACACGGCACAAATAATTTGCATGCAAGGCTGATTGATTGCCCAGCAGCTAAAAGGCAGCTGCATTTTGACCTTAAAAACATTTAATAGATGAAAATAAAAGAGATGTAGAGTCAAAAGGTCATGTCATTAGAAACATAA:1 - chr3R 26207064 5' + G4 452 1 62.76 GCGTGGGATATTTGGGCGGACAGACAAACGGACAGGACCAGATTGGCTCGGCTATGGAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTT:1 + chrX 179832 5' - I-element 5296 1 57.86 AAGGCGAGTAAGATGTTCCTCCTAATGTTGTTGCTGCTGGCTCCTGGGAATACGGAATATTCTATGCGGGTATGACACTGGTATTATGGTAATATTAAGTGCTTTACTAAAGTTGCATAAAATATATATTTGTATTTAATTAAATA:1 + chr3R 7046679 5' - transib1 1941 1 59.59 GCTAAGTAAGTAAGCGAAAAGGCAAAATAAAAAGTTCGATTAATGGCAGATTGGAAAATATTGACTTAGATGCTAAGATTTTCATTTGTTCCTAAGGACAAAAAAAAAATGGGGCGGAGTTGGGGCACGCGCACTTTTCCAAAAT:1 - chr2R 11147742 5' - hopper 108 1 67.59 CGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAA:1 + chr3L 23456268 5' - Gypsy6A_LTR 274 1 63.08 ATCAGTGAAAAGTCTCTGTACTTAGCCTAATAAAAGTTATTGGGGTGAAGCTCTTTTAACAGCAACATTCCTAATTAACAGATCTCCAATTATAAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr2L 22775623 5' - pogo 2085 1 73.29 CACCGATAGAAAGAGGTGTTTAAAGAAAGTGTTCTGTAACTGGGATATCATTTTGGTCTTGAAAACGTTGAAGAGTATTTCGTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCTAAAGAACGGGATGTTGCTGAAACGCATTGTT:1 + chr2L 20612436 5' - HMS-Beagle2 6813 1 52.05 GCGCCACTAAATGTTATTCACATTCTAGCCCCCTACTTTTACACTTCCCAGTGGCTGTCAAACTGCTAGTGGCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAT:1 + chr3L 2425862 5' - hopper 1367 1 51.37 GAGACGTTGCGCCATTAATGCGAAGCGTACTTTTGGGCGCGCTACTTAAAGTTGCAAGTTGGCAGTAGGATGGCGGTTGAAGTGCGGGCACTTCGGCCATAAACGGAAGTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 + chr2R 7889485 5' + jockey 4683 1 68.49 TCTATGTGCGGTTTTATTGCGAACTGCAATATATCAGCAGCACTTGCCAAATATCATTAGCTAAGGTTCTACCGGAAACTTGTGCTTATAAAATTCCTAGGAAAGTACACTTCTCACGTAGAAGTATGCAACATTTTTTTAAATCA:1 - chr3L 18657527 5' - Transib5 2802 1 76.71 ATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr3R 25751865 5' - roo 322 2 79.45 ACCAATGGCTGTCTGACCGGTTTGGAGATTAAAGTCGGCTTCAATGGCATATGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGC:1 - chr2R 14849016 5' + flea 4760 1 65.07 GTTTTTGTTATCATCTGGTTTGGTTTGTTTGTATTTGGTGTGCGTGAAATGGGTTGAATGGAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - 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chr3L 16571495 5' + baggins 5341 1 55.71 AATAATCCACATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 + chr3L 17537740 5' + Doc 68 1 63.70 AATTCATCTATCTATTTCATGAATGCATTCTGCTGCATTCATTTTAAATCCGTTTTGAAAGTTTTTGACGGTATTAAGGTGACAAGACGATTTTTTGTTAGTTTTGGCAGTCACAAACAAATAATACAAACCACACTCAATA:1 - chr2L 17551093 5' + Transib-N1_DM 231 1 54.93 GAATGTCTGCTAATTTGACTGCAATGGCCATCGAATCGATTGCCAACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chr2L 19406985 5' + Doc 9 1 68.49 AGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTACCAAT:1 + chr3R 7470965 5' + Doc 111 1 67.59 AATTTTGCAGCGTTCATTTAGATGCGAATTTATAATTTACAAGGGGCTGTAAGGCAAAGGCGGTGGAGTGCTCCTGCTGCCGAGAATTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGGTTTCACTCCGAACG:1 - chr2R 9666935 5' - F-element 4372 1 60.58 TTTTTAACGGATATGCCTATGATTCCAACTGATATTAACACGATACCCATCAGCAAAGCCCAAACAAGCATTTCTTGTTTGTAATGTGAATTTGAAAATCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 4190853 5' + pogo 20 1 71.92 ATGTTTTTGGCATTGCATTAATTGGGCAGCTTAATTATGGTGCTTGGGCCTCATTGGTTGAATGAAATGCGAACTATTAAAATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGC:1 + chr3R 31483627 5' - I-element 5312 1 55.86 TCTTAACGCTACCCTGATAAGCGTTTGAACACCTTAACCCATAAATATTTGACAGGGCACAGTTTATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr3L 12835989 5' - 1360 3339 1 56.83 CTTTAAATTAAGTCAAATGCCAAACAACGACGAACGCCTAAAAGTCTGCAAACAAAGAGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr2R 17332258 5' + jockey 28 1 70.71 GTGAACAATGCAGTATTATTTAGTTTGCGCTGGCCATTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 + chrX 18239121 5' + jockey 90 1 73.29 CTGCACTACGAGAAATAAGGTTATATTTTTAATTTATATATTATAAGGTCTTACAATAAGTTATATTAATGTGTACCGCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTA:1 + chr2L 6104819 5' + Ivk 45 1 55.48 ACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 + chr3R 9125655 5' + Doc 63 1 54.48 CCATGTATTTGGTAACAGTTTCCCCTTTTTTCAATTCTCACAGTGCCAAATTGACAACTAACCACCAACCCATTTAAATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 7756334 5' - roo 396 1 45.21 CGAGAAGACAAAGCCATGTGGTCGGTCGTAGGCGTGGGTTGGTATATAATCAAAACTAATACAAAAATGCGGTATTTTATGTAATCTAGGTTTCATTGTAGCAACCTTTAGACATAGATCAACTGTGTAAAGAAAGATCACCTTGG:1 + chr3L 14282472 5' - I-element 5021 1 76.03 ACCATAACAACAACCCAAGCTTCTACAACAACTACTCAGACTTCAACGGCAACAACAACTACACCACCTTCCACGCCCATACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAACACTCAAAAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGCAC:1 - chrX 4245144 5' + HeT-A 5978 1 51.72 AAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTG:1 + chr3L 3453612 5' + Tirant 56 2 63.28 CGCCAAATGAAATGAAATAAAGACAACTGCATATTGGCCAAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 - chr3R 16240984 5' + Tirant 8173 2 67.65 ACTGGGTTGCTAATGACACTTGTCGCGTGTGCGGATTTTATGTTCTCGCTGTTTTTACTCTGCATTTTCCATTTTGTTTGTTCGCTTAAGTGCTATGACTACAACGGCATTTAAAAATTGAATTAAAAATTAT:1 + chr3L 14362057 5' - Juan 3780 1 61.65 TACTTGACACCACAACTGATACACTGGGAAAAAGTGCAACTACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAG:1 + chr3R 15054128 5' - 297 6906 2 70.63 CTCCTCCAACAGAATACTCAAACAATTCTTCCATATGTAAAAAAAAATGCCACAAAATTGATTTATTTCTATTTCCATCCACAAATAAATTACTTCAATTTTGTGCTTCAATTCAATTGTTATTCAATTCGATTGCCGACGTGTGA:1 + chr3L 26741149 5' + F-element 12 1 71.23 CTTGGTGATAGCGTCCACGTTTTTGGGGTCATCTATATTCAGGATCTGCTTGGCTTCCTCCAGTATAATCTTGAACCTTTAATGGTAGGGCCTAAGTGCTGGTAGGTGTTCCCAGTAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCCAGTGACT:1 - chr3R 15934424 5' - baggins 4991 1 56.85 AAATTTGAGGACCCAATCGCTAGGAACTTTCTTTTGATCAAGTGAGAAATTGGTGTGCGAAAAACGCCAGTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACT:1 + chr3L 21124123 5' - invader4 252 2 52.05 CAGAGAAAAACATTTAAAGTACAAATTCTTGGCTCGACGACATATTTTAAACAACGGGAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3L 2330217 5' - roo 396 1 73.08 TGCAGCTGCATTCTGGCATTAAATCCATGCCAAATGCGCAACAAGGCAAATAGTCAAGGCAAGCAAATTATGAAAAAAAAGCAACCAAGAAATGAGTATGCCGAATCACCTAGTTCTATATTTCTGAACCCAGCTGTA:1 - chr3R 9286366 5' - HB 4 1 76.09 ACGCATAATTATTTGCTAATTAAATCACTTTCACGAAAGAAATTACCGGATTCCGCTACCAGTTCCCCGAAATCCGGCATCTCACTCAATGAAACAATTTAATAAAATATAAAAAAATAA:1 - 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chrX 7001667 5' + Cr1a 236 1 75.34 TAATTGTGATTGATATAATTAGTTCATTTTTAATTACCAATTGTGTTACAAGCTTTAACATGGCTTAATGTATCAGCTCTAGAAATATTCATATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:1 - chr2L 2120494 5' - I-element 5339 1 66.67 CAGACGACCATATAAATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAT:1 - chr3R 13437259 5' - hopper 1367 1 52.74 TGTATTATTTGTTAAATTTTGTAAAGAATATTGTTATATTTAAGCACTCCTTTACTTTGATCGCACGATTGTAATATTTTACAAGCGTTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 11944799 5' + roo 22 2 69.63 AGTATCTAGGAGCGATTCGCCTGCTGAAAGCTAGTGGCTTCCAACCAAAACGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATATTCGGTTTAAATAGTTGACATG:1 + chr3R 23098174 5' - roo 337 2 61.64 TGTATCTTGGGGTAAATCACTCAAAACACGGTATTTATACACCCGCTGATACCCAAATACACGCGAATGTACCCGAATTGGTGTTGGTTAAAACACAGTGCTCGCTAAATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGATGGTCCCGT:1 + chr3R 25049936 5' + P-element 8 2 77.40 AAGGCTTAATATAGATCGTCCTTATACTTATTAATAAGGGAGATTTCTTTACAATGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCTTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTGT:1 + chr3L 22641974 5' + hopper 56 1 59.40 CTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 - chr2R 18344625 5' + 1360 73 1 67.12 AATTCGAACGGCAACTGTCAATGCAATTTATATGTTATGTGTGCCGGATTTCTTTCACCAGTGGCACAATAATATACGGCACGAAAATGAAATCTTCAAAGATACCATCTATCATCCTTAGATGGCATGCACGATTCATAACTCTC:1 - chr3L 938047 5' - Rt1a 5000 1 50.68 GATCTCCCTCAGTACGTCGTTAACCAACGTGGGAAGGCCTTCATCACAGTTACAACCACAGGGTGAGTGCATAATATGTAAGCCTGATTTTGGTTAAGAGCAAGATAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCG:1 + chr2R 3504164 5' - diver2 136 2 71.92 CCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACTCATTCGCAAGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAACACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chr3R 7885602 5' + jockey 75 1 66.67 AGAAACGAGAAGGAGGAGAAAGAGAACATGAAGGGAGGACGATAGGGAGCGTAAATGGTGCCTTTGACAAAGTTAAGAGTGTTGTGGAGCTTGCACTCGATATCGCATAAGCCAGGTAAAGAAGTCACTTTGATAAATTTGTCACT:1 + chrX 13699084 5' - Ivk 489 1 70.55 GGGGGCATGGCAACCCTGACAGAAACTTTGATTTTCCCACTGCTTCAGCACTCTATCTATCACCGTTATACCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTACAACGGACTT:1 + chrX 3639390 5' + 412 465 2 50.68 AATTCATCTTCATAAAAACATAAAACACAGCGAAAAAGGGAAAACAAAAACGGGGGTACATTTCAACAAAACATGGACATTACGAATATTATTATTATTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCCGGTTGGATC:1 + chr3L 13253707 5' - baggins 5408 1 54.55 AAGAATTAATGAAACAAGAGAGAATGCTATATTGAAAGCAATGTACAAGACTAAAAAAATTATGAAAAAAAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACTTTCATACGTATACAGCCAGATCGACTTGGCTATTGATCCTGATCAAGA:1 + chr2L 9547517 5' - INE-1 88 1 74.66 TATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr2L 9275022 5' + F-element 43 1 67.86 GATGTACTACGAATGGGTCATCATTTCAACCTGGTGGTGCTGTCGATCATGCACCCACGACTGCTAGGAGTTGCAGTTGGTTCCACTTGTTGCATGCATAGAAGATACAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr2R 18612053 5' - P-element 2874 1 76.71 GAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGGGTAAA:1 - chr2L 21910207 5' + Doc 88 1 80.14 GACTTCTCGGATCCCTCGGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGCGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGATATAGAGATT:1 + chr2R 10910183 5' - Tabor 7288 2 58.90 CTGGTTTGGTTTGTTTGTATTTGGTGTGCGTGAAATGGGTTGAATGGAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - 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chrX 7158451 5' - I-element 4950 1 65.00 AGTTAGGTTGCCTCGATACCAAAATGCACATCGAAATATACAATATACAATGCACATACAAAATACAATACAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr3R 7450289 5' + Doc 55 1 51.03 GAATTTTGAGTAGTTATGGAACTTGAATCTATTTCCGGCTTTAAAGACTTTCACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCT:1 - chrX 887622 5' + Quasimodo 345 2 54.39 CAATATGTATTATATTGTATGTAACTAAATATATGAAAGACTATTGATCGATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGC:1 + chrX 14836178 5' - invader4 261 2 64.14 CTTCGTTACGAGTAGCGAGTATGATCGGCGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCA:1 - chr3R 2637704 5' + gypsy5 7003 2 73.11 ACATATAATAAATCACTGTGCTTTTGTAAGTAAGTGCTTCTGTCCGCCGATCCTAAAATACATACATGTACATACATGTATGTATGTGAATTTCCGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATCTTGAG:1 - chr3L 24763610 5' - 1360 489 1 36.30 GACAAACACTTCGACTCTAATGAGGCAACTTAAAGTGTGCTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCTCGGGTACTTACACACAC:1 - 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roo 403 1 78.77 AATATTAATCACTTAGCTTTACTCTAAACAAAGCACAAGGTGTTTTGTTGGGGAAATTTCAATTTTAATTAAACATCTGTTGAGCGCTAAACAAATGGCACACGGGAAACAATTGCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGTCATT:1 + chr2R 22587279 5' + baggins 5330 1 65.75 ACTAATTATGTTTTAGTTAATTTAATAATTAAACTATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3R 6413663 5' - 1360 3343 1 54.11 CGAATTTTAATTGCTTGTATATCCTTAATTTTGTATGTTGTATTCCCAGAGCAATAGGGATATCAATAATATTTGGCTTACGTTTAATTATCCTTAAGTTATCCTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCA:1 - chr2R 8280136 5' + F-element 35 1 42.47 CACCTGAAAGTAGGCAGCACATTTTAATGAGCCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 - chr3R 25795838 5' + jockey 67 1 59.59 GGCTAAAAGTGTCTGAGTGGATTGTTATATATATATATAGCATTACGTATATGGATTTGGCTGACATTTCGAAGACATAACAAGTAAGTAAATAATTTTTAAACTTGCTAAGTTGCTTGTGAGCAACCTTGGGCATTCGTAGTAAT:1 - chrX 9999437 5' + looper1 385 1 52.74 CCACTCCACTTGCCACTTACCAGCGCCAGCTTTTCATTTTCCAAGCCCACAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACACAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - 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chr3R 7778396 5' + transib2 3 1 80.45 GGGCTTACGTGACTTGCCGATGACCTATAAAAAGAATTTGGACTGTCATCGTTCCAAGAAGTATTTATTTGCAAGTATTACAGGCAAATAGTTCCAAAGTTACCATATAAATTTAAGGGTTACAAATTATTAAGTATAAAAGTAAA:1 - chr3L 19014157 5' - G5 4724 1 67.12 AATAGCACCTTTTGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 14969068 5' + 412 7095 2 49.32 CATCGACAGCGACAAAATCTATTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTA:1 + chr3L 18183058 5' - Tirant 364 2 61.64 ACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGGGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr3R 13225483 5' + hobo 53 1 56.93 ATATAATTAAACTTTTTCAAAAGAATGGGCCCTCTAAGTATATTTAAGTACTTATCTAAGACCTTACCTGTTCAGTCATCTATTATTATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACT:1 + chr3L 18801749 5' - I-element 5325 1 62.33 ATTCTCGAGTTTTCAAAAAGGTTGCCCGAGCTGGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGTATCAATGTAAGC:1 - 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chrX 3647049 5' + 412 13 2 75.34 GTGTGCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACAACAAAATCTA:1 + chr3L 13952783 5' + I-element 5173 1 65.07 GGCGAAATGGCAAAGGCATACTATATATCCATATCTATATCTATACAGCACACAAAACATGACGAGCAGGGGAAAAACAACGACGTCAAAGCCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr2R 15528419 5' + 1360 5 2 78.05 GTCCCGAAAAGAGCAAACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTA:1 - chr2R 18014126 5' + Doc 53 1 52.71 TTGGAGCTAACAGATATATGAACGCATTTGCTTTTCTATTAAGATCTTATTTTCTTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGCCCGTCTGTCCGTATGAACGTCTCGATCTCGGGAACTATAAAAGCTAGAGGGTTGA:1 - chr3L 21732702 5' + INE-1 160 1 60.96 ACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 28450741 5' + roo 8740 2 73.97 GCCGGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCCAAACAAATCA:1 + chr3L 3453581 5' + Tirant 8133 2 65.12 TGATCACGAATCAAAATTAGTAGGAACTGAGATGAGACTGTACATAAGTAAGATAAGTAAAGTCGCCATCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTA:1 + chr3R 7481453 5' - invader4 3071 2 76.71 ACGAAGCGGAACGCACGGCAACAACTACAACGAGAAAACGAGCTGTTAAGCGCCACCCACAAGTGTGCGCAAAACACACAAAAATCAAAGGAAAAAAAGCACTCCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 + chrX 9305804 5' + P-element 17 1 71.92 GAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr3L 2330160 5' - roo 8986 2 75.34 GCAGTGGGACGGGTTTCGAGTGTTTCGGAAAAATCTAATTTTCCGTATCCGCAGCGTTCAAATATGGTGATTTAAGGCCCAACAAATTTATGAATTTTATAATACTAAACGAAAAAAAATACTATAATAAACTTTAAAAATATATT:1 + chr3L 13922377 5' - hopper 174 1 88.36 CCTGTAACGTCTGTTTTCGCGTTTTTTTAAAAGACTTACTACTTATACATAGTTTGGCCGAGTAGTATTTTTTGCTCATATAACATATTAATTTTTGAATAGAATAGTGGGCAAACGAAAAAAACTAATTCTAAAGGGTGGGCAAA:1 - chr2R 1523103 5' - FB 224 4 69.86 CATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCCGAAACGACTTC:1 + chr3L 7791914 5' - Transpac 5172 2 66.95 GTTCACATCTGTTTCTGTGGAGTGGGTTGAGTTCTAGTATCGCATTTCTGCTGCCTGCGTCCAAAATTGGCAATACTTGAATTTTTAATAAGCAGCCCCGCCCTCAAAAAAGAAAAAAAATTAAAAAAAGAAAAAAAGGAAAAACA:1 + chr2L 16384738 5' + Doc2-element 230 2 67.12 GATTTCGACTCCCGCACAATTTGAATATATAAAGCCCGGCCTTTAAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGTCATAAAGTCTAAAAATT:1 + chr3R 7778214 5' - transib2 2799 1 68.49 GAAATCGGTAAAAGAGTGGAGTGCTTAAAGATATTATCCCAAAACATGCTTATGAAGGCAAACTGTAGGGTTATGAGCGCATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCA:1 - chr2L 10446161 5' + flea 39 2 54.79 ACTAAGACAGGAAATGATCGCTTAAAGATTTGGGGAAAGCATTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACCAATAATAATATAAAAAACAAGGGAGAATGCTATAGTTGAGTTCCCCGACTACCCGTTACTCAGCTAGTGGGAATG:1 + chr2R 5190070 5' - INE-1 535 1 71.92 ATTTTGTGATTTATTTATTAGTTGATTATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGT:1 + chr3L 25951921 5' + G4 3728 1 78.08 ATTTGGTCCAAGAAAAGTATATACATACATATGTACATGTATGTACTATCTATTGCTTCTATATTCATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chr3R 6461890 5' + 297 6594 2 77.40 GCAGATAGAATGGATGAGTTGGCGTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chrX 3648962 5' + 412 72 2 67.12 ATATTGAAGTGCAACATTTTTCATATTTTAATAAGCTAAATTTTCATTTTAGCTTCGGCGTTTGAAAGTCATATTGAAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 - chrX 20975861 5' - copia 246 1 54.79 GTTACTTTCCCTTTGAATCCTGTGCAAATCAAATAAAAGAAAAACTTTGCTCATTTAGAGGCCGATGAGTTTTTCGTGAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCAC:1 + chr3R 20431889 5' - 1360 182 1 52.05 TTATAGATCGTCGTTGTGTCACGGTTAGGTCTTCACCCTCTTCTTTGTCGTCGTATTGTTGTCGCTCTCTTAGCCACAGAGGCAGAAAGGACAACTTACTTCTTCCACGCGCCGGCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTT:1 - chr3L 24157888 5' - invader2 300 1 78.62 ACTATTTGTTTATAAATATAATTTGTAGTTCGCCCATTTTAGGCAATGGCCTATATAGTCTATGTTCCCCGACTATCAGGTAACCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCAAACGCGGAAGTTTCATAATTTTTCTGGGATATCGGTAG:1 - chrX 6224381 5' - INE-1 502 1 63.70 AAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGA:1 + chr3L 7791891 5' - Transpac 5176 2 56.20 ACCTTTGCCAGCAGCTTAACCCTTGATCCGTAATTAACCCATTAGGGTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr2L 14239225 5' - 412 7519 2 54.08 TACATCATTTTCATTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 - chrX 19730199 5' + Doc 64 1 60.96 CAGATGGAAATGATGGCGATTGAAACAGTCACACTCACACTCACACTTGCACACTTACACACGAAACAACCCAACATGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTA:1 + chr3R 20285101 5' - roo 8602 1 50.68 ACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 19436101 5' - roo 369 1 55.07 CTCTGTTGTCCAGCACAGCACTGCGTGTTGTTCCTTTTATCGTTCTCACCAAAGACACTAGAATTATTCTGGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAAAGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTA:1 + chr2R 2498386 5' - 1360 448 1 60.43 ATGGGAATGGGTTCACTATCAGCTAATTGTGATGATTTTCGTACGCTCTGCACTAAGTGCATTTTGTGGAGTTTGATCTTTCGAGACAAAAGTGGATTAATGCAGCTAAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGACTATGACCG:1 + chrX 18495815 5' - rooA 173 2 64.38 GTTTTCTTTTTCCGCTACGTAATTTAATTAGACGAAGAAATATTCAGTATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCT:2 - chr2R 5045706 5' + invader6 4518 2 67.12 GCAACGAATATACCTTTTAGTATACCGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAACATAG:1 + chr2L 22113013 5' - 1360 3277 1 64.44 ATATGCACACACATGCCCAATATTTATAATTGGTGGGCAGCAAATGACAAATGTATCTGGGTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAATGTAG:1 - chr3L 11232856 5' + 17.6 6941 1 58.22 ATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 11164536 5' + roo 22 2 68.84 TGCGGAGATCGGATCGAGAAAATCACAACTTCTCGCTGCGAAGTAAGAATCAAAACTGATCGCAGCTTGCCGTTTTGCTGTTTTCCTGGAGTTACCGTATTACGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr2L 8984814 5' + pogo 16 1 74.66 AAGGACAACAATCGCTGAACTATTCAAATATATACATATATAGTGGCTAAGTATAGAATGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 - chrX 11008408 5' + hobo 58 1 60.27 CGTTGCTAACAAGCCAGGAGTTTGGGATAAAGCCAGAACTATTATATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGTGCACCGTCAGCAGGCGACTCGGGGC:1 - chr3R 28406444 5' + opus 69 4 67.36 AATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGATATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 - chr3L 27415324 5' + transib2 52 1 52.74 GAAAGCATTTCTCCGTCATCCGATACTGACTCCAGTTTTATTAAAAAAAAAAGAAAAAAGGGGG:1 - chrX 5158692 5' - hopper 139 1 81.25 CTGGAGCTGCCACATGTTCTGGTCCAGCCGAGCTCCCTGTGTGCCAAGAAAACGGGAGCGGGTCCTTGTGCCAGCGATGGTTGTAATGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 14218547 5' - roo 394 1 69.23 GTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGT:1 + chr2L 22719592 5' + 1360 83 1 76.03 GTCATTGCGTGTTTTATATATATTGTTATTGTAGTTTTAATTGAATTTGTTCCAAACGAAGACCAAAAATTCTCTAGTTATGGGTCGCGAAAAGCATTGTACCGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAATGTA:1 + chr2R 5401543 5' + Tc1 404 1 77.40 GAGATGCCAGCACTGGAGTTTCCATCATGAAAATCGAACCTCACCGGTTCGATATCGGTGATGTAAGTTCATTCTTATCTTACCATTGTATGCAGTAGAGTAGGTATAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGAAGAGTCATCAGGATG:1 - chr3R 31254339 5' - invader1 403 1 67.12 CTGCTTGGCCAACGGAAGGAGCCAACCAAAGCGCTTAGTACAGCGGCATGTGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAAT:1 - chr3R 12520829 5' - Burdock 185 2 66.44 AGTCTGTTTTGGGCCATTTTGCTTTGCTTTCGGCCAACTTGTTTGGCTAAAGGCAAATTGTATCTTTCTGGCTTTGCGTTTTTCTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 - chr2R 8177840 5' + FB 39 1 56.85 GCGACATTTGTAACGTCTGTACCCGCTTAAGGAAATCTTGAAATTCCAGAGCACGCATTTCTGTAATCGGTACAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 - chr4 1219267 5' + 1360 49 1 52.05 ATTGTTGTTGAGCAATGCATTAAGTGCACAAATGAGTCTCTCTTATTTGTTCTGTCGTGGGCTATTGAGCCAAAAAGGATAGAAGAAATCTTTGAAATAATTAAATTACTGCCGAAACATAAAGCTCCAGGAATTGACAGGATTTG:1 - chr4 905655 5' + Helena 5 1 72.60 ATCGTGCTGCTCTTGGAGGCTTCGAGCTCGTTTAGCGCTCATTTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chr2L 11405847 5' + 412 7128 2 69.44 TGTTGAATCGACGTCGAATGGGAAAACTCGATGAATCGATGACTATATCTACGACAGCAGAAATTATTTATTTAACAGTATATCGGAGCCGCTGAGCGCGCAATTCGCGTTGGCTCGATTTGGTCGTTGTCTATTTGTTTTTTTTT:1 + chr2R 11813845 5' - Doc3-element 179 1 59.59 GCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - 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roo 9018 2 54.11 TCCATTACTTAAACGGTTCGTAATACCTAAAGTTTACCAAGTTCAATGACATTAGAGTATATCTGCAGTGTTTATGAACATATAGATTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATC:1 + chr2R 5965147 5' + INE-1 96 1 49.21 ATTTGCACAGCCAAAAACCCACTTTCACCCATGCAGCCGCAGATATAGTGATAGAATAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTG:1 - chr3R 23104013 5' + BS 4933 1 72.60 TTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:1 + chr2L 18112469 5' - transib2 2786 1 58.22 GAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:2 + chr2L 19407037 5' + Doc 61 1 60.96 AACAAGTTGTTTTCATCCCATTACTTATCATTCGTTTTTTTGTCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATAAGAATCGC:2 + chr3L 3238269 5' - roo 8993 2 68.49 CATTTTGAAAACACCATCTGAAAACACCATCAATAGTCGATTTCAATTTCGTTACTGATGGATTTTTGGTCGACAGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 - 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Burdock 6350 2 57.24 AAGCCAAGAACTTCTCCCCGTACGCTCATATTTTACACAAGATATGGGCGTGTCGTTTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAAT:1 - chr3R 14912037 5' + Stalker4 7023 4 61.64 AATCAATTCGTCCTCTAATCTGCTTATCAGTAAAACGGTGTCAGCTTTGCTTGAATTTGCTCAACTGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACAAGAGTCACTTATTTTTGCTACCTTTAGCTGTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCC:1 + chr3L 295574 5' - roo 497 1 56.16 GTTTTAAGTTCATACTAAACGATTAGTACTAGCATTAGGATAGGATATAAAGGATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGGTTGATCTGGGCGTGTTCGTCCGCCTGTCCGTTCGTCTGAACGTTGAGATCTCAGGAACTAC:2 + chr2L 22048157 5' + INE-1 143 1 68.28 GTTTAGAATTTATTTGTGGTTAGCATGGTTCGTAAATTTTTAAAGGTTCTGGGGGAATGAAATATTATGGAACAAAAGTTGTTGGATGAATATTATTGGTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 + chr2R 21870117 5' + copia 4891 2 67.12 CCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTGACTGAAGGG:1 + chr3R 7481525 5' - invader4 3000 2 69.86 AGCCCACACACTGACATCCATTTAAACAATGCACTCAAATATATAGCCCAAGTATTTGTTTTCCGTTTTGATGCTTTCCAACTGCTGCTTCAAGTAATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACA:1 + chr2L 7667025 5' - BS 5052 1 60.27 GTGTTACTGTGATTATACTTCAGGTGATGGTTCACTACGATGACTACTTCATTTAGACATGATAAGTGGGCAAACTATAAATATGTTCTAATTATAGGCTGCAATAAACATGTCACTGGACGGCATAAGTGGCAACTACAGATAAG:1 - chr2L 21369462 5' + rooA 7323 2 60.96 CACTTTGGCCAGCCAGCATTTTCGAGCTGCATCATCGGTAGTTGCGAAGGGGATGGCCTTCGATGTCAGCACATAATAGTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTG:1 - chr3R 5773257 5' - Stalker4 7320 2 54.79 GCCTGCGACGGACTGGCCGACTTCAACTTCTCCTGCGCTGACCTTCAATCAAGAGTTCGCTTTGGCCAGGCGAATTAGAATTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTGTTGTG:1 + chr3R 16240871 5' - Tirant 8492 2 69.92 ATGGGAGAATGTGAGAAAGGGAGAGTGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3L 19580882 5' - roo 9013 2 57.53 TTACTGACATCGGAAAGAAGCCAGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGAACTTTTGCAACAATGTTTAT:1 - chr2R 10910286 5' + Tabor 6906 2 67.44 CACTCATTCAAAACGGCGCTGAGTGAGTTCGCAATATTACCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGCACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCA:2 - 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chr3R 22494199 5' + 297 6636 2 57.53 CACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTATGCACTATGCAGCCCCACTTTTTTGGTGACAATCAAAATTGCCCTATGTCCGGCTCGCTTACGCTAAGAGCGGAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTG:1 - chr2R 1982172 5' - 1360 3261 1 82.19 GCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3R 25751861 5' - roo 318 2 82.19 TGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2R 11164499 5' + roo 8703 2 60.17 CCCAGTTAACCGATTCCCAGCGAACGGATTTGTACAACCACTTCAGGAAGTGCGAGTACACCTTTCGCAAAGACAATGGAAATGTGAATGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGA:1 + chr2R 15857374 5' + 297 6782 2 65.07 AGTGCGGTGCGCCAGTAGGTACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 - chrX 16117280 5' - opus 450 2 54.86 GTTCTGCTGCTGTGCTCGCAAAAATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - 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roo 323 2 73.97 GGCATCGTCGCAACTTCGGTCCCACGACACGAACGGTTTCGTCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2L 17260798 5' - P-element 2841 1 41.74 AGCAAACACTCTCTTTCAAGCTTCAGGCGTTTGACTGTGTGTGTAAGCCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGA:1 + chr2R 17097477 5' - P-element 2815 1 36.30 AATTAATAGGCTCATAAAATCAAAACGAAAAAGCCTTAAAGTGTAAAAACAACAAATCACTCAAGATGACCTCAGACACCAATGGACAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACTAGAT:1 - chr2L 14501253 5' + 1360 34 1 62.33 ACAACTAAGCATACAATTATGGAATATTAAAAAACAAAAACATTTAAGGACTTAAAAAGATATTTGAAAGAAAAGTCATCCTATCAAGTCTAATCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 - chr2L 15644993 5' + transib2 26 1 67.81 GGCATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGGTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGCGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTG:1 + chr2L 12291846 5' - Tirant 387 2 61.80 ACAATTTGAATATATAAAGCCCGGCCTTTAAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGA:1 + chr3R 7778229 5' - transib2 2784 1 58.22 CATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAATCTACGAATAGCAAG:1 + chr2L 17295813 5' + Doc 41 1 54.11 TTTTGCTTTTTCCCCTTGTTTTGTTTTATGACTTGATTTGGGGAAATGGGGAGTGAGCGCAGGATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCT:1 + chr3L 10112185 5' - I-element 5297 1 56.16 AGAAAACACTCGATAAATGGGAACAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr3R 8849897 5' + 297 24 2 69.86 TTGATGCAATATTAATATATTATTATCAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACC:1 - chr3R 17586895 5' + Max-element 67 2 78.81 CCTATGAAATCATCGAGAAGAACATCCTATGACATCAGCTAAATCTTTAAAACGATTGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr3L 25607267 5' + 412 7090 2 53.78 GATGATTGCCCTTTTTGTAAGCTTTCGATTACGGAAATAAACGATTTTTAAATGAAGTTATTTTTGTTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGCGCAGCCGTCACGCCACC:1 + chr2L 5791978 5' - blood 7337 1 52.74 GCATTTTCAAAAAGAGCCACGTTAGCGTTTTTTTCCCAACAATCTGGTCATTTTATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 - chr3R 26486118 5' - 412 7483 2 61.38 ATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAG:1 + chr3R 11151812 5' - mdg3 5432 2 62.07 ACATAGACTGTAATGAGGATTTGATTATATTATATTATTATTATAAAAGTTATGTCAACTAAAGTCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr2L 11143092 5' + 1360 55 1 57.24 AATTGAAATAAAAGGTACACTTAAATAAAATTGCTAGTGTCGATGCGTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGAATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGT:1 - chr4 184080 5' + 1360 160 1 56.85 GGGAGGGAACAGAAAAAATTGCAGTGGAAGCGTAGAAAACATTTCATGGTTCAATGCCAAAGCAAAAGCGAATGACTTAAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAGAA:1 + chrX 11524828 5' + 1360 475 1 53.33 CAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:2 + chr3R 9125623 5' + Doc 32 1 68.49 CGAAACATAGTTCCAAACCATGGAAGTTGTTAACTCTTGAATAAACGCAATCATATTAGCCACAAAAACCTCCATTACGAATCCAGGACAACGCCATACTCGAGCTGCACCAACAGTAATACCGGACATTAAATATTTTCAGTTTT:1 + chr3L 25764244 5' + Juan 70 1 36.30 CGTTCTCGAAGAGTCCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCG:1 + chr3R 24750937 5' + G6 20 1 70.49 GGAAGTAAGTACTTTGTTTTGAGCTTAGATGTGGCAAAGATGGGCAAAAGCTTTAATGACAACACGTTCAAGGCATCTGGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTC:1 + chr3L 13790957 5' - Porto1 242 1 58.90 ATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCC:1 - chr3L 7801312 5' + Transpac 5080 2 52.74 GCAAAACACTATTTGCCATTGTCACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 28450641 5' - roo 361 2 52.74 TTCATTCGGAAATGTTCTTTATTACCGTCCTGGCACAAACTCAGCGTTTTGAATAATTATTCCATAAGGTTGCTTTACAGCAGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:3 + chr3L 10469459 5' + roo 8671 2 79.45 GGTATATGCGTGCAAAAGTTACGGCTTCCAATTTGAAATTACTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:2 - chr3R 12379779 5' + roo 8744 2 74.66 AAATAAGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGGGAAAGTTAAACACA:1 + chr3R 7507153 5' + Doc 79 1 71.23 AAACGATATTTTCGCAATTGTCGCACGGATCGATTCATTTGCGGGCAGCGCAAAAATACCTTAAAGCGGCATTAATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr2R 22463269 5' - roo 9034 1 46.04 GCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGA:1 + chr2R 22746045 5' + jockey 4804 1 53.42 AAGGGAGGACTTCTCGGATCCCTCGGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAAT:2 + chr2R 10910176 5' - Tabor 456 2 65.07 TGGGACTTACCTTGTGCATGGTGTATTCTTCTAAACCCCAGTCACTCGAGATGTATGTCATTACTTAAGACTGCTGGGACTCGATCAGAAGGTAAAACAAGAGAAATGCAATAGTCGAGTCCCCCGACTATCAGATACCCGT:1 + chr2L 22318167 5' - INE-1 554 1 47.18 AAACAATTCTTCCATATGTAAAAAAAAATGCCACAAAATTGATTTATTTCTATTTCCATCCACAAATAAATTACTTCAATTTTGTGCTTCAATTCAATTGTTATTCAATTCGATTGCCGACGTGTGAAGACG:1 + chr3L 26741168 5' + F-element 17 1 64.39 TAATCGCTTTTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAA:1 - chr3L 10112260 5' + I-element 81 1 71.03 ATGGTTAAAACTAATACACATGGGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCC:1 - chr2L 19140419 5' + Max-element 8283 2 63.39 GGAACTTCGTTTATGTTTAAAAGTCAAAATGTATCACAATTTTGATCATTTTGTTATAATAAATACGGCTGCACCTGTCACAATGCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 17047932 5' + 412 16 2 70.40 ATTAATGTTCGCGTTGCGTTTGCAAGTGCAATTCTTGGCGTTTATAATATGGGGCACTCTCCAAGTAAAGGAATCTTAGATTTCTGTTTATTAATATTGATTGGCATTGTCATAATTAATTTGAATTAATATTCAAAATTAAATTT:1 + chr3R 9396598 5' - hopper2 20 1 61.64 CGTGAACAATGCAGTATTATTTAGTTTGCGCTGGCCATTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCAATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 + chrX 18239120 5' + jockey 87 1 70.83 TATATAACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3R 18528290 5' - roo 9002 2 69.85 AACTGGGCTTATGTAGCTTGCTGGCTCTTTAGCTTTTTTAGCCATTTGGGGTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 21013815 5' + roo 8679 2 73.33 AAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCTAGGTTATAAAA:1 + chr2R 5582148 5' + Cr1a 467 1 59.59 TTCATTAAATTTTTAATCAATTATTATCAGTGTGATACTTGAGGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:2 - 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INE-1 561 1 67.91 AAATTCTTGGCTCGACGACATATTTTAAACAACGGGAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3L 2330195 5' - roo 9021 2 51.37 GATTGTTTTCCAAATACATTGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr3L 24766008 5' - 1360 3340 1 80.14 GCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chrX 1103581 5' + pogo 19 1 68.89 TAGACAGTCAGTTAATATTTAAATGGGTAAATTGAACCATCATAGAAACCGAAGCGGATATGCTCTTCAAATTGAGAGATATCTAAATAGGATGTCAAGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTAC:1 - chr3R 28448678 5' - roo 308 2 71.03 GACATAAGACTTAAAACATGGGTTGTTGCATTAAGTAAAACTTACAATTAGTTTTACCTTAGAAAATTATTTGAAAACTATATGGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTA:1 - chr2R 21870289 5' - copia 5088 2 46.58 AACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 24673658 5' - roo 352 2 57.53 GAGGTAAAAACATTGGAAGTTAATTGACTCTCAAAAATTCTGATATTACCCAAAAACTCCTTTAACTATCTACGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTACCGGACTATCAGATACCCGTTAT:1 - chr2R 5498495 5' - INE-1 551 1 51.72 GATAACACAAGTTATATTTTCCAATGTTTATTCTACCAATTCCAGGTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:2 + chr2L 21642977 5' - Tabor 475 2 78.08 TCCGTCTTTATTTCTGGGCACTTACTCGTGTATGACAATTTCATTGATATTTCCCTGCTCGCGGTGCTTTGGACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAATACCTATGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTATAATATCAATAGG:1 + chr3R 31887298 5' - HB 1542 1 56.85 CTAGCTTTATTTTATAATTGCCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCC:1 + chr3R 25711636 5' + flea 4704 1 73.88 GTAACGCATTTATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAG:1 + chrX 7480749 5' + Bica 338 1 68.18 AAACAAAAATAACGAAAACGATTCGACGGAAATACAGTCGAACTTCCATAGTTCAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAAC:1 - chr3R 19880681 5' - FB 715 3 62.76 GCACTGAATGAGTTAAGAAAAACTATATTATCGAATGATCTTAATAAATCCTACATCAATCAGTGAAAATAACTTAAACTAAGAAAGCTTAGAACTTATTTTACAAACCAAAGATTAAACAAAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTCC:1 - chrX 22672496 5' - INE-1 573 1 48.63 GTTCCCTATCTTAATGTTTATAACTTCCTTTCGTAACTCACATCGTATATTTTTTATGACTTTTACTTGCCCAACGTTTTTTCATTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTTACTTAAGAGACTAACAACAAGTTTTCAAATCT:1 - chrX 13818547 5' - Doc3-element 4669 1 56.85 AGGACCAATTAGTAACAGCTTGGAAGTACACCATGTACTGACTGCCATGTCACAAGGAATTGGATTTTGGTATTTACTGTATAAACGTATTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 - chr2R 20911066 5' + mdg3 5304 2 39.04 GGGCGCCACAAAATAGGCAACAGTATCCAATGGACATTACCTTAACCTGGTCATAAGCTACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGAAATTGTGATCCATCAC:1 - chr2L 6388156 5' + jockey 68 1 55.48 GAAATTTGGAATTTAGATGTATTTTTCAGGAACAGAAAACACAAAGAACAGAAAAACGAAATTAGTTGAGCTTAGCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 - chr3R 7778368 5' + transib2 42 1 54.86 CATAATACAACATGGGCAAGTGGCAACGATTTCCTAATACATTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr2R 13293367 5' - roo 330 2 71.03 CACTGGGCTACAAAACATCCAGAGCAGCAGCCCAGAGGTACCTCACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 - chr3R 27810105 5' + Burdock 62 2 66.42 TTTTACAGTCGCCGGCAAGGAGATGCGACATCATCGCAGATGCCATGAGGACTCGGGATCTGGAACCAGGTATCATGAGTCTGGGTTGACACTTTACTGCAAGAAATGACTAAGCCCCTGACTTTGAATGTGTGTGTGTGTGGGTG:1 - chr2L 21778359 5' - accord 186 2 60.27 TATTTACATACGAATATCAGTTCGCGAGCTAATTTGAAAATGTTTTGCCTCCACTTTAGTTAACTTTGTGCTAGTTCTGCCTTCTGCAAATATTTGTTAGATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr2R 10160652 5' + hobo 22 1 64.38 GATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTA:1 - chr3R 15790116 5' + flea 4739 1 64.38 CGACCCATCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr2R 21820727 5' + Doc 49 1 59.13 CAATAGATTACATTATTGGGAAAATTACGAAAATTTCCAAAACTCAAAAATTCTAGTAGTAAAAGAAATTCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTTAAGAGAGATTTTCATATTGGCTTGTTGTAAAATATTAATTATTTT:2 + chr3L 25208718 5' - TLD2_LTR 105 1 53.42 AAAAAGAAGCAAAAGTTCTGTGACGCTTATTGTCTGCGATTTATTTTGCTACGCCGAAAGGTTCAGTTCCATTTATGCATGACTAGTAGACTGATGTGGGTTCATTTGAAGAAAAAAGTCGCAAAAAGGTCACCAAACAACCGATC:1 + chr3R 27026338 5' + S2 1286 1 61.64 AAGCTGAAGACCACACAAAAAGGTTATTAATATTATCATATGCATTTTGAATAATTTATAGACAAATTAATTTATTAAGTTGTTACTTGATTAATTAGTTCATATTTGTTTTTCCATTTCTGATTACAAATTAAAACAAATCCAAT:1 + chr3L 4639086 5' + frogger 241 1 71.23 GGTTCATGATAATCAAATGCAATTTTGCGTAATGAATATTCGTAGATAAACTAAATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATATACATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCATGTC:1 - chrX 21575373 5' + INE-1 92 1 57.53 GCAGATATGCGTTCGGATATGTACATTGTACAATATTGCATAAATTATTAATGCCAACTTTTATTTTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGA:1 - chr2L 18911521 5' + jockey 4559 1 54.79 ATTCGAGCTGTCAATAAAATCCCACAGCGGTATTCCCGGAAAACATACAACTAGAAATGTAATTTTAATCTTTTCACTTTTGATGACTTCATTAATATTTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACA:1 - chr2L 9418634 5' + rover 21 2 67.81 CTTTAAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAAC:1 + chr3R 7778254 5' - transib2 2759 1 66.44 GGGGGGAGGGACTGTGTGTTGTTTGCTGAGGTGACTCACAAAATTTCACTAAATGTACTTTACTTTCGTTACTTGACTGAAGCTTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATAACAAGTTTTATTTGTAAGCCCCTGTGTATATTCTCGT:1 - chr3R 30116461 5' - Doc3-element 4436 1 62.33 ATGCCGTCGCGACGTGTTAATGTTTTGCACTCAGCTTAAAGTGCGGCAATCGAAAGGCCCAGCATGAATTTCAGTCGAAAGTATCTATCTATGTATATATGTAGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 + chr3R 8849713 5' - 297 381 2 75.17 GGTGGCTAGTTAAATGTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAACCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 24673696 5' - roo 394 1 75.52 CTTGAAACCGACGGGAGCGAATCAATAATCCTTCAATTGTTGTGATTACTTCAATGGCATGGGACTTTTCACAACTGCCAACGAACGCTGACATTTCCAGGACGCCAAAGAAAAACTAAAAAGAGAAATGTGAGAAAGATTTTTCA:1 + chr3L 11985142 5' - Tc3 25 1 71.23 AAGTTCTTCAAATCCGAAAAGACAAGTAACATGATCATGCGGTAGAGTTAATCAGGCAAAGAATTCATATATATTTTATCCTTAGACCGTGGTCCATTGATTGAAGGATGGCGGGATGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGAT:1 - chr2R 17696615 5' + F-element 4609 1 78.77 TCATCACATTGCATCAATCAAGTTCCTTGCGATATTAAACCGTTATTTTTTCAGATCGATGGTTTGCCACTTTAAATAAATCCACTGCTCGGCTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAG:1 + chr3R 28492619 5' - accord 7217 2 49.59 GTTGGCAAACGGAATCAGAGACCCAAGCAGAAAATTCACAGAGAGCAGCAATGGCCGTCTAGCGTTTAAGTTAGCAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCTGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAA:1 - chr3L 17552455 5' + Quasimodo 6935 2 55.17 GCAGCTCCAGATTAGAAAGCTTAAGTCCCTGGTAAGAACACACATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 18205762 5' + 412 16 2 71.92 CTGACCACCTGCATTTATATGGCGCTCTATCAGTACCACATATCCCGTGAACCCTTCGCCGCCAGCGAGGTTGTCAAGGTGAGTTCATATCTGCACTGCGAGAAAATGCCACTCTACTCTACTTTTTTGTATAACAAAATTAATT:1 - chr3L 11183690 5' - Juan 4067 1 73.79 ACCGGAAGTCCTTGATGCAAATGTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chrX 7741918 5' - hobo 2892 1 77.89 CCGGAGAAGTGTCCCCCGTTAAGATAAAGTATATCAATTTATATATTTTTGGATTGCCCGTAACATATTTCCGGCCATTAAACGAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCTGGGGGATCCTT:1 + chr2L 2078434 5' + baggins 5362 1 57.53 GTGGCCTTCGTTCAAAAATTTTAGATAACGAAGTAGTAATGCATTTTAATTAGATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3L 9470065 5' + 412 23 2 69.86 AACAAATCTCTTTGAATGGCCAGCAATTCTAAAGGCGATGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 + chrX 6632966 5' + P-element 68 1 31.54 GGTAGGATAGAATACTGTCTGCACATTCACATCTAAGCCATCTCTGGTGAAGGGATTGAACACGGAGGAAGGGAACGAAGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTG:1 + chr3R 14223393 5' - roo 37 2 64.23 CTGCAACAATTTTTCACTTTATGCGATATTATGCTGCAATTATGTGTGTCATTTTCACCAACCCCCTTCCGCACTCTCCTTCTCATTCTCACACAGTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCAC:1 - chr2R 17356212 5' + blood 7181 2 79.23 AAGGTAAATGTCTTTGGTGGGCCACCTGAAAGTAGGCAGCACATTTTAATGAGCCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr3R 25795860 5' + jockey 10 1 75.00 CTTCATCTTGATGTGGAAGTGGCAGTGGAGTTGAATATCACGATCACAGCCCTATCGATTTGAATTCGATTTCGGAACCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTA:1 - chrX 16124500 5' - accord 7201 2 61.90 AAATATTCCTCCCAACGAGATGCGTTGCCTATGCAACAGATGATCGGCGATCCGGTGGCTGTAGTGGATTACCTTGCGCGGCTGATGAATTATATCTTAAGAACTATGTT:1 - chr3L 13007301 5' - 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chr2L 21031007 5' + FB 61 1 59.59 CATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGCGTAAAG:1 + chr3R 9125680 5' + Doc 89 1 70.55 GAGGACGTACAAAATTAAGTTCACATCTAAAATCTAAAATACACCCGACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGATGACAAGCGTCGA:1 + chr2R 1000277 5' + HMS-Beagle2 6849 1 58.33 AACATTACCAAAGTTGTCGTCCTTTAGAATTATTGGATTATATTTTCCTAGTCGTGTTTGAATTCATATGCCTTTAGTTTATTTTGTTGTTTCAGTTCAGACGCTTCAAATGATTATGACGCCACCGATGCGTACGTTTTT:1 - chr3L 26695587 5' - 3S18 262 2 51.06 TCTATGTCATTTGGCCAAAACGAATCATTTACAATAAACCATCTTCAAAGCAAATGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCTTC:1 + chr3R 17099896 5' + Tirant 8122 2 64.21 GTATGCAGTTTAATATGCCTGAAAGTACATATATCCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 11513473 5' - roo 8989 2 72.41 GATCAATCGAGTAGAAAAACAATTCAATCGCGTCAATATCATCCTGATACACATATCGAATCTATCCTCGAACGAGCGAGCCATTGGCGATGTCAAGGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCC:1 + chr2L 21778651 5' - Stalker4 195 4 67.81 AAATTGTGTGCATGTACTAGTTTTCACCGTTCATTTCATGATCGTAATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 - chr3R 12363831 5' + jockey 4698 1 64.84 GGACCACTTTTGCTGGCCACTGACTCCACTGACCCTTTAAGGCACGCCAGATCCTTCTCCTTCTCCTCTCCAGGATCACTCTTCACTTGTGGTGATCGTCCTTCGGTGTCCTTCGGGC:1 + chr4 145843 5' - gypsy8 498 1 83.05 AAGACAATAAATAAATAAAAAAGACAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTG:1 + chr2L 102439 5' + P-element 2626 1 17.12 TAATGAACGTCGCTTGTGGACCAGCTCGAAATAGAGGGGGAGGAATTAAAAACACGCTTTACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTA:1 - chr3L 25162409 5' + Bica 4681 1 56.03 AGAGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 - chr2R 17332203 5' + jockey 90 1 72.60 AATGCGTTAGTCGGTCAGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3L 23146434 5' + 1360 23 1 69.66 GCTTTGAATTGCATTTTCCATTTCCATTTATATTTCCAAAAGATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGG:1 - chr3L 21262641 5' + jockey 4552 1 69.86 AGATCCTAGTGAGCGGCGGCCTGCCGAAACTGGAGACCAGCAGGGTAAGTTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chr3L 9212687 5' + hobo 11 1 63.10 AAAATATTTGGTCTTAACCATCATGATTAGGCGGCCATTGAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr2L 5792120 5' + blood 7031 2 70.07 AAATAAGCAAAACAAATAAATCTAGTTCAATGTTGTGGCCGAATATGTGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCA:1 + chr3L 13001458 5' + gypsy 68 2 67.86 CCATTCAAGAGCTGTATTGCGGTCTAGGTCTAGGTCTTCGGGCTAGAAGCTGCCTCTTAGCCTCTTATATAATATGAAATATCTGCTGACGTTTTAACCGGTGCTATCCTGTCCACTGGCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAA:1 + chr3R 3697511 5' + Doc 224 1 54.79 CCCCTAATAATAATTGAACGATGGGTACCCCGAAAATTAGAATCAACCGAAATAAAAAAAGGATAACAAGAAAAACTAACCGGATTTTCTTTTTTTCCCTATCTACACATTCCATTTAACAAAAATAAGTGGGATAAAAAGTCGAT:1 - chr3R 31898359 5' - HB 81 1 66.44 GATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGTCTACATACATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCCTACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 + chr3R 18635227 5' - opus 7438 2 73.81 GAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGACCCA:1 - chr3R 23601764 5' + jockey 64 1 57.78 ATGTCAACTTTTATGCTCCGTAAGGGTAATGTTTTCACAGTGAAAAAGATTTGCTGCAGATTTGGACACACCACAAGGAAATCCAGGAGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCTCAA:1 + chr2L 10957432 5' + 17.6 262 2 60.27 AATGTGAAAATGCATTTGTTCCAAACATCTCAAATGGCAGTGGAAAAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGTACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3R 17258165 5' + 412 75 2 66.44 AGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGGTAAACACAAA:1 + chr3R 7507158 5' + Doc 81 1 72.73 AACAACAAACGAAGTTTTGCGAAAAAGAATTTTGTTAGCAATGCTAGTAAAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTC:1 - chr2L 15056245 5' + jockey 4756 1 65.75 TACACAGCCAAAATGTTTAGTCGATTTCGTGTATTAATTATGTTCACTAATCGTAGAAACATATGTGTGAAAAATGTATTGATACTCCTTCATTAACCTATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr3L 18381905 5' - copia 233 1 58.90 CTGTCGAGCTTTTATTTCATTGCAGTTGGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCAT:1 - chr3L 15723921 5' + jockey 4750 1 80.30 TTTGATAGAAGAGGGATTTTAATAGTGCACAAAATGGGCAACGTCCTTTGTTATTCTTATATATTGTTAACTTAGATGGGTTTCCACAAAAATCGTAATATCAGCACATTTATCTTATTTTATTCTTTAATTATAATGTATACAA:1 + chrX 7045313 5' - G5A 2740 1 87.59 TGATATTTACAAAAAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACC:1 + chr2L 2120372 5' + I-element 4965 1 58.22 AAAAAGAAAAACATGCATTTAAAATCACTTTATTGTTATCCAGGTGGGGAGCGGGCCAAGATGCAATTAGCCGCGCATCCGAGAGATCGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGC:1 + chr2R 16920692 5' - jockey 4599 1 65.19 ATTTACGGTCCAAGCACTTTTAGTGGCGTAAAATTAAAATCAAATGCGCTCGGAAGTGAAGTTAAAGCACCAAGTGCATTTAATCCAGTCGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 + chr2R 7599118 5' + diver 5918 2 63.45 AAGTGAAGTTAAAGCACCAAGTGCATTTAATCCAGTCGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTC:1 + chr2R 7599171 5' + diver 84 2 71.92 AGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAAC:1 + chr2R 12065590 5' + Stalker2 70 2 64.38 GGGTATAATTAATCATTGCGTTCTCTGGCAAGCGGAACAATTAGCCAGCAGGCCCAAACTCCGCCCCACAGTTGGGAGCAGTCAACGTGCTATCTTACCAATTAACTGCAAATCAAATTTATTCAGGCCGCCAAGTCTTCGGTTG:1 + chr3R 15066244 5' - gypsy10 5885 2 62.07 ATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATACA:1 - chr2L 22684598 5' + transib3 73 1 58.22 TTCCATTCTATGCGCTTCTAGTGGCCAGCTAAATTTAATGGACCGTTCCATTTTCTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTAC:1 + chr2R 17332147 5' - jockey 4928 1 60.27 AAATTAAGTCAAATGCCAAACAACGACGAACGCCTAAAAGTCTGCAAACAAAGAGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2R 17332254 5' + jockey 35 1 66.43 CTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGGCG:1 + chr2L 3960204 5' + jockey 33 1 58.82 ATACCCTATGAAACCCAGTTCTTAATCATACTAGTTCTAATAGTTAATTAGTCGACATTCTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr2L 2494789 5' + Doc 29 1 64.38 AAATATTTAAATTCAATAGCAGACAATAATTATTATTAAAAGAACTTATCAAGATCTTAACGTGTAAAAATGTATTTCCTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGA:1 - chrX 367109 5' - Ivk 122 1 54.11 AAATAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATA:2 - chr3R 11151910 5' + mdg3 58 2 56.85 TATAGATTTTCAGTAATATATTTTGGGTATTAACAATAGATTGGGAGTTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGT:1 - chrX 18937565 5' + FB 75 1 67.81 CAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 - chr2R 10910298 5' + Tabor 6879 2 54.39 ATACACTCAAATCGAAGATAACTTTCACCGCACATTTTTGATGTTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTC:2 - chr3R 13349633 5' + Ivk 14 1 74.66 CACATTCGGGCAACAAAAAAAAATTGCCAACTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr3L 4524002 5' - roo 8984 2 77.24 GTTTTGACTAATCTACCAGTTTTAGAGTTTTAGTTTCCTTATCAAATAAATGACGGTATTTCTTAGTTTGGGTACACTAATTAGATATGAGTAGTAGCTTGTAAAATTATATGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chr3R 7664626 5' + I-element 10 1 75.34 CGGGCCTCTTTCGGCCGTCAGTTGGGCGTTGCGATAAAAATCAGTCCATGCGGCTACGCTTGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAAT:1 - chr2R 17544244 5' - gypsy5 7286 2 60.27 ATATTAACTCAGGCAAAATGCACCTGCATAATTCCCTCATTGTTGACTGACAGCTGAGTTTTCAATTCGAAAATTCCCCATTTACTACCCCTTCATCACTCAAAGATCCCCCTGA:1 - chr2L 9725426 5' - baggins 5370 1 71.30 GGATAACTGCTGGAGAGCCGTAGAAGGAAGCCCTGCTAAATCCTTTACGAAATTGGCCAAATAAATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTT:1 - chr2R 19186734 5' - 412 7270 2 50.79 CATCCCGACTTGTGTGTGTGTGTGTGGGCCCAAATGTGTCTGTCCGTCTGGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 - chr2R 15528545 5' - 1360 3360 1 54.63 TAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACA:1 + chr3L 17921963 5' - copia 5042 2 73.29 GTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGCCTTATGTATGAGCGTTAG:1 - chrY 3648876 5' - Stalker2 7399 6 75.00 GGATATATTTTTCACAGAAGCAGTTGAACCGTATCCTTTCGGGGAACTAACTGAATGTCCTGCGCTGTCTGCTCCTTTGCCTTTGTTGTGGTTTTTTTACGGAAGCCTTACTACAAGGTAATGATTAACAGAG:1 - chrX 1831694 5' - Q-element 336 2 73.68 TTTTAACTTGAAAATCGGTGCTTTGTACAAAACGAAGTCGATAGCTTCTAGCCAAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGT:1 + chrX 12907018 5' - Tirant 8435 2 63.01 GTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGCAGCAGAAACG:1 - chr3L 18253858 5' - blood 7300 2 78.77 TGAGCAAACAGCAACAACAACTGGTTGCAACATTGACCACAACAAAAGGAGTCGAGAGACTTGCATTGTTAGTCCCTTCTATGTATATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAC:1 - chr3L 14302315 5' + Quasimodo 21 2 70.55 AGCTGAGAAGTTAGGTTGCCTCGATACCAAAATGCACATCGAAATATACAATATACAATGCACATACAAAATACAATACAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTAAAGCTACGAATAG:1 + chr3R 7450281 5' + Doc 37 1 40.00 GTTTTAAATTGTTTTATATGGATTTTCTTGTATTTTTGTAATCATGACCATTACGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGG:1 - chr3R 20873797 5' - 297 6601 2 59.23 CTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGAATCGTTGAAAAGTAATATGAAGTATATATGTTCTTGACCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCCACCTGTCAGTCCGTCTGTCTGTTCATCTGTATGAACGTCGAGATTGCAGGAACTATAA:1 - chr3L 25245594 5' + INE-1 145 1 71.23 ACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chrX 7706743 5' - P-element 2835 1 44.85 ATGTACTATCTATTGCTTCTATATTCATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr3R 6461850 5' + 297 6634 2 58.22 ATTTTCTGTGCGTTTTTCTTTCGCTCGTGTCGAGTCGTTCAAGCTGTGGCATAATTTTTACGCATTTCCTCGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAG:1 + chr2L 16611991 5' - hobo 286 1 52.05 AATTACTACATTTTCTCGGTACGAGCAACATAATCGCAAAGTAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:2 + chr2L 14239095 5' + 412 18 2 73.29 GGCGACCATGCCTCACGAAGCGTGCGGTAATTGGCAAAAGAAACACACCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCAACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1 + chr3R 20450430 5' + hobo 71 1 69.29 CTTGGCCACTTCGTGAGCACCTTCGTTTCGCTGGCGTTGCATAATGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGGTGAGAGGAAAGGTT:1 + chrX 19887053 5' + P-element 76 1 33.10 GTAATGTATGCATTATACAACGAATACGCAGTTGAAAAGGTTAAACGAGAACTAAAACAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2R 9769535 5' + 1360 63 1 59.59 ACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3L 14375599 5' - roo 9030 1 54.11 CTGATCCAACATAGAAATACATACGAATGGCCTATCAGCGAGTTATGAGATAGTCAAAAGGAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chr3R 25862677 5' + roo 59 2 58.90 CATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACAC:2 - chr3R 7616837 5' + Stalker2 48 2 54.11 AGAAAAAATACGTAGTGTAATTTATGTATATGGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACA:1 + chr3R 10437005 5' - BS 5074 1 71.23 AGCATTCACTTGCGATATTTCGGTCACACAGAGCGCTTAACAGCATATCGTGCCAAAATGAGGAGATATATTCTAAAACAGTAAGAGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr3R 20635378 5' + 1360 31 1 64.38 AGAAGGCGTTCGCCCTCTCGGACATTGTTAAGTTCATCCAGCACAAGGTGCTGCAGTGCAACAAGGAGAACTATGGCCAGTGCGTATGAGTAAGAGTTTTTGAGGAATAGAATGTTTATGCAGATTTTAATTTAGTAGGATTTAT:1 + chrX 7232427 5' - jockey2 3218 1 57.93 GCGAATTACAACTACAATGCCGAAGGTGACGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 + chr3R 14277892 5' + P-element 73 1 35.62 GATTGGATTGCGATTGGGTATGCAGTTTAATATGCCTGAAAGTACATATATCCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGACATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3R 11513456 5' - 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chr2R 11728670 5' + Tc3 310 1 68.49 GTAGGGATAAATGTGTATAATAATAAAAAGCAAATCTTCCTTCTTCTCTGTGACTCCTAGAGATCTGGTTAAAACGTAGAATGGACTGTAAGAGGGCGACGATTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGCATTTT:1 - chr2L 21294949 5' + Cr1a 171 1 68.49 GCTCGTACATATATTATTCGATATTGATTATGTACGTCCTGTTCCTCTAATACACAACTCATTTGTTCGTTCGCTTCCTCTCTGTCGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1 - chr2L 22690084 5' + Tabor 14 2 76.06 GCTTTTGAGTGCTTTCCACCTGAGCACAAACTTAAGTGGCGAAACTTGATTAAAACCGCCCACAATAATAGCAAATACATCGAGTTGCCACTGGGTGGTACGAGTAATGCACCTTAATACACACACACACACACTCACACACATTC:1 - chrX 7769555 5' + accord 7031 2 51.37 ATCGAAGAAAATCGTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr2L 7652168 5' + roo 30 2 55.80 ACAAATGTGCACTGTGAAAAAGAGTGCTACCAAAATAAATAACGTCTAATTTAAGAACAGAAACTTAGTAGAAGATGTATTTAACAATATGAAAATTATTTATTTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAA:1 + chr3R 16818876 5' - Ivk 5351 1 60.27 GCAAAAAAAAAACAAGTGCACAAATCAGACAAAAATTGCTTGGTCATTCGCCTTTTTACAGAGTTATAGTTATGAACATATCAAGCCTATCCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACC:1 + chr3R 13564356 5' + G4 25 1 59.42 GCCATGCACTTTAGAGCTGTGAATCGGTGAATATTTTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATCCACACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 19031332 5' + roo 50 2 55.00 AAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTC:1 + chr2L 2120385 5' + I-element 4978 1 67.12 CGCGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATT:1 - chr2R 18344605 5' + 1360 35 1 69.32 GATTCATCAGGTTTAGTTCGTCCACAGTGCGCAGGTGCAAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCTAC:1 - chr3L 363455 5' - blood 376 2 63.72 GTTATCATCTGGTTTGGTTTGTTTGTATTTGGTGTGCGTGAAATGGGTTGAATGGAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr3L 15364935 5' - 1360 3355 1 60.27 ATGATACTCGTACATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr2L 17626701 5' - roo 9028 1 56.16 GATGTGGCTTTATCACCAGTGCCACATTTACCGCATTTTGAAGTGATTACCCAACTGCGGTTGCCATTTAATGTGTTTAAAATATTTCGAATTAAGCCGCTTTGTATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGT:1 - chr2R 11095884 5' - diver 208 1 73.29 CAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATACGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGCA:1 + chr3L 14375622 5' - roo 9049 2 53.85 TATGCCTAAAAAGCCGCTAGCAACAATTTGTATGCCAAACACTAACGCCCACTAGCACATCCCCAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACAGAG:1 + chr2R 11040107 5' + accord 7104 2 75.61 TCGTGTAAATTTCTTTCGATTTGCTAAAAAACTTTTTGCCACGCCCATTTTAACGCCCTAAACCAGACCGGGCACGCCCACACTTTGGAACAATTTTTCAATTTTTTCTCATATTATTCATCAATATCTGTCGTTATCCCAGAAAA:1 + chrX 4797164 5' + INE-1 499 1 72.60 ATGGAATTTAATTTGCTAATACGCTTCGTTGAGTGGCAACGGGAGGCGTTTTAGTGGGGTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr3R 20934637 5' + 412 7080 2 65.75 GAACACACTATGGTTATGATTAAGAACTATTTGCTATGTGTTTCCAATTACGCGCAGAATCTATTTTAGTCTCTTTTCTGTCACACATATATACATATTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTT:1 + chr2L 13138933 5' + McClintock 14 2 76.71 AGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATG:1 - chr2L 12486418 5' + roo 8731 2 66.21 GTCTTCCATTTACACAGCATACTTTTAGGGACTACCCCACACACACACACACACACACACAGAGAGAGACATACACACACACAGAGACACAATCGCGCACACGTGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chrX 18144009 5' + jockey 14 1 73.38 GAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr3R 16276438 5' - pogo 2058 1 57.78 GCCTGCGCCCGGGACAAAAGTTTATCTCGCCAGGCTTTTCCGGGCGTTTTCCGAGGGAACGAAATGCTTTTTGGCACCACTATTCGTATCCCCAACGAATTTTTTGAATCGCACACTCCAACCGCCTTCAGCAAGGATCACCGACA:1 + chr3L 996120 5' + Chimpo 3831 1 58.90 CATCTTCTCCTACGCCAACAACAACAATAACAAAAGATACGGAAACCACCTCATATCTGGTTGAAACAGATTTTATTGGAGCCAGGCATAATGCCCTTTATCAGTATGTGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCAC:1 - chr4 901820 5' - invader1 3995 2 73.97 TATTTATTAAAACTCGCAATCATTTTTCTTACATTTCTTATTTCAGCCTTTGTCGCAAAATTATTACTCGTAGAGACCCTATACTGTAGATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 + chr3R 20872067 5' - 297 368 2 67.81 TTAAACAAGTATTTGGTCAAGCTTATTAATGCTTAGTAAAATATAATTTCAAATACCCGTCAGCCGATTGCATGCTAAAGCATTCGTATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGT:1 - chr2R 3901514 5' - Quasimodo 29 2 65.75 TTGTGAATATGGCGTGGTTCTGGGCGGGATTTGACCAGCTTCTCCCAACATCTAACCACTTGTCACAGCGCAAAACCACGCCAAACGTAATGGCATATGGCATGCATCATATGTGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAAT:1 + chr3R 12520684 5' + Burdock 8 2 78.77 GGGATATTAATTGATTAGTATCTGCCCCAAGTCAATAGGATATCCCTAAATTCCAGTTTTTCGAATGAAAATCATCGTTTTGGTCAAATGAGCGTTAACAAGTGTCAATTACATACATATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATA:1 - chrX 2336018 5' - Quasimodo 469 2 76.71 AGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3R 25751886 5' - roo 343 2 65.07 ACAATCTGAAAAATATGAAAAATAAACCATCGCTGCGATGTACTGAGGCTAACATTCACGCCAAGGTTCCCCTCCATTGAGGTAGTGCGAAATGCTTTAGAGGGAAGTTGTTCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGCATTCTCT:1 + chr2L 21950002 5' + INE-1 574 1 56.85 AAATTATATACCATTCAAAAGGCTTTCTGATTTGCTATTCTTGCAGGGGGTAAATCGATTTAAGTTAGAAGTTTTCAATGCAGTGACGATCATATACTCCTACTCGATTCCCCGCGTTATGAGAGCTGGAGTTCCGCAGGGCAGCG:1 - chr4 409438 5' + BS4 70 2 65.07 CTAGGAAAATGCACTTCCATTCGGGTTTAGTCCAATGCAAACGGATATCCCGGTTGATAAATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGA:1 + chr2R 23106556 5' + jockey 4534 1 57.53 AATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATT:1 - chr2L 8574450 5' + Transpac 4989 2 67.12 ATTCTTGGCTCGACGACATATTTTAAACAACGGGAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr3L 2330193 5' - roo 9035 1 54.62 GTATAGATTCAATAGAACTGCTTTTATGTTCAAAAAATAATCTTCGCCCATCGAATCAATTCCATAAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCT:1 - chr2L 8574516 5' + Transpac 4 2 80.14 GTGAGGATGTCAAATGACAGCCAACCACGTACTCTTCAAATTATTGACACTCGGCTGGATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGA:1 + chr3R 18493441 5' + Stalker 7171 4 60.27 CGTCTGTGGAAATTTCAATTAAATGCGCACATGCCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATA:1 + chr2L 19310282 5' + Juan 4092 1 61.64 GTCGTTGCCCGCATGCCTGAATGCCAATTCTACATGTCGTTTTTAATAACTGTGCCAATCGTGTGTTCCGAGCACTACTCACCCATTCCGTCCCATCGCATCCCATCTCGGCCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 - chr2R 9340272 5' - 412 7538 2 78.08 GGGAAATCTTTATACAAAGTTATTCGATTTAAGCCCCGCCCACACTCTCATGAATAGAAGTAGTAACATTTTCCTTGTTTCGTAGCGTTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1 - chr2L 23068969 5' + 1360 32 1 63.70 CAATGTCTGAGGAGGGTTCAATCAGTTTCCAGTAATATTTCACTTTCCATTCTTTGCCTACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGACACTTTGTACATTTTGTTTT:1 + chr2R 10160869 5' - transib2 2764 1 57.53 ATTCGCGAGCAATTGCTGAAAAACTTGTCTACAAATAGTACTTCATATATAATGAATTATTCAAGTGAAACTGCTGCGGCTGATGAATCATTGGGCTCCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTTAAAAAATCAAGCG:1 - chr3L 23821899 5' + X-element 404 1 29.93 CGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr3R 14277921 5' + P-element 63 1 21.50 ACAGTTTAAAGCTTCAATAAACGCAATAGTTAATTGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCTGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGTAACGAAGACATA:1 + chr2L 4113062 5' + Porto1 4373 1 74.66 TTCACACCTCGAAACGCCACAACATCTCACACATCTCCGCCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAA:1 - chr2L 9602346 5' + Tirant 471 1 71.43 GACGTCAGCGGTTCAATCGCCCAACTGTCGCCACATTAATAAATCAGTTTAATTTAATTCAGTTGACAGCTTTAAGTCAATATTGTTGATTAATTGTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr3L 11396049 5' + I-element 25 1 69.18 AGGCTAAGCTAGAAACTGGATTTAGTTACCATTTTAAACTAATTTACCACAAACACGATATTATCCTTCATGGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAG:1 - chr2L 19140488 5' + Max-element 8240 2 79.71 AGAATCAGTGAACAAGTTTAAAATGCCATCGCAGGGCAAAATAGAAGAATTCCAAATAACCAAAATGGGCTGAAAACCAAAAAAATAAAAATCAAAAAATGCACACAGGTCGATCGTTGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAG:1 + chrX 4986173 5' + transib2 2707 1 82.19 GAAACATAGTTCCAAACCATGGAAGTTGTTAACTCTTGAATAAACGCAATCATATTAGCCACAAAAACCTCCATTACGAATCCAGGACAACGCCATACTCGAGCTGCACCAACAGTAATACCGGACATTAAATATTTTCAGTTTTG:1 + chr3L 25764245 5' + Juan 71 1 35.62 TACAATAAACCATCTTCAAAGCAAATGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGC:1 + chr3R 17099925 5' + Tirant 8186 2 83.08 CTTTTATTGCAGGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:2 - chr3R 22494204 5' + 297 6631 2 54.11 CACATTAAAAAATCACTCGCTCAATCACTCTAACTCGACTTTGCCTTAGGTGATCGTTTTCGCTCAACACATCGCCTGATACAATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 19863913 5' + roo 8702 2 58.22 AAAGAGCTTAACTTAACTGATTTGCAGCAAAAAACAAAGTACATTTACTGTTAAAAGGCAGCATGATATCTTTAAGAATTGGTAATAGTTCGATGAATATTGAATCCAAAAGAGACATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTT:1 - chr2R 16591959 5' + Cr1a 4295 1 63.70 ATGGCCAGGTAATGAACACATACATATGTACATATACTTTTAGGGGTATATGCGTGCAAAAGTTACGGCTTCCAATTTGAAATTACTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 12379823 5' + roo 35 2 61.38 GTACCGACACCCACGAATTAAAAGCAGGCAGCACGTAATGCCGTTGCTAACAAGCCAGGAGTTTGGGATAAAGCCAGAACTATTATATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chr3R 28406485 5' + opus 7140 4 67.86 CCGGCACGCTCAATTGCCAAACATTTTCGAAACAACCGAAGCCCGAAACACTCGAAACGTGTAATGAGTACAGTGCCGATGTGGAGTAAAACGAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr3R 19223394 5' + FB 31 1 63.01 TTACCTGTAAAATTAAAGTATAAAAAATCGTTGTTTTTTTGTATATGATGACGCGAATTGTGCGTAGCACTTTAAGGACTGCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAA:1 - chrX 20968856 5' + Ivk 303 1 76.85 CCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr3R 18528355 5' + roo 78 2 72.60 TCCAATATAAATCAATCAAACGTACGTTCAAACCTCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCT:1 - chr2R 7947491 5' + Tirant 8206 2 75.69 ATGGGCCTACACCAAAGAGGTTTATGAGTATTAAGATCATCCTTATCAAGAAATGACGTTATCATCAATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGT:1 - chr3R 15282962 5' - 17.6 60 1 56.16 ATGCCGCATATTTTATGAAAGGGACAGTTCACTTAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 28450779 5' + roo 8702 2 54.11 AATTCGTCCAAAGTAATGCAGATAGTAACAAATTACTCTAAATTTCATTTTAGCAAGATACATTTTAAATATGTTTTCAAGAGTAAAGTACAAGATTTTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCTGGAGGCC:1 - chr2R 19265732 5' - TAHRE 10081 1 63.45 CAAACAATCCGCCGCTTATCGGATGAACTGAGAGCCGGATGGGCAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACAC:1 - chr3L 3308824 5' - R1A1-element 5273 1 66.67 GATTTGTGTTTAATTGTGGAAAAAATGATCTTCCATTTAAAGACGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGCAGGCTATATATATATTCCGACTATATATAAAGTATATATATTCGCATTCGCACTAACTAAGTAACGGGTATCTGATAG:1 - chr3L 25839275 5' + INE-1 547 1 70.55 AAAGGAATATTATCTTTACTACCTAAAAGTTAAATATTTTAGAATTATCATTACCAAGTTAATTAATTAATACAAAGAATATAAGTGTTTTTACTTCTATGCAAAGAGTATTGAATCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGA:1 - chr3R 9233414 5' - opus 388 2 76.03 AAGCGAAATGCAAAGACACACTGGCCAAATACAACTACAACAAAGAGCTAGAGAGAGAGGAGAGAACAACGCACAAAAGGTAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCAC:1 + chr3R 9236986 5' - Cr1a 159 1 56.85 AAGCTTTATTTAGTGGTTTACTCTTCCCGCTGGAATATTCATAATAAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAG:1 - chr3L 18380212 5' - copia 49 2 69.18 AATAATTTAATGTTCATTTAAAAGACTTCAGACGTAAAAGTTGTTCTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCCTGGGATTTCGGATCCTAATGGTTCTGTTCCTTAATTATAATGTGTACAA:1 + chr3L 11837681 5' - G5A 2740 1 57.53 AATTATGTATGCCGCTTGGCTTGAGTAAATAATCTCAACAGTGGTCGGTCGATAAATGGAAAGGGGGTTGGTTGCTTAGACGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTACGGCG:1 + chr3L 10677073 5' + roo 94 2 54.79 ACTTCGTAAGGTGTCTAAAAGTATGCAGCACAAAATTATTGCATAGAATAATACGCATGTTATATGTGTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chrX 18179889 5' + jockey 34 1 44.17 GTGACGGGCGCCTGCAAGTATGCAACACAAAATATTACAAACAGCAACCAGACCCAGTCGCATACAAAACTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATACGAGAACAAGAGACATCGA:1 - chr2L 5646985 5' + jockey 4575 1 64.29 TTGCAAATCGATAGAAATTTACAATACTATTTACAAGGCGTTAGATTGGGCGTAACAAGCAAATTTGGTAAGACAAATTTACAAGACTAATTAAAATATAAAAAAATATCAACCGATTTTTGAAAAGTGTGGGCGTGGAAGTTTTG:1 + chr2R 5667271 5' - INE-1 244 1 46.58 GTGTTTTGCATAATTAAATTTTTGCGCTTTACAGTAATTTGTGGCTGTGGGGCCGCAGCAGCTATTGCTGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCG:1 - chr2R 14913554 5' + X-element 4414 1 64.71 AATATGAATGTAATAGTTTTTGATTTGTTGTGGCTTTTGTTGGCGATGTTCGGGGTAGTTGCCCCCGATATGAAATCATCCGCTGCCATGTTTTTCTCAAGCCCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTAT:1 - chr3R 20846417 5' - roo 8746 2 71.23 GTGTGCTGGTTTGGTTTCTTTTTTTTTATGGGCTTCCCCCTCCCCTATATGCCACACACACACACACACACACACACATATA:1 + chr3L 21669027 5' + accord 7030 2 46.34 TAGCACTCCCGATCCGATCAGGTAAGTCTCAGTCCATACAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTT:1 - chrX 18220661 5' + Burdock 6214 2 73.97 ATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTT:1 - chr2R 5045658 5' + invader6 74 2 69.18 ACGAGGTCCTTTGACGAGCAGTTTCAGCAAGCTTTTTTCCGGACTCTGCTCCTCCTACAGTGTATTCTCCTATTTAAAAACCTTCATACATCTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCG:1 + chr2L 17656675 5' + Tirant 402 1 50.00 AAAAGAATCCCACTGTCCACCGCCATGGTAGCCCCTATAGAAGCCCCAAGTCCCAGGTGTAACTGATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2L 3231856 5' + roo 8675 2 67.31 ACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:2 - chr3R 19436097 5' - roo 357 2 52.74 AGCACACGCAGCACCCTCGTCTCGTTGGAAATTGTGTTGTCGCCTAGTTTATTTCTTTCTGCCCCACCGCTAATTCTATTTTTTTTTTTCATATTCTGATGAAATTTTAATATTGCGG:1 - chr2L 17545604 5' + invader4 2813 2 75.42 AAACTTCGATTCCTCGCCATTGTGCCACATTTGCCTACTTGATTTCTTGGCCGAGCAGGAAGTGCAAGTCCATCGAGATTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGTCAGCGCCCCTCGG:1 - chr2R 11806457 5' + Cr1a 4404 1 54.11 CAGACCCAAATAAACTGAAGAAATCGCAATCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - chr3R 20840127 5' + roo 8755 2 80.00 CTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTC:1 - chr2L 21153565 5' - 1360 3316 1 68.49 TATGTCGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr3L 7460616 5' + 412 7115 2 61.38 AAATTCAATCTCCCCGAAAACTGTGGATAACATTTTAATGGAATTTTTCGCATAAAAAATTCATAAAATTAAAAAGTTTTTGACATACCGTATATATGTATATTCTTGATCAAGGAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGAGGGTT:1 + chr2L 18158994 5' + INE-1 158 1 60.96 AAATATGCCCACATCAAGCCAAAATTGCACAAACAAGCCAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACA:1 - chr2R 11146127 5' + Quasimodo 60 2 58.90 GCTTTGTTTTAATTTTCTTACCATCCCCGGATATTGCCGGCAAAGTTGGTGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCGG:1 + chr4 174090 5' - Doc 496 1 54.90 AGGGGCACCTTGCACCTGCGCACTGTGGACGAACTAAACCTGATGAATCGCACCGAGGTGGAGCACTTAATCGTGCCCAATCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 + chr3L 363428 5' + blood 40 2 56.85 ACGGCTAACTATGAGTTACAATTTGCCGTGTGGCAATTACCTAGCTCGCAACATTCCCGAGATCATAGCGTTCATGCGGACAGACAGATGGACATACGGACATGTCCGGATATGCTAGTGATCCTGATCAAGAAT:1 - chr3R 21477784 5' - INE-1 86 1 60.74 GAGGCAACTTTAATTGATGTATATCTGCGTGGAATTAATAAATAATGAGTTTGAAAGTTCAGATTCGAGCAATGATAATTATTTCGTCATTTGTCAAGTCTTAAACCGATATTTAATAAAAAACAAAACCGAATTTATTCAGTTTC:1 + chr3L 23614849 5' + McClintock 6292 2 65.07 TGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 + chr3L 7791910 5' - Transpac 281 2 56.38 TGGGTAAGTCATTTGCTCAAGTATTATGAATAATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAA:1 + chr3L 465997 5' - Juan 4126 1 78.08 AAGGATAAAACTACACGTACGAGCACTAAATGTGCCCCACATATTATAGATACGATGCTAGGGACACATGTCCTAAAAACGCAATATGCAAAACTTTTTGGGTCGCATTATGGGCGTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 - chr2R 14135418 5' + copia 4876 2 79.45 TATTCAACCAGTCATAAACAATAAGTATGTGGGCAATTTATTTCGATTCAAAAAGGGCGCCCTTTTTCGAATTTTCAACGTTGCCGTGTGATCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTC:1 - chr3R 10378257 5' + roo 164 2 62.33 AAGTTGCGAATTCCATATTTGAAATGGGATTTACTTGTCAAAAGCCTAGGTGTTAAATGTTGCGTCAATAAGCGAAATCGAAATTGAAATTGAAATTTTATTGTACTACAGCGAACAGCTCTTTTCAA:1 - chrX 16970414 5' + 1360 130 1 80.47 AAAATTCTTTGAAAATATCACAAATTGAAATACACAATAAATAATTAATCGCATTTGGATTCGCGCAAAAAGGAATCTGGTAGTTAGCGAAATTGGCCAAAACTCCCCAAATACGTAAAGTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTT:1 - chr2R 18774336 5' + 1360 3171 1 60.69 GGTGCAAAGAAAGCGGAGAATGCATCTCTGGAAATTAGCATGCGACCTAAATGTACATTGGAGCCATGCTCTGAAGGAAAGTGG:1 - chr2R 14614103 5' + Gypsy12A_LTR 1933 1 72.62 GTGTGCTGGGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr2L 15777898 5' + 297 59 2 63.01 GGTAAAGTACCCCACAACGTCATTTAATATGTACATATGTATGTGCATGTGCGCAAGTCACAACAAATGCAAGCCTCAAAGTGCGGACATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATGA:1 + chr3L 295878 5' - Quasimodo 7281 2 61.64 CTATCATCAAATTGTAATTACTGCAGCCAGAATAAATGACATTTTGAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 12379711 5' - roo 395 1 56.47 GTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 - chr2L 21910210 5' + Doc 82 1 78.99 CTTCATGGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACC:1 - chr2L 19140423 5' + Max-element 67 2 65.93 GCAGAAAGTACCATTTTCACTGAAGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr3R 21216903 5' - 1360 3351 1 77.70 TCTCATCCAACTTTAAATTACTTTCACTTTGGCCAGCCAGCATTTTCGAGCTGCATCATCGGTAGTTGCGAAGGGGATGGCCTTCGATGTCAGCACATAATAGTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATT:1 - chr3R 5773281 5' - Stalker4 388 1 71.23 CGAAAAAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr2L 12325014 5' + jockey 4694 1 58.18 GACTGTCTTATTATAGAAACCAACCCATTAATCGAATCGCTATGCGTTGCCAAACTACCTAGTATTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATT:1 - chr3R 9583377 5' - Juan 4156 1 54.48 GTTCTCGACACAAAATCGTTGTTTTAGCGGTTTTTCACTTTTTATATGTATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGTACAAGAAATATATTCAATATATTTCTTTATAACTCATTGTATACTTAAACCAAAATTGTTTAATAATTTTA:1 + chr4 221373 5' - Tc1-2 1551 1 67.12 AACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 + chr3R 9125634 5' + Doc 43 1 60.96 GATACACGTTTCTATAATCTGCTTGCTCAGTCTTAACTTCAGCTTATATAGTTCACGATGATATCATATTTTCTTACTTCTTCTACCTGTTATATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCTGTGCGTATACATTA:1 + chr2R 12988852 5' + accord 340 2 58.90 ATCCAAAGCTGTAGTTTACTTAACCCTTCTGCCACGTTAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr2R 15070209 5' + 412 7073 2 69.29 GGACAACTTCCCGTACTATCGCACCCGCAAGAGCGTCTGGCAGTAGTGGGCGGATGGTGGGCGTGCCGAAAAGTTATTTGGCAAATCGATAAAATCTATAGAACTCACAAAAATGTAAAAGAACATCTTCTATAGTTCCTGAGATC:1 - chrX 20092098 5' - INE-1 150 1 74.66 AGATGACAGCTTTTAGTTAATTTCGAAATTAAATGTCAAAAACAAAAGCAGAAAAAGACATGTAATCTGTGCCAAAAAAAAAAGACAGAATCACTTATGATTTAGCACGTTAATTGTTGAATTAGAAAAAAAAAAACGAAAATCAA:1 - chr2L 12309809 5' + Doc2-element 250 1 71.92 ATCATGTCATATAAGACCAAAAGTTCAAATGGCTGTAAGTTTGACTGCAACGTTACATCCTCGTATTCGCCCTTCATACAGACCCAAAAAAAAAAGAAACCCCTGCCATAAAGGTTATACTAAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAAA:1 + chr3L 15910205 5' + Doc2-element 254 1 64.14 AAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCA:1 + chr2L 2120386 5' + I-element 4979 1 67.81 ACGTCCTGTTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr3R 14218456 5' + roo 88 2 78.77 TAATACACAACTCATTTGTTCGTTCGCTTCCTCTCTGTCGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTT:1 - chr2L 22690037 5' + Tabor 65 2 59.59 TAGTAAGCTTGGGGAAAGAGAAGTAATTTATGACAGCTTTTATAGGGAAGATATATCTTTTAACATATCAAACTGCTTTATAATTAAACATTCAGGAAATACTGACTACGCCTATCGATTACACCGTTCGATCCGCGACATCCCCG:1 - chr2R 11651760 5' - aurora-element 4040 1 54.11 ATGTTCTGAAAAATCATTGTTTGGAGGAAGCGCCAGATTCTCTCACACATAACTAAATACATGCACGAATATGCTGCCGTTACGTGTAATCAAGAAACAAGAGAGAATGCTATGCCCGACTATCAAATACCCGTTACTCAGCTA:1 + chr2R 25196946 5' - INE-1 544 1 63.89 TCACCGCCTCCCGTCCGACAGAGCTTTCCACGCCGCCTTTCGCCTTCAATTATGTCCTGGACCCTTTGTCCTTCGCCTTCTGTATGGTTTTTCGATGATGGAATCACAAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 + chr3R 20203552 5' - 412 7537 2 71.23 ATTTAATGCAAGGTCCTGAAAAGAGGCTCGTGTTGCAAAAAACCGGAAAGCAAGAAGCCGAAGCTCAATGTTGAAACATTTGTTTAGTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTTAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 21403519 5' + roo 22 2 66.91 GACGAACAACGCCTACTTCTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 + chr2L 22719551 5' - 1360 3347 1 56.16 TTTGCATACAATGCCCATTGAGATAGTCAGGTATTTAATGTTTGGCTCACTTTAAATGGGGGTTATAATGACACCAAAATATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTT:1 - chr2L 7600112 5' + hopper 307 1 54.48 ATTCATCCGAATTATTCAAGAGGCATACTTTCCACTTCGAATATCACACACCTGATTCACGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTT:1 + chr2R 14135265 5' - copia 5062 2 58.90 AAAACGTGACTTGGAGCTCTTTGCTAATCAACACTGTAAAAAAAACCACCGGCTTTAAACAAGGACCAATGTTAAAGCTAGATTATTGAGGTCTTGAAATATTGTATGTACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTA:1 - chr2L 21976841 5' + Idefix 1 2 58.22 AAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 21674894 5' - roo 328 2 73.29 AACGTGTATGCGACTCAGACAAGCAGCCTCAAAATTTAAAGGAACACGAACTAAACTCTATCGTCCGGGTTTTTATCCATTCGTGTATAAACCCAAATATAAGAATTATCCTTGAGATCCATATATTCCAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 - chr2L 17375570 5' + gypsy7 5002 2 79.45 TTTGGTCGTGGCAACTTTTCTCCTTAGACGAAAGCAAAGACTTTTCACAGAAACCGGTTTCCATCGATCAATAGATAGACGGTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chrX 4673580 5' - roo 9033 1 58.90 AGAAGAATCACGCACTGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 - chr3R 30264113 5' + blood 7049 2 54.69 GACTCCCGCACAATTTGAATATATAAAGCCCGGCCTTTAAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 + chr3R 7778220 5' - transib2 2793 1 64.38 ACTCGCAATCATTTTTCTTACATTTCTTATTTCAGCCTTTGTCGCAAAATTATTACTCGTAGAGACCCTATACTGTAGATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 + chr3R 20872078 5' - 297 6938 2 63.01 TGTGTGACAAAAGACGAAGAGAAAACTTGGACCGAGTGCATAGAAGGGCGAATACTTTTGAAGACTGGTTACGAAGTTGGATTATTGGATATGATATCCAAAAAATTTACGAATGATGAAAAATATATTGTTAAAAAAAAAAACAA:1 - chr2L 12188812 5' - hopper 157 1 72.60 GCCTTTTTTAACCACCCTTACCAATTGACGTTTTGACGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTATAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACT:1 - chr2R 2643733 5' - Cr1a 4076 1 74.66 CGTACATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTA:1 - chr2L 17626693 5' - roo 356 2 55.48 TCCAGAGTTTTAAATAACAAGTAAACACTCCGAGCTGCAATTTGTATTACTTATTATATGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCACAC:1 - chr2L 1361030 5' + Stalker2 7308 2 56.16 TGCTCCTAATTCAATAGCGGGGGATAAACTTCTGTGAAAAAAAGCTCAAAAAAATCTCACAAAAAATAAAACTTCTGATAAAATAAATAAAACCAATATGACCGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATC:1 - chr3R 1272036 5' + Porto1 4288 1 38.85 ACAAATTCTTGGCTCGACGACATATTTTAAACAACGGGAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 2330197 5' - roo 9038 1 57.25 TGTAGACAAAATGTAGAAAGTATTGGGTAAGTACGGAAGTAAGTAAATATACTAGATTCCTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAAGTGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGTT:1 + chr2L 20024488 5' + INE-1 95 1 67.81 AATGATATAGAATTCTTACGCCATTTGATTTGATTTACTTCAAATGCCATTTAAAAATTTTGAGGTATGCAAGAAATTCTTGCACAATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 - chr2R 23409194 5' - opus 495 2 53.78 GATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr3R 5422924 5' - roo 320 2 77.24 ATTCAAAACACAAATCCGCAAAAACGAAAACGTACGAAAACACCAATTAAATCAATATGTATTATATTGTATGTAACTAAATATATGAAAGACTATTGATCGATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTT:1 + chrX 14836126 5' - invader4 313 2 77.24 GTGTGAACATTAAATACGTTTATTAACAAAAACGAAAGAGTGTGAAAAAAACCTAAAATAAACGAAATAAGGCAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAAT:1 + chr3R 21978070 5' + FB 713 1 55.00 GTGGGGCGATCTTAGCTACTAAAGAATATAATGTAATTGGAAATATATATATAATTAAATAAATCGAAAAATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAG:1 - chr3R 6555320 5' + Juan 4078 1 50.68 TTGTGTCGGTGTTTTCCTAACTCAACTTCCAGCTCCATCGGTATTTGTCTTAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGATGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTAT:1 + chr3L 23434652 5' - Porto1 4396 1 75.86 AATTGGTAAGACAAATGTTTGGGTGTATGATGAATCTCAACCTTCTAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGG:1 - chr4 1038866 5' - INE-1 107 1 79.28 ATTAATGCTAAATTTTCATAATTTCCTAGGTCAGAAATTCATTTACTTTTCCTCGAGTAGAAAATCATCCAACGAACCCAATCGAAAATCCTGAGAACCATCACCGGCGCACCGTAGTACGTTCGAAGTGATAACTAACATAGGGA:1 - chr3R 11943370 5' + Fw2 3660 1 57.53 ACTTAAAAAGATATTTGAAAGAAAAGTCATCCTATCAAGTCTAATCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGACTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAG:1 - chr2L 15644944 5' + transib2 65 1 67.65 TGATAAATAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGT:1 - chr3R 11151914 5' + mdg3 54 2 54.11 AGTTTCTGTTTTTGTTGGTCGGAAATGTTTAGCGCTTGCTTAGAATGATTAAAGTGTCGCTTTTTGTCTAGTTCCATTTGCTTTTTCAAGTTTACAGTAATTTTACTACAATTACATAACAATCACAGGATTTAAGATAAGTGTCA:1 + chr3L 12436274 5' - X-element 4551 1 58.22 CCTGCGGCCATGCACTGGAAACAAATCTTCAAACGTATTTTCATAAGATGTGGCCGATTTATTAGTTACTTCGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTAC:1 - chr3R 28117087 5' + hobo 49 1 52.05 CAAGCAGATTCTACACACGACTGTGGAAGATTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACCAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGACACACTAAA:1 + chr2R 6647537 5' + Chimpo 91 1 77.93 AGCGCATATTTTTTTTGTTTGTAAACCGACCGACATAAATGAAAATGGGCTTCTGAAAGTTCCTGCCATCTTATACCACGCCATCTTATATGGATGAAATTGAAGATCATCATGCAAAATTCCGAAATGCACGCTGTGTTTTAATA:1 - chr2R 7394700 5' - mariner2 199 1 76.03 CCAATTTAAAGTAAAGGAGACACCACTGGGAAAATATAGAATTTTGGTGCAGGACTACAAATGAGCCAAAAACCAGACAAAGATTTAAAATGAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGGCT:1 - 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Helena 67 1 60.96 CTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTTGTCTTCGTT:1 - chr2R 5045648 5' + invader6 4575 2 75.86 ATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAA:1 - chr2R 19727744 5' - R1A1-element 5116 1 61.11 AATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr3L 3453592 5' + Tirant 32 2 58.87 AAACTTAAAGTACTTTATTCCCTGGAAGGCATATAAAAAACGTACAATCGGCAGAACTTTTCGTCCGGTGTCCTGGGATCCTTCCGTATTCGAGCCCACACATCTGCCGGACTTACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCTCCGTAACTC:1 - chr3R 5970603 5' - R1A1-element 5058 1 76.03 AAAAAATCGCCTCATATAAATCTTACTTAATTCCTCCCATTTTGTTTCATTTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:1 - chr3R 9963272 5' - I-element 5279 1 68.49 GTGCAGTGGGCATGGCTTAAACTAGTTAAAAGTATATAACAAACGCAAAGGAGACACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATC:1 + chrX 8967334 5' + HMS-Beagle2 6894 2 78.08 ATGTAGCATTAAGGTGCACACCTTCAAACACCTCTTCCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTC:1 - 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P-element 2848 1 55.07 TATGCTGTATTTATTGCCCGGTCGCAGTGATCATCGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 + chr3L 6355615 5' + Tirant 61 2 70.00 AAGAAAACAATAAATTGTTTATGATGCAGTCTAGATCTAGAAGCAAGCGTGCTCCTTTCGAATTTATGGGTTCCTTGTATCATCGCATATGTATATGTAAAATCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAA:1 + chr3R 19448492 5' - roo 9045 1 58.04 CGTTGACTTTACTCACTTAACTCTTAGTTCTTTTCCATGGCTCCTCCACTCCACTTGCCACTTACCAGCGCCAGCTTTTCATTTTCCAAGCCCACAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2R 21439561 5' + jockey 15 1 74.22 CAACACACTCTGCGAAATTGGCACTAATGCAAACTGTTTTTAATGCTTTTATCTCATGAAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTT:1 + chr3L 20251914 5' + copia 58 2 63.12 AGCGATGAAAAAGACTTCATATCAGCTTATACATTTTAATACTTTGGCTAGCAGTCACAGAGCAATTTTTTTCTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAA:1 + chr2R 20346986 5' + copia 454 1 51.85 GCCCAACTTTCATTACGGCATCCGCAACAACAACAACAACAACTCTATCGGCTGCCAAAAAACCGACAGCGAAATTATTGAAAATTCATTTAAATGTCAGCTCCAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 + chrX 8919501 5' + G2 3074 1 67.21 TCCTGATCCCATGCAACTGTGCTGGCACTAAGTGGGCAGCGCCGGTCTGGTCCGGTGTTGGAAAACTGCGGCAGCTATCAGCTGAGCCGGCAAAACAAAAACTATATGCATATATATATTCTTGGTCAGGATCAATAGCCGAGTCA:1 + chr3L 8721413 5' + INE-1 93 1 67.81 TTGGGCTACACTAACCCAAAAGTAATAGTAGCTTTGAGCTATATTGTAATATAAACTTAAATGCAATTTGATAGATATATATAACTATATATATATAGCTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 - 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Burdock 153 2 50.68 TGACAACAAAAGCAGGCATCAAAAGATGGATTGGCCAATTTGGTTTTCGCAGTGTTTACCCTGTAGCTGGCATGGCCTTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr3L 13690247 5' + hobo 41 1 58.22 TTGAACGCCGTTGATTGGAAGTAAATGTTTACAAAATCAAACTGATGGGATCTTATGAAATGCTGGTAAAGCGTTTCGAGGGAGAAGGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr2R 9294279 5' + Tirant 8 2 77.69 GTGCTTGCAAGTGAAGGTTACACTCTAAAATAGTTCTAAAGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr2R 23409038 5' + opus 7034 4 52.14 TGGTGCAATAAAATATGAAATATAATTGACATGTAATGTTTTTAACATATCTATATGTATGTATAGATTTTATTGCCCCCTTCAGCGGCTTTGCGCGGGGTGAGGGGAATAAGTTGCCCGATGGGCAGGTATCGTAGCTACACCGC:1 - chr3L 11350062 5' - BS 168 1 56.16 ATCTCTAGACGAGTCAATCTGACCCTATCAACCTCAAGTTATAAGATCTATTTGGAGGCGTAGGCGCAGCTTAAGGTTGATTCAGAAGATTCCTACGCCCATTTAAACTCTCTTAAAACCAAATATTATCAACAAAAAACGTTTGC:1 - chr3L 21816144 5' + FB 338 1 78.08 CGTGATGAGCGAACTGTTCGGGCGCCAATCTAAGCAGTCGAAAATACTACTTGTATACTACTTCAAGGTCTTAGTTTCTTTTATTTCTATAATTAAGTACAATTTTATAATTTGATTAAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCT:1 + chr2R 5065122 5' - 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copia 255 1 57.53 CCTTGGCATGCGATAATTGAGATCCATGCAGTAGGCATCAGTGAAACAGGGTTGTTCGGAACAATCAGCACTACTGATGGCAAACATCTAAACACCTCGCCACATGCAATGCACGTGCAGTTTGCACAACTAACAATCATTGACTA:1 + chr2L 9289286 5' + Doc 120 1 73.97 GGTGGAACCAAAGAGCGCAGCTGGCAATCATCGACAGCGACAAAATCTATTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCC:1 + chr3L 18183030 5' - Tirant 8499 2 80.82 TCTGCTCCACAGTTTTCCCTTTCTTCAGCCATTTCTCCGGCAGAAGAATCACGCACTGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 - chr3R 30264154 5' + blood 15 2 75.34 CGGTGCTTATCTGTGAGAGTCAAAAGTGATGCCACACGGTGAAAAGTGGAAATCGAATTCGGCTTTAACTGATCGCAATTGCTTGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTG:1 + chr3R 16723655 5' + Ivk 369 1 51.37 ACTGTTTACACTAAGCAATGGGCACTTAAACAGACTTTAAGCGCTTTTATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAG:1 - chr3R 21395278 5' + G2 427 1 73.79 AGGGGCATGGGGTTATCTCCATATTATATGAAACATTAGCCAAATTCACTAGAATTTGGTAGTGAAGCTAAAAAGAACAAAATGTTTAATAATATGTTAAATCTTCCTCATCGATCGACTTTCATAAAATAGGTTTTGGCCAAAAA:1 + chr2L 15153137 5' + Transib-N1_DM 470 1 65.75 ATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCACCAATGTTTAT:1 - 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chrX 20795356 5' + Porto1 367 1 54.17 ACTTAACCCGTACTCTCAGTGATTTAAGAGGAAAAAGCAAAGCAAATCATTTGCAGAAAGTGGGCTAAAAAGTTGTGAAGGAGTCGGCAAACGGTATGAATCGCAAAGCAAATTCAAGCTATCTGAATGGCAGGACGCAACAAGTC:1 - chrX 17438615 5' + Q-element 420 2 75.34 GAAAAATAGCAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGAACAGAACAAAATAAAGGAAAATAA:1 + chrX 15254904 5' + Doc2-element 249 1 75.86 GAGTTTCCCGCAATCGCGTTTCCATTGAGGATAAGTATAAAAGGGATATTGTTGTTTTATATTTTATTTCAGCGTGTGTGTTTTGATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACTCGATG:1 - chr2R 11697619 5' + accord 6994 2 60.94 AGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTC:1 - chrX 16117244 5' - opus 7420 2 79.43 AAAGCATATGATGTGTGTATGTTTTTCATAGCCTTTCTTCCTTTAAGTAGTTCGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 28116984 5' - hobo 2909 1 52.78 GTCGAGCTTTTATTTCATTGCAGTTGGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTAAATGCTGACCTTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGTGACAACAC:1 - chr3L 15723919 5' + jockey 4744 1 74.19 CGCTATTTTAAAATATTTCAAGACAAAAATGTAATACACGATTCGGTATTCGAACATTTCTGCGCAACAATAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATACATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACG:1 - chr2R 1076575 5' - FB 222 1 52.05 AACTGCTTACATATCCCTCTGGATGCAGTTTGACCAGGAATCGCTTGCGCTTGAAAGAAATCTTGCGTATCTTATCCTCGGCTTTTCGGGAAGGTATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGGGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAA:1 - chr3R 4923466 5' - gypsy4 6475 1 49.32 AAACGTTTAGCAACAAATTATTATTAGTAAATTGATGGCATCAACGTTTGAATCTTCATACGTTCTACAAAAAAAGGTTCATCGTTTTCGTTAGCATTCTATTTTTAAACAACATTGATATATATACATATTGACATATA:1 - chr2L 17785748 5' - G3 4506 1 75.71 TTTTAGCCATTTGGGGTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAAAACGAATATATTT:1 + chr3L 21013850 5' + roo 8670 2 70.33 AATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACA:1 - chr3R 7616822 5' + Stalker2 7311 2 64.38 GCATAATGAAATCATGTGTGTAATTGCCTACGGCCGTGGTGGCAAAAAGGCTAACGAAGTGTGCCTAATGTGGATAAAGCAAGCGAGCTGTTAAAAGTACCGCCAAAAATTAGTCTGCACGCAAAGAACTTTAGATTTTGTGTGG:1 + chr3L 2297836 5' - Cr1a 319 1 51.72 CTTAAGTCCCTGGTAAGAACACACATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr3R 18205743 5' + 412 35 2 58.90 GGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3L 18183198 5' + Tirant 15 2 67.89 ACTAGAAATGTAGCTTTGCACTTTTGTATAAAAATCTATGATAAATAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 - chr3R 11151952 5' + mdg3 5268 2 73.29 AGTTTTTGATTTTAGATCTTTTATTTGCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 - chr2L 19997132 5' + Tirant 8151 2 74.49 TAAAAATATGGAAAAGAGGGCGGTCGAAATATAAGAAACTTTACCTAACCATTTGAATATACAAGGTATCGTAAAAGTTTTTGAAAGTATAATTTTTATATTAGTAAAAAAATTGGTACTTCTTTTAAATAAATAAAATCAATAAT:1 + chr2L 15819463 5' + HeT-A 38 1 71.23 AAACACTATTTGCCATTGTCACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 28450644 5' - roo 9022 2 54.11 TCTCGGATCCCTCGGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 + chr2R 10910187 5' - Tabor 7284 2 57.53 CAAAATCATTAGCAACAAAATGGCAGACCCCTTGTCTCCATCCCTCCTGACTTAACATTTTAATTTAATTTCGCACAACAAAAAATTGTACAATTTTTTTCATCTGAGTCCAATTCCTGCCTTTGTTTGTTTTAGTTAACTAAGAG:1 + chr3L 14261920 5' + invader2 226 2 80.82 AGTAGGAACTGAGATGAGACTGTACATAAGTAAGATAAGTAAAGTCGCCATCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTA:1 + chr3R 7481471 5' - invader4 316 2 75.81 AATGCTCTCGGCTCCATTAGATGAGTCCTTTTTTTGGTGCGCTCCACCGAGCACATAGTTTTATTTCCCAAATAAAATGAACACTCAAAAGCATTTCCACATGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTC:1 + chrX 14742454 5' - FB 30 1 75.18 CCACCCTTCATTTAATGTGGCCATCAAGTCGTAATTACGCTCGTTGTTGAAACGATGAAGACATCAAATTGCATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chrX 6633060 5' - P-element 2853 1 60.14 GTACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:1 - chr3R 7616832 5' + Stalker2 7301 2 57.53 ATTGTTTTTAACTTTAGATACTTAGATATTTTTTATCCTCTTCAATCCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 - chr3L 25607352 5' - 412 419 2 66.44 CTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3R 25751888 5' - roo 345 2 63.70 CTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr3L 18253788 5' + blood 62 2 60.42 CCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 + chr3R 23161279 5' + 412 7128 2 68.97 AAATGAATACAGCTATCAATATAAAATGAAATGTGGTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGGCAGGCCAC:1 - chr3L 18253893 5' - blood 7338 1 53.85 TTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 11164502 5' + roo 46 2 60.94 CATGTGCAAAAATAAGAAATAAGTGTATTTGATTGCAGTGCAAGTCAATAGGTTCTTATTAGCTTATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTTG:1 + chrX 14137199 5' - 3S18 282 2 55.48 ATGTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3R 24673683 5' - roo 9041 1 65.07 CCTAAAAGTAGAAGAGATATTTTGACCAAAGAAATATAAATAACGGAGCCGCAAAATATGCTTCATAAATATTCGATTACGATGATGTTTTTATTATTGGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 - chr2R 11264085 5' - jockey 4954 1 51.85 ATATACATATATCTGCGACATGTACATTATGTTGTTGTTGCTTGTTATTTCGTTTTTTTCTTTTTCAATTTTTTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTG:1 + chr3L 18884711 5' - F-element 4605 1 58.22 AGATAGCCTCAAAATTAGTTTATTGCATTTTAAGTTTCAACGTAAACAAATTATGAGTTATTCGCAAATAGTGTAACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 - chr2L 14969243 5' - 412 7540 2 73.97 CGGCAATGTGCTTCCTTCTACATTCTTGGCTTTGACTTTACGCGACTGAACTGCCTCTCAGTTCGTATGATACGATAATATACTGTTATTATACCGCATCGTTTTACAGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTTGTCTAC:1 + chr2R 5129019 5' - Cr1a 3981 1 63.01 GAACACACATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr3R 18205727 5' + 412 7101 2 51.75 GTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chr3L 18183194 5' + Tirant 8133 2 60.34 AGTTTGTATTTATTTATGTACTTCTTTAATTTATTATGTACTTATTGTTATCAGTTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACCATGAATTAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATATTGAACTCGTCTGATGTTTCT:1 - chr3L 26265111 5' + Gypsy12A_LTR 1880 1 78.77 CTTCGTTTCGCTGGCGTTGCATAATGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTT:1 + chrX 19887073 5' + P-element 92 1 19.86 ATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAACGTA:1 + chr2R 2832930 5' - 1360 3293 1 80.82 TTAAACTGAAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTT:1 - chr3R 2520341 5' - Tc1-2 1598 1 59.59 ACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTG:1 - chr3L 18183169 5' + Tirant 8163 2 76.03 TTTGTGTGTTGTCCACCACTTGCTGACCTGCATCCATTTGGAGTTATTTCATTCGGTTTTTGTAATTTCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3R 11513560 5' + roo 8716 2 54.79 ATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr2L 3960194 5' + jockey 72 1 67.67 ATGCGCTGTTGGCAATTTGTTGGATATAAAAATTACAACGCACCCGCCCCTCCACCAACGTCTGAGCAATGAAATATTGTAATTAACTTTTCTGCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr2L 12144160 5' + transib2 17 1 72.46 CTGTTAGTAACAGGCTGTTACTCAGCTAGCCGCAGGTAGACATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGGGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTTACTAAACTTA:1 + chr3R 5167536 5' - Tc1 1565 1 72.60 GATTACCATAATTTTTCGTACTGTGTGTGTACTTAGAAACTTGCGTTGGTGTACGTTTGTGCCACATTGTGCGACACTTGTTATTAAGTACTTGCGCGCACAATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAG:1 - chr3R 14965769 5' - roo 8644 1 69.86 CACATTTGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 19436120 5' - roo 9051 2 68.84 CATGGCTGCGAGCGAAAAGGAATTATTACTATTATTGCTCTTTCGAGCAGCGCAGGTAAATCAATAAATTTACATAATCATTGTGCAAAAGGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2R 22463104 5' + roo 29 2 65.07 GTAAAGCCCCACTTATTCACGTTGAATACAAATTAATTATAATTTTGTTAATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 + chr3L 17667557 5' + F-element 47 1 50.42 GCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1 - chr3R 25804202 5' - mdg1 7394 2 65.22 CACTTCGACTCTAATGAGGCAACTTAAAGTGTGCTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr3L 13364366 5' + hobo 46 1 68.57 ATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGA:1 + chr3L 3453625 5' + Tirant 47 2 67.92 ATGGGCTAAATAACCTTTTATAAGTAATCTCAATGCGATGCCGGGTCGTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chrX 19107487 5' - roo 9032 1 51.80 CGTCTGTCTTGGCTGCCACCTGCCGGGCCCGTGCCTTGGCTGACGTTACAATTACCAGGTAATGCGAGGCACGATGACGACGATCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAAT:1 - chr2L 9602199 5' - 412 404 2 71.68 GGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr3R 9125649 5' + Doc 58 1 50.68 ATAAAAATTCCCGTTAAGACAGTTGAACCGTTAACTTTTGGGTCTGAAAATTACGTAGCATACTTTCAGGAAGGCTCTAGGTCGTTGTAATCTAAATTGCCCAGTTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTATAAGCGATGAATCA:1 - chrX 12545905 5' - BS 5079 1 66.44 CTTCAATTTATGCCTAATCATCTTTGACAAAGAGTATGCCTGGTTTACCTTTTTATCCGTAAGCACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 19031174 5' - roo 401 1 79.17 GGCAACAGTGGCTATTAAAGTCTTAAAAGGCGTGGTCAAATCGTGGGTAAGTCATTTGCTCAAGTATTATGAATAATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGT:1 + chr3L 465954 5' - Juan 4169 1 56.16 GATTTAAGAGCCACCGCGATTAAACCCATTTGATTTTGCGCCAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr3R 11870082 5' + pogo 57 1 68.99 GCAGAATCTATTTTAGTCTCTTTTCTGTCACACATATATACATATTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAA:1 + chr2L 13138986 5' + McClintock 6019 2 71.23 CTTTTGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr2L 14969076 5' + 412 7091 2 49.25 CGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - 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INE-1 545 1 65.07 CAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAAC:1 + chr2L 18630484 5' + G-element 69 1 73.60 CATAATTAAAAGAGTCGGGTACATCAACTATGGAATGAGGCTTACATACTTTCTTGCTAGGTTTAAATTTAGGTAAAATCACAGACATTAAAGTTTATATTTTTATTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3L 20859334 5' + roo 8717 2 71.92 GTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTAC:2 + chr3L 7837168 5' + jockey 4827 1 58.22 AATCGGTTGTTGTTAGAGTACTTATTTAAAATTTTTTCCTAAACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 - chr2R 21848759 5' - Transpac 239 2 69.29 GTCTGGTGGTGTAATTATTTGGAAATGCTTTTTAAGCGATAATTGCCGGTGGCACTACACTACTCATTCTCCATTCAGCTCGGAATTTTCCTTGTTCTCGTTGGTTTTGAATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGC:1 + chr3L 10353848 5' - Stalker 7091 4 69.18 TATATGAAACATTATGATGTTGTCCTTGCCGCAGCCGTTGCTACTTGACACCACAACTGATACACTGGGAAAAAGTGCAACTACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 + chr3R 15054087 5' - 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chr3L 1856769 5' - Transpac 5179 2 61.48 AGTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:1 + chr2R 22746054 5' + jockey 4813 1 52.74 GTTTCCCTTCTCCGAAAGTCGCGAAAGAATAAACCGAAGATTATATGCCCTTAAAAACCATTTCCGATCGATCTTAGAGGAGATTTGGAGTTGCATAATGTATGCTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:1 - chr3L 786017 5' - I-element 5339 1 73.97 GCAATATGTTAGAATATTTCACACAGAGCAAATGCCTCAAAATCGGCGGGATATAGGCACGTCTAGGTACATATACATATGTGTATATTTTCTATATATATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 + chr3L 16059199 5' - 297 6959 2 75.34 ACTCAAACAATTCTTCCATATGTAAAAAAAAATGCCACAAAATTGATTTATTTCTATTTCCATCCACAAATAAATTACTTCAATTTTGTGCTTCAATTCAATTGTTATTCAATTCGATTGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 + chr3L 26741164 5' + F-element 27 1 60.96 GGAAAGATCAAAAGCGAGGTGAGCCATCAAAAGCAGGGATATATACTATATATAAAAGGAGGCTTCAGTTTGCAATTTCTCAACTGTACACTGCGGCCCCCTAAATTCCTTGTAGAATATACGAACATAATAACATTAATA:1 + chr3R 25804068 5' + mdg1 7048 2 73.76 GACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACA:1 - chr3R 15790112 5' + flea 4742 1 62.07 AATTACAGCATAAAAAAAGTTACAAGCTAGAAATTTAGCTGCTTGCTGTACTTTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATT:1 + chr3L 14944498 5' + G5 4751 1 74.66 GGGATTACAGTGAACTTCAGCTAAAATGATTTAAGACGATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 + chr2L 19140363 5' - Max-element 273 2 56.18 GCCAGGTAATGAACACATACATATGTACATATACTTTTAGGGGTATATGCGTGCAAAAGTTACGGCTTCCAATTTGAAATTACTTCTGTCCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 12379820 5' + roo 39 2 58.90 TGTCGTGCAAATTGCTGGCGAATGTGTTTCTTTTGTTTTTTTTTGTGTTTTTTTTTTCTGCAGTTATGACATGTGAAGTTTTTTTTTGGTGTCGCTACATATACACACACACACACAC:1 - chrX 12180459 5' + Quasimodo 29 2 47.46 GCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGATTCTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGT:1 - chr2R 18014097 5' + Doc 71 1 71.19 CCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGCAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAG:1 + chr2L 12291853 5' - Tirant 350 2 62.18 ATACCTTGAAAGAAGGTATTTAATTACCTATGCACGATAAGATACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr2L 23068821 5' - 1360 3371 1 66.67 GGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:2 + chr3L 19580908 5' - roo 323 2 75.34 GGTACTATATAGTTTCTAAGAACAAACTGGACCATCTAAACCAAAACTTGAAAGCCATATGGCAGTAGTCATGTAATCGCATATATGAAATATCCGCTTTAATATCTTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATG:1 + chr3R 21519936 5' - Copia1_DM 166 1 60.96 CACTAAATGTTATTCACATTCTAGCCCCCTACTTTTACACTTCCCAGTGACTGTCAAACTGCTAGTGGCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTA:1 + chr3L 2425866 5' - hopper 1363 1 51.37 TAATAGTTTTAATAAAAAACGGTGAGAGTTGCATGCTGGAAAACCTTTGCCAGCAGCTTAACCCTTGATCCGTAATTAACCCATTAGGGTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr2L 14239267 5' - 412 473 2 68.42 AAAATGTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 - chrX 1103727 5' - pogo 2052 1 53.79 GATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAA:2 - chrX 16117258 5' - opus 426 2 70.55 TTTTAACGGATATGCCTATGATTCCAACTGATATTAACACGATACCCATCAGCAAAGCCCAAACAAGCATTTCTTGTTTGTAATGTGAATTTGAAAATCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 + chr3R 4190854 5' + pogo 21 1 71.23 TCGAAGATAACTTTCACCGCACATTTTTGATGTTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTG:1 - chr3R 13349622 5' + Ivk 6 1 77.17 AAAAGCGCAGAGGGCGACCCTCGGATATTCAAATTCGATGGGCCAGCCTGAAAGTATGCGGCGAAAATTGAGCAATGAAAAATGCATAGGGCATAAAGCACGAACTAATGCCTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr2R 7232597 5' + jockey 20 1 75.34 AAACAGTTTTGTAAAAATGTGGGCGTGGTACGTCACTTTCACTTCACAATTTCCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAACCTCTAAATTGTC:1 + chr4 857187 5' + Q-element 110 2 70.71 AATCAGCTGTGGAATATCCAAGGACGATTGCTACCCTTTTGGAGTCATTCCAAAGCCCACAAGCCAGCTCACAGAATCTGGGGTCGGAAAAATCGAATCGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTA:1 + chr3R 3751271 5' + FB 80 1 75.41 CATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 + chr3R 13225477 5' + hobo 5 1 72.63 GTATGCTGACCCCAGTACCAGCTAAAACTGAGCTCACTGCGCACATATTAGTGCAACGTCATTCTGAAAATAAATATTGATTCCACGAGGCGAGGTTTCATATGTTAGATCAGCTTTTTG:1 - chr3R 20565376 5' + transib3 165 1 80.83 TAATTAATATTACTCATACGCAGCGTTGGACGTAGCGATACCATACAATGCGATGCGATGCGATGCGATGCGAGGCAAAGCGAAGCGAAGCTCCTTCGCCGGGCATAATGGCGACTGAACCGTGTCGG:1 - chr3L 9988177 5' - mariner2 112 1 69.53 ATCATTCACATGTTATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:1 - chr2L 19310416 5' - Juan 4175 1 56.16 GGCCTGTTGCTTTGACTTCATTATGGTGGTTGGTGCTGGCTGTTTGCTATTTGCTGTTTGCTGTTCGGTTGTTTGAGCTCTTTGTCTGCTCATTAATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 + chr2L 14570141 5' - flea 220 2 66.90 AGTCCAGAGGTCTTCCTTCTTATTATTGGTAGTCGGCCTATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1 - chr2R 1243238 5' - mdg1 7381 2 71.03 GTCCTGCGAAAGCGTTTTATTTAAATATGTACGTGTGCAGCACGCAAATATATATACATATGTATATATATGCGTTCATATATGTGTTTACATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTA:1 - chr3R 27849872 5' - Cr1a 4159 1 63.01 GATGTTTATCTCCGTCATAATATGCGCTGGGAATCACCTTAAAGTGATATTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr2R 25106042 5' + roo 8735 2 67.12 AAAAGTGTGTCCATTGTTGGGCAATGGCAAGGTGCCTTTTGTAAAATCAATTGGATAATGACTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATAC:1 - chr2L 5397257 5' + 1360 137 1 56.12 TATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATCAACATTTT:1 + chr2R 11095745 5' + diver 5929 2 50.00 GAGTGGGGGACTTGTTTAATAACAAACTAAGAGTATGCAACGTACAACCGTAAGTATGTGTGGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGCGTTTCAGGTAG:1 + chr3L 9146655 5' - accord 143 2 62.50 ATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCA:1 + chr2L 14239167 5' + 412 90 2 77.40 CTGGCGAAACAATGTGTCACAGTCATAATCCTCAGAGTTAGAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAA:1 - chrX 10579980 5' - pogo 2024 1 71.23 GCAACATTCCCTTTTGTCTGCCAAGAAATAGTCAAATATTTGAGACTGCCAGTGTTCACACACTTTATGCTAATCAAACACCCTTAATTGTTCTTCGACGCACTGCGAGAATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAA:1 - chr3L 19229272 5' + mdg3 5359 2 73.29 TTTTATTTTCAGACAACAAATAAATTGAAATATTCATATACCAGAGCTGAGCAGAAGATGTTCAATTAAGATCTAATACGTGGGTGTGAAATTTATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATT:1 + chr3R 16538323 5' + G2 2609 1 67.12 TAAACGAATAGTAATGTTTTTAAATCTGAATACTTCGTTACTAATATTTTTCCTTTTTTTAAATACTGCTGAGTATAGTGCAGGATGTATATTTCCCTGCTACATTTTTTATAGAGCAACTCCCATATTAACTACTGGTATGTCTC:1 + chr2L 7247155 5' - transib2 2678 1 76.71 AAATATACATTTCTAGCAGTATTAGAAACTTTCACTCAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGC:1 + chr3L 1358460 5' - 412 410 2 71.92 ATGTAATTATGGGTCGCTGAGTTACGTGCTTCAATAAAACCGCTGGTATGTCACCATTTTTTGATCCCAGAATACGTCTAATATTAGGTAAAACTTCCTGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATT:1 + chr4 200772 5' + 1360 3268 1 67.81 ACATTGACCACAACAAAAGGAGTCGAGAGACTTGCATTGTTAGTCCCTTCTATGTATATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACA:1 - chr3L 14302286 5' + Quasimodo 36 2 58.33 CTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGGGGAAAGTGCAGTT:1 + chr3R 7585754 5' + Doc 96 1 73.29 ATGTTAGAATATTTCACACAGAGCAAATGCCTCAAAATCGGCGGGATATAGGCACGTCTAGGTACATATACATATGTGTATATTTTCTATATATATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCG:1 + chr3L 16059204 5' - 297 373 2 71.92 GTGAATTTGCACCCGGCAACGGCTGGCTGAACGAGACCGAGCTGCGTGACCAGGGGAGGACAGAATAATGGCTCCATTGCTCTGCTATGCAGCTACTAATGGTGTAATAAATAATAAGTAATA:1 - chr2R 12065721 5' - Stalker2 404 1 80.49 AAAGTATATAACAAACGCAAAGGAGACACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAA:1 + chrX 8967362 5' + HMS-Beagle2 39 2 58.90 AAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAATAATGGTTGG:1 - chr2L 23034056 5' - FB 360 1 54.11 GCAGTTCCCCAACCTTTTGCACTTTGCTGTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTATTTG:1 - chr3L 10469645 5' - roo 388 2 69.34 ATTAAACTCAATTAATGGCCAAATGACCAATCAACTGGCACAGAGAGGGCACATCATGTTGCCTCCTGTTATGTGTTGCCATTGTGGGCTGGCGCGCTTAGCCCGGTATAATAAAACATTAAAAGTAACTCCTAATCTTTCATTGT:1 - chr3L 22610923 5' + gypsy2 262 2 65.07 ATCTAACCCACATATTCCCTCTATCTTTTATTATCCCCATTTCGTTATATAGTGTTAAAAATGTGCAAGTGAAGCGGAAATCTTACCAAAGAAAATAAAATAAAAATCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGAC:1 + chr2L 162540 5' - Rt1b 4981 1 79.85 ATTAGTGCCTCCTCTGCGTTTGGAATAATGTGCACAGGGGGCAGGATAAAACCATATCGACCGGTGTCCCTAAATTCAATGGTATACGATTATTGGTAGTCGGCCTATGAACACTGAATTAGGAAGATTATGTTGGAGGGCTTGAC:1 + chr2L 7691222 5' - gypsy 363 2 58.90 GCGCCTCCCAAAAGTATACCAAGAATTATTGTTTGGCAGTGAAGAAACCGCTACTCCCCAAAAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTCTAAGCCCTAAATTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 + chr3R 31458353 5' + jockey 4674 1 77.40 AGAAACCATTTTAATTTATAGACGCAAAACACTATTTGCCATTGTCACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 28450618 5' - roo 385 2 68.49 CTCTCCTCCACTTTCCACTCATTTGGGGCGAATTTATGGCGCTTTTGATCGCCCGACTGCCGCAAGAAACACTCAAGTTATAAAGACACGAGTGGATTCGACTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 - chr3R 10213167 5' + P-element 17 1 73.97 ATTATAAAAATAATAAACACGCTGGTGGCCGTATTCCGCGTCTCATTTTGGCACACATTCAACTAATATCTCGCCAGATCTGCACTGCAGCCCAAAATGTATCTAGAACGCCCTCGCTTAACTAAGGGTGGAGTTATCATAAGTA:1 - chr3L 9548312 5' + gypsy9 5006 1 75.17 GCTGCTGCCATTTCTCGATAACTGCCGCCATTGTTGTAAATTCCTGTGCGTGTATATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAA:1 - chrX 12273158 5' + jockey 4734 1 62.50 TATCATTGCAGATAAGATCTGCATAAGCATAGAGTTAAAGGATATACACCAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAACCATATATGTTGAAATTTCTCGTTCTTTCCTTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGAT:1 - chrX 15666900 5' + INE-1 545 1 55.86 AGTTTAACCGTAAAAAAAGAAAATTATATATCATACATTTGTGGACAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGA:1 + chr2L 15081014 5' + Doc 12 1 76.39 AAATGAAGAGTTCTTAGGTGTGCACCATGAAAGATCTACGTCCGGCAATGATCGGTGGTTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTG:1 + chr2R 16272857 5' + 1360 163 1 60.00 AATCAAATTGTTTCATAATAATACTGCAATTATACTAGGTAGTTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACGAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATT:1 + chr3R 9583303 5' + Juan 4105 1 67.81 ATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCA:1 - chrX 20880651 5' + invader4 2838 2 78.57 CTCGCTTATCTAATTAGGTCAGCTTGGCAGCTATGACACACGTTCTATATTTCCGTAGGCAAAGTCAATAACTAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACC:1 + chr2R 21848615 5' + Transpac 4921 2 78.77 AAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGC:1 - chr3R 21395220 5' + G2 432 1 53.26 AGATTCAGAAAATAAGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 + chr3R 7507144 5' + Doc 70 1 66.44 GCCGTTGATTTGCAGCAGTTTACTTCATTAAGTTCGCTTTTGTCTGTGAACTTCACCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCG:1 + chr2R 23208293 5' - Tirant 8282 2 55.00 AGGCCAGCTGGCAACTCCATTGCGTAGTTGGGGACGAAAAAAAATTTAAATACACAGACATTAATGAATAAGATCGAGAATTGAGCGTGATTGCGACAAAAGAATAGTAAACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATATATTCGGA:1 - chr3R 17965689 5' - Gypsy12A_LTR 2052 1 61.81 CGGGGAGTTATGAATGGTAAACTGTTTAAAATTTAAAAGCATACATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:1 - chrX 7384983 5' - I-element 5278 1 69.18 GTTTAACCGTAAAAAAAGAAAATTATATATCATACATTTGTGGACAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 + chr2L 15081015 5' + Doc 15 1 74.66 AGGGTGCGTCGGTCGTCTTTCCTCCTCTGTTCTGTTGCTCGTTGTCTGCGGTTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCG:1 + chrX 898662 5' - F-element 372 1 57.95 GGTACCATACATTGCAGAACATGCAGCTTCCAAAGTTGCTCGGAACTTGGCCAGCCTAGATAAGCTTTAAAATGGATCCTCCATATATTAATCTAAGTGATTACATTTTGTTCAATATTCACTTTTTATTTTGTGATTGCTATTTT:2 + chr3L 1692284 5' + transib4 41 1 73.29 GCATTGCTGCGCGAACTGAAACATCAGAACGTAATTACCCTCATCCGGGTGTTTCGGAGAAAGAAACACGACGAGATGTTGCTATGAATTTAAATTGTTTGGAGTTTCCAACGTGGTTCATATACATATAATTTTACT:1 - chr3L 9838321 5' - transib3 2620 1 59.42 TACAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATGTCCCAGGTGCAAGTACTCATCAATGAAAGCCTTTCATTGGGCCTTTTTTCTTTTGATTTTCGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCT:1 + chr3L 24088926 5' - 412 383 2 65.75 ATAGCTCTTATCGTTGGAAGTATGATAAGTATTTCCCTTCATTTTGGCCATGTTTTGCGTGTGCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAG:1 + chr3L 13952725 5' + I-element 5115 1 72.60 GCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chr2L 14969099 5' + 412 7125 2 67.59 CCAAGGATGCGCCACAAAATATGGATGCACTGTGAACAAAAGTGGGTAGAAAAGTTGGACTTTCATACTATCTGCACTGTTTCGCCATTTGAAGAGTAAACACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr3L 1358580 5' + 412 19 2 67.12 GCGAAAGGAGAAGGATACGGACCGGGACAGTAAGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCAACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr2R 8688187 5' + F-element 28 1 63.48 TGTCTTACAAATTTCTATCGATATACCATAAACACTTTGCCCACGCCCTTCCTGACATCTTCAATAAGCCGAAAACGATCACGACCACGTTTTTGAACATATTTTAAGGGGTAAGGGGTATCTAATAGTCGGGCAACTCGACTATA:1 + chr4 1038875 5' + INE-1 565 1 65.07 CGCAGAAATATACGCCATACTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 25751907 5' - roo 9028 1 55.48 AATTTAGTTGGCCCATTTTCCTGGACGCCCAGGATTCGAGTAAAGTGGAGCCGGAGTGGAGTGAAGTGGAATGGGAATGGGTCCTTCGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATCAGTAGTGGGATCTGTGCG:1 - chrX 1765083 5' + micropia 475 1 59.31 ATAGACCGGCTATGAATAAGAACCTTACTAGTTTCATCTCAAAACTGTTTCAACTTTTTATTTAATTCCTAGCTTGTTAATTTAGCATTTGCAAAACATAATATCACAAAAATAAATTTAAAAAATGACTTTATATAAGAATATTT:1 + chr3L 3884777 5' + 1360 387 1 62.33 ATACATTTATGCCTTTAATTTTGCTCATTAAGCGTATTTAATCCTGAGCCAACTTTTGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTCTCTGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTC:1 - chr3R 15600770 5' + Tirant 271 2 58.90 TCTCAACAATCATTCATCAAAATTGTGTGCATGTACTAGTTTTCACCGTTCATTTCATGATCGTAATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chr3R 12363850 5' + jockey 4694 1 69.93 ACAATAAACAAATGTGGCAAAAGATACTATGCCAGTATCGCAGCATGGGGTTGATGTATTCACAGAGTCCTTGAAGGCTATGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 + chr2L 6177498 5' - pogo 2064 1 60.27 CACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCACATAATAGTCAAGAT:1 - chrX 21667920 5' - opus 7415 2 76.71 TAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr3L 18253775 5' + blood 7023 2 69.16 ATAAATTGAAATATTCATATACCAGAGCTGAGCAGAAGATGTTCAATTAAGATCTAATACGTGGGTGTGAAATTTATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTC:1 + chr3R 16538342 5' + G2 2628 1 54.11 GTGTAGTGACCTCTTCCAAGTTGGTTAAAAGACGAGATATGGAAAACAAAGGAACTGAGCGAATTTATAAAAAATGAAATAATAATTAAGTATAAATATGGTATTTCGATACAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCCACGGG:1 - chr2R 12319560 5' + Tc1-2 443 1 68.28 AAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 + chr3L 7791890 5' - Transpac 5168 2 58.22 GTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chrX 1103587 5' + pogo 36 1 59.59 GAAAATGTTTAGAACCATAATAAATATGTGATTATAATAATGTTGTGATTAAATTTTGTGATTAAAATGACTACGATCTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTACATTTTATAATTAATCTTATATTAACAGAGGCAG:1 + chr3R 7080578 5' - G4 3781 1 50.68 GGTCGAGGCATCGGAACCCATTAGCGTGAATTGGCGAGTGACCGGCAGCGGCTGCGGCTCATATGACAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 - chr3R 31141096 5' + Burdock 6156 2 71.92 AAAATGCAGGTCACGAAATGTTTAACCCGAAAGCCAAGGCAAAACATATACAAATACAAATAAAAATACATATGCATATACATATACATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chrX 3351710 5' + opus 143 4 61.38 CACGTTTTGGTTCGAAAATACAGGTTATTGCAAATTATAACATAATATATGCTGTATATTGGAATGTAATCGATGTATTTCGAATAAGTTGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr2R 18344485 5' + 1360 4 2 72.66 TTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCG:1 - chr2R 2868548 5' - Rt1b 4720 1 50.00 GTAAGAATGGGGATCTTGGTGCCAGTCTCCTGACAACTAGTTAATTATAATCTTTTAGTGGGGATGTTAAGAGTCCAGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAGGTAGATTCACTAGAAACTATATACCTCTTATCTAA:1 - chr3R 25099571 5' + Cr1a 4129 1 60.96 TTAGAATTTATTTGTGGTTAGCATGGTTCGTAAATTTTTAAAGGTTCTGGGGGAATGAAATATTATGGAACAAAAGTTGTTGGATGAATATTATTGGTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACA:1 + chr2R 21870119 5' + copia 24 2 65.75 GTTGCGGGTGTTGGTTTTCGTTATGTTTAACCCATTGATTTATATTGGTAATTTAACGCCATTATGTTGCAGCTGCGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTG:1 - chr3R 8854742 5' - 297 6607 2 51.37 AGTTCCTAGAACAATCGTTAACGAAACTAATGAAACCTATTCTCTTGATATTGACCAACTTGATCATGTCTTTGGAATGGGGGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCAGTGCGTTAGGGTTCACTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAG:1 + chr3R 2208313 5' - Doc3-element 391 1 56.16 ATCGTTGGAAGTATGATAAGTATTTCCCTTCATTTTGGCCATGTTTTGCGTGTGCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATAC:1 + chr3L 13952734 5' + I-element 5124 1 66.44 GGGGGTGAGTAGTCTTCAGGTTGGGAGTATTTCAAGGGGGGGGCTCTGCCAAAGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTG:1 - chrX 4420663 5' - gypsy5 6981 2 60.22 GAGTGTCACCTTGCAACACTGGTTTTATGCTATTATAGTTGTCCCGCTTTAGGAGGCAAATTCAAAAGTGGCTCCCAACTTCAAAGATAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr2R 9607236 5' + pogo 30 1 65.07 AACTGCGAATAAAAAAATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chr3L 18253755 5' + blood 7042 2 64.38 CACTGAAATTAGAACAGAATTAGAACAGTTCGATCACTTTTCTATAAGGCCAAAACATATGCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAGTTATATAAAGTATTCT:1 + chr2R 5438210 5' - flea 4953 1 62.76 TATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAATAAAGAATGAG:1 - chr3L 23583088 5' - looper1 85 1 50.34 GTTGAGTGGCCAAAAACTTTGGCATCATAATTTATAGCTGCGTTAAACAAGCGAGGATAACAAATTAATTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:2 - chr2L 20515297 5' + I-element 53 1 55.48 GTCCAACTACGAATATTCGCCTCCCTACGCAGTTTAGCCGCTCCTGTAAGCATCTGTTTCGAATAAATAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGA:1 + chr3R 1227644 5' - Cr1a 4254 1 80.00 TAGCTTTTGATGATCATGTGGCCCGATTGTGTTTACGCATTCAGTTCGCACCTCGACGCGAATTGACCATTCATTTAAATGGATTACGTAAACACTCAGCGGGAGTAAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAA:1 - chr3R 19060414 5' + 1360 3323 1 67.14 ATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chrX 388228 5' + 1360 55 1 55.48 CATACCAATGCACAGTCAAACAGCCGTGCACACCAATACACAGGAAGCACACACAGACGTGGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:2 + chr2L 9879681 5' + jockey 69 1 60.27 GCATTTTCAAAAAGAGCCACGTTAGCGTTTTTTTCCCAACAATCTGGTCATTTTATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr3R 26486118 5' - 412 458 2 52.14 ACCGCCATGGTAGCCCCTATAGAAGCCCCAAGTCCCAGGTGTAACTGATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chr2L 3231874 5' + roo 71 2 67.12 ACATGGATTTCGCGAAATTTCATAATACGATATGATATGAGAATGATATGATATGTGAGTCCAATATTTTGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTA:1 + chr2L 20223245 5' - transib2 2447 1 64.38 GTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATAT:1 + chr3L 7837178 5' + jockey 4837 1 65.07 CCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGCT:1 + chr3R 24750956 5' + G6 57 1 54.29 GGATGTTGTGCAATAAAAATGCAAAGTGCGCCAAAGTTGCCGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr3R 7470914 5' + Doc 61 1 63.70 CTGCGGCTCATATGACAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTA:1 - chr3R 31141045 5' + Burdock 71 2 67.81 ATCCCATTTCCACTTGTTTAATAAAAACTTTGTTCCCTTTTTATATGAAGTGTGGTCGGAAGTATGGTTGATCAGAATCGATAGGCGGAGTCGATTTGGCCATGCCCGTCTGTCCGTATGAACATCGAGATCTCAGGAACTATAAA:1 + chr2R 1986536 5' + INE-1 146 1 70.55 ACTTGTGCTTCATACAACAGGGCTTAACAAGGCTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGATC:1 + chr2L 11554507 5' + roo 164 2 76.03 GTTATTTTTCTCCATTTTATGTATGTCCTTCCTCATCGTTACTCGTCGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGAAACGTTTGTAACAGGCAAAAGGAAGCGTTTTCGACTATATAAAGTATATATATATATTCTTGATCAAGATC:1 - chrX 19122444 5' + INE-1 80 1 80.14 AATTAAACTGTTTTATTGAGACATATATATGTACATACCACTTATTGCCTAACAATCGATATCTTACAATTTATGTCTCTCGTTCCAAAGACTTTACGATATCCGGCTCGAAGGACCAG:1 - chr3R 30860397 5' - 3S18 368 1 69.75 CTTTCTCCAGTAGCCACTTGATGACAGCGTACAAGTTGCACATAAACCAAAATTAATACCCATATAAGTTACAAACAGTTTCAGTACGAGGTGTACGAGTATGTGATAGTGCAAAAACAAAAAAAAACTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 12303575 5' - hopper 148 107 75.00 GTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 - chr3L 18183167 5' + Tirant 63 2 78.57 ATACCATTGTGCGAAAAGAATCCCACTGTCCACCGCCATGGTAGCCCCTATAGAAGCCCCAAGTCCCAGGTGTAACTGATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2L 3231843 5' + roo 8704 2 56.85 TGTCATTCTCTTTTTATTTTTAAAATGGTTATTTTTTTAGAGTTGTTTGACGATAGAAATTTACAAGACTAGTTTAAGACTAAATTATGAAAAAATATGCAAAAATTGTTTAAAAATGTGGGCGTGACCAAAGACACTTGAATAAT:1 - chr3L 23745455 5' + Tc3 239 1 73.97 TCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGTGTACATT:1 - 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HB 1580 1 68.49 GCCTGCACCTCTGACCCGGTGAAAACCTGCCCCTCAACCCAAGACCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGAAAGAAACTAATTTTATTTGGCAATATCTT:1 + chr2L 12486340 5' - roo 9021 2 61.67 CATATTCTGCGAATATTTGCAGCCATAAATAATGGACCAAAAATTGGAATGTAAAAAACAAGCATTCTTGCTCAACGAAGCAAAAGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3L 2320739 5' - roo 9037 1 63.01 GAGCGAAAATACGGTACTCCCAATAAAATACCGCGCAATTCAAAATGGCAGAGAAATGTGCAAAACACCAACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3L 11795558 5' - 1360 3341 1 52.41 ATGGCAAAGGCATACTATATATCCATATCTATATCTATACAGCACACAAAACATGACGAGCAGGGGAAAAACAACGACGTCAAAGCCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 + chr2R 15528425 5' + 1360 34 1 61.64 AAAGTCTGCAAACAAAGAGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr2R 17332218 5' + jockey 75 1 62.33 ATACTTCTCAACAATTGTTGGAATATATATATTTCATTTTTTACCATATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCT:1 + chrX 22905226 5' - 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pogo 2072 1 65.75 GCAATTAAAATAAAATTTGCAGAGAAAATTTGCAAAACCCCGCGAAAACGAATTCAAAGTGCACGAGAATTACACTAAATTAACACGAAAAAAAGCTGAGTACGCTCCTTCTTCAGATTCTTCTTCTTCTTCTTGTTTGTTGTCTT:1 - chr2L 8098757 5' - mdg3 5089 1 67.81 CATTTAAGGACTTAAAAAGATATTTGAAAGAAAAGTCATCCTATCAAGTCTAATCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGA:1 - chr2L 15644953 5' + transib2 66 1 65.07 ATAGTAACTTAAACTTCACGCTCTCCAATAATTTTAATGTAAAATGTAGTAGTAGTATCATAAATATGTATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGT:1 - chr3R 7481608 5' + invader4 55 2 57.53 TGGTGTGTTGGTGGTTGTGGAGCATTGATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2L 3960159 5' + jockey 25 1 67.21 AATATATTCCCCTGTTTCTCCAAGTGCATCAAGCCGTGCCCAGTCGAGCCGCTCTTAATCCAATTAAAGTATGGATTTATGAACTACTGTAATAATATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 + chr3R 30263983 5' - blood 337 2 58.90 AAACACAATCAGCGAAATTTCGAATCTAATCAACACGATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACA:1 - 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chr3L 8400713 5' + 1360 3211 1 51.37 CCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGT:1 + chr3R 7585753 5' + Doc 95 1 75.34 GAGAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTGTGTCTCCCA:1 + chrX 22726191 5' - Helena 1233 1 55.86 TGTTTGGATTTTAAAATCCATCGAGCTCTTAGTTTATTTATTTAGCACTATTTGCACCAGCAAATAAGCTGGAATTATGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTAT:1 + chr3R 25751772 5' + roo 8706 2 47.92 GAAAGCGCCGATTTAAAATCACCAGGAAAAATAAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGC:1 + chr3R 20206228 5' + 412 7498 2 80.82 CTTCAGAATTCTTTTTGCTTTGTACTGTATAAAGTATAGTTTTCTGATTGGTCTGTATTGTTATTTTCGAAATTGACTTTAAAACGGAAAACCAAATAAGTATAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr3R 21216795 5' + 1360 19 1 67.12 AAATGGCTCTTAACGCTACCCTGATAAGCGTTTGAACACCTTAACCCATAAATATTTGACAGGGCACAGTTTATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr3L 12835982 5' - 1360 3339 1 54.11 GCAGGGTTTTATTGGTCAAGCTCATTTTTATCGGTTAAAAAAATGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCT:1 - chr2R 5433981 5' + Transpac 4979 2 66.67 TGTTGGATATAAAAATTACAACGCACCCGCCCCTCCACCAACGTCTGAGCAATGAAATATTGTAATTAACTTTTCTGCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 + chr2L 12144177 5' + transib2 42 1 56.85 TAATAAATCAGTTTAATTTAATTCAGTTGACAGCTTTAAGTCAATATTGTTGATTAATTGTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAACACTCTTATCA:1 - chr3L 11396013 5' + I-element 61 1 58.22 ATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTACATGTATGTTTCTTTTTTTTTATTATATACGGCAGGAAAA:1 - chr2L 5069689 5' - Rt1a 5059 1 72.73 GTGAAGGTTACACTCTAAAATAGTTCTAAAGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr2R 23409048 5' + opus 7165 4 60.80 ACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCCTTCTTATTATTGGTAGTCGGCCTATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chrX 21670001 5' - mdg1 7418 2 56.16 GTACAAATTTCATAATAATAAACACCCATAAAGAACCATATTCTTGGTAAATATCATTATCATTATTATATATTATTACAAAACCTAACTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAA:1 - chr3L 13987290 5' - diver 6078 2 54.79 AAGTTTTTCTTTCAATTCAAAATGGTTCGTGCTGTGTGGGGTTAACTGGCGCTCATAAAAGTGGAAATGTGTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:1 - chr3R 8639343 5' + copia 4921 2 54.11 ATTCGCGCTCAGACTCATAGAGAGCAAGACGAACAACGCCTACTTCTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2L 22719524 5' + 1360 15 1 74.66 CAGTCAGAAAACCAAAGCCAATAAATACGCAAATAAGCTGTGTGTGACTCCGACCCAACGCTGCACCCACGCTCCTAAGCATTTGGCCTTGGCCATAAAAGGGTATGAAACTTAAAAACCTTCATACATCTACACATCATATCTTC:1 - chr3R 4283194 5' + Tirant 364 2 71.92 AATTTTAAAGGTTAACCCTTTTCGCTTCACTTTTATGGAAGAACCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr2R 19843322 5' + jockey 70 1 64.62 CGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr2L 22719583 5' + 1360 56 1 65.62 TAGAAGACTAGTAATAAAAATGACAAAGTTATAATAATACCATTGGAAATAATTACCAAATTGCAATTTTTGAAATTGCAAAGTGTGACTGCACGAATACTTGTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAA:1 + chrX 4938780 5' - 412 7157 2 72.60 ATACATTTGTGGACAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr2L 15081046 5' + Doc 30 1 61.54 CGCCGAGTTGTGTGTGCACGAAGTAGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGAC:1 + chr3R 31724890 5' - P-element 2790 1 18.49 GGTTCGTTTAAAATTAATTGGATTCGATTTGATATATAGTTTATATGTAAGGAAAAGAAGAAAGAAAATGTTGGGTAAGTAATATCTGTTCCACCGAGTCCATCCAAGCGTGCATTGTATTATTATTATTATTATTATTATTATT:1 - chrX 11699264 5' - mdg1 37 10 54.48 AATATACGACTTCTCGCACCACAAACGACTGAATAGAAATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 + chr3L 14167354 5' - mdg1 7388 2 71.11 ACACCCATTAAAGAACGGAAAATATTCGCTGCTTTATGGCCTTATAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGC:1 - chr3R 15294463 5' - roo 8902 2 64.60 GAGTGACCGGCAGCGGCTGCGGCTCATATGACAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTC:1 - chr3R 31141061 5' + Burdock 6159 2 61.40 ATGTGCGGCACATTCTACGTGCTACGGAAATTTCCAGTCAATTTCCAGGCGGGAGCGGTACACGCTGCAGTACCCCCTTTGAATTTTAAGTTGCATTCAAGAGTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAGTTTTACATCAACAT:1 + chrX 10026371 5' - Tabor 81 2 72.03 AGCTTGCCGGAGGGGGGTAAGTAGTGAGTGGCGAGCGGGGGGCGGGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTGTGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAG:1 - chr3R 11150645 5' - mdg3 35 2 73.29 CAAGAGGAGCTGGATAATATTATGTCTGACCTGAACGAACCGCAGAACGACGTTGAAGTAAAGAAAGATCTATATCAGGTAAAAAGAAGTCCTTCCAACTTTGAACTTGGTTGTTTGAGTAAGAACATACAATAAGTTTAAAAATC:1 + chr3L 18610753 5' - F-element 4628 1 73.97 ATCTATATCTATCTATATATCTGTCAACAGTTCTAGAGCTGCTATTTACAGTTTGTCGAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGCATTTTTGACTTCAAATGTCAAAATTAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTT:1 - chr2R 24317467 5' + S-element 77 1 66.44 CATTGATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2L 3960181 5' + jockey 23 1 61.22 AAATTAGATTCCCATTAATAGACTAGTAGAATAGGAACAGAGAAATTGGAACAGTTTACAAATGATAATCATAAAGTTATAAAAAAGAAGAATATTTGCACACGAGTCAGAGAAAAAAAAAATTAATAGAAGCAATGCATCGACGG:1 - chr2L 3800143 5' + invader2 312 1 65.75 CAAATTCAATTTTTCCAACGTCTGCGTCCCAATGTCGTTCAACTTTGGCTTTGTGCTTCCCTTGGCTTGGTACGTGCCCGGAAAGATTGCGCTGATGAGATGCCACGCGCGCAGATCAACAACCACTAACCTCTTGGAGTTAACTT:1 - chr3L 22375982 5' + Q-element 241 2 68.49 AGCTTTTTTCTTGTTTGCATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCAGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chr2L 17295796 5' + Doc 24 1 64.38 GTTGCTCAGCAATCTGCACTGAGAAAATAGCATGTTGTCGTATTGACCACGTACTATTTGATACAATAATCAGTACACTTTTTTGATTATAATCTGTGACTTTTTACCATTTATTTTAGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAAC:1 - chr3R 12744794 5' + Stalker2 5 2 68.49 AATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAGATTAAGAAATTCTTATGTTGAAATTAGATGTTAAGCTGAAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATAC:1 + chr2R 545172 5' + Bari1 1463 1 52.05 CTTAATTTATTTGCATGACTAACTCCTCTCGGCAATTGAATTAAACTATATAATTAGTTGCTCAATGATATTCTCCGAAATATGTACTTATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 + chr2R 17014348 5' + flea 30 2 64.38 ACTAAGAAAAATGGGACGTTGTTAACGAAGTATTTGTAATAAGCAAATTATCACGCAAATTATCCTAATTGTACACAAGCCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGA:1 - chr2L 14772413 5' + Cr1a 4003 1 51.37 AAAGTTAAATATTCAATTCCTCGAACTGGGTAGCTTATTCGGGCGTTTTGCTCCTTTCCCCGCCGTATTGTACACGCCAAATGGAATACAAATCAGTTCTTACTTAGTCGCAGATTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAA:1 - chr2L 3191476 5' - 1360 470 1 76.71 AATTTCACCCATACACAGCCAAAATGTTTAGTCGATTTCGTGTATTAATTATGTTCACTAATCGTAGAAACATATGTGTGAAAAATGTATTGATACTCCTTCATTAACCTATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr3L 18381894 5' - copia 244 1 65.07 AAGATAAAGATATCTTTAACACAACGACTACCAACAGATGGAGCCACAAAGTTAAGCGCAAAAAAATTTAAACATTTTTTAAAATCGTGTTAGTTTTGAAACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTAG:1 - chrX 20996656 5' - INE-1 103 1 76.56 CATCAAAGGCACATCTTAACCTATAGACAATTCTTATGTTATTTTGTACCAAAAGTAAACAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTCT:1 - chr2L 15644573 5' - transib2 129 1 65.07 TTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGC:2 - chr2L 17599966 5' + 1360 486 1 73.29 CAATCTCTTGGCATTTGAAAACAAATATCGATCCAAGCTTTTATTAGACGATTCTTCAAAATTGGTTTAAAAGGTTATTTATATATAATAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - chr3L 18801900 5' + I-element 32 1 60.96 ACTTCAGCTCTATATATTTCTGTTACATATGAACATGACTGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCG:1 + chr2R 4577035 5' - Chouto 493 1 66.67 AATTAACAACGCATCCTTTGCGCATCGCTGATTGTTTTGTTTCAATTTCTGGTTGCGCCCCTCGATCTAATTTACGGGGTCGGGGATGTCGCGGATCG:1 + chr3R 10626549 5' + aurora-element 4036 1 70.41 AAAAATGAAAATGAAATGTAATGCATGAAAGCCTGGCTTAAATGAAAAGCGCAGGGTTAGCATTTGTTACTAAAATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr4 648695 5' - pogo 2057 1 55.48 CTCGATCTCAGTAGTTCATCTTTTATAATGCCCACACACACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGA:1 + chrX 2295138 5' - Transpac 5153 2 71.92 AAATAGCAGGTAAGGAGGATTTAAGAGCCACCGCGATTAAACCCATTTGATTTTGCGCCAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr3R 11870065 5' + pogo 57 1 60.96 AAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr2L 14969089 5' + 412 62 2 60.69 AACACACTCACATTCGGGCAACAAAAAAAAATTGCCAACTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTCGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 4524010 5' - roo 9009 2 66.41 AGTTGTAAAAAGAAATTAGTTGCCACCGCTTGCGGGTTTATCCATCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTGTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACT:1 + chrX 6462027 5' + hopper 32 1 54.00 TAGAAGTGGAGCCAAATAAATGCTGCTGTTGAAAACATTTGTTGTTTATTGGCAGTCGAAGTGAATTTTCATTTCGCTCCTTTATTTGAAACCGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGG:1 + chr3L 12344692 5' - Idefix 197 1 69.50 GTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTG:1 + chr3L 25804307 5' + gypsy 141 2 83.72 GAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chr2L 15081091 5' + Doc 84 1 80.58 GCAAATTGCATGATACTCGTACATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr2L 17626710 5' - roo 9041 1 64.08 GTTTTTCTTTCAATTCAAAATGGTTCGTGCTGTGTGGGGTTAACTGGCGCTCATAAAAGTGGAAATGTGTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 - chr3R 8639341 5' + copia 4923 2 55.48 CCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAG:1 - chr2L 21643118 5' + Tabor 72 2 65.07 CTCACTTGATTTATTTATTACTATTATTACTTTATAATGCCCAAAAGGCATATATATATAAAGGTCTACCAGTCTATAAATTCTGTCAGTATATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAG:1 + chr2R 5296738 5' + INE-1 17 1 63.70 GAATTTAATTTGCTAATACGCTTCGTTGAGTGGCAACGGGAGGCGTTTTAGTGGGGTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 + chr3R 20934640 5' + 412 9 2 74.40 CTTTGACAAAGAGTATGCCTGGTTTACCTTTTTATCCGTAAGCACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAGA:1 + chr3L 19031195 5' - roo 9043 2 65.97 AAGCCAGAAACATTTGCCTGCGCGCGTTTCTTGGTATAGTGCCATCAACTCGATCTCGATCTCAGTAGTTCATCTTTTATAATGCCCACACACACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:2 + chrX 2295084 5' - Transpac 288 2 70.55 GCAGCACCACCAAGTTTCCCTCCGAGAATGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATACATGTC:1 + chr3R 24499524 5' + blood 59 2 75.22 TAGGCTTTCGTTTTTGGCTTCTGTATGGCAAAAGTAGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 + chr3L 12874891 5' + jockey 92 1 74.66 ATTTACTCAAATTTGGTATATAGAATAAGTTAACATATTTTTATTATCTAACTAGCCAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTTTACCAAATATGGACTGTTTCAATGCAGCTTGT:1 - chr3R 6816781 5' + Juan 457 1 60.96 ATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGGATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATT:1 + chr3R 7616731 5' - Stalker2 345 2 57.04 GTTTCACTTAGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCCAGGCACCCCG:1 - chr3R 13225562 5' - hobo 2891 1 59.13 TGTTAGCCGCTCTAAAGTTGCACTCGCCGCACGGATCCGGTGACTTTAACGCCGGAGAGGAACGCGGATTGTAATTGTTTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTG:1 + chr3R 6495260 5' - Stalker 355 4 50.00 GTATAACTTGCACTTTGCTCGACTTGCCCCCCCGCCCGCTGAAGTGTCACTCGAAATTGAACTGCAGTCTGGATGGGGCATATCATTGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCAT:1 + chr2R 10658478 5' + invader3 105 2 68.38 ATGGAGGAGGCGCTGAGTCGCCAGCAGACGCCCTACATTCTTGTCAGCGATGTGCGGCGCAAGAACGACATGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGG:1 - chr2L 19579745 5' - Doc 331 1 65.71 GGAACTTTTACTTCGCGCGTAATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAT:1 + chr2R 12065547 5' + Stalker2 21 2 71.43 ACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:2 + chr3R 9125679 5' + Doc 88 1 71.23 ATGCCACGCTGCAAGTCATTAGGTGGCGCCTGCACCTCTGACCCGGTGAAAACCTGCCCCTCAACCCAAGACCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 12486313 5' - roo 9051 2 68.38 ACATTCTTTCTCTCACTTTCCATTCCACAGGCGGCCCTCAAATGTATGCTACATTTTGTTATTGTTAAATATGCTACGGTTTGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chr3L 2216647 5' + jockey 9 1 76.15 ACTATACTTTGTAAAGCCCCACTTATTCACGTTGAATACAAATTAATTATAATTTTGTTAATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAC:1 + chr3L 17667547 5' + F-element 64 1 52.74 GCAATGATTGCGGTGTCGTGGATTGGATTGCGATTGGGTATGCAGTTTAATATGCCTGAAAGTACATATATCCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATA:2 + chr3R 11513436 5' - roo 9025 2 53.42 TTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:1 - chr3R 7616835 5' + Stalker2 50 2 55.48 ATCACTGGTTGTACAAAGTATCTAAAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTG:1 - chr3R 16997464 5' + G6 62 1 57.53 AATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 + chr3L 7791877 5' - Transpac 5209 2 63.56 ATACTCGTACATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2L 17626698 5' - roo 361 2 54.11 CACCTCACGTATGTAATTGTGATTTTCCGTGTTTTCCATTTGATTTTTCCTTGTTTTCCATTCGCTTTCCTCCCCTCCGCCAGAGTTCGACCAAGTGCATGAATTTGTCGTTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATT:1 + chr2L 11294191 5' - Tirant 449 1 74.66 AGCACTTTAAATTAAGTCAAATGCCAAACAACGACGAACGCCTAAAAGTCTGCAAACAAAGAGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:2 - chr2R 17332262 5' + jockey 30 1 70.55 ATATATATATAGTGACGTATTCATGCTCAGTTAATTGAATATACGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTT:1 - chr3R 2472939 5' + McClintock 6006 2 66.67 ATGGTCGAATAAAGACACGAAAGATTGGAGACTGATTGCTAATTTAACTGATATGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGCGAGCGATACAT:1 - chrX 4400393 5' + roo 66 2 62.76 TATGTACTTACATATGACTTATGTACATACATATGCTCATATATGTACATATGTACATATGCTCATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCT:2 - chrX 2295254 5' + Transpac 47 2 52.05 ACCCAGAACACCTTGACACCAAATGAAATCTTTTCGATTGAATGTATATGAATACATATATAAAACGAATATCGTAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACC:1 + chr3R 9130716 5' - copia 5040 2 50.68 AAGCGCCAACAAAGAAGCCAGTTGAAAAGAAGGAACAGGGGAATTATGAAATTGCATCTGCATCTGAAGAAGGAATAGGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCAACT:1 - chr2L 17143368 5' - diver2 85 2 54.23 ATAAACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACC:1 - chr3R 24454881 5' + F-element 268 1 52.71 CTCGTTGTTGAAACGATGAAGACATCAAATTGCATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 - chrX 6633021 5' - P-element 2806 1 30.14 ATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTA:1 + chr2L 14239144 5' + 412 67 2 61.64 GTAAAGTAACTGGTTGGATTTGGCCTGGCCTCCATTTAGAGTCTGATGGCGAAACCATGGCATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 + chr2L 12291788 5' - Tirant 8501 2 81.43 AACACTCAAGTTATAAAGACACGAGTGGATTCGACTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr3R 10213100 5' + P-element 53 1 35.65 TAATTTAAAAAAAAAATTCTATTCATATTATTTTATAATTAAATTTATTTTTTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTT:1 - chr3R 7475468 5' - X-element 4623 1 78.08 TATTCTACCAATTCCAGGTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1 + chr2L 21643005 5' - Tabor 448 2 59.31 CAAGTTTCTACTAATGTTAGTTTTAAGCTAAAAAAGATTTGATTCTTTAAAGCACTGACACTTAAAGTATTTAGAGATCGAAACTATTTAAATTCTAAATAAAGAAGGAGACTTAAAAGATTTCACGTGCTAGATCTCCCGGACAG:1 + chr2L 8776806 5' + G4 3700 1 68.49 CGACTTCAGCTCGTCATCGCCAGACATTTTACTTGCAAAGTTTACCACTAATGGCTTACGATGCTCTTTCAAAGCGCTTACAAGATTTGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr2R 21843902 5' - pogo 2069 1 62.33 GGATAGAAGTGGGTTAGAAAATGCATTTTTTGGTTTAGATCCAAATCTCCAAAACGAAGAAACCCCTGAGTTCTTAAAATGTTTTATATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr2L 13255412 5' + pogo 30 1 60.96 GAACCATATACTGATCAAAGCTGTAGTTAACTTTAAGAACTTATTTTTCGACCTACAGGTAGATTTGCTTTTAGGCAATGTCCACTGTATATCTACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTT:1 + chrX 3687118 5' - P-element 32 1 66.44 CGCCTATTAATTTTAGGGACATTTCCTTTTATTGATTCACTGTCAATATTATATTGAACCCATAATTTACACATAAAAGGGCTATGGCTATACACTCGCAAAACTTATCCATTCCATGAAAAAAGGCTTCAACTTGTAGCCAAAGC:1 + chrX 7831597 5' + S-element 1395 1 63.70 AGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAATTATATTCGGTTTAAATAG:1 - chr3R 25751857 5' - roo 345 2 77.39 TAGTATTTACATAACAAACTATACCCAGTACTTAACTTATTTAATTTGTGCAACTTGTATTCTTACAATATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGA:1 + chrX 7775873 5' + roo 8807 2 53.10 CAAGGCACACAGGACACTCCAGTAATTGGGAAATATGTTGCAGGCATGTTGCAAACTTTTGCAGCGATTGTTGATTATGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAG:1 + chr3R 23006597 5' - accord 7001 2 64.17 CCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr2L 12291935 5' + Tirant 12 2 65.56 AGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr3R 7507158 5' + Doc 82 1 75.69 GTTGAACTGGCGAAAAAGAAAAAAAAGCACTCAAATTCACCAGCGAACTTTGCTAGTTTTAACAGCTAGATGAGCCGATGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCAC:1 + chr2R 22373098 5' - 1360 436 1 53.42 CACACAACGAAATGGCGTGGAAGAGAGATAGATATAAAGAGATAGAGACAAGTAGTAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCC:1 + chr3R 12515720 5' + P-element 2730 1 42.47 AGCACCGCAGAGGGGCACCTTGCACCTGCGCACTGTGGACGAACTAAACCTGATGAATCGCACCGAGGTGGAGCACTTAATCGTGCCCAATCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr3L 363418 5' + blood 30 2 63.70 AATACCCTTTAAGGATGATGGATCAAAATTAAAAATAAAAAAAA:1 - chrX 8940098 5' + Doc 4696 1 77.27 TAGCTCTTTTAGCATTCTATAGATTATTTATTTTTTTTACGAAATCTGAGACTGACAATGATAGGGCAATTAATAGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 - chr4 295785 5' - 1360 3331 1 65.75 TAAATATACATTTCTAGCAGTATTAGAAACTTTCACTCAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGG:1 + chr3L 1358459 5' - 412 7464 2 71.23 CTACACAAAGTGAAGTCGAATTCGCCTTCATTTAGGTGAGACAAAAGCTTTCATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATT:1 - chr3L 22642063 5' - hopper2 1543 1 62.33 AGGAACTTGCTGCTACTACCATAGTATATGAGTTTGTAGTCGAACAACAACTAGCTTGGGTCGTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 - chr3L 24710044 5' - 1360 3330 1 56.85 ACAAGCTAGAAATTTAGCTGCTTGCTGTACTTTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGT:1 + chr3L 14944519 5' + G5 4772 1 60.27 AGCAGATAATAATATTGTGAGTATATTAATCGTAAATTCGAGTCTTGTGTGGACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3L 21013970 5' - roo 9032 1 60.42 AAGTAAAGAACAATAGAAAACACTCGATAAATGGGAACAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chr3R 8849911 5' + 297 10 2 79.45 GTACATAAGTAAGATAAGTAAAGTCGCCATCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCC:1 + chr3R 7481492 5' - invader4 274 2 50.00 CTTGCCGCTCTCACCAAGCAAACACTCTCTTTCAAGCTTCAGGCGTTTGACTGTGTGTGTAAGCCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCGCGTCGGCA:1 + chr2R 17097461 5' - P-element 2874 1 65.05 AAAACTTTGGCATCATAATTTATAGCTGCGTTAAACAAGCGAGGATAACAAATTAATTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAA:1 - chr2L 20515285 5' + I-element 65 1 63.70 GGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAA:1 - chr3R 24454855 5' + F-element 300 1 68.15 CATTGTGTCACTCCATGAAATGCAAATCCGAATGACGGTATATTTATGATAAATGTGCGAATAGGAGGGGCCGAAGTGTTTTTGGCTTACCATAAACATTGACATCAAATTAAATAAAATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGGGCT:1 - chr2R 21460727 5' - INE-1 255 1 58.22 AATGGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAA:1 + chr3R 10437033 5' - BS 5046 1 52.74 AGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCT:1 - chr2R 5173239 5' - Stalker4 7323 2 54.79 GTGACTGTCCTGGCCAAAGGAACAGAGGGCAAGATGGGGAAGTCGTGACTGTACCGATTAAAGAAGGATGACTTTCCCACCCTAGCAAGCGCTCTTGGAATCAAGCCGGGGTTAAGGCCATCAGCGGAAATCACGATCAGCTGAAA:1 - chr3L 23768602 5' - Gypsy12A_LTR 201 1 73.29 GTAATGGCATTCGGCCACTTTGAAGTTCCAGTGGGCCACCAATGCACCGTGGGCCGAAAAAGTATTATTTATTATTTCATAAAAAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 + chr2L 8574331 5' - Transpac 285 2 69.12 CCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 + chr3R 9125660 5' + Doc 69 1 58.22 ATGATGTTGTCCTTGCCGCAGCCGTTGCTACTTGACACCACAACTGATACACTGGGAAAAAGTGCAACTACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 + chr3R 15054100 5' - 297 6931 2 52.05 ATTTTTGAGATTCTCATAGATAATGTCTACTGTAAGTTAATGCAAAAAAAATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCGTAGATTGAAAGGGTATACTAGATTTGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAG:1 + chrX 20782714 5' + INE-1 21 1 63.19 CCCTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACC:1 + chr2L 18630456 5' + G-element 25 1 59.63 GTGGTATTACGCTACTTCGGAGTTCTACAAATTAAACTGTTAAATATTAAAATTTTTTTGAACAAAATGAATGATTACAAGATGACCCCAAAAAATTTGGAAATGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - 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roo 404 1 79.31 TACTATTATTGCTCTTTCGAGCAGCGCAGGTAAATCAATAAATTTACATAATCATTGTGCAAAAGGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2R 22463130 5' + roo 38 2 55.04 CAGGGAAATGGTTTAAAAATTTATAGTAATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chr3L 13678867 5' + hobo 11 1 70.91 TGTGAGTGTATATAGCTGGAAGACCCGAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr3R 16276464 5' - pogo 2073 1 63.70 GTTTTATTCATTCATTTCGATTCTGTCTCTTGTCGCGAACAGACGTTTGGGAAATAGTTCGGTGCGGGTGACGTGACAGTGCAAAAATTGAATACAAAAAAATAAGTTACCAGTCGAGAGCTGCACGTCACGCATCTGAGCTCCCC:1 + chr3R 10388250 5' + G5 4464 1 72.60 ACAGCCTAAGCCGAACGCTAGCCCGAAACCGAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3L 19580998 5' + roo 17 2 67.83 AGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr2L 13629089 5' + Tirant 41 2 67.68 AATATATACACATAGTGCTAGTTGAATTTAATTTTAATGGGGTTAATACATTTTCGTCTCAACTTTAAATAGCAACTTTAAAAAAAAAAATTTAA:1 + chr2L 15535094 5' + gypsy2 430 1 76.84 TTCAGAATAGAATCAAGAATCCTAAGGGTTTCGCATCATTAGTATTTTAAAAATTCCTTAAATATTAGCAACATTTAAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 8658665 5' - roo 400 1 75.34 CGCTAAAAGACATAAATATCACTTTATGCATATGTATAGTTCTGGTTTCTGATTTTTTACGGGTCATTTGAGCACTCGACGAAACGACCAATATGGATATCCTGGTTCTTATTGATTTGGCTGTCACAAGCTAAGCCCCAGATTTG:1 - chr2L 8843450 5' - X-element 4248 1 62.33 AACATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAG:1 - chrX 23182957 5' + Idefix 10 2 65.52 ATTTACTATCATGTCTACTTTATCTTGATAATTGCCTTTTTTTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 + chr2R 13046501 5' + 412 79 2 70.55 ATTGTTTTCCAAATACATTGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3L 24766007 5' - 1360 3343 1 80.28 GCAAATTGCATGATACTCGTACATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:3 - chr2L 17626710 5' - roo 9037 1 62.33 GAAATGTAGCTTTGCACTTTTGTATAAAAATCTATGATAAATAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 - chr3R 11151948 5' + mdg3 19 2 71.03 GCTCGAGCAATCCCACCGACCAATGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGC:1 + chr3R 22762068 5' + 1360 3357 1 73.33 GCTGCGTGTAGCAACTTTGCTGCGCAAATATGTTTCGCCAACTTCAATTTGTGTCCCAGGTAGTAAGTTTACCACTGTGTGCGTGTGTTTGAGTGGCATGCCGTGTTACTGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTA:1 + chr3R 29194260 5' + Circe 224 1 72.60 GAGCTATTTAGTAGAATTTATTTCGTTTTTATTTGCGGCATAAAAAGATCATAAAAAGAAGTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGTGTGTGTTTAACACAATTTGCTGCTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCATTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr3R 19171579 5' - opus 7488 2 73.29 GATGGCATATCCAGAGCCATTCCATTAAATATTCCCCCTCTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTCAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 + chr3R 6645338 5' + blood 7089 2 67.81 GATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 + chr3L 7791904 5' - Transpac 235 2 67.81 GTGATTACCCAACTGCGGTTGCCATTTAATGTGTTTAAAATATTTCGAATTAAGCCGCTTTGTATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACT:1 - chr2R 11095842 5' - diver 6054 2 58.22 ATAGACATAAGACTTAAAACATGGGTTGTTGCATTAAGTAAAACTTACAATTAGTTTTACCTTAGAAAATTATTTGAAAACTATATGGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCTTTTCTCAATAAATAAATAAATAGTCAAGT:1 - chr2R 21870292 5' - copia 222 1 48.63 GCTTGCAATAAATACTATTTGTAAAGAACAAGTAATAATAAGTACTTATTGGATTACTATTCAATTATTCTTAACCATTTAATATATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGAT:1 - chr2L 13139111 5' - McClintock 447 2 64.38 GGTGAAGAAAACAATCCAACAAATGTGTTGTATCAAAAGCCAAATCCTCTAAGTAAATAACGATAAAATGGGTGGCATTTGCAATTCAAATATCTTTATTTTTACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3R 13838160 5' + 297 6595 2 75.34 GTAGTTGAACGCAAGTTTTAGTATTATAGCAAATAGTTTATTACACTGTTGATTAATAATTTAAAATGAATGCGATTAATTTATTAATAAAAACGATATATCTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATA:1 - chr2L 7822350 5' - Juan 4198 1 72.60 GCCCGAAGCGGCGACCATGCCTCACGAAGCGTGCGGTAATTGGCAAAAGAAACACACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 + chr3R 20450421 5' + hobo 68 1 65.75 AGCAACTGCCAATTACAAAATATTTTCAATTATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 + chr2L 9274949 5' + F-element 32 1 71.23 AACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTA:1 + chr2L 9274999 5' + F-element 82 1 65.75 GTCCAATGAACTCCAAGAAATTTTGATAGCTCGGATTTGATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr2R 15070068 5' - 412 7490 2 56.16 TGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACT:1 + chr3R 10437067 5' - BS 5012 1 71.23 AAATTGAAATATTCATATACCAGAGCTGAGCAGAAGATGTTCAATTAAGATCTAATACGTGGGTGTGAAATTTATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTC:1 + chr3R 16538344 5' + G2 2630 1 52.74 ATGCAATATTAAGAACAAATAAATAAAAATATGATAACTGTTTGTTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAAAATTACTCTAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3R 29313749 5' - 412 470 2 54.33 GTTTTAACAGGTAAAGATATTTCGTCGTGCTTTGGCCTACATTTGCATCAATGTGATATAATCAGGACGCCAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTT:1 - chr2R 9294428 5' - Tirant 8462 2 55.48 GTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr2L 7652253 5' - roo 325 2 80.58 ATTTTACAGACCATTTCACAATGCATAATTGCTTATTATGCGCATTATTTATACATAAATAATTTACAGATTTTTAATAACCCATATATTCCGAAAGTGTCGCCGAGGAATAGAAGAGCTCAATAAGTGTCACTATATATTTTCAA:1 + chr3R 31040740 5' + TART-A 13338 1 63.01 GGGAGCGGGTCCTTGTGCCAGCGATGGTTGTAATGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAATTATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 14218494 5' - roo 8994 2 77.17 AACCTTTTGAAATTAGGCCTTAAAGCTTTAGCCCCCTTAAAAAGCCACATTTAAGCCAAGAACTTCTCCCCGTACGCTCATATTTTACACAAGATATGGGCGTGTCGTTTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAA:1 - chr3R 14912089 5' + Stalker4 6971 4 75.34 CACATTGTGCTCCATGCCGAAGAATGCGGCAGTGCGATGAATCAGCATACGATTGTACGAGGAAGCTGGCGGAAAACGGTACTCACAGCCACGACTGCGAGAGAAAATGTCAAATTTACAATGCATGAGAATACGTGTGCACACAT:1 - chr3L 3832928 5' - 1360 178 1 70.55 AATATAAAAAAGTTAAAATAATAGAAAGCTGCTGCTGCTGGTGCTTTCGCTGCTGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTG:1 + chr3R 16539638 5' - G2 2870 1 52.88 CTTATGTATGGGAATATCTTAGTTTATGAAGTTTGAAATATCAATATTCAATGTGTGGACGCCGAAAAATGAATATATGTGCTCCTTCCTTTTAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGA:1 + chr3L 20892181 5' - invader3 5392 2 73.97 GAAATGGCCAAACGCAAAAATTATGTAAATGAATTTCCTGTTGCATGTGGTGCCGATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGTCTACATACATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 + chr3R 18635173 5' - opus 7472 2 65.75 GTAATACCTATTCCCTTCGACGATTTTCGAACTACCGACTGTTTATGAGTGTGGGCACACATACAGTGGTCGGCTGTGGCTGTATGCGTGCAAGAGATCTGCTGCCTCTGGAGCTCTCTGGCTTTCGATCAAAAATTCGAGAGAGC:1 - chr2L 20117609 5' - 1360 87 1 78.77 AACTAATCGCTTTTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 - chr3L 10112263 5' + I-element 48 1 60.87 GTGCGTATGAGTAATGCTGCATGGGTATAGCGAAGTACGGTAGTAAAATGTTGCTTCCACCTAGCACTTCGCACTTTTTCTACGCTTTATATACGTGTATAGATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTT:1 + chr3R 27809979 5' - Burdock 231 2 67.81 AGGCATCGGAACCCATTAGCGTGAATTGGCGAGTGACCGGCAGCGGCTGCGGCTCATATGACAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:1 - chr3R 31141091 5' + Burdock 6161 2 68.49 GCAAGAGCAATGTGTCGTGAGCTGTCGCCATTGTGACTTTTATTGCAGGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr3R 22494240 5' + 297 6595 2 75.34 AAGTGTAAATAGTTCACAGATAAACACACACATTGAGGTAAAAGCTATACACAAATTTTGAGATTCAATATATTCAAGCTGTTCATAAATAAACCCGCCAGTGTTACTGTTTAGATTGATTTATTGGTTAATTTCAGACACTTAAT:1 - chr3R 17758724 5' - 3S18 295 2 50.00 TTTGGGTGGCAAAGGTGTACTTTTCATACCAAAACCATTTACTTGTGCTTCATACAACAGGGCTTAACAAGGCTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTA:1 + chr2L 11554467 5' + roo 122 2 50.69 TGATAAACCAATTATGCAGGATGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAT:1 - chrX 21247603 5' + blood 7179 2 71.43 GAATATGGCGTGGTTCTGGGCGGGATTTGACCAGCTTCTCCCAACATCTAACCACTTGTCACAGCGCAAAACCACGCCAAACGTAATGGCATATGGCATGCATCATATGTGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAG:1 + chr3R 12520688 5' + Burdock 6148 2 76.03 GGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3R 9125641 5' + Doc 49 1 56.55 TTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGATTTTTAAGTTTCAGC:1 + chr3L 18183079 5' - Tirant 8450 2 56.85 AACATTGATGAGATCGAAGAAAATCGTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2L 7652156 5' + roo 16 2 65.44 GATCCTATCCTTATGATCTCATATATCAATACCAAGAAGGCTGAAGTTACTAAATACAATAGAAGCGTTTATTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 - chr3R 18153667 5' - copia 5075 2 52.74 TGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGA:1 + chr2L 18112485 5' - transib2 2784 1 52.27 TGAATATATTGTTTTCAAATGCACGGCGAACAATAAGATTGAGATTCAGAAAATAAGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr3R 7507103 5' + Doc 21 1 68.84 CATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr3R 18205720 5' + 412 58 2 57.53 GATTTGGTTAATTGGAAAATATTTGGTCTTAACCATCATGATTAGGCGGCCATTGAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 - chr2L 5792135 5' + blood 14 2 76.03 GCTTATCACTTTATTGGAGAATATACAAAGATTAACGATTTTTATAATCAAGCGCTAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr2R 11256160 5' + roo 8728 2 63.70 AGGCGGAAGTAAAGAAGTATATAGAAAGTACCCAAGCGCGTAACGTTGCTATATAAATATTATGATTAACTAAAAACAATTTTTTGTTAGACTTTAAAAAATATGTGAAATGGGAAAAACGTGTGTATGTATGCGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 20470014 5' - Quasimodo 39 2 63.01 CTCTGCGACTGCCACTTTTCCGATTCACTCTTTCTCTATCGCGTAAAGTCTACACAAAGTGAAGTCGAATTCGCCTTCATTTAGGTGAGACAAAAGCTTTCATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAAT:1 - 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chr3L 14516091 5' - blood 258 2 72.60 AGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 24673644 5' - roo 338 2 67.12 ACGGAAATTGCCAAGACCCTCGACCCTTCTCCACCTTTCCCCACTTGTCGCCTCCTATTGTATTTCCTGCCAAGGGGGCGAGCAACAAAAATATTTTATATTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACA:1 + chr3L 15459836 5' + 1360 3138 1 60.96 CTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTGTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTGGGATTACTGGGATTAAAGTTTTTGAGATTTCGACGTTTATACGGA:1 + chr2L 18177045 5' - INE-1 134 1 77.93 TGGAGAGTTGATCGATGGGTTTGTTTTGGCCAGAAAGTGGAGAAAGAAGTAATGTGCATTTCAGTTTACAGAGCCATCAAGTTTATGGAATACGTTTATGACACCTTTGTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCA:1 + chr3L 456924 5' + roo 8620 1 73.29 AAAAACTAACAAACAAAAATTATGTGGGACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chrX 7706715 5' - P-element 2853 1 60.96 GTTGGTGAATAAGATTCTAGATTTTGTATTGCCCCGTCAGAAACCCAAATTTTCGGGCACTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCT:1 + chr3R 8087592 5' - BS 4761 1 59.59 CTCGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCATACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAG:1 - chr3R 24454858 5' + F-element 285 1 60.98 AATGCAGTGTTGAGTACCATTTTTTCGTCCCCCTTTTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAG:1 - chr2R 17590952 5' - Doc 4578 1 76.03 CAATAGCACCTTTTGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr2L 14969067 5' + 412 40 2 50.34 ACACGCAAATGTACCCGAATTGGTGTTGGTTAAAACACAGTGCTCGCTAAATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAACGGAATAGTA:1 + chr3R 25049994 5' - P-element 2821 1 40.41 AAGCAATTTCTGGAGACTCTTACGCTGTGAAAGTTGATTCTTACCGTCATGTCGTTTAGGTTTTGTTAGTTTTACTTTCTTTATGTAAATTTAATATTTTCCTTTAACCAATGACTAGTCGCAAATCTGCATTCACAGAGATCGGT:1 + chr3R 8042250 5' + BS 3 1 72.60 AGATGGTTGTAGCCATCCATCCAACACTCTTTTTTTTGGCAATAAATTGGTAATGTATTTTGGTGACAGATAAGACCTCTTGCACATTGTTGTGATAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - 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chr3R 6461843 5' + 297 54 2 60.00 AGAACTATTTTGGCACAAAGGGACGTAGTCGGTGGTTTTTCCGGGGGGTTTCCTCAGTATCATCCATAAAAGTATGAATTTTGAAAGTGTCAAAATTACGCAAACTTGGATTCAGTTGTTTTTATCGTTCATTGTTAATAGTTTT:1 + chr2L 1558031 5' + S2 1559 2 50.34 CTTAATAATATTTTTTCCCGTGTTTTTATTGTATTTAATGCCGTTTTGGCCTTTGTTTCATCTTGTTTTATGTGCGCGCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 + chr2L 21030891 5' + FB 43 1 56.16 TAATACATTCGACTTTCGCACAAAATGAAACGGCCTTGAAATTGCAAGTACTAACCCTATCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 6413546 5' + 1360 55 1 57.34 CAGATTATTATAATTTTCTTTTGCACTTGCCTGCTGTGAAACCCTAAAAGTGAGCCAAGAAAACTTCTTTCATAGTTCTGCTTCTCACTAAATTAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 + chrX 7446165 5' + jockey 4686 1 40.74 ATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3L 14375606 5' - roo 9039 1 55.38 ACTTATGTACGTTTTTCGTTTTTCTTATGTTGGGCGAGTATGGCACAGTAATACTGTTCTACAAATAAATTAAATCCTCTTTGGAACAATTTTGATAATTTTTCTTATTTTCTTCTCCAATATCTATCGATATCCCAGAA:1 + chr2L 15829763 5' + INE-1 497 1 47.14 GTCCCGTTTTGTAGCAATAACTTTTTACTTTGTCTACTTTTTTCAGTGCCTAAAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:1 + chr3R 12609176 5' - 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chr3L 19031346 5' + roo 42 2 55.48 ATCGCGTGATGCCCACCTACCGAGCTGCGCAAGGCGCCATCTACATATTATTATCCTTCCGTCCACTTCCGTTTCCGTTTGTACACCCATATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCTCAGCAA:1 - chr3R 22484125 5' - copia 5016 2 62.24 GACGAAGGCTAAAGTGTGTTTGGTTCTTGGTCTAATAACGACAATAATTGTCGTTATAATAATGGTCACTTTTATAATGATAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr3R 15296031 5' - roo 9031 1 48.63 ACCACTTCCATACTAATGTTTTCATTTTCATCATCCATAGCTTTCTACTGGGCTTTGGATTCACGAAACTAGCCTGTTAAATTTAGCACGTGCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr2R 5754632 5' - P-element 2858 1 68.49 CTTACCAACGAGTACAAGGCTCTAATTAGATATCAACTAATATCCCAGTAGAACAATTTTAAGGTAGATGGTCTTAGTAATTAATATTATATTTTATGTAATCACGAAATTTTTATTTCTTAGGTTAGAGTTAATTAGCCAAAGCC:1 + chr2L 8434099 5' - Burdock 359 1 65.07 AATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCAACCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTGACTGAAG:1 + chr3R 7481545 5' - invader4 3002 2 79.03 AGTAATCTCAATGCGATGCCGGGTCGTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACA:2 - chrX 19107465 5' - roo 339 2 67.12 ATAGGCTAAACACAGGCACACTTATCGCATACCCTGTAAGTTGCAACCCCCAACTTTTGTGTAATTTCCTTCGCGACACGATAAGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAGATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAG:1 - chr3L 11286149 5' + S-element 37 2 58.62 GAAAGTAGGCAGCACATTTTAATGAGCCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 - chr3R 25795833 5' + jockey 72 1 61.64 AACACACAAAATAATATGAGATTATAAGATGATATCAAAACCTTCATTGCTCAACTGATAGCCACCACACATACCGATGTATGTACGTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATT:1 + chr4 540439 5' - flea 4982 2 63.01 GTGGCAAATGTCCGTCCGTTAAGTTTTGGGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGGTTTATT:1 - chr3R 5422974 5' - roo 9033 1 57.53 GAGAATGTTCCACACACTGATTATACTTGCACTTTGTTGACAAACGAGCTGATTAAATGCCGGCTCTCGCTCGGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGG:1 + chr2L 13693517 5' + F-element 4267 1 52.08 AGTTCTAATAGTTAATTAGTCGACATTCTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr2L 2494821 5' + Doc 61 1 56.85 CTGCGATGGAATTGGATTTGCCCTTTGTGCGAGTGTGTCAATATGTCAGTCAACTCTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATG:1 + chr3R 31140955 5' - Burdock 6329 2 61.64 AATGCATTTTAATTAGATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chr3L 9470028 5' + 412 7113 2 57.53 TTCGCAATTGTCGCACGGATCGATTCATTTGCGGGCAGCGCAAAAATACCTTAAAGCGGCATTAATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2R 22463259 5' - roo 9017 2 54.79 AATACGCTTCGTTGAGTGGCAACGGGAGGCGTTTTAGTGGGGTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr3R 20934654 5' + 412 7097 2 54.11 TACTGATGAGTATGAGTCATTCGAAGAATCGCCAGAGAATCGATGTATCTATATGTATATATATACATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCA:1 + chr2R 7720681 5' + Bari1 51 1 64.38 TGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr2L 14969080 5' + 412 54 2 54.79 GGGGACATTTAAGTAAAGGCGTTGGCGAAGCAAGGGTTTCTCGTAACAATAATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3L 14375737 5' + roo 42 2 57.53 AGTCAGACCACCGGAGTCAGAGCCGCAAATGGAAGTCATGGCAACAACGTATGGAAATCCCCATGTGCGTGTGCACGTAAAAGTTGCTCTGGGAATTGTTTTGGGGTGGGGAGGGTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGAT:1 + chr2L 12888605 5' - Cr1a 4264 1 78.62 ATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCCCTAAACA:1 - chr2L 12291915 5' + Tirant 8128 2 60.76 TCGCTCTTTTTTCAAGACCTTCTGACGTCAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGA:1 - chr3R 25050060 5' + P-element 88 1 25.34 AATGGCAACTCTGGCCTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 21910495 5' + pogo 20 1 68.99 TAGGTAGCACACAACTAATATTATTTATAAATATTTAATTTGAATTTAATTATGCGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGATAGTATACTTAGCGACTAATGTAATGTAAGTAAATATGAGAAGCATATTATG:1 - chr2L 20174817 5' - rover 6957 2 58.90 CTAAATCTCTTTATAACCGTCATAAATGTTGCCATTTGCTTCAATGTCCAATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTA:1 + chr3R 13349505 5' - Ivk 5304 1 64.38 AAAAAAGGCTAAGCTAGAAACTGGATTTAGTTACCATTTTAAACTAATTTACCACAAACACGATATTATCCTTCATGGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGTCGCAAACAGTTG:1 - chr2L 19140493 5' + Max-element 8 2 78.77 AATGAAAAATCCGCTACGCTTTGAGGGTTTTTTACTGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chr2L 16330968 5' + roo 85 2 76.71 TCATAATGTTTTCTTTGCTTTCAAAATAAATACCTTGAAAGAAGGTATTTAATTACCTATGCACGATAAGATACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr2L 23068792 5' - 1360 3377 1 73.97 AGCTAATTTTCGATATAACTTTAAACTTTAACTTTAAAGTCTTTTACTTCAGTTTTTTGTAGTTGTACACAACATCCGCAATTAAATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:3 - chr3L 18382071 5' + copia 36 2 60.96 CTTCGAGTCGAAACCCAATTAATTAGCCAGAAAGTTTCGGTGCCAAGTGGTCGTAATTACGCATACGCCACGTTCGCCAGGCGTAAAAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTG:1 + chr3R 23008717 5' - accord 161 2 60.56 CATCCCGTTTGGGCCAAAAAACAAAGTGTAAAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACA:1 - chr2L 12291975 5' + Tirant 8126 2 72.26 CTAGTTTCGCTACTTTGATAAAAAAAAAAGGGAAAAAAACACAGGTATTATGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCC:1 - chr2L 5890559 5' - invader3 201 2 69.86 TACTTACCTAACTTCAACAATTTGTTTAATATGTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAG:1 + chr2L 22315526 5' + frogger 35 2 49.32 TCTAGGTCTAGGTCTTCGGGCTAGAAGCTGCCTCTTAGCCTCTTATATAATATGAAATATCTGCTGACGTTTTAACCGGTGCTATCCTGTCCACTGGCACAACGACATACGTTCTCAGCG:1 + chr3R 3697533 5' + Doc 220 1 61.67 TCCATTTACACAGCATACTTTTAGGGACTACCCCACACACACACACACACACACACAGAGAGAGACATACACACACACAGAGACACAATCGCGCACACGTGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chrX 18144013 5' + jockey 14 1 68.89 TACTATCAGCCACTCTTTATTTCAAAGCCGCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1 + chr2R 5754532 5' + P-element 91 1 23.29 TATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - 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chr2L 12291917 5' + Tirant 8121 2 58.11 GCTGCTCTTGGAGGCTTCGAGCTCGTTTAGCGCTCATTTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 - chr2L 11405842 5' + 412 74 2 71.74 AAAAAACAAATTTAAGAGAACAGGAACTTTGCTAGTAAACAAATGACTGATCTATTCATACATACATATCTATTTCGCTTAAATTGGATTGCATACAACTAAGTTACAAACCTAAACAAATAGTC:1 + chr3L 16047586 5' + Tc3 1697 1 84.00 ATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATG:1 - chr3L 25508748 5' + 1360 336 1 62.68 GAAAATGCAAATCGATACCAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACC:2 - chr3L 7801332 5' + Transpac 141 2 56.16 GGTTCTCCGCAATTCTCTACGATTCTCCCCCTCATTTCTGTGTTCTTCGTTTCCCTTTGGGTTTTCGGGTTAATTGCACTTACACAATATTTCGATCTATGAATGGTTAAATAAAATCCAAGTTTTTCTTTATTTTTTTTTT:1 + chrX 17495836 5' - HMS-Beagle2 489 1 51.41 GGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTA:1 + chr3L 7837167 5' + jockey 4826 1 57.53 ACGAAGAAGCATCATTTTAAATACCCAAGGCCTTGATCTGTAGGATAATGAGAAGTCTGAGATACACTTGATGCAATATTAATATATTATTATCAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCA:2 - 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Transpac 270 2 56.85 GAGCAATGTGTCGTGAGCTGTCGCCATTGTGACTTTTATTGCAGGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGTGTGGTCCAAACCAGCAAC:1 - chr3R 22494236 5' + 297 6592 2 76.26 AAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chr2L 19407052 5' + Doc 64 1 68.66 ACATATATAGTATTTTATAGTAATTGTACCTGCCAAATCAAGCCAAACACACGCACACACACACACTTCACTCTACACAGAAAACCAAAAATATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTTGCTGGG:1 + chrX 5388944 5' - Tirant 154 2 43.55 AATGTCTTTGGTGGGCCACCTGAAAGTAGGCAGCACATTTTAATGAGCCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr3R 25795854 5' + jockey 23 1 65.55 GAGCAGGCGGATTATGTATGTATGTGTCTACATACTTACAAGTACAACACAACAACCAACCGGTTTACCTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 - chr3R 7089578 5' - P-element 2836 1 50.68 ATTTTGTTGTGTTTGTTCCTTTGTAAAAGCCAAAAGGTCGCCGATACTTTCCAGCTGCAGCAAAAACGACAACTGCAAAAATCCGCAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAG:1 - chr2L 9877293 5' + Idefix 93 2 68.29 AAAGTGGAAATTAATTTAAATGTCTAACAATTTAGTTGCAAACACAACACAGCACCAGCACACACACACACACACACTTACACGGAACCGGGTTTGTCCGTCCGTATGAACGTCGGGTTCTCAGGAACTATAAAGGCTAT:1 + chrX 15421668 5' + INE-1 152 1 58.57 AAAATGTTTTGCCTCCACTTTAGTTAACTTTGTGCTAGTTCTGCCTTCTGCAAATATTTGTTAGATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr2R 10160616 5' + hobo 56 1 54.86 GCAAAGTCTTCTAAAGCATCTTCTGGAACAACTAGTGAAGCAACAACCTCTGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAG:1 - chr3R 14276680 5' + P-element 422 1 36.99 TGGGACATTGTAAATTTTAAAGGTTAACCCTTTTCGCTTCACTTTTATGGAAGAACCCCATTCGCATGGGAGATGAGCGATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr2R 19843310 5' + jockey 74 1 58.90 ATGGACCAAAAATTGGAATGTAAAAAACAAGCATTCTTGCTCAACGAAGCAAAAGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTGC:1 - chr3L 2320708 5' - roo 9020 2 54.55 AGGAGGGAACATGCGGCTTTTCGCTCCAGCGCCCGTTAAGTGTGAAAAATTTGTTAAATACGCCAAAGTAGTCGTTATCGATGTCGTTCTTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCA:1 + chr3L 21134750 5' + Ivk 231 1 69.23 GGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAG:1 - chrX 12649914 5' - Cr1a 288 1 91.89 CATCCCAAAGTATTTTTCCGTCTTTATATCTTAGAAAGAATTCATTTAATTTTGCAGGAAGCATTCTCTGCAAATAATTATAGACTTCTCTGAATATATACAGATTATTAGGTCACCTTAACAACAAACACAACAATACCGCTAAT:1 - chr3L 18953068 5' + I-element 138 1 73.97 GACCGATAAGGTTATGCACTTGGCTTGTGGTTTTACCGAGCCTAATTGAATTTAATTGATTCGGTTTAGGAGTTTTTGGGGGAGTCTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTT:1 - chr2L 16401004 5' - Doc 69 1 62.33 CAGACATGGGGAAACTTAAAAGTCAGAGCCTGCTATGTATTGTAGGTAGCAAACTATAGCAAACATGGTCATGAAAAACATCATAAAAGAAGTGATGTAAATATTTGGATAGGAAATCAATAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 13955192 5' + BS 5094 1 56.30 ACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTGAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGAC:1 - chr3L 20224224 5' + Chimpo 55 1 64.84 ATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTG:1 + chr3R 4679471 5' - hopper2 1526 1 71.92 CTCCCCGTCCTGGGAAGCCATATCATATGCCACTTGGGGAAGGGAGAGTACCGAATTAGAAATGAAAATTAAGTAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr3L 22594123 5' + 297 44 2 52.41 GTCGCCATTGTGACTTTTATTGCAGGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3R 22494217 5' + 297 37 2 59.59 GCCAATTAATATGCATAATGCAATATGCATACCATTACATAAGCTTGCCTAAGTGCAAGTTTTCTCTTCTCCTCTTTGCTCAGACATCAGGTGTACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr3R 1267810 5' - P-element 2859 1 68.49 ACGGGACGAAACGGGAAATATCGATTTAAATTTAGCTGGACCCCTGTGGCGTTATGGGACCGTTTTTCCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCT:1 + chrX 21974851 5' - pogo 1708 1 53.42 TAAGCAAAATAAAAGAAAATTATACGACACCTTGCCAGTCCAAACCCAAACAGAAACCCCACACTCCGGTCAGATAGAAGCGATGTTCGCTCGCATGGATGGAATGATGGTAAGGATGATGGAGCGCATGTTCACCCAGATGACAC:1 + chr3L 12879509 5' + G6 1552 1 73.97 AGTCTCCCAATGCACAGAGTTCTCTTTCTTCTTAGCCAGAATTAAGTGGCTTCATTCTATTTTGGATCTTCTTTCCGGTTCATCCTTTGCTTTGTTCATTAGATGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTT:1 + chr3L 4676159 5' + Bari1 81 1 69.86 ATCAAGTGCTTATTTATGTACTTCTTTAATTTATTATGTACTTATTGTTATCAGTTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACCATGAATTAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATATTGAACTCGTCTGATGTTTCT:1 - chrX 22824652 5' + Gypsy12A_LTR 1880 1 72.60 AAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 + chr2L 14969105 5' + 412 79 2 71.92 GGCATCTTTAAGAGTATTCGTAGGGAGAAGCCAACCGAACAGGCGAATCCAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGCATG:1 - chr2L 7060106 5' + opus 7452 2 68.13 CAACCCGTATCTTGAATAATAAAAAACAAAATGGCAACCGTTCTGCGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCC:1 + chr2L 5792833 5' + blood 493 1 66.92 ATATGCCTGATTGATTTCATGTATTAAACAAGTTCAACAAAAAGTTAAGAAAATTCCATTTTACGTATATATAGGTCTTTCCAACACTTAATTTGATTATGTTCTCGATCACTACACTTCGTGCCACAGTTGTGAACTTGTCCGTA:1 + chr3R 7193944 5' - G5 70 1 54.79 CGTATCTGAACGAAACTCATATTTTTTTTTTACGACACCCACTGTGGCGTCAATTATAAAGATATTTAAGTACAGTTAGCATGCAATTAGACGGAGTTGACTGTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCAC:1 - chr3L 7940521 5' + R1A1-element 5299 1 62.02 GTGTCCCCGATTCGTCTAAGTGGATTTGAAGCCTCAGCTGCAGGCATTAGGGTGTGTATGTATGTATGTGTGGGTGCGCATCTGTGAGCGGCCAAGTGCGATATTTGAATTTAGATGAAAATAAAAGTGATGTAG:1 + chr3R 8621785 5' + G4 422 1 74.81 GGGGAAGGGAAATGCACAAAATAAATATAACGAAAATTACATTTATACATTCAACTTCAAGTTTTGCTAAACGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr3R 6422929 5' + jockey 58 1 50.68 ATTCTATAAGAATGTGAAAGGTGCTCATATGTAATCATTCACATGTTATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTAT:1 - chr2L 19310449 5' - Juan 4208 1 78.77 AAGCTTATCAGGCTTATGGAATGATTGTTTTTGTTCACAGCCCCACGCAATTAGCTTAGGTGGTGATAAGGTCCACTGGGCTCGAGTACTCGAGTGTTATATATATTGTATTACTTAGTTCTAAACTGACAGCCGAAATA:1 + chr2L 7926580 5' + Chouto 135 1 72.14 AGATCTCTAGCGCTCCATTGGTGGGGAACGTTGTGATGTCACAATCTGTTGCCCAACTCATGCATCACGCAGTTGCATGCCGCAGCGGATGAGCTCATTATCGTGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACATCCAATTTAT:1 + chr3R 10176013 5' + transib2 343 1 70.55 TAGCAGGTAAGGAGGATTTAAGAGCCACCGCGATTAAACCCATTTGATTTTGCGCCAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr3R 11870068 5' + pogo 60 1 63.01 ACTTAATAAATGTTTTCAAACCAACGGGAAAAAAATAGTTTTAAGGTTTTTTTTAGTGATATTTGTGATATGTTGTATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 - chr4 540589 5' + flea 4787 2 62.22 GGGATATACTGTGTTCAGAGTTGGAATTCAAACTGATATCCCAACAAGGTCGCCCCATTGCCCTTATTTCTCGGGACATGGTCAGAAAAACAAACAAAACAAAAGAAGGCTATAGTCGAGTTTCACGACTATCGGATACCCGTTAC:1 - chr2L 22714501 5' - INE-1 551 1 56.16 ACGTGCTTTTTACGACACCCACTGTGGCGTCAATTATAAAGATATTTAAGTACAGTTAGCATGCAATTAGACGGAGTTGACTGTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACAT:1 + chr3L 7939011 5' + R1A1-element 5335 1 59.31 ACTTACATCACACACATTGTGCAACTCGTTTTTATTTTTTGTTTTTTTTTTTATCCTTCTACTCGATTTCGTTCTTTAGAGTGTAACTACTTATTCTGCTGTTTGTTTGTTAATTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTAACTT:1 + chrX 13586753 5' - TAHRE 10442 1 50.00 ATGTGATACCTCGGATTTTCCGATAATATGTATTTTTAAGCTCGCCAGAAACAAACAGATCGAAACGAAAGTACCCTCATAAATATCATAAATATTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGAAGGAGAGGCGG:1 + chrX 7656215 5' - Doc 436 1 72.31 CAGAGCTGAGCAGAAGATGTTCAATTAAGATCTAATACGTGGGTGTGAAATTTATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACG:1 + chr3R 16538364 5' + G2 2649 1 62.07 ATGTGAGAAAGGGAGAGTGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3L 19580890 5' - roo 341 2 63.01 ATGCGTGCAAAAGTTACGGCTTCCAATTTGAAATTACTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr3R 12379774 5' + roo 85 2 78.08 GAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGAAAATCCCGTTAGCTTTTCATGTTATCCTTTTTT:1 + chr4 123973 5' + HB 151 1 63.01 GTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2L 7652181 5' + roo 8713 2 52.08 CAAAAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTTTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCATTTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTTGTAAATGCAGCT:1 - chr2L 23390135 5' - rooA 7447 2 58.40 CAGCCATGTTTGTTTGTATTTATGTCGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3L 7460596 5' + 412 7094 2 56.94 GTGCTCGTCGTGCCATCTCTTTCTGCCCATGTGGCCCCATCTCTTTCTCCGCACAGTGTGCGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chr2L 16615753 5' + hobo 62 1 60.27 AAATGCTTAATACTAAAACAACATATTCACTGTGGTCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAAAGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAGGATTAAT:1 + chrX 22633228 5' + INE-1 83 1 51.37 TATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGTTATTATGG:1 - chr2L 15622432 5' + micropia 139 4 52.05 TCGATGTACTTTCTTATCATCGTTTGACCTCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGTTGTTGCGAATAAAAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACAATTCTGTTTATTTTGCGAATTGTTTAC:1 + chr3R 1282954 5' - diver2 287 2 78.52 CACACTCACATTCGGGCAACAAAAAAAAATTGCCAACTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3L 4524008 5' - roo 8989 2 71.92 GAAAAGAGCAAACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 - chr2R 18014121 5' + Doc 68 1 61.15 AACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAA:1 + chr3R 2169843 5' + gypsy11 107 2 65.75 ACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTT:1 + chr2L 17295858 5' + Doc 23 1 49.40 ATTTAGTAGAATTTATTTCGTTTTTATTTGCGGCATAAAAAGATCATAAAAAGAAGTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGTGTGTGTTTAACACAATTTGCTGCTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chr3R 19171574 5' - opus 7483 2 69.86 ATCGCTTGATTTTTTGAATATATTGTTTTCAAATGCACGGCGAACAATAAGATTGAGATTCAGAAAATAAGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 + chr3R 7507089 5' + Doc 15 1 74.66 GAAGGTGTCAGCTTTGACTACATTTAGAAACTGTAATTGTTTTAAAAAATGTGACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAGTCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTG:1 + chr3R 14911974 5' - Stalker 317 4 76.71 GGTGCCAGTGGTGGCTTTTCCCAAATGGCAAGCTGAAAGCTGAACTTCCATTTAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAC:1 - chr2R 19852240 5' - Transpac 5175 2 60.74 ATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCATCAGGAGTGGCATCCAGTACACGGAGC:1 - chr3R 21395214 5' + G2 480 1 69.40 AATATTCTTAAATCTCCTAATGGTCGAATAAAGACACGAAAGATTGGAGACTGATTGCTAATTTAACTGATATGCATTGTTCACATATGAACACGCATATATTTATAGACGTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTA:1 - chrX 4400412 5' + roo 45 2 52.45 GAGTGCGCAATTTACTGATGAGTATGAGTCATTCGAAGAATCGCCAGAGAATCGATGTATCTATATGTATATATATACATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTT:1 + chr2R 7720669 5' + Bari1 39 1 56.85 CCGCTTTCTCTGCCGGCGTCGCAGTCGCAGCTAGTTTGTTGTAACTATAGTATAGTGTATGTATGGTACGTTATATATATACCGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGCTACAGTGACAACAACAATAATAATAATAACA:1 + chrX 11423736 5' + mdg1 7069 3 78.77 AATCGAAAATTCTTCAATTTCTAACTTTATGCTTATTTCGTTGGCAGTTTCGTGTGTGTTTTAAGCGGGGAGAGACAGAGGCAATTAGATAGAGTGCGACATCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAA:2 - chr2L 5027247 5' + FB 804 3 68.49 ATCTATGTCATTTGGCCAAAACGAATCATTTACAATAAACCATCTTCAAAGCAAATGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 + chr3R 17099895 5' + Tirant 65 2 64.38 TTCTGAAGTAAACAAAATAATTCCCTTCTTGCCCACGTGTATCTAATCAGTTAAAAAAGCAAGTTCATTTGTTTATTAAAAATGGCTTATAAGTAAATATAAAAGGCGGAATTGATATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 - chr2R 13046644 5' - 412 7544 2 74.66 AATTAGACGAAGAAATATTCAGTATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGTCATCTCTATTAAAT:1 - chr2R 5045681 5' + invader6 4543 2 53.42 CACTACCTCTTTCCAGTTAACCGGCCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTG:1 - chr2R 17097530 5' + P-element 77 1 21.88 ATCATTAGTTGCTTTCATGGGTAAACATTTTTCCAGTGTACACATACTGTAGCGTGTTTGTCACACATATCCAATAAATTTACATTTTTATCGAAAAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr3R 17259210 5' + 412 12 2 73.68 AAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAAT:2 - chr2R 4206655 5' + 1360 323 1 70.55 AGTTAAAGGAACTCAAACTTTTCTTTCATACCTAATATTACCAAAAATTTTGACATCCTAGCTGGTTTCAGCTGCACTGCAATATATTCTATTTCAAGATAAATAGCCAAGTCGATCTGGTCATATCCGTCTGTCCGTACGAACGT:1 - chr2R 5934516 5' + INE-1 125 1 63.01 AAACAAGAACTATAGATTTCTTTAAGCATGGAGATGGCATATCCAGAGCCATTCCATTAAATATTCCCCCTCTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTCAGTTGCATTGC:1 + chr3R 6645306 5' + blood 7057 2 54.11 AAGCACCAATAAAATTACCATAAATGCCGTAATATGTTGATACTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3R 10150224 5' + 1360 8 2 61.84 TGTATTTGTGTATCGTAAGTGTTTTAATGTATATGTATTTCCGGCTTTCTCTTTTCTTCCGGCCCACACCACACCACAAACTCCCACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGCC:1 + chr3L 8274039 5' + accord 7104 2 80.00 ATACGCCGACATCGGTGTGCTAGTGTGGCTGCCTGTGTGAAAATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3L 6015116 5' - accord 186 2 77.97 TAGTCGTAGTGACAGTACATATACTGGAATATATGAAATTAAATTGTTTGGATTTTAAAATCCATCGAGCTCTTAGTTTATTTATTTAGCACTATTTGCACCAGCAAATAAGCTGGAATTATGCATGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr3R 25751728 5' + roo 8664 1 74.66 TAAACAATTATTAAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAATATTTATAGCGGCACTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACT:1 - chr3R 1960327 5' - gypsy9 164 2 87.67 ATTACCATGCGCTTTTATTAGAAATTTTCTTTAGTTACCGAAAACATACGATGGTTCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr2L 13255282 5' - pogo 2035 1 64.38 TTTGCCTTCTCCATGGCTTTTCATCCTTTTTTCGTTGCATACCCCCAGGCGGCAAGCTGTGCAGCAAACACTATTTTGTGGACTGCGACGGGGCGTGGCTGAGGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 - chr2L 795194 5' - jockey 4971 1 76.09 AGCTGAGACTGGTTCGGGCCAAGGGTAGCTGCACTGCCAGAAAAAAAGAGGTTCCTTCTATAAATATACATTTCTAGCAGTATTAGAAACTTTCACTCAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr3L 1358398 5' - 412 471 2 70.55 AAGGGTGCTCCTAAAAAAGGGGACATTGCCAGGACGACGAGAAGAATATCCTGTGCGTGCGGGTGCGTCGGTGAGAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGG:1 - chr3R 14046817 5' - hobo 2642 1 77.95 AGATTATGAAAAAAACATATTGTTAAATTGACAATTTTAAAGTACTTTAAATAAGCAACCAAATTTCACAAGATAGTTAAGGTCAGTTTAAATGTTGAACGTACTTTATTGCGCCAACTTAAGCATAACAACTTATAATAATGGTT:1 + chrX 11657306 5' - FB 362 1 43.15 AGTGTCGATGCGTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGGTCATGCTTTGTAAATTTGACA:1 - chr4 184045 5' + 1360 195 1 57.53 GTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - chrX 21667930 5' - opus 7450 2 65.29 TAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGCGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 - chr2R 10910295 5' + Tabor 53 2 58.87 AGTTGGACTGGGTAATTCTTATTCCCAGCAACCACTACTATACTATAAGTCCGTATGAAAATTCGAATATTCTTTTCTTCGTTACCATGAAGACCATTTTTATTTTTCGTTTTTTTTT:1 + chr2L 21749303 5' - Doc2-element 252 4 62.71 ATATCCAAGGGAGCGCCACTGTTAAACCGCTCAGTAACGAAGGACACCAGACGATCATTGCTGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chr2L 17380616 5' - hobo 2923 1 62.50 AACTGTGCCAATCGTGTGTTCCGAGCACTACTCACCCATTCCGTCCCATCGCATCCCATCTCGGCCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr2R 9340225 5' - 412 440 2 52.78 GAACGGCAGGACGATGCGATTGCCGTTACCTGCTCACCTACGCCCTGGGGGAATATTTCACGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATA:1 + chr3R 13437997 5' - hopper 1343 1 58.22 CCTTTTTAAAGCCGTTCTCGACAAGGATCCTGTATTGCTTGCTTTGCTTAATGATCTCCGCGTTAATTACGTTCACCATTCCCACGTTAAGTCCCGCTAGTTTTTGTTGGCAATTTCTTTTTGGATGTTGGTTTTCAAATCTTGTA:1 + chr4 656428 5' - mariner2 651 1 74.66 GTGGCAACTTTTCTCCTTAGACGAAAGCAAAGACTTTTCACAGAAACCGGTTTCCATCGATCAATAGATAGACGGTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chrX 4673587 5' - roo 9026 1 54.11 GGTCATTCCGTCTATATACAAAACAACATTATCAGGATCAGGATATTAAGGATTTGAAAGCGAATGCCAGATACGGATCATTTGTTCGACTTAAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATC:1 - chrX 12295466 5' + McClintock 6398 2 52.05 CTTAAAAGGATAATATGCAATATAATAAAATTATACCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3L 19864015 5' - roo 325 2 79.31 TGTGCATGGGCACATTTTTAGGTGCGGAAATTAAAAATTACGAAATATTACCGTAGTTAATAGATGTGAAGAATAAAAGAAACGGTCCTTCCCAGTGCAAGGATACGCTAATACAATAAAAATTTAATAGTTTAGTTATGTTGGAG:1 - chr2L 21802106 5' - Porto1 4541 1 58.90 TTCGAAGAGCAGCTTTTGGCCTCGTATCTCCATATCTTACAGGGTGTTGCATGCATGCAAATCGTTGGAAGTTTTCATTTGATTTACGATCAAATGTCAGTCGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 18522378 5' - roo 390 2 71.03 CCGAATTATTGGACAAATTAATTACTCGGCCCCACTGGCACAGGTCATTCAATCGATAGTCCGTTGTGGGCTGATTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCC:1 - chr3L 9690520 5' + GATE 45 2 59.35 ATGGATAATTTGACAAGATCGCTAAATAATTTATGTATATATTTATTTGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTCTGAAAGGGTCTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAACGATTATCCACCAAAT:1 + chr3L 27262718 5' - Ivk 211 1 66.67 GCCTGATGCGCTTTGCATTACAAGCAGCGCCAGAGGAAATCAGTAAAAACGAAAGGGCCACTCGGCAGATCGAACATTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCT:1 - chr2R 7147585 5' + 1360 3220 1 52.05 AAAGTTGTTAATTAAATATGTACATAGTATTAACTGTTTTTAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3L 7870265 5' + roo 8740 2 77.08 TCTTATTGTTTCAAATTGAGAAACACTCTTAATCGCTTCTCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTTAAATTCATT:1 - chr3R 12928267 5' + jockey 4801 1 66.14 GTGACCTATACATGACATTTTTTCCTGTTTTTTGTAAGAGATAGGATAAGGATGTGTGGTCTGTTGAATGAAAAGTCAGTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 7652337 5' - roo 398 1 77.24 AACAACTCGCCGCCTTTGACTTTATTGTCCCTCCGTCTCAATGTCCAATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTTAAAAGAGTTGAGCGAAAATGCTTTGTGCGCACAGTATGTATATAGCGGCATTTG:1 - chr3L 15404760 5' - gypsy11 201 2 67.81 GAGGGAAAGGGGACTGAGTCGCCTTCCACCCAATCGTAGAATTTGCTAGAGCTATGTGCAGAAATTCAATTACTATTAAATAATTAGATACATACATTTTGCACAATGAAAATAAATTGTATTTTTGAC:1 + chr3L 13598362 5' - S2 1686 1 55.81 GTGTGTTGTCCACCACTTGCTGACCTGCATCCATTTGGAGTTATTTCATTCGGTTTTTGTAATTTCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 11513557 5' + roo 53 2 56.25 TTTGCTTTTTGGTTTATCGACCTTTTCATCCATCACTGGCTGCGCCCTTTCCACTTCACCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTT:1 - chr3L 2425978 5' + hopper 59 1 56.85 CGGCAGCAGAATGAAAACTTAGAAAAAGAATCGCAAAGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTG:2 - chr2L 16331075 5' - roo 377 1 67.12 CGCCTCGATTACCTTGAGTGCAACAGTTTAGCGACATCTTCAGCGGTATTTGGCAATGCATCAGCATCAATATTGACAGAGCGATAAAGGGGTCATGGTTGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCAGCATTTGACTTT:1 - chr2L 17326382 5' - G3 4360 1 62.04 TAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTT:1 + chr2R 21848687 5' + Transpac 4986 2 67.63 TGGGTAGAAAAGTTGGACTTTCATACTATCTGCACTGTTTCGCCATTTGAAGAGTAAACACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chr3L 1358538 5' + 412 7113 2 58.62 TGATAAGCTCATTGCGTGAATTGTCTTTAAAGCTGCGGACAGGCGTCTCCATTCGTCCAGCCATCCATCTGTACATATCTTTATATCAATCCATTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACA:1 + chrX 4214896 5' - transib2 475 1 62.33 ACCATATTCTTGGTAAATATCATTATCATTATTATATATTATTACAAAACCTAACTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTT:1 - chr3L 13987253 5' - diver 6044 2 66.44 TTCGGTCGGAAGCGAGAGCTTCGTTTTTGGGTTTTTCTCTCTATTTGCTTGGGCTGAGATTATGATCGGACTTTTGAAGAGAAAAAGCTTTCCGTTTCTGTTGGATTCAAGTGCATCTGCTCTT:1 - chr3L 18117713 5' - Idefix 7157 2 56.45 CATGCTCGAATGAAAATGCCTACAAGAGCATCTTCATATGGTGAGTACTAAAGTCTTTAGTTTTAGTCATTCTTCAGCCTTTTTAAGTATTAAAGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3L 19999306 5' - 1360 3365 1 69.86 AATATAAAAAAATATCTTAATATTCACTTTATTGTACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGC:1 + chr2R 4750341 5' - 1360 3309 1 76.71 CATCCCAGTTAAAGCTACTGTGGAACATAGTTTTAAACCGATATATAACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3R 18528249 5' - roo 9033 1 56.16 CTCATTTGAAAGTCCCGAAAAGAGCAAACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:2 - chr2R 18014137 5' + Doc 59 1 52.05 CTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACACAATTTGACGTCT:1 - chr3R 14049397 5' - transib2 2727 1 80.14 GTATGCCACGTTTTCTGACGTGTCGTTCGCTCGCTGGCTGGCTCCACGTACATAAATGGCGACAAAAGTCCCATTCACATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGGCGC:1 + chr2R 6798213 5' + jockey 34 1 60.00 CTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCCTTCTTATTATTGGTAGTCGGCCTATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chrX 21670009 5' - mdg1 373 2 51.72 TTAGGATCAGGATCATCCAATCTAGGTTTCTTTAATACTAAAGAGCTGTATGCTCCGTGGTGACCTGTGCCACCTACGAGTATAGCCTTAGTTTGTTCTGCCGGCCTTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 + chr3R 5776261 5' + pogo 77 1 71.23 TCGCTTTGATGTCATAATGGCCACCGATGAGGAGTGACCTCTTTGGGTGGTCCTAAGCTGCCGTCTTTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2R 9340110 5' + 412 48 2 51.06 CCATTAAATATAGTCGAGACATTCAGCATAAATGTGTACTAAATAATTAGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 + chr3R 17047819 5' - 412 420 2 71.23 GTATTATACTTAAACTGTAACTGTTGTTTGGCCCATGTTTATCAATATTGAAGAAGCTATCGGCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr2L 10514232 5' + 1360 21 1 65.75 GTGTGCTTACAAGCGCCGTAACTCAAACAAATTGCAGCGCCCAAACGCCTGACTCAAATGGACCTATTGGCGCACAGCTATGGGGCAACGCCAG:1 - chr3R 13846525 5' + F-element 4278 2 67.02 GTTGGACGGCGATGCGCTTACATAATAATTAGTAAAATAAATTTCACCTAAATACACACAGCGAGTAAAAGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCG:1 + chr3R 10995046 5' - I-element 4950 1 55.56 ATTCGGCCACTTTGAAGTTCCAGTGGGCCACCAATGCACCGTGGGCCGAAAAAGTATTATTTATTATTTCATAAAAAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:2 + chr2L 8574339 5' - Transpac 267 2 58.90 AAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATG:1 - chr3R 15790073 5' + flea 4744 1 62.96 AGCGCTGCTTCTTCTACTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 - chr3R 31724907 5' + P-element 57 1 20.62 AAACGAAATGAATCAAATTCACGGGAATCAAACCAATCAACCAATCATTTGTTTGGCGATAATATGGTAAATATCTGTGCACATAAATATTAGTTTTTCCTATTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACATTC:1 - chr3R 18694203 5' + Transpac 5219 2 69.86 CTGATTGGGCTTCGGTAGACAATCCCAACGAAAATCTCGTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCGTTGCACCCCTCTGACTTGCTCGGTTTAACTCCTCCTTGTCTTAAGATTAATTCGTCCT:1 + chr2R 3145754 5' - gypsy10 5615 1 62.50 GATAATTCGGCCATTAAATCGGCCAAACTCTTCTTTTGTCCGCCCACGCTGATCGGTGAAATCAGTTTCTGGGTGTACGTGAAGTCCTATCAATAATGGAGATAAAATAAATATTTTATTAGAGCCGACTGCTCTGAATTCTGGTC:1 + chrX 7322387 5' - 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Stalker2 343 2 58.90 AAACAATGAACACATACAAGATTACATGCTGAATTTATTTAAACATGGGGGAAACAAAGGAACTGAGCGAATTTATAAAAAATGAAATAATAATTAAGTATAATTCTGGTATTTCGGTACAAAATATCATTGATTTATACAAAAT:1 + chr4 352614 5' + Tc1-2 435 1 74.48 AAGAGAAATAGCTAAAATTGCGGCAGTGCGAAAGCGTAAAGCAACAATAACAAATGGCACAGAAGTGGGCTAAATGCACACCAAAACAAAACAAGCGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCACGACTATCAGATACCTATTACTCAGCT:1 + chr2L 18247896 5' - INE-1 545 1 50.68 AATGCTTATCATTTATTTGCCAAACCGAAACCGGTGCGGAGGAGCGGCCTCCACTCCCAGCCAGGTGGCAACATATTATAATATAGTTAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACG:1 - chr3L 22594261 5' - 297 353 2 57.53 TCCATACTAATGTTTTCATTTTCATCATCCATAGCTTTCTACTGGGCTTTGGATTCACGAAACTAGCCTGTTAAATTTAGCACGTGCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr2R 5754626 5' - P-element 2852 1 64.38 ATCGCAATAGTCGAGGGCCGCAAGTATCAGATAGCAATTTGAAGGAAGTTGACTTCATTGGAGATTGTATTCAAGTTCCGCGTAACATCGCAATATTGATGCTCTCACTGCATCAATGTTCTCAGGTGATCTAACGGGTCGAGCG:1 - chr2L 22027973 5' - mariner2 334 1 39.31 ATAGTTTTCCGGACAAAGAATTCGACTACTTAAATTACAGGACATTAACTCTACAATTGATAAGTGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACT:1 + chr2L 11360154 5' - Idefix 6988 2 55.17 TAGGAACTGAGATGAGACTGTACATAAGTAAGATAAGTAAAGTCGCCATCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTACTCCATATTATTTAT:1 + chr3R 7481473 5' - invader4 3070 2 72.44 GAACGCACCAACAACCAAATGCCATCGCATATTTTTAAGCAGTGGCAAAGGAAGAGAAAGGGAGAGAGAGGGAGAGGGAGAGCGACACGAAAAGGAGTTGAAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 + chrX 19788753 5' - hobo 2919 1 66.90 CTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACAT:1 + chrX 21087607 5' + mdg3 5321 2 71.23 CTTTCGACCAGTACTCACCAGTAGAGGTAGGGCTTCTCACGTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGG:1 - chrX 5224037 5' + Doc 390 1 67.83 ATCACCAGATCGTGGTAGATGCCAGCGGTAAAAGTGCCAGGGAGAAATGTCAGAATTCATTTCGCATATCGATAGAAATTGGCTAGAAAAACAAAATAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCCGGACTATCAGATACCCT:1 - chrX 21290315 5' - INE-1 555 1 71.23 AGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAATCAGTGTAATTTTGTTCAATTGTATTGGGAAAGATTATTATATCATCCATAT:1 - 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chr2L 16562186 5' - opus 474 2 54.79 AGGGTGGTTAGGGGCGGGGGTTTACCAACCAGTAAAACCGGGATGTCTGGGGGAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 + chr3L 9469939 5' - 412 7538 2 57.50 AATGAAATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGATTATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2R 11164542 5' + roo 24 2 69.18 AAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr2L 17295854 5' + Doc 56 1 63.33 AAATAGTTTCAATAAATATTGATGTATTTATATATATCGTAATTATCTGCTTGCGTATACTATTACCAAAAAACAATTACTATCTACTAAACTGGGTGGTAAGTTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3L 11795406 5' + 1360 20 1 70.55 ACAGTCGCACAGACCCACTCGACATTGCCGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACATCA:1 + chr3L 5069412 5' - opus 7465 2 78.85 AAAAAATCATAAAACGAACCAAAGTCAAGCAAAATTTGTGTACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAAGGACTATATATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAGTCTAGCCATGTCCGTATATCCGTCTGTCCGTATGA:1 - chr3L 22972623 5' + INE-1 121 1 51.72 AACTAGTTAAAAGTATATAACAAACGCAAAGGAGACACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:2 + chrX 8967353 5' + HMS-Beagle2 30 2 65.07 GCGGGTCTTGGCCAAACTATGTGGCGCAGAGTGGATTTGAATTCACCTGAACTAGAGATTCGGTTGGGTTTTACACAAGACTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGAT:1 - chr3R 26359412 5' - jockey 365 1 55.17 TTCGAAATCAATTTTACATAACTGCCGAAGATAATGGCTTCGATAGAATATTCCCCCCCTCCCCCACTCCATAACTAGATATAAATGTATCTAAACGTACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATT:1 + chr3R 25713977 5' - flea 4994 2 67.81 ACAATTGAGTGGAAATGAATTATGTATTAGTTGTTATTATGAAATGGAATGTACTCAATAGCTTGGCTTATATGGTATTACAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTGGCAGTTGTGTGCAGCC:1 - chr2L 4929919 5' - blood 7348 2 56.16 AGGATTAAGAGTATTATACTTAAACTGTAACTGTTGTTTGGCCCATGTTTATCAATATTGAAGAAGCTATCGGCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr2L 10514222 5' + 1360 11 1 72.60 CATTTACTCGAACTTTTGCTATTCATCACATATAATTTTTCAATGTGCCGCAGTGGTACGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGCTAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr3L 12964818 5' - hobo 2893 1 55.38 GCACACAAAAGTGGAATGGCCCAATAAATGGCCATTGGCCAGAGACTAAAAGTGGAATCACCCACACTCGCCACTCGATGTTTTATTATAAAGAGCTAAGCGGAGCTGTAGCGTCGGAGACAAAATCAGAACTGAATATAAAATA:1 - chr3R 19517179 5' - gypsy2 189 2 54.48 GGAGGAATCTCCTGCGATTGCTTTGGCACCCACTACGAGGGCGAGCACTGCGACATTTACAGTGAGTACTTATCATTGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACAC:1 - chr3L 4670157 5' + Tirant 353 2 51.37 AATTTACCACAAACACGATATTATCCTTCATGGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 - chr2L 19140448 5' + Max-element 8288 2 51.37 AGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAAC:1 + chr3L 3453609 5' + Tirant 60 2 62.96 GAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:3 - chr2L 17626682 5' - roo 9009 2 63.70 GTGTTCGAATGAATTGCAACCTAGTTGCAGGAAAGTTGCTCTACTTTGATTTCGTTTATCAACTTGCACCTGCAGCCTTAATCCTGCCCTTTCTTCACTAGTCAAACGAAGAAATGCTGCAGAATATAACTGGT:1 - chr2R 20457217 5' + Chouto 6138 1 56.72 GAATCCGAAACCGATATATGGACTCGTTATAAGCGCACCTCAAATGTATCTTAATTTATGCCCCTTTGTCTTCTGGAGCGTGTGTGTAGCACTATGCTAATATGCTATGCAGTTTCCTATTGTATGTTTTTTCTGTGTTTTTTTTT:1 + chr2R 11254590 5' + transib1 7 2 81.51 GCATATCCAGTGACTTAATATCACAAAAAAAAAGAAAGTAAACTTAATATCACAAAAAAAAAGAAAGTTAAACATTTCTTGGTACACCTTTAGGTATGCATTGTATCTTGCATTTGGACTGTAAGTAGCGGGTATCTTATAGTCGG:1 - chr2L 5684218 5' + INE-1 551 1 73.97 AATGAATGTTGAAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTCTTTAATT:1 - chr2L 13332709 5' - micropia 5379 2 61.81 TACCCGCTTAAGGAAATCTTGAAATTCCAGAGCACGCATTTCTGTAATCGGTACAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTGGGCACACGATTTT:1 - chr4 1219248 5' + 1360 37 1 53.91 CTACAAAACTGCACACTCCCATACACGTCCTTTGCTTGTCGGGTTACAATTTCCACCGCCCGGTCGACTTTAATCAAAACAAGAGAGAATGCTATATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTC:1 + chr3L 33468 5' - INE-1 549 1 55.38 CTTTTCATTTAAATCAAAATGTTGTTATTAATAAATGTTTGAGAAAACATCTTAATATCTTTATGCTCTTCGAAAAACAACCTTTTTTTAAACGATTTTCGGTATTTAGATAATTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAG:1 + chr2L 19155487 5' - R2-element 3192 1 76.71 CGGGCAATGAAAAATCAATGCAACAAATGCGCAACAAATCTATGTCATTTGGCCAAAACGAATCATTTACAATAAACCATCTTCAAAGCAAATGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 + chr3R 17099858 5' + Tirant 20 2 71.74 ATTTTTATTTTGCCAATGCGTGTGGCATCGAGAATTATTCTGGAAAATAGGGAAACACTGCATCTTCAGGTGCAGATTTTTTATTTTTTTTTTATTTT:1 + chrX 2888562 5' - F-element 4686 2 65.31 AAATAGTAATATATGCTTACGCTATTCCACTTTAGGCATTTAAATAAAGAAGTCATTCCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGC:1 - chr3L 18665296 5' + I-element 5039 1 60.96 ATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 - chr3L 9470012 5' + 412 7129 2 68.49 GAAGAAATTATATTTTGCCCAACAAGCATGGAGACACACACTGAGAGCGGAATGTATCTACCAGATACAAATACACCCTGCCACACAGCTACATACAGTTTAATTTTTGTATCGATTACACCGTTCGATCCGCGACATCCCCGACC:1 - chr2L 14813848 5' - aurora-element 4037 1 74.66 GCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAG:1 - chr3R 25804202 5' - mdg1 348 2 65.75 TGTGTACGCTTTTATTTGCGTTCACGCGTGAAATTAGTTTGCGGTTAGGAAGGGCAAAGAGTTTGTGATTCTAATTAGCTAAAATAAAATCAAATTGAACGCAAAAATATTTCTTTAATATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTC:1 + chr2R 6510335 5' + blood 6962 1 71.92 AGTTCAGCTCGCAAAACGAAGTCAAATTGTTTGAATATAGATGGATAAAATATCTTTTAACATTGCTCGATAAAATACTATATTTTTATTTATGTTCTTATATTAAACAGTATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 15754628 5' + accord2 345 1 60.98 CTATGCATATTTGTTTTAATTAAACGATATTTTCGCAATTGTCGCACGGATCGATTCATTTGCGGGCAGCGCAAAAATACCTTAAAGCGGCATTAATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2R 22463290 5' - roo 386 2 54.48 AAAATATCATCTATCATAAAATATGCCCGCTTATAAGACGTTGTGATAGGATTTCGAAAAGCCCAAATATATTTGTATGCTTAAAATACGCTGGTCCCTGCTCGGGC:1 - chr3R 27996493 5' - HMS-Beagle 270 2 40.19 ATCCCCTCCAGGTGGGCCACCACTTGACGTGACAGCCGCGTGCTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 - chr3L 7460698 5' - 412 431 2 66.15 TTTGGATTCCCCAACTTCTAATCCCCGCCAGATGCAACGTGCCATGCTGCTGAATGTTCTGCGCAGCCTGATAAACGCCGCCCAGGTGATTACCATTTTTTTTTTAAATGGGTATCTTAATGTT:1 - chrX 9234763 5' + accord2 363 1 70.16 GCAGATCAGTTCAACTCCTTAGGAATATTACTATGTGTACTAATTGTTCTCCGTGTAAAAACAGAGATGATCCTACGGTAACATCTAAATGTGCAGTTGTGGATTTAAGTGAATCGGTTATTTACGGGGGCGGGGATGTCGCGGA:1 - chr3R 19324914 5' + aurora-element 4033 1 48.97 GCAGTCAATGTGTAATAAATTATTTTTTATTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr3R 24564855 5' - opus 7460 2 56.16 ATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTACGGCTCGATTCGTGAGA:1 - chr3L 23940541 5' - Cr1a 4384 1 60.96 GGGAAAAAATCAATTGTCAGCAGGAAGGTTGATTGCAAACGCCAGAACAACACACACACCCACACGCAGGAAGGGGAGAGCAATCATCGGCATCCGAGCAAGTCGCAAGTGTGTGTGTGAGCCATGATGAAATAACATAAGCTGG:1 + chr2R 8665968 5' + P-element 2 2 77.93 TCGATCCGCAGAGCAATTATCTGCGATGGAGCAGGTTGCTGCTGCTATTTCAAGTTCAACTTAATGTCACCGCAGCAATCCACACGAATGGACTTATAGTTTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGA:1 - chr2R 14973742 5' + FB 18 1 72.60 GAATTAAATGATTATTATTGTTTTTTTTTTAATTTACCAATT:1 + chr3R 30222493 5' + Tc1 1477 1 90.48 AAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTAGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCT:1 + chr2R 4260432 5' + micropia 5204 1 42.86 CTAGCCCCCTACTTTTACACTTCCCAGTGGCTGTCAAACTGCTAGTGGCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 + chr3L 2425886 5' - hopper 1391 1 52.04 CCTTCCAAGGGAATCCGTATATGTGTACATGTATTTTTACAGCACATGTTTCAAGCGTCGGACAAACAAGGGAATCTATAGTCTATTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTAAAGCAGATCAAATTAAGT:1 - chr3R 4604547 5' + jockey 4941 1 58.90 TTTTAAAAATTCCTTAAATATTAGCAACATTTAAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 8658709 5' - roo 9019 2 52.74 GTACAATCAACAAAATTAGTTTCATTTGGGCAAATGGCATGGCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:2 - chr3R 25804243 5' - mdg1 389 2 63.01 TGTCAGATACAAAACTTACACACACACTCACCCACACATTCATCGAGGCATGTGCACATTGTGGGGAAAATGGAAAAAACGAAGATACTTTGTTGATAAAAACAAAACAACAAGAACAGCCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGTG:1 - chrX 3676817 5' - Cr1a 283 1 56.85 ATTTAACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 + chr3R 26486022 5' + 412 7116 2 58.22 AGATATACTCGCGAAACAATGGCAACTCTGGCCTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr3L 21910512 5' + pogo 15 1 75.18 CTGCAGCAGCAAAAGAACGAAAAGCGTATTTGAAATTTCTATGAAAAGACTTTTACCTTCACTTCGGCAAGAACTTTCATTGATCATTAATGAATTCTATAAATATCCTTAGCAACCTTCCTCGTCCATGTCTATGTTAT:1 + chr3L 5556786 5' - Chouto 6286 1 79.29 AAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:2 + chr2L 13629074 5' + Tirant 69 2 66.90 GTGGAGCGAACCGAATGGCTTATCCATGGGCATAATCCAATTGGATTGGTTGGGGTGTGCTAGTCCGGGACACTTGTCTGGCGTATCCCCAGGCACATGCACCATATGCTCACTTGTTGTTATGCTCAGTGTGGAACACGCCATGT:1 - chr3L 3652191 5' + R1A1-element 5301 1 61.64 GATGCATTCATCATGTATTGTTAAAAAACGTGAACAATGCAGTATTATTTAGTTTGCGCTGGCCATTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAACACGTAATTGTGAT:1 + chrX 18239092 5' + jockey 61 1 52.05 AATGGATACTTTAATTTCCCATTCAAAAATATTAACAAAATTATTGCATAGAATAATACGCATGTTATATGTGTCACATTCGCATGGGAGGTGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chrX 18179797 5' + jockey 35 1 41.27 GGCACTTTCCAGAGCCAAGGAAATTAGATTTCTCGTAAACGCCTAATTTCGAAGTAGTGCATTTGTAAAGATATTAGATGCAAAATCCTAAAAATGTGAAAGTAATGAAGTTCCTTATATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTA:1 - chr3L 13690216 5' + hobo 2469 1 56.16 GGCAGCTCGCAAGGGTGAAAATGAATTAAAACCAGTAATTGCTATCGAACAGGAGGAGGCAGCCAGAAATTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGT:1 + chrX 347118 5' - gypsy4 439 1 52.05 GCCAAGTCACCCCATTTTCGACTGCAGCCCTTTCACTTGTCGCCCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACTCATTCGCAAGGGAGATGAGCAATCGAGCG:1 + chr3R 7885559 5' + jockey 14 1 77.12 GCGTAATGTGGCAATGAGATATAAATCGAAGGCAGCGCATTAATGGCCAACTATTAAACTAATCGCTTTTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 - chr3L 10112319 5' + I-element 22 1 68.97 TAAAACATCGAAAATTAAGGAAAAAAAGGAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCGTAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCGAGCTGGGGACAATGTGGCAGCGCGACTTTTGTGTAACGTCAGCAGTCGG:1 + chr2R 9294444 5' - Tirant 8219 2 70.29 TTTCAACATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTACGACTT:1 - chrX 23182961 5' + Idefix 7 2 67.81 CGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAACGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTACTCTGC:1 - chr3L 23678155 5' + Osvaldo 32 1 72.17 TATCGCTCAACATTAAGCGGAAATGCAGTCGCTGCTGCCATTTCTCGATAACTGCCGCCATTGTTGTAAATTCCTGTGCGTGTATATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - 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chr2L 18522333 5' - roo 9034 1 52.10 GCAGGCGAAAGGAGAAGGATACGGACCGGGACAGTAAGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr2R 8688191 5' + F-element 36 1 62.20 AATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTCTTAAACGAGTGTTATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACAAGTTAACTCTAAAATCTTTATTTTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGAAT:1 + chr3L 23635037 5' + gypsy6 183 2 53.79 GGCGATGTGGCGATCCGTCGGATACTCAGATACTCAGATACATTCGGCCCCACTCGGATGGATACGCACAGGCACACACATCTATCTACATACATACAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGAATTTTTA:1 + chr2R 11145987 5' - Quasimodo 7342 2 68.53 GGTTCAGGAAATTAATACTTGGAACAGAAAATTCCTTGTTTGACTTTAGTATTATCACATATATAAGAAGCCCCCAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACGTATATT:1 + chr3R 10029438 5' - 412 443 2 53.47 AAATTACTACATTTTCTCGGTACGAGCAACATAATCGCAAAGTAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr2L 14239094 5' + 412 7070 2 73.97 ATGATTGATTAAATGAAACGCACACACCTACAACCGCAGATAGAATGCATGCTGTTGTTGTTGTGTGTTCAAGTCCTCAACCTTATTTTTTATCAGCAACAAGTTTAATCGCTCTAAGTACGATGTCCATTTGTCTGGATACGCCA:1 - chr3L 969009 5' - R1A1-element 5234 1 48.63 CATGGGGGAAAGTCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1 + chr3R 14049306 5' + transib2 36 1 60.96 TGGTTTTCGCAGTGTTTACCCTGTAGCTGGCATGGCCTTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr3L 13690287 5' + hobo 37 1 61.76 CCGGCGGCCTTTGGGCGCAATTATTTATACATGCCTCATAAAAATCGCAAGACAATGGGACCCCGGCCTGGGACCCTGACCAATATATATATAGTATAATTGTTGTTTTATTTTTGAGTCGAACTA:1 + chr3L 14302130 5' - 297 6962 2 72.22 AAGTGACCTGGCCAACGTATCTAAAATGCACTAAAACATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCC:1 + chr2R 19198333 5' + FB 85 1 76.03 AGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 + chr3R 16276332 5' + pogo 66 1 67.81 ATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr2R 18344630 5' + 1360 53 1 60.31 AAAGATTTTCTTAGTGTGAATTTTGTTTTGTCAAAAATCTTCGGTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCTTGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATG:1 + chr3L 10546764 5' - F-element 160 1 69.86 TAAATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chrX 7756420 5' - roo 324 2 76.92 TCATATGACAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTT:1 - chr3R 31141038 5' + Burdock 6214 2 72.60 CGTCTCCATTAAACCTCTCAGTAATAAAGCTTATAAATATAAAAAAAAACCACATAATGATCAAAAACAACTATTTTGTGATATCCTTTCTATTATTTTCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAA:1 + chr2R 5497468 5' + pogo 1944 1 70.55 AAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAG:1 + chr3L 7837151 5' + jockey 4803 1 51.80 ATGATTTCCCTTTAAAAGCACATTTCACTTTCCCTTTTATTCATTTCTTTATTTTATGTTTTTTTAATGCGCCAAATAAAACTATTTATGAAATGCCAATGAAGAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr3R 15152766 5' - opus 485 2 76.71 AGCTGAGCCATCGCTTGGAATTTTCCTCAGTAAAGCTCCGTTAGCGCTGGCGGCTGGCCGCTTCCACTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTAC:1 - chr3L 15495008 5' - roo 8972 2 55.93 AATACCACATTTGTGGTATAAATTTTTTACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATATATATACTATAATAGATTCGTTGAAAAGGTTTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATTCTTGATCAGGATC:1 + chr2L 21582250 5' + INE-1 80 1 69.86 GTTACCATCCGTTGTCGAAATATTATTAAATACGACGAATCGTGATTTTACTTCCCAGAATTTCCTGCGCAAAGATTCCACGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCC:1 - chr2R 5396165 5' - R1A1-element 25 1 55.48 CAAATCTGTGAACTAAACAAATCAATAAAAAAGTCAAGAGACTTCTATCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTCAGTGGAGATA:1 + chr3L 18030958 5' - mdg3 5145 1 66.90 GGTACCAAACTGTGGACCAGCTCCAGCAGTTTCTGGACACACCGACTCAACCATCCATCGAGTATTTGCAACAACTCTGCGCCTCGACAAAACCTTTCTACATATTTCACTATAAGTTATGCTTATATAATAATAATTATTAACTA:1 + chr2R 16851363 5' + Tc3 261 1 76.71 GTATCTACAAGTGTAGATGAAATTACATACATATTTAATTGAAGAATTTCGTGTGTAATTCATTTCAATTGCGACTAACTACGCGCTAAATACGAATATATTTGTATTTATGTATGCTGTATATAAATATTTAATTTAAATTTTAA:1 - chr3L 141700 5' - 1360 3045 1 66.44 TACCGTTATCTTTTGCTATGCTAATGCCTTAAATTGGTTTGTATTAATTTTGATAAATACAATTATTTTATTAATGTTTCAATAAATTTTTGAATTATTCTTTAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCTTTGGGTA:1 + chr3L 13867593 5' - Stalker2 314 2 70.55 AATATTTTCAATTATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr2L 9274967 5' + F-element 43 1 61.87 GGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCCGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCC:1 - chr3L 21093242 5' + Ivk 25 1 61.02 GTGTGCGCGTGTGTGGTGTCATAATACCTTTTTACATTTGGCACTTGCCTTTTTACGCTTCTTATTTATGCATTCCGTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATA:1 - chr3R 31021372 5' - Tirant 445 1 56.72 CTTTAATCAGCGGTGTTTCCAAATCAGAAAACGGGAGAACTGCTTCAAGAGAATGGGAAACGACCCTATAAAGAGACTCTACATGGGGAGAACTAAAAATACAAAATATAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 + chr3L 2192229 5' - jockey 4975 1 65.07 GGGGGGCCCTCAAGGTGTTTGACTTGCGGATAAGCTCTGAAGAGCACTCTAACAAGCGAATGCAAATTTTCAAACTCACCTCTTTTCAGTCGATCCAAATTTAGAAGGTATTAATTTGCTTCTTTCGATTTTGTATACTAGCTCCT:1 + chr3L 8151089 5' + Gypsy12A_LTR 2076 1 69.18 TGGTGGGGCAGAACGAAATAAACCAATGCATGAAGGACAACAATCGCTGAACTATTCAAATATATACATATATAGTGGCTAAGTATAGAATGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chrX 11008440 5' + hobo 26 1 63.01 ATGTACTCGTGTGTTTACGAGACGGCCGGCATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chr2R 7982425 5' - P-element 2794 1 21.92 GTGTATATAGCTGGAAGACCCGAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3R 16276459 5' - pogo 2076 1 63.77 CACTCGAACGCTTTGCTTTGGCTTCGAGCACCTGGCCAAAAAAAATCCTAAACCCACTTGAGTTTTCAACTTTACATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 - chr2L 17839489 5' - blood 344 2 58.33 TAGGTGCAGAGGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAA:1 + chr3R 5773149 5' + Stalker 70 4 63.01 TTTTTGTTTAATAAATTTTACATCTATCAGACTAATTATGTTTTAGTTAATTTAATAATTAAACTATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr3R 6413693 5' - 1360 3373 1 74.66 TATTTGCGGCATAAAAAGATCATAAAAAGAAGTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGTGTGTGTTTAACACAATTTGCTGCTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chr3R 19171550 5' - opus 7461 2 54.17 AGTAAAAATTTTAAAAATTCTGAATTCGAAACAAATAATTTCATACAGTTTTCTGAAAAGCTTTTAAAGTTGATCAATATATTGTTACCGTTAAAATTTTTATAAAAAGATATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGT:1 + chr2L 7822164 5' + Juan 11 1 77.40 ACTAGTTTTTTAGTGGCTCTTTCCCCAGAGAATCGGTTTAACCACTAATGTTATGTGCCTATGACTTTGCATGTCTGCCCATATAGTCTATATGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTA:1 - chrX 4561534 5' - Doc 4634 1 64.38 AAAACTGCATATAATTATATGGATGCTCAGACCAAACTTACTCTTTAAATATGACCTACTTCTTTATACAAGATTATATGACTCGCTGCTGCGTGGGCTTCGCCATTTATTCATTCTTACATCGGTTCTTATCATCTAATTATATA:1 - chr4 110034 5' - rooA 7493 2 53.42 AAAGTTGTAATTTCGGACAACAACATTTTTTTTAAATTAAAAAAACAATTAATAACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAG:1 + chr2R 13685688 5' - 297 6916 2 63.01 GAAATAAAAAAAAAACCAAAACCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTGGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3R 20840094 5' - roo 349 2 75.93 GGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGCATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCTAAACCAGCCACTTCTATTATTTCAAAGAACTCAGTAATGCACTCT:1 - chr2L 15777890 5' + 297 6626 2 58.06 AATAAAGATGCGCATAGAGAGTCGGGCAAAGTGTTGCATACTTTTGGGGCGGCCGATCGCATGGGTGTATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATACACATTTGAAGTAT:1 - chr3R 22341241 5' - hopper 1367 1 51.43 AATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACG:1 + chr2R 18689165 5' - Burdock 6324 2 74.62 ATATAAAACGTACTTATATGTACATAGATAAGATCTCGACCTCTGCAAAGGGTCAAGTTTTACGAAATAATCAACTTGTTTTATTCTTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTC:1 - chrX 20485062 5' - flea 4747 1 72.27 GCAGCACAGGAAAAACTCTGCGGGAATTCAAACGGAAAGTACTCAATGTACTTCACAGCGTCCATAAATTCAAATGACAAACCCGACAAAAGCAATACGGAATAAGTTTTGACATGTCTATCAATAATATATTGGTACAATAATTG:1 - chr3L 13739656 5' - TAHRE 10344 1 73.29 CTTTTAGTCAATTTTGTATTTTGAGATACAAGATTCAGACATTTTTTAGGAAATATAAATTAATTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTTGTGCCTC:1 - chr3L 14611727 5' + 1360 470 1 56.16 ACCAAAGATGTTACAGTTCATTTATACATTTGAATACTTTAAAGAAATTTGGATACTTTAGAGCTACCAATATTTTCAGCATTAAGTCACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAA:1 - 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chr2R 5023341 5' + rover 67 2 66.44 TTACGTATTTCTTCTATAATTAAAACTCTTAGAATATTTAAAGTTATAGAGATGTCTATATATTATAGCATGCGGCCGATCGTTGACTGTGCGTCCACTCACACATACGGCTCTTGCGCAGCAG:1 - chr2R 11240687 5' + hobo 2777 1 53.23 ATGGTAAACTGTTTAAAATTTAAAAGCATACATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATAT:1 - chrX 7384970 5' - I-element 5265 1 78.08 GCCCGACTGCCGCAAGAAACACTCAAGTTATAAAGACACGAGTGGATTCGACTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGCCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 - chr3R 10213117 5' + P-element 32 1 52.25 CTAAAAGTAGAAGAGATATTTTGACCAAAGAAATATAAATAACGGAGCCGCAAAATATGCTTCATAAATATTCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAA:1 - chr2R 11264084 5' - jockey 4942 1 54.79 GCTTAACCCTTGATCCGTAATTAACCCATTAGGGTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAA:1 - chr2L 14239212 5' - 412 405 2 77.40 GCAAACATAATAAAACCCAGTAATTGCCTGCATCATAAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCGTCGTTTATACGGA:1 + chr2R 11574975 5' - INE-1 134 1 63.01 ACATGGAGGCGGTGGCCAAGGAGGTTGGCAGAAGAACGGAGGAGGTGGTGGACAAGGAGGCTATGGAGGTGGCAATCAAGGTAAACATTAAGTTAATAAGCAAACAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAA:1 + chrX 17222130 5' - Bari1 264 1 63.01 ATGGAATCGCGAACTCATTCATTTACATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAG:1 + chr3R 23605108 5' - jockey 4631 1 78.45 ACGCCATACTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATGATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 25751896 5' - roo 353 2 56.16 TATCTAATTAGGTCAGCTTGGCAGCTATGACACACGTTCTATATTTCCGTAGGCAAAGTCAATAACTAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTT:1 + chr2R 21848621 5' + Transpac 4926 2 75.17 GGAAAAAGAAGAACTTTTAAAGTTCAGCTCGCAAAACGAAGTCAAATTGTTTGAATATAGATGGATAAAATATCTTTTAACATTGCTCGATAAAATACTATATTTTTATTTATGTTCTTATATTAAACAGTATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 15754648 5' + accord2 345 1 65.03 AATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATT:1 + chr2L 21643046 5' - Tabor 7245 2 69.18 GATAGCTGTGGCAGGAAGTGGGTTTCCCTTGGTGTGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTG:1 + chrX 17484535 5' - blood 7177 2 74.67 AATGAATTTCCTGTTGCATGTGGTGCCGATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGTCTACATACATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 + chr3R 18635200 5' - opus 7446 2 60.00 GTTGGGGAATCCCCAAAAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATAGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTT:1 + chr3R 25543445 5' + G2 223 1 43.15 ACAATTACGATTACATTGGCATTTTGTATGGGAATATACCCCATGGCATATATTGTACTAAACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 24673549 5' + roo 58 2 59.59 AACATACCCAATCTCATTTGTTTCGCACCACCTTCCACCTTCCAGTTCCCATCTCCAAGGTGCCATAAAAATTCGCCAAGCCGCAACATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 - chr3L 22226138 5' + jockey 4777 1 66.92 GGATTTGACCAGCTTCTCCCAACATCTAACCACTTGTCACAGCGCAAAACCACGCCAAACGTAATGGCATATGGCATGCATCATATGTGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTC:1 + chr3R 12520710 5' + Burdock 6170 2 60.96 GTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr3L 18183188 5' + Tirant 8147 2 61.29 ACTTAAAGATCAGAACTGTTTCGTAATGGATATCCAACGTTTTCTGAAGTTTTATAAGGTCGGATGGAAGACTTATCGGGATCCACTGATGGTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 + chr3L 6325587 5' - jockey 4966 1 63.01 GTGCATCCTCCCTCCGGCTTCTATGGCACTTTCAATGACCACTTAAAGAGCATTTTCTTCACACTTTCATTGGTAACCACAGCGGCAAAACGGCACCAGCTGATTTTTGTAAGAAACTGACTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTA:1 + chr3L 4509418 5' - roo 9014 2 71.23 CACTTTCCACTCATTTGGGGCGAATTTATGGCGCTTTTGATCGCCCGACTGCCGCAAGAAACACTCAAGTTATAAAGACACGAGTGGATTCGACTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTAC:1 - chr3R 10213159 5' + P-element 25 1 68.49 AGTTTGCGCTAGTTTTGCTTTGTCCACCAATCTCGTTGACATTGAAAGCAATACAGAGCACAGCGTAGAGTGGAAATTGCTGTAATTATGCCAAATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chrX 10047437 5' + I-element 27 1 65.75 AGCCAAAATGTTTAGTCGATTTCGTGTATTAATTATGTTCACTAATCGTAGAAACATATGTGTGAAAAATGTATTGATACTCCTTCATTAACCTATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 + chr3L 18381910 5' - copia 228 1 55.48 CTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCG:1 + chr2L 2120401 5' + I-element 4994 1 78.08 CTGCAGGTAAACCCACTATATACCACATATACTACTGTATGCCATTCTCTATATAGAGAAAGAAAGAAAACATAATGAACTGCAGTCCATGGTACGAATTAATAAATACGAATACCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCC:1 + chr2R 16831848 5' + I-element 4883 1 58.90 GTTTGCATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTATGAATA:1 + chr2L 17295808 5' + Doc 36 1 57.53 CAACCTATTTTATTGCAGTTCTTAAAAATTTATCAATCCCAAGGCTGACTATTCCAAAAGATATCCAACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTACGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGA:1 + chr3R 10030652 5' - BS 5083 1 74.13 GGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr3L 18183173 5' + Tirant 8147 2 69.72 ATTTGCCAAATCCCATGCCCTACCCATAAGCTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr3L 15364836 5' + 1360 50 1 71.30 AATTAAATGATTGCTAACTAATAAAAATTGATCATTGATTGATTATAAGGACTTCTTCGAATAATGTTAAATTGTGACTAGTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATTGTGGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 - chr3R 8017855 5' - mdg1 391 2 60.45 GACAGGGTCTGTTGTGAAAACGTGTAATCAAAGTAGCCTTGTTCGGCTCATGTTTCTAATTTATATACCCTCTGGCAAATATATTGGTTGATTGATCTTAAATTGAAAAACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGG:1 + chr3L 14220097 5' - baggins 5031 1 69.18 CCACTACACTTCAATTAATAATCCTAGCAAAATATTTATCCGAAATTAAGAATATTGAATGCTTTATTTCATCTTAAGCTTCCTCGTTTAGTAACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAAT:1 - chr3R 12610091 5' - 297 232 2 65.07 TTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGATTAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr2L 17295823 5' + Doc 51 1 47.26 CCTCCGACTTCAGCTCGTCATCGCCAGACATTTTACTTGCAAAGTTTACCACTAATGGCTTACGATGCTCTTTCAAAGCGCTTACAAGATTTGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr2R 21843898 5' - pogo 2073 1 65.07 ACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCC:1 + chr2L 2120400 5' + I-element 4993 1 77.40 GGGGGGCAAAAAGGGGGCGGGGCCGGGAGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGAAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGATATTGTACGAGCATCTGCGCGCCGGAGTTACCACCCTACACCCTAAACCCCC:1 + chr3L 3453560 5' + Tirant 8 2 70.45 ATGAGGCAACTTAAAGTGTGCTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chr3L 13364353 5' + hobo 49 1 78.95 CAGCTATGACACACGTTCTATATTTCCGTAGGCAAAGTCAATAACTAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACACTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chr2R 21848642 5' + Transpac 29 2 60.27 TGTCACCTTAGGAGATTCAAAGAAACAAGCGATAGCTCGTTACATGAATCTGGAGAAAAAACTAAAAAGAAATGAAAAACTTAAGGTTGACTACACTAAATTCATTCAATATGTAGAGTAGTGCGAGTGACTTTAAACGGTGCTAA:1 + chr3R 19445040 5' + Stalker 466 1 71.92 GCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGT:1 - chr3R 13349581 5' + Ivk 66 1 59.59 ATAAATCACTCAAATTGGCTATTTATGTAACTGCGCTCCGTTTGCCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGG:1 + chr3R 5764741 5' - Quasimodo 192 2 66.19 ATGTTTGACTTTCACCAATTTTTCGATGGATTAATAGGCTTGAGTGGGTCAATTCTTGCTGATGTCGTGCTCCTATCACCCAGTCCGGAGGAGTGGGGGTTTCCTGTGATTCTATGTGATTTGTGTAGTAGTTTAAACAAATATAT:1 + chr3R 774470 5' + Cr1a 161 1 73.97 TTTTGTTTCAGAATATAAGTTTAATTTTTCATTTAGCTTTGCAGCAAACGGTTTCGTACCAGATTATATTCGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGG:1 - chrX 5013185 5' - HMS-Beagle2 6997 2 52.24 AAGCAACAATAAAAGTGACCTGGCCAACGTATCTAAAATGCACTAAAACATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTG:1 + chr2R 19198321 5' + FB 62 1 65.19 AGCAGCAAGGCCGCATCATTTCCAGAATTTTTACTGACACGATAATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTGTATTGTT:1 - chrX 22945381 5' + BS 46 1 54.79 ATCAGGTTGCAGAAGGGGCTACTGGTGTTGCTGCTGTGGCTGATGTTGCTGTGCAGCATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 18527170 5' - roo 349 2 57.53 AACAAGGACCAATGTTAAAGCTAGATTATTGAGGTCTTGAAATATTGTATGTACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGTATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAA:1 - chr2L 21976784 5' + Idefix 58 2 63.70 AAAAACAACAACTTAAATTAAAAAGCAACATAGGCCCTTAGTTATATTTTCTATCAATTAATTGAATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:2 + chr3R 8140841 5' + pogo 51 1 56.85 GTTCGCTTTGCGAGTATCTCAGCCATCTTTGGTATTTTGGTTGCCAAAATGTTCGCCAGCATTTTCCAGAGACAAAACTCATGTCAAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGC:1 - chr2L 3264360 5' + jockey 437 1 58.90 CCCACAGCGGTATTCCCGGAAAACATACAACTAGAAATGTAATTTTAATCTTTTCACTTTTGATGACTTCATTAATATTTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTT:1 - chr2L 9418614 5' + rover 41 2 55.48 AAAACTTATGTAAGCTTAAGAAATATAAAATAAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTA:1 - chr2R 5023325 5' + rover 83 2 76.03 AAGCCAAGAACTTCTCCCCGTACGCTCATATTTTACACAAGATATGGGCGTGTCGTTTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACA:1 - chr3R 14912037 5' + Stalker 6904 4 58.21 AGCCAAACGAAACTAAACCAAAGTGAACCGCCAATTATATGTAAATCCACAGTGATGAAAAAATCCCTACCTTGAAACGGTTTTATCAATACATATATATATATATATATATATATACATATTT:1 + chr3L 8085602 5' - G3 4505 1 65.32 CGCCCAACTGTCGCCACATTAATAAATCAGTTTAATTTAATTCAGTTGACAGCTTTAAGTCAATATTGTTGATTAATTGTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 - chr3L 11396032 5' + I-element 26 1 64.62 ATGGTTCGTGCTGTGTGGGGTTAACTGGCGCTCATAAAAGTGGAAATGTGTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACC:1 - chr3R 8639322 5' + copia 55 2 64.06 GATGGAATTGGATTTGCCCTTTGTGCGAGTGTGTCAATATGTCAGTCAACTCTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGAC:1 + chr3R 31140959 5' - Burdock 6325 2 64.38 GTGCAACTGAGCATATGAGCGTGATTTCTGCATTTGAGCTTTGCTGGGCATAAACGAAAGTGTGGCAAGGGGTGACTAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 + chr2L 17337525 5' - 1360 3340 1 49.32 CTTATAAATTAGCACATTTGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 19436132 5' - roo 392 2 73.29 ACTCCCACGGATATCATTAGGCGAGGTCGTTTCTCATTGGAAGTTTTTGGATCGTACTGTATGGAAAAATATAATATTGTTTAGTTTTATATTTCCAAATTGTAGCGTATCCTTGCACTGGTAAG:1 - chr2L 16237168 5' + Porto1 4578 1 63.20 ATGTGTGGGAGCCAGAGATAGTTTCATTTGGGTCGCCAATGTCGCGACATTTTTAAATGGGGGAAGGGGATCCTGGCCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGGC:1 + chr3R 6485665 5' + opus 74 4 78.00 GTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr3R 9125677 5' + Doc 50 1 60.00 CAAGTAGTTATAAAATACATCAAAACTTGATCATTTTCTACTAGTCTTCGAAAAACGTACAGCTTTATCAATTTTAGTTTTGATCATAAAGAATGCGGCAATTGGGTGCTGCCCAACTCCAGTCAGCCAATCACGTAGCGACTTGA:1 - chr3R 8121481 5' - R1-2 2952 1 74.66 TAGCTTTGGGGGCAAAGGCAAAAACCAAGTGAGGGTTGGGTATGCCACTTGCTTGGGGCTCATGTTAAGGAAATGGGCCATATGATCGTCGAGGATCCATTCCGACCATATCAATATATTCTTGATCAGGATCAATAGC:1 - chr2L 17498979 5' + INE-1 86 1 55.40 ATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGC:1 - chr3R 6413628 5' - 1360 3309 1 73.79 AATTGTCGCACGGATCGATTCATTTGCGGGCAGCGCAAAAATACCTTAAAGCGGCATTAATTGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2R 22463254 5' - roo 360 2 55.22 AATTGATAAGTTTTTAGCACATGATAAATTTTAATATTGTGTGGCAGAGGAACTTGCTACTCTGACACAAGCTGCGCACAAAAAGAGCCACTGATGCAGCAACAGCAGCAGCAACAACAGCGGCGGCAGCAG:1 + chrX 13921009 5' + TART-A 424 2 71.21 AAGACGAACCTTGACTGTGGGTACGTATACGTAATGTAGCAACTTCTTTTTCGAAGCTGGAAGCATCTGCAGAGAGCAGAGATCAAGATCTAGCATCTCTAGATCTTAATTCTCTCAATATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCAT:1 - chrX 6528529 5' + roo 295 2 76.03 ACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3R 14277965 5' - P-element 2844 1 44.35 ACTTGACACGCGAAATATAATTAATGAAAGCACACTTGATATTTACAATTTTTGCACCACACAGAATGTTGCACATACGCCCTCAGGCCATAACTTTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACT:1 + chr3L 1909782 5' - Quasimodo 6974 2 65.07 TGAAGTGCCGCTAAGGACAGCATTTGTCTGGATTTTGCCACATTATCCTTTAGATGTGCAACGTGACTTGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGCCTACTATGA:1 - chr3R 4359268 5' - gypsy4 6756 2 58.20 AACTTCAGGTTGCATTGTGGCTTCTTCGACAGCGTTTGCCACGCCCACTTTGGCAATCTCAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGCA:1 + chrX 13490420 5' + Tirant 8183 2 50.86 CGGGAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:2 - chr3L 2330163 5' - roo 325 2 73.29 ATTAAAATTTTCACTAACTGAAATGTGTTTCCTTGGCTTCAGTTTTTTGTTTTACTTTTTCAGTGAGTTTTCATTTGATTTACGATCAAATGTCAGTCGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chrX 3490282 5' - roo 388 2 45.45 GGAGATGGCATATCCAGAGCCATTCCATTAAATATTCCCCCTCTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTCAGTTGCACTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 + chr3R 6645335 5' + blood 75 2 64.38 CATGCACTTCAGTTCCTGGGTAATCGGCACTATCACCGAATCCATGGGACTGTTTTTTCCGGCGCATTGGCAGTCGAGTTTGGCAGCGAGTCTGGAGAAGAGAAATCTCAGCATTGACCACAGCTGCAGCTCCTAGCTTCCTTGCT:1 + chr2R 23101533 5' - jockey 4687 1 73.29 AAATTATGTAAATGAATTTCCTGTTGCATGTGGTGCCGATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGTCTACATACATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 + chr3R 18635190 5' - opus 7455 2 54.11 ATGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:2 + chrX 1103576 5' + pogo 25 1 67.12 GTTTTTCTGCCGTCTTGTTTTCCTGCCAGCCACATGTCGCATTTGGTTTTATTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTCTGAGTTCTATA:1 - chr3R 29339346 5' - gypsy4 400 1 65.07 CAAAGCAATAAAAAATAATAAACTTGCTATTACATTTAACAAGCTAACAAGTACGCCAAAGTATTTCATATCTTATCAGTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 - chr3L 17922061 5' + copia 4911 2 56.85 TCCGAGTGTTTTTCTGTTAATTGAAAATACGTTCAACGAACGCGAACAAATATGCCGACAGCTGGAGGAAGGGGTGGGGTTTTTGGGTGGTTTTTGGGTGGTTTTCGTGGCATTAAATATTCGGAAACGCTTCCTTCTGCGTGTTA:1 + chr2L 10867013 5' - INE-1 33 1 77.40 AGACTTGCATTGTTAGTCCCTTCTATGTATATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCC:1 - chr3L 14302259 5' + Quasimodo 77 2 82.19 GGTACGAGCAACATAATCGCAAAGCAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr2L 14239112 5' + 412 27 2 63.77 GCAGCTTTAGAGAAGATTGGAAAGCAGCACATGCTAGCCGACGTCGTTGCAATAATTGGAACTTTGGATGTCGTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAAT:1 - chr4 568441 5' - FB 484 1 53.42 AGTAATAAATACAATGTAAGAATATTACGTATAAGCAGATGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCT:1 + chr2L 1360949 5' - Stalker2 321 2 71.23 GGTTGTTCACGCTCAATTTGCATGCATTTCATTTAGGCGGTGAGCATGGCTATACCTCTCTCTCTTTCGCTGAATTATATATTTGCTTCTTTTCGGTTTGCTGAGTTGTTCGCAGTAACTTGAGCCGAATGTAGCTGTTG:1 + chr2L 18629371 5' - G-element 200 1 37.86 TATTCAAAGATTATAAATATTCATGCTGCTGTTGAATCAAAGCACCAATAAAATTACCATAAATGCCGTAATATGTTGATACTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr3R 10150263 5' - 1360 3350 1 58.90 GCTCAAACGCGTAGCGCACAAATTGAAAAACAAGCGGTTAATGTGAAAAACAGGACGAGTTTAGTTGTTTTCTATCCGAGGGGACGCGGCGTTGCAACAATTCTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTG:1 - chr3L 15094590 5' - Stalker4 7279 4 68.49 ATAACAAATTCACAAATATTTCCGGTAATTGTTAAATAATTAACGAGTGAGAAACAATAGGATAACTAATATTTTGGCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACATAT:2 - chr2L 15641190 5' - transib2 2418 1 55.48 TACGGAGACATTGTGGCCAAAAGGATCTTGGGGAAAAAAAGGTCCAAATGAGAGAAAATGCGCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 - chr2L 21031008 5' + FB 37 1 52.03 CTATTTGCCTGAAGGCTATATGTTCAAATAATTTGTTTGCTGCTGGCTGTTATCCTTGTCTGTCCCTTCCTTTGTTTGGCTATATTTTCTAAAAAGTGAGTTTGGTTAAGTTAATTAGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAA:1 + chr3R 31897913 5' + HB 308 1 60.96 CTTCCAATTGTTGTTAGCTAAATCATAAAGCACACATAATACTACAAAGTCAAGAAGATAGCAAACGTAATTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCCCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chrX 15116015 5' - pogo 2055 1 49.32 GTTTGGCCATCTCCGCGGGATCAGATTGCGCACCCGATGTGCTCACTTCCTCGTCTTCGTCAGAGTTATCATCATTATCATCATCATCAGTCAATAATTAACTTCCCTATTTTTATAGCACTCCTAATAGCTGAGTAACGGGTATC:1 - chr3R 8256014 5' + INE-1 541 1 61.64 TAAGGAAATCTTTGACAGTTGGCACAGGTGAAAGTTGTTTTCGGAAGCCTCACAAGATCGATGGGCTGGAAAAAGAATTGGTTTGCCCTACACTTTTGAACAATTTTTAAATTTTTCGCATTTTCACTAGCAGAGTAATGGGTATC:1 - chr2R 11784525 5' + INE-1 541 1 51.37 ACAATGATCTCTAGGTTTTCTTATAAAACATACTCCATAGCTTACGGATTAAAAACATCCTTCAATTGCATATACATACGTTCCATCCTTTGGCATAAGGAGCAATTTATATTTTCTCTCCGTATGAACGTCTCGATCTCAGGAAC:1 - chr3R 30411419 5' + INE-1 140 1 77.40 ATGCAAAGTGCGCCAAAGTTGCCGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:2 + chr3R 7470932 5' + Doc 79 1 51.37 GGAGAAGTCTCCTCTAGCTCTTGGTTACTCAAGTTTTTGGCTGGTCGGGTTGCTTGCGGACAATGTTGCTGTGCAACTTTGTAAGCAAAGTCAGCACTTGGCCGGATGCGGTGCTCCAGTTTTTCGCCTTCCCGGTTCAGTGTCCG:1 - chr2R 5071033 5' - Tirant 8156 2 56.16 ACCTCCAATTACCTGCTATTTATATGTGGCACTTTCAGCTTGAGGCTGCAAGGCCTGCTAGTATTTCTTGGGCTATGCCAAAGTCTGCTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACGCGGCATGTG:1 - chrX 1306121 5' - Tirant 168 2 68.46 AAACAGTTTTGTAAAAATGTGGGCGTGGTACGTCACTTTCACTTCACAATTTCCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAACCTCTAAATTGTCGGCTAT:1 + chr4 857187 5' + Q-element 116 2 71.92 AAAGTCGCCATCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAA:1 + chr3R 7481511 5' - invader4 255 2 61.64 CTATAAGAAATTTTAGTCGTGTTTAGATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTACACACACACACATACATTACCACATAGCAACAGACATAAACCAAATCATAGAATGCCTTAGGTTATAA:1 + chr2L 23016844 5' + Quasimodo 88 2 72.60 CTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr2R 23409079 5' + opus 7038 4 77.50 TAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2R 11164526 5' + roo 8704 2 58.22 ATTGCCTCTGCAATCAGTTTCACAGTACGCACTAGATAGGGGAAAAATATATTCTCACTTTCTCAGTAAATTAAATTTTGGAATTATTATACATATTAAAAGTAAATAAAGTAAATATTCACCGATATCTATCGATATCCAAGAAA:1 + chr2L 15912021 5' + INE-1 498 1 77.40 ATGAGTTTCCACACAGTTGAGTGTGCTGGGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr2L 15777918 5' + 297 38 2 59.31 ACACCCATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTCCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGGATTCCACAGTCTTCGGGTGGATACGTG:1 + chr3R 9125615 5' + Doc 16 1 76.81 TTATGTCTCCATTACTGCAAGTTGTTTTCATTTTCATTTTTATGGCGGAACCTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chrX 3647024 5' + 412 20 2 66.41 TACATACATATGCTCATATATGTACATATGTACATATGCTCATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATT:1 - chr2L 7951419 5' + Transpac 70 2 67.81 GAGTCAAAGGCAATTAAAGTTTGATCAATGCCAGACTAGCTGGCCCTTGATGGCACCTAATCATTGAGACTGTTAATTTGAACCATAATATACACTTTAGAGTAAAACTTTTACATTATTTTTCAAATATGATAAAATAAATCAAA:1 + chr3L 13174216 5' + TAHRE 29 1 55.48 GATTGCTAACTAATAAAAATTGATCATTGATTGATTATAAGGACTTCTTCGAATAATGTTAAATTGTGACTAGTGTAGTTAATTAGGATTCCAATACTTCTGATTGTGGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 - chr3R 8017847 5' - mdg1 375 2 52.82 AAAAGCGATTTAAAAATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTC:1 + chr3R 7616716 5' - Stalker2 7616 2 55.91 GTTTTCCTCTCCCCAATCTCACACACTAACGGGGTGCCCTGTGCGCACGCACACAAAACGGGTTAAGAAAAAAAAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGA:1 - chr2L 161054 5' - diver2 4674 2 64.91 CGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1 + chr3R 26486044 5' + 412 84 2 73.10 GGCAACGGCTGGCTGAACGAGACCGAGCTGCGTGACCAGGTGAGGACAGAATAATGGCTCCATTGCTCTGCTATGCAGCTACTAATGGTGTAATAAATAATAAGTAATAGCTCAGTGGAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCT:1 - chr2R 12065707 5' - Stalker2 367 2 59.59 CAGATGGGCTCAGAGGCGGCGAAAGTAGGGGTTCTATGGTTAATTGTTTAATAAAGTACGACAATCAAAGGTATCATGGTATTAAAATGGGTAAAGATATATTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAAT:1 - chr3R 6950483 5' - G4 3812 1 69.86 GTTGATGGTGGTGTAGTTTTAGTAGTTGTTGTTTGCTCTGTAGATGTTGTTGTACCTTCCGTAGTTGTTGTTGTTGAAGCTTCAGTGCTTGTTGTTGTTGTTTTTGCTGTTGCTGTTATTGTTGTTGT:1 - chrX 12968769 5' - Doc4-element 316 1 74.22 GAGGAGTTTGAGATGGCGGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr2R 23212635 5' + Tirant 8143 2 75.00 TGGCACCACCTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGT:1 - chr3R 18635313 5' + opus 9 2 68.00 AAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 + chr3R 7585764 5' + Doc 75 1 76.52 AAATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTA:1 + chr2R 11095734 5' + diver 5943 2 52.41 AAGGAGGAAAAATTTTCGAAATATGAGGCCCAAGAACTTCACCTTTAAATAATGTTAAGCGAAACTCGAGCGGGCAGGGGCTCTCCCGGGAAACTGGGCACTGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTAGT:1 - chr2R 25106176 5' - roo 398 1 76.26 AAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 + chrX 7706745 5' - P-element 2823 1 40.41 TAGACAGTGTGATTTTCGATATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAA:1 + chr2L 18112444 5' - transib2 2811 1 73.97 CATTTATAATTTTTGAGTAGAAACTCCAATTTTTAACTCCATGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGA:1 + chr3L 23082168 5' - 1360 3168 1 71.92 ATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCT:1 + chr3R 28406359 5' - opus 430 2 69.86 GAATAGCATGCCGTTAGATGGATGGAAGATACTTATTTTAAGATATATCATAATGTCCTCAGCAATCGCATCAATCGATTTTTCCCACCAATGATTTTTTTATATTTGGAATGCCGTCTTGGCGTCGAAATTAAAATTAAATTAAT:1 - chr3L 972185 5' - Rt1b 127 1 63.70 CTCACGAAGCGTGCGGTAATTGGCAAAAGAAACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3R 20450441 5' + hobo 31 1 68.54 GAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACC:1 + chr2L 18630466 5' + G-element 70 1 64.58 ATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr2L 17295814 5' + Doc 40 1 54.17 TAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAATAAT:1 - 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chr3L 21665302 5' + 1360 82 1 74.66 ATATGTACGCGTACATTATAGTCGAATGCCGCACCATTGCAGCTGTGCACAACAACCAAATTCGGTGTGATATAATGAATTGCTAGTTGATTCGGGTGGACCAT:1 + chr2L 11881580 5' - G5 4582 1 74.04 CTGCAGTCATTTGCAGTCATTTGTTCGCTGATTTCCGTTTGACATAATTAAAAAAGCAGTAAGCCGTCTTTGAGTATCGATTAATTTTTCATTTACCATAATACCTAAAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTT:1 + chrX 10430156 5' - flea 4952 1 78.68 ATTTCGAATAAGTTGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGCTCGCTCACGCT:1 + chr2R 18344564 5' - 1360 3302 1 76.03 GCTTTAAGCGATGTTTATCTCCGTCATAATATGCGCTGGGAATCACCTTAAAGTGATATTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 25106033 5' + roo 8716 2 58.09 AGTCAACATTGCAGGCCGCATTTCTCGTCCAGTGGCAGTGGCATGTTCAACAACCTTGAGTCAGGTTTTTCCACTTCCGACTTTAAATCAGAACAATAATTCCTAAGAATCAATTACTCAAATTAGAATGTTTTTTCTTT:1 - chr2L 18480800 5' - Circe 478 1 54.29 AAGTCAAGTAAATAAATTCGTCACATTTTTTTATATCACGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCGTC:1 + chr2R 1949264 5' + Cr1a 4402 1 66.29 CTGTCTGAAATAGGCAGAATTTGCATTTTTATTCTATTCTTTTAGTTGGTTCGCCATTGTGCCTTCATCATTTGCGCTCAGTTCTTGCCTCTTTCCACCACCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCG:1 - chr3R 32011546 5' + jockey 4988 1 71.72 AGACTATCCAACTCCGGGCTGGAGCCCAAGTTCCAGTTCAAATGGCGCGCTGCGAAATCTTCTGAGTTATGGCATCTTTACACCTGACCCTGGGTTTGTAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCA:1 - chr2L 14681287 5' - FB 120 1 74.19 GTAGCTGTCGACCGATTGAACCTTAGATTATGTAGATATGTATGCGGATTGACTAGTTGTATTTAGACTGATATTTGTGTTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCA:1 - chr4 397392 5' - 297 165 2 51.08 CATAATCATGGTGTCCATGGAACCACTGGAGTCTCCGCCACCTTCGGGCTTGAAGATGATCACTTTCTTGGTCCATTCTGCGCAGAGTCATGCCAGGACTGGACGAGGCTGGCCTGATTC:1 + chr3R 18046793 5' + G7 339 2 62.50 AAAAATAAATGAATACAGCTATCAATATAAAATGAAATGTGGTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr3L 18253899 5' - blood 329 2 52.05 TGTAGCTTGCTGGCTCTTTAGCTTTTTTAGCCATTTGGGGTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3L 21013826 5' + roo 16 2 70.40 AGTCCGAGCGTTCGTGCCAAGTCTGGGGAGTCAATAAGAAATTTCAGGAATTTTGCGAGCTAATTCATACGAATCCTGTGCGTATTTTTGGGTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAAGCGGCAATATTAGCAG:1 - chrX 6425368 5' - blood 448 1 60.27 ATAAGATGTGGCCGATTTATTAGTTACTTCGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCA:1 - chr3R 28117045 5' + hobo 59 1 74.56 AGAGCCATTCCATTAAATATTCCCCCTCTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGTGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 + chr3R 6645350 5' + blood 7039 2 55.95 AGGCAAGGCCGAAGGTTGGTAAAAAGAAAAGTATTTATTTAAGAAGTGCAAGAAAATGGGTTCGAACAAGCAAACGATCGGAGGTAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 + chr2R 1320381 5' + Transpac 4953 2 62.33 GCGATGCAGCAAACGAATGAATTTTATTAAAACTTTTCTATTCACACAAAAAAATGAAATAATAATGAAGATATCTAGACGATGCAGCTAACTATAGATGC:1 - chr3R 24949371 5' - pogo 20 1 78.22 CCTCATCCACATCCTCTTCCTGTCCTGCTTTATGTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTGTGTATGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 1947198 5' - Quasimodo 39 2 65.26 TGTCTGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAAACACTGAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAT:1 - chr3L 14600611 5' - blood 7177 2 46.81 TTCGTAATCGTTTGTACATTTGAGACACAGTTATATGCAACGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGATCGACTCGGTTATTGATCCTTATCAAGAATATAT:1 - chr4 194653 5' - INE-1 82 1 52.05 GCACCTGAAAATTCCGCCTTGTTACGTTTGATTAAATCGGTTGTTGTTAGAGTACTTATTTAAAATTTTTTCCTAAACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 - chr2R 21848793 5' - Transpac 273 2 57.86 TGGATGATCTACAAAACCTATGAAATCATCGAGAAGAACATCCTATGACATCAGCTAAATCTTTAAAACGATTGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3L 25607251 5' + 412 7101 2 52.74 GACATAAAAAGTATATAAAGAAATATGTTGTTATGCTTTAAAAGGTTTCTCCTGCATTTTGGTAAGATAAGTTTCGGCGTCCCATTTGCTGGGGTATATTGGAGTTTTCAAAATCACTAATCACTTTTCTATTAGAAAATAAATG:1 + chr2R 6499841 5' - transib2 70 1 67.59 TACTACTTAAATAGCTTTCAGCGTCTTAGACGTTAATTGCAACAAATCGACGCCATTCTGAGAATGTTACGCCATTACTCAGCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGACCG:1 + chr3R 12557951 5' - roo 237 2 55.17 AGTTATGAATAATATCCGGCCATTTTTCTACCCTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGC:1 + chr2L 18630426 5' + G-element 16 1 73.08 GACTCGTCTAGACAGTTATGAATATATATTTTATAAGATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCCCTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAA:1 - 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P-element 2874 1 71.72 GACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTG:1 - chr2R 5173200 5' - Stalker 7177 4 72.60 ATAAAAATCGCAAGACAATGGGACCCCGGCCTGGGACCCTGACCAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGA:1 + chr3L 14302167 5' - 297 6905 2 69.86 GTTTGGCAGTGAAGAAACCGCTACTCCCCAAAAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTCTAAGCCCTAAATTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCAAATTCGCATGGGAGATGAACAATCGAG:1 + chr3R 31458383 5' + jockey 12 1 58.22 GATATCACATAACAACGAAATCATAATAAATAAAATATATTAGACGGAAAAGCCATCATCACGATTAGGAAGTGTTTTAACACTTTTCGTTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTA:1 + chr3L 18544715 5' + roo 127 2 41.10 AGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr3R 9125648 5' + Doc 16 1 71.43 GCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACA:1 - 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NOF 3951 1 53.42 AGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTG:1 + chr3R 7470969 5' + Doc 116 1 71.92 CCCACGATCTGATGCACTGAGATAAATAAAAAGCAGTTCATCAATCTTAAATCCGCTGAAAATGTAGTTACAAGAATGCATTTGATTTCATCAAAGGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3L 2330048 5' + roo 25 2 65.07 TAAACATTCAAAGGGCTGTAGGCGGTAAACTATTTAATATATCATGTTTGCATTTAAATACGTTTATATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:2 + chr3L 12433409 5' - roo 9019 2 55.48 CAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 + chr2L 12325026 5' + jockey 4710 1 52.63 TATTATTTGTTAAATTTTGTAAAGAATATTGTTATATTTAAGCACTCCTTTACTTTGATCGCACGATTGTAATATTTTACAAGCGTTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 11944801 5' + roo 8688 2 68.15 TTCAGGATATTTTGCAAGTCGGTGAGCCCATCAGCAATCCAACCACAGTAAAAAACTTTCTCTGCGTCTACGTCTCTAAAATCTGGATGCTTTATCTTAACTAGCTTTACTACCTGAACTACCTGAGATCTCGACGTTCATACGGC:1 + chr2L 21207490 5' - INE-1 134 1 68.49 GTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGC:1 + chr3R 14277922 5' + P-element 82 1 17.60 TCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1 + chr2L 18112495 5' - transib2 2785 1 53.72 GGTGCACAATGGACCGTGGAACTTAACCCACTCACCCTGTCATTTTAGCCATTGTCCTTTGGTCGCACCTAGCAGCTCAAGTGATTAAGATAAGATAAGATAACAAACACATAGTCTTAAGCACGCCATGTGCGTGTGGCTGTACC:1 + chrX 7211924 5' + Stalker3T 246 1 54.79 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTATAGCAACTGTCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGA:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 354 1 56.59 GTTGCCGCCTCATGAAGGCAGAAATTTCCATCGGTTTGCCCGTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCA:1 - chr2L 12144278 5' - transib2 2744 1 74.66 AGCTCTTAGTTTATTTATTTAGCACTATTTGCACCAGCAAATAAGCTGGAATTATGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chr3R 25751795 5' + roo 8725 2 64.29 AATAAAAGAATAAATTCAAAGTGTCTTATAATTAATTTTAGGGACTTTAGATAGGCCCAAATAAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - 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chr2L 17839519 5' - blood 360 2 73.29 GGAATAGAAATCTAAAAAAAAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGA:2 - chr2L 21643159 5' + Tabor 6870 2 63.70 ACAAATTAATTAAATTAATGAATGAGTTTGGATAGAAGATTTCGAGTCATTTGTCTTAAAATTTGCCAGGCCAGAAAATGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATA:1 - chr3R 9181312 5' - Tc1 1561 1 53.79 GGGCGCCGACTCACTGTGTGCCAATTAATTATTCATAATTAGCTGCTGACTAAATGTTTAACTAAATCAGAGGACGTCCGCTTCGTCCTCTGTTGGGTGTTTATTTAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACG:1 - chr2L 9274197 5' + F-element 110 1 75.86 TTCATTTGGGAATCGAAGATACACCTTCTAATACCTACGGGAAATATAATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGA:1 + chr3R 8216658 5' - P-element 2633 1 36.30 ATTTAATATATCATGTTTGCATTTAAATACGTTTATATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3L 12433440 5' - roo 324 2 76.71 ATTATAATTTAGTTTGAATGATAAGAAATATTTTAACGCAGTATGTAAATGTGTGTTTAAAAATCTTTTTAGATGTAAACGTGCTATTGTCCAGACTAATTTTATGACCCAATTCGATATTAAAAACAAGAGAGAATGCTATATTC:1 - chrX 21088583 5' - INE-1 580 1 37.67 ACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAG:1 - chr2L 22063441 5' - INE-1 153 1 56.20 AAGTTCTTAGCCACACCGAGTTGGTTAGCGCGGTGGCTGGAAATTTTAGGTATAAAAATTGATTTACAAAATTAAGAAAATAAATCCACTTGGAGATTCACGATGATTACGTTGGGAAGATGACTGTCTTCCTTAATGCGATTGGC:1 - chr2L 14884010 5' - gypsy3 6809 2 51.37 TCTCGACAATTCTAATGGCGTCTGACACTTTGAAATGTAAAATAGACTTTGACTCTGAGCCCGAGGTGGTTGTGGGCTATACAGCAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGCGTTGGGAGCGTAATTCT:1 + chrX 13508547 5' - jockey 431 1 64.12 AAGTTTCAACGTAAACAAATTATGAGTTATTCGCAAATAGTGTAACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr2L 14969212 5' - 412 480 2 64.75 GAAAGCTCATTTCCAAACTAAATATTGAAACGCAATAAGTTCCCAAAATCACCATCAGCCCAGGTGGGCCAAAGGCAAATGAGACAGTGGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAA:1 + chr2L 2440249 5' + Quasimodo 109 2 70.97 GTGGTTTGCCACCCGCGCCCCCCTCAGATAGTGCTGAAAACTTTTGCAACAATGACATTATCAAAGCCAGAAACAATGGAGACACGAAGAAAGCAACAGCACCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTA:1 + chr3L 939715 5' + Idefix 6986 2 74.81 CTGAAGTATTCGAAATAATAATAGTAATAAATACAATGTAAGAATATTACGTATAAGCAGATGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTG:1 + chr2L 1360927 5' - Stalker2 343 2 56.85 TCAAGGATACTGCCACTTAGCCACTTGTTTGTGTAGTCCTCGGACGAAATCCGAACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr2L 3231995 5' - roo 9040 1 61.64 GCAAAAGTGAGTGCCAAGTGTGAGATTAAGTGCGAGTGTGTTTGTGTCCCTCGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGCATTAATACATTG:1 + chrX 13164005 5' - hopper 1349 1 60.27 GTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2L 17295826 5' + Doc 8 1 66.00 ATCAGCCACCACCGCATTAAAGCAGCAACAGCAGCATTAGCAAAAATAAAGAAAACGAAAATGGAGACGCCAAGGTGACTGTGAAAACTAACAAGAAATCATGTTATCCCCTTAAGTCCGTAAAAATGTAAAATAAAATAATTTAA:1 - chrX 22936775 5' + jockey 4925 1 54.11 AAAACAATTGGCAGTGAAATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTT:1 + chr2R 11095718 5' + diver 40 2 56.85 GATTGATTTCAAAAGCGCGGAAAATTTTCCCAATAGCACCTTTTGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chr2L 14969037 5' + 412 10 2 71.03 CAAAAACGAAAACGTACGAAAACACCAATTAAATCAATATGTATTATATTGTATGTAACTAAATATATGAAAGACTATTGATCGATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGT:1 + chrX 14836144 5' - invader4 3053 2 64.38 AAAAGCACCGGGCTTGAAATGAAGGCAGCCTCTCTCTCTTTCCCTCTTTCGCTATTTCACTTGCACACAGCGTATTTTCGTACATCTTTGTTTACATGTGACATCCTTCATTGTTCTCTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTA:1 + chr2L 2494486 5' - Doc 485 1 78.08 AGGTACTCCTTTTTCTTCTTCTTGAAAATGCTGTTGTGTCTCAGGAGATACTTGATCTTGCTGAAGGGACGATGGGTGGTGGTCACCGTATGTGGTTTCTTGGTAGTATAATAACAAGGGCGCGAATTTTTTAAAATTATTTTATT:1 - chr3L 17323949 5' + 1360 3090 1 73.29 GAAATAACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTTACTTCGCGATTTTGTGCGCCAGCGCAGCAAGTTCCGA:1 + chr2L 21325085 5' - invader4 272 2 69.86 AGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGGTGGCAGCGC:1 - chr3R 15790071 5' + flea 4784 2 72.60 GGAAATCAGGATACGCTTTATATGTATCTATATACATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTG:2 + chrX 18220598 5' - Burdock 6309 2 79.45 GTACTACTTGTTGAACCTATCACACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAAATTGTTCACAAGAGTAATATCAAAAATGACTAGAAGTCCGAATATTTTTTTTAAAATATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATGCATTGTG:1 - chr3L 24104298 5' + Stalker4 52 4 75.89 ACGCTCGAGGACCTTTTACACTTTTAAAGCCAAGCTTCGGCAAACCATGGCTTAAATACCCTGACCGTAGATACGAGTGTATATATTCGAGAAGCAACATCGACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCATTACT:1 + chr2L 21965369 5' + Doc3-element 4392 1 58.90 CAAGGCGTTCATCCATATTGTAAGGTTACAGGAATATCAAGAAACGATAAAAAGAATAACTTAATGAATTAATAACGCTGATCGTTATAAAGGGATTACTAGCACACGAGGACGTTTGATAGGTCAGGATGGCCGTG:1 - chr3L 27396586 5' + invader1 3590 1 62.77 AGTAAAGATTTCCACGTTGTGGCTGTAACGGAACCAAAATGGGTTCGCCAATAGCCAAAGACGTTCAAGAACTTTACAACAAATAAAGAAAAATATTATGTACAATAATGTTAGGTACATGTCTAAAGTTTTTATTTATATTTTAT:1 + chr3R 15808914 5' - mariner2 792 1 69.86 CATCTTACAACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTG:1 + chr2R 5582132 5' + Cr1a 451 1 70.55 TAGCAGGGGGCAGATGGGCGGAAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTT:1 + chr3L 7837130 5' + jockey 4789 1 62.33 TGCTGCATTTTGAAAACACCATCTGAAAACACCATCAATAGTCGATTTCAATTTCGTTACTGATGGATTTTTGGTCGACAGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 - chr2R 4536710 5' - mdg1 376 2 54.79 ATGCAGGCGCTGAAAAAATTCAACATTTCTTACAAGACTCTTCTTTGATATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 - chr3R 20203963 5' + 412 8 2 78.36 AAATATATTTCAAAATTTCTGTGATATTCAAGTTTTGTACAAATTTCATAATAATAAACACCCATAAAGAACCATATTCTTGGTAAATATCATTATCATTATTATATATTATTACAAAACCTAACTTGAATAGTTGTGATGCCTCA:1 - chr3L 13987326 5' - diver 226 1 79.45 GAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 + chr3L 19580912 5' - roo 319 2 78.08 AAGTGCGGCAATCGAAAGGCCCAGCATGAATTTCAGTCGAAAGTATCTATCTATGTATATATGTAGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAAT:1 + chr3R 8849751 5' - 297 344 2 61.11 TTCTTCGGAATAGAAATCTAAAAAAAAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGACCA:1 - chr2L 21643165 5' + Tabor 6864 2 67.81 CGGATGTCCTTTGCTCGAGTTCCATTCTATGCGCTTCTAGTGGCCAGCTAAATTTAATGGACCGTTCCATTTTCTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCT:1 + chr2R 17332128 5' - jockey 4949 1 46.53 TTAATTAGTCTTTATAATGAGAGAGAGGGGACGATTCTGTTGACATCGAAATTTTTGACCTTTCATTTACCTTCCTTAGCTATAGTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACG:1 - chr3L 23648154 5' + 1360 132 1 76.71 CAGTGGCAAAGAAAAAGCCCAAAAGACCGTCTACACAAATTAGAAAACTAGTGGGATCAATACGATGAGTGATATTTTCCACAGAGCGATTGATTCCTAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAAAAAGT:1 - chr2R 4511429 5' + transib2 2459 1 70.55 ATATCACTAGAATTCTATTTGGCCGGGTATTAAAAAATGAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCT:1 + chrX 12576943 5' - jockey 189 1 71.11 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr2L 10450247 5' + opus 162 4 71.54 ATATATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGGATAGTGCCAATTGATCAAAAATAATACAGATTTTTAGATTTCTTACGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCATCACC:1 + chr2R 4826124 5' + 1360 3320 1 55.48 GAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1 - chr2L 21643137 5' + Tabor 47 2 52.14 CATCTATCAGACTAATTATGTTTTAGTTAATTTAATAATTAAACTATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3R 6413673 5' - 1360 3354 1 61.38 ATGTGGCCGACATGGCAGTCCACAAGGCTCCCAACTTTCATTCATTCTCTTCACAAAAGCGAGCTTGCCCAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGACTAAT:1 + chr2R 5581739 5' + 3S18 5952 2 57.04 GTTGCCCCACTCAAAAGCTCTAACCGCACTCTGTGCGCTAAAAACCCTTTTTGAAGACCCTTAACCCGGTTTTCCCCCTGAAATGCACCAATCAATCAGGAATTAGGGTGGTTAACATTTTCATAAACACATTATGCTTT:1 + chr2R 13339195 5' - 1731 4242 1 79.29 ACTATGGTTATGATTAAGAACTATTTGCTATGTGTTTCCAATTACGCGCAGAATCTATTTTAGTCTCTTTTCTGTCACACATATATACATATTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGA:1 + chr2L 13138939 5' + McClintock 20 2 72.60 CCTTGGCTATTTCGAAACCTTAAAATACATTTTTTGACAGGTTATGCCTCGTTGCATATGCATACCCTTGAACTGAATAAAAACAGCAACGAAAAATTTGATATCATCATCATCTTATGGCTCTCGTCAAG:1 + chrX 12529848 5' - BS3 1600 1 71.76 AGCCAAAATTGCACAAACAAGCCAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGC:1 - chr2R 11146111 5' + Quasimodo 76 2 69.86 TATATACCCTGTATATTCAGCGCTCAATAAATGCGAAGTACCAATAGCAAAACCGCATCATACGAACATATCAGGACGAAATGAAACGGTGCAACGATTTTTTGACATCTTTCCCCTGATTTTCAATTTTATAAAATAAAATTAAA:1 + chr2L 13619123 5' - TAHRE 72 2 71.92 ATGAATAAACGCTCACCCAATGCAAATGAAAACATTTTTATTCAACTTTTGTGCGCATTCGAGGCTAAGCCTGTAAATTGTTTAACAATTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACG:1 + chr2L 12227227 5' - opus 183 4 72.50 GGAAACAAGTTCAGCATTGTTCAGATCCGCTGTGGAGCAGGGAGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chr3R 23161217 5' + 412 14 2 74.66 AAATTGGAAACGATTCACAAAGATCTCCATTACCACCAGCAATTTCTAGCATAAGTTTAGTTCCGAGTAAGACGCCACTGACGCCGACATCGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGC:1 + chrX 2111216 5' - Doc 366 1 72.87 AACACAAAAGGAGTCCGCATCGAAAAAGGACACCTTCGAGGAGTACGATTTACTGCCCGCAACCGTATTGCATTCGACTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCT:1 + chr2R 10832983 5' - 1360 450 1 52.74 ACATAAAACGGGGACGAGCAGAAAGTTTTGCAATTTCCCTGCCACGTCTCTCTCACACACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATAC:1 + chr2L 19281904 5' + Doc 4476 1 60.27 GCCCCTCGCCCCTCGCCGCTCCCCTGAGCCATCACCCGTGTTGACGTTAAAATTTAAAGTTCAAAATTTGTTACGTTCACGGCAAGTTTCAGTGAAAACAATAAAAAATACAAATAAAAAACAAAACCGAATAA:1 - chrX 9933279 5' + McClintock 6282 2 68.66 CTCTTCAAACGGTGGAGAATCAGTGGGAGCTGGAGCAGACGAAGCCTGGCAGTATGGGTCAGCAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCGCTAGAAGCTGCATGTTGAATCTCAACCTTCTAGTTTTTATAGTTCCTG:1 + chr2R 7047583 5' - INE-1 155 1 58.21 CTGAAACCAAACAAACAGCTGTTGCGCGGGCATAAACTTGCATTTATATTGTTATTTACCATATCTACCCGGTATTTTAAAGACTAAGAACTTGTAAAGTGAAGGACATTATTTGTCAAATTTACGATGCATGAGCATAC:1 + chr3R 26863391 5' - 1360 190 1 52.86 TATTGCTTCTATATTCATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1 - chr3R 6461840 5' + 297 63 2 65.07 AAAGTGTAAAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 - chr2L 12291953 5' + Tirant 50 2 54.11 AGAAAATGGTAAATCAAATACCAAATACCACACGAAAACAACCATTCGCAGGTATTAAGTAATGAGTGTGTGTGTGTGATTAGAGTTAAATCAAAAATTAGTGCTTCTCATGTAAAAGACATCTGCAAAGCTACTAATAGTTTTTG:1 + chrX 6801932 5' + hopper 397 1 73.97 TCTTTCGAGCAGCGCAGGTAAATCAATAAATTTACATAATCATTGTGCAAAAGGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr2R 22463142 5' + roo 8731 2 65.07 GAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr3R 23601764 5' + jockey 8 1 66.25 GTGCGCCAAAGTTGCCGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:1 + chr3R 7470939 5' + Doc 86 1 51.37 ATGTATTATTTATAAGCTGAAAACAAATGACAACATGAACTTAAATTGTTAAATGTGGGGCAATAGAAGTTTTTTTTTATTTCTTTATTAATTAGAAGCGATAAATCCATACAATGCAGTAATAGTAACATAACAGCGCAATTAAC:1 + chrX 20266154 5' - BS 5041 1 66.44 CTTACATCTCCCCCGGCCAACATAAATTTGGTAGATTTGGTTTTTAAAGGCAGCCAAAAATATTTTGACAAATTATGAGGTAGGAATGTGTTCACTAAATCGTTTTATGAGTTTTTAAAGTTGAAGTTTTAAACAGCTGATTG:1 - chr3R 18544173 5' + transib2 165 1 55.24 TATGTTATATTATAAATATAAAATCTTTTTGTTTTGTAATTAAAAATTATATGGGAATACTTTTCCAGGAAGTTATTAATCTATTTAAAAAAGATTTTTAAATGTAGTAAACAAAAAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCT:1 + chr3L 18035451 5' + mdg3 5258 1 69.86 TTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr3L 19031297 5' + roo 8749 2 80.14 AGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:4 - chr2R 11164525 5' + roo 8705 2 57.53 TGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr2L 12291918 5' + Tirant 8147 2 68.32 CACGCTGCAAGTCATTAGGTGGCGCCTGCACCTCTGACCCGGTGAAAACCTGCCCCTCAACCCAAGACCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAATTTACTCGATGAGATTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr2L 12486317 5' - roo 9030 1 56.72 ACCCTTCTGCCACGTTAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2R 15070187 5' + 412 7095 2 55.00 AAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:2 - chr2L 16331025 5' - roo 8991 2 75.34 AATGCCAATTTGACACTTGTGAGGAGTTTGAGATGGCGGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 + chr2R 23212615 5' + Tirant 8175 2 69.70 CTTTTATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCATCAGGAGTGGCATCC:1 - chr3R 21395235 5' + G2 468 1 56.64 CGCTGACCACATGGCCACGATAGATGGTTAGACTGTCGAAACCACAATTTCTGCTGGACTCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr3L 11803967 5' + blood 7061 2 53.33 TACCAAGAGAAGAATAATAGAGCGCGTTCTCTCGTTCCACGATCCTCTTAATTTCATCACTCTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAGTGCATCATATCAGCT:1 + chr2R 1373092 5' + pogo 138 1 48.63 GTAAATCATTTGATTTTTTATTTGAATACTATTCTTTTATTGCAATCATTGATTATACTTACACACATTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACATTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAA:1 + chr4 334647 5' - mdg3 5035 1 54.11 AAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3L 2330159 5' - roo 8985 2 76.03 TTTGAATATATAAAGCCCGGCCTTTAAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACT:2 + chr3R 7778233 5' - transib2 2780 1 55.48 GCGGCATAAACAACAAACAGGGAAAATGCGGTGAGTGAGTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGA:1 + chrX 13551601 5' - I-element 4998 1 73.10 GTTGCTAATAATATCTCGTTATTTCCACTCCCCCTCTAAAAGGGTTTCAAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATT:1 + chr3R 12458397 5' + FB 72 1 69.18 GGATGATAAGGACGATCTCGTCGAAGAGTTTGGGGACATTGTGAATGCCAAAATTGAGTTGCTCGCAGCGGCAACGCAAATATGCCGTGTTTGCCGGCTGC:1 + chr3L 20261546 5' - Gypsy6A_LTR 93 1 61.39 AAGGCCTCATACATACTTCTCAACAATTGTTGGAATATATATATTTCATTTTTTACCATATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCA:1 + chrX 22905214 5' - INE-1 91 1 57.53 CAGGATGCGATTTGGGGCAGGCACAAAAAATCAAATAAATATTTTAGCTTGGAAACATTTTCCAGCATTTTCCTCACTCCTTGTCCAGGTTTCTGATATGTACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAA:1 - chrX 887444 5' - Quasimodo 7353 2 73.29 AGTTTAGTAGATTGTAAAATTCAGACCTTGACTCAATCAAGATGCAACAAAAGATCCCAGCTATTGGGAGATTGATTATTTTAAATCATCACCAGCCTTGGCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCA:1 + chr3L 9493722 5' + roo 8620 1 44.14 CCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTTACTTCGCGATTTTGTGCGCCAGCGCAGCAAGTTCCGATCG:1 + chr2L 21325092 5' - invader4 3028 2 67.61 AAATAAAGACAACTGCATATTGGCCAAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr3R 16240970 5' + Tirant 8115 2 54.69 TGGAGGCTTCGAGCTCGTTTAGCGCTCATTTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGTCA:1 - chr2L 11405834 5' + 412 90 2 77.40 ACATCATTTTCATTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 - chrX 19730198 5' + Doc 64 1 61.38 TTCGTTGATAAGTATGTAACAGGTACAAGGAAGCGTTTATATATATTCTTGAACAGGATCAACAGCCATATTTCTGTCCGTCCATATGAACGTCGAGATCTCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATCT:1 + chrX 124083 5' - 1360 493 1 68.49 AATTATGTATTAGTTGTTATTATGAAATGGAATGTACTCAATAGCTTGGCTTATATGGTATTACAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTGGCAGTTGTGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTA:1 - chr2L 4929902 5' - blood 7331 1 54.11 AAATTGCAAAAGGCAGATGATGGGGTATGTGTGGCGTCATTATATAATCAAATCAAATAACAATTTGTACTTTGTTAAATTTCTTGTCGCCCTCGATGGCTGGCTGTCTTTGCCTCGAAAAAATATGCAAATTTCCAGTATTTTCG:1 - chr3R 6014079 5' - hopper2 1555 1 69.86 ATATAAACATCACCGCAGCCATTGAACCGAGACTTGCTCGAGTAATTACAACAAGTGTTGTTGCGCTCTCTCGCTTTTCCCCTGCTTTCGCCCCTTTTCCCTTTTCCACCTCCCACCCATTCGATTTTCCTGTTTTTTTTTATTTT:1 - chr2L 12677520 5' - Doc2-element 246 1 72.60 GGCACACCCACACACATACATATATGGTATCGTTTTGAATTTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 15645065 5' - accord 7032 2 80.70 CCAAGAAAAATTGAATATTTCCGGGAGAAATGCAATTTTCAATTAAGATATTTCAATCGAGAGTGATGACATTAAAGTAGAGGATAGAATAATATTTCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2L 19674045 5' + roo 8683 2 43.15 AAAGAGCTTGCGGTTTAAGTTTCACAGAATGGGCAAACTTTAATTGAAATGCTAAAGTAAAGTGGCTGCTGTTTTTTTCTTTATTAAATCTGTTGCCTGGCAACTTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAA:1 - chr2R 15075717 5' + mdg1 17 2 73.79 GGTTTATCGACCTTTTCATCCATCACTGGCTGCGCCCTTTCCACTTCACCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTA:1 - chr3L 2425968 5' + hopper 69 1 63.70 CTGACAACTAAGCATACAATTATGGAATATTAAAAAACAAAAACATTTAAGGACTTAAAAAGATATTTGAAAGAAAAGTCATCCTATCAAGTCTAATCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATT:1 - chr2L 15644996 5' + transib2 23 1 69.86 ATAAACAGTAGACATCACTTAAATACAAAAGCAATTGGCTTTCATATAAAGAGCATGCACTAAGGTAATTATGACACAGCTCTCGGTAAATAAAATTAAATTATAAAATTATTATAATTTTTTT:1 + chr3L 12956537 5' - HB 325 1 56.45 TATATTTCGCTTGTTGCGCAATTTCAGTTGCAGTTGCAGCCAACGTTTCCTGCCCACCGCCACCTGTGTCCTTGTCCTTTCATCCTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGT:1 - chr3R 6495388 5' + Stalker4 6996 4 58.22 AGGGTTTTATATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGACAGAAGATATACATATATTCTTGATCTGGATCAATAGCCGAGTTGTTCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTA:1 - chrX 19192404 5' + INE-1 118 1 63.01 ATAAAATTTCAGCAGTATAGAAATTTATCCTTAAATAATACCCATATTTTAAGCTTTAATGTAGTGGACATTATACCGATTAAAATAGGTACATGTGTGAACGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTG:1 - chr2R 11710118 5' - Stalker4 142 4 30.82 GTACACCTCGCAATAACTTGTGTTAACTGGTTAACAAAAACTTACCGTTAAAATCAAGTGCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chr3L 12964720 5' + hobo 60 1 56.85 GAATCGATTGCCAACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr2L 19407017 5' + Doc 41 1 47.26 GTGGTGCAGGAAACAAGAAAAGCTCAACCGAAAAATTTCCAAAAATATTCATAGCAATCAGGTAAGGCTAGACGACTCTGTGTACATATCAGCCCTTGCTCGTTTTTAAATCGGCAAAATGTAAAAATATACATTTATTTGCATAA:1 + chr3R 4602621 5' - Tc3 1503 1 59.59 GTCGTCCTTTTTTAAAGGCGCTAGGTTATTTTAAATTTACTGCACAGGCAGCTGCACTAATGCGGAATTCTAGGGATTCTAGTGAATCTACTTGGAATAGAGAAGTTAAGCAGACTAATCAAGCCGGGACTCTCAACATCACCACG:1 - chr3R 29333975 5' - Cr1a 4061 1 50.68 ATTTATAAACAGTAAATTCTCGAGTTTTCAAAAAGGTTGCCCGAGCTGGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGC:1 - chr2L 19160430 5' + 3S18 74 2 65.07 AGCTAATTTTGTAGATTGAAGTATATGGGTTTTTTTTCCATAACGAAAGAAGACTTAAAAGATTTCATGTGCTAGATCTCCCTGACAGGTATTAAGTAGTAGGGATTAATGGATAACTACTACCTCTGTTAATTTAAGATTAATTA:1 - chr2L 22090612 5' + G4 3786 1 70.55 AAGAAATAAGTTTTGGCTTACGTAGCTCCAAAATGTGACTTAAACTCATTACGTCATCGCCACAGCTGCAAAATACCTGAGATAGAGCGAGATGGAAAGAGAGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAG:1 + chr3R 19225632 5' + 1360 3327 1 76.03 ACGCTACTTCGGAGTTCTACAAATTAAACTGTTAAATATTAAAATTTTTTTGAACAAAATGAATGATTACAAGATGACCCCAAAAAATTTGGAAATGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2R 6913488 5' + roo 24 2 67.12 CTATATTGAATTTTCTAATCAGGAAACTTAGCATTGAAATGTGCGCCAGTCTCTGGATTCTATATGCTCTATATGCAACCAAAAGAGTCTCCACGACACTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCAC:1 + chr2R 21194015 5' - P-element 283 1 67.12 CCGCTAAACTGGGCGCCACAAAATAGGCAACAGTATCCAATGGACATTACCTTAACCTGGTCATAAGCTACTGTCATTCGCATGGGAGATGCGCAATCG:1 - chr2L 6388166 5' + jockey 10 1 72.73 AATGGTTTAAAAATTTATAGTAATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACAGACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCGCTTTTTTACCACTCGACCCCCACCCTACAATTTTG:1 + chr3L 13678873 5' + hobo 35 1 53.91 GCACCGAGGTGGAGCACTTAATCGTGCCCAATCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACACA:1 + chr3L 363477 5' + blood 7098 2 76.39 CTTACTTTAGCCACATTCAAATTTGTGTAGAAAAACATCGCACAGAATTAACTATTTATATTCAATAGTTTTTCAAATACATATGTATTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAA:1 + chrX 5772981 5' - jockey 4957 1 56.16 CACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCT:1 - chr2L 19140403 5' + Max-element 57 2 75.24 GGCAATCGAAAGGCCCAGCATGAATTTCAGTCGAAAGTATCTATCTATGTATATATGTAGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAG:1 + chr3R 8849757 5' - 297 348 2 62.69 ATCGAAGGGGGCAATACCCTTAAATGTGCTTGCAAGTGAAGGTTACACTCTAAAATAGTTCTAAAGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 + chr2R 23409013 5' + opus 10 2 71.07 AATTAGGTGGCACATGGCTCCGATGATGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTCT:1 + chr2R 22746018 5' + jockey 4770 1 75.54 GTCAATTTTATTTACATACGAATATCAGTTCGCGAGCTAATTTGAAAATGTTTTGCCTCCACTTTAGTTAACTTTGTGCTAGTTCTGCCTTCTGCAAATATTTGTTAGATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2R 10160660 5' + hobo 14 1 68.49 AGGATAAATTCATGAATTTTGTTGCAAAATGATTGTTTTCCAAATACATTGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 24766038 5' - 1360 3370 1 72.60 GAACTCGTTCTCGAAGAGTCCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCT:1 + chr3R 24750932 5' + G6 17 1 73.39 TATGTCGAACAAGTGATTTCAATGAATAGAAGTTTTTGGTTTGCAAAACGGATTCTAAACGAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAAGCATAATA:1 - chr3L 14167434 5' + mdg1 7099 2 56.16 GAGAGGCGCCATCGATCTGCAAATATATGGGTCAGTACTGAATATCTTCAGCGCCTAGCTATGTACATTTATTAACCATAAATAGAATCACAAAGTTGAGTAAAAGCTTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAACAGCTCATCTAACA:1 + chr2R 18636256 5' - transib3 169 1 52.05 CATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr3R 5422942 5' - roo 9001 2 65.07 CAAGGCGGCTTTCTTCAGGCAGCCCCAAAAAAAATCGTGCTGCTCTTGGAGGCTTCGAGCTCGTTTAGCGCTCATTTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr2L 11405879 5' + 412 7086 2 58.52 TGGGCTGTACGAGTAGCAGCATCCACATCCGCAGACGACCATATAAATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCGTGTTTTTTTTACAATAATG:1 - chr3R 13437290 5' - hopper 1398 1 73.97 AACATAGAAATACATACGAATGGCCTATCAGCGAGTTATGAGATAGTCAAAAGGAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr3R 25862670 5' + roo 8730 2 63.70 AAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCACCTGGAACACCGCATCC:1 + chr3L 3453632 5' + Tirant 8176 2 76.03 GACGAACGGAACTGAACTCTCTGCGCTGCCGAAGACTCGCACTCACACAATCGTCCATTAAGCCTACCATCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGT:1 + chr3L 9469137 5' - hopper 1361 1 52.05 GAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 - chr2R 18014108 5' + Doc 79 1 70.07 TTTAATTCTTGTCACTAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTT:1 + chr3L 17921948 5' - copia 5057 2 63.01 TATTGCATTTTAAGTTTCAACGTAAACAAATTATGAGTTATTCGCAAATAGTGTAACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAG:1 - chr2L 14969223 5' - 412 467 2 61.64 ATTATAATTGAAATGCCAAAACAGGCGAGCCAACCGCTTGAGTTCAATAAATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr3L 16059398 5' + 297 9 2 80.14 CATGGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCA:1 + chr3R 10437033 5' - BS 5047 1 53.10 AAATGGAATGGTACGCAAAATAAGCGAAGTTTCAAGGTGGCATATATAGAATTTCTTTTCGCGAAAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:2 + chrX 10579881 5' + pogo 50 1 56.16 GTGGTTAACAACATTTCCTGATTGAACTTGAAATAATTGGGCAATTTTGACAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGTACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGTTGTTCGC:1 + chr4 862220 5' - 1360 134 1 67.69 AAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chr3R 12363778 5' + jockey 4709 1 66.28 AATTGCAGCAGCCCAGTGCTGCAAGTGCTCGAGCTGGTGATGTTTTTCATGCAGCCAGCTTTTTTTTCGTAGATTTCCTTTATAAAAAAGATAATTTATATTTTAGAATACAAAAGAATTTAACTTTTTACAATCACGCGGTCAAA:1 - chrX 15814215 5' - Tc3 359 1 56.16 GAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTACTCGACAAAGAAGTCGATG:1 - chr3L 7801286 5' + Transpac 187 2 69.18 GAAGGAGGATACATTCAGGATAGTTCGATCTCAGCGTTCGATATCACTTCTTTAATCTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTC:1 + chr3L 17869903 5' + 1360 50 1 58.02 ATAAATAAGTAATTTACGTATTTTCAAAAATATATCTATTTTAAGTTATTCTATTTAGGAGTAAATGGAATGTGTATCATATATATATATATTGTATATACCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTC:1 - chr3L 20512485 5' + roo 391 2 67.12 CTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chrX 388225 5' + 1360 52 1 53.42 CAGTTAGCTGTAATACAACTCAACAATTTAAGAAAAAGTGAACACATTAAAAATCTAGTTCTTAGTATTTTATATAATTTGTTGTGGTATAATTCCATTTGTTTTTGAGGCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCG:1 - chr3R 10621058 5' - Doc 4386 1 78.08 GGCTCCATCTGCCATAAAATATTATTAATTATTTCACAACAATAGCAGCACGCACTAAACATCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCCTAATAAAAACC:1 + chr3L 6742929 5' + mdg1 7381 2 56.85 AACAGCAGTTGATTTCGTTTAAACATACGTATCACCCAGCAGCCGCAAAAACCTGAATGGCAAAACATAAAATGTAACAAGAGAGAATGCTATAACCTTGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGTA:1 - chrX 22838784 5' - INE-1 531 1 62.33 CGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCACCCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr3R 443026 5' - opus 7477 2 66.44 ATTAAAATGGGTTAAGGAGTAATGTTTCTGATTTAAGCTTAAATACACTGTTTTCATTAACAGAAAAAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2L 19691343 5' + roo 8717 2 56.16 AGCAACAATAATAATCTAGCTGAAATTTCAAGCGCGCAAAAGAGATGAAAGATATTGTGAAGAGGGTACACCCCATCGATCTCCCTACCCGGAGGATAGTATTATATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGATAAATTTTTCC:1 - chr2R 10534102 5' + G5 4707 1 60.96 CCCGGTTGGAACCTGTAACTCTCGCTACCATTGATTCTTAGTTTTTCGTTCACGGTCTTGTGAAATCTTTCTATGTCTGATATACCATTTTTGCTGATCGTTACAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACT:1 + chrX 21939679 5' - Tabor 467 2 71.92 AGTATTTTAAAAATTCCTTAAATATTAGCAACATTTAAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3L 8658705 5' - roo 9023 2 50.00 GATGGATCGCTTTATTTAGTTCTCCCCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGGCAAAAGAAGACTCAA:1 - chr3L 2192318 5' + jockey 4734 1 77.78 GTACCAAATAAAAATAAATAGGGACGATATTAAGAAACGTTTACGTTTAACATACGATTCAGCCTTGGCAATCAAATGGATAGGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 2496299 5' - accord 186 2 73.47 AATAATTTCAATTATTGGTATAATAAAGATATATTCTTAAGGAAGCCTTTAAGGAGTTAAGGCTTAATATAGATCGTCCTTATACTTATTAATAAGGGAGATTTCTTTACAATGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr3L 22641916 5' - hopper 1404 2 78.08 ACAAAGGCCAGTTAATATCCAAGCCAACAGTCATTAAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3R 21674936 5' - roo 9034 1 55.48 GAAAACCTTTTGTTATGGTAATGAGCAATGAGCAAACACTGCAATGGCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3L 486956 5' - 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chr2L 2120472 5' - I-element 5306 1 51.37 CAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTT:2 - chr3R 19436108 5' - roo 368 1 56.85 AGGTGAGAGTTGCATGCTGGAAAACCTTTGCCAGCAGCTTAACCCTTGATCCGTAATTAACCCATTAGGGTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 - chr2L 14239248 5' - 412 7495 2 53.10 ATATTGTATGCAACAACACCATCAGAGAGACGACTTATTCTACGAACTGCCTCAAATTCTCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 + chr3R 4576955 5' - mdg1 359 2 60.96 CACTTATTTTTCATTTTTTGATACCAATGTGCTTCCAATGTGATTTAGTGCTGCTCGTCGCAACATGGATATGTTCTCCCTGCGACCGACACCAGCTCCAGGCTACGAATATATATATTTAAATTATTTAAAGATGGATCGTACCG:1 - chr3L 7972908 5' - Gypsy6A_LTR 396 1 45.21 GGTTTTTTGGAGTATTTCAGTTGCTTGGTAAAGTAATTTGATTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTAATATTAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGT:1 + chr3R 23264443 5' - P-element 106 1 32.19 ATTATAGCAGGGTTTTATTGGTCAAGCTCATTTTTATCGGTTAAAAAAATGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 - chr2R 5433987 5' + Transpac 4984 2 65.07 GTGCTACTTTTCCGTTTTCGTTGTTCTGCTGCTGTGCTCGCAAAAATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3R 15920321 5' + 412 39 2 58.90 GAGAAAGTAACTTGTAAACATTTGGTTGATAAAAATGAGTACTTTAAATAATTGAAGTCATATACTATTATAGATAGCACAAGTCGAACTAATACGATAAATAAATAAATAATAAAAACCTGGTTTTGACCTAGAATGTCTTAGTT:1 + chr3L 13360506 5' + jockey 4789 1 71.23 TGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3R 19436074 5' - roo 340 2 67.14 CACGGCAACAAAAGCATCGAATTCGCGGCTTATAAAATTGGTAACAGCAACAACAAACAAGCCTAATTCTGAGTTTGAAGTCTAATAGTTTGATTCGTTTTATTTTGTCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGGCTTAGTT:1 + chr2R 6114138 5' + 17.6 7355 2 50.36 GGTATGCCAAAGTCTTATTCCGACACATTGATACAGTTTTCCTCAGTTGCTCTTGTCCACATTTCGAGGCTTTTGGGCCTCTCTCCCGGGTTCAGCCTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAAT:1 - chr2L 21867392 5' + G6 2003 1 78.95 TGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGT:1 - chr2R 1000391 5' + HMS-Beagle2 6919 2 60.00 ACCATTTTAATTTATAGACGCAAAACACTATTTGCCATTGTCACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 28450622 5' - roo 396 1 73.28 TTCACATATCATAGCCTACTTTTTGGCTGTTACGATCAAGCAAATTCAATACAAAGGCATTTTTACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTAT:1 - chr2L 5270374 5' - jockey 4933 1 59.59 ATCTGATGCACTGAGATAAATAAAAAGCAGTTCATCAATCTTAAATCCGCTGAAAATGTAGTTACAAGAATGCATTTGATTTCATCAAAGGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 2330054 5' + roo 8695 2 60.96 AGGAAATCGAAAAATCGTTTTTATCTTCTTTCACCATTGATGTCATCAAAGCTGAATGCAAAAACTACAATGACAAAGTCTGAACCCACAGAATTTGCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTC:1 + chr2L 9322909 5' + 297 291 2 71.43 AAATATGGCGAAAGGCATTTATAATTTAAGCAAACTGACAATGTTCTGTTGGGATTAAAATTGCCAAAAAAACCAAACCTCTCACGAGGATTACTAGCAGGTTGTGGGAGGGCTGGACGATAAACGAATCGTCTTGCTGAATCACA:1 + chr3R 9119968 5' - BS4 586 1 51.37 TAGCAACGCATTACGATGAAAGATTTGAAAACGGAGATCCTAGTGAGCGGCGGCCTGCCGAAACTGGAGACCAGCAGGGTAAGTTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3L 9212653 5' + hobo 39 1 59.59 ATGGCGAAACCATGGCATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTGTTTAAGTTTCA:1 + chr2L 12291833 5' - Tirant 8452 2 54.86 ATGGATTACGATAGTATCTCCGTTCTCGTTTACGTTTAAAGATAGTAGCATTAAATCTTCGATTGTTGCTAGAATGTGGAAAATAGTTCAACGCAAGGCGAAATTGATTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAA:1 + chr2L 2359410 5' + 1360 3306 1 73.29 CATTTTAATTTATAGACGCAAAACACTATTTGCCATTGTCACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3R 28450624 5' - roo 9042 1 64.38 CATCGCCACGCAAATCGAAACTTGAATACTCATTTAGCGCAGACTGCGCTTGTCAACGCAATTGTTAATGTTATATTTTTTCGTCGGCCATCGTCACAAAAATAAGTTAAATAGACGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr2R 4601425 5' - roo 325 2 75.37 AGATGATTGCCCTTTTTGTAAGCTTTCGATTACGGAAATAAACGATTTTTAAATGAAGTTATTTTTGTTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCAC:1 + chr2L 5791977 5' - blood 7338 1 54.79 GACTAGCCGCGTCGAGTCAAGTCTCTGTCTATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chrX 4673676 5' + roo 88 2 78.08 CAAGTGAAGGTTACACTCTAAAATAGTTCTAAAGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chr2R 23409045 5' + opus 163 4 59.69 GTTGAATACAAATTAATTATAATTTTGTTAATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr3L 17667577 5' + F-element 86 1 71.74 GGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr3L 13678905 5' + hobo 63 1 72.58 AGTGTTGGTGGGGTTTATGCCGAGGGATTTCAAGAACAAGTTCAAGAATTTATGTTATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 - chr3L 12223247 5' - Transpac 262 2 52.74 CTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGC:2 + chr3L 18253793 5' + blood 69 2 64.38 GGCCTTGATCTGTAGGATAATGAGAAGTCTGAGATACACTTGATGCAATATTAATATATTATTATCAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 - chr3R 17586934 5' + Max-element 8288 2 55.24 CTTAGCCATACGAGCAGACAAATTTATTCAAAGATTATAAATATTCATGCTGCTGTTGAATCAAAGCACCAATAAAATTACCATAAATGCCGTAATATGTTGATACTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3R 10150287 5' - 1360 3374 1 75.34 AGTTGAGGTTTTTTGAAAAGTTGATATTACGATTTTGTGCTGCATACTTTCGGGCTCTAAAGTTTCCGAATGACTTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCG:1 - chr3R 11568694 5' - BS 5049 1 50.00 ATTAGCAATGTGGCTCGAGTGAGGTCGTTGGCGCGCTATAAATACGTGTCATGTCTGCCTTTCTTTGGACTCCAGGACTCCACCGCTCAGTGGCAACCCTTCTTCGACTTGGATTAAAAAGAAAAACTAAGTTAGTTCTAGGACAA:1 - chr3R 7453135 5' + HB 1377 1 77.40 TCTTATCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATAGGCTTTATTTTTTGTTTTCATCTGCACGAATATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCA:1 - chr3R 19446753 5' + F-element 68 1 56.16 ATGGTATACAGCTGAGCTAAATGCCAAAAACTAAGCTTTAAATAGTCGCTTCTAATTGTCAAAGTCAAATTACACTTTAATCGGCAATTGCCCAAAAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATATTATCAACAAAAAA:1 - chr2R 12993844 5' + FB 331 1 64.38 ATACACGTCCGTTCGTTAGCAATGATGAATAAATAGTGAGTTGAATGCTGAAAAATGTCTTTGTCTTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTC:1 - chr3R 443322 5' + flea 4807 2 54.79 ATGCATTTTAAATAATAAAAATGGATCATTTACATACATACATCATATTAAGTCAAATGACTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTGAAA:1 + chr4 410139 5' - 1360 249 1 52.05 AAATGTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chrX 1103726 5' - pogo 2057 1 53.24 CCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTA:1 + chr3L 18253815 5' + blood 91 2 79.45 CAGCAAAGAGCATGACAGATGTGCATGATATAGCGATGTGGCGGAGGAGAACGTAGGAGGAGTTTGTGGCACTGGATACGGGTATTATTTTTATGAAATGTAATTATTATTATATTTCATCATATTGCTA:1 - chr3L 8207725 5' + 1360 3104 1 62.31 AACAACACAAGGGTAACCTAGGCCAACTGGAAGCGTAGAGACTAAAAGCAAGGGATCTACACTGGCTTATAAACGTTCACTCTCCCGTAAGCTTGGAGTACAAAGTCCTCTTATATAACTCCGTTTT:1 + chr2R 15155829 5' + Doc3-element 4289 1 70.08 TTGCAGCTCCAGATTAGAAAGCTTAAGTCCCTGGTAAGAACACACATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chr3R 18205764 5' + 412 14 2 73.29 AAGCTATGAAGTCTTTCGCAAACTTTCCTCATACTTTGTATAAGCGCATTACCCTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTTTATTA:1 - chr3R 19448414 5' - F-element 4592 1 63.70 GGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr3R 18635302 5' + opus 7043 4 64.17 GCTTCGAAAAACATTTCAATTGAATAACATTTGCAGGCTCTTGGGAATACTTTTGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCTTT:1 + chrX 5970077 5' - Stalker2 7567 2 61.15 AGCGATTAATTTATTAATAAAAACGATATATCTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTG:1 - chr2L 7822280 5' - Juan 4128 1 76.03 GCTCTTAGTTTATTTATTTAGCACTATTTGCACCAGCAAATAAGCTGGAATTATGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr3R 25751796 5' + roo 67 2 66.21 GCTCGACGAGGTGTGCAGCGATTTCGAGCGGACGCTGGAGCGGACTTCCGTAAAGCGACGCAAGTCTCCCTATGGAACTGGATCCCTGTCCATGGATCGGAATAATCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCC:1 - chr2R 14910411 5' - 1360 79 1 71.03 CAAAGAACTCATTGAAACCAATTCCATGCACGCTACGCCGTTAAAGAAACCACAACGCGTACGACTACTTGCCCATAAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGCGCCCAAATTAGGAGACAAGCTC:1 + chr2R 16920118 5' + jockey 4612 1 39.69 ATCTAATAAAAAATAAAGGAATTTTCTCGTGTAAAGTGCAATAATAACAACAAGTCAGTGTTTATCGCCTACAGAACAAAGGTTTGCAGACCGACAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAA:1 + chr2R 5262473 5' + 1360 483 1 63.01 ATTCTCTAAGAGTTTCTCTCACTTTTCACGCTGCCATCTCTGTGTATAGGTAGCCCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr3R 24499589 5' - blood 331 2 57.14 ACTGTCTTATTATAGAAACCAACCCATTAATCGAATCGCTATGCGTTGCCAAACTACCTAGTATTTTCAATTTCAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTA:1 - chr3R 9583376 5' - Juan 4154 1 55.48 CCAGTTCTTAATCATACTAGTTCTAATAGTTAATTAGTCGACATTCTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 + chr2L 2494803 5' + Doc 43 1 56.16 CTAGAAACTGGATTTAGTTACCATTTTAAACTAATTTACCACAAACACGATATTATCCTTCATGGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTA:1 - chr2L 19140480 5' + Max-element 20 2 70.34 ACTTATGGAGTGTCACTTGCTTAACTGATAATCAAAGCAATACAAACTATGAAAGTTAAATGTATCTCAGCTTCGAACCCAAAACATTTCGATTCAGCAGATGTTTGTCCAAACCTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCGCTCCGC:1 - chr3R 17965986 5' - invader6 4840 2 78.87 CTCCACTTGCCACTTACCAGCGCCAGCTTTTCATTTTCCAAGCCCACAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACACAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chr2R 21439513 5' + jockey 82 1 65.07 GCTTTATGCTGAAAATATTCCACTGCATTGTGAAATTCAATTATGCTGATCGATGCAGTTTTTGATTGAAGCGTAACCTAATCAGGCATCGGGCTGTCCAACGTTTGTGCGCCAATTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCG:1 + chr3L 26503367 5' - Circe 7429 2 52.05 CGGGCGGACAGACAAACGGACAGGACCAGATTGGCTCGGCTATGGAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:1 + chrX 179844 5' - I-element 5278 1 67.81 TAGCAGGTAAGGAGGATTTAAGAGCCACCGCGATTAAACCCATTTGATTTTGCGCCAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3R 11870068 5' + pogo 50 1 60.29 GAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr2R 24284770 5' - roo 321 2 76.03 ACGTGAGTTTACAACGATTATTGTGGTGTTACCATATTAATTATTTTTCCTTAGATGGTGGCAATACTACTTACTCGACGTAGTTGCGGTTTATTTAATTTTACTTTACGTTAAGCCGACTAATCAAATCGGGACTCTCAACATCC:1 + chr2R 5548774 5' - Cr1a 4066 1 76.03 GGGAATTAAGTACATGAACCAGGTTATGAATCAGATTACGAAATTATTTACTGTAAAGAAAATATTTCGTATCAGTGAACTCTGTACCAAAATTTAAACCATCTTCAACTCGTTTTCATAACACGACTATATTTCGGGTGTTTTGT:1 + chr2L 12149135 5' - Burdock 14 2 71.92 AACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCGCGCT:1 - chr3R 6413619 5' - 1360 3308 1 77.37 GGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr2L 16331038 5' - roo 9004 2 66.44 GCTTCGTTGAGTGGCAACGGGAGGCGTTTTAGTGGGGTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3R 20934659 5' + 412 7084 2 57.81 AAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAG:1 + chr2L 5593128 5' - looper1 107 1 60.71 ATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTC:1 - chr2R 5206900 5' + G4 3766 1 60.00 GAAGATAGCCTCAAAATTAGTTTATTGCATTTTAAGTTTCAACGTAAACAAATTATGAGTTATTCGCAAATAGTGTAACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCAAATTAAGAAC:1 - chr2L 14969245 5' - 412 489 2 75.34 CTTCTCCTGCTCGGTAAGAGGTGCATTACCACGAAGTTTGTTCTGGTACCTGAAAACGAAATATTTGCAGCACGTTACAGCATTCCAACAGGGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3L 19999135 5' + 1360 26 1 67.81 ACATTGATGAGATCGAAGAAAATCGTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2L 7652157 5' + roo 27 2 60.27 AATATTAAAAATATGAAAACAGTTTTGTAAAAATGTGGGCGTGGTACGTCACTTTCACTTCACAATTTCCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAACCT:1 + chr4 857171 5' + Q-element 100 2 60.96 CTCGCTTTAAGCGATGTTTATCTCCGTCATAATATGCGCTGGGAATCACCTTAAAGTGATATTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr2R 25106030 5' + roo 8723 2 58.90 TATGAGTTTTTAATGTATAGCTATCCTCTTCTGGAAATTATAAGTATGCCTTTAAGTATTTTAGTTCTTATGGTTGAGCTGTCATAGAGGTTAGGCAAAAGTATATTTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 - chr3R 14954121 5' + jockey 4776 1 40.41 ATAATAGACTCCGCACAGCCAGACACTGGTGTTTTCCCCACCAAAAGGGAATGGGAATGGGTAACGAACTGGGCCGCACATGGGATGTTTGTTTATTTTTTTATACACTTTTGTATAAATGAATTATGAGGAAGGCATAATTACGT:1 - chrX 18465209 5' - Tom1 5 1 56.16 GTATTATACTTAAACTGTAACTGTTGTTTGGCCCATGTTTATCAATATTGAAGAAGCTATCGGCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2L 10514232 5' + 1360 15 1 68.57 TACTAGAAAGTATGCAGTGGAATTTTAACACCTCATTGCTCAGCCAGAAATAAGCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 + chr2L 13842280 5' + jockey 4687 1 54.74 GGCTTAGCGAAATGTTTGACTGGCATAGGTGATAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 + chr2L 22235209 5' + 1360 65 1 74.38 AAAATTAAAACACTACCTCTTTCCAGTTAACCGGCCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chr2R 17097540 5' + P-element 49 1 34.55 GTGTTTTGTTAATTCAGTATCCATTACAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACATTCG:1 + chrX 22915142 5' + BS 89 1 79.17 AAAATATAGATGGGCAAGTCACTTTGAAAGACCGTATTGCGATTATTATTTTTGCTACATATCATTATAAACGATGAATTTGTCTCCGACGTTCGCTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATATTTTTTTTTTTATAAACCAACAAACC:1 + chrX 21265907 5' + Quasimodo 7352 2 49.32 AATAACATGCATGAGTGTGCAATTTTTGCAGTTGCCAAGACCATCGTCAGTTCCTATCGCTCCAGCTCCGTCCTGCGGGAAATTGGCCGCAAGATGATGGTATGTAGAAACGAAAAGACAAATAAAACGTTTTATATTGGAATTAT:1 - chr3L 17080096 5' - FB 482 1 57.53 CTCATTATCATTTGCCATTTTCTGTTCTGTCTTTTTGTTACCATTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTGAAGGTGTAAAACTACTTGCTTATACTATTTATATACTTAGTATACTTATATACTACAC:1 - chrX 3107277 5' - Doc2-element 160 1 69.35 GAAAAGTTTATTCACTTTCCTGGCGAGGGGAAAAGGAAACCAAAATATCGCAGTACTCAGGCAGTTCCTGCCTGGTGCAGACCAATCCATACAATTTTAGTGGGTAGAGGACAGTACTGCTCCC:1 - chr2L 22095507 5' + HB 354 1 79.03 ATAATAGTTCCCCAGATAATTTATCTATGGGGTAAACTAAACATACGAGTACATTAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTCTGCAAAAGGTGATAGACGCTAAGGGAGGCTATATTTTTTATTAATTTAT:1 - chr2L 16849327 5' + Tc1-2 1362 1 62.76 AAATTGTTTCATAATAATACTGCAATTATACTAGGTAGTTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAG:1 + chr3R 9583307 5' + Juan 4109 1 71.92 TGATCTTTGAATTATCGCCCATAATTAACGAGACTGCTCTGGCCAGATATGATAATCGATTAGCCACAGCAAGGCTGCTAATCTTCTCGAATTTAGCATTAAACGGGCAATAAGCATATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTATCT:1 - chr3L 18962269 5' - Stalker3T 204 1 76.71 AATCATGTTGCACATGAACAAAATTGAACAGATTTTAAATATGTTTTCAAGTGTCATTATCTGTTGTCAAGACTGTTTGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 + chr2L 14501109 5' - 1360 3345 1 53.42 AAGCTACTCCTATATAAGATCCCAGGAAAATTTGCATATAAAAAAAATTAACAAAAAAGCACAGTCAAAATAAAGAGCATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGTCAAAACTCCCCTAATATGAAAATTCGTTTCTTCGATCAGAA:1 + chr2R 25141489 5' + 1360 3164 1 52.05 ATCTAATCGAACTTCAATTGCCACAGGTCAACGACTACCTGATGATTTCAAGTGCCGGGGATTTAATCTATTCCGAGTATATGCTTAAATTTATTTTAATAGTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - chr3R 31483780 5' + I-element 19 1 71.92 CATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr2L 21153472 5' + 1360 55 1 54.79 GACTGGGATTGCTATAGAGGTCTTCGAGAGAGCCTGAAACCAGCTTTTTAGCCAGCACGAAGAAATCGTGTGCAAAATATCGAAGGGCGTTACCCATCTTGTTATTCGA:1 + chr3L 23250444 5' + 1360 3379 2 68.81 AACCGACCGACATAAATGAAAATGGGCTTCTGAAAGTTCCTGCCATCTTATACCACGCCATCTTATATGGATGAAATTGAAGATCATCATGCAAAATTCCGAAATGCACGCTGTGTTTTAATAACCGAACATCCGCTTGAAAAGTA:1 - chr2R 7394677 5' - mariner2 176 1 60.27 TATATTTATTCACGTTTAAAGAGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGCTTTCTATATTATAAGTTTTTATTTCAGCATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr3R 15054259 5' + 297 6598 2 70.55 GGGTTTCTCGTAACAATAATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3L 14375704 5' + roo 75 2 72.60 TTCCATATCGCAACCGAAACTGACTAAGCATATATCTTCTCTCCAAAAGCTTTCGATGGATCGCTTTATTTAGTTCTCCCCCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chr3L 2192372 5' + jockey 4716 1 52.41 GCGACCAAGAGGTGAATCCGATTTAATTAAATAGAAAAATGTTTTGTTGTTTACTCGGCTGATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGA:1 + chr3R 13437529 5' - hopper 1347 1 58.22 GTCGGCAGAATGCATGTGCCAATTGAATGGCAGGAAAATGCTGGAAAAAAAACAGGCAACAGGACTGGGTTACTCATTCCGGCAATCTTGAGTAGACTCCAAAATCTAACTCCTGAGTTTCACTACACGTTTCTCCTTTAGGCAGC:1 - chr2L 4146897 5' - 1731 362 1 54.11 TTGCGATTTAAGGATTGGCCAAATGGTCTTGTCGTCGCGGAATGTGTAAGGCGTAGTCTGGAGAACTGAGTGGGTGGCATATCGCTGTCGGCAGGAGTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCAGAAAG:1 - chr2L 9642613 5' + 1360 3299 1 75.19 CAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTA:1 - chr3R 31141030 5' + Burdock 6222 2 78.08 CAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAACACTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1 - chr2R 18014103 5' + Doc 73 1 68.80 CTAATCAGTGTTGAAATGGCTTTTCTTGTTGTGCGTTTAACACTCACCACCCACCGCATAGGCCGCAGAGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGCGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr2L 12486484 5' + roo 8663 1 81.38 GGGGCAGTGGTGCAGGACTCGAATGAATGGCAAAGTCAGAGTTGGAGTTTGGGGTGGATTTTGCATTTTGGCTGTTGGTCTTTTTTCAACTTAAGACTGATTTCAAATGTGAGTGAGATTGAGGAGGGGCCTTTATGGGTAACAGA:1 - chr3L 1046586 5' - McClintock 227 2 58.90 GGCGTTCGGTTCGTTGTATCTTTCAGTTTCAGTGCTGCGGTATCTGTTTAGTTTATCTTTTGCTTTGCCAATTATTTTTAAAATATCCATTAGATACGTTACAAATTTTTTTATTTTAATTGAAAATCATTGTACTATTTAAGTTT:1 - chr2L 1928101 5' + Tc1 1550 1 54.11 CTGCTGTCCATTTTGACGTCATGATTGATGTCCTATGCTGGCGACAGTCAATTATCGTCAATCACTGGGCTACAAAACATCCAGAGCAGCAGCCCAGAGGTACCTCACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAG:1 - chr3R 27810167 5' + Burdock 12 2 77.40 CCATTTAGCAACGTTGTCATTTCTCTTGTTTCGTAACGTTGATTTCATTTTATTGTTGCCCGTTTGCCACTCCAACTTCACCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 - chr2R 20447920 5' + hopper 39 1 58.22 AGGCACAAAAAATCAAATAAATATTTTAGCTTGGAAACATTTTCCAGCATTTTCCTCACTCCTTGTCCAGGTTTCTGATATGTACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATC:2 - chrX 887426 5' - Quasimodo 7336 2 60.96 CGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 - chr2L 22319334 5' - Transpac 5172 2 76.15 TGGGCGGTACCTGTTGAGTGCATAGCGATTCGCTGGACGGTCATCAGGCTTATGTGGCATATAATTTTTTTATTTGGTCCGTTTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAG:1 - chr2L 21778269 5' + Tirant 405 1 61.19 AACTGCCGAAGATAATGGCTTCGATAGAATATTCCCCCCCTCCCCCACTCCATAACTAGATATAAATGTATCTAAACGTACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 + chr3R 25713996 5' - flea 5002 2 67.23 ATAAGACACATACAAATTGCAAACTACAAGCAAATAAATATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATACATATACATGTGTATGCAGAAGGCATACATATGTTATGTA:1 - chr2L 16705064 5' - Stalker2 227 2 73.79 GAGGGAAAAATAAATACCAAATATGTAGATGGAGTATACAAATAACACCTATGATTCGTAGGGCCAAAATTATAAAAGTATCTGTTTTTACGATGAAGCGCAATGTCAGCATTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCGGAAGACGGGCTAC:1 + chr3R 19830482 5' + gypsy4 163 2 63.70 AATGCGCCAAATAAAACTATTTATGAAATGCCAATGAAGAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATA:1 - chr3R 15152701 5' - opus 420 2 72.60 TTTTGAGTCGCAGCAAAATGAATCGGTATAAAATTGACGATTTCATATGCATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGACATC:1 - chr2R 5438298 5' + flea 4814 2 64.62 ACCACCTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 - chr3R 18635309 5' + opus 141 4 56.52 AAGTATTATAGCAGGGTTTTATTGGTCAAGCTCATTTTTATCGGTTAAAAAAATGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTCTTTGTCTGAGCTT:1 - chr2R 5433991 5' + Transpac 4980 2 60.96 CGCTTTGTTTGCTTTAGTTTCAATTTTGTGTGCTAGTTAACGTCAGTCTTAGTGAGCGGCCAGGTTTCCGGCTGCTGGCGAGGATTAAACATTGATTCGAGCCTGTTTTCTAAATAAATATAAATACATTAAATCGCAATCGGTTG:1 + chr3L 22345622 5' + diver2 462 1 76.03 CAAAACATCCAGAGCAGCAGCCCAGAGGTACCTCACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTAC:1 - chr3R 27810095 5' + Burdock 56 2 70.34 GTGGGCCAGCGTTTCGCTGCTGCTCGGACTCGGTTTGGGCCAACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGCATGCTTGCAATAAGTGC:1 - chrX 19887138 5' - P-element 2838 1 40.00 AAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATTTTACTTCCCTCCCTTTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCC:1 - chr2R 6271506 5' - rover 6920 1 76.71 GTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCG:1 - chrY 3648876 5' - Stalker4 181 4 74.36 GATTATAATATTAAATTGTCTTTTTTGGAATATTTTTGGAAAATCACATAATTCAACACTCTTAAGGCCTCAGTAAGTCGATAGAAATTTACAAGACCAATAAAAAATTGCGAAAAAATATCAACTCATTTTTCGAAAGTGTGGGC:1 - chr3R 3752432 5' - INE-1 256 1 51.37 CGTCTCTCGCTTTAAGCGATGTTTATCTCCGTCATAATATGCGCTGGGAATCACCTTAAAGTGATATTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:2 + chr2R 25106025 5' + roo 54 2 55.48 ACCTGCCACGCATGGAACAAGGATCGAACCCGTAAGTGCTACCCAAATTACTCATCCGGCAGCGGAAGTTAATCTTTACAATTTACTAAGGCATTCTATGATTTGGCGTATTGCTGTTGCTATGTGGTAATATATGTGTGTGTG:1 - chr2L 13829355 5' - Quasimodo 44 2 61.11 AGTGTCTTATAATTAATTTTAGGGACTTTAGATAGGCCCAAATAAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1 - chr2R 21844025 5' + pogo 71 1 67.81 GTTTCTCTCACTTTTCACGCTGCCATCTCTGTGTATAGGTAGCCCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGAGTTTTC:1 - chr3R 24499578 5' - blood 355 2 50.55 CTTCTCTTATGTTCTAGGGAAGCCAAATATACACATAAATAACCTCAAACAAGGACGTTCGGTGAGAAACTTTCGCTGCGTCTTTGTCTTTAGATTCTGTACGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTTTAGTTCCTGAGATCTCG:1 + chr2L 180603 5' - INE-1 147 1 54.48 CAGCTCGTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGTGCAGTGTGTGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATC:1 + chr2L 4420509 5' + gypsy5 6992 2 59.06 TGGTACGGGGAATCAATAAACAGTCGGAGGGACGGAGCAAGGGAGTGAAGTTGAATGCCGAAAGAGAGCGAGAAAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGTTCTTTTTTACGCATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACA:1 - chr3R 30563721 5' + 1360 167 1 57.24 CATCTTTTTCACAATTTTCATCATTGCTACATCATTTTCATTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 + chr2R 5237707 5' + Doc 37 1 48.63 GTAGATAGACTATATTATTCTTAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGCAGATGCATACGATCATATCCCTGTTTGGAATAAGCACATCATTGCTATCTCGC:1 + chr2L 5890512 5' + invader3 85 2 75.19 CAAAGAACTCATTGAAACCAATTCCATGCACGCTACGCCGTTAAAGAAACCACAACGCGTACGAGTACTTGCCCATAAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAATATCGCCCAA:1 + chr2R 16920118 5' + jockey 4627 1 45.89 TTTCAGGTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCA:1 + chr2L 21643016 5' - Tabor 7275 2 50.00 CAGTCTGCCACATAAAAACGCGCTCTCTCATTCAATCATTCTCAATGTCTGTCAGTACATGTCTTCGTCCCTGTCCGTCCGTTTGTCCTTGCGTCTCCTTTTTGCAGAGCAACAAGGACGTCCTATTGTTATTAATATTGTTATTT:1 + chr3R 30312247 5' - mdg1 18 2 65.75 ATAGCAATTATCGAATTCAATGGGATGGTGACAATGACATTTTGCATATTCTAATTAAGGAACTAATGGAAGAAGAGATCGTCTGGAAGGGCTTGCACCTGATATTTCTTTGGTATGATTATTATTGTTATTATTT:1 - chr3R 30187859 5' - mdg1 27 4 77.21 CAGTCATGATTCAATGCCAATTTGACACTTGTGAGGAGTTTGAGATGGCGGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chr2R 23212603 5' + Tirant 53 2 59.69 GAATAATATCCGGCCATTTTTCTACCCTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACG:1 + chr2L 18630432 5' + G-element 29 1 64.96 CTCTCTGCGCTGCCGAAGACTCGCACTCACACAATCGTCCATTAAGCCTACCATCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAA:1 + chr3L 9469153 5' - hopper 1345 1 62.33 AATAAGCTTTGAAGTATGAAAATATAAACAATTAAGAATCTTAAAAACGGGAAATGAAGCTTAGGAGTAGGAAAACAGAGTTGTGTTATTTTATAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTG:1 - 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297 6898 2 78.36 TATGTAAGTTCTCCGAAGTTAATTATTATCGCAGAGATTGCTATATTCGCGACTATTGGATGTACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTAGACACC:1 - chr2R 6164649 5' + Tc1-2 7 1 67.83 CACTTCTCTCTCAAAACCAACCCTAGTAAAAGCGGGAGAGCCGAAGCGAAGGAAGCTAAAGGGTAACAAAATCCGGAAGCAGAACTTTAAAAATCAAGTTATCAATCTAATAATGAAGAAGAAAAAGTGGAAGAGGGAGACGAATT:1 - chr2L 3426954 5' + transib4 2208 1 53.42 GTATTTGGTGTGCGTGAAATGGGTTGAATGGAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 - chr3L 15364911 5' - 1360 3331 1 56.85 GCAACTCTCAGCGATCTTCGCATCGGATGTAATACTGTGAGCACCGAGAGAGAGAGAGAGAGAACTTGTATTCGAATCCCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAG:1 - chr2R 18611899 5' + P-element 20 1 66.67 ATCATGTCTACTTTATCTTGATAATTGCCTTTTTTTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 + chr2R 13046508 5' + 412 7135 2 74.65 GTTGTTTTGAGGTTTCATTATTTTTTTGACTTCAGTTACTTTTGGTGGGAATAACGAATTCGGCAGCGGATGTTAATGCTTACATTAGG:1 - chrY 519058 5' - Quasimodo 6900 2 61.80 AATACTTGTTTAGAATTTCAATAATTAAAATGGGTTAAGGAGTAATGTTTCTGATTTAAGCTTAAATACACTGTTTTCATTAACAGAAAAAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr2L 19691366 5' + roo 8672 2 74.19 AACATTCACACACTCGCTGAAAGATTGTGTCGCATGCAAACGCGATTTTTGTTTTCAGTTCTCGGTTTTTTTTTTTGTTGGACCA:1 - chr3L 8753713 5' + Tc1 1474 1 77.65 CAGTAAGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 - chr2R 8688160 5' + F-element 66 1 64.29 GAAGTTGAAGAAAGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chrX 4400310 5' - roo 8999 2 69.18 ATTGCGTGTAGTTGCAACGAATGACTTTAATTAAAGTTTGCTTTTATGACACGAATGCAAGTGTTATTTATTTCCCACTCGGATTTAATGGCTAAGGAAACATTTCTCAACATCACCACCAATAAGCTTACAAATAAAGACTTATC:1 + chr2L 18550469 5' - Cr1a 4035 1 68.49 GGGACAACCGCAATTGATAAACCAATTATGCAGGATGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAT:1 - 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chr3R 23161343 5' - 412 7468 2 74.47 AATTGTATCCATTCTGTTTATGCATTTGACGAGCTCTGAAAAGGAAAATTGTCGAAATTGATTGATTAAATATTTATTCATACGGAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAAT:1 + chr3L 14694006 5' + Doc 147 1 62.33 ATAGGTTTTTTCTTATTTTATTCCATACTATTTTTATATTTTCCTTTTCTTTGCAGAAAGGTCAGGTTGCTGTATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATAGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGC:1 - chr3L 6435807 5' - F-element 4237 1 53.42 AAGTTCAATTAAGTGCATTGTTTATGGATGTTTGAGAAAGTTATCCGACAGATGACTCAGTGAAGCAGCCACATCACGTGATATCATGTCACGTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 - chr3L 1856817 5' - Transpac 290 2 57.14 ACAAGGGAGGACGAAGGAGCTCAATAGGTTTAATTTAGTTCTTGGCCAGTTTACAGTTGTAACCCGAAAGAAGTCAGGGTATGTGTTGACAATCGGAGGATAAAGTATATATATATATGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTG:1 - chr2L 1873698 5' + INE-1 98 1 54.11 GCTAAAAACTTCTCTACCCAGGAGTATGTTGTCTAATTTTGTAGCACAGTGTTGGCTGACACACACACACAGTTATCTGCTTAGAAATGCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr2R 7982329 5' + P-element 30 1 65.52 GAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 + chr2R 5237762 5' + Doc 68 1 72.09 TATATTTAACGCTGAGAAAATTCAATCATATTCCAATTAATTCATTTTCACATCAGCGGAAATAACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3L 4641000 5' + jockey 64 1 56.55 GGACATACGGATGCATTTTGAAATTTTGTATAATTCCTGCAAAAAGAATACTATTTTACATGCAAGGAAAAGCAGGTTGTTAATGTAATACTAACACTAATAAAAATATAAAAAAAATATCAAAACAGTTTTCAAAAGTGTGGGCT:1 + chr2L 23016055 5' - 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chr3L 14858880 5' - INE-1 565 1 53.42 AATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGA:2 + chr2R 11095743 5' + diver 65 2 58.90 CGACGAGTGTTTGTTAGCCATTAAGTAGTTCCATAGCCATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3R 13225440 5' + hobo 19 1 72.60 ACTTTAGATTAGCCAAGGGATTGGGTGGCCAGCAGCAGGATGATCCGGCTCTTCGTCACGTTGCTCTACTTCCTGCTGACCAGTTCGTCCATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCG:1 - chr2R 13128956 5' + 297 6914 2 64.29 TTCCGCTACGTAATTTAATTAGACGAAGAAATATTCAGTATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACAT:1 - chr2R 5045697 5' + invader6 4527 2 60.96 CGTCCGTTAAGTTTTGGGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTT:1 - chr3R 5422962 5' - roo 9036 1 54.96 CTAAGCAATGGGCACTTAAACAGACTTTAAGCGCTTTTATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAG:1 - 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chr2R 8688156 5' + F-element 90 1 71.92 ACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCAGGAAGACGGCAACTGGAACACCGC:1 - chr3L 18183169 5' + Tirant 8172 2 76.15 TAATTGAAACTCCGGACTGATTGGGATCTTAAACCAAAACAAATCTCTTTGAATGGCCAGCAATTCTAAAGGCGATGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chrX 6632929 5' + P-element 47 1 53.42 CGCTGTTGTATTCGAAAGAGCAAAGTTTCGAACTAAGGGATTACAGTGAACTTCAGCTAAAATGATTTAAGACGATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGC:1 + chr2L 19140327 5' - Max-element 8513 2 62.50 TATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr2R 11164421 5' - roo 330 2 71.92 TTAAGGTATACTTTTAGACTGTCCTAAAGTATATGCTACATATACCATGATATGCTACATATCTATGATACATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr2R 17169310 5' + hobo 50 1 53.42 GTAAAGAAATGCACTTACAATCCATCTATCATAACTTTCCTTTTGATTAAGCTTATTAAATGTATCTCAAGTTGAAAAATGTAGAAGTTAGCTAAGACCATGACCGATCATAATTCAGTTCTATTTTTAGAAAGTACCGTTAGCTT:1 - chr3L 15530075 5' - Transib5 121 1 69.18 CTAATGTTTTCATTTTCATCATCCATAGCTTTCTACTGGGCTTTGGATTCACGAAACTAGCCTGTTAAATTTAGCACGTGCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr2R 5754620 5' - P-element 2852 1 62.86 AGTGTTGGTAACTGAGTGGTTGCTTATGTGTGCGTGTGTTTCTGAGTGCGTGTGTTTGTGTGTGGTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr2R 23671770 5' + hobo 45 1 51.11 AAACGAGCCAAGACATCGAAAGGCATCACGTGCCCAGGAGTCGGTTCCTCCTCGCTCCATCCCAGTGTAATGCGGGGCCAAGAAACAAAAAAAAAAACCACGTGTATTCTAACATAAC:1 - chrX 19130264 5' - Transpac 39 2 75.42 AACGATTGTATTAATCAGAGGAGGAGAGGCCTCTACATACATATATAAACCATCTGGTGCGATTCAAGTAAATCAAATAATTGTAGCTTGTATAACTCTAACGAACACACTCATA:1 + chr3R 14014861 5' - Circe 223 1 73.04 ATCTTAGAATTATTGTTATTATATACACTTATTGAATAAAATCCATTTATAATTTTTGAGTAGAAACTCCAATTTTTAACTCCATGCTGACCCGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAA:1 + chr3L 23082125 5' - 1360 3190 1 63.01 CGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chr2L 12291934 5' + Tirant 8150 2 60.00 CAAATTTGGTATATAGAATAAGTTAACATATTTTTATTATCTAACTAGCCAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTTTACCAAATATGGACTGTTTCAATGCAGCTTGTAACCAAC:1 - chr3R 6816774 5' + Juan 464 1 65.75 TAGACAACCATGAATATTGCTCGTAAAATCTACATTTTTGATATTCCTCGAAGGAACTCAAGTCGGACGCATTATTTCTTGTGAAAATGGGGGAGTTGGCGTAGAAATTGCTGATGTGGTAACTCGTGTACTGTAAGATTGGAAGA:1 + chr2L 9459292 5' - jockey2 61 1 58.22 ATGCTTTTGAAATTTTTCAGATCAAGTATGCCTGGAGTCGGAATGTCATATCCCTAGCTGGACCCATTTGTTCAGTTGTGCCAGAGACACCTACCCACATAGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTA:1 + chrX 894400 5' + hopper 430 1 74.62 ACAGTCATTAAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3R 21674910 5' - roo 9008 2 62.33 ATTGCCATTTTACTGCACTTCCCATTCGTATGCGTTAGTATGCGTGTGTGTGAGCTGCATTGTTTGCATTTCAAATTGAATTCCTTTACATTTTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:2 - chrX 19788919 5' + hobo 27 1 67.12 AGTGACGCGGCTGCAGGACGCCTCCTTGAGTTTTTCCTTTGACAATTTCTCTCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTT:1 + chrX 15559483 5' + hopper 68 1 63.01 GAACGATAAGATTGTAAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCT:1 - chr3L 27415349 5' + transib2 18 1 71.53 GGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAA:2 + chr2R 10910200 5' - Tabor 432 2 53.42 ACTCAACGGCGTGCGCCTTCTTTATTATTATCTACCTCTCCTTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACCTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTG:1 - chr2L 19144030 5' - F-element 448 1 61.95 TAGCTGCTTGCTGTACTTTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAAAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAC:1 + chr3L 14944533 5' + G5 4786 1 50.68 AATAAATAAGCAAAACATGAAAAAAAGAAAAGTTGTAACCTAGCGACTAACAGACCACTGTGCACGAAAACACAAAATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACTGCGAACAACGCACAAAAAAGGGAGAGGAAACAAAAAA:1 + chr3L 25929322 5' - Cr1a 209 1 66.44 ACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr2L 7652184 5' + roo 46 2 53.62 TGATCATTTTGTTATAATAAATACGGCTGCACCTGTCACAATGCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - chr3R 17047890 5' + 412 7132 2 69.18 GGTTGCCTTAGCCAGCTGCCTTTGAATCATAAACAATATGAGGAAACCAACGGGGCACTGCCGACTTCGCATTTGCATAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATAT:1 - chr2L 14222952 5' + baggins 5222 1 66.44 ATAGGGTAAATGTGAAATTAAAAAAAAAAACACTCAGAACTAAAATAGAACGCCATAGCAAAACTTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1 - chr2L 21698349 5' - 297 6924 2 58.22 GCTGTCTGTGGGACTGTTCGTGTTTTTGGTCATCTGCTGTCGCCGGGTACTCCTGTTGTCTACGAATGTTTTATTATTAAGGGGATGTCGTTAATGAATAAGGTAAAAAGAAGCGGACCAAGATGGCTCCCTTTTGG:1 - chr2R 13142295 5' - Q-element 490 2 54.74 CACGTGGGTGCTTTGTATTATGCATACACTTGGGCTTGACTGTATATGTACACATTGTAACGGAATGCTACAATGTGCTTGTATGTTAGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 - chr3R 3181163 5' - 297 372 2 71.92 GAGTGTGGCAGAATGTCAGTCTTTGCTAGAATAGTAAGCTTGTCATATTTATGATTTTAATTCTTTGTGAAGAGAGATTGGGTCAGTTAGTGATCGATCGTTGAGCAGAACAGACATGTCTCGCTCACGCGCCAGAAA:1 + chr2L 21646792 5' + invader1 3947 2 57.97 AAGTACAATCCAAGGCCTTGCATTGCGTGGCGTTGTTTGTATGAAGATTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATAAAGTTTATTGTCAGA:1 + chr3L 6661824 5' - Tirant 259 2 71.92 GTTATTGTTTTGTATAATGATCGTAGAGTAGTGGGTAAAAGTAAAACAAAAAGGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCT:1 + chr3R 24603070 5' + I-element 70 1 62.33 GCGTGGCACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1 - chr2R 10910319 5' + Tabor 41 2 51.47 GCGGTCAAAATAATAGGAGCAAAAATATATTCAGTATGATTTTGCTGGGCTACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTA:1 - chr3R 17492895 5' + jockey 4826 1 61.64 CCATTACCATTATGCATTTGTTTATTCCTCTTCGTTTTCTTCGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGCGAAGATATGATGTGTACATGTAT:1 - chr2L 13629149 5' - Tirant 8470 2 56.73 ATAAATGTTATTTTCCCATGCTAAAGTGTTAGATAGAAAAAACTTATGTAAGCTTAAGAAATATAAAATAAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCAC:1 - chr2R 5023363 5' + rover 6996 2 55.48 GTTTATGGATGTTTGAGAAAGTTATCCGACAGATGACTCAGTGAAGCAGCCACATCACGTGATATCATGTCACGTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 - 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chr3L 15364905 5' - 1360 3327 1 61.81 ATGGTGGGGTTAAAGCCAAGTTTATGCAGTGCGAATCTAATAGAGCTCAAAAGCACGTTGTTGCATCCTCATAGTGAATAATGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 25862551 5' - roo 9034 1 59.59 GATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAA:1 + chr2L 9275020 5' + F-element 90 1 78.20 AAAGGCCCAGCATGAATTTCAGTCGAAAGTATCTATCTATGTATATATGTAGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 + chr3R 8849765 5' - 297 6932 2 65.85 GTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr2R 11164503 5' + roo 8726 2 64.83 CTTTCTACTGGGCTTTGGATTCACGAAACTAGCCTGTTAAATTTAGCACGTGCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGT:1 - chr2R 5754592 5' - P-element 2834 1 47.69 TGGTAAGTACAATTAAGTCAGTTTGCTTTAATAAAGCGATGATATTGTAGTTCATTAACCCACTGATAGTATAAGTAATAAGTACTTAGTTATTAAACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2L 19691196 5' - roo 386 2 67.81 CATAAATATAAGCACCCAACAGAACACATTGTGAACAGTTGAATAAAGAACCTCATAAAGAGCAGAAGCTCTTCTCTTGTCATAATTTAATTATCTAGCACATTTTATCGATGTATAAATTATTTAAAGATTAATCGCACCGTCTT:1 + chrY 3648878 5' - Gypsy6A_LTR 392 1 58.22 CCTTACCAACCAAATATATCCATACCAAATATGAAACGCAGATCAACAACCACTAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCATCAAACAGATGTCATCTGCACTGATTTTAGTAAAGCAATTG:1 - chr3R 8040200 5' + Q-element 313 2 78.62 GTCGACGGTGTCGCCGTCTCTCGCTTTAAGCGATGTTTATCTCCGTCATAATATGCGCTGGGAATCACCTTAAAGTGATATTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2R 25106011 5' + roo 8703 2 58.62 GTTCGTTGTGTTAATTTCCCCTTTTATGTTGTACTCCGACGTGTTGTGGGCAATGGTAAACTTGTCCCGGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAG:1 - chr2R 25169978 5' - Doc2-element 374 1 62.83 ATAAAGGCCATGAACCAAATCTAAATATATATATTTTAACAGTCTTTCATTTAGAACAAACCCTTTTTTGGTAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 21674802 5' + roo 46 2 49.32 AACCATGGCATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chr2L 12291840 5' - Tirant 8481 2 57.41 CTAGTTTTGCTTTGTCCACCAATCTCGTTGACATTGAAAGCAATACAGAGCACAGCGTAGAGTGGAAATTGCTGTAATTATGCCAAATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 - chrX 10047429 5' + I-element 35 1 60.27 TTCCTTTATGCGGATTAATTTCCAAATATTTAGTGGCCTTAAAGGATTAGGTATGTATAATCAGTCATAACCATACCTCATATATGTAATAAATATTAAATAGTAAGGTTATAACTTATATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 - chr3R 11482040 5' - BS 5085 1 70.55 GGACACATGTCTGGTGGAAAGTTAATTTTCCCCTTCGCAAGGTCGATTATCAATCAACATTTTCCACCATGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAA:1 - chr3R 23235345 5' + BS 22 1 63.70 AACTCAAGATTTGATGCATGTTAATACAATATTATGATGTACAGTTGTGGTAACAATAATAGCACCATAACGCATTTCGTGTTTGTCCCACCGATTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATAATTTTACTCACCAAACTTAAATACT:1 - chrX 22900323 5' - Tc1 1559 1 68.49 AACACAAAGAACAGAAAAACGAAATTAGTTGAGCTTAGCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAA:1 - chr3R 7778331 5' + transib2 81 1 72.60 ATAGGAAACTGGATGATCTACAAAACCTATGAAATCATCGAGAAGAACATCCTATGACATCAGCTAAATCTTTAAAACGATTGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr3L 25607242 5' + 412 39 2 58.90 ACCAATTCCAGGTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 + chr2L 21643011 5' - Tabor 442 2 55.17 ACGCATCGATGTTATTATTGAGTTTATAAGTCGTTAAGTACCATCACTACTGAATCATTGTCCTGTCATCACTATCACTATCATCACTAATGAAGAATCAGAACAAAGAAGTAAAAGATTAGTAAAATACCCGTTACTCATCTAGT:1 + chr3L 27980710 5' - INE-1 542 1 75.34 GAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr2L 22719605 5' + 1360 56 1 79.25 ATATGTATGCAGATATAGAGAGATAAAGAACAAAGATAAACATATTTACGCTAAGATGATTCTTTTTTTAGATTCACAAAAAGAATTCAAATTATGAATACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGC:1 + chrX 4200273 5' + roo 8627 1 46.90 ACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 + chr3R 23161286 5' + 412 83 2 73.97 CTTTGGCCAATAGCAAACCACTTAAATTCATTTTAATTCAAGTGAATAGCAAACCGACCTCTTTCCACATCCTTTGCCATATAGCCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGA:1 + chr2R 21748213 5' + 1360 33 1 59.03 TCCTTATGATCTCATATATCAATACCAAGAAGGCTGAAGTTACTAAATACAATAGAAGCGTTTATTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1 - chr3R 18153660 5' - copia 199 2 56.85 ACAGGGAGTTTAGCGAAAACTGTTTCAGAATATAACAAACTCACTCAAAATAAATATATATATATGTATGGAAATGTAGCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2L 17380736 5' + hobo 42 1 56.85 TAGATCCTTTATCAAATTATCACCAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr3R 14278007 5' - P-element 2855 1 63.70 ATATACAAACGAATGTACACACACACACACAC:1 + chr2L 12567073 5' + accord 7025 2 78.12 GTGTAGTCCTCGGACGAAATCCGAACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTGTAAATA:1 - chr2L 3231965 5' - roo 9010 2 54.11 AACAATAAGATTGAGATTCAGAAAATAAGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr3R 7507131 5' + Doc 57 1 57.53 GATTTTTAATAAACATAAATATATTGATAAATTATATGTTTATTATATTTAACGCTGAGAAAATTCAATCATATTCCAATTAATTCATTTTCACATCAGCGGAAATAACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3L 4640957 5' + jockey 21 1 69.18 TAAACGTTACAACTTAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACCGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 14375567 5' - roo 399 1 74.66 CTTGCAGTCTAGGCGCCAACTAATGGTGTGCTTGTAGGCCTTGACGTACACATACACAAGCTCCTAACAAGTTTTTTTCCACCTTACCTCCTTGTATAGCGCCACTAAGGGACTATTTTAGGAG:1 + chr2L 80774 5' - roo 191 2 79.84 TAGGAAGATTGATTTCAAAAGCGCGGAAAATTTTCCCAATAGCACCTTTTGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 + chr2L 14969031 5' + 412 5 2 74.66 ATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr3L 3453620 5' + Tirant 37 2 61.39 ATGTATTAAATTTTCAAAACTACTTTATGCAGAATGTTGCATATTTTGATCTGAGCTTGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 + chr3R 2649171 5' + 412 7117 2 60.96 CAAAATGAAATGGATCCGTGTTTTGACGGTGGATGGATTTGATTTACACAGCAATTAACCGCAGGGGAGGTATGGTGGGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGAACGGATGTATAGTCTACCAGTGGG:1 + chr3L 419192 5' - Idefix 177 2 60.45 GCAGACAGTTGGGCTGTACGAGTAGCAGCATCCACATCCGCAGACGACCATATAAATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr3R 13437299 5' + hopper 8 2 80.14 GTGTTTAGTGTGTGACAAAAGACGAAGAGAAAACTTGGACCGAGTGCATAGAAGGGCGAATACTTTTGAAGACTGGTTACGAAGTTGGATTATTGGATATGATATCCAAAAAATTTACGAATGATGAAAAATATATTGTTAAAAAA:1 - chr2L 12188820 5' - hopper 165 1 78.08 TGCTTAATAAATTATTGAAATACCATCTAATTTCACCAGTTTTTAATATTTTTAATATTCATTATTGGTATTTCACATAACCAGCCAATGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCA:1 - chrX 12104168 5' + Stalker2 7424 2 52.05 GATTAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTCTTAAACGAGTGTTATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACAAGTTAACTCTAAAATCTTTATTTTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTT:2 + chr3L 24039754 5' + springer 7307 4 52.05 AATCATGCTTAATGTGGCATTTGTATGTTTATTTTTTTATTTTTATACATTTTCCTTCTACGCTTTTCGCAGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTT:1 + chr3R 7593732 5' - Doc 4461 1 61.67 CTGACGATTTTACCTCGTGTTCGCTTATTGACATTTCTAGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chr3R 16276294 5' + pogo 27 1 66.90 GTTGAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr2L 5792084 5' + blood 7075 2 60.00 GAATCAAGCTTAAGTATTTAACATAAAAAAAAGAAGATTTTTTTTATTAATCTTTAGCTAAAGGAATTTATCAGTCTGAATCCCAAATTCAGTAATTCCCCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAA:1 + chr3R 19482321 5' + jockey 4628 1 58.90 AATTTCAAGTGCCAATGAATATACTAATTGTACGCTGTCAATTGAGGCTTTTTAAATATTTATGAGCATAGAACCAATAAATAAGAAATCTTATTTCAACGCCAAACCTAACAAAAGTGTCTGAATTTCATCATATTGCTACGAAA:1 - chr2R 23584210 5' + 1360 3109 1 76.03 CATTCGCAGTCAGTCAGATAGTCAAGTGAATTTAATTTTCCACACGAATGCGGCGATGCTCGCAGCGCCAGCGAAAGAGATGGCTGCTGGCGAATGGAAAGAGACGGCGTAAGATCAATTGAACATTTGTTCTTTATAACGTGTTA:1 + chrX 9410231 5' + Tc1-2 298 1 71.92 TTCTGCGGTTGAGGTGTAAAAAAGTCGAGCAGTTTGTTTGAGGGTCGGTGAATTACCTTAGAATTATTTGGTACACATAGTCTCTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACA:1 + chrX 20685850 5' + Ivk 5237 1 52.63 CTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3L 19031239 5' - roo 8997 2 65.75 GCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr2R 17332192 5' + jockey 73 1 75.42 ATTTAAATCAGGTGAATATTAGAATAATCCACATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:2 + chr3L 17537718 5' + Doc 46 1 56.16 GCAATATTAATATATTATTATCAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTTC:1 - chr3R 17586890 5' + Max-element 48 2 76.60 GTACGCTCATATTTTACACAAGATATGGGCGTGTCGTTTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATA:1 - chr3R 14912018 5' + Stalker4 7042 4 74.66 CTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTC:1 + chr3R 28406372 5' - opus 7420 2 78.77 CTCCATGGCTGAAATCTCCAGCGCTCGCACACAATTCGCAACCAGATTCTTGCCCCAAATCAAACGGGCTGTATCCCTCAAATAGGAGATTTTCAAAAAAAATAATTGTTAAAACAAAAAAAACCTTCAAATCTAGGCGGTAACAA:1 - chrX 6971610 5' - Tc1 1453 1 60.96 CATACCCCCAGGCGGCAAGCTGTGCAGCAAACACTATTTTGTGGACTGCGACGGGGCGTGGCTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAA:1 - chr2L 795157 5' - jockey 4984 1 70.45 CATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chrX 13484932 5' + Doc 18 1 70.91 GTCTTAATCATCCTCTGCAGATGTCAAATGATGTATACACTTGGTGCATGGTAATGGATTACCAACTAAGTAGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAGAACTTAAGAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr2L 1090931 5' + 412 7115 2 47.26 AGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAA:1 - chr2L 21910212 5' + Doc 87 1 78.62 AATTATAATGAAATGTTTTTATTTTCTCGACCTCCGAACTTTTATTTGTTCATATATGCGCGTGTGTGTGCGAGCACACTGGCAGCTGACATTTTCCCGACCTTAAGCCGCCATTAAATAATTACAGCTTA:1 - chr3R 22952068 5' - HMS-Beagle2 314 1 51.15 TTTTGCTGGATTTTAAAACTGCTTTCATGGGCGATGTGGAGAATAGCAGAATATCCGAGATTGAATCCCAGGCGATACAAAGAGTTTTGGTAAGACCTCCACGCTCATTCTTCGGCTCATTTCCTGCAGAGGTGGTCTTGAAAGTG:1 - chr3L 26023044 5' - Osvaldo 246 1 65.07 CGCCATCTTATATGGATGAAATTGAAGATCATCATGCAAAATTCCGAAATGCACGCTGTGTTTTAATAACCGAACATCCGCTTGAAAAGTAGGCCTCATCGGCAAAGGCACGCTCCTCAC:1 - chr2R 7394630 5' - mariner2 147 1 61.67 ATCACTGGTTGTACAAAGTATCTAAAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGAGAGCAACTTGTTCACAGTT:1 - chr3R 16997464 5' + G6 45 1 48.84 AGCTCCACGTTCCCGGAACGCCGTGAACAGAATGCCAAATGTCGAGTTAATCGCGGCTTGCGTGGCGTGGTCCACACTGAAG:1 - chrX 13502576 5' - R1A1-element 5300 1 68.29 AGTTTATTGCATTTTAAGTTTCAACGTAAACAAATTATGAGTTATTCGCAAATAGTGTAACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTT:1 - chr2L 14969227 5' - 412 7524 2 64.38 CGAGGCAGCTTCATTGGTCCCTTCCAAAAACTGGCCAACTAAAAGATGAATAGTGTTAGGAGACTAGAAAAATATATTAGTGGTAGTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCAT:1 - chr3R 2742408 5' - Stalker2 7489 6 60.56 AGCAAAACGCACTTTAATATCACATGTTCGGAAACATTGTGTACATACATACATACATACATACATATAGCCTTATCTGGGCAGCAAGTGCTCCATATTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACG:1 + chrX 15071173 5' - invader4 266 2 65.07 CCATACACAGCCAAAATGTTTAGTCGATTTCGTGTATTAATTATGTTCACTAATCGTAGAAACATATGTGTGAAAAATGTATTGATACTCCTTCATTAACCTATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 + chr3L 18381902 5' - copia 236 1 60.27 TAAATTGAAATATTCATATACCAGAGCTGAGCAGAAGATGTTCAATTAAGATCTAATACGTGGGTGTGAAATTTATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCT:1 + chr3R 16538343 5' + G2 2629 1 53.42 GAATGGCCGTAAGTTTTGGCATCTGGGCAGGTGAATCGTTACGTTGGATGTGCGTGTTATTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGCCAATTGATTTGGATTCGTTACAAGTCCCTTTAGGACAATTTCAGTTTTCACAACTGGAATC:2 - chr2L 16857045 5' - Doc4-element 2739 1 78.08 TAGGCATTGAGTTGCATATCCTAAGTTAAATATAATATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCA:1 - chr3R 23161342 5' - 412 7462 2 76.03 CGGACGTCAAAAGGAAATGGCGCGAGTGTGTTGCATTTAGAAACTCTGATTGGTGGTGGAACACTTTTCTGGATATAATGGCGATTTTGTTTTGGGCAGCCTGAATGCGGCAAATTTGGCTGTCGCAAGCCAAGCCCCAAATCTAA:1 - chrX 721255 5' - BS3 1318 1 52.05 AATTCACTGAGATGCGGAAAATAAGCCAATTGACGAGGGCGAAATGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCC:1 + chr2R 11168377 5' + roo 485 1 63.03 ATGGCTTAAACTAGTTAAAAGTATATAACAAACGCAAAGGAGACACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAA:2 + chrX 8967345 5' + HMS-Beagle2 22 2 70.55 TGATGTCATAATGGCCACCGATGAGGAGTGACCTCTTTGGGTGGTCCTAAGCTGCCGTCTTTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr2R 9340116 5' + 412 50 2 54.01 AATATTTTCAATATTTAATGGCAGTTATGGCCTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr2L 7771943 5' + jockey 80 1 73.85 TATTACTATTATTGCTCTTTCGAGCAGCGCAGGTAAATCAATAAATTTACATAATCATTGTGCAGAAGGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2R 22463127 5' + roo 8716 2 55.48 AAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGATCCAGGCTCTCTCGACTTTTTGTTAGAG:1 + chrX 388261 5' + 1360 88 1 75.34 AATAGAACTAATGTCTACGAATTAATTCCGAATATTCGGTCGAAGCAAACAAATCGTAAATTATGGTTTTCCATTGAAAAATGTAAGATTTTTTCACACCATTTGTTTCAGTCTTAAGCTGACATTCAATCAATAAAAACGCAAAG:1 - chr3L 19154577 5' + Tom1 299 1 57.53 ATACATATGTACATATACTTTTAGGGGTATATGCGTGCAAAAGTTACGGCTTCCAATTTGAAATTACTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 12379804 5' + roo 8719 2 57.53 GGCAACCGGGTAAGTTCAAGGACGTAAAATGCGGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chr2R 15075560 5' - mdg1 373 2 52.74 TGGTGAGCAGAGACATGGATGTCTAGTAACATCTTGTGGAGCTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACA:1 + chr3L 8848799 5' - I-element 5277 1 69.86 AAATATTTTCAATTATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 + chr2L 9274966 5' + F-element 34 1 66.41 ATTTAATGTGTTTAAAATATTTCGAATTAAGCCGCTTTGTATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAA:1 - chr2R 11095819 5' - diver 6031 2 72.60 CCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTC:1 - 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chr3R 17258173 5' + 412 7120 2 62.33 CGGAGGAATGGTTCCCATCCAGCCCATCAACATCCACTTCCACATCCACATCCATGTCAGGCCTTTTCCATTCATGTAACATGCATAAAGCGAAACCGCATAAATCAGTTGACGCATAAATTTTCATTTTACATACATATTTTCAA:1 + chr2R 14915550 5' - Dm88 3 2 65.75 CAGATACCCATTACCCAGGTGGGGTGGGGGGGGAGACATAATATTTTGAATAACGATTGAAAGGTATGTTTAATCCCACATAAAAACAAAATAAATTAAAACAATACAAGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCA:1 - chr3R 7775744 5' + transib2 2686 1 72.60 CATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 + chr3L 17537749 5' + Doc 77 1 69.86 GGGTAGGCAATGAAGAAGCCGAAAATTAGGGCGAGCGAGACGGGTTAATTTGCCGCTACGCGTGAATGCTTATGTGAGTAAGCAAAGAAACCGAAAACGAAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGG:1 + chr3L 25952771 5' - Quasimodo 6941 2 69.34 GAAAAACTTTTCGATATTTTTTCATAATTGTATAAGTCTTGTAAATTTCTATTGATTTGCCAAAAAAACCCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCT:1 - chrY 1803456 5' + F-element 4214 1 60.27 AGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCNNNTTCTNNACACNNGTAGTNTNNNCNNNNNNANNNNTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chr2L 14239152 5' + 412 7119 2 46.72 CATCTCCCCTAGGGGATTGCTCGATTCCGTATTCAATCGGAGCCATATGGATCGGAGCTCACCCACTTTGATTACATAAAGTTTGCCTACAATTGCTTGTTATATAATGTCATGTGAATTGAATTTCACTGTTTTTTTTTTTAT:1 - chr2R 6939802 5' - transib2 2643 1 53.47 ATCGATGTATTTCGAATAAGTTGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGCTC:1 + chr2R 18344556 5' - 1360 3311 1 70.34 ACCAAGCAAACACTCTCTTTCAAGCTTCAGGCGTTTGACTGTGTGTGTAAGCCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:1 + chr2R 17097473 5' - P-element 2819 1 37.67 TTGTTTGGCCCATGTTTATCAATATTGAAGAAGCTATCGGCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 + chr2L 10514255 5' + 1360 44 1 51.37 ATTGATTGATCACCTCTCAAAGTAATTATGCATAATAATCTAGCGAAATAAGCGAAAATAATATGGTATGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTT:1 + chr2R 20301479 5' + 17.6 184 2 50.37 TAGATCGGAATTTGACTGTTGTCTGTTGAGCAAATAAAAAAGTCTGAATTTGCTGATGCTTCGATACAATCGTTGTTTTCAAATTAAATATTTAGATATATGTTATATTTGTAACTTTACAAACAATCATTGCATTCTTAATTTTT:1 - chr3L 6401971 5' - 1360 439 1 57.53 GCCAACCATGCTTAATTTGACTGTGGCACCACCTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 - chr3R 18635336 5' + opus 7035 4 62.33 GAAACCGCACATTAAAAAATCACTCGCTCAATCACTCTAACTCGACTTTGCCTTAGGTGATCGTTTTCGCTCAACACATCGCCTGATACAATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 19863906 5' + roo 8695 2 63.01 CTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 25751867 5' - roo 8988 2 78.08 AAATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAAT:1 + chr2R 18689143 5' - Burdock 6330 2 62.33 AATTCAGAAAGTTGTAATTCAATTAAAGTTTAATTGGCCCGCAAGCAATTGGCGTAACTTGGGCAATGAATGTTTCTTTATTTCATCACCAAGAATGACCAAAACCAAGCGTTTCCCTTTCTCATTATCCTTCATACACCACTACA:1 + chr2R 22369136 5' - invader5 3877 2 51.37 ATCAATAAATAAGTCATTATAACAAGGATAATAGCACTGAGATAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTACTAAGTA:1 - chr3R 6136055 5' + mdg1 7118 2 69.18 TATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 + chr2L 18112466 5' - transib2 2791 1 61.11 AGTTGCAGAGCGGACAGCACACCGCGAGGCCAAAGGTGTAGGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAAGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chr2L 22319234 5' + Transpac 29 2 62.76 AGTTAAATAATATTGAACTCGATTGCCTTTTGTTATTAATGCGAGTCATCATCGCATAAATCTGCAAGGCGGTCATAATTGCAATTATTCATTAATGAAATATTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3L 21910322 5' - pogo 2085 1 78.08 GTTTGGATCGAGTGGAAACTCGGACGGCTTTCATCCACATTGAGGAAAATGTATATTTATTTTCTTCATCTTTTTAGAATTATTAATAAATTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAG:1 + chr3R 17286222 5' - F-element 132 1 60.96 AATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 - chr2R 11164476 5' + roo 88 2 83.33 GTGTTGGCCGCTGCAAGCTGCGGGCAGAAATTAACCAGAAAACCAAAATCAAAAATAAAATATGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTT:1 - chr2L 8268929 5' + pogo 283 1 57.53 GGTGGCACATGGCTCCGATGATGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCCAACCTGGTTT:1 + chr2R 22746023 5' + jockey 4769 1 75.19 GCTTCATCTATCAGAAAGATTCCAGCTTAAGAGTTTGTAAACTGCGATGTCTGACTAAAATCTTACATTAAAGTGACTTATTAGTCACAAAATGGTATCCAATGCCATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAACCCGTGGTACCAAA:1 - chr2L 4637891 5' + HB 494 1 61.38 CTCGAACTTTTGCTATTCATCACATATAATTTTTCAATGTGCCGCAGTGGTACGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATACACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr3L 12964812 5' - hobo 2894 1 57.72 ATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr3L 16059348 5' + 297 6640 2 66.44 TGATGTTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTA:2 - chr3R 13349595 5' + Ivk 52 1 50.00 GTGCGTGCGTACGTCATTGCAACTCCGGTAAAACGCAAATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTA:2 + chr2R 18689107 5' - Burdock 6365 2 67.81 ATGCGAATACCAAATATCAATAGTAATCACAAAACATTCATCCGAATTATTCAAGAGGCATACTTTCCACTTCGAATATCACACACCTGATTCACGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 + chr2R 14135230 5' - copia 228 1 66.44 TAATAAATACAATGTAAGAATATTACGTATAAGCAGATGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCTTT:1 + chr2L 1360951 5' - Stalker2 319 2 72.60 ATATCAGTTCGCGAGCTAATTTGAAAATGTTTTGCCTCCACTTTAGTTAACTTTGTGCTAGTTCTGCCTTCTGCAAATATTGGTTAGATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2R 10160639 5' + hobo 6 1 67.52 TACTATTCAAGAATTTCCAAAGAATATCATAATTTTGATCGAAAAGGTTTATCTTGCAAATGTTTAAAAAGTGTATATATACATCTTTGTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chrX 15454647 5' - 1360 3356 1 63.70 ATGCAGCTCAGGTCTTGCATATCGAAGTGGCCGCTGATAAAGGATTTGGGAAGTAGTTTAAGCCATTTGGACGGGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATG:1 - chr2L 21040656 5' + invader4 2953 2 56.16 GCTGGGAAGGCAACATGACATATACACAAAATGGCGACAGGACAACGAACTCGACTGGAAAATTGCAAGAGCCCCTCTGCCCAGAGCGCGCACCCTTACAATCATACAGCACCCATAACACCCACACACCAACACACACACACACA:1 + chr3R 24423278 5' + gypsy3 419 1 69.18 TCCCTCGTTGCGCATTCTGTGTATTCTTAATAATATTTTTTCCCGTGTTTTTATTGTATTTAATGCCGTTTTGGCCTTTGTTTCATCTTGTTTTATTTGCGCGCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGTAAAATCGAATTTTT:1 + chr2L 21030866 5' + FB 16 1 72.92 AGGTCGAGGCATCGGAACCCATTAGCGTGAATTGGCGAGTGACCGGCAGCGGCTGCGGCTCATATGACAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGGGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 - chr3R 31141097 5' + Burdock 19 2 71.23 GTAGGGAATATTAAATTATTAATCCAATCAGCGAGTGCAGCTGATGCCACGCCCACAATTGTTGGTATCGTAAAAGATATGACCTAGTGTAAACCAATACAAAAAACAGAAACTAAATATGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGG:1 - chr3L 17877958 5' - Transib-N1_DM 20 1 70.34 TCCCCAAAGCCGTTTATTAACAACTAATTGCGACTGGCAATGCGTGAAAAAAGTTTGTCATTTCTGGTCAGCGTTTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACT:1 + chr3L 5028043 5' - gypsy4 461 1 60.96 AGTTGCAAATTGATTTCTAAATGATTCATGACCGCGACGAGTTCATAAAAGTGTTGTATGCTTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 - chr2L 14556786 5' + I-element 56 1 55.94 AAGGGAAATTTATAGAAACAACGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3L 7870181 5' - roo 9012 2 60.96 CGGATTTCCCGGCACTGGTGTTTCGCGTGGGGCATCTCCCTGACTGAAAAATTTTCTGAATAATTATGTTTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chr2R 1923589 5' - pogo 2055 1 54.11 CGCGACGGGAATAAAATGGCAGGAACACACAGCAAGAAAATCTAGACCAGGAAACGCAGCTTTAATTACCCTGTCAGCTACTTTGGGCAGCCCGAATATAAACAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAACAA:1 - chrX 19030685 5' + mdg1 7058 4 62.41 ATAAGTTCGGCTAACCATAGTGCAGGAGGTTAAGGCAAATAACTATACAGATTCTTGAACTATTAAGCATATATTAATTAGTACTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGC:1 + chr3L 2873620 5' + Doc 307 1 42.76 AGGTAACAGCAGTGCGTTATACAGCGAAACAAGAACTATAGATTTCTTTAAGCATGGAGATGGCATATCCAGAGCCATTCCATTAAATATTCCCCCTCTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTATACTGTACCTA:1 + chr3R 6645280 5' + blood 7027 2 73.94 GATATTAGTCCAGATTATTATAATTTTCTTTTGCACTTGCCTGCTGTGAAACCCTAAAAGTGAGCCAAGAAAACTTCTTTCATAGTTCTGCTTCTCACTAAATTAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chrX 7446155 5' + jockey 4685 1 45.14 TAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chr2R 11164481 5' + roo 82 2 79.72 AGGCCTTACGTAAAGCAATAACCAGGTCTAAATAAATCTCAGCTACGTGAGCTGTCGTAGCCCTTAACTCCACGTAGGACCATTCCTGAACAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTAAAAGTTTTGATTTTGTGT:1 + chrX 4248252 5' + Cr1a 381 1 53.42 ATGCACGCCATATGTTTGCCCCACCGACATTTACGGCTGGTACAAGGGTTTTAAACAAGCCAACAGTTTATGAAACATAATAGCACCATAAGCACATTTCGGGTTTGTCC:1 + chr3R 5156454 5' - Tc1 1617 1 75.45 AGCTATCATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCTCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTC:1 - chr3L 15099685 5' + G4 3804 1 58.27 ACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATACATTAGGGACACCAAA:1 - chr2L 22684584 5' + transib3 87 1 67.81 AAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTGTGTCTC:1 + chrX 22726194 5' - Helena 1236 1 56.12 AATTCATTTATTTTTTATTAAGCGAAAAAAAAAATCTACAATAATTGGTTTGCATAATTTTTTTTTGGGGCGGCCTCTAGGCAGTTTTCCTTTTGTGTTGTTTTTTTATTTTTTTTAATTTT:1 + chr3L 16324800 5' - Doc 4698 1 85.25 ATGAGCTGCTGTTTGACCAAAATACGCCTATACTCTAATTTGAATGAGTGGATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 - chr3R 12762442 5' + 1360 67 1 62.33 GACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 + chr3R 28406355 5' - opus 7441 2 66.20 CAGATCCGCTGTGGAGCAGGGAGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr3R 23161238 5' + 412 7071 2 68.22 AAACTGAGTGTTTTGCGATGAATGTTAAGACATTTTTGAAAAATCCATGTCTGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGC:1 - chr2L 7651912 5' - roo 8777 2 64.38 ATAGAAATCTAAAAAAAAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 - chr2L 21643156 5' + Tabor 6873 2 61.64 GATTTATGAACTCGAATGTAATTGTGATTGATATAATTAGTTCATTTTTAATTACCAATTGTGTTACAAGCTTTAACATGGCTTAATGTATCAGCTCTAGAAATATTCATATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATA:1 - chr2L 2120512 5' - I-element 5346 1 73.97 ATTGCTATTCCCTTCACCGTTTTCATTAAGCTTAATTATTTTCGTAATACTCATAACGGGGTAGGATTTCAAAGGAATGCAAATTAAGTAATACTTGAAATTGAAAAATGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATG:1 - chr3L 20851730 5' - accord 357 2 73.97 CCAATGTTTATTCTACCAATTCCAGGTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 + chr2L 21642997 5' - Tabor 455 2 64.38 ATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAA:2 - chr2L 19310381 5' - Juan 4140 1 67.81 ATTCTTTTCAGTCGCGCAGTTCTAATGACCTATCATCAAATTGTAATTACTGCAGTCAGAATAAATGACATTTTGAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 12379682 5' - roo 9026 1 54.11 AACGATACTAAAACATGAAACACCTAAAAATATATATACTATACACGTTTTTTGATTTCTTATATGAATTATGTTTTATATTTCATTTAAACCACTTTTTTTCAGTAAAATATTATTTTTTATTTTTATTTTTTTAAGTTTTTTTT:1 - chr3R 20038558 5' - gypsy2 424 1 76.03 CAGTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCAGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGT:1 - chrX 16117268 5' - opus 7439 2 62.33 AATATGTACATATTCCATTTGAATATTTTGCATTAATCTTTTGCATACAGTTGGCCGCTTTTCTTGTGTTTTTGTATATTCGAGGGACGCCTCCCTTCGTCGCATTTGAATAATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCAT:1 + chr3R 12276387 5' + G2 448 1 76.03 GAACCCTGCTATCATACGAAAAACAGCAATCGTAGAGATAGAAACCTTTGGAAATACAATACATAGTACATCAGTAAATGTGCGGTAACTTTATATCTTCCCTTAGTTAAGTGAGGGCCGTTATCGGGTTTCTGCAGAGCTGTCTC:1 - chr3L 17033432 5' - gypsy9 4964 1 63.01 CAAAGCAAAATAAGTTAACCCCACAAGGCTAACAAAAAAACATAATAAGCATTAATTTAGATAACAAAGCATCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAA:1 - chr3L 4182130 5' - R2-element 3475 1 51.03 GCAAAGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr2L 16331043 5' - roo 345 2 63.01 ATAGAATAGAATAGAACATACGTTGATAACTTTATTCTCTTAAACCCGAGATCGCCTTCAATTTTTTGCACTTTATTATCGCACTTGTAAATTAAGACTAACTTAAAACTAAGATTGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAA:1 + chr3L 24821500 5' - Max-element 8376 2 67.12 TTTTGTAAAGAATATTGTTATATTTAAGCACTCCTTTACTTTGATCGCACGATTGTAATATTTTACAAGCGTTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 11944815 5' + roo 49 2 53.42 CAGGCAATGGCAATTTAATGCCACGCTGCAAGTCATTAGGTGGCGCCTGCACCTCTGACCCGGTGAAAACCTGCCCCTCAACCCAAGACCGTTGTAAAATCCCAAATCAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2L 12486296 5' - roo 9042 1 67.83 ACGGTAAGATATATTTTATTCATATTACTATTGTTTAAAGCGCGATGATAACGATGTTCCTTAGAGTAACTGATATCGGTTATTAAAATGCAAACAAATTCCATGTGAGTCAATAAAAGTTCATTTCACATAATAATGGTTTTTG:1 + chr2L 15784167 5' + transib4 2308 1 60.69 AATTGTGCTGGCATAGTCTTAGCTATATATTGTCCATTAACAATTGACGAAATATTTTAAGTTAAAGAAGTCGGAATATTTTGCGAACAAGGCTTTAGTTGCCTCGGTTTTTACATCCTGCTCATCGAGGTCATACCTTGACTGGC:1 + chr2L 18739482 5' + Rt1b 4976 1 75.34 GTGTTTTTGTGGAAGGACCAAGGCGCGGTTCACCGATTGCGATGAACTATGGCATGGAAAGCTGCTTCTCTTTCTGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGA:1 + chr2R 18343541 5' - 1360 3244 1 54.79 ACGCCCACTTACCACCTACCTTTCACCCCCTAACCACAGTCACTGTTGTTGTTGTCGGTGGGTGTTGATGTTTTGGTTGTTGCTATTCACTCACTAGTTACGATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 + chr2L 2707518 5' + jockey 4780 1 69.86 ATCAACAGTTTTGCTCGGCCGGCCGGCAATTGTTCTCTTTGCTCTTTGTTGCAAAGCTACCTACGTTCCACCACGGCTTGTCGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 10735862 5' - accord 7030 2 53.33 GGCCGACTTCAACTTCTCCTGCGCTGACCTTCAATCAAGAGTTCGCTTTGGCCAGGCGAATTAGAATTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGG:1 + chr3R 16240885 5' - Tirant 357 2 52.55 ACAACGCCGCCAAAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr2L 13629062 5' + Tirant 34 2 55.46 AGCACTATTCTGGTACCCTAAGTCTTGATTTAAAAAATAGGATTTGGAATAGGTCCATGATCACCAACCTATATGGAAATTTGGATTGAAAACATGATTTTTCTTTCGAATAAATATTCTTAATGTTTTTATTTGCTCATTGTTTA:1 + chr3R 17339375 5' + looper1 74 1 75.34 GTTTCCGTTTCGTTTTTCCTCGCTTTGGCCAGCCTTTGTTTTCTATGGCCATTTGCTATGTTGCTATTTGCCATTTTCGAAGCAATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAG:1 + chrX 18583937 5' - jockey 4795 1 57.53 GGCGATTATCGAGAACTACAACTGATATCTAAATAGTGTTCTGACTTCATGTTTAGTACTGCGTACAATGCAATAGTCAAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTCTGAATGTGAACGCGAAATTGCATAATTTT:1 - chrX 18815060 5' - INE-1 518 1 52.05 GAAAATGTAGTTACAAGAATGCATTTGATTTCATCAAAGGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3L 2330105 5' + roo 8746 2 75.34 ACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 - chr3R 18205693 5' + 412 85 2 76.03 ACTGCCCCTGGAATGGGATGAGGCAACAAAAACAACAACGACAGCAGCAGGCAAAGGCGGCAACATAGGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGTAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTT:1 - chr3R 12744985 5' + Stalker2 7638 2 57.93 AGCTTTTTTCTTGTTTGCATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGG:1 + chr2L 17295796 5' + Doc 5 1 74.02 TGGTAATAACAGCGAGAAAGGGAGAAAAATGGAGAATCGTAGAGGGTGGAAGAGAATTGGGGGGTTTCCAATCGGGAGAAAGGGGGGAAAACACTCTCTACATGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTA:1 + chr2R 22521443 5' + Doc 426 1 70.55 GGGGGAGAGTTATCCAACCCGTAAATATAGCACCTGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATGAATGCACGAAATGAACACCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCTCTATT:1 + chr4 1155823 5' + Doc3-element 441 1 76.12 GCTCCACAGAACGATGATCCTGCTCCTTTTCAGGTTGCTCAGGTTCCTTAATTTGCCAAAGGGAAGACGCTATCGCCAGCCCATCGCCACCAGCGAGCGGATCATGATCCCGCCACCGAAGGTGAATAATAATAATAATACTAATA:1 - chrX 7576248 5' + mdg1 37 2 65.07 ATTTCCAAACATTTTCCGCAGATACAATAAAGAAATGTTCAACAATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAA:1 + chrX 1103734 5' - pogo 1889 1 69.86 GCTGTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3L 10469620 5' - roo 353 2 58.22 ATATATGTACATATATACCAAGCGCATCAGGAGAGTTCGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAAT:1 - chr3R 4679592 5' + hopper 20 1 70.55 AATTGAGAACTATTTTCGCCAAAAATTAACCCCCATTAAAGTTTAAATATCCTACTGGACATTGCTCGTTACGAGATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:2 + chr2L 17839359 5' + blood 46 2 54.11 AAAAGTAAAAAAAATTATTATTAGTTCGCTTAGAAAAGCAATACATTTTTAGGATTCACACTGTTCAGCTATTGAGCTTTTTTAATAGCTGTTGCGTAAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTT:1 - chrX 13287874 5' - diver2 4832 2 54.79 TATTCATGTATTTATTCACTTGCACCTTATAAACTTACAAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATGTTTATTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTG:1 - 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chr3R 6495406 5' + Stalker 22 4 70.55 GTTCGCTTATTGACATTTCTAGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTTCATCGCTAGTTAGCGGCATCGGCAAGATATCGTCATTATTTTTCCAT:1 + chr3R 16276312 5' + pogo 46 1 54.11 ATTTATTTATTTATTTCTTTTTCGCGCGCGTTTCTCGTTGCGCGCTCCTTGCTTTGCGAATTACAACTACAATGCCGAAGGTGACGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:2 - chr2L 14682023 5' + P-element 18 1 73.29 GGTTTTCATAAAGTATGCATGCATGCATATGCATGTAGGATATGAAATGATCATATGTTAAACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGC:1 + chrX 12745127 5' + Doc 478 1 58.22 TCTCGCATTAATTTTCAATGAAATCAAATCAGCAAGGACATTCAAAACAAGCTGGAGCAAAATATGTGAGAAGCAATCGACTTGGGGATACCATAGAATTTCGAAATTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAAC:1 + chr3L 4081527 5' + mdg1 15 2 73.97 TTTCATATTTTAATAAGCTAAATTTTCATTTTAGCTTCGGCGTTTGAAAGTCATATTGAAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:2 - chrX 20975843 5' - copia 228 1 58.90 ATCGATGCTGTCAGCAATCATCCGTTGAACAAGTTGGGATCTAATGAATGTTCCAATATGATTGGACGATCCGAGTGGGAGGTTTCGGATTGAAGTTCTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGG:1 - chr2R 17845226 5' - G2 2977 1 66.67 GCTGCCTTGGCAATGAATAATTCAAATGGAATGCCAGCTTCAGCTTCAGATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTC:1 + chrX 8219377 5' - opus 7432 2 67.12 AAAATGTACTCCATTGTGGACTAATGACAGGTAACCGGAAATGCTCTCGCTTTCAGTGTGAAAACCACAGTTGGGTTCCTGCATTTTTTATGGAGTGCAAATCCTGAACCCACCGCGGTATGGCCGTGAAGCAGTGCTTCGCGAGG:1 - chr3L 12352143 5' - Rt1c 5323 1 56.85 ATATAAAAAAATAAAAATATAAGTACACAAAATGTACCGTACCCCCACACACTACGTAGTCTTAGAACAACTTAGACGACCAGATATTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTT:1 - chr2L 17097165 5' - opus 7344 2 66.43 ATGAAATCATCGAGAAGAACATCCTATGACATCAGCTAAATCTTTAAAACGATTGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTA:1 + chr3L 25607270 5' + 412 67 2 64.38 CATCCTATGACATCAGCTAAATCTTTAAAACGATTGAGGGGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTTTGTTTATGTTTATGGT:1 + chr3L 25607289 5' + 412 7124 2 70.23 ACGTAAATAAAAAACGATTCCGTTGACTCACCAACAGCAGCAACCATTAAAAGTGAAATAAAACAAAGAAAAACACAATTAATGTGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAAT:1 - chr3R 22058040 5' + hobo 2531 1 57.53 TATCCAAATTAAAAAGATTCATGTGCAAAAATAAGAAATAAGTGTATTTGATTGCAGTGCAAGTCAATAGGTTCTTATTAGCTTATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACA:1 + chrX 14137180 5' - 3S18 301 2 58.22 ATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 - chr3R 8849865 5' + 297 6637 2 59.59 AAAGGCTCGGTCAAGTGGTCTCCAGGTCTCCGTCTCCATCGAGACCCGAACTCCTCCTGGAGCTGGAGCCTTGCGCGTGATAACTGTATTGATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGT:1 + chr3R 21490960 5' - Quasimodo 43 2 63.89 CATACCCAATCTCATTTGTTTCGCACCACCTTCCACCTTCCAGTTCCCATCTCCAAGGTGCCATAAAAATTCGCCAAGCCGCAACATCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTT:1 - chr3L 22226136 5' + jockey 4789 1 60.71 ATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAAT:1 + chr3L 27415241 5' - transib2 2736 1 78.77 GATAACTGGGATAACAAGGATCTTTTGTCACTAGATTGATATTTTTAAACAACTCGCACAATTTTTTATATATATTCTACCGACTGCGCCATTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACGTGTTAT:1 - chr2R 2144584 5' + F-element 4600 1 65.07 GTCATTGAATGTTATGTAGGACCGGTGGGTGCTGCTGGAGAAGCTGCGCTGGTGTCCTCCACTGCAACAGGATAAGAGCAATCTGAGTGTCACGATCAATTTTGCTGCCGCAATGTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTT:1 - chr2R 6669369 5' + G2 2947 1 79.45 GGAGAAGAGAACGAAAAACAAACACACAATAGTACAATAGCACACGGCACAATCGATATACTGTGGTGTCGTCTTATTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCC:1 - chr2R 9507825 5' - BS 4838 1 54.37 AGTAAAATTCGCACAAGACACGCATCGAGAAAAATATGCCCACATCAAGCCAAAATTGCACAAACAAGCCAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACAC:1 - chr2R 11146158 5' + Quasimodo 25 2 68.49 CACTTTGCTGTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 10469626 5' - roo 359 2 54.11 GTTCGCTTTCACAGTCGGGTTGGAGGTGACGGTTTTGTGCGGTTTGTGGGCGAAATAGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATGCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACATG:1 + chr2L 22197430 5' - INE-1 130 1 64.38 GATACCATATAAAACCATATATACATATATTATATATTAAATCAGAGGGATTGCCATGTCGGTCTGACCATGGCGATACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTG:1 - chr3L 7939155 5' - R1A1-element 5303 1 56.72 CAATTGAGAACTATTTTCGCCAAAAATTAACCCCCATTAAAGTTTAAATATCCTACTGGACATTGCTCGTTACGAGATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAATTAGTTGCATTG:1 + chr2L 17839358 5' + blood 7056 2 54.79 AGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr3R 9125664 5' + Doc 56 1 55.81 TTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGG:1 + chr2R 13367468 5' + jockey 4642 1 73.79 CCGCCACACCCATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr3R 9125610 5' + Doc 18 1 77.93 TCAGAACAAAATGCTGTCGCTTCCACACTCTATTTGCAGATCTGATTTTGGGGATCTGATGAACCAAATATTTTTTAACTTAATACTTCCTGCCAAGAAACGCTCTCCCACACACACACACAGACACACACACACACACATATGCA:1 + chr2R 5185489 5' + accord 7032 2 56.16 ATAAAAATTTCTGCACATGATTCCGCTTTATTTCTTTATGACCGTGTGTGAGTTCTACTTGGAAATTCATATCTCTGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chrX 21403374 5' - roo 9026 1 52.74 GAATGCATGCCGAAATGGAGGCCAAGCGCAGCCAAAACTAAATAGAAATAACAAAGCAAAGCCAATAGCTCATCGGTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATC:1 - chr3R 21931282 5' + G2 2639 1 52.14 GCCAAGAGATAGGAACTTGGCCCTGATCCAACATAGAAATACATACGAATGGCCTATCAGCGAGTTATGAGATAGCCAAAAGGAAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGT:1 - chr3R 25862699 5' + roo 31 2 52.14 TGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr2L 17295818 5' + Doc 30 1 56.92 GAAAATGCCGCATTGGGCGCAAACGGAGCAGGCGGATTATGTATGTATGTGTCTACATACTTACAAGTACAACACAACAACCAACCGGTTTACCTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3R 7089603 5' - P-element 2861 1 67.81 GAGTTTTAAATAACAAGTAAACACTCCGAGCTGCAATTTGTATTACTTATTATATGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAA:1 - chr2L 1361026 5' + Stalker2 7312 2 60.27 GGAGATCACTCCCCGCAGCACCCAAACGTCCTGTTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:2 + chr3R 14218431 5' + roo 8727 2 61.64 CACGTTTTGGTTCGAAAATACAGGTTATTGCAAATTATAACATAATATATGCTGTATATTGGAATGTAATCGATGTATTTCGAATAAGTTGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr2R 18344485 5' + 1360 10 2 69.66 CTCTCAGCTCGGAGTTCTTTTGGTTGGGGTGCTATGATTCACTGGACAAATTCTTCTACTTGTTCTGATGTGTTTTTGCAGTCGATCTGCCAACGATTTGGTTGGCGATGTCGTCAGCGATCTCGCTGGGAGTGATCGTCTGC:1 + chr2L 11088900 5' - BS3 196 1 34.27 ACCACTACTTATGAGGATGGTATTAAGCGAGTAAATCAGGGTAATTATGCGTTGGAATAGTGAGGAGCTTGCCTTTGCCGTTGAGGCCTACCTTTCAAGCCAGTGTTCGGTTATTAAAACACAGCGTGCAATTCGGAATCGCTTTA:1 - chr4 639447 5' + mariner2 212 1 68.49 GAATATGTTCTTACATGCATGCCCGAAATGCATCTGCCCTTTTCATAATTTTTTTTTTTGTATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTG:1 + chr3R 28144338 5' - Doc 4417 1 58.22 GTATGAAAGTAACTGAAGCCAGGAACGAGGACCCAGCCAGAAACTCTGGCAGTTAAGTGCAAATTATTGGTTCGGAATTAGTAATTTTTCACACGGCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATAT:1 + chr3L 13259158 5' - 1360 395 1 62.41 GTTCAGCGTTTTCAATTGCCAGCATTCAGGGACTTGGCCAACTCCGCTCCATCAAGAGTAAAGTTCATCTGGGCTTAAGTGGAAAGCTTTCCTATACATATATAATCCAACTTAAATCCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTG:1 - chr3R 7880099 5' + Doc 4290 1 55.48 ATAAAAGAATCGGCATACAATAAAGATTTACAAATAAACATTGGGTTTCAAAATTTTGAAATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCAC:1 - chr3L 18350080 5' + Ivk 186 1 58.90 GAGTGTACAATCAACAAAATTAGTTTCATTTGGGCAAATGGCATGGCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chr3R 25804247 5' - mdg1 7453 2 77.42 ATTTAAATGTAGCAAAAGCCAGGAGGGGTTGGCTATCAATGAATAAATAAGTGAATGAGTGTGTATTCAAATGTAATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCAT:1 + chr2L 19198720 5' - Bica 4889 1 50.68 TTTTATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCA:1 - chr3R 21395234 5' + G2 415 1 70.79 AAGGGGTATTCGAACGAAAATGCAAATCGATACCAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAA:1 - chr3L 7801347 5' + Transpac 126 2 66.44 GAGGGCAGCGAACATTTATGAGTACGACAGGGACAGCTAAGCAAGGAGATATATATTAAAACAATGAATAATTTAAAATGTTATGTGCGATTATTATGAGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCAC:1 - chr2R 1983893 5' + Idefix 310 2 77.78 GATCAAGGATCGTTGAATTCATTTAATCCGCTTAAGTTATTAAAAATGTATTTCTTTGATGTTGTTTATCACTTACTTGCCAACCATCGCAAATAAAAGACCCTAAGATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCG:1 + chr2L 15777741 5' - 297 6967 2 73.29 CGCGTTGAGCGCCAATTAATATGCATAATGCAATATGCATACCATTACATAAGCTTGCCTAAGTGCAAGTTTTCTCTTCTCCTCTTTGCTCAGACATCAGGTGTACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:2 - chr3R 1267820 5' - P-element 2869 1 75.34 CTTTAAATAGCACCCAGCGTCCACAATTTGTTGTTTTACCCGTTAGTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTACAATAGATTCTTTGAAAACTATGTAACAGGCAGATGAAAGCGTTTCCAACGGTATATATATTCTTGATCAGGATCAA:1 + chr2L 22053084 5' + INE-1 82 1 67.81 GATGTTTATTGTGTTCAGTTCTGCGCTGCAAAACTCCTAAATGTTAAAATAATTAGAGACTATGAAAAGGGGGGATATCGGATCAATAATAGTTTCATGTGTTCGCTTTATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chr2R 9607048 5' - pogo 2093 1 77.40 AAGATGGTTGGTGAAGTTGCTGCTGCCAGCCAAATTACTGGCAAAGTGTCCACTGTTTGTGGGGTTGCTGGTTGTTGAGTTGTTGGTGAAGTTCCCACTGCTTGTGGGATTGCTGGCATTGCCCCATAACTGCGAGCCATAGGTCC:1 + chrX 7078637 5' - F-element 4266 1 73.97 CGTAGACAATAATTTAAGTAGGCATTGAGTTGCATATCCTAAGTTAAATATAATATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 - chr3R 23161360 5' - 412 427 2 63.70 ACCGGGAACCTTTGTTCATTCTAAGATCGATACAGATCTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTGAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAG:1 + chr3L 27131336 5' - 1360 226 1 70.55 GGGTGGGGACTTTCTTTTGGCGCACTGCCTTCTTTACTATTTAATTATTTTCGCTGCTCTTTTCAGCCTCGCCTTTTGCTTACAACTTGTAAAATACTGATATAATAAAAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGCAT:1 + chr2L 16362014 5' - Tirant 497 1 77.40 CCAGCGGTGGGTCGACATCTTTGAACTGTGCCAACTAAATGCTGTTTACAGAAAGTCTTACACGGTAACTTAGATACATCATCATTATTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 15295846 5' + roo 8684 2 66.67 AGATAAATTAAAAATAAATGAATACAGCTATCAATATAAAATGAAATGTGGTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:3 - chr3L 18253908 5' - blood 7350 2 56.85 GTCCCGAAAAGAGCAAACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGATCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 - chr2R 18014126 5' + Doc 70 1 58.22 AAAAGTATATACATACATATGTACATGTATGTACTATCTATTGCTTCTATATTCATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr3R 6461878 5' + 297 25 2 69.18 ATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 - chr3R 13349583 5' + Ivk 50 1 53.79 GAAACCCAGTTCTTAATCATACTAGTTCTAATAGTTAATTAGTCGACATTCTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 + chr2L 2494798 5' + Doc 38 1 56.16 TTATGATAGAGATTCGCTAGTCAGAGAAAAGAGAGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3L 4651575 5' - roo 330 2 69.86 AGAATGTTCCTCAACAACGGCTGCCAGGCTTAAGTTTGCCCCTCGCTGACTCTCTATCTATTTGGTTAATTAACGCAAAGGCAAATTTAAATATTTATAATCCCTTCGATGATTTAACGCAGTACCAAGTTGGCAGTAT:1 + chr2L 15988053 5' + Burdock 6014 1 69.06 AAGTGAAAATCCACCAAGGAGCCATTCGCAGTAAGCTGGTGATATTTACAAAAAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGAC:1 + chr2L 2120333 5' + I-element 4926 1 67.12 AACAAAAGCAGGCATCAAAAGATGGATTGGCCAATTTGGTTTTCGCAGTGTTTACCCTGTAGCTGGCATGGCCTTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCATA:1 + chr3L 13690251 5' + hobo 27 1 63.28 TAGGAGGAACTTTTACTTCGCGCGTAATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATA:2 + chr2R 12065542 5' + Stalker2 22 2 71.92 ATGTTCGACTTTGGCACCTCTCTAAAACATTTACTCGAACTTTTGCTATTCATCACATATAATTTTTCAATGTGCCGCAGTGGTACGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr3L 12964845 5' - hobo 2911 1 63.31 TACCAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCA:1 - chr3L 7801317 5' + Transpac 125 2 58.26 CAATGGGGCATTGACATGAATATCCAGATGGATTACGTAGACAGAGATGCGCAAGTTGTTTAAGGATAATAGGTCCCTAAAGCTTCATCATGATGAGCTTTGCAAAAGCCTAGCTGGGCTTTTCGACCTTTTTGCCACTTTTTTCT:1 - chrX 15917943 5' - S2 1271 1 69.18 AATTTTTCATACCACTCCATTGTCAATATCCGCCCGATGGCGATGCATTCATCATGTATTGTTAAAAAACGTGAACAATGCAGTATTATTTAGTTTGCGCTGGCCATTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 18239051 5' + jockey 18 1 78.62 ATGGCAAATCAAACAAGACTTCGTTTCGTTAGAAAGTTTAAAAAATAAACATAAATTTGTTAACAGCTCCCAAAGAGTGTGTTAAAAAATGAAATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGTTCAATG:1 + chr2R 13761576 5' + jockey 4700 1 60.27 ACCATACCTACACCAATCACAAAATGTTGTGGTGGCTTTCAGGAATTCTGGTAACTATAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCACAA:1 + chrX 20359096 5' + I-element 67 1 58.62 ATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr2R 9871059 5' + roo 79 2 72.60 ACTTGCCTCTCAATGGCCTGGTACGCTCCGGTGGCACCGAAGTCATTCTTGCCCCACCCAGCTACCCAGCATCTCTGACCCACGAAACTTCACTAATTTCCCTGGAGTTAACCAGCAAGAGAAGGTTACCATCCCGAAGATTAG:1 + chr3R 8771569 5' - Ivk 439 1 61.81 GAGTGGGATGGCCCCCCCACATGGATCGCTGTGGTCCCCAGTGATGGGAAGTGAGCATTCAAGGGGGCTGGCAAAAGAACGAAGAAAAAAAAAACAGAATGAAAATGGTTTGAAAAAAAGCGAATAAAAAAAAAAGGAAAAACAAA:1 + chr2R 19077653 5' + Doc2-element 232 1 51.37 AAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTACATAAAATAGCATCTTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 14969090 5' + 412 7095 2 51.61 CAGTCATGATTCAATGCCAATTTGACACTTGTGAGGAGTTTGAGATGGCGGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chr2R 23212603 5' + Tirant 8159 2 59.38 TGGAACAAGGATCAAGGTGATGGAAGATGGCGATTCCTGGTGGGCAGGCACAAAATGTTAATGGGATCTGGATTAAGGTGGCAAAGGAAGCCTTGTAAGTGGATATTAGTTAAACGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAA:1 + chr2L 5863376 5' + copia 470 1 73.29 ACATAGCTGGGGATAGTAGACCTCCATGGCAGATTCGCTATTATTTCATTCATGACTCAAACTATAACTATAAAATAGACTTGAAGAATAAAAAAGAATGAACAAGAAAACTTTTTACGAAATATTATATTCATATATAAAACAAA:1 - chr2L 14576495 5' + gypsy9 439 1 60.96 TCCATTGCATACTTTTCGGCTGGTGTGCACAAACCGGAAGTCCTTGATGCAAATGTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTAC:1 + chrX 7741886 5' - hobo 2873 1 63.70 TAATTGTTCAACCCTTCTGTTTGTTTAGGGTACAGTTGTACCTATTTATAAACAGTAAATTCTCGAGTTTTCAAAAAGGTTGCCCGAGCTGGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGAATACGCGAACAA:1 - chr2L 19160473 5' + 3S18 14 2 73.64 GCAAAAAGTCCTTGCAACCGGATGTTGTGCAATAAAAATGCAAAGTGCGCCAAAGTTGCCGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:2 + chr3R 7470895 5' + Doc 42 1 76.71 GAGTTATGAAAGCGCAAGCGTCGCACGCAAGTAGCAACAACAGCTACAACAAAAAAAAACATGAGAGAATGCTGTAGTCAAGTTCACCGACTATCAGATACCTGTTACTC:1 + chrX 7308264 5' - INE-1 549 1 50.00 AATGTGCCGCAGTGGTACGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCC:1 - chr3L 12964777 5' + hobo 2709 1 63.41 GATAAAAATATTCAAATAACATGAAAAACACGAAAATGCGAAATGCGTTATTAGAGCCAGCTAATTGGTGTTGTCTCATACGCCTATCGATTACACCGTTCGATCCGCGACATCCCCGACCCCGTAAATA:1 - chr2L 2271583 5' - aurora-element 4028 1 53.85 GGCCCTCTAAGTATATTTAAGTACTTATCTAAGACCTTACCTGTTCAGTCATCTATTATTATATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGC:1 + chr3L 18801776 5' - I-element 5298 1 55.48 TAGTGCCTTGTGCATCCACTTTCAATAGGCTTTAGAGAAATTTCTTTCTTTATTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTGGCCCCGACGTGATCGTGTTAATTTGCATGCCTTAAT:1 + chrX 7170318 5' + diver2 406 1 65.07 CGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 + chr3R 9125661 5' + Doc 70 1 58.90 CACACTTGCCATTGCATAAGCATAAGAAATGATGCCCATCTACATTATTTTCTCCACAGCTTGGGACCCAGATCAAGGTCAGCCCCGATGAGTACGAAAATTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACC:1 - chr3R 12358866 5' + invader2 239 2 69.86 ATGGCACATGGCTCCGATGATGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 + chr2R 22746024 5' + jockey 4777 1 70.00 CTTCTCTGTTGCGTCCGTCGTCCTGTAAGTCCTGTAATGACATTTTTGGTTTCGCTTTAGCCACCCACATCTAATTTTACCCCCTTCGCATATTATGGGATTGAGTACCATTGTTTAACTCTTT:1 - chr3R 14078095 5' - rover 472 1 74.19 AATATTTTCAATATTTAATGGCAGTTATGGCCTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chr2L 7771943 5' + jockey 75 1 72.80 GTGCCTGTGGATGAGTTCCAATGTTTTAGCAGGGGGCAGATGGGCGGAAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 + chr3L 7837104 5' + jockey 4763 1 78.77 AGCGACGTCGAGATGCATGTCCTCGAGGGCCGGAATCGGTGGGTTATATACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chr3R 19435992 5' + roo 8726 2 64.08 AAATTATACAATATTTTTAAAGCAATATCGATGATCATATAGTAATCTTAAAAGCAGCAATATTATAAAAAGTAATAGAATTTAAATCATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 - chr3L 5630474 5' + I-element 39 1 58.22 GGTCATGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 + chrX 1103572 5' + pogo 21 1 69.86 AAGCAAACAACTGACGAGAATCCTGCCGCCTCTCAACAGGGGTTACATTCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chrX 7741964 5' + hobo 56 1 63.49 GTTCTATTGACATCCAATTGGATCTGGGCAAAGGCCGTCTATCTCAAAATTTTTGTTATACTATATGTATGTATGTATTACGAAAGCACAAGTATAAATATATTAACATACAGCAAGATAAATAATATATAAATAATTATGAACAT:1 - chr3L 1033577 5' + 1360 2943 1 82.19 AAAGCACCGCAGAGGGGCACCTTGCACCTGCGCACTGTGGACGAACTAAACCTGATGAATCGCACCGAGGTGGAGCACTTAATCGTGCCCAATCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chr3L 363416 5' + blood 7035 2 66.90 AAACGTGTCGGGGGCACACAAAGGGTTAAGGGTCGGGCAACTCATAGTTGGAACAGAGAAGTTAAGCCGACTAACCAAGTCATGACTCTTAACTTCTCCACGAATAAGCTTACAAATAAAA:1 + chr3R 24067752 5' - Cr1a 4042 1 75.21 CCAGGACTAATGACCCCATGGGGCCTTGCTGGGGAACTGGGTGCCGTTATCGCACACGACCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTAAAAATAGTAGACAGAG:1 + chr2R 5271781 5' + Circe 7390 2 56.19 TAAACACACGCCGAAGGCCTTTGCTAATTAAATAATATGCAATATGCGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATAT:1 - chr2R 7599233 5' - diver 6036 2 69.18 TGACTTGTTCGTTCGTTTTTATTGCCTTGATGATTTATGGTTTGTATTGATTTTTATTTTAAGCTTTGAATATTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGAT:1 + chrX 11389295 5' + hopper 343 1 50.68 ATGGTACGTAAGAACGGGTTGAACTGCGAGAGAAAGAGACGGTACTAAAAATGTCAGTCGAAACTCTTTGGCCAGCGGCAGATCTATTTAATTAATTGCTAACAAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGT:1 - chrX 405721 5' + gypsy12 10158 2 72.60 CAAGAACTTCACCTTTAAATAATGTTAAGCGAAATTCGAGCGGGCAGGGGCTCTCCCGGGAAACTGGGCACTGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr2R 25106146 5' - roo 9039 1 59.54 GTCACCGGAAATGGACCACACAAACACACACAGACACAGGGATTTGAGACAACACCAATACAAATACTCAGAACACACACACACACATATGCA:1 - chr3L 11672582 5' + accord 7032 2 58.06 CGTGACCAGGTGAGGACAGAATAATGGCTCCATTGCTCTGCTATGCAGCTACTAATGGTGTAATAAATAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGA:1 - chr2R 12065677 5' - Stalker2 338 2 60.69 GCATAATGAATTGCAATTATGGTTAATGTGCACGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTAACTTATCTAGAATTG:1 + chr3R 27627031 5' - Idefix 6976 2 77.14 TGAACACAATATTTTTATTTATTTAAATAAAAACAACAACTTAAATTAAAAAGCAACATAGGCCCTTAGTTATATTTTCTATCAATTAATTGAATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3R 8140813 5' + pogo 23 1 67.81 TGTATGTATAACACTAGCAAGTGATAAATCTAGGCACGACTTTCTTGATGCCCACCAAAAGGTTAAAGTAGTAGCATGTGCATTTGCCAAATCCCATGCCCTACCCATAAGCTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr3L 15357302 5' + 1360 7 2 43.84 ACTCGAAAAAACACTGGGAAATCTGAAATAGCAATTGATAACAAAAAATATATAAAGCCCAAACTTGCGTATCAAGAAGAAAACTAACGACATATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATG:1 - chr2L 18305333 5' + F-element 122 1 69.18 GCAGCTTCTTGTCCCGAGTGCGTTCTACGATAGAGTTAATAGACATATATACAAGAATATATAAAAATGAAATTTGAAGTTGTAAGTAGGGAAACTAAGTAATACAAATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGTCTTTTTATTC:1 + chrX 21626867 5' + HB 74 1 58.62 GCCACGTTGCCATTCTGCACTGAAGTACGACAACGCCGCCAAAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 + chr2L 13629033 5' + Tirant 26 2 67.86 AAAATGATGAAACATAATGAATCCTCTGAACGGATGTCCAAGTCAAAATGTGAAAATGACTTGGTGTCCTGTCCTCCTTTTAAGAATATTTCATTTGACTTCAAGTTCAACCAAGCTCAATCATACATATATTAAATAAAAAAAAA:1 + chr2L 17987989 5' + X-element 4719 1 69.86 TATGATTGTAATGTCTAACTTAATAAATGTTTTCAAACCAACGGGAAAAAAATAGTTTTAAGGTTTTTTTTAGTGATATTTGTGATATGTTGTATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGC:1 - chr4 540606 5' + flea 4779 2 70.14 GAAGATTAACCAGCAACGACGTCATGGCCAGAAGCTTGACTTTAATCAGTACAAGACCATGACGGAAGCTTTCGAATGGGATACATACATATTTTTTCTTTAATATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTA:1 - chr2L 17531432 5' + blood 6971 1 57.86 CGCAACCATTACAAAATTTCATTAAATTTTTAATCAATTATTATCAGTGTGATACTTGAGGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr2R 1373250 5' + pogo 12 1 76.71 AAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTA:1 - chr3L 25508750 5' + 1360 338 1 61.64 AGATGAGGAAGTGGCCGCCAGGCAGCCATGTTTGTTTGTATTTATGTCGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3L 7460574 5' + 412 7074 2 70.55 GGATGAGTTCACCACCCAGGGTCTGGATGATCTAGCCAATCGATGTGCACAACCACAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATG:1 + chr3R 26414491 5' + Stalker 7029 4 61.48 TAACTATTTATATTCAATAGTTTTTCAAATACATATGTATTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTA:1 + chrX 5773029 5' - jockey 4909 1 73.97 ATAGCTCACAGGTGTTTTCCTTTTCGTTGATCACACCTCCGGAGATCACTCCCCGCAGCACCCAAACGTCCTGTTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 14218391 5' + roo 17 2 72.86 ATACCCAAATACACGCAAATGTACCCGAATTGGTGTTGGTTAAAACACAGTGCTCGCTAAATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chr3R 25049984 5' - P-element 2831 1 47.26 TTTGTTGCAATAGTAAAGTACGGAAATATACGCGCAAATAGTAAATGTTAAAACATAATGGCCCATTTGAATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr2R 4582643 5' - 1360 3339 1 61.64 ATAAATGGGAACAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chr3R 8849885 5' + 297 36 2 61.64 ATCCTTTATCAAATTATCACCAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr3R 14278004 5' - P-element 2852 1 61.64 GGAGAAATGCAATTTTCAATTAAGATATTTCAATCGAGAGTGATGACATTAAAGTAGAGGATAGAATAATATTTCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr2L 19674022 5' + roo 8705 2 48.97 AATAACAAATATAGTAAAGAAAATAATATCGGACACAGATCTAGGATTTTTTGAAATAATAACGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGCCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAAACAGAACATAAAACTCTGTAAGG:1 - chr2L 5361403 5' - Cr1a 4184 1 61.64 AGGGTTGGTACCAAAAAAAGAAGTGGGAAAAGGGTTAAGAAAAAGGAGCAGGGGGTTAAGCAGAAATGTATTCTTTTCTAACGCAAAATATACTTGTAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCC:1 - chrX 5589754 5' - jockey 347 1 67.12 TTTTGTCGTTGTTTGCGAATTGTGAGCGGTTGTCATAACCACTGCTCCTGCTCCCGATGCTCCATCTATTGTTGCTGGGCTAGTGCTAATAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGC:1 + chr3R 21342251 5' + hopper 1247 1 63.43 GGTTAAATGCTATCAGCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr2L 4929786 5' + blood 49 2 52.05 GTTCTCCAGCTGACGGATCTTCCGCTGCTCCTGGTTCTCCAACTGACGGATCTTCCGCTGCTCCTGGCTCTCCTGCTGATGTCACAAATAGCTGAAATATATCAAATTTCGCGTAGAACTGTCTACTACTTAATAAAAAA:1 + chrX 12061268 5' + Bari1 491 1 39.29 ATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 + chr2L 3960186 5' + jockey 77 1 65.07 TTCGCATCATTAGTATTTTAAAAATTCCTTAAATATTAGCAACATTTAAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3L 8658694 5' - roo 9034 1 56.85 CCTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr3L 21910481 5' + pogo 51 1 54.79 ATTTTCCTTTATCACACTTTGTAATAAGATTTCATAAGATTTCTTCCAAGGAATTTATATGCATTTTCAAAAAGAGCCACGTTAGCGTTTTTTTCCCAACAATCTGGTCATTTTATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 - chr3R 26486174 5' - 412 489 2 78.08 GATGATTATTAGGTACATAGTTGCTTTTCATAACAACTACAACTACTATAACTTTTGAAACCTAACCGCGTTTACAATCTGTTGATATATAGGTAGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3R 8218057 5' - P-element 2861 1 68.49 GGCGTGGGATATTTGGGCGGACAGACAAACGGACAGGACCAGATTGGCTCGGCTATGGAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATT:1 + chrX 179831 5' - I-element 5309 1 53.12 AAACATGCATTCCTCGTCCGTTTGATTTTGTTATGACCTGTGCAGTTTGTCGAATTTTTTTTGTGAGCTACGAGTACTTTTTTTTAGTTGTAGTAGTAGTAATGATTTATACACTATTACTATTGTTATTATATT:1 - chr3R 29504592 5' - mdg1 7052 2 60.74 AAGCTCGGCTTGAACGCCGCCGAAAATGATGTACGTGCTAGCTAAGTCGTTGGAGTCCCCGGATACCCGAATCCCCGTATCCCCGATAATATTGTTTTTTTTTTATTAATTTATATTT:1 - chr2R 15942794 5' - S2 1621 3 71.19 GAAGGGTGGGGCTTGGACCAGGGGTTCCATGTTGACGAAGGTTTTTTGGAGCCGAGGCTCATGGGGACTTAAAATCAAATTCGAATTTGTATTAGCATAAGGTTTGTGTAGAATTGGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATA:1 - chr3R 10417928 5' - Circe 7081 1 70.55 GCACTTTAGAGCTGTGAATCGGTGAATATTTTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATCCACACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3L 19031327 5' + roo 61 2 60.27 ACTTTCGCGGATCATTTTTTGTAAGTTTCCAGTTCACCGTTACTGGCCGGAACTCATGCAGACGCTCTGATGATCTACGACTCACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCTGAATAATC:1 - chr3L 24880542 5' + Porto1 4337 1 60.96 ATGTATATGCGTTAAGGGAAATTTATAGAAACAACGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTT:1 + chr3L 7870168 5' - roo 373 1 56.72 TTTCAAATGTGTAGCCATTGCAGTTTTGGTCAGCATGCGGGTGTGTAGGGGTCACAAGAGTCTACATGTCCAATGGTAATGCCCATGTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr3R 4191028 5' - pogo 2070 1 65.75 ATCATTTACAATAAACCATCTTCAAAGCAAATGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 + chr3R 17099919 5' + Tirant 8175 2 77.60 GTCCAAATTGTGGCCAAAAGCATAAGGGAACAAAAAGGGTACGACTCAAAAATATGAGAGTGGTATGTAACTGTCAGAAGGAAGCGATTAAGACTATATAAAGTATATGTTCTTGATCAGGATAAATAACCGAGTCGATCTTACCA:1 - chrX 22666296 5' + INE-1 102 1 54.79 CCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 - chr2R 15070146 5' + 412 7142 2 78.77 ACACTAGAATAACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGACCGGACCAAGTTGTGCGCAAATTCAAGAGGTAATTTTATTCAAGTCTTTATTCAAGTTCTCCAAGTCATTCTTGGAGAACAGTCTATTTCCTGAGGTGAATGCATGCTCAT:1 - chr2R 5876940 5' - Bari2 870 1 51.37 TGGCAAACAGATGCCACACACTCGTGCATGGCTGTGTGTGTACGTGATGGTGGCTCAATAATTAACTAACTTTAGTCTCTTCCGACAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGAC:1 + chr2R 20420198 5' - diver2 4736 2 62.83 GGCGCCAAGCATATTAACTCCCATTTTTAAATGATTGTTTTTTTCTGAGATTTTGGGAGTTTTTGTTGATACAGTGGACAGACAGACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATTAAGAATATACA:1 + chr3L 12196793 5' - INE-1 81 1 55.40 TATTGCGATTTCCCGTTAACTCGCGCACACTACACCCTCACACACACACACACACACACACACACATTCACACATT:1 + chr3R 22825142 5' + accord 192 2 72.37 CCCAAAGCCCTTTGCTATATCAAGTCAGAGGAGTGGGTGAACTTTCAAAGCAAAAGACAAAGAGAAGGATATGAAACTGCTTATTTACTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTAGGTTCTCATAAAAAATTA:1 + chr2L 15800430 5' - 1731 4375 2 45.21 CGGTCGCAGTGATCATCGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3L 6355633 5' + Tirant 40 2 77.78 GCTCGGCACGTGCGCGACGTGTTTCCACAGCGGGGGTTGGGCTCAGAGAGTTTGAGGGGTTCCTCCAGGAGTCTAAATGACTGCATCAGCAGGAGAGCAGCGG:1 + chrX 10534024 5' - G7 79 1 67.96 GTATGTGTGGCGTCATTATATAATCAAATCAAATAACAATTTGTACTTTGTTAAATTTCTTGTCGCCCTCGATGGCTGGCTGTCTTTGCCTCGAAAAAATATGCAAATTTCCAGTATT:1 - chr3R 6014055 5' - hopper2 1559 1 62.71 ATATTAGAATAATCCACATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr3L 17537733 5' + Doc 61 1 58.90 AATTAATACGTAATATGTAAGGGTGTTAAAACATTCTTTAGGAAACAGGTTCGGAAAGGCCTCATACATACTTCTCAACAATTGTTGGAATATATATATTTCATTTTTTACCATATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGTT:1 + chrX 22905159 5' - INE-1 142 1 76.03 ACTAGTCCCACTCTCTTCCAGCAGCAGCTGCTTTCTTGGTTTTTTCTTTTCGTTCATCCGCCGTGTTTGTAATTTACACAAACCAAAACAACAAAAACGCAAAACAAAAAATAAAAAACCCCAGTGCAACTGCACTAGGCGAGTGA:1 - chr3L 15593514 5' + gypsy9 498 1 59.59 AAAAGATAGCTATCATAATTAAATCGGCAAAGGACAGGGTTTAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr2L 11296169 5' + 1360 52 1 63.56 TCGCACACATGTGCACTTGTTTGCCATACTGTGTGTGTGTGTGTCTATTCGAGCATTTGCCCCTGTGGCGCTTGGCAAATGTGCAACTGCCACTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr2R 21242376 5' + roo 72 2 66.19 GATAGCACAACATCAGTGACATGTATTTACTTTTCACACACAAAATATTCCCTGGCCTTAAAGTATTCCATGAGCAATTTTATTTATTCTGATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAA:1 - chr3L 15298713 5' + roo 8601 1 63.01 TTTTTACATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 - chr2R 18344637 5' + 1360 61 1 58.90 TTTTACTTCGCGCGTAATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGA:1 + chr2R 12065552 5' + Stalker2 32 2 65.07 TTTTGGTACCATTTCTGGTACTTTTTGGCTCATTTCTACGCATACAGTGACAGCACATGTATTGTTCATGCATTGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGG:1 + chrX 3464186 5' + hopper 37 1 79.26 GGCTTATAAGTAAATATAAAAGGCGGAATTGATATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 - chr2R 13046560 5' - 412 408 2 75.34 AATGAAAAAGAACTTGTCGAGGTCGCACGCACTCACACACACCACACACTGTTTACAGGAGAAAGCACCTGCAATTGATAACGGGTCGCCAAATGGTAAATAGTACAAACAATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATA:1 - chr2R 18689296 5' + Burdock 6145 2 79.45 CAATATTAGGGAACATACGCTAATCCCTGCATTGCTTTGCGGTAATATTCGGATTCAATGTTTTGGTACACGTATTTGTTTTCCAAAGCAAGCTTTACACGCACACCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGC:1 + chr3R 2690269 5' + F-element 4489 1 62.24 GGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGC:1 - chr3R 24454855 5' + F-element 311 1 70.55 GGGACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTCAAC:1 + chrX 7706740 5' - P-element 2857 1 54.70 GCTATTATCGTTCTTGCAGAAAGTACCATTTTCACTGAAGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACTGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr3R 21216918 5' - 1360 3359 1 67.12 CGGAGCCACTGATGGCAGCTACGGTGCTAAGATCCGCTTGCTGCATAACCAGTCGGTCCAGGACAATGTCCATGGCCTTCACCCACATCACTGGTTGTACAAGGTATCTCTCGCTGAGCCTGGAGATTTCATCAGCGCCTTGT:1 - chr3R 16997550 5' - G6 1764 1 74.83 GCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chr2L 14969108 5' + 412 7125 2 72.06 CATATCAAGCATTTGTGAGATCTTCTTGAAAGAAAAATTTAAAAACACACTTTAACTTAAAGAAAGCGGAATGATGTCATTTCGGGACTTTACGTTGGTCAAAAGCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGTCTAAAACTTGTGATT:1 - chr2L 21911594 5' - HB 192 1 56.16 CATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTT:1 - chr2L 21643112 5' + Tabor 6917 2 69.18 TGTATGTACTTTGTGCAGGCCTTTAATGGGGGTTGATTTGCCAAAACGAAATTGGAGCCTAGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chr3R 7089470 5' + P-element 59 1 44.44 AGGCAATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCA:1 + chr2R 17544152 5' + gypsy5 33 2 50.91 ATTGCAACTTTATTTTAAATTGTTGTAAATTGAAATAAAAGGTACACTTAAATAAAATTGCTAGTGTCGATGCGTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGC:1 - chr4 184107 5' + 1360 133 1 75.34 ATAAACTAAATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATATACATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCTAGCCACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGG:1 + chr2L 12183689 5' + INE-1 157 1 70.55 CCCGAATCCGAACCAATCCCAGTCCGGATCCCACAGCCTAAGCCGAACGCTAGCCCGAAACCGAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGTCCTGTTCACACATGAACACGAAGATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3L 19581030 5' + roo 16 2 75.34 GAAACTTTTAGCTCGTACAAATGAATGAAACTGGTTGAATATTTTTTCGATATTTTTTCAGACCTTTTCCAGCGCTTCCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr3R 7585676 5' + Doc 18 1 78.08 ACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTTAACAAATCA:1 - chr2L 12291910 5' + Tirant 26 2 67.09 CATATATATATATATATATATATCTGAGGTGCGTGCGCCTGCGCACACCTTTCCAATCAGCCGGCCCGTCAATCAATCATATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAG:1 + chrX 4486483 5' + 1360 397 1 53.79 AAAAAGTTTAAAATTGAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chrX 388201 5' + 1360 28 1 67.12 TCCAGATATTTGGCCACACAGCGATCGATGCACACCATCTCGCCTTTGCCTGTAGGGTGCGGAAAGCATTAAAATTATAAGTGCGGAATTGTGGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2R 21690426 5' + 412 7081 2 62.33 ACAATCTGTTGATATATAGGTAGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATA:1 - chr3R 8217984 5' - P-element 2824 1 24.55 AAGAACTCGTTCTCGAAGAGTCCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGAGCAGACGCGCCTGCGGATCGACAGCACATTGT:1 + chr3R 24750930 5' + G6 37 1 63.70 CCGACTGCCGCAAGAAACACTCAAGTTATAAAGACACGAGTGGATTCGACTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chr3R 10213115 5' + P-element 69 1 38.36 GCGGGATATAGGCACGTCTAGGTACATATACATATGTGTATATTTTCTATATATATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:1 + chr3L 16059244 5' - 297 333 2 71.23 CAAGTAAAGACGAGACCAAACAAACCATAAAAGTGTTTGCTTTTTGGTTTATCGACCTTTTCATCCATCACTGGCTGCGCCCTTTCCACTTCACCACTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCAAAAATTA:1 - chr3L 2426013 5' + hopper 18 1 72.86 GAATCAATTCCATAAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGA:1 - chr2L 8574464 5' + Transpac 4976 2 58.22 CGGAGCGGCATGACCAAATGCAAATAAACAAAACGCTTTGATTAGAAAATTCAGTATTTATAGCCAAATGATAAAAATAAGATTTATTAACATTTTGCTGCCCCCTCGCCATCTCGCTCACACACACACACACACACACATACAT:1 - chr2R 16470413 5' + Quasimodo 37 2 56.55 ACATTTGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAA:1 - chr3R 19436119 5' - roo 380 2 64.83 TGGTGAAGAAAACAATCCAACAAATGTGTTGTATCAAAAGCCAAATCCTCTAAGTAAATAACGATAAAATGGGTGGCATTTGCAATTCAAATATCTTTATTTTTACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr3R 13838159 5' + 297 13 2 76.03 CTTGATCTTTAACGTTTTTTTTTTTCAATTTTTATAA:1 - chr2L 18711903 5' - Doc 4693 1 64.86 TCGACACATAAACGGTTGTCCCCGTTCTCCTTAAACGCAAGCACGATGGGAGATATCCAAGCACTCGGGGCAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCT:1 + chr2R 3703767 5' + F-element 132 1 52.05 GTTTTCGCAGTGCACCCGACTAACTAAGTTTCATATTAAGACAGCTGCCAGACTGAGAAACGCGGGGCAGGGGTGATCACATACATCATACAACTGATACGCGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGTTATGCTCCAGAAAAACATC:1 + chr2L 9110795 5' + gypsy11 410 2 61.64 AAAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACTTCGCGTCGCG:1 - chr3R 16997441 5' + G6 84 1 73.10 GATAACAATAAAATATCGCCAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chrX 13439088 5' + G-element 4324 2 73.68 TTTTCGTAGGATTCACGGTAGGATTCATGGCAACCGGGTAAGTTCAAGGACGTAAAATGCGGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr2R 15075532 5' - mdg1 7445 2 75.00 GTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGTGTACAT:1 - chr3R 25804195 5' - mdg1 7379 2 70.55 GGAAATGGAATGTACTCAATAGCTTGGCTTATATGGTATTACAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTGGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTA:1 - chr2L 4929880 5' - blood 7309 2 70.55 GTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGCCGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 + chr3R 9125644 5' + Doc 30 1 64.23 GCGCAAACTGCCCAATAAAATATCGCCGAGGCGATGGCTTTAGCTTAAAGTGTAGCCAGAAACCTAAAACAAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTTAAAATCAGAAGCGAGAGTTTCATTCACCCACATATCAAACTACACA:1 + chr2R 21947803 5' + Porto1 288 1 54.79 AAACAGTTTATGGGTTATTTCAAGGATTTTAAATATGCGAAAATAGCCAGAATATTAATATAATTCGAAAAAGGTCTTACTTTGATTAAAAGTTTCTAAGAATATTAGGTTTTGGTATACGTTTAGTATTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chrX 13947364 5' - HMS-Beagle2 489 1 46.58 CTTGGTTTCCTTTCCCACGCACGCACAGCATAGCAATAAGATTTCGAGATCTTTACGGTGTTCGCAGGTAATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAA:1 - chr3R 26029871 5' - copia 4997 2 52.05 GTTTTTCGCCTTAGTCGAGTCGACTCGAATGCATGGAATGCAATGCAACAGCCGCACCGAGAATTACGTCAATGAGACTATATCATAAATAATGTTAATTCATTAAAAATAATATTTAAGTAATTTTTATTTTATAATGGTAATAT:1 - chr3L 19785577 5' + blood 6937 1 53.42 ATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:2 + chr3R 9125621 5' + Doc 30 1 69.86 AATCGCATCTTATGAATGGCCCACATTGTGGACGCAATGAAATAAAATCACTTGTTTGTTTATCCAGCCAACACTTCGAATGGCGTTAATTTGTAAGAAAAATCAATTTCAAAAAAAAATTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATA:1 - chr3R 29459102 5' + Stalker4 6885 2 65.07 TTTATTCTTTCTATTAAAAACACTTCCCTTGAAATCATCGTTGTCAGTTTCGACATTTTAAATTGGTAGCCAGCAAATGATGCCCAAAACTGCATTCTGTTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 - chr3L 20252052 5' - copia 234 1 70.55 GTTTTAAATAACAAGTAAACACTCCGAGCTGCAATTTGTATTACTTATTATATGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAA:1 - chr2L 1361024 5' + Stalker2 7313 2 61.38 TGGCATCTCGGCTATGAAATGGAACCCAATGGAATGTCATTCCTCCCTCCCGAGTCGACGTCATCAGTCAATGTCAGCTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGACGTGCT:1 + chr2L 21910602 5' + Doc 18 1 69.11 ACTGCCAGAAACTCACTAATGTATGGGTATCTCTTCTCTCTCTCTCTCAATCTCAAAAACGAACTGCTAACCCAACGTCTAACCAACAAATGTTGTACAAACACTAAACATACCAGTCCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAA:1 + chr2L 16769302 5' + copia 299 1 75.34 ATTATTGTGCTGAAGAATCTGGCTTGAGGAGAGCCTCAGAGAGAGCAGACGAAACTGCTAGGTCAGGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTTGGTGG:1 - chr2L 18366783 5' - McClintock 51 2 76.42 ATTCGGCAGCCACTAATTAAGTTGTGACCCGCTTACACGAAACTTTGGCTATATAATTAAACAGAAGAAGCTAAGTAATCGATTAATGTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATATCTGCTAGTCGGTTCGGGTG:1 + chr2L 15340748 5' - G5 4588 1 60.27 AATGCCACAAAATTGATTTATTTCTATTTCCATCCACAAATAAATTACTTCAATTTTGTGCTTCAATTCAATTGTTATTCAATTCGATTGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCATAAAATCGGTTGTTTTGAGTGA:1 + chr3L 26741193 5' + F-element 57 2 51.37 GCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCA:1 - chr3R 4571526 5' + 1360 3366 1 57.53 AATATTTTCAATATTTAATGGCAGTTATGGCCTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATC:1 + chr2L 7771943 5' + jockey 96 1 75.34 GATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTA:1 + chr2R 21848693 5' + Transpac 68 2 70.90 ATTTAATGTTGTTAACCTTTGGCTCGCGCGGCTTCGGTTTTCCATTCGAAAAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGACAG:1 - chr3R 30663612 5' - diver2 4761 2 55.06 AAATAACGAAATTTAATGCAAGGTCCTGAAAAGAGGCTCGTGTTGCAAAAAACCGGAAAGCAAGGAGCCGAAGCTCAATGTTGAAACATTTGTTTAGTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACGTACAATTTT:1 - chrX 21403529 5' + roo 8686 2 67.81 CACATAAATGTTAGTATAAGAATTATAACTTACATCTAAGATACCTATATATCAGATTCAAAATCCTAAAAGTGTGAAAGTAATGAAGTTCCTTATATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAG:1 + chr2R 10155807 5' + hobo 2491 1 60.96 CCTTGATAGAGCATTGAAAGAAAAAGCATGCCAAATATCCCCACAGTTGCCATTCCTGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGGTTTT:1 + chr3R 26846743 5' - hopper 1391 1 58.88 CTTAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 14375579 5' - roo 387 2 67.81 GTGGCTTTTCCCAAATGGCAAGCTGAAAGCTGAACTTCCATTTAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1 - chr2R 19852230 5' - Transpac 235 2 70.55 AAGCGTCAACTTAATTACTATTTCTCTGCCCCCCTTGCAAACCGCCACATACTCACACACACACACACACATACTC:1 - chr2L 3915192 5' + accord 185 2 89.47 AAACTGGGCGCCACAAAATAGGCAACAGTATCCAATCGACATTACCTTAACCTGGTCATAAGCTACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACACAAACGCAATTGTGATCC:1 - chr2L 6388161 5' + jockey 63 1 50.68 CCTTTTGAAATTAGGCCTTAAAGCTTTAGCCCCCTTAAAAAGCCACATTTAAGCCAAGAACTTCTCCCCGTACGCTCATATTTTACACAAGATATGGGCGTGTCGTTTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATA:1 - chr3R 14912087 5' + Stalker 17 4 73.97 GCAAAATGCAAAAAACAAAAGCCGAGAAAAGGTTAATTTCAGCTAAGTGAAAGCTGTATGCAAATAGCCCAAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGGTTTTTCCATTCTC:1 - chr2R 20592046 5' - Idefix 143 2 53.24 TGGAAATGGAAACGGAGGGCCGAAAGGCATTCCATGTGGCCAAGCCGCACCGACCACAAAATGCCTCCAGGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAG:1 + chr3R 14988083 5' - Stalker 168 6 52.05 AGAAACAAATAGGTATGAGGAAAGACATTTATAAATAAAGGCCATGAACCAAATCTAAATATATATATTTTAACAGTCTTTCATTTAGAACAAACCCTTTTTTGGTAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3R 21674768 5' + roo 8674 2 70.83 GATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCA:1 + chr2R 21848693 5' + Transpac 78 2 72.92 GGCGAGACGCCCAATCCGGAGCTACGGATCATCACGAGCACCTTCAACAAGGTGTTGTATAGAGGTGAGTGCGAATTTCCAGCCCGCTGGCAGCTGGCAGCAACGAGAATCGTCAAAAAATTTTTCAAAAAACTACATGTTGACAC:1 + chrX 7837424 5' + hopper 1048 1 76.71 GATTTTCACTTTGTGCACTGAACTGTTAAGGGCAAACTTTTTTGTTATTAAATATTTACTATCATGTCTACTTTATCTTGATAATTGCCTTTTTTTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr2R 13046448 5' + 412 26 2 67.81 CAGAATAAGGATGCCATTCGCAAAGTGCTTTTTTGCTCACCGTCGAGCGATTTCTTGTCCTGTTTCGAAGCAAATGCTAATTAATAAACTTACCCCGGGCAAGTTTATTATATAAAGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGG:1 - chr3R 13348522 5' + Ivk 5300 1 65.75 ATTTCACAAAACATTTTTGAAATTGCTCGCAAGTGTCTGTGGAAATTTCTTAGATTTATTTCAATATCGACTTGAAACATTTAAACGCCATGACTATTATAATTTTAAAGTTTTCTAATATTCGTTTGCTAAAATCGCCGCTCG:1 - chrX 11293249 5' - 1360 2994 1 54.86 AATGAACTCCAAGAAATTTTGATAGCTCGGATTTGATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 + chr2R 15070072 5' - 412 7486 2 58.90 TTTTATTTTTAACGTGCTTCAGTTTATTTTTTTGCCCTGTTTGTTTGTTTTTCAATATAATTTTTTTTTTGTTTTACCAATTATTTTTAAAATATCCATTACATCTGTTATTAATTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTA:1 - chr3L 3879118 5' + Tc1 1541 1 58.22 GGCCAGTTAATATCCAAGCCAACAGTCATTAAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3R 21674931 5' - roo 9029 1 52.05 CATGATTCCGCTTTATTTCTTTATGACCGTGTGTGAGTTCTACTTGGAAATTCATATCTCTGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chrX 21403389 5' - roo 347 2 56.85 TAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr2L 17626601 5' + roo 74 2 75.71 GAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chrX 1103598 5' + pogo 47 1 53.42 CTTGCATTGTTTTCCTTTTAATTGCGATTTATTATTTCTTTAAAACCTCCATTTCACTCACTCTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGA:1 + chr3L 27414192 5' + invader4 2711 1 54.35 AAAGCTACTGTGGAACATAGTTTTAAACCGATATATAACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 18528259 5' - roo 360 2 50.34 AAATGCCAAAACAGGCGAGCCAACCGCTTGAGTTCAATAAATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr3L 16059388 5' + 297 19 2 73.29 GTCATCTGCCAGCCGGCTAGTTTCGCTACTTTGATAAAAAAAAAGGGAAAAAAACACAGGTATTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTC:1 - chr2L 5890575 5' - invader3 5402 2 60.96 TCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr3R 14277961 5' - P-element 2841 1 41.23 ACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCATCAGGAGTGGCATCCAGTACACGGAGCTAC:1 - chr3R 21395204 5' + G2 483 1 75.59 TTGGTGTTTGAATTTTATTGCCAAGCTTTGGCGAGACTTTGATTTGATGACGATTTGATTTGGTTATCGCCAATGTCGATGATGCGGATGTTATTTTGGTTGTTGTTCTCATTCTGGCTTTGGATGTTATTTTGGTTGTTGTTCTC:1 + chr3R 7514564 5' - gypsy9 406 1 60.27 TGCTAATTTTGCTTTTTGTTCAGGATTTTAATTGTAACGGCATCTTTTGATCGAATGTTTGATTATGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTG:1 + chr2L 15348465 5' - 1360 479 1 55.17 CATCAATTATTTCAGTAAAGGATATAAAAATAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTAT:1 + chr3R 19446746 5' + 1360 3354 1 67.37 TGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 + chr3R 28406354 5' - opus 435 2 66.44 TTTGCCTGCCGACAACTGCACCAATGACTTTTATAAATCGTTTATAAAATTTGCCACCGAAGACGGGAACCACTCAAGAGAGCGCCTAATTACGGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATTAGCT:1 - chr3R 24494087 5' + Quasimodo 7208 2 52.74 ATCGAACGCGAGCGTGGACTTTGGTCCGGTGGAGACGGGCTGTTATACAGGCAGCTATTTACCGATAGGGTAAAGGTCTATCGGCCTCGCCAAAACCCTTATCAGCAAGATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATA:1 - chrX 15796099 5' + I-element 103 1 60.96 ATTCAAAACGGCGCTGAGTGAGTTCGCAATATTACCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGCACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:1 - chr2R 6493168 5' - transib2 2739 1 74.66 GGCCTTTATTTATTTAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chr3R 18528374 5' + roo 8723 2 59.59 AGCGGGGAGTTGAGGGCTATCCGAGAGGCTTCTACATCTCTGGTGTGTTTTCTTTCTTGTCCCCCCCAGTTTATGTAGGTTTTCTTCCTACATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTG:1 + chr3L 19026792 5' - G2 3075 7 50.43 AAGAGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chr2R 17332204 5' + jockey 56 1 63.72 AATATAAATATATAGGAAATCATGGCGTAGTCAGAGCGCAGTTCATAGCAATAATGGAAAAAAAAAAACCAAACAAAAACAAAAGCAACCAAACAAACAAAACGAAATGAAATGATATGCTAAAAAAGCGAAAAAAAAACAACAA:1 + chrX 18170620 5' + gypsy7 5012 1 55.17 AACCTTTTGCACTTTGCTGTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr3L 10469635 5' - roo 9032 1 58.22 AAGTGGCTGGCAGGCGAAAGGAGAAGGATACGGACCGGGACAGTAAGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr2R 8688200 5' + F-element 36 1 64.71 AAGCTAATTTTCGATATAACTTTAAACTTTAACTTTAAAGTCTTTTACTTCAGTTTTTTGTAGTTGTACACAACATCCGCAATTAAATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 - 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hopper2 1527 1 71.23 GGCCTTCGTTCAAAAATTTTAGATAACGAAGTAGTAATGCATTTTAATTAGATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr3L 9470063 5' + 412 7077 2 68.97 GTTCTCGAAGAGTCCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGCTCGACAGCCAATTGTTCACAGTT:1 + chr3R 24750938 5' + G6 45 1 58.22 GCCATTGATCAATGTAGCCAACTGGCCACCACATGCTAAATACACCGCAAGAAATAATCTGACTTAAATCAAGTTAATTTTTGGCATTTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chrX 10444723 5' + opus 141 4 62.33 GTCTTACACGCTAACTTAGATACATCATCATTATTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3R 15295792 5' + roo 8725 2 74.59 AATACATTTGCGTTTACAATAGGTAAACTAGGTATAGGTAAACATATATCAAATTTGACATTTTGACACGAAAACGAGCCGGGAAATTGTTACCCTAGCTAGGGTACAATTTATGAAAGAAAATGATTATTTTTTTTTTAAGTTTT:1 + chr3R 23660576 5' - rover 6830 1 74.66 GAAAAATATGCCCACATCAAGCCAAAATTGCACAAACAAGCCAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCA:1 - chr2R 11146130 5' + Quasimodo 56 2 56.55 ACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr2R 18344628 5' + 1360 28 1 52.88 ACAGCGTTCAAGTCGGCAGAAGTCAAGGGGAATTTTGGATAAAATTTAATAACTTGTCAGTAGAGCTTTAAAGCCCTAAATTATTTCAATAAAACCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTG:1 + chr2L 15530152 5' - opus 7041 4 60.96 TTGGGCAGCCACTGGAGGAGTCAACAGGGGGGAAAACCCCAGAAGGGAGGACTTTTGGGGCATGAAAATGGAGTAGCAGGCAAAGGGGATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACG:1 - chr3R 14593718 5' - invader1 361 2 66.92 ATAAATGAATACAGCTATCAATATAAAATGAAATGTGGTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:2 - chr3L 18253895 5' - blood 7337 1 54.79 CGCAAAGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2L 16331044 5' - roo 357 2 59.26 AGAAGTTTTTGGTTTGCAAAACGGATTCTAAACGAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAAGCATAATAATAAGGCAACTAATAA:1 - chr3L 14167407 5' + mdg1 77 2 71.11 GTAACGGCGTCAGTCAGAGAGCAATTGAAGCGATTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGGTCAGGTACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGT:1 + chr3L 13142744 5' - Stalker4 7202 4 79.26 CTCCCGTTTTTGTTGTTATTTTGCGACCTTGCGACAAAACAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACA:1 - chr3R 9962887 5' + I-element 4879 1 81.15 GGGTTAGAGATCGCTAGCTCCGACTGTGATTTTTGATATGTGGGTAAATGAGAGGTAGGAGGTGTTTTTATTTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATACGCTGATATTTTCGTTTTGTTTATTGTTTT:1 - chr3L 20595872 5' - Porto1 188 1 77.40 GAACTTTTGGAATACTATTTCTTTAATTACTCTCTACTGTTGAAAATTTCCCACCACCCTTCAAAAAATCTCTCTTTCAGTTCATAATCACAGCTCAAACATAAATACATAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGGA:1 - chr2L 7250293 5' + G5 4804 1 68.49 AATCGCAAAGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2L 16331047 5' - roo 9013 2 60.27 CCCGAAAGCTTACGCGTACAGATGTAATATGCACAAAAACAATACCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chrX 3322715 5' - roo 334 2 67.59 ATATATGAAATTAAATTGTTTGGATTTTAAAATCCATCGAGCTCTTAGTTTATTTATTTAGCACTATTTGCACCAGCAAATAAGCTGGAATTATGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAACGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 25751756 5' + roo 28 2 55.48 AAATCGTAAAATAAGAAATTCGTCGCCTGCTTACCTAGAATTAGTATATGATTGCCATGTGGCCGCAGTTGGTTTATATAACGACATACTTAGTTACTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACA:1 - chr3L 22670511 5' - roo 8727 2 66.44 ATATTGGTGTTTTGTTAATTCAGTATCCATTACAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATT:1 + chrX 22915136 5' + BS 43 1 65.38 CATTTGAGTGCCGACATTGGCCATTAAGCTAAGCCATAAATTCCGAATATTGCCGAACCTATAAAGTACTCAACTTGGTTAAACCGGAGCCAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATG:1 - chr2L 10170034 5' + hopper 960 2 65.75 AAATGCCTCAAAATCGGCGGGATATAGGCACGTCTAGGTACATATACATATGTGTATATTTTCTATATATATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 + chr3L 16059228 5' - 297 6933 2 59.44 AAAATGACCAACAAATACATATAGATTTTGCACAGACAACTCAACATTCAAAGCATTTACTTCGGTTGCTATTGCGATCACAGCTCTGAGCAAAGCGCAGATTATCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGG:1 + chr2L 2477784 5' - HMS-Beagle2 185 2 71.92 CACTGCTAAATATACACATTAAAAATAATGTTACACAAATATAGAACCTCTCTTATAAGAAACGACGACTTAGAAGCAAGTTAGGAAATTCTTATAAACATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCGTAATGAACA:1 + chr3L 7028063 5' - Tirant 185 2 59.59 AAAATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chr3R 15920279 5' + 412 7133 2 73.10 AGGGATATATACTATATATAAAAGGAGGCTTCAGTTTGCAATTTCTCAACTGTACACTGCGGCCCCCTAAATTCCTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGA:1 + chr3R 25804102 5' + mdg1 52 2 49.32 CAAGATAGTTTATAATTCACAGTCATTTTTTCAAGCTGTCAACAATTTTGACTTTTCCATTTCTCACATTACCGAAATTCTGATCATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCA:1 - chr2R 10161004 5' + transib2 32 1 59.59 TTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGAG:1 + chr3L 17537764 5' + Doc 84 1 77.54 AGGAACAGAAAACACAAAGAACAGAAAAACGAAATTAGTTGAGCTTAGCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAAT:1 - chr3R 7778341 5' + transib2 70 1 65.52 ATTAAAATTATATGAATATATCTTGATTCCCATGTCCAAATCGCAATTGACATTATAAACTTGTGCGTACATTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTACTGCGAGGGCTTCG:1 - chr2R 5329312 5' - rooA 302 2 59.69 TAGTGTTTGAAGAGATACATTTTTATTACTTTTTCATCACTTTAAAGTCCAGACCTCAACATAATAGAAAACCTCTGATCATATATAAAACATAATAATCTAATCTAGATGTCTAGATGATCTTATCTAGAAGTCGCGAAGAAACG:1 - chr2L 23173573 5' + Tc1-2 1234 1 74.66 ATTTGTTGTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAA:1 + chr3L 27356043 5' - Tc3 1674 1 65.75 CTCTAGAGCTCGGCCTACTGATTGCTGCAGTTGTTGTAGATGTAGTATTGCAAGTAGTACTTGTAAATATCATCGCTATGAAAAAACGCACATTGTATTTTTTCATATTTTTTTTTTGTTTTTTAAATTT:1 + chr3L 23213313 5' - TART-C 11097 1 52.31 AATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTG:1 + chr2R 4577095 5' - Chouto 462 1 74.31 AGCAAGAAAAATGGTGTTTTCAATGAAATTGCGAGGTGGAAAGGTGACCCAGAACCCAATATTGGCTGCCTTACTTTGCAAACTTTAACCGTCTGGCTGTCTGTCCGTATGAACGCCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAG:1 - chrX 1143487 5' + INE-1 152 1 56.64 TTTCGCTTTCGTTCCAACTGCAATTGTTTTTCGCGTGAAATCATTCCGTTCAGCTTCTCGCGGGCAATCTGCGCCAGCTTATCCTTAACACGCTCCTCTCTAACACACACACACACACACACATCTTCACT:1 - chrX 1045049 5' + accord 188 2 74.81 GGCTCTCCCGCTTTTACTAGGGTTGGTTTTGAGAGAGAAGTGCCGCTCTCGCTTTTACCCCCTTTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTT:1 + chr2L 3426934 5' - F-element 4608 1 57.53 CCAATTATGCAGGATGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATAT:1 - chrX 21247596 5' + blood 170 4 73.00 AATTAATAAACAAATTTCGTAAATAAATATCATTTAGCCATTGAAACAAATCAGAGCTCAAAGCAATCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATACATATAACAAACACATAGTCTTAAGCACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAA:1 - chr3R 16178812 5' + Stalker2 7547 2 54.79 ATATGATGTTTATAAAATACATGGGTTCTTGGAGAACTTTGGATTGTCTTAGTTGCCATTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCA:1 - chr3R 4820191 5' - hopper2 1168 2 63.01 TTAATGGGCAACCTACAATGAATGTTGAAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGC:1 - chr2L 13332725 5' - micropia 448 2 75.24 GTTTTGTACTTATTTCCAATCGATCGATTGCCGCACCAAGTGGAGTAATAAAATCGGAGGGTTTCGAAATCGCTTGATATCGTCCATGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAAT:1 + chr3R 16172033 5' - Tc1 1562 1 56.85 GTTTGCCCAGCATTCCCATTCACACTTAATGGCAGGCATTATATTCGGGGCCCAGGCATTGATGATTGCATTGCAATTAAAATAATTAAGATTTT:1 + chr2R 17983581 5' + TLD2_LTR 100 1 77.89 ATGACCGTGTGTGAGTTCTACTTGGAAATTCATATCTCTGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chrX 21403411 5' - roo 325 2 71.92 TATTTATTTATTTTTATTTTGCAAAGTCTTTGCAAAGACACTAGATTAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr3L 8069146 5' + 1360 38 1 67.86 AAAAAAAAAAACACGTTTTTCAGACTCGGTTTTGCTGATTTCTTATTAGATATTCTGTTGCTGTCCCCGTCTCGCTTCCCCTTTTACTGCATCTATCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCG:1 - chr2L 13571153 5' - Max-element 7 2 54.07 AAATGTTAGTACAATAATAATATTAGATAGATGGCAAAAAGCATGTGCAGACACATAAAATATAAAAAACTATTTATACAAAAAGTCTCTCCCATAGTTTAGAAAGGGAGGGTAAGCGGCTTATAGGCCAATACGACTCAGGATCA:1 - chr4 268489 5' - Helena 171 1 53.42 AACTAGTTATTTTGTTGTCATTTAGCTATTTTTCTAAAATATTTTCAATATTTAATGGCAGTTATGGCCTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr2L 7771906 5' + jockey 59 1 51.37 GAGGTTTTGACTTGGGATCTGATCTACCTGCCAGTTTTACCATAAGATTTAAAAAAATATAGTTAAATACATAACTAATGAAGGGACTGCATTGGTATCAATTGAGTATAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 - chr3L 4081738 5' - mdg1 7446 2 38.36 ATATATTTCCATAAATAATTTAATATATTCCCCTGTTTCTCCAAGTGCATCAAGCCGTGCCCAGTCGAGCCGCTCTTAATCCAATTAAAGTATGGATTTATGAACTACTGTAATAATATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 - chr3R 27415607 5' - blood 358 2 71.92 ATATAAATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTA:1 - chr3R 13437250 5' - hopper 1360 1 57.64 GAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAA:1 + chr2L 18630466 5' + G-element 51 1 59.20 GTGCTGGGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:4 - chr2L 15777896 5' + 297 61 2 64.38 TCCATAAGGTTGCTTTACAGCAGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3L 10469519 5' + roo 8720 2 61.48 ATATACTAAAAGTATTCACTCTAAATTAATATGTATATAATATGTATATGTTATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTA:1 - chr3L 19339441 5' - Tc1 1578 1 63.70 TGGATGAATAACTTAAGCCAGCTGCTTCGCCTTTCCTCTTAGTGTGCGATGTTATGTAATGTAATAACGTCAATCAAATTTAAAAAGGCAGACTGGAGAACCACCACAATCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCC:1 + chr2R 22753970 5' + G2 2888 1 63.70 CCTTTTTATCCGTAAGCACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 19031221 5' - roo 9015 2 53.42 ACAAGGTTTTTCCATTCTTTCAAATTGAAGAAGAAGTTGAAGAAAGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 4400281 5' - roo 9053 2 63.71 GTAATGTGGCAATGAGATATAAATCGAAGGCAGCGCATTAATGGCCAACTATTAAACTAATCGCTTTTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGCAGAGATAAG:1 - chr3L 10112317 5' + I-element 9 1 75.38 ACAGAAGTTCAGGGAATTCCAAGTCAAAGAAAAGTGAACTTGAATTCAGAAAAAGTTGTTAATTAAATATGTACATAGTATTAACTGTTTTTAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr3L 7870316 5' + roo 27 2 65.75 TATACCCATTACTCGTTGAGTAAGAGCGTATACTAGATTCGTTTTAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATTCTTGGGCCTTTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAAGAACTATAAAAGCTAGAAG:1 - chrX 544112 5' + INE-1 155 1 52.05 GCTATATTTACGGGTTGGGTAACTGGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCGCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGAAGCCA:1 + chr3L 25841904 5' - 1360 78 1 79.70 AAAAAAGACTGCAACCACAAGGGAATTCAAATAAAAGCAAACAAAATCAAAACAAACCACTAGGGCCTAAACAACAAATTAGCAACAGTCGTTAGTCGTGCGTTCTCTTTCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAACTTC:1 - chr3L 14714616 5' + P-element 45 1 75.89 ATAAAAATAAAGCAATGTATAAAAATAAATATAGACCATAAATCAGTCAAGCAGAAAGCGAACGCATGTAACTTTTCTATTATTCAGGCCGCCAAGTCTTCGGTTGGAGGCAGCGGTCCCAGCAGAGCGCTTAGTCAGCGCCTCGT:1 + chr2R 19534442 5' - gypsy10 5845 2 45.89 TGTGATACAGCCTCGGAGCCAATTGCGGACAGTCCTGCACCCTCTCCCTTACTCGTAGTACTGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCGTATGTATAAGC:1 + chr2R 1451930 5' - Stalker 167 6 56.88 CCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAAT:1 + chr3R 14049340 5' + transib2 70 1 64.38 GTTTGTTCGAGATAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:1 + chr3R 11151797 5' - mdg3 194 2 52.05 ACCTTAATATAGTCAGCGAAGCGAACTGCGCCCTGGAGCTGCCACATGTTCTGGTCCAGCCGAGCTCCCTGTGTGCCAAGAAAACGGGAGCGGGTCCTTGTGCCAGCGATGGTTGTAATGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 14218579 5' - roo 398 1 77.93 AAATCCAGTTCTATTATATTTCTCAATGTAATCTTTATTATATTTGATTGTACTATGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTACGTTTGAATCGTTTTATTTGA:1 + chr3R 12744655 5' - Stalker2 7590 2 60.00 GCGAAACAAATATGGCTCTGGCGCTCACACAGATACTCGTACTGGGTGCACACATCCACAGTTCTTAACCAAATATTCGCAGAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTT:1 - chr3R 7569984 5' - jockey 4648 1 60.27 CCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGAGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGACGAATGTAACATGAAGTA:1 - chr3R 15790106 5' + flea 4749 1 47.95 GTTCTTTTTACCCACAGTTAAGTCGTCTTAGGCCAACGATTTTCATCGTCCGCCTAGGAAGGAATTAATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATG:1 - chr3R 6014666 5' - Juan 3779 1 53.79 TGTGTTGTTTCATTCATTTAGCAGATACATCTGCTTGTTTGTACAGAGATACAAAAATATATATATGCGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTT:1 - chr3L 3453712 5' - Tirant 8454 2 54.79 GGAATCGCAGATCATTGCATCGGTGGTTTGCAGGGTTGGTTAGCGGGCGTGGAGTTGGAGGGCAGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACG:1 + chrX 19521440 5' + R1A1-element 4926 1 63.89 GAATCACGCACTGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 - chr3R 30264109 5' + blood 54 2 57.14 CCTATCCAGGTGTGTGTGTGTGTGGGTGGCAATGTTGGGTCCCCGGCTATGCGCGCATTATTTTTGATTTGGCAACAGCGATGGCCCCCAAACCAACAGTAAACATATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAA:1 + chrX 6141874 5' - accord 7263 2 69.01 CCTATTCAGATGACCACATCTGGGCGTAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATT:1 + chr3R 25387751 5' - I-element 4989 1 71.28 GGAAGGGTATTAAAGAGCTGTACTTTCTCATCTGCATTTCATTTATTCCTACTAAATTGAAAGGTTTAAAACCCCTGAACTAAACACACTTGACTTAGTGTGAGGCCGAATTAACCCATGTCGCCTTAGATACCAAAATCCTAAAT:1 + chr2R 11250253 5' - roo 8755 2 77.40 TTCACCAATTTGCATCCGCTACTCCGGGAATTTGAAAGTTAAGGTTGCTAAAAGCTGCTACAAGCTACACCAAAGCTACGTCGTAGACTGATGGAAAGCGAAATGCAGTCACATATAATATGTACAAAGCTCTCCTCCTCCATGC:1 + chrX 2523277 5' - baggins 5216 1 58.62 CAGGCGCAACAAAAAAGCGCCATTCCCAAAAACCCATCATAGTCAACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTCAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTTG:1 - chr3R 20934758 5' - 412 7470 2 65.75 ATCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr2R 21820733 5' + Doc 41 1 59.41 CAGTTTTCCCTTTCTTCAGCCATTTCTCCGGCAGAAGAATCACGCACTGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGGACCTATAAGTACA:1 - chr3R 30264145 5' + blood 24 2 69.86 GGCGGCATGAAGTTTTCTGGGTTGCTACTGTTTACCATTACCATTATGCATTTGTTTATTCCTCTTCGTTTTCTTCGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTT:1 - chr2L 13629183 5' - Tirant 355 2 54.11 AGCCATTTCTCCGGCAGAAGAATCACGCACTGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 - chr3R 30264128 5' + blood 41 2 58.22 CGAGGGCAGCTTCAGTCAGTACTTACACAGTCAACGCCTTTCTGTTAAACCCACAAGCAATATATCACACGTATGTGTACATTAACAACTATATATTATCAAAGAGCATACATAAGGGACACGAAAACGACATTTATAAACATTTA:1 + chr2L 13587086 5' + transib3 107 1 52.05 AACAGGCTGAGCGGAGCCACTAGCACTCCCGATCCGATCAGGTAAGTCTCAGTCCATACAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCT:1 - chrX 18220681 5' + Burdock 58 2 60.27 ATGTTAACTAATTCATTAACTTACTCTGATTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTA:1 - chr2R 17097646 5' - P-element 341 1 17.46 ACAGAAATTAGTTATTTCCTTCGTAATACGTTTATCATAATACCTACTTTAACTAATATACTTAAATCTAAAACGGACTTGATTAGTAATACGATTTTAAAACTTCAAACTAAAATTAATTCAGATAAAATTAAAATTAAAATTTT:1 - chr3L 16942354 5' + 1360 3045 1 29.45 AAGGACAACAATCGCTGAACTATTCAAATATATACATATATAGTGGCTAAGTATAGAATGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chrX 11008408 5' + hobo 47 1 57.04 ACTTGGACTCCTATCTGTATCTCTGAATCTAAATCTCACTGCAGAACAAGAAGGGCGTTTGCCTCTAGCATAAAACTGACCCCTATTCAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTT:1 + chr3R 15051661 5' + 297 6503 1 63.70 CCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAG:1 + chr3R 24750951 5' + G6 43 1 54.96 ATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr3R 16276419 5' - pogo 2079 1 60.00 CAGTTCTTCGTATTCTTCTATCCATACTTCGGCTGGAATAGTGTTAGTGCCATCATAACTGAGTATGCTCTCTTCTACGTCGCGAAAATTGATCGCATTCTATCATTTTCTGTAACTACGTTGCGTCTACTCCTT:1 + chr2R 1340879 5' + gypsy5 6884 1 56.30 TTATAGGTGCGTTTGCGTTTCATATTAAGGTATACTTTTAGACTGTCCTAAAGTATATGCTACATATACCATGATATGCTACATATCTATGATACATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr2R 17169334 5' + hobo 26 1 65.07 GACTATCTGAGAATCGTAGACAATAATTTAAGTAGGCATTGAGTTGCATATCCTAAGTTAAATATAATATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3R 23161374 5' - 412 452 2 56.30 GATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCA:1 + chrX 21087585 5' + mdg3 5299 2 54.11 AATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAAAACCCATAGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGAGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCG:1 - chr2L 3133716 5' + roo 217 2 68.49 AGCTGAGATGGCTGCCTAAGGCCAAAATCTGTCTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr3L 5069510 5' + opus 151 4 56.30 AAGAGAGCGAAAGGCAAAAAGAGAGCGAGAAACGTAAATAAAAATGTAAAATAACTGTATTAAATATAAGTGTTATTGGGATCTAATTATGTAATAGAAAAGTTAAAGTTAAGTTAAAGTCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAG:1 - chr3L 20540461 5' - Cr1a 4243 1 71.03 GAATATCAGTTCGCGAGCTAATTTGAAAATGTTTTGCCTCCACTTTAGTTAACTTTGTGCTAGTTCTGCCTTCTGCAAATATTTGTTAGATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2R 10160641 5' + hobo 33 1 56.85 ATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCC:1 + chr2R 17544157 5' + gypsy5 6987 2 59.17 AGCTGGAAGACCCGAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGCAACTTAAA:1 - 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roo 8649 1 71.92 TACCAATTCCAGGTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 + chr2L 21643010 5' - Tabor 7281 2 55.48 AAAAGTATGTCGCACAAAAAAAAGCACACACTAAATTACGTGCAAAATCAAAGAACTCATTGAAACCAATTCCATGCACGCTACGCCGTTAAAGAAACCACAACGCGTACGACTACTTGCCCATAAGAACAAGAGACATCGAACGC:1 + chr2R 16920071 5' + jockey 4579 1 45.89 GCTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr2L 3960190 5' + jockey 14 1 62.50 AACAAAACAGAACAGGCGGGCTGCTCGATTGTGCCCCATAGATTCCGAGCGCGCGTATTGTGTTTGCTCATGTTTTGATAAATGAGTGACAAATAAGATTAATTTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGT:1 + chr3L 17971627 5' + Doc 172 1 71.23 ATAGTATAAGTAATAAGTACTTAGTTATTAAACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2L 19691261 5' - roo 8987 2 77.08 AACTTTCTTCAGAGATGAATTGTCAGCTGAGCAAATGCAACTGAATTTCAAAAGAGGGAGTGCAAAAAAGTAAGGATTTGAGTGGAGAAAGTTCCAGGGGCTTCGAGGTGCGAAATTTCGGAAGAAACTTACCTTGTTATTGATTT:1 - chr2L 12953363 5' - TAHRE 10135 1 69.18 AAAGCAAAACAATATTTAACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3R 26486009 5' + 412 7103 2 51.37 TATAGGAACTTGCTGCTACTACCATAGTATATGAGTTTGTAGTCGAACAACAACTAGCTTGGGTCGTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 - chr3L 24710047 5' - 1360 3333 1 54.79 TTTCAGTATGTGTTGCGTGAACGAGGACCGATGACCACATTGGGTGGAGTCGAGGGTCTGGCCTTTGTGCACACACCCTACTCAAATCGCAGTCTCCAGCCGGTGATGAGTATTGCTACCTTTTTTTGAATAGCCTGGATCCTTTT:1 - chrX 14864840 5' - X-element 4281 1 65.75 GGATGTCGGATGTGGATCCCTGCGTCCGCACACACTAAGAAAATATATAAGCGAAATTCCGCTTATATATGCTTATGCACAACATTATTTTATATGTGATAATCACATAATATTCAAGCAAATGCTTTAACTTTATTATTATTTGA:2 - chr3R 24547880 5' + 1360 308 1 47.26 CAATATGTTAGAATATTTCACACAGAGCAAATGCCTCAAAATCGGCGGGATATAGGCACGTCTAGGTACATATACATATGTGTATATTTTCTATATATATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 + chr3L 16059200 5' - 297 377 2 74.66 GCAAATTGCTCACACAGTGGGTTAAGAATGATTGGAAATGGGAAAAGGATATGAACTGTTATAAACTAGCTAAATAATAAGAAAACCACATTTATTTAGTTACACATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 - 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chr3R 19447145 5' + invader1 83 2 71.92 GCCCAAAAGTCGGCACACTCAGAAATGCCAGAGGCAATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTA:1 + chr2R 17544121 5' + gypsy5 14 2 69.67 GAAAGCACCTGCAATTGATAACGGGTCGCCAAATGGTAAATAGTACAAACAATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTG:1 - chr2R 18689236 5' + Burdock 69 2 64.38 TGTCCAGATATTTGGCCACACAGCGATCGATGCACACCATCTCGCCTTTGCCTGTAGGGTGCGGAAAGCATTAAAATTATAAGTGCGGAATTGTGGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2R 21690424 5' + 412 7077 2 64.58 TTTTTTTTTTACATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr2R 18344642 5' + 1360 55 1 55.86 GGGTGGATTTGAGCTGAGGTGTAAACCGTTCAGAGGTCACAAAATGATTGTTATTATACGCCCTTGTTATTATGATTATTACTGTTATCAAAGCCAATGTCAAGCCGAAGAATATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr2L 19600591 5' + roo 73 2 73.97 CTATCGAACTAAAGCTCTCATCTACCATTTCCCATTAATAATACAAGGTAATTCCCTTTCACGATCTGATAAATTCACTTATATCATAACTCTCTCTCCTGGTCATTATTTTTTCATTCGCATTTTTTGCATAATTTGATTTTGCT:1 - chrX 14559746 5' - HMS-Beagle2 391 1 69.18 AATCGCGGAACATTCTGAAGAAGAAAACTTCTCTCGCTAGAAGAAGCCAATACATTCATTGATTGAAAGATTTTCATTTTAGTGGCGCCAATCGTTAAACACTTTTTCGTATTCTCGGCTTAACTATTACGTACGTACATACATAT:1 + chr2R 17205538 5' + 412 7277 2 69.18 AGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr3L 18253809 5' + blood 7050 2 64.00 AAGCAGCTTGTGATTTGTTCAAGCGTGAAAATGGCTGTCGACAACAGACAGCAGCATGGTCGCCGAGCGGGAAAGCGTGGAGAAATCGAGGGATACAGTGGCAGCCGGAAACTTTATGTGTGCATACGTATGCTCATGC:1 - chr3R 15754094 5' + 1360 180 1 66.91 AGGCCCCCGCTTCATTATTCAAATTACTTGTGTGTTTGTGCGGAATTTATCAAAGTCCTCCCGCAGCCACAGATGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGGGTG:1 - chr3R 23504274 5' - F-element 4463 1 69.30 GTTTGGGAGCAAGTCTGTCCAGTTCCTTCATCCCCATTCCGCTCGCTATTTTGAATAGGCTGCAGGGATCAGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTT:1 - chr3R 11944940 5' - roo 9037 1 62.88 GCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACC:1 - chrX 22386763 5' + hobo 50 1 49.25 GGGAGAGTGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3L 19580900 5' - roo 9033 1 59.26 ACCACCTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGCCAGCAGGC:1 - chr3R 18635309 5' + opus 59 4 64.38 ACGCCCCACTATTAACTGTTAGCAAGCCCAGGTTCACATGTGTAAAATTTCAATTCGCTTTAGGCTAATTGAATTGGTCTCACAAGGAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAGATC:1 + chr3R 14963786 5' + jockey 4973 1 62.33 CATATTCCAATTAATTCATTTTCACATCAGCGGAAATAACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:3 + chr3L 4641026 5' + jockey 91 1 74.66 ATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chr2R 15070165 5' + 412 70 2 65.75 CTTTTCCATTTCTCACATTACCGAAATTCTGATCATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAA:1 - chr2R 10160953 5' + transib2 82 1 75.86 ACGCTCGTTGTTGAAACGATGAAGACATCAAATTGCATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 - chrX 6633024 5' - P-element 2809 1 32.19 GATGGACAATGGATAATGCCGTACTTAAAATGGAATGGTACGCAAAATAAGCGAAGTTTCAAGGTGGCATATATAGAATTTCTTTTCGCGAAAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chrX 10579854 5' + pogo 23 1 69.86 GTCCTTCGCCTTCTGTATGGTTTTTCGATGATGGAATCACAAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 + chr3R 20203619 5' - 412 443 2 60.83 ACAGAGCATAGGTGCAGAGGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTC:1 + chr3R 5773141 5' + Stalker4 62 4 57.53 CAGGATTTTCATATCGGGGATGAATGGATTGGAAGATCTCTATATAAGTTATGGTTATGGTTTTAGCAATTAAAAAAGGACGCGCTGATTACATTGTATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTTACAGGTAGGGTGGGTATAGAATA:1 + chr2R 16060868 5' + Circe 7197 1 59.59 GCAAATAAATACTTTTTAAATACTTTTTGAATAACTCGGGCGTGAGCTCTATTTGTTTTCTTTCACGTGAATTGAGCTGAAAGTAATTAGGCAGAAGTTGACACTTATCTTAAATCCTGTGATTGTTATGTAATTGTAGTAAAAT:1 - chr3L 10075049 5' + X-element 4587 1 60.69 CTAATAGATATACAAAATACATACATAGATAGAACAAGCAAATGTTGCGTTATCACAAGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chr2L 6177627 5' + pogo 60 1 60.27 GAATTATAAAATTATATTTTATATCTTAAAAATGAATCTAATTTTAGCATACTCGTGGTATTTTTATATCCCTAGTATTTTTCATCGCACCGGTGGCAGTCACTCTAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGA:1 - chr2L 16731085 5' - flea 4939 1 72.60 CGACATCTTTGAACTGTGCCAACTAAATGCTGTTTACAGAAAGTCTTACACGCTAACTTAGATACATCATCATTATTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3R 15295834 5' + roo 8707 2 56.16 CAGAAGAGTATAAATAGCAGGTAAGGAGGATTTAAGAGCCACCGCGATTAAACCCATTTGATTTTGCGCCAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTTCAT:1 + chr3R 11870054 5' + pogo 46 1 52.74 AAATAATTATTGTCATGGCTGCGAGCGAAAAGCAATTATTACTATTATTGCTCTTTCGAGCAGCGCAGGTAAATCAATAAATTTACATAATCATTGTGCAAAAGGGCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2R 22463091 5' + roo 8680 2 73.97 TAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTA:1 - chr3L 7801278 5' + Transpac 195 2 76.03 TAAGCCAACTTTGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCTAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 - chr2L 22319364 5' - Transpac 246 2 60.27 AGCACCACACTTTGCTGCATTTTGAAAACACCATCTGAAAACACCATCAATAGTCGATTTCAATTTCGTTACTGATGGATTTTTGGTCGACAGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 - chr2R 4536722 5' - mdg1 389 2 63.45 ATATTGTTACCGTTAAAATTTTTATAAAAAGATATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTT:1 + chr2L 7822242 5' + Juan 69 1 59.59 GAAACAGGGGGTTCGAGATAAACTTCACTGATGACTCAGTTTCCGAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr2L 21153425 5' + 1360 8 2 80.14 GCAAGTGAAATTTGAATAAAGTTCGAACGCTCCTCATCGAAGGTGTTTTAACTCTAGATGATAAGCCCCCATTGTGTTGAGCTGTCTGTGAAAACAACTTTCCTACTTCCCCCAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCT:1 - chr3L 16261198 5' - 17.6 7113 2 77.40 GCAACGAACTGTCTGCAAACCCTTTTTGGGTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTGTCTTTTTCCATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1 - chr3R 9379475 5' - jockey 4955 1 70.40 AATTTCTATTTCTTCATATCGCACAGAAAAGTTGAATTTGTTGTCCTGCAGATAGCGGAGGCAGCAGAAAAAGACCATTGGTCAAACAATATCTGTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTTAAAATAGAATTTGCTTG:1 + chr2L 20622311 5' - 1360 3267 1 63.01 GCCTGGTCAAGTTGACCGCAGTTTATGCCCGGGGTTTTACGGCCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGATTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTT:1 + chr2L 19476979 5' - hopper 1339 1 67.12 AAAGGCCCAGCATGAATTTCAGTCGAAAGTATCTATCTATGTATATATGTAGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAG:2 + chr3R 8849765 5' - 297 328 2 71.23 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGC:1 + chr3L 25232765 5' - accord2 7579 2 58.87 ATACTAACTGTTGACCTAGCTCCATGAGCACTGGCTGAATTCATTGCCACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGT:1 + chr3R 4663920 5' + FB 75 1 67.12 GAATGGTACGCAAAATAAGCGAAGTTTCAAGGTGGCATATATAGAATTTCTTTTCGCTAAAAATGATATACAGTATAATTCGCTAAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCTGCAAGATATCTGCATT:1 + chrX 10579886 5' + pogo 36 1 53.54 TCCGCCGATCCAATTAGACAATTTGACCAGCTTTACACATATGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGCTTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGC:1 - chr3R 23235257 5' - BS 4702 1 64.29 GAAAAAGGGCCGACATGTGTACGACTCAATTCCGAATTAAAATTACACATAGACTGGCGGTCAAAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 - chr3R 15667738 5' + R2-element 3584 1 60.98 GAGTGAGATATGATTAAGGGCTAGGGGAACTCTTCTACTTTCTTTCCTTTTGGTTTCTTGGCTGAAAGCAAAATATTTGCTGTTTTTGTTGCTTGATCTTCTCTCCAAACTATAAATGTTTGTGTGTGCGTATGTGTGTGTGTG:1 - chrX 9845611 5' - accord 190 2 68.75 AGTCCAGTTGAGTTGGGTAGCTGTGGCAGTTATTAGAAATTCCATTATGCATGTGTATGGGGTGCCCATGTGGGCTGTGTCAACACTGACGGTCTGGATTCACTATTTCTAATCTATTTTCAATTA:1 - chr3R 17336396 5' - 1360 323 1 80.95 TACGTAGTACACAGATTTAATCGTAAACACTAGCAAGTCGAGTAAGAATTGATAGATGGCTCTGAGCGGTTGCTCCATGTGCAGAAGACCCGGTGAGGCGGTCATGATGATGACTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAG:1 - chr2L 4813437 5' + Idefix 241 2 76.55 TAGGAAACAGGTTCGGAAAGGCCTCATACATACTTCTCAACAATTGTTGGAATATATATATTTCATTTTTTACCATATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCG:1 + chrX 22905197 5' - INE-1 108 1 50.00 ATAAAATATTAAATTGAAAGCCCAATTTTTATTCAAAGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATACCATAGTACTTATTATTTATTTGATTCTTCTAATGAA:1 + chr2L 2708634 5' - jockey 4817 1 79.45 GCTACCTAAAAAAATACAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGATGCGTGACCTTTTGTTGGCATGGAGTCCACCAAGTCCTGGCACCGTTATTAAGGAATTTTGCTCCA:1 - chr3R 19416855 5' - Tc1 1253 1 60.27 TATTCATACTTAGATTTAATCAGCTTTAATACAAGAGAACGATAAGTCAACTTCATCGACTATCAGATACCTGTTAGTCAGAATATGGAAACAACTATTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACAT:1 + chr2L 20045042 5' - looper1 112 1 76.15 CCGACAGAGCTTTCCACGCCGCCTTTCGCCTTCAATTATGTCCTGGACCCTTTGTCCTTCGCCTTCTGTATGGTTTTTCGATGATGGAATCACAAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTT:1 + chr3R 20203566 5' - 412 7523 2 63.01 ATTTTATGAAAGGGACAGTTCACTTAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 28450770 5' + roo 47 2 54.11 GTTGCGTTTTATGTCTTTCGCATGTCATGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCG:1 - chr3R 972159 5' - blood 139 2 74.79 GTTTTGTCAATGCCCGATACCCGATGCTCGATGGCTTTTCCGTGAGTGGGCCGCCCTGCGAAAAACCTGTTACAGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACA:1 - chr2R 20150536 5' - diver2 249 2 58.56 AGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATGGCTCTCTTTCCGCT:1 - chrX 388295 5' - 1360 3312 1 82.26 AGATCTAGGTGCCCGAAATAAACTAAGAAAAAGGGAGTTTTACTGCTTATTAAATGTTACCACAAGGCTAATTTATTCGACTATTTATAGGCACCGCCTAACTAACCATGTAAAAATATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCC:1 - chr3L 18266289 5' + INE-1 87 1 76.71 ACCAGGGCAAGGATAGCACTCCACCTGGTCATGTAGAACCAACACCAGCTATGTCCGCTCAGAAAACATCGGAAAGTGTTTCGGTGACATCGTTCCACGATTAGCTAGGGAAGGTAAATTAAATAAAAGTAGTCTACTGGAATATG:1 + chr2L 196522 5' - Cr1a 3972 1 59.59 AATGCACATCGAAATATACAATATACAATGCACATACAAAATACAATACAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr3R 7450311 5' + Doc 56 1 60.48 CGAATAAAAAAATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr3L 18253760 5' + blood 36 2 60.96 TACTCATGGGGCTAGTAACGCAAAACCAAAGAATCTGTTCAGCCCCACGCTTTTAATTTGCCTATACACTAATACACATACAACATGTACACCCAAATACACCCTACACTAGTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAAAATA:1 - chr3L 285794 5' + Idefix 6918 2 60.27 AAATATGTGATTATAATAATGTTGTGATTAAATTTTGTGATTAAAATGACTACGATCTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTACATTTTATAATTAATCTTATATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTAC:1 + chr3R 7080599 5' - G4 3760 1 60.96 AGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAACTCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAA:1 - chr2L 12291944 5' + Tirant 59 2 58.90 ATTTATAATTCTTTTGCGCATTCATTAATGTCGTTTTGTACTTTTGATTTCAATTTTGTTGTAAATTATATTTTTCATTTGTCTAAAAAGGGTTAAGCATTTCCGACCATATAAAGTATAAATACTCTTGATCAGAATCAATAGCC:1 + chr4 394952 5' + INE-1 87 1 61.64 TGATTTCTTACCGGCGTCTGCTGATCTGCCAGATCCTCCTCAGATTTCTCCTTCTTTTTACCATGGTAGCTAAATCTGTTGACCAGAAGTAGTTATCTCTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAG:1 + chr3L 26865222 5' + flea 404 1 74.66 CACCACATCGAGTTATTGTTTTGTATAATGATCGTAGAGTAGTGGGTAAAAGTAAAACAAAAAGGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 + chr3R 24603059 5' + I-element 55 1 53.52 CACTTATTAAAACGCGACCGACTGAACCGACACTGCTTGCCGGAACAAAGGCACCAGCACGTGCCGCCCAATTATCAGCCACTCGTGTTGAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCGTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 + chr3L 1856656 5' + Transpac 28 2 63.70 ATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chrX 388218 5' + 1360 14 1 70.43 CTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATA:2 - chr3R 7616812 5' + Stalker2 73 2 71.23 ATGTGCTGCACGCGCGGCGACTAATCTACATTTATTTATGGATCCTGGAACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 - chrX 388368 5' + 1360 26 1 69.18 TGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTCGCAAACACAAATAAACATA:1 + chr2R 12065594 5' + Stalker2 7321 2 65.52 ATGAAAATGCAAATGTGCTCGTCGTGCCATCTCTTTCTGCCCATGTGGCCCCATCTCTTTCTCCGCACAGTGTGCGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr2L 16615739 5' + hobo 48 1 54.11 GGTATTCCCGGAAAACATACAACTAGAAATGTAATTTTAATCTTTTCACTTTTGATGACTTCATTAATATTTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGC:1 - chr2L 9418606 5' + rover 7000 2 54.79 TAGACGCAAAACACTATTTGCCATTGTCACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr3R 28450636 5' - roo 9030 1 56.16 GGGAAAAAAATAAAATAATATTGAAAACCTCACGAGAAAAGCAATTCTTCTTGCAATCTTTTGTCTAAAACCCTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACA:1 + chr3L 9589348 5' - 1360 435 1 66.35 GTGAATTGGCGAGTGACCGGCAGCGGCTGCGGCTCATATGACAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGTGTATAAGGTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTC:1 - chr3R 31141071 5' + Burdock 6170 2 59.26 AAATTGAAATAAAAGGTACACTTAAATAAAATTGCTAGTGTCGATGCGTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTA:1 - chr4 184081 5' + 1360 157 1 59.72 TTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATCCACACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - chr3L 19031297 5' + roo 91 2 80.82 AGGCGTCTCAAGTGAGAAAATGCACATATGTATTTGTCCAATATGTCCAAGCCACTCAATCGGATTAATCCCAGCTCTGCTTAACTTTTTGGAGCATTGTCTGATGACTGTCAGCTTACTGACGATTTTTTTTTTTAGTTTTTATT:1 + chr2L 21898335 5' - Doc 4694 1 61.64 GGAAATAAATGCATTAACTAGTCAAACACACCCATTTGAGGAACAATTACAGGATATACAAATGGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCAC:1 - chr3L 18276033 5' + micropia 5197 1 56.16 TGAATTTATTTATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCACACGTGAATCCTGTCACGGTCGCATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAA:1 + chr3L 15280091 5' - Stalker4 214 4 61.11 AGTTGATGTCAAAACGTTGCGCCTAGAAAAGTTTTACGTTGTTATTAGTTTATGGGTGTGAGTGTGTATATGTATATGTATATGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTT:1 + chr3R 25699586 5' + flea 385 1 63.01 AAAACGCAAATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCT:1 + chr2R 18689136 5' - Burdock 6348 2 53.73 GTGCTATTGTAGCCGGCGTTTTTTGCCGGTGCTTAAATCTCAATCGGACATTTCCATTGCAAAGGCGATTGGATATTAAGAAATAGACCAAGTCACGGTCGCCATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGA:1 - chrX 1276420 5' - Stalker2 7631 2 57.53 GTGTGTGAATTCCGACTTACGAGTGTTCCCATCGAAGGTTAGGCATTATTTTTTTCGTTCGGATGTCAATGGTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTC:1 - chr3L 640185 5' - Doc 87 1 50.34 GGCTTATGTAGCTTGCTGGCTCTTTAGCTTTTTTAGCCATTTGGGGTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTTATCAGCCTGTTCACACATGTACATGAATATATTTAAAGATTTACAATT:1 + chr3L 21013820 5' + roo 8684 2 63.70 AAACTATTATTTAAATTAACGCAGTATTCAAAATTTTTACTAATAACAAAATAATGTTTTTTTATATTCATAATAAGACAACAAGATTATTATATGTACGTTCAGTAGTCTTCTCTCATTTATGCGTTTCCTCCGGATATAAATGA:1 - chr3L 24535872 5' - rooA 7175 1 49.32 TACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 - chr2R 18344629 5' + 1360 52 1 59.69 ACATTCAAAACAAGCTGGAGCAAAATATGTGAGAAGCAATCGACTTGGGGATACCATAGAATTTCGAAATTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGA:1 + chr3L 4081564 5' + mdg1 52 2 54.79 AGCTCGGATTTGATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr2R 15070095 5' - 412 7524 2 56.47 AATTTCTAAATCCAAAACATATGCTTCAGAACAAACTCTGAACAAGCTGTCAGCGTGGACGCGGAACGGCTGCCTTGGAAATCAAGATGTATTTTTTGTGAGGGTCCCATGGTTTCGTAACCCTATATACATACATATTATGTACA:1 - chr2L 21749184 5' - Dm88 4372 2 73.29 TCTATCTTTATAAGAAATACGCGTGATTACAAAAAAATCAAATTTCTAAACTCACATTTGTCAATACAAGTGCAATTATTTCAACATGCTAGTCAATGATAAACATTATCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr2L 10514417 5' + 1360 9 2 72.14 AGTGTGGGCGTGGCAGTTTTAGACGGTCTAAGGGCGTTAGAGTGGGGGGTGGACAAAATGCTTTTATTTATAACTTATATAACTACAAAAAACAACTTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chr3R 4322612 5' + F-element 42 1 40.41 CGGACAGCACACCGCGAGGCCAAAGGTGTAGGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAAGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 + chr2L 22319244 5' + Transpac 4959 2 55.48 CGGGGTCATGTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chrX 1103569 5' + pogo 17 1 72.41 ATAATAACACCGACTAGGATTAATACAACACGCTCTACGGTAAATAAACATTGTACATACAATCTTGCACCGCACATACAATCTTGCACACGAAACATGAAACCAATTCACATTTTTGCTTACACCTAAGCGCATGATTTGT:1 + chr2R 3142414 5' + rover 103 2 68.31 CTTTCTCGAGTCCCTCGCGTACCTGCAAATTGGAAGTGGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAG:1 + chr2R 6885318 5' + flea 4758 1 70.59 TTGAGTTTCTGTATTCACTTTTGGATTTTCCTCGAACACCCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 23773163 5' - roo 9052 2 47.01 TGTATACATACGTGTTGGATTATGTATACTGTAAATGTACATTTTTAAATGACCTAAATTATTGAAATAAAAAAAAAACCAAAACCCGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATT:1 + chr3R 20840031 5' - roo 374 1 62.33 GTTTAAAGAGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGCTTTCTATATTATAAGTTTTTATTTCAGCATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 - chr3R 15054246 5' + 297 6611 2 62.33 ATTGAGAACTATTTTCGCCAAAAATTAACCCCCATTAAAGTTTAAATATCCTACTGGACATTGCTCGTTACGAGATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 + chr2L 17839360 5' + blood 7012 2 78.00 GAAGCGTGAGTCGAAATGTATCTTGTATCTGCCGGATGTCCTTTGCTCGAGTTCCATTCTATGCGCTTCTAGTGGCCAGCTAAATTTAATGGACCGTTCCATTTTCTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 + chr2R 17332096 5' - jockey 4979 1 66.44 AATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 19436107 5' - roo 367 1 56.16 GATGTATTAGTTTGTTATTAGTTTCTGTCCGGGTTCGGGCACGGAACATGAGCTCACCTTTACCAGAGGCACCCCGAATAGATTATACCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTGTCCAAAAGGAGATAGACGCTAAGGAA:1 - chr3L 5667978 5' + Tc1-2 1339 1 52.74 ATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGG:1 + chr2R 18689166 5' - Burdock 172 2 77.93 ATCCCACAGCCTAAGCCGAACGCTAGCCCGAAACCGAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3L 19581003 5' + roo 8705 2 57.64 AAGTAATTTTAAAATCGAATATAAGAAGATTCTACTACATAATTAGATCCCAATTTAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAA:1 - chr2L 17292450 5' + Doc 4495 1 61.64 CTTAGCATATAAGCCTATTATTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chr3L 16015385 5' - 1360 3387 2 78.08 GGTAGGGAAAGTTCTGCATGTATTTTATTTGATTTATATCCGAGAACCCTTGAAGGATGATCACCTGACAGGTGAGCGGAACTTAATTGAGCACTAAGTTCCCGCAACAACACCATCCAAAAAGAAAAACAAAAAAAAAAATTGAC:1 - chr2R 17184432 5' + transib2 105 1 59.59 CACAATTCCATGTTCATTTACTGCTGCCGCCAGATCGCACCGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAACCTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAAT:1 + chr3R 10907556 5' + X-element 97 1 75.34 ACATGACTAATCACATTTTGCTTCCTTTGCGGACTCGATATTATACCAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATT:1 + chr2R 12371068 5' - I-element 5285 1 65.75 GGCAGCAGGTAAATGAAAAATTTGCCTCCATTTTCGTGGTGCGCGGGGTCCAAATGTATTTTGCATCATTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr2R 16413173 5' - roo 359 2 51.41 AGGGATAAGAAAACAAAAGATTTGATTAATTAAGGTAAGAAGACGCTTCTGGGATGTAAAAGAGAAGTATGCAAAGGGCATATGAACGTCGAAATCTCAGGAACTTTAACGCCCAAAACTGCCACGCCCACAATTTTGAAAACTGT:1 + chr3L 21362976 5' + INE-1 255 1 56.85 CACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3R 28450663 5' - roo 339 2 67.12 CCGGCCACCTTGGCCCAAAGCGAACCACCAAAAAAAGAGCGACCAAATCACAAACAAACATTAACTTGCATAATCACATGAAACCAATTTACATTTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCAATACCGTTCTTTT:1 - chr3R 19413538 5' + rover 125 2 51.37 CCCATGTCCTTAACTCCCTTTACCCGCCCACTTGGGCATGTGGGCGTGGTCCGATTTGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAAGCCGAATGGCATCATGTTCAAGCCACCAA:1 + chr3R 15511828 5' + Ivk 4988 1 53.33 AATTAGTTTAGTGCAAAATTATGATTAAGACAAAATTGAGAAAGATATTCTTAGGGCTCCTATATTATATACACACGCAGTTTGCTTTTAGTTGTGCTTTATGTTAAGTTATATACACTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCT:1 - chr3L 11080009 5' - 1360 3285 1 76.71 GACATTTCTAGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr3R 16276323 5' + pogo 57 1 61.64 ATAAGTTTAAATATTTCAAATCATTTTATGTCGAGGTAATGCAACAACTCTTTTTTGTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCC:1 + chrX 14993786 5' + Quasimodo 278 2 60.96 AACCACAAAGACCCTTTCGCAGATCGATAAAATTATTGAGGAAACCTATGCCACAACTCGCAGTAAGTTGACTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr2L 11143205 5' - 1360 3343 1 52.14 CAAAGGGAGGACTTCTCGGATCCCTCGGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:1 + chr2R 10910174 5' - Tabor 458 2 66.44 AAAAATATTTAGGTACTTTCATTAATGGGCAACCTACAATGAATGTTGAAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGC:1 - chr2L 13332746 5' - micropia 5433 2 79.37 CCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAATACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1 - chr3R 25795807 5' + jockey 98 1 78.08 CATAATTTGGCAACTAAAATCGAAAAGAACAAAATTATAAATCGTTCAACATGCTATTCAAACACTTATGACATCAAGTGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chrX 8349858 5' - roo 9030 1 58.22 GTTCCACTCATTCAAAACGGCGCTGAGTGAGTTCGCAATATTACCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGCACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTT:1 - chr2R 6493177 5' - transib2 2748 1 68.49 GTAGCATTAGTTAGTAGTATGAAAAACGACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chrX 1103578 5' + pogo 15 1 71.64 AATTGGATGATTATATTTTCCCTTTTGCCCGATTGGGTGGCAGTTGGCCAACAAACTGCGACCTTGGCGTTTAACCGGTAACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2L 18522215 5' + roo 8703 2 60.27 CAGCGAAGCGAACTGCGCCCTGGAGCTGCCACATGTTCTGGTCCAGCCGAGCTCCCTGTGTGCCAAGAAAACGGGAGCGGGTCCTTGTGCCAGCGATGGTTGTAATGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 14218566 5' - roo 391 2 71.94 TTGTGATTCTGTAAAATATCACCTTAAAAGGATAATATGCAATATAATAAAATTATACCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3L 19864037 5' - roo 346 2 64.38 TGAATCACATTTCGATATTGTGTTTGAGGTCCAAGGTTGATTTATTTTCAGTGTACAACCCGAGTATGAGAGCAATTCTACGGCACTGAATTTTGCCCTTGTTAACTTTTAATCTTAGTATATTTTCGAAACTATTGAGGAAATAA:1 - chr2L 4071721 5' + HB 1484 1 69.18 GATATATGTGGCAAGCATTTGTTCGCAGCTCGCATTCCACTTAAAATTGCGGATGAATAGTGCTGAATGAATGAATGCACTCATGATTTTATCTAGATTGTTTTTTTTCTTCCTAATGCTATACCAGTTACTCAGCTAGTGTTAAT:1 + chr3R 25523538 5' - INE-1 536 1 76.71 AACATTTGGTTAGGACGGCATCAAGTTGGCCTTTATTTATTTAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTT:1 - chr3R 18528401 5' + roo 8696 2 60.27 GAATTTAGATGTATTTTTCAGGAACAGAAAACACAAAGAACAGAAAAACGAAATTAGTTGAGCTTAGCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 - chr3R 7778360 5' + transib2 52 1 52.74 GTTTAAAAATTTATAGTAATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 + chr3L 13678877 5' + hobo 5 1 72.34 CGATGTCCGGCAGCAGGTACTCCAGGGCCAGGGCAAACTTATCCAAGTACTGATGCAGTTTTTTGTTCAGATGATCGTCGCGCAGCTTCTTCATGTGCCGCCGGAATATGTCGTTCTTCCAGATATGACTTTAAAATACAGCA:1 + chrX 17649184 5' - Helena 475 1 75.52 CCCGAAACCGAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTACAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3L 19580977 5' + roo 8722 2 62.22 AGGAAAAGGTGTTTGGGGTGTCCAGTAAGTGGCCGTACATTCTTTGTATGTGGAATTCTATTAAAACAAATAATGGAAGAAAGTTAGCTAACGGTTAGAATATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGC:1 - chr3R 17302812 5' - I-element 5224 1 68.49 TTACAATTAGTTTTACCTTAGAAAATTATTTGAAAACTATATGGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTG:1 - chr2R 21870248 5' - copia 178 2 72.60 CCAATGCCAAGGTCTTGGTATCGGTCCTCTCCCCGTCCTGGGAAGCCATATCATATGCCACTTGGGGAAGGGAGAGTACCGAATTAGAAATGAAAATTAAGTAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr3L 22594095 5' + 297 6598 2 71.23 GCGGAAAATTTTCCCAATAGCACCTTTTGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr2L 14969053 5' + 412 7080 2 59.59 GCAAACTCATACCTACCCCTTTTACATATGTGAATATAAATCTATATTTAACATAGGTTAGCAACAAGTTCCGCATCTGCATTGTTTTATTTTTCCAACTGTTCTAAGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAG:1 - chr3L 15703004 5' - F-element 4535 1 55.48 GAATTGACTCGATTGGCAAAAGCATTGTTCGGCCCAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGA:1 + chr3L 4641191 5' - jockey 4818 1 76.71 AATACAAAAACGGAAATAGCCAAAATTTGTTAAATTTATTTTGTGTGTTTTTTAACGGGAAAAAGCAAAACAGCAACTAAAACATAACGGTAATAAAAAAAGCCAAAAACATTTCTGTGTTTATTTATTTCTGGTATGCAGGAATA:1 - chr3L 22832754 5' + Transib-N1_DM 391 1 77.40 CTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chrX 3646973 5' + 412 7124 2 75.78 AAGTGCAACATTTTTCATATTTTAATAAGCTAAATTTTCATTTTAGCTTCGGCGTTTGAAAGTCATATTGAAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 - chrX 20975855 5' - copia 240 1 51.37 GATTGTATTGGAGTGAATTAAAGTCACTAACTATCCGAACTAATTGGCATTGCTCCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTT:1 + chr3L 16973305 5' + S-element 1523 1 74.66 AGCAGACTGCATAGAATTTTTTCATATTTTACGATTGCGTTTTTTATTGTCTCTACTTTAAGGGATAATCGGTTTTAATTACATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTCTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGA:1 + chr2R 19839532 5' - TLD2_LTR 146 1 54.11 CGACTGTGACTGCAAATGCAGGCGGCAATGATTGCGGTGTCGTGGATTGGATTGCGATTGGGTATGCAGTTTAATATGCCTGAAAGTACATATATCCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAACTTTACTCGCTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 11513412 5' - roo 9049 2 69.86 ATGTATCACAATTTTGATCATTTTGTTATAATAAATACGGCTGCACCTGTCACAATGCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 - chr3R 17047904 5' + 412 65 2 59.59 ATTTATAATTGATACAACAAATTCATTAAGGGGTATCAAAGGATTCATTTTGTATAACTTATTCCCCCAGACCTCTTTGCTTTAAGCTTGTCTTGGTTTTACTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAA:1 + chr2L 17209214 5' - roo 52 2 69.18 GATACCAAATCATCTAACTATTTTTCACATGTCGGTAAAAATTTGTTTTATATTTTTTACGGTTTTATTGACTTAGTAATAACAGTTGAATATCCAGACCTCATTTAAATTTATTGTAAATATATTTCAAATTCAAATTCAAATTT:1 + chr3L 14920326 5' + Rt1a 311 1 54.11 GTAGTAATCCGTCTTAACAAACTCCGCCATGCCCAGATGACCACCAGTCTCTTCGTCGGGAACAAAGGTCACATACAAAGTCTGTGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3R 23098286 5' + roo 16 2 64.75 AGATTGTATTGGAGTGAATTAAAGTCACTAACTATCCGAACTAATTGGCATTGCTCCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACT:2 + chr3L 16973304 5' + S-element 1522 1 74.66 ATAGCTCACAGGTGTTTTCCTTTTCGTTGATCACACCTCCGGAGATCACTCCCCGCAGCACCCAAACGTCCTGTTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 14218391 5' + roo 8685 2 70.83 ATATGCATTTTCAAAAAGAGCCACGTTAGCGTTTTTTTCCCAACAATCTGGTCATTTTATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGCCATCTATTTATTCAATTT:1 - 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chr2L 5792099 5' + blood 50 2 51.37 CGCCATCTGCTTTCAAGCGTCTGGCCTTGGCCCTTGGCATTTCTTTGGGGAACATGCCCACGATTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTG:1 + chr2R 22222354 5' - Quasimodo 318 2 60.00 AGGAAAAGTGTTGGGTAAGCAGAACAGGCGATGTAAAAATGAGCGGAGAGGGGTTTCCATACAAGCGGTAAGGTACTATATACTATAAACATACATATTATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 - chrX 8219508 5' + opus 7 2 67.65 GAACAAGTTACAATTTGGGCGAGAGCTGGCCCAACCCTCACCCATGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chr3R 28406310 5' - opus 479 2 69.86 ATCACAACTTCTCGCTGCGAAGTAAGAATCAAAACTGATCGCAGCTTGCCGTTTTGCTGTTTTCCTGGAGTTACCGTATTACGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr2L 8984835 5' + pogo 26 1 65.19 TAAGCGTCTTCTGCCTTATGGTGACTTTTATTGTTTGAAAATGTTTGCTGGGTGTTCTGCAACCGGTTTTTCTCACTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCGCCGCACAGTGGTCTGAATTCAGATAA:1 - chr3R 9394701 5' + Cr1a 411 1 71.53 GAAATAAACTCAAGTGAGTACAAAATCAAAATGTTTTTAATATATAATATATGGATTTTTACTTTTTTATAAGCCATGGTAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGCCCCCTCAAAAA:1 - chr3L 18380360 5' - copia 4856 1 57.53 GACTCACCCGTCAAATGGCCAATTAATCACAGACCCCCGAAAAAGCTCAGCCAAAAACGACCCAAAACGAACCAATCGACATTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTT:1 - chr3L 3276403 5' - Doc 60 1 53.42 GTTGAAATGGCTTTTCTTGTTGTGCGTTTAACACTCACCACCCACCGCATAGGCCGCAGAGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAA:1 - chr2L 12486475 5' + roo 8673 2 76.03 CATCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 + chr2R 21820732 5' + Doc 68 1 67.44 AGTACGTGTGATTACAATTTTTTAAGATAATCAAAAACGTATGTACTTACATATGACTTATGTACATACATATGCTCATATATGTACATATGTACATATGCTCATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTA:1 - chrX 2295293 5' + Transpac 8 2 58.22 CTTACATATATCATAGGAACGCTTACATAACAAATTTTTTTTCTATCTCTTTTTATTTACAATCTGTTCTAAAAAAGCATGACATTAAGTAAATTTTATAATTAATATTAAATTAACAGAGGCATTAGTTATCCATTAATCCCTAC:1 + chr2L 19817828 5' - G4 3760 1 68.49 ATTTATTGCCCGGTCGCAGTGATCATCGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGA:1 + chr3L 6355623 5' + Tirant 58 2 74.31 AACAAGAAAAAAAAAATACGAAAATATTTTAAGCCCAACGAAAGAATAACAAATGAATGGAAATATTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACT:1 + chrX 9067434 5' + FB 929 3 55.48 CGATTCTTCAAAATTGGTTTAAAAGGTTATTTATATATAATAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:1 - chr3L 18801852 5' + I-element 80 1 73.29 ACATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 - chr2R 18344632 5' + 1360 66 1 62.33 AGATAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCATTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAGTTAGG:1 + chr2L 17626598 5' + roo 8740 2 71.72 TTGGCCATCCGAACTGACATATAAATTCCCAACCAACTTACCGGGCCCTAAACGAAAGACTTAATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACG:1 + chr3L 4507656 5' + G2 2796 1 56.85 AAAATAGATATACTCGCGAAACAATGGCAACTCTGGCCTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr3L 21910517 5' + pogo 15 1 76.03 ATTTTTCAAAAAATTAAATTCCATCCTTTAATAGAATGCTAGATAACAAAAATGACATTGATGCAATAACACGGTATAACCAAAGACACTAGAATAATTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCA:1 + chr2L 17431992 5' + 1360 3348 1 59.42 TTTCAAACCAACGGGAAAAAAATAGTTTTAAGGTTTTTTTTAGTGATATTTGTGATATGTTGTATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 - chr4 540576 5' + flea 23 2 61.74 GTCGCTGCTGCCATTTCTCGATAACTGCCGCCATTGTTGTAAATTCCTGTGCGTGTATATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chrX 12273161 5' + jockey 4694 1 56.07 TATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 + chr2L 3960187 5' + jockey 78 1 65.75 ACAAGCCAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCA:2 - chr2R 11146095 5' + Quasimodo 92 2 80.82 GGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGC:1 + chr2R 4577099 5' - Chouto 497 1 65.71 GTACCCAGGATTGGGGCGATGTCCGTCCCACCACGCCCCCCAATCACTGTTAATGTGTGTGTGTGGGTATGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 11679920 5' - accord 190 2 71.60 CCGCAATCAGAACACATTTTGTTGATTTTACACATTTGATTTATTTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGC:1 - chrX 14836264 5' + invader4 2831 2 69.18 GATTCCCCCGAATTTCGTTGCGAAAACTCGCTTGAAACCCTATGTTTTCACTTAGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - 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chr3R 6461864 5' + 297 6620 2 59.59 TAAGTGGGGCTAAATGGATGAATAACTTAAGCCAGCTGCTTCGCCTTTCCTCTTAGTGTGCGATGTTATGTAATGTAATAACGTCAATCAAATTTAAAAAGGCAGACTGGAGAACCACCACAATCACCTGGCCGTCAACC:1 + chr2R 22753956 5' + G2 2868 1 76.43 TATTAATCGTAAATTCGAGTCTTGTGTGGACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr3L 21013947 5' - roo 9034 1 55.46 GAGAGTGTCCAATAAAAATTACGTATACGCAGCGAGTGCCCGAAGCGGCGACCATGCCTCACGAAGCGTGCGGTAATTGGCAAAAGAAACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr3R 20450384 5' + hobo 24 1 67.63 ACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGATATATCTTCGGTTTAAATAGGTGTCATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2L 3231941 5' - roo 8988 2 72.22 GTGTGTGTGTGTGCCTGTGGCCAAGGAACCGGATGTGTGTCCCTTCACGTGTTATCCCTTGGTCGGGGATAACCGCATAACTGTTTTACAAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 + chr3R 28988475 5' - 1360 3372 1 65.35 ATGTACCGACACCCACGAATTAAAAGCAGGCAGCACGTAATGCCGTTGCTAACAAGCCAGGAGTTTGGGATAAAGCCAGAACTATTATATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chr3R 28406487 5' + opus 7140 4 68.31 GCACCGTGGGCCGAAAAAGTATTATTTATTATTTCATAAAAAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAG:1 + chr2L 8574374 5' - Transpac 232 2 74.66 CTGGGATATTTCTTTCTGTGTACCATATCTTTGGACAAACACTTCGACTCTAATGAGGCAACTTAAAGTGTGCTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr3L 13364405 5' + hobo 48 1 52.05 GCGTGTGCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATC:1 + chr3L 13952781 5' + I-element 5171 1 65.07 GTGCCGAGTGGCGTAATTCCCGGTGTTGTGTCTCCCGTTTTGTTAATAGCGCTGGGTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTCTTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 + chr2R 19852143 5' + Transpac 56 2 57.86 AGTCCCATTAAAAGACGAAGCAGCGAAGGAGTATCGCCTTACGTGACGTAAGCCAACCTTAAGTTGTGCCTTATGACGATGGCTGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chrX 6936577 5' - hobo 2909 1 57.14 AGCCCTGCTCAAAGCCGGTCATTGTGTGCGTGCTTAGTGTGAGATTAAGTGCGAGTGTGTTTGTGTCCCTCGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTA:1 + chr3R 11095772 5' - hopper 1368 1 52.05 CGCAGGGAAAGAAATTCAAGAATGCAGAAACAAATCATTAAGAAAAATAAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATA:1 - chr2L 12319214 5' + jockey 4914 1 68.49 AATGGCGATATATGTGCATATTGCACAGTAGCTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGTTGCTGCTGTTGTTGCTGCTGGTG:1 - chr3L 5803388 5' - TART-B 152 2 56.84 ATAAGAAGGATCTACTTAGAAACATTAAAATTCTACTATAAATTTCTTTCCTATCCTGAATACATCCTCATCCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCAT:1 + chr3R 16818401 5' + Ivk 4974 1 51.37 TCTATCCTTCGTTACGAGTAGCGAGTATGATCGGCGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACT:1 - chr3R 2637710 5' + gypsy5 79 2 72.86 ATGTGCTGACCTTTGTTTTATAGGCAGAAGTGTTTATACTAAGTTGGGCAGAAATAAGTTGACAGGCTTAGCGAAATGTTTGACTGGCATAGGTGATAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr2L 22235145 5' + 1360 26 1 67.81 TTCTTACATTTCTTATTTCAGCCTTTGTCGCAAAATTATTACTCGTAGAGACCCTATACTGTAGATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1 + chr3R 20872092 5' - 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chr2L 21672656 5' - HB 1505 1 73.61 AAATTGAATGGTTGTAAGTAATATTAATTCTAAGGAGCTAGTTTGGATATACATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCACTAAATGATTACAATCTTTTTATTTGAGAAGAACACCGA:2 + chr2L 21976708 5' - Idefix 7322 2 67.12 CAATTTGACACTTGTGAGGAGTTTGAGATGGCGGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chr2R 23212620 5' + Tirant 46 2 66.67 AACCGACTCTGCAACAACGACAATAATTGTCGTTATAATAATGGTCACCTTTATAATGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3R 15295716 5' - roo 346 2 65.75 CAGGTGCATTGTTTTTGATCATAAAATATACCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATG:1 + chr3L 14954386 5' + transib2 2559 1 67.12 TTCATTGATTTGAGTATTAAATAGACAACTATTAAATTTTTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3L 16015169 5' + 1360 14 1 56.85 TTCATTAACAACAGACTGGTTGGGATTGAATCTGAATGATGTTTCCGAGAAGCTATAATTGCCCAAGATAGTAGTTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATAT:1 + chr2L 22689926 5' - Tabor 438 2 53.42 ACTAACAAGTGTTCCCGAACCACAAGGTTTATACGTAGGCGATTGAACTGTATATTACTATATAATACTGAATACAACAGCAACAGCCAGTAACAATATGATTAATAATAATATTAATAATA:1 - chr3R 11185655 5' + mdg1 7078 3 59.02 ACGGATGTATATTCTAGGGAGATTAACATAGCGCAAGTGTAAGTGCTTAATAAACACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 + chr2L 4637198 5' - mdg1 7393 2 61.64 ACTGGGATTTACGTAAAAGGTGGTCTTAAAAAAAGTATTCTCGAATTATATCACAATTAATCATTTAATAATATTTGCTAGATATAGTGTCAGTTTTTTAAACTTTCAATAATCACTTGTGGATTTTTATTTTATTTTATTTGCTA:1 - chr3L 18258669 5' + transib1 1901 1 82.88 AATCAGTTTCCAGTAATATTTCACTTTCCATTCTTTGCCTACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATA:1 + chr2R 10160888 5' - transib2 2751 1 70.71 GTCTTCTCTACCAAAAAATGGCTTTTGACGGCACTAAGCTATTGGTGATGTAACTGTAGTCCCGAATATTTGATGGCCGTTACTCAGCTAAGAAAAAAGTGGCTGTGGGAATATTTTGTATAATTTAGGAACAGAATCCATAATAT:1 + chrX 21412035 5' + G5A 2756 1 34.25 CTGCAGCCATGATTGCACAAAACAAGGTTTTTCCATTCTTTCAAATTGAAGAAGAAGTTGAAGAAAGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chrX 4400260 5' - roo 392 2 68.53 CGGTGGGTTAAGAATGATTGGAAATGGGAAAAGGATATGAACTGTTATAAACTAGCTAAATAATAAGAAAACCACATTTATTTAGTTACACATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr2L 6601409 5' - roo 392 2 38.35 ATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTG:1 + chr2L 17295869 5' + Doc 91 1 79.29 TATTTTTTCAGACCTTTTCCAGCGCTTCCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr3R 7585726 5' + Doc 58 1 52.21 GAGGAGGATTTGCCGAGTTGTGTGTGCACGAAGTAGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAG:1 + chr3R 31724880 5' - P-element 2802 1 26.39 GGTGTGGCATTTATACAAAAATATTAAAGCGGAAGTTGCCAAAATATATATATTTCTAAGCAGTTAGAATACTTTATTCTCTATAGTTCTATATTTCTATACTTAGATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 - chrX 13550586 5' - I-element 5343 1 66.44 AGTCGCGGCGACGACAGAAGCTGCCATCTAAATATATATGTGTGCACTTGAAAAAACTGGTGAGCATATATCATAGCATATGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr2R 17169180 5' - 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transib2 2804 1 71.92 CATGGAAACTTCGTTCAGGGAGCACTTCAACCGCCGGTACATGCTGGTGCTGATCGTGTTCGGCGATACAATCGGACACCCCTTATCCGGGGTACCGAGCTATGTTGCATAAATGCTGAG:1 + chr2L 419109 5' + gtwin 150 2 55.00 CAAACAAAAATTATGTGGGACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chrX 7706724 5' - P-element 2853 1 58.39 ACAAAGACCCTTTCGCAGATCGATAAAATTATTGAGGAAACCTATGCCACAACTCGCAGTAAGTTGACTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGCTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr2L 11143201 5' - 1360 3348 1 52.67 GGCCAAATTATAAATCGTTTTCCCTTCCTTTGCAGCCACTTTCGGTGGAGAGCAAAAGAAAGTTGTGCCGACAGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACA:1 - chr3R 7479943 5' - invader4 2760 2 52.05 TACATTTCTTATGGTACAATTGTGGTGATGAAATGTAACTTGTATTAAATGCGCTTGTATTGTTGAACATATCACACAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAGG:1 + chr3L 15901166 5' + Osvaldo 21 1 57.55 CATTTTTGTGGGCCGCCCTCTGTCATAAAAACGGCGACCGTGGGACATTGTAAATTTTAAAGGTTAACCCTTTTCGCTTCACTTTTATGGAAGAACCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2R 19843270 5' + jockey 33 1 68.49 ACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTGACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATAGCATCTTAA:1 - 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chr3R 4720554 5' + Ivk 5052 1 60.27 TGTTTGTACAGAGATACAAAAATATATATATGCGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGA:1 - chr3L 3453677 5' - Tirant 323 2 77.04 CTTTCAGATGGGCATATTTGTCGGAATTTCAAGGAATTTAAACGAATCCCCCATCGAATCGTAGAGCGGATTTTAATAAGGGCTTTTCTGTCTATAGAATTATGCCTAATTTCAACCCTGAAGCTTTTAAAGTTCCTGAGATCTCG:1 - chrX 1298511 5' - INE-1 147 1 52.05 TTTTAATTATCGGACCTTACTTATCTAATCTAACCATAATTATTCCCAGAGTTTTAAATAACAAGTAAACACTCCGAGCTGCAATTTGTATTACTTATTATATGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACA:1 - chr2L 1361074 5' + Stalker2 16 2 62.33 GAGGTGCATTACCACGAAGTTTGTTCTGGTACCTGAAAACGAAATATTTGCAGCACGTTACAGCATTCCAACAGGGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr3L 19999152 5' + 1360 22 1 65.60 ATTACATCACCTCTGCAGGAAAAACAACAAAAATATGGGAGCCTTGTTTTTCATACACATACTGACCAGGAGGAAAAAAGAGTATGCTAACATAAAAATCAACAAAAAGAAATCAGAGAGATGTACACACACACACACACA:1 + chr3R 11096915 5' + accord 180 2 72.34 ACTTTTCCATCAATAAAGACAGAAATATATCTTGGTTACCGGAGACTGTGAACTAACGGTACCGCGCTGGACCTTGAACTCTAGGCGGATGTCGAACGTTAACGGCGCGTACTTTGGACGAGCACAAAGAGGATGCACCGTGA:1 + chr3R 24840500 5' + gypsy8 4897 2 27.27 ATTTATACACCCGCTGATACCCAAATACACGCAAATGTACCCGAATTGGTGTTGGTTAAAACACAGTGCTCGCTAAATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr3R 25049968 5' - P-element 2847 1 58.22 CGCCACTTCCAGCTCTCGAAATTCGCTAAGGCTGCTGCAATTTCTGGCTACAAATTAAATATAGTCTAACCGGATCTATTCAACATAAGAATTTCTTTATTTTATATAAATACAATACTAATATTTTGTAACACCACCTTCGGCAT:1 + chr3R 16550764 5' - Bari1 1370 1 50.68 AATTAAGTCAGTTTGCTTTAATAAAGCGATGATATTGTAGTTCATTAACCCACTGATAGTATAAGTAATAAGTACTTAGTTATTAAACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2L 19691206 5' - roo 9046 1 64.03 GGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATA:1 + chr3R 10437041 5' - BS 5038 1 55.48 TAAACCGAAAAATTGCGAATCGGCAGTGAAAAATTATTTCTGCTTGTCAGGATGCTGAAGATACGGCAATAAGTCAGACGGTTGGTTTATGCCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 19652486 5' - roo 9044 1 65.07 ACACACACACACTCAAGCACACACACATGGACAGCAGCTGCGGCACTATAAAAATTAAATGCTTTCTGCTGCCTACTTTCCGGGGCTGTCGAGCTTTTATTTCATTGCAGTTGGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chr3R 9418236 5' + jockey 4679 1 77.40 AATTACCATAAATGCAGTAATATGTTGATACTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3R 10150212 5' - 1360 3385 2 56.67 CTAAATTTCAATGGCCATCCCAGTTAAAGCTACTGTGGAACATAGTTTTAAACCGATATATAACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 18528234 5' - roo 9048 2 66.44 GGATGATAAATGGTCTGTCAAATGCAGCATCATCAGGAAGAAGCTGAGCAGAAGGCAGTCAACTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGG:1 + chr2L 8615004 5' - roo 205 2 56.85 AAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTG:1 + chr2R 5582177 5' + Cr1a 493 1 54.55 ATGGCAACAACATTAACAACAATCAAAATAGTAACAATAATAGTACTAACAATGGGAGTACAAACAACAATAAAACAAAAATAGCAACAAAGGGCGCGCAAACAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCT:1 - chr3L 2419270 5' + I-element 145 1 70.55 TCCAGATATCGTAGTCATTCAATTGGAACAGAAACCCTACGTAGGCTTAAATGAAATATGTACAAAGAATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGT:1 + chr2L 9418482 5' - rover 7247 2 56.16 ATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTA:1 - chr2L 21643123 5' + Tabor 66 2 61.38 GTAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATA:1 - chr3L 27415312 5' + transib2 64 1 60.96 GTACAATCCAAAAGGCCTAGAGATGACAGATCTATAAGCGATATATTGCAATTTGTTGACTTTGCCAGGATAAGCATAAGAAAAAAGGGACCTAAAACACGACAACAGCTTATGACTGCAATAGTCGAAGAGTGTGAAAAGATCCC:1 - chr2L 6698109 5' + S-element 1329 1 55.48 GACGTCGAGCACTAAGAATACAGTTTTTTTTTCTTTGTTTTTTCGCCAGCCACCTCTTGACTATAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 + chrX 3646899 5' - 412 7488 2 58.22 GGTCCGATACCATATAAAACCATATATACATATATTATATATTAAATCAGAGGGATTGCCATGTCGGTCTGACCATGGCGATACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGAT:1 - chr3L 7939160 5' - R1A1-element 5296 1 55.48 AACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr2L 14969095 5' + 412 7121 2 64.83 ACGCGCGGCGACTAATCTACATTTATTTATGGATCCTGGAACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chrX 388359 5' - 1360 3371 1 71.32 GCTGGCGAAACAATGTGTCACAGTCATAATCCTCAGAGTTAGAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chrX 10579981 5' - pogo 2035 1 69.12 GTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGGATATATTTAAA:1 + chr3L 21013868 5' + roo 8673 2 60.53 AAGTTGTCTTCGTGAAACTTTCTTTGCCGCAAGATTGCTTTAGGCAACACAAATTAGGTGATAATTGAAAAAACATTTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGG:1 + chr3L 9920555 5' - P-element 210 1 53.42 TGGGACGGCGTATGGAGGAAAAGATTCAAATCGAGAACGTGCCCCAAACGAAGAAGAAGTGCCCCAGTCAAGACGATTATGTACGTATAAATAGTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTA:1 + chr3L 6349420 5' + Porto1 4255 1 56.16 CACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGTAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATG:1 + chr3R 4604451 5' + 1360 478 1 64.38 ATAAGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr3R 7507155 5' + Doc 80 1 73.79 TGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTACAA:1 + chr3R 9125640 5' + Doc 49 1 56.85 ATTGCTCAGAATTGCGAGTGTCTTTAATCGCTTCCGACGCAGAATACTTGTGCTCTTCCTTTCTCGATCCACACAGACACTAGAATTATTCTCGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCCTGAGGCACG:1 + chr3L 23183414 5' - 1360 484 1 57.60 TGAAGCTCGGTATAAAAAGACGATCGGCGGACGCGTCCCGTTTGCACTTGGGAAAGCCTTCGGCTGAAAAGTCGAGACAAAAATCGGTTAAGTCGCGCTCTCTGCATTTTGACACCCCCATAC:1 + chr3R 24524759 5' + 17.6 117 2 55.28 GGGAAAGACAAAAAATGCTGGAAAATTATTTTACGGCTAGTGTATGCGTTGTGAAATTATTATGAGCTAAGGGTTCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr2R 21748353 5' - 1360 3355 1 57.46 ACGCGAAACTATGAACCAAATTAATGTATTTTTATATAAATGGTATATCCCGTGTTTATGTGAACCGTCCAAGAGCCCTACAAGATTTGAAAACCAACATCCAAGAAGAAATTGCCATCATAACACCTGCAATGCTAACAAGACTC:1 - chr4 1091619 5' + mariner2 697 1 66.44 TACATACATATTTACCTTGATTTTCGCTGCACGTATATTTATTTTTTGGCTTCTGTTTGTCTTTCATATTTACTTTCAGAGCCCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTTGGGCACCATGGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCA:1 + chrX 7055053 5' + Doc2-element 4469 1 53.79 ATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACGAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chr3R 9125675 5' + Doc 84 1 71.23 AGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACAAAGAG:1 + chr2R 21820742 5' + Doc 84 1 73.33 GAGAACCTGATCTTCATAGATAACGAAAGCTGAGGTGTCGTAGATACTAATTGTGTCTCGAATGTTAGCAATAAATTAAGACATAAGTTACGAACTGGTGGCTGTTACATTTGTTAAGTTGACTGTAAAAAAGGCACATAAACAAA:1 - chr3L 25147085 5' - transib1 356 1 71.23 ATTATATCAGATTACATTTGTCTCCGCTACCTACGACAAATAACCGTGCATACATACACAACGATTTGTGGATGGGAGACGCGGGTGCAGGCAAAAAATGCCAACAAAAAAAAAAACAAAAAATTAAATAAATAATACAAAAAACA:1 - chr2R 10119298 5' + BS 5093 2 70.55 CACTGGAAACAAATCTTCAAACGTATTTTCATAAGATGTGGCCGATTTATTAGTTACTTCGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chr3R 28117075 5' + hobo 51 1 56.62 AAAAATAGGCGCCTACGGCAGGGGGAAATCAGGATACGCTTTATATGTATCTATATACATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGGCTGCACTTA:1 + chrX 18220575 5' - Burdock 196 2 62.33 GCAGGTGTTCCATATTGTAGGTAATGGCATTGGGTTCTCTGGTGGCCAACAGTCGCAGATCATGACCACTCAATTTGAACTCCTTTTGGAAGTAACCCAATCGACTAATTTCCTTTTTCAGAACTCAATGAAAACTATTGTAGGCA:1 + chr3L 20520047 5' - mariner2 856 1 70.55 CGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTACGACT:1 - chr2L 21643115 5' + Tabor 6914 2 63.70 GTGCATCGCAAGGATTTGCATAAATCCCACCACATTTATTCAATAAGCAAACCACACAGAACAGAACACAAGCACTTGACTCGGCTGGGAGAGTCTACTAATATGAAATCAATAAATTGTAAGCATTTTTTTTTATTTTTTTTTAT:1 - 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chr3R 10152262 5' + 1360 3237 1 54.79 CCAGTTCCTTCATCCCCATTCCGCTCGCTATTTTGAATAGGCTGCAGGGATCAGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTT:1 - chr3R 11944922 5' - roo 9037 1 57.02 TCGATGCACACCATCTCGCCTTTGCCTGTAGGGTGCGGAAAGCATTAAAATTATAAGTGCGGAATTGTGGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAGTATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr2R 21690450 5' + 412 52 2 52.05 TTTTATTACTTAGTCTGGTCGTCCATTTGTGAAAATAATGCAGTCAGCCGTTCCTACCGCGTCGGTGTGGGTTGAAGTCCTTGCTAAGCAATATCGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAG:1 - chr2L 21677883 5' - HB 1282 1 65.75 ACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGC:1 + chr3R 11151833 5' - mdg3 164 2 75.71 GCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGTGT:1 - chr3R 25804192 5' - mdg1 7383 2 71.22 CGCTCTCTATTTTCTAATTTCTACCTAACCGACTCTGCAACAACGGCAATAATTGTCGTTATAATAATGGTCACTTTTATAATGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 15295690 5' - 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chr3R 17492946 5' + jockey 4775 1 73.29 ATTTCGCTAGTCACTCTACGGCCTGCAAACAGTGAACACTCGATAATTGCTTAATTTGGTCGTTAGACGATGATGTTTATATGGACAATTTTAAAACTATATCGCTCATTCGCCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGAT:1 + chr2L 7836222 5' + roo 204 2 73.97 CAGCACGTTACAGCATTCCAACAGGGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTA:1 + chr3L 19999202 5' + 1360 52 1 72.38 GCATGCTGCTAGAAACAGAAAAGAATATTGTTTAAATTAATCATAAAATAGCTCTAGTTTTTGAAATCATGTTTACACTTTATACTTTATCGTAAACACCATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTAT:1 + chr2L 19160307 5' - 3S18 317 2 57.53 GTGACAGCGGAACAGAGACGTGGAGCCGAGTACGATATTTGGAAAAAGTATGCTCTAGATTGGATGCAGATTGTATTACTCTAAGCCTATTGAGCCGAGTCTTAGAGGCTGTTCCCC:1 + chr2R 6044237 5' - G5A 2450 1 58.97 AATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 - chrX 1103715 5' - pogo 2039 1 62.33 AGCATAAGCAAGAAATATAGAATGCATTATACAAGTTATGAGCTCCTTAACAACTTTTTCTATATAAACATAACTTGTTTAGTGCTGTTATCGTTTTTAATGTGATCTTTGATACTTTGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTA:1 + chr2R 16071662 5' - roo 8691 2 73.97 GAGCAGCTTGGCCACTTCGTGAGCACCTTCGTTTCGCTGGCGTTGCATAATGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 + chrX 19887047 5' + P-element 64 1 38.85 ATGCATATTTGTTTTAATTAAACGATATTTTCGCAATTGTCGCACGGATCGATTCATTTGCGGGCAGCGCAAAAATACCTTAAAGCGGCATTAATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2R 22463288 5' - roo 9046 1 52.74 AAAATTAGTAGGAACTGAGATGAGACTGTACATAAGTAAGATAAGTAAAGTCGCCATCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGC:1 + chr3R 7481465 5' - invader4 302 2 69.44 CTAATCTACATTTATTTATGGATCCTGGAACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGTCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCTACTTTTT:1 - chrX 388348 5' - 1360 3343 1 55.48 GTTCTCAACAATCATTCATCAAAATTGTGTGCATGTACTAGTTTTCACCGTTCATTTCATGATCGTAATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chr3R 12363852 5' + jockey 4694 1 70.34 GGGCAGCGGCAGGGGCAACAACGAGCATGGCCACAATGAAAACCCATCTAAAAAAAAAAACTTAAAAACAAAAAA:1 + chr2R 11601529 5' + gypsy2 425 2 58.67 GTCATTCGCCTAATGAAGACTTTGTTGTCTATGAAGGCTAAAGCTGGAAATGTCTAGACATTCTCGGTTGCTTGAAAAAAACATGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTCACCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGC:1 + chr2L 17090052 5' - 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opus 413 2 70.55 CCTAACCGACTCTGCAACAACGACAATAATTGTCGTTATAATAATGGTCACTTTTATAATGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCATC:1 + chr3R 15295713 5' - roo 356 2 56.12 AAAAGGCTTTTTAATTCATTAACATTGATGAGATCGAAGAAAATCGTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:2 + chr2L 7652136 5' + roo 8670 2 74.66 GGACCCCGGCCTGGGACCCTGACCAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAA:1 + chr3L 14302187 5' - 297 6923 2 77.78 GCGAACACTGTCAACGACACAAAAATGCAATCACACAATTACATTGAAATAATACAACAATCAAAAATCCTGCGAGCAATAACTGGTTCGCCTTGGACCTACGGATTCCAGTTGTAAAAACTGAAATTGTCCAGCAGAAGGCTAA:1 - chr2R 5531939 5' + Doc4-element 2759 1 72.41 ATAAATGTTATTTTCCCATGCTAAAGTGTTAGATAGAAAAAACTTATGTAAGCTTAAGAAATATAAAATAAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATATAATCTTGCAC:1 - chr2R 5023363 5' + rover 6996 2 55.48 CCAAGGTGGAACCAATGCTCGATTTAAATGCCTTTTAATTGAACGCAGCATGAGACTTTTTATCGCTTGCAAAAACAGGTTGCAGTATACTATTAAGTTGTGAAATTGAAGTATAAAACACACAAAGGCAGGAG:1 - 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Doc 176 1 54.11 CCGCACATTAAAAAATCACTCGCTCAATCACTCTAACTCGACTTTGCCTTAGGTGATCGTTTTCGCTCAACACATCGCCTGATACAATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3L 19863910 5' + roo 35 2 60.27 AATGTAATTGATTTCAGAGTCGCAGCGCGCAATTATTTACATTTTGCGGTTTCGATGTGAGCGATAGGGCAGGTGGTTTGGCTGGGGGGGGTTCGTATCTTGATTATTTTTCCTTTATTTTATCGTTGATAAGCAAAATTACTCA:1 + chr3L 6627157 5' + Circe 6988 1 59.31 ATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGGGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1 + chr2L 9275023 5' + F-element 97 1 79.56 AGGGGGTGGCTAGTTAAATGTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 24673700 5' - roo 397 1 76.39 ATAAATAATTTAATATATTCCCCTGTTTCTCCAAGTGCATCAAGCCGTGCCCAGTCGAGCCGCTCTTAATCCAATTAAAGTATGGATTTATGAACTACTGTAATAATATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 + chr3R 30263972 5' - blood 7367 2 69.78 TCGGAATAGAAATCTAAAAAAAAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 - 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roo 408 1 81.56 CCAATTGTTGTTAGCTAAATCATAAAGCACACATAATACTACAAAGTCAAGAAGATAGCAAACGTAATTTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chrX 15116018 5' - pogo 2088 1 37.27 ACACAGTTGAGTGTGCTGGGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr2L 15777908 5' + 297 6630 2 56.16 ATGCCTCACGAAGCGTGCGGTAATTGGCAAAAGAAACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACCAA:1 + chr3R 20450437 5' + hobo 78 1 75.71 TGATTTTCGATATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 + chr2L 18112453 5' - transib2 2802 1 69.18 CAGTGTGATTTTCGATATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTT:1 + chr2L 18112448 5' - transib2 2819 1 77.61 TCTTAATTGAGACACACGACTATATAGTTGTCATGTCTTTGACTAGATTTTCCTGTGACGGAAATCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTT:1 + chr3R 5766301 5' - Stalker 6972 4 54.29 CATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATA:1 - chr3R 7616818 5' + Stalker2 7315 2 67.12 CAAATGGCAAGCTGAAAGCTGAACTTCCATTTAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACT:1 - chr2R 19852219 5' - Transpac 5143 2 78.08 CCACTAGCTGAATAACGGGTATCTGATAGTCCGGTAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCGTAGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGACTAGA:1 - chr3R 17733318 5' + pogo 63 1 56.16 GTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTACACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3L 27391422 5' - 1360 3365 1 63.01 AATCAAAACGAAAAAGCCTTAAAGTGTAAAAACAACAAATCACTCAAGATGACCTCAGACACCAATGGACAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 - chr2L 14501236 5' - 1360 3338 1 54.79 TGTAGTCCTCGGACGAAATCCGAACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - 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1360 59 1 69.78 AGATCTTGAGTGTCACCTTGCAACACTGGTTTTATGCTATTATAGTTGTCCCGCTTTAGGAGGCAAATTCAAAAGTGGCTCCCAACTTCAAAGATAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr2R 9607243 5' + pogo 23 1 69.86 CAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3R 28450673 5' - roo 8993 2 73.97 GAGATACAATGGAATACGATGGTATTTGTATCTGTTGGAAGGTGGTTCTATAGAACTCTATAACTAACGCCAATACTTTTACACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTAACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCG:1 + chr3R 30925240 5' - Bica 4911 1 52.41 AGTTTGACTTGAGCAGGCATTTAGAAAGCGATTTGTTCAAACATTTCTTTGGGCAGTTATCGAAAAAAGCAGAGCTTAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTTAGCTAACCC:1 + chr3R 26812755 5' - Stalker 303 4 55.48 GCAGTAAGTTCTCGAGTTCAGTCACTGGCATTTCCTTTACTTTCAGTGGAGTTAGACCTCGGTCTTTAAGGCGATTCATGGCTTCATAAGTAGTTTGGTCTTCGGATTCATAGTCCTAAGGGAATTTAAAATATCTTACAAAAAA:1 + chr2L 20926941 5' - HeT-A 5804 1 68.97 GAGCGACCTAGTTGCAGAGCGGACAGCACACCGCGAGGCCAAAGGTGTAGGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAAGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1 + chr2L 22319225 5' + Transpac 21 2 68.49 CTAAAGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 + chr2R 23409073 5' + opus 7168 4 76.70 AATAAATCAGTTTAATTTAATTCAGTTGACAGCTTTAAGTCAATATTGTTGATTAATTGTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCA:1 - 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chr2R 24043300 5' + hopper 949 1 60.16 TCTACATGTCGTTTTTAATAACTGTGCCAATCGTGTGTTCCGAGCACTACTCACCCATTCCGTCCCATCGCATCCCATCTCGGCCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr2R 9340244 5' - 412 457 2 58.90 GTCTTCATAAATTGGGAAATCCACAAATCAGGTATGCCACATATTTTATGAAAGGGACAGTTCACTTAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACAAGAATATATT:1 - chr3R 28450812 5' + roo 5 2 78.08 ATTCCTAAAAGCACACCGAACACAACCCACTACCAACCGCCACCCCACACTTAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAACAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAAT:1 - chr3L 19049090 5' + Quasimodo 156 2 63.01 CGACTCACGTTTGATTTGTGTTTTTGGTATCGCTCCAAGCGCCATCTCCGATACAGCGTCAATGGCCTCCTTTTTCACCGCCACCGGTGTGACACTCAGTCCGCCACCGTATAATGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCA:1 - chr2L 2948943 5' + 17.6 6968 2 76.03 GTTTCCCCTTTTTTCAATTCTCACAGTGCCAAATTGACAACTAACCACCAACCCATTTAAATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chrX 7756351 5' - roo 9042 1 39.73 ATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGA:1 + chr2R 18689145 5' - 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BS3 1553 1 78.51 GGTGAGATTACACAAATACCCTTTTTCAATTGAGTGTACTTAATCAGTTTGGATAAGTAGTTTTAGCCAAATATGATATTAATCTTTTTGTTGCGTGACCTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCATCGTCCTGGCATGGAGTCCACC:1 + chrX 8768471 5' - Tc1 1288 1 57.53 AACTATTTTCCACATTGCCGTGCCAATAAAAGTGGGCCTAAAATGGAAAAAAAACAAAAAAAACTTAAACCTGCGTCTGTGTGCCTTTGAATCTGAATGTTAAATAGCCAAATGTTGGCTTTTAAAGTTCATACGGACAAACGGAT:1 + chr2L 20045134 5' - INE-1 125 1 57.53 CTAGTTATGTTATATTATAAATATAAAATCTTTTTGTTTTGTAATTAAAAATTATATGGGAATACTTTTCCAGGAAGTTATTAATCTATTTAAAAAAGATTTTTAAATGTAGTAAACAAAAAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTAC:1 + chr3L 18035446 5' + mdg3 5253 1 73.29 GCCGTGGAAGCTGACTCCTGGCGTCAGGCCATAAAAAAAGGTAAAACAAACAAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACT:1 - chrX 10111096 5' - mdg3 175 2 67.81 ACAAAATAAATATAACGAAAATTACATTTATACATTCAACTTCAAGTTTTGCTAAACGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:2 - chr3R 6422914 5' + jockey 73 1 58.90 GTTGTTATTATGAAATGGAATGTACTCAATAGCTTGGCTTATATGGTATTACAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTGGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATC:1 - 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HeT-A 281 1 77.98 ATCTGTCATGCAGCGTGGAAGCCCAAGCACCGTGTCGCACACACCCACTCACACACACACAGCACACAGGACGAGTTCACAGCACACCACCCCACTTTCCATTCACATATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACAT:1 - chr2L 12206278 5' - Stalker4 250 4 71.92 GACTAATTATGTTTTAGTTAATTTAATAATTAAACTATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3R 6413664 5' - 1360 3344 1 54.79 TGCACACTTGGAAATACAGTTTGCTCTCACATCTAACCTTGGAAAAAAACAAAGGAAGTGAGTTTGCTCTCGACTATTTTGAAGTAAAGAGTGCGCGAATCTAAGGCCTTTGTGGCAAAATATGCACAAACATGTATATGTATATA:1 + chr2L 19161186 5' + Stalker2 251 2 70.55 AATATACGCCATACTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3R 25751901 5' - roo 9038 1 57.69 GGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAA:1 - chr3L 15099666 5' + G4 3829 1 43.84 AGGACAGCATTTGTCTGGATTTTGCCACATTATCCTTTAGATGTGCAACGTGACTTGCCGCTTTCTCAGATCTTGCCGCTAGCTAAGCATGCCTCTGCGAAAACACAGTTCTTTACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGA:1 - chr3R 4359255 5' + copia 84 2 78.77 TCCACATATTCCAGTCTCTGTAAATAATCCGTCAGAAAATGTATAAGATATGTAAGGAACAAAGTGTCGAATTAGTCATGCACACGAGTTTTCGTCTTTACATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr4 916251 5' + roo 19 2 72.60 ATATATTTCAAAATTTCTGTGATATTCAAGTTTTGTACAAATTTCATAATAATAAACACCCATAAAGAACCATATTCTTGGTAAATATCATTATCATTATTATATATTATTACAAAACCTAACTTGAATAGTTGTGATGCCTCACT:2 - chr3L 13987324 5' - diver 224 1 78.08 GTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGCGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 - chr2R 8688148 5' + F-element 52 1 65.00 GTCTTCTAAATACAATATATTGCACGGATAAGTGATTTAAAAACATAGTAGTTAAAAACATTCGCTATCACAGAAAACACCAATTTGGTTATTAGCTATAAGAAATTCTAAGGTGAATGGCATATTTTGTCAAATTTACA:1 + chr2R 22348888 5' - 1360 204 1 70.71 CTCTGCAACAACGACAATAATTGTCGTTATAATAATGGTCACTTTTATAATGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3R 15295722 5' - roo 340 2 69.86 TACTCAGGACATGAAATCGGTGGGCACTCAGTATCTAGGAGCGATTCGCCTGCTGAAAGCTAGTGGCTTCCAACCAAAACGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3R 23098145 5' - 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roo 8993 2 71.92 AAGAGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGCTTTCTATATTATAAGTTTTTATTTCAGCATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 - chr3R 15054241 5' + 297 6616 2 59.59 CACCATCTGAAAACACCATCAATAGTCGATTTCAATTTCGTTACTGATGGATTTTTGGTCGACAGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 - chr2R 4536694 5' - mdg1 7398 2 56.85 GGTATCCGTATAATACTTGGATCATATCATATGATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTA:1 + chr2L 9948789 5' - I-element 5271 1 76.71 GTCCATTGATGTGGCTTTATCACCAGTGCCACATTTACCGCATTTTGAAGTGATTACCCAACTGCGGTTGCCATTTAATGTGTTTAAAATATTTCGAATTAAGCCGCTTTGTATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGAC:1 - chr2R 11095891 5' - diver 216 1 78.62 GCTGTCAACAATTTTGACTTTTCCATTTCTCACATTACCGAAATTCTGATCATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGA:1 - chr2R 10160970 5' + transib2 66 1 64.38 TTAGATAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr2L 17626596 5' + roo 75 2 73.29 CCTTGTTACGTTTGATTAAATCGGTTGTTGTTAGAGTACTTATTTAAAATTTTTTCCTAAACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 - 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chr3L 10469652 5' - roo 9049 2 69.86 ACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAA:1 + chr3R 14049339 5' + transib2 69 1 63.70 GAAAAAGAACTTGTCGAGGTCGCACGCACTCACACACACCACACACTGTTTACAGGAGAAAGCACCTGCAATTGATAACGGGTCGCCAAATGGTAAATAGTACAAACAATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATA:1 - chr2R 18689293 5' + Burdock 6145 2 79.02 GTGGCACAATTGTGGTAATTAATTAGCACTATGTCATAAAGCAATTATCGTCTATTTTAAAAAGTTTTAACAATAACATCTCATCATTTTCTGATTATATTACATTTTAGTGCCCGATAATGTTAATTTAAAGTATTATTATTATT:1 - chr3L 16762446 5' + Burdock 499 1 63.70 GTTTATATGCATGTCTGGTAATGGAGATCGCCCGTTTATATGCATGCCGGCCAGTTGAACTAATGTTTTTTTAAACGCTGCCATTGACGGTTGCTCGTGGCTACTCCTACTTATATATACATATATATAGTT:1 + chr3L 10210012 5' - 1731 4409 1 63.64 ATACACGTCCGTTCGTTAGCAATGATGAATAAATAGTGAGTTGAATGCTGAAAAATGTCTTTGTCTTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCA:1 - chr3R 443322 5' + flea 39 2 52.59 CTCCAAGAAATTTTGATAGCTCGGATTTGATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 + chr2R 15070078 5' - 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chr3R 9583409 5' - Juan 4187 1 66.44 TTTTGTTATCATCTGGTTTGGTTTGTTTGTATTTGGTGTGCGTGAAATGGGTTGAATGGAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGAAGCGTAACGGCCATACATTGGTGTGGCAC:1 - chr3L 15364939 5' - 1360 3359 1 63.01 ACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 - chr2R 18014110 5' + Doc 79 1 69.06 CATGGAGATGGCATATCCAGAGCCATTCCATTAAATATTCCCCCTCTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTCAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 + chr3R 6645332 5' + blood 72 2 63.70 ATTTATGAGTTGGCATTTTATTAGACACTTTTATGCGGCACATGCATATGGAACTCGGCGCAAAATGCGTCGGCCAGCGCCTATTCATTTGTGATTTTTAATTCAGCGCAACCACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCC:1 - chr2L 18542133 5' + F-element 276 1 65.75 TTTTAATGAGCCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 - chr3R 25795817 5' + jockey 71 1 68.99 AGTTGAACAAGTTGCAAAGGGAGGACTTCTCGGATCCCTCGGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGCGTTCTTTATA:1 + chr2R 10910160 5' - Tabor 7311 2 76.03 CTCTGTGCGTTATATTTTATGTTGAATTATGGCGCCTATTGTGTTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTTATTTTTCTGATGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAAC:1 + chr2L 14825475 5' + invader1 96 2 63.33 ATCAATATCCACATATCAGCCTTCTTATATATTTTTCATTAGCTTGGTTTACAATCTTATCGTTCTTACATATATATGTCGGCGACACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAAT:1 + chr3L 27392388 5' + invader4 41 2 79.58 AATGAATGTATAAATCAATAACTTCATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:2 + chr2L 16857874 5' + P-element 97 1 19.18 CTGTGAAACAGAGTTTTGGCCAAGATTTCTTATTATTTTTCCAGTCACTCGGCGGTTCATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGGAATATTATCTT:1 + chr3L 22377945 5' + Circe 7068 1 60.27 CTACGAGTAAGAAGTTTGCCAGATATGAACAAATAATTTTGAGCATGAGCCATGGTCCTATAAAAGTGGAAAAACAAAACTTTTGAACAACCCAAAAATAGGAACAAAAATAATCAGATTTTAAAAACAATTGGTAAAACAAATAA:1 - chr4 782902 5' - Tc1 1481 1 47.95 GTCGTTTAGGTTTTGTTAGTTTTACTTTCTTTATGTAAATTTAATATTTTCCTTTAACCAATGACTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTAT:1 + chr3R 8042300 5' + BS 45 1 52.17 CGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGA:1 + chr2R 4260424 5' + micropia 5215 1 47.59 GGACTTCTCGGATCCCTCGGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:1 + chr2R 10910182 5' - Tabor 7289 2 60.96 CTGGATGAGGTCCTGCCAATTCTCGGGCTTCACCTCCTCGCGCACGGGCTTCAATCGTTCATTTAGAGTCTCACACGCCTTGCTAATTTACAAGACTAATAAAATTTTGAAAAAATATTCAACAATTTTTCACAAATGTGGGCGTG:1 + chr3R 15532956 5' - INE-1 253 1 55.48 GTTCAAAAAATAATCTTCGCCCATCGAATCAATTCCATAAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:1 - chr2L 8574489 5' + Transpac 31 2 63.01 CATTGTGACTTTTATTGCAGGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr3R 22494212 5' + 297 42 2 56.16 TAGGTGATCGTTTTCGCTCAACACATCGCCTGATACAATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTCCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3L 19863959 5' + roo 8748 2 73.97 TGTCCACCACTTGCTGACCTGCATCCATTTGGAGTTATTTCATTCGGTTTTTGTAATTTCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3R 11513551 5' + roo 8725 2 60.96 AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAAACTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439059 5' - P-element 2495 1 60.27 AACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAG:1 - chr3R 15790090 5' + flea 4728 1 62.39 CAAAATCTAATAGGATCGCATACCAAACGTTGATAGGAAAAAGAGAGGTGAAGTCGTTGAAAAGTATGCAACAGGCAGACGGAAGCGTTTCCGACCATATAATCAAATATATAAATATATATTTTTGATCAGGATTAATAGCCAAG:1 + chr2R 5705571 5' + INE-1 90 1 67.12 TTTGATTTTATGTAAACACATGCGAAAGCAGAGCAACTTTACAGACCATCGTTTTCCCCACCCAACTTGTGACCCCCTCACACACACACACACACACACACATAT:1 - chr2R 13107349 5' + accord 183 4 64.76 GCACCGCCAATTACAAATGCTAATTGATATTTTCCTACAATTAAGTCCAATGATAAGTGAACCTGAATTGTTGCAATAATTTCAAAAAAACGCAAAAAACAATTAAAAAAGCTGTATGTAAATAATTTTGACGCGTAAAAATTGTG:1 - chr2L 3629695 5' - Bari2 90 2 57.53 GCTAGTTATGTTATATTATAAATATAAAATCTTTTTGTTTTGTAATTAAAAATTATATGGGAATACTTTTCCAGGAAGTTATTAATCTATTTAAAAAAGATTTTTAAATGTAGTAAACAAAAAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTA:1 + chr3L 18035445 5' + mdg3 5252 1 73.97 ACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGCAGTACGTTTAAGAATCAGCGTTCACACATGGACACGAATATATATAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 9871055 5' + roo 22 2 50.59 TAAGCATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chr3R 4679428 5' - hopper 1376 1 57.53 CATGACGTTTCACAAAACCTTTGGTTACGGATGCATTGTATTAATATGTTTTGAACTCCTGTTTGCTGGAGTTGAAATCAATCAGAAAAAAGGGTTTCCGACTATATAATGTATATACATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCG:1 - chr4 1121553 5' + INE-1 88 1 52.74 GTTCTCGAAGAGTCCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGCGCCTGCGGATC:1 + chr3R 24750938 5' + G6 24 1 68.00 GTACTTTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCA:1 + chr3L 14944545 5' + G5 4798 1 53.42 ATTTAATGTATTAATCCAGGTAATTATAGCAATGGATTCATTTCATTTGTATGCTTAAATTAAATTGCATAATTTAATTGTATACATATATATAATACATATAATTAATTTCTTGCAATATTTATAAGTGGAAAAAATATAATTTT:1 - chr3L 23579437 5' - Idefix 7368 2 51.37 ACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCACCCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTTCATCAGGGTTC:1 + chr3R 443028 5' - opus 487 2 72.52 TGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCAAATCCTGGTCGTCCTCGCGAAGCAATGCTTCACGGCCAT:1 + chr3R 4571527 5' + Rt1c 5328 1 94.52 AGCTAATATTCCGGATTGACAGCCAGTTGCAAATTGGTCAATGTCTGAGGAGGGTTCAATCAGTTTCCAGTAATATTTCACTTTCCATTCTTTGCCTACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 + chr2R 10160831 5' - transib2 2802 1 66.44 ACACCTACTGAGAGATTGAAAGTGGGCAAAGGTTTTGATTATAGCCATATGGAGTAGTCTAAGTGTATGATGTGGATTTAATTTGGTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATACCATCACAAAATAAATTT:1 + chr2R 12659946 5' + 1360 360 1 59.31 CAAATGTGTTTTCCTTGTCTCGCACAAACACTTCAGGCTGTATCAATATTTTGGTTCGAATGAAAATCTCCACTCGGCTTAAAAAAGCGAATACACACAAAGTGTGATCGCGCAGAACACGGTGTTCGGATGGACCGTTTCT:1 + chr2L 9108996 5' + Max-element 8134 1 75.35 TTTGCAATACACGAAATAACCGATATCGTTTATATGCTTTAAAATAAAGAGAATAAAGAGAAGAGAATCTTAAAATTGGTAAAAAACTTTTCTTTAGGACGTGCCCTTTTTTTTTTGTTTTAATCTTT:1 - chrX 21008701 5' - Doc 4697 1 42.97 GTTATGCCCACCTTGGCTGCGCCATCATTCTGCTCCGGCGTGGAATGTTTACATAAATTCATAAAATTATTGCTATAATCAACATTATGCATTTGGAAACAAACAAACCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCC:1 + chrX 7448185 5' - Rt1b 4817 1 71.92 GACCATATAAATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:2 - chr3R 13437254 5' - hopper 1362 1 55.48 CATGTATGTAGATGTTGGCCACGGCTGGCCGCCCACGACAAGTGTTACGAGTGTCAGTAAAATAGTTGAATAATGGCAAATGGCAATGGCAGAGGCAAAGGAAACTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCG:1 + chr2R 15433549 5' - F-element 266 1 71.72 CTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 - chr3R 18635304 5' + opus 7063 4 68.31 GCCGGGTGTGACATGGCCAACCACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCA:1 + chrX 16117129 5' + opus 11 2 71.64 AAATGTAAATCCAAAGCTGTAGTTTACTTAACCCTTCTGCCACGTTAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr2R 15070217 5' + 412 7071 2 71.92 GTCTTTGGTGGGCCACCTGAAAGTAGGCAGCACATTTTAATGAGCCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3R 25795851 5' + jockey 35 1 58.59 TTCGAGCACGTAAATGGACATGCATAGAATGGAGAGTGGATATCCTTGGCTCAGATTCGATAATACGCATAACTTTCTATTTAGATTTGCCCCGAACGCGAGTTTACTTTTTATCAAAGAACTACGTAGTGTCGCGAGATTTCTTC:1 - chr3R 19963134 5' + G-element 96 1 76.71 AGAGAGTGACACAAACACAGTGGCGTCGCGTAAAAAAGTTGTGAGTAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - 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chr2R 7394632 5' - mariner2 123 1 63.01 TTTCAGAATAGAATCAAGAATCCTAAGGGTTTCGCATCATTAGTATTTTAAAAATTCCTTAAATATTAGCAACATTTAAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 8658664 5' - roo 401 1 76.03 CAACACACATCATCGAAGGACCTCAGCATCGGTCCTGGGTTACATGTTGACTTAATGGCTTAGGCCAGCTAAGAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATC:1 + chr2L 8505913 5' - roo 8916 2 51.72 CACGTACGGATATTTAGTTTAAGTAAAACCACAACTCATGTTTGAAATCAGCTGTATTTCAACAGGCCAAGTACAGCGCATAACGCTGCTGCCCAAACCATTCATGAATTATAACAATATGCCTTATTAATTTTTCACCCGTCGCA:1 + chr3L 342180 5' - 1360 428 1 78.77 GGCTGTGGTGGGCGATGAGGATGCTCAACTCCTTATGAGCTCCAGGACGACGGCAATCGAGAGATACTAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGG:1 + chr3L 12966968 5' - hobo 442 1 53.42 AGGATTCATGGCAACCGGGTAAGTTCAAGGACGTAAAATGCGGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 + chr2R 15075551 5' - mdg1 382 2 58.90 ATCAAACCTATCTAATCTAATTAACCGATGATCGTTCCACTCCGCCTAGTGTTAATATGATCAACGGCAGCTCATCAGCATCTTAACTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 7561644 5' + frogger 2174 1 74.51 CACCTGTTTCTGATTGAAAGTGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAATTATTGTAGGGTCTTTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr2L 17432125 5' - 1360 3334 1 55.17 GAAAAACCCGCATCCGAAAGTTGCCCCGTGGCCGGTGTGAAGCAGTGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 - chr3L 13690343 5' - hobo 2933 1 60.87 AATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTAATATTAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACA:1 - chr2R 11329662 5' - P-element 99 1 16.44 GTTTCAACTGCGAATAAAAAAATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3L 18253750 5' + blood 26 2 67.81 GAGTGGCGTAATTCCCGGTGTTGTGTCTCCCGTTTTGTTAATAGCGCTGGGTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr2R 19852148 5' + Transpac 4949 2 53.21 TGAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGC:1 + chrX 388215 5' + 1360 42 1 57.53 CATATGCAAATATGCAAAGAATGCACATAAACATAGTGGGCCAGTGCAAGCAAACACAGAGGGCTCTTGTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCAC:1 - chr3R 17965843 5' + blood 7181 2 76.92 GATTTGTGCCCGAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr3R 23601775 5' + jockey 17 1 62.00 GATGTGACTCGGAGAATACAAGATAAGGAATTTTTAAAGAGGACTTGTTGTGTCCTGCCATTCAGATAGCTTAAAATCTAAAAAAAAAAACCTAAAAGATCAATTTTTCTTATAAGAAG:1 - chr3L 25058773 5' - Q-element 352 2 79.83 ACTTGCATTGTTAGTCCCTTCTATGTATATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGA:1 - chr3L 14302257 5' + Quasimodo 72 2 82.73 AAATACAACAAACATAAGTAAATAAAGCTGAAAACGCCGTGGAAGCTGACTCCTGGCGTCAGGCCATAAAAAAAGGTAAAACAAACAAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTAT:1 - chrX 10111131 5' - mdg3 211 2 60.96 GGGACGGAAATAGGTAAAGAAATTGAGAGAAGAGTGCTTGGCGGGTTCTCAATGAGTTTTACAGTTAAATGTGTTTATTTTTTCCATTATAATTTCTTAAAAATACGAAAAAATTAAATATAAAAAAACACACACAACCAAAAAAA:1 + chr2L 14672311 5' + Bica 4635 2 74.66 GATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr2L 16331036 5' - roo 338 2 67.81 CTCTGTTATATTTGATAAGCATAACCTTGATATTTCATATACTATTCCATTATTTTCTACAACTATAGTTAAGTTTGAAAATGAACAGGCAATATATTTTCATGCATACCAAAGGGTACATACCAAAGGGTATGTAAAGCAGCGGT:1 - chr3R 2999450 5' + Circe 7145 1 68.49 CTTACTTTCAGAATAGAATCAAGAATCCTAAGGGTTTCGCATCATTAGTATTTTAAAAATTCCTTAAATATTAGCAACATTTAAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAGATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr3L 8658659 5' - roo 406 1 79.45 GAAACAAATAGGTATGAGGAAAGACATTTATAAATAAAGGCCATGAACCAAATCTAAATATATATATTTTAACAGTCTTTCATTTAGAACAAACCCTTTTTTGGTAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 21674769 5' + roo 8677 2 69.18 ACTTTTACTTCGCGCGTAATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAC:2 + chr2R 12065550 5' + Stalker2 30 2 66.44 ATTTGTAAAAAAAAGTAACACTGTACTCTAATATCGACGCTGAAATAAATAAAATGAATGAATCCGCTTTGAGAAAGTCTTAGATGTACTGGGCTAGTGGGTTGTTTACTTGATCTGCGCGAGAGCGCGTCTTGCTTATGGTTATG:1 + chr3R 4991879 5' - Tom1 194 1 68.49 GGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr2L 17295825 5' + Doc 50 1 48.95 GCTTTATCACCAGTGCCACATTTACCGCATTTTGAAGTGATTACCCAACTGCGGTTGCCATTTAATGTGTTTAAAATATTTCGAATTAAGCCGCTTTGTATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGG:1 - chr2R 11095878 5' - diver 202 2 69.18 CCAAGAAGGCTGAAGTTACTAAATACAATAGAAGCGTTTATTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAA:1 - chr3R 18153636 5' - copia 5044 2 73.29 GTGCCGAGTGGCGTAATTCCCGGTGTTGTGTCTCCCGTTTTGTTAATAGCGCTGGGTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTATTTGTCT:1 + chr2R 19852143 5' + Transpac 55 2 57.55 AGGAAAAATGTCCAAATTAATACTTTTTGCCTGGAAAGGATTTGGAAAACTTTCCACCGGCTTTGTCAGGGACTTTGGCTCAAAAGTAAAAATAAAAACACATTCCATAATACTTCATAATTACATTGTGAGAAACAATATAACCA:1 + chr2R 9326509 5' - TLD2_LTR 188 1 69.86 CAAATGCCTCAAAATCGGCGGGATATAGGCACGTCTAGGTACATATACATATGTGTATATTTTCTATATATATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 + chr3L 16059227 5' - 297 350 2 59.59 ATTCAGCTAAAAAAAAAAATAAAAAAAAACTT:1 + chr3L 11002309 5' + HMS-Beagle2 490 1 84.38 AAAAAAAAAATTGGGTGATTCATATTTACGGCCGGCCATTTTAAAGGTCAGCAAAGATGGAAAGTCGGTAGTTTGATTGTCTAAGTAATAAGTGAGGGGTCCACTTATGACATTTTATTGTTAAAAATTAAATTTTTAAATTTTTT:1 + chr3L 10300000 5' - 1360 3037 1 37.67 ATTTGTTAACAGCTCCCAAAGAGTGTGTTAAAAAATGAAATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTC:1 + chr2R 13761630 5' + jockey 4748 1 73.57 ACATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGCTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr3L 17537748 5' + Doc 59 1 63.57 GACTGCAGAGAAAAAATACGTAGTGTAATTTATGTATATGGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGA:1 + chr3R 10436997 5' - BS 5083 1 77.24 CGAAGTACGCTGGCAGCACTCAGAGCACTAAACAGGCTGAGCGGAGCCACTAGCACTCCCGATCCGATCAGGTAAGTCTCAGTCCATACAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 - chrX 18220711 5' + Burdock 28 2 63.70 AGCGATGAGTCCAAGCGACCCATCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr2R 21820712 5' + Doc 58 1 55.40 CATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr3R 9125620 5' + Doc 16 1 77.44 GGAACTTTTACTTCGCGCGTAATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGT:1 + chr2R 12065547 5' + Stalker2 27 2 68.49 AATCGCTGAACTATTCAAATATATACATATATAGTGGCTAAGTATAGAATGTACATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:2 - chrX 11008399 5' + hobo 67 1 66.44 ATCATCGCATAAATCTGCAAGGCGGTCATAATTGCAATTATTCATTAATGAAATATTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr3L 21910369 5' - pogo 2038 1 60.27 AACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACCAAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3L 14375583 5' - roo 9046 1 62.33 TTCCAGTATTGAAAAACTTATACGTATAATAGCATATATGAATAGGCTTTATTTTTTGTTTTCATCTGCACGAATATTTCACTTCACTCAAAACAACCG:1 + chr3R 19446666 5' - F-element 63 1 41.41 GAATGGAAATTCACAAGTTTTATTTATGTTTTCTTTTAGTTTGTTTAGTTCTTAAGACATAGAAACCTGTACAGCCTTGTTGTAATCTCAAGTGTATAAAGACCAGGTCAAATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGT:1 + chr2L 13897929 5' + invader4 400 1 66.44 GATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTA:1 + chr3R 7470973 5' + Doc 120 1 74.66 AACAGCGGACTTGTAGGCGAAGAGGGAGAAGAGGACGGCAATCAGAAACAGAACAGAACTGAACAGAAGAAGAGAGTGTAAGAGCTCGAAAGAAACGGATTCTATTCCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTT:1 - chr3R 5671521 5' - Circe 7172 1 39.58 AGCATACCAATTTTCCTTATCCCCTTAGAATTTAGACTCTGATTTACAGATGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCTTTGGACCTGAGAGTTTAAGATAAAAATTCCTATGATTTACAGTTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTC:1 - chr3R 4516759 5' - HB 1510 1 65.75 TCTATTGATTTGCCAAAAAAATGTTTGACATGTCCGATTTAACGTCCTAGGGCGTCTCATTTTATTGCCCAATTTGCAATCGATATCCCAGATATATGATGAAATTTCGCGTTAGCATTTACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGA:1 - chr3L 21533861 5' + INE-1 544 1 84.93 GTATGCGTAATGTGGCAATGAGATATAAATCGAAGGCAGCGCATTAATGGCCAACTATTAAACTAATCGCTTCTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 - chr3L 10112323 5' + I-element 18 1 68.97 CTTCGTCGGGAACAAAGGTCACATACAAAGTCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chr3R 23098236 5' + roo 8754 2 81.51 ATTCGGAATTATTTTTGCCCTCGTCGGAATACAGAAATACTAAGAAGGCCAGGAGAGTTATAGATGGCTAATATAAGTTTTTATTTTATTATATCGGATGTAACCATATCATTTTACCGTAATCGTAAATAGGCAGTCCACGTCAT:1 + chr2L 16078704 5' + Helitron 93 1 66.44 AAATGGACCCAAATTAAAGAGGACAGTTCACCCTTAATAAGTAGTAAGAATGCAAAAAAAGTATTGAAAGAAATGATATTTAATGTAAATATATTTAATAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCT:1 + chr3R 6596544 5' - Doc 47 1 67.12 TATATGGGTTAAATGCTATCAGCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:2 + chr2L 4929780 5' + blood 7054 2 56.16 TAAATGGCAATTTACATTTAAGCAGCACAGAAATGTGAAAATGCATTTGTTCCAAACATCTCAAATGGCAGTGGAAAAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 17258196 5' + 412 7095 2 53.47 TCCTCTTTAAGCAGCTTAGCGATTTAGGGCAAACACTTTAAAGTGTTAAGTGTAGAGTAAAATGGTATACTAGATTCCTTGAAAAGTTTTTAACAGGTAGAAGTTACCGTGTATTCCATTGATCAGGATCAATAGCTCAGTCGATC:1 - chr2L 12157218 5' + INE-1 96 1 50.00 AGCTTAACAATTGGAAAGCTTGTCCTGGACAGTAGAAGTTTCTCGGAGGAGTTACAAAATCATTCGAAGGAATGGAGTAACTAAAATTAAAGGGAAGCAAAACAAGGAAGAAAGCTATAGTCGAGTTCTCGACTATCAGATACCCG:1 - chr3L 20259649 5' - INE-1 555 1 63.70 AGTTTTCCAAGTTGGTGTGTTGGTGGTTGTGGAGCATTGATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr2L 3960147 5' + jockey 15 1 75.81 CGACAACGAATCTCTTAAAAAAGACAAAACAACCGACTACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTGCGCCACGA:1 - chrX 9009720 5' + gtwin 84 2 72.60 GTATTATTTGTTAAATTTTGTAAAGAATATTGTTATATTTAAGCACTCCTTTACTTTGATCGCACGATTGTAATATTTTACAAGCGTTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 11944800 5' + roo 34 2 63.70 GGAGCATTTGCCACTTGGATGATACACCTAACTTATAAAAATTTCTGCACATGATTCCGCTTTATTTCTTTATGACCGTGTGTGAGTTCTACTTGGAAATTCATATCTCTGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chrX 21403340 5' - roo 397 1 76.03 AAGTTATATTTTCCAATGTTTATTCTACCAATTCCAGGTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACT:1 + chr2L 21642985 5' - Tabor 467 2 72.60 AGTGAAAAGTAACAGCTTGCATGCGTTTTTAAAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATAT:1 + chr3L 20224102 5' - Chimpo 159 1 66.90 GCAGCCCTTTCACTTGTCGCCCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACTCATTCGCAAGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3R 7885582 5' + jockey 36 1 58.12 ATGCCTTTGCACACTATTTCTGCATATTTACATACAGAAAGATATTTGAATTTTATATTTGGCTCTTAAGTCGTATGTTAGGTATAAAATTACAATACCAATTGCATTTCCTGGGTGTGCTAGTGTATCTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 4755916 5' - accord 185 2 57.53 AAGCTATCTCGCAATCATCCGTAAAAGACTGCAGGATCTATCATGGGAAACACTTGACTTTAATGGCCAGCTGACCGCCAAAGATCTCAGAGCCTTTTTGCGTGGTGTTGTTCCAAGCTTGTGGG:1 - chr3R 7917354 5' - G6 347 1 65.60 GATTGCCAAGAGATAGGAACTTGGCCCTGATCCAACATAGAAATACATACGAATGGCCTATCAGCGAGTTATGAGATAGTCAAAAGGAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 25862703 5' + roo 8697 2 61.64 AACTATTAAGGCGGGTAAGGGGGAACTGCTAGAACTATATTCTAAAATGGGGTACTCCTGCACCAAATGAAAGTTATGTCGAATTTTATCCTTTCTAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAAT:1 + chr3R 8017702 5' + mdg1 27 2 67.81 CAGTTTTGTTTGCTGCTTTAAACACCATAAAGGTTAAAGTAGTAGCATGTGCATTTGCCAAATCCCATGCCCTACCCATAAGCTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chr3L 15364784 5' + 1360 36 1 60.27 AGATATTTTTATTTTATATTTATTCACGTTTAAAGAGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGCTTTCTATATTATAAGTTTTTATTTCAGCATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 - chr3R 15054273 5' + 297 2 2 79.31 GTAGATCTTTTAATGCTGTCTTAAGTCACTAAATCTAAGTTGATTGAAAAAATAGAAATTCATCTTTGTCTACATATAGTCACCGATCGTGAACACCACCTGATCCCGATCCGCACTCTGCACCACACCGCCGCTGCAG:1 - chr3R 12985433 5' + Chouto 292 1 52.52 ATTAAAAATGGTAGTGGCTTTGGGCAGGTGAGCTCAACTTGACTATGCACTCGGTGCGTATACTTAACGTAAAACCCTAAACCACTAATACACACACAACATGTACAAAAAAATACACACTACACTACTCCGGATGTACCCAACAG:1 - chr2L 14956639 5' + Idefix 86 2 48.63 CAGTTCTAATGACCTATCATCAAATTGTAATTACTGCAGTCAGAATAAATGACATTTTGAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 12379698 5' - roo 9011 2 61.38 ACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 26486027 5' + 412 7095 2 53.33 GAAAGGTTCGGCCAGTGATTGACCCAATTTTTCGGTCATTTATGTCGAACAAGTGATTTCAATGAATAGAAGTTTTTGGTTTGCAAAACGGATTCTAAACGAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAA:1 - chr3L 14167478 5' + mdg1 20 2 71.72 GTGCAGCCCCAAAAAATCGCATATGTGGTATATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTT:1 + chr3R 15152641 5' + opus 7202 2 76.71 AAAACAAGTAATACAATTATTTGGAAGCAATACATTGTGCACCTTTTTTGTTTAACCTAATTAATTTCTGCTAGTGGGTAGATTACCTGCGGCCTATAAAGGGTAGGCGCGAGCACGGATGCGGGGCAGTCAGTTGGACAGCAAGA:1 + chr3L 18385344 5' + gypsy8 374 1 58.22 GGTCCTCTCCATGTAATACAATTTACACATACCATTGTGCGAAAAGAATCCCACTGTCCACCGCCATGGTAGCCCCTATAGAAGCCCCAAGTCCCAGGTGTAACTGATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr2L 3231815 5' + roo 8676 2 73.29 AATTGATGTAAGTTGTAGTGTAAAGCAATCAGCATTCCATATGCTAAGTAATATAGATATATGTATAGTAGTACATATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCT:1 + chr3R 18918619 5' - 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chr3R 11482034 5' - BS 5079 1 66.44 TAATCGAAAAAATTTTAGAATTCTTCTCAAACAAAGTCAGTTATAACTGAATCAATATCCAGTTTTAGTAATGCCAGATAAATTACGTTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATAT:1 - chr2R 8036963 5' - copia 8 2 60.27 AAACGGCCTTGAAATTGCAAGTACTAACCCTATCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTA:1 + chr3R 6413573 5' + 1360 85 1 75.34 GGGTTAGCAATAGATAAAAGACCATACAGGAAATTAACAAATAACAAGACGGTTAAAAAAGACACCTTTCTTCGTTATCTTCAATAAATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTT:1 - chr2L 8282346 5' + flea 413 1 62.69 CGAGCAACATAATCGCAAAGTAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr2L 14239116 5' + 412 7092 2 58.90 TATATAGAACATTTTGTTCCTTTCCATTAATATTATATTATATTATAATTATATATTATCGATATAGCTAATATAGGGAGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAAT:1 + chr2R 5173102 5' + Stalker 44 4 54.11 ATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCATCAGGAGTGGCATCCAGTACACGGAGCTACCTGCG:1 - 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chr3R 15054242 5' + 297 6615 2 60.27 CAAACGTCCTGTTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3R 14218453 5' + roo 8746 2 76.22 CCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGCGTTACCACCCCACCCCCTACAC:1 + chr2R 5070928 5' + Tirant 4 2 21.88 CATTAAAAGCGATTTAAAAATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTCTG:1 + chr3R 7616712 5' - Stalker2 366 2 56.39 GCGCCAAAGTTGCCGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 + chr3R 7470941 5' + Doc 88 1 52.74 GAGAACATTCTTTAAGACGGCTCTGCGAATTTTACTTTCGGTTGCACGCTTTGGAGGGTAATTTATCTTAAATATCTAAATCCTTTTGTGAAAATGATACTACATAAAAATTTTAACATTATTTTTTATTTTACTTTCTTTTTATT:1 + chr3R 19294714 5' - F-element 4672 1 50.68 ATGAAATAAAGAGCACATTAGCATTTTTTCTCTTAATTTTTAAAATATTATTTTCTCTTCTGATGCAATGTTATGAATTAGCGTTGAGATAGAAATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTGGTTGC:1 + chr2L 3656996 5' - F-element 259 1 63.70 ACCTTTTGCACTTTGCTGTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr3L 10469634 5' - roo 9031 1 57.53 ATTATACAATATTTTTAAAGCAATATCGATGATCATATAGTAATCTTAAAAGCAGCAATATTATAAAAAGTAATAGAATTTAAATCATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr3L 5630472 5' + I-element 41 1 56.85 TTTGGGCTACACTAACCCAAAAGTAATAGTAGCTTTGAGCTATATTGTAATATAAACTTAAATGCAATTTGATAGATATATATAACTATATATATATAGCTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGTGTTCTCGGC:1 - chr2L 16562194 5' - opus 482 2 58.90 TTGGAGCTCTTTGCTAATCAACACTGTAAAAAAAACCACCGGCTTTAAACAAGGACCAATGTTAAAGCTAGATTATTGAGGTCTTGAAATATTGTATGTACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGC:1 - chr2L 21976831 5' + Idefix 11 2 48.63 CAGGTTCTTGATCGCAGTGCCATTTACACTGATCACAACCACATCTCGGCGCTCTCTCAGCTCTCTGCCCCTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGCGGCTTTAG:1 - chr3L 5630734 5' - I-element 45 1 53.42 CGAAAGAAATGAAATACTAGGTGTAAATAATAGGTATATTTTAATATCCGTTATTTGTGGGCTAAAGGGTATTCGATACTTTTCATGCTTTATTTTAACTTTCCAGCTTTAGTAATTCCCGAAATGTGGACGTTCATACGGACAGA:1 - chr2R 7217601 5' - INE-1 130 1 74.66 CTTGGCTCGACGACATATTTTAAACAACGGGAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 2330190 5' - roo 352 2 54.79 ATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGC:1 + chr3R 11151812 5' - mdg3 5431 2 62.33 CATTAATGGGCAACCTACAATGAATGTTGAAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCG:1 - chr2L 13332727 5' - micropia 423 2 60.90 ATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAA:2 + chr2R 11095744 5' + diver 66 2 59.59 GAAGAATCACGCACTGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAAAAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chr3R 30264112 5' + blood 7030 2 62.04 AGAACTATAGATTTCTTTAAGCATGGAGATGGCATATCCAGAGCCATTCCATTAAATATTCCCCCTCTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGTAACACTCAGTTGCATTGCATAAA:1 + chr3R 6645311 5' + blood 51 2 50.68 GTGATGGTAAGTCGGTCAACGTTCGGGGGTTGATGACACCTCTGTATATAGAAACCCCCCAATTTGCCAATAAAAAATTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTTAACTACCCTTTTAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTA:1 - chr3L 5655398 5' - invader2 316 1 50.68 GGATAGTTTGGGGAGATGTACATATGTACATATTTTGTCAGGCTGGTCATCGGCTTGACTTTTACGTTGCACTATGGAAACCTTTTTGTGGCCAAAATCAATAACTTCAAAATAAATAAATTATATATAATCTTGATCAGGATCAA:1 + chrX 22575907 5' + INE-1 82 1 70.55 GGTCTCCGGTGTGGACAGAGTGGGTGTAAATTGGGTTTGTTTTTGTCTTTCTAATTGTACCTCGTCGAACCACGCTGTCGGCGACGGCGATGACTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGT:1 + chr2R 5853768 5' - Bica 4658 1 64.38 AATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr3L 16059349 5' + 297 6639 2 65.75 GCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCA:2 - chr2L 22684602 5' + transib3 69 1 55.48 GCACTGAGAAAATAGCATGTTGTCGTATTGACCACGTACTATTTGATACAATAATCAGTACACTTTTTTGATTATAATCTGTGACTTTTTACCATTTATTTTAGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATA:1 - chr3R 12744779 5' + Stalker2 7268 2 58.22 TGGCCTTTCATCTAATGGGGGAGTAGCACATCCGAGTCCGTTTTCCAGAATTTCGGCATCATTTAGTTCTAGTCCGGCTGCGCCAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGACCGGGGGGCCTCCTTTCTCTACTCTTCGTTAG:1 + chr4 31523 5' - accord 7351 2 48.55 CATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGG:1 - chrX 21933314 5' + springer 7185 2 51.37 GGTAACAAATAACAGAAATAGCCGCTAAACTGGGCGCCACAAAATAGGCAACAGTATCCAATGGACATTACCTTAACCTGGTCATAAGCTACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2L 6388187 5' + jockey 36 1 63.70 CTTTAAGGAGTTTTTCAAACGGTAGACTTAAACGCAAATGGAAAATATTTACCTAATATTAAGACAAATGAAAATGTATTTTTTACGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGTAATAA:1 - chr2L 6300985 5' - Gypsy6A_LTR 239 1 51.37 GTGGTTTCCAAATACATATGTTAGCCAAATTATATACCCTCTGCTACCCTGTTTGCTGCTAGATGTAATGCTCGAAAAAAAAGAAGACGTTGTCGGTAGGAAGCAAGACTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATG:1 + chr2R 16684741 5' + accord 151 2 76.09 GAGCGATGAGTCCAAGCGACCCATCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAACAACTACAACAGTATAG:1 + chr2R 21820711 5' + Doc 64 1 55.48 TATCTTTTAAAGGGGTATATAATTTTATGATAGAGATTCGCTAGTCAGAGAAAAGAGAGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 4651551 5' - roo 9018 2 53.42 ATCTCTTTTATCGTTGTTTCGTTGCTGACTCGTAGTAGCAATCAATGCATGGAACAGTCTTTATTTGTAAGTCTTATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACT:1 - chr2R 3132847 5' + Cr1a 4064 1 57.28 CATCATAATCAACAGCAAAAAAATATTAATGGAGTTTTCATGTTTATAATGTCATTAGCTCACAAATGCTGCGTTGCTCTCCGTCGTTGCCGAGCACAGTTCCAAAATCTTGGTGCGAAGAGTGC:1 - chr3R 10952436 5' + Doc4-element 162 1 58.40 TCATAAATACGATAAAATATTGATATGACTAGTTACTTGACCTTTATTACTCTGCACCTTTAATTTACCTTTATCTAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAAT:1 - chr2R 17014495 5' - flea 4968 2 54.79 AAAGTGTAAAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2L 12291953 5' + Tirant 13 2 70.64 GAATCCATGCAGCACACAATTCCATGTTCATTTACTGCTGCCGCCAGATCGCACCGGTTCGTGTCTAACAATACGCAC:1 + chr3R 10907542 5' + X-element 15 1 57.69 GACTTTGTAATAAATATTAAAAATTAATTAATTTATTACATATTTATGATTCGAAAAAATTGAGGTTATGTTACTATTTTGTATGTTGCGGACTCCGTTGACGTTTTGCAAAAACGTAGCGATCCA:1 + chr3R 20571007 5' - Doc4-element 479 1 38.10 GTTTTTGTTGGTAGTCAACCAAGCAGTTAATATACATATAAAAAATCAGCGTGTTTTCGCCCGGGTAAGTTTTCGTCGCGTTTTTCGTGTTTTTAGAAAGTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTC:1 + chr3L 17352424 5' - mdg3 5414 2 67.81 ATTGCAACACTTTCATCATGTACAAGGGTGAGCCACCTCGCCATCGGTCTTCGCCAGAATGTTCCACTCACTTTTTCCCCCATTTTTCTCCTTTAGTTTCGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTT:1 + chr3R 18695249 5' - gypsy4 446 1 71.85 GGGGCGGCATGAAGTTTTCTGGGTTGCTACTGTTTACCATTACCATTATGCATTTGTTTATTCCTCTTCGTTTTCTTCGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 - chr2L 13629185 5' - Tirant 8464 2 55.48 ACTGTACATAAGTAAGATAAGTAAAGTCGCCATCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAGT:1 + chr3R 7481489 5' - invader4 3036 2 52.05 GCCGGGGATTTAATCTATTCCGAGTATATGCTTAAATTTATTTTAATAGTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTG:1 - chr3R 31483727 5' + I-element 72 1 66.44 TTATATATATACATGTTCATCCTGCTAAAGTTGAGTTCTCCATTTGCGGGTCCTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGATGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGACATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chr3R 9300744 5' + 297 6634 2 61.64 AAATAGCAGGTAAGGAGGATTTAAGAGCCACCGCGATTAAACCCATTTGATTTTGCGCCAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATCGTTAGATGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr3R 11870065 5' + pogo 41 1 53.08 GCGTGCGTGTCCCTGTCAAAGTGTTGGTAACTGAGTGGTTGCTTATGTGTGCGTGTGTTTCTGAGTGCGTGTGTTTGTGTGTGGTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr2R 23671751 5' + hobo 37 1 50.00 TATGTGAACGGACGGACACATGTCTGGTGGAAAGTTAATTTTCCCCTTCGCAAGGTCGATTATCAATCAACATTTTCCACCATGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTC:1 - chr3R 23235358 5' + BS 9 1 71.23 TAAATCCAAAGCTGTAGTTTACTTAACCCTTCTGCCACGTTAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr2R 15070212 5' + 412 23 2 65.75 CGGATATTAGCGCAAACAAAATGCAACTCTTGAGCTGAAAAATTGCCGTAATGAACAAGCTGCGGAGACCCCAGCCACCCCTTTTAACTCACCCTCACACGAGTTGCAGAGAAATTAACGGTCCACCCGGGC:1 + chr3R 14934606 5' - baggins 357 1 75.00 TATTATATTATTATTATAAAAGTTATGTCAACTAAAGTCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGT:1 + chr2L 11143119 5' + 1360 83 1 76.03 TTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGTTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 15920272 5' + 412 7119 2 73.39 TTTGGATTTTAAAATCCATCGAGCTCTTAGTTTATTTATTTAGCACTATTTGCACCAGCAAATAAGCTGGAATTATGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 25751774 5' + roo 46 2 51.37 CGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCACTTAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 - chr2L 12291934 5' + Tirant 8148 2 55.93 CCCCATTTTGAACACACCTGCAAACAAGCAGCAGCATCAAGTCCTTCCCATCAATATGGCTGGACTGCAGGAAGAACTATGAGGAATGGTACAGAGAATGATAGGTTTTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTCAA:1 - chrX 22405553 5' + invader2 4640 1 72.59 GAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTT:2 + chr2L 18112477 5' - transib2 2778 1 52.74 AGCTAAAGTTGGGTTACAGCCAAGTGCCTCATACGACAAAATGCTGCAGTGGCATACTTGTCAATCTTTTGTCAATTAACAACCCGAATAACAAGCGCTGCATTATATAATTGGATGATAAGAACCTATGTACGAATGAATAAAAT:1 + chr3R 25613004 5' + rooA 7514 2 58.90 GACATTTAAGTAAAGGCGTTGGCGAAGCAAGGGTTTCTCGTAACAATAATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 14375734 5' + roo 45 2 55.48 ATACGAGCCCAAGGAGATTCTGGGCAGGTAAGAATCGAACTACACTTGCCGTGATCTCAAACCTCTTATCAAATCCCTAATTGATCTTGCACTTAACCATTCAAATACGTTTCTTTCTATTTTCACTTCAAATAATTAAA:1 + chrX 11696514 5' + TLD2_LTR 95 1 52.86 GGGCAATTCATTTTTAACGGTTCGCCATGCACTTTAGAGCTGTGAATCGGTGAATATTTTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATCCACACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 19031355 5' + roo 22 2 66.67 CTATGTAACCGCAAAAATAACTAACCTTCAGACAATATTTAATTTTGTTCTCATTTTATAGGCAATATCTATATACACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAAC:1 + chr2R 5082981 5' + Tirant 8323 2 50.34 CACACACTCCTCCAATCGTCCAGTCACGCGCAAAATTATTCAGGGCATCCGAGCGATGTAAAAGCAAGGTGAAGTTTAAATACCTTAACGATAGCAAATCCAAATTGAGAACTATCATAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTT:1 - chrX 16092576 5' - 1360 207 1 76.03 ATCACATGTGGTGGCATGACGAGCGCACAGAAGTATCCGCAGTCGCAGACCCTAGCACATGCCAAGCCTAAGGGAAAGCCCGTCGCGCAGAACACGGTGTTCGGATGGACCGTTTCTGGAGCG:1 - chr2R 24391473 5' + Max-element 8140 1 63.41 GGTCCCAGATGTTTTCGGCTGACTTGTCAATCGGCTCCAAGTAAAATGGATTGTAGTTGGTACCCTGTCTCAGGGTCTAGCGTAATATTTGCTCGCAAACAAAAACTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAG:1 + chr2R 16845604 5' - F-element 461 1 67.81 GTAATTAATGTCGCGTTCAGTAGTGCAACCAAAAACATTTGAATTGGTCCTAACCGTTGAATTTTCGAAGCACTAAACAAAAAAGCTTGCCTTGCCAATTTGATGGCTTAAGCACATGCCTACATACTAATACACATAC:1 - chr3R 9546456 5' + Idefix 37 2 76.98 CTAGTTTGTTTGGCGCACGTGCCAAATCCACCAGGATCTACATGGAAATCGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAG:1 + chr3R 8050707 5' + BS 81 1 68.49 AATATTTTAAAGTATTATAGCAGGGTTTTATTGGTCAAGCTCATTTTTATCGGTTAAAAAAATGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTG:1 - chr2R 5434000 5' + Transpac 52 2 56.16 TAATCAAAACAATACCAGCTATTCCACTACCCATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGAC:1 - chrX 21933345 5' + gypsy6 7419 3 77.52 CATTTTACAAAAACCCGATGTTACAAATGTTGTTTTTCAAAACGCTTCCACACCTTTCTGTTCCCGAATTTTGAATATATTGATGGCACAGGCGATCCCGGTGCCTTATCAGCGATTGATGTACACATATACGGTCGC:1 - chr2R 5064367 5' + accord2 7211 1 56.52 ACACCCATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr3R 9125615 5' + Doc 16 1 78.26 ACGAAAATGCAAATCGATACCAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAAT:1 - chr3L 7801334 5' + Transpac 127 2 62.69 AATGCATTTTTTGGTTTAGATCCAAATCTCCAAAACGAAGAAACCCCTGAGTTCTTAAAATGTTTTATATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr2L 13255393 5' + pogo 49 1 55.48 CGGCTACCGAACAGATTCCCCACAAATGAGTTTCGTTTCGTTTACAAGTTTTGCGGAATGTTGCTGACGCTCATTAAATGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAA:1 + chrX 5000341 5' + flea 4608 1 62.14 CTGCCACATGTTCTGGTCCAGCCGAGCTCCCTGTGTGCCAAGAAAACGGGAGCGGGGCCTTGTGCCAGCGATGGTTGTAATGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCT:1 - 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chr3R 14218494 5' - roo 8975 2 80.14 ACGTAGTGACGAAACGCACCTGAAAATTCCGCCTTGTTACGTTTGATTAAATCGGTTGTTGTTAGAGTACTTATTTAAAATTTTTTCCTAAACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr2R 21848808 5' - Transpac 282 2 65.75 ATTACAATTTTTTAAGATAATCAAAAACGTATGTACTTACATATGACTTATGTACATACATATGCTCATATATGTACATATGTACATATGCTCATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 - chrX 2295283 5' + Transpac 18 2 51.37 GGGTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAAC:1 - chr2L 23034072 5' - FB 376 1 44.52 TTTTATGAAAGGGACAGTTCACTTAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 28450769 5' + roo 48 2 54.79 AAGTCTAAATAGAATTTAATTTTTAATTAATCTTTTGTATTACTTTTGTTTTTTTTTTCTCTTAACTTGTTGGGCGTTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCAC:1 - chrX 9966697 5' - I-element 33 1 54.11 GGCCCAACTAATTAGCCCACAAAGGGGGTTTCTGATGGGGGCAGTGGTCAGTGTCCACGGATAAACAACAAAAACATGGGCTTAAAGGCATAAAACCTTTCAAAACAAACCAAAAAACAACAACGAAAAA:1 - 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chr3R 30369286 5' + INE-1 58 1 61.87 CTGTACAAAACAAGCCAGTTCCAGCCCGAATCCCACCACGAATCTGTATCCGAGACCGAATCCTAGGGCCAGGCTGCGGATACTGGTCCGCAGACTAGAGACTCGCTGAGAGCGGACGAAATCTAGAAATATAATTTGCTTGCTTG:1 - chr3L 3651226 5' - 1360 3263 1 69.18 GGTTGCAACATTGACCACAACAAAAGGAGTCGAGAGACTTGCATTGTTAGTCCCTTCTATGTATATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1 - chr3L 14302293 5' + Quasimodo 43 2 58.90 ATTGTTATTTTCGAAATTGACTTTAAAACGGAAAACCAAATAAGTATAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 21216851 5' + 1360 55 1 70.63 AATAGGTGAAGATATAAACCAAACGGAGGAATTTCATTCGGATCGCATCGTTCGGATCGTTACTCAAAATGTTCCGCACTTTTTTGCTGTTGTTTCGCGAGTTCGTCAAATAATAAGTACCATATGTTGGCTCTCTGAACAAGAAA:1 - chr4 118363 5' + Tc1 116 1 73.97 TACATCATTTCTATGCTGTATTTATTGCCCGGTCGCAGTGATCATCGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACT:1 + chr3L 6355604 5' + Tirant 8162 2 62.40 GGCGGGCATCGTCGCAACTTCGGTCCCACGACACGAACGGTTTCGTCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:2 - chr2L 17260802 5' - P-element 2814 1 35.62 AGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chrX 4400322 5' - roo 324 2 77.24 GGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCT:1 - chr3R 15790070 5' + flea 28 2 74.66 AACTCGAACAATACGTATGAGACTTATTTGTCAGCGTAGCTGCTTCGGCCTAGCAGGACCTCCGCCCACCAGGACTCGTTTCGAGCTGTCACCGAACTCAGCATAAAAGTAAAACGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCACAA:1 - chr3R 22340940 5' - hopper 109 1 74.66 GATATTAGGTAACATGATAAGTATTTCACTCACGACTATTTTAAATTACAGCTGTCGGCACAGTCATCAGCACACTAACTGTTTGCCAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTA:1 - chr3R 11685008 5' + hopper 953 1 61.64 GTAAACAAACAACAGCAACAACAGCTGGCACCACAAAAACAACAACAACACGGCGAACAACCTGAGAACCATCACCGGCGCACCGTAGTACGTTCGAAGTGATAACTTACATAGGGATTTATTCATACTTCCGGTCAGAGATGAAA:1 + chr3L 14273302 5' + Fw2 3689 1 58.90 GTTTGCGGTCAAAAACTTCACTTAGTGGCATTTTAGTTTACTTGTTCCTATTCGCTAGTGTGTTTTTTGTTTCCCTTCTTCAGTTGTGTGCGTTTGTATGAGTCATATTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATT:1 - 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flea 218 2 60.96 CTGCTTGCAAGTGGCTTGACTTTTGGACCGCAGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 - chr2L 21910250 5' + Doc 4 1 73.00 GAGTGAGCGATAACATCAAAAGACCAGACATGATTTGTCCCAGACATGAGTATATATAGTATTGCATATAGTATATAGCGTGGCCTTGCCTTACAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAG:1 - chrX 17340829 5' + P-element 409 1 63.70 CGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1 - chr2L 21643134 5' + Tabor 6893 2 53.47 ATGTACGTATTGAAGTGACAGCGTTTGTACATACACATTATGTATGTACTTTGTGCAGGCCTTTAATGGGGGTTGATTTGCCAAAACGAAATTGGAGCCTAGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGC:1 + chr3R 7089430 5' + P-element 21 1 69.86 AATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGG:1 - chr3R 21395219 5' + G2 439 1 53.06 TCTTTACAAACTGCTGCCCCGCCCCCTTTTAGCCTTTGCCCACCGCCCACTCGAGTTCTAAGCAAATGCAGTCGCTTTGGCCTATAAAAGGCAATGGGCTAATATATTAATAGCAACACATAATAAAAACATAAAGATTGATTAT:1 - chr3L 19218863 5' + hopper 1140 1 71.03 GTGGAAATAAATGAATGGGCGGCAACTGTGAATATGATGTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAA:1 + chr3L 3282253 5' + opus 7471 2 61.76 GCCACACTAATTCAATTTCGGTTCCAATAAAACGCACACGAAAAGATGACGCCGCATCCTGGCCAGGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGT:1 + chr3L 11745452 5' - roo 8700 2 52.52 TTTACATACGAATATCAGTTCGCGAGCTAATTTGAAAATGTTTTGCCTCCACTTTAGTTAACTTTGTGCTAGTTCTGCCTTCTGCAAATATTTGTTAGATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chr2R 10160650 5' + hobo 24 1 63.01 TATTCATATGAGTTTTTAATGTATAGCTATCCTCTTCTGGAAATTATAAGTATGCCTTTAAGTATTTTAGTTCTTATGGTTGAGCTGTCATAGAGGTTAGGCAAAAGTATATTTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 - chr3R 14954127 5' + jockey 4763 1 42.45 CATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGG:1 - chr3R 24454850 5' + F-element 316 1 73.97 ACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGC:1 + chr3L 27356055 5' - Tc3 1662 1 63.01 TTTCTCCTAATTCTAAATTTCATTAAGGCCATCCTAAGTAAGGTTGTTCAAAATGCACTATGTCTACTTTGTAAATTCTACATTGTCAAAATAAAAAGCTTTTTAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCT:1 + chr3L 16733868 5' - Ivk 267 1 71.23 ATTCATTAACATTGATGAGATCGAAGAAAATCGTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2L 7652149 5' + roo 8683 2 65.75 CCAACTGGCCACCACATGCTAAATACACCGCAAGAAATAATCTGACTTAAATCAAGTTAATTTTTGGCATTTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chrX 10444740 5' + opus 147 4 54.81 CTTAACCCATTGAAGACCGTTCGTCGAAAATCGGATGAGGTACACACATTTAACTTACTTAAGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGC:1 - chrX 14137302 5' + 3S18 5826 2 56.85 GTTTAGCTAATGGCCAGGTAATGAACACATACATATGTACATATACTTTTAGGGGTATATGCGTGCAAAAGTTACGGCTTCCAATTTGAAATTACTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr3R 12379832 5' + roo 8691 2 67.12 TGTTATTAATTATTAGTCACCAAAATTAATACAGAAATGAACATCTAAAAATTTAAATACTGAACTCGGCTAATGCTCCTTAACGAAATAGGTACGGTAGGGCAATCCGCGAACACAACTACACCGGTGTTTCGCTAGCAACAAAT:1 + chr2R 4774819 5' + Gypsy12A_LTR 1994 1 41.78 CTTAGTTATATTTTCTATCAATTAATTGAATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr3R 8140877 5' + pogo 57 1 76.72 CTGTCGCGCAGGGGGGCAAAAAGGGGGCGGGGCCGGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTAATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr3L 3453550 5' + Tirant 8119 2 77.40 AGATCCTTTATCAAATTATCACCAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chr3R 14278006 5' - P-element 2854 1 63.01 CCATGCCTCACGAAGCGTGCGGTAATTGGCAAAAGAAACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAGTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTGACAAACACA:1 + chr3R 20450435 5' + hobo 82 1 72.60 GCCCGAAACATTCAATATTTTTTTAATCAATATATCGCCAGCTGTACCAAATTGCTTAAGCGCATTTGGTTGGAAAGTGTTTTTCACACAAAACTGATTCGGTTCGATATTTCTCCTCAATTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCC:1 + chr2R 17482308 5' - 17.6 7168 2 79.45 AAAATATCAAAGGTGATTGAATGCATGCGAATAAGATTTTGAAAGGATTTAATTTGTTTGTGAAAAACGATTTCGATAACTCATTGTAATCTCTAATGGATATAAGCTAATTGAGTAGAAAACAAATTTTAATTTATTTGTAATTT:1 + chr2L 8329163 5' + Rt1b 124 1 76.71 ATATATACATGTTCATCCTGCTAAAGTTGAGTTCTCCATTTGCGGGTCCTATATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGTATGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr3R 9300748 5' + 297 6601 2 57.66 ATATTAGGCGGCCAAGTTTTAATGAAAAATGTCGTCTTCCCACACAAGTTAACGCTCAACTGTGACACTCAAACCCGGATTTAGCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCT:1 - chr2L 22737680 5' + Cr1a 4035 1 60.29 GGATGCTGAAGTTGAAAGGAATGAAAATGATATGATTGCTTTTCAAACAAAACAGTGATTATAGGCATTTTGAAGTTCAATTCTTATAACGATTTTATGGAATTACTTGTCTACGAAATAATATAATAATAATATTAATGTTAATT:1 + chrX 7374030 5' + mdg1 7081 2 69.18 TTTGGGTGGCAAAGGTGTACTTTTCATACCAAAACCATTTACTTGTGCTTCATACAACAGGGCTTAACAAGGCTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCACAAACATGTAAT:1 + chr2L 11554467 5' + roo 8788 2 50.00 AATGTCATTCTAGAGTCTCTGAAACCTCTAATATAAGAATATAAATGGACTATAACCAGTAATTACTGTCGAAATGAACGACTTTTCGCTGACAACCCTAAAAGATTGGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGGAGGGCACAAAAA:1 + chr3R 16707097 5' + mdg3 365 1 50.68 CCACCAGAAACCTCATTTGAAAGTCCCGAAAAGAGCAAACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr2R 18014148 5' + Doc 48 1 52.05 AACTATTTGTTTGGTTTAGAGCTCTTTTAACAAATTGCCGCTGATCCATTCTACGGGCTCTTAAACAGATTATTGCACAACGGGAGAAAATAATAATAATCAAAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGG:1 - chr3R 17496117 5' - I-element 250 1 74.29 CTTCCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAATTACAACAGTATAGTGAA:1 + chr3R 7585750 5' + Doc 68 1 66.39 AGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chr3L 3453609 5' + Tirant 8160 2 60.94 AGACGAAAGCAAAGACTTTTCACAGAAACCGGTTTCCATCGATCAATAGATAGACGGTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chrX 4673605 5' - roo 9019 2 60.74 TTTAGAATTTCAATAATTAAAATGGGTTAAGGAGTAATGTTTCTGATTTAAGCTTAAGTACACTGTTTTCATTAACAGAAAAAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr2L 19691358 5' + roo 38 2 56.16 TAATTATTTGGAAAGTTTTTGTTTTCGGAAGTGTTTTATTTTGTTTTGATTGGAGGGTATTGTTTCGTCGGCACTGTGTTAGTGGGTTGTTTACTTGATCTGCGCGAGAGCGCTTCTTGCTTATGCTTATGTTCATACATATGAAA:1 - 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chr3L 1543036 5' + Bica 4843 1 80.82 CTGGATCCGAATCGGTATCCAAAATCAGAATTAGCCGCTTAATTTCCTCTGTGTAAAACACACTTGGCTACCTGTTGCACACACACACACACACACACACACACAAATTC:1 - chrX 9068459 5' + accord 7031 2 53.64 ATTAGAGTCATTGGCCTGATATGGTGTCCAAAATTTATTAGTAACTTAACATGAAAACAATTATTTACATACCTAGAGTAATTTAGTTTGCTGCCTAACTTAAGTTTTTATGGAAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATAT:1 - chr3R 15690131 5' - Doc 175 1 77.40 GAAAAAAGTTCATGAATAAATACACAACATGGACACGGAAATTTTTTGAATATTTCTGAACTCTTGGACTTTTTAAACCTCAATTCCAAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATAT:1 - chr3L 778284 5' + I-element 5230 1 60.27 TCCCTGGTTTCCTTCCGTTCGTCCTTCTATGTTCTTTAGATTTTTCTCCACCCACTTTGCTGACTACTTTTCCTTTAGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGCCATAAGAAACAAAAACACA:1 + chrX 3737391 5' - pogo 305 1 54.79 TTTGTTAAATTTTGTAAAGAATATTGTTATATTTAAGCACTCCTTTACTTTGATCGCACGATTGTAATATTTTACAAGCGTTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 11944806 5' + roo 40 2 59.59 CCCCACACGTCTATAACCTTGAACCTTAGTCGGAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTAACTTTAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTTGTTGGAAAAATAATACAACTGTTC:1 - chr2L 14955007 5' + F-element 4584 1 36.80 GAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 - chr2L 21910207 5' + Doc 80 1 80.45 TTTAGTTTGTTTAGGAGGAACTTTTACTTCGCGCGTAATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACT:1 + chr2R 12065531 5' + Stalker2 11 2 78.77 AAATTAAACGAAATATGCTTTGTCTTCCGCTAGCTGGATTCAATTCAAATTCAATTCCCCGTCGCAAAAGGCAACGCAGACGTCAGTAGAATCCCGCATATCTAACCTAAGCTTTCTAGCTATAATAGTTTCCGAGATCTCGACGT:1 + chr2L 21800269 5' - INE-1 143 1 51.37 ATAAATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTA:1 - chr3R 13437248 5' - hopper 1357 1 59.31 CCTTGTAGATTTCTGTGAGCTTCACGAAACGTTTTTCGTAAGAAATTCAACAGGCAAGCTAAAGATTTCGTTTCTTGAGCGAGTTGGGCATTCAGAAATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGA:1 + chrX 3413193 5' - transib2 384 1 63.01 TATTGACATTTCTAGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 + chr3R 16276319 5' + pogo 53 1 58.90 GCCAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCCTACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chrY 917823 5' + 1360 58 1 93.02 GATACATAATCGCAAGAACGAATAAAAGTTTTTTTTTTTCTGTTTTTTGGCATTCGTGTAAACAAAGAAAATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAG:1 + chr2L 1692825 5' + accord2 7596 2 52.74 CCTTTTATGCTTTGTTACTGTTACGTGGCTTGTGCCCAGAATGGCTAATGAGCCGGCCAAAACGGGCATAAGCGCTTGCTAATAATCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGC:1 + chr2R 10869204 5' + roo 243 2 70.09 CATAGTTTTTAAAACTATGTAAGAGGTGTACGGATCGAGAGAAGTACACAAATTCAAGCCCATATGGATTGATTCACTTGATTTATACAAAATTCCACGGGCAACGGTGTATTTCCAAATAAATAAATATAAAAAAACACACACAA:1 + chrX 456876 5' + Tc1-2 488 1 51.37 ATTGAATTGCTTAACTAAAAAGTGAAAAAGCGACATCAAAATAAATTGAGATTCTTTAAACACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTG:1 - 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accord2 7256 1 58.46 TGAACAAAAGTGGGTAGAAAAGTTGGACTTTCATACTATCTGCACTGTTTCGCCATTTGAAGAGTAAACACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr3L 1358548 5' + 412 7103 2 51.72 GTATGCGTAATGTGGCAATGAGATATAAATCGAAGGCAGCGCATTAATGGCCAACTATTAAACTAATCGCTTTTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - chr3L 10112323 5' + I-element 19 1 69.86 TCATGATTCAATGCCAATTTGACACTTGTGAGGAGTTTGAGATGGCGGCGCGGGAGTTAACACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr2R 23212606 5' + Tirant 12 2 58.82 GCGACTAGGACGGCAGTGTGAAAGAAAGAGAACGAGCACGCCCGGCCGAGGAAAGTAGAGTAGTTCCTTCAACAATAGACCTAGACATCGGAGCTGTGAGGTGGATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCATTTTTTTT:1 - chr3L 18400215 5' + copia 366 2 69.18 AAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACTTCGCGTCGCGGG:1 - chr3R 16997440 5' + G6 86 1 72.60 ACCTGCGAAAATGGAATTTAATTTGCTAATACGCTTCGTTGAGTGGCAACGGGAGGCGTTTTAGTGGGGTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr3R 20934627 5' + 412 7070 2 72.60 GAAAGCAATACAGAGCACAGCGTAGAGTGGAAATTGCTGTAATTATGCCAAATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCT:1 - 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INE-1 554 1 83.33 TCGCTGCTGACCCGGCCACCAGACCTGCTCGACTGCATCCAACTAATTTGTGCCACTAATGAATTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCGAAGCTTAAACCTAAATTTTTTAATTATTTTAT:1 - chr3L 5073902 5' - S-element 1458 1 54.79 AAGATGTTACAGTTCATTTATACATTTGAATACTTTAAAGAAATTTGGATACTTTAGAGCTACCAATATTTTCAGCATTAAGTCACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 - chr3L 21665347 5' + 1360 37 1 60.96 CAGCTGACGATGTTGGCCAACTGATAAGCACGACTCTATAAAGTTTTAATGTCTTTTGCAATTAATGCGAACAACGGCGGAAACTCCAAAGGTTCATCAAATCAGAATTTTTTTTTATAATAATGTTCG:1 - chr3L 19582341 5' - Circe 463 1 74.42 GTAATTTGTGGCTGTGGGGCCGCAGCAGCTATTGCTGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCCGGCCAGCGCGTTAAACAGATCTCGCCC:1 - chr2R 14913521 5' + X-element 4456 1 63.96 GGATTTGACAAAATGCATCTTTTAGATCAAGACTTGTAATGTATTCTGCTTTTGGTAATTTACTTAATATGCCATCGATCAACGGCAGGTGTAAAGTTCATTTCCTAAAAAAATTCTTAAATGTTTATATTTTT:1 + chr3L 25059138 5' + Tc1 61 1 64.93 GTGTATGCGCTTGGTCGCTAAGGTATCTCAGCTGCAATGAAATGTAGGTTGTTTGTTCCTTCACGGAATTAAGAATTGGGAACTGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAGTCTAAAAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAA:1 + chr2R 4260439 5' - 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Ivk 5359 1 76.03 GTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTTGTGTCCGCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGAT:1 - chr2L 14588753 5' - 1360 366 1 93.84 ATCATCCACCTCATTTTCCACTCTGTCATGTGACCCAAACTTCAGCTCTCTAACAAAAACTCGAGAGAGCCTGGACGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTG:1 + chr3L 24764357 5' + 1360 3388 2 69.66 ATTGCAGCTTTCGAGGGCAGCAGCAAAGTCAAGAGATACTCATACATAATGCACGCAAATATATATATATATATATATATATATGTATGTATATATAT:1 - chr2L 9810141 5' + 1731 4409 1 74.49 GTTGCAAAAAACCGGAAAGCAAGAAGCCGAAGCTCAATGTTGAAACATTTGTTTAGTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chrX 21403488 5' + roo 41 2 55.65 TAAGAAAAAGGAATTATTAATTTAACATACATACACTGGCATACACTGCCAGAAAACGTTGAAAAGTTTTTAACAGTCAAAAGCGTTTCCGACCATATAGAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCC:1 + chr3L 27171037 5' + INE-1 101 1 72.60 ATGAAGTACAGTCCCAGGACATCGAAAAAGATGGCATGTCCTGTGGCATAAGCCTAAAATATATCGATAAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGAC:1 - chr2R 19383077 5' + 297 6566 1 52.74 CGAATAATAATTTGAACTGAAAAGCCTGTCAGGCAAAAGAGAGAGTTGAGTTACCATCATAATCAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAACATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGT:1 - chr2R 12542723 5' + FB 59 1 56.16 ATTATTAAACGCCGATACTCGGCACGACCTTCCACTATTATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAT:1 + chr3R 15290277 5' + roo 395 1 72.14 AATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3R 18528359 5' + roo 8738 2 69.86 AAGTGAAAGAGTATAAAATAATTTATAAGTAAGATCATAAGGAAATAAAATGCGGCGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATCGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACA:1 - chr3R 4079522 5' + 1360 3197 1 62.33 TCACTTCATTTTGAGGGCGTCCTATGAAATATTGAGTAGATCACCAGGCCTTCGGGTATGCCAATCGATTTGGGCCAAATATCAACCCACTTACGATTAGTGACTGCCGCAATACCCGGTGTTTCACTTAAAATATTTATAAAAAA:1 + chrX 10150113 5' + TART-B 10623 2 69.18 CTGTACCATGCGAATCTGGACCACGCCTCGTTGTGGGTTTTAGCTTTCTGTGCCGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 - chr3R 17099990 5' - Tirant 385 2 60.64 AGAATGGGAGAATGTGAGAAAGGGAGAGTGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 19580879 5' - roo 9016 2 54.11 GTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:2 + chr3R 9125677 5' + Doc 86 1 69.86 TCGAGCTTTTATTTCATTGCAGTTGGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGACAATGCTGACCCTCGGACTAGAGGCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCA:1 - chr3L 15723918 5' + jockey 4749 1 78.91 ACGAGCAGACAAATTTATTCAAAGATTATAAATATTCATGCTGCTGTTGAATCAAAGCACCAATAAAATTACCATAAATGCCGTAATATGTTGATACTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3R 10150278 5' - 1360 3365 1 69.18 ATAGTAAAAAAAAAAATGAATAATAAACCTCCTTATTATGACTGCATAACTTTCTTAAATCCGTTAAACATTTCAACTAAAAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTT:1 - chrX 11278355 5' - roo 372 1 54.48 TTCACTGCGCCTCCAAGAAAATGCTCGCTTACTTGCTTGCTTTCGCGAGGAGTAACAAAATAAAGAATAATAAAAAAAAAACAACCACATAGGAACAGCCATACACCAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCAT:1 - chr3R 22193977 5' + Quasimodo 101 2 55.48 CCTCAAGGAGAAGTTCTCGGTCGCATTGGTTAAAAAAAACGGCAAAGAATAAGACGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACCGCTCT:1 - chr2R 2903263 5' + 1360 124 1 56.45 GCCCATATAATGGAGCTGGTTCTCTCGCATTTTCGATTCGGTTCATTTGCAGTTTGTTGCTGATTTAATTGCAAAATATATACATATCTCTATAGATATTTATTTATATACGCTCAATATGAAGAAGTAAATA:1 - chr3L 13232280 5' + Quasimodo 476 2 77.44 ATTCGTAATCGTTTTTGTGTTCGTGTGTACTCCTCGCTCTTTTTTCAAGACCTTCTGACGTCAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr3R 25050093 5' + P-element 55 1 47.95 GGTAAATCAGCTGCCCAAACATCGAGCCATGTGCGTATCGAGTGACAGTCCGTTAGTGAACCCGCACGGTACAGTGCATCAAGTTTCCCCAAGTCCACAGAGGATTCCAGTACATAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTACTAAA:1 + chr3L 12816533 5' - Q-element 319 2 75.34 ACTCGTAGTTTACTTTTTATTTTGCTCCTCGCTTTCTTCAACTTTTTTTTTTT:1 - chrX 4168159 5' + FB 173 1 64.15 CCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGATCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr2L 17295873 5' + Doc 80 1 76.80 CAGCACAGACACCGGCCGCGCGGTGGGCAGAGATTCGCCGTGGGGGTGGCCTGGATGTCGCCCGTGCATTTGTTTGGAGTGGCTATTATCCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGA:1 + chr2R 7615477 5' + Doc 486 1 62.86 GTGGGCATGGCTTAAACTAGTTAAAAGTATATAACAAACGCAAAGGAGACACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATA:1 + chrX 8967339 5' + HMS-Beagle2 6899 2 74.66 CTAATCATCTTTGACAAAGAGTATGCCTGGTTTACCTTTTTATCCGTAAGCACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 19031187 5' - roo 386 2 69.18 ATATTTATTCTTTCTATTAAAAACACTTCCCTTGAAATCATCGTTGTCAGTTTCGACATTTTAAATTGGTAGCCAGCAAATGATGCACAAAACTGCATTCTGTTTCTGTTGTACTTTATAATTTATATGTCCTTTC:1 - chr3L 20252055 5' - copia 247 1 76.47 AATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGAACCCTCAACCG:1 + chr2L 13629084 5' + Tirant 41 2 60.58 GAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTGTGTCTCCCAATT:1 + chrX 22726193 5' - Helena 1230 1 57.53 AGTAGCTTTGAGCTATATTGTAATATAAACTTAAATGCAATTTGATAGATATATATAACTATATATATATAGCTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 - chr2L 16562167 5' - opus 7458 2 56.85 GCATATATAAGCCACAACCACATAATAGAATTTTATTTATATGCCACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATA:1 - chrX 4032220 5' - transib2 2751 1 69.18 GAAAAATAGGAGTATCCTGAATTCTGAGACGATTGTTGTATAGTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTC:1 - chr3R 2999834 5' + McClintock 6028 2 71.92 GCGGGCATCGTCGCAACTTCGGTCCCACGACACGAACGGTTTCGTCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 - chr2L 17260801 5' - P-element 2814 1 35.17 GGGCACCTGCTAAACACGCTAACTGCTTTGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3L 8658789 5' + roo 8731 2 77.24 GTTATAATAAATACGGCTGCACCTGTCACAATGCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 - chr3R 17047880 5' + 412 81 2 74.64 GCACCTGCAATTGATAACGGGTCGCCAAATGGTAAATAGTACAAACAATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAA:1 - chr2R 18689232 5' + Burdock 72 2 66.90 TATGTTCAAAAAATAATCTTCGCCCATCGAATCAATTCCATAAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 - chr2L 8574492 5' + Transpac 4943 2 66.90 AGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGCTTTCTATATTATAAGTTTTTATTTCAGCATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3R 15054238 5' + 297 6619 2 57.53 TAATTTAACAATTTTTCAAAAATGCAAGCGTTACACTTTTTATGCGGTTTATTTAAACATTTTTCAAAATGTTTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTTGGAAACATACTAATGCAAAAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTACCCGAT:1 + chr3L 27543 5' - INE-1 568 1 74.66 AAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGT:1 + chr2L 15081065 5' + Doc 65 1 63.70 CATGGCAACGAATTAGTCAAATAGGGTTAGAACTTTTTATATGCGCTATACATCCAATTCCTGGCGAATACTTGAATGTCCTTGTATGTTTTTCCTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTGACATTATTTTCTCCTGGGAGCAGTGCTG:1 + chrX 5383109 5' - HB 363 1 49.32 CAGGCCGAAACAAAAGGGGAAAACCAAGAGGAAAAAACAAAAAAGAAAAGCAGACCGACCACAATGTTGCCTAACTGCACTTTGGCTGCAACTTTTTTTAAATGAGGCTTGATTTAATAAGAAAAAATAATAATAA:1 - chr3L 556393 5' + flea 5002 2 71.32 AACACTACCTCTTTCCAGTTAACCGGCCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 - chr2R 17097532 5' + P-element 57 1 27.27 TCTTACTCTTGGGGTGGTGCCAGTGGTGGCTTTTCCCAAATGGCAAGCTGAAAGCTGAACTTCCATTTAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 - chr2R 19852255 5' - Transpac 294 2 64.29 AAGGGGAACAATAAAACACGGAGCGTGTAAATAGAATTTTTGGCCCGATGGCCGCCCGGGGAGTGCTTTGGCATAATCTGCATGAGCCGTTGGCATTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACAGAT:1 + chr2R 14441854 5' - jockey 4969 1 65.75 CACCGCACATTTTTGATGTTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:1 - chr3R 13349608 5' + Ivk 28 1 62.22 AAATCCACAAATCAGGTATGCCACATATTTTATGAAAGGGACAGTTCACTTAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 28450796 5' + roo 21 2 67.12 GAGCCGGCACAATAATCCCTCATATTTATTTTTGCAAAATTATTTGCTTTGTCTGATTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAA:1 + chr2R 13367412 5' + jockey 4587 1 64.38 CTGTCTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chr3L 5069482 5' + opus 7053 4 66.39 ACTTGTAAGTACCGGATACGGATAATCAGTCAAAGGTTTTATTCGGTTTGTGGGCGCTAGAGTGGACGTGGGTCAAAAAACATGTGCTGCGTCTTTGTCTCTAGCACCTGTATGCTGTATCTTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAG:1 + chrX 136072 5' - INE-1 153 1 73.29 CCAATCAATGAAAATCAATAGGTATGTGTGTTGATTTACGCTCATTCAAACTAGTCATACTTTTAGGCGCTTAAATCATTCTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTTCAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATC:1 + chrX 11447043 5' + Cr1a 4202 1 52.74 AAGTTTGGCGACAGAAGCGACTCGGCGACGAAGGCCATAAACTCTAAAATGTAATTTAATTGTTGTCGACAGTAAAAACTTATCTCATAAATGCAGCAATCATTGTGCCGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr2L 16615901 5' - hobo 2931 1 78.47 AACACAACAACCAACCGGTTTACCTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGA:1 - chr3R 7089533 5' - P-element 2791 1 19.86 CTCAGCTGCTGAGTAGAGCGAATGTTCCTAATACAAAATAATTGTTTCTTTTATGATCTTTTCTGCGTTATCTACGTGAC:1 - chr2L 123662 5' + McClintock 144 2 85.00 GAGTGGAAACCATGCCCTGCTCCAAAACGGTTTCACACAAAAGTTTATTTATCTTGTTGGGGCTAACAGTGCACAGTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAA:1 + chr3R 30071824 5' + P-element 210 1 53.42 GGATGCGCCACAAAATATGGATGCACTGTGAACAAAAGTGGGTAGAAAAGTTGGACTTTCATACTATCTGCACTGTTTCGCCATTTGAAGAGTAAACACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - 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roo 8993 2 66.90 GTTCTGTGGCTGCGCCACTAAATGTTATTCACATTCTAGCCCCCTACTTTTACACTTCCCAGTGGCTGTCAAACTGCTAGTGGCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 + chr3L 2425851 5' + hopper 6 2 74.78 GATTTCATAAGATTTCTTCCAAGGAATTTATATGCATTTTCAAAAAGAGCCACGTTAGCGTTTTTTTCCCAACAATCTGGTCATTTTATGAAGTGTAATGATGAACTACAATTAAGAATACAAG:1 - chr3R 26486151 5' - 412 7537 2 75.00 GTTTAGTGTGTGACAAAAGACGAAGAGAAAACTTGGACCGAGTGCATAGAAGGGCGAATACTTTTGAAGACTGGTTACGAAGTTGGATTATTGGATATGATATCCAAAAAATTTACGAATGATGAAAAATATATTGTTAAAAAAAA:1 - chr2L 12188818 5' - hopper 163 1 76.71 GTACACATAAAGCCACGCGATGAAAAACGTTTGAATTCTCGGTCGCAATCAGGAGATAATTTGTAGTCACTCTTTGGGCAACACTATATACAAACTAGAGAAAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAAAATCTG:1 - chrX 11941681 5' - Cr1a 419 1 35.62 ACTGAGTAATGAAAATCCGGAACCCAAGCAACAAACCAAAAAACAAAAATGCAGATAAGTCAGTCAGGTGAGTGAAAGAAGATAGAGGGTATACGCTTGTGCAGCATTTTTCGATATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACA:1 + chr3R 11400646 5' - Stalker 6919 4 76.71 GCCAGTAATATACACATACGAACACTCCAACACACTCACATTCGGGCAACAAAAAAAAATTGCCAACTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - 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chr3R 19449462 5' + roo 8638 1 58.22 GGGGTAATATTAATGGTTTAAAAACTAAATTCGACAACCCAACAGCAAGTATGTACTATAAGACCAAATATGTTAACTTCTTCACGGTGTTGCTATTCTAGGGAGGTCACTGCACTTGTTATTGCAGTGTTACAGTTAC:1 + chr3L 15134739 5' - Doc 484 1 66.91 GTGTATGCAATTACAGTCGCCCACATAAATATATAGCCAAGGCATTCACTTAAGTTGCACAATTTTAATTACAATTGTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 + chr2L 2317354 5' + 1360 37 1 63.31 CAGTTAAAAGGCGAGATTTTCTAGTTTGGACAGTAATCCTGATCAAAACAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTCCTCGATTGTCAGATACCCTAGTGGAAATGCGAACGCGAAATTTTCTTCATTTTTCTGGTATATCGATAGATT:1 - chrX 20446211 5' - INE-1 499 1 55.48 GAGATTGATGCAAGTTTTGAAATTTGAATAGGAGTTTAAATTATGATCTTTTAAAATTCAAACCAAAACTTGCCGAGTCGATGTGGACATGTCCTTCTGTCTGTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAA:1 - chr3L 23823953 5' + INE-1 144 1 48.92 TCTGTTTGGCAAATCACACTTGACTGAGTCCCCAAAATCCACATTCTCGTCATCGTTGCCGCGCATTATATAGTCGAGTTACCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCT:1 + chrX 4884978 5' - INE-1 545 1 61.82 AAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATAGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAA:1 + chr3R 25543461 5' + G2 239 1 54.11 GAATTTGCGAAGGGGATCGACCCACGGCTGCCACTTTTTAATCAAATTATTTATAACAAATGCCATTTAAATATCTATCTCTGTATATTTTTATAACCATTACTCGTAGATTCTGTATAAAGTGTATATATTCTTGTTCAGGATCA:1 + chrX 15408643 5' + INE-1 81 1 71.23 ATTAACCCACTGATAGTATAAGTAATAAGTACTTAGTTATTAAACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr2L 19691249 5' - roo 333 2 69.18 AAATAATAATAGTAATAAATACAATGTAAGAATATTACGTATAAGCAGATGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTAT:1 + chr2L 1360939 5' - Stalker2 331 2 64.38 TGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATCGCGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr2L 3960192 5' + jockey 82 1 65.75 GTGCATTCTGAGCTCTCTTAAATATTTTGCGACTTTGTGGCCTGTGCTGACTTTGAGTGGCAAAGAAGCTTGTGAGTAAACACATTTGCCAGAGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2L 11554611 5' - roo 9045 1 67.59 AAAGTCATCAGCATGCATCAGTCAGCGGTTTTCAAAGAAAGTGCAGAGTCGGCGGAAAAAAATATGAGAAAACTCGCAGTTGCCTCTGTGGCATTTTTAGTTCCTTCAGCGCGCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATG:1 - chr2L 18112640 5' + transib2 2559 1 75.34 CAAAGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 16331042 5' - roo 362 1 58.59 TATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr2L 17295816 5' + Doc 32 1 56.72 TAAAAATCATTATCATATTGCGAAGCAATCGAAACCTATAATATCATTATTTCTTAATTTTTGCCAATTCCGCTCACTTATTCTGGTATATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAAGACTCGCAGCG:1 - chrX 22405700 5' - Gypsy6A_LTR 124 1 56.16 CGTACGTCATTGCAACTCCGGTAAAACGCAAATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:1 + chr2R 18689114 5' - Burdock 222 2 63.01 AAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chr2L 14969106 5' + 412 80 2 72.60 AGCCACCCCCAGAAGAGTACTTTTTAGGGCGCAGGTTTTTCGGGGTTGAGTTGGGGGATGCAGATGGGGGTCGTCTACGTGATTGCTGGGCGATGGATGTCTGCTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTC:1 + chr2L 8791854 5' + rover 301 2 71.13 ACGTAATGTATGCATTATACAACGAATACGCAGTTGAAAAGGTTAAACGAGAACTAAAACAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr2R 9769533 5' + 1360 39 1 52.42 GTGCTGTGTGGGGTTAACTGGCGCTCATAAAAGTGGAAATGTGTTTGCTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGA:1 - chr3R 8639315 5' + copia 4949 2 71.23 CACTAATTTGTACCAGACACATTTGTTTGTTTGTGTATGCGCATGTAACCCATGAACCCATCCAGATAGTAACCTCCGGCGAGGCTTCCTCGCGGTATCTAACCCACAGCAACCACAGTCGTAAATATATTCGTGTACATGTGTGA:1 - 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INE-1 547 1 58.22 AATATCTGGCAGCATTTCAATAGCAATGTAGGCCATTTTTTTTATTCTATTTTTATTTTTTTATTTTATTCCCCAGTATTATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCCCATTCCCACTAGTTGAGTAACGG:1 - chr2L 21618501 5' + INE-1 536 1 66.67 GAAATGTTCAGAGAAAAACCCAATTAACTCCGGCCACGATCATGATGATCATGGAATCGAGAACCAATGGAGCATTTCGATCAGAGCTGCGCACTGCCGTTGCCAAACAAAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACAT:1 + chr3L 1449022 5' + Stalker2 36 2 40.97 CCAGAACAAATTTAAATAAATTAAATAATACAAACAATTTGTTATTTTTTACATCTTTGTGGGCGTGACTTGCGCTGCGGCTATGTGTCTAGAAGCTGCAAGCTAAGTCTTAACATTCCTGAGATCGAGACGTTCATACGGACAGA:1 + chrX 22653602 5' - INE-1 130 1 58.90 AAGTTTTTGCCATCCCGCAGCTGCAGTTTCTCTTATTTCTAGTCCGTTCTAGACCCCATCCGCTTCTCAATCCCCGCGAGAAACTAGAAGCATATGCAAATTCATTGAACTGAGTGTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGT:1 + chr3L 8828918 5' + 1360 3217 1 78.08 GGAGCAGGGAGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 23161250 5' + 412 47 2 52.05 CATGCGGGTGTGTGGGGGTCACAAGAGTCTACATGTCCAATGGTAATGCCCATGTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 - chr3R 4190995 5' - pogo 2037 1 65.75 AGAGAGGTTTCAACTGCGAATAAAAAAATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3L 18253744 5' + blood 7031 2 71.92 TCTGGCCTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTTCAT:1 - chr3L 21910486 5' + pogo 46 1 54.79 AGTTTTTTGTAATCATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTGTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTAC:1 + chr2L 18176990 5' - INE-1 551 1 72.41 AAAATTTATTTAAATTCCAAAGTAGTTTTAACATTGTGTTGAAAATATTGAGCACTACTTATGGCTAAGTTACTGTGGTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAAT:1 + chr3L 10545850 5' - Quasimodo 325 2 50.69 ATGCGGTGAGCAGCATCACTTGGAGAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1 - chr2L 3323168 5' + jockey 4696 1 72.86 AGCTTTTTTAGCCATTTGGGGTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 21013845 5' + roo 8704 2 53.08 ATGTCTGCTAATTTGACTGCAATGGCCATCGAATCGATTGCCAACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGG:1 + chr2L 19406987 5' + Doc 5 1 70.00 GAAGATGGAGTAGTGGAGAACCAGAAGGTAGCTCGGTTACACCAAGAATAATCTACGGGTCAAATATAAGATTTTCAATTCTCTGATATTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAG:1 - chr2R 21364966 5' - 1360 3208 1 58.22 GTTTAGAAAGCAAAATAGTTATACTAATTAGACCTAGTATTTATAGAAGGCGCACAAACGAATGTTTAAGGAATATTAGCCATACTGATTGTGAAATTCTGCAATTTTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCT:1 - chr3L 15790852 5' - invader1 355 2 79.23 TATTGGTGTTTTGTTAATTCAGTATCCATTACAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACAT:1 + chrX 22915137 5' + BS 86 1 76.03 CCTTTTGTCATACATTTCACGCTTGGCAGGACCACATCATTATACACACATACGCACGAGTGAGTGTGTGTGTGGGTGCGTGGCATTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACATATTGT:1 - chr2R 15436558 5' - transib2 2415 1 65.22 TGTTTCTAAGCGAGGAAATGACGAGCGAGTATAATAATGGTACGGGTTTCGATTGTCGACTGCTTCCACTTTCGAAGTGCCCTTAGCTGATGTGATTGTTATGTAATTGTTGTAAAATTACTGTAAACTTGAAAGAGCT:1 - chr2R 2641354 5' + X-element 4608 1 69.06 ACGCAGATCCAAAGACCAAATATATACAACCAGACTCCTTATAAAGATTCAATAAATAAGGAAAACATGGAAAAAAAAACATTAAACATGCACCTACATTATAAAAATAAATAAATATTTTGCGATGCCTACAGTAGTTTTCA:1 - chr3R 833207 5' + mariner2 852 1 72.03 TGGAAATTTCAATTAAATGCGCACATGCCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAAT:1 + chr2L 19310288 5' + Juan 4098 1 57.53 CAGCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGTGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGCCTATCAGGTACCCGTTACTCAGCTAG:1 + chr3R 18346662 5' - 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chrX 21933274 5' + springer 71 2 79.03 ATTCCTCAAAACAAACTGTCCTTCCCAAGAACTTTTTGCCTCGGATAGGCCTCGTATACATACTTATAGCTAAGTATTTGTGTATATGCTCGGATTTATTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAAC:1 + chr3R 4554642 5' + Doc 322 1 67.81 TATATATTTCTACCTACGTATAGCTGTCCATGATCTTGACCACATAACACTCAAATCTTCAGAGCTTCTACGTTGGTTTCATTGACATCAAATTCGGCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCCTTCG:1 + chr2R 25168540 5' + Burdock 6100 1 64.38 TAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3R 18528360 5' + roo 8720 2 63.57 AGTATAAGTTCAAAGCCAAAACAAAAAGTTTCCACAAGTTTCCTTTTCCTTATAATATCTGGAATCTGAAAGGGTTGTCCAATAATTGCTCGAAATTAACATGGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:2 - chrX 16994641 5' + roo 8681 2 71.23 CCTACGGCAGGGGGAAATCAGGATACGCTTTATATGTATCTATATACATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAG:1 + chrX 18220586 5' - Burdock 6327 2 70.00 CAATAGGTGTGGACAGGAAAGGGCGGAAAAAGGGTGGCGGACAGACATCTAAGGACACGAAGCAGCAGGACATTGTGAAAAATATGATGCAATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTC:1 + chr2R 16990570 5' - Ivk 4933 1 57.53 CGGGATAGGTGGCTGGGAAGCTGTGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCT:1 - chr3R 7616876 5' + Stalker2 8 2 80.00 GAAGAGGAAATTTGAGCAAACAATTTATAAAATAAACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTAC:1 - chr3R 24454912 5' + F-element 251 1 69.23 AAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:2 + chr3L 14375597 5' - roo 9032 1 55.48 GTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAAT:2 + chr2R 22746055 5' + jockey 4814 1 53.42 ACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3L 16015235 5' + 1360 55 1 61.19 AAGGACACCAGACGATCATTGCTGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACCCTAGGCACC:1 + chr2L 17380655 5' - hobo 2894 1 71.28 TCATAGATCCTTTATCAAATTATCACCAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr3R 14278010 5' - P-element 2858 1 65.75 ATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chr3R 26486032 5' + 412 71 2 64.58 GAAGAAATATTATAATTTGGATATCACAAATAAATTGACAAATTGACAAATTACGATTGCTCAAATTAGCAAATAAATCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCG:1 + chr2L 21805234 5' + mdg3 158 2 74.76 CCATATGCCAACGTCTGTTTGGGCCACTCCCCTTACAAACATATAGTGGGCCAATTAAATCGAGGATTGGGGTGTGTAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 - chr3L 2704866 5' - blood 7358 2 59.26 ATTAAACTATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTC:1 - chr3R 6413636 5' - 1360 3316 1 68.49 TGGACCTCGGTTTTGACGAATCGAAAATCTCGGCGGCGCTACTCAAGTTCAACAATAATAAGGACAAGGCGCTGGACTATCTAATCAACTAGTATAATTTAGTGGAAACCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTT:1 - chr3R 8011179 5' + mdg1 172 2 76.03 AAAAGGAAATCAAGACAAATAATAAAATATTGTCATTGAATCCATTTTTGGACAAGGATGGGGTTCTAAGAGTTGGAGGAAGATTGCAAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTA:1 + chr3R 19446848 5' - roo 293 2 63.01 GACTCCAATTGATAAAAGAAGAATGAATGGTCGTCGTCGTCCAATATTCAGTTTGCAACGATCAGATAAAGATCCCAAAATTGGACACAGAAAAAATCCAACCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATT:1 + chr3L 25480791 5' + 297 6969 2 71.92 GAGCGGAATGGGAATCTAACTGAATTACCTATAAACTGGTTAAATGACGGTTGAAATTTTTTGTGTATCTAACGAATGGGGTAAGCTTTGGAGCTTGAGAAGAAATGAATAAGCTGTCTGGTCTTATATATACATATATACATATT:1 + chr2L 3698182 5' - G3 4506 1 76.71 TTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCAGGATACGGCAGCGGCGGAGCGGCTTTCTTATGTTTATCTTATATAT:1 + chrX 21949004 5' - 412 268 2 78.42 GGCATGAAGTTTTCTGGGCTGCTACTGTTTACCATTACCATTATGCATTTGTTTATTCCTCTTCGTTTTCTGCGCGCTAGTTAAGCCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTGTTGTGACGATATGATGTG:1 - chr2L 13629180 5' - Tirant 372 2 54.76 ATTTGACCAAGTCACATTTATGATATTGACATGACTAATCACATTTTGCTTCCTTTGCGGACTCGATATTATACCAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:2 + chr2R 12371040 5' - I-element 5313 1 54.11 ACTAAAGTAAAGTGGCTGCTGTTTTTTTCTTTATTAAATCTGTTGCCTGGCAACTTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTC:1 - chr2R 15075667 5' + mdg1 7106 2 63.01 GATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chrX 16117176 5' + opus 162 4 68.80 CAACCTTCGATGCCTTTGTTTGCCTTTGACAGGCAACAACAACAACAAAACTCAACAGAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAACCAAAAACCAAAAACCAAAAATGACACTTGGTTAGTAAAAGCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAA:1 + chrX 4338867 5' + gypsy2 318 2 69.18 AAAGAATATTGTTATATTTAAGCACTCCTTTACTTTGATCGCACGATTGTAATATTTTACAAGCGTTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3R 11944821 5' + roo 8719 2 57.53 TTATTTTTGCAAAATTATTTGCTTTGTCTGATTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTA:1 + chr2R 13367437 5' + jockey 4600 1 51.49 AGTGTTTATGGATTATTTTTAAGGCCAACCATGCTTAATTTGACTGTGGCACCACCTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCT:1 - chr3R 18635359 5' + opus 3 2 81.43 GTAGCCATGGCGGCTTAGGCGTCGGCCATACGCAATTCACATCGTTTGCGCAGCTCTCGACAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTGAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGATATTATGTATGTGTACCTCAAGC:2 + chr2L 22075981 5' - invader2 9 2 57.53 ATTCCCAAGGGCCTTAAAAAGCAAAACAATATTTAACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3R 26485992 5' + 412 33 2 63.01 TGAATGATTACAAGATGACCCCAAAAAATTTGGAAATGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2R 6913429 5' + roo 83 2 75.34 GCTATTGTGGGACTTTTCAGAAAATATTTACTAATTAGATTTTAAGCATACATTTTGTTATTATCCTGTGATTTGATTATGTTTCCATACACCATTTTAACACATTTTGACTTTTTTAAGTACAAACAATAATAATAAATAATTT:1 + chrX 17508085 5' + flea 5009 2 75.86 AAGAGGAAGAGCTAAACTATATTTCAAGTCGGTTAACTCCTCTAATTTTCTGTTAATAATTTGCAATTTCGACTCCTTAAAGGCATCTAAAATCATTGTTAATTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAAT:1 + chr3R 10478775 5' + copia 320 1 70.55 ATACGACATCTTTAATGTCGGAATAGAGTTTGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCTACCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAG:1 - chr2L 21403593 5' + G5 4407 1 64.83 GTTCGACTGGGCTGGGTGCTGGCACTCTAAATAGCTGCCTATCTTGACGACTAATGAGTTTTATTTAGAATATACTCTACAGTAACTGGAATAAAAATTAAAGAAATTAATAAATATCAGTAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCC:1 - chr2L 15621292 5' - INE-1 571 1 52.74 GTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2L 7652181 5' + roo 8715 2 54.11 GTGTGCTTTGGAGTGGAACGCGTGCTGCAAAAATGCTGACCGGTGGCCATGTGAAACCGAAAACCGGCTTGACACGTTGAGTTTCCTCTGCTTGCAGTCACCTTAATAGTTACTGCCTGGATATGATTTTGCGATAGAG:1 - chrX 1094700 5' - G5A 260 1 55.40 GATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGAGCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCC:1 + chr3R 24750974 5' + G6 54 1 61.34 ATCAGGCGTTTCCCTTCTCCGAAAGTCGCGAAAGAATAAACCGAAGATTATATGCCCTTAAAAACCATTTCCGATCGATCTTAGAGGAGATTTGGAGTTGCATAATGTATGCTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATA:1 - chr3L 786024 5' - I-element 5346 1 78.77 AATAATCCCTCATATTTATTTTTGCAAAATTATTTGCTTTGTCTGATTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAA:1 + chr2R 13367422 5' + jockey 4597 1 57.53 GTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGACAATCGCATC:1 - chrX 19107440 5' - roo 326 2 79.85 GTATTTTTCATATATAATATTTGTATCATATACTTATTGAATAAAAAAAAGCAGTTTAAAAGATTAATTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 + chr2R 20355310 5' + Transpac 26 2 54.11 CGGTGCGCCAGTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTTACCT:1 - chrX 16117276 5' - opus 7462 2 52.67 GGAGTATCGGAAGGGCGTATGGATCGGCAGGACCTAAGCCAGTTGCCAGGCAACTCCTTCGACAATAACAAGCCAAACGAAGCACACATAAATAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTT:1 + chrX 22745412 5' - roo 8942 2 69.78 AATTAACATTTTAAACTTTCAGGCGACTCGAATTACAAGTTTTTGCAGCCCCAAAGAACCAGTTGAAGTTGGGCGTCTGAAATTAGATCAAGCAAATCAGTTAGCTTAGTTTGTTTTCCCCTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGT:1 + chr2L 15012983 5' - Doc3-element 4679 1 67.12 CACACAATATACGGACCGCCCGGTACCCCACTAGAGTTTGGTCCTTCAGGTGAAAGTTTAGCACTAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3L 13364294 5' - hobo 2909 1 55.65 CATGATTCAACAATTTACCCAGGTTAGGCGACGTGAATTCCTAAACGACACCGTGACGCTCAGGAACGCGGCTCAAACCCCAGAGTAGAGTGCAGGTTTTTGTTGCAGTTTAAGGCTGACCGGACTCG:1 - chr3L 13832529 5' - Rt1a 63 1 75.78 GACAGTTTCATTGATTTGAGTATTAAATAGACAACTATTAAATTTTTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAA:2 + chr3L 16015163 5' - 1360 3381 2 56.85 CAAACGGCCAAATACAATTACGTCAATGAAAATTTTCGTTTCGTTTCGGCTCGGGCGTGTTTATTTTGGCAAAAGGCCTCAAAAATGAACAAAAAAAAAAATAAAAAAAA:1 - chr3R 15177582 5' + G2 3076 1 90.00 ACTTAAAAACTTAATTAAAAATATTAAACACGAAATGTTTGGCGCCACCGTTTAGGAAACGCTCAAAAGTGGACCGCACACATCCACGGAGCGTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCG:1 - chr3L 9045864 5' - I-element 246 1 64.14 AAAATTGCGAATCGGCAGTGAAAAATTATTTCTGCTTGTCAGGATGCTGAAGATACGGCAATAAGTCAGACGGTTGGTTTATGCCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTAATTTT:1 + chr2L 19652494 5' - roo 9036 1 59.59 AACACAAACTGGATTTTTTCTTTAAACAATTTGGGTACTTTTCTATATGTGGATTCTGTTAATAAACACTTAAACAGCACATTGTTTATTACTATATTAAATATTAGTGTTACTAGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 - chr3L 11488948 5' + mdg3 5261 1 56.85 CTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 + chr3L 10590622 5' + 412 57 2 76.85 AGTGAAAATCCACCAAGGAGCCATTCGCAGTAAGCTGGTGATATTTACAAAAAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACT:1 + chr2L 2120334 5' + I-element 4927 1 66.44 AAGTATCCCTTTAAAGTGAATTGTCCTTTATAATTCCCTCAGTGTCGGAATGGGAAAATTTAAAAAAATTGCTGTGTTCTCAGCCCGATCGAATGGAAAACAAAGTTGTTTTTTAAAAAAGTTGTTTTTTATTTTTTTT:1 - chr2R 20461810 5' - HMS-Beagle2 491 3 74.82 CGTTGCTGACGATTTTACCTCGTGTTCGCTTATTGACATTTCTAGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 + chr3R 16276289 5' + pogo 21 1 70.83 CAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chrX 4400325 5' - roo 8989 2 78.72 AAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chrX 388248 5' + 1360 38 1 58.72 GAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTACGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr3L 3453600 5' + Tirant 8169 2 59.59 AGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3R 26486039 5' + 412 7094 2 58.88 CATACTCTATCAAATGCGGTTTTGCATAAACTATTTTTAAGAAATAATTGAAGGAACAACATGAATATTTTATTCCTTATTATTAGTATTAATGCCTCAGTTAGAGTAGTATTTATAAATGCAACATTTAAAAAATATATATTTAG:1 - 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chr2R 11095854 5' - diver 6066 2 54.11 ATCGGCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 + chr2L 10514290 5' + 1360 71 1 71.74 GTTTACATGAACTCGTACACATCCGACAAATCACTCATAAGCACTATTTTATGAACATAATACAACATGGTCAAGTGGCAACGATTTCCTAATACATTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2R 13293312 5' - roo 400 1 74.81 ATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr3R 13225478 5' + hobo 57 1 56.16 TATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCA:1 + chr2R 4577083 5' - Chouto 481 1 60.78 CTAAACTCACATTTGTCAATACAAGTGCAATTATTTCAACATGCTAGTCAATGATAAACATTATCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 - chr2L 10514372 5' - 1360 3329 1 59.59 AAACTGTAACTGTTGTTTGGCCCATGTTTATCAATATTGAAGAAGCTATCGGCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chr2L 10514243 5' + 1360 32 1 59.59 TCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chrX 388222 5' + 1360 49 1 52.74 ATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAG:1 + chr3R 24750961 5' + G6 43 1 52.89 AGAAATGCAATTTTCAATTAAGATATTTCAATCGAGAGTGATGACATTAAAGTAGAGGATAGAATAATATTTCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2L 19674020 5' + roo 44 2 50.68 GTTGCCATTCTGCACTGAAGTACGACAACGCCGCCAAAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr2L 13629038 5' + Tirant 8 2 76.92 ATAAAATAGATAGCCATTCCATAGGGACAATTGAGAACATTCCTATATTTATTTGGTTGATTTACCCAGTCCATTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCG:1 + chr3R 22314399 5' + hopper 1240 1 50.00 AAGGGGATGCGGGCGCGCGCTATACAAAGCTTCATCGTTAGGCTATGCATTGATTTCCACTCAGCAATTGTCTATTTTAATTGAATAGCTTGCAATGCAATCTGAGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGT:1 - chr3R 9129667 5' - 1360 390 1 71.23 CCTGGGAAGCCATATCATATGCCACTTGGGGAAGGGAGAGTACCGAATTAGAAATGAAAATTAAGTAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chr3L 22594131 5' + 297 6634 2 55.48 GCGGCCCATAAAGTGTCTGAAGAGGGTAGATTAGCTAAATGGCTGGGTGCGATACTAGCCTTTAGGGGACTAGTATGCTGAGCCAGCCAAATTAAAGCAACTGAATACGCGTAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGCG:1 + chr2L 15141805 5' + invader2 314 1 76.03 GTATTCGAACGAAAATGCAAATCGATACCAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCAT:1 - chr3L 7801342 5' + Transpac 111 2 73.02 GAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 - chr2L 5792081 5' + blood 7073 2 60.71 ATTTCTACATTCGTCTCTATTCAAACCGAAGCGCCAGCCCCTTCCACTTTTCACCCCCCTCCAAAAACGAAAATGGAAGCGAAAACAAGAGGACGGGCTTCAGTCGAGTGTCTCGACTATCAGA:1 + chrX 18146924 5' - INE-1 561 1 91.13 TTTGCGAATTACAACTACAATGCCGAAGGTGACGAATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGA:1 + chr3R 14277889 5' + P-element 70 1 36.30 ACTGTAGAGGGGGGATCCCCACATTTCGTCAGTTAATTTTCATGCGCAATAAATTAACAATTTAATTTAGTGCCAGCCCGTCATTTCGTGTCTAACAATACGCAC:1 - chr2R 17917268 5' + X-element 15 1 77.14 CCCAAGGGCCTTAAAAAGCAAAACAATATTTAACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:2 + chr3R 26485995 5' + 412 7089 2 60.96 GCATTGTCACTGCCACGAAAAGGAAATTTCCTCTCATTAAAAGCCAAATATGTGCTATCACAGCGACCCAAAGCAATAGGAGCCAAAAGCTCAGCAAAAATAAATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGT:1 + chr2R 15617314 5' - 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roo 9046 1 65.07 TCATCTTTTAGTGTCTTGATCAGTCGTGGTATTTAGCGGTGGACATGCAGCTGTACATCCTGAGTCAGAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCT:1 - chr3R 23597509 5' + jockey 4784 1 53.08 AACAGGTTCGGAAAGGCCTCATACATACTTCTCAACAATTGTTGGAATATATATATTTCATTTTTTACCATATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGGCTAT:1 + chrX 22905202 5' - INE-1 103 1 49.32 ACGACACTCGGCGACAACGTCGCGACGCATCGTCGTGCAGCTAGACAGGCGACGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 + chr3L 26057879 5' + P-element 53 1 42.64 GCAACGAATTTGAAACTCTAACTGAACGGTTTAAATAATTTAAATGCGTAATATGAATCAATTCTGAAGTTCGAATCTAAAACAGACCCAAATAAACTGAAGAAATCGCAATCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3R 20840209 5' + roo 9 2 76.55 ATGCTTTTGTCTAACTTGAGTGAATTATGGTCAGCGGTCGGTCGGTGGTCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACA:1 + chr3R 21341329 5' + hopper 71 1 64.38 CGCACAAAACTGCCACGCCCAAACTATTAAAAATGTTTCGATATTTTATTATACCGCCCAGAACTCCAACGCCCACACTTATAAACATTTTTTTCTGCCTATTATGTCGTTTTAATATTTATTTTCGAAACTATTGAACAACT:1 + chr3L 19271025 5' + HB 1482 1 47.55 GCGCGGAAAATTTTCCCAATAGCACCTTTTGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr2L 14969051 5' + 412 7072 2 63.57 GTTTTTGCCTTCTCCATGGCTTTTCATCCTTTTTTCGTTGCATACCCCCAGGCGGCAAGCTGTGCAGCAAACACTATTTTGTGGACTGCGACGGGGCGTGGCTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 - chr2L 795197 5' - jockey 4966 1 69.86 GTCCTTTCAAAACGCCGTCTGTAATTGTGTGGCGCAGTGTGCGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAA:1 + chr2L 4420515 5' + gypsy5 6954 2 48.19 AGACTCAGAAACCGCACATTAAAAAATCACTCGCTCAATCACTCTAACTCGACTTTGCCTTAGGTGATCGTTTTCGCTCAACACATCGCCTGATACAATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3L 19863899 5' + roo 24 2 67.81 ATTGCCAACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr2L 19407023 5' + Doc 31 1 47.69 CACAATGGGTTCTCCAAAGAAAGCGGATTGAATCCCAGTCCCAAGATAGCAGTGCACCAGTGTGACCGTTGAGTCCCGATTAGAATATACCGCACAGTCTCGCGCTACTCTTTATGCTTAATCTAAGCCTTCTAACTTTTATAGTT:1 + chr3R 13271946 5' - INE-1 159 1 71.92 CGGGCATAAATCTTAAGTGTGCAGCTCTCTAATATCGAATGTTTCGACGACTGCAGGCCTCTCGAATGAAGCCCACTAACCACTGACCAAAGACACTAGAATATTATTATTATT:1 + chr3R 30262832 5' - Tc3 305 1 73.68 TATAGACGCAAAACACTATTTGCCATTGTCACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 28450634 5' - roo 9032 1 57.53 GCATGCCTGAATGCCAATTCTACATGTCGTTTTTAATAACTGTGCCAATCGTGTGTTCCGAGCACTACTCACCCATTCCGTCCCATCGCATCCCATCTCGGCCAGGTGTAATGATGAACTCCACTTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - chr2R 9340262 5' - 412 475 2 71.23 AAGTGGCTTGACTTTTGGACCGCAGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 - chr2L 21910242 5' + Doc 8 1 67.71 AGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 + chr3R 9125648 5' + Doc 54 1 52.45 AGCTGCGTGCGAAATTTAGCAGCTTGTTTGCCTGGATTGCATTTGGCCCACATCACGATTCTGTCTGTAAGAGTATCTGCAAATGAATCCGTATCTGTATCTCTGTGTGTTTTGGCCATCGCCAAATATTATTATTATTTTTATTA:1 + chr3L 14276995 5' - mdg1 33 4 80.14 GATCTATCCGATTGGGTGCCCGATCCTCACGGCTTTAAGCGCCAGTGCCCAGAACTAATACCCCAAACACGACGAGCTGCAGATCCCATAGAAATGAGGGGGGTAAACCGCAGGAAAAGACCGCCAAAAAATAAAAAAAATAAAAA:1 - chr3L 8425094 5' + R2-element 3585 7 73.29 ATAGCCATAAACAGGGAGTTTAGCGAAAACTGTTTCAGAATATAACAAACTCACTCAAAATAAATATATATATATGTATGGAAATGTAGCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - 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chr2R 1373235 5' + pogo 27 1 67.12 AAAAGGACGGCACTGTGTGTTGCAATCAATGTTTTTGTGCACTACTTTCAGATGAAAAATGACATTTTCTTGATGCTTGGCTTATGATCAGTACCCATGAGTTATCCACTCAAAAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCG:1 - chr2R 14996433 5' + Quasimodo 296 2 57.53 GGCGACTAATCTACATTTATTTATGGATCCTGGAACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chrX 388353 5' - 1360 3348 1 58.90 AAAACGTATGTACTTACATATGACTTATGTACATACATATGCTCGTATATGTACATATGTACATATGCTCATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chrX 2295260 5' + Transpac 41 2 47.95 GAATAGAAAATTAATAACTCTACAGCATGGACTAACACACTTCAACAAATTTTTAAAACTCTATGTAAAGTTCAAAAGTAAGTAACAGGTAAAAGGAAGCGTTTCCGATCATATATGGTATATTTATTCTTGATCAGGATCAATAG:1 + chr2R 5647008 5' + INE-1 85 1 50.00 GGCCTTACCCATGACAAAGTCGTCGAAAATCGCGTGAGTACCGGCCGCTACTGCATTGTGCGCGGTGAAGACCACAAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAATACGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAG:1 + chr3R 18255915 5' + Stalker2 7433 2 53.79 CGGGTAGTTGGTGACCTCGACCATTCTTTCTTAACCCTCCCCCGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGGTTTGACCCTTTGGT:1 - chr3L 23974845 5' - Quasimodo 6943 2 64.86 GGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:2 + chr3R 16276333 5' + pogo 67 1 68.49 GTCCTCCTTTTGTAGAAGTCAGAGTTCGTAGAAGGTTAGGAAGCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGTCTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGC:1 + chr2R 1725107 5' + Stalker 444 1 71.23 TATACACTGCACTCTATTTATGAGCTGATTTAATGCTATTAGAGCATATATAAGGCACTGTTTTCAGGCACTTTTTATTTAATTTATGCTCTTATGGCATATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1 - chr2L 20725835 5' - blood 357 2 71.23 TTTGACGTTAATTAAATGGGCATGTCAGGGTCGAATTTTATGGCTTATAGGAAATGTTGTTGAAATGTTAAGACCGTGAGCGGGGGCAGCCGATGACGAGGCAG:1 - chrX 10891937 5' - F-element 457 1 67.31 GCTTAATGCCGGACAGAGATTGCATTTTAGTATGCACCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAAT:1 - chr2R 23212674 5' - Tirant 315 2 74.66 TATATGAAGCAATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 + chr3L 7791867 5' - Transpac 272 2 58.22 AGTCCTCGGACGAAATCCGAACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCGGTAAAACCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAG:1 - chr2L 3231961 5' - roo 345 2 51.75 TCCATAATCGCTGGTTAAACAAGCCCGCTCACACATGCCTGGTCAAGATGACCGCAGTTTATGCCCGGGGCTTGACGGCCTAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGATTT:1 + chr2L 19476943 5' + hopper 4 2 61.82 GCCTGCCATGCCAGCTCGAGCGCCAGAATGGTACCGCCAGCGGCCACGGCCATAATCTTACTCGCCTTGAGGAGCACGAAGTATCTATCGATATCCAAGAAAAATGATCTAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAATGG:1 - chr2L 5678915 5' + INE-1 536 1 55.48 ATAGTTTATGTTGATAAACCAGAAGTGCTTCCAATCTTTTAACACTTTCAAAAAAACTGGTTGGATAAATTGTAGTTAATTGTTTACAATGAAAGTGGATACAAACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chrX 15454815 5' + 1360 19 1 72.41 TTATGGCGGAACCTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - chrX 3646985 5' + 412 77 2 70.55 AAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGTGCTATGTTTATGTT:1 + chr2L 14969091 5' + 412 7118 2 60.96 AGGTCAATCGCAAAATTAATTTAGGGACTGTGGGAATTTTTTGAGGCCATTACATCAATTAATTTATTAGTAAAATTATTAAACAATGGATTTTCTTTCATACAAATTTGTTAATGTTTGATCGGCACTCGTTTCTAATCTCGTGA:1 - chrX 12154240 5' - BS 427 1 73.29 GGCTGACTATTCCAAAAGATATCCAACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTACGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAG:1 + chr3R 10030694 5' - Tc1-2 478 1 69.57 GCCGAAGATAATGGCTTCGATAGAATATTCCCCCCCTCCCCCACTCCATAACTAGATATAAATGTATCTAAACGTACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGT:1 + chr3R 25714000 5' - flea 212 2 52.05 CATCCCAATCATTTCTTGAGCTTTTCATTTCGTTCTTTCGTTTGAGTAATAATCAAAAGTATTATCCAACAGCCGAGAAACAGAACAAGCCAACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGC:1 - chr2L 4193019 5' + Porto1 331 1 69.29 AGTGTAACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGTAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCATTTTCTTCTTTTGAT:1 - chr2L 14969174 5' - 412 422 2 64.08 ACTCCCCTTACAAACATATAGTGGGCCAATTAAATCGAGGATTGGGGGGTGTAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr3L 2704841 5' - blood 329 2 58.27 GCTATTGTTGAATAAAAGAATAAATTCAAAGTGTCTTATAATTAATTTTAGGGACTTTAGATAGGCCCAAATAAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr2R 21844054 5' + pogo 42 1 56.85 GGTACGCAAAATAAGCGAAGTTTCAAGGTGGCATATATAGAATTTCTTTTCGCGAAAAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 + chrX 10579890 5' + pogo 59 1 62.33 GTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3L 10469610 5' - roo 357 2 61.36 GTCCGCACAGAAACTATGAAAATGCAAATGTGCTCGTCGTGCCATCTCTTTCTGCCCATGTGGCCCCATCTCTTTCTCCGCACAGTGTGCGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr2L 16615724 5' + hobo 33 1 64.38 TTAAGCTTTGGTGTGGGTGAAAGACAGCCCTTGAGTCGATTGAAAAATTCAACAAATTAACTCGGAAACTAATTTGTTCACACCTCTAGTACGCGAATGGTAATTGCCAATGTTATTGTTATTGTTATTATTATTATTATTATTAT:1 - chr2L 2729470 5' - mdg1 7076 8 73.29 AATAGATAAATGGCAAGTGGCCAAGCTAAAGCTGAACAGTTTTGCCAGACTTAGTCTACTTATACGCCAAACACTTTTGGCTCCACCAGCTGCCGATCTCGGCAAACTCTCAGAGTTTTGTCTTTCTGTTGTTTTTTTTTTTCTTT:1 - chr2R 15885042 5' - gypsy7 5013 1 58.90 GTCACCCCATTTTCGACTGCAGCCCTTTCACTTGTCGCCCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACTCATTCGCAAGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3R 7885564 5' + jockey 20 1 72.27 CAATTCTTCCATATGTAAAAAAAAATGCCACAAAATTGATTTATTTCTATTTCCATCCACAAATAAATTACTTCAATTTTGTGCTTCAATTCAATTGTTATTCAATTCGATTGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 + chr3L 26741171 5' + F-element 26 1 59.42 GTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:2 + chr3L 21013865 5' + roo 8740 2 71.92 AATATATATATTTAAATAACATCATTATGCTGAAATAAAGAAAATGTTATTGGCTTGTCTTAATGGCAAGTGAAAATAGGGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAA:1 - chrX 21973942 5' - pogo 2060 1 54.11 TAAAATGTTGCTTCCTCCTAGCACTTCGCACTTTTTCTACGCTTTATATACGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGAC:1 + chr3R 27810022 5' - Burdock 189 2 65.75 GAAAGGAGCTTGCTCAGCATTCTCGGGATCTCGAGTAGCCCCGCGGCCATGGCTACACTCGTATGTATACACACGACGCATCGCGAATGAAGCTGTGGATGTTTATGTCTGTTGG:1 + chr3L 19978312 5' - Quasimodo 298 2 70.43 TATGTTTCAGTAAGTAGAAACAGAAACTCTGAGCTACAGATTATTTCATTAGTATTCGTAACGCTGATTGCATTTTAATTAACAAGGCGCCACTCCCCCAGTCAGAAGAGCGCCTTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTT:1 - chr3L 398090 5' - 1360 492 1 79.72 GAATGGGTACTACAAGTACAGTCTGCACCCGCGGAATCATTGGCCTTTGGTTTTTGGGATTTTCTATTCCAAATGAAAAATCCGCTACGCTTTGAGGGTTTTTTACTGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTATAGACTT:1 + chr2L 16330897 5' + roo 14 2 75.34 TGCAATGCGAAAAAGAGCGCGAAAAAAGGTGGGCAAAGGACAACTACAGGGCGCACGTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCACAAAACTACAATCAAAC:1 + chrX 21035896 5' + Juan 110 1 59.03 ATGTGTATTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:1 - chr2R 1000428 5' + HMS-Beagle2 6915 2 63.77 CACAAACAGTAGACAGTGTGATTTTCGATATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTT:1 + chr2L 18112435 5' - transib2 2820 1 80.14 AATGCAAAAAAGTTAATTGAATGACTATCTGCAAGCTTCAAAATTTATATTATATATCATTAAAGATATGGGCTGGTGTAAGGCAATGCAAAAAAAAGTTGGAGTTATTGAGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGTGGTCAAATTT:1 - chr2R 16581824 5' - Transib-N1_DM 10 1 78.77 CATCCAGCTCAGGTGACATCAGTTCCGTCTCGTTACAGTTTGAAGTTTACCGTGTGTGACAGGCCTGGGGTTTGGTTCAGTTCGCTTCGGTTCGGTTTGGTTGGGTTTGGTTGGGTTTGGTTGG:1 + chr2L 2599786 5' - G2 103 1 72.58 AGAAAAATGTTCTGAAAAATCATTGTTTGGAGGAAGCGCCAGATTCTCTCACACATAACTAAATACATGCACGAATATGCTGCCGTTACGTGTAATCAAGAAACAAGAGAGAATGCTATGCCCGACTATCAAATACCCGTTACTCA:1 + chr2R 25196940 5' - INE-1 548 1 67.12 GACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTC:1 - chr2R 5173238 5' - Stalker4 7322 2 54.11 ATTTCCCCCCTGTTTCCGGCGGTCCTCCGCTTTGGTGTCTCCTCGCATTGGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTCGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGG:1 - chr2R 979673 5' - Porto1 4300 1 65.75 ACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAAT:1 + chr2L 2120388 5' + I-element 4981 1 69.18 TTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr3R 14277975 5' - P-element 2845 1 49.19 GTAACAGAAGTTCAGGGAATTCCAAGTCAAAGAAAAGTGAACTTGAATTCAGAAAAAGTTGTTAATTAAATATGTACATAGTATTAACTGTTTTTAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3L 7870319 5' + roo 8688 2 67.81 GAGAGCAGGCAGCAGCACTGCCGTTTGTTGACTTTAGTTTCCCAGTCCAGCATCCACAGCAGCGGTCAAAATAATAGGAGCAAAAATATATTCAGTATGATTTTGCTGGGCTACCATTACACCACCCTCATGACATCCCTAACCTG:1 - chr3R 17492956 5' + jockey 4765 1 80.14 TTTTTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr3L 16015218 5' + 1360 50 1 52.74 CTTTTTGTGCAATTTCCTTCACTTTCCTACGAAGCAGAAAATGCCCCAAAAGAGTTTTCTTTTCGGCTCCGTGCCAGATTTCACTTTTCTTTTGTTTTTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAATGACTTACA:1 + chr3L 486678 5' + roo 17 2 71.43 GATTGAGTTGCATATCCTAAGTTAAATATAATATAGCGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGA:1 - chr3R 23161338 5' - 412 7460 2 77.78 TCATGACTGACGTGAAAAACGATTGGAAAACTATCTTTCTCTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTA:1 + chr3L 18484390 5' - hopper2 1531 1 67.12 CGGTGCGCCAGTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chrX 16117276 5' - opus 7464 2 53.49 CTTGGCGCCTGCACTTGTGGGCGCCAATAATGAAAAAAAGTAAAAAAATAGAAAAAACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTAATCCGGATGTACC:1 - chrX 16851498 5' + Idefix 80 2 56.39 AAATAATCTACATGGAAACTGAACTTCATAAAGTTGGTTAGCTGAAGAATGAGGCCATTATGTAAGGGATGACCTTTCCATTCTGTGGAACTTACATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:2 + chr2L 21691774 5' + 297 16 2 73.97 TAACCATACCTCATATATGTAATAAATATTAAATAGTAAGGTTATAACTTATATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCT:1 - chr3R 11481973 5' - BS 5018 1 66.44 TGGCAACCGGGTAAGTTCAAGGACGTAAAATGCGGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 + chr2R 15075559 5' - mdg1 7412 2 53.42 TTACAATTTGGGCGAGAGCTGGCCCAACCCTCACCCATGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 + chr3R 28406317 5' - opus 7500 2 78.51 AATGCTCGCGTCGAAATAGACTAAACGTATCTTTCAGATACATTCGCTTTCCGTTTTTCGTGTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chr2L 17260711 5' + P-element 56 1 47.26 GTCCTCCGAAACCCTCCTCAAAGTTGGCAGTTCATAGCGATCTGATTTAAAGGTATAAATTGCTGAGCAAGTCATTATATATTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATA:1 + chr3L 12159643 5' + Quasimodo 34 2 61.64 AAGATTAGCTATAAAAAACTGAGTAAGACTTAAAAAACTTCGTAAGGTGTCTAAAAGTATGCAGCACAAAATTATTGCATAGAATAATACGCATGTTATATGTGTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chrX 18179925 5' + jockey 24 1 59.59 CTTCAAAAGCGGAAAGTGTCTGTGTGTGCCGTTGACACGCATACACAAAATGAGGTAGAGGCACCCAAATACCCCCCACACACACACACACACACATTCTGTCATACCCCTACATCCCAACATTTCGGCCCTTCGAGCC:1 + chr3L 19039493 5' + GATE 268 1 71.22 CAATAATCCAGTGGATATGCAAAGTTAGGATATGGCTATATTTTTGTTGCAATCATCATCACCAAAGGCAGGGTATTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCC:1 + chr3L 5095252 5' - mdg3 168 2 56.15 GTGAGTTGTTCATTGTTCACAAGTGCGAAGCCTTGCTATGCAATAAACCAGTAAAATCTAGTAAATATTTAATATAACTTAAGAATGTTCCAATATTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGAC:1 - chr2R 20220107 5' - roo 8893 2 63.70 TTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCA:1 + chr2L 21643044 5' - Tabor 7247 2 67.81 CGGATCCCTCGGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 + chr2R 10910190 5' - Tabor 7281 2 55.48 ACTGAAAAAAATGCCTTATACATTATATATTATTTGGTTAATTATAATCAAAATAATGTTTTTTATTCTTTAATTAAAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGAAAATTCTATTTTTAG:1 - chr3R 20413655 5' + 1360 3265 1 52.74 CAACTCATCAATTCCGTAACATACGGATCCTGCTTGTAGGCGGGCACATCCTTTGGCTCAATTACAGGGACCTTCAATGGAAAATTATAGGGATGTGAAAAGTATATAAAGATAATGTATAAAGATTATATACATATACAAAAATA:1 + chr2R 16089216 5' + transib1 1947 1 79.45 TATTCGCCCGAAAATGTTGTCGGTTGTTTGTTCTTCGAGGCGGAGATCCCTGCCTCAACAAGTTGCTTTATGGCATATGCACAAAAACGCAATTCAGTTAAAAAGTACTACGTCAAGCTTACACCAACCACATAGCGCGAAGTCTA:1 + chr3L 13274004 5' + F-element 4474 1 55.48 ACTGCAGAAGACGGAAGCGAAGGACCGCGCGTCCTGGAGAAAGGTGGCCTGGCAGTGTAACGTGATGGAAGGCAAGGGAACCTGTACTGGGGGGGGCACGCTTT:1 - chrX 21175400 5' - Gypsy12A_LTR 2217 1 56.73 GCTTATCGACTTGGCTTCCTGGCAGCTAGGTAAACTCCTCGCCGCACGACTCGGGTATTCTCTGTGCATGAGTGTTTTTAATTTCTCCCCTGACCATGCTCTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGTGCAATGC:1 - chr3R 17261017 5' - 412 7212 2 69.47 AAAGACAAAAAATGCTGGAAAATTATTTTACGGCTAGTGTATGCGTTGTGAAATTATTATGAGCTAAGGGTTCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr2R 21748350 5' - 1360 3344 1 52.11 CGTTGAGCGCCAATTAATATGCATAATGCAATATGCATACCATTACATAAGCTTGCCTAAGTGCAAGTTTTCTCTTCTCCTCTTTGCTCAGACATCAGGTGTACGCATGATGAAATAACATAAGGTGTTCCCGTCGGCAAGAGA:1 - chr3R 1267818 5' - P-element 2869 1 75.00 GAAAAACATTCATTCATTAAATTGAATATATCTCTTCATTTTAAGTAAACGTAATATTGTTTTAGCGATGCTGATTTATAATTGCTATGCAGTACAAACACTTTCCATTGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTG:1 + chr3R 31103637 5' + Stalker4 313 4 59.31 CTTGAGTTCAATAAATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chr3L 16059362 5' + 297 28 2 62.79 AAAGATTTACATATGTACATAAATGTGTGTACAATACGTACCTATTCTATTCTATTCAAGCGACCCATTTTAACAAACTGTTACTCATCTGCATCACAAAGTTTTGTTAAGAATCATAGACTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3L 21621224 5' + roo 8668 2 58.22 CACTCCCCGCAGCACCCAAACGTCCTGTTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 14218437 5' + roo 60 2 63.50 AGGTTGGTTCAGTGGGGTGGTTGAGGTGGGGAAAAGAGGATAGGTTCAGGGATTGGGTGGGTGGTGGACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATC:1 - chrX 15106573 5' - X-element 4522 1 54.11 CATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr3R 13225477 5' + hobo 45 1 51.85 GGAAAAACAATTGGCAGTGAAATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACA:1 + chr2R 11095715 5' + diver 5925 2 58.90 CATAGTTTCTTGACTAAACTACGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCA:1 + chr3R 10030725 5' - BS 5007 1 75.34 GGGGACGGGAGAAATTCCCTCATCCTAAGACCGTTGCTATTTCGGACTGGCCTCAATCAACAGTTGGTTCTAATTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATAAAGTTTATTGTCAGAAAG:1 + chr2L 3729755 5' - Tirant 8363 2 62.93 CACACAGGGCAAAATAAAACTATTCTTTCGAACCGACAAAGGAAGCCAGAGCCGGAATAAACTAAGATCCAGTCGCTCCACCCAAGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAATTTAATCTTTTATGT:1 - chr3L 13720715 5' - I-element 468 1 55.48 TAGCTATAAAAAACTGAGTAAGACTTAAAAAACTTCGTAAGGTGTCTAAAAGTATGCAGCACAAAATTATTGCATAGAATAATACGCATGTTATATGTGTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chrX 18179920 5' + jockey 28 1 56.55 AATTAAATCAACCAACAGAGCTATACAGTGGTCTTTAGATAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2L 17626562 5' + roo 8704 2 58.62 GCCTGGGATGGAACCTACTCGCTCCTCGTCGCATCAGCCACTTACACGGGCCCATTGCTGTTTAGCAACTATTTATGGAGACAAGTAGTTGCCACTTGCCACCTACATGCTCTTTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGT:1 - chr3R 5136213 5' + INE-1 105 1 77.40 AAGGGGGGGTTCTGAAACCAAAATTTTGGGAAATATGATTGAAAGTTACCTATTTAGTCCGAATTCATATTCAATTTCCGTGCTGTAGAAAAACGGAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTT:1 + chrX 21454311 5' - INE-1 549 1 71.23 CTGACCGCCGACCAATCAGAGAGCAGCTTGGCCACTTCGTGAGCACCTTCGTTTCGCTGGCGTTGCATAATGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chrX 19887027 5' + P-element 17 1 66.07 GCCGAAAGTCAGAAACCACAGTGGAAAAAACTCGTTTTGCATCTATTTGGGTCGCCAACAGCAGCATTCATTTCCAGTTGGGAAAACCATATCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGCAGCCACCTCTAG:1 - chr2L 10516277 5' - 1360 71 1 60.96 AAGCTTTCATGCGCATTACCAATACAATTAGCCCTGCTCAAAGCCGGTCATTGTGTGCGTGCTTAGTGTGAGATTAAGTGCGAGTGTGTTTGTGTCCCTCGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 + chr3R 11095743 5' - hopper 1397 1 71.92 GGAGATTAACATAGCGCAAGTGTAAGTGCTTAATAAACACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCC:1 + chr2L 4637215 5' - mdg1 338 2 73.29 AATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 + chr3L 7791877 5' - Transpac 5181 2 51.37 GCCATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTTCTCGCC:1 + chr3R 13225475 5' + hobo 54 1 52.74 ACCGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCACCCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr3R 443024 5' - opus 7479 2 67.81 AGCGCTTTACCATCGCGTGCCAATGAAAATGGTCTGGGAAAATCTGCGGGATGGGGCTAATAACCAAAGCTAAAGCTAAACAGTAGCGGAATACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTA:1 - chr2L 19801920 5' + roo 326 2 60.96 TAGTTTTCACCGTTCATTTCATGATCGTAATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGCGTCAAAAG:1 - chr3R 12363814 5' + jockey 4725 1 50.72 GGCGACGCTGCTTTTATACGCTTGCCGCTCTCACCAAGCAAACACTCTCTTTCAAGCTTCAGGCGTTTGACTGTGTGTGTAAGCCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2R 17097441 5' - P-element 2851 1 59.59 CTGCAGACATTTGTTATTCGCTGTTTTGTGAAATTTTATTGCTTCTAGCGGCTTTTGGGTGTGGAAATGAATGGGTGAGTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGA:1 + chr2R 21503573 5' + gypsy4 6622 2 65.60 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTA:1 - chrX 10664377 5' + Stalker 6999 4 62.76 CATTCGGAAATGTTCTTTATTACCGTCCTGGCACAAACTCAGCGTTTTGAATAATTATTCCATAAGGTTGCTTTACAGCAGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3L 10469461 5' + roo 7 2 79.17 CTGGGGAGAAATTAACTTTTTATGCGCCCTCCTGCAAACGAACGCCTGGAAGGTGTTGAATAGAGGTAACGCCTTAATTAAATTTCCAGACTTTTGTCTGGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTA:1 + chr2L 17744647 5' - jockey 4806 1 70.63 AAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAATA:1 - chr3L 23583098 5' - looper1 94 1 53.42 TTCAAGTTTAATTCTTGTCACTAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:1 + chr3L 17921942 5' - copia 194 2 58.90 AATACTTTTCCAGGAAGTTATTAATCTATTTAAAAAAGATTTTTAAATGTAGTAAACAAAAAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAG:1 + chr3L 18035506 5' + mdg3 60 2 55.86 GTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTAATGTGAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATTGTTAGATATTGGGGTGACCAATAGAATCTCAACCTTCTAACTTTTATAGTTCCTAAGATCTCGTCGTTC:1 - chr2L 7088857 5' - INE-1 141 1 52.74 CTGCTCTAGTTGGCCAACTAAGTTATGAATAATATCCGGCCATTTTTCTACCCTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGAC:1 + chr2L 18630406 5' + G-element 12 1 78.77 ATACCCCATCTCCAAATCACAATAGCTTTAAGTGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTT:1 + chrX 10579742 5' - pogo 1672 1 77.40 AATTTTAACACCTCATTGCTCAGCCAAAAATAAGCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAATCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 + chr2L 13842300 5' + jockey 4758 1 74.66 GACTTAACGGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chr3L 18183206 5' + Tirant 8145 2 58.57 AAAGTAGGAAAAAGTGAGAAAAGCCATCTGAGAACACGCAGCTGCACTGGAAAAAAAACTATAGAAATCAAGAGAGCTTTAAATTGATATAAAATATTTAATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chr3L 3541228 5' - roo 316 2 66.44 GTATATGGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAG:1 + chr3R 10437030 5' - BS 5051 1 56.25 AGCATGGTTCGTAAATTTTTAAAGGTTCTGGGGGAATGAAATATTATGGAACAAAAGTTGTTGGATGAATATTATTGGTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 + chr2R 21870138 5' + copia 4911 2 53.10 CAGCATTTTCGAGCTGCATCATCGGTAGTTGCGAAGGGGATGGCCTTCGATGTCAGCACATAATAGTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATC:1 - chr3R 5773244 5' - Stalker4 351 4 55.48 CATAAAATGGCAAAAAAAGAACCAAATAAAAGAGAAGTGTGGTCGGTTGGATAGGAGTCGCATGGTTGACTAGGACAGTTAAAGATGGAACGCACCATCTTGCTATCGTCGTCTTCAGGAATCCTCCAGAGGTGAAGTGC:1 - chr3R 10593796 5' - Gypsy6A_LTR 351 1 55.71 GCTGGTGTTACTGTTGCCTCTTATTTATTTATAAATATTTTGTGCGGTGGCTCTGTGTGATATGTTGGCTATTCCGTTTTGTTTGTTTCCTTTGCACGTTTGCGAGACACACATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATAT:1 + chr3R 27069488 5' + mdg3 222 2 77.93 GTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 + chr3R 20934695 5' + 412 7138 2 74.66 ACTTTGAATTGCGTGCCCGAAAAAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr2L 12324997 5' + jockey 4713 1 55.48 GCGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGT:1 - chr3R 15790103 5' + flea 4738 1 59.85 GGACTTTACTCTGTGTGTTTAGGGGAGTGGAATGGTCGAAGTATACCCCAAAAGTCTTAACATGGCAGAATTATGACTTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCGCA:1 + chr3L 12065556 5' + F-element 314 1 60.47 AAAACAACACCAGCTATTCCACTACCCATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACC:1 - chrX 21933340 5' + springer 7159 2 66.44 TATCCTCTTAAATTTAGCCAGCAGAACAGTTCAATTGTTCAACAAAATGATAATATATTATTGATAATTTTAATTTTAAATGGGGTATGAAATACTTTGAACACGTCAACAGTCAATTTTTGTGAATAAATATATATATACATATA:1 + chrX 16999819 5' + Stalker4 86 4 65.07 GTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 24673672 5' - roo 9031 1 57.93 CTGCGCCCGTTCCGTTGACCCGCATCCACAAACAAGGACGAGGACGTGGATGGGTATGTGGATATGGAAGTGTCTGCTTTAAGTGGTTTATTCGAATTATCAAAGTGTGCTGA:1 - chrX 15194162 5' - Stalker 322 4 61.95 CTGGGCAACATGGTGCACACTTCGATTGTTATAAAAAGAGTTTTCAATTTTTATTATTATAATTATTTTCTTGTTTTTTACATATTTCCATAAAAATACCAAAATAATAATATAATAAATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTAC:1 - chr3L 12827546 5' + copia 4873 2 52.05 GGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 + chr3L 7791918 5' - Transpac 5158 2 74.22 GGCCAACGGAAGGAGCCAACCAAAGCGCTTAGTACAGCGGCATGTGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAG:1 - chr3R 12520823 5' - Burdock 179 2 70.55 TGAACATCCACTCTAGAGGAAGAGGAACCAACCCCCACTTGGCCATAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTACTTCCCCACCCCCCTAAACCTCCACGCTGAGCC:1 + chr3L 15615417 5' + gypsy5 113 2 69.18 AGGGTCCAGATCTCATCGCCCAGGATGGGATTAGCTAGGATGTTTGCTAGTTGATTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTG:1 - chr4 114176 5' - G5 4560 1 74.44 CACGGCAAACATTCCGGCAGGCAAAAGTTTAGCTCTAGGTCGGCCAAAAATGTAGTTTGATTTTGGGGCCTCGTTCGGGCTAATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTC:1 - chr2R 10920373 5' - 1360 169 1 61.94 ACCGCCACACCCATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr3R 9125609 5' + Doc 18 1 78.08 AATGACCTCTGCATATTTCCACTGGGATGCAAAGTGACCAAATGACTTTGTTCCATAGCTACCTTTAGATTTTTAAGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCGGGTCGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGG:1 + chr3R 3697325 5' - Doc 455 1 54.68 CATGACTGACGTGAAAAACGATTGGAAAACTATCTTTCTCTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAA:2 + chr3L 18484391 5' - hopper2 1530 1 67.81 ATAAACAGGGAGTTTAGCGAAAACTGTTTCAGAATATAACAAACTCACTCAAAATAAATATATATATATGTATGGAAATGTAGCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr2L 17380740 5' + hobo 12 1 72.50 GTGAAAATCAACTAGGAGGGTAGCCAAGATTAAGCTTAAAACAATTTAATTATATATAATACATTTTAAAGATATCTTAAATCATTTCAAATGGTATAGATATAGATATGTTTTGGCACTTTTTAAATTTTTTTTTATTTTCTTA:1 + chr3L 12050745 5' - transib4 2278 1 81.38 GTGAAAGGTGCTCATATGTAATCATTCACATGTTATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 - chr2L 19310436 5' - Juan 4195 1 69.86 AGCTAGGCGCTTTAACCGAGACCTTTGGTCTGAACTTGCCAAAAGGCTAGCGGCACAGCAAATTGTTTCATGTTCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATT:1 + chr3L 17938071 5' + micropia 5154 2 55.56 CAGCAGATGCAGAACGCACCAACAACCAAATGCCATCGCATATTTTTAAGCAGTGGCAAAGGAAGAGAAAGGGAGAGAGAGGGAGAGGGAGAGCGACACGAAAAGGAGTTGAAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 + chrX 19788742 5' - hobo 2929 1 73.97 TAATTCAGAACAAGTGTAAATGCAAGCTGCAGTTGAATAAAACCCCTTTCAAATAACATTGGGAACAGCGTTTAAATAAATATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr2R 6913329 5' - roo 9032 1 57.53 CGCACTTGCTAGACTAAATTTTTCTAATGGGCTAAATAACCTTTTATAAGTAATCTCAATGCGATGCCGGGTCGTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chrX 19107513 5' - roo 394 1 71.43 AATCGAAGATAACTTTCACCGCACATTTTTGATGTTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTG:1 - chr3R 13349624 5' + Ivk 6 1 77.52 GTGCGGCGTTTCTGGCCGGGAAAAACAATTGGCAGTGAAATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGT:1 + chr2R 11095697 5' + diver 5907 2 71.23 AGCAGTTCTGGGTTCCAGCTGGGGATGTCCTGAAGGCAATGCATATCACCTCCCAGGAGGATGTTGAGGATATGATCACTTTGGGTGACTTACATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATG:1 + chr2L 7680723 5' + mdg1 150 2 64.38 GCCAGGACGCCTACGTCGCTATCTGAGCGCCTGGCTGGCAATTCCATGCGCTTCTCACATACAAACAATCAGAATTGCGGAGGGGCACACGAATAGCATACACAGACACACACACACGCACGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGT:1 - chr2L 4420658 5' - gypsy5 7346 2 76.71 ATAAAAATTTCTGCACATGATTCCGCTTTATTTCTTTATGACCGTGTGTGAGTTCTACTTGGAAATTCATATCTCTGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chrX 21403374 5' - roo 9033 1 55.40 AGTTTTGTGTATACATACGTGTTGGATTATGTATACTGTAAATGTACATTTTTAAATGACCTAAATTATTGAAATAAAAAAAAAACCAAAACCCGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 20840024 5' - roo 9044 1 67.12 TCTCCCCGTACGCTCATATTTTACACAAGATATGGGCGTGTCGTTTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATA:1 - chr3R 14912025 5' + Stalker4 78 4 69.66 ATTGAATATTTATACACAATTTATTGTACTTTATCTCCTTCCCAAAATCGAAGTCCCAAAATTAGGTTATTAAAAACGGGAACAAAGCTGATTATATTAGTTAGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr3R 10150100 5' + 1360 19 1 72.60 ATCCGGCCATTTTTCTACCCTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTA:1 + chr2L 18630439 5' + G-element 19 1 68.33 CATCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACA:1 + chr2R 21820732 5' + Doc 79 1 66.43 CTTGGTGTTGATTTTTTAAAATATTTTTGGTTCTAGATTTTGATTTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAGCGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAG:1 + chr3L 25840982 5' - roo 8952 2 65.44 CGAGAGGCGACGGAAGAGATTGGCAACTCACGATGGCAGCCATAATCAAAAGCTTTCCCACCACTTAACTCACCCCCTCGAATAGCCCACCCCCCCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAAT:1 + chr3R 11095694 5' + hopper 20 1 39.57 CATAAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTT:1 - chr2L 8574454 5' + Transpac 66 2 64.38 AATAGGATCTCGAATAAAAATACATAATATTACAAACAGCGATATAAAACAATCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 - chr3R 2649261 5' - 412 424 2 65.07 CAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTT:2 - chr2R 18014099 5' + Doc 97 1 78.08 CATGTTTGTTTGTATTTATGTCGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3L 7460600 5' + 412 41 2 55.71 GAATACCAAATCTTTGTTGCCCCAAAATCGCCTTATTGAAAAGGAAGGACTTCCTATGGTAGGCAACTAAATATTTGGTATAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chr2R 12371168 5' + I-element 40 1 54.11 TTATCGCTGAACAATTAGTAGGGAAAAAACAGAACGAAAGCACAGCAATAAGCATAAACATGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 7756494 5' + roo 60 2 62.07 GAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATATATATTGTTTAATTATA:1 + chr3L 16973390 5' + S-element 1608 2 71.92 ACGCATCAACGTACCCAACTCCTGGGGCTTGCCTTTTATTCGCTCTTCTATTATTTGCCGTACTAGGCTTTCGTTTTTGGCTTCTGTATGGCAAAAGTAGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGA:1 + chr3L 12874828 5' + jockey 28 1 72.60 AACCGGGTAAGTTCAAGGACGTAAAATGCGGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 + chr2R 15075563 5' - mdg1 370 2 51.37 AAATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 11164538 5' + roo 28 2 66.44 GTATTCAACTACTACTTCACCTACTATATAAGATAAAAGCAATTACAATAGACGAACTATGTTACTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAAAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTCTGAGTAAAAACAAGAGACGAGA:1 - chr3R 16627687 5' - 1360 3239 1 56.16 TTCTTCCCTCGATGGTCTGAACTTTTGCGCAGTCGCAGAAACGGAAATGGAGGCCCAGCGAACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGCTTCAGCAGATA:1 - chr3L 6355693 5' - Tirant 8445 2 56.85 CGGCCAAATGGTTATGATCAGGAATTTACACAAAAATGCATTCAGCGCTGCTAATAGATATACAAAATACATACATAGATAGAACAAGCAAATGTTGCGTTATCACAAGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:2 - chr2L 6177677 5' + pogo 10 1 77.40 GGTGCGAATCTAATAGAGCTCAAAAGCACGTTGTTGCATCCTCATAGTGAATAATGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 25862578 5' - roo 9009 2 62.50 ATTGTTTCAGTTTTGTTTGCTGCTTTAAACACCATAAAGGTTAAAGTAGTAGCATGTGCATTTGCCAAATCCCATGCCCTACCCATAAGCTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3L 15364777 5' + 1360 29 1 65.07 GTAAATTTTAAAGGTTAACCCTTTTCGCTTCACTTTTATGGAAGAACCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr2R 19843319 5' + jockey 83 1 66.44 AAGTATTTTAATATGTACCTTAATGTCAATATATTGTTAATTAAATAGCCTATGTTTCTTATAATCGAAATCAAATGCTTATTTTGAATAGATTCAAATGTTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGA:1 - chr2L 16456895 5' - BS 5083 1 71.74 ATCGCCTCATCTCTGAAAATTGATATTATTGTTCTCTCAATGTGATTGTAACGAAAATGGCATTTTCATTTAAAGTCTAAATGGTTTAATTGAGTTTGTAAATTTATTATATGAATTAATAAAAAGAAATAATCATGCCAAATGTA:1 + chr2R 22355501 5' + transib3 2693 1 65.75 TATGCTGCGCACAACTTATTGTTTCCTTTGGCTTTTAGTATTTGCAAGAATACGAAATTATACGCTCCTTGTCCTGCATGCTTCTGGTCTCAGCCTGTCGTTAGGCATCTCGACGGGGCATCTTGACCCTTCACATATCCTTCTCC:1 + chr3L 15141747 5' - gypsy8 4484 1 56.16 AAAATCGGCGGGATATAGGCACGTCTAGGTACATATACATATGTGTATATTTTCTATATATATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAA:1 + chr3L 16059237 5' - 297 340 2 66.44 GAGGAGCGCGAGTACAAGAAGCAACTGCTGAACATCGCCAAGGAGCACGAGAAGGCGCGGGACAAAGTTCATTTTCAATTTTAATATTGTATAAAAATTCATAGTCGCCTTCCTCTTCACAATCAGCAGAGTCTGAGGAATCTTTA:1 - chr2L 19126472 5' + hopper2 81 1 56.16 ATTTTCCCGCTCCTCCAGCCACCGAAATGAATGATATTGCTCATACGACGCGTGGTTTGCATTATTGAGTAATTAAATACTAATTAAAGCGTAACATGAGCCATCATAAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAA:1 - chr2L 12234107 5' - Tc1-2 347 1 70.55 ATCCGCTACGCTTTGAGGGTTTTTTACTGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chr2L 16330976 5' + roo 89 2 81.69 AAGCTTGAAGTTATTAAAATTAATGAGTCATAAATTAATAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 17821799 5' + jockey2 3405 2 66.00 GTGCGCCAGTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 - chrX 16117274 5' - opus 7445 2 59.59 CCGAGGGATTTCAAGAACAAGTTCAAGAATTTATGTTATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGTTTGATAGTGCCTTCCGAGCAGTGACCGTTGTGTCCA:1 - chr3L 12223228 5' - Transpac 5200 2 53.70 TATCGGTCCTCTCCCCGTCCTGGGAAGCCATATCATATGCCACTTGGGGAAGGGAGAGTACCGAATTAGAAATGAAAATTAAGTAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chr3L 22594113 5' + 297 6589 2 72.27 TTTCAACTATATAATTAAGGTTGCAACGCTTTTATTTAGTTATATTTGTATTATTATATAAATTAATTAACTATATTTAGTTATATAGTTTTCATTTTATGTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr3R 6888312 5' + Doc 29 1 63.01 GTTGTACGTAAAGGAACTTTAGCGAATGGTGAACTTTAAACTTATTCAAATAGCTTGGGAAATTCCTTATAATTCTCCCTATCATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATA:1 + chr2R 7619248 5' - jockey 4866 1 54.70 AAAGCAGGCAAAGCCAGGAGGCGGATAAATCGCCGAGCGAGTGCAGCAAATCGATCAGCTGTGACGTCGACGGGGGCAGAAAGCTTGGCCAAAAGAAAAGGTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGCCGGCAAGAGA:1 + chr3L 20497688 5' - P-element 2869 1 71.92 AGAATGTTCTTAAGTCATCGAAAAGTGGGGCAGTGTAGATTTGGAAAACTTCTGAAGATGTTGTGTGGTCTTTGACTTAGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTAC:1 - chr2L 16712694 5' - Stalker2 301 2 54.48 TTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCAC:1 - chr2L 17599965 5' + 1360 460 1 68.07 TCAGTAGTTATCTATACATATTAAGTTTCAAAGAAATAACGCATAATTAAAACAATTGATAATTTAATACTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAA:1 + chr2R 19482453 5' - Quasimodo 6962 2 50.71 ATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTG:1 - chr3R 7616843 5' + Stalker2 7290 2 56.85 ACATATCATTTGAGGAATTTTCACGGATACTGGCGATAGTATCCGAGAGATGCACATAGACGGCGTCAATTGCGACGATGGCTGCCATAAATACGGTAAGTACGCGACATCATCAACCAAATAATGCTAAAATATAATAAAATAAA:1 + chr3R 9482218 5' + TAHRE 24 1 60.27 CGGGAGCAGGCTGGTAAACGGGAGCTGGAGCCGGAATGCTCACGGGAATGGGAGCAGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCG:1 + chr2R 17165862 5' + hobo 2923 1 53.21 TTACCATTACCATTATGCATTTGTTTATTCCTCTTCGTTTTCTTCGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAG:1 - chr2L 13629152 5' - Tirant 8431 2 69.86 ACTCTCGTCCTTTTCGCCTCTCAGTAAAAAGTATTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTG:1 - chr3L 18035568 5' - mdg3 158 2 74.66 GCGGTCACACACGTCCCAATCTTCAGGACCCTTATTCTTGCCATCGAATGCGGCGTAATTTCGATTTAAGTAATTTCCTTCTTTAGCATTCGTGCATGGACTTGCGATACGGCATTTGGATCTG:1 - chr3R 30231532 5' - BS4 213 1 79.84 CCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr2L 12291937 5' + Tirant 8117 2 67.78 ACACAGATTAATTACGATTCTAAGCCCTAAATTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCAAATTCGCATGGGAGATGAACAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr3R 31458437 5' + jockey 65 1 52.78 GAAGGCAAAAATTATTTGTGTATTTATGTGCAAAAGAAACAAGAGAGTAGGCTATAGTCGGATACCCGTTATAGTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATG:1 + chrX 22806281 5' - INE-1 535 1 69.64 GCAGTGTTTACCCTGTAGCTGGCATGGCCTTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACAACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACGCGCCACGCACATAGCGGGTAC:1 + chr3L 13690295 5' + hobo 71 1 71.09 GCCAAAAAGTATGCTTTGAATTGCATTTTCCATTTCCATTTATATTTCCAAAAGATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCG:2 - chr3L 21262653 5' + jockey 4540 1 61.64 AAGTATAAACCGAAAAATTGCGAATCGGCAGTGAAAAATTATTTCTGCTTGTCAGGATGCTGAAGATACGGCAATAAGTCAGACGGTTGGTTTATGCCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2L 19652481 5' - roo 386 2 68.49 AAGTCGCGTCGATGCGAGCTCTTAGCTTTGGTAATTTCTTGAAAAGAATCCCTCCCTTTCAGCTGCCTTTTTTGCCCTGTTTTTTGTTTTCTTTTTTTT:1 - chr3L 1169704 5' - gypsy7 5008 1 72.73 CAAATAATAATTATTATTCTTTTTTAAGTGCATCAGAATACGACTGACCACTTTTGAGTTCTGTTTAAAACTAAGGTACAATTTCATATTCAGATATTTATAGCGGCACTTCTGCCACTATTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGAC:1 - chr3R 3080547 5' - gypsy9 165 2 79.45 AATATGAGAAAACTCGCAGTTGCCTCTGTGGCATTTTTAGTTCCTTCAGCGCGCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTATTT:1 - chr2L 18112580 5' + transib2 2619 1 63.70 GGGCATTATTGGAAACGATGGCCGACATTACATCCTCGACTTATTGCGCACGTTCCCGCCAGACGTGACTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCA:1 + chr2R 16190384 5' + Doc 320 1 62.86 AAGTGAAGGGTAAAAAACGAGCAATAATTTCTGTGTTTATGTGAAATGGCCTGCAAATATTGCTGGATTAGATTCAAAACAAAAGAGAGAATGCTTTAGTCAAGTTCCCCGCCTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGATCG:1 + chr2L 2832574 5' - INE-1 535 1 61.64 ATAAGACTTAAAACATGGGTTGTTGCATTAAGTAAAACTTACAATTAGTTTTACCTTAGAAAATTATTTGAAAACTATATGGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 - chr2R 21870286 5' - copia 5085 2 46.58 CCCCAAAAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATAGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAAT:1 + chr3R 25543455 5' + G2 206 1 38.66 ACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTG:1 - chrX 16117255 5' - opus 437 2 69.70 GTCTGCGAGTGGGTTTTAATTGTTTTTTCCTTTTTCGCCGACATTTTCACAGGATGTTAAGGCATGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTA:1 - chr2L 18376629 5' + I-element 435 1 55.48 GCTTACAGCAGGCCTGAAACCAAACGTCTTATGACAATATTCATCATTCAAAAGTTCTAATTCGGATCGTATATAACCCATGAAATGGTCAATCTCACTCACATTTGAAATCAGTCTTAAGTTGAAAG:1 + chr2L 21906269 5' + McClintock 270 2 68.75 ATCAATGTAGGTCACCTCATTCGGATCGATGGTGGGCAGGGTCTCCAACCACTCTCGCTCCACCAGTCCAATCAAGCCAATGGATATCTGATTGTTGGCATTTCTGCTCATTGAT:1 - chr2R 10638965 5' - Doc4-element 2326 1 79.13 CACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chr3R 13225482 5' + hobo 60 1 58.62 GCCAATGGAGATTTGAGTGGTAATTCAAAGGCCCCAAGTCTAAAATTGATGGTCGATAAGTCTTTGAATGTTCTTACTAAATATAAACAAGGCTCTGCGCGGGGTGAGGGGAATAAGTTGCCCGAAGGGCAGGTA:1 - chr3R 10074364 5' - BS 183 1 68.15 CTGAAAAAATTCAACATTTCTTACAAGACTCTTCTTTGATATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:2 - chr3R 20203954 5' + 412 29 2 65.75 TTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCA:1 - chr2R 1000417 5' + HMS-Beagle2 6934 2 53.42 GGTAATGTATTTTGGTGACAGATAAGACCTCTTGCACATTGTTGTGATAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCT:1 - chr3L 12836080 5' + 1360 72 1 67.59 TTTTTTATTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGATGTG:1 - chr3R 24564833 5' - opus 7438 2 59.59 ATACACAGACACACACACACGCACGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCT:1 + chr3R 6420243 5' - gypsy5 371 2 72.94 CTTAAAACTTTCCCACCACTTAACTCACCCCCTCGAATAGCCCACCCCCCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACA:1 - chr3R 11095875 5' + hopper 73 1 66.44 CGGCACGTTGTCCGTCGACAAGAAAACACAGAACAACGAAGGTAAAGCGCGCAGGAGTAACGCCGCAGGAGCAACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTC:1 + chr2R 2747174 5' - P-element 38 1 55.56 CAGTTGAAAAGGTTAAACGAGAACTAAAACAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGACTTTTTGTTAGAGAGC:1 + chr2R 9769563 5' + 1360 91 1 77.40 CACACTGAAATATATGGTCGCGATTTACGGCACAGCTCAAATGAAGCTGAGTTGAGCAGCTGAAGCTGAAGCATAAATAAAAATGCTAAGTAAACACAATTTTTTTTGCATTCAAAAATGCAAATT:1 - chr3L 18936102 5' + TAHRE 10327 1 42.06 ACGAAGCAATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 + chr3L 7791870 5' - Transpac 269 2 54.79 AGAGTTTTAAATAACAAGTAAACACTCCGAGCTGCAATTTGTATTACTTATTATATGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACA:1 - chr2L 1361027 5' + Stalker2 7311 2 59.59 ACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr2L 12291929 5' + Tirant 8117 2 64.63 AAACTTTCCCACCACTTAACTCACCCCCTCGAATAGCCCACCCCCCGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGCATTAATACATTGGAAATACGTTA:1 - chr3R 11095871 5' - hopper 1338 1 65.07 AGCTTGGACTGTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chrX 21087527 5' + mdg3 17 2 70.55 AGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 - chr2L 21643136 5' + Tabor 7 2 72.73 ATGAGTTTACTATTTTCAAACATAAGCCCGCACTTTTCCAATATTACTTTCATTTTAAAATTATTTATTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATC:1 - chr3L 10012805 5' + F-element 4333 1 53.42 TCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 - chr2L 12291923 5' + Tirant 8152 2 66.67 CAATTTGTTTTCTTTTTTTAATTGCTTTGGTTATATTCCAAAAGGGTTTGCTGCATTTATCCAGCTTTTGAAGTTTATTGTTCCATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTA:1 - chrX 8893789 5' + Juan 101 1 61.64 GTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTAT:1 - chr2R 5173196 5' - Stalker 344 4 71.43 AACCCTAGAGAAAAACTAACAAACAAAAATTATGTGGGACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chrX 7706705 5' + P-element 2 2 79.84 TTAGGGGTATATGCGTGCAAAAGTTACGGCTTCCAATTTGAAATTACTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 12379784 5' + roo 54 2 66.40 GATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr3L 27391417 5' - 1360 3371 1 65.93 GGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCC:1 - chr3R 24454854 5' + F-element 312 1 71.23 AAACAGTAAATTCTCGAGTTTTCAAAAAGGTTGCCCGAGCTGGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATC:1 - chr2L 19160424 5' + 3S18 5845 2 69.18 AAGACCTTTTTTAATGCTTTTCGACATACTAATTTGATAATTTAGAACTAAACCTGATTATGAGTGATGTCTTGATATTAATTTAATTATCATATATTTATCATTTATTTTATGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACT:1 + chrX 408482 5' + Cr1a 278 1 55.48 CATACTATAAATATTTAAGATCGGGATAGGTCAGTTCAACTATTCAGTGCCATTATTACATTATTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAA:1 - chrX 8365317 5' - mdg1 7012 2 55.94 CAAAAATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAGTAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGGTTATGCACG:1 - chr3R 15920281 5' + 412 79 2 69.18 ATTAGCCGTTCTCGCTTTTCTACATTTTCCTCCTTTTCCTCTTTTAATTTTTCCCGCTTGTAATTTTCTTCCTTCTTTTCGTCTTTATGGTTCTTCGTCTCCTTTTAGTTATGGGGCGGCTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1 - chr3R 15158974 5' - TAHRE 10425 2 67.12 CGAAAGAGTAAACTCCGAGACGAGCATGCGAAGAAGATGGGTATAGGAGGCCTCTAGCGCATTAGCAGGCAGCAGCGTCAGTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGAT:1 + chr3R 8022732 5' - Transpac 5109 2 75.00 TAGGAAAATGCACTTCCATTCGGGTTTAGTCCAATGCAAACGGATATCCCGGTTGATAAATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGA:1 + chr2R 23106557 5' + jockey 4534 1 57.93 GAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr3R 23601764 5' + jockey 32 1 50.96 ATGAATTAAGTGAAACCGTATTTAAAAACAATATATCAGGCAGTAATAATATGATGCTTTTAAGTTAAAGTAAAACTCGAATAACATGCTATGTATTGATCAAAAATTTTTTTTTTTAAATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTT:1 + chrX 7325009 5' + FB 204 1 65.07 CTCTTATGATCTACATACAAAGGTTTCTTAGCCTAAGTCGAGGAGCAGCGCTGCCGGCATAGCCTGCAGCGCAGCAACGCTTATATGCGTATCTTATATATATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAGATC:1 - chr2R 6460655 5' + 297 6595 2 76.71 GAAGTGACAGCGTTTGTACATACACATTATGTATGTACTTTGTGCAGGCCTTTAATGGGGGTTGATTTGCCAAAACGAAATTGGAGCCTAGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3R 7089441 5' + P-element 5 2 76.47 TCAATTTTTAATCGTCAAAATCGTCAGTGTGTTCTTAGAAATTTTTCGACTGATTTAAGGTTTGTATTTTGCAAGTATTTATTTTCAATTATATTTTTAGAAAGTACCGTTAGGTTTGAAGCAAAATATTTGGACTATTTGGAG:1 - chr3R 3848216 5' - Transib5 75 1 53.47 GACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAG:2 + chr2R 12065606 5' + Stalker2 86 2 75.34 TATTATACTCATGAGTTTCCACACAGTTGAGTGTGCTGGGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chr2L 15777928 5' + 297 6610 2 65.75 TAGTGGGGTGAACGGCATTTCGCAGTTAATATTATTAATTCGGTTCATTGGAAGTACATAGTAGTTGTGGTTGCGATGTTATCGTTATCGGTGTGACCCAGTGATTGTTGAAACCAAAGAGAAAGAGAGAGAGGGAGAGAGCTTCT:1 + chrX 11975312 5' - blood 164 2 54.79 GTAAGCCGTATTTTCGTTTCGGAATAAAAAATTAAAAACAACCAATATTTTAAAGTATTATAGCAGGGTTTTATTGGTCAAGCTCATTTTTATCGGTTAAAAAAAATGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTA:1 - chr2R 5434043 5' + Transpac 4927 2 73.29 AAGCAGTGGTAGTATTACAAGTGGTTCAATGAATTGAATACTTATCATTTTCCTTCTGGTTTTTTATCCAATATTTGGCCATCGAAGGGAAGGCAGCTCTGCGTGTCTGGATGATCCGAGAAGTTCGTAAATGCTGCTGATTCTCC:1 + chr3R 23737895 5' - Burdock 5941 1 52.05 GCTAATAGATATACAAAATACATACATAGATAGAACAAGCAAATGTTGCGTTATCACAAGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - 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chr2R 12787707 5' - FB 68 1 56.94 ACTAATACATTTACTCAAATTTGGTATATAGAATAAGTTAACATATTTTTATTATCTAACTAGCCAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTTTACCAAATATGGACTGTTTCAATG:1 - chr3R 6816789 5' + Juan 449 1 55.48 GTGTTTTGCATAATTAAATTTTTGCGCTTTACAGTAATTTGTGGCTGTGGGGCCGCAGCAGCTATTGCTGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCAC:1 - chr2R 14913554 5' + X-element 4418 1 62.26 AGTTGTTTTCATCCCATTACTTATCATTCGTTTTTTTGTCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATAAGAATCGCATCTT:1 + chr3L 3238273 5' - roo 8988 2 71.92 GCTATACAGTGGTCTTTAGATAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2L 17626581 5' + roo 8724 2 63.01 TTTATATGTCTAAACAAATATTTGGTTGGGTTATTTAGCATGTGTTGTGAGGTCACATTGTCCAACAAAACAATGAAAATCTCAAAAATAGCCAAATACATCAAGAAAAGGGTAAATATTTTAAAATAGCACTCACCAGTACATTC:1 + chr3R 5282027 5' + BS 88 1 50.00 ATCCCACAGCGGTATTCCCGGAAAACATACAACTAGAAATGTAATTTTAATCTTTTCACTTTTGATGACTTCATTAATATTTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATC:1 - 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chr3L 7801362 5' + Transpac 5030 2 76.71 TAATTAATACGTAATATGTAAGGGTGTTAAAACATTCTTTAGGAAACAGGTTCGGAAAGGCCTCATACATACTTCTCAACAATTGTTGGAATATATATATTTCATTTTTTACCATATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGT:1 + chrX 22905158 5' - INE-1 143 1 76.71 ACCCAATGCCGAAGTACGCTGGCAGCACTCAGAGCACTAAACAGGCTGAGCGGAGCCACTAGCACTCCCGATCCGATCAGGTAAGTCTCAGTCCATACAGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 - chrX 18220720 5' + Burdock 6155 2 69.86 CTCACATTTGTTATTGCCACGAATCGCGTGGCACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATTGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 - chr2R 10910344 5' + Tabor 6865 2 63.70 CCTTTAATGGGGGTTGATTTGCCAAAACGAAATTGGAGCCTAGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chr3R 7089489 5' + P-element 69 1 33.33 GGCGAAAGGAGAAGGATACGGACCGGGACAGTAAGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:2 - chr2R 8688188 5' + F-element 36 1 61.29 AAGATGGTTAGACTGTCGAAACCACAATTTCTGCTGGACTCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr3L 11803987 5' + blood 7060 2 64.04 GAGTTATATGGGTTAAATGCTATCAGCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr2L 4929776 5' + blood 7049 2 59.31 CGATTATCAATCAACATTTTCCACCATGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTTC:1 - chr3R 23235302 5' + BS 54 1 53.42 GTGTAAAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAACAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2L 12291950 5' + Tirant 15 2 66.67 ACCCATTAGGTTTATTAGACCAAGTGGATCATAGAATTGGCCTATTGTTGACAATGCAATCCGCTTAGTAGGTCGATGATTGGACGTTATTTTAGAATTATTAAATATGTGTTATAAGTTATTATAAAAATTGTTATTATTTATT:1 + chr2R 5029455 5' + Gypsy12A_LTR 1814 3 76.55 CGCTGGTAAAGCGTTTCGAGGGAGAAGGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGG:1 + chr2R 9294339 5' + Tirant 57 2 75.45 CTGTGGAACATAGTTTTAAACCGATATATAACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCTCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 18528266 5' - roo 352 2 54.11 GACTTTCGCACAAAATGAAACGGCCTTGAAATTGCAAGTACTAACCCTATCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 + chr3R 6413556 5' + 1360 65 1 64.34 GAAAACTCGCTTGAAACCCTATGTTTTCACTTAGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr3R 13225585 5' - hobo 2908 1 57.02 ATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 + chr3L 17537750 5' + Doc 77 1 70.34 CCAAATATCAATAGTAATCACAAAACATTCATCCGAATTATTCAAGAGGCATACTTTCCACTTCGAATATCACACACCTGATTCACGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTT:1 + chr2R 14135239 5' - copia 220 1 60.69 CGGTCTGTTTCATGAAAATGCCGCATTGGGCGCAAACGGAGCAGGCGGATTATGTATGTATGTGTCTACATACTTACAAGTACAACACAACAACCAACCGGTTTACCTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr3R 7089616 5' - P-element 2874 1 76.71 TAAGGAGGAAAAATTTTCGAAATATGAGGCCCAAGAACTTCACCTTTAAATAATGTTAAGCGAAATTCGAGCGGGCAGGGGCTCTCCCGGGAAACTGGGCACTGATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr2R 25106177 5' - roo 9055 2 74.66 GGACAATATGCAATCAGCAGTTAACATTTAGCACACGCAAAAACGTAACAAAACCCAAAATGGCACGTACACACACGCGCAAAAAAAGTGTGGCAAATCAAAGATAATCTTAGCATCAACGACTTAGTCATTATAAAGGATGATAA:1 - chr2R 11095632 5' + diver 5651 1 66.44 GATTTGGCCTGGCCTCCATTTAGAGTCTGATGGCGAAACCATGGCATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGTTATGATGTG:1 + chr2L 12291804 5' - Tirant 8479 2 67.12 CTTTAAAGTCTTTTACTTCAGTTTTTTGTAGTTGTACACAACATCCGCAATTAAATAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATA:1 - chr3L 18382040 5' + copia 4936 2 65.07 GTTTTCGTTGTTCTGCTGCTGTGCTCGCAAAAATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTATGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3R 15920308 5' + 412 7092 2 54.89 CATGCTGCTAGAAACAGAAAAGAATATTGTTTAAATTAATCATAAAATAGCTCTAGTTTTTGAAATCATGTTTACACTTTATACTTTATCGTAAACACCATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATT:1 + chr2L 19160308 5' - 3S18 6081 2 56.85 ATTATCTAGAGATAACACTGATAGTAACAGAAGCAACAAGTTACTACATGACAATTTCTTTTGTCTAATGAAATGTGATACCAAACCCATTTACACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAA:1 + chr4 256464 5' + INE-1 555 1 65.89 TGCATAACCAGTCGGTCCAGGACAATGTCCATGGCCTTCACCCACATCACTGGTTGTACAAAGTATCTAAAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAA:1 - chr3R 16997509 5' + G6 11 1 77.14 AGGTGGAAACAGGTCGCTTACTTTGTACATTTTTAAATGTTCAACATTAAAAAAAAAACAATAATAATATCCAATAATACAACCTTATATTTTAAAATGAAACATATTTTATAATTCAGTTTATTTATTTACCTTAAATATTAAAT:1 + chr2L 17432142 5' + Transib5 420 1 91.78 GCGAAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAGGGAAGAGTGACAAACACAAAATAAAAAATCGGGGCGCAAAAAAAAAATACGACCGTTCGCTTTAAAA:1 - chrX 21260977 5' - Cr1a 6 1 58.90 TAATAATATTGTGAGTATATTAATCGTAAATTCGAGTCTTGTGTGGACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3L 21013964 5' - roo 9024 2 55.48 GGATGTGACATGGCCAACCACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 + chrX 16117132 5' + opus 26 4 62.33 TTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATAAGATTCTACCCATGTTGTCACAAATCGCAAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGT:1 - chr2L 21737999 5' + INE-1 255 1 73.29 AGTGAGTTGGGGCATGCAATTAGATCGAACAGCATTGCACGTGTTTTGCATAATTAAATTTTTGCGCTTTACAGTAATTTGTGGCTGTGGGGCCGCAGCAGCTATTGCTGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGG:1 - chr2R 14913594 5' + X-element 4410 1 76.81 AAGCGGAAATGCAGTCGCTGCTGCCATTTCTCGATAACTGCCGCCATTGTTGTAAATTCCTGTGCGTGTATATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCC:1 - chrX 12273174 5' + jockey 4720 1 52.05 CCGATCAAAAGCAAAAATTTCAATTACAGTCGAATCTCAAGGGACCAGGCGATCTCAAATTGAGCGATTAAGTTGAACTTTCCCTGCACCCAAACAAGATCTTCGCCCTGTATATTCTAATTCTAGTTTTGAGTGTCTTCCTATTA:1 - chrX 363180 5' - Porto1 4198 1 77.40 CAGCCAATTGTACTGACAACCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGG:1 - chr3L 10071696 5' - Quasimodo 216 2 79.31 GTCATCATTTCAACCTGGTGGTGCTGTCGATCATGCACCCACGACTGCTAGGAGTTGCAGTTGGTTCCACTTGTTGCATGCATAGAAGATACAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr2R 18612037 5' - P-element 2858 1 65.75 GAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCGCAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 - chr2R 17332198 5' + jockey 84 1 72.59 CCCGAACCGGACAGAATTATCACACTTTGTTGACTCAATCTCGGGGCGATTCATTAACAATGTGTGTACTTTATCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAG:1 - chr3R 18798416 5' - R1A1-element 5048 1 59.02 CTTTTCCGTTTTCGTTGTTCTGCTGCTGTGCTCGCAAAAATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:2 - chr3R 15920315 5' + 412 7098 2 54.79 ATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTATCACAAAACAAATTTCAAAAATGACTTTATAATAGAA:1 + chr3R 21400026 5' + 1360 382 1 73.79 CAAACAACAAGCGAAAAACTTTCTTCACTCCGGGGAGGTTAAGGTTCAACACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTC:1 + chr3R 8639245 5' - copia 5052 2 67.81 TATTTTACTGATTGTTCAGTTCTGCGTAAATAGCATACATTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAA:1 + chr3L 785902 5' + I-element 81 1 71.92 CTTGCAACCGGATGTTGTGCAATAAAAATGCAAAGTGCGCCAAAGTTGCCGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGATTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTACTAAAAACT:1 + chr3R 7470905 5' + Doc 52 1 69.86 CCTCATATTTACTATTTACATATTCACTGCGCATCATCAGGTTAGTGCCCCTTGATAGGAGAGAGAGCATAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAATCCCTCAGCTGAGGGTTATTAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGTTAGA:1 - chr3R 1192686 5' + Rt1a 5017 1 61.64 ACAAAATATTTTCAATTATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 + chr2L 9274963 5' + F-element 23 1 73.17 AACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGTAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTA:1 - chr2L 14969169 5' - 412 413 2 69.86 ACGTCGAGATGCATGTCCTCGAGGGCCGGAATCGGTGGGTTATATACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 + chr3R 19435996 5' + roo 70 2 67.81 AAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chrX 388247 5' + 1360 63 1 65.93 GGTGTGGGCCATTTGCAAAGTGTTTGACTTAACGGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr3L 18183231 5' + Tirant 8115 2 79.26 AATCCAAAGCTGTAGTTTACTTAACCCTTCTGCCACGTTAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chr2R 15070210 5' + 412 14 2 72.59 ATTTGAACGATCTTTTTCTGAAAATCGGTCATCATCTTTTTCACAATTTTCATCATTGCTACATCATTTTCATTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTCCGG:1 + chr2R 5237675 5' + Doc 5 1 70.55 TATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chr2L 17295816 5' + Doc 20 1 62.30 AATAAACATAAATATATTGATAAATTATATGTTTATTATATTTAACGCTGAGAAAATTCAATCATATTCCAATTAATTCATTTTCACATCAGCGGAAATAACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3L 4640964 5' + jockey 28 1 65.75 ATTAAACTGTTAAATATTAAAATTTTTTTGAACAAAATGAATGATTACAAGATGACCCCAAAAAATTTGGAAATGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 6913466 5' + roo 8710 2 56.16 ATATTTATTAAAACTCGCAATCATTTTTCTTACATTTCTTATTTCAGCCTTTGTCGCAAAATTATTACTCGTAGAGACCCTATACTGTAGATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 + chr3R 20872066 5' - 297 369 2 68.49 GAGTCAGTTTCTTAAGACTCGAAGGATGATTAAATGTTTCACTTCATCAGGTTGCAAGTGGAAAAGTGATAACTATTATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATC:1 + chr2L 2895531 5' + Burdock 6175 2 56.16 GCAGGCGCTGAAAAAATTCAACATTTCTTACAAGACTCTTCTTTGATATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 - chr3R 20203961 5' + 412 22 2 70.55 AGTTACAAAATATATTTCGTTAAAACGAAAAACGAAAGTTACCGGGTTCAAAATTAAAATCCGGTTTAGCGGGAAAAGTATTTAAATTATGTTAAGAATAAAAATATTTTGTCGTGCTTTGACGTGATCTTTTTTATATTTATATT:1 + chr3L 18128717 5' - transib4 2577 1 68.49 GAAAAGCAGCTGTGCGCACAGTGTGTTAAATATTTCGGGAAAGTTTTGGAAATATTCGTATAAAATTTAATTTCATACGAACAATTTAATAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2L 6601247 5' + roo 17 2 63.91 TGGTCGCGTGCTTGGCCACGTTGCCATTCTGCACTGAAGTACGACAACGCCGCCAAAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCTCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 + chr2L 13629019 5' + Tirant 18 2 74.66 GCAGTGGTATTACGCTACTTCGGAGTTCTACAAATTAAACTGTTAAATATTAAAATTTTTTTGAACAAAATGAATGATTACAAGATGACCCCAAAAAATTTGGAAATGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:2 - chr2R 6913499 5' + roo 13 2 78.77 TAATCAAAACAACACCAGCTATTCCACTACCCATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCG:1 - chrX 21933345 5' + gypsy3 10 4 73.38 GTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGAAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTACATAGGTGACATGAGAACCGCATCTTAAAGTA:1 - chrX 19107440 5' - roo 318 2 76.06 GGTGACAGATAAGACCTCTTGCACATTGTTGTGATAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3L 12836067 5' + 1360 53 1 69.91 ATGGATGCACTGTGAACAAAAGTGGGTAGAAAAGTTGGACTTTCATACTATCTGCACTGTTTCGCCATTTGAAGAGTAAACACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3L 1358560 5' + 412 7092 2 53.42 ACTAAAATTAAAATATTCTTAAATCTCCTAATGGTCGAATAAAGACACGAAAGATTGGAGACTGATTGCTAATTTAACTGATATGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chrX 4400423 5' + roo 36 2 57.93 ATAATATAATAAACCAACAGCGAGCGACCAACAAAATGAGCACATATAGGGCGCAGATAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTG:1 - chr2R 17115519 5' + P-element 154 1 43.84 GAAACCTTTTCTTAAGTTTTCAAATTTGAAGTCATCTGTTTTTGTCTTACCTTTTGATTGAAAACGATAATAAAATGTGTTAAATTTTTCATTGTAACATAATCATAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGC:1 - chr3R 21599470 5' + hopper 312 1 73.97 CTGCACCCGCGGAATCATTGGCCTTTGGTTTTTGGGATTTTCTATTCCAAATGAAAAATCCGCTACGCTTTGAGGGTTTTTTACTGCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTG:1 + chr2L 16330919 5' + roo 8689 2 65.19 CTTTGGGTGGTCCTAAGCTGCCGTCTTTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGG:1 + chr2R 9340150 5' + 412 7146 2 80.14 GCTGGCAGGACATTCAAAACAAGATTTATGACAGGCGTGCGCTTGCTGGAAGATGGCAAATGGGTGGGGGTCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 + chr2R 20447775 5' + hopper 35 1 56.06 AATATACACATACGAACACTCCAACACACTCACATTCGGGCAACAAAAAAAAATTGCCAACTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3L 4524032 5' - roo 9013 2 56.85 ATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATGCCTTCTGAGATTTCATATTCTGATGATATTGTAATAT:1 - chrX 20880649 5' + invader4 2808 2 68.52 TACTAATCAACAAAATATTTCCATTTGCTATGTGCTCACCAAGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:2 - chr2R 11256242 5' - roo 331 2 70.55 CACAGTTGGGTGGCCACTTAAAAGTTTTCATTTCTCAGGGAATTGATGTTTTATTAGTTTTTGTTATATGCTGCTTGAAGAGCACTATGTACATCAATATTTACATTATGAAATTTAATTATATTTATTATTATTGTTATTATAAT:1 + chr3L 22124038 5' - mdg1 14 4 73.97 GATGTTATGTAATGTAATAACGTCAATCAAATTTAAAAAGGCAGACTGGAGAACCACCACAATCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATAC:1 + chr2R 22754017 5' + G2 2935 1 71.23 GCAAGCCCAGGTTGGTACTTACATCCTTAGTTTGCTACTTAAAAAAAAAAACACAAATATTTACCGAATGGAAAGAAGTCACTTGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTAAGACTTCGGCGAGC:1 + chr3L 24734178 5' - Rt1b 4971 1 67.74 GTAAAGGTGGCAATAATAAAAACGATAACAATGCAAATACGTGATGGGCCTGAAAAGAGATTCAGATGCCAGATTTGTGCCGTTCTAATCCATCATTAGGCCAGGTAAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCC:1 + chrX 14536739 5' - roo 419 1 73.10 GTGGCATTATTTAATTTAACGCCCGTTGATTCCAAAGCGGCGATATGTGTCCTTCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chrX 5503664 5' - hobo 2907 1 51.35 AATTACGTGCAAAATCAAAGAACTCATTGAAACCAATTCCATGCACGCTACGCCGTTAAAGAAACCACAACGCGTACGACTACTTGCCCATAAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTC:1 + chr2R 16920103 5' + jockey 4612 1 36.99 GTCATGAATGCGGATTGCCGTAAGTTGCTCGGTTTGCCATTTATTTTTCACTTTGGCTTGGCTTCAGTTCAAGGTCACCTTGATAGCTGCTTAAAATATAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAA:1 - chr2R 19189771 5' - Cr1a 4269 1 61.64 AGTCAAAATGTATCACAATTTTGATCATTTTGTTATAATAAATACGGCTGCACCTGTCACAATGCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGTC:1 - chr3R 17047911 5' + 412 40 2 52.34 TTTTTTTATTGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATT:1 - chr3R 23021015 5' + INE-1 570 1 48.63 CATAGGAACCAAAAACCCGAATGGGGCGCTTATATATTATATATATGTATATATTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr3R 24564736 5' + opus 37 4 69.75 GTGAATATTTTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATCCACACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - 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F-element 480 1 60.87 ACAAATGCGGAATAGCAAGCAAAGGAAGGATAACAGATGATTTATTAACTTTAAGCAGCGTTGTTAACTAAACATAGAAGGGGTGTAGTTTCAAATAGCTGATAAAGAGAAGACAATTTTCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGAA:1 + chr3R 29047679 5' + transib2 206 1 47.95 GGGGTTTTACCAACCAGTAAAACCGGTATGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACGTATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAAT:1 + chr3L 9469954 5' - 412 7457 2 75.34 GAACGGTGAATGATGAAAACGATTAGTTTCATATGTATGAGGGAAACATTTTAATGTAATTATACCCGTTACTTGTAGAGTAGATGGGTATACTAGAAAGCGGAAATGGAAAAAAGAAAGCGCATTCTTGATCAGGCTCAATAGC:1 - chr2R 25233786 5' + INE-1 86 1 70.34 CAGCTTGATAGCTCATTACGCTGACACTTGATTGTTGCACGTACCTTCCAAAGAAGCTGAGGCAGCACCACCAAGTTTCCCTCCGAGAATGTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chr3R 24499463 5' + blood 31 2 63.01 AAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATA:1 + chr2L 18112504 5' - transib2 2751 1 67.81 GGATCGTCAAGTCAACCGATTCGACTGTTTTCTTCACTCAAGTTGTTCGGGAAGTGAGAGATCGGATCGATCGATCGTTTGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTCTGCT:1 + chr3R 10213005 5' - P-element 2850 1 59.86 GTGAAGGTTACACTCTAAAATAGTTCTAAAGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chr2R 23409048 5' + opus 7046 4 58.82 AGATCAAAAGCGAGGTGAGCCATCAAAAGCAGGGATATATACTATATATAAAAGGAGGCTTCAGTTTGCAATTTCTCAACTGTACACTGCGGCCCCCTAAATTCCTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 + chr3R 25804072 5' + mdg1 19 2 69.86 CTTGCACACAATTTACCTAGTACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCCCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGC:1 - chr3L 17670504 5' + F-element 376 1 74.68 CCTTAGTGGGTCACCATCCCGGCAGCATTCAGCACCATCATCCCGGCGTGGTCGTCGATAGCGATAGTGAGTTCGAGATTGCTAATTAAATAATATGCAATATGCGTGAATAGTTGTGATGCCTCACT:1 - chr3R 24005782 5' - diver 224 1 60.16 TGAGTTTGGTTATGTCTCCATTACTGCAAGTTGTTTTCATTTTCATTTTTATGGCGGAACCTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chrX 3647033 5' + 412 29 2 64.38 AGTATCCAATGGACATTACCTTAACCTGGTCATAAGCTACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr2L 6388135 5' + jockey 74 1 67.94 GAAAGTTTAAAAAATAAACATAAATTTGTTAACAGCTCCCAAAGAGTGTGTTAAAAAATGAAATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATG:1 + chr2R 13761607 5' + jockey 4700 1 49.57 GTATAGCTATCCTCTTCTGGAAATTATAAGTATGCCTTTAAGTATTTTAGTTCTTATGGTTGAGCTGTCATAGAGGTTAGGCAAAAGTATATTTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTT:1 - 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accord 185 2 42.47 AAATGGAAGTGCAGAAACATCGATGTTATTGATCTTTCAAAGCCTTTCCCATTTCCGAGCGCACTTAAACTGCACTGTGCTCCCGCTCTCTCGCACTCTAGCGGTACATTTGACATCCCGATGCAAGTTTTGATTTTGTGTTTTTG:1 - chr2R 5179422 5' + Cr1a 386 1 65.07 TTTATATACTTCAATTTAGAATATATTTTTGTAATGCATAGATATCTGAAAAAAATATCTTTTTAAATTGCAAAGCTATAGTCACCGATCGTGGACACCACCTGATCCCGATCCGCACTCTGCACCACACCACAGCTACAGAGGC:1 + chr3L 14463890 5' + Chouto 438 1 50.34 GCAATCTTGACCAGGTTCGAGCTGCAAGTTCGGGCCTCCTTGTTGGCCAGTGCACAGGAAGAAATTTACGACTCCTTACTAATACTTTAAAAGGGATACGTTAATTTTCGATCTGAGCCGTCCTATTGTTATTAATATTGTTATTT:1 + chr2L 3485565 5' - mdg1 7056 2 69.18 AATTACAAAATATTTTCAATTATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr2L 9274959 5' + F-element 39 1 65.73 GTTTAACACTCACCACCCACCGCATAGGCCGCAGAGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 12486450 5' + roo 10 2 70.49 GCCAGATTTCACTTTTCTTTTGTTTTTGTGGGTTCCCACAAGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3L 486750 5' + roo 8693 2 61.25 GAGTCAAGTGGCAAATGTCCGTCCGTTAAGTTTTGGGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - 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Tabor 7310 2 75.34 AAGTTTAATTCTTGTCACTAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAA:1 + chr3L 17921945 5' - copia 191 2 60.96 GGCGAGAGTACATCAAAGTTGTACTCCTGACCCCTCATGATGTTCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACT:1 - chr3R 24750850 5' + G6 1983 1 71.23 CGTACATATATTATTCGATATTGATTATGTACGTCCTGTTCCTCTAATACACAACTCATTTGTTCGTTCGCTTCCTCTCTGTCGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 - chr2L 22690081 5' + Tabor 6860 2 71.92 GCTGACATTTCCAACAACGGCGAAAGGACTGTGACATGTGTGTGTGTAGTGACGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTG:1 + chr3R 28209573 5' - jockey 4681 1 57.94 ATACTTTTATGTAAGTGCTTTGGAGATACACTCCGTAATAGGTTTGTAATAGGGTTCAATCTAAGCAAATTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGG:1 - chr3R 15502574 5' - Ivk 5324 1 56.16 GCGCCTGAACTTGTCAAATAAAGGATTCTCTTCCTCTGCTTCTTACCATTTCAGCAATGCTTTTGGGCCAATTCGTTTGACACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 - 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hobo 2930 1 64.71 AGATATTTAAGTGCCGAGCAAACTGAAAGGTTAAATAAAACAGTGGAATAATAACGTAAAACTAAAAAAAAAAATACTTCACCGTCGTGTCAGACGCCCGCGAGTGCCAAATCATCCACCCCGTCAATGACCTATCCCCTGCAGAA:1 - chr3R 835674 5' + Doc3-element 349 1 67.12 GCTGATGCTGCCCCAAACAGCATAGCAAATGTGCAACAGCAACAGGAGGCTGAGGTAGCAACTGCAGCAGTCAGCGATTGAAAGCAGTTCGAGAAACAAAAAATGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGCAGTGCCACGTACA:1 + chr2L 7260393 5' - BS 4776 1 65.07 TGAGATGGCTGCCTAAGGCCAAAATCTGTCTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 - chr3L 5069507 5' + opus 7168 4 55.48 ACTATCATGTCTACTTTATCTTGATAATTGCCTTTTTTTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 + chr2R 13046505 5' + 412 83 2 73.29 ACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chr3R 9125655 5' + Doc 64 1 54.79 ATGTGACTGCAGTTACCCACTCACTCAACGACGGTTATTGTTGTTTTCAAACTAATTGTACGCAACAAAGAGCAGGGAATGAACATTTTTGTGTGTAAAACATTTGAGAAAGAATTTTGCACTTAATCTTCGAAATTAACTGGACC:1 + chr3L 22489839 5' - Porto1 40 1 76.03 AACCACACAAATAAAAAGCCACAGAAAGCCGCAACAACTGGATGAGTTTTTCGATATAGGCCACATCACAAACGAAAAACTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACAAGAGACCAGACCTGATCAGTATATGGC:1 - chr2L 9271202 5' + invader4 378 1 52.74 ATTGGTCTGTATTGTTATTTTCGAAATTGACTTTAAAACGGAAAACCAAATAAGTATAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 + chr3R 21216841 5' + 1360 65 1 67.81 ATGGAACTATTATTGCTGGCATTCATTGATAGTATAAGCCCCTCCTCCCACTTGTTTGCCGTTCATACAATATTATCCCTCTAAAATACCAAGAATTTTTTTTTTATTATTCGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATATTCTAAAGA:1 + chrX 17442896 5' - Rt1b 5114 1 67.81 CTTCCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1 + chr3R 7585750 5' + Doc 81 1 71.11 AGTGCCTTAAAGGATCCCCTTTTAGTTGGAGGGAGCGATTTCAGTTCGAGTGCTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGGAGGCTGGATTTGTTAT:1 + chr2L 18268326 5' - Quasimodo 154 2 63.01 AATGGAGCACTGTCATAAAGTGCCAGTTAAAAGTTAAGTCCCACGACTAAGCACATCATGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAATCTTCTCTTGCTGG:1 + chr2R 21602785 5' + Ivk 450 1 58.90 CCCTCTCGAATGAATATGAACCGAATCGAACCTTGCTGCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr3R 6226039 5' - 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chr2R 11164534 5' + roo 8694 2 64.58 GATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr2L 3960193 5' + jockey 73 1 67.41 CGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTT:1 + chr3R 14049324 5' + transib2 54 1 54.11 GAAGCTAACATCTTACAACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTAT:1 + chr2R 5582124 5' + Cr1a 443 1 76.03 TACTTATGCAAACGGATGTATATTCTAGGGAGATTAACATAGCGCAAGTGTAAGTGCTTAATAAACACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr2L 4637187 5' - mdg1 7404 2 54.11 AAGATTTAGATGGTCGATATCTTCATTTTCAACCAAAAACTTATGTACACCTCGCAATAACTTGTGTTAACTGGTTAACAAAAACTTACCGTTAAAATCAAGTGCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3L 12964676 5' + hobo 14 1 74.31 GGGAAAATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGA:1 + chr3R 3617306 5' - micropia 5132 2 77.40 AAAGGATATATTTCTTTCTAAATATTAGATAAGACACCTCAATAAAACATCATTATTTTACTGATTGTTCAGTTCTGCGTAAATAGCATACATTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:2 + chr3L 785849 5' + I-element 28 1 65.07 GCCCAAAAGTCGGCACACTCAGAAATGCCAGAGGCAATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCA:1 + chr2R 17544121 5' + gypsy5 27 2 62.96 TTCAACAATTTCTCCCGCAGGCGCAACAAAAAAGCGCCATTCCCAAAAACCCATCATAGTCAACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTCAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATT:2 - chr3R 20934775 5' - 412 434 2 55.48 CCTATCATCAAATTGTAATTACTGCAGTCAGAATAAATGACATTTTGAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3R 12379710 5' - roo 8998 2 69.86 CTAGTTTTATTAGGAAGCCCGTTGTATTTTTTTTTAACTTTTTTATTAAGGTACTGATTTCTTTGTCTGTCTAGCCTATATTATAGTATTATTATGGAACATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGAC:1 + chr3R 7791476 5' - flea 4719 1 64.38 CATACCCGGCATCTTAAGAAGAAGTGCACAACGTCAAACAAATCATAATCGGTGGCTCGTAGACAGTAGCTACATATGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGG:1 - 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Tc3 1656 1 54.79 AAAAATGTAGAGTCTCTAAGCGGATTTCAACATGCTTCATCCGCCCACGCCCATTGCGATTTATATTGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATA:1 + chr3L 14833064 5' + Transpac 117 2 50.71 AGTAATTTCGCTTTTTTATTTCCTTCGACTATTGCCTGCGATTTCCGTTTTTTCTCTCCTCTCCTCAGTCGCCAATAATTTCATCTCATTTCATTCTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 18392723 5' - roo 9044 1 64.38 ATTAGGCGTGAACTGTCGGTTATTAAAAAAATTAATTGATGCTGCTGTGTAACCTGTTGCCGCCTCATGAAGGCAGAAATTTCCATCGGTTTGCCCGTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAA:1 - chr2L 12144333 5' - transib2 2810 1 72.59 AATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTC:1 - chr3R 10736163 5' + McClintock 5978 2 65.75 ATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTG:1 + chr3R 9125689 5' + Doc 98 1 78.08 TCATTACTTTCATGGGGGAAAGTCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 + chr3R 14049296 5' + transib2 26 1 67.81 ATCTCCCCCTTCTTGAGACCCAAATTGCTTCTGTATTATACACATTATCCACATGGCATGCAAACAGAATAGATCTGGATGCTAGAATGATATGCCACAATTAGACGCGAGTTACCACAGTCACCACACCCCCTCAACCCCCACGC:1 + chr3R 12368889 5' + Tirant 8119 2 71.92 GTCAGCGTTGGTACGCAGCCTGCGACGGACTGGCCGACTTCAACTTCTCCTGCGCTGACCTTCAATCAAGAGTTCGCTTTGGCCAGGCGAATTAGAATTGGCGCGAGGTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 + chr3R 16240854 5' - Tirant 394 2 78.63 AGTAAGACTTAAAAAACTTCGTAAGGTGTCTAAAAGTATGCAGCACAAAATTATTGCATAGAATAATACGCATGTTATATGTGTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chrX 18179904 5' + jockey 23 1 53.23 CGGCAGTCAATGTGTAATAAATTATTTTTTATTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr3R 24564857 5' - opus 468 2 61.31 AAAGTTTCTACCATGAGAAAAAAAAATTCAACAAAAGTTAAAATGGAGAAAAAAGAAACAGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 + chr4 1219153 5' - 1360 3331 1 60.27 AATCAAGCGGAATTATTGATGTAAAACTTAATAACAAAGATCAACTTTTAACTCCCACCTTATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGG:1 - chrX 138742 5' + jockey 409 1 56.43 GTGGGCGTGTCAACATGGGTCAACGAATTTGCGCTGCTTCTTTGTCTCTAGAATTTGTATGCTGAAGCTTAACCTTCTAGATTTTATAGTTCTTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGGCGGA:1 - chrX 14770553 5' - INE-1 126 1 80.65 GAGGGTAGAAAAGAACTAAATATACGAATACAAGAATTCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAATAAGTGTCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGT:1 - 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Doc2-element 232 4 69.77 AAATTTGTGGATATTTTTGCATAGTTTTATTAGTCTTCTAAATTTCTGTCGATTTTTCGACTTCCCCCTTACTCTAAAGCCGTCAAGCTGGTCACGCACATGCTTTCTCATTTTAATCCCCAATATTAATCGATATCCCAGAAAAA:1 - chr3R 24776703 5' + INE-1 500 1 34.25 GCCGCAAGAAACACTCAAGTTATAAAGACACGAGTGGATTCGACTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr3R 10213109 5' + P-element 64 1 37.04 GGTGGCGGAGCTACTGGAATAATCGAGAATTTGATAAACGCGCTCTTGCTGCGCCTTCGCATTGATCTGTTGTTCGAAGAATATCAAATTTTTGAGTTTTTTTTAGATCATTTGAACATTTGTTCTTTATATCGTG:1 - chr2R 12322038 5' + Tc1-2 295 1 53.68 TTACAACTTAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 14375573 5' - roo 393 1 71.92 GCTTCCTGTGAGCAACAGCGACCAGCGAGTGAGCCATGAATATTTCAGGCATTTAATTGTAAATTACACATACGCCCTGTGCGACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACAATTTATTCATTTCCTCGT:1 + chr2L 14075775 5' + Cr1a 4329 1 63.85 AGGAATGAGGAAATGCTGGGAAAGTATGAATAAAACTGGAACAAGTCTTTAAATGCAGTGCAATAAATATTCAACAGGAATTGAGAGGTTTTCGAACACACTCTTCTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGG:1 - 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BS 170 1 78.33 ATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGTGCAATCG:1 + chr2L 3960194 5' + jockey 10 1 65.28 CCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACCGTTTTAAGTCCCGTTAC:1 + chr3R 24750952 5' + G6 59 1 53.42 GGGTGGAGAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTGTGTCT:1 + chrX 22726186 5' - Helena 1237 1 52.74 AAATCATAAAATATAAATTATGTGGTACCGGTGCAACTCGTAGCTAGCCGTAGAAGTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAG:1 - chr3L 23768690 5' + Cr1a 4095 1 69.86 GGAAAGCATTAAAATTATAAGTGCGGAATTGTGGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 + chr2R 21690486 5' + 412 88 2 78.08 CAAACCACTTAAATTCATTTTAATTCAAGTGAATAGCAAACCGACCTCTTTCCACATCCTTTGCCATATAGCCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr2R 21748226 5' + 1360 48 1 50.68 ATGGCTGGGAAGCTGTGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGGGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTCCAT:1 - 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blood 341 2 61.11 GCAAGTCACTTGGCAGATTCGTAAAAGCCCAAAAATGACCATAAAATTTTACGCAAGTAACACTGGAAAAGGAGGCTGTTGCGAGCATATACCACGTGGCTGCTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTT:1 - chr3L 10473187 5' - hopper 1197 1 52.05 CAGGCGGTGAGCAGTCTCAAGCAGCGTTGACTCCCAAACAAAGTGGAGTTGTAAAGCAGCAGTTCATAATTGAAGACAAGCCTGAGAGAAAATCTAATTGGAAGAGCTGGCGGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATATGTCCATATTT:1 + chr3L 24880659 5' - Porto1 4264 1 76.03 AGTCATTTTTGAAATTTATTTTTTAAAATTATGTACATTGATTCGGCTAGTTCTAAGCTATATTTAAATAATAATAACGTTAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - chr2R 5260084 5' - 1360 3349 1 48.63 GGTTAAAGTAAAGAGGATTCCTCAGCGACTCACCCTCTGGGCGTTGGAGTGGTCATGGAAACATGGGTCAACAATCTTGGGCTGCGTCTATGTCTCTGGAATCTGCACGCTTAATCTAAACATTCTAGCTTAAATAGTTCCTGAGA:1 - chr3L 9448851 5' - INE-1 152 1 74.66 AGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTGGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGAAGCACTTT:1 + chr3R 23161259 5' + 412 7101 2 51.45 GAACTGCAGTAATATTGTTCTCTCAGTGCATTCAACAAATATGCACATACCACTCGTTTAATATCAAAATCCAACTTGACTAAATTGCTGCAAAAACAGAAACACACTTAAAATGAACACACACACACACACACACACACACATT:1 - 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412 418 2 70.14 ATATTGGAATGTAATCGATGTATTTCGAATAAGTTGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCT:2 + chr2R 18344543 5' - 1360 3323 1 62.33 ACATCTCACATCGAATGGCACACAAATCAAAAATCCAAATCGAAACGTGCCACAGAAAAACAATAACAAGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCAT:1 - chrX 2299383 5' - Doc 286 1 52.41 TCAATTCAAAATGGTTCGTGCTGTGTGGGGTTAACTGGCGCTCATAAAAGTGGAAATGTGTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGC:1 - chr3R 8639332 5' + copia 63 2 61.64 AAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAG:1 - chr3R 21395207 5' + G2 444 1 62.64 GCAGGAAATGCCATAAAAACAAAGTCCTGGCCATAAAACATAAGAGATGGTCAGAGCAAAGTGCAGCCCCAAAAAATCGCATATGTGGTATATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 + chr3R 15152581 5' + opus 7142 4 67.81 GCATGTTGTCGTATTGACCACGTACTATTTGATACAATAATCAGTACACTTTTTTGATTATAATCTGTGACTTTTTACCATTTATTTTAGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTAC:2 - chr3R 12744765 5' + Stalker2 34 2 48.63 CATTTTAAACTAATTTACCACAAACACGATATTATCCTTCATGGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTA:1 - chr2L 19140459 5' + Max-element 8272 2 57.45 GTACGAATATCTTAAGCTAAATGTTGTTAATTCAACACCCACTAGTTAAGGGTTGTGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACACAAAAAAAACAAATAGACAACGA:1 - chr3L 20058786 5' + Doc3-element 180 1 55.77 AAACTCACTCAAAATAAATATATATATATGTATGGAAATGTAGCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGCACTTACAAA:1 - chr2L 17380700 5' + hobo 78 1 72.60 AATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACC:1 - chr3L 7801313 5' + Transpac 160 2 52.05 GCAGGTTTTTCCAACCCGTTCTTTTTGCCTAGTAAGCAGACATCTTGACAGACACAAGTGCGTGGCTGGGCATTGTTTTCTAATTTCTGGCAATTAACTTACATATATTTGTGAAATAGCTTTTTTTTTTCACATTCTTGTGAAAT:1 + chr3L 1836765 5' + copia 354 2 73.29 GACCCTCATTTAAATGACGAACAACCCGAGATAGTTTCCATGCCCAGCGCATGCAGATCTTAAAACACATTTCTGTTTCCATGCCTCTCTATACGTTATCGACTGGGATAATTGTTTCCCGGGCCCCCAGCCTGGCAGACTCTCGG:1 - chr2L 14097953 5' - baggins 241 1 63.70 GTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGAC:1 - chr2R 10910296 5' + Tabor 6913 2 65.75 AAAATATTTAGATTTGCCAAGGGATTATGAAACTATGATATCTTATTATGGGTTAGATTGAATCCAATCGAAAACCTTTGGGCGGAAGTGAAAAAAAGATTTCTGAAGCCAAACCCAATAATAACGAGGATCTTTGGGGTGTTGTC:1 - chr2L 6307518 5' + Tc1 1222 1 60.96 GGAACGAGGCGCGAAAAAGGGGAAAAATATGTTTGTGACTTGACGTAAGTCAACCCTGCTTACAGGAATATACCAAAAACACTCACTCAGCTAGTGGGAATGCGAACGCAAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATAGA:1 - chr2R 5795155 5' - INE-1 497 1 42.47 ATAACAAACTCACTCAAAATAAATATATATATATGTATGGAAATGTAGCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTT:1 - chr2L 17380705 5' + hobo 73 1 70.55 ACTTAAAACAAATTCAAGTTAAATCATTTAACATACATTTCTCATTTCTCAATAGCTGTTGAAATATGCTTCCCAAATGTGTGGAATTAAAAATAAAGCTTGCTTCATATTGTAATTAATATAAGTTATATAATATAATTTGAATA:1 - chr2L 887020 5' + Doc2-element 4705 1 65.07 CATCGAATCAATTCCATAAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACAATTACATACACTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 - chr2L 8574468 5' + Transpac 4963 2 52.17 GCGTGTGCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATAC:1 + chr3L 13952781 5' + I-element 5162 1 62.77 AAGCAACACACAAAATAATATGAGATTATAAGATGATATCAAAACCTTCATTGCTCAACTGATAGCCACCACACATACCGATGTATGTACGTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTT:1 + chr4 540435 5' - flea 227 2 65.75 GTGCATTCGTTTCGCACACCAATTCGCGAAAGCTTGCATCATAGACACACACACGCACAGACACACACACACACACACAGGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCT:1 + chrX 12905404 5' + Tirant 8107 1 80.19 GTGAGCTGTTGCTGAAGCTGCTTCAGCTCCGATCGTTTTCCGTACATCATTTCTATGCTGTATTTATTGCCCGGTCGCAGTGATCATCGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3L 6355562 5' + Tirant 7 2 78.15 CAATAGAAAACACTCGATAAATGGGAACAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr3R 8849901 5' + 297 20 2 72.60 TATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 + chr2L 14969083 5' + 412 57 2 56.85 ATTAGATAAGACACCTCAATAAAACATCATTATTTTACTGATTGTTCAGTTCTGCGTAAATAGCATACATTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATACGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGCAAGCCCACA:1 + chr3L 785872 5' + I-element 51 1 50.68 GCTTGGGCTTAGGTTTTATTTAGTTTACTTTTAATGTTGGTTGTTGGCTGTGTTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGCTGTGTCCAACAGATCGTT:1 + chr3L 1859434 5' - Transpac 271 2 65.75 CACCACTGAAATTAGAACAGAATTAGAACAGTTCGATCACTTTTCTATAAGGCCAAAACATATGCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATT:1 + chr2R 5438207 5' - flea 196 2 62.33 CATTTTCCATTTCCATTTATATTTCCAAAAGATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGA:1 - chr3L 21262630 5' + jockey 4559 1 76.76 GGGTTAAGGGTGTGCAGGGGACAAGGTCAACGCATCGGGGCAGAAAATTGAAGTGGCTGATGAGGACGCAGCGAGGGTTGATACCTGAGTTACGAGACATTTTAAGTACTTATAACACCCAACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGAC:1 + chr2L 16649238 5' + Burdock 185 2 80.82 CTGGGAAACCACCTACATATAGGATATACATATATAAAAGATCCTGTTCGGTTTGTATATATAATCTTTCTACATGGTTGGACTTTATTTTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 + chr2L 4876829 5' - 297 6949 2 67.12 CTATCATCAAATTGTAATTACTGCAGTCAGAATAAATGACATTTTGAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3R 12379711 5' - roo 333 2 70.55 TAAATATTTTGCGACTTTGTGGCCTGTGCTGACTTTGAGTGGCAAAGAAGCTTGTGAGTAAACATATTTGCCAGAGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 11554593 5' - roo 9026 1 56.16 GGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3L 19580907 5' - roo 325 2 74.48 ATGGCTCCTCCACTCCACTTGCCACTTACCAGCGCCAGCTTTTCATTTTCCAAGCCCACAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACACAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGGGATCCATCACAA:1 - chr2R 21439525 5' + jockey 70 1 55.48 AAATTCCTCCAAATGTATTTTGCTTTGTCCCATTACTAATCAACAAAATATTTCCATTTGCTATGTGCTCACCAAGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr2R 11256275 5' - roo 9028 1 54.11 TAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr2L 14239136 5' + 412 45 2 51.52 ACATGACTTTGGCATTTCCCTCCCTCCTGCCACGCCCAAACTATTAAAAATGTTTCGATATTTTATTATACCGCCCAGAACTCCAACGCCCACACTTATAAACATTTTTTTCTGCCTATTATGTCGTTTTAATCTTTATTTTCGAA:1 + chrX 22679106 5' + HB 1468 1 46.58 TAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGC:1 - chr2R 1000396 5' + HMS-Beagle2 72 2 67.81 ATGGCCATCCCAGTTAAAGCTACTGTGGAACATAGTTTTAAACCGATATATAACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr3R 18528244 5' - roo 9038 1 59.59 ATGTAATTGTGATTGATATAATTAGTTCATTTTTAATTACCAATTGTGTTACAAGCTTTAACATGGCTTAATGTATCAGCTCTAGAAATATTCATATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGA:1 - chr2L 2120497 5' - I-element 5331 1 63.70 ACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATG:1 - chr2R 10910308 5' + Tabor 62 2 57.53 TATGTTGACTAGAGTGTTGAAAGGTCTGTAAGCTAGCGTAAGCGGCAGCTATTTGTAATTTGCTCATGAATTAACGCTATGTACAATACTATCACATAAATAAATTTCAAAAATGACCTTTTAGTAGAATAATTGTCAATAGAGTA:1 + chr2R 5476651 5' + 1360 399 1 52.05 CTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGT:2 - chr3R 25804201 5' - mdg1 347 2 66.44 AGTTGAGAATTTGAAAATTAAATGAAGTCAGTGACTGTGTCAGTGACGGAAATGAGTTTGTCTCCTCACCAAGGACCTCGACTTCCCTGCCCCGAAAATACACACAAAGATACGGTAGATTACAAAAAAACGATAACCAAACG:1 - chr3L 18708800 5' - Circe 68 2 75.52 ATAGTTGCTTTTCATAACAACTACAACTACTATAACTTTTGAAACCTAACCGCGTTTACAATCTGTTGATATATAGGTAGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr3R 8218041 5' - P-element 2845 1 57.53 TAATCAGCCCAAGGGAATATTTTGAATTCCATTACCATTTATGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGAT:1 + chr3R 6394538 5' - F-element 4411 1 70.50 AAAAAGTTGTTAATTAAATATGTACATAGTATTAACTGTTTTTAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3L 7870267 5' + roo 74 2 75.69 TAGCTGAAGAATGAGGCCATTATGTAAGGGATGACCTTTCCATTCTGTGGAACTTACATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr2L 21691812 5' + 297 6618 2 56.59 GTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 + chr3R 9125685 5' + Doc 88 1 74.29 TTTCTCCACTCTGCTTGCAAGTGGCTTGACTTTTGGACCGCAGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 - chr2L 21910260 5' + Doc 29 1 61.48 GTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAG:1 + chr2L 22315568 5' + frogger 35 2 61.40 GCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 - chr3R 22494162 5' + 297 6637 2 77.27 CAGCGTCTTCTTTGTTTTTATTTGCCAGCTAATATATGTATGTACTACTTCCCTGATATTAAGATACAGGGTACACACATGGCATATGCCCAAAAGACATTGGCACATTAAAAAAGAAAAAAAGAAGAAAAAAAAACCAAAAAAAT:1 - chrX 19379476 5' + mdg3 5104 1 73.29 GTCATAAATGTTGCCATTTGCTTCAATGTCCAATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATG:1 + chr3R 13349523 5' - Ivk 5302 1 73.85 ACCACCCTTCATTTAATGTGGCCATCAAGTCGTAATTACGCTCGTTGTTGAAACGATGAAGACATCAAATTGCATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chrX 6633061 5' - P-element 2846 1 57.53 GTTATTTTTTAACGAAAGTCAGGATCAAAAGTATGGATTCCAAACCTAGAAAAACCAATAACAAAATGAAAAAGAAAGAAATATTCCAAGATCAAATCTTATAACCATTAAGTTAACTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr2L 11296307 5' - 1360 3386 2 80.14 GTTGTATAACGAAGTTACTTCTTTTTTTTCTGATCTCACTATATTTTACTATACACTTGAAAACATTATGAAACATAAATTTAATCGTTTATAATGATATGTAGCAAAAATAATAATCGCAATATGACTCGTCGTTGATGTTTATG:1 - chrX 21266057 5' - ZAM 105 2 52.05 AATGGTCCTAATACTAAGCTTTTGCCTGCTCTTACTGGGGGTATAATGATTCAGTCAAAAGTTTCCAACGCGAAGAAGCGAACAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGACGAGTTCCCCGACTATC:1 + chrX 20381369 5' - INE-1 564 1 78.40 GCTGGTGCCCCAAACCCGACCGACCCCTTCATACCTTCGAGGGCTTAGAAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCT:1 - chr2L 12500522 5' - blood 410 1 66.67 GGCTGCAGTGACACAGCAAATGCGTATCCCTACTCGAATACCTGACGCAAAAAGCAAAAAATGTTAATAAAAATCATTTAGACAAAGGAAACTGAAATAATCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATGATTTTTTTTTATCATATTGCTA:1 + chr3L 15203512 5' + 1360 3104 1 68.49 ACTGGGCGCAACCCTGGGAACGGGAACCTTCGGCAAGGTGAAGATCGGCGAGCACCAGATCACACGCGTCAAGGTGGCCGTCAAGATGCAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chrX 1375995 5' - copia 233 1 68.50 ATACTCGGTTACTTGCGGAGAGTGGGGGCACACACTACATTGCTTTAAATACTGGGCAAGGTATTTACAACTTCAAGTCGAGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTCAC:1 + chr3R 27381182 5' + jockey 100 1 56.85 TTACAGAGGAGTGTTCCATGACGAGTGCATTTGATTGCTAAGCTCGCGCCACTTCTAGCTTATCGAAAAGAGGCGTCGATTCTCGTGTCAACTTTATACATGTGCATACACCATATGGAACAATATCTATCGATATTCCAGAAAAA:1 + chr2L 16882471 5' + INE-1 500 1 72.60 TTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAATATTTATAGCGGCACTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTTCTCACGCCACAACGTCC:1 - chr2R 10557925 5' - gypsy9 5159 2 73.97 GTAAGGCTTGAATCTCTAATCACTGCCTGGTGCGGTAAAAAATATTTGCCTTCATCACTCACTTCAATCATGTGTCCTAATTACCAACGCAGACTGCGGCGTCTTAAAAGAGCTGCATTATATAATTAGATGATTAGAACCTATGT:1 - chr3R 19445219 5' + rooA 264 2 54.79 CTATTTCTCTCAGGTACAGTCCCGTTTTGTAGCAATAACTTTTTACTTTGTCTACTTTTTTCAGTGCCTAAAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 + chr3R 12609158 5' - 297 6932 2 51.37 GCCGAATGAAGGCAACTATTAGCCACAAAGCTGTAAGTAATGACAAGCTGAGTGCAATTTGATGACAGTTGCCAGTCAGATTGAGCAGCTCATCCTCAAGCCAGGTCCGTAGTCCGGCTGCGCCAGTTACAATCC:1 + chr2L 16417321 5' + accord2 7426 1 77.04 AAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTA:1 + chr2R 10910238 5' - Tabor 7233 2 79.45 CCGAGCTGCGTGACCAGGTGAGGACAGAATAATGGCTCCATTGCTCTGCTATGCAGCTACTAATGGTGTAATAAATAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTG:1 - chr2R 12065685 5' - Stalker2 7614 2 52.00 ACAGAAAACCCTTATCACAGCTCTATAGTTTGGTTAGATATTTTAATGAATTCTCGTGAAATAAGAATATATATACTTCATGGTTGTTATTTAAGTTAATCTTTTATCTCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAAAAC:1 - chr2L 9169431 5' + Doc3-element 4709 1 69.18 GTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 + chr2L 19407046 5' + Doc 70 1 67.12 TACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCT:1 - chrX 23182949 5' + Idefix 19 2 59.59 AAGTTATGAATAATATCCGGCCATTTTTCTACCCTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGATCACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGC:1 + chr2L 18630425 5' + G-element 31 1 65.75 CAGAATAAGTAGAAAGCAAAAATAATATGTATCTTTATTATGTCTCCCTGAAAATGCAAAATTCTTTGTATATTTGTACAAACTACTGCACAAATCACAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATTTTTACAA:1 - chr3R 1513833 5' - Cr1a 104 1 65.75 AAAAGACTTCTTTAAAAAAATAAAAGTCAAGGCATTAATTTCTATATTACATTTTTTTCTTCTGGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTTACACGTTATACGCGTTTTTACACACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATT:1 - chr2R 1441828 5' + 1360 3268 1 60.96 TCAATGTTGGACTTACAAGAAATGGGCGACAAAATAAGTAATTGAAAAAGGTACATTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGT:1 - chrX 12817657 5' - Tabor 7171 2 62.33 CGTCATCGCCAGACATTTTACTTGCAAAGTTTACCACTAATGGCTTACGATGCTCTTTCAAAGCGCTTACAAGATTTGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr2R 21843913 5' - pogo 2058 1 54.79 TCCTGATTTCAGACATTGATATTTTCCCTTAGATTTGAGGCTACACATACAATGATGAAATAAATAATTAATTAAATAAATGCATTATATACATTTAATATACATAACATACATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTG:1 + chr2L 13332558 5' + micropia 4964 2 77.40 AAAACAAAATGGCAACCGTTCTGCGGATGAGCTGTAACTTGGCTAAAATGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCC:1 + chr2L 5792855 5' - blood 7154 2 57.63 AGTTCCACAATAGACGCTTTCGAGGAAGGGGACTGCGAGTGGTGGCCATCACGCCCCAGGAAATCGCTGATAGGATGAAAACGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGACATTAGAGAATATGATGAAGAAGGG:1 - chr3L 1560841 5' + invader4 2964 2 57.04 AGTGTGATCTCTATGTTTTTTTTTTTATAGGGGATTTGATTATTTCCAGAATTTACACAATCGTTTTAATGACAGCCAAAGCAGGGTCATAAATCAGATACTTCAGTCATTATATCAGCATCCAAAGCACTGATTAAATGGTAGT:1 + chr3L 18254618 5' - Chimpo 445 1 61.38 GGCCAGACGTAGGTGTATCTAACTACGAAGTTTTTGGGTAATATCCATTCGGTGTGAATGAAACCGTGCCGAAAATTATATATCTTTAGGGGTCATTGGCAACTTTAAAAGATATATGTATGTAAGATAATATAAGATAATATAA:1 + chr2R 19358941 5' + Stalker3T 203 1 76.55 CACCTCTCTAAAACATTTACTCGAACTTTTGCTATTCATCACATATAATTTTTCAATGTGCCGCAGTGGTACGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr3L 12964831 5' - hobo 2902 1 55.22 AAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCG:1 + chr3L 18183160 5' + Tirant 402 1 66.09 CCAATGTTAGGTTTAAGGGAGTCTTAATTTACAAGTGCGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCCTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCTGCTCAACTGTTTGCGCTCTTCTGGCG:1 + chr3L 25186271 5' - Max-element 7 2 71.23 GACTGTCGAAACCACAATTTCTGCTGGACTCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACATCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATCAGATCACCCATTTA:1 + chr3L 11803997 5' + blood 91 2 76.03 AGCCCATAAATCCATCTGCCGTCCATCCATTTGCATAGTTGAGCCGGATAGTTAAGCTATTTACAGACTTACAATGGTTTCGTTTTTTATTTCCTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCT:1 + chr3R 25277571 5' + 3S18 28 2 67.12 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGAGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCCAATCTCTTTTTACTATATAATTT:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 5378 2 63.16 AGTGCATCGCGTCTGGTTCGGATTAGCGTTTCGGTTCGGTTCGATATTGAGCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAA:1 - chrX 6630734 5' + P-element 456 1 44.20 TCCAATAATTTTAATGTAAAATGTAGTAGTAGTATCATAAATATGTATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGTGCTGCGGC:1 - chr3R 7481585 5' + invader4 2837 2 71.92 ATGTATGTACTTTGTGCAGGCCTTTAATGGGGGTTGATTTGCCAAAACGAAATTGGAGCCTAGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 + chr3R 7089469 5' + P-element 53 1 46.76 ATTCCATAAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTA:2 - chr2L 8574458 5' + Transpac 62 2 61.64 GTGGCCGCCGGGTCGAAATTTCTGATATGGATATGGAAAAAGGGTCACAGAGCATAGGTGCAGAGGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCAT:1 + chr3R 5773095 5' + Stalker4 16 4 75.34 AATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 - chr2L 12291942 5' + Tirant 48 2 57.89 TATTATTTGCCGTACTAGGCTTTCGTTTTTGGCTTCTGTATGGCAAAAGTAGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 + chr3L 12874876 5' + jockey 77 1 64.38 AACTGAACATTCGACATGTCCATTAGCCTCTCTGAATTCTATCAATCCTCACTGACTTTCTGGAGCCATCTGATCCATATAGTGCTGCAGTTCATACAAATGGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAGCAACA:1 - chrX 16948434 5' + hopper 1113 1 62.33 AAACCCGAAAAGGAAGAAGGAAAACTATCTAGATTCATGTGAGTGAAACCCTTTTTTATGAATTGCCAAAAGAAATTAAAAGGAAATGTAACAAAATAATGCAATTAAAAGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATT:1 + chrX 10817242 5' - Doc 244 1 77.40 ACATGAGTACGTCTAGCTGGATGATAGCCAGGCTCATGAAGCGTGGCAAAAACCTACAAAAAATGGAGAAGGAAAATATAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 11873067 5' + TART-C 11095 1 52.69 CAGAGAGACGACTTATTCTACGAACTGCCTCAAATTCTCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:1 + chr3R 4576977 5' - mdg1 7375 2 74.66 CTTTTTCTGAAAATCGGTCATCATCTTTTTCACAATTTTCATCATTGCTACATCATTTTCATTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr2R 5237686 5' + Doc 16 1 63.01 GCGTTATCCCATGCAGGAACCAGTTCCAGGCCAAGTTCTCTATCCACCATCGACGCCCAGTACAAAATCGCCAGGATGATTACCGAATGGTACCTGAGGAACACAACCCTGCACAAAGATCTCAAACTAGCCACTGTCTT:1 - chrX 753108 5' + BS3 1437 1 61.43 GGGAATGAGAGGAGCCACTTCAGCTTGGTCACTTCAGATGGTTATATCCTATCACAATAATACTCCGCATAGTAGAGAGCCACGTCCAGACTTAATGCGCCCCAATGAATCTGTCCCACGTAGATTCACGAGGAACTATATACCCC:1 + chr3L 13205431 5' + Cr1a 4121 1 74.66 TGGGTGCTGGCATTAAGGAACGACTGGTGCATCATCATCCATAAGTCTAATGCGCCACTCAATGAGGGTGAGCAGAGACATGGATGTCTAGTAACATCTTGTGGAGCTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTT:1 + chr3L 8848732 5' - I-element 5342 1 75.34 GCACAGAGAAAAACATTTAAAGTACAAATTCTTGGCTCGACGACATATTTTAAACAACGGGAAGTGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 13317983 5' - roo 394 1 69.63 AGTTGTGATGTGCTCTAGGCAAATATTGCACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGT:1 - chr3R 14049477 5' - transib2 2808 1 73.29 AAGCAATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCACAAGATCGTTGCCTC:1 + chr3L 7791873 5' - Transpac 266 2 54.11 TATTTCTGCTTTTTTTCGGCAGTCAATGTGTAATAAATTATTTTTTATTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 - chr3R 24564873 5' - opus 7478 2 67.12 GAACTGGTGTACTATTACCCTAGAACATCAGAAACCCAACGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr3L 23871347 5' + Doc 53 1 50.00 GTTAACATATTTCTAATTCGTCTCTTCTTCAGGCAAAACAATTGAAAATTTTCCAAAAATTCTCTAGTTATGGGTCGCGGAAAGCATTGTACCGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAAAATACGC:1 - chr2R 5078951 5' + Tc1 414 1 73.29 CATTCATTAGGAAGAGCAGACAACACCCAGCGAATTAAAGAAGAAACAATCAGAACATTGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGCCGAAGTACACATACAAACCTACTTAATAA:1 - chr3R 21693526 5' + baggins 5428 1 49.15 CACGAGGCAAACACATACACATACGAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTTTTTGTGCAAAAATCATATGGGATGCTCTCTCGCTCAAGTCTTTGTGTATATTCTCTTTCCGAATATACCA:1 - chr3L 13228566 5' - Doc3-element 4423 1 75.89 GACTTCAAAGTTTACAAAGTGAAAAGCACAAGTTCCGTTGCGAACCATATTTTTTCGCAGTTATTAAGTACGTCACAATGAAAACTAAACAAAAACAAACGGAAATTCATCTACGATGAAGGGCAGATTTTGTCAAATTTACA:1 + chr3L 5183671 5' - 1360 204 1 76.22 CTGCCCGAAAAGTGGGCGTCTGTGGAAATTTCAATTAAATGCGCACATGCCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAAC:1 + chr2L 19310266 5' + Juan 4076 1 72.60 GAATAGCAAACCGACCTCTTTCCACATCCTTTGCCATATAGCCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 + chr2R 21748256 5' + 1360 78 1 71.23 TATTACGAATTTTAATTGCTTGTATATCCTTAATTTTGTATGTTGTATTCCCAGAGCAATAGGGATATCAATAATATTTGGCTTACGTTTAATTATCCTTAAGTTATCCTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGC:1 - chr3R 5059323 5' + F-element 29 1 32.41 GTTGTTTAGAAATAGAAATGATTTCACAATGTACTTTTTTTGTGTCGAGCTTAGAGCTTCAGTTGACCGTTTCGTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACTTTC:1 + chr2L 19141238 5' - invader1 147 2 77.67 AAAATAATATAATAATTTTAATTAAAGCGTTATTGCAACTATTTACTTTTATTAGTTATAAATTTGACGATTAATTGAGCTGAAATGTGTAACATATGGAGGTATGGTTGTCAGATTTGGGGCTTGGCTTGAGACAGCCAA:1 - chr2L 17264871 5' + BS3 1327 1 57.45 ACACAGCGATCGATGCACACCATCTCGCCTTTGCCTGTAGGGTGCGGAAAGCATTAAAATTATAAGGGCGGAATTGTGGTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr2R 21690441 5' + 412 29 2 56.06 TGTCACACTTGCTTCATTATCCGAGGAATATTTAGGGAGCTCTAGTCCGGCAAATTCTTGGTAAATGTTTTGCCAACTTCGTTTGAGCACTCAATTTAAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGAC:1 - chr3R 24480760 5' + F-element 225 1 67.12 CTGGCCTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATACC:1 - chr3L 21910485 5' + pogo 30 1 61.24 GACCGTGCCGGTCCGATACCATATAAAACCATATATACATATATTATATATTAAATCAGAGGGATTGCCATGTCGGTCTGACCATGGCGATACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACAC:1 - chr3L 7939169 5' - R1A1-element 5305 1 60.27 GATATTTTTATTTTATATTTATTCACGTTTAAAGAGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGCTTTCTATATTATAAGTTTTTATTTCAGCATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chr3R 15054272 5' + 297 6585 2 78.77 CATATATTATTCGATATTGATTATGTACGTCCTGTTCCTCTAATACACAACTCATTTGTTCGTTCGCTTCCTCTCTGTCGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 - chr2L 22690077 5' + Tabor 25 2 69.18 TAATGCAAGGTCCTGAAAAGAGGCTCGTGTTGCAAAAAACCGGAAAGCAAGAAGCCGAAGCTCAATGTTGAAACATTTGTTTAGTACCAGTGTTCACACATGAACCCGAATATATTTAAAGACT:1 - chrX 21403516 5' + roo 13 2 70.97 TTTCCTTTTTTACCAGTTTTTAAATTTAACAATGATCTTACGAGCGCTACATCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGGTAGCAGACAACTATATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATAT:1 + chr2R 3492792 5' + 1360 201 1 69.29 CTTAAGATATATATATATAGTTATAGTTAAGGCACGGTTTAATCGCTTTGGATTAAAGGTTAATTTCTTTTGGGTGCATGACCACTTTCCTTAATAGCAAGGCTCTAGTGGCCTCTTATGTGCCCTATTTCCGGAGAAACATCAGC:1 + chr3L 6952669 5' - Gypsy12A_LTR 1890 1 53.42 GATGGGCGGAAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATT:1 + chr3L 7837142 5' + jockey 4801 1 55.48 GCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGC:1 - chr3L 27415327 5' + transib2 49 1 52.05 ATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAAAGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 + chr2L 17957155 5' - 297 6928 2 55.48 TGATTATTAGGTACATAGTTGCTTTTCATAACAACTACAACTACTATAACTTTTGAAACCTAACCGCGTTTACAATCTGTTGATATATAGGTAGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr3R 8218055 5' - P-element 2859 1 67.12 GATGATTTTAAAACTATTCAAATGTTGTTTTATAACTATATAGACATATTACCTTAAGGTGAAATCTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 + chr2R 10160500 5' - hobo 2884 1 54.11 GGATCCCACAGCCTAAGCCGAACGCTAGCCCGAAACCGAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3L 19581005 5' + roo 41 2 58.22 ACTTAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 14375578 5' - roo 388 2 68.49 AGCTGCCATCTAAATATATATGTGTGCACTTGAAAAAACTGGTGAGCATATATCATAGCATATGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chr2R 17169198 5' - hobo 2894 1 54.14 TGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCA:1 - chr3R 23235276 5' + BS 80 1 74.66 CAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chr3R 14277984 5' - P-element 2853 1 56.00 AATAGCATGTTGTCGTATTGACCACGTACTATTTGATACAATAATCAGTACACTTTTTTGATTATAATCTGTGACTTTTTACCATTTATTTTAGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAC:2 - chr3R 12744769 5' + Stalker2 30 2 51.37 GCTGGCCCAGGATATCCTGATATCCACAGTGGTGCTTCGGTGGGTAGCTCACAGAGTGGCTCTTATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 + chrX 14329163 5' + jockey 4707 1 48.80 CATCATAATTTATAGCTGCGTTAAACAAGCGAGGATAACAAATTAATTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATA:1 - chr2L 20515275 5' + I-element 75 1 70.55 TACCTATTCTATTCTATTCAAGCGACCCATTTTAACAAACTGTTACTCATCTGCATCACAAAGTTTTGTTAAGAATCATAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3L 3238352 5' + roo 8706 2 45.89 GGTATTCTTGTTGTTTCTTAATAACAACTGTTTCCGCTATTCTTATCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATAGGCTTTATTTTTTGTTTTCATCTGCACGAATATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr3R 19446793 5' + F-element 28 1 71.23 CGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTC:1 - chr3R 7616808 5' + Stalker2 7325 2 73.97 TATTTCGCTGCCTGCTTTTAGGCGCAAATATTTGCCAGCTCTGTGTGTCAGTGCTTCAGTCTGTCCATGTGTGTGTGTGTGTGTGCCGAGGCACGCGTGTTCTATTACTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTCTTGCCTATT:1 + chrX 8290380 5' - accord 174 2 57.86 ACATTAATGGGATATCCTGGGGTTTAGATACGAGCTCAGATCGTAACCGCATCTTTTAGTTTAAATAAGTAATATCCTTCAAAGCATAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATG:1 + chr2R 17222256 5' - Ivk 4993 1 45.14 CTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGG:1 - chr3L 5069478 5' + opus 7183 4 72.73 CTTCTCCTGCGCTGACCTTCAATCAAGAGTTCGCTTTGGCCAGGCGAATTAGAATTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGGATGAAGGGTTTTAAGTTTCAGCAGATAGT:1 + chr3R 16240897 5' - Tirant 8443 2 58.22 AACCAAAAACTTATGTACACCTCGCAATAACTTGTGTTAACTGGTTAACAAAAACTTACCGTTAAAATCAAGTGCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr3L 12964706 5' + hobo 46 1 52.74 ACACTCACCACCCACCGCATAGGCCGCAGAGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 12486445 5' + roo 8703 2 55.48 AATGCCGGACAGAGATTGCATTTTAGTATGCACCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGA:1 - chr2R 23212670 5' - Tirant 8430 2 75.37 ATCATAGGGTGTGCTACATGGATGGATAAATTTCATAAATTTATTACAAATTAATAATATTCCAATAATAATTAACAAGAAAGTAAGTAAGATTGTATGCTAGATTCGTTGAAAAGTATATGTATATATATTGTTGATCAGGATCA:1 - chr3L 11887892 5' + INE-1 81 1 79.45 CTTAGTGTTGTCTAACAGTTTCATTGCTGGCTGTATGTCCATCGTTACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAATAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGC:1 - chr3L 22721166 5' + INE-1 29 1 66.42 ATTAGGGACACCCAACCTAAGACATATCTTATCTTATCTTACTTAGAACAATTTAAAAATTTTTTCTCAGTTTATTCCCCAATATCTATCAATATCCCATCAAAATTATAAAATTTCGTGTTCGCATTCACACTAGTTGGGTAACG:1 - chr2R 6172754 5' + INE-1 535 1 68.49 ACAGGAGAAAGCACCTGCAATTGATAACGGGTCGCCAAATGGTAAATAGTACAAACAATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATC:1 - chr2R 18689242 5' + Burdock 6175 2 52.46 ACAAGAATGCATTTGATTTCATCAAAGGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3L 2330117 5' + roo 8718 2 77.36 CATGTGCAAAAATAAGAAATAAGTGTATTTGATTGCAGTGCAAGTCAATAGGTTCTTATTAGCTTATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCG:1 + chrX 14137199 5' - 3S18 6047 2 56.85 TTTTAGATTTTAGATGTGTATTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCA:1 - chr2R 1000441 5' + HMS-Beagle2 6910 2 68.49 CGCAGGATTGCGTTGCCAAGCGAGTATGCCATATTCATACAGATACCCAGGCCCACTTTAAAGGGTGCACTGGGAAAAAATAATACTACAAAAAATCATATTCAATCCTGCTGCCAATTTATATACATTTATATATATACATATGT:1 - chr3L 12613397 5' - Stalker 246 4 73.97 ATGTCCGACTGTCCGACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAACTATAA:1 + chr2R 20168811 5' + INE-1 145 1 83.33 ATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 + chr2L 17295847 5' + Doc 11 1 57.32 GGTTATGATTAAGAACTATTTGCTATGTGTTTCCAATTACGCGCAGAATCTATTTTAGTCTCTTTTCTGTCACACATATATACATATTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATT:1 + chr2L 13138944 5' + McClintock 5977 2 69.18 GGGAGGCACATGCAAGTCCCTGATGTTTTGGGAAGCTGCGGATTTGACTATTTAATGGCCAATGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 - chrX 6844438 5' - 297 351 2 57.53 TGGGAAACCACCTACATATAGGATATACATATATAAAAGATCCTGTTCGGTTTGTATATATAATCTTTCTACATGGTTGGACTTTATTTTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 + chr2L 4876830 5' - 297 6948 2 66.44 TGGAAGAGGAAATTTGAGCAAACAATTTATAAAATAAACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACT:1 - chr3R 24454914 5' + F-element 252 1 69.18 CCGCTACGTAATTTAATTAGACGAAGAAATATTCAGTATTTAATTGTCTAACGTATAAATAAAAATATATGCATATTATTAAAGTATATGTCGCATCATTATTAGACTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATGGACATGT:1 - chr2R 5045695 5' + invader6 4529 2 59.59 CTCAAATTTTGTTTGTAACTAATAAAAAACATCAAAAAATAAGAAGAACTGGGAAAATCAACTTGAAACTTTGTCTTTGGTTTTTGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTACTTCTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAG:1 - chr3R 10301244 5' - F-element 248 1 62.33 GTCCACGCAAATGGAACCATTTGTGGAGCAACTGATGGCATTGATCAACTTAAACAGCTCTAGCTTAAAAATGAGGATCAGTGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTCTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAG:1 - chr3R 23595739 5' - jockey 4704 1 55.48 GGGTAGCTGCACTGCCAGAAAAAAAGAGGTTCCTTCTATAAATATACATTTCTAGCAGTATTAGAAACTTTCACTCAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr3L 1358420 5' - 412 7518 2 62.31 TGAATGTGCTTTGTAAGTTGGTTTTTGAACCGAAAGAGCTTTGAGCAGTCATTACATTTATGTGGTTTCACACTAGGGTCCAAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTT:1 + chr2L 16700213 5' - micropia 5242 2 56.16 TATACACCAAAAGAAAAGCTTGCAATATCTTATGACACATTAAAATAAAAATATAATTTATATAAAATATAAAACATAGGAACAGTTATTTTTTCAATTCTTCTTTCATCTGACTCTGCATAGGTTTGAATTTGCAAAAGCAAAAG:1 - chr3R 20782408 5' - Bari1 100 1 56.85 GACGGCAGCTGCAGTTGCTTACCCCGTCTCCCTCGCCACCGCAGGCTATCTCTTTCTCACTGCGTGTTTGGAAGTGCATGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAAACTTCCACATAA:1 - chr3R 25446045 5' + Transpac 5226 2 60.32 ATGATTGCGGTGTCGTGGATTGGATTGCGATTGGGTATGCAGTTTAATATGCCTGAAAGTACATATATCCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 11513439 5' - roo 9022 2 51.37 TTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTATTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTACAATACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATTGGCTA:1 + chr2L 22121340 5' - I-element 5304 1 68.49 ATTTGTGCAAGACCCATTAAATATAGTCGAGACATTCAGCATAAATGTGTACTAAATAATTAGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 + chr3R 17047806 5' - 412 433 2 62.33 AAAAGCGCGGAAAATTTTCCCAATAGCACCTTTTGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr2L 14969047 5' + 412 7074 2 63.70 GTTGTAGCCATCCATCCAACACTCTTTTTTTTGGCAATAAATTGGTAATGTATTTTGGTGACAGATAAGACCTCTTGCACATTGTTGTGATAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTCACA:1 - chr3L 12836125 5' + 1360 30 1 64.38 AGAAATGCAATTTTCAATTAAGATATTTCAATCGAGAGTGCTGACATTAAAGTAGAGGATAGAATAATATTTCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2L 19674020 5' + roo 8708 2 50.68 ATTGATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGATCCGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCT:1 + chr3L 24757194 5' - Cr1a 4260 1 56.16 TTAATCAATTATTATCAGTGTGATACTTGAGGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATCTT:1 - chr2R 1373221 5' + pogo 41 1 57.53 GTATTTCGAATAAGTTGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGCTCGCTCACG:1 + chr2R 18344562 5' - 1360 3304 1 74.66 AACCCACGACGTAGCCAAGTCAGAGCCATTAAAAATACATATACCCAAGACTTAAGAACATGTCTACGCACTAATACACACACAAAATGTACACCCAAATACACCCTACACTACTCCGGATGTACCCAAGAGATACCAGATAAGAA:1 - chr3L 8014277 5' + Idefix 6916 2 70.55 GAGTTCAATAAATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr3L 16059359 5' + 297 6629 2 58.90 GGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chr2L 21910208 5' + Doc 14 1 60.29 CGTTACAACTTAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 14375571 5' - roo 395 1 73.29 TTTATTTCAATTTGTTTGCATAAATATTTGAAGCGAAGCTAAATTAGAATGTCGAAAGGCGAGAAAAAAATTCCTCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGATG:1 + chr3R 31886716 5' + HB 1286 1 59.66 CATAGGTTTAGGTTACACTTACATATATTAAACACGACTTAATGAAAACGATGTGTAATTGTAGTTTTATTTTTTATATATGGCCAAAATGAGTATTGTTGATTTTTGATAGGCAATGCGTATCTATTATTAAAAAAAAAACAAAA:1 + chr2L 12706634 5' - hopper 156 1 50.00 ATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr2L 22719578 5' + 1360 55 1 62.88 ATAACGTTTTTCCTGTACACACACACACACATATGCCCAAGGAAAATGGCCCCCAATCGATGAATGATGGAGGGCCATTTTCCTTGGGCATATGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 18500469 5' - accord 188 2 50.94 ATCGGTAAAAGAGTGGAGTGCTTAAAGATATTATCCCAAAACATGCTTATGAAGGCAAACTGTAGGGTTATGAGCGCATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAG:1 - chr2L 10446158 5' + flea 4758 1 73.33 TTTTCATTTAGACCCACCTTTTTTTTTTTGACAAATTAATAAAGTGACATGGGATTGGGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGATTTTTGCTGCTTTTT:1 + chr3L 15398537 5' - Porto1 4437 1 42.31 AATAAGCGCGAGGCAGCCAAGCATGTCCTGATGCGATGACGGCGACACTTTTTCCATGCGGTTGAAGCGTCGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTT:1 - chr2L 18889367 5' - Ivk 5107 1 54.70 CCCGGCCCACAACTGCCATTGTTTACTGTACCTGTTGCCGTAGCTGTTGCCAGTTGCCGTTTGGCGTTGGCTTTTAATTGAAATAGCGAATAGCAAAAATTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCTTATGTTGATGTTA:1 - chr2R 11914173 5' + Tc1-2 1497 1 69.78 GAAGACATCTCAGTGTAAGCAACGATTTTTTCCATTTCCCCTTAGTTCATTTTTATAATGCTCAATTTTTCCACAATTTTTTTTGTTATCCTTTCGGCCTTAGCCATTCAACTGGACATTGCCGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTA:1 + chr2L 4155938 5' - HMS-Beagle 262 2 69.18 AATCAAATTTCTAAACTCACATTTGTCAATACAAGTGCAATTATTTCAACATGCTAGTCAATGATAAACATTATCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr2L 10514382 5' - 1360 3355 1 53.85 TTCGTCGCTTTTCTGTAAGATTTTTTTTTAGTTGCTTTGCCATTTTTATTACTCAGATGCTCTGTGTGCTGGAATGGGTGGCAATTAAATTGAAAATAGTATGTCTGTAGTATTACTGATAGCGCTTTGTTTAGCTATTGAGCTTT:1 - chr2L 15125722 5' - diver2 367 1 54.11 CGAAAAGAGCAAACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 - chr2R 18014122 5' + Doc 74 1 62.33 GGGTCGTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 - chrX 19107445 5' - roo 8983 2 80.82 CAACGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 - chr3L 23871311 5' + Doc 89 1 73.29 TTCCTTGGCCAAAAAGATCTTGGCCTCGTTGCCACCCGTGTTCTCAATCCGAATGATCTCGCTATCATGCGAATTGCGCTTGCCAAAGGTCAGTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTT:1 - chr3R 14635468 5' - invader4 3035 2 72.66 GTAGCTATCATCAACTTGCCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACT:2 - chr3L 15099687 5' + G4 3809 1 56.85 AAAGGGAGGTTTTTTAACGGATATGCCTATGATTCCAACTGATATTAACACGATACCCATCAGCAAAGCCCAAACAAGCATTTCTTGTTTGTAATGTGAATTTGAAAATCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr3R 4190843 5' + pogo 10 1 78.77 CCCGAGCGCCAAGGCAGCGCAGTCGGCGTCGCTGCCAGCGCTGCTTCTTCTACTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAATTCAG:1 - chr3R 31724943 5' + P-element 47 1 45.53 ATTATTGGATTTTGCGACTTAGTCATCATTATCGTGTTCTTATCGATATACAGCCATCAGAACGTTGAAAATGTCCCAAAAAAAAAGGACAAAGCAAGTGAGAACTCTGTGGTCCAGTGTATCGAATATCATATACCCGTTACTCA:1 + chr2L 12321874 5' - INE-1 548 1 54.11 CGGAAGTGGAACCTATTTGGATTTCGAATATTTATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGAC:1 + chr2R 11264008 5' + jockey 4753 1 75.89 GTGTTGCATGCATGCAAATCGTTGGAAGTTTTCATTTGATTTACGATCAAATGTCAGTCGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTTAATAG:1 - 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chrX 17549766 5' - Idefix 241 2 76.03 ATCATGTATTGTTAAAAAACGTGAACAATGCAGTATTATTTAGTTTGCGCTGGCCATTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chrX 18239101 5' + jockey 70 1 59.59 GAAAGTCTCGCAGTGAACTTTGCACTAGACTACAAGCTTTATAGCTGCGATGATCTTTGCCCGGCTGTCAATTTAGACAACAATGAAACACCAGATATACTACGCATTAAAATGCTCCATACGTCGTAATTGTCGTTGCCTCATTT:1 - chr3R 11566288 5' - Copia1_DM 353 1 67.81 GTACGCCGGGTGTGACATGGCCAACCACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chrX 16117125 5' + opus 7022 2 68.49 GGCGGGGCCGGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 + chr3L 3453575 5' + Tirant 26 2 65.19 GCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 + chr3L 7791882 5' - Transpac 270 2 52.63 AATGGCCATCGAATCGATTGCCAACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGCGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr2L 19407007 5' + Doc 31 1 53.42 AGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 - chr2R 17332201 5' + jockey 92 1 73.97 AGTAGATTCAAGTTAAGTAAGAAACAAGTTGGACTGTATTTGGCATGCGGATGCGATTCGCAAGGTCTGGGTGCCCTGGATTGTAGTTGCCGGCTACCTGGGAGCACCAGCCCCTCTCAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCCCG:1 + chr2R 14443929 5' - accord 7026 2 71.23 TTTAACGGTTCGCCATGCACTTTAGAGCTGTGAATCGGTGAATATTTTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATCCACACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 19031343 5' + roo 45 2 53.42 GTACTATCTATTGCTTCTATATTCATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr3R 6461848 5' + 297 6636 2 59.59 ATAAAATTATAATTGTTCAACCCTTCTGTTTGTTTAGGGTACAGTTGTACCTATTTATAAACAGTAAATTCTCGAGTTTTCAAAAAGGTTGCCCGAGCTGGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCT:1 - chr2L 19160482 5' + 3S18 5787 2 71.23 AACCCCGGAGTATTCGTACCCGAGGAGGGCTGCATTATTGTGGAAGTTGATCCAGAGAATCTGGCAGAGAGCAGTGAAGAGGAATTCGCACTCGGCTCCGATGTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCGGCC:1 + chr2L 8465001 5' - gypsy4 6622 2 76.87 ATAGCTGGAAGACCCGAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - 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copia 327 1 76.03 GATGGCGGCTCTACTGCCCCAGATTTTTCCTCCGCATCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAGCAAGGCATGTCTGTTATGCGTAACGATCGAAAACTGACTGACTGATCTCTTC:1 - chr3L 20639351 5' - invader1 3902 2 73.10 GAGCTGTCGCCATTGTGACTTTTATTGCAGGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr3R 22494222 5' + 297 6612 2 63.45 CGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 25751862 5' - roo 8989 2 80.71 GCAATTTACTGATGAGTATGAGTCATTCGAAGAATCGCCAGAGAATCGATGTATCTATATGTATATATATACATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGT:1 + chr2R 7720675 5' + Bari1 45 1 60.27 ACTTGAGGCGAGTATGAAAAATTTACGGAAAATATTTAAAACCTCTGCCTAAGAAAATAATATTTGTTTAGTTATTTAAGCTTTAAGAGCGCCTTAAACCAAACACCATACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAA:1 - chr3L 3577816 5' - hopper 1300 1 74.66 TTCTATGCTGTATTTATTGCCCGGTCGCAGTGATCATCGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr3L 6355612 5' + Tirant 8144 2 60.61 ATGGTAGCCCCTATAGAAGCCCCAAGTCCCAGGTGTAACTGATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr2L 3231880 5' + roo 76 2 71.03 GAGATGGCTGCCTAAGGCCAAAATCTGTCTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 - chr3L 5069506 5' + opus 7046 4 52.94 ATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTAAAACCTACACCAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGT:1 + chr3R 9125681 5' + Doc 90 1 68.49 ATCCGGGGACAATACATTTTACTACTGCTCCTGTGATCTTCAGGCAGGCAGATGCGATCTCAACTGCTGCTGCGACAACGGCACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATAT:1 - chr2L 6129540 5' - Stalker 6819 2 68.42 GTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 + chr3L 3453616 5' + Tirant 61 2 66.67 AAACCATTTGGAATTGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTCGCATTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATCTTATTATATAACTTATATTAATTACAATATGAAGTAATTGTATT:1 - chr2R 3550651 5' - Doc2-element 4673 1 78.77 TAGCAATGGTCAAATCAGGAAATTAAAAAATTTATGTTTTCAAATTATGAAATCATATAACGTTATAGCATATAGCAGATTTTATGTTCGGTGTACATTTTTTTTTTTCTTTTTGCTTTT:1 - chrX 21283303 5' - Doc2-element 239 1 50.83 TAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGCCATTTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATA:1 - 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chr2R 14092227 5' - Bica 468 1 54.48 GAGCTGGCGGAATCAAATACTAATCAAAATTAAAAAAAAAAATAATGCCTATAGGGATGTTATGCCAACGGAAAATGATGAACTATGCATTATATGCGCTGGCGGAATCAAATACTAATCAAAATTAAAAAAAAA:1 - chr3R 13177089 5' + Doc 4691 1 62.96 ACTTCAGCTCGTCATCGCCAGACATTTTACTTGCAAAGTTTACCACTAATGGCTTACGATGCTCTTTCAAAGCGCTTACAAGATTTGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr2R 21843904 5' - pogo 2073 1 63.57 AATTGAGATAGTAGGAACGAAAATGAAATGTCTCTTCAGACACAGCAGAACTTTTTCGGTCTGTGGTAGAAGGTGACCCACATGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGA:1 + chr3R 32012513 5' + jockey 4778 1 56.85 GTATTGATTAATTCATGAGATAAACATTCAAAGGGCTGTAGGCGGTAAACTATTTAATATATCATGTTTGCATTTAAATACGTTTATATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3L 12433389 5' - roo 9039 1 61.64 GCCATCGAATCGATTGCCAACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr2L 19407011 5' + Doc 16 1 58.27 GAGAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCG:1 + chrX 22726191 5' - Helena 1249 1 51.94 ATCTCTGCGAAAAACACAATGCACAATGTGCATTGCACATGCCAAGTTTCAATACCAACAGCAAATATCACACTCTTTTGTGTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGTACTGCAAGCACATCACATAGAAGGAA:1 + chrX 19819986 5' + G2 2692 1 54.11 CTCCGACTTCAGCTCGTCATCGCCAGACATTTTACTTGCAAAGTTTACCACTAATGGCTTACGATGCTCTTTCAAAGCGCTTACAAGATTTGACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGCGTACTTTGCACAATG:1 + chr2R 21843899 5' - pogo 2081 1 68.61 GTGTGACATGGCCAACCACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chrX 16117134 5' + opus 28 4 62.33 GTTTTATTGGAGTTTTACTTTCAACTCATTTTCGTTTCCATACTTGTGTCCAATATATCCATACACACACACACACACATTATATATATAAATAATTATTAATAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTA:1 - chr3R 8376674 5' - jockey 4868 1 68.49 GGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAAT:2 + chr3L 7837155 5' + jockey 4814 1 49.32 TCTACTCTTCCCCATTTCTGCAGTTCCCCAACCTTTTGCACTTTGCTGTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 10469664 5' - roo 398 1 78.08 AGGATATCCTGATATCCACAGTGGTGCTTCGGTGGGTAGCTCACAGAGTGGCTCTTATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 + chrX 14329171 5' + jockey 4724 1 58.21 TTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGACCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 - chr3R 23601730 5' + jockey 83 1 80.83 GGGGAAAAAAAGGTCCAAATGAGAGAAAATGCGCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTT:1 - chr2L 21030978 5' + FB 79 1 77.21 AGCCACACCATCTGCACCACTTTTCCTCGGGGGAGTGATGTCCATAGCCTGTTTGTTTAGTGCACATAAATAAAGCAAACACTCGCTTAATTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGAAGAGCACGCGGAGG:1 - chr3R 26685763 5' + Rt1b 5016 1 62.96 TGTGCCTGTGGATGAGTTCCAATGTTTTAGCAGGGGGCAGATGGGCGGAAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 + chr3L 7837103 5' + jockey 4762 1 79.45 CTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr2L 9275003 5' + F-element 39 1 53.54 CCGCAGCAATCCACACGAATGGCCTTATAGTTTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 - chr2R 14973673 5' + FB 35 1 62.77 CAGGCCTATAAAGTTTTTATATTCTTAATCAGAATAACCAGCCGAGCCGAAACTAAGTATAAAAATAGATATTCAGAAACCCGAAGAATAAAGTCTACGCAAGTTCGTTCTAAAGCAATACCATGCCGACTCTAACGTCTACAAAC:1 + chrX 23067457 5' + INE-1 218 1 56.16 TCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACAAATCATC:1 + chr3L 3453598 5' + Tirant 28 2 58.77 TGACCTAGCAGTTTCGGCTGCTCTCTCTGGGGCCCTCCTCCACGTAAACATCCAAAAACATCACATGATTTTAACGTTTAAAGCTATTTTTTTCGTTATCTGCGT:1 + chr3R 2062281 5' + McClintock 6093 2 84.76 CAACGAAAAGAATGAAATCAAATTAGCAACACACTCTGCGAAATTGGCACTAATGCAAACTGTTTTTAATGCTTTTATCTCATGAAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 + chr3L 20251888 5' + copia 4905 2 60.69 GTGCCAGATTTCACTTTTCTTTTGTTTTTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGCTTTTGTTATCTAAG:1 + chr3L 486748 5' + roo 8755 2 81.94 AATAGACCTACTAGTATTACGCGGACCACGGCGGTACGTGCTTTTTACGACACCCACTGTGGCGTCAATTATAAAGATATTTAAGTACAGTTAGCATGCAATTAGACGGAGTTGACTGTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGT:2 + chr3L 7938976 5' + R1A1-element 5301 1 81.51 TATTTAAATAAAAACAACAACTTAAATTAAAAAGCAACATAGGCCCTTAGTTATATTTTCTATCAATTAATTGAATTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3R 8140832 5' + pogo 42 1 56.16 GTACCCAACTCCTGGGGCTTGCCTTTTATTCGCTCTTCTATTATTTGCCGTACTAGGCTTTCGTTTTTGGCTTCTGTATGGCAAAAGTAGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr3L 12874838 5' + jockey 31 1 69.06 GTCACACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 28450661 5' - roo 9006 2 65.52 TTGATTGTCTGCTGAAAATGTCTGAAGTTTTTCCGACCGGAAAAACAACTGGCCGGCATTCAAGACTAGCCGCGTCGAGTCAAGTCTCTGTCTATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chrX 4673739 5' + roo 25 2 67.12 GAATGCCGAATCTATCGTACAAAGGCCAGTTAATATCCAAGCCAACAGTCATTAAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 21674954 5' - roo 389 2 67.81 GACAACGATAATAATGAGAGCGGCATTGGCACAGCCACGCCACCAAAGGATACTCTCGGTCTGAATTCGTAAATGGCGCAGTCGGTAGG:1 - chr3R 14409456 5' + rover 361 1 58.43 ACAACACAACAACCAACCGGTTTACCTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chr3R 7089535 5' - P-element 2794 1 21.38 TGCTACGAAATTGGCCAAAACTCACCAAATATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTTTTCTAGCACATGCAAAGAAAAATAGTGGGATCAATACGATGAGTGATATTTTCCACAGAGCGATTGA:1 + chrX 3703807 5' + transib2 2371 1 59.59 GCAGATGGGCGGAAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTT:1 + chr3L 7837139 5' + jockey 4790 1 59.42 ATACGAGCAGACAAATTTATTCAAAGATTATAAATATTCATGCTGCTGTTGAATCAAAGCACCAATAAAATTACCATAAATGCCGTAATATGTTGATACTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - 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INE-1 498 1 71.23 GGCAGTCAATGTGTAATAAATTATTTTTTATTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chr3R 24564856 5' - opus 7461 2 56.85 TACGATGGCACACTTGGCAAGTTGTCTGGGTTTGTTAACTAGGTCGAGCTTTGAGCGTGGGAACGTGGCGATGTTGCGAGCGCTTAAGCAAGGAATGTTTAAATTAGGCGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTGG:1 + chr2R 3177345 5' - Idefix 165 2 69.86 ACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGGTCTAGAGGGGGCTCCAGGCTCTCTCGCATTT:1 + chr2L 21153496 5' + 1360 79 1 67.12 ACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGTGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 5422943 5' - roo 338 2 63.01 GTTGTGCAATAAAAATGCAAAGTGCGCCAAAGTTGCCGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr3R 7470918 5' + Doc 50 1 67.94 AAAAAAACTAATACATTTACTCAAATTTGGTATATAGAATAAGTTAACATATTTTTATTATCTAACTAGCCAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTTTACCAAATATGGACTGTT:1 - chr3R 6816795 5' + Juan 443 1 51.37 GGAGGCAATAAATTAGATGCCCAATTCAACGGCACCAAAACATCGTCATCAATACGTATGTGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACA:1 - chr3L 18381033 5' - copia 1 2 58.90 GATTAATGTGTGGTTATTGATGATGAAATTAATGTCTCACGTACAAAAGCAAAAAAAGGTTACAAATAATGGTAGGGAAATAAAAGGGATAAGATTAGAGGTAAATTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGT:1 + chr3R 26256632 5' + Bari1 1485 1 67.81 GTTGGAGGGAAAGGATATTGAGAAAATTGCATTCTGCAGCAGCAGAAAGAAGAATAAGAATTGAATGAAGCTTTTCGCATCAGCATGGGCGCTCTAATGCTTTCCAAGCCGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAA:1 - chr2L 18189851 5' - mdg1 317 2 74.66 CGCCATCCCGTTTGGGCCAAAAAACAAAGTGTAAAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATC:1 - chr2L 12291978 5' + Tirant 8132 2 69.86 GAGCTCCACTTAATGTCGGCTCAACTCAATATCAATTATTTTTTGAAATACTTTGGGTGGCAAAGGTGTACTTTTCATACCAAAACCATTTACTTGTGCTTCATACAACAGGGCTTAACAAGGCTCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr2L 11554396 5' + roo 73 2 62.33 CAAGGCTTATGTTAGGTTATAGACACCCCCAAACATAATGATAGTAATGGTAAACGCAGCATTATGAGTTTAATAGATAAATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGC:1 + chr3R 7823277 5' + flea 4795 2 57.93 ACTTTTGGTAGGCAGAAAAAAAGTCGTATAATCGCACATATATATACATGTACTTGCCCTCTCCCTCTGACCCCATATGCACCTCTCTTTCTTCGGTCGGCAAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGATAGGCCGG:1 - chr3L 10332367 5' + Bica 4919 1 72.66 GACAAGAATGCGCACCCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:2 + chrX 1103605 5' + pogo 54 1 58.22 CATCGCAGATAAAAACAAACAGATTTTCATTAATAAATCGATAGCTTGGCTTTTGACCAAATAAGGAAACAAGCTGCCCGTGTCCACCTCTCTCACTCTCTCTTGATAGTGCCTGTATTAGACGGTTGTTCGTCACGTCTC:1 - chr2R 13913921 5' - Bica 4499 1 73.05 CGGATGTGCTGCACGCGCGGCGACTAATCTACATTTATTTATGAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCTGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACA:1 - chrX 388371 5' + Tc3 240 1 57.34 CTAGTCCAAATTTTATACATTTTGTGAGTGCATCAATATCAACCAGTTCTCCTTTTTTTTTTTAATAAAATACATGTACCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGAC:1 + chr3L 9199148 5' + hopper 1046 1 60.16 GAATATGGCGTGGTTCTGGGCGGGATTTGACCAGCTTCTCCCAACATCTAACCACTTGTCACAGCGCAAAACCACGCCAAACGTAATGGCATATGGCATGCATCATATGTGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATACAG:1 + chr3R 12520688 5' + Burdock 12 2 76.03 TACACACATGCAAGCTAATATTCCGGATTGACAGCCAGTTGCAAATTGGTCAATGTCTGAGGAGGGTTCAATCAGTTTCCAGTAATATTTCACTTTCCATTCTTTGCCTACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCA:1 + chr2R 10160819 5' - transib2 2814 1 74.66 AGGTTTATTTATGTCGGTCTGCCCTCCTCACCAACCTCACCTCCTTTACAATTCAATAAAAAAATAACTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGT:1 + chr2L 15196257 5' - I-element 5044 1 54.11 ACTGCAAGACATCAGCTATAAAGCTAGCTGTTTTCAACAAAAGCTGTGTGTCTCCTGCAGCGCCTGCAACAATGATCTTACAGTCCGAGTCCGATTACATCTGGATGCGTTACACCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGAT:1 + chr3R 10594661 5' - Doc 4281 1 55.48 TAACTGATTTAATTACTGGGCTCATGGTGTTCGAATGGTTTCTCATAAATTGTTTACGAAGTTTTTACACCCGTTACTTATATAGTTAAAGGGTGTCCATACCAAATACTAAATAATGCTAAAGCAGTACCTTTTATTATTTAAAC:1 - chr2L 22748301 5' + Tc3 1457 1 63.01 GTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 + chrX 21087603 5' + mdg3 52 2 65.41 GAAGAGGAAATTTGAGCAAACAATTTATAAAATAAACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCAGAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACA:1 - chr3R 24454912 5' + F-element 243 1 71.85 GATGCTACTTTTATAGATGTTTTCAAATTTCTGTTTTCGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3R 5422871 5' + roo 8746 2 74.66 TTATTCAACTGTTCAAAGTTTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGA:1 - chrY 3648902 5' - 17.6 7359 2 65.75 AGTTGGCCTTTATTTATTTAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 18528378 5' + roo 55 2 56.85 ATTGGAGATAAAAACGAAAACAAGTCAGTGGGTGGTGTGGGAGGCTTCGAAAACAGTATGCTGATTCCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTT:1 - chr2L 21209828 5' + P-element 429 1 47.59 CTTGGCCATAAAGTCAAATCTGAACGTAAAAACAACACCGGATATCTAATCTCTATCTCTGTCCGACGGCTGTGGGAGGCATAAAAATGTCCTTGACATAAAGATGTTATCTATATTTAAATAATAATACCGTTAAGGAAATGCAA:1 + chr2L 12229808 5' - 1360 300 1 73.29 TTTTGAATAATTATTCCATAAGGTTGCTTTACAGCAGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 10469505 5' + roo 53 2 54.79 TAATCTACATGGAAACTGAACTTCATAAAGTTGGTTAGCTGAAGAATGAGGCCATTATGTAAGGGATGACCTTTCCATTCTGTGGAACTTACATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr2L 21691777 5' + 297 19 2 71.92 TGTTAACTTTAAAATTCCAATTAAAGTGGATTTAACTGAACAACAATAAAGCCGCGACGATTAAACATTGCATGTTTATTTTGACTTTTATGTTACTTTTTATTACACATTTATTTATTCTGTTAAATAAATGTAACAGGTAGAAG:1 - chr2R 12989331 5' + INE-1 24 1 69.18 ACAATAGCTAACACGCTTCTACCAAAGACATTAGAATAACAAGATGCGTAACGATTTTTTTGGCGTGGCTCTAGAAGAGGTTGCTCCAGGCTCTCTCTCTCATTTTTATTCAACAGCGAGAGAGCGGAGAGCTCTACAGCGAACA:1 + chr3R 22733060 5' + 1360 119 1 88.28 ACTTGCCTGCTGTGAAACCCTAAAAGTGAGCCAAGAAAACTTCTTTCATAGTTCTGCTTCTCACTAAATTAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chrX 7446189 5' + jockey 4694 1 42.86 ACCTGATTTGTGGATTTCCCAATTTATGAAGACTGTATTTCAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAA:1 + chr3R 28450801 5' + roo 178 2 74.66 TAGGAGCGTGGAGAGGACATGTGAACGTTGCAATTGGCGAGACGCGGACAATAAATGGCCACATGACAAAACATACGTTTCATGTACAAATGTATGTGTGTCATAATTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTT:1 - chrX 22900535 5' - Doc 4446 1 76.92 CTTATAGGTGCGTTTGCGTTTCATATTAAGGTATACTTTTAGACTGTCCTAAAGTATATGCTACATATACCATGATATGCTACATATCTATGATACATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2R 17169335 5' + hobo 25 1 65.75 CATTGAATATTTATACACAATTTATTGTACTTTATCTCCTTCCCAAAATCGAAGTCCCAAAATTAGGTTATTAAAAACGGGAACAAAGCTGATTATATTAGTTAGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 + chr3R 10150099 5' + 1360 18 1 73.29 ATATAAATCAAAAATTAATTCAAATTTTAATTCGCTATTATATATTGCTTTTCGATATTTGTGCTCTTCAAATGTTACTTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAG:1 + chr3R 8945231 5' + roo 144 2 55.17 GCCAAAAAGCGAAGAGAGCTTCCCTGGCCCGGGAAATAGGTGTGTTTTTATTGAGGGGTTGTTGAGGTTTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAA:1 + chrX 16187706 5' + Burdock 234 2 52.74 TGGCACACCATTATCACTTTTTGTATCGTTGAATTCTATAGATTATTATTGTGTTAATACTTTATGTTGTTATTTTTATTCCTTTTTTGTTTATTAATCTTTGGTATAGAATTAAAGCAAGATAGAACGCTATAGTCGAGTTCCCC:1 - chr2L 17561128 5' - INE-1 571 1 69.18 TCTGGAATCTGAAAGGGTTGTCCAATAATTGCTCGAAATTAACATGGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chrX 16994578 5' + roo 8738 2 71.23 TATTGCTCCATTTACCACATAAGGTACTAAGTACTAGGGGTTCAATTCTCCATATTGATGAATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTT:1 - chr2L 2895657 5' - Burdock 197 2 58.90 CAGGACCCCATTGAAAGAGGCTGCTAGGAGTAAGTATTGAGGCAGAAAGATGCATCTGCAAAACACGCACAACACAATGGAATCAAACGCCGCTATGGATGCCACATCCCCAGCTTCCCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTC:1 + chr2R 12999274 5' - G6 1871 1 49.66 ACCTAATATGAACATTCAATTTATTTCTGACAAATTTGGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 - chr3L 13984327 5' + diver 6 2 64.06 ACAAACAAAAATTATGTGGGACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chrX 7706723 5' - P-element 2864 1 63.78 GGGGCATGGGTGCAGTTGATTCGGAGTTATATGGGTTAAATGCTATCAGCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr2L 4929753 5' + blood 7026 2 75.17 TCTTACATTTATTATTAAGACAAGTACTAGAAATGCCGTGCACTAGGGTGCTTAAAAATGCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 - chr3R 18396332 5' - P-element 2827 1 45.21 GGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3L 21013874 5' + roo 82 2 77.62 GGTTATGATTAAGAACTATTTGCTATGGGTTTCCAATTACGCGCAGAATCTATTTTAGTCTCTTTTCTGTCACACATATATACATATTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATAT:1 + chr2L 13138944 5' + McClintock 24 2 68.28 TAAAATGCGGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAGGCGA:1 + chr2R 15075584 5' - mdg1 7387 2 63.70 TTGGTTTATTTACGCGCCTAAGAACGACCTTGGATGCTCACTGGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT:1 - chr3R 29326871 5' - accord 7027 2 74.68 CTTTGATGTCATAATGGCCACCGATGAGGAGTGACCTCTTTGGGTGGTCCTAAGCTGCCGTCTTTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr2R 9340113 5' + 412 45 2 51.11 AATTCCAGGTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATAT:1 + chr2L 21643014 5' - Tabor 438 2 52.74 AGTGGTCTTTAGATAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr2L 17626588 5' + roo 67 2 67.81 ACTGAGGGAAAATCGGTGTTCCAGTTGGAAAAGGAGACCGATAAGGAAACATTCAAGATCCGGGATGATAATCCCTGGGTGACGGTGGAAACAAACGGAGCTGTGCGAGTTAAAAAGATCACACGCCGACCACATACATATTACAT:1 - chr2L 17738135 5' + 412 210 2 80.82 TTTGAGATGCTACTTTTATAGATGTTTTCAAATTTCTGTTTTCGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3R 5422866 5' + roo 8740 2 71.03 GACTTTACTCACTTAACTCTTAGTTCTTTTCCATGGCTCCTCCACTCCACTTGCCACTTACCAGCGCCAGCTTTTCATTTTCCAAGCCCACAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2R 21439557 5' + jockey 18 1 71.65 GCCAACCATGCTTAATTTGACTGTGGCACCACCTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGTCTC:1 - chr3R 18635336 5' + opus 7148 4 62.33 AGTGGGTATGTAATACGAGGTGGGCAAATATTTGCGTCCGTTTGAGTGAGTGTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGGTGCGGTGGTGCAGAGGTAAGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGGCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACATCC:1 + chr3R 13437120 5' + hopper 26 1 56.85 ACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTCGGGCATTTGCGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGATGTGCCTACGGAC:1 + chr2L 18630464 5' + G-element 24 1 53.00 CAACTTAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 14375576 5' - roo 390 2 69.86 ATGCGATGCCGGGTCGTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:2 - chrX 19107455 5' - roo 8993 2 73.97 CTGCAGTACTTTGTTTTGTATTAATCTCAAGGCACCAACGTGTTTGCTCAGAATAGATAAACAACAACCGATTAAGCACAAGGAATTGGCAACATAAGCGGATTGTGAGAATGGAAAGAGAGTAATATTGGCAGTCACCAAAAAAG:1 + chr3L 17431280 5' + 1360 3327 1 58.22 CATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTCCTTTTCTCTAAAATCTGTATACTGAATCTCAGCCTTCTAGCTTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGATGTTCATACGGATGAACGAACATTTCCAGATTAACTCGGATATTGATCCTGATC:1 - chr2R 5296379 5' - INE-1 92 1 71.23 CGTTGTTCTGCTGCTGTGCTCGCAAAAATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - chr3R 15920303 5' + 412 44 2 52.63 ACATTTGTATATGGAGATGAGAAAAATTGTTGCGCCCGCAAATGACACATATTTGAAACTCGAATTGCAACTGAGGCATTAGACACTGGACTGCCGGGTTTGCAATTCCAGGCATTTCATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCA:1 - chr3L 16834931 5' - S-element 374 1 71.72 GTCTTCTGGGGCTCTCGCTCCTATTGCCTCCCGTGCATCGCCTCTTTGGATCCGGCGATTGTACCCGTATTGCGAGATGCAACCCTTATCAGCTGCACACGGAAAGTTCAGGGATAATTTGGTTATCGTAAATAGAGTGACTTTCA:1 + chr2L 21645548 5' + Gypsy12A_LTR 184 1 54.79 CAGTGTAAGGCGTCCGCCATTCGCATCCAAGCAGCAAACTAATCTAAACGGCGCCGAGTCTCGCATCTGAAATTGAGTTTCGCTTCCGGTTCCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTC:1 - chr3R 24456654 5' - F-element 290 1 76.47 GAGCGGGGGCGGCATGAAGTTTTCTGGGTTGCTACTGTTTACCATTACCATTATGCATTTGTTTATTCCTCTTCGTTTTCTTCGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 - chr2L 13629190 5' - Tirant 394 2 75.44 GCTCAGAGTGCTGCCGGAACTCATGGCATTTGCCGCCAAAGTGGGCATCGTGTGCAGGGCATTGCTCTGATCACCCTGTTCCACTTCTTCACCCTGACCAACGCTCTTCCACACAAAATTTTGTCTGCTTTTGTAAAAATTGTTGC:1 - chr2R 14384855 5' + Cr1a 455 1 43.84 GGCTTTTATACAGCCAGTTGTGAATCGAAAGAATCTTCATATCTCGATGAAAAGTTGGGTCACCCGACTGATAATCGATCCGATCACTAAAAGAGTTCTTTATAATAACAATTTAAGTGTGGTATGAAAAAAAAACAGATTTTAT:1 + chr3R 26135732 5' - looper1 1624 1 62.07 TGGGGGAATGAAATATTATGGAACAAAAGTTGTTGGATGAATATTATTGGTTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCAGAAAAC:1 + chr2R 21870168 5' + copia 71 2 65.75 AAACAGTGTCAATTTACGAATAAATTGAAATGAGAATATACAATAATGTGTATATGTTTATGTTTACAATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCACGACGAACGCCGGCTC:1 + chr3R 19132785 5' + F-element 227 2 52.80 CAACGATGTATAATATATAAACGTGTAAGCGCGCGCAGGGTGAAACGATGATAATCTCGAAAGCGTTAGATCGTATTTCATTGGCTGGGGTGTTTATGTTAGTGCATGTGGGCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGT:1 + chr2R 11432018 5' - Stalker2 7328 2 52.86 CTAATTTTGCTACTTTGCCTGCCAGCTGTGGAAAGAGAGGGGGCTAGCGTGGAGTGAAAGAGAGCGGGCTAGCGTTTAATTTATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCT:1 + chrX 7621196 5' - 1360 116 1 55.48 ATCATAATTTATAGCTGCGTTAAACAAGCGAGGATAACAAATTAATTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAA:1 - chr2L 20515274 5' + I-element 76 1 71.23 GCGGCGGAATTTACAAATCTCACGGCCTTGACGGATTCTTCGCTCTTGGGGCCTCTCTTCCACAATCTTCGGAAACAGAAATCGAGTCTTTTGAGTCTCTCTTCTCCAATAGCCTTAAGTTTGGTAAATAATAATAACAACGTCAG:1 + chr2L 7494643 5' + G4 3661 1 74.66 CTCCTTCCCAAAATCGAAGTCCCAAAATTAGGTTATTAAAAACGGGAACAAAGCTGATTATATTAGTTAGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3R 10150134 5' + 1360 53 1 54.11 TTCACTTTCCCTTTTATTCATTTCTTTATTTTATGTTTTTTTAATGCGCCAAATAAAACTATTTATGAAATGCCAATGAAGAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 - chr3R 15152743 5' - opus 462 2 60.96 GCTACTTCGTGTGCTGTCGGCGGGCATCGTCGCAACTTCGGTCCCACGACACGAACGGTTTCGTCTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr2L 17260820 5' - P-element 2858 1 58.33 AAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTGTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGT:1 + chr2L 5593128 5' - looper1 101 1 56.85 CTGCCAGCGCTGCTTCTTCTACTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAA:1 - chr3R 31724912 5' + P-element 101 1 17.12 TATTATTCTAGTGTCTTTGATATTACCTTGTCTTATAGTGTCGTTGACCCGATTGGCAATAAGTCTCTCCCATAATTTAGAAAGGGAGGGTAGGAGGCATATCTTGGGAACACTTAGACCCTTAATATAGCATTAAAGATTAGTG:1 + chr3R 23893864 5' - Helena 74 1 65.52 ATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chr2L 12291915 5' + Tirant 8139 2 67.78 TAAATATTTTTAGACAATAGCCTCGGAAGAATCACCACCGCAATAAAGTTAAAATTAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTGTTAATACGAATACCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAA:1 + chr3L 23846627 5' + I-element 4900 1 67.12 AAAAGGTATACGAATAGTAAGGAAACCGTATTCATTTCATATTAACTCATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTAT:1 - chrX 8977517 5' - I-element 5282 1 66.44 CAATCTTTCGTTCTCAACAATCATTCATCAAAATTGTGTGCATGTACTAGTTTTCACCGTTCATTTCATGATCGTAATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 - chr3R 12363861 5' + jockey 4686 1 76.03 CCCACTCCACCCGCACACGTTCACACATACATAGTACACCCTCTCAAAGCGACTCCATGGCGAGGCAACAAACGAACAAACAAACAAGCACGCAGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCAT:1 - chr2L 18944967 5' + jockey 128 1 67.81 TAGTGTGTGACAAAAGACGAAGAGAAAACTTGGACCGAGTGCATAGAAGGGCGAATACTTTTGAAGACTGGTTACGAAGTTGGATTATTGGATATGATATCCAAAAAATTTACGAATGATGAAAAATATATTGTTAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 12188815 5' - hopper 160 1 74.66 ATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chr2R 15070155 5' + 412 80 2 72.60 GTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTC:1 + chr2L 22719594 5' + 1360 50 1 70.27 GAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3L 19580968 5' + roo 8696 2 60.00 CAGCATGGAATCTTGAGGGGCTCTCTTTTTGTATGCCAGTTAAGTGTAATGATGAACTCCCATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTA:2 + chr3R 15920217 5' - 412 413 2 69.18 ATTGTGACTTTTATTGCAGGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr3R 22494211 5' + 297 43 2 55.48 CAGGTTATAGGATTGCAATGTCGCTCTTCATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 - chr2L 21153601 5' - 1360 3352 1 60.27 GCTGTAAAGTAGCCAAATGCGCAACACACTTAGCAAGTGTATTAACTGAAACTCATTTCGGTCTGTTTCTGCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTGAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGA:1 + chr3L 2319119 5' - roo 8937 2 58.46 ACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 - chr2R 18344628 5' + 1360 65 1 63.83 AGTAGCTAATATTCTAACAAAATAGATATATAATCTTAAAGATATAAACTTATTGTGTATAAGATACATGCCATGGAATCATACTATATATTTATATACAAACTCTAGTTTCATATTCATCAATCAAACAGTAAACATATTGAAAA:1 - chr3L 16520015 5' + 17.6 31 1 75.34 AGTGTGACCAGGGCAGTTCTCTGCTCAAGCTAAGCCTACAGTGTGACCCTGCTACACGAAAGGAGGCATTATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAACAATAATAACGTTAAGGCAA:1 - chr3L 1118182 5' - 1360 305 1 53.42 AGTAGAGTAGTGGGTAAAAGTAAAACAAAAAGGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATAAA:1 + chr3R 24603091 5' + I-element 87 1 74.65 GTTTAACTTTAATATAGCCAACATATTACATAATTTGTCAGTAAGACTCTTGACTTTCAGATACACCAGTCAGCCGGCAGGATAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTACAGACACC:1 - chr3L 5416061 5' - invader2 4683 1 56.16 ATAAACGGACAGGACCAGATTGGCTCGGCTATGGAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTAT:1 + chrX 179855 5' - I-element 5267 1 75.34 ATTACTAATCAAAAGTAAAGTTGTAAGCTGCAAATTATCGTTGGGTCGTACAAAAGCTGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTG:1 - chr2L 15776529 5' - 297 263 2 59.72 GTTTTGATTCTCAGCTTTCCCGACCCTTTCCATCCTTAACATAACGTTTTGAGTGATCATTATAAATTGGAAATCTTTTTCCACTATATCATTGATATCATTGATATATCATTGATTCAGCTTGCAATATTTTATTTATTTTT:1 + chrX 3840270 5' - P-element 145 1 76.92 CTGTGCGATGGTGTCGTTTGCCGGACGGAGGCAGCGGCAACTGATCTTCAGGTGCAACCTTCTTTTCGGGAGCCTCTGATCTATAAATAAACGAAATGAAATAAAAATCAAATTTCGAAAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACT:1 - chr3L 281342 5' + Porto1 4191 1 56.85 ATATAAGCCTATTATTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAATA:1 - chr3L 16015379 5' + 1360 1 2 77.70 AGTGGGTTAAGAATGATTGGAAATGGGAAAAGGATATGAACTGTTATAAACTAGCTAAATAATAAGAAAACCACATTTATTTAGTTACACATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr2L 6601408 5' - roo 9041 1 40.41 CCGCGTGGAAGTGCGGACAAAGTCAATTACGTGTCAACGAGATTGAACCCAGAGCAGGTGAGTGTGATCGGAAGGAAGGTGACTAGTAAAACGTAATTAAACTCATTCTTTCATTTTTGGACATTTAAAAAATTTAAAAAAATCTT:1 + chr3L 18911501 5' + HB 323 1 61.64 AAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTAT:1 - chr2L 8574451 5' + Transpac 69 2 66.44 GAATATGCGCCTGACTTGGGGCCCAATTGCATGTGACACTTTCGGCGCAACAATTCAATGTGTGGACGCCGAAAAATGAATATATGTGCTCCTTCCTTTTAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACG:1 - chr3L 20894629 5' - invader3 5399 2 64.38 GCCCAGATGACCACCAGTCTCTTCGTCGGGAACAAAGGTCACATACAAAGTCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3R 23098256 5' + roo 8713 2 60.80 AGGCTTTTTAATTCATTAACATTGATGAGATCGAAGAAAATCGTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr2L 7652139 5' + roo 9 2 72.60 GATGTGAACTTAAAAGTTTTGACGAGAGGTTGTGTAGCTCGAGTGTGGATGGCCAAAAATTGATTTTCAAATTCAGATTTTGATACAATTTGTTTACGAAGTCTGTAGCGGGAGATTGATAAATTTGTCACTAATTTCCCTGGAGT:1 + chrX 18437153 5' - Ivk 475 1 71.92 TGGCAAGAAAGTTGAATTTTTATTGAGCAAATTCACGAGTCCCCTTAAATATTTCAACACGAAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAT:1 - chrX 15559582 5' - hopper 1359 1 59.59 GTGCACGTATGGCCCACCGCGTGTACTAACTTACTGGTCACATGGTTATTTCTCTCTAAAGCTTAATCTACTAATAACAAGATACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAAAGAGGAAAACACTTGAGGCTTACGACTATAT:1 + chr3L 25255125 5' - Burdock 6164 2 64.38 ATACAAGCGTCTGTGCACCCCAAATCCCAGTCTACAGCCCGATTGCGCATTCCCCAATCCCACTCTCCAGATCTAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCAT:1 - chr4 412243 5' - BS 4981 1 54.11 TACTACATTTTCTCGGTACGAGCAACATAATCGCAAAGTAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr2L 14239098 5' + 412 21 2 71.23 GAACTTCAGCTAAAATGATTTAAGACGATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAAAA:1 + chr2L 19140374 5' - Max-element 8480 2 73.58 TCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1 + chr3L 25782376 5' + F-element 91 1 74.66 AAGACAAAAAATGCTGGAAAATTATTTTACGGCTAGTGTATGCGTTGTGAAATTATTATGAGCTAAGGGTTCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr2R 21748349 5' - 1360 3343 1 52.82 ATCATGTCTACTTTATCTTGATAATTGCCTTTTTTTTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 + chr2R 13046508 5' + 412 86 2 75.34 CGGTTGAGGTGTAAAAAAGTCGAGCAGTTTGTTTGAGGGTCGGTGAATTACCTTAGAATTATTTGGTACACATAGTCTCTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTA:1 + chrX 20685855 5' + Ivk 5255 1 60.27 ATCTCTGGGAATTCAAAAGATAGCTATCATAATTAAATCGGCAAAGGACAGGGTTTAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 + chr2L 11296155 5' + 1360 66 1 60.96 CGAGAAGAGCTTCCCAATGGGTTTTCTGTTTTCAGTTTACAGTGCGAAAATGGGAGAAAAAGTGAGCTGGCGGTTGGAAAAACTTTTGTCATTATGCAGGCAGTGCTTTCTCTAAATTTCCCGATTCTTTGACGTCTTGTTTTTGA:1 + chr3L 2549304 5' - diver 491 1 82.88 CTGAACGGAAATAGTGCATTTTTAGTTATGAAACTATAGGTGTATACGGTGATTAACTATTAAGTTTTAGTAAAATATATATTCAATTCATATTTGTTATTACACAAATAATTATACCCGTGTTACTTTTTATTATGATTCACATT:1 - chrX 13631242 5' - mdg1 67 2 57.53 ACAATGTGTGCTCAAGGATTTGTATTGTTGATATTGACGATTCGTATTTATGATATATTTGTTAATGGTATATTCGACTCGAATAGTAAATCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTAC:1 - chr2R 19583245 5' + Tirant 436 1 62.33 CGTGGGGCAGGAAATGCCATAAAAACAAAGTCCTGGCCATAAAACATAAGAGATGGTCAGAGCAAAGTGCAGCCCCAAAAAATCGCATATGTGGTATATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr3R 15152575 5' + opus 20 2 70.55 GAATCCTATCATGTAAAATTGTTCACGAAGAACAGAACTTACAATTAAACTAATTATCAATGTAATTAATACATATTAAACGAGAGAGAACTAATAACAAATCGAAGAGCAAATATACTGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCG:1 + chr2R 17465024 5' - diver 370 2 78.62 GTCAGCTTTGACTACATTTAGAAACTGTAATTGTTTTAAAAAATGTGACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAGTCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCA:2 + chr3R 14911980 5' - Stalker 7160 4 80.82 CAATTTAGTATTACCTTTGACCAATACAATCACTTCACCACTGAAATTAGAACAGAATTAGAACAGTTCGATCACTTTTCTATAAGGCCAAAACATATGCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 + chr2R 5438172 5' - flea 4990 2 69.86 GTCAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 + chr2L 15081057 5' + Doc 56 1 57.93 CATACGAAATTAGGGAAATACCTATACAAAATTAGTTAATTAAATATAAGAGGCGTTGCAACATGGATCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGCATGCTAAATCTCCGCCTTCCAGCTTTTATAGTTCCTGAGA:1 - chrX 23095625 5' - INE-1 152 1 65.07 ATGCTGAAGTTGAAAGGAATGAAAATGATATGATTGCTTTTCAAACAAAACAGTGATTATAGGCATTTTGAAGTTCAATTCTTATAACGATTTTATGGAATTACTTGTCTACGAAATAATATAATAATAATATTAATGTTAATTAT:1 + chrX 7374032 5' + mdg1 45 2 67.81 GAACGCGCCTAAGCTCGCTATAGAAACCACATCAGGAGAAAAGAATATGAATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGT:1 + chr2R 21657062 5' + invader4 2814 2 65.89 GTTTCTGGCCGGGAAAAACAATTGGCAGTGAAATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACA:1 + chr2R 11095704 5' + diver 5914 2 66.44 ATTTAAGCTACATGATTCGTTTCGAAAATATTTCACAGTATATGGATGTTTTGAATACTTAGTAAAAATATTTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAATAACGCGTATCTGATAGTCGGGTAACTGGACTAAAGCATTCTCTCTT:1 - chr2L 8738067 5' + INE-1 577 1 54.79 AAAAAAAAAACCGTTGACCATAAACTAGTTTTTGGCTCTTTGTCCGAACATATAAAGCTTATATATTCTTAATAAGGATTAATAGCCTAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAACGTCGAGATCTCAGCAACTATAAA:1 - chr3L 13261288 5' + INE-1 146 1 73.97 CCACATATGTAAGTTTGCACGCTGAACAAAACCATGATACGCAGCTTGGAAAGTTTCCGGGATTTTGTTAGAAATAATCCACGTCGAATCCTTTGTCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCG:1 + chr4 142725 5' + invader2 4942 2 78.05 CGAGAATACGATTTGGAGCCAAAGTTTTCACAGTACCGTTTCTAATACTAGAGAAGGTTACGGGGGAATCCTGTTGGGAATAGATTTTTTCTATTTATTTTGGTTCCAAAAGGAATCGTTCGGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTT:1 + chr2R 5204808 5' - G5 4784 1 58.22 GGGTACGCCGGGTGTGACATGGCCAACCACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTC:1 + chrX 16117123 5' + opus 17 2 69.86 CTGCGGCACTATAAAAATTAAATGCTTTCTGCTGCCTACTTTCCGGGGCTGTCGAGCTTTTATTTCATTGCAGTTGGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chr3L 15723969 5' + jockey 4716 1 52.05 GATGTCCTTTGCTCGAGTTCCATTCTATGCGCTTCTAGTGGCCAGCTAAATTTAATGGACCGTTCCATTTTCTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 + chr2R 17332130 5' - jockey 4954 1 45.99 ACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - chr2L 12486396 5' + roo 8754 2 82.19 ACATACACACACACAGAGACACAATCGCGCACACGCGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGGCGTGTTCACAG:1 + chr2L 11596321 5' + jockey 27 1 52.38 GTTTCCACTCGAATGTTGCAGCGTCTACGGCGATTGTTGTTTCGTCTGCTGGCAGTTGGTCAATAATTGGCATAGATTTATTTTGGCTTGTTCACACACGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 4523904 5' + roo 21 2 67.69 AGGAGGCGGATAAATCGCCGAGCGAGTGCAGCAAATCGATCAGCTGTGACGTCGACGGGGGCAGAAAGTTTGGCCAAAAGAAAAGGTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr3L 20497703 5' - P-element 2854 1 63.01 AGATATCAGGTGCATTGTTTTTGATCATAAAATATACCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAA:1 + chr3L 14954380 5' + transib2 2551 1 72.22 AACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCA:2 - chr2R 1000395 5' + HMS-Beagle2 6956 2 68.49 AACTAGAAATGTAATTTTAATCTTTTCACTTTTGATGACTTCATTAATATTTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCT:3 - chr2L 9418586 5' + rover 7020 2 65.75 CAGTCAGCTTTATTGCGCACTTATCTTTAATCAGCATTAATCGATTACTTAGCTTCTTCTGTTTAACTGAGTTTGCGTGAAGATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACA:1 - chr2L 15340848 5' + 1731 312 1 52.45 GAAATTAGGCCTTAAAGCTTTAGCCCCCTTAAAAAGCCACATTTAAGCCAAGAACTTCTCCCCGTACGCTCATATTTTACACAAGATATGGGCGTGTCGTTTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGAT:1 - chr3R 14912081 5' + Stalker4 6979 4 69.86 TTTATAAATTTGATCTTACTTTGACCACTGTTAATCCATGCTAAGGTAATCGTGGAATCACTCCAACTACTGGCTTTCAGCTTCAAATGCGTTTTCTTAGCTCCAATGTGCTTACGCCAAGCAAATCTTCTGTCTAGATGAGCTCC:1 - chr3R 19446383 5' - Doc4-element 2437 1 54.79 GGGCCACCAATGCACCGTGGGCCGAAAAAGTATTATTTATTATTTCATAAAAAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCT:1 + chr2L 8574363 5' - Transpac 243 2 67.12 AATTGATTTTTCTTCGTTTTTTTTACGAGTTTTCCAACGCTGTTGCATTGTTTGTACGCCGCTGACTTTTCTCCCCGGCTTTCTTGTATTTTTACGTTTTTTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGT:1 + chr3R 22326899 5' - hopper2 1270 2 69.18 AAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 21674901 5' - roo 335 2 68.49 GCGGAAGAAGGTAAGAAAAGCTTACTCGAATTTCAAATACTATGGGAATATTACATATATATAGTAATTTTTAATTTTGAAAAAATGTCTGCCCAGGAAGTCTATGTGTCTAGAATCGTTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTT:1 - chr2L 21711969 5' - INE-1 166 1 70.55 CACTGAGTGCGAGGGCAAGCAAAAAGTCGTGGTTAATGCTATGTATATGTGTAATCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCT:1 - chrX 1329581 5' + 1360 266 1 62.33 CAGGGTGGAGAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTGTGT:1 + chrX 22726184 5' - Helena 1239 1 51.37 AAACGCCAATCTTAAAATATCTTAAGATATTTGGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATTGGCACACGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAG:1 + chr3R 3282476 5' + 1360 96 1 72.39 ACACGCAAATGTACCCGAATTGGTGTTGGTTAAAACACAGTGCTCGCTAAATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTA:1 + chr3R 25049994 5' - P-element 2821 1 40.41 CTTTCCCCATGGGGGTAGAATCTGTGTGTTTCCCCGCTGTGTCAGCATATAATTTGGCCCGTCGCAAGACAAAAGAATGCCATAACACATGAGTTGCCATCGCAGACGCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTT:1 - chr2L 3247550 5' + BS 35 1 76.39 ATCTTTTTAAACCAAATCTGATTTGTTACAATCTGATTTCTGTGCTGACTATCTGTATCTTTCCATATGAATTTAAATGTAATAAAAATGCAAAATAGCTATATTTAATTAGTTCGCATTGATCTGTTGTTCGATGAATATCAAA:1 + chr3L 12062326 5' + Tc1-2 249 1 71.03 AAATAAATATTGATTCCACGAGGCGAGGTTTCATATGTTAGATCAGCTTTTTGTTCAAGCAAAATTGGCGCGAAGCTTTTACTCAACTTTGTGATTCTGTTAAAAATACACCACGTGTCCAAATATTTACAAATAAAATGGAACAT:1 - chr3R 20565309 5' + transib3 258 1 74.66 GGCAATTAAACCAGCTCCAATTGCTATTGCCACTTCCATTTCCACTTTCGATCCCATGTGGCTGCCTTGGCAATGAATAATTCAAATGGAATGCCAGCTTCAGCTTCAGATATATAAGTTAACGCAAGTTGCCCTTGCATCAG:1 + chrX 8219317 5' - opus 492 2 80.42 CTTGCACCTTTTGCTAATTCTGTTATCCTGGTAGGATTTTCGTTAAGGGGTTAAATTGTCTTTAATTTCATACACGCTCGAAATTTGACACCTTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTTTCAGTGCGTTCGGG:1 + chr2R 13568658 5' - Doc3-element 422 1 57.55 AATTTCTCCCGCAGGCGCAACAAAAAAGCGCCATTCCCAAAAACCCATCATAGTCAACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTCAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 - chr3R 20934769 5' - 412 7488 2 57.55 AAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr3R 9125657 5' + Doc 59 1 53.96 GTCGCTCTTCCGTGTTGATGTCCTTGTTAATGGGCGAAGGAATATGGAGCCTGGCTTTTTGGAAGATTGCATGTACATACATACATTTAAACGTTTGTGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCT:1 + chr3L 20048407 5' - invader3 5315 2 77.17 CCGCACATTTTTGATGTTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTG:1 - chr3R 13349606 5' + Ivk 41 1 56.16 ATTCGGGTTTAGTCCAATGCAAACGGATATCCCGGTTGATAAATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGA:1 + chr2R 23106574 5' + jockey 4531 1 64.80 AGCATTTTCGAGCTGCATCATCGGTAGTTGCGAAGGGGATGGCCTTCGATGTCAGCACATAATAGTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGT:1 - chr3R 5773243 5' - Stalker 7207 4 53.62 CAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATC:1 - chr3L 7801302 5' + Transpac 171 2 59.59 GTTATTGATGGATATGGAATTATTAGGGATTGCATCTAAAGAATCTAACTTTACAAAAGTAGCGATAAAATGGCTATAAAAGGATGGATTAGTCAAGAATCTGAGCTGTTTTCATCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTT:1 + chr2R 11902994 5' - blood 7287 2 76.71 GTTCAAGGACGTAAAATGCGGTCTGTCTATTAATAAGCCTAGATACGCTGTGAAGGGGTAAAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 + chr2R 15075573 5' - mdg1 360 2 58.22 TTTAAAGTCAAAAATTCCACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAG:1 + chr2R 12869195 5' + invader1 3648 2 91.20 GATTAATTCATGAGATAAACATTCAAAGGGCTGTAGGCGGTAAACTATTTAATATATCATGTTTGCATTTAAATACGTTTATATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr3L 12433394 5' - roo 9034 1 58.22 GGCTCGAGGCCCCTGGGCAACTCGCACTTGGCTGGGTTACTTGGCCCGAAAGCCCATAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTC:1 + chr3L 11393837 5' + I-element 4929 1 61.38 GCTACTACCATAGTATATGAGTTTGTAGTCGAACAACAACTAGCTTGGGTCGTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGTAGCCACTTTTTTGGT:1 - chr3L 24710033 5' - 1360 3339 1 57.14 ATTTTTTTTTATAGAATTTATTTTAAGATTTAAAAATTTAATACACTTGTACTTTAACATTTCATCGACGCACCTGGCATTCAAAACATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACAT:1 + chr2L 21591319 5' + HMS-Beagle2 6812 1 56.85 CACTAAAAATTGGACGATTGCAGGTCTGGACACATCAACGCCAAAGACAAGGTCAGGGCGCTGACTTTCCGATGGCATATCTACTCTATATATATATGTA:1 + chr3L 1484853 5' - gypsy11 3988 2 68.00 ATAAATTTATTCCAAACAAAAAAAAACCGTTTATATCCATAGCATTAAATAATAAAAAATGTGTCAGAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACGATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2R 5106925 5' + roo 8716 2 56.85 ATAATCGCCGGAGCAACTGCCAATTACAAAATATTTTCAATTATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 + chr2L 9274938 5' + F-element 21 1 78.77 ACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTT:1 + chr3R 24750955 5' + G6 45 1 52.71 ACAAGGATAAAACTACACGTACGAGCACTAAATGTGCCCCACATATTATAGATACGATGCTAGGGACACATGTCCTAAAAACGCAATATGCAAAACTTTTTGGGTCGCATTATGGGCGTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACA:1 - chr2R 14135420 5' + copia 4874 2 80.14 TTTGTCCCATTACTAATCAACAAAATATTTCCATTTGCTATGTGCTCACCAAGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2R 11256252 5' - roo 9010 2 62.41 GACCGGAAAAACAACTGGCCGGCATTCAAGACTAGCCGCGTCGAGTCAAGTCTCTGTCTATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chrX 4673705 5' + roo 58 2 59.31 GAAGACAATGCTTCTTGACCACGAGCGCGGCCAATATGCTCTAGACTATTTCAAGCTGCACAGAACCCTCAAAAATTATTCTTATGCATTATTCTTATCAATGCATTCATCGGATCTTTTACTTTCAAGCCTAAATATAAGGAAAA:1 - chr3L 23689084 5' + transib3 2419 1 54.11 CAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTACATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAAT:1 + chr2L 12291867 5' - Tirant 315 2 77.86 CTCCGGACTGATTGGGATCTTAAACCAAAACAAATCTCTTTGAATGGCCAGCAATTCTAAAGGCGATGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chrX 6632938 5' + P-element 45 1 51.11 AATTGTATCTTTCTGGCTTTGCGTTTTTCTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTT:1 - chr2R 8177785 5' + FB 78 1 80.77 GCAACTTGACTTTCCCTCTTTCCCCTTTAGGTTAACCTCTCTATTCCCCGACAACTGAGATATTCGTGTTCTTAGCAGCATTAGCATCTCAAACAAGGTGTAAAACCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTCAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2L 1776220 5' - roo 9045 1 67.12 GTAAAAATTGAAATAAGTTATATAAGCAGAAGTTTTAAAACCGCCCTCGCCTCATTATAAATGTGTGCTTTTGAGCGAACGAGCGAGTGTGTCTCGCGCTACTACCATTTAATCAGTGCTTTGG:1 - chrX 3731028 5' + Chimpo 447 1 74.19 GCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr3R 22494189 5' + 297 21 2 57.84 CCTTTCAAATGCAGAAGTTCAATGCACGCATATTTTTCGACAATTTTGTGTAATGTAAAAAGTAAAAAAAAATATATATTCATACATATATCATAAATATGTATGCTTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 + chrX 7384857 5' + I-element 14 1 73.29 CTGTGATATGAGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCC:1 - chrX 21994012 5' + McClintock 5987 2 57.55 GGGTTGGCTCAGAATTAGGCCGGCTTATTCGCACGCGCTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATTGCG:1 - chrX 11001568 5' - hobo 320 1 73.29 AAACTAAATTTGCATTGATTTCGGCAAAGATAGGGTGTTCTTTTTTCGTAGATAGACTATATTATTCTTAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGCAGCATACGAT:1 + chr2L 5890466 5' + invader3 5231 2 50.00 AACGAAGTAGTAATGCATTTTAATTAGATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3L 9470039 5' + 412 49 2 52.05 TATTTACTCACGATCGATTCTTCGTGGTCATGCGGTTGTCCCGTCAGCTTAATGCCCGTTGCCTCGGCGGACGTGGATGCTGATCCCGCTGCCGTGAGGTCGAGCTGGGAATAATTTAACATCGTCTGCGGACATAAGTACACGCA:1 + chr3R 10002487 5' - Q-element 563 2 75.34 GCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3R 5422931 5' - roo 326 2 72.60 GCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTA:1 + chr3R 7470966 5' + Doc 113 1 69.86 GTATTTTGAATATTTCACATATCATAGCCTACTTTTTGGCTGTTACGATCAAGCAAATTCAATACAAAGGCATTTTTACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1 - chr2L 5270387 5' - jockey 4946 1 54.79 AGCCGATGGCACTCAGCCTGGATTTCTTCTCCAGCCTTCTGCGCACCTGGACTTTGGGTCTGATCTTAGCCGGTCTGGCTTTTGCTGCCGAAATGAAGTGGCAAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGA:1 - chr2R 19511839 5' - transib2 404 1 69.18 CGAGCAGACAAATTTATTCAAAGATTATAAATATTCATGCTGCTGTTGAATCAAAGCACCAATAAAATTACCATAAATGCCGTAATATGTTGATACTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr3R 10150277 5' - 1360 3376 1 74.63 ACGGCCTCTAATCCCGTCATTTAATTTAAATTCTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGCGGCTTACAGCTATATTTACTTACAATGTTAT:1 + chr3L 5630386 5' - I-element 5270 1 76.03 GGTGTGGCACCGCACCTTATATTTAATTAACTAATTTTGTATAGGGATTCCTCTAATTTCGTATGTTTTTCCTAGTCAAATAATAACCACAAAAATAATAAAAAAAAAAATTATAAAAATAGGTTTTGGCCAAAAA:1 - chrX 15567879 5' + Transib-N1_DM 470 1 70.59 TAATGACTGGAGCTGATTCGGTAGAAGAAGACTTACTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCGTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAGAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTA:1 + chr3R 19445624 5' - roo 8957 2 71.85 GCAATGATTGCGGTGTCGTGGATTGGATTGCGATTGGGTATGCAGTTTAATATGCCTGAAAGTACATATATCCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTCATTTTATTTGGA:1 + chr3R 11513436 5' - roo 9029 1 54.93 AGGACCACCTTGGGACTTACCTTGTGCATGGTGTATTCTTCTAAACCCCAGTCACTCGAGATGTATGTCATTACTTTAGACTGCTGGGACTTGATCAGAACGTAAAACAAGAGAAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGAT:1 + chr2L 22318157 5' - INE-1 560 1 65.75 TGTTTCTATTGGAGAGTATCGTCTCTTCGGCACTGTGTCTCCTCTCATTGTCAGTGCAGTGTGTATTTATGTATGTGTGCCGATATGCGTACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr3R 1267648 5' + P-element 30 1 67.81 GTAATTTATTTTGTGTTCTGAAATTATTGAATACTTATAAATAATGGTTTTATTGTTGGCTGTACGTTAGAAATAGTGCAGGTAACACTTGCATTGGTGTTGCTGCTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGG:1 + chr2L 3962910 5' - jockey 492 1 63.01 CAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGTGTACATTCCA:1 - chr3R 25804191 5' - mdg1 7375 2 73.29 AAGGGCAAAAGTTTAGATACTTTGGGGATGATTAAACAAAGGCAGGCAGGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGATACATACATCAT:1 - chr2L 9271656 5' - accord2 108 1 55.65 GAAATAGTTTAACCGTAAAAAAAGAAAATTATATATCATACATTTGTGGACAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2L 15081009 5' + Doc 8 1 79.31 AATCCATTTTTATGTATATTTATGAATTATTTATGTTTATATTGAGCGATTTGATCAATTTTTTATACAGAAGTTTTAGTGGTAAATCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGA:1 - chr3L 10082409 5' - jockey 366 1 40.69 CAACCACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chrX 16117146 5' + opus 19 2 63.20 GGAGTAATGCCAACCCTTTAGATTCCCACCTATCTAAGGATTCATCATTTGTAGAGACGGATAACTGATACCCCTTCTTTTAATCTTCTCTTAGGAATCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAA:1 - chr2R 7566423 5' - 1360 56 1 70.29 TTATATAACGAAATATAAGAATAAGGAACGAAATATTTGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAA:1 + chr2R 5503690 5' - pogo 2021 1 71.92 ACATTTAAGTAAAGGCGTTGGCGAAGCAAGGGTTTCTCGTAACAATAATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 14375733 5' + roo 46 2 54.79 GAGCATCTTCATCTCCTTTTCCCGGACTTTGTCAATTTGTCTGTCTTCCCCTTTCGTTTGTATTTACTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGGG:1 - chr3L 466528 5' + invader4 136 2 59.63 ACGACAGAGTACCAAGAGAAGAATAATAGAGCGCGTTCTCTCGTTCCACGATCCTCTTAATTTCATCACTCTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGACGCAGGTAACTT:1 + chr2R 1373083 5' - pogo 2063 1 58.39 CATGTGCTAAAATTTCCCAGCGAAGCGTATGAAAATGTCGTGAAGGGCGAAAGTGGAACCTATTTGGATTTCGAATATTTATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr2R 11263961 5' + jockey 4711 1 56.16 AAATGTTTAGTCGATTTCGTGTATTAATTATGTTCACTAATCGTAGAAACATATGTGTGAAAAATGTATTGATACTCCTTCATTAACCTATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 + chr3L 18381915 5' - copia 223 1 52.05 GGACCACCTTGGGACTTACCTTGTGCATGGTGTATTCTTCTAAACCCCAGTCACTCGAGATGTATGTCATTACTTTAGACTGCTGGGACTTGATCAGAACGTAAAACAAGAGAAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATA:1 + chr2L 22318158 5' - INE-1 559 1 66.44 TTTGCAAACCACAAATTCAGAAAGGAAACTATAAACGAATTTGTTTATGATGGTAAAAATTTAATCTAAAATACATTCATTCACACTAGTTCTGGTCGGTTTTAGGACTTTAGAGTAGGCGGACAGACGGACATGGCCAGATCGAC:1 - chr2R 19153448 5' - INE-1 111 1 56.16 TACTACATTTTCTCGGTACGAGCAACATAATCGCAAAGTAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTATGAACAATTAAATAAAA:1 + chr2L 14239098 5' + 412 7074 2 71.23 AATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGATGCATTGCATAAATAAATGTC:1 + chr3L 18253790 5' + blood 59 2 58.99 GGGAAAAACAATTGGCAGTGAAATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAAC:1 + chr2R 11095714 5' + diver 36 2 59.59 ACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1 + chr3L 18253802 5' + blood 7089 2 70.55 ATGAACAAGTTACAATTTGGGCGAGAGCTGGCCCAACCCTCACCCATGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 + chr3R 28406308 5' - opus 492 2 77.04 GTTAAAGTAGTAGCATGTGCATTTGCCAAATCCCATGCCCTACCCATAAGCTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAA:1 + chr3L 15364816 5' - 1360 3328 1 66.19 ATTGTATTATGTATAAAAGATCATTTTGTCGGATACACTGATGATGAAATCTTATGTTCGTGAAGGTGATCCACCTTCCTTGGTTAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGC:1 + chr3L 23650298 5' + 1360 133 1 73.10 ACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACCTGAGA:1 + chr3L 19031238 5' - roo 8998 2 63.70 GTTCGTCGAAAATCGGATGAGGTACACACATTTAACTTACTTAAGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAA:1 - chrX 14137284 5' + 3S18 78 2 68.97 AAAACGAGACCAAATGCCGCACATTAAAAGCGATTTAAAAATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACA:1 + chr3R 7616691 5' - Stalker2 380 2 68.57 CTGTGACGAGGCTGGAAAAAGTTTTCCAGTGCGAAATGAACCCTTTGACAGCATTGTGTTTACATTTTTGTCTTTTTTGAGTGCGATATAAGGTTCTTAAGTTTTCCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTA:1 + chr2L 3224580 5' + FB 307 1 57.53 ACCAAAATATGAATAATCTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTCAAATTAGACATTTTTTTTTTAAATAATCTATTCTAGATATTTATTTTGGATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTAT:1 - 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chr3R 11944905 5' - roo 345 2 68.00 ATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACA:1 + chr2L 13629085 5' + Tirant 8191 2 75.34 TATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGC:2 + chr2L 18630479 5' + G-element 72 1 71.43 GCTGGCTCTTTAGCTTTTTTAGCCATTTGGGGTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3L 21013834 5' + roo 14 2 69.57 ATTGGCAACTAAAACCGACACGGACGACAAAATAGACAAACAGGCACGCACACACACACACACACACACACACACACATCA:1 + chrX 6496434 5' + Quasimodo 39 2 82.72 ATAAAAAAATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3L 18253763 5' + blood 7048 2 59.72 ACGGTGGTGCAGGTGGTAAAAAGGCAGTATTAAACTAGATTCCCGTGTTTTAATAATAAAAAGGTTTTAATAGTGAATTCAATTTAAAACTCATTTTGTCATTTTATCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCG:1 + chr2L 14063816 5' + Cr1a 4353 1 75.35 AGGAGAGCAACGTAGGGAGTATCGGAGCGGGGGCTCCAAGGTGACGGTGCAGGAAGCCGCTTCGAAAATTTAATAATTATAGTAATAATTTAATAGTTTAGTTCCAACTTTGTCATCGGTATTTCTCTCAAGTTTGAGTTTAGGTG:1 + chr3L 18081942 5' - Porto1 4474 1 53.42 AAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAAT:1 - chr3L 23583099 5' - looper1 95 1 54.11 GTTTCTTCGGAATAGAAATCTAAAAAAAAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGA:1 - chr2L 21643167 5' + Tabor 6861 2 69.66 CGTCAGAAAATGTATAAGATATGTAAGGAACAAAGTGTCGAATTAGTCATGCACACGAGTTTTCGTCTTTACATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr4 916280 5' + roo 8712 2 52.74 CGCACTGAAGGTCACTAATTGATTAATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chr3R 14986142 5' + jockey 4744 1 80.83 TTGGACTGTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chrX 21087530 5' + mdg3 5267 2 71.63 CAGCGAAGTAAATGGCGCTAGGCAAATAAACTGGAACTGGGATTGAATTGTCACAGCTGCAATTTTTCAAATGTCAAATCTTTCTTATGAACAGCCTAAAAATTGCTCAAGAATGTAAATAAAAAAGGATAACATGAAAAACTAAC:1 - 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Tirant 382 2 63.81 GTTTACACTAAGCAATGGGCACTTAAACAGACTTTAAGCGCTTTTATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCG:1 - chr3R 21395275 5' + G2 431 1 71.23 AACAGTTTTGTAAAAATGTGGGCGTGGTACGTCACTTTCACTTCACAATTTCCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAACCTCTAAATTGTCGGCTATC:1 + chr4 857188 5' + Q-element 117 2 72.60 GATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 + chr3L 3453624 5' + Tirant 10 2 58.57 GTATTTCCATTGTCTGCTTTTTATTTCAGCTTAATGCTTTCTGGCATATCCTTCCTGCACTTGCAGAACTTACAGAAAAGTCAGGCCAAAGTGTTAAATTTTTTTATTATTTATTGAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAA:1 - chrX 5447648 5' - Doc 4656 1 63.70 ACCAGAATCATGCGAATACATTTGTGTAGCACACTTTCGGGCTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTG:1 - chr3L 22339481 5' - hopper 1349 1 66.43 GAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCTTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGATCTCTCGAACTTTTG:1 + chr2L 22719605 5' + 1360 82 1 78.79 TGCACAGTGGAAGAGGAAATTTGAGCAAACAATTTATAAAATAAACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAAC:1 - 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chr3L 3308818 5' - R1A1-element 5275 1 69.42 ACTATATACTTAGCCAAACTAATTCAAAGCAGTGATATATACCTTTTAAATTCCTAGTTAATTGTTCTAATTGGTTTCGAGATCAGAATCTACAAATAAAATCATCGGCTTATCCGTTACCAAGTGTCAACGACCAGTTCAAAGTG:1 - chr3L 18210890 5' + HMS-Beagle2 6988 2 70.55 ACCTTGGTGGCGTTATATTAATTGGTGCCGGCGATAAGCGAACCGTGATTAGAGATTGCCATTATCTGGCCACTTTTGTTGCCATTGTTTTTTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGCGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCA:1 + chr2R 16135202 5' - 1360 161 1 61.64 CTATTTGGCATATCCCTTTTTAGTTTTTACTGCGCTTGGTAACGCCTAATGGTGTGCATTACCATACAAAAATTGTATGAACTAAAAAAGAGTGTTTCTCTTCTCATCAATATATTATTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATT:1 + chr2R 1264210 5' - hopper 1087 1 73.97 AATACTCTTATCTATATTTGTATGTTACGAGGAAGTTCGATAGAATGTAAATTCCACCAAATGCGGATGTCTGGATATTTCGACGTTTATACGGACAGACGGACACAGCCAGGTCGACTCGGCTATTGATCCTGGTCAAGAATATA:1 + chr2R 9323234 5' - INE-1 83 1 50.68 GAATTGGTGTTGGTTAAAACACAGTGCTCGCTAAATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATT:1 + chr3R 25050010 5' - P-element 2805 1 29.45 GGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3R 5422946 5' - roo 9005 2 62.33 ACTCCGGTGTTCCCAACTCGGAGCTTAATTCCGATAGCAATTGATTTACCATCTCTGGGAATTCAAAAGATAGCTATCATAATTAAATCGGCAAAGGACAGGGTTTAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:2 + chr2L 11296105 5' + 1360 16 1 73.29 GCCTAATCATCTTTGACAAAGAGTATGCCTGGTTTACCTTTTTATCCGTAAGCACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:2 + chr3L 19031185 5' - roo 9051 2 70.55 CTCTTGTTTCATATCATATCGCATCATATTCTTATCTACAGCTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGATTTTAAGTTTTAATGTGTAATCTTTTTTTATAATATCATTTGGTATTTATTTTCAAACAATTCAACAAATGATTCACTTTT:1 + chr2L 21149227 5' - HB 1504 1 56.85 ATGTGTGTCATTTTCACCAACCCCCTTCCGCACTCTCCTTCTCATTCTCACACAGTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCAC:1 - chr2R 17356171 5' + blood 7181 2 69.66 GACAGAAGGAAATAAAAAGTTTAAAATTGAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chrX 388188 5' + 1360 15 1 76.03 ATTTGAATATATAAAGCCCGGCCTTTAAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 + chr3R 7778232 5' - transib2 2782 1 56.55 CACAATTTGAATATATAAAGCCCGGCCTTTAAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1 + chr3R 7778228 5' - transib2 2785 1 58.90 AGATAAACTTCACTGATGACTCAGTTTCCGAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr2L 21153440 5' + 1360 23 1 67.12 GCCGAGTGGCGTAATTCCCGGTGTTGTGTCTCCCGTTTTGTTAATAGCGCTGGGTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1 + chr2R 19852145 5' + Transpac 61 2 61.54 AATTGTTGTTGAGCAATGCATTAAGTGCACAAATGAGTCTCTCTTATTTGTTCTGTCGTGGGCTATTGAGCCAAAAAGGATAGAAGAAATCTTTGAAATAATTAAATTACTGCCGAAACATAAAGCTCCAGGAATTGACAGGATTT:1 - chr4 905656 5' + Helena 4 1 73.29 CCTTTATCAAATTATCACCAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3R 14278002 5' - P-element 2856 1 62.86 ATGCTCCGTTTATTCCACCTCGCCCTGGTTGCAGCATATTAATGTTGCCATGAGCATGGCCAGGAGTTAGAATACAGTGGGCTTTCACTTCAAAACATTATCAACAATTATTCAGAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAAT:1 - chr4 576196 5' + FB 7 1 47.26 ATGTCGCGTTTTTGTCACTTGCAACTGCAACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCC:1 - chr2R 10365952 5' + I-element 5280 1 80.14 GGTTTATGCCGAGGGATTTCAAGAACAAGTTCAAGAATTTATGTTATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 - chr3L 12223236 5' - Transpac 251 2 58.22 GTTAGCGTTTTTTTCCCAACAATCTGGTCATTTTATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 - chr3R 26486098 5' - 412 7468 2 74.29 ATACTAGCATAAGAAAACTGCAACGAAAAAAGTTTATCTTAATTTGAGATGCTACTTTTATAGATGTTTTCAAATTTCTGTTTTCGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGT:1 + chr3R 5422824 5' + roo 8695 2 63.38 ATCATTTTTCTTACATTTCTTATTTCAGCCTTTGTCGCAAAATTATTACTCGTAGAGACCCTATACTGTAGATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 + chr3R 20872085 5' - 297 6949 2 66.41 CCATTCATCATCGAAAGAGATGAGCGGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATGATTTTTCCATTTTTTTGTGTGATTA:1 + chrX 1103620 5' + pogo 61 1 62.32 GTTTAGAGAAAAATAAATGAGTTAATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chrX 8977473 5' + I-element 40 1 71.91 GAAGTTCGATTATGAGGTCTTCAGCAAGCTGACCATGTACGAGAAGGAGTACAAGGATATCCTTTACAAAGACTACAGTGAGTTCACCGGCAATATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAA:1 + chr3L 67110 5' + Doc 196 1 66.20 GTGCATAAAATTTGGGGACATTTAAGTAAAGGCGTTGGCGAAGCAAGGGTTTCTCGTAACAATAATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:2 - chr3L 14375750 5' + roo 8693 2 66.44 ACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 28450721 5' + roo 8714 2 82.00 TAATAGATGAAAGTAAAAATTATATCCGAATAAATTAAGACTAAAAAGTATACTGGAATGCAAGTGGTATGTCGAAAACCTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACG:1 - chr2L 8636584 5' + R1A1-element 5300 1 47.41 GGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 + chr3R 23161290 5' + 412 7140 2 76.71 ATTAATGTTGGGGAATCCCCAAAAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATAGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCT:1 + chr3R 25543439 5' + G2 215 1 38.19 ATCTACTGCATACTTCATGCGAATACCAAATATCAATAGTAATCACAAAACATTCATCCGAATTATTCAAGAGGCATACTTTCCACTTCGAATATCACACACCTGATTCACGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr2R 14135214 5' - copia 244 1 77.40 TATGTACATACATATGCTCATATATGTACATATGTACATATGCTCATATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTT:2 + chr2R 12806039 5' + Transpac 66 2 65.07 CATGTGTGTGTGTGCGTGCGTACGTCATTGCAACTCCGGTAAAACGCAAATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTA:1 + chr2R 18689096 5' - Burdock 240 2 75.34 CAATGCACCGTGGGCCGAAAAAGTATTATTTATTATTTCATAAAAAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 + chr2L 8574370 5' - Transpac 5161 2 70.71 CAATATTGCGCATGCGCCACTTATGCAAAAGAAGGCGCCGAACTGCGTGGAGGCAGCTATAATCCGAGGCGGGAGAGAGAGAGAGAGAGCGTATGAG:1 - chr3R 21688366 5' - blood 161 2 63.92 ATATGATCGCGAGATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTGAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCC:1 - chr3L 20224250 5' + Chimpo 47 1 52.74 CCAGCGGTGGGTCGACATCTTTGAACTGTGCCAACTAAATGCTGTTTACAGAAAGTCTTACACGATAACTTAGATACATCATCATTATTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 15295846 5' + roo 8684 2 66.67 TTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGA:1 - chr2L 17599966 5' + 1360 479 1 71.94 AAGAAGAATTAGACTAATTAAACCAGAGAAATTGCTATAGTCGCTAGAAAGTGGGAATAAGTATTTTTTGTGGCAATGAAAAGTTGCATGTTTGTATGTAAGCCCCACATGAAAACCTGCAGCCTTAATCCTGCCCTTTCTTCACT:1 - chrX 17524597 5' + Chouto 6103 1 78.08 GATGCATGTCCTCGAGGGCCGGAATCGGTGGGTTATATACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3R 19436003 5' + roo 74 2 72.03 AGCCAGGATCGACATTTGGCAGGACTTTTCGGTGTTTCTCGTTCTTTTTGCTTTTTCCCCTTGTTTTGTTTTATGACTTGATTTGGGGAAATGGGGAGTGAGCGCAGGATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTT:2 + chr3L 10112140 5' - I-element 5342 1 75.34 TTTGTAAAAATCAATACGAACAAATTTCAAAGTCGCATAGGAAATGGCCATAAATTGTTGATTGTATCGATTCAATTGAGAACGAGGACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGAAG:1 + chr3L 18843453 5' - Circe 7093 1 59.59 AAAATTTTCAGAAACCTTAACAATGTCTACAATATGGCGTTGATTTTACTCAAACAAAAACTAACTAATCTCACTCTCGCTCATTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCATACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTA:1 + chr2L 16460220 5' + Cr1a 351 1 53.42 AAATAAGAGATAAAGGATAAGCTAGGCACTTATGGAATAAAAGTCATGCAAAACATATTATATCTAAACATCTTCTATTAAAAATATCAAACAAAATTTAAAAAACGAGCATAATAAAACATCCTGCGAACAATAAC:1 + chr2R 14432451 5' + Doc4-element 2669 1 38.69 CAGCCTTCAACCAAGTTTTTGTATCTATTGGTGTTTGGTTGTAGCCAAGATAATACATTCGACTTTCGCACAAAATGAAACGGCCTTGAAATTGCAAGTACTAACCCTATCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:2 + chr3R 6413496 5' + 1360 8 2 80.14 CAATTTACATTTAAGCAGCACAGAAATGTGAAAATGCATTTGTTCCAAACATCTCAAATGGCAGTGGAAAAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3R 17258189 5' + 412 7104 2 51.37 GCCATGTTGGACGCTGAAAATGAGCAGCCCCGCAACATCATTTGCATGCAGCCGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAG:1 - chr3R 27322770 5' + 297 6768 2 65.19 ATGTTGCTTCCTCCTAGCACTTCGCACTTTTTCTACGCTTTATATACGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATG:1 + chr3R 27810026 5' - Burdock 193 2 66.67 CATTGTCGGAAGGCGGTTTCTGTTTGGGATTAGACTGGGGTTACAGCACCAACGTGAAATGGGTATGACAATGGTAGGTAATTTAGCGGTCCGTGGAAGTGGTGCG:1 + chr2L 19234656 5' + R1A1-element 83 1 69.81 AGCTCCAGACTGTCTGTTTGGCAGTGCGAGGGTATTGGTGTACCTCCTCTGGTGTGTGTGTGTATGTGTTTTCCACACACAGAAAATTTTTTGGTATAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTAGCTTTCGATTTATTTAT:1 - chr2R 15238671 5' - Doc3-element 91 1 53.42 AAATAGGCCATAATAGGTGCTTTATGACTTTTTAAACTCTGGGTAAATATTGAAACCGGAAGGCGGCCATAAAGCTTCAGCACCAGCTGCTGTGTGTAAAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAA:1 - chr2L 21862029 5' + Quasimodo 7346 2 71.94 CCTGGTTAGGCAGCTTTTGAGTCGCAGCAAAATGAATCGGTATAAAATTGACGATTTCATATGCATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGG:1 - chr2R 5438312 5' + flea 4809 2 58.27 GGGCGCTGCATGCAACACGTTGCCGAGAAATGCCATTTACATATTTTCCAAATGGCAATCGGAAGTTCGTATTTTCGCATGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACATGTTCG:1 - chr3L 564511 5' + R1A1-element 5313 1 52.05 CCATTCTCGCACCTGTTTTGCCTCCTTTGCGTAGTCCTGCTGTGCTGCTCTTGCGGTATCGCGCCTATCACAAGCAGACTGCTAACGACTTCTACATTTGCCGACAACACAGCGATTTTAAGTCGATCCAAATGTCCTCTACAAG:1 + chr3L 23459836 5' + Fw3 2974 1 53.10 ATTAATTGGTTTTTGGACACTGGATGAAATATATTTAATTTAGGCTTAATGCCGGACAGAGATTGCATTTTAGTATGCACCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 - chr2R 23212717 5' - Tirant 374 2 64.34 GAAGAAACCTCAAGAACTATTTGTCTCTATTAATTACACGGTGAAAAATCTGTAGATTTTAATTTTAGAATTAAGATAGGCTAGCATTTCACTTATATCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGGCTTAGCAGAATCAGTTG:1 - chrX 12434694 5' - G4 147 1 61.64 TATTAGCGAATCTCAAAGTGAATGTCAAATGGTGGGGTTAAAGCCAAGTTTATGCAGTGCGAATCTAATAGAGCTCAAAAGCACGTTGTTGCATCCTCATAGTGAATAATGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 25862523 5' - roo 400 1 79.31 GGCTTTGTGCTATCCGTGGATAAAAGTGAGCTAGTGCACGATAAGAATTGAAAAAGCATTACACTTTGCACTCAGATAATGGGCATGGCAAAGGAGAATCAAGTATTATGTATGGCTCTGTGTTGTCGCGAATCTGCTGACCCAGC:1 + chrX 14805450 5' - 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Burdock 6377 2 74.26 GGTTGCAACTTGACTTTCCCTCTTTCCCCTTTAGGTTAACCTCTCTATTCCCCGACAACTGAGATATTCGTGTTCTTAGCAGCATTAGCATCTCAAACAAGGTGTAAAACCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTCAGTTTTTGTA:2 - chr2L 1776224 5' - roo 386 2 69.86 AGTGAGGCATGAATGAAAATGGAGCAAAGGACAAGTGTTGTTATAAGGATGCGATTAAGGAAAAATTAATCGACTACTTCGAAAATTATACAGGATCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTC:1 + chr2L 10557604 5' + R1A1-element 329 1 62.24 ATCTGATGGGCTGAATATATTTAAATGATTTACATCATGGATCAAGTGTTGAATATTTTCCAATACAAAATATTTCAATCAAACTCTTTTGTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTCGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCA:1 - chr3R 9944860 5' + Cr1a 4093 1 58.22 ATTTAAAGTGCCTTGGGCGATGAATATCGAAGGGGGCAATACCCTTAAATGTGCTTGCAAGTGAAGGTTACACTCTAAAATAGTTCTAACGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 + chr2R 23408988 5' + opus 10 2 74.66 GTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAA:1 + chr3R 14049352 5' + transib2 82 1 72.60 CACACTCCACGGGGAGATCGTCCAGACTAAAGACCTCTGGTCTTTACACAGAGGCACAACACAGAGGCAGACTCGAGACCAAGTCACGGTCGCCATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAG:1 + chr2L 1365435 5' - 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Idefix 52 2 59.59 AATTTTATATATATACATGTTCATCCTGCTAAAGTTGAGTTCTCCATTTGCGGGTCCTATATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGATGGTCCACACCAGCCACTTACATTATTTCAAAGA:1 + chr3R 9300740 5' + 297 28 2 56.69 GTCATCGTCTTTGGCGGTCTTCTCGTCCTTTTGCGTCCTTGTTTCGCATTCCTTTGAGACTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 + chr3R 17258079 5' - 412 439 2 57.97 GACGACAACAATCATGCCCGGAGGCAGTCACACGGACAATGTTATTGACACCCCAGCGACAGGGTTTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCT:1 + chr2R 11821876 5' - blood 7058 2 52.86 ATTTCGGACCAAATCGCGAGTGGTCAATGGTGCGATCGGTGGATTGGGATCGGGATCTTTATCGCGCCATGTCGAGCGTAAGAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGC:1 - chr3L 2874532 5' + F-element 460 1 59.71 GTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAGTCTGACTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAAAAATAGCCAAATCTAGCCAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTAT:1 + chr3R 4571528 5' + 1360 400 1 35.62 AGACTCTTCTTTGATATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - 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chr2R 14135341 5' + copia 84 2 72.60 CATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1 - chr2R 18344631 5' + 1360 46 1 56.80 CTGTGGGGCCGCAGCAGCTATTGCTGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGG:1 - chr2R 14913510 5' + X-element 4427 1 64.79 AAATTGAATTTTCTGTGAGGGATATTTACAAACAAATAACTTAGTGACTTAATCGAGAATGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATAT:1 - chr2L 11110523 5' + hopper 1102 1 59.59 ACATATAGAACATAGAACATAGAAAAAATATTCTATTACTTTTTTTTAATAGTTTACAATAATATGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTA:1 - chr3R 27700244 5' - copia 192 2 60.27 CTTATATTTTATGACTTTGAATTGCGTGCCCGAAAAAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 + chr2L 12324984 5' + jockey 4688 1 70.15 GACAACGCCAGAGACGTGACTCTTGTTCGTCGGACGCAGGGGGGATTGTTGGAGTAGATAGGGGAATACGTATTACAGGTGAGTCAGGTAAAACCAACATACACACACACACACATACAC:2 - chr3R 18006556 5' + Quasimodo 37 2 49.17 ATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr3L 16015343 5' - 1360 3345 1 52.05 CAAGTCGTTATTACGCTCGTTGTTGAAACGATGAAGACATCAAATTGCATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chrX 6633036 5' - P-element 2844 1 46.34 GCATAAGAAAACTGCAACGAAAAAAGTTTATCTTAATTTGAGATGCTACTTTTATAGATGTTTTCAAATTTCTGTTTTCGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 5422830 5' + roo 8704 2 57.93 AACAAGGGGGATAGCGAAAGTTCCAGGAAGTGGCGTAGAAGCTGATGGATAATTGCAATTATAAAACGAAATTTCAGATACTTAGGAAACGTGATAACTTATTAAACTTAAATGGCTCCAAGTGTAAAGTTTTGACCTTTTGTCGT:1 - chr3L 21516928 5' + Q-element 676 2 60.96 ATGGATTCCAAATCGTCCGAAAAAAGCGTGTGCCATCTGTCGCCTGGCGCTGCATTTCCAAAATATCGATGCGATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAA:1 + chr3R 8270199 5' - jockey 4811 1 50.68 GAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTAT:1 + chr2R 11095750 5' + diver 72 2 63.70 ATACGGTGAGGTGAGAACGCAGAGAGGGAGAGCATGAAGGGGGAGTAGTGCTGATTTTGTTCGACTTTGAAGACCAATGCAATGACCTCCGCCAAAGGACAACTGACGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAAT:1 - chrX 6625274 5' - Idefix 207 2 71.92 ATTTACACAGAGGCAAAAAGAGATCATTTTTTTTGTTGGAGATTCCTTTAGAGAACTTCCTAGAGAATTATTTCCTGGAATGCTCCTCCATTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGT:1 + chr3L 13683263 5' + hobo 2505 1 67.14 CAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAACCCGGTATAGTAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTAGTAGTATGTCAAAACCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTT:1 - chr2R 5924402 5' - jockey 4736 1 29.45 AAGGTACCATATTTGCTATCTATGGGAATGCTAGCGCTCTTTATAATTTTGAAAAATTCCATTGTAATGCTGATATGTGTTCATGTGAGTATATTTTGTGATTTTTTGTGAAGATATGATATATA:1 - chr2L 3532164 5' - Tirant 370 2 56.00 AGTTGCTTTGAGTTCTTAATGAAGACTTTATAAGAAAAAAATCGCATATTGGTTTCTAAAATATTATATAAAATTTATATTCAATGTATATTTTAAGCACTATAGTGTTTATTTTATATTGGGTATATAAAAAAACCATATATTTT:1 - chrX 7529628 5' - transib1 66 1 40.41 GTATGTACTATCTATTGCTTCTATATTCATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:2 - chr3R 6461852 5' + 297 6632 2 56.85 GGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr3R 19436073 5' - roo 335 2 68.75 CATATTAAGCGCGGGGTCGGCTGACTGGCCATATGCCAACGTCTGTTTGGGCCACTCCCCTTACAAACATATAGTGGGCCAATTAAATCGAGGATTGGGGTGTGTAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr3L 2704894 5' - blood 363 2 73.97 ATTATAATCGTCTTAGGAATAATAACAGCCAGTGGAATTTTAACAACAATTACAATTACAATACAATTTTTTATTAATCAAAAACTTAAGCGAACGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTTAAGTATGAATAAAATCTA:1 + chr3L 23777694 5' - Quasimodo 7271 2 69.44 CTATTAATGTTGGGGAATCCCCAAAAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATAGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCT:1 + chr3R 25543437 5' + G2 215 1 37.67 GACATAAATGTGCATAAAATTTGGGGACATTTAAGTAAAGGCGTTGGCGAAGCAAGGGTTTCTCGTAACAATAATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 14375759 5' + roo 8684 2 72.60 AAGACAGTCGAAGCGACGTCGAGATGCATGTCCTCGAGGGCCGGAATCGGTGGGTTATATACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATATTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 19435981 5' + roo 54 2 55.17 AGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAACACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAA:1 - chr3L 27415307 5' + transib2 69 1 63.01 CTAATTAGCTTCAACAAATCCAAATAGACTGATAATTAGTTAAAATAAATAAAAATCGACTGAAGGGCTAAAAAAAATAAAGAAAAAA:1 - chr2L 7470782 5' + G-element 4325 1 80.68 AACTTCACGCTCTCCAATAATTTTAATGTAAAATGTAGTAGTAGTATCATAAATATGTATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGT:1 - chr3R 7481597 5' + invader4 2824 2 64.83 CTTGATTCATATTGGAATATTTTATTAGGCTTAAAACAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 + chr3L 12223151 5' + Transpac 28 2 61.70 ACTACCTATACAGTCTAGCAATATCCTGCCTGCCCTGATCCTCCCATTGAAGGCAACGAGGTAACTAATATCTGTTGCAATTGCCAATGCCAATTTTCCTATTTAATATGCCACTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTA:1 + chr3R 8144138 5' - 1360 338 1 77.40 AATATGTTAGAATATTTCACACAGAGCAAATGCCTCAAAATCGGCGGGATATAGGCACGTCTAGGTACATATACATATGTGTATATTTTCTATATATATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 + chr3L 16059201 5' - 297 376 2 73.97 ATGCAAATTGGCGAGGGGGCAGGGCACACTGGGCGAAATAAGTGGCAGGGACCAAGGCAAATATCTCCCCGACCCACTGTGCAGCATGCTGCAAGTCTCGTGGAAACTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAAT:1 + chr3R 12795110 5' - 297 265 2 75.17 AATCGGGAAAAGAATAGAAGATGGCACGATGAACCCAGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGGAGCGTTCTGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTACACCAATAAACACACACT:1 - chr3L 20584575 5' + Porto1 454 1 73.13 ACATCTGCAGCTATTGTTGAATAAAAGAATAAATTCAAAGTGTCTTATAATTAATTTTAGGGACTTTAGATAGGCCCAAATAAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr2R 21844063 5' + pogo 33 1 63.01 ATTATTTGAAATATTAAAATGGCTTGATAACGCCAATGCGGCGAAGTAATAGTAATTTTTAATAATCAGCAAAATAATTAAAATGAGCCTGGTGCTACGCGCCGTAATTGTGACACACTACTGGAAATGCAACTACACTCTCCAC:2 - chr3R 15126504 5' + baggins 81 1 59.31 ATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3L 8658743 5' - roo 321 2 76.03 ACACTGATTAAAATATCTATATTTTGCTAAAAAACATACCTCTGGAGCAATGTAATCAGGTGTACCGCAGAAATAACATGTTCGTGAAAGTTACGAACCCTCTTCTTACG:1 - chr2R 16942173 5' + opus 7117 2 61.82 GCAACAACACCATCAGAGAGACGACTTATTCTACGAACTGCCTCAAATTCTCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr3R 4576964 5' - mdg1 366 2 63.08 TTACAGGTTATAGGATTGCAATGTCGCTCTTCATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCGTTCGGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr2L 21153604 5' - 1360 3357 1 58.90 AGTCGGTCCAGGACAATGTCCATGGCCTTCACCCACATCACTGGTTGTACAAAGTATCTAAAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGGGCAGAAGTGCCTGCGGATCGA:1 - chr3R 16997500 5' + G6 26 1 67.81 TTATATTTACTTAACTTACTTTAGTTTGTATTTATTTATGTACTTCTTTAATTTATTATGTACTTATTGTTATCAGTTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACCATGAATTAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAAT:1 - chrX 23175831 5' + gypsy12 9813 2 75.34 CACCCATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chr3R 9125616 5' + Doc 20 1 75.89 AGAAAGGCAATAGGAAATGGAAAATGCCTCTTGAGCAGCCCAAGAAAATTAAAAGAAAATGAAAATCGGATTGTAAGTCCAAATGGCACGAAGTGTCCTTGTACTGGAGGCATAATTAAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGC:1 - chr2R 19587802 5' - Q-element 564 2 57.53 TGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr3R 9125640 5' + Doc 34 1 63.36 GACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr3L 21013919 5' - roo 322 2 81.29 AGCTTATTCTATATGTTTACTGGTTGTTTTCCATTACATTTATAAAGTTCAATTTGGCATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTT:1 + chrX 10047312 5' - I-element 5296 1 57.53 AAGCGAAAAAATCTGGATACTCCAAATGTGGTAAGCAACAATTTATATATTAAGTTTATATTGGGACGAAGCATTAACAACTTTATAGAAGACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTA:1 - chr3R 18365680 5' + F-element 4221 1 63.70 TTCTTGTTTGCATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:2 + chr2L 17295803 5' + Doc 31 1 60.96 TTAAATAAATACAGTGTGTAGCCCGCTTTATAAAAAGTGTGACCGTTACGAGGGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATTATTATGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGGT:1 + chr3L 23696455 5' - Idefix 398 2 63.01 GCCACACCCATCAAATTAATCAAACAGCTGGAGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr3R 9125612 5' + Doc 16 1 77.30 CACAATTTTGATCATTTTGTTATAATAAATACGGCTGCACCTGTCACAATGCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 - chr3R 17047898 5' + 412 65 2 62.14 AAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAG:1 - chr3L 7801285 5' + Transpac 5097 2 69.12 AAGCGATGATATTGTAGTTCATTAACCCACTGATAGTATAAGTAATAAGTACTTAGTTATTAAACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 19691229 5' - roo 9017 2 55.48 AAGCCTATTATTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3L 16015375 5' - 1360 3377 1 72.60 CGGAAAGAATGAAACTTTTCGATCTTAAAATAACAATCCGTAATGGGAAACTTAATAATGCAATATACTCACACCTCCATATTTTCCCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACT:1 - chr3L 18484505 5' + hopper 32 1 63.01 GGGCACGGCAGTATAATCATCGACAGCGCCACGCTTGGATCCAGAAGAACTGCTGTAGTCGTTACGCTTGCTGGAGTAATCCAATCGCTTGCTGGAACTAGAATAGTCATCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAAT:1 - chr3R 24821447 5' - F-element 4310 1 76.71 AGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTGCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr3R 8849873 5' + 297 48 2 53.42 GGGTATCAAATTTCATGATGCCATAATTGCATGCAAACAATTGGCAAACAAATGTCGCGCTCGCCATATGGGAAGTGAGAGCTTTTTTGAGGCAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTT:1 - chr3L 5629887 5' - I-element 5124 1 65.38 TTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTG:1 - chr2L 17599965 5' + 1360 466 1 69.60 GCACTAAAAGTATTAAATTTCTTCAAATATTCTCGGTACACGTGTTTGTATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCAC:1 + chr2R 23353982 5' + gypsy 7056 2 67.12 GCTGCAGTAAGACCAACTTCATTATGATTTGCACGAGAAATCACTCTAAAACGCATCGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGT:1 - chr3L 10529876 5' - FB 345 1 60.96 TGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACAT:1 + chr3L 3453623 5' + Tirant 85 2 75.34 GTTCCTCTGCATATTTGTGAGTGTGCGTTTGTGTGTGTGTGTGCGAATGTAAGTGGCAAGAAAGTTGAATTTTTATTGAGCAAATTCACGAGTCCCCTTAAATATTTCAACACGAAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - 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roo 409 1 54.11 GTGTGGGATTGCCTTAATCCTAGGCTAAGCATGCAGTTTCAGTGGATGTTTCATTAGCTTCCGATTTACACGTATGTATGTATATGCGGCCTATCTAGGACAATGATGCGACCCCTCTCAAAACTTG:1 - chr2R 12622891 5' + aurora-element 3981 1 68.50 AAATAAATGCAGTGCGGTGCGCCAGTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 - chrX 16117290 5' - opus 7500 2 77.57 AATCTCCTAATGGTCGAATAAAGACACGAAAGATTGGAGACTGATTGCTAATTTAACTGATATGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chrX 4400402 5' + roo 8683 2 60.75 ACATAAAATTATAATTGTTCAACCCTTCTGTTTGTTTAGGGTACAGTTGTACCTATTTATAAACAGTAAATTCTCGAGTTTTCAAAAAGGTTGCCCGAGCTGGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACC:1 - chr2L 19160484 5' + 3S18 20 2 72.60 CATGATTGCACAAAACAAGGTTTTTCCATTCTTTCAAATTGAAGAAGAAGTTGAAGAAAGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chrX 4400267 5' - roo 394 1 69.40 AAATATTAATGAATTCGATTAGCTTATTCAACAAGGAGGCTTTTAGGTCCAATATCCATCGCCAATCACGTGTTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGTTTTTTCAAATTTACAGTAATTT:1 + chr3R 24337510 5' - X-element 4605 1 50.69 GCCACAAGTGGAAGCATTCAAAGAATTAACCATCCTACCAGGACTTGACTGTTGTGAACCCCTAGATATAATAAAATCTGTAGTAGGCTAGAGGTACATATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAG:1 + chr2R 2725156 5' + invader2 4905 2 53.42 ATTTAGCAAATGAAATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2R 11164550 5' + roo 8678 2 75.69 AAATAATCCGTCAGAAAATGTATAAGATATGTAAGGAACAAAGTGTCGAATTAGTCATGCACACGAGTTTTCGTCTTTACATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr4 916272 5' + roo 8704 2 58.22 AAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACAGCATC:1 + chr3L 3453632 5' + Tirant 8175 2 75.83 AATCAAAAATCAATATTTTTTGCCTATCAAATGGCCCATTGAATATAAACAAGCCCAAGGGTTTCTCTACCTCCCTCCCTCCCTCCCACCATCCTTCCCACTCTCTCTCTCTCTGTTGTTCACATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTC:1 - chr2R 14908418 5' + blood 7178 2 47.26 TACATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 - chr2R 18344633 5' + 1360 65 1 61.64 GTGGAGCTAAAAGTCTGATCAACCTCGGGATCACTTAGCACACTAGCATCCGACTCGGTCTCCAGGTCCAGGCGGGCGAATTGTCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAA:1 + chr3L 14776847 5' + I-element 418 1 56.16 ATATGTAATCATTCACATGTTATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCAT:1 - chr2L 19310423 5' - Juan 4182 1 60.96 GACCACCAATTTTGGGCAGCGAATTATAGCAATTTCTATTTATTTTTGTCATGAAAATCAGTAGCCAACAACATGCTGTTATCACAACTATACATGTAAGTTCGTTTTTAACTTCGTATTTTGTTGGTTGTGCGTGTTTTGCGTC:1 - chr3L 22776988 5' - Bica 4630 1 73.79 CGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGA:1 + chr2R 18689171 5' - Burdock 166 2 81.51 AGGTGGCTGGGAAGCTGTGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTAC:1 - chr3R 7616870 5' + Stalker2 7263 2 75.34 GGTCACACAGAGCGCTTAACAGCATATCGTGCCAAAATGAGGAGATATATTCTAAAACAGTAAGAGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3R 20635399 5' + 1360 51 1 54.48 AAATGTTATTTTCCCATGCTAAAGTGTTAGATAGAAAAAACTTATGTAAGCTTAAGAAATATAAAATAAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACAT:2 - 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Stalker4 368 2 56.16 CGTGACATGTAGACAGAATCAGTTTATTGCATTACGCCATCCGCCTCGCGGCCCAATAATATATGCCCAAAAACATATACATACATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 - chr3R 9300876 5' - 297 377 2 69.78 CACAAAAACAATCTAAACAAACTAAAAAGAAGGAAAAACAAAAACCTGTTTGTCCAGTTTGACAAACAAAAAACGTGAGGGACGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTT:1 - chrX 8437609 5' + accord 7239 2 54.79 GCCTAGGTAATGTGAGAATCTGCCTAAAAGTAGAAGAGATATTTTGACCAAAGAAATATAAATAACGGAGCCGCAAAATATGCTTCATAAATATTCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGG:1 - chr2R 11264107 5' - jockey 4965 1 63.01 GTCTGATTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATG:1 + chr2R 13367462 5' + jockey 4636 1 69.66 AGGTGCATTGTTTTTGATCATAAAATATACCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGT:1 + chr3L 14954387 5' + transib2 2560 1 66.44 AATTGCATGATACTCGTACATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:2 - 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TART-A 122 2 56.16 GAATATGCGTATAAATACATATTCCGGGGGTAACGAAAGCGTAGCTGATTTTGTTGTATTATAAACACAAATAAATAATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGGAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGT:1 - chr2L 3845665 5' + invader4 3006 2 54.55 CAAATGCAGGCGGCAATGATTGCGGTGTCGTGGATTGGATTGCGATTGGGTATGCAGTTTAATATGCCTGAAAGTACATATATCCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTT:1 + chr3R 11513424 5' - roo 9037 1 61.64 AATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr2L 12291942 5' + Tirant 8168 2 61.64 AGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr3L 18253777 5' + blood 53 2 53.42 AAACTATATTCTGCCGATTGCCAAGAGATAGGAACTTGGCCCTGATCCAACATAGAAATACATACGAATGGCCTATCAGCGAGTTATGAGATAGTCAAAAGGAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 25862718 5' + roo 18 2 71.92 GTGTGGTCTGTTGAATGAAAAGTCAGTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - 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blood 7176 2 78.52 GCCGGATGTTGTGCAATAAAAATGCAAAGTGCGCCAAAGTTGCCGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr3R 7470911 5' + Doc 58 1 65.07 AAAGTGTTTGACTTAACGGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr3L 18183215 5' + Tirant 8134 2 65.94 GGCTGCGTTAAACAAGCGAGGATAACAAATTAATTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAAC:1 - chr2L 20515262 5' + I-element 88 1 79.45 CGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCACATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAA:1 + chr2L 9275015 5' + F-element 98 1 75.34 AAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGG:1 - chr3L 7801285 5' + Transpac 5107 2 71.23 CTACCTTATGGTGTGATTGTTTCGGCACTAGGTAAACCTACATATATGAACATACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGT:1 + chr3R 22494090 5' - 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Tirant 487 1 75.34 CGTTGCATAAATAGACTTAAGACTTTTGATAAAGATAAAGAGAGAGCATCTCGGCCATAGCTTCTGTTACCAACAACCTTCGATCGGCCGAAAACTTACGCCGTCATCCTCTACTGACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGAC:1 - chr2L 18768985 5' - baggins 4964 1 73.29 TTCGAGATAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTG:1 + chr3R 11151802 5' - mdg3 189 2 55.48 GGTTATAGGATTGCAATGTCGCTCTTCATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr2L 21153599 5' - 1360 3350 1 58.90 ATTTGAACTATGAAAGAACAACATATAGCACTCTGCTAAAATGTTATTATTATTTCCCTTACAATTGCGTCAATATCCTTGGCGGCATAGTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAG:1 + chr3L 11334911 5' + pogo 420 1 67.97 ATGGCTGGGGCACATTTTGCAGCGGATATAGTCATGTCAGCTGCCTATAAATAACCCCAGCCTGACATCAAATAATCATGAAGGTGTCAGCTTTGACTACATTTAGAAACTGTAATTGTTTTAAAAAATGTGACAGGTATAGATGT:2 + chr3R 14911895 5' - Stalker4 396 1 75.34 GACCAATCCCGAGCAATCTGGCAACCTAATCCACCAGGGGCCCAGCATGGGTCACCGGAAATGGACCACACAAACACACACAGACACAGGGATTTGAGACAACACCAATACAAATACTCAGAACACACACACACACATATGCACAG:1 - 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chr2R 1373218 5' + pogo 44 1 55.48 ACACACACACACATAGGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr3R 27715887 5' + Tirant 27 2 73.91 ATTGTTCGACTGTAGGGGAAATGTACGAATTTGACAAAGCAGAAAGTCGTTTATTGCTGATGTCCAACTAATGTATAATCAACTAATAAATATATCACAAAATCAGTGAAACTAAAATGGAAAACGAAATTTGTGAGCAACGTCAA:1 + chr3R 1614653 5' + Doc4-element 6 1 61.64 GATACCAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTT:1 - chr3L 7801319 5' + Transpac 154 2 47.95 ATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAC:1 - chr3R 13437244 5' - hopper 1353 1 62.07 AAATCATTACAAAATCTTAATAAAAATAAGCTTTTGTGAAATTGATAGCATATAACCACAATTTCTTTCATTTTTTCCATCCAATTCTGTTCATATGTTTTTTTTATCCATATGTAAAAAAATAAAAAAACTATTAACAATGAAC:1 + chr2L 10229526 5' - S2 1562 2 60.69 CAAAGAAGCTGAGGCAGCACCACCAAGTTTCCCTCCGAGAATGTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 + chr3R 24499511 5' + blood 79 2 71.92 AGATCCGGATGGTATAAATGATCAATGTTCCTGCGGTCACACTAAAACTGAATTACTATCAGCCACTCTTTATTTCAAAGCCGCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chr2R 5754479 5' + P-element 38 1 59.59 GTTTATTGCATTTTTGTGGTAGTTTATTTAGCTAGGAGTAAAAAGCAATGCACACACTTAACACTCACACACACAAACACAAAGGCAGTCACTCACTCGTTGCCGCGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTT:1 - chr3L 16865473 5' - FB 834 4 67.81 CGACATAAATGAAAATGGGCTTCTGAAAGTTCCTGCCATCTTATACCACGCCATCTTATATGGATGAAATTGAAGATCATCATGCAAAATTCCGAAATGCACGCTGTGTTTTAATAACCGAACATCCGC:1 - chr2R 7394670 5' - mariner2 186 1 62.79 TAAGCTGATTATTCGTCAATAGGTTACTGAAATCGGTAAAAGAGTGGAGTGCTTAAAGATATTATCCCAAAACATGCTTATGAAGGCAAACTGTAGGGTTATGAGCGCATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 - chr2L 10446189 5' + flea 11 2 73.97 GAGTAGCGAGTATGATCGGCGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCA:1 - chr3R 2637695 5' + gypsy5 7003 2 79.09 CTTAAATTCATTTTAATTCAAGTGAATAGCAAACCGACCTCTTTCCACATCCTTTGCCATATAGCCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr2R 21748233 5' + 1360 55 1 55.48 GCCAAGATGCGACTTTGGCAACATGTTGGCAAAGCGGACAGGTATTGCATTTCAGCTGCACTGGGTCTACACGTAGAGTGAACTAGTTTCGACTTGCTTTTAAAGTTTTAGATTCTTCGAACAACAGATCAATGCGAACTAATTAA:1 - chr3R 15525331 5' - Tc1-2 230 1 69.18 CCTCCGTTATGAGTGCCGAGTGTTATCGGCGCTCGAGACGCAGAGTACCGTATTGATCTGCATTTGCAGATTTATGCGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCAATGTGCGTGG:1 - chr3L 23164938 5' - hobo 74 1 50.46 GATAAACTTCACTGATGACTCAGTTTCCGAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 + chr2L 21153441 5' + 1360 24 1 66.44 ATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTA:1 - chr2L 7652241 5' - roo 9041 1 78.67 CTCTTAACCCATTGAAGACCGTTCGTCGAAAATCGGATGAGGTACACACATTTAACTTACTTAAGCTGTTTGGGAACGAGACACACTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGT:1 - chrX 14137304 5' + 3S18 48 2 50.37 CTTATCCCTTTCTTCCCACGTAGCAGATAATAATATTGTGAGTATATTAATCGTAAATTCGAGTCTTGTGTGGACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 21013991 5' - roo 9052 2 74.48 GAAATAGACATAAGACTTAAAACATGGGTTGTTGCATTAAGTAAAACTTACAATTAGTTTTACCTTAGAAAATTATTTGAAAACTATATGGAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 - chr2R 21870295 5' - copia 225 1 50.68 GTATTATAGCAGGGTTTTATTGGTCAAGCTCATTTTTATCGGTTAAAAAAATGTATTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:2 - chr2R 5433989 5' + Transpac 4982 2 63.70 GCCAAATATAATGACGCACGTGAATATTTACAGCGACCTCGGTTCTTTTGTCCTTCCCAATACATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGGTACC:1 + chrX 16904955 5' - Doc2-element 4466 1 52.31 CAGTGACCCATTTCGGATTCAAAGAACTTAACTATTAATGTTGGGGAATCCCCAAAAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATAGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATG:1 + chr3R 25543406 5' + G2 183 1 48.97 CTTCCCCATTTCTGCAGTTCCCCAACCTTTTGCACTTTGCTGTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 10469658 5' - roo 9055 2 73.97 AGTCATGATTCAATGCCAATTTGACACTTGTGAGGAGTTTGAGATGGCGGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr2R 23212604 5' + Tirant 42 2 56.41 ATAACAACTACAACTACTATAACTTTTGAAACCTAACCGCGTTTACAATCTGTTGATATATAGGTAGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chr3R 8218028 5' - P-element 2832 1 48.63 GGGTAGGGGGTATATGAAGCAATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 + chr3L 7791857 5' - Transpac 5217 2 73.08 GTATCTGCGGAAAATGTTTGGAAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chrX 1103737 5' - pogo 2061 1 58.22 GTAGTAATACACTAGTTATTTTTTGCATTATTTTTGATAAACAATTCCACATGTTTATGACGTTCTGTTGTCAGAAACCCAACCTTCGTCCTGGTCCAACTTCAGGGTCTATGGCTTTGACAGATGCTATTGTTGGACAGTTCAT:1 - chr3L 20557183 5' + G5A 365 1 55.86 AAAGGCGGAGGTCACAAATGGCAAATGTTGGCTGCTAGGCAGCCGGGCTTAGAGCTCATAACAATGCAGCTTAATAATACAATAAATGCAATCAACGTTGATTCTTATAATAGTAAAGTTCTCTTTTAATTTTAGAATTAAGATAG:1 - chr3R 16527397 5' - G4 214 1 63.70 AACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr3R 26486026 5' + 412 7106 2 56.82 ATCCGCAACATCATACAAAATTGAACAGATTTTAAATATGTTTTCAAGTGTCATTATCTGTTGTCAAGACTGTTTGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGACGCGTAACGGCTATACATTGGTTTGGCACGATGCAGCGACTTTT:1 - chr2L 14501013 5' - 1360 3344 1 43.06 GTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3R 24673681 5' - roo 9039 1 60.27 CAGCCATTGAACCGAGACTTGCTCGAGTAATTACAACAAGTGTTGTTGCGCTCTCTCGCTTTTCCCCTGCTTTCGCCCCTTTTCCCTTTTCCACCTCCCACCCATTCGATTTTCCTGTTTTTTTTTATTT:1 - chr2L 12677505 5' - Doc2-element 247 1 70.00 CACTGACATTTCTCTTTCACGGCATTCTTTTCAGTCGCGCAGTTCTAATGACCTATCATCAAATTGTAATTACTGCAGTCAGAATAAATGACATTTTGAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 12379659 5' - roo 9050 2 70.34 CCTTTAAAATGCATTAAAAAATGTAATGAATGCCTCCTGCATACATGCATAAACATACATACATACGTATATATATTCGGGTACTACCTCCCATATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAAT:1 - chr3R 20199218 5' + Doc 193 1 66.91 CTGAGCAATGAAATATTGTAATTAACTTTTCTGCCAACGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAA:1 + chr2L 12144221 5' + transib2 86 1 74.66 AGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTGGGTGAGGACTTCCTTCAGTTGGGCCGCAG:1 + chrX 21772501 5' - springer 7065 1 79.71 AGTTGCAGAGCGGACAGCACACCGCGAGGCCAAAGGTGTAGGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAAGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr2L 22319234 5' + Transpac 30 2 62.33 GAAACGCTATTATCGTTCTTGCAGAAAGTACCATTTTCACTGAAGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - 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chr2R 6493183 5' - transib2 2754 1 64.38 CTTTGTCTGTGTGCTTAGTGGAAGTAATTTTTCCTGTGTTTGCGGTTAACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGCATTAATACATTGGAAATACGTTAA:1 + chr3L 15636003 5' - hopper 1337 1 64.38 ATAGTGGCAAAACCAATATTTTCTTTTATAGCAAAATCTTAAATTTTATTAAAAAAGTCTGTGATCGACACGCTTTAATTAATGGCTATGTTAGAAATGACCTACTTGGCAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGG:1 + chr3R 26405932 5' - HMS-Beagle2 207 2 45.89 CCAGGCTATATGCATACAAAGCACTATAAAGTTTACCATGTATTCATATTTCACATATAGTATACTTCTATGTTCAAATTGCATTACGGATAGGAAATTGTTGATTTGGCGTACAGATATATAAAAATATTTATTATTAAGAA:1 + chr3R 26397244 5' + gypsy9 294 2 60.14 CATTGCTCTTAACACCTGATTCAAGGATACTGCCACTTAGCCACTTGTTTGTGTAGTCCTCGGACGAAATCCGAACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr2L 3232015 5' - roo 397 1 75.34 GAAATCCATTTTATGAATATTAATTCAGAACAAGTGTAAATGCAAGCTGCAGTTGAATAAAACCCCTTTCAAATAACATTGGGAACAGCGTTTAAATAAATATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 6913309 5' - roo 389 2 71.23 CGGTGTGTTGAATTGCAATTGACATCGCCTATACAACTAAACAAGAGAATGCTATAGCCGACTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGGAAATGCGAACGCGAAATTTGATTTATTTTTCTGGGATATCGAGAGAT:1 - 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chr3R 25751905 5' - roo 9026 1 54.11 CAAATAAATAAATGCAGTGCGGTGCGCCAGTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGTGTTCTCGGCACTCGCTGCGGC:1 - chrX 16117295 5' - opus 470 2 63.31 AGAACTGCTTCAAGAGAATGGGAAACGACCCTATAAAGAGACTCTACATGGGGAGAACTAAAAATACAAAATATAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATT:1 + chr3L 2192264 5' - jockey 4940 1 50.68 GAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 + chr2L 19407037 5' + Doc 28 1 49.56 GGAGAATATACAAAGATTAACGATTTTTATAATCAAGCGCTAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr2R 11256175 5' + roo 79 2 73.97 GATTAAGTATGGCTGGGATAGAGGTGGAAAGCGGAGAAGTTGGCAGACTGTCGGCCAGAGGAATCTTGTGGTTGTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCG:1 - chr3R 22149049 5' - Ivk 313 1 65.52 GTAGCAAAAGTTTTTTGCGCAAGTCACAGGGTCAAGCAACTGCAGATGGGATCCAACACCCCCAAAACAGATATATACTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGAC:1 + chr3R 16388884 5' + Doc 458 1 66.07 ATCAAAAGATGGATTGGCCAATTTGGTTTTCGCAGTGTTTACCCTGTAGCTGGCATGGCCTTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr3L 13690264 5' + hobo 58 1 57.53 ACTCCAAGAAATTTTGATAGCTCGGATTTGATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr2R 15070077 5' - 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chr4 829131 5' - INE-1 152 1 69.86 ACTGACACTCAATTGAGCCATTCTATGAACCTGCGCCCCCAATATTATGAGCTGGCTGTTGTTTTGTTGTTATACACATACTACATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGG:1 + chr3L 16079741 5' - F-element 4498 1 58.62 TCGCTGCATATTCTGCGAATATTTGCAGCCATAAATAATGGGCCAAAAATTGGAATGTAAAAAACAAGCATTCTTGCTCAACGAAGCAAAAGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3L 2320745 5' - roo 9043 1 65.75 CTTGTGCTTCATACAACAGGGCTTAACAAGGCTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGATCC:2 + chr2L 11554508 5' + roo 165 2 76.71 AATCTTTAATAAAATCATAATTGTACTAATTTTATATTTTATCTTAATCCTACATCGTTCATGGTTTTATAATAGTTATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr2L 16562056 5' + opus 27 4 52.94 CTTCTCGCTCTCAGTGTAAAATTGACTAAAATGTAGGAAAATTATGATACTCTTAAATGCGAAATGAAACAGCAGAACATTAGATCTGCTATAATTTAAGAGGAGAACTTGGAACAGAGAAGATAAGCCGACTTACCAAGTCGGGA:1 + chr3L 10114053 5' - Cr1a 4078 1 54.11 GTATCATTAATTGGCAAATGCAATTAAGAGCTTTTTCCACACTTACCCACGGTGATGACAGCGCAACTGATTCTGCTAAGACCCCACCTATCATTCTGTCTGACGTCAATGATATAAGTGAAATGCTAGCCTATCTTAATTCTAAA:1 - 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roo 9035 1 43.15 TTACATAACTGCCGAAGATAATGGCTTCGATAGAATATTCCCCCCCTCCCCCACTCCATAACTAGATATAAATGTATCTAAACGTACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTAT:1 + chr3R 25713990 5' - flea 245 2 69.92 GAGCATTGAAAGAAAAAGCATGCCAAATATCCCCACAGTTGCCATTCCTGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr3R 26846751 5' - hopper 1412 2 69.62 GTGACGTCGACGGGGGCAGAAAGTTTGGCCAAAAGAAAAGGTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCG:1 + chr3L 20497748 5' - P-element 2809 1 32.19 AATTGAAATGAACCCTCGAATTGCACCCACCTCCCGCTCAATTTGTGCTCATGTATTTATTGTACGTGGAAATGGCGCATTTACTTTGCTGCTTCCGCTGTTGACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 24670675 5' + roo 35 2 75.34 AGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 + chr2L 14239138 5' + 412 61 2 57.53 ATGGAGCGAAAATACGGTACTCCCAATAAAATACCGCGCAATTCAAAATGGCAGAGAAATGTGCAAAACACCAACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - 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roo 9021 2 53.42 GGTCGTTGGCTCGCAACAAAAGAGACAAGAGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTACAGTA:1 - chrX 19107444 5' - roo 8982 2 76.71 ACAAATATGATTCCCAAGGGCCTTAAAAAGCAAAACAATATTTAACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr3R 26485983 5' + 412 24 2 67.81 GAGGACTTTGACTTGTTCAGTCTCTCGCCAGTCTTTCTCGAGTGAGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGT:1 + chr3R 31725764 5' + P-element 493 1 36.09 AATTCTGAAGTTCGAATCTAAAACAGACCCAAATAAACTGAAGAAATCGCAATCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3R 20840150 5' + roo 69 2 64.38 TGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr2L 9275019 5' + F-element 86 1 76.92 GGGCCAATTAAATCGAGGATTGGGGTGTGTAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCTTTGCAGCTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1 - chr3L 2704819 5' - blood 7316 2 73.08 AGAATCTAGTATACCCTTTTATACGAGTAACTGGTATATATAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATG:1 - chr3L 27130318 5' + Quasimodo 75 2 76.03 GGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAG:1 + chr3R 10437036 5' - BS 5051 1 54.35 ACGGACGACCAGAATCATGCGAATACATTTGTGTAGCACACTTTCGGGCTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATT:1 - chr3L 22339488 5' - hopper 1350 1 63.01 AGCTCAATCTCGAAAGTTAACCAACCAACCATTCCCCCACAGAGCGGCTACTTTGACTGCGATATAGAAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGTTTATAAAGTAAAATAACTCTAATAATTATTAGTGTTAGTAGGATTTAATTATG:1 - chr2R 24621088 5' - Cr1a 4286 1 60.27 ATTAAATTACTATGATGTGCTTTGGCAAACGCAAGGTAACTAATACGATTTTTGTGTTTTTTGATATCTTTGCAGGTATGTGCTCATTATACGAATTATGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAATCAGTGTAATGTTGTTCAATT:1 + chr3R 17977281 5' - TLD2_LTR 75 1 69.18 AGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAAT:1 - chr2R 8688155 5' + F-element 71 1 69.84 CATTTCTAGCAGTATTAGAAACTTTCACTCAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATG:1 + chr3L 1358467 5' - 412 7456 2 76.71 TTCACAATATTTCGATCGGGCCAGGCAAATAAATTTTCAACCAGAATATACGAATAATACTTTTACTGGGCTTTCAGAAAAATCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACT:1 + chrX 7619296 5' - Doc 4248 1 58.57 GCTGACTTTGAGTGGCAAAGAAGCTTGTGAGTAAACATATTTGCCAGAGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2L 11554566 5' - roo 8999 2 65.75 ATCAAAACAACACCAGCTATTCCACTACCCATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGC:1 - chrX 21933343 5' + springer 7156 2 68.49 GCTGAGGGGGTGGCTAGTTAAATGTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:2 - chr3R 24673704 5' - roo 399 1 78.08 TTTCGTTTTCACTGCAAACAGCAAACATGGCCGCCCAGCGAGAAGTCAATGAACGTGGAAAAGAGAGTGCGAGAGAGTTTGAGTGTGTTTGTGTGCGTGTGTGTGTGATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 + chr3L 17968649 5' - 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chr3R 12379788 5' + roo 71 2 68.49 AAAAGTCGATTTTGGCAAACTAATTACAAGCTAAATGCCCCATAATAAGAATGATAATAAAAACAAAAAAAAAAG:1 + chr3R 13991515 5' + Rt1b 5150 3 78.67 CCCGAAGAAAGGACGGTTGGTGTTAGCATGTCGTTTTAAAAATTCCTCACAATAGTCGTAGTTATGCTTGATATTAAATCGCCTATCAAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAAT:1 + chr2L 8961275 5' - 1360 3274 1 59.59 GCCCGGGCAATTCATTTTTAACGGTTCGCCATGCACTTTAGAGCTGTGAATCGGTGAATATTTTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATCCACACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3L 19031359 5' + roo 29 2 64.38 CAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr2L 16331016 5' - roo 8982 2 81.51 GGAAATCGAGGGCAATTAAAAAGCATAGAAAATGTATGTTTATTATTAGAATTAATGCCAAATGACAATCGTCCACAATGACACCCCTCATTTACCCGCATTTCGGGACTCCGCATTTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATA:1 - chr3L 18316489 5' - Tirant 8327 2 79.45 GTGCGGTGAATAGCCATCGCATGTGCCGCATGAATATGCAAAAGAACAAGTAAACGAGTTGCTCAGCGGGATAACTTAGAGATATCGCCTGATCTTAGTTTAGACTGCGGTTAGAGTTAGCTTTTTTAATATATTTTTCAAATTTA:1 + chr3L 3258940 5' + copia 4667 1 80.82 CGTTTTGGCCTTTGTTTCATCTTGTTTTATGTGCGCGCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTTCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGC:1 + chr2L 21030932 5' + FB 84 1 72.60 ATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 + chr2L 9274985 5' + F-element 30 1 62.96 GGCATGGCTTAAACTAGTTAAAAGTATATAACAAACGCAAAGGAGACACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTT:1 + chrX 8967342 5' + HMS-Beagle2 6902 2 72.60 AGGTCATTTATTATGCTCATGACACCTTCCATCCTTAGCCGTTCCGGCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTT:1 + chr3L 14662379 5' + FB 76 1 67.81 TCTCATGTATTAAATTTTCAAAACTACTTTATGCAGAATGTTGCATATTTTGATCTGAGCTTGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr3R 2649167 5' + 412 7113 2 58.22 TATTTCATCAAACGGAACGGACGTGTTTCTGCAGACTATTTACATTACAAAATTGTTTGTAACAGAAAAACTTAGATATTTAGATTCGTTTAAATTGATACCGATGAGATTAAGTTCTCCAAGAAGGGTAATAATACGCTAG:1 - chr3R 23819202 5' + jockey2 3358 1 57.75 GATGGTATAAATGATCAATGTTCCTGCGGTCACACTAAAACTGAATTACTATCAGCCACTCTTTATTTCAAAGCCGCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAA:1 + chr2R 5754486 5' + P-element 13 1 70.18 AATGGTTGTAAGTAATATTAATTCTAAGGAGCTAGTTTGGATATACATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCACTAAATGATTACAATCTTTTTATTTGAGAAGAACACCGACCTTTT:1 + chr2L 21976714 5' - Idefix 7316 2 71.23 ATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCAGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 + chr3L 7791878 5' - Transpac 5181 2 49.66 CATCATGATTAGGCGGCCATTGAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 - chr2L 5792102 5' + blood 7058 2 53.42 ATTTCAATTATTGGTATAATAAAGATATATTCTTAAGGAAGCCTTTAAGGAGTTAAGGCTTAATATAGATCGTCCTTATACTTATTAATAAGGGAGATTTCTTTACAATGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAA:1 + chr3L 22641920 5' + hopper 15 1 75.34 ATACCTTATAAGCATTTTATACAATCCTTTTAGTTTTTGCAATGTCATTCAATTGATGTATATCAGTTTGTTTGATCGAACAGCCACAACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr3R 4679420 5' - hopper 1384 1 63.01 TGGTTACTCGTATTATAGCGCATTCATTTAACCCAAGATACCCTGTATGGACTGCTAATTTTTCTACGGTATTATGGCAGCATAGTTTCGCACGCCTCCGATTTGGCATGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATAGAATATGCTTGCT:1 + chr2L 433517 5' - 1360 3265 1 75.34 AGTGTGGGTATTCGCCGTCTATGTCGTTGTAAGCGGTATATAAGTAGACTTCCAACTGGTTTTATATTTAGGCGGTTGCCTCTGCTTAAAAGCACTGAAAAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGG:1 - chr3L 6622412 5' + blood 334 2 76.71 TCTGAAAATCGGTCATCATCTTTTTCACAATTTTCATCATTGCTACATCATTTTCATTTCATTTGAAAAATTAGTTTCTTTTTCTATCTGAATTTCGGCATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr2R 5237691 5' + Doc 21 1 59.59 GTGCAATTAGCAACAAAAGCATAAAACTAAGAACAAGTGCAGTTAATCGCAAGAGTTGCGCGATGCAAAAGGGAAAATCGAGAAAATAACGCAGAAGGCTCTTTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGA:1 + chr3L 9678600 5' - R1A1-element 371 1 73.38 CATAAAAAAATTTGTTGTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGT:2 + chr3L 27356034 5' - Tc3 1683 1 77.40 CGTTAAGGGAAATTTATAGAAACAACGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 7870177 5' - 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Doc2-element 251 8 65.45 ACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCG:1 + chr2L 3960202 5' + jockey 86 1 73.38 TCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGATAAGCACAAA:1 + chr2R 21820734 5' + Doc 81 1 63.57 CGTCCAATAGCAGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCAC:1 + chr3R 7470954 5' + Doc 101 1 61.64 GCAACGATTTCCTCATGGCTTTCAACTTCCAATCTCGTTCAATCTACTCCTAATGTGCACAGCGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATC:1 + chr2R 23409948 5' + opus 7342 2 54.63 ACTGCCGTTTGTTGACTTTAGTTTCCCAGTCCAGCATCCACAGCAGCGGTCAAAATAATAGGAGCAAAAATATATTCAGTATGATTTTGCTGGGCTACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTT:1 - chr3R 17492940 5' + jockey 4770 1 74.81 TATAGGAAACTGGATGATCTACAAAACCTATGAAATCATCGAGAAGAACATCCTATGACATCAGCTAAATCTTTAAAACGATTGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3L 25607241 5' + 412 7086 2 61.70 CATGCGAATACATTTGTGTAGCACACTTTCGGGCTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAAC:1 - 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chr2L 13332732 5' - micropia 451 2 77.06 TTGAAGCTATAGACAGACTGAGGATTGAGGAGGCACAGCGGCACAGGGGAAGGTAGCTTAAGTAGGGGTTTTTGGATATAGGGTCATAAGCCAGGAAGGGGTCATCTCCATTATTAATAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACT:1 + chr2L 11018684 5' + INE-1 562 1 76.03 AAATACACCGCAAGAAATAATCTGACTTAAATCAAGTTAATTTTTGGCATTTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCGCG:1 + chrX 10444760 5' + opus 163 4 61.83 CGGACAAAGAATTAATTGGTTTTTGGACACTGGATGAAATATATTTAATTTAGGCTTAATGCCGGACAGAGATTGCATTTTAGTATGCACCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAAT:1 - chr2R 23212727 5' - Tirant 367 2 63.01 AAAATTAATAACTACGTAAGTATATATATTCTGACTGTTATAGCCCAAACTAGCTTATCTATATTTGGTTCCTCTTCTTGCGAGGCCATTATTTATATTTTTTTATTATTATTTTTCTTTAAATTACAATTTGTTTTTTAAAAATT:1 - chr2R 3146334 5' - Porto1 4648 1 33.56 GCATAACCAGTCGGTCCAGGACAATGTCCATGGCCTTCACCCACATCACTGGTTGTACAAAGTATCTAAAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCT:1 - chr3R 16997508 5' + G6 17 1 73.79 ATGTGGCCATCAAGTCGTAATTACGCTCGTTGTTGAAACGATGAAGACATCAAATTACATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chrX 6633046 5' - P-element 2872 1 63.81 AATATGCCCACATCAAACCAAAATTGCACAAACAAGCCAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACAC:1 - chr2R 11146126 5' + Quasimodo 61 2 59.59 TTAAGGCGCCTAGTTAAGGTACACTCACAAACATACATATGCAACTCCGGAGGAGGAGACCCTACAATAAGAGCCAACACTGTTCCAAATACCCCTCTGACGCCTATAAACCGCCCAAAACTTTCCCACTAGATGAGTAACGGGTA:1 + chr2R 7223032 5' + INE-1 539 1 63.01 ATATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:2 + chr2L 18112462 5' - transib2 2793 1 63.01 ATCCTAGTTACCTTTTTTAATAACGACGAAGTTAGGCAAGAAATATAATATCACTACCTCATAAAAAAACGCATATTAAATTGCCTATTAAAACCCTTATTAGCAATAATAGGTGCGCAACGCTTTGGCATGGAGTCAACCAGGTC:1 + chr2R 8106929 5' - Tc1 1283 1 62.33 ATTATCAATCAACATTTTCCACCATGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTTCTT:1 - chr3R 23235300 5' + BS 56 1 58.22 CATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGAA:1 + chr4 123951 5' + HB 113 1 53.68 AAATAAAAAAATTATACAATATTTTTAAAGCAATATCGATGATCATATAGTAATCTTAAAAGCAGCAATATTATAAAAAGTAATAGAATTTAAATCATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1 - 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roo 334 2 69.18 CCAGCTGCTGTAATTTGCTTAAATCAGAAAGCAAAACTGTATCGTTTGCATTTTTCCTTTGCATCGTTTTTCTCTGACTTTTCTTTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCC:1 - chr2L 12495077 5' - blood 441 1 63.01 CTTAAAATGTTAGAAACCCCTTCTGAAAATAACAATTCCTTTTTTAATACTTGTATTAACCAAGATAATATTAAAAATATGAAAACAGTTTTGTAAAAATGTGGGCGTGGTACGTCACTTTCACTTCACAATTTCCTCATATATG:1 + chr4 857105 5' + Q-element 29 2 79.31 CAATATTCAGCACTTTGCGTTATGAGAATCAAACTCAATAATTTCGAAGCATTGGTTGCACTTATGACAAGCCACTAATTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTGTCTTTCACGGTA:1 - chr3L 23063416 5' + transib2 467 1 54.11 GGCTGCGGCTCATATGACAGCTCAAACCATATAGCCACATAACCATGGGGTGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTG:1 - chr3R 31141047 5' + Burdock 6205 2 66.44 ATGCAGCGCCGAAAATAAATTCATAAATCCTCAAACATAGTTAGTACCAACTTCAAACATAAATAAATATAAAAAAGATCCATAAACCAACTGTTCTATGATTAAACGGCTCTAATAATTTATTCGCTG:1 + chr2L 20627597 5' - F-element 4544 1 65.89 TGGCAGGCGAAAGGAGAAGGATACGGACCGGGACAGTAAGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 - 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chr2L 1119264 5' - Bica 59 1 54.11 ATTATTTGCTTTGTCTGATTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGAATATGAGAACAAGAGACATCGAAC:1 + chr2R 13367450 5' + jockey 4577 1 57.14 AAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTT:1 + chr2L 18112472 5' - transib2 2821 1 75.93 TGTGTGTGCACGAAGTAGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 + chr3R 31724898 5' - P-element 2786 1 14.08 GCCTAAAAGTCTGCAAACAAAGAGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr2R 17332223 5' + jockey 70 1 58.90 GTTTAACACTCACCACCCACCGCATAGGCCGCAGAGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 12486450 5' + roo 8685 2 64.66 AAGTTATGAATAATATCCGGCCATTTTTCTACCCTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTAC:1 + chr2L 18630425 5' + G-element 20 1 71.11 AAGGAATGGCAAATCAAAAAATTCCAACCTGTTGCCATTGTTCGCCGGTCTAATAGCAAGCAGCAAAATTATCAAAGAACAACAAAAACCGAGAAACACAAAAAAAAAAAGAAGGGGAAAA:1 - chr3R 19089455 5' + gypsy2 406 1 57.02 CCTGATCGACCAACCAGTGACCACAATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAAT:1 - chr3R 15790119 5' + flea 4736 1 66.44 GCATCAGCATTCTCATTTCAAGGAGACATAAGGCAAAAAACTCCGCTGCTCTTCTCATTTCGAGATTTCGCCTCCATCATCATCATCAACGTTTTTTTGGCAAAAAACTCTAAATATCAAAATTGATTTCGGCCCGAAAATTGTAT:1 + chrX 5923434 5' + 1360 3188 1 65.75 GAGACAAGTCGCACATACACTTAACGAACGGGCTAATGGCTGACTCCTTGCCTCTTGGCACTTGGCAACTTTTTTGCTTGTTAAGTTTTTAATAAAATAAGTATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCTTGTTACATAC:1 + chr3L 20874519 5' - INE-1 28 1 69.18 AGGTGAATATTAGAATAATCCACATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr3L 17537727 5' + Doc 55 1 54.79 AATTGCAAGTACTAACCCTATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTT:1 + chr3R 6413585 5' + 1360 3387 2 68.97 GGGTGCTTGCCAACGAATTGCAGATGCCCTGGAAAATGTAACAATGGTTTTAGAAACAAATATACCTTCTGACAGATTTTCATATACCAATTGCTAATTGGTGTATGTATGCGAATCATTATTAATATTTTTTTAAAAAAGAAGAA:1 + chr3L 18423628 5' + TART-C 11035 1 76.71 AAGTTCAAGAATTTATGTTATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCATCCAGAAAGGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAG:1 - chr3L 12223210 5' - Transpac 5151 2 71.94 CTGCACATGCAGTCCGGATTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - chrX 16117254 5' - opus 447 2 67.77 AAAATATTAGTGAAATGCAGCCACATAATTTGGCAACTAAAATCGAAAAGAACAAAATTATAAATCGTTCAACATGCTATTCAAACACTTATGACATCAAGTGTTTTGTAAAATCCCACATAAGACGACTTTACTCGTTGAGTCTT:1 + chrX 8349835 5' - roo 9053 2 73.29 ACAGAAAACACAAAGAACAGAAAAACGAAATTAGTTGAGCTTAGCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATC:1 - chr3R 7778337 5' + transib2 75 1 68.49 AGGGAAATGGTTTAAAAATTTATAGTAATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 13678868 5' + hobo 42 1 55.00 CATTTTCTTGTAGTAATCCGTCTTAACAAACTCCGCCATGCCCAGATGACCACCAGTCTCTTCGTCGGGAACAAAGGTCACATACAAAGTCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3R 23098295 5' + roo 8695 2 60.27 AATATACGCCATACTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 25751901 5' - roo 358 2 54.79 TAACGCCGATCCATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:2 + chr3L 27415186 5' - transib2 2791 1 63.01 TTATATTATGATTTTATGACTTTTTACGATTTTCCATGGGAGCTGCGAAATATTTTTATTTATTTTATTTATTTATTTTGTGCTTTTTCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGT:1 + chr3R 6015082 5' - Juan 4150 1 58.90 ATTGGGGTGAAGCTCTTTTAACAGCAACATTCCTAATTAACAGATCTCCAATTATAAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 - chr2L 22775585 5' - pogo 2047 1 57.53 CGGTCCATTAAAATCAAAATTCGCAATTGATGCGCGTAATCAAGTGAGAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCATGCTGACACGTTGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTGCAAATGA:1 + chr3R 30229136 5' - Q-element 168 2 67.12 CGTGGCACTTGTAATTTGTGCTGAGGTTTTTTTCGCCTTGTTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATCTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGA:1 + chr2L 3960026 5' - roo 58 2 68.84 TTTTATGTGCAGCAGAAACGCACTCCAGATTTTCAACAGTATCCTCCGCCGAATAGCGTGTTTGGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGT:1 - 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roo 9014 2 56.85 GATTTCGACTCCCGCACAATTTGAATATATAAAGCCCGGCCTTTAAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATT:3 + chr3R 7778214 5' - transib2 2799 1 68.49 CTTCGTAGCTAAAGAATTCGCATCTTAAAAAAATGTAAAACGTGATTGTCGATATGGTTATAATACAAGTGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCG:1 + chr3R 9228118 5' - jockey 11 1 50.70 AAAATAAAGTAAAATTCGCACAAGACACGCATCGAGAAAAATATGCCCACATCAAGCCAAAATTGCACAAACAAGCCAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:2 - chr2R 11146165 5' + Quasimodo 18 2 73.29 ATAATGGACCAAAAATTGGAATGTAAAAAACAAGCATTCTTGCTCAACGAAGCAAAAGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 2320711 5' - roo 345 2 59.59 ATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chr2L 15777871 5' + 297 45 2 72.38 TGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACG:1 - 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Quasimodo 7177 2 70.55 GAGTCCCTAGCCCGGAACCAGAACCTCCGCCGATTGCTCGAAAGACCAGGAAACCCCTGAGATTTCTGCAACGATCCGCCACGCGACGAATGGCGTTCATGGTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCC:1 - chr3R 18024299 5' - pogo 41 1 69.86 AAGTGGCTTGACTTTTGGACCGCAGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 - chr2L 21910242 5' + Doc 11 1 65.66 ACAAACAATCAGCGACTAAGAAAAATGAAAATGAAATGTAATGCATGAAAGCCTGGCTTAAATGAAAAGCGCAGGGTTAGCATTTGTTACTAAAATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:3 - chr3R 11870210 5' - pogo 2077 1 69.18 AATGTCACAGCATAAACTAAACTGTATTCGTTTAAAAAAATATATCGCTAAATAAGCATGCCCAAGAATTAAATCAAATTGTTTCATAATAATACTGCAATTATACTAGGTAGTTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTT:1 + chr3R 9583232 5' + Juan 4034 1 79.45 ATACAGCTATCAATATAAAATGAAATGTGGTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr3L 18253887 5' - blood 329 2 56.72 TGAATCCTGTAGGCTGTCTCACATTTGTTATTGCCACGAATCGCGTGGCACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGC:1 - 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roo 9052 2 66.67 TCTCAATCATGGTCCACAAAAATCGAGGAAAAGTGGTCACAATGGAATGAAGACATCAAGAAGGTGGAAAATGAAAAACCATGATAAGAGAGTACTTCTATCACGAGGAGAATCAATTTATTTTCTGCACCTAATCTCCAAATG:1 - chr3R 19944027 5' - looper1 146 1 79.17 ACGATAGTGAACATTGTCGGCATTTAATGGGTAATCTTTTGATATTGTAAATGCTGTTAATTGTATAATTGTATAATTGTATATATTGTAATCCTGTTAAATGCTTTTCGCTATAAATACTACTCGACTTCGTCGTATTGATATGC:1 - chr2L 14268598 5' + Fw2 3800 1 34.93 GAATACCGGAGTGACTAGGCATGTGATAGATTTCAATGTGTGTCAAGCATTGGGATTGTTAACTATCTTCTGTTTAATGCTAGATTATATGTAGGACCAAAGACTAGAATGACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 - chr2L 21153683 5' + 1360 30 1 52.05 ATAATTGTGTGTGTCGCGAAGCGTTAATGGAACTTTAATTGAAACTCCGGACTGATTGGGATCTTAAACCAAAACAAATCTCTTTGAATGGCCAGCAATTCTAAAGGCGATGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAA:1 + chrX 6632894 5' + P-element 12 1 77.40 AGAATAAAATAATAATCAAAGTCGCTTCCACAAATAAGAAAAAAAACAAACACTAAAACACAGACTTCTCAACTCTCGATGCAACTTAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 9870038 5' + TART-C 11099 4 65.71 AGTTACATGTATTGTAAATACATTTTCGCAGGGTATTTCCACATTCGCTACCTGGGTTTTCTGGCCTTTGCCGGTTTTTACTTTTTCGGCGCACGAAAAAATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTC:1 + chrX 18294259 5' - 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roo 9019 2 57.14 AAAATGCCCCCTCGGGCGTTTCAATTACATTATTAATCACATCACTCGCAGGTCTTATTTTAAGCAGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAA:1 - chr3R 13355922 5' + FB 927 3 57.53 TTTTGTGTTTAAAGGTACAAAAAGTATAAATTCACTTAGCAAGGACTTAGATAAGGAGTTGGATAATCCATTATTTCCGGTGTATTTGGGCTGCTGACCAGGAGAAGGAAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAG:1 - chr3R 26522262 5' - mdg1 430 1 63.70 AATTCGCAATCGTGTCTTCAGGCACTGCGGTGGCTCCTTTGCCATGTCGGCCTGCGTTCTCAATGTCTTCAAGTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 + chr2L 17527347 5' - mdg1 355 2 53.68 GGGTCACAGAGCATAGGTGCAGAGGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACT:1 + chr3R 5773136 5' + Stalker4 57 4 54.11 GTGTTTGGATGTGGCTCCAGGAAAAGTGTTGGGTAAGCAGAACAGGCGATGTAAAAATGAGCGGAGAGGGGTTTCCATACAAGCGGTAAGGTACTATATACTATAAACATACATATTATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTT:1 - chrX 8219526 5' + opus 7114 3 75.86 ATGTTTAGTCGATTTCGTGTATTAATTATGTTCACTAATCGTAGAAACATATGTGTGAAAAATGTATTGATACTCCTTCATTAACCTATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 + chr3L 18381917 5' - copia 221 1 50.68 TGCAACCGACGGGAATCTTAGGTAAATTTTCACCCAGAACCTACACGCACCCAAGACAAAGCCGAGAAAATGTATATCCATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGA:1 + chr3R 12268366 5' - GATE 73 2 55.56 AGCAAGGAGAAATCAAAATTGTAAAGAACTAAGTCGAGGGTTGCGAAGCCTGCTTACTTGGCTGTAAATGCTATTTTAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTGATTAGGCGGGGTGTTGTTGGTATATGCC:1 + chr3R 15058202 5' + accord2 301 1 52.71 GAACAAGTAATAATAAGTACTTATTGGATTACTATTCAATTATTCTTAACCATTTAATATATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTT:2 - chr2L 13139086 5' - McClintock 6374 2 63.01 GTAAAATTCGCACAAGACACGCATCGAGAAAAATATGCCCACATCAAGCCAAAATTGCACAAACAAGCCAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACA:1 - chr2R 11146157 5' + Quasimodo 26 2 67.81 TGGAAGTCTTTGAGGCAGTCCGCGTACCATTAGTAGTGACAATGGTACAAACTTTGTTGGTTCATAGAGCGAGCTTGCCGAATATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTATAGCTTG:1 + chr2R 2516697 5' - Stalker2 7468 2 57.75 GAAGTGGGCAGTACGAATTTTTGTTTGTACCGTTTGGCATTTCGAATTCGCCTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATGTCTGTTTTTCAAGAGTTGGTCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACATGATACGTAA:1 + chr2R 4193270 5' - 1360 3381 2 73.29 GTTTATTGAACTAAAATATGTGTGTTCTATTATTAGCCGACTATCTGAGAATCGTAGACAATAATTTAAGTAGGCATTGAGTTGCATATCCTAAGTTAAATATAATATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:2 - chr3R 23161410 5' - 412 7532 2 74.66 AAATGCTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCC:1 + chr2R 5070920 5' + gypsy5 26 2 26.21 ATCCATTGTTGATTGTCTGCTGAAAATGTCTGAAGTTTTTCCGACCGGAAAAACAACTGGCCGGCATTCAAGACTAGCCGCGTCGAGTCAAGTCTCTGTCTATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chrX 4673747 5' + roo 8681 2 72.60 GCGTAATAATGGGTTGGTTAATCTATAAGTTTTTACAAATAAGCTTTTTATGGCCAGGAGAGAATGCGTCAGGTAGCAAATTAGCAAAGCATTTTTTAACTTCCACGTTTACAGACTATATGTATTTATAATTAATTTAATTATT:1 - chrX 21049403 5' - flea 232 2 57.93 GTGTATCTTTTGTATCCTTCTATCTGGGTTCCCCTTATCCGCTTCCTTTGTATCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCAT:1 + chr2L 17253083 5' - P-element 153 1 38.36 AACAATGGCAACTCTGGCCTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - 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chr2L 17839492 5' - blood 7345 2 54.79 AGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 + chr3R 26486039 5' + 412 64 2 66.15 AATAAAGGAAGTCACTTTTGTTTTCAGCCCGCATTATTCGCCATTATGCAGTGTGCTCCACTATAGATTTTTACCAGGCTTAAATCAAAAAAAAAAATGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGA:1 + chrX 20920638 5' - 1360 3180 1 66.90 GTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGG:1 - chr2R 1000401 5' + HMS-Beagle2 67 2 64.38 ATTTCTCCGGCAGAAGAATCACGCACTGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chr3R 30264124 5' + blood 45 2 55.48 AAATTGTAAAAGGTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 - chrX 1103716 5' - pogo 2040 1 61.64 GGCTGATTAAACAGGATATGCAAAAATGGCTGGGCATGATGGCCATTAAAGGAGCAGCTGGAGACTTGGCCCTGCGCCAATTAGAAGTACTTTTCAAGGTTATAGTGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAATAAT:1 - chr2L 4637337 5' + mdg1 7068 2 73.97 TTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGGAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCAC:1 + chr2R 12065599 5' + Stalker2 79 2 69.18 CTTTTAAAGGGGTATATAATTTTATGATAGAGATTCGCTAGTCAGAGAAAAGAGAGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATATGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 4651554 5' - roo 351 2 54.11 CAATATTACAATGTGCTAAGGTAACAAATAACAGAAATAGCCGCTAAACTGGGCGCCACAAAATAGGCAACAGTATCCAATGGACATTACCTTAACCTGGTCATAAGCTACTGTCATTCGCATGGGCGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2L 6388206 5' + jockey 14 1 78.32 TGCATTTAGGTGAAAGTGTAGGAGAAATTAACAGCTTTAAGCAGCTTTCACTCTGCTTTGACGATTAAAATAGTTAACAGAGCCATTACACACCTAAGCCGCCTCCAATCTACATCAGAGAAAAAAGTTCCAGCG:1 - chr3L 4954259 5' + Fw2 224 1 68.15 GGGATCTAATTATGTAATAGAAAAGTTAAAGTTAAGTTAAAGTCGATTGCTTTGCGGCGCCTAAATTGGTATGCAACCCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTGCTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGCAGAAC:1 + chr2L 17292394 5' + Cr1a 4005 1 67.12 CACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3R 19436102 5' - roo 366 1 54.23 CACGATCTATCAAGCCAACTTAAGCTACAGCTACTATTTCAAAACCAGCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGA:1 + chr3R 10735979 5' - McClintock 466 2 77.40 CTTGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGC:1 - chrX 388318 5' - 1360 3313 1 70.55 TCTTACAACTATTGAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAA:1 + chr2R 5582134 5' + Cr1a 446 1 72.66 GATTATCCGTGACCTATACATGACATTTTTTCCTGTTTTTTGTAAGAGATAGGATAAGGATGTGTGGTCTGTTGAATGAAAAGTCAGTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr2L 7652345 5' - roo 405 1 82.19 AAACATAAATATATTGATAAATTATATGTTTATTATATTTAACGCTGAGAAAATTCAATCATATTCCAATTAATTCATTTTCACATCAGCGGAAATAACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3L 4640967 5' + jockey 28 1 65.03 AGTAATTTTTGCTTCTCTTTTTTACTCTCTCCAATTGCCATTCAATGTGAGCACGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAG:1 - chrX 8271614 5' + P-element 66 1 40.00 ACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTAGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTT:1 - chrX 1018150 5' + 1360 245 1 67.81 AAATTTTCCCAATAGCACCTTTTGTTATGTGAAAAGCAACCGCACGCAAAGCATTCTCATACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr2L 14969058 5' + 412 31 2 56.55 CCGCCTTTCGCCTTCAATTATGTCCTGGACCCTTTGTCCTTCGCCTTCTGTATGGTTTTTCGATGATGGAATCACAAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 20203584 5' - 412 452 2 52.05 ATGCGTGTGTGTGAGCTGCATTGTTTGCATTTCAAATTGAATTCCTTTACATTTTCAACCAGAGCACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chrX 19788880 5' + hobo 11 1 64.84 AGATTCGTTGAAATGTGTGTAGCAGGTAGAAGGAAGCGTTTCCAACTATAAAAAGTATATACATTCTTCACCATTCTTCACCATGTCCGTCTGTCCGACTGTCCGTCTATCCGTATGAACGTCT:1 - chr4 281581 5' + INE-1 127 1 58.06 CGAAATTTTTGACCTTTCATTTACCTTCCTTAGCTATAGTAAAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCAT:1 - 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chr3L 1856767 5' - Transpac 265 2 60.87 ATTCATATTTATTTAGCTAATAATATAAGTCAAATCGAAATTATTTATGACATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1 - chr3R 16230358 5' + blood 67 2 64.29 GAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGGTGTTTCTCCGGACATAGGTCCTAGGTAGGGTAGGGCAATCCGCGAAAACGATCACGCAGGCAAAAAATTCTCAAGCTTTTCCCCCTC:1 - chr2R 5173235 5' + Gypsy12A_LTR 2013 1 75.00 GTTCACCAGGATTGCTGAGAGAGACGCTGATCCGATCACAGAATGAGAGGTACATATATATCGCAATAGTAGTAGTATAGTTATTTTACATTTTATTTATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTCTTGTGTATCGCGTCTAAATCTTCTCG:1 + chr2R 5537236 5' + Cr1a 4367 1 54.79 GGTATGAGGAAAGACATTTATAAATAAAGGCCATGAACCAAATCTAAATATATATATTTTAACAGTCTTTCATTTAGAACAAACCCTTTTTTGGTAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 21674779 5' + roo 17 2 65.00 ATCACTCCCCGCAGCACCCAAACGTCCTGTTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 14218435 5' + roo 51 2 60.00 ATCTGTTTGAAACGTTAGCTCTACCTTCGATTTTGCGTGATAAGTCAAACAAAAACGTTACTTTCTAATCGAAACAGCGAATTTAAATTAGACACCTTTGAAACAAAAAAAGAGAGAAACCTATAGTCCAGTTCCCCGACTATCAG:1 + chr2R 5217637 5' - INE-1 562 1 75.34 TTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACCATGAATTAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATATTGAACTCGTCTGATGTTTCTCTGGACATAGGGCACCAAAGGCTCCTTAAGACCCATGCTCTTAAGGAAAGTAGT:1 + chr2R 4774809 5' + Gypsy12A_LTR 1934 1 80.14 GGTCTTTTTTTATACCAATAACCTTTTATTTATATTTTATTATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATGTAAAGTACTCTTAGTTTGTGACCGAAC:1 - chr3R 7823384 5' - flea 4937 1 69.18 GTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 24673646 5' - roo 360 2 60.32 CTTTAGTTGGAATTCCATAATGAATGACACAGTGAAACATTTTTGAAGGTTTCAACTGTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 11164363 5' - roo 390 2 63.45 ATGCTGTGCCTCTTGTGGCACCATTGGCACTTTCAGTCGCTCGGAGGACGTCACAAGGATAGCACGCACATCCAAAACTGTCCTTCAGTCGTACGAGTAACGTGTATGAAAAGAGGGTGCGGAAGCATATCTTCCTTTTTTTAAAT:1 - chr2R 10002474 5' + mariner2 13 1 59.59 AGTTGGGGAATCCCCAAAAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATAGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGGTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCT:1 + chr3R 25543444 5' + G2 222 1 41.10 CTTGTTTTCTAAAACGCTCGACATCCGAAATGGGGAAAAGGGTTTTCCGATGGGTTTTTGGCGCGCATCGCGCAGGCGCAACGTGCATTTGAACTTAGTTACACAATGGAACTGCCTTTTTGTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGAT:1 - chr3L 8547065 5' - I-element 104 1 84.14 GAAAGGCGCTAAGACAACGCGAACCCAATATGAAAGGAGCAAGAGCAAGAGCAACAAACGCTCGGAAAAGTCGGCCAAGTAAGCGAAACCCTGCCCTCGCTTTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTG:1 + chr3R 6487246 5' - 1360 171 1 70.55 GTCGTAATTTGTTGCATACTTTTCAGAGCGCAAACTTGGACTACAACTATGTAAGTAGGTAAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 - chr3R 27374481 5' + jockey 65 1 55.94 TATTAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCGATTTCC:1 - chr2R 4886042 5' - INE-1 573 1 51.37 GGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr3R 16276415 5' - pogo 2089 1 58.02 ATGTGCATAAAATTTGGGGACATTTAAGTAAAGGCGTTGGCGAAGCAAGGGTTTCTCGTAACAATAATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3L 14375752 5' + roo 8683 2 71.74 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCGGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTAT:1 - 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Bica 484 1 63.70 AAAATTTCCCAGCGAAGCGTATGAAAATGTCGTGAAGGGCGAAAGTGGAACCTATTTGGATTTCGAATATTTATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1 + chr2R 11263969 5' + jockey 4702 1 57.36 AACAACACACAGGAGGCACATCCACATGAGTGTTAGTCACACACGATTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGCAAATTAATTAAAAGCAGTCTACTGGAATAA:1 + chr3L 12632941 5' - Cr1a 3973 1 59.65 AACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAGGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGA:1 + chr3R 9125658 5' + Doc 67 1 55.48 TGCAGAGGCGGCGGCTGCCAAGAAGCACAAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAA:1 + chrX 22866500 5' + I-element 5177 1 77.86 GGCGATCCTCTGGCGATCCGATCGGCAACTGGGCTCCAAGTTCCCGAGCGCCAAGGCAGCGCAGTCGGCGTCGCTGCCAGCGCTGCCTCTTCTACTTCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCC:1 - chr3R 31724985 5' + P-element 6 2 77.42 GAATAAAAGAAATGTCCTGACTTTCCTACGTCTGGCTGCTTAATTATGAAGCTTGTTAACTATTAATGAAAAAGTTGTAAACCTCACCAGACGTAAGCACCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCG:1 + chr3R 9207770 5' + Doc 461 1 72.18 AGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAC:1 - 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P-element 2867 1 70.55 ATGCACTGCAGAGCTGGGCGATGCCCAGAGAAAAGCTGAAATTTCGATAAGATTTCGCCAAGATGCTGCCAAATAAAATGTCATAAATCTTGGCGCTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTTAATGCAGCTAAGTTTTATTCTTAAA:1 - chr3R 7043938 5' - rooA 196 2 68.49 TGTATATATGAAATAATTCCTGGGATATTTCTTTCTGTGTACCATATCCTTGGACAAACACTTCGACTCTAATGAGGCAACTTAAAGTGTGCTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr3L 13364424 5' + hobo 29 1 66.44 TACCAAGTCCAAGACTCTGACCGATATTATTATAAATTTTGATAAACAAGCATGTTGCATCAAATGCATATATACGATCTTCTCTTGGATCAGTTATACTATTTGCTTGCCTTTGTTTTTTTTTTTATTATTATTATTATTATTTT:1 + chrX 6631661 5' - mdg1 7079 20 77.40 GTGAGGATTACGAGGAAGTGATGGTGATGAGTGGTCCCCATAAATATGGACGTTATTATCCATCAGAATCGGAGGAAACAGATCAGGATCACGCACATGGTTATGATAGTCTAGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTC:1 + chr3R 9178415 5' + 1360 440 1 74.66 TAATATTAAAAAACAAAAACATTTAAGGACTTAAAAAGATATTTGAAAGAAAAGTCATCCTATCAAGTCTAATCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1 - chr2L 15644972 5' + transib2 46 1 53.10 GTTTGGAGCGAAGTATCTGAGAGTTACGCAGATACTTGCACATACTTGCAGATACTTCTGTGTGGCCGCATAATTTTTCAGGGATATCGATAGATATTGGTGAATAATATGGGAAAAAATTTAAAAATTGTTCAAAAGTGTGGGCG:1 - chr2L 8282748 5' - INE-1 255 1 53.42 CTCAGTCAATTTTATTTACATACGAATATCAGTTCGCGAGCTAATTTGAAAATGTTTTGCCTCCACTTTAGTTAACTTTGTGCTAGTTCTGCCTTCTGCAAATATTTGTTAGATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 - chr2R 10160664 5' + hobo 1 1 75.91 TTAAAATCAAATGCGCTCGGAAGTGAAGTTAAAGCACCAAGTGCATTTAATCCAGTCGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACT:1 + chr2R 7599151 5' + diver 5951 2 59.31 AGTTGTGCATACCAATTGTTAACATAATCAGAAAATTAAAATCTTATTAAGTAAAATAAAAATAAATATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAAC:2 + chr4 213081 5' + BS 4939 1 54.79 AATTAATTTTTAAATGCAATTGAATATAATAAATTGATATGATAAGTGATATGGTGAATTCCTACCGTTATGTTTGGTGGTAGATATTCTCTTAACATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTC:1 + chr3L 26540995 5' + Idefix 7061 2 65.75 AAAAAAAAAACTATTTTTTGTATATAATCCTGGACTGAGTTTTTAATTGGTTCTGGTTTCATTTCAATATACAAATTTCGGATCCTGATCAGGAATATATATACTTCATATATAGTCGGAAACGCTTCATTCTGCCTGTTACATAC:1 + chr2L 23173466 5' - INE-1 28 1 58.22 ATAAGAGCAGATAAACAATACTATACTTTGTAAAGCCCCACTTATTCACGTTGAATACAAATTAATTATAATTTTGTTAATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 + chr3L 17667528 5' + F-element 45 1 56.16 ATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTT:1 + chr2R 5582173 5' + Cr1a 492 1 52.74 AAAAATGTCCATATTATATATATTATTATAGATCTCCCCCCTTTTGTTGCAATTATTTGCCTAAAACCGAAATGATTTCAATTTGTGAACTTACAATGCCCATAGGGATCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAAT:1 - chr3L 5369139 5' + hobo 311 1 66.44 CCTTAATTTGCGGCTAATTTGCATATTGTATATTTCGCTTGTTGCGCAATTTCAGTTGCAGTTGCAGCCAACGTTTCCTGCCCACCGCCACCTGTGTCCTTGTCCTTTCATCCTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAG:1 - chr3R 6495416 5' + Stalker4 6964 4 79.58 GTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCA:1 - chr2R 1000405 5' + HMS-Beagle2 6946 2 61.64 GGGAAAGTTTTGGAAATATTCGTATAAAATTTAATTTCATACGAACAATTTAATAAATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr2L 6601283 5' + roo 66 2 67.81 AAATATAAATCCCAAACCTCCCGCACTCGAACTAAAGTACCCAAACTGTAATGCCTCCAAGTTGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACG:1 - chr2R 3590824 5' - FB 353 1 55.80 GTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chr3R 28406370 5' - opus 7445 2 73.17 AAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGAGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr2L 17295854 5' + Doc 82 1 68.49 GCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGT:1 + chr2L 19407048 5' + Doc 71 1 68.28 CAAAATGTTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGCAAC:1 + chr2L 13629072 5' + Tirant 8167 2 62.22 CATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 - chr2R 18344631 5' + 1360 67 1 63.01 AAGAAATCCTATAAAGTGAGTATATCCTTGATTAGGATCACTAGCAAACTCGATCTGGTTAGTTTAAGTTCTCGATGTTTAAACATTAATATAATCGGATTATTTGATTATGATTTAAATATTAAAATATTTAAAATAAAAAAAAA:1 + chr2R 11925504 5' + TART-B 10629 2 78.08 CATTCCCAACACTAAGCGGTGAAATGTGGATTCAAGTTTTTTGTGGACTTAACATGTTTTCGATATCAGTTCTGAAATATTGACCAATTCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTC:1 + chrX 6094228 5' + F-element 436 1 65.44 TCCGTCTTTTGCTGAACGAAGCGTTTGAATGGAATTATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTG:1 + chr3R 19171447 5' + opus 7188 4 76.87 ACTACTATATACGCACGCTATACAGCTCGGTTCCCCCGACCTTAGCACGCATTTAGCAGTTTACAGAGCCTCCGAGTGGCGACGTAAACAACAACAAACACAAACACA:1 + chr2R 14265726 5' + gypsy3 419 1 74.07 ATTTGCAAAGTGTTTGACTTAACGGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr3L 18183221 5' + Tirant 12 2 76.15 ATACCATTGTGCGAAAAGAATCCCACTGTCCACCGCCATGGTAGCCCCTATAGAAGCCCCAAGTCCCAGGTGTAACTGATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2L 3231843 5' + roo 39 2 57.24 ATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:2 - chr2L 17626657 5' - roo 8985 2 80.69 GTGTGGGGCTAACTGGCGCTCATAAAAGTGGAAATGTGTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAA:1 - chr3R 8639310 5' + copia 4937 2 73.64 CCCATAATAGACAGCGGAAAGAAAGAACCTGCGGTTCTTGCACAGAAAAATGGAATTCCCAAAGTATGTTTTGTTTTTTCTATTTTGTTTAAAATGTTGCCAACGAGCCATTAGGGTCAATAAGTCCATAGCCCAACTTAAGGAAG:1 + chr4 735761 5' + gypsy3 6502 1 66.44 CAAAATTCGTAACAACAATGTTGAATGTCTCTATGGGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTTTGTGTTTGTGTGTGGTGTATGTGTGTGTGTGTGGCGTCTGCTTGTGGTGGTGTATGTGTGTGTG:1 + chr3R 20362873 5' - Quasimodo 44 2 63.16 CCGCACATTAAAAGCGATTTAAAAATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTT:1 + chr3R 7616707 5' - Stalker2 7606 2 54.79 TATGCAGGGAATTTCTATTATAGCCGCAAAACAAAGGACACACAACACAGTTTCAATGAAAGCCCCATACTCAATTGCGTGAAAAGTTCGCAAATATTATCCACATATACTTACACACAAACACACATACATAACCA:1 + chr2L 4245872 5' + Quasimodo 42 2 72.26 TCGGCTGGTGTGCACAAACCGGAAGTCCTTGATGCAAATGTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGCCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chrX 7741901 5' - hobo 2905 1 59.60 GTGCAGCCATCGAACTGCGAGAATATAGTGTACAGAAAACATGGCAATCATTGGCTTTGTTTTTAAACCGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGACAGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACC:1 + chr2R 21424903 5' + F-element 457 1 52.45 GAAATGCAGCCACATAATTTGGCAACTAAAATCGAAAAGAACAAAATTATAAATCGTTCAACATGCTATTCAAACACTTATGACATCAAGTGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:2 + chrX 8349846 5' - roo 9042 1 65.75 ACTCAAGGATAACATTGCTAAGCTATTGTAGATTTTCGTATCATGATTTTTATACCTGTTCCTTGCTAAGTAAAAGGTTTTCAACAAAGTCTAAATTGTCTTCCTTTTTCGTACATTCCCCTGGACAAAAGTCCCCAAATGTTTTC:1 + chr3R 4354723 5' - Tc3 1250 1 65.75 CTAACCGACTCTGCAACAACGACAATAATTGTCGTTATAATAATGGTCACTTTTATAATGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3R 15295714 5' - roo 9013 2 64.14 TATATGACTAAAGATACAATTTGCATGCAGTTATAGAATGCTATTATTAATATAACGTAATTATTATATATGAATGGAAGACAGGCAATAATTGACTATAAGAATTATACGCGTTCTTGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAG:1 - chr3L 16016059 5' + 1360 3249 1 75.34 TCGGGATTTCTTACTCTTGGGGTGGTGCCAGTGGTGGCTTTTCCCAAATGGCAAGCTGAAAGCTGAACTTCCATTTAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAG:1 - chr2R 19852263 5' - Transpac 310 1 76.92 AATATGATTCCCAAGGGCCTTAAAAAGCAAAACAATATTTAACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr3R 26485986 5' + 412 7080 2 65.75 TGGGTCGTCATAGTTGGGTTCTCTCAACTTTGCACTCAGAATATTAAATTATCATAAGAAGTCAGAATAATATACTTAAAATGCGATATTTATAGTGGAACATGATGCAAATGCTTAAGTTACTATATTGGTGACCCCGCAATA:1 - chr2L 18558279 5' + Chimpo 203 1 60.42 AGATGAGTAGTTAATCGGCTTCTTCTGAGATTGGTTAGAAGCGTAGATAGAAGAAAGGGCTTCCGAGCATTGTACAAAGTATATACATATATTCTGATATTTATATTCTTGACCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATATCCGTA:1 - chr2R 6159433 5' + INE-1 110 1 65.28 AAATCATCGTTGTCAGTTTCGACATTTTAAATTGGTAGCCAGCAAATGATGCCCAAAACTGCATTCTGTTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chr3L 20252021 5' - copia 204 2 53.79 AGCGAGGGCGTTAGTGTCCAAATAAATAAATGCAGTGCGGTGCGCCAGTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 - chrX 16117313 5' - opus 7484 2 71.92 GGTCTTAACCATCATGATTAGGCGGCCATTGAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2L 5792111 5' + blood 7048 2 60.00 ACATTTTAATGAGCCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chr3R 25795820 5' + jockey 85 1 70.55 AAACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTCAAACACA:1 - chr2R 18014112 5' + Doc 79 1 66.67 CACTGGCGCATTTTGTCACCTGTTTTTTTTTTAGTTAGAAGTGAAGGCAATCGACGTGATGGATAACAAGTTTAAAATTAGTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chrX 1102659 5' + pogo 38 1 47.26 CACCGCAGCGCAGAGCAACATTTAAAAGCTTTGGCCAACAAAAAGCGAATTGCGTACAGTTGTGCAACGGCGAACATTCGATTCGATTCGATTCGATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTA:1 - chr2R 11598789 5' - Burdock 31 2 71.09 CACGTAAATATTACATTTCTCATTTTCGCTTGAAGTTAATTTACGAACATACAATTACTGATGTAGGAAATTATTTTTTGTAATAATATTGTTCAAGCATAATGATCAGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACG:1 + chr3R 14955298 5' + Tc1 485 1 63.77 TTAAAATCCTAATAGACAAATTACGCTACCGACTTTAGATTAATGAAAGTTTAGAGAAAAATAAATGAGTTAATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chrX 8977425 5' + I-element 43 1 54.29 ACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACT:1 + chr3R 11151816 5' - mdg3 5427 2 65.07 GGCAAGTCGTGGGTATGTAATACGAGGTGGGCAAATATTTGCGTCCGTTTGAGTGAGTGTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGGTGCGGTGGTGCAGAGGTAAGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAA:1 + chr3R 13437113 5' + hopper 19 1 63.70 CGTGGTCAAATCGTGGGTAAGTCATTTGCTCAAGTATTATGAATAATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAG:1 + chr3L 465984 5' - Juan 4139 1 69.18 CATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:2 + chr3R 13225477 5' + hobo 56 1 55.48 AGCGTCTCCGTCTCGGAAATCGTAATAGAAACGCCGAAAAGATGCCAAGGTAAAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAA:1 - chr3R 29334576 5' - roo 100 2 63.70 ATCGTACTTGGCACGGGTCTCCATGCCAGCGGGGTCACTACCGTGGTTTGGTTCAGTTAGGCCAAAGGCACCTGAATAAATATGTAAAATATTTGATATATTGAATTTGTTTTTTAATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATT:1 + chr2L 6493784 5' - S-element 111 2 58.90 AAATTACAATCAGCGACTAAGTGCATAAGTGTGTTGTGTGCTGAAATGTGTCACTACGCACATATATGTAAGCCAACATATAGCCTAGTGTATATGTAACGCGAAAGTGCATCATTTTTCTGGGAAATCGATAG:1 + chr2L 3266060 5' - INE-1 502 1 69.40 GGACGGATTCAAAGTGAAATGAAATACGCAGACGGAAAAGCGGAAAAAAGGGAAAAGATCCCGCTTGAATATGACCTACAAAAACTTATCCATTCCATGAAAAAACGGCTTCAACTTGTAGCCAAAGCCAATGGGGGAG:1 + chr2L 12225108 5' + S-element 1406 1 64.03 GATAAACGGTACAATCGAACAGCTGACTGGCAGGCATGCGCAATGATAACGGTACGGCGCACTCCGCCGTAAATGGAGATCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGG:1 + chrX 6039817 5' + Transpac 319 1 65.83 AAATGGCTCTTAACGCTACCCTGATAAGCGTTTGAACACCTTAACCCATAAATATTTGACAGGGCACAGTTTATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr3L 12835982 5' - 1360 3365 1 60.83 AAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAG:1 - chr2R 18014094 5' + Doc 94 1 80.43 GCGGACAGCTGTGGCAAAAGTTTGCTACTTTCTTTTTATCTTTTAAAGGGGTATATAATTTTATGATAGAGATTCGCTAGTCAGAGAAAAGAGAGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 4651515 5' - roo 9054 2 73.29 AGAATATTTCCCTAAGACCTTCCTCAACAAACGAATGAGGCTTCCCTCTTCTTTGGGGATTCCCATTTCAAGCTTTCTGAGTGGCAGAAAGCATAAGGTCCTCTTTAAAAATTCTCTATCTCTAAGGGAGCCACCTTAGTCCGCT:1 + chr2L 5750815 5' + Q-element 494 2 60.00 AAGGAGACACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGC:1 + chrX 8967381 5' + HMS-Beagle2 6940 2 57.93 ATGTGTGTGTGTGTGGGTGGCTGTACGTTTGGTGTGGGTGAGATAGGAAAGGAGATCCTTGGCCTGGCTAAGACAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 22894852 5' + roo 8711 2 53.42 GCTGTGCCCTGTTTTTCGAGAAGAAACGGTAATTCTGCCACTCTGTGGCGACAAACGTATATGCCACGCAGGCTGGCCCGCACAGTTAATTGAATATTCGCGCC:1 - chr2R 15136849 5' + McClintock 31 2 50.96 GCCATGGTGGCCTTCGTTCAAAAATTTTAGATAACGAAGTAGTAATGCATTTTAATTAGATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr3L 9470071 5' + 412 17 2 72.60 AAAAGTCCACCCCTAATGGCTAGCTAACAGCGACCAAAAAAGCTGAAAACCCCTGGACCGCGGACATCGAACGGACCTGAAGCGGCCATTTGCCATGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAA:1 + chrX 7265410 5' - 1360 459 1 68.57 AATTATATGGCTTTCGATGGGATGTGAAAAAATGTGATGTGTGCCAAGGGCTATAAGTTAATACTATAAGTGGGTACATTTGAATCTATTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCG:1 + chr2L 16456727 5' + BS 5029 1 45.21 GGGCTGGGGTTTCGGTTTGCTGCCACCATTGCCGCCATTGCAGCAAGAGCTCTCTGCCAAAACAAGATAATGAATAATGAATAAATGAGTGATTGCATATATTCACTTCAGTTATGAAATGGTAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chrX 5633976 5' + jockey 4691 1 79.45 AGGGCGTGCGCTGAATGGTCTTTAAAGTAGGTGCCTGAAAATTGTAGAATTTCCCCATAACTAAATACGACGATACAGTCGATTTCAAGCAGCAAACACTTGTGGACGTACATAATCTCCGATCAAAATTCTCC:1 - chr3L 15669687 5' + ZAM 364 2 52.99 AATGCCGAATGCCGAATCTATCGTACAAAGGCCAGTTAATATCCAAGCCAACAGTCATTAAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 21674960 5' - roo 395 1 71.92 ATTGCACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGA:1 - chr3R 14049453 5' - transib2 2784 1 56.85 ATGCAACACTGGTTTTATGCTATTATAGTTGTCCCGCTTTAGGAGGCAAATTCAAAAGTGGCTCCCAACTTCAAAGATAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr2R 9607226 5' + pogo 40 1 57.53 CGCACATTTTTGATGTTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTG:1 - chr3R 13349605 5' + Ivk 41 1 55.86 CGCGTTTCTCGTTGCGCGCTCCTTGCTTTGCGAATTACAACTACAATGCCGAAGGTGACGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 + chr3R 14277863 5' + P-element 22 1 65.32 ATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTG:1 - chr3R 14049401 5' - transib2 2733 1 79.86 AACGAAATTTAATGCAAGGTCCTGAAAAGAGGCTCGTGTTGCAAAAAACCGGAAAGCAAGAAGCCGAAGCTCAATGTTGAAACATTTGTTTAGTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 21403525 5' + roo 22 2 68.31 GAAGAGTCCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGC:1 + chr3R 24750944 5' + G6 15 1 71.82 GAATCACGAGTAAGTCGAGCCTGAAATTCCCAATATCGAGACCCAAATAATGATCATTTCTATTGTAGCTGGTATTACGGACGCATCACGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGT:1 - chr2R 13497779 5' - 1360 230 1 59.59 GAATTCTCAGACTCTCATGTAATCTTACATGACAACTGTCACTCATTTCATTGTTATTTAAGTCAAAAAAAAAGAAAGAATTTTTAAGTAGCTTATACTCATATATAGCAGACAATTGTAGATTTAAGAAAATAAATATTTTAATT:1 - chrX 14875020 5' + Stalker2 7182 1 41.10 ATATGCTACATATACCATGATATGCTACATATCTATGATACATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:3 - chr2R 17169280 5' + hobo 80 1 73.97 AATGTTGTGATTAAATTTTGTGATTAAAATGACTACGATCTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTACATTTTATAATTAATCTTATATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTACATACTCTAGGCATA:1 + chr3R 7080616 5' - G4 3743 1 72.60 GTCGTGGGAAGTGGGCCGCACTGAAGGTCACTAATTGATTAATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 - chr3R 14986158 5' + jockey 4733 1 68.80 ATATTTTCAATTATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTGT:1 + chr2L 9274968 5' + F-element 50 1 58.62 GAAAAAGAATCGCAAAGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2L 16331054 5' - roo 9020 2 55.48 GACACCACAAGACAAAGAATAGATCGAAAGTTAAAATCATATTACACTTTTTAAAGATAAAGCAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGC:1 + chr3R 7583669 5' + Doc 346 1 57.53 CGCTTTCCGTTTTTCGTGTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGG:1 + chr2L 17260755 5' + P-element 74 1 20.83 GTTTATTTCAAACAGATATTAGTCCAGATTATTATAATTTTCTTTTGCACTTGCCTGCTGTGAAACCCTAAAAGTGAGCCAAGAAAACTTCTTTCATAGTTCTGCTTCTCACTAAATTAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGA:1 + chrX 7446141 5' + jockey 4673 1 54.11 TATGGATTATTTTTAAGGCCAACCATGCTTAATTTGACTGTGGCACCACCTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:1 - chr3R 18635353 5' + opus 15 2 73.97 ACCATATCCTTGGACAAACACTTCGACTCTAATGAGGCAACTTAAAGTGTGCTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr3L 13364384 5' + hobo 53 1 60.77 TCTAGGTCTTCGGGCTAGAAGCTGCCTCTTAGCCTCTTATATAATATGAAATATCTGCTGACGTTTTAACCGGTGCTATCCTGTCCACTGGCAAAACGACATACGCTCTCAGCGACAATGTGAACAAGAC:1 + chr3R 3697539 5' + Doc 236 1 69.23 ATTGGCGCAAAGCTCTCATCTAGAGTGGGTGGTGGTTGTGTTTTTTATTTTTTTTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTA:1 + chr2R 19183020 5' - FB 611 3 63.70 AAATGTTATTTTCCCATGCTAAAGTGTTAGATAGAAAAAACTTATGTAAGCTTAAGAAATATAAAATAAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTT:1 - chr2R 5023361 5' + rover 41 2 56.43 GGCTCCTCTGAGAATCGTTTTGCTTTCATTCAGTTCGGTTCGGTCCGGTTTGGATTCAGTTTTCATTTTTCAATTCAATTAAGCGTCTTTTGCTATTTCTTTTTTAACATAAGGGATTCCTAAGTCTTTATGGATACTTGCATTTG:1 + chr2L 20912779 5' - G4 3541 1 59.59 AGTTTTGGGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTCAA:1 - chr3R 5422953 5' - roo 348 2 56.16 ATGAACATGACTGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCC:1 + chr2R 4577063 5' - Chouto 457 2 58.90 CAACAACAACACTAAGCGAGCATAGGACAAGTTAGGCACTTACCTTTCAATGGCCGCCACTACCACAACAACAACGCACACACTTTTAAACAATTTTTAAATTTTTTCTCATTGTATTCCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAA:1 - chr3L 11118042 5' + INE-1 499 1 55.48 CATCGCTGCCTCTTGAACTGAATGGGCGGTGGACTGATGTCGTCCACGGATGGCGCCGATCCGGGACTCTGGACCAGAGAGCTCTGCGATTAATGTATAAGATCAAGAATAGAGCGCGCTTGCGACAAAAGAATATAGCAGCTAG:1 - chr3L 3945538 5' - Gypsy12A_LTR 2089 1 60.00 GTTGATTGGAAGTAAATGTTTACAAAATCAAACTGATGGGATCTTATGAAATGCTGGTAAAGCGTTTCGAGGGAGAAGGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr2R 9294288 5' + Tirant 8149 2 58.22 CAGTGGAATGGCAGTTCCGCCATTGACCTTTGCGTAGGCGGGGGCAATTTGTCTGCAATCGAGAAAAAATGCATATAGATATTAAATTCCACTGTTTGTTCTTTACCGACTTATCCGCGCGTTTTCACTCCCGAACTC:1 - chr2L 19907792 5' - gypsy8 438 1 62.32 TTTGAATAATATTTAAGTGCGTTGGAGGTATTTGCCTACCCGTATCTTTGCGAATGAGCAATGAGAGGAGTCAACTACTTTTTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCCGTTC:1 + chr3R 19263672 5' + Cr1a 4091 1 56.30 TTTCACGTAACATTTATGGGTATTTAAATGTATATTTTGAAAACACTTCTTTATTTTCAGTTTAACTAAACTTTTAAATGCAACTTAGATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3L 4651689 5' + roo 8695 2 56.16 GTTTGGATTTTAAAATCCATCGAGCTCTTAGTTTATTTATTTAGCACTATTTGCACCAGCAAATAAGCTGGAATTATGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 25751773 5' + roo 8709 2 50.68 GTGGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAAT:2 + chr3R 10437034 5' - BS 5045 1 52.05 GGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chr3L 3453584 5' + Tirant 8153 2 55.48 GAATTTATGAAAATTTTGCATACTCGTATCTGGCCAAGAAACCGAGAAATCATTTGGATGGATGCCAAATTGAGGCTTTTGTGGAATGGTTTCGAAGTTATTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATT:1 - chr2L 12417088 5' - hobo 405 1 70.55 TGACACAAATATGATTCCCAAGGGCCTTAAAAAGCAAAACAATATTTAACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 26485979 5' + 412 7073 2 70.55 AAGCCCCACTTATTCACGTTGAATACAAATTAATTATAATTTTGTTAATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATACAATA:1 + chr3L 17667560 5' + F-element 77 1 58.22 ACTTTCCCACTTTTACCTGCCTAATCCTGGGCAGCTGTAAATGATTAATTTGTTCAGCGGTTGTGACCTCCGCTTGAGTTTTCGTTTTATTTCTTTTCTAATCAAATCGACGTGAAGTCAAGTCGTG:1 - chr3L 16025713 5' + Gypsy12A_LTR 275 1 52.76 AAAACACTCAGTACTAAAATAGAACGCCATAGCAAAACTTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTT:1 - chr2L 21698322 5' - 297 317 2 76.03 GGTAGGCAGTGTAAAACAAAATGTCGAACTAAAAAACTTGGTTAAATAAGGTTCGCAGAACCATAAAACAATATAGACAGAGTCAACACTTTGGATCGTGGTTTTTTCCTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chr2R 13813302 5' - Doc2-element 234 6 62.10 GGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTA:3 + chr3R 10437036 5' - BS 5043 1 52.05 TAAGGACTTAAAAAGATATTTGAAAGAAAAGTCATCCTATCAAGTCTAATCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAAT:1 - chr2L 15644949 5' + transib2 70 1 67.81 TATTGTGTTGTTTCATTCATTTAGCAGATACATCTGCTTGTTTGTACAGAGATACAAAAATATATATATGCGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAG:1 - chr3L 3453715 5' - Tirant 8457 2 52.74 AATCATTTTTCTTACATTTCTTATTTCAGCCTTTGTCGCAAAATTATTACTCGTAGAGACCCTATACTGTAGATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 + chr3R 20872084 5' - 297 352 2 59.31 GTTGTGCTACTTTTCCGTTTTCGTTGTTCTGCTGCTGTGCTCGCAAAAATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3R 15920324 5' + 412 7080 2 64.96 CTGGCTAAGGACTCTTGGCGGCCCATTACAAGCACCCACTTAACCACTCGTACATTCCCTTGCCACCGAAGCAGCCTAACAAGCGGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCA:1 + chr2L 13693334 5' + F-element 4585 1 60.96 AAGAGTACCCTGTTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCACCTCATC:1 - chr3R 10736185 5' + McClintock 4 2 79.45 ATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTG:1 + chr2L 12291849 5' - Tirant 327 2 67.81 CTTTTATTCGCTCTTCTATTATTTGCCGTACTAGGCTTTCGTTTTTGGCTTCTGTATGGCAAAAGTAGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr3L 12874860 5' + jockey 61 1 53.42 ATTAAAGTAAAATCCTGAAATGCCTGGATTGTGTCTCAAGTTAAACCAAAGCTCACATGCTACGTTTACTTCAAAAATTGCTTTCGAGAACGCGAATATGGGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCGGAAATCAATTTT:1 + chr3L 11449615 5' - 1360 3182 1 51.37 TCCCACAACAGTGGGCTGTTAGGCGCAAAAGAATATGTATGTTACGTTACCGAACTGTTATCGAGCTTGAAAACATTATAAAAAAGGAAAAAATTAATAACCTTAAAATTTTTCTTTTGGGCAAAAAGTTAAAAAAAGAAAAAAGA:1 + chr2L 3171132 5' + TAHRE 10441 1 50.68 GTTCTCTGACGGTCGTTCGCTTGCTCTAGCCGTTCTCTGCGACTTTGAGCCACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAC:1 - chr2R 1320504 5' - Transpac 5175 2 59.40 CATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGTAGCCGGCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 - chr2L 14969153 5' - 412 421 2 75.41 CATCTCGTCCTTCGCCCATCCAGTTGGTTGTCTTTATTCCACCACTCATTCGCTTAATTAGTACTTCCGGATCAGTGCAGTACCTACATCTACTTCCCCGCCCCCAAAACCTCCACGCCAAA:1 - chr3R 28703032 5' + gypsy5 29 2 37.70 CGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGC:2 - chr3R 7616829 5' + Stalker2 56 2 59.59 CATACGAACACTCCAACACACTCACATTCGGGCAACAAAAAAAAATTGCCAACTAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3L 4524024 5' - roo 341 2 62.33 AAGGAAATGAGTTTGCGACGTATAGGAAAAGGTGTTGACGGAAATTTGTATTCTGGTTTTGATTTCATTCATGGATAAGCGTTATAAAGTGGATATCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAA:1 + chrX 11643118 5' + pogo 1952 1 62.33 GCAAATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTA:1 + chr2R 18689141 5' - Burdock 6332 2 60.96 TATGCTACATAATCATATTTCAAGAAAAAGTTACAATCGATTGTAAAATACTTTAGACACCTCATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCGAAAACACTTGGACAACACTA:1 + chr2L 15013236 5' + BS 4943 1 57.53 GCACCTGCAATTGATAACGGGTCGCCAAATGGTAAATAGTACAAACAATGCAAGTTAGCACAATCACAAAACA:1 - chr2R 18689232 5' + Burdock 6136 1 71.23 CCAAATGCGAGCAACGTGCACCACTTAAAACTTTCCCACCACTTAACTCACCCCCTCGAATAGCACACCCCCCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTAT:1 - chr3R 11095898 5' + hopper 34 1 54.62 GTTCCATAGCCATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr3R 13225467 5' + hobo 46 1 54.11 AATTGCACAAACAAGCCAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATGTACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGG:1 - chr2R 11146105 5' + Quasimodo 82 2 72.60 TAGTGCCGAGTGGCGTAATTCCCGGTGTTGTGTCTCCCGTTTTGTTAATAGCGCTGGGTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 + chr2R 19852141 5' + Transpac 39 2 52.80 CAAGAGTCGTGGGAAGTGGGCCGCACTGAAGGTCACTAATTGATTAATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGA:1 - chr3R 14986163 5' + jockey 4673 1 68.57 ATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTT:1 - chr3L 16015312 5' - 1360 3318 1 70.71 GATTTCTGACTTGTAAACAGGCAAAATCCATATTCGAATAGTATAGACCAGCCCAGTATACCCCTGAAACATCATAATTTAATTTATACTATCCTCCGGGTAGGGAGA:1 - chr3L 22122886 5' - G5 4662 1 64.81 CATACTGAAATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGA:1 + chr4 123932 5' + HB 104 1 63.01 AACACACTATGGTTATGATTAAGAACTATTTGCTATGTGTTTCCAATTACGCGCAGAATCTATTTTAGTCTCTTTTCTGTCACACATATATACATATTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTA:1 + chr2L 13138934 5' + McClintock 15 2 76.03 GTTTACCTTTTTATCCGTAAGCACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTC:1 + chr3L 19031216 5' - roo 9020 2 52.05 AGCGCTTCAATTAAATGTTAACACATGAGAAGATGTGTTATGTGTGTGTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGATGCTG:1 - chrX 5155229 5' - accord 177 2 54.55 TGCTATGTGTTTCCAATTACGCGCAGAATCTATTTTAGTCTCTTTTCTGTCACACATATATACATATTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGG:1 + chr2L 13138964 5' + McClintock 5995 2 56.25 AAGGAAAATATCGATTATCTGGCGACAGGAAAGGCTTCGCTTTGGCTGAATAAAATATGCGTATATATATTCTTGATCATGATCAATAGCAGAGTCGATCCGGCCATTTCCGTCTCTCCGTATGAACGTCGATATATCA:1 + chr2L 13732870 5' + INE-1 135 1 57.55 ATGATTAGGAAAGTGTGTGGAAAAAAGACAAGTGTATGTGAACAGCGATTGTATGTGTGCGTGACGTGACTGTACGCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATGACTTCACGAAATGAACCCGCA:1 - chr2R 18157771 5' + Doc3-element 406 1 59.50 GAGCGGGGGATTGTTCACGGGAAAATTTATGACAAGTGGTCAAAGTGCGGGCTGACAACGAGGCAATAGAGATGCCAAAAACTAAAAAATTCCAAAGGCAGCTTTTCGAAGTAATCAAATATTAAAAATTGATAAATAAATCGAAA:1 - chrX 886773 5' + Doc3-element 84 1 75.34 TCGTTGCATGTTTGCTGCGTTTTGCACTTTTGCTGAACATTTTTCATCTGCCGGGCAAAACTTTTTGACATGTTGCAGTGCAAATTGAATAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 - chr2R 15068370 5' - 412 7484 2 66.44 GCCGAGCTCCCTGTGTGCCAAGAAAACGGGAGCGGGTCCTTGTGCCAGCGATGGTTGTAATGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAATTATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 14218521 5' - roo 346 2 59.42 ATGGCCAAACGCAAAAATTATGTAAATGAATTTCCTGTTGCATGTGGTGCCGATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGTCTACATACATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chr3R 18635176 5' - opus 466 2 63.70 GATCCCTCGGAATCGGTCCAGTGTTTCACCCATTGCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGAT:1 + chr2R 10910192 5' - Tabor 440 2 54.11 TATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3R 20203915 5' + 412 7121 2 65.07 GCTTCTGGCGCTGAAATACTATAGAAAAAAACCATAGCACAGTTATGGGGTGGAAAACCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACC:1 - chr3R 15376675 5' + F-element 4457 1 63.70 TTTGAATTGCATTTTCCATTTCCATTTATATTTCCAAAAGATTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTA:1 - chr3L 21262639 5' + jockey 4554 1 71.23 TATTGAAGATTTAAATCAGGTGAATATTAGAATAATCCACATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 + chr3L 17537710 5' + Doc 38 1 61.64 TGGGATATTTCTTTCTGTGTACCATATCCTTGGACAAACACTTCGACTCTAATGAGGCAACTTAAAGTGTGCTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr3L 13364404 5' + hobo 48 1 53.10 GGCTGGGAAGCTGTGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATAT:2 - chr3R 7616866 5' + Stalker2 19 2 72.60 CAGTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGT:1 - chrX 16117268 5' - opus 7439 2 63.70 TATAGAACCCGGCGACTTTCTCAAATTGTTTAAATGAAGGCAAAAATTATTTGTGTATTTATGTGCAAAAGAAACAAGAGAGTAGGCTATAGTCGGATACCCGTTATAGTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAAT:1 + chrX 22806246 5' - INE-1 536 1 76.71 GAGGTTAATGGACATAATAATTTCTCTAGAGCAATTATGCCACCTAAGACAGAATCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAACCCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAA:1 - chr3R 3919721 5' + Idefix 171 2 60.96 CGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACCATGA:1 + chr3R 3617317 5' - micropia 5126 2 72.34 AGTGGTGCACGAGTTCATCGGTGGTTACATTTTCATGTCCATGCGATCCAAGGACACCAACCAGACCCTGAACGAGGAGCTTTTCCACATTGGTGGGTCTGTCATGATTTTT:1 + chr3L 17026694 5' - I-element 180 1 79.46 GTCGATGCGTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGGTCATGCTTTGTAAATTTGACAAAA:2 - chr4 184042 5' + 1360 198 1 59.59 GGTGGGGATGAAGGCCAAAGGCCGTGATAGAGCCAGAAAGCTTTCCACATATCTGTTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATG:1 - chr3L 15287776 5' - roo 138 2 61.64 TTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTG:1 - chr2R 1000382 5' + HMS-Beagle2 6968 2 77.24 GACGACATATTTTAAACAACGGGAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3L 2330182 5' - roo 344 2 61.64 ACACACACACACACACACTGCCCATTAAAAGCGTACATGTGTGCTGTGTGCACCCTCAAAGGAAAGCGTGAAACGAAAAAAAAGAAAAAAGACAAGAGAGAGAATGCTATAGCCGAGTT:1 - chrX 6461973 5' - INE-1 575 1 68.07 CCTTGCTGTGGTCAAGACACCGTCTTGATCGTAAAAATATATATTTTTGGCAGCATCAGCCTCGGAGAGACCCCCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAA:1 + chr2R 16418008 5' + F-element 4316 1 50.70 CCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCG:2 + chr3L 27356056 5' - Tc3 1661 1 62.33 TTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chrX 388226 5' + 1360 53 1 54.11 TTCGTGAAATTAATTAAATTTTGTAATGCGATTATCTACATATATCTTATGCCCAATTAAGAAGAAATAGAAAGAAATAAAACCTTAGCGAAATGACCATATTGAATATTTCCCCCAGTTATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCC:1 + chrX 20146979 5' + Juan 4027 1 80.82 GCAGCAGCAGGAGCAGCAGCATCTGCAGGAGCAGCAGCAGCATCTGCAGCAACTGCATCACCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGACCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATA:1 + chr2L 11255605 5' + Quasimodo 476 2 56.94 ATCAGAAAATCGCTTTCGCTGCGAAAACCTCTTCTTATACCCTTTACTCTTCCAGTGAAAAGGTATGCTGAATTTTTTAATTTCAATGCCAAAAAGATTGTTGAACTTTCTCGTTCGCACTGCTGCCAGCTGAGTAACGGGTATCT:1 + chr3R 19113895 5' + INE-1 542 1 45.89 AAGGAGCCATTCGCAGTAAGCTGGTGATATTTACAAAAAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACA:1 + chr2L 2120348 5' + I-element 4941 1 56.85 AAATTTTCGCTTTCGCACTTTATTTAGTGCATATACTGTTGAGCCAAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGC:1 + chr3R 779404 5' - Bari1 1637 1 65.73 ATTTGCTAATACGCTTCGTTGAGTGGCAACGGGAGGCGTTTTAGTGGGGTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr3R 20934647 5' + 412 7090 2 58.90 GAGCACTTCTTCCAGTGCCACTCGTTATAGCCATGTAATTCTGTTTGTGCCTTCTCCGGCAAAAAGCGCATGATAAGCAGAATATTGCACATCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGGGCCGATGTTGCGAAAC:1 - chr3R 13440015 5' - invader2 4958 2 63.70 AATTTATTCCAAACAAAAAAAAACCGTTTATATCCATAGCATTAAATAATAAAAAATGTGTCAGAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chrY 402882 5' + roo 55 2 60.27 TACAATAAACCATCTTCAAAGCAAATGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 + chr3R 17099925 5' + Tirant 61 2 80.36 ACTTTTATGCTAGAGCGTGATGCATTAGTTAAGTTCGGTTTGATGGGTACTTTTAGGAGAAGAATCTAAGCTGAAAGCACTCATAACCGCGCTAGTTATGCATTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTGTGGGTTCC:1 + chr2R 22142436 5' - springer 419 1 67.12 CAATATTCTAAGTTATGTTTCAAATAGATTGACATTTAAGTTAGGTCTTTTTATTAGAACTTCATTCTTATATATATTTTAAAGTAATATTACAATGTTGCTAAATACCAAATTTTAATCGTACGATAGTTAGTAATAATATAAAA:1 - chr3L 8731353 5' - TAHRE 10277 1 72.60 ATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCAAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr2L 9274980 5' + F-element 49 1 53.79 AAGGATGTGTGGTCTGTTGAATGAAAAGTCAGTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2L 7652284 5' - roo 349 2 60.27 CAAGCTAATATTCCGGATTGACAGCCAGTTGCAAATTGGTCAATGTCTGAGGAGGGTTCAATCAGTTTCCAGTAATATTTCACTTTCCATTCTTTGCCTACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 + chr2R 10160829 5' - transib2 2804 1 67.81 TCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGG:1 + chr3L 21013881 5' + roo 8756 2 82.88 GCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTG:1 - chr2R 18014097 5' + Doc 98 1 79.31 ACAGTAAGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 - chr2R 8688161 5' + F-element 61 1 62.30 CTGGGAAGCTGTGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAT:1 - chr3R 7616864 5' + Stalker2 7269 2 71.23 AAAAACAATTGGCAGTGAAATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATT:3 + chr2R 11095717 5' + diver 5927 2 57.53 AACTATGGCGATTTTTCTGTTATTTTCGGATTTCCCCTGTTTCAGTTCCAAGCGTTCACTTGCCAGCACAGGGGAAAGTCTGCAACTGCGCTCTTGTCGCTCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTCGCTCTCT:1 - chr2L 21830542 5' - 1360 106 1 71.54 TAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3R 25751887 5' - roo 9008 2 64.38 ATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chr3L 5069465 5' + opus 7053 4 77.45 AAGCGAATGAATTAATCTTGATGCTGCATGTGGGGTGGCGTGAGGCCGGAGAAAAGCCACATGCGACACATGTCGAAGGGGAGGAGCAAAACAACACACCCCCCCCTCCCCAATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAA:1 + chr3L 22443845 5' + mdg1 77 2 74.66 GAATAAAAGAATAAATTCAAAGTGTCTTATAATTAATTTTAGGGACTTTAGATAGGCCCAAATAAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - 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INE-1 505 1 80.14 GTGGCTAGTTAAATGTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAATCGTTTAGTTTT:1 - chr3R 24673695 5' - roo 390 2 73.29 GTCCACTTTTCATACTTCTTTATTTACAATGACGTAAATCAAGTAGGTTTGCCTAAGCAAACACAAAATAAATCTTGGTAACTGAAGCGAAAGAGACGCTATTGCCATTATTAAATTGCTATACTACAAAATTTTCTGTGTGTAGA:1 + chr3L 24375212 5' + Doc3-element 144 1 57.53 AATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:1 + chrX 388217 5' + 1360 44 1 56.16 TAAATGCATTAACTCTTATTCATTCGTTTCATTATAGATTAAAAAATCGCCTCATATAAATCTTACTTAATTCCTCCCATTTTGTTTCATTTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:1 - chr3R 9963312 5' - I-element 5319 1 63.70 GGGATGGTCAGAGAGCTGGTGCGTTTATTTTGTGTAAGACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGT:1 + chr3L 18193153 5' - Tirant 408 1 60.42 GCCGTGCTCCACCATAGAGCTAATGCCCAACTGCCACGCCTTGAGCTTGATCCATAGCAACTTGTACTTTTGTGTGTATATCTCGAACAAGGTCGCCCAATAAATGTCGCCCGGTGTTCATTAAATCATAAATGTATTTACATTTA:1 - chr2L 15015692 5' - looper1 1816 1 52.05 GATTCCGGATCTTGCCGTTGCCAGCCGGATGAGTAATCACGAATTAATCATCTGAACCAAGCCATTCGTTGCATACTTTTGTGGGTGGAATGCGGTGAGCAGCATCACTTGGAGAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr2L 3323257 5' + jockey 4683 1 76.71 AAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr2L 14239137 5' + 412 7113 2 56.85 GGACGAAATCCGAACGTGGAGAAGGTGCTTGTGGCGACTGAGTAAACAACGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2L 3231954 5' - roo 8999 2 66.44 ATAGCTGTTGTTTCTGCTATCCTAGGTAAACCTTCGCAGGTAACGGGGGTTGCTTATGTGTGTTCGCTCGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCTTAAGCCGAAGCTTACCGAAGCATAC:1 + chrX 8271513 5' + P-element 35 1 55.04 AGCTTCCAAACAAAAATGTTGTAATGTAATAATATTATATATACCCCTTGATAGAGCATTGAAAGAAAAAGCATGCCAAATATCCCCACAGTTGCCATTCCTGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATG:1 + chr3R 26846698 5' - hopper 1398 2 72.60 GAAACTGACTAAGCATATATCTTCTCTCCAAAAGCTTTCGATGGATCGCTTTATTTAGTTCTCCCCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 - chr3L 2192357 5' + jockey 4733 1 58.22 GTGTTGGTTAAAACACAGTGCTCGCTAAATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 + chr3R 25050016 5' - P-element 2799 1 25.34 ACAATTTACGCAGTGCAAACTTATATTTTATGACTTTGAATTGCGTGCCCGAAAAAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGG:1 + chr2L 12324965 5' + jockey 4680 1 77.93 GCGAATTTCGCCTTGAAACATTTTTTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 - chr3R 16241066 5' + Tirant 69 2 70.37 AAATCATTAAAGATAGCTTACTAAAAATCAAACAGTATAGGGTAAATGTGAAATTAAAAAAAAAAACACTCAGTACTAAAATAGAACGCCATAGCAAAACTTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr2L 21698385 5' - 297 6960 2 75.34 GTGTGCTACATGGATGGATAAATTTCATAAATTTATTACAAATTAATAATATTCCAATAATAATTAACAAGAAAGTAAGTAAGATTGTATGCTAGATTCGTTGAAAAGTATATGTATATATATTGTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 - chr3L 11887884 5' + INE-1 88 1 79.31 GTGATGCTCCTGCTGTGGAAGCCAAAAAAGATAGCGCTGTCATTGCCAACAAAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTATTTTTTTGGTT:1 - chr2L 227745 5' + Tc1 1398 1 73.57 GCTGTCGACAGCACGACCACAATCAAAATGAATGGTCACCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCCACGTCCAC:1 - chr2R 23671835 5' - hobo 2922 1 52.50 TCTAGAATCTGTATGATGAATCTCAACCTTCTAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACACCGTTTATACAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTAGACTTATGGCATACAGCTCTGTGGTACTGCCAGCAACTCAAATAT:1 - chr2L 21930845 5' + G4 3454 1 50.00 CACACACACTCACACACATACTCGAACCGAAAGCTTACGCGTACAGATGTAATATGCACAAAAACAATACCCCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:2 - chrX 16457452 5' - roo 9022 2 50.68 GTTGGTTAGCTGAAGAATGAGGCCATTATGTAAGGGATGACCTTTCCATTCTGTGGAACTTACATATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTACTGCACTCTA:1 + chr2L 21691806 5' + 297 6627 2 55.56 ACGTATTGTTGCATTTCTATTAACCCAAACTCAAACAAACCAAGAAGACATGTTAACACCTAATATGGAAAACAAAGCATAGTTTCACTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGT:1 - chr2R 19698572 5' + jockey 230 1 70.83 AGTTTGCCCGTGTCCCAAAAAAACAAAAGAAAAATCTTTTTCCCGAATGCAATTTGCAAAATGTCTTCACCAATGATTGCAACAAAAGCGGCAACGAAAGCCAGCCAAAACCCAGAAACAACAAAAAATACACAACAAAATAAT:1 - chr2L 11974111 5' + gypsy11 3934 1 73.61 TATCGCTGAACAATTAGTAGGGAAAAAACAGAACGAAAGCACAGCAATAAGCATAAACATGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chrX 7756493 5' + roo 8704 2 58.06 AATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 - chr2R 18014106 5' + Doc 88 1 72.92 GTACAAAAACCTATTGTTTCATAAATGAGCAGCGAGACCGCAATATTATTATTGCCAAGGTGTGCTGCTAAGAAACAATTTAAAATGCACCTTGACAAACTGCCAATCGGAGTACTAATTAAGTAAATTAGCAAATTAAATAAAAG:1 + chr3R 19982562 5' + HeT-A 314 1 58.22 AAGTTGGACTTTCATACTATCTGCACTGTTTCGCCATTTGAAGAGTAAACACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chr3L 1358529 5' + 412 7123 2 66.44 AACAAGTTACAATTTGGGCGAGAGCTGGCCCAACCCTCACCCATGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 + chr3R 28406311 5' - opus 478 2 69.18 GAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 23161262 5' + 412 42 2 51.94 ATTGGAAGTAAATGTTTACAAAATCAAACTGATGGGATCTTATGAAATGCTGGTAAAGCGTTTCGAGGGAGAAGGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 + chr2R 9294292 5' + Tirant 10 2 73.64 AGTTATATTTTCCAATGTTTATTCTACCAATTCCAGGTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTT:1 + chr2L 21642986 5' - Tabor 466 2 71.92 ATTTTATTATTTCACATATTTTTGAGATATTCAATATTGTTGATATAATTATAGTTTATTCTCTAAGAGTTTCTCTCACTTTTCACGCTGCCATCTCTGTGTATAGGTAGCCCACTGTAATAAACCAATATATGCCACAAATTGAG:1 - chr3R 24499646 5' - blood 368 2 77.40 AAGTTATGAATAATATCCGGCCATTTTTCTACCCTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACC:1 + chr2L 18630425 5' + G-element 25 1 68.57 AGTCAAAAGATCTTGAGTGTCACCTTGCAACACTGGTTTTATGCTATTATAGTTGTCCCGCTTTAGGAGGCAAATTCAAAAGTGGCTCCCAACTTCAAAGATAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr2R 9607250 5' + pogo 15 1 75.17 GTCCTGTGTATATTTTGGATGTAATTTAACCTAATTTTTCAAAGTAACAATATAGGCTGTAAGGACATACAAAATAAGTCAAGCTATACCCGTATAGTAAAAGTGCATACAGTATATATATTCTTGATCAGAATCAATA:1 - chr2R 25192204 5' + INE-1 84 1 56.83 ACTAGCAAGGGTTACATTTCCGTGTTTGTTTATTCAAACGGAAGCAAAGTCGTTCTGTTATAATCAAAATTTTCTGCGTCGAAATGCATAGAAAATGGATCATCGTGATCCGAATCCGAGTCGCTATCATCGTTTCCCAAAAAATG:1 - chr3R 10444978 5' - transib3 2527 1 54.79 CATGCCCAAGAATTAAATCAAATTGTTTCATAATAATACTGCAATTATACTAGGTAGTTTTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACA:1 + chr3R 9583288 5' + Juan 4090 1 58.90 CTTGTTCCGAGTGGATTCTGATGCTTAGACTGTTGTTGCTGAAATTTGGAATTTAGATGTATTTTTCAGGAACAGAAAACACAAAGAACAGAAAAACGAAATTAGTTGAGCTTAGCCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTT:1 - 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chr3R 1267809 5' - P-element 2858 1 67.81 GGAACAAAAATATAAAAAAATAAATACGAAAAAAATGGCTGTTTTATTTATTTTTGTGTGACATAATATATCAAAATTAATTTTGAAATACCCAGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACA:2 + chr3R 10815001 5' - 1360 473 1 65.75 AGATATTAGTCCAGATTATTATAATTTTCTTTTGCACTTGCCTGCTGTGAAACCCTAAAAGTGAGCCAAGAAAACTTCTTTCATAGTTCTGCTTCTCACTAAATTAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 + chrX 7446154 5' + jockey 4686 1 45.21 GAAAACCTTAACACATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAA:1 + chr2R 5582147 5' + Cr1a 466 1 60.27 GAGCATTTTAAAAACGAATATTCGCCCTAAAGAGATGATTGCCCTTTTTGTAAGCTTTCGATTACGGAAATAAACGATTTTTAAATGAAGTTATTTTTGTTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 + chr2L 5791945 5' - blood 358 2 71.92 CGCAAAGGAGACACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAA:1 + chrX 8967377 5' + HMS-Beagle2 54 2 55.48 GTGCAATTTCCTTCACTTTCCTACGAAGCAGAAAATGCCCCAAAAGAGTTTTCTTTTCGGCTCCGTGCCAGATTTCACTTTTCTTTTGTTTTTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 486684 5' + roo 22 2 67.63 CTTTCATGGGGGAAAGTCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGGTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCA:1 + chr3R 14049302 5' + transib2 32 1 63.70 ATTATTTTTTAAAGTAAATGTGAACTTTTCTCTTCCCTCTCCAAATAAAGTCCATCAAACTTTATCCAAATTTCTCAGATCAGTTGCATATTTATCATCATTTACATATAATAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGTTCTTGACA:1 - chr2R 8642777 5' + accord 7219 2 76.03 CTGTCAAAGTGTTGGTAACTGAGTGGTTGCTTATGTGTGCGTGTGTTTCTGAGTGCGTGTGTTTGTGTGTGGTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr2R 23671763 5' + hobo 48 1 49.66 AAGCTGGTTGGCAAAACGTGATGTAATTAGAGGCAATTGTGAGCCGAAATCAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCG:1 - chr2R 1087239 5' + 1360 3173 1 65.43 CCGAATGGCTGGATAAGACCAACTAAATTATATGCAATAGAATATCGATGCCGTTGGGCAAGATTTTTTCGGTCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTC:1 - chr3L 17559352 5' + 1360 3219 1 56.41 GTCGATAACGGACCCAAATGGTGAAAATGAGCCCGAAGCAGCAACGAATAGAAACAATTTTGTATGGAAATTCAATTTGCCTTTAGCAACATGTTGCATTTTCCTAGATTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCA:1 - chr2L 4030948 5' - 17.6 7156 2 68.49 ATTGAAGGAACTGTGAATGCCTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTCTGATTGTAAATTCCCATATAAGAAGACTTTATTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 9870944 5' - roo 388 2 69.57 GTGGTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 - 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HB 1523 1 70.34 AATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 - chr3R 15920277 5' + 412 83 2 74.66 GATAGGCTGCGTACTCGTACCAGACGCCCATATACTGAAGTATTCGAAATAATAATAGTAATAAATACAATGTAAGAATATTACGTATAAGCAGATGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCT:1 + chr2L 1360893 5' - Stalker2 377 2 73.29 ATCTGCCACCGAGGGTGCCGCGCCTGGATTTGGAGGACTCAATGCCTGCCGCTACGAGTGTCAATATGAAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCG:1 - chr2L 17619663 5' + INE-1 108 1 58.06 ACCGAATTTGGATGTTACGTTTTGTAAGTTCAGTAAACATTAAAGTTCGAGTAAACAGGAGGAGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTATGTTCACCTAATTGAGATTGTTATGTTTTTG:1 + chr3R 13460858 5' - I-element 221 1 55.17 TTGATCACACCTCCGGAGATCACTCCCCGCAGCACCCAAACGTCCTATTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 14218417 5' + roo 49 2 52.05 AAGCAAATTAACATTTTAAACACACTGCCAAAACGAATCCATGCAGCACACAATTCCATGTTCATTTACTGCTGCCGCCAGATCGCACCGGTTCGTGTCTAACAATAC:1 + chr3R 10907508 5' + X-element 11 1 73.15 ACTAAACCTGATGAATCGCACCGAGGTGGAGCACTTAATCGTGCCCAATCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 + chr3L 363460 5' + blood 72 2 66.44 GAAGCTAAACGAAGGCAGAGCAGCGCATTTTTGGCAACGAATCCACAACTACATATTGGCATAAGATATTTGATACTCGCGACAAGGCGACAACAAATCGGCACACCATTCTATCACATAGCCAATAAATCATTTTTGGCTGCTCA:1 + chr3R 24707467 5' - Cr1a 491 1 69.18 TTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr3R 8849861 5' + 297 6640 2 62.07 AAAAGTCTGCAAACAAAGAGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr2R 17332219 5' + jockey 63 1 58.52 TGTGTGTGTGTAGAGGATATTTGACCCTATCTGCCAAATGCGAGCAACGTGCACCACTTAAAACTTTCCCACCACTTAACTCACCCCCTCGAATAGCCCACCCCCCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATT:1 - chr3R 11095931 5' + hopper 17 1 72.60 ATGTGATTATAATAATGTTGTGATTAAATTTTGTGATTAAAATGACTACGATCTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTACATTTTATAATTAATCTTATATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTACA:1 + chr3R 7080603 5' - G4 3756 1 63.70 TTCTACCTAACCGACTCTGCAACAACGACAATAATTGTCGTTATAATAATGGTCACTTTTATAATGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 15295708 5' - roo 354 2 60.27 CATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGC:1 - chr3R 24454850 5' + F-element 283 1 66.37 CAATATATATCATTGCAGATAAGATCTGCATAAGCATAGAGTTAAAGGATATACACCAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAACCATATATGTTGAAATTTCTCGTTCTTTCCTTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTA:1 - chrX 15666907 5' + INE-1 539 1 60.27 AGTCAGTGATTGTAAGGTTCCAAAGAACCTACCATTATCAGACCCTTATTTCAACAAGTCACAAAAAATGTTGCAACATTTGTGGTTTATATTTCCTCAGAGAATTAAAAAAGTTTAAAGTGTTGTCATGGAAAACAGTAGCACAG:1 + chr2R 3141988 5' + transib1 267 1 59.59 CTGCACCCGCATGACGCAATTACACCTGATTTATCCGAAGGCCCACCTAGTGTATCTGAACAGAGATCTGCTTGCATCCCACTGTCTTTTGTGTGACATTCCTCGCAGATTGTCCTACCCTACCAAAGACACTAGAATAACAA:1 + chr3L 9039463 5' - Tc3 312 1 67.83 GGATGAAATTGAAGATCATCATGCAAAATTCCGAAATGCACGCTGTGTTTTAATAACCGAACATCCGCTTGAAAAGTAGGCCTCATCGGCAAAGGCACGCTCCTCACTATTTCAACGCATGTTGGCGACTGAACCGTGTAGGGACA:1 - chr2R 7394617 5' - mariner2 108 1 73.29 TTTAGAATATTATTAAATTGTATTTGATACCGTGCAATTCACCCTTAATTTAAGCCTAAAGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTCTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTCG:1 - chr3R 2398225 5' - diver2 4831 2 63.01 GTTGCGGTGGTGGCGTTAAGTATCAGGTTAGGAAATGCATCAATCGGTGAGTTATACTAATACTACTGCTTAAGATATAGAGGGTATTATTGGTTTTATGGAATATATATATATATATACATATATGTAAGATTGTTTTTTATTAT:1 + chr2L 10445987 5' - flea 255 1 76.03 ATTGGAAAATATTTGGTCTTAACCATCATGATTAGGCGGCCATTGAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr2L 5792125 5' + blood 24 2 69.18 GTAAGACTCTACCTAAACAAACCACTCGAAATTAGCTAACACTTCAAATTGATTTGTTGTGACATTTCATTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTATAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGT:1 - chrX 12789209 5' + F-element 4262 1 52.74 TACGTAGTTTACGAAAGCTAATTGATGGCAATTCCTAAATTTATACTTTGTAGATAAGCCAACTTTGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:2 - chr2L 22319418 5' - Transpac 300 2 78.77 TTCATGTGCTCCTTAAAATCGGTCCAATTACTATGGTTCCTTTTAAAAAGGATTCCCCTTGTTGCTCTCAAAAGGGAAATTACATGATACTTCCTATCTGGAATAAACATCCTTAAATCTCGCTGTGTTTTGTTTTTCGATTTTGT:1 + chr2R 14055538 5' - I-element 5185 1 78.08 GACTAATCTACATTTATTTATGGATCCTGGAACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chrX 388350 5' - 1360 3345 1 54.79 GTGGAGCTTCCATTGTGAATGGTTTTGTTTTTGTCCGGGGCTCCTGTTACCCTTCCATATGAACTGACCATATGACAGATATAAATATCTATTTAAATCGATTATACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGTAGT:1 + chr3L 14610470 5' - P-element 2681 1 71.92 AAAGAAAAATAAAAGCCTTTTAGAAATAACATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCATCGGACTAGAGCCAAAA:1 - chr2L 11012228 5' + jockey 4724 1 70.64 ATAGTAGCTTTGAGCTATATTGTAATATAAACTTAAATGCAATTTGATAGATATATATAACTATATATATATAGCTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACAT:1 - chr2L 16562169 5' - opus 464 2 51.80 ATTGAGATTCAGAAAATAAGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAGGTGATTCTT:1 + chr3R 7507140 5' + Doc 22 1 56.86 CTCTGCAACAACGACAATAATTGTCGTTATAATAATGGTCACTTTTATAATGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 15295722 5' - roo 351 2 67.41 GATCATTTTGTTATAATAAATACGGCTGCACCTGTCACAATGCTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAATTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 17047889 5' + 412 7125 2 66.67 GATTTTGCCATTCTATTCTTTTGTCTGCTCAACGACACTCGACTGAAATAGAAAGTGCTGGCAAAGGCAAAATCGTCGACATCATTTACAGATCCAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTG:1 - chr3R 9377709 5' + F-element 4361 1 67.12 CCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAAT:1 + chr2R 12065596 5' + Stalker2 75 2 68.28 GCAGAAATATACGCCATACTAGAGTTATTTAAATAGAAACTATACGCATAGACGAAACATAATTTATGCATATCATGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 25751906 5' - roo 9027 1 54.79 GCAATATCGATGATCATATAGTAATCTTAAAAGCAGCAATATTATAAAAAGTAATAGAATTTAAATCATACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 - chr3L 5630453 5' + I-element 60 1 55.48 CATAATGGAGTTAAGATCGTAGGGCAGTAGAGGCAAGCCCACCTCCTCCGGCGAGAGAAAGCGAAAACCGGCAAAGAAAGCACAGGGAGAGGAGCTGGAAGAGA:1 - chr3R 24750899 5' + G6 472 1 52.88 ATCAATAGTAAATAAAAAATAAAATTATATAACAAAAAAAAGGGAATTTAACTGGAGAAATAAACTGAAGATAAATCGTGCGTATATGATTTGTATTTGCGAACCCCATTACTATGATGCCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTAAT:1 + chr3R 19449915 5' + diver 222 1 78.08 TATTATTCTAGTGTCTTTGATATTACCTTGTCTTATAGTGTCGTTGACCCGATTGGCAATAAGTCTCTCCCATAATTTAGAAAGGGAGGGTAGGAGGCATATCTTGGGAACACTTAGACCCTTAATATAGCATTAAAGATTAGTGC:1 + chr3R 23893864 5' - Helena 73 1 65.07 AAACGATTCTATTATTTTTGTTACTATTCTATTTTAGATATTTGTAATTGACATGTTCACACATGAACATGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3R 2861126 5' + roo 72 2 94.52 AAATACAATGTAAGAATATTACGTATAAGCAGATGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTC:1 + chr2L 1360955 5' - Stalker2 7570 2 74.10 AGAATAGGTAGTACGATTCTAACCCAATTGGCTGAATAAAGTGGGTTCAAAACTTAAATTAACTACTTTTAAATTTTGTTTCCATTATATCGAATAACCACTAAAGCGAACTAATTTCATTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 6316620 5' - transib2 2645 1 77.44 GGTAGCTGCACTGCCAGAAAAAAAGAGGTTCCTTCTATAAATATACATTTCTAGCAGTATTAGAAACTTTCACTCAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3L 1358421 5' - 412 454 2 57.14 GAAAGGGTTGTCCAATAATTGCTCGAAATTAACATGGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTATGTT:1 - chrX 16994568 5' + roo 8748 2 76.71 AACAGAAAAATTCAATCTCCCCGAAAACTGTGGATAACATTTTAATGGAATTTTTCGCATAAAAAATTCATAAAATTAAAAAGTTTTTGACATACCGTATATATGTATATTCTTGATCAAGGAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTA:1 + chr2L 18158987 5' + INE-1 151 1 65.75 CGTAAAATGTATTATACTCATGAGTTTCCACACAGTTGAGTGTGCTGGGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr2L 15777937 5' + 297 20 2 71.92 GCCGTGAAGGAAGTATAGAACTCAACACAGCTGCACTGTGGAAAATATTAGGAGAAATTTCAAATTAATCTTAGAATTTATAGTTAATTATAAAGAGTTGGCAAACGAAAAAAACCAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATT:1 + chr2L 10559894 5' - FB 706 2 52.05 AATGATTGTTTCATAAATACGATAAAATATTGATATGACTAGTTACTTGACCTTTATTACTCTGCACCTTTAATTTACCTTTATCTAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 - chr2R 17014505 5' - flea 221 2 62.50 AGATGGGGAACGAAGGTAGATGGGGGGTCAAGATAAAGAGTGAACAATGAAGTGAGTAAGTGTATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chrX 11658981 5' + roo 83 2 57.53 CAAGGGTCGAATCCCGATATACCCTATGAAACCCAGTTCTTAATCATACTAGTTCTAATAGTTAGTTAGTCGACATTCTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 + chr2L 2494771 5' + Doc 11 1 75.34 AGGAGCTGGCAAATTGTTGCAGGAGAAAAATTAAACGCATTAGCTGTATATTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGTATTTGGATGTAAGGATAGTTGTTCATTGTATTTCTTCTCTGCTATTGTCTTAATGACAAGTTTTATTTGTA:1 - chr2R 19923525 5' - Doc3-element 4457 1 75.34 GATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 + chr3R 23161291 5' + 412 76 2 75.37 GCCCAGTAGAAAGCTATGGATGATGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCAC:1 + chr2R 5754601 5' + P-element 185 1 19.18 TTTTCTTTTATTTTTTTTGGTTGATCAGACCTTTTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTTTTTGTGTAGTTTGATATGGTGG:1 - chrX 5404463 5' - Porto1 290 1 74.66 GTTTTAATCTATGGAATGGCTAGAATCAAATTTTGGCTCTCTGGCATAGAAAGTTTTCCAGCCTGAACTTGTCATTTGCGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAA:1 + chr3R 25785544 5' - Cr1a 236 1 51.37 GGAAGGTTACTTTTTGGAAATAGATTCTTTGACGAATTGTCTACCTCGTACGGTTTAAAGGTACAAACTGACATTTTTAATTTTAGTCAGAAATTGTCAGAAAATGAGTTATACTCCGCGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTT:1 + chr2R 5487352 5' - transib2 379 1 63.01 AGGCTACACATACAATGATGAAATAAATAATTAATTAAATAAATGCATTATATACATTTAATATACATAACATACATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCT:1 + chr2L 13332595 5' + micropia 132 4 60.27 ATGGGGGTTGATTTGCCAAAACGAAATTGGAGCCTAGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chr3R 7089495 5' + P-element 69 1 30.23 AATTTTATGATAGAGATTCGCTAGTCAGAGAAAAGAGAGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3L 4651571 5' - roo 338 2 66.20 CATTTATACATTCAACTTCAAGTTTTGCTAAACGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTCGCGAAGATCGTGTGCTTATCT:1 - chr3R 6422890 5' + jockey 97 1 72.60 AGTCAGGCAGTGACAAAAAGAAAGCCGACTGACAAAGTATGCAACATGCAGAAGGTAGCGATTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATGGCCTAGACGTATAGACGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAATT:1 - chr2L 21855874 5' + INE-1 141 1 77.40 ATGTACATGTATGTACTATCTATTGCTTCTATATTCATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:2 - chr3R 6461860 5' + 297 6624 2 56.85 ACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCCTTCTTATTATTGGTAGTCGGCCTATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chrX 21670001 5' - mdg1 7419 2 56.55 AAGTCCTACGTATATATTCACCTGAAAATCACTATACTCAATTTTAAACATGAAACCTTAAAAGTTAATCTGGTGTAAATCGGATTTAGTTTTATAAGACTTAATGACACACGGGAAAAACAGCGTCCGCATTTTGACTGGCCTTC:1 - chr3R 21887780 5' + baggins 5119 1 56.85 ATGAAATTATAGGGCTGGACATAATATATGAAACATTATGATGTTGTCCTTGCCGCAGCCGTTGCTACTTGACACCACAACTGATACACTGGGAAAAAGTGCAACTACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 + chr3R 15054063 5' - 297 387 2 76.03 CACTGATACAATGAAAAACATCTTTACTACCTGAGTTAAAATTTTAAAGGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3R 28450665 5' - 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chrX 21933338 5' + gypsy3 3 4 76.00 GTTTCGCATCATTAGTATTTTAAAAATTCCTTAAATATTAGCAACATTTAAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:2 + chr3L 8658692 5' - roo 9036 1 58.22 GATTTTGTGCTTCTTTTGGTTTCATTGAGAGCACCCTTTTATTCACACTACATCAATTATTATGGTCAACGAAGGACTCTTCAACTTCCAGCAATTTGGCTCCGAAAATTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGT:1 - chr2L 10784299 5' + Tabor 6940 2 68.49 AAGTTGCACTCGCCGCACGGATCCGGTGACTTTAACGCCGGAGAGGAACGCGGATTGTAATTGTTTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCG:1 + chr3R 6495274 5' - Stalker 7190 4 58.22 CAAAGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr2L 16331042 5' - roo 344 2 63.70 TTTGTGGCTGATAATTCAACAACAGGCAAGCAGGCAGGCAGAAATAGCTCTTTGCTCCCTGCTTCCAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCC:1 - chr2L 19094259 5' - F-element 4358 1 54.79 GTATATGAAGCAATGGGCATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr3L 7791866 5' - Transpac 5213 2 68.80 GCCTCTACGAGCAAATGGGTCTCATGCACGATGGTGTTTTTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGCAACTTCTGTTAAGAC:1 + chr2R 10910226 5' - Tabor 411 2 68.79 GCTCCACATTATACGCTCGTTCACAGAAATATAATGGAGCTCGTATGTCCGATTGGTTGCATTGTGCGGCTAGCGACAAAAGACCACCAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATA:1 + chr3L 3105474 5' + Stalker3T 107 1 66.12 TTTGTCCAAAAAGTGGCATTATTTAATTTAACGCCCGTTGATTCCAAAGCGGCGATATGTGTCCTTCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 + chrX 5503652 5' - hobo 2884 1 54.79 GACTTCAACTCCTTCGGCTGTCAGCTTAAAGTGTGAAATGCGGCACCATTCGCATAATTTACCAGCCAAGTGAAAAATTTCCAGATAGGTCCATGTGGGTTTCAAAACGGAGTTATATAAGAG:1 - chr3R 22251073 5' - Doc3-element 4291 1 67.48 ATATGAAAACAGTTTTGTAAAAATGTGGGCGTGGTACGTCACTTTCACTTCACAATTTCCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAACCTCTAA:1 + chr4 857181 5' + Q-element 104 2 66.43 GTTACAACTTAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 14375572 5' - roo 394 1 72.60 GATAACTACCCTTGTATAAATTTTAGAGAAGCCACCTTCCTCCCCAGCCCCAAAATCGAGAAAATCGAATCTATTAACTAATTAAGAGGGACAAACGGGGGAGCAATAATTCCAATATAGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGT:1 + chr3L 6922728 5' - Idefix 389 2 74.66 AATAATTATTCCATAAGGTTGCTTTACAGCAGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3L 10469510 5' + roo 58 2 58.22 ATTGTGGGTGGTAAATGTGAGACGGTGCGTGAGTCGTTTGCTAGCCACAGCATTGCGGGACAACAACCGAAACAAACCATGAGTCCGGCATATATAGTCCGCCTG:1 + chr2L 16524087 5' - R1-2 3037 1 69.52 TACTTTACCCCCGGTTTTTATGAGTGCATCATGAATACGCCGGCGTTGTTGTTGATGTTGTTTGTTAGCCTGTTTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1 + chrX 10110991 5' + mdg3 48 2 53.42 TAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATGAAATTACAGTAGTTATAATAATTTCTATTGTACTTCCTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTG:2 - chr2L 6007626 5' + 1360 443 1 45.21 AAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr3L 18253776 5' + blood 7052 2 54.07 GCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTCGAGCGTAAGCTCTCTTCAATAAAAAAAAACGCGTATGTCTCGTTCGTTT:1 + chr2R 5206901 5' + Doc4-element 67 1 66.20 AAAATATTTATATTTATATAACGAAATATAAGAATAAGGAACGAAATATTTGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr2R 5503677 5' - pogo 2034 1 65.07 CGAGCGCAACTTCAGTGCGGCAATTGTTCCGATTCCGATGCACACGATGGCCACCAGGATGCCAACGAAGATGCCAATCGACAGGATCGGTGTCAGCTCAAAGTTGTCCGGACTCTGAGTGACTTTTGTTTTTTATGATATTTTT:1 - chr3R 11045369 5' - jockey 4997 1 80.69 GTGATGACCCAAGGAAGTGCACTGTCGGGGTTTCCGGCCAGAAGAATACAAACCATTTTTATACACATAAAGTGTTCGAAAGAAAGGAAAAAAATTTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTTGAAATTTCG:1 - chrX 443206 5' + invader2 4799 1 64.38 GCTCGCTTAGACCCCACGTGGAATAACAAATCAAGAAAGAGCCCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGAC:1 - chr3L 24939145 5' + F-element 382 1 68.00 AGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGAT:1 - chr3R 30264087 5' + blood 7092 2 73.79 GCTGTCAGTAATGCTTGAACGCCCCTTGTGAGCACCACTTGACAGGTTTTCCCCCAGCGGCTGTATTTTTTCCAGGGATGATAAAAAAAAGAATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAA:1 + chr3R 19551991 5' - Quasimodo 7321 2 67.50 GGTTACACTCTAAAATAGTTCTAAAGCTGTAACGCTGAAAGTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:1 + chr2R 23409053 5' + opus 170 4 65.62 GCACAAGTGTTTTAATTTTACGACATTGTATGAATTTTACTGCTGGCACTGCAGAAACATCAGCACCGCTGTTACATATCGTTAGCTTCCTTAACGGACATATCTACATCCTGCTTGGATGCCTACCGGTATACCGTACA:1 - chr3L 17130342 5' + R1-2 3160 1 75.71 AATTTTACATCTATCAGACTAATTATGTTTTAGTTAATTTAATAATTAAACTATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 - chr3R 6413680 5' - 1360 3360 1 65.75 TTATATAAATTAAACAATTTTTAAGTTAAGACAAATAATAATCATTATTCTTTATTAAGTGCATCAGAATACGACTGATCACTTTTAAGTTCTGTTTAAAAATAAAGTACAATTTAGATATTTATTTCTGTCAACGTTGCGCCTCG:1 + chr2R 10074728 5' - gypsy9 5182 2 67.81 CAAAAAGCACATACACCTAAAGTGCAGAAATGTGTGGGGGGACAGAAGAGCCAAGGAGGAGTTGTTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAG:1 + chr2L 2048641 5' - Doc 456 1 67.01 GGATTCCGGCTGCGATTCCTTAACTGCCTTAACTCGCGTCCTCGTCCTGAATCCCTTGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGT:1 + chrX 11980976 5' - Stalker4 74 4 60.96 TTTGTCCTGCATAATTAAACAATTGTCAGGCAAATTGTTGCAACTCCCCGTATGCAACGGTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGACATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTGATTTTACAGTCT:1 + chr3R 25799401 5' - 412 357 2 56.16 CAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGC:1 - chrX 388308 5' - 1360 3303 1 76.03 CACGTCAATGCCAGGACACACTCGCACTCCAAATCACTCAGGCCAAGTACACCTTGTTCTCGTCCTTGCACAGCTGTGGTAAAGGAAAAAAACTTTCAAGCTAACTGTTAAAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTCAGAAATTT:1 - chrX 7799447 5' - Cr1a 332 1 63.70 GTTGGTTTTAGATTGATGTCTGCACGTACTACATAGGCTGTCCGATATTCTCAGACGTAAAAGTTTAAAAATAGAAACAGTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCT:1 + chr3R 5261841 5' + S-element 281 1 61.64 GTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCA:1 + chr2R 12065577 5' + Stalker2 57 2 55.48 CTATTTTCGCCAAAAATTAACCCCCATTAAAGTTTAAATATCCTACTGGACATTGCTCGTTACGAGATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:2 + chr2L 17839368 5' + blood 7066 2 53.42 CAACGGATCATTTGATATTTGTATGGTGCTGGTAGACAGATCTGTAAAATAAGGACAACTCGCTAACATTAGAGAATTCAATCAAAATTGTGTTTTTAAACTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCA:1 - chr2R 5671547 5' + roo 8894 2 68.49 GTTATATGGGTTAAATGCTATCAGCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chr2L 4929778 5' + blood 24 2 65.12 AGTATAGTAATATGTATATATCATTAAAGATTGATAAATTTCCATCACACTATTTGGGTTCAGCCGTTTAGTAGCTGAGGCTAGTTAGATAATTTATTTATTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTT:1 + chr3R 6816668 5' - Juan 4185 1 62.33 TGGGGTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAGCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3L 21013861 5' + roo 72 2 67.81 CATCGATCCCAAGTTCGTTAACAACCCAGAACTCAGCGACGTGACCTTCAGGTGGGTGTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr3L 21665226 5' - 1360 3377 1 65.26 GCATTTTGATTAAATTAAGTTTTTGAAGTTCTAGAAATTTCTGAATTAAAAGTTCAGTTTATTAATACCGATTTTATCGATTTCGTTTTCATTGAAGGCACTTTCTTACCATTAATTAAATTGAATCATTAATACTTTACTTATTT:1 + chr3L 11423048 5' - Tc1-2 75 1 82.88 AATATTCAACGAAACCAGCAAGTTGGCAGTATAAAAGGCTTTTTATGTTCATCATTTCGAATCGAGTTGGGTACGGTAACCGAGTTGGGTGGTTTAAGGGCGTTAGAGTGGGAGTGGCAAACATTTTTTTGGCAAATCGATAGAA:1 - chr3R 14141447 5' - INE-1 312 1 56.55 TCAGCATGGAATCTTGAGGGGCTCTCTTTTTGTATGCCAGTTAAGTGTAATGATGAACTCCCATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 + chr3R 15920216 5' - 412 7478 2 65.93 AATAAAAAAATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:2 + chr3L 18253762 5' + blood 38 2 59.59 TCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr2L 17626662 5' - roo 8989 2 77.40 TTTGGCCTACATTTGCATCAATGTGATATAATCAGGACGCCAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGA:1 - chr2R 9294398 5' - Tirant 8433 2 71.23 CCAATGATACCTGATGTGTGAAGAATAATAAATTTATTATGCTGTCACTGTATGAACTTCCCTGAAGTAACATATGGCGCCCCATGTGGGGCACTCATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACC:1 + chr3L 21093105 5' - Ivk 5354 1 72.41 GTTTTCTACCCATAAACCCAGAGGTATCCGTATCTCCGCTGGCTTTCATACAGGTCAGAATCGAATTCAATTTGTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGCCGTTCGCTGAGGG:1 + chr3R 6932114 5' - Doc 360 1 56.06 GAGAGATACTTTTTAACTATACAAAAAAATGTATTGAAAAGCTTAGTCCATAATCTGTTAAGCTTATGAATTATTGAATACTTTTTATATTCCGGTACATGTATAAATGCGATTCTGGGTTATTATGGAAGGTATGCCAACTCAAT:1 - chr3L 10302823 5' + jockey 480 1 76.71 AAAGTCCAAAAGGAATTTGATGTTCGAACTGCAGACCACGAAATGAACTACACAACCATAGATGATAAGCTTGATGAAGCGGTCAAGGATTCTACAGAGTCTCTCTGATTTTACAGTTTTTAATATATTTGGACTTAGGCTAATCC:1 - chr2R 10804131 5' - 412 330 2 60.27 CATCTAATTGTTCAATTCTACCGCTTTGCCTTCCGAGATCTTGAGCTTGTATATATTTTTAGTCAATTTCGTTAATACTGTCTGTTCTCCCTAAGTTTTTTTTTATGTAATAAGGAAATTTTTATTTTTTAGGTTAGAGTTGATTA:1 + chr3L 25255826 5' - Burdock 368 1 76.03 TCCGTGTTTTATGAATATTTTTCTCCACTCTGCTTGCAAGTGGCTTGACTTTTGGACCGCAGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 - chr2L 21910279 5' + Doc 21 1 69.86 CATCCATTCTTGTTTGTAGCTATGTGTAGTTTTGGCCTTTGAAAGGAACTAATTACCGAACTAAATCGTCTCTTGTTTTTACTATCACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGTTCTCA:1 + chr2L 17292102 5' + 1360 3281 1 51.18 AAATTCAACATTTCTTACAAGACTCTTCTTTGATATGGCGACATGCTTAAACGCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:2 - chr3R 20203948 5' + 412 7088 2 61.64 TACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTC:1 + chr3L 10596451 5' - transib2 2440 1 69.86 ATGAAGTGCCAAATTTATATAACCATTAGATACGGCAGTGGCTAAGCTGCTAGATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGG:1 + chr3R 23443268 5' + jockey 4952 1 63.70 GAAAAGAGCAAACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 - chr2R 18014121 5' + Doc 75 1 63.01 CCAAACTCCTGAACACCGGAACAGGAAATGGAAATGGAAAGCAGTGGTGCACTGCTTGGCCAACGGAAGGAGCCAACCAGAGCGCTTAGTACAGCGGCATGTGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTA:1 - chr3R 12520874 5' - Burdock 6371 2 65.75 CAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCCTTCTTATTATTGGTAGTCGGCCTATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chrX 21670002 5' - mdg1 7418 2 56.55 GCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 - chr3R 20203896 5' + 412 7133 2 76.98 TGGTGGGTACGCCGGGTGTGACATGGCCAACCACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 + chrX 16117119 5' + opus 7 2 75.71 CATTGGGACGTTAAACGATAACTGTTACTCAATCGCATTAGTAACTAATTAATTTATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGACTA:1 + chr2L 22724084 5' + pogo 61 1 61.64 GGTCGCAGGAGAGAAACGGGGATGTGCTGCGTCATTAGGAATGCCTCGGGCACCTGCTAAACACGCTAACTGCTTTGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - 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chr3L 23691121 5' - Idefix 7373 2 58.22 AAAGTTTCGAACTAAGGGATTACAGTGAACTTCAGCTAAAATGATTTAAGACGATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCC:1 + chr2L 19140348 5' - Max-element 256 2 55.37 GGAAATGGTTTAAAAATTTATAGTAATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3L 13678870 5' + hobo 39 1 55.56 ATGCTGGCAAACGACAGCGAAAAAATTTGTCATGTTGAATCAATAAATTACAACTCTCCCCTTAGTCTGGAATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCCTCTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTC:1 - chr2R 5303457 5' + Doc2-element 4376 1 69.18 ATTATATAAAACACGTCTGTAAAACTTAAAACTTAAAACTTAATTAAAAATGTTTATGTTAGTTGGTTCGAAACAGATTGACAGAATTTCCGTTCTCTTAACTGGCATAATCGTCATACATTAGAAACGAAGACATACATAATAAT:1 + chr3L 12165870 5' + Porto1 4382 1 71.92 TGAGTATTGAATCACATGTATTTGGCTTTCTGATAAATGAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATT:1 - chr2L 16857915 5' - P-element 2805 1 29.45 ATATATATATGTAAGCATGGATGAGCTTAGCGATCGATCCTATCCTTATGATCTCATATATCAATACCAAGAAGGCTGAAGTTACTAAATACAATAGAAGCGTTTATTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 - chr3R 18153702 5' - copia 241 1 76.71 ACGCTTCCTTCCGTTCCTTCTGACATAATTTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGTTGACACGGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTTCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTA:1 - chr2L 22170551 5' - Q-element 123 2 78.08 GTGTCCACTTTCTGCGTGAGTGGTCCTAAAACATCACTAAGAAAAGAGCTTCAAGTGCATATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGT:1 - chr3R 10030823 5' + BS 5033 1 66.44 CAACAGGTTAATTTCGCTTTCATATTGGGGCCTATTGGCAGGTTTTCTGTATAAATAACACATTTTATGAGTGCCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCC:1 - chr3L 21093247 5' + Ivk 25 1 62.60 GGGCTTCTTGAATTCCTTGCAGCCTTCGTTCTTCCAGTTGTTCCACATCTCTTCGCGGGCCAGCATGTGATACACTGTCCGTGACACCTAAAAATCGTAGTCTTCAACTTTTCACACGTTGCAAGATGAATACTCTAATGACAATT:1 + chr3R 5819815 5' - 1360 405 1 57.53 TAAATTCGCCCAGTGAGCTCTGAGGTTTTTCGGTGCCGCTCCAACGTCTACGCCGTCTGAATAATTAACGCCAGGACATCGAACGCGACCTCAAGGAGCCCAAATTAGGAGACAAGCGCCAG:1 + chr2L 5639673 5' + jockey 4615 1 64.75 ACATCCGCAGACGACCATATAAATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr3R 13437266 5' - hopper2 1567 2 57.53 CTGCCAGACGATCGTTGGCAGAGCTCATTGTGCTCCTGTTCCGTTCAATGTGTGAATGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 22825234 5' - accord 190 2 78.57 ATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2R 11164533 5' + roo 8697 2 62.33 CAGCTAGACAGGCTTTGCTTCTGGTCACTGGAATGGGAAAGGCTGGCGTCAAGGTAAGCGAACAGGACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCTCTGTAGCGCTCTCCG:1 - chr3L 8934697 5' - 1360 120 1 52.17 AGGCTTAGCGAAATGTTTGACTGGCATAGGTGATAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2L 22235208 5' + 1360 63 1 73.33 ACACACACACACAGAGAGAGACATACACACACACAGAGACACAATCGCGCACACGTGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 - chrX 13005348 5' + jockey 69 1 60.00 GAGTAAGTGTATTTCGTTGGGTTCGTCATTGCGTGTTTTATATATATTGTTATTGTAGTTTTTAATGAATTTGTTAATAATTGTTTGACTGGCATAGGTGATAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr2R 5401519 5' + 1360 21 1 59.59 CATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTCTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 9870968 5' - roo 355 2 54.79 CTTATCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATAGGCTTTATTTTTTGTTTTCATCTGCACGAATATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 - chr3R 19446752 5' + F-element 32 1 59.63 GAACTGATTTTTTTTTATTTATTTACTTTTATTAAGGTACATATACATATACATACATATGGAATATATGTATTTTTTGCTTCGTTTTATTTTAATTTTACACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCT:1 - chrX 21414251 5' + jockey 4775 1 73.13 TAGCATGTGCATTTGCCAAATCCCATGCCCTACCCATAAGCTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 + chr3L 15364826 5' + 1360 78 1 71.92 GCCGGTTATATTCATTAATTTTACTTTACAATCAAAGCGACAGAACCTGTATATGTGTTCACACCCAAAATAAATGGTATTAGTACCATAAATTTGTCTGATGTTTGCTAGATTTAAGAGTATATTATTTACATTTATAATGTAGG:1 + chr2L 8271745 5' - mariner2 823 1 50.68 ATTTGCAAAGTTATTACATTTTTGTTATGATATTCTCTGCTTCCGCTCTTATAAATATGTTAGTATTGGTATAGTTAAAACTTCCCCTTGTTAAAGACAAAATAAAGTCAAATGTAGAGCGACACATAAGTAAACTACACGACTAT:1 + chrX 290056 5' + G3 4381 1 57.53 TTTCGTAGATAGACTATATTATTCTTAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAA:1 + chr2L 5890508 5' + invader3 5251 2 78.63 AATTCCCTAAACATTATTTAAAAATAATTAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGCTTTTGTTATCTAAGG:1 - chr3L 14375687 5' + roo 92 2 82.88 TTGTACTCTTGTTTCATATCATATCGCATCATATTCTTATCTACAGCTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGATTTTAAGTTTTAATGTGTAATCTTTTTTTATAATATCATTTGGTATTTATTTTCAAACAATTCAACAAATGATTCA:1 + chr2L 21149222 5' - HB 1509 1 53.42 ATCAGAAAACGGGAGAACTGCTTCAAGAGAATGGGAAACGACCCTATAAAGAGACTCTACATGGGGAGAACTAAAAATACAAAATATAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 + chr3L 2192251 5' - jockey 4954 1 50.34 GCATGATCTCCAAGACTTCTTCGGTTGAGTTACCTCCTGTGATGAGGTCATCGACATAAAAATATCGTAGAAGAATTTAAGGGCCAATTGCAACATGGAACACAAATTGTAATTTTAAATCAGTAAGTTATATCTATATTAATCAT:1 - chr3L 23751740 5' - transib3 292 1 61.64 GTAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 + chr2L 14239135 5' + 412 7111 2 55.48 CTTGCCTAAGTGCAAGTTTTCTCTTCTCCTCTTTGCTCAGACATCAGGTGTACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 - chr3R 1224291 5' - P-element 2816 1 39.04 GCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTT:1 - chr2R 5173227 5' - Stalker 382 4 57.14 CTTTTCACAGAAACCGGTTTCCATCGATCAATAGATAGACGGTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chrX 4673620 5' - roo 329 2 73.97 AATTTTCATTCCTTAAAATATTTAATCAAAGGAAAAACGTGCCAAAAATCATATAAAACTCACGTTCGTCACCAGAATTGGGGTTCTTATTGGATACTTGAACTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTGTGGC:1 + chr2R 8507658 5' - Quasimodo 74 2 52.74 GGTATTTTAAGTCAATGGTGTGTCTTAGCAGCTCAGTTCGACTTAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGC:1 - chr2R 1985282 5' + Idefix 249 2 70.14 TCCTTCGTTACGAGTAGCGAGTATGATCGGCGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTACTTCCCCAC:1 - chr3R 2637706 5' + gypsy5 7028 2 76.71 ACAAATTTTTGCCATACCCATTCTAACCCATTTTTCAAGCTACTTTGTCTCCGATTCTGACGAACCTTTTGAGACTTTAAAAGGATATTTAAATGTCCGCTTATTGGGTCTAAGCGAAACAGGTTATGTACATATGAATAGATAAG:1 + chrX 21452437 5' + invader3 5089 1 76.03 CTCCCACTTAGTTTTATTAGACACACCGAGGCTTTTGGAGCCACAAAATTGCCCAGCAATTTCCTTTATTATCCTGTAGACCCCACCATGCTCAAGAGTGTGTGTGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr3L 13679028 5' - hobo 2931 1 78.99 GTCCAGCGTTAGATGTGATTCACGTTTGTTACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCACACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGC:1 - chr2L 23049730 5' - opus 439 2 65.47 CAGCATGAACTCTTATTTTAATTTCTGTTTTACGGTTCACATGCTCTTATTTACTTAATATGCACAAATATTCATGTTCACGTTAAAATGCAACATCCTATACTTGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTG:1 + chr2L 2125234 5' - I-element 5123 1 76.03 GTTGAGTTTTATTTGAAGTCTTGGCACAAAATAGAGAAATCAAATATGGGTTAGATTTCTGTTTGTCCTAACTTGATTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGG:1 + chr3L 15186891 5' - accord 26 2 70.59 ATGATTATTAGGTACATAGTTGCTTTTCATAACAACTACAACTACTATAACTTTTGAAACCTAACCGCGTTTACAATCTGTTGATATATAGGTAGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chr3R 8218056 5' - P-element 2860 1 67.81 ATCCATTCAGTCAGAAGTGACAGACGGCACAAATTCACGTATCCCCACATATCCACATATCCCCACAGCCTTTATTAAAACCAGCGCACTTAGTAAGCACCATTCTGTCACATAGCCAATAATTAATTTTTGGCTGCTCAGGTTGT:1 - chr3L 12113602 5' - Cr1a 485 1 50.00 AATGTTAAAATAATTAGAGACTATGAAAAGGGGGGATATCGGATCAATAATAGTTTCATGTGTTCGCTTTATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr2R 9607087 5' - pogo 2070 1 56.92 AAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACAAATCATCGGACACTCAACCGGGTAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr2L 12291931 5' + Tirant 61 2 63.70 GGGAACACACTATGGTTATGATTAAGAACTATTTGCTATGTGTTTCCAATTACGCGCAGAATCTATTTTAGTCTCTTTTCTGTCACACATATATACATATTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAG:1 + chr2L 13138931 5' + McClintock 12 2 78.08 ACAAAGCAAACGGCCAAAAGGCACAACACAAACAAAAATGCAAACATTTTGTTAGTCCTCTCTTGTTAAAAAAAAAAGCAAAAATAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTA:1 + chrX 21091647 5' - Doc 66 1 54.11 CTTATAAGTAAATATAAAAGGCGGAATTGATATGTAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chr2R 13046558 5' - 412 7459 2 76.71 AATATTAATATATTATTATCAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:1 - chr3R 17586888 5' + Max-element 8249 2 68.97 TTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAG:1 - chr3L 7801291 5' + Transpac 5097 2 66.20 GGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTC:1 - chr2L 19140417 5' + Max-element 8275 2 61.76 ATTATCGTTCTTGCAGAAAGTACCATTTTCACTGAAGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chr3R 21216915 5' - 1360 3361 1 69.50 ACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr3R 9125652 5' + Doc 53 1 51.45 ATGATTTTATGACTTTTTACGATTTTCCATGGGAGCTGCGAAATATTTTTATTTATTTTATTTATTTATTTTGTGCTTTTTCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGC:1 + chr3R 6015089 5' - Juan 4143 1 63.70 AAAAACAAATAACAACATATTTTATTATGACACCCTTATATGTTTTCAAAACGAGAATTTAAATTCTTAGATTCTTATAATTTCATCCAAAAATATTATGACCAGCATTTGGCCGGAAGCTCGAGCATAGCCGGCAAAGCTCTGC:1 - chr2R 6091778 5' + gypsy3 58 2 70.34 TATTCCAATTAATTCATTTTCACATCAGCGGAAATAACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 + chr3L 4641028 5' + jockey 93 1 76.03 AATTGTACTAAAATGCGCCAAATAAAACTATTTATGAAATGCCAATGAAGAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - 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chr3L 9470018 5' + 412 7123 2 64.38 ACTTGAAGGAGCTGGACCTGAGCTCTAACCAGCTAAATGAGGTTCCTCATGCCCACCCCTTCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAAACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACAAACAAAAACTCA:1 + chr2R 19828304 5' + I-element 5133 1 67.81 TGGTCATCACTGCGCCGAGAGGATCCCATTTGGGTGTCCGAATCATTATCATCTCGAAGTTCCTCTTCGGTTTTAGATCCTTTACAATTTTGTTTTATAAAAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGCATATAGTTTG:1 - chr3L 16906174 5' - Tirant 489 1 58.22 GAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGA:1 - chr2L 22684605 5' + transib3 66 1 53.42 AAATGGGTTAAGGAGTAATGTTTCTGATTTAAGCTTAAATACACTGTTTTCATTAACAGAAAAAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr2L 19691339 5' + roo 8721 2 58.90 CAAGGCATTGTTTACTCAAAATATTGCTCCATTTACCACATAAGGTACTAAGTACTAGGGGTTCAATTCTCCATATTGATGAATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chr2L 2895678 5' - Burdock 217 2 58.22 TAGCTCGTACAAATGAATGAAACTGGTTGAATATTTTTTCGATATTTTTTCAGACCTTTTCCAGCGCTTCCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chr3R 7585684 5' + Doc 20 1 75.71 TATTTCACCGCCTGGCCGAAAATGTGACTGGGCCCATAACCTTTTGAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCGAGGGTGAAAGTATCGAGTAAAAAACAAAAGCATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAAT:1 - chr3R 1684180 5' + Idefix 300 2 67.14 ATAGTGTATTCGAAAGATCTTAAGTGAAGCAATATGATTTCGTTGAATGCGAAACGCTCATTTCAACCACATTTGAATGAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAACCCACTGCACCGGAACGACCAACCAG:1 + chrX 7741796 5' + Doc3-element 4576 1 55.48 CCACCTACCTTTCACCCCCTAACCACAGTCACTGTTGTTGTTGTCGGTGGGTGTTGATGTTTTGGTTGTTGCTATTCACTCACTAGTTACGATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTT:1 + chr2L 2707529 5' + jockey 4791 1 62.33 CCTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTC:1 + chr2L 18630457 5' + G-element 63 1 58.90 GTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTCACACGATTTTTTGG:1 + chr3L 23146451 5' + 1360 41 1 57.53 GTCAGACGAATCAGTTGTCTGGGCCACAGCCACGTGGGCTACGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTA:1 - chr3L 13986711 5' + diver 220 1 68.18 GTTGGTGGTTGTGGAGCATTGATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 + chr2L 3960165 5' + jockey 6 1 78.35 AAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGCCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr2L 17295854 5' + Doc 51 1 60.00 GCAAAATTTCATTTCACGCTTGTTAGCCGCTCTAAAGTTGCACTCGCCGCACGGATCCGGTGACTTTAACGCCGGAGAGGAACGCGGATTGTAATTGTTTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCT:1 + chr3R 6495240 5' - Stalker4 375 2 60.96 GCACTTTAAATTAAGTCAAATGCCAAACAACGACGAACGCCTAAAAGTCTGCAAACAAAGAGTGAATACGCACACACTCGACGACGGTTCACGGTCCATTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2R 17332261 5' + jockey 14 1 79.07 CATTAAACCTAATCTCCTGTCTCCAATATGAAATTCTGATGCAGCCAGCGAGGCTTTGTCTCTGGAACAGACCGTAACAAAGACTTTGATTGCGACGACCGATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTA:1 - chr2R 24004886 5' - roo 8620 1 69.86 TATACTAGCATAAGAAAACTGCAACGAAAAAAGTTTATCTTAATTTGAGATGCTACTTTTATAGATGTTTTCAAATTTCTGTTTTCGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 5422823 5' + roo 8698 2 62.33 GTAATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGA:2 + chr2R 12065565 5' + Stalker2 45 2 57.53 GCAACACTCGAGTTGGGTTTCTTCCCTTTAACAAAAATTTGGTTGTAAATGGAGTGGGGCGGAGGTTAATGAATCAATAATATAGAAATGCAAATGAAGGAATGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTG:1 - chr3L 18116063 5' - Transpac 195 2 66.67 ATGGCAATCGTGCCAAACATAACCCACACAGAAAGCAAATGAAATGAACGGCGCAGAATTAGAGTGAGTAGCAGCAAATGAAATGCTAAAGTCGATTCATTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACA:1 + chr3L 14321180 5' + Quasimodo 62 2 67.81 ATGACATCAACAAACAATCAGCGACTAAGAAAAATGAAAATGAAATGTAATGCATGAAAGCCTGGCTTAAATGAAAAGCGCAGGGTTAGCATTTGTTACTAAAATTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr3R 11870219 5' - pogo 2086 1 75.34 AACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 + chr3L 14375598 5' - roo 9031 1 54.79 CATTTCAAGTTTAATTCTTGTCACTAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATA:2 + chr3L 17921939 5' - copia 197 2 56.85 GATTAAATCGGTTGTTGTTAGAGTACTTATTTAAAATTTTTTCCTAAACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 - chr2R 21848764 5' - Transpac 5170 2 63.91 AAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGA:1 - chr2L 12291945 5' + Tirant 58 2 59.59 AGCCATGATTGCACAAAACAAGGTTTTTCCATTCTTTCAAATTGAAGAAGAAGTTGAAGAAAGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 4400264 5' - roo 9049 2 65.52 CCTGCACCTCTGACCCGGTGAAAACCTGCCCCTCAACCCAAGACCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:2 + chr2L 12486341 5' - roo 330 2 71.23 CGCGAGGGCGGGCCCAGAGTGTGGATTGGTCTATTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCCCACCTCCCCCCATTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTGTTTTCGTTTTCTTCTTTTTCGTTTTTTTTTATT:1 + chrX 13593764 5' - Doc2-element 231 1 53.44 ATTCCTATTGCCTTCCCCCATTTGCATATCTGTTTTATTTCCAATTTGCGTCAATTGTTTTACTTCATATTCCCCTTTTCCTTTGTTGTTCTCCCCATTACGTATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAG:1 - chr3R 31608879 5' + Bica 21 1 66.44 AGAATTCAGTTTCTATTTTTCTATGTTAAATGACACCGTGTTTGGTAAATTGATTATTCAAAAACCACTTCACTAAACGGGCTAAAATTTGTAAAAAGATTTCGAATCTTTGACGGTAGATGAGATGATTCATATTATAATTATTA:2 + chr3R 17608656 5' - mdg1 7095 2 75.34 GATGCAATACACGCATTTTGCCGACGCCATGCCGCCAGCAACAAAGTTGAGGGTACAGTGGAGCTTCGCTAAAGGAAACTAGGGACATTCATCTATCATCTTATTATGCTTATGGGGATACATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGC:1 - chr2L 1632940 5' - hobo 185 1 76.71 AGGCGGTAAACTATTTAATATATCATGTTTGCATTTAAATACGTTTATATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr3L 12433428 5' - roo 9000 2 68.49 TGTCAATATTGCAGAAACAGCATTGGCTGTAGATTGACTGAAAGAATCGGTGCTCATTATACTACAATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACATGCAGAAGGAAGCGTTTCGGACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGACC:1 - chrX 19821231 5' + INE-1 80 1 76.03 AGATAGTTTATAATTCACAGTCATTTTTTCAAGCTGTCAACAATTTTGACTTTTCCATTTCTCACATTACCGAAATTCTGATCATACAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 - chr2R 10161002 5' + transib2 34 1 58.22 ATGGCATTGCAATTGAAGTTGTAAATCTTGTTCTTTAGTTTTTGGATTGGCACTTCCTTTAAATTGCCAGTGAAGGCAATCAACTTGGGTTTAACCAAAGACACTAGAATAAAATTGATAGAATTGATAAAAAATAATATAGATTA:1 - chr3L 16047749 5' - 1360 252 1 29.45 ATGGCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAA:1 - chr3R 25804205 5' - mdg1 7391 2 63.19 AGCCAGCTGATACAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATT:2 + chr3R 7470965 5' + Doc 112 1 69.18 TTTTATTCCTTCTTTCCCAACGACACAATTACAAATTGCCTTTCACAGCTGCAATAGTTGTGCTTGGAAATGGTAAATGGCAAATGGTCCGGTTTAAACCATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCATTGCTAATTTGTAAA:1 + chr2L 21011939 5' + Tc1-2 1447 1 63.01 TTTTACATAACTGCCGAAGATAATGGCTTCGATAGAATATTCCCCCCCTCCCCCACTCCCTAACTAGATATAAATGTATCTAAACGTACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTT:1 + chr3R 25713988 5' - flea 4986 2 60.14 GGCAGTAGCGTTCGTTTTGGAACTGACTCGCTTCGGCGCCTAAGGGAAGGGTTCTCAGGGCGTTACCCAGATACAGTGGCTCCATTTTCTTGCCATGCATGGAAACTGCTTGTTTATTTTTTTTTTTACTTTTT:1 - chr3R 15930723 5' - Doc 4697 2 65.67 CTTCATATGGTGAGTACTAAAGTCTTTAGTTTTAGTCATTCTTCAGCCTTTTTAAGTATTAAAGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGC:2 - chr3L 19999275 5' - 1360 3334 1 60.27 TGTTTTCATTTTCATTTTTATGGCGGAACCTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTTTTGCTATGTT:1 - chrX 3647002 5' + 412 7112 2 57.24 CTATACAGTGGTCTTTAGATAGAGGTAACAAGACACGAAATGAGATATACAAAGTACATAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2L 17626582 5' + roo 52 2 61.31 CTTCTACCAATGCCAGTACCCAATCTCAGATCGGAAACTATCCTGCAGGTGGAGGAGCCTTTTGTGTGTCTCGAATAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAGAAAAGTACTTATCCATTCTC:1 - chr2L 1198871 5' + GATE 465 1 50.00 CAATTGATAACGGGTCGCCAAATGGTAAATAGTACAAACAATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAA:1 - chr2R 18689225 5' + Burdock 80 2 71.92 TATAAGGTTTTGATCGCATTTTCGGAGTGGTTATGGTCCTTCGACGTAGTCTCGAATGCCAACATTTATGCGACCCTCGGCAGCAGTTACTGAAAACCTAAGAATTGACCAGCTGTTTGTTCAAGCAAAATTGGCGC:1 + chr4 855480 5' + transib3 183 1 75.18 GTGGAAAGTTAATTTTCCCCTTCGCAAGGTCGATTATCAATCAACATTTTCCACCATGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTT:1 - chr3R 23235332 5' + BS 34 1 55.17 AAAAAGCCCAAACAAATTAGCAAAGATGCCGCACGAATAAGTTTTCTGGCGAAAAACTACGCTCAACGTATAAAGAAGACATCCTACTTTCAAGGTGGCAATCGACATAGGTACGGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3R 19319443 5' + 1360 8 2 55.48 GGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAATTCC:1 + chr3L 7791917 5' - Transpac 222 2 75.34 CAATAATCCCTCATATTTATTTTTGCAAAATTATTTGCTTTGTCTGATTGCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAA:1 + chr2R 13367421 5' + jockey 4596 1 58.22 GATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chrY 311344 5' + 1360 55 1 57.24 CTGATGATTTCAAGTGCCGGGGATTTAATCTATTCCGAGTATATGCTTAAATTTATTTTAATAGTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTT:1 - chr3R 31483742 5' + I-element 57 1 56.16 GACCTAAATTATTGAAATAAAAAAAAAACCAAAACCCGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTTAAT:1 + chr3R 20840081 5' - roo 9011 2 72.36 AAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACAT:1 + chr2R 12065601 5' + Stalker2 7329 2 71.92 CGCCCATCGAATCAATTCCATAAATCTTCTCAACGAAACAACAAATTCTCTGAAATATTTTAGTGATTAACTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:1 - chr2L 8574472 5' + Transpac 48 2 52.05 ATGTATGTACTATCTATTGCTTCTATATTCATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr3R 6461854 5' + 297 49 2 59.59 GAAAAATGTTCTGAAAAATCATTGTTTGGAGGAAGCGCCAGATTCTCTCACACATAACTAAATACATGCACGAATATGCTGCCGTTACGTGTAATCAAGAAACAAGAGAGAATGCTATGCCCGACTATCAAATACCCGTTACTCAG:1 + chr2R 25196941 5' - INE-1 547 1 66.44 CTCACATTTGTTATTGCCACGAATCGCGTGGCACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 - chr2R 10910344 5' + Tabor 26 2 65.07 TATTGCAGCCGACTTCTGGGCGAATATTAAATTTTTATATTGCCCCCGGAACAGTAGACAACTGAAACCAACAGATAAATATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGATAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAACAGCT:1 - chrX 12964830 5' + 1360 3007 1 51.37 GTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr3R 18528346 5' + roo 87 2 78.77 GAAAATGCCCCAAAAGAGTTTTCTTTTCGGCTCCGTGCCAGATTTCACTTTTCTTTTGTTTTTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3L 486714 5' + roo 59 2 60.27 TTTATACCACCTCCAAGTTACCCGAATTCGAACCGCTTCTTGAATCTGTTCAGGAAGTAATAGACAGCAAGTTTATAGACTACCCACTACAAGCAGTTGGTCAACAAATGATCCGTATTTAAACTAGGATCAACTCCGAAATAAAT:1 - chr3L 3113209 5' - McClintock 364 2 69.86 TCCTTAATGAACAAGTTACAATTTGGGCGAGAGCTGGCCCAACCCTCACCCATGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 + chr3R 28406302 5' - opus 487 2 75.34 CCTGATCCAACATAGAAATACATACGAATGGCCTATCAGCGAGTTATGAGATAGTCAAAAGGAAGTCTGTTCTCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3R 25862678 5' + roo 58 2 56.85 CAATATCGAAGAGAATCGCATATTCCATTATAATATTTTCTTACAATCCGATGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTACAATAGTCAGGGCGCGCATTTTAAAAAATTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGA:1 + chr3L 19993175 5' + 1360 3107 1 62.76 CGAAGAGTCCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCG:1 + chr3R 24750943 5' + G6 25 1 66.12 CGCCACACCCATCAAATTAATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 + chr3R 9125611 5' + Doc 19 1 77.24 AAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTT:1 - chr2L 14147250 5' + transib2 2592 1 69.86 ATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr3R 13225542 5' - hobo 2936 1 52.00 ATATTTTTCTCCACTCTGCTTGCAAGTGGCTTGACTTTTGGACCGCAGGGCTTAGGTGGAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 - chr2L 21910265 5' + Doc 19 1 67.69 CCAACAACTTTCTATGAAAAAATTCACTTTTCCTCCTATGACCAACAACAACAACAACAACACCTCACCACCACCTGCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATAT:1 + chrX 17715196 5' + accord 6924 2 58.52 GGCTGTGGCGGTGGTAATTCCTTAGGCAACTATTTCCCAACGCACAAATGTCACATTTTTGCTATGCAAAAATATCGTAGAAGTTAATTATACACATGTCATCGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAA:1 - chr3R 27457477 5' + F-element 104 1 51.05 ATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 - chr2L 12291915 5' + Tirant 8148 2 70.71 GGTTAGTGGGTGTGGTAGGATGCGGTAGTGAGAATATAAAATCTTAAGCAAGTTATAATTCTGTCGTTAATTTTATATTTGATCATAGCAATCTGAGTCCCTAGGCCAAATGCATTAAGGAAGACAGTCATCTTCCCAAC:1 - chr2R 25188748 5' + gypsy3 248 2 59.29 GAGTCTGATGGCGAAACCATGGCATTCCCTAATCTAAGAGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGACGGTTTTTAAG:1 + chr2L 12291826 5' - Tirant 350 2 52.05 AGGTTTTGACTTGGGATCTGATCTACCTGCCAGTTTTACCATAAGATTTAAAAAAATATAGTTAAATACATAACTAATGAAGGGACTGCATTGGTATCAATTGAGTATAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 - chr3L 4081737 5' - mdg1 407 2 37.67 GGTAGAAGGGGCGCTGCTCGAGGAGGTGGGCGTGTGGATTATCTCTTGGTTGTTGTAAAATACCCTTCGTGTGGTTGTTGATCTGCGTTTGATAAAACAGTGCTGACACGGTGATATG:1 - chr2R 5925516 5' - Q-element 195 2 63.56 GTAGACCTGGAAGGTAAGGTAGTTCACTTGCTGGCTCAAGATGTTACTTTCCTTCCACTTACCGTCTCCACGGTGGGACCATGGCTGTGGTAGGACTGGATGTACCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGAT:1 - chr3L 3330695 5' + Cr1a 4100 1 67.81 AGGGCCAGCGAGTAATTTTAAAATGTTGTATCAAATATATAAAAAAAACTGTAATAATATGCAATCTTGTCACCATCAGCATCGGTGGCCTCAACTTTTCCCATGATCGCAAATCGCTGATATGTCACACTACTGTTGCTCTCCAT:1 - chr2L 17748483 5' - R1A1-element 385 1 57.53 CCGAAAGGAGAGGTGTTCTTCCGTTAATAGAGGAGCTCCCGAAAAATAGGAGTATCCTGAATTCTGAGACGATTGTTGTATAGTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCC:1 - chr3R 2999874 5' + McClintock 5987 2 62.07 TATATGTAAAGATAAACATCTAAAAAAAACTAGAGTTTATTGGTTGGATCGTATAAAAGGTCTGGGAATCCAGGGCATTTCAAAGTCCAAGCCCCTATGCAATATCGTTTCATTCTAATGATTATTTCTTTCTATTAGTT:1 + chr2L 7807296 5' - transib3 2682 1 75.71 CAAAAATAAAGTAAAATTCGCACAAGACACGCATCGAGAAAAATATGCCCACATCAAGCCAAAATTGCACAAACAAGCTAAGCGACTCAAGAAATATGTACATATGTATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACT:1 - chr2R 11146167 5' + Quasimodo 16 2 73.29 GGCTACACATACAATGATGAAATAAATAATTAATTAAATAAATGCATTATATACATTTAATATACATAACATACATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTA:1 + chr2L 13332596 5' + micropia 5002 4 60.96 GGACAAAGAATTAATTGGTTTTTGGACACTGGATGAAATATATTTAATTTAGGCTTAATGCCGGACAGAGATTGCATTTTAGTATGCACCCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 - chr2R 23212726 5' - Tirant 8473 2 63.01 GCACTCGCTGAACGGCTGATGACAAAATACAGAAAAAACAATGTAAAAAGAAGAAAAAAATGGAAAAGAAATGAGCACACCCCGCCGAATTGCAGACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTC:1 + chr3L 10036985 5' + Doc 4346 1 56.16 AAATGATTGTTTTCCAAATACATTGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACCATGCAGACACTTTT:1 - chr3L 24766012 5' - 1360 3344 1 74.66 GACAGCGAGTGCGCCATAAATTCTGTAGCATACTTTCTAGCGCGCGTTTTGTTTTTTTTTTCACAAACTGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1 - 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Tc1 1613 1 55.48 TGGTATTACGCTACTTCGGAGTTCTACAAATTAAACTGTTAAATATTAAAATTTTTTTGAACAAAATGAATGATTACAAGATGACCCCAAAAAATTTGGAAATGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 6913495 5' + roo 17 2 76.03 GATCCATTGTTGATTGTCTGCTGAAAATGTCTGAAGTTTTTCCGACCGGAAAAACAACTGGCCGGCATTCAAGACTAGCCGCGTCGAGTCAAGTCTCTGTCTATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chrX 4673748 5' + roo 16 2 73.29 AAGGCAAATTGTATCTTTCTGGCTTTGCGTTTTTCTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCAGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCAC:1 - chr2R 8177791 5' + FB 88 1 77.40 ATAGTTAATTAGTCGACATTCTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:2 + chr2L 2494828 5' + Doc 68 1 61.64 TACAAGAACTTTCACATTAGAGCGCAGATTTAGAGCAAATGTCCTTTGTTTCGATCGAAACGAGACGGAGAAGGAGAGTCCTGTATTTGGCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTAT:1 + chrX 9743914 5' - F-element 91 1 65.00 TATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAA:1 + chr2R 12065584 5' + Stalker2 64 2 60.27 GAGGAACTTTTACTTCGCGCGTAATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAA:1 + chr2R 12065545 5' + Stalker2 25 2 69.86 GTTCAGCATTGTTCAGATCCGCTGTGGAGCAGGGAGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr3R 23161225 5' + 412 7075 2 69.18 TTGGAAAAGCGGAAGAGGGGCTGGGGGAAACTAGTGCAGAGTTTCCATTATGTAGACCACATAAACCCTAGTTTTATCCTTTTAGGTTATGTCTGTGTGTCCTAGTCCAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCCAT:1 - chr2R 10334070 5' - I-element 4912 1 61.64 CTTGCGTATACTATTACCAAAAAACAATTACTATCTACTAAACTGGGTGGTAAGTTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 + chr3L 11795455 5' + 1360 67 1 65.97 AAGGGGGCTTAAAATTTTCCTGTTTTTCAAATTGTTTTTTAACCATATCGAAGTTATTAATATTCAAGTACGATTTGGGTTTTTTGTCATGGTGGATTTCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTAC:1 - chr2R 1727545 5' - Stalker 6851 4 76.43 GAATATAGGAATTATTAACTAATGCCACAATGTTACATTTTAAAAGGATACAATGTATGTAAGTCCACAGTTGAATTTATTTGTAATTCAAAATGCACACCAGATATATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAG:1 + chr3R 25544337 5' + F-element 4658 1 63.01 ACTAAATTACGTGCAAAATCAAAGAACTCATTGAAACCAATTCCATGCACGCTACGCCGTTAAAGAAACCACAACGCGTACGACTACTTGCCCATAAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAA:1 + chr2R 16920099 5' + jockey 4608 1 35.62 GCGGATTTGCAGCTGCAGCGTTTGCACAGTTACTTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAA:1 + chr2R 13367470 5' + jockey 4629 1 72.31 CAAACCACCGAGGAGCGCTGGCATCCCGAACCCGTTCAACGTCAGCGAAGGGATGGAGAGGAGACCTCTGATGAGGAAATTGTTTTTACCATGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGC:1 - chr2R 16172950 5' - blood 486 1 67.72 AAAAAACCGGAAAGCAAGAAGCCGAAGCTCAATGTTGAAACATTTGTTTAGTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chrX 21403483 5' + roo 62 2 64.29 GTAACCACTCCGCTTGATTTCTATGCCAACGAACGAACTATGAACTTGGAGTTAGTTAAATTGGCCCAAAATATTGTGCAAAAGCTGGGCCAAATAAAAATTCTAAGTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTAATCATCTA:1 - chr3R 22902871 5' - rooA 7501 2 71.23 GGGGAAACATAGAGAACATCTTAATAAAATTATTTTAAAAAATCTAAGTTAGGCTACGATTCATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGA:1 - chr3L 11398934 5' - I-element 17 1 54.07 AAGTAAGTGGGCAGGATCTACAGCTTGAAAACACATTCAAAAACATCGCTGTATGTGCTGAACACATGATCGCTCAGCGATTCCAGCGCCAGCCACTTGATGGGCAATTTGCCATTCTCTAATTAATTTGTTTTATTAATATTTAT:1 - chr2L 8228474 5' - S2 1623 1 71.23 ATCCAACATAGAAATACATACGAATGGCCTATCAGCGAGTTATGAGATAGTCAAAAGGAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr3R 25862674 5' + roo 62 2 60.96 CTCGTACTCCACATCCATTGGAAGAGGGAACCACGAGTATAATAATCAAAAAGTAAGCGAACAAATAAATTAAAATATAAATTGTGCATATTACTTATGTACATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 + chr2R 3822002 5' + HMS-Beagle2 6901 2 65.75 TCCTAGCACTTCGCACTTTTTCTACGCTTTATATACGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTA:1 + chr3R 27810037 5' - Burdock 181 2 74.82 ATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATC:2 - chr4 829129 5' - INE-1 150 1 34.93 TGGGAAGCTGTGCTAACGAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATA:1 - chr3R 7616863 5' + Stalker2 22 2 69.18 TAGAATGAGACTATCCGTTGCCAGTTGGCCAAATCTGTTTCCGTCTGCTGGTTACTTAGAGTTCGGCTGTCCAGTGCTTCAATTCATCGGCTTTGCGCGGGGTGAGGGGAATAAGTTGCCCGAAGGGCAGG:1 - chr2R 7957861 5' - BS 185 1 62.60 GTAGTTGCGAAGGGGATGGCCTTCGATGTCAGCACATAATAGTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTG:2 - chr3R 5773220 5' - Stalker4 7284 4 71.72 ATTCGAGAGCGAGCGTCGTGCTCATAAGTCCTGGCATCGTCCTGAGATGTGGTTTTTTCCTCTTGGCCGCCGCCAGTGCCGTCGCCCCAGACAAAATTAATTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTA:1 + chr2L 20515155 5' - I-element 5341 1 72.60 ACACGCTAACTTAGATACATCATCATTATTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3R 15295787 5' + roo 74 2 80.00 GAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr3R 8849868 5' + 297 6634 2 57.53 GTTTATTGTGTTGTTTCATTCATTTAGCAGATACATCTGCTTGTTTGTACAGAGATACAAAAATATATATATGCGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTT:1 - chr3L 3453718 5' - Tirant 389 2 71.82 AATAAAGTTCAATTAAGTGCATTGTTTATGGATGTTTGAGAAAGTTATCCGACAGATGACTCAGTGAAGCAGCCACATCACGTGATATCATGTCACGTGATATAGTTATGTGGAAGGATGATAGGGCGTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 - chr3L 1856821 5' - Transpac 5207 2 58.90 GAAGCAGCAGTCGAGCTGAGAACTCTAGAGTGGAGAGCTGGGAAAGCTGGGAAAGCCGGGTGGAAAATGCTCGAGGAGGGGGGCAGGAGACCGGAAAATTGTGGGGTACACCAGATTGAATATATTTGGACTTAGGCTGATCCGCG:1 - chr2R 17217908 5' - 412 327 2 71.92 AACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 + chr3L 7791912 5' - Transpac 5161 2 70.23 GCCCGAAAAAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGCGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr2L 12325011 5' + jockey 4693 1 58.04 GGTTGGAAATTTTGAAACTATACCAGGACGATTGATTTCTCAACTTTATACGGAATGCCGAAAAGACCGAAAATCAATTGTTACATGTGTCACTACATTCAGGCAAACTGCAAGTGCGACAAAACGAAGAACTG:1 - chr2L 16836886 5' + mariner2 308 1 52.99 CAACTGCGAATAAAAAAATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:2 + chr3L 18253754 5' + blood 7041 2 65.07 ACGCAGTATCCATTGCATACTTTTCGGCTGGTGTGCACAAACCGGAAGTCCTTGATGCAAATGTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chrX 7741878 5' - hobo 2915 1 60.71 GTGGGGATCTAGCTAAAAAAAAAATTTGAACCAAAATAGGAGAAAACATTCACGTCTTAGGGACCACTGCAATGATGATAAAAGGTTTAATTACCTACACCTCATCTATCATACATGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACT:1 + chrX 383373 5' + 1360 495 1 78.77 GCCGGCCAACGCATTGCCCTCCGCCGGAGCTTAACCGTAACTCCGGGCTCGACTCCGGGTCTTGGTCTCCGGCTTTTGCGGATTTGTGGTCAGCTTTGGCAATATGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 22871339 5' - accord 7033 2 67.23 GAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr2L 19407037 5' + Doc 59 1 60.42 GTTTGGCTTTCTTACTGTTTCGCTCGTTGTAGGAATAAGTTGGTGTATCGGCTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr2L 22719662 5' - 1360 3348 1 54.62 GTCAGGATGCTGAAGATACGGCAATAAGTCAGACGGTTGGTTTATGCCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr2L 19652531 5' - roo 335 2 67.12 ATTGACTTCGAAGGGCATCTGACATGAAGGTGTGTGACAATGGTGTTTACGGAGTTAAAGATGAAGATTTTTTCGATTTCTCTGATGATTTCTAGCCGGCCAAAGTCTTTGACTTTGTCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chr3L 27368819 5' + blood 165 2 76.39 CAGCACTGAGAAAAATTGGAAATCCATTTATCATTAGAAATCAAAGCATATGATGTGTGTATGTTTTTCATAGCCTTTCTTCCTTTAAGTAGTTCGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGACACAC:1 + chr3R 28116942 5' - hobo 2913 1 67.81 CGAGCAGGGGAAAAACAACGACGTCAAAGCCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 + chr2R 15528481 5' + 1360 57 1 74.34 ATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCTACAGCGACTGA:1 + chr3R 11151818 5' - mdg3 5425 2 65.07 GTATTTTATTCTACAAAAAAGTACACACACAAATATTTGTAATTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCCCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTATG:1 - chr3L 2433213 5' - Quasimodo 356 2 71.23 TAGAAATGTAATTTTAATCTTTTCACTTTTGATGACTTCATTAATATTTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTAC:1 - chr2L 9418583 5' + rover 72 2 67.81 ATTGTTGATATAATTATAGTTTATTCTCTAAGAGTTTCTCTCACTTTTCACGCTGCCATCTCTGTGTATAGGTAGCCCACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGCGCAGCCGTC:1 - chr3R 24499611 5' - blood 333 2 53.42 GAGCGCATTTTAATCGTCCTTTGATTCTGTTTTGCGGTTTATTAGTTTTTGAGGAATTTTGCTTCCTGAATCCTTGACCACACCCCAAAATTCCTCGTTATTATTGGGTCTGGCTTCAGAAACCCTTTTTTCACGTCCGCCCAAAG:1 + chrX 19690334 5' - Tc1 1172 1 69.86 CGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr3L 27391423 5' - 1360 3366 1 65.07 ACCCTTTGAAAGGATATATTTCTTTCTAAATATTAGATAAGACACCTCAATAAAACATCATTATTTTACTGATTGTTCAGTTCTGCGTAAATAGCATACATTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chr3L 785841 5' + I-element 20 1 70.55 CGGTATGAGAAATCAAACTAAACGCAAATGTTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTC:1 + chr2R 23679863 5' + I-element 5329 1 77.40 GTGGAGAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTGTGTCTCC:1 + chrX 22726188 5' - Helena 1235 1 54.11 CATGGAAATTGCATGCTAAAGTCAATCAGCCAAACAAAACATGGTCCAAAGTTGACAAAAGAGGGGGAGAACTACTTAAAATTCTCTGGGATATCACAAAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCT:1 - chr3R 15633665 5' - roo 8974 2 67.12 AGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTA:1 - chr3L 7801277 5' + Transpac 195 2 76.55 AAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCTAAC:1 + chr2R 5070933 5' + Tirant 19 2 31.88 CTCCTCGCTCTTTTTTCAAGACCTTCTGACGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr3R 25050064 5' - P-element 2841 1 35.58 CACATTTGTTATTGCCACGAATCGCGTGGCACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:1 - chr2R 10910342 5' + Tabor 6867 2 63.70 AACCCATTTAAATCCATAAAACCCTAATAATTGTCTTTGACATCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chrX 7756412 5' - roo 332 2 71.33 ATTTATGATATTCCAAACATTTTAACATTACCATACCCAATTAAAAGTCTAAAATGGGTCTTACTTGAATAGCTCTGGCGAAATGTTCCGTTTGACTCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAG:1 - chr2R 21845505 5' - Stalker2 311 2 53.57 GTATTTAAATGTATATTTTGAAAACACTTCTTTATTTTCAGTTTAACTAAACTTTTAAATGCAACTTAGATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 4651670 5' + roo 8714 2 55.48 GCTGCTTCGCCTTTCCTCTTAGTGTGCGATGTTATGTAATGTAATAACGTCAATCAAATTTAAAAAGGCAGACTGGAGAACCACCACAATCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAAC:1 + chr2R 22753990 5' + G2 2908 1 52.74 AGTGCATTCGTTTCGCACACCAATTCGCGAAAGCTTGCATCATAGACACACACACGCACAGACACACACACACACACACAGGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTCAACAAATCATCGGACAC:1 + chrX 12905403 5' + Tirant 8141 2 60.99 TTTTAACTGCACACTGGGCTCGGCATCGTCCTCGCTCTCATCCTCGCTTCCCACAGAACCAGCGCCTCCGCCGAGGATGCCGTCGATGCTGTGTGCGTATAGGGTTGGCACGACAAAAGGTCATAACTTATCA:1 - chr2R 25063703 5' - Q-element 674 2 69.92 AAATATCAATTTTGTTTATTAAAAACTGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:1 - chr2R 6885405 5' - flea 4970 2 49.32 CCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3R 21674898 5' - roo 8996 2 70.55 GGAGTTATATGGGTTAAATGCTATCAGCAGTTACTTTCTCTTAACATTTCCGTTCTTAATACATTAATATAGTTGGTTGAAAACTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr2L 4929775 5' + blood 38 2 59.59 GACATACGGACATTTGCCGGAAAGCCGGCTTTGAATGTGTCTTGAAACTTGGCTGGTGGGATGGAAATTGAAATGGAAACGGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATT:1 + chrX 12966209 5' + roo 9066 1 56.85 GTCTCACATTTGTTATTGCCACGAATCGCGTGGCACTGACGTTCTGGCCAGTAATCGGAATTACTGACATCGGAAAGAAGCCCGAATAGATCGCGTTCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:2 - chr2R 10910346 5' + Tabor 6863 2 66.44 AGATAGGAACTTGGCCCTGATCCAACATAGAAATACATACGAATGGCCTATCAGCGAGTTATGAGATAGTCAAAAGGAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3R 25862693 5' + roo 8707 2 54.79 GAGCTATATTGTAATATAAACTTAAATGCAATTTGATAGATATATATAACTATATATATATAGCTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - 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chr2R 18014095 5' + Doc 101 1 80.82 GTTGAAGCCCCGGATTAAGTCCTGGACTTCTCCATCTGTAATACATTTTACACTTTAGGCTACTTAACGCTACATTCTTGTATATCTTTTACATTAAGATACAATTCCTGACTTGATTTGGAAATTTGTAAATTTCTTAGATA:1 + chr2L 19176417 5' - Ivk 5242 1 60.84 ACCAAATGAAACTCAAACATATATTCAAACACAGGAAAAAAAAAGAGAGAGGAAAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCA:1 - chr3L 26694923 5' - Tirant 279 2 63.01 GAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr2L 21153469 5' + 1360 52 1 52.74 GTAAACAGTATTCTCTATCATTTGCAATATTGTCCAATTAAACGCAATACTTCGCCGCAAGCTTTATTTCTTAAACTCCCTTTACTTCGATACTTGCAAAAATAAAATATGACAAGAGGTTTTC:1 - chr3L 14432681 5' - Tc1-2 1190 1 75.00 TGGAAGAGGAAATTTGAGCAAACAATTTATAAAATAAACGAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCACTTCAGCGCAACAACGCGTACT:1 - chr3R 24454914 5' + F-element 252 1 69.18 AAAGACATAAATATAATAATTAAGTGGGAGTGAAAATTACACATGTGTATTATAAACAAACATTTATAATTTTTGGATTGTTCACACCAATCTTTAAACACTTAAAACAAAAAGTTGGAGCTCTCGACTATAGCATTCTCTCTCTG:1 - 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invader5 3907 2 55.48 AATTTTCTTATTATTTAAATAATATTTTGATAACTACTTCTATTGCATTAAAATAGGATTGCATTTCTTATTTCTCACTAAAATATTAAAAAAGGACTAAAGTATCAATAGAAACTCGGTATAAAATTCATATCTCAAAAACTGGA:1 - chr2R 11548078 5' - FB 111 1 78.08 GGAATCAAAACTCCAAGGCGGCTTTCTTCAGGCAGCCCCAAAAAAAATCGTGCTGCTCTTGGAGGCTTCGAGCTCGTTTAGCGCTCATTTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr2L 11405892 5' + 412 7084 2 63.01 CGCCCCTTTGCGTCTTTTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 - chr3R 24564824 5' - opus 487 2 60.00 TCTTATAAATTAGCACATTTGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3R 19436133 5' - roo 393 1 73.29 AATTATAGCTGAATTGAGTGAGGCAATTAAGCACTTTAAACTGCATTAGTTTTTATCGTGTTTTATTACATTGCTATTACATTGATATCTTATCGTAATTTTTTTCAGTGTATTTCGTGGGCCATTTCCAATTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2R 1343390 5' - P-element 2660 1 65.75 AGTCGCGGACACGCGGCGTATACGTAATGTGCTTGCTGCCAGCACTCCGTCCGCCATCAACGTCATCATCATCATCAGAAGCAACTGTGTACACATCGGCATCATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTGCCCTCTTCCTTTACTCTTAGT:1 + chr3L 16518397 5' + mdg3 5273 2 71.92 ATACGCAGGCACACTTTTGCAACCGTTAGCCATGTTGGCAATGAAGGATAAGCCTTGGCTGCTGCTATTTGGCCTATTGGCCGCATTAAGCTGTAACTGCCGATCTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTTAGTACATAATTAGAT:1 + chr3R 10687211 5' + Cr1a 4275 1 65.75 CGCATACGCAACGTTGCCCTCGCAATTGGCATAACTTATAAGGTCGTTAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1 - 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Stalker4 7305 4 52.74 AAAATGGCACACTGGCTATGGAATTAAAATACATATCAAAGTTTTAATACCTCATCCCCCTGGCTCACGGGGCTTTGCCTCAAACTTTGCAATGACAGTTTAATGCTTATATCTAAGTATTCTTACTTACATTTATACATATACAT:1 - chr3L 13597055 5' - Stalker 250 4 45.21 CAGAGTTTTAAATAACAAGTAAACACTCCGAGCTGCAATTTGTATTACTTATTATATGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACAC:1 - chr2L 1361028 5' + Stalker2 7310 2 58.90 GTCAGTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2L 7652257 5' - roo 8986 2 78.77 GAACTTTAATTGAAACTCCGGACTGATTGGGATCTTAAACCAAAACAAATCTCTTTGAATGGCCAGCAATTCTAAAGGCGACGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chrX 6632923 5' + P-element 41 1 55.48 GCTTTTTTTCGGCAGTCAATGTGTAATAAATTATTTTTTATTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr3R 24564866 5' - opus 473 2 65.96 GTAGCAGGTAAGGAGGATTTAAGAGCCACCGCGATTAAACCCATTTGATTTTGCGCCAAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3R 11870067 5' + pogo 50 1 59.85 CAAGTTTAACAGTAAGTACAGTTGTACTTATCCGCTTTTGTTATTGTCAATTATGTTAAATACTTCATAGTTTAGATATTAGGTATTAAGATATTCATAAATGAACGTATATAGGCTGAGGTACTTTTTTTTTTAAATTTATTGCG:1 + chr3R 28440010 5' - Doc2-element 4768 1 55.48 TAATGAATTTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTATATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGACAGAAGATATACATATATTCTTGATCTGGATCAATA:1 - chrX 19192435 5' + INE-1 84 1 78.32 GAATCCTAAGCCAGGACCTACCTGCGTTGGCAGAGCGAAATACAAAACAATTTGCCAGATACGGTAAGATTAATGATCGCTACAAGGAGCTGGGTCTTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGC:1 + chr2L 12600600 5' - Tirant 252 2 71.64 GAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTCAA:1 - chr2L 12291899 5' + Tirant 8110 2 66.67 AGTGGAAAATTCCCAAAATCTCGCCAGAAAGGGACGGCGAAAGAGAGCAAGGATTACGGGGGGCGTTGCAGGAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCAGAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATT:1 + chrX 6338829 5' - micropia 5134 2 50.36 TAAGTTTTTAGCACATGATAAATTTTAATATTGTGTGGCAGAGGAACTTGCTACTCTGACACAAGCTGCGCACAAAAAGAGCCACTGATGCAGCAACAGCAGCAGCAACAACAGCGGCGG:1 + chrX 13921015 5' + TART-B 154 2 84.17 GAGAGTACCGAATTAGAAATGAAAATTAAGTAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3L 22594166 5' + 297 14 2 58.33 ATGTGAATGTCTTTTTAGTTTTTTTTTACGTCAGTATCGGCTTAAAAATATCAATTTTGTTTATTAAAAACTGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:1 - chr2R 6885450 5' - flea 244 2 74.48 GTAAATGTACATTTTTAAATGACCTAAATTATTGAAATAAAAAAAAAACCAAAACCCGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3R 20840061 5' - roo 343 2 65.75 GGCTGGCATACATTTTCCGTTCGTTTCCTCGTTTCTAACTGCCTTGCATTGTTTTGTTCTACTTTTATTGCATATTTGCAGCCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTC:1 + chr3L 18802339 5' + I-element 270 1 59.86 GAAATGGGTTGAATGGAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTC:2 - chr3L 15364896 5' - 1360 3316 1 68.49 GAGTTCGCTTTGGCCAGGCGAATTAGAATTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGGTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGA:1 + chr3R 16240923 5' - Tirant 8417 2 77.40 GTGTGGTCTGTTGAATGAAAAGTCAGTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr2L 7652278 5' - roo 9007 2 64.38 AAGCCTGTGACAAGATACATTAAGCATCCTTGCAAACAGTAACGCTGTTCCACTAGTGTAAGCCCCATTCGCATTCGCATTCGCAACCGTGTTTGTATCCGAAAATGTATCTGTAACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCT:1 - chrX 4896373 5' + Doc 386 1 78.77 ATGTTGGGGAATCCCCAAAAAATCACGTTTATGGGTATTTCTTGAGGATAGCTCTATTAAGCAGAATCGTAACATAAAAATTACCTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGC:2 + chr3R 25543443 5' + G2 221 1 41.78 GAATTTCCAAAGAATATCATAATTTTGATCGAAAAGGTTTATCTTGCAAATGTTTAAAAAGTGTATATATACATCTTTGTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 + chrX 15454657 5' - 1360 3346 1 56.85 AACTGGGCTTATGTAGCTTGCTGGCTCTTTAGCTTTTTTAGCCATTTGGGGTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 21013815 5' + roo 8686 2 69.72 GCTTTCTTCAGGCAGCCCCAAAAAAAATCGTGCTGCTCTTGGAGGCTTCGAGCTCGTTTAGCGCTCATTTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr2L 11405872 5' + 412 7104 2 52.05 CTCGTCACAGCAACTATAATATTTTGATAAAAAATCGGTCAATTCTCTAAAATCTATGTTCGGGTTTAATTCCTATTGATTTTTAATTGAATTTGATACCTGGAAATTTCAGACATTTGTATTTTCCTTTTTTATTTTCCTTTATT:1 + chr2L 4133219 5' - Doc2-element 256 1 78.77 CGCAGGGCTTAGGAGGAGTGATTTTAAAAATCCTTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chr2L 21910222 5' + Doc 25 1 55.91 GAGTTACCGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCACCCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGACA:1 + chr3R 443019 5' - opus 7484 2 69.18 CTCCGATGATGCGCCTTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAA:1 + chr2R 22746035 5' + jockey 4794 1 60.27 GATAAGATCCCGATCTTTCGATTAGATGCCAAACATTTTGGTGAGTCGAGATGGCAAATTGCGGTCATTCACAAATGCGGACTAAATACTTATCTTTAACTCGATAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCA:1 - chr3R 5305559 5' - I-element 92 1 69.86 GAAGATTTAAATCAGGTGAATATTAGAATAATCCACATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTGTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr3L 17537714 5' + Doc 42 1 58.90 ATAACCAGTCGGTCCAGGACAATGTCCATGGCCTTCACCCACATCACTGGTTGTACAAAGCATCTAAAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGGCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGAC:1 - chr3R 16997506 5' + G6 1 1 79.53 GAATCAAATTTGTGCAAGACCCATTAAATATAGTCGAGACATTCAGCATAAATGTGTACTAAATAATTAGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 + chr3R 17047799 5' - 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chr3L 7469593 5' + I-element 5251 1 64.38 AGCAAATTCACGAGTCCCCTTAAATATTTCAACACGAAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACT:1 - chrX 15559557 5' - hopper 1334 1 76.71 TGTATGCATTATACAACGAATACGCAGTTGAAAAGGTTAAACGAGAACTAAAACAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 + chr2R 9769539 5' + 1360 67 1 62.33 GGACGATTTCCATACCTTATGGGACTATCTACCTGCATTGCTTCTGGAGGGGGATGTACATTATAATTGTTATTTAAATTCCAATTATTTGGCGCTCTGAAGTTTACTTCCGTTTTGACTTCCGCTTTT:1 + chr3L 25839758 5' - Fw2 328 1 67.44 AGCGCATTAATGGCCAACTATTAAACTAATCGCTTTTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 - chr3L 10112286 5' + I-element 56 1 53.42 CCTTAATGAACAAGTTACAATTTGGGCGAGAGCTGGCCCAACCCTCACCCATGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 + chr3R 28406303 5' - opus 493 2 78.42 TTGTATATTGCTTCAGAATTCTTTTTGCTTTGTACTGTATAAAGTATAGTTTTCTGATTGGTCTGTATTGTTATTTTCGAAATTGACTTTAAAACGGAAAACCAAATAAGTATAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3R 21216785 5' + 1360 9 2 73.97 ACACAGTCGCACAGACCCACTCGACATGGATATAGATATATATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGCTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCCCCTTGATATGACAA:1 + chr3L 5069410 5' - opus 448 2 69.60 AGGCCTCATACATACTTCTCAACAATTGTTGGAATATATATATTTCATTTTTTACCATATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGGCCATT:1 + chrX 22905215 5' - INE-1 102 1 52.99 ATCGAAGAAAATCGTGACTTTTTACACTTTACACCATCATATAGTCTAGGAGTACATTGTTAATACCATCAAATGTTTTATGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCAGTTCATATC:1 + chr2L 7652168 5' + roo 38 2 52.74 ACCCCACTAGAGTTTGGTCCTTCAGGTGAAAGTTTAGCACTAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACATTCGGTACTCTAGGC:1 + chr3L 13364318 5' - hobo 2897 1 61.17 TTTGCGCCACCCACACCGGCCAATTCATTATTTCGAATAATGAAGTATGCGTATGCGCAGTATACATTCTAGTAAACATTCTAGAACTGTCTTTTTCCGAATATATTAATTTGCTTCCTCTGATTTTGTTTACTAGCTCCTATATT:1 - chr2L 21715739 5' + Gypsy12A_LTR 2081 1 52.74 CTTAACACTTAGTTAATAATAGTGGATTAATCCTGTTTTTTCTTTTTAAAGGAAAATTATTAAAAATTAAAAGAAAAAA:1 - chr2L 15399619 5' + Doc 4693 1 32.91 AAGGTCAAGGCAATATAGCGCAGCAGATATTTCCGGAACTACACCACCCAGAGTAATCCCCCCACTTTGTATGCCCCCGCCTCAAAATCGAAGGAAGCAAATT:1 + chr3R 30365856 5' - Gypsy12A_LTR 2064 1 72.82 GACTTCCCCATTTTCCGCCCACCCATTTCGGTTCTTAACAATTTATTTGTTGTTGCTGTATTCACATTGGTTGCTCCATTTCGCCGTTGTTGTTGCGGTTTTGACTTATGCGCGAGTCACCACACCACCCCCTAAACACCCACGCC:1 - chr2L 20944256 5' + Tirant 8120 2 78.08 GGATACTAGCTGAGTCAAGTGGCAAATGTCCGTCCGTTAAGTTTTGGGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 5422992 5' - roo 394 1 72.86 GTAGCAGGGAGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr3R 23161250 5' + 412 7088 2 55.22 ATCCAAGCTTTTATTAGACGATTCTTCAAAATTGGTTTAAAAGGTTATTTATATATAATAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chr3L 18801870 5' + I-element 50 1 57.46 CAATCAATAAAAGGTATAACATTTCATTGTCTACAATAAAATTCCCTTTAAAAATACTCAAGCTTATCATATTTATTAGGTGCTTGCATAGTCTAAGCTAGAGTTTCTTTTTAATGAGCTAATACCCAATCATCTATTGTATTCTT:1 + chr3R 14923042 5' - Stalker4 6983 4 73.97 GTTAAAAATGTAAATCCAAAGCCGTAGTTTACTTAACCCTTCTGCCACGTTAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCCCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGTCGATTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chr2R 15070222 5' + 412 13 2 73.97 GATAGAGATTCGCTAGTCAGAGAAAAGAGAGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr3L 4651579 5' - roo 326 2 72.60 CTCGATACGCAGTTCCAGTTGTAGTCGTTTCAAGACTTTGCCATTTTGTATCTCACAGATGCATAGATACGCTCGTACGGAAGCAGCTTAAAATCAGTTCTATCTATTTAGTGTACTAATGGAGAAATCATACACATTCATCAAAT:1 - chr3R 29013473 5' - transib1 1733 1 51.37 CTTGTTACTCAGCAAATATTATCCATTCGCCTAGTTGTTTGGAGTCCTGTTAACATTTCAAAGTTGTAGTTTAGTTGTAAGTGTGGGCATTAAATTACAATTTGTTCAATTGAATTAAAAGCTGAAAGGTTGAGATTCAGCATACA:1 - chrX 19810455 5' + INE-1 173 1 78.77 GGGCGTATAAGTTATGAAAAAATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTT:1 + chrX 7695212 5' - P-element 2661 1 19.18 TCGTAATCCTCCTCTAGATCCTTAGTTGATTAGTTGCCAATACCATTCGCTAAATGCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTGTTTTTTGAAAATAGATTAGAAAAAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATAAATT:1 + chr3L 27349106 5' + 1360 359 1 67.81 AAAAAAAATTTAAATTAAATTATGGATGGAATTTCACATAACAAAACGTATGCCCTTCCTGTCTGACTTCCACGCCAACTCTTATTATGTTTATAATCGAACATTATAAAACGTGTGTTCGATTTCGATCAAAAAAAAAATAAAAA:1 - chr3R 18818276 5' + R2-element 3580 1 56.16 CCAGCTGAGATGGCTGCCTAAGGCCAAAATCTGTCTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGTCT:1 - chr3L 5069512 5' + opus 7034 4 60.00 CTAAAAAGCCGCTAGCAACAATTTGTATGCCAAACACTAACGCCCACTAGCACATCCCCAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACAGAG:1 + chr2R 11040112 5' + accord 7104 2 74.58 TTACAACTAGTTAATTATTTATTATCCATTTGTGACTAGTTTCAAGCTCCAAATTTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATA:1 - chr2R 5095042 5' - jockey 4866 1 63.01 GAATAGAAATCTAAAAAAAAAGAGCGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1 - chr2L 21643158 5' + Tabor 32 2 63.01 CTGTGCAGCAAACACTATTTTGTGGACTGCGACGGGGCGTGGCTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAG:1 - chr2L 795138 5' - jockey 4907 1 72.60 AGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2L 12486410 5' + roo 75 2 72.41 CAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3L 10469612 5' - roo 346 2 63.45 AAAACCAACCCCGAACGATATTTTCCAACAAAAGTGGGGTTTGATAAACAAGTTTACACCTCTTTCGTAGGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCTTGTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGAG:1 + chr3L 15730391 5' - rooA 7444 2 50.70 ATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAA:1 - chr2L 23034068 5' - FB 372 1 46.58 GGCTATAGTTATATATATATATATTTCTTTTACCGTTTACGGTCGAAATCCTGGCTTCGCGACTATTCAAATTTATTTAATTCAAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGCCTGCAACGCTGACTTCCACTC:1 + chr2R 17016525 5' - flea 131 2 61.11 CCTTTTCAGACCCTTGGCCCCGTAAGGCATCACTTGCTACTCTTAGTATCGGGCTTATAGATTTTTTGCCAGAGTGAATCGTTAAGCCCGTAAATGATTCAGAATACCACATGCTTGGAGCCCCGTTCGTTCTGGCGCTCCAC:1 - chr2L 21911096 5' - Juan 206 1 77.62 GAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 - chr3R 16276438 5' - pogo 2047 1 60.96 AGCCAACCGCTTGAGTTCAATAAATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:2 - chr3L 16059371 5' + 297 6617 2 61.64 ACTGCATACTTCATGCGAATACCAAATATCAATAGTAATCACAAAACATTCATCCGAATTATTCAAGAGGCATACTTTCCACTTCGAATATCACACACCTGATTCACGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 + chr2R 14135218 5' - copia 240 1 74.66 GCTAGAGAGCTCAAAGAGTATGTGCAGTAGGGAGAGGAAAATAGAGAATGCATTCCACCAGCAACTAAATCAAAAAAGTGTGAAGATGACCTGGTTGCTTGGCCGAAAATCTGCAACCACTCTGGAAAATAAAGTCCGTTTATACA:1 + chrX 3546424 5' + G4 3387 1 60.96 CAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chr3R 8849874 5' + 297 16 2 68.70 ACTGGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTC:1 + chr3R 4604452 5' + 1360 463 1 71.54 GCAGTATTATTTAGTTTGCGCTGGCCATTCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 + chrX 18239130 5' + jockey 77 1 75.81 AATGGCTAAATTTTATTAACGCCGATCCATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCAT:1 + chr3L 27415170 5' - transib2 2813 1 77.14 AAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATT:1 + chrX 8967398 5' + HMS-Beagle2 75 2 69.86 GGTGTTGGGGCATTGGAAGCTTCGCGCTCGTGTATGTGTGCCAGTTTACATTCACTTTGTGCGGAGTAGTACCTTAGAATAATGTTTCGACTACAATAGACTTTATCCAATACAGATGATAACTTGTAATCCTGACTCTCTGCCGC:1 + chr3L 8420097 5' + Cr1a 4232 1 54.11 TACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1 + chr2L 15081078 5' + Doc 78 1 72.60 ACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCG:1 - chrX 388319 5' - 1360 3314 1 69.86 TGGAAGAGTGAGCCACCAATCACACATAATTATATCACATTAGCTCAATTATTGACAAAATTCTCGATCACCACACTTTATCAAAAAGTTGCCAGCCATAACTTTGGTAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACAT:1 - chr2L 2706471 5' - jockey 4850 1 72.99 CAATGTTAAAGCTAGATTATTGAGGTCTTGAAATATTGTATGTACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTA:1 - chr2L 21976775 5' + Idefix 67 2 71.23 CCCACATTCAAATTGTGACTCTCTTACCACTCGCTTTTAGTTGCTCAGCATTTGAAGCTGGTTAAATACATATGTATGTACATACATTGTTCATATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAC:1 + chrX 887255 5' + Quasimodo 21 2 71.92 CTTCGGAGTTCTACAAATTAAACTGTTAAATATTAAAATTTTTTTGAACAAAATGAATGATTACAAGATGACCCCAAAAAATTTGGAAATGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 6913482 5' + roo 30 2 67.12 CTTTTTTGTTGGCATTGCCATCGTCATAGGCATGGTTACCCAGAGACAATGCGAGGAAAGCATTACAAAAGTTGCGCCTGCCTTTTTTTGCATACAACTTACAACTGGAGTTGGAAAAAAGTAAAAATATATGTATATATATATAT:1 + chr2L 13585008 5' + 1731 4409 1 73.29 TTCCTGTATCCGAAATCCCCCATCCTAACGTCGCTCCTGAGCTCGACTTTTGAAAATGGCATTTTGGATGGTGACACTGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTT:1 + chr3L 5371846 5' - Doc 417 1 66.96 AGCCACGTTAGCGTTTTTTTCCCAACAATCTGGTCATTTTATGAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr3R 26486104 5' - 412 458 2 59.22 GCTTTTGTTGTTGGCTACATTCATTACACGCATTTAGCCATAAATCCGATGGCAAACAAACCGGCATCCATCTAGTGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGC:1 + chr2R 19092064 5' - X-element 4343 1 51.37 ATTGCGCAAATATTTCCCAGACATTTCAGGCATTTTCGCCCAAGGTTGCACAGAGGATGAGATATAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCGTATGAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATCTTGAG:1 - chr3R 15721764 5' - 1360 489 1 55.48 ACATTTGGTTAGGACGGCATCAAGTTGGCCTTTATTTATTTAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 18528400 5' + roo 8697 2 59.59 AAATTGCTAACCTCATCCTCCAGTTTATTCTCGACCTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTACTAGCACACTTCGGCACGTGA:1 - chr2R 2796032 5' - P-element 203 1 28.08 GGCCATTGAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 - chr2L 5792088 5' + blood 7072 2 57.53 GAAGTGGCCGCCAGGCAGCCATGTTTGTTTGTATTTATGTCGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr3L 7460581 5' + 412 7081 2 66.44 ATGACGATCATGGCTTATTACTTTATTGGAGAATATACAAAGATTAACGATTTTTATAATCAAGCGCTAACGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTTTGTAAATGAAT:1 + chr2R 11256148 5' + roo 8716 2 54.11 GCTAAATTGACACGAGCAGAGTTTTCCTTCTGCTTTTCCGGCTGTTGTTGTTAGTGTGGCACGTACATTTATTACTTTTCCCCCTTCTACTCACACACACACACACA:1 - chr3L 12284206 5' + Quasimodo 32 2 80.37 AAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCACGCTACGAACA:1 + chr3R 9125633 5' + Doc 36 1 64.29 GACACTCTTCAAGTAAGGGGTATAATATAATGAAAATACATACATACCGCTGCTTCGAGCACTGGGTTTTTTGCGCTGATAACACGCACACTCGGGTGTGCGATGGTGTTAGTGCGAACTACCGTTAGGTACGT:1 - chr2L 23034089 5' - G6 139 1 67.91 TGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATA:1 + chr3R 10437043 5' - BS 5036 1 56.85 AAAACAGGCGAGCCAACCGCTTGAGTTCAATAAATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr3L 16059381 5' + 297 26 2 68.49 AGATAAACACACAGTGCGCCAACATCTGCCACCAAATGTTGCAATCCCGATTGTGACGCCTCTATTTTGTCCTCTTTGCAGTTCTTGCTCAATATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGA:1 - chr3R 9498224 5' - 1360 3180 1 60.96 ATCAGTTAGATGTCAAAGCAAGTAAGTTAGGTACAATTGTAATACAACATCAAATGCACAATGCTGGTAAAAAACGGTGCCAGGACTTGGTGGACGATGCGCAGCTGTCATTGCCCACAAAGGTCACGCAACCAAATAATAAGATT:1 - chrX 2429594 5' + Tc1 1337 1 52.74 GTAAGAATTTTTAATTTACGAGAATTAATACTATATTTCAATATATTTATACCTTTACTCTTTTATTTAAGTGTGTCTTACCAATTATTTTTAAAATATCCATTAGATCTGTTTACTTTTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTGT:1 + chr3L 19338409 5' + Tc1 1537 1 52.05 CGCGACGTGTTAATGTTTTGCACTCAGCTTAAAGTGCGGCAATCGAAAGGCCCAGCATGAATTTCAGTCGAAAGTATCTATCTATGTATATATGTAGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 + chr3R 8849720 5' - 297 6955 2 70.34 GTAGGGAATATTAAATTATTAATCCAATCAGCGAGTGCAGCTGATGCCACGCCCACAATTGTTGGTATCGTAAAAGATATGACCTAGTGTAAACCAATACAAAAAACAGAAACTAAATATGTTATTAATTTTGGCCACAAA:1 - chr3L 17877958 5' - Transib-N1_DM 24 1 69.50 AGCTTTCTACTGGGCTTTGGATTCACGAAACTAGCCTGTTAAATTTAGCACGTGCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 - chr2R 5754594 5' - P-element 2820 1 43.84 TCCGACCCGGCGACTGGGATGGCACTCAGTTGAGCAGCTTCATCTAGAAGTCCATTCCGTTTGGAGCAAGATATCCCCTCCATAGATTCAGTTCAGTTCAGTTCAGCTCATTTGCAGCACCTTTGTAGATCACTCATATCACCGTG:1 + chr2R 21512402 5' + Q-element 185 2 75.34 GGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr2L 17295825 5' + Doc 16 1 61.47 ACTCAGCGGCCCCTCTTAACCCATTGAAGACCGTTCGTCGAAAATCGGATGAGGTACACACATTTAACTTACTTAAGCTGTTTGGCAACGAGACACCCTGTATACG:1 - chrX 14137316 5' + 3S18 5772 2 70.75 ATCCTAATAGACAAATTACGCTACCGACTTTAGATTAATGAAAGTTTAGAGAAAAATAAATGAGTTAATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 + chrX 8977430 5' + I-element 35 1 55.91 CGATCTTCTGAGTTCACGCCTCCCTCTCCCCCAACCCCTTTCTCGCTTTTCCTTCGAGGAATTTTCCCCTTTCTCTTCTACTTTTACGTATTTCATTAAAGCGCAATGAAGACATTTTCCGAGGCACAGTGTGTATGTGTGTGTG:1 - chr2L 18786866 5' - accord 7105 2 43.45 AAACTGCACAGGTCATAACAAAATCAAACGGACGAGGAATGCATGTTTGTCGAATTTTTTTTGTGAGCTACGAGTACTTTTTTTTAGTTGTAGTAGTAGTAATGATACATACACTATTACTATAATATAATAACAATAGTAATAG:1 + chr3R 29504567 5' + mdg1 7052 2 76.55 CCTGGCCCCAAAGCGACGGACTTTCTGAGGATGCGTTCGTGACACGAAGTGAGATGAGAGAGAAGTTAAATTGCTAAGATAAATTTATTTGCAAAAATTAATTACTAATAATAATAATAATATGGCCACGTCCGTCTGTCCGTATG:1 + chr3L 10942566 5' + INE-1 120 1 77.40 GAATAACTTTTGAGTTTCGGGTTGTTTACAAATTCCTCCAAATGTATTTTGCTTTGTCCCATTACTAATCAACAAAATATTTCCATTTGCTATGTGCTCACCAAGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2 - chr2R 11256304 5' - roo 394 1 73.97 CATTTTGGCCATGTTTTGCGTGTGCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTA:2 + chr3L 13952764 5' + I-element 5154 1 53.42 ATCAGAAATAGTTACGTTACGATTTAAGTATTTGTCTTATTTCTGACCAATGGTTGTCAATGGGTTAAGATACCTCCAGTCAAATGAGCTCAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGG:1 + chr3L 12097061 5' - jockey 4644 1 65.07 ATAATTAGGGCCAATGACAATCGAATCGGACTGCAGCAACTGCACCACCACCAGGAGCTTCGTTTCGATTTATTGAAAAAAATTTAATTTTCAGAAAGATAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCC:1 - chr2R 21103284 5' - INE-1 571 1 60.16 CAATCCCAGTCCGGATCCCACAGCCTAAGCCGAACGCTAGCCCGAAACCGAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3L 19581017 5' + roo 8 2 77.60 AGTTGTTTTCATCCCATTACTTATCATTCGTTTTTTTGTCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATAAGAAT:1 + chr3L 3238273 5' - roo 8996 2 68.35 AAAATCCAGTTTATACCCACAAAGGAGACGAAAAAGCCTCGACTGACATAAGCAAACCGTGTGCCGGACCATCGATTGCCAAGCACGCTCTCATCACGACAGAGCTAAGTCACGTTGCCCTTCGATTCCGTTAGATTTGCCGAAAT:1 + chr2L 55328 5' + diver 457 1 58.22 GTACTAAAATAGAGGCTTCCGATTGCCCTTTTGTCCCTCAGTATGGAAACCGGGTGCATTGGATCCGATCCAGCTGTAGGATCCAGTTCCCCAAGGGTTGCATTTCCCGCAAAAAAAAAAGAAAAAAAACA:1 + chr2R 10548053 5' + Doc2-element 217 8 78.63 CTTGTCACTAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATCT:1 + chr3L 17921955 5' - copia 184 2 65.73 ACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTT:1 - chr2R 18014100 5' + Doc 96 1 77.40 CATGTTGTCGTATTGACCACGTACTATTTGATACAATAATCAGTACACTTTTTTGATTATAATCTGTGACTTTTTACCATTTATTTTAGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:2 - chr3R 12744764 5' + Stalker2 35 2 47.95 GAGTCAAGTGGCAAATGTCCGTCCGTTAAGTTTTGGGCACATCTACGGCTGCCGCTAGATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTAATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTGG:1 - chr3R 5422981 5' - roo 9040 1 62.33 CCAACAGTCATTAAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:2 - chr3R 21674913 5' - roo 9011 2 60.27 AACCCTAGAGAAAAACTAACAAACAAAAATTATGTGGGACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chrX 7706705 5' - P-element 2863 1 67.81 ATATGGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCA:1 + chr3R 10437032 5' - BS 5047 1 54.11 GTATATTATTTTTGAAAAATATACCTGAAAGTGCGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGGTTATGTCTGTT:1 + chr3L 12193698 5' - Quasimodo 7028 2 72.93 AGTTATGTATTGTCTGCCAACCGCACACATACAGAGCGACACCAATACCAACACAGGTACGACTTTTTCACCTCGTCTGAGTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAA:1 + chr3R 10906348 5' - hobo 2493 1 57.93 AAATCAAAGAACTCATTGAAACCAATTCCATGCACGCTACGCCGTTAAAGAAACCACAACGCGTACGACTACTTGCCCATAAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGA:1 + chr2R 16920114 5' + jockey 4616 1 41.73 GGGATCGAGTTGGGAACTGTGTGGTTTGGCTAATGCTGATGTTCTCTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGC:1 + chr3R 19087909 5' - Stalker 7150 4 66.42 GAGGTGCCAATATATCCTTTTTCTTCCTTATTTCAAACCCATTCAGCTAATGGAAAAATACCATTCCCGGTTGGAAAGGCATAAAATATGACCTGATATGTATGTATCTAATTAGAAAAATCCCCTTTTTTGTTTTTTACGCTGCA:1 + chr2R 15702873 5' + hobo 384 1 78.08 ACTGTACTCCTTATCAAGTAACTTGCACGCTTCTCGTGCCCATATTGCATCGCCAGTTTGTCTTTTTTCTCGATTTGTTTTGAAAATGAACTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTATAGAGCCACG:1 - chr3L 20516966 5' - 1360 64 1 61.64 GCCATTCTGCACTGAAGTACGACAACGCCGTCAAAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr2L 13629041 5' + Tirant 39 2 58.62 AAAATGTCGCGACATCGTCTAGTCAAATTGCTTTTAGCCATTATGAAAATTTTCAAAAAAAAAAA:1 - chrX 3596137 5' + TART-A 13401 1 66.15 GGTGGAGCAGGTCGCAGGAGAGAAACGGGGATGTGCTGGGTCATTAGGAATGCCTCGGGCACCTGCTAAACACGCTAACTGCTTTGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3L 8658845 5' + roo 8685 2 67.67 ATATGCACGAGTAGTACATCGAGTTTTTGAGAAGTGCATGAAAAAATGAAACTTGTAGTTTCTGGAAAATTCGCATGTTTCCAAGTTTTGATGTCCTTTGTGTGTGAGTGTATTTTATGTAGTATTATTTTAATTATTTTAATTTA:1 + chrX 12748938 5' - HB 319 1 76.03 TACTTCTTACTAAGCGAAGTGGAATTTGAGGTATTGTAGTATGTGCCCATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAG:1 + chr2L 14969117 5' + 412 91 2 78.77 AATAAATATATTTGAAAAAATAATAGATATACTTTAATATTACCAAACCATTTTTACTTAGTTTTGATTTTGCCATTTGTAAGAGTGCATTTATCGATATCCCCGAAAAGTTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAG:1 + chr2R 16769216 5' + INE-1 530 1 61.64 TGGCCGTTAAAAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGT:1 - chr3R 30264098 5' + blood 71 2 66.44 GCCCAAAAAAGTATGCTACAATTTCTGTCTTCCTAGATCGCGCAACTCGGAGAAAGAGAGTGCACAAAAGGAGAGGAGAGGACGATCAGCAGGTGAGCTCCCCAACTCGGCCAATACAGGTGAATACTCTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 13438728 5' - gypsy3 427 1 48.97 TTGGACTGTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 + chrX 21087530 5' + mdg3 19 2 69.66 ATTTGAATTACACATATATATTTCTGTTCTTTTGTTGTATACACATACGTGTACATGTAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGA:1 + chr3R 442445 5' - HMS-Beagle2 246 2 63.01 ATATACAAGAATAAGTATCGAAACTCAAGTGGCCACATATATTTAGGTGTGTGCTCCACGTTTTTAATTTGTTTGCGCGGGGTGAAAAAGTTAAATAATACACATAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGA:1 - chrX 6795473 5' + Doc 4439 1 69.18 ATCTTCCTATTAAGCTTATGAAACTGCTTCTGTTCCGAATTCAGATTCAAATTACTAATCGGCGCAAGCTGCAAAAAACGTTGCACATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTT:1 + chrX 382519 5' - hopper 1141 1 58.90 GCTCGGTCCTCTCGCAATGGAAATGGCAAAATGGAATGGGCTTAGATGCTCAGGGATGCAGGAATATTAAGGTTTCTATTGGGTTTCTATTTGGGTATCAGTTATTATTGGAATATTGAGATTTCTTTGTACATTTTATAGTTAAA:1 - chr3L 6870056 5' - transib2 2760 1 77.40 GTTGCAGGCGGCGCTGAAACAAACCACTTGGAAGGACGAATGTCTGGACCTTGTCACTGATGCTTGACCAAAAAGTACACTTAAAAAAAGGATATTTTGTAATTTTTAGTTTCATTACATACTTTATATTGTTATATTAATTATTC:1 + chr3R 19339231 5' + Rt1c 5385 1 68.49 AATTTAATTTGCTAATACGCTTCGTTGAGTGGCAACGGGAGGCGTTTTAGTGGGGTTTCGGGGTTTGAATTGAAGTTAGTCAGGTGAGACAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3R 20934641 5' + 412 31 2 63.01 ATCTAAAGGTATAGAAAATTTGATTTGATGAAATTTAGAGCTCGAAGTAAAACAAATTACAGCATTAATTTACAAATCAATATTCTTGTTTTATTAAACACCGCTCCCTCTTACGCCTCCCTCTTACCGGCGAACAAATTATAAGA:1 + chr3R 13208688 5' + GATE 316 1 69.18 GGCATGTGCTAAAATTTCCCAGCGAAGCGTATGAAAATGTCGTGAAGGGCGAAAGTGGAACCTATTTGGATTTCGAATATTTATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 + chr2R 11263959 5' + jockey 4672 1 77.06 CACCCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGC:1 + chrX 8967388 5' + HMS-Beagle2 57 2 60.87 CAGCAATGAAAAAACGAATAAAACCTATTGGATTGCATTTAAATGCGATACAATTAATTATTGCTGTTCTAGCTGGTCCATAGAAATCATTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAATTAAAAACCTATC:1 - chr3R 23652382 5' - invader2 4626 1 59.59 ATGGGGTCAATAAATTCTTAAACACCACACGAGCATGAGTTAAGTATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGAGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTGTGTGTGTCCTAGTCGAAG:1 - chr3L 5628946 5' - I-element 4947 1 73.97 GACAAGAGTCGCATTTTGGGCAACTTTCATTTGCAGTTTGCATTTCATTTGCATGTCAAGCAGCGGCGGAAGGGGGCAAAAGGGAAATCTTCCTAATTCAGTGTTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 - chr2R 18751371 5' + mdg1 19 2 58.22 TTAAGGGAAATTTATAGAAACAACGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 7870179 5' - roo 350 2 59.59 ACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAATAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGAACATATAAAGTATATTTATTCTTGATCTGGATCAATAGCCGAGTCGATCT:1 - chr3L 22721120 5' + INE-1 97 1 80.82 AAATTAGTTTATTGCATTTTAAGTTTCAACGTAAACAAATTATGAGTTATTCGCAAATAGTGTAACTAGCAAACCAGCTCATGTAAGGAAAACATAATTAACAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr2L 14969232 5' - 412 476 2 67.81 TTAATTCCTTCTAGTTATTAGATATTTAAGTGCATAATCTTTGTATATATTCGTAACATTTCAAGGGTATCCACAAAAAAAAACATATCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGT:1 - chr3L 11152112 5' - roo 8618 1 58.90 CTGCATATTCTGCGAATATTTGCAGCCATAAATAATGGACCAAAAATTGGAATGTAAAAAACAAGCATTCTTGCTCAACGAAGCAAAAGTGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3L 2320742 5' - roo 9040 1 65.07 TATTAGAATAATCCACATATTAATCCATATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAATACAACAGTAT:1 + chr3L 17537734 5' + Doc 62 1 58.22 ATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTCTGTTTATGTT:1 + chr2L 14239144 5' + 412 65 2 59.72 CTCGATTGGCATCTGCAGCAGGCCCAATACTAGAATCTCCCCCCCTCCCAACGACTGCTATCTCCACTCTCCATAGTTATGAACAGCCTAAAAGCTGGGATTTTACTCAAGAATGTAAATAAAAAAAGGATA:1 + chr2R 18871153 5' - HB 162 1 56.82 CATGCCAAAAAGTATCTATCAGATACGTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCTAGAAACGAC:1 + chr3L 7791883 5' - Transpac 5175 2 52.05 GGTAATTATTTTTGCACAAAAAGCGAGGTGTTTCAATTTAATTAAAATATAAACACACGCCGAAGGCCTTTGCTAATTAAATAATATGCAATATGCGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCG:1 - chr2R 7599282 5' - diver 6085 2 65.07 CAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGCC:1 + chr3L 3453611 5' + Tirant 72 2 65.52 TCTCGAAGAGTCCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGA:1 + chr3R 24750940 5' + G6 3 1 81.37 GGTTGTGGAGCATTGATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2L 3960171 5' + jockey 36 1 57.85 CTACACTAACCCAAAAGTAATAGTAGCTTTGAGCTATATTGTAATATAAACTTAAATGCAATTTGATAGATATATATAACTATATATATATAGCTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGTCACTCGC:1 - chr2L 16562188 5' - opus 7479 2 56.16 GTATGTATATGATGTATTTTAGATTTTAGATGTGTATTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATC:1 - chr2R 1000457 5' + HMS-Beagle2 6894 2 79.45 CATGCTTAATTTGACTGTGGCACCACCTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr3R 18635330 5' + opus 7154 4 58.22 ATAATTATTCCATAAGGTTGCTTTACAGCAGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:2 + chr3L 10469511 5' + roo 8723 2 58.90 AAGTCCCGAAAAGAGCAAACGAAATCAAACAGCGAAAAATTGTTTATTAAAAGCAAAGGGGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1 - chr2R 18014128 5' + Doc 68 1 58.22 TTTCTATCGATTTGCAAAAAAAAAACTTTTTGGCACGCAAACTCTAACGTCTACAAACGACCAAAACTGCCACGCGCGCAGATCAACAACCACTAACCTCTTGGAGTTAACTTCTTTCGTATTAC:1 - chr2R 5667266 5' + Q-element 253 2 41.60 TCATATTTCAAGAAAAAGTTACAATCGATTGTAAAATACTTTAGACACCTCATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCG:2 + chr2L 15013248 5' + BS 4955 1 68.49 CAACTTCCATAAGTAGATCAACACAACTTTTCCAGCATCTCAAGACGTGGGAGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 10930651 5' - accord 186 2 91.78 AAAATGATTGAAAACGGCAGAGCAGCAGCACGATTAGAAGAGGAAAAGATGCTGAGAATAGAAAGAGATAGGGCGAGTGTGTGAAAGATGGAGGATATACCGTGGACCATGAAAAAAGCGTGTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGC:1 + chrX 9025881 5' - blood 168 3 72.41 AGATGACATAACTGGGGTTATAACTATAAGCTATTGCTTGCCCCCGGCTGCTGAATATTCATTAGGTTTTTGGGCAAATTATGATATGATTGATATACAAAGGTGCTGCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGA:1 + chr3R 10946626 5' - Q-element 137 2 55.48 AATAAATTACAAATTTGGATTAGCGCCACAAGATAAAAGTGCAAAGAAGATACATAAACCATATGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:2 - chr3L 16059353 5' + 297 54 2 63.01 CTAACTTATTTTTTGCCACTCGAACGCTTTGCTTTGGCTTCGAGCACCTGGCCAAAAAAAATCCTAAACCCACTTGAGTTTTCAACTTTACATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 - chr2L 17839505 5' - blood 7358 2 63.70 ATTTAATTAGATATTTTGCGATGTACAGAAGCAAACAAGAACTCAATTAATTACATACACACAAAGCCCATGTAACAATGGCCCATAATCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 + chr3R 10743725 5' + FB 34 1 63.01 CGAAAACTGTTTCAGAATATAACAAACTCACTCAAAATAAAAATATATATATATGTATGGAAATGTAGCAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr2L 17380723 5' + hobo 39 1 52.27 GAAAAACAAGTGCGTCTAAGTTTTCATGTTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAC:1 + chr3L 14291832 5' - Stalker4 6956 2 80.14 ATAGATAGATGTCTTTTGGGGGCTATGCCCATGTAGGTGCAGCTTACGCTAATGCAGTTCAAGTGTTGGAATCATAGAAGAAATAATCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACACAAAATGACA:1 - chrX 2536740 5' + hobo 2691 1 58.90 AGCGAAGAAAAACGAGACCAAATGCCGCACATTAAAAGCGATTTAAAAATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAA:1 + chr3R 7616683 5' - Stalker2 7630 2 71.23 ATATTAAGTCATTTAATCTAATCTTAGGATTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr3L 18253771 5' + blood 7057 2 53.79 GGGGCCGGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3L 3453578 5' + Tirant 8147 2 59.59 CAGGACAATGTCCATGGCCTTCACCCACATCACTGGTTGTACAAAGTATCTAAAGAAGAACAAGTAAAGGCGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGTGATCGAACACTCGACG:1 - chr3R 16997492 5' + G6 2 1 78.07 ATTGTGTTACAAGCTTTAACATGGCTTAATGTATCAGCTCTAGAAATATTCATATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTA:1 - chr2L 2120455 5' - I-element 5289 1 63.01 CTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGGGAAAGTTAAA:1 + chr2L 15081098 5' + Doc 75 1 82.11 GTAGTTGTCAGCGTGATGATCCCGGACAATATCAATGGACAACGCGCTGATCTTCTTTCCCAACTTAACCATGGATACATCGTATACGTTCTCATTGATTCTTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGAATTCATA:1 + chr2R 7341389 5' + 1360 3273 1 66.44 GTTGAGGTGTTAAAAATGTTTTCTTCTTCGGCTTTACTTATTTTTAAAAATTTTTTTTATTTTTGTTTCTTCGCTTACCTTTTTGCCAGGGAGTTCGGACGTGTGCTCGCTGGGGGAACGATGAA:1 + chrX 17546239 5' + Bica 64 1 60.00 GAAGCGCTTGGCGGAAACTTGGGGGCATAAGAACTCCTCTCAAACAGAAATCAATATACAAATGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCG:1 - chr3R 24454875 5' + F-element 291 1 56.85 CATGAAGGTGTCAGCTTTGACTACATTTAGAAACTGTAATTGTTTTAAAAAATGTGACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAGTCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAG:1 + chr3R 14911971 5' - Stalker4 320 4 74.66 AGGAGGCAGCCCATCCGTTCTAACATCCGTCTTGCCAGTTACCAAGGCGACTGATCAATAAATAAGTCATTATAACAAGGATAATAGCACTGAGATAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAA:1 - 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ZAM 227 2 60.96 AAGTGAATTTGAGTTTTTTGCTGCTCCTCCGTTTTTTCCTCTTTTCAAACACTTGTTCAAGTCGCATTTGCTTTTCCTCTATTTTTCCTTTGTGGTCGGCGAGTGTTGTTCGCAGTGCTGTTTTGTGTTGTTTTTTGCATGCACAT:1 + chr2L 15495796 5' + Cr1a 255 1 69.86 GATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGAGCA:1 + chr2L 17295865 5' + Doc 93 1 76.03 GAATTAAACTATATAATTAGTTGCTCAATGATATTCTCCGAAATATGTACTTATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 + chr2R 17014385 5' + flea 24 2 55.34 CAAATGAATTATAATTTTGTTAATTTTTTGATAAGAGCAGATAAACAATACTATACTTTGTAAAGCCCCACTTATTCACGTTGAATACAAATTAATTATAATTTTGTTAATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 + chr3L 17667498 5' + F-element 15 1 77.24 GAATTTTTTTTTGTTTGTTTTTAATTAATTTACCTTTTTTATGAGTTAGGGTGTATCCCGGTGCCTTATCAGCGATTGATGTACACATATACGGTCATCACAAACAGCAACTTGTTCGTATAATTGATGTAAAT:1 + chr3L 9168684 5' + accord2 7152 1 85.82 TAACTTAAACTTATAATTTTATCAAGTAAGCCCCTTAAGAGAAATAGATTAAGAAAACGAGTAGACTACGCTTTAAAATTCCACTTTATCCAGTCAGCTTATAAGCTATTTCCGCTGTCTCTGTCAATGGGACAGATCGGAAGAGC:1 + chr2L 8716909 5' - mariner2 570 1 35.62 CGTCCTTGGCCCCCATTTTCCTCCACCCAACCCCCTGTCACTTTAGTGACTTTGAGCCAAAGCTGCATTTCATTATGTGCGCATGCTCTGTGTGTTTGTGTGTGTTCTTA:1 + chrX 9505726 5' - gypsy3 421 1 76.36 AAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGT:1 + chr2L 17295855 5' + Doc 83 1 70.55 ACTAATCTACATTTATTTATGGATCCTGGAACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:2 - chrX 388349 5' - 1360 3344 1 56.16 ACCCCCATTAAAGTTTAAATATCCTACTGGACATTGCTCGTTACGAGATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 + chr2L 17839387 5' + blood 74 2 66.44 TACAAGCTAGAAATTTAGCTGCTTGCTGTACTTTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTA:1 + chr3L 14944518 5' + G5 4769 1 61.81 AGCCAGTCGGGTTTCAGTTTCCATTCCATAGTTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGT:1 + chr2L 12291864 5' - Tirant 373 2 62.35 ATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATATCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGA:1 + chr2R 5582167 5' + Cr1a 486 1 48.63 CGAAACTATTGATAACAAAATGATATTGATATATCACTGAATCAAGTGATCAAAATAATATATTTTTGCTCTAGATAAATGTAGGCAACGATCGACTGGATAGAAATATAATGTTTATATTGTTGTTTTAAAAATACTCGCCTTCT:1 + chr2L 135721 5' - transib2 2597 1 76.03 GTATACTAGATTCGATAAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTTCGACTATATAAAGTATGTATATTGTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCTATGTCCGTGTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACT:1 + chr2L 23075090 5' + INE-1 141 1 88.36 TGTCTACATGGACACAGATAATTGACACTAACATAGACAGTACGACACCCTCACACATATGCACTGACCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chrX 17982756 5' + hobo 54 1 54.11 CACCAATATATCCACCAACAACACACACCAAAAAAAAAGAAATAATAATAATAACACACATACAGTTGTCTGCTATTACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGA:1 - chrX 13381757 5' - 1360 93 1 61.64 TTTTTTTTACATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr2R 18344640 5' + 1360 51 1 54.68 TGCCACATGAATTTTGGAAATTCTGCTTTTACATATTTCTAATTTATAATCTTCTTCTTCTTATTTTTAGGTATGTATATATATATATATATATTTAGAGATATATATACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCT:1 - chrX 3701566 5' - invader4 121 2 78.47 CGGAGCAGTTGCTCAGCAATCTGCACTGAGAAAATAGCATGTTGTCGTATTGACCACGTACTATTTGATACAATAATCAGTACACTTTTTTGATTATAATCTGTGACTTTTTACCATTTATTTTAGTTGTAGTGTATCTACCCTCA:1 - chr3R 12744801 5' + Stalker2 7246 1 73.29 ACCTGGCAGATTTATGGAAATGTCCCTGGTCAACGCACAAATACATAAACATATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr3R 18635306 5' + opus 7043 4 62.10 CAAAGTGTAAAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTTGCATAAAACGGCAAAATAGAGCGGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCCGACACTCAACCG:1 - chr2L 12291954 5' + Tirant 41 2 55.07 TCAAGTTGGCCTTTATTTATTTAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATACATTTAAAGACTTAC:1 - chr3R 18528381 5' + roo 8680 2 63.64 GAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGAAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCT:1 - chr3L 15364881 5' - 1360 3319 1 74.22 ATAATAAACAACAAAGGCAGAATTGTTAATAGATTGGTGAAGAAGGCTAAGATCTCGTCTAGTGCTATAGAGTTTACGTGTTTTGCTTTGTTTATTGTTTATCACCACGCCCCTTTAGCCCAAGTGCAGTCTTTAATTGCAATTAT:1 + chr3L 17539825 5' + hobo 2540 1 58.22 TATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGA:1 + chrX 12657099 5' + blood 7084 2 66.44 AAGATCCTGTTCGGTTTGTATATATAATCTTTCTACATGGTTGGACTTTATTTTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATACAAAATAGTTTT:1 + chr2L 4876866 5' - 297 331 2 63.01 ATGTGAACGGACGGACACATGTCTGGTGGAAAGTTAATTTTCCCCTTCGCAAGGTCGATTATCAATCAACATTTTCCACCATGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCG:1 - chr3R 23235357 5' + BS 10 1 70.55 ATTGTAAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATGTT:1 - chr3L 27415339 5' + transib2 25 1 65.67 ATGGCAGGATAGGGTGGATCGATCAGTACAAAAAAATTTGCGGAAATTCTAACAATACTCTTTAAATTTCTCCGTTTATCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTTGGTACATAATTAGATCCTACTAACACTAAT:1 - chr3R 10295258 5' + Cr1a 4290 1 53.42 AGAGTGTGTTAACCTCGAGTTTTGGTCGTGGCAACTTTTCTCCTTAGACGAAAGCAAAGACTTTTCACAGAAACCGGTTTCCATCGATCAATAGATAGACGGTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 4673560 5' - roo 9053 2 72.60 GAAAGTCGACTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGAGAAAGAGACCTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGTGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1 + chr3R 18346606 5' - INE-1 546 1 48.89 ACTTTTTTCCTTTTTTTTTAAATTATTTTTTTTTT:1 + chr3R 8896252 5' + FB 175 3 77.14 CGCACCTGCACCGGAGCCAGCTCCTCGACGTTCTCTTCGTAGTTGCCGAAGCACTTGGTTATCTTTTCGTCGAACGTATTGACCAGATCCTCCAAATGCATGCATTTAATATTATCTTAATC:1 - chrX 2081608 5' + Transib-N1_DM 436 1 75.41 GCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAATTACAGTATAGTTCGCTTTGCTGCCTC:1 - chr3R 16276425 5' - pogo 2098 1 64.63 ATTACGGAATAGATCAAGCTTATAAATCAAAACAGGCAAAAGAACTGGTTGCTTCAAAGAAGATGTAGACTTTCCATCAAAACAATTAACAGCTACAATTACCGATTTATGTGAATCTAAGAGCAATCCAAGTGGACGCCCAAATT:1 + chr3R 1614213 5' + Doc4-element 439 1 58.22 TCCCACGTAGCAGATAATAATATTGTGAGTATATTAATCGTAAATTCGAGTCTTGTGTGGACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAG:1 - 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roo 357 2 52.05 AGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCACATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCAATTCGTGCCTCAAGAT:1 - chr4 158193 5' + 1360 475 1 67.81 GTCTCTGTGTGTGTGTGGGTGTGTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2R 20894919 5' - Rt1a 5087 7 80.95 GTAGAATTTATTTCGTTTTTATTTGCGGCATAAAAAGATCATAAAAAGAAGTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGTGTGTGTTTAACACAATTTGCTGCTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr3R 19171569 5' - opus 7482 2 68.31 GGAAAGTTACTGACTCACAAAAAAAGTACATTTCCTCAGTTGCAAGTGATGCAGAAATGTGCCAATTACACAGTAAGCTGTGAATAATCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTAT:1 - chr3L 21236627 5' + copia 4729 1 59.59 ATAAAATAAAAAAAATTTTAAAAATTCGCGCTCTGACTCTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTACA:1 + chrX 7584291 5' - 1360 396 1 71.92 AAGTTACAATTTGGGCGAGAGCTGGCCCAACCCTCACCCATGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr3R 28406314 5' - opus 7478 2 67.12 GTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATCCCTCACCTTGATATG:1 - chrX 16117266 5' - opus 7455 2 58.59 AAAACCCAAAAGATAACACTCTGATTAGTTGTTTGGTTATTTATAATTTTAGACTAATTTCTAGACGAATTTCTGATTTTAGCTTGATCTTTGGGGAGCAATGGGTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTG:1 - chr3L 12705182 5' + Copia1_DM 160 1 70.55 AAGGGCTTACCTTTCCCGCAACAATCGCAGTCACAGACGAGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGAT:1 - chr3R 30264088 5' + blood 7092 2 73.29 GCGTGCCAGTTTTGACACTCTTCAAGTAAGGGGTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGG:1 - chr2L 23034102 5' - FB 406 1 57.53 AACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 18205711 5' + 412 66 2 63.45 ATTTTCCCCTTCGCAAGGTCGATTATCAATCAACATTTTCCACCATGTAGCTTTAACTTCTACTTCCGCCGATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATT:2 - chr3R 23235321 5' + BS 46 1 52.05 ATGACACACGTTCTATATTTCCGTAGGCAAAGTCAATAACTAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 + chr2R 21848647 5' + Transpac 34 2 56.85 CCGAACCAATCCCAGTCCGGATCCCACAGCCTAAGCCGAACGCTAGCCCGAAACCGAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTATAGACTTACAATTTTG:1 - chr3L 19581023 5' + roo 23 2 67.81 AAGGATGATTAAATGTTTCACTTCATCAGGTTGCAAGTGGAAAAGTGATAACTATTATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTAT:1 + chr2L 2895552 5' + Burdock 60 2 63.01 ACATTTCCAACAAATACTTATTCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCCTCTACATACATGGTGCGGCAGATTAATTTCGTGGATATCGCAGTATTGACGCTTTCACAACTTCAATGTTCTCAGGTGATCTAACGGGTC:1 - chr3R 3268061 5' - mariner2 339 1 60.27 CCGCTGGCGAAGACAACGTGGTCAAAGTATGGTGCATTACGGATTCAGAAAACATTTATAAGCGCGGAACGATGGGGATTATTAATATTATGAAGTTGGTTTGTATGTGTACCCTTCATGACTCAAAGATC:1 - chr2L 21100526 5' - baggins 5377 1 56.49 ATAGACTAATCACAGATGTCATTACTCGGTATATATAACTATTTCCTTTTAAGAGCGTTGTCCCTTTTTTAGAAATGTTCTTGTAAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAG:1 - chr4 698341 5' + Ivk 5333 1 62.22 CGCAGATAGTTATTTCCCTCGTCATTAACTGCCGGTTGTGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:2 - chr2L 21643134 5' + Tabor 56 2 54.11 GATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAACTGAAAGCGAA:1 + chr2L 9275020 5' + F-element 103 1 78.77 GGGGGAAATCAGGATACGCTTTATATGTATCTATATACATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTA:1 + chrX 18220595 5' - Burdock 177 2 77.24 TATGTGGGACAAACGGCGCATAAACAAACTCTCTCGCAAAGATGTGAGTCGAGAGACGCTAGAGAGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCCTGC:1 + chrX 7706735 5' - P-element 2847 1 52.27 AACCGATGTCAAATACTCGTATCGTGAATCAACTACAAATGGTCCTCTGTCCGTTGCCGAAAAACTTCAGTTAAACTCGCATCAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACT:1 - chr2R 20412754 5' + pogo 1714 1 58.90 GGGGCAAAGTGGGGCTTTTGTTTTGTTTCTGCTGACTGAGTGTGCTCAATTCCAGATCAGTTTAGCTGGTAGGTTGTCTTGCCACTTTCTTTCCGTTTGTTTTGCATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACC:1 - 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chr3L 18223252 5' + copia 4663 1 76.71 ATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 19436063 5' - roo 324 2 75.86 ATCTAATAGGATCGCATACCAAACGTTGATAGGAAAAAGAGAGGTGAAGTCGTTGAAAAGTATGCAACAGGCAGACGGAAGCGTTTCCGACCATATAATCAAATATATAAATATATATTTTTGATCAGGATTAATAGCCAAGTCGA:1 + chr2R 5705575 5' + INE-1 94 1 69.86 GGGCATGCTGCCTATCGTTATAATGATGTTGCCGGGGATTTAGCCTTGCCTTTTTGCTTTGACATCAACACCATCGGAAGGCAACATAAAGCACACACATCCACACACACACACACACATAT:1 + chrX 5189879 5' + accord 183 2 61.48 GCAATCGTAAAATGTATTATACTCATGAGTTTCCACACAGTTGAGTGTGCTGGGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:2 - chr2L 15777942 5' + 297 6592 2 77.46 CCAAAGGACTTAAAAAAAAAACTAATACATTTACTCAAATTTGGTATATAGAATAAGTTAACATATTTTTATTATCTAACTAGCCAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTTTACC:1 - chr3R 6816809 5' + Juan 429 1 58.22 AACCTCGACCAGACCAAACTAATTAAAACTCCGGGGGTAACTCGTAAAAGCCAAGCCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACATAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTT:1 + chr2L 14652779 5' + I-element 268 1 62.33 ATAGAACTTTCAGCAACCGCCACCGTTCTCTGACGGTCGTTCGCTTGCTCTAGCCGTTCTCTGCGACTTTGAGCCACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 - chr2R 1320528 5' - Transpac 267 2 56.16 GGGCCAAAGTTTTGGTTTCGGACTTAGCTGCTGCAGGTAACCAAGCAGAGCTCTATTCACAGTCAAGGAGCATTCTTGGAAGTGGGAATTTGGGTACGAAGTGTAAAATCGCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 6681895 5' - roo 9048 2 49.32 TGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAAT:2 + chr3L 7837165 5' + jockey 4824 1 56.16 AATCAACACTGTAAAAAAAACCACCGGCTTTAAACAAGGACCAATGTTAAAGCTAGATTATTGAGGTCTTGAAATATTGTATGTACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACT:1 - chr2L 21976816 5' + Idefix 26 2 43.15 CATGTTTTGCGTGTGCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACC:1 + chr3L 13952773 5' + I-element 5163 1 59.59 AACTGAATGGCATGTATCCTGAATACGCAGTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTAGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTA:1 - chrX 1018184 5' + 1360 214 1 68.49 GGTCAACAGTTGAGCAGTGCCGTTAGTGCGTGGCAATCCGGCTTGAGGGACCAACGGCTTATGGTGGAAACTCCTCTCCTTCATGCCAGTCAATTTCGGGCAGTTCATGAAGATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATG:1 + chrX 680514 5' - 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chr2R 22413983 5' + Bica 461 1 62.33 AGTCATCATCGCATAAATCTGCAAGGCGGTCATAATTGCAATTATTCATTAATGAAATATTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 + chr3L 21910365 5' - pogo 2042 1 57.53 GTTGTCATCGTCTTTGGCGGTCTTCTCGTCCTTTTGCGTCCTTGTTTCGCATTCCTTTGAGACTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATT:2 + chr3R 17258076 5' - 412 434 2 58.22 GCAAGTTGCCTCCCACCCTCCATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGCT:1 - chr3R 8049043 5' + Q-element 114 2 66.90 GGCCATTTGCAAAGTGTTTGACTTAACGGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3L 18183225 5' + Tirant 8122 2 74.26 AATATGTATATTTTGACATTTCAAGTTTAATTCTTGTCACTAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTAAGTTTATGTTTG:1 + chr3L 17921923 5' - copia 213 2 56.16 TTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr3L 18183183 5' + Tirant 8146 2 63.56 CATATTTAAACGCTATGTAATTGACACAGGCAACCTATTGAAGTGCAACATTTTTCATATTTTAATAAGCTAAATTTTCATTTTAGCTTCGGCGTTTGAAAGTCATATTGAAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 - chrX 20975895 5' - copia 246 1 78.77 AGATGAGTGGCTCCATCAACAACGAAGTGCATACGATAAATTTCTTTATCAAGATCAATAGCCGAGTCGATATGGCCATGTCCATCTGTCCGTATGAACGTCGATATC:1 + chr2R 19364553 5' + INE-1 132 1 62.04 AACTTTCACCGCACATTTTTGATGTTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGT:1 - chr3R 13349614 5' + Ivk 33 1 61.64 ATTACCTTACTTTGTTTGTGTAAATGACTAATAAGTGTAGCGCATTAGTTTAAAAATATTATCAGCTTCATAAATCAATTAAGCTTATATATCAATCACCTGTCGCACTTCTCTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 21483053 5' - gypsy2 404 1 70.16 AACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTAGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATT:1 - chrX 1018151 5' + 1360 244 1 67.81 AGTTAAATGTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:2 - chr3R 24673689 5' - roo 9047 1 69.18 AGATAATTTAGATATGCAAATATTCCTATTGTTATAAAGAATTAATATACATGTAAAGCACTCTAGTAAATATTAGTGTTAACAGGATCTAATTATGTACTAAACAAGTTAAAATTGATTACTTTAAGAGCGGAAGAGAGTCAAGA:1 - chr3R 4133222 5' - Cr1a 4237 1 69.18 CTCTTAGTGTGCGATGTTATGTAATGTAATAACGTCAATCAAATTTAAAAAGGCAGACTGGAGAACCACCACAATCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCT:1 + chr2R 22754005 5' + G2 2923 1 63.01 ACGTCATTGCAACTCCGGTAAAACGCAAATAAGGGGCAGCGAAAAGCCAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1 + chr2R 18689117 5' - Burdock 6355 2 60.96 CTTGGTAAATATCATTATCATTATTATATATTATTACAAAACCTAACTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATAT:1 - chr3L 13987245 5' - diver 148 2 70.55 CAAGTAATTATGGAAGGTTGATTTTTCGGAACTGCACCACTGGAACGATGTCGATTTGTGCCCGAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr3R 23601836 5' + jockey 11 1 76.03 TAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGTAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 14375581 5' - roo 9048 2 66.44 GTTAATAAATTCTACGTAGTGACGAAACGCACCTGAAAATTCCGCCTTGTTACGTTTGATTAAATCGGTTGTTGTTAGAGTACTTATTTAAAATTTTTTCCTAAACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:2 - chr2R 21848821 5' - Transpac 5214 2 73.29 ACGTTGTCATTTCTCTTGTTTCGTAACGTTGATTTCATTTTATTGTTGCCCGTTTGCCACTCCAACTTCACCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTAT:1 - chr2R 20447910 5' - hopper2 1560 1 51.37 AAAGGGGGGATATCGGATCAATAATAGTTTCATGTGTTCGCTTTATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr2R 9607113 5' - pogo 2034 1 69.29 CTTCAGCTTTTTTCTTGTTTGCATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chr2L 17295792 5' + Doc 20 1 67.12 CCATCCAACACTCTTTTTTTTGGCAATAAATTGGTAATGTATTTTGGTGACAGATAAGACCTCTTGCACATTGTTGTGATAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGG:1 - chr3L 12836114 5' + 1360 41 1 56.85 GTTTAGGAGGAACTTTTACTTCGCGCGTAATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATAT:2 + chr2R 12065539 5' + Stalker2 7267 2 73.97 TAAAAGGTACACTTAAATAAAATTGCTAGTGTCGATGCGTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACAC:1 - chr4 184072 5' + 1360 168 1 52.74 GCATTGTTCAGATCCGCTGTGGAGCAGGGAGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr3R 23161230 5' + 412 15 2 71.64 AAAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr2L 13629073 5' + Tirant 8139 2 54.72 AATACTGAGGAGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACCTCGATGAGCAGGAT:1 - chrX 19820785 5' - Rt1b 4966 1 77.27 AAAGGCTTCAAAAAAACTATGTGGTGATGAATTGTGGAACGCATGGAAACAAAGGAAAAGAAATACGTAAAGCTTTCAAAGAGAACGGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTG:1 - chr3L 21483965 5' + Cr1a 37 1 56.56 GGCAGCAGAATGAAAACTTAGAAAAAGAATCGCAAAGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr2L 16331074 5' - roo 9055 2 74.62 GCTTACAACTTGGCCCCAAACATAAATCCCGCAAACACACAGTCGCACAGACCCACTCGACATGGATATAGATATATATATATATATATAAGTTAACGCAAGATCCACTTGCATCAGGGTTCGCGGCACTCGC:1 + chr3L 5069374 5' - opus 476 2 66.17 ATATTGATATGACTAGTTACTTGACCTTTATTACTCTGCACCTTTAATTTACCTTTATCTAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTT:1 - chr2R 17014479 5' - flea 4952 1 59.59 CGAGCGATGAGTCCAAGCGACCCATCGCGCTCAGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr2R 21820710 5' + Doc 50 1 51.88 GAAGGGCGAAAGTGGAACCTATTTGGATTTCGAATATTTATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAG:1 + chr2R 11264002 5' + jockey 4735 1 68.99 CGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCA:1 - chr2R 5173205 5' - Stalker4 333 4 69.18 CTGCTTTAAACACCATAAAGGTTAAAGTAGTAGCATGTGCATTTGCCAAATCCCATGCCCTACCCATAAGCTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr3L 15364796 5' + 1360 22 1 63.33 GGTGGCAGTTGGCCAACAAACTGCGACCTTGGCGTTTAACCGGTAACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2L 18522250 5' + roo 53 2 63.20 AATTAATAGGCTCATAAAATCAAAACGAAAAAGCCTTAAAGTGTAAAAACAACAAATCACTCAAGATGACCTCAGACACCAATGGACAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 - chr2L 14501253 5' + 1360 34 1 62.33 CATTTGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAA:1 - chr3R 19436118 5' - roo 380 2 64.58 AGGATTGCAATGTCGCTCTTCATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr2L 21153593 5' - 1360 3344 1 54.79 AGTAGTAATGCATTTTAATTAGATGAAAATTAAATTAGAAATCCAACTCTAGTCGTAAAGTAATTTTCCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr3L 9470034 5' + 412 54 2 53.42 ACAAAAATCAAAGGAAAAAAAGCACTCCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chrX 9305880 5' + P-element 56 1 27.78 ACGTGCCGCCCCACAAACGAGAGCATTGAGACAACATGGTAACAGCCTGTTAACAACGTATTTAAATCAATTAACATGTTTCGTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATCAAAATTGTGACTGACT:1 + chr3L 14789560 5' - 3S18 237 2 59.31 ATATTTTCCAATGTTTATTCTACCAATTCCAGGTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTAT:1 + chr2L 21642990 5' - Tabor 462 2 69.18 ATATATTGTTACCGTTAAAATTTTTATAAAAAGATATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGT:1 + chr2L 7822240 5' + Juan 67 1 60.96 GCCTACACTCCCACCCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chrX 21667961 5' - opus 457 2 56.16 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCACCTTTCTGCTGGAAAAATTAAGGAAAAATGCGGTGTAAATGCTAGTGTGGCAACGGTAAAAGGAAGGAGGAAGACAATTTAGTGACACTGGGACCCTAGT:1 + chr3R 21723226 5' + Tc3 1302 1 71.23 TGCATATTTTGCAGCTTGATAGCTCATTACGCTGACACTTGATTGTTGCACGTACCTTCCAAAGAAGCTGAGGCAGCACCACCAAGTTTCCCTCCGAGAATGTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3R 24499452 5' + blood 7031 2 70.55 AAGCCAGAGCCAGCACTGAGAAAAATTGGAAATCCATTTATCATTAGAAATCAAAGCATATGATGTGTGTATGTTTTTCATAGCCTTTCTTCCTTTAAGTAGTTCGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCCCTCGCACTCT:1 + chr3R 28116932 5' - hobo 2930 1 78.42 AATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCCAAACCAATAATCGGACACTCAA:1 + chr3L 3453602 5' + Tirant 8145 2 52.50 GTACACTCAACTTGTTCTGCACGATCCCTCCCATGGAATGTGGACAGCCGAAGGACGCAGACATGTGTATATCCATATATTTGTACCTTTACCTAAGACATGTATGCCAAAGTGTTCGTCTATTGTGGAGTGAAAAATGATT:1 + chr3L 20382175 5' + transib3 403 1 74.65 ATTGAAATGTTATATATAAATATTTATTCCCCTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGCGGAAACGTTTCCGACAATATGAAGTGTATATATTCTTGATCAGGAATATCAGGATATTGAGATCTCAGGAACTATAAAAG:1 + chr2R 5374749 5' + INE-1 148 1 44.52 ATGAAACATTATGATGTTGTCCTTGCCGCAGCCGTTGCTACTTGACACCACAACTGATACACTGGGAAAAAGTGCAACTACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr3R 15054090 5' - 297 360 2 57.53 GTTTGTATTTATGTCGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr3L 7460607 5' + 412 7107 2 55.48 TTCGGCACTGTGTCTCCTCTCATTGTCAGTGCAGTGTGTATTTATGTATGTGTGCCGATATGCGTACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTACATTCAGTGCACGCT:1 + chr3R 1267673 5' + P-element 55 1 50.68 AGTGGGTAGAAAAGTTGGACTTTCATACTATCTGCACTGTTTCGCCATTTGAAGAGTAAACACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chr3L 1358540 5' + 412 7112 2 57.53 GAATTTGCAAGAAAGGCAATCTGCAGTCAAACTAAATTTGCATTGATTTCGGCAAAGATAGGGTGTTCTTTTTTCGTAGATAGACTATATTATTCTTAATACTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGA:1 + chr2L 5890438 5' + invader3 5209 2 65.07 TTTCTGGTAAGTTTCCGCACAATAGGGTTTCCCCTCACGACCGTGCACCGTAATTGATTTCATATATCTTATCTTATCTTATCTTATGCCCTTGAACAAGCTTAAGGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTAC:1 + chr2R 5064769 5' - diver2 133 2 69.18 GGGGCAAAAAGGGGGCGGGGCCGGGTGTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr3L 3453562 5' + Tirant 8 2 79.23 GTCTTGACCAGAGCAAAAAGTTGATATCATTTTGGTCTTGCAGTTGGACTCGCAGTACCAAATGGCAGCCCCAAAATCAGCAATCAACAATCCGTCTGGTGGCTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCG:1 + chrX 4238875 5' - jockey 4730 1 47.10 ATTTAAAATGCAATCTTGCAGCAGGGATCAAGTATTTTCTATATATTCTATTTATATACTTACGATCTAATTTTGAGGATACGGTTAGCCGACACAACACGCACACATATACGCGTCCTCGTCTCCTGTTTTTACTC:1 + chr3L 15623131 5' + 1360 3238 1 67.15 CCACCCTTCATTTAATGTGGCCATCAAGCCGAAATTACGCCCGTTGTTGAAAAGATGAAGACATCAAATTGCATTGCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACTTTCACTTAACGTATG:1 - chrX 6633060 5' - P-element 2852 1 53.96 AGGATTACGTTTCTTTTTTTTATTTATAATAATTGTCAATACTTTACAGTTCCCCACAATGTTTATTGGTGCGCCCCTGGACGAAGGAAAGCGATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGATTTGCACGTACGCGTTG:1 + chr3R 12385162 5' - Ivk 140 1 63.70 AAACCACCACATCGAGTTATTGTTTTGTATAATGATCGTAGAGTAGTGGGTAAAAGTAAAACAAAAAGGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 + chr3R 24603055 5' + I-element 55 1 52.05 CCTTAGATGCTCACGCAGCCGATCTGCATAGATAATGTGAAAGGTGCTATTTTAAAGGTTGCTATTTTGATGTTTAATGAAAGAAGAGCTTAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTG:1 + chr3L 23571613 5' - Stalker 317 4 76.71 ATCTGTTGGGCAATAACTCAAAATCTGAAATCTGAAATGTGAACGTGAACGTGAAAGTCAGCTTCGGTTCCAGTTCGCGCGGGCTCATGTCAGAGCTTAACATGAGCTCAAGACCAGTGCTTATGACTGCACGAAATGAACCCGA:1 - chr2L 14406386 5' + Doc3-element 405 1 78.62 TGGCAGGGAAATGGTTTAAAAATTTATAGTAATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 13678864 5' + hobo 42 1 56.25 TCATTTCACGCTTGTTAGCCGCTCTAAAGTTGCACTCGCCGCACGGATCCGGGGACTTTAACGCCGGAGAGGAACGCGGATTGTAATTGTTTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAA:1 + chr3R 6495248 5' - Stalker4 370 2 55.24 TGGCAATGAGATATAAATCGAAGGCAGCGCATTAATGGCCAACTATTAAACTAATCGCTTTTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGACGCGCCTCTCAGTCTAAAG:1 - chr3L 10112311 5' + I-element 29 1 63.89 GCAAATTGCACGCCTTTTCAACATTAATTAGAAATGTTTACTAATCTAAACTGAAACTATCATGGACCAAAATCCACAGCAATGTGACATCATAGCGGCCTCTGCCAATGCGCAGAGCTTCTGCCGGCTATGCATGAGCTTCCGGC:1 - chr3R 9172508 5' - springer 69 2 60.27 AGTGTAGCTCATTCCCCGCCCTGTCAACTTTCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAACTTATATTTAGGATTT:1 + chr3L 10469540 5' + roo 80 2 76.09 ATAATTTGGCAACTAAAATCGAAAAGAACAAAATTATAAATCGTTCAACATGCTATTCAAACACTTATGACATCAAGTGTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chrX 8349859 5' - roo 9029 1 58.22 AGGACCGGTGGGTGCTGCTGGAGAAGCTGCGCTGGTGTCCTCCACTGCAACAGGATAAGAGCAATCTGAGTGTCACGATCAATTTTGCTGCCGCAATGTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATGCTTAACCCCTACCCAAGTAC:1 - chr2R 6669352 5' + G2 2964 1 68.49 GGGTACTGGGGAATCAACTAAATGCTAAATAATCAAATGTACGCAGGTAAGGTACACGCAGTAAAAGAAGGTCGACAGCAAGGCAAAGGAATATGAATGCCATAAAGCGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 + chr3L 15371382 5' + 1360 3 2 78.62 ATGCTTGAGCTATTTCTCTCAGGTACAGTCCCGTTTTGTAGCAATAACTTTTTACTTTGTCTACTTTTTTCAGTGCCTAAAATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr3R 12609149 5' - 297 6941 2 57.53 CGCCAAATGAAATGAAATAAAGACAACTGCATATTGGCCAAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCG:1 - chr3R 16240984 5' + Tirant 74 2 69.44 ATAGTATTGATTAATTCATGAGATAAACATTCAAAGGGCTGTAGGCGGTAAACTATTTAATATATCATGTTTGCATTTAAATACGTTTATATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3L 12433386 5' - roo 9042 1 62.33 GCATATGTTTGCATTGTTGCCGCATAACAGCTTCCATTTTTTTTTTTGTCATTTTCACCGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATT:1 + chrX 20905294 5' - jockey 4896 1 60.27 AGATGCTTGTTTTTCCCAACTCTTGTGCGAATTCCTTTTCCCCAGCAGGACACACGTTTCGAGTGGTGACATTCTTTCGAAAGAGTTATTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTT:1 - chr3R 21648529 5' - I-element 224 1 55.48 CGGGAAAAACAATTGGCAGTGAAATAATGTAATATACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTA:1 + chr2R 11095713 5' + diver 5922 2 60.69 TATCGCCGGTCGCCTGGCGCAATTATGCAAAACAATATGGTGACCCAACTATCGATCCAAAAGATAGCCATAGATAGTACATGCTAGATAGCCCAGTCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCT:1 - chrX 15489568 5' - 1360 493 1 61.97 ATGAGATTATAAGATGATATCAAAACCTTCATTGCTCAACTGATAGCCACCACACATACCGATGTATGTACGTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATT:2 + chr4 540454 5' - flea 208 2 52.74 TGCAGATCGCAAAGTACTTGAATTTTGGGTTGCATTATTCTTTGTTTCGATATATAATTTGTAAGAAAGTGATTTTTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCATATGTTTATGTTTCCTCTACATTTAACTACGATAGCCTACCTAT:1 + chr2R 13103834 5' + Tc1-2 1525 1 61.64 TTGCATTTCAAATTGAATTCCTTTACATTTTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCTACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGCACTTACACACACACAGTATAA:1 - 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chr3L 12836061 5' + 1360 51 1 73.33 CCAAGGTCTTGGTATCGGTCCTCTCCCCGTCCTGGGAAGCCATATCATATGCCACTTGGGGAAGGGAGAGTACCGAATTAGAAATGAAAATTAAGTAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr3L 22594101 5' + 297 6603 2 67.59 GACGTGGCCGGCCACGGTGAAAAGTCGCCCGTGCTTTCCCGCTCGTTGAGTGGCCAAAAACTTTGGCATCATAATTTATAGCTGCGTTAAACAAGCGAGGATAACAAATTAATTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 - chr2L 20515341 5' + I-element 7 1 80.56 TGGCAATTCCTAAATTTATACTTTGTAGATAAGCCAACTTTGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 - chr2L 22319393 5' - Transpac 275 2 61.64 TATATATCAAAGCGCTGTAAAAACACAAATAGTATTACAACATCCCAGCACATATGAACTACGATGTGCTGAGCATGTGACGTGACGTATGTGTACGATGTAAAGGTATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTA:1 - chr3R 4733818 5' + FB 678 4 71.92 ACGAATGCATCTTTTTTTATGTTGCACATACATACATATGTATCTATATACATACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGT:1 + chr2R 11095748 5' + diver 70 2 62.33 ACGGGCAACGCGAGTGAGTCGTGACTCATTTGGTAATACACCGTTGCCCGTGGAATTTTGTATAAATCAATGATATTTTGTACCGAAATACCAGAATTATACTTAATTATTATTTCATTTTTTATAAATTCGCTCAGTTCCTTTGT:1 - 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roo 363 1 53.42 AATAAATCTAACAGATACAGTTTAATGATATAATAACACCATACAACTTTATACATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACT:1 - chr2L 8575154 5' - Transpac 423 1 65.07 TTCGAGTATGCAACGAATAGATATCGCACATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 + chr2R 22746050 5' + jockey 4809 1 50.00 ACGAAATTTAATGCAAGGTCCTGAAAAGAGGCTCGTGTTGCAAAAAACCGGAAAGCAAGAAGCCGAAGCTCAATGTTGAAACATTTGTTTAGTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chrX 21403524 5' + roo 8691 2 65.75 CAGTAAATAAATGTAAATTAATGTTGTTTCAAAACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGT:1 + chr3R 7470977 5' + Doc 124 1 77.40 GGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCATTT:1 + chr3L 27356091 5' - Tc3 1626 1 72.60 AGTGTACACAACAGAATATTCAGGTGTTCATTTACCGTCATCCCTTGAATTCTTTTGCAGATCGATAGAAATTTACAAGATTATTAGTCTTGTATGAAAAAGTATGTATGAGAAAATATAAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGACGT:1 - 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F-element 4306 1 60.27 TTTGATATACCGAAACACACGAAAATGTTAGGTAAATAAATAAATAAAAAAAAAACAGAAATATTCACGTATTTTTCAGTACGTTTTGGAATCGTATATAGAAATGACTTCATATTAATAAATATACTAAATAATTAAATAATTAA:1 - chr2L 12177285 5' + HeT-A 28 1 73.29 GGGTGGCTGGGCACGTGCCGCGGGGGTTACGCGGGGCCCGCTGGTGCGAAGGAATATGAAA:1 - chr3R 17968813 5' + Osvaldo 1218 1 44.26 GCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3R 19436072 5' - roo 332 2 69.86 TAATATGCGCTGGGAATCACCTTAAAGTGATATTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTATGTTATCT:1 + chr2R 25106059 5' + roo 8752 2 77.40 ATATAAACACACGCCGAAGGCCTTTGCTAATTAAATAATATGCAATATGCGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTC:1 - chr2R 7599236 5' - diver 152 2 66.90 GCCGAATCTATCGTACAAAGGCCAGTTAATATCCAAGCCAACAGTCATTAAGCCAAAAAGCAAACGGCAATTATATCTTAATGCCTGCAAAATAAATACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTGTTG:1 - 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chrX 18220729 5' + Burdock 6146 2 76.03 ATAAAAAAAAATCCAGATCTGGTTTAGGAAATTTGTATATAATTTGGCTTTTCAAAAAAATGTATTCAATTTTTAATAGAACATTTGCATGATTGTTTGTTTGTTGCTGTTCACTATTATTGTGCAGCGCGCGAGTCCGAAGTGTT:1 + chr3L 8148706 5' - gypsy10 455 1 60.96 GGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTCGTTAACGCTTCCTGTTACTAATTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCG:1 + chr2L 21738001 5' + Tc1 1592 1 59.59 TGGCCATCCCAGTTAAAGCTACTGTGGAACATAGTTTTAAACCGATATATAACTAGAAGTAATTATCTTTAAACTTAAGAGATTAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 18528245 5' - roo 9037 1 58.90 CCATTCATTACTACAGGTAGAACCGCCCTACCTGAGTCACCAAATACCCCTCTCTCCCAACCTCCCTCAAAAGCTGGCACTTTGCATAAAATATTTGTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAAT:1 - chr3L 8214646 5' + Doc 295 1 66.44 CGAATGTCTGCTAATTTGACTGCAATGGCCATCGAATCGATTGCCAACAAAATGAAAGAAGTGTGCAAAAATATTTTTCACTTAGTAATTAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATCAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2L 19406984 5' + Doc 8 1 69.18 AATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACT:1 + chr2R 5582169 5' + Cr1a 488 1 50.00 TAGGAGAAGTTAGTGAAGCGCCGAAGATTATTTGGGATCCGCTGAAACTATCAATATTAAATCATACTGAGGAATTTGAACGATTGAATGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAA:1 + chr3R 19449632 5' + Doc 4234 1 60.96 CACTGTGTCTCCTCTCATTGTCAGTGCAGTGTGTATTTATGTATGTGTGCCGATATGCGTACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCAGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGAACGTTTGCTT:1 + chr3R 1267678 5' + P-element 60 1 47.26 TGTGTGTTGTCCACCACTTGCTGACCTGCATCCATTTGGAGTTATTTCATTCGGTTTTTGTAATTTCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - 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chr2L 16409426 5' + baggins 5092 1 71.92 GGCCGAAAAAGTATTATTTATTATTTCATAAAAAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCT:1 + chr2L 8574382 5' - Transpac 243 2 77.17 GTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTA:1 - chr2L 23034070 5' - FB 374 1 45.89 ACAAGAAACAAAATACAAACATCAAAATGCGTGGCCATAATGTGAATGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGAT:1 - chr3L 781959 5' + I-element 432 1 67.81 GCATGAGGATGACCTTTCACAAGTGCAAGTAACATCATGACTGACGTGAAAAACGATTGGAAAACTATCTTTCTCTGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTC:1 + chr3L 18484356 5' - hopper 1390 1 64.84 ATATAACAGGCGGTGCCACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGTTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACGAT:1 - chrX 22913220 5' + gypsy7 5274 2 58.22 AGTCATGTCAGCTGCCTATAAATAACCCCAGCCTGACATCAAATAATCATGAAGGTGTCAGCTTTGACTACATTTAGAAACTGTAATTGTTTTAAAAAATGTGACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCT:1 + chr3R 14911924 5' - 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chr3L 27415310 5' + transib2 66 1 62.33 GTTTAATTTATCGAAATGTGTAGCAAATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACAACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 + chr3L 3453588 5' + Tirant 43 2 55.40 GCGAGTATGATCGGCGCCCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTC:1 - chr3R 2637690 5' + gypsy5 40 2 77.78 GCACTGTGTCTCCTCTCATTGTCAGAGCAGTGTGTATTTATGTATGTGTGCCGATATGCGTACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 + chr3R 1267677 5' + P-element 36 1 55.28 CTGGCTGCTTTTGTTCCTAAAGTAGAGTGGGGTGGTGCGAATAAAAATGTTGATAACATGGCCAAGCGCAGCCACATTTGTATACATAAGGCTAACAAAGAAAGAGCTTCATAGCGGCCTCTGCCAAAGTGCAGAGCTTTGCCGGC:1 + chr3R 31874293 5' - gypsy3 6639 2 58.90 AGGCAAAGCAAAGGAAAGAGTTTTAAAAGTAAATTAAAGGAAGTAAAAGGTATACGAATAGTAAGGAAACCGTATTCATTTCATATTAACTCATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 - chrX 8977561 5' - I-element 5326 1 64.38 CAAAAGCAGGGATATATACTATATATAAAAGGAGGCTTCAGTTTGCAATTTCTCAACTGTACACTGCGGCCCCCTAAATTCCTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATATTAATAATAATTAT:1 + chr3R 25804095 5' + mdg1 7083 2 54.11 GATTGGCCAATTTGGTTTTCGCAGTGTTTACCCTGTAGCTGGCATGGCCTTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGT:1 + chr3L 13690275 5' + hobo 69 1 65.07 ACGAGGGATTTCAAGAACAAGTTCAAGAATTTATGTTATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr3L 12223228 5' - Transpac 5169 2 61.87 AGAACGGATGCATTAAATTTGCAGGGAAAGGAGGGGAAAGTTCGAGGGTCTCCATTCAAGTGGCTTCTTGTCAAGTTGCTGTTGCCAATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCG:1 - chr3L 19407573 5' + F-element 205 1 63.57 GCATTTAAGGCAAACGTTTGCTTAAAGAGTTTCGTAGTTTCTACTTGTTGAATGGGAACTCTAAAAAATATTATGGAAATTATATCTCCCGACGAGAAGAGCATACATACATTTGGTGGAATATGACTTGCTCGTGTTAACTCCTC:1 + chr3R 23295772 5' - gypsy10 5639 1 44.52 AATTGAAAAATGGACATTTGTAGTTTGATACCCATTTGGAGTTGGACAACAAGGGCTATCTACGTGTAAGGTTGTCATATACGAGTCCGGTCAGCCGTAAACTGCAACAAAAACCTGCAAATCCACTCTGGGGTTTGCGCCGC:1 + chr3L 12651650 5' + Rt1a 102 1 49.65 GAAACTATGAAAATGCAAATGTGCTCGTCGTGCCATCTCTTTCTGCCCATGTGGCCCCATCTCTTTCTCCGCACAGTGTGCGGCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr2L 16615733 5' + hobo 14 1 72.03 ATTATTATCAGTGTGATACTTGAGGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr2R 1373214 5' + pogo 48 1 52.74 TAGTTAGTTATATTGCGTCCGCTAAAGTGATCCTTCACTGTACCCCTCGTGTAGCAAGATTTGTCCAATAACCGTGTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACG:1 - 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chr2L 9202530 5' + 1360 116 1 66.44 CCATGATTGCACAAAACAAGGTTTTTCCATTCTTTCAAATTGAAGAAGAAGTTGAAGAAAGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 4400266 5' - roo 9046 1 64.38 AAGAGGGTAGGATCTTTGCACGGGGTACTCAGGACATGAAATCGGTGGGCACTCAGTATCTAGGAGCGATTCGCCTGCTGAAAGCTAGTGGCTTCCAACCAAAACGGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 23098120 5' - roo 392 2 69.86 GCGTACTCGTACCAGACGCCCATATACTGAAGAATTCGAAATAATAATAGTAATAAATACAATGTAAGAATATTACGTATAAGCAGATGGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCG:1 + chr2L 1360901 5' - Stalker2 370 2 66.90 ATCAATGTTCCTGCGGTCACACTAAAACTGAATTACTATCAGCCACTCTTTATTTCAAAGCCGCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 + chr2R 5754499 5' + P-element 52 1 47.86 ACACTAAGCAATGGGCACTTAAACAGACTTTAAGCGCTTTTATGTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATC:1 - chr3R 21395271 5' + G2 421 1 75.76 AATGTTTATTTGATCAATGAAATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGA:1 + chr3L 3453613 5' + Tirant 75 2 68.49 CTTAAAAAGCAAAACAATATTTAACTTGATACCCGAGTTACGTAATCTGTCTGCCAACTTTTGATACTGTTGTTTACTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr3R 26486004 5' + 412 7098 2 54.79 AGCGACGAGGGGGCGGGGGGTGGAAATATGCAAGCCAAGCAATTTGCATTTGCACACCGCAAACGGTGAAGCAAAACTTAAGAACACAGCAGACAAGGACAATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATGATTGTTGAGTGCTTGTGT:1 + chrX 12420791 5' + 1360 454 1 67.81 GACAGAAATCGAGGGAAATCAAAGTGAAATCATAGGATAAGAATATAAAATCTAATTTTGGAGTGCTATGGCTATGGCTATGTTGGCGAACAGTGAGGCATGGGAGCTGGGATACAGCCTAATCATTAATTTGATGAAGCGAGTC:1 + chrX 11949722 5' + Rt1b 4769 1 55.86 AGATAATAATATTGTGAGTATATTAATCGTAAATTCGAGTCTTGTGTGGACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - 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chr3R 14912016 5' + Stalker4 88 4 76.03 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGCCATTTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAACAGCTA:1 - chr3L 19045000 5' + INE-1 151 1 65.75 CGCCATCCCGTTTGGGCCAAAAAACAAAGTGTAAAGAATTTCCCCGAAAACCAATTCATTCGCATAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 - chr2L 12291978 5' + Tirant 14 2 74.07 CGAGAGAACGAGAGAATGGGAGAATGTGAGAAAGGGAGAGTGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 19580867 5' - roo 394 1 69.23 TGGCGTATGCCTTGCATTCGTGTACATTGTTAAGATTAGCTTATAGTTACACGAATACTATCGATTTGCGATTGAATTTTAATTTCATTCTGTGGCTTTATTAATCAGAGTATGTTGTTTTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCT:1 + chr2L 17354872 5' - opus 187 4 72.22 ATTCTGCACTGAAGTACGACAACGCCGCCAAAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 + chr2L 13629044 5' + Tirant 8123 2 70.59 ACGTAGAATGCAAAATGCGAATGCGAAGTACAAAATACGATTTTCCCGAGCCCGGCGATCAAATGCGACACGGATGCAAAATTGCAACACTACCGACTATGTGAATCTATCTGATTCAATTGACAACGCCTAATCGAACCAGAGAC:1 - 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Doc 4429 1 51.37 TACATTTGCAGACGATAGGTCGAAACGGGCCGGCGAAAGAAGAAATTCTAAATATTTTCCAAAAGTGTTAACGTGACAGTATTGAGCGGATGGACTGGTGGCCGGAGAGGACGTGGCCAGATCGGCTATTGATCCTGATCATGAAT:1 - chr3R 9869558 5' - INE-1 86 1 71.23 CGGTTTCTTTAGTTGGAATTCCATAATGAATGACACAGTGAAACATTTTTGAAGGTTTCAACTGTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2R 11164357 5' - roo 9058 1 67.12 TAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2L 22719595 5' + 1360 63 1 73.98 AATTTATCAATCCCAAGGCTGACTATTCCAAAAGATATCCAACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTACGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCA:1 + chr3R 10030678 5' - BS 5079 1 64.46 TTTGAAAGGATATATTTCTTTCTAAATATTAGATAAGACACCTCAATAAAACATCATTATTTTACTGATTGTTCAGTTCTGCGTAAATAGCATACATTATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr3L 785845 5' + I-element 24 1 67.81 GCATATTGTATATTTCGCTTGTTGCGCAATTTCAGTTGCAGTTGCAGCCAACGTTTCCTGCCCACCGCCACCTGTGTCCTTGTCCTTTCATCCTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGG:1 - 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chr2L 12285195 5' - Tirant 491 1 67.12 TGTACATGTATGTACTATCTATTGCTTCTATATTCATTCTTCATATTTCTATTCGACTGTTTGCTACCATATAGAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr3R 6461859 5' + 297 6625 2 56.16 GTATCGTCTCTTCGGCACTGTGTCTCCTCTCATTGTCAGTGCAGTGTGTATTTATGTATGTGTGCCGATATGCGTACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chr3R 1267663 5' + P-element 42 1 58.74 CAGTATCCAATGGACATTACCTTAACCTGGTCATAAGCTACTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 - chr2L 6388136 5' + jockey 88 1 70.55 AAGGTTTTGTTTTAATTCCCATAAAATATGTTCCATTTTTTTATGTATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTC:1 - chr2L 13332698 5' - micropia 417 2 63.64 GCGCAATTTACTGATGAGTATGAGTCATTCGAAGAATCGCCAGAGAATCGATGTATCTATATGTATATATATACATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTT:1 + chr2R 7720673 5' + Bari1 43 1 58.90 GTTGATCCACAGGTAGAATGCCGACAGGTAAAGTGGCACAAAGGGCAGCACAACACCGGTCAACGGCGTGGGTATGCGAACATGGAGGCTCACATTTCAAGTATGCTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTATCTAAC:1 + chr2L 11119950 5' + Cr1a 3997 1 68.84 AATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:2 + chr3L 3453633 5' + Tirant 39 2 71.11 TAGTTAATTTAATAATTAAACTATTGAATTTAACAGGTACAGAAGTTCAAAGGTAAATGGTATAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 - chr3R 6413650 5' - 1360 3330 1 60.27 GGCACACTCAGAAATGCCAGAGGCAATCCCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCAGTTCAGTTTACAAGTGCAAGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTA:1 + chr2R 17544132 5' + gypsy5 6975 2 55.64 TGGCATGTGCTAAAATTTCCCAGCGAAGCGTATGAAAATGTCGTGAAGGGCGAAAGTGGAACCTATTTGGATTTCGAATATTTATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGACCTGCAGCTGTGGTCA:1 + chr2R 11263958 5' + jockey 4697 1 62.96 GTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2L 17626659 5' - roo 322 2 79.45 GGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3L 2330156 5' - roo 8982 2 78.08 GGAGGGTTCAATCAGTTTCCAGTAATATTTCACTTTCCATTCTTTGCCTACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAA:1 + chr2R 10160879 5' - transib2 2754 1 65.75 GCAAGCAGCACGCTTATAAGAAAACTAAAACTATTTCCAGTTCAACAAAAGGAAAATAGCAAAGACCAAGCACGAAGAAAGTGCTGCAGTCAAAGTTTTTAAGTGTTTTATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATG:1 - 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Burdock 184 2 75.18 AAGATCTTGAGTGTCACCTTGCAACACTGGTTTTATGCTATTATAGTTGTCCCGCTTTAGGAGGCAAATTCAAAAGTGGCTCCCAACTTCAAAGATAGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr2R 9607244 5' + pogo 22 1 70.55 CAAACTTTAAAAGCAAAATACTTTAAAATATATCAGCAGTAATTGGCAAACTTGATTTCTCGTCAAAAAACGGCCAGGAAATACACTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1 + chr2L 796002 5' + jockey 4773 1 57.53 GGTAACGGGGGTTGCTTATGTGTGTTCGCACGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGCATACACTTAAATTCATTGCACGTTTGCTTGTTGT:1 + chrX 8271551 5' + P-element 65 1 23.97 ATCCATTCTACACCCACCACTCCATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGTTGGTCAGTCGGAACTATAGATAATGAGTACTCCCGTATGTTG:1 - chr3R 3389425 5' + Rt1a 4781 1 79.05 CTGACGTGTCGTTCGCTCGCTGGCTGGCTCCACGTACATAAATGGCGACAAAAGTCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr2R 6798227 5' + jockey 12 1 69.05 ATGCTGCTGTTGAATCAAAGCACCAATAAAATTACCATAAATGCCGTAATATGTTGATACTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGTGACGGCCAAAA:1 - chr3R 10150241 5' - 1360 3328 1 66.44 ATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTGTCTTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGAATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr3R 9125687 5' + Doc 80 1 69.23 ACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTT:1 + chr2L 15081097 5' + Doc 97 1 85.62 TTTTTTTTTTTAGGTTTTGTACATTTTTTAAAAATTACGTAAAATTATTTCATAAATATTTTCTTGCTGTTGTTTTTGTTTCGCTTTTGGATTGCGGCTCCAAGCTTTGAACGTGGG:1 + chrX 8630858 5' - Idefix 7067 2 81.20 ACTCGCGAAACAATGGCAACTCTGGCCTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3L 21910506 5' + pogo 26 1 68.49 AATAAAGTTCAATTAAGTGCATTGTTTATGGATGTTTGAGAAAGTTATCCAACAGATGACTCAGTGAAGCAGCCACATCACGTGATATCATGTCACGTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 - chr3L 1856821 5' - Transpac 288 2 57.53 GAAAAATCTATTAATTTGCATTACTTGCAGAAACAGATTCTTTAAATTCTTGCCACATGTTGCTCGCCATTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTGGCGCAGTCGGTAGGAT:1 + chr3R 20603924 5' + rover 363 3 60.50 GCCACGGTGAAAAGTCGCCCGTGCTTTCCCGCTCGTTGAGTGGCCAAAAACTTTGGCATCATAATTTATAGCTGCGTTAAACAAGCGAGGATAACAAAATAATTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - 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chr2R 17286596 5' - Porto1 171 1 59.59 AGTCTTACACGCTAACTTAGATACATCATCATTATTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr3R 15295793 5' + roo 8748 2 78.08 ATGTCAGGACTTATATTATACTGATGGTGAGTTTTTGTCCCACTGTGACTACTGCGATTTGAATTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGACCAGAAGTG:1 + chr2R 11721043 5' + Tabor 6985 2 53.33 GTCCAGATTATTATAATTTTCTTTTGCACTTGCCTGCTGTGAAACCCTAAAAGTGAGCCAAGAAAACTTCTTTCATAGTTCTGCTTCTCACTAAATTAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chrX 7446162 5' + jockey 4694 1 39.73 ATGCAATTTTGCTTAACTCATTTTCGGGGAAGTGAAGACTCCGGAAAGTAAACACAAAACTAAATTACGACTCTTACTCTCGTCCTTTTCGCCTCTCAGTAAAAAGTATTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTACTATTCTAAT:1 - chr3L 18035627 5' - mdg3 234 2 64.38 CCATTGCTGTTGCGGATGTTTTCTGGTTGCAAAGAGTTAGAATAGTTGCATTATTGCTGCTTGGCTTTGTTGCTGATGTTGCGTGTTGCATGTTGCTTGTTGCTGGTGAAATTTCCATTGCTTTCCTAAATTCAGCTGCCTCTTCT:1 - chrX 16452518 5' + hopper2 300 1 71.23 GGTCTAGGTCTAGGTCTTCGGGCTAGAAGCTGCCTCTTAGCCTCTTATATAATATGAAATATCTGCTGACGTTTTAACCGGTGCTATCCTGTCCACTGGCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCG:1 + chr3R 3697531 5' + Doc 244 1 68.49 CTAGTCGCATAGAACTTTCAGCAACCGCCACCGTTCTCTGACGGTCGTTCGCTTGCTCTAGCCGTTCTCTGCGACTTTGAGCCACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 - chr2R 1320536 5' - Transpac 307 2 78.95 GAATGCAGTAATGTTCTCAGGGAACTTTGTCGATTTGAAAACGTACGATTTAATGCACCTCAACAGTACAAACGCGGTCCACTGGCCAATTGTGATTCGCACATGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAAT:1 + chr3R 17647772 5' - blood 476 1 77.70 CGAGAATCCCAAGGATGCGGTGAGACAGTAGGTGCAAATGTGCCAAAAGTGTTAGTCGAGGTGCTCAAGCAGGCAACTTAATGAGCACTCAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGTAAAAAAACCACC:1 + chr3L 15444744 5' - hobo 2805 1 60.96 CGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr2R 11164489 5' + roo 71 2 73.57 ATACATTCCATTTCTCTTTTTATTTGGTACTCATAGCTTTTGGCCTGCTTCCTCAGCATCCTCCACAAGGCTAGGGCAGATTTCTTCT:1 + chr2R 4955015 5' - G7 394 1 71.59 ATGTAATTTTAATCTTTTCACTTTTGATGACTTCATTAATATTTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTT:1 - chr2L 9418578 5' + rover 7028 2 71.23 GTAAAGAGTTAAATCTTTTTGTATTCTAAAATTTAAATCATCTTTATCATCTTTTTCTAAAATGGGCCGCGGAAAACCTTTATCCGATTTTGAAAAATCAAAGGGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGTCGTTACTCATCT:1 + chr3R 3589395 5' - 1360 20 1 65.07 AAAATGAAAATTGTTTTTACAAGTTTTTTCGCTATTTTAAAATATTTCAAGACAAAAATGTAATACACGATTCGGTATTCGAACATTTCTGCGCAACAATAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATACATT:1 - chr2R 1076604 5' - FB 251 1 69.18 ATTACTATTTTTCGTTGTTTTAAGATATTGCTTGATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 + chr3R 17586857 5' - Max-element 8508 2 65.48 ATCATGTTCCATCGCAAGCTCTGGAATTCGTTTACTCGAACTCTGAAAACGTTCAAAGCTCAACGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATA:1 + chrX 23183420 5' + jockey 281 1 56.55 TTTTATGGCGGAACCTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 - chrX 3646987 5' + 412 68 2 67.63 AAACGAGCTGTTAAGCGCCACCCACAAGTGTGCGCAAAACACACAAAAATCAAAGGAAAAAAAGCACTCCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chrX 9305839 5' + P-element 38 1 53.03 AATTTTAAAAATTCTGAATTCGAAACAAATAATTTCATACAGTTTTCTGAAAAGCTTTTAAAGTTGATCAATATATTGTTACCGTTAAAATTTTTATAAAAAGATATATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAA:1 + chr2L 7822170 5' + Juan 17 1 73.29 CATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCAT:2 - chrX 23182955 5' + Idefix 13 2 63.70 TAATATTTGGCTTACGTTTAATTATCCTTAAGTTATCCTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGGGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 - chr2L 19095149 5' + F-element 86 1 71.76 AAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3R 19436090 5' - roo 350 2 57.53 GCAGTATCCATTGCATACTTTTCGGCTGGTGTGCACAAACCGGAAGTCCTTGATGCAAATGTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCCGATAAACACTCGGTACTCCAGGCAC:1 + chrX 7741880 5' - hobo 2895 1 51.54 ACAAAATGAAACGGCCTTGAAATTGCAAGTACTAACCCTATCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr3R 6413565 5' + 1360 49 1 63.56 AATGTATGCATTATACAACGAATACGCAGTTGAAAAGGTTAAACGAGAACTAAAACAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGA:1 + chr2R 9769537 5' + 1360 54 1 57.78 GGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3R 22494193 5' + 297 6618 2 54.10 AGTCTTTACGGCTCTCTCTCCTCTCCACAATGTTTAGGCTAAGAAATTTCAGAACCGGCAAAGCCAAAAGAGCGTTGCCAACAAAAAAAAACACGTTTTTGTGTTTGCAAGCCAAAAAACAAAAAAAAAAAGAGAAAGAAAAAAAA:1 - chr3R 31936493 5' + Doc2-element 237 2 62.33 ATAAGAAAAATAATGATATCTAGGTATTTTTCTAATTACTGCATTTTCTTGTTTTTTTCCACCAACTGACATTCGCTGCAGGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTT:1 + chrX 18180018 5' + jockey 272 1 57.53 TTGGATAACTGCTAAAACTTACGGCATACATAGATATAAACGCTGTAATAATTGTAATGCATTTGTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAACACTCATTAA:1 + chr2L 21643048 5' - Tabor 404 2 67.81 CATGATTGCACAAAACAAGGTTTTTCCATTCTTTCAAATTGAAGAAGAAGTTGAAGAAAGCCAAAGAAAGCAACGTTTGCTTTATTTCTTTTGATGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chrX 4400267 5' - roo 9045 1 63.70 CCTCAGGGCATCCTAGGTTGGGTGGGTGCGCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTCATCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAGTAGCGAATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGG:1 - chrX 21032634 5' - Quasimodo 6899 2 74.62 TTACGGATCAGAATCCCTGTGTCTGCGATTCTAGAACTTTATGATCCTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATAT:1 + chr3L 18253800 5' + blood 7087 2 69.18 TGAAGTGATTACCCAACTGCGGTTGCCATTTAATGTGTTTAAAATATTTCGAATTAAGCCGCTTTGTATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTT:1 - 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Stalker2 341 2 58.22 GTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACC:1 + chr2L 18630475 5' + G-element 70 1 68.89 GTAGGAACTGAGATGAGACTGTACATAAGTAAGATAAGTAAAGTCGCCATCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGC:1 + chr3R 7481472 5' - invader4 302 2 67.88 GACAGAATAATGCGGAATAATGATGATTTTATCAAAGACACCAGAATAAAAAGATGCGTAACGCCATACGTTTTTTTGACAAACGATTTTTTCGCCGTAGCTCTAGCTCCAGGCTCTCTCAAAATTTTGTTGGAGAGCGAGAGA:1 - chr2R 949547 5' + 1360 97 1 75.00 TTTGAAACTATTTTTTAATCACAGCTAAAACTATCACATTAATAGTAGCCCCTTAAGATTTTCCACATTTGATTACAATAAATTGAGACATTATATAATTGAATGAATCCATATTGCTGTTCTTGGGTACAGCTACCCGTACATGG:1 + chrX 16331278 5' - Stalker2 7545 2 64.38 ACTCGCAGTCGAGTTCGTGACATAATTAAAACACAAATAATTGTTAATTAGTTAACCTGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTG:1 - chr3R 20524655 5' - roo 37 2 58.99 ATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - 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chr3L 16680724 5' - TART-B 152 2 50.00 TTTTTACGCTCCTTGTTTCCTGTCTCATTTAGAATTGTGATTTTCACAAAAACAAAAAAAAACAAAAAAATTAACAGACACACGACAAGGGGCACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCA:1 - chr3R 9962767 5' + I-element 4985 1 68.57 GAGCGGTGCTGCTCCTTCGTTGTCTTTCCTTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGAT:1 - chr2R 4986918 5' - F-element 4571 1 78.03 CAGCATCGAACTCATCCTTTTTCGCCCCTTCCCATTCACTGTCTGCCCGTTTTGGCATCGCTTGATGGCCCTCTTAACCCCCTGTTGCCGATGCCTTCCGTTTCAACGCAGGCGAAACTGGTTGCCCT:1 - chr3L 3589135 5' + R1A1-element 491 1 79.69 GATATGGAAAAAGGGTCACAGAGCATAGGTGCAGAGGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATA:1 + chr3R 5773124 5' + Stalker 36 4 59.12 ATACAAAATTAAAGAAAATAAATAGTTCTTGATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCATGGGCCGTTTCGTCTTGGTTTTTTCACTTGATTTTTTTTT:1 + chr3L 16184095 5' - Porto1 172 1 58.04 ATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3R 9125681 5' + Doc 49 1 61.90 AGTGCCGAGTGGCGTAATTCCCGGTGTTGTGTCTCCCGTTTTGTTAATAGCGCTGGGTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1 + chr2R 19852142 5' + Transpac 4980 2 60.27 GCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTAGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACATGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTATGA:1 - 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Quasimodo 72 2 71.23 GCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2R 11164490 5' + roo 76 2 73.97 AGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr2R 8688155 5' + F-element 44 1 61.62 TTACATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1 - chr2R 18344634 5' + 1360 64 1 60.96 AATGTATGCTACATTTTGTTATTGTTAAATATGCTACGGTTTGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr3L 2216607 5' + jockey 73 1 66.67 GTTAATATTTACAATATATGACAATAGTTAAAATTTACAATATATGACAATAGTTAATATTTACAATATATGACAAATAGTTAATACATTAACCCCACTTGAATATATGTTTTTAAGCGCAATAAAAGAAAAATAAAAAGAAAAAA:1 + chr2L 9403199 5' + Doc2-element 219 3 76.71 GGACTTCATCAACGAAGATATACATTAAATTAAGTAAATTCAATTGTACATGTATGTACAATTCAGTTGTATTGTCTGCAGACTAAGTCTGTCGGCATATCGGCTGCTGCGGAAGTTTATTTGTTCTCCCAATGGGACAACTTTTA:1 + chr3L 23287620 5' - G5A 2564 1 56.16 CCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr2R 18344626 5' + 1360 16 1 54.44 AATAAACAACAAAGGCAGAATTGTTAATAGATTGGTGAAGAAGGCTAAGATCTCGTCTAGTGCTATAGAGTTTACGTGTTTTGCTTTGTTTATTGTTTATCACCACGCCCCTTTAGCCCAAGTGCAGTCTTTAATTGCAATTA:1 + chr3L 17539827 5' + hobo 2539 1 58.74 ATCAAATTGTTTAACTCGTATGTATCTTGTATCTCTTAAATCACATTGAAAACATGCTCCTCTTCNNCGTTCCTAGCTGTGTTAATATTATAATCGCAATTGTTCTTTTATTTATTATTCGCGTGGCCGCGGTGAGTCTTTGTTAG:1 + chr3L 10895012 5' + Gypsy6A_LTR 121 1 76.71 AGGGGAAGGGTTGGAACCCCTAACAACACAGCTTACCCTTATCAAATGCAGTGCACGTTTTTGCCTCGGAATTATTTATTTTATGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTGATGAAGGGGTAGTGCAATAGATCCGACTGGG:1 - chr2L 13870921 5' + baggins 5398 1 56.25 AGGGATATTGATAAAAAACCAGCCAATGCTAGAAATGAAAAAAGTAAGGAAGATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2L 16331039 5' - roo 9005 2 65.75 AGCAGGAAGTGAAAATCCACCAAGGAGCCATTCGCAGTAAGCTGGTGATATTTACAAAAAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAA:1 + chr2L 2120327 5' + I-element 4920 1 71.23 GCGGGAGGCATAAAGACCAGTGGCATGACCGGGATTATCCGGATAATATCTAGTGGGCGAGGAGGTGGACGTGGTGTGCGAACTGCTGCAGTTGCTCGAATTTGTTCTTTGTCTATATGTTTTTTGGTTTTACTTTATTATTCCAC:1 - chrX 10122946 5' - Doc3-element 161 1 67.12 ACAAATATGTATATTTTGACATTTCAAGTTTAATTCTTGTCACTAATTCTTATCATGATCAAGCATAATGATACATAATGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTTAAGTTTATGT:1 + chr3L 17921920 5' - copia 216 2 58.22 ATACAGCTATCAATATAAAATGAAATGTGGTTACGAAGATCAAAAAGATATACCACCATTGAGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATT:1 - chr3L 18253887 5' - blood 7329 1 60.27 GGATTAAGAATGATTGGAAATGGGAAAAGGATATGAACTGTTATAAACTAGCTAAATAATAAGAAAACCACATTTATTTAGTTACACATTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr2L 6601405 5' - roo 9038 1 41.78 GTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTG:1 - chr3L 7801282 5' + Transpac 191 2 73.29 CATTTTCGTGGTGCGCGGGGTCCAAATGTATTTTGCATCATTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr2R 16413145 5' - roo 8991 2 71.23 CCCCTCATTACTTTCATGGGGGAAAGTCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAT:1 + chr3R 14049292 5' + transib2 22 1 70.55 GCGAGTGTACAATCAACAAAATTAGTTTCATTTGGGCAAATGGCATGGCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTCGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCTAAT:1 - 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chr3L 17922059 5' + copia 44 2 55.48 TAGCCAAATGCACGAAAACAAATCCGCGTAAGGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAG:1 - chr2R 18799929 5' - roo 8858 2 78.08 ACTCTGCAACAACGACAATAATTGTCGTTATAATAATGGTCACTTTTATAATGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGATTAAATAGTTGA:1 + chr3R 15295721 5' - roo 9005 2 66.44 GGAAATGCTTGGGCTACACAAAAAAATTAAGTACATATGTATATGCGTTAAGGGAAATTTATAGAAACAACGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 7870133 5' - roo 397 1 75.34 TATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr3R 9125682 5' + Doc 58 1 63.72 ACACATTGTAACGGAATGCTACAATGTGCTTGTATGTTAGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAA:1 - chr3R 3181114 5' - 297 323 2 76.71 GAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chr3L 19580914 5' - roo 317 2 79.45 CACTCGAATGTTGCAGCGTCTACGGCGATTGTTGTTTCGTCTGCTGGCAGTTGGTCAATAATTGGCATAGATTTATTTTGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAATACTT:1 + chr3L 4523909 5' + roo 8678 2 70.34 ATTTGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTG:1 - chr3R 19436117 5' - roo 377 1 63.01 GAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAA:1 - chr3L 27415308 5' + transib2 68 1 63.70 TTTCAATTATAAAATGTCAAAACCGCAAACTCTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chr2L 9274972 5' + F-element 54 1 55.86 CCCCGCAGCACCCAAACGTCCTGTTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 14218441 5' + roo 8710 2 61.34 GTTATTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGCCAATTGATTTGGATTCGTTACAAGTCCCTTTAGGACAATTTCAGTTTTCACAACTGGAATCCGTAGGTCCTGGTAAATGTTCGGAGGATTTTTGATTGTCCTCGTTGTATTATTTC:1 - chr2L 16856990 5' - Doc4-element 2647 1 56.85 GCCACGCGAAGAGAACCGGAGAGAGGGCGCAACAAATAACGAATAACACAACCAAAAGGAAACAGCCAACTAACCAGGCAAACAAATCAAAGCAAACAAACGAAA:1 + chr3L 22834135 5' - accord2 7255 1 63.81 ATGATTGATGTCCTATGCTGGCGACAGTCAATTATCGTCAATCACTGGGCTACAAAACATCCAGAGCAGCAGCCCAGAGGTACCTCACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTT:1 - chr3R 27810147 5' + Burdock 32 2 63.70 TAGAAATGTAGCTTTGCACTTTTGTATAAAAATCTATGATAAATAAGTTTCCATACTAAAGTATTAAAAGCATGCTATGTTATTAAATTCTATATAAAGAGTAATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTT:1 - chr3R 11151950 5' + mdg3 18 2 71.92 CCTTCCAAGCTGTTAGCAACTATATGATCTGGTTACCTAGTCTTTCACTACCTTATGGTGTGATTGTTTCGGCACTAGGTAAACCTACATATATGAACATACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 + chr3R 22494043 5' - 297 6962 2 69.18 CTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr3L 21910480 5' + pogo 52 1 55.48 ACGTTTAAGTTTATGCATTTAATTTTTACACTGTCTATCATTTCCGATAAAGAAAATTGAATGGTTGTAAGTAATATTAATTCTAAGGAGCTAGTTTGGATATACATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATA:1 + chr2L 21976655 5' - Idefix 7375 2 75.34 CGAGAGACTTGCATTGTTAGTCCCTTCTATGTCTATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCA:1 - chr3L 14302263 5' + Quasimodo 68 2 73.38 TCGGGTGGATAGTTTCTGGATGTAAAAAATCCAAAGGAAAAGAAACCATTGTAGCCACAACAATAGAAATAAAAGACGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGACCGCTTAGCAAA:1 + chr3R 19444829 5' - Quasimodo 7240 2 54.29 GGGAGAGTGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3L 19580900 5' - roo 9037 1 57.69 GAGGAGGATTTGCCGAGTTGTGTGTGCACGAAGTAGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTAGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:1 + chr3R 31724880 5' - P-element 2800 1 26.03 AATGGTTATGATCAGGAATTTACACAAAAATGCATTCAGCGCTGCTAATAGATATACAAAATACATACATAGATAGAACAAGCAAATGTTGCGTTATCACAAGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr2L 6177671 5' + pogo 16 1 73.29 ACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTCTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGC:1 - 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INE-1 128 1 78.01 GGACAAGGTCAACTCGGAGGCCATGTATCACGTTTACTTCGATAAGGACTCGGTGCTCTACAGGTGCGTGCACCAGCAAATAAGCTGGAATTATGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 11140841 5' + roo 8681 2 45.93 TTCCCATCGATGCCCTTGTCAATTTTTCGCAACTGTCGCATTTGGAACCACAAACAAATTTGTCTACGACTTTCGAGATGAACGCACCAACGGTCGCAGTCCAAAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGA:1 - chr2L 5448645 5' - Doc 363 1 73.29 GAATGGGGGGTGGGTTGCAACATGAAAGGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTATGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGG:1 + chr3L 9469885 5' - accord 7010 2 76.92 TTATAAATGATGGGCGCCGATCTGTCGATGGGGTTGATGATGAACGATGATCCTGCGGTACTGTAAATACCTAAATGTCAGCTAACCCGCACATACCTTGCTCATATCTATGTATTCTT:1 + chr2L 9585739 5' - Stalker4 7228 4 62.18 ATGGCGACGTCGAAGGAAATGTGGGCCGGAGTTTTGCGGGTTAGTTGTTATTGGCAACGGCGGGGGAATTAATTTTATTATAGGTTTTAAGTGAATTT:1 - chr2L 7357828 5' + Tc1 306 1 57.14 CCCGATGTCCTTGGTCCTGGGAGCCACACACCGACCGCTGGATGTCATCTTTTACTTTAATATATTTTGGATCTACGCACAAGTTTATAGTGCGAACATTTTCGTCCTTCGAGAAATTCTGTTGTTTTCCCCCACCAGTGGTAAGA:1 - 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chr3R 30264116 5' + blood 7064 2 54.11 CATCTAAAGTTGCGCACTAAACTTTCTAGGAAATCAGCATTAGTCCGGTAAAGGTTGCTGTAAAAAAAAGTTATGATCAGATGATTCCGCCACTGAATTAGGCTTTAAACCTAGCAACAATACCAGCCCGGGCCTCAACTGTTAAC:1 + chrX 19132653 5' - Bari1 396 1 65.75 AAGGATGAGGAAGTGGCCGCCAGGCAGCCATGTTTGTTTGTATTTATGTCGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr3L 7460572 5' + 412 19 2 72.60 AGTCGACATTCTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1 + chr2L 2494838 5' + Doc 78 1 68.49 TATTGGAATTTGCCCCTTTCAGTGAAAAGTTGCTGATATTAACAAGCATACGGTTTCCCTAAAATATGTTCACTACAGACATGCTTCACTGTGCCCCATATTGGCCGCGGTATTGATGAACTCCAATTAAGA:1 + chr2L 11405741 5' - 412 7544 2 53.79 TATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCGTTCATTTATTTACTTCGCGATTTTGTGCGCCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTAC:1 + chr2L 21325126 5' - invader4 2990 2 77.40 GTTTATGGATGTTTGAGAAAGTTATCCGACAGATGACTCAGTGAAGCAGCCACATCACGTGATATCATGTCACGTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr3L 1856798 5' - Transpac 5185 2 47.59 AGATCACTCCCCGCAGCACCCAAACGTCCTGTTCCCGCAGCATCAATGGTCCACCACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr3R 14218433 5' + roo 64 2 62.76 AGACGGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGACA:1 - chr2R 2879468 5' - Stalker 6929 4 58.90 ACTCATTTGAAGTTTTTATGAACACTTTTTTCTACGTGTGGCAATGGGAAATGGAAAAACGAAGCTGTCAAAGTATCATATGACAGCAAGCGGTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTCAAAGTAAATG:1 - chr3R 10914834 5' - roo 314 2 63.64 TTAGTCTGAGAATCGGTTTCGGTTCGTGATCACCGGGCCAAGCTAGCAATAAAGTGATCGTGAACAAGCAATTAGTTTGGTAATCGCCATAAATCAATCAGAAAAGTATCATGGAGATATTTTTTTTTCATGTTTCGCTTATTTAT:1 + chrX 7552881 5' - Doc3-element 4716 1 71.23 GCTCATATTTTACACAAGATATGGGCGCGTCGTTTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGCTTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAA:1 - chr3R 14912014 5' + Stalker4 7022 4 71.31 CGGAACTGCACCACTGGAACGATGTCGATTTGTGCCCGAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr3R 23601810 5' + jockey 26 1 62.96 AGGTAAAGCTGATGCAAGCAGTAAATTGCGCTTACAATGCCATTTCAGCCATCTTAAGTTATTTCAGTTATCTACACTTGATTGCAAACAAGATTTAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGCTTACTA:1 - chrX 15563655 5' - Doc 4437 1 62.07 GCAATCGGATTGGATCCTCAAGCAGGATCGCAGCACCAACGTCAGCCAGGTGAACTTCCATCCCTGGGCGGGTGCCCACTTCGAAATTCACGAGTGATCCAGTAAGCTGGTAATTAATCAGATCAGCTGCATCAGACAATACAGCT:1 + chrX 17259666 5' + Rt1a 191 1 56.16 TGCCTATTTCAGTGTTTGGGAGAGAGTAGCTTTCCAGCCCCTCTCGCAACGGTTCCCACATCTATAAACTAAGGGCCGAAGTTCTTTACCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGT:1 - chr2R 3288610 5' + Idefix 314 2 67.81 ATATAAACACACGCCGAAGGCCTTTGCTAATTAAATAATATGCAATATGCGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCA:1 - chr2R 7599236 5' - diver 6039 2 67.12 TCTTAGCCATACGAGCAGACAAATTTATTCAAAGATTATAAATATTCATGCTGCTGTTGAATCAAAGCACCAATAAAATTACCATAAATGCCGTAATATGTTGATACTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr3R 10150288 5' - 1360 3376 1 76.55 AGCACAGCAATATAATTATATAAGCATACTCTCAATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGCACAAAG:1 + chr2R 21820742 5' + Doc 82 1 74.44 TTTTATTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATTAGAACCAACATGCTGTGG:1 - chr3R 24564831 5' - opus 434 2 61.38 GGATGATCTACAAAACCTATGAAATCATCGAGAAGAACATCCTATGACATCAGCTAAATCTTTAAAACGATTGAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr3L 25607252 5' + 412 7102 2 52.05 GCGGAACCTCGAGCTTAAGAGAAAGGCTTGAACGGAAGCTTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chrX 3646980 5' + 412 72 2 70.59 CATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 - chr2R 18344631 5' + 1360 61 1 61.43 ATAAAAGAACTTGATGAACTGGTGTACTATTACCCTAGAACATCAGAAACCCAACGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 - chr3L 23871362 5' + Doc 38 1 60.27 TACACAGGCACCGCCAAACACGCAGCACCCTTTCCATCCTTTTTACCCTCTGTCCATTAGCTTTGAGCCGCACAAATGCCATGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACC:1 + chr2L 17879440 5' - Stalker 6896 4 54.79 GAACATGACTGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACA:1 + chr2R 4577065 5' - Chouto 474 1 54.33 GACCATTACAATCACTTCACCACTGAAATTAGAACAGAATTAGAACAGTTCGATCACTTTTCTATAAGGCCAAAACATATGCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 + chr2R 5438190 5' - flea 4972 2 56.16 AGCATGAAGAAGAAGAGGCAAGACCACATTGGAGACCCTGGTAACTGCAGAACTGCCGATGGATAGACAATGCGAATAAAAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTGCGAATACTGTTTATTTTGCGAATTGTTTACG:1 - chr4 633682 5' - diver2 4818 2 50.00 ATGAAACGGCCTTGAAATTGCAAGTACTAACCCTATCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chr3R 6413570 5' + 1360 82 1 74.66 AGCTGAAGGGCAAAGGCGGCGGCAGCAGTTTTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTT:1 - chr3R 10907582 5' - X-element 4623 1 80.14 AGTGGATTTTTTTTTTATGAGGAGAGGTCAAATCGTATGATGTATTTTTGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGGGTAAGTTTTGCTATTTTTTTGTGTAGTTTGATATGG:1 + chr3L 23665466 5' - Porto1 293 1 62.33 ATTCAAAACAGCAGTTGATTTCGTTTAAACATACGTATCACCCAGCAGCCGCAAAAACCTGAATGGCAAAACATAAAATGTAACAAGAGAGAATGCTATAACCTTGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAA:1 - chrX 22838790 5' - INE-1 537 1 58.22 GCCCTGGCTGCGAGGGCGTTAGTGTCCAAATAAATAAATGCAGTGCGGTGCGCCAGTAGATACGATACTGCACATGCAGTCCGGGTTTTCGCTCCTATCTTATATGGTTATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chrX 16117321 5' - opus 489 2 78.08 ATGCACTATGCGAAGAACTCGTTCTCGAAGAGTCCCTACCTGGATACCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCG:1 + chr3R 24750918 5' + G6 25 1 71.92 ACCTGCAGCTAAACAGATATTTGAATCGTTTAGTAAACTCTTGTGAAGCCCTAATTAAAGAAATTTTTGCTTGAAAAAGAACCCAAGTGTATTCAAAATATGGTAAATATAATAATGAACTTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCA:1 + chr3L 2283355 5' + jockey 4799 1 73.97 GGGTTCCTCTGGCGAGCGGAGATCATTTGTTTTCCTGGCGACACACATGCCTGGACCCTTGGACAAGCACTTACAAAAGTTACTCCTCCGGATGGAAAATGTATTTATATACAAATGAAAGAGGTTTT:1 + chr3R 6784196 5' - transib4 2451 1 78.91 GTGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAA:1 + chr2R 12065585 5' + Stalker2 65 2 60.96 ATTAGTTTCATTTGGGCAAATGGCATGGCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - 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Cr1a 4250 1 71.23 GCTGAAGACCAAGGGACTGGACCTGTTCGTCATCTTTCTTTTTAGCAACTTTGCATTGGTGTTGCTGCTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAG:1 - chr2L 6396221 5' - jockey 475 1 60.00 GTGGGTAAGTCATTTGCTCAAGTATTATGAATAATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGA:1 + chr3L 465996 5' - Juan 4127 1 77.40 AGAGGAATTAATGTGCGTGCGTGTCCCTGTCAAAGTGTTGGTAACTGAGTGGTTGCTTATGTGTGCGTGTGTTTCTGAGTGCGTGTGTTTGTGTGTGGTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2R 23671737 5' + hobo 23 1 59.59 AGAAGGATTATTAAATTAGTTAAATCGTTTCCATATTGATTTTGATTTTTTTAAATTTTACAAGGTAATTTCCACTTCGTTGGCTTCATACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3L 2320581 5' + roo 14 2 67.97 CAAGAGCATTCTTAATAATGTTCTTTGCGACGTATGGATGAAGTACAGTAGGAACTGGCAAAGTGTAACATAGTTGCATGCGCAGGGAATTTTTTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCA:1 - chr3L 22046341 5' - R1A1-element 238 1 52.74 GGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATC:1 + chr3L 7837179 5' + jockey 4838 1 65.75 AAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACT:1 + chr2L 19310321 5' + Juan 4131 1 56.85 TTCACTGATGACTCAGTTTCCGAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr2L 21153448 5' + 1360 31 1 61.64 CAACGCCTAGACCAAAAGTCCGACAATTGTGCTGAGTCCGGGGATTCCCCGTCCGATCCACACATCATCTTCCGGGCCGGACAACTGCCACTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTCC:1 - chr3R 13440237 5' + hopper 460 1 65.03 GTGTTCCCAACTCGGAGCTTAATTCCGATAGCAATTGATTTACCATCTCTGGGAATTCAAAAGATAGCTATCATAATTAAATCGGCAAAGGACAGGGTTTAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr2L 11296111 5' + 1360 22 1 69.18 CCATCACACCGATAGGGATTCCACCCGGAACCCATTTGGAGTTGGGTCAGCGGACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTT:1 + chr3R 24750964 5' + G6 45 1 55.00 GAAACGTGTGCTCTGCATACATGGCGGATGAGTGATGTTCGAATTGATTTTAATCGCAGCGCGATCTTGTCGCTATTGTTATTGTTAATGTTAAAGTTAATTAATTTTTATCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCG:1 - chr3L 975173 5' + Ivk 222 1 75.34 TAAAACGGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 - chr2L 12291914 5' + Tirant 62 2 76.47 GGCGGCCCTCAAATGTATGCTACATTTTGTTATTGTTAAATATGCTACGGTTTGCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 - chr3L 2216618 5' + jockey 19 1 60.00 GCTTTGTCCCATTACTAATCAACAAAATATTTCCATTTGCTATGTGCTCACCAAGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - 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transib2 2762 1 60.27 GCTGACTTTGAGTGGCAAAGAAGCTTGTGAGTAAACATATTTGCCAGAGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTTACATGAG:1 - chr2L 11554566 5' - roo 335 2 64.38 TTTTTTGCTGACTCACCCATATCCATTTAATATTAATATTTCTTAATTCGTTTAATTCTTAAAAGTTGCCGCAATCAGAACACATTTTGTTGATTTTACACATTTGATTTATTTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTC:1 - chrX 14836325 5' + invader4 2763 2 52.05 CATGATACTCGTACATAGATGAATGCCCACTTTTTGTCATTCTGTATGAATATAGCTTTCACTTTTGATCGGAAATAACTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr2L 17626702 5' - roo 9029 1 56.85 GGCAGTGAAAAATTATTTCTGCTTGTCAGGATGCTGAAGATACGGCAATAAGTCAGACGGTTGGTTTATGCCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGCAATATC:1 + chr2L 19652507 5' - roo 9023 2 50.68 AAAAAGGCTAAGCTAGAAACTGGATTTAGTTACCATTTTAAACTAATTTACCACAAACACGATATTATCCTTCATGGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGACGGGCGCAAACAGTTGA:1 - chr2L 19140492 5' + Max-element 8244 2 78.08 TGCGAATACATTTGTGTAGCACACTTTCGGGCTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTG:1 - chr3L 22339471 5' - hopper 1333 1 74.66 GAATGAAATCAAATTAGCAACACACTCTGCGAAATTGGCACTAATGCAAACTGTTTTTAATGCTTTTATCTCATGAAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 + chr3L 20251897 5' + copia 4915 2 54.11 GTGAATGGAAAGATGATGAATGAGCTGAGACAAATTGCATAACCAGTTAAATAATAAACGACCTTCTTCTGGCCAACTTGCTCAGAAGGTTTGAATTAAGTAGGATTTATGTCATGTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGG:1 + chr3L 8076693 5' - jockey2 3182 1 57.53 ATACCAAAACCATTTACTTGTGCTTCATACAACAGGGCTTAACAAGGCTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGAGCATTGCTCAACAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGA:1 + chr2L 11554492 5' + roo 143 2 62.86 TCATGAGTTTCCACACAGTTGAGTGTGCTGGGCCAAAGAATATGTCATAATGTTTAAGTGCCGTGTACATGCGAAGTCGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr2L 15777920 5' + 297 6618 2 60.27 GTCATATACTTTTTAAGTCTTCCAATTTTGTGTCCTAAGTCTTTCGTTTAAACTTTCACTAGTATATATTATATTTTTTATCATAGAAGACAATATTGAAACTAAGTTTACCCTCGAGCAATGCATCGCGCCGCCACA:1 + chr3L 4054317 5' - gypsy 7166 2 55.80 ACGTTTAAAGAGAATGGACAGCATTAACATACCATGGGGAGATAATTTTTTAAAAGTGAAGCTTTCTATATTATAAGTTTTTATTTCAGCATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chr3R 15054248 5' + 297 28 2 63.01 CCCGATCACTGAAGTTTCCCGTCCGATGGCTCGTTCCAATGCACTATGGGAAATTTACCCCCTTTTTTTTGGCCAAAACCTATTTTATAATTTTTTTTTTTATTATTTTTTTGGTTATT:1 - chr3L 21879275 5' + Tc1 1401 1 75.63 GATCACATCGTTCGTAAGAAAAATCGGCGCGCAGTTCATTCATTGCTGCTCAGTTGGTTTAAATGCGATGATATTCAAATCTTATTATATAACTTATATTAATTACAAGTAATTGTATTAGTTAGAGACGG:1 - chrX 9640330 5' - Doc2-element 4661 1 54.20 CTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chrX 388221 5' + 1360 48 1 53.42 AGAGATAGGAACTTGGCCCTGATCCAACATAGAAATACATACGAATGGCCTATCAGCGAGTTATGAGATAGTCAAAAGGAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 25862695 5' + roo 8703 2 56.94 GTTGCAGAGCGGACAGCACACCGCGAGGCCAAAGGTGTAGGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAGGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:1 + chr2L 22319235 5' + Transpac 31 2 60.27 ATTACCATCGGCTCATCTCGCCAGCACCTCCAGCATTTCCTTCACTAAGACCCAGCATTAAACACAATGTTTTTACATTTATTTTTTCATTTTTTTTTTTCATTT:1 + chr3L 3390467 5' - Doc2-element 246 2 77.14 TCGGCTAGTGTATGCGTTGTGAAATTATTATGAGCTAAGGGTTCGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr2R 21748321 5' - 1360 3340 1 66.67 TTTGATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGG:1 + chr2R 15070103 5' - 412 7464 2 78.83 GAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGA:1 + chr3R 14049350 5' + transib2 80 1 71.23 CTGGATTAATATTTAAATATATTCGGAAATTTGGACTTAGAAAGGACCAAAATGTTGTGTTGTAGGGGGATGCTGTCCTGGAATTTTCCAAATATGCTGAAAAGAAACACTCGAATAAAAGCGAACACTATACTTTTCGTAATTGC:1 + chr3R 20005368 5' - GATE 8417 2 67.81 GTTGTTCGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCATCAGGAGTGGCATCCAGTACACGGA:1 - chr3R 21395228 5' + G2 478 1 62.33 TGTATATGGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGC:1 + chr3R 10437029 5' - BS 5050 1 56.16 AAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3L 8658741 5' - roo 323 2 74.66 CTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 + chr2L 2494848 5' + Doc 88 1 75.34 GCAGCTGTGCGCACAGTGTGTTAAATATTTCGGGAAAGTTTTGGAAATATTCGTATAAAATTTAATTTCATACGAACAATTTAATAAATGCGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCAT:1 + chr2L 6601252 5' + roo 8699 2 54.79 CACAGTCACCTACTTCCATCTCCGATAGAACTAGAGAACATTCCTGTTGGTCAAATACCAGCCCCTCTAACGGCGTCACTTTCAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTA:1 - chr4 863311 5' + Cr1a 4314 1 58.22 CAAGGTCCTGAAAAGAGGCTCGTGTTGCAAAAAACCGGAAAGCAAGAAGCCGAAGCTCAATGTTGAAACATTTGTTTAGTACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chrX 21403511 5' + roo 8704 2 56.85 ATATATTTACATACATATCTAAAGCCCTGTGAGACCATTACTGTATAAGCTTATGTTTTATAAAAACGAGAAGGTTACCATCCCGAAGATTAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAG:1 + chr3R 13353473 5' - Ivk 386 1 54.11 CGGTCGACCAACAAATGCAGAAAGAGAAAGCTCAGTGGTATCATTGGGATCCCCAAGCAGTGTTTCTTCGCATTAATCAAAGAAGTACAAATTTCAGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAG:1 + chr3L 25911959 5' + looper1 1509 1 76.71 ACGGTGTCGCCGTCTCTCGCTTTAAGCGATGTTTATCTCCGTCATAATATGCGCTGGGAATCACCTTAAAGTGATATTATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2R 25106015 5' + roo 8707 2 55.86 TCCTTGCTTTGCGAATTACAACTACAATGCCGAAGGTGACGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr3R 14277882 5' + P-element 63 1 42.47 AGTAATAGTAGCTTTGAGCTATATTGTAATATAAACTTAAATGCAATTTGATAGATATATATAACTATATATATATAGCTATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr2L 16562173 5' - opus 7464 2 52.74 ATTTTAAGGCAATTAACCTAAGCTCCTCTCATTTATCAATCGTAAATGCAAAATAATCGGTCCTTTCCCAGCCTAGAAATATTACTTTACACGGCCGAAAAAGACTACAAGCAAGGGATCTACACTGGCTTATACACGTTCGCT:1 - chr3L 6141537 5' + Doc3-element 4243 1 68.06 CAAACAATATATTTATGGCCGCAATTAAAGGTAAATGTCTTTGGTGGGCCACCTGAAAGTAGGCAGCACATTTTAATGAGCCTTGTGTCCCCGAAGACAGAGTCAAATATATTTTTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - 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chr3L 12836093 5' + 1360 60 1 58.90 ACGACGAACGGAACTGAACTCTCTGCGCTGCCGAAGACTCGCACTCACACAATCGTCCATTAAGCCTACCATCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTA:1 + chr3L 9469135 5' - hopper 1363 1 50.68 AAATATTCATATACCAGAGCTGAGCAGAAGATGTTCAATTAAGATCTAATACGTGGGTGTGAAATTTATTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCA:1 + chr3R 16538350 5' + G2 2636 1 52.74 TTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 + chr3L 17537764 5' + Doc 66 1 75.83 CTCTCTCTCTCTCGGTGCTCACAGTATTACATCCGATGCGAAGATCGCTGAGAGTTGCATAGTATGCTCATTCCAAGGCGTTCGATCTCCAACATGGTATGTTTGTATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 + chr2R 18611863 5' + P-element 17 1 74.66 GCGACAATGTGACGGTCTGACAATGCCAGAAATAGTCGCTGCTGAGTTGCACAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAA:1 - chr3R 7506923 5' + Doc 138 1 63.70 AACACCACCAAAGTCATGTACAGATGTCAGTTTCGAGGAAATGCTATGACAAAGTGGCTGGCTGACTTCTCCACTCTGCTCTTTACATTAATTTTTATATTTGTATTTTT:1 - chr3R 13887173 5' + BS3 1648 1 65.45 TCTGTTTCGCCTGCTGGCCATAATTGATTTAGGCATTTACTGCATTAGGCAAAAAAAAAGGCGCTCATACACTGGGAATGAAGTCAGGAAGAGGATATACTTAAGGGCTCTATGGACGGC:1 + chr2L 10960654 5' - Ivk 390 1 78.33 CTTATTACGAACTTCCTGTACTATGTCAGTATACCCTTTCTAGCCTAGGGCATTTGAGAAAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCT:1 + chr2L 18630458 5' + G-element 64 1 59.59 AAAGTCTTGTCAACTGCCTTCGCTCTTTTATACATATTAATTTTATTTTTATTATTTTTTGCTTGCTGGTCAGCCCGAATGAAACAATTGCTAAGAGGATTTACTCCGCGGAATATAAAGTATATATATTTTTGATCAGGATCAAG:1 - chrX 22516273 5' + INE-1 83 1 82.19 ATTTTTGCACACCAGATGAAATTTCAATATTAAAGCCGCTGGGTCTGGGCACAGCAAGCAGTCACCGAATCCGGCATATGTTCAATATTTGCATAAATATTTTAATATGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAG:1 + chr3L 15413832 5' + Rt1b 5050 1 76.64 CTCTCCTTTTTTATGGATCTCTAACATGCGAACTATATGAACTTTTACACTGCAAAACAGGGTGTGTGTTTAAGTTTAGGTTTTGCTTATGGTCATATGAGAAAGGTTTTCGAACAACTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGA:1 + chr3L 520419 5' + 1360 149 1 73.97 TACAGAACAACTGTCGTTTTCAATCAATTCCTTACAAACAAGCAAATAGTAATTATTTCAACAATCGCTCAATGAGTTTATCACATTTAGTGCTGTAAGTTCCTTTTATACATTATTAAGTGCATCAGAATATGACTGATCACTTT:1 - 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chr3R 13437294 5' + hopper 7 2 80.00 ATAAAATAAACAAATTTTTAAAAAAAAACCTCGCCACAAGTGGAAGCATTCAAAGAATTAACCATCCTACCAGGACTTGACTGTTGTGAACCCCTAGATATAATAAAATCTGTAGTAGGCTAGAGGTACATATACATA:1 + chr2R 4025267 5' + invader2 4865 2 70.29 GGTTAACAAAAGACTGCAAAACAGTAGAGGAATTGGAGAAGGCTCTAGGGCAGCCTTCCATTGTGGGAGTGACCTGTCTGGGATGTGGACACGATTTTCTTGGCTATTACACAGTGTTTTAAGCCAGATTCAATATAGCCTTTG:1 + chrX 10012866 5' - Tc3 482 1 63.19 ATGGGAAATGAAATCTGCTTTGAAGTGTCAGTGTGAAGTTGGCATAATTAAAGCAAACACAAGATCCCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGGAGGAGAGGCGG:1 - chr3L 1923861 5' - Doc 436 1 63.48 TAGTTAACATTACCAAAGTTGTCGTCCTTTAGAATTATTGGATTATATTTTCCTAGTCGTGTTTGAATTCATATGCCTTTAGTTTATTTTGTTGTTTCAGTTCAGACGCTTCAAATGATTATGACGCCACCGATGCGTACGTTTTT:1 - chr3L 26695592 5' - 3S18 6027 2 52.74 ACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 19436093 5' - roo 353 2 55.48 TGAGCCATCAAAAGCAGGGATATATACTATATATAAAAGGAGGCTTCAGTTTGCAATTTCTCAACTGTACACTGCGGCCCCCTAAATTCCTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATATTAATA:1 + chr3R 25804087 5' + mdg1 37 2 59.59 TCTCGATTTCATTTTTGTTATGGCTCCTTAATATTTTTTGTTTTTTCCTTTTTTT:1 + chr2L 9844386 5' - Doc2-element 236 3 74.55 GTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCAATACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATCTCTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATTTTGGCCAGAAAACGTGGT:2 - chrX 22906774 5' - Transib-N1_DM 17 1 67.81 CCAGCGCTTCCTGTAGTTTTAAAAAGCTTGTTAAACTGTTGCCAGCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:1 + chr3R 7585744 5' + Doc 86 1 69.18 AAATAAGCTTAGGGACCAACAGTCTAGACAGCTGCATTAGTTTCGGCCGACTTTGGTGGCCAATTAATTAGGTCGAGAGCAGCAGGAGCCAGATTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCT:1 - chr2R 19217343 5' - roo 9022 2 68.42 ACAGAATCAGTTTATTGCATTACGCCATCCGCCTCGCGGCCCAATAATATATGCCCAAAAACATATACATACATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGATGACTAAGGA:1 - chr3R 9300864 5' - 297 358 2 58.90 GTCAGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGCTTTT:1 + chr3L 23146447 5' + 1360 37 1 60.27 CAGCATTTGGCCGGATGTGCTGCACGCGCGGCGACTAATCTACATTTATTTATGGATCCTGGAACTCGGAGGAGCAACAAAATTCAGAGCGAAAGAGCCACATAGGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chrX 388382 5' - 1360 3377 1 78.77 ATAACAATCGACGTCTCTTGTCTCTACATATCTACTTACCTATGATCTCTAATAAGCAGACAAACAAGAAAATAAACAACAAATTTCAAGTTTACACATTTTTGAGAGTGTCAAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAACCTAAGT:1 - chrX 22575603 5' - S-element 1486 1 55.48 TCGGTCACCGTGTGGGTCACAGTCCGTTTGCATATGTGGTGACGCAGGGTGTGCTGGTGTGCATACTTGTGTGTGTGCTGCGGGGATGTATGCGGGTGGATGAGTGGCTGGGTTAAAGCAAACTTAAAACAAAAAAAAA:1 + chr2L 16991687 5' + TAHRE 10439 1 68.35 GGGCAAAGTGCAGCCCCAAAAAATCACATATGTGGTATATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTA:1 + chr3R 15152634 5' + opus 7082 2 75.34 TCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATTTTACTTCCCTCCCTTTAAAAGGGAAGCTTAT:1 - chr2R 6271501 5' - rover 6926 1 79.26 AATCTTTCAGCTGCTTTCCATCTGCATGATTTACATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCATAATGAAAATAAATTGTATTTTCAACTTAACTACATATTATGAAAGAGCATCATTAGGGACACCAAAACGATATTTAAAAACATT:1 - chr3R 4563854 5' + transib3 105 1 56.85 GGTGTATTTGCAAATTTTGGATTATTCATCGTGGTGTTTGGTTTGGCTTGGCTTGGCTTGGATACACCATCAACAGCCTTACTTGATGAGGAAAAACAAAGCGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCG:1 + chr2R 20191589 5' - 1360 3353 1 40.31 CTCGTGCTCCAGCTCTTGGCGAAAATGGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGACTCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAAT:1 - chr2L 13105970 5' + Doc 266 1 78.52 GCTGGGAAGCTGTGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAAAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATA:2 - chr3R 7616865 5' + Stalker2 7268 2 71.92 AAACGTTACAACTTAAACCGTCAAGATTAAAACGATACATAATTCAGTTCGATTCAATGAAATCGATTTATAAGCAATATTTTGAAGGTGACTGTGACATTTTAATTGACTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 14375568 5' - roo 401 1 75.52 GTTTTGTAAGCAGTCAAGCATTTACATACCATTAGACGAGTCAAAAGGAAAATGGGAGTGGTGCGGTGCGGTGCGGTGTGGCTGACAGGCGCTGGCGCTTGAGCGAGGCATGTCTGTTATGCGTAA:1 - chr3L 13661541 5' - invader1 322 2 69.05 AATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAATAATG:2 - chr2L 23034061 5' - FB 365 1 50.68 TATTGAACTCGATTGCCTTTTGTTATTAATGCGAGTCATCATCGCATAAATCTGCAAGGCGGTCATAATTGCAATTATTCATTAATGAAATATTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3L 21910332 5' - pogo 2075 1 71.23 AAAAAAAGGCTAAGCTAGAAACTGGACTTAGTTACCATTTTAAACTAATTTACCACAAACACGATATTATCCTTCATGGTTAAAACTAATACACATGTGCACATAGTCTAAGCATCGTTGTTCACGCCAGAAGGCCGCAAACAGT:1 - chr2L 19140494 5' + Max-element 6 2 77.93 TGCAAATTTTCACTTGACTTAATAGGGTAAATGGATTATCTCAATCGATGTGAATCCAGTGTGATGCTAATCAATATTGCATTTCATGATTTTGCGGTTCTTTATGCTCGTTCCTTTACACTAGGCGGCGACACATACA:1 + chr3L 6995782 5' + TART-A 96 2 50.36 AAGTTGGCGAGGGTACCTCAAGTCGACACACACTTTTTTAAAGTGACACAACTCTTTTGACGGACAAGCTGCAAACTGATATATGCATTTTATTAGTTCAAGTATTTT:1 + chr3R 30255562 5' - G7 1162 1 51.85 GTCTCTTCGGCACTGTGTCTCCTCTCATTGTCAGTGCAGTGTGTATTTATGTATGTGTGCCGATATGCGTACACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 + chr3R 1267668 5' + P-element 50 1 54.11 TTATAAAGGGGTATTCGAACGAAAATGCAAATCGATACCAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATT:1 - chr3L 7801352 5' + Transpac 5031 2 74.45 GTAATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 + chr3L 13678892 5' + hobo 72 1 67.81 ATCGAACAGCCCATTTCCATCTTGTAATACCCGTTACTTGTCGAGTGAAAGGGTATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chr3L 22885025 5' + P-element 44 1 47.15 CAGTGCAATAGCACCTACATCAGCGACGACATGGATGAGGCCTCCGAGTCGGATGACGACGATTTCGAGGAAGAGGATGAAATATCGAAAGAATTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTG:1 + chr3R 31373981 5' + I-element 319 1 60.74 GTAATCTATGCATATTTGTTTTAATTAAACGATATTTTCGCAATTGTCGCACGGATCGATTCATTTGCGGGCAGCGCAAAAATACCTTAAAGCGGCATTAATTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr2R 22463295 5' - roo 406 1 64.62 TAACTATTTTGTGATTCTGTAAAATATCACCTTAAAAGGATAATATGCAATATAATAAAATTATACCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 19864045 5' - roo 354 2 58.90 AAAACGTACGAAAACACCAATTAAATCAATATGTATTATATTGTATGTAACTAAATATATGAAAGACTATTGATCGATATGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCAC:1 + chrX 14836152 5' - invader4 307 2 68.80 ATAAAACAAAAAACTGAAAAAATAACAAAAAAAAAGAATGGCTGAAGAAAAATATCCACAAGTTTTGTCGGCCTGACTTTTACTCAAGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCC:1 + chr3R 23168883 5' + jockey 197 1 57.53 GATATCGTTTTTGGTCATTATTTGTGTAAAAAGTGTCCCATTACCACTTTGATGATTTTAAAACTATTCAAATGTTGTTTTATAACTATATAGACATATTACCTTAAGGTGAAATCTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr2R 10160450 5' - hobo 2934 1 69.18 GGCGCAATTATTTATACATGCCTCATAAAAATCGCAAGACAATGGGACCCCGGCCTGGGACCCTGACCAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGCCAACGCCA:1 + chr3L 14302143 5' - 297 6931 2 54.86 GTTATTTTTAATCACACGACATTCACGCAATTTTCTGGCGCCTAGTTTTGCAACGCATATAATATCTATATAATATATTTAAATAAATAATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr2L 1091074 5' - 412 462 2 57.53 GGTCGTGGCAACTTTTCTCCTTAGACGAAAGCAAAGACTTTTCACAGAAACCGGTTTCCATCGATCAATAGATAGACGGTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chrX 4673583 5' - roo 9031 1 57.24 ATTCCAGAGGCACTTGGACGGCTGCTTCTTCTACCTAGGCGCGACATAGAAAAATCTTAATTAGTTAATTAAAACAACAATCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACG:1 - chr2R 16715785 5' + roo 9042 1 54.79 GTGTTCGCTTATTGACATTTCTAGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr3R 16276310 5' + pogo 43 1 55.86 CCTCATAAGTGAGGAATAATTGTTTAAGCTGCCTGAAAAACCTAACTCAAATTTTTAAAATAAAGAAAAATAAAAGCCTTTTAGAAATAACATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - chr2L 11012289 5' + jockey 4699 1 61.38 GAGAGACTTGCATTGTTAGTCCCTTCTATGTATATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAAT:1 - chr3L 14302262 5' + Quasimodo 74 2 80.14 GTGTGACCCTCGATGGGACGGATGAGCAGGGTGGATACTGAGGTGGATCGGGTGGGATGGTGATGTAGATAGATACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTGGC:1 + chr3R 7567384 5' + accord 7170 2 51.37 ACAGCGGAAGAGGGGACCTCGGAAGTGGTTGGCAAAAAAGTATAAAGAAATGAAAGAAATAAGCGTTATTATCGTTATTACGTGAGCAAAATAAAGTTCGTTTTGGACACTCATAAAATAAAGAGCCATCGCTCATTAA:1 + chr3R 11911381 5' + gypsy3 6726 2 68.35 CGACTGCGAAAAGGCAAATATTTAATAGTTTTAATAAAAAACGGTGAGAGTTGCATGCTGGAAAACCTTTGCCAGCAGCTTAACCCTTGATCCGTAATTAACCCATTAGGGTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:2 - chr2L 14239289 5' - 412 482 2 76.03 ATATTTAATAGTTTTAATAAAAAACGGTGAGAGTTGCATGCTGGAAAACCTTTGCCAGCAGCTTAACCCTTGATCCGTAATTAACCCATTAGGGTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr2L 14239272 5' - 412 7518 2 65.75 GCGAGAAAAAGAAACGAAATTATACGCGACCAACAAAAAAGACATAGAGCGAAAGTTTAAATACATAGATGAAAATGTACGGGCATACAATAGCATAATCCGCACAAAATCGGTTGT:1 - chr2L 9060318 5' + F-element 48 1 82.91 ATGTTGATAAGTTCCGACGACGAACGGAACTGAACTCTCTGCGCTGCCGAAGACTCGCACTCACACAATCGTCCATTAAGCCTACCATCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chr3L 9469119 5' - hopper 1379 1 60.96 GAACGCTAGCCCGAAACCGAAACCGAGACCCACATCCTTAGCCCGTATCCAAAGCCCAAGGGTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:2 - chr3L 19580986 5' + roo 8724 2 60.27 GGCAAAATAGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chr2L 12291908 5' + Tirant 8139 2 73.49 ATGGCTAGCAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGC:1 - chr3R 25804205 5' - mdg1 351 2 63.70 AGCCCACCGATTTCTCAGTCCGACTGTAGGACCCATTTCAGTGTAATTCCTATTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGG:1 + chrX 182894 5' - I-element 4880 1 63.45 TTTGGTCACACAACCAGTTTTAGTGTGACCATCCCATTCATCCTTTTTTGAGTTTATCTAAGTTTGAACTCCAATCGCTCCACCCCATCGTTCCCATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGA:1 + chr3R 22180217 5' + Tirant 222 2 64.38 CTCTTAACGCTACCCTGATAAGCGTTTGAACACCTTAACCCATAAATATTTGACAGGGCACAGTTTATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 + chr3L 12835988 5' - 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Stalker2 380 2 75.34 CTGACATCAAATAATCATGAAGGTGTCAGCTTTGACTACATTTAGAAACTGTAATTGTTTTAAAAAATGTGACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAGTCTGTTTATTCGAATGAT:1 + chr3R 14911956 5' - Stalker4 335 4 64.38 GGTGATTTTTGTTGCTGTTTGTGTTTTTATTATCGCTCAACATTAAGCGGAAATGCAGTCGCTGCTGCCATTTCTCGATAACTGCCGCCATTGTTGTAAATTCCTGTGCGTGTATATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 - chrX 12273218 5' + jockey 4676 1 78.77 ATGTTGACCGCAACTGTACATATATATTAAACATGAATCCATATCATGCTATAAATATTAATGGAATGGAAATCCCAAGCTATTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGA:1 + chr4 1026007 5' + F-element 108 1 56.16 GTTTAATTCTTAAAAGTTGCCGCAATCAGAACACATTTTGTTGATTTTACACATTTGATTTATTTAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCTTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGCAATATTGCG:1 - chrX 14836283 5' + invader4 53 2 53.42 ATTTAACAAAGAAATTTACTCGAAATATAGTTAATCCCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTG:1 + chr3L 17537762 5' + Doc 91 1 73.97 TAAGGGGCAGCGAAAAGCGAATTGCCGTTGAGTGGTCTAATTGGACACCTTGCGTATGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAG:1 + chr2R 18689146 5' - Burdock 6327 2 64.38 GACAATAATAAAATGTTAAAAACGAATACGCATGCATCGCTTATATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGG:1 + chrX 21385136 5' - jockey 4568 1 69.86 CGAAAGATTGGAGACTGATTGCTAATTTAACTGATATGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chrX 4400376 5' + roo 8748 2 77.40 TTTGTAAAGCCCCACTTATTCACGTTGAATACAAATTAATTATAATTTTGTTAATTTATGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1 + chr3L 17667554 5' + F-element 69 1 56.94 GTGGAAATTTCAATTAAATGCGCACATGCCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAA:1 + chr2L 19310287 5' + Juan 4097 1 58.22 AGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCGGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGG:1 + chr3L 25272527 5' + 1360 86 1 48.28 CAGTCGCAGCATTTCGACCCACATAACAAACTTGGCTTAGATAGGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGTGTAC:3 - 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Transpac 5170 2 73.45 GGCGGACAACAAAACATTTATCCATCTCTAACAAGAAAGAATGAATCTATAGCCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCTGCTACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAG:1 - chr2R 5439227 5' - INE-1 502 1 60.80 CCATCTTTAGCAAAAACTTAGCAGAAGCGATCGAAAATAGTCGAGTGATAGAATCAACTATCATCATACTTATAAGTATTATAAAGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTA:1 - chr3R 13118010 5' - Quasimodo 107 2 62.33 GCCTTTAAGTATTTTAGTTCTTATGGTTGAGCTGTCATAGAGGTTAGGCAAAAGTATATTTAACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAA:1 - chr3R 14954060 5' + jockey 4823 1 59.59 GTATTTGGCTTTCTGATAAATGAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAGGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTGTTGAGTCTGAGT:1 - chr2L 16857898 5' - P-element 2795 1 18.71 AACAAAGGCACCAGCACGTGCCGCCCAATTATCAGCCACTCGAGTTGAGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTT:1 + chr3L 1856699 5' + Transpac 71 2 65.75 CGTGTCCTTTAGTGTAAGTTGATAGAATTTGGGATCAATAGCATGTTTCCGATCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGA:1 + chr3L 6095475 5' + transib2 66 1 63.70 ATTGCGTGCCCGAAAAAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGGGCTGCAGTGATGCCAAATTTATGGAATCAGTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr2L 12325004 5' + jockey 4713 1 53.24 GGAATACATATATTAGATAGAATTGGTAGAATTTGGCCAGAAAATTAGGAAAAAGCATTAATAGCATTTCAATATTGCACTGCACTGTCACTTGAATCTAAGTCCAAATATTCCAGATCATAAAGTTCACGACGTTCATACGGACA:1 - 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chr3R 26170256 5' - 1360 3092 1 54.11 GAGTGATTTTAAAAATCATTTGTCCTTTGATAGGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGAGTA:1 - chr2L 21910207 5' + Doc 86 1 79.86 GCAACTCTGGCCTTGCACTACTCCCTGCCCCGAAAGTGCATACGATTGTGTCGCTGACTGTACATACCACACAGAGATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:3 - chr3L 21910491 5' + pogo 41 1 58.22 AGCAGCTTTCTGGGGGCTTATCTTATCAGCAGACTAATTGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 - chr3L 10528448 5' + FB 28 1 56.38 GATTCACCAAGTAAGTCGTCTCTTTACAGCGTGGGTTGTCAACTTTGCACAAAAATCGTTTAGCGAACTGGGACTGCAGCAATTAAAGGCGAAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGC:1 - chr3R 7083899 5' + Quasimodo 7072 2 66.19 CTATTGGTGTTTGGTTGTAGCCAAGATAATACATTCGACTTTCGCACAAAATGAAACGGCCTTGAAATTGCAAGTACTAACCCTATCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr3R 6413520 5' - 1360 3361 1 65.49 GGTGCGGTGCGGCCGGTACGGTGATATGATGGAATGGATTACTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATA:1 + chr3R 5773159 5' + Stalker 6929 4 69.86 AGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAAC:1 + chr3R 13225500 5' + hobo 79 1 71.23 ATCTGATTGTCAGAGTTCAAATAGCAATTGAAATAAACGTCCCAAGAGCGTTAATTGCTTCATTAACGCGCAAATTACCATACAAATGAAGGCATGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTAA:1 - chr2L 16397204 5' - INE-1 164 1 62.33 GTTTCGGGTTGTTTACAAATTCCTCCAAATGTATTTTGCTTTGTCCCATTACTAATCAACAAAATATTTCCATTTGCTATGTGCTCACCAAGCCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:2 - chr2R 11256291 5' - roo 9044 1 65.07 AAATTATAATTGTTCAACCCTTCTGTTTGTTTAGGGTACAGTTGTACCTATTTATAAACAGTAAATTCTCGAGTTTTCAAAAAGGTTGCCCGAGCTGGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGACACC:1 - chr2L 19160479 5' + 3S18 5785 2 71.63 GTTACTGCCGACTCTAAAATGTCATTATAATAATTGATTTAACATTTAAGGGTGTTCTCTTTTTTTGATACTGGTTACTGGGAGCGCACAAGTCGTTAAGAAAGGGGAAAAGGCACAAAGGTCGCGGACAGACCAAATATCACCCT:1 + chr2R 17032114 5' + Rt1b 205 1 57.53 ATACTCGAGAGGGGCGCTTGGCGAAAGGGGGCGGGGCTGAGTAGGGAAGAAGCTGAGACAAACTTCAATCAAGCACATAACGGGCATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCGAAAGCCGACTACAC:1 - chrX 9916146 5' + Doc3-element 4560 1 60.99 TACCAGGGAAGCACAAGCAAACAAGGCTTATGTTAGGTTATAGACACCCCCAAACATAATGATAGTAATGGTAAACGCAGCATTATGAGTTTAATAGATAAATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 + chr3R 7823256 5' + flea 4775 2 71.92 TTCGGATTCAAAAAGATCGAGCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAAACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAAC:1 - chr3R 25337246 5' + Doc 451 1 76.77 AAATGGAAAAAATACCGACTTGTTTCAAAAATGTAGTTGTAACAGTTTTGTGCATTAGCGATTGCATAGCAACGTTCTCAAACAATTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTTTT:1 - chr2R 6647630 5' - Chimpo 148 1 58.90 GGCCTATCAAAATATTCCGTGCCTAACAAGAAATCGCAATCAATTACCCAGTTCTGACTCCCTACCGCGATAAGGAAATTCTGGAACCAACAAATAGTTTTGGGATATCCGACAATTTAGAGATTCCTCTGTAATTGCT:1 + chr3R 18727424 5' - Q-element 103 2 65.47 ATTTACAGACTTACAATGGTTTCGTTTTTTATTTCCTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTA:1 + chr3R 25277629 5' + 3S18 5851 2 73.29 CGGACAATCGATTGTAGAATCACTCAAGGACATTGGATAAGCATCCTTTTTCGCAGAAGATTGCAAACAATGTGCTAAGTTATAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTCTATAAAGGGAGGGGTAGTGTATCTACCCTCACT:1 + chr2L 2805487 5' + Stalker2 7248 1 54.48 ATAATTGTCTTGTGCAACTTCTGTCGGGGCCCACGTGGATTTGACCCACCAAAAAGGATACCAGGTGGTGCCACCTGCTGCCACCCAACAAAATGTGTTGGTAATGCGTGTAGAGTTAAGAACTACGCATAATTCTGATTT:1 - chr2R 19581339 5' + invader1 3874 2 62.41 AGAAGTTGAAGCTTACCATTGGCGAGGGATTCGACTATATGAAGAAACACATGTTTGTATTTATGTTGATAATTA:1 + chr3R 9632649 5' - 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hopper2 1520 1 76.03 TTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGC:1 + chr2L 13629080 5' + Tirant 8186 2 71.92 ATGTATATGATGTATTTTAGATTTTAGATGTGTATTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTT:1 - chr2R 1000455 5' + HMS-Beagle2 13 2 78.08 AGGTGCCGGCAATTACGTGTCGCGTGCCGGAAGAAGCACGTTGTTGCATCCTCATAGTGAATAATGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 25862118 5' - roo 353 2 56.16 GATTCCATTGTTTTGTCTTTACTTCTTGCTTTGACAGCTGACAAACTGTGCGTGTGTTTTGGTATTTATTTTTGCTTTTGGTTCTCCTGGCGTTTTTTTTTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCT:1 + chr3R 26122443 5' + roo 437 1 39.73 CGTTGAAATTTTATGCAAACCTCAACAAATTGTCATTAAAAGCGGCAACACATACACACAAGCAAACAGGACTTGGCCATAAACAGAGCCGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 + chr3R 27505418 5' - copia 223 1 61.64 GTTCATACGGACAGACGGAAATGGCTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3L 23871827 5' - 412 419 2 82.26 ATGTGATTTGGTTAATTGGAAAATATTTGGTCTTAACCATCATGATTAGGCGGCCATTGAGAAAGTTTCACAATCCACTTGGTTTCGGTGTGAAACCGTAGCTTGACTAACAAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 - chr2L 5792139 5' + blood 10 2 78.77 ACTGTTAAACCGCTCAGTAACGAAGGACACCAGACGATCATTGCTGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2L 17380633 5' - hobo 2909 1 53.47 AGAAGTTCAGGGAATTCCAAGTCAAAGAAAAGTGAACTTGAATTCAGAAAAAGTTGTTAATTAAATATGTACATAGTATTAACTGTTTTTAATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 7870314 5' + roo 8686 2 65.47 CAGGAATAATTATATTCCAATTTAACTAGCGATAATAAACACAATTTTCACTTTGGGTCGCAACACTGGTTGACATTTCTAGTTTTCACACGTCGCAAGCTGAATACTCTAATCACAATTATTCTAATATAAAGTCATTTTTTAAA:1 + chr2L 7124321 5' - 1360 379 1 50.68 GTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGCCTTATGTATGAGCGTTAGATCGTATTAC:1 - chrY 3648876 5' - Stalker 152 4 76.71 AATCTTCAATTTATGCCTAATCATCTTTGACAAAGAGTATGCCTGGTTTACCTTTTTATCCGTAAGCACTTGCCATCAATTTTGCACCAACTCTCGCCCCAAAATCTCCCAACTCTTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3L 19031171 5' - roo 402 1 80.14 ACGGGATGCTCAATGGGGGCCTCAATGGAATGCAGCAACAGATTCAGAATGGCCACATCTACATCTACTTCCC:1 - chr2R 6123166 5' + gypsy5 5 2 73.97 AATAAGTGTATTTGATTGCAGTGCAAGTCAATAGGTTCTTATTAGCTTATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCG:1 + chrX 14137216 5' - 3S18 6036 2 67.14 GAATGTTATGTAGGACCGGTGGGTGCTGCTGGAGAAGCTGCGCTGGTGTCCTCCACTGCAACAGGATAAGAGCAATCTGAGTGTCACGATCAATTTTGCTGCCGCAATGTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCC:1 - chr2R 6669363 5' + G2 2953 1 76.03 GCCGCGTGTGATAAGATAACCGCGTTACCCGAAACAAGTGCAGCGACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAA:1 + chr3L 13952787 5' + I-element 5177 1 69.18 GCGTCCAGCGTTAGATGTGATTCACGTTTGTTACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 - chr2L 23049732 5' - opus 7437 2 67.12 AATGGCCAACTATTAAACTAATCGCTTTTGTTGCTCAGCGACTGGCAATTATCCTGCGCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCA:1 - chr3L 10112278 5' + I-element 64 1 58.90 CGCAATTCGCCCATCCCATCACGCATACGCCATGTATGGCCGCCTTTAAAACGGATTAAACCGGGGGACTTAACCAGGCAGCATAATTAAAAAACTTAAAGCAAGTGCACCACACTGTGGGATGATCAATTTTCTTTAAGAAAATA:1 + chr3L 15063164 5' - transib2 74 1 82.19 GAGCTTAGCGATCGATCCTATCCTTATGATCTCATATATCAATACCAAGAAGGCTGAAGTTACTAAATACAATAGAAGCGTTTATTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTA:1 - chr3R 18153680 5' - copia 219 2 61.64 GGGTTTGTTTGTATTTGGTGTGCGTGAAATGGGTTGAATGGAGAGGAGCTATTGAAGTGTTTAGGGAAGGGTATAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3L 15364921 5' - 1360 3341 1 50.00 AATCAAACAGCTGGTGTGCAGGAACGACAAACCGCAGAAACTATGTATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCT:1 + chr3R 9125629 5' + Doc 29 1 68.61 CCAACCACAACACACATGAATATGCGGATGGGATGGCACCCATGTGCATATGGTTATATATCTACATATATGTCCGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chrX 16117145 5' + opus 152 4 54.79 ATGCTGCATGGGTATAGCGAAGTACGGTAGTAAAATGTTGCTTCCTCCTAGCACTTCGCACTTTTTCTACGCTTTATATACGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 + chr3R 27809992 5' - Burdock 6354 2 60.27 ACGATATTATTTTCTTTCTCCTTCGCCGCGGCTCTCTCTTTGACTCTCTCTGCCTCTATAGCTCACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGATTG:1 - chr2R 8666124 5' + P-element 57 1 46.58 CTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGAC:1 + chr2R 12065609 5' + Stalker2 7336 2 77.24 ATATACCCTATGAAACCCAGTTCTTAATCATACTAGTTCTAATAGTTAATTAGTCGACATTCTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr2L 2494787 5' + Doc 18 1 70.07 ATGGAGTTCGTGTGCAATCTCGGGTGATATTTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3R 5422923 5' - roo 8982 2 78.77 GTCCTGGACCCTTTGTCCTTCGCCTTCTGTATGGTTTTTCGATGATGGAATCACAAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 + chr3R 20203605 5' - 412 7484 2 58.22 TATTCACTGGCACATTAAAAATTTGTATAACAAAAACAAAAAAGAAGGCTAAACACAGCTCTGGAGAGCTTGGATTTATATAGATTTTTAAACACGTTATCACGGCACCATATTTGAAATCGATCTAGATCGGATTGTAAGTCTAA:1 + chr2R 19568808 5' - Q-element 628 1 58.22 AAGTTGAATTTTTATTGAGCAAATTCACGAGTCCCCTTAAATATTTCAACACGAAGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTA:1 - chrX 15559574 5' - hopper 1357 1 63.57 ACTTTCACTTTGGCCAGCCAGCATTTTCGAGCTGCATCATCGGTAGTTGCGAAGGGGATGGCCTTCGATGTCAGCACATAATAGTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAAC:1 - chr3R 5773262 5' - Stalker4 7325 2 58.22 ATTTGCGGCATAAAAAGATCATAAAAAGAAGTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGTGTGTGTTTAACACAATTTGCTGCTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr3R 19171549 5' - opus 478 2 62.60 AATTGGTGTTGGTTAAAACACAGTGCTCGCTAAATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTG:2 + chr3R 25050011 5' - P-element 2804 1 28.77 ACCACTAATTAGAAATTCTTTCGTGCGCAATTAAGGCAGCCAATACGGCCGGTATTGCTGATATACATACATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr2L 974001 5' + pogo 49 1 54.79 AGCGCTTATGTTTATGTCCTTTTGAAGTGGTTGCGGAATACATTAGTATATGCTATATATAAAGGTTCCGAATCGCCCATTCCACTTACCAACTCAACGTGCCGACTTCTATGACTTTAGGGAAAAAATAAAATAAAATAAAATAT:1 + chr2L 2330568 5' - transib1 1898 1 73.97 ATTGTACTCTGGGTTGATCACACTTACTTGGCTAGATCGAACAAAAAACGCAAATAACATTTAAATTCTTCGCTTGGTTTACATAAACATCCGCTGCCGAATCCGTTATTCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTAGGCAGCTCAAGT:1 - chr3L 3288908 5' + Quasimodo 6955 2 52.74 GTTGTCCAATAATTGCTCGAAATTAACATGGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTTTTATCTAA:1 - chrX 16994562 5' + roo 90 2 80.82 AGGTATTTCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGA:1 - chrX 20880668 5' + invader4 68 2 67.81 AATGAGTTATTGTACGAGCATCTGCGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1 + chr3L 3453633 5' + Tirant 8170 2 77.19 GATTGGGTGGCAGTTGGCCAACAAACTGCGACCTTGGCGTTTAACCGGTAACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr2L 18522245 5' + roo 69 2 65.07 AAGCAGTAAGCTAATTCACGAGCAACTAGCGCAAACGAAACGTGGCAAAAACGAGTGTGTTTTCGAATACTTTTATAGAATTTTTTTCATGTTTTGCTTATTTTTTGAATTTGCCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTC:1 - chr2L 21400816 5' - Doc3-element 4675 1 42.47 CACATTTGTATGCAATGCCACGCACACACAAAACAGAACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAA:1 - chr3R 19436120 5' - roo 380 2 65.07 AATAATTAGACATGGTGATTAAATAGTGCAAGCGGGATAACTAATAAGGGCACGCAAAAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACAT:1 - chr2L 25557 5' + Stalker4 7111 6 62.33 CCACAAAAAATGTATTTATAATTAGGCCGGGTAACTATTTGCACTTCTACTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAACATGCTGACCAAAG:1 + chrX 8967391 5' + HMS-Beagle2 6949 2 63.19 GTCGTCATTGGCTGCTTCCGTTGCAGAGTTGCGTTGGCTTTACACAACCTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 21013865 5' + roo 10 2 55.00 AAGTGACACAAATTGAAGACATTTCGGACAAGTGTTGCGGTTGTAATACTTTTGAAGATACTTAGGAATTCTGTCAAAAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGT:1 - chr3R 25045850 5' - mdg1 440 1 56.52 CTCATCAATGAAAGCCTTTCATTGGGCCTTTTTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCCTCTGATTTTACAGTTTTTAATATATTTGGACTTAGGCTACTCCGCGTAGC:1 + chr3L 24088991 5' - 412 7376 2 73.79 GCTTTACGGAGCTTTAAATGAAAAAGATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGGTATTAGCTCAAAAAACTGGCTTCGGAAAAATCAAATTTGTGAAATTTTAATGCTGAAATCGTTTGCCCACCAATTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTT:1 - chr2L 22989092 5' + FB 97 1 88.36 GTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTAT:1 + chr3L 7837171 5' + jockey 4830 1 60.27 GGCCTTTTTTTATTTCTGCTTTTTTTCGGCAGTCAATGTGTAATAAATTATTTTTTATTCGCCCCTTTGCGTCTATTTCCATGTTTGATACTCGGTTTGGCGTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 - chr3R 24564883 5' - opus 497 2 80.60 AGCAGCAGCAGCAGCAACTGCGTTAATAATACGGCTGTCTGGCTGGAGAACCAAAACCAGACTCACAGTCATATTCTCATTTCAATTGCGAGCCAAAGCTTTAAATAATATAATTTTAATTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 18058267 5' - transib2 2645 1 57.14 ATGTCAAATTGCTCGAGTGGCTGCCTATTACTTCCCTGATATCAACATCATCGAAAACATTTGGGGACTCTTGTTAAGGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCA:1 - chr2L 23170705 5' + 1360 3366 1 56.85 GACAATGTCCATGGCCTTCACCCACATCACTGGTTGTACAAAGTATCTAAAGAAGAACAAGTAAAGGTGGAGTCAGGTTAGCACATATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGAGCAGAAG:1 - chr3R 16997489 5' + G6 12 1 72.73 CTGTTAAGCCATATGCGAGTTAACAGTTCTAGTTTCGATCAGCTGTTTGGGGTAATCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAC:1 - chr3L 16417188 5' - 1360 26 1 65.07 AGATGGGCGGAAATGGTTAGGCTGTGGGTGGTGTGTGGTGGGTGGCAGGGGAAGCTGTCAGACAAGCTGCCTTCAGCAAAACACTTCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCAT:1 + chr3L 7837141 5' + jockey 4800 1 55.48 CAGCGACAACAAACTGTTAACAACTATTTTTATATTATTATTATAAGCTATTGACTGACCTATTTCGATGTTATAATGTCCACTTCTTTGGAAAGGATTTAGAAAAGAGGTTAATTACAAAATAAATAAATAATAAAAATAAAATA:1 + chr2R 19452026 5' + Doc 4687 2 69.18 AATGCGGCCACAGGCGAGAGCTGAGGTTTGAGCTGCTTGGCTGCGATGGAATTGGATTTGCCCTTTGTGCGAGTGTGTCAATATGTCAGTCAACTCTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 + chr3R 31140915 5' - Burdock 237 2 72.34 GAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGTTATGATGTGTAAATGTATGAAGATTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCA:1 + chr3L 18183105 5' - Tirant 317 2 73.29 CAGTTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTTGTTTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGG:1 - chr2L 15825508 5' + P-element 74 1 28.57 GACTAGGACAGATCGGAAAACGTTTCGTTCCTGTTGATCGCCAAATTAACTCCCGTATGTTGGCGGGGCAAGAACTCTACGACTGTATGCTCAGGTGGTCGTAAAAAGGC:1 + chr3R 3389522 5' + Rt1a 4829 1 54.55 GGGAGCGCCACTGTTAAACCGCTCAGTAACGAAGGACACCAGACGATCATTGCTGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2L 17380624 5' - hobo 2911 1 52.78 AGAGCAGGCCAGGGTGTTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 - chr2L 12291900 5' + Tirant 30 2 80.82 GAAGCTGTGCTAACAAGATTCGACATTTGAACGAGAGTAATCCATCAGCTAACGTTGAGTACAAGAATGGATTAAGAAGAAATGTGTGTGTGTATAGTATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAA:1 - chr3R 7616860 5' + Stalker2 25 2 67.12 ATAATTATAAATAGTAAAACAATATATGGAATTGTAAAAGAAAAGGATAAAATGGAATGGAATACGAAAATAATAAAGTCCTTTGCTTATGCCCAGAATATATGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGACAAGG:1 + chr3R 18888021 5' + copia 420 1 63.70 TTTTTATAGCAATCCGTTAGACGATAGTCCAGATACATAGATACATTTCTCCACCCAATCAGCAGACAAAAGTTATGCAATCCCAGATGCTTCGTAATTGAGGTCAGTAGATTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chr2R 11261831 5' + opus 30 4 72.41 CCTTGGCTCTTCTCAGTCCGCTCTTCGTTTTCTTATTTTCATTCTGTGCAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAA:1 - chr2R 18344846 5' - 1360 145 1 66.44 CGAAATAAATAAAGGAAAACAAAGATTAACGACCCAGTAAGTTGCAGGTGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCATCAGGAGTGGCATCCAGTACACG:1 - chr3R 21395222 5' + G2 476 1 64.49 TCATATTGGAATATTTTATTAGGCTTAAAACAACAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAA:2 + chr3L 12223157 5' + Transpac 5005 2 78.08 ACCACGCCTACACTCCCACCCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chrX 21667966 5' - opus 7476 2 64.44 CAAGAAATTTTGATAGCTCGGATTTGATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAGATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 + chr2R 15070081 5' - 412 424 2 63.70 AAAAGAAGAACTTTTAAAGTTCAGCTCGCAAAACGAAGTCAAATTGTTTGAATATAGATGGATAAAATATCTTTTAACATTGCTCGATAAAATACTATATTTTTATTTATGTTCTTATATTAAACAGTATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 15754645 5' + accord2 345 1 64.29 GCTTTCTGCTGCCTACTTTCCGGGGCTGTCGAGCTTTTATTTCATTGCAGTTGGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr3L 15723946 5' + jockey 4710 1 56.41 CTAATCAACACTGTAAAAAAAACCACCGGCTTTAAACAAGGACCAATGTTAAAGCTAGATTATTGAGGTCTTGAAATATTGTATGTACATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATA:2 - chr2L 21976818 5' + Idefix 24 2 43.84 ACATCCTTTTACCTTCGGCTGCGTTTTGCTACGTTAAGAATCCAGCTCTAGATACCGAAAACAGCGCTCTCCTATCTCCCAAAGTCATTTACCACAGCAACTTAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGG:1 + chr4 588772 5' - HMS-Beagle2 155 2 71.23 ACACATAAGTGTAACTGATTCAGTTTTACGACAAACTCAAATTGAGAGCCATTGGAACCACTTAAAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 - chr3R 18205723 5' + 412 7108 2 55.48 CGAACATTCGCTTTGATGTCATAATGGCCACCGATGAGGAGTGACCTCTTTGGGGGGTCCTAAGCTGCCGTCTTTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr2R 9340103 5' + 412 44 2 52.08 AGTTCCCCAACCTTTTGCACTTTGCTGTCAGCAGTTTGCACGATTTCCATACAAGCGGGTTGCCAGGCTCATAATGAAACACTTTATCATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr3L 10469643 5' - roo 9041 1 64.14 GGGTATTCGAACGAAAATGCAAATCGATACCAATTAGATTGGCAAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTT:1 - chr3L 7801344 5' + Transpac 129 2 64.38 ACTTTCGTCTGAATAACATTTGGTTAGGACGGCATCAAGTTGGCCTTTATTTATTTAATGCCCAGCACAGTGGGTTAAAACTGGATGTAACCAAGAATGAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3R 18528415 5' + roo 15 2 69.93 AAATAAAGCGTTTTGGAAGGTATTAGCTGAAGTCGAATTCATGCCCGAAAATGATAATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATC:1 - chr3L 7801301 5' + Transpac 5090 2 60.00 AATCGTTTTTGTGTTCGTGTGTACTCCTCGCTCTTTTTTCAAGACCTTCTGACGTCAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:1 - chr3R 25050087 5' + P-element 61 1 43.84 TGCACACAGCTGCCAGATTCAGACAATGCGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGT:1 - chr2L 21643096 5' + Tabor 6921 2 78.36 GAAAAACTTGGCAAGTGAACGATGTCAGTCAGTGGCGTTCAGAATTCAGTAAGCCCAAAAAGGTTCGCTGCTGATTGACCATAAACCCAGTTTATATTTGCTGCTGCTAGTCCATATGTGTGTGTGTGTGTGTTT:1 + chr3R 14209901 5' - accord 7029 2 81.48 GTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGAT:1 - chr3R 10736129 5' + McClintock 6013 2 64.38 GCAGTATGTAGGCCACAGCCTCGAAGATCAGGGACACGATGAACAGCCGCTTGCTGCTGCACCGATCTGCCAGATACGGTAGCCATCGCTTTTTGTTTGCGTTTTTTTCTTTATTTTTT:1 - chr3R 12979021 5' + Tc3 73 1 63.87 AATTTTAAAGGTTAACCCTTTTCGCTTCACTTTTATGGAAGAACCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 + chr2R 19843322 5' + jockey 68 1 64.06 CAATAAAGTAACCATAATTTGGATCATTAAAATGCACACATTTCGCGCTACGTGAGACAACCGAAACCCAAAAAAATCTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGTCAATTTT:1 - chr3R 14001994 5' - 1360 3344 1 60.96 CGGGCAATTCATTTTTAACGGTTCGCCATGCACTTTAGAGCTGTGAATCGGTGAATATTTTGCCACCCAAATCGAGTCCCAAATCCACACAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 19031356 5' + roo 8686 2 66.91 AATTTTTAAATTTTCTCTTATTTTATTATCCCCAATATATATATATATATCCCAGAAGAAATTATGGAACTTTGCCTTAACATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACTATAACATTCTCTCTTTT:1 + chrX 21452476 5' + INE-1 579 1 73.29 TAAGTACATATGTATATGCGTTAAGGGAAATTTATAGAAACAACGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTAT:2 + chr3L 7870159 5' - roo 370 1 58.22 GAAACTGTTTCACAGCGAATTTCCAGCTACACGGGTTTTTTTGTAAGAACCTTTTAATTTACCCATATCTTTTAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATT:1 + chrX 600512 5' + I-element 243 1 50.00 GGCAAAGGCATACTATATATCCATATCTATATCTATACAGCACACAAAACATGACGAGCAGGGGAAAAACAACGACGTCAAAGCCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chr2R 15528427 5' + 1360 36 1 60.27 AAAATATTACAAACAGCAACCAGACCCAGTCGCATACAAAACTTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAA:1 - chr2L 5646957 5' + jockey 4629 1 68.12 AATTGTGTAATTAGTTTACAGGAACACTAAGGAGGTTCTGTATAAATGTTGACATCGCATAACCTCAACTTTGCCGCACTTTTGTGCATACAGCTTAAATCCAAATGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTATGCACCTTGTTATTCT:1 + chr3R 7223678 5' - 1360 11 1 70.55 ATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 - chr2L 19310402 5' - Juan 4161 1 53.42 TATTTGCCGTACTAGGCTTTCGTTTTTGGCTTCTGTATGGCAAAAGTAGATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATATGCGC:1 + chr3L 12874879 5' + jockey 80 1 65.07 AAGCTTTCGTTGCTGACGATTTTACCTCGTGTTCGCTTATTGACATTTCTAGGTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr3R 16276282 5' + pogo 16 1 74.66 GTTCTTGTTGGGCCGAAGTCTTCCTGTGTCTGTGTATCTCTGTTTTTGTTTTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chr3R 16276334 5' - pogo 2036 1 64.34 CTATTATTGTTTCGTTTGATATTCTAAAAATAAAGTGTCGCCAGTTTGTCCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr2L 9275003 5' + F-element 86 1 68.49 ATAAATAAAGTACTTAAACATCAATCATCGCTTCATATTCAAAAAATGTTTCTAAAGTCGAAAGACATATCGATTATCTTTTTTTCTAGTTTTCACACGTCGCAAGCTGAATACTCTAATCACAATTATTCTAATATAAAGTCATT:1 - chr3L 18673474 5' - 1360 386 1 53.42 GCCGCCAAAATGCTTGTAATAAAGACAAACAGTTTGGCAATGGCCAAGTAAAAAGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr2L 13629067 5' + Tirant 8122 2 64.21 GTATGCGGCGAAAATTGAGCAATGAAAAATGCATAGGGCATAAAGCACGAACTAATGCCTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr2R 7232650 5' + jockey 74 1 58.90 GGAACCACTGTCTTTGTGCTCGATCCCGCCGAGGCTAGATGTGAGTTTAGCCGCTGAAAGTCTGGGTTATTTATGTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTG:1 - chr3R 10172804 5' - McClintock 52 2 59.52 AGACAACTGCATATTGGCCAAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAA:1 - chr3R 16240964 5' + Tirant 8166 2 77.98 AATTAAGCACATATGTATATGCGTTAAGGGAAATTTATAGAAACAACGTGATTTTCAAATATTTTTTTAAAATTATTTACAAACAATATTGTAAAATCCCAAAAAAGAAGACTATACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAAACTGATTT:1 + chr3L 7870156 5' - roo 373 1 58.90 ATGCGTGTTTTTATGACTTTCGCGCGGCACAAACTTTACAGTAAAACCACCACATCGAGTTATTGTTTTGTATAATGATCGTAGAGTAGTGGGTAAAAGTAAAACAAAAAGGGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:2 + chr3R 24603012 5' + I-element 12 1 77.40 CGCAGAGGGGCACCTTGCACCTGCGCACTGTGGACGAACTAAACCTGATGAATCGCACCGAGGTGGAGCACTTAATCGTGCCCAATCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr3L 363423 5' + blood 35 2 60.27 CAGAGAAACAGATGGACCTCATCCCTACATTGGCGGCATTGGCATGCGCCATGAATGAAATCGATCGGTGAGCGGGGAGAGCGAAGAGAGCGCCCCCAAAAGAGATGCTATTTCTTTTTCCTTTTTTTTGTTGTT:1 + chr2L 8433613 5' - Doc2-element 229 1 80.00 GGAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3L 2330161 5' - roo 8987 2 74.66 GCCTTGTTACGTTTGATTAAATCGGTTGTTGTTAGAGTACTTATTTAAAATTTTTTCCTAAACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCG:1 - chr2R 21848778 5' - Transpac 5171 2 57.53 ACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAGATCTTATGTAAATGAATTG:1 - chr2L 12486396 5' + roo 54 2 72.73 GAGAAAGTTATCCGACAGATGACTCAGTGAAGCAGCCACATCACGTGATATCATGTCACGTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 - chr3L 1856784 5' - Transpac 5186 2 52.31 GCTCTTAACGCTACCCTGATAAGCGTTTGAACACCTTAACCCATAAATATTTGACAGGGCACAGTTTATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGTCGG:1 + chr3L 12835987 5' - 1360 3334 1 56.16 CTGTTAAATAATAAATATGACTTGGTTGCCATGAGGCACTACAAGATGCTTTGGATTATGGGAACATTTCCTGAAATGAGTAAAGAAACTATTGAAGATAATCAGCTAATTAATCCTAAGACCAAAAATTAAAAAGAAAAAAACAA:1 - chrX 4202403 5' + Doc 4698 2 79.45 AACAGCGACATGCCCAGAATTGCGTAGATAAAGGTGATCAGTCCTAGCAGAGCTCCGATGTTAAATAGGGCGGGCAGGGACACTACGAGAGCGCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTG:1 - chr2R 24914167 5' + I-element 445 1 63.70 ATACGTAGTGTAATTTATGTATATGGAGGGGTGGTGACTGGAGTCTTGAAAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAG:1 + chr3R 10437012 5' - BS 5068 1 66.90 CGGTTTGCCGAGCAACGTTTTGCGGCATTCAGACATTCAAATGCAGAGTGACTACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr3L 7460621 5' + 412 7121 2 65.07 GGCGAGGGATTTCAAGAACAAGTTCAAGAATTTATGTTATTGTGGAAGCACTGAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chr3L 12223229 5' - Transpac 5163 2 63.01 CAGAGCGAAAATCTGAGAGAATTAGGTCATTAGGCAGCGTACTCTTAAGATTGATTCCACATGTGCATATGTAATTTTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCA:1 + chr3R 20124058 5' + 1731 4428 1 63.01 CACTGTTCCTTTCAAACACGCCAGGTCCTTGTCGGCTCCTCCGAAAGGCGACCTGTCAACTGAAACGTGTAACGAAATGAAAGACTAAAGTAGCTATACTTGAGGGTGCACGCTTTAGAGACCGG:1 - chr3L 24248159 5' - gypsy12 10146 2 56.00 ATGTCAGCTGCCTATAAATAACCCCAGCCTGACATCAAATAATCATGAAGGTGTCAGCTTTGACTACATTTAGAATCTGTAATTGTTTTAAAAAATGTGACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGC:1 + chr3R 14911928 5' - Stalker4 363 4 51.37 CCACTCGCTTTTAGTTGCTCAGCATTTGAAGCTGGTTAAATACATATGTATGTACATACATTGTTCATATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACA:1 + chrX 887281 5' + Quasimodo 44 2 56.83 GCATCGATTTTAAACTGTTGACTGGCCGAACTTTGGCAGTTGGGAAAAGTTTTTTCATTTGCGCGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - 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chr2L 14293044 5' + hopper 1207 1 80.14 TATGAGGATGTTGATAAGTTCCGACGACGAACGGAACTGAACTCTCTGCGCTGCCGAAGACTCGCACTCACACAATCGTCCATTAAGCCTACCATCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAA:1 + chr3L 9469112 5' - hopper 1386 1 65.75 TAAAGAACAATAGAAAACACTCGATAAATGGGAACAGATAGAAATTCTTTCGAACAAAAAATGCCCATGAGTGCGACGCGAGTTTGCTTGGAAAGTTTTCATACACTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr3R 8849908 5' + 297 11 2 78.47 ATGTAATGGTAGTAAATAAAAAATTGCAGAAGGCTTTAAATGTATATACATCTATATATGTAGAAAAGTCCATGTACCTTTTGTCGCAGATGGTATATACTTTATATATATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAAT:1 - chr3R 6171274 5' - rover 335 2 77.40 GGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTACGTGTGTATGTATTGTATATGTGTTTATATAATTACAACTTCGCGGGTTGTTGGTT:1 + chr3R 22496254 5' - Quasimodo 7362 2 50.00 TGTGAACTTTAATTGATAGCAATAATGAAGAAAAATTGCAGAATTAGCCAACACTGGGACTTTCCCTGTTTTTCATTTTGTTATAAAAAAAAAAACAAAAAATT:1 - chr2R 21472864 5' + gypsy11 3931 2 43.27 AGTAAGGGGTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGAT:1 - chr2L 23034078 5' - FB 382 1 41.10 CAAACGAAAAACAAGAGAAAATGATATAGTCGAGTTCCTTATTTTTAAGGCATATTGATAGAAATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATA:1 + chr2R 25106965 5' - roo 289 2 56.85 GAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 24673659 5' - roo 9051 2 63.39 GGTGCCAGTGGTGGCTTTTCCCAAATGGCAAGCTGAAAGCTGAACTTCCATTTAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 - chr2R 19852240 5' - Transpac 5165 2 63.45 ATCGTGCTGCTCTTGGAGGCTTCGAGCTCGTTTAGCGCTCATTTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr2L 11405847 5' + 412 41 2 60.00 CTTTAAAGAAATTTGGATACTTTAGAGCTACCAATATTTTCAGCATTAAGTCACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 - chr3L 21665315 5' + 1360 69 1 65.75 TACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGATTCTGACCATATTAAGTATATATACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 - 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chrX 13139134 5' - Doc2-element 4698 1 52.41 AAATCTTGAGAAAAGGTATTTTAAATGAGCTTTTGTTCGCAAACAACTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAAC:1 + chr3R 10437061 5' - BS 5020 1 66.67 TTTAGATGTGTATTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGG:1 - chr2R 1000433 5' + HMS-Beagle2 6918 2 63.70 GACTGTACATAAGTAAGATAAGTAAAGTCGCCATCTACCACTGAAAAACTTTCTATGAATGCACCAATAATATACATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 + chr3R 7481488 5' - invader4 301 2 63.11 AATACTGCCTACGGGCTATGGGGCATAAGGATGACATGGATAGTACCGATAGTACCGCACTCAGCTTGAACCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTG:1 + chr3R 4256997 5' + 17.6 7267 2 50.34 GCCAATCGTGTGTTCCGAGCACTACTCACCCATTCCGTCCCATCGCATCCCATCTCGGCCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTC:1 - chr2R 9340219 5' - 412 7485 2 57.53 CTCATGTATTAAATTTTCAAAACTACTTTATGCAGAATGTTGCATATTTTGATCTGAGCTTGATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 + chr3R 2649168 5' + 412 61 2 58.90 CTCACTGCGCACATATTAGTGCAACGTCATTCTGAAAATAAATATTGATTCCACGAGGCGAGGTTTCATATGTTAGATCAGCTTTTTGTTCAAGCAAAATTGGCGCGAAGCTTTTACTCAACTTTGTGATTCTGTTAAAAATACAC:1 - chr3R 20565344 5' + transib3 223 1 50.68 GCGTAATGTTCTATGTATCGTTATGCGAGTTTGCCATTAAAAGGACCTCCATCGATGTAAAATTTCTCCCAATGCAGACCATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGAAACGTACATACATTGT:1 + chr2R 12065563 5' + Stalker2 43 2 57.53 AAATCAATTTTACATAACTGCCGAAGATAATGGCTTCGATAGAATATTCCCCCCCCTCCCCCACTCCATAACTAGATATAAATGTATCTAAACGTACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1 + chr3R 25713981 5' - flea 4991 2 65.75 TTTACATGTCAATGGATTTTGTTTGATGATTAGTTGGGAGAGTGTAAAACAGCAGCTCATCAAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGT:1 + chr2L 19230910 5' + Stalker3T 55 1 56.85 GGAACTCACTGGACGCCTCTACGCTGCATGTCTAAGGCGGAGGTTGCCCGGAGAACTTGTAGTCGTATATATATAGATGTCTGACTATGTGATATTCTGCACCCCAAAAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCAT:1 - chrX 9125257 5' + HMS-Beagle 6730 1 73.97 AGTGTATATAGCTGGAAGACCCGAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr3R 16276460 5' - pogo 2085 1 68.46 GTTGGAAGCGGGAAATCGAGCTACGGGAAAATCAGCCCGAAGATCGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chrX 1103704 5' - pogo 2085 1 58.43 ATTTATTTTTGACACACTTAACCATTCGAGCATTAAAAGTTTGAAAGCCATGCTCTGCATAAATGTGTGCATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATT:1 - chr3R 25714136 5' + flea 4804 2 55.48 AGCGTGTCAACGCATAGTTTGACTAGCTTCAGTGACCTATTCCACAATGAACTATTTCGCGTCCAGCGTTAGATGTGATTCACGTTTGTTACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:2 - chr2L 23049790 5' - opus 7495 2 81.51 AGATTGTCGAAAATATAGTAATTGTGAATTAGCGTCGTCGTTCAACTTTTTTTTTGCCTATCGATAGGAAGTAGAAACAAATAACAAAAATAAATGGTGTTCAATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTAA:1 - chr3R 7178053 5' - HB 1401 1 62.94 AAAAGACAAAAAAAGATATCAAAATTATGCGCATAGACCAATAATTTATTTCAATTTTGCAGGACTTAGGCAGTCTAAAATTCTCCTCCGTGATCTCCTCATTGATCCTCCCTTCATGAGGTAGTACAATAGGTCCGACTGGGTCG:1 - chr3L 24299210 5' + baggins 5401 1 60.27 TTTGGTTGTAGCCAAGATAATACATTCGACTTTCGCACAAAATGAAACGGCCTTGAAATTGCAAGTACTAACCCTATCCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGG:1 + chr3R 6413529 5' + 1360 41 1 57.53 ATAGATAGACGACCCACCGATCTATTGTACATAAACAGAAGCATTAAAAGGAAGTCGCCTTAATCTGCCAAATTCATTCGAGGCCAAGTGTTCAATAATCTCGAAGGACGAAAATGTTCGCACTATAAACTTGTGCGTAGATTT:1 + chr2L 496210 5' - rooA 7592 2 66.67 CGTAGGAGGAATCTGCCAAGGGAGATAGATTATAGTAAGTATAGGAGTAACGAAGTAACTAAGATAGCCCACCTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGGAACA:1 - chr3L 6089780 5' - transib2 460 1 52.86 ATGATTCCGCTTTATTTCTTTATGACCGTGTGTGAGTTCTACTTGGAAATTCATATCTCTGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chrX 21403390 5' - roo 346 2 57.53 TTTCGAGACAGACCTGGGAAACCACCTACATATAGGATATACATATATAAAAGATCCTGTTCGGTTTGTATATATAATCTTTCTACATGGTTGGACTTTATTTTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 + chr2L 4876816 5' - 297 6962 2 76.03 GCGATGGTCAAATTGCCCTGTACTAGACTTATACTTATCCTTATCGGCTCTCGGCTTCATGCAGGGCGCCCGCATTACCTGCTAATCACAAACCACAAAAAGGGAAATAACGGGATTCCTG:1 - chr2R 7712655 5' + gypsy8 317 1 75.21 ACATTTTCTCGGTACGAGCAACATAATCGCAAAGTAAGTGAAATTTTTTCAGTTTGCCCAATTTGATTTGCGTCATTCCAAAGGTCGCTTTCTGCACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2L 14239102 5' + 412 24 2 68.97 CAATCAAGAGTTCGCTTTGGCCAGGCGAATTAGAATTGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGGTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCA:1 + chr3R 16240916 5' - Tirant 8424 2 72.60 AAATTCAATCATATTCCAATTAATTCATTTTCACATCAGCGGAAATAACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr3L 4641017 5' + jockey 82 1 68.49 GGAGTTGAGGGCTATCCGAGAGGCTTCTACATCTCTGGTGTGTTTTCTTTCTTGTCCCCCCCAGTTTATGTAGGTTTTCTTCCTACATTTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 + chr3L 19026797 5' + hopper 142 2 51.40 GACGTCGAGATGCATGTCCTCGAGGGCCGGAATCGGTGGGTTATATACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chr3R 19435995 5' + roo 8732 2 66.21 GGGGAGTGTGTTAACTATTAAGGCGGGTAAGGGGGAACTGCTAGAACTATATTCTAAAATGGGGTACTCCTGCACCAAATGAAAGTTATGTCGAATTTTATCCTTTCTAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 + chr3R 8017690 5' + mdg1 7052 2 76.55 GAGTCTTGTGTGGACTCGAGTCTTGTAAAATTGGGGACTGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATA:1 - chr3L 21013931 5' - roo 9010 2 68.50 TGGCAAAGTCAAGCGATCGCCCCGCATACCAATAAAGAGACCCCCTATTCGTATACGAATATGTACTCGTGTGTTTACGAGACGGCCGGCATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATGCACTTAACGTA:1 - 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chr2R 14908567 5' - X-element 4406 1 56.16 AATAGATTTTATGGTCAATACTTTGTCCACTCAACATTTTGAGACTTGTTTAATGGCTAAGTGAATGATTTGTGAGCAGCTAAATTGAAATGATTTTATTTTTATACCAGTTTATTAATCCGAATTGCAACATGTTCAAGCCACCA:1 - chr3R 21697245 5' + Ivk 4987 1 68.49 AACTTGTTTAACTATTTTCCTTCTGGGCTATTCTGTTTCGAAAATCCTTGTGAAATTCAAAGTTTCCGACTGATTATTATAAATACGTAGAACGTTAAATACTAGGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCA:1 - chr3R 25277747 5' - 3S18 6087 2 77.40 AACATTTAAATGAATTAGAAAATACCACTCCAGAACGAAACAGGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3L 8658734 5' - roo 8994 2 69.86 ATAGTCGACAAATGTAAAAATGCTCACAAAGAAACAACAACAAGCAGCGAAATCCCTGCGTAATAGACCACCAGTTGTACAGTTAGTTCACCTCTTTGTGCATGCACCGTTACCGCTCGACCTCT:1 + chrX 9957330 5' - gypsy8 134 2 53.60 TGATCGTAATATACAAAACGCATAAGATACTAAAGCTTATCTACTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACC:1 - chr3R 12363793 5' + jockey 4754 1 69.18 AATTATGTCCTGGACCCTTTGTCCTTCGCCTTCTGTATGGTTTTTCGATGATGGAATCACAAGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr3R 20203599 5' - 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Quasimodo 301 2 68.57 GTAAATTCTCGAGTTTTCAAAAAGGTTGCCCGAGCTGGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGT:1 - chr2L 19160419 5' + 3S18 85 2 72.60 TTTGCTTGTCTACATGGACACAGATAATTGACACTAACATAGACAGTACGACACCCTCACACATATGCACTGACCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chrX 17982750 5' + hobo 42 1 55.00 AGTTGGTGTGTTGGTGGTTGTGGAGCATTGATATACTGATACAGTGACCTGTGAACCGCTGACCATCGCACCACCGCCCCCCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 + chr2L 3960156 5' + jockey 6 1 80.19 GCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAGGTAGTTCAACTTCAGCCGGCTGCACTTAACTTATATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 24673675 5' - roo 9033 1 59.59 GTGAACATGGGGAATGCCGGCTATGCAACGCATGGCGTCTGTGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCG:1 + chr3L 7791909 5' - Transpac 5171 2 66.13 GCAGAAACTTTGATATATATTTTGTGCCATAAATCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 - 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transib2 2791 1 58.90 ATAAAGGTTAAAGTAGTAGCATGTGCATTTGCCAAATCCCATGCCCTACCCATAAGCTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1 + chr3L 15364810 5' + 1360 60 1 60.42 CACGTTTTCTGACGTGTCGTTCGCTCGCTGGCTGGCTCCACGTACATAAATGGCGACAAAAGTCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 + chr2R 6798219 5' + jockey 67 1 58.22 ATGAACAAGTTACAATTTGGGCGAGAGCTGGCCCAACCCTCACCCATGACAATCCCATCTCGGTCTCATCAATATGGAATTAGACCCCTTCTTATATATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr3R 28406308 5' - opus 7486 2 72.22 GTTTTTCGTTTTTTTCCCTGCTTTTCGCCCAGCTTATCTCTTTTGGCCCAAAAAGTCGCCAAATGAAATGAAATAAAGACAACTGCATATTGGCCAAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCT:1 - chr3R 16241040 5' + Tirant 8123 2 73.94 CCATGTTTATCAATATTGAAGAAGCTATCGGCAAAATAAATAAACCTACACACTGAACCAAGACAGATAATGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr2L 10514264 5' + 1360 53 1 55.48 AGGCTTCAGTTTGCAATTTCTCAACTGTACACTGCGGCCCCCTAAATTCCTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAAT:1 + chr3R 25804127 5' + mdg1 7113 2 65.28 CCATTCCAGTGGAACTCCAGCGGATGGGCACATGGTTTTTGTCCGCCACCAGCGACCAACTAACAGTCAGTTGTCTTCGCGACTTGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 24712716 5' + 1360 55 1 67.69 GAAGGTTGGTAAAAAGAAAAGTATTTATTTAAGAAGTGCAAGAAAATGGGTTCGAACAAGCAAACGATCGGAGGTAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 + chr2R 1320391 5' + Transpac 4963 2 55.48 ACATTTAAAGTACAAATTCTTGGCTCGACGACATATTTTAAACAACGGGAAGGGAGGTGGAAAAGATATGATTAGATGAAACATTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAATTTTAT:1 - 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chrX 12545903 5' - BS 5076 1 65.07 TTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr2R 18344622 5' + 1360 54 1 63.71 TGAGCTGCATTGTTTGCATTTCAAATTGAATTCCTTTACATTTTCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 - chrX 19788869 5' + hobo 77 1 71.92 ACCACCCACCGCATAGGCCGCAGAGTAACGGAGGTCAAAGGTTGAACTTGACGTGAGTTCGCCTTTCGCTTTTCAACGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2L 12486439 5' + roo 8709 2 51.37 ATAAAGATAAATTTATAGAGGTTTTAACAAGTTGTTTTCATCCCATTACTTATCATTCGTTTTTTTGTCTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 3238244 5' - roo 355 2 52.41 AGGCGGGATATAGGCACGTCTAGGTACATATACATATGTGTATATTTTCTATATATATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAG:1 + chr3L 16059242 5' - 297 6916 2 69.86 ATATATATATATATTTCTAATGAGTTTAAACAGCCGAGACGATTATAGTATTCCTTTCCCTACGCCAACAAATTGTTAAAATTTCCCTGTGATCTCCCACTAGTGTAGTATAGTCGGTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATT:2 + chr2L 1432067 5' + INE-1 570 1 71.23 CGCAAAAATATTTCCACCACGGCATAACTAAATGTGCCTGTGGGCTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - 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roo 393 1 73.97 GTGTTCGTGTGTACTCCTCGCTCTTTTTTCAAGACCTTCTGACGTCAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 - chr3R 25050077 5' + P-element 63 1 39.13 AATTAAAATAAATGTTATTTTCCCATGCTAAAGTGTTAGATAGAAAAAACTTATGTAAGCTTAAGAAATATAAAATAAAATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAAT:1 + chr3L 5132102 5' + rover 6989 2 60.27 AGCAGAATAGGACTCAACCTGGCACTGATATACACAAAGCACGTATGTGGAATGTTTCGGTTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCG:1 - chr2L 14952644 5' + invader4 2874 2 58.90 TGGAAGACCCGAAAATGCAGACAGCAAACATTGGGAAGACCCAATGGCAAACATATGCGCGTATGTATGTATAAAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr3R 16276448 5' - pogo 2060 1 55.24 AAGAAATCCGTAAAGTTTATTTATTATTATTTTCCATATTTTACTATAATTTTTGGATGCGTATTAACGATCGTACTACGTGCAAAAGTAAACAAATAATTTGGCG:1 - chr2L 15645111 5' - transib2 202 1 75.47 TTGTGCGAAAAGAATCCCACTGTCCACCGCCATGGTAGCCCCTATAGAAGCCCCAAGTCCCAGGTGTAACTGATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr2L 3231849 5' + roo 8710 2 52.74 GGATTTAGAGCGGGGATCTTCGTACGGTTCGGTTTTCTTTTTTGGTTACACTCTAGGCCCAATATTGTCCCGGGGTAAGGTTGCCGTCTCTTGTTGTTTGCATCCCTCGACTTCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCT:1 - chr2L 22128432 5' - I-element 317 1 55.00 CGAGAACCCCCAATTGGTGGCCCCGACTAAGGCACCTCCCCCCCCTCCCCCCCCCC:1 - chr2L 6817609 5' + accord2 225 1 66.07 CATACATTTGTGGACAAGAAAAATAATATGTTTTACATCACTGGCCGAGTCGACTTATTCATTTTTGTCCGTTATATATCCGTACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTGTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr2L 15081045 5' + Doc 36 1 59.12 GTCAGTGAATGAGTGCGCAATTTACTGATGAGTATGAGTCATTCGAAGAATCGCCAGAGAATCGATGTATCTATATGTATATATATACATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTC:2 + chr2R 7720659 5' + Bari1 29 1 63.70 AAACAGTAGACAGTGTGATTTTCGATATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTG:1 + chr2L 18112438 5' - transib2 2817 1 78.08 AAGACCAAAAAATAGCGCCTAACGATCTGCATGTTTCTGCATTCGTTTTACCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTG:1 + chr3R 7778258 5' - transib2 2768 1 66.17 ATTATAAATTTATTCCAAACAAAAAAAAACCGTTTATATCCATAGCATTAAATAATAAAAAATGTGTCAGAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAC:1 - 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chr3L 14141940 5' + F-element 412 1 72.07 CTTGCAATAAATACTATTTGTAAAGAACAAGTAATAATAAGTACTTATTGGATTACTATTCAATTATTCTTAACCATTTAATATATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGAT:1 - chr2L 13139110 5' - McClintock 447 2 64.14 CGTAGCTTTCAGCCAAGTCATGAGTGTAATCCAAGTCCAGTGGGTCTGGGAGGCTGTGAAGTGAGCACACTGCTCAGTTGGTCAAAACCAGGCACTGCTATTCTTATGAACAGCCTAAAAATTGCGATTTTGCTCAAGAATGCAAA:1 - chr3R 4186901 5' - HB 175 1 50.68 AGATGGCATATCCAGAGCCATTCCATTAAATATTCCCCCTCTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTCAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 + chr3R 6645337 5' + blood 7088 2 67.12 GAAGCGGAACGCACGGCAACAACTACAACGAGAAAACGAGCTGTTAAGCGCCACCCACAAGTGTGCGCAAAACACACAAAAATCAAAGGAAAAAAAGCACTCCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAA:1 + chrX 9305806 5' + P-element 19 1 70.55 AAATGGTTTAAAAATTTATAGTAATGCGCCTATGGCTAGGCAACACATTGCTGTTAGCAGATGGCACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3L 13678872 5' + hobo 25 1 61.34 GACCAATACAATCACTTCACCACTGAAATTAGAACAGAATTAGAACAGTTCGATCACTTTTCTATAAGGCCAAAACATATGCATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 + chr2R 5438190 5' - flea 214 2 57.93 TTAAAAGCGATTTAAAAATAGGAGGAAAAACCCGTGGCCCGATATGAAACTGAAACCTTCGCGTCCGTATACTGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTC:1 + chr3R 7616714 5' - Stalker2 368 2 56.59 CATGACATTTTTTCCTGTTTTTTGTAAGAGATAGGATAAGGATGTGTGGTCTGTTGAATGAAAAGTCAGTGAGGTTCTTAATATTTTATAGAGACAAAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2L 7652327 5' - roo 387 2 69.86 CAGTTCACTTAAACACGCATTCTAGTCCTGGAGAACAACCTTTAAATTTTGAAAAAGAATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3R 28450755 5' + roo 56 2 62.86 GTTTGATGGCTTTAATTGGCTTTGATTGCAAAATAACAAGTGCATAACAAAAGTGCCTTATAAATGCTCTAATAGCATTAAATCAGCTCATAAATAGAGTGCAGTGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr2R 13094596 5' + blood 16 2 52.05 GATTTGATTCCGTTTTGGTTACGTGACTGATGGGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 + chr2R 15070101 5' - 412 408 2 78.17 AGTGAAAAATTCTCAATGATGAAACAGGCGGAACTGATTTCGAAATGGGTCACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTT:1 + chr2L 13142346 5' - McClintock 6090 2 68.49 ATACTTGTTTAGAATTTCAATAATTAAAATGGGTTAAGGAGTAATGTTTCTGATTTAAGCTTAAATACACTGTTTTCATTAACAGAAAAAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 19691365 5' + roo 8695 2 62.33 GGCGAACAATAAGATTGAGATTCAGAAAATAAGCAATGCCATTTAAAAAAATATATATATAAATACATTTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3R 7507127 5' + Doc 40 1 53.38 ATGTAAATGAATTTCCTGTTGCATGTGGTGCCGATCCTGATGCGTTTGCCATACTATATGTCTACATACATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chr3R 18635195 5' - opus 447 2 56.85 ACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGA:1 - chr2R 5173243 5' - Stalker4 371 2 57.53 AGGGAAACAGTCACGCACAATGGCAAATAAGCACGCAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTT:1 - chr2R 9440336 5' - copia 26 2 75.17 GTCCGCACCTGGTTAGGCAGCTTTTGAGTCGCAGCAAAATGAATCGGTATAAAATTGACGATTTCATATGCATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGAT:1 - chr2R 5438319 5' + flea 46 2 53.57 GTGGAGCTGAATGCGAGACAATACAAAATGGTTCGGCCAAAAATTCTAAACAAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCCTTTTTTTTTCACATTCTTGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAA:1 - chrX 20975387 5' + copia 408 1 66.44 GATTGTTAATCGATAAGCGATTTGTTGCATAATAATTGATCTTAGCCTAAATACATAAGAAAGCTGTCGACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAA:1 - chrX 17477967 5' - blood 7222 2 73.96 CTGTCCACCGCCATGGTAGCCCCTATAGAAGCCCCAAGTCCCAGGTGTAACTGATAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 3231868 5' + roo 8712 2 58.14 AGCGGTAAGGTACTATATACTATAAACATACATATTATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 - chrX 8219445 5' + opus 7168 4 80.51 AATGCGCTCGGAAGTGAAGTTAAAGCACCAAGTGCATTTAATCCAGTCGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAAT:1 + chr2R 7599160 5' + diver 57 2 61.54 AAGAATATATATATTTTATACATTCGGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTGGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCC:1 - chr2L 9970926 5' - BS 4838 1 78.46 ATGCACATTTGGATGGAATACAATCCTGTTAATTATAATGAACAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATC:1 + chr2R 22746079 5' + jockey 4838 1 69.86 ATCCCGATATACCCTATGAAACCCAGTTCTTAATCATACTAGTTCTAATAGTTAATTAGTCGACATTCTGTACCAGCTACTAAATGACATCAGTATTAAGATATATCATTCGGCATTTCACAGACTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr2L 2494781 5' + Doc 16 1 72.34 AAGGATTTTCTTTAAATACAAGCAATTGATAGAAAATTTAGTTTCACTATCTACTACATGTAGCTCTTCTGAAAGAGTATCTCGAAAATATTCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAA:1 + chr2R 17397971 5' + Doc 293 1 68.49 CAGCATTCCATCCTTCTTATCTGTTCCCAAGAAGCTATCCTGAACCCTGATTTCTGGGGGGTTTTTAAGATATTAAAAGGGAGATTTCTAGTTCTTTTTGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTG:1 + chr3L 25255341 5' - Q-element 236 2 67.81 ACATTGGAAACAAGTTCAGCATTGTTCAGATCCGCTGTGGAGCAGGGAGCGAGGGAATGGCTTACCACCTTTCCACTGGGATAAATCTTGCGCAGCTTGGCAATCATTTTGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCCATATTAAGAA:1 + chr3R 23161212 5' + 412 8 2 78.62 GCCCCTTCTTTCATCTACAAAATGCCCAAAATGGTCACACCCACCCTTTTAAGCAATTTATAAATGTTTTACCGTTTTATTATTTTATCGATATCACAGAAGGATGATAACATTTCGCGTTCACATTTACACTAGCTGAGTAACGG:1 + chr2R 5789341 5' + INE-1 536 1 40.41 GCTATTCGCCGCTGTTGTTGCTGATGTTTTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 - chr2R 19198373 5' + FB 1 1 54.72 CTCCCCAACTTTGGTGTATTGATTTATTGGATCGCCTTGTTTGAGCCGATAATTCTCGTCTGTGTGCGAAGGGTAGAAATCAATTCAGCTGGCAGACAAAAAATAAAAATTGAAAATAATCTTCAAGCAGATGTCATCTAAACTG:1 + chr3L 19962963 5' + Q-element 295 2 78.62 CATCTGTTTGTTCGAGATAAATTCACATTATGGTTTTCCCAACGATCTGAATGCACAAACCATATCACCATATCAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTC:1 + chr3R 11151792 5' - mdg3 199 2 53.42 AATTTAATTTAATAATTTTCTTTTATTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGTTTCGCGGGTGATTCGCAGTGCTGTTTGGAGTTGTTTTTGTATGTACATAAACTGCACT:1 + chr2L 21362554 5' + Cr1a 265 1 80.82 GATAGAGATTCGCTAGTCAGAGAAAAGAGAGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:2 + chr3L 4651579 5' - roo 8997 2 71.22 CAATGCTTTATAATTTCGACTATATTTTTTTTTATAACTGCTGATAAAACTCTTTTAAATTAAGACTAACTTAAAACTAACATTGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGAAGGAGAGCGAGAGGAG:1 - chr2R 3090207 5' - Max-element 8344 2 62.33 AAGACTAGCCGCGTCGAGTCAAGTCTCTGTCTATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTNNAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTACATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chrX 4673678 5' + roo 8750 2 73.97 CAAGGAATGGCAAGTCGAATTGTTGGCAATTTGCATACATCATATGTTAACAGGGCTCACATATTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGG:1 - chr2L 1476282 5' - Doc 4504 1 54.01 TTATGGGTATTTAAATGTATATTTTGAAAACACTTCTTTATTTTCAGTTTAACTAAACTTTTAAATGCAACTTAGATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 4651676 5' + roo 8707 2 51.03 GTATTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCTACATCTTATATTTCACCATCATTTCTGGGTAAACACA:1 - chr2R 1000424 5' + HMS-Beagle2 6926 2 58.62 GCTTCCAGTCATGCGCTGGCTTCAGCTGCGAGTCCGAGTCTTGACTTTGGTCCCGAGGTCCCTGGGGTTCGATTAACGCTTTTTGTTGTTGGCCAAATGCCGACACCGCACGAAGCAGCGCCCGAATGTACTGGTGAGTG:1 + chr2L 11023881 5' - BS 93 1 52.14 GGAGAAGGATACGGACCGGGACAGTAAGCAAACGTGGCAGCCATAAAAATGTCGACAACATGCCGGGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chr2R 8688181 5' + F-element 33 1 60.53 CTTGTGTCTGTCTTTTTTTTCCGGTGCATATGTTGCGACCACTTCGCTTCTTAGGCGCAGTCGGTAGGATAATACATTGTTGATGCGATAGTAACCCTATTCAATTCTTCAATTATTATCCACAAAAGAACTAACGCAGTCGCGTC:1 - chrX 7859696 5' + rover 439 1 63.70 GCCTAAGGCCAAAATCTGTCTTAATATGTGCGATGTGTTGTCTGCGTTCTCTGACTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chr3L 5069497 5' + opus 41 4 56.00 TATGTACATATGTATATAGTACAAGATTTTTGGCACACACCAACCAAACGGCATTCCACAGTCTTCAGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr3R 9125674 5' + Doc 82 1 66.21 ATATAAAGGGAACATTCTGTAATCGTGGGCAATTGACAGATTCTGTCAATGACAGAAAATCAAGAAAAGTGGCTTTATATTCGCAGCTTAAAAATATTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGA:1 + chr3R 14844812 5' + Tirant 8294 2 71.92 CAGGAGTTCTTCTCCTGCTCGGTAAGAGGTGCATTACCACGAAGTTTGTTCTGGTACCTGAAAACGAAATATTTGCAGCACGTTACAGCATTCCAACAGGGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGA:1 + chr3L 19999127 5' + 1360 18 1 73.29 TGGTTAACTTTAAATCAGTTAACTATATATAACTTTCACGTTGCTGTTTTTGTTGCTGGCTGATGTCGCAGCTACAGCAGCGGCAACAACAACGCCAACAGCAATAGTAACAACAATAACAGCAACAACAACAATAATAATAATAA:1 - chr3R 5679024 5' + mdg1 7067 3 56.16 AAATGGAAGTGCAGAAACATCGATGTTATTGATCTTTCAAAGCCTTTCCCATTTCCGAGCGCACTTAAACTGCACTGTGCTCCCGCTCTCTCGCACTCTAGCGGTACATTTGACATCCCGATGCAAGTTTTGATTTTGTGTTTT:1 - chr2R 5179422 5' + Cr1a 384 1 65.97 GAAGGAAATAAAAAGTTTAAAATTGAATCCTCTCTTATCGAAATCCGTCCAATTTAAAATCAATTCATCAAAATAAAAAGTTACAATTGATTTTCGGTGGCTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGACTCGTAACGCCATACGAT:1 + chrX 388192 5' + 1360 19 1 73.29 ACACACGTTCTATATTTCCGTAGGCAAAGTCAATAACTAATTCGATTTGGCATGTTGCCTCACAAACGGAGAGATAGTGAATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr2R 21848650 5' + Transpac 4956 2 54.79 AACAGAACTCTGGCGTAATTTATTAGTAGCACCATGGGTACACATTCGTAGGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 19436084 5' - roo 355 2 58.52 TAAACATTGGTTGAAGAAATCGGCGATCTTCTTCGGGTGCATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAG:1 + chr2R 5083347 5' - mdg3 24 2 71.20 ACCCCATTTTCGACTGCAGCCCTTTCACTTGTCGCCCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACTCATTCGCAAGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3R 7885567 5' + jockey 12 1 76.85 AAGAGCACGTCTTAAGAGTTTTTATTCAAGCAAAAGACAATGATGCTTTTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAATGATACCACCTACAGTCCGTAGGTG:1 - chrX 12891536 5' - Rt1b 5092 1 57.98 AACCTTGGTCAACGTCTCGTGTTCCAGCGGCGACCCATTGTCCAACATGAACGTGCAGTTCGGATCCCCAGAGGATGGAGTCCGGGGAGCAAAAGTGTATTTTTTACGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTT:1 + chrX 19493030 5' - Gypsy6A_LTR 277 1 58.14 GGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCCTTGTTTACAGCC:1 + chr2L 21976791 3' - Idefix 51 2 60.27 GCACAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTATCGGTGTGATGG:1 - chr3R 24750964 3' - G6 65 1 61.43 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAGGCCATTCGTATGTATTTCTATGTTGGATCAGGGCCACGTTCCTATCTC:1 + chr3R 25862694 3' - roo 42 2 54.11 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATTTCATTAATGAATAATTGCAATTATGACCGCCTTGCAGATTTATGCGATGATGACTCGCATTAATAACAAAAGGCAATCGAGTTCAATAT:1 - chr3L 21910331 3' + pogo 2076 1 71.92 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGAGAAAAATATTCATAAAACACGGAAAGC:1 + chr2L 21910283 3' - Doc 17 1 72.60 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTTGCCTAGAGCA:1 + chr3R 14049467 3' + transib2 2798 1 66.44 ACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGGTT:1 - chr2L 12291840 3' + Tirant 336 2 61.64 CTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGGGGGGGGTAAGGACGAGTACGTCAGCTAAGCAGC:1 + chr3R 27383535 3' - accord 6938 2 76.47 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATC:1 - chrX 7706773 3' + P-element 2839 1 32.00 CTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGAGTACACGCATACTCATTATTTTCACCCCTCGTAACGGTCACACTTTTTATAAAGCGGGC:1 - chr3L 23696475 3' - micropia 5054 2 73.97 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATATTTGCCCACCTCGTATTACATAC:1 - chr3R 13437125 3' - hopper 20 1 58.52 ATAGCCGAGGCGATCTAGCCATGTCCATCTGTCCGCATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTACAAAAGCAAGAAGGTTGACGGAACTAATCTCCTCACACAATTGTTTCAGTGAAATCTATCGTATTTTTATTGGCATTACTTCTAA:1 + chr2L 7403243 3' + INE-1 103 1 54.11 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGTTTAGCAAAACTTGAAGTTGAATGTATAAATGTAATTTTCGTTATATTTATTTTGTGCATTTCCCTTCCCCACAAGTAATAATTAATTTGATCATG:1 + chr3R 6422954 3' - jockey 32 1 65.07 ACTCGACCATAGCGTTCTCTCTCTTGTATGGTTATCAGGTACCCCTTACTCAGCTAGTAAAAAAGCGAACGCGAACTTTAATCATTTTTCTGGGATATCGATAGATTTATAAGATGAGAAAAAATTTAAAAATGGTTTAAAA:1 - chr3L 14534776 3' + INE-1 576 1 54.93 ATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAATACGTTCGTTGAGATTCTGCGCCCTTACGAGTTCATCTGCTTGCTGTCTTCGGCCACTCAGTAGATTCTGAATACGAAAACCATTTA:1 - chr3R 21333397 3' + hopper 462 1 75.20 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATGTTATTTCTAAAAGGCTTTTATTTTTCTTTATTTTAAAAATTTGAGTTAGGTTTTTCAGGCAGCTTAAACAATTATTCCTCACTTATGAG:1 + chr2L 11012288 3' - jockey 4699 1 61.11 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTATGGCAGGCATTCACAGTTCCT:1 - chr2R 9870949 3' + roo 9038 1 62.33 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAAGC:1 + chr2L 17839469 3' + blood 7322 1 63.01 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTAATCTCTTAAGTTTAAAGATAATTACTTCTAGTTATATATCGGTTTAAAACTATGTTCCACAGTAGCTTTAACTGGGATGGCCATTGAAATTTAGCGTTTAGGCCAG:1 - chr3R 18528222 3' + roo 397 1 74.66 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACTGGCGCACCGCACTGCATTTAT:1 + chrX 16117288 3' + opus 466 2 59.56 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGAGGTACTGATATTAACTCATTTATTTTTCTCTAAACTTTCATTAATCTAAAGTCGGTAGCGTAATTTGTCTATTAGGATTTTAATGACAGCATTG:1 - chrX 8977414 3' - I-element 22 1 66.92 GAACAAGGAATAAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTAATTCGGCTTACAATATTATTGTCTGTATTATTCAATTGTACAGGGATTACAATTAAAATTGA:1 - chr2R 4369186 3' - diver2 4665 2 67.81 ATACCCCTCAACTTAAATCATTGTTTGTCTAACTGCATACATGTGTGCATGTATAAGTTAACAACAGAAACTTTTGTTACTCCTCTCGACAACACCTAAGGCCTAATGATCTGTGGGATACAGATCTTGTGTTGGGGAGGAGTTA:1 - chr3L 25511271 3' + Cr1a 4136 1 62.07 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAACCATCGCTGGCACAAGGACCCGCTCCCGTTT:1 + chr3R 14218498 3' + roo 9035 1 65.56 GGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATG:1 + chr3R 934284 3' + Rt1b 4741 1 56.55 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATATTTGCCCACC:1 - chr3R 13437138 3' - hopper 43 1 47.59 TTTTATATTTGATCATAGCAATCTGAGTCCCTAGGCCAATTGCATTAAGGAAGACAGTCATCTTCCCAACGTAATCATCGTAATTCTCCAAGTGGAGGCCATTGCTAGATGTCCGACAACAAA:1 - chr2R 5542960 3' + gypsy3 6775 2 76.42 TATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCTCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACAAATACACCATTGTAATAACAGCTCTTTTCAGTGCTTCTCAAACTGTAATCTCTATCCATATACAATTTGAAAACT:1 + chrX 1041885 3' + 1360 3159 1 55.48 GCACTGAGAGCGTCTCTTTCAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTATCAAGTTTTTTACCTACCAGTACAGCAATCACGACATCTACTGCAACTGCACCTTTAGCAAAGTTAACATGTTTCGTATATTCTATAATGTCCTTCCGACCA:1 - chr2L 16228187 3' + Doc3-element 429 1 71.92 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAGAAAGAAATATCCCAGGAATTATTTCATATAT:1 + chr3L 13364421 3' - hobo 32 1 64.38 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATTGTTATTTTAAGATCGAAAAGTTTCATTCTTTCCGCACTTG:1 + chr3L 18484511 3' - hopper 22 1 69.01 ATAAAATATTAAAAAAATAAAATATATCTATTTCAAATTTTATTTTGGTAATCCCCGTGACCAGTGTGCCTCACATATATTTAATTGCAATTGACACTGATTAGCATTTGCACGCCAATGCGGCGGGGCGTTAAGTAGCCGAAGGC:1 + chr3R 18503770 3' + BS4 731 1 81.51 GGGGAGAGATATTAAGATAATTTTCGCAATGGGGTTTATTTTTTGTGGCTTATAACTCCAGAACGGAAAAATATATTTAATTAACTAATTTTGTATAGGGATTTCCCTAATTCCCTATGCTTTTTCTAGTACAAGCTAAAAAAAAT:1 + chr2L 22107809 3' + Transib-N1_DM 53 1 47.95 CGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGATTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCGGTTGGGGTGTACGGCTTATTTTTGGCTGAGCAA:1 - chr2L 13842324 3' - jockey 4747 1 79.17 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTTTCCTTGATGCGCATTTGGCACAGCGCTGAAAAGCGTGCTACACTTTTTGAAATCCTCGGAAGAG:1 + chr3R 26846850 3' - hopper 54 1 54.79 TTTTACTTTTATACTTAATAATTTGTAACCCTTAAATTTATATGGTAACTTTGGAACTATTTGCCTGTAATACTTGCAAATAAATACTTCTTGGAACGATGACAGTCCAAATTCTTTTTATAGGTCATCGGCAAGTCACGTAAGCC:1 + chr3L 19014156 3' + G5 4723 1 66.44 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATGTTGCGGCTTGGCGAATTTTTATGGCACCTTGGAGATGGGAAC:1 + chr3L 22226094 3' - jockey 4806 1 66.96 AAAGGTCTTTATGTTTTTGCATTTAAAGTCAAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGATCACTGGTCGGCTGGAAAACGGAACGGAATCTAAGCCAAGGGCTTAGTCACGGCAAAACCGAAAAACCAAAACAAT:1 - chr3R 17360761 3' + S2 1659 1 52.05 GCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAATGATGCGAGCCCAAAAAGGGCCACATTACTCATACGTTATAAACACATTAAAGACGCCGACTCAA:1 - chr3R 13201087 3' + BS 4906 1 64.49 AACTGCGCAGATGGCATAAAGTATGAAAATCAATTAAGTGCCTTTGTTTGTTTAAAGTTATTCAAAATAATGAATTGGCCAGTGTGGGTGGCGCAAAAATACGTCACAGAGAGGTAAATTTGAGCAGATCCCAATTCCCATCCACT:1 + chr3R 15751378 3' - 17.6 137 2 68.49 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGATCGGAAACATGCTATTGATCCCAAATTCTATCAACTTACACTAAAGGACACGTAGAAGGTGGCTC:1 - chr3L 6095462 3' - transib2 53 1 54.79 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATATAGCCTTCAAGGACTCTGTGAATACATCAACCCCATGCTGCGATACTGGCATAGTATCTTTT:1 - chr2L 6177516 3' + pogo 2046 1 58.22 CTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAGTCGTTATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGATAAAACCCTATCAAAAAATAAGACAAGACGAAATTGATCGGTGACGGCTGAGTCAAAGCCACAATGCAAA:1 + chr3R 30697146 3' - 1360 53 1 76.71 TTTGTTTTTTCTTTTTTTTAATTGACCGATTCCCATGTCTCTTCTATCTTTATATAAATACAACAGAATTTAGAAGTAAAATCTATGAAGTATTTGATTACAAGTACCTTGCTCGTGGTAAAGGAAACAAAAACCATATGTACTTG:1 - chr2R 11133728 3' + hopper 152 2 45.89 ATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAAGTCAAAATTGTTGACAGCTTGAAAAAATG:1 + chr2R 10160981 3' - transib2 55 1 56.85 GTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTTCTCAAGATTTTCAAGACTCCAGTCACCACCCCTCCATATACATAA:1 - chr3R 10437026 3' + BS 5053 1 58.22 TAAGGCTGTGATAGCTAACAAAGGCAATCCAACCAAGTATTAGACACTTTGAAACATTTGTTGAATTTTTATTTAAATTTAATTTAAAATAAAAACCTAATTATTTTTGACCTATGTACAAAAAAAATTGGCCATTAACTGTACAT:1 - chr3L 23124885 3' + HB 1308 1 65.75 TTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGC:1 - chr3L 17667562 3' - F-element 79 1 63.01 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAA:1 - chr3L 19031223 3' + roo 9013 2 54.79 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCTAATCCAAATTT:1 + chr3L 16059343 3' - 297 6629 2 66.15 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTATTTAACATTTAACATTAGCATTTAAAAATGGAATAAATACTTACACATACATATTCTATACTTCGACTGTGCT:1 + chrX 3370155 3' + S-element 1674 1 56.85 GGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAACTAGCCGGCTGGCAGATGACAAAGTTCCCAGCTTGAGATAAAACGTATTCGAATGAACAATG:1 + chr2L 5890617 3' + invader3 263 2 71.13 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTTCAAAATGTCATTTATTCTGACTGCAGTAATTACAATTTGATGATAGGTCATTAGAACTGCGCGACTGAAAAGAATGCCGTGAAAGAGAAATGTCAGTGTTGCGGG:1 - chr3R 12379652 3' + roo 394 1 75.17 CGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTCCGATCATGAAATGAACGGTGAAA:1 + chr3R 12363810 3' - jockey 4737 1 57.53 AATTTGATCTGCATAAATTATTTAAGTTTTTCTCGGGGCCTTGACATCTTAGGGGGGAATCCTTTTCTCGAAAATCCTACGCCTCTTTCTCTGATTAATACTGTCACCTGCCACCAGAATGTTTCTATGCTTATGTAG:1 + chr3L 1179122 3' - jockey 4937 1 76.81 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAATCACA:1 + chr2L 23049717 3' - opus 154 4 62.14 GCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTATATAGGAATAAGTGTATAAGTTAAAAAGGCT:1 + chr2L 12357911 3' + R1A1-element 5193 1 76.32 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGACGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCC:1 - chr2R 11164427 3' + roo 324 2 76.03 CTCAACCTTCTAGCTTCTATAGTTACTGAGATCTCGACGTTCAAACAGACGGAGGAGAGAGATATAGACGAGCAAGCAGCAATAAGATTGATAAGGTGGGAGCACCTAAAAAACTATGACCTTTTACTAAATACAACATTT:1 + chr2R 5869243 3' - INE-1 161 1 64.54 GAACTCGACTTTAGCATTCTCTTTTGTTTAATCTTTGGTTTGTAAAATAAGTTCTAAGCTTTCTTAGTTTAAGTTATTTTCACTGATTGATGTAGGATTTATTAAGATCATTCGATAATATAGTTTTTCTTAACTCATTCAGTGCA:2 + chrX 22672497 3' + INE-1 574 1 48.63 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTCTA:1 - chr3L 17537737 3' - Doc 65 1 61.64 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGGGGGTGGTGAGTGTTAAACGCACAACAAGAAAAGCCATTTCAAC:1 + chr2L 12486475 3' - roo 8670 2 76.22 AGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAA:1 + chrX 2295236 3' - Transpac 65 2 64.38 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAAAAAAAAAAACTAGTTACGATGATAAAGCACAAAAAAGGAACTGCGGAAATTCTGCTGATGACGATAATGTTGACGCTGACTTCGAGGTGACTTCACCTTCGGCCCC:1 + chr2L 2707686 3' + jockey 4978 1 67.12 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTAAAGAAATCTATAGTTCTTGTTTCGCTGTATAACGCACTGCTGTTACCTGTCACCAACAC:1 - chr3R 6645269 3' - blood 9 2 79.45 TACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGCGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTG:1 + chr3R 10736115 3' - McClintock 54 2 68.00 TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTATCCAATTAAAAAAACAAAAAACAAAAAGGACCTG:1 - chr2L 21643019 3' + Tabor 433 2 50.68 AAAAATACTAATTATAAACTAATCCACCACGCCCAAGCCACAAACTCACACAAGTACACTAACACCTTGCTTATCAATGCAAAAGTACATTGACAACAACGAAAACACAGAAAACGAGCTCAATAATTTCGTCATCGAATCGGGTA:1 - chr3L 1569653 3' + HeT-A 5899 1 72.60 CTGTGTGTGTGTGTGTGTACATCTCTCTGATTTCTTTTTGTTGATTTTTATGTTAGCATACTCTTTTTTCCTCCTGGTCAGTATGTGTATGAAAAACAAGGCTCCCATATTTTTGTTGTTTTTCCTGCAGAGGTGATGTAATGGGT:1 - chr3R 11096911 3' - accord 7027 2 72.60 ATTCATTTTTCGGCGTCCACACATTGAATATTGATAGAAAGATAACCGATTAAAGTTTTCTGTTAGTTAGTGGAATTATTTCAAATTTATTTATTTCAAATTTACCGTGATAAAGAATCATTTTCCCAGTAAATTGCGAACTCATT:1 - chr2R 10735056 3' + invader3 278 1 74.66 CGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGGCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTG:1 + chr3R 15790074 3' - flea 4733 1 56.12 ACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAACGATTATGTAATTGTGAGCTTCAATGTCGCCGTGGTTTCCCCATCGCCTCC:1 + chr2R 21368701 3' + I-element 5203 1 65.07 TGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGCCAGTGGACAGGATAGCACCGGTTAAAACGTCAGCAGATATTTCATATTATATAAGAGGCTAAGAGGCAGCTTCTAGCCCGCAGACC:1 - chr3R 3697543 3' - Doc 256 1 76.71 CGTACCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCCTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAACTTTGAAATGGAGCTATACTGTTAATTACTGGTTTACTAATCCGACTATAACTAAGT:1 + chr3R 16400896 3' + 1360 3193 1 58.99 TGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCCCTTTGCTTTTAATAAACAATTTTTCGCTGTTTG:1 + chr2R 18014103 3' - Doc 93 1 75.34 GTACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATACAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGAATTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGT:1 + chrX 22945343 3' - BS 84 1 71.23 ACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTAATATCACCCGAGATTGCACACGAACTCCATCTAGCGGCAGCCGTAGATGTGCCCAAAACTTAACGGACGGACATTT:1 + chr3R 5422969 3' + roo 9039 1 58.52 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTTCCCGTTGTTTAAAATATGTCGTCGAGCCAAGAATTTGTA:1 + chr3L 2330198 3' + roo 360 2 52.05 GAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAACGCGGTTTTGTTGTAATTTGTAATTTGC:1 + chr3L 20555927 3' - 1360 463 1 57.53 ACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCCAATGTTTTAAGGGAAGGTCGTTAATGAATGAATGTCCAAAGGAATCTTCTCCGGAAAGAAACTCAAAAATTAGCAGCATCGAAAAAACATCTCATAGTTCTCTTAAGTTTAGTTCGAA:1 - chr3L 12776425 3' - Q-element 569 2 63.70 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATATAATAGTTCTGGCTTTATCCCAAACTCCTGGCTTG:1 + chr3R 28406435 3' - opus 59 4 72.80 GTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAAAAAGGCCCAATGAAAGGCTTTCATTGATGAGTACTTGCACCTGGGACATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGTAACT:1 - chr3L 24088923 3' + 412 387 2 68.28 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGCAAATGCCACCCATTTTATCGTTATTTACTTAGAGGATTTGGCTTTTGATACAACACATTTGTTGGATTGTTTTCTTCAC:1 - chr3R 13838161 3' - 297 14 2 75.17 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACTACATATATACATAGATAGATACTTTCGACTGAAATTCATGCTGGGCCTTTCGATTGCCGCACTTTAAGCTGAGTGCAAAAC:1 - chr3R 8849734 3' + 297 359 2 60.27 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGCTCGATGGAAACCGGTTTCTGTGAAAAGTCTTTGCTTTCGTC:1 - 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chr3R 10388308 3' - G5 4506 1 63.08 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTTC:1 - chr3L 9212712 3' - hobo 51 1 73.74 CAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATAGTTTGGTTAAGTCACTCTCGTCATACAACTGCACCTTGTCC:1 - chr3L 24150313 3' - gypsy 463 1 71.23 AGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGACCGACTAGAGAATAATAAACGAGTAATAGGATACAAAGGAAACAAATGATAGAAAAAAGAAACAAAAAATAATTGGTATTTTGTTT:1 - chrX 15203138 3' + 1731 75 2 64.83 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAGCATACATTATGCAACTCCAAATCTCCTCTAAGATCGATCGGAAATGGTTTTTAAGGGCATATAATCTTCGGTTTATTCTTTCGCGACTTTCGGAG:1 + chr3L 786008 3' + I-element 5331 1 68.28 AACTAGAGCACCGCATCCGGCCAAGTGCTGACTTCGCGTACAAAGTTGCACAGCAACATTGTCTGCAAGGGACTCGGTCAGCCGAATGCTGAAGCGGTGTACCAAAAATCTCAAAAAAAATCTTATCGTTTACTTTTTGCGTATTT:1 - chr2L 4120227 3' + Tirant 8180 2 69.86 CGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTACACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCA:1 + chr3L 15364892 3' + 1360 3314 1 70.83 TCACATCCTGCTCACCGCAGTCATACGTTGACTGGTGAGCAAGCAAGGACTGCAGAGCACACCGAGCTTTTTGTTTTAGTTCGTACGCATAATCCCAGTAGATCACTGGCAGATGTTTCGAGGCCACTTAATTTAGGCCATTGGAT:1 - chr2R 10242835 3' + Rt1b 4962 1 65.75 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTGAAAGAGAGTGTTTGCTTGGTGAGAGCGGCAAGCGTATAAAAGCAGCGTCGC:1 - chr2R 17097442 3' - P-element 9 2 72.88 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATC:1 - chr2L 19652545 3' + roo 8995 2 75.00 ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAATACTAGGTAGTTTGGCAACGCATAGCGATTCGATTAATGGGTTGGTTTCTATAATAAGA:1 + chr3R 9583372 3' + Juan 4150 1 58.22 GAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAAACTCCTAGAACTAACAAAAATTGCTGTTAATGGATGTAATGCCGCACAAAACGAAGAAAATATTAACCAGTTTAAGCAATT:1 + chr2L 5940060 3' + I-element 352 1 63.50 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATTAGATTAAATGACTTAATATTTTTTTATTCGCAGTTGAAACCTCTCTCACAAT:1 - chr3L 18253738 3' - blood 9 2 78.72 CAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATATTTTATTATTCCTGAATCTCTATTGTAAGGAACAGGACTCCAATTATCCCTTTGGCAAATTGAATTAGGCTGTCG:1 - 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Cr1a 4424 1 53.00 CCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAAAATTTTTTGATATTGATTTTTCTTTTTAATTATTAGCTCATCAGATTGCCGAGCTCGGTAGAGATTCAA:1 - chr3L 15346113 3' - Stalker4 6935 2 78.08 GTTTATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCGGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTTTAATGAGGCAGCCAGCTTAAAGCTGCGCCAT:1 - chrX 20359003 3' - Cr1a 413 1 78.08 CCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAACAGCAACAACTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAAGAAAAACAAAT:1 - chr3L 11099718 3' + HeT-A 5986 1 69.18 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAACGAGTCAGCTGTTCGCC:1 - chr3R 8217942 3' - P-element 79 1 31.51 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCA:1 - chr3L 7837169 3' - jockey 4828 1 58.90 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTTGTCT:1 + chr3R 14049461 3' + transib2 2818 1 74.17 CAAGAAATTGCAACAATACAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTCAGTAAAAATTCTGGAAATGATGCG:1 + chrX 22945370 3' - BS 57 1 52.74 GAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAACAAAAATAACTTCATTTAAAAATCGTTTATT:1 - chr2L 5792013 3' + blood 7327 1 75.21 AATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATCCAAACTAGCTCCTTAGAATTAATATTACTTACAACCATTCAATTTTCTTTATCGGAAATGATAGACAGTGTAAAAATTAAATGCATAAACTTA:1 - chr2L 21976660 3' + Idefix 7370 2 71.92 GCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAAAAGGAGACGAAATTGATAAAGAATGGAGATGCAATCAGCCAAAGTAAACCACTTTTTATCGGCTTAAAATAACATTGGTTAGAAAGTCCGCCA:1 + chr2L 9446168 3' - GATE 40 2 59.59 GTTAAAACAAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTG:1 + chr3L 7801314 3' - Transpac 5078 2 51.37 ATAAGTTTTTTTCTTTTTTTTTGGAATATATGGATCTCAAGGATAATTCTTATATTTGGGTTTATACACGAATGGATAAAAACCCGGACGATAGAGTTTAGTTCGTGTTCCTTTAAATTTTGAGGCTGCTTGTCTGAGTCGCATAC:1 + chr2L 17375565 3' - HMS-Beagle2 492 1 78.77 ACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATACTTCTTATATCATTGGAGAGGGTTTTTTGATTTGTTTAAACGCAGGTTACATTTTCTACCATAATTATTTGATATAAAGTATATACACTGCGCCTCACCAGGTTAGCGCACCT:1 + chr2L 22984612 3' - INE-1 91 1 64.14 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGAGAAAAATATTCATAAA:1 + chr2L 21910272 3' - Doc 28 1 65.07 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCCTTTTGCACAATGATGATGTAAATTTATTGATTTACCTGCGCTGCTC:1 - chr2R 22463148 3' - roo 49 2 63.11 TATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAACGACACGCCCATATCTTGTGTAAAATATGAGCGTACGGGGAGAAGT:1 + chr3R 14912028 3' - Stalker4 68 4 65.94 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTC:1 - chrX 1103598 3' - pogo 46 1 53.10 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGA:1 - chr2L 13629046 3' - Tirant 40 2 58.16 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTC:1 - chrX 1103610 3' - pogo 59 1 60.27 GGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGCGCTCATAACCCTACAGTTTGCCTTCATAAGCATGTTTTGGGATAATATCTTTAAGCACTCCACTCTTTTACCGATTTCAGTAACCTATTGACGAATAATCAGC:1 + chr2L 10446186 3' - flea 4771 2 71.92 TCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTACGTATAAATCAAAAGACAGTAGGCTGGCAAAAAGAGCTCAAAAATACAAGTTATGCAACATGTTCCCGCAAAGAAATCAAAACACGACTCTCAC:1 - chr2R 17158215 3' - hobo 2492 1 68.31 CGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCAAGTTTCATTGTGTTTGACTTTGAC:1 - chr2R 17101141 3' - P-element 2860 1 17.12 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCGAGGGACACAAACACACTCGCACTTAATCTCACACTAAGCACGCACACAATGACCGGCTTTGAGCAGGGCTAATTGTATTGGTAATGCGCATG:1 - chr3R 11095750 3' + hopper 1390 1 67.12 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACA:1 + chrX 6633016 3' + P-element 2801 1 26.71 GCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTACAGCGTACTCTCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTGAAACAAAAGCGTATAAATGCCTGTTTACGTAATGCGCTCTTTAATATTTAAATAGCTGCGACAAATATGC:1 + chr2L 18179021 3' + INE-1 546 1 56.85 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTAATCTT:1 - chr3L 14375590 3' + roo 9040 1 60.69 GTATATAATATATATGTATATATAACGTATGTCGTCAGCCGCCGCGCGCATGCCCCACAAAATTGGAAGATAAATCAACTGCTATGTACGCCAACTAAATCTGCGCACCATAACCTCTCATC:1 - chr3L 6742605 3' + Dm88 13 2 68.85 GGGATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTAAAG:1 + chr3L 25350827 3' + baggins 5375 1 56.16 AAAGAAATATTTATATATATTTTTGTTAGAAACAAAGTTCAAAATATCTTAGAAAAAAAGTTTTAATGTCCTAAATAAAATCAGATTTTGGCTTTTCGGCGAAATTTGATTCAGAAATACGGCCACACAATGCGCAGCTGTCAAA:1 - chr3L 10267150 3' + copia 4657 1 39.31 TAGCTGAGTAACGAGTATCTGATATTCGGGCAACTCGACTATCGACTATATCATTTATGAAAAGCTGGTGTAAATTATAAAATAAGAAGGACTATACTATAAGAAGGAATAAGAAGAAGGGAATTGTAAAATCTGTAATGATTTAA:1 - chr2R 4695750 3' + INE-1 544 1 67.81 ATTTGTTTGTATTATATTAATAACCATTCACTTCAGTAAAAAAAACAACCGATTTTATACGAGGCTCGATGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGAACACTCAGAATAGTATTGTAAGTCAATAGAATTATTAAGAACAGCTATAA:1 + chr2R 5348429 3' - Doc2-element 81 1 73.97 GTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCTGCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTTTTATATAATTTTATGCAGTCAACGCAGTCAAGCACCCGTAACGCCTCAGCAATGGAACTACATCCACGA:1 + chr3L 16030386 3' - micropia 454 2 72.03 GTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGTTGTTGTTCTTGTGGGGGTGCTGATGGCATCCCCATCCGCTGTCCACTTTCCCACTATCCCCACTATCCGCCATTGCCAGTG:1 + chr3L 12882465 3' - jockey 131 1 68.10 GTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGCATTGACGCTATGTTATACCCAATCATATTTTAAAAAAAATATTCGGACTTCTAGTCATTTTTGATATTACTCTTGTGAACAATTTTCC:1 - chr3R 433145 3' - Stalker4 7066 4 58.90 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACACACACACTTGCGACTTGCTCGAATGCCGATGATTGCTCTCCCCTTCCTGCGTGTGGGTGTG:1 - chr2R 8666018 3' + P-element 2841 1 48.89 GCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGCATATGGTAACCTTAACAATCTGTAAAAAAAAACCTAAAAGATACTTAAATCAATGCTATCCCGGAGGTCCTATGAGTTTTAATAGGTG:1 + chr4 1105191 3' + 412 7389 2 67.39 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTGCACGTTGCTCGCATTTGGCAGATAG:1 + chr3R 11095905 3' - hopper 15 1 67.80 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACCCTTTCACTCGACAAGTAACGGGTATTACAAGATGGAAATGGGCTGTTCGATTCTTCAGCGGGAAATCTAATATTACAGACTGAGTTGTCC:1 + chr3L 22885064 3' - P-element 27 1 66.90 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGCGGCAGTTATCGAGAAA:1 + chrX 12273148 3' - jockey 4710 1 60.00 CAACGTAATCATCGTAAATCTCGAAGTGGATTTATCACCCTCTTCCCCTGTAAGAGAGACACCATCACTTAGAATAATTCAAAGTTAGCTTTGTGAAGAATGGTCACTTCCTGGTGTTAATGTGATTGTTCTGGCATTATAATACA:1 + chr3R 26031576 3' + gypsy3 266 2 54.11 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTCGATTGAAATATCTTAATTGAAAATTGCATTTCTCCCGGAAAT:1 + chr2L 19674029 3' - roo 35 2 44.52 AAAACAAATTTTTAAGTGTGGGTGTGACAGTTTTTCGCAGGTTGTGGGCGTTGTAATAGTGCAATCCCATTAACTTGTTTAGATTTATACTGAGAAACACACTAGGAAATTCGAATTGATTAATGAAAATATTTAAAATTATAAAA:1 - chr3L 9694729 3' - FB 720 3 65.75 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCCTTTTGCACAATGATTATGTAAATTTATTGATTTACCTGCGCTGCTCGAAAGAGCAATAATAGTAATAATTACTTTTCGCT:1 - chr2R 22463114 3' - roo 39 2 59.59 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAATAAAGCGGAATCATGTGCAGAAATTTTTATAAGTTAGGTGTATCATC:1 - 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chr2R 14363663 3' + Tirant 8441 2 53.42 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCCATGTTAATTTCGAGCAATTATTGGACAACCCTT:1 + chrX 16994566 3' - roo 8750 2 79.45 AACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAACCAGGTGACTGGGACAGTCTATCCGACCGGATGCGCAAGCTTCGCCGATCC:1 - chrX 17677000 3' + Tabor 7224 2 64.34 AAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTCAGCCTGTATATGTATGTGTATTTGCTTTGTACAGCCTTTTGTTTTCTTTTTGCATTGTGC:1 - chr3L 22339386 3' - hopper 56 1 54.11 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTCTAATATTCACCTGATTTAAAT:1 - chr3L 17537718 3' - Doc 45 1 56.55 AATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAGTAGGAAAACAACGAAGAAGGAGCTCAATTCCCCAGAGTGGCTG:1 + chr2R 16371214 3' - S-element 310 1 74.40 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCATTTATTTTTAATTTATCTTTTTTGTCAAGGCAAGTGTC:1 + chr3L 18253928 3' + blood 7370 2 69.18 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACGTTTAGATACATTTATATCTAGTTATGGAGTGGGGGAGGGGGGGAATATTCTATCGAAGCCATTATCTTCGGCAGTTATGTAAAATTGATTTCGA:1 - chr3R 25713978 3' + flea 4993 2 67.12 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTTCTACCCACTTTTGTTCACAGTGCATCCATATTTT:2 + chr3L 1358565 3' - 412 7087 2 56.85 TCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAAATGTATTTATATATATATTTTTTTAAATGGCATTGCTTATTTTCTGAATCTCAATCTTATTGTTCGCCGTGCATTTGAAAACAATATATTCAAAAAATCAAGCGATAAATT:1 - chr3R 7507084 3' - Doc 10 1 78.08 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATTGCCACAGGCATTTGTTGTGTGTACAACGCACAGAAGTTGAAAGTTTGGGTCCGAATGCAAAAGCGAACTGCAAACTGGTTCTGTTAACTCAAATATTTTCTTTGAGAAATGTT:1 + chr3R 4664056 3' - FB 7 1 80.00 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTGCATGCATGCAACACCCTGTAAGATATGGA:1 + chr2L 18522350 3' + roo 9024 2 51.37 ACATTTATTTTTAGAAAAATTTAGCAAAATTTTAGTATGCCACGCCCATTAGTTTGGGCGGTAGAAAAGTATTACTTCCATTTAACCAACCTTCTGATAAATTATCTACGTAACTATGTTGTCATAATCTCTGCGTAAGTAATTTT:1 - chr2L 12337239 3' - looper1 1801 1 56.16 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAGACAGCA:1 + chr2L 21153571 3' + 1360 3322 1 63.01 AAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAACGCAAAAAAAAGGTAGAAAAATCTAGCAAATTGTAAAAGTCTACGTAAAAATAAAATACAATCGGCCACAATGGAAGCAAAGCGCGAGAGAAAGTCATCCCTGGTACG:1 + chr2R 20641102 3' + mdg1 7027 1 76.03 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAA:1 + chr3L 1358526 3' - 412 7126 2 67.12 TATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAA:1 + chr2R 10160952 3' - transib2 84 1 76.71 GTATGCTTAATATAGATATAACTTACTGATTTAGAATTATGTGTTCCATGTTGTAATTGTTGTTGTCTTTGGTTTGCTATTAATTGCCCTATCATTGTCAGTATTTGTATCTCCTCGAATATTTGTTCGAAGAGAGGAAGTTGGAT:1 - chr4 294570 3' + transib3 290 1 56.85 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTT:2 - chr3R 9125633 3' - Doc 31 1 66.67 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTTTGT:1 + chr3R 21674936 3' + roo 9047 1 60.90 ACAATAATAATAATAATAATAAAAATACGAAGACAAAAAAAATTGTATTTAAGAAATAATTAAAACTAAAAGTTGCGAACCATGTCAACGTGTCGTGTTGGTTTTTGTCTCATAAAACATTCATAGAGCATTCAAGTTGTCAGTCT:1 - chr2L 16635829 3' + mdg1 7061 4 75.34 CGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAATTAATCAACAATATTGACTTAAAGCTGTCAACTGAATTAAATTAAACTGAT:1 + chr3L 11396007 3' - I-element 64 1 62.24 GATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGGATAATTGAAAATCTGTCAACACTTTTACTAGAGCATGGCGAAGCGAAATAAAATTGCAATTTCTGCAAACAAGAATGTCATAATTTTTCGGAGGCCGTCTGAGGGAGGGAGTG:1 + chr3R 9113426 3' - I-element 165 1 80.14 GATAATAATAATAATAATAATAAACCAAGCGGGCGAACAAGCAACAACATTTGGCACTAGCCAATTTGTAGGCCACTTAAGTCCCGATCTACGCGCGGCCAAGATAATGCAGATTGTCTA:1 + chrX 16926175 3' + mdg1 7069 11 65.00 TATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCCACTCAAAGTCAGCACAGGCCACAAAGTCGCAAAATATTT:1 + chr2L 11554592 3' + roo 9025 2 55.48 CGGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACACTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTATATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCTCCCGAAA:1 + chrX 22576493 3' - Burdock 187 2 55.48 GGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGACACTCGAACACAGATACACAGTTGCGGATACGCAATGCACACATCCTGCAGGCACTGCACAT:1 - chr2L 17293933 3' + Doc 424 1 63.46 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTGGCACTGTGAGAATTGAAAAAAGGGGAAACTGTTACCAA:1 - chrX 7756342 3' + roo 9051 2 39.73 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAAGCCAAAGCAAAGCGTTCGAGTGGCAAAAAATAAGTTAGCCCGAGTTATAAAGT:1 + chr2L 17839520 3' + blood 361 2 73.97 TTGTTTATTTTTTTTTTTATTTTTTCAATACAAAAGTTTACACTTGTCCACGCAATATGATGAAAAAATGTCGGCCCTTCTCACACAGCTTGACATAATGTTCCAAATAATGATGTCCATGCTGACTCTCATCATTGGCCTAATAT:1 - chr2R 4704044 3' - F-element 4687 2 59.59 AGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTAAATTAAAGGGAAAAAACAATTTTTCCATTTCCATGCTGAAATAACACTTTAACCAAATAACTTTCGTTG:1 - chr3R 21674697 3' + roo 310 2 52.74 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAAT:1 + chr2L 23049713 3' + opus 7489 2 64.00 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGA:1 - chr2L 19652524 3' + roo 9006 2 62.33 CTCTGTGCTGTGTGTCTCCGTGTTCATATATTGATATCGGAGCCGTAATCGTAATCGCTCTAATAACGATTATCCCGATAATCCTGATAATCTAGCCATGCAATCAATTTTAGCCAAACAATAAAAAGAATCGTTTGGTTTCAGTT:1 + chrX 11679894 3' + Stalker 437 1 63.01 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTAATCTTGACGGTTTAAGTTGTAACGTTTAATC:1 - chr3L 14375564 3' + roo 402 1 78.08 ACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAA:1 + chr2L 17599966 3' - 1360 465 1 68.80 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATT:1 - chr3R 26486019 3' - 412 7113 2 56.16 GAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCAGGAATGGCAACTGTGGGGATATTTGGCATGCTTTTTCTTTCAATGCTCTATCAAGGGGTATATATAATATTATTACATTA:1 - chr3R 26846719 3' + hopper 1380 1 60.84 GATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGCATATGAAATCGTCAATTTTATACCGATTCATTTTGCT:1 + chr2R 5438287 3' - flea 4830 1 75.56 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTGTCTGCGCTCTTTTTTTT:1 + chr2L 21643145 3' - Tabor 6872 2 58.96 CGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTAATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTCCGACTCGGAGAAGCTGCCTCCGCCGCCCATTCACTACATATCCACGGACA:1 - chr2R 14762728 3' - G4 65 1 59.69 ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGT:2 - chr2L 17295862 3' - Doc 90 1 75.34 GCTTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCTTAAGTAAGTTAAATGTGTGTACCTCATCCGATT:1 + chrX 14137274 3' - 3S18 89 2 76.03 GTGGTAACTCCTCCCCCCCCCCAGTTCGA:1 - chrX 4882219 3' - Tirant 8097 2 89.66 ATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAGGGAACGGTTCCTTATGTCTGCTAAATACATTTCAATG:1 - chr3L 26417973 3' + Quasimodo 6930 2 73.97 GATAGCAATACGCCAGTTAGCCAGCCAATTTTCCACAACAGTTAGGTGACCAGCCAGTTGCGCTAATGTTTACAGATGTTTTGGCCGGTCCTCCAGGGTTGAAGTTGCGATCAGTATTGGAGACCGTGACCAGATCGAACCAC:1 + chr3R 8142848 3' - Doc4-element 2307 1 53.15 CATTTCTAGTACATTTTTATTATTTATACATATACTTAGTGGTTAAGCCTTACGTCTCTATAATAAATTCAATTAATTTTTTCACTCTCTTGGAGCATTGGAGCTTTTCAGGGGGGGCTGGGTGAAGGTGGGGCGGTGGTGCTG:1 - chr3R 16000968 3' - Helitron 470 1 58.33 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATGGTAGGCTTAATGGACGATTGTGTGAGTGCGAGTCTTCGGCAGCGCAGAGAGTTCAGTTCCGTTCGTCGTCGGAACTTATCAACATCCTCATAATCAGGG:1 - chr3L 9469105 3' + hopper 1398 1 73.05 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGACCTTTCTAAAAGCTATCGCAGGCAGTAACCCTCTAGTCCTCGTCCTACACAAAAACTCGAATATCAAGTGCGACATTCTGAGGGAT:1 + chr3R 6645450 3' + blood 7356 2 62.33 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTAACGACCTTATAAGTTATGCCAATTGCGAGGGCAACGTTGCGTATGCGTAATAAAATGTAGAACCAATACATGGGTATTAAATTCACTTAATCAATTCTCTTTGC:1 + chrX 15116190 3' - pogo 13 1 48.63 GCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTCAAAAGGTTCTCTACAAATCATAGCTTAAACGTAG:1 + chr3R 7863765 3' - Transpac 5055 2 74.66 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTTTTTATGAAATAATAAATAATACTTTTTCGGCCCACGGTGCATTGGTGGCCCACTGGAACTTCAAAGTGGCCGAATGCCATTACGGTAACTGCAAGGAGCGGGCG:1 - chr2L 8574310 3' + Transpac 302 2 82.14 TCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTAGTGGTGGCAAAGCGTGCAAAGGTGGTGGTAAGCCAGTGCTGGCAGCTATGGCGTTTTCCCGCTAAATTTGGCCGAAATGTGATAAGTCCTTCAAAGAA:1 - chr3R 14278600 3' + P-element 2797 1 71.23 CTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTT:1 - chr3L 27356080 3' + Tc3 1637 1 66.44 ACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTGTAATAGACTTTATTCTATTATCCCTAATCTTGACTCTCTGCCGCTTTAACGCAATGGGGATCCACCAAAGCATCTTGTCCTGGTCGGGAACATCATGTAGCCGT:1 + chr3L 23889365 3' + Cr1a 4182 1 54.55 TTAAGGTTGTGATTTTATTTTGATCTCACTCATCGAGTGTAGCTTAAGACTGACTTATTACAAAGGAGAATCAAGTATTATGTATGGTCTACAATTTCCTTTACCGTATTTCAGACAACTTTATTTTAGTCTCTTGAAGCCTACCC:1 - chr3L 3566529 3' - gypsy5 7248 2 57.53 CCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGAATGGGTCAAATTAAT:1 + chr3L 24210040 3' - F-element 375 1 77.78 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACTCTATATGGTAGCAAACAGTCGAATAGAAATATGAAGAATGAATATAGAAGCAATAGATAGTACATACATGTACATATGTA:1 + chr3R 6461865 3' - 297 6619 2 60.27 ATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCTAGACGGTTTTCAGCGAACTCTTCTTTTTTTCTATATTTTTCCGCTAATTGGCAATGGCGAGCCGCCATTCATTGAGGTTTTCCCTTGAATTTAATTTTCTTA:1 + chr3R 25803891 3' - mdg1 7352 2 73.97 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCAT:1 - chrX 1103596 3' - pogo 45 1 53.42 GGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTCTAAAGGTGTCCCAATTAAAACCAAATGCTGTATTTA:1 - chr2R 7771340 3' - FB 86 1 75.34 GCTGAGCAACAGTGTGGTCTGGCAGATCTTCCACCATATACCGATCGTTGTTGAGGACCTTTGTTACTATATAAGGTCCTTTATAAGCAGCATCCAATTTATGTGAACAAAAAGAAGCAAGAAGAAGCAGCTGC:1 + chr2L 12116296 3' - Bica 4795 1 79.10 GAGGAGACTGTTGCGGTTATTGTCTATACGATTGCAGTTGTGAGAGAGGCAACCGTGCTGGTAGTTACTAGGCTTACGAGAGTAGGCTTGCCTACAATGGTTAACGAAGTTTGTGTGTAATTTGTTGTT:1 - chr2R 18885049 3' - Doc4-element 323 1 82.17 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTATGTACTTTGTATATCTCATTTCGTGTCTTGTTAC:1 - chr2L 17626606 3' - roo 8749 2 80.14 CTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATTTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTTCGATGTCAGTAAT:1 + chr2R 10910287 3' - Tabor 6911 2 68.15 ACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTTCGCTGGGCCTCCATTTCCGTTTCTGCGACTGCGCAAAAGTTCAGACCATCGA:1 + chr3L 6355685 3' + Tirant 330 2 63.70 CTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCAACTTGGTTGGCAAGATACGGTATTCCAGGAGCACCAGTTTTTGCATATCATGCGACTTA:1 + chr2R 5283332 3' + Cr1a 4042 1 55.00 TACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGAAATTTGTATAACCCTGCAAAATAATACAAAATGTTGGAATAAAATGTCTTAATGATCT:1 - chr2R 16578942 3' + Doc 4265 1 58.74 CTTATCTAGAGTTGGGGTTTTTCCACTCTCGAGAAACATATGGTAGTCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTATATCCGGATAATCGCATTTGGTCGGCTTCTCGGATTCAAAAGTCGGAGACGAATGCCATTTGTTAGGAGG:1 - chr2L 1509069 3' - Idefix 152 2 57.24 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGTTACACGTTCGTGCGAATATACAAATGAGAAGTAGGCGTTGTTCGTCTTGCTCTCTATGAGTCTGAG:1 - chr2L 22719531 3' - 1360 15 1 73.38 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCT:1 - chr3L 13690270 3' - hobo 64 1 61.64 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAATTAATCAACAATATTGACTTAAAGCTGTCAACTGAATTAAATTAAACTGATTTATTAAT:1 + chr3L 11396015 3' - I-element 59 1 58.22 GAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATGAT:1 - chr2L 15013247 3' - BS 4954 1 67.81 GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAATAAGTATTTAATTAACCTATATTGGGTACCTCATTCGGGCTAGACTAGAGTTTATTGATATGGTTACTTGTT:1 - chr2R 7908863 3' - F-element 93 1 50.68 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCTAATTACACATGCAGCTGCAATAACAACAACAACAAAAGTGGAAGGCGGTTAATGATCACCACGAACAGTTG:1 + chrX 3322813 3' - roo 45 2 51.77 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATGTGTATATCTCGATGTATACCTTTAAATATAAAACGAAACAAAGGAATTTCCATTGAATATTTACTCTCTACAAGCATTTTGCCCTCTAAGCTAGA:1 - chr3R 19139334 3' + pogo 2084 1 73.79 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCT:1 + chr3L 16059323 3' - 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chr2L 12321872 3' + INE-1 549 1 52.74 ATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACTAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTA:1 + chrX 1018161 3' - 1360 234 1 67.81 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGGAACTCCCGCGCAAATGAAAAAACTTTTCCCAACTGCC:1 + chr2R 12202316 3' - Tirant 8170 2 72.17 ATTGTTATAATTATTGTTATTTCACAAAATACTGCATAAGGACTAAGTTGTACCTGCAACATCTAAATTAACGTTGAAAATCAGAATTTCTTATTAGGTTTAAGCCTACTTTAGGAAGAAACTGAACCCCAATCACAGAAAAA:1 - chrX 7711064 3' - mdg1 7056 2 72.03 GAAGCTGGGCACCGTAAGCCGGTGAGCCAGGCAGCACGTGGCTGCTGCTTTGCAAATATACCGCTGCTTCGAGCACTGGGTTTTTTGCGCTGATAATATATAAATGTTTGTTTACCTTAGCATTTTACGATAT:1 - chrX 12861159 3' - G6 265 1 72.18 AATGCTATAGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTGTCTGGGATATCAATAAATATGGGGGATGACGTACGGGCACATCTAGCGACTGGAGTGGCCGGAG:1 - chr2L 8628547 3' - INE-1 570 1 73.61 GACCTAAAAACCAAATTAGTAATCGAAGTACTAACTGAGAAGAAAATGAAATACATAGAAAATCTGACCACCCATCCAAATCCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGAGAAGCGGAGCAGAAGTTGGGGATAAGAAGTCGCTGGGGG:1 - 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Tc3 236 1 75.34 GCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAACCCAGCGCTATTAACAAAACGGGAGACACAACACCGGGAATTACGCCACTCGGCACTACACACTAAAGTATGCAAAA:1 - chr2R 19852122 3' - Transpac 41 2 57.53 TAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGACGGTAAGA:2 - chr3R 8042288 3' - BS 41 1 46.58 ACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATAATAGTTATCACTTTTCCACTTGCAACCTGATGAAGTGA:2 - chr2L 2895569 3' - Burdock 6213 2 74.66 CCCGACTATTAGATACCCCTTACCCCTTAAAATATGTTCAAAAACGTGGTCGTGACTGGTTTTCCACTTGTTTGTAGTCTTTTCTCCGCTTTTTTTTCATTTTGA:1 - chrX 22513108 3' - INE-1 552 1 51.43 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTATGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCAATCGAATTGAATAACAATTGAATTGAAGCACAAAATTGAAGTAATTTATTTGTGGATGG:1 - chr3L 26741222 3' - F-element 86 1 69.86 TGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAACTATTAAAATAAATTTAAGCATATACTCGGAATAGATTAAAT:1 + chr3R 31483720 3' - I-element 79 1 71.23 TCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCAATTCTAATTCGCCTGGCCAAAGCGAACTCTTGATTGAAGGTCAGCGCAGGAGAAGTTGAAGTCGGC:1 - chr3R 16240886 3' + Tirant 384 2 65.14 CCCCGACGTCTAAGGCTCAGATTTGGAAAGTTGTGGAGGATGTATGGGCAGGTTCCATGCGTATGTTTATGTTGGGGTTTGGTAGATATAGTTCTATATCTAGATCTATTTCACGTCGCAATTTTTTACGTAAATTAGTTTTTGTT:1 + chr3R 4514599 3' + HB 1205 1 66.44 ATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGTAGTGAGGCATCACAACTATTCACGCATATTGCATATTATTTAATTAGCAAAGGCCTTCGGCGTGTGTTTATA:1 + chr2R 7599235 3' + diver 6038 2 66.44 GCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAA:1 + chr2L 23069852 3' - F-element 434 1 76.03 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACTAACTAATATAATCAGCTTTGTTCCCGTTTTTAATAACCTAATTTTGGGACTTCGATTTTG:1 - chr3R 10150142 3' - 1360 61 1 59.59 GTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGTAAAGTAAAAACAAAAAAAAAAGCAGTTGCCGACCACGTCTTGAATGGAATGGCATAGTTGTTTAAA:1 - 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F-element 4262 1 71.23 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAACAAGAAAAAA:3 - chr2L 17295799 3' - Doc 27 1 62.33 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGCGC:1 - chr2R 22746045 3' - jockey 4804 1 53.42 ATTTTACAGTTTTTTGTATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTACTCTGGCCTGGTTAACCGCAACTCGTGCCATTCGTGCCGGAG:1 - chr2R 15448602 3' - 412 347 2 69.86 ATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATGCATGTGCCAAAAAGAAGTACAAAATTGACACACTCACACAAGGACGAAGTGCACACACACTAGCACGCACGCAGAGGGGCAAGAAAAAACGGAGAGCGTAGCATACTTTT:1 + chr3R 7290443 3' - hobo 2719 1 80.14 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAATTTCGAAATTCTATGGTATCCCCAAGTCGATTGCTTCTCACATATTTTGCTCCAGCTTGTTTTGAATGTCCTTGCTGATTTGATTTCATTGAAAAT:1 - chr3L 4081537 3' - mdg1 7063 2 67.12 CTTGAGTTGGTTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTGGCTAGTTAGATAATAAAAATATGTTAACTTATTCTATATA:1 + chr3R 6816765 3' - 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INE-1 88 1 78.08 CGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGCCGAT:1 - chrY 1706287 3' - 1360 44 1 60.96 AAAAAAAAAAAGAAAATAATAAAAAAGGGCTGAAAATCCAGGGGCCGCCCCTTTCGCCGGCC:1 - chrX 5826737 3' + Doc2-element 252 4 87.10 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCACTTCGGGTACATTTGCGTGTA:1 - chr3R 25049993 3' + P-element 2844 1 46.77 CTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTTCAGCGATTTGCTGTTTCAAAATGGGAATAATATTTCAGTATGT:1 - chr4 123931 3' - HB 103 1 63.70 TTTTTTTTTTTGTTTTTTTAGAGCCAGTAGCTGGGGGGGGGCT:1 + chr2R 16519936 3' - HMS-Beagle2 482 6 90.70 CTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCTTAAGTAAGTTAAATGTGTGTACCTCATCCGATTTTCGACGAACGGTCTTCAATGGGT:1 + chrX 14137298 3' - 3S18 65 2 59.59 ATTTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAAGATCAATTAGGGATTTGATAAGAGGTTTGAGATCACGGCAAGTGTAGTTCGATTCTTACCTGCCCAGAATCTCCTTGGGCTCGTATTTG:1 - 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chr3L 18381933 3' + copia 5074 2 53.42 AGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTATTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACACCCACACACAGAGATAAATACACACATAAAAAT:1 + chr2R 1000384 3' - HMS-Beagle2 6967 2 74.66 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCCCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACCCTCACTCAAACGGACGCAAAT:1 - chr3R 13437149 3' + hopper 1414 2 59.78 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATTTTTGGCGAAAATAGTTCTCAATTGTTTTGA:1 - chr2L 17839352 3' - blood 39 2 58.90 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAACGTAGTAGGAAGACAGAATGAACACCTTC:1 + chr2R 21288786 3' - roo 48 2 52.05 GCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGTAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTCATCTCTCTTTCGGCCAAGTCCTTAGTCCTGAGTCCTGCCATAT:1 - chr2L 19917351 3' - 412 497 1 67.36 ATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGGATATATGTACTTTCAGGCATATTAAACTGCATACCCAATCGCAATCCAATCCACGACACCGCAATCATTGCCGCCTGCATTTGCA:1 - chr3R 11513422 3' + roo 9039 1 63.01 TAGGAGGATGTCTATGTCGTGAAGCTCAATAAAAGCGAGGATCTCAATGGTCTTTAAAGAGGACTCATTTGAATTCAATTTATAATTTTGAGATAGATTCCTATCACATAATGACGGAAGCCACATTAAATCAATGTCAGA:1 + chr3R 19449250 3' - G5A 96 1 54.61 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGGCCGGTTAACTGGAAAGAGGTAGTGTTTTAATTTTAAGTTTGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' + P-element 2880 2 72.48 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAG:1 + chr3L 13364390 3' - hobo 63 1 60.96 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGT:1 - chr3L 18484399 3' + hopper2 1522 2 73.29 AAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGGTTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGAAATTGTGAAGTGAAAGTGACGTACCACGCCCACATTTTTAC:1 - chr4 857197 3' - Q-element 126 2 78.77 TATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTATTGTTGAATAAATTTTCAATATATTTATTAGTGTAGGTTTATTAATTATAACTGGGTTCCGCTATCCACACGCGGAGTGAGTTTTCGGCGCTTAAA:1 - chr3R 13545337 3' - Burdock 299 1 69.18 TCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATACGCCAGCCAATATATTTGCGTAAGTAAGACAGAGACGGATGTTCCGATC:1 + chrX 16608009 3' + 412 7223 2 65.00 TTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATTCGATTCGATTCAATGGAGATATTGGAGCCTTT:1 + chr2L 14270290 3' - Idefix 83 2 79.45 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGA:1 - chr3L 6355608 3' - Tirant 8136 2 54.74 GTCTAATACAAGCTCTATCAGACGATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTAAATAAAGTTTTACAGAATGAATAAAACTTTATTAAATTCTCCCGGTGTACTCACACTGGGGCGAA:1 - chr2L 14370025 3' + Bica 4517 1 55.48 ATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTGGCCAGAACGTCAGTGCCACGCGATTCGTGGCAATAA:1 + chr2R 10910334 3' - Tabor 36 2 58.22 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCCGCGTTC:1 + chrX 388321 3' + 1360 3351 1 61.26 GTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGTCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCGCACC:1 + chr3L 25118793 3' - 1360 339 1 66.44 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCATTATTCACTATGAGGATGCAACAACGTGCTTTTGAGCTCTATTAGATTCGCACTGCATAA:1 - chr3R 25862572 3' + roo 350 2 58.62 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCTCCATTTGCTTTGTAGATGGTTTAT:1 - chr3R 17099929 3' - Tirant 8180 2 81.67 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGCTTTACAAAGTATAGTATTGTTTATCTGCTCTTAT:1 - chr3L 17667528 3' - F-element 45 1 56.16 AAAATAAACATTGTTTAATTATATTTCATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTGACCAAAAATTCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTCGAAGAGTCATCAGGACG:1 + chr2R 4284687 3' - S-element 109 2 82.88 TTATATACTATGTTGCTATACTGAACTTATGTATGATCTTGTCGAATTTTTTAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGTAGCTATTTGTTTAAATTTTTATACGATTACATAGATGCATAACAAATGCGCGAGGCACGCGTGCAG:1 - chr3R 10289842 3' - invader2 4897 2 68.49 AACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCATTTTCGTTCGAATA:1 + chr3L 7801341 3' - Transpac 132 2 62.33 GACACACAAGTCGATACAGTGACAGATTACTGAGCCACAGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTCTCCACCCT:1 - chrX 22726185 3' + Helena 1238 1 52.05 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTGTTTATTAAGCACTTACACTTGCGCTATGTTAATCTCCCTAGAATATACATCCGTTTGCATAAGTAGCCGCTATAGCCGTATTTCACAATCAAC:1 - chr2L 4637159 3' + mdg1 394 2 65.07 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTCAGAAA:1 - chr2R 6798224 3' - jockey 72 1 61.64 CTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGGGATTATTGTGCCGG:1 - chr2R 13367415 3' - jockey 4588 1 63.19 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACAGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTATGGAACTACTTAATGGCT:1 - chr3R 13225455 3' - hobo 34 1 60.96 AGGGGCTACAGCTAAGTTTTGTTACGGTTCAGTCGCCATCATGCGTTGTAATAGTGAGGATCGTGCGGGAGATATAATGATAAATGAATTACGTCGATTCTGGTGGATGATCACAGCGATCTTCCAGAATTGGAATTCCATTTGCA:1 + chr2L 14359957 3' + mariner2 89 1 66.44 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCAGCTTACTACCTCACATACCCTTTATTTTCGA:1 + chr3L 18405368 3' + roo 403 1 78.08 CACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGG:1 + chr2R 5173198 3' + Stalker4 7282 4 73.97 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCTAATCCAAATTTGTAATTTATTGAACTCAAGCGGTTGGC:1 + chr3L 16059370 3' - 297 6618 2 60.96 GGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGACATCGAAAGGATTCTCACACTTTTCATCAAGACCGACAACACAGAGCATGTCCTGATGTGTCTTAGGCG:1 + chr3L 19554115 3' + R1A1-element 5071 1 52.05 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGT:1 + chr3R 19436095 3' + roo 9019 2 54.11 GTGCCTGAATGTAGTGACCTATATAACAATTGATTTAAGGCAGTAGCCCCTCTTGAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAA:1 - chrX 21585265 3' - mariner2 280 1 67.69 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCATATAATTTTACAAGCTACTACTCATATCTAATTAGTGTACCCAAACTAAGAAATACCGTCATTTATTTGATAAGGAAACTAAAACTCTAAAACTGGTAGATTAGTCAAAAC:1 + chr3R 7664626 3' - I-element 10 1 75.34 ATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAAATATTAATGAAGTCATCAAAAGTGAAAAGATTAAAATTACATTTCTAGTTGTATGTTTTCCGGGAATACCGCTGTGGGATTTTATTGACAGCT:1 + chr2L 9418629 3' - rover 26 2 64.38 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAA:1 + chr3L 18183209 3' - Tirant 8146 2 59.03 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCTCTTACTGTTTTAGAATATATCTCCTCATTTTGGCACGATATGCTGTTAAGC:1 - chr3R 20635412 3' - 1360 65 1 63.70 ATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTTACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGAACTCCATTATGGCGCGTCAGCATTACTTTGCGTGGCTACTTAGTTGCTAAGGGAATGTGAACTTGATGGTTTGTTAACTTGTAT:1 + chr3L 23797514 3' + invader4 2988 2 62.33 CCGTATAAACGACGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGGCAATTACTGGGTTTTATTATGTTTGCT:1 - chr2R 11574974 3' + INE-1 135 1 63.70 CCAATTGCGTCACTTGAACGTTTGATTGTAGTTTTTTGCGAATATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCTAGAACTTAGAATCAAGTATTA:1 - chr3R 5509734 3' - Juan 129 1 75.34 GTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGTGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGC:1 + chr3R 24454865 3' - F-element 271 1 54.31 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACACACACACTCTTGAGCATGGTGGGGTCTACAGGATAATAAAGGAAATTGCTGG:1 + chr3L 13678976 3' + hobo 2932 1 67.06 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTAATGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAGG:1 - chr3R 7885587 3' - jockey 71 1 60.27 ATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACAGGGCTAGATCGACTCGGTTATTGATCCTGATCAAGAATATATATATGAAACGAGCCGTTAAGCTAACACAAAAAGAAAATATTCACTCGCTGGGGC:1 - chr3R 22834178 3' - INE-1 131 1 60.00 GAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTC:1 - chrX 1103632 3' - pogo 81 1 73.97 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAATACTAGGTAGTTTGGCAACGCATAGCGATTCGATTAATGGGTTGGTTTCTATAATAAGACAGTCAATTTGTTCCATGATTTAAATATGCAGCT:1 + chr3R 9583406 3' + Juan 4184 1 64.38 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATGGCAACTGCCTCCTGCAATAAAAGTCACAATGGCGACA:1 + chr3R 22494218 3' - 297 10 2 73.33 ACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGGGATTATTGTGCCGG:1 - chr2R 13367415 3' - jockey 4590 1 62.33 TGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCT:1 + chr3L 20251985 3' + copia 5036 2 78.77 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTGCCGGGAAATCCG:1 + chr2R 1923589 3' + pogo 2055 1 54.11 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAAGTGGCAGTATCCTTGAAT:1 + chr2L 3231997 3' + roo 9053 2 68.15 ACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGAGCCCCCATGTAAGATTGTTTATTATTTGAGCAATGCATTTAGGGTTTCTATTTTGATAGTGGAAGTCACGATCCTGCACTCCGCATCGGAAACTGAGCTCATCCG:1 + chr2R 7044860 3' - flea 300 1 53.47 AAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGCAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCATCGTCCACCTTTTGCCACGAAACTCCACTGCAGAGAGAGAAAGATGTGT:1 - chrX 20038850 3' + 412 7410 2 65.07 GGTTGAGCGATGCATGTCTGTTCTGCGCAATGATCGAAAACTATTTACTTGAACGTTCTCTTTGACAGCTTCAACTTTGTAAACTGCATTTTCAAGTTGGGCACATAGAGACATTAGAACCCTTTTGTCGGCTTAATTTTCTCTGC:1 + chr3L 16507275 3' - invader1 3939 2 75.34 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATACATGCACGCAGACACTTTATTTATTTACATTCCAGCCAGATTGAAAGTGACATCAC:1 - chrX 11008310 3' + hobo 2900 1 56.91 AGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAACCAAAATTATAATAACTTGGGCTCAAGAGCAATTTACATAAATCTTGT:1 + chrX 19376111 3' + transib2 12 1 69.86 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAGTTTTGCTATGGCGTTCTATTTTAGTACTGAGTGTTTTTTT:1 + chr2L 21698325 3' + 297 6901 2 73.97 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCTAATTATTTAGTACACATTTATGCTGAATGTCTCGACTATATTTAATGGGTCTTGCACAAATTTGATTCAATGAAAC:1 - 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roo 38 2 47.95 AATGGCCAGATCGACTCGGCTAATGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTACATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACGGGACTAAGACCGAGAAGTACATTAGGACTGTTTGT:1 + chr2L 21268596 3' - INE-1 104 1 75.17 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTATAGCCCTTGG:1 - chr2L 16456784 3' - BS 5072 1 74.66 ATGCACTGAGCCAACTGTTCTAGTTCTTTGGCTTGGCGATAAATATTATGCGATGTGAATGATTAGCATCAATTTCTCTCCCGAACTCTTTGATAAACTCCAAGTTACGTTCATTGTACTCTATGCATGTGTATGTGTATAT:1 - chr2R 20744489 3' - Gypsy6A_LTR 22 1 52.11 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAGACTTTAATAGCCACTGTTGCCAGACACTAAATAATGTCTTTTCTTAAGATTCT:1 - chr3L 465922 3' + Juan 4201 1 77.40 AGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACACACACACTTGCGACTTGCTCGAATGCCGATGATTGCTCTCCCCTTCCTGCGTGTGGGTGTGTGTGTTGTTCTGGCGTTTGCAATCAACCTTCCTGCTGACAATTGATTTTT:1 - chr2R 8665972 3' + P-element 2880 2 76.03 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGACCTTTCTAAAAGCTATCGCAGGCAGTAACCCTCTAGTCCTCGTCCTACACAAAAACTCGAATATCAAGTGCGACATTCTGAGGGATTGTA:1 + chr3R 6645454 3' + blood 348 2 65.07 CTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGGCAATGAATTCAGCCAGTGCTCATGGAGCTAGGTCAACAGTTAGTATTCCATGTAAGCTGGTACATAAATGGTTATATACAATTCTCGCACAAA:1 - 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chr2L 12226045 3' + HMS-Beagle2 7114 2 71.03 ATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAAC:2 + chr2L 1361024 3' - Stalker2 66 2 61.64 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAAATGTATTTATATATATATTTTTTTAAATGGCATTGCTTATTTTCTGAATCTCAATCTTATT:1 - chr3R 7507134 3' - Doc 60 1 59.59 GTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGATAGAGTCATTCCATGTGGATACAACATTTTAATAAGTAGTACGATGATTTGAAGGAATGTGAAAATATTACCCACCACATCAATTGCCA:1 - chr2L 19405628 3' + Doc 186 1 39.04 ATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAATGCCCGCCTTTTCTCCGTGTGTATTTGCGGGTTAATTGAATTTTATGTGTTGGTCGCCAATCCTTAAGATTGTCTTCCCTCGAATACGCCCCCATCT:1 + chr2L 12768460 3' + roo 429 1 66.44 GGGTGAGACGTAGGAGAAGTGCGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCCAAGCGCTTCGTTTATTTTATAAATTGT:1 + chr3R 24454893 3' - F-element 269 1 56.34 TAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCCAAGCGCTTCGTTTATTTTATAAATTGTTTGCTC:1 + chr3R 24454899 3' - F-element 259 1 62.32 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATAATGATGATGTATCTAAGTTAGCGTGTAAGACTTTCTGTAAACAGCATTTAGTTGGCACAGTTCAAAGATGTCGAC:1 + chr3R 15295836 3' - roo 8705 2 57.53 CGTAAAAAGGCGCTGCTGTGCATCGCAAAAGAAGATGGAGTGTGACTTGTCGCCGGTGACTTTCAGTCTGCGGGTGAAATAGCGGTGGCGGAGGGGGGTCGAAATCGAGGAAGTCTTACATTAGTTGA:1 + chrX 7834693 3' + Rt1a 4840 1 61.72 GGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGTATATAGATACATATAAAGCGTATCCTGATTTCCCCCTGCCGTAGGCGCCTATTTTTATTTTCCCATTCACTGCCAACTTATTTACGGGCCGCAATTATT:1 - chrX 18220532 3' + Burdock 6388 2 78.79 CGTGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGGCAGACAAGATCCGCACAGAAGCAGTAGAGAAACCCCCTTGGCCGCCCACTCCTTTCGTTGTTCG:1 - chr2L 19405054 3' + Doc 324 1 54.39 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCATTTT:1 + chr3R 16276437 3' + pogo 2052 1 60.00 CAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCAC:1 - 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Cr1a 4290 1 54.68 ATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATAATGTATGTATGTACATCATACATGTGCTGGAATGCAATACCCCTTCAAGTGATACCCCTTCTATAGG:1 + chrX 11383683 3' + roo 8609 1 54.11 GTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGCCGATTATACTCGCTCCTCGTAACGAAG:1 + chr3R 2637704 3' - gypsy5 7012 2 75.00 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACACACACACTCTTGAGCATGGTGGGGGCTACAGGATAATAAAGGAAATTGCTGGG:1 + chr3L 13678977 3' + hobo 2930 1 63.64 GGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCCAAG:1 + chr3R 24454869 3' - F-element 276 1 54.40 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGTGCATACTAAAATGCAATCTCTGTCCGGCATTAAGCCTAAATTAAATATATTTCATCCAGTGTCCAAAAACCAATTAATTCTTT:1 + chr2R 23212722 3' + Tirant 8474 2 62.41 TATTATTTTTTAAGATATTGATTCAATCTGTAAATGTATTGCTAAATGTGTCTAACTTGCAGAGATTACATAACATACATAACATAACAACATAACATAGTAGAATCTTAGAATATTGCCAAAGCAAAGTTTTGTCCTTGCTTTA:1 + chr3R 27075407 3' - 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chr2L 18112464 3' + transib2 2792 1 60.69 GGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTGTTTATTTACTATTGATATTTATAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGTTATTGC:1 - chr3R 19449877 3' + roo 311 2 67.12 CTTAAGTCAGTCGATTTTGGAAGATTAGAAGCGTCGGTCAGTATCAATTGCGAAAGCGAAACGGAAACGGAAACAGAAACGAGAACATCCTGAGATTATGATTACGAACGCGTTGCCAAGTAT:1 + chr2L 2868046 3' + Burdock 129 2 70.73 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGACTAGAATGCGTGTTTAAGTGAACTGTCCCTTTCATAAAATATGTGGCATACCTGATTTGTGGATTT:1 + chr3R 28450796 3' - roo 8685 2 67.12 TTTTAAATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTC:1 + chr2L 18112575 3' - transib2 2623 1 66.90 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATATAAAACATTTTAAGAACTCAGGGGTTTCTTCGTTTTGGAGATTTGGCTCTAAACCAAAAAATG:1 + chr2L 13255389 3' - pogo 53 1 58.22 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTGAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTTGACTATGATGGGTTTTTGGGAATGGCGCTTTTTTGTTGCGCCTGCGGGAGAAATTGT:1 + chr3R 20934771 3' + 412 7483 2 58.22 CGAATTCACACCAGCTGAGTAACGGGTATCTGAAAGTCGGGGAACTCGACTATAGCCTTCTCTTTTGTTCTTTGCTAAGCTCTAACGCGATGCCTATAAAATGTTAAAAAAGAAATTACAACAAATCCATTTGTAAAATTGCAAAC:1 + chr2L 6261331 3' + INE-1 533 1 74.66 ATTACATTGTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTCTCTAATTTAAAGAATTTAAATTTTTCTAGAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTATTGTTGGCTCATTAAGTGGGCAAACATATTTTCGCATTTCGCAT:1 + chr3L 7839357 3' - TLD2_LTR 193 1 69.86 ACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAAAAAGGCCCAATGAAAGGCTTTCATTGATGAGTACTTGCACCTGGGACATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGTAACTTAGTTGTATGCAATC:1 - chr3L 24088908 3' + 412 401 2 78.08 AAGATGCGTAACTTCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCAAAATTGCCCTCTGTCCGCCCGCTGAGAGCGCTTGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGAGGGGATGCTTTTTTCTATTTCTCCGATGCTTTTCTTC:1 - chr3R 23420150 3' - 1360 3370 1 76.55 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATAATTTTTCACTGCCGATTC:1 - chr2L 19652502 3' + roo 9028 1 54.11 AATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCCTTGTTTAA:1 + chr2L 21976787 3' - Idefix 55 2 62.33 TGCACTGAGCTATTACTTAATACTTATTACAGTATACGGACGCGAAGGTTTCAGTTTCATATCGGGCCACGGGTTTTTCCTCCTATTTTTAAATCGCTTTTAATGTGCGGCATTTGGTCTCGTTTTTCTTCGCTTATCCAGCCGCT:1 - chr3R 7616671 3' + Stalker2 7642 2 79.45 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCGATAAGAGAGG:1 - 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chr2R 13037261 3' + Bari1 448 1 59.59 GACCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGTTTTGAGTTCCCGTTTTGAAATCTACACAAGTACTCAATTCTAATCGATAATATAATACAAAAATTTAACAAAACAT:1 - chr4 979921 3' + F-element 367 1 54.11 TATTTACACATTTCACATTGAAGTACTTATTCGAATGTCAATAATTGGTCTTACTAATTGTTAACTGGATTTCCTCGATCAAGTATAATGCAGCATTGCTAGAAACACTGCACAGAGTCAACTCCAATTGACGAGCGATTGTTGGC:1 - chr3L 17945042 3' + Bari2 112 1 80.14 AAACAAAAAAAAAAACATTGTAAGTAAACAGAAAAGAAAACACGAAGGTGGAAACCCCTTGGCAATTATGCAAAAACCACCAGCTATTCCGTTCCGTTCAATTCAATGAGTTAATTGCATTTCATAATTTCCCATCTCGCCCCC:1 - chr3L 19200759 3' - Tc3 85 1 48.61 CTGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTG:1 + chr3R 19436094 3' + roo 354 2 53.42 CAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCATTTTCGTTCGAATACCCCTTTATAACCGTGACT:1 + chr3L 7801360 3' - Transpac 5032 2 75.34 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATTAGATTAAATGACT:1 - 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I-element 58 1 54.79 TATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACTACATATATACATAGATAGATACTTTCGACTGAAATTCATGCTGGGCCTTTCGATTGC:1 - chr3R 8849758 3' + 297 6917 2 66.21 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGTTCTTCCATAAAAGTGAAGCGAAAAGGGTTAACCTTTAAAATTTACAATGTCCCACGGTC:1 - chr2R 19843305 3' - jockey 63 1 55.00 CCAGTTAGTTTTGTGAAATTTAAAAATGCCTAGCAAAAGATAGAGTTAGGCGGGGAGAACAAAAAACGACAGGCTTGAATTTTTACCCAATGACTTAAAAAATCTGTCTGCCAGGCGGTGTGCTATTTTTACATTACCGTAGCCGA:1 + chr3R 2474247 3' + S2 378 1 67.81 CTCAGGAAATATAAAAGATAGAAGATCCAGCATACGGATTGATTATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACACAAATAACTAATTTGCAATTTGGTACACGTGGCTTGGAACAGAGAATGTATTTTCCAGCTGAA:1 + chr2R 18487414 3' + INE-1 153 1 57.46 GCGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGATGTGGG:1 + chr3R 16997469 3' - G6 56 1 53.10 AAATTGTACATATTATGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATACTCCAACTACAGCAGCGGCTGCAGCTACTGTTCCGTAGTTGTACTGGCTGTCGATCTGCGAGCGTTGTGGGAG:1 + chr4 964862 3' - 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F-element 4216 1 55.56 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATAATATGTATGTTTATAGTATATAGTACCTTACCGCTTGTATGGAAACCCCTCTCCGCTCATTTTTACATCGCCTGTTCTGCT:1 + chrX 8219491 3' - opus 7148 4 52.08 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGCAACCTGCTCCATCGCAGATAATTGCTCTGCGGATCGAAGCCGA:2 + chr2R 14973748 3' - FB 12 1 76.71 AAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATATGTTGTATTTTCTAATAATAAGAATAATAAGAGCCACAAAATATACAGCACCTTTTTGTATCT:1 - chr3R 26541084 3' + jockey 4747 1 60.69 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCTTGAAATCCCTCGGCATAAACCCCACCAACACTCGC:1 + chr3L 12223250 3' + Transpac 266 2 55.17 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTAGTGCTAAACTTTCACCTGAAGGACCAAACTCTAGTGGGGGACCGGG:1 - chr3L 13364312 3' + hobo 2919 1 50.57 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATCTTTGAAGTTGGGAGCCACTTTTGAATTTGCCTCCTAAAGCGGGACAACTATAATAGCATAAAACCAGTGTTGCAAGGTGACACTCAA:1 + chr2R 9607238 3' - pogo 28 1 66.44 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGACTTAATGCTGAAAATATTGGTAGCTCTAAAGTATCCAAATTTCTTTAAAGTATTCA:1 + chr3L 21665321 3' - 1360 63 1 61.64 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGCTAAGCTGCTGGCAAAGGGTTTC:1 + chr2L 14239229 3' + 412 422 2 65.75 ATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTTTCGATTTATTTAATTATATATATATTTCCAATTACATTATATTCTTTAGTAGCTAAGATCGCCCCACTGTGCCTGCGTTAGGGTTCTGCTTTT:1 + chr3R 6555346 3' - Juan 4052 1 65.07 GCACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGGTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGGCATTAGTTCGTGCTTTATGCCCTATGCATTTTTCATTGCTCA:1 - chr2R 7232665 3' - jockey 89 1 67.12 ATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTTGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTGAGTGTTTTTGGTATATTCCTGTAAGCAGGGTTGACTTACGTCAAGTCACAAACATATTTTTCCCCTTTTTCGCGCCTCGTTCCG:1 + chr2R 5795156 3' + INE-1 500 1 40.97 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCCCGCCCCTAACCACCCTTCCATTAGTTTTAAACCAGATTACACCTTTCATGTTGCAACC:1 - chr3L 9469897 3' + 412 7514 2 61.64 CAGCGCTGCCAACCGGGCTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGCGCTCATAACCCTACAGTTTGCCTTCATAAGCATGTTTTGGGATAATA:1 + chr2L 10446130 3' - flea 4786 2 52.38 ATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAAGTCATTCGGAAACTTTAAAGCCCGAAAGTATGCAGCACAAAATCGTAATATCAACTTTTCAAAAAACCTCAACTAACAGCT:2 + chr3R 11568701 3' + BS 5056 1 56.16 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTAAAAACAGTTAATACTATGTACATATTTAATTAACAACTTTTTCTGAATTCAAGTTCACTTTTCTTTGACTTGGAATTCCCTGAACTTCTGTTA:1 + chr3L 7870318 3' - roo 25 2 67.12 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACTGCCAACTTTGAGGAGGGTTTCGGAGGAC:1 - chr3L 12159643 3' - Quasimodo 27 2 64.75 TTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAATTAGCAATGGAGATTAAGTAGCCCAACTGAGGCGTCA:1 - chr3R 25632371 3' - 297 427 1 73.57 GAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTAAACACGTGAAGTATCAAATAAACCAAAGAGGCCAACTCCTGCGTTTGTGTTTTATTTAGATAAGAGGATATATAGTACCCCTACATTGTTTATTTATCTTGGCACCCTGCGCTGCTGTTGTTT:1 - chr3L 22255254 3' + invader2 5015 2 73.97 ACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAAAAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGCAACTGCAATCAATCTAAATGTCGAGCTGTCAATAAAATTG:1 - chr2R 21772807 3' + hopper 1108 1 70.55 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATC:1 + chr2L 17626685 3' + roo 9012 2 61.64 CAAACACACACACACACACATACATATATACACACTCGTGCATTGTTGGTGTTCAAATTTTGATTAGATTCATGCTTGACTGCGTCGGGAATGCACATATTTGCACCAACGATCCCATTTCTTTTGCTGTGCAAACATATGAGGTT:1 - chrX 9864620 3' + accord 182 2 40.41 ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACA:1 - chr3L 27415225 3' + transib2 2752 1 67.81 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATGTATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTCGATTGAAATATCTTAATTGAAAATT:1 + chr2L 19674012 3' - roo 8716 2 54.79 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATCTTTGCGAGAGAGTTTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTTGTGTCACTC:1 + chrX 7706835 3' + P-element 2855 1 33.56 AATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCAAAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGATCAATCGCATGTCTGACAGAGTGTAGCATACTTTTCAGCACT:1 - chr3R 16582472 3' - BS 4990 1 63.87 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGTTTG:1 - chr2R 9294316 3' - Tirant 8176 2 65.52 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGAAAAAGCACAAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAATATTTCGCAGCTCCCATGGAAAATCGTAAAAAGTCATAAAATCATAATATAAATCCCATTGAAATTACA:1 - chr3R 6015065 3' + Juan 4167 1 47.26 TATGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGCTGTGTATTGGTGAGGGTAACCCAGGGCTTCACCTTAGTTAAGCT:1 + chrX 4032954 3' - accord 192 2 92.50 GTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTGTATGTATGTAGATAGATGTGTGTGCCTGTGCGTATCCATCCGAGTGGGGCCGAATGTATCTGAGTATCTGAGTATCCGACGGATCGC:1 - chr2R 11145996 3' + Quasimodo 7330 2 60.96 AGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTGGCGCAGTCGGTAGGATAACAGGTGGATCCCGCTTGGGACGACGATCGCGGAACTTTTGGAACTCGTAGGTCGTCTTG:1 + chr2L 20756721 3' + rover 306 2 57.86 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCATTAATGGTTAAATAAATAAATTGATAATAATGGCTGTGTTTATTAGGCATAAGAATGTTAATGCTCG:1 + chr2R 13293457 3' - roo 8717 2 56.55 GGATCAATAGCCAAGTCGATCTGGCTGTATACGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTTTTTTTCATAATTTTTTTAGTCTTGTACATTGCTTTCAATATAGCATTCTCTCTTGTTTCATTAATTCTTTTAACAAAA:1 - chr2L 9547508 3' + INE-1 97 1 75.34 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAAAGTGCAAAAGGTTGGGGAACTGCAGAAATGGGGAAGAG:1 + chr3L 10469660 3' + roo 394 1 75.34 AATATGAAGACAAATTTTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCTTTGTATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAACATAGTAAAAAGCAACAAGACGAACTAATAACAATAGTGGGGTGTGTGGAGACTTC:1 - chrX 4014953 3' + G4 3503 1 69.86 AGTGGCGGGCTGCAGTTCTTTGGGGCGTACCACTGCGGCACATTGAAAAATTATATGTGATGAATAGCAAAAGTTCGAGTAAATGTTTTTGAGAGGTGGCAAAGTCGAACATGGT:1 + chr3L 12964848 3' + hobo 2938 1 73.91 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTATACCAAATATTTAGTTGCCTACCATAGGAAGTCCTTCCTTTTCAATAAGGCGATTTTGGGGCAAC:1 + chr2R 12371153 3' - I-element 55 1 57.53 AGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTACAGCGTACTCTCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTGAACTAGTAATGTAATTGAGATAATTCGTTTTGCGAAATGCGCTCCTAAACTCTA:1 - 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Ivk 473 1 75.52 AAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCAGTAATAAGTAGTAGTATATAAGAAGTATCTGGCTAAGTTCAGGTTGATGTCTGCACTACGGTCAAACTTCTTTAGAAAGGCTTGCCTGTTTGTAG:1 + chr3L 23181783 3' - 1360 373 1 67.12 ATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTCAGTGTTTTTCATATTCATAAGCTTTGGCATAATTTTGACAGTTTCCTCCTTCGTGGTGGACTGTTTAGATTTATTTTCTCACTTT:1 - chr3R 9109479 3' + blood 7177 2 78.36 ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTTGCCTAGAGCACATCACAACT:1 + chr3R 14049477 3' + transib2 2808 1 73.29 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATACATATGTATGAAATATTTCAAGAGTTTCCTGATTTTTCGACTAGCCCATATATCAGTTTTCGTTACCAACTTGTATTTCATTGTATTAGGTAGTTGAGTGGAGAATGT:1 + chrX 5773109 3' - jockey 19 1 44.52 GCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTT:1 - chr3R 11151810 3' + mdg3 5444 2 57.78 TGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGTGTTT:1 + chr2L 19140438 3' - Max-element 8296 2 57.64 ATCTACACACACACACACACATCTGAACAAATGCGGATAGTTACACGGATAGGTGAATCGCATTTCGATTTGCTGCCTGCACTGGGAAATTGCCAACTAACCATGCCGTGCACCCAAATCCCCC:1 - chr2L 3138653 3' + accord 7027 2 70.97 GTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAATATGTATATATGTGTGACAGAAAAGAGACTAAAATAGATTCTGCGCGTAATTG:1 - chr2L 13138977 3' - McClintock 6009 2 64.83 GCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTTGAGGATCGGAGCTTGAGGCCACTTCGTTTTTAATAGGCTTTTTTTTGCTTAACATGAATCTTTAATAA:1 - chr2R 15857529 3' - I-element 5039 1 52.74 GCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTATACTTATTTGGTTTTCCGTTTTAAAGTCAATTTCGAAAATAACAATACAGACCAATCAGAAAACTATACTTTATACAG:1 - chr3R 21216819 3' - 1360 42 1 52.41 AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACG:1 - chr3R 7470954 3' - Doc 72 1 52.14 AAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCTGTTCCTGAAAAATACATCTAAATTCCAAATTTCAGCAACAACAGTCTAAGCATCAGAATCCACTCGGAACAAG:1 + chr3R 7778408 3' - transib2 4 1 81.51 GAAAATAAAGTGAAAAATTTATTGTCTATATGGCATTTCATTTCACTCTGGCCGAGCCACTCCTTAAGGATAAACTCCTTACTGGGTATATTGGATATGGTGTCGGGACAGGATGTTGCACATCA:1 - chr2L 3875914 3' - transib4 2475 1 61.60 GGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACACTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTATATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCTCCCGAAAG:1 + chrX 22576494 3' - Burdock 6322 2 56.16 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAACGCTTGTAAAATATTACAATCGTGCGATCAAAGTAAAGGAGTGCT:1 - chr3R 11944841 3' - roo 8738 2 71.03 TACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCATTACTTCAAACTTTTGCCGGGCATATATTTTGT:1 - chr3R 12749374 3' + mdg3 5311 2 77.40 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCAATTCTAATTCGCCTGGCCAAAGCGAACTCTTGATTGAAGGTCAGCGCAGGAGAAGTTGAAGTCGGCCAGTCCGTCGCAG:1 - chr3R 16240873 3' + Tirant 8485 2 65.62 ATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGTATGTTATGTATATTAAATGTATATAATGCATTTATTTAATTAATTATTTATTTCATCATTGTATGTGT:1 - chr2L 13332600 3' - micropia 50 4 63.70 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCCGGTCACTCGCCAATTCACGCTAATGGGTTCCGATGCCTC:1 + chr3R 31141092 3' - Burdock 6149 2 74.81 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGCAGAAAAGTTAATTACAATATTTCATTGCTCAGACGTTGGTGGAGGGGCGGGTGC:1 - chr2L 12144199 3' - transib2 48 1 56.15 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCCCTTTGCTTTTAATAAACAATTTTTCGCTGTTTGATTTCGTTT:2 + chr2R 18014112 3' - Doc 84 1 69.18 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCTACATTTCCATACATATATATATATTTATTTTGAGTGAGTTTGTTATATTCTGAAAC:1 + chr2L 17380715 3' - hobo 63 1 63.70 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCGCACACTGTGCGGAGAAAGAGATGGGGCCACATGGGCAGAAAGAGATGGCACGACGAGCACATTTGCATTTTCATAGTTTCTGTGCGGACGACGATGCTCG:1 - chr2L 16615713 3' - hobo 15 1 74.10 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTT:1 - chr3L 18035520 3' - mdg3 75 2 65.75 AAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATGTATATATATACATATAGATACATCGATTCTCTGGCGATTCTTCGAATGACTCATACTCATCAGTAAATTGCGCACTCATTCACTGACCAATTGAATGCA:1 - chr2R 7720647 3' - Bari1 16 1 72.41 GGGAAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTTGCACTTGTAAACTGAACTGAGATAGCGAATCCCTAA:1 - chr2R 17544169 3' - gypsy5 7025 2 74.66 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTAAAAATTCTGTTATTGCTGTCGAACACACATTAAAATTAGACTAAAATAAACCCAAAGCAACTTTTAAATTGTACAATTGTT:1 - chr2L 15644833 3' + transib2 2787 1 60.27 TGGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAAAATGTAAAGGAATTCAATTTGAAATGCAAACAATGCAGCTCACACACACGCATACTAACGCATACGAAT:1 + chrX 19788896 3' - hobo 27 1 60.98 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCT:1 + chr3R 21674915 3' + roo 9013 2 58.90 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTATTTCACTGCCAATTGTTTT:1 - chr2R 11095718 3' - diver 5928 2 56.85 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAGGGCTGCAGTCG:1 - chr3R 7885577 3' - jockey 57 1 52.11 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGCGCTCATAACCCTACAGTTTGCCTTCATAAGCATGTTTTGGGATAATATATTTAAGCACTCCACTCTTTTACCGATTTCAGTAA:1 + chr2L 10446166 3' - flea 15 2 65.35 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGACAACCAAATTGGCCA:1 - chr3L 13690278 3' - hobo 49 1 60.98 GCTCCCTCTCGTTTTCTATTTTTATCAATAGTTCGTTGGTTTTTAAAAAGGTATAATACAAATGGATTCATATTATTATATGAAAGAAATATAAAATAATATATAAATTGGGAAATATTATCATGTGCGCTTGGTTTTATGTTATA:1 + chrX 23290628 3' - Bari1 1253 1 66.44 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGTATATAGATACATATAAAGCGTATCCTGATTTCCCCCTGCCGTAGGCGCCTATTTTTATTTTCCCATTCACTGCCAACTTATTTACGGGCCGCA:1 - chrX 18220538 3' + Burdock 232 2 67.12 TGAATCGAGCTGTACGATACACGGCAGCGCCCCTTGGTTGGTTGGGCGGGAGTTGTGACCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAATTATTTATATATACTAACATCGAAAACAACAAAAGCCACACGCAAAGTGGCCTGGTATTCACA:1 + chr3L 976109 3' + Cr1a 4389 1 68.49 CTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGAACCCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGTTCCATTTTCTATTAACCATACACTCCCGACTTTAATCATGGCAAATTGCTCTCGGGTTAAGCACATTTTTCTGGTCCCTC:1 - chr3R 23639019 3' - R1A1-element 5087 1 54.11 GGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAGTGTATCCTCTTCGGTGTAATTTCTTCCACTTAACTTAATCCCCACGATGCTTTACGGCAAGCAAACAAACATCTGTATCGCTGCG:1 - chr3R 30353297 3' + 297 6580 1 56.16 AATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAATTATGAAAAATATCCAATACATTTTCATAAACGTGGGAGTAGCAGTTTTGGTCGATTTTAGCGCTTTGAGTGGGCGTAGTCAAAATGTTTGTTAACACAACAAGTAAAATGACAAA:1 - chr4 1091927 3' - INE-1 301 1 76.71 GAGCTGTTACTTATTATTTATTACACCATTAGTAGCTGCATAGCAGAGCAATGGAGCCATTATTCTGTCCTCACCTGGTCACGCAGCTCGGTCTCGTTCAGCCAGCCGTTGCAG:1 + chr2R 12065708 3' + Stalker2 7648 2 75.44 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGTTTGATTTTGTAAACATTTACTTCCA:1 - chr2R 9294294 3' - Tirant 8155 2 54.11 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATTTTCATCTAATTAAAATGCATTACTAC:1 + chr3L 9470033 3' - 412 55 2 54.11 GGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTCTTCGTCAAGGGCTGGGGACCTGACTACCCACGC:1 + chr3R 31614766 3' + Stalker 7077 4 75.36 ACGTACGTATTTTAAATGTCAGATGCACCAATTCTAAAAAAATCAGCTCTCTAGCTTTATTATTTGACTTTATTCTCGATGTTAAGTTTATTTTGAATTTCTTTTACTACTAGGAATTTTGAATACCCGTCAATGCAAGTTAGGAA:1 - chr4 299677 3' + transib3 2780 1 52.74 CTGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATACCATGGAGCTCCAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCTCGCTGTACTATGTCTCTGTCACTTTTGACTCGCTTTTATTTATACAAATTGCTTTTGTTTTTCTCGCTCTCTCGCTT:1 + chr3L 4637264 3' - Doc3-element 4430 1 56.85 AAGTCTTTAAATATATTCGAGTTCACGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGGCATTAAATAAATAAAGGCCAACTTGATGCCGTCCTAA:1 + chr3R 18528392 3' - roo 14 2 68.07 ACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTC:1 - chr2R 5237762 3' - Doc 85 1 75.34 AAGTGTGGGCGTGACTGTTTTGTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAAA:1 + chr2L 21738000 3' - INE-1 244 1 63.50 GAAAAAGAAAAAAAAAAACACCGAGACGCCGAGAAATAAAAACCTATCAGCAGCAGCTAAAACGCAACACCAACATCGAACAACCTGC:1 - chrX 7565305 3' + gypsy7 5010 1 87.50 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTAACTATATTATAATATGTTGCCACCTGGCTGGGAGTGGAGGCCGCTCCTCCGCACCGGTTTCGGTTTGG:1 + chr3L 22594242 3' + 297 6926 2 60.00 CGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACGTATATAAAGCGTAGAAAAAGTGCGAAGTGCTAGGAG:1 - chr3R 27810036 3' + Burdock 6311 2 75.34 GATCTCGATGTTCATACGGACAGAGACGAACCGACTCTATTAAACAAAAAAGTACGCAGTATCATTCTGGGCGTAAACATACGCTTCTATATTGTTTAAAATTTTAGCTATAAAGTATTTCTTAGGCCATTAGTTTGACACTTGAA:1 - chr3L 6679646 3' - INE-1 132 1 53.42 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTCTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTAGACTTTGTAAAAGGGTTCTAAGAAAGCCATTTAAAAGCACACTTTAAAAGCAGGTTATAAATTTTCATTTTCAAA:1 - chr3R 18153540 3' - copia 46 2 54.11 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTTTGTACGATAGAT:1 + chr3R 21674945 3' + roo 9043 1 61.64 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGCGATTATGTTGCTCGTACCGAGAA:1 - chr2L 14239107 3' - 412 7083 2 65.07 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTGGCCCAAACGGGATGGCGGAAAAGG:1 + chr2L 12291985 3' - Tirant 8121 2 76.76 GAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTATCTGCCTTCTGCTTTTCTTTCCACTACCCCTACTTTAC:1 - chr3R 26505960 3' - Quasimodo 124 2 73.97 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTTTACACACAAACTACCGGATTGA:1 + chr4 311606 3' - 1360 57 1 56.16 CTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATACTTTGAATGTTGACATTTGCTTAGTTTCTTTTTTATAGCATAAAGTAACAATTTTGATTCCACAGTTTTTTGTTT:1 - chr3R 20149463 3' + Transpac 5182 2 51.37 ATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTCCGCCGACTCTGCACTTTCTTTGAAA:2 + chr2L 18112611 3' - transib2 2588 1 55.48 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTAT:1 - chr3L 14375602 3' + roo 9027 1 52.05 GTAATTAATATTATTATATTTATTGTATGAAGTAACTTTGTATATCTTCACTCCGATAGATACGCTTGTACGCTTACAGGGTATTTAAGTCTCTGCCTGCCTGCCGAAATGAACTACTCCGCCTCGTTCCTTTTCTGCGTGACCAT:2 - chrX 19409304 3' + Tc3 276 1 71.23 ATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCATACACTATGCGAGCGTTTCGGTAATGGAAGAGCCTCTC:1 + chr2L 8933942 3' + 1360 3153 1 73.97 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATGTTATTTCTAAAAGGCTTTTATTTTTCTTTATTTTAAAAATTTGAGTTAGGTTTTTCAGGCAGCTTAAACAATTATTCCTCACTTATGAGGTAACTGGTAAAT:1 + chr2L 11012301 3' - jockey 4688 1 69.18 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATAGATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACGTTTTTGATTATCTTAAAAAATTGTAATCACACGTAC:1 + chrX 2295292 3' - Transpac 9 2 57.53 CGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCCAAAGTTCAGACAAAGTTTGTTTTAGCTGGAAACTCAGCACTCAGCTATTGTCAGCATATTATT:1 + chr2L 18375365 3' - I-element 141 1 56.16 TTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGTTGCCAGGCAACAGATTTAATAAAGAAAAAAACAGCAGCCACTTTACTTTAGC:1 + chr2R 15075667 3' - mdg1 62 2 61.43 GGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATATATATGTCTTTAATAATAAACGACATTAAAGATCATGGCACGGTATGTTCGGACAAGGAAAAAGAAGGAAACAGTAA:1 - chr3L 15149383 3' - McClintock 31 2 63.57 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGCAAATGCCACCCATTTTATCGTTATTTACTTAGAGGATTTGGCTTTTGATACAACACATTTGT:1 - chr3R 13838178 3' - 297 32 2 63.01 GTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGAGGAAGTCCTTCCAATCTTCCTACTGTATTA:1 - chrX 4032159 3' - transib2 89 1 76.71 CTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTGAAATATTAACAACAAACGAAGCATTGCCAAGGGATGAAGTGAGCCTAAAGGTGAAAACCAATCCCCATTCT:1 - chr2L 15891525 3' - Doc 218 1 51.37 CTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTATGTCGAGAAGGCGCTGGACGTGACCGGTTTGCCGTCGG:1 + chr2L 336076 3' + jockey 4804 1 73.97 CACCACAGAGTACGGGGCTTACTAAAGTCAATTGCAGCCCTGAACCCTAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTGATGAAGGGTGTGGATGTTTGGACATTGCCTTTTAATCAAGCCCA:1 - chr3R 16113122 3' + baggins 4966 1 75.34 TCACAAAAAAAAACAAAAAAAAAATGTAGGAAGAAAACCTACATAAACTGGGGGGGACAAGAAAGAAAACACACCAGAGATGTAGAAGCCTCTCGGATAGCCCTCAACTCCCCGATAATGGCAGCATTAATTT:1 - chr3L 19026775 3' + R2-element 3584 2 57.89 ACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGTGTTTGTGGTAAATTAGTTTAAAATGGTAACTAAATCCAGTTTCTAGCT:1 + chr2L 19140482 3' - Max-element 19 2 71.23 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAACGAGTCAGCTGTTCGCCCGTATATATTCATATCGATTACGCAGAAGACACATTAGAAGATC:1 - chr3R 8217898 3' + P-element 2860 1 63.77 ATGAATTTTTTTTTATTCGTTACACATGCCTCCAGAAATATTTTGGAAAAGAGGGCGTGCCCCAACCCCGCCCCATTTATTACCCGATCAATTTTGCATACC:1 + chr2L 1953330 3' + hopper 69 1 70.59 TTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAACACTAAGCGGAGGCACTAGAGAAAACAAATCGAAACAGCTACGGGGTGTAC:1 - chr3L 7894603 3' + F-element 4583 1 65.07 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTCTTTTTTTT:1 + chr2L 21643145 3' - Tabor 6858 2 67.50 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATTTTAGTAACAAATGCTAACCCTGCGCTTTTC:1 + chr3R 11870147 3' + pogo 2055 1 71.43 ACCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCAAGCGTAGCCGCATGGACTGATTTTTATCGCAACGCCCAACTGACGGCCGAAAGAGGCCCG:1 + chr2R 17544244 3' + gypsy5 353 2 57.14 ACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTATAGCCCTTGGCACACATCACATTTTTTCACATCCCATCGAAAGCCATATAATTCATGGAGCCACACACGTTTCTTCATTAAATTCCACG:1 - 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Doc 144 1 74.66 TATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTGTGATTTATTAATATATATTTTTTTTAATTCAATAAAAGTCAAACAGAGTTTCTTGTGTATTTAAATTTTA:1 + chr3R 13620159 3' - X-element 4702 1 62.96 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAAAACGCCTCCCGTTGCCACTCAACGAAGCGTATT:1 - chr3R 20934654 3' - 412 43 2 54.48 CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTA:1 + chr2L 21643128 3' - Tabor 6901 2 58.22 ATTATTTAAAAAAAAAAACAAATGCAAAACAGGGAACGCCCTTTGACAGGCTTATGGAACTGCTTATTAGAACAAACATTAGGATATGATACAATTTTATTATTTGTTATTTTAT:1 + chr3L 18760632 3' + TART-B 10630 3 78.26 GTGTGGATGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTCCAAGGTGTTTTAATTAATTAGCTTTTTGTTTTTATGCCGGCGCTCTCTTGCTGTGTTGCTTCCTGAGCGCATTTTACATGTGCTTAGACACCGTATACCTAGACACCAAAACCCTCG:1 - chr2L 17098052 3' - accord 7035 2 60.27 GAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTG:1 + chr4 829120 3' + INE-1 141 1 34.93 CAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATATCTTTTTATAAAAATTTTA:1 - 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X-element 4708 1 65.07 GCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCGGCGGAAGTAGAAGTTAAAGCTACATGGTGGAAAATGTTGATTGATAATCGACCT:1 + chr3R 23235306 3' - BS 48 1 57.14 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATGGGGGCATTGCATACTTTCGGGCACAAATCGACATCGTTCCAGTGGTGTTCTATATTTAAGTTTTCCCAT:1 - chr2R 11083803 3' - jockey 23 1 52.74 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGAACCGATGGCAATGACCATGATGGAGCTTCCGCCCGTGCAGCAGCAGCCAATGGAAGTA:1 + chr3L 363550 3' + blood 352 2 57.27 GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTAGCCCAGCAAAATCATACTGAATATATTTTTGCTCCTATTATTTTGACCGCTGCTGTGGATG:1 + chr3R 17492906 3' - jockey 4759 1 74.44 ACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATGAAAGTAATGAGGGGCAGACA:1 - chr3R 14049286 3' - transib2 16 1 74.66 AGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGCTGAGTGTGTTTAAATGCAAATTACATTTCATTTCATTACTGCGCGCGGTATT:1 + chr3L 12982067 3' - accord 7101 2 66.67 TTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATATATAAGTTATAACCTTACTATTTAATATTTATTACATATATGAGGTATGGTTATGACTGATTATACATA:1 + chr3R 11481989 3' + BS 5034 1 55.48 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:7 + chrX 23439059 3' + P-element 2495 1 60.27 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGGCTATATGGCAAAGGATGTGGAAAGAGGTCGGTTTGCTATTCACTTGAATTAAAATGAATTTAAGTGGTTTGCTATTGGCCAAAGTTGCTCCCATATGCAG:1 - chr2R 21748197 3' - 1360 19 1 69.18 AATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGTATGATGT:1 - chr2R 5582131 3' - Cr1a 450 1 67.12 ATAGTTTGTAATTTAAAGAAAATATAAATTGCTTTAGTTTGATTATGTTTGTATAGTTAGGAGTAAAAATACAAACCTGAGCATTTTCTAACTTATAAAAAATGGCATCAATGGGCACAATAAGCATATAACAATGACATGAAAGC:1 + chr2R 16074110 3' + Porto1 4660 1 65.07 GCTGTCTCAAGCCAAGCCCCAAATCTGACAACCATACCTCCATATTGGCGCTATAATTTCCTTGTAAATTATCACCTTGTTGGAGAGTGGCAATTTACTTCGCGAATTAATGCTCTCGATTTTCACACTTTTTTAACAATTGAACG:1 + chr3R 14286714 3' - BS3 1324 1 76.03 TGGCGCCCGAGCAGGGACCAGCGTATTTTAAGCATACAAATATATTTGGGCTTTTCGAAATCCTATCACAACGTCTTATAAGCGGGCATATTTTATGATAGATGATATTTTAAGAGAAATGTATATATTTTAGAAACTCACAGGAC:1 + chr3R 27996526 3' + HMS-Beagle2 332 2 50.00 TTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTTGGCTCAACAGTATATGCACTAAATAAAGTGCGAAAGCGAAAAT:1 - chr3R 779406 3' + Bari1 1632 1 67.81 CAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACGTTTAGATACATTTATATCTAGTTATGGAGTGGGGGAGGGGGGGAATATTCTATCGAAGCCATTATCTTCGGCAGTTATGTAAAATTGATTTCGAACATTTACTCTT:1 - chr3R 25713966 3' + flea 5012 2 79.14 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCAAAGCCCAGTTGAAAGCTATGGATGATGAAAATGAAAAC:1 + chr2R 5754615 3' + P-element 2848 1 58.27 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGG:1 - chr3L 19031221 3' + roo 352 2 53.10 TATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTGTATGGACTGAGACTTACCTGATCGGATCGGGAGTGCTAGTGGCTCCGCTCAGCCTGTTTAGTGCTCTGAGTGCTGCCAGCGTACTTCGGCATTGGG:1 + chrX 18220719 3' - Burdock 6147 2 73.72 AACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTTGCACTTGTAAACTGAACTGAGATAGCGAATCCCTAATGGCTG:1 - chr2R 17544163 3' - gypsy5 6978 2 59.05 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGGCCGGTTAACTGGAAAGAGGTAGTGTTTTAATTTTAAGTTTGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATTCTAGTTCCAGTGGGCGTTGAAAAGGAAACGAAGTT:1 + chr2R 17097629 3' + P-element 2883 2 80.82 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGCTTT:1 - chr3L 17667559 3' - F-element 76 1 60.96 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCCTAGAGATGGTCCGCCCATCGAAGGCGTTCGTTCTACACACACACACACACACACATCGCTGCGATCGCAGACATCGCCAG:1 + chrX 6462134 3' + hopper 1376 1 55.86 GTAACGAGGAGTCTACAGACCCTGGATCGCCATATGAACGGCCCACAGAAATTTGGTTCTTTGCGTTTTGTTGAATATCTTCTCGATCGGCACGTCATGCCTTTTACACCTGCAAATGG:1 - chrX 15325806 3' + invader5 321 2 73.11 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGT:1 - 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Tirant 18 2 70.40 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCC:1 + chrX 21947743 3' - mdg1 50 2 52.05 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTTTTCCACTGCCATTTGAGATGTTTGGAACAAATGCATTTTCACATTTCTGTGCTGCTT:1 + chr3R 17258177 3' - 412 7114 2 59.03 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATGAAAATTGTGAAAAAGATGATGACCGATTTTCAGAAAAAGAT:1 - chr2R 5237684 3' - Doc 13 1 64.83 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCCCGGCATGTTGTCGACATTTTTATGGCTGCCAC:1 + chr2R 8688148 3' - F-element 55 1 67.96 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCACACCCACCTGAAGGTCACGTCGCTGAGTTCTGGGTTGTTAACGAACTTGGGATCGATGCGGGACCCCT:1 - chr3L 21665216 3' + 1360 3377 1 68.57 GACTATCAGATACCCGTTACTTATTATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGTCCAAAACTCCAAATATTGTACATCTGTCCGACAGTGCGTCTATCCGTATGAACGTCAAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTGGAAGGT:1 - chrX 392288 3' - INE-1 549 1 58.90 CACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACAAGTAAATGGTTTTGGTATGAAAAGTACACCTTTGCCACCCAAAGTATTTCAAA:1 - chr2L 11554457 3' - roo 8767 2 61.48 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTTTTTCTGTTAATGAAAACAGTGTATTTAAGCTTAAATCAGAAACATTACTCCTTAACCCATTTTAATTATTGAAATTCTAAACAAG:1 + chr2L 19691362 3' - roo 34 2 60.27 GTTTTTTTTTATTGAAGAGAGCTTACGCTCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTTACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAA:1 - chr2R 5206895 3' - Doc4-element 48 1 59.69 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCGCACACTGTGCGGAGAAAGAGATGGGGCCACATGGGCAGAAAGAGATGGCACGACGAGCACATTTGCATTTTCATAGTTTCTGTGCGGACGACTA:1 - chr2L 16615719 3' - hobo 26 1 68.75 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATTAGATTAAATGACTTAATATTTTTTTCTTCGCAGTT:1 - chr3L 18253755 3' - blood 7042 2 63.01 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATG:1 + chrX 3646990 3' - 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chr2L 63846 3' + X-element 4331 1 54.79 ATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGCTTAATTGTGGTCACTGGTT:1 + chr3R 15790108 3' - flea 4716 1 73.04 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCCTTTTTGTTTTACTTTTACCCACTACTCTACGATCATT:1 - chr3R 24603085 3' - I-element 84 1 72.41 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGTCTTTAGTTGTCATAACTTTTATAATAATCATATAATATAATCAAAT:1 - chr2L 11143110 3' - 1360 70 1 70.42 CAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATAACGAGCTTATCTTAAAAGCGGAAAAAATAGTACAAGCA:1 + chr2L 10147792 3' + Ivk 4924 1 73.29 GAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGT:1 + chr3R 6413631 3' + 1360 3311 1 71.92 GCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCATATGCCATTGAAGCCGACTTTAATCTCCAAACCGGTCAGACAGCCATTGGTATGGACGGG:1 + chr2R 14849025 3' - flea 4731 1 52.38 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCAT:1 - chr3L 13690272 3' - hobo 39 1 54.62 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTTTGCCGATAGCTTCTTCAATATTGATAAACATGGGCCAAACAACAGTTACAGTTTAAGTATAATACTCTTA:2 - chr2L 10514227 3' - 1360 16 1 69.18 GGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAGGGAAATACT:1 - chr3L 13952752 3' - I-element 5142 1 55.48 GACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGGTTTGAAAGGACGAGCTGGA:1 - chr2L 4420507 3' - gypsy5 7009 2 63.01 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTATGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCAATCGAATTGAATAACAATTGAATTGAAGCACAAAATTGAAGTAATTTATTTGTGGATG:1 - chr3L 26741223 3' - F-element 59 1 65.25 AGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACAT:1 + chr3L 27415316 3' - transib2 60 1 58.22 TATGCACATAAGCATAAGCAAGAAGCGCTCTCGCGCAGATCAAGGAAACAACCCACTAACCCAGTACATCTAAGATTTTTTCACACCATTTGTTTCAGTCTTAAACCTTTCATGTAGTCAAAAACGTACTTATTTAAATAGTACTT:1 - chr3R 26352281 3' + Tom1 188 1 71.23 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATCACAACAATGTGCAAGAGGTCTTATCTGTCACCAAAATACATTACCAATTTATTGCCAAAAAAAAGAGTGTTGGATGGATGGCTACAACCATCGATC:1 + chr3L 12836133 3' - 1360 22 1 69.86 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAAACTCGCATAACGATACATAGAACATTACGCGCGAAGTAAAAGTTCCTCCTAAACAA:1 - chr2R 12065537 3' - Stalker2 7265 2 75.34 TAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGGTTTGTAGTTATTGTGTTATCGTAATTAGTGTTAAGTATT:1 + chr2R 1918713 3' - F-element 171 1 72.60 AAAGACAATAAAAAGGCCATTTGAAGATATTCATTTTACTTAACTTAGTTAACTGATTAGTTATTTATAAATTTTTGTAAACAAAGTAAATACCTTCTACTTTATTCCACACTCGCAGCGTAACATAAATTCAGTTAGCCTTGCTG:1 - chr2L 19856327 3' - Transib5 363 1 71.23 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGAATTTTAAATTTTATATGTGCGTTGATTTTTTATGTATGGTGTATTTTAGATTTTAGATGTGAACTTAATTTTGTACGT:1 - chr2R 1000281 3' + HMS-Beagle2 7158 4 60.27 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTTCTACCCACTTTTGTTCACAGTGCATCCATATTTTGTGGCGCATCCTTG:1 + chr3L 1358579 3' - 412 7073 2 66.44 GCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTA:1 + chr2L 8574479 3' - Transpac 41 2 56.16 TTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTGAGGAAGAACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAATTTCATAAAAATATGATAACTA:1 + chr2L 6007626 3' - 1360 434 1 46.38 TAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGACTTGTTCATGATCTCTTAAAGTCTTATTTATACTGAGTGTTTTGTGTGCCTTTTATTT:1 - chr2R 916504 3' + micropia 104 1 60.00 CTACGCATACAGTGATAGCAGACAAATGTGTGTGCACACGTATCCATGCATTGTAAATTTGACAATATATGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTAACGCATTTTCTGTACTTCGCTGTGGCTGTGGTTCGCTG:1 + chr2R 7079172 3' + 1360 149 1 47.95 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGCTTTACAAAGTATAGTATTGTTTATCTG:1 - chr3L 17667535 3' - F-element 45 1 55.40 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGAC:1 + chr2L 17260780 3' + P-element 2849 1 33.71 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGATGTGGGGCCATAAAAATAGCCTACTGAACAGTTTGCCGAATCGAACTATGCCAATATCATGCCCACCTATTTTACTCCACCTGCCACACATATGTGTGATTATTCAA:1 + chr3L 4044452 3' - 1360 53 1 44.52 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGGTGTATTTACTTTGCAGGGGGCAAATAGACCTCGAC:1 - chr2R 9776759 3' - jockey 4750 1 77.17 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAGCATACATTATGCAACTCCAAATCTCCTCTAAGATCGATCGGAAATGGTTTTTAAGGGCATATAATCTTCGGTTTATTCTTTCGCGACTTTCG:1 + chr3L 786005 3' + I-element 5327 1 65.75 ACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCC:1 + chr3L 21093262 3' - Ivk 33 1 63.01 GCTTGACATCACGTTACAATAGCGTCGCTGAGTAACAGTGTGGTCTGGCAGATCTTCCACCATATACCGATCGTTGTTGAGGACCTGAGTTTAAACGAAGATCTGTATTAAAGAGTTTTCACTTGATTTCGGTTGTGACTCGCAG:1 - chr2R 15432696 3' - Bica 4821 1 59.31 TATTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTAAAAAATTTGAATAATCTTGAATAACTTCAAAAATGTTGTATCTCTCAATTAATATTTCTAATAATCGAGAAATATATAGAGCTCAATTTATTCAGACAGTCAGTCTGGTCTAGCTTGTCTA:1 - chr3L 12059438 3' - Doc 4694 5 73.29 TACCCATGAGTTATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAACCCCCGCTGGGCCAATTGATTCAACGATCCCACAGCTTAGCTCCCCCATCACTTTTGGCCCACCAGAGGGCCCAATATGTGAGTTTAAAACTTTGTTT:1 - chrX 13017705 3' + Quasimodo 6991 2 50.68 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTGCAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTCCCTTTCTCACATTCTCCCCTT:1 - chr3L 19580881 3' + roo 9014 2 54.79 CCCCGACCAATCTACAACTTTGTAATCCCTTAAGTTAATGCCCCCCCACCCAAACATGTAATTATTGTCCAGATGGACAGTATATTTCTTTTTTTTTTTAGTAAAAGTTCGTTTGGTATATTTTCGAATGATTTTT:1 + chr2L 2469211 3' + G-element 4222 1 55.88 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAAAACGC:1 - chr3R 20934682 3' - 412 65 2 64.03 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTACCAAAAAAGGGTTTGTTCTAAATGAAAGACTGTTAAAATATATATATTTAGATTTGGTCCATGGCCTTTATTTATAAATGTCTTTCCT:1 - chr3R 21674785 3' - roo 8693 2 56.85 TTCTTGATCAGGATCGATAGCCGAGTCGATCTCGCTATGTCCGTCTGGCCGTATGATACAGACGATATTTATTCACATTTTGCGCTGTATATTATTGTACATACATCACGGATTTATGTTAATTAAAACA:1 + chr2R 5682483 3' + INE-1 87 1 63.08 CTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCC:1 - chr3R 14049349 3' - transib2 79 1 70.55 AATGGCACGAAGTGTCCTTGGACTGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGAGAATGTTTTATTATTACGGGGAGATCGTTAATGATTGAAATAAGCATCACGGCTTAAACTTATCTTATATTTAA:1 - chr3L 20904989 3' - Q-element 607 1 68.35 GTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACATTTTTGGTGACGGGCAAAATTACCCCTTTTCCGCTCGCTTACGGCGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAGCAGACTGTAGCAAGTATTCACATCAGAGC:1 - chr2L 40310 3' - 1360 3363 1 74.10 TTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATTGTATGTTTCTCTAGATAAAATTAAATTGGTGGTTTCTTTT:1 - chr3L 21907555 3' + 1360 3275 1 71.13 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATCAAAAGAAATAAAGCAAACGTTGCTTTCTTTGGCTGTC:1 - 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chr3L 7460607 3' - 412 7107 2 55.48 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGTCTTGAAAAAAGAGCGAGGAGTACACACGAACACAAAAACGATTACGAATACGAGTGGGA:1 + chr3R 25050103 3' - P-element 45 1 54.79 ATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATAAATGTGGTGCGCTGGTCCTCCGATGACTGGGCCACCGTT:1 - chr3R 16537859 3' + G2 2807 1 57.69 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATTTTAGTAACAAATGCTAACCCTGCGCTTTTCATTTAAGCCAGGCTTTCATGCATTACATTTCATTTTCATTTTTCTTAGTCGCTGATTGTTTGTTGAT:1 + chr3R 11870214 3' + pogo 2087 1 75.00 CTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCACATATGATGCATGCCATATGCCATTACGTTTGGCGTGGTTTTGCGCTGTGACAAGTGGTTAGATGTTGGGAGAAGCTGGTCAAATCCCGCCCAGAACCACGCCATATTC:1 - chr3R 12520688 3' - Burdock 6148 2 76.03 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGATTAGACTTGATAGGATGACTTTTCTTTCAAATATCTTTTTAAGTCCTTAAATGTTTTTGTTT:1 + chr2L 15644962 3' - transib2 57 1 58.90 GGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGACCGAGAAATCTGCAATTTTTACTAGAAAAATTCCTTCACAGTGACTTAGGCAATGTT:1 + chr3R 12528369 3' - roo 8862 2 60.96 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCCGGAAAGTAGGCAGCAGAAAGCATTTAATTTTTATAGTGCCGC:1 + chr3L 15723967 3' - jockey 4717 1 51.03 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACTAACTAATATAATCAGCTTTGTTCCCGTTTTTAATAACCTAATTTTGGGACTTCGATTTTGGGAAGTAG:1 - chr3R 10150134 3' - 1360 53 1 54.11 GAAGTTATGTACACAGTTCAGTTCTAATAAAGCATTCACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGAT:1 - chr2L 22315576 3' - frogger 75 2 75.34 CAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCAACTGCAACAGCAGCCGCATGTAAGCGGCGTACGTGTGAAGACCCCG:1 + chr3L 21263231 3' + jockey 4689 1 62.40 CGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCGGAGCGTGGGACCCCGATGAGGCGGGGACTATTTATTTAGGCCTCTGCGTAGTTACAAAGTGAAAGAGAATACAGAATACGAAAAACAGGTCGATAATTCCCCCTCAGTTGGCAA:1 + chr3R 22074238 3' + roo 237 2 52.90 GTTTTGAGTAAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATATCGGGATTTTTCCGGATGTGTTTTCCACGAGGGAACACGAAAT:1 - chr2R 16993480 3' + F-element 68 1 69.06 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGGCATTAGTTCGTGCTTTATGCCCTATGCATTTTTCATTGCTCAA:1 - chr2R 7232664 3' - jockey 72 1 64.62 GAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAATATTTTCATTTACGTATTGGATTCTTGCTTATAATCGTTGCCTTCACTGTTTATATTGCCAATTAGACATTAAAACCAGTTA:1 - chr2L 52895 3' + Tirant 8393 2 56.16 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTTTTTCTGTTAATGAAAACAGTGTATTTAAGCTTAAATCAGAAACATTACTCCTTAACCCATTTTAATTATTGAAATTCTAAA:1 + chr2L 19691358 3' - roo 38 2 57.53 CTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAA:1 - chr3L 14375610 3' + roo 9019 2 53.42 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGCAATCGACTGCAGAGACCATAAATTTCGATGGGATATTTAATAAAACAGAATATTGTTAACGTGGCAGAAGGGTTAAGTAAACTACAGCTTTGG:1 + chr2R 15070207 3' - 412 7081 2 65.75 TTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTC:1 - chrX 1103632 3' - pogo 78 1 73.43 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACGTGGCCAAGCACGCG:1 - chr2L 13629023 3' - Tirant 8120 2 76.64 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCGGGTACATTTGCGTGTATT:1 - chr3R 25049991 3' + P-element 2860 1 56.36 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGTCAGTGCATATGTGTGAGGGTGTCGTACTGTCTATGTTAGTGTCAATTATCTGTGTCCATGTAGACAAGCAAAGTAAGCTTTTTGGACGGCAAAAAAAAAAA:1 - chrX 17982721 3' - hobo 15 1 74.65 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTATTGAGGTGTCTTATCTAATATTTAGAAAGAAATATATCCTTTCAAAGGGTA:1 - chr3L 785840 3' - I-element 19 1 71.23 TATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTGGCATGCCCATTGCTTCATATACCCCCTACCCACAAC:1 - chr3L 7791852 3' + Transpac 311 1 80.33 TGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCC:2 - chr3L 7837180 3' - jockey 4839 1 66.44 AGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAACGGTTGGCCAACTTGCTGCCATTGATGTGTGATGACGGTTTCTGGGCGCGT:1 + chr3R 7161627 3' - F-element 4214 1 61.79 AAAAATAATAATAATAATAATGTGTACTATACCCAGCCTATTTTTCGTTAATATTTTTTATTATTAATCGCTTTATATTCCACTGCCTAATTAACCCCGTTTAACTTACTGACTTTTGCGTTGGGTTGAAATGAAAACACGCTTAC:1 + chr2L 12495649 3' + invader6 4388 3 58.90 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTGTTTATTAAGCACTTACACTTGCGCTATGTTAATCTCCCTAGATTATACATCCGTT:1 - chr2L 4637197 3' + mdg1 390 2 49.11 AATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTG:1 + chr3R 10030772 3' - BS 5062 1 62.90 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGTTCTCTGGTTGAAGGACACATATCGCCGCTGTGGAATCAACGGGCGTTAAATTAAAT:1 - chrX 5503672 3' + hobo 2913 1 50.52 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACGTTACGA:1 + chr2R 20447890 3' + hopper2 1543 1 61.54 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGGAGTTTTCTGCTTCGAACTACTTAAAGGGAGAAAGGCTATGAAAAACATACA:1 - chr3R 28116999 3' + hobo 2925 1 51.95 GTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATATAGTACCCCTACAATATTAAGTCAAATAACTTAATTAATATACTAAATAATTAAAGGAAGTACAATCCGACGCCAAGAATTGCTCTCCTCGGATTCGCGGCTTTC:1 - chr3R 14164461 3' + invader2 228 2 73.29 TGTATGCTGAATCTCAACCCTCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATTTTTTATGCGAAAAATTCCATTAAAATGTTATCCACAGTTTTC:1 - chr2L 18159009 3' - INE-1 173 1 52.05 GGTGGGGTGTTCTGTAGTGGTTCCATTAGCTTCCGGTTGCGGCTGACGTTTCGCGCTCTCACTCCCTCCGCCGTCCAAATACATATTCCCCTCTCACTATCCGGCTAATGCTGCTGCTTCTT:1 + chr3R 20898863 3' - HMS-Beagle2 6791 1 77.05 GGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGACGAGCTGGAAAAGCTTGCGTCTGAATTGAGAAAAAAACATAAAAGGACGGGTCTGAAAT:1 - chr2L 4420457 3' - gypsy5 6948 2 76.30 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGCGCAGGATAATTGCCAGTCGCTGAGCAACAAAAGAGATTAGTTTAATAGTT:1 + chr3L 10112271 3' - I-element 33 1 50.93 CATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGAGTCCTGTTTACTGCTAGGAACTTCAATTGCCAACTTAAA:1 - chr3R 19475864 3' + jockey 355 1 72.60 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGAATTTGAGGCAGTTCGTAGAATAAGTCGTCTCTCTGATGGTGTTGTTGCATACAATATTTTTTTCCTCCTTTCATTTTTTTCCATAGTCGGCTTCATTACGTAGAAA:1 - chr3R 4576906 3' + mdg1 7446 2 76.03 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCAAATGGCCCACACCCTCAACC:1 + chr3L 18183238 3' - Tirant 6 2 81.43 CGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGTATACTGACATAGTACAGGAAGTTCGTAATAAGGGTAGAAAAATGG:1 - chr2L 18630445 3' - G-element 43 1 55.07 GTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAA:1 - chr2R 12065599 3' - Stalker2 79 2 70.55 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATAGTGCGAGTCGGTCTGGAACACCTCCATGGCTGGATTTTCTACTCT:1 - chr3R 21521038 3' - roo 76 2 69.86 TGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTATGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCAATCGAATTGAATAACAATTGAATTGAAGCACAAAATTGAAGTAATTTATTTGTGGATGGAAATAGAAATAAATCAAT:1 - chr3L 26741204 3' - F-element 68 1 58.90 GGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGAGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATATTGAT:1 + chr2R 3760472 3' - accord 34 2 58.16 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGTCTTGAAAAAAGA:1 + chr3R 25050056 3' - P-element 92 1 22.60 CCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCGTCTCCCAACGGTCCGTCCTGAATAAGCCCTAGGATATTATGGTGGCTTGGC:1 + chr3L 27141114 3' + FB 85 1 77.50 GCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAACAAGTTTTGTATGCGACTGGGTCTGGTTGCTGTTTGT:1 + chr2L 5646949 3' - jockey 4623 1 70.16 ATGGGTGGCGAAGGATATGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGAGTGATGTGAGCGGAAAGTGTAGGAAGTGCTGAGATTGAAACCATGCCGCATAGTTAACCAATGTAATAAATAACACCAAACACCCTCAGAAGAG:1 + chrX 6759971 3' - transib4 2417 1 69.18 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTCTGTGTGGTATGTACAGTCAGCGCCACAATCGTATGCACTTTCG:1 + chr3L 21910461 3' - pogo 40 1 60.00 ACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAATGATTGCTCGAATTAGTTATCCCCTGCCCCGCGAATCCTGCAAACAATTTCTTTGCGGCCGGTCCTGGAAGTTTCGT:1 - 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chr3R 14277890 3' - P-element 44 1 43.70 AATACACATAAATTGGATGTTACACAACACAAAAACAGTACAACTACACATATATTAACTAAATACGTTAAAAACAACATACCTTGGCATTTATTTTCCATATGAATCCAAAGCAATCAGGTTCCGGGAATTTAAAATCATTTGCT:1 + chr2L 7555636 3' - transib2 350 1 70.55 ATGTTTGTGATGGATCACAATTGCGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGACACATATAACATGCGTATTATTCTATGCAATAATTTTGTGCTGCATACTTTTAG:1 + chrX 18179875 3' - jockey 74 1 62.07 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAAC:1 + chr2L 12486401 3' - roo 8749 2 78.77 AGTCGTCAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCTTAGGGTCTTTTATTTGCGATGGTTGGCA:1 - chr2L 15777818 3' + 297 309 2 78.08 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCATTGACGACCCCAAATGGCTAAAAAAGCTAAAGAGCCAGCAAGCTACATAAGCC:1 - chr3L 21013820 3' - roo 31 2 63.01 TTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATATATAAGAAGGGGTCTAATTCCATATTGATGAGACCGAGATGGGATTGTCATGGGTGAGGGTTG:1 - chr3R 28406341 3' + opus 448 2 57.53 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACACACACACTTGCGACTTGCTCGAATGCCGATGATTGCTCTCCCCTT:1 - chr2R 8666034 3' + P-element 2814 1 34.25 AGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGCATTTCTTTTGTGCTTGTTTGCCAGCGGAAACGGAAGTTTTTAATGTTGTCCATTGGCCGTAGGTT:1 - chr3R 15727068 3' - blood 7360 2 61.90 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTTGAAACCCTTTTAGAGGGGGAGTGGAAATAACGAGATATTATTAGCAACTATCCATTCTT:1 - chr3R 12458386 3' - FB 61 1 61.64 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTCTAATATTCAC:1 - chr3L 17537729 3' - Doc 35 1 57.26 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACA:1 + chr3R 6413655 3' + 1360 3335 1 56.85 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCAAAGCCCAGTAGAA:1 + chr2R 5754590 3' + P-element 2816 1 41.10 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCGGGTACATTTGCGTGTATTTGGGTATCAGCGGGTGTATAAATACCGTGTTTTGAG:1 - 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chr3L 15734434 3' + hopper 343 1 56.85 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCGTTTAGAATCCGTTTTGCAAACCAAAAACTTCTATTCATTGAAATCACTTGTTCGACATAAATGACCGAAAAATTGGGTCAATCACTG:1 + chr3L 14167462 3' - mdg1 32 2 63.45 ACATTCTTGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATGAATCGAGCAAGAGTTAAGATCCCAGATTGCGTCGTTTGTAA:1 + chr2L 1882273 3' + copia 389 1 71.23 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAAAAC:1 + chr2R 10160611 3' - hobo 63 1 58.90 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTTACCGGTTAAACGCCAAGGTCGCAGTTTGTTGGCCAACTG:1 - chr2L 18522255 3' - roo 8743 2 71.92 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATATTTGCCCACCTCGTATTACATACCCACGACTTGCCATTATC:1 - chr3R 13437107 3' - hopper 13 1 66.44 TAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGG:1 - chr3L 17667565 3' - F-element 82 1 65.07 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACACATCCTTATCCTATCTCTTACAAAAAACAGGAAAAAATGTCATGTATAGGTCACGG:1 + chr2L 7652339 3' + roo 399 1 78.08 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTAGCCCAGCAAAATCATACTGAATATATTTTTGCTCCTATTATTTTGACCGCTGCTGTGGATGCTGGACTGGGAAACTAAAGTCAACAAACGGCAGTGCTGCTG:1 + chr3R 17492947 3' - jockey 4765 1 78.83 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATTAATCAATTAGTGACCTTCAGTGCGGCCCACTTCC:1 + chr3R 14986152 3' - jockey 4701 1 62.07 GCTGATCGTGATTTCCGCCGATGGCCTACATCTCGGCTTGGGTTTCCTGTTGGCTTTCTTTTCGAATAGAACAGTCGATTGGCCACTGTAACAGCCGCGG:1 + chr2R 11634091 3' + Gypsy12A_LTR 206 3 79.00 AGACCACAAGGCTGACAGTTAAAAGAGAAGTGTTCCTCTCTACGTAAATAATAATCTTCTGCTCACCGGACTCCCCGGAGCAGCCAGCGAAGGTTAATGGTTTTCGTTTTTAGTCATCACATTTACACCTTAAGTAGTATGTTTCT:1 - chrX 7609202 3' + Gypsy6A_LTR 256 1 63.70 TACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAAAAAACGTGAGAAAGGAAGAATAATTTGCTCTTAAATATTTTCCCATTAAATG:1 - chr3R 13241300 3' + jockey 259 1 64.38 CTATCAGATACCCGTTACTCGATTAGCAGAAGTGCTTACCCAATTCTAAACACCATTTCTGGCCATCTAAATATTTAAATTTTTGTATAATAACAATGGAACATTAAAAGGTGGAGTGGATCTACCGCCGAGGGGGGAAATTCCGA:1 + chr3R 28477676 3' - INE-1 547 1 43.84 TCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGAACCGATGGCAATGACCATGATGGAGCTTCCGCCC:1 + chr3L 363526 3' + blood 7304 2 76.03 AATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACAAAAACACATTAGCTTGCTTACCGAAATTCCA:1 - chr2L 20718422 3' + Stalker4 6917 3 77.70 AAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTA:1 + chr3R 6413638 3' + 1360 3318 1 67.12 GGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATCGGGCGTACTCCATGTCATCCCGATCCGAGCTGGAGTAAGCACTGCCGTTCAGC:1 - chr2R 23047328 3' - F-element 4452 1 56.45 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGTATTC:2 - chr2R 5070907 3' - Tirant 8108 2 33.56 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCAAGG:1 - chr3R 14277883 3' - P-element 58 1 43.57 TTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTGGCTCAAAGTCGCAGAGAACGGCTAGAGCAAGCGAACGACCGTCAGAGAACGG:1 + chr2R 1320506 3' + Transpac 278 2 53.10 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGACTAAAC:1 - chr3L 18381919 3' + copia 5088 2 49.32 CTGCCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTCGTATGAGTAATTGG:1 + chr2L 18689249 3' + Gypsy6A_LTR 251 1 71.23 GATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCA:1 - chr3L 7837179 3' - jockey 4838 1 65.75 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTATCTATTAAACTCATAATGCTGCGTTTACCATTACTATCATTATGTTTGGGGGTGTCTATAACCTAACATAAGCCTTGTTTGCTG:1 - chr3R 7823270 3' - flea 4789 2 61.64 AATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAATAAAAGTACTTAGGTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATT:1 + chr3R 1035905 3' + GATE 407 1 52.45 AGCATCCGCTTGAAAAGTATGCCTCAACGGCAAAGGCACGCTCCTCACATTTAACTGAATGGCGCGCCTTTTAAAAAACTACATAAACAGCAACAATAACAGGAACGGGAGCAGTTGCAGTCAC:1 + chr2L 17120069 3' - mariner2 173 1 62.90 TAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATATACATAGAAGGGACTAACAATGCAAGTCTCT:1 + chr3L 14302261 3' - Quasimodo 79 2 78.08 CACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTC:1 - chr3L 26852647 3' - 1360 46 1 64.71 GCTCTCGTTTTTGCAAAATCTCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATATATGTGGGTGAGTGTCCAGCGGCCAATTGATGGCGTTTGCGATTTAATTCAATGCG:1 - chr3L 19819115 3' - micropia 5170 1 53.72 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATA:1 - chr3L 18381936 3' + copia 5071 2 55.48 GGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCC:1 + chr3R 24454854 3' - F-element 306 1 70.00 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGTAAGCCCTTTTAA:1 + chr3R 30264092 3' - blood 10 2 62.03 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAAATTTATGTTT:1 - chr2R 13761622 3' - jockey 4746 1 67.12 CTACATACCCCTAATCTTAAATCATTCTGTATGTTCATAGATTTAAATATCAACATGCTGTGCATGCTTGCTTACACTGATATAATCGCCTTTACCCGAAATTGTCTGCCTGTACTTGTTCAATATTTATAAAGTATTAATTACGT:1 - chr4 1179584 3' + Cr1a 4132 1 78.77 CAATACACAGAGGCACAACACAGAGGCAGACTCGAGACCAAGTCACGGTCGCCATGTAATAAGTATTAAGTAATTGAGTGTGAGTCTATGTGTCCTGTGGCATGTTGTACCTGCTTCAACAGCTGCTAGCAAAA:1 + chr3R 7685293 3' - Stalker2 457 1 53.73 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTTTCCTTGATGCGCATTTGGCACAGCGCTGAAAAGCGTGCTACACTTTTTGAAATCCTCGGAAGAGCCAAGAATATGCACCAGATGTGATGCTAACCG:1 + chr3R 26846882 3' - hopper 22 1 71.92 TTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAATTATCCTGCTCCACATTACATCTGTGCTCCAGCCGAA:1 + chr3R 27123774 3' + 1360 397 1 73.97 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTCAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGGTTTTGGTTTTTTTTTTATTTCACTAATTTAGGTCA:1 - chr3R 20840080 3' + roo 8989 2 76.03 AAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAATGCACCACATCCATCTGCTCGTGCTCCATG:1 + chr3L 2722260 3' + Doc 162 1 75.00 ATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGATAAATTAATTAAAAGTAGTCTCGGAAAAGTAGTAGACTCGGAGAATTGTAGTTGCAGTGGACTAATGCAGATCTCTGATTCCAATCCATGGCATCGTTTCTGGAACAGCGCTGCAGGGCT:1 + chr2R 4720580 3' - Cr1a 4008 1 49.32 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACCGAACTAAGACAGCA:1 + chr3L 21093280 3' - Ivk 15 1 75.34 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAAATGAAACAAAATGGGAGGAATTAAGTAAGATTTATATGAGGCGATTTTTTAATCTATAA:1 + chr3R 9963281 3' + I-element 5288 1 62.33 TAAAAATTAAATAAATAAAAAAAATAAATAAAAACGAAAAACATATGTACAGTTATTTCTGGAATCTACGATGGCTTGTATCCTATTCCACATTCCGTATCCTATCTTTAAGCCAGCTGTACGATCCATTCGCCTAACGAGGTACG:1 - chr3L 3295867 3' + Doc 4696 2 76.03 CCACTTCTGAGATTTTAGCCGCAAATCGTTAGAGAATGAAATTGTTAGTCCAAAATCGTTTAAAAATGCCAAAGCCAAAATCCAAAAGACAAAACGAACTTAATTTCAGCGGCAACCAGAAATAAATCGG:1 + chr3R 11149528 3' - mdg3 259 1 54.62 ATAATAATAATAATAATAATAATACTTGTGCCCACATGGTCCGCTGTCTGCGCGAGTGCGCTTAATTTTATTTCGTTAGAAAAATGCCATAAATTAGATTACCCGGCGAAATGCGACGCAAGCTTTGCGCCGATTATAGCCAGTT:1 + chr3R 5067173 3' + mdg1 7067 8 53.10 CTTGCTGCGCTGACGCAAAAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTCTCGCCGACATGTATATTATTGGTGCATTCATAGAAAGTTTTTCAGTGGTAGATGGCGACTTTACTTATCTTACTTATGTACAGTC:1 - chr3R 7481488 3' + invader4 278 2 52.74 GTGTGCACAAGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGGCAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTTAAAGTCGCCCCAACTGACGGCGAACATCTGAGCCCGATTCGATTTGATTCGATTCG:1 - chrX 4087133 3' + 1360 180 1 60.96 TGCTCATTCTTTATTATAACGGTTCTTTTATGTGTCTACTCTAAATATGAAAAGCAAAAAACGCATTTGGAGATTTGGAGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTAT:1 + chr3L 23583087 3' + looper1 83 1 51.37 TATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACGAATGGGTGGGACATTTCGCCTACTTTGCGCTGCGGCAGTAAACATACCGAAATGCTTTTTGAATTGTAATTTCTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 17286477 3' - hopper 1120 1 65.94 GAAGACAAGAACAGCTCGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTTTATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACACGGTTGCGTTTCTGTTCTGCTCCTCAACTGCTGCTGTTGTTGTT:1 + chrX 19373565 3' - invader6 80 2 71.72 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAAT:1 - chr3L 12433440 3' + roo 324 2 76.71 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAGCCCGAAAGTGTGCTACACAAATGTATTCGCATGATTCTGGTCG:1 + chr3L 22339483 3' + hopper 1354 1 64.23 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATTTTTCTTGTCCACAAATGTATGAT:1 - chr2L 15081043 3' - Doc 43 1 56.85 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTATGTACTTTGTATATCTCATTTCGTGTCTTGTTA:1 - chr2L 17626607 3' - roo 8750 2 80.82 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTGAGTGAAGAAAACAGTCGAATCGGTTGCCTTGACGATCCA:1 - chr3R 10213004 3' + P-element 2860 1 63.16 GTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGCTTTTATAAGAAGAGGTATATTGAAAATTATTTGCGACATTTGGTGGCATGCGGCCGGGTGGATCAGTTTCAAAATATTGTTACAAAAATTGTTTGTATTCGTATGTATGTATG:1 + chr2R 4698108 3' - 1360 494 1 73.29 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAGTCTTCAGATACATTTAGTATCTTGAAGCTTCAAGAAGTTTTCTAAGATGATTAACCATAGAGGTCATTGATCCTTACCAAAAC:1 - chr3R 6135949 3' + mdg1 384 2 58.22 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGGTTTTCCAGCATGCAACTCTCACCGT:1 + chr2L 14239249 3' + 412 442 2 52.74 AGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGACGGTAAGAATCAACTTTCA:1 - chr3R 8042277 3' - BS 30 1 54.11 ATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCAAAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGATCAATCGCATGTCTGACAGAGTGTAGCATACTTTTCAGCACTGCCTAACATTTGTCAGCTATCTGC:1 - chr3R 16582448 3' - BS 4986 1 71.94 ATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTACAAATTTGAACTGTAAAAAAATGGATT:1 - chr2L 4237208 3' + copia 4834 1 73.27 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTATATATACGCATCTGATTACTCCAAATTGCAATAACATGTGAATGATTACATATGAGCAC:1 + chr2L 19310429 3' + Juan 4188 1 65.07 CTCAGGAAATATAAAAGATAGAAGATCCAGCATACGGATTGATTATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACACAAATAACTAATTTGCAATTTGGTACACGTGGCTTGGAACAGAGAATGTATTTTCCAGCTGAAATAATCTGACAT:1 + chr2R 18487426 3' + INE-1 153 1 60.96 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCATAGCTGCCAAG:1 - chr2R 21848637 3' - Transpac 4943 2 63.70 ATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATATTCTTAAATTATAAAAGCAAAATTAGATACAATCAGTGCAACATCTACAGGCATTTAGGTAAGTCAT:1 + chr3L 12159787 3' + Quasimodo 7320 2 56.85 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCTACCAATTTAAAATGTCGAAACTGACAACGATGATTTCAAGGGAAGTGTTTTTAATAGAAAGAATAAATATTAAG:1 + chr3L 20252059 3' + copia 241 1 75.34 TTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAAATTTATGTTTATTTTTTAAACTTTCTAACGAAAC:1 - 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chr2R 5296821 3' - INE-1 96 1 71.64 CAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAGATTTTATTTCGTAATTTCTTTCAGTGTACACCCACACAATCGGTGGGCGGACAGGTGGCACAGCCTTCAGTAAACAGTT:1 + chrX 7503646 3' + Ivk 320 1 71.68 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTAAAA:1 - chr3R 16276301 3' - pogo 27 1 65.22 GGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCTCACTTCGGCAAGAACTTTCATTGATCATTAATGAATTCTATAAATATCCTTAGCAACATATAAATCAAACTTAAAGT:1 + chr3L 5556907 3' - FB 92 1 52.05 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGGCAACTTTGTCGCACTTTGCATTTTTA:1 - chr3R 7470927 3' - Doc 64 1 57.35 GCTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTGTACTATGACGTTCTCTCGTTTTTTTAGTTAATATGCGATCGGCTTTAATAAAACATTAGTTTTAGTTTTTGAATAAAAAGCCTTATT:1 - chr2L 13384809 3' + INE-1 530 1 52.55 CATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGTGCAAGGACTAAAGAGCACACGGAGGTTTTTGTTTTAGCACGTAGGGACAATGAATGGGGAATAATATGGATATTGTCGGTGGAGCCAAGATTGTGGGTACTCACATTCAT:1 + chr2L 7091849 3' + Rt1b 4983 1 60.71 TTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATAT:1 - chr2L 15013250 3' - BS 4957 1 69.86 AGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAATTAATCAACAATATTGACTTAAAGCTGTCAACTGAATTAAATTAAACTGATTTATTAATGTG:1 + chr3L 11396018 3' - I-element 56 1 56.16 GTGCCCAGCTTCCCCCCCCTCCTCACTCCTTATCAACTTTGGAGTGAAAGGGAGGCAGACACTAGGCAAAAATGCACATGCAAAA:1 + chr3L 5244288 3' + G6 275 1 52.94 TTTATTATTAAAAAAGAAAAATTATACATTTATAAAGTTAAATACGGGAATCAAATATCAGGAACTAATAATGTTATATATAAAAGAAGAATGTCTGAATGAATGAATGAATGAAGCCAGAAAAGTTCCGAGAAACTGGATAAATT:1 + chr3R 12587711 3' + copia 5104 2 65.75 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCCGGAAAGTAGGCAGC:1 + chr3L 15723939 3' - jockey 4746 1 69.86 GCAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAAACCTACATGCCCGCGTATGAAAACTGGGTATCCATCGCGTCGAGTTTC:1 - chr3L 16177795 3' + jockey 4583 1 66.44 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCGAGGGACACAAACACACTCGCACTTAATCTCACACTAAGCACGCACACAATGACCGGCTTTGAGCAGGGCTAATTGTATTGGTAATGCGCATGAAAGCTTTTGATTAT:1 - chr3R 11095735 3' + hopper 1405 2 77.40 GTGGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATAAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGACTAGGAGAAAAGGTGGTGCCCTTGG:1 - chr2L 3885996 3' - Tirant 313 2 72.58 ACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGC:1 + chrX 21994001 3' - McClintock 6005 2 56.85 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAATGTGCTAATTTATAAGAAAAACAAT:1 + chr3R 19436141 3' + roo 402 1 78.62 TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAATGTGTTCACTTTTAAATAATATCGAAAATCACACTGTCTAC:1 - chr2L 18112443 3' + transib2 2812 1 74.66 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGGCTACCTATACACAGAGATGGCAGCGTGAAAAGTGAGAGAAACTCTTAGAGAATAAACTATAATTATATCAACAATATTGAATATCTCAAAAATA:1 + chr3R 24499630 3' + blood 7364 2 66.44 AATATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATAAGTTGTACATGGCAAAAAATATGGCTCCTCTCTCTGATTTTTTATTTATAATATTTAAAAAAATATGTC:1 + chrX 14963628 3' - 1360 3023 1 52.74 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCCGGACCATAGAGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTT:1 + chr3R 7778317 3' - transib2 48 1 65.66 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCG:2 + chr3R 19436100 3' + roo 360 2 51.37 CAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGT:1 - chr2R 6798230 3' - jockey 77 1 65.52 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCAAG:1 - chr3R 14277884 3' - P-element 46 1 47.24 CACACACACACATATACACACAGCCAGGATCTGAAGCTGTGTGCAAACAGTGAACATGGCCAAAAGGAGCACTGCCAGCGGGCCAAGATGGAAAAGAAAAAAAAAAATAAGGGCGGCAAAGGCAGCAAAATATACAGCCCTCGGCT:1 + chrX 16985801 3' + accord 190 2 69.86 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTCTGTGTGGTATGTACAGTCAGCGACACAATCGTATGCACTTTCGGGGCAGGGAGTAGTGCAAGGCCA:1 + chr3L 21910484 3' - pogo 48 1 53.42 AGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTCCACACTGAGATTGGCCACCGGTTCCTGCTTCCCCTCTAGGTTCACCTCCAGCTCTAGCCGCTCCTTCACGG:1 - chr3R 21220874 3' + 1360 110 1 54.11 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAAAACATTTTCAAATTAG:1 + chr2R 10160624 3' - hobo 42 1 49.28 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGC:1 + chr2R 21439505 3' - jockey 78 1 67.91 ATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTCAAACTGTGTTTGTCGTTTTATCACCACTTTTGACGGC:1 - chr3L 11286043 3' + S-element 1634 2 72.60 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAAT:1 + chr3L 15364871 3' + 1360 3333 1 79.81 ACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGTAAAAATGCGAAATGTTTTCCCCTGTCCGACCGGGGTTTTCCTTCGCCCCTGGGTTATGGAAAATGTCATTTGGAT:1 + chr2R 16931614 3' + opus 9 2 52.05 TAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTTATCCTACCACATATTGTAATTCTACACCCTGACAGATAAAAGAAAAAACCTCTACTGTTACTGATTAATGGTGTACAGTTGGCCC:1 + chr2R 12953871 3' - invader3 58 2 53.90 GCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAATGGCCAGCGCAAACTAAATAATACTGC:1 - chrX 18239130 3' - jockey 80 1 76.38 TTATTATTATTATTACTATTATATTAATTTCCCGCTCGGTGGGAATGCAATTAAAACCGAAAGTTGAGCCCGTTCAGCAATC:1 - chr2R 21687506 3' - mdg1 29 11 90.24 AAAATTAAACTTAATATGAAGTACATTTACATAATGTAGAGAAACGTCGCCCACAAAGGAACGACACATCTTACGAAGCTAAACATCCAGCCTTTCTATTATTTTGTTTTTACAGATTGCAGCAATTTGCGACCAGAGCTACGCTC:1 - chr3L 19616449 3' - gypsy4 183 2 60.96 AAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTAT:1 - chr3R 24750975 3' - G6 61 1 65.60 CAGTATCAATAGCCGAGTCGGTCTGACCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACGATAAAAGCTAGAAGGTTGTGACAAGCAACACAATCGCTTTTAAATTTATAAAAAAGAAACAAAGAAAAGTTAT:1 + chr2L 21734266 3' + INE-1 95 1 53.10 GGAGTTCATGTAGACAGAAGATTAACTTGGCTTACATTAAAGCCAAGAAAACGCATTTCAAGCTGAAAGTAGTTTCACTGGCTTATCAACACACGCTCTCCACTTGGACTACATCAGAGACTCACAAAGATGCAGCTTTCATAATG:1 - chr3L 16435974 3' + Doc4-element 2437 1 77.40 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAAACAAGCAGCAGCAGCAACAACAACGCGAAAAGAGAGGC:1 - chr3L 20497562 3' - P-element 22 1 34.48 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATATAAGTTAAGTGCAGCCGGCTGAAGTTGAACTACCT:1 + chr3R 24673632 3' + roo 327 2 75.17 AAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACAAGTAAATGGTTTTGGTATGAAAAGTACACCTTTGCCACCCA:1 - chr2L 11554469 3' - roo 126 2 51.37 CATACGGACAGACGGACATGACTAGATCGACACGGCTATTGATCCTGATCAAGAATACATATACTTTTTATAGTCGGATAAGCAGCCAGCAAGGTCGCTGCTTACATG:1 - chrX 21126131 3' - INE-1 120 1 74.07 AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACA:1 - chr2L 18112485 3' + transib2 2770 1 54.79 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAAAGTGCAAAAGGTTGGGGAACTGCAGAAATG:1 + chr3L 10469652 3' + roo 9053 2 71.83 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTTTGTACGATAGATTCGGCATTCG:2 + chr3R 21674955 3' + roo 390 2 68.49 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCCCTTTGCTTTTAATAAACAATTTTTCGCTGTTTGATTTCGT:1 + chr2R 18014110 3' - Doc 66 1 65.87 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATCTTTGAAGTTGGGAGCCACTTTTGAATTTGCCTCCTAAAGCGGGACAACTATAATAGCATAAAACCAGTGTTGC:1 + chr2R 9607224 3' - pogo 36 1 59.29 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATATATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAGCTCAAAGCTACTATTA:1 + chr2L 16562171 3' + opus 460 2 53.79 CCGTTGCAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGTGTGATATGTTCAACAATACAAGCGCATTTAATACAAGTTACATTTCAT:1 - chr3L 15901193 3' - Osvaldo 37 1 75.00 ATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATTGTGTTGGCTAGTGTATTTTCTAGCTGTCATAGGCGCTCTCTCTTTCTGT:1 + chr2L 16365574 3' - Idefix 6928 2 65.83 AGGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTCACTCACCCCTTGTAACTTCTTTTCTTCTCATACCCTCCCTAAAACACACATCGCCTAATACTAAATGAACGATGAATACATAGTTATGTAGGC:1 - chr4 671530 3' + 1360 132 1 64.38 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTGTATGGACTGAGACTTACCTGATCGGATCGGGAGTG:1 + chrX 18220658 3' - Burdock 6193 2 71.31 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAATGTATTAGGAAATCGTTGCCACTTGCCCATGTTGTATTATGTTCATAAAATAGTGCTTATGAGTGATT:1 - chr2R 13293340 3' + roo 9020 2 52.74 AGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACGTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTTG:1 - chr3R 10030720 3' + BS 5012 1 71.92 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTTTGTGGGTGTCTCCTTTGCGTTTGTTATATACTTTTAACTAGTTTAAGCCA:2 - chrX 8967346 3' - HMS-Beagle2 6906 2 69.86 CGCTTCCTTCTGCCTGTTACATGCTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACTTATATGACTTATATATGGGTTTGTAAAGAAGTCTATGAAGATGACATTGTGTCTTGGCTCTTGAGTCTTGT:1 + chr2L 12582795 3' - INE-1 30 1 49.66 ACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGATACTTGTAACATGTTGTATGAGTGGGCGTTTTCAAATCCTACAAGGAATATT:1 + chr4 735263 3' - hopper 364 1 64.38 GTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTGCAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGTAATATTGCGAACTCACTCAGCGCCGTTTTGAATGAGT:1 + chr2R 6493172 3' + transib2 2743 1 71.92 AATTATTAAATGTTTATTTTTTTTAAGTCAGATTGCATGAATAATAAGTACCATATGTTTGGCTCTCTGAGCAAGAAATTTGTGTGATATTTGATGATGTTGTTGCTGCGCTTTTTCCCTGCGCTAATTACGAACAGAGCGGGCTT:1 - chr3L 21715874 3' + Tc1 60 1 55.48 GCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAGCTCCACAAGATGTTACTAGACATCCATGTCTCTGCTCACCCTCATTGAGTGGCGC:1 - chr3L 8848785 3' + I-element 5291 1 61.64 GCGCAGTCGGAAACTGGACCTGATGCAGCTCCTTTTCATCACAATTGTACTTAAGTGAGTAGAGTGAGAGAATAAAGAATAATTCGTGGCTGCGGCCATCACCGCTACTCCAACAGGAGGAGCAGGAC:1 + chr3L 22569319 3' + gypsy5 432 1 64.84 ATTTCAATGCAGCCGCATTTCTTCAGATAACACGCGCTACTACCATTTAATCAGTGCTTTGGATGCTGATTTGACTTCTTATTCTATACATTTTGTGTAAAAAAATACCATGTAGTTCTTCCTGTTTCAATAAC:1 + chr2L 17049437 3' + Chimpo 407 1 52.24 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGTATCAACATATTACGGCATTTATGGTAATTTTATTGGTGCTT:1 + chr3R 10150224 3' + 1360 3317 1 77.14 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAGGCAAAGGCGAGATGGTGTGCATCGATCGC:1 - chr2R 21690446 3' - 412 7088 2 53.38 AATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATGAACTTTCCCGTTGGCCATTTCCCTTTTCCTCTTCACTTGGCACACGATTAGTCTAGGTGAGACTTTAGCCAGCTGCCAAGT:1 + chr3L 5721924 3' + F-element 4495 1 62.33 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATTTTTGGCGAAAATAGTTCTCAATTGTTTTGAAAAAGTACCGA:1 - 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chr2R 9217594 3' - Cr1a 4102 1 53.62 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGGGTGTGGCGG:1 - chr3R 9125610 3' - Doc 15 1 79.58 AATTACTCAAATTAGAATGTTTTTTTTTTACAATAATGTTCGATTATTACCGAACTGATAGAAAAATCCTGGTGCCCACGGGCAATGCGATTACGGCTCTGACTTTTGCCATATATCTGCTGAAACCTTT:1 + chr3L 14989987 3' - Circe 485 1 50.77 CAAATATCTCCCGTAGTTTAGGAGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTTCAGCGTTCCCCCTTTATCACAATTACAAGTACAATTCAATGAGTACGATCAGCACAATGATCGTGCAAAATTTTACTCT:1 - chr3R 4686020 3' - hopper 46 1 53.42 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGAAATGTTAAGAGAAAGTAACTGCTGATAGCATTTAACCCATATAACTCCGAATCAACTGCACCCATGCCC:1 - chr2L 4929754 3' - blood 17 2 73.97 GGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTTCTCTTGTTTTACCTTCTGATCAAGTCCCAGCAGTCTAAAGTAATGACATACATCTCGAGTGACTGGGGTTTAGAAGAATACACCATGCACAAGGTAA:1 - chr2L 22318173 3' + INE-1 555 1 72.59 AATATATGTCAGCCCGACGGCTACCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATTGTTAATTATGTTTTCCTTACATGAGCTGGTTTGCTAGTTACACTATTTGCGAATAACTCATAATTTGTT:1 + chr2L 14969199 3' + 412 7496 2 49.32 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGACTTTGTATGTGACCTTTGTTCCCGACGAAGAGACTGGTGGTCATCTGGGCATGGCGGAGTTTGTTAAGACGGATTACT:1 + chr3R 23098284 3' - roo 8706 2 52.74 TCGGCGGTTTAGGTGGCTGCGAAATCTGTTGGTCAGTCGGTAGATCCTCGTGGTGGTCTTCGCAAGCGTCAGCTTCATAATGAAGATGTTTAAGAAGCTTAATTTTTGGACTATCTAATATCAAATATCCTGGGCATAT:1 + chr3L 11759531 3' - Chimpo 4172 1 58.99 AAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATCCCCCTTTCCCCCATCACCAATCACCACCTTTGTCTGACCATAATGGAGTGTG:1 + chr3L 3708087 3' + 297 6889 2 62.94 CAACGAGCAGAAATGCAATCTTGTCACATTTACGCTTAATAGGCGTAGCTGTCCCCCATTAACTCTAAATAACGTCAAACTGATTGATCAATAAAAGGCTGCGGAATTTATCAAAATCTTATCTCCTCCGTCGCCGCCGTTCAAGG:1 + chr3R 22557607 3' + Doc4-element 2328 1 54.11 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAAATGAGCGCTAAACGAGCTCGAAGCCTCCAAGAGCAGCA:1 + chr2L 11405843 3' - 412 72 2 70.80 ACGGGTATCCGATAGTCGTGAAACTCGACTATAGCCTTCTTTTGTTTTGTTTGTTTTTCTGACCATGTCCCGAGAACGTAGTTACAATTCAGTTTTGTATCCGATGATCTATGATCATCGAAACATGGACTTC:1 - chr3L 490649 3' + INE-1 554 1 57.14 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTATCTATTAAACTCATAATGCTGCGTTTACCATTACTATCATTATGTTTGGGGGTGTCTATAACCTAACATAAGCCTTGTTTGCTT:1 - chr3R 7823270 3' - flea 32 2 62.33 GTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACGTCTACTGCATTGAAAGTTGAAAAAATCGATTGAATTCCCTGGGTAATATAGTTGTCTGATGTTCGCTTGCCAGGCAGCCTATTAATT:1 + chr2R 8651041 3' + flea 493 1 60.45 TGTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGT:1 - chr2L 3960210 3' - jockey 101 1 80.14 AAAATAAAATAACAAAAAAAATCAGTATTTTTATAATTTTGTAAGAACTTTAGATTTTATCTCATTCGAGTTAAACTCAGTATTGGGCTGGTTTCCCAAATTCTTTTAAACAAGAATTTTTAATAAGTGCCGAAGTGTGTTATCAA:1 + chr3R 16849362 3' + HeT-A 309 1 84.93 ATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCCGTTTTGTTTTTATTATGTTTATTGCGAATACGCAATGTTAGTTAGGGCCAAAAGGGGGCAGGGCAGCATTAGGCTCACATTCCAACTTTTTTTTCTGCCC:1 - chr3L 17533970 3' + Doc 245 1 71.92 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGACAAACAGTCTTGAGTGATTTGTTGTTTTTACACTTTAAGGCTTTTTCGTT:1 + chr2L 14501230 3' + 1360 3322 1 65.00 AATTAAATTAAAAAATATTATGATTCCTTACCAAACCGTATGTTCGGAGTAATTAAAAACAATACTAAATAATGCTAATCTTAACATTTATGTGGCAAACTTTCCAACGGAACCACTATACCCTGCAGATAGAGAGTGCAAAAAGT:1 + chrX 6453655 3' + Tc3 1361 1 52.05 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAATATTTATGAAGCATATTTTGCGGCTCCGTTATTTATATTTCTTTGGTCAAAATATCTCTTC:1 + chr2R 11264075 3' + jockey 4933 1 60.96 GATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGCTAAACCGGATCTGAAGCTCATTTTAGCTG:1 + chr3R 9081732 3' + 1360 3286 1 79.45 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACC:1 + chr2L 12486409 3' - roo 73 2 72.54 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTAATTTAGTGAGAAGCAGAACTATGAAAGAAGTTTTCTTGGCTCACTTTTAGGGTTTCACAGCAGGCAAGTGCAAAAGAAAA:1 - chrX 7446178 3' - jockey 4710 1 45.89 TCTTGTTTGTTCTCTTTGTTCTCTTCTCTTTAATAATATTACTTAAATAATCTAAAACTTTGATATTATTAATGGATATTTTCAAAGATTGCTTTTTATTTGTTATATATCTGTAACTCCACCCAAGACTTCTTAAGCCAGAAGAC:1 - chrX 17356726 3' - mdg3 5083 1 69.18 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAAAAAAAAAGGCAATTATCAAGATAAAGTAGACATGATA:1 - chr2R 13046507 3' - 412 84 2 73.97 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGAAAGCTTTTGTCTCACCTAAATGAAGGCGAATTCGACTTCACTTTGTGTAGACTTTACGCGATAGAGAAAGAGTGAATCGGAAAAGTGGCAGTCGCAGAG:1 + chr3L 22642112 3' - hopper 16 1 74.66 GGTCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTCCGAAACGCTTCCTTCTGCATGTTACATACTTTTCAACGAATCTATTGTAGTATAATGAGCACCGATTCTTTCAGTCAATCTACAGCCAATGCTGTTTCTGCAATATTGACA:1 + chrX 19821231 3' - INE-1 80 1 76.03 ATTACCCTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCATGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTTGTACTTTATTGCTTTTATCCTATATCATTGTGAATA:1 + chr3R 5027286 3' - Chouto 84 1 94.37 CTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGATTGTGTTTTTAACGACTCGCCTTGAGTCAAATGGAACAAGAGCAATAAAAAATATTCCTTTAGCCAGCG:1 - chrX 7795216 3' + F-element 4238 1 52.74 GTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCCAAGCCAACGCGGCGTATACTTGATGCAGGTTTTCAACTAATTTGTTAAACTTCATCTTATACTCCTTGCTTAAGCCCCTAAATATATTTCACAAA:1 + chrX 8312147 3' - blood 170 4 78.69 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGA:1 - chr3R 6645347 3' - blood 7098 2 73.97 ATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCT:1 + chr2R 14973669 3' - FB 71 1 75.40 GGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGATAAATATAGAAACAGTAAATTTTGCCTGCTGTCACCGAGCACATCTTTTGAAAGTGAGCGGCTCGGC:1 - chr3L 8166498 3' + Cr1a 363 1 73.88 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCGCTCTATTATTCTTCTCTTGTTACTCTGTCGTTGTTGGCTC:1 - chr2R 1373074 3' + pogo 2063 1 59.59 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAGGCAAA:1 - chr2R 21690470 3' - 412 66 2 65.71 AAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTA:1 + chr3L 7801278 3' - Transpac 194 2 75.86 AAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAGGCCATAACTGCCATTAAATATTGAAAAT:1 - chr2L 7771946 3' - jockey 93 1 76.43 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAGTTTTGCTATGGCGTTCTATTTTAGTACTGAGTGTTTTTTTTTTTATT:1 + chr3R 23825355 3' + 297 327 2 69.18 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGCATTTTACGTCCTTGAACTTACCCGGTTGCCATGAATCCTACCGTGAA:1 - chr2R 15075543 3' + mdg1 390 2 64.38 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCGTTTAGAATCCGTTTTGCAAACCAAAAACTTCTATTCATTGAAATCACTTGTTCGACATAAATGACCGAAAAATTGGGTCA:1 + chr3L 14167455 3' - mdg1 7060 2 67.19 ATATGTATATATATAAATGTATACATTCATTTGACTCATCTCAGGGACGTCTTACAGACAAACCCTGCTGAACCCTGCCTATGTTCTGCCGCAAATCCACTCTGAAACTAAACCTTCGCCAACATCATTTCGGCCGTACGAGAACA:1 - chr2R 4706940 3' + Stalker4 248 4 68.49 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTGGCTCAAAGTCGCAGAGAACGGCTAGAGCAAGCGAACGACCGTCAGAGAACGGTGGCGGTTGCTGAAAGTTCTATGCGACTAGGGGTC:1 + chr2R 1320541 3' + Transpac 298 2 74.22 GGTATCTAATAGTCGGGGAACTGGACTATAGCGTACTCTTATGTTATTTAGTCGAGTCTTTATAATAATGCTTAATATATTTTGTATCAACATATTGAAGCTACCGTACGCATCCCTAAATCCTAATTAATTGCGCCGAATTACAG:1 + chr2R 5950017 3' + INE-1 557 1 53.42 GGGAGAGGAGCTGGAAGAGAAGCCAAGCACTAGCGCATAATGGAGTTAAGATCGTAGGGCAGTAGAGGCAAGTCCACCTCCTCCGGCGAGAGTACATCAAAGTTGTACTCCTGACCCCTCATGATGTTCCCCTTGTTAATCACGAT:1 - chr3R 24750810 3' + G6 474 1 76.71 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAA:1 + chr3L 18183208 3' - Tirant 42 2 57.53 GGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTT:1 - chr2R 5582176 3' - Cr1a 469 1 49.17 GAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCGCCACGAATATACTGACAAATAAAGACACTTTAATAAAATAACCAGTCTTATGTTAATTGGCGCCCAAACGGAAAAAAAGCCCAGTTACTCTAACTTTTCGAGCT:1 - chr2R 599654 3' - Cr1a 4086 1 55.48 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAAATGAGCGCTAAACGAGCTCGAAGCCTCCAAGAGCA:1 + chr2L 11405840 3' - 412 65 2 70.87 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAGTTTGTGAAAAAAAAAACAAAACGCGCGCTAGAAAGTATGCTACAGAATTTATGGCGCACTCGCT:1 + chr2R 23441720 3' + jockey 4935 1 63.70 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTTTACACACAAACTACCGGATTGATGTACACTTTCTCATATCGATATGACGCAACCTAGTGATTTTGGAAG:1 + chr4 311653 3' + 1360 3379 2 78.77 CGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATTATGCAGCACACAAATCAGCTCCAGTTTTTCCTCCAATTTTCCGAGTT:1 + chr3R 30305582 3' + roo 274 2 70.55 CAATCTTATTCTTATCTGGTATATGTTGGGTACATCGCTAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTAATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAGTGTCTCTTTCCCAGGTCAAACGCTACTTCATCTCATTCTGGAA:1 - chr2R 23767411 3' - Idefix 108 2 69.66 TAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAATATTTATGAAGCATATTTTGCGGCTCCGTTATTTATATTTCTTTGGTCAAAATATCTCTTCTACTTT:1 + chr2R 11264081 3' + jockey 4939 1 56.85 AAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATATAGTTTGGGCAACCACCGACCTGACAAACGCTACCCAGGAAGGATGTTTCAATTTCTATTTTGTTTT:1 + chr3R 6428184 3' + Stalker 6944 4 54.11 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTAGCGGGAAAG:1 + chr3R 30264078 3' - blood 7082 2 76.98 CGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATGA:1 - chr2L 15013248 3' - BS 4955 1 68.49 TCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCCCGGCATGTTGTCGACATTTTTATGGCTGCCACGTTT:1 + chr2R 8688152 3' - F-element 15 1 59.70 CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTG:1 + chr3L 21093247 3' - Ivk 48 1 52.74 CTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACCACTTCCAATTTGCAGGTACGCGAGGGACTCG:1 - chr2R 6885324 3' - flea 34 2 65.26 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCGACTAATTAACTATTAGAACTAGTATGATTA:1 - chr2L 2494811 3' - Doc 42 1 54.01 CTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGACTTTTGAAATAATACAGGTGCTGGAGGGTGACAGGTACACTTTAAAGTCCTTAACCAAT:1 + chrY 3069851 3' - 1360 53 1 56.25 GCGGGGGAAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGCGTACAGATGCGGTGTGCATTAGTATTAATGTATGTGGATTGGAGTGTCAGATAATGTCCAACTGCATAAAGCCCAAGTAAATGGCAGAAAAATCATTGGTGATTTTTCGT:1 - chr3L 13670240 3' + invader1 142 2 54.79 TAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTC:1 - chr3R 6645351 3' - blood 91 2 76.71 GTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGCGGC:1 + chrX 12273135 3' - jockey 4753 1 77.86 ACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAATATATATATATATATTATATAATAATTCTATATATAAATTATAT:2 - chr3L 24209361 3' + F-element 4599 1 71.92 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAAACAAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAACTGCACGCGGAACGGAAAGAGGAGGAGCTCTGTCACAAG:1 + chr3L 20497839 3' - P-element 51 1 50.68 GCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTCAGCCTGTATATGTATGTGTATTTGCTTTGTACAGCCTTTT:1 - chr3L 22339406 3' - hopper 76 1 66.44 CAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATCGATCAATAGTCTTTCATATATTTAGTTACATACAA:1 - chrX 14836192 3' + invader4 246 2 73.97 CTTTTTTTTTGTTTTCTTATTCAATCTGTCTGTGTTTTTGCATCTGTGTATAGGGCGACGGCACAAATTGTAATTAGTGTTAGTTTTTCTTAGCTGTAATTAGAATTTTCTTTTAGCAATCGATGTGCCGCCATCGCAACATTGCC:1 + chr2L 21938385 3' - Doc2-element 222 1 76.03 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCTTGTTTAACGCAGCTATAAATTA:1 + chr2L 20515270 3' - I-element 75 1 73.05 AATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGAAAGCTTTTGTCTCACCTAAATGAAGGCGAATTCGACTTCACTTTGTGTAGACTTTACGCGATAGAG:1 + chr3L 22642079 3' + hopper2 1559 1 52.05 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACTGTTTGTTGACAAAAAGGTAAACAAAGTGAAAATTTCGCAAATGTGCAAAATAATTAAGTAAGGGTCAGTAAT:1 + chr3R 20635524 3' + 1360 3344 1 54.11 GGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAAACAATCG:1 - chrX 21087544 3' - mdg3 5255 1 75.65 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCCCTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGGTACTCTCCCTT:1 - chr3L 22594162 3' - 297 6629 2 65.45 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATTAAAAA:2 + chr2L 1361075 3' - Stalker2 7263 2 63.01 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTGTTTATTAAGCACTTACACTTGCGCTATGTTAATCTCCCTAGAATATACATCCGTTTGCATAAGTAGCCGCTATAGCC:1 - chr2L 4637175 3' + mdg1 7416 2 54.11 GAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACTATTTGGTATTCGATTTTCGATATCCCTACCGTCC:1 + chr2R 19524553 3' - hobo 462 1 76.03 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTTCGGCAGGCCGCCGCTCACTAGGATCTCCGTTTTCAAATCTTTCATCGTAATGCGTTGCTA:1 - chr3L 9212653 3' - hobo 21 1 67.97 ATGAACGTTGAGATCTCAGGAGCTATAAAAACTAGAAGGCTGAGATGCCATTATGAATTACAAGAAGGAGGAGATAGGTACCTTGCTCGAGAAAATCGGTGTGACTCTGAAGCATGAAGACAAGGACAAAGATGGCAAAGCTCTGC:1 - chr2L 21679963 3' + INE-1 139 1 68.49 AATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAATATGTATATATGTGTGACAGAAAAGAGACTAAAATAGATTCTGCGCGTAATTGGAAACACATAGCAAATAGTTCTTAATCATAACCATAGTGT:1 - chr2L 13138937 3' - McClintock 18 2 73.97 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTGTTTATAAATAGGTACAACTGTACCCTAAACAAACAGAAGGGTTGAAC:1 + chr2L 19160468 3' - 3S18 5789 2 67.16 GTGCATTGGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTACATATGAACACATAACTAAACTACCACACAGCTCACCAAAAACATAAAATAAATTCGGAAAGTATAGCACCAAAGCTGAAATTTCAAGGAGATGCTGCTCAAATA:1 + chr3R 16274637 3' - Transpac 435 1 71.92 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTAGACTTTGTAAAAGGGTTCTAAGAAAGCCATTTAAAAGCACACTTTAAAAGCAGGTTATAAATTTTCATTTTC:1 - chr3R 18153543 3' - copia 4902 2 58.46 CAAGCACTCAACAATCATTCCCTTATTAATTTACTACTGTTATTTCAGTTTTGTAAACCATTTTTTGTCACCACATCTCTGGATCTATTGACAGTTATCTAAAGATTTA:1 - chr2L 16957635 3' - 1360 451 1 67.89 ATCTGGAATGTACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTATCTAAGCCAAGTTTGTTATGTGGGTCGAAATG:1 + chr3R 25804188 3' + mdg1 7372 2 75.34 GGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGATCGCTAAGTACATAGCTATAGGTGCTAGTCCGGGACACTTGTCTGGCGTATCCCCAGGCACTTTATTGGTCGTGCGTGTCTCTGTCTTTATG:1 - chr2L 18720539 3' + R1A1-element 5158 1 72.00 TATCAAGTGAAAAGTGAAAATATATAAGTACATGCGCCCAGCCACCGTGATTACTTTTTTTTAAGTGCATAAGTACATTGTGAAATCATTTCTATTTCTAAACAACAACAAGCGGAAGCAACAACAATTGGTACCACAGAAGAATT:1 - chr2L 19141198 3' + Max-element 462 1 52.05 TGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATATATAAGAAGGGGTCTAATTCCATATTGATGAGACCGAGATGGGATTGTCATGGG:1 - 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chr3L 12743560 3' - pogo 333 1 64.38 CTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTATCGGTGTGATGGTATCCAGGTAGGGACTCTTCGAGAACGAGTTCTT:1 - chr3R 24750930 3' - G6 29 1 67.39 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCAAAGCCCAGTAGAAAGCTATGGATGATGAAAA:1 + chr2R 5754608 3' + P-element 2846 1 56.72 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTAAAAATTCTGTTATTGCTGTCGAACACACATTAAAATTAGACTAAAATAAACCCAAAGCAACTTTTAAATTGTACAATTGTTGTTCCATTAAAT:1 - chr2L 15644821 3' + transib2 2799 1 68.49 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTTATATATGTATGTGTATTTATTCACTTCGCTCTTCGTGTTTTTAATGAATTGTTGATGGGAATTAATGTGCGCATATTTAATAAAAATT:1 - chr2R 14973573 3' - FB 32 1 62.33 GTATGCGTAGAAAATAGCTGTTCGCTGTAGAGCTCTCCGCTCTCTCGCTGTTGAATAAAAATGAGAGAGAGAGCCTGGAGCAACCTCTTCTAGAGCCACGCCAAAAAAATCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGGTAGA:1 - chr3R 4565325 3' - 1360 137 1 87.67 TTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATAATTAAACATATATATAATCTATCTAATGTAATCTATAATCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAATGGCTGCTG:1 + chrX 22810015 3' - F-element 4588 1 72.39 GTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTAACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTT:1 + chr3R 10030781 3' - BS 5075 1 61.64 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTTCGCGAAAAGAAATTCTATATATGCCACCTTGAAACTTCGCTTATTTTGCGTACCATTCCATTTTAAGTACGGCATTATCCATTGTC:1 - chrX 10579858 3' - pogo 27 1 67.12 AAAATGTGCTTATGGTGCTATTTTGTTACCGCAACTGTATATTCTCGATCAGGATCAATACCCGACTCGATCTGGCCATGTCCGTATGAACGAGGTCTCAATTTTTTCTGCACAACATGTTGTTATGCTTTGTTGTTGCCTCAG:1 - chr3L 11374320 3' + Tc1 1627 1 77.78 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATGGGAGTTCATCATTACACTTAACTGGCATACAAAAAGAGAGCCTCTCAAGATTCCA:1 - chr3R 15920222 3' + 412 424 2 69.23 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAACAAGAA:1 - chr2L 17295803 3' - Doc 31 1 60.96 ATCAACGCGCTTTTACCCATGCGGCAACTAAAGTTGATGTGCTAAAGCATTTCGTTGCGGTTTTGTATCTTAATAGTGCTAGGGAGTACGATGCTGTCGGTATTGGTTTCTCTTTTAGCTTTTTAGTGCAAA:1 + chr3R 28600218 3' - 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chrX 7559890 3' - Stalker4 285 4 58.22 AAATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATT:1 + chr2L 18112580 3' - transib2 2619 1 63.70 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAAGTGTCAGTATCCT:1 + chr2L 3231992 3' + roo 9037 1 58.22 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATATTTATTTAAACGCTGTTCCCAATGTTATTTGAAAGGGGTTTTATTCAACTGCAGCTTGCATTTACACTTGT:1 - chr2R 6913338 3' + roo 9026 1 53.15 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAGGCA:2 - chr2R 21690472 3' - 412 74 2 68.49 GATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAATTCTATACAGTATTATCAACAGCTTGCAGTGTGCACCTG:1 - chr2L 21313937 3' - Doc 4357 1 72.34 TTTGCCAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTCCGACACCCACATTTGTAAAAAATTGTTGGGAATTTTTTTCATAAATTTATTAGTTTATTATAATTATATTTATAAGAACGTCATATTTGATTTTTTTACGTACGTAGATGCATAC:1 + chr4 62278 3' + INE-1 338 1 65.75 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATAATGATAATGTATCTAAGTTAGCGTGTAAGACTTTCTGTAAACAGCATTTAGTTGGCACAGTTCAAAGATGTCGACCCACCGCTGG:1 + chr3R 15295846 3' - roo 31 2 61.64 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATA:1 - chr3R 16276319 3' - pogo 53 1 58.90 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTTCGGCAGGCCGCCGCTC:1 - chr3L 9212697 3' - hobo 52 1 64.35 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACTGTTTGTTGACAAAAAGGTAAACAAAGTGAAAATTTCGCAAATGTGCAAAATAATTAAGTAAGGGTCAGTAATAGGTGCTACTGGTTAATCGGACCATAACAACT:1 + chr3R 20635556 3' + 1360 3376 1 75.34 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCATTGTATCAGTGTGACAATGGCAAATAGTG:2 - chr3R 28450647 3' + roo 355 2 56.16 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCG:1 + chr2L 17260782 3' + P-element 2811 1 24.81 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAACTCGCGTCGCACTCATGGGCATTTTTTGTTCGAAAGAATTTCTATCTGTTCCC:1 + chr3R 8849879 3' - 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Porto1 4375 1 59.57 ATTTATTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTGCAAATAATAGACCTATTCATAAATTTCATACTAATTAGCTATAATCAATGTATTAGAAATAATTACAGAGCCAAGCTTACGCAAAAACATTACAA:1 - chr2R 16703559 3' - 1360 358 1 58.90 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACAGTTATCGTTTAACGTCCCAATGAAAGACGAAGCGATTATTGCGATATCATTTTTTTTG:1 - chr2L 22724048 3' - pogo 14 1 73.33 TAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCACTGTTAAATTGCTATACTACATGTTTGAAGCTCATCAAATCTCCTGGTTACGACAAAATCGACGCAGCTGCCCTCAAGCTACTCCCAGC:1 + chr2R 4000606 3' + Doc3-element 78 1 50.72 CTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACCTTTTCTTTTGGCCAAACT:1 - chr3L 20497769 3' + P-element 2788 1 17.81 CGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGGTTCCGTGG:1 + chrX 22386760 3' - hobo 64 1 53.85 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCGCTCTATTATTC:1 - 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INE-1 90 1 68.97 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCTACCAATTTAAAATGTCGAAACTGACAACGATGATTTCAAGGGA:1 + chr3L 20252028 3' + copia 210 2 54.11 ATGTTATCTGGATTGGGATTGCGAGGATCATCGGTTTGCAGGTGGACCTTCACGGTATCGAAGGGATGGCCGACAAGAACACCAGCAGCTCCTGGTTTTCAAGTTTGATTAAGTTTTTTTTCGTATAGTTGGGGAGGTAAACTTAC:1 - chr2L 10323780 3' - I-element 5122 1 60.27 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGCTTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTGTCA:1 - chr3L 19031198 3' + roo 396 1 72.00 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATTCAATTAATTGATAGAAAATATAACTAAGGGCCTATGTTGCTTTTTAATTTAAGTTGTTGTTTTTATTTAAATAAATA:1 - chr3R 8140828 3' - pogo 38 1 58.90 ATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAAT:1 - chr2L 15013252 3' - BS 4959 1 71.23 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAACGAGTCAGCTGTTCGCCCGTATATATTCATATCG:1 - chr3R 8217925 3' - P-element 62 1 41.78 GGGTAGGAGAGGCGGCCTCTGCGCTCGACGATTTGTTTGCTTTATGTCTGTGTGTGTGCGTGTGTGAGTGATTTGTTTGTTTGTTGGTTTTGTGTCTTTGCTTTGTTTTGTTTGGCTGTAACCCGTTTTTATGGCCAAAAGCTG:1 - chr3L 7818435 3' - Doc 429 1 75.00 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAG:1 - chrX 6632973 3' - P-element 91 1 23.29 CTGTGTGTGTGTGTGTGTACATCTCTCTGATTTCTTTTTGTTGATTTTTATGTTAGCATACTCTTTTTTCCTCCTGGTCAGTATGTGTATGAAAAACAAGGCTCCCATATTTTTGTTGTTTTTCCTGCAG:1 - chr3R 11096927 3' - accord 181 2 69.23 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATGGAGCCGCAGTGTTGCGGTTATGCAATAAAATGTTGCATTTTGCTTTCGGTTTGCCACACGCCT:1 + chrX 14743033 3' - FB 57 1 58.22 ATTACCTAATGATATTTTTAAAGACTGTCCTATTGGGATTCTAGTTTGGTCAAATGGAAAATTATACCTCTTATTTAAATGAACTCCAGTGCTTCCTTCCGGCAGAATTTTTCTAATTTGAAGCGTTAACCAACTGTCCTCCTCT:1 - chr2L 18030213 3' + HB 1538 1 62.76 ACCCGCTCTCCGCTCCCTTTTACGTTCTCCACTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCACAGAGTCTTTCCGACTCCCTGCACCACCGCCATAAACCCTAACATTGC:1 + chr2L 6236048 3' + GATE 8272 2 64.22 CTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCCCG:1 - chr3L 9469953 3' + 412 492 2 61.02 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAGACCAAATATTTTCCAATTAACCAAAT:1 + chr2L 5792134 3' - blood 8 2 79.14 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAGA:1 + chr3R 11151918 3' - mdg3 50 2 51.37 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCGATAAGAGAGGATTCAATTTTAAACTTTTTA:1 - chrX 388200 3' - 1360 27 1 67.81 CCTGAGATATCGACGTTCATACTCTACAAGTAACGGGTATAACAAATAATAACTTTATTTCGGACGAAATATACAATAATCACTCTTTTATAGATACAACAAATAATTGAGTCTATGGTTTGAAATAAAAATGTAATATTTAGTTT:2 - chr3L 18072334 3' - INE-1 137 1 21.92 ATAGTTCGTCAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACAGACAGAGGGACATAGCTAGATCGACTCGGCTATTGATACTGATCAATAATATATATGCTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAA:1 - chrX 124083 3' - INE-1 143 1 81.51 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCC:1 + chrX 7706817 3' - P-element 82 1 29.45 CACGTCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTTTTATATAAATACCATTAAGTGGCCTTTACTGATTGTCGTTGAGGAGCTAATTGATGTAGTTCAAACTATAAGTCGGAGATATCTAACCATCCTCACCAACTATCTCGTTT:1 - chr3L 12201869 3' - 1360 415 1 61.64 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATAC:1 - chr3R 9125685 3' - Doc 86 1 73.91 ATGTATGTACATATTTACATATTTGGCATGGTTATATGTACATACATATTATGTAAATGTGTATGTAAGTACATACTTGTACAAACATACATACTATGTAAATAATTGATAGGTTGAAAGACGTTCCAGGAGCAAGTCTACAACAA:1 - chr2R 22483752 3' - G3 4507 1 76.03 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAGTTTTGCTATGGCGTTCTATTTTAGTACTGAGTGTTTTTTTTTTTAATTTCACATTTACCCTATACTGTTTGATTTTTAGTAAGCTATCTTTAATGATTT:1 + chr2L 21698385 3' + 297 6960 2 75.34 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGATGGATAAACCCGCAAGCGGTGGCAACTAATTTCTTTTTACAACTGTAGCAGT:1 - chrX 6462019 3' - hopper 70 1 64.38 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGAACCCCAAACAAACTCACACACCCACACGA:1 - chr3R 13225508 3' - hobo 60 1 71.43 ACAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTGCACGTTGCTCGCAGTTGG:1 + chr3R 11095898 3' + hopper 1411 2 69.00 GTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAATGT:1 + chr3R 19436119 3' + roo 379 1 64.38 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATCCTGCGCTCACTCCCCATTTCCCCAAATCAAGTCATAAAACAAAACAAGGG:1 - chr3L 10112197 3' + I-element 5285 1 64.38 AAAAGAAAAAAAAAAAGTAAAGAAAGCGAGGAAAAGCATCAACAACAACTGCGGCAATATAAGAAAATAGAAAACAAAACTACAGTTCGACTTTGATAAGATTCTGCTCTTGAGATGACCCCTCATTGTGAAGGGGCC:1 + chrX 4237001 3' + Doc2-element 246 1 70.29 CTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAAAAGCTCATTTAAAACAATTAAAATGGAAACAATGTCCCCCATAAAATTTGGTCGGAGTTGACCGACCGCAGATTAGGTATTTAAATCTCTTCACCATTCCTCACC:1 - chr4 494011 3' - aurora-element 4201 1 71.72 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGCATATGAAATCGTCAATTTTATACCGATTCATTTTGCTGCGACTCAAAAGCTGCCTAACCAGGTGCGGACATTGC:1 + chr2R 5438324 3' - flea 25 2 62.90 ATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATTAAATTTTGCGTTCGCATTTACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGAAAGTCGGGGAACTCAATTCCCTTCTGGAAAGAAACTCACGGAATTGCAATTGCCAATGGAGATGGAAAGGGCGC:1 - chr3R 16581212 3' + INE-1 500 1 58.90 ATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTTATACGGACAGGCGAACTTGGCCAGATCGACTCGTCTACTGATCCTGATCAAGAATATACATACTTTGTATATTATATATTTATA:1 - chr2L 1134281 3' - INE-1 143 1 74.07 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTTCCCGTTGTTTAAAATATGTCGTCGAGCCAAGAATTTGTACTTTAAATGTTTTTCTCTGTGCTCTGCAAAGAAAAAAATAG:1 + chr3L 2330239 3' + roo 402 1 78.77 ATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAAATCGGCCAAATTGAAGGGAAATACTTAT:1 - chr3L 13952749 3' - I-element 5111 1 64.41 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTTTTGAACA:1 + chr2L 8574490 3' - Transpac 4949 2 63.70 ATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAATAATTTTCATATTGTTAAATACATCTTCTACTAAGTTTCTGTTCTTAAATTAGACGTTATTTATTTTGGTAGCACTCTTTTTCACAGTGCACATTTG:1 - chr3R 16818877 3' + Ivk 5350 1 59.59 TTTTCAATCGAAATAAAAAAATTAGTAACACATCTAATCTTAAAGATCTTAAAGGTGAAGCGAGGATTAAATTCAGTTCGTGGTGGACGACGAACATAAGACCACCGAAAGCAGAAATACGTATCCAAAGTATATACACGCATATA:1 + chr2L 11603795 3' - Tc1 1530 1 71.23 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCA:1 - chr2L 17295818 3' - Doc 46 1 50.68 TTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATAATAGAGTTTGCGGTTTTGACATTTTATAATTGAAAATATTTTGTAATTGG:1 - chr2L 9274957 3' - F-element 40 1 65.75 GACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTATATAAGTACTCTAACAACAACCGATTTAATCAAACG:1 + chr2R 21848769 3' + Transpac 244 2 63.45 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCCGAGTTCCAGGATCCATAAATAAATGTAGATTAGTCGCCGCGCGTGCAGCA:1 + chrX 388365 3' + 1360 3360 1 67.12 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGATGCCTGCTTTTGTTGTCAAATGACGAAGGCACTTTC:1 - chr3L 13690229 3' - hobo 23 1 70.55 ATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAAAG:1 + chr2L 21738001 3' - INE-1 253 1 57.53 AACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTATTTATATAAAACTTATTCTTATCGTGTATTTTTAAATTTAGAAAATTATTCATTGTTTATACTCTCAAAAAATGACGTATACGCAACGTTGGCCAT:1 + chrX 21413265 3' + INE-1 575 1 87.10 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAATGTAAAGACGAAAACTCGTGTGCATGACTAATTCGACACTTTGTTCCTTACATATCTT:1 - chr4 916295 3' - roo 8726 2 60.69 CATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTTCTCAAGATTT:1 - chr3R 10437061 3' + BS 5032 1 64.39 CGTTACGCAATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCATCTCGTCCCCGTACATCTCCACTTTTTCGCTGAGCTTCGCATATAGCAGCTTGGCTTAGAAGAACATCACAGTAAAAATAATGGATAACAATTGAAGAAAAGGG:1 - chr3R 11286769 3' + 1360 3379 2 65.28 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGCTTTACAAAGTATAGTATTGTTTATCTG:1 - chr3L 17667535 3' - F-element 52 1 52.74 GTGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATATGAACAATGTATGTACATACATATGTATTTAACCAGCTTCAAATGCTGAGCAACTAAAAGCGAGTGGTAAGAG:1 - chrX 887275 3' - Quasimodo 45 2 58.22 CACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAGGCCATAACTGCCATTAAATATTGAAAATATTTTAGAA:1 - chr2L 7771937 3' - jockey 90 1 71.23 AATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACGAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGATTTTTGTGTGCGGTCAGCATGGAAAATGAATGAATGAATGAGTGA:1 + chrX 3874943 3' + invader4 310 2 68.75 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCG:1 - chr2R 981623 3' + 1360 3339 1 74.04 GCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATACAGTCAACTCCGTCTAATTGCATGCTAACTGTACTTAAATATCTTTATAATTGACGCCACAGTGGGTGTCGTAAAAAGCACGTACCGC:1 - chr3L 7939006 3' - R1A1-element 5329 1 63.19 TAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCGTTTCGACTGCCTGCAGCAGCAAAAACAACAGTACAACAGTAAAAGACTACAGCCAAAAATGCGAATTGAAAAGTTTGCAGGGCGACAAATGCGCT:1 + chr3L 21911464 3' - 1360 307 1 74.29 CTACATATACTTACACACACACACATACATTACCACATAGCAACAGCTAACACAAAATCATAGAAAAAAGCGGAAATATGTGCATTTTTAAATTGTGTGTGTCTGTAATTATGTGAATAATAATCAGCA:1 - chr3R 18658608 3' + Quasimodo 27 2 50.39 GCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAATTGGCTGTAATAGCGAAATGTTCGCACCAGGAATGTTCCACTGTAGTGCACTTTGTTGTCCTTGGCGTGCCCATGTCTCA:1 + chr2R 13165806 3' - P-element 160 1 55.48 ATATTCTAGGGTCTTTGGTTGTAAACTGACTACACATCCTTCGGAGAGTGGCACAAAGCAGGCCTTTTCCCGCACACAAATGGCTTGATAGTAGCTTGACGAATAGGTAGTGGGATT:1 + chr2R 5877062 3' + Tc3 315 1 64.96 TAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATACTGATAAGATATGAAATACTTTGGCGTACTTGTTAGCTTGTTAAATGTAATAGCAAGTTTATTATTTTTTATTGCTTTGTCTAACATTATATATATATTTAATT:1 + chr3L 17922086 3' - copia 17 2 73.97 GCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAACTTACCACCCAGTTTAGTAGATAGTAATTGTT:1 - chr3L 11795477 3' - 1360 91 1 81.51 TTTTGGCCAAAACCTATTTTATGAAAGTCGATCGATGAGGAAGATAATATTAAATGAATATATCCCGGAATGTTGTGATTTGGGACCAATTAAATAAATAGGTAAATTAAATGAACAGAAAAGGGCTTAAAAAGAAAATTTTTTTA:1 - chr2L 21107439 3' - Transib-N1_DM 469 1 68.49 CAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTTGCTATTCATTTTCTTCAGTGCATCATTTCGGGGGAAGACCCCTTCGCTGTG:1 + chr3L 1977064 3' - Rt1a 18 1 64.38 TATTGAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTTGACCAGACCCCAAAGATCATCGTTATTATTGGGTTTGGTACAACTTGTGGATGTGCTCGTTGTGGGCCGTCGTCGGCTGCATGGCCTTCATCAA:1 + chrX 7726520 3' - Tc1 1251 1 54.47 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAGATTTTTA:1 + chr3R 11151924 3' - mdg3 44 2 54.11 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAAGGT:1 - chr3R 4679422 3' + hopper 1413 2 78.26 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTA:1 - chr2L 16456794 3' - BS 5081 1 81.38 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATAC:4 - chr3R 9125673 3' - Doc 82 1 67.12 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTTGAACCTTAACCTCCCCGGAGTGAAGAAAGTTTTTCGCTTGTTGTTTGACAAATTGTTTTGTGCAGCCTTCGAAGGAAATAAAAGGCAACATTCGACTGTAAAGCG:1 - chr3R 8639187 3' + copia 243 1 76.39 GCGTTTCGTTAAGGAAACAGAGAAAGACTCTTGTAAGAAAAGTTAGTAGTAGATAATTATGTTTTGCAGTTTGGCACCCTATTAATTAATGCTTTTGTTCTATCATTTATATTTAGGTAACATTTGTGAACGAGTATTATTTGTTT:1 + chrX 16144227 3' + invader5 3975 2 72.60 TACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGG:1 - chr3L 27415204 3' + transib2 2775 1 52.78 AGGCTGTTGGGGTGTACTTTAATTTAGTGAGAAGCAGAACTATGAAAGAAGTTTTCTTGGCTCACTTTTAGGGTTTCACAGCAGGCAAGTGCAAAAGAAAATTATAATAATCTGGACTAATATCTGTTTGAAAT:1 - chrX 7446145 3' - jockey 4665 1 55.97 GTTTGTAGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAACATGAGTTACCAATTGCAGACTTCTATAGTTCTATAGTCTAGTCCATTGTCTAGCTTATGTATCTCAAACACAATCGATGGCAGGACTACGCATA:1 + chrX 22680733 3' - INE-1 218 1 49.19 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTGGCCAGAACGTCAG:1 + chr2R 10910311 3' - Tabor 6876 2 50.81 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACAC:1 - chr3R 9125642 3' - Doc 48 1 56.64 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTGCGAAAGTCGAATGTATTATCTTGGCTACAACCAAACACCAATAGATACAAAAACTTGGTT:1 - chr3R 6413504 3' - 1360 16 1 74.66 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAGTCTTCAGATACATTTAGTATCTTGAAGCTTCAAGAAGTTTTCTAAGATGATTAACCATAGAGGTCATTG:1 - chr3R 6135963 3' + mdg1 7413 2 53.90 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTCTTTTTTTTTAGATTTCTATTCCGAAGAAACAGTAAACAA:1 + chr2L 21643176 3' - Tabor 6853 2 75.34 ATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTACTTAAATTCAAGGCCATTATACACTATAGTTAGTGAGAAGGACCAACAAGAAGTTTTAACACCAGGTCATTTTTTAATTGGAAGACCACCTTTAGAAA:1 + chr3R 19447762 3' + P-element 2 2 67.12 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACAAGTTTCAAGATTTCTATTCAAATTTCATCAATCGAATCAAAGAGAAACCTGAAGTGAATATCATAGAAAGAGCTGCGAACTAGATACAGCATTCTATATGGCTATGGTACTCA:1 + chr2R 21690615 3' + 412 7540 2 76.71 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTTTGCCGATAGCTTCTTCAATATTGATAAACATGGGCCAA:1 - chr2L 10514259 3' - 1360 48 1 52.05 GTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTGGCTCAAAGACGCAGAGAACG:1 + chr2R 1320474 3' + Transpac 5175 2 76.70 AATAAAAAACTTAACAACAAACACTCCATCACCTAATATTCACACAAACACAACCCAATCACAACAACAAAATCCGCACCACACACCCAAATCAGCAGCACAAAACACTTCAGCTAAGACACCAACTACGCCACTGTTAAAACCCC:1 + chrX 7379860 3' + I-element 121 1 77.40 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCGTTTTGGTTGGAAGCCACTAGCTTTCAGCAGGC:1 - chr3R 23098192 3' + roo 8999 2 75.38 ATTCTTTTTTTTTGTTTTGAACATCCTTCACACATCAAACTTTTACGCCGAGTGGGCGGCTTTAATGGGTTAATTATTGTTCGACTTTTTAAGAAATATTATGTCAACAAGTTATGGGAAATACATAAGCCGTGCACGTGATTTTT:1 - chr2R 19338651 3' + Tc3 90 1 41.78 AACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGATTTAGATTCAGCATACAGATTATAGAGACATTGACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGACACAAAGCCATAAATATAGGAATAGGAAATAGGAATTAATATCAAAT:1 - chr4 176173 3' + INE-1 142 1 67.81 GTATACAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCGGAATAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACTATCTTAGAAATTAAATTGTTAATTTGATCGACGCATTTTCCGCACTCACCGGCTGCCCC:1 + chr2L 14570086 3' - Cr1a 4118 1 56.52 ACTGAGGTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCCAAAAGTGTTTAAAAATGTGGTCGTGACCGGTTTGGCGGCTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCTTGGCAAAAAATTTTGTTTTAAAAATCGATAGAAATTTAAGAA:2 - chrY 3652613 3' - INE-1 531 1 54.79 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCTAAAAAGGGTTCCCTATGTGTACTTGCGGTAATTGCAGAGCGTTTTAA:1 - chr3R 27323066 3' - 297 6634 2 61.24 GATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAACCGCAGTTGGGTAATCACTTCAAAATGCGGTAAA:1 + chr2R 11095858 3' + diver 6073 2 56.64 AATCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTT:1 - chr3L 18183072 3' + Tirant 8463 2 54.29 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTAGTGCTAAACTTTCACCTGAAGGACCAAACTCTAGTGGGGTACCGGG:1 - chr3L 13364312 3' + hobo 2897 1 59.63 TCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGCATATGAAATCGTCAATTTTATACCGATTCATTTTGCTGCGACTCAAAAGCTGCCTAACCAGGTGCGGA:1 + chr2R 5438318 3' - flea 4810 2 56.16 TTATTGTTATAATTATTGTTATTTCACAAAATACTGCATAAGGACTAAGTTGTACCTGCAACATCTAAATTAACGTTGAAAATCAGAATTTCTTATTAGGTTTAAGCCTACTTTAGGAAGAAACTGAACCCCAATCACAGAAAAAC:1 - chrX 7711063 3' - mdg1 20 2 71.23 GTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACGTAGTTTAGTCAAGAAACTA:1 - chr3R 10030727 3' + BS 5013 1 75.36 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGTTTAGCAAAACTTGAAGTTGAATGTATAAATGTAATTTTCGTTATATTTATTTTGTTTGGGGGACATGTACTTAGGAGGATAGAAAAGCTTTTAAA:1 - chr2R 12669324 3' - jockey 32 1 40.41 TTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGTATATAGATACATATAAAGCGTATCCTGATTTCCCCCCTGCCGTAGGCGCCTATTTTTATTTTCCCATTCACTGCCAACTTATTTAC:1 - chrX 18220546 3' + Burdock 225 2 60.96 GAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGC:1 + chr3R 16276425 3' + pogo 2034 1 69.18 ACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGGCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTTCGGCAGGCCG:1 - chr3L 9212703 3' - hobo 86 1 74.13 CAAGATATTTTTGAAGAGAAGCACAGATTCATTATACATCCTTTTCATAAATTCCACTGCTTCTTCAGTAAATCTAAAATCCAAACCTTGTTTTGTTATTTCTTAAGATTAAAACTACTATTTACAAATACTCAAATTTTTTGTCA:1 + chr2R 9251384 3' + hopper2 346 1 32.19 CGAAAAAATCGTGTACCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTATATGACATTTCCAATAGAATCAAACATTCCTAACTCTGTCCAATCCGATTACTCAATTGCCTGTTTCCTCCAATCCGCGC:1 - chrX 10965793 3' - 1360 41 1 54.11 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATGAAAATTGTGAAAAAGATGATGACCGATTTTCAG:1 - chr2R 5237692 3' - Doc 22 1 58.90 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCA:1 + chr3L 19031313 3' - roo 8739 2 69.86 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATG:1 + chr3R 25795819 3' - jockey 70 1 67.69 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTACCAAAAAAGGGTTTGTTCTAAATGAAAGACTG:1 - chr3R 21674836 3' - roo 85 2 76.03 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTTGACTATGATGGGTTTTTGCCCTGGCAGTGACGTAGCTTAAGTGGTTGAGAAATTCCGTAGATACTTCAGCCAAGATGCGAACATAATACGAGAG:1 - chr3R 20935758 3' + 412 489 2 66.13 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACACTATAACCTTGAAAAGTACTTCTAATTGGCGCAGGGCCAAGTCTCCAGCGGCTCCTTTAATGGCCATCATGCCCA:1 + chr2L 4637307 3' - mdg1 7044 2 73.08 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCCTTTGATGAAATCAAATGCATTCTTGTAACTACATTTTCAGCGGATTTAAGATTGATGAACTGCTTTTTATTTATCTCAGTGCATC:1 - chr3L 2330058 3' - roo 8699 2 58.22 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTCAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGC:1 + chr2R 9871554 3' - roo 16 2 37.93 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTAACGACCTTATAAGTTATGCCAATTGCGAGGGCAACGTTGCGTATGCGTAATAAAATGTAGAAC:1 + chrX 15116149 3' - pogo 54 1 56.16 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGACCACCACCCATGTGCCATCTTCCAGCAAGCGCACGCCTGTCATAAATCTTGTTTTGAATGTCCTGCCAGCGTTGATAGCGCCATGGTGAGAGA:1 - chr2R 20447752 3' - hopper 26 1 66.44 ATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAATTGATCGGCAACATTTTTTTCTTGTTATTTACCAATTTATGTATTTTACATATTATT:1 - chr2L 65265 3' - 1360 316 1 60.96 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTCTTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCATTGT:1 - chr3R 28450672 3' + roo 8994 2 71.92 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCGTAAATAAATCATCTATACAATTAAA:1 + chr3L 23456275 3' + 1360 3363 1 51.37 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAAACAATCGACTTCACAG:1 - chrX 21087535 3' - mdg3 5260 1 74.42 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTCAATCGTTTTAAAGATTTAGCTGATGTCATAGGA:1 - chr3L 25607291 3' - 412 88 2 78.77 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTAGCGCTTGATTATAAAAATCGTTAATCTTTGTATATTCTCCAATAAAGTAATAAGCCATGATCGTCATACC:1 - chr2R 11256145 3' - roo 49 2 53.42 TTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGCCACTAGCAGTTTGACAGCCACTGGGAAGTGTAAAAGTAGGGGGCTAGAATGTGAATAACATTTAGTGGCGCAGCC:1 - chr3L 2425858 3' + hopper 1371 1 54.11 CGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATCTCAACTCAATCTCTCAACTGAGTAACGAAGTAA:1 + chr3L 22275842 3' - FB 89 1 81.51 TTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTCGCCCTTCACGACATTTTCATACGCTTCGCTGGGAAA:1 - chr2R 11263973 3' - jockey 4723 1 52.74 TATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAA:1 - chr2R 12065593 3' - Stalker2 73 2 66.44 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCATAAAACATTTGATGGTATTAACAATGTACTCCTAGACTATATGATGGTGTAAAGTGTAAAAA:1 - chr2L 7652186 3' - roo 8720 2 57.53 AAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCACCGCATTCCCGTCTCCTTAGCCAGTGTGATTTCCACCTTGGTCGAAAAGGCCTTGTAGGAGGCACGCTCCACAA:1 + chr3R 8304938 3' + blood 166 2 71.43 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATTGTAAGTTTTACTTAATGCAACAACCCATGTTTTAAGTCTTATGTCTATTTCT:1 + chr2R 21870296 3' + copia 226 1 51.37 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATG:2 - chr2R 22746078 3' - jockey 4837 1 69.18 ATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATATATACACTTTATACAGAATCTACGAGTAATGGTTATAAAAATATACAGAGATAG:1 - chrX 15408717 3' - INE-1 516 1 67.12 TCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTGGCAGCAGTGCGAACGAGAAAGTTCAACAATCTTTTTGGCATTGAAATTAAAAAATTCAGCATACCTTTTCACTGGAAGAGTAAAGGGTATAAGAAGAGGTTTTCGCAGCGAAAGCGA:1 - chr3R 19113904 3' - INE-1 551 1 52.05 GTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATTGGACATTGAAGCAAATGGCAACATTTATGACGGTTATAAAGAGATTTAGATTCTCTTTTAGAAAAAATTATT:1 - chr3R 13349482 3' + Ivk 5327 1 50.68 GTAAGAATGAATAAAATGCCAAGCCCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACAGCTGAATCTAACTCATTAAGTGTACACACAAGTTGATAGTATGAACAAAGACTTTTTCGCCCAGCACTTTGGAACACGTGGAAATCCGAA:1 + chr3L 528620 3' + rooA 7519 2 71.92 AAAAAATGTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTATTGTTGCGCAGAAATGTTCGAATACCGAATCGTGTATTACATTTTTGTCTTGAAATATTTTAAAATAGCGAAAAAACTT:1 + chr2R 1076584 3' + FB 247 1 63.85 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAG:1 - chr2L 19691258 3' + roo 8988 2 75.34 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGGGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCAC:1 + chr3L 18183162 3' - Tirant 8163 2 77.19 GATTTCTGGCGTATGTCGTGACTGTTGTTAGCATAGCAGGTGTTATGTTGGCAATTTCCTCTTGGATGTTGGGTTTCTTGTTTCTTTCTTGCTGCAGCCTATAATTTCTTCCCTACGAAATGATTATAGCATTTGCTGCTGTGCGA:1 + chr2L 14666617 3' - mariner2 716 1 54.11 CACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGGGGAGGGTTAAGAAAGAATGGTCGAGGTCACCAACTACCCGTTACTAAGTT:1 + chr3L 23974855 3' + Quasimodo 6942 2 61.98 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGACCTTTCTAAAAGCTATCGCAGGCAGTAACCCTCTAGTCCTCGTCCTACACAAAAACTCGAATATCAAGTGCGACATTCTGAG:1 + chr3R 6645446 3' + blood 342 2 60.42 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTATATAACCCACCGATTCCGGCCCTCGAGGACATGCATCTCGACGTCGCT:1 - chr3R 19435992 3' - roo 65 2 64.14 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTGG:1 + chr2L 12486438 3' - roo 46 2 52.05 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCTAATTATTTAGTACACATTTATGCTGAATGTCTCGACTATATTTAATGGGTCTTGCACAAATTTGA:1 - chr3R 17047802 3' + 412 437 2 59.59 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACTGGCGC:1 + chrX 16117272 3' + opus 7443 2 60.96 ACCGTGCGCATTTCGACTGGCCTTATAACGGAGCATTGCCGACTTCAAAGCCATCTGCACAAAATTGGCATTCTGACAGTTAGGAGAGATCAGTTTTGGCCAAAAAACCAGGCGACTAGAACAACAAACGCCGACGACTGGCATTG:1 - chr3R 6486920 3' + baggins 5116 1 52.74 GTGTTTAACTTTCATTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTT:1 - chr2L 17295851 3' - Doc 78 1 66.21 GATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATAAAAAAATGGAACATATTTTATGGGAATTAAAACAAAACCTTCAACATTCATTGTAGGTTGCCCATTAATGAA:1 + chr2L 13332729 3' + micropia 5397 2 56.85 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGAAAATACGTTT:1 + chr3R 28117057 3' - hobo 57 1 66.94 AAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCC:1 + chr3R 31141053 3' - Burdock 31 2 54.39 GTGGGCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGGGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACCAGCCAAATGCTCATCCGATGATATCATGAAG:1 - chr2R 22515700 3' - 412 7201 2 72.58 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCC:1 - chr2R 6798248 3' - jockey 96 1 78.08 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACGGAGCCG:1 - chr3L 486741 3' - roo 86 2 78.77 CTTCGGCTATTTATTATTCTCACTAGTGAATGCAGTCGCGTCAATTTTTGTATAGTTTGGCATTGGTGAAAAATAACCAGGAGACTCGAAAGTGAAAGATAGCCAGCGCTGACAACGCGCGCTTTTATGCGTGGCCAGTTATAGGA:1 - chr3R 2689536 3' + diver2 4865 2 60.27 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGGGCAAACCGATGGAAATTTCTGCCTTCATGAGGCGGCAACAGGTTACACAGCAGCATCAATTAATTTT:1 + chr2L 12144306 3' + transib2 2772 1 55.48 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTG:1 + chr2L 12486437 3' - roo 8711 2 52.74 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAATCACGACTTGCTGCTTCTCGTCGAGGGATCTCCGCTTTTCGTTTTAATTCGAAAAAAACGTTCGAG:1 + chr3R 16625292 3' - Doc 41 1 46.40 TTTGTAAGCTTATTTGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTTGGTTCCAAGTAGATTCACTAGATCTAAATGATAATTATCATTAAAACAAAGAAGATACAAAAGGCGAATATCAATTACGTGCTGA:1 + chr2R 15894916 3' + Cr1a 4047 1 55.48 CGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTACCAAAATCAAATTAATTGAAATGATAGCGAATAATCAAAGCTAAAAGACACCAATGATACGGATGTAAATGATGCCAAAGAGGAATAATAGTGATGTATCTCCCATTTGAAAG:1 - chr3R 18341538 3' - INE-1 559 1 58.90 AAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAATATGTTTTTTATAATAACAATTTTTGTGCCGATTAAATGGTTTTAAGTACAACTAAACTTACAATATATCACGAAAGACT:1 - chr2R 14814197 3' - Transpac 5132 2 53.49 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGCATTTTACGTCCTTGA:1 - chr2R 15075575 3' + mdg1 7396 2 59.59 AAACTGAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACACCTTGTTTGAGATGCTAATGCTGCTAAGAACACGAATATCTCAGTTGTCGGGGAATAGAGAGGTTAACCTAAAGGGGAAAGAGGGAAAGTCAAGTTGCAACCACTC:1 + chr2L 1776228 3' + roo 391 2 73.10 ATGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCA:1 - 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chr2L 17839393 3' - blood 80 2 70.55 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTTTGTCCCATGTTTTCTTTCTATCTGC:1 + chrX 9948510 3' - accord 7030 2 86.44 ATTGTTTGAAATTTAATACCTATTGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTG:1 - chr3R 31887316 3' + HB 1524 1 69.18 GTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCG:1 + chr3L 21093233 3' - Ivk 57 1 59.57 ATTAAGGCGTACGGGGTAGCTGAAAACCCCTTTGTCACTTTGGTCGCTATTAATTCAGCCCATTCAGGCTGCAATCTCTGCTTCAAGTTTCGCTTTGTCTCACTTAATTTTTTGCTCGTCTATTTTTGCTTCCTTTCATTTTATTT:1 + chr2L 16162979 3' - BS3 1750 1 65.07 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGGCTATATGGCAAAGGATGTGGAAAGAGGTCGGTTTGCTATTCACTTGAATTAAAATGAATTTAAGTGGTTTGCTATTGGCC:1 - chr2R 21748217 3' - 1360 31 1 58.70 ACAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAACCATCAGATTAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGATGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTAAACCTATGCGCCAAGGGAAAGCGAACGGAGGAAGGACCT:1 + chr2L 19919781 3' - Circe 7148 1 77.40 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGACCACCGACCGACCGCTGACCATAATTCACTCAAGTTAGACAAAAGCATTTTGGTTGCCCCGCCCCTAATT:1 - chr3R 21341307 3' - hopper 49 1 52.05 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATAACGCGTATCTGATTGTCAAGGAACTTTCCTAGTACTAAATAATGATTTTAGTTTAAATTGTAAAAATTATTAAATTAA:1 + chr3R 5421286 3' - roo 8731 2 55.56 AGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACATATACATAGAAGGGACTAACAATGCAAGTC:1 + chr3L 14302258 3' - Quasimodo 78 2 82.88 GCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATGCAACTTATATATGTGTAATTACTAGTGACCCTCCTGAACAACTG:1 - chrX 12786976 3' + I-element 50 1 69.18 CCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTAAAAATACTCTATAACTTGGCATAACCAGCACAGGTCTTCACTGTTTCTCTAACTAAAAACTACCTTTCCAAA:1 + chr2L 22748588 3' + jockey 4794 1 52.74 ATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAAAACAAACAGCAAAGGCTTCTTAAGACCAGCCAAAATCGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGTAGTTAA:1 + chrX 21087705 3' + mdg3 234 2 56.16 GTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAATATTCATTTA:1 - chr3R 22341149 3' - hopper 113 1 71.92 GCTGCTCCTTCCACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGCACCGCATAGCACTCCTATCAGCAGACTGTGACCCGATCCATCGG:1 + chr3R 27173550 3' + mdg3 5261 1 64.00 TGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAAGTCAAAAT:1 + chr2R 10160960 3' - transib2 76 1 71.23 TAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTAAGTCATTTGACTTAATATGATGTAACATTAACATTAGAAGAAAACACTCTATTTTGTTACCTGAACCCATTTATATCCCTTTTCACTATTTGAAC:1 - chr3R 10090571 3' + 1360 2970 1 34.25 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATACATTCTTGAACTTG:1 + chr3L 12223211 3' + Transpac 253 2 69.75 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTACCAAAAAAGGGTTTGTTCTAAATGAAAGACTGTTAAAATATATATATTTAGATTTGGTTCATGGCCTTTATTTATAAATGTCTTTCCTCATACCTATTTGTTTCTTATATT:1 - chr3R 21674762 3' - roo 6 2 72.60 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAAACAAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAACTGCACGCGGAACGGAAAGAGGAGGAGCTCTG:1 + chr3L 20497832 3' - P-element 39 1 52.76 TTTTTTATTTTTTTAACTTTGTCATCTGAATTTCTAGCCCCCTCCATTTTCTAGCCCCCTTTTAAGTTGGCACGCCTCTAGTTTACAAATATTTTGGTATCTCAGCTTACTTTGTGTATATTGTGACTTTAGATCGAACTTTAA:1 + chr3L 10548939 3' - TAHRE 10439 1 67.36 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGCATTTTACGTCCTTGAACTTACCCG:1 - chr2R 15075566 3' + mdg1 7405 2 53.42 GCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATTTATCTATACA:1 + chr3R 2689452 3' + diver2 4474 1 70.97 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTATGAAGCCAACGAAGTGGAAATTACCTTGTAAAATTTAAAAAAATCAAAATCAATATGGAAACGATTTAACTAATTTAATA:1 - chr3L 2320589 3' - roo 40 2 54.79 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACATTCTATACTTAGCCACTATATATGTATATATTTGAATAGTTCAGCGATTGTTGTCCTTCATGCATTG:1 + chrX 11008417 3' - hobo 49 1 54.11 AAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAAATATTAATGAAGTCATCAAAAGTGAAAAGATTAAAATTACATTTCTAGT:1 + chr2L 9418585 3' - 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roo 99 2 70.87 CCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGTAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATCTTTCTCGATGCGT:1 + chr2R 11146139 3' - Quasimodo 48 2 52.74 GGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAACTAGCCGGCTGGCAGAGGACAAAGTTCCCAGCTTGAGATAAAA:1 + chr2L 5890598 3' + invader3 5453 2 68.91 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAAATGAGCGCTAAACGAGCTCGAAGCCTCCAAGAGCAGCACGATTTTTTTTGGGGCTGCCTGAAGAAAGCCGCCGTGGAGTTTTG:1 + chr2L 11405887 3' - 412 7088 2 58.62 ACACTTTTGAAAAATGTTTTGATTGCTCTTCGTTCTATTGTTTGTCTTGCTAATTTTTATCGCTATACCATGTCATTATTATTATAGATTTCCCAGCTTAGTTTTCGCTTTGCAGACTGCAATTAATTTTCTCGTTGTTCTACAAG:1 - chrX 751480 3' + INE-1 260 1 51.37 AAATAAAAAAAGAAAAACAAGTGGAAAACCAATAAATAAAAATCGAATAAAAACGCATGAATCATTTTCATTCACATTCAGAGATACCGGTTGCCCCTTTTCAATGCTGCAATGCTTCTTGCTATCCCCACCTTAAATTAC:1 + chr3R 14067885 3' + Porto1 165 1 60.99 GGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTTCATCATTGTGGGCGTTCCCGGAAATTTACTGACCATAGTGGCCCTGTCGCGAGGTCGTCAAACCCGCAACTCCACGGCCATATT:1 + chrX 2053068 3' - 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chr3L 12874877 3' - jockey 78 1 63.70 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGGCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAA:1 - chr3R 14277890 3' - P-element 45 1 43.33 TAATTGCATGACTTGCTGTTGAGAATGGTGGCCACCAGCTGTGTCATCTGGGTGAACATGCGCTCCACAAAGTACGGAGAGACGTTGCCTAAAATCGAATTTGGACTGACCGGAATGTCCAGGCGCTTGTCC:1 - chr3R 16998011 3' - G6 1592 1 55.30 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTTAATGAACTACAATATCATCGCTTTATTAAAGCAAACTGACTTAATTGTACTTACCATCCTTGAGAGAGTA:1 - chr2L 19691182 3' + roo 400 1 77.40 CCAATTTATGTGACTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGTTGTGCGTGTTTTGCGTACTGTAAGAACATAATGCCATTATATGGCATTTGACAGCTCCTGCACTAAAGA:1 - chr2L 22228197 3' - Bica 4702 1 63.70 AACCAAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCCCCCTTACGAGTTCATCTGCTTGCTGTCTTCGGCCACTCAAATTTTTTAAATAATATGACGTTTTCCTTTGCACGAAATCTCTATTTTTATTTAAATCCAATAAGCACGTTTGCATTC:1 - chrX 8497225 3' + hopper 492 1 63.01 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCACATTAAATGAAGGGTGGTCTGAAAAC:1 + chrX 6633069 3' + P-element 2854 1 63.01 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACATTCTCGGAGGGAAACTTGGGGGTGCTGCCTCAGCTTCTTTGGAAGGTACGGGCAACA:1 - 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accord 237 2 67.12 CGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCTGCTATGCGAACTCGTTTGTTATTTATTAAGCTAAGAATTATACCTATGAGTACTTTATAACTGTTGACTCTTTCCGTGTTTTTGTCGCTAATGCGATGGCACGTCCAAGTTTTGGCTGGA:1 + chr3L 27972516 3' + INE-1 555 1 73.29 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCAAATCTTGTAAGCGCTTTGAAAGAGCATCGTAAGCCATTAGTGGTAAACTTTGCAAGTAAAATGTCTGGCGATGACGAGCTGAAGGCGGAGGGCAT:1 - chr2R 21843894 3' + pogo 2077 1 66.44 TTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTCGAAATAATACATGAAAACCTTATCAAAATAAAGATTGATGATTTTGTTATAAGTTAGTACAAAACTTCCTGGCCTTTTATCTTATCTTAACGA:1 + chr3R 23097195 3' - roo 114 2 63.70 GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGCGCATTTTCTCTCATTTGGACCTTTTTTTCCCCAAGATCCTTTTGGCCACAATGTCTCCGTGTCCATTTTATTATTCCTGCCGTTTTTCATCT:1 + chr2L 21031039 3' - FB 29 1 63.01 GTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAAACAATCGA:1 - chrX 21087543 3' - mdg3 5253 1 77.19 TCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTACACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGCATACCTTGAAGGGTCGCTATTTCATCAAAAATGCATAAAATAATAATAAAATCGTACGCGAAAA:1 - chr2L 14131662 3' - Quasimodo 49 2 50.68 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTT:1 - chr3L 14375598 3' + roo 9031 1 54.79 AGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAATGCCAATTAGTTCGGATAGTTAGTGACTTTAATTCACTCCAATACAATCT:1 - chr3L 16973304 3' - S-element 1522 1 74.66 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACACGCCAAACCGAGTATCAAACATGGAAATAGACGCAAAGGGGCGAATAAATAATAATTTATTACACATTGACTGCCGAAAAAAAGCAGAAATAAAAAAAGGCC:1 + chr3R 24564883 3' + opus 7488 2 72.60 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAAAATGTAAAGGAATTCAATTTGAAATGCAAACAATGCAGCTCACACACACGCATACTAACGCATAC:1 + chrX 19788892 3' - hobo 54 1 56.16 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAAAGTGCA:1 + chr3L 10469628 3' + roo 9032 1 56.12 ACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAG:1 - 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chr3R 14218452 3' - roo 8748 2 76.03 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTATGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCAATCGAATTGAATAACAATTGAATTGAAGCACAAAATTGAAGTAATTTATTTGTGGATGGAAATAGAAATAAATCA:1 - chr3L 26741206 3' - F-element 70 1 58.90 TATGAGTATTAAAGAAGTGGAATGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTG:1 - chrX 15746284 3' - jockey2 3264 1 56.16 ATATGTCAGCCCGACGGCTACCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATTGTTAATTATGTTTTCCTTACATGAGCTGGTTTGCTAGTTACACTATTTGCGAATAACTCATAATTTGTTTA:1 + chr2L 14969201 3' + 412 7499 2 47.59 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCCGGTCTCTGCTTCGAACTACTTAAAGGAAGAAAGGCTATGAAAAA:1 - chr3R 28117005 3' + hobo 2908 1 55.68 CAAGAAAAAGAAAAAAAATAAATAATACAACAATGCACGAAAAATGGCAAGAAAATTTTAGATGGCAACAACATAAGGTCAGCACGCTGAACCAGTGGACGCGAAATTAGTTTAACAAATGTAAA:1 - chr2R 18937284 3' + Doc2-element 219 1 71.20 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAGTCTTCAGATACATTTAGTATCTTGAAGCTTCAAGAAGTTTTCTAAGATGATTAACCATAGAGGTCATTGATCCTTACCAAAACGATATCCTTAAAAAGGTCATTAA:1 - 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chr2L 10259015 3' - G3 103 1 57.53 ACATTAATATATCATCCATATAAACATTGCAACAACAACAGAACAACATTATACCGATCTAATTCAAATAATGAATATTTTACAACAAGCTAATATGAAACTTTATTTTTGGTAGCTACAAAAATAGTAAATCAAACACAGTTTTG:1 - chr2L 14205146 3' - TLD2_LTR 43 1 71.92 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATTAATGCCGCTTTAAGGTATTTTTGCGCTGCCCGCAAATGAATCGATCCG:1 + chr2R 22463244 3' + roo 397 1 43.18 GTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTCGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAATTATCAGATTTGCAGGTACTTATAAAAATGCGAGCAATCAGTATTACAATTTTATCGAAAGGCTCAACAAAACTGCATGATGTTCATTA:1 - chr2L 10904581 3' - jockey 245 1 58.22 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCT:1 + chr3L 16059332 3' - 297 6590 2 63.75 CTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACTGCCAACTTTGAGGAGGGTTTCGGAGGACA:1 - chr3L 12159642 3' - Quasimodo 33 2 62.33 TTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAATCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGT:1 - chr3L 18183107 3' + Tirant 8423 2 75.86 AGACCGTAAAGTTCAATAAGTCTTAAACCGATATTTAATAAAAACCAAAACCGAATTTATTCAGTGTTTAATTTATTTCGGATCCCTCGCATACATTACCCTCATGTGCATTTTGCTATTTTGTTCCAGCTCCCGACTATTGCGCA:1 + chr3L 15367727 3' + McClintock 294 2 56.16 AAAAAAAAAGAAAAGAAAAACCCCCCGAAACGGGACAGGAGTACGCCCATCCGGGTATGGGATTGGGCTCCAGGCCCTGCTGTCCCTTCACTTCATGAGTATGAGTAGGC:1 + chr2L 10099835 3' + gypsy7 5007 5 73.64 GGGCGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGATTAGACTTGATAGGATGACTTTTCTTTCAAATATCTTTTTAAGTCCTTAAATGTTTTTGTTTTTTAATATTCCATA:1 + chr2L 15644976 3' - transib2 43 1 56.16 AAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAACCGCAGTTGGGTAATCACTTCA:2 + chr2R 11095846 3' + diver 170 2 55.48 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGGGTGTGGCGG:1 - chr3R 9125610 3' - Doc 18 1 77.93 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCAACTTCGTTTACACTTTCAGCCCTCTGGGCCAAACCCACTTGACCTGCCATTACGAGCCGAGTTCTACACTGCAAGTTTGTGATGTATACACATTAAA:1 + chrX 6936737 3' - 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chr2R 16720907 3' + G6 1590 1 65.07 GTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTTAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTAATGTTAACTCGCGCGGTAACGTTTCAGCTCGAAACGCTGCTAGT:1 + chr3R 29077945 3' + accord2 117 2 75.69 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCTTGTTTAACGCAGCTATAAATTATGATGCCAAAGTTTTTGGCCACTCAACGAGCGGGAAAGCACGGGCGA:1 + chr2L 20515317 3' - I-element 33 1 63.01 CTACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTTTATTTTTTTTTTATTTTATTTCCATTCCAATTTCCAATTTTATTTCCATTTTATGTTCCAGAAAATGTTGCATTTTTTACTAGCACTTGCAGTAGCGAAGTAACGGGTGTATCGTTT:1 + chr2R 5741255 3' + INE-1 579 1 78.08 GCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTT:1 + chr3L 18253865 3' + blood 7307 2 75.34 AGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGATTATTTATTAATCTCATCTTTCTATATATGAACTAATTG:1 + chrX 12636686 3' - 1360 495 1 73.29 GAGGTCGAACGGTAACCGTGCGGACCGTGCGCGAAGACGGAAATAACGGGATCCCTGCGGCCTAAAAAGGGTTAGTTTTCCTCATCATGTATTTTTGGAGTTTGAACTTTGAAGTTTACAATGACAATGAACGGCTTTCAATTGTC:1 - 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chr2L 3960141 3' - jockey 31 1 65.75 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCGGTTAGGGTTCAAAAGTTATAGTAGTTGTAGTTGTTATGA:1 + chr3R 8218030 3' + P-element 2834 1 48.63 GGATCACCTGGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGCATTTCGTTAGACGATCCAACTAACACAGATCTTAATTGTTTACTGCGGTTTTTTAATTT:1 - chr3L 14281533 3' + GATE 290 1 60.27 ATCTATCGATATCCCAGCAAAATAATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACAGGTATTTCGTTTTGCATATAGACCCGAGACACCCTACATCAGTGTAGAGCAGCATGCGCATT:1 - chr4 528299 3' + INE-1 500 1 57.66 AGTTCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGCTAAGTTAATAGAATAAGTGCATAGAATATTAAAATGCTATTATGTGGCCTTAGAAAAAAATTGCCTGCCATGCAGTTTTC:1 - chr2L 16428724 3' + jockey 102 1 42.76 AGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTTTATCATTTTCGTTCGGTTTGTCGGATTCAGTTCGATTGGTTATGTTTAGTTTTTGTACAACATTT:1 - chr2L 16769389 3' - Doc 4473 1 58.62 TTGTAAAATGGCAAAAAAAAAGGAGCTATCAGTTGAACATCGAGCCGAGATTGTCACTAAATTTAAGCTCAAAAAGATAGGCATAGTTAAATTTGAGAAACTCTCTTGCTGCTCCCAAAAAGGTTAAAAAG:1 - 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Tirant 8158 2 52.05 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGG:1 - chr2L 17839389 3' - blood 7087 2 67.81 TTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACAATTTAAT:1 - chrX 15746261 3' - jockey2 3240 1 57.24 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTCATTTACATAATTTTTGCGTTTGGCCATTTC:1 - chr3R 18635173 3' + opus 7474 2 66.67 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAATTAATCAACAATATTGACTTAAAGCTGTCAACTGAATTAAATTAAACTGA:1 + chr3L 11396006 3' - I-element 68 1 64.38 GGGGTAGGGCAAACCGCGAACACAATGACACCGGTGTTTCGCTGGCAACAAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTTCGTCCGAATATATTAATTTGCTTCCTTAAAAATAACTTGCAGCAGCGCCAATCAAAGCA:1 + chr2L 21648676 3' + Gypsy12A_LTR 1963 1 76.71 CCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAATATTAAGACAGGTTCTTCTACAGACTGCTGCCGAGGCCAAAGTTCTTTTGGGTCTGCTAGCCATTTCGGACCTTTCCACCAA:1 - chr3R 19446528 3' + R1A1-element 5285 1 56.16 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGCTTTACAAAGTATAGTATTGTTTATCTGCTCTTATCAAAAAATTAACAAAATTATAATTCAT:1 - chr3L 17667501 3' - F-element 19 1 74.66 ATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAATCTTGAGTTTAA:1 + chrX 22900326 3' + Tc1 1562 1 66.44 GGTTTTAACAAAGACACTAGAATTCTAGTGTTATTAGTTATTCTAGTGTCTTCGGTTTTAACAACAAGGGCTCAACGAATGGACACAGCTACCGTGGGAAAGCATTGTTTATAGGGAACGATGGCTGAGCCTTCTGCTGGAAGAAC:1 + chrX 22897422 3' + Tc3 235 1 47.26 TCTATTTATCCTCACACATTGACAATTAAAAGGAAAATGCAAAATAGGAGAAGGAACATGGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCGAATACAAGTTAACAAACCATCAAGTTACATTTGTGTTTAAAATCAACAATAATGACGTCC:1 + chr3L 28092758 3' - micropia 5132 2 79.45 AGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTGAATTGCTGGGCAAAAGAGCATGCCAAGGATATTATAATTCTGTAAGACATGGCCGAGTGAGCCCCTCGT:1 - chr3L 1680212 3' + Tirant 8401 2 52.05 GCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAGTTTTGTATGCGACTGGGTCTGGTTGCTGTTTGTAATATTTTGTGTTGCATACTTGCAGGCGCCCGTCACTTCC:1 + chr2L 5646989 3' - jockey 4579 1 63.33 TGGGTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATGGGGGCATTGCATACTTTCGGGCACAAATC:1 + chr3R 23601775 3' - jockey 64 1 53.42 TATCTATTGCACTGAGCTATTACTTAATACTTATTACAGTATACGGACGCGAAGGTTTCAGTTTCATATCGGGCCACGGGTTTTTCCTCCTATTTTTAAATCGCTTTTAATGTGCGGCATTTGGTCTCGTTTTTCTTCGCTTATCC:1 - chr3R 7616678 3' + Stalker2 7635 2 74.66 TCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGTCAACAATAAAATGAAATCAACGTTACGA:1 + chr2R 20447890 3' + hopper2 1540 1 62.33 ACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATTGGATCGGTCCAACGGTCCCCAACGAAATTGAGTGCAGCTGCCACATGGCGTATGCGCAATGTGAGAACAGGCAAGGCAACCAA:1 - chrX 12815860 3' + roo 16 2 67.20 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTACGCATATCGGCACACATACATAAATACACACTGCACTGACAATGAGAGGAGACACAGTGCCGAAGAGAC:1 - chr3R 1267668 3' - P-element 32 1 61.72 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTAGGTAAACCGGTTGGTTGTTGTGTTGTACTTGTAAGTATGTAGACACATACATACATAATCCGCCTGCTCCGTT:1 + chr3R 7089582 3' + P-element 2851 1 57.78 GGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTTTCTTTTGTTTCTTGCCCGCTTCCACTTTTGTTTGCCACTGATTTAGGATAACTGCCAGGGATTCGAGGGCGGGGTTAGTGGTTAGGGG:1 - chr3R 11442953 3' - G2 107 1 77.78 GCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTGAGGTACCTCTGGGCTGCTGCTCTGGATGCTTTGTAGCCCAGTGATTGACGATAATTGACTGCCGCCAGCATAGGACATCAATCATGAC:1 + chr3R 27810150 3' - Burdock 6165 2 63.01 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTTCAATATGACTTTCAAACGCCGAAGCTAAAATGAAAATTTAGCTTATTAAAATATGAAAAATGTTGCACTTCAATA:1 + chrX 20975860 3' + copia 245 1 54.79 CAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGATGTGGGTGAAGGCCATGGACATTG:1 + chr3R 16997487 3' - G6 18 1 68.80 TGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACAAGTAAATGGTTTTGGTATGA:1 - chr2L 11554490 3' - roo 8811 2 65.75 CAGAAGGCAACATGATGCTGCCACGATTAGTGCCACTCGCTGGGGGCGTTCTGCGTTGACCTCTTCTCTGAACCTTCGTATTGTTATTCATCAAGCCATCATTGATTGCATGCCCTTCTACTCACATCATCACTCCGATTGCATAT:1 + chr3L 2801067 3' - gypsy2 6350 1 57.53 TAACATTTTCAAAAATTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACC:1 + chr3R 8049019 3' - Q-element 139 2 63.70 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCACCACACACAAACACACGCACTCAGAAACACACGCACACATAAGCAACCACTCAGTTACCAACA:1 - chr2R 23671772 3' - hobo 50 1 53.62 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATTGTTATTTTAAGATC:1 + chr3L 18484485 3' - hopper 52 1 54.11 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGAT:2 - chr3R 9125621 3' - Doc 30 1 69.86 GGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCTCATATCACAGAGTATCAG:2 + chrX 21994020 3' - McClintock 5986 2 60.27 AGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTAAAATAAAAAGTTTTGTAATCATTTAGTGAAATAAAATTTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGAATATAATTATATATATATATTTTCCTGATGTTTATCTTCCGAAAT:1 - chrX 23182849 3' + Idefix 486 2 78.08 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAACGGTGAAAACTAGTACATGCACACAATTT:1 + chr3R 12363831 3' - 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blood 7046 2 61.64 ATATCAAATAACTGAATGGCGCGCATTTGAAAAAATGGAAGGGATGCTGCCGCACCCATTCGTAAAATTTACAAATGTCGAAAAGAAACAAAAAAAAACTGGCTGAAATGGCGCTATGGGTTAATTGATGTCAAATAATTGTGATA:1 + chrX 22819390 3' - mariner2 37 1 63.01 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGTATGCTTTTAAATTTTAAACAGTTTACCATTCAT:1 + chrX 7384974 3' + I-element 5270 1 75.17 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCCACGTCTGTGTGTGCTTCCTGTGTATTGGTGTGCACGGCTGTTTGACTGTGCATTGGTATGGGAG:1 - chr2L 9879677 3' - jockey 23 1 58.10 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATATCAAAATACTTGAACTCTATTACGACGGCATGCTGTGGAGGCGCGGTGATCCTCCATTCGCATAACGTATTG:1 + chr3L 11804082 3' + blood 7342 2 52.74 TGATATAATAATCTTTCCCAATACAATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGC:1 + chr2R 2875186 3' + TLD2_LTR 51 1 64.83 GTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTTCCTGGAAAAGTATTCCCATATAATTTTTAATTACAAAACAAAAAGATTT:1 - 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jockey 67 1 54.79 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGCGTATATTTCTGCGATTA:1 + chr3R 25751911 3' + roo 9032 1 58.22 TTTTGTTGTTTTATTTTACTTTTTGCATATCACAGATTTTCCTCGCGTGGCTGCCAAAAAATAAATCGATAAACTTTCACCCTGCTCCCATTAAAATGTTGATTAATATCAATTTGGAAAATGCATTAAATCGAAATCTAGCCATC:1 - chr3L 22324141 3' - F-element 4681 1 64.38 CATAGATTTAAGAATGAAACTCAGCTACATTTACAAACGCATACTGCGGCGTCTAACAAGCGCTGCATTATATAATTGGATTATAGGGGGATGTAAAAAGATGCTGCTAAAAGTAAATGCCTCTCTTAAAGTAATGTTTAGTGGTG:1 - chr3R 5930522 3' + rooA 7425 2 55.48 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTAAAAACAGTTAATACTATGTACATATTTAATTAACAACTTTTTCTGAATTCAAGTTCACTTTTCTTTGACT:1 + chr3L 7870295 3' - roo 48 2 56.85 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACTGGCGCACCGCAC:1 + chrX 16117279 3' + opus 453 2 54.29 TGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGCGTTGGATGGAAAAATATTTAAAATGGGCCCCTCTATCATACAATTAATATTAAGCAATTTGAACTAGTTGTTTAACTATACTGAAATTTTGG:1 - chr3L 18066888 3' + mdg3 5080 1 63.70 ATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTATTTCACTGCCA:1 - chr2R 11095726 3' - diver 47 2 51.72 CACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGGTTTCGCCATCAGACTCTAAATGGAG:1 - chr2L 12291817 3' + Tirant 385 2 70.83 GGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGAGGGGAGTGAAATTCAAGATCGCAAAACCACAGAGTCAAAAGAGGATAACATTTTGATTGCACTTGGGCAGCATG:1 + chr3R 15434563 3' + invader4 3019 2 52.78 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGTCAG:1 + chr3R 19436075 3' + roo 335 2 67.81 AAAAAGGAAAGAAAAAAAAAAACGCGAGCTGGGCTTGTTTTTGGTTCGGAGCGGGAGGGGGGATT:1 + chrX 17981618 3' + Doc2-element 238 2 87.69 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGCAACCTGCTCC:1 + chr2R 14973715 3' - FB 24 1 63.20 TAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTTGCCTA:1 + chr3R 14049462 3' + transib2 2793 1 63.01 TTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAAT:1 - chr2L 21153508 3' - 1360 76 1 77.10 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAACGAGTCAGCTGTTCGCC:1 - chr3R 8217942 3' - P-element 38 1 43.81 AATGAAAAAAAAAAGAAAAAAAATTGCTCCGCCGCCTGTCGAGCGGCGCGCGGGTGTT:1 + chrX 6381225 3' + Doc 4700 8 91.38 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACATTCTATACTTAGCCACTATATATGTATATATTTGAATAGTTCAGCGATTGTTGTCCTTCTTGCATTGGTTTATTTCGTTCTGCCCCACCATGTTTCTTCCCCC:1 + chrX 11008453 3' - hobo 12 1 71.03 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAAGCATACATATTTATGATATATGTATGAATATATATTTTTTTTTACTTTTTACATTACACAAAATTGTCGAAAAATATGCGTGCATTGAACTTCTGCATTTGAA:1 - chrX 7384860 3' - I-element 17 1 71.23 GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTTCTTTGGTCCAACCGTAGTTGCAAATGGTGCATCTTAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCTTTTATATTAGCAGTTT:1 + chr2R 5531223 3' + 1360 3332 1 41.10 CAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGACGCATTCGCGACTTCCACCGGAGGGTCAAAACTGCTTACGCAGCTCAAATCCTTGGCATATCCAGTATCCATGCGCGATCCACTCAATTATTTTGCTTGTTTTTATTTGACCAGATAT:1 - 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chrX 9831794 3' - mdg1 22 4 69.90 CCACACACACACACACATATTATCTAATACACGCATGCCTACAGCAACACCAATACGCACACACTAATAGGAAAATAGGAATGGACCAC:1 - chr3R 30552733 3' + accord 185 2 80.90 GCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAACAACTCCTCAATTAAAACCCCACCTTACGCCTATGCCAGGAAGGAGTCACTCTACTCGGTGGTTTCGCCCAAGTCTCGAAAGGGAAGCCTGGACTCGCATC:1 + chr2L 13962230 3' + Doc 461 1 73.94 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGACGAACTGATCTGACGCGCCAATGTGACCAATTACATTAACAATAAAAACGCATACATTAAAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTAT:1 - chr2R 5106274 3' + 1360 3355 1 42.47 AGATCTCGACGTTCATACGGACGGACAGGCAGACGGAAGGACAGTCTGGTGTGCCTAAAGCAGGCCTTCAAAATCTTCGATCGCAGCGAAGTGAACAGCTTTACAATTAACGAG:1 + chr2R 7950796 3' - INE-1 133 1 64.91 TTTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATGAGTTATACTCCACGAAACACTGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTCAAATACACATAAATAGGATGTTACACAATGGGGGCAGCTTTTCCCCGCTTGTCTAGGCACAGTCCTA:1 + chr3L 16681963 3' - transib2 430 1 73.29 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTTTTCCACTGCCATTTGAGATGTTTGGAACAAATGCATTTTCACATTTCTGTGCTGCTTAAATGTAAATTG:1 + chr3R 17258189 3' - 412 7104 2 51.37 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGCACTTGATTTTAACGGTAAGTTTTTGTTAACCAGTTA:1 - chr3L 12964743 3' - hobo 83 1 72.60 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCAAATATTTCGTTCCTTATTCTTATATTTCGTTATATAAATATAAATATTTTTATAAACACTAAAACTTTTCTCTTCCAGGTT:1 - chr2R 5503646 3' + pogo 2065 1 60.96 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAG:1 - chr3L 19031213 3' + roo 359 2 54.11 CGATCGGACCTCACTCAGCTGTAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCATTGTGCACAATCTCCAAGGGAGCTAACCCAAT:1 - chr3L 810633 3' - invader4 119 2 75.76 TCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTTTAGGCACTGAAAAAAGTAGACAAAGTAAAAAGTTATTGCTACAAA:1 - chr3R 12609183 3' + 297 6907 2 68.49 GTCGTTCAGGATGATTTTATCGTCCATTTTGGATTATTAATCCCACTTCTGAGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTGGCGGAGTTTACGACAGCGTGGCGCTCTGCTCTCATTTATCGACGGTCCCATTTTCACGGCATTTTCTT:1 - chr3R 13233179 3' - mdg3 301 1 52.74 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTTTAATATT:1 - chr3L 17537732 3' - Doc 60 1 58.22 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGTATATAGATACATATAAAGCGTATCCTGATTTCCCCCTGCCGTAGGCGCCTATTTTTATTTTCCCATTCACTGCCAACTTATTTACGGGCCG:1 - chrX 18220540 3' + Burdock 6366 2 65.75 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGTTTGATTTTGTAAACATTTACTTCCAATCAACGGCGTTCAAT:1 - chr2R 9294278 3' - Tirant 8115 2 77.87 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTATCCAATTAAAAAAACAAAAA:1 - chr2L 21643033 3' + Tabor 419 2 60.27 AAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTATCATTGCTCTCAACATTTACGATTTTCTTGCTTTGTTTGCTATTTTGATATTTTAACATATG:1 + chr2L 16363420 3' + P-element 2709 1 40.41 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGT:1 + chr2L 12291955 3' - Tirant 6 2 75.96 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTAAAAACAGTTAATACTATGTACATATTTAATTAACAACTTTTTCTGAATTCAAGTTCACTTTTCTT:1 + chr3L 7870290 3' - roo 8717 2 60.27 CTCATAGGGAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAAACCCTAAGACTGGAGGGTAAGTGCTTAGCTATTTCTTTTTTTGTTCTTGAACGAAACAAAAT:1 + chrX 22879751 3' + G6 1742 1 53.08 GATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGGGATTATTG:1 - chr2R 13367421 3' - jockey 4573 1 69.11 TATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTT:1 + chr2R 11146129 3' - Quasimodo 58 2 58.22 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATACAAAGATGTATATATACACTTTTTAAACATTTGCAAGATAAACCTTTTCGATCAAAATTATGATATTCTTTGGAAATTCTTGAATAGTATCAATAA:2 - chrX 15454640 3' + 1360 3363 1 68.49 GTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATGCATAACGATAAGTAGTTCATATACTCGTAAGCCA:1 + chrX 20685985 3' + Ivk 5360 1 71.23 GTTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTCCGCTCTCACTCTCTCGCTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATCTTCGCTCATCCAGGGATTTTCATAATTCCCGGCCTATTTTACTATTTGTACTCCAAGGAATT:1 + chrX 5969798 3' + Cr1a 247 1 55.48 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACAGATGCGAATGCCGCGGGGGTAGCG:1 + chr3R 28951886 3' - jockey 4747 1 80.31 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCA:1 - chr3R 28450676 3' + roo 8990 2 76.03 AGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATTAAAAAAATACCAAATACAAA:2 + chr2L 1361090 3' - Stalker2 7248 1 73.29 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGGCACAGAAAGCTAAAACCCACAACGAGGCGTGGTCCAGATTCGCATGGTACA:1 + chr3R 17099989 3' + Tirant 375 2 54.37 GGCTGCACCCAACTGCCAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGTAATACCATATAAGCCAAGCTATTGAGTACATTCCATTTCATAATAACAACTAATACATAATTCATTTCCACTCAATTGT:1 + chr2L 4929919 3' + blood 7348 2 56.16 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGTAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTC:1 + chr3R 14954021 3' - jockey 4786 1 68.57 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTCCCTTTCTCACATTCTCCCATTCTCTCGTTCTCTCGCGCT:1 - chr3L 19580863 3' + roo 9032 1 58.22 ACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTTAAATTTATTTTGTGATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATGATGTCAATGCCGTTGACGCTGCCAATCGATCAATCTTATTTAAATGTTGACAGTTGTCTTCGCATTGTATCCTGT:1 - chr3R 12525343 3' - 1360 389 1 51.37 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTT:1 - chr3R 6413574 3' - 1360 73 1 74.44 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCCCGCGCAAATGAAAAAACTTTTCCCAACTGCCAAAGTTCGGCCAGTTAACAG:1 + chr2R 12202336 3' - Tirant 8132 2 52.58 AATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGCATATGTTTTGGCCTTATAGAAAAGTGATCGAACTGTTCTAATTCTGTTCTAATTTCAGTGGTGAAGTGATTGTATTGGTCAAAGGTAATA:1 - chr2R 5438180 3' + flea 223 2 64.38 GGAAAAACCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTGGCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAATGGTGTATCAATCGTTACGGTCTTACAGG:1 - chr2L 21705260 3' + FB 21 1 78.08 ACATCTATACCTGTCACATTTTTTAAAACAATTACAGTTTCTAAATGTAGTCAAAGCTGACACCTTCATGATTATTTGATGTCAGGCTGGGGTTATTTATAGGCAGCTGACATGACTATATCCGCTGCAAAATGTGCCCCAGCCAT:1 - 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chr3R 16276326 3' - pogo 60 1 63.70 GGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTTTATAATAGTCAGTACACAATACTCTGTAAAGGTCATGCAACTTGATATTCACAAAATCCATCTATTTGAAATTGTTTCGACTGTGAATGCTTTATTTAAAGTTTTGAAG:1 - chr2L 12851128 3' - Cr1a 4230 1 54.11 CTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTAACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCATTATGTATCATTATGCTTGATCATGATAAGAATTAGTGACAAGAATTAAACT:1 - chr3L 17921946 3' + copia 5059 2 61.64 TTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTAACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTCTTTGGTGTAATATTACGTATACGTCTAGTACAACTATTGTTGTTTTTTTATTGGCCCATGCTTATGTGGCTTTTCGTGTTAGTTTTGTTGTT:1 - chrX 10104260 3' + Cr1a 197 1 61.64 TCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATACAACATATCACAAATATCACTAAAAAAAACCTTAAAACTATTTTTTTC:1 + chr4 540562 3' - flea 4825 1 65.75 ACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATTTATCATTGAATCCATTCTGGACATTGTCAAGTCTTACATTTGCGCGATTGTTCCTGAATTTAATTAAAAAAGAATGAA:1 - chr3L 14180111 3' + Stalker2 162 7 54.48 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATTGTAAGTTTTACTTAATGCAACAACCCATGTTTTAAGTCTTATGTCTATTTCTTTT:1 + chr2R 21870299 3' + copia 229 1 52.05 TATTGATCCTGATCAAAAATATATATACTTTATACAGTCGGAAATACTTTTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAGCGAATCTAGTGTGCTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATGATTACTTTTTAAGTTTTAATATTTTACTTCG:1 + chrX 143611 3' - INE-1 84 1 79.45 AAAAAAATAAAAACAAAATAATGAACGACAAAAACAAATGAATCCAAGTTTTGAACAGTTGTAATAATCTATCAGGGAGTGAGCGTTGAATACCATTTTTATTGTAGTTGCCATTGCTTGTATATACTATACTG:1 + chr3R 833448 3' + gypsy11 3934 2 62.69 AAAATGTGCAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGTAATATTGCGAACTCACTCAGCGCCGTTTTGAATGAGTGGAACCTTTTAAATAAGGTAGTAACG:1 + chr2R 6493198 3' + transib2 2769 1 54.11 ATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGATAAACTAACTTCAGTCGTGTGTTTCAGCCGTAACTTGAAGATCAATACGTTGG:1 + chr2L 2000282 3' + opus 7424 2 69.18 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACTCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATG:1 + chr3R 31141037 3' - Burdock 41 2 64.81 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAACATTGATGGCAAGTGCTTACGG:1 - chr3L 19031230 3' + roo 355 2 55.64 GTGACCATCAAAACACAAACAAACACACGGTAACGAGAATACACACACCGGGTCACACGAACAACAACAACACGGACACAGACACACAAACTGTTAAACACTGCCTTCGC:1 - chr3R 8160299 3' + gypsy10 487 1 78.18 GCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAATGTGTTCACTTTTAAATAATATCGAAAATCACACTGTCTACTGT:1 - chr2L 18112440 3' + transib2 2815 1 76.71 TGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGATGTGGGTGAAGGCCATGGACATTG:1 + chr3R 16997487 3' - G6 28 1 63.70 AAGTTCGTTCTAAGTCAAGTTGAATTTTGTTACAATTTTTTCATAGCACTGCTATTTCATTGAACACCAGAATTTCTGCCTATTTTATTTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTAC:1 - chr2L 21675224 3' + HB 1381 1 57.53 TTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATACGTACATACATCGGTATGTGTGGTGGCTATCAGTTGAGCAATGAAGGTT:1 - chr4 540477 3' - flea 309 1 49.32 GTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATTTTTCTTGTCCACAAATGTATGATATATAATTTTCTTTTTTTACGGTTAAACTA:1 - chr2L 15081013 3' - Doc 13 1 76.03 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGAGAGAAATTGTCAAAGGAAAAACTCAAGGAGGCGTCCTGC:1 - chrX 15559495 3' - hopper 80 1 71.23 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATTCAATTAATTGATAGAAAATATAACTAAGGGC:1 - chr3R 8140874 3' - pogo 62 1 75.81 AAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTTAATGAACTACAATATCATCGCTTTATTAAAGCAAACTGACTTA:1 - chr2L 19691209 3' + roo 373 1 58.90 ACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGGTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAA:1 - chr3L 13690292 3' - hobo 86 1 75.34 ATACATAGATATAAGCAATGTATATGCGGGTTAGCTGAACCCAATTTCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTTTCATGGGTATCCTGGCTGGATTTTTGCCCCTCTCCAAAACCTCCT:1 - chr3R 21882613 3' + Stalker4 7232 4 67.12 AAAAAAAAAAATCCACTAAAAATGCGCGCCAAAACGGGGCCATGAATTAATCTGTTTCTTGTTGTTCCTATTTTATAGGTACACATGCGTGTTTTTTTTTCCCCTATTTCTTTTTATTTTTTTTTGTAATCTATTCT:1 + chrX 12723524 3' - Tc1-2 1390 1 77.37 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGTTCACAGGTCACTGTATCAGTATATCAATGCTCCACAACCACCA:1 - chr2L 3960167 3' - jockey 58 1 52.05 GTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCGGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAAGTACGCATCGAGAGGCATAAATCGATTTAATTCAATACTACGTTCAAAAGTAAGAA:1 - chr2L 17261191 3' - 1360 3346 1 58.82 TCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGCGCGTGGCAGTTTTGGTCGTTTGTAGACGTTAGAGTTTGCGTGCCAAAAAGTTTTTTTTTTGCAAATCGATAGAAA:1 + chr2R 5667266 3' - Q-element 233 2 49.52 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACCCTTGGGCTTTGGATACGGGCTAAGGATGTGGGTCTCGGTTTC:1 + chr3L 19580968 3' - roo 8726 2 69.23 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTG:1 + chr2L 3231974 3' + roo 9046 1 57.98 GACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCG:1 + chr3R 15790113 3' - flea 4709 1 80.53 AAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGCAGAAAAGTTAATTACAATATTTCATTGCTCAGACGTTGGTGGAGGGGCGGGTGCGGTGTAATTTTTATATCCAACA:1 - chr2L 12144177 3' - transib2 6 1 73.64 TTGACAAGGAGAGGAGAGAGAGCGGAGGCTTTTTTAATTCTCTAAAATATCTTAAAGATCTTGCAGTTTTGACGAACAAAATTAACAGGAAGGTTGATACGCCCACTGTGACTCCCACATATTTGAAACATTTTTGGAG:1 + chr2R 5490079 3' + Rt1a 4939 1 58.99 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAAATTTATGTTTATTTTTTAAAC:1 - chr2R 13761611 3' - jockey 4735 1 61.64 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAA:1 + chr2R 1923568 3' + pogo 2035 1 65.52 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACA:1 + chr2L 17626668 3' + roo 8995 2 73.29 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTAAACCCTGTCCTTTGCCGATTTAATTATGATAGCTATC:1 - chr2L 11296173 3' - 1360 53 1 66.09 GCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGGGCA:1 + chr3L 23678168 3' - Osvaldo 14 2 60.91 GAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAACGCACTGCTCCCGAACTGCTTGGCCAGCGATTGCCCCACCATGATGATCAATTCAATTTACTTA:1 + chr3R 14787379 3' + Quasimodo 342 2 56.16 GACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCTACTTTAGCATTCTCTCTTGCTTTTTTCTAATTATTTTTTCTTTTTGTTCAAGTCCTAGCAATGGAGAAACTTTTAAACTTCT:1 - chr3L 27172920 3' + INE-1 553 1 68.18 TATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTGTTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTCTGTCTGTATAAACTCGAGATGCAAACGCAGATGAAGTTGGTTC:1 + chr3R 6672531 3' - Quasimodo 135 2 73.29 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAACTCGCGTCGCACTCATGGGCATTTTTTGTTCGAAAGAATTTCTATCTGTTCCCATTTATC:1 + chr3R 8849886 3' - 297 6616 2 62.33 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGACATTAAGTAGTGTATGTGTGTTGCAGTTAAATTTAAGACTAGATAGGCATTTTATTATATTTAGCTTGTTGTGTAGTTTGGGTAGAAGTAGGTTTATGTGTGAAGGTGAATGCGTGC:1 + chr3L 10106574 3' - I-element 60 1 71.23 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCC:1 + chrX 1103718 3' + pogo 2042 1 60.27 CGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAACCTTTATGGTGTTTAAAGCAGCAA:1 - chr3L 15364793 3' - 1360 44 1 54.48 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAATGACGCAGCACATCCCCGTTTCTCTCCTTCGAC:1 + chr3L 8658835 3' - roo 44 2 54.79 GTAATACAATCGCGTGCGACACAATATGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTGAGCAACCGAGTTATTGAAAGAGACTTAGGAAAATTTGGAGTTAATAATTTCAAATCGAAATTCACTTGTCGGACATGCCGCATTTTTG:1 + chr2L 20787458 3' + G5A 2488 1 56.12 GGATCAATAGCCAAGTCGATCTGGCTGTATACGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTTTTTTTCATAATTTTTTTAGTCTTGTACATTGCTTTCAATATAGCATTCTCTCTTGTTTCATTAATTCTTTT:1 - chr2L 9547515 3' + INE-1 97 1 74.10 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTA:1 + chr2L 12486416 3' - roo 63 2 66.91 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAGAC:1 + chr2L 5792110 3' - blood 7050 2 58.90 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCGGCAACTGGCATAAATCAAAGCGTGGACCAGTTTGCAGCTCAATTGAAAAGGCGAAAAATCAGCAGGGAAACATA:1 - chr3L 662590 3' + opus 473 2 50.36 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGACCACCGACCGACCGCTGACCATAATTCACTCAAGTTAGACAAAAGCATTTTGGTTGCCCCGCCCCTAATTCTCCA:1 - chr3R 21341302 3' - hopper 44 1 55.48 GCTGATAAGGCACCGGGATCGCTTGTGCGGGACAATTTACAACAATTATACCAACAAGTTACTGTGCATTTTTCGCTTCGTTGGTTGTCCACCATCCCATTTGATGGATTTGTCTACAAGTTAGATAATGAGAATGTCAAGATAT:1 + chr2L 6121497 3' - accord2 7186 1 51.72 AATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAATTGGCGATGCTGAAGCATCTGCCGTTGAAAAAATCGAGAATCTAGAAAATTGAGTCTAAATAAATGGATTGATTCATAAAAATATAGGAAAGTTTATG:1 - chr3L 59213 3' + Juan 99 1 56.16 GTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAAGGGAGCTAATCGCCTATCAGATAGAAATAAGCAAGACAAATGATAATATAAAACGATTTCAAATACATTCACAAAATTCTTGATGATTCAGTTTTGAAAAGTT:1 - chr3R 4474894 3' + mdg1 2 2 76.03 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAATAAACGCTTCTATTGTATTTAGTAACTTCAGCCTTCTTGGTATTGATATATGAGATCATAAGGATAGGATCGATCGCTAAGCTCATCCATGC:1 + chr3R 18153688 3' + copia 227 1 67.12 TAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGTCGCAAAAGAGAGAAATAACCATGTGACCAGTAAGTTAGTACACGCGGTGGGCCATACGTGCACGAAGATATATGAGAAGAGA:1 - chr3L 25255106 3' - GATE 103 2 56.85 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAACGAGTCAGCTGTTCGCCCGTATATATTCATATC:1 - chr3R 8217926 3' - P-element 63 1 41.10 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAGGCCATTCGTATGTATTTCTATGTTGGATCAGGGCCAAGTTCCTATCTCTTGGCAATCGGCAGAATATAGTTTGGCAC:1 + chr3R 25862723 3' - roo 8677 2 75.34 GCCCTCACTTTTGATAAATGTGTTAATATTTTTAAAAAGTTTTATTGCCCAAAAACTTTGCCACGCTCATTCTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACCGCCACGCTTGGGTTGTGAATGTATATCTTTTGGTACTAACGCAGGGCA:1 + chr2R 7728255 3' + INE-1 256 1 71.72 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATGGAGCCGCAGTGTTGCGGTTATGCGATAAAATG:1 + chrX 14743002 3' - FB 88 1 79.45 GCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTTCATTCTAGTTCATTATTCACGTTATTGCTTTTTTACTAACTTCGA:1 - chr2R 14611560 3' + jockey 4688 1 65.93 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTGAGTGAAAGTTTCTAATACTGCTAGAAATGTATATTTATAGAAGGAACCTCTTTTTT:1 - chr3L 1358440 3' + 412 7518 2 56.76 TGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCAC:1 + chr2L 21643097 3' - Tabor 87 2 78.57 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGCTTAATTTGA:1 - chr3R 9125622 3' - Doc 30 1 68.28 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATGTTATTTCTAAAAGGCTTTTATTTTTCTTTATTTTAAAAATTTGAGTTAGGTTTTTCAGGCAGCTTAATCAATTATTCCTCACTTA:1 + chr2L 11012284 3' - jockey 4705 1 56.16 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATTGTATATGTTCTAATATAACATATTTTTATTTTTAAATTAGAAGCAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTAAAACAGATCCTGAAAAAATTTC:1 - chr3R 2102748 3' - 412 15 2 75.17 AGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATT:1 - chr3R 23020790 3' + INE-1 557 1 64.38 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGTGCTGCCTACTTTCAGGTGGCCCACCAAAGACATTTACCTTTAATTGCGGCCAT:1 + chr3R 25795873 3' - jockey 31 1 66.44 AGTACTTAAATCTAGAATATATACATCTAGTATATAAGTTATAACCTATATTACACACTATCGCCTACAACCCGCAAAAAGTCAGTAGTTTTGTATTTTTTTTTGCCAAAACAATGTCCCAATGCCAAAGACCACGCCCACTCTAG:1 + chrX 7332390 3' - P-element 2611 1 50.00 AAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGACAGGTATTAAGTATGAAAACATGTTATGCATAGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGAAACCTAATGCCTCTGTTATTTTAAGATAAGGCGTACATGTCGCCCAACATGCAGTTCG:1 - chr2L 2234460 3' + G4 3558 1 78.08 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTGTCA:1 - chr3L 19031198 3' + roo 9039 1 62.33 GAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAGTTAAGAAAAAAAAAACGACTTCTTCAAACATTTCTTGTTTTGTTCGCAATAACAGCCTTTGCCCATCCTTAGAATTTAGAGATAAGACGCCGAGTAGTTTGCATTTACAATAAAAT:1 + chrX 1022602 3' + FB 121 1 66.44 AGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCATTTCACG:1 + chr3L 15364899 3' + 1360 3319 1 66.44 GAATATTCTAGTGTCTTTGGTTATACTTATACGTGAATTATAATTATTATAATACGATATTATATCGTAATTATTTTTTTTGGCCTATTATAGGGCATTGAAAAGAAGGAAATCCGCTTTCGCAAGATCTTAACTTTCCTTTG:1 + chr2L 16673120 3' + Tc3 313 1 65.03 TTTTCCCTACAGACATTAATGAATAAGATCGAGAATTGAGCGTGCTTGCGACAAAAGAATAGTAAACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATATATTCGGACGTCATGGCAGCATTTTAATTTGTTTATGGTTTCATTACTATTTTCT:1 - chr2L 15005164 3' - Gypsy12A_LTR 2138 1 69.18 AGGGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGCGTGTGTGTGTCTATGATGCAAGCTTTCGCGAATTGGTGTGCGAAACGAATGCACTTGTTGTTGTTTTCCATTTGC:1 - chrX 12905383 3' - Tirant 8118 2 76.81 AAATTATAAAAATTTCATTTTATAAAACCCAGGATGATTAAACTGCTCTAATGAAATGCACTTATAGCCAAAAATCACTGATGTGAAGCAAACACCTACTACCACTTTTCCACCTGTC:1 - chr2L 19590073 3' + HB 329 1 67.80 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCATAAGAACTAAAATACTTAAAGGCATACTTATAATTTCCAGAAGAGGATAGCTATACATTAAA:1 + chr3R 14954113 3' - jockey 4784 1 40.41 TACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTGTGTCTTCGGTCCGAAGGTACCACTGCGCTCCAGTGATGGTTCTCAAAATAATGTATGAATAATGAATAATGTATTTGTTTGAAATTATGCAAATTACTGCTCCAATAGTTTGTCATT:1 + chrX 13071677 3' - Doc 4420 1 73.97 TTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAAATATTAATGAAGTCATCAAAAGTGAAAAGATTAAAATTACATTTCTAGTTGTATGTTTTCCGGGAATACCGCTGTGGGATTTTATTGACAGCTCGA:1 + chr2L 9418632 3' - rover 6973 2 66.90 ATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAAACTCGCA:1 - chr2R 12065586 3' - Stalker2 7314 2 61.64 CATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTACTTCAAATCATAAATCATACTTAATTGGCCTCTTTGTTTTATACAAGTAAAGAATTCTTGTATTCATTAATTAGTAATTGTTTGTAAAAAGAGTAGTATGGCT:1 + chr3L 13952188 3' - I-element 5291 1 69.17 ATAGAATTTGCTTGCTTGTGATAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTCGCGTGAAAATGCCGTCGGTGGAAAGGCAGTTGTCATAATTCGTTGCCTACTTCAGGGCGCTGCAGCATATCAACTGGATTTTTCCGACAGCCCATTA:1 - chr3R 31097111 3' - 1360 3259 1 70.55 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCG:1 - chr2L 2494841 3' - Doc 81 1 70.55 GCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCC:1 + chr3R 24454855 3' - F-element 311 1 70.55 AGCCGTTCTTGTAAACAAATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGCTTTGCCTGCTCTCTTTAAATCTTCTAAACTTATATTTTTTAAACATTGAGATTACTCGCCAATCTCGCTTACATTTGATTTCTAGTCTTAAGCTGATATCCGA:1 - chr3R 3788264 3' + 17.6 196 2 49.66 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACATTCTATACTTAGCCACTATATATGTATATATTTGAATAGTTCAGCG:1 + chrX 11008396 3' - hobo 62 1 66.67 AATTTTAATTTAATTTTGATTTAAACACTTGTTCCTTCACTGAAGACATACATACGGTTTAAAATAGTACTACTCCGCAACGATAAATTTTTGCTATCAACTAAATAATTTAAATTACCCTCGCAAATCACTGGCAAATTGACCAA:1 - chr3L 3824166 3' + Rt1b 124 1 78.77 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTAGGTAAACCGGTTGGTTGTTGTGTTGTACTTGTAAGTATGTAGACACATACATACATAATCCGCCTGCTCCG:1 + chr3R 7089580 3' + P-element 2875 1 69.72 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTCTAATATTCACCTGATTTAAATCTTCAAT:1 - chr3L 17537711 3' - Doc 39 1 60.96 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTCT:1 + chrX 21403467 3' - roo 84 2 76.71 CGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTAAAAAGAGCTGTTCTCTGTAGCGCTCTTCGCTCTTGGAGGTATAACTGCTCTGTTACCTCAGACTACGGCTCCTCTGGTGTAGAGGTGTGG:1 + chr3L 23182253 3' - 1360 169 1 56.82 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCCGAGTTC:1 + chrX 388321 3' + 1360 3348 1 62.28 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGC:1 + chr3R 19436099 3' + roo 9023 2 51.37 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTATGTACTTTGTATATCTCATTTCGTGTCTTGTTACCTC:1 - chr2L 17626603 3' - roo 8744 2 77.78 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCAAACCGTAGCATATTTAACAATAACGAAATGTAG:1 + chr3L 2216599 3' - jockey 62 1 68.14 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGTGCTGCCTACTTTCAGGTGGCCCACCAAAGACATTTACCTTTAATTGCGGCCATAAATATATTGTTT:1 + chr3R 25795886 3' - jockey 17 1 75.86 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACAATGATGGACACAACACAGAAAGACAGATGAAAAACAAACACAGAA:1 + chr3R 13431565 3' - hopper 41 1 45.89 GCATTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATTTGATAGTCGGGCATAGCATTCTCTCTTGTTTCTTGATTACACGTAACGGCAGCATATTCGTGCATGTATTTAGTTATGTGTG:1 - chr2R 25196989 3' + INE-1 534 1 54.05 AACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAACCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGTGAAGGTTTTGTGGGCAGGGGAGTAGATGTAGGTACTGCTGATGTGGTAACTCGAGCGACAGAGCTACTTTGGC:1 + chr3L 24995307 3' + 1360 2980 1 54.79 TTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCTTTCTGTTTTCGTTTTCTGGGGCGGAGTTTAGGTTGGGACCTTTTTTTATGTAGCTGAATCATTGCCAAGA:1 + chr3L 18400518 3' - I-element 4876 1 57.93 TATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTC:1 - chr3L 18484394 3' + hopper2 1545 1 65.62 ACAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGGGGAATCCCTATCGGTGTGATGG:1 - chr3R 24750964 3' - G6 63 1 60.87 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGAGAAAAATATTCATAAAACACGGAAAG:1 + chr2L 21910282 3' - Doc 11 1 75.54 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGGGCAAACCGATGGAAATTTCTGCCTTCATGAGGCGGCAACAGGTTACACAGCAGCATCAATTAATTTTTTTAATAACCGACAGT:3 + chr2L 12144322 3' + transib2 2788 1 59.59 GCATGCAAAAAACAAAACAAAAAAAAAAACACGAAAAACGAAAAACAAATGCATGTGCCACATACAACTCGCATGTACATACACACACACACACATACATTTGTATATATACACGAATTCTACACGATTTCAGATATTTCAAGCT:1 - chr2R 5541823 3' - Cr1a 251 1 77.93 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAAGCCCACAGGCACATTTAGTTATGCCGTGGTGGAAATATTTTTGCGAGCACAGCAGCAGAACAACGAAAACGGAAAAGTAGCACAAGATGTCCAAC:1 + chr3R 15920333 3' - 412 27 2 65.75 GTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACGTATATAAAGCGTAGAAAAAGTGCGAAGTGCTAGGAGGAAGCAACATTTT:1 - chr3R 27810023 3' + Burdock 189 2 66.21 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGT:1 - chr3R 26486034 3' - 412 75 2 66.44 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGGCTACCTATACACAGAGATGGCAGCGTGAAAAGTGAGAGAAACTCTTAGAGAATAAACTATAATTATATCAACAATATTGAATATCTCAA:2 + chr3R 24499625 3' + blood 7359 2 63.01 CGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATACAGTCAACTCCGTCTAATTGCATGCTAACTGTACTTAAATATCTTTATAACCATCAGTAATATTAACACGATCACGAACAACATCAGCATGCCGGAAATTCAATTG:1 + chr2R 7401198 3' - R1A1-element 5313 1 39.73 GTGTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCGCAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATAAATGGTGATGTTCTTTTGAAACGACGGTTCGATGTCAAGTTGCCTTGTCAACGGCAAAGTTTTCCCCACATGTCGGGG:1 + chr3L 14846865 3' - I-element 354 1 59.31 AGCTAGAAGGTTCAGATTCAACTTACAGATACTAGAGACAAAGTCGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGCTGACTGTTCTAACGCTTACAAACCGCCCAAAACTGCCACGCCCACATTTTTTAAAAAACTTTTCGATATTTTTTC:1 - chrY 1803455 3' + INE-1 168 1 57.93 TTCACTTTTTAAAAAATATTGATCATTTCGGGACTTTACGTTGGTAAAACCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGACTAACTCCCCAGAGATAGTACTCAACACTACCTTCGTATCTGGCATCGATGCAATTGCCCATTCCCCAGG:1 - chr3R 19391482 3' - HB 262 1 54.79 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTCAGAAAACGTGGCATACATTC:1 - chr2R 6798209 3' - jockey 35 1 60.80 CCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACAGCACGCGGCTGTCACGTCAAGTGGTGGCCCACCTGGAGG:1 + chr3L 7460694 3' + 412 456 2 62.38 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACACATCCTTATCCTATCTCTTACAAAAAACAGGAAAAAATGTCATGTATAGGTCACGGATAATCGT:1 + chr2L 7652347 3' + roo 407 1 83.56 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATAGCCTTCAAGGACTCTGTGAATACATCAACCCCATGCTGCGATACTGGCATAGTATCTTTT:1 - chr2L 6177516 3' + pogo 2046 1 56.85 GTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCCTCCCCCCCTTGAATAAAGTGGCGGAAGAGAAATGTTCCTCAAGATAGTATATATCGTCGTATATATGAAAAATATGGCATATGAGCTGCTGGTA:1 - chr2R 15908628 3' - gypsy5 6962 2 55.00 GGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTA:1 - chr3L 7837158 3' - jockey 4783 1 54.46 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCATATCAGTTAAATTAGCAATCAGTCTCCAATCTTTCGTGTCTTTATTCGACCATTAGGAGATT:1 + chrX 4400402 3' - roo 8722 2 59.59 TTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATT:1 - chr3L 17537740 3' - Doc 68 1 63.70 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTCACTTCCGAGCGCATTTGATTTTAATTT:1 - chr2R 7599148 3' - diver 5945 2 56.34 AAAGTGGTCCTTCGTGCCGGATTAAGAAGCAAATTCGGCTGCGAGAACCATGAATTGATGCGCTCACCTGTCACCAGGGTCTCTTCGGTGGGGTTGCGCTGGTAGAGATGACCTCGCTTCTCGTA:1 - chrX 4904818 3' + 3S18 365 1 68.80 GTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCCTTGTTTAAAGCCGGTGG:1 + chr2L 21976796 3' - Idefix 46 2 56.85 ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGCATATGAAATCGTCAATTTTATACCGATTCATTTTGCTGCGACTCAAAAGCTGCCTAACCAGGTG:1 + chr2R 5438314 3' - flea 4803 2 55.56 CTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCCTTTTGTTTGGACCGATCCGATCTCAATTAAAACCGGGCCATATTTTCTATATTTGGAAACCCGGTGGCCTCCAGCTGCGCCCGGCTCGCCAGAT:1 + chr3R 17552182 3' + diver2 131 2 79.83 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATATTTGCCCACCTCGTATTACATACCCACGACTTG:1 - chr3R 13437115 3' - hopper 21 1 60.96 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCG:1 - chr2R 6798244 3' - jockey 91 1 75.17 TTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAATATTCGTGCAGATGAAAACAAAAAATAAAGCCTATTCATCAATTAT:1 + chr3R 19446734 3' - F-element 87 1 69.18 CGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATTCATCAATATGGAGAATTGAACCCCTAGTACTTAGTACCTTATGTGGTAAATGGAGCAATATTTTGAGTAAACAATGCCTTGACATAATAAAATGTATATTT:1 + chr2L 2895698 3' + Burdock 237 2 71.92 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAA:1 + chr3R 19436066 3' + roo 8990 2 73.97 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGTGCATACTAAAATGCAATCTCTGTCCGGCATTAAGCCTAAATTAAATATATTTCATCCAGTGTCCAAAAACCAATTAATTCTTTGTC:1 + chr2R 23212725 3' + Tirant 372 2 65.47 AAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAGCCGATACACCAACTTATTCCTACAACGAGCGAAACAGTAAGAAAGCCA:1 + chr2L 22719659 3' + 1360 3318 1 65.07 AAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCAAAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGATCAATCGCATGTCTGACAGAGTGTAGCATACTTTTCAGCACTGCC:1 - chr3R 16582469 3' - BS 5014 1 54.11 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAATGACGCAGCACATCCCCGTTTCTCTCCTGCGACCTGCT:1 + chr3L 8658840 3' - roo 33 2 62.14 TGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATCAGCAACTGCATTGGGGAATGGGGCGCAGTCCCTGGGAAATCGCTGCAC:1 - chr3R 8160824 3' - Doc 4339 1 66.44 ACATAATACAACCCCCACTGAATAAAACTAATTATTACGCCACATTTAATAATAATAATAATAATAATAAGGTGTATGAATTACTATATAATACTTACAACGAACGAACGCTTTTAAAGTTTATTAATGCCCTCTTGCCACATGAT:1 + chr3R 18568463 3' + Transib-N1_DM 229 1 67.81 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTT:1 - chr2L 19691252 3' + roo 8994 2 71.23 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGA:2 - chr3L 18381931 3' + copia 207 2 52.05 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTCAGAAAACGTGGCATACATTCGG:1 - chr2R 6798207 3' - jockey 25 1 66.67 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACACATCCTTATCCTATCTCTTACAAAAAACAGGAAAAAATATCATGTATA:1 + chr2L 7652331 3' + roo 391 2 71.23 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCCACTCAAAGTCAGCACAGGCCACAAA:2 + chr2L 11554578 3' + roo 9011 2 57.53 TGCAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGAGCAGCAACGTGCCGCAACACACATTCAGCAACCACTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACCGATCGTGGCCATTACAGCTGCCCATCATTAAATGACCATCGGC:1 + chr3L 2274129 3' + Chouto 309 1 76.30 GGCGATGGTGACGCCGCTGCTTAAAATGGGTCTCGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACTAATATGTTGGAGGTTCTGCAGCGACAGCTCGTGCAAGAACGGCAAGCTTAGTATTTTCTCAGTGCATCGCACATTGCGGAATAATT:1 + chr2L 18725129 3' - gypsy4 6415 1 76.71 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCATTTTCGGGTCTTCCAGCTATATACACTC:1 + chr3R 16276461 3' + pogo 2082 1 64.93 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGG:1 - chr3R 9125619 3' - Doc 25 1 72.73 AGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTAC:1 + chr3L 15099687 3' - G4 3809 1 56.85 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAATGCCAACGGCTCATGCAGATTATGCCAAAGCACTCCCCGGGCGGCCATCGGGCCAAAAATTCTATTTACACGCTCCGTG:1 - chr2R 14441870 3' + jockey 4964 1 59.26 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAATGTGCTAATTTAT:1 + chr3R 19436129 3' + roo 389 2 71.23 CGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATCAAGCAATATCTTAAAACAACGAAAAATAGTAATACAAGTCATATATCATATATCAAAGGGAAAATGGTTTGTATTTAAGCTATAGGACCAAGGAAGTGG:1 - chr3R 17586791 3' + Max-element 8512 2 67.12 TCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATTGTATCAGCATTGTATATTTTTTTCCCCCCTTTTTGCGAAAGATACTGCATCGCAAGAGAACAATGTGCAATCAAAGTGGGGCAACACCGCG:1 - chr3R 11991470 3' + 1360 148 1 50.69 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCTAATCCAAATTTGTAATTTA:1 + chr3L 16059351 3' - 297 45 2 61.48 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACCAATAATAATTCGGATATCTAAGCATAAATTTAGTTTATCTGTTCCAATCCTTCATGGATAAGTTATGTAATAATAGGCT:1 + chr3L 16015374 3' + 1360 3376 1 71.92 AAATAATAATAATAATAATAATAATAATATAAATCGAATTACAAATTTATAAATAAAAGGATATGTATTCTCATTTACTGCTAGATTGAAATATGACTGCTATCGATCAGATATAATAAAATACTCTCTCAAATCAGCATGATTCA:2 + chrX 17205716 3' + mdg1 27 17 75.34 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATGAAGTTATTGATTTATACATTCATTTCACCTC:1 - chr2L 16857867 3' - P-element 83 1 25.18 TAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAGACTTTAATAGCCAC:1 - chr3L 465961 3' + Juan 4162 1 53.42 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTATTGAGGTGTCTTATCTAATATTTAGAAAGAAATATATCCTTTCAAAGGGCATACGAAATAAG:1 - chr3L 785829 3' - I-element 8 1 77.40 TGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTT:1 - chr3R 25277624 3' - 3S18 81 2 69.86 CCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTGATAATAATATATTAATATTGCATCAAGTGTATCTCAGACTTCTCATTATCCTACAGATCAAGGCCTTGGGTATTTAAAATGATGCTTCTTCGTGTCTGTTCTGTTAAC:1 + chr3R 17586977 3' - Max-element 8248 2 75.34 AGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGTGTTTGTGGTAAATTAGT:1 + chr2L 19140451 3' - Max-element 39 2 54.07 CTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATATGAACAATGTATGTACATACATATGTATTTAACCAGCTTCAAATGCTGAGCAACTAAAAGCGAG:1 - chrX 887284 3' - Quasimodo 53 2 60.00 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCACACCCACCTGAAGGTCACGTCGCTGAGTTCTGGGTTGTTAACGAACTTGGGATCGATGCGGGACCCCTGGACGGGCTGCATCGGCG:1 - chr3L 21665198 3' + 1360 3372 1 68.75 CATTGACCGCGTGGATGATTTGGCACTCGCGGGCGTAAAATAAGGAGGACGCAACAGGGAGAACTACTTCTTGAATTAGAGGGTAAAGCCTCTGAGGTCATCCCCAACTTTAAAAATGAGCTAGATGC:1 - chr3R 29123063 3' - Doc3-element 332 1 71.88 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATTGTTATTTTAAGATCGAAAAGTTTCATTCTTTCCGCACTTGATT:1 + chr3L 18484514 3' - hopper 23 1 69.18 AGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGTAAATAACTAAAAATACCAACAGCAAAACGAAAATAAATAAAAGGAATCGACCAAAAAAATTTC:1 + chr2L 12274494 3' + Quasimodo 6933 2 55.86 AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTC:1 + chr3R 14049439 3' + transib2 2770 1 54.79 ACTTGCAGTTTGCCTGAATGTAGTCCCATGTAACAATTGATTGAATTGAAACGATTTCTAACACTGTGTACCTAATGGTCATTTCCTTTTTTATGTTATATGTACTCATATATATTGTAAGTAACTGAGTGCAGCTAAGCAAAAAA:1 + chr4 647242 3' - mariner2 289 1 68.49 CGGCAAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCCGAACGGTCTCAGCACAGAG:1 - chr2R 1276187 3' - gypsy 154 2 44.29 AGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCTGCGCAGGTATTTTTCTGTCTTGTTGTAGATCTATTCAAATATATATATGATACTTGTGAGAACATTCAAATTGGAGAACTGATCCATACCGGCTTGCAAAAATTA:1 - chr3L 3483787 3' + transib2 2806 1 47.26 ATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGCATATGAAATCGTCAATTTTATACCG:1 + chr2R 5438275 3' - flea 4822 1 81.74 ATACGGGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGATAGCGCTCTCCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCATTTACCAACTCCTTCCAGTTCTGGGAACATTGGTATACATGCCTCCCTCTCAAGTTC:1 + chr3L 27412731 3' - 1360 172 1 60.96 GTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAATGTGTGTGTGTCAGCACTGGAAAGATGCAGGTTACATTCATGAAATATCTATCAAAACCATATAATCCTAAAATATCTCAATGTAGTCAAAATATCAGAACATTGTAGATTGAAGATCAAAATC:1 + chr3R 21999026 3' - accord 7027 2 67.12 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGGCCTCGC:1 - chr2L 22319257 3' - Transpac 4966 2 51.43 AGCAACTCGCCGAAACGCACTTGAACTTCTCCACCGTCCAGTGCAGCACAAATGCATAGAAACAATGATGTTTGGAATGTTATCGAAGTTAGGTATACAGAATGAAACCATTTATTAATTAGTTTCGCCAGAACATTGAATATATC:1 - chr3L 15041154 3' + Chouto 486 1 53.42 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCGTGCTCACATTGAATGGCAATTGGAGAGAGTAAAAAAGAGAAGCAAAAATTACTCATTCAACTTTGTTTTTGCTTCGACTGCTTGTTTTTGTTGCTCTACGC:1 + chrX 8271662 3' - P-element 16 1 72.73 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTCTTTCATTTTGTTGGCAATCGATTCGATGGCCATTGCAG:1 - chr2L 19407003 3' - Doc 27 1 56.16 CGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATT:1 + chr2L 1361070 3' - Stalker2 7264 2 61.27 ATATAAAAAATAAAACAATAAATTTAAAAAATGTAGCTTTCAATGTTTTATACATGATCAATTTGTTTCTCTGTACTTTTACACACATGATTACGAATGTTGCGGTGTACCACGCGTATGAGTAACGCTAAAAAGGGGAACGCCTG:1 - chr3L 2410934 3' + gypsy11 3929 1 60.96 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAAGTATAGAAATAAAAACAGACAATCAATCATTATCTTATACAATTCTTTCATCCATTAATCATCATGATGTCCCAGTCCAATCATCACTTGCAAGA:1 - chr2L 14302313 3' - GATE 8273 2 42.47 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTAATCTCTTAAGTTTAAAGATAATTACTTCTAGTTAT:1 - chr3R 18528293 3' + roo 325 2 73.97 GCAAATATGCAAATTTCTCTAGGTGCCAGCTAGGAGTACCATGTGCATGCGCGCTATATGGAAATAAAGTGCTGACCCAGCGCACTGACAGGAATTCCATGGGAATGCAACTGTTCGGAAAGAATTATCATGGTAAGTGCAAGATC:1 - chrX 16487869 3' + TLD2_LTR 129 1 65.75 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTGTAAGAGAGTGTTTGCTTGGTGAGAGCGGCAAGCGTATAAAAGCAGCGTCGCCGG:1 - chr2R 17097439 3' + P-element 2884 2 75.65 CATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCGTATCGCGGAGTTAGCGATTGCCCTGGGCATGCAGCCACCAATTTCGGGAATGGAAGCCTACTGGCG:1 + chr3R 13162912 3' - gypsy4 75 2 65.57 GAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCACACGGACAGTGAAATGAGCACGCAATTGGCGG:1 + chrX 12905505 3' + Tirant 346 2 71.93 GGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTCACATTTTTTAAAACAATTACAGTTTCTAAATGTAGTCAAAGCTGACACCTTCATGATTATTTGATGTCAGGCTGGGGTTATTTATAGGCAGCTGACATGACTATATCCGCTGCAA:1 - chr3R 14911911 3' + Stalker4 380 2 64.38 GAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGGGATTCCCCA:1 - chr3R 25543447 3' - G2 224 1 44.14 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTGAAAGAGAGTGTTTGCTTGGTGAGAGCGGCAAGCGTATAA:1 - chr2R 17097454 3' + P-element 2838 1 50.68 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAATATCACTTTAAGGTGATTCCCAGCGCATATTATGACGGAGATAAACATCGCTTAAAGCGAGAGACGGCGACACCGTCGACGAATGACCATCTTTAAAGGCCACTCTCA:1 - chr2R 25105983 3' - roo 8676 2 77.40 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCATTGTATCAGTATGACAATGGCAAATAGTGTTTTGCGTCTATAAATTATAATGGTTTCTGGGGAA:1 - chr3R 28450612 3' + roo 391 2 69.86 ATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTGGCTGTATACGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTTTTTTTCATAATTTTTTTAGTCTTGTACATTGCTTTCAATATAGCATTCTCTCTTGTTTCATTA:1 + chr4 631314 3' + INE-1 82 1 74.66 ATACGTGTGCCCAGATAAAGTTGTCTGCTATCACTGCATGCGTAGAAAATAGCTTTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTATCTCGCTTTCGCTTCATTTGCTCGGGCTTCAGAGTG:1 - chr2L 17726754 3' - 1360 172 1 72.57 CATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTATACTTATTTGGTTTTCCGTTTTAAAGTCAATTTCGAAAATAACAATACAGACCAATCAGAAAACTATACTTTATACAGTACAAAGCAAAAAGAATTCTGAAGCAATATACAAAGTAAA:1 - chr3R 21216779 3' - 1360 3 2 78.08 AAATAGTTTTTGTGTTGAGTTGAATAAATAATCCGTATTTGAACTAAGATAACCGCCGAAAAAATCTACACTTCTCCTTGACTTTGAACCTAACAAAAAAAAAAGTAGTGAACTTGCCGGG:1 + chr3R 1221788 3' - Tom1 385 1 55.37 ACACAAGCACTCAGCAATCATTGCCTTATTAATTTTTCAACCCCCGCAAGATGAATACTTTGCCTGCAATAATGCCACAGATTTCCTATCAGACGTTTGCATCACGCTGGTCCTGACCCTTCTACCCGGGATTGTTGCCTATTTAA:1 - chr2L 3261004 3' - 1360 454 1 56.85 AATAAAACTAATAGGAGTGATTGTTTTGGTTTTTTTTCGACAAATTTTGAAAAAAGGAGTCGTATTAAAGGTTTTAATTGAAAATTATACTTTATGAGCAGCGGTTCCAGCAGTTTCATACCACCAATGCAGTTCCAGTTTGGCGT:1 + chr2L 8975552 3' + Tc1 242 1 55.48 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGG:1 - chr2L 13629042 3' - Tirant 41 2 58.90 AGTGTGTAGAGGACAGCACTGCTCCAAGGAGAAAAGAATATCAATTTTTAAACTAAGAAAGGAAGGAAAAACATTTAAAGCTAAATTATATACTGCAAAGAAAGCCGGCAATTTGTTTGCTCATAGTCTGGTCAGAGAATTTACG:1 - chr3L 2380369 3' + HB 350 1 52.41 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATAATTTTTCACTGCCGATTCGCAATTTTTCGGTTTATACTTGGAGTGAGGG:1 - chr2L 19652471 3' + roo 396 1 75.34 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCGAACTACTTAAAGGAAGAAAGGCTATGAAAAACATACACACATCATATGCTTTGATTTCTAATGATAAATGGATTTCCAATTTTTCTCAGTGCTGGCTCTGGCTT:1 - chr3R 28116932 3' + hobo 2933 1 80.15 TCTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCG:1 - chr3L 14375631 3' + roo 334 2 67.81 ACCTTAGTCCGGCCCGGAGATGTGGAAATTTAGAGAGCTACCAGCTCCAGCCTAACTACGATTAGCCAGCACTAACTAAGAGCCTGTTTGGAGTCCACAATACGTAGTCCACTCGGACCGCATTGAATCGGTCCAAAAAAAAC:1 + chr2R 946428 3' - baggins 204 1 55.94 CGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATACAGTCAACTCCGTCTAATTGCATGCTAACTGTACTTAAATATCTTTATAATTGACGCCACAGTGGGTGTCGTAAAAAGCACGTACCGCCGTGGTCCGCGTAATACT:1 - chr3L 7938988 3' - R1A1-element 5313 1 73.29 CAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCGGAGAATGTTGCCTTCATTGGCGGCGGCAGTGGCAACAGTCAATTATCCTCAGTAATTGAGAATTTATCCCATAACAGCG:1 + chr2L 12289077 3' + Tirant 8399 2 63.85 AAGTTAACACAATCACCAAACAGACCAAATATAGTCGGAGCAGGACGAGCGAAACAGCAAAAATACAAGTGTGAGTGGTTGGGGGAAAAAAGTAAAAAAGCCCAACAGGAAAAAAAAGAAAGCCGAGCAAACAAAAGGAAATAAA:1 - chr3R 25372155 3' + Burdock 6136 1 77.93 GGGTCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACGTCGGACTGACGGACAATACGACAGACTGAGAGACAGGAAATCGATGACCAGGACACGCTCATTTGTACTGCATACGGAAATCCTATAGAGGTAAGTGTTGTTAAGTGTTAACTAA:1 + chr3L 23019616 3' - INE-1 133 1 60.27 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGACTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCGGGTACATTTGC:1 - chr3R 25049998 3' + P-element 2817 1 37.67 GTGTTCTCAGAGCCTTTTTGCGTGGTGTTGTTCCAAGCTTGTGGGTGCGCGGGGGGGTCTGCCAGTCCGGAGCCACTGATGGCAGCTACGGTGCTAAGATCCGCTTGCTGCATAACCAG:1 - chr3R 16997520 3' - G6 370 1 57.14 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTA:1 - chr3R 26486046 3' - 412 86 2 74.48 TAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAGGGAAATACTTATCATACTTCCAAC:1 - chr3L 13952737 3' - I-element 5100 1 78.99 ACATGCACACACACACACACACATGCACGGTGTCAGTGGCAATTTTGGGCTTTTTGGCAAACTGCACGGAGTCCCGGAGGGGACTTCCCCCACTT:1 - chr2L 10537120 3' + accord 179 2 86.32 GTACAACTTAGCGTCAATACATTGTGAAACTTTGTCATATAATATGAATTGCAAAACAGACTGTTTGCTCACTATGGCTTGAGTTAGGATAATGAAGAAATCAAACTAAATGATGATCAGGAGTTAGATGAGTCATTTGCATACGT:1 + chr2R 4545370 3' + Stalker4 7004 4 72.60 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTTCTACCCACTTTTGTTCACAGTGCATCC:1 + chr3L 1358558 3' - 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chr3L 4935804 3' - INE-1 545 1 63.01 CCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATATAACTCCGGCAAGCGCAGGATCAATAAGG:1 + chrX 21772532 3' + springer 16 2 54.79 TGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTAGTATTTCTCTCATTCAAATATAATCATATAACTTATAGGGATTTTGATGTGTTTC:1 - chr3L 19583335 3' + roo 8665 2 60.27 ACATAATACAAACCTGAAGATTGATTATCCATTTAAAATATACTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAATTTCTAACACTTTGAGGAGGCGAGGGATCAGGCTCTGGGCCAAAAGGCATCGTGGGGTCAATG:1 + chr2L 2270570 3' + hopper2 1338 1 60.16 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCGGGTACATTTGCGTGTATTTGGGTA:1 - chr3R 25049985 3' + P-element 2851 1 54.40 GTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTTGCCAATTTCATCATTCTCCGCCAGCAGCTTTATGTTCTTCACGTTCTCCAGCCAGGACTCGTAGGAA:1 - chr2R 23076026 3' + pogo 91 1 60.96 TGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGTGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCCAA:1 + chr3R 24454868 3' - F-element 266 1 50.88 TTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAG:1 - chr3L 13952761 3' - I-element 5151 1 51.37 ATTTTATAATGGTAATATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAGAGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTACAAATTTTATGAATTTTTTGTAACATCAAAGACAACAC:1 + chrX 3774412 3' + blood 6941 1 73.97 GAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTAGTATCTTA:1 - chr2L 23068858 3' + 1360 3311 1 73.97 AAATGCTAGAAGGTTGAGATTCATACAGGTTCTAGAGACATAGACGCAGAGCATTGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAGCCGAACAAAACTTACAGATTCCGATCGCAATTGATCACAAGGGCA:1 - chr3L 14744782 3' + INE-1 165 1 74.42 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATTTTCATCTAAT:1 + chr3L 9470017 3' - 412 71 2 65.07 GATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCCCTCCCATTTCGATCTATAGCTACGTTGCTTAAGCCTACAAGTGGTAGAATATTCTGTTCTTGTTGC:1 - chr3L 21264469 3' - jockey 4984 1 66.97 GAGGCTTGAAAGTCAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGCTTGAGACCTAAATCTAAAAGGCGGGGGTTCTTCTCAACCTACTGTGGGACAGCTGCAGC:1 - chrX 16958978 3' + Idefix 438 2 70.19 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTTTTTCTGTTAATGAAAACAGTGTATTTAAGCTTAAATCAGAAACATTACTCCTTAACCCATTTTAATT:1 + chr2L 19691344 3' - roo 8716 2 55.48 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTGGCATGCCCATTGCT:1 - chr3L 7791874 3' + Transpac 265 2 53.42 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAATAAATCTCTAATGCTGTACGATGCACGGCATGGCTCGGTGTCTTTTGGCCAAGAGCAAGGCAAAACCAGTT:1 + chr3L 17583183 3' - 1360 86 1 51.11 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAATAAAGCGGAATCATGTGCAGAAATTTT:2 - chrX 21403377 3' + roo 9023 2 50.68 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAG:1 + chr2R 1923554 3' + pogo 2048 1 69.49 GGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTGGGAAATAACAAACAGTGGAAACGTCTGGCGGCAAGAAGCCCGAAGGACATGGAAGGACGATCACCACAAGCGAGGAGAGATGTTCCCTTGCAGTTTTTCTGGTTCGTTTCGTGGCCATT:1 + chr2R 15103474 3' + gypsy8 445 1 72.03 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCATTATTCACTATGAGGATGCAACAACGTGCTTTTGAGCTCTATTAGATTCGCACTGCATAAACTTGGCTTTAACCCCACCATTTGACATTCACTT:1 - chr3R 25862538 3' + roo 9047 1 68.49 GTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCTAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCAGGAATGGCAACTGTGGGGATATTTG:1 - chr3R 26846774 3' + hopper2 1528 1 74.44 AAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCAGCTTTCGCAGCTTGCGGCCGAGCTTCTTCAGCGCCAGCCACACGTACTCGCCGATCCTGACCAGACC:1 - chrX 10596778 3' - F-element 4619 1 54.11 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTCTGTGTGGTATGTACAGTCAGCGACACAATCGTATGCACTTTCGGGGCAGGGAGTAGTG:1 + chr3L 21910476 3' - pogo 46 1 55.15 AATGATCCGCAACGCACTGCTGTTACTCGAAAAAAACGAAACACGGCGATGTCCAATGTGGAGATCAAGCGCTTGGTTCGGCAAAGCAAGAAGGAGCCTTTTAAGCCGGCGACGGAACTGAATCCCGGCAGTCCGCAGATGAATCG:1 - chr3R 31442427 3' + Tc1 469 1 49.32 AAATTCATTTGTTTTTTTTAAATACAGTTAAGCTTAAGCAGTTCTATTAATCATCGTAAAGAGGCTTAGTTGTTTAGGATGATTATTTCATTTCTGCCTATGTTTAATACCAGAATTTGTCTCTCATACAAATATAAATTATACT:1 + chr2L 12124307 3' - pogo 474 1 68.97 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGC:2 + chr2R 14973705 3' - FB 55 1 54.11 AGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGTTGCCAGGCAACAGATTTAATAAAGAAAAAAACAGCAGCCACTTTACTT:1 + chr2R 15075663 3' - mdg1 72 2 65.75 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAGAAAGTGGACACAGAAAGG:1 + chr3R 10030830 3' - BS 5026 1 71.23 TCTCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTATCTTTTTCAAGTTTACAGTAATTTTACTACAATTACATACCCATACAAAAATGGGCTTTTTATATCTAATTATACTTTAATACAATCACGCATACCAAGG:1 - chr2R 495465 3' - X-element 4653 1 63.01 CGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAAACAGGCTAACAAACAACATCAACAACAACGCCGGCGTATTCATGATGCACTCATAAAAACCGGGGGTAAAGTACGGCGCCGGAAAGCGGGCAGAGTTCTCGGAAGGTAAAA:1 - chrX 10110953 3' - mdg3 5262 1 78.08 GAAAGCATGGTGAAATAACGTTCCATCTAACGCAGCTGATCAGTGGACATGGCTTTGGACATGAGGAGGCGATTGGGTTAATGGCAAATAGATTGCTTCAAAAGCGACTCCCACCCCCAATCGGCACTTACTCATC:1 - chrX 11688419 3' + Rt1c 4970 1 52.21 GGTATCAAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTCGAAATACTTCGTAGTGTTGTCTGATTTGGGTAAGCCCACGAATAGACAGATAATCATTCACAGAAGGCTGGGAAGTTGCTCGAAT:1 + chr2L 21976137 3' - Idefix 416 2 72.09 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACGGAGCCGAAAAG:1 - chr3L 486736 3' - roo 81 2 75.34 GCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGGGATTCCCCAACATTAATAGTTAAGTTCTTTGA:1 - chr3R 25543424 3' - G2 202 1 37.67 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATA:1 - chr2R 11164421 3' + roo 330 2 71.92 GATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGGGATTATTGTGCCGGCTC:1 - chr2R 13367412 3' - jockey 4573 1 71.21 GAAGGTATGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATGATCCTCGGGCTCCATTGGCCGCTGATCTTTGCCAAATTTGTAAATGTTCTTTTAATGGAATTTGAACACTTGCCCGGGGCCTTTGGTTTTCCAAGGGATATGTGTTCT:1 + chr3L 6356262 3' - Tirant 8055 1 76.92 GTTGAACTTTCGCTCGGCTCTTAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGAGGGTAATGTTAACTCGCGCTGTTTTTGTAGCTGACAGATACCTCCGTCGTTCTCCATCC:1 - chr2L 21016754 3' + accord2 161 2 57.27 TAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCAAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTAATGGGCTAATGTATCTGTGTTTTTGAAGCCTTGGTTCTGACATTGAAAC:1 + chr3L 18277531 3' - Idefix 449 2 64.38 TAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTAAAACGAATGCAGAAACATGCAGATCGTTAGGCGCTATTTTTTGGTCTTAAAGGCCGGGCTTTATATATTCAAATTGTGCGGGAGTC:1 - chr3R 7778220 3' + transib2 2793 1 64.38 ATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGTCCTCCCAGGGGGTAGTGCGAGTTAGTCTGGATTTTGTTTTTTATAAACCACTGCCGAGTGGCGGCG:1 - chr3R 17337887 3' + Stalker 7135 4 53.15 CCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCG:1 + chr3R 15790113 3' - flea 4729 1 68.42 AAAATAAAATAATTTGAAAAAATAACTAAGTAAGCATACTAATAAAGTTTAAAAAAAAATTAAAAATGGTTGGTTGGCTTAAATAAATGGATTCTAA:1 + chr3L 12096946 3' - 1360 3092 1 71.13 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATAATGATGATGTATCTAAGTTAGCGTGTAAGACTTTCTGTAAACAGCATTTAGTTGGCACAGTTCAAAGATGTCGACCC:1 + chr3R 15295838 3' - roo 39 2 58.90 ACCATTTCTGCCTACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTGAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTTGACTATGATGGGTTTTTGGGAATGGCGC:1 + chr3R 20934742 3' + 412 7454 2 76.71 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTAAGGATCAAGGGTTA:1 + chr2L 14239209 3' + 412 7465 2 77.94 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGATGTAATTGCCAAACATTTGAAT:1 - chr3R 11151772 3' + mdg3 219 2 67.12 GTGCTTGTGTCTGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTTATCATCACAGTCCGTTTTCCAAAAAGTCAACTATTTTCAACGAATAACTCTTAAGGTTTCATGGCTTTAGAATGAATGTT:1 - chr2L 7555802 3' + 1360 466 1 50.00 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCACAAACGAAAGCCTA:1 - chr3L 12874891 3' - jockey 90 1 74.31 TATGTACATATGTAAAATGTATAGGCTACGATTAATTTATTTTTAACATATACATACATATTTATTTTTATTTTACATATGTACGTCAAAGAATATTGAAAGAACACAAATTGTAACACAAATTTTTAGGAAAACAAATCAAAAG:1 - chr3L 14967054 3' - 412 219 2 75.17 CTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAATATCGCTTACCTCTCACAGGTACCTTATTTTTGGTTTGACAGTTTCACATGAAACCCATACAAGTTGCTCACATGTGATTATCGAAATCCATA:1 - chr3L 15688200 3' - Stalker 269 4 65.75 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGTAAGCCCTTTTAACGGCCAGTGCGTGATTCTTCTGCCGGAGAAATGGCTG:1 + chr3R 30264129 3' - blood 7033 2 67.19 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCAATGCTGCTGGCCTGGGGAATCGGGTGCTGCTTGATCTATATCCAGATAGTGACCAACAACTTTTCGTGCACTGCATGCATTGTG:1 + chr2L 12914830 3' - F-element 71 1 59.59 TGGGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGTATCAACATATTACGGCATTTATGGTAATTTTATTGG:1 + chr3R 10150219 3' + 1360 3306 1 78.08 GTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTGCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTACTGGCTCCGACAGAAAGGATACACTAGGCAAAAGGTAGGAGGGCAGATGAGCAGGAATG:1 + chrX 18621295 3' + F-element 317 1 67.41 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGGCCTCGCGGTGTGCTGTCCGCTCTGCAACTAGGTCGCTCAATATCATTC:1 - chr2L 22319215 3' - Transpac 11 2 75.34 GTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGGCGCACAAAATCGCGAAGGAAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTA:1 - chr2L 21325115 3' + invader4 3007 2 69.29 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTAGGTAAACCGGTTGGTTGTTGTGTTGTACTTG:1 + chr3R 7089540 3' + P-element 2810 1 26.87 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGGCATTAAATAAATAAAGGCCAACTTGATGCCGTCCTAACCAAATGTTCTTCAGACGAAAGTTGTATTA:1 + chr3R 18528422 3' - roo 2 2 78.10 AGCGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATGCACCCGCAGATACGTATGTAGATACGTTTTTCTGTCGAAAGATATAACGAGGCACA:1 - chr2R 23211841 3' + Tirant 8342 2 56.85 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGACCTTTCTAAAAGCTATCGCAGGCAGTAACCCTCTAGTCCTCGTCCTACACAACAACTCG:1 + chr3R 6645423 3' + blood 7336 1 56.12 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAGATTTGTTTTGGTTTAAGATCCCAATCAGTCCGGAGTTTCAATTAAAGTTCCATTAACGCTT:1 - chrX 6632912 3' - P-element 30 1 65.07 CGGGTACTTACAAACACCCAGTAAAAAAGCCTACATGTGCAGGCAAGCACCCGGTTGTGCGCGCACCCGAATCATTAATATCTATTGTTGTCTTTCCAAACAATTAAGTTGTTTTGGCCAAAAAAATCTTCTTTAAAAACTCGTT:1 - chr2L 5115787 3' + hobo 86 1 51.03 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATAAGAGCCACTCTGTGAGCTACCCACCGAAGCACCACTGTGGATATCAGGATATCCTGGGCCAGCGAATTAT:1 - chrX 14329156 3' - jockey 4691 1 56.90 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGCATATGAAATCGTCAATTTTATACCGATTCATTTTGCTGCGACTCAAAAGCTGCCTAACCAGGTGCGGACATT:1 + chr2R 5438322 3' - flea 49 2 53.42 CCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACTGTAATATTCTTTGGTAAATTAAATGAGTCTCATTGTTAGCATGGAAGTCATTTTCAAATGCCTGGCTTCTTTTGACCATT:1 - chr2R 13366634 3' + jockey 4676 1 68.18 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCG:1 - chr2L 15081090 3' - Doc 70 1 74.60 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTAGCGCTTGATTATAAAAATCGTTAATCTTTGTATATTCT:1 - chr2R 11256177 3' - roo 8745 2 75.34 AATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTATTACACGTGCCAATAAAGGGAATGATTACGTCAAACAATGAAATTTACATAAAA:1 + chr3L 18768527 3' - S-element 65 1 67.81 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAGTTTTGCTATGGCGTTCTATTTTAGTACTGAGTGTTTTTTTTTTTATTTCACATTTACCCTATACTGT:1 + chr2L 21698354 3' + 297 6929 2 55.17 GCTGTCTCACTCAGAGTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGCCTCTCGACT:1 - chrX 7706779 3' + P-element 2787 1 16.44 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCACTATCATAATGCAAACAAGAAAAAAG:1 - chr2L 17295798 3' - Doc 23 1 62.94 CCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTTAATCTTTGTTTTCCTTTATTTATTTCGAACAACATAAAAGCGCTTAAAGTCTGTTTAAGTGCCCATTGCTTAGTGTAAACAGTATTT:1 + chr3R 21395282 3' - G2 424 1 76.03 AAAGCTTACACCTTCAAAGTGATGGAAGAGCGTGATACAGTTTGCAATGCTTCAAAGCCGATATGCTCTTCTTAGCGAATATTATAACGCCCACAATGATTAAAACCAGCTTGAAGCTAAGTAAATATTTAAAATTTAATAAAAAC:1 - chr3R 13159126 3' + Porto1 320 1 64.38 GAGGAGAATCTTAGACTGCCAAAGTCCTGGTTGGTGTTCCCAGAAGGACAGACAGAATACTCTGTGGTGACCAACACCACAGAACTGTTCGGGCCCAGTTAGACTCCTCGGAGAACTGTCTGGGATTTAAATTT:1 + chr3L 3580805 3' - baggins 5043 1 48.51 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTT:1 - chr2R 13761637 3' - jockey 4748 1 77.44 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTGTGCGGCACAATGATTTCTGCATTTATGAGATAAGCTTTTACTGTCGACAACAATTAAATTACA:1 + chr2L 16615852 3' + hobo 2907 1 50.42 TTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTG:1 + chr2L 5792071 3' - blood 7089 2 69.18 CAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTCTTTTAGTTTCAGGTATATTCATCAGCTTTGAGGTAAC:1 - chr2R 8169919 3' + FB 489 1 73.97 CACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTTGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATATGACAGTTCTCTACTGGCTGCTAATAAGTATTTAAAAATTAACAAAAATTCATATGTATAGAATATCTAAAGAGTGCAGAATATCACTTTCTT:1 - chr3R 11087678 3' - hopper 402 1 65.75 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAG:1 - chr2L 19691258 3' + roo 338 2 72.73 TTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATATATATAAATATATATTTAAATTTATCTAATTATGTTTTGAGTCCCTATATG:1 - chr3L 24210168 3' - F-element 168 1 64.38 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAATGAC:1 + chr3L 8658806 3' - roo 8737 2 69.18 GGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAAACAAGCATTAACCGTGTGCATCGTTACTTCTGTAGCTAAGTAATTTAAATAGTTTAATTTTCGAGTTTAAATAGTTTATATTCCTCCTTTGGTTGAAAATGAA:1 + chr2R 6673495 3' - BS 5031 1 71.23 AGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAGACACAAAGACAAAAAATGCATCCAGCACACATGCCAGAAATTAAATTCAACGGGCAAACTTACACTGTGCTGCATA:1 + chr2R 20507214 3' - Cr1a 260 1 61.64 AAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGATATTCGAGCTACTCGACTATGGCGGTCTCTCCAGTT:1 + chr2R 6885382 3' + flea 4947 1 63.70 GGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAATATTCATTTATGTGAGAGCAGCAGCTGTGTCAGTTACTGC:1 - chr3R 22341119 3' - hopper 77 1 49.29 AGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTCCATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATCAAATCCTTGACTATGGTGGATCCCATCATTCCAACACCCAG:1 - chr2L 10006328 3' - invader4 258 2 71.23 AAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAATATGTATATATGTGTGACAGAAAAGAGACTAAAATAGATTCTGCGCGTAATTGGAAACAC:1 - chr2L 13138970 3' - McClintock 51 2 60.27 ATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGAAATTGTGAAGTGAAAGTGACGTACCACGCCCACATTTTTACAAAACTGTTTTCATATTTTTAATATTATCTTGGTTAATA:1 - chr4 857158 3' - Q-element 87 2 52.05 TATATTATCTTATATTATCTTACATACATATATCTTTTAAAGTTGCCAATGACCCCTAAAGATATATAATTTTCGGCACGGTTTCATTCACACCGAATGGATATTACCCAAAAACTTCGTAGTTAGATACACCTACGCCTGGCCGC:1 - chr2R 19358939 3' - Stalker3T 202 1 76.03 CAAAAACTGAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACACCTTGTTTGAGATGCTAATGCTGCTAAGAACACGAATATCTCAGTTGTCGGGGAATAGAGAGGTTAACCTAAAGGGGAAAGAGGGAAAGTCAAGTTGCAACCAC:2 + chr2L 1776226 3' + roo 388 2 71.23 AAGATTACTGATAAATAAAAGGTAGGCTAAAGTTCGATTCAAAACTTTTAATAAATAAATACGTTAATATACAACAGTAGACATGCACCCACGCTCAAAAAAACTGGTGAAACCGTTACACGATTAAAGAAATGAAAAGTACGGTC:1 - chr2L 15811193 3' + BS4 495 1 32.19 GGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTC:1 + chr3L 15364879 3' + 1360 3315 1 77.69 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTAAATAAGTACTCTAACAACAACCGATTTAATCAAACGTAACAAGGCGGAATTTTCAGGTGCGTTTCGTCACTACGTAGAATTTATTAACTTG:1 + chr2R 21848824 3' + Transpac 5217 2 75.34 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTACCTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAAA:1 - chr3R 20934686 3' - 412 50 2 61.67 ACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCAGGAATGGCAACTGTGGGGATATTTGGCATGCTTTTTCTTTCAATGCTCTATCAAGGGGTATATATAATATTATTACATTACAACATTTTTGTTT:1 - chr3R 26846705 3' + hopper 1397 1 70.71 ATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGCGTGTGTGTGTGTCTGTGTATGCTATTCGTGTGCCCCTCCGCAATTCTGATTGTTTGTATGTGAGAAGCGCATGGAAT:1 + chr2L 4420618 3' + gypsy5 367 2 50.68 GTAAAGTTTTTATTTATTTTTTTTTTGTTTACTGAGCTTACCCATTGGTCTGTGACCGAGCCTTGTTCCTTTACGGCAATTTTTGAATGTGGCAAACTGAACCGAACTAAAGTGGTTGCGACA:1 + chr3L 4952404 3' - mariner2 794 1 69.92 GTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAACAAGAAAAAAGCTGAAGAGTCAAA:1 - chr2L 17295785 3' - Doc 13 1 71.92 GAGAGATATTAAGATAATTTTCGCAATGGGGTTTATTTTTTGTGGCTTATAACTCCAGAACGGAAAAATATATTTAATTAACTAATTTTGTATAGGGATTTCCCTAATTCCCTATGCTTTTTCTAGTACAAGCTAAAAAAAATTAA:1 + chr2L 22107812 3' + Transib-N1_DM 56 1 50.00 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCAAACCGTAGCATATTTAACAATAACAAAATGTAGCATACATTTGAGGGCCGCCTGTGGAATGGAAAGTGAGAGAAAGAATGTTATTGTGCGAGAGCACAC:1 + chr3L 2216665 3' - jockey 28 1 69.18 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGCATATGTTTTGGCCTTATAGAAAAGTGATCGAACTGTTCTAATTCTGTTCTAATTTCAGTGGTGAAGTGATTGTATTGGTCAAAGGTAATACTAAATTGA:1 - chr2R 5438171 3' + flea 232 2 70.55 CTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCAATTTACAATGGCCAAAAACAATGTGCCCAGACCATTCCATTCCAGTCAAAACTAATACCCTTCCCACCACTTAA:1 - chrX 20805253 3' - aurora-element 4214 1 73.29 ATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCATTGAAAGCATCTGAAACCATTTTAGGCCCCATTTTT:1 + chrX 8915758 3' + 297 6772 2 75.34 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTGCTTATTGTACCATGCTAACAGACAATTAGATTCTCCGTTAGTTTATGTGTACATAAGAGCTCAACATCAAAATCAAAAATGTTAAAAAATCAAAAATTTGACCTTTTCAATTTTTTC:1 + chr2R 5311568 3' + 1360 3387 2 63.01 ATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAACTAACTTTCATGAAGTATTGTTCTTGTTAACAAAATATATACACAAAAGTCAAATAAAAACAATTCGAACTTGCGAAATACTCTATAGCAGAGCA:1 - chr2R 19725967 3' - Juan 4054 1 66.44 AGCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAGTGTGTATGGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATGACACTGGCGAGATTCCGACTATCAGATACCCGTTAATAACATTAAGAGTGCAAGAGAGGGGAAGAAAA:1 + chr4 375408 3' + 1360 3339 1 77.40 GTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTAGGAAGTGATGGTTCTCAGTGTTGTTGACTGATGGACGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAGGTCCAGATACCCCAGAGTGAAAGGAAGAAAGAAAATGCCAGGAATAGACACCGTGGCA:1 - chr3L 18428813 3' - Doc 4396 1 66.21 TCTATACATTATAATTAAGGAACAGTATCCATAATAGTATCCAGTTCAGCTTCCTGAGCTTCTCGCGGCAAATTGCTGCAATTTTATGAGTGAGCTC:1 - chr3L 23610963 3' + G5A 2741 1 60.82 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAGATATATCGTTTTTATTAATAAATTAATCGCATTCATTTTAAATTATTAATCAACAGTGTAATAAACTATTTGCTATAATACTAAAACTTGCGTTGAACTACATA:1 + chr2L 7822353 3' + Juan 4201 1 73.29 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCA:1 - chr3R 16276322 3' - pogo 56 1 60.96 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCCACTCAAAGTC:1 + chr2L 11554563 3' + roo 332 2 67.81 GGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTATATATGAATATATATCCAGACATGTTTTCAATATGCTTTGAGTGCGGAAATTTCACT:1 + chrX 3035984 3' - Quasimodo 6974 2 60.96 ATCGCACTTTTTAGAAAATATTGATCATTTCGGGACTTTACGTTAGACAAGAACAGATATAATATGTATATACGCGTCTGGAAAGCTTGGAGGACTAACCACTCTTCTATCTCAATGGATTACAATTTATTCTTATTCTTACAAGG:1 - chr3R 4557610 3' - HB 264 1 64.38 GTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATGAATGAATGGCACATCGGGGAGTTGGGGACACCAACTCCACTTGACCGGGGAGCTAA:1 - chr2L 19296680 3' - roo 8796 2 54.40 AGCTGAGTAATGGGTATGTGATAGTCGGGGAAATTAGGTGAAAGATGGTCGGATTGTCTTTACTCCTGACATGGATGCCATTGGAGATATGATCAATGGAATCGTGGACAGTATACGCAGCATGTTGGATCAGTTTCCGCGATTGG:1 + chr2R 16286539 3' + INE-1 545 1 73.29 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCCAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGTAATACCATATAAGCCAAGCTATTGAGTACATTCCATTTCATAATAACAAC:1 + chr2L 4929890 3' + blood 7320 1 63.45 GGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATATATAAGAAGGGGTCTAATTCCATATTGATGAGACCGAGATGGGATTGTC:1 - chr3R 28406355 3' + opus 465 2 58.26 CTGGAATAGATTTTCCCAACTGGTGGTTTTAGTATATTATTTGGGTCACTTCAAAAGCTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAACTCATCTAGCCAAAGGGTAAGGGTATGGGCACAATAAAGTTATGCGCATAATA:1 + chr2L 4111802 3' - S-element 458 1 67.12 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCTCTAAAGTGCATGGCGAACCGTTAAAAATGAATTGCACGG:1 + chr3L 19031357 3' - roo 31 2 61.64 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAAGCCCACAGGCACATTTAGTTATGCCGTGGTGGAAATATTTTTGCGAGCACAGCAGCA:1 + chr3R 15920295 3' - 412 7118 2 62.33 CCGGCTTATTCCTGTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACTGATCGTGGTCATTACCTGATCCCGTTCGTGAGGCCGCACCATACAGCCGCATCGCAGGCGGT:1 - chr3R 26976889 3' + Chouto 216 1 52.00 GATTAGTTTTCTTGTGAGGGGATTTGAATGGGTGGTCAGTTTTACTAGGTATTTTAATTTTCTTCTCAGTTATTATTTCGATAATTCCCACTGAGTTGTGGTGTTCTTTACCCACTGTGGATGTACTCAAACCCATTGGCCCTGCG:1 + chr2R 6585027 3' - Doc 4501 1 57.53 ACTCCGCACGTGTTGAGCGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGAGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACCGCTAACCCCCTTTCCCTCTGACGGACGGTTTGTGATCAGCTACCTGAG:1 - chr2L 17744065 3' + R1A1-element 171 1 65.60 CTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTCCGCCGACTCTGCACTTTCTTTGAAAACCGCTGACTGATG:1 + chr2L 18112625 3' - transib2 2574 1 65.07 GGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTCCCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGCAGTGTTCAACTGGCAGATTAATCTGCACAGAGAAAGAGTGAAGGGGTTCGTGCCGAATTTCTAAT:1 + chr2L 14823980 3' - Idefix 216 2 53.42 TCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCATCATGTGCATGTGAGCTGGTGGGTTTTTGCTATTTTTCTTTGTTGAATTCGAATTTGGACTT:1 + chr3L 17568589 3' - Quasimodo 7143 2 57.93 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGGAGTGCTTTTTTTCCTTTGATTTTTGTGTGTTTTGCGCACACTTGTGGGTGGCGCTTAACAGCTCGTTT:1 - chrX 9305839 3' - P-element 52 1 47.95 TTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGCATATGTTTTGGCCTTATAGAAAAGTGATCGAACTGTTCTAATTCTGTTCTAATTTCAGTGGTGAAGTGATTGTATTGGTCAAAGG:1 - chr2R 5438185 3' + flea 218 2 60.96 AGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTG:1 - chr3L 19031201 3' + roo 401 1 76.07 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCGTCGACGATGTCAGCGAGGATTTGATGGTATTCTTTGTGTACGAGCGGAAAATGTCCAGTTCACTGCTGCCGGAGGAGGAAGCC:1 + chr2L 3089980 3' + 1360 3317 1 59.59 ATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAAACTCGCATAACGATACATAGAACATTACGCGCGAAGTAAAAGTTCCTCCTAAAC:1 - chr2R 12065539 3' - Stalker2 19 2 73.97 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGCGATTATGTTGCT:2 - chr2L 14239118 3' - 412 41 2 57.53 CATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCACTGTAGTTTTCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGCTGTCATTGTGGTTGTTGTTATGGTTGTGCCTTCAGCTGCTCTCGGATGACCACAACAAACCC:1 - chr3R 8959461 3' - Dm88 393 1 43.84 GGTCAATGCCTTCTGCATGCATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGTTTAAACTAAGAAATAAACCACCGTGCATATTGAATTTA:1 + chr3L 22431225 3' + Stalker 228 4 76.71 GTGTAGGACCAAATACATGTGATTTAGTAATGAAACTTATTAAAGACTTCAACTTTTGTCTGAACACACGTGCTGTAATGTCATGGCGATGCATTGCAAAATTTCTTGGAAACTTCTCTTAGGGCCATAACTTGAGTTATTACAAC:1 - chr3R 7007504 3' - Helitron 315 1 65.75 AGATACCCGTTACTCAGCTAGGAAGCATGAACGAAGTAGAAATTTTTTTGGAATATCAATAAAGTGAACCAACTGAATAGCACCATGTCATTTAAAGTATCTTTGCTTTGTCTGCTGATCCTGGCAGGATATCTCACTTCAATTGA:1 - chr3L 13424107 3' - INE-1 542 1 60.96 TGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCCAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGCAAAAATCGTATGTCGTTACTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAA:1 + chr2L 17599965 3' - 1360 138 1 73.29 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTC:1 + chr2L 3231943 3' + roo 324 2 73.97 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTTGTGCGAATTTTACTTTATTTTTGGGC:1 + chr2R 11146170 3' - Quasimodo 13 2 76.71 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATAATAGTTATCACTTTTCCACTTGCAACCTGATGAAGTGAAACATTTAATCATCCTTCGAGTCTTAAG:1 - chr2L 2895541 3' - Burdock 47 2 54.86 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATCAAAAGAAATAAAGCAAACGTTGCTTTCTTTGGCTTTCTTCAACTTCTTCTTCAATTTGAAAGAATGGAAAAACCTTGTTTTGTGCAATCATGGCTGCAGCCTATGTTAATTAT:1 - chrX 4400246 3' + roo 406 1 78.32 CTTTATATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACTATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATAAAGCTTAGAAATAGAAATATCCGAATCACACCCTATATAAATATAGTACATAACAATTGG:1 + chr3L 9465364 3' + 1360 248 1 75.34 AACTAACTTAGTTTTTCATTTTAATGTGTTAATTAGGGCCTAATACTTTGTTGTATAGCCTTTTTAGCCAGCACAGCCTTACACCTGCGTGAGTTCACCAGGTCCTGGCAACGTTTTTAAACAAACTTCTATCTCTACTAAATCAT:1 - chr2L 8296803 3' - HB 1368 1 79.45 TATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTCATTTCAAGCCACATACACCACCATGAAACGCCCCTTCTTCCGAGGGCGAGGCAGAGAA:1 + chr2R 5710123 3' - I-element 5267 1 54.26 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTCACTTCCGAGCGCATTTGATTTTAATTTTACGCCACTAAAAGTG:1 - chr2R 7599132 3' - diver 45 2 53.42 AAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCG:1 + chr3R 31141048 3' - Burdock 6167 2 52.29 GATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAA:1 + chr3L 21093213 3' - Ivk 94 1 71.92 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGGT:1 - chr3R 14277901 3' - P-element 76 1 29.29 CTAGGCTGTTGGGGTGTACATAAGAGCCACTCTGTGAGCTACCCACCGAAGCACCACTGTGGATATCAGGATATCCTGGGCCAGCGAATTATAACAACAATGTGGTGAACAGCGGGCAACAGATTAGCCCTGGCAACAAATCATTA:2 - chrX 14329102 3' - jockey 4667 1 80.82 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGACGTGGGGAGTGGGTGAGCGGGAGTTAGAGAGAGCGAGCTGGCTTTTGTGTAGCATACTTTTGT:1 + chr2L 9879779 3' + jockey 4936 1 54.11 AATTAGGATTTAAAAAGTATTTTCTTTTTAAGCACATTCAGCACAAGCAGTTGATAAGAGGATATCTAAAAGCTATTTTTCAGGATTAAAATATTCAATATTCCCAAAAGATTAAAAGTACCATATCACATTCAAAATATCGTGTT:1 + chr3L 14473694 3' - transib4 2558 1 53.42 TATTGTTTTAAAAATATAACATAATAAATGCTGATGCTTAACTCATAAATATATTTTTTTGAAATAGCATCTGAGATATTCGTTGCTATTGGCTTGACTTCAGCTGTATGAGTGCTACGCCATAATTTAGTGAAACATCCCAATCT:1 - chr2L 6027656 3' - Stalker4 406 1 45.89 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTGTAACTAAATAAATGTGGTTTTCTTATTATTTAGCTAGTTTATAACAGTTCATATCCTTTTCCCATTTCCAATCATTCTTAACCCA:1 + chr2L 6601406 3' + roo 9039 1 41.10 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTAAATAAGTACTCTAACAACAACCGATTTAATCAAACGTAACAAGGCGGAATTTTCAGGTGCGTTTCGTCACTACGTAGAATTTATTAACTTGAAA:1 + chr2R 21848827 3' + Transpac 5220 2 77.40 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAATATCACTTTAAGGTGATTCCCAGCGCATATTATGACGGAGATAAACATCGCTTAAAGCGAGAGACGGCGACACCGTCG:1 - chr2R 25106013 3' - roo 8706 2 56.85 GAGGAAAGTTCCTCTCAACGTAAAAAATACACTTTTGCTCCCCGGACTCCACGGAGCAGCCAGCGAAGGAAGTAACTAGCGAATTGCTTAATTACCAAGAGAAAAAAAAAAACAAAAAACACTAAGAGACCTTACAAAAAATTGCT:1 - chr2R 13789613 3' + Gypsy6A_LTR 280 1 49.32 TTTTTTTTATTTTTTTCTAAATGTTGCCGGCCTTAATTTGTAAAAAAAAACAAATTAAAATTCATTTTTCAACTAAATTAAATACACCAATATCTCAACATGCCGCGATTTT:1 - chrX 3426662 3' - TART-C 11099 3 63.39 GGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAATATTCATTTATGTGA:1 - chr3R 22341144 3' - hopper 108 1 68.49 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATCTTTGCGAGAGAGTTTGTTTATGCGCCGTTTGTC:1 - chrX 7706742 3' + P-element 2837 1 45.93 GCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCATGCCTTTTGTAGTCTGGCAATAGAATGAGAATGTGCGGCTGG:1 + chr2L 17722645 3' + Doc 452 1 64.41 TTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTGTCTTTTTTATTTATTTATTGTCTTTTT:1 - chr2L 102436 3' - P-element 2623 1 17.12 GGTCGACCGGTAACGGTGCGTTCACAAAGAGGACGCACCGTGAACGGTACAACTGTTGAACCTTGTACCCGAGCTGGCCGTGCGAAAAGAGGAAAATTCAGTGGATCAGTAGGTTGTCTATCGGAGACGTGC:1 - chr2R 5535205 3' + gypsy8 137 4 70.45 CTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTATTATTGCGTCTACATTAAGTGTGCATTCTTTATGATTCGCCCGGATTCACCCATAGTTC:1 - chr3R 23001825 3' - Quasimodo 6979 2 63.01 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGAAAGCTTTTGTCTCACCTAAATGAAGGCGAATTCGACTTCACTTTGTGTAGACTTTACGCGATAGAGAAAGTGTGAATCGGAAAAGTGGCAG:1 + chr3L 22642104 3' - hopper 13 1 73.33 GACAGCCTTTTATTCGCAGTCCTAGGGCGACTGCAAGGGCAACTTGCGCTGGAATGCGCTGAATGGTTTAGACGGCCAGCTAGATTGTAGGCACTTTCTCGGCATGCTCTTTCGCTTTCTTCGCACAATCATGCTTAGCCAACACT:1 - chrX 15476798 3' + aurora-element 109 1 57.53 ATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATAAAAAAATGGAACATATTTTATGGGAATTAAAACAAAACCTTCAACATTCATTGTAGGTTG:1 + chr2L 13332717 3' + micropia 400 2 59.59 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACCAATAATAATTCGGATATCTAAGCATAAATTTAGTTTATCTGTTCCAATCCTTCATGGATAAGTTATGTAATAATAG:1 + chr3L 16015371 3' + 1360 3376 1 71.33 AATAAATGATTGGGTATAACTTAGCATTGTGAAAATTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTG:1 + chr2R 2879431 3' + Stalker4 35 4 78.77 ACTAAAATCAAAATTAAAATTAAGCATTATAGATATTATATTGATGGAGTGACAAATATGCATTATAATCTTTAATAACAGCGTATCTAAGCACCTGGTCTTAATATGAATATGTTGATAAGACTATCTCATATAGCGTTGGCAAT:1 - chr2R 23000828 3' - Rt1b 134 1 66.44 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTAAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAAT:1 + chr2L 18522302 3' + roo 8990 2 78.03 TTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGGTTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGAAATTGTGAAGTGAAAGTGACGTACCACGCCCACATTTTTACACA:1 - chr4 857194 3' - Q-element 123 2 76.71 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTTGTGATTCCATCATCGAAAAACCATACAGAAGGCGAAGGAC:1 - chr3R 20203619 3' + 412 424 2 66.19 TATATTCTTGATCAGGATTACTAGCCGATATTAAAGAAAGACTTTCTGAATAGAGAGCGAATAGTTAGATCAGGTGAAGAGCGAAGTTTGAGTACCCTTTTAGAGTAAGTAAAACAAAAAGATTAGGAATCATAAAAATCTTTATC:1 + chr3L 20753516 3' + INE-1 83 1 72.60 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTAATACGGTAACTCCAGGAAAACAGCAAAACGGCAAGCTGCGATCAGCTTTGATTCTTACTTCGCAGCGAGAAGTTG:1 - chr2L 8984839 3' - pogo 35 1 58.57 CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCCG:1 + chr2L 21643090 3' - Tabor 62 2 78.70 GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATGTTGCGGCTTGGCGAATTTTTATGGCACCTTGGAGATGGGAACTGGAAGGTGG:1 + chr3L 22226104 3' - jockey 4798 1 58.97 ATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGTTGCAAAAGTGCGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACGTATTTGCTGAATAAAATTGTAGGCAACAAAGATGGGGCACAAAAGCCCGGGAAATCTTCAGCCAG:1 - chr2R 9450405 3' + Tc1 152 1 64.38 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATAAGAGCCACTCTGTGAGCTACCCACCGAAGCACCACTGTGGATATCAGGATATCCTGG:1 - chrX 14329169 3' - jockey 4692 1 50.96 GCCACCTCTAGAGCAACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTCTAGGGTCTTTGCTCTTGGATTCCACAATACGCAGTCCACTCGGACCGCATTGAATCGGTCCAAAAAAAATTCTTACTTTTT:1 - chr2R 2007459 3' - 1360 60 1 51.37 AGAAAATGAACTAAATCCAAGTTTGCACAGATTTGACACTGTCAAGAAATTGATTTGCACAAAGTACTTAAGCTATCTTAGACTTATAATTTATAACAAAGAACTCCTGCGTGCACGGGGGATTGGGTGGGCGTCGGACCCTGAC:1 - chr3L 3152830 3' + S2 174 2 69.66 ACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGG:1 - chr3R 18635225 3' + opus 7421 2 77.24 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCCTTTTTGTTTTACTTTTACCCACTACTCTAAGATCATTATACAAAACAATAACT:1 - chr3R 24603069 3' - I-element 68 1 61.38 GGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGT:1 + chr2L 19140434 3' - Max-element 67 2 60.96 GAGGACTTGTTGTGTCCTGCCGTTCAGATAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCAACGGGGAAACCTAAAAGATCAAGTTTTCTTATTAGAAGGTACATACGGATACATTTATTGTAATTATAAATTGTGACAATAATACCACATA:1 + chr3L 19782894 3' - Q-element 423 2 65.75 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTAGTCTATGATAT:1 + chr2L 5270369 3' + jockey 4928 1 63.01 GATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGG:1 - chr3R 24750988 3' - G6 24 1 60.00 ATCAGTTGAAAGTCACTCTATTTGCGACAACCAAATTATACCAAAACTTTCCGGGTGCAGCTGATAAAGAGTTGCATCTCGTCTAGTATATTCCCCATGCATAATTATATTTAATAGTTTTCCAATCATTTATTTATATATTAATA:1 - chr3R 10976103 3' - Gypsy12A_LTR 190 1 74.66 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATAAAGCGAACACATGAAACTATTATTGATCCGATAT:1 - chr2R 9607122 3' + pogo 2043 1 72.13 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCATTATGCAACGCCAGCGAAACGAAGGTGCTCACGAAGTGGCCAAGCTGCTCTCTGATTGGTCGGCGGGCAGTGCCACGAGGCCAGCCGAAGTTCTCTCGCGAGAACC:1 - chrX 19886991 3' - P-element 15 1 73.97 CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAAGGTATA:1 - chr3R 4679419 3' + hopper 1385 1 63.70 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGACATTGTGGTTTCGACAGTCTA:1 - chr3L 11803995 3' - blood 7100 2 77.40 CGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGCAACCTGCTCCATCGCAGATAATTGCTCTGCGGATCGAAGCCGATCA:1 + chr2R 14973751 3' - FB 9 1 78.77 GCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTTAATCTTTGTTTTCCTTTATTTATTTCGAACAACATAAAAGCGCTTAACGTCTGTTTAAGTGCTCATTGCTTA:1 + chr3R 21395267 3' - G2 425 1 69.70 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTTACCGGTTAAACGCCAAGGTCGCAGTTTGTTGGCCAAC:1 - chr2L 18522257 3' - roo 8737 2 71.74 AGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATA:1 + chr3L 18253874 3' + blood 7316 2 69.18 GCGTGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCACTCTTCTCATATTTATATTTACCGTTAGAAGCCGCTAAAGTTTCTCGTTTGACTTTGCCAAGATGGTTCTTTAGTTGTTGCCTTTTATTCGC:1 + chr2L 9208249 3' - Doc 4488 1 66.44 TGGCTAGATCGACTCGGCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAATATACTGACAGAATTT:1 - chr2R 5296815 3' - INE-1 102 1 71.23 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCTACTTCGTGCACACACAACTCGGCAAATCCTCTTCTCTCGAAAGGAACG:1 - chr3R 31724866 3' + P-element 2822 1 36.23 AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGGTTTCGCCATCAGACTCTA:1 - chr2L 12291824 3' + Tirant 355 2 54.55 CTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGACGGTAAGAATCAACTTTCACAGCG:1 - chr3R 8042272 3' - BS 24 1 57.93 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGGCTGGATTTTCTTGTAAGGCCTCTTGCAGCGTCGGCAAGTCCCTCTGTTTGGTGGGCACAGTCCATATTATTATTATTATTATTAAATATTGCCATATTTATTTATTTAT:1 + chr3R 12780917 3' + hopper 1405 2 78.77 GGCGCACAAAATCGCGAAGTAAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGGATAAAGGCAACAACAAGTGGTTATTTCTGTGCACGGTGTAAATA:1 - chr2L 21325068 3' + invader4 3048 2 81.51 CAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACATATAATCAGTGGCCTAGAGTGGGTAATTAAGGAAAACTAGTTTCCACAGATGAGGCATAATCTGAATGCGATGCCTGACTG:1 + chr3R 15126595 3' - FB 41 1 56.85 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGCTTGAGTAATGTGTAATGGC:1 - chr3R 13225475 3' - hobo 51 1 53.15 TGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACACTGGACCGATTCCGAGG:1 - chr2R 10910196 3' + Tabor 436 2 51.37 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTATTGAGGTGTCT:1 - chr3L 785880 3' - I-element 59 1 56.85 ATTGGAAAATATTTCTTTATTTTTATAATGAAGGTACATGTCTAAAGTTTCCTTATATATTAAATTTAGAAAGCAAGAAAAAATAATCAGGAACCACAACATACCCTATAAATGTGAAGCCCAATGGGTATTTGTAATTTTTGAGA:1 - chr2R 14393014 3' - mariner2 835 1 69.18 GATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGATGTGGGTGAAGGCCATGGACATTGTCCTGGACCGAC:1 + chr3R 16997499 3' - G6 24 1 68.53 ATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAAAGTAGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTGTTCAATATCTATTGCACTGAGCTATTACTTAATACTTATTACAGTATACGGACGCGAAGGTTTC:1 - chr3R 7616765 3' + Stalker2 299 2 79.45 ACACTACCTCAGTAACGGGTATTTTCTAGTCGGTAGTAGGTACACTGCTTTTAGTGCATCAACGATGAATGTTGTAAAAACCAAATGCTTGCCGTTTGTGTGACGCCGCTGTTCCTTGGAGATGTCCTGCAGTCGGGCAATTTGTG:1 - chr2L 16308488 3' + INE-1 540 1 50.68 ATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTATGTATCATAAACGATGTTGAACCAGGCTTCC:1 + chr3R 5745924 3' - flea 4822 1 74.60 TGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTGCCGGGAAATCCGCACATAAATCTTACCGACACGT:1 + chr2R 1923611 3' - pogo 23 1 69.66 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTCCCTTTCTCACATTCTCCCATTCTCTCGTTCTCTCGCGCTTCTCT:1 - chr3L 19580858 3' + roo 9037 1 61.64 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATTTTTCTTGTCCACAAATGTATGATATATAATTTTCTTTTTTTACG:1 - chr2L 15081022 3' - Doc 22 1 69.86 ATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAAATTATTCGAGTATGCAACCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACGCAGTGAATAATCCATTGAATATTAAATGCAAATGTGCAAAGAAAAACTCGAATTGCATACCAGCTGGGTTAATCG:1 + chr3L 3724921 3' + Doc3-element 4526 1 52.41 ATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACACTAAAAACACAATAAAACACAAATTCTACAAAAGACTAGTTTAAGAATCAGTGTAATACCTTTACA:1 - chr2R 10079826 3' + I-element 5063 1 57.53 GCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATTCATATTCTTTTCTCCCGATGTGGTTTCTATAGCGAGCTTAGGCGCGGTCCT:1 - chr2R 21657060 3' - invader4 70 2 68.49 GATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTATTGGGTGCTTTTGATTTGAAGTCGGACCCACCAACTTGGTTAATGG:1 - chr2L 10336668 3' + Transpac 5036 2 68.49 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTCAGAAACCGTGGCATAC:1 - chr2R 6798213 3' - jockey 57 1 52.82 CGTCTGAAGAGAATACATCCCCATGAACTACCCCCATGAACACGTAAGATAACATAATCTCTTCACTGTACATTTGTACACATTATAATTAAGGAACAGATCCATTAGGATCCGAAATCCCAGGGGTCAGAACCCGATGCAGCCT:1 + chr3L 11816246 3' + G5A 2680 1 56.55 ATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGTGTTTGTGGTAAATTAGTTTAAAATGGTAACTAAATC:1 + chr2L 19140470 3' - Max-element 8265 2 63.45 AGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATTACTATAAATTTTTAAACCATTTCCCTGCCACGGACTACAGGTGCA:1 - chr3L 13678849 3' - hobo 29 1 65.75 GGGGCTCAATTAAAGCGATTCCTAAATGACGCTATGTTTTAATAACCGAAAACCCTAAACAAATCACCCTCTAGTAGACCAAACATCCGTTGAATAATTTTGTCAATTCAGCATGTTCCCTTTTTCCAAGCCCAGACTCACAAGCT:1 + chr2R 3928703 3' - mariner2 222 1 71.23 TAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAACTACCTAGTATAATTGCAGTATTATTATGAAACAATTTGATTTAATTCTTGGGCATGCTTATTTAGCGATATATTTTTTTAAACGAAT:1 - chr3R 9583257 3' - Juan 4059 1 62.33 ATTTTCGAAAATTTTCGAACTTTTTGAAAATTCAGATCTCGAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAACTTAATCGGTGGGCAGACCAACTCTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGAAAAGTAGTTGCCATAAGATTTTCTAAATAAA:1 - chrX 2968846 3' - FB 140 1 68.49 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCATGAGATAAAAGCATTAAAAACAGTTTGCATTAGTGCCAATTTCGCAGAGTGTGTTGCTAATTTGATTTCATTCTTTTCGTTGCAAATTGTTGAGCTAATT:1 - chr3L 20251870 3' - copia 19 2 72.60 AAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTATTTGTTTATAAACTGGGGTAGAGTGCTATTTTTAAGAGATGGATAACTTGCATCCGAC:1 + chr2R 651212 3' - Tirant 270 2 59.59 ATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAACTAATAACGATATTAAAAAAAAATCTTCGTAGTTTTGGGAACAATTTTTTTGGTATAATTTTTTATTTTTATAAT:1 - chr3L 13987145 3' - diver 47 2 47.26 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCTGGCAACAGTTTAACAAGCTTTTTAAAACTACAGGAAGCGC:2 - chr3R 7585747 3' - Doc 89 1 71.23 TCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACCATCTGCTTATACGTAATATTCTTACATTGTATTTATTACTATTATTATTTCGAATACTTCAGTATATGGGCGTCTGGTACGAGTACGCAG:1 - chr2L 1360899 3' + Stalker2 7621 2 70.14 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATT:1 - chrX 1103611 3' - pogo 60 1 60.96 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCC:1 - chr3R 23161290 3' - 412 7139 2 76.55 CACCAAAGTTAAAGTTGTATGTTTTTACAAATATATGTGGAATCATATGGTATTAATGTTTTTGTACATTAATTGTGAGCTATGGCTTCGATGGATCTACGGGCCAATTATTCATTTACTCGCAGTTGCCATGCGATTTGTTCTAT:1 + chr2R 6683233 3' + transib4 440 1 73.29 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGGGTGTGGCGGTGTTT:1 - chr3R 9125605 3' - Doc 13 1 80.00 GTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTACCTACTATCTAGCGAAACCACAGCCTAGGGAACGGGCTTGGAATTATTAGCGGGGATAGAATACAATTTGTTATTATTTTAATTTTACT:1 + chr3L 10803275 3' + R1A1-element 5330 1 70.97 TTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGTTACTTTTGCTTTAGTTTAGTAATAATATTCATTATAAGATACGAGTAATCTCAAACACAATAGAGACAGTTACAGATCGACACTACAATACAACAATGAGACAACAATAAATTCTTCAATTAAC:1 + chr3R 29764418 3' - G2 3076 3 68.49 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTAAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGACAAAAAAACGAATGATAAGTAATGGGATGAAAACAACTTGTTAAAACCTCTATAAATTTATC:1 - chr3L 3238249 3' + roo 349 2 56.16 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAACTTCTCAGCTCTTCTACGGTGGAGTTAAGGTTGATGCCGA:1 - chr3R 7450251 3' - Doc 7 1 57.78 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAAATGTATTTATATATATATTTTTTTAAATGGCATTGCTTATTTTCTGAATCT:1 - chr3R 7507144 3' - Doc 70 1 66.44 AATATAAAATAAATAAGTAAATATATTTAATCAGCCCTATTCCCCGAAGCTAACAATTTTCGAGGTAAAACTTCAATATAAAAAAAAAAGTTCAATCTAATAAATTTAAGTGAGCTACAACGTTCCACAGTAATACCCAAGCCAA:1 + chr3L 14605036 3' + Doc3-element 79 1 82.07 AGCTGTTTAAAACTTCAACTTTAAAAGCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTGTGACGAACTATGGACCCGGACCTGGCATGATGGTACCGCCTTCAATTCGAGCACCCTCGCCAATGGGTGGACCCGCTA:1 - chr2R 20326062 3' - transib2 160 1 53.15 AAATATTAAGAATTATTATTAAGACAATGGATGAGAACAATTCTGATGACACCCAGCTTTTAAATAAGCAGAGTAACCATATTTACTCTACGAGAAACGGGTATAATTATTTCAAAAAACGGGGAAGGGCCAAAGAAATTCGATAG:1 + chrX 22757922 3' + BS 315 1 55.48 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATAAACTGTGCCCTGTCAAATATTTATGGGTTAAGGTGTTCAAACGCTTATCAGGGCAGCGTTAAGAGC:1 - chr3L 12835987 3' + 1360 3334 1 57.53 TCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAAACAAGCATTAACCGTGTGCATCGTTACTTCTGTAGCTAAGTAATTTAAATAGTTTAATTTTCGAGTTTAAATAG:1 + chr2R 6673466 3' - BS 5060 1 51.37 ATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACCATCTGCTTATACGTAATATTCTTACATTGTATTTATTACTATTATTATTTCGA:1 - chr2L 1360936 3' + Stalker2 336 2 61.81 ATGTGAGCAACCGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCATTGGGATACTAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATTCTGTAAGTGTACACAACGGCACAAACCTAGCGACACAGGACATTTACGCCAACACCTTCTAATCA:1 + chr2L 14954156 3' + G5A 2534 1 49.32 AATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATATGAATATTTCTAGAGCTGATACATTAAGCCATGTTAAAGCTTGT:1 + chr2L 2120447 3' + I-element 5281 1 68.49 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTGTCAAAGA:2 - chr3L 19031194 3' + roo 9043 1 66.21 GACTCGGCTATAGATCCTGATCAAGAATATATACACTTTATATGGTCGGAAACGATTCATTCTGCCTGTAGCATACCCTTTTACTCTAATAGTAACGGGTATAAAAATAGAGGACCATAATTAAAAAATCGTAAATGCTTTAGTTA:1 - chrX 22484665 3' - INE-1 92 1 55.48 CCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGATGAACTGGACCAAGCTGCGCCTGCCGCCCCTCTTCGC:1 + chr3L 21264362 3' + jockey 4614 1 55.42 ACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCATTAAATAACATCAAAAATGTGCGGTGAAAGTTAT:2 + chr3R 13349616 3' - Ivk 31 1 63.01 CACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAATCCTTTAGGATATGAAGATCTTCAATCTCATGATCTATCTACTAACGTTTGTAAGTAATATACTCTATAAAGATTTTTC:1 + chr3L 4231359 3' + P-element 204 1 51.72 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCATGTTCATGTGTGAACATGTCAATTACAAATATCTAAAATAGAATAGTAACA:1 + chr3R 2861108 3' - roo 8750 2 94.37 ACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAAGGCCGCTAGCGAAATGATTCGTTTTCGTTGGCTTGTAAAATTATATGCTCATATTTCACACGATCTCGTCGCACATTCA:1 - chr3L 17470536 3' + HMS-Beagle2 62 2 71.43 AATCATTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAA:1 + chrX 22900314 3' + Tc1 1550 1 74.66 GTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCA:1 - chr2R 13367444 3' - jockey 4606 1 53.38 ATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCTCTTGAATAATTCGGATGAATGTTTT:1 - chr2R 14135260 3' + copia 198 2 55.48 GCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAAACACCACGTCCCTTGTCTATTGTACTTCAGTAGTAAAACAGCTCAGGCTACAACTGCAACTACTATTAAAACCGCCAATGTAAAACAGCTCGAAAATC:1 + chr3R 16293388 3' + 412 7373 2 75.34 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTAATACGGTAACTCCAGGAAAACAGCAAAACGGCAAGCTGCGATCAGTTTTGATTCTTACTTCGCAGCGAGAAGTTGTGATTTTCTCGATCCG:1 - chr2L 8984823 3' - pogo 25 1 68.49 TTTTTGTTTTTTTTTTATTATTTTAGAGTTTCCACAGTCGTTGCTCATTCAGAGCTTTTCCAGGGTATCAGAGCAAATAAACAAAGCGAAATGTTTGGCTACAT:1 + chr2R 20419885 3' - BS 5099 3 88.46 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATTGTATCAGGCGATGTGTTGAGCGAAAACGATCACCTAAGGCAAAGTCGAGTTAGAGTGATTGAGCGAGTGATTTT:1 - chr3L 19863921 3' - roo 8710 2 52.74 GATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCCAAGCGCTTCGTTTATTTT:1 + chr3R 24454884 3' - F-element 275 1 51.08 CATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGAAGAAAACGAAGAGGAATAAACAAATGCATAATGGTAATGGTAAACAGTAGCAACCCAGAAAACTTCATGCCGCCCCCGCTCGCTT:1 + chr2L 13629194 3' + Tirant 8473 2 61.64 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTG:1 + chr2R 21439503 3' - jockey 88 1 71.13 ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACAGAGAGGAAGCGAACGAACAAATGAGTTGTGTATTAGAGGAACAGGACGTACATAATCAA:1 + chr2L 22690061 3' - Tabor 6880 2 58.22 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTTTTTCTGTTAATGAAAACAGTGTATTTAAGCTTA:1 + chr2L 19691310 3' - roo 8748 2 78.47 ACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGGCAACTTTGGCGCACT:1 - chr3R 7470938 3' - Doc 85 1 50.68 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCTAATCCAAATTTGTAATTTATTGAACTCA:1 + chr3L 16059360 3' - 297 6604 2 64.75 GAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGAGGCTGACGCTTATCAAAAAACCTATTTGTTATATGTGTTTGTTATGTACTGTATTGTCATTTACTCCGCTTTTCCGCTACTCTTGATCATCGCCGCTCTGTGC:1 + chr3R 7469436 3' + X-element 4505 1 67.12 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTGGCTCAAAGTCGCAGAGAACGGCTA:1 + chr2R 1320478 3' + Transpac 265 2 71.43 GTAGCTCCTGAGATCTCGACGTTCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATATACTTTATATGAGCGGAAACGATTCCTTCTGCCGTTACATATTTTTCATAAGATAGCTGCAAGATGGACAGACGTAGATCATATATCCGTAACAT:1 - chr3L 10470062 3' - INE-1 143 1 67.81 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTGCGTGCGGTTG:1 - chr2L 14969094 3' - 412 7121 2 64.38 CGATCAGGATCAATGGCCGAGTCAATCTTGCCATGTCCGTCTGTCCTTCTGTCCGAATGAAGTCAAAATTAAAAAGAAAATAAGATTTACCGTTTCATCCAAGACTATATCCTGGTACCGTTTTTTGCACATAA:1 - chr3L 24166415 3' + INE-1 91 1 58.96 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGCAGCGATTTCATTTCTCCAATGAGTCATGCGGCCAGTCCGTCGCTTGAAATAATATTATTAAATAT:1 + chr3L 13952872 3' + I-element 5305 1 50.68 AGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATTGTTTGTACTATTTACCATTTGGCGACCCGTTATCAATTGCAGGTGCTTTCT:1 + chr2R 18689237 3' - Burdock 6204 2 63.70 TGGCGGAGAACGCGGAGAAATTGAAGGAAATCTTCGGAGAAACATGAAGAGAGTGCCGCAGGATCAGGCGCGCCACTATACTTCGATAAATATCGCCGCATTTGGGGCGAGATGTAAAATAAATAGTGAAAAATAACAAGTCATAA:1 + chr3L 11342421 3' + Osvaldo 1181 1 54.11 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGGGCAAACCGATGGAAATTTCTGCCTTCATGAGGCGGCAACAGG:1 + chr2L 12144281 3' + transib2 2747 1 72.60 ACACATTTTAAATACTAAATAAATGACTGCATTTGCTGAAATTTGTTCCGCTACATGTTTTGGCCACTATTGCCTTGAACATATGTAGCTGTTTCTTATTGAGTTCTATTTAGGCAATCTTCACCGTACCTTCCCAATGCCCAATG:1 + chr3L 11092114 3' + G2 3048 1 43.15 ACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTTTTATTATTATTAATCTCTCGTTTCATTCTTGAACT:1 + chr2L 7117984 3' + jockey 124 1 74.10 AACTCGACTATAGGATTCTGTCTAACTTCTAATCCCTGTCTAATCATGGATTCTGATTCGCAAAACAGATTTTCGTTCAACTTGAGATTTTTAGGATCGTCGGATAGTGGTAGCGTTGATTCATTGACTTTGGATTGTTCAGACA:1 - chr4 680797 3' + INE-1 575 1 67.59 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACTGGCGC:1 + chrX 16117272 3' + opus 7456 2 57.14 AGGGGAGGAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGCTTGCGCCAAAGGAGCGAGCGGGAAAAGCGCGAAGAAGCAGTTGCGG:1 - chr3R 5604503 3' + Burdock 6129 1 67.59 ATCACCTTTTGCAGACGTTTTGGTACAGACTGTACCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATATAATTTTAATGTATTATTACCTGGTGACGAGGCCGCAATGTCTCTCGTCCGTTAGGTGAACTCAACAAAGAACAAACGTTGCAGA:1 + chr3L 26720787 3' - Tc1-2 1326 1 76.71 AGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAATCTTGAGTTTAATGCTAAAAATCTTCGCTTACCCAGTGCTGCATAAGC:1 + chrX 22900362 3' + Tc1 1598 1 86.99 AAACTGCACTATACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTG:1 - chr2R 21820744 3' - Doc 97 1 75.34 GTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGCGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCT:1 - chr2R 18689161 3' + Burdock 176 2 74.66 GAACGAACACACACACACACACACATTCGCTCCCAGAAAAAGGGAGCCATGTTAAATGGGAAATTAGCAGCGACAACTTCTTCTGGTCACATGCATAACGTATATAAGCAAATGATTAATGACCAGGGTACCTCCTCTGTTTATCT:1 + chr3L 15225143 3' + accord 7025 2 67.12 GTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAACAAGAGAGAATGCTATAGACGA:1 - chr2R 19947138 3' + Transpac 5175 2 76.19 ATACATAACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATATGTAATAAAGAATCAATATATCAACAAGACTTTTTAAATCCCAATAGAGAAATATTACAAAACAATCAAAATAATCGAATCATTATTACTGAT:1 - chr3R 29698316 3' + Stalker2 226 2 56.43 ATCAGGTGAAACGGAAATATAAATATCAAAATGAAGATTGTGAAACCTAACATTTCTGTACTCCTATTATTTACATATGTATTACTTAATGAAAGGTTGTTTGGGACCGGAGTTTCTTGAACTGATTTTAGGCAGTGCGTTTAGCT:1 - chr3R 6938948 3' + Transpac 4790 1 64.38 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTCTTTTTTTTTAGATTTCTATTCCGAAGAA:1 + chr2L 21643165 3' - Tabor 19 2 70.71 GGTGAGCAGGATGTGAGGCCAAGTCGCACCCCCTTCCTTCATTGTAGTCCATGAGGGCTCCTTCTTCCACCCTTTAGTCGACTTTTACGACAAGCCGGTAACTATTTTCGTTTGTAATAACGTGCTGGAAATGATTACGATGTTGA:1 - chr2R 6112626 3' - Rt1b 4956 1 67.12 TTTATAGTTCCTGAGATCGAGACGTTCATACGGACAGAAAGATTCTTTTACCCTAAAAACTCCCGTTCGATCCTCAGGTGTGGTGGAGGATCGTGTAATGCCCGCCCTACCTTGGTCATTCTTTAC:1 + chr2L 23315720 3' - INE-1 146 1 75.40 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGAAAGACGGCAGCTTAGGACCACCCAAAGAGGTCACTCCTCATCGGTGGCCATTATGACATCAAAGCGAATGTTCGAGGGCGAAGAGAT:1 - chr2R 9340090 3' - 412 33 2 61.64 GCCAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGAAGAATGGGAGCAGCACATAATGCTCTAACTAACCATGGTACAGTTTTAACCTTTGAAGCTATTCTTTCCAGATGGGATTTTAGTTTTATGGATAAAAGACGGGGACGCAAAGTTTTGA:1 - chr3R 2651248 3' + mariner2 728 1 73.97 GTTTATTTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCGTGAGTGGATCGTCATGTAATGTAGACAATATAGCTTCTTTTTCTTTTTCATTATTTATTTTGGTCACCGGGTTAAGTAGCGCTACTTTTAAATTCTTTAATATTTTATTGCCCATAT:1 - chrX 22752678 3' - Quasimodo 291 2 78.08 GACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAAAGCTGGCAACTGCGAGGGGGAAAATCGAGAAGAGGAAAATGGAAAAAGGGAAAAGGGAAAAGGGAATGCGGCTGGGACGACAGTGCGAAATGAATGAAAACGAATGAAGCC:1 - chrX 11000720 3' - hobo 287 1 74.66 GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTAAAACGAATGCAGAAACATGCAGATCGTTAGGCGCTATTTTTTGGTCTTAAAGGCCGGGCTTTATATATTCAAAT:1 - chr3R 7778232 3' + transib2 2781 1 56.16 CACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTAATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTACCATTCGACTGACTCCCTCTCAGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTTTATTTCTATGCATCAGAGTTGTTATAAAACCTTTAAAA:1 + chr3L 13237270 3' - invader2 5067 2 70.55 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATCAAAAGAAATAAAGCAAACGTTGCTTTCTTTGGCTTTCTTCAACTTCTTCTTCAATTTGAAAGAATGGAAAAACCTTGTTTTGTGCAATCATGGCTGCAGCCTATGT:2 - chrX 4400253 3' + roo 396 1 71.92 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTTTAAGGCCCT:1 - chr3R 26485999 3' - 412 40 2 58.22 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCAC:1 + chrX 6633044 3' + P-element 2829 1 45.89 GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGATACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATT:1 - chr3R 11151841 3' + mdg3 5431 2 76.07 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTTGGTGTTTTGCACATTTCTCTGCCATTTTGAATTGCGCGGTATTTTATTGGGAGTACCGTATTTTCGCTCCATTTGGTGGTGCAACGTTGGTCAGCCTGGGCACAC:1 + chr3L 11795594 3' + 1360 3378 1 72.22 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCTTAGGGTCTTTTATTTGCGATGGTTGGCAAGTAAG:1 - chr2L 15777812 3' + 297 315 2 75.34 ATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTTCCTGGAAAAGTATTCCCATATAATTTTTATTTCCAGCCCTGGAAAAATAC:1 - chrX 16787019 3' - mdg3 24 2 42.76 CTTTTCCCGGTCCAACTTCAGGGTCTATGGCTTTACCCTACATACTGCCAACAAATCCATTTGCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTATGCAGAATCTACTAAAGAATAATCACAGTAATTGTGACA:1 - chrX 21668309 3' + G5A 135 1 70.55 GTATTCCAGACTAAGGGGAGAGTTGTAATTAATAAGCCAGTGAAGATTGGCTGCTTTAAGCTTCTTATGAGTCCTCTTAGTCCTCTATATGTCGCCGCCAGGTGAGGCGTCTATCTAGGTGAACATATATCGTGGATGCAATCGG:1 - chr3L 8742656 3' - Doc2-element 4305 1 80.69 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATCAAGTATTATTCTTAAAGCACAACTTATTAACCGC:1 - chrX 14529710 3' - transib2 46 1 50.71 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTGGTACTTTCTATTCTCGCTCTTATTACAATCATCACGGTATAAAGCTAG:1 + chr3R 28633202 3' + roo 9032 1 66.44 TTTTTCACTTATAAATATTGCAAACATTAGCACTTTCGCAAATAAGCCGAAGTCTAACATACAAGTTTTTTAATTTTCCTTGTGACACAGTAACTTACAAAACTTAAATAACTTATAATATATGCAAAAATAATACAATTTCGAAT:1 - chr2R 579347 3' + Idefix 7379 2 57.53 CCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATCCAATTATATACATATGTGCATCTGGGTGCCCTTATGACC:1 - chr2L 15169570 3' - Stalker4 283 4 72.60 CTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGCGCATCATCGGAGCCATGTGCCACCT:1 - chr2R 22746022 3' - jockey 4781 1 69.18 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAAA:3 + chr3L 10469623 3' + roo 356 2 56.16 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAATGATGCAAAATACATTTGGACCCCGCGCACCACGAAAATGGATGCAAATTTTTCATTTACCTGCTGCCA:1 + chr2R 16413174 3' + roo 9037 1 55.81 TTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAACAAATTAATTTTGTCTGGGGCGACGGCACTGGCGGCGGC:1 - chr2L 20515220 3' + I-element 5276 1 71.23 TTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGCCCTTGCCTCCTTTTCTCATGGCCAACTTGTGCATGGATCTCAGTTCGCGTTTAGACACCGAATCCAGTGAAATGAATTCCTACATGGAAATACTTTAACTAATCCTT:1 + chr2R 16089045 3' + 1360 427 1 75.34 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTATTGTCTTTGGTAAATTGGTATACTATATTGGTACTATTGGTACGATATTAATCTACAATTACTTGTGAGAAATAACTTTATAATGGTACCCTTTTATAAAAATTAAGGACTT:1 + chr2R 9869850 3' - 1360 22 1 52.05 TCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTAGTTGCACTTTTTCCCAGTGTATCAGTTGTGGTGTCAAGTAGCAA:1 - chr3R 15054124 3' + 297 6907 2 69.18 CTTAGTTTCCCTTGCACTGCTATTTAATTGAACACAGTGTATACAAGAAATTTATATAAAAGGTATGAGATGCCTGAGAGCTTTCTTCCTCCTTGTGCTCCACAGGACGCGTACTTTTACTGTGTTTAGGTATTGTTGCTAGCATA:1 - chr2R 1735230 3' - HB 24 1 67.12 GAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAGGGAAATA:1 - chr3L 13952754 3' - I-element 5144 1 54.11 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAACAAGCAGATGTATCTGCTAAATGAATGAAACAACACAATAAACGCAACTATTC:1 + chr3L 3453728 3' + Tirant 363 2 60.96 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCTGTTCCTGAAAAATACATCTAAATTCCAAATTTCAGCAACAACA:1 + chr3R 7778378 3' - transib2 34 1 60.96 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGAGGCTCTTTAATGGGGGCATTGCATACTTTCGGGCAC:1 + chr3R 23601770 3' - jockey 27 1 54.29 TTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTAAATAAATCAAATGTGTAAAATCAACAAAATGTGTTCTGATTGCGGCAACTTTTAAGAA:1 + chrX 14836277 3' - invader4 59 2 60.27 CTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTTAATCTTTGTTTTCCTTTATTTATTTCGAACAACATAAAAGCGCTTAAAGTCTGTTTAAGTGCCCATTGCTTAGTG:1 + chr3R 21395270 3' - G2 429 1 71.22 CGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTT:1 + chr3L 23940544 3' + Cr1a 4399 1 68.66 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTT:1 + chrX 1103726 3' + pogo 2050 1 54.79 CGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGTT:1 + chr3R 16997445 3' - G6 20 1 49.41 AATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTG:1 - chr3R 6413566 3' - 1360 78 1 71.92 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCCTAGAGATGGTCCGCCCATCGAAGGCGTTCGTTCTACACACACACACACACACACATCGCTGCGATCGCAGACATCGCCAGATGCGAG:1 + chrX 6462141 3' + hopper 1394 1 65.67 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGTTTGATTTTGTAAACATTTACTTCCAATCAACGGCGTTCAATTAATAGTGTTGCTATTGGATT:1 - chr2R 9294257 3' - Tirant 8118 2 79.45 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTGCATGCATGCAACACCCTGTAAGATATGGAGATACGAGGCCAAAAGCTGCTCTTCGAA:1 + chr2L 18522378 3' + roo 9052 2 70.55 CTTATTGTGTTATCCTCTTTAGCGTGTAATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTACCTCTATTTATATTTTATTCTTTTTGATTCTGAAACCATTTTACATTTAACATTTAATTCATGTGTCGTTAT:1 + chr3L 13523503 3' + Dm88 4465 2 53.33 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTAGGCTATGATATGTGAAATAT:1 + chr2L 5270378 3' + jockey 4944 1 54.68 GTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGGTTGGGTGCCTTCTTGAGTGGGTCACTCAAAGTTAGACTAAACATTCATTTTCAGGTTTAATGGATTTTTAGGGGGAGAACAGCTACC:1 - chr3R 24843441 3' - Quasimodo 332 2 56.25 CAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGGGTCTCCTTCATAATTTAG:1 + chr2R 2875239 3' + TLD2_LTR 105 1 65.75 GAATATACCATGGAGCTCCAGTAATGATTCTTAGAATCCTAGACTGTGCTCGCTGTACTATGACAAAGTATCGAAAAATGTTTCAAAAATGTGGGTGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAAAAAG:1 + chr3R 4078935 3' - Doc3-element 4411 1 58.62 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAAC:1 + chr2L 5792075 3' - blood 7069 2 62.31 TATCATGTCTAAACACATATTTATACATTCTCCGGGGGGAAAAGTGTACGGCCAGTAGTCGTCTCTCATTTATTCATTGCCTCCGGATATAAATTTCGACAGTTCAACGATGGTCATGTGATAGCGGATATTTTCCTTA:1 - chr2R 10140119 3' - rooA 6 2 61.15 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTCGATTGAAATATCTTAATTGAAAATTGCATTTCTCCCGGAAATATTCAATTTT:1 + chr2L 19674039 3' - roo 25 2 39.04 ACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCACGCGGCCAGTTGCAGTGTAGCTATAGTCCTAAGGTGTACATCCCCTTCCACAGTTAGGAGCACTGAACATCAAACAGCTCGCAAATAC:1 + chr2L 21154489 3' - 1360 337 1 65.07 GAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAAT:1 + chr3R 16276419 3' + pogo 2034 1 72.14 ACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATTGTGTCCGTGTTCTTGAACAAACGTTTCGATGATTACAAATCGGCTGAAGGACCACCACATATAGCCACCA:1 + chr3L 18512706 3' + roo 8680 2 51.37 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCCGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAACATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCCCATTAAAATGTGCTGCCTAC:1 + chr3R 25795829 3' - jockey 62 1 56.82 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTCTTGCTTTCCGGTTTTTTGCAACACGAGCCTCTTTTCAGGACCTTGCATTAAATTTCGTTATTTCGTGCTCTTT:2 + chrX 21403539 3' - roo 12 2 76.03 GTCATAGGACTTAAAAGATTTCATGTGCTAGATTTCCCTGACAGGTATTAAGTAGTAGGGATTAATGGATAACTACTACCTCTGTTAATTAAAGATTACCGGGGCAAGTGCTTTTTCGGGCGAGGACACATCGAAACAAGTGGCGG:1 + chr2L 798592 3' + G4 3678 1 59.59 ATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATTAATCCAGTTTTTGTTCCTCGTTGAAAGGTTCATCTAAAAACCTGCTACCCAAAGCTCTGTTGTAAAAAACGCTTAATGTAAGGACTAATTTTTCG:1 - chr2L 9818893 3' + Cr1a 4287 1 66.44 GGAAAAGACGCTAACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTGTGAACAAGATAAACAAAAAAAAATGTAGAGGAAACAAAGGGGCCAGAAAGACGGAAAAAAATCACAGTCGAGCCGAGCAATTGACCGCTGGGAAATGAACC:1 - chr3L 18259824 3' + Porto1 103 1 60.56 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACATCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAG:1 + chr2L 5792108 3' - blood 7051 2 56.55 GACGAGATCGCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTAGAGATTAAGCAGATTGTAGAGATATAGACACAG:1 + chr3R 5732784 3' + INE-1 145 1 80.88 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGGCCTCGCGGTGTGCTGTCCGC:2 - chr2L 22319243 3' - Transpac 4958 2 56.16 CAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACAATCATATCACCGTGTCAGCACGGTTTTATGAAACGCAGATCAACTACCACTAAACCAATAAATACAAGTGTTTGCTTCTGCTGCCCCCGCGATCCCCCCATCCGATGATTGGCAGCTG:1 - chr3R 8920553 3' + Q-element 140 2 54.86 CCAAGAAGAAATTGCCATCATAACACCTGCAATGCTAACAAGACAAAAAAATATTTTTAAAAAACGATAAAACTTGTGTGATATCGGGTAATGAAACTTTACTAAAAACATAAAAACACTCCATACAACAACAAAAATTTATATAA:1 - chr4 1081249 3' + mariner2 673 1 78.08 GTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAAAAGAGAGCGAGAAAAATACAGAATGCGGGGCACACTTCGTTCATCGATTGCAAATC:1 - chr2L 3863047 3' - micropia 5148 2 59.57 GAAGTGCGGACAGAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTTACACGTCGTAAGCTGAATATTCTTTTTTTTTCTCCATGTTTTGCTTATTTATTTCCCCTTTACAGGCGCTCTTGATATTGGTCCAAAAAGCCATGCAAA:1 - chr3L 22324626 3' - 1360 463 1 75.34 ATTATAAAAAATAAAAAAAAAAATTATTGTATCTATGTTCCTCTAGATTAATAAATTAAAAGCTTAACTGACAACTTTTTCTGTTTATATATGTATAACTAAAAGATAAATACAAATATATATAATAGGAGCCTTATATTAATAAT:1 - chr3L 18291437 3' - hopper 152 9 67.81 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAAGCCAA:1 + chr2L 17839472 3' + blood 7325 1 60.96 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTAGCTTATGACCAGGTTAAGGTAATGTCCATTGGATACTGTTGCCTATTTTGTGGCGCCCAGTTTAGCGGCTATTT:1 + chr2L 6388172 3' - jockey 8 1 75.73 ATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGAGGTTCTGAAATAAAGCTTTTATATTCCTTTCTTCACGATGACTATGAAATTTAAGAGAAGGATTCGATGAAAAGGATATATTTCAAGAGCT:1 - chr3L 20251208 3' + copia 4884 2 64.38 TCGACTGAGCTATTGATCCTGATCAATGGAATACACGGTAACTTCTACCTGTTAAAAACTTTTCAAGGAATCTAGTATACCATTTTACTCTACACTTAACACTTTAAAGTGTTTGCCCTAAATCGCTAAGCTGCTTAAAGAGGACT:1 + chr2L 12157220 3' - INE-1 94 1 64.38 AAATATATTCGTGTTCATGTGAGAACACCAGAATGCGAGCAACTTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGCTTTCATTTGCTAAATATACCGAGAT:1 + chr2R 11164560 3' - roo 8670 2 77.40 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAGGGCTGCAGTCGAAAATGGGGTGACTTGGCTTGAATTATGA:1 - chr3R 7885548 3' - jockey 30 1 70.34 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGAATTTGAGGCAGTTCGTAGAATAAGTCGTCTCTCTGATGG:1 - chr3R 4576973 3' + mdg1 341 2 71.92 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACACTGGACCGATTCCGAGGGATCCGAGAAGTCCTCCCTTTGCA:1 - chr2R 10910172 3' + Tabor 7299 2 67.81 ACTCTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTCGGGACTGTGCTAACCATCCAAATTAGCAAACTAATATGATGTTCCAAATATATGAGATAATTTTATTTTACACATTTATTTCGAT:1 - chr3L 6355068 3' + Tirant 255 2 62.33 AAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCGCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACAGAGAGGAAGCGAACGAACAAATG:1 + chr2L 22690025 3' - Tabor 76 2 66.21 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGCATATGTTTTGGCCTTATAGAAAAGTGATCGAACTGTTCTAATTCTGTTCTAATTTCAGTGGTGAAGTGATTGTAT:1 - chr2R 5438195 3' + flea 4968 2 54.48 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGGCTATATGGCAAAGGATGTGGAAAGAGGTCGGTTTGCTATTCACTTGAATTAAAATGAATTTAAGTGGTTTGCTATTGGCCAAAGTTGCTCCCATATGCAGACAGAG:1 - chr2R 21748191 3' - 1360 13 1 73.29 GTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAACAAAGCTGAGATGTAAATTTGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTAGACTGTATTTATGTGATATACGTTCATTTATTTTGAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATGATAATGCATGT:1 + chr3R 19449318 3' - roo 8652 1 73.97 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATTAATGCCGCTTTAAGGTATTTTTGCGCTGCCCGCAAATGAATCGATCCGTGCGACAATTGCGAAAATATCGTTTAATTAAAACAAATATGCATAGATTACTTTAAAT:1 + chr2R 22463302 3' + roo 397 1 62.33 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTAAAATCGT:1 - chr3R 16276297 3' - pogo 30 1 64.83 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGACTAGAATGCGTGTTTAAGTGAACTGTCCCTTTCATAAA:1 + chr3R 28450768 3' - roo 8713 2 55.48 GTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAGTTTTTTTGTAAATATCACCAG:1 - chr2L 2120368 3' - I-element 4961 1 55.48 ATCAGTCTGTCCGTATGAACGACGAAATCTTGCCACGGACTCATTACTCGAAAGCTGGGGGTTACATGCTCATTAACTGTTTTCCCCCTTGTTATTTTTTTAAATAAATATTGTATATTATGAAAAAACCATATTTTAGATAAAGC:1 - chr3R 7060271 3' + INE-1 125 1 73.97 GGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTAAGGCACTTTATCTCTTGCCTAAACTGGTATTCTTGTTGTTTCTTAATAACAACTGTTTCCGCT:1 - chr3R 19446777 3' - Doc 4487 1 55.48 GTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGTGTTCTTACTCCTGTACTTCTTGTACTCCTTGTACTCTTGTTAGCTGACTACGTTCTCACTTGCGGATCTC:1 - chr3R 1281471 3' + 17.6 156 2 52.74 ATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCCGGTCACTCGCCAATTCACGCTAATGGGTTCCGATGCCTCGACCTGATCCCTT:1 + chr3R 31141105 3' - Burdock 6146 2 77.24 AACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATTGTAAGTTTTACTTA:3 + chr2R 21870258 3' + copia 5057 2 65.75 AAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATTGGTTGTGCACATTTCTAAGCTATCGCTAATTGCAGTCCCACTTGAATAGTCGAACCGCCTAATTGCGGC:1 + chr2L 14463559 3' + copia 4760 1 52.05 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGT:1 + chr2L 12291955 3' - Tirant 41 2 56.83 AAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTGTGTGAGTGTGCGATCTTTAGCTGAATGGGAAATACTGCGAAAAGGTTAAGGAAACACAGTCATACGAAAAAGTGCTAAACAATTTTCAAATGTCTT:1 - chrX 13903453 3' - I-element 4998 1 67.81 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGTGCGGGACAATGATTGCTGCATTTATGAGATAAGTTTTTACTGTCGACAACAATTAAATTACATTTTAGAGTT:1 + chr2L 16615862 3' + hobo 2928 1 64.81 AGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACGGACATATATGTAGATATATAACCATATGCACATGGGTGCCATCCCATCCGCATATTCATGTGTGTTGTGGTTGGCCATGTCACACCCGGCGTACCCACCAACCC:1 - chrX 16117115 3' - opus 8 2 75.86 GACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTCAATTTTTATGAATGAATTTTTACGAATGCTCGACATTGATCAGTTGGCTCTTGGTAGCATTCATTTGTTGTTATTGCCGCAACCGATACGCCC:1 + chr3L 3453529 3' - Tirant 8266 2 74.07 GTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCACTTATATTTATCATTTTTATTTATCAAGTATAAGATAGATAAAAACGCTTTTATACCCTTTTGGGT:1 + chr3R 15025698 3' - 412 216 2 58.90 GTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACCATTGTTTGGCTCATACTGTATATTTTAAAAAAGGAATTGTAATCTGCAACACCAAATTATGCGTACACTTAAAAACACTGAAGTGAACC:1 + chr2L 22257489 3' - 1360 3240 1 63.01 GACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAATATGTGCGAACTCAAAATTTCATATTTTTTCTGGGATATCGATAAAGTTTTTCTCATTTTATCAATATCTATTAATATCCCATTCCCGGTTCGGATTTCCACTAACTGAGTAACGGGT:1 - chr3L 23974862 3' - INE-1 549 1 50.68 AATAAACAGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGAATTTTAAATTTTATATGTGCGTTGATTTTTTATGTATGGTGTATTTTAGATTTTAGATGTGAACTTAATTTTGTACGTC:1 - chr2R 1000280 3' + HMS-Beagle2 7159 4 60.96 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTATGGAACTACTTAATGGCTAACAAACACTCGTCGCGGG:1 - chr3R 13225436 3' - hobo 15 1 75.34 ATAGAGCGTTGTCCACCTCAACACACTCTGTCTACTATTTTGACCGCCGTCAGCCCTCCAACTCCTGGCCAGCAGTCTCGTGGTGGCTCTTGCTCTAGTTAGTTACCATCATCAACATGTTGACATGTCTATGACTGCATGCGGAC:1 + chr2L 22012286 3' - Circe 204 2 68.49 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGGTGGACCATTGATGCTGCGGGAACAGGACGTTTGGGTGCT:1 - chr3R 14218447 3' - roo 66 2 69.92 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACCCTTGGGCTTTGGATACGGGCTAAGGATGTGGGTC:1 + chr3L 19580960 3' - roo 85 2 77.93 TTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGAAAGCTTTTGTCTCACCTAAATGAAGGCGAATTCGACTTCACTTTGT:1 + chr3L 22642059 3' + hopper2 1539 1 65.07 GTCACGCCCACACTTTTGAACAATTTTTAATAGATTTTTTTTATTTTATTCCCCAATATCACACTAGCTGACTATCGCATATGTGGGAAAGTTGATCTAAAATGGGAACCTGCTTTTGCATTCTATTTTCGTGTTCCTCTAATTGT:1 + chr3L 6272890 3' + INE-1 251 1 53.42 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATTACTATAACTTTTTAAACC:1 - chr3L 13678876 3' - hobo 48 1 54.35 GGGTATCTAATAGTCGGGGAACTGGACTATAGCGTACTCTTATGTTATTTAGTCGAGTCTTTATAATAATGCTTAATATATTTTGTATCAACATATTGAAGCTACCGTACGCATCCCTAAATCCTAATTAATTGCGCCGAATTACA:1 + chr2R 5950016 3' + INE-1 556 1 52.74 GAAATTGAATAAATATACGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCC:1 - chr3L 9469955 3' + 412 432 2 70.09 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACTAACTAATATAATCAGCTTTGTTCCCGTTTTTAATAACCTAATTTTGGGACTTCGATTTTGGGAAGGAGATAAAGTACAATAAAT:1 - chr3R 10150118 3' - 1360 37 1 60.27 GTGTGTAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTGGCATATAAATAAAATTCTATTATGTGGTTGTGG:1 + chrX 4032209 3' + transib2 2741 1 75.17 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAATCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAATGTGCAAAA:1 + chr3L 10469631 3' + roo 9028 1 52.74 ACTTCTTTTTTTTTTTGTTGCTAGCCTACGATTCGGGACTCGGCACAACATGGCGTACACAATATTTTCCATTTTTATGCCAAGATTTATTAGTTTAGCGATAAATAAAAGCTTACTAAAAAATTCTATAATTTACGTTATTC:1 - chr2L 17070203 3' - gypsy2 400 1 75.52 CGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCTGTTCCTGAAAAATACATCTAAATTCCAAATTTCAGCA:1 + chr3R 7778372 3' - transib2 40 1 56.85 GTTGGTGGCTTGAATATGATGCAATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGCTCCGACCAGCGGTAAGTGCTGAAATGTGTCCTACCTACGCGGCCAACGAAATGGGC:1 - chr3L 15171619 3' - Ivk 4989 1 60.96 AGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTTTCGATTTATTTAATTATATATATATTTCCAATTACATTATATTCTTTAGTAGCTAAGATCGCCCCACTGTGCCTGCGTAAGGGTTCTGCTTT:1 + chr3R 6555345 3' - Juan 4028 1 76.03 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAAATGAGCGCTAAACGAGCTCGAAGCCTCCAAGAGCAGCACGATTTTTTTTGGGGCTGCCTGAAGAAAGCCGCCTTGGAGTTTT:1 + chr2L 11405886 3' - 412 7090 2 58.90 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTAACTTTCAGCGTTACAGCTTTAGAACTATTTTAGAGTGTAACCTTCACTTGCAAGCACATTTAAGGG:1 - chr2R 23409029 3' - opus 164 4 53.42 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTT:1 + chr2L 12291930 3' - Tirant 8156 2 63.93 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGAGAAAAATATTCATAAAA:1 + chr2L 21910273 3' - Doc 27 1 65.75 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGGCTTTGACGTCGTTGTTTTTCCCCTGCTCGTCATGTTTTGTGTGCTGTATAGATATAGATATGGATATATAGTATGCCTTTGCCAT:1 - chr2R 15528425 3' - 1360 34 1 61.64 ACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTGGTATAATATCGAGTCCGCAAAGGAAGCAAAATGTGATTAGTCATGTCAATATCATATTTAACGATTTTTTTGTTAACGATTCATATAATTAGGGAAAGCAAGAAA:1 - chr2L 14789490 3' + I-element 5344 1 34.93 ATAGTCGAGTTCCCCGACTGTCAGATACCCGTTACTCAGTTAGTAAGAATGCGCACCCGAAATTCCATAATTTTTCTGGTCTTCCTCTTCATGCGGCTTTTC:1 + chr3L 6328262 3' - INE-1 564 1 73.53 TGTTGTGTATATAAACGTTACATCTAATGCTAAAGTTACATTTTGTTTACTTAATTTCTATCTTATATTATTATTTGTTTCTTATGAAATAACAGTTTAGGGATAATGTTTTTATTCCCCAATATCTATCGATATCCCAAAATAT:1 + chrX 23078703 3' + accord2 394 1 75.17 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTT:1 + chrX 7706826 3' + P-element 2880 2 65.00 ATATTTTATATTATTGATTTAAAATATATTTTGATATATACATATAACAGCCTGTATTACTCAGATTTCAAGTAGCTTAAAAAATCCACAAGTGAGCAATAAGGACGTGCCTGCGGAAATGAAAATCTCTCTTTCATTTTATCGT:1 + chr2R 13104970 3' - G7 1147 1 77.93 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACACGCTAAACCGAGTATCAAACATGGAAATAGACGCAAAGGGGCGAATAAAAAATAATTTATTACACATTGACTGCCGAAAAAAAGCAGAA:1 + chr3R 24564870 3' + opus 7475 2 65.07 GGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAATGCTTGTAATGGGTATCG:1 + chr3R 10736107 3' - McClintock 35 2 69.39 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTATGAAGCCAACGAAGTGGAAATTACCTTGTAAAATTTAAAAAAATCAAAATCAATATGGAAACGATTTAACTAATTTAATAATCCTTCTG:1 - chr3L 2320580 3' - roo 8695 2 59.59 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCCTTTGATGAAATCAAATGCATTCTTGTAACTACATTTTCAGCGGATTTAAGATTGATGAA:1 - chr3L 2330084 3' - roo 8725 2 60.96 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTATATTTTGTATTTTTAGTTCTCCCCATGTAGAGTCTCTTTATAGGGTCGTT:1 - chr3L 2192287 3' + jockey 4917 1 66.44 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACAACTTGC:1 + chrX 3647008 3' - 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chr2L 12893452 3' + Stalker 169 6 60.96 ATCTGTATCCATGCGCATTCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATACTCAATACTACCAACATTGTGTATTCTTTTTCTTCCTTTCTTTGTGTGAACC:1 + chr3L 22281167 3' + Quasimodo 406 2 70.14 GTTTAAAAATAAATTTAAATTTGGCGCCAGATGCTTGCAAGCAGTCCAAGCAGTGCATCAAACACACAAGCAGTACATGCCGCGAAATTTGAAATTTTACCTAATACATTAATACATTCTTACTAAGTGTATTGTATTTTTACGTT:1 + chr3L 9824516 3' + NOF 3955 1 59.59 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTC:1 - chr3R 16276323 3' - pogo 57 1 61.64 ACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACGTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTTGTTGGATATCTTTTGGAATAGTCAGCCTTGGGATTGATAAATTTTTAAGA:2 - chr3R 10030671 3' + BS 5061 1 59.59 ATCAATTTCAAAATCATTTTTTCAAGGGAATTATGTTCTTCTGTGCATTCTACCCTACCGCGAAACAATTTTAACACTTTTCCGCTTAAGCAGATGAGCGTTAATTAAAAAATCGTGAGGCAGCGCGGCGCAGCACAAAGGAAAAG:1 + chr2R 22524479 3' + Stalker4 6862 1 56.16 AGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTTGGGCTTCATCATTTCCTTGTTGATTTCTCTTTGACGTGGCAA:1 + chr3R 25328946 3' - Doc 285 1 96.77 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGAT:1 + chr3L 18253879 3' + blood 7333 1 62.69 AGCTCTGCACATATTATATGTGACTGCATGGCGCTTTCCATCAGGAACAGATTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCACAAGCGTCACATGTCGCCAGGATGAAAGGGAGCGGCAGCTTGTTGTTCATATCCTG:1 - chr2L 15914810 3' + baggins 5230 1 61.64 GTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGC:1 + chr2R 11095822 3' + diver 6034 2 70.55 GGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTA:1 + chr3L 21093239 3' - Ivk 25 1 60.00 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGATCGGAGCTGAAGCAGCTTCAGCAACAG:1 - chr3L 6355567 3' - Tirant 5 2 78.57 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAACACCCGGCCCCGCCCCC:1 - chr3L 3453572 3' - Tirant 28 2 66.43 ACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAAACTCTGTACAGTCAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAATAAAGATCACCCCAAGTAGAGAAGGAAGCCCAGCAGCCGGAGAAGGAAACCA:1 - chrX 5779611 3' + rover 162 2 68.49 TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTATGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCAATCGAATTGAATAACAATTGAATTGAAGCACAAAATTGAAGTAATTTATTTGTG:1 - chr3L 26741227 3' - F-element 69 1 70.16 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTC:1 - chr3R 9125650 3' - Doc 58 1 51.03 ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTG:1 - chr3L 7837186 3' - jockey 4837 1 68.84 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCCCCCCATTATTTGTGTAT:1 - chr2R 18611827 3' + P-element 2807 1 18.70 AAAAACATTTCAATTGTAGATTCCAACTCCTGCTATAAATATTTCTTGATTTTAAATATAAATCCTAAAAAGTGCGGCGAAGCTAACGTACAACGAGGCGCTTAAGAATCTGGAACAGATTTCGGAGGACATTCACCGTCAGCGT:1 - chrX 14830191 3' + TAHRE 10177 1 49.66 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGATCGGAAACATGCTATTGATCCCAAATTCTATCAACTTACACTAAAGGACACGTAGAAGGTGGCTCCTGCCTTAACGTACTGATGGT:1 - chr3L 6095441 3' - transib2 32 1 63.70 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTTGGCGTCCTGATTATATCACATTGATGCAAATGTAGGCCAAAGCACGACGAAATATCTTTACCTGTTAAAAC:1 + chr2R 9294428 3' + Tirant 8474 2 60.45 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGT:1 + chr3R 19436078 3' + roo 9002 2 65.75 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAATGTGCTAATTTATAAGAAAAACAAT:1 + chr3R 19436141 3' + roo 401 1 78.08 CGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCACCGTTAGCTGATGGATTACTCTCGTTCAAATGTCGAA:1 + chr3R 7616842 3' - Stalker2 7279 2 59.70 GGCGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGGTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTCCGCCCTTCACGACAT:1 - chr2R 11263995 3' - jockey 4745 1 65.07 AAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCCACTCAAAGTCAGCACAGGC:1 + chr2L 11554572 3' + roo 9036 1 53.04 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACGGAGCCGAAAAGAAAACTCTTTTGGGGCATTTTCTGCTTCGTAG:1 - chr3L 486704 3' - roo 49 2 53.42 GCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGTAATTAGAAGCAAGCTATCCCCAGGGCAGAATATCGATTCCGGCCTATCAAAATGCCATTGACTAAGCAGAA:1 + chr2L 8613668 3' + roo 8902 2 50.68 AGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAATAAAGTTAAAATTGACTGCTTTAAAAGCGGCAGAGAGCCAATTATAGCCAGAATATAATACTCTGTAAGATAACATAGATTTAACAGAGTTGGCTAAGTAGTATTGAAAACTTTAAC:1 - chr3L 23869167 3' - Cr1a 4287 1 67.81 CGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATATGAACAATGTATGTACATACATATGTATTTAACCAGCTTCAAATGCTGAGCAACTAAAAGCGAGTGGTAAGAGAGTCACAATTTGAAT:1 - chrX 887260 3' - Quasimodo 26 2 68.49 AAAAAAAAAAACATTTGAAAAGACGTATGAAGAGTGCAGTAATTCTCTTACATCAATTAGAACGAAATACAAACAAACGTGCATATATGGTTCGGTCATCATCATCATGTATGCGTATATTTCTGCATGTAAGTGTTCCAACCAAG:1 + chr3R 11049905 3' - FB 175 1 70.55 GTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTATTTTTTAAGTCGAACAAATGATCCATCTACATCTCCATAGCATATATCCCTATATTCTCGTGCCA:1 + chr3R 28092664 3' - McClintock 469 2 69.63 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACTCGCTGCG:1 - chr3R 20450411 3' - hobo 45 1 56.39 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCT:1 + chrX 21403464 3' - roo 8740 2 77.04 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTATACTTATTTGGTTTTCCGTTTTAAAGTCAATTTCGAAAATAACAATACAGACCAATCAGAAAACTATACTTTATACAGTACAAAGCAAAAAGAATTCTGAAGCAA:1 - chr3R 21216792 3' - 1360 16 1 67.12 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAATTAATCAACAATATTGACTTAAAGCTGTCAACTGAATTAAATT:1 + chr3L 11395999 3' - I-element 75 1 69.18 CAATGAAAATAAATTGTACTTTTGAATTTCAATGCAAAAATATAAAGGCCTTTTATTAAAATTCATGGATTTTTTTTATTAATATCTATTTATTCATATGTTTTTCATCATCGCCATAAAATCACCTCGATCTCGGGGATACGCAA:1 - 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297 45 2 64.91 GTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTCTAGTTTTTAGAATCGGCACACAGCGTCAATTTGTCTACCGTTTTGAGTAAATACTTGTGCCTATAAATTAGCAACTAAACTTTCATTTCTC:1 + chr2L 19876730 3' - Doc 108 1 54.11 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAA:1 - chr3L 19031217 3' + roo 355 2 51.37 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGAAAAAGCACAAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAATATTTCGCAGCTCCCATGGAAAATCGTAAAAAGTCATAAAATCATAATATAAATCCCATTGAAATTACAAAAA:1 - chr3R 6015061 3' + Juan 4171 1 45.89 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGATATTGCTTCACAGCTGAGGTGTCGCTGAGTTTAACTGTCTCCAAAGTTGGCTTATCTACAAAGTATAAATTTAGGAATTGCCATCAATTA:1 + chr2L 22319400 3' + Transpac 282 2 66.44 GTTCCCTCGGTACCGACTATTACACATATTACACATAAATAATTATCAACATAAATATAAATATGTAAATGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACATACGAATTTAATTGGTTATAAAAGTATTCTAGTATGTTATGATATCA:1 + chr2L 17857308 3' + 1360 2913 1 75.34 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGTATCATAGATATGTAGCATATCATGGTATATGTAGCATATACTTTAGGAC:1 + chr2R 17169290 3' - hobo 69 1 66.90 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGAAAGACGGCAGCTTAGGACCACCCAAAGAGGTCACTCCTCATCGGTGGCCATTATGACATCAAA:1 - chr2R 9340114 3' - 412 57 2 55.48 TGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGATCATTGGCAAAAGTCTGGTCATCACGGCT:1 - chr3R 9113253 3' - 1360 482 1 73.10 TTTTTAAAATTATTTTATAGTACTTAAGCTAAAAGTATTATGTAAATTTAATTACAATTCGCCATTGCACAATAAAACTTAACAGTTTTTTTTATGTCTTTCATTGCATCCGTAGGAAAAGAAATATGTACATCTTTATCACTTTT:1 + chr3R 26170257 3' + 1360 3093 1 54.11 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATAAAAGTTCTACTGTAGCTGGGAAAAACTGTCGGGCAAATGTGTTGCATACTTTTAGGCAGCCACCGCACATGCAATCCCCTCCATGAATCCCCACCA:1 - chr3R 25388568 3' - BS 5012 1 71.43 AGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCAGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACATGCATGGACCATTGTGACAAATCATGGTCTGAAATT:1 + chr3L 12909524 3' + F-element 203 1 71.65 CTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATGATTATGTAGCATACTTTTCAGGAGAGTCCTTTTAGGGCAGAACTCA:1 - chr2L 15013203 3' - BS 4910 1 65.07 AGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAAATCTGTAAGGGACATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAACAGTTGGAAACGCCGCTGCTGGTAGACCCGACAAAGAG:1 + chr2L 5237379 3' - Cr1a 4218 1 71.92 AATACAATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGA:1 + chr2R 2875206 3' + TLD2_LTR 70 1 51.37 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTG:1 + chr3R 8217983 3' + P-element 2787 1 17.81 ATATACATACATATATATTGTTTGATTTTATTTGAAACTTCACTCGTCGCTAAATAATCTGCTACGTGGAGAGTGTCGACTATGCGATACCCGCTACTCAGCTAATGCGTATTTGCATTTTTTTAGTTTCTGTTTTTAGGTTTTGT:1 + chr2L 11434382 3' + INE-1 70 1 69.18 AGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAACAAAGCTGGCAACAAATCAAGGTAATCAACATGAAATCAATCGATTTGCTCTTCTAGGCGCTTCCAATTCGATTTTCCTA:1 + chrX 21490805 3' + Rt1b 5106 1 69.63 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAACGG:3 + chr3R 12363805 3' - jockey 4742 1 60.96 GAAACTTAAAAATCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAG:1 - chr3L 18183076 3' + Tirant 346 2 54.79 CTTCATACATTTCCCTTCTTCAACATATTCTCTAATATCTATACACACTGGCGTTCACTACATTTTCATCTCCCTCTATCCTCTGCTCCCCAAGAAACCGCAGCAGCTGCACGGCGAGAAGTTGTTCATTAAAAACGGTCACTTA:1 - chr3R 15098117 3' - invader4 2976 2 52.41 AACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCTCCGCGAGGAGCCTTTCACTTTCCATTCCAC:1 + chr2L 19241569 3' + Doc 222 1 74.17 AACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAATATATTAAAATAATAAATTAAAATGAAAATAAATAAAAGTGAATTTAGTATTTCCATTTTAAGCTCATGTAAGCTCTTTAAG:1 + chr2L 16707959 3' + Stalker2 7612 2 56.85 AACAATGCTGACGCGCCCAATATAAGTTCATCACCCCATCCTAGTGTCATGGCCAAATTTCCTAAATCTATCTGTGCTCCCATTTCTTTCAGGGTGTCTTTGCCGAAAATTGATATGCAAATACTGTAGAATACT:1 + chr3L 5560045 3' + gtwin 60 2 51.85 GGATCAATAGCCAAGTCGATCTGGCCATATCCGTCTGTCCGTTTGAACGTCGAGATCTCAGAAAATGTTTACTTACTTCAGAATTAAATGATGGACGAAAATGCTTATGCAGTTCATACTCTCAAAGCGATACGGAATTGCGGCGA:1 + chr3L 4369244 3' + INE-1 97 1 45.21 TTTTTTTTTTGTTTTTTATTATTGTTTTCCAGCCACTCTTTCAGAGA:1 - chr3L 20545320 3' - Rt1b 5150 3 93.62 TATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTT:1 - chr3R 14049338 3' - transib2 64 1 61.97 ACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACT:1 - chr3L 18484383 3' + hopper2 1554 1 57.69 ATGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAATATGTATATATGTGTGACAGAAAAGAGACTAAAATAGATTCTGCGCGTAATTGGAAACACATAGCAAATAGTTCTTAATCATAACAATAGTGTGTTCCC:1 - chr2L 13138931 3' - McClintock 12 2 76.71 GCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTATTCATACAAATTTTGTTTTATAAGCCACTTT:1 + chrX 13540308 3' + roo 8921 2 50.68 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTC:1 + chr2L 7652266 3' + roo 331 2 72.60 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACAAGTCCGCAGTTTCGGTGGCATTTT:1 - chr3R 28453769 3' - P-element 99 1 43.48 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTTACCTACTTACATAGTTGTAGTCCAAGTTTGCGCTCTGAAAAGTATGCAACAAATTACGACAA:1 + chr3R 27374483 3' - jockey 66 1 55.48 GCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATTCTTTTAATTTGATAAATAAAAAAAAAAGTATCCTGACTGAGTCAGGTCTCTATGTACCTATCGTGGTA:1 - chr2L 16746103 3' - micropia 139 4 64.14 GCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCTTAAGTAAGTTAAATGTGTGTACCTCATCCGATTTTCGACGAACGGTCTTCAATGGG:1 + chrX 14137297 3' - 3S18 5831 2 60.27 ATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTAAATGGTAAGCGATCTAACTTCAGACGCATTTTTAGCAGCACTCAGAAGATTTATTGCTAGACGGGGAAAATGT:1 + chr3R 19447389 3' + roo 22 2 50.68 ACTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAATTTAGACACATAACACCTATATGCGCCTTTAACCAGTGTAAGCACACCCCGATTCTAGAAGATA:1 + chr3L 8183288 3' - copia 4792 1 56.16 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTATCTAAGCCAAGTTTGTTATGTGGGTCGAAATGCTGCGACTGCTAGCCATGCCATTTGCCCAAATGAAACTAATTTTGT:1 + chr3R 25804234 3' + mdg1 7418 2 56.85 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCTGTTTCGTTCTGGAGTGGTATTTTCTAATTCATTTAAATGTTGCTAATATTTAAGGAATTTTTAA:1 - chr3L 8658711 3' + roo 9043 1 56.67 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATCTACAGTATAGGGTCTCTACGAGTAATAATTTTGCGACACAGGCTGAA:1 - chr3R 20872108 3' + 297 327 2 71.23 AATAATAATATTAATGTTAATTATTACAATCTACTATAGCCTTAATTTAGATTAACCAGCCCTCTTTTGCGAGACGTTAATTTCGTTCTATTCATTCTCATCTCAGAGTACACGGCAATACATTAGCCTTCATTCTTTGCAGCTCC:1 + chrX 7374292 3' + mdg1 43 2 73.29 AGCTGTAACAAAACAATAATACAAATATAACAATTAACAATATATAAATTTGAGATCATATTTACAACATTTTGTTGCATTTCGCTGAGCAAAATGTTGCGGCAACTGCATGTAATACCCTTGGCGTTGCCAATTACGTGGCACTC:1 + chr3R 7262494 3' - BS3 1662 1 60.96 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAGTCTTCAGATACATTTAGTATCTTGAAGCTTCAAGAAGTTTTCTAAGATGATTAACCATAGAGGTCATTGATCCTTACCAAAACGATATCCTT:1 - chr3R 6135940 3' + mdg1 393 2 64.38 TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACA:1 - chrX 21403420 3' + roo 316 2 78.08 ATACTGTAGACAGAGATACGATAGATGCAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAACCAGACAAAAAGGCTGCCAGCAACGCGTAAGCAATAATTGCAATTTTATTTTATTTTCCTTTAAAATGGATCCCATTACGAGAGCGAGAAGAA:1 - chr3R 26752610 3' - Circe 96 1 60.96 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCA:1 - chr2L 13629053 3' - Tirant 49 2 52.45 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATATATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAGCTCAAAGCTACTATTACTTTTGGGTTAGTGTAGCCCAAAAACT:1 + chr2L 16562198 3' + opus 490 2 63.38 AACAAAATACATTTTTATTAGTGGAGCACACTGCAAACACTGTTTGTGTGACCAAGGTGTGGATTCAACCCCTCAAACCCCACCGACCATCACCCCTGTGAAATGAGAGTTAAGCCCAACAATGGACGTA:1 - chr2L 18328637 3' - Dm88 4281 1 75.38 AGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCC:1 - chr3L 7791918 3' + Transpac 221 2 77.40 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGCGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTCTTGCTTTCCGGTTTTTTGCAACACGAGCC:1 + chrX 21403495 3' - roo 17 2 64.49 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTA:2 - chr2R 21690478 3' - 412 7133 2 72.60 AATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCACAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGAT:1 - chr3R 16582513 3' - BS 5058 1 76.03 ATTTTATTTTATTTTATTTTTTCCCTAAAGTCATAGAAGTCGGCACGTTGAGTTGGTAAGTGGAATGGGCGATTCGGAACCTTTATATATAGCATATACTAATGTATTCCGCAACCACTTCAAAAGGACATAAACATAAGCGCTGA:1 - chr2L 2330566 3' + transib1 1900 1 76.03 CAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAG:1 - chr2L 23068868 3' + 1360 3301 1 79.45 CACAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATACTTGTCTGTAGAGTATTCAGCTTGCGAATAACTAACGTTATTATTATTAGTATTATTATTAGTTATTATTATGAAAAAAGATATTCCTCGAATCTTCATGAGGCGAATCG:1 - chr2L 7261349 3' + 1360 370 1 72.60 TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGC:1 + chr2R 21439492 3' - jockey 81 1 75.81 CGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTTTACTACAAAGCACTACTCTGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACACAAATGGTTTGGATGGCAAAGGAAATTTGAGAAGTTGGAGAAGTCTTTGACCGGAAATGAACATTCAA:1 - chr3L 2181060 3' + Doc3-element 107 1 53.42 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACATTCTCGGAGGGAAACTTGGTGGTGCTGCCTCAGC:1 - chr3R 24499518 3' - blood 7093 2 76.06 CATGGACACACACACACACACGCACACCCACTCACACGTACATATCCTGCGATCGACCGCATTATTGTCACAGGCGCTTCTCGCACGTTATAATACCATCGAAGCCTCTGCATTGTGCAATTGCATTTTT:1 - chr3L 5505037 3' + accord 7026 2 71.54 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTAGCCCAGCAAAATCATACTGAATATATTTTTGC:1 + chr3R 17492877 3' - jockey 4800 1 62.75 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATATGTAAGTTCCACAGAATGGAAAGGTCATCCCTTACATAATGGCCTCATTCTTCAGCTAACCAACTTTATGAAGTTCAGTTTTCATGTAGATTATTTTAATT:1 - chr2L 21691769 3' - 297 6592 2 74.66 GCTCGATCTTTATGTCCACATGACTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTGCCAAAGTTAAGTACATAAGAGCAAAGCAACGTCCTTGAAGCTGGAAGAAATTGTTTCCTAATGAGTTAGGAAAAGGGTCATAAGATTAATGACA:1 + chr3L 10789890 3' + Tabor 197 2 57.64 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAAAAAAGTGTTAAAAAGCCGTTAAATAGGCG:1 + chr3L 13695382 3' - hobo 42 1 46.58 AAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTC:1 - chr2R 7599175 3' - diver 5976 2 74.66 AATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACGCATATTGCATATTATTTAATTAGCAAAGGCCTTCGGCGTGTGTTTATATTTTAATTAAA:1 + chr2R 7599246 3' + diver 6049 2 61.64 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACAAACATACCATGTTGGAGATCGAACGCCTTGG:1 - chr2R 18611935 3' - P-element 8 2 56.92 AAATCATAAAAATAAAAAAAAAATAAACAAAAAAGAAATTCTTAAGCCACAATTGTTTCTTCATATCTTCTCATAACTTTCTTTTGCCTAATTTATTACCTTTTCCAACTATCTTCTCGC:1 - chr2R 10927100 3' + Doc 4690 3 42.50 GCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTAGCTTATGACCAGGTTAAGGTAATGTCCATTGGATACTGTTGCCTAT:1 + chr2L 6388144 3' - jockey 80 1 65.07 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCATACTACTAACTAATGCTACATGACCCCG:1 - chrX 1103569 3' - pogo 18 1 71.92 AGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTGATGGATTACTCTCGTTCAAATGTCGAATCTTGTTAGCACAGCTTCCCAGCCACCTATC:1 + chr3R 7616873 3' - Stalker2 8 2 79.58 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGGTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGGGAGAGGGAAAAGTGGCTCTTTAATGGGG:1 + chr3R 23601749 3' - jockey 88 1 70.83 CCTCATTTTTTTCTTTTTTTTTTGCCAACTTTCTGTGCGCCAAATGTTTGCCTACAATTTCACAACGGCCCACAGTGCGAATGAGAATTATTTCCTTGACTACGTGCGCTCA:1 - chr2L 10603066 3' + hopper 139 2 84.82 AGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTGCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATCAAAAACGAAATGCAGCTTATCAAGTGCTTGGTTATAATTCAGCTGTCCCTCTTGCTGGTGGAGGAG:1 + chr2L 453297 3' - F-element 4461 1 53.47 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCTTCCTTACTTTTTTCATTTCTAGCATTGGCTGGTTTTTTATCAATATCCCTTT:1 + chr2L 16331041 3' + roo 358 2 60.31 GGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACGTGG:1 - 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chr3L 6599393 3' - roo 55 2 58.22 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATTGTAAGTTTTACTTAATGCAAC:1 + chr2R 21870265 3' + copia 5064 2 60.96 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCATATGGTGTTACGAATCTTGTTTTTCTAGTGTCTTCGCTTTTAAAAATCTGATTATTTTTGTTCCTATTTTTGGGTTGTTCAAAAGTTTTGTTTTTCCACTTTTATAGGACCATGGCTC:1 + chr4 782856 3' - 1360 43 1 64.38 GATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACCGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATAGATAGTGCTTATAGGTTTCGGTTGAGCTAGAATTTCCTTCTTTTTTT:1 - chr3L 7749215 3' + roo 178 2 60.00 CTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTTTCAGAGTAATTGACTTAAAAGGGAAACATTAGTGATCTCTGTAAAAACTATGC:1 - chrX 5853715 3' - Tirant 8338 2 61.64 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATCTATGTACGA:1 + chr2L 17626694 3' + roo 357 2 55.48 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTG:1 + chr3R 11095859 3' - 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chr2L 13629038 3' - Tirant 37 2 61.64 CGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTGCATTTTTTGTTGTATTTCTCACCACCCATCGGCCAACGCCTTTTGTGCGTGCGTGTTCTTCCGATTTGATTTTCCATTTTTTAT:1 - chrX 8327743 3' + hopper 142 9 77.06 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTG:1 - chr3R 25050029 3' + P-element 2786 1 16.44 GTTCTAGCCAAAACTTGAACCCTGGGATAGAAAGCTTTAAGCTCGCAAACAGCTGTTTGTGCGATCGCGTGGCAGCTGGGCAGCGGAGCCCCAGTTCGAGAATTGCGTTTCGCAATTGTGAGAATCGAGTATTAAATAATTCT:1 + chr3R 23469887 3' - X-element 274 1 71.33 AAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGAT:2 + chr3L 7801322 3' - Transpac 5070 2 49.32 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATAATAGTTATCACTTTTCCACTTGCAACCTGATGAAGTGAAACATTTAATCATCCTTCGAGTCTTAAGAAACTGACTCATTGCCCAGGA:1 - chr2L 2895520 3' - Burdock 6164 2 63.70 AGGTGAATGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATATGTGTGCAAGTAATCAACCCCATAAACAAAGCACCTTCCAACAGTTTATAAACAAATTTCATT:1 + chrY 378916 3' - 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chr2L 10450247 3' - opus 185 4 76.03 AAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGCTCATGAATATAATCAATGTCAAGAGCGACGCCAAGTGTCGTCTGGGGATCGCACTCGCCGCGCTCTCGAATCC:1 - chr3R 22640206 3' - P-element 96 1 49.66 CAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGCAGCATTCGTTTATCTTTGGCAGCGCAGCCGTTCTTGTAAACATCCTATGACCTCGAACTCTTCAGGTTGTTGTGGTTTTGGTTTCTTCTTGCGCGTCACGA:1 + chr3L 2050229 3' + 297 6634 2 66.44 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGGTATTGTTTTTGTGCATATTACATCTGTACGCGTAAGCTTTCGGTTCG:1 - chrX 3322712 3' + roo 9000 2 65.75 TAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATTTTAATAGTTCGCATTTCATTCAACCAATGAGGCCCAAGCACCATAATTAAGCTGCCCAATTAAT:1 - chr3R 31483643 3' + I-element 5295 1 55.48 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTGCCGGGAAATCCGCACATAAATCTTACCGA:1 + chr2R 1923606 3' + pogo 2072 1 65.75 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAACG:1 + chr3R 12363804 3' - jockey 4742 1 61.38 GCAGCGCTTGTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTAAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGATGTGTTTTGAATTCCATAAGAAGCGCTTAATGCAGAAAAAGTTACTCCCATAAACTACCTTTCCAATCTAT:1 + chr3L 16541838 3' - rooA 7469 2 50.00 CAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCATGCTCTTGATTTCTGTGCTTGAATCCCTGAATCGTTTAGTCGAACCTTTTTGCCTTTTCCCCTTTTTGTTGTCCTGAGTTCTTTTGGG:1 + chr3R 12770221 3' + Doc 284 1 58.90 GTGGGTGACTTATCTAGAATTGGCGTGAGTGGCTATCTGTTGATTCTGTCTTAGGTGGCATAATTGCTCTAGAGAAATTATTATGTCCATTAACCTCGTTGTTAGAGCGATGCCGCTGTCCGTAA:1 + chr3R 3919749 3' - Idefix 160 2 80.80 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGATTGGGCACGATTAAGTGCTCCACCTCGGTGCG:1 - chr3L 363476 3' - blood 7093 2 76.43 ATAGGTTTTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTCAATTAGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTTTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAATCCCACGGTCGGTTAAAGCTCGCGGAGTAGGTGGTCTGC:1 - chr3L 22789033 3' + invader2 4627 1 73.29 AGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTTGTGTCCGCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTCGGTTTCACGCATTCAACTGCCTTGGGCAGCGAAGCGCATGGGGTT:1 + chrX 17422483 3' - 1360 495 1 61.81 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTACACCTGATGTCTGAGCAAAGAGGAGAAGAGAAAACTTGCACTTAGGCACGCTTATGTAATGGTATGCATATTGCATTATGCAT:1 + chr3R 1267800 3' + P-element 2849 1 60.27 CACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTATGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATTGGACTTGGGCCAAAACTTCGAGCAGTTTAGCCAGCCA:1 - chr2L 19864018 3' - R1A1-element 72 1 72.60 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTTTCCGCAGATACAAT:1 + chrX 1103740 3' + pogo 2064 1 60.27 GACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCATTAAATAACATCAAAAATGTGCGGTGAAAGTTATCTTCGATTTG:1 + chr3R 13349626 3' - Ivk 20 1 70.34 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTAGGCAAAGAATGGAAAGTGAAATATTACTGGAAACTGATTGAACCCTCCTCAGACATTGACCAATTTGCAACTGGCTGTCAA:1 - chr2R 10160846 3' + transib2 2787 1 56.16 AAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGTCCATTGGTGTCTGAGGTCATCTTGAGTGATTTGTTGTTTTTACACTTTAAGGCTTTTTCGTTTTGATTTTATGAGCCTATT:1 + chr2L 14501249 3' - 1360 38 1 59.59 GTGTCAATGCCTGCCCAACTCCAGTCAGCCAATCACGTAGCGACTTGATATGTGAAAGAACTTCCAACCGCACCGATGGATCCCTGAGGAAAACGGTGTGACTCCGCGCTTAATTTGCACACAGCGTAATATGCGTAATCCTTCG:1 + chr3R 3072571 3' - R1-2 2978 1 61.38 AGGATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATTAAATTAGCCACCCACGCACACATTAGCACTCTCGAAAATCCACACACACACACACTCACATACTCTCGAGCATTTGTATAACT:1 + chrX 21091502 3' - mdg3 5336 2 50.00 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCCGAGTTCCAGGATCCATAAATAAATGTAGATTAGT:1 + chrX 388349 3' + 1360 3344 1 56.16 AATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAGTTACTGTGTGTGATGACCGTATATGTGTACATCAATCGCTGATAAGGCACCGGGATCATCCATACACCCTAACTCATAAAAATGGTAAATTA:1 + chr3R 22133278 3' + gypsy4 442 1 67.81 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCCTGCCCGCTCGAATTTCGCTTAACATTATTTAAAGGTGAAGTTCTTGG:2 + chr2R 25106147 3' + roo 361 2 54.11 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTCTTTCATTTTGTTGGCAATCGATTCGATGGCCATT:1 - chr2L 19407007 3' - Doc 31 1 53.42 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTGGTATTAATTCTTCTTATTGTTCATATCCATTCAT:1 + chrX 19959875 3' - roo 85 2 81.51 AAAATTAATAACTTCAGAACGGGGAGAGATATTTTTGCAAATGTCCCTATGTGTGTGTATTGAATACAATACAAAAGCCTATTGATCTGTAAGAGCAAAGAATATGACTAATACATATGCAAATGTCAACGC:1 + chrX 22906776 3' + Transib-N1_DM 33 1 64.39 AAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAAGTATGGCAATATTGCTGTTGCTCATTTTAATAAAATGTTTTTTGCAGTGCAAAACAGTTCACTG:1 - chr3L 13706311 3' - F-element 4380 1 71.23 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAAGTGGCAGTATCCTTGAATCAGGTGTTAAG:2 + chr2L 3232008 3' + roo 390 2 70.55 AAAAAATCACCAAACAGCACTGCGAACAACACACGAAATGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACAAGAAAAAAACCTATTGAAAACCAAATGGGAATTATCAAAAAGGCAAAGTCCGAATCAAAAGCTTTTATGTACTATATGAAAA:1 - chr2L 16199280 3' - Cr1a 243 1 58.22 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAA:1 + chr3R 25795816 3' - jockey 72 1 69.77 AACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGATATTGCTTCACAGCTGAGGTGTCGCTGAGTTTAACTGTCTCCAA:1 + chr2L 22319354 3' + Transpac 5155 2 68.49 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACAATGCATAAAATCTGAGCGAATTTAATGAAAAACTTAAGTGCTACGAGGGTGTTCGAGGAAAATCCAAAAGTGAATACAGAAACTCAACGATACCCA:1 - chr3L 23773154 3' + roo 9049 2 49.32 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTC:1 - chr3R 9125665 3' - Doc 63 1 58.52 GTCGTCTTCCTCTTCACAATCAGCACAGTCTGCAGAATCGTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATGGGACCACCTGTTTAGATATCCTTCGGACAAAGCAGTCCGGGTAGCGAGACAAAGA:1 + chr2L 19098247 3' + hopper2 60 1 54.40 ATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGAT:1 - chr3L 18253812 3' - blood 7099 2 77.40 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATTAGATTAAATGACTTAATATTTTTTTAT:1 - chr3L 18253763 3' - blood 7050 2 58.90 ACCTTCTAGCTTTTATAGTTCTTGAGATCTTGACGTTCGTACGGTTACTCTACGAGTAACGACATCTCACATTCACTTCCCACTGGTATCTACGTTACTTGGTTTCAGCAGAAATTTTTAATAGGAAAAATTGACACCTTTTACCC:1 + chrX 11698244 3' - INE-1 157 1 51.37 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAAATGTATTTATATATATATTTTTTTAAATGGCATTGCTTATTTTCTGAATCTCAATCTTATTGTTCGCCGTG:1 - chr3R 7507124 3' - Doc 50 1 52.74 CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACTAAAACCTCTTTCCCATATGGCAGCCAATAATTTGAACTATGGAAGTTCGACTGTATTTCCGTC:1 + chr3R 19880657 3' - FB 58 1 57.93 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTAATTTAGTGAGAAGCAGAACTATGAAAGAAGTTTTCTTGGCTCACTTTTAGGGTTTCACAGCAGGCAAGTGCACAAGAAAATTATAATAATCTGGACTAATATCTGT:1 - chrX 7446152 3' - jockey 4684 1 45.21 ATGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAA:1 - chr3R 22341159 3' - hopper 123 1 78.77 ACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCATTAAATAACATCAA:1 + chr3R 13349596 3' - Ivk 51 1 49.32 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTATATGGTCGTCTGCGGATGTGGATGCTG:1 + chr3R 13437274 3' + hopper 1382 1 63.01 GGCGGGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTAC:1 - chr3L 6355603 3' - Tirant 13 2 61.90 GAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAAGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGGCGATTTTCTGGAGCGCCGTTTTTTCATCAACAACAACCTACAGGT:1 - chr2R 16025189 3' + Quasimodo 485 2 66.91 GGCTGCACCCGCTCACGCTCTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAATCAAATCTCCGGCGATTGCACTTGGCAAAGACCGGACCGCAAGCACATGAAGCGCACGTCACCATTTGTGCAATCAAACATCGGAATGGC:1 - chr3R 22816769 3' + F-element 470 1 64.75 GGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGAGCTATAGAGGCAGAGAGAGTCAAAGAGAGAGCCGCGGCGAAGGAGAAAGAAAATAATATCGTGGCAAAAGCGAAACGGCGAAAAAGTTCAGAAACAAACTTAACGTGAT:1 + chr2R 8666171 3' + P-element 2877 2 78.77 TATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTTCGATAACCAACGAAAAATATTAATTTTACTTTCCAGAGTCCACCTTTGAAGGGACGCTTGGC:1 + chr2L 17641986 3' + P-element 2730 1 49.59 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTAGGTAAACCGGTTGGTTGTTGTGTTGTACTTGTAAGTATGTAGACACATACATACATAATCCGCCTGCTCCGTTT:1 + chr3R 7089583 3' + P-element 2883 2 75.96 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTATTTTCATTTTTGTATTTCACCTCAAGTATCACACTGATAATAATTGATTAAAAATTTAAT:1 + chr2R 1373230 3' - pogo 32 1 63.70 TGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGCGTGTGTGTGTCTATGATGCAAGCTTTCGCGAATTGGTGTGCGAAACGAATGCACTTGTTGTTGTTTTCCATTTGCCTGGC:1 - chrX 12905378 3' - Tirant 11 2 77.62 ATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGTCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTATGGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGTTTCATTTGATATTGTTTGTATTGTCGTAGCAATGTATACAAGAAGAGCAGAAAGAA:1 + chr3R 15173005 3' - Ivk 203 1 60.96 ATTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAATATAACAACAAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAAGGAAAAAAGTATTCAACCCAATAAATCAAGTTTCCTAACTAAAGCCTATTACTAGAGAACTTATATTATCTAAT:1 + chr3L 12926674 3' + 297 368 2 54.79 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGCCACTAGCAGTTTGACAGCCACTGGGAAGTGTAA:1 - chr3L 2425900 3' + hopper 1380 1 61.05 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAA:1 + chr3R 11151887 3' - mdg3 81 2 72.60 CAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAGCTTATTTAACATTAACTAAGTGATAGTGTTTGTGATTAATACTCTAATAAGTTCATTTGTTATGGAGCATCTCAGACGGGATTGGACCACTTCACATCGTAGCTATCGGTACAAGTAGGA:1 - chr3L 9640789 3' - Doc 4637 1 44.52 GGCGAAAAAATCGTGTGACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAGTGCCGTGCTTCAGTTCTCTGTTGTCCAGCACAGCTTATTTTTATTTCTTTTAGTGTTATTTTAGAAT:1 + chr2R 12489918 3' - 1360 43 1 74.07 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCCACTCAAAGTCAGCACAGGCCACAAAGTCG:1 + chr2L 11554582 3' + roo 351 2 54.79 CTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATAATTTATTTATTTTGAAGTTATTGATTTTGGCCACAAAAAGGTTTCCATAGTGCAACGTAAAAGTCAAGCCGATGACCAGCCTGACACAATATGTACATATGTACATCTCCCCA:1 - chrX 22575915 3' - INE-1 90 1 63.70 AAAAAAATAAATAAAAAAATGGTACAAAATAGTTAATTAGGCAACACGAGCATTTGATTTTAAAACTTTTAATTATGTCCGAAATAAACAACAAAGTTTGCACAAATTTTTGTTATTCTCCCCCGTTTTCATTTCCATTAGAACTA:2 - chrX 15247014 3' - hopper 141 1 69.18 CTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCTTTTCGCTGCCCCTTATTTGCGTTTTACCGGAGTTGCAATGA:1 - chr2R 18689120 3' + Burdock 6352 2 58.90 GATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACACTATTGTCATATTCATAATTAAAAGCAATAATGGACGTTGTTGAGTTGTTTTAACAAGCTTTCCATTACCACAGCAAATCTGTTGC:1 - 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chrX 4320662 3' + S-element 126 2 66.44 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATGGACCGTGAACCGTCGTCGAGTGTGTGCGTATTCACTCTTTGTTTGCAGACTTTTAGGCGTTCGTCGT:1 + chr2R 17332232 3' - jockey 61 1 52.74 GGTATTTCATATTCCGTCCTGGAATTTATGGTCTCTGGAGAGTTCCGGAGCCATACCGGAGGCACTCCCCCACCATTGACGGCCTCTCAGTCGACCAGTGACCTGGGCCACGACGTGGATATGTCGCCGCCAAAGCGCGCCCGC:1 + chr3R 17084007 3' + Circe 352 1 56.25 GTCTAAGGCTCAGCTTTGGCAAGTTGTGCAGGATGCGTGGGCAAAAGTTGCCCCCAACGTTGCCAGGACCTGGTGGTTTCTGTATAGCTATCCCCGCCGTTTGGCATTCGCAATGCTCCATGGCAACCCTGGCCGGCCC:1 - chr2L 18499906 3' + HB 1212 1 54.68 GCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAGTAACGGAAGTTGCCGCTTATTGTTCTTTGCGCTCAACTTCCCGATTGAACC:1 - chr2R 5082925 3' + mdg3 5264 1 58.06 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCTACATTTCCATACATATATATATATTTATTTTGAGTGAGTTT:1 + chr2L 17380700 3' - hobo 44 1 66.07 CGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATGAAAATTGTGAAAAAGATGATGACCGATTTTCAGAAAAAGATCGTTCAAATG:1 - chr2R 5237674 3' - Doc 4 1 71.23 GCATAAGCTTCCCTTTTAAAGGGAGGGAAGTAAAATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTAACGAAACTTG:1 + chr2R 6271507 3' + rover 6924 1 79.02 ATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAGCCCGAAAGTGTGCTACACAAATGGATTCGCATGATTCT:1 + chr3L 22339478 3' + hopper 1344 1 69.01 CAAGTTAAAACAATAAACAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTGAATGTGTTTTAGTGGATTTTTTTTTTATGAGGAGAGGTCAAATCGTATGATGTATTTTTGTAATAGCAGTTCGTCGACT:1 + chr3L 23665513 3' + Porto1 182 1 60.27 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCATACTACTAACTAATGCTACATGACCCCG:1 - chrX 1103569 3' + pogo 2083 1 71.92 ATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCAAGTTCTTAGGGTTCTTGTGATTCTTCACTCTTGCTCTGATCATTGAAAACAG:1 - chr2L 4640177 3' + mdg1 7103 2 63.70 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTATGCAATGCAATTTGATGTCTTC:1 + chrX 6633004 3' + P-element 2810 1 18.40 AGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGT:1 - 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Max-element 8259 2 67.59 ATTCAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACACATAATAGGCAGAAATTCTGGTGTTCTTCGAGCAGGAAATTTATGTGACCAATTTAATTTTTTAAATTACCACATAGAATTCCTTTTTTCGTTTTTAATTTTCATAAATTTCAC:1 - chr2L 22096940 3' - HB 1478 1 67.81 CAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATCTCACATGCATTATCATTCGCTGAATTCCAGGGCCAACTTCCTTTGCATATTCTCTTATTTAGTTGCCATTTCTGACATTGATTTGATGTGGCTTCC:1 - chr3R 19449246 3' + roo 8616 1 67.81 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCTACATTTCCATACATATATATATATTTATTTTGAGTGAGTTTGTTATATTCTGAAACAGTTTTCGCTAAACTCCCTGTTTATGG:1 + chr2L 17380742 3' - hobo 23 1 66.92 CTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTATCGGTGTGATGGTATCCAGGTAGGGACTCTTCGAGAAC:1 - chr3R 24750938 3' - G6 29 1 65.38 ATGTGCCTGCCTAATAGCTGGGTTTTGGCTACGGCTTGAGCAAATTGGCCAAATGAAAACGATGTAATGAACTAAAGTGCATGAGCCAATGAAGGAAAAGGACCGGGGTAAAAGCCAAAAGAAAAACACCAATCGATGCATACACA:1 - chr3R 19545834 3' - Tom1 132 1 73.97 TCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTTCAAAGACATTCGAGCCTATAGCGTTCGACACGGCC:1 - chr3R 4365423 3' - mdg1 7357 2 75.34 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCCATGTTAATTTCGAGCAATTATTGGACAACCCTTTCAGATTCCAGATATTATAAGGAAAAGGAAACTTGTGGAAACTTTTTGTTTTGGCTTTGAACTTAT:1 + chrX 16994638 3' - roo 20 2 69.18 TTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAAGTATCCGAAAAAAAAAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTGTAATCCATTCAGTCCAAAGGCAACTAAGTTTTAAAACCAACATATAAAAATAAAACAAAAATTACAATG:1 + chr2L 16579498 3' + 297 408 1 54.79 GTATACGCTCTCCCCTAAGACTAGAATATAAGGCCTTACTCTACAACTCCGTCCTAAAACCAACCTGGACCTATGGTTCCCAGCTATTGGGGAACGCCAGTAACAGCAGCGTAGAAATTATCCCGATCTACCCCAATGTTGCCC:1 - chr3R 11867408 3' + Fw2 3483 1 77.08 CGCGCCTCCTTAAATTAATTGATGATATTATAGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTGAAACACATCTGCGAAGCTACAAATACGATTATGCTTCCTTGCGAAACATTGTATACATATTTACATATAGATAGTGCATCTAACTAGG:1 - chr3L 14280224 3' + hopper2 167 1 68.49 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACAGTTATCGTTTAACGTCCCAATGAAAGACGAAGCGATTATTGCG:1 - chr2L 22724063 3' - pogo 40 1 57.53 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGCAACCTGCTCCATCGCAGATAATTGCTCT:2 + chr2R 14973733 3' - FB 27 1 66.44 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAGACCAAATATT:1 + chr2L 5792118 3' - blood 31 2 64.38 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGC:1 + chr2L 12291917 3' - Tirant 48 2 71.30 ATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAATACTAGGTAGTTTGGCAACGCATAGCGATTCGA:1 + chr3R 9583346 3' + Juan 4124 1 76.03 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAG:1 - chr3R 9125639 3' - Doc 31 1 65.12 AAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAACTCAATGGAGCAGATAGGTGTCGGTGGATTCATCGAGTTGGGGCAACCAAGTGGGTTCCATTATGCG:1 - chr3R 9374087 3' + invader2 4670 1 53.79 ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCCAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGTAATACCATATAAGCCAAGCTATTGAGTACAATCCATTTCATAATAACA:1 + chr2L 4929888 3' + blood 7330 1 61.65 GGGTACTGCCAGCAACTCAAATATTGAGATTCTACAACTCTACCAATCGAAAATATTAAGACATATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGTCTTAGGAAAGACAGTTCTCACGCCTATTGTGCAAT:1 - chr3R 17548722 3' + G4 3452 1 80.14 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTG:1 - chr3R 9125623 3' - Doc 20 1 74.63 GTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTCTACTACTCTAAAAATCAAGGAGATACTGCGATATTTAAAGAAATAACTTACTGAATTATTTAATGCATTTCGATTGGGATACGTATCAGGGG:1 + chr3R 8378767 3' - 1360 3213 1 67.81 GCTTTTGGTCAATTTTGTTTTTGGTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAAAGGACGATATATTGACGTACAAATTTAGACATTATGCCAAAAAAAAAACAAATTCTGGACTGCACTGCACTGACTACA:1 + chr2R 21257946 3' - transib2 112 1 81.51 GTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAACGACACGCCCATATCTTGTGTAAAATATGAGCGTACGGGG:2 + chr3R 14912022 3' - Stalker4 81 4 71.72 AGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCA:1 + chr3R 8049020 3' - Q-element 114 2 64.75 AATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACATAGTACAATCAAATATAATAAAGATTACATTGAGAAATATAATAGAACTGGATTTGTATCTTGAAGCATCTGACCATTATGCCATAATATTTTTACATT:1 - 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flea 43 2 55.38 ATAGTGAGGGTAGATACACTACAACTAAAATAAATGGTAAAAAGTCACAGATTATAATCAAAAAAGTGTACTGATTATTGTATCAAATAGTACGTGGTCAATACGACAACATGCTATTTTCTCAGTGCAGATTGCTGAGCAACTGC:2 + chr3R 12744797 3' - Stalker2 2 2 70.55 TGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGG:1 - chr3L 27415204 3' + transib2 2773 1 53.42 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTTGGCCAATATGCAGTTGTCTTTATTTCATTTCATTTGGCGACTTTTTGGGCCAAAAGAGATAAGCTGGGCGAAAAGC:1 + chr3R 16241021 3' - Tirant 14 2 71.07 CTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCGACTAATTAACTATTAGAACTAGTATGATTAAGAACTGGGTTTCATAGGGTATATCGGGATTCGACCCTTG:1 - chr2L 2494771 3' - Doc 11 1 76.71 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACT:1 + chr2L 21910241 3' - Doc 20 1 59.81 TATGACAGCTGTAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACACGTCCTACATCAAGTTTCGCCATCGCCCGGTCGTCTACCTCTAGCGTCACGTTTACAGTGGCACCAACACCCACTTACTTTGTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3L 3491805 3' - diver 23 2 78.72 CACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGATTGATGCGGGCCGAACTCTGACTTAGATTAATGACTCAAATGCGATGGGTACCTGGCCAAATTTTCTAAAGTTTCCCCCCCT:1 - chr3R 19574805 3' + Stalker2 7364 2 53.42 AAGACGAAAAATGCAAATTACTTTGTATATTTTTTTGAACTACTGCACAAAAGAGTTTTAAGTGTTTTATTTTTTTTATTTTTTATTTCCTTTTCAAATGAAACATTTTTATTATGTATATTTGCATAGATATACTCTACGGGCCA:1 + chr3R 7958615 3' - Cr1a 185 1 65.75 TTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATATGAACAATGTATGTACATACATATGTATTTAACCAGCTTCAAATGCTGAGCAAC:1 - chrX 887294 3' - Quasimodo 64 2 67.12 AGTAAAAATGTAAACTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTGTGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACT:1 - chr3R 6171137 3' - rover 81 2 77.40 GAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCCCACTGCCAGTTTGTCCATCCAAACAAGAGTGTTGTGTTGTGTAGTGTTGACACTG:1 + chrX 10759283 3' - 297 6815 2 61.64 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTT:1 + chr3R 21674896 3' + roo 330 2 71.92 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTATAT:1 + chr3R 13437250 3' + hopper 1358 1 58.22 GAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGGATATATGTACTTTCAGGCATATTAAACTGCATACCCAATCGCAATCCAATCCACGACACCGCAATC:1 - 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mdg1 413 2 75.34 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGACATACATGCACGCAGACACTTTATTTATTTAC:1 - chrX 11008338 3' + hobo 2875 1 77.50 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGACGTGGGGAGTGGGTGAGCGGGAGTTAGAGAGAGCGAGCTGGCTTTTGTG:1 + chr2L 9879765 3' + jockey 4922 1 63.70 CGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGTTGAAACCTTCAAAAATGTTTCACTGTGTCATTCATTATGGAATTCCAACTAAAGAAACCGCAAT:1 - chr2R 11164353 3' + roo 9062 1 69.86 CTGACTCAGCGTCGTCGATGTTGTTGTTGGCACATCCGGTCTTGGATGGCACTTCGGCGGGGCGTTGCAACAGAATTAAAGACAAAAACGCAATCGACTAAAGTAATTAGTTAATAACTAGCTGTCTTTGTTGCGCGT:1 + chr3R 29799743 3' - gypsy10 73 2 50.00 TTTTCTGGCCGAAATTAATAACTCAAGAACGGGGAGAGATATTAAGATAATTTTCGCAATGGGGTTTATTTTTTGTGGCTTATAACTCCAGAACGGAAAAATATATTTAATTAACTAATTTTGTATAGGGATTTCCCTAATTCCCT:1 + chr2L 22107779 3' + Transib-N1_DM 23 1 65.75 GGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATG:1 - chr2L 14969115 3' - 412 89 2 78.77 AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTGTGCAAGAATTTCTTGCATACCTCAAAATTTTTAAATGGCATTTGAAGT:1 + chr2R 23409136 3' + opus 7435 2 65.07 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTT:1 - chr2L 14239133 3' - 412 7108 2 53.79 ATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTCGATAGTATAGCATTAGCTACGGGTATTGTATTACTCTTGTTGCTGCTTGCCGCTCAACCCATTTAAGGCCCA:1 - chr2L 14660928 3' - I-element 5342 1 54.87 CGATTTATCATAGTAGATTCGGACCGGATACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGACCTTACTTATGATAACTCCACCCTTAAAAAGTTGTAATGAAATAACGGTAGGTAGATATA:1 + chr2L 4069460 3' - gypsy9 56 2 70.00 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACTGTTTGTTGACAAAAAGGTAAACAAAGTGAAAATTTCGCAAATGTGCAAAATAATTAAGTAAGGGTCAGTAATAGGTGCTA:1 + chr3R 20635532 3' + 1360 3352 1 58.90 GTCTGGCAGAGTAAGTAATAAGAATGTATTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGATAAATGCAAATTCATGTATAGTCTTCGTAAAATATCAACTT:1 - 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chr3R 18153534 3' - copia 40 2 58.22 GAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCACTAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTA:1 + chrX 21667939 3' + opus 431 2 65.07 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGAGAAAAATATTCATAAAACACGGAAAGCGGAAAC:1 + chr2L 21910289 3' - Doc 11 1 76.71 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGCACTGTGGCACTTGAACTCACCTGTCCGCAGCAGAGGAGCCGAAAGCGTGCGTCCCCGCAGACGATATGCCACC:1 + chr2R 23166747 3' - jockey 4801 1 53.73 CTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATTGTATCAGCATTGTAATCCCTACTACTTGTGCACTTCAGTTTTGGCATCTCAAGCAGCTCGCCTAAC:1 - chrX 20263682 3' + 1360 129 1 63.04 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCTTCCTTACTTTTTTCATTTCTAGCATTGGCTGGTTTTTTATCAATATCCCTTTGCGATTCTTTTT:1 + chr2L 16331053 3' + roo 356 2 55.86 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCTTTTCGCTGCCCCTTATTTGCGTGTTACCGGAGTTGCAATGACGTACGCACGCACACA:1 - 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chr2R 7599153 3' - diver 5910 2 53.92 ATCTTAATTATTTTTCCTTTATTTTGTACTGGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACGTAAACAATTTTCTTCATGTGGCTCTATCATTAAGGCAGAGTGCGGCTTAATTGTTGCCGCAG:1 + chrX 9912953 3' + Circe 6961 1 57.69 GATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGGTTAGTTTCGGTTCTAACCTTTAAA:1 + chr2L 23390221 3' + rooA 7503 2 45.89 CCCATTTTTTTTTTTGTATTTTTGAACGGCATAGATATTCCAAGATCGATTCATGAGGGTAGAGGCTATAAAAGTAATTGAACTAAATTTTGCAAGCTAATTTCTATGTTTCTAACGGATACTAATCTTATTCCCCATTCAATCTA:1 - chr3R 21240790 3' + hopper 140 1 76.71 AGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTAAATAAGTACTCTAACAACAACCGATTTAATCAAACGTAACAAGGCGGA:1 + chr2R 21848781 3' + Transpac 255 2 55.48 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAACACATTTCCACTTTTATGAGCGCCAGTTAACCCCACACAGCACGAACCATTTTGAATTGAAAGAAAAACTTTTAGTTACACTCCAGCCAGTTTC:1 + chr3R 8639366 3' - copia 4897 2 64.83 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCACTCTAACTCTGAGGATTATGACTGTGACACATTGTTTCGCCAGCGAATTAT:1 + chrX 10579988 3' + pogo 2043 1 60.74 GCAGTCAAACTTGACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGCCAAAAAAGATCGAAGAATAACCGAACCCCTACCGACACTGTGCTCTCCGAAATCAGTATTTAATTTTATCCCATTCTTGCATTC:1 + chr3R 20293573 3' - 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chr3L 25607285 3' - 412 82 2 74.66 TCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGCGAAGAAAGGTGAAGCTGGAGTCGCACAAATTTCCGGACTATTTATTTGGAGGCCGGCTGGTTGTACCGACACATTCCACACCGAACAGA:1 - chr3L 23666487 3' - GATE 8340 2 65.07 GACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATATGTTTATGTATTTGTGCGTTGACCAGGGACATTTCCATA:1 + chr3R 18635294 3' - opus 187 4 76.03 TATTCTTTTTTTTTATTATTTGAGAAAGTTTAGTATCACAACGACAAGTAATTTACCCAATTCAACTAAATTCATCAATTGAATGATACCAAAATACTCCACCAGCTGAACATAGATAATTTTATTTTCCACTGAATCAAAATGGT:1 + chrX 9426408 3' - Rt1b 5147 1 21.23 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCTTCAGTGAAAATGGTACTTTCTGCAAGAACGATAATAGCGTTTCAGTTCGGCGATATAA:1 + chr3R 21216938 3' + 1360 3379 2 56.16 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCCAGTTCCCGAAGAGAGCAGGACGACCACGGGGCTTACTGGTTTCTGTG:1 - chrX 388937 3' + 1360 3355 1 43.84 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATATATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAGCTCAAAGCTACTATTACTTTTGGGTTAGT:1 + chr2L 16562184 3' + opus 7475 2 53.42 AATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGACATCGCAGTTTACAAACTCTTAAGCTGGAATCTT:1 + chr2L 4637876 3' + mdg1 159 2 76.03 AAATGGTGTGTTAGAGGGAGATGACAATGTAGTGAACGCCAGTGTGTATAGATATTAGAGAATATGTAGAAGAAGGGAAATGTAAGAAGATTCCTTCAGTAAAATAAGGTCAACGAGGGCATCGCCTACGACTTCCTCATGACGTA:1 - chr2R 23399354 3' + invader4 150 2 68.49 ATAATTAAATTAATTATAAATACATATAGTCTGTAAACGTGGAAGTTAAAAAATGCTTTGCTAATTTGCTACCTGACGCATTCTCTCCTGGCCATAAAAAGCTTATTTGTAAAAACTTATAGATTAACCAACCCATTATTACGCAA:1 + chrX 21049405 3' + flea 233 2 58.90 GTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGACCACCACCCATTTGCCATCTTCCAGCAAGCGCACGCCTGTCATAAATCTTGTTTTGAATGTCCTGCCAGCGTTGATAGCGCCATGGTGAGAGAGGGG:1 - chr2R 20447748 3' - hopper 22 1 70.55 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGATGCCTGCTTTTGTTG:1 - chr3L 13690250 3' - hobo 44 1 56.16 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATGAAAATTGTGAAAAAGATGA:1 - chr2R 5237706 3' - Doc 36 1 49.32 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCATTTTCGGGTC:1 + chr3R 16276443 3' + pogo 2052 1 57.53 ATATATATTCTTGATCAGGATCAATATCCGAGTCAATCCAGCCGTCTGCGGGCTCCATGCACACTGATTCGGAATATGCTTAAAACAGTAGAGGGCTTAATTATGTTAAACTAAAATACAATATTTTGCAGCAAATAACTTAGTCA:1 + chrX 20778553 3' + INE-1 80 1 69.18 CAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTGGCATGCCCATTGCTTCATATA:1 - chr3L 7791867 3' + Transpac 314 1 81.73 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCAAACCGTAGCATATTTAACAATAACAAAATGTAGCATACATTTGAGGGCCGCC:1 + chr3L 2216618 3' - jockey 63 1 58.65 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCT:1 - chr3L 18253809 3' - blood 7096 2 75.34 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATACAACATATCACAAATATCACTAAAAAAAACCTAAAAACTATTTTTTTCCCGTTGGTTTGAAAAC:1 + chr4 540578 3' - flea 31 2 56.80 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATTTTTGGCGAAAATAGTTCTCAATTGTTTTGAA:1 - chr2L 17839351 3' - blood 7049 2 59.59 GGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTGTTTGGTGAATTTAGGCAGATAACATGCGAGATCATTGTGTAATTTCTTTATCCGTTTGCTTGCGACCG:1 + chr3L 27168373 3' + 1360 2999 1 53.24 AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTATAGCCCTTGGCACACATCACATTTTTTCACATCCCATCGAAAGCCATATAATTCATGGAGC:1 - chr2L 16456719 3' - BS 5014 1 36.69 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGTTTGATTTTGTAAACATTTACTTCCAATCAACGGCGTT:1 - chr2R 9294282 3' - Tirant 36 2 62.33 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACATTCTATACTTAGCCACTATATATGTATATATTTGAATAGTTCAGCGATTGTTGTCCTTCATGCATTGGTTTATTTCGT:1 + chrX 11008428 3' - hobo 31 1 57.55 ACTTTACATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAATCAATTTTCGAGTTGCTATTGCTATTCGTTTGGGGCTCGGCGGTGTCGGGTAATTTACAATAATTACAGTGCGGCTTGTT:1 + chr3R 14432478 3' + flea 199 2 56.16 GAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTATTGAGTTATTTGTTTTGGAAGCTTGGGCTTT:1 - chrX 22792194 3' - BS 76 1 70.55 AGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAGAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATTTAAGAGCAACATTACGAACA:1 - chrX 17567637 3' + 1360 3321 1 76.40 ATATATGTATATACAATATATGTACATATTTGACATATATAGTATAGAATTTCCGAGTTCTTCACAGCCGCCAAGAACTGGAAAATCGCTTCATTTGTGGCTAAGTAGGCAAGAAGTGCCGTTATGGAAAAACTTGAGTAGGATGT:1 - chr2L 10469980 3' - INE-1 60 1 89.04 GATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCACCGACATATATGTTATTTTCTTTACCTATCCTACGTATCCTATTATTATTTCTAAGTATATACACAGTGCCTTCA:1 + chr3L 9959935 3' + invader4 3029 2 56.16 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATAATTTTTCACTGCCGATTCGCAATTTTTCGGTTTATACTTGGAGTGAG:1 - chr2L 19652473 3' + roo 394 1 73.97 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATT:1 - chrX 7756422 3' + roo 319 2 78.77 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACATATACATAGAAGGGACTAACAATGCAAGTCTCTCGACTCCTTTTGTTGTGGTCAATGTTGCAA:1 + chr3L 14302291 3' - Quasimodo 45 2 60.27 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCAGTAAAAAACCCTCAAAGCGTAGCGGATTTTTCATTTGGAATAGAAAATCCCAAA:1 - chr2L 16330949 3' - roo 66 2 63.70 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGTT:1 - chr2L 22719596 3' - 1360 72 1 76.34 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATCTATGTACGAGTATCATGCAATTTGCGAGAATGTGTTTCAAGAGAAAGTG:1 + chr2L 17626734 3' + roo 398 1 78.77 GTCCAGATGGGCTTGAGAATTGCCTTGTACACCAGGATTTTGTGGTTCTGCCTTAGCTTGGACCCTCTCCTATTAATATTTATCAATATTCAATATTTCCTAAAATGCAGTATCCAATTTCTATTTTGTTCAATTATTATTACAGA:1 - chr2L 21870673 3' - G2 2644 1 50.68 GCCATCGGACAAGTACGAGAAGGAGATTAAAACGCCACCACCCTCAACATCTGACTGACCTGAACTTGACAGAAAACCAAATAATAATATAAGGAGTTGAAAATAGTATTTAAGCGATGTAATAAGTATT:1 + chr2R 7879146 3' + jockey2 3148 1 43.85 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACATATGCTATGATATATGCTCACCAGTTTTTTCAAGTGCACACATATATATTTAGATGGCAGCTTCTGTCG:1 - chr2R 17169191 3' + hobo 2924 1 65.45 ACACGTCGGCAATCGAATTGAATAACAATTGAATTGAAGCACAAAATTGAAGTAATTTATTTGTGGATGGAAATAGAAATAAATCAATTTTGTGGCATTTT:1 - chr3L 26741191 3' - F-element 10 1 62.38 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATACTGGCAGAAGCATCATTATCTTAGCCATAATAAATCGC:1 + chr2L 17574095 3' - 297 6588 2 67.24 TCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACCATACTCACACACTTTATTACCCCCATTTCGCAGTCGGTTTTTGTTCACGGCGG:1 + chr2R 14944137 3' + accord 7100 2 78.26 GTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATTTAATTGCGGATGTTGTGTACAACTACAAAAAA:1 + chr3L 18382019 3' - copia 4957 2 78.77 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTGAGTGAAGAAAACAGTCGA:1 - chr3R 10213025 3' + P-element 2852 1 54.17 TTTAACCCAAGAGACGTGACGAACAACCGTCTAATACAAGCTCTATCAGACGATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGATTCAGTGGTCGGATAAACTACCCGGTCAAGTCTTTTCCAGTGCATGCTTTATTGAGGAC:1 - chr2L 8446149 3' + Bica 4489 1 59.59 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAATGGAATTCTTAAATTTGAAATACAAAAAAATAAATGTTTTCTATATGTTTTCAATACAACAAAAAGATAAAAAAAACATATGCAAATTTAAATAGCTTATTTTAGTGCAGTA:1 - chr2L 22149836 3' + S-element 1678 2 21.23 ACTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACCGATCGTGGCCACTACCTGGTCCTGGTCCACACTCTGTACCACACCACAGCTACAGATTGAATGAGGAGAAATTCAATTTACATTTGGCT:1 + chr2R 11724485 3' + Chouto 228 2 69.57 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACAC:1 + chr2L 7652278 3' + roo 350 2 62.59 CTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGTATCCAATCATTCGCGATCACACAAAAGCTCGCAGTTAGCAGGATTCTCAAAACTGAAGTGTAAAGTTGAA:1 + chr2L 7055669 3' - R1A1-element 5259 1 51.37 AAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAACCGCA:1 + chr2R 11095829 3' + diver 6041 2 65.75 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAA:1 + chr2L 21910229 3' - Doc 33 1 55.56 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAATCACATCTAACGCTGGACGCG:1 + chr2L 23049733 3' + opus 435 2 66.44 GTATTTAGACATCACATTTGATTAGTTCGCATTGATCTGTTGTTCAAAGAATATCAACTCCTTGGTCTTAAAATATAAGTAATGCATGTGATCGATAGACTTGGGCAGATGTCTAGCCTCGCCCTCGTTATATAACTTGAAACGAG:1 + chr3R 16046957 3' + Tc1-2 213 1 61.64 CGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTTCTCGATGGAGTGGCCCAGTAGCTACGAACGGCATATATTCTAGGATAGTTAGCTAATAAGAATACCAAGTCATTGACACTCCCAAC:1 + chr2R 12375063 3' + I-element 291 1 73.13 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGTTTGCAATATAA:1 + chr3R 13225536 3' + hobo 2909 1 73.24 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATATACCACATATGCGATTTTTTGGGGCTGCACTTTGCTCTGACCATCTCTTATGTTTTATGGCCAGGACTTTGTTTTT:1 - chr3R 15152595 3' - opus 7142 4 64.39 CGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATCGATCAATAGTCTTTCATATATTTAGTTACATACAATATAATACATATTGATTTAA:1 - chrX 14836172 3' + invader4 266 2 60.27 GGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGAATTTAGGGGGCCGCAGTGTACAGTTGAGAAATTGCAAACTGAAGCCTCCTTTTATATATAGTATATATCCCTGCTTTTGATGGCTCACCTCGCTTTTGATCTTTC:1 - chr3R 25804069 3' - mdg1 7042 2 76.87 GTGTGAAATAGTTTTTTTTTTCAAATCGATATAAATTTACAAGACCAATAAAATATCGAAAGTTTTTCAAAAATGTGGGCGTGGCAATTTTTTTTCAAATCGAAAGAAATTTACAGGACTAATAAAAATGTTAAAA:1 + chrX 9470682 3' + copia 367 1 52.21 GTTGAGTGCTTGTGTCCGCTTTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACCAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACTTGTTGTTGCGATAAACATTTTCCGCCATTGGCCTTTATTATTTTTATAGCACTTTTAAGTA:1 - chr3L 9557880 3' + 1360 461 1 68.49 GAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGCACATACGTATTTAATATTTTACATGGATTTTCCTTGATTAATAGCCATAATTATAGAAATTC:1 + chr3R 11033437 3' - invader1 3868 2 59.59 ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGACCACCACCCATTTGCCATCTTCCAGCAAGCGCACGCCTGTCATAAATCTTGTTT:1 - chr2R 20447791 3' - hopper 63 1 59.03 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTTAATGAACTACAATATCATCGCTTTATTA:2 - chr2L 19691224 3' + roo 358 2 52.05 CCGACGTCGCCGAAATCGGTAACCATATCATTTTACCGTAATCGTAAATAGGCAGTCCACGTCATATGCAAGAATATTTACACGCCACACACGACTCCATTAAAACTAA:1 - chr2L 3176816 3' + Helitron 50 1 75.23 AGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCA:1 - chr3R 7470972 3' - Doc 119 1 73.97 GTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTT:1 - chr3L 18484386 3' + hopper2 1535 1 64.38 GCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTGATAATAATATATTAATATTGCATCAAGTGTATCTCAGACTTCTC:1 + chr3R 17586913 3' - Max-element 8311 2 70.34 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCGAGGGACACAAACACACTCGCACTTAATCTCACACTAAGCACGCACACAATGACCGGCTTTGAGCAGGGCTAATTGTATTGGTAATGCGCATGAAAG:1 - chr3R 11095746 3' + hopper 1394 1 69.86 AGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCAATCCGAACTATCCGAAGTCTCTGGAAACTCTTTCAAGTCAACGCACTAAAAAGGGGTTATCAGCAAC:1 + chr3L 17577163 3' + 1360 4 2 53.42 TTAGATTTTGTGGCATAATTTAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAGGAGATGGAACTCACGCTAGTGGGGCTGCAGTTCTCCGGGAAGACGACGTTCGTCAATGTTATTGCAGTGAGTATTT:1 + chr3R 8126831 3' - I-element 5174 1 57.86 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTTGTTGTGTATTTGAGGCTAGCTAAAGTTATGAAAAAAAAAAATCCAATGAAACCTTAAG:1 + chrX 8349976 3' - roo 8726 2 63.70 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGGTCGGCACCACATG:1 - chr3R 18635216 3' + opus 433 2 69.78 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCATAGAACATTTGATGGTATTAACAATGTACTCCTAGACTATATGATGGTGTAAAGTGTAAAAAGTCACGATTTTCTTCGATCTCATC:1 - chr2L 7652162 3' - roo 30 2 56.25 CTGGCCTCACATCCTGCTTACCGAAGTCATACCTTGATCTGGCAACGCCTCGCTCGCTGCGCCAAGTTGGCAGCGCTATCAGCTGTTTTATACGCTGCAACAATCCCAAGATAATAAATTACTTATTTACCTGAAATACAGTATA:1 + chr3L 25525531 3' + Rt1b 4956 1 77.24 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAG:1 + chr2R 10160584 3' - hobo 85 1 73.97 TGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTGTTGTTTTGGCCATTCGCGCGCCACAATTTTCCGCAACATTAATTGCTTGTCATTGTCAACATCCTCAATGTGCCGTGCCCCTTTCCACCCTTTAGTCGGTTCAGCCTAATGCCGC:1 + chr3L 5288090 3' - jockey 4661 1 80.71 GGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAA:1 + chr3L 21093229 3' - Ivk 65 1 63.45 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGTATCATAGATATGTAGCATATCATGGTATATGTAGCATATACTTTAGGACAGTCTAAAAGTATACCTTAATATGAAACGCAAACGCACCTATAAGCAAATTAGATTTTGA:1 + chr2R 17169350 3' - hobo 10 1 76.03 AATAAAAACCTTTAATACAACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTTATTAATTTTGCAGCTGTATAAAATTTAAATAAAAATAAATAATAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTA:1 + chr3L 19339415 3' - Tc1 300 1 50.68 ACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATGTATATATATACATATAGATACATCGATTCTCTGGCGATTCTTCGAATGACTCATACTCATCAGTAAATTGCGCACTCATTCACTGACC:1 - chr2R 7720658 3' - Bari1 28 1 64.38 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGCATTGTGACAGGTGCAGCCGTATTTATTATAACAAAATGATCAAAATT:1 + chr3R 17047895 3' - 412 74 2 65.75 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTT:2 + chr3L 1358531 3' - 412 68 2 63.70 AGAGAACAGGAACGAGGAAATGAGTATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATGTACCGGTGCCGTCGTAGGCAAAGGATTTGACGAACAGCGTCGACTCGTCC:1 - chr3R 23830195 3' - Cr1a 4340 1 66.90 AGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATATGTTTATGTATTTGTGCGTTGACCAGGGACATTTCCATAAATCTGCCAGGTGGTGCCACAGTCAAATTAAGCATGGTTGGCCTTAAAAA:1 + chr3R 18635344 3' - opus 7027 4 67.81 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGCTATTTATACTCTTCTGTCGTCTGGGGAGTTTTGGAGCCCACTGC:1 - chr3R 11870026 3' - pogo 18 1 71.92 ACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTG:1 - chr3R 7470977 3' - Doc 124 1 77.40 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATCAAGCTCAGATCAAAATATGCAACATTCTGCATAAAGTAGTTTTGAAAATTTAATACATGAGACCCGTAAACCGTTAAATGAGTTTCAAAAA:1 - chr3R 2649138 3' - 412 31 2 66.44 TACCAATCAAAAATATGAAGACAAATTTTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCTTTGTATCCATTAATTTAATGATTATCGCAAAATATGTGTTTATCTTGCACATTATTTTGAAAGTGAATTTAGGGAGTTCCTTTTTCTGT:1 + chr2R 5547377 3' + G4 3492 1 60.27 AACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACATCAACTTCGTCAGCGGCCCAACTAATTATCGCTGTGCCAGCTGTAATGATGGTGGCGAGAATGCCCCACTTGTGGGTGGCCTTGGTATC:1 + chr2L 1300325 3' + Doc 492 1 70.55 GCTCTATCTCGCTTGATACATGCTGGTCCGAACTCACCACAGGACAAGCATTTGTCTCACTCTAACGCATCGTCGAACCGAGGCTATGTAGAACAGAGTATTTTGTGTTTTATTGTGTCGTGTTTGCTGCACGTTGTTTGGCCGAG:1 + chr3R 17665977 3' - invader6 4725 2 67.12 AGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCTAAGAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGTTTTCTGATTATGTTCAGTATCTGATGTCGATTTTTAAC:1 + chr2L 12810183 3' - F-element 398 1 68.80 ATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGAGTTGACTGACATATTGACACACTCGCACAAAGGGCAAATCCAATTCCATCGCAGC:1 - chr3R 31140954 3' + Burdock 6330 2 60.96 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGCTATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCT:1 + chr2L 5792080 3' - blood 7045 2 50.45 GCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGC:1 - chr3L 3453610 3' - Tirant 72 2 66.44 CTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCG:1 - chr3R 178124 3' - BS 71 1 77.34 ATATTCATGATCAGGATCCATAGCCGAGTCGTTCTGGCCATGTCCGTCCGTCTGTCGTTTTCTATCTTAGGAATATATACTACGGTTTCCATTTATAGGCTATGTATATATACTTTGTGTTTGGCCTGCGAAGAGAGATCTCT:1 + chr2R 13901282 3' + INE-1 84 1 53.85 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGACCACCGACCGACCGCTGACCATAATTCACTCAAGTTAGACAAAAGCATTTTGGTTGCCCCGCCCCTAATTCTCCATC:1 - chr3R 21341300 3' - hopper 42 1 56.85 AACCCTTACGGATAATATTTTTATCTTAATTCCAAAATCAAAATACATTTTTGTTATTTTATGTTGCAGCAAATTGTTTATTTAATTTTTAATGTGTATACTGCATGGAACGGCAGAGTTTTGTTTTTACGTCAC:1 + chr3L 22442625 3' - Dm88 4317 1 45.19 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCATTTCACGCACACCAAATACAAACAAACCAAACCAGATGATAACAAAAACGAA:1 + chr3L 15364944 3' + 1360 3380 2 74.62 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATCTTGTGGTCCTTAGACTTTTTCGTTACATTTTGATGCATGCATATTGTTGGCAACGTCTGCTACAAAAGCGGTAGC:1 + chrX 4031570 3' + mdg1 378 2 54.48 CTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTCTTTCATTTTGTTGGCAATCGATTCGATGGAC:1 - chr2L 19407010 3' - Doc 11 1 59.35 GAAAATATACAAAAAAAAGAAAAATGGGTTACTCTGGGGCGTGGCTGCTAATCGAGAAAAAATCAACAGAAAATTACAAACCAATACAAAAAAATAAAAATAAATAAAATGTCATCCAGTCCCTGTCCACCGAAATGGTAAGTGCT:1 + chr2R 21205529 3' + TART-A 13402 2 71.92 GGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAA:2 + chrX 23182913 3' - Idefix 71 2 69.18 GTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATATTCTTAAATTATAAAAGCAAAATTAGATACAATCAGTG:1 + chr3L 12159758 3' + Quasimodo 7294 2 76.22 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGTTGCCAGGCAACAGATTTAATAAAGAAAAAAACAGCAGCCACTTTACTTTAGCATTTCAATTAAAGTTTGCCCATTCTGTGAAACTTAAACCGCAAGCTCTTTA:1 + chr2R 15075718 3' - mdg1 7055 2 73.97 TTTTGTTTTTTTTTTATTATTTTAGAGTTTCCACAGTCGTTGCTCATTCAGAGCTTTTCCAGGGTATCAGAGCAAATAAACAAAGCGAAATGTTTGGCTACATCG:1 + chr2R 20419887 3' - BS 5098 2 88.57 CGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGTATACTGACATAGTACAGGAAGTTCGTAATAAG:1 - chr2L 18630458 3' - G-element 43 1 52.80 TAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATGTAGGTGTCATATGAAGTCGGTTGTCAGTTGGCTCCGATCGTGTCTCCGCATCGAGCCGCATTGTTTACAATCTGCAGGGGTTCGAATGGACACCTTACCCAC:1 - chr3L 18253146 3' + blood 7080 2 80.00 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCATAAAACATTTGATGGTATTAACAATGTACTCCTAGACTATATGATGGTGTAAAGTGTAAAAAGTCACGATTTTCTTCGATCTCATCAAT:2 - chr2L 7652159 3' - roo 8693 2 58.90 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTTTAAGGCCCTTGGGAATCATATTTGTGTCAGTAA:1 - chr3R 26485975 3' - 412 16 2 73.29 ATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACACTAACCCTTACGTGGAATAAATGACCCACCACCGCACCTCCATTTAAATGCGATTTACATTTTTCCACC:1 + chr2L 12674629 3' + P-element 63 1 36.09 GGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGAACAATTTGGAATATTGGAACTTTAGTAACTTCGCTAGGAACATGCGAAATAATAATCAAAAT:1 + chr2R 23795145 3' - Idefix 7075 2 57.53 TGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGTCAGAGAACGCAGACAACACATCGCACATATTAAGAC:1 + chr3L 5069480 3' - opus 7169 4 68.33 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTATTTAACATTTAACATTAGCATTTAAAAATGGAATAAATACTTACACATACATATTCTATACTTCGACTGTGCTAGCTATT:1 + chrX 3370162 3' - S-element 35 2 61.64 TGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAACTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTATGATAGCAAAAATTGTGAGCGTGGCACCGCCTGTTATATATTTTATAGTTTGTAACTCCAGAACGG:1 - chr2L 21109022 3' - gypsy7 14 2 61.64 GTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGGATACTGACATAGTACAGGAAGTTCGTAATAAGGGTAGAAAAATGGCCGGATAGTATTCATAA:1 - chr2L 18630428 3' - G-element 20 1 67.42 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATA:2 - chr3R 9125682 3' - Doc 91 1 73.29 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTATCAGTTACACCTGGGACTTGGGGCTTCTATAGGGGCTACCATGGCGGTGGACAGTGGGATTCTTTTCGCACAATGGTATGTGTAAATTGTATTACATGGAGAGGACCCATTTACTT:1 - chr2L 3231806 3' - roo 8667 2 79.45 CATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAA:1 - chr2R 13367475 3' - jockey 4649 1 78.62 ATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTTAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGGCAATTTGGAAACTGAGCAAAAAGTT:1 + chr3L 22043092 3' + invader4 2673 1 79.03 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTG:1 + chr3R 16276424 3' + pogo 2040 1 69.06 GCTGACCCAGCGGATTTGGGGAATGCCTCCGTTTTGCTGAGCTGTTTCCGCCTACACTGTTGCAACATGAGGGGACAACGAACTAGCGGCTCAGCGTGGAGGTCCAATTGAATGCAGCAGACGCGAACGTGGCCCACTCGCAGTA:1 + chr3L 6028830 3' - gypsy5 7139 2 69.66 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTATGATTCTTAACAAAACTTTGTGATGCAGATGAGTAACAGTTTGTTAAAATGGGTCGCTTGAATAGAATAGAATAGGTACGTATTGTACACACATTTATGTACATAT:1 + chr2R 23267901 3' - roo 6 2 61.59 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTACGGCAAATAATAGAAGAGCGAATAAAAG:1 - chr3L 12874860 3' - jockey 61 1 53.42 AGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATGAGTGCCCCACATGGGGCGCCATATGTTACTTCAGGGAAGTTCATACAGTGACAGCATAATAAATTTATTAT:1 - chr3L 21093129 3' + Ivk 5329 1 55.48 GCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAAC:1 - chr2L 13629098 3' - Tirant 51 2 77.00 GTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCT:1 - chr2L 12325028 3' - jockey 4744 1 63.01 GCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAAAAGATATAGGCACGATATAAAAAAGAGAACAGGAACCAGGAAATGAATATAATGTAAACATCGAGGAGGAGCAATGTGAAGGCGCCCATGCGATGCACTTGCTCTTCT:1 - chr2R 15412577 3' - Cr1a 4395 1 62.86 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATTGTATCAGGCGATGTGTTGAGCGAAAACGATCACCTAAGGCAAAGTCGAG:1 - chr3L 19863946 3' - roo 71 2 66.44 ATTATTTTCTAAAAGAAAATTGATCATATAAATAAGTAAAAAAAAGGATATTGATCAAAAGCTTCACTAAAGCTTTTTATGAACTTTTAGGGGTGCAGTGTTAAACAGTACTGTTGCTTTTTGCTGAATTTTCACCTTTCTTACCC:1 + chr2L 20139417 3' + transib2 72 1 73.97 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAG:1 + chr3L 13364364 3' - hobo 63 1 74.17 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCGAAGTTGCGACGATGCCCGCCGACAGCAC:1 + chr2L 17260810 3' + P-element 2849 1 50.42 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGCTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTG:1 - chr3R 9125663 3' - Doc 65 1 58.27 ATTCCGTTTAATTAAGCAAATAATTCTTAATTTTTACCTTTAAAGTCAAAAATTTAACTTTTTTCACAGTGTCTAATTCGATTTAATTTATGTTTTGGGAGAAATCCTACTGTCATACACATATGGCCGCTACTGTACGCTCCTA:1 - chr3R 14832002 3' - S-element 74 1 52.41 ATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAAGTAAACGAAAGTTGAAAAAAAAAACCAAACCATATTTTGCTCTGCGGGGCTCCATGGTCTCCTATTGAAATGAAGATAATATATCATAGTATTAGCATTTTCTATAT:1 + chr3L 20000498 3' - 1360 243 1 74.66 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAGATTCTTTACACTTTGTTTTT:1 + chr2L 12291959 3' - Tirant 41 2 56.64 CAAGGAGGCTCAATAAAAGGCAACCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAGGGGTCAGCAGAAGCTGACGCTTATCAAAAAACCTATTTTTTGTACTCACTTGACATTTTGTAGATACGTCG:1 + chr3R 3511195 3' + X-element 4480 1 74.22 CATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACAAGCCGTCGACGATACTAAAGAAAATTGAGA:1 + chr3L 3287035 3' + blood 163 2 77.21 GTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATAACATATACATATTATATACATATTAATTTAGAATTTGTAGAAATAATAAATTTATTTACCGAATACGATTTTAAATTCCTTTTATATATTTAAGCGGATGTATT:1 - chr3L 19339289 3' + Tc1 1632 1 68.28 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACGTTAC:1 + chr2R 20447888 3' + hopper2 1560 1 57.26 GTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGATATAATCCCTTTTTAATACCTTTGTTCTTCCCCTGTTGAATCCACTGTCGTCGTGCGGTCGAGGTCTTTGTCCCGGCTGG:1 + chrX 15965256 3' + P-element 456 1 54.79 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGTTTGATTTTGTAAACATTTACTTCCAATCA:1 - chr2R 9294290 3' - Tirant 8134 2 64.34 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACGAAAGTTGACAGGGCGGGGAATGAGCTACACTGCTGTAAAGCAA:1 - chr3L 10469528 3' - roo 76 2 70.55 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGTGCATACTAAAATGCAATCTCTGTCCGGCATTAAGCCTAAATTAAATATATTTCATCCAGTGTCCAAAAACCAATTAATTCTTTGTCCGGCCGCTTGGGTTTGTTGCTGC:1 + chr2R 23212748 3' + Tirant 8495 2 76.71 TGCAGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGGGC:1 + chr3L 23678167 3' - Osvaldo 33 1 65.62 CAGCTATTGATCCTCATCAAGAATACTTTATATGGTCTGAAACGCTTCCCTCTGCCTTTTAAATACTTTTTAACGAATCTAGTATAAATAAATAAATAAATAATAAAAATACCAGTCCAGCGTACTATATTGACAACTGGGTGAAC:1 - chr2L 20413502 3' - INE-1 88 1 53.42 GTAAGAACGTCGAGATCTCAGGAGCTACGAAAGGTAAAAAGTTGATATTCAGCATACAGATTCTAGAGACATACACACCTTCAAACTGCTATGCACTTTTTAATGCATAATTGAAAAAGTCAATTAATTTATCGCCATTTAATGAG:2 - chr2L 17665819 3' + INE-1 137 1 53.42 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACAACCGGGTGCTTGTCTGCACGTGCAGATTTATACCCAAAATTGTTGGCTGTCAGTCGAGTGGCAAAAAATGCAGAACCCTTGCAGTTCTCTCGTTGTTGTACAGTGGGGGAGTGAG:1 - chr2R 4707655 3' - Tirant 8107 1 68.31 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTGAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTTGACTATGATGGGTTTTTGGGAATGGCGCTTTTTTGTTGCG:1 + chr3R 20934754 3' + 412 449 2 60.00 GAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTTTAGTTAAGCAGTTTTACATCTTCAAGCAGCATGAAATTGATTGATGGCCAG:1 + chr3L 19427357 3' + 1360 438 1 67.86 GGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATG:1 + chr3R 12363800 3' - jockey 4747 1 63.70 GTTATTATTATTATTATTATTGATCTGCTCTCCTCTTTCGCATTTTGTGCAATTTGATTACTAACTGTAAGTGAGATGTAGAAAAATCAGGTAAATTATACACGTTTTTGCGGAAATGAACGAGGAATTACAAATTATTACAAATA:1 + chrX 5070756 3' - mdg1 7074 8 73.29 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATCACAACAATGTGCAAGAGGTCTTATCTGTCACCAAAATACATTACCAATTTATTGCCAAAAAAAAG:1 + chr3L 12836100 3' - 1360 53 1 54.11 GGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGGGGTAACTCGGGCGCCGATAATACTCGCTACTCGAAACGAAGGAT:1 + chr3R 2637707 3' - gypsy5 6965 2 55.95 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAACGCTTGTAAAATATTACAATCGTGCGATCAAAGTAAAGGAGTGCTTAAATATAACAATATTCTTTACAAAAT:2 - chr3R 11944814 3' - roo 8712 2 54.11 AAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTAATAAAGTAAAATCAAATCGAA:1 - chr3R 6171110 3' - rover 6969 2 65.45 GTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGCCGCAC:1 - chr3R 5773165 3' - Stalker 81 4 73.05 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACG:1 - chr3R 16276309 3' - pogo 32 1 60.74 TATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTATGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCAATCGAATTGAATAACAATTGAATTGAAGCACAAAATTGAAGTAATTTATTTGTGGATGGAAATAGAAATA:1 - chr3L 26741211 3' - F-element 72 1 61.54 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTGGCCAGAACGTCAGTGCCACGCGATTCGTGGCAATAACAAATGTGA:1 + chr2R 10910343 3' - Tabor 6866 2 64.38 GCAAGTTATTTTGTAAATATTAAGATAATGAATGAGATCAATTCTGATGGCTCCCAGCTTTTAAAGAAGCAGAGTTGCTTTATTTGTAATTTTGTCAAGAAACAAGGAAACCGGTA:1 - chrX 17844619 3' + BS 301 1 64.66 AACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTCGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTT:1 + chr3R 10736160 3' - McClintock 14 2 69.47 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTTTTTTTTTATAATTGGAGATCTGTTAATTAGGAATGTTGCTGTT:1 + chr2L 22775566 3' + pogo 2047 1 67.72 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGCGGCTTTGAAATAAAGAGTGGCTGATAGTAATTCAGTTTTAGTGTGACCGCAGGAACATTGATCATTTATACCATCCGGATCTGGAAAATACTA:1 - chr2R 5754468 3' - P-element 27 1 67.12 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATAATGATGATGTATCTAAGTTAGCGTGTAAGACTTTCTGTAAACAGCATTTAGTTGGCACAGTTCAAAGATGTCGACCCACCGCTG:1 + chr3R 15295845 3' - roo 32 2 62.33 TGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGAAAAAGCACAAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAATATTTCGCAGCTCCCATGGAAAATCGTAAAAAG:1 - chr3R 6015101 3' + Juan 4132 1 71.72 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCATTAAATAACATCAAAAATGTGCGGTGAAAGTTATCTTCG:1 + chr3R 13349621 3' - Ivk 23 1 67.83 GGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGGGCATTTCTCATATTCCCCCGGGGAATTTTC:1 + chrX 697176 3' + HMS-Beagle 6963 2 75.71 TCTCCAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTTGGGTTTTGATTATTCTTTCT:1 - chr3L 25272535 3' - 1360 89 1 53.57 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATGAAGTTATTGATTTATACATTCATTTCACCTCATGTGCTACATTTACCAAGTTTATGATAAAATAAATCGTTGAGCGATAGAATCTAAAGTTAGCACGTT:1 - chr2L 16857799 3' - P-element 19 1 69.23 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGAAATTACAAAAACCGAATGAAATAACTCCAAAT:1 + chr3R 11513525 3' - roo 63 2 74.59 CCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATATATAAGAAGGGGTCTAATTCCATATTGATGAGACCGAGATGGGATTGTC:1 - chr3R 28406355 3' + opus 7437 2 67.12 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAATAGTTTACCGCCTACAGCCCTTTGAA:1 - chr3L 12433415 3' + roo 9013 2 59.59 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCTGATCCCTGCAGCCTATTCAAAATAGCGAGCGGAATGGGGATGAAGGAACTGGA:1 + chr3R 11944923 3' + roo 342 2 61.64 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGC:1 + chr3L 18183177 3' - Tirant 12 2 62.35 AACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTGTGCAAGAATTTCTTGCATACCTCAAAATTTTTAAATGGCATTTGAAGTAAATCAAATCAAATGGCGTAAGAATTCTATATCATTTTCTATGCATAAATATTCAT:1 + chr3L 21464930 3' + opus 7491 2 43.84 GGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATGATTATGTAGCATACTT:2 - chr2L 15013233 3' - BS 4940 1 58.22 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCATGTGGTCAGCGAGGAGCAGAGAAC:1 - chr3L 11803954 3' - blood 7048 2 57.04 AATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCAGCAGCAACACCAATGCAAGTGTTACCTGCACTATTTCTAACGTACAGGCCAACATGATCTGTACTCCTACATACACATGATGTATGTTAACTTTGCGTTCCCAAAGAAATAAT:1 + chrX 5958173 3' + jockey 499 1 77.40 CAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGGCTATAGATTCATTCTTTCTTGTTAGAGATGGATAAATGTTTTGTTGTCCGCCACTGATTTCGTCC:1 + chr2R 5439240 3' + INE-1 514 1 70.63 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGGCTATATGGCAAAGGATGTGGAAAGAGGTCGGTTTGCTATTCACTTGAATTAAAATGAATTTAAGTGGTTTGCTATTGGCCAAAGTTGCTCCCATAT:1 - chr2R 21748201 3' - 1360 23 1 66.44 CCAATTTTTGTCACATTCAGATCGAGTTCGATATCTCTGGTCCTCATGTAGCAAGGAGCGCCTGTAATCTTCCTCAACTCTGCCGCTCTCAACTCTTCCGCTCTCAGCAACATCAGAAACCAACACCACAACTGCAGCAACAACAA:1 - chrX 14038031 3' - jockey2 3034 1 47.26 TTAATTTTTTTTTTAATTTTTACCATAATTGGTACAAACGAGAAGATTCATGTCACTTCCTTCTTCTCTTATTTTGTTTTGCTGTTTCTAATCGACAACTTATTAGCTTTTAAAGCACAAGTGGGCATTTTCTGGTTTGTTAAA:1 - chr3R 26800286 3' - Doc 4696 1 78.47 ATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTCGTAGGGGGCAGCAGCATTTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAATACGGAACATATGTATATATT:1 - chrX 6638362 3' - P-element 433 1 43.84 CACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATATGTGCGAATTTGCGCGCACTTTATCCAACTTGCTTAAAGTTTTAGTTATGCCAAAGTTTTGCAAATAAAATTTAAGATAAACTTTGTGTAAGTCTTGAC:1 + chr2R 14087976 3' + roo 8819 2 67.81 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTTGCGGCGT:1 - chr2L 13629065 3' - Tirant 48 2 55.38 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGATTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCATGTG:1 - chr3L 11803974 3' - blood 68 2 63.01 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATAATGATGATGTATCTAAGTTAGCGTGTAAGACTTTCTGTAAACAGCATTTA:1 + chr3R 15295811 3' - roo 8730 2 65.75 GCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCTACCAATTTAA:1 + chr3L 20251995 3' + copia 177 2 71.92 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTCAGACAACGTGGCATACATTCGGGC:1 - chr2R 6798205 3' - jockey 19 1 69.03 TTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCATGCTTTTGTGTATCTATTAAAATAAGATTTTAGCTGCTTTATTCGCTGGCAACAAGTCGTCGTCTCAATGCCAACTTGTTTACG:1 - chr2L 19119813 3' + Doc 356 1 58.33 TCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGATTATACATTTTATTATTAAAGCTGGCTTTGTTCTGACACTCGGTTTTATGGCCACAATTTTCAGTGC:1 - chrX 22916699 3' - HMS-Beagle2 108 2 54.11 TAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTT:1 - chr3L 7837151 3' - jockey 4802 1 52.17 ATAATAAACTTTAAAAATATATTAGGAAAAATAATTACTCATGTCAAATGTGCTTCGAGTCTCGAACTATCCTAAGTTCTCCTCCCGATAAAGTTCTGCCAATTCCACTGTGCCAGTCTACAAAAAAAGACAGCAACTGTGGAGT:1 + chr3L 13922605 3' - hopper 175 1 65.52 TACCGTCGAAAAAAGAAATTTCATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAAAATACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCAATTGTTCAATAATGCAAAGTGCATGGCCAGGTTCCAACTTCTCCAGTCTGTCCGTTCGTTCGCCTGTCT:1 - chrX 4198649 3' + Tc1 379 1 58.90 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCTCTCTTTTCTCTGACTAGCGAATCTCTATCATAAAATTATATACCCCTTTAAAAGATAAAAAGAAAGTAGCAAACTTTTGC:1 - 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F-element 105 1 78.08 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTTAAGTGGTTCCAATGGCTCTCAATTTGAGTTTGTCGTAAAACTGAATCAGTTACACTTATGTGTGTTCTTACCAGGGACTTAAGCT:1 + chr3R 18205745 3' - 412 33 2 60.27 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATAGCAGCAAATTGTGTTAAACACACACAAAAAAAAAAAGAAAAGAAACTTCTTTTTATGATCTTTTTATGCCGCAAATAAAAA:2 + chr3R 19171554 3' + opus 460 2 56.16 AAAGTGCTGCCATAAGTTCTTAAGTTCTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACTACTTAGTTGGTAATCCATTACCATGCACCAAGTGTATACATCATTTGACATCTGCAGAGGATGATTAAGACATCCTTGCACTCA:1 - chr2L 1090918 3' - 412 48 2 56.55 TGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTAAAGTTGGTCGATTACTGAGACGTTCGAGATCGCATTG:1 + chr2L 22293399 3' - blood 83 2 73.29 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCTACCAATTTAAAATGTCGAAACTGACAACGATGATTTCAAGGGAAGTGTTTTTAATAGAAAGAATAAATAT:2 + chr3L 20252055 3' + copia 237 1 72.60 ATTTCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTGAAGCTTTTCCTTTAGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATGGGGGCGATGACGATGCTTATGTTCCTTGTCTGTTACTTTAACTTTAC:1 - chr3R 25638942 3' - pogo 410 1 67.12 TACAAGAACGGCTAAGTGCCGCTGCCAAAGAATTTTTTATTACAAACGGATGCTGCGCAGCTGGGATACATTAGTGAGTATAAATTAATCCTTGTATAAATCATTAACAAAATGGAAATAAAATCTGGGACAGGAGTCGAGCAATG:1 + chrX 22740672 3' - 17.6 187 2 53.42 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGCAAATGCCACCCATTTTATCGTTATTTACTTAGAGGATTTGGCTTTTGATACAACACATTTGTTGGATTGTT:1 - chr3R 13838169 3' - 297 6604 2 69.18 AGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAGTTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTAAGCTCTTTATCACCCACGGCGGATTGTTGAGCACCATCGAAAGCATTCATCATGGCA:1 - chr3R 11169013 3' - F-element 188 1 58.62 TTTGCACAGTCTGCAACGTTCACCTTTATCATAACGTTGTGACACCGTAGGACTTATCGAAAATTTGTACTTCTTTGATTGATGCGAATAAACACTGCTTGGGGATTCTATGATAGATGTTATTATGTACTGCGTTTATCCTATGA:1 - chr4 880338 3' - looper1 1544 1 72.60 ATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGGGATTCCCCAACATTAATAGTTAAGTTCT:1 - chr3R 25543428 3' - G2 206 1 34.93 CGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGTGTGTTATATAACCACGATTTTTGGGTTGGG:1 + chr2L 15345921 3' + accord 6956 2 78.77 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCTGATCCCTGCAGCCTATTCAAAATAGCGAGCGGAATGGGGATGAAGGAAC:1 + chr3R 11944919 3' + roo 9002 2 64.38 ACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTTCTTGTTGCCGCTGTTGTTAATTGACGACAGTGAAAATACGACACTTTGCGCTCTGCGATCGGTTAGTT:1 - 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chr2L 19652497 3' + roo 9033 1 57.53 CAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTATTGATCTCATTTTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATACTTAGATTTTTCTTCGTAAAGTTGTGGCAAAGTTTTGGATGTTTTTCTTTTCTTGTTTTTGTTGCAT:1 - chrX 9391317 3' + INE-1 101 1 62.86 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACATTTTTTTAACCGATAAAAATGAGCTTGACCAATAAAACCCTGCTATAATACTTTAAAATATTGGTTGTTTTTAATTTTTTATTCCGAAACGAAAA:1 + chr2R 5434033 3' - Transpac 19 2 68.49 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAA:1 + chrX 3646986 3' - 412 76 2 69.86 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATA:1 - chr2L 19652520 3' + roo 9011 2 59.31 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTG:1 - chr3L 11803982 3' - blood 7071 2 64.62 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACACATCCTTATCCTATCTCTTACAAAAAACAGGAAAAAATGTCATGTATAGGTCACGGATAAT:1 + chr2L 7652344 3' + roo 404 1 81.51 AATAAGATCTAAATCTAATTTCCAAAGCGAACGCTTAGCAAAACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATAGTCCGGGAACGGTTCGTTACCAGTGCGATCTCAGTGATGCGAC:1 - chrX 11699384 3' - Quasimodo 7260 2 67.83 TTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATAAATTTCACACCCACGTATTAGATCTTAATTGAACATCTTCTGCTCAGCTCTGGTATATGAATATTT:1 - chr3R 16538350 3' - G2 2632 1 51.41 AATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACTCCGGCAAAAACCTGATCTGGATAAGCAAGGCGAATTCGTAGCTCGATTTCAATCATCATTTGACTCACTTTATCATATTA:1 - chr2R 19052826 3' + Tirant 8372 2 58.22 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGCTGTTTTTATAATAATAAAATATTCCACTCTTGTCTCCGACCC:1 - chr3R 21343054 3' + Transpac 302 2 76.03 GTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAAAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGAATATTATAATTTTAAAGCTTTAGAATGGATAAGAAGGGGAGTGACCTGCTGAGTTCGCCATTTCAACTTTGCCATCATCTCCGT:1 + chr2L 257141 3' - 1360 3120 1 56.85 CAAAAATAAGTGGAATAAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTATTAATTAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACGGCTGTACGTACCATTTTATGTAATATTCAATTTTTATATGTATACATGATCCAATTTCTATTG:1 - chr2R 6989074 3' - HB 86 1 76.71 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCTACCAATTTAAAATGTCGA:1 + chr3L 20252003 3' + copia 185 2 66.44 ATTAAATTAAATTAAACAATTAGAGTTCCTTGTAAATTTTTAATGATCTAAAACAACGAGCGTGAATTTATAGCGAAGAATTTTGACTGGGCTGTTGGTTTAGCCCCACTCCATAGTTTCTTTTTTATTTGAGCAGTTGTAACAAA:1 + chrX 16151859 3' + HeT-A 7 1 82.88 TTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTGGTTATATTTTAAGTGTAGGCAATCGAAAAAAATGCTTGTTAAAGGTTTTTTTTAAACGATAAAAAAGTGAAAGATTTAGTGGACATTTGTGGTGCAACCCACTAGTGTTCGGAAC:1 + chrX 19503965 3' - FB 461 1 57.53 AACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAA:1 - chr3L 465976 3' + Juan 4147 1 63.70 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTTTTCCACTGCCATTTGAGATGTTTGGAACAAATGCATTTTCACATTTC:1 + chr3R 17258167 3' - 412 7126 2 66.44 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATTTAATTGCGGATGTTGTGTACAACTACAAAAAACTGAAGTAAAAGACTTTAAAGTTAAAGTTTAAAGTTATATCGAAA:1 + chr3L 18382064 3' - copia 4912 2 56.16 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATTACGTTTGCTATCTTCTTGACTTTGTAGTATTATGTGTGCTTTATGATTTAGCTAACAACAATTGGAAGTT:1 - chrX 15116013 3' + pogo 2057 1 49.32 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTA:1 + chr3R 21674924 3' + roo 358 2 52.74 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCAAAATAAATCTATGCCAATTATTGACCAACTGC:1 - chr3L 4523955 3' - roo 8751 2 82.07 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACTGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGATCGGAGCTGAAGCAGCTTCAGCAACAGCTCACCA:1 - chr3L 6355560 3' - Tirant 8138 2 64.14 AAGTGAATCATTTGTTGAATTGTTTGAAAATAAATACCAAATGATATTATAAAAAAAGATTACACATTAAAACTTAAAATCACTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTAGATAAGAATATGATGCGATATGATATAAAACAAGAGTA:1 - chr2L 21149225 3' + HB 1506 1 55.48 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAACACGCCTCCCGTTGCCACTCAACGAAGCGTA:1 - chr3R 20934656 3' - 412 46 2 51.37 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATTAAAAAAATA:1 + chr2L 1361079 3' - Stalker2 7258 2 66.21 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTAAAGAAATCTATAGTTCTTGTTTCGCTGTATAACGCACTGCTGTTACCTGTCACCAACACG:2 - chr3R 6645268 3' - blood 8 2 80.14 AAGTGAAACATTTGTTAAATTGTTTGAAATTAAATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCATAGGAATTTTTTTATCTTAATCTCTCTTTTAACTGACTTACTTTGCCATTAATTTAAAAGTTGAT:1 - chr2R 25097595 3' + HB 1506 1 71.23 AATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCAT:1 + chr3R 14954038 3' - jockey 4845 1 74.66 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGTTTCCTGGTATGGGCTATGGAAAATATGCCCAAAAAATAACTTTCGGCTGGCGAAAAAAAGAGAGTGAATGG:1 + chr2L 6892803 3' + roo 346 2 50.68 GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACA:1 - chr2L 9275010 3' - F-element 93 1 73.29 TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTCTTTTTTTTTAGATTTCTATTCC:1 + chr2L 21643159 3' - Tabor 6870 2 63.70 GCAAAGCCAAATAAAAAAAAAAATAAACTGGCCGGGGGCGAAACTTGGAGGTCGTTGGGCGGGTTATGAGGCGGTGGTGATGATGCTGGGAAATTCATTAAAATAGCACAGAGGCGATCCAACAATGAAACGGTCCACTTGGGTTC:1 - chr3R 31884360 3' + F-element 4679 1 54.79 AAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTACATTTTAAAAACTTATTTACAAGGAAATTTAAGGATGTTTTCCACGATCGATCAGCCTGCCTACATATAGATACA:1 + chrX 23046676 3' - Tc1 1482 1 53.42 AAAATAAAGAATTTATTTCTTTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGATATCCACTTTATAACGCTTATCCATGAATGAAATCAAAACC:1 - chrX 11643172 3' - pogo 2006 1 71.92 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCAGTAAAAAACCCTCAAAGCGTAGCGGATTTTT:1 - chr2L 16330972 3' - roo 8753 2 79.45 CATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATCCAGATCACGATAACCATGTCATGTTAGAGGAAAACCTAGAT:1 + chr3R 3076852 3' - Quasimodo 75 2 73.97 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGTGAATGCTTTGCGTGCGGTTGCTTTTCACATAACAAAA:1 - chr2L 14969077 3' - 412 51 2 52.74 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGTCTCAAAGGAATGCGAAACAAGGACGCAAAAGGACGAGAAGACCGCCAAAGA:1 - chr3R 17258086 3' + 412 7477 2 65.07 TTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACGCCCATAATGCGACCCAAAAAGTTTTGCATATTGCGTTTTTAGGACATGTGTCCCTAGCATCGTATCTATAATATGTGGGGCACATTTAGTGCTCGTACGTGTAGTTTTATCCT:1 + chr2R 14135417 3' - copia 4877 2 78.77 AAAATAAAAAAAAAATAAACAAAAAAGTAATTCTTAAGCCACAATTGTTTCTTCATATCTTCTCATAACTTTCTTTTGCCTAATTTATTACCTTTTCCAACTATCTTCTCGCAGTTTTCGCTCAGTGTAGATGAT:1 - chr2R 10927077 3' + F-element 4686 3 54.81 AAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCATGCAAGCTGTT:1 - chr3L 20224112 3' + Chimpo 148 1 59.59 AGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAAGGGTACAATAAAGTGAATATTAAGATATTTTT:1 - chr2R 4750348 3' + 1360 3302 1 81.51 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTTAAGTGGTTCCAATGGCTCTCAATTTGAGTTTGTCGTAAAACTGAATCAGTTACACTTATGTGTGTTCTTACCAGGGACTTAAG:1 + chr3R 18205743 3' - 412 33 2 59.72 ATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGCGTCAGTCGACGAGCAGAGATATCCGGGATTCCGTTGATTCGGCGATCGTGATCTCCGGCTAAGATAAAACAGGCAAAGGAAGGGCACGATCT:1 - chr3R 4726243 3' - 297 6501 1 73.38 GGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGCAAACCTGCCAATAGGCCCCAAT:1 + chr3L 21093224 3' - Ivk 64 1 65.47 ATCATATTGCTACGATATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTATAATTTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACACTCAACCGGAAGAACAGATCGAAGATTCGACCTTAAGTCGTTC:1 - chr3R 8829542 3' + 1360 3114 1 70.55 ACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAGATGTTTAAGGCATCCCCGGAATCTTTTAATGGTTGCCACGCCC:1 + chrX 9757919 3' + roo 8934 2 65.08 TTAACAAATGACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATCGGATTGTATATATCTTTTTACAACGTTTTAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTACATTTGTAGATAGATAGACCAT:1 + chr2L 22750385 3' + Tc3 1621 1 76.03 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCAAACCGTAGCATATTTAACAATAACAAAATGTAGCATACATTTGAGGGCCGCCT:1 + chr3L 2216619 3' - jockey 75 1 61.64 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACACTTTTGCTTCGTTGAGCAAGAATGCTTGTTTTTTACATTCCAATTTTTGGTCCATTATTTATGGCTGCAAATAT:1 + chr3L 2320727 3' + roo 9041 1 61.54 TCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGTAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTTTGTTTTAATCTCATTAAAGGAAAAATAACAAAGGCTCAAATTGATTAGGGCTAAAAACTTCAAAAACAATCAGCTGCA:1 + chr3R 25754650 3' + INE-1 532 1 52.74 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAAGCCAAA:1 + chr2L 17839473 3' + blood 340 2 51.67 TACGCATTCACACTAGCTGAGTAACGAGTATCTGATATTCGGGCAACTCGACTATCGACTATATCATTTATGAAAAGCTGGTGTAAATTATAAAATAAGAAGGACTATACTATAAGAAGGAATAAGAAGAAGGGAATTGTAAAATC:1 - 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roo 44 2 55.48 TGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCATAAAATCCTTATAGAATTAAGCCCACACAATCTTCCAATTTAGATAATTGTATTTTGTGACTTACCTGGAAGTTG:1 + chrX 17992802 3' + hobo 209 1 54.79 ATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATAATTTTAATGCCTAATCTCTGATACACTTAATACACCCGGCAGGTTCT:1 + chr2L 17838092 3' + blood 112 2 65.22 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTA:1 - chr3L 18253801 3' - blood 7088 2 69.86 ATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCAAGGTAAGCTAATCAAAATCCTTTCGGTA:1 - chr3R 23161182 3' - Quasimodo 74 2 68.49 GCCAAACAGCTTTTAGCAATTATTAATTATGATTCTTATGAGCAAGGTTCCCCTCATGGGCCACCAATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGATTAAATTGAAATGAGCTAGGTATATGTAAGTATCACACTTTGAAATAGAT:1 - chr3L 19116408 3' - diver 291 1 65.75 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAGATTTTTATACA:1 + chr3R 11151928 3' - mdg3 40 2 56.85 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTACTA:1 + chr3R 11151889 3' - mdg3 5331 2 71.23 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAA:1 + chr2L 5270355 3' + jockey 4914 1 72.60 CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAG:1 + chr2R 14973701 3' - FB 58 1 56.55 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTAATCTCTTAAGTTTAAAGATAATTACTTCTAGTTATATATCGGTTTAAAACTATGTTCCACAGTAGCTT:2 - chr3R 18528260 3' + roo 358 2 51.37 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCT:1 + chr3L 10469590 3' + roo 323 2 78.77 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATGAAGTTATTGATTTATACATTCATTTCACCTCATGTGCTACATTTACCAAGTTTATGATAAAATAAATCGTTGAGCGATAGAATCTAAAGTTAGCACGTTTGGGAAAAGCGGTTA:1 - chr2L 16857784 3' + P-element 2880 2 78.08 GAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACACCCACACACAGAGATAAATACACACATAAAAATTTAAACATGTTATATACATACTTTACACAAAAATAAATACACATCTAAAATCTA:1 + chr2R 1000438 3' - HMS-Beagle2 6913 2 66.44 ATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATCTTTTGGACCCTTGGAGCTGGAGAAGGGCGCCTCCTC:1 + chr3L 22962164 3' + 1360 405 1 71.32 ACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCTCTTTCTTAGTGTACTCATTTATCTGCACAAAACTGACCATTTCGGTCTTGAAATGGTTGCGTATCCGTACGTAGTCAAAGTAG:1 + chr2R 23937867 3' + Idefix 180 1 56.16 ATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAA:1 + chr3R 19436115 3' + roo 375 1 61.64 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTGGCACTGTGAGAATTGAAAAAAGG:1 - chrX 7756357 3' + roo 9036 1 42.47 TAGTTTAGGAGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATA:1 + chr3R 4679579 3' - hopper 33 1 61.64 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCATAAAATGACCAGATTGTTGGGAAAAAAACGCTAACGTGGCTCTTTTTGAAAATGCATATAAATTCCTTGGAAGAAATCTTATGACAT:1 + chr3R 26486150 3' + 412 467 2 65.00 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGT:3 - chr2R 21848650 3' - Transpac 37 2 54.79 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTC:1 + chr2L 7652262 3' + roo 397 1 57.14 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACGAAAACAGAAATTTGAAAACATCTATAAAAGTAGCATCTCAAATTAAGATAAACTTT:1 - chr3R 5422852 3' - roo 8727 2 62.33 AGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGATGCTCCATTATAATCCGAATTCAAAGCCCTGTTTGTATAGCAACCCGCA:1 + chr3R 17965344 3' + invader2 456 1 63.70 CTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTG:1 + chr2L 17260776 3' + P-element 2788 1 17.81 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTA:1 - chr2L 18112515 3' + transib2 2747 1 74.10 AAGGCGCGATGTGCTCTTTATTAAAAATAAAGATTTTAGAGTTAACTTGTACAAAGGGCAGGGACGTAATCAATAACACTCGTTTAAGAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAAT:1 - chr3L 24039755 3' - springer 7307 4 51.72 CCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGTATTTTCTTTTCCCCTCTTTGTCTTCCGCGCTTTTCCTTCTCCCCTTGTGCGCTGTTGCATTCGACAAAGTTTTATAACGATTGCT:1 - chr2L 15177553 3' + P-element 2751 1 57.53 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATG:1 + chr3R 12363800 3' - jockey 4747 1 64.38 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGTGCATACTAAAATGCAATCTCTGTCCGGCATTAAGCCTAAATTAAATATATTTCATCCAGTGTCCAAAAACCAATTAATTCTTTG:2 + chr2R 23212723 3' + Tirant 363 2 60.96 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAACAAGAAAAAAGCT:1 - chr2L 17295796 3' - Doc 24 1 64.38 GTGCAAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTAAAGTGTCTTTGATAAACCCACTCCGCGATTCCATTCACAACAGTTACCAATAACGGACCAAAACTGAAGATGGAAATGCGGAAAAGATAGCGTCAAAGTGAAACGAA:1 - chrX 10647175 3' - 1360 29 1 67.81 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTTGAACCTTAACCTCCCCGGAGTGAAGAAAGTTTTTCGCTTGTTGTTTGACAAATTGTTTTGTGCAGCCTTCGAAGGAAATAAAAGGCAACATTCGACTGTAAAGCG:1 - chr3R 8639187 3' + copia 242 1 75.86 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTGAGTGAAG:1 - chr3R 10213036 3' + P-element 2839 1 44.26 CGCTGACAACTCTAAAAGATTGGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGGAGGGCACAAAAGCCGAATTAATCGCGAGGCTTTGGAACTGTTATTGTTTTTATAGGACCTTCAGGTCTCCTATCTTCTCAA:1 - chr3L 24152970 3' + mdg3 327 1 61.24 AGAACATTCACGGGTTTTTTGAATGTCCTTATATGTTTTGCCTTCCTTTTTAAAACTGCCTCCCACATTTTTGAAAAATTGATCGATAGATTGGCACAGTGGTTCGTCAGTGGAAATGTGGCAACATAAGGCTGACTTCTGGCTTT:1 + chr2L 9835043 3' - HB 434 1 62.33 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCT:1 + chr2L 5792080 3' - blood 7080 2 63.01 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGCTGGCAGACAGATTACGTAACTCG:1 - chr3R 26486037 3' - 412 7113 2 64.06 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTGAGTGAAAGTTTCTAATACTGCTAGAAATGTATATTTATAGAAG:1 - chr3L 1358453 3' + 412 7488 2 62.50 ACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAAGTGCTGACAAGGCAATGACGAAAAAACAAAGTCACAGGCAATGCCGC:1 - chr2R 5399798 3' + 1360 2961 1 57.69 GGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTTTAGTTCTCATTGTTGCCATCAACAACGACGCGCCTATAAACCGTTTATTATTATTTACAATTTTCGCCTCGACGCTGTCAAATATTTTCAAATCG:1 - chrX 4790515 3' - Quasimodo 40 4 56.10 CTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTATAGCCCTTGGCACACATCACATTTTTTCACATCCCATCGAAAGCCATATAATTCATGGAGCCACACACGTTTCTTCATTAAATTCCACG:1 - chr2L 16456691 3' - BS 4992 1 53.10 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATCAAGCTCAGATCAAAATATGCAACATTCTGCATAAAGTAGT:1 - chr3R 2649189 3' - 412 82 2 73.29 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACATTTGACCTCC:1 + chr2L 12486412 3' - roo 74 2 71.23 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGTCAGAGAACGCAGACAACACATCGCACATATTAAGACAGATTTTGGCCTTAGGCAGCCATCTCAGCTGGCCTGACCAGCATATTTA:1 + chr3L 5069529 3' - opus 7029 4 66.90 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATGGGAGTTCATCATTACACTTAACTGGCATACAAAAAGAGAGCCCCTCAAGATTCCATGCTGAAAATCTTAAAAAAAGAGGCTTAAGAGCACGGCTGAGTGG:1 - chr3R 15920177 3' + 412 7506 2 57.53 ATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATGTATATATATACATATAGATACATCGATTCTCTGGCGATTCTTCGAATGACTCATACTCATCAGTAAATTGCGCACTCATTCACTGACCAATT:1 - chr2R 7720654 3' - Bari1 24 1 67.12 ACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCAAATAAATAAGTAAACATAGAAAAACGATTGCTCGCGTGACACATGACTTCAAAAAAATATTCAACTATAAAGTGTTTTTTATCCTTTAGTG:1 - chr2R 12319732 3' + Tc1-2 40 1 65.04 ACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTGCTGAGCGCGATG:1 - chr2R 21820732 3' - Doc 85 1 69.86 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCATGTGGTCAGCGAGGAGCAGAGAACG:1 - chr3L 11803953 3' - blood 7021 2 71.56 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACCACAATCAGAAGCATTGGAATCCTAATTAACTACACTAGTCACAATTTAACATTATTCGAAGAAGTCCTTATAATCAATCAATGATCAATTTTTATTAGTTA:1 + chr3R 8017841 3' + mdg1 7403 2 55.48 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCCAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGTAATACCATATAAGCCAAGCTATTGAGTACATTCCATTTCATAATAACAAC:1 + chr2L 4929890 3' + blood 308 2 63.70 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTATTAAATTGTTCGTATGAAATTAAATTTTATACGAATATTTCCAAAACTTTCCCGAAATATTTAACACACTGTGCGCACAGCTGCTTTTCGGCGTGACGTTACGTATA:1 - chr2L 6601229 3' - roo 8674 2 71.53 GTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTTGTTTGTTTTACCTTTTTTTATGGCCTGACGCCAGGAGTCAGCTTCCACGGCGTTTTCAGCTTTATTTACTTATGTTTGTTGTATTTGC:1 + chrX 10111133 3' + mdg3 219 2 65.00 AAACATAAATATACACATATACTTTTCAGTTCTTGAATAAATCTAAAACGTTTTGAGTTAACCTTTTCATTCTCTAAGTTAATGTAGTTCGCTTGGTTGCTTATACAACATTATAACTGAAATATTTTTCATATAATTTTTAGCAC:1 - chr2L 12148044 3' + Stalker4 7045 4 49.32 GAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGGGGCTTGGGGGTATTTTTGCGCGAGTATTTCTGCGGAAACTGAAAAAACCCATCATCATCAGCAGCTGA:1 + chrX 10434658 3' - accord 7031 2 81.63 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGTCTTGGGTTGAGGGGCAGGTTTTCACCGGGTCAGAGGTGCAGGCGCCACCTAATGAC:1 - chr2L 12486327 3' + roo 9045 1 60.55 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAACTTCTCAGCTCTTCTACGGTGGAG:1 - chr3R 7450267 3' - Doc 27 1 44.60 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATAC:1 + chr3R 11151890 3' - mdg3 78 2 70.55 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGCAAGTGGAGTGGAGGAGCCATGGAAAAGAACTAAGAGTTAAGTGAGTAAAGTCAACGTTTAATGA:1 + chr2R 21439569 3' - jockey 25 1 70.55 CGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGACGGTAAGAATCAACTTTCACAGCGTAAGAGTCTCCAG:2 - chr3R 8042259 3' - BS 12 1 66.44 AAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATAAAAAAATGGAACATATTTTATGGGAATTAAAACAAAACCTTCAACATTCATTGTAGGTTGCCCATTA:1 + chr2L 13332724 3' + micropia 5392 2 54.79 TGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATATATACACTTTATACAGAATCTACGAGTAATGGTTATAAAAATATACAGAGATAGA:1 - chrX 15408716 3' - INE-1 515 1 67.81 TTTGTCAAATTTACATTGCATCATGAGCTCTTTCCGCTCTCTCGCTCTTGAACAAAAATTCGAGAATGCCTGGAGCGACCTCTAGAGCCACGCCGAAAGAATAGTGTGCAAATTTCTTTTTTTATGATAAAACTTTTCATTCACAC:1 + chr3L 25231821 3' - 1360 197 1 77.40 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATCAAGTTGCAAGCGGCGGTCTTAAGTTGAAGTTAAAGTTAATGCCA:1 + chrX 6405159 3' - jockey 4746 1 68.49 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTAATACTTAAAAAGGCTGAAGAATGACTAAAACTAAAGACTTTAGTACTCACCATATGAAGATGCTCTTGTAGGCATTTTCATT:1 + chr3L 19999298 3' + 1360 3357 1 64.38 CTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCATATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGACCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGAATTTATTGGTAGGTCAATCACCCAACCACCTAGGAACCCGATC:1 + chr4 714216 3' - 1360 3249 1 73.97 GTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCCTCTTTTCTTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGCCTATGGGTGCTCATTCATATCTATAAAAAGTATAACTTTATGCGTGTTCACTCGACTCTAG:1 - chr3L 23082380 3' + copia 98 2 53.42 AACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCCCTTTTTTGCTGTTGGGAGCGGGCGCACGCCCATGTGTGAGTAGG:1 + chr3R 18397491 3' + P-element 2663 1 37.78 CAAACCCAGTCCAGATAACATACAAAACTCATACTTCTCCTCAAAAAAAGTAAATTATACCACAAACAGAGAAGCATAAAGACAGAGACACGCACGACCAATAAAGCCAATGCAAAAAATGCCTCACATAGAAAAGATTAATACGC:1 + chr2L 18720589 3' + I-element 5123 1 58.22 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACATAATTAGTCTGATAGATGTAAAATTTA:1 + chr3R 6413682 3' + 1360 3362 1 67.12 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACACCTTGCAGTAATGGAGACATAACCAAACTCAAT:1 + chrX 3647035 3' - 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chr2L 14093919 3' - R2-element 3584 1 90.91 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGTTTAGCAAAACTTGAAGTTGAATGTATAAATGTAATTTT:1 + chr3R 6422897 3' - jockey 90 1 70.55 GAGTTGGTTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTGGCTAGTTAGATAATAAAAATATGTTAACTTATTCTATATACCAAATT:1 + chr3R 6816772 3' - Juan 466 1 67.12 AAACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGCGGACGTTTAAGGCGGTTTGTGGAAGTTTTTTGGCATATCGATAGAAATTTACAAGACTAATACAAAAATATTATGATGACATATGGTATTTTACCTTATTCCCCTCAACGCACACACAAAA:1 + chr3L 10592409 3' - INE-1 257 1 64.38 AGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATCCAAACTAGCTCCTTAGAATTAATATTACTTACAACCATTCAATTTTCTTTATCGGAAATGATAGACAGTGTAAAAATTAAAT:1 - chr2L 21976671 3' + Idefix 7359 2 64.38 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTGAGTGAAAGTTTCTAATACTGCTAGAAATGTATATTTATAGAAGGAACCTCTTTTTTTCTGGCAGTGCAGCCACC:1 - chr3L 1358421 3' + 412 7507 2 55.71 GTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCCTCTTCTTTACCTTTAAAGAGTGTCAGATTTAAGGGTACGTGGGTATGTGGCAGCGCCTGCTGTGAGGCTGGGTCATTGATTCCGC:1 + chr3R 31852262 3' - opus 345 2 57.04 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCATTGTATCAGTGTGACAATGGCAAATAGTGTTTTGCGTC:1 - chr3R 28450638 3' + roo 9028 1 54.79 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTATTTCACTGCCAATTGTTTTTCCCGGCCAGAAACG:1 - chr2R 11095703 3' - diver 5913 2 67.12 AGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAACATTCTACTGCCCGGCGCGTGTGAAGCGCAATGTCAGCATTCTGCCGTGAAGTCCTATTTGCCCAGAATTGACCAAGGAAGTTGCTGAGCAATATCGATGGAGCGAACTGAAGG:1 - chr2L 11909349 3' + gypsy4 6653 2 55.24 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCT:1 + chr3L 12223215 3' + Transpac 5151 2 72.22 GAATCTCAACCTTCTAGCTTTACCTTCTAGCTAATGTGTCGACGTTCATACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTCATCACTTTGTCAAAGTATCACAAAAGCATCTAGAAAAAAGCA:1 - chrX 12566980 3' - INE-1 165 1 50.00 GATAGTCGGGGAACTGGACTATAGCACTCTCCTTTGTTTTGTTTTTATTTCACTTTCTTTCCTTTGCTTCCTGTTAAACAGCTATGTCACTTGTGTTGCTGCTTTTCCGGGACAAGCATATTTAGACTTTACAGTGCAGGCGGACG:1 + chrX 22786671 3' + INE-1 564 1 69.18 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATATATACTTAATATGGTCAGAATCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAA:1 - chr3L 19471448 3' - mdg3 53 2 60.96 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTCTACCATAAAGCAGGGGAATTGAGGTTATAATTATTGTGCTGA:1 - chr3L 21256886 3' - jockey 4716 1 70.55 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTTTGCCGATAGCTTCTTCAATATTGATAAACATGGGCCAAACAACAGTTACAGTTTAAGTATAAT:1 - chr2L 10514234 3' - 1360 23 1 65.07 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAATATTTATGAAGCATATTTTGCGGCTCCGTTATTTATATTTCTTTGGTCAAAATATCTCTTCTACTTTTAGGCAGATTCTCAC:1 + chr2R 11264096 3' + jockey 4954 1 55.48 GAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCACACCGCACACAGTCCATTGAAATTCGAAAAGACAAACGCAAGAATCG:1 - chrX 5370186 3' + accord 183 2 76.92 AAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGAAAAGGAAAGGCGATAAAAATAGAAAGAGAGCAAAGGAAATCCTTGGCAGGATGCGCGACACATTGCGCTTTGCACTCTCCAGGAAATGCTGAAAAAAAGCGCTGCAGAAGTG:1 + chr3L 3799011 3' - accord 185 2 76.03 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAAC:2 + chr3L 10469610 3' + roo 343 2 65.07 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAAAACATCAGCAACAACAGCGGCGAATAG:1 + chr2R 19198372 3' - FB 68 1 78.15 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAGATTTGTTTTGGTTTAAGATCCCAATCAGTCCGGAGTTTCAATTAAAGTTCCATTAACGCT:1 - chrX 6632913 3' - P-element 31 1 64.38 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCACATTAAATGAAGGGTGGTCTGAAAACCGGGTCGC:1 + chrX 6633077 3' + P-element 2878 2 76.92 CCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTCTTAAGTTCTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACTACTTAGTTGGTAATCCATTACCATGCACCAAGTGTATACAT:1 - chr2L 1090961 3' - 412 92 2 42.47 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATAACTACTATCTTGGGCAATTATAGCTTCTCGGAAACATCATTCAGATTCAATCCCAACCAGTCTGTTGTTAATGAAATTCTATCG:1 - chr2L 22689917 3' + Tabor 7288 2 60.42 CTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACACTGGA:1 - chr2R 10910208 3' + Tabor 435 2 55.56 GTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTCAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGATTTCATTGGGATTTTCATTTGCAGCAATATTGATCTGTCCAATCGCATCTGTCAA:1 + chr2L 805175 3' + blood 7011 1 60.27 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGGCTACCTATACACAGAGATGGCAGCGTGAAAAGTGAGAGAAACTCTTAGAGAATAAACTATAATTATATCAACAATATT:1 + chr3R 24499614 3' + blood 7348 2 55.48 CAGGATCTATAGCCGAGTCGGTCCGGCCATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCAAAATCTCAGGAACTATAAAAGCTTGAATATTTGTTGGATATTTTTTCACAATTTTATTATTTTATAAATTTATAAATTTTTTCTCATTTTAT:1 - chr4 809188 3' + INE-1 95 1 73.29 ACTTACACACACACACACACGCCCGCACGCACAAGGACGAGTGTTACTGCAGTTGTTTTGTTTATTGATGAGTCTCGCAAACCAATAT:1 - chr2R 20512048 3' + Quasimodo 35 2 68.18 ACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGATACGAAACGAAACAAAATCCCAACTGACAAGCAAGACTGACACA:1 + chr3R 16241544 3' + Tirant 8276 2 62.90 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACTCGCTGCGTATACGTAATTTTTATTGGACACTCTCACGCGTCG:1 - chr3R 20450376 3' - hobo 11 1 76.12 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCATAAGAACTAAAATACTTAAAGGCATACTTATAATTTCCAGAAGAGGATAGCTATACATTAAAAACTCATATGAATA:1 + chr3R 14954127 3' - jockey 4770 1 40.41 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAGTTTTGCTATGGCGTTCTATTTTAGTACTGAGTGTTTTTTTTTTAATTTCACATTTACCCTATACTGTTTGATT:1 + chr2L 21698360 3' + 297 6934 2 57.53 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTAGCTTATGACCAGGTTAAGGTAATGTCCATTGGATACTGTTGCCTATTTTGTGGCGCCC:1 + chr2L 6388156 3' - jockey 57 1 53.33 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAAC:1 + chr2L 3231969 3' + roo 9050 2 58.18 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATTAACTCATTTATTTTTCTCTAAACTTTCATTAATCTA:1 - chrX 8977460 3' - I-element 84 1 73.97 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTGCGAA:1 - chr3R 6413560 3' - 1360 46 1 60.83 AACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATATATTAAATGGTTAAGAATAATTGAATAGTAATCCAATAAGTACTTATTATTACTTGTTCT:1 + chr2L 13139087 3' + McClintock 6377 2 62.33 GAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACCATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGCAAATGCCACCCCTTTTATCGTTATTTACTTAGAGGATTTGGCTTTTGATACAACACATTTGTTGGATTGTTTTCTTCACC:1 - chr3R 13838160 3' - 297 14 2 73.29 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCGGGTACATTTGCGTGTATTTGGGTATCAGCGG:1 - chr3R 25049978 3' + P-element 2861 1 61.48 AGATCCTGATCAAGAATATATACACTTTATATGGTCGGAAACGATTCATTCTGCCTGTAGCATACCCTTTTACTCTAATAGTAACGGGTATAAAAATAGAGGACCATAATTAAAAAATCGTAAATGCTTTAGTTAAATA:1 - chrX 22484661 3' - INE-1 81 1 51.08 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGA:1 - chr3R 13225508 3' - hobo 51 1 69.09 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAG:1 + chr2L 5792108 3' - blood 7015 2 77.06 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTG:1 - chr3R 10213043 3' + P-element 2814 1 33.57 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGGTGGACCATTGATGCTGCGGGAACAGGACGTTTGGGTGCTGCGGGGAGTGATCTCCGGAGGTGTGATCAACGAAAAGGAAAACACCTGTGAGCTA:1 - chr3R 14218392 3' - roo 23 2 69.66 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTCTAATATTCAC:1 - chr3L 17537729 3' - Doc 57 1 56.16 AGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATGAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATGTTATTAAATATGATCCGTCTTAATGAGAATTG:2 + chr2R 4270302 3' - gypsy9 19 2 61.64 TACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATTGTTTGTACTATTTACCATTTGGCGACCCGTTATCAATTGCAGGTGCTT:1 + chr2R 18689234 3' - Burdock 6207 2 65.75 CGAGATCTCGGGAACTATAAAACTGGAGGGTTGGGATTAGGCATTCACGCAGTAAAGGATAATATCGACAAGCAAAAAGCGTCCCACCACCATAATTTGTCTGTTACTGTGACTGTCATTTAGTTTATAGTATATGATAT:1 - chr2R 4706095 3' + INE-1 147 1 68.57 TTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATAAGTATATTAATACTTTTAATATTTATTCGTATATAGCATTATTTCGTTGTTAAATATGCATAAGACTCAGA:1 - chrX 20145528 3' - Juan 4074 1 51.03 CATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATTCTATTCGCATTGGAATAAACATTGTTACCTCGAC:1 - chrX 7425997 3' + 1360 411 1 79.45 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGATTTCATTTGCTAAATATA:1 + chr2R 11164553 3' - roo 8677 2 76.71 CTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAATCACA:1 + chr2L 23049717 3' + opus 419 2 77.40 ACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAGGCCATAACTGCCATTAAATATTGAAAATATTT:1 - chr2L 7771942 3' - jockey 83 1 73.13 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACAATGTATTTGGAAAACAA:1 + chr3L 24766006 3' + 1360 3338 1 81.51 AATCTATGCTTATCAGCAAAACTGATCCGTATTTGATCTGTTTTGTGGTCAGTTAAGCAAGCTATTTTGTAAATATTAAGAATTATTATTAAGACAATGGATGAGAAAAGTTATTACTTCAACATGATCCCAATGCTGACATCGTT:1 - chr4 122946 3' + BS 245 1 73.29 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGCAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTATGAAGCCAACGAAGTGGAAATTACCTTGTAAAATTTAAAAAAATCAAAATCAATATGGAAACGATT:1 - chr3L 2320603 3' - roo 8718 2 54.11 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTAACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCATTATGTATCATTATGCTTGATCATGATAAGAATTAGTGACAAGAA:2 - 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roo 32 2 59.38 TATTGATCCTGATCAAGAATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTAAAACCTTTTCAACGAATCTATTATAGTATATATATACCCTTTTACTCTACGAGCAACGGGTAAAAAATTTATACCACAAATGTGG:1 - chr2L 21582254 3' - INE-1 84 1 72.60 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGA:1 + chrX 6633032 3' + P-element 2817 1 37.67 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACAC:1 - chr3R 9125642 3' - Doc 31 1 64.29 AAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCGATAAGAGAGGATTCAATT:1 - chrX 388212 3' - 1360 39 1 59.59 ATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGTAGGGGACGATGTGTCAATTGCATATCCAGGTAGACATAATAAAGCACGATAGTTAG:1 + chr2L 21754986 3' + accord 7297 2 56.82 CTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATTGTAAGTTTTACTTAAT:1 + chr2R 21870260 3' + copia 190 2 64.38 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCCGGTCACTCGCCAATTCACGCTA:1 + chr3R 31141075 3' - Burdock 6176 2 57.93 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATGCTGAAATAAAAACTTATAATATAGAAAGCTTCACTTTTAAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTCCATTCTCTTTAAACGTGAATAAATATAAAATAAAAAT:1 + chr3R 15054269 3' - 297 7 2 77.40 GTTGGAAAAATAAAACAACTGTTTAGAAGAACTGTGTAATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATGCCAGAAAA:1 - chr2L 9778709 3' + F-element 4582 1 65.07 AAAATATGAATATATGTATATATATATAGATTTATATGTGTTGGTGGTATTCGAATATACATATACACACACTGTATGTTTCATGTGCAAATTGAACTAGCAGGTCAGGCGAGGACATATTGGGGCCATCGGGCCGCGATACAGAC:1 - chr2R 22063056 3' + G3 4504 1 52.05 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCTAATCCAAATTTGTAATTTATT:2 + chr3L 16059353 3' - 297 43 2 60.00 ATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACACTACAAGTAACTGGTATAATAACGCAACAGACGAAGAGCTTTTGGTATGAAACTTGCAGAGATTTCAAATAAGAAGTTTACATTAAGAATACGATTAT:1 + chr2R 5436744 3' - INE-1 10 1 56.82 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAA:1 + chr3L 21093255 3' - Ivk 40 1 58.22 ACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGCCAGGCAGTCAGCAACATTTTTGCCACGCCAAAAACTTTTCTCATTACGAAATCGTTGCAAC:1 - chr3R 7480208 3' + 412 29 2 60.27 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAA:1 - chr2L 14239164 3' - 412 86 2 75.17 GCCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTT:1 + chr3R 21395195 3' - G2 464 1 77.78 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCATATATATAGAAAATATACACATATGTATATGTACCTAGACGTGCCTATATCCCGC:1 - chr3L 16059244 3' + 297 350 2 67.44 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGGTTTTGGTTTTTTTTTTATTTCAATAATTTATGTCATTTA:1 - chr3R 20840076 3' + roo 8996 2 74.13 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCGGTTAGGTTTCAAAAGTTATAGTAGTTGTAGTTGTTATGAAAAGCAACTATGTACCTAATAATCATCGCCCTGCTTGC:1 + chr3R 8218068 3' + P-element 2879 2 79.86 CCTTGTAGCTTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTCCATACGAACAGACGGACATGAAGAAGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACCCTTCTGCCCTGTTACATACTCGTAAGATTAAATGTTATTTCTCAAAGAAAATTAT:1 + chr3R 6130739 3' - INE-1 156 1 76.03 AATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGATACTCAAATAAAATGAGTTGTAATAAAAAAAGTTTTTTCGCATAATATACCCTCAACTACTATTAAAA:1 - chr2R 19194990 3' + FB 198 1 53.42 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAACGGTGAAAACTAG:1 + chr3R 12363815 3' - jockey 4732 1 54.11 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAATGTAAAGACGAAAACTCGTGTGCATGACTAAT:1 - chr4 916321 3' - roo 8736 2 75.97 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATG:1 - chr3R 13225477 3' - hobo 45 1 51.85 ATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTACCATGCCCCCTTGGTCACCCACTCGCACTACATAGCTGCACCCACGCTGGTGCATCATGCCCCAATCATATCGCATGCCCCACTCA:1 + chr2R 11146696 3' + Quasimodo 209 2 69.63 GTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATG:1 + chrX 20685951 3' + Ivk 5327 1 53.10 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTAGCCCAGCAAAATCATACTGAATATATTTTTGCTCCTATTATTTTGACCGCTGCTGTGGATGCTGGACTGGGAAACTAAAGTCAACAAACGG:1 + chr3R 17492936 3' - jockey 4785 1 66.44 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGGTACTCTCCCTTCCCCAAGTGGCATATGATAT:1 - chr3L 22594142 3' - 297 42 2 56.45 GTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTTCTCAAGATTTTCAAGACTCCAGTCACCACCCCTCCATATACATA:1 - chr3R 10437027 3' + BS 5053 1 57.93 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACT:1 + chrX 7706820 3' - P-element 62 1 35.66 AATTATATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTAATCCTTTAACAATTATTATTCAATATTTACAGACAGATATGAACCGTTGATTATCAAGATTAATGGCAGAGAAAATTTAAGTTCAATTTGTCGGAAA:1 - chr2L 12766977 3' + S-element 1623 2 66.44 GAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACAAAAAAAAAAAGAAGAGAAAAACAGAAAAAAAAAAACACCAAAAAATAA:1 - chrX 1572165 3' + Bica 76 1 62.11 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGCGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGATTGGGCACGATTAAGTGCTCCACCTCGGTGCGATTCATCAGGTTTAGTTCGTCCACAGTGCGCAGGTGCAAG:1 - chr3L 363436 3' - blood 7059 2 51.37 GAGCATGCACTGTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTACACAAAACATATGCATGCCCTCTGCATGCATCAGAATACATAGATATAAGCAATATATGTGCGGCTTAGTTTGAAATTTGTTTATCAACTGGGGCAGAGTGCTATATTTACT:1 - chr2R 4344578 3' + Stalker4 204 4 71.92 ATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGTTAGGTTTTGTAATAATATATAATAATGATAATGATATTTACCAAGAATATGGTTCTTTATGGGTGTTTATTATTATGA:1 + chr3L 13987281 3' + diver 6069 2 50.00 TCGGTAAGCTTCGGCTTTCTTCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGAGCTATAGAGGCAGAGAGAGACAAAGAGAGAGCCGCGGCGAAGG:1 + chr2R 8666105 3' - P-element 28 1 47.96 TTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTTTAAAAGCAGCAATCAATTTTCATATACAGAAGTTATGAAAAGCATGGCAAACATGAAAATTTATTTCAAACTCAGCAATTAGTCAAAA:1 + chr2L 15081706 3' - Doc 4455 1 65.75 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTAACCCCTGTTGAGAGGCGGCAGGATTCTCGTCAGTTGTTTGCTTAAAACAAATTACAAGCAG:1 + chrX 7741982 3' - hobo 47 1 54.07 GGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCG:1 + chr2R 14973672 3' - FB 85 1 76.22 AGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGATGTAA:1 - chr3R 11151789 3' + mdg3 5454 2 55.48 ATAAGTTTTTTTCTTTTTTTTTTGGAATATATGGATCTCAAGGATAATTCTTATATTTGGGTTTATACACGAATGGATAAAAACCCGGACGATAGAGTTTAGTTCGTGTTCCTTTAAATTTTGAGGCTGCTTGTCTGAGTCGCATA:1 + chr2L 17375564 3' - HMS-Beagle2 492 1 78.08 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACGAAAGTTGACAGGGCGGGGAATGAGCTACACTGCTGTAAAGCAACCTTATGGAATAATTATTCAAAACGCTGAGTTTGTGCC:1 - chr3L 10469490 3' - roo 8702 2 58.90 AAGTGAGGGTAGATACACTACAACTAAAATAAATGGTAAAAAGTCACAGATTATAATCAAAAAAGTGTACTGATTATTGTATCAAATAGTACGTGGTCAATACGACAACATGCTATTTTCTCAGTGCAGATTGCTGAGCAACTGCT:1 + chr3R 12744798 3' - Stalker2 7249 2 71.23 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATCTTTGCGAGAGAGTTTGTTTATGCGCCGTTTGTCCCACATAATTTTTGTTTGTTAGTTTTTCTCTAGGGTTGTCATA:1 - chrX 7706699 3' + P-element 2876 1 75.54 CCTTAAAAAAATATAAAAAAAAGAAAAAAAAAACCCAAACGAAACCATAATTTAA:1 - chr2L 9197510 3' + BS3 1765 2 70.91 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCATTAATGGTTAAATAAATAAATTGATAATAATGGCTGTGTTTATTAGGCATAAGAATGTTAATG:2 + chr2R 13293453 3' - roo 58 2 59.59 TCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTT:1 + chr3L 18253870 3' + blood 301 2 71.92 GTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAAGGGCGAGAGTCGGGGAAAATGGCACTTAACGCGCTTGTAATGAGTATTG:1 - chr2L 9594391 3' + blood 7010 1 65.75 ATAAAAGCGAGGATCTCATTGGTCTTCGAGGAGGCCTTATTTGAATTTCATGCTGCTATCTTAAGAGGACCCATGTTTAATGACGGACCTTACGCATATTCACAAATTGGTAGCCACCTTAAAGTTTCAC:1 + chr2R 4341781 3' - G5A 68 1 60.00 GGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTTGCACTTGTAAACTGAACTGAGATAGCGAATCCCTAATGGCAGGGGGATTGCCTCTGGCATTTCTGAGTGGGCCGACTTTTGGGCTTGATT:1 - chr2R 17544115 3' - gypsy5 6944 2 74.79 GAAATGTACATATATATATAAGGGAAAAAGCACAAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAATATTTCGCAGCTCCCATGGAAAATCGTAAAAAGTCATAAAATCATAATATAAATCCCATTGAAATTACAAAATTGTTGATGTATCA:1 - chr3R 6015048 3' + Juan 4184 1 53.42 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTGCGAAA:1 - chr3R 6413559 3' - 1360 71 1 67.12 GGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACCACAATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTAGTCACAATTTAACATTATTCGAAGAA:1 + chr3R 8017803 3' + mdg1 327 2 78.77 CTCTCATATTCTTATAATTTGTTTATTGACATCGATACTTTTGTTTAATGATTGCCTTTTCCGGGCCCTGTAACTGTTCGAATCGCACTGTGTCGTACTGTACGCAGCACTGAGGTGCACTTCGCGCCCCCGGGCTCACCCCGATA:1 - chr2L 11036620 3' - Idefix 307 2 71.92 ATTTTAAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCATGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAATTATTTTCTGAAAGACGAAGGCTCCACAGGCCTTCA:1 + chr2L 11458915 3' + hopper 1198 2 74.66 TTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCTCTTGAATAATTCGTATG:1 - chr2R 14135268 3' + copia 191 2 60.69 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTATGTAGCCAGTTCATGTGCACATGGCAAATCAGAGCT:1 + chr3R 12609263 3' - 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chr3R 4217216 3' - HB 444 1 62.76 AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTAACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCATTATGTATCATTATGCTTGATCATGATAAGAATTAGTGACAAGAATTAAACTTGAAA:1 - chr3L 17921941 3' + copia 5064 2 58.22 CTGCTATTCTTATGAAAAGCCAAAAAATTGCGATTTTTAAAAGACAAAGATAAAGGAGTATTTCAGGGTATATAAACAATGCATTCGGGCTTTTAATAAACAAGCTTGCGTTTGTTTTATTTGGAACTTATGGCCTCGGGATAGCT:1 - chr2R 25175038 3' - HB 205 1 75.34 CAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAATATCTATAGCCAAGCTTCTTACCTAATCGAAAATATCTT:1 + chrX 16690619 3' - FB 83 1 73.97 TTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTCACTTCCGAGCGCATTTGATTTTAATTTTACGC:1 - chr2R 7599143 3' - diver 5944 2 54.11 GTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAAAAAAAAATTTCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCTTGACATTCCATATAGCAGCAAATTGGCATGCACATATGTATGTATCATCAATATTATAT:1 - chr2L 16834890 3' - 1360 137 1 57.53 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACTCGCTG:1 - chr3R 20450413 3' - hobo 60 1 61.64 GGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGTGTTTGTGGTAAAT:1 + chr2L 19140447 3' - Max-element 54 2 51.37 TTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGGGATAAAATCACGATTCCTCCTGCAACGGGGCTAGCAAGCAGGCTCAGCAATGGACCCGGAATGGTCATGACACCGAAGCACTGAGCA:1 + chr2R 13292133 3' - roo 9018 2 68.50 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACTCAATTGATACCAATGCAGTCCCTTCATTAGTTATGTATTTAACTATATTTTTTTAAATCTTATGGTAAAA:1 + chr2L 10426733 3' + mdg1 7412 2 50.68 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGTATCATAGATATGTAGCATATCATGGTATATGTAGCATATACTTTAGG:1 + chr2R 17169288 3' - hobo 72 1 68.49 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTAATCTCTTAAGTTTAAAGATAATTACTTCTAGTTATATATCGGTTTAAAACTATGTTCCACAGTAGCTTT:1 - chr3R 18528259 3' + roo 359 2 50.68 AACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATCGTCTTAAATCATTTTAGCTGAAGTTCACTGTAATCCCTTAGTTCGAAACTTTGCTCTTTCGAATACAACAGCGGAAGATCCAACAAAAGCACATTAAACAAAGA:1 - 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chr2R 13916839 3' + jockey 227 1 61.64 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTATATAACCCACCGATTCCGGCCCTCGAGGACATGCATCTCGACGTCGCTTCGACTGTCTTG:1 - chr3R 19435980 3' - roo 54 2 56.16 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGAAAGCTTTTGTCTCACCTAAATGAAGGCGAATTCGACTTCACTTTGTGTAGACTTTACGCGATAGAGAAAGAGTGAATCGGAA:1 + chr3L 22642095 3' + hopper 1404 2 74.19 AAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCTTTTGTCATCATCATTTTGTTGAAGAGTACGTACAAAAAATAAATAATAGGGAGTGTTTGCACAGACAAAGA:1 + chrX 10046449 3' + I-element 5146 1 58.52 GTAGCTGTACCCAAAGACAGCAAAGTAGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTGTTCAATATCTATTGCACTGAGCTATTACTTAATACTTATTACAGTATACGGACGCGAAGGTTTCAGTTTCAT:1 - chr3R 7616757 3' + Stalker2 307 2 73.97 CAAGAGAGAACGCTATAGTCGACTATTAGATACCCATTACTCAGCGGCTAAATTAAAAAATCCATAAAATATATAATATATAATAACATTTTGAAATCGGTAAGAGTTACAACGCTTACTTCTCATACTTTTCAACGAATCTACTG:1 - chr3R 19440217 3' - INE-1 578 1 50.68 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAAC:1 + chrX 7706801 3' - P-element 91 1 19.42 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAAAAC:2 - chr3R 20934684 3' - 412 74 2 67.12 AAGTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTGCTCCCATCATGAAGAACCCTCCGGACAAAAACGAACCGAACAAGTAAATTTTATGGTAATTATAAACTTTATGGCTTTATTAAAAAATATTGAAGAGAGAACA:1 - chr3L 5711382 3' - HMS-Beagle2 490 1 62.02 AGAACTAGCGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCATGATGGTAAGTATGTAACGGGGAAGTTTAGGGAACCATAAAATAACATAATT:1 + chrX 401982 3' + accord 7159 2 62.07 TCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATATCGCAACGACAACCTATTATTTATAACAACTTTACGGTTTCAACTCTGGCAG:1 - chr3R 6425232 3' - accord 163 2 64.38 GAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGTTGAAACCTTCAAAAATGTTTCACTGTGTCATTCATTATGTAATTCCAACTAAAGAAACCGCAATT:1 - chr2R 11164352 3' + roo 9063 1 69.18 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCGAAGTTGCGACGATGCCCGCCGACAG:1 + chr2L 17260807 3' + P-element 2830 1 42.22 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAGACTCGAATTTACGATTAATATACTCACAATAT:1 + chr3L 21013959 3' + roo 355 2 54.79 AAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAA:1 + chr3R 13349559 3' - Ivk 99 1 74.48 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTTTATATTACGATCATG:1 + chr3R 12363795 3' - jockey 4745 1 66.19 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTATACTTATTTGGTTTTCCGTTTTAAAGTCAATTTCGAAAATAACAATACAGACCAAT:1 - chr3R 21216841 3' - 1360 65 1 67.81 AGCGGGTATCTGATAGTCGAGAATTTCGACTATTGCTATTCCTTGTCTTAATCCGTTCATGTAAGCCACAACTTACTACCATTTAACCGATGATGAATGTACGTTTTAATAAATAACGCATAGCTAAACCCCTCCCGCTTTCACTC:1 + chr4 707698 3' + INE-1 553 1 56.16 TACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATACAAACACGTGTACCGAGAATATTTGAAGAAATTTAATACTTTTAGTGCACAAAGCGAAAACTGTTGAATGCCGAGCGATGGAGCTGAAAAGCAGA:1 - chr2R 23353935 3' - gypsy 20 2 71.53 GACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTGGCATATAAATAAAATTCTATTATGTGGTTGTGGCTTATATATGCTGTGATCGTTACCAAAATTTTCCACTACGCCAGCGAAATGGGAAGGATTTTTGGCA:1 + chrX 4032276 3' + transib2 2807 1 72.60 ATTCACACTAGCTGAGTAACGGTTATATGATAGTCGGGGATCTCGACTATAGCATTCTTTCTTGTTTAAACTACTCCTATACTTGTTTTTGGACATTTATACGGATGATAATTGCTAGTTTCCCGCGACTAGTAAACCTGAATAGT:1 + chr2L 16670677 3' + INE-1 536 1 60.27 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAGTACATATTTCGGAGAATATCATTGAGCAACTAATTATATAGTTTAATTCAATTGCCGAGAGGAGTTAGTCATGCAAATAAATTAAGCAAAATATTGAAAATAG:1 - chr2R 17014331 3' - flea 13 2 76.03 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTACTT:1 - chr2L 12325019 3' - jockey 4735 1 56.85 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGTAATACCATATAAGCCAAGCTATTGAGTACATTCCATTTCATAATAACAACTAATACATAATTCATTTCCACTCAATTGTGCCGCAAAGGTTAGCCCCCATAGAGAC:2 + chr2L 4929946 3' + blood 7375 2 71.92 AAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAA:1 + chr2R 11095824 3' + diver 6044 2 68.84 GACCACGCCTCCACCTCCGCCCCCGCCAACGCCACCGCCCACATTGCCATTCGAATTGGAGCTGCAG:1 + chrX 17825796 3' - transib4 2512 1 64.18 ATTTTATCGTCCATTTTGGATTATTAATCCCACTTCTGAGATTTTAGCCGCCGAGTAAAAGGCTAATTGAAGTGGAAACAATGACCTTTCCTTGTGTAAATGAGTCACAAACAATTTGTGTGG:1 - chr3R 9912561 3' - mdg3 288 1 65.04 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTAACTTTCAGCGTTACAGCTTTAGAACTATTTTAGAGTGTAACCTTCACTTGCAAGCACATTTAAGGGTATTGCCCCCTTCGATATTCA:1 - chr2R 23409008 3' - opus 7 2 73.98 GGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTAAAACGAATGCAGAAACATGCAGATCGTTAGGCGCTATTTTTTGGTCTT:1 - chr3R 7778258 3' + transib2 2758 1 68.53 ATCGGCTCATTTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACATTGGCCTCATATGGTCGCTTGACATCACGTTACAATAGCGTCGCTGAGTAACAGTGTGGTCTGGCAGATCTTCCATTTTGGAAAATAACTTATATTTTAAAATACT:1 + chrX 18620257 3' - Bica 4877 1 78.77 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCGCACACTGTGCGGAGAAAGAGATGGGGCCACATGGGCAGAAAGAGATGGCACGACGAGCACATTTGCATTTTCATAGTTTCTGTGCGGAC:1 - chr2L 16615724 3' - hobo 33 1 64.38 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGGCATTAAATAAATAAAGGCCAACTTGATGCCGTCCTAACCAAATGTTATTCAGACGA:1 + chr3R 18528411 3' - roo 22 2 67.12 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCATTTCACGCACACCAAATACAAACAAACCAAACCAGATGATAACAA:1 + chr3L 15364937 3' + 1360 3369 1 67.16 AACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATTGTTTGTACTATTTACCATTTGGCGACCCGTTATC:1 + chr2R 18689220 3' - Burdock 78 2 74.10 AAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGAGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGATCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCC:1 - chr3R 14049328 3' - transib2 58 1 52.74 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGCATTGTGACAGGTGCAGCCGTATTTATTATAACAAAATGATCAAAATTGTGATACATTTTGACTTTTAAACATAAACG:1 + chr3R 17047925 3' - 412 7097 2 55.48 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTGGTGAGGGTTAAACGCACAACAAGAAAAGCCATTTCAACACTGCT:1 + chr2L 12486481 3' - roo 8666 2 77.93 GTCCCGACACGGTTCAGTCGGTTCAGTCAAGCTAAACATAACATATGCATAGTTATGTACAGTCAAGAAACTGTTTACACACTATCAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTATTTATTATATTCGCAAGTTGAGTGGATTCATTTTTG:1 - chr3L 13876252 3' + mariner2 109 1 73.29 TACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTTCGCTGGGCCTCCATTTCCGTTTCTGCGACTGCGCAAAAGTTCAGACCATCGAGGGAAGAAC:1 + chr3L 6355694 3' + Tirant 8471 2 53.72 TTCAAACAATTCAACAAATGTTTCAGTTTTATTTGTTCAATAGTTTCGAAAATAAAGATTAAAACGACATAATAGGCAGAAAAAAATGTTTATAAGTGTGGGCGTTGGAGTTCTGGGCGGTATAATAAAATATCGAACCATTTTTA:1 + chr3L 13359753 3' - HB 1512 1 55.48 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCGTAACTAGTGAGTGAATAGCAACAACCAAAACATCAACACCCACCGACAACAACAACAGTGACTGTGGTTAGGGGGTGAAAGGTAGGTGGTAAGTGGGCGTACTAGAGGGGCGGCG:1 - chr2L 2707503 3' - jockey 4765 1 80.14 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGGCTATATGGCAAAGGATGTGGAAAGAGGTCGGTTTGCTATTCACTTGAATTAAAATGAATTTAAGTGGTTTGCT:1 - chr2R 21748224 3' - 1360 46 1 52.05 TCATGTTATTAGAAACATAAGTAATATTACGCCACTGAACATGTTTTACGTAGATATTGAGCCTAAAAACGAAGTGATATACCGCATGTCCCAAATAGTTGAACTGCTTTAGTCAATTAGTAGTTTATTCGACGCGCTGCTTAAA:1 + chr2L 17387633 3' + G4 454 1 52.41 TTCCAAAAAATAAAAATAAAAACGGAGGCAACATCAAAGAACTGGAACACAACACATGCCAAAAGAATCGTAATTAAAACTCTATAACCACTGTGCGCATGATGAATTCCTGGGGCTGTGTGACAAAGACAACTTGAGCTGCCAT:1 + chr3L 3690395 3' + mariner2 788 1 51.72 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCATAGCTGC:1 - chr2R 21848641 3' - Transpac 27 2 61.38 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTG:1 - chr3R 25050031 3' + P-element 2805 1 17.60 TATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTAACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCATTATGTATCATTATGCTTGATCATGATAAGAATTAGTGACAAGAATTAAACTTGAAATG:1 - chr3L 17921939 3' + copia 5066 2 56.85 AGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGATAGAGCAAATCATATGTCTCCATAATTTCGAACTTTAATATTATAAATCCATATATTTTTTAAAAAA:1 + chr3L 6437882 3' + mdg1 7300 2 54.11 AACATTTACCAGGACCTACGGATTCCAGTTGTGAAAACTGAAATTGTCCTAAAGGGACTTGTAACGAATCCAAATCAATTGGCCAAATCACTTATAGAAGTGAATAATAACACGCACATCCAACGTAACGATTCACCTGCCC:1 - chr2R 5284601 3' + Doc4-element 2719 1 77.46 GATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCACTAGAAGCGCATAGAATGGAACTCGAGCAAAGGACATCCGGCAGATACAAGATACATTTCGACTCACGCTTCTGCTTCA:1 - chr2R 17332089 3' + jockey 4986 1 71.23 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTCGTGATTGTGTTAACTTGCACATATGATGCATGCCATATGCCATTACGTTTGGCGTGGTTTTGCGCTGTGACAAGTGGTTAGATGTTGGGAGAAGCTGGTCAAATCCCG:1 - chr3R 12520708 3' - Burdock 32 2 62.33 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGGTTTTCCAGCATGCAACTCTCACCGTTTTTTATTAAAACTATTAAATATTTGCCTTTTCGCAG:1 + chr2L 14239286 3' + 412 479 2 73.97 AGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGATTACGGATTTTGTTAGAAACCAAAGCAAAACGGTGAAATGGATTAAGTATAGACTTAAAAATATACATGCGAATTA:1 - chrX 7605546 3' + 1360 450 1 50.68 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACCTTTTCTTTTGGCCAAACTTTCTGCCCCCGTCGACGTCACAGCTGATCGATTTGC:1 - chr3L 20497733 3' + P-element 2868 1 60.78 AGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCATCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCTTGAAA:1 + chr3L 12223220 3' + Transpac 5174 2 62.70 ATATATATGTATGTATATATTATGTATATATATTATATATACATAAGCTATATACATATTTCCAAATGTGTTGTTGGTTTTTGGTGAAAAAAAAAGTAAATTTTTTGATTGTTACTTTAAACTCCTAACCCAAAACCTAAAATAT:1 + chr2R 8287019 3' - INE-1 66 1 76.55 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTAATCTTGACGGTTTAAGTTGTAACGTTTAA:2 - chr3L 14375566 3' + roo 400 1 76.71 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGAT:2 - chrX 388258 3' - 1360 85 1 76.03 CGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGGAAAGGGAATCTGACAGCCTTAGGGTTGCAGAAATTATTCGAACCTCCAACGACGCCGAATCGAAGATCAATCGAACCCAA:1 + chr3R 20873229 3' + 297 6893 2 59.59 CACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCC:1 - 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chr2L 9275004 3' - F-element 81 1 65.00 GGGGAGAGCGAACGTTTATAAGCCATTGTAGATCCCTTCCTTTTAGTCTGAGGTGCGTCGTCTTGGCCTCTATGTGTTTCCGCCAGGTGAGCCGCTTTTTGGGTATACGCATAACTTATGGATTTCT:1 - chr3R 14303427 3' - Doc3-element 4249 1 73.23 GAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAGCCGATACACCAACTTATTCCTACAACGAGCGAAACAGTAAGAAAGCCAAA:1 + chr2L 22719661 3' + 1360 3320 1 63.70 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCACTAGAAGCGCATAGAATGGAACTCGAGCAAAGGACATCCGGCAGATACAAGATACA:1 - chr2R 17332112 3' + jockey 4967 1 57.04 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAATGTATTAGGAAATCGTTGCCACTTGCCCATGTTGTATTATGTTCATAAAATAGTGCTTATGAGTGATTTGTCGGATGTGTACGAGTTC:1 - chr2R 13293320 3' + roo 9040 1 63.01 GTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAAATATTAATGAAGTCATCAAAAGTGAAAAGATTAAAATTACATTTCTA:1 + chr2L 9418583 3' - rover 72 2 67.81 CCGAACTTGTTTTACGTGGAGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCATATACACCCACAAGTGAGCATATCAGGCTCACTCCACACTGCGTCGCATCGTATCTGCCACAGTAATCTGAGTAAAGCGATGTCTATTCA:1 + chr3L 15005644 3' - R1A1-element 5314 1 51.37 AGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAAAG:1 + chrY 3648904 3' + 17.6 434 2 64.38 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATTTTTCTCGTCCACAAATGTATGATATATAATTTTCTT:1 - chr2L 15081030 3' - Doc 23 1 67.63 GCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAACTCGGCCATCCTGACTAGCTGATCCCCTGATCATGTTTTACATTGATTGCTTAGTTGTATGATGAATTCTTTTACCTTATTTATCATACTAGACTAGCCTTGAAACTCCATTTTCATA:1 + chrX 22413868 3' - invader3 5191 2 78.62 GAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTACCTATCGAAAACAGCTGATTCCGAAAAAGAGAGGAAAAGCGCGTCCCGAAAGCTTTTCCTTGT:1 - chr3L 9695569 3' + P-element 2609 1 45.89 AAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTCTGTGTGGTATGTACAGTCAGCGACAC:1 + chr3L 21910444 3' - pogo 89 1 78.77 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACCCTTGGGCTTTGGATACGGGCTAAGGATGTGGGGCTCGGTTTCG:1 + chr3L 19580969 3' - 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Cr1a 3976 1 73.29 GTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGCAGCGTAGATTCATTCTGAGGCATCTGAAGAACTTTGGCTTTGCTAGAAGTGGCATGATGGATATAGTGCACAATGAGGCCACGTGCTTGCTGCAG:1 + chr2L 16294809 3' - Doc 484 1 67.81 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAG:1 - chr3R 23161287 3' - 412 7137 2 74.66 CACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAGGCCATAACTGCCATTAAATATTGAAAATATTTTAGAAAA:1 - chr2L 7771935 3' - jockey 88 1 69.86 CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGATTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCAT:1 + chr3L 18253868 3' + blood 7311 2 71.72 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCATAGGCCGACTACCAATAATAAGAAGGAAGACCTCTGGACTGTCTGGAACCTCATAATTTATACACTGCAGAAAACTGTCGAAGAA:1 - chrX 21669994 3' + mdg1 387 2 60.27 TAATAATATAATAATAATAATATTATTTAATATTATTTAAACTAATTAAAGATAGAAAAGCGTAACTCGACGCATGCCTAATATAATACGTGTAATTAGATAACCAGGTAAAGTAAATCACTAAAATTATCCACTTCTGTTGACCA:1 + chr3R 17414879 3' + invader3 5053 4 56.16 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAACGCTTGTAAAATATTACAATCGTGCGATCAAAGTAAAGGAGTGCTTAAATATAACAATATTCTT:1 - chr3R 11944822 3' - roo 56 2 58.22 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATCACAACAATGTGCAAGAGGTCTTATCTGTCACCAAAATACATTACCAATTTATTGCCAAAAAAAAGAGTG:2 + chr3R 12919806 3' - 1360 49 1 51.37 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAACTTCTCAGCTCTTCTACGGTGG:1 - chr3R 7450269 3' - Doc 18 1 48.44 ATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGGGCAAACCGATGGAAATTTCTGCCTTCATGAGGCGGCAACAGGTTACACAGCAGCATCAATTAATTTTTTTAATAACCGACAGTTCACGCCTAATAAATATTCATGAAT:1 + chr2L 12144347 3' + transib2 2813 1 76.71 ATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCACTAGAAGCGCATAGAATGGAACTCGAGCAAAGGACATCCGGCAGATACAAGATACATTTCGACTCACGCTTCTGCTTCAA:1 - chr2R 17332088 3' + jockey 4987 1 71.92 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCTAATTATTTAGTACACATTTATGCTGAATGTCTCGACT:1 - chr3R 17047830 3' + 412 420 2 77.04 CTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTACATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGGTTAGTTATTCTAGGGTCTTTGAACAGACCTTGTTAAAAATTGTATTTCAATAACAAAATTAAAC:1 + chr2R 9769610 3' + 1360 256 1 58.22 CCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTTTGCCTTGAACTATCATGCTCACTGGTAAAAAATGACTTAATGCCATTAGTGCCAAGTAGTGAAGCATTCTTAGA:1 + chr2L 3367028 3' - 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chrX 5834835 3' + Doc2-element 246 1 86.21 GCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCCGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTAC:1 + chr3R 2689432 3' + diver2 4474 1 63.46 TTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGC:1 - chr3L 7837147 3' - jockey 4795 1 56.30 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTGCATGCATGCAACACCCTGTAAGATATGGAGATACGAGGCCAAAA:1 + chr2L 18522365 3' + roo 9040 1 62.07 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCCGGAAAGTAGGCAGCAGAAAGCATTTAATTTTTATAGTGCCGCAGCTGCTGTCCATGTGTGTGTGCTTGAGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 9418236 3' - jockey 4676 1 79.02 TATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTCTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCTATAGTGCATGGTGCGCCTGTGATTCCTCATACAGTCCAACTTCCATAGCTGGAACATCC:1 - chrX 10816819 3' + hopper 1343 1 75.34 CAAGAAGAAATATACCAAAAAAGAAACATGGGTGTAAATTGGAAAACAGCAACAACGAGCAAATAGCTCGTCGTTCGAATGCGTTCCACATGGGATCCATTGGCTCATTTTGCCGTCTCTCAATTTGATCTTGTACTTAGGGGGC:1 + chrX 10556249 3' + Bari1 1653 1 72.41 TACTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTTTACCGAAAAACGAAGAAGAGGCAATTGGCGGTATAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAAGGTACCAGAATGCAATGAACTTCATTAGCACCATCA:1 + chr3R 10518887 3' - diver2 4794 2 73.97 ATTATTATGATTATATTATTAATATCATTAATGATATTAATGATTAAATTTAAATGAAATACTAGAAAATCAAGTAAAATAAAAATCCTTGTTAAAAACTAAAAAAAAATAGATATGTTCTTTCGATTTTTTA:1 - chr3L 4516722 3' - invader3 5052 5 66.17 CAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATAACTACTATCTTGGGCAATTATAGCTTCTCGGAAACATCATTCAGATTCAATCCCAACCAGTCTG:1 - chr2L 22689937 3' + Tabor 427 2 58.90 ATATATACTTTTTATGCCCACTTTGTTTTTATTAAAAAATCAGCAAATACCGTCATTAGTTTTATTATGTACATGAAAAATGTATACAAATTCGCAGGACTTGATGAGCACTTAGACCTGGAACACATAATCATGCAATCTAAGTC:1 + chr2R 17257258 3' + hobo 2468 1 54.79 ACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAGTTTTGCTATGGCGTTCTATTTTAGTACTGAGTGTTTTT:1 + chr2L 21698323 3' + 297 318 2 75.34 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATAATTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAACCATCGCTGGCACAAGGACCCGCTCCCGTTTTC:1 + chr3R 14218500 3' + roo 338 2 72.00 CGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGTATCAACATATTACGGCATTTATGGTAATTTTATTGGTGCT:1 + chr3R 10150223 3' + 1360 3310 1 78.08 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATGGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAACACAAAAACAGAGATACACAGACACA:1 - chr3R 16276358 3' - pogo 51 1 76.19 GATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGTTAGGTTTTGTAATAATATATAATAATGATAATGATA:1 + chr3L 13987236 3' + diver 139 2 76.71 GAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAGATTGCAGCTGCTCGAGGATTGCATTTCCACCACTCAAGAGCAAG:1 - chr2L 20624861 3' - 1360 470 1 64.83 CTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATTGTTTGTACTATTTACCATTTGGCGACCCGTTATCAATT:1 + chr2R 18689224 3' - Burdock 6217 2 72.60 AACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATAATATGTATGTTTATAGTATATAGTACCTTACCGCTTGTATGGAAACCCCTCTCCGCTCATTTTTACATCGCCTGTTCT:1 + chrX 8219488 3' - opus 7153 4 54.11 TTATTATTATTTTTTATTATTATTTGTAGTAAATATCCCGCTAACTGCTAACTTTACGCTTAGCAACTTCGGCTGCAAGACGAGATCACATATAAAAGCT:1 - chrX 19430583 3' - flea 5002 2 70.00 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACAGAGAGGAAGCGAACGAACAAATGAGTTGTGTATTAGAGGAACAGGACGTACATAATCA:1 + chr2L 22690060 3' - 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Transpac 133 2 60.00 AAAATCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTC:1 - chr3L 18183068 3' + Tirant 8461 2 54.79 AAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTGGCGCAGCCGGACTAGAACTAAAAGGATTAACGTATTTTGGCCCACGGACCTTGCGGTTAATAACAGGCTTCGCAGCTCATCTGTTGTATTCCATTTTCATT:1 + chr3R 23949616 3' + accord 7367 2 50.00 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGCCCATCTGCCCCC:1 - chr3L 7837135 3' - jockey 4764 1 74.14 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTAAATAAGTACTCTAACAACAACCGATTTAATCAAACGTAACAAGGCGGAATTTTCAGGTGCGTTTCGTCACTACGTAGAATTTATTAA:2 + chr2R 21848820 3' + Transpac 294 2 72.60 ATCAACACGTTTTTCAAAAGTGTGGGCGTTGTAATTTTGTAGGCGTGGCAACATGGGTCAAAAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTT:1 + chr2L 22036461 3' - INE-1 261 1 93.15 TGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATCGTTCGTAAATGTCTTTGTCATTGTTTCCGTCCGGTCAGCATAGTCTTCGTAAGTCGTCAAGTTCGTAGAGTGCTGTAGGTATCCGTACG:1 + chr3L 23878261 3' + X-element 4531 1 65.75 TATGTATTTGTATAAATGTAATCTCTTGTTTACTAGACGTTGTTGTTCGCTTCTGTGGCTGCTTGCCACATATTGCCAGCTTGTGAGTCGCTAGGCCTATATAAATATATTGATCAACTTTTATCCGTCGCTGGAAAGGAAGAA:1 + chr3R 25574455 3' + Stalker 7098 4 76.39 GTTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTATAGCGTTTTCTCTTGTTTTTTTATAATGAGTTATGAGTTAGTTTATACCAATGCTCGCTTTTGGCCAAGTTGCTGATGGTCAGCCTGCCGCCATTTTGATGACGTTG:1 + chr2R 12125750 3' + INE-1 546 1 65.07 AAAAAAAAAAACGAAAATAAAATGAAAAAAATATTTCGAAGACATATTTACTTTATTTGAAAATACTTTCCTTATTGTTTGCACACTTGCCGATCGGCCTGTGGGCGTCATTTTGCACCGAC:1 + chr3R 26746319 3' + Doc2-element 251 1 74.59 GAGTATTCAGCTTGCGACGTGTGAAAAATTTAAAAGGCATTATTGAGGGCTAGTGTCCGCATTTCGTGCCTCAAGATATGACTTTTGCAGTAAACAAACTTCCACTGTCTGGAAGGAGG:1 - chr3R 20607926 3' + 1360 416 1 80.67 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAAATGAAACAAAATGGGAGGAATTAAGTAAGATTTATATGAGGCG:1 + chr3R 9963265 3' + I-element 5272 1 73.29 CGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTTTATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGTATGCGTGTATATCATGAATGCCTTATACATATTTATGT:1 + chr3L 707730 3' + Tirant 237 2 69.18 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGCTATTAACTGGCCTTTGTACGATAG:1 + chr3R 21674943 3' + roo 401 1 69.92 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGTCTCAAAGGAATGCGAAACAAGGACGCAAAAGGACGAGAAGACCGC:1 - chr3R 17258092 3' + 412 7478 2 67.63 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATATGTTTATGTATTTGTGCGTTGACCAGGGACATTTCCATAAATCTGCCAG:1 + chr3R 18635304 3' - opus 7054 4 66.17 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCAAATATTTCGTTCCTTATTCTTATATTTCGTTATATAAATATAAATATTTTTATAAACACTAAAA:1 - 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G2 422 1 77.40 ACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATAC:1 - chr3R 4679477 3' + hopper2 1520 1 76.03 ATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAGTAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGAAGCGGGCATTTAAATGCCCAACACGACGACGAGCCAC:1 + chr3L 19162771 3' + F-element 61 1 63.21 GAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACGTGATAAGCAAATCGAGTAATTTTTTGTGCCAAAACAACAGAAGCACATCGTTATGCTGCGTTA:1 - chr3R 20870836 3' - 297 158 2 54.68 CTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCATCTCATTAAATGGCGGCCAGGACAGCGAAAATAATAACTACTCAACTTTGAGCGCAACTATGAAAAGCAGTTGCGTC:1 + chr2R 13362498 3' + jockey 4899 1 60.16 CTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGTCACTTGCTGCAAAAGTGCGCGAAATTAGGCGGTAACAAAAATAGGACTGACCACGTATTTGCTGAATAATGTGTTGGTCTTACCAAAGTGCATAAACTAATCATTAAGTTTATAAA:1 - chr3R 24389425 3' + Tc1 148 1 63.70 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGTAATATTGCGAACTCACTCAGCGCCGTTTTGAATGAGTGGAACCTTTTAAATAAGGTAGTAACGATTGTAACAGACAACGACGC:1 + chr2R 6493218 3' + transib2 2789 1 65.75 AAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCCGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATACTAGGTAACAATTTGTTGTTATATGCGGAAGCAGAGAGGGGCTTCCCGTTTCGTTGTCACTGTG:1 + chr2R 4932007 3' + Stalker4 7133 4 55.48 TTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATA:1 - chr2L 9275007 3' - F-element 90 1 71.23 ATACTGTGCCGCTAAAACTTTAAGCTTCTAGCTGGTTCGAGTCGTCGCTAAGCATTTTTCTTTTTGAAAATGGATAACTTTTCGAGCCGTTCATGGTGCCCGGCTCGGCACGTATGCCAGTTTTGAAAAGTCCATACAT:1 + chr3R 30095849 3' + G5 342 1 55.40 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAA:1 + chr2R 10160608 3' - hobo 63 1 60.14 AACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGAGATGAAGGAGAGCTTCGGGGACTGCAGCGAGACTTTTTGTCCCCCATTCTCGCACCATAAAACATATGTACATCACACTGGTAAAAG:1 - chr3L 14303645 3' + Quasimodo 228 2 60.27 CATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATTTAATTACATATTAAACAAATTGTTGAAGTTAGGTAAGTACAACATTTATAAGCGTATGTAAAC:1 - chr2L 22315502 3' - frogger 2291 2 65.75 GTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTA:1 - chr2R 4577094 3' + Chouto 436 1 78.68 AAAGCAATCACTCCTATTCATTTTATTCAACAAATACGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCACCTCATTTCGCGCTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGAATTGATGTGACTACAGCAATCCGATTCCACCTACCTACCTA:1 - chr3R 5183409 3' - Tc1 247 1 71.92 CAATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGCTCACCCTCACCGCCCTACACGATCCTGATGAGCAGCTGAATATGCAACAGCAGCA:1 - chr2L 3917029 3' - 1360 437 1 61.64 GTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTTAATGAACTACAATATCATCGCTTTATTAAAGCAAACTGACTTAATTGTA:1 - chr2L 19691203 3' + roo 379 1 63.01 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGTCGCCTGTCTAGCTGCACGACGATGCGTCGCGACGTTGTCGCCGAGTGTCGTTCGTGGTCAATGCGGGGCAGTTAGAAAAACGAGCA:1 - chr3L 26057844 3' - P-element 27 1 60.87 GGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAACCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGTTCAGCCGTCCGAGATCACGAACCCGAGCACGTTTCCCGAG:1 - chr3R 14841114 3' + 1360 2983 1 63.64 TCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGTCTTGAAAAAAGAGCGAGGAGTACACACGAACACAAAA:1 + chr3R 25050081 3' - P-element 67 1 39.73 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTATGTACTTTGTATATCTCATTTCGTGTCTTGTTACCTCTATCTAAAGACCACTGTATAGCTCTGTTGGTTGATTTAATTTTTG:1 - chr2L 17626558 3' - roo 8701 2 60.96 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCACTAGAAGCGCATAGAATGGAACTCGAGCAAAGGACATCCGGCAGATACAAGATACATTTCGACTCACG:1 - chr2R 17332100 3' + jockey 4977 1 64.58 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAGTAGAAGAAGCAGCGCTGGCAGCGACGCCGACTGCG:1 + chr3R 31724926 3' + P-element 2883 2 61.90 GCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGATATGAATCAATTCTGAAGTTCGAATCTAAAACAGACCCAAATA:1 - chr3R 20840137 3' - Doc 4332 1 70.55 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATATATACTTAATATGGTCAGAATCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGA:1 - chr3L 19471445 3' - mdg3 50 2 58.90 CTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAAAGGAAATTAGTGTTTGTTAATTGCATATATTGCGATAGTTTAGAACGTTATTTTGCATGTA:1 - chrX 20456311 3' + 297 6950 2 59.59 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTAGTTGCACTTTTTCCCAGTGTATCAGTTGTGGTGTCAAGTAGCAACGGCTGCGGCAAGGACAACATCATAATG:1 - chr3R 15054096 3' + 297 6935 2 53.42 AAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACCTGGTTTAGGAATTTTTGGTTGTTTCTTAACCTGTCTTTTACCCTGTATAGACATCCTTTTCTTATGACCGCCAA:1 + chr2R 25160315 3' + invader2 5053 2 51.37 GAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTCTGTGTGGTATGTACAGTCAGCGACACAATCGTA:1 + chr3L 21910451 3' - pogo 81 1 74.66 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAATCACATCTAACGCTGGACGCGAAA:1 + chr2L 23049736 3' + opus 438 2 64.38 GTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAATAGGCTATGAATTGAGCTCTGACTATCTGTGGA:1 - chr3L 20918499 3' - F-element 403 1 76.52 AAGGTCTTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCCGATGTTAGGTTTAAGTTAGTCTTAATTTACAAGTGCGAGAGAGCGCTTTCAACGATGAACAAACTGAGTAAGTGATTTTCGCATTGTGTGAAGCGGGCAAGGACAGAAAA:1 + chr3L 25079140 3' + Max-element 8370 1 53.42 CGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGAAGGTTGAAGTGGTACTG:1 - 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chr2R 25175490 3' - I-element 5158 1 68.46 ATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACGCATATTGCATATTATTTAATTAGCAAAGGCCTTCGGCG:1 + chr2R 7599225 3' + diver 6028 2 74.66 ATTTTGCATGATTTTTTCTTTTACCCCAATAAATTCTCATAGCTCCATTCATTCATAATATCAAATAAATTTTTCTATATATAAATAGAATAATAAATTTTACTCACCGTTATTGTTGCTGATGGCGAATCGCTGCTGCAGCTG:1 + chr3L 3767152 3' - transib3 2690 1 79.86 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTTTATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCATTTATTTTTAATTTATCTTTTTTGTCAAGGCAAGTGTC:1 + chr3L 18253928 3' + blood 358 2 67.81 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGCTTTGATTTCT:1 - chr3R 28116977 3' - hobo 66 1 69.17 TTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAGTTTTT:1 - chr2L 2120384 3' - I-element 4950 1 58.82 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCTCTTGAATAATTCGGATGAATGTTTTGTGATTACTATTGATATT:1 - 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chrX 124083 3' + INE-1 527 1 75.34 GCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTATAGCCCTTGGCACACATCACATTTTTTCACATCCCATCGAACGCCATATAAT:1 - chr2L 16456728 3' - BS 5030 1 45.89 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAG:1 - chr3L 19031261 3' + roo 8995 2 77.78 ATTTCTATCGATTTGCCAAAAAAAACTTTTTCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGCGGTCCTAGTATACCCGGATACCAAAGACCCTAGAATAACTTTGCGGATACCCTAGCATACCGGATTTTACTGTATAAAAGGAA:1 - chr2R 5738127 3' + INE-1 310 1 72.86 GCTTAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATTGTCGATAAAACTGAATAGATTACAGCATTAAGATTGCTTTTAATAACCAGAGATAAACGCAATGATTTTGATACTAC:1 + chr3L 23318774 3' - Cr1a 4010 1 56.85 CGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGCGGCAGATATCGAG:1 + chrX 12273145 3' - jockey 4737 1 69.40 ATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAACCGCAGTTGGGTAATCACTTCAAAATGCGGTAAAT:1 + chr2R 11095859 3' + diver 6071 2 54.11 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGTATGCTTTTAAATTTTAAACAGTTTACCATTCATAACTCCCCCTGCCAATAGTTATTATAGCCAGATCTCTCAGCCAGATTGGCC:1 + chrX 7385025 3' + I-element 5320 1 65.07 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATATATAAGAAGGGGTCTAATTCCATATTGATGAGACCGAGATGGGATTGTCATGGGTGAGGGGTGGGCCAGCTCTC:1 - chr3R 28406330 3' + opus 7478 2 61.54 ATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAAATATTAATGAAGTCATCAAAAGTGAAAAGATTAAAATTACATTTCTAGTTGTATGTTTTCCGGGAATACCGCTGTGGGATT:1 + chr2L 9418617 3' - rover 6989 2 57.53 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACATTCTCGGAGGGAAACTTGGTGGTGCTGCCTCAGCTTCTTT:1 - chr3R 24499512 3' - blood 7069 2 67.74 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCG:1 - chr3R 25050009 3' + P-element 2806 1 30.14 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGATGTAATTGCCAAACATTTGAATTTCTG:1 - chr3R 11151767 3' + mdg3 224 2 70.55 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTTTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTG:1 - chr3R 9125647 3' - Doc 55 1 51.03 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTAGGCTATGATATGTGAAATATTCAA:1 + chr2L 5270382 3' + jockey 4941 1 54.11 TGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATTTAATTGCGGATGTTGTGTACAACTACAAAAAACTGAAGTAAAAGACTTTAAAGT:2 + chr3L 18382041 3' - copia 65 2 64.14 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTGTATGGACTGAGACTTACCTGATCGGATCGGGAGTGCTAGTGGCTCCGCTCAGCCTGTTTAGTGCTCTGAGTG:1 + chrX 18220695 3' - Burdock 44 2 50.68 ACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTT:1 + chr3R 24454833 3' - F-element 297 1 80.91 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGC:1 + chr3R 19436072 3' + roo 350 2 65.62 AGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAACCGCAGTTGGGTAATCAC:1 + chr2R 11095842 3' + diver 6054 2 58.22 ATATACACATATCTACATATTTACATACATTTCAAGAGTTTTTACTCTGGCTTGTATTTATTATATACTCTCCTCCTGTCCACCTCATCATTGTTGTGCAAATTCGTTGTTCTAGTTGTAATTTTAAGCTGAAATTTGTTGCGCGC:1 + chr3L 10692494 3' - G3 4505 1 67.81 AGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAAACGAGACGAATCGAAATGAAAATCGAACAATTAAAAGCTTGTGGTGGGTGGGGGGAGATGGCGA:1 + chrX 7612859 3' + 1360 430 1 55.48 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATCTTTGCGAGAGAGTTTGTTTATGCGCCGTTTGTCCCA:1 - chrX 7706739 3' + P-element 2830 1 44.83 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAATAAACGCTTCTATTGTATTTAGTAACTTCAGCCTTCTTGGTATTGATATATGAGATCATAAGGATAGGAT:1 + chr3R 18153666 3' + copia 5074 2 52.74 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTAATATCACCCGAGATTGCACACGAACTCCATCTAGCGGCAGCCGTAGATGTGCCCAAAACTTAA:1 + chr3R 5422956 3' + roo 393 1 62.86 ACCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGAGATTTCGTGTAGTCACCACTTTCAAAATTAA:1 + chrX 9455912 3' + Ivk 4920 1 78.08 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCGCACACTGTGCGGAGAAAGAGATGGGGCCACATGGGCAGAAAGAGATGGCA:1 - chr2L 16615763 3' - hobo 50 1 61.29 GCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATAACATATACATATTATATACATATTAATTTAGAATTTGTAGAAATAATAAATTTATTTACCGAATACGATTTTAAATTCCTTTTATATATTTAAGCGGATGTATTAAACATGCAAAC:1 - chr3L 19339277 3' + Tc1 1643 1 74.66 CACTTTTTCTGGCCAAAATTAAAAACTCCAGAACGGGGAGAGATGTTAAGATAATTTTTATTCCTCGTGTATTTATAGACCATCTTCTATATTTTTCACGTTTCCACAAGACTGTTTTTCCTCTATTACTT:1 + chr2L 21108507 3' + Transib-N1_DM 19 1 55.73 TCTCACAATATGTTTTCTGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACCAATAATATTCATCCAACAACTTTTGTTCCATAATATT:1 - chr2R 21870179 3' - copia 82 2 73.29 TCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAATACTTTTTACTGAGAGGCGAAAAGGACGAGAGTAAGAGTCGTAATTTAGTTTTGTGTTTACTTTCCGGAGTCTTCACTTCCCCGATAAGACCATTGAAGTCTTTGAGCGAACACTACGAGCCT:1 - chr2R 19824429 3' + mdg3 249 1 45.21 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTATTTTCATTTTTGTATTTCACCTCAAGTATCACACTGATAATAATTGATTAAAA:1 + chr2R 1373223 3' - pogo 39 1 58.90 GAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAAAAGGGGCGAGGGAAAGGGTGTGAGACCAATGGAATTTGCAGGTTTTT:1 - chr2L 5504797 3' + G2 196 1 67.36 ACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATGCCAAATTGAACTTTATAAATGTAATGGAAAACA:1 - chrX 10047336 3' + I-element 5273 1 73.79 AGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAGCAGACGCAAAAGAAAGCAAACAGTCAGAAAAAGGAAAGTACGCAAGCAGAGATGAGTTACAAATCATACATACAGTTATGACCTGGGTGTCTCGTTAAGACTTGGGTGTCTCATAGGC:1 - chr3L 24153680 3' + BS3 216 1 62.33 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATATACCACATATGCGATTTTTTGGGGCTGCACTTTGCTCTGACCATCTCTTA:1 - chr3R 15152621 3' - opus 161 4 61.72 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAAC:1 + chr2R 11164503 3' - roo 63 2 65.07 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGCAGAGGGTTCTTAACTTGTATATGTATATGTATATGCATATGTATTTTTATTTGTATTTGTATATGTTTTGCCTTGGCTTTCGGGTTAAACATTTCGTGCCCTGC:1 + chrX 3351705 3' - opus 36 4 56.16 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAAT:2 - chrX 7756417 3' + roo 8988 2 75.34 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTTCGGCAGGCC:1 - chr3L 9212704 3' - hobo 28 1 59.52 ATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTGATGGATTACTCTCGTTCAAATGTCGAATCT:1 + chr3R 7616845 3' - Stalker2 7288 2 58.22 GTGACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAACGGCCATATCAACATCAGCAACACAAGCTGCATAAAAGCGTATATCAAAGTGGGGAAAAATAATGAAAAATATAAAGAGTCGGAAAAACTGAACTCAA:1 - chr2L 21862990 3' - accord2 7351 1 73.97 TTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCATTTTCGTTCG:1 + chr3L 7801337 3' - Transpac 119 2 67.44 ATTTGTAAATATTTGGACACGTGGTGTATTTTTAACAGAATCACAAAGTTGAGTAAAAGCTTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAAAAGCTGATCTAACATATGAAACCTCGCCTCGTGGAATCAATATTTATTTTCAGAATGACGT:1 + chr3R 20565321 3' - transib3 246 1 66.44 TAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCATTTTTTGTCGTTGTTTGGCTTTTTCCACAGACGCGCTTTAAACTTTGCTGAGTGAAACTGAAGTTGCCGTTGTGGAAATGCAGGG:1 + chr2R 15807895 3' - copia 5078 2 41.78 ATTTTCAATCGAAAAAAAAAAACGAACAGCACTGCGGGGCAAAAGAATATGGCA:1 - chr3R 10664721 3' - Tc1 1531 1 81.48 AATAAAAAAAAAATAAAAAAATAAAAATATAAACATTCCTCCACACTCGCTGCATTAAAAAGTAAAATGCGGTGGTATAAGCGAGACCATCGAGCAGCAGGCCACTCAGGCGATGGCCAAGCTGCTCCAAAAGCTTGGCTCCAAGC:1 + chr2L 1983296 3' - hopper 143 14 54.11 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGGAGTGCTTTTTTTCCTTTGATTTTTGTGTGTT:1 - chrX 9305875 3' - P-element 86 1 24.48 TTTTTTTTTTTGCTTTTTCTTTTTCCTGCGTTAGCTGTGTGTGTACTTATGCAATAAACCAAAAGCCGTCGCAAATCAACAAAGGGAAATTCATTTCAGATTTGATTTGGGGGCCCCTGAAAA:1 - chr3L 9201946 3' - Doc2-element 219 1 68.29 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTATGAAGCCAACGAAGTGGAAATTACCTTGTAAAATTTAAAAAAATCAAAATCAATATGGAAACGATTTAACTAATTTAATAATCCTTC:1 - chr3L 2320582 3' - roo 33 2 59.59 AGAAATGGATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATCACCTCCCGATCCGCGCGCGGCACATGCTCGTTCAGGTTCTGGGCGA:1 + chr2R 23555387 3' - 1360 3154 1 66.44 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACGGAGCCGA:1 - chr3L 486740 3' - roo 8749 2 78.08 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGAAAATACGTTTGAAGATTTGTTTC:1 + chr3R 28117070 3' - hobo 66 1 63.01 TTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATGAGAAAAAATTAATAATATGAAAACATTTTGCATAATGACTTCCGTATGCCACTTGCGGTATTTATTTAAATAACAGCCTTCAATAGCTCATAGTTAAAGTGGGTAGGTGA:1 + chr3L 20761418 3' - INE-1 498 1 53.42 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTATTTTCATTTTTGTATTTCACCT:1 + chr2R 1373192 3' - pogo 63 1 63.31 GTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAAACTCGCATAACGATACATAGAACAT:2 - chr2R 12065568 3' - Stalker2 7296 2 55.48 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCTGATCCCTGCAGCCTATTCAAAATAGCGAGCGGAATGGGGATGAAGGAACTGGACAGACTTG:1 + chr3R 11944931 3' + roo 350 2 56.16 CAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAAAACCTTGCAAACTTAAACATATGACACTTAGGAAGCATAAATTCTTAATTTCCATTTCCCGCCCCATCTTTGGCCGCTGCATATTGCAATCC:1 + chr2L 7995033 3' - S-element 1546 2 65.07 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCTTGAAATCCCTCGGCATAAACCCCACCAACACTCGC:1 + chr3L 12223250 3' + Transpac 265 2 54.79 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGACACGAAAAACGGAAAGCGAATATATCTGAAAGATACGTTTAGTCTATTTCGACGCGAGCATTGTAACTGATCGCAGGTCACGG:1 - chr2L 17260690 3' - P-element 35 1 58.90 TTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTC:1 - chr3L 25232771 3' + accord2 7570 2 64.57 GTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCAGCTAAATTTCTAGCTTGTAACTTTTTTTATGCTGTAATT:1 - chr3L 14944498 3' - G5 4748 1 76.22 CCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGT:1 - chr2L 13629051 3' - Tirant 44 2 55.00 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGTATCTTCTATGCATGCAACAAGTGGAACCAACTGCAACTCCTAGCAGTCGTGGGTGCATGATCGACAGCACCACCAGGTTGAAATGATGACCCATT:1 + chr2R 18612042 3' + P-element 2879 2 77.69 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTAGTCTTGAATG:1 + chrX 4673683 3' - roo 72 2 72.99 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGCAAATGCCACCCATTTTATCGTTATTTACTTAGAGGATTTGGCTTTTGATACAACACATTTGTT:1 - chr3R 13838177 3' - 297 18 2 69.92 AAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATGACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGAAGATCTCTTTGCTTATGATAAACCTATTTTTATTTAAAGTACCA:1 - chr3R 4591496 3' - mdg1 373 2 74.66 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAAAAAGGGGGAAGCAAAAGCGGACAAACAAAAAACATAACCGAGTGTATATAGATATTTGTATGGCGACTATGCCG:1 + chr3L 4875160 3' - blood 13 2 56.85 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATCTGAAGCTGAAGCTGGCATTCCATTTGAATTATTCATT:1 - chrX 8219388 3' + opus 7469 2 62.24 AAACTGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCCAGACGCTGAAGTCGCTGATCCTCCG:1 + chr3R 16093376 3' - Max-element 402 1 73.20 ACGGGTATCTGATAGTCGGGGATCAACTCTCTTTTGTTTTTAAGGTTGATTTACGATTAGCATAAAATGTATAATTTTAACAGAAAGGTTTTCGAGATCACGTAGTACCAAAAACCAATCTACATATGTACAGCTGTGTTCAGAAA:1 + chrX 10801556 3' + INE-1 554 1 71.23 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTACACCTGATGTCTGAGCAAAGAGGAGAAGAGAAAACTTGCACTTAGGCAAGCTTATGTAATGGTATGCATATTGCATTATGCATATTA:1 + chr3R 1267804 3' + P-element 2853 1 64.38 GTAGCGCTCTTCGATCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGATAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTTGTGCGAATCAATAATTAAATGGTTAAGTGCAGTTCAAGCTTATTCATCTGTGGCTTACTGGCC:1 + chr3R 14849281 3' - 1360 111 1 58.22 GCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTCGATCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTAT:1 - chr2L 23069853 3' - Stalker4 171 6 72.03 AGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAGTACTTTACATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAAAATAAATTGTATCTAAAACGGACGATAAAAAGTTATGTGATACGAATAAAATTGGT:1 - chr3R 7825642 3' + flea 154 1 63.70 CACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATGTATATATATACATATAGATACATCGATTCTCTGGCGATTCTTCGAATGACTCATACTCATCAGTAAATTGCGCACTCATTCACTGACCAATTGAATGCACATTAA:1 - chr2R 7720641 3' - Bari1 11 1 76.03 CAACGCATCGAGAAGCAACATCGACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTCGGAACGAGAATATACACAGAGACTTACTAAATAAATAGTTTTCCAACCGCACAGAGGCAG:1 - chr2L 17921233 3' + Doc3-element 4347 1 81.51 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTTACACTTTCCTTACCATCCAAAATCACACATGTATATGATGTATCACATGTTGTAAGCCAGCGATCTTTTTAGGCCTTCAGAAGTGTAAATATTGTTAAAACCGGAAAGAG:1 - chr3L 1491427 3' - 1360 10 2 56.16 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGATCGGAAACATGCTATTGATCCCAAATTCTATCAACTTACACTAAAGGACACGTAGAAGGTGGCTCCTGCCTTAACGTACTGATG:1 - chr3L 6095443 3' - transib2 34 1 62.33 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATATAAGTTAAGTGCAGCCGGCTGAAGTTGAACTACCTCGATTGGCCTCTACGAAAGTGTTGTTCTCAGTT:1 + chr3R 24673665 3' + roo 9023 2 52.74 GAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGCTTTAACCATGA:1 + chr2L 19140421 3' - Max-element 8315 2 69.86 ACGGTTCTTTTATGTGTCTACTCTAAATATGAAAAGCAAAAAACGCATTTGGAGATTTGGAGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTT:1 - chr2L 5593128 3' + looper1 101 1 58.22 TGGCTGTCGCATGCCAAGCCCCAGATTTGGCACCCATATTTCCAGTTTGGTGCTAATATCTGTTTGTAAATTGTCAGCTTGTTGGATAGCGACAATTTACTGCGCGAACAAAGTACAAAAGGGAAGGTTGGATGATTTCATAGTG:1 - chr3R 20581712 3' - BS3 1326 1 77.93 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTGCGAAAGTCGAATGTATTATCTTGGCTACAACCAAACAC:1 - chr3R 6413526 3' - 1360 37 1 60.00 GCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGCAAATAAAAGATCTAAAATCAAAAACTTTTTATTGCATTCCCTCTTCCGTTTTC:1 + chr2L 19997159 3' - Tirant 8172 2 64.38 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACAATGCATAAAATCTGAGCGAATTTAATGAAAAACTTAAGTGCTACGAGGGTGTTCGAGGAAAATCCAAAAGTGAATACAGAAACTCAACGATACAC:1 - chr3L 23773155 3' + roo 9054 2 49.29 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACATATAATCAGTGGCCTAGAGTGGGTAATTAAGGAAAACTAGTTTCCACAGATGAGGCATAATCTGAATGCGATGCCTGA:1 + chr3R 15126592 3' - FB 44 1 54.79 CTGGAATGTACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACCACAATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTAGTCACAATTTAACATTATTCGAAGAAGTCCTTATA:1 + chr3R 8017812 3' + mdg1 336 2 72.60 TTTCAAATTTTAAGTTAAATTTAAGTTAAGTTATAATGATGTATAATTTCATATAAATATGAACATATGAACATATATGACATAGTGCATTCCGCATGTACACAAAATTCTCTAAATTCTATAAAGAAAATTGAAAGAAAATTGAT:1 - chr2L 19625942 3' - 1360 3048 1 63.01 TATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTTGTGCGAATTTTACTTTATTTTTGGG:1 + chr2R 11146169 3' - Quasimodo 14 2 76.03 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAGACCAAATATTTTCCAATTAACCAAAT:1 + chr2L 5792134 3' - blood 15 2 75.34 TCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAAAACTGTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGGTTTTTGTGGGCACTAAGCGCTCG:1 + chr2L 20318468 3' + 17.6 322 2 67.44 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTTACCTACTTACATAGTTGTAGTCCAAGTTTGCGCTCTGAAAAGTATGCAACAAATTACGACAAACAGACTTGC:1 + chr3R 27374493 3' - jockey 56 1 52.74 AATATATTAGTAAAAACACATAGTAAACACCTGAAGAATGACTATTAATTTTAAATGTGATAGATTTAGGCCTTGTGATTGAAAAGACATTTATTTTCGTAAGCACTAAAATCAGAAACCAACAGCTGTTAATTTTTAACATTGGA:1 - chr2R 15309474 3' + hopper 1117 1 71.92 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTGGTGAGTGTTAAACGCACAACAAGAAA:1 + chr2L 12486463 3' - roo 8685 2 67.81 TAGTGTATGTTGTAGTGGGGTGTATACGTTGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCCTGCTCCCGTCACGAGCCAACGACCAATAAATTGACAAAAGTTTGTCATATG:1 + chr2R 18899632 3' - Idefix 67 2 80.43 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGGCTATATGGCAAAGGATGTGGAAAGAGGTCGGTTTGCTATTCACTTGAATTAAAATGAATTTAAGTGGTTTGCTATTGGCCAAAG:1 - chr2R 21748213 3' - 1360 24 1 62.96 TTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTC:1 - chr2R 5582147 3' - Cr1a 466 1 60.27 AGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACT:1 + chr3L 18183213 3' - Tirant 37 2 60.96 TTTTTGTATTTATTTTATGTTACATGCCAGGAGCAAACTTAAACTGAAAACTTAAAGTGGAACAGTGGAAAAATATTGTTCTCATAAGATTAAACTAAAAATGGAGGAACATCACATATGTAGATATATGTATATAAAAAATCAGC:1 - chr2L 7603134 3' - Doc3-element 78 1 47.95 ATAGTTATATTTCGGGAGAGCCCCGCTGTTGGGTTCTTGAGATTAGAGAGAGCAGTTAAATCTGCTTAGGTCAGGCAAGAACGGCTGAGTGCCTTTGGAAGCCATAGAATTTCACTTCAGGATCATGTTTAATAAGTAAGTCGCGG:1 + chr3R 851827 3' - 297 212 2 63.70 TGGACAAAACCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGCATAAAAGTTGTGAATTTGCTCAAGAATTTAAGCAGAAAAGGATAATGCTGCGGTCATTGCATGTGCGATGGGCAGTCAGAGTCGGACGGGCGG:1 + chr2L 21796968 3' - HB 221 1 62.79 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGGCATAATTACAGCAATTTCCACTCTACGCTGTGCTCTGTATTGCTTTCAATGTCAACGAGATTGGTGGACA:2 + chrX 10047417 3' - I-element 47 1 52.05 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTT:1 - chr3L 19031203 3' + roo 9033 1 59.59 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAATAGTTTACCGCCTACAGCCCTTTGAATGTTTAT:1 - chr3L 12433408 3' + roo 356 2 54.79 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCCTGCCCGCTCG:1 + chr2R 25106110 3' + roo 8988 2 73.97 GTTTTTTTTTTATTTTATTTTTTTTTTATTATTATTCGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCCCCTGATAATGATAAATGATTTCGATGCGTCTCACCTCCAACGCCGATGTAAGTTCATT:1 - chr3L 2918962 3' - Rt1a 5087 5 57.24 GGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTCGCCCT:1 - chr2R 11264004 3' - jockey 4754 1 73.97 GTCGATCAGTCGATAAGTTTCTTGATAATATTTGTATGTATGTATATAGTAAGGATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTGAATTCGGTACTTCTTGCTACTTCTCCATCCATCGTCTGAAAA:1 + chrX 21088669 3' - mdg3 5377 2 69.18 GACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATGAAAGTAATGAGGG:1 - chr3R 14049293 3' - transib2 17 1 72.86 ATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATGCATAACGATAAGTA:1 + chrX 20685965 3' + Ivk 5340 1 57.53 GCAAAAAATGGGCAAACAAATCCCGAAATAAGACAAACCTAATGCGGGTTGATTAATAGTTATTATTATTATTATTATTCAACAAATGATTAATTATAATATGAACGCTGCGACGTGTGGGGATAGCGACTTCAGATTCTGCCACA:1 + chrX 11689094 3' - FB 53 1 63.01 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTATTAAATTGTTCGTATGAAATTAAATTTTATACGAATATTTCCAAAACTTTCCCGAAATATTTAACACACTGTGCGCACAGCTGCTTTTCGGCGTGACGTTACGTAT:1 - chr2L 6601230 3' - roo 8674 2 71.33 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTTTTTATGAAATAATAAATAATACTTTTTCGGCCCACGGTGCATTGGTGGCCCACTGGAACTTCACAGTGGCCGAATG:1 - chr2L 8574338 3' + Transpac 268 2 58.22 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAGTCGAATCCACTCGTGTCTTTATAACTTGAGTGTTTCTTGCGGCAGTCGGGCGATCAAAA:1 + chr3R 10213125 3' - P-element 45 1 50.00 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAAGTGG:1 + chr2L 3231983 3' + roo 398 1 69.03 AAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTATGGGAGACATAGCCATGCTGTGGATTTCAACATAAACAATGCA:1 - chr3R 14012919 3' + P-element 2662 1 26.71 AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTCAACTCGAGTGGCTGATAATTGGG:1 - chr3L 1856721 3' - Transpac 48 2 73.00 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTAGGCTATGATATGT:2 + chr2L 5270371 3' + jockey 4930 1 61.64 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATTACTA:1 - chr3L 13678890 3' - hobo 69 1 66.21 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTAGTTGCACTTTTTCCCAGTGTATCAGTTGTGGTGTCAAGTAGCAACGGCTGCGGCAAGGACAACAT:1 - chr3R 15054103 3' + 297 347 2 54.11 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATCTGAAGCTGAAGCTGGCATTCCATTTGAATTATTCATTGCCAAGGCAGCCACATGGGATCGAAAGTGGAAATGGAAGTGGCAATAGCAATT:1 - chrX 8219335 3' + opus 471 2 66.44 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTATCCAATTAAAAAAACAAAAAACAAAAAGGACCTGGAATTGGTAGAATAAACATTGGAAAATATAACTTGTGTTATC:1 - chr2L 21642977 3' + Tabor 475 2 78.08 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATATACCACATATGCGATTTTTTGGGGCTGCACTTTGCTCTGACCATCTCTTATGTTTTATGGCCAGGACTTTGTTTTTATGGCATTTCCTGC:1 - chr3R 15152581 3' - opus 7142 4 67.81 TATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTTTCCATTTCCACGCGCTCGCTATCGAAGTGCCGATCTGTGGCCTGTGTCGCGGTCAGCTGAGATAATATTTACTACCAATCG:1 + chr3L 7095494 3' + copia 4670 1 43.84 GTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACATCA:1 - chr3R 907901 3' - gypsy11 364 2 30.82 TAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCTCCCCGAGGCGGCAGACGCGTGCCT:1 - chr3L 4083659 3' + mdg1 54 2 56.16 AAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACATTTCAGACTACTATGGGTCAAAACTCACGCACAAAAGCGTTTAAATAACGTGGTTAATACAATTTT:1 - chr2R 13364742 3' + jockey 4660 1 52.82 GATCGTTAATACGCATCCAAAAATTATAGTAAAATATGGAAGAGTAAGGGTCGGAAAATCTATTAAAAAATTATAGGTTAATGCGCTGCAATTTATGGAGCGACGAAAGTTGTTGCCAACAAATTGTCCACACGTGAGACAATCAA:1 - chrX 4030252 3' + transib2 236 1 76.03 GAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAATATTCCATGCATGGCCAAACAGTTTGCGAGCCCAGATAAATGCATGCAAACAAAGTTAGATACAATACAATAG:1 + chr3R 28618923 3' + Transpac 5077 2 50.68 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTAATACTTAAAAAGGCTGAAGAATGACTAAAACTAAAGACTTTAGTACTCACCATATGAAGATGCTCTTGTAGGCATTTTCATTCGAGCAT:1 + chr3L 19999305 3' + 1360 3364 1 69.18 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCTGGCAACAGTTTAACAAGCTTTTTAAAACTACAGGAAGCGCTGG:1 - chr3R 7585744 3' - Doc 79 1 67.63 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATATGTAAGTTCCACAGAATGGAAAGGGCATCCCTTACATAATGGCCTCATTCTTCAGCTAACCAACTTTATGAAGTTCAGTT:1 - chr2L 21691790 3' - 297 32 2 61.64 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATTTCGAGGCGATCGCGAGATTTTCGAAC:1 - chr3R 18399194 3' + P-element 2823 1 42.47 AGCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACACTTTTGCTTCGTTGAGCAAGAATGCTTGTTTTTTACATTCCAATTTTTGGTCCATTATTTATGG:1 + chr3L 2320717 3' + roo 9016 2 53.79 GACTCAGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATATATACTTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTTTGCCTGTTACAAACGTTTCAATGAATCTAGTATACCCTTTTACTCGACGAGTAACGATGAGGAAGGACATACATAAAATG:2 + chrX 19122432 3' - INE-1 92 1 80.14 AAAGACACTAGAATATTCTTATGGTTTTTAGTATAACCTTCTTGCTCACACCACATAATGATGTTTTTAAACGCACTTTAATTTTTTTGATTGTATACAAATTTTAACAAATATTTATCGGCTTATTTAATCGCAAAAGTAAGTTT:1 - chr2L 16672901 3' - Tc3 309 1 73.29 GCTATTACTTATTATTTATTACACCATTAGTAGCTGCATAGCAGAGCAATGGAGCCATTATTCTGTCCTCACCTGGTCACGCAGCTCGGTCTCGTTCAGCCAGCCGTTGCCGGGTGCAAATTCA:1 + chr2R 12065720 3' + Stalker2 402 2 80.65 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTCTAATATTCACCTGATTTAAATCTTCAATATTTCTGA:1 - chr3L 17537703 3' - Doc 31 1 66.44 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTAGTGCTAAACTTTCACCTGAAGGACCAAACTCTAGTGGGGGACCGG:1 - chr3L 13364313 3' + hobo 2917 1 51.14 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCCGAGTTCCAGGATCCATAAATAAATGTAGATTAGTCGCCGCGCGTGCAGCACA:1 + chrX 388367 3' + 1360 3362 1 68.49 TAATAATAATAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTTGGTTAAAAATTGATAAAAGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCAGCTGTAGTATTTACTTTTGCATCTGCAGACCCGCCGAC:1 + chr2L 15763146 3' + mdg1 21 4 48.63 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAAGCCCACAGGCACATTTAGTTATGCCGTGGTGGAAATATTTTTGCGAGCACAGCAGCAGAACAACGAAAACGGAAAAGTAG:1 + chr3R 15920318 3' - 412 7095 2 56.85 GTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAAAAGGAGGAAACTATTACGTTTAAAATTCAAATTTATCTAAAAGCAAAAA:1 - chr2L 23373384 3' - Tc1-2 20 1 64.83 AGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACATAGCTTGGCTATAGCTGTGGGGCATCTCGGGCTGGAAATACGGTTACCGCTGTT:1 + chr3R 15997999 3' - 17.6 208 2 62.76 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGCGCAGGATAATTGCCAGTCGCTGAGCAACAAAAGCGATTAGTTTAATAGTTGGCCATTAATGCGCTGCCTTCGATTTATATCTCATT:1 + chr3L 10112307 3' - I-element 35 1 60.27 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTGTGCGGCACAATGATTGCTGCATTTATGAGATAAGTTTTT:1 + chr2L 16615828 3' + hobo 2895 1 64.49 ATACCTATTGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTGCCCAGAAATAAAGA:1 - chr3R 31887302 3' + HB 1539 1 59.31 CGTGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAATATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGCAAGTGGAGTGGAGGAGCCATGGAAAAGAACTA:1 + chr2R 21439537 3' - jockey 35 1 55.65 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACAAAATAAAGTCCAACCATGTAGAAAGATTATATATACAAACCGAACAGGATCTTTTATATATGTATATCCTATATG:1 - chr2L 4876844 3' + 297 6934 2 58.22 TGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACTGCCAACTTTGAGGAGGGTTT:1 - chr3L 12159651 3' - Quasimodo 42 2 56.16 ACCTATTTAAACCGAAGATAATTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAACCATCGCTGGCACAAGGACCCGCTCCCGTTTTC:1 + chr3R 14218500 3' + roo 343 2 70.83 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGGTTTTTTGCGCTTATGTTTCTGGACGTGTCTGCTTTTGGGTT:1 - chrX 11019388 3' + mdg1 388 2 42.97 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGCGGCAGTTAT:1 + chrX 12273141 3' - jockey 4696 1 58.43 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTAATACGGTAACTCCAGGAAAACAGCAAAACGGCAAGCTGCGATCAGTTTTGATTCTTACTTCGCAGCGAG:1 - chr2L 8984845 3' - pogo 36 1 57.78 TTTGTTTACCGAAAAAATGGGGATTCGTTTTATAGTTTGAGCGGCTCTTTGTTGGCATACTTTTTGAGATGGGTACAATCTAATAAGAAAATATATAAAGATATAAGGATTTGCATATTAAATTCTCACAGCTTTAGTAACTATGT:1 - chr2R 18775187 3' + Transib5 2845 1 67.12 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACAACCGGGTGCTTGTCTGCACGTGCAGATTTATACCCAAAATTGTTGGCTGTCAGTCGAGTGGCAAAAAATGCAGAACCCTTGCAGTTCTCTCGTTGTTGTACAGTGGGGGAGTG:1 - chr2R 4707657 3' - Tirant 8112 2 66.90 TTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGCATTTTACGTCCTTGAACTTACCCGGTTGCCATGAATCCTACCGTGAATCCTACGAAAACCA:1 - chr2R 15075529 3' + mdg1 404 2 73.97 ATTTCTTTAAAAATATAATTAACATTATATGGTATTTGAACATTACATCGCAGAATTTGTTGCATTGCCTCACCTATTATGCTGACCGCTGCTGTCAACTTTCGCCCAAGCATTTGGCAAACGTTCAATGCGCAACTGTC:1 - chrX 9467678 3' + hobo 479 1 64.29 GGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAATATCTATAGCCAAGCTTCTTACCTAATCGAAAATATCTTACAGTTTCGTTGAGATATTT:1 + chrX 16690639 3' - FB 54 1 57.66 AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTATCCAATTAAAAAAACAA:1 - chr2L 21643036 3' + Tabor 7255 2 62.33 CAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATAGACTTTTTGTCAAGGCAACAAGCAAACAAGTATTTGCTAAGTAATGCCAACGCTTTT:1 - chr2L 14973995 3' + jockey 254 1 60.96 AAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGTTACACGTTCGTGCGAATATACAAATGAG:1 - chr2L 22719569 3' - 1360 38 1 53.23 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTA:1 - chr3L 7837158 3' - jockey 4804 1 46.62 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCT:1 + chrX 16117264 3' + opus 7446 2 63.70 AGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTT:1 + chr3R 10030780 3' - BS 5076 1 61.64 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAACGGTGAAAACTAGTACATGCACACAATTTTGATGAATGATTGTTGAGAACGAA:1 + chr3R 12363855 3' - jockey 4692 1 71.92 CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACACTATAACCTTGAAAAGTACTTCTAATTGGCGCAGGGCCAAGTCTCCAGCTGCTCCTTTAATGGCCATCATGCCCAGCC:1 + chr2L 4637310 3' - mdg1 51 2 57.86 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTCTGTGTGGTATGTACAGTCAGCGACACAATCGTATGCACTTTCGGGGCAGGGAGTAGTGCAAGGCCAGAGTTGCCATTGTTTCGC:1 + chr3L 21910502 3' - pogo 12 1 75.00 CGATGCTTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCTTAAGTAAGTTAAATGTGTGTACCTCATCC:1 + chrX 14137270 3' - 3S18 93 2 78.77 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTACCAAAAACGGGATTGTTCTAAATGAAAGACTGTTAAAATATATATATTTAGATTTGGTTCATGGCCTTTATTTATAAATGTC:1 - chr3R 21674791 3' - roo 35 2 51.37 AAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTTCAGTAGACCTTTCTAAAAGCTATCGCAGGCAG:1 + chr3R 6645389 3' + blood 7328 1 74.34 GAGTGAGAGCGGAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACGCACAAAAAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAACAATGGGCCAAGTGGTTCTGGCCATAAAATGGGCAAATATCTACTGTCATTGTTATTGCT:1 - chr3R 17963208 3' - Cr1a 279 1 58.90 TTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAGAAATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATCAACAATTTTCAACGAATTCAGCTGTGAATACTTTTTCTTTGTGCCTTCTTGGTTTTTTTCCCGCTTT:1 + chr2L 8645575 3' + 1360 470 1 54.35 ACGATGTTATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCGGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCATCAGGAGTGGCATCCAGTACACGGAGCTACCTGCGTTTCAGGAGGAATTTATTTTGACAGAACTAATATTTTGTCGCAGAGATCAG:1 - chrX 7279712 3' + G2 415 1 72.60 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATGTTATTTCTAAAAGGCTTTTATTTTTCTTTATTTTAAAAATTTGAGTTAGGTTTTTCAGGCAGCTTAAACAATTATTCCTCACTTACGAGGTAACTGGTAAAT:1 + chr2L 11012301 3' - jockey 4688 1 67.81 GATGGTACACCCCACCGATCTCCCTACCCGGAGGATAGTATAAAATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGAAAAATTTTTCCTTTTGATCAATAACCTGGGCGAAGCCCATGTTACATATGTTGGCTCACATTTAACCGCGTG:1 + chr3R 896587 3' + G5 4644 1 60.96 CTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTTGCAGTACAGTTCCGCATCGAGCTCTCCTAAAGTTGACTCTAACAAATTGAAAATCATTGAACACGCCGGGCAGATAAGGTGG:1 - chr2R 19541022 3' + 1360 195 1 57.53 CAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAAACAATTACAATCCGCGTTCCTCTCCGGCGTTAAAGTCACCGGATC:1 - chr3R 6495293 3' + Stalker 7172 4 71.03 AAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAACTTCTCAGCTCTTCTACGGTGGAGTTAAGGTTGATGCCGAGCAGAAATCCG:1 - chr3R 7450240 3' - Doc 2 1 63.12 GCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCATCCCTTTTCTAATTATCGATGTAAAACTCTAGTTATAACATAAACTTAATTGAGACGAGAAAAACTTTACA:1 - chr3L 17660219 3' + jockey 111 1 54.79 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGTGCTGCCTACTTTCAGGTGG:1 + chr3R 25795839 3' - jockey 66 1 57.53 AGAGGGTCACGTTGTGTTAGAGTACACTTCTACGAATGAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAATCTTTCAAAGGGAAAGCATAATTGCAATCTCCTTGACAAAGAGCTAAAAGCGCAATCTTCTCCATAAATTAATAGTGTGT:1 - chr2R 15506721 3' + 1731 4164 1 60.27 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGTCTTGGGTTGAGGGGCAGGTTTTCACCGGGTCAGAGGTGCAGGCGCCACCTAATGACT:1 - chr2L 12486326 3' + roo 346 2 60.69 ACTGGAGCACCGCATCCGGCCAAGTGCTGACTTTGCTTACAAAGTTGCACAGCAACATTGTCCGCAAGCAACCCGACCAGCCAAAAACTTGAGTAACCAAGAGCTAGAGGAGACTTCTCCGACACAATAAAGAC:1 + chr2R 5071047 3' + Tirant 8181 2 44.78 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTA:1 - chr3R 16276304 3' - pogo 38 1 59.59 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCATAATTCCAGCTTATTTGCTGGTGCAAATAGTGCTAAATAAATAAACTAAGAGCTCGATGGATTTTAAAATCCAAACAATTTAATTTCATA:1 - chr3R 25751759 3' - roo 8695 2 53.42 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAACCCAGCGCTATTAACAAAACGGGAGACACAACACCGGGAATTACGCCACTCGGCACTACACACTAAAGTATGCAAAAAGTGGGGGAAAGTAGC:1 - chr2R 19852106 3' - Transpac 4944 2 67.12 ACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGGTTTCGCCATCAGACTCTAAATGGA:1 - chr2L 12291818 3' + Tirant 8478 2 63.16 TGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTCATACTCTCTCTTAAACAGTTTTGTCATTTGCAACTGCAGCTTAAATGCAGAGCATATTATCAGGAACTCCTTCATTTGTCACAGTCCTAAATGTATACAGTCTTAAAATATT:1 - chr3R 1310835 3' + diver2 4543 2 72.60 TCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCTTTTCGCTGCCCCTT:1 - chr2R 18689147 3' + Burdock 190 2 65.07 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAAGCCAAAGCAAAGCGTTCGAGTGGCAAAAAATAAGTTAGCCCGAGTTA:1 + chr2L 17839514 3' + blood 356 2 70.34 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCACATTAAATGAAGGGTGGTCTGAAAACCGGGTCGCGG:1 + chrX 6633079 3' + P-element 2881 2 79.07 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTAAATAAGTACTCTAACAACAACCGATTTAATCAAACGTAA:1 + chr2R 21848772 3' + Transpac 247 2 61.38 ATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGTTTCAACTAACAATGTCTAGTCTCTTGTGAAAGTCTTTATATAACTAATATATTAACTTCTTAAAATGTTTATAGAGTTTTGAACTAAA:1 - chr3L 8326621 3' - roo 8971 2 61.64 GTTCCGTCTATTCCTTCGTTATGGCCGTCACTTTATTCAAGGGGGGGAGGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCTAGCATAATTTCGTTCTATATGAGATAGATTTAAGTTGGCTAACTGCTTGAAATAATACAACTTCAATTA:1 + chr3R 7867325 3' + gypsy5 6890 1 52.05 GGCTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCTAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAACAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCAGGAATGGCAACTGTGGGGATATT:1 - chr3R 26846776 3' + hopper2 1513 1 76.71 CTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACCACAATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTAGTCACAATTTAACATTATTCGAAGAAGTCCTTATAATCAATCAATGATCA:1 + chr3R 8017827 3' + mdg1 352 2 64.83 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAGTAGAAGAAGCAGCGCTGGCAGCGACGCCGACTGCGCTGCCTTGGCGCTCGGGAACTTGGAGCCCAG:1 + chr3R 31724957 3' - P-element 10 2 70.00 ATGCATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGAGCGTTAGATAATATTACTCGGAAAAACTGGACACCAAACGAGTTTTG:1 + chr2R 6500962 3' - Stalker2 221 2 78.03 TATGTACACAGTTCAGTTCTAATAAAGCATTCACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCTCGGCGGCACTCTTATGCAAACACACACTATCCACCAACACTAACTCCATCCCAATTGAACAAACCGAAATTTGATAA:1 + chr3R 18174471 3' - frogger 70 1 65.75 ATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGCAGAAATTTATCAACCGGGATATCCGATTGCATTGGACTAAAC:1 - chr2R 23106580 3' - jockey 4536 1 67.74 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAAATGTATTTATATATATATTTTTTTAAATGGCATTG:1 - chr3R 7507160 3' - Doc 86 1 77.40 CAAACAGTAAACATATTGAAAATAGTTTTATAAACCTATAATATCATGTAGAATTTATATAATCATAAAATCATATAGTCATCTAAATATGTGTTTACATCTAGGACATTTTCTTTTAACATTTTTACTATACTTATTTCAAGATA:1 - chr3L 16519783 3' + 17.6 31 1 75.34 CAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCATTGTGTCGAGTAATTTGCGTATATTTTTTAATTACTTGGATGCTGGCTTCGAAGCTTAAGTGCGGCTGGGG:1 - chr2L 20632591 3' + jockey 427 1 58.82 ATTGCTACGAAATTGTCCAAAACTCCAAATATTGTACATCTGTATTCAATGAAATAGCAGTGCGAGGGAAACTAACATTTCAGTGTCATAAAACACTTGAATTGCCTATTTATTTAAAATGCTACAATCGAAATTGAAAAGCTGCA:1 + chr2L 19853117 3' + 1360 3119 1 51.37 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAATTATTGTCGTTGT:1 - chr3R 15295729 3' + roo 333 2 74.66 CAATTCAATACCAACTTGTACGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCATATATTAAACTCATGCCCATCCCACCTACAAGCCAAACAAGACATATTTAACAACACTAACCCTTTTGGCCCACTTGGGCGACACGTGCTCATTA:1 + chr2L 20430766 3' + I-element 4994 1 77.40 AGTATCAATAGCCGAGTCGAACTGGCCATGTCCATCCGTCTCATTCACCATAAGAGCTAGAAGGTTGAAATTAATGACAGCTGCCTATAATTTATAAGGGCATTTAGCTGCAGATTTTGTCCCTCATGATGGAAGCTTAGTTCAAA:1 + chr2R 12221581 3' + INE-1 96 1 50.68 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCTAAAAAGGGTTCCCTATGTGTACTTGCGGTAATTGCAGAGCGTTTTAACTATGCTG:1 - chr3R 27323058 3' - 297 6621 2 53.23 TTGGCTTGCGACAGCCAAATTTACCGCATTCACGCTGCCCAAATCAAAATCGCCAGGACGATTACCGCCAGGCGAATGGTAAGTAAGGAACACATATTTTAATGGGCATCTTTAGTTTTGTAACGTGTATTTATGTAGTTCTTTGT:1 - chr2R 8278983 3' + BS3 1331 1 63.01 GTGGCGCAGTCGGTAGGATGATACTAATTGATGCGATATTAAACATATTCAATTCTCTGTGTATCATCCGCTAAAGAACTACAACTACAACTACAACTTCCATATCTCGCGTCGGTAAATCGGTACAATCACTTCAAAATTAAATC:1 + chr2R 4122892 3' + rover 366 1 79.45 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCCGCCAACGAACCGAAAACACCAAAACAACGTGACTGGTGCATCC:1 - 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chr3L 12223084 3' - Transpac 4932 2 76.71 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGGCAACTTTGGCGCACTTTGCATTTTTATTGCACAACATCCGGTTGCAAG:1 - chr3R 7470905 3' - Doc 52 1 69.86 TTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAATAATTATTAAAAATTTAATAGTTGTCTATTTAATACTCAAATCAATGAAACTGTC:1 - chr3L 16015163 3' + 1360 3381 2 56.85 TGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCTCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTCACACACAACATTTCACAAATCCGATGTAATTAATGAATTCCGCATAAATA:1 - chr2R 2457346 3' + 1360 3161 1 68.28 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAATGTGCTAATTTATAAGAA:2 + chr3R 19436134 3' + roo 394 1 73.29 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTATATGGTCGTCTGCGGATGTGG:1 + chr3R 13437268 3' + hopper 1407 2 74.78 CGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCG:1 - 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chr2R 17332161 3' + jockey 4914 1 69.86 GATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAGATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGAT:1 - chr3L 465993 3' + Juan 4130 1 73.97 GAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAACTAGCCGGCTGGCAGATGACAAAGTGCCCAGCTTGAG:1 + chr2L 5890592 3' + invader3 5421 2 52.41 ACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGCTGTCCCTTTCGCGCAGCGTGCTTTCCCGCTCT:1 - chr2R 6121215 3' + hobo 191 1 77.24 GCCTACTAGATAACACCAGCAACCGAAGGCGACGAAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATTTACAAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGATTGACTTCTTTTTTTGCATTTTAACTGATGGGTAAG:1 + chr2L 8472752 3' + G3 4422 1 78.08 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAACTATTAAAATAAATTTAAGCATATACTCGGAATAGATTAAATCCCCGGCACTTGAAATCATCAGGTAGTCGTTGACCTGTGG:1 + chr3R 31483760 3' - I-element 39 1 58.22 TACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAG:1 + chr3R 26987341 3' + Stalker 7094 4 63.45 AATATATATATATACATATAATATGTGCAGCTACCAGACCTTGTATCATGTAAACGAAAAGAACAAGTCCTGGCAGATTGAGAGTGTCCAGCTTTGAATTTAACGAACTATGTATATTGATTGCT:1 + chrX 21254519 3' - 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gypsy11 450 3 68.46 AAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCTTCCTTACTTTTTTCATTTCTAGCATTGGCTGGTTTTTTATCAATATCCCTTTGCGATTCTTTTT:1 + chr2L 16331053 3' + roo 372 1 58.91 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACGTTTAGATACATTTATATCTAGTTATGGAGTGGGGGAGGGGGGGGAATATTCTATCGAAGCCATTATCTTCGGCAGT:1 - chr3R 25713997 3' + flea 4975 2 52.74 GTAAGCAAAAGACCACCAACACTTTCATTTCATGTTTTGAAGCGAATTTCAATTGCTGAGTCCCGTGAAAAGTGAAAGCAATTGAAATTCGCTTCAAAACATGAAATGAAATATTTCTCTGTGCAGGATATATGAAAAATCAACAG:1 + chr3R 20206439 3' + Stalker3T 79 1 65.75 GAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACA:1 - chr3L 13952775 3' - I-element 5144 1 54.40 GCCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTCAGATATATTTGGACGAGATTTATCAGCTAATCATGTCGCA:1 - chr3R 2691135 3' + diver2 94 2 71.92 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGCAGAAAAGTTAATTACAATATTTCATTGCTCAGACGTTGGTGGAGGGGCGG:1 - chr2L 12144203 3' - transib2 31 1 52.29 GGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGTGCTGGGCCGAACAGCCTGACATGCGTCCCGACTT:1 - chr3R 4496482 3' - accord 126 2 72.87 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAACCTTTATGGTGTTTAAAGCAGCAAACAAAACTGAA:2 - chr3L 15364782 3' - 1360 34 1 61.64 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAATTCCTTTTCATATAGTTTTAATTGAAATATTGCTCGAATATTTGCTAGATTTTGTCACGTAAATTTAGATTGCACGTACATACATTTAT:1 + chr2L 4876999 3' - 297 22 2 70.00 AAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCAAACCCTAATAAATATTCAAAATTTTCCTTTAAGCTCTATGAAAATTGAAGGTACGAGACA:1 + chr3L 18359893 3' + FB 699 2 58.90 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGACCACCGACCGACCGCTGACCATAATTCACTCAAGTTAGACAAAAGCATTTTGGTTGCCC:1 - chr3R 21341318 3' + hopper 1413 2 73.86 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCATATCAGTTAAATTAGCAATCAGTCTCCAATCTTTCGT:1 + chrX 4400377 3' - roo 83 2 76.71 TTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCATAGCTGCCAAGCTGACCT:1 - chr2R 21848630 3' - Transpac 4936 2 68.49 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTATCTAAGCCAAGTTTGTTATGTGGGTCGAAATGCTGCGACTGCTAGCCATGCCATTTGCCCAAATGAAACTAATTTTGTTGATT:1 + chr3R 25804239 3' + mdg1 385 2 60.27 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAA:1 - chr3L 13690286 3' - hobo 60 1 66.67 ATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTTAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTG:1 - chr3L 7319826 3' - 1360 475 1 71.23 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAAAATGTAAAGGAATTCAATTTGAAATGCAAACAATGCAGCTCACACACACGCATACTAACGCATACGAATGGGAAGTGCAGTAAAATGGCAATGGAACACGAACA:1 + chrX 19788931 3' - hobo 15 1 75.34 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGCGCAGGATAATTGCCAGTCGCTGAGCAACAAAAGCGATTAGTTTAATAGTTGGCCATTAATGCGCTGCCTTCGATTTATATCTCATT:1 + chr3L 10112307 3' - I-element 18 1 68.22 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCCGTTGGGGTGATTAATCAATTAGTGACCTTCAGTGCGGCCCACTTCCCACTACTCT:1 + chr3R 14986161 3' - jockey 4718 1 61.06 GTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGGAGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTAT:1 + chr2R 545172 3' - F-element 472 1 58.78 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTTTCCGCAGATACAATAAAGAAATGTTCAACAA:1 + chrX 1103757 3' + pogo 2082 1 72.41 GGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGCGCATCATCGGAGCCATGTGCCAC:1 - chr2R 22746024 3' - jockey 4774 1 72.26 CGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACGGACATATATGTAGATATATAACCATATGCACATGGGTGCCATCCCATCCGCATATTC:1 - chrX 16117162 3' - opus 7159 4 60.15 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACACATCCTTATCCTATCTCTTACAAAAAACAGGAAAAAATGTCATGTATAGGTCA:1 + chr2L 7652336 3' + roo 396 1 76.03 TAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAATAATTTACGATGCTCCAAAGTTTTTTTTATTTTTTTGTAGCTTTTTGTTTTGAGTTTGTGGCG:1 + chr2L 18632121 3' - G-element 65 1 66.67 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTAGCGCTTGATTATAAAAATCGTTAATCTTTGTAT:1 - chr2R 11256182 3' - roo 8742 2 77.54 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGATGCCTGCTTTTGTTGTCAAATGACGAAGGCACTTT:1 - chr3L 13690230 3' - hobo 24 1 69.86 GGAGCGCCAGAACGAACGGGGCTCCAAGCAATTTAGATGGCCACGCAAATGGATCTAAAAAATATTACTGATTTTATTAATTTGCTTGTAGTAGTATTAAAACTGCATTACTTACGTTTCCCAATCTACGTA:1 - chr2L 7820384 3' + Juan 208 1 75.00 ATTCACACTAGTTGTGTAACGGATATCTGATAATCGGGTAACTCGACTATAGCACTCTCTTTTGCATTAGTATGTTTCCAAGCCAATGTGACAATGGTAACATTAAACATTTTGAAAAATGTTTAAATAAACCGCAGAAAAAGTGT:1 - chr3L 27575 3' + INE-1 536 1 51.37 GATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAAAAAAGGGGGTGTGAAAGAGTGTGGATTGTGACATAAAGGATTGTCGCCAATCGGGGCGTGTAAACCAATTAGCAGCC:1 - chr3L 14165319 3' - mdg1 202 2 64.80 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAAAATGTAAAGGAATTCAATTTGAAATGCAAACAATGCAGCTCACACACACGCA:1 + chrX 19788879 3' - hobo 67 1 65.07 GTTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATTTGTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTGACAATCTGACATCTGACAATTTTTTAAAAGCGAAATATATCGGCTTCTTCCGTTGTATATTCCTGTAATTTATTTTGACCCTGTTGGAAAATAA:1 + chr2R 15532842 3' - 1360 3006 1 61.64 TGGTGTGGCGGTCTTGCTTGTACAGGTTTCTCCCTTGCCCTTGTTCATAAACTTATTTCGTTACACGTTACAATTTATGCATAAATTGATACCCGTTTTGGAACCAGTGCC:1 - chrX 19596098 3' - Gypsy12A_LTR 2168 3 79.28 AAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGGCGCACAAAATCGCGAAGTAAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGACACATGC:1 - chr2L 21325121 3' + invader4 2995 2 76.03 CACGCCCACACATTTGAACAATTTTGAATTACTTCTCATTTTATTCCCCAATATCTATCGATATCCCACAATGCAGAAGATCAAAGCGGCCTGTGAGCATTTTCTACTTCGGATTGGGTGTCGACAGATTCAGACTCAGATAACAG:1 - chr2L 681861 3' + INE-1 253 1 50.00 CTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCG:1 + chr2L 1361064 3' - Stalker2 7274 2 55.48 ATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCATTTAATCAATCTTAGGAATTATTCAGTTGGATCAATTATTAATTTATGTGTGTCTGTCTATGTCCT:1 + chr3R 9828427 3' + Quasimodo 7211 2 54.79 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAAGCCA:1 - chr3R 23161269 3' - 412 66 2 62.33 AAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTAACCACGCCTTTTAAGACTTTAATAGCCACTGTTGCTAGACACTAAATAATGTCTTTTCTTAAGATTCTAT:1 - chr3L 465920 3' + Juan 4203 1 77.40 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATTTAATTGCGGATGTTGTGTACAACTACAAAAAACTGAAGTAAAAGACTTTAAAGTGAAAG:1 + chr3L 18382046 3' - copia 4930 2 60.96 CAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATATGATGCTCGAATTAATAAGCGCCAAGATGTCCATAAGGTCACCTGAA:1 - chr3L 2299758 3' + Doc 45 1 67.81 ACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATTGTTTGTACTATTTACCATTTGGCGACCCGTTATCAATTGCAG:1 + chr2R 18689228 3' - Burdock 77 2 69.86 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGATCGATGGAAACCGGTTTCTGTGAAAAGTCTTTGCTTTCGTCTAAGGAGAAAAGTTGCCACGACCAAAA:1 - chrX 4673579 3' + roo 9034 1 59.59 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTTTAGTACAATATATGCCATGGGGTATATTCCCATACAAAATGCCAATGTAATCGTAATTGTAATTGTCGGTACTATCGTTTCGTAATTACGTGGATAATCGAAAGCGAAGTGC:1 - chr3R 24673497 3' - roo 8670 2 77.40 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTAGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACATAATTAGTCTGATAGAT:1 + chr3R 6413672 3' + 1360 3353 1 59.31 TATTGCACTGAGCTATTACTTAATACTTATTACAGTATACGGACGCGAAGGTTTCAGTTTCATATCGGGCCACGGGTTTTTCCTCCTATTTTTAAATCGCTTTTAATGTGCGTCATTTGGTCTCGTTTTTCTTCGCTTA:1 - chr3R 7616681 3' + Stalker2 391 2 74.82 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGCGATTAT:1 - chr2L 14239124 3' - 412 47 2 53.42 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATGAAAGTAATGAGGGGCAGACAA:2 - chr3R 14049285 3' - transib2 14 1 75.86 TGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCTACATTTCCATACATATATATATATTTATTTTGAGTGAGTTTGTTATATT:1 + chr2L 17380708 3' - hobo 59 1 65.93 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATATAATGGGTTAACCCACAAACATTTGATGTTTATGGTAAGCAGCAAATTGTTGGTTGCTACAAAATAA:1 - chr3R 14993077 3' + roo 358 2 53.42 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCTCTAAAGTGCATGGCGA:1 + chr3L 19031334 3' - roo 20 2 61.61 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAA:1 - chr3L 12874896 3' - jockey 97 1 78.08 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAA:1 + chrX 19887126 3' + P-element 2872 1 49.28 TGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTGGGTGCAGATTTTCGTCCAAGCAACCAGGTCATCTTCAAACTTTTTCAATTTAGTTGCTGGATGTTTTGATCTACTTATTAGTCTTGTAATTAACACACGGCAGGTGGTCTCCTAG:1 - chr2L 17742099 3' - G4 3387 1 81.25 TAACAAAAAAAATAAAAAAAAAAACACAAAAAAAAGGGAACACCTATAAAAATGTGATGTAAAAAACGAACCCCATTCACACC:1 + chrX 9299942 3' + gypsy7 5003 16 80.72 AGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATTATTATGTATGTCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCAGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAACAAAGCCACAAAACGACATTCTCCCCTCG:1 + chr3R 5974813 3' - Porto1 4409 1 80.14 GCAATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGATTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGAAACTTGACAACTTAACACAAACAACAACATTGCCATAATGATTCCGATCTTGG:1 - chr3R 19448180 3' + 1360 3000 1 63.01 GAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTTTTGAACATAAAAGCAGTTCTATTGAATCTA:1 + chr2L 8574513 3' - Transpac 7 2 78.08 AATTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCA:1 + chr2R 2879457 3' + Stalker 6925 4 63.31 GAATATATGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATTTCTTTATTCGACTTCTCCCTCCCCCATCTTCGGGGTGTGATTAGCTTAGTTTCCATTACCAAGAGAGAGGCTTGGCCCAATTTTCTCTGCCCTTTAATTAGCATTTT:1 - chr3R 9182181 3' - invader3 5446 2 60.00 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGT:1 + chr3R 12363781 3' - jockey 4735 1 71.30 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGC:1 + chr2L 21910244 3' - Doc 41 1 51.91 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGTCTCAAAGGAATGCGAAACAAGGACGCAAAAGGACGAGAAGACCGCCAAAGACGATGACAACG:1 - chr3R 17258075 3' + 412 7488 2 57.53 TCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATT:1 - chr2R 11095743 3' - diver 5953 2 58.90 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAAATGACCGCACTCAACGTGGCCGAGC:1 + chr3L 18183177 3' - Tirant 73 2 76.03 GAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTTTAAATTTTAAGAGATTTGCGCAAATTCATGCAACACCCCAGCGGCCA:1 + chr3R 16112449 3' + roo 70 2 55.14 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGG:1 + chr3R 21674929 3' + roo 9029 1 51.39 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTAC:1 - chr2L 22319271 3' - Transpac 36 2 53.04 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCCATGTTAATTTCGAGCAATTATTGGACAACCCTTTCAGATTCCAGATATTATAAGGAAAAGGAAACTTGTGGAAACTTTTTGTTTTGGCTTTGAACTTATAC:1 + chrX 16994640 3' - roo 8682 2 70.55 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAAT:2 - chr3R 26486022 3' - 412 7116 2 58.22 GCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGTATGTATCATAAACGATGTTGAACCAGGCTTCCAGGCTAAAGATTTCGATGACGTGGGACACGCGGCAGACAAAGGTGGGTCGCCTCT:1 + chr3R 5745979 3' - flea 4764 1 77.24 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATAAACTGTGCCCTGTCAAATATTTATGGGTTAAGGTGTTCAAACGCTTATCAGGGTAGCGTTAAGAGCCATTTGAATACATTTATTGA:1 - chr3L 12835967 3' + 1360 3355 1 60.69 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTGCACGTTGCTCGCATTTGGCAGATAGGGTCAAATATCCTCTACACA:1 + chr3R 11095925 3' - hopper 12 2 74.07 GTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCAAAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGATCAATCGCATGTCTGACAGAGTGTAGCATACTTTTCAGCACTGCCTAACATTTGTCAGCTATCTGCATTTTTTTC:1 - chr3R 16582439 3' - BS 4984 1 74.66 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACGAAAGTTGACAGGGCGGGGAATGAGCTACACTGCTGTAAAGC:1 - chr3L 10469530 3' - roo 8740 2 71.53 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTC:1 - chr3R 6645336 3' - blood 7072 2 62.60 AAATATATTCGTGTTCATGTGTAAACATGCATAATTCCAGCTTATTTGCTGGTGCAAATAGTGCTAAATAAATAAACTAAGAGCTCGATGGATTTTAAAATCCAAACAATTTAATTTCATATATTCCAGTATATGTACTGTCACT:1 - chr3R 25751735 3' - roo 8670 2 70.34 GCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATGCTTAACATCGCTGGTTTTCGTCACTCAATGGGATAATGCGAATGGAAAAG:1 + chr2L 8810944 3' + 1360 452 1 64.03 AAACGCTCAAGCCCTTTCAAGACCAGAGAGCGAACTCTTGCTCTCCGTCGTTGCCAAGAACAGTTCCATGAGGCTCAGATACGTCAATATAACAAAACACACAGATACACACACTTACACTTACACAGCCATCAAGCAACAGAGAA:1 + chr3R 29089357 3' + Doc4-element 95 1 53.42 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATATCAAAATACTTGAACTCTATTACGACGGCATGCTGTGGAGGCGCGGTGATCCTCCATTCGCATAACGTATTGTGG:1 + chr3L 11804085 3' + blood 333 2 54.79 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCATAATTCCAGCTTATTTGCTGGTGCAAATAGTGCTAAATAAATAAACTAAGAGCTCGATGGATT:1 - chr3R 25751786 3' - roo 8722 2 59.59 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATGGCAACTGCCTCC:1 + chr3R 22494193 3' - 297 61 2 61.64 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATTAATCAATTAGTGACCTTCAGTGCGGCCCACTTCCC:1 + chr3R 14986153 3' - jockey 4742 1 73.64 CAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACACTGGACCG:1 - chr2R 10910205 3' + Tabor 7266 2 56.85 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACGGAGCCGAAAAGAAA:1 - chr3L 486733 3' - roo 78 2 73.29 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACTGCCAACTTTGAGGAGGGTTTCGGAGGACAAACACGATTTGGG:1 - chr3L 12159629 3' - Quasimodo 13 2 74.82 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATATGTCTTGGCCTTTTACTCAAGCATTCCGTTTCCGCTTTGTTTCGCCCACTATTTAC:1 + chr3L 3593305 3' + 1360 3348 1 49.26 TTTTTTAAATTTATTTTATGTTATTTTATCAAATATTCCTTGCACTCAACTGTTCCATAACATTTTAAACTGAGTGATTTTTGAATGCTATTTAGAATCACTCCGATTTGAGAACAGCGTTAAGCATTAGTAAACATTTTGGCTTT:1 - chr2L 19607928 3' + 1360 3092 1 71.23 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCGGGTACATTTGCGTGTATTTGGGTATCAGCGGGTGTATAAATAC:1 - chr3R 25049966 3' + P-element 2860 1 63.70 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGACCACCGACCGACCGCTGACCATAATTCACTCAAGTTAGACAAAAGCATTTTGGTTGCCCCGCCCCTAATTCTCC:1 - chr3R 21341303 3' - hopper 14 1 69.57 GTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTAC:1 + chr3R 6413614 3' + 1360 3305 1 82.22 CCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGG:1 - chr2R 13367429 3' - jockey 4602 1 53.47 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATTTCATTAATGAATAATTGCAATTATGACCGCCTTGCAGATTTATGCGATGATGACTCGCATTA:1 - chr3L 21910358 3' + pogo 2051 1 54.17 GTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGTCTATTCAAACTTCAAATGGTATCCCTTACAGTTTGTTCGCTTGTTTCTTTGTGTGTGCTTGTTTCTTTTTTTGTTTGTTGTTTCAATTAAAAAAG:1 + chr2R 5855043 3' - Doc 350 1 58.33 AATTTTGATTTTATTTTAATTTTTTTAGTTGTAATGTCAAAACATTTTAACGCCCACAAACAACATTAAGCCCACGATTTCGAAATAAAGCGATCGCTTAGCATAGCAATATCTCTTCTACGTTATTTAAAATGATTAAAATGTTT:1 - chr2R 4695632 3' + Rt1b 124 1 58.90 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAACACCAAAAATATTTACTTAAAAATCCACGTAGCAGCTTTGTTTGATTAGAAGTGGTAACGTTTTTGGGAACGACAAATATTGAAATTC:1 + chr2R 17693745 3' + pogo 2073 1 66.21 CTCTGCTATTGATCCTGATCTAGAATATATGTACTTTATATGTTCAGAAAAGCTTCCTTCTGCCTATTACATGCTTTTCAACGAATCTAGCAGAAATCATATGACTATATTATTTTAGTATGCAGAAAAGCTTTCGCATTACTGTA:1 - chr3R 18084359 3' - INE-1 90 1 68.49 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCGAACTACTTAAAGGAAGAAAGGCTATGAAAAAAAAACACCCATCAAATGCTTTGATTTCTAATGATAAATGGATT:1 - chr3R 28116962 3' + hobo 2922 1 60.68 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGAACCGATGGCAATGACCATGATGGAGCTTCCGCCCGTGCAGCAGCAGCCAA:1 + chr3L 363542 3' + blood 7320 1 65.07 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTT:1 - chr2L 17839386 3' - blood 59 2 62.12 TTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCTTGAAATCCCTCGGCATAAACCCCACCAACA:1 + chr3L 12223245 3' + Transpac 261 2 51.72 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCC:1 + chrX 3646978 3' - 412 7137 2 75.34 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGCTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGGCAACTTTGGCGCACTGTGCATTTTTATTGCACAAC:1 - chr3R 7470918 3' - Doc 44 1 69.60 GAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTTGTTTGTTTTATCTTTTTTTATGGCCTGACGCCAG:1 + chrX 10111079 3' + mdg3 160 2 79.17 CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAGACTTTA:1 - chr3L 465969 3' + Juan 4160 1 57.14 AATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGACCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGT:1 + chr2L 22036460 3' - INE-1 301 1 54.11 AATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACAATTAGTCTGCTGATAAGATAAGCCCCCAGAAAGCTGCTGCCTAA:1 + chr3L 10528454 3' - FB 72 1 66.67 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTGGCACTGTGAGAATTGAAAAAAGGGGAAACTGTTACCAAATACATGGG:1 - chrX 7756333 3' + roo 397 1 45.89 CCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTGGCAGCAGTGCGAACGAGAAAGTTCAACAATCTTTTTGGCATTGAAATTAAAAAATTCAGCATACCTTTTCACTGGAAGAGTAAAGGGTATAAGAAGAGGTTTTCGCAGCGAAAGC:1 - chr3R 19113906 3' - INE-1 553 1 53.42 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACACAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTT:1 + chr3L 18183214 3' - Tirant 8123 2 69.84 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAAAATCCATAACAGCGGCGGACTCAATTCGCC:1 + chr3L 15192042 3' + Transpac 268 2 74.79 ACAAAAAGAGAATTGATTTCGCGTTTCAATATTTTAACAAATGAAAAGCAAAATCAATTGAAATTATTATTAACAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGTCTTCCTTCCGCTTGGAACATGCCACCTGCCAGGACATTT:1 + chr2L 4337519 3' + invader2 381 1 68.06 GGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATACATTTTCTGCCTTATCTGACCATGGATGCCGCCGGTCCCCAGCACATGAACCTGAAGCTGACACG:1 - chr2R 14254331 3' - FB 312 1 59.03 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGCGTGTGTGTGTCTATGATGCAAGCTTTCGCGACTTGGTGTG:1 - chrX 12905418 3' - Tirant 38 2 53.08 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATTAACTCATTTATTTTTCTCTAAACTTTCATTAATCTAAAGTCGGTAGCGTAATTTGTCTATTAGGATTTTAATGACAGCATTGCGT:1 - chrX 8977411 3' - I-element 35 1 61.64 TTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCAAGTAATGTCCGTCAAATGAAAAAAAAACCATGTTTTCTCCTATGTT:1 - chrX 16097587 3' + copia 421 1 69.86 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTTAACTATCCGGCTCAACTATGCAAATGGATGGACGGCAGATGGATTTATGGGCTGTGAAG:1 - chr3R 25277565 3' - 3S18 5786 2 71.72 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCTTGAAATCCCTCGGCATAAACCCCACCAACAC:1 + chr3L 12223246 3' + Transpac 268 2 54.68 CAGAGCCTCTGCTTAGGCACCAGCACGGAGACAAGAGACAGGTCTGTCCGCGACCTTTTTGCCCTTTTCCGAAGGAACCAGTATCAAATTAAATCTAACGATTTAAAATTAAATTTAATTTTGAATT:1 + chr3R 17922341 3' - Rt1b 237 1 33.07 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTTCAATATGACTTTCAAACGCCGAAGCTAAAATGAAAATTTAGCTTATTAAAATATGAAAAATGTTGCACTTC:1 + chrX 20975856 3' + copia 243 1 52.78 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAAAA:1 - chr3R 20934685 3' - 412 7128 2 67.81 TTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCCCGGCATGTTGTCGACATTTTTATGGCTGCCACGTTTGCTTACTGTCCCGGTCCGTATCCTTCTCCTTTCGC:1 + chr2R 8688187 3' - F-element 13 1 75.00 AGAGCTGCCTTCCCTTCGATGGTTTAACGCAGTACCAGGTTGGCAGTATGGGATGTTAGGGCGAAGTAATTTGTCCAAAATCTGAATGGTAATGTAGCACAACAAAACCGTTCGTAACCCTTTTCAATGGCAAACGAATCAGTTCG:1 + chr3R 12800060 3' + Burdock 5987 1 60.96 ACTGTAAATCATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTGCCCAGAAATAAAGACGGAAAAAGGGAGTCAACGCCAGAGAA:1 - chr3R 31887275 3' + HB 1577 1 63.70 TAATTATTATTATTATTATTCTCCGACATAAACTGACAAGCGCATTTCCCACTCGAAAAGTGTTCGATGCATTTTCGCACTCTCGGGCAGCCAGAAACCCTTAATGGCATGTTGCCTTTCG:1 + chr2L 17998681 3' - invader6 4386 1 64.46 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACTTACATGCGCGCTGTTGACAGGAAAGTTGCCAAAACAAAAAATAGTCATCCACAGCAGTTGTGCCCGTCATTTCAATT:1 - chr3R 20140061 3' - roo 43 2 56.16 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGCCCATCTGCC:1 - chr3L 7837138 3' - jockey 4770 1 69.75 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAGTAATTTCAAATTGGAAGCCGTAACTTTTGCACGCATATACCCCTAAAAGTATAT:1 + chr3R 12379792 3' - roo 67 2 65.75 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAAATTTATGT:1 - chr2R 13761624 3' - jockey 4748 1 70.55 AGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAGAGTAACATATCGCTTTTGTAACTTTTAATTTTATTTGGCAAAAGTCGAACGTCAGCAGCCAAATGGAATAGCAATA:1 - chr2R 17172481 3' + hobo 2470 1 53.10 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGTAGAATGGCA:1 - chr2L 13629040 3' - Tirant 8127 2 67.72 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCT:1 + chrX 6633002 3' + P-element 2787 1 17.12 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGTAAGCCCTTTTAACGGCCAGTGCGTGATTCTTCTGCCGGAGAAATGGCTGA:1 + chr3R 30264130 3' - blood 7050 2 59.59 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGGTCGATAAAC:1 + chr3L 2425967 3' - hopper 70 1 64.38 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCATTTGCTTTGAAGATGGTTTATTGTAAATGATTCGTTTTGGCCAAATGACATAGATTTGTTGCGCATTTGTTGCATTGATTTTTCATTGCCCGTCAAATGAAAGGGGC:1 - chr3R 17099843 3' - Tirant 13 2 78.08 ATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGAGCGCGAGTGTCGCTCTGACTCATAATGTTTACTGTTCTAACTGTTTCAAAGCGCTCAT:1 - chr2R 10995216 3' - F-element 274 1 72.93 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGGTTTTGGTTTTTTTTTTATTTCAATAATTTAGGTCATTTAAAAATGTACA:1 - 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chr2R 11168411 3' - roo 4 2 52.74 GCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAAAAGGAGGAAACTATTACGTTTAAAATTCAAATTTATCTAAAA:1 - chr2L 23373391 3' - Tc1-2 27 1 60.00 TTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTTATTTTAAGTTTTCAAAATACGACTACGATTAATGTGTATACAGATTAATAATTTATTA:1 + chr3R 17396577 3' - 297 6533 2 68.49 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGTGACCATTCATTTTGATTGTGGTCGTGCTGTCGACAGCCCCC:1 + chr2R 23671839 3' + hobo 2920 1 53.49 CACACGTCGGCGATCGAATTGAAATATTCGTGCAGATGAAAACAAAAAATAAAGCCTATTCATCAATTATTTCAGTAAAGGAGATAAGAATAGCGGAAACAGATGTTATT:1 + chr3R 19446774 3' - F-element 11 1 77.27 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAGGGCTGCAGTC:1 - chr3R 7885578 3' - jockey 62 1 54.11 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCAGTAAAAAACCCTCAAAGCGTAGCGGATTTTTCATTTGGAATAGAAAATCCCAAAAACCAAAG:1 - 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chr4 495284 3' + aurora-element 148 1 78.33 ACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACCACAATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTAGTCACAATTTAACATTATTCGAAGAAGTCCTTATAATCAATCAATG:1 + chr3R 8017823 3' + mdg1 7385 2 67.12 ATCATACCTTGACATTTATTTTCCATATTTTACTATAATTTTTGGATGCGTATTAACGATCGTACTACGTGCAAAAGTAAACAAACAATTTGGCGGGAATTGCATTTTCATAAATGTGTCCATCGGACCAAACAACATTAAAATCT:1 - chr2L 17893658 3' - transib2 275 1 72.60 AAAACCAACGAACTATTGATAAAAATGAAGACGAGAGGGGCTTGGATGTCGGCTAGTGCATAATAAAGCTGTTTGTTAGTGGAGCGAATGCAAAGGAAAAAGGGGAAAAAGGATACCCTTCATT:1 + chr2L 9285488 3' + Bari1 1232 1 80.65 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATTAATGCCGCTTTAAGGTATTTTTGCGCTGCCCGCA:1 + chr2R 22463230 3' + roo 8988 2 74.66 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTGG:1 + chr2L 12291962 3' - Tirant 10 2 74.78 CTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTGATAATAATATATTAATATTGCATCAAGTGTATCTCAGACTTCTCATTATCCTACAGATCAAGGCCTTGGGTATTTAAAATGATGCTTCTTCGTGTCTGT:1 + chr3R 17586968 3' - Max-element 22 2 69.18 AAAAAAGAAAAAATAAAACAAAACAAAGCTGCAAAAAATCGACAGAACAAACAAAACAAAAAAGCGAATGGCAAATGGCAAATACCGAGCTCTCTTGGCTTATTTTCCTGCTGACCCTGTTTTTGCCCCTGCGCCGCCACT:1 + chr2L 2096314 3' + gypsy7 5010 2 78.01 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGCAAATAAAAGATCTAAAATCAAAAACTTTTTATTGCATTCCCTCTTCCGT:1 + chr2L 19997155 3' - Tirant 69 2 65.75 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCGAAGTTGCGACGATGCCCGCCGACAGCACACGAAGTAGGGCCCTCTTGTGG:1 + chr2L 17260832 3' + P-element 2849 1 56.74 ATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGAACAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTTAATACTGGCTATTTTAAATTAGCTGCTTATAATCCTGC:1 - chr3L 17426685 3' + HMS-Beagle2 37 2 71.92 TATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATCAATGCACAGTAAACAAAAGGACGAGGCAGCTATCAGTGTTGTCAGGTGTTTAACAAAGAATACAATTTTTA:1 + chr3R 13351265 3' + Ivk 108 1 54.11 AAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAGGAAGTCTACTAATATAAGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGTAGAGCTAGTTCTTACCCTTCAGTAGATACTGCTGAGAAGTT:1 + chr3L 21483757 3' - Cr1a 4023 1 71.23 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACATTTTTTTAACCGATAAAAATGAGCTTGACCAATAAAACCCTGCTATAATACTTTAAAATATTGGTTGTTTTTAATTTTTTAT:1 + chr2R 5434020 3' - Transpac 4951 2 59.59 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTCTAACTCTGAGGATTATGACTGTGACACATTGTTTCGCCAGCGAATTATAACTTAAGCACTTTGTTAGCACTTGGCTAACAAG:1 + chrX 10580022 3' + pogo 2066 1 61.64 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGGCATAATTACAGCAATTTCCACTCTACGCTGTGCTCTGTATTGCTTTCAATGTCAACGAGATTGGTGGACAAAGCAAAA:1 + chrX 10047425 3' - I-element 38 1 57.93 ATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAACACATTTCCACTTTTATGAGCGCCAGTTAACCCCACA:1 + chr3R 8639309 3' - copia 4955 2 76.03 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAGGCAAAGGCGAGATGGTGTGCATCGATCGCTGCG:1 - chr2R 21690442 3' - 412 28 2 56.15 CTCAGCACATATTATATGTGACTGCATGGCGCTTCAATCAAGAGGAACAGATTCCTCGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAGCGCGACCAGTGCCAACGTTTGATTTC:1 - chr2L 13094621 3' + baggins 5232 1 75.00 CACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAGTAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGTTAGCTTTACATTTCTGTTCTCGTTTGGTCTACGACGATTTACGCAGCTCCTCGAGG:1 + chr3R 24560214 3' - opus 442 2 58.87 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCTTTTCGCTGCCCCTTATTTGCGTTTTACCGGAGTTGCAATGACGTACGCACGCACA:1 - chr2R 18689106 3' + Burdock 230 2 68.49 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAACTGGTTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTG:1 - chrX 7756380 3' + roo 9014 2 57.93 CTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCCTTCGCAACTACCGA:1 + chr3R 5773223 3' + Stalker 330 4 69.86 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAGATTTTTATACAAAAGTGCAA:1 + chr3R 11151937 3' - mdg3 31 2 63.01 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCATTTCTAAGCAGATAACTGTGTGCGTGTGTCAGCCAACACTGTGCTACAAAATTAGACAACATACTCCTG:1 - 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Tirant 5 2 80.71 ATTTAAGGTAAATAAATTTGTATTGAATATTTCAGCCTAATTAAAGTTAAGAGTTTTTATCAGTTAAAATTGTGCTTTCACAGAGGAGTGTACCCATATTTGTTCTGTGTGTAAGGCTGTGCATTCTTAGAGCGGC:1 - chr3R 18857572 3' - Tc3 1648 1 74.26 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTTAATGAACTACAATATCATCGCTTTATTAAAGCAAACTGACTTAATTGTACTTACCATCCTTGAGAGAG:1 - chr2L 19691184 3' + roo 398 1 76.03 TATTATTATTATTATTATTATTTTTATGCCTATGTATGAGCATACTATACATATAAGATACGCATATAAGCGTCGCTGCGCTGCTCCTCGACTTAGGCTAAGAAACCTTGGTATGTAGATCATAAGTGCATTGACAAATTGACTTC:1 + chr2R 3203076 3' - mdg1 7069 10 69.86 ATATCTATACATATGTACATATACATACATACTATCTGCTAGAACGTTCTGCTTCTGTCTGTGTTCCTTTAAAGTTTGCAAATTCTTCTCTTTTTGCAGGCGGCGCCGCGCTTTCGAATGTGACATACTTGTGCTCGAACAACGCC:1 + chrX 7329616 3' - G3 4507 1 49.32 AATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAGGTGGCGGTGGGCAGGAAACGTTGGCTGCAAC:1 + chr3R 6495356 3' - Stalker4 7021 4 62.59 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAATGACGCAGCACATCCCCGTTTCTCTCC:1 + chr3L 8658829 3' - roo 8708 2 54.29 GTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTATTAAATTTTTATTTACTGCCATTTAAATGGCGGCAACAGAAACTCCAGACA:1 - chr3R 14596287 3' - I-element 229 1 65.07 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAGACTCGAATTTACGATTAATATACTCACA:1 + chr3L 21013955 3' + roo 353 2 56.94 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCC:1 - chr2R 9294326 3' - Tirant 8177 2 70.59 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCG:1 + chr3R 8217991 3' + P-element 2795 1 23.29 GCTTATAGTCCGATACGACTGAGGATCAACTTCTGGCTTCCCAGCCTTCTGGATGACTTTTCTGAAAAGAATGTAATTTAACTCCAGGACTGAATACGTTAACACGTTTGTTGGCTTAGTCTTGGCTTCACCCTGTACTACATTTG:1 - chr2R 4973041 3' - Helena 177 1 66.44 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATTTAAATAAATTATTATTTAAAACAAACCCATTTTAAAGAAATGTTGATTAAACAGGCATTAGAATATATGAACATATTATAAACAATACAAATCGAAATAGGGCTTTAT:1 + chr2L 4346170 3' + jockey 4978 1 73.97 ATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTCTTCAGCTGTAGCTCGCCAATCCGGGTGGACTTCTTGGTGTTTGTA:1 - chr3R 9356716 3' - F-element 182 1 68.49 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACTAACTAATATAATCAGCTTTGTTCCCGTTTTTAATAACCTAATTT:1 - chr3R 10150158 3' - 1360 77 1 70.55 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTAGTCACTCTGCATTTGAATGTCTGAATGCCGCAAAACGTTGCTCGGCAAACCGACATAAATACAAACAAACATGGCTGCCTGGCGGCCACTTCCTCATC:1 - chr3L 7460575 3' - 412 7075 2 70.55 ATGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCGGTATAGCAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAAGGTAAAATAACTATTATTAATATTATTATTAGTGTGAGTAGGACCTAATTATGTAGTAAAAAATTTAAAA:1 + chr2L 259004 3' - Cr1a 4389 1 77.40 CAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATCGTCTTAAATCATTTTAGCTGAAGTTCACTGTAATCCCTTAGTTCGAAACTTTGCTCTTTCGAATACAACAGCGGAAGATCCAACAAAAGCACATTAAACAAAGAAACACA:1 - chr2L 19140290 3' + Max-element 292 2 77.62 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTTGTGTCACTCTCTTTGGCTCTCTCATT:2 + chrX 7706852 3' - P-element 47 1 53.42 TAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATCCTGCGCTCACTCCCCATATCCCCAAATCAAGTCATA:1 - chr3L 10112211 3' + I-element 5271 1 73.97 GCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTATTCGACGCCCTCATCGTCGTCGGGCATGGCCCTGACTGGTATATCCGGCACGTCCAGCTGGGAATCGCACATGCTGATGCTGATCAGGGGACG:1 - chrX 11832340 3' + transib2 2585 1 60.27 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCATAAAATGACCAGCTTGTTGGGAAAAAAACGCTAACGAG:1 + chr3R 26486101 3' + 412 7465 2 73.29 CTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGACTCCAAGCTGTACGACAAGGAGGCTGTATTTATATACGAAAC:1 + chr2R 17808763 3' + roo 8644 1 69.78 GATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAATATGTATATATGTGTGAGAGAAAAGAGACTAAAATAGATTCTGCGCGTAATTGGAAACACAGAGCAAACAGGTCTTAATCATAACCATAGGGTGTTCCCTCTAT:1 - chr2L 13138926 3' - McClintock 5956 2 76.22 AAAAATTAAAAAAATTAAAAACAAACAGCCAAGCGAAAGGCGTCGCATCCATAAATCCCGCCAGAATTTCACATTTCACATGTGTATAGGTTTTTTATTCAGCTCCCAAATCCACCATTCACCATCTCCGCTTCGAAAAA:1 + chr3R 18893513 3' + HB 318 1 65.00 ATATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACGCATTTTGCCCGCTACTGTGGCCCGCTTTCCCT:1 + chrX 15660542 3' + F-element 94 1 76.03 TACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCGGGTTTTTTTTTTGTGGAGGGAGGAAGCTTTATTTTCAGGGTTAGTG:1 - chr3R 9124842 3' + Doc 274 1 64.93 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGCCTTTCAATGCAAAATTAAGGGCTTTTTGTTTACCTTTATGGATTTTATTTGTTTATATGTTTTTTT:1 + chrX 20934918 3' - copia 4924 2 56.16 TATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAACGACACGCCCATATCTTGTGTAAAATATGAGCGTACGGGGAGAAGTTCTTGGCT:1 + chr3R 14912036 3' - Stalker 68 4 62.33 TAGCTGAGTAACAGGTATCTGATGGTATATGGGCTCGACTACAGCGTTCTCTTTTGTTTCTTTTAATTTCGCGTCAAGATTTTTAACTTTCTTTTCACACTTGAAATAGCTCGAATGCGAAATCGATTATAAAATGCCAAGTTGTA:1 + chrX 7696201 3' + INE-1 544 1 73.29 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTG:1 - chr2R 21848651 3' - Transpac 4957 2 54.11 CAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATGATTATGTAGCATACTTTTCAGGA:1 - chr2L 15013226 3' - BS 4933 1 53.42 ATAGTCGATTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTCCTCAGCTAGTGGGAATGTGAATGCGATATGGCATTATTTTTTTTGGGATATCGAAGGATATTGGGAATTTTTGATGATGTTTCAGCATGAAAAGTACCGAAAACATTGCTCT:1 - chr3L 10591167 3' - INE-1 564 1 69.18 CACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACTTTTGCAATAAACAGTTTTCATATTTTTATTTATTTTACAAATTGTTTTATTGGCCTAAATTAACTATCTGATTCCCAAC:1 + chr3R 10609588 3' + 1360 479 1 78.77 AATGCATACTTCACCGTCGTGTCAGACGCTCACGAGTGCCAAATCATACACCCGGTCTATAACCTAGCACCTGCAGAATGCAAACGATCGCAGGTGCAGATGGATTCGAGATGGCTTGCCAATGG:1 + chrX 2980050 3' + Doc3-element 293 1 73.60 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACCCTTGGGCTTTGGATACGGGCTAAGGATGTGGGTCTCGGTTTCGGTTTCGGGCTAGCGTTCGGCTTAGGCTGTGGGATCCGGACTGGGATTGGTTCGGATTCGGGGTTGG:1 + chr3L 19581035 3' - roo 6 2 80.85 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTTGTGCGAATGTTACT:1 + chr2R 11146158 3' - Quasimodo 25 2 67.12 CTCATGCATTGTAAATTTCACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAAAAAATTGTCAATTTTTACTCCAAGTGCTCTTTATGAATATTGTCATTATTGCACGCAAGAATTGTG:1 - chr3L 14804148 3' + 1360 195 1 56.85 ATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAGATATTAAATATACACATCTACTTAAGCCTGGAATGAAAGGGCCTGACAACCATATAGGCAATTTCCTTTGCCTTGCATGCACCATCACCCCCA:1 + chr3R 6475896 3' + S-element 107 2 55.56 AGAACTTGCTATTCGGAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGTCAACTTTGACGCACTGTGCATTTTTATTGCACAACATC:1 - chr3R 7470915 3' - Doc 45 1 66.67 GGCAATGCATGCAACAGCAACATTGAAATAATACAACGAGGACAATCAAAAATCCTCCGAACATTTACCAGGACCTACGGATTCCAGTTGTGAAAACTGAAATTGTCCTAAAGGGACTTGTAACGAATCCAAATCAATTGGCCAAA:1 + chr2L 16856966 3' + Doc4-element 2623 1 42.47 GTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACATATTTTAAATCACTGAAAACTAAAACAAAAGCGGCAAATGCTAATTACTTACACTGCATAGC:1 + chrX 14994764 3' + Doc 199 1 56.03 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGATGTAATTGCCAAACATTTGA:1 - chr3R 11151774 3' + mdg3 5469 2 65.75 GTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCGTTTAGAATCCGTTTTGCAAACCAAAAACTTCTATTCATTGAAATCACTTGTTCGACATAAATGACCGAAA:1 + chr3L 14167445 3' - mdg1 3 2 76.77 CGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTCTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCTCTGGACACAGGAAGAAAAACAAAAAATTGGCCAGATTAA:1 - chr3L 27862180 3' + Circe 7184 1 72.60 TATTGCTACGAAATTGGCAAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTGCCTTACCCTCAATCTTGTTACGAATAGCTCTTAATAGCATTTTAGCATATGAAGTCATCTCCGTACCCTTTTTTATTATCAATATCTCC:1 - chr3R 546089 3' + 1360 3118 1 55.48 CTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATTCTTTGTACATATTTCATTTAAGCCTACGTAGGGTTTCTGTTCCAATTGAATGACTACGATATCT:1 - chr2L 9418485 3' + rover 7251 2 56.12 ATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCTAAAACGCTTTAT:1 + chr3L 7801299 3' - Transpac 170 2 60.56 TTAGAAGCAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTAAAACAGATCCTGAAAAAATTTCGAATATGATATGCCAGATTGCACTGCGGCGATTTGAAATGTTTCAGCTAATTGGATA:1 + chr2R 18263394 3' + TLD2_LTR 171 1 68.00 GTCCACGCGATTGCACATCTCCCAGGCGAATGATGCACACGTGCGCGCGTTTGTGTCTCTGCGTGTGTGTATGGCTCTCTCTGTGTGTGGGCGTGTG:1 - chr3R 25719706 3' - jockey 17 1 30.93 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATGAAAATTGTGAAAAAGATGAT:1 - chr2R 5237705 3' - Doc 33 1 50.69 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTAATTTAGTGAGAAGCAGAACTATGAAAGAAGTTTTCTTGGCTCACTTTTAGGGATTCACAGCAG:1 - chrX 7446195 3' - jockey 4705 1 50.00 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGCATTGTGACAGGTGCAGCCGTATTTATTATATCAAAATGATCAAAATTGTGATAC:1 + chr3R 17047902 3' - 412 7120 2 60.96 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACGGACATATATGTAGATATATAACCATATGCACATGGGTGCCATCCCATCCGCATATTCAT:1 - chrX 16117160 3' - opus 23 2 56.52 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAGGCCATTCGTATGTATTTCTATGTTGGATCAGGGCCAAGTTCCTATCTCTTGGCAATCGGCAG:1 + chr3R 25862708 3' - roo 8680 2 70.90 AAGAGAGAATGCTATACTCGATTTCCCAGACTATCAGATACCCGGTACTCATAGAGTAAAAGGATATACTAGATTAGTTAAAAAATGCCACAGGTTAAAGAATCCCTTTCCAACCATATAAGGTATATATACATATATATAT:1 + chrX 16472403 3' - INE-1 577 1 71.13 ACTATCTGCTGAAACTTAAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGTGCATACTAAAATGCAATCTCTGTCCGGCATTAAGCC:1 + chr2R 23212675 3' + Tirant 8443 2 69.84 TCCATGATTTACAAGCCTGGAAAGCCTGAAAAGAACCCTGGGTCCTACCAGCCAATCAGTCTCCTGCCTTCGATGTCGAAGGTGTTTGAGAGACTGATCCTTCTTTGTCCGTCATGCAATTGTCGGCCATAAGTCATTAAAAGTAA:1 - 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chr3L 17887805 3' + mariner2 796 1 60.27 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGGGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGACACGAAAAACGGAAAGCGAATGCATCTGAAAGATACG:1 - chr2L 17260736 3' - P-element 80 1 28.97 CGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCACATGCCGCTGTACTAAGCGCTTTGGTTGGCTCCTT:1 + chr3R 12520814 3' + Burdock 6306 2 76.71 AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAACAAAAATAACTTCATTTAAAAATCGTTTATTTCCGTAATCGAAAGCTTACA:1 - chr2L 5791993 3' + blood 7329 1 64.03 AAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAAAGCAATTAACCCTGAGAAAAACATACATTTTTAGCAATAATAAATGTGCTGAATATACACAAAGACCATAAAGTTTCTCCTATTTAAGCGTTGAGCTTGGGCTCTCGTTGCCA:1 - chr3L 21096295 3' + Ivk 5258 1 74.66 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGCATC:1 - chr2L 19652545 3' + roo 8985 2 76.71 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATATAAAACATTTTAAGAACTCAGGGGTTTCTTCGTTTTGGAGATTTGGATCTAAACCAAAAAATGCAT:1 + chr2L 13255392 3' - pogo 50 1 56.16 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTATTTTCATTTTTGTATTTCACCTCAAGTATCACACTGATAATAATTGATTAAAAATTTAATGAAATTTTGTAATGGTT:1 + chr2R 1373247 3' - pogo 15 1 75.34 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTGTAACTAAATAAATGTGGTTTTCTTATTATTTAGCTAGTTTATAACAGTTCATATCCTTTTCCCATTTCCAATCATTCTTAACCCACTGTGTGAGCAATTTGCGTCGCCC:1 + chr2L 6601430 3' + roo 400 1 50.68 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTAT:1 + chr2L 21643129 3' - Tabor 61 2 57.53 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTCGATTGAAATATCTTAATTGAAAATTGCATTTCTCCCGGAAATATTCAATTTTTCTTGGTGATATT:3 + chr2L 19674052 3' - roo 8676 2 47.95 ATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTGTATGTATGTAGATAGATGTGTGTGCCTGTGCGTATCCATCCGAGTGGGGCCGAATGTATCTGAGTATCTGAGTATCCGACGGATCGCC:1 - chr2R 11145995 3' + Quasimodo 7337 2 64.29 GACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGCAAGTGGAGTGGAGGAGCCATGGAAAAGAACTAAGAGTTAAG:1 + chr2R 21439546 3' - jockey 32 1 61.54 GCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATAATAGTTATCACTTTTCCACTTGCAACCTGATGAAGTGAAACATTTAATCATCCTTCGAGTCTTAAGAAACTGACTCATTGCCCAGGAACGCACAT:1 - chr2L 2895512 3' - Burdock 6156 2 69.18 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAGATTTGTTTTGGTTTAAGATCCCAATCAGTCCGGAGTTTCAATTAAAGTTCCATTA:1 - chrX 6632918 3' - P-element 35 1 61.38 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCAAAATAAATCTATGCCAATTATTGACCAACTGCCAGCAGACGAAACAACAATCGCCGTAGACGCTGCAACATTCGAGTGGAAA:1 - chr3L 4523905 3' - roo 8702 2 59.59 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTTGTGTCACTCTCTTTGGCTCTCTCATTTGATTTGCCATGCGGTTATCG:1 + chrX 7706873 3' + P-element 2879 2 77.34 TTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCTAAAAAGGGTTCCCTATGTGGACTTGCGGTAATTGCAGAGCGTTTTAA:1 - chr3R 27323066 3' - 297 6610 2 52.38 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATGAA:1 - chr2R 5237723 3' - Doc 53 1 53.42 GTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCTATTTTACATGTTGTACATGTAGTCTCAACTTTGTCTTCCTTTTT:1 + chr3L 6343502 3' - Tirant 310 2 68.97 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTTACCGGTTAAACGCCAAGGTCGCAGTTTGTTGGCCAACTGCCACCCAATCGGGCAAAAGGGAAAATATAATCATCCAATTTC:1 - chr2L 18522213 3' - roo 8695 2 64.29 GACGCCGAAAAATGAATATATGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTTTTGTTTAAATCTTAAAACATTTTTTATGTAATATTAGCATT:1 - chr3R 21679398 3' - invader3 5459 2 70.00 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTCAACTGTGTG:1 + chr2L 15777909 3' - 297 48 2 55.48 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTCGCCCTTCACGACATTTTCAT:1 - chr2R 11263989 3' - jockey 4739 1 63.70 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGCAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATCTAGTA:1 - chr2L 2494858 3' - Doc 62 1 74.55 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTTTTGAACATAAAAGCAGTTCTATTGAATCTATAC:1 + chr2L 8574516 3' - Transpac 3 2 80.69 GTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATAAAGACCTTTGCACGTCTTTGCGGATGACGTGTGTACAAATTTAAAAGTGCATACTACAAAAATTATAAC:1 + chr2R 5542467 3' - roo 8800 2 52.05 GAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATAAATTTCACACCCACGTATTAGATCTTAATTGAACATCTTCTGCTCAGCTCTGGTATATGAATAT:1 - chr3R 16538352 3' - G2 2628 1 50.74 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGCGGCA:1 + chrX 12273136 3' - jockey 4742 1 75.38 GACCCCAAGGTTCGACTGGTGCAGTAACAGGCGGCAGTAAGAGAGAAAAGAACCGAGTCAGGCCGTCTAGTGAGCACCCTTCCCATCGAGTGACCGAAGCCTAGAGAAGCAACCCCAGCGGGACCGCAGCTGCAAATAAAATGAGA:1 - chr3L 497004 3' + Gypsy12A_LTR 418 1 70.55 GAACGGTCGTTTTTTTTTTCGCCCCGAATTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAGTAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAATGATTGGAAGTTGAGAAGAAAGTTTTGTCTTCAACATTAAGCGGAAAATTT:1 + chr3L 15824911 3' + Cr1a 15 1 64.38 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGTTTAGCAAAACTTGAAGTGGAATGTATAAATGTAATTTTCGTTATATTTATTTT:1 + chr3R 6422912 3' - jockey 75 1 60.27 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTG:1 - chr3R 9125636 3' - Doc 45 1 59.59 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGGCATTAAATAAATAAAGGCCAACTTGATGCCGTCCT:1 + chr3R 18528390 3' - roo 43 2 54.11 AGAAATTGCCATCATAACACCTGCAATGCGTAAAAAAGTTGCTGACCTCGAAGTCCTTAGAGTATCAAGGTTTGTGGCGG:1 - chr4 1082880 3' + mariner2 679 1 75.00 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAGGTGG:1 + chr3R 6495329 3' - copia 14 2 61.64 AATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAACACAAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTTTTGTGTGTTCTTTAAAGCTTTTATGACATTCCTTTTACATATACGTAATTTTATAGTTGTATGTTTTGTTG:1 + chr4 734248 3' + Tc1 1581 1 55.48 CTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATAATAGAGTTTGCGGTTTTGACATTTTATAATTGAAAACATTTTGCTAACGATTTATGTCCGTTGCATGCTGACTTT:1 + chr2L 9269616 3' - F-element 14 1 60.00 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAAT:1 - chr3L 17537762 3' - Doc 83 1 77.70 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTAATCTCTTAAGTTTAAAGATAATTACTTCTAGTTATATATCGGTTTAAAACTATGTTCCACAGTAGCTTTAACTGGGATGGCCATTGAAATTTAG:1 - chr3R 18528234 3' + roo 9048 2 66.44 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCATGTGGTCAGCGAGGAGCAGAGAACGGGCCTACTATGCG:1 - chr3L 11803940 3' - blood 7022 2 73.98 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGCCCATCTGCCCCC:1 - chr3L 7837135 3' - jockey 4771 1 69.92 GTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGG:1 + chr3L 23678165 3' - Osvaldo 24 1 64.10 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTGAGTGAAGAAAACAGTCGAATCGGTTGACTTGACGATCCAGTGCAGAAC:1 - chr3R 10212995 3' + P-element 2877 2 76.00 ACAAAACACTAAACCTAAGTTTAATCTAAAAAGTTTAATTTAAAATATTTTATTACAATTTTAAAAGTTTTAGTATGCAGTATGTCCCCCATTGGCTTTCGCTGCAAGTTGAAGCCATTTTTATCCGATTAAAAAGAGGTAAAAAA:2 + chr3R 6461285 3' - S-element 1484 1 82.19 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTATTAAATTGTTCGTATGAAATTAAATTTTATACGAATATTTCCAAAACTTTCCCGAAATATTTAACACACTGTGCGCACAGCTGCTTTTCGGCGTGAC:1 - chr2L 6601239 3' - roo 8686 2 63.70 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCT:1 + chr2R 21439495 3' - jockey 84 1 74.62 TTATAGTTCCTGAGAATTCGACCTTCATATGGACGGACAGCAGAACGCTAAGCCAAAGGTGTAGGTGCGAGAGTACTATAAAGAGAGCAAGAGATGGGAGCTTAGATAAGGAAAGATATTGCTGCACAGCTGCGG:1 - chr2R 4606435 3' - INE-1 145 1 74.07 AATGAATAAAATTGTTTGTCATTTGATAAAAGAGATCTATATGTTGCTATGGATATAAAAGATAAATGGGATTCTCCTCCTAACAATGAAATTTGAACAGGATGCGTGGAGTAAGCG:1 - chr3L 2440043 3' + Penelope 96 1 77.78 CTCGATCAGGATCAATACCCGACTCGATCTGGCCATGTCCGTATGAACGAGGTCTCAATTTTTTCTGCAAATCGATAAAAAATTTACAATGGCCGTTGTTTATGATTTATATGTTGGCCTGTCCTGTCCGGCTATTCAAATTGTTT:1 + chr2L 20354928 3' + INE-1 89 1 60.96 TCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTCACAGTTCGCATAAGCAATTCGGTTTTGTGCCCTTTCCTTTTCAATTTCTCTCCTTATTTACAATAAAAAGGAAAAGGCTT:1 + chr3L 2702195 3' - blood 396 1 56.85 TCTAAATGCGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAGGGTCTTGAATCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAAAATCTTAGACTGCCCAAGTCCTGGTAGTTTACAAGTTGCCTCGGTTTCCCATCATACATATAGCTATATATAT:1 + chr3L 6658953 3' - baggins 5110 1 68.49 CAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATAATAGTTATCACTTTTCCACTTGCAACCTGATGAAGTGAA:1 - chr2L 2895568 3' - Burdock 6212 2 73.97 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGGTCGATAAACCAAAAAGC:1 + chr3L 2425975 3' - hopper 22 1 60.38 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACATAATTAGTCTGATAGATGTAAAATTTATT:2 + chr3R 6413684 3' + 1360 3364 1 68.49 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAATTATTG:1 - chr3R 15295736 3' + roo 326 2 79.45 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTATCTAAGCCAAGTTTGTTATGTGGGTCGAAATGCTGCGACTGCTAGCCATGCCATTTGCCCAAAT:1 + chr3R 25804220 3' + mdg1 7404 2 54.79 TAATATATTTATATTAATATTTAAATATTAAAAAGTTCTGCATAATTTTGATTTTTACAAGCCAAGCCCAAAACATGATATTTATTTATAGACGAATGAAAGCTACTCTATAATTCTTGTAGATTTTAACAAAAGATGTTTCTAAT:1 - chr2L 7770642 3' + Tc3 299 1 69.86 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCATACTACTAACT:1 - chrX 1103586 3' - pogo 35 1 60.27 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAAGTGGCAGTATCCTTGAATC:1 + chr2L 3231998 3' + roo 9043 1 63.70 ATTCTAGCACTGCCAATGCGTATGCGTATCTGAGCACATTGTAATCTATGTATATATATATTCGAAATATATATGTACGCATACCACATCTCCCTCCTTTTAAAATTGGCCCTGGTAAAGGTGGAATCTCTACATTATCCAGCGAC:1 - chr2R 7641943 3' - gypsy11 4067 2 71.23 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAAGTG:1 + chr2L 3231982 3' + roo 9027 1 52.74 ATTTATTTTTTTAAATTTTCAAATATTTTATATGTTTATTTATTGTATAAATTTGAAAGCATTACAACAAATATATCGAAAGAGCTTTTACTTTGACAAGCCTTTCTTAAAGTTGTGACAACGGGTCCAATTCATCACTTAATTAA:1 - chr2R 11789652 3' - TART-C 11093 1 56.16 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGTATCAACATATTACGGCATTTATGGTAATTTTATTGGTGCTTTGATTCAACAGCAGCATGAATATTTATAATCTTTGAATAAATTTGTCTGCTCGT:1 + chr3R 10150278 3' + 1360 3365 1 69.18 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTTGC:1 - chr3L 7791886 3' + Transpac 253 2 55.48 TCGGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATACTTTATATATACTTCGTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAATGAATCCAGTCATACCCGATTGTCAGCAATTTCATTCCGACTGCAGAACATCATCCCAAATTGCAGTCCGGAAC:1 - chr2R 5815828 3' - INE-1 89 1 53.42 CGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATATCCACTTTAGCAACCATATCCAAATGTTAAAAAC:1 + chr2L 14625761 3' - jockey 268 1 76.71 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACAAGTAAATGGTTTTGGTATGAAAAGTACACCTCTGCCGGTCCCATCGTCGTCGAATGGCAATGTCAAACCATCCTTGGTCCTT:1 + chr2L 11551836 3' - roo 85 2 43.84 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGGTTTTC:1 + chr2L 14239229 3' + 412 7477 2 65.28 CTGTAAAATCAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCAGTTCTTTTGTTTACCTAGGCTACAGTTGCAAACATTTTCCTTTTCCCCACTTTTCCCCAGCTCATCCCCGTTTGTTTGTACAAATTATTATGAATGATAAT:1 + chr3R 17249741 3' + 412 360 2 71.23 GAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTAT:1 - chr2L 21643052 3' + Tabor 7248 2 71.53 GACAGAATGCCGGAGTTGTTGGTTAATGAGCGATGGCTCTTTATTTTATGAGTGTCCAAAACGAACTGCTTAAAGCTAACAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTCAGCGGACGATCATATAAATACATAA:1 + chr3L 21814592 3' - gypsy3 6748 2 58.70 AGATTCTTATAATTTGTGTATTGAAATCGATATTTTTGTTTTTTCGGGATTGCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGACGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAATGCCATGGTCAGCTGCCACACGCTACTGTGCACATCCTGCAG:1 + chr3R 24538157 3' - Idefix 302 2 69.86 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACGTTTTTGATTATCTTAAAAAATTGTA:1 + chrX 2295281 3' - Transpac 20 2 50.00 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATATTATTACAGTAGTTCATAAATCCATACTTTAATTGGATTAAGAGCGGCTCG:1 - chr3R 30264027 3' + blood 7315 2 68.38 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCGGGTACATTTGCGTGTA:1 - chr3R 25049993 3' + P-element 2870 1 61.22 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTGGCACTGTGAGAATTGAAAAAAGGGGAGACTGTT:1 - chrX 7756347 3' + roo 9046 1 36.99 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAATATTCATTTATGTGAGAGCAGCAGCTGTGTCAGTTACTGCAAAAAAAGAGAACTGGCTTTTTTTGAAACTATCTTTATTAAATTCGA:1 - chr3R 22341073 3' - hopper 36 1 75.34 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGC:1 + chr2L 21910216 3' - Doc 57 1 70.59 AGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTCACATTTTTTAAAACAATTACAGTTTCTAAATGTAGTCAAAGCTGACACCTTCATGATTATTTGATGTCAGGCTGGGGGTATTT:1 - chr3R 14911943 3' + Stalker4 7323 2 50.39 GCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGATTAAATGGAAAGCGATAGAATGACTGGCGGAGTGAAAAATGCTAAGAAAGAATCAAAAATTCATGAGGCGGTGCGCGCGAATTATAGCGACTTACTTGATGGTT:1 - chr2L 18112132 3' - transib2 2695 1 76.71 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGCAAATGCCACCCCTTTTTTCGTTATTTACTTAGAGGATTTGGCTTTTGATACAACACATT:1 - chr3R 13838181 3' - 297 35 2 59.59 AAAAAAAACAACAACAAAAAAAGAGGAGAAAAAATACGAAACGAGACGGGCATAGGGGCAGGAGAAAGAGAGAGGGAAAGTAAAAACAACAAGAAGCAACTTTGCGGTTGCAAGAGGAGGCAAAACACTG:1 - 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chr2R 17198027 3' + accord 7025 2 79.57 GGTTTATGGCGTGATGCATTGAAGCCAGGGTAGATCCACACTTTGCATATTCTTTTGTATTCAGTTTTAACGAAAACATCTTTAATAAGCATTTACATTTGACGTCCGACTGACACAGAAATCTGCACCGTCGGCTATTAGCAATT:1 - chr3L 20555827 3' + gtwin 7105 2 52.05 AATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGC:2 + chr3R 19436109 3' + roo 369 1 57.53 GCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAACATTTGAATCTATTCAAAATAAGCGTTTGATTTCGATTATAAGAAACATAGGCTATTTA:1 + chr2L 16456854 3' + BS 5070 1 50.91 ATATAGATTTAAAGTCCAAGAACTTGAAGGGCATGTTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACATGGGCACACATACAGTTGTCTGCCATCACTGTATGCGTAGAAAAGATTCATTTAATCGACTATTAGATACCGTTTAAGAG:1 + chr2R 12831485 3' - 1360 240 1 76.71 AATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGTCTGTTGCAGCGCTTCGGTCCAAGCGGAGCAAATGCG:1 + chr3L 22873625 3' + P-element 2741 1 30.37 ACTGTACCAAGCTGTGGATATAATCTATTGAAATATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAATCGTTTCTTCGCGACTTCTAGATAAGTTAAGATGTGGAAAATAAATGCAATCACCTAAGAGGCTGTTATAGACCGCCTTATCA:1 - 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INE-1 97 1 74.66 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTG:2 - chr2L 14239151 3' - 412 7127 2 66.44 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTT:1 - chr3R 9125658 3' - Doc 67 1 56.85 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCTACCTTTTACAATTT:1 + chrX 1103716 3' + pogo 2052 1 58.21 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTCGCT:1 - chr3L 18183065 3' + Tirant 8482 2 64.84 ATTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAG:1 - chr2R 13367430 3' - jockey 4588 1 58.91 TGACAAGGAGAGGAGAGAGAGCGGAGGCTTTTTTAATTCTCTAAAATATCTTAAAGATCTTGCAGTTTTGACGAACAAAATTAACAGGAAGGTTGATACGCCCACTGTGACTCCCACATATTTGAAACATTTTTGGAGACATTTTT:1 + chr2R 5490087 3' + Rt1a 4940 1 55.48 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAAC:1 - 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chr3R 9125622 3' - Doc 31 1 69.18 CAAATTTGTATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATGCAACACTTTGCCCGACTCTCTATGCGCATCCTTATT:1 + chr3R 22341241 3' + hopper2 1566 2 52.24 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAA:1 + chr3L 21093240 3' - Ivk 47 1 53.62 CGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACGTGGCCAAGCACGCGACCAGCGCC:1 - chr2L 13629014 3' - Tirant 8120 2 78.08 GTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATGATTATGTAGCATACTTTTCAGGAGAGTC:1 - chr2L 15013221 3' - BS 4928 1 52.74 TATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAAATCTTTTGGAAATATAAATGGAAATGGAAAATGCAATTCA:1 + chr3L 21262637 3' - jockey 4556 1 72.60 CCTCCCCCCCTCCCCCCTCCCACCCCTCACTTTGTGGCACGGAAAAA:1 + chr3R 30305534 3' + accord2 225 1 80.85 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATACATATGTATTTGAAAAACTATTGAATATAAATAGTTAATTCTGTGCGATGTTTTTCTA:1 - 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INE-1 255 1 50.00 AACTGAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACACCTTGTTTGAGATGCTAATGCTGCTAAGAACACGAATATCTCAGTTGTCGGGGAATAGAGAGGTTAACCTAAAGGGGAAAGAGGGAAAGTCAAGTTGCAACCACTCCA:1 + chr2L 1776230 3' + roo 9055 2 73.97 ATACATTGCGTAAACCGATTTCTAGCGTTTGTCGTGACTCTTGTTAGCATAGCAGGTGTTATGTGAAATAAAATAAAATATAAATTCCGAACCAGGCCAACAAAGGTGCATAGCCGCAAGCCCTTTCTTCATCT:1 - chrX 22783327 3' - mariner2 732 1 53.73 GACGAAGATATTTGGGAGATACATTTATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAGCTATTTTTGCCACGTGTTCATAAATAGGAAGTATTCTCGAAGGTATCTACTCGGCTTATTTGCTGT:1 + chr2L 9104399 3' - accord2 117 2 51.37 GCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAGTCTTAATTAATCCTCTTATTGTTGCTGATTACACCTATCTCTTTCCATTTTTGCTTGGCTTAGCATTGTTTTTTGGGCTTTC:1 + chr3L 20827639 3' - 1360 486 1 56.85 AAATAATAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTGGTAGTGCGGATTGAAATTACAGCAATCGACAGTCAAACGAGACTTTATTAAAAGCGCTTTCCGCAAATCATTCGCGCTTTATTTTGCATACACGCCTGC:1 - chr3L 22885275 3' + P-element 2502 1 66.90 GACGTGTGAAGACGTGTTTTCTTCGAGCTCCGTATAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAATGAGTAATCGAAACTAATTGGATATGTTTTATTAAAATAAGTTTTTACACCCTGCACGTTATGCAAAGATACAAGACTTTGTTTAGCCC:1 + chr2L 11475131 3' + Doc2-element 15 1 61.64 AAATTATAAAAATTTCATTTTATAAAACCCAGGATGATTAAACTGCTCTAATGAAATGCACTTATAGCCAAAAATCACTGATGTGAAGCAAACACCTACTACCACTTTTCCACCTGTCCAAGCCCATGGCACAAAGT:1 - chr2L 19590054 3' + HB 329 1 72.26 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCACT:1 - chr3R 25050012 3' + P-element 2808 1 27.66 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTATGTACTTTGTATATCTCATTTCGTGTCTTGTTACCTCTATCTAAAGACCACTGTATAGCTCTGTTGGTTGATTTAATTTTTGTATTTATTT:1 - chr2L 17626549 3' - roo 8692 2 67.12 ATTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTTCATTCTTAGGGTAGATTAGTCCATTAATAACTCTTAAGGGGAATATCAGCTTCGATTCTTAAA:1 - chr3L 5878074 3' - Stalker 95 4 72.60 AAATAATACAACGAGGACAATCAAAAATCCTCCGAACATTTACCAGGACCTACGGATTCCAGTTGTGAAAACTGAAATTGTCCTAAAGGGACTTGTAACGAATCCAAATCAATTGGCCAAATCACTTATAGAAGTGAATAATAACA:1 + chr2L 16856991 3' + Doc4-element 2648 1 57.53 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTTGTATCCACTTTCATTGTAAACAATTAACTACAATTTATCCAACCAGTTTTTTTGAAAGTGTTAA:1 + chrX 15454777 3' - 1360 58 1 58.22 CAAACTATTTGTGGTTTAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTG:1 + chr3R 14049416 3' + transib2 2746 1 69.86 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAAATGAGCGCTAAACGAGCTCGAAGCCTCCAAGAGCAGCACGATTTTTTTTGGGGCTGCCTGAAGAAAGAC:1 + chr2L 11405873 3' - 412 7091 2 52.99 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAAT:1 - chr2L 14969110 3' - 412 84 2 75.34 GTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 7573 2 62.20 GAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATAGTTTTAGTATTTGAATCGAAATAGCCACTGAAAGGATTAACACAAAT:1 - chr2L 1244444 3' + roo 8662 1 65.22 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTAAA:1 - chr3R 16276302 3' - pogo 36 1 60.96 GTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATCGATCAATAGTCTTTCATATATTTAGTTACATACAATATAATA:1 - chrX 14836185 3' + invader4 253 2 69.18 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTGCACGTTGCTCGCATTTGGCAGATAGGGTCAAATATCCTCTACAC:1 + chr3R 11095924 3' - 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chr2L 6606666 3' + roo 285 2 80.14 CTGTAATTTCCCCACCATCTGTGTTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCGCAAGGAACTTTGGGCCAAATTGTGTGATGAACTGCCTAACACACAAGTGGACTTCCGTATCGATGCCATAAACCGGAGA:1 + chr3R 23502015 3' - G5A 437 1 69.60 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATAATGATGATGTATTCGTCCTTTCTGGAAAAAAACCTTGTCATGGACTATTCACTTTTGGTGGGCTTGGACAAG:1 - chr2R 17775524 3' - roo 8708 2 50.68 CTTATTCTTGATCAGGATCAATAGCAGAGTCGAATGAAGGATTCTACTTCGGTGTAAGTCCAGTTTTATGTATTATGTATTGATTGCTAAAATACTACATAAAACTTGAATTTATGTGTGTTTTGGCTGCCGACTTTCACTTGGCT:1 - chr3L 17692263 3' + INE-1 83 1 52.05 AAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATTCTTTGTACATATTTCATTTAAGCCTACGTAGGGTTTCTGTTCCAATTGAATGACTACGATATCTGGAGATCCCCAC:1 - chr2L 9418473 3' + rover 305 2 52.05 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATGGACCGTGAACCGTCGTCGAGTGTGTGCGTATTCACTCTTTGTTTGCAGACTTTTTGGCGTTCGTCGTTGCTTGGCATTTGACTTAATTTAA:1 + chr2R 17332256 3' - jockey 16 1 73.81 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCT:1 - 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chr3R 17267814 3' - flea 4751 1 63.01 AAAGTAAATTAAAGCAAAGCAATCGAAGAGGCAAAAAGCAAACAAACGGAAACAACAAAACGGCAAATGACGAAAAACAAGAGAGTTGGGGCTTTATTTTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTGCAGAAGGAGAAAAGCAAAAAAAAA:1 - chrX 5474353 3' + TART-A 13142 1 60.96 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCC:1 - chr3L 21013874 3' - roo 68 2 75.19 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCAAAATACATTTGGAGGAATTTGTAAACAACCCGAA:1 + chr2R 11256289 3' + roo 9042 1 63.70 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGACTAGAATGCGTGTTTAAGTGAACTGTCCCTT:1 + chr3R 28450761 3' - roo 8720 2 60.27 TAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTGATGGATTACTCTCGTTCAAATGTCG:1 + chr3R 7616840 3' - Stalker2 7262 2 69.57 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACG:1 + chr3R 12363789 3' - jockey 4757 1 71.72 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTTAATGAACTACAATATCATCGCTTTATTAAAGCAAACTGACTTAATTGTACTTACCAT:1 - chr2L 19691195 3' + roo 9050 2 68.49 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTGGCCCAAACGG:1 + chr2L 12291971 3' - Tirant 11 2 76.00 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTG:1 + chr3L 21093244 3' - Ivk 46 1 52.48 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGCATTTTACGTCCTTGAACTTACCCGGTTGCCATGAATCCTACCGTGAATCCTACGAAAACCAGACAT:1 - chr2R 15075524 3' + mdg1 7449 2 78.47 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATCTACAGTATAGGGTCTCTACGAGTAATAATTTTGCGACAAAGGCTGAAATAAGAAATGTAAGAAAAATGAT:1 - chr3R 20872085 3' + 297 6932 2 58.62 AAATTAATTAGTTTATCAAATAATCAAGTCTGTGCAATTCTGTATTTGAGTGACACCTACCTGGAAGACATGACGATGCCGCACGGCGATCTTTTTGCTGTTTCTGATTCCGTTTCTGATATCAGCGGAACGTTCTTCGCTCTCCC:1 - 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Doc 33 1 63.70 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAGACTCGAATTTACGATTAATATACTCACAATATT:2 + chr3L 21013960 3' + roo 9020 2 54.11 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCCATGTTAATTTCGAGCAATTATTGGACAACCCTTTCAGATTCCAGATATTATA:1 + chrX 16994585 3' - roo 67 2 66.44 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATAGTAACATGTCCATTCTACACCCACAACTTCCCAACCACACACTATTGTAAACAATCACAGACACACATTAATGTCTAAGTGCGAA:1 - chrX 22252719 3' - flea 4788 2 64.38 TTTAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGATTGGCACTTGGCACTGGGATTATGCCTTCCAGGCGAGCACTTCCCAACCGAACCACTGAG:1 + chr2R 15443086 3' + 1360 427 1 58.90 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAACTCGCGTCGCACCCATGGGCATTTTTTGTTCGAAAGAATTTCT:1 + chr3R 8849869 3' - 297 21 2 62.61 AAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTTCGTGAGGTTCCAGCAGTAGAGTTGATCCCAC:1 - 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chr3L 12835940 3' + 1360 3380 2 77.40 CTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATAAGGGAAAAAGCACAAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAATATTTCGCAGCTCCCATGGAAAATCGTAAAAAGTCATAAAATC:1 - chr3R 6015091 3' + Juan 4139 1 64.38 ATTTGGGACTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTATTGCATTATTTGTCGTCTGTATTGGCAATCTTTACCGGATA:1 - chr3L 10478823 3' + roo 415 1 71.92 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAAC:1 - chr3L 19031216 3' + roo 356 2 52.05 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCTTCCTTACTTTTTTCATTTCTAGCATTGGCTGGTTTTTTATCAATATCCCTTT:1 + chr2L 16331041 3' + roo 9007 2 64.38 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATGGAGCCGCAGTGTTGCGGTTATGCAATAAAATGTTGCATTTTGCTTTCGGTTTGCCAAACGCC:1 + chrX 14743032 3' - FB 30 1 56.78 AAGTATGAGTTCTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGATGTTGAATATGTCTTGTTTGGCTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTATTGTTTCAGCAATCAGATAGTTTCATACTCAGCTCA:1 + chrX 10754957 3' - I-element 5138 1 75.34 AGCTTTTAAATTTCAAAAATTCCATTTTTTCGACTCCAGCTTCTTTGAGCTCGTACATTATGCGCAAAATGAGATCGCACTCACCCGTGTCCTTAATCCAGTAGTTAATTGATTTGGGCGAGGCTTCGACGTGACACTCGATTTGG:1 + chrX 3514908 3' - FB 30 1 53.42 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTGCATGCATGCAACACCCTGTAAGATATGGAGATACGAGGCCAAAAGCTGCTCTT:1 + chr2L 18522374 3' + roo 9048 2 67.81 GTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTTAAAAAGAAATGAATTTGCGATTTATTTTTGTATGCATATTTCTTCTTCGAG:1 + chr3L 7991867 3' + roo 8606 1 62.07 TTGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCTTCTCCAAGGATCAATTGAAGTCTGAAATCATTAAGTGGTTTCTCTAAGGTATGAAT:1 - chr2R 3877208 3' - Ivk 134 1 60.96 GTTGAAATTGGAAAAAAAAACACTTCAAAATTTGGACTTCTGGAATTTGTATTGCTCAAGTAATAGAAATTATTTTGAGAGTCTTAAAGTAAATACCACTTGTCATTGCCTGGTTTCCAGAAAGTTCCACCTTTGGGGAAGTCCAA:1 + chr2R 16129526 3' - pogo 159 1 51.37 CTTTTCCCTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGGTTGTTGTAATGAAAATAAATGCGTTACATTTCAATACGTTTGACACAATCCCTTCGTTTT:1 - chrX 7480716 3' - Bica 338 1 74.13 TATTTTCCTTTTTTTTTCTTTTGCGTTGGCCTGACCTTTTTTTTGATTACACGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCAGAGAGGCCTTGTGTGGCTGGTCAAATATTT:1 - chrX 9543611 3' - Doc2-element 248 1 83.78 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGACTAGAATGCGTGTTTAAGTGAACTGTCCCTTTCATAAAATATG:1 + chr3R 28450773 3' - roo 8708 2 52.05 GACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGATCGGAAACATGCTATTGATCCCAAATTCTATCAACTTACACTAAAGGACACGTAGAAGGTGTCTCCTGCCTTAACG:1 - chr3L 6095451 3' - transib2 42 1 55.48 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTAGAAAGGATAAAATTCGACATAACTTTCATTTGGTGCAGGAGTACCCCATTTTAGAATATAGTTCTAGCAGTTCCCCCTTACCCGCCTTAATAGTTAACA:1 - chr3R 8017698 3' - mdg1 7061 2 70.55 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCTTGAAATCCCTCGGCATAAACCCCACCAACACTCGCACTCACTTG:1 + chr3L 12223259 3' + Transpac 5193 2 60.96 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAGAAAGAAATATCCCAGGAATTATTTCATATATACATATT:1 + chr3L 13364428 3' - hobo 25 1 69.18 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGTAAGCCCTTTTAACGGCC:1 + chr3R 30264097 3' - blood 7083 2 67.12 GGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCCTTGTTTAAAGCCGGTGGTTTTTTTTACAGTGTTGATTAGCAAAGA:1 + chr2L 21976824 3' - Idefix 18 2 47.95 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGATTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGCTTATTTTTGGCTGAGCAATGAGGTGTTAAAATTCC:1 - chr2L 13842298 3' - jockey 4756 1 73.29 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTCCATTAGAGATCATTCCGTGTGAGGGCCTCATAAAGCGAAGGCTTGATGGCGTGCCATTTTTTATGCCGCGCCAAATAGT:1 + chr3L 2482177 3' + roo 9031 1 59.59 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAATAATTATTAAAAATT:1 - chr3L 16015216 3' - 1360 48 1 51.37 TACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAAACTCTGTACAGTCAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAGGCGGCGGGGCGTGGCCCAGGGCACGACAGGTGCCGCTGACGTTCGCGCTGATAATTT:1 - chr3L 17159351 3' + rover 7120 2 58.04 AAAACAAAATGTGCAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGTAATATTGCGAACTCACTCAGCGCCGTTTTGAATGAGTGGAACCTTTTAAATAAGGTAG:1 + chr2R 6493193 3' + transib2 2764 1 57.53 GCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATCGTAAATTTGACTTAATTTGGACCACTGTAAAAATAAAACAAAACCAAAACTTGCCTGCTGGATTTTAAATGTATC:1 + chr2R 5529396 3' + 1360 134 1 56.16 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATTTCGAGGCGATCGC:1 - chr3R 18399207 3' + P-element 2816 1 35.00 CTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATCGATCAATAGTCTTTCATATATTTAGTTACATACAATATAATACATATTGATTTAATTGGTGTTTTC:1 - chrX 14836161 3' + invader4 278 2 53.10 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAAATGTATTTATATATATATTTTTTTAAATGGCATTGCTTATTTTCTGAATCTCAATCTTATTG:1 - chr3R 7507133 3' - Doc 59 1 58.90 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCGGTTAGGTTTCAAAAGTTATAGTAGTTGTAGTTGTTATGAAAAGCAA:1 + chr3R 8218037 3' + P-element 2857 1 61.54 CCGGACTCCCCGGAGCAGCCAGCAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGATTCCTGACGACGACGATACAAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAATAAGAAAGTTCTTACCGTCAGTTTATCATATTCAGATACGAACCTTATA:1 + chr3L 21651896 3' + Gypsy6A_LTR 321 1 65.97 TGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGAT:1 - chr3L 27415222 3' + transib2 2755 1 65.75 ACAATTTTCAAAAATGTGGGCGTGGCAGTTATGGGCGGTTTGAGGTCGTTGGAGTGAGTGTGGCAAAACTTTTTTTGCAAATTAATAGAAATTTACAAGACTAATAAGAATGAGAAAAAATATCAACACATTTTCCAAAAGTGTGG:1 - chr2R 5212078 3' - INE-1 255 1 70.55 CTTGTATTGTTGGCCAAAATAAGTTTTCTATTCATCGGATGCAGAGAAATCCACACAGACACGCGGTTTCGGAGGAACTGGCGGCGGATGGCGATAGCTTCGATAGCTA:1 + chr3R 17782898 3' + G3 414 1 72.48 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTAT:1 - chr3R 26486032 3' - 412 73 2 65.07 CATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTCAGTGTTTTTTATATTCATAAGCTTTGGCATAATTTTGACAGTTTTC:1 - chr3R 9109518 3' + blood 7176 2 71.74 ACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTCCGCCGACT:1 + chr2L 18112594 3' - transib2 2605 1 54.11 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTGTTTATTAAGCACTTACACTTGCGCTATGTTAATCTCC:1 - chr2L 4637215 3' + mdg1 338 2 73.29 AACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTT:1 + chr3L 12223210 3' + Transpac 236 2 74.07 AGTCTTCTTTTGATTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGTTAAATATGAATTTCAGTTGTGACGAGAATTATGCAAAATCACAAGGGATCTTAGGTAACGATTTTACT:1 + chrX 13575270 3' - jockey 4731 1 51.37 CAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATATCTTTTTATAAAAATTTTAACGGTAACAATATATTGATCAACTTTAAAAGCTTTTC:1 - chr2L 7822218 3' - Juan 45 1 43.15 TTTTTTTTAAACATTTTTAGTGCTTGAGCAGCAATAATCAACTAACTCTGCCATCTCTGCTGTTATCGATATATCAAAACAGAAATCGACCACTTACTGAATCGACGACCTACCCAATCTCCAAACGAAGAGTTTTTTATTGGC:1 + chr4 702862 3' - TART-B 10623 2 57.64 TTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGGGAAAAACCGG:1 - chr2R 12770045 3' + hopper 146 103 76.60 ATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGCTACTTTGTGGGGGGGGGTGCTATGTGTGTGTGTGTGTTC:1 - chrX 7247063 3' - Quasimodo 170 2 61.90 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATCCTGCGCTCACTCCCCATTTCCCCAAATCAAGTCATAAAACAAAACAAGGGGAAAAAG:1 - chr3L 10112190 3' + I-element 5292 1 59.59 AATAAAGGAAAATAAAAAAGGAAAATACAAATGTCTGAAATTTCCAGGTATCAAATTCAATTAAAAATCAATAGGAATTAAACCCGAACATAGATTTTAGAGAATTGACCGATTTTTTATCAAAATATTATAGTTGCTGTGACGAG:1 - chr2L 4133219 3' + Doc2-element 256 1 78.77 AGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGAATGCTGACTTAGCTTGCTTGACTTAAATGTGTCAACGGACCCAGCAACTTTAACAATGGCGCCTACTACGACAACATGAGTTTTCAACAACAGGCTCAAGCTCAC:1 - chr3R 6709678 3' - blood 7164 2 52.05 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACTGGCGCACCGCACTGCATTTATTTATTTGGACACTAACGCCCTCGCAGCC:1 + chrX 16117316 3' + opus 7487 2 74.66 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAATAAAGCGGAATCATGTGCAGAAACTTTTATAAGTTAGGTGTATCATCCAAGTG:1 - chrX 21403351 3' + roo 9050 2 67.59 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCC:1 + chr3L 15364882 3' + 1360 3334 1 71.93 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAGATTTTTATA:1 + chr3R 11151926 3' - mdg3 5294 2 55.48 GTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAAT:1 - chr2R 18689166 3' + Burdock 176 2 77.30 TGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATTTTAATAGTTCGCATTTCATTCAACCAATGAGGCCCAAGCACCATAATTAAGCTGCCCAATTA:1 - chr3R 31483645 3' + I-element 5293 1 56.85 ATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATAGCTATCGAATCCATGGGCCATTTCATGACCTATAATATTGCCCACTCCAGCGTATTTGAGTACATCGGGAAAGTCTA:1 + chr2L 12667791 3' + 1360 458 1 53.10 CGTGCTGAAACCCATCTAGACATACGGCTGTGAACTATGGGAAAAAGCTTTAAGTGTTTGCATAAATCCAGGAAACTGTGAAGTCCTCAATTCTACAACTATAAGTGCCAGCTTGAAATTGTAAGTTTTTAAATCGAAGCCAAGGT:1 + chr2L 18061347 3' + Doc2-element 4347 1 71.23 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTAAAACGAATGCAGAAACATGCAGATCGTTAGGCGCTATTTTTTGGTCTTAAAGGCCGGGCTTTATATATTCAAATTGTGCGGGAGTCG:1 - chr3R 7778219 3' + transib2 2798 1 66.90 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTT:1 - 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chr3L 18035523 3' - mdg3 78 2 67.81 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAATAAAGCGGAATCATGTGCAGAAATTTTTATAAGTTAGGTGTATCATCCAAGTG:1 - chrX 21403351 3' + roo 386 2 68.49 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGA:1 + chr2L 8574473 3' - Transpac 47 2 52.05 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTTCTACCCACTTTTGTTCACAGTGCATCCAT:1 + chr3L 1358560 3' - 412 7092 2 53.42 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTG:1 + chr3R 11095880 3' - hopper 67 1 62.76 GAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAATCCTCCACCTCTTCCTCAACCA:1 - chrX 5235260 3' - P-element 2807 1 15.07 ATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAATCAATTTCAACTGTTGCTTTTGTTGTTCTCGACTGTGTGTAAC:1 - chr2R 12549168 3' + copia 93 2 70.55 CGCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGGTAGTCGGGGAACTCAACTATAGCATTCTCCCTTGTTTTTTATATTATTATTGGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGCCAAATGCTTTCCCCAAATCTTTAAGCGATCATTTCCTGTCTTA:1 - chr2R 5190072 3' + INE-1 533 1 73.29 TATGTTCCATTTTATTTGTAAATATTTGGACACGTGGTGTATTTTTAACAGAATCACAAAGTTGAGTAAAAGCTTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAAAAGCTGATCTAACATATGAAACCTCGCCTCGTGGAATCAATATTTATT:1 + chr3R 20565308 3' - transib3 259 1 74.66 GAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCTCCCTTTTTAGAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTAAGGGAAGATGGCGAATCGATGCGCTGTACATAAGGCCACTGACAATGTTAATATCCAAACCGGGGTATCGC:1 + chr3R 7616356 3' - Stalker2 12 2 52.05 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATTACTAT:1 - chr3L 13678889 3' - hobo 69 1 65.75 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCGTTTAGAATCCGTTTTGCAAACCAAAAACTTCTATTCATTGAAATCACTTGTTCGACATAAATGACCGAAAAATTGGGTCAATCACTGGCCGAACCTTTCGTTTTTGCTCTTT:1 + chr3L 14167491 3' - mdg1 7045 2 80.69 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCATGTGGTCAGCGAGGAGCAGAGAACGGGCCTACTATGAGGCAATGT:1 - chr3L 11803933 3' - blood 7038 2 65.75 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTG:1 - chr2L 19691256 3' + roo 326 2 73.97 GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATAAAAGTTCTACTGTAGCTGGGAAAAACTGTCGGGCAAATGTGTTGCATACTTTTAGGCAGCCACCGCACATGCAAT:1 - chr3R 25388589 3' - BS 5028 1 58.52 AAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTGCAATGTGTGTGCGGGTGTGTGTGTGTGAGCCCCACTCACACACTCAAGCAAAATCGAGCACA:1 - chr2L 7655429 3' + roo 9053 2 47.95 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATTGTTATTTTAAGATCGAAAAGTTT:2 + chr3L 18484494 3' - hopper 43 1 56.85 TTATTATTAATAATAGTTATTGCTAATAATTAGGTACATTTAAAAAAAAAATATTTTTGCCTTTAAAGCCAATCTTATCTATTATTGTTTGGCGCAGTGTAGGAGAAATCAACATAGAACACACAAAATATTACAACAATTTGCAT:1 - chr3L 14296474 3' - gypsy9 5310 2 55.48 TGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAAAAAGGCCCAATGAAAGGCTTTCATTGATGAGTACTTGCACCTGGGACATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGTAACTT:1 - chr3L 24088922 3' + 412 7447 2 71.94 ATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTGCCCAGAAATAAAGACGGAAAAAGGGAGTCAACGCCAGAGAAAAACGTCTGCCTACCTTTGAG:1 - chr3R 31887254 3' + HB 1587 1 73.29 GGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAACAAATAGTAATCAATGAAAATCGACAAGCGAACAGAGGTCTCAAAGGTG:1 + chrX 19715580 3' + Bica 57 1 62.60 AGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTAAGGCTTATACGGTAAGCAAAAAACAATAGAAATATTATTTCAACTCTGAAAGTTATGTAAAAAATAAAAACAACTATAGGTTTTAATGACAT:1 - chr2L 15622596 3' + transib2 2584 1 67.12 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGTGCTGCCTACTTTCAGGTGGCCCACCA:1 + chr3R 25795846 3' - jockey 56 1 53.15 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGGCCGGTTAACTGGAAAGAGGTAGTGTTTTAATTTTA:1 + chr2R 17097541 3' - P-element 3 2 60.00 ATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCACAAGAGCGACAGAGAGAGCAAGAGATCCAATCGGAGTTAGCGGCGAACGAGAGAGAATGTAAGTTACGCCCTCGCCCG:1 - chr3L 17668087 3' + F-element 4406 1 65.38 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTAGTGCTAAACTTTCACCTGAAGGACCAAACTCTAGTGGGGTACCGGGCGGGCCGTATATTGTGTGTGATGCGAGCCGTAAAGATAAAGGCCAAAAAGCAGACAGAGGCGG:1 - chr3L 13364249 3' + hobo 2933 1 77.21 CGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTAGTATCTT:1 - chr2L 23068859 3' + 1360 3310 1 74.66 ATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCCATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACCATTCACCTTTCATAATGATTTAGTAAATGTTAAAAGAAAACCTATATTGTATTT:1 + chr2R 10096785 3' - Quasimodo 69 2 62.33 AAAAAAAAAAACATACAAATTTACAGGAAAAACATGGCATCATTTCTAAATAAATTTCTATATACTATTATATTTCTATAAATACTCATTATATCCTTCCTAATGTTACTATATCCTTAAAATGGCACGCCTCTGTCCTGTGAAAC:1 + chr2L 13744498 3' - Tc1 1465 1 69.18 AGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGGCCGATAATTAAAAAAA:1 + chr2L 1361077 3' - Stalker2 13 2 63.01 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATATAAAACATTTTAAGAACTCAGGGGTTTCTTCGTTTTGGAGATTTGGATCTAAACCAAAAAATGC:1 + chr2L 13255390 3' - pogo 51 1 57.24 AGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGCAGCGATTTCATTTCTCCAATGAGTCATGCGGCCAGTCCGTCGCTTGAAATAATATTATTAAATATTTTGTAAACAAAAACACTCCCTCTTTATG:1 + chr3L 13952901 3' + I-element 5334 1 63.70 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAGTAATTTCAAATTGGAAGCCGTAACTTTTGCACGCATATACCCCTAAAAGTATATGTACATATGTATGTGTTCATTACCTGGCCATTAGCTAAACACTTCATA:1 + chr3R 12379840 3' - roo 19 2 72.60 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAACTCGCGTCGCACTCATGGGCATTTTTTGTTCGAAAGAATTTCTTTCTGTTCCCATT:1 + chr3R 8849882 3' - 297 32 2 61.15 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTCTTGCTTTCCGGT:1 + chrX 21403478 3' - roo 8737 2 69.18 AATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGTCATGAGTAATTAATGTATCCGCCGCTTGGAAATACATTCATTTTTGT:1 + chr3R 835137 3' + Bica 4869 1 67.12 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTT:1 + chr3R 14049457 3' + transib2 2789 1 60.00 ATATAGATTTAAAGTCTATGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCTTGAACATATGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCAGGGCCCAGATCTCGGCCAGGCTAATTGCCCAGCCATGAACATAA:1 - chr2R 18872399 3' - 1360 240 1 69.66 ATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTATTTTTAAAATGAAATAAACTCGAACTAGTCCTACTCACTTTTAATCAATTTTAATGGTTTCTATTGCACAATTTGTG:1 + chr2R 16234088 3' - roo 8604 1 53.10 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTGCCG:1 + chr2R 1923580 3' + pogo 2048 1 56.94 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTATGATTCTTAACAAAACTTTGTGATGCAGATGAGTAACAGTTTGTTAAAATGGGTCGCTTGAATAGAATAGAATAGGTACGTAT:1 + chr3L 3238357 3' - roo 8701 2 48.63 CTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTGTGTGTGGGCATTATAAAAGATGAACTACTGAGATCGAGATCG:1 - chrX 2295134 3' + Transpac 239 2 66.90 TATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATGCATAACGATAAGTAGCTCATATACTCGTAAGCCAGATATATTTGG:1 + chrX 20685996 3' + Ivk 5371 1 77.40 TACAGATAATAGGATAAAGTCTTTTATAGTCAGAATATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATTTTAAACCGAATTTAATTGAATTTACCCAAAACTGACTGACATT:1 + chr2R 15010280 3' - Cr1a 4214 1 69.86 GTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTTGTTTGCGGAAATCATCAGCATCATCATCACTTCCGCCATGAGTCCTTCTCGCCCCAAGGAGCAGCTCACGTGCGGGTGCCACTTCTTAGAC:1 + chr2L 2121620 3' - I-element 4907 1 76.80 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATTTCATTAATGAATAATTGCAATTATGACCGCCTTGCAGATTTATGCGATGATGACTCGCATTAATAACAAAAGGCAATCGAGTTCAATATTATTTA:1 - chr3L 21910325 3' + pogo 2082 1 76.03 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATTG:1 - chr2R 15070071 3' + 412 434 2 58.22 GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAAACAAGCATTAACCGTGTGCATCGTTACTTCTGTAGCTAAGTAATTTAAATAGTTTAATTTTCGAGTTT:1 + chr2R 6673460 3' - BS 5066 1 54.11 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTAGGCTCCAATTTCGTTTTGGCAAATCAACCCCCATTAAAGGCCTGCACAAAGTACATACA:1 - chr3R 7089470 3' - P-element 61 1 43.84 GTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGAACCCTTAGCTCATAATAATTTCACAACGCATACACTAGCCGTAAA:1 + chr2R 21748324 3' + 1360 3324 1 69.12 AGTTTCGTTGACTGTTTCTATGCTTAAATCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGGGATTATTCTGAGCATTTCCGATTGCGTTCGCTGATATGCTGGTTGGCTGGTCGCTCGGCAGTTTGGGTGTTTG:1 + chr3R 4884743 3' - Porto1 4409 1 73.10 TATGAAAAAATTGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTGGTTTTTCTTTTTAATATGTTAATGTCCCAGGTACTCCGACGGCTGGGAGCAGTCCATGGAAGTGGCCTCCTTCCAACAGGGACTCTTCAGTTGGTCCATG:1 + chr2R 20211851 3' - HB 1404 1 53.42 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTATGTAGCCAGTTCATGTGCACATGGCAAATCAGAGCTAATGATGCTGCCACGAC:1 + chr3R 12609280 3' - 297 6606 2 55.26 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACTGTCGCACCGCACTGCATT:1 + chrX 16117285 3' + opus 453 2 52.05 GAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTATCCATGAAGCATAATATCGTGTTTGTGGTAAA:1 + chr2L 19140446 3' - Max-element 47 2 50.72 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACCAACTAAAGGATTTATCTAAACTTCTCCAGCTTATGTGGCTTTTTTAATATATATATGTATGTATGTATGTAATAGCTAAATAAACAAAATGGCCAAA:1 + chr2L 974157 3' + pogo 2080 1 62.33 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACA:1 - chr3L 15364831 3' - 1360 70 1 72.93 GCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTGATAATAATATATTAATATTGCATCAAGTGTATCTCAGACTTCTCATTATCCTACAGATCAAGGCCTTGGGTATTTAAAATGATGCTTCTTCGTGTCTGTTCTGTTAACAA:1 + chr3R 17586979 3' - Max-element 11 2 76.71 GATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATAGTATACAATATTTATTCCGGTTGTTTGTTTTGTGAGCTTTAGCTTTAGATTTTACGCTAGTTAATGTTTCTATTTAATCGTAGTAACTGCAACTTTAAGAA:1 + chr3L 15721708 3' - jockey 4860 1 71.23 AAGAGAGCAATTTTGGCCGTTACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCATTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTTTTCTAGTGTCTTTGATTGAACTACTATGAGGAACTTTAACGAACGATCCATATGTAATTAGC:1 - chr2R 4597848 3' + 1360 3318 1 72.14 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCTCTTGAATAATTCGGATGAATGTTTTGTGATTACTATTGATATTTGGTATTCGCA:1 - chr2R 14135231 3' + copia 227 1 65.75 GAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAATACTTTTTACTGAGAGGCGAAAAGGACGAGAGTAAGAGTCGTAATTTAGTTTTGTGTTT:1 + chr3L 18035594 3' + mdg3 5437 2 56.55 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTTTTGAACATAAAAGCAGTTCTATTGAATCTA:2 + chr2L 8574513 3' - Transpac 4926 2 78.08 AAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACAATTAGTCTGCTGATAAGATAAGCCCCCAGAAAGCTGCTGC:1 + chr3L 10528450 3' - FB 78 1 69.86 ACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGCGTGTGTGTGTGTCTGTGTATGCTATTCGTGTGCCCCTCCGCAATTCTGATTGTTTGTATGTGAGAAGCGC:1 + chr2L 4420611 3' + gypsy5 384 2 54.92 GTAGGCTCGCGTAAGCGACTTCGTGAGGGGATGTTGCTTGATGTTGACTTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAGAGGTGGAGCGAGGTTTGGGGGAGGTTATCGAGGTATAGGCCTAGGTTGATAACCGAAATATATGATTT:1 + chr2L 22558677 3' - Doc2-element 4584 1 52.74 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATCTTTG:1 - chrX 7706769 3' + P-element 2849 1 38.30 GTGGGGATGTTTAGAGTCCTGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTTACTAGAAAAAATATTGAATATCAGTCTTGTTTCTAAAACATTTTCCATCACTGTATGTGTGAAACCATCAGATGCCGAGCTCTA:1 + chr3L 10594849 3' + Cr1a 4062 1 50.00 GGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAATTCTAAGGTAATTCACCGACCCTCAAACAAAC:1 - chrX 20685881 3' - Ivk 5281 1 78.08 AAGAGAGAATGCTATAGTCGGGGTTTCCTATGGTATATTGCAAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAAAATTTTAAAAGTGTGGG:1 - chr2L 22758883 3' - INE-1 577 1 60.00 GCATGATGGCGACTGAACCGTAACAAAACTTAGCTGTAGCCCCTCTTGAACGGTACCACTGCGCGCTGCTATGACATCAACTAATTTCTTTACAGTCCCCCAATGTTTTTCACTGCGCATTCACACA:1 + chr3R 5013061 3' - mariner2 116 1 66.14 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTCAACTGTGTGGAAACTCATGAGTATA:1 + chr2L 15777925 3' - 297 32 2 63.70 AATTGAATAAATATACGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCCCGCCCCTAACCACCCTTCCATTAGTTTTAAA:1 - chr3L 9469924 3' + 412 7487 2 54.79 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAACAAAAATAACTTCATTTAAAAATCGTTTATTTCCGTAATCGAAAGCTTACAA:1 - chr2L 5791992 3' + blood 7323 1 65.07 AATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAATGATCTCCAACAGCAACAACAACTGACAAGAGA:1 - chr2R 2666292 3' - Rt1a 31 1 59.59 AATTGAAAAAAATTTAATTTTTCAAAAGCTTGCGGAATGTGATTTTTTTCGAAAGCTTAGGTTGCCCGCTTCTTAAAACAATGTCTCTTTTTATTTTGAGACTTATGCCCGCTTGACAAAAAGTTGTGGGCAAAAAACAACAATTA:1 + chr3L 559909 3' - Idefix 7367 2 75.34 CGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTTGTGATTCCATCATCGAAAAACCATACAGAAGGCGAAGGACAAAGGGTCCAGGACATAATTGAAGGCGAAAGGCGGCGTGG:1 - chr3R 20203579 3' + 412 457 2 55.48 CAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACA:2 + chr3L 21093254 3' - Ivk 41 1 57.53 AGTAAAGTAAAGTAAAATAAATAGAAGTCGCATTACTTACCACTAAGTACTCTTGTGTAGAAGAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACACCTACGCAACTCCTTTGCTGCAAAATATATTGATCCTAATCTGGTTTGCAATTCGGTTAC:1 + chrX 19196974 3' + TART-A 13134 2 71.23 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTAGGCAAAGAATGGAAAGTGAAATATTACTGGAAACTGATTGAACCCTCCTCAGACATTGACCAATTTGCAACTGGCTGTCAATCCGGAATATTAGCTTGCATGTGTGTACAAA:1 - chr2R 10160815 3' + transib2 2818 1 77.40 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTC:1 + chr3R 19436085 3' + roo 9009 2 60.96 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGGCAACTTTGGCGCACTTTGCATTTTTATTGCACAAC:1 - chr3R 7470918 3' - Doc 57 1 64.49 ATTAGAAAGGGAGGTGTAGCATATGGTAGCAATCCACCCTACCAATACAATAAATGATTGAGTATAACATTGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATATATTATTACCAGTATACAATAACCACAACGACTTTTACCTAAG:1 - chr2L 6466212 3' + Stalker4 6943 2 70.55 GCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTT:1 + chr3R 10736160 3' - McClintock 5980 2 64.14 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTTCTACCCACTTTTGTTC:1 + chr3L 1358547 3' - 412 52 2 52.74 AGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTTTGATTTTGGTATTGTCGTCCCAGGAGGTTCGCATAATTTCAGCAACCCTACGACTGTCACGTTGACGTTCTTGATTGGAATAGGCCGAGCA:1 - chr3R 20874091 3' - 297 6542 2 66.90 ATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTAAAGGATGGCATAGAGGGAAATGCGCCAACAACGGGAAACGACAACAACTTATATATGAATATA:1 - chr3R 3624101 3' - jockey 4975 1 56.16 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATGAAGTTATTGATTTATACATTCATTTCACCTCATGTGCTACATTTAC:1 - chr2L 16857852 3' - P-element 75 1 32.88 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCCTGCCCGCTCGAATTTCGCTTAACATTATT:1 + chr2R 25106129 3' + roo 9028 1 54.40 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACA:1 + chr2L 3231970 3' + roo 391 2 60.75 ACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATTTTGAAACACAGATCTCCA:1 + chr3R 23021006 3' - INE-1 579 1 42.47 GGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATGTTTGCTAGTTGATTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGACATAACGGCTGCTGTGAAAATTGATCTGATCCCCAAGAGGGGTAACTTTCATTGATAGAAACAATAGTTGATAGAAAGCGTAG:1 + chr3L 8261269 3' - G5 4612 1 78.08 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCTGATCCCTGCAGCCTATTCAAAATAGCGAGCGGAATGGGGATGAAGGAACTGGACA:1 + chr3R 11944925 3' + roo 344 2 60.27 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGGTGGACCATTGATGCTGCGGGAACAGGACGTTTGGGTGC:1 - chr3R 14218448 3' - roo 80 2 73.29 TTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTGTGTGAGTGTGTAAGTGATGTGAGCGAGCGACAGTCGAGATTTTTCGCATCCCATGACGCATGATTTATGCCAATAATTGGGCTTTATTAATATGCAGCATACGTG:1 - chr3L 2426306 3' - hopper 1013 1 77.40 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAACGGTGAAAACTAGTACATGCACACAATT:1 + chr3R 12363830 3' - jockey 4711 1 58.57 ACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATTGAGCAGGTAGCAAGCAGGTGGGTTGGATGCCTGGAATGCGTGGA:1 - chr2L 11026939 3' + Tirant 8229 2 69.18 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAGCCACGCCCCGTCGCAGTCCACAAAATAGTGTTTGCTGCACAGCTTGCCGCC:1 + chr2L 795147 3' + jockey 4917 1 66.21 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACT:1 - chr2L 14239138 3' - 412 61 2 57.53 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGA:2 + chr3R 12363790 3' - jockey 4757 1 71.23 TTCATTATTAACTACCAAATGTGATCAGCATTAGAAATGAGTGTTCGTATGACTAACGATGTATGTATGTCACTTCGATTGGATCGGAACCCCCATATTACCGCCAAAGTTGCAATTGTGTACAGTGTTATCTAAACTTACAGGAT:1 + chr2L 14184890 3' - copia 4802 1 69.86 AACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAAGGCAAAAATGAGATGGGGAGCGGCAAATGGCAAATAAA:1 + chrX 14340655 3' + F-element 4578 1 76.55 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTGAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTTGACTATGATGGGTTTTTGGGAATGGCGCTTTTTTGTTGCGCCTGCGGG:1 + chr3R 20934762 3' + 412 447 2 56.67 ATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCATCCTCCTCATGCATCAGCGAACTGGAAATGGACATTGATGATGACATGTCCGCCCAGCCCACCATCACCTCCACGCCCAAGCCGCGCTTTACCAGC:1 + chr3R 31193546 3' - BS 4833 1 62.33 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGAAAGACGGCAGCTTAGGACCACCCAAAGAGGTCACTCCTCA:1 - chr2R 9340137 3' - 412 7131 2 70.83 CAGACTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTCACATTTTTTAAAACAATTACAGTTTCTAAATGTAGTCAAAGCTGACACCTTCATGATTATTTGATGTCAGGC:1 - chr3R 14911954 3' + Stalker 349 4 59.70 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTATTATATATAAATAACCTTTTAAACCAATTTTGAAG:1 + chr3L 18801847 3' - I-element 82 1 76.22 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGACATACATGCACGCAGACACTTTATTTATTTACATTCCAGCCAGATTGAAAGTGACATCACAAAGTTTT:1 - chrX 11008302 3' + hobo 2906 1 55.20 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACATAATTAGTCTG:1 + chr3R 6413666 3' + 1360 3346 1 56.16 ATAACAAAACCGAAGATCTCGAAATGGTAAATGATGACAGCGCAACTGATTCTGCTAAGACCCCACCTATCATTCTGTCTGACGTCAATGATATAAGTGAACTGAGTGCGATGTTTCTTTAAGATCTAACTAAC:1 - chrX 21562884 3' + G4 105 1 75.37 GTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAAC:2 - chr3L 18035522 3' - mdg3 77 2 67.12 CTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCAGCAATAGCTGCTGCGGCCCCACAGCC:1 + chr2R 14913512 3' - X-element 4474 1 77.50 TTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTATGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCAATCGAATTGAATAACAATTGAATTGAAGCACAAAATTGAAGTAATTTATTTGTGGATG:1 - chr3L 26741223 3' - F-element 83 1 71.13 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGATTAGACTTGATAGGATGACTTTTCTTTCAAATATCTTTTTAAGTCCTTAAATGTTTTTGTTTTTTAATATTCCATAATTG:1 + chr2L 15644980 3' - transib2 39 1 58.90 ACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTATGACCTATTTTACCGCCTGCACGAACTCAGGCACATATTTACCCGGCGGC:1 - chr3R 5906761 3' + P-element 353 1 34.97 ACATGGAAAAATACCTTTGTATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTACATATCTTAGTCCGACAAATACATGTATGTATGAAAATATTGGCCTTCAATCAGCAATTTAGCGAACATACCTATAATGT:1 - chrX 8097239 3' - HB 48 1 70.55 GAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTCATTTACATAATTTTTGCGTTTGGCCATTTCGCATCCTTTGCGCTTG:1 - chr3R 18635157 3' + opus 485 2 76.71 GCCGCTCTTCTAGTAAAGCAGCTGCTCGGTTTTTTGGTGACCTTTTTGCCACTTTTTCAGGTTAATATTGTTCTTATAAAAACCGAATTTTTTGGCGCTGGATGTCATCAGCGGAGTGCTGCACTTCTGACAGCATTATTATGCGG:1 - chr3L 8757695 3' - S2 1318 1 73.29 AAAACAAAAAAAAATGAAAAAGGACATTCTATTTTGACATGCACTTTCAGTGTTTTTGTGTGCGGGAGTTTCTCTTGATATCGATGTTGGGCGATGTTTTGCAAAA:1 - chr3L 21335172 3' + Doc2-element 229 1 61.32 GTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATTGGACATTGAAGCAAATGGCAACATTTATGACGGTTATAAAGAGATTTAGATTCTCTTTTAGAAAAAATTATTTGAAAAC:1 - chr3R 13349475 3' + Ivk 5334 1 55.48 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGT:1 - chr2L 17839387 3' - blood 74 2 66.44 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCTAATCCAAATTTGTAATTTATTGAACTCAAGCGGTTGGCTCGCCTGTTTTTGCATT:1 + chr3L 16059387 3' - 297 19 2 71.72 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGAGTGAGTATAT:1 + chr3L 18484443 3' - hopper 80 1 81.06 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTATTATATATAAATAACCTTTTAAACCAATTTTGAAGAATCGTCTAATAAAAGCTTGGATCGATATTTGTTTTCA:1 + chr3L 18801885 3' - I-element 47 1 52.05 CGGCAAGAGGCCCGAAGGACACCGAAGGACGATCACCACAAGTGAAGAGTGATCCTGGAGAGGAGAAGGAGAAGGATCTGGCGTGCCTTAAAGGGTCAGTGGAGTCAGTGGCCAGCAAAA:1 - chr4 145850 3' + gypsy8 489 1 82.50 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTAAAAACAGTTAATACTATGTACATATTTAATTAACAACTTTTTCTGAATTCAAGTTCACTTTTCTTTGACTTGGAATTCCCTGAACTTCTGTTACGCGAGTG:1 + chr3L 7870326 3' - roo 8681 2 72.60 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGTTGTTTTAAGCCTAATAAAATATTCCAATATGAATCAAGTATTTTATAGAAATCTTTTCAAAATTTTTCGACATTTTGTATTA:1 - chr3L 12223107 3' - Transpac 36 2 60.96 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAA:1 - chrX 7756418 3' + roo 323 2 76.03 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGCTTTACAAAGTATAGTATTGTTTA:1 - chr3L 17667539 3' - F-element 56 1 50.00 CAATTTCGTAGCAATATGATGAAATTGCGCTCTTTTTTAGGAATATCAAATTGGAATATAACAAAAAAAAAAACTGAATTAAAATTACATCATATTAAAATTAAAAAAATTTCATAAA:1 - chr3L 20281914 3' - 1360 3112 1 64.41 GAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTCACATTTTTTAAAACAATTACAGTTTCTAAATGTAGTCAAAGCTGACACCTTCATGATTATTTGATGTCAGGCTGGGGTTATTTAT:1 - chr3R 14911941 3' + Stalker4 366 2 50.00 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATACATATGTATTTGAAAAACTATTGAATATAAATAGTTAATTCTGTGCGATGTTTTTCTACACAAATTTGAATGTGGCTAA:1 - chrX 5772987 3' + jockey 4951 1 52.05 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAAGCCATTCCCTCGCTCCCTGCTCCACAGCGGATCTGAACAATGCTGA:2 - chr3R 23161227 3' - 412 24 2 67.81 GGTTGGTTCTTTTACTTCACTCATCCACCCTTTTATTTGCTCTTCGCTTGCTTTCTGGTGGCTTTCTGGCTGCTTTCTTGATTGCTCGCTTGATTTCTGGACAAGTTTTTACCCGGGCCCTACCACCCGACCACCCGTCGTCAGGG:1 - chrX 22845866 3' - invader2 353 1 76.71 CTACTAACACTAATATTTATTAGAGTTATTTTACATTATTTCATTTTCTCGTTTCTATTCTCTAATCTATATCGCGCACAAAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCG:1 + chr3R 2533919 3' + Cr1a 4298 1 44.52 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCATAAAATGACCAGATTGTTGGGAAAAAAACGCTAACGTGGCTCTTTTT:1 + chr3R 26486110 3' + 412 7474 2 67.12 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAGACTTTAATAGCCACTGTTGCCAGACACTAAATAATGTCT:2 - chr3L 465936 3' + Juan 4187 1 67.81 CTAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCTTCAGTGAAAATGGTACTTTCTGCAAGAACGATAATAGCGTTTCAGTTCGGCGATATAAAAAAAATGATAATAGTAGGGGAGCCGGGTGAACCTCG:1 + chr3R 21216975 3' + 1360 3367 1 70.55 AATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAACGTCTGGCTGCTGCCTTCATGGCAGCGTCAAGAAAACGGCGACACTTACAATCAGTATGAA:1 - chr2L 1365767 3' + F-element 4610 1 58.22 TATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATT:3 + chr2L 1361070 3' - Stalker2 20 2 59.59 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCTCTGGTGATGCGCCTAAGTCCCTTTGTCCATGTGACCATGTTTGAGTTATGCTTTTACATATTTTTATTCACT:1 + chr2L 19477082 3' + hopper 1405 2 72.32 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCTAATCCAAATTTGTAATTTATTGAA:1 + chr3L 16059356 3' - 297 39 2 57.46 CCTATTGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTGCCCAGAAATAAAGACGGA:2 - chr3R 31887298 3' + HB 1542 1 56.85 AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTAG:1 + chr2L 5270359 3' + jockey 4918 1 69.86 ATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAGCATACATTATGCAACTCCAAATCTCCTCTAAGATCGATCGGAAATGGTTTTTAAGGGCATATAATCTTCGGTTTATTCTT:1 + chr3L 785993 3' + I-element 5315 1 57.53 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTTTGCCGATAGCTTCTTCAATATTGATAAACATGGGCCAAACAACAGTTACAGTTTAAGTATAATACTCTTAATCCTCATAAGTG:1 - chr2L 10514214 3' - 1360 2 2 78.62 GACTACATATACTTGCACACACACACACACACACACATACATTATAGCAACACTTAGCAACAGCCATACAACAAACGGAAACAGCAACAGGAAAAGTCAAGCAGACCAGCCATCTAACAAATAAATATA:1 + chr2L 4018880 3' + Quasimodo 25 2 55.04 GCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAGATCTACTAAAATGATAATTTATACATGTATATAGATACATATAAAGCGTATCCTGATTT:1 - chrX 18220600 3' + Burdock 6307 2 79.45 AACCAAAAGTTGTTTTTTTTTTTCAATTCCAAATTACACGAACAAAATGGCGGCGGG:1 + chrX 4477137 3' - HMS-Beagle2 496 1 59.65 GTGCGGTTTGTGGACGTTAGAGTGGGCGTGACAACATGGGTCAACGGGCAATATGTATGCATAATATGTATGCATAATCTCTACCTTCTTGCTTTTATAGTTCCTGAGAAGAAAGGGGAAAAGGTGGTTACTGGGAGC:1 + chr4 152502 3' - INE-1 223 1 78.99 GTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGCCTTATTATTATGCTTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCGTTTAGAATCCGTTTTGCAAACCAAAAA:1 + chr3L 14167402 3' - mdg1 7131 2 76.71 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGATTAGACTTGATAGGATGACTTTTCTTTCAAATATCTTTTTAAGTCCTTAAATGTTTTTGTTTTTTAATATTC:1 + chr2L 15644972 3' - transib2 46 1 53.79 AACGAGTAAAGTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGGATATATGTACTTTCAGGCATATTAAACTGCATACCCAATCGCAATCCAATCCACGACACCGCAATCATTGCCGCCTGCATTTGCAGTCACAG:1 - chr3R 11513415 3' + roo 397 1 75.00 ATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATCCTGCGCTCACTCCCCATTTCCCCAAATCAAGTCAT:1 - chr3L 10112212 3' + I-element 5270 1 74.66 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTT:2 - chr3R 9125651 3' - Doc 60 1 52.05 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCC:1 + chrX 7706817 3' - P-element 81 1 29.66 GACTTGTTTACGTTGACGTTGCACTAGAGTTTTGCTTTGCTTTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAAAGCA:1 + chr3L 25951945 3' - Doc4-element 18 1 51.65 AACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATAT:1 - chr3R 9125687 3' - Doc 96 1 76.71 ACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGGAAAGTCGTTATGGTTGTTCACTAGAATATGCAGGCTATATCTCAGTTTTAAGAAATTTATACTTTCCGAGATATCGACTTTATAGCAATTTTTTTTAACAATATACTTGGTAG:1 + chr2R 5693802 3' + INE-1 11 1 82.19 AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCTTAAGTAAGTTAAATGTGTGTACCTCATCCGATTTTCGACGAACGGTCTTCAATGGGTTACG:1 + chrX 14137302 3' - 3S18 5806 2 50.00 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGGTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATGG:1 + chr3R 23601747 3' - jockey 92 1 72.60 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATT:1 - chrX 7756382 3' + roo 347 2 59.59 GCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCATT:1 + chr3R 13349584 3' - Ivk 63 1 57.53 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATGGACCGTGAACCGTCGTCGAGTGTGTGCGTATTCACTCTTTGTTTGCAGACTTTTAGGCGTTCGTCGTTGTTTGGCAT:1 + chr2R 17332242 3' - jockey 17 1 73.45 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCCTGTTTAACGCAGCTATAAATTATGATGCCAAAGTTGTTGGCCACTCAACGAGCGGG:1 + chr2L 20515304 3' - I-element 38 1 54.35 AGTGAACTCTGTCGCTTCTGCGGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGACTGCATGGCGCTTTCCATCAGAAGGAATAGACTCCTGGGCAAGTATGTAGCCCTTTATTTAATAATTTTTTTTTGACTTTTTGGC:1 - chrX 14471895 3' + baggins 5194 1 77.78 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCATAATTCCAGCTTATTTGCTGGTGCAAATAGTGCTAAATAAATAAACTAAGAGCTCGATGGATTTTAAAATCCAAACAATTTAATTTCATATATTCCAGTATATGTACTG:1 - chr3R 25751740 3' - roo 12 2 66.44 AGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGG:1 + chr2L 8574455 3' - Transpac 65 2 63.70 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCA:1 - chr2R 15070074 3' + 412 7491 2 58.27 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATT:1 + chr3L 18253876 3' + blood 7334 1 63.85 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTTGGCCAATATGCAGTTGTCTTTATTTCATTTCATTTGGCGACTTTTTGGGCCAAAAGAGATAAGCTGGGCGAAAAGCAGGGAAAAAAACGAAAAACAAAAAAT:1 + chr3R 16241047 3' - Tirant 12 2 77.24 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCTACATTTCCATACATATATATATATTTATTTTGAGTGAGTTTGTTATATTCTGAAACAGTTTTCGCTAA:2 + chr2L 17380727 3' - hobo 51 1 55.48 CTATGCACCGAACGCAAAGAGTGCCAAATGACAACGTGGCTGCAGTGCTTCCAAAATTTAACCCCGACCGCACTGGTTCAGACGGAGCATCATGGTGTGCAACAGTACAGGGCGTTTTACTTCTGTGTGCAATATCGGAAACCCAA:1 + chr2R 4430537 3' + invader5 447 1 76.71 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATTTTCATCTAATTAAAATGCATTACTACTTCGTTATCT:1 + chr3L 9470043 3' - 412 7098 2 54.79 CACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAACGACACGCCCATATCTTGTGTAAAATATGAGCGTACGGGGAGAAGTTCTTGGCTTAAATGTGGCTTTTTA:2 + chr3R 14912052 3' - Stalker 52 4 51.37 CGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTGTCGCCGACATATATATGTAAGAACGATAAGATTGTAAACCAAGCTAATGAAAAATATATAAGAAGGCTATCTATAATGTATGTCGCATATTTTAGTTTTATTGCCTAGT:1 + chr2L 3067991 3' + invader4 301 2 69.18 TTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAAGTCAAAATTGTTGACAG:2 + chr2R 10160969 3' - transib2 67 1 65.07 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATAC:1 - chr3R 7885608 3' - jockey 92 1 74.66 AATGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAACTTCGAAAATAATTATTGACTCCCCATCACGAAAAGTCTGCCATTTCACATCCAGCCACCCCAAAAAAGGGGGCTGGGCGAGGCGATAATCCTTTTGTATCC:1 - chr2L 9592014 3' + X-element 4695 1 71.23 TCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAACAAGCAGATGTAT:1 + chr3L 3453688 3' + Tirant 323 2 71.23 TTTTTTATTTTGTTTAGTTTATTAAATACTTTACTTTACATCGTTTGTATCAGCTTATAATCCAGGGGGAACTATCCGTCGCTTCTGTAGCCAGCTAATGTTTAAAAATTAAAACTGCGGCTGGCGCTATT:1 + chr3R 6032381 3' - F-element 91 1 61.83 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACCCAACGAGTAACGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCTGTTTCGTTCTGGAGTGGTATTTTCTAATTCATTTAAATGTTGCTAATATTTAAGGAATTTTTAAAATACTAAT:1 - chr3L 8658702 3' + roo 9026 1 49.32 TTGCTCATCTCCCACGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATCTACGTGGAGCCAGCCAGCGCGCGAAC:1 - chr2R 6798237 3' - jockey 7 1 63.77 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTCTTAAGTTCTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACTACTTAGTTGGTAATCCATTACCATGCACCAAGTGTATACATCATTTGACATCTGCAGAGGATGATTAAGACATCCTTGCA:1 - chr2L 1090922 3' - 412 53 2 53.42 AAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGATCTTATGCCCCCAAGATTCCGCCAAGCGATTCGTTTAT:1 + chr3R 24454881 3' - F-element 253 1 54.39 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGACAGCCTAGTACGGCAAATAA:1 - chr3L 12874878 3' - jockey 79 1 65.75 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACAC:1 + chr2R 1923572 3' + pogo 2038 1 63.01 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAAACAATCGACTTCACAGTCCAAGC:1 - chrX 21087528 3' - mdg3 5261 1 75.18 GGTTATTTACGGGGTCGGGGATGTCGCGGATCGAACGGTGTAATCGATAGGCGTAGTCAGTATTTCCTGATTGGATAACGATTTGTACAACATTTATATTCTGCTTTATTACGATAAGAAGACTCGAACACATTAATTGAGAG:1 - chr3L 22996996 3' + aurora-element 4025 1 49.65 GTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGCTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGTCGATCATACTCGCTACTCGTAACGAAGGA:1 + chr3R 2637706 3' - gypsy5 7012 2 72.31 TCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCATGAGATAAAAGCATTAAAAACAGTTTGCATTAGTG:1 - chr3L 20251935 3' - copia 84 2 77.40 ACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTGATACCCTAACTGAATTCGATGACTATCAGATTAGGAAGGAAACATCGAAGCCCAGTTATGACTTT:1 + chr3L 5029961 3' + roo 8618 1 53.42 GGTAGCTAATCCGAGCGGCGATTTTAACAAACGAATTTAAAAATCTTTAAAATTATACTTCAATTCGTTACACGTTACAGTTTAGTTAAGAATAATAATAAATAAGCTAACGCTGTATCAAGATAGCTTCGTTGGCAGCAATTAT:1 + chr3R 24592815 3' + 1360 2983 1 60.00 ATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAGGTGGCGGTGGGCAGGAAACGTTGGCTGCAACTGCAACTGAAATTGCGCATCA:1 + chr3R 6495377 3' - Stalker4 20 4 62.61 GGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTGATAATAATATATTAATATTGCATCAAGTGTATCTCAGACTTCTCATTATCCTACAGATCAAGGCCT:1 + chr3R 17586935 3' - Max-element 8283 2 53.24 TTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCCCTTTGCTTTTAATAAACAATTTTTCGCTGTTTGATTTCG:1 + chr2R 18014109 3' - Doc 87 1 71.23 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCA:1 - chr2R 10910225 3' + Tabor 7246 2 70.55 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCTACCAATTTAAAATGTC:1 + chr3L 20252001 3' + copia 183 2 67.81 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCAATTCTAATTCGCCTGGCCAAAGCGAACTCTTGATTGAAGGTCAGCGCAGGAGAAGTTGAAGTCGGCCAGTCCGTCGCAGGCTGCGTACCAACGCTGACTG:1 - chr3R 16240852 3' + Tirant 8496 2 76.09 CTCGACGTTCATACGGACAGACGGAAATGGCTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGGCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3L 5685501 3' - INE-1 129 1 76.92 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACCACCGTTAAGTCAAACACTT:1 + chr3L 18183214 3' - Tirant 8143 2 60.27 CCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATATAATAGTTCTGGCTTTATCCCAAACTCCTGGCTTGTTAGCAACGGCATTACGTGCTGCCTGCTTTTAATT:1 + chr3R 28406470 3' - opus 45 4 54.79 CTTTTGGACACAACGGACTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGATGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTGGCATGC:1 - chr3L 7791882 3' + Transpac 277 2 53.97 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGC:1 - chr3L 18253824 3' - blood 7082 2 80.87 CTTTTCCAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCGTATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGGGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTCATATTCTTTAGCTTCTATATGCCGCGCCACGATTTTTTATT:1 + chrX 5746832 3' - Idefix 7224 2 74.66 CCTTCGAGCCGGATCACCTGGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCCATAGACATGTTGAAAGGGAACCCCAGCCGCAGTCCA:1 - chr2R 9018812 3' + GATE 280 1 74.66 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACAACTTGCAGTAATG:1 + chrX 3647015 3' - 412 47 2 52.05 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATCACAACAATGTGCAAGAGGTCTTATCTGTCACCAAAATACATTACCAATTTATTGCCA:1 + chr3L 12836092 3' - 1360 55 1 57.86 CCGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATACTAAAAACCAATAAT:1 + chr3L 16015303 3' + 1360 3314 1 74.81 GTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAGAAGTGCGAAGCAAACAAAGTGATAACAAGAATAAAAAAAAGCTAAACCAACGGTTAAAACAACATACCACCGGGCATGTGTGTGTCTGCTGCGGGGGAAGCTCAACAAATTG:1 + chr3R 21686508 3' + gypsy4 319 2 68.49 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGG:1 - chr3L 21013856 3' - roo 8723 2 63.77 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATATATATAAGATACGCATATAAGCGTTGCTGCGCTGCAGGCTATGCCGGCAGCGCTGCTCCTCGACTTAGG:1 + chr2R 2308852 3' - 297 6590 2 73.64 GATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGAGTTAATATGAAATGAATACGGTTTCCTT:2 + chrX 8977499 3' + I-element 5264 1 78.77 CTTTAAGGCAATAAACATGCATTCTAGCCAGTACCAAAACAGCCAAAGCACTAACCAGATGTCGCCCCCAGAATGCTCCAAAGGAGACAGCTAAATGAACAGCTGCAAGTCTAAGGATTTATTTACACATATG:1 - chr2L 8975899 3' + BS3 1456 1 73.68 TATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTCAATATGTCATCCATTGCTCTGTCAGGTATTGTGCTTTCGTTTAATTTTTTAGGTTTTCGTCAGGAAAATATATAAATGAAAATTGTTTTTATTTTGCCCC:1 + chr2R 20702969 3' - TLD2_LTR 36 1 66.44 AGTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAATTTG:1 - chr3L 16015236 3' - 1360 66 1 63.19 AATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTCGAAAATTGTAAAATGCTCCTTTTTCTGTTTCGTGTCCAGTCCCTGCATTCAAAATTAGTCGCTTGTAGTCGCTGTGGTTGTGTGC:1 - chr2R 5953469 3' - I-element 5212 1 67.16 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATCTTTGAAGTTGGGAGCCACTTTTGAATT:1 + chr2R 9607178 3' - pogo 37 1 68.42 GGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAACATTTGAATCTATTCAAAATAAGCATTTGATTTCGATTATAAGAAACAT:1 + chr2L 16456844 3' + BS 5024 1 69.18 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCGACTAATTAACTATTAGAACTAGTATGATTAAG:1 - chr2L 2494809 3' - Doc 49 1 52.05 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGAAAATACGTTTGAAGATTTGTTTCCAGTGCATGGCCGCAGGCCTAGCGAAATGTCTTCGATTTCAA:1 + chr3R 28117112 3' - hobo 24 1 69.18 AAATGTTAGAAATAGAAAAAAACATTTATCAATTTATTAGATAGATGAAGTAATGCGACTGAGCAACATATCAAGTATTTTGACTTTTAATTGTGACTCCGAATCTGTTGCATGTATAATGAGTTCATTATACAC:1 - chr3L 7618860 3' - Tc1-2 1405 1 70.37 AAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTAGGAATGAAATAAAAAATGAAAAACAAATGTTCAATTGATCTAAAAAAAGTCAAAAGTTGACAATAATTGGTTTAGCGGATGGTATAGAATTTA:1 - chr2R 5499539 3' - Tc1-2 364 1 42.34 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATGATTTAAATTCTATTACTTTTTATAATATTGCTGCTTTTAAGATTACTATATGATCATCGATATTGCTTTAAAAATATTGTATAATTTTTTTATTTTTGTGTGTTAGAAGAGTTTA:1 + chr3L 5630502 3' - I-element 10 1 77.93 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTTCGCTGGGCCTCCATTTCCGTTTCTGCGACTGCG:1 + chr3L 6355666 3' + Tirant 8481 2 59.04 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGCCATTTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTATAAGTTTGGGATTCAGCATACAGATTCCAAAGACATAGAC:1 + chr2L 10986817 3' + 412 7518 2 64.38 GGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACAACTAAATATCTCCGATTCTTGCACATTGTACTTACAGTTCTCATATTTCCACTCGTATATATGGGTTGTGGGTATTCCAGGTCCCAGAGAGGTGATCACAATATGGTTATTG:1 - chr3L 14745805 3' - Ivk 353 1 58.22 TGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATACTGATAAGATATGAAATACTTTGGCGTACTT:1 + chr3L 17922013 3' - copia 4959 2 78.77 CACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAATTATTTACATCTGCGTGTAAACTCCGT:1 + chr3R 10451216 3' - Stalker 7129 4 76.52 GAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATACTTATATTTTCATGCCACAGCATCCCTATGATTCATATTTTTAGGGTTTCTCTAATTAGTCATAACA:1 + chr3L 19905483 3' - 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chr3L 23146505 3' + hopper 1408 2 61.64 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTTGAACCTTAACCTCCCCGGAGTGAAGAAAGTTTTTCGCTTGTTGTTTGACAAATTGTTTTGTGCAGCCTTCGAAGGAAAT:1 - chr3R 8639213 3' + copia 224 1 61.31 AACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTT:1 + chr3L 7801324 3' - Transpac 149 2 50.68 ACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAAGGTTTGCTAATAGTCCTTGGTCCTTGGTGGTCCATCTAATCCTCGAATGCTGACCATCCGAGAAAGCCGGAGCTGATGTGTAAATGCCG:1 - chr2L 7142303 3' + Quasimodo 454 2 54.48 AGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAACCGCAG:1 + chr2R 11095830 3' + diver 6042 2 65.07 GGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCGTATTTGTATTTGTATTTTGTCGACCGCCGTTTGCTGACCCATAATGCATTGATCCAGCGGCC:1 + chrX 10025114 3' - I-element 179 1 56.85 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTATTGAGGTGTCTTATCTA:1 - chr3L 785874 3' - I-element 53 1 52.74 TTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTGTGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGGCCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTAATAA:1 - chr3R 6171127 3' - rover 62 2 68.61 TACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTTCGCTGGGCCTCCATTTCCGTTTCTGCGACTGCGCAAAAGTTCAGACCATCGAGGGAAGAACGACTGC:1 + chr3L 6355700 3' + Tirant 8471 2 54.33 ATTAATTAAATTTAATTAACTTATTTAGCTTGAAATTAATAAATCAATTATGATAATTAGTAGTGATAATGTAGTTAAAGATCAGCTTGCTGAATTAATAAAATATATTATGAAGTACATCGAGCCTAACCGTATCCTCATAGAT:1 + chr3L 14608928 3' - TAHRE 44 1 79.31 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCCAATTGGC:1 - chr3L 13690280 3' - hobo 74 1 68.49 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCCC:1 - chr3L 9469954 3' + 412 458 2 63.04 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAACCTTTATGGTGTTTAAAGCAGCAAAC:1 - chr3L 15364791 3' - 1360 43 1 55.48 CTAAGGTGAATGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACGTACAGTTGTCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTATTCTAGTGTCTTTGATAAAATCATCATTATTCCGCATTA:1 + chr2R 949540 3' - 1360 215 1 44.52 AGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTCAAGGAGGCGGAGATGGAAACGGAGGTGGAGGATGAAGGATGGAGGTTGGTTCTGTGCTGCATCCATGGCCCGAGTTGGCTGACA:1 - chr3R 23277789 3' - 412 7279 2 56.85 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTT:1 + chr3L 1358531 3' - 412 7118 2 62.94 GATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATTCTTTGTACATATTTCATTTAAGCCTACGTAGGGTTTCTGTTCCAATTGAATGACTACGATATCTGGAGATCCCCACACAAATTT:1 - chr2L 9418465 3' + rover 7264 2 57.53 CTTTCGGTCAATTTTGTTTTTGGTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGATAAATTCTATATTACTAAGGGAACTGAATGACTAAGCTAATGTAGGAAC:1 + chrX 9047202 3' - transib2 111 1 66.21 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCATAAGAACTAAAATACTTAAAGGCATACTTATAATTTCCAGAAGAGGATAGCTATACATTAAAAACTCATATGAATAAAAATA:2 + chr3R 14954133 3' - jockey 4764 1 40.41 ATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACCTTCCGGGTCCCAAAAAAAAATCA:1 - chr3R 25761527 3' + blood 7087 2 80.14 TTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTCTAACTCTGAGGATTATGACTGTGACACATTGTT:1 + chrX 10579973 3' + pogo 2017 1 76.03 GCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGAATGACTTCTTTATTTAAATGCCTAAAGTGGAATAGCGTAAGCATATATTACTATTTATGTAAATTATTGCCATTTTAATAGCTTACTACACTAAAT:1 + chr3L 18665336 3' - I-element 4991 1 70.29 GATCAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTCCCAAGTCATTAGGACTAATGGCCACCTAAGCGGGGGGCATCCCTGCAAAGCCGGTATCAGTGGGTG:1 - chrX 12181774 3' + diver 129 2 52.31 CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAG:1 + chr2L 17839458 3' + blood 300 2 70.55 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGAAATGTTAAGAGAAAGTAACTGCT:1 - chr2L 4929800 3' - blood 7074 2 61.64 GCTGGTTTGGACCATCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATATAGGACCCGCAAATGGAGAACTCAACTTTAGCAGGATGAACATGTATATATATAAAATTCTTGGCCCAAAACGGATTGATGGTGTTGCCATGGCTTGC:1 - chr3R 9300701 3' - 297 8 2 76.03 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCGGGTACATTTGCGTGTA:1 - chr3R 25049993 3' + P-element 2828 1 42.86 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTCAACTGTGTGGAAACTCATGAGTATAATACATTTT:1 + chr2L 15777934 3' - 297 6604 2 69.86 ATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGGGATTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCCTTTTTAAATTTGATTGACGTTATTACATTACATAACATCGCACACTAAGAGGAAAGGCGAAGCAGCTGGCTTAAGTTATT:1 - chr2R 22753976 3' - G2 2886 1 63.04 CGGGGAACTCGACTATAGCATTCTTTTGTTTTTAAGATTTTTTTGCTTTCCACTTTAAATATTCCTTTTAATATTCCTTATTTTCATCATCATTTGAACGTTTTTTAGCATATGATTTCATTTTTTCGTTCAATAGTTTCGAAGGC:1 + chrX 4798688 3' + INE-1 570 1 56.16 AAATGCGGCTGCATTGAAATTGCGCTTCGATCTGCACAAACCATAACCGCACATTTTGCTTCCAAAATTGCGGTAGCTTGATAAATTTAAAAAGAGCGGCACAATAACAAAACATTGTTGGAGG:1 - 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chr2L 21030940 3' - FB 89 1 79.02 ATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGAATGGTTAGCGCGAGCTCATCCCAAGTTACATCATCCCGAATTGGAACTCTAAACTGACCGCCACAGCCTCCTCTCAGGG:1 + chr3L 19589625 3' + roo 245 2 70.83 CACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGAAGAAAACGAAGAGGAATAAACAAATGCATAATGGTAATGGTAAACAGTAGCAACCCAGAAAACTTCATGCCGCCCCCGCTCGC:1 + chr2L 13629192 3' + Tirant 385 2 70.40 GCACAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTATCGGTG:1 - chr3R 24750970 3' - G6 65 1 64.18 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCGTTTAGAATCCGTTTTGCAAACCAAAAACTTCTATTCATTGAAATCACTTGTTCGACATAAATGACCGAAAAATTGGGTC:1 + chr3L 14167454 3' - mdg1 7078 2 58.62 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCATACTACTAACTAATGCTACATGACCCCGATTA:1 - chrX 1103565 3' - pogo 14 1 74.66 GAAGCTGGGCACCGTAAGCCGGTGAGCCAGGCAGCACGTGGCTGATGCTTTGCAAATATACCGCTGCTTCGAGCACTGGGTTTTTTGCGCTGATAATTGGATCGCTGCTCCTCGATAGCTTCCATTGTGGCATTT:1 + chr2R 22226113 3' - G6 265 1 69.63 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTGAAAGAGAGTGTTTGCTTGGTGAGAGCGGCAAGCGTATAAAAGCAGCGTCGCCGG:1 - chr2R 17097439 3' + P-element 2866 1 66.92 AGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACATTTTTTTAACCGATAAAAATGAGCTTGACCAATAAAACCCTGCTATAATACTTTAAAATATTGGTTGTTTTTAATTTTTTATTCCGAAACGAAAATACGGCTTACAAAAT:1 + chr2R 5434048 3' - Transpac 4923 2 77.40 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTATATTTTGTATTTTTAGTTCTCCCCACGTAGAGTCTCTTTATAGGGTCGTTTCCCATTCTCTTGAAGCAGTTCTCCCGTT:1 - chr3L 2192258 3' + jockey 4946 1 46.58 CTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACTAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTC:1 + chrX 1018164 3' - 1360 218 1 63.85 CTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATGGCTGTGTGCGTAAAAGTTTTCCCGCACTCCTGGCAGGCAT:1 - chr3R 11621366 3' - Quasimodo 71 2 70.50 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCAAAATAAATCTATGCCAATTATTGACCAACTGCCAGCAGACGAAACAACAATCGCCGTAGACGCTGCAACATTCGAGTGGA:1 - chr3L 4523907 3' - roo 40 2 58.22 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGTCGCCTGTCTAGCTGCACGACGATGCGTCGCGACGTTGTCG:1 - chr3L 26057890 3' - P-element 53 1 37.29 TCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAATATCAGTTAGAAGACGAATAAGAGCAGAGGTAGAAAATGTTTTCGGTT:1 - chr2L 18678742 3' + 1360 3168 1 67.12 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGC:1 - chr2L 15081088 3' - Doc 88 1 79.45 CCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTGTGAAGATGGGCAGGATCGCCAGGTTGAAATTCTTAATTCGGGAAGGTCATGGATTACATTGAAAGATGTTGAAGTGTAGCACAGTT:1 - chr3R 2999061 3' - McClintock 5994 2 69.18 CACTCTTTGCTGCTCATTGAATTTTCTGCTGATTTCATTTCGACTTCTTTTGCTCCGCTGGGAACGAACTTAAAGTGTGTGGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGGCAGTAGATGTTAGAGGAGTACGGGTGACGTGCAAATGCCAGAAA:1 + chr2L 8746827 3' - gypsy7 5245 2 69.86 CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGCGGTACACATTAATATAACTTATTGTAAGACCTTATAATATATAAATTAAAAATATAA:3 - chr2L 7578741 3' - Ivk 65 1 69.18 TTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCCCTTTGCTTTTAATAAACAATTTT:1 + chr2R 18014093 3' - Doc 103 1 82.19 GTTCAATAGTTTCGAAAATAAAGATTAAAACGACATAATAGGCAGAAAAAAATGTTTATAAGTGTGGGCGTTGGAGTTCTGGGCGGTATAATAAAATATCGAAACATTTTTAATAGTTTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGTTTG:1 - chr3L 19271020 3' - HB 1478 1 47.22 AAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAATGGTTTGAAATCCACTCCATCGAAGTCACACATTTTAGATATAATTAACACGATGTT:1 + chr2L 17842618 3' + P-element 225 1 37.67 ATTTACATTGTATATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATTGTGTTGACTTACATTCACCTCATTTCCATATCTATTATCTTGAATTCTGCTATTCCAAATCTAATAATAATTTGTTCTTTATTTTCCT:1 + chr3L 14216790 3' - 1360 3146 1 59.59 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAA:1 - chr3L 15364817 3' - 1360 69 1 65.75 TTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCAC:1 - chr3L 7837164 3' - jockey 4823 1 55.48 TTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATC:1 + chr2L 5270341 3' + jockey 4902 1 81.94 GATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAA:2 + chr3L 21093205 3' - Ivk 102 1 77.40 GACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGT:1 - chr3R 26486043 3' - 412 84 2 71.92 CGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTGGCATGCCCATTGCTTCATATACCCCCTACCCACAACCCT:1 - chr3L 7791849 3' + Transpac 290 2 69.18 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAGACCAAATATTTTCCAATTAACCAAATCACATTACA:2 + chr2L 5792143 3' - blood 6 2 81.51 GAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCACATATGATGCATGCCATATGCCATTACGTTTGGCGTGGTTTTGCGCTGTGACAAGTGGTTAGATGTTGGGAGAAGCTGGTCAAATCC:1 - chr3R 12520710 3' - Burdock 34 2 60.96 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACGGACATATATGTAGATATATAACCATATGCACATGGGTGCCATCCCATC:1 - chrX 16117171 3' - opus 162 4 66.15 GAACGTCTCTCCGTTGTTGAGTGCCCTTAAGGCTAGTCAACCAATCAACCAATTTAATAATGACAGCAAGAGCTGGAGCCGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAATATAAAATCTTTCTCGATGATGAAAAACTCTTTCT:1 + chr3L 10775482 3' - gypsy6 264 2 79.31 AAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAATAGGTTATAACCACTTAACTTTTTTCTTTTTGATTTCCGATGGAACTTATGCAC:1 - chr2L 8916715 3' + flea 449 1 56.45 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAATGACGCAGCACATCCCCGTTTCTCTCCT:1 + chr3L 8658830 3' - roo 30 2 60.63 GGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATGTCGGGGGAGCACTGTCCATGGCATGACAAGTCAATTTAAATACAGAAAATATGTTT:1 - chr2R 13295001 3' + roo 283 2 60.96 TTTTTCTTTTTTTAATTTTTTTTCTTTTTTGAGGGCGGGGCTTGGCGGTTGACAGACACTCAAATCGAATT:1 + chr2L 16385869 3' - Doc 4695 2 84.51 ATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATATATATATATTCCATAAAACCAATAATACCCTCTATATCTTAAGCAGTAGTATTAGTATAACTCACCGATTGAT:1 - chr2L 10446025 3' + flea 4976 2 55.48 GCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATATTATTACAGTAGTTCATAAATCCATACTTTAATTGGATTAAGAGCGGCTCG:1 - chr3R 30264027 3' + blood 7307 2 70.14 CGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGAATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTATTTCACTGCCAATTGTTTTTCCCGGCCAGA:1 - chr2R 11095707 3' - diver 29 2 63.01 AAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGGTCGGGAACGTTTCCTTATGTCTGCTAAATACATTTCAATGATACTAGATTCAATGATACTAGATACTCTTTTACTATACGAGTAC:1 - chr3L 26417928 3' + Quasimodo 226 2 60.96 GCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGGGCACCATCACCTTCAACTAACTCGAAGGTTTTTTGGGGGTATCAGTATCCGAATTGTTGCAACAAAAACTGCAACTGTTCA:1 + chr2R 21809398 3' + Doc 262 1 60.96 GGAAAGCGCCATGCAGTCACATATGATATGTGCAGAGCTTTCCTCCTCCATGCAGCAGGAGCGACAAAGTTCACTGTCTGCAATGCCTATTTTGTGCAGATGGCTTTTGAAAGAGTTCGCGAGATGCAGCGGTTGCATGACATGGC:1 - chr2R 18767318 3' - baggins 5247 1 65.07 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATAATTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAACCATCACTGGCGAACATATAGCAGAGACAGC:1 - chr3R 14220620 3' + roo 315 2 76.71 GTCTAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAGTTAAGAAAAAAAAAACGACTTCTTCAAACATTTCTTGTTTTGTTCGCAATAACAGCCTTTGCCCATCCTTAGAATTTAGAGATAAGACGCCGAGTAGTTTG:1 + chrX 1022587 3' + FB 110 1 76.06 CAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCGGTTTGACTAATGTGAACGCTTCGCCAAACATATCTTTGCAATCA:1 + chr2L 22697035 3' + Doc 237 1 69.18 TACATAATGATTTAAGCATAGAAACAGTCAACGAAACTATTTAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAACTACTGGACTTTGGTTGGCGTGATGGTTAGAAGAGTTAGGGGGATGAGAAGATGGGGG:1 - chr3R 9378722 3' + Porto1 4393 1 59.09 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATACATATGTATTCGAAAAACTATTGAATATAAATAGTTAATTCTGTGCGATGTTTTTCTACACAAATTTGAATGTGGCTAAAGTAAGCTGCATACTTTCAGG:1 - chrX 5772966 3' + jockey 4972 1 65.07 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACCCTTTCACTCGACAAGTAACGGGTATTACAAGATGGAAATGGGCTGTTCGATTCTTCAGCGGGAAATCTAATATTACAGACTGAG:1 + chr3L 22885058 3' + P-element 2881 2 77.12 GATATTTTCCACAGAGCTATTGATTCCTCGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCATTTGTGGATGAAAAAATAATGACTAATGGGTTCCTCGACTCGAA:1 - 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chr3L 785887 3' - I-element 66 1 61.64 CGGACCTCACGCAGCTGCAGAGGTTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTCATCTCCCTCTAACACACTCTTCTTGACAACCCAATTGAACCCTGTCCTCCCGCTTTGCTCTCCGAGCCGAC:1 - chr2R 6547870 3' - invader4 115 2 68.94 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTG:2 + chr3R 21674897 3' + roo 331 2 71.23 GAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATAAAATACCCATTGTAAATAACCTACGCATCGGCAAGGACCTTCCTTTCCCTC:1 - chr2L 15869457 3' + Doc 4402 1 67.12 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATATAATAGTTCTGGCTTTATCCCAAACTCCTGGCTTGTTAGCAACGGCATTAC:1 + chr3R 28406451 3' - opus 7164 4 61.54 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTTCTTCATTGGCATTTCATAAATAGTTTTATTTGGCGCATTAAAAAAACATAAAATAAAGAAATGAATAAAAGGGA:1 + chr3R 15152736 3' + opus 7458 2 56.16 GCATATTGGACTTATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACATGACATAACAAGTCCGGAGTGTGCCCCGTGTCTATTTCCGTAGTGGGCCTGTCCCAC:1 + chr2R 19259063 3' + Stalker4 5 4 60.47 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGCGGCTTTGAAATAAAGAGTGGCTGATAGTAATTCAGTTTTAGTGTGACCGCAGGAACATTGATCATTTATACCATCCGGATCTGGAAAA:1 - chr2R 5754473 3' - P-element 31 1 64.14 CCTCTATGATTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTTAATGTTTATACAGGAATTGGGAAATGCGCCTTAAATGTCAAGAGGTGCCACAGTTTCT:1 + chr3R 7226459 3' - invader2 4974 2 66.90 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCA:1 - chr3L 21013861 3' - roo 8717 2 64.57 CAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCACTCTTTAAGTTCATTTATTAGTATTTATTACAAAAAACTAGTCAATTTCTTTAAGCAGGCTCCTTGCTAAAGAATATACATAA:1 - chr2L 7865451 3' - flea 20 2 57.24 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGAAAGCTTTTGTCTCACCTAAATGAAGGCGAATTCGACTTCACTTTGTGTAGACTTTACGCGATAGAGAAAGAGTGAATCGGAAAAGTGGCAGTC:1 + chr3L 22642106 3' - hopper 16 1 73.57 TAACATTTAAATAATTGGTCCAAATACTTATGCCATTGCTAATTTGTAAAAAAGTAATTTGTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCCTAGTTTCTGTTAATAAATCCGAAGGGTCGGAGTAAATTGCACGCACACAGTCCACAGAC:1 + chr3R 11114114 3' + Tc1-2 1419 1 57.53 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCAAATGGCCCACACCCTCAAC:1 + chr3L 18183237 3' - Tirant 8112 2 81.88 TGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAAC:1 - chr3L 24272068 3' - gypsy11 81 2 59.59 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAAGCCCACAGGCACATTTAGTTATGCCGTGGTGGAAATATTTTTGCGAGCACAGCAGCAGAACAACGAAAACGGA:1 + chr3R 15920311 3' - 412 7095 2 54.68 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACACACCCTGTGAATTCAGGCGGCTCTCTCGGCGCGGGCATGCCAACTATGTAT:1 + chr3R 18399281 3' - P-element 26 1 54.37 GTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGCCAGTGGACAGGATAGCACCGGTTAAAACGTCAGCAGATATTTCATATTATATAAGAGGCTAAGAGGCAGCTTCTAGCACGAAGAACTAGACCTAGACCGCAATACA:1 - chr3R 3697523 3' - Doc 236 1 63.01 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGC:1 + chr2L 17626678 3' + roo 341 2 66.44 ATTTTTTTGCTTTTATTTTCTTTATATTTTTGCTGGCGGTTGGAAACGAGGGTGAGCAACAACAAACTGGCAACGTTTGTGGTTTGCCATTTGCCGCGTTATGCGTTTTTCCTGCGGCAGCCGAAAA:1 - chrX 15183114 3' - mdg3 5104 1 64.57 GAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCGTTTT:1 + chr3R 3320518 3' - 1360 79 1 71.23 TTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAGGATAACTTAAGGATAATTAAACGTAAGCCAAATATTAT:1 + chr2L 19095150 3' - F-element 98 1 74.31 AAGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTAGCGCTTGATTATAAAAATCGTTAATCTTTGTATATTCTCCAATAAAGTAATAAGCCATGATCGTCATACCAATAGTGTG:1 - chr2R 11256136 3' - roo 8704 2 55.48 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGGCATTAGTTCGTGCTTTATGCCCTATGCATTTTTCATTGCTCAATTTTCGCCGCATACTTTCAGGCTGGCCCATCGAATTTGAATATCCGAGGGTCG:1 - chr2R 7232611 3' - jockey 15 1 75.59 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATCATATGATATGATCCAAGTATTATACGGATACCCCTTAGAATTCAAAATCCAACCTCTTTGTTCCATAAATTCACGTGGAAATGGAAATGA:1 - chr2L 9948731 3' + I-element 5329 1 56.16 GTCGTCCTCGGCTTTTCGGGAAGGTATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGCGTTACGAAATAGCGGGAACAACAACTGAAC:1 + chr3R 21186574 3' - gypsy4 6529 1 70.19 CGTCCGAATTCGGTCATGCAGACTGGTATGGATCGTACGTTTTTGTAAGACGTAAATGGAGTCTGCAACACACAACAGTTAACAGAGCCAAAATAAATTGTGGTAAAACTACTACTAAAATAAAAACAATAATAAAACAATAAAAA:1 - chrX 11294323 3' + Doc4-element 451 1 72.60 GGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATAACATATACATATTATATACATATTAATTTAGAATTTGTAGAAATAATAAATTTATTTACCGAATACGATTTTAAATTCCTTTTATATATTTAAGCGGATGTATTAAACATGCC:1 - chr3L 19339280 3' + Tc1 1640 1 73.97 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAATATTTATGAAGCATATTTTGCGGCTCCGTTATTTATATTTCTTTGGTCAAAATATCTCTTCTACTTTTAGGCAG:3 + chr2R 11264088 3' + jockey 4946 1 52.05 AACTTTATAGCTTTTATAGTTCCTGCTGTCTCGACGTTCATACAGACAGACGGAAGAATATATATACATTTTATGGTCAGAAACCCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTATTAACCCGCTTAGGTAATAAAGTTTACAGTTTGTT:1 - chr2R 1366608 3' - INE-1 158 1 73.29 TTTAAATAATATATAAAATGCTCCATCGTTTTTTCTCGAGTCTTATAATTTGCACACAAAAGTTGACTTAAACCGAAGCCAAATATTGCATAAATTGTTGGTAGCTCTTAGGGCTTGAGTAATTTCGCCTTTGAATAATATATTTT:1 - chr2L 3091659 3' + G2 3054 1 78.77 ACATATTACATACGTACATATTCCATATTAAACCTTTAGTTTTTTCACATTTTTCTTTCTTAAGCTAAGAAAATCAAATTTTTAAGTGTTTTCTGCTGAGAGCGAGTAGAGAAAAAGGAACCAAGAAAGCCACATGAAAGGCATT:1 - chr2R 18511618 3' + 412 221 3 79.31 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGCCACTAGCAGTTTGACAGCCACTGGGAAGTGTAAAAGTAGGGGGCTAGAATGTGAATAAC:1 - chr3L 2425874 3' + hopper 1362 1 54.68 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTAGTATTGAAT:1 + chrX 4673682 3' - roo 8744 2 73.61 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGCAGCAATGATCGTCTGGTGTCCTTCGTTACTGAGCGGTTTAACAGTGGCGCTCCCTTGGATATTT:1 - chr2L 17380614 3' + hobo 2899 1 51.54 CATTCACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATGTGGATATTCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAAT:1 - chrX 10445545 3' + INE-1 535 1 69.83 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCCTGCCCGCTCGAATTTC:1 + chr2R 25106116 3' + roo 331 2 69.66 AAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGATAGGTGAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATAAGTCCAGCTAAGCGTTTAATATGATCCCAGCGAG:1 + chr2L 13064343 3' - Circe 114 1 71.11 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAGTCGAATCCACTCGTGTCTTTATAACTTGAGTGTTT:1 + chr3R 10213101 3' - P-element 61 1 33.87 GAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCCGCTGCACCGCAACGACCTCCCATTGTTGCATTTGGGGTCCTGTTTTCCCT:1 + chr2L 20479336 3' + Doc 4478 1 73.91 AATCTAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCGGATACCATCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTGCACCAACATCACCAACATAATCAGATATATTCATATTTTTATATATTCTTTGAGTGTCAAGTGA:1 + chrX 13537066 3' + springer 285 2 72.60 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTAATCT:1 - chr3L 14375591 3' + roo 9038 1 59.59 TTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTTCAGCGATTTGCTGTTTCAAAATGGGAATAATA:1 - chr4 123942 3' - HB 114 1 56.16 ATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATAAAGGGGTAGTATAATAGATCCGACTGGGTCGCATTCCTTTGTGATACTGCGTAGTAGCATGATGGTTAACAGATCGTCAATATTCATGAGGTTAACTTCGTTTATTT:1 + chr2R 5452715 3' + baggins 5353 1 56.85 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTAATTATTTTTAAATAATGTTTAGGGAATTATTGT:1 + chr3L 14375692 3' - roo 8751 2 80.82 AAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTACTAGTTTTGATGAGCCATCCCTGAAGGCCACTTTTAATGTAACCATG:1 - chr2L 15879410 3' + McClintock 6009 2 67.81 TCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTATGAATATTGTGTAGATAAAACTTGCATTTATATTTTCATTAATATCCATTTATACTTTATATACGTACTTCCTTTCGCTCTTTGGTTCGTCTTTTGTGT:1 - chr3L 17068437 3' - X-element 36 1 62.33 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCATTTCACGCACACCAAATACAAACAAACCAAACCAGATGATAACACAAACGAAGGCAAGA:1 + chr3L 15364951 3' + 1360 3371 1 69.86 TCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTGTGTGTGGGCATTATAAAAGATGAACTACTGAGATCGAGATCGAGTTGATGGCACTATACCAAGAAA:1 - chrX 2295110 3' + Transpac 262 2 52.74 ACTGCACTTGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGAATGTTCGATTGTGGCTGTGTGGGGGTGGTGGGGGAGGCCCATTCGGCTGATTAATAATTTACGTGGTAATATTTCTGTTGCCTGTTAACCCCCCAAAAAAAAATAAAATA:1 + chrX 3582917 3' - Doc 493 1 58.90 CTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACTAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTCAGGATACATGCCATTCAGT:1 + chrX 1018183 3' - 1360 215 1 67.81 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAGCTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTGAGTGAAAGTTTCTAATACTGCTAGAAATG:1 - chr3L 1358467 3' + 412 422 2 71.65 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTCGCCCTTCACGACATTTTCATACGCTTCGCTGGGAAATTTTAGCACATGCCAAAC:1 - chr2R 11263955 3' - jockey 4705 1 60.27 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTATCTCAGTGCTATTATCCTTGTTATAATGACTTATTTATTGATCAGTCGCCTTGGTAACTGGCAAGACGGATGTTAGAACGGATGG:1 + chr3R 6136098 3' - mdg1 27 2 65.44 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGCGCAGGATAATTGCCAGTCGCTGAGCAACAAAAGCGATTAG:1 + chr3L 10112261 3' - I-element 63 1 66.41 GGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATGAAGGGGGGGCGCGGGAATGAGACGACACTAGGTGAAATCCGTTGGCTTGT:1 - chr3L 4629165 3' + mdg1 7166 2 65.07 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCGTTGGATTGATGTTCGG:1 - chr2L 21153467 3' - 1360 34 1 54.62 AGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGTTTTTATGGTGGCGAATAAAGCTGTGGTATCCCATTCCTATTGATAGGGCATTGGTGTGAAAAATAACTAGTTCTAAAT:1 - chr2R 6247373 3' - diver2 149 2 53.42 TACTAAAAAAAAAAGAAAAAAATACTAAACGTATACCAAAACCTAATATTCTTAGAAACTTTTAATCAAAGTAAGACCTTTTTCGAATTATATTAATATTCTGGCTATTTTCGCATATTTAAAATCCTTGAAATAACCCATAAACT:1 + chrX 13947360 3' + G2 3075 6 48.63 GCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGGATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTCAACTCGAGTGGCTGATAATTGGGCGGCACGTGCTGGTGCCTTTGTT:1 - chr3L 1856699 3' - Transpac 4983 2 62.59 TCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACCCGAATCAATACGGTACTCTGCGTCGCGG:1 + chr3R 1465917 3' + Tirant 8417 2 78.77 GTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGCCGATCATACTCGCTACTCGTAA:1 + chr3R 2637699 3' - gypsy5 60 2 75.45 ATCTATACCTGTTATAATTTAAAAAACAATTACAATCCGCGTTCCTCTCCGGCGTTAAAGTCACCGGATCCGTGCGGCGAGTGCAACTTTAGAGCGGCTAACAAGCGTGAAATGAAATTTTGCCGGAAA:1 - chr3R 6495234 3' + Stalker4 398 1 73.64 GTGACCCTCTTTCATGACTTCTCTAATGAAATGATATCGAATGTCGATGTGCTTCGTCCTAGATATTCAGTTGGATATCGCAGAGCCCTTTAATTGCTTTACTAC:1 - chr2L 19020225 3' - 1731 4152 1 60.00 CTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGTATTAAGAATAATATAGTCTATCTACGAAAAAAGAACACCCTATCTTTGCCGAAATCAATGCAAATTTAGTTTGACTGCAGATTGCCTTT:1 - chr2L 5890449 3' - invader3 5220 2 57.53 ATTAGTTTCTTAAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGACAAAAAAACGAATGATAAGTAATGGGATGAAAACAACTTGTTAAAACCTCTATAAATTTATCTTTATATGTCTCACGTTTATTAAAG:1 - chr3L 3238224 3' + roo 9039 1 52.41 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGCGTATATTTCTGCGATTATTTTAGGTATTT:1 + chr3R 25751923 3' + roo 9044 1 66.44 ATATTTTATTTTATTTTATTTTTTCCCTAAAGTCATAGAAGTCGGCACGTTGAGTTGGTAAGTGGAATGGGCGATTCGGAACCTTTATATATAGCATATACTAATGTATTCCGCAACCACTTCAAAAGGACATAAACATAAGCGCT:1 - chr2L 2330568 3' + transib1 1898 1 73.97 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCGGCGGAAGTAGAAGTTAAAGCTACATGGTGGAAAATGTTGATTGATAATTTTTGTAGCTCTATTTTTGGTTGTTTG:1 - chr2R 15475122 3' - BS 40 1 47.95 TCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTTAATCTTTGTTTTCCTTTATTTATTTCGAACAACATAAAAGCGCTTAAAGTCTGTTTAAGTGCCCATTGCTT:1 + chr3R 21395266 3' - G2 440 1 65.07 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGGCATTAAATAAATAAAGGCCAACTTGATGCCGTCCTAACCAAATGTTATTCAGACGAAAGTTGTATTAGCTCG:1 + chr3R 18528427 3' - roo 8670 2 78.08 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACACTTGATGTCATAAGTGTTTGAATAGCATGTTGAACGATTTATAATTTTGTTCTTTTCGATTTTAGTTGCCAAAT:1 - chrX 8349862 3' + roo 9026 1 56.16 GGCTACCTCTTATAATGGCTAAAGCGATGACCGTGCCTTATTGATTCATTACAACAAAGAGTTTTTTCGGCAGAAAAATGCGACCGATGAACTTCCGCTTGCGACGCTACGCCTTCTTGTGCTCCTCGTAGTCTC:1 + chr2R 9374004 3' - gypsy7 5142 1 57.04 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTAATTTAGTGAGAAGCAGAACTATGAAAGAAGTTTTCTTGGCTCACTTTTAGGGTTTCACAGCAGGCAAGTGCAAAAGAAAATTATAATAATCTGGACTAAT:1 - chrX 7446158 3' - jockey 4690 1 42.47 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACGTTTAGATACATTTATATCTAGTTATGGAGTGGGGGAGGGGGGGAATATTCTATCGAAGCCATTATCTTCG:1 - chr3R 25714002 3' + flea 4986 2 58.91 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGG:1 + chrX 3646974 3' - 412 88 2 78.08 ATTATTAAGTGTTTTGATTAATTTTCTGAATTCTTCAATACCTTTACCCCATCACGTTCTCTTGTTTTGATGTTTGCCCAAATGGCGTGCTATTATTCAAGAGACCGAACATTAAGTAGAATTTCTGCTTTTAGTTGTGCAACATG:1 - chr3L 6274607 3' - G4 313 1 56.16 AATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACTTGCACTTGTGAAA:1 - chr3L 18484370 3' + hopper2 1551 1 53.42 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCTTGTTTAACGCAGCTATAAATTATGATGCC:1 + chr2L 20515277 3' - I-element 53 1 64.29 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTT:1 - chr3R 6645329 3' - blood 69 2 61.64 ATGGTCATGCATTGCAAATTTGATAAAATATGCCCTTCACTTTACTAACACGCCATCGTTCTATTACATTATTGTTATTAGTATTTAAAGCTTGATTACTTATTTGTAGATTCAAAACCATGTATTGGACTATTAAATCCAGATC:1 + chr4 136893 3' + 1360 192 1 68.97 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGCTAAAAAAGCTAAAGAGCG:1 - chr3L 21013837 3' - roo 48 2 52.74 GCTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTT:1 - chr3L 18484407 3' + hopper2 1514 1 78.77 AATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATATTGGAAATGGGCCAAAGTTCTGGTGAGGAAATAAAAGTGGGTAATTGCCAGCATTTAGTCGCTGAGCTTAAA:1 + chrX 14633569 3' - 297 6969 2 50.68 CGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGATAAATAAAACGAAAATTACCAAATGCCATTTGAGATTAAAGCTAATTTAAATATATGTTAATTAACCAACT:1 + chr3R 9330628 3' + Burdock 35 2 51.37 GTCGACCTCTCAAAGACAGCTGATTGTCGATAACATACGTAAGACAAAATTGATGGCAAATCATTTTGCAACATTTGTGGTTTATATTTAGTTTACTTACCGAATTGACGTAGGTCGCAGAATAAAATATGGTTTGGCTTATGTGT:1 + chr3R 17407410 3' + transib1 149 1 60.96 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAGTCGAATCCACTCGTGTCTTTATAACTTGAGTGTTTCTTGCGGCAGTCGG:1 + chr3R 10213115 3' - P-element 39 1 48.28 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTTTCCGC:1 + chrX 1103731 3' + pogo 2097 1 75.96 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCCTGCCCGCTCGAATTTCGCTTAACATTATTTAAAGGTGAAGTTCTTGGGCCTCATATTTCGAAAATTTTTCCTCCTTA:1 + chr2R 25106177 3' + roo 392 2 74.66 ACCTATTAAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTGCATGCATGCAAC:1 + chr2L 18522333 3' + roo 343 2 58.90 GTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATAAGACAAAGACATTTTTCAGCATTCAACTCACTATTTATTCATCATTGCTAACGAACGGACGTGTATTGTCCAGACATATTTTGTAAACTTAAAATAAAAATATCAC:1 - chr3R 2845486 3' - flea 10 2 73.97 AAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCTGCGCAACTGATCCCCACTTCGGCAGTTGAAGATCCACACAGTAGGTAT:1 + chr3R 25319081 3' + Doc 4427 1 66.44 AATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAAACTCGCATAACGATACATAGAACATTACGCGC:1 - chr2R 12065561 3' - Stalker2 7289 2 58.90 ATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCATTTTCGTTC:1 + chr3L 7801336 3' - Transpac 127 2 63.24 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCA:1 - chr2R 21848648 3' - Transpac 35 2 56.16 ACTGAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACACCTTGTTTGAGATGCTAATGCTGCTAAGAACACGAATATCTCAGTTGTCGGGGAATAGAGAGGTTAACCTAAAGGGGAAAGAGGGAAAGTCAAGTTGCAACCACTCCA:1 + chr2L 1776230 3' + roo 393 1 74.48 AATAGCAGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTTAACTTGACCAAAATCGAACATAGTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTAGGGCGTAATATTTGGTTGGTTGCTTTGGGCTTGAATTGACATTGTGGCCTAAGTTAGCGCAAAC:1 - chr4 512093 3' - HB 1415 1 67.81 CGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATTCATCAATATGGAGAATTGAACCCCTAGTACTTAGTACCTTATGTGG:1 + chr2L 2895643 3' + Burdock 188 2 67.38 GGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGCCCCCCCGAGCTCATGTGCATGCCGCCCCAAAGCT:1 - chr2R 8844953 3' - McClintock 277 2 75.34 AACCTTCTAGTTTTTATAGTTCCTAAGATCTACGGACAGACGGACATGACCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATTTATATAATCTATATGTTCATAAACACTGCAGATATACTCTAATGTCATTGAACTTGGTAAA:1 - chr2R 5965179 3' - INE-1 158 1 76.71 GAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTCACTTCCGAGCGCATTTGATTTTAATTTTACGCCACTAAAAGTGCTTGGACCGTAAATCCAATTTAT:1 - chr2R 7599109 3' - diver 5901 2 73.72 GAAATATAAATTATAAATTTAATTAAAAACAAGAGAGAATGCTATATAGTTCCCCGACTATAAGACACCCGTTACTCAGCTAGTACATTTAATTGCTAACAAATGGCAAAAGGGCGTAAAGGCTCCATGCTTGGTCTCTGTTTACA:1 + chr2L 9486087 3' + copia 252 1 58.22 GTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCTAATTGATCACGCACTTCTTTGATACGAGGCTTTAAATGCGAATCATTGCACTCAGAAAAATGATTATTAACTACTTGATACAAGATCTCCG:1 + chr3L 15279709 3' - pogo 1666 1 57.53 TTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAAAGCAAAATTTGACCAAATTTCTAATTTTGTATTTATACATGTTCTTATTTCGATTTACCATCTCCTTCAGGCTTTTCAAGCTACCAAAACAAGGGCGAGCTAATA:1 - chr3R 18528439 3' + roo 464 2 66.44 CATCAACTAACTGAATGGAGCGCATAAAAACGGAAGTTATGCTGCCGCACACTGTATTTGTGTAGAGTAAAATTTCGATATTACCTGAAAATGACAAGTTGTGAACCAATTTAAGAATCAATCAAACAAAATGACGCAAAATAAT:1 + chrX 2521499 3' - mariner2 36 1 77.24 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATGGACCGTGAACCGTCGTCGAGTGTGTGCGTATTCACTCTTTGTTTGCAGACTTTTAGGCGTTCGTCGTTGTTTGGCATTTGACTTAATTTAAAGTG:1 + chr2R 17332260 3' - jockey 32 1 69.18 GGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTATAAGAAGAATAACCAAGACCCTTGCATCCCCAGGC:1 - chr2R 22947998 3' - I-element 5163 1 75.34 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGACTAAACATTTTGGCTGTGTATGGGTG:1 - chr3L 18381899 3' + copia 239 1 61.64 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGATTGGGCACGATTAAGTGCTCCACCTCGGTGCGAT:2 - chr3L 363474 3' - blood 86 2 76.03 ACTCAAACATAAACTTAACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCATTATGTATCATTATGCTTGATCATGATAAGAATTAGTGACAAGAATTAAACTTGAAATGTCAAAATATACAT:1 - chr3L 17921926 3' + copia 210 2 54.11 AGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAATG:1 + chr3R 19436118 3' + roo 378 1 63.70 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACACTTTTGCTTCGTTGAGCAAGAATGCTTGTT:1 + chr3L 2320683 3' + roo 8994 2 76.69 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTGGCATGCCCATTGCTTCATATACCCCCTACCCACAACCCTT:1 - chr3L 7791848 3' + Transpac 307 2 78.46 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGTAAGCCCTTTTAACG:1 + chr3R 30264094 3' - blood 7075 2 66.67 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGCCGGAACGGCTAAGGAGGGAAGGTGTCATGAGCA:1 - chr3L 14662392 3' - FB 88 1 76.55 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAGGCCATTCGTATGTATT:1 + chr3R 25862662 3' - roo 74 2 69.18 ACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATACATATTTATGATACTACTACTACATTTTACATTAAAATTATTGGAGAGCGTGAAGTTTAAGTTACTATTTTTAATTTAA:1 + chr3R 7481619 3' - invader4 44 2 54.79 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGACTTTTTACAATTGGCAAATCTATTTGATGCTATTTAACAAAAAAAGCGAATGATAATTTAT:1 + chrX 21337412 3' - Burdock 6163 2 75.89 TCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCTAAAGTGCGCGAAATGAGGCGGTAATGCCGTTGACAGCTAGTCAGTCGGTCGTCTTGCTAAAAGTTCGAGATATTAATCCAAATGTATTTCAATTACAATTG:1 + chr3R 8712430 3' + Tc1 145 1 53.10 ATGCCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTTAATCTTTGTTTTCCTTTATTTATTTCGAACAACATAA:1 + chr3R 21395232 3' - G2 466 1 57.25 GTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTTATCAGCCGAGAACTTGACGAAAACGGCCGCTGACTCAGATTCTATTTTCATAGATATACTCAACGAAAAATGC:1 + chr2R 11989380 3' - Quasimodo 291 2 55.56 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGAGAAAC:1 - chr2R 10910214 3' + Tabor 460 2 52.88 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTCTGTGTGGTATGTACAGTCAGCGACACAATCGTATGCACTTTCGGGGCAGGGAGTAGTGCAAGGCCAGAGTTG:1 + chr3L 21910490 3' - pogo 42 1 57.53 CCCTCAATTCTCACTCACATTTGTAATCAGTCTTAAGTTGAAAGTTAGACCGTAAAGTTCAATAAGTCTTAAACCGATATTTAATAATGCTTGGGCCTTTGTTTGAATTAATCGAAGTGATATTTTGCTTGTCCCAAAATAATTTA:1 - chrX 6020562 3' + McClintock 248 2 58.90 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGGCGAAACATTCAAATTGATGTGACCCCAAGATGAGGAGGGAGGCAGGTGCTCATCTCCATTTGAGCGAGGAGACGAACCGCAAGTAGGGATGCATTG:1 + chr2L 1807099 3' - roo 13 2 69.63 CCTAATATATTTTTAAAGTTTATTATAGTATTTTTTTTCGTTTAGTATTATAAAATTCATAAATTTGTTGGGCCTTAAATCACCATATTTGAACGCTGCGGATACGGAAAATTAGATTTTTCCGAAACACTCGAAACCCG:1 - chr3L 13922386 3' + hopper 171 1 87.14 TATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGCAGGCAAATATTAGTTTATTAAAAAGGTATAATACAAATGGATTCATATTATTATATGAAAGAAATATAAAATAATATATAAATTGGGAAATATTATCATGTGCG:1 + chrX 23210718 3' - Stalker 6985 4 55.17 CTATCGATTTGCCAAAAAAAACTTTTTCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGCGGTCCTAGTATACCCGGATACCAAAGACCCTAGAATAACTTTGCGGATACCCTAGCATACCGGATTTTACTGTATAAAAGGA:1 - chr2R 5738128 3' + INE-1 314 1 71.85 GAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATAAGTATATTAATACTTTTAATATTTATTCGTATATAGCAT:1 - chrX 20145560 3' - Juan 4107 1 71.23 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACGAGTCTTTTTTAAGCACCAGGACGGGAGTTTTAATACCCTTGCCGAGGGTATTCTGATTCCAGTCAGAAGTTTGCA:1 - chr3R 6461928 3' + 297 337 2 52.41 GGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAGGGAAATACTTATCATACTTCCAACGATAAGAGCGATTCAGATA:1 - chr3L 13952718 3' - I-element 5108 1 76.03 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTG:3 - chr3R 9125623 3' - Doc 31 1 68.97 TACAGAGTTTTATGTTCTGTTTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGGCTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTCAACAGAATCATAATGAGGAACTAAATTCACATCAACACCAGGTAAAGCAGGCTAACAAGC:1 - chr4 862072 3' + Cr1a 4187 1 60.96 TTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTG:1 + chr2R 4206656 3' - 1360 321 1 71.72 AATAATATTAATAATAATAATACTTCCCTGTCTTTCTACTTAAATTATCCCTTTGTTATCTTATGCATTGTATTCACTTACCTACGTATGAAATTTGTACGAATTTCAGCTGTTGCCGGAAAGTATGCAGCAACCTTAGA:1 + chr2L 13670271 3' + mdg1 7084 3 57.14 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTATATAACCCACCGATTCCGGCCCTCGAGGACATGCATCTCGACGTCGC:1 - chr3R 19435993 3' - roo 8731 2 65.07 TATATAAGTATATATAATAATATGAAAAGTTGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCTATCGTCCGTTTTGCTTTTGAATTTG:1 + chr2L 5460085 3' + Dm88 4381 3 38.36 AAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGTATGTTATGTATATTAAATGTATATAATGCATTTATTTAATTAATTATTTATTTCATCATTGTATGTGTAGCCTCAA:1 - chr2L 13332592 3' - micropia 4998 4 58.22 AATAAACTGTAATTATTTACTTACATGTACACGCATGTGTATACAACAAAAGAACAGAAATATATATGTGTAATTCAAATGTACAATGTATTTAAGTGGGGCAAGAAGCGCAGTGCATATACACACGTAAATATATTAAATTAGAG:1 + chr2R 982087 3' + HMS-Beagle2 7195 1 75.34 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACAGCACGCGGCTGTCACGTCAAGTGGTGGCCCA:1 + chr3L 7460686 3' + 412 7506 2 68.75 GTATGTAGGCATGTGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATTCCTTATAAAATTACAAGTCCGGAACCACCACCAAGTCGCAGAAGACCACAAAACCGCTGTATGAGCG:1 + chr3L 8976909 3' - Idefix 25 2 57.72 AATGCGACAAATTTGGCTGTCGCAAGCCAAGCCCCAAATCTGACAACCATACCTCCATATGGAGCTATATGCAGAATGCCAAATTCGCAGAACGCTGAGCGCCGAGGCACGTGAAGTCGAGACTTTTGGGCAAACGGCCAGAGATG:1 + chr3L 9064956 3' - BS3 1339 1 53.42 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTTGAACCTTAACCTCCCCGGAGTGAAGAAAGTTTTTCGCTTGTTGTTTGACAAATTGTTTTGTGCAGCCTTCGAAGGAAATAAAAGGCAACATTCGACTGTAAAGCGG:1 - chr3R 8639186 3' + copia 242 1 76.03 ATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTTATTTTATCATCCCATCGTCCTCGTCGTCGTCCATCGATGCATTCTTGCGCTCAATCTCCGCTAACGCTGGCT:1 - chr3R 21212382 3' - 297 6519 1 54.79 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTATATATACGCATCTGATTACTCCAAATTGCAATAACATGTGAATGATTACATATGA:1 + chr2L 19310425 3' + Juan 4184 1 62.33 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACGGACATATATGTAGATATATAACCATATGCACATGGGTGCCATCCCATCCGCATATTCATGTGTGTTGTGGTTGGCCATGTCACACCCGGCGTAC:1 - chrX 16117125 3' - opus 19 2 68.49 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTACATTTGCATCAAGGACTTCCGGTTTGTGCACACCAGCCGAAAAGTATGCA:1 - chrX 7741891 3' + hobo 2890 1 61.29 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTTTCCTTGATGCGCATTTGGCACAGCGCTGAAAAGCGTGCTACACTTTTTGAAATCCTCGGAAGAGCCAAGAATATGCACCAGATGTGATG:1 + chr3R 26846875 3' - hopper 10 2 77.17 CGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAACGACACGCCCATATCTTGTGTAAAATATGAGCGTACGGGGAGAAGTTCTTGGCTTAAATGTGGCTTTTTAAGGGGGCTAAAGC:1 + chr3R 14912065 3' - Stalker4 39 4 58.90 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTACGCATATCGGCACACATACATAAATACACACTGCACTGACAATGAGAGGAGACACAGTGCCGAAGAGACGATACTC:1 - chr3R 1267661 3' - P-element 43 1 58.90 TAAGATGATGAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACC:1 + chr3L 21093207 3' - Ivk 100 1 74.66 GACGAAATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAAGATTCAGCATACAGGTGCTTATTACCAAGAAGTGAAAAATGTCCAACCAAAAATTGTTTGCTTATCGAGGTGGATATCCATATCCAAGTGGGGGGTTGGTTAAATG:1 - chrX 131817 3' + INE-1 145 1 67.63 AAATTCAAAACACAATTTACATATAATTCGCATGTAAAGATCATTAAATAGAAGAGGGAATATACATAACTTTACATAAGTGGGTGATCATAGTGCTGCGTGTCGATTGCTCGGCTGCGAAAACAAACACTATGAATGCACAGC:1 - chr2L 22015423 3' - transib3 47 1 47.22 CCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGA:1 - chr3L 7791901 3' + Transpac 5157 2 65.75 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTT:1 + chr3R 21674933 3' + roo 9031 1 53.42 TATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCATTAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCTCTCTTTTGAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCTCTCTCTGTATACAACACTTATCGTGCA:1 - chr2R 7884576 3' + invader3 99 2 78.46 GAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTTCCTGGTCTTCCAGTCGTAGAAGACTATATCACTC:1 - chr3R 13181863 3' - 412 7237 2 76.03 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAAG:1 + chr2L 17839468 3' + blood 7337 1 59.23 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTATACTTATTTGGTTTTCCGTTTTAAAGTCAATTTCGAAAATAACAATACAGACCAATCAGAAAACTATACTTTATACAGTACAAAG:1 - chr3R 21216812 3' - 1360 36 1 56.85 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAATAAATAAATTATCTAACTAGCCTCAGCTACTAAACGGCTGAACCCAAATAGTGTGATGGAAATTTATCAATCTTTAATGATATATACATATTACTATACTTTTTTGTAGAAG:1 - chr3R 6816656 3' + Juan 4197 1 70.55 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTA:1 - chr3R 26486025 3' - 412 7119 2 60.27 ATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCAGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATATTGAT:1 + chr2R 3760472 3' - accord 6928 2 71.92 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTTTAAGGCCCTTGGGAATCATATTTG:1 - chr3R 26485984 3' - 412 7078 2 67.12 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGGGACACTTTAAGGTAGCGGTAACAGTTAAATAAACATCAGAGCCATTTTCCTAGCGGTGTTTTTTTT:1 - chr2R 18055298 3' - jockey 4780 1 50.75 AAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAAGTCAAAATTGTTGACAGCTTGAAAAAATGACTGTGAATTATAAACTATCTTGCAAATTTAAATAAAATAGGTTACGTGGGTA:1 + chr2R 10161034 3' - transib2 2 1 80.14 GCTGTTGTGGTTGCTGGTGGAGTTGCCCCGCTGGAATCTTCTGTTGCTGTTGTGGATGCTGTTGGAATTGCCCCGCTGAAATCTTCTGGTGCTGT:1 - chr2L 6483797 3' - TART-B 149 2 73.68 AAGCGTAAATGACGATTATGTATCGTTTGGTTATCGAAATTCCTCGGAATAGGAGCAAAATAGAAAACAGAAGAAAAGTGTGCAAACAACCGACTGCAGCTGCTTTAACAGTTGTTCCTGTTGTTGTTTTGAGGT:1 - chr3L 21993684 3' - S2 290 1 62.96 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTT:1 + chr3R 11151893 3' - mdg3 5327 2 68.49 CTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAACCCAGCGCTATTAACAAAACGGGAGACACAACACCG:1 - chr2R 19852163 3' - Transpac 82 2 74.66 GGGGGTGGGGAAGTAGATGTTGATGTGGTAACTCTTGCACTTGTAAACTGAACTGAGATAGCGAATCCCTAATGGCAGGGGGATTGCCTCTGGCATTTCTGAGTGTGC:1 - chr2R 17544133 3' - gypsy5 6951 2 67.59 GATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGACAAAACACGAATTGCAAATTTGAGCCACGCATCATTGATAGCTCGTCATTGGAATTC:1 + chr3L 12869614 3' - jockey 4860 1 63.70 GAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTGGATGGTAGTTGGTAGTCTGCAGTGTGGTGCTGCCAGGGAGGTGGTTGCCATTTTCCGGGGGAAATGCCGGGAATTCGCCGAAACAGCCCACGAAC:1 - chr2L 11399006 3' - 412 7280 2 74.05 GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGACACGAAAAACGGAAAGCGAATGTATCTGAAAGATACGTTTAGTCTATTTCGACGCGAGCATTGTAACGGATCGCAGGTCACGGACGCTTGGA:1 - chr2L 17260681 3' - P-element 25 1 68.28 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTGCCGGG:2 + chr2R 1923582 3' + pogo 2048 1 56.16 CGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATAAATTAATTGCGTACTTCATGTGGGATTACTGTGCCCTCGCGTCTGCCACAGTCA:1 + chr3R 7261728 3' - invader4 67 2 63.01 CGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTACATATTCCAGTGATAGTTGATAAGCCGTGGCGTGGCCGTCACACGAGCTAGGACAGCCAGCATTGCCATCAAATGGGTAGTGGAATA:1 + chrX 21933326 3' - springer 7147 4 69.17 GAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATACATATTTATGATACTACTACTACATTTTACATTAAAATTATTGGAGAGCGTGAAGTTTAAGTTACTATTTTTAATTTAAATATTAAACCAT:1 + chr3R 7481631 3' - invader4 32 2 63.01 ATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCTCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGC:1 + chrX 21994030 3' - McClintock 5969 2 70.50 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTATAGTCAAGAGGTGGCTGGCGAAAAAACAAAGAAAAAAAAA:1 + chr3R 18282392 3' + 412 412 2 72.60 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGGTTTTGGTTTTTTTTTTATTTCAATAATTTAGGTCATTTAAAAATGTACATTTACAGTATACATAATCCAACACGTATGTATACACAAAACTTCATAAATAATATAA:1 - chr3R 20840009 3' + roo 396 1 77.40 ACTCGAGACCGAGTCACGGCCGCCATGTAATAGGGTCAACAAGAAATACGGTATTTTGGTAGATGATGAA:1 + chr3L 24104319 3' - Stalker 411 1 88.57 AATATCCATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTTTAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAATAAAAGCATTCAAAAAGTTGTAATAATAAAATAAGAATTTAAAATGTGTTATTTTTTATAGCTCTCCCACAA:1 - chr4 271837 3' + Tc1 1507 1 49.32 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTTGTGTCACTCTCTTTGGCTCTCTCATTTGATTTGCCATGCGGT:1 + chrX 7706868 3' - P-element 31 1 64.38 AAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACGCATATTGCATATTATTTAATTAGCAAAGGCCTTCGGCGTGTGTTTATATTT:1 + chr2R 7599238 3' + diver 153 2 65.75 AGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATTTTTTATGCGAAAAATTCCATTAAAATGTTATCCACAGTTTTCGGGGAGATTGAATTTTTCTGTTA:1 - chr2L 18158986 3' - INE-1 150 1 66.44 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGTGTTTGTGGTAAATT:1 + chr2L 19140448 3' - Max-element 53 2 51.37 AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTAT:1 + chr3R 13349570 3' - Ivk 55 1 61.29 GCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCCCTCTTTCCGATTTTTTCAGCCACATAACTAATGTGGATTGCTATTGTTGGACTTGCCAAAAAGGGTTTTC:1 + chr2R 6797590 3' - jockey 216 1 55.47 CAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTGGCCAGAACGTCAGTGCCA:1 + chr2R 10910316 3' - Tabor 54 2 52.05 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATG:1 - chr3L 17537759 3' - Doc 86 1 76.55 TATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAG:1 + chr3R 10030775 3' - BS 5081 1 65.07 GAACAGGGACCAGCGAATAAAAACAAAATCACTGTGGGCAATAAAGTACTGTACTGGGCATACATGCGTGGGTGGAGATGGAAAGAAGAGAGGATTCGTTAATATGGCGATACGCAAGAAAGTGTCAGACCAAAGACACTAGAATA:1 - chr3L 22016760 3' + HMS-Beagle 274 1 59.59 ACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCAAGCCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGGACAACGCTCTTGTTCGTAGGAAAATATCAATCTTTATGGAATCAAGTGTTTAATTTGAATAA:1 + chr3L 8710781 3' + Circe 7341 2 67.12 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGT:3 - chr3R 9125655 3' - Doc 64 1 54.79 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACAC:1 - 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chr3L 21730800 3' + HB 79 1 63.70 AAAAAAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCATATATATGCGAACGCCACGTTTTATATGTCCTTTGCAATTGGCCACATCGGGAATGAATTGAAATCGAATTCAATC:1 - chrX 11960805 3' - pogo 147 1 54.81 TCTCAAGCTTTTCCTCTTCTTCTAGAACTGTCTCCTTTCGAATATATTAATTTGCGTCCTCTGATTTTGTATACTAGTTCCTCCATTTTGAAAATAAATATTAAACAGTGTTTTAGCCACTTTTTCATTCCAGCGGAATGCACACA:1 - chr3R 4719457 3' + Gypsy12A_LTR 2016 1 61.64 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACGCGCTGCGTATACGTAATTGTTATTGGACACTCTCACGCGTCGTCATC:1 - chr3R 20450371 3' - hobo 14 1 72.54 ACATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGG:1 + chr3R 15790110 3' - flea 4745 1 60.27 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAAGTTACTCACAACGATTTCTTTAAAGCGTAATTATATTTTTAAGGGCCCAACATATAAACAAGTTATTGATTTGCTAA:1 + chr3L 9212790 3' + hobo 2895 1 53.42 GAGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAAGCCCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGATAGATGGTATCTTTCTCCTTCCCTGAAATAAATGTACCACTATTAA:1 - 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P-element 353 1 14.38 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTTTAAGGCCCTTGGGAATC:2 - chr3R 26485991 3' - 412 7085 2 63.70 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAACTCGCGTCGCACTCATGGGCATTTTTTGTTCGAAAGAATTTCTATCTGTTCTCATTT:1 + chr3R 8849883 3' - 297 6598 2 68.80 GAGCGCTGAACTCCGTTGGGGCACGTCAGCATTGCTTATATGTGGTAACTTAGTGTTTATATATTCGTCTATCTCACGGTTTGATTGCTCTTTAATCTATGAATTATTTATTTTG:1 + chr2R 4517357 3' - gtwin 74 2 53.04 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCTGTTTCGTTCTGGAGTGGTATTTTCTAATTCATTTAAATGTTGCTAATATTTAAGGAATTTTTAAAATACTAATGATGCGAA:1 - chr3L 8658694 3' + roo 9034 1 56.85 ATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGGGATTATTGTGCCGGCTCCAAGGAGTAG:1 - chr2R 13367402 3' - jockey 4572 1 72.86 ATTGAAAAAGAAAACTCAACTAGAGGCATGTCAATCATTGTGGCACTCCACATGGAGTTTCAAATATAGAAAATACAACTATAATGTTATTAAATGTATGCTATAATCCATTTTAATGTCAATGTAAATCTATGTTATACTATCTT:1 - 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chr2L 11554480 3' - roo 8801 2 58.90 CTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGTTAGTAGTTAATTACAGTTAAGTGTAGAGTTAACGAAATATACAACATTTTTTGTTATAAAATGACGCAATTTTTGGAAATATTTTAAGTAATTCCGAAATG:1 + chrX 21088017 3' - mdg3 5312 2 67.12 GGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGATGAATGTCTCCCAGTTGCGTGGCCATTCG:1 - chr2L 8404698 3' - McClintock 6136 2 76.92 CTCAGCCTAGACCACAAGTTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAACAAAACAAAGCGATGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 4326115 3' + F-element 4214 1 70.55 ATGGACCAATAACCATATGTGGCGACAACATAAGTTCTCATCATATTGCGAAGAATCCAGTACACCATAAACGACCATTGCCAGGGCGCTGTCTACAAATTGCAAATTGATTTTTATCGATTTCCCATAATCAGAATTATTATGGA:1 + chr3R 5033143 3' + Copia1_DM 4050 1 51.37 CGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACGGACATATATGTAGATATATAACCATATGCACATGGGTGCCATCCCATCCGCATATTCATGTGTGTTGTGGTTGGCCATGTCACACCCGGCGT:1 - chrX 16117127 3' - opus 7024 2 67.12 TTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGACAGCCAAACCAGCACTTCCTGATTGGCCAAACCATGAAGTGGCCCAGCCAGGCCGCACATGCTGGCCGAGAAAGACA:1 + chr3R 12061846 3' - I-element 120 1 53.47 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTATTATATATAAATAACCTTTTAAACCAATTTTGAAGAATCGTCTAATAAAAGCTTGGATCGATATTTGTTTTCAA:1 + chr3L 18801886 3' - I-element 45 1 53.10 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCATTTTCGGGTCTTCC:1 + chr3R 16276447 3' + pogo 2056 1 54.79 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTAAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGACAAAAAAACGAATGATAAGTAATGGGATGAAAACAACTTGTTAAAACCTCTATAAATTTATCTTTAT:1 - chr3L 3238244 3' + roo 9018 2 52.74 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGATTTCATTTGCTAAAT:1 + chr2R 11164550 3' - roo 8680 2 74.66 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTATTATATATAAATAACCTTTTAAACCAATTTTGAAGAATCGTC:1 + chr3L 18801854 3' - I-element 78 1 71.92 GGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCAT:3 + chr3R 13349583 3' - Ivk 64 1 58.22 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAGAAAGAAATATCCCAGGAATTATTTCATATATA:1 + chr3L 13364422 3' - hobo 31 1 65.07 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTAATCTCTTAAGTTTAAAGATAATTACTTCTAGTTATATATCGGTTTAAAACTATGTTCCACAGTAGCTTTAACTGGGATGGCCATTGAAATTTA:1 - chr3R 18528235 3' + roo 9047 1 65.75 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATGATTTAAATTCTATTACTTTTTATAATATTGCTGCTTTTAAGATTACTA:1 + chr3L 5630435 3' - I-element 78 1 67.81 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTCTAATATTCACCTGATTTAAATCTTCAA:1 - chr3L 17537712 3' - Doc 40 1 60.27 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACATTTTTTTAACCGATAAAAATGAGCTTGACCAATAAAACCCTGCTATAATACTTTAAAATATTGGTTGTTTTTAATTTTTTATTCCGAAACGAAAATACG:1 + chr2R 5434037 3' - Transpac 15 2 69.86 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTGGTGAGTG:1 + chr2L 12486444 3' - roo 33 2 57.55 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAAAACGACGCATTGAAGTCGAAAGCCAAACACTGCGTGTTATCTTATCGCAGTACATAAAAAAGCGCACAAATGGCG:1 + chr3R 19223536 3' - FB 8 1 73.15 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGAATTTAGGGGGCCGCAGTGTACAGTTGAGAAATTGCAAACTGAAGCCTCCTTTTATATATAGTATATATCCCTGCTTTTGATGGCTCACCTCGCTTTTGATCTTTCCCGACTG:1 - chr3R 25804062 3' - mdg1 9 2 75.34 CAAGAGAGCCTGGAGCCACCCCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTC:1 - chr3L 26852647 3' - 1360 74 1 67.69 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCGAACTACTTAAAGGAAGAAAGGCTATGAAAAACATACACACATCATATTCTTTGATTTCT:1 - chr3R 28116977 3' + hobo 2920 1 59.62 AGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGTTTTCTTTTCCTCTTCCCCTCATATACATTTCTTTGCTTCTTTCTTTTGATCGTACGTCGCAAGGTGAAAGTC:1 - chr2L 14183003 3' - hobo 364 1 50.00 TCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAAC:1 + chr3L 18183167 3' - Tirant 82 2 81.38 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACTTGTGATAACGCAACATTTGCTTGTTCTATCTATGTATGTATTTTGTATATCTATTAGCAGCGCTGAATGCATTTT:1 + chr2L 6177645 3' - pogo 29 1 60.90 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAG:1 + chr3L 10469619 3' + roo 9054 2 63.89 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTT:1 + chrX 6633035 3' + P-element 2847 1 48.74 CACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGTCACCAATAAAAACTCTGTGGACAGCCTTCGTCTTATGAAAAAGAAAATATAGTCGTAAGCCTAGCTCAATAGTATTGTGAAGTTATAGGGCAAGCTTTAGAG:1 + chr2R 4726001 3' + Burdock 6048 1 75.34 ACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACAAGCACACGCACGAATTAAAAAAAAATCATCCAAGTGCCGTGCAAAACACGTAATAAATATCAAAACACAAGCGAAATGC:1 + chr2L 1119263 3' + Bica 59 1 53.79 AACTTAAAAATCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATT:1 - chr3L 18183112 3' + Tirant 8455 2 72.22 TATTATTATTGTTATTATAATACTTCTTCTTGCTACTTTTTATGTTTATTATTATTTCATCCTGTTTTCGTCTTGTTTTAAGTGACAGCTTGAAGCTTGAAGAGCCTTGAAAGAGCGTTCAAGAGCAGCTTGGAAAAACTGGC:1 - chr3L 1180441 3' - mdg1 7063 5 60.14 ATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGATGTTTGTTAAACATTTCTGGCATTTTAGGCGTGTGCCTTCTCTGT:1 + chr3R 26387606 3' + X-element 4385 1 69.18 ATATATTATGGAAAAAAAAAAATATCTTTAACTAGTAAAGATTCGTAAAAACATGTATTTTATAGAAAGTAGATATTTTGTTTCTGAGGATGGGCACCATAGATTTTTCTCCTCAACAGT:1 + chr2L 1281739 3' - hopper 159 1 87.50 AAATACAAAAAAAAAGTTAACTTTTTAATTGGTAACAAAAAAATAGGAAATACCTCTAGAGTAAAATGATTTGGAAAAGATTGCATTATAACTGAATGCACGATAGAGCCCGACGAGATCGATGTGGCTGCCCTGG:1 - chr2L 12058694 3' - Tc3 380 1 75.00 TGTGAAGATTTCAGAGATAAGGTAAACAGGTTCAGTAGCGGCTTGCACAAGGCTTCCGCACAGAATAGACAGGATTAACTTAGCATTTTACGATATTTTTCCCCGTGCTCGCATTTCTTGCCCGTTTCCTTTATTTTTGTATTTAT:1 - chrX 20693344 3' - Q-element 14 2 54.11 ATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTACCAAAATACCGTACTACTTGTTGAACCTATCACACCTGATTATTCCAAATTGCTTCGAAAATGGCAAATAGCAACATA:1 - chrX 18583993 3' + Stalker3T 289 1 69.86 CAAACGATCGGTTCACCGGTAGCAGCATACATTTATGGGCGGCTGACGGGTATCCTTGGCAACATCCCATGGAAACCCGGTCTTTGTAAAATTAGAACGTATTTTATAGCTGGTTCAATTATCATAATAAATTATATAATCTGATA:1 - chr2L 16537248 3' + Rt1c 459 1 54.79 TATATATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACATTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATATGTATATATACCAAAATACTATCGCCGCAGCAGCTTTC:1 - chr3L 5854354 3' - 17.6 43 1 75.22 GAAAGAAAGAAAAAAAAAAACAAACACAAGTCGAAAAAGTTGCACCGCTGTCAATGTCATTAACAAAAGATTGAGGCATTTAGCTGAAATTTTTACTATAATTGTCACCCTGAACAATAATCAAGCAAACACAACATCCG:1 - chr2L 19194585 3' + gypsy7 5008 1 68.57 GGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATAAAATTTAAATTAAGACAAACAAAAAACTGAAGATATAAAGTTTGAATAAATTAAAATAAACTAAAACTATACAATACAAAAATAAAAATAACAATAA:1 - chrX 21056524 3' - McClintock 34 2 71.03 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTTTGTGGGTGTCTCCTTTGCGTTTGTTATATACTTTTAACTAGATTAAGCCA:1 - chrX 8967346 3' - HMS-Beagle2 6906 2 68.49 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTTACCTACTTACATAGTTGTAGTCCAAGTTTGCGCTCTGAAAAGTATGCAACAAATTACGACAAACAGACTTGCATTTGCAG:1 + chr3R 27374501 3' - jockey 25 1 68.55 CTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAACAAGCAGATGTATCTGCTAAATGAATGAAACAACACAATAAACGCAACTATTCCATAAATGCCAC:1 + chr3L 3453740 3' + Tirant 382 2 72.66 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTATATTTTGTATTTTTAGTTCTCCCCATGTAGAGTCTCTTTATAGGGTCGTTTCCCATTCTCTTGA:1 - 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Tirant 83 2 73.97 GGGTCGGGGATGTCGCGGATCGAACGGTGTAATCGATAGGCGTAGTCAGTATTTCCTGATAGTGATAGTTTGAAATAAACGCGTGCTGCGAGAGGCAAAGTGCACAGTGACTCCCACCGAGACGACAGTGAGGTCATATAAAGATA:1 - chr3R 28687650 3' + aurora-element 4036 1 56.16 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCTACATTTCCATACATATATATATATTTATTTTGAGTGAGTTTGTTATATTCTGAAACAGTTTTCGCTAAACTCCCTGTTTATGGCTATAAAAAGTACAAGTGGGCAGCAC:1 + chr2L 17380768 3' - hobo 10 1 77.40 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATGTATATGTATATGCATATGTATTTTTATTTGTATTTGTATATGTTTTGCCTTGGCTTTCGGGTTAAACATTTCGTGACCTGCATTTTTGTTGTTGGAAATAAATTGGTCGC:1 + chrX 3351734 3' - opus 7 2 77.40 GTTTAGAGTGACAAGTGCCGGTTTGTTTGCTTAAATACATTTAAATTATTGAATAAAAATTAGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGAATGCAATCTTAAGTATAACCAGTCGTGCGTGTAATCCATTTTG:1 - chr2R 7720187 3' + Bari1 281 1 69.66 GCTGCTTTTTCTCTTCTCAATTTTGGCATTCCCTTTTCATTATGTCGCTTTCTCACTCTAACCAAGCACTGCAAGTGGCCACGTTTAGCCGCAGCTCTATCTAGGTAGAAATTATGCAGCTATTGCCATTACTTTAC:1 - chrX 9020460 3' - micropia 5272 2 73.72 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACTTGCACTTGTGAAAGGTCATCCTCATGCACA:1 - 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accord2 61 2 52.05 GCATAAAGTAAGCAAATTGTCTCCAAATAGTCCAAATATTTTGCTTCAAACCTAACGGTACTTTCTAAAAATATAATTGAAAATAAATACTTGCAAAATACAAACCTTAAATCAGTCGAAAAATTTCTAAGAACACACTGACGATT:1 + chr3R 3848198 3' + Transib5 55 1 55.48 CGAGTCTGGTCCAATTTGTGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGTATGTGTGTGAGGTATTCCTATTAATAGATTGGTACCATGGAGTGCAGTTTATTATGTTTCCTTTTTTGCTTCGGTTATTTCTATTTGAATGAGTACAACTCTTC:1 + chr2L 2959344 3' - I-element 4905 1 72.60 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAA:1 + chr2L 17839467 3' + blood 7320 1 64.38 AAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTAGGCTATGATATGTGAAATATTCAAAATACTGGTTGAAGTAAAATATACGTAGAAAGGAATTTCTGCAAGTGCA:1 - chr2L 5270723 3' + jockey 4990 1 69.18 GTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACAAGTAAATGGTTTTGGTATGAAAAGTACACCTT:1 - chr2L 11554478 3' - roo 8798 2 57.24 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATCACAACAATGTGCAAGAGGTCTTATCTGTCACCAAAATACATTACCAATTTATTGCCAAAAAAAAGAGTGTTGGATGGATGGCT:1 + chr3L 12836120 3' - 1360 17 1 69.53 AAAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAGTAAAGGAACCGAAAA:1 + chrX 5210629 3' + gypsy7 5009 1 73.33 ATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGATAAATTAATTAAAAGTAGTCTCGGAAAAGTAGTAGACTCGGAGAATTGTAGTTGCAGTGGACTAATGCAGATCTCTGATTCCAATCCATGGCATCGTTTCTGGAACAGCGATGCAGGGCT:1 + chr2R 4720580 3' - Cr1a 4008 1 50.00 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCCGAGTTCCAGGATCCATAAATAAATGTAGATTAGTCGCCGCGCGTGCAGCACATCCGGCCAAATG:1 + chrX 388379 3' + 1360 3374 1 76.71 AAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACAGAGAGGAAGCGAACGAACAAATGA:2 + chr2L 22690026 3' - Tabor 76 2 67.12 ATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAAATATTAATGAAGTCATCAAAAGTGAAAAGATTAAAATTACATTTC:1 + chr2L 9418581 3' - rover 74 2 69.18 ATCGCAACAATGTGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGAAAAGTCGCACTGCTGCAGGCGGTCAGCGATTGTGATAGCGCAA:1 - chr3R 15718202 3' + gypsy2 6626 2 59.63 GGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCGATGAGTAGAGTATCCTAGAAATATAATAAACATAAAGGTATAATTAAACATTATTTGAAAAACTAACAT:1 - chrX 17616249 3' - F-element 4451 1 56.85 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTGTTTACAATCT:1 + chr3L 27415341 3' - transib2 34 1 62.07 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAGTAGAAGAAGCAGCGCTGGCAGCGACGCCGACTGCGCTGCCTTGGCGCTCGGGAACTTGGAGCCCAGTTGCCGATCGGATCGCCAGAGGATCGCCG:1 + chr3R 31724986 3' - P-element 6 2 79.20 GCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAG:1 + chr2L 17599966 3' - 1360 486 1 73.29 GTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCGTGGCTGAATGGGAGGTCGCAGGACTCGGTGCGGGGGAAAAACAGGCGG:1 - chr2R 20449796 3' + hopper 326 1 69.93 AGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACGTTT:1 + chrX 2295259 3' - Transpac 4961 2 48.63 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACGTGGCCAAGCACGCGAC:1 - chr2L 13629021 3' - Tirant 12 2 77.54 TTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCTCT:1 - chr2R 14135283 3' + copia 175 2 71.23 ATTATTATTATTCTAGTGTCTTTGTACATACTATATGTAGTAGCAGACTGGCTCTGCTTAGCAACAATTTGTAATAAGCAAGTGCATTTAATTTTCTCTACTATGGTGCTGCAGTTGCAAGGCTTTGCAAGTTTTTAAATGTCGAC:1 - chr3L 11910458 3' + Tc3 308 1 72.60 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCT:1 - chr2L 12325023 3' - jockey 4739 1 59.59 TTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCTCGATCGTGATCGTGATTACTTCATATGGTCGAAAGTGCTTTATTCTACCCTTTACCCTTTTATTTTCTATACCTTTTGGCTGGTTTTCACAATTACAACAAGATGTGACAAGTGT:1 + chr3R 10026042 3' - INE-1 155 1 36.55 TCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTTTGTTATTATTATACACGAGCAATTTAAGCAATCTGTTTGCTCTCTAA:1 - chr3L 13284972 3' - 297 6864 2 67.12 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAAC:1 + chr2L 3231969 3' + roo 9014 2 56.16 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCC:1 + chr3R 21674931 3' + roo 9029 1 52.05 TTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTGTTGGGCCCTTTGTCGAGGGGTGCCTATAATTGAATAAGTTTTCATTTCTGACGGGGAAGGTGGTTGTGCTCGGTAAAATGTGTTTAGGTA:1 - chr3R 21337342 3' - G2 3076 1 76.99 GAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGAGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGAATCATGTAGTGTCTGCTTCAGATATTGATGAAGACTTCAGCAG:1 - chr2L 5420437 3' - roo 213 2 68.75 GACAATTTAGAGGTTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGAAATTGTGAAGTGAAAGTGACGTACCACGCCCACATTTTTACAAAACTGTTTTCATAT:1 - chr4 857181 3' - Q-element 110 2 67.81 GGTGAAAAAATAGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTTTTCTTTTTAATGTACGCGCTTCAGCTGCGATCGCAGCAACCGGGAGGAGTTTCGCACCAGGGACATATTTAAATTAAATAAATCAATTTAATGAAG:1 + chr3R 8824080 3' - HB 1404 1 58.90 GGACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAATTCTATTTTAAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGAGGTCTATATCTGAATTTAAGAAAATCTCTTTAATAAATCTTA:1 - chr3R 5445828 3' + 1360 3214 1 72.60 ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACTACATATATACATAGATAGATACTTTCGACTGAAATTCATGCTGGGCCTTTCGATTGCCGCACTTTAAGCTGAGTGCAAAACATTAACACG:1 - chr3R 8849725 3' + 297 368 2 65.07 CACAGTTGCATAAAATTAAATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATAAAAAAATGGAACATATTTTATGGGAATTAAAACAAAACCTT:1 + chr2L 13332698 3' + micropia 381 2 71.23 GGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTATTTATATAAAACTTATTCTTATCGTGTATTTTTAAATTTAGAAAATTATTCATTGTTTATACTCTCAAAAAATGACGTATACGCAACGTTGGCCATTATAACGAATATACACATTT:1 + chrX 21413285 3' + INE-1 573 1 89.04 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTG:1 + chr2R 14973675 3' - FB 68 1 71.32 ATGGACTGGGCCCATAACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCATTTTATACGAGTGCGTTTGGCTGGCTTACAAGCTCATTTGCTTTTTCGTCGTGCAGGTGGGTGCTGTCGTTTTAT:1 + chr3R 22857490 3' - copia 274 1 52.05 AAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATCATTGTAACAAAATATGTTTACAGGAGAACCCCCTGGCCATAAAGCAGCTCAA:1 + chr3R 19691777 3' - copia 4761 1 77.12 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAACAAGCAGATGTATCTGCTAAATGAATGAAACAACACAATAAACGCAACTATTCCATA:1 + chr3L 3453732 3' + Tirant 8474 2 63.70 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAG:1 + chr3R 25795806 3' - jockey 96 1 79.72 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGACTTTGTATGTGACCTTTGTTCCCGACGAAGAGACTGGTGGTCATCTGGGCATGGCGGAGTTTGTTAAGACGGATTACTACAAGAAAATGAACGTGGGATTCAGCCTGGACGAA:1 + chr3R 23098319 3' - roo 8668 2 76.92 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATTTTCATCTAATTAAAATGCATTACTACTTCGTTA:1 + chr3L 9470040 3' - 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chr3R 15645663 3' - gypsy5 7003 2 50.68 GCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGTGTTGTTAGAAACTACGGAATTTTTATAATATAAAATTCATTTGACCATTGCAGGTTTTAAGTCGGTGGAAGGAGAAAGGCTTGTCTTAACAAA:1 + chr2R 547250 3' - Stalker4 190 4 68.06 ATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAAAAAAAAATCGAGAGTGCGACTAATTTGGCTGCGGTAATTGACCTTGCATTCGTGAATAAATAGTTCGC:1 + chr3L 12479590 3' - 412 105 2 53.10 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCTGTTCCTGAAAAATACATCTAAATTCCAAATTTCAGCAAC:1 + chr3R 7778374 3' - transib2 38 1 58.22 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACCCTTGGGCTTTGGATACGGGCTAAGGATGTGGGTCTCGGGTTCGGTTTCGGGCTAGCGTTCGG:1 + chr3L 19580988 3' - roo 58 2 58.90 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACTACATATATACATAGATAGATACTTTCGACTGAAATTCATGCTGGGCCTTTCGATT:1 - chr3R 8849760 3' + 297 333 2 67.81 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACTGGCGC:1 + chrX 16117272 3' + opus 7462 2 55.12 GATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATTATGCAATGTTGGTTAATTTTAATAACCTTCAAGAGCTTATAAAAATATAGCTAAA:1 + chr2R 1926257 3' - pogo 134 1 61.64 CCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAATAAAATAAAAAAAAAAACAAAAAGGGTCGAAGGTTTCGTGGAGAAAGTGTACTGTCTGCTCTCTTGCTTGATAATAAA:1 + chr3R 24603155 3' + I-element 5300 1 54.79 GGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTATCGGTGTGATGGTATCCAGGTAGGGACTCTTCGAGAACGAGTTCTTCGCATAGTGCATAATGGAGTT:1 - chr3R 24750909 3' - G6 16 1 78.08 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAA:1 - chr3L 3453589 3' - Tirant 8137 2 60.80 GTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATGCCCATTCCCAACTCTGCTCCATGGAAGACACTCCAGGATCTGGATCTGCTGCGCATG:1 + chr2L 5507628 3' + 17.6 6959 1 60.27 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATACAACATATCACAAATATCACTAAAAAAAACCTTAAAACTATTTTTTTCCCGTTGGTTTGAAAACATTTATTAAGTTAGACATTACAATCATATT:1 + chr4 540608 3' - flea 22 2 70.55 GTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGTATACTGACATAGTACAGGAAG:1 - chr2L 18630469 3' - G-element 69 1 65.71 CACGCCCACACTTTTCAACAATTTAAAATTTTTTCTCATTAATATTCATTCCCTGCTAGGCGCTTCTGGGATTTTGCGGTCATATATTCTGTTTATGCCGGAGTTAACTCATTGCCGGCATCTTGTTGCTGACTCGAGTAGAGCTG:1 - chr2L 22050789 3' + INE-1 253 1 72.60 ATTGGTCCTGATCAAGAATATATATACCTTAAATGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTATCATACTTTTCAACAAGTCTAGTATACCCTTATACTCTACGACTAACGGGTATAATAAATTCATCACCACATTACTAGAAGTAAT:1 - chr2L 22130378 3' - INE-1 83 1 63.70 TTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATATTATATTTAACTTAGGATATGCAACTCAATG:1 + chr3R 23161338 3' + 412 405 2 78.77 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTATATGGTCGTCTGCGGATGTGG:1 + chr3R 13437268 3' + hopper 1397 1 68.80 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATA:1 - chr3R 9125674 3' - Doc 82 1 67.59 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATCTTTGAAGTTGGGAGCCACTTTTGAATTTGCCTCCTAAAGCGGGACAACTATAATAGCATAAAACCAGTGTT:1 + chr2R 9607222 3' - pogo 44 1 55.48 TGGATTGGGTTTGCTAAGATGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGAAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAATGAAGCGCTATTATCGTCCGGTACTCC:1 - chr2L 23389636 3' - I-element 5114 1 80.14 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAACCTTTATGGTGTTTAAAGCAGCAAACAAAACTGAAAC:1 - chr3L 15364780 3' - 1360 32 1 63.01 ATGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGCCTTAATTGAAAGCCAAAGAGTACAAATTAAAAGCGCATTGCAGAAACACCATTAACAAGGCAACAACACCGGTGTTGATCAAACATGTCAGATAATAAAGAT:1 + chrX 10739332 3' - Quasimodo 33 2 60.77 CAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATCAAGCAATATCTTAAAACAACGAAAAATAGTAATACAAGTCATATATCATATATCAAAGGGAAAATGGTTTGTATTTAAGCTAT:1 - chr3R 17586807 3' + Max-element 267 2 58.57 ACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCCGATCGTTGACTGTGCGAGGACGCGGAGGATATCAACAACGACGACGAGGATAACAGCAGCGATGG:1 - chr3R 23081589 3' + hobo 2671 1 66.44 CAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGTCAACAATTGAGAACGATTTTCGCCAAAAATTAACTCCCATTA:1 + chr2L 17839375 3' - blood 451 1 76.47 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATC:1 - chr2R 15070101 3' + 412 425 2 75.20 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGAAATCGACTATTGATGGTGTTTTCAGATGGTGTTTTCAAA:1 + chr2R 4536702 3' + mdg1 368 2 51.37 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCCGCACACTCAACTGTGTGGAAACTCATGAGTAT:1 + chr2L 15777924 3' - 297 6612 2 62.50 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAA:1 - chr3L 6355597 3' - Tirant 69 2 61.64 CTAGCAAGGAAGCTAGGGACTGCAGCTGTGGTCAATCTGACAGGCACAACACTTAACTATTCCTCCTTGTTCTCGGCAGCCGGAACTTCCCAGTAGTGCTCGTCCTGGTGATGTTCGTCCTTCTTC:1 - chr3L 4918793 3' + jockey 4685 1 78.57 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGT:1 - chr3L 18484387 3' + hopper2 1543 1 62.77 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGCTAAACAAGCTAAAGAGCCAGCAGGCTACATAAGCCCAG:1 - chr3L 21013817 3' - roo 28 2 63.70 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAA:1 + chr2L 21910229 3' - Doc 69 1 66.67 GAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATGATTATGTAGCATACTTTTCAGGAGAGTCCTTTTAGG:1 - chr2L 15013213 3' - BS 4920 1 58.22 AAAATTTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATGAGGTCGCTTGGTAAATTAAATTTAATTGCATTTTTAGCAGTTGCGAAGTGCGGT:1 - chr2L 7465478 3' + Stalker 6767 2 62.33 TATTAATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGAATTTAGGGGGCCGCAGTGTACAGTTGAGAAATTGCAAACTGAAGCCTCCTTTTATATATAGTATATATCCCTGCTTTTGATGGCTCA:1 - chr3R 25804087 3' - mdg1 7075 2 59.59 CTGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATAATTCCATTCAAACGCTTCGTTCAGCAAAAGACGGAGGCAAACAGAAAATAAACATAAATAAAGAGAA:1 + chr3R 13876972 3' - opus 50 4 54.86 TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACTACATATATACATAGATAGATACTTTCGACTGAAATTCATGCTGGGCCTTTCGATTGCCGCAC:1 - chr3R 8849753 3' + 297 340 2 62.33 CGTGAAGAGAAAAAGCTTTACGTTTCTCTTGGATTCAGGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGGGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATAGATTTTTATTCTTTCCAATTCTTTTACCGTTAAAATTGTATTTGAAAATTATTAGT:1 + chr3R 14326849 3' - Idefix 370 2 58.22 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCC:1 + chr2L 21910217 3' - Doc 83 1 75.34 TCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATGAAAATTGTGAAAAAGATGATGACCGATTTTCAGAAAAAGATCGTTCAAA:1 - chr2R 5237676 3' - Doc 6 1 69.86 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAG:1 - chr2L 21153504 3' - 1360 71 1 73.85 ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAAACTCGCATAACGATACATAGAACATTACGCGCGAAG:1 - chr2R 12065557 3' - Stalker2 7284 2 62.07 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTCAACTGTGTGGAAACTC:1 + chr2L 15777916 3' - 297 40 2 57.93 ATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACGTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTTGTTGGATATCTTTTGGAATAGTCAGCCTTGGGATTGATAAATTTTTAAGAACTGCAATAAAATAGGTTGA:1 - chr3R 10030651 3' + BS 5081 1 73.29 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAAC:1 - chr3R 20934695 3' - 412 78 2 73.38 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTAGCGCTTGATTATAAAAATCGTTAATCTTTGTATATTCTCCAATAAAGTAATAAGCCATGATCGTCATACCAATAGTGTGCAGTCGGTGAGATAATAT:1 - chr2R 11256118 3' - roo 22 2 67.81 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGCCGGAACGGCTAAGGATGGAAGGTGTCATGAGCATAATAAATGACCTCAACTTACCGATACGGCATTTTCCCTTTTTATTCTAGCTGACGCTGTGAAAATCACCCCGT:1 - chr3L 14662318 3' - FB 15 1 75.34 GTTAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATAACCTTTACTCACCTAGTGAGAATGCGAACGCAATATTTTATAATTTTTCTGAGATTAAGTATGAGTATTAATTTAAATGATGTAAACGATTCAATTTGATTTCCTCGC:1 + chr2R 17872702 3' - INE-1 575 1 72.60 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCATTTATTTTTAATTTATCTTTTTTGTCAAGGCAAGTGTCTGACGTTTTTTTT:2 + chr3L 18253941 3' + blood 371 2 78.08 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTAGTCTTGAATGCCGGCCAGTTGTTTTTCCGGTCGGAAAAACTTCAGACATTTTCAGCAGACAATCAAC:1 + chrX 4673740 3' - roo 8688 2 67.81 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTC:1 + chr3L 19031312 3' - roo 8740 2 70.55 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGCGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTCATTTA:1 - chr3R 18635198 3' + opus 7458 2 52.59 AACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTC:2 - chr3R 11151805 3' + mdg3 186 2 57.53 GTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAATCTTGAGTTTAATGCTAA:2 + chrX 22900332 3' + Tc1 1568 1 69.18 TAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAA:1 - chr3R 8042312 3' - BS 65 1 63.01 CTTGCAGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGG:1 + chr3L 23678165 3' - Osvaldo 35 1 67.19 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATAATGATGATGTATCTAAGTTAGCGTGTAAGACTTTCTGTAAACAGCATTT:1 + chr3R 15295810 3' - roo 67 2 66.44 ATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAATTAGGCGGTAACAAAAGTAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAATCTTGGCCATGAAAAAGCGCACAACTTTAAGCACAAGAGACGGTCAAAAGCCCATAGAACTGCACTC:1 - chr2R 21462940 3' - Tc1 1490 1 54.11 GTGTTCTCAATTGGGGGCATATATTGGTTTATTACACTAGAACCGATGGCAATGATCATGATGGAGCTTCCGCCCGTGCAGCAGCAGCCAATG:1 + chr3L 363544 3' + blood 7375 2 59.14 GCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGATGATATGATATGCATGGCGCTTTCCATCAGGAGGAAGAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCAGTGACCATTTTAGTTTTTTTTTTTACCCAGC:1 + chr2L 18872721 3' + baggins 5213 1 77.04 GACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTACCTCCGATCGTTTGCTTGTTCGAACCCATTTTCTTGCACTTCTTAAATAAATACT:1 - chr2R 1320410 3' - Transpac 54 2 57.66 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATAATTTTTCACTGCCGATTCGCAATTTTTCG:1 - chr2L 19652491 3' + roo 9039 1 61.64 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTGAGTGAAAGTTTCTAATACTGCTAGAAATGTATATTTATAGAAGGA:1 - chr3L 1358451 3' + 412 7496 2 59.02 GTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGCGTCCTCACGGAAATGCAGATACCGTGGAGACCATAGAGCAGTCC:1 + chr2L 13133564 3' + McClintock 192 2 51.58 TTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATTCTCAGTTAGTATCTCTCGATTGCCGTCGTC:1 - chr3L 12967013 3' + hobo 418 1 80.00 CTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTAAAACGAATGCAGAAACATGCAGATCGTTAGGCGCTATTTTTTGGTCTTAAAGGCCGGGCTTTATATATTCAAATTGTGCGGGAGTCGAA:1 - chr3R 7778217 3' + transib2 2796 1 66.44 TATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGGCAGGCAGCGGG:1 - chrX 6417716 3' - Quasimodo 38 2 72.63 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCAAAGCCCA:1 + chr2R 5754584 3' + P-element 2810 1 36.99 ATTCACACTAGCTGAGTAACGTGTATCTGATAGACGGGGATCTCTACTATTGCATTCTCTCATTAGGCAACGCACATAGACAAAAACGAAAAGATTCTCCAATTTGTAAAGATCTGTTGTAGTTTAGTTCGGTATACAGGAGACAT:1 - chr3R 4555648 3' + INE-1 536 1 69.18 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTACCATTTCATAACTGAAGTGAATATATGCAATCACTCATTTATTCATTATTCATTATCTTGTTTTGGCAGAGAGCTCTTGCTGCAATGGCGGCAATGGTGGCAGCAAAC:1 - chrX 5633990 3' - jockey 4705 1 69.86 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGTCTTGGGTTGAGGGGCAGGTTTTCACCGGGTCAGAGGTGCAGGCGCCACC:1 - chr2L 12486334 3' + roo 353 2 62.31 AACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGCCGGAACGGCTAAGGATGGAAGGTGTCATGAGCATAATAAATGACCTCAACTTACCGATACGGCAT:1 - chr3L 14662360 3' - FB 39 1 53.12 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACACTGGACCGATTCCGAGGGATCCGAGAAGTCCTCCCTTTGC:1 - chr2R 10910173 3' + Tabor 467 2 71.01 CATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTCAGTGTTTTTTATATTCATAAGCTTTGGCATTATTTTGACAGTTTCC:1 - chr3R 9109518 3' + blood 7176 2 62.77 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGTACTCTGCTGGAAAGCGCTTGTTCTCACAAAACGGCGCGCC:1 - chrX 5753355 3' - roo 79 2 71.92 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGACTAAACATTTTGGCTGTGTATGGGTGAA:1 - chr3L 18381897 3' + copia 241 1 63.01 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATGAAGTTATTGATTTATACATTCATTTCAC:1 - chr2L 16857870 3' - P-element 93 1 21.92 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGATGGATAAACCCGCAAGCGGTGGCAACTAATTTCTTTTTACAACTGTAGCAGTTC:1 - chrX 6462017 3' - hopper 55 1 59.40 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATAATGATGATGTATCTAAGTTAGCGTGTAAGA:1 + chr3R 15295791 3' - roo 86 2 79.45 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGATTTATGGCACAAAATATATATCAAAGTTTCTGCGTTTAAGCATGTCGCCATATCAAAGAAGAGTCTTGTAAGAAATGTTGAA:1 + chr3R 20203945 3' - 412 38 2 59.59 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATAATGATGATGTATCTAAGTTAGCGTGTAAGACTT:1 + chr3R 15295794 3' - roo 83 2 77.40 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCAAGACGTCCGCAATCGACCAACCACGTAAACAAATGTTAACTTTCCCGTTTGCTTCGCTTCACTCTTGCTCACTTCACTCCGCGTCCATTGTGTTTTTGGGAATTTTTTG:1 - chr3R 28952846 3' - jockey 4745 1 78.77 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTAGATGTCACCTTAAGGGAATATGTCTATATAGTTATAAAACAACATTTGAATAGTTTTAAAA:1 - chr2R 10160505 3' + hobo 2903 1 49.18 CATTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAATCT:1 + chrX 22900317 3' + Tc1 1553 1 72.60 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCT:1 + chrX 4673672 3' - roo 8699 2 70.79 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGATCGATGGAAACCGGTTTCTGTGAAAAGTCTTTGCTTTCGTCTAAGGAGAAAAGTTGCCAC:1 - chrX 4673587 3' + roo 9039 1 59.40 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCACATTTTTTGGTCAGATTATTATCTGAGATTTTTACTGGTTTCTGAATTAGAATAGGAAACTGGCAATCAGTGGAATAGTTCATTTAAAGATTTCTATATGGTATTGTTAAGC:1 + chr3R 15298728 3' + roo 8999 2 72.60 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTAGCGCTTGATTATAAAAATCGTTAATCTTTGTATATTCTCCAATAAAGTAATAAGCCATGATCGTCATA:1 - chr2R 11256147 3' - roo 8713 2 54.17 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCATATATATAGAAAATATACACATATGTATATGTACCTAGACGTGCCTATATCCCGCCGATTTTGAG:1 - chr3L 16059234 3' + 297 344 2 64.14 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCGACTAATTAACTATTAGAACTAGTATGATTAAGAACTGGGTTTCAT:1 - chr2L 2494796 3' - Doc 19 1 67.44 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAACATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGAAACTCTGCAAC:1 - chr3L 21013884 3' - roo 28 2 69.62 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGAT:1 - chr3L 785897 3' - I-element 74 1 68.06 GTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGAAGTCACTTTGGGATAAAAACATATGCGACTGGATGACGC:1 + chr3R 16985564 3' - BS 5047 1 69.34 AATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCATTTTTAGTCGGTTCCAAGTCATCGCCGCGTGTCAATGGACCGACTTT:1 - chr3L 11926143 3' + 1360 3273 1 66.19 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTTCCCGTTGTTTAAAATATGTCGTCGAGCCAAGAATTTGTACTTTAAATGTTTT:1 + chr3L 2330211 3' + roo 9037 1 60.96 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACACACACCCTCTTGAGCATGGTGGGGTCTACAGGATAATAAAGG:1 + chr3L 13678966 3' + hobo 2891 1 67.24 GCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGTGCCTTTGTGGTAAATACATTTTTAGCATTTTGTCTGCTGATACCTATGGGTGTTGTACATGGCAGCG:1 - chr2R 20149517 3' + Stalker2 76 2 51.77 GCTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACGTGGCCAAGCACGCGACCAGCGCCGA:1 - chr2L 13629012 3' - Tirant 11 2 79.45 AATCGCAATGACATCGTTTGCCCACGTGGCCAGACCACTGAACCATCCGCCTCTTCATCTTCTTCCTCTTCTTCAAAAACTAACATCTAATCTTACTATTTCCTATCAAAATGAGAGAATTTATGAAGAACACATTAATTTTGACT:1 - chr2R 10213082 3' + FB 198 1 58.22 TTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGGGCAAACCGATGGAAATTTCTGCCTTCATGAGG:1 + chr2L 12144271 3' + transib2 2737 1 79.45 AAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCAT:1 + chr3L 7801328 3' - Transpac 5064 2 53.42 GTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTTTTGCGTCGATGTCGTAAATTTTCCAAAGTTCTTTGGCCTGTTTTCGAGGTTCCGAATTTTTGGTCGCAGTTGTAGCTTGCAATATCAATAAACAGCATA:1 - chr3R 3617232 3' - F-element 4238 1 67.83 CCATATTTTTGAAAAATGTGTTTAATTTCAATTTAACTTCTATTGTATTAAAATTCTGGAATATTATAAAATATTTGAGCGTAATCACTAATAAATTCAATTTTGGTTATTATTAAATATTTTAAATATTTTTGTACAATCTATTT:1 + chr2R 10382531 3' + INE-1 258 1 63.70 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTAAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTT:1 + chr2L 18522310 3' + roo 8984 2 73.29 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCTTGTTTAACGCAGCTATAAATTATGATGCCAAAGTTTTTGGCCACT:1 + chr2L 20515293 3' - I-element 57 1 58.22 ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGGCTACCTATACACAGAGATGGCAGCGTGAAAAGTGAGAGAAACTCTTAGAGAATA:1 + chr3R 24499590 3' + blood 7330 1 60.71 CGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAAATATTTTATGTCATTTCTGTGCACGACTTTTGTGCGCTTGCTTGTAGTTGCCTGGGTGCTTCATGTTTGTTACTTTT:1 + chr3R 24425020 3' - jockey 4988 1 51.72 GTAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAACTGCTGCCGCCGCCTTTGCCCTTCAGCTCTTCAGCTCTTCGGCTCTTGTGAGCTTTTGTTTGAGTTTGTTTTGC:1 + chr3L 19497659 3' + X-element 4676 1 47.48 ATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACACCCACACACAGAGATAAATACACACATAAAAATTTAAACATGT:1 + chr2R 1000394 3' - HMS-Beagle2 74 2 69.18 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAAA:1 + chr3L 10469623 3' + roo 9037 1 56.59 GGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCACCAACCCTGGCGGGCAATCCTGGCGCCGGAAGTAACACGACACTGACATTTTAATTTAGTGCCAAGCG:1 + chr2L 4116228 3' + Quasimodo 401 2 52.74 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAAGCCAAAGCAAAGCGTTCGAGTG:1 + chr2L 17839489 3' + blood 7342 2 52.74 GTTAACTCCAGGGAAGTAAGTGACAAATTTATCAAAGTGACCTCTTTACCTGGCTTATGCGATATCGAGTGAAAACGGTATTGGAAAATTTGAAACAAATCGGTTAAAAAAAAACCTAAAAGTAAATAGCTGGAAGAAATAGTTAG:1 + chr3R 1267516 3' + Ivk 471 1 55.48 GGAAAGCATTGTACAGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAACCTACGTCGGTTATTCAAACAATCAGGCAGACGTGCCCCTTTGGATCCTCCTTCTCGTGGAAATTGT:1 + chr2R 6898951 3' + Tc1 368 1 64.84 TGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAA:1 + chr2L 17599965 3' - 1360 487 1 73.97 AAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAGGCCATAACTGCCATTAAATATTGAAAATATTTTA:1 - chr2L 7771940 3' - jockey 93 1 73.29 GACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTCGCCCTTCACGACATTTTCATACGCTTC:1 - chr2R 11263982 3' - jockey 4720 1 55.22 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTACACACCCCAATCCTCGATTTAATTGGCCCACTATATGTTTGTAAGGGGAGTGGCCCAAACAGACGTTGGCATA:1 + chr3L 2704863 3' + blood 7363 2 60.63 CTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTGCAAATAAAGACTGTTCCACTTGTAGACTAAAAGGGTATACTAGGGAAGGTATTCCCTGCTTTTCCGCTCCAACTGGTCAATTGTACAGTGTGATTAATGCGCAG:1 - chr2L 10604712 3' - Cr1a 4071 1 58.22 GCAGAGAGTCAATATTACAGATAATAGGTTAAGTCTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCAGGGTTTTATAAAACCACATTTGTTTTTAGAGAGATTTCTCCGATAGCATCATGTAC:1 + chrX 15089351 3' - Cr1a 4229 1 67.48 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGTTTAGCAAAACTTGAAGTTGAATGTATAAATGTAAT:1 + chr3R 6422894 3' - jockey 93 1 72.60 ATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAACTAATGTTTATTTTCACTGGGGCCCTGATACCCTTATCAATTGAAGTGCTCCAATCAATTAACGCTCTGC:1 + chr2L 5211158 3' + P-element 158 1 47.26 CATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAACACACTCTCGCGCAGTCGGAAACTTTCACAATAATGCTGC:1 + chr3R 6419123 3' + jockey 4639 1 72.60 GATCGCGGGGCGGGGGAATGCTGAGGAGGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAA:1 + chrY 3648880 3' + Stalker 7031 4 65.00 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCTATTTTCACTTGCCATTAAGACAAGCCAATAACATTTTCTTTATTTCAGCATAATGATGTTATTTAAATATATATATTATGAGAA:1 + chrX 21973949 3' + pogo 2067 1 61.64 GGGGTCGGGGATGTCGCGGATCGAACGGTGTAATCGATAGGCGTAGTCAGTATTTCCTGATAGTGATACCAATTGCAATCGCAATGGCAATGGGAATCCGCCAGAAGCGATTTCAGGCTGACAACTTCGCCGAGTGGAACAACGGA:1 + chr3R 5454644 3' + aurora-element 4035 1 47.95 CAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGATGTGGGGGAAGGCCATGGACATTGTCC:1 + chr3R 16997490 3' - G6 36 1 59.59 AACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACATGGCGCCCGTCTGTCGCTGGCTTGGGTCATTGCATTATTGATCAACTGCATGCCGA:1 + chr3R 24018417 3' + 297 317 2 65.07 CACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGTAATATATCGATATATTATGTATATATTTATTATAGACTGATAGTTGTTACTCCATTTTTTAAATGTCAAATAATGTTACGTTTAAAACTAGGACACAG:1 + chr2L 21355229 3' - Bari1 21 1 60.96 ACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCGGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAGAATATAAAAGAATTTTTATGATCGACATTTTACATTTAATTTAAGAACATCTAA:1 - chr4 310244 3' - 1360 3352 1 66.44 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGCGGCAGTTATCGAGAAAT:1 + chrX 12273149 3' - jockey 4709 1 59.09 AAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTCACTTCCGAGCG:1 - chr2R 7599164 3' - diver 5965 2 68.49 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGGATGTAGTATATGTAGATGTAATATATGCAATGTATATGGATGTAGTATATGTTGATGTAATATATGTAATATATATGGATGT:1 - chrX 15029565 3' + 297 357 2 60.96 ATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAACGACACGCCCATATCTTGTGTAAAATATGAGCGT:1 + chr3R 14912016 3' - Stalker 87 4 75.86 AGTTGCATAAAATTAAATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATAAAAAAATGGAACATATTTTATGGGAATTAAAACAAAACCTTCAA:1 + chr2L 13332701 3' + micropia 5369 2 69.18 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATTCAATTAATTGATAGAAAATATAACTAAGGGCCTATGTTGCTTTTTAATTTAAGTTGTTGTTTTTATTTAAATAAATAAAAATATTGTGTTCA:1 - chr3R 8140813 3' - pogo 23 1 67.81 TGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGGATTAATTTTTGTTTGCCGTGCACATGTGAGTGTGTGTACTCAAT:1 - chr3R 22341158 3' - hopper 122 1 76.71 TGGGCATAAAAAGTATATATTAAATATTTTAAAACACATTAAAGAGGAACTTTATTTTTCTCACATTTTAAGTTTAATTATGATTGATCTATTTTGTATCCATTCGTAAATGATAACCACTGTAAACAAAAAAACGATAAATAAAC:1 + chr2L 14277965 3' - hobo 2466 1 49.32 CAGCAGAAGAGTTGGAGGAATTGGATGGAGCTGCAGCCTGGCCAAAGCAGAGAGAGCCAACATTGACTTCCAAGAAAACAACCAAACGGAATTGATTGGCGACTACAAATTGGGCGAACAACACAGTTTT:1 + chrX 13838304 3' + invader3 484 1 52.31 CCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATCTGAAGCTGAAGCTGGCATTCCATTTGAATTATTCATTGCCAAGGCAGCCACATGGGATCGAAAGTGGA:1 - chrX 8219357 3' + opus 490 2 71.43 AAAAAAAAAGCTATTTCACAAGAATGTGAAAAAATGCTATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTAATTCACAATTTTCTAAATGCCCCCCACCCCCACTTTGGCTCAATGGAACTGACCTCATTCGGATTGGACTTGACTGTAG:1 - chrX 10187106 3' - copia 366 1 53.10 TCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTTTGCCGATAGCTTCTTCAATATTTATAAACATGGGCCAAACAACAGATAC:1 - chr2L 10514248 3' - 1360 33 1 54.93 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCACTAGAAGCGCATAGAATGGAACT:1 - chr2R 17332145 3' + jockey 4930 1 58.90 TGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTTCTCAAGATTTTCACGACTCCAGTC:1 - chr3R 10437047 3' + BS 5052 1 53.17 ATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCATTCATTGATGAGAACTAAAACTTTTACTG:1 - chr3L 19942822 3' + 1360 34 1 80.14 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCT:1 - chr2L 22319267 3' - Transpac 4982 2 60.27 ATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCC:1 - chr3L 13952770 3' - I-element 5160 1 57.53 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAAGCCCACAGGCACATTTAGTTATGCCGTGGTGGAAATATTTTTGCGAGCACAGCAGCAGAACAACGAAAACGGAAAAGTAGCACAACATGTCCAACAGGCGT:1 + chr3R 15920339 3' - 412 21 2 71.23 AGAGAATTTTTGGCCTTCGTTTGGAAAAAATTCAATTAAAACCTTTAATACAACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTTTACTTCTTCATAATTACAAGAATTAGGTCGAATCGTAT:1 + chr2L 10805188 3' - Tc1 333 1 75.34 GTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTCTTAGAAATAGGCGCGCACAATTTACGCGCGCACACACTCACACTCGCGTATGAAAGCAGGCGCACATATGGG:1 + chr3L 9467202 3' + hopper 1020 1 63.19 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAG:1 - chr3R 13225489 3' - hobo 47 1 57.60 AATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTAT:1 - chr2R 11095736 3' - diver 58 2 54.11 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTAATACTTAAAAAGGCTGAAGAATGACTAAAACTAAAGACTTTAGTACTCACCATATGAAGATGCTCTTGTAGGCATTTTCATTCGAGC:1 + chr3L 19999303 3' + 1360 3362 1 67.81 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTATTTTCATTTTTGTATTTCACCTCAAGTATCACACTGATAATAATTGATTAAAAATTTAATGAAATTTTGTAATGGTTGC:1 + chr2R 1373249 3' - pogo 12 1 77.24 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAA:1 + chr3R 12363797 3' - jockey 4750 1 66.44 ATAATAAAAAAAAAACAAAAAAATAATACAACGACCGAAAACGTGCCGATAACACGGTGTCGCACACTCCCCTCACTCACACTCCCCATCAGAGAGAGAGATAGCTGGGTTGCTTCTTTTAGCTGGGTTTAATAGTCAAG:1 - chr3L 74374 3' + Rt1a 5076 3 66.43 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATATTTATTTAAACGCTGTTCCCAATGTTATTTGAAAGGGGTTTTATTCAACTGCAGCTTGCATTTACACTTGTTCTGAATTAATATTCA:1 - chr2R 6913322 3' + roo 9039 1 63.01 TGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCATAATCAACATTAAATGGACATGATCTACAATAATT:1 + chr3R 10743823 3' - FB 87 1 78.08 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATAAAGCGAACACATGAAACTATTATTGATCCGATATCCCCCCTTTTCATAGTCTCTAATTATTTTAACATTTAGGAGTTTTGCAGCGCA:1 - chr2R 9607069 3' + pogo 2072 1 63.01 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGACATTAAATAAATAAAGGCCAACTTGATGCCGTCCTAACCAAATGTTATTC:1 + chr3R 18528405 3' - roo 28 2 61.64 ACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCACTTGTATTATAACCATATCGACAATCACGTTTTACATTTTTTT:1 - chr3R 9228145 3' + jockey 6 1 63.64 AATTATTATTAATATTAAATTACTTGAATTTTAAAAAGAAAGAATTTTGTTAGAAATATTTAACATTGAAAGCACTGGAAAACGAAGGCATTATTAATATGAGCTTCAATTTGAACTAAGAAATACAGAATACTAGGGACTTATAT:1 - chr2L 15243984 3' + gypsy9 5314 2 80.14 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCATTTCACGCACACCAAATACAAACAAACCAAACCAGATGA:1 + chr3L 15364931 3' + 1360 3351 1 57.53 ATGCTCATCAGGAGTGGCATCCAGTACACGGAGCTACCTGCGTTTCAGGAGGAATGGGCTATGAAAGGTAAGTCAACGCGGCGTATTAGCAATGTAATTTAACCCAAGGGCAGCCATTTCCAGATATAAATGTTTCTCTTTTCCAA:1 - chr3R 25541009 3' + G2 468 1 60.27 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAAT:1 + chr3R 12363799 3' - jockey 4748 1 65.07 CGACAGCGCCACTCGGTCGGTTGGTTAGTTTTGTAAATTTCTAACGGTATTCCTAAAAACTTTTTGCCACGCCCACAAACCGCCAAAAACTGCCTCGCCCACACTTTTTAAAAATGTATTTATCCTCTTTACCAATTAGCCTGAA:1 - chr2R 15824288 3' + Cr1a 4410 1 66.90 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTCCCTTTCTCACATTCTCCCATTCTCTCGTTCTCTCGCGCTTCTCTGC:1 - chr3L 19580856 3' + roo 398 1 74.19 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAAAATGTAAAGGAATTCAATTTGAAATGCAAACAATGCAGCTCACACACACGCATACTAACGCATACGAATGGGAAGTGCAGTAAAATGGCAATGGAACA:1 + chrX 19788925 3' - hobo 21 1 71.23 GAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATACATATTTATGATACTACTACTACATTTTACATTAAAATTATTGGAGAGCG:1 + chr3R 7481590 3' - invader4 62 2 67.41 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACTAACTAATATAATCAGCTTTGTTCCCGTTTTTAATAACCTAATTTTGGGACTTCGATTTTG:1 - chr3R 10150142 3' - 1360 57 1 58.45 GGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGGCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACAATGAAGGCGGATGTGTGTTTATGTGATTGTTTTTATTTGCAACAGCAA:1 - chr3R 5670336 3' + Bica 9 1 71.67 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCAATCAACGTCGCCGAGCACAAAAG:1 + chr3L 18183184 3' - Tirant 8136 2 59.63 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATTACTATAAATTTTTAAACCATTTCCCTGCCACGGACTACAGGTGCAAAA:1 - chr3L 13678846 3' - hobo 26 1 67.81 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTGTAAGAGAGTGTTT:1 - chr2R 17097480 3' + P-element 2834 1 38.71 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAAATGAGCGCTAAACGAGCTCGAAGCCTCCAAGAGCAGCACGATTTTTTTTGGGGCTGCCTGAAGAAAGCC:1 + chr2L 11405873 3' - 412 7 2 70.87 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGAC:1 + chr3R 28450731 3' - roo 8750 2 80.82 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGGCTTGAAAAAAGAGCGAGGAGTACACACGAAC:1 + chr3R 25050075 3' - P-element 38 1 45.05 TGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGCAGAAAAGTTAATTACAATATTTCATTGCTCAGACGTTGGTGGAGGGGCGGGGGCGTTGTAATTTTTATATCCAACAAATTGCCAACAGCGCATTAAACACAAAAGTAC:1 - chr2L 12144145 3' - transib2 10 1 77.40 GATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATGGTTATCCCAGCCAACAGTTACCAATTCTCCATACACAATGGTTTCCCGAAGGGGGCGAATGTATGCGGAATTGTTTTATTAT:1 - chr2R 18344068 3' - 1360 3368 1 60.27 CTTGCGGGAAGGAAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTAC:1 + chr3R 19450181 3' - Max-element 8351 1 53.42 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTACCATTTCATAACTGAAGTGAATATATGCAATCACTCATTTATTCATTATTCATTATCTTGTTTTGGCAGAGAGCTCTTGCTGCAATGGCGGCAATG:1 - chrX 5634002 3' - jockey 4705 1 67.16 AATATAAACAAAGTGAGGAAATGTTAAATTGTTGCAATTTTTATTAATTTAAATTAATGATAATGAACAATATGACAATAATTATTACCCCTCCTCTAGTAAGGCATATATCATATTCCAAGGAAATTAAGAACTAGAATATTCTA:1 - chr2R 22683998 3' - Transib5 2630 1 75.34 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATAAGAGCCACTCTGTGAGCTACCCACCGAAGCACCACTGTGGATATCAGGATATCCTGGGCCAG:1 - chrX 14329164 3' - jockey 4719 1 53.68 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAATGACGCAGCACATCCCCGTTTCTCTCCTGCGACCTGCTCCACCGATTCTTC:1 + chr3L 8658853 3' - roo 26 2 68.49 TTTATTTATTTAAAATTGTCCATGAAACTATTAGTCTAGATAATAAGGATAACTACATTCTAAGAAAATAATTTGTTACTAACTTGTATCCCTATGTTTTTCTTAAATTCATCCGGACTAGCTCCCGAAACTCAGTCAACGTCCAA:1 + chr3L 9948992 3' - G7 1138 1 50.00 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTATTTTTCA:1 - chrX 3267046 3' - opus 26 4 67.81 AAATTCACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAATGATTCCTGAATATTTATTTTCGGGTGCGCTCTCCAAGCTTACTTAGTAATTATCGCAATTAGCGCTTCCATTCTATCGATTCAAATTGATTGC:1 - chrX 18022809 3' + G4 3810 1 65.00 ATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACTGTATGGTGGTATAAAAATCTGATCAATGCAAAAGCTGAAATATTTCTGAAATATTGGTCTGCAGTG:1 + chr3L 8694476 3' - frogger 2302 2 50.78 AAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATGTTTAACATTGTTATATTATTATTTTTGTTAGGCTTTTATAATTTAGTATTACGTGTCAAA:1 - chr3R 6293845 3' + pogo 1906 1 69.18 GCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCACACAACTGTATGTGTGCACACGGATGCTCGTGCATTTTAAATGTGACAAAATATGCCCTTCACCTTTGATGTAAATGTCTTCATTTTTTTCAGCTCCATTGGTTT:1 - chrX 12877668 3' + 1360 128 1 67.81 CGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGCTTTATCTTTAAAAAGTGTAATATGATTTTAACTTTCGATCTATTCTTT:1 - chr3R 7583682 3' - Doc 359 1 66.44 TATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCTGTCCCTGAAAAATACATCTAAATTCCAAATTTCAGCAACA:1 + chr3R 7778375 3' - transib2 37 1 57.53 GACTAACAACAGATTTTGTTTGTTTTCACTTACTGCGAAGGTCAAGAATGATTTTGTAATAACTTTGCATTACTTATTAGACTTCATGTATATTACTAATCTAATTTTTGTAATTTTTG:1 - chr3L 5343507 3' - jockey 121 1 58.82 GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTCTTTTTTTTTAGATT:1 + chr2L 21643151 3' - Tabor 6878 2 58.22 TTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTGACTGAATTGAATTTGGTTATTTCCAGTATTTGCACGTTTCATTTCAA:1 - chr3R 14070654 3' - Doc2-element 217 3 69.01 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGC:3 + chr3R 25751894 3' + roo 351 2 59.59 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGAAATGTTAAGAGAAAGTAACTGCTGATAGCATTT:1 - chr2L 4929790 3' - blood 7064 2 54.79 TTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCGTTGGATTGATGTTCGGAAACTGAGTCATCAGTGAAGTTTATCTCGAACCCCCTGTTTC:1 - chr2L 21153425 3' + 1360 3381 2 80.14 ACAGTTCAACAACGCTCTATCTCGCTTGATACATGCTGGTCCGAACTCACCACAGGACAAGCATTTGTCTCACTCTAACGCATCGTCGAATAATCAGCACAATCTGCGAGATATCAGTGAGCGGG:1 - chr3R 23705062 3' - invader6 246 2 72.00 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGTTACACGTTCGTGCGAATATACAAATGAGAAGTAGGCGTTGTTCGTCTTG:1 - chr2L 22719548 3' - 1360 39 1 58.22 GATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGA:1 + chr3L 21093234 3' - Ivk 61 1 60.27 CTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGTTCTATTTAAAAGCAAGAGATAGTTGTGGAAATAAGCAATCTTAATGG:1 - chrX 17425195 3' + R1A1-element 5048 1 67.12 AAATAAGGTAAAAGGAAGCGGACCAATGTGAGACCATTGGGGGACACCGGATGTGACTCGGAGAATACAAGATAGAAAATATATAGAAAAGGATGTGTGTGTTACCCCAAAAATGCGACCAAAGGAAGCTCAGAAAAAAAGCACAC:1 + chr2L 1838932 3' - Q-element 510 1 54.79 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCATAAGAACTAAAATACTTAAAGGCATACTTATAATTTCCAGAAGAGGATAGCTATACATTAAAAACTCATATGAATAAAAATATGTAA:2 + chr3R 14954138 3' - jockey 4759 1 40.41 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAGAAAAACGCAAAGCCAGAAAGATACAATTTGCCTTTAGCCAAACAAGTTGGCCGAAAGCAAAGCAAAATGGCCCAAAACAGACTGGACAAGCC:1 + chr2R 8177849 3' - FB 30 1 63.01 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCGAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATGGAGCCGCAGTGTTGCGGTTATGCAATAAAATGTTGCATTTTGCTTTCGGTTTGCCAAACGCCTCGACCAGAATA:1 + chrX 14743044 3' - FB 46 1 54.11 AAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAGCCCTCGAACCTCAGCCACCTTTTCTCCCATACCATTCTGTGTTTCTTCTTTTT:1 - chr2R 19853629 3' + Transpac 4956 2 63.28 GTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTACGCTTTTCCGGTTCTGTTTTCTTTCCCTTCACCTTGCCGCGACTTTTGCGAGTGTCCGAGGCATGCAAAAGCTTTTCTAATACCAAAGA:1 - chrX 3033062 3' + 1360 3107 1 60.96 AAATACATATTTGTTACTTTAAGGCAATAGGACCAAAAGAGGACTTCTTAAAATCAAATAGCATTTCAAGCCGCATTGATATTGAAATTATTTGATTATAATCAAAGAGAATGAATCTAGATTTCTGTCCAATAACACTTTATTCT:1 + chrX 19121186 3' - Dm88 4277 1 78.77 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCGTTTAGAATCCGTTTTGCAAACCAAAAACTTCTATTCATTGAAATCACTTGTTCGACATAAATGACCGAAAAATTGGGTCAATCACTGGCCGAACCTTTC:3 + chr3L 14167478 3' - mdg1 7059 2 71.23 ACATAATAAAAATCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAATCTGATATATGATATTGATACAAAATGCAATCTGTGGCATTCATTATAACAGAT:1 + chrX 17803886 3' + hopper 1134 1 61.64 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAATAAAGC:1 - chrX 21403398 3' + roo 9002 2 63.01 GTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAAGTGCAAG:1 + chr3L 25232920 3' - GATE 37 2 54.78 AAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGATGTAATTGCCAAACAT:1 - chr3R 11151778 3' + mdg3 213 2 63.01 TCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCGAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCACCGGAGTAGCGCTCTCTGGTTTGTGTGTCCTGGCATAATTAAGATTTTAATTTATGCAATTAT:1 - chr3L 10308034 3' + BS 4667 1 51.13 GGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTT:1 - chr2R 5070919 3' - gypsy5 26 2 26.03 ATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTAGTGGACTTTGACAGCCGTTTTCGTTTTCG:1 + chr2L 16341445 3' - I-element 5197 1 79.31 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGAGTTAATATGAAATGAATACGGTTTCCTTACTATTCGTATACCTTTTACTTCCTTTAATTTACTTTTAAAACTCTTTCCTTTGCTTTGCCTCGCCTCACAAATCATT:1 + chrX 8977577 3' + I-element 5342 1 75.34 GCTGAGAAACGGGTATCTGATATTCGAGGAACTCGACAATAGCGTTCTCACTTGTTTGTTAAAACTTTTGGAAGTAATTCACACATTGTCACACATAAAATGTCTTGTACTAAAACGTGGGCCGACGTAAGCATTTTGTCCTCTGC:1 - chr2R 8517341 3' + INE-1 546 1 74.66 AAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAATAAATAAATTATCTAACTAGCCTCAGCTACTAAACGGCTGAACCCAAAT:1 - chr3R 6816719 3' + Juan 4134 1 71.92 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGTAAGCCCCGGCGTCCCAATAACTCAACACAATG:1 + chrX 17236654 3' + mdg1 406 2 77.40 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGTTTGATTTTGTAAACATTTACTTCCAATCAACGGCGTTCAATTAATAGTGTTGCTAT:1 - chr2R 9294263 3' - Tirant 10 2 79.14 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAA:1 + chr3R 8217987 3' + P-element 2854 1 36.14 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACGAAAGTTGACAGGGCGGGGAATGAGCTACACTGCTGTAAAGCAACCT:1 - chr3L 10469525 3' - roo 8729 2 66.67 GAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATAAATATAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGAGGGTTAGCTAAACCCATTTCCCGCATTTCCCGCCTTTCCGCCCTCCCGCAA:1 + chr3R 6141062 3' - 297 14 2 50.37 TAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAAACAATCG:1 - chrX 21087544 3' - mdg3 33 2 60.00 AGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTAACAACCATAATTGTCACGCCCACACACAAAATAATCTCGACA:1 - chr2L 18111191 3' - transib2 2789 1 70.55 GAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGTTAGGTTTTGTAATAATATATAATAATGATAATGATATTTACCAAGAATATGGTTCTTTATGGGTGTTTATTATTATGAAATTTGTACAAAACTTG:1 + chr3L 13987298 3' + diver 198 2 60.27 ATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATGGTCGTGAATGTTAGAATCTTACTAACATTTTATTTGTAGGTCCGGAATCTGATGATGAGCTCAAGAAACGGTTGGAGATAGAAAAATTACTTAATAA:1 + chr2R 4672314 3' + S-element 112 2 70.55 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCCTGCCCGCTCCAAT:1 + chr2R 25106113 3' + roo 354 2 65.55 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTTTCAGGCCCTTGGGAAT:1 - chr3R 26485992 3' - 412 7086 2 61.64 CATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATGCCAAATTGAACTTTATAAATGTAATGGAAAACAAC:1 - chrX 10047334 3' + I-element 5274 1 72.60 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTAATACGGTAACTCCAGGAAAACAGCAAAACGGCAAGCTGCGATCAGTTTTGATTCTTACTTCGCAGCGAGAAGTTGTGA:1 - chr2L 8984836 3' - pogo 32 1 62.14 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATTGTTATTTTAAGATCGAAAAGTTTCATTCTTTCCGCACTTGATTC:1 + chr3L 18484515 3' - hopper 22 1 69.86 GAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACACCGCCCGTGTCCTTTTTAGCGACCGCTGAATAAATGTGTTTGGCTTTTGTCAAGGATTTAGGCGG:1 + chr2L 12281917 3' + Tirant 8402 2 55.48 GACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACCGAACTAAGACAGCAT:1 + chr3L 21093281 3' - Ivk 14 1 76.03 TTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGACGGTAAGAATCAACTTTCACAGCGTA:1 - chr3R 8042270 3' - BS 23 1 58.90 ACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAACAAGCAGATGTATCTGCTAA:1 + chr3L 3453695 3' + Tirant 330 2 66.44 TCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATAATCAATAGCAGAACATCAGAGTTCAATGATCTATGCTAGCTAAGCGATATCAGGAATTCATTTGGGTCAGTAAATCGATAAAAACACAACTTCACTATCTT:1 + chrX 1095319 3' - pogo 1765 1 65.75 GAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAAATACAAATCTGTGGCAAGTGTCTCTGCCGCAGCAGCGCTTGCATCACCATTCA:1 - chr2R 8244823 3' + Doc 4619 1 62.50 ATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACACCATCGGTGCCCACGGACCATCAACCAGCTGAGTGTGTTGTTTATGGGTTCGTCTTTAT:1 + chr3R 7616006 3' + Stalker2 7445 2 59.59 ACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATATTGAGTGATTCGATGGGGGTGCTCGGATAACTATTGCATTGCTTTCAATTCAC:1 - chrX 12988864 3' - opus 492 2 63.19 TTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATGAATTTGTACATGGCATCGGGTAAATCCCTCTAATAATCCACATAATAAGCACTGGAAGTAGCTGTGGCAGCAACAGGCCGAAAGGGTTGTGCCCGGTTTCCCTTGTTTATAA:1 - chr2R 13375008 3' - jockey 4849 1 77.40 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTGATGGATTACTCTCGTTCAAATGTCGAATCTTGTTAGCACAGCTTCCCA:1 + chr3R 7616863 3' - Stalker2 7263 2 74.10 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGACTTTAGTTGACATAACTTTTATAATAATAATATAATATAATCAAATCCTCATTACAGTCTATGTCTTCATTGGGGAGCACATTGCCATGGTGGACTT:1 - chr2L 11143059 3' - 1360 22 1 67.59 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATGGAGCCGCAGTGTTGCGGTTATGCAATAAAATGTTGCATTTTGCTTTCGGTTTGCCAAACGCCTCGACCAGACTAAC:1 + chrX 14743046 3' - FB 40 1 55.63 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTC:1 - chr3L 19580902 3' + roo 329 2 71.23 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGTTCACAGGTCACTGTATCAGTATATCAATGCTCCACAACCACCAACACACCAACTTGGAAAACTAAAACAGCAAACTTGGCTCGAA:1 - chr2L 3960125 3' - jockey 15 1 79.45 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAACGCTTGTAAAATATTACAATCGTGCGATCAAAGTAAAGGAGTGCTTAAATATAACAATATTCTTTA:1 - chr3R 11944820 3' - roo 8718 2 56.85 CATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCAAAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGATCAATCGCATGTCTGACAGAGTGTAGCATACTTTTCAGCACTGCCTAACATTTGTCAGCTATCTGCATTTTT:1 - chr3R 16582442 3' - BS 4987 1 72.60 AACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCAACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACACATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTGCCAACAACGAGCTGAGAAAGCTAAATCGATATACATTTTAAACTTTAATAACATAAATT:1 - chr3L 15027907 3' + F-element 264 1 61.64 GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACCAATAATATTCATCCAACAACTTTTGTTCCATAATATTTCATTCCCCCAGAACCTTTAAAAATTTACGAA:1 - chr2R 21870145 3' - copia 4919 2 52.74 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATGGACCGTGAACCGTCGTCGAGTGTGTGCGTATTCACTCTCTGTTTGCAG:1 + chr2R 17332213 3' - jockey 23 1 57.78 GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAATAATTATTAAAAATTTAATAGTTGTCTATTTAATACTCAAATCAATGCAACTGTCATAA:1 - chr3L 16015159 3' + 1360 3385 2 56.85 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGTACGG:1 + chr3R 12363805 3' - jockey 4742 1 60.96 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGC:1 + chrX 7706816 3' - P-element 63 1 33.33 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTTCAATATGACTTTCAAACGCCGAAGCTAAAATGAAAATTTAGCTTATTAAAATATGAAAAATGTT:1 + chrX 20975849 3' + copia 234 1 54.79 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACGAAAGTTGACAGGGCGGGGAATGAGCTACACTGCTGTAAAGCAACCTTATGGAATAATTATTCAAAACGCTGAGTTTGTGC:1 - chr3L 10469491 3' - roo 39 2 58.90 ACATGTATATGTATATACAATATGTACAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGGATTCATTCAAATAAAACGAGGTCCTGCAACGAAACCTGATCAGCCGGAGGCACTTTTCTAT:1 - chrX 369257 3' + Stalker2 7504 2 73.05 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATCTATGTACGAGTATCATGCAATTTGCGAGAATGTGTTTCAAGAGAA:2 + chr2L 17626730 3' + roo 394 1 76.03 GTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACATGACCAGTTCGACT:1 - chrX 14061526 3' - INE-1 561 1 54.76 GTGGTGACGATAACATTGCCCGCTACCTCTTATAATGGCTAAAGCTTTTATTTATGGCTTTGGCAATCCAATTTTTCATATTTTCCCCATGCGCAGGAATTTTGTCCGTTCGACCTCCGTGCCCTTGGCCGCCTCGACTCCAAGGT:1 - chr2R 4897436 3' - gypsy7 5162 1 29.45 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTACCATTTCATAACTGAAGTGAATATATGCAATCACTCATTTATTCATTATTCATTATCTTTCTAACATTCACATCTTACCTTTTTTTTATTCAAATTTTTT:1 - chr2L 13119762 3' - jockey 4713 1 36.30 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTTTTTCTGTTAATGAAAACAGTGTATTTAAGCTTAAATCAGAAACATTACTCCTTAACCCATTTTAATTATTGAAATTCTAAACAAGTATTTCTGCATGTGT:1 + chr2L 19691377 3' - roo 19 2 70.55 CCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAGCTCCACAAGATGTTACTAGACATCCATGTCTCTGCTCACCCTCATTGAGTGGCGCATTAGACT:1 - chr3L 8848777 3' + I-element 5299 1 56.16 CCAGGGAATGATGATGATCTCATAATTGTTATAATGTTAATTGTTATATTTGTATTATTGTTTTGTACAGCTAACTCTTGTTAGCCGGTGCGCCTGCAAGGGCTGAATTAATATTACGGCTAATAATGACAATTGATTAAACGTAA:1 + chr2R 21448019 3' + BS3 1611 1 77.40 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGTAAGCCCTTTTAACGGCCAGTGCGTGATTCTTCTGCCGGAGAAATGGC:1 + chr3R 30264127 3' - blood 7028 2 69.42 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGCAAGTGGAGTGGAGGAGCCATGGAAAAGAACTA:1 + chr2R 21439537 3' - jockey 58 1 48.63 GTCACCTATTTAAACCGAAGATAATTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAACCATCGCTGGCACAAGGACCCGCTCCCGTTTTCTTGGCACACAGGGAGCT:1 + chr3R 14218517 3' + roo 9004 2 62.86 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTTACCTACTTACATAGTTGTAGTCCAAGTTTGCGCTCTGAAAAGTATGCAACAAATTACGACAAACAGACTTGCATTTGCAGAAAGATTCCTTGGCTAACTTTACCTTCATTGGC:1 + chr3R 27374534 3' - jockey 14 1 78.08 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAGTACTAGAAAAAACCTAATTTAACCCAAAAAATGTAAAAAGGTATAGAGTTCCGATCCTGCCAGGAGT:1 + chr3R 8140964 3' + pogo 2052 1 53.10 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGCAATCGACTGCAGAGACCATAAATTTCGATGGGATATTTAATAAAACAGA:1 + chr2R 15070163 3' - 412 71 2 66.90 GGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACAACCCGATCAATGGCGAGAAATCCCTAAGCCCCAAACAATTTACGCACATTTGCCA:1 - chrX 20975746 3' - copia 64 2 61.64 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGGCTACCTATACACAGAGATGGCAGCGTGAAAAGTGAGAGAAACTCTTGGAGAATAAACTATAATTATATCAACAATATT:1 + chr3R 24499614 3' + blood 7348 2 54.11 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTATATTTTGTATTTTTAGTTCTCCCCATGTAGAGTCTCTTTATAGGGTCGTTTCCCATTCTCTTGAA:1 - chr3L 2192272 3' + jockey 4932 1 56.16 TCACATCGCGGGTACTTACGAACACCCAGTCAAAATCTGCATGTGCAGGCAAGCTCCCGGGTGTTTGCGCACCCGAATCAATTCGGGACTCTGCGTCGTGTGTGCCGATCACCTAGACACCCGGTGTTTAGCGGGTGGACTTAGAG:1 + chrX 22765933 3' + hobo 78 1 74.66 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCAC:1 + chr2L 19652600 3' - roo 8745 2 76.03 ATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTAGGCTATGATATGTGAAATATTCAAAATACTGGTTGAAGTAAAATATACGTAGAAAGGGTAGAAATATGTA:1 + chr2L 5270429 3' + jockey 4987 1 78.08 TACATCTACATACATATTACATCCAGAAGCCTTTCAGAGTAATCTTAGAAATATTAAAGGAGTTTAAAGGAACATTGTTCGAGACTGAACAAAATATTCCACACATTATTGACGTTTGTATAGAAAAGTTATCAAAGAAATATAT:1 - chr2R 4619027 3' - Dm88 15 2 71.03 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACATAATTAGTCTGATAGATGTAAAATTTATTAAACAA:1 + chr3R 6413690 3' + 1360 3370 1 72.60 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACGTTACGAAACAAGAGAAATGACAA:2 + chr2R 20447907 3' + hopper2 1557 1 50.68 CGGGGAACTCTACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTTTATTTTTTTTTTATTTTATTTCCATTCCAATTTCCAATTTTATTTCCATTTTATGTTCCAGAAAATGTTGCATTTTTTACTAGCACTTGCAGTAGCGAAGTA:1 + chr2R 5741240 3' + INE-1 570 1 75.71 GTGTGAGTAAAAATAAGAGACGAGGGCGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGGTAGAAGACGTTATTAAATTATTTTTACGCAAATCTTTTTTACGCATCCGCCGTTTTGAATATGCAAAATTAGGAACAGTAACTATTTAGGCAGCCA:1 + chr2L 18393102 3' - 1360 3242 1 58.90 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGTCTTGGGTTGAGGGGCAGGTTTTCACCGGGTCAGAGGTGCAGGCG:1 - chr2L 12486339 3' + roo 340 2 68.12 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTG:1 + chr2R 10910298 3' - Tabor 6892 2 59.06 AAAGCAAAAACCTCCGCGTGCTCTTCAGTCCTTGCTTGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCTTGTGCGATAAATTTATGTTTAATTTAGGAAGAGAGTAGGGATTTCCCCAT:1 + chr2L 1528591 3' - Rt1b 5026 1 65.07 ATTAAATAATATAATAAACTTAAAGGGGAGGGATCAACTTCATAATGGAATTGGTAAAACATAACATAAAAATTAAAGTCAATTCTTTTACTAAAAATAAGGAACACAATTACTTAATCCATTTGCCAAAAGAAAAGTATGTCATC:1 - chrX 21963288 3' - transib3 2667 1 61.64 CACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTGGAGTAGAGTTATAGTGTGGGTAGACACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACACATTGCAGCTCGAAGTGTTTACTTGTT:1 + chr2L 1361015 3' - Stalker2 44 2 53.91 ATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAGTTAAGAAAAAAAAAACGACTTCTTCAAACATTTCTTGTTTTGTTCGCAATAACAGCCTTTGCCCATCCTTAGAATTTAGAGATAAGACGCCGAGTAGTTTGCATTTACAATAAAATTGCGT:1 + chrX 1022607 3' + FB 126 1 63.01 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAACTTCTCAGCTCTTCTACG:1 - chr3R 7450273 3' - Doc 38 1 40.28 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAATGGTTTTATAATGCAGACTAAGCTAAACCGTTAGCTGCTCTAGTTTCTGGCTTGGATAATGACAGATTG:1 - chr3L 458817 3' - Juan 4045 1 52.74 CGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCTTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTCCACGGTGGACACCGCCCCGCTCACCCGCTGGCCGAGCGGCCAAAATCGATGCCCCAAC:1 - chr2L 2800037 3' + invader4 4 2 49.59 GACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTACGTGGCAAGTGGAGTGGAGGAGCCATGGAAAAGAACTAAGAGTTA:1 + chr2R 21439544 3' - jockey 32 1 59.38 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTAAATGGAAGTTCAGCTTTCAGCTTGCCATTTGGGAAAAGCCACCACTGGCACCACCCCAAGAGTAAGAAATCCCGACACCTGAGCTTATTGATTTGTCGCTGGAATCCAG:1 + chr2R 19852297 3' + Transpac 5221 2 78.08 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACGACCGACTGTTGCTCCTGGCGGTCCTTCAACAGAGAGAGAAATGTATTTTAAAACTACTTTA:1 - chr3L 2704744 3' - blood 7070 2 57.53 ACTAATTAGAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCACAGCTGTGACAAATAAACGAAAACGTGCAAAGTGAAAATTTGATGAGAAATCAATCAAATGTATCCTTTTTG:1 - chr3R 779373 3' + gypsy4 394 1 64.22 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAACCTTTATGGTGTTTAAAGCAG:1 - chr3L 15364796 3' - 1360 48 1 52.05 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCTGCTTGTATGGAA:1 + chr3L 10469599 3' + roo 9037 1 60.95 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGCTTTATGGATT:1 - chrX 7756422 3' + roo 319 2 78.77 TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCA:1 - chr2R 22746088 3' - jockey 4836 1 74.07 GAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATAACTACTATCTTGGGCAATTATAGCTTCTCGGAAACA:1 - chr2L 22689965 3' + Tabor 7238 2 78.08 GTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAGCGCGAAAATTAATCATTTTTTTGATATTTTCTGGATAGAAATTGGGAAAAAAATGAGAAAAAAAAGCCAAATACTCGAAATGCCATCGTCATGTAATTTAATGGGAGGGAATCCACCAATT:1 - chr3L 14833463 3' - INE-1 534 1 43.84 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTC:1 + chr2L 15777900 3' - 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Ivk 66 1 62.33 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACTAAAATAAATGGTAAAAAGTCACAGATTATAATCAAAAAAGTGTACTGATTATTGTATCAAATAGTACGTGGTCAATACGACAACATGCTATTTTCTCAGTGCAGATT:1 + chr3R 12744784 3' - Stalker2 7263 2 61.64 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAACAAGAAAAAAGCTGAAGA:1 - chr2L 17295791 3' - Doc 19 1 67.81 TGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTT:1 - chrX 21087565 3' - mdg3 41 2 52.74 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTAACCCCTGTTGAGAGGCGGCAGGATTCTCGTCAGTTGTTTGCTTAAAACAAATTACAAGCAGAGTGAGAGAAATTAATGAACTTTAAGCCAGGCCAAC:1 + chrX 7742018 3' - hobo 22 1 69.18 GACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAATCATAAAATATTGGTGTAAGCGGTCAAGGGATATATTTTCGATAACACATTTCAACTCAACACACAATAAAATTGTTGT:1 + chr3R 20873697 3' + roo 8950 2 54.11 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCAAAATACATTTGGAGGAATTTGTAAA:1 + chr2R 11256280 3' + roo 9034 1 57.93 TTCTGATTTCGTTGAAGGAAATAGGAATCTTTGCAACAGGTACTGTACGTATGATAAAGTTGAACATTGGGTAGTTTTTGGAGAAAGAGGACGTTGCAGACTGTGCAAAACTTAGCGAATTCTGGGTTTGTTTTCATGTAAGAAAG:1 + chr2L 21084782 3' + looper1 1457 1 76.71 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCCATGTTAATTTCGAGCAATTATTGGACAACCCTTTCAGATTCCAGATATTATAAGGAAAAGGAAACTTGTG:1 + chrX 16994603 3' - 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BS 19 1 69.85 TGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACACTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCTCATAAAGAG:1 + chrY 3648918 3' + Stalker4 194 4 54.11 AGGATGGATTGTTTATTAACGGGAAGCTCGGCTGTCAAACGACAACTGCCCCAGTCGGTCTGGACTTTGGAAATTAATTTCCTTATATTGACTTTTTTCTTTCTGCTCCACCATTCCCCCGCCGCCTTTTGTGCACTCCC:1 + chr2L 12768563 3' - Circe 314 1 70.71 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGCTATTTAT:1 - chr3R 11870063 3' - pogo 55 1 59.59 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATATTTGCCCACCTCGTATTACATACCCACGACTTGCCATTATCGTTAAGACA:1 - chr3R 13437098 3' + hopper 1411 2 72.60 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAATTAATCAACAATATTGACTTAAAGCTGTCAACTGAATTAAATTA:1 + chr3L 11396000 3' - I-element 74 1 68.49 TAAACATAACATACAATGTGATAATGTTACCAGTCCATGTTAGTCTAAATCACATTTACCACTCGAACTCACCTTTGAAATGTTGTTTTCATATATTTTTCTCCACTCTTTCTCTCTGTCTGTCTCGCTCACACCGACGGGCGGC:1 + chr3L 8441384 3' + TAHRE 10200 1 56.55 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGATCGATGGAAACCGGTTTCTGTGAAAAGTCTTTGCTTTCGTCTAAGGAGAAAAGTTGCCACGACC:1 - 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chr3R 17099855 3' - Tirant 25 2 69.86 TGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAAGCATACATATTTATGATATATGTATGTATATATATTTTTTT:1 + chr3R 8112151 3' - I-element 79 1 70.55 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCAAACCGTAGCATATTTAACAATAACAAAATGTAGCATACATTTGAGGGCCGCCTGTGGAATGGAAAGTGAGAGAAAGAATGTTATTGTGCGAGAGCACACTTTTCC:1 + chr3L 2216671 3' - jockey 22 1 73.29 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATATGTAAGTTCCACAGAATGGAAAGGTCATCCCTTACATAATGGCCTCATTCTTCAGCTAACCAACTTTATGAAGTTCAGTTTCCAT:1 - chr2L 21691785 3' - 297 27 2 66.44 GAGGAAACAAAAAACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTATACTACTGCACAAATCGCAAAGAATCATTCAATAAGTGAATTAAATGCGATAAGTACTGACTTAACTTAACTTAACTGTCTTAGTAGTTTTAA:1 - chr2L 12571697 3' - Cr1a 201 1 54.79 CAAAGGGTCAAAACCGCTTACACAGCTTAAGTTCTCGGCTGATGCATTACCCACTCCGACAAGAAGGAAGCTGGCTTGGTGCCTGGGTCCAACTTGAACGCACTTAACTC:1 - chr3L 24150115 3' + Quasimodo 6945 2 60.91 AGCTCGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTCCATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAA:1 + chr2R 5045664 3' - invader6 4560 2 65.07 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGTTTGCAATATAAGCTAATCCGTGTGTTCTAAGGGAAAACATAGGGGTTCAAGCGAGTTTTCGCAACGCAATTCGGGGG:1 + chr3R 13225602 3' + hobo 2921 1 64.00 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCAAAGCCCAGTAGAAAGCTATGGATGATGAAAATGAAAACATTAGTATGGAAGTGGTGG:1 + chr2R 5754634 3' + P-element 2872 1 76.12 CAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAAGACGTCACTGTATAACTATACAACAATCGTCTCAGAATTCAGGATACTCCTATTTTTCGGGAGCTCCTCTATGAACGGAAGA:1 + chr3R 2999858 3' - McClintock 52 2 52.74 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTG:1 + chr2L 17260776 3' + P-element 2843 1 28.57 TAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGAATTTTAAATTTTATATGTGCGTTGATTTTTTATGTATGGTGTATTTTAGATT:1 - chr2R 1000307 3' + HMS-Beagle2 7132 2 60.96 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATATTTATTTAAACGCTGTTCCCAATGTTATTTGAAAGGGGTTTTATTCAACTGCAGCTTGCATTTACACTTGTTCTGAATTA:2 - chr2R 6913329 3' + roo 9032 1 57.53 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGACCACCGACCGACCGCTGACCATAATTCACTCAAGTTAGACAAAAGCATTTTGGTTGCCC:1 - chr3R 21341318 3' - hopper 43 1 53.49 AAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAATTATGGCGAATAGCGAAGGAATTTTGTGTACATATTTCATTAAGATAACACTTAA:1 - chr3L 16917508 3' + roo 351 2 57.53 TATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGACAGAATATATATGCTCAGAAGTGGGTTTTTATATTTTAAAAAGTATAACCTTAAAATATTTATAATGTCAAACTTAATGTAATGTGTAAAGATGTTCTATCTAATG:1 - chr2R 15329907 3' + invader4 2655 1 76.03 ATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGGTTTCTCTCTGATTCGTGGTAAAATACATTGTGTTCTCTTTTGTTTTTGCGTAGCACCAGCGATTTTTAAGTAATTTTTTAAGTAATAAAAAATGTAATGTATTTCTAATTAATTGTG:1 - chrX 21315328 3' + INE-1 560 1 69.18 ACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCGTTGAATTCGACGTTCATTCAGACAAATATGAATCTCTTTAACAAATAAATTAATAAAACATTACAACAATGTTTAGCCACGGAAATATTAATCATGGATTGGGTAGATAATACAACGATGGAA:1 - chrX 22646144 3' - INE-1 157 1 62.33 ATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAGTAGAAGAAGCAGCGCTGGCAGCGACGCCGACTGCGCTGCCTTGGCGCTCGGGAACTTGGAGCCCGGTTGCCGATCGGATCGCCAGAGG:1 + chr3R 31724979 3' - P-element 8 2 75.00 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGTATCAACATATTACGGCATTTATGGTAATTTTATTGGTGCTTTGATTCAACAGCAGCATGAATATTTATAATCTTTGAATAAATTTGTCTGCTCG:1 + chr3R 10150277 3' + 1360 3364 1 68.49 GAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGTATACTGACATAGTACAGGAAGTTCGTAATAAG:1 - chr2L 18630458 3' - G-element 48 1 54.62 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAATAGTTTAC:1 - chr3L 12433433 3' + roo 331 2 71.92 TAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTGCGA:1 - chr3R 6413561 3' - 1360 52 1 63.20 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCATATAATTTTACAAGCTACTACTCATATCTAATTAGTGTACCCAAACTAAGAAATACCGTCATTTATTTGATAAGGAAACTAAAACTCTAAAACTGGTAGATTAGTCAAAA:1 + chr3R 7664625 3' - I-element 11 1 74.66 ATTTAGCTCTTGTTTTTTATGAAGCTCATTTAATCGGTTGCTCAATGTCGGAATTCGAATGGGCCATTCGATATGTGATTTACACTTGCGATCAATTGTACGATCAATTGTTTTTTTTTCTTTGAGTGACACATTTCGCTGCACAA:1 + chr3R 26928240 3' - HeT-A 273 1 69.86 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAA:1 - chr3R 4679425 3' + hopper 1391 1 64.93 GCTAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAAGCAGAAAAATGTTGCCACATCTTGATTTCTTTTTAGTCGAAATCACCATTTAAATAGCTCGCTTATGTCATCGCCGGTTTATTGTTCCTGACTACAAATGGTGCCTTGT:1 + chr3R 4678197 3' + hopper2 1279 1 77.40 AAAAAAAAAAATTGGAAAAAACCAAAAAATTTGAAAAAATCATAAACGATAGATTGCGGTTCTAGAAAGTTATTAAT:1 + chr3R 20273625 3' - FB 173 1 83.12 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAA:1 + chr2L 3231979 3' + roo 360 2 50.68 TTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAAATGGATCGGCGTTAATAAAATTTAGCCATTGCA:1 - chr3L 27415167 3' + transib2 2810 1 76.03 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGTATGTAGCCAGTTCATGTGCACATGGCAAATCAGAGCTAATGATGCTGCCACGG:1 + chr3R 12609279 3' - 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1360 3220 1 71.03 GGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGATTGATTTTTGGGGTCAATCAAGAACAGGTTGGAAAAACTTTCCTCTGCATCGACTCGTATGCAAATGAT:1 + chr3R 12228494 3' - roo 8903 2 52.74 TCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGAGAAAAATATTCATAAAACACGGAAAGCGGAAA:1 + chr2L 21910288 3' - Doc 12 1 76.03 CTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGGTTTCGCCATCAGACTCTAAATG:1 - chr2L 12291820 3' + Tirant 382 2 68.33 CAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGATATTTATTATGTGACATTATGTACATAGATTCGACTATTACGATTTCTAAGCTATATTTAAATAATTAAATTGCATTGAATTTCTTAGGCCCCTAAAGGCTTTGTTACTCTAACCTT:1 - chr3L 4519006 3' - 1360 388 1 60.96 CAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACACAATTATTTAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTTTGTGATTTGTGCACAGACCAGGGTTGCCAGCCACGCTTGCGTTGCA:1 + chrX 19847532 3' + Cr1a 65 1 75.19 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAATACTAGGTAGTTTGGCAACGCATAGCGATTCGATTAATGGGTTGGTTTCTATAATAAGACAGTCAATTTGTT:1 + chr3R 9583385 3' + Juan 4163 1 50.00 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACAGCACGCGGCTGTCACGTCAAGTGGTGGCC:1 + chr3L 7460684 3' + 412 437 2 72.73 AAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAGGTGGCGGTGGGCAGGAAACGTTGGCTGCAACTGCAACTGAAAT:1 + chr3R 6495368 3' - Stalker4 7015 4 56.55 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGGTACTCTCCC:1 - chr3L 22594164 3' - 297 52 2 71.43 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTAGACTTTGTAAAAGGGTTCTAAGAAAGCCATTTAAAAGCACACTTTAAAAGCAGGTTATAAATTTTCATTTTCAAAGTGCATCACAATGTCCTCCGAGGCAG:1 - chr3R 18153514 3' - copia 4889 2 71.92 ATTAATTGTTTTTTTAATTTAAAAAAAATGTTGTTGTCCGAAATTACAACTTTTGCGAGGTACGCAGAGATAAAGCGTAGCGTAAAATGGTCAGAAGAAATCGGTTTATCATCAAAGTTCCTATGTGAAAAGTGGAAAAAAGAACG:1 - chr3R 9429419 3' - TAHRE 56 1 63.70 ATTGGTAAAACAAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATACCACTGTTTCTCAACTCACCTTTGGGTCAAAAGTTACTTTCAAAGTATCACAAAGTTTCATTGGGAATTTTCCGTATTTTAGGTTTGTCAAATACAC:1 + chrX 17486092 3' - Tc1 1476 1 61.64 AATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCTTTTCGCTGCCCCTTATTTGCGTTTTACCGGAGTTGCAATGACGTACGCACGCACACACACACATGC:1 - chr2R 18689095 3' + Burdock 241 2 76.03 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTAGACTTTGTAAAAGGGTTCTAAGAAAGCCATTTAAAAGCACACTTTAAAAGCAGGTTATAAATTTTCATTTTCAA:1 - chr3R 18153541 3' - copia 46 2 53.79 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGAAAATACGTTTGAAGATTTGTTTCCAGTG:1 + chr3R 28117075 3' - hobo 23 1 59.26 CGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTTGCTTAGATTGAACCCTATTACAAACCTATTACGGAGTGTATCTCCACAGCAC:1 + chr3R 15502560 3' + Ivk 5311 1 65.52 ATTTTCCTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACAACGTTTTTGGTTGTGTGTTTTTTTATATTTATTGATTTGGTAATACACAGTTGCCCGTGGATTGGGTATCTGGTGGTCACTGCTAAACATAGATTGTGAAAGTTTTTATAA:1 + chr2L 16031252 3' + Tc1-2 157 1 41.78 ATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGAATTTAGGGGGCCGCAGTGTACAGTTGAGAAATTGCAAACTGAAGCCTCCTTTTATATATAGTATATATCCCTGCTT:1 - chr3R 25804098 3' - mdg1 7086 2 52.05 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATAATAGAGTTTGCGGTTTTGACATTTTATAATTGAAAATAT:2 - chr2L 9274968 3' - F-element 51 1 58.22 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTAGTTGCACTTTTTCCCAGTGTATCAGTTGTGGTGTCAAGT:1 - chr3R 15054129 3' + 297 6902 2 71.92 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTAGCTTATGACCAGGTTAAGGTAATGTCCATTGGATA:1 + chr2L 6388133 3' - jockey 85 1 71.43 TAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCG:1 - chr2R 10910233 3' + Tabor 7244 2 75.00 TTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTCACAAAAATTGTAAGTCTTTAAATGCATAAGACCCACTTCCCCACCCTGC:1 - chr3R 13088205 3' - roo 128 2 78.95 GCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCGGTGCGATCTGGCGGCAGCAGTAAATGAACATGGAATTGTGTGCTGCATGGAT:1 - chr3R 10907544 3' - X-element 84 1 68.28 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATGTTTTAGGCACTGAAAAAAGTAGACAAAGTAAAAAGTTATTGCTATTCAATCATGGAAAGTTTTCCCCCTGTGGCCTGTGTCAATTTTCACTTAACACAT:1 - chr3L 9545610 3' + 297 6958 2 37.67 ACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAACATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGATTTCCCCGGAGTTCTCAAAAACACGCAGTTTTGGTTAGGCGTTCAATAAACTG:1 + chr2L 6218313 3' + gypsy5 324 2 61.64 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCGTTTTGGTTGGAAGCCACTAGCTTTCAGCAGGCGAATCGCTCCTAGATACTGAGTGCCCACCGATTTCATGTCCTGAGTACCCCGTGCAAAGAT:1 - chr3R 23098131 3' + roo 396 1 69.47 TTTGTGGCCAAAATTAATAACATATTTAGTTTCTGTTTTTTGTATTGGTTTACACTAGGTCATATCTTTTACGATACCAACAATTGTGGGCGTGGCATCAGCTGCACTCGCTGATTGGATTAATAATTTAATATTCCCTACCGTCG:1 + chr3L 17877963 3' + Transib-N1_DM 24 1 67.12 CTGCGAACAACGCACAAAAGGTAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTATGACGCAAAACCAGAAGAAGTCTGATGATTTGCAATTGACAAAAGTTACACTCTCCGCGGAAGCTCACACTGACCCCAATGC:1 - chr4 551150 3' - Cr1a 224 1 56.85 GGGAGAGATATTAAGATAATTTTCGCAATGGGGTTTATTTTTTGTGGCTTATAACTCCAGAACGGAAAAATATATTTAATTAACTAATTTTGTATAGGGATTTCCCTAATTCCCTATGCTTTTTCTAGTACAAGCTAAAAAAAATT:1 + chr2L 22107810 3' + Transib-N1_DM 54 1 48.63 ACATTTGGATCGACTTAAAATCGCTGTGTTGTCGGCAAATGTAGAAGTCGTTAGCAGTCTGCTTGTGATAGGCGCGATACCGCAAGAGCAGCACAGCAGGACTACGCAAAGGAGGCAAAACAGGTGCGAGAATGGAGGTTTCGTTA:1 - chr2R 4231759 3' - Fw3 2964 1 53.42 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACGTGGCC:1 - chr2L 13629032 3' - Tirant 8136 2 66.67 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCTACTTCGTGCACACACAACTCGGCAAA:1 - chr3R 31724888 3' + P-element 2799 1 21.58 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTCGTCTTGAAT:1 + chrX 4673682 3' - roo 55 2 69.75 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATATATAATAGTTCTGGCTTTATCCCAAACTCCTGGCTTGTTAGCAACGGCATTACGTGCTGCCTGCTTTTAATTCGT:1 + chr3R 28406473 3' - opus 7022 2 67.48 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAAATGTATTTATATATATATTTTTTTAAATGGCATTGCTTATTTTCTGAATCTCAATCTTATTGTTCGCCGTGCATTTGAAAACAATATATTCAAAAAATCAAG:1 - chr3R 7507093 3' - Doc 19 1 71.92 AATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACGTTTAGATACATTTATATCTAGTTATGGAGTGGGGGAGGGGGGGAATATTCTATCGAAGCCATTATCTTCGGCAGTTATGTAAAATTGATTTCGAACATTTACTCTTGCAGAATC:1 - chr3R 25713958 3' + flea 5013 2 80.82 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATTCAATTAATTGATAGAAAATATAACTAAGGGCCTATGTTGCTTTTTAATTTAAGTTGTTGTTTTTATTTAAATAAATAAAAATAT:1 - chr3R 8140821 3' - pogo 31 1 63.70 AGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTCTTTTTCTTGCAGGTATGTTATACAACACTCGGTTAGACTTTAACCTCTGCCACAAGGACCTG:1 + chr2L 10606281 3' - Cr1a 4211 1 56.55 CAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTGCATTCGTTTTGTATTCGTTGCCTTGAAGGAAAGGAAGTTGAACTTACCTGAAAGAAAAGATGAGGATACATTGGTTAGATATAATTTTAACGAAT:1 + chr3R 9121452 3' - Doc 4465 1 69.72 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGTCTCAAAGGAATGCGAAACAAGGACGCAAAAGGACGAGAAGACCGCCAAAGACGATGACAACGTTATCGTGTG:1 - chr3R 17258065 3' + 412 7509 2 55.56 CGATTTGGGCGATGGCAAAAGTATTTAGACATCACATTTAAATGGTTCGCATTATTCTGTTGTTTGATGAATATCAAATTTTTGACTTTTTTTTTAATGTCAATTAAACGCTGATTGACTTTGCATTCGCAGGACACGGATTG:1 + chr3R 18358083 3' + Tc1-2 193 1 64.34 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATG:1 - chr3R 14049306 3' - transib2 36 1 60.96 AAGGGGTATATAGTTCCTCGTGAATCTACGTGGGACAGAGAAGTTAAGCCGTCTAACCAAGTCGGGACTCTCAACTTCACCACGAATAAGCTTATAATTGCTTAATAGTCGAGACATCAATAAATCAAAGAAAAATGCGCGTAAG:1 - chrX 18143296 3' - Cr1a 4123 1 64.83 ATTTTTTATTTTATTTATTTATTACACTTTTCACGCAATTAAGAGCAATGAAACACCTTTTCTTCGTTTTGTTATTAATAAAATATATGTATGTATCTCGCGTATGATCAGAAGTTGGGGAAAAACGCGCTTGTCCACACACAATT:1 + chr2R 18154393 3' - G7 1147 3 65.75 GAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAATCTTGAGTTTAATGCTAAAAATCTTCGCTTACCCAGTGCTGCATAAGCG:1 + chrX 22900363 3' + Tc1 1599 1 86.99 GGTGCGTATTGTTAGACACGAACCGGTGCGATCTGGCGGCAGCAGTAAATGAACATGGAATTGTGTGCTGCATGGATTCGTTTTGGCAGTGTGTTTAAAATGTTAATTTGCTTGTTTAACTTCGGTTTTGGCTGCTGCTGCTGCAT:1 - chr3R 10907475 3' - X-element 16 1 76.71 GACGCTATTGTAACGTGATGTCAAGCGACCATATGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGTTCTCTTTTTCTGACTTAAGTAGCTTCTGTCG:1 + chr3L 15301016 3' + Bica 4817 1 78.08 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCACGTGTGAACACTCTTATGCACTTTGTATATCTCATTTCGTGTCTTGTTATCTCT:1 - chr2L 17626602 3' - roo 8745 2 76.03 AGACCTTGCACGTCACACTGCCAAAATCTGCGCTGACAGCGCTGGTAGGCAGTGCGCTCGTAATAGCGTTGAGCAAAGCGTTAGGATGGAAAATTAGTACATGTTGAAAACGCTGCGATTGTT:1 + chr3L 10827965 3' + invader4 480 1 69.11 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATTTCGAGGC:1 - chr3R 18399213 3' + P-element 2878 2 59.72 GTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATGCAGGCCACATCTATAAACGTTCTCTTCGCTTTTGCCAGCTGGAAATTTCAAAAGGAATTTCGTTATTTATTGTGCAAGACGAAAGACAAACAAAAGTCAATGCTTTT:1 - chrX 10333389 3' + Tc1 1632 1 59.59 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCCGGAAAGTAGGCAGCAGAAAGCATTTAATTTTTATAG:1 + chr3L 15723961 3' - jockey 4724 1 54.79 GATCCTGATCAAGAATATATACCTCATATGGACGGAAACGATTCCTTCTACCTGTTATATACAACGTAGAAGGATATGTATATGTAGAAGGATGTATATACTTTACAACGAATCTATAAAAGACAAAAAACTGACAAAAATTTCGA:1 + chr2L 21371891 3' - INE-1 80 1 72.60 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGT:1 + chr2L 17260775 3' + P-element 2800 1 18.80 TTTTTACTTTAGATCTTTATTTCTTTGTTGTCGGCTTAAGACTAACGTACAGAGGTTTTTGATCGGCTCTTATTGAGTCGCGAGAATGGGACCTCTGATGGCCATCACGCTTTTC:1 + chr3L 4538560 3' - rover 7204 2 72.17 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTG:1 + chr3R 15790062 3' - flea 4770 2 76.42 AGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAACTAGCCGGCTGGCAGATGACAAAGTTCCCAGCTTGAGATAAAA:1 + chr2L 5890598 3' + invader3 5427 2 57.93 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGACTGGCAACGTGGCCAAGCAC:1 - chr2L 13629026 3' - Tirant 8107 1 82.64 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTT:1 - chr2L 14969105 3' - 412 7132 2 71.92 CGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAG:1 + chr2L 19140423 3' - Max-element 75 2 67.83 ATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTTTCGTTTCTGATTGGAAAGAGGTATGCCGTGGAG:1 + chr2R 15169070 3' - Ivk 312 1 76.71 ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTC:1 - chr3L 18484403 3' + hopper2 1522 2 75.35 TGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTTAACTATCCG:1 - chr3R 25277615 3' - 3S18 72 2 63.70 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAACTTTTTGACATTTATTTGACGCATGGCAATGAAGTTCATAAATTTTCAGTCCAGCAAAGTGCAATTC:1 + chr2R 17203318 3' - flea 4804 2 54.68 GTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAGTTTTGCTATGGCGTTCTATTTTAGTACTGAGTG:1 + chr2L 21698318 3' + 297 6894 2 78.77 GTGGGGGCTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAACACACGGCCCCGCCCCCTTTTTGCCCCCCTGCGCGAC:1 - chr3L 3453552 3' - Tirant 10 2 78.17 CGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTCTCCAAGTGATGCTGCTCACCGCATTCCACCCAC:1 + chr2L 3323177 3' - jockey 4759 1 78.17 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATTAACTCATTTATTTTTCTCTAAACTTTCATTAATCTAAAGTCGGTAGCGT:1 - chrX 8977447 3' - I-element 71 1 65.07 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACATTTTTTTAACCGATAAAAATGAGCTTGACCAATAAAACCCTGCTATAATACTTTAAAATATTGGTTGTTTTTAATTTTTTATTCCGAAACGAAAATACGGCTTACAA:1 + chr2R 5434045 3' - Transpac 4926 2 75.34 AACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGATGTGGGTGAAGGCCATGGACATTG:1 + chr3R 16997487 3' - G6 38 1 59.31 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCATTTC:1 + chr3L 15364896 3' + 1360 3358 1 55.77 AGGTATTTCATATTCCGTCCTGGAATTTATGATATCTGGAGAGTTCCGGATATCATAAATTCGTATTTTGTGTGGCAAGATGGCGATTTATTTGAATTTACATTGCGAGATGTTTTTTTTTGTTTAAATGTTTGAATAGAGAGTCC:1 + chrX 5439097 3' + Circe 351 1 45.89 CATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATGCTCTTTCTCGCATGATTGAAGGCAACATGTGTTTCGGAAATTATGCAAAATTGCCTTTCTGGCCAACAG:1 - chr2L 7266547 3' - Juan 4168 1 52.05 AGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCCTTCGCTCTGAATTT:1 + chrX 388303 3' + 1360 3302 1 78.87 GCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATATCGGCCCGTTATCACTCCTCGTTGGTTAATATCAAAGGCG:1 - chr3L 14701920 3' + 1360 3085 1 78.08 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGCACTTGATTTTAACGGTAAGTTTTTGTTAACCAGTTAACACAAGTTATTGCGAGGTGTACATAAGTTTTTGGTTGAAAATGAAGATATCGACCATCTAA:1 - chr3L 12964681 3' - hobo 21 1 69.86 CTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTTAACTATCCGGCTCAACTATGCAAATG:1 - chr3R 25277598 3' - 3S18 5819 2 51.72 TCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTATCTATTAAACTCATAATGCTGCGTTTACCATTACTATCATTATGTTTGGGGGTGTCTATAACC:1 - chr3R 7823291 3' - flea 4810 2 58.22 GAACACACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAATCGGGAACTGACACTTTCTTTTGGAGGAAAAGCAGCACCGTTACACGCTTTTCTGTGTCGATAATCGCCGCAAGATCTGAGTGGATCGAAGATTGTTGGATCACTG:1 - chr3R 13881471 3' + hopper2 1169 2 74.66 AAAAAAAAAATCATGCAAATATGAAATTTCTACTATATATTGTATATTATTCATAAAAAAATATTAGCTTATGGAAACATTATGGAATCAACAAGTACCAAAATGATCTCAACTTCATACCACTTATTTTCAGTTTTTCCCATT:1 + chrX 3597211 3' - hopper 61 1 65.97 GAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3L 5685501 3' + 1360 3183 1 72.59 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGCGATTTTACACTTCGTACCCAAATTCCCACTTCCAAGAATGCTCCTTGACTGTGAATAGAGCTCTGCTTGGT:1 - chr3L 6681934 3' + roo 345 2 76.03 CAAAGATACTAGAATATTATTACATTATATATATATATATTATATACACCAGGCCAGACCTCTCAGTGGCCTTCGCCTGCTGCACGGAGATCATTCCGTCCTCCAGGAGTTCGGTGACCGGTGGGCCCCAGTTTATAATACCGC:1 + chr3R 13835389 3' - Tc3 310 1 77.08 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCC:1 + chr2L 21910218 3' - Doc 76 1 73.57 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAGATATATCGTTTTTATTAATAAATTAATCGCATTCATTTTAAATTATTAATCAACAGTGTAATAAACTATTTGCTATAATA:1 + chr2L 7822329 3' + Juan 4177 1 58.22 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGGGTGTGGTG:1 - chr3R 9125611 3' - Doc 13 1 79.14 GACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGA:1 + chr2L 8574443 3' - Transpac 4996 2 71.23 TGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTACCTGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCATTTGGCATCCATAGCCATTTCTTATTTGTTTTCCTGAAAGAACTTCCAGAAACTAGGCTACGAAACACAGCACTGAAAAGACATCCTAAGACCAA:1 - chr3L 20063065 3' - X-element 4417 1 58.22 ATACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGAAGACAGATTTGGAACCAAGAAGATTATTTTTCAGTCTTAAAACTTAAAACATAAGTGATATCTGAGCCAATCTTTTACATATATTTACGTTATAAGAAGCTCA:1 + chr3R 22534645 3' + Porto1 4462 1 50.68 GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTTTGCCGATAGCTTCTTCAAT:1 - chr2L 10514278 3' - 1360 67 1 65.07 AATGTATGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCG:1 + chr2L 22684596 3' - transib3 75 1 59.59 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAATAAACGCTTCTATTGTATTTAGTAACTTCAGCCTTCTTGGTATTGATATATGAGATCATAAGGATAGGATCGATCGCTAAGCTCATC:1 + chr3R 18153683 3' + copia 222 1 63.70 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCAAATGGCC:1 + chr3L 18183225 3' - Tirant 8 2 78.29 AGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTACAATTTACTTATCAAATCCTTCAACCATTGCAGGATCAGGAGACTCTAC:1 - chr3L 12827567 3' - Idefix 6975 2 65.07 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCGTTTAGAATCCGTTTTGCAAACCAAAAACTTCTATTCATTGAAATCACTTGTTCGACATAAATGACCGAAAAATTGGGTCAATCACTG:1 + chr3L 14167462 3' - mdg1 33 2 63.01 GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCTTAAGTAAGTTAAATGTGTGTACCTCATCCGATTTTCGACGAACGGTCTTCAATGGGTTAAGAGGGGCCACTGAGTG:1 + chrX 14137317 3' - 3S18 40 2 55.71 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCTAATCCAAATTTGTAATTTATTGAACTCAAGCGGTTG:1 + chr3L 16059368 3' - 297 6602 2 67.97 TCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGG:1 - chr2R 10910220 3' + Tabor 7251 2 67.12 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTATGGAACTACTTAA:1 - chr3R 13225460 3' - hobo 39 1 58.90 GAGTCCACCAGGTCCTGGCAACGTTTGGGGGGAATTTTTGCCAATGCATCCTGCACAACTTGCCAAATCTGAGCCTTAGATGCTGCTCGATAAGAAAGCTGTCACCACGAGGCCTCTGCGGCGCCGTCGC:1 - chr3R 7843816 3' - Tc1 1275 1 61.54 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATGTAAATCTTTCAATTTTTGATGGTTCTCTTTCATAAATTTAATTT:1 - chr3R 19449725 3' + roo 9043 1 43.15 AAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGATAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGTGTTGTGACTATCGGAAATTAAATTAAAAGATAAT:1 + chr2L 22235837 3' + Bica 131 1 76.03 GCCGATCCTTGATATGCGTGCTAGGTCGATGAGATGAGCCGACCAACAGGCTGCAAACGGTTAATAGTACCCCATTCCATGGGCTGACATCCAAAATCAAGTGGTGTTTTTTTCATCGATTTTGTAGGTAAAGATACGATTACCTT:1 - chr3R 5842058 3' - Chouto 6049 1 60.96 CTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTCACCGTTTGGCCAGGGTCATTTTCTAATGGTGCAGTGAATTGTGGAGCACGTTGTGCAGAGATTTGTCATTTTGATTCTTGGATTCTATCATGGGCATC:1 - chr3R 31500065 3' - I-element 172 1 72.54 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATTTCTATTCAGTCGTTTGTGGTGCGAGAAGTCGTATATTGCTTATAATAAAGTCAAAAAGTTTCTATCG:1 - chr3L 14167324 3' + mdg1 369 2 52.74 TGAAGTACAGCCAATTTCGTTATTCTGTCGCTCTTTACGGCTAAGATAAAAATATAATGACACTGCACTAGCCCCAACTGGAGCAAGACTCGAGCTAATTTCTCCACTTTCCCCATCGA:1 + chr3R 5348027 3' + FB 441 1 72.27 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGAC:1 + chr3L 10469617 3' + roo 9014 2 60.27 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAAATTTATGT:1 - chr2R 13761624 3' - jockey 4745 1 69.93 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCTTCAGTGAAAATGGTACTTTCTGCAAGAACGATAATAGCGTTTCAGTTCGG:1 + chr3R 21216930 3' + 1360 3379 2 59.42 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATGATTTAAATTCTATTACTTTTTATAATATTGCTGCTTTTAAGATTACTATATGATCATCGATATTGCTTTAAAAATATTGT:1 + chr3L 5630467 3' - I-element 46 1 53.42 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGGTCGATAAACCAAAAAGCAAACACTTTTATGGTTTGTTTGGTCTCGTCTTTA:1 + chr3L 2426009 3' - hopper 28 1 67.12 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTACATTTGCATCAAGGACTTCC:1 - chrX 7741921 3' + hobo 2907 1 76.62 TAGGATTCTTGGAATCATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTCGGAACGAGAATATGCACAGAGACTTCCAAATAAAACGTGTCATTGAGACAATATGAAATAAAGAAACGAAATTAAAATATATACATACATATATGTAACAGCGGC:1 + chr2L 11332250 3' + Doc3-element 4392 1 63.01 GACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCC:1 - chr3R 14049348 3' - transib2 42 1 61.82 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGGCGAAACATTCAAATTGATGTGACCCCAAGATGAGGAGGGAGGCAGGTGCTCATCTCCATTTGAGCGA:1 + chr2L 1807070 3' - roo 8671 2 69.00 TACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACTTGCACTTGTGAAAGGTCATCCTC:1 - chr3L 18484360 3' + hopper2 1561 1 54.11 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTACGAAGTATGAGAAT:1 - chr2L 14969110 3' - 412 7137 2 75.34 AGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGGCTACCTATACACAGAGATGGCAGCGTGAAAAGGGAGAGA:1 + chr3R 24499575 3' + blood 305 2 71.22 TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAG:1 - chr2R 15070097 3' + 412 423 2 73.28 CAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACCGCAGCGAGTAGAATCCCCCGCGGCAGAGGCACTGGTAC:1 - chr2L 12162835 3' - jockey 125 1 73.29 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAATGCCAAACCAATGTATCTAGTGTCTTTGCTAACACCTTGTGAATAGAGTAGGTGACATAGGATACCAAGGATATTTGTTCTGATAGGCCAAAAAAACATTTTTACAAAATGTTTTAAAT:1 - chr3L 22964268 3' + 1360 3333 1 58.90 GATAGGTTTTCTCTAACCCTGCTTTTCGGAGCAAGAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGCCAAAATAAACAAGTATAAAGTATAAAC:1 - chr2R 9275347 3' + R1A1-element 4877 1 77.78 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAACCATCGCTGGCACAAGGACCCGCTCCCGTTTTCTTGGCACACAGGGAGCTCGGCTGGACCAGAACATGTGTC:1 + chr3R 14218539 3' + roo 9031 1 52.59 CTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACTGCCAAC:1 - chr3L 12159665 3' - Quasimodo 4 2 72.34 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAATGTATTAGGAAATCGTTGCCACTCGCCCATGTTGTATTAT:1 - chr2R 13293368 3' + roo 8998 2 70.71 AGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATCGAGAGTGGGCTCCCACCCACTCCGC:1 + chr2R 8184790 3' + copia 158 2 80.15 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAATAGTTTACCGCCTACAGCCCTTTGAATGTTTATCTCATGAATTA:1 - chr3L 12433397 3' + roo 9038 1 58.99 AACCATTCGCCACTCTATCGCAAAATCATATCCAGGCAGTAGTTATTCAGCTGACTGCCAGCAGAGGATACACAACAGCCGCAAAAGCCGCAGACAAGCGTGGGAGAGGGGAAACGGGGGGCTTCGGCTATCATGCATTTTTGGTT:1 - chr2L 17613778 3' + G5A 248 1 52.05 TCCACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATCGTCTTAAATCATTTTAGCTGAAGTTCACTGTAATCCCTTAGTTCGAAACTTTG:1 - chr2L 19140347 3' + Max-element 232 2 62.33 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGA:1 - chr3R 8217960 3' - P-element 97 1 19.18 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTCATTTATCAGAAAGCCAA:1 + chr2L 16857894 3' + P-element 2784 1 15.07 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCAT:1 + chr2L 19652597 3' - roo 84 2 78.08 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACCAATAATATTCATCCAACAACTTTTGTTCCATAATATTTCATTCCCCCAGAACCTTTAAAAATTTACGAACCATGCT:1 - chr2R 21870138 3' - copia 4894 2 60.16 GCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCG:2 - chr2L 18112510 3' + transib2 2745 1 71.92 ATCCGGAACTCTCCAGATATCATAAATTCCAGGACGGAATATGAAATACCTAACTGAAACGGATTGGATTGTTTATTAACGGGAAGCTCGGAACAACAAAATAGACACACTACTCACTCACACACGCCGTGTTGCGTGAGCTTGAC:1 + chr2R 19423404 3' - Circe 380 1 57.53 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCTGGCAACAGTTTAACAAGCTTTTTAAAACTACAGGAAGCGCTGGAAAAGGTCTGAAAAAATATCGAAAAAATATTCAACCAGTTTCATTCATTTGTACGAGCTAAAAGTTTCGCA:1 - chr3R 7585673 3' - Doc 15 1 80.14 GTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCAGCAATAGCTGCTGCGGCCCCACAGCCACAAATTACTGTAAAGCGCAA:1 + chr2R 14913533 3' - X-element 4458 1 61.60 ATGTATATACAATATGTACAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAAAGTAGATTCATTCAAATAAAACGATTCACTGCTTAGGTGCTTGGATACCGCCTCTATGTCGATCCATTCCGCTTCATAC:1 + chrX 19408255 3' + Stalker2 7512 2 60.00 GGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGAG:1 - chr3R 23020779 3' + INE-1 572 1 68.31 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAGTTTG:1 - chr3R 9125623 3' - Doc 24 1 68.84 GGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAAGGAAGTACATCTATGGGCTTAGAATTCTTC:1 - chr3R 9185989 3' - 1360 456 1 53.42 GTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAATACCTTGTATTCACTTGACCGCGATTGTCGAATG:1 + chr2R 19806824 3' + 297 6588 2 68.81 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTA:3 - chr3R 9125628 3' - Doc 37 1 65.07 TATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAAACGGCTGGGTATTGTAGAAGATGACCGGCTGGTGGTGCG:1 + chr3R 23816680 3' - mdg1 7338 2 62.86 AAGTAATAAGAATATATTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATCAGCTCGACAGACGCACACAGGGATCCAAGTGGGAACCAACATTAATACTTAATATAATAAATTGTAGCCA:1 - chr3L 22317339 3' - Gypsy6A_LTR 226 1 55.38 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGTGCTGTTTTTCTTTTCTTTTTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTACCAGAGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTACCAGTGTGTTTGTAACCCACCTTACA:1 - chr2R 8177690 3' - FB 12 1 67.69 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGTTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGA:1 + chr3R 12363796 3' - jockey 4751 1 65.75 ATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAACACTCACACACCAGTTGCTATTTGGTCTATGCAAATGCACTGCGAGAAATGGAGAAATAGACTTGCGTTTTGGGGTATGTTTTGCATATAGATTATAATTCTGTTAAAACAGCACAA:1 + chrX 3065558 3' + 1360 304 1 78.77 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCAGGTCTCTGGTGCGTACCACTGCGGCACATT:1 + chr3L 12964777 3' + hobo 2897 1 77.65 GCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAGGTGGTATATTACCATACTTATATTATAAAATTTTTCATCTTTAATGTACGTTATCCTTAAAGCAA:1 - chr2L 19641103 3' - Stalker 6887 4 41.78 TTGATCATAATCAATAGCCGAGTCAATCTATCTATGTCCGTCTGTCCGTATAAACGTTGAGATCTCATAATATATAGATATAGGTATAAAAGCTCCGCCAAAAAGTCGTGCATGAGAATGTGGTTCG:1 + chr2L 2261177 3' + INE-1 90 1 74.02 GTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAAACAGGCTAACAAACAACATCAACAACAACGCCGGCGTATTCATGATGCACTCATAAAAACCGGGGGTAAAGTACGGCGCCGGAAAGCGGGCAGAGTTCTCGGAAGG:1 - chrX 10110958 3' - mdg3 5266 1 75.17 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCAAAATA:1 + chr2R 11256260 3' + roo 9013 2 58.22 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGTCAGTGCATATGTGTGAGGGTGTCGTACTGTCTATGTTAGTGTCAATTATCTGTGTCCATGTAGACAAGCAAAG:1 - chrX 17982749 3' - hobo 47 1 53.42 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATTGGACTGTACGGCAGAGTTGAAACCTCAG:1 - chr2R 15070044 3' + 412 461 2 63.01 CCCTACCCAAGTACACTAGATGTATTCCCCTTACGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATCACGAGTATTATATTTTAAAAAAGCTTACTTACTTTTTGTTATAACAAGGGAAATAAAAATTGGGCACCGAGTTTATTCTGACACATCA:1 - chr2L 20121759 3' + G2 2972 1 58.22 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTTGTGATTCCATCATCGAAAAACCATACAGAAGGC:2 - chr3R 20203626 3' + 412 7463 2 72.60 AGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCGTCCCAAGCAAGTGCAGTAAAATGTCCGACAAACTCAAATTGGAATACACAAAATGGCCGAATGTGTTTGTTAATAGAAAACTCG:1 + chr2R 13368674 3' + Tirant 8409 2 57.53 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACACCCACACACAGAGATAAATACACACATAAAAATTTAAACATGTTATAAGAAGTCGTTGGGATTTTCCAACGCGGAATTTGCA:1 - chr3R 6459925 3' - HMS-Beagle2 6901 2 45.74 TACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAAGGTA:1 - chr3R 4679421 3' + hopper 1383 1 62.33 GGCGTCAATTAAACCAAATAGGTTTGTATTAATAAATGGTTCTTTTATTAGAACCAACTGCTCTAAATTCTGGTCTGTTACGAACTAACTACACGTAAAAATTCTTTTGGTATCGCGCGCGCGT:1 + chr3R 20264137 3' - gypsy10 349 1 75.00 GAACACGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTCTGACGTCTGAAGAGAATAGATATAATCTCTCCACGGTACATACATATGTATACACTATAATTAAGGAACAGCATCCAACGAGTCCTGAGGCCGAG:1 + chrX 7717973 3' + G5A 2637 1 74.07 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATTAACTCATTTATTTTTCTCTAAACTTTCATTAATCTAAAGTCGGTAGCGTAATTTGTCTATTAGGATTTCAATGACAGCA:1 - chrX 8977417 3' - I-element 23 1 64.06 TCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGATTAGACTTGATAGGATGACTTTTCTTTCAAATATCTTTTTAAGTCCTTAAATG:1 + chr2L 15644953 3' - transib2 66 1 65.07 GAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGG:1 + chr3L 2425958 3' - hopper 79 1 70.55 CGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTAAATAAGTACTCTAACAACAACCGATTTAATCAAA:1 + chr2R 21848767 3' + Transpac 5177 2 60.47 ACGTACAAAATCGCGAAGGGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATCGATCAATAGTCTTTCATATATTTAGTTACAAAGCGGAAGTGACAACTCATTGCGGAGTGACTCAGGTGTTCG:1 + chr2R 13725196 3' + invader4 3049 2 44.60 AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCG:1 + chr3L 21093233 3' - Ivk 55 1 58.99 ACTAATAGAAAGAAATAATCATTAGAATGAAACGATATTGCATAGGGGCTTGGACTTTGAAATGCCCTGGATTCCCAGACCTTTTATACGATCCAACCAATAAACTCTAGTTTTTTTAGATGTTTATCTTTACATATATCTAATAT:1 - chr2L 7807288 3' + transib3 2683 1 77.40 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGATTAGTACAATATATGCCATGGGGTATATTCCCATACAAAATGCCAATGTAATCGTAATTGTAATTGTCGGTACTATCGTTTCGTAATT:1 - chr3R 24673522 3' - roo 18 2 64.66 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTAGTCACTCTGCATTTGAATGTCTGAATGCCGCAAAACGTTG:1 - 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Max-element 8310 2 69.18 ACGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTACCATTTCATAACTGAAGTGAATATATGCAATCACTCATTTATTCATTATTCATTATCTTGTTTTGGCAGAGAGCTCTTGCTGCAATGGCGGCAATG:1 - chrX 5634002 3' - jockey 4711 1 64.29 ATAGTCGGGGAACTGGACTATAGCGTACTCTTATGTTATTTAGTCGAGTCTTTATAATAATGCTTAATATATTTTGTATCAACATATTGAAGCTACCGTACGCATCCCTAAATCCTAATTAATTGCGCCGAATTACAGGCCATAAA:1 + chr2R 5950025 3' + INE-1 565 1 58.90 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCAAAGCCCAGTAGAAA:1 + chr2R 5754591 3' + P-element 2828 1 45.19 AAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACC:1 + chr3L 21093207 3' - Ivk 99 1 75.86 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACATTTTTTTAACCGATAAAAATGAGCTTGACCAATAAAACCCTGCTATAATACTTTAAAATATTGGTTGTTTTTAATTTTTTATTCCGAAACGAAAATACGGCTTACAAAATA:1 + chr2R 5434049 3' - Transpac 4922 2 78.08 AGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTA:2 + chr3L 7801310 3' - 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rover 7161 2 66.92 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCA:1 - chr3R 13437166 3' - hopper 70 1 71.64 TCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATTTCTATTCAGTCGTTTGTGGTGCGAGAAGTCGTA:1 - chr3L 14167358 3' + mdg1 335 2 76.03 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATTGTAAGTTTTACTTAATGCAACAACCCATGTT:1 + chr2R 21870275 3' + copia 205 2 54.11 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGAAATGTTA:1 - chr2L 4929816 3' - blood 79 2 72.60 ATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACTTCCCTGGCTGCGAGGAATTTGTTGTCATTTATTACAGTTGCTGCCAGTTGGCCACTTGCTTTT:1 - chr3L 14913284 3' + jockey 4857 1 51.88 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCC:1 + chr2L 11554553 3' + roo 322 2 74.66 TAGAAGGTTGAAATTCAGCATACAGACTCCAGGGACGAAGACGCAGCAGACATAGTTGCCAGCGTTCCAGAAAGTACCCCATAAAATCCCATAAAAGCATTCCAAAATAAGGAAAAGTGCTGCTAAAATAGCCTCAGAAATTTGTA:1 - 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chr3R 9125676 3' - Doc 85 1 69.18 TAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGACGAGCTGGAAAAGCTTGCGTCTGAATTGAGAAAAAAAAATAAAAGGACGGGTCTGAAATAAGGAA:1 - chr2L 4420451 3' - gypsy5 14 2 73.29 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAG:1 + chr2L 3231972 3' + roo 9028 1 50.37 GATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTTTAATATTTTCTCGCGACTTTTCCGCAAAGAAGTCGTTGAGTTTTTGCAGTTTGTCGAGAATAACCTGGAGCTCCGCACG:1 - chr3L 4888589 3' + 1360 494 1 50.70 GTGTGATTGTGTGTGTTTTTGTTGCCTCCCAGATGAATTATGGCCGGCAGATCCGGGGAAGGCACGAATAGCTCTTCTCTTGGTTGGAAATTTGCATTTTTCTGTTGCGTTGCGTT:1 + chr2L 9084331 3' - gypsy3 420 2 81.90 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGT:1 + chr2R 2427623 3' - Doc 59 1 58.90 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTT:2 - 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roo 86 2 80.82 TTTTTTTTTTTGTAATTTTTTTTGTTTCTATATTTTGTTTATTTTTTTTGTTTGCTTCCCATGCTCTTTCTGTTTCTTTGCATTCATGTGCGAGGCAATTTTCTATTCAAGCATTTTCCTTTTTTATTTTCGTGTGTGTGTGTTTG:1 - chrX 5366775 3' - Doc 4695 2 76.71 AGAGATGACAATGTGGCACACGCCACTGAGCAGGGGAAAGTTGCGACGGTGGGAGATATACCGCTCTTCTTTTTGCAAAGCCAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAATAAAGGAAACCGAAGACG:1 - chr2L 22218248 3' + invader4 166 2 79.69 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATATTTATTTAAACGCTGTTCCCAATGTTATTTGAAAGGGGTTTTATTCAACTGCAGCTTGCATTTACACTTGTTCTGAATTAA:1 - chr2R 6913328 3' + roo 9033 1 58.22 GCTAGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATATAAGATTAATTATAAAATGTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAGATCGTAGTCATTTTAATCACAAAATTTAATCACAACATTATTA:1 - chr3R 7080612 3' + G4 3747 1 69.18 CGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCGACGTATATAGTAAACACTTTTACACTACTAGTAACGGGTATAAAAATCTAATTTATAGCTTAGACTATTTCGTGTGATTTCGGGACCCATCCACAGGTAGCTGACCGTTCTGATCT:1 + chr2R 5735161 3' - INE-1 30 1 52.74 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAGCCCGAAAGTGTGCTACACAAATGTATTCGCATGATTCTGGTCGTCCGTGTGAAGTGGTGGTGG:1 + chr3L 22339503 3' + hopper 1380 1 58.02 ATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATACAAAACAAGAATCGCATGGTGCCAATAGAAGAATCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAAACGCTGCTACCGAATGAATGAAAGCTTTTAAGCCTTTTTAAAA:1 - chr3L 9055168 3' - 1360 323 1 70.55 CTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACCATTTCCAGTTGCGATTTGCAGGCCCAG:1 + chr3R 22317723 3' + blood 7182 2 76.47 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTCTAATATTCACCTGATTTAAATCTTCAATATTTCTGAGCTTAAAGT:1 - chr3L 17537694 3' - Doc 22 1 72.60 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGC:1 - chr3R 9125646 3' - Doc 55 1 52.74 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATTAATCAATTAGTGACCTTCAGTGCGGCCCACTTCCCACGACTCTTGGCGTAGCATACTTTTGAGAGCCGACCAGGCAAAAGGTTAAAAGTGCTAGGCAAC:1 + chr3R 14986217 3' - jockey 4695 1 69.86 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACATTCTATACTTAGCCACTATATATGTATATATTTGAATAGTTCAGCGATTGTTGTCCTTCATGCATTGGTTTATTTCGTTCTGCCCCACCATG:1 + chrX 11008442 3' - hobo 24 1 64.38 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTATACCAAATATTTAGTTGCCTACCATAGGAAGTCCTTCCTTTTCAATAAGGCGAT:1 + chr2R 12371142 3' - I-element 60 1 63.57 ATCCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGGGATTCCCCAACATTAATAGTTAAGTTCTTTGAATCCGAAATGGGTCACTGA:1 - chr3R 25543405 3' - G2 182 1 49.66 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATTTCTATTCAGTCGTTTGTGGTGCGAGAAGTCGTATATTGCTTATAATAAAGTCAAAAAGTTTCTATCGTCTT:1 - chr3L 14167320 3' + mdg1 7412 2 53.10 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACCTTTTCTTTTGGCCAAACTTTCTGCCCCCGTCGACGTCACAGCTGATCGATTTGCTGCACTCGCTCGGC:1 - chr3L 20497719 3' + P-element 2851 1 57.14 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCACACGGACAGCGAAATGAG:1 + chrX 12905491 3' + Tirant 378 2 73.53 AAATCTGCCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTTTTGGGCTTAAGAATGTACTTTTCGGGTTTGTTTGTTTGAATCTCTGCAAATCTTAGCGGGCTCATCAATCTGCGAGGCCTCCGGGCG:1 + chr3R 14398499 3' - G6 1994 2 65.00 ATACTTAAAACTCTTTTGTTAAACCCAGCCAAGGCAGAGCAGGCAGATTGAAAAGTAGGGAATTATGTGCAGCTCGGCTGCATTCTGATGCACATAGCCATATGCGCGGCCACTTGGAGAGTTTTAATGGGAAATCGCAGACCGA:1 - chr3L 18484200 3' - hopper 431 1 77.24 TATTAGATACCCGTTACTCAGATTGCGCGAGTACAAGTGAGTCGTTCGGCATATCAACAGAAGACCTGTCTTCTGAGTCCATGCGAGAAAATATGCCTGAATTCAGCTAGAAAAACAGTACAGAGATGCGACAAAAACTATTCACC:1 + chr2L 22079812 3' - INE-1 546 1 60.27 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAA:1 + chr2L 17626670 3' + roo 333 2 71.92 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATCTATGTACGAGTATCATGCAAT:1 + chr2L 17626706 3' + roo 9033 1 59.59 GAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGCGTCTTTAGACGGGTCAGTGGGCTTGGTGCAGGTCCTGTT:1 + chr2L 9271109 3' - F-element 399 1 63.30 TATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTAATTTACTGTA:1 - chr3R 7470975 3' - Doc 122 1 76.03 CAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCGCCCTTACGAGTTCATCTGCTTGCTGTCTTCGGCCACTCACATTTTTTAAATAATATGACGTTTTTTCGGCATATGAAAGTGGAAATGGAAATAGAGA:1 + chr3L 16015543 3' + hopper 472 1 76.03 ATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACATATACATAGAAGGGACTAACAATGCAAGTCTCTCGACTC:1 + chr3L 14302267 3' - Quasimodo 69 2 76.71 CATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATGAACAAGGCAATGATCGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTATGTGCCTCAAGATATGACCGAAGCAAATGGAAGAGCCAACTTGTTTATATAATTTACGAAAAAGAATCGAACT:1 - chr3L 971397 3' + 1360 411 1 68.49 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAAATGTATTTATATATATATTTTTTTAAATGGCATTGCTTATTTTCTGAATCTCAATCTTATTGTTCGCCGTGCATTTGAAAACAATATATTCAA:2 - chr3R 7507102 3' - Doc 28 1 65.75 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATT:1 - chr3R 9125625 3' - Doc 31 1 68.53 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTTTTGAACATA:1 + chr2L 8574492 3' - Transpac 4947 2 65.07 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGGCATTAGTTCGTGCTTTATGCCCTATGCATTTTTCATTGCTCAATTTTCGCCGCAT:1 - chr2R 7232652 3' - jockey 76 1 60.27 GGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTTCCTGGAAAAGTATTCCCATATAATTTTTAATTACAAAACAAAAAGATTTTATATTTATAATATAACATAACT:1 - chr3L 18035448 3' - mdg3 5255 1 71.92 GTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATT:1 - chr2R 3262650 3' - mdg1 183 2 53.79 TTTGTTTCCCCCATGTTTAACAAATTTATGAATGAAATAAGGTAAAGGAATGAAAAGCCATAAAGGTGGCATATTTGCATATATAGATCTCAGTCGCACTCTCTTTTGTTAGGTAACGGGTGTAAACTTTCTGTGGACTATGGCT:1 - chr4 339364 3' - Tc1-2 348 1 73.79 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATG:1 - chr3R 13225484 3' - hobo 32 1 53.91 TATTATGATATATACATAAATATATCTGCTAACTCGTTTTGCAGCTTTTACTTTTCCATTAGTGCAGATATTCGTGTTCTGCTTGCTACAGCATTTGCTTCGATTAAGCAGAATTATGTACTTTGTATGTATTAGTAGCGTCTTT:1 + chr3L 18723691 3' - Dm88 21 2 52.41 CAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGTTGAAGAAAACGAAGCAAAACATTCAGAATATTATTATACTTATAGCAGAATTTTTTGATTGATTCTGGGTAATATTACGTTTCGTTTGTGTACCATAGATAAACTGAGAGGGGCTACTTC:1 - chr2L 408490 3' + I-element 360 1 78.77 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAATGGCCAGCGCAAACTAAATAATACTGCATTGTTC:1 - chrX 18239123 3' - jockey 92 1 74.66 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCCAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTCAACTCGAGTGGCTGATAATTGGGCGGCACGTGCTGGTGCCTTTGTTCCGGCAAGCAGTG:1 - chr3L 1856686 3' - Transpac 49 2 52.55 AGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTATTATGTTGTAACAGAGAAGTTAAGCCGACGAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCATTGTTTGCGGCTGTGTGTTGCTTATAAATTGCTCCACAAAG:1 - chr2L 10922024 3' - Cr1a 4204 1 69.63 GCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAACCAAATAATAGCA:1 - chr2R 4577080 3' + Chouto 458 2 66.41 TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACGAGCGAACACACATAAGCAACCCCCGTTACCTGCGACGGTTT:1 - chrX 8271540 3' - P-element 71 1 31.88 ATAATTGCAATTAAAGACTGCACTTGGGCTAAAGGGGCGTGGTGATAAACAATAAACAAAGCAAAACACGTAAACTCTATAGCACTAGACGAGATCTTAGCCTTCTTCACCAATCTATTAACAATTCTGCCTTTGTTGTTTATTAT:1 - chr3L 17539825 3' - hobo 2540 1 58.22 TGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTAACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCATTATGTATCATTATGCTTGATCATGATAAGAA:1 - chr3L 17921966 3' + copia 170 2 75.34 GACCGTTTCTGGAACGTGCGCGAAATGAAGAGGACGATCCTGATGCGCTGCGGTTATTTGTTGTGTTTGGCGGCAGCAGCGCAGGCGCCCGCTGGTGGAG:1 - chr2R 24884783 3' + Max-element 8146 1 58.00 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACA:1 - chr3L 7837172 3' - jockey 4831 1 60.96 GAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATTGGGACAGAAGGACATGGCCAGACCGAATTGGCTGTGGATCCTTATCTTCGAATCTAAGTTCTCAGCACTTTTCAACCAATATGGTACACCC:1 + chr3L 21482930 3' - INE-1 165 1 65.00 CAGTGCCTTTTATTATTTTAACCATCCAGTGCCTTGAAATTTTGCTTTATACTAATAAATGTATACTTTATTAAATAGTTTTAGCGGTCAAACCTATTCATTGCCCCGAGTCCTAATTGCGCATCGATTGGTCTTGTATCCGTGAA:1 + chr3R 24231117 3' + Tc3 1457 1 68.49 AGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTCCCTTCCGAATCCGCCCCCAAAGACGACCCCATTGCCTCGGATAAAGCCAAAGTGCACAGTTAACAAAGCCCCAAAGCAACC:1 - chrX 10208014 3' + 1360 4 2 56.16 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAGCCCGAAAGTGTGCTACACAAATGTATTCGCATGATTCTGGTCGTCCGTGTGAAGTGGTGGTGGGCGGCGG:1 + chr3L 22339510 3' + hopper 1379 1 59.71 AATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGACCGGCATCTCTACGCTTGTTGCGTAAAATTGAATTTGACTCGCAATAAACA:1 + chr3R 11814002 3' - roo 343 2 64.38 AAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGACGTGGGGAGTGGGTGAGCGGGAGTGA:1 + chr2L 9879742 3' + jockey 4910 1 77.78 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCATATCAGTTAAATTAGCAATCAGTCTCCAATC:1 + chrX 4400371 3' - roo 8753 2 80.82 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATAATTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAACCATCGCTGGCACAAGGACCCGCTCCCGTTTTCTTGGCACACAGGGAGCT:1 + chr3R 14218517 3' + roo 8999 2 64.14 GAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGCGTGTGTGTGTGTCTGTGTATGCTATTCGTGTGCCCCTCCGCAATTCTGATTGTTTGTATGTGAGAAGCGCATGGAATTGCCAGCCAGGCGCTCAGATAGCGACGTAG:1 + chr2L 4420648 3' + gypsy5 7336 2 69.86 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACCCTTTCACTCGACAAGTAACGGGTATTACAAGATGGAAATGGGCTGTTCGATTCTTCAGCGGGAAATCTAATATTACAGAC:1 + chr3L 22885054 3' - P-element 32 1 62.14 TCTCAACCTTCTAGCTTTCATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATTCGGACAGACATGGCCGGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATATAAATTATAAATGTGAAAACTTAAATTTACAACACAATATACATA:1 - chr2R 10692485 3' - INE-1 162 1 69.18 GAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTGAGGTACCTCTGGGCTGCTGCTCTGGATGTTTTGTAGCCCAGTGATTGACGATAATTGACTG:1 + chr3R 27810123 3' - Burdock 23 2 61.06 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGC:1 - chr2L 19652527 3' + roo 339 2 64.38 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACGCAACTGTGTCGCAATCTGAGGTGCCCGACATCCACGAAGGTTTTATGTTAGGCGCACCATCGTTTTTTTAAGGCAAATCAATTTAT:1 - chr2L 22632730 3' - 1360 36 1 74.66 CATTAGCATGGTGGTCACTTATTCTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTAGTATGATCGCAAAAAACCTTTTTGATATTGGGTTTTGATTCTCAAGAGATTTTTGTAACATCGCTAATGACATTGCCGCTTTACCTTTTTTTT:1 - chrX 8050706 3' - 17.6 69 2 63.70 CGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCAAAAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTCTCGCCGACATGTATATTATTGGTGCATTCATAGAAAGTTTTTCAGTGGTAGATGGCGACTTTACTTATCTTACTTA:1 - chr3R 7481497 3' + invader4 3028 2 52.05 AGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATAAATTTCACACCCACGTATTAGATCTTAATTGAACATCTTCTGCTCAGCTCTGGTATATGAAT:1 - chr3R 16538354 3' - G2 2640 1 55.48 GTGTGTTAGAGGGAGATGAAAATGTAGTGAACGCCAGTGTGTATAGATATTAGAGAATATGTTGAAGAAGGGAGCAAGCAAATCCAATCGATAAAAGAATAAAAAAAAACGCTTTAGAACTGATATGCCAATGTTCCG:1 - chr3R 32069071 3' + invader4 2914 2 52.90 TCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCCGGTCACTCGCCAATTCAC:1 + chr3R 31141071 3' - Burdock 45 2 54.79 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATAT:1 + chr3L 18253875 3' + blood 7336 1 63.78 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATTTCATTAATGAATAATTGCAATTATGACCGCCTTGCAGATTTATGCGATGATGACTCGCATTAATAACAAAAGGCAATC:1 - chr3L 21910342 3' + pogo 2065 1 64.38 ATGGATGATATAATAATCTTTCCCAATACAATTGAACAAAATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTT:1 + chr2R 2875182 3' + TLD2_LTR 46 1 67.81 GCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCTGTTTTAACAAAGCTTACCATCGACGATGGTAGTACAATTGTATAAATTTGTATAAGTCTTTAACACATCGGGTTGCTCTCTTTAGAAGATTTACATTA:1 + chr3R 2557729 3' - Cr1a 4414 1 68.57 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGATGGGTTTCCCCTTGACAAGTCTGTGATATTCTAAAATACATCAAATCGAATCCATTA:1 + chr3L 6095571 3' + transib2 2790 1 52.10 CCGTGTGTAAACAGTTTCTCGACAAACTGTAAATAGCAGCTCTAGAACTGTTGACAGATATATAGATAGATATAGATGAAGGCTCCAGAGGCATATGGGAATAACTTAAAAGGAAAAAAAAATCAAAACAAGCAGAATGGCAAAAT:1 + chr3L 3688831 3' + S-element 1708 2 56.16 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCACACCCACCTGAAGGTCACGACGCTGAGTTCTGGGTTGTTAACGAACT:1 - chr3L 21665237 3' + 1360 3358 1 57.28 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCGGCACAATGATTGCTGCATTTATGAGATAAGTTTTTACTGTCGACAACAATTAAATTACATTTTAGAGTTTATGGCCTTCGTCGCCGAGTCG:1 + chr2L 16615884 3' + hobo 2913 1 66.21 CTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTT:1 - chrX 14317415 3' - 1360 96 1 78.77 TATGTTACTGTTACTGCATTGTACTGATTCATCGCTTCTAAATAAAAGAGAAAAAGTATAAGTAAGAAACAACGTATGATCAATGACATCAACATGCCGAAGGATTATATAGAGTGTCATTGCTATTTACCAGTTCAGAAGTATTC:1 + chr3R 23234994 3' + BS 5055 1 72.60 GCATGTAAAGTCAAAAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGATCCAGAAAACCCCTATCCAACATACCGCCCATGTCCCAGACCC:1 - chr2L 12964703 3' + invader1 3860 2 75.34 GTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCATTATCTTAAATCATTTTTGGTACATAATTAGATCCTTCAAACACAGTTATTTAATTCCAAATTGCCTTGAAGGTGACATGCGGGAGCG:1 - chrX 22979958 3' + Cr1a 4092 1 65.47 ACTCGACTATAGTATTCTCTCTTTTATTATTATTATAAACGCGAGTGATGGCACTATAATTTTATTAACTAATGTACAAATTATTTAATTGGTATTATGTTTCTATAATGTGTGTTAAATTCTTAAAAATCGATATATATCATTCA:1 + chr2L 22130810 3' + INE-1 576 1 43.15 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGATGCCTGCTTTTGTTGTCA:1 - chr3L 13690247 3' - hobo 41 1 58.22 GGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCAAAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGATCAATCGCATGTCTGACAGAGTGTAGCATACTTTTCAGCACTGCCTAACATTTGTCAGCTATCTGCATTTTTTTCGGAC:1 - chr3R 16582435 3' - BS 4980 1 77.40 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTTTGTGGGTGTCTCCTTTGCGTTTGTTATATACTTTTAACTAGTTTAAGCCAT:1 - chrX 8967345 3' - HMS-Beagle2 6894 2 76.30 CACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATT:1 - chr3L 14375623 3' + roo 342 2 62.33 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAGATTTGTTTTGGTTTAAGATCCCAATCAGTCCGGAGTTTCAATTAAAGTTCCATTAACGCTTCGCG:1 - chrX 6632908 3' - P-element 26 1 67.81 AAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTAGACAAAGCATAAAAACCATTCTATGGCAACCGGGTGCTTGAATGGTTACATTTAGTTAAATATTTTCAAGGTAATTGGGTAAGGATTGGATAGCAGGATCTTTAAATTCATTTGCT:1 - chr3L 12970967 3' + hobo 2519 1 79.45 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACAACTTGCAGTAATGGAGACATAACCAAACTCAAT:1 + chrX 3647035 3' - 412 7079 2 66.21 AATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAA:1 + chr2L 17599966 3' - 1360 439 1 61.62 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAGATGGGATGCGATGGGACGGAATGGGTGAGTAGTGCTCGGAACACACGATTGGCACAGTTATTAAAAACGACATGTAGAATTGGC:1 + chr2R 9340250 3' + 412 7516 2 63.01 CTTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTAAAAGAGCTAGAGAGTTAAGATGGAGATCATGGAGATTTCACATCACTTAAAATATGCAATTAATATTATGTGTGTTTGCCATAATTAAAAATAATGTGTTCATCTTATTAGGAG:1 + chr3R 7279973 3' + INE-1 132 1 54.79 ACTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAACCGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAACGTTTTGGTTGATAAACGAGCAATTTATTATGTGTGTTGATGTGTGGACTACATTTCTTTTCATTTTTGATACTCTGAAGAAACAA:1 + chr2L 15791265 3' - transib2 471 1 58.90 TATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTTAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCT:1 - chr3R 20683400 3' + 1360 3113 1 59.59 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTAACCCCTGTTGAGAGGCGGCAGG:1 + chrX 7741943 3' - hobo 28 1 70.13 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGCAACCTGCTCCATCGCAGATAAT:1 + chr2R 14973727 3' - FB 33 1 62.33 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTTTGCCGATAGCTTCTTCAATATTGATAAACATGGGCCAAACAACAGTTACAGTTT:1 - chr2L 10514243 3' - 1360 32 1 59.59 GCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCTATAGGCTTTTATAAGCAAATCGCACATGTGGCTTTATAGCTTATCACCTACCGAAACTCACCCCAATGCAAACACAATGTACACACATCAAACAATGATATA:1 - chr2L 7159005 3' + 412 7149 2 71.23 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACAGCACGCGGCTGTCACGTCAAGTGGTGGCCCACCTGGAGG:1 + chr3L 7460694 3' + 412 438 2 66.39 ACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTCAATATAACCATAAAGGATTCAAGATCGTAATGACACACCGGAAAAACAGCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTTTAAGTGAATCAATTCCAAATAGGGTTGCGACCCTCTTGAATAATA:1 - chr2L 10838549 3' + baggins 5040 1 69.86 ATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATGCATAACGATAAGTAGTTCATATACTCGTAAGCCAGATATATTTGGA:1 + chrX 20685997 3' + Ivk 5372 1 79.45 ATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTCCGCCGACTCTGCACTTTCT:1 + chr2L 18112605 3' - transib2 2588 1 55.00 AATCTCATACTCTTTAATATTGTAAGCCGAAGTAGCCAGTCGTAGCAGTTGCGAGGCCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCAGATTCTGGGCAGACAAGAGAAGGGCTCAACTGACTCAAAGCCGGGC:1 - chr3R 12837591 3' + diver2 39 2 62.99 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGCCACTAGCAGTTTGACAGCCACTGGGAAGTGTAAAAGTAGGGGGCTAGAATGTGAATAACATTTAGTGGCGCAGCCACAGA:1 - chr3L 2425853 3' + hopper 1376 1 57.53 CGAAAATCGTATTTTAGCACAACACGCACACATATAGGCGTTCTCTTCTCTTTTTTTACGCACACAAGCAAGAAAATTCTATTTTTCTCGGCAAGGGCAACGCGGGAGCTAAGATCCTCCAGGATCTTCTGGAACTGACGCATTTT:1 - chr3R 19590124 3' + 1360 3198 1 58.90 GTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTTCTCTTGTTTTACGTTCTGATCAAGTCCCAGCAGTCTAAAGTAATGACATACATCTCGAGTGACTGGGGTTTAGAAGAATACACCATGCACAAGGTAAGTCCCAAG:1 - chr2L 22318165 3' + INE-1 558 1 70.00 CTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTACGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCATATATTAAACTCATGCCCATCCCACCTACAAGCCAAACAATTGATGATTTAACAATCTAAAGTTCTGATATTAACTTTTAAAA:1 - chr4 148131 3' + I-element 4982 1 73.97 AAATGTTAGAAATAGAAAAAAACATTTATCAATTTATTAGATAGATGAAGTAATGCGACTGAGCAACATATCAAGTATTTTGACTTTTAATTGTGACTCCGAATCTGTTGCATGTATAATGAGTTCATTATACACTTTTTCTTCCC:1 - chr3L 7618849 3' - Tc1-2 1405 1 72.60 GACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTTCTTCATTGGCATTTCATAAATAGTTTTATTTGGCG:1 + chr3R 15152697 3' + opus 7420 2 75.17 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGGCTACCTATACACAGAGATGGCAGCGTGAAAAGTGAGAGAAACTCTTAGAGAATAAACTATAATTATATCAACA:1 + chr3R 24499609 3' + blood 331 2 52.05 GCACACACACACACACACATTCACAGAGCCACATAGTCCTGCGCACTTTTGCCATTACATATGTGTG:1 + chr2R 21272694 3' + accord 185 2 77.61 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGTGCTGCCTACTTTC:1 + chr3R 25795833 3' - jockey 65 1 59.71 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTA:1 + chrX 19730199 3' - Doc 64 1 60.96 TCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTAGCCCAGCAAAATCATACTGAATATATTTTTGCTCCTATTATTTTGACCGCTGCTGTGGATGCTGGACTGGGAAACTAAAGTCAACAAACGGCAGGGCTGCTGCC:1 + chr3R 17492949 3' - jockey 4772 1 73.97 TCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAA:1 + chr2L 17599966 3' - 1360 479 1 71.94 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGCGGAGTAAAATGAAACTGCCACTGCCTTCTAAATGGAATTTCATCAGCACAGATACTGCTCATTGGGAGTTG:1 - chr3L 5290168 3' - jockey 4765 1 58.06 GTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCC:1 + chr3L 15723925 3' - jockey 4760 1 76.71 GATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAATAAATAAATTATCTAACTAGCCTCAGCTACTAAACGGC:1 - chr3R 6816730 3' + Juan 4130 1 78.42 AAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGAATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGGACGATAAACCAAAAAGCAA:1 + chr3L 2425977 3' - hopper 60 1 56.16 GGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCCGGTCTCTCGCCAATTCACGCTAATGGG:1 + chr3R 31141080 3' - Burdock 6139 2 76.99 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGGCAACTTTGGCGCACTTTGCATTTTTATTGCACAAC:1 - chr3R 7470918 3' - Doc 42 1 72.36 AAATTATTTATTTATTTTTAGAAGCAATTGTTATCAACGCTCCCAAAATGTTTAGACTATATAGTTACTATGATTGTTTATTTTATGAATTTTTATGGGTGTATTTTATGAATTTTTATGTGATGGTAAGTGTCAAGCTGGTAATT:1 - chr3L 8809277 3' - mariner2 830 1 73.29 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAAGC:1 - chr3R 23161271 3' - 412 7121 2 63.70 ATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGTATATAGATACATATAAAGCGTATCCTGATTTCCCCCTGCCGTAGGCGCCTATTTTTATTTTCCCATTCACTGCCAACTTATTTACGGGC:1 - 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Max-element 54 2 52.05 CGGAACAGACGCTCTGAGCTGTTCAATATCTATTGCACTGAGCTATTACTTAATACTTATTACAGTATACGGACGCGAAGGTTTCAGTTTCATATCGGGCCACGGGTTTTTCCTCCTATTTTTAAATCGCTTTTAATGTGCGGCAT:1 - chr3R 7616704 3' + Stalker2 7609 2 56.85 GTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTGTCAAAGATGATTAGGCATAAATTGAAGAT:1 - chr3L 19031172 3' + roo 402 1 80.00 GAAAAGATCCCGTTTGAATATGAAATAATGAAATGAAAATAAAATAAATATTGTTTAATTCAATTTTATAAAAAAAATGAGTGTTTCGCCTGACAAGCTCGTTAAAATTTATGCTTTGTTTGTATTTCAGGAAAA:1 + chr3L 18467857 3' + S-element 1340 1 60.74 AAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATATCTAGAATAGATTATTTAAAAAAAAAATGTCTAATTT:1 - chrX 12458314 3' + G5 4746 1 83.08 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAGATGGGATGCGATGGGACGGAATGGGTGAGTAGTGCTCGGAACACACGATTGGCACAGTTATTAAAAACGACATGTAGAATTGGCATTC:1 + chr2R 9340254 3' + 412 468 2 66.21 GCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTTGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGT:1 + chr2R 10910280 3' - Tabor 90 2 75.34 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATATTTGCCCACCTCGTATTACATACAC:1 - chr3R 13437123 3' - hopper 29 1 55.48 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGAGA:1 + chr2L 21910258 3' - Doc 35 1 58.27 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTGTAACTAAATAAATGTGGTTTTCTTATTATTTAGCTAGTTTATAACAGTTCATATCCTTTTCCCATTTCCAATCATTCTTA:1 + chr2L 6601401 3' + roo 9034 1 44.52 ATTAGTCTTTTTAATTTCTATCGATTTGCCAATATACTTCTTGCCACGCCCACTTTTACGCTCCAAAGCCGCCAAAAACTGCCGCGCCCACACTCGCCGTGCACCAGGAACGGTGTGTGCGTTTCACTCATGTAGACCTGCACCAG:1 + chrX 10856032 3' + INE-1 297 1 64.38 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAACACCCGGCCCCGCCC:1 - chr3L 3453574 3' - Tirant 8137 2 65.00 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACGCCCATAATGCGACTCAAAAAGTTTTGCATATTGCGTTTTTAGGACATGTGTCCCTAGCATCGTATCTATAATATGTGGGGCACATATAGTGCTCG:1 + chr2R 14135399 3' - copia 26 2 63.70 TGGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTATGGTGGGCTGGTCCCGAGGAGCTTATACCGTTGTCCTGGGATATTTACTTCGGTCCACCGTTTTCCGGTGCGCCACTGG:1 - chr3L 25514026 3' - G-element 4248 1 53.33 GAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTGAGAAGCGATAAAGCAAAGCGGTACTCAAACTAATTAAAATACTATGTATTTGCAGGTATTCTTAATCGTTTTATTCAA:1 + chrX 18005920 3' + invader3 5408 2 54.48 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGAGCTATAGAGGCAGAG:1 + chr2R 8666077 3' - P-element 95 1 15.33 CTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATCCGAAAAATTCTTTTGCATTGCCTTAACGTTAAAGCTATGTTAGTTTTAAATGGTACAAAAGGAAAATGTTACTGTGGCTATTGTTGCTGTTGCTGCGTCTGA:1 - chr4 669426 3' + 1360 242 1 51.37 AAATGGCGCGAAATGTCCTTGTGCTGGAGGCATAATTTAACATAGTCTGCGTACATAAGTACTCGCGAATGTTTTATTATTAAGGGTGCTAAAGACATTGGGATCTATGTGGGCGATGGCGTTGGACTCCAAGTAAATGACATCGA:1 - chrX 22877528 3' - Q-element 608 2 57.53 GGAACTATAAAAGCTGGAAGGTGGAGACCCATGTTGTCACTCCAACGCCCACAAACCGCTCAAAACTGCCACGCCCACACTTATAAAAATATTTTGTTATTTTTGGAATTTCGGGCTCTTTTGTCTGTCAAATTGCATTTGACGGG:1 - chr3L 3553710 3' + INE-1 157 1 71.92 CCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCATGTCTGTATCTGTGCTTGTGTGCGAGTGCTCAAATGTAACGAACTATTTTCGAAAAACTGAAACTAAA:1 - chrX 5891066 3' + Idefix 6993 2 53.42 TTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCTGATCCCTGCAGCCTATTCAAAATAGCGAGCGGAATGGGGATGAAGGAACTGGACAGAC:1 + chr3R 11944928 3' + roo 9027 1 54.62 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACAAGTAAATGGTTTTGGTATGAAAAGTACACCTTTGCCACCCAAAGTATTTCAAAAAATAATTGATATTGAGTTGAGCCGACATTA:1 - chr2L 11554406 3' - roo 8747 2 62.33 CTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACAAGTAAATGGT:1 - chr2L 11554500 3' - roo 8808 2 69.92 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGAAATGTTAAGAGAAAGTAACTGCTGATAGCATTTAACCCATATA:1 - chr2L 4929780 3' - blood 7054 2 56.16 ACGCCAAGATTTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGACACACTGGAACTTCAGCTCCGCGCGCAGCAAGCTTACGGCATTTCTGCCTGCAGGGGCGCCGTTGACAACTGACAAAT:1 + chrX 11714765 3' + Chimpo 53 1 72.09 TACTAAAAAAAAAAGAAAAAAATACTAAACGTATACCAAAACCTAATATTCTTAGAAACTTTTAATCAAAGTAAGACCTTTTTCGAATTATATTAATATTCTGGCTATTTTCGCATATTTAAAATCCTTGAAATAACCCATAAA:1 + chrX 13947358 3' - hopper 153 6 49.31 GAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACATCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGAGAGAGAGATAAAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - Cr1a 289 1 72.00 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACA:1 - chr2R 13761633 3' - jockey 4757 1 76.71 CGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTACTTCGTCTTGGTCCGCAATT:1 + chr2R 5173251 3' + Stalker 379 4 63.01 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCAAAATACATTTGG:1 + chr2R 11256267 3' + roo 9020 2 53.42 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTAATTATTTTTAAATAATGTTTAGGGAATTATTGTTACGAGAAACCCTTGCTTCGCCAACGCCTTTACT:1 + chr3L 14375726 3' - roo 53 2 57.53 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTCATTTACATAATTTTTGCGTT:1 - chr3R 18635183 3' + opus 7463 2 59.31 ATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGACGCACCGCACCTCTGCACCTATGCTCTGTGACCCTTTTTCCATATCCATATCAGAAATTTC:1 - chr3R 5773109 3' - Stalker 30 4 64.38 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGGTACTCTCCCTTCCCCAAGTGGCATATGATATGG:1 - chr3L 22594140 3' - 297 61 2 60.00 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAAAACATTTTC:1 + chr2R 10160617 3' - hobo 57 1 54.79 CGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTT:1 - chr2L 15013263 3' - BS 4955 1 76.34 AGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTTCCTGGAAAAGTATTCCCATATAATTTTTAATTACAAAACAAAAAGATTTTATATTTATAATATAACATAACTAGCG:1 - chr3L 18035444 3' - mdg3 5251 1 74.66 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATGAAGTTATTGATTTATACATTCATTTCACCTCATGTGCTA:1 - chr2L 16857859 3' - P-element 82 1 28.08 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTGGCACTGTGAGAATTGAAAAAAGGGGAAAC:1 - chrX 7756351 3' + roo 9042 1 39.73 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTCAATCGTTTTAAAGATTTAGCTGATGTCATAGGATGTTCTTCTCGATGATTTCATA:1 - chr3L 25607269 3' - 412 7117 2 63.19 GCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATGTTGGTCACTTTGATATTGCTACTCGTTCGACATGAAAAGACCATAGAACCGAATGATAAATAAATAAGAGAAACCATTTTCTGCCTTTTGGATT:1 - chr2L 19400762 3' + Doc 119 1 69.66 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAA:1 - chrX 21403404 3' + roo 8996 2 67.12 ACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGTATACTGACATAGTACAGGAAGTTCGTAATAAGGGTAGAAAAATGGCCGGATATTATTCATAACTTAGTTGG:1 - chr2L 18630419 3' - G-element 14 1 75.56 ATTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTGAAGCTTTTCCTTTAGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATCTAATTACTTTCTTTTTCCTGGGCATCTCTGTTCGCCACCCTCCGGAAAATAGAAAACTGCCATTGGCGC:1 - 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jockey 72 1 68.22 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAACTCGCGTCGCACTCATGGGGATTTTTTGTTCGAAAGAATTTCTATCTGTTC:1 + chr3R 8849877 3' - 297 38 2 57.14 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAATGTAAAGACGAAAACTCGTGTGCATGACTAATTCGACACTTTGTTCCTTACATATCTTATACATTTTCTGACGGAT:1 - chr4 916277 3' - roo 45 2 54.79 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCTTGAAATCCCTCGGCATAAACCCCACCAACACTCGCAC:1 + chr3L 12223252 3' + Transpac 5186 2 56.16 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAATAAAGCGGAAT:1 - chrX 21403393 3' + roo 343 2 59.59 AATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCACTGACTCCACTGTCCCACTCGAATCCGCTACGTCGTTGGCGTCTCCGCTGGAAAACCACCTGCCGGTCGGTATGG:1 + chr2L 23189413 3' - Stalker4 49 4 59.26 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGG:1 - chr3R 14049323 3' - transib2 36 1 55.81 GTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGAAAACCACAATGCACCCACGCCGACGAAAAGAGAA:1 - chr3R 10957868 3' - accord 7035 2 81.43 ACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGACAAAACAAACAAAACAAAAAACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTGCTGCACAAAGCACAAAAGAA:1 + chrX 12082245 3' - Cr1a 240 1 77.08 AGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTAGCGCTTGATTATAAAAATCGTTAATCTTTGTATATTCTCCAATAAAGTAATAAGCCATGATCGTCATACCAATAGTGTGC:1 - chr2R 11256135 3' - roo 8703 2 56.16 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTTTTTCTGTTAATGAAAACAGTGTATTTAAGCTTAAATCAGAAACATTACTCCTTAACCCATTTTAATTATTGAAATTCTAAACAAGTATTTCTGCATGTGTAAACC:1 + chr2L 19691382 3' - roo 8678 2 73.29 ATATTAATAACAACACATAATAAAAACCTAAAGATTGATTATCCATTTATATTTATTTTGGAATAAATATTCCTAGTCGTGTTAGTTGTGAACCCATTGAAGTTCGACTGCAGCTCAGATGTTGGTGGGAGTTCAGGCAGGACCCA:1 + chr3L 307978 3' + hopper 1120 1 67.12 ACATAAGCCGATTGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATGCATAGATATATGATTGTTTTTCCATGTAAATCGCAGGACG:1 - chr3R 7321018 3' + Stalker 173 7 78.08 GTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGTGTAGTGTGCGCGAGTTAACGGGAAATCGCAATAAATG:1 - chr3R 22825138 3' - accord 7033 2 80.00 GAGGGTATAAGGTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTAAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTATTTGTATGCTTTTTAACCATGGCCTGCCACTTGGAGCTAAACGATGTTTCGCTCGACGACGAGTATGCACGAGTT:1 - chr3L 26344847 3' - Porto1 313 1 56.85 ATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTAATCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATTGATTTGCAGTAGAAACTGCCGGCGCAGCTGTTCCAAGACCTTCGTA:1 + chr2L 6384409 3' + Stalker 7024 4 63.85 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCATACCTATATATAGTGTACATACCTGGGAAGACTTCGGAGTTATTTTTCTTTTAACTGATAATGCAGTTTCTTTATTCAATTTTATT:1 + chr3L 10853849 3' + 1360 3354 1 69.86 CATGGTGGCAATTGATCAAAAATNATATAGGTTTAAAGTCCAAGAACTTCTAAATTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTATGCACACATACAGTTGTTTGTCCAAGGCAGTAAAGTCACAAAATGCC:1 - chr2L 17555726 3' - 1360 264 1 78.77 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCCTCTTCTCCATTGTTCCGCTTGCTTGACCAGGCAGCAGCAAGTAC:1 + chrX 15164953 3' + P-element 2881 2 48.11 GTATATTTGTATATTTATTCTTCTAGAAAATCAAAAATAAAAAAAATGTTTACGTCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCAATATACAAAAATGCTTTGAGACAAAACATTGCTAATAATTAATAAGAAAAATCAATATC:1 - chr2L 6251865 3' - Stalker 89 4 56.85 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGGTTTCGCCATCAGACTCTAAATGGAGGCCAGGCCAAATCCA:1 - chr2L 12291802 3' + Tirant 8487 2 71.43 GTCCTTGTATGTTTTTCCTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTGACATTACTTTGGGCTCCTGGAGCTTGTTGTCTGTTGTCCTTTTTTTCTGCGCCGTATCCTGCTGTTGTTTGTCTTTTTACACCAAAAACCTGTCAACTGTATAAA:1 - chr2L 9323148 3' - HB 410 1 68.49 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAATTATTGTCGTTGTTGCAGAGTCGG:1 - chr3R 15295718 3' + roo 352 2 65.22 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGGTTTTCCAGCATGCAACT:1 + chr2L 14239241 3' + 412 7487 2 58.22 GGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGACCCA:1 + chr3R 8049020 3' - Q-element 119 2 60.63 CTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTACCATTTCATAACTGAAGTGAATATATGCAATCACTCATTTATTCATTATTCATTATCCTGTTTTGGCAGAGAGCTCTTGCTGCA:1 - 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297 44 2 79.79 TAATAATTATAATATGAATCATCTCATCTACCGTCAAAGATTCGAAATCTTTTTACAAATTTTAGCCCGTTTAGTGAAGTGGTTTTTGAATAATCAATTTACCAAACACGGTGTCATTTAACATAGAAAAATAGAAACTGAATTCT:1 - chr3R 17608656 3' + mdg1 57 2 75.34 AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCAC:1 - chr3L 7837168 3' - jockey 4825 1 57.64 ATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGTAAGATGTT:1 - chr2R 5582130 3' - Cr1a 449 1 71.92 CAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAGTATCTGCATCCGATTTGGCCTTCCGACTTAATGTTGTTGGATCAGGTAGTAAGTCATTACCAAGGCAGCGGGACAGTGATTATAATTTCTTTAGTCTAG:1 - chr3R 16536849 3' - hobo 2489 1 52.74 ATTTGTAATTAGTCTTAAGTTGAAAGTTAGACGAACGCTGTCGATTGCGTTTAAAAGGAATCGTTCGAAGTAAGAGAAGCTAGAATGAATATATCTATAAGTAATGATGCAGAGCTGACAAGCGAATAAATTATGTGTGGGGAAAA:1 - chr2L 17875380 3' + McClintock 266 2 75.34 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAAATGAGCGCTAAACGAGCTCGAAGCCTCCAAGAGCAGCACGATTTTTTTTGGGGCTGCCTGAAGAAAGCCGCCTTGGAGTTTTGATTCCGCACTTTTTC:1 + chr2L 11405902 3' - 412 14 2 73.38 ACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACACGGCCATTCTGACATTTACATATTTATCATTAAATTTGTAACGAGATTATTTTCTTCTTTATAATTACG:1 + chr2R 19528386 3' - micropia 143 4 66.44 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACATTCTATACTTAGCCACTATATATGTATATATTTGAATAGTTCAGCGATTGTTGTCCTTCATGCATTGGTTTATTTCGTTCTG:1 + chrX 11008432 3' - hobo 28 1 60.00 CATTAAAACTGTAAATCATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTGCCCAGAAATAAAGACGGAAAAAGGGAGTCAACGCCTGAGAAA:1 - chr3R 31887274 3' + HB 1570 1 59.44 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTGTCAAAGATGATTAGGCATAAATTGA:1 - chr3L 19031176 3' + roo 397 1 76.71 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAGACAGCATG:1 + chr2L 21153573 3' - 1360 65 1 62.33 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACACACACACTTGCGACTTGCTCGAATGCCGATGATTGCTCTCCCCTTCCTGCGTGTGGGTGTGTGTGTTGTTCTGGCGTTTGCAATCAACCTTCCTGCTGACAATTGATTTTT:1 - chr2R 8665972 3' + P-element 2880 2 76.03 CCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTATCTATTAAACTCATAATGCTGCGTTTACCATTACTATCATTATGTTTGGGGGTGTCTATATCCTAACATAAGCCTTGTTTGCTTGTGCTTCCCTGGTAAAAGAAACGC:1 - chr3R 7823246 3' - flea 4763 1 78.47 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTGTTTATTAAGCACTTACACTTGCGCTATGTTAATCTCCCTAGAATATACATCCGTTTGCATAAGTAGCCGCTATAGCCGTATTTCACAATCAACGA:1 - chr2L 4637157 3' + mdg1 7434 2 66.44 ACATAGTAAAAAACATATAGACAGACTAAGAACACATGAAAATAACTTAGCGTTATTTTCTGAGCTCTCAGAGCATTTAGGAACAATATTGCGTAAGAATCAAATGTTTTTACGTTTCAACACATATATTTATACATTTGTTTGCC:1 - chr2L 19821949 3' + G4 3599 1 62.33 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTCTTTCATTTTGTTGGCAATCGATTCGATGGCCATTGCAGTCAA:1 - chr2L 19406999 3' - Doc 23 1 58.90 TTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACCTAGTATTTAACGTTCTACGTATTTATAATCATCAGTCGGAAACTTTGAATT:1 + chr3R 25277694 3' + 3S18 290 2 57.60 AATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTATCTATATATATAAAGCCTGGTTTTAATTGCGGCCAATGAGTATTAATGCCAATGTAATGCAAATTAGACGTAAA:1 + chr3R 9549992 3' + Transpac 146 2 51.72 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCAGTTTGTGAAAAAAAAAACAAAACGCGCGCTAGAAAGTATGCTACAGAATTTATGGCGCACTCGCTGTCAAT:1 + chr2R 23441726 3' + jockey 4941 1 59.59 ACGCTCTATCTCGCTTGATACATGCTGGTCCGAACTCACCACAGGACAAGCATTTGTCTCATGTGCAACTATGCAACGAATAAAAAAAGAGAAAAGCACAAAAAATACTTGTCGAGGGTCGCATTCCGCTTTTTGGCACGTAATTG:1 + chr3R 9876753 3' - invader6 235 2 58.22 AACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAAGTGGTCGATTCTCACCCTTAGTTCA:1 - chr4 713189 3' - micropia 123 1 79.03 TAAAAATAGAATTTGCTTGCTGGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCATGTTTAATGTTTGAGCTAAAACAGCTGACGAAATGGTTGTCTTTTTTTTTTTCTGCTAATCGAAAATCGACGCAAATTACTT:1 - chr2L 5408606 3' - 1360 3264 1 54.11 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAGACTTTAATAGCCACTGTTGCCAGACACTAAAT:1 - chr3L 465943 3' + Juan 4180 1 63.01 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGATCGGAGCTGAAGCAGCTT:1 - chr3L 6355576 3' - Tirant 8155 2 54.11 CATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAAATATAACTTTTGGCTCATTGGGGTGTATGATTTATTTATTGATCTTTCGGCTTACAGATGTAGCAGGTGTCGCACTGATT:1 + chr3R 12581963 3' - 412 429 2 55.94 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAAAGTGCAAAAGGCTGGGGAACTGCAGAAATG:1 + chr3L 10469652 3' + roo 9051 2 69.44 CAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAGGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAATTTCATAAAAATATGATAACTA:1 + chr2L 6007626 3' - 1360 443 1 45.21 GATTTTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTGGGGACGGGATAGCTTGCCATAAATCATCATCTATATTATATAGATATCGCCCTATGACGCCGCATTTTTCCCGAGCCTGCGGTCTTAATAGCCCTTTTTATTTTCGTTTTTTATTATTAT:1 - chr2R 19934690 3' - gypsy11 3935 1 62.33 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACTCGC:1 - chr3R 20450415 3' - hobo 24 1 58.33 ATTTATGCCATTTAAATAATTTGTCTATATACGTATGCCACTGCTAATTTAAAAATAAAAATAATTTTTCCTAAATCAGCACGCACACCATCACAATCCAATAACAAAGCGGTGGACATGC:1 + chr2L 2331161 3' + Tc1-2 1414 1 66.94 GGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACATTGACGTAATTACTAAATACTCTTGGCGCTTTCTCTGTCCTGGTCAGGTACTTTTTCCT:1 - chr2L 16066370 3' + BS 4910 1 57.97 TAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGG:1 - chr2R 10910227 3' + Tabor 7244 2 71.92 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCG:1 + chrX 4673669 3' - roo 8742 2 80.62 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTATTGAGGTGTCTTATCTAATATTTAGAA:1 - chr3L 785864 3' - I-element 43 1 56.16 GGATTAGCCTAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAATCAGAGGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAAAAAGGCCCAATGAAAGGCTTTCATTGATGAGTACTTGCA:1 - chr3L 24088983 3' + 412 7383 2 69.86 ACGGCCATACATTGGTTAAGCACTTCTTTGGTGACGGCCAAATTTGCCCTCAGTCCGCCCATTTATGCTCAGAGCGTAAGAAATCTTAGTGCTGTTGATTCGTAGGAGGGCAATGTCATTTGCATACTTGGGCTGGTCGTAGTTCG:1 + chr3R 9743773 3' - 1360 3360 1 58.90 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAGGCCATTCGTATGT:1 + chr3R 25862659 3' - roo 8741 2 71.23 GCCTAGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATATAAGATTAATTATAAAATGTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAGATCGTAGTCATTTTAATCACAAAATTTAATCACAACATTAT:1 - chr3R 7080614 3' + G4 3746 1 71.03 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGCATTTTACGTCCTTGAACTTACCCGGTTGCCATGAATCCT:1 - chr2R 15075551 3' + mdg1 382 2 58.90 GAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGACGAATAATAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACGCGGGACTGTGTACCGATCGTGGTAGAAGATGTGGGAGCAGCCAAGAAGAGAGCGCAAGAGTGGAACGGCGTAAGAGA:1 - chrX 3689280 3' + Rt1b 5120 1 38.52 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTATCAGTTACACCTGGGACTTGGGGCTTCTATAGGGGCTACCATGGCGGTGG:1 - chr2L 3231872 3' - roo 8699 2 55.36 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTTCAAAATGTCATTTATTCTGACTGCAGTAATTACAATTTGATGATAGGTCATTAGAACTGCGCGACT:1 - chr3R 12379691 3' + roo 9017 2 56.85 GAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCC:1 + chrX 388315 3' + 1360 3311 1 72.41 CTGGGTTTTCCCCGTATCCTCACGCTCACATCCACAGTTGCCCACATGCACACACACACACACACACACAAACATGGGATTGCGAATGCCAAACAGGACCACAAACAGTCGTCCTGCTTTG:1 + chrX 20112799 3' + copia 4734 1 76.03 CATGAAGCTGGCATTTTTCTCTGCCTGTCCCCCCTTTTTATATCCCAGTTATCTCGTACTCCTTACGTCTCTATCCCATGGTATCATAAACTTTCGCTCCTCGGTGAGTGCTTTTTGCCCTTTTTTTTATGGGGGCACATTGAATA:1 + chrX 13021197 3' + 1731 4448 1 57.53 TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTA:1 - chr3L 785907 3' - I-element 86 1 75.34 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTAAAATCGTCAGCAACGAAAGCTT:1 - chr3R 16276282 3' - pogo 9 1 78.42 GTAAGTATATGTGGTCTTACACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGCATACCTTGAAGGGTCGAAAACGCTTGATTCTGTCAGTTACATAATTTTACGTAACGGCTTTTTTCGAATTTTAATTTAGAAAGGCTGTTTGGGA:1 - chr2L 21874562 3' - Quasimodo 19 2 71.92 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTACCGTAAACGGGGGCAAATTATACATCTCCGGCTCGAAGTCGTCCAGGTACTCG:1 + chr2L 1353249 3' - roo 8755 2 61.87 CCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAGTTTTGTATGCGACTGGGTCTGGTTGCTGTTTGTAATATTTTGTGTTGCATACTTGCAGGCGC:1 + chr2L 5646978 3' - jockey 4589 1 54.62 ATTTAACAATGCACTGTTATAATAACAGCTGTTAAAGTCAGCTGTTGCGAGCACATACCACGTGGCTGCATTGCGCGAAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAGAACTTAAATTGTATGTGTGAATAATTGTTAACACAATTA:1 - chrX 19317143 3' - hopper 1287 1 71.92 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATT:1 - chr3L 18253790 3' - blood 7077 2 62.33 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTAGGTAAACCGGTTGGTTGTTGTGTTGTACTTGTAAGTATGTAGACACATACATACATAATCCGCCTGCTCCGTTT:1 + chr3R 7089583 3' + P-element 2867 1 65.83 ATATACATATACATGTATATACATATGATATGTACCTCATGTCAAGAAATGTTCTTTAAGAACTGACCAATTGGCAATCTAATATGCTTGGCATATACATTTGTAACACCGCTAATTAAATCCTGTTCATTTTTACAACGTTTTTA:1 - chr2L 2929327 3' - Stalker2 7498 2 47.95 GGGGAAGTCAAGCCCTCCAACATAATCAACCTAAATTCAGTATTAAAAGAGGCGATGTGACTGTAAAACGCATCTGAGGCAGGCCTAGGAATAACATTTTTTCATAATTTAGCGTTGTTGTACGAGCTGAATTTGGTATGTGCTA:1 - chr2R 6060433 3' + gypsy 357 2 68.28 GGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAACTCCCTATATTAGCTATATCGATAATATATAATTATAATATAATATAATATTAATGGAAAGGAACAAAATGTTCTATATAAGAAAATACCACAATCCACTCTTTCGAAACCCATTATCCT:1 + chr2L 13481413 3' - Stalker 4 4 64.38 AAGAATATATATACATACATATATAGTATGTATGTGTGTATGAATACATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTTTTATTTTGTTTTTTGTCCATCGTGCTGTGATTCTTGTTGCTGACAATAAAT:1 + chrX 11541605 3' - 1731 4413 1 78.08 GAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACCATCTGCTTATACGTAATATTCTTACATTGTATTTATTACTATTATTATTTCGA:1 - chr2L 1360936 3' + Stalker2 334 2 62.33 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTAGTAAGTACACGACCCATGGGATGCCCTGGCGCAGTTAAAAATATTTACTTCTGGCCAAGAGTTTACCATAACTTGTAAGTGG:1 + chr3R 27323188 3' + 297 6943 2 62.33 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAGTTAACTTAATGGTTATAAGATTTGATCTTGGAATATTTCTTTCTTTTTCATTTTGTTATTGGTTTTTCTAGGTTTGGAATCCATACTTTTGATCCTGACTTTCGTTAAAA:1 + chr2L 11296301 3' + 1360 3380 2 76.03 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTGAGGTACCTCTGGGCTGCTGC:1 + chr3R 27810082 3' - Burdock 6193 2 79.25 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATTAATGCCGCTTTAAGGTATTTTTGCGCTGCCCGCAAATGAATTACTTTGCCATTTGGCACCCGACTGATAATGAATCTAATGGATGCGCTAAT:1 + chrX 5783071 3' + roo 9046 1 35.62 GATAATTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAACCATCGCTGGCACAAGGACCCGCTCCCGTTTTCTTGGCACACAGGGAGCTCGGCTGGACCAGAACATGTGGCAGC:1 + chr3R 14218542 3' + roo 9023 2 52.05 GAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTATCGCCATGGTCAGACCGACATGGCAATCCCTCTGATTTAATATATAATATATGTATATATGGTTTTATATGGTATCGGACCGGC:1 + chr3L 7939163 3' + R1A1-element 5310 1 62.22 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAATAAAGCGGAATCATGTGCAGAAATTTTTATAAGTTAGGTGTA:1 - 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transib3 2433 1 59.59 GACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTATATTAAAGTCCTTGGCGAACATGCAATAAATAGGGATCATCAATATAGGTATA:1 - chr2L 5649960 3' + jockey 4625 1 63.01 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCATAATTCCAGCTTATTTGCTGGTGCAAATAGTGCTAAATAAATAAACTAAGAGCTCGATGGATTTTAAAATCCAAACAATTTAATTTCATATATTCCAGTATAT:1 - chr3R 25751746 3' - roo 8678 2 64.08 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTAACCCCTGTTGAGAGGCGGCAGGATTCTCGTCAGTTGTTTGCTTAAAACAAATTACAAGCAGAGTGAGAGAAATTAATGAACTTTAAGCCAGGCCAACAACAACAA:1 + chrX 7742026 3' - hobo 14 1 74.66 AATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTCGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGGGTGGTAAAAGTAAGGATAAATTATGTATAGATTTTACTTTTTTGTTGCCTAATA:1 - chr3L 23324438 3' + 1360 3326 1 65.07 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGGTTTTGGTTTTTTTTTTATTTCAATAATTTAGGTCATTTAAAAATGTACATTTAC:1 - chr3R 20840061 3' + roo 9010 2 63.89 ATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTACGATTTGGTTTAT:1 + chr2R 4206662 3' - 1360 316 1 73.97 AAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTCAGATTGCGTGTCAGTCCCTTTCCAATAAAGCCTTTAAAGAGTTATATTACAAAAATTAGGT:1 + chr3R 5543304 3' - copia 95 2 57.53 GAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACACATTTATAGAATGTGAATTAACGCTTTGGTAAAATATTTGTAATATTTTGTGCAGTGTTTTCCTTGGGCTCCTGCTGCTTTTAAAGCCTGCGTTGCCGCCCTTTGTCG:1 - chr3L 17992198 3' - invader2 17 2 54.11 AAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTTTCCTTGATGCGCATTTGGCACAGCGCTGAAAAGCGTGCTACACTTTTTGAAATCCTC:1 + chr3R 26846843 3' - hopper 61 1 59.59 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCAACAGTGAATCCAAAGTCAAATGAAGGAAAACGAAATTATGAATATCCATGCGAAAAAATGCGAGTTGTCAAAAGAAAACTCAATGGA:1 + chr3R 10211691 3' + P-element 2820 1 60.96 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAGACCAAATATTTTCCAATTAACC:1 + chr2L 5792130 3' - blood 19 2 72.60 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCC:1 + chr3L 10469587 3' + roo 8984 2 80.82 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGCGATTATGTTGCTCGTACCGAGAAAA:2 - chr2L 14239105 3' - 412 7081 2 66.44 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATTTTCATCTAATTAAAATGCATTACTACTTCGTTATCTAA:2 + chr3L 9470045 3' - 412 43 2 56.16 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTGGCCAGAACGTCAGTGCCACGCGATTCGTGGCAATAACAAATGTGAGACAGCCT:1 + chr2R 10910351 3' - Tabor 19 2 68.49 AGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGTCGGAGACGGGAACGACTGCTGAGCTGGGTTAGATTTCTCGCTAGGCGGTGGGGGTGCAAGGAAAGCGTGCTATATGTTGGGCGCATTGAAAATCAAAAAACTGCTTTGCGCGTGCTCTTGG:1 - chrX 22884162 3' - F-element 4527 1 63.45 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGAGAA:1 + chr2L 21910259 3' - Doc 41 1 56.16 ATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGG:1 + chr2L 12291936 3' - Tirant 8174 2 65.75 GTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTAAAAATTCTGTTATTGCTGTCGAACACACATTAAAATTAGACTAAAATAAA:1 - chr2L 15644864 3' + transib2 2756 1 64.38 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGAAAATACGTTTGAAGATTTGTTTCCAGTGC:1 + chr3R 28117076 3' - hobo 49 1 55.56 ATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTA:1 - chr3L 18484385 3' + hopper2 1537 1 63.45 ATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTTTAAACAATTTCCTGCTGTTGATTTTTCGCTCCACTC:1 + chr2L 17381021 3' + hobo 324 1 70.40 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACATATACATAGAAGGGACTAACAATGCAAGTCTCTCGACTCCTTTTGTTGTGGTCAATGTTGCAACCAGTTGTTGTTGCTGTTTG:2 + chr3L 14302311 3' - Quasimodo 25 2 67.81 GCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCATCGTAAGCGAGAGGCGAGGGCAATTGTGGCCGTCAACAAAAAGGTAGTGAAAAACCAAGCATACCTGGGTCCAAAGGGGTATTAATACGTACACATATCTCTCTATGAAAGAG:1 - chr2R 18753737 3' + 1360 3270 1 70.55 GATTTATGTCAAGTTCCGGTCAGGCAGGTCTTGAGGGGGGTGGCGTTTCAGTGTTCTCGTTCTCGTCCTTTGGCTTTGGGCTGCGATACTATCTTTGTGGGCGTGATGCAAATGCAGAACAACATTGTGTTCACTGAGAT:1 + chr3R 12931995 3' - jockey2 3203 1 62.86 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATAATTTTTCACTGCCGATTCGCAATTTTTCGGTTTATACTTG:1 - chr2L 19652480 3' + roo 387 2 69.18 GCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAAATAAACTTTTGCGAGCCTACAATGAAAAATGAACAACACAACAAAATATTGTAGAAGATCGACTCAACAACTTCCACTAACATAAAATGTTTGTATACTGCGTGATATATCAAATATT:1 - chrX 21078216 3' + Doc 327 1 47.59 GGTCGCTGACGTGCGAAGACGGGCATTTATTGAGCTCTGTATTAAATCGGCTGATTTTGTGAAGTGAATGGAAATTAATAAAAAATGGTAATAAAGAAATCCCAGCGCCGTTTCTACGCTTTTAGGCAGTGCGCTCAATGCTGGTT:1 - chrX 3649897 3' + Doc2-element 8 1 79.45 ATATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCATAGCTGCCAAGCTGACCTAATTAGATAAGCGAGA:1 - chr2R 21848614 3' - Transpac 4920 2 79.45 TTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTGATTCTCTCTGCCTTTTGCGGTTTTTCGTCCACCGTTTATGAGTGGCAATTTTTTTTGTATTTTATACCGCAAACTCAGATCGCATAGTATAGTTATTGGATTCGCTGGTGAGC:1 + chrX 9579931 3' - Doc2-element 236 6 77.04 AAAAAAGAAAAAAAAATGGGGAAAAAACACGAGCACATAAGCCTGTATCTGTGTGCAAACACACTCACAGAAACAGCTCACACACACACACACACACACACGCACTAACGCAAGCGCAAAAATTGTAGCAAAGGCAACA:1 - chrX 3761391 3' - hopper 138 1 58.27 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTCTTTGTCATAAAAATGGTCAACATAACGTAGAAATGTTGCCGAAGCATTTGATGCGTGCAATA:1 + chr3L 18392859 3' - roo 8722 2 58.22 AAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGGGATTCCCCAACATTAATA:2 - chr3R 25543438 3' - G2 216 1 38.36 AGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACACCCACACACAGAGATAAATACACACATAAAAAT:1 + chr2R 1000384 3' - HMS-Beagle2 84 2 76.03 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACTTGCACTTGTG:1 - chr3L 18484373 3' + hopper2 1548 1 55.48 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAGACCAAATATTTTCCAATTAACC:1 + chr2L 5792130 3' - blood 7 2 79.10 TAGATCTGACAATAAATCTGACAGCAAAATGAACGAAATTGGATGTTCGAACCTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAAGGTATGGTACTTAAGCTCTCTTAAAATCGAATCTCCCCTACCACAAACTTCCCCCAACAATTGTGCGTG:1 + chr2L 9283981 3' - GATE 415 1 57.53 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGACCTTTCTAAAAGCTATCGCAGGCAGTAACCCTCTA:1 + chr3R 6645399 3' + blood 304 2 72.79 CAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGCTTTGGTGCGTTTATAAGATAAATATCAATATAATAATATAAAGTTTTCGTAATTGTTTA:1 - chr3L 16855203 3' - FB 62 1 60.69 CGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATT:2 + chr3L 18484471 3' - hopper 66 1 63.70 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTTAATATGCAAATTGATGTTGCCTATATTTAGGTTTTGCCGTTCCCTCCGCTCGAAAGGCCCCTCATTTCCT:1 + chr3L 14383486 3' - roo 8735 2 51.03 CTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATTGATATTTTTTCCACACAAAATCTTTAACATCTTTAACAACTTACTCTTATCTGTACTAACTTGTCCACTAAAATGGCACGAGTCTTCACATTTCTTTGTTCACCCAT:1 + chr3L 7859696 3' + roo 302 2 77.40 CCGGTATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTTGTTGTTGCTGTTGCCGCCGCGATGCGGAAGAATAAAACACGAGTTTGTTTTCTTGTTTCTGTGTGTATTTTAAACCACA:1 + chr2L 19159776 3' + 3S18 5760 1 56.85 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCCATGTTAATTTCGAGCAATTATTGGACAACCCTTTCAGATTCCAGATATTATAAGGAAAAG:1 + chrX 16994593 3' - roo 53 2 59.29 ACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACTAAAATAAATGGTAAAAAGTCACAGATTATAATCAAAAAAGTGTACTGATTATTGTATCAAATAGTACGTGGTCAATACGACAACATGCTA:1 + chr3R 12744767 3' - Stalker2 7280 2 50.00 GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATTTCTATTCAGTCGTTTGTGGTGCGAGAAGTCGTATATTGCTT:1 - chr3L 14167350 3' + mdg1 343 2 70.55 CTCTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCAAGCCGGTTTGCAGTTGCACCTATGGCCAATGT:1 - chr3L 4949960 3' - Circe 221 1 45.00 CTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGGCACCTTGATATGGATTTCGAGCTAATTGACCAAAAACATTTTTATAAGAAGAAAGCAGAATTTACATTCCTTC:1 + chr3L 19133689 3' - invader2 4738 1 68.49 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATAACAAAAATAACTTCATTTAAAAATCGTTTCTTTCCGTAATCGAAAGCTTACAAAAAGGGCAATCATCT:1 - chr2L 5791977 3' + blood 7338 1 54.79 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATTGTTATTTTAAGATCGAAAAGTTTCATT:1 + chr3L 18484498 3' - hopper 39 1 59.59 AAAAAACACGGAATCTGGCCCAGTGTGCACTGGAAGGAATCGCTGTCTCTCTTTCTGTTTTTGTTCGGGTCTCTTTGCAATGCTGAGATCGAGTTCAGTTGCTTGTAGACAACGAGTACGTGCACATCGAAAAAAGATAAAATAAA:1 + chrX 22908586 3' - transib3 6 2 62.33 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGACCACCACCCATTTGCCATCTTCCAGCAAGCGCACGCCTGTCATAAATCTTGTTTTGAATGTCCTGCCAGCGTTGATAGCGCCATGGTGAGAGAGG:1 - chr2R 20447750 3' - hopper 24 1 69.18 TATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTATCTTGTTATTAGTAGATTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTCGAATGGTAACGGCTTAGACTTTGGACGAGCACAAAAAGGACGAACCGTTAACTAAAGGA:1 - chr3L 25255217 3' + Burdock 6197 2 59.59 CATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGATTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGTGATAAATGGCACATTGCATAAAATCAATGTCGGCAGATTATTAATAAGCCATTTTTCA:1 + chr3L 3316453 3' + hopper 218 1 58.22 CCTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGA:2 - chr3L 14375611 3' + roo 354 2 54.11 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTAGGCTATGATATGTGAAATATTCAAAATAC:1 + chr2L 5270387 3' + jockey 4946 1 54.79 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAATATTTATGAAGCATATTTTGCGGCTCCGTTATTTATATTTCTTTGGTCAAAATATCTCTTCTACTT:1 + chr2R 11264080 3' + jockey 4938 1 57.53 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGCGTATATTTC:1 + chr3R 25751903 3' + roo 9039 1 58.78 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGTCTTGAAAAA:1 + chr3R 25050053 3' - P-element 95 1 20.55 ACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTTGTACAATTTGCAGTGCAGCTGAGCAGCAGTGACAAAGAAAGAACTGAAGTAGATTTGAACGCT:1 + chr3L 8049498 3' + roo 8626 1 55.48 GTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGTATCTTCTCAAAGTTGTGAAATAGTTGGAATCATATTGTTGCAC:1 + chr2R 18485440 3' - hopper 1156 2 69.86 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCAAACCGTAGCATATTTAACAATAACAAAATGTAGCATACATT:1 + chr3L 2216607 3' - jockey 87 1 69.86 AAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCGCAGGGCAAAACTATCTCATGGATATCGCCATCGATAAACTCGAAGATATCCTCCTTCTCAGTGCCGATAAAAGCCTTGCTAACAA:1 + chr3R 13943107 3' + Quasimodo 7014 2 63.12 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGGAAGCCCTTTTAACGG:1 + chr3R 30264095 3' - blood 45 2 60.68 ATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTATTTGTTGCAATGCTTAGCGTAAATTAAAAATTAATTGGCCACGGGTAGATATCCTTTACCCTCGGCAGTGCTC:1 + chr2L 19592913 3' + Stalker 6799 2 50.68 TACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAAACTCGCATAACGATACATAGAACATTACGCGCGAAGTAAA:1 - chr2R 12065553 3' - Stalker2 7281 2 64.38 ACTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACACTTTAAAAAACCCAAGAGAAGAAACTTCCGCTT:1 + chr2L 11965462 3' - hopper 152 10 79.66 GTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACGTTTTTGATTATCTTAAAAAATTGTAATCACACGTACTCCTGCCA:2 + chrX 2295300 3' - Transpac 1 2 73.29 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGGGTGTG:1 - chr3R 9125614 3' - Doc 11 1 81.34 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGTTGTTTTAAGCCTAATAAAATATTCCAATATGAATCAAGTATTTTATAGAAATCTTTTCAAAATTTTT:1 - chr3L 12223122 3' - Transpac 51 2 55.48 TGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGCGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGGTCTTTGTGCTCCAAGTGTTCCCGGTCAGCGA:1 + chr2R 14854815 3' - F-element 4479 1 77.40 ATCTACCGTTTGAAAGCCAAACGTCAACAACCATCTAAGACCATTGAATCCGGGGACGAATTCATCTTAAGACAAGAAGGAGTTAACACGAGCAAATCATAAAATGTAACTGGGGAAAATGTTACCATTTGGGCGTTGAAGCATGA:1 + chr2R 21859750 3' + gypsy10 5572 1 67.81 GGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATAAGTATATTAATACTTTTAATATTTATTCGTATATAGCATTATTTCGTTGTTAAATATGCATAAGACTCAGAAATTCTTGAAAAAACCGATGGTTG:1 - 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chr2L 6104819 3' - Ivk 45 1 55.48 GTGGCAGTTTTGCGCTGTTTGTGGGCAAAAGACATTGAAAAGAACTCAACAATTTTTCATGAAATAGGGGCTCTGGACATGCGACTGCAGTTCACTTTGGGAACACTTTTGAGGCATCGCGCCACTCGCGCG:1 - chr2L 1441071 3' - INE-1 234 1 53.79 GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACTGTTTGTTGACAAAAAGGTAAACAAAGTGAAAATTTCGCAAATGTGCAAAATAATTAAGTA:1 + chr3R 20635512 3' + 1360 3332 1 59.59 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCTTCCTTACTTTTTTCATTTCTAGCATTGGCTGGTTTTTTT:1 + chr2L 16331028 3' + roo 330 2 73.29 AACCAAAGACACTAGAATAACACTTATTCTAGTGTCTTTGGCACAACTGATAGTAGCCAATTTCCATTAGTTCACCATCTCAATAAACAAATGCTGAGGGCGCCACTGTAACCTCTTTGATTAAATACTTAGTAAATTAAGTACT:1 + chr3R 16205718 3' - Tc3 313 1 66.90 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAGGCCATTCGTATGTATTTCTATGTTGGATCAGGGCCAAGTTC:1 + chr3R 25862687 3' - roo 8712 2 51.72 ACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGCATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAACATTGCGGCAGCAAAATTGATCGTGACACTCAGATTG:1 + chr2R 6669291 3' - 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chr3L 19471448 3' + 1360 3356 1 48.33 GGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGAATTTTAAATTTTATATGTGCGTTGATTTTTTATG:1 - chr2R 1000325 3' + HMS-Beagle2 231 2 73.29 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTTGTTGTGTATTTGAGGCTAGCTAAAGTTATGAAAAAAAAAAATCCAATGAAACCTTAAGCTTAACGTGGCAGATGAAAACTAATTATTAACCTAAATGCCGCAAGAAGAAATCGC:1 + chrX 8350032 3' - roo 8670 2 78.08 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAACGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTAAAGAAATCTATAGTTCTTGTTTCGCTGTATAACGCACTGCTGTTACCTGTCAC:1 - chr3R 6645275 3' - blood 15 2 73.97 GCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACAAATATATATATGGGGCAACTGGGAGGGAACACACAAGTTAAAAGTACAATTTGATTTCAGAATACCTAAATTGTTGTAGC:1 + chr2R 21657169 3' + invader4 281 2 53.42 CGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTACAGCAAGAACCATCGGATACCCCAACAACACTAGCCCGCATCGT:1 - chr2R 1927586 3' + R1A1-element 5031 1 67.67 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCTACCCCAGATTTCCTTGTAAACTGATT:1 + chr3L 16973516 3' + S-element 1707 1 77.40 AAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCAGAACGCGCATAGTCGCATAATAAATCTCAATACCCAAAAGCCTTGTCTGTTAATTTACATAACCACTAACCACTTTCAACTATGTTTAGGACAAAAACTTTATACTCAAATTAT:1 - chr3L 27874572 3' + gypsy4 6769 2 73.97 AGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGG:1 + chr3R 10736108 3' - McClintock 75 2 76.98 CGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATATCCACTTTAGCAACCATATCCAAATGTTAAAAA:1 + chr2L 14625760 3' - jockey 268 1 77.24 AATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGCAGAAACATGCTGATCGAATGCTGAACTAATCGAAATTGTTGAGGATATTCTCAATTAGTCCTGTACTTCCCACCTAATTT:1 + chr3L 1469531 3' - 1360 439 1 52.05 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAACGAGTCAGCTGTTCGCCCGTATATATTCATAT:1 - chr3R 8217927 3' - P-element 62 1 40.97 ATTGATCTTGATCAAGAATATATATATATACTTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTTTGCCTGTTACAAACGTTTCAATGAATCTAGTATACCCTTTTACTCGACGAGTAACGATGAGGAAGGACATACATAAAATGGAGAAAAAT:1 + chrX 19122441 3' - INE-1 83 1 80.14 CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACTTGCACTTGTG:1 - chr3L 18484373 3' + hopper2 1549 1 55.17 AACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCAGCTTTTCGAAGTAATCAAATATTAAAAATTGATAAATAAAT:1 - chrX 886619 3' + Quasimodo 6915 2 71.92 TTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTTGCCTAGAGCACATC:1 + chr3R 14049471 3' + transib2 2802 1 69.18 GCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTCGTCACACGCATAAGAACCCCCATTTTCTAGCAGTTGACA:1 + chr2R 21409095 3' - Chouto 71 1 69.47 CAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTCAGAAGGAGTACACCAAGTAGAAAAGTTTGTCCATTGTGCTCGCCTAAAAAGTTTTAATGCAGCGCTCTTCAAACGAATGC:1 - chrX 20500778 3' - FB 41 1 56.85 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTAAAAACAGTTAATACTATGTACATATTTAATTAACAACTTT:1 + chr3L 7870265 3' - roo 78 2 77.40 GAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTGATAATAATATATTAATATTGCATCAAGTGTATCTCAGACTTCTCATTATCCTACAGATCAAGG:1 + chr3R 17586932 3' - Max-element 8293 2 57.53 TGTCTGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAAACACTGAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAT:1 - chrX 9023556 3' - accord 190 2 46.81 TACACGTGAATGTTTTATTACTAAAAGAAGGTCGTCAATAAATAAAGTAAAAAAAGTGAACCAAAGAATTATATCATTTAAGTAGGCTCCGTTGCGTCCTGCCATTTAGATATTTCTAAATAAATATGTAAATAAATGCCGACACG:1 - chr3L 6661512 3' - Q-element 549 2 80.82 TCTTACAAAAACTGAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACACCTTGTTTGAGATGCTAATGCTGCTAAGAACACGAATATCTCAGTTGTCGGGGAATAGAGAGGTTAACCTAAAGGGGAAAGAGGGAAAGTCAAGTTGCA:2 + chr2L 1776221 3' + roo 9046 1 67.81 GTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATAACTACTATCTTGGGCAATTATAGCTTCTCGGAAACATCATTCAGATTC:1 - chr2L 22689953 3' + Tabor 411 2 69.86 TGTAGATAAACATGGAAACAGTCTGCTTTTATAAAAATTGCTGGTTTTAAAACCTGAGTAGCCAAAAATGATTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTCTACTTAGAGATCTGCTTAGATAGCTTAGATAGTTAATAAATG:1 + chr3L 22734549 3' + Cr1a 424 1 70.55 GTGGAAGTTTATTTGGTCTCCCAACGGACTCTTAAGTCCCTTTCAATAGCTCGGTTGCTCACTTACCAGGGTAGCCCAGAGCAATCGTTGGAAATCGACCAAGATCGAAGCTTAAGAAATGACAGTGCTGGCCAAGAGAG:1 + chr2L 21646773 3' - G5A 2580 1 57.14 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGA:1 - chrX 388239 3' - 1360 66 1 63.01 ACAAATCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAATTTTTTTTTTATTTACGGTTTCCAATTTCCGAAAAACCACTGAACGAATATAACATTAAGGTTTTTATAGAGAAAGAGAAA:1 - chr3R 1849014 3' - Cr1a 491 1 56.39 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTCTTTCATTTTGTTGGCAA:1 - chr2L 19407024 3' - Doc 48 1 52.05 CAGCTGGGTAACGGGTATCTGACAGTCAGGGAACACGACTATATCATTCTCGCTTGTTTTATTTATTGTATTTAAGCGAAAGACATACTTCTCCTGTAAGCCGAGGTAAAACCCCAGTCGATTT:1 + chr2R 6027605 3' + INE-1 544 1 59.68 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTT:1 + chr2L 15777885 3' - 297 6621 2 64.04 GATATCGCATAAAAAATGCAGTGTTGCAACTTAAATGTTTTTAAATCTCGTGCTACTAAGTTTCCAATTCCTTGTGTTAGAATTCGGAAGTCCTTGACAAAGTTGCCTAGATCCTCCTTATCATAACTATGTCCTTGAATAACTCC:1 + chr3L 2960733 3' - transib3 138 1 54.11 TTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTCAGTAAAAATTCTGGAAATGATGCGGCCTTGCTGCTGTTCGTAAAATAGTAAT:1 + chrX 22945398 3' - BS 21 1 70.29 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGCAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAA:1 - chrX 388245 3' - 1360 65 1 65.47 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCATAGC:1 - chr2R 21848644 3' - Transpac 4949 2 59.31 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGACCACCGACCGACCGCTGACCATAATTCACTCAAGTTAGACAAAAGCATTTTGGTTGCCCCGC:1 - chr3R 21341315 3' + hopper 1409 2 71.58 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGGTACTCTCCCTTCCCCCAGTGGCATATGATATGGCTT:1 - chr3L 22594137 3' - 297 6628 2 55.97 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATAATAGAGTTTGCGGTTTTGACATTTTATAATTGAAAATATTTTGTAATTG:1 - chr2L 9274958 3' - F-element 41 1 65.07 ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGATAACTCACCTTGAACCGCTCGGCGCAACAGGGCATGGCCGC:1 - chr3R 30360209 3' + opus 7439 2 70.71 GGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTTGCACTTGTAAACTGAACTGAGATAGCGAAATACGGTGGTAGCCAAACAGAGAAAGTAATAGATAGCATGAGAGAAAGAGCGTTAGCCGAGTGCAAGGACCCGAGTTAGTGAGA:1 - chr2R 20596354 3' - gypsy5 6948 2 61.64 GATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCTAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCTACCAAATTTAGATGGCCTGCCTCTGGCCAACAGCAGTTGATTT:1 + chr2L 6590195 3' - roo 431 1 58.77 GAAATTGAATAAATATACGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCCCGCCCCTAACCACC:1 - chr3L 9469941 3' + 412 7485 2 62.60 GAACTGTATAAGAACAATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGATGGCAGATGATCTAACCAAGAATTTGAATAGATTTAAACATGAAATTATCTAGAAGTTTCTGGGAATTCTGGGAAATTGTGGT:1 - chr2R 18529611 3' + Dm88 4157 1 71.01 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACAGCACGCGGCTGTCACGTCAAGTGGTGGCCCACCTG:1 + chr3L 7460690 3' + 412 444 2 68.81 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAGG:1 + chr3R 6495326 3' - copia 4885 2 62.07 CGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAA:1 - chr2L 18630495 3' - G-element 57 1 78.43 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCGGTTAGGTTTCAAAAGTTATAGTAGTTGTAGTTGTTATGAAAAGCAACTATGTACCTAATAATCAT:1 + chr3R 8218056 3' + P-element 2860 1 67.81 ACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATTTGAACCTATTGTTCTTGATAAGAACGAGCTCCTAGCTCTCCATGTTGCTT:1 - chr3L 1854168 3' + Transpac 54 2 57.28 ACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGTGTGGTACTGAAGAAGCCCAAGACGAGAATGTATGCAGCAACCGCATATGGACATAAAGATAAGACTTTCGATGAAGCGATTGGCCGTAGTG:1 + chr2R 12351460 3' + F-element 159 1 62.07 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTAAAAACAGTTAATACTATGTACATATTTAATTAACAACTTTTTCTGAATTCAAGTTCACTTTTCTTTGACTTGGAATTCCCTGAACTTCTGTTACGCGAGTGCCC:1 + chr3L 7870329 3' - roo 14 2 74.66 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAAAACGCCTCCCGTTGCCACTCAAC:1 - chr3R 20934664 3' - 412 7107 2 53.42 CTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTCTAAAATTAAGTTAAGTTAATCAAACTTTTATAATTTAATAAGTGAAATCAAAATAAAATTA:1 + chr2L 12874364 3' - Transpac 58 2 58.90 GCCCCCGGCACTCTTATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGCGAAGTATTTTTTCTGACCAAGAACACAGCAAACAAAGCGAATCAATTTGTGACAAGTCGGTTGAGCAA:1 - chr2R 15603604 3' + gypsy4 286 1 71.23 CGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGATGCCTGCTTTTGTTGTCAAATGACGAAGGC:1 - chr3L 13690235 3' - hobo 29 1 66.44 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGG:1 + chr3R 21674918 3' + roo 9017 2 56.55 ATCTTTTACATCTATACCTGTCACATTTTTTAAAACAATTACAGTTTCTAAATGTAGTCAAAGCTGACACCTTCATGATTATT:1 - chr3R 14911965 3' + Stalker4 389 1 50.60 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTTCCCGTTGTTTAAAATATGTCGTCGAGCCAAGAATTTGTACTTTAAATGTTTTTCTCTGTGCTCTG:1 + chr3L 2330224 3' + roo 9050 2 68.49 AGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATTGTTTGTACTATTTACCATTTGGCGACCCGTTATCAATTGCAGGTGCTTTCTCCTGTAAAC:1 + chr2R 18689246 3' - Burdock 52 2 55.40 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCCGGAAAGTAGG:1 + chr3L 15723935 3' - jockey 4750 1 72.60 AATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACGCATATTGCATATTATTTAATTAGCACAGGCCTTCGGCGTGTGTTTATATTTTAAT:1 + chr2R 7599242 3' + diver 157 2 64.38 ACGTGGCGAAAATAATGAATGCGCGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTTTGATGTTGTTTGTTGGCCTTTGTAAACTTTAATCCCATCTATATGCTTATTTAGATTGTTTCGCTGCCATG:1 + chr2R 6597553 3' + micropia 5048 1 49.32 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAACTTCTCAGCTCTTCTACGGTGGAGTTAAGGTTGATGCCGAGCAGAAA:1 - chr3R 7450244 3' - Doc 11 1 58.22 GTCGGGGAACTCGACTTTAGCATTCTCTTTTGTTTAATCTTTGGTTTGTAAAATAAGTTCTAAGCTTTCTTAGTTTAAGTTATTTTCACTGATTGATGTAGGATTTATTAAGATCATTCGATAATATAGTTTTTCTTAACTCATTC:2 + chrX 22672491 3' + INE-1 568 1 52.05 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTTACCTACTTACATAGTTGTAGTCCAAGTTTGCGCTCTGAAAAGTATGCAACAAATTACGACAAACAGACTTGCATTTGCAGAAAGTTTCC:1 + chr3R 27374510 3' - jockey 28 1 69.12 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAAGAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTTTGTGGGTGTCTCCTTTGCGTTTGTTATATACTTTTAACTAGTTTAAGCCA:1 - chrX 8967346 3' - HMS-Beagle2 6906 2 68.49 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAGCAAGTGGACACAGAAAG:1 + chr3R 10030829 3' - BS 5013 1 76.52 AATAGATCTGGAATGTACACTCGCCTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATT:1 - chr2R 15075604 3' + mdg1 7367 2 77.40 TTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAATGCAACCGATAACTCCATCGTTACAAGAGCCACGTGG:1 + chr2R 5030051 3' - 1360 484 1 73.97 ACATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATCAAAAGGAAAGACAACAACTCTATCGAAAGAATTTCACCCTTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTAGTACTTTATGGATCGTTGGTGACATAGGATACCATGGAT:1 - chrX 22557853 3' + I-element 226 1 69.86 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTATCTAAGCCAAGTTTGTTATGTGGGTCGAAATGCTGCGACTGCTAGCCATGCCATTTGCCCAA:1 + chr3R 25804218 3' + mdg1 7402 2 56.16 AAATTTAGCTTTTCATTGTCGTGTAAGAGTTGGAGAACAAACTGCGGTGAGCTAATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGATGTTGCCGTTGCCTCTGTGTGCCCGTTTCAGCTTTTGCCTTTTGCATAGAG:1 + chr3L 9110569 3' + aurora-element 4172 1 61.07 TTATATGATTATGAGTATTAAAGAAGTGGAATGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCT:1 - chrX 15746293 3' - jockey2 3273 1 62.33 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATGGTGCAATATTT:1 + chr3R 14049457 3' + transib2 2788 1 59.59 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTGTTTGTAAATAATTTTAAAAAAATATTTGAAAATCACGTTGTTTCTATAAATTTCCCTTAACGCATATACA:1 - chr3L 7870169 3' + roo 9024 2 52.74 CAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCT:1 - chr3L 24272065 3' - gypsy11 78 2 57.53 AGCCAAGAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAGCCTGGCAACAATTTTTATAATCTTCGCCGGCAAGCAGCTGGAGGATGGCCGCACTC:1 + chr2L 4228169 3' - Cr1a 496 1 61.29 AAAAAATAAAAAAAAAAATTATTGTATCTATGTTCCTCTAGATTAATAAATTAAAAGCTTAACTGACAACTTTTTCTGTTTATATATGTATAACTAAAAGATAAATACAAATATATATAATAGGAGCCTTATATTAATAATGAAAC:1 - chr3L 18291432 3' - Tc3 86 3 76.03 GCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTCTCGCCGACATGTATATTATTGGTGCATTCATAGAAAGTTTTTCAGTGGTAGATGGCGACTTTACTTATCTTACTTATGTACAGTCTCATCTCAGTTCCTACTAATTTT:1 - chr3R 7481465 3' + invader4 3061 2 69.44 CGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAA:1 + chr3L 7801289 3' - Transpac 5103 2 68.49 AGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGATTTGTGTGTGCCTAGTGCAAATCGCTCCCTCTTCGTATTTTCCTCAACTTCTCGCACAATTGTAAAGAAAATGTTATTAAGGAGTTTCT:1 + chrX 5123713 3' - Doc 476 1 62.33 CCATCCCGAAGATTAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGTAGCAGCTCATTAGGCGTTGCCGAAAAAGGCAGAAACATCTTCTT:1 - chr3R 16810407 3' - Ivk 433 1 68.31 GTATACTGTGGTGTCGTCTTATTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGATGCCCATGTTTGGCACACCTTTACCGGC:1 - chr2R 18744591 3' - BS 4864 1 75.00 TTAAAACTAAAAAACTTTAAAACTAACCTACTTGAATAGAAAAGCAAGCATGTATTCTTTTTAAAATTTCACCGATTTCTCCAAGTGTAAAAGCTAAGCCGTGAAAGGCGCAGGGGATCGGGGGCATGGCCCATATATTAAACAC:1 + chr3L 11336767 3' + 1360 3029 1 63.45 ATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAGTTTTTTTGTAAATATCACCAGCTTACTGCGAATGGCTCCTTGGTGGATTTTCACTTTCTGCTGTTTTT:1 - chr2L 2120321 3' - I-element 4912 1 75.00 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACTCTATATGGGAGCAAACAGTCGAATAGAAATATGAAGAATGAATATAGAAGGAATAGATAGTACATA:1 + chr3R 6461851 3' - 297 52 2 57.53 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGTTCTTCCATAAAAGTGAAGCGAAAAGGGTTAACCTTTAAAATTTACAATGTCCCACGGTCGCCGTTTTTATGACAGAGGGCGGCCCACAAA:1 - chr2R 19843274 3' - jockey 20 1 74.42 AATCATTGTAGATCTAACTATAAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCCGACTATAATAGACTTTATTTCCTTTGCCTCGCCACCAGTGCTTCTTTTCGAGAGGTCCACACTGGAACTTCTACTTTTACGAACCCGTGCAT:1 + chr3R 25921678 3' + Cr1a 4151 1 50.68 AAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGATGTGGGTGAAGGCCA:1 + chr3R 16997478 3' - G6 47 1 53.10 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAA:1 - chr2R 9870996 3' + roo 327 2 73.97 ATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACCATCTGCTTATACGTAATATTATTACATTGTATTTATTACTATTATTATTTCGAA:1 - chr2L 1360935 3' + Stalker2 340 2 63.83 TTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTTTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTGTTAGTACATAATTAGATCCTACTAACACTGAAGTGCAAATGCGCCTCCTTGGACTCCCTGAACAATCTGACGGATGAGGAGCACG:1 + chrX 10955875 3' + Cr1a 4219 1 63.01 AATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAATATATTAAAATAATAAATTAAAATGAAAATAAATAAAAGTGAATTTAGTATTTCCATTTTAAG:1 + chr2L 16707940 3' + Stalker2 7593 2 60.96 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCTTTAGACCCAAATTCGAAAAATCGTTTCATCATTTCGCAGTACAATTTTGGCAAAACAATTTATTTTTGCCTCGTCATAATTGCGGGAAAATTGGTAT:1 + chr2R 7771448 3' - FB 22 1 69.93 GGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATG:1 - chr2L 15013249 3' - BS 4955 1 68.28 GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTGCGAAAGTCG:1 - chr3R 6413555 3' - 1360 67 1 63.70 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGAGCAAAATATTCATAA:1 + chr2L 21910271 3' - Doc 7 1 74.19 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAACGAGTCAGCTGTTCGCCCGTATATATTC:1 - chr3R 8217931 3' - P-element 68 1 34.93 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCATTAATGGTTAAATAAATAAATTGATAATAATGGCTGTGTTTATTAGGCATAAGAATGTTAAT:1 + chr2R 13293452 3' - roo 59 2 60.27 GAGTAACGCGTATCTGATAGTCGAGAAAATCGCCTTTTGATTCCTGTTCTTGCTTGCTGACATAAAAATAGGTAACGAACCAATAAATTAATCAAAAAAGTTCCGTGGTCAGCGGTGTCCAAAAGGCGTAAACCGAAACGCAAACA:1 + chrX 8960976 3' + INE-1 549 1 47.95 GGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAAGCCCTGAACCTCAATAAAAGTGGGCACAATATGATAAAGTGTCTCAAATTCGTTCAAAAGAAAATCGGTGTTGGGCATGATGTTTAATTGTGTATATCATTATTTAAGA:1 - chr3L 10580414 3' + baggins 5281 1 69.18 TTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCAC:1 - chr2R 17332167 3' + jockey 4908 1 73.97 AAAAACAAAAAGAAAAAGAAAAGATAAACACAATAGAAACCAAGTGAATAGCAAACCAAGAACACAAGTAAATAATCCGAAAGTCCGGAGCAGTTCCAGTTTCAAATTGCTCCATAGTATTTTTCGTTAACTGACAACCCGGCGTT:1 + chrX 6668979 3' + Doc2-element 233 3 67.81 TTTTTTGGTGCTTTTTTATAATAGTAGCGTTCAGGTTAGTGGACTGTGCACGACCCGAATGGATTTATTATTTTGTGTGAGTGACTGAGTGTCATGACGGGCGTAATCTAATTGTTAGTGGCCATAAAATTAACTAATTA:1 - chr3R 11021570 3' - Porto1 4431 1 52.14 AATAATAATAATAATTTAAATATTGTTCCTTAGCTGTTGTAAAATTTCTATCATTATACATTATTATTTCATTGTTAGAAATTGTCTCATACCTATATATACTCAGTTCAAAAACACCACCCATCTTTTAGCAACTTCAGCCAATG:1 + chr2R 16963355 3' + mdg1 7075 2 80.82 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTTTCCTTGATGCGCATTTGGCACAGCGCTGAAAAGCGTGCTACACTTTTTGAAATCCTCGGAAGAGCCAAGAATATGCACCAGATGTGATGCT:1 + chr3R 26846877 3' + hopper 1405 2 77.52 TTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTGTTATCTGATATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTAGTGTGTATTTTTTTGTACATGTTGTGTGTGTATTAGTGGTTTAGGGTTTTACGTTAAGTATACGCACCGAGTGCA:1 - chr2L 14956068 3' - Idefix 131 2 74.66 CTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGCCCATCTGCCCCC:1 - chr3L 7837135 3' - jockey 4787 1 61.87 GGGAGAGCGGAAGAGCGAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACAAAACAGCAAAAAAGTGTAGTGAAGGAAATCAATTGGTGGCTATATAAAAAAGCAGCCAATTAAAGTGCTCAATTTCAAGTC:1 - chr3R 23239716 3' - Cr1a 299 1 54.79 ACAACAACAAAAAAGAAAAAAAAAACACATTCACATTTTAAATTGCGTGCACTTTTATGCGTACGCACACATAACATACACATGTACATATGAATTCGTAAGTACACCTGCGTGTAAAAGCGCAATAATAGCCA:1 + chrX 3080981 3' + gypsy7 5002 1 45.52 CATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCCCAAATAAATACATACCCACGAAAACATGGCCGCAAATCAGTGTGCAATGCGCCGTGAAATATGCAAACAA:1 + chr3L 6023181 3' + R1A1-element 28 1 54.11 CCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGATCTAGATCGATTTCAAATATGGTGCCGTGATAACGTGTTAGTGAGTGGGCATTTTTGAGCATATTTCGAACTGAACGTTTTCCACGTACGTACGTCGGTCG:1 - chr3R 8857687 3' + Q-element 600 2 58.90 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGCACTTGATTTTAACGGTAAGTTTTTGTTAACCAGTTAACACAAGTTATTGCGAGGTGTACATAAGT:1 - chr3L 12964714 3' - hobo 54 1 52.74 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCTCTCTTTTCTCTGACTAGCGAATCTCTATCATAAAATTATATACCCCTTTAAAAGATAAAAAG:1 - chr3L 4651546 3' + roo 359 2 52.05 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTACATGGGCATTACCATTGGACATGTAGACTCTTGTGACCCCTACACACCCGCATGCTGACCA:1 + chr3R 4191002 3' + pogo 2044 1 60.96 GTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAAATATTAATGAAGTCATCAAAAGTGAAAAGATTAAA:1 + chr2L 9418571 3' - rover 84 2 76.03 TATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAAC:1 + chr2R 11095825 3' + diver 6037 2 68.49 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCC:1 + chr2R 25106100 3' + roo 8990 2 79.10 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTCTTTCATTTTGTTTGCAATCGATTCGATGGCCATTGCAGTCAAA:1 - chr2L 19406998 3' - Doc 22 1 58.22 CAAGAAAAAGAAAAAAAATAAATAATACAACAATGCACGAAAAATGGCAAGAAAATTTTAGATGGCAACAACATAAGGTCAGCACGCTGAACCAGTGGACGCGAAATTAGTTTAACAAATGTAAATGAGAGAAAGAAATG:1 - chr2R 18937269 3' + Doc2-element 219 1 76.43 GGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATTGTTTGTACTATTTACCATTTGGCGACCCGTTATCAATTGCAGGTGCTTTCTCCTGTAAACA:1 + chr2R 18689247 3' - Burdock 58 2 56.16 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGGTTTTGGTTTTTTTTTTATTTCAATAAGTTA:1 - chr3R 20840085 3' + roo 320 2 80.82 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAATCACATCTAA:1 + chr2L 23049722 3' + opus 7427 2 73.97 ATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGTCTAAGCCATAAAGTAAATGGGAAAAAGTAGTCTTTGTTAACCAAGAGAAAACCAGTTTTTAGACATGAAACCCGCCCACAAGATTTATAACCTT:1 + chr2L 12488229 3' + roo 8803 2 65.75 GTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCTCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGCTT:1 + chrX 21994032 3' - McClintock 5958 2 76.92 AATAAAGGAAAAATAATCAAGATACGAATGCAAATACTGGTATTTAAGTTTACATTAATGCTTTTGTTTGTTTGGCTTACTTTACGTTAGAATTATGTATGATTAATGTATAAATCCTCATCCGGCTTTTGCATTTTGC:1 + chr3R 8436135 3' - Circe 6962 1 79.14 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTA:3 - chr3L 18253795 3' - blood 71 2 65.75 AAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTGTTTGTAAATAATTTTAAAAAAATATTTGAAAATCACGTTGTTTCTATAAATTTCCCTTAACGCATATACATATGTACTTAATT:1 - chr3L 7870156 3' + roo 373 1 60.27 ATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATGGTAGGCTTAATGGACGATTGTGTGAGTGCG:1 - chr3L 9469174 3' + hopper 1324 1 76.71 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATTAGATTAAATGACTTAATA:1 - chr3L 18253772 3' - blood 48 2 52.74 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGCTCTCCAAGTGATGCTGCTCACCGCATTCCA:1 + chr2L 3323172 3' - jockey 4692 1 65.71 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTCTTTCATTTTGTTGGCAATCGATTCGATGGCCATTG:1 - chr2L 19407006 3' - Doc 30 1 52.05 GCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATAAAAAAATGGAACATATTTTATGGGAATTAAAACAAAACCTTCAACATTCATTGTAGGTTGCCCATTAATGAAAGTACCTAAATA:1 + chr2L 13332741 3' + micropia 5409 2 65.07 GCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAATAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGATGCCCCAAATTTGACAGCTTAATTGAGCTGCACCGGTGTACTTG:1 + chr2R 16966304 3' + 17.6 56 1 69.86 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTTCAATATGACTTTCAAACGCCGAAGCTAAAATG:1 + chrX 20975817 3' + copia 5071 2 76.71 CCATATTTATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACATAAAATCAAAACTTTCAAGCGTAAACTGGAATATGATCGCTGAATGCACTTTTAAACATGTAAAGTTTTGAATTCAAATGTTCATTTAAGGATCCAAACTTTTGAAC:1 + chr3L 5730683 3' - Cr1a 417 1 57.53 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTCCCTTTCTCACA:1 - chr3L 19580891 3' + roo 9015 2 60.74 CAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCCAGTCATGTTCATATGGAACAGAAATAT:1 - chr2R 4577048 3' + Chouto 488 1 59.23 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTGTTTATTAAGCACTTACACTTGCGCTATGTTAATCT:1 - chr2L 4637217 3' + mdg1 7374 2 74.66 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGCCACTAGCAGTTTGACAGCCACTGGGAAGTGTAAAAGTAGGGGGCTAGAATGTGAATAACATTTAGTGGCGCAGCCACAGAACGCA:1 - chr3L 2425848 3' + hopper 1388 1 64.03 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTAATCTTGACGGTTTA:2 - chr3L 14375581 3' + roo 385 2 66.44 TACCGACTGCGCCACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAATCGGCGACACTATTTTGACTTACGAAGAAATGTCAACTCTTTTATGTCAA:1 + chr3R 19447653 3' - rover 359 1 65.75 ATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGATTAGACTTGATAGGATGACTTTTCTTTCAAATATCTTTTTAAGTCCTTAAATGTTTTTGTTTTTTAATATTCCATAATTGTATGCTTAGTT:1 + chr2L 15644991 3' - transib2 28 1 66.44 GGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTTCTTTGATTTGGGTGGCGGCACCACCAGAACAGTGGGGTACTCTGGTTCCTCATCCTGTTGCGATTTC:1 + chr3L 3173776 3' + Doc 4311 1 55.65 GCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGCACTGTGAGTCTACTTTAATTTATAATTATAATTAAA:1 + chr2L 7756995 3' + roo 8659 1 74.66 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCG:1 + chr2R 10910291 3' - Tabor 6900 2 64.84 AAATATAAACATAGCAACAAAGTGCTTCTATATGTTGGTATGCTATTATACTTAAATGTTCTTTAATATTACATAGGCACATACTACACCAAATATGGCTTTTAGTAAAAGACCATTTTCCAGGCAGCCCAAAAGGCCAAGTCCCA:2 + chr2L 18426977 3' - 412 66 2 76.71 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATTGGACTGTACGGCAGAGTTGAAACCTCAGTGA:1 - chr2R 15070041 3' + 412 7523 2 67.86 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGATCGATGGAAACCGGTTTCTGTGA:1 - chrX 4673624 3' + roo 8989 2 76.71 CAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATGACGTGCGAAATACGCGGGAACTACATACAAATGTCGCATGTTCTGTGTGTGTATTTGTTTGT:1 + chrX 7086455 3' - Rt1b 4823 1 56.74 CTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATTATAGCCAAATGAACAGCATAGGCGGAACTACTTCTACGCAGGAAGGAAAGCT:1 + chr2L 22122783 3' - 412 315 2 63.70 TATTTTTTTTATATATATAATTCTTTAATCTTTCAACTTTATAATTAGCTTCCATTGTGGGTGTGTTGATGCGATCGTGTAAACGCAAAAATATGCGCAAAGCCATAAAAACCTAACAACAGGCAAACAAATGAAATATATATGCA:1 - chrX 16570566 3' - transib4 2576 1 63.01 TCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAAAAAATTCAAATTCACACAGGAAAATCATTGTATCAATCAATTA:1 + chr3L 10468401 3' - roo 473 1 67.59 AGAAATATTTATATATATTTTTGTTAGAAACAAAGTTCAAAATATCTTAAAAAAAAAGTTTTAATGTCCTAAATAAAATCAGATTTTGGCTTTTCGGCGAAATTTGATTCAGAAATACGGCCACACAATGCGCAGCTGTCAAATCG:1 - chr3L 10267147 3' + copia 4659 1 41.10 GGTTTGGCACTATGCAGCCACTGTTTTGGTGACGGGCAAAATTGCTCTCTTTCCGTTCGCTTACACTGAGATCGTAAGAAACCTAAAACTGTCTACATAACTGAGCTGGAAATAACGCATCCTTAACCAATTT:1 + chr3R 9793964 3' - 1360 3347 1 66.17 AAAAACACGGAATCTGGCCCAGTGTGCACTGGAAGGAATCGCTGTCTCTCTTTCTGTTTTTGTTCGGGTCTCTTTGCAATGCTGAGATCGAGTTCAGTTGCTTGTAGACAACGAGTACGTGCACATCGAAAAAAGATAAAATAAAA:1 + chrX 22908587 3' - transib3 5 2 63.01 AAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAATCTTGAGTTTAATGCTAAAAATCTTCGCTTACCCAGTGCTGCATAAGCGC:1 + chrX 22900364 3' + Tc1 1600 1 86.99 GGAATGCGAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCCAGATCCCACTTTATGCAACTGTTAAGTAATGGAATACTATGCTCG:1 - chr3L 5007288 3' + G6 1633 1 78.08 CCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGTTATATTATCGCCTTGTATATTGCAATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTGTCCTATTAGCCAGTTAGATTCCGAGCCAGATCTTGAGTGGCCC:1 - chr2R 19438133 3' - Porto1 4272 1 79.23 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTGATGGATTACTCTCGTTCAAATGTCGAATCTT:1 + chr3R 7616846 3' - Stalker2 16 2 69.92 ACAGTACAACTACACATATATTAACTAAATACGTTAAAAACAACATACCTTGGCATTTATTTTCCATATTTTGCTATAATTTATGGAAGAAGAGACCACAGCGTAAATGGGGGCCAGCAATAAAACTGTTTGCTGCATGGACAGCA:1 + chrX 2765748 3' - transib2 316 1 59.59 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTC:1 - chr3L 18253810 3' - blood 86 2 76.03 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGTCTTGAAAAAAGAGCGAGGAGTACACACGACCACAAAAACGATTACGAATACGA:1 + chr3R 25050097 3' - P-element 40 1 53.33 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTAAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGACAAAAAAACGAATGATAAGTAATGGGATGAAAACAACTTGTTAAAACCTCTATAAATTTATCTTTATATGTCTCA:1 - chr3L 3238236 3' + roo 9026 1 47.26 CAAATGACTGATCTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCC:1 - chr3L 27356092 3' + Tc3 1625 1 73.29 GTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCAGGCCTTGCCCAAAAACTCCCAGGCATCACCATAAACATT:1 + chr3L 15363224 3' - 1360 3213 1 72.60 ATATGTCAGCCCGACAGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACAAGTTTCAAGATTTCTATTCAAATTTCATCAATCGAATCAAAGAGA:1 + chr2R 21690547 3' + 412 7499 2 57.98 ATCTCGAAGTTCATACGGACAGATGGACATGGCCAGATCGACTCGGCGATTGAAACTGATCAAGAATATATATACTTGTGTGAGCTTGTTATAAAGTATACTTGACTGAAGTTCTTATTCCCTTG:1 + chr4 651872 3' - INE-1 131 1 60.00 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGT:1 - chr2L 18112491 3' + transib2 2764 1 58.90 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGTTCTTCCATAAAAGTGAAGCGAAAAGGGTTAACCTTTAAAATTTACAAT:1 - chr2R 19843316 3' - jockey 76 1 63.38 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTT:1 + chr3L 2330159 3' + roo 322 2 75.86 AATTTTTGTTACTTCTAGGAGTTTTTTTGTTTGGCATTTTCGGCATTGGCTTTGGCTTTGGCTTTTGGCATAGAAATACTGCTTCGATCACGGGGTTATCTTTGGTGGCATTCGGTCTGTACACTCTCTGGCGATTTGGCGAACTT:1 - chr3R 24693362 3' - I-element 420 1 73.97 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTCAGCCTGTATATGTATGTGTATTTGCTTTGTACAGCCTTTTGT:1 - chr3L 22339404 3' - hopper 74 1 65.07 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACCCTTGGGCTTTGGATACGGGCTAAGGATGTGGGTCTCGGTTTC:1 + chr3L 19580968 3' - roo 47 2 65.22 ATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAACATAGGAACAGTCAACGAAACTGTTAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAATTCATAATACTCAATACTCTTTTGCTGCGGGATATTTTAAAGGGTAGTTAACTGT:1 - chr2L 6600219 3' + Porto1 4370 1 65.07 TAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTGTATAAAGGGTAGAATGCGGCACGATTCTGCAAAGGGAACTCGTCTC:1 + chr2L 18175188 3' - roo 8990 2 62.40 GAAAAAATAAAATAAAATAAAATATCGGCGGCGATCGGGCTTTCACTTGTGCTTTCACTCAAATCCCTTTGACATCCGACCAGCTTAGGCCTGGTTTAATCAGGCTAATTATGTAAGCTGCT:1 + chr2L 2330791 3' - transib1 1901 1 77.87 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGCATATGTTTTGGCCTTATAGAAAAGTGATCGAACTGTTCTAATTCTGTTCTAATTTCAGTGGTGAAGTGATTGTATTGGTCAAAGGTAATACTAAATTGATATG:2 - chr2R 5438167 3' + flea 236 2 73.29 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATTGCTTTCCACGAGCAGAGGTAGCTAAGATGGAAGCAATGGATGAGACATATATCTAG:1 + chr2R 24037354 3' - 412 7135 2 60.96 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCATTTATTTTTAATTTATCTTTTTTGTCAAGGCAAGTGTCTGACGTTTTTTTTT:1 + chr3L 18253942 3' + blood 372 2 78.77 GGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCCTCAACTCGAGTGGCTGATAATTGGGCGGCACGTGCTGGTGCCTTTGTTCCGGCAAGCAGTGTCGGTTCAGTCGGGCGCGGTTTAATAAGTGTCAATTAGCAC:1 - chr3L 1856645 3' - Transpac 2 2 77.86 TTTATTAAAATAATTTTATTTTCCCCTTACAGAAACATAATCAAGTGGTATTGGAAGGTACATTTTGTAATAAAACTCGCTGGCCTGTAATAAAAGGCCGAAACGAAAATACATTCAGTTGGCCT:1 - chr3R 25787903 3' + 1360 3092 1 72.80 ACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGT:1 - chr2R 5582141 3' - Cr1a 460 1 64.38 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTCAATCGTTTTAAAGATTTAGCTGATGTCATAGGATGTTCTTCTCGATGATTTCATAGGCTTTGTAGATCATCC:1 - chr3L 25607252 3' - 412 42 2 53.24 GCTGCAAAAAAAAAAAGAAAAAAATCAGCAAGTGGAATCAGGACTCCGCGTGGAGTGATTATTTTCACATTAACACAACGGCATTTTCCTTTCGGCTTTTTAACTTCCTTGAAAGAGGTACTTAACTTATATGATACGATACGATG:1 + chr3R 26822408 3' + G2 3073 1 77.40 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCG:1 - chr2L 22719600 3' - 1360 77 1 79.55 GTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCTCTCGATCCCATCCGTTGTTTATTTAATTTATGTTATTATTACCTGATTAAGTATGAAGTGCTATGGTAAAGTGTTGGTTTTTCGTCTGT:1 - chr3L 13097361 3' - I-element 309 1 75.97 GAGGGTATGTAAGGGAATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACA:1 - chr2L 22319276 3' - Transpac 5 2 62.03 AGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTGGCTCAAAGTCGCAGAGAACGGCTAGAGCAAGCGAAC:1 + chr2R 1320490 3' + Transpac 5174 2 66.67 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTGGTGAGTGTTAAACGC:1 + chr2L 12486452 3' - roo 8696 2 60.27 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATATCTAAGTTGCATTTAAAAGTTTAGTTAAACTGAAAATAAAGAAGTGTTTTCAAAATATACATTTAAATAC:1 + chr3L 4651670 3' - roo 8714 2 55.48 CTTGAGGGGGTGGGGGGGGGGTATTGGAAAAGGGGGCGCCTGGGGGCGTGGCCTT:1 + chr3L 10179351 3' + gypsy2 6467 1 85.45 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTATTGAGGTGTCTTATCTAATATTTAGAAAGAAATATATC:2 - chr3L 785853 3' - I-element 32 1 62.33 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGTCAACCCGCTTGTATGTAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAA:1 + chr3L 10469622 3' + roo 355 2 56.85 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATAAACTGTGCCCTGTCAAATATTTATGGGTTAAGGTGTTCAAACGCTTATCAGGGTAGCGTTAAGAGCCATTTGAATACATTTATTGAATGGAAAG:1 - chr3L 12835959 3' + 1360 3362 1 65.75 CCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTACCATTTCATAACTGAAGTGAATATATGCAATCACTCATTTATTCATTATTCATTATCTTGTTTTGGCAGAGAGCTCTTGCTGCAATGGCGGCAATGG:1 - chrX 5634001 3' - jockey 4694 1 73.39 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGGGAAAACAAGGGAAAAGCACGAAAAATTCGGGCGCGGAATGTAAGAGCGCTTACAGCAGAGCACAG:1 + chrX 19887206 3' + P-element 2876 1 78.62 TTTTTTTTTTTAGTTATTTTACCGCCATTTTACCGACGAGCAATTTGGCAATAATTGTATGGATACCTTAATAAGCCCATTTCGAGTG:1 + chrX 3468955 3' - F-element 4684 1 73.86 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGG:2 + chr2L 17260778 3' + P-element 2790 1 19.18 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATAATAGAGTTTGCGGTTTTGACATTTTATAATTGAACAT:1 - chr2L 9274970 3' - F-element 51 1 56.25 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGGTACTCTCCCTT:1 - chr3L 22594162 3' - 297 48 2 69.09 CATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATT:1 - chr3L 14375628 3' + roo 9001 2 65.75 CACACTAAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGCTTACGGCATAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAATTGTTTGAGAACGTTGCTATGCAATCGCTAATGCACAAAACTG:1 + chr2R 6647588 3' + Chimpo 104 1 69.86 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTT:1 - chr2R 15070085 3' + 412 420 2 67.81 AGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATGAAAGTAATGAGGGGCAG:1 - chr3R 14049289 3' - transib2 18 1 73.10 ATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGCATAATTTACGCAGTATTTTGTTTATTTACTATTGATTTTTCTGCATAATATTTATTGCTTCTAGCAACTAATCTAATTTCCCCGCCTTTACTGGTTATCCTGTCGCCTGATTAA:1 - chr3L 6586314 3' + 412 332 2 75.34 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGAGTATGAAAACTTTCCAAGCAAA:1 + chr3R 8849826 3' - 297 47 2 77.55 GTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAACAAGAAAAAAGCTGAAGAGTCAA:1 - chr2L 17295786 3' - Doc 13 1 71.72 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATGTTGCGGCTTGGCGAATTTTTATGGCACCTTGGAGATGGGAACTGGAAGGTGGAAGGTGGTGCGAAACAAATGAGATTGGG:1 + chr3L 22226132 3' - jockey 4788 1 60.00 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTT:1 + chr2L 8574483 3' - Transpac 37 2 58.90 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTA:2 - chr3L 17537742 3' - Doc 70 1 65.07 AAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTA:1 - chr3L 465977 3' + Juan 4146 1 64.38 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATTTCATTAATGAATAATTGCAATTATGACCGCCTTGCAGATTTATGCGATGATGACTCGCATTAATAACA:2 - chr3L 21910352 3' + pogo 2055 1 57.53 GCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTC:1 + chr3R 10030806 3' - BS 5050 1 54.79 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGG:1 + chr3L 10469597 3' + roo 352 2 69.35 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGAAGTTACTCACAACGATTTCTTTAAAGCGTAATTATATTTTTAAGGG:1 + chr3L 9212758 3' + hobo 2904 1 54.29 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATTGTTATTTTAAGATCGAAAAGTTTCATTCTT:1 + chr3L 18484501 3' - hopper 36 1 61.64 GGTTTTTTATGTGTTTTTTTGGCAGAAAGTCAAAAAAATGTTGCAACATTTGTGGTTTATATTTCCTCAGAGAATTAATTATCTCCCCTTGAATTTTCGGATTCTGTGGATAGTATTTTAGCTTAATCGCTTTATACTTGATGTTC:1 - chr2L 22700868 3' + transib1 7 2 51.37 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTGAGTGAAAGTTTCTAATACTGCTAGAAATGTATATTTATAGAAGGAACCTCTTTTTTTCTGGCAGTGCAGCTACCCTT:1 - chr3L 1358418 3' + 412 463 2 61.94 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAACTCGCGTCGCACTCATGGGCCTTTTT:1 + chr3R 8849852 3' - 297 6599 2 57.89 TGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATAAATTTCACACCCACGTATTAGATCTTAATTGAACATCTTCTGCTCAGCTCTGGTATATGAATATTTCAATT:1 - chr3R 16538345 3' - G2 2631 1 52.05 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACAT:1 + chr3R 6413656 3' + 1360 3336 1 56.16 GGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACTGCCAACTTTGAGGAGGGTTTCGGAG:1 - chr3L 12159646 3' - Quasimodo 30 2 62.59 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCAAAATACATTTGGAGGAATTTGTAAA:1 + chr2R 11256280 3' + roo 9033 1 57.53 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGTTGGTGTTTTGCACATTTCTCTGCCATTTTGAATTGCGCGGTATTTTATTGGGAGTACCGTATTTTCGCTCCATTTGGTGGTGCAACGTTGGTCAG:1 + chr3L 11795583 3' - 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jockey 89 1 76.43 GACTATCAGATACGCGTTACTCAGCTAGTGGGGGGGGAAGAAATATAAAGGACATAAGAAGAATCTATTCTTTTCGAGATTGCCAAATTA:1 + chr3R 19718851 3' - INE-1 549 1 84.44 AGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCATCCCAACCCCCCGTCGCAACTTTGGCACAGTTGGCAAACTTTCAATTCGATATGCGACATTGGACATCAAAAGCCCACTCAGGCAGCTGATGATGAAGTTAATGATGGCTA:1 + chr3L 2422389 3' + F-element 4440 1 76.76 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCATGAGATAAAAGCATTAAAAACAGTTTGCATTAGTGCCAATTTCGCAGAGTGTGTTGCTAATTTGATTTCATTCTTTTCG:1 - chr3L 20251891 3' - copia 40 2 58.22 CATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTATTTTTCAAATAAAATAGATTTTGGTTGTTCAAAAAAATATGATTGCGCAGTTATCTTAATGTCCA:1 + chr2R 4829064 3' + 1360 154 1 55.48 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTAATCTCTTATGTTTAAAGATAATTACTTCTAGTTATATATCGGTTTAAAACTATGTTCCACAGTAGCTTTAACTGGGATGGACAT:1 - chr3R 18528244 3' + roo 9044 1 59.29 CCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTACATTTATGGCAAGGCTGCGACAGACTGCGCCGCTGCCCGTTGATGACTAAAAACTATGCAGCTGGGATGGCG:1 - chrX 22697246 3' - P-element 2746 1 55.48 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGCCACTAGCAGTTTGACAGCCACTGGGAAGTGTAAAAGTAGGGGGCTAGAATGTGAATAACATTTAGTGGCGCAGCCACAGAACG:1 - chr3L 2425850 3' + hopper 1379 1 59.59 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGACTAGAATGCGTGTTTAAGTGAACTGTCCCTTTCATAAAATATGTG:1 + chr3R 28450775 3' - roo 8703 2 53.85 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAATAATTATTAAAAATTTAATAGTTGTCTATTTAATACTCAAATCAATGAAACTGT:1 - chr3L 16015164 3' + 1360 3380 2 56.85 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTCGCTGTCGATGATT:1 - chr3L 18183055 3' + Tirant 375 2 67.39 AAAAGGAAGAGTAAACAAAACACAAAGACTTAAAAATTGGGGAAAGGGGAAAAGGAGGAGAAGGAAGTAAGGGATTACATGTGTTCCTGGAATAGCTCATTCGCAGTGTCGACCAATTG:1 + chr3R 1712434 3' - Cr1a 209 1 79.83 ACTATTAGATACCCGTTACTCACTCGGCGGACACACCGCACACACCCGACGGTGTCGTAACTATTTTTTTTTTTGTTGCTTATGAAACTTTTTTAATAATATTCAGCTAAAGAGCAAATTAAATT:1 - chrX 3593817 3' - INE-1 548 1 77.60 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTGAGTG:1 - chr3R 10213039 3' + P-element 2835 1 41.46 AATAAAAATAATAATAATAATAATAATAACAACAACAACCACCTAGGCAAACAAAAACAAACGGAGAAAATGTTCCGTGTTCCGTTGTGATTGTGTGCCAAAATAGCCTTATTTAGTTGGATAGCCCCACAAACAGACTG:1 + chr2R 9300082 3' + mdg1 7069 2 50.71 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAGTAGAAGAAGCAGCGCTGGCAGCGACGCC:1 + chr3R 31724919 3' - P-element 58 1 29.09 GCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAGCAAAAGTTGTGGGCAGAAAATATGGAATGCGTGTGTATGTGTTGGCTTATTTATCTTTCGTTTCTTTTTTTTCAATTTTGCATGCAATTTCGTT:1 + chr3R 2239423 3' - invader2 94 2 68.49 AAAGTTTTTTTTTCATTTCAATTTTACATATGCCATCTGTTGAATAGTTTAAAGAGTTTATTATATCAAAACTTTGAAATAAAACAAATATAGCCATGTGTTTTCCAAACTAAAATTTTAATAATTAAATGCACACGGAGACGAAG:1 + chr3L 3750024 3' + hopper 185 1 79.45 GGCGTCTTACAATCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAATTTCCTCACGGACTACCAATTTAAATTGTTCCTTTTAAGATTTAACCTAGGTCGACGAGCTATTACAAAAAGGATGTATCGAG:1 - 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chr3R 7507143 3' - Doc 69 1 65.75 TAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAACAAAAGAGTTAACAGTTGAGGCCCGGGCTGGTATTGTTGCTAGGTTTAAAGCCGGTACACCTGCGGCCAATTATAAGGAATTGAATTAGGTATATCCGTTACT:1 - chr2R 15676996 3' + Bari1 347 1 77.24 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGACTTAATGCTGAAAATATTGGTAGCTCTAAAGTATCCAAATTTCTTTAAAGTATTCAAATGTATAAATG:2 + chr3L 21665333 3' - 1360 51 1 53.42 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGTTCATTAAAATGTGCTGCCTACTTTCAGGTGGCCCACCAAAGACATTTACCTTTAATTGCGGCCATAAATATATTGTT:1 + chr3R 25795885 3' - jockey 19 1 73.29 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGTCTCAAAGGAATGCGAAACAAGGACGCAAAAGGACGAGAA:1 - chr3R 17258098 3' + 412 412 2 73.29 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAGTCGAATCCACTCGTGTCTTTATAACTTGAGTGTTTCTTGC:1 + chr3R 10213106 3' - P-element 38 1 44.34 ATTTAATTTATTTTATTTATTTCTCCAAGCAATGAAAACGAAAAAGAATGAACCACACACACGCAAGATAATGTTAAACCGGACAACACCAGTATCAGGTGATGTCTCTGCGATCGGACAAGTCCAAGCTTTT:1 - chr2L 15028003 3' - HeT-A 2 1 73.68 TACAACGCTACCAATCAAAAATATGAAGACAAATTTTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCTTTGTATCCATAAAGACTTAGGAATCGTGTGAGTAAAACAGCTTTAGCTACGCCACTGAGAACAAATAGGCAGTGCTATGG:1 + chr2L 316719 3' + G4 3484 1 62.07 GAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCATATCAATCATATGGACAGATGGACGGACATTTCCAGATCAACACTGCTTGTCTTGATAAATTTATA:1 + chr4 831226 3' - INE-1 558 1 37.67 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCATTATTCACTATGAGGATGCAACAACGTGCTTTTGAGCTCTATTAGATTCGCACTGC:1 - chr3R 25862576 3' + roo 345 2 61.64 GTGCCATCCAAGACCGGATGTGCCAACAACAACATCGACGACGCTGAGTCAGCATTTCGCTTTAGCGAAAGCGATAGACAAGGCTAATGTGAAGGGTTGCATATTAATGGGATTCAGTTGGGGAGTCCCAATTTCTAATGTAAACG:1 + chr3L 3755464 3' + gypsy10 43 2 56.85 ATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATCTAAGTATAGAAATATAGAACTATAGAGAATAAAGTAT:1 + chrX 13550514 3' + I-element 5282 1 73.38 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGG:1 + chr3L 13364377 3' - hobo 75 1 69.66 CGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGCGCTCATAACCCTACAGTTTGCCTTCATAAGCATGTTTTGGGAGAATATCT:1 + chr2L 10446133 3' - flea 4815 1 62.77 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACAACCCGATCAATGGCGAGAAATCCCTAAGCCCCAAACAATTTACGCACATTTGCCAATTAATTATGGCACGAAATTTGATTTCGTTTTGCAATTAGA:1 - chrX 20975705 3' - copia 23 2 69.86 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAGACAGCATGAAGAGCGACATTGCAATCCTATAAC:1 + chr2L 21153598 3' + 1360 3350 1 58.62 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTATTTTCATTTTTGTATTTCACCTCAAGTATCACACTGATAATAATTGATTAAAAATTTAATGAAATTTTGTAAT:2 + chr2R 1373243 3' - pogo 19 1 72.60 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGGCATTAAATAAATAAAGGC:1 + chr3R 18528373 3' - roo 8723 2 60.00 AACTGAATAAAATATAAAAAAATGGCGTTAATTTTTTAGCATGTTGCATGGCTAAAGCAATTTGTCCAGTGGCTCCCTCCTCCCAGCGCTCCCATGATGAATTCATGCCATCATTTTGCTTGTAACAAAACTTGCGATTGTTGCTG:1 + chr3R 17359404 3' + transib4 2274 1 53.42 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCACACCCTGAAAATGCTAATGTTGCATGCCACATAATCCTGTTAGAGACGCGTGAATGGAACTGCCAAAAACTTGGACT:1 - chr3L 14655507 3' - roo 8704 2 52.05 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCCATGTTAATTTCGAGCAATTATTGGACAACCCTTTCAGATTCCA:1 + chrX 16994576 3' - roo 8738 2 72.22 AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCT:1 - chr3L 11803996 3' - blood 7101 2 78.08 TTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAATGCTGAAGTTATTTCCCAGGATTGTGAAATTGAAATTTGCTGACTGGTGCAGTTTGATTGAAGCGCAACAAGATGATCGTGGC:1 - chr3R 4063891 3' - G4 87 1 71.77 TATTGATCCTGATCAACAATATATATACATATACTTTTCAACGAATCTAGCATACAATCTTACTTACTTTCTTGTTAATTATTATTGGAATATTATTAATTTGTAATAAATTTATGAAATTTATCCATCCATGTAGCACACCCTAT:1 + chr3L 11887889 3' - INE-1 84 1 79.45 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACCAATAATAATTCGGATATCTAAGCATAAATTTAGTTTATCTGTTCCAATCCTTCATGGATAAGTTATGTAATA:1 + chr3L 16015367 3' + 1360 3369 1 67.12 TTTCGCTTTTTTCAAAATTTTTTTTTTTAAATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGATTTCCTCAATTTTCGCTACGTTTTCCTTACAGTTTGAACTGCACTC:1 - chrX 7337629 3' + FB 168 1 63.20 GAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAACCGC:1 + chr2R 11095828 3' + diver 6040 2 66.44 CACGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGCTTATTTTTGGCTGAGCAATGAGGTGTTAAAATTCCACTGCATACTTTCTAGTAGCATGTAAGGTAAAAAAAAGTATAA:1 - chr2L 13842255 3' - jockey 4712 1 51.72 CAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTGGAGGAGCAGGGGCTCCATAAGATTTGGAGGGTGGTG:1 + chr3R 18689456 3' + 1360 132 1 74.66 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCATATATATAGAAAATATACACATATGTATATGTACCTAGACGTGCCTATATCCCGCCGATTTTGAGGCATTTGCTCTGTGTG:1 - chr3L 16059218 3' + 297 6940 2 62.33 GCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTA:1 - chr2R 11095737 3' - diver 5941 2 52.86 TTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAGTTAAGAAAAAAAAAACGACTTCTTCAAACATTTCTTGTTTTGTTCGCAATAACAGCCTTTGCCCATCCTTAGAATTTAGAGATAAGACGCCGAGTAGTTTGCATTTACAATA:1 + chrX 1022598 3' + FB 117 1 69.18 GTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACATATATTTTCTTTGTAAATGTAACCGATGAAGGAACAGGTTCGCTTACCCCGTTAGT:1 + chr4 1108477 3' + hobo 16 1 63.70 AGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGATTTCTAAGTGAGTGGCTTGCTATCGTTGCTTGCATTGGTGTTGAGTACGAGTAGTATCAGATATAACGGAATCGAATACA:1 + chr3R 13227843 3' - F-element 4228 1 68.03 ACGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTTCATATTAGAAAAGCTCAATACCGAGGCTTGAACGTCAATAAAATCAGAAAAAATATGTTCAATTTAATTTTCATTTGAAGAATAAAACATTAATTTTTACCGGACATCAAGCATTGCTG:1 + chr3R 18561348 3' + Idefix 389 2 52.05 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGCGGC:1 + chrX 12273135 3' - jockey 4717 1 70.19 CCATTTACTTTAAGATGCGATTCCCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATAATTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAACCATCGCTGGCACAAGGACCCGCTCCC:1 + chr3R 14218494 3' + roo 8977 2 78.47 CAAACAGCTCTTTTCTACGCATTCAGTGATAGCAGACAACTGTATGTTTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAACGCCTTGTGGCGTCTGTGTGGGCGGCGATAACTATAAGTAGG:1 + chr2R 12057400 3' + 1360 135 1 71.23 TTAAAAATAATATTTCACTAATATTAAACTAAGCATATTCACTTCAAGCTGAGTTTCTTTAAATGTAAGATGTTTGTTTAGTTGTTGTTGTTGTTTAGTTCTTTTAATTATGTGTATAGATTTTTTTTCTGTGCACGCACTCATGG:1 + chr3L 12673191 3' + blood 6915 1 76.71 AGTAATTATTATTTATTTGTTAAAATGGCAAGGGAGTGATTGTTTAATGTAATCGACCCGTTAATTGTTCATTTGTTCTGGCTAATTTTATAAGACTTCAAGATAGCCGTAATAAACTCATCTATGTAATGTGATTTCTC:1 - chr3L 7607801 3' - jockey 4828 1 79.29 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGG:1 - chr3R 26486035 3' - 412 7129 2 67.12 ATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTGGAGAATATATACTCTCTACAAGGGTATACAAAAACGTATGCAGCCTATTGACTCCGTTGTCAGGTCACTTAAGCTCACAATTAAATTATAGAAACGAGCTGATAATACAGCGGGCGATA:1 - chr2L 21370944 3' - INE-1 501 1 63.01 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCGTGCAGTTCTCTGAAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTT:1 - chr3L 9212713 3' - hobo 62 1 77.06 CACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAATTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAACATTCTACAGCAGAGTGATCAAGGGTGGGAGTGAGAGACATCATGAGCGGGAGG:1 - chrX 21282026 3' + gypsy4 6604 2 67.83 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCCTAGAGATGGTCCGCCCATCGAAGGCGTTCGTTCTACACACACACACACACACACATCGCTGCGATCGCAGACATCGCCAGATGCGAGTTGTTGTAATTGACTCAGACAATATGCTGC:1 + chrX 6462171 3' + hopper 1412 2 80.82 GTTCCTGAGATCTCGACGTTTATACGGACAGGCGAACTTGGCCAGATCGACTCGTCTACTGATCCTGATCAAGAATATACATACTTTGTATATTATATATTTATATAGTCTGAATGCCTGTTACATACTTTTCATCGAATCTAGTA:1 + chr2L 22211546 3' - 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Idefix 27 2 43.84 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACCAATAATATTCATCCAACAACTTTTGTTCCATAATATTTCATTCCCCCAGAACCTTT:1 + chrX 6536852 3' - copia 4932 2 61.64 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGTCCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAA:1 - chr2R 22746050 3' - jockey 4809 1 50.00 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGACTAGAATGCGTGTTTAAGTGAACTGTCCCTTTCATAAAATATGTGG:1 + chr3R 28450776 3' - roo 8705 2 53.42 GTGAACAGTATGTATGTATATAGCCCACCGATTCCGGCCCTCGAGGACATGCATCTCGACGTCGCTTCGAC:1 - chr3R 19435987 3' + 1731 94 1 83.10 GCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAA:12 + chr2L 17599966 3' - 1360 486 1 73.29 CAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACATTCGAAATATCTTTTCAGTTCATTGGAGAAAAGTTGCGGGCAAGGGTTGACTTTTATAGTTCTGTCCTGATTCACTT:1 + chr3L 6902247 3' - 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Ivk 65 1 62.33 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATCTATGTACGAGTATCATGCAATTTGCGAGAA:1 + chr2L 17626715 3' + roo 9042 1 65.75 AGCCTGGAGCCACCCCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCC:1 - chr3L 26852646 3' - 1360 68 1 67.20 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCAT:1 + chr2L 17626657 3' + roo 320 2 80.82 CCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAAACGACAAATTCATGCACTTGGTCGAACTCTGGCGGAGGGGAGGAAAGCGAATGGAAAACAAGGAAAAATCAAATGGAAAACACGGAAAATCACAATTACATAC:1 - chr2L 11294199 3' + Tirant 443 1 70.14 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAA:1 + chrX 12273128 3' - jockey 4739 1 79.83 GAAACATGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGACATAAAATGAAAACTATATAACTAAATATAGTTAATTAATTTATATAATAATACAAATATAACTAAATAAAAGCGTTGCAACCTTAATTATATAGTTGAAAAGTTCATAT:1 - chr3R 6888303 3' - Doc 20 1 69.18 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATATAAAACATTTTAAGAACTCAGGGGTTTCTTCGTTTTGGAGATTTGGATCTAAACCAAAAAATGCATTTT:1 + chr2L 13255395 3' - pogo 47 1 54.11 GCCTCTGTTAATATAAGATTAATTATAAAATGTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAGATCGTAGTCATTTTAATATTTTTAACTGGTCAGTGATGGAAAGTGTCTAGGATCTGCGATCCAACTATCACTCAACATA:1 + chr3R 7068332 3' + G4 3783 1 45.21 AAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTTATTTTATATTTCTTAAGCTTACATAAGTTTTTTCTATCTAACAC:2 + chr2R 5023338 3' - rover 7021 2 67.12 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGCGGCAGTTATCGAGAAATG:1 + chrX 12273150 3' - jockey 4742 1 68.06 GTAATTTCCCCACCATCTGTGTTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCGCAAGGAACTTTGGGCCAAATTGTGTGATAAATAACAGAGTATATCCTCCATATGACAAATCTAATAAATGT:1 - chr3R 12848767 3' - G5A 435 1 62.61 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCTTTTCGCTGCCCCTTATTTGCGTTTTACCGGAGTTGCAATGACGTACGCACG:1 - chr2R 18689110 3' + Burdock 233 2 69.06 CGTTTGATTGTAGTTTTTTGCGAATATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAAAGGATACTGAATCTGCAATTAAAACAGCGGCAAACGCCCACCACAAGAAGCTGCTCA:1 + chr3L 10392562 3' - Juan 111 1 50.86 CATATAACGGTTCCACTTGAACATTATTGTTTATGCTAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATGTAACTATGTATTCTAAATATGTGTGTACGTGTATATACAAGATGTTGATAAGATTGGGGCGATGTGTGAATTATACTCATGA:1 - chr2L 9619050 3' - gypsy11 123 2 66.44 TAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACAATTTAATCGGCTCACCTTCGACCACCGATGGCGA:1 - chrX 15746234 3' - jockey2 3214 1 73.97 CGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCAAGCGTAGCCGCATGGACTGATTTTTATCGCAACGCCCAACTGACGGCCGAAA:1 + chr2R 17544236 3' + gypsy5 7294 2 61.54 GCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTTGCACTTGTAAACTGAACTGAGATAGCGAATCCCTAATGGCAGGG:1 - chr2R 17544161 3' - gypsy5 6964 2 51.61 GGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGG:1 - chr2L 12291842 3' + Tirant 392 2 68.18 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAA:1 + chr3L 18183166 3' - Tirant 56 2 77.97 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGGGCAAACCGATGGAAATTTCTGCCTTCATGAGGCGGCAACAGGTTACAC:1 + chr2L 12144287 3' + transib2 2764 1 65.93 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCTACATTTCCATACATATATATATATTTATTTTGAGTGAGTTTGTTATATTCTGAAACAGTTTTCGCTAAACTCCCTGTTTATGGCTATAAAAAGTCCAAGTGGGC:2 + chr2L 17380763 3' - hobo 15 1 75.34 AGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTT:1 + chr2L 19140412 3' - Max-element 89 2 76.03 ACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCGCCTGTATATGCGATTCGGGAACATATCGTGGCCGTAGTACATGGAGTCCGGGGAGTCCAAATTC:1 + chr3L 9372273 3' - 1360 398 1 55.48 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGCCTTTCAATGCAAAATTAAGGGCTTTTTGTTTACCTTTATGGATTTTATTTGTTTATATGTTTTTTTTT:1 + chrX 20934920 3' - copia 52 2 54.48 ATGATCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAGAGCAATCAATTTTAACTCTTTTATTACATAATATACGATGGCTTGTGGGTGGTTTGGGGAGTCTC:1 + chr3L 11311099 3' + Cr1a 4179 1 76.03 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTATGAAGCCAACGAAGTGGAAATTACCTTGTAAAATTTAAAAAAATCAAAATCAATATGGAAACGATTTAACTAAT:1 - chr3L 2320595 3' - roo 8710 2 50.68 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATTTCTATTCAGTCGTTTGTGGTGCGAGAAGTCGTATATTGCTTATAATAAAGTCAAAAAGTTTCTATCGTCTTGTA:1 - chr3L 14167317 3' + mdg1 7414 2 54.79 TTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCATGAGATAAAAGCATTAAAAACAGTTTGCATTAGTGCCAATTTCGCAGCG:1 - chr3L 20251921 3' - copia 4939 2 69.18 GGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATCGTCTTAAATCATTTTAGCTGAAGTTCACTGTAATCCCTTAGTTCGAAACTTTGCTCTTTCGAATACAACAGCGGAAG:1 - chr2L 19140323 3' + Max-element 8491 2 53.42 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGGCTTTGACGTCGTTGTTTTTCCCCTGCTCGTCATGTTTTGTGTG:1 - chr2R 15528467 3' - 1360 74 1 70.14 ATGACGTCAGCAATCTCGCTGGGAGTGATCGGTTGCATCGGCAAGACCATTTGGAGCGCTAAAATAAAGAGGTGGAAATCCTATGGATGGAAACCAACATCCAAAAGGACCAACTGTCCACCTATACGAATGGG:1 - chrX 3590134 3' - BS3 210 1 44.78 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAGACTCGAATTTACG:1 + chr3L 21013940 3' + roo 9000 2 67.81 AAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCATTTTGTGCGTTCTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACCCATTTTTATTACTCAGATGCTCTGTGTGCTGGAATGGGTAGCTTT:1 - chr2L 15125659 3' + Cr1a 175 1 68.49 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACGTGGCC:1 - chr2L 13629032 3' - Tirant 8127 2 71.11 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTTCAACTCCATTCTCCATGGTCGGCGAACATTTAGTAGCCTCTTAATTCAGTTAAAGGTCCAGTTAGCCGTGCTAATGTTTTTCAATTTTATTATTCGCACTTAGCGTGCAT:1 + chrX 5503806 3' - hobo 11 1 78.08 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAATATCACTTTAAGGTGATTCCCAGCGCATATTATGACGGAGATAAACATCGCTTAAAGCGAGAGACGGCGACAC:1 - chr2R 25106018 3' - roo 47 2 53.42 ATTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTTTAATTTAACTTTGCTGGTGGTTTTAAACTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - HeT-A 17 1 40.41 GCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTATGTGTTTGTGCGTTGGTATTTATGTTGGCTTCTTCTATCCACTTAGCCTTGGTTATTTTGACTTTATTAAGCCAAAA:1 + chr3L 13677385 3' - hobo 151 1 54.11 ATTGTGTGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTAATAAAGTAAAATCAAATGCCCAGAGACCTTGCCACCC:1 - chr2L 11587353 3' - rover 6989 2 47.95 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTG:1 - chr3R 11870071 3' - pogo 63 1 65.07 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATGAAGTTATTGATTTATACATTCATTTCACCTCATGTGC:1 - chr2L 16857861 3' - P-element 84 1 26.71 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGC:1 + chr2R 5754561 3' + P-element 2829 1 29.81 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGC:1 - chr3R 9125638 3' - Doc 47 1 58.22 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGTCTTGACAAAAGAGCGAGCAGTACACACGAACACCAAAACGATTACG:1 + chr3R 25050090 3' - P-element 55 1 42.66 ATAATAATAATATTAATGTTAATTATTACAATCTACTATAGCCTTAATTTAGATTAACCAGCCCTCTTTTGCGAGACGTTAATTTCGTTCTATTCATTCTCATCTCAGAGTACACGGCAATACATTAGCCTTCATTCTTTGC:1 + chrX 7374286 3' + mdg1 7079 2 71.13 ATGTATATACATACATATAGCTGTAGTTGATAATGTAAGCTTTTTGTGTGGTGGCTATGAAGGCACATTCGTGTCGCGTATTTGACATAAAAAGAGAGAGCAAACGGCCAACGTCGAATGCCAACCGAAAACTTCACAACTGCAGC:1 - chr2R 15056975 3' - 1731 4409 1 57.53 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACC:1 - chr3R 11870073 3' - pogo 49 1 62.31 AGAAATTGTCAGAAAATAAGTTATACTCGAATACGAAACACAGGGGAATTTTCTATTAAAATACAATATTGATACGATGTTATAGATATCATTTACAATGGATTGGCTC:1 - chr2R 2121557 3' - transib2 415 1 59.63 TACACACACATACACACACATACACACACATACACACACAGACACACACACACACACACACACACACACATACATAGCACACCCTCTCAAAGTCTAGATGATCAGAAAGAAGTCGCGTCAATCCAGAGCCACATCGAAAT:1 + chr3R 20211170 3' + Quasimodo 38 2 42.86 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATCAAGCTCAGATCAAAATATGCAACATTCTGCATAAAGTAGTTTTGAAAATTTAATAC:1 - chr3R 2649173 3' - 412 66 2 62.33 CAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGTAAG:1 - chr2R 5582135 3' - Cr1a 454 1 68.49 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGGATATATGTACTTTCAGGCATATTAAACTGCATACCCA:2 - chr3R 11513470 3' + roo 8991 2 70.55 AACGATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGAACCCAGCTTTCTTTGAGCTGTTTAAACATGTTTACTTCCATGTCTTCTCGCACTCTCGCGAGCTTTTAATGAGAGCTTTGTCGATTCGATCCAGAAGTTGCTAG:1 + chr3L 7865555 3' - FB 39 1 57.53 CCTGCGCGTGTTAACTCCTCCCCGCGTTAGGTTAAAGTCGTCCTCGGCTTTTCGGGAAGGTATCGTCATCTCTATATGTAGTTAGTTTCTGAAGATAGAAGCTTGCATTGCGAATGTTTTGCTAGTTACTTTCGATTAAATTAAA:1 + chrX 5936171 3' - gypsy4 6565 1 49.66 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTC:1 - chr3R 18635203 3' + opus 466 2 55.46 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTATTATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTGC:1 - chr2L 14969103 3' - 412 7119 2 66.67 AGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTTTCTTTGCTCTGCAAATTTCATTTGGCACTGCGACAGGAAGGAAATGTGAGCATGCAAAGCCGAAAAAGGTC:1 - chr2R 17120885 3' + roo 111 2 50.68 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATACAAAGATGTATATATACACTTTTTAAACATTTGCAAGATAAACCTTTTCGATCAAAATTATGATATTCTTTGAAAATTCTTGAATAGTATCAATAAACTAGTGGTTCAGAGA:1 - chrX 15454624 3' + 1360 3379 2 78.08 GACGTTCATACGGACAGATGGACATGGCTAGAACGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATTTCGTCTGTGTGTGCGTTTGTGGTGTGTTTTCAGCGTGAAATTAAAATTTTAACACAGAGGATACAAA:1 - chr2L 19689523 3' - INE-1 126 1 51.54 GGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCC:1 + chr3R 24454854 3' - F-element 312 1 71.23 AAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCTTAGGGTCTTTTATTTGCGATGGTTGGCAAGTAAGT:1 - chr2L 15777811 3' + 297 6897 2 74.66 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATG:1 - chr3L 21013870 3' - roo 81 2 75.34 AGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGCAAGGATTAATCATCCGCAGCAGCAGCTACAAAACTAACACAAAAACAAATGAAAATTTCAAACGTTTTCAAACACACACAATTTTTCGT:1 - chr2R 21394296 3' + Transpac 201 2 61.64 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCTCTCTTTTCTCTGACTAGCGAATCTCTATCATAAAATTATATACCCCTTTAAAAGATAAAAAGAAAGTAGCAA:1 - chr3L 4651536 3' + roo 9033 1 58.90 CCTTTAAGGTTGTGATTTTATTTAGATCTCACTCTCATCGAGTGTAGCTTAAGACTGACTTATTACAAACTCCCCGATGCGATTCAACAATTCCTGTCCAACTATTTGGAACTTTGTGTTTCAGTGTTTGGCGG:1 - chr3L 22834515 3' - gypsy5 7251 2 51.49 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTACATTTAGCTGGCCACTAGAAGCGCATAGAATGGAACT:1 - chr2R 17332145 3' + jockey 4951 1 52.00 GATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCA:1 + chr3R 13349565 3' - Ivk 94 1 70.55 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTAAC:1 - chr3L 23146439 3' - 1360 29 1 65.75 GCGACTATCAGATACCCGGTACCCTACCCTATATTTAATAGTGTTGCTTAAAAATATCAAGCTAGTTTATCAAAGATTTTTTATTAATAGGACTCCTTTAAGGTTTTCAATGGGTAGAAGAACTGTGTTTGTACGGACCCTAAAAA:1 + chr3L 14166523 3' - INE-1 551 1 54.79 CGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGTGTCGACATTTTCATATTGACTTTGACCGGTC:1 - 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chr3L 18253815 3' - blood 66 2 75.21 TATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTA:1 + chr2L 23034076 3' + FB 381 1 41.38 GCATAGTGCAAAACCAATGCATTGGTTGCAATGCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGCGAAATCTAACAATTTTGGCAATAATAAGGTTATGTACTGCAATAATAGTTTTCTTACAATCTGAGAAGTATCTACA:1 - chr3L 20982491 3' + 1360 3354 1 56.85 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCTCTAAAGTGCATGGC:1 + chr3L 19031332 3' - roo 8720 2 56.85 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTGCGTGCGGTTGCTTTTCACATAACAAAAGGTGCTATTGGGAAAATTTTCCG:1 - chr2L 14969054 3' - 412 7081 2 58.90 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAACACATTTCCACTTTTATGAGCGCCAGTTAACCCCACACAGCACGAACCATTTTGAATTGAAAGAAAAACTTTTAGTTACACTCCAGCCAGTTTCCATAATTCATT:1 + chr3R 8639377 3' - copia 16 2 72.92 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTGCATGCATGCAACACCCTGTAAGATATGGAGATACGA:1 + chr2L 18522357 3' + roo 9031 1 56.16 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCTTCCTTACTTTTTTCATTTCTAGCATTGGCTGGTTTTTTATCAATATCCCTTTGCGATTCTTTTTCT:1 + chr2L 16331055 3' + roo 9023 2 54.17 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCGATTTGGCACTGTGAGAATTGAAAA:1 - 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I-element 8 1 76.03 ATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTTTCTCCGTATGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTATATGGTAAAAAATGAAATATATATATTCCAACAATTGTTGAGAAGTATGTAT:1 - chrX 22905222 3' + INE-1 84 1 62.76 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCATGTTTATGCTTATTGCTGTGCTTTCGTTCTGTTTTTTCCCTACTAATTGTTCAGCGATAAGAA:1 + chrX 7756497 3' - roo 8722 2 61.64 TTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCAAAAACCCATACACATGCGAGCGAAAACTTTACCCACTACTAATCAAAACTTATAATTCGTGTACAACGCAAAAGTTTAAAACGAAAATTCTACAC:1 - chr3L 9469607 3' - hopper 366 1 78.23 CGAGGAGAGGAGAGAGAGCGGAGGCTTTTTTAATTCTCTAAAATATCTTAAAGATCTTGCAGTTTTGACGAACAAAATTAACAGGAAGGTTGATACGCCCACTGTGACTCCCACATATTTGAAACATTTTTGGAGACATTTTTTTT:1 + chr2R 5490090 3' + Rt1a 4943 1 52.05 TTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTG:2 + chr2R 4206656 3' - 1360 322 1 71.23 ACCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTTTCCTTGATGCGCATTTGGCACAG:1 + chr3R 26846809 3' - hopper 84 1 77.78 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTA:2 - chr3L 14375595 3' + roo 9034 1 56.85 GAAGCAGACACAGCTCATTCACTCCCCGCTTCGTGAATCCTGTTGGTGTCCTCAGCACAGCAACTGGAGCGTCTCCATCTCTTCCAGGCAGCAGCTCAAATACTCTCGCTAACGGCC:1 - chr3R 2689360 3' - diver2 4466 1 52.99 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGATTTATGGCACAAAATATATATCAAAGTTTCTGCGTTTAAGCATGTCGCCATATCAAAGA:1 + chr3R 20203922 3' - 412 59 2 59.72 ATAGCAACAAAGTGATGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGATTTATGGCACAAAATATATATCAAAGTTTCTGCGTTTAAGCATGTCGCCATATCAAAGAAGAG:1 + chr3R 20203926 3' - 412 56 2 55.86 AGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTTTAGTTATCATATTTTCGTTGGAATGAATGTATCATTGGCCGCAAAGGTTGCGGGCTATTTAGATAAACGCTTCCAAGGAGTAAG:1 - chr2L 11070647 3' + 1360 465 1 53.42 TATCTCTGGTCCTTATGTACCAAGGAGCGATCTTTTTCAGAGTTCTTGCCTGAAGAACCCGAGTTTTATTCAGTCTGCATATACCACAAACGGTACATGGTTTTCTGTAACACTATACTGTAACTTCGGAAAGATTCATTTCCCCA:1 + chr4 1174063 3' - jockey2 3003 1 50.68 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCACTAGAAGCGCATAGAATGGAACTCGAGCAAAGGACATCCGGCA:1 - chr2R 17332125 3' + jockey 4981 1 59.13 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGCTAATTTTTGGCGAAA:1 - chr2L 17839372 3' - blood 59 2 56.16 AGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGGGAAATGGAGGAAGTTGGGATTTCGTCTCGGAGCGACTCGTCCCTTTTCCACAGTCACTTTCGCCCGCTCCCATCGAAAATTCTGCATAATTCATGTATTTTATTTAAAGAAGATGCA:1 + chr3R 6460322 3' + S-element 2 2 76.71 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTTGTGTCACTCTCTTTGG:1 + chrX 7706842 3' - P-element 50 1 48.92 ATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAA:1 - chr3L 16973363 3' - S-element 1581 2 54.79 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGGTGACCATTCATTTTGATTGTGGTCGTG:1 + chr2R 23671824 3' + hobo 2904 1 65.52 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACAGTTATCGTTTAACGTCCCAATGAAAGACGAAGCGATTATTGCGATATCATTTTTTT:1 - chr2L 22724050 3' - pogo 27 1 66.44 ATATGAACAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAGGCCGACGATTCACTAATTGCTGTTGCCAGGA:1 + chr2R 3171109 3' + 1360 495 1 76.71 ACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGGGATTATTGTGCTGG:1 - chr2R 13367415 3' - jockey 4590 1 60.96 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGCTATTTATACTCTTCTGTCGTCTGGG:1 - chr3R 11870045 3' - pogo 19 1 67.19 ATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACGTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTTGTTGGATATCTTTTGGAATAGTCAGCCTTGGGATTGATAAATTTTTAAGAACTGCAATAAAATAG:1 - chr3R 10030656 3' + BS 5077 1 70.34 TAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTACTTTCGTGAATAAAA:1 + chr2L 22150650 3' - S-element 62 1 83.56 CAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGA:1 + chr2R 5754572 3' + P-element 2798 1 28.77 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGAACCCTTAGCTCATAATAATTTCACAACGCATACACTAGCCGTAAAATAATTTTCCAGCATTTTTTGT:1 + chr2R 21748346 3' + 1360 3336 1 56.16 CCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGTGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGTGTGAGACTTAGTTGTGAGGTTTCCGTGAAGATTTAGTATACTTTATAAGT:1 - chr3R 6783598 3' + G2 2763 1 63.20 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATACATGCACGCAGACACTTTATTTATTTACATTCCAGCCAGATTGAAAGTGACATCACAAAGTTTTGGGGC:1 - chrX 11008297 3' + hobo 2937 1 76.77 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGATTGGGCACGATTAAGTGCTCCACCTCGGCGCGATTCATCAGGTTTAGTTCGTCCACAGTGCGCAGGTGCAAGGTGCCCCTCTGCGGTGCTTCCAAAATGTCCA:1 - chr3L 363405 3' - blood 17 2 69.86 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCA:2 + chr2R 11256255 3' + roo 9008 2 61.64 AATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATAACCGAGTAACTTCCTGGCAAGTGGATATGATACAACCACCAGGCGTAA:1 + chr2R 10716000 3' + Quasimodo 7290 2 66.44 GATTTGACCTTTTTCAAAATCGGATAAAGGTTTTTCGCGGCCCATTTTAGAAAAAGATGATAAAAGAGCGCTATCCCAGTCTTTCTGTTCACGGAATTGAAGGTGCATTTTATGAGCCAGGCGCAAAAACTGTCATTCCGAAGAAG:1 + chr2R 5699538 3' - Tc3 461 1 54.11 GAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAACATTGCGGCAGCAAAATTGATCGTGACACTCAGATTGCTCTTATCCTGTTGCAGTGGAGGACACCAGCGCAGCTTCTCCAGCAG:1 + chr2R 6669338 3' - G2 2977 1 59.31 CTGCCAGTCAAGGTATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCGTCTGT:1 - chrX 19820620 3' - Rt1b 4978 1 59.13 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGGGAAAACAAGGGAAAAGCACG:1 + chrX 19887161 3' + P-element 2830 1 47.26 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTGCATGCATGCAACACCCTGTAAGATATGGAGATACGAGGCCAAAAGCTGCT:1 + chr2L 18522371 3' + roo 9045 1 65.75 GAGGCATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGACCACCGACCGACCGCTGACCATAATTCACTCAAGGTAGACAAAAGCATTTTGGTTGC:1 - chr3R 21341320 3' - hopper 25 1 55.96 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTGAGTGAAAGTTTCTAATACTGCTAGAAATGTATATTTATAGAAGGAACCTCTTTTTTT:1 - chr3L 1358439 3' + 412 7511 2 53.78 AGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAGATCCTCAACTCGAGTGGCTGATAATTGGGCGGCACGTGCTGGTGCCTTTGTTCCGGCAAG:1 - chr3L 1856691 3' - Transpac 42 2 51.20 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATC:1 + chr2R 5754575 3' + P-element 2801 1 30.82 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTGCGTGCGGTTGCTTTTCAC:1 - chr2L 14969086 3' - 412 60 2 58.90 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGC:1 - chr3R 6413578 3' - 1360 74 1 76.92 TAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTCTTATAATAGAAAGTTCTTCTTAGAGAGCTCTTCAGCTCTTTGATGTCTTTCAGCATAAATGTCATTTCGATACTTTGCACAAAGGATTCTCGTTTGGATGCTCTTGTCGCA:1 - chr3R 27852235 3' - mdg3 5252 1 49.26 ACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACGTACAAGAAGGAAAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAAATTTTCATGTTGCCATGTCAGTTGATAATCAGAATTTATGGTTTAATTGTTAGATAATAGAGCAAAGAA:1 + chr3L 4704487 3' - copia 154 2 51.37 TATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGCTT:1 - chr3L 17667560 3' - F-element 77 1 61.64 ACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATGAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATGTTATTAAATATGATCCGTCTTAAT:1 + chr2R 4270294 3' - gypsy9 27 2 56.16 AACGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACTTGTGATAACGCAACATTTGCTTGTTCTATCTATGTATGTAT:1 + chr2L 6177611 3' - pogo 76 1 69.86 AAAAAAAACAAATAAATAACCAAGAAAAAAGCAAGAAAAAACCGAGTCGAAGTCGACGACGCGCCAGTCAGTCAAACAAATAAATACGTATTTAAATCGTTATAA:1 - chr2R 18346293 3' - transib1 6 2 79.05 ACCCGAGAAGTTAAGCCGACGAATCAAGTTAGGACTCTCAACCAACTGACTACAAAATACTGTAGTATAACAATTTTCAACTTTGCGATTCCCACGAGGACCCTCCAAAGTAGAAAAAAAAACAGCTACTGGTTTTTACACATAAT:1 - chr3L 25192008 3' - Cr1a 4090 1 73.97 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATTGGACTGTACGGCAGAGTT:1 - chr2R 15070054 3' + 412 472 2 65.60 TATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATGAAAGTAATGAGGGGCAGACAATCG:1 - chr3R 14049282 3' - transib2 12 1 77.40 GAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATCTGAAGCTGAAGCTGGCATTCCATTTGAATTATTCATTGCCAAGGCAGCCACATGGGATCGAAAGTGGAAATGGAAGTGGCAATA:1 - chrX 8219341 3' + opus 487 2 73.39 CCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCTCATATCACA:1 + chrX 21994011 3' - McClintock 5995 2 54.11 ACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAATCGCTTAGAGTGCGGTCGGACTTGATGGGATCGCTGGCTGGAT:1 + chr2L 16511031 3' - 297 418 1 67.91 ATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCCTCAATCTCACTCACATTTTGAAGTCACTGGGGTACATGCCATTTTCCACGCCCAGACTGCCGTACGGC:1 - chr2L 10390190 3' + McClintock 6125 2 65.75 CCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTTCAGCAAACCGTTTATTAATGTTTATCCAGCGGCAATTGAAGGGGGCAATTGTTTGCCAAGGCACAAATAATATAATAT:1 - chr3L 9212220 3' + hobo 359 1 60.96 ATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAAACAAGCATTAACCGTGTGCATCGTTACTTCTGTAGCTAAGTAATTTAAATAGTTTAATTTTCGAGTTTAAATAGTTTATATT:1 + chr2R 6673474 3' - BS 5052 1 56.85 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGGTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTTGC:1 + chr2L 12291963 3' - Tirant 8126 2 66.40 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCAGTAAAAAACCCTCAAAGCGTAGCGGATTTTTCATTTGGAATAGAAAATCCCAAAAACCAAAGGCCAATGATTCCGCGGGTGCAGACTGTACTTGT:1 - chr2L 16330908 3' - roo 8673 2 76.15 AAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAGATATATCGTTTTTATTAATAAATTAATCGCATTCATTTTAAATTATTAATCAACAGTGTAATAAACTATTTGCTATAATACTAAAACTTGCGTTCAACTACATATA:1 + chr2L 7822355 3' + Juan 4203 1 76.03 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATTCATCAATATGGAGAATTGAACCCCTAGTACTTAGTACCTTATGTGGTAAATGGAGCAATATTTTGAGTAAACAATGCCTTGACAT:2 + chr2L 2895682 3' + Burdock 6357 2 60.96 TCTGTATATGCCTTACTAGAGGAGGGATAATACTTGTTATCATTGTTTATTATCAACTTAAATAAATAACAATTGCACCGCCCCCCCTAAGAACTTCCCTCCCTCAAGGAAGCTCCCTTTACTTATTTGTAATGGGATCACAAACA:1 + chr3L 10294332 3' + Transib5 2538 1 52.74 GGAATAAAAAGACAAAAAAAAAAAGCAAAAAAAAAAGGTTAAAAAAAAAT:1 + chr3R 24206799 3' + Osvaldo 1521 1 64.00 AATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACATAAGCTAATAAGAACCTATTGACTTGCACTGCAATCAAATACA:1 - chrX 14137222 3' + 3S18 6050 2 66.67 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGG:1 - chr2L 17839390 3' - blood 7088 2 68.49 GGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAGTACATATTTCGGAGAATATCATTGAGCAACTAATTATATAGTTTAATTCAATTGCCGAGAGGAGTTAGTCATGCAAATAAATTAAGCAAAATATTGAAAATA:1 - chr2R 17014332 3' - flea 4771 2 75.34 TGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAAC:1 + chr3R 7616807 3' - Stalker2 7326 2 74.66 AAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCATTTTCGTTCGAATACCC:1 + chr3L 7801344 3' - Transpac 5048 2 64.38 ATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAATTATTCATGCACTTTTTCCATGGATTACAAATGGCCCACTCACCTGAACGCTCCA:1 - chr2L 8464763 3' - micropia 5301 1 62.33 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTTTTTCTGTTAATGAAAACAGTGTATTTAAGCTTAAATCAGAAACATTACTCCTTAACCCATTTTAATTATTGAAATT:1 + chr2L 19691353 3' - roo 8700 2 56.83 AGTTAGCGATTTTGGCCTTGCGCGTGTTAACTTATATGTAGTTCACGCTAACTTAGTATCAGCATTTATATAGTTTCAAACGTGTCCTTTTCAACAAATTTTAAATTTATATTCTTTAACCACTGTGCATAATTATTTCCACCTTT:1 - chr2L 19938518 3' - gypsy4 11 2 74.66 AGGATCAATAGCCGAGTCGATCATGTCAGTCTGTCCATATGAACGTCGAATTCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATATTCAAAGTGCTCGCTGCAGATGTAAAGCGGCCATTACGATAAATGGGTAAT:1 - chr3R 23167027 3' + INE-1 96 1 64.34 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAACTATTAAAATAAATTTAAGCATATACTCGGAATAGATTAAATCCCCGGCACTTGAAATCATCAGGTAGTCGTTGACCTGTGGCAATTGAAGTTCGATT:1 + chr3R 31483776 3' - I-element 22 1 69.66 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCATTTCACGCACACCAAATACAAACAAACCA:1 + chr3L 15364921 3' + 1360 3347 1 52.86 GCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGGTTTCAGATAAATATGGAAACCCTAAATGTTGTCTGCTGTTATAAA:1 - chrX 21504669 3' + Cr1a 161 1 51.37 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATCTACAGTATAGGGTCTCTACGAGTAATAATTTTGCGACAAAGGCTGAAATAAGAAA:1 - chr3R 20872100 3' + 297 335 2 65.75 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACATGGTCACTTAAGCCTGTATCGTCGAATGTAGGTCAAACATTTTTGGCATTTCTCAAGTGCCTGTCGCCG:1 + chr2L 11871656 3' + Tabor 7284 2 64.83 GGGATCGCTTGTGCGGGACAATTTACAACAATTATACCAACAAGTTACTGTGTGTGATGACCGTATATGTGTACATCAATCGCTGATAACATAGGAGAGCTCCTCGTCGCTATCATAGAACTTCAGATTGTAGTGGAAGATCAA:1 + chr2R 20608345 3' - accord2 7172 1 61.81 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACCATATGGCTAAAAAGGGTTCCC:1 - chr3R 27323100 3' - 297 42 2 76.19 TAAAAACAAAAAAAACAAAATATAATAGTATAAAGAAGAGACACCGAAGCGAGTGTGTGCGGTTTACGCATAAATGGGCGAGGTGCGGTATCAAAATTAAGGTCTATTTACAGATTGATTGGTAGAAGCTTGGTAAACAGTTAAGC:1 + chr2L 8273415 3' + gypsy11 3932 2 60.27 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTTCAAAATGTCATTTATTCTGACTGCAGTAATTACAATTTGATGATAGGTCAT:1 - chr3R 12379706 3' + roo 338 2 67.12 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAATCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGCCGTAAAACCCCGGGCATAAACTGCGGTCAACTTGACCAGGCATGTGTGAGCGGGCTTGTTTAACCAGCGAT:1 - 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chr2R 19852165 3' - Transpac 5003 2 75.34 AGCAAAAAAAAAGCAAAAAAAAATACAAAGGACTCTTGAATAAATAAGTGTTTCTGTCTGTGCTGAAGGATGGCACAGAAAAATTATATGTTTGTGCTCCCAACTATGATACAATTTGGTAACATAGCCTAGATTTTGTTATTAAA:1 + chrX 11275738 3' + gypsy7 5004 1 59.59 ATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTTGTGCGAATTT:1 + chr2R 11146154 3' - Quasimodo 29 2 65.75 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAAGTCAAAATTGTTGACAGCTTGAAAAAATGAC:1 + chr2R 10160983 3' - transib2 53 1 55.48 GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATT:1 - chrX 388233 3' - 1360 60 1 58.90 GACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGAATTTTCTTTAATGATGACACCACACGACGCCGA:1 - chr3L 2137038 3' - roo 321 2 77.40 ATCGTAACATGTGCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGTTGTTTTTTTTCTGTTGAATTATTTCTACTTAAAAGCTTGGGATAACATGTTTATATTTTTTGGTTGCGTTGTTGCACTTAATGTAC:1 + chr2R 4511676 3' - 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HB 44 1 70.15 GTATTCATCTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACAGAGTCAGAGCGCGAATTTTTAAAATTTTTTTTATTTTATCATATT:1 + chr2R 5753855 3' + 1360 418 1 63.85 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGGTACATACATGCACGCAGACACTTTATTTATTTACATTCCAGCCAGATTGAAAGTGACATCACAAAGTTTTGGGGCCAGA:1 - chrX 11008293 3' + hobo 2894 1 54.79 GCAATTTTGGTCGTCACCAAAAATGTGAATGCATAGTGCAAAATCGATGTATCAGTTTGTCTGGTCCTTGGATGGCTGGTTTTCCCTCATGGTCCTGTTATTTCTACACATGCTCGCCCAGGACTCGCTCTTTGTTGCTATTTCGC:1 - chr2R 17252925 3' + 1360 3324 1 67.81 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACACATCCTTATCCTATCTCTTACAAAAAACAGGAAAAAATGTCATGTA:1 + chr2L 7652329 3' + roo 9052 2 71.23 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTAATATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAATTTCGAAATTCTATGGTATCCCCAAGTCGATTGCTTCTCACATATTTTGCTCCAGCTTGTT:1 - chr3L 4081572 3' - mdg1 60 2 58.90 TGTTCGACTTAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATATTAAATGGTTAAGAATAATTGAATAGTAATCCAATAAGTA:1 + chr2L 13139069 3' + McClintock 404 2 73.97 GAATCAATAGCCGAGTCGATCCAGCCATGTCTGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAGCCAGCGGTCCATCGCCCCAATCCTACAAGTGTCATTACAGAGCCCCCAATCATCAATAACTCATACAAAG:1 - chr2L 23000806 3' + INE-1 97 1 51.49 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCATAAAACATTTGATGGTATTAACAATGTACTCCTAGACTATATGATGGTGTAAAGTGTAAAAAGTCACGATTT:1 - chr2L 7652176 3' - roo 44 2 50.00 TTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATTTGGATGCGGAAAGAGCCATATTACGAGATCTGGGACGATATCGAGAAAAGTAAGTCG:1 - chr3L 23485838 3' - Stalker 6924 4 62.33 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAGACCAAATATTTTCCAATTAACCA:1 + chr2L 5792131 3' - blood 18 2 73.29 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGCGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGCCAACCACTTTGCAAATGGCCCACACACTCAAC:1 + chr3L 18183237 3' - Tirant 13 2 73.29 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCCTGCCCGCTCGAATTTCGCTTAACATTATTTAAAGGTGAAGTTCTT:1 + chr2R 25106145 3' + roo 359 2 52.74 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAAT:1 - chr2R 16503847 3' - Doc 69 1 64.83 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGGCTACCTATACACAGAGATGGCAGCGTGAAAAGTGAGAGAAACTCTTAGAGAATAAACTATAATTATATCAACAATATTGAATAT:1 + chr3R 24499620 3' + blood 7354 2 59.59 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGGTCGATAAACCAAAAAGCAAACACTTTTATGGTTTGTTTGGTCTCGTCTTTACTTGGCT:2 + chr3L 2426016 3' - hopper 21 1 71.92 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCT:1 - chr3R 26486011 3' - 412 7105 2 50.68 CAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTA:1 - chr2R 11095747 3' - diver 69 2 61.64 ATACTAATTCACTTACAACATATAAACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACACTTACAAACATTATTCACAAACAATATGCTTCAGAAATATCAAAATCTGAAACCAACCAGACAACTCAAACTTAAGCAACAA:1 + chr2L 14494888 3' + Idefix 43 2 50.68 GTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTACTTTCGTG:1 + chr2L 22150643 3' - S-element 69 1 82.19 TGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACTAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTCAGGATACATGCCATTCAGTTGG:2 + chrX 1018186 3' - 1360 212 1 69.86 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTT:2 - chr3R 26486016 3' - 412 57 2 54.11 TGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTAGGTACTCACATCCTGCCCTTTTCGATTTACATGCAGCATGCATTAAAAATAGAACCTTCGGAAAAGTTTCGTGAATACTCGTATTAGCTTTTA:1 - chr3L 23027499 3' + INE-1 563 1 66.44 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGCTATTT:1 - chr3R 11870065 3' - pogo 57 1 60.96 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGGCCTCGCGGTGTGCTGTCCGCTCT:1 - chr2L 22319240 3' - Transpac 30 2 60.71 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATATTTGCCCACCTC:1 - 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hopper 74 1 71.11 CACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATAT:1 - chrX 12657098 3' - blood 72 2 65.75 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTCCCAAAGAATGCCACGCGTAATTATGCAAAATGCTATAAACGGAACTGCATTATCTCAGTTTATTTATGTTACTG:1 - chr3R 25753368 3' + roo 9018 2 55.48 TTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAATACTTTTTACTGAGAGGCGAAAAGGACGAGAGTAAGAGTCGTAATTTAGTTTTGTGTTTACTTTCCGGAGTCTTCACTTCCCCGAATATGAGTTAAGCAAAATT:1 + chr3L 18035623 3' + mdg3 5487 2 62.41 GGAAGAAAAACGTTTGTCCTTTTGGAAACACCTACCAGGACGTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTTTTAATAAAAGCAAGCAACTAATAGTTTATCTTGTACAAGCCCTATTATACATATACAT:1 - chr3L 14127828 3' + baggins 5001 1 58.22 ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCTCTTGAATAATTCG:1 - chr2R 14135272 3' + copia 186 2 63.70 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCTCTAAAGTGCATGGCGAACCGTTAAAAATGAATTGCCCGGGCATATTTTATAAACGA:1 + chr3L 19031374 3' - roo 14 2 74.66 CTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGCTGTTCTTGCCGTAGTTCTCGTTCGAGTTATGCTTACTGTTTATGCCGGAGTTGCTGCTC:1 + chr2R 21399176 3' - Quasimodo 478 2 53.85 GCGTGTAAATAGTTTCTTGACAAACTGTATATATCTACAAATTTACAACTTGCCGGTACCATCTGCAAGATTCATTACATTGAGAAGAGGACTTTGACTCTCAGAATGAACTCCCAAAATGAGCTCAAGGAACTGGAGACTTGGCG:1 - chr2R 7073534 3' + S-element 1710 2 72.60 GTCCGTCTGTCCGTAAGAACGTCAAGATCTCAGGAACTAAAATGCTAGAATGTTGAGATTAAGCATACAGATTATAGAGACAAACCCCATGTTTCCACGCTACTCAAACTCGAAACCAGGTTTTCAGTCGGATCTTACC:1 + chr3L 18845831 3' + INE-1 125 1 52.52 AGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAACTGTGGATGTGTGTTCCATTTAATTATCATTTTGACTAAGACCTTAATTCAT:1 + chr2R 23446528 3' + hopper 1215 1 64.14 TAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGCAGCGATTTCATTTCTCCAATGAGTCATGCGGCCAGTCCG:1 + chr3L 13952846 3' + I-element 5279 1 68.49 AGGAACTATAAAAGATAGAAGATTGAGATTAAGTATGCAGCTTCCGCATAGACGCAGCGCAAGTTTGTATCCAAATGTGGCCACGCCCACGAAACTGCCAAGCTCACACTTTTGCAAAATGTTTTGATATTTTCA:1 - chr3R 28551465 3' + INE-1 156 1 51.11 AGCGGCATTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTATTTCTGCTATTCCAGCTCCCACTTGACTTTTTGTGACTTTCAGGTTCAGCGATGTTGCCGCAGTAATTATTTAACTCTTTCAAAAT:1 + chr2L 21060966 3' - TART-B 10516 1 50.00 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTGCGTGCGGTTGCTTTTCATATAACAAAAGGTGCTATTTGGAAAATTTTCCGCGCT:1 - chr2L 14969050 3' - 412 24 2 58.90 CCAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACGACTTCGCATGTACAAGGCACCTAAACAATATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTCCACTGT:1 + chr2L 15777906 3' - 297 47 2 54.29 AATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGTAACTAAAGGAATATGTCTTGCGTTTCAGGAAAGTCAACCGGATTTTATTAAATCAATTTCCAAAGGATCGTTTAAGGACAGTC:1 - chr3L 25874330 3' + 1360 208 1 57.53 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACAA:1 + chrX 3647003 3' - 412 59 2 58.22 CATTTCCCGAGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCTTTCAACATCAAAGAGTTTAAGTGAAGCGCACTACAGAATGTGAGACATTAGAAATGGTGTTATACGAGTCAGAAGTTTTTATGTTTATTCAAT:1 - chr3L 26695619 3' + gypsy7 271 1 57.53 GTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAGTGTAAAGAGATCCGCAAGAGACTCAAACAAAACGAAAGAAAACCCTTTAAATTCCGACACTTTGAA:1 + chr2L 201755 3' - pogo 1834 1 54.11 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTG:2 + chr3R 21674928 3' + roo 9026 1 50.00 GTCTCTTAAGTAAAAGAGAAGATTCAATAAATAAGCAAAACATGAAAAAAAAGATTGTTTGGACTTGGATCTCATCATTGGAAAGCGAGGTAATAAAAGAAATAATTCTTTAATCTACAGTCATAACTTTTTTTGGCATATGGTA:1 + chr3L 24366097 3' + Doc3-element 4690 1 69.66 CTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGAACACTACATGATTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCTCTTAGTGGGAGACCACAGATAATTGAAAATGTAGCAACAAATTACTTT:1 + chr3R 20457590 3' + roo 108 2 78.08 ATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGGGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAA:1 + chr3L 21093223 3' - Ivk 54 1 61.72 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAGACAGCATGAAGAGCGACATTGCAATCCTATAACCTGTAACATTAAAAAGAAGATAGTTAACAA:1 + chr2L 21153628 3' + 1360 3379 2 78.77 TTTTCATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTTACTTAAGAGTTTTCAAGTTTTCAATAAGTTTTCAAATTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGAGCAAGGCAAACCGATCGATTTCCCCGAATTGCTGT:1 - 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springer 28 2 57.03 GCAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGTCAGCTAGCTTGGCCTATTGCTTATCTAGCAGACTTGGCCATTTTCTAGACGCGACACAACACACG:1 - chr3R 23453505 3' + Doc 242 1 54.11 TATCAACCTTCCACATAACTATATCACGTGACATGATATCACGTGATGTGGCTGCTTCACTGAGTCATCTGTCGGATAACTTTCTCAAACATCCATAAACAATGCACTTAATTGAACTTTATTGATACGGTCGCATAAAACCA:1 + chr3L 1856841 3' + Transpac 311 1 72.73 ATAAATACCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGAGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTGCAGCACTATTTGCATTTGTTTCCAAACAACGGAGTGTAAAAGTTGT:1 - chr3R 27148705 3' - baggins 5333 1 67.81 CACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACCACAATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTAGTCACAATTTAACATTATTCGAAGAAGTCCTTATAATCAATCAAT:1 + chr3R 8017822 3' + mdg1 346 2 67.12 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGTCTTGGGTTGAGGGGCAGGTTTTCACCGGGTCAGAGGTGCAGGCGCCACCTAATGACTTGCAGC:1 - chr2L 12486320 3' + roo 353 2 56.25 ATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAGGGTCAAGACTAGGTTCTCTAGCCGACATCGATGATTTTCCGTCCCAGAGCATGTGCGTGAGATCGCCGGACTCATG:1 + chr3R 28538838 3' + INE-1 139 1 42.48 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGGTGGACCATTGATGCTGCGGGAACAGGACGTTTGGGTGCTGCGGGGAGTGATCTCCGGAGGTGTG:1 - chr3R 14218422 3' - roo 27 2 59.66 GTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTGTCAAAGATGATTAGGCATAAATTGAAGATT:1 - chr3L 19031171 3' + roo 402 1 80.14 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAATCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATATATAAGAAGGGGTCTAATTCCATATTGATGAGACCGAGATGGGATTGTCATGGGTGAGGGTTGGGCCAG:1 - chr3R 28406335 3' + opus 454 2 52.74 GCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGGCAAACGGAGCTAGATTAAAAATTTAAGCGACCTTCCGGAAGTAAAATATGTTTAAAAGCGTTTTTATAAAAAAATATGTATACTTTTTATGTGATTCAATGAAAAATACT:1 - chr3L 14302661 3' + Quasimodo 6979 2 78.08 CGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACGAGAGACCAGATCTGATCAGTATATCTTAAGAAGTTGTTTTGAATTATACTATTTCAAT:1 - chrX 11246559 3' + invader4 285 2 76.71 TTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGCTGTTAATTATGCAGTTGACTGGGCGAATTTATGGTTTTTTACTGGCTGTGG:1 + chr3L 8848037 3' - I-element 5168 1 67.83 ATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGATGTTGTTTGTGTGCGTAGCGTTTTTGCCTTACAAGCAAGCCCACCGATTGTAAAACGTAAA:1 + chr2R 24814141 3' - FB 683 2 59.59 GATACTTGCATTTAAAATATAAAAATGGGCATTAACAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGGTAGCGTTGTAGAATCTCAACTAATAATGGACGCATATGAGTTGTATTATCCTTATTTTCCCTGCCTGTTTGGGGTTATTCTT:1 + chr3R 13894010 3' - G4 3533 1 54.55 TACCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGGCTCCGCAGTCCAAAACGCAGAGCTCAGGACTGTGTCCCTCCATGTCCCGCGCTGCTGGATTGTCCCACCGACATGTCCTGCTAATCTGACCCGCCGACCTGTTGTTCCATA:1 + chr3R 17733425 3' - INE-1 553 1 73.29 GCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCCAGTC:1 - chr2R 4577071 3' + Chouto 458 2 62.04 AAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTATCAGGACCCGAGGGCTGCAACCTTTTCATCTACCATCTGCCGCAGGAGTTCACCGA:1 + chr2L 12310712 3' - Copia1_DM 120 1 56.92 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTTTAGTACAATATATGCCATGGGGTATATTCCCATACAAAATGCCAATGTAATCGTAATTGTAATTGTCGGTACTATCGTTTCGTAATTACGTGGATAAT:1 - chr3R 24673511 3' - roo 20 2 67.81 TTAAATTTAAATTAAAAAAAATTAAGTTTAATTTAAATTTGTTAAAAGGACTCAATAATAGAGGTAGTCATCCTTCTTTGGCGGTCATTGCTCCTCCTTGTTCAATTAATTACAAGTAAGTGCGCAGTATTTTGTTTGTTTTTTTT:1 + chr3R 13362938 3' - S2 91 1 71.23 GAATGGCGCGCATTTTAAAAAAGGAAGTTATGCTGCCGCACCCTGTATTTTCATTATTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATTGATTTGCCAAAAAAATTTTTGCCACGCACACTCTAAGGCCACACTTTTGAACAATTTTAATTTT:1 - chrX 18376745 3' - mariner2 24 1 65.07 GAAATGTGCTTATGGTGCTATTGTTACCGCAACTGTTCATATACACAAAGCACAACAAAAGTCAATAATATTCAAGTTGAACAAGAGAGAATGCTAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 - chrX 15903342 3' + Tc1 1627 1 46.83 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGGCCGGTTAACTGGAAAGAGGTAGTGTTTTAATTTTAAGTTTGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' - P-element 41 1 53.96 GATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAGGGAAATACTTATCATACTTCCAACGATAAGAG:1 - chr3L 13952729 3' - I-element 5112 1 73.38 GTATGTACATATGTAAAATGTATAGGCTACGATTAATTTATTTTTAACATATACATACATATTTATTTTTATTTTACATATGTACGTCAAAGAATATTGAAAGAACACAAATTGTAACACAAATTTTTAGGAAAACAAATCAAAAG:1 - chr3L 14967054 3' - 412 220 2 75.34 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCT:1 + chr3L 19031318 3' - roo 58 2 63.43 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGTTTAGCAAAACTTGAAGTTGAATGTATAAATGTAATTTTCGTTATATTTATTTT:1 + chr3R 6422912 3' - jockey 74 1 60.00 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGGCAACTTTGGCGCACTTTGCATTTTTATTGCACAAC:1 - chr3R 7470918 3' - Doc 46 1 70.08 GCCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTTAATCTTTGTTTTCCTTTATTTATTTCGAACAACATAAAAGCGCTTAA:1 + chr3R 21395242 3' - G2 464 1 52.74 TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGGTTTCGCCATCAGACTCTAAATGGAGGCCAGGCCAAA:1 - chr2L 12291806 3' + Tirant 370 2 65.75 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTAC:1 - chr3L 15364822 3' - 1360 74 1 69.18 GTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTTGTCATTGTGGTTGTTGTTGCTTTAATTTAGATGCATCTCGAACTGTTTTTGCTTTTGTTTCTCCTGCTGCCTGTTGGCTGGCAA:1 + chr3R 9962391 3' - I-element 4959 1 60.27 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTATGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAAACAAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAACTGCACGCGGAACGGAAAGAGGAGGAGCTCTGTCACAAGCAAGGGG:1 + chr3L 20497846 3' - P-element 43 1 55.86 ACTGTGTTCGCTGTACTATGTCGATGTTGCTTCTCGATGCGTTGCCCCATAGCTCGGAGCCATAGGTCCATATGGGTTTTAAAACGGAGTTATATAAGAGGATGCCCTCCACCAATACAGTTGGCTGATTTCAGAGGATGACAGAG:1 - chr2L 17692336 3' - Doc3-element 4369 1 69.86 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATGAAAATTGTGAAAAAGAT:1 - chr2R 5237708 3' - Doc 38 1 47.95 AAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGATGGATAAACCCGCAAGCGGTGGCAACTAATTTCTTTTTACAACTGTAGCAGTTCCTCAGCTTT:1 - chrX 6462008 3' - hopper 59 1 56.85 AGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTG:1 - chr3R 25543458 3' - G2 230 2 50.00 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAAACAAGCATTAACCGTGTGCATCGTTACTTCTGTAGCTAAGTAATTTAAATAGTTTAATTTTCGAGTTTAAATAGTTTATATTCCTCCTTTGGTTGAAAATGAACTTTTATTT:1 + chr2R 6673504 3' - BS 5022 1 77.40 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCATTTCTAAGCAGATAACTGTGTGTGTGTGTCAGCCAACACTGTGCTACAAAATTAGACAACATACTCCTGGGTAGAGAAGTT:1 - chr2R 7982335 3' - P-element 37 1 60.96 CGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGCTTTACAAAGTATAGTATTGTTTATCTGCTCTTATCA:1 - chr3L 17667526 3' - F-element 43 1 57.53 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGGGATTCGAATACAAGTTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chr2R 18611854 3' - P-element 90 1 26.03 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACGGAGCCGAAAAGAAAACTCTTTTGGGGCATTTTCTGCTTCGTAGGAAAGTGAAGGAAATTGCACAAAAAGCTACAAATCAAAT:1 - chr3L 486665 3' - roo 8674 2 77.40 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTAC:1 - chr3L 12874887 3' - jockey 82 1 70.71 TTTGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTGTGCAAATATATTAATACATTTTGCAAAAGTGTGGGCGAAAAATCGTATGGCGTTAAGCATATTATTACTCTAATGTCGGCATTTACTGTACAACTAACGCGTGTAACAACGGACAT:1 + chr4 1097152 3' - INE-1 307 1 45.89 GCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTATATCTTACACAATCAAACCATTGCACTTCCTTATTTTACAACCCATAACTATTCCC:1 - chr3R 28907475 3' + 1360 432 1 70.79 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGCACTTGATTTTAACGGTAAGTTTTTGTTAACCAGTTAACACAAGTTATTGCGAGGTGTACATAAGTTTTTGGTTGAAAATGAAG:1 - chr3L 12964696 3' - hobo 36 1 59.59 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAG:1 + chrX 2295248 3' - Transpac 53 2 56.16 GCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGATGTGGGTGAAGGCCATGGACA:1 + chr3R 16997484 3' - G6 19 1 67.48 CGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATG:1 + chrX 20685951 3' + Ivk 5326 1 53.42 CTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTACAACGAATGTAGTATAAGTTAACAACTAAAGATAGCACTCAATATGTTTTAGTTGCACATTTTCTGGAGTTTCAGTTTGGGTTATATTGGATATATTTTGCTTTGTCAATCTTTACAGTT:1 - chr2L 20770925 3' - INE-1 28 1 54.11 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAAGTCAAAATTGTTGACAGCTTGAAAAAATGACTGTGAATT:2 + chr2R 10160991 3' - transib2 45 1 50.68 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATTGGACTGTACGGCAGAGTTGAAACCT:1 - chr2R 15070047 3' + 412 7511 2 60.96 ATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGAATTTAGGGGGCCGCAGTGTACAGTTGAGAAATTGCAAACTGAAGCCTCCTTTTATATATAGTATATATCCCTGCTTTTGATGGCT:1 - chr3R 25804089 3' - mdg1 29 2 61.15 TAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGCGATTGAGTTAACTTGCACATATGATGCATGCCATATGCCATTACGTTT:1 - chr3R 12520766 3' - Burdock 79 2 75.56 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGGCATTAAATAAATAAAGGCCAACTTGATGCCGTCCTAACCAAAT:1 + chr3R 18528398 3' - roo 8699 2 54.79 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGGCGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAAC:1 + chr3L 21093253 3' - Ivk 42 1 56.85 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTGCATGCATGCAACACCCTGTAAGATATG:1 + chr2L 18522348 3' + roo 9024 2 50.69 AAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTCTTGTCTCTTTTGTTGCGAGCCAACGACCCGGCATCGCATTGAGATTACTTATAAAAGGTTA:1 + chrX 19107477 3' + roo 9015 2 58.90 CATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTGTTTGTGTAGAATATCTATTGTTTCGTTATGCATATAGCGTATTACATTGTTAAATTAATAT:1 + chr3R 21570902 3' + copia 4961 2 57.53 ATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAATCGCAGCTGTATAAAATTTAAATAAAAATAAATAATAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTATATATATGTATTATATGTATATTA:1 + chr3L 19339462 3' - Tc1 26 1 49.32 AGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTTCTTCGTCTAATTAAATTACGTAGCGGAAAAAGAAAACTTGTAACGC:1 + chr2R 5045715 3' - invader6 13 2 75.35 GCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGACTCAAATACAAACAACAACCACATTTATATTGTTGTTACATATATATATACAG:1 + chr2R 497220 3' + Bica 401 1 63.70 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAG:1 - chr3R 16276307 3' - pogo 41 1 57.53 GGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCCGGTCACTCGCCAATTCACGCTAATGGGTTCC:1 + chr3R 31141084 3' - Burdock 6157 2 68.89 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTT:1 + chrX 388307 3' + 1360 3380 2 58.82 TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCGGTGGATTGATGT:1 - chr2L 21153471 3' - 1360 54 1 54.11 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGCTATACTTATTTGGTTTTCCGTTTTAAAGTCAATTTCGAAAATAACAATACAGACCAATCAGAAAAC:1 - chr3R 21216833 3' - 1360 57 1 60.96 CCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTG:1 + chr2L 23034087 3' + FB 391 1 47.26 CCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAACG:1 + chr2R 20447884 3' + hopper2 1541 1 64.75 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCAT:1 - chr2R 21848647 3' - Transpac 4953 2 56.85 AATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGATTCCCATTTATTTTGCGACTGTGGGAACCTGAACAAATTTGGCTA:1 - chr3L 5864537 3' + I-element 274 1 64.00 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGATTTATGGCACAAAATATATATCAAAGTTTCTGCGTTTAAGCATGTCGCCATATCAAAGAAGAGTCTTGTAAGAAATGTTGAATTTTT:1 + chr3R 20203950 3' - 412 7086 2 63.01 AAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGGCCTTTTAATGGCAAACTCGCATAACGATACATAGAAC:1 - chr2R 12065570 3' - Stalker2 50 2 52.74 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTTATTTCTAAGACTTTCTGATGTTCACTTGT:1 + chr4 916364 3' + roo 9007 2 78.33 GGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTGTATGGACTGAGACTTACCTGGTCGGATCGGGAGTGCTAGTGGCTCCGCTCAGCCTGTTTAGTGCTCTGAGTGCTGCCAGCGTACTTCGG:1 + chrX 18220712 3' - Burdock 3 2 75.41 AAATAGAAAAAAATCACAAGGGGGCAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGGCAAATGGGGGACGTCACCTATCAGATTTCATCTTCAAAAAAATATAAATAAGAACTGTGTGTGGAATAATAACGTAAAACTAAAAAAAAAAATACT:1 - chr3R 22193512 3' - mariner2 586 1 73.97 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTGAGGTACCTCTGGGCTGCTGCTCTGGATGTTTTGTAGCCCA:1 + chr3R 27810102 3' - Burdock 54 2 65.85 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATATAAGTTAAGTGCAGCCGGCTGAAGTTGAACTACCTCGATTGGCCTCT:1 + chr3R 24673644 3' + roo 9002 2 67.12 TACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTTCTCAAGATTTTCAAGACTCCAGTCACCACCCCTCCATATACATAAATTACACTACGTA:1 - chr3R 10437013 3' + BS 5066 1 65.75 GCGGTCAAACAAAAAGTGAAGTCAAAAGTGTAAAACCTATTCAGATGAAAATAGTGCACACATTGAGCGAATTTCACGATGAAAGCTAAATTCCGAATTACCGTTGAATTTTTAGAAACCCGTTGATAGCCTCTATAATTGGCCCG:1 - chr3L 3493164 3' - Tc3 346 1 71.92 CTTGGCGTAATCACATTGAAGCCAAGAAAACGCATTTGAAGCTGAAAGCCAGTAGGTTTCACTAACTTATATCAACTCACGCTCTTCACTAAGTTGGTGCTGTTATACAACACAGTTCTAATGCTTTCTGTTTTCGGCTTTCCATA:1 + chrX 19148000 3' + Doc4-element 2462 1 67.12 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAATTAATCAACAATATTGACTTAAAGCTGTCAACTGAATTAAATTAAACTGATTTATTAATGTGGCGACAGTTGGGCGATTG:1 + chr3L 11396036 3' - I-element 38 1 60.27 AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCACTAGAAGCG:1 - chr2R 17332159 3' + jockey 4919 1 67.83 GTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATTAAAAAAATACCAAA:1 + chr2L 1361084 3' - Stalker2 7253 2 69.66 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATTACGTTTGCTATCTTCTTGACTTTGTAGTATTATGTGTGCTTTATGATTTAGCT:1 - chrX 15116030 3' + pogo 2040 1 60.96 GAGTAACGGGTATTTGATAGTCGTGCAGCAAGCCTAGTGTTTTATGAAGTCTATATATAGGATACACATAAGCATCGAAAAGTGTGTTTACTTACGTAAGCAGTAATCATGTTACCTCCTTCAACAAACACAAATAGGTCTCCTT:1 + chr3R 14925773 3' + INE-1 549 1 70.34 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTCTAACTCTGAGGATTATGACTGTGACACATTGTTTCGCCAGCGAATTATAACTTAAGCACTTTGTTAGCACTTGGCTAACAAG:1 + chrX 10580022 3' + pogo 2077 1 66.67 GGAGGAAAAGCTTGAGAATTTTGTCGCCTGCGAAACACGTGTGGAATCGCGCTGCCCACCCAAGTGCCACTTGAAAA:1 + chr3L 16429276 3' - Gypsy12A_LTR 2011 1 58.44 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTTTTTATGAAATAATAAATAATACTTTTTCGGCCCACGGTGCATTGGTGGCCCACTGGAACTTCAAAGTGGCCGAATGCCATTACGG:1 - chr2L 8574329 3' + Transpac 5217 2 76.80 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTATGATTCTTAACAAAACTTTGTGATGCAGATGAGTAACAGTTTGTTAAAATGGGTCGCTTGAATAGAATAGAATAGGTACGTATTGTACACACA:1 + chr3L 3238367 3' - roo 8691 2 54.11 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCGCTCTATTATTCTTCTCTTGGTACTCTGTCGTTGTTGGCTCT:1 - chr2R 1373073 3' - pogo 30 1 64.75 GAACCCACACACACACACACACATACACTCACGCACTGCGTGCTTAATAAGCAGCACACACACACGCACACATGCGAAAGGCCAAGGAGTAAGCCCAACAAGATAAAACAAATGCTGGAAAA:1 + chrX 5284727 3' + accord 252 2 51.64 AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATATGTTTATGTATTTGTGCGTTGACCAGGGACATTTCCATAAATCTGCCAGG:1 + chr3R 18635305 3' - opus 63 4 68.49 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTATCCAATTAAAAAAACAAAAAACAAAAAGGACCTGGAATTG:1 - chr2L 21643013 3' + Tabor 7278 2 53.42 GCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGTATACTGACATAGTACAGGAAGTTCGTAATAAGGGTAGAAAAATGGCCGGATATTATTCATAACTTAGTTGGCTAACTAGA:1 - chr2L 18630410 3' - G-element 16 1 74.66 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTAATTATTTTTAAATAATGTTTAGGGAATTATTGTTACGAGAAACCCTTGCTTCGCCAACGCCTTTACTTAAAT:2 + chr3L 14375731 3' - roo 8712 2 54.11 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCCTTTCATAAGATCCCATCTGTTTGATTTTGAAAACATTTACTTCCAATCAACGGCGTT:1 - chr2R 9294282 3' - Tirant 10 2 70.83 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTT:1 + chr2L 7652259 3' + roo 324 2 77.40 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTAATCTCTTAAGTTTAAAGATAATTACTTCTAGTTATATATCGGTTTAAAACTATGTTCCACAGTAGCTTTAACTGGGATGGCCATTGAAA:1 - chr3R 18528239 3' + roo 9043 1 63.01 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGCATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATA:1 - chr3R 4679437 3' + hopper2 1560 1 50.00 TACATAAGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTAGCGCTTGATTATAAAAATCGTTAATCTTTGTATATTCTCCAATAAAGTAATAAGCCATGATCGTCATACCAACA:1 - chr2R 11256141 3' - roo 8709 2 52.05 GTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACGTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTTGTTGGATATCTTTTGGAATAGTCAGCCTTGGGATTGATAAATTTTTAAGAACTGCAATAAAA:1 - chr3R 10030659 3' + BS 5075 1 68.75 AATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACA:1 + chr3R 19436114 3' + roo 374 1 60.96 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTATGATTCTTAACAAAACTTTGTGATGCAGATGAGTAACAGTTTGTTAAAATGGGTCGCTTGAATAGAATAGAAT:1 + chr3L 3238347 3' - roo 8711 2 49.32 ATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAACGACACGCCCATATCTTGTGTAAAATATGAGCGTACGGGGAGAAGTTCTTGGCTTAAATGTGGCTTTTTAAGGGGGCT:1 + chr3R 14912060 3' - Stalker4 23 4 64.80 TGTGTGTTTTGCGTTCCAGTTATTTGCCGCTTGTTGCTATTGTGATACCCTGTAATCGGGGGTCATGCGCGAACGTTCGGTCGATTCGTTGATGTCGTATGGAGCAAGTGGGAGGTTTTATGATTCATACACATACTTTTAAAACC:1 - chrX 17578296 3' - G5A 420 1 64.38 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCACA:1 + chr2L 21910229 3' - Doc 69 1 66.67 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGTTGTTACTTGCACTTGTG:1 - chr3L 18484373 3' + hopper2 1548 1 55.48 TTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCG:1 - chr2L 18112496 3' + transib2 2760 1 62.07 CGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATGGCCATATAGGCGAGCTGGGTAAATTGGAAACCAGTGTTGGCCTTGGCATGGAACTTGATCTGCCGAGTTTG:1 + chr2L 10515090 3' - 1360 3185 1 65.49 AAATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATTAAAGTTCGCGTTCGCTTTTTTACTAGCTGAGTAAGGGGTACCTGATAACCATACAAGAGAGAGAACGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAG:1 - chr3L 23747154 3' + INE-1 498 1 47.54 GATAGTCGGTGAACTCGACTATAGCATTGTCTTTTGTAATTTATTCAGTAGTAAGGATACAATACAATAGCATTCTCTCTTCTTTTTATATTGGATACAAGTTGATATTGCTTTCCAAAACTCGAATTCGAACATCGGGTGACTAC:1 - chr3L 23260685 3' + INE-1 564 1 58.22 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACCAATAATATTCATCCAACAACTTTTGTTCCATAATATTTCATTCCCCCAGAACCTTTAAAAATTTACGAACCATG:1 - chr2R 21870140 3' - copia 34 2 55.56 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAGGCAAAGGCGAGATGGTGTG:1 - chr2R 21690456 3' - 412 58 2 57.53 TCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGATTTTTGTTTTTATTATATACTGCATGCATAAC:1 + chr3R 25936949 3' - Doc 4363 1 80.82 ATTTTGTTTTTTTTTTGGTTACTTTTTTGCGACGGGGGGTTGTTGTGAAACTCCC:1 + chr2L 19167153 3' + frogger 2179 1 90.91 CAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACGAAGAAGCCAAGCAATTATGTCATCTCATCGCGCCTTTGGCTGTCTGTCTAAAGTCCGTCTATTCTGGTTAACCCA:1 + chrX 14624919 3' + 1360 3158 1 51.72 GAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAACAGGAAAAAAAACCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAATGTGAACAAATGAGCGTAAAT:1 + chrX 11906361 3' - INE-1 34 1 50.68 TTAGTCTTAAGCTGAGATCAAAAGTGTAGTAGGCTTGAGGTACACATACATAATATCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTCAGTCATTGTTCGCTTTCGCGTGTGGCTCAGTGTGTGTTTCTGCCCATTTACCGAG:1 - chr2L 22078496 3' + 297 280 2 74.48 TAGAACTCGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCT:1 - chr3R 9125637 3' - Doc 46 1 58.90 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGACGAACTGATCTGACGCGCCAATGTGACCAATTACATTAACAATAAAAACGCATACATTAAAATACTAAA:1 - chr3R 1869764 3' + 1360 3339 1 53.42 GACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTTGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:1 + chrX 706056 3' + Juan 10 1 76.19 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGA:1 - chr2R 6798235 3' - jockey 65 1 64.84 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTTTGT:1 + chr3R 21674936 3' + roo 9034 1 55.48 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGATCGATGGAAACCGGTTTCTGTGAAAAGTCTTTGCTTTCGTCTAAGGAGAAAAGTT:1 - chrX 4673592 3' + roo 9021 2 54.79 CGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCCCAAAATATTCGAAGCAAGAAAAATTGTGGAACTGAGTACACATTTAGTGCACGCCTCGCTAATTAGATGATAGTAAATTCGTCAGC:1 + chr2R 18017991 3' + Doc 240 1 63.70 GCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATATAGAAAGCCACAACTCCTTTCAGCCCATTACCGAGCTGGTTTTTCGTGCATAACTAATGACAAAGTCAG:1 + chrX 20069340 3' - roo 8768 2 51.49 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTACCAAAAAAGGGTTTGTTCTAAATGAAAGACTGTTAAAATATATATATTTAGATTTGGTTCATGGCCTTTATTTAT:1 - chr3R 21674798 3' - roo 42 2 50.00 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTTTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACACATTTATGT:1 - chr2R 13761624 3' - jockey 4748 1 69.18 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGGCCACCCAAATACGGCACTATATTTAATTAATTTTCATTTCTAATTCGGGACTCTCCCTTCCCC:1 - chr3L 22594158 3' - 297 6609 2 60.64 TAAATATTTTAAAATTCTATACACATATAAAACTACTTATAAATGGCCCTAAAATATCAAAGTTAAAATAATATAAAAAACATTACTAAATTATGGAAATGATTTATTTTAACGTATATTAAATAGTACTAATTTCATTTCAATGT:1 - chr2L 2538397 3' - springer 485 1 67.12 CGTGGCCACCACCTGGTCCTGATCCACACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCTACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACATAATATCCAGTGTGATCCGGAAGAGGATTC:1 - chr4 902999 3' + Chouto 404 1 76.74 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTC:1 - chr3R 20450425 3' - hobo 7 1 65.43 ATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCCAATCTTAGTTTTAAGTTAGTCTTAATTTACAAGTGCGATAATAAAGTGCAAAAAATTGAAGGCGATCTCGGGTTTAAGAGAATAAAGTTATCAACGTATGTTCTATTCTATTCT:1 - chr3L 24821502 3' + Max-element 140 2 68.28 AAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAATCTTGAGTTTAATGCTAAAAATCTTCGCTTACCCAGTG:1 + chrX 22900352 3' + Tc1 1588 1 81.51 ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGCACACATTTATGCAGAGCATGGCTTTCAAACTTTTAATGCTCGAATGGCTAAGTGTGTCAAAAATAAAT:1 + chr3R 25714136 3' - flea 46 2 54.48 AGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATG:1 - chr2R 10910222 3' + Tabor 410 2 68.49 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCAAATGGCCCACACCCTCAACC:1 + chr3L 18183238 3' - Tirant 5 2 82.01 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACTCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAACCTTTGTTATTACTATTGATTGTTATGTACTATTAAAGCTCACG:1 - chr4 968716 3' - S-element 75 1 69.18 GGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAACTACTTATGACCTTGGCAAACAGCCTAACGCCTCTGTCCTGAGCCATTTGGCAAACAGACTCAAGACTCTACGCCACTCGCCTCGCA:1 - chr3L 13649185 3' + Transpac 331 1 62.14 TATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTTTAATGGCAAATTTTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAGTTTATTTTCTGATAATATGTACATAGATTTGCCAGGAAGGAAGCAAAGTAACGTTCATTTAGCGGGTCACTCCGG:1 + chr3R 22634573 3' - 1360 428 1 69.86 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGGCCTCGCGGTGTGCTGTCCGCTCTGCAACTAGGTCG:1 - chr2L 22319228 3' - Transpac 24 2 66.44 AGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACGGACAGACGGAATGTTTATACTTTATATAATCGAAAACGCTTCCTTTTGTTTGTTACATACATAGATACTCAAAGAATGGAAACGGAAAAGCTACGAGAAAAATGCGTTTACTGTC:1 - chr3L 8167141 3' - INE-1 133 1 52.05 TAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCACTGCGGCACATTGAAAAA:1 + chr3L 12964783 3' + hobo 2888 1 76.00 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCATTTTCGGG:1 + chr3R 16276441 3' + pogo 2050 1 58.90 GTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGCCGATCATACTCGCTACTCGTAACGAAGGATAGAGAAGGCA:1 + chr3R 2637717 3' - gypsy5 7017 2 69.18 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATT:1 - chr3L 13678894 3' - hobo 74 1 69.18 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTCCCTTTCTCACATTCTCCCATTCTCTCGTTCTCTCGCGCTTCTCTGCTCAGAAGTACATATTTCTCATTT:1 - chr3L 19580833 3' + roo 399 1 77.40 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAGCCACGCCCCGTCGCAGTCCACAAAATAGTGTTTGCTGCACAG:1 + chr2L 795138 3' + jockey 4946 1 62.62 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTATACTTATTTGGTTTTCCGTTTTAAAGTCAATTTCGAAAATAACAATACAGACCAATCAGAAAACTATACTTTATACAGTACAAAGCAAAAAGAATTCTGA:1 - chr3R 21216797 3' - 1360 21 1 67.12 CGCGATTCTCATGTCACCTATTAAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGAT:1 + chr2L 18522318 3' + roo 8992 2 68.49 TCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGA:1 - chr3R 8042296 3' - BS 27 1 48.39 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAACGAGTCAGCTGGTCGCCCGTA:1 - chr3R 8217938 3' - P-element 75 1 32.88 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGGTACTCTCCCTTCCCCAAGTGGCATATGATATGGCTTCCCAGGACGGG:1 - chr3L 22594126 3' - 297 22 2 60.83 ATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGAAATGCCACATTAACACATTTGTTGAACGTATAATCAA:1 - chr2L 15816905 3' + roo 224 2 74.66 AGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCA:2 + chr3R 13349582 3' - Ivk 65 1 58.22 AACATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATAGGTGGTGAATCCACTTTAGTACTGCGATCTTTGTGTGCATCGAATTGTGCGTGAGATACTGTGAAAGAACGTCCATAATCGAACGCAAATCAATCTTGGCC:1 + chr3R 12463921 3' + Dm88 154 2 72.60 GCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGACGGTAAGAATCAACTTTCACAGCGTAAGAGT:1 - chr3R 8042265 3' - BS 11 1 65.47 TTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAACGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTGTTAAGAATAATAAAAATCAAATTACACAGAGAATTAACCAACAAAATATACCTAT:1 - chr2R 5401656 3' + 1360 3330 1 60.96 TTTTAAAATAACGTAAAGAAATGAAGTTATTTTCTATCAACTATATTACCATTATAAAATACATATGGCTAATAGCCAGCCCATGGGCTGGATCGAGATGGAGATGGCGCGTTTTATGGGTTTCCAGGGTGCGGACACAATTAGA:1 - chr3L 1674346 3' - blood 6979 1 58.62 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTTTAAGGCTCTTGGGA:1 - chr3R 26485994 3' - 412 35 2 60.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCTTCCTTACTTTTTTCATTTCTAGCATTGGCTGGTTTTTTATCAATATCCCTTTGCGATTCTTTTTCTAAGTTTTCATTCTGCTGCCGCTTGTTGTT:1 + chr2L 16331084 3' + roo 387 2 73.79 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATATATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAGCTCAAAGCTACTATTACTTTTGTGTTAGTGT:1 + chr2L 16562186 3' + opus 474 2 53.42 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACA:1 - chr2R 10910213 3' + Tabor 419 2 62.33 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAGTCGAATCCACTCGTGTCTTTATAACTTGAGTGTTTCTTGCGGCAGTCGGGCGATCAAAA:1 + chr3R 10213125 3' - P-element 34 1 54.55 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATTGTATCAGGCGATGTGTTGAGCGAAAACGATCACCTAAGGCAAAGTCGAGTTAGAGTGATTGAGCGAGTGATTTTTTAATGTGCGGTTTCTGAG:1 - chr3L 19863902 3' - roo 8691 2 65.75 GGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGCGGGCAGTTCGTGCTGTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGGGGGGCGGGGCCTTAACACTTTATGGCCAAGTGATATT:1 + chr2R 20808913 3' + invader4 2746 1 39.81 CTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCTATAAATAAAAGCAAAGTAAAACAAAAAAAAATCCTTGCAGTTCACTTAGCATACTTATAAGCAGACTTTCGCCATCGAATGTCTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTCTGCGAGTG:1 + chr3L 1982050 3' + F-element 4638 1 54.11 GCGCAAGAATGTAAATAAAAAAGGATAACATGAAAAGCTAACGGGATTTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGTGCATTTAAAAACATTGTTTGTTTTGTTA:1 - chr4 123996 3' - HB 168 1 76.26 ATCGTGTGCCAACAAATCGTATGGCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTAATCTAGCCACGCCCGCTCTAAAGCCCACAAAACGCACAAAACTGCCCCGCCGCTGACAGAAAAAATGGTCTTCCTCTCTTATCGTGATATA:1 + chr3L 4082751 3' - 1360 34 1 71.23 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCGTCATTACAGTACAAGTTTCAAGATTTCTATTCAAATTTCATCAATCGAATCAAAGAGAAACCTGAAGTGAATATCATAGAAAGAGCTGCGAACTAGATACAGCATTCTATATGGCTATG:1 + chr2R 21690608 3' + 412 481 2 72.41 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACGAAAGTTGACAGGGCGGGGAATGAGCTACACTGCTGTAAAGCAACCTTATGGAATAATTATTCAAAACGCTGAGTTTGTGC:1 - chr3L 10469491 3' - roo 8702 2 59.31 AAAACATTGCAATTTAGGATTAATATTGTTTAATTTGTTTCTTTTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGATTCGCTGGGAGCCTCTGGCGACGTTACAGGTATATGGCTCACTGATGGGCACACAGAGACCCAGGGCA:1 - chr2L 22028398 3' - HeT-A 5786 1 72.60 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTGGCCCAAACGGG:1 + chr2L 12291972 3' - Tirant 11 2 76.19 ACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAAGAGCTATCGGAGGCTTCTTTGCGTTTTTATTGAGCAGGCATAAAAATTATTTGTCCTGATCCGATTGGAGTCCATCCACTCAA:1 - chr3R 8226759 3' + P-element 478 1 60.15 TTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGGACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTTACTAATAAAATCTCCACAACCACTGCCGAGGTTTCCATTTTCTACAAATTAATCAAACAAATTG:1 + chr2L 4135091 3' + accord2 7260 1 71.03 GTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGCGAATTGTTATCTTACGCTCGCCATCGATCATCTACTC:1 - chr3R 8678065 3' + F-element 75 1 80.47 ATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAGACCAGCAAGAACTACGTATGCATTCCAGTGCCCAAGTAATACGATCTAACGCTTATACAAGTTATTGCCCTATTTTTTTACTTTGCGCATTGAAACCTGGATGGCAGCAGACAT:1 - chr2L 9192157 3' + Stalker 84 4 71.92 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACATAATTAGTCTGATAGATGTAAAATTTATTAAACAAAA:1 + chr3R 6413692 3' + 1360 3372 1 73.97 AGTTCAGCATACCAGAAGTAAATATAGATGGCACCACAGCAAAGAAATCAGCTGTTGAAAACAGCTGTTGCACGCACAATAAATTCAAATGCTTTGCCTTATGACTCAGAAAGTAAAATGG:1 + chr3L 510330 3' - Transib-N1_DM 390 1 61.98 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTTAAGACCAAATATTTTCCAA:1 + chr2L 5792124 3' - blood 7036 2 68.49 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTC:1 + chr3L 18253866 3' + blood 7322 1 71.97 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGAATTTGAGGCAGTTCGTAGAATAAGTCGTCTCTCTGATG:1 - chr3R 4576974 3' + mdg1 351 2 70.37 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTATGGAACTACTTAATGGCTAACAA:1 - chr3R 13225450 3' - hobo 5 1 78.69 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTGTGTTATTTCATCATGGCCATTATGCAACGCCAGCGAAACGAAGGTGCTCACGAAGTGGCCAAGCTGCTCTCTGATT:1 - chrX 19887040 3' - P-element 27 1 55.96 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAAC:1 - chr3R 16276312 3' - pogo 46 1 54.11 CGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGTATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATGCAACACTTTGCCCGAC:1 + chr3R 22341221 3' + hopper 1341 1 65.07 CTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTATGTGTAATATACGCTTCTTACCCTCTCCATCTCCACTTCCATCCTC:1 - chr2R 25007858 3' + roo 8772 2 65.93 GGTATCTGATAGTCGGGGAATTCGACTTTAGCATTCTCTCTTGTTGCTTTTCCTTTCAACGTGCGTAGTTTCCTAGAGAGAGGAAAGGAGAAGAGGGGGGGGTTAAAAATAAAGCATAATACCACCAGACAACA:1 + chr2L 8732227 3' + INE-1 557 1 73.88 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGTTCACAGGTCACTGTATCAGTATATCAATGCTCCACAACCACCAACACACCA:1 - chr2L 3960159 3' - jockey 22 1 68.91 ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGGGCAAACCGATGGAAATTTCTGCCTTCATGAGGCGGCAACAGGTTACA:1 + chr2L 12144286 3' + transib2 2752 1 69.18 TTTTATTTTATTTTCTTATCTAAACACCTGAGAAAATAATTAACAGTATTGGTCTAATATTTGGGATTCTCATCCATTGCCATCACTTAGAAACGTAGCTTTAGGTCAGTACCATTCTTGGTTGATAGAAATTGAAATTGAAGATT:1 + chr2L 17516855 3' + transib1 1901 1 67.81 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTTGAACCTTAACCTCCCCGGAGTGAAGAAAGTTTTTCGC:1 - chr3R 8639255 3' + copia 5053 2 72.59 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTAATCTTGACGGTTTAAGTTGTAACGTTTA:1 - chr3L 14375567 3' + roo 401 1 77.08 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGC:1 - chr2L 14239130 3' - 412 7106 2 52.05 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTTATTTCTAATTCGGTACTCTCCCTTCCCCAAGTGGCATATGATAT:1 - chr3L 22594142 3' - 297 6612 2 56.64 GAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTTCTTCGTCTAATTAAATTACGTAGCGGAAAAAGAAAACTTGTAAC:1 + chr2R 5045713 3' - invader6 19 2 71.92 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTTAAGTCGTGGCCTTTCGCCAGCTGGTCACACCAATTTGCTGCGGAACTCTATGTGCCAGTGTTGGCTAGCGCAGCG:1 - chr3R 17385783 3' - jockey 4800 1 69.23 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGACAAAAAAACGAATGATAAGTAATGGGATGAAAACAACTTGTTAAAACCTCTATAAATTTATCTTTATATGTCTCACGTTTATTAAAGTCATATACTTTTTGAAGATACATATAAACAAC:1 - chr3L 3238192 3' + roo 407 1 73.97 AAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCCACTCAAAGTCAGCACAGGCCACAAAGTCGCAAAATATTTAATAGAGCTCAG:1 + chr2L 11554604 3' + roo 9037 1 62.33 GAATTAACTTAACCAAACTCACTTTTTAGAAAATATTGATGATCTTTGGACTTTTCCTATTAAAAATTGTCTAATTCCACCTTAATTGCCAACAAGCAAGCTGTGTGTGTATTTAAACAGGGCGTGGCCAGAAGGACAAACAGGTT:1 - chrX 10980244 3' - HB 279 1 38.36 TGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACAACCCGATCAATGGCGAGAAATCCCTAAGC:1 - chrX 20975772 3' - copia 4959 2 78.08 GATCACGAGCCAAAGAAGAAAAAAAATGGATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTAAAATGCTTTATTTTACATGTTCCGACTTATTCAAAGACATTATATCAAATTTATTGGCTTTTCTTTC:1 - chr4 190613 3' + invader2 283 1 56.16 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGGGGCTAAAACTTGGAGTAATTATAAAACCGGCTTTCAAGTCAAGGCGTGGT:1 - chr2R 12886820 3' - jockey 4766 1 49.04 TTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTT:1 - chr2L 18112501 3' + transib2 2754 1 65.75 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGATGGGTTTCCCCTTGACCAGTCTGTGATATTCTAAAATAAAT:1 + chr3L 6095555 3' + transib2 2747 1 71.23 GCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAATTATGAACCACCACTTCTCGGCCAGCGAAGAGTG:1 - chr3L 10922204 3' - F-element 4481 1 61.84 CATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAGGACAACAAATTTT:1 - chr3L 27356040 3' + Tc3 1677 1 67.81 GAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATACATATTTATGATACTACTACTACATTTTACATTAAAATTATTGGAGAGCGTGAAGTTTAAGTTACTATTTTTAATTTAAATATTAAACCATAAAATCTTTGAGTAA:1 + chr3R 7481646 3' - invader4 2776 2 73.29 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTATATAACCCACCGATTCCGGCCCTCGAGGACATGCATCTCGACGTCGCTTCGACTGTCTTGCCGCCGTTACGGTTACGGCCACGTT:1 - chr3R 19435955 3' - roo 8679 2 68.18 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGGTGGACCATTGATGCTGCGGGAACAGGACGTTTGGGTGCTGCGGGGAGTGATC:1 - chr3R 14218434 3' - roo 8699 2 53.91 CTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCG:1 - chrX 21087584 3' - mdg3 5286 2 54.72 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGTCAGTGCATATGTGTGAGGGTGTCGTACTGTCTATGTTAGTGTCAATTATCTGTGTCCATGTAGACAAGCAAAGTAAGCTTTTTGGACGGCAAAAAAA:1 - chrX 17982725 3' - hobo 23 1 69.86 AGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATTGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATATCTGGTTTATATAATTTATATAATATTT:1 - chr3R 13213607 3' + hobo 2511 1 78.77 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCAGTAGCTTATGACCAGGTTAAGGTAATGTCCATTGGATACTGTTGCCTATTTTGTGG:1 + chr2L 6388151 3' - jockey 58 1 55.73 GGTGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAGAAAGAAATA:1 + chr3L 13364399 3' - hobo 54 1 53.42 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCTTAAGTAAGTTAAATGTGTGTACCTCATCCGATTTTCGACGAACGGTCTTCAATGGGTTAAGAG:1 + chrX 14137304 3' - 3S18 22 2 59.63 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCCAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGTAATACCATATAAGCCAAGCTATTGAGTACATTCCATTTCATAATAACAAATAATAC:1 + chr2L 4929896 3' + blood 7325 1 59.59 GGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTTTGTGGGTGTCTCCTTTGCGTTTGT:1 - chrX 8967372 3' - HMS-Beagle2 6932 2 52.05 GTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACCATTGCATTTTACAGCTTCCAAGGGCGCTACTATCGAGGAAGTAGTGGTGGAATCAGCCTTATA:1 + chr3L 15959715 3' + Stalker 7119 4 56.94 CTGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCACTCGTTGGGATTCAGCTACCGAGTGAACGATTCGAGCTGGCACGAGGAGCAATGTATTGTCTGTGGCACGAA:1 + chr3L 7014025 3' - Idefix 219 2 50.00 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATA:1 + chrX 3646984 3' - 412 78 2 71.23 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTT:1 - chrX 388247 3' - 1360 65 1 66.42 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTATTAAATTGTTCGTATGAAATTAAATTTTATACGAATATTTCCAAAACTTTCCCGAA:1 - chr2L 6601280 3' - roo 63 2 65.75 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCGACTAATTAACTATTAGAACTAGTATGATTAAGAACTGGGTTTCATAGGGTATATCGGG:1 - chr2L 2494783 3' - Doc 23 1 68.49 AACTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCATTTCTGACGCAACCACACACACAATGACGAACAGAAAATCGGGAGCAATGGCCCCTGTTTAGAGCGGCGGAGCGATGAGATTGGGACGTTC:1 - chr2L 15576846 3' + jockey 129 1 62.76 TATGGCAATAAGTAAATTTTATAATACAAAAACGTAACACATATCAAAACGAGTAACGTGTATAAAAAGTACACACTAGAAATTTTCACATATATAAATGCAGGACGGTATGCATATTTTTATTAACTGATAGATTGGTTGGGTGA:1 - chr2L 17054620 3' - G4 3807 1 75.34 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACTAACTAATATAATCAGCTTTGTTCCCGTTTTTAATAACCTAATTTTGGGACTTCGATTTTGGGAAGGAGATAAAGTACAATAAATTGTGTATAAATATTCAATGGAAA:1 - chr3R 10150095 3' - 1360 14 1 76.03 TTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTG:1 - chr3L 17667566 3' - F-element 83 1 65.75 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAGCATACATTATGCAACTCCAAATCTCCTCTAAGATCGATCGGAAATGGTTTTTAAGGGCATATAATCTTCG:1 + chr3L 785983 3' + I-element 5305 1 51.37 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTAAAAATTCTGTTATTGCTGTCGAACACACATTAAAATTAGACTAAAATAAACCCAAAGCAACTTTTAAATTGTACAATTGT:3 - chr2L 15644834 3' + transib2 2786 1 59.59 ATATCGCTGTATCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATC:1 - chr3R 10213069 3' + P-element 2782 1 11.64 CGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTTGCTTAGATTGAACCCTATTACAAACCTATTACGGAGTGTATCTCCAAAGCACT:1 + chr3R 15502561 3' + Ivk 5311 1 65.07 TACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTTCTACAAACCAAACAAGATTTTTAAATCCGTTAGATTTTCGTTTACATAACTTAGAAATAATAATAGGCCTTAATTTTT:1 - chr2R 990879 3' + I-element 5002 1 58.22 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCACTAGAAGCGCATAGAATGGAACTCGAGCAAAGGACATCCGGCAGATACAAGATACATTTCGACTCACGCTTCTGC:1 - chr2R 17332093 3' + jockey 4982 1 68.49 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGCTAAAAAAGCTAAAGAGCCAGCAAGCTACATAAGCCCAGTTAGTCAGTCAC:1 - chr3L 21013805 3' - roo 16 2 74.66 GTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATGATTTAAATTCTATTACTTTTTATAATATTGCTGCT:2 + chr3L 5630422 3' - I-element 91 1 76.71 AATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGACTTAATGCTGAAAATATTGGTAGCTCTAAAGTATCCAAATT:1 + chr3L 21665306 3' - 1360 78 1 71.92 AACAAGAATTTTTCGCATGGCGCCAATTGATAAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGTATATGGATATTCCCAAGGATAATCACTGAGCATTGCAAATACGCTAGCAGGTGTATTGCAAACTACAG:1 + chr3L 11749170 3' - 1360 279 1 56.16 CGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAACGTAAAGCAAATTTATAACGAGTAATCTTTCAGTCGTTTATCATATTTCTGTTGCAATGTTGCATGCTGTCGACAACAGAAGCAGCAG:1 - chr3R 23905736 3' - F-element 43 1 52.99 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGGCTGCGTGTGCTTTGCATCTGTGTGCGTGGCACTGTGCCCTTGGCTTTAGCTCCTTTTTG:1 + chr3L 16515706 3' - hopper 45 1 53.44 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTAGGTAAACCGGTTGGTTGTTGTGTTGTACTTGTAAGTATGTAGACACATA:1 + chr3R 7089558 3' + P-element 2817 1 37.24 AAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTCTGAGTTCTATAAGAGTGCCGTGGAGTACTTGCCAAATACTCTTGGTTATTCAAAAATGTTTTTGAACACTCATCATCATGATGA:1 + chrX 6795898 3' - gypsy4 451 1 55.48 AAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACATAAAAATAACCAAATAAATTTAATCATATTGCGTTTAGTTAAAATACCAAATGTCAAGCGCCTTGTCGCATCCTAATAGGATGCATTATATACA:1 + chr3R 4152133 3' - pogo 1913 1 72.73 GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGT:1 + chr3L 21093245 3' - Ivk 11 1 70.09 CCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTC:1 + chr3R 15790129 3' - flea 4726 1 71.92 ACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTACCCCCTCTGGCAGCCCCCCGCCCCGCAGCCCCTGTCATGGTCATTGTGTTGAACGTTTTCATGTTTT:1 - chr3R 6963907 3' - 1360 213 1 54.11 AGCGCCATGCAGTCACATAAAATGTGTGCAGAGCTCTACTCAATATAGCAATGTCCTTGCCATGACGCACTGGATGCATTATAAGTTCAGTATGGCTCCTTCTATACTACGGACTAATGGCATATTTTATGCACTATCAAATGATA:1 - chr2R 20076342 3' - baggins 5243 1 54.11 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGATTTTCAAATTCACATTACAAACAAGAAATGCTTGTTTGGGCTTTGCTGATGGGTATCGTGTTAATATC:1 - chr3R 4190883 3' - pogo 14 1 68.18 GCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATACATATTTATGATACTACTACTACATTTTACATTAAAATTATTGGA:1 + chr3R 7481585 3' - invader4 2837 2 73.29 CATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTGAATTTGAATTTGAAATCGATAAATCGGTGCTCCGGTTTTCGATTTATGAAAC:1 - chr4 1261436 3' + 1360 303 1 63.70 CAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAAT:1 + chr3R 19436117 3' + roo 377 1 63.01 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGACTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACAC:1 + chr2R 11164486 3' - roo 8744 2 75.34 TTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGG:3 + chr2L 21643119 3' - Tabor 6910 2 64.38 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCGACTAATTAACTATTAGAACTAGTATGATT:1 - chr2L 2494812 3' - Doc 52 1 50.68 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTT:1 + chr2L 5792078 3' - blood 71 2 64.38 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAG:2 + chr2L 8574475 3' - Transpac 4964 2 53.42 ACACTATTTATGACAACCCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTTGTGCCTCTGTGAGAAGTGTGTCCGAGATATCCGTATCTGTCCCATATCGTTCGCTCCACCTGGATATCCCTGCG:1 - chrX 2328614 3' - invader4 2896 2 48.00 TGCACACACACACACACACACACACACGGAGTGAATGCTTCACTCCAGCTGCGTTTGCTTAGGCTTTATTTAATTTATGGTTAGATAATGAATAAATTAGGTGCCAACAAAGGTCGCTGAAGATTCAGCACAGCAAATTTTATTCA:1 + chr3R 14044913 3' + accord 182 2 80.82 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATAAT:1 - chr2L 19652518 3' + roo 9012 2 58.22 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGCATATGTTTTGGCCTTATAGAAAAGTGATCGAACTGTTCTAATTCTGTTCTAATTTCAGTGGTGAAGTGATTGTATTGGTCAAAGGTAATACTAAATTGATATGACG:1 - chr2R 5438164 3' + flea 4998 2 75.34 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGGGAGGACTAAATAAAGCGATCCATCGAAAG:1 + chr3L 2192323 3' - jockey 4756 1 76.30 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTCGATTGAAATATCTTAATTGAAAATTGCATTTCTCCCGGAA:1 + chr2L 19674027 3' - roo 8701 2 45.89 CGTGATCTGTGCGAGATAGGGTAATCTTAAGCTTTCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTGAACTGCCTGCCGGGTATCGTATGAGCATGCCTGATAAATATTTTCGTCTGAATGCATTAATCTGGGAATTAGTTACGAAACAAGCTG:1 + chr3R 5026122 3' + Chouto 81 1 60.27 GCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCCAGTTCCTCGTGGTTTGCCCCATTTCATTTGAAAATCTCCCATTTGTGTGTCAGCAGCGACATGCGCGATGCATAAATATTCCGCCTGGCTTG:1 - chr2L 14638986 3' + jockey 4721 1 62.68 AAAACTGTAAATCATTGGAATTTTTTATCTTAAACACTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTTAACACAGCTGTAGATATGTACGAAATACAAACAAATACGTCAATCTTAAACTCCAGAACTACTGACATTATTAGAATCGTC:1 + chr3R 5367038 3' + HB 1574 1 64.38 GTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATGACCACGGTCCAGGTCGGCAATGAACCTCAAAGAAGTGGAAAGCACCACTGGCATCGC:1 - chr3L 21842827 3' - roo 8781 2 57.04 CTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGG:1 + chr2L 21643118 3' - Tabor 72 2 65.07 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTTGAACCTTAACCTCCCCGGAGTGAAGAAAGTTTTTCGCTTGTTGTTTG:1 - chr3R 8639245 3' + copia 183 2 67.81 AGGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCCATTTTATATTTAGGTGAAAAGTGGGCGTTGGATTAAGAAAATTGTAATGGGCACGT:1 + chr3L 18378787 3' + copia 4931 2 59.59 CTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTCTTGTCTCTTTTGTTGCGAGCCAACGACCCGGCATCGCATTGAGATTACTTAT:1 + chrX 19107468 3' + roo 9019 2 61.65 CTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCCGCCACAGAGTTGGTGGTCAGGGATACCACCTGCTGAGCTTGTTGCGGACGAAGAGAGTGCAATTGTGATTTTAAAAATACAGGGA:1 + chr4 962526 3' - invader4 200 2 61.38 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAAAAAAAAGGCAATTATCAAGATAAAGTAGACATGATAGTAAATATTTAATAACAA:1 - chr2R 13046489 3' - 412 7120 2 62.33 GGGAACACACACACACACACATACTGAGAGGGGCTGGTGCTCCCAGGTAGCCGGCAACTACAATCCAGGGCACCCAGACCTTGCGAATCGCATCCGCCTGCCAAATACAGACCAACTTGTTTCTTACTCAACTTGAATCTACTACA:1 - chr2R 14443926 3' + accord 181 2 66.44 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAGGCCATTCGTATGTATTTCTATGTTGGATCAGGGCAAAGTTCCTATCTCTTGGCAATCGGCA:1 + chr3R 25862707 3' - roo 29 2 63.01 TTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAATATCTATAAAAAAGAATAGACCTTATTCTCAACTGAAAAG:1 + chr3L 18381388 3' + copia 146 2 71.92 CATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTCACTTCCGAGCGCATTTGATTTTAATTTTACGCCACT:1 - chr2R 7599139 3' - diver 52 2 51.37 CAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATATATATATGTGTATATGTGTGTGTGTGTGGCATGAGCAATGTTTTATTTTGTTGCATGCCGCTTCTTACTCCAATGACCTGTTTTTATTTCATTT:1 - chr2L 13628344 3' + Tirant 8271 2 68.49 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATTAGATTATATGACTTAATATT:1 - chr3L 18253770 3' - blood 33 2 57.89 CTCAGGAAATATAAAAGCTAAAGGGTTCAGCATATAGATTCTAGAGACGCATGTTGCCACGCCCTAAAAACGCTCAAAGGACCAACATTTTTGAAAAAAAACGTGTAATATCTATATATATTAATACGAACACACAAAGATAAAAT:1 + chr4 194778 3' + INE-1 153 1 67.12 CGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTATTTAACATTTAACATTAGCATTTAAAAATGGAATAAATACTTACA:1 + chrX 3370127 3' - S-element 70 1 69.18 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTAGATTTCACCTTAAGGTAATATGTCTATATAGTTATAAAACAACATTTGAATAGTTTT:1 - chr2R 10160509 3' + hobo 2894 1 54.33 AGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTAGATAAAGGTAAATTAAAGGTGCAGAGTAATAAAGGTCAAGTAACTAGTCATATCAATATT:1 + chr2R 17014480 3' + flea 4953 1 58.90 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGCAGCAATGATCGTCTGGTG:1 - chr2L 17380660 3' + hobo 2903 1 75.00 CTTCGGAGGTTGGAGTGGTACTGTCATAATATTTATAATGATCTTAATGATGACATAGAGCCAATTTTCATTTCCACCTCTGACGAAGACGACGAGGGCGGCTCTGTTTCTTGGTTGCAATGTGTTGACTTATGGTTACTTATATT:1 - 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chr2R 19198308 3' - FB 60 1 58.90 CCACGCTGGATAAACATACGCCCGGTCGCGCCTGCGCAATTACGAAAAGTCTAGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGTTTAAAATTGTATTGGCATTTGTAAATAAAATTTCACTTCTTTGCCAAACGAATTAATGAT:1 + chr3R 30297254 3' + GATE 8385 2 56.85 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTT:1 - chr3L 14375639 3' + roo 326 2 73.29 GCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAAATGAAACAAAATGGGAGGAATTAAGTAAGATTTATATGAGGCGATTTTTTAATCTATAATGA:1 + chr3R 9963284 3' + I-element 5291 1 60.27 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTC:1 + chr2L 19652604 3' - roo 8701 2 63.21 GACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGATTATTCTACTTTCAAAACTACATGTTTTATAAACGTTCAACAATATAAGTTCTCATATAATATTGT:1 + chrX 324687 3' + F-element 234 1 54.79 GTCGTGTGCGTGGATTTAGTGCTCTTTGTTTGTGTTTGTGTGTGTATCCATACATATACATGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGTTTATTGTAAAATCTTAAATATGTCATTAAATACTTTACTAAATAATTGTTTTGTATTTTA:1 + chr3L 23283701 3' + flea 493 1 43.84 ACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACCATCTGCTTATACGTAATATTCTTACATTGTATTTATTACTATTATTATTTCGAATACTTCAGTATATGGGCGTCTGGTACGAGTACGC:1 - 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F-element 50 1 77.38 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAGACTTTAATAGCCACT:1 - chr3L 465960 3' + Juan 4163 1 52.74 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGAAAATACGTTTGAAGATTTGTTTCCAGTGCATGGCCGCAGGCCTAGCGAAATGTCTTCGATTTC:1 + chr3R 28117110 3' - hobo 26 1 67.81 TGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTATTGAGG:1 - chr3L 785885 3' - I-element 64 1 60.27 ATGCATTTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGAGGCTTATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCGCGTCAGGCCGATTTAAAATTTCAAGAACCAAAATAAT:1 - chr3L 26057241 3' - Cr1a 4159 1 73.61 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCTGT:1 + chr3R 7778337 3' - transib2 57 1 64.06 ATACATAAGGCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACACTTTGAACAGT:2 + chrY 3648895 3' + Stalker 171 6 65.07 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCTAATTACACATGCAGCTGCAATAACAACAACAACAAAAGTGGAAGGCGGTTAATGATCACCACGAACAGTTGGGTGAAAAAAGGGAGAGAGGCGGGGGAAA:1 + chrX 3322842 3' - roo 8679 2 71.43 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGA:1 - chr3R 16276329 3' - pogo 18 1 61.39 TCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGGGTTCATCCTACCACAGTATTAAGAATAATATAGTCTATCTACGAAAAAAGAACACCCTATCTTTGCCGAAATCAATGCAAATTTAGTTTGACTGCAGATTGCCTTTCTTGCAAATTCCCA:1 - chr2L 5890435 3' - invader3 5206 2 67.12 GTTGTAAGTGTATTGGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCCTTGTTTAAAGCCGGTGGTTTTTT:1 + chr2L 21976802 3' - Idefix 40 2 51.37 TGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAG:1 + chr3R 14049442 3' + transib2 2773 1 52.74 GTGTGTGTGTGTGTGTACGTGCATGCGTGTGGGAGGTGGGGGATGGAAAATCGGTGAAAAATGTGGAGCAGTGGAGCCAAGAAAGGGTGTTTTTTCTCGTATTTTTTTAAGGCCACGCCACTGCCAAATATTAAATAACCTTTCGG:1 - chrX 6512090 3' - accord 7025 2 70.55 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGATCGGAGCTGAAGCAGCT:1 - 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Rt1c 5027 1 71.23 CATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACACCATTTGGGTTAACAAACGCCCCTAGAATATTTCAAAGAGCAATGGATGATTCCATTTTTAAAGCATTTAGTTAAACATCTTGGCCAACGGTGCGTATGCG:1 + chr3R 11848246 3' - Copia1_DM 17 1 61.87 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTT:1 + chrX 388304 3' + 1360 3348 1 73.20 GCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCT:1 - chr3L 7837159 3' - jockey 4782 1 55.45 GGCGTTAATAAAACCAATATGGACGTATGGAATATAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGAAATTAAAAATGTTCAGAATAATCTGCGTTATTTATACATATGTATGCATTTGCGTGCGAG:1 + chr3L 14756739 3' + Porto1 4250 1 74.66 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTC:1 + chr3L 18183164 3' - Tirant 8107 1 66.67 GTGTGTGTGTGTGTGTGAAAGTTAGTATGTGCATGTGTTTGTTTTAAATGCACGAGTGCAAAAGGCTTAAGATTGAACTCAACCAAAACGTATGATTAAAGTTCTGTACACATTATTTGCAGAATCCTTCTAAGGATGATGCTTTT:1 + chr3R 28213214 3' - Quasimodo 35 2 56.85 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTTCGCGAAAAGAAATTCTATATATGCCACCTTGAAACTTCGCTTATTTTGCGTACCATTCCATTTTAAGTACGGCATTATCCATTGTCCATCGGTATATTTC:1 - 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chr3R 26486044 3' - 412 7138 2 73.29 AAGAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTAGGCAAAGAATGGAAAGTGAAATATTACTGGAAACTGATTGAACCCTCCTCAGACATT:1 - chr2R 10160870 3' + transib2 2763 1 58.22 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGTATTGCATACAAATGTGCTAATTTA:1 + chr3R 19436128 3' + roo 9051 2 69.18 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATATTGTACTATATA:1 - chr3R 9125686 3' - Doc 86 1 74.45 TGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTAAATAAAGTTTTACAGAATGAATAAAACTTTATTAAATGCTCTAAAGACCAGCACAGTTGAGATGCATATTTTTTAGCGGGAAAATCACTTTAAAAGAGTTTTCACCTTTTG:1 - chr3R 13994568 3' + Bica 4563 1 37.67 AGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTATATATAGCCCTCAACGAGGTAAAAACTAGTAACGATCGCACATGCAACATACAATAGTGTTGATATCAGCTTTTGTAACAAAT:1 + chr3R 4972071 3' + invader1 3989 2 49.32 TCTGTGCGATGCACCATCTCTCGAATACCTATTCTGTGTAGTATATAAGTATACTAAGTATATAAATAGTATAAGCAAATGTTTTAAAATGATCAGGATATTGAAAGATAGAATATCTGAGCATCCACTGTACTCCAGACCAAAGT:1 - chr3R 6964189 3' + Doc2-element 125 1 55.48 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTCAAACTGTGTTTGTCGTTTTATCACCACTTTTGACGGCCTGTGACTACGAGTAATCATGGCAGGCAA:1 - chr3L 11286014 3' + S-element 1675 1 54.48 GGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATGATTAT:2 - chr2L 15013244 3' - BS 4951 1 65.75 GGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCCTTGTTTAAAGCCGGTGGTTTTTTTTACAGTGTTG:1 + chr2L 21976813 3' - Idefix 26 2 43.36 GGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCATAGCTGCCAAGCTGACCTAATTAGATAAGCGAG:1 - chr2R 21848615 3' - Transpac 2 2 78.77 AGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGCTCAGGGGGCGGAAAATGGGTGGTTTGCATAGTGGCGGATTGGCATTGGCGAAAATTGTCAACGTAGTCGACGGCT:1 + chr3L 15037001 3' - I-element 4927 1 79.00 AGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTTCTCAAGAT:1 - chr3R 10437063 3' + BS 5016 1 68.49 GGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGTATACTGACATAGTACAGGAAGTTCG:1 - chr2L 18630465 3' - G-element 70 1 64.14 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGCAAGTGGAGTGGAGGAGCCATGGAAAAGAACTAAGAGTTAAGTGAGTAAAGTCAACGTTTAATGAAGTA:1 + chr2R 21439573 3' - jockey 20 1 72.41 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTTATTTCCGCTGATGTGAAAATGAATTAATTGGAATATGATTGAATTTTCTCAGCGTTAAATATAATAAACATATAATTTATCAATATATTTATGTTTATTAAAAATCAGAT:1 - chr3L 4640953 3' - jockey 17 1 71.92 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATGACTATAAATTTTTAA:1 - chr3L 13678879 3' - hobo 28 1 55.65 ATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGG:1 - chr3R 6645348 3' - blood 7099 2 74.66 TTTTTTTTTATTTTTATGATTTGTAACAATTTATGGATTACAAAATATTACAAAATATATTACAATGCTTTTTACATAATTATATTTTCACAATACATATTCACAATGCAATTACAAAGATTTGTTTCCGAATTAGGAACTCTGTT:2 + chr2R 10927264 3' - Rt1b 5148 3 69.18 GCTGCATTATATAATTGGATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAATGCCAAGCCCTCGCAGTAGCGAGTCAAAACACATTTGTGACGCGTGATTTTGCATAAGTTGGCACTTGGTTCCGACGATATTGCTGCCACAACAGCA:1 + chr3L 20943071 3' + rooA 251 2 51.37 TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTATGTTCATATATGTAGGTTTACCTAGTGCCGAAACAATCACACCATAAGGTA:1 - chr3R 22494091 3' + 297 6921 2 66.19 AAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGACCACCACCCATTTGCCATCTTCCAGCAAGCGCACGCCTGTCATAAATCTTGTTTTGAA:1 - chr2R 20447787 3' - hopper 61 1 56.16 TCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTTGTGATTCCATCATCGAAAAACCATACAGCAGGC:1 - chr3R 20203626 3' + 412 416 2 71.43 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAAT:1 + chr3R 14277945 3' + P-element 2844 1 32.63 AAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTGTGGCACACACGTACTACGGCCGATGACTTATTTCTTTTTACTA:1 + chr2L 7993162 3' - S-element 77 1 69.86 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGGAAAAAAAAAATATAGCAAAGTCGAACAACAGCGGAAAATATTTCCAATTTGCTAATGGCAATAATTGTTTCTACGTTTTGTTTTTACCTCA:1 + chr3R 26065625 3' + roo 390 2 63.01 CAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAAACAATTACAATCCGCGTTCCTCTCCGGCGTTAAAGTCACCGGATCCGTGCGGCGAGTGCAACTTTAGAGCGGCTAACAAGCGTGAAA:1 - chr3R 6495251 3' + Stalker4 364 2 53.42 ATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCATCGTCCTGGCATGGAGTCCTCCAAGTCCTGGCACCGTTATTGAGAACACGGAGATGTCTAACAATTCTGCGAAACTACTGCCCTCGC:1 + chr2L 7700861 3' - Tc1 1347 1 70.55 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTAATTATTTTTAAATAATGTTTAGGGAATTATTGTTACGAGAAACCCTTGCTTCGCCAACGCCTTTAC:1 + chr3L 14375725 3' - roo 8717 2 57.93 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATTGTTATTTTAAGA:1 + chr3L 18484483 3' - hopper 54 1 55.48 ATCAAAACATTTTTCAAAAGTGGGCGTGACAGTTTTGTGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGGGGACGTGGCAACATGGATTAAGAACCTCCTTATCTTGTTTCTAGTTAGCCACTCTTCAGAGAAATTAAATACGTTCAGACACTGTAT:1 + chr3R 5285514 3' - INE-1 261 1 52.74 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGCGCAGGATAATTGCCAGTCGCTGAGCAACAAAAGCGATTAGTTTAATAGTTGGCCATTAATGCGCTGCCTTCGATTTATATCTCATTGCCACATTACGCA:1 + chr3L 10112320 3' - I-element 22 1 69.18 GATACGCATTAAAAAAAAAAATTTGTAAATTTTTTGGTCTTAGGATATTAAGCATGTTTTCCATAGTCGCAAACACCTAAGCGAGATTTTAATTTATTAAAATACCTCGGCACTGGCTTTTAACTTATT:1 + chr2R 16903125 3' - accord2 355 1 79.07 AGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTAAAACAGATCCTGAGAAAATTTCCACAATTATGAAGTATCCGATTCCACAACACTTTGTACACGCGTGAATAGCTTGTGGTTCCTAAGAACAGATAGATATTATAAAAG:1 + chr3R 26259578 3' + TLD2_LTR 179 1 60.27 GGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATCGAGAAAGAAATTCGCGTTAAAGAATACATTTCCAAATTTGAAAATGCGTCTTG:1 + chr2L 8443594 3' - Stalker 101 4 63.01 ATTAGATCTCACTTATTTGGTACACATAGTCTCTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTATTTATACTTGTTTACAATATTTCGAAGTCTCCACGTCACCAG:1 - chr2L 20634714 3' + Ivk 5177 1 70.55 AATATTTAAAAAAATTTTATTTGCGATACTGATTGATATCTAACCAATTAATCCTTATCAGGCACTACAATATTATATTTTCCCCACAATGTTAACTAACACCGACAATGAGGAACGCCTATCCTGCGGCAGTCGAGTCGACGAGT:1 - chr3L 12682424 3' + HB 327 1 60.27 GCATAATGCTTACATTGCAGAATGTTGTTGTTGCCGTTTTTCACATACTCGCCGTAGCGGCGTTAACTTAAGTTAACTTATACACAACGAAATTTAGTAAAATTTAGCCGACTTAACATCA:1 - chr2R 4816407 3' - gypsy2 6545 2 69.42 AGTTCTTTGGCTTTAAATCTATATTATTTGTTATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTGGAAAATATCTTCAGTGATGAGAATTAAAATTTAATTAAATTTATCTTAAGTAAAA:1 + chr2R 5260044 3' + 1360 238 1 64.38 ATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTACCCTCAGTTCCAAAAGTTAAAGTAATGGAAACACAGGCCTACTTTCTAGAATTTAATAACTTTTTGCAAG:1 + chr2L 1275668 3' - jockey 4850 1 52.05 TGGCTGGTTTGGACCATCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATATAGGACCCGCAAATGGAGAACTCAACTTTAGCAGGATGAACATGTATATATATAAAATTCTTGGCCCAAAACGGATTGATGGTG:1 - chr3R 9300715 3' - 297 10 2 72.39 TATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTCTTTCTGTTC:1 + chr3R 7778323 3' - transib2 78 1 76.30 GATTCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTTGTACAGAAGTGTACTACATTAAAAAAGACACTGTTGAAAGGGGGTTGTGGGGG:1 + chrX 3868246 3' - G5 4806 1 63.01 CCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAACAAATTTTAAAAATTCGCGCCTTGTCTCATTTCATTCCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATAATGAAATTTCGCGTACGCATTCACACTAGCTGAGTAACGAGTATCTGA:1 - chr3R 3322237 3' - 1360 3113 1 62.33 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTTCAAAATGTCATTTATTCTGACTGCAGTAATTACAATTTGATGATAGGTCATTAGAACTGCGCGACTGAAAAGAATGCCG:1 - chr3R 12379678 3' + roo 9030 1 56.85 GTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGACGAGCTGGAAAAGCTTGCGTCTGAATTGAGAAAAAAACATAAA:1 - chr2L 4420473 3' - gypsy5 17 2 70.08 GAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGCGTATTTGCATATAAGGTCTTTTTAATTAA:1 - chr2R 18344580 3' + 1360 3322 1 80.91 GAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAAC:1 + chr2L 21153563 3' + 1360 3316 1 69.44 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTCA:1 + chr2L 15777901 3' - 297 6625 2 57.46 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATGGCAACTGCCTCCTGCAATAAAAGTCACAATGGCGACAGCTCACGACACATTGCTCTTGCCCC:1 + chr3R 22494243 3' - 297 10 2 77.93 AGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCCAGTCATGTTCATATGTAACAGAAATATATAGAGCTGAAGTA:1 - chr2R 4577034 3' + Chouto 486 1 63.70 GATCAGGACCAATAGCCTAGTCGATCTACCCATGTCCGTCTGTCCGTAAGAACGTCAAGATCTCAGGAACTAAAATGCTAGAATGTTGAGATTAAGCATACAGATTATAGAGACAAACCCCATGTTTCCACGCCCACTCTAACGCT:1 + chr4 71482 3' + INE-1 92 1 65.75 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTTGAACCTTAACCTCCCCGGAGTGAAGAAAGTTTTTCGCTTGTTGTTTGACAAATTGTTTTGTGCAGCCTTCGAAG:1 - chr3R 8639218 3' + copia 210 2 54.11 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATATAAAACATTTTAAGAACTCAGGGGTTTCTTCGTTTTGGAGATTTGGATCTAAAC:1 + chr2L 13255380 3' - pogo 30 1 54.39 TTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTAATGGAAATCTTCACACTACACCAATTTTGTTTCTGTTCCGTCTGAAGTAAAATAAAATGTTCGTAGTTTAAATGTTTTATTCGACAATAACAAATTCGTGTT:1 + chrX 12903764 3' + Tirant 8379 2 54.79 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCTCTAAAGTGCATGGCGAACCGTTAAAAATGAATTGCCCGGGCATATTTTATAAACGAA:1 + chr3L 19031375 3' - roo 13 2 75.34 TCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGTGCATACTAAAATGCAATCTCTGTCCAGCATTAAGCCTAAATTAAATATATTTCATCCAGTGTCCAAAAACCAATAA:1 + chr2R 23212715 3' + Tirant 8483 2 61.60 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTACGGCAACTAATAGAA:1 - chr3L 12874873 3' - jockey 72 1 61.81 TGGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATCGATCAATAGTCTTTCATATATTTAGTTACATACAA:1 - chrX 14836192 3' + invader4 3005 2 72.60 AAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGATCTTATTCTCCGTTTCTCTGCGCTGCGCTGAGCTGAGCTACTCCCTTCTCTCCCTCTCTCTGGCTTATCA:1 - chr2R 17462357 3' - 1360 281 1 50.71 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAA:1 + chrX 1103720 3' + pogo 2056 1 55.22 GGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAATTCTAAGGTAATTCACCGACCATCAAACA:1 - chrX 20685884 3' - Ivk 5280 1 79.58 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACATAATTAGTCTGATAGATGTAA:1 + chr3R 6413676 3' + 1360 3356 1 63.01 AAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGATATGGCTTTCCGTTTACATTATTCCGTTGCATCATTCAACGGTTGGTTAACTTACCCCACA:1 - chr2R 11197540 3' + flea 4643 1 57.53 AAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTAGCTCTGGTATTTTAGACTAAATCAAAATTAGCAAGAGTTTCAAGCGGACTCGCATTC:1 + chr2R 16137725 3' + Stalker4 6874 2 59.15 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTAAAGAAATCTATAGTTCTTGTTTCGCTGTATAACGCACTGCTGTTACCTGTCACCACCAC:1 - chr3R 6645269 3' - blood 9 2 78.08 AGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGGTGGTGGTGGCGGCGAGCTACAGCACCTGTTTCAGGTACAGG:1 - chr2R 17525711 3' - jockey 460 1 51.16 ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTGCGAAAGTCGAATGTATTATCTTGGCTACAACCAAA:1 - chr3R 6413529 3' - 1360 34 1 60.43 GCCACAAGGCTAGTGATAATAACTAAGGGGGCGAAGTCAAGCCCTCCAACATAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGTTATTCTTTATATTACGTATACGCAGTGTAGCTTGACTAGTAGACCACTGTAT:1 - chr3L 1838028 3' + gypsy 328 2 60.43 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCCAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGTAATACCATATAAGCCAAGCTATTGAGTACATTCCATTTCATCATA:1 + chr2L 4929885 3' + blood 303 2 67.12 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTATCCAATTAAAAAAACAAAAAACAAAAAGGACCTGGAAT:1 - chr2L 21643015 3' + Tabor 438 2 52.41 AACAATAATAATAATAACAATAACAACACAAGTAATAATAACAACAACAACCACCACAGTGACGTTCAAAGATCCCAAGTTCGTTTATCCACCATTTAGTTTATTGTTAGCCACGTAAATCCACTTGTCAGAGTCATCAATATCAA:1 - chr2R 11205845 3' + mdg1 7072 10 60.27 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTAATTATTTTTAAATAATGTTTAGGGAATTATTGTTACGAGAAACCCTTGCTTCGCCAACGCCTTTACTTAAATGTCCCCAAATTTTATGCACATTTATGTCAGC:1 + chr3L 14375762 3' - roo 17 2 74.66 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATACATGCACGCAGACACTTTATTTATTTACATTCCAGCC:1 - chrX 11008329 3' + hobo 2908 1 64.58 CCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCTGTCTGATGTCCCAGGCACCACAAAAATATACGTATATATTTTAATGCTGCATACTTC:1 - chr2R 17340126 3' - jockey 256 1 63.81 AGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGCGCAT:1 - chr2R 5070922 3' - Tirant 16 2 28.08 ATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAACTAGCCG:1 + chr2L 5890562 3' + invader3 5390 2 69.18 ACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGTTTGTGATTTCTAGTTGGATTTGACTATGCACG:1 + chr2R 18373007 3' + copia 45 2 76.92 CGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGACACACTGAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGCCAAACACAAAACATTTGCAATGATAAATCAAAGGAAAAAAATGCATGGGAGTAG:1 + chrX 13578273 3' + Chimpo 45 1 62.33 ATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCCTTGTTTAAAGCCGGTGGTTTTTTTTACAGTGTGGATTAGCAAAGAG:1 + chr2L 21976825 3' - Idefix 13 2 48.59 AAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGACAAAAAAACGAATGATAAGTAATGGGATGAAAACAACTTGTTAAAACCTCTATAAATTTATCTTTATATGTCTCACGTTTATTAAAGTCATATACTTTTT:1 - chr3L 3238211 3' + roo 9051 2 60.96 GATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAA:1 + chr3R 13349579 3' - Ivk 61 1 58.99 GTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAATATGTATATATGTGTGACAGAAAAGAGACTAAAATAGATTCTGCGCGTAATT:1 - chr2L 13138978 3' - McClintock 6009 2 65.28 GGAGGATATATAGTACCCCTACATTATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGTCAGAGAAAAAAACAAATGCACCACCACGAATAATCTTCGATTTCTGAGCTAGTGGTGGCCAGCTGCTGGGCAGTCCGTATCGATTG:1 + chr3L 17654296 3' + invader2 5102 2 60.74 GTGCATCGCACAGTGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTTGTTTGTATTATGTTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTATACGGAGCTCGAAGAAAATGGCCCACTCTATGCGTTTAAGTGCTTGTTTGAGGTTT:1 + chr3R 26817862 3' - Doc2-element 117 1 72.60 GATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGGAACTCGCGCGCTTTTTGGCCAATATGCAGTTGTCTTTATTTCATTTCATTTGGCGACTTTTTG:1 + chr3R 16240992 3' - Tirant 8175 2 61.64 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTATTTCACTGCCAATTGTTTTTCCCGGCCAGAAAC:1 - chr2R 11095704 3' - diver 26 2 66.44 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTGAGGTACCTCTGGGCTGCTGCTCTGGATGTTTTGTAGCCCAGTGATTGACGATAATTGACTGTCGCCAGCATATGACATCAATCATGAC:1 + chr3R 27810150 3' - Burdock 6163 2 65.28 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAGGGCTGCAGTCG:1 - chr3R 7885577 3' - jockey 58 1 52.45 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTA:1 + chrX 19730199 3' - Doc 62 1 60.42 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTCGGCGGTTGCTGGCTGTTTGTTTCGGGCAATTTCCGTACAATT:1 - chr3R 20912734 3' + hopper 1365 1 61.98 GATCTGGAATGTACACTCGCTCAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGAAATC:1 + chr2R 4611936 3' + mdg1 333 2 73.29 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGAACCCTTAGCTCATAATAATTTCACAACGCATACACTAGCCGTAAAATAATTTTCCAGCATTTTTTGTCTTTC:1 + chr2R 21748351 3' + 1360 3349 1 54.35 ATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGAATTTGAGGCAGTTCGTAGAATAAGTCGTCTCT:1 - chr3R 4576980 3' + mdg1 334 2 76.71 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTGCGTGCGGTTGCTTTTCACATAACAAAAGGTGCTATTGGGAAAATTTTC:1 - chr2L 14969056 3' - 412 22 2 60.87 TATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACGAAGCGATAGTGTTGCTGCCTTTTGTTCGCCGAATTCGAGTGGAAACAATGCAACAGTTACGAAGCATTATCA:1 - chr3L 12879778 3' - jockey 129 1 50.00 GGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTATGTCCGCACTTCCTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGTCGAATTTCAGATAGAACTATAGCGTTCTCCCTTGTTA:1 - chrX 20777765 3' + 1360 430 1 70.55 CAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTGTATGGACTGAGACTTACCTGATCGGATCGGGAGTGCT:1 + chrX 18220660 3' - Burdock 76 2 74.13 TATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCC:1 - chr3R 14049309 3' - transib2 12 1 72.27 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATCTATGTACGAGTATCATGCAATTTGCGAGAATGTGTTTCAAGAGAAAG:1 + chr2L 17626732 3' + roo 396 1 74.66 CTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTAACAAGGTTGCCAAGTTGGTGGCCGACGAG:1 - chr3R 14516375 3' + I-element 5070 1 79.29 ATCATAGTCGTGTAGTTTACTTATGTGTCGCTCTACATTTGACTTTATAAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATTCATTAGGCAGACACCAAGTCGCGCCTACATTACTGCTACCTATGCATGTTCCACTGAC:1 - chrX 292333 3' - G3 4384 1 70.55 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCGTAACTAGTGAGTGAATAGCAACAACCAAAACATCAACACCCACCGACAACAACAACAGTGACTGTGGTTAGGGGGTGAAAGGTAGGGGGTAAGTGGGCGTACTAGAGG:1 - chr2L 2707510 3' - jockey 4759 1 81.20 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGAACCCTTAGCTCATAATAATTTCACAACGCATACACTAGCCGTAAAATAATTTTCCAGCATTTTTTGTCTT:1 + chr2R 21748349 3' + 1360 3343 1 52.82 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTGGTATAATATCGAGTCCGCAAAGGAAGCAAAATGTGATTAGTCATGTCAATATCATAAATGTGA:1 - chr2R 12371051 3' + I-element 5302 1 54.11 GACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAATATATTAAAATAATAAATTAAAATGAAAATAAATAAAAGTGAATTTAGTATTTCCATTTTAAGCTCATGTAAGCTCTTTAAGAGG:1 + chr2L 16707962 3' + Stalker2 368 2 59.31 TAGATGTAGATGTGGTAACTCTTGCACTTGTAAACTGAACTGAGATAGCGAATCCCTAATGGCAGGGGG:1 - chr2R 17544159 3' - gypsy5 6938 1 68.12 TAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAATGTACGATGAAGTGTTAAGAAAATAAATCACGCTC:1 - chrX 17479611 3' + 1360 3163 1 76.03 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTCCCTTTCTCACATTCTCCCATTCTCTCGTTCTCTCGCGCTTCTCTGCTCAGAAGTACATATTTCTCA:1 - chr3L 19580836 3' + roo 396 1 75.34 GTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTAGAAGTTCTTTCCAGTTCCAGCAGATATTTGCAGATCATTTAC:1 - chr2R 9380431 3' + 1360 160 1 72.88 GCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATGAAAATGAAGTGCTACTGGTACTTAAGTAGTGCTTATACAAACCA:1 - chr2L 7128963 3' - 412 94 2 69.18 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATGTGTATATCTCGATGTATACCTTTAAATATAAAACGAAACAAAGGAATTTCCATTGAATATTTACTCTCTACAAGCATTTTGCCCTCTAAGCTAGATACA:2 - chr3R 19139330 3' + pogo 2087 1 76.03 GCTCACCGGGACTGGCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGAAGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTCCCTTAAGTGTAGTCCATGAGGGCTCCTCCTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTGTGGATTAAGTTCATAAAATCTAAGTTC:1 - chr2R 10517149 3' - Rt1b 4989 1 80.82 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGGCATAATTACAGCAATTTCCACTCTACGCTGTGCTCTGTATTGCTTTCAATGTCAACGAGATTGGTGGACAAAGCAAAACTAG:1 + chrX 10047429 3' - I-element 35 1 60.27 CTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACAAGCTACAATCAAACATCTGGTATCTGCTATTAATTGGATTGGGTATATAGAGTTAGATATAGAATACAATACAAAACCA:1 + chr2L 9947956 3' + I-element 5151 1 53.42 CTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACCGACAGACGGACATTTCCATATCGTCTCGGCAAGTTGGCTGTCACGATGCTTGAGTTTGATGTATTA:1 - chr2R 9805995 3' - INE-1 155 1 64.49 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACCAATAATATTCATCCAACAACTTTTGTTCCATAATATTTCATTCCCCCAGAACCTTTAAAAATTTACGAACCATGCTAACCACAAAT:1 - chr2R 21870128 3' - copia 30 2 60.84 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAAGTGGCAGTATCCTT:1 + chr2L 3231993 3' + roo 9038 1 60.27 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAGACTCGAATTTACGATTAATATACTCACAATATTATTATCTGCTACGTGGGAAGAAAGGG:1 + chr3L 21013986 3' + roo 9046 1 70.55 CGATTCATTTTCATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTTACCGGTTAAACGCCAAGGTCGCAGTTTGTTGGCCAACTGCCACCCAATCGGGCAAAAGGGAAAA:1 - chr2L 18522230 3' - roo 54 2 53.42 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCAAAATACATTTGGAGGAATTTGTAAACAACCCGAAACTCAAAAGTTATT:1 + chr2R 11256303 3' + roo 393 1 73.29 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTAAAGA:2 - chr3R 6645324 3' - blood 7075 2 58.22 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATGATTTAAATTCTATTACTTTTTATAATATTGCTGCTTT:1 + chr3L 5630424 3' - I-element 85 1 74.65 ATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAGTTTTTTTGTAAATATCACCAGCTTACTGCGAATGGCTCCTTGGTGGATTTTCACTTCCTGCTGTTT:1 - chr2L 2120323 3' - I-element 4912 1 76.06 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTTAAGTGGTTCCAATGGCTCTCAATTTGAGTTTGTCGTAA:1 + chr3R 18205698 3' - 412 80 2 72.60 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCTAATTACACATGCAGCTGCAATAACAACAACAACAAAAGTGGAAGGCGGTTAATGATCACCACGAACAGTTGGGTGAAAAAAGGGAGAGAGG:1 + chrX 3322833 3' - 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chr3R 26486045 3' - 412 7139 2 73.97 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATGAAGTTATTGATTTATACATTCATTTCACCTCATGTGCTACATTTACCA:1 - chr2L 16857850 3' - P-element 73 1 34.25 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTG:1 - chr2L 13629063 3' - Tirant 63 2 59.59 GGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTTATCGTATTGAAGATTATCCGTTTTTGTCAGCGGGTGAGGATCCCCTGAT:1 - chr4 525757 3' - Transpac 488 1 70.80 CTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACATATTCGGCCACAACATTGAACTAGATTTATTTGTTTTGCTTATTTATGTAT:1 - chr3L 13738046 3' - gypsy 61 2 63.31 GTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTACACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGCATACCTTGAAGGGTCGAAAACGCTTGATTCTGTCAGTTACATAATTTTACGTAACGGCTTTTTTCGAATTTTA:1 - chr2L 21874583 3' - Quasimodo 40 2 57.53 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCATATATATAGAAAATATACACATATGTATATGTACCTAGACGTGCCTATATCCCGCCGATTTTGAGGCATTTGCTCTGTGTGAAATATTCTAACATA:1 - 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chr3L 17537722 3' - Doc 50 1 53.42 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCA:1 - chr3R 9125640 3' - Doc 23 1 69.17 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCATTAATGGTTAAATAAATAAATTGATAATAATGGCTGTGTTTATTAGGCATAAGA:1 + chr2R 13293444 3' - roo 67 2 65.75 TTTGTCAAATTTACAAAGCATGACCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGACCTGTTCGCTTTAGCGATATGATACCACTTTAAGTCGTTTGACTTTAGCAAAAATTAAAACGCATCGACA:1 + chr4 184043 3' - 1360 197 1 58.90 GTGTGAATAGAAAATTTGTACGTTTTGTAATTTGTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACATAGCCTTCAAGGACTCTG:1 - chr2L 6177560 3' + pogo 74 1 61.31 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTATCAGTTACACCTGGGACTTGGGGCTTCTATAGGGGCTACCATGGCG:1 - chr2L 3231876 3' - roo 8708 2 60.68 ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTTCAATATGACTTTCAAACGCCGAAGCTAAAATGAAA:1 + chrX 20975820 3' + copia 5074 2 74.66 TTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCTGTTCCTGAAA:1 + chr3R 7778345 3' - 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Doc 101 1 80.14 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATAATAGAGTTTGCGGTTTTGAC:1 - chr2L 9274987 3' - F-element 70 1 57.53 ATGTGCTGCCAAAATGGTATCCAATACCATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAAACCGTGGTACCAAACGTAAAACCACACAGATAGAGGATCGACGTGACAAGGGGCAATGGGGGCCCGAGGGCATTCCGTTCTGCGG:1 - chrX 15150691 3' + HB 449 1 68.12 GAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGACCTTTCTAAAAGCTATCGCAGGCAGTAACCCTCTAGTCCTCGTCCTACACAAAA:1 + chr3R 6645418 3' + blood 7324 1 61.64 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTTGCA:1 + chr3L 27391405 3' + 1360 3348 1 51.37 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGTAAGCCCTCTTAACGGCC:1 + chr3R 30264097 3' - blood 7071 2 64.18 GAGATGAGCAATCGAGTGGACGACTTTCCATTCCACAGGCGGCCCTCAA:1 - chr3L 2216628 3' + jockey 18 1 55.10 CGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCATGAAAAATATAAAAAAGTTAAAATAATAGAAAGCTGCTGCTGCTGGTGCTTTCGCTGCTGCTACTTTGTGTGCATATTTCGCTGCATATTTTGACTCCAGAATAAATAGACTT:1 + chr3R 16539724 3' - G2 2701 1 79.45 TGTTCCATTTTATTTGTAAATATTTGGACACGTGGTGTATTTTTAACAGAATCACAAAGTTGAGTAAAAGCTTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAAAAGCTGATCTAACATATGAAACCTCGCCTCGTGGAATCAATATTTATTTT:1 + chr3R 20565310 3' - transib3 257 1 73.97 TGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTA:1 - chr2L 18112515 3' + transib2 2740 1 75.34 CACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTAAGGAGGAGATTAAGAGGATGATTTCCGACATTGACAAGGACTGCAGTG:1 + chr2L 22550811 3' + 1360 154 1 66.44 TTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTTTCGATTTATTTAATTATATATATATTTCCAATTACATTATATTCTTTAGTAGCTAAGATCGCCCCACTGTGCCTGCGT:1 + chr3R 6555331 3' - Juan 4067 1 54.79 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTACCAAAAAAGGGTTTGTTCTAAATGAAAGACTGTTAAAATATATATATTTAGATTTGGTTCATGGCCTTTATTTATAAATG:1 - chr3R 21674793 3' - roo 8701 2 52.74 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATCTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGA:1 + chr3R 19436076 3' + roo 9001 2 65.52 CATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCG:1 + chrX 21947732 3' - invader6 4388 1 55.14 TGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGC:1 + chr2R 21439494 3' - jockey 101 1 78.08 GATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCACAACCTCATTAGTTTCCACCATTAGCTAATTTAACCTTATC:1 + chr3L 17666479 3' - F-element 155 1 74.66 ATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCG:1 + chr3R 15790113 3' - flea 4736 1 65.00 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCATACTACTAACTAATGCTACATGACCCCGA:1 - chrX 1103568 3' - pogo 16 1 73.10 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTAATCTTGACGG:1 - chr3L 14375585 3' + roo 9044 1 63.70 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCATTAATGGTTAAATAAATAAATTGATAATAATGGCTGTGTTTATTAGGCATAAGAATGTTAATGCTCGATACGAATAAACGTAAGCTATA:1 + chr2R 13293479 3' - roo 32 2 65.75 CTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGCAACCTGCTCCAT:1 + chr2R 14973717 3' - FB 28 1 61.83 GCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCGGCGGAAGTAGAAGTTAAAGCTACATGGTGGAAAATGTTGATTGATAATCGACCTTGCGAA:1 + chr3R 23235312 3' - BS 48 1 56.12 GGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTTTTTCACTGCTGATTGAGTCAATGATGATGCC:1 - chr3R 17259525 3' - 412 89 2 78.77 CAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTGTTCAATATCTATTGCACTGAGCTATTACTTAATACTTATTACAGTATACGGACGCGAAGGTTTCAGTTTCATATCGGGCCACGGGTTTTTCCTCCTATTTTTAAATCGCTTTCAATGTGCG:1 - chr3R 7616708 3' + Stalker2 357 2 52.74 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATTGTTAATTATGTTTTCCTTACATGAGCTGGTTTGCTAGTTACACTATTTGCGAATAACTCATAATTTGTTTACGTTGAAACTTAAAATGCAATAAACTAATTTT:1 + chr2L 14969233 3' + 412 7530 2 68.49 ACAATACAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTTTCATAAATGTCCTCATCGATCTTCCGCGTTTGCTTTTCCTAAAGGGGTACAAGTACAATGGGGTGT:1 - 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chrX 1103594 3' - pogo 43 1 54.79 TACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGTACGGCCTGATTCTTGAGCTGCTTTCGCTTCAATGTCAACTCGGCTCGTTT:1 + chr3L 16452627 3' + copia 4976 2 61.62 TAAGTAGATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAATTAATTTACAAGCAATAAAGCGAAACGAACAACAAAACGAAGAAAGGCAACGGAAAAAAGTT:1 - chr3R 23142424 3' - roo 277 2 49.61 GACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGCTAGCGCGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAATGACGCAGCACATCCC:1 + chr3L 8658818 3' - roo 8696 2 52.14 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACAACTTGCAGTAATGGAGACATAACCAAACTCAAT:3 + chrX 3647035 3' - 412 7080 2 65.75 TGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAACATTTGAATCTATTCAAAATAAGCATTTGATTTCGATTATAAGAAACATAGGCTATTTAATTAACAATATATTGACATTAAGGTACATATTAAAATACTTAAGG:1 + chr2L 16456899 3' + BS 5079 1 70.55 AACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCCAACTGTTAATTGAGTTGTTTTAATGGTTAGCTGTTGGATGGGCGGGTTTAATGGGCCAACAAATGTGTAATAAATTAT:1 - chr3R 15054873 3' + 297 23 2 52.74 CGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACCAAAACCCGTCCCGATCCCGCCTTCCGGCAATTCCCCGTAGTCAAATAACATTAATGTGTGC:1 - chr3L 13131930 3' + P-element 2719 1 37.67 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAATCGCTCTCTCAGTCGGAGCGTACGCTCAAAAAAAAAATTGGTGATAATTTGATAAAGGAACTATGATT:1 + chr3R 14278012 3' + P-element 2860 1 65.75 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAAGTCAAAATTGTTGACAGCTTGAAAAAATGACTGTGAA:1 + chr2R 10160989 3' - transib2 45 1 50.69 TTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACACCCACACACAGAGATAAATACACACATAAAAATTTAAACATGTTATATACATA:2 + chr2R 1000404 3' - HMS-Beagle2 6947 2 62.33 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGCGTATATTT:1 + chr3R 25751902 3' + roo 9023 2 54.11 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAGA:1 + chr3L 21013928 3' + roo 324 2 76.03 GAAGGGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTAGTGTAGGGTGCAGTATTTCAAGCGGGTTAGTATTGAAAATT:1 + chr3R 1712528 3' + Tc1 1471 1 89.71 CTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTCCTGCAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAG:1 - chr3L 25373416 3' - GATE 435 1 63.85 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATTAGATTAAATGACTTA:1 - chr3L 18253775 3' - blood 7062 2 52.05 CAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACGTTTAGATACATTTATATCTAGTTATGGAGTGGGGGAGGGGGGGAATATTCTATCGAAGCCATTATCTTCGGCAGTTATGTACAATTGATTTCGAACATTTACTCTTGCAGAAT:1 - chr3R 25713959 3' + flea 5012 2 78.77 ACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATCTCAACTCAATCTCTCAACTGAGTAACGAAGTAACTCGACCAAATGCATTTAATTTGTATTGAC:1 + chr3L 22275872 3' - FB 38 1 54.40 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCG:1 - chr3L 18253803 3' - blood 79 2 71.23 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTTAAGTGGTTCCAATGGCTCTCAATTTGAGTTTGTCGTAAAACTGAATCA:2 + chr3R 18205708 3' - 412 70 2 65.75 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTTTAAGGCCCTTGGGAA:1 - chr3R 26485993 3' - 412 34 2 62.33 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGAT:1 - chr3L 13690264 3' - hobo 23 1 61.26 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAATCACATCTAACGCTGGACGCGAA:1 + chr2L 23049735 3' + opus 7440 2 65.07 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAAGGTATAAAAGTAA:1 - chr3R 4679412 3' + hopper 1392 1 68.49 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGCACTTGATTTTAACGGTAAGTTTTTGTTAACCAGTTAACACAAGTTATTGCGAGGTGTACATAAGTTTTTGGTTGAAAATGAAGATATCGACCATC:1 - chr3L 12964684 3' - hobo 24 1 67.81 AACAAAGAAAAGAGCTTCATAGCGGCTTCTGCCAAAGTGCAGAGCTTTGCCGGCTATGCTCGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTTCTTACACTGCAACACCTCTTGGAACTGGG:1 - chr2L 8960955 3' - gypsy3 96 2 77.44 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGCGATT:1 - chr2L 14239126 3' - 412 34 2 58.02 ATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATAGTTATGTAACAGGCAGAAAGAAGCGTTTCCGACTACATAAAG:1 + chr2L 22758838 3' - G3 4505 1 72.41 GCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAAAGTATAAGATTAGTGTAGTTTTATGAGACTTACATTTATATTGTCCACTAATAAAATTAATGGATTTATTCAATTCGGCCTGTG:1 + chr3L 12570731 3' - diver2 4622 2 52.05 ATGTCGTGATTGCTGTACTGGTAGGTAAAAAACTTGATACCGTTTGGAATGGGAGAGCTTTTTTTCTTGGGACGTGGGGTTCAAAAATCTACGTCATCTAGTTCAGAATAGGAGTCTTGAGCTAAAATCTGTTGTGCATTGCCAGA:1 + chr3R 2741753 3' - Doc3-element 488 1 66.44 CTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAACCCAGCGCTATTAACAAAACGGGAGACACAACACCGGGA:1 - chr2R 19852160 3' - Transpac 79 2 72.60 ATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTATCGCCATGGTCAGACCGACATGGCAATCCCTCTGATTTAATATATAATATATGTATATATGGTTTTATATGGTATCGGACC:2 + chr3L 7939160 3' + R1A1-element 5296 1 55.48 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAATATCTATAGCCAAGCTTCTTACCTAATCGAAAATATCTTACAGTTTCGTTGAGATATTTAAAAATCACTGTTTAGAGCATCTAATTTATATTAGTAACGCCTGAAACTG:1 + chrX 16690689 3' - FB 13 1 75.34 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAAAACATTTTCAAATTAGCTC:1 + chr2R 10160627 3' - hobo 47 1 48.63 GATCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGGCGGGGAACTTGACTAAAGCATTCTCTCTTTTGTTTTGAATCTAATCCAGACAAAAATTTTTCCACATGATGTGATGGCAAACTCACTTCGGGCAGCCCTTCTCGGAAAATGC:1 - chr3L 21874607 3' + INE-1 536 1 54.11 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGG:3 + chr2L 8574469 3' - Transpac 4970 2 54.11 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTGTGTGTGGGCATTATAAAAGATGAACTACTGAGATCGAGATCGAGTTGATGGCACTATACCAAGAAACGCGCGCAGGCAAATGTTTCTGGCTTATTTGTCCTCTTG:1 - chrX 2295071 3' + Transpac 301 2 79.45 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACAATGTATTTGGAAAACAATCATTTTGCAACAAAATT:1 + chr3L 24766024 3' + 1360 3356 1 69.18 TTTATTGTTTCTTTTTTTTTTTGCCTAAGAATGGAAATCAATTATATTTTTTATTCAACAAAAAAGGAAGCTTAACCTAAAACAAAAACACTTAAAGCCCGATCAATCTTTTACT:1 + chr3R 14060943 3' - transib2 2641 4 64.35 CTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAACCCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCAATTCTAATTCGCCTGGCCAAAGCGAACTCT:1 - chr3R 16240922 3' + Tirant 311 2 76.71 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTT:1 - chr3R 14049315 3' - transib2 45 1 54.79 TTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGG:1 + chr3R 19436103 3' + roo 380 2 60.47 AGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTACCTCCGATCGTTTGCTTGTTCGAACCCATTTTCTTGCACTTCTTAAATAAATACTTTTCTTTTTACCAACCTTCG:1 - chr2R 1320390 3' - Transpac 4961 2 56.55 CGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATACTATTTCAATTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCATTACTGACTGGTGGGTGGTTTCCATTGCCGTTATGTGGCTT:1 + chr2R 21880085 3' - mdg3 5492 2 71.92 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCAT:1 + chr3L 18484463 3' - hopper 74 1 69.18 TAATCAAATTAATTAAAATTAAGCAAAAATCCATGAAGGAAAATGATATGCCACAAGTTCAAACAGAACGTATTAATCGGTTTGCATAGAATCAAAAATATGGTTTATTCTAAAGCAATATTGCAAAAAACGTTATTCTTTAACAA:1 + chrX 14180618 3' - HeT-A 380 1 60.96 AAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAGCATATACACAACCATATACCATATACCTTATACAATATACCATATAGAATATACGTTAAACAATGAACCATATATACCAACTACCGATACCGAATACAA:1 - chr3R 21334800 3' + hopper 1096 1 71.92 CTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGCTAGAGAGTCAAGATTACCCGGCTGGGACAATCGAATTAGAAGAGCAGGACTCATGAATGCGCCGGGCCAGACCTCGAAGTGAAGTCG:1 + chr2R 24804757 3' - Cr1a 4273 1 49.24 CACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTTTGTGGGTGTCTCCTTTGCGTTTGTTA:1 - chrX 8967370 3' - HMS-Beagle2 47 2 53.42 AAGAAATTGAAAATTGCTAAGCCGGCAATCAAAATACAAACATCAGGCGAAACTCAACGAGTACCATTGTTGTCCAATATCTGGATCGGATTTTGTAAACTCATCCGGTTCAAGACTGCCCACAAGTCCCAGATCTTGGGTCTC:1 - chr3L 8756843 3' + NOF 436 1 53.47 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCAAATATTTCGTTCCTTATTCTTATATTTCGTTATATAAATATAAATATTTTTATAAACACTAAAACT:1 - chr2R 5503661 3' + pogo 2050 1 54.11 AAAACAAATTTAAGAGATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTGATCTATTCATACATAAATAAGATTGTTCACCCAACAAAATGATCCATCAAATGCCACTCAGACAAATCCATTTCAATCCTGTCTTCGGACTCAGATGCG:1 + chr3L 27361577 3' + Tc3 1588 1 63.70 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACACTTGATGTCATAAGTGTTTGAATAGCATGTTGAACGATTTATAATTTTGTTCTTTTCGATTTTA:1 - chrX 8349872 3' + roo 352 2 55.48 GTCTACGCCTTGGGCAAGGCTGTTACAGTTTGTTCTCTGCTTGTTATCTTTCGAGTTTGCGTTGTTTTGAAATAAATAATCAAAAGTACCACCTTATTTTTATGTGTGCACTTTACTTTTTCACCGTTTATTTGCAGC:1 + chrX 7751376 3' + jockey2 184 1 57.97 AAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTTTCCATAACAGAAACAGAATTCTAAGATCTAACGTTAGTTTACAACAAGCAACAACATCATTGACCAAATGATT:1 - chr3L 16485948 3' - 1360 3263 1 50.68 AAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTGTTAGCGTTTCGCAAAAGAGTTTTCATCATGGTCGATACTCTAGCGGATAATGGGTACAACGATATTTTAAAAAAGAGAAAAATCAAATGGCCATGAGCTTACTTTGCAA:1 - chr3R 15125141 3' + FB 25 1 79.45 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATTAACTCATTTATTTTTCTCTAAACTTTCATTAATCTAAAGTCGGTAGCGTAATTTGTCTAT:1 - chrX 8977436 3' - I-element 59 1 57.24 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCTGTTCCTGAAAAATACATCTAAATTCCAA:1 + chr3R 7778363 3' - transib2 49 1 50.68 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAAATGTATTTATATATATATTTTTTTAAATGGCATTGCTTATTTTCTGAATCTCAATCTTATTGTTCGCCGTGCATTTGAAAACAATATATTCAAAAAATCAAGCGAT:1 - chr3R 7507089 3' - Doc 15 1 74.66 ATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTGGCGCAAATTAATTAAAATTCAGTCAGTCGTTGTCGGCACGACTTTCCCTCTCGCGGCTGCCATAAAACTGCTGGCAGTCTCCTCTCCACA:1 + chr2L 4932296 3' - blood 7377 2 76.00 ACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGG:1 - chr2R 18689163 3' + Burdock 174 2 76.03 GTTTTGGGCGGTTTTGGGGCGTTGGAGAGCGCAAAACTATTTTAGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATGATTAGGTTTTGATATCTCGTTTTGCCCTTCTACTCGTTGAACTTTGTTTT:1 - chr3R 14957819 3' - INE-1 345 1 60.48 CGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTAAAATTTAGAACTGACATCTTTAAATGCATGATGGTAAGACTAGAATTTCTAATAGCATTC:1 - chr3L 11408919 3' - I-element 4994 1 56.20 ACAAACATAGCACAACTTATGATTTTCTTGGACCGAAAAACGAATGCAACATACCTCTGAAATCTTCAATGTCTTGCTAATATAGGAAGGAAAGGAAAAATCAACACTTTTTTACGACATTAATGTTCCTTCCCTCTTTC:1 + chr3R 30200080 3' + Penelope 562 1 82.86 CGTTACTCAGCTAGTGGGAATGCGCACGCGAAATTTCATTATTTATCTGGGGTATATTGAGAATAAAATGAGTAAATATTTAAAAATTGCCTGGATTATGACAGTCGGGTTAACATAGCTAGGAACATAGAATGAAAACAACTCTG:1 - chr3L 22938062 3' - INE-1 535 1 59.59 AGATCTGGAATGTACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACCACAATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACTAGTCACAATTTAACATTATTCGAAGAAGTCCT:1 + chr3R 8017808 3' + mdg1 332 2 75.34 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGG:1 + chr2R 11256246 3' + roo 335 2 67.81 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGTGCTGCCTACTTTCAGGTGGCCCACCA:2 + chr3R 25795846 3' - jockey 59 1 52.74 AAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATACAAACGAACAGCGAACACAATGGGCAAAATCAAATAGAAAGAGGAAAAGACGTAGAGG:1 - chr3R 19556620 3' + jockey 4910 1 67.12 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATG:1 + chrX 6633039 3' + P-element 2844 1 49.21 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTTCGGCAGGGCGCCGCTCACTAGGATCTCCGTTTTCAAATCTTTCATCGTAATGCGTTGCTAGAA:1 - chr3L 9212650 3' - hobo 2 1 78.57 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCATA:1 - chr2R 21848646 3' - Transpac 4951 2 57.93 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTG:3 - chr3R 9125632 3' - Doc 41 1 62.33 ATTCGAGCTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCAGTGCAGTCGACTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGCATCCACACCAACCTTGTCGCCAAGCGGCA:1 + chr3R 29260523 3' - Doc3-element 4612 1 76.92 TGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAGGGAAATACTTATCATACTTCCAACGATAAGAGCTATTCAGAT:1 - chr3L 13952719 3' - I-element 5109 1 76.71 TATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAAATGCGAAATGCGAAAGTGTTAGAAAGTGTGTTGCTAAATCGATTCGGCTTCTGAGCTATCTGAGTCCGTACTTCAACTACATTCCGGAAGCGAC:1 + chr3R 15706973 3' - INE-1 546 1 61.29 TAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGAGTTAATATGAAATGAATACGGTTTCCTTACTATTCGTATACCTTTTACTTCCTTTAATTTACTTTTAAAACTCTTTCCTTTGCTTTGCCTCG:1 + chrX 8977563 3' + I-element 5328 1 65.75 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTTTTTATGAAATAATAAATAATACTTTTTCGGCCCACGGTGCATTGGTGGCCCACTGGAACTTC:1 - chr2L 8574352 3' + Transpac 254 2 59.59 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCATTATTCACTATGAGGATGCAACAACGTGCTTTTGAGCTCTATTAGATTCGC:1 - chr3R 25862581 3' + roo 340 2 65.07 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTCGATTGAAATATCTTAATTGA:1 + chr2L 19674007 3' - roo 8721 2 59.59 AGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGTAAACGAATGGGGTGAGAGTCAAGGGCCTTACAGGCATGAAATTTTTATTGTTATGTTGAAAGT:1 - chr3R 25454682 3' + Bica 446 1 60.96 GGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAATATTCTCAGGCCAAATCAGCTTAAAAAAGAAATTGCCAA:1 + chr3R 19448951 3' - roo 173 2 70.90 ATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTCGGCGGTTGCTGGCTGTTTGTTTCGGGCAATT:2 + chr3R 21341395 3' + hopper 1329 1 76.03 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGCAGAAAATAGAATTTATTTTCTATGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATGTGATGAAGGAACACAATAGAGTCAACAGAGGAATAGAATAGAATGGAATAGAATAG:1 + chr3L 24821492 3' + copia 242 1 76.71 GGGGAACTCCACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTAAATTTGATTATTATTTCTTGGACTGAATTCTCGTTTTATATTAGATTCTTGACATGACCTTTAAGCTTAGTCTTTATTAGGCTAACGGCTAAAGCTTCAAGCGATTCCTTCA:1 + chr2R 332536 3' + INE-1 571 1 27.40 AATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGCGAGTACGCAAAGCTTGTCGGCGTCATCAACTCCATCACTGTCCATTAGGTCTATGACCACATCCAAACATCCTCTTTTTATGTCCACTGTCATTATAAAAATGCGTTGGCGT:1 - chr3R 7090105 3' - P-element 2696 1 17.12 TATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAG:2 - chr2L 2120389 3' - I-element 4982 1 69.86 GATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTT:1 - chr3R 10437071 3' + BS 5008 1 73.97 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGGTATAATTTTATTATATTGCATATTATCCTTTTAAGGTGATATTTTACAGAATCACAAAATAGTTAAATCAATCAAACGATTCATCTG:1 + chr3L 19864067 3' + roo 9040 1 66.44 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGACCTTTCTAAAAGCTATCGCAGGCAGTAACCCTCTAG:1 + chr3R 6645400 3' + blood 304 2 72.26 TAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGACTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCT:1 - chr3R 9125664 3' - Doc 73 1 59.59 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAATCGCTCTCTCAGTCGGAGCGTACGCTCAAAAAAAAAATT:1 + chr3R 14277983 3' + P-element 2847 1 53.08 ATAAATAAAAATATTTAAATATTGCCAAGAAAAACGCAGTGAATTCAAAACTTGTGTTAATAAATCGTTGCCTCAAGTGTTTTGGCGCAGAAAACTGTAATTTTTATTCATTTCCAGGACGCAGTCTGAAGTTCC:1 - chr2R 22860641 3' + G3 4497 1 52.59 AGATGAATTTGGCGCGCATTATGCGCTCCTGTGCTGAGTTGTTCATTGTTGGTTTTGGGTTCGGGTTCGGATTTCTTTGGTTTTGGGTCGGTTCGGTTTGGATTGGTTTAGTATATACGAAAGACTTCATAGTGCGCAGGCAGAAC:1 + chr2L 7647244 3' - Porto1 408 1 71.23 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGTGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTGCTG:1 - chr2R 21820741 3' - Doc 67 1 73.11 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTCACTTCCGAGCGCATTTGATTTTAATTTTACGCCACTAAAAGTGCTTGT:1 - chr2R 7599127 3' - diver 5928 2 56.16 ATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCCTTGTTTAAAGCCGGTGGTTTTTTTTACAGTGTTGATTAGC:1 + chr2L 21976819 3' - Idefix 23 2 44.52 ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAA:2 + chr3R 14049436 3' + transib2 2767 1 56.85 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTC:1 - chr2L 19407041 3' - Doc 65 1 63.70 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGGTGGACCATTGATGCTGCGGGAACAGGACGTTTGGGTGCTGCGGGGAGTGATCTCCGGAGGTGTGATCAACGAAAAGGAAAACACCTGTGAGCTA:1 - chr3R 14218392 3' - roo 6 2 78.91 GGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAAAGTGGGCATTTCGATAAGCCAAATTAGACGCACTGTTGATTTATTGATC:1 - chr3L 3306657 3' + R1A1-element 5086 1 64.75 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACTTGCACTTGTGA:1 - chr3L 18484372 3' + hopper 1377 1 53.60 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACCCTTGGGCTTTGGATACGGGCTAAGGATGTGGGTCTCGGTTTCGGTTT:1 + chr3L 19580973 3' - roo 73 2 69.18 TTTATTATATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACAAAAGTAATTACTTTTAATTGTTACAACGAGTTGCATTTACGTTGAAGTGATTGCGGTGTTTGTGGAAAAATATCGGCCAACGCAGAATTTAAGGGGT:1 + chr3L 26002571 3' + Tc3 285 1 70.37 TTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACACTTCGTCGAGTTTCTTTTGTGTACACATGTGCGCGGTTTATTTTTTTGTTAGTTAGA:1 - chr3R 20980762 3' + hopper 1192 1 60.69 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAACAAAAATAACTTCATTTAAAAATCGTTTATTTCCGTAATCGAAA:1 - chr2L 5792000 3' + blood 7315 2 70.55 TATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATGCATAACGATAAGTAGTTCATATACTCGTAAGCCAG:1 + chrX 20685986 3' + Ivk 5361 1 71.92 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGA:1 + chr2R 25106095 3' + roo 9003 2 80.17 CATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGGCTATATGGCAAAGGATGTGGAAAGAGGTCGGTTTGCTATTCACTTGAATTAAAATGAATTTAAGTGGTTTGCTATTGGCCAAAGTTGCTCCCATATGCAGACAGAGCCAAGAAGCA:1 - chr2R 21748181 3' + 1360 3386 2 76.71 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGAACCGATGGCAATGACCATGATGGAGCTTCCGCCCGTGCAGCAGCAGCCAATGGACGTAACTTCACAGC:1 + chr3L 363560 3' + blood 343 2 55.04 CCGCTATGATGTTTTTCCCTTTGTTAGCTTATAGTCAGTTCGTTTTGGATATTCAAAGAATAAAGATAAGTGAGTAACTTAGACTCGCAGCCATTTGAACGGAACTAGTACCAAGAGTATAGGATGAG:1 - chrX 17528741 3' + springer 7254 2 51.56 TCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGACATATATATATTTCTGAGTGGGGGGATTGTTGTGGGTAGGTCGATTTCACGCATATGTGGCCAGATTTGATTTGCACTCCCATA:1 - chrX 4022526 3' - Doc 346 1 54.79 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGCAGAAAAGTTAATTACAATATTTCATTGCTCAGACGTTGGTGGAGGGGCGGGTGCGTTGTAATTTT:1 - chr2L 12144188 3' - transib2 49 1 52.11 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATTGTTTGTACTATTTACCATTTGGCGACCCGTTATCAATTGCAGGTGCTTTCTCCT:1 + chr2R 18689240 3' - Burdock 42 2 54.47 CCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGCAGCTGGCGGGAGAACTACAATCACAATGTGCTGAAAATGTAATTTTCCCCGGCATAGCAAATGAGGCATAAGCGACGAGGG:1 + chr2R 6961729 3' + roo 8713 2 57.53 CAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATGGAAGAAGTAGACCAGGACGGCCAAGAGTTCCCGG:1 + chr2R 17466864 3' - gypsy5 410 1 69.30 AACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGCCCCGTCCAGACTTTTAGGGCTATTTTGTAAGATGTTCTGTTATGTCTG:1 - chr3R 15477768 3' + roo 8677 2 65.00 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTATATGG:1 + chr3R 13437252 3' + hopper 1361 1 58.62 TTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAAATAATTGCACGGCATGCACAGGAGGACATGTGGAGTGCTCTCTGGCTGTGTGGCTGCTGTTGGCCCAAGACTA:1 + chr3R 8222616 3' + P-element 2692 1 62.31 AAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAA:1 + chr2L 17599966 3' - 1360 450 1 65.45 GTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATACAACATATCACAAATATCACTAAAAAAAACCTTAAAACTATTTTTTTCCCGTTGGTTTGAAAACATTTATTAA:1 + chr4 540587 3' - flea 41 2 56.94 AACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTATCGCCATGGTCAGACCGACATGGCAATCCCTCTGATTTAATATATAATATATGTATATATGGTTTTATATGGTA:1 + chr3L 7939153 3' + R1A1-element 5311 1 59.68 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAACACCCGGCCCCGCCCC:1 - chr3L 3453573 3' - Tirant 8124 2 71.88 GTTACGTATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAAATTCGTACTGCCCACTT:1 - chr2R 4193271 3' - 1360 9 2 72.60 TCCTAATATATTTTTAAAGTTTATTATAGTATTTTTTTTCGTTTAGTATTATAAAATTCATAAATTTGTTGGGCCTTAAATCACCATATTTGAACGCTGCGGATACGGAAAATTAGATTTTTCCGAAACACTCGAAACCCGTCCCA:1 - chr3L 13922381 3' + hopper 170 1 87.67 TGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTTGGCAAACGATGTTGGATCCATTTGATGTTCCAGCACAGAGAACTTTGCCGATTGCACTTTGGCC:1 - chr3L 22747163 3' - FB 280 1 65.07 AAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGTTGTTTTAAGCCTAATAAAATATTCCAATATGAATCAAGTATTTTATAGAAATCTTTT:1 - chr3L 12223132 3' - Transpac 4980 2 62.33 GTGGGGGGGGGGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCCCATACATAATAA:1 + chrX 21772477 3' - accord2 218 1 68.60 GTAAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGAATTACACTAGAAAATTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAATTGTATACAAGATCGCTGAAAAGTATATAACAGGCAGAAGGGTTTCCAAGTTGCTTATCACGCTGCCTCTTGCGC:1 - chr3R 4508387 3' - Tc3 317 1 76.22 GATTTGCGGTGAGACGAAAGAAATGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTCATAATAATAAACTTCGCTGCAATACC:1 - chr3L 18374925 3' - Doc 296 1 76.80 ATATATATTTGCTTTTATTTTAATTAGCCAGCAGCCAATGTTTTAACTAACTTAAATTCATGCGATCCATGCGCATTTTTCTCTTTCTCTCTCTGTCACGCACACTAAACGGATTATTTATACTTAACCTCGCGGGGTAGATGGGG:1 - chr3R 4708278 3' - HeT-A 325 1 69.18 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTGTTTATTAAGCACTTACACTTGCGCTATGTTAATCTCC:1 - chr2L 4637215 3' + mdg1 7411 2 64.86 GCCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGGGTGTGGCG:1 - chr3R 9125611 3' - Doc 13 1 80.58 CTGCTCGAAGACGATTTTCGGGCCGGAAACAATTTTAATCTAAGAAACGAAGTTATCTAACGTTTACATATTTTAAGACATAAACTCGATTCGGAATGCCAAAGTGTGTGCTAACAATCCTCTGAGAGTGAGGGAGCTGGCTGCA:1 + chr2L 7306331 3' - 1360 3196 1 50.34 CTATCTGCTGAAACTTAAAACCCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCAATTCTAATTCGCCTGGCCAAAGCGAACTCTTGATTGAAGGTCAGCGCAG:1 - chr3R 16240903 3' + Tirant 337 2 61.87 AAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGTCCTTTATCAATCGCAACAAAATTCCCCTTCGACTACTTTTTTTGCGAGTTGTCCCAAAG:1 + chr2L 9070097 3' - 1360 3233 1 58.90 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTTATTTCCGCTGATGTGAAAATGAATTAATTGGAATATGATTGAATTTTCTCAGCGTTAAATATA:1 - chr3L 4641000 3' - jockey 65 1 56.85 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACGTTTTTGATTATCTTAAAACATTGTAATCACACGT:1 + chrX 2295290 3' - Transpac 4929 2 65.52 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCTACATTTCCATACATATATATATATTTATTTTGAGTGAGTTTGTTATATTCTGAAACAGTTTTCGCTAAACTCCCTGTTTATGGCTATAAAAAGTCCAAGTGGGCAGC:1 + chr2L 17380766 3' - hobo 12 1 77.40 GCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTGAGGTACCTCTGGGCTGCTGCTCTGGATGTTTTGT:1 + chr3R 27810096 3' - Burdock 6218 2 75.17 TAATGATAATAATAAAAAAAAATAATAATAATTATTTCACGCTGAAATAATGGCGTGGTTACTATATAACCTTTATTATCTACGGGTAATGGGTGTAAAATATATGTAACGAAAATCTTATTTTCGTTGTATTTGATCG:1 - chr3R 4693826 3' + HB 1544 1 70.50 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTGCGTGCGGT:3 - chr2L 14969096 3' - 412 7123 2 65.75 AAATCAAGAAACTGTAATTATTTACATATATGTCGTTTCTATGGGGCCACTTACTGTGCTCAAGGTCTCG:1 - chr3L 23235596 3' + HMS-Beagle2 7190 2 88.57 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAGATTTGTTTTGG:1 - chrX 6632962 3' - P-element 80 1 30.82 GACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTACCAATGCGGGCTGCACTAAGAGAAAAGTGGTAATAAGCAAACTGATAAATAGGATAAAAGACTGAATAGAAACTAATTACTCAGACTTAA:1 - chr3R 10496950 3' - GATE 64 2 65.07 GTTAGCTTTTTCAAGTTTACAGTAATTTTACTACAATTACATAACAATCACAGGATTTAAGATAAGTGTCAACTTCTGCCTAATTACTTTCAGCTCAATTCACGTGAAAGAAAACAAATAGAGCTCACGCCCGAGTTATTCAAAAA:1 + chr3L 10075026 3' - X-element 4611 1 54.11 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAAAAGCGAGATAACATATTTTCCAA:1 + chrX 14680919 3' + Juan 4171 1 47.26 TTTCAAAAGTGTGGGCGTGACCGCTTTAACGGCTTTAGGGCGTTAGAGTGACGTGGCAAAGGCCACGAAAAATCCACGAAAGGATTTTTTGTACTCGGCTAGCTTTGCCCTACTCTACGATTAA:1 + chr3R 18295928 3' - INE-1 250 1 52.42 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGATTGTTTTATATCGCTGTTTGTAATATTATGTATTTTTATTCGAGATCCTATTA:1 + chr3R 2649262 3' + 412 7478 2 64.38 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAATTACGTTTGCTATCTTCTTGACTTTGTAGTATTATGTGTGCTTTATGATTTAGCTAACAAC:1 - chrX 15116024 3' + pogo 2046 1 56.85 ATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAG:1 + chr3R 6495325 3' - copia 4879 2 65.22 ATAGGTAGGACATCCTACCGACTGCGCCAGTTAAGTCCGTGCTGATGTGTGCGAGTGTGTGTAAGAGACTGAGTGTGTTTGGCAAGTGGGCGTGGCAGACTATGGCTTTGAAAGTCATAAATTTCACAAACAAGTCTACTAAAA:1 + chr2R 16892877 3' - Tirant 426 1 70.83 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTTAATGAACTACAATATCATCGCTTTATTAAAGCAAACTGACTTAATTGTACTTACCATCCTTGAGAGAG:1 - chr2L 19691184 3' + roo 399 1 76.55 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGG:1 + chr2L 17626677 3' + roo 341 2 66.90 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTGCTGAGCGCGATGGGTCGC:1 - chr2R 21820726 3' - Doc 66 1 63.91 TCTACCGACTGCGCCAGTCAAATGTTTGCATTTTATTGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAGTTTTCACGCACGCAGCTGCATTAGCGATGGCCACGG:1 + chr3L 1573559 3' - 297 408 2 72.55 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTG:1 - chr2L 19652533 3' + roo 348 2 64.89 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGAGTTGTGGGACCGAAGTTGCGACGATGCACGCC:1 + chr2L 17260802 3' + P-element 2845 1 40.00 TGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTATCTATTAAACTCATAATGCTGCGTTTACCATTACTATCATT:1 - chr3R 7823313 3' - flea 4831 1 73.10 TTTGTTTTTTTTTAATTATTTTATAGTGATATACATTTATACTATAGTAGGTAAATGCATATAATTACTAATTATAGTACTTATTAGGCCGTGCATAGCAACTTTCGATAGATGCTGCTGGGCTGTAAAGAGCAAGATGAAAATT:1 + chr2L 11497913 3' - TART-B 10507 2 62.76 TTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGGAGTGCTTTTTTTCCTTTGATTTTTGTGTGTTT:1 - chrX 9305874 3' - P-element 89 1 24.66 CATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAAAAGGATAAGATCAATGGAATCGGGGGCTTGTTCTTAAAGCTAAAATCTTAACTAAATTATT:1 - chr2R 17276797 3' + F-element 4351 1 60.96 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATTGTATCAGGCGATGTGTTGAGCGAAAACGATCACCTAAGGC:1 - chr3L 19863955 3' - roo 75 2 71.63 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTGGCTCAAAGTCGCAGAGAACGGCTAGAGCAAGCGA:1 + chr2R 1320488 3' + Transpac 250 2 69.11 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCATTTCACGCACACCACATACAAACAAACCAAACCAGATGATA:1 + chr3L 15364933 3' + 1360 3359 1 60.00 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACAACCCGATCAATGGCGAGAAATCCCTAAGCCCCAAACAATTTACGCACATTTGCCAATTAATTATGGCACGAAATTTGATTTCGTTTTGCAATTAGAATGCA:1 - chrX 20975700 3' - copia 18 2 73.29 TGAGTATCGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCTACAATGGCTTTCTCACTTGTTTTAAATTGATTATAGCGAAATAGTGCCGGCACAGATACCCGCTGTTTGGGATTGGGGACGCAGCCATTATCATTCTAAGGCAACACACACAA:1 - chr3R 4590772 3' + INE-1 548 1 58.90 TAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAACTAGCCGGCTGGCAGATGACAAAGTTCCCAGCTTGAGATAAAACGTATTCGAATGAACAATG:1 + chr2L 5890617 3' + invader3 5446 2 69.66 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCGATAAGAGAGGATTCAATTTTAAACTTTTTATTTCCTTCTGTCATTCG:2 - chrX 388183 3' + 1360 3379 2 79.45 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTTCGGCAGGCCGCC:1 - chr3L 9212701 3' - hobo 31 1 58.89 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAA:1 - chr3R 13437150 3' - hopper 54 1 55.56 GTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTT:1 + chr2L 18112585 3' - transib2 2607 1 58.27 GGCAGACAGCCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTATTTTTGTGAACTTTTCTTTATTTTTTTCAATGGTCACAATATGTATTTTGTTTTCACTTTTTCGATGTTAAGGCCTCGTATACGCACAATTTTTATTTTGTTTTTCATTAGAG:1 + chr3L 23198571 3' + invader1 88 2 74.66 AAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCA:1 + chrX 22900312 3' + Tc1 1548 1 76.03 GCATCGGGAATATACTAGACAAGATGCAACTCTTTATCAGCTGCACAAGGAAAGTTTTGGGATAATTTGGTTTTGTTTTTGGCAAGGGTCCAGACACATGCGGCGTTGCAGGCGGCGCTGAAAC:1 + chr3R 19339229 3' + Gypsy12A_LTR 112 1 59.68 GCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTTAAATAAGTCCTAACCAAACTCGAATTCATATTTAAGTAATTCACATTTTATGTGCTGA:1 + chr3L 3498285 3' + opus 7500 2 45.89 GCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGTGATGATAACAGCGTGGATATGGATGAAGCAGGGAGGGCTCTAGAGGCTCAACTAATGAGTGACTTTGATACCAAGCCGAT:1 + chr2L 193126 3' - roo 93 2 55.48 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTTCAACTCCATTCTCCATGGTCGGCG:1 + chrX 5503720 3' - hobo 21 1 62.86 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACTTGCACTTGTG:2 - chr3L 18484373 3' + hopper2 1560 1 51.49 GAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTCACTTCCGAGCGCAT:1 - chr2R 7599161 3' - diver 74 2 66.44 AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGA:1 + chr3R 14049434 3' + transib2 2765 1 58.22 GTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTCAATTGAATAATTTATGACCACCAGAACAGCCTTCTGCTGTGTATGGCAAAGTACTGGGTCGGCTATAGGTATATTAGCCAGT:1 + chr3R 5422760 3' + roo 141 2 70.34 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGACACATATAACATGCGTATTATTCTATGCAATAATTTTGTGCTGCATACTTTTAGACACCTTACGAAGTTTTTTAAGTCTTACTCAGTTTTTTATAGCTAATCTTCTGAGAAGTGCCA:1 + chrX 18179938 3' - jockey 8 1 68.53 AATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTCCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAATAACCTTTTAAATTTGAGTACCTGAAGTGCATTTCAATATATTAGCTCGATGATAAC:1 + chr3R 14065178 3' - Idefix 7265 2 59.59 TGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATATGAACAATGTATGTACATACATATGTATTTAACCAGCTTCAAATGCTGAGCAACTAAAAGCGAGTGGTAAGAGAGTCACAATTTGAATGTGG:1 - chrX 887256 3' - Quasimodo 22 2 71.23 CTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCAGGACCATTGCAGGACGCACACGAAGTGTTTAAGGTAAGCGCCTCGAATCTTTTTTTACGATGTCTTCCATCCATGTTATATGTGTTGCTCCCTCAACTTCT:1 - chr3L 14862145 3' + Stalker4 168 6 52.74 ATAAAGATCGAGCAGTCGCGCATGCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGTAATATTATTATTTCTTTTGATATTTTGACATTTACGTGAG:1 - chr3L 588640 3' - Tabor 7027 2 71.92 GCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATACATATTTATGATACTACTACTACATTTTACATTAAAATTATTGGAGAGCGTGAAGTTTAAGTTACTATTTT:1 + chr3R 7481611 3' - invader4 52 2 55.48 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATTGTTTGTACTATTTACCATTTGGCGACCCGTTATCAATTGCAGGTGCTTTCTCCTGT:1 + chr2R 18689242 3' - Burdock 57 2 58.57 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCTTGTTTAACGCAGCTAT:1 + chr2L 20515264 3' - I-element 78 1 76.81 GGGCACAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCA:1 + chr3R 16997459 3' - G6 67 1 60.96 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGTATCTTCTATGCATGCAACAAGTGGAACCAACTGCAACTCCTAGCAGTCGTGGGTGCATGATCGACAGCACCACC:1 + chr2R 18612021 3' + P-element 2877 2 72.07 GTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATGATATTGCTGTGCTGAGCGCG:1 - chr2R 21820735 3' - Doc 78 1 74.26 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATATGTTTATGTATTTGTGCGTTGACCAGGGACATTTCCATAAATCTGCCAGGTGGTGCCACAGTCAAATAAAGCATGGTTGGCCTTAA:1 + chr3R 18635341 3' - opus 140 4 64.38 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCGGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGATTTTCAAATTCACATTACAAACAAGAAATGCTTGTTTGGGCTTTGCTGATGGGTA:1 - chr3R 4190896 3' - pogo 63 1 63.01 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGAATTTGAGGCAGTTCGTAGATTGTTTTTTATCCCATTTTTCCATTTTTGCG:1 - chrX 13996157 3' + mdg1 354 2 63.89 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATTTTCATCTAATTAAAATGCA:1 + chr3L 9470026 3' - 412 7115 2 58.90 CGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTTAATCTTTGTTTTCCTTTATTTATTTCGAACAACATAAAAGCGCTTAAAGTCTGTTTAAGTGCCCATTGCTTAGTGT:1 + chr3R 21395271 3' - G2 435 1 68.49 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAGACTTTAATAGCCACTGTTGCCAGACACTAAATAATG:1 - chr3L 465939 3' + Juan 4184 1 65.75 GTAAGTGACAAATTTATCGAAGTGACCTCTTTACCTGTCTTATGCGATATAGAGTGAAAACTCCACGACTGCTCTAAACTTTAATCTTTAAATATTTTTGTACCCTTTGAAGAACTAACCACTTAGCAAATCCCTCCTATTATTTC:1 + chr2L 16480236 3' + Ivk 486 1 61.64 AGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCCCGGTTTTGGTGTATGTCAGAAAGTAGATGTTTAGGTGTTTAATAAATTTTATAAAACATAATTTCTAGGCAGTGATTGGTGTAAGAAGTTCACCACGAGGTCTCCCATTGATTAAAGCAT:1 - chr2R 14444679 3' - accord 7030 2 67.81 TAACAATAATAATAATAATGTTAATAGATTTCACTATATAGTTTAAATAAGAAATTAAAATAAGATGCGAAATATTTTTTTATAGGAAATTGCAAACAAAACATTGAAATACCCTCATCAGGGTGTACGCTGCATTGCGATGCAAT:1 + chr4 137940 3' + mdg1 7071 2 71.92 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAAACAAGCATTAACCGTGTGCATCGTTACTTCTGTAGCTAAGTAATTTAAATAGTT:1 + chr2R 6673446 3' - BS 5080 1 63.70 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAGACTCGAATT:1 + chr3L 21013936 3' + roo 9002 2 69.29 AAAAGGCAAAGAATCTCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGTAAACGATTGGATTACCTTTTCCCTGCTCCCACTCGCCATCTCTCTCTATCAACCGCCGCCGCAAACGCAATCGCTCTCTGACATGCGCCCTC:1 - chr2R 13941201 3' + Bica 475 1 53.42 AAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAA:1 + chr2L 22684610 3' - transib3 60 1 50.34 GAAGAGAATACATCCCCATGAACTACCCCCATGAACACGTAAGATAACATAATCTCTTCACTGTACATTTGTACACATTATAATTAAGGAACAGATCCATTAGGATCCGAAATCCCAGGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCC:1 + chr3L 11816252 3' + G5A 2685 1 52.74 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTACGGCAAATAATAGAAGAGCGAATAAAAGGCAAGCCCCAGGAGTTGGGTACGTTGATGCGTTAAAT:1 - chr3L 12874823 3' - jockey 23 1 76.03 GATGTCGTATTATTTATATTTGATCGAGTCCGGTCGAATTTGGGTATAATTGTTTTCCGCAATGCCTTCGCAGTATGCTTTGATTTTAGGCCTGGATAATTTTCAGACTTGTCCGACACATCACTTTCACTCTTATCACTGCCCTT:1 + chr2R 1344989 3' - I-element 4929 1 66.44 TTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCCTTTTTGTTTTACTTTTACCCACTACTCTACGCTCATTATAC:1 - chr3R 24603081 3' - I-element 81 1 69.86 ATAATATTATTTATTAATTAATTTAATTAATAATTTCTTACCCCAGGAGTGGTTGGTAAATTGCGATAACATAGAAATGGCCTGAATGGCGTCTCACTTTAAAACACTTAACCCTTGACTTCACCCTGCTACACGAAAGCACCCTA:1 - chr2L 14873474 3' + Tc3 263 1 69.86 AGCGGGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAAAAAATACAAAGAAGGAATGCCCACCATGGCTTACAGGAAAAAATTAAATTTAAT:1 - chr3L 12918575 3' - F-element 354 1 62.33 GAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACCTTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGATTTTTGCTGCCCATATATCGCCACTTATATGGGTTTGTATGGGCGGGATTAAAAAATTACATTCATAGCTTTATGGA:1 - chr2L 8586918 3' - roo 8877 2 48.97 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACTAAAACCTCTTTCCCATATGGCAGCCAATAATTTGAACTATGGAAGTTCGACTGTATTTCCGTCGAATCGTTTTCGTTATTTTTGTTTT:1 + chr3R 19880682 3' - FB 27 1 65.47 AAACAAATAAATAAGCTGTATGAATTTGAGTGAGAAAGCTATCACTAATCAGAATCACCAAACACTCCGTCATAAGTTACCATATGCAATTTTCGTTAATATTTCGGTGAGGCTTCATCATATAATGCCACGAGTCATAAGTTTTC:1 - chr3L 14985374 3' + Bari2 926 1 52.05 AAAAACAAATGAAATTCATGAAGCTGTGGCCGCGTCAGGTTTAAAAAGAAAGCGTCAAAGAAAAGGAGACACATAAAAAAAACCAAGGAAAAGAGCGAAAAAATACGAAATCGTGACTGTCATTTCAACGAAGCGAAGTTATTTTT:1 - chrX 1104088 3' + pogo 480 1 57.53 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGG:1 + chr2L 21910223 3' - Doc 51 1 65.00 GCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATGTATATAAGATAAGCTCAATATGATATGTAAACATTAATATATATTTAAACATTTTTACAACATATCAAATGCTTCCTCCTTTAGGCT:1 - chr3L 366797 3' + blood 144 2 60.42 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTTTAAGGCCC:1 - chr3R 26486000 3' - 412 41 2 57.53 CTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCTTGAAATCCCTCGGCATAAACCCCACCAACACTC:1 + chr3L 12223248 3' + Transpac 5182 2 53.42 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTATGGAACTACTTAATGGCTAACAAACACTCG:1 - chr3R 13225443 3' - hobo 21 1 71.03 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAATGACGCAGCACATCCCCGTTTCTCTCCTGCGACCTGCTCCACC:1 + chr3L 8658845 3' - roo 8696 2 63.89 TATGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACACTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAAAATCCTAAGTAGAAAAGTTTACCCTTTTGTGTTCCTTCCTACAAG:1 - chr3R 11034511 3' - G2 2880 1 68.75 GAAGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATCCAAACGCGAAATTTCACCATTTTTCGAGTGCCGAGGGAGCTTTTTAGATTACCAAAGAGGAAGTGTGAAG:1 - chr2L 7561071 3' - INE-1 571 1 60.16 TGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATT:1 + chr3L 9470007 3' - 412 7134 2 71.23 AATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGAGTTGACTGACATATTGACACACTCGCACAAAGGGCAAATCCAATTCCATCGCAGCCAAGCAGCTCAAACCTCAGCTCTCGCCTGTGGCCGCATTGTGGTCGTTGCTG:1 - chr3R 31140902 3' + Burdock 245 2 78.77 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGATATTGCTTCACAGCTGAGGTGTCGCTGAGTTTAACTGTCTCCAAAGTTGGCTTATCTACAAAGTATAAATTTAGGA:1 + chr2L 22319386 3' + Transpac 5187 2 56.85 ACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTTCGCTTTTATTTCCCATACATAGCTACCAATTCGTTCGTTACTTGTGACTC:1 - chr2L 8880490 3' + Tirant 328 2 65.07 ATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACCCACATACACATCCAAGACCATTAGCCATTCAGCTATATCTGATTAATAATGGCATCGGCCTGTAGACGACACGCGATGACTAATTCCACAACCTATGGCACCGCTTATCA:1 + chrX 15448313 3' + Quasimodo 9 2 72.41 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACCCTTTCACTCGACAAGTAACGGGTATTACAAGATGGAAATGGGCTGTTCGATTCTTCAGCGGG:1 + chr3L 22885036 3' - P-element 40 1 53.08 GGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCATTTTC:1 + chr3L 7801332 3' - Transpac 5060 2 56.16 CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATT:1 + chr3L 18484452 3' - hopper 83 1 76.39 GTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTAGATAAAGGTAAATTAAAGGTGCAGAGTAATAAAGGTCAAGTAACTAG:1 + chr2R 17014467 3' + flea 4942 1 67.36 GGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAAAAGGAGGAAACTATTACGTTTAAAATTCAAATTTATCTAAAAGCAA:1 - chr2L 23373387 3' - Tc1-2 24 1 62.33 GTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAGGTGGCGGTGGGCAGGAAACGTTGGCTGCAACTGCAACTGAAATTGCGCAACAAGCGAAATATACAATATGCAAATTAGCCGCAAATT:1 + chr3R 6495412 3' - Stalker4 6969 4 76.22 TGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTTGTGCGAATTTTACTTTATT:1 + chr2R 11146163 3' - Quasimodo 20 2 71.92 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGAAAGACGGCAGCTTAGGACCACCCAAAGAGGTCACTCCTCATCGGTGGCCATTATGAC:1 - chr2R 9340120 3' - 412 7116 2 59.59 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGC:1 - chr2L 14239157 3' - 412 7133 2 70.55 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGGGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTATATGGTCGTCTGCGGATGTGGATGCTGCT:1 + chr3R 13437276 3' + hopper 1398 1 69.70 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATTGTAAGTTTTACTTAATGCAACAACCCATGTTTTAAG:1 + chr2R 21870280 3' + copia 211 2 50.34 AAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTCCAAAAAATGTTGCACTCCTGTTCGTTCAGCCGTGTTGGTGTGTGTGTGTGCT:1 - chr2L 20947898 3' - 297 260 2 63.45 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAAATGAAAAAACTTTTCCCAACTGCCAAAGTTCGGCCAGTCAACAGTTTAAAATCGATGCTGGCTTATTTGT:1 + chr2R 12202362 3' - Tirant 8149 2 56.43 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCA:1 + chr3L 18183165 3' - Tirant 8153 2 76.64 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAACGGTGAAAACTAGTACATGCACACAATTTTGATGAATGATTGTTGA:1 + chr3R 12363848 3' - jockey 4699 1 67.12 AGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCTATCTTTTCATGGGAGGTTGGCATTAACGAAAGCAGCAGCAGTAATACTTGCAAACAAACTTGAGGATCGGTTCCCAAGCCTCCATTTCCCCTCGTCCCTGCC:1 - chr3L 5853272 3' + Ivk 254 1 77.40 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCGCGACTCACATCTTTGCGAGAGAGTTTGTTTATGCGCCGTTTGTCCAACATAATTTTTGTTTGTTAGTT:1 - chrX 7706718 3' + P-element 2872 1 66.13 AACCACTCTGGAAAATAAATTCCGTTTATACAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGGTATACAGCTTTGGAAGATTCTACAACGCTACCAATTAAAAAATATTACGCGAATGTTGAAAATGTCAAGTACTACAAGTATAG:1 - chr3L 23686151 3' + G4 3377 1 74.66 CGAGAGCTTCAAGCTTAACAAAACAAAAAACAACTCCTACCTCTCACCCACATATCAAACCACACAAACAATTATCAAAGCATACAGATACAGATACATTCTCATCCCAATCTCACAGAGCCACGCATGACTATAAAGTATATTT:1 + chr3L 19019512 3' + Porto1 241 1 59.31 GCAGTTCTGTTTGGTGTTGTTTCTGTATGCACATAAACTGCTCTGTGCACCCACTCCCTCGCTCTCCTACACAACATCTACAGCTTTAAACTTAAATGCATAACTAATCGAGGGTATGTTTTCTTGAATCGAGAGAGGATTTTCTT:1 - chr3L 5744648 3' + Cr1a 242 1 62.33 CCACGCACTGTAGTTTTCACCATCAAGTTTTTCTAATTGGTTTATTGATGAATATGATCACTTAACAATAATATTCGTATCATATCGTAGCAATAGCCAGCTTACCATTTAATGCGCACAATCTGAATAAACACTTGGTCCTCG:1 - chrX 19087047 3' - Dm88 352 1 64.58 GATGTGGATGTAAGAGCAAGTGAACATAACACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACAGTAACGACCTTACGACTTATACTTGGCTAAAATGTGAGCCGATCCGATTTTCAGCCGACACATAAG:1 - chr2R 15032234 3' + I-element 445 1 57.48 GGCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTCCTCCCCGCGTTAGGTTAAAGTCGTCCTCGGCTTTTGTGTTGTACACTCCATCGATTTGCATCTCTCGGGTTTCCTACGGCTTTTGTCAAC:1 + chr2L 17493157 3' - gypsy4 6604 2 62.33 TATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGTATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATGCAACACTTTGCCCGACTC:1 + chr3R 22341223 3' + hopper 1343 1 63.70 GCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCCGCCATCTCAAACTCCTCACAAGTGTCAAATTGGCATTGAATCAT:1 - chr2R 23212608 3' - Tirant 51 2 61.48 TGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAG:1 - chr3L 7791898 3' + Transpac 264 2 56.91 AGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAGTAGCGAATTCGGCAGCGGGGGACCTGGAACCTCCTAATAATGCAATTTTAATGTAACACAAACAATTTCTGTAACCTCTATTGCTTTACATTTTTAACTAAACGGTTTATATTTATATTAT:1 + chrX 21038188 3' - Quasimodo 213 2 71.23 GTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACACTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTATATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTCA:1 + chrX 22576478 3' - Burdock 185 2 49.61 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATAAACTGTGCCCTGTCAAATATTTATGGGTTAAGGTGTTCAAACGCTTATCAGGGTAGCGTTAAGAGCCATTTGAATACATTTATTGAATGGAAAGCCTATAAAGTTGATTTA:1 - chr3L 12835942 3' - 1360 10 2 77.40 GGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCAACTCTTCGCATTCTAGGATTCTTTCTGTGAATTCACATGCTGATGAAATTGTAATATATTCACAATCCTGTCGGGGATTTGGACACGGACCAACCGGAGTACACCAAGAGATGT:1 - chr3L 20472681 3' + invader4 2746 1 60.71 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCTGGCAACAGTTTAACAAGCTTTTTAAAACTACAGGAAGCGCTGGAAAAGGTCTGAAAAAATATCGAAAAAATATTCAAC:1 - chr3R 7585709 3' - Doc 51 1 55.48 ACGAATTTACATAGTACATATTAGGGTAGTTTATGCCAATTTCCTAACAATATTATAAAATAAACAAATTTTTAAAAATTCGCGCCTGGAACCCCAGGGGGAGTCCCATTGAGGCGCAGGTGTAATAATGCCAGCTGCCACAGAG:1 + chr3L 12016190 3' - 1360 3150 1 59.31 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCATTTATTTTTAATTTATCTTTTTTGTCAAGGCAAGTGTCT:1 + chr3L 18253929 3' + blood 7371 2 69.86 GTTTTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTAAGATGTCAAAATTTGCAGTTGCTGGCGTTGTCTTGTGACTGACAAAGATAATATTTTCCAAATTGTGTTATTTCACATGGTTTGTTATTTTGCACCAATTAAAAAAAAAAATTTA:1 - chr2L 11233023 3' - F-element 4329 1 56.85 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACTCGCTGCGTATACGTAATTTTTATTGGACACTCTCACGCG:1 - chr3R 20450379 3' - hobo 15 1 73.33 AAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTGGACACAAATGG:1 - chr3R 460072 3' - F-element 133 1 52.74 TTTAATGTATTTATATTTATTTATAAACGGGATAAGTGCATTAATTAATGCATGCAAATTAACACGATCACGTCGTATAGAGCATCAAGAGTTGCCATATATCATCACAGCTCATCTAGCCCCAAAGAATCAGGCTACAACTCGGG:1 - chr3L 18211730 3' - diver2 449 1 51.37 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTGCTGAGCGCGATGGGTCGCTTGGACTCATCGCTCGATC:2 - chr2R 21820707 3' - Doc 60 1 54.11 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCATTGTATCAGTGTGACAATGGCAAATA:2 - chr3R 28450650 3' + roo 352 2 58.22 CCTTACCAAACCGTATGTTCGGAGTAATTAAAAACAATACTAAATAATGCTAAAACAGTGCCTTTTATTATTTAAACTATCCACTGAAGATCTCGTGATCCGTGTGTGAACTACGGGCTTTGGGTCTGGGCTGGTTCAAAGTGAA:1 - chr3R 16126312 3' + Tc3 1386 1 55.86 GGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAAACAATCGACT:1 - chrX 21087541 3' - mdg3 5283 2 61.64 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATGGTAGGCTTAATGGACGATTGTGTGAGTGCGAGTCTTCGGCAGCGCAGAGAGTT:1 - chr3L 9469151 3' + hopper 1369 1 54.84 CAGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCAAATGGCCCA:1 + chr3L 18183227 3' - Tirant 8119 2 76.30 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAATTAATCAACAATATTGACTTAAAGCTGTCAACTGAATTAAATTAAACTG:1 + chr3L 11396005 3' - I-element 68 1 64.83 AATGCAGTAATAGTAACATAACAGCGCAATTACCAAGTAAATGATAAAACCAAACCTCGCACTAAGCACGTGAGGACTTACAATAGTAAATTCGGCTAAATTTTATCCTTTTTTTTTCGTTTGTTCGATAACTAGAAATGGTGGTA:1 + chrX 22801316 3' - BS 5053 1 67.12 GAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGCCACACGCAAAAC:1 - chr3L 13952776 3' - I-element 5144 1 54.84 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGA:1 + chr2R 9871071 3' - roo 8731 2 64.38 ATTGATCCTGATCAAGAATGTATATATGTTTATATGTATAGTATACCCTATTAATTTACGAGTAACGGGTATAACAATCCGAGTCGAAATCATAATTTTTATAAAATAAGTTTAATTCCTGATTCGCAACATAGACTTTAGATTTT:1 - chrX 15903124 3' - INE-1 83 1 71.92 CACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGAATGGGTGGGGTTTTGTTTCGCTTGATTTGGATTAGTTTTCGCTTGGATGCTCAACGCAT:1 + chr3L 10733274 3' - BS 4837 1 61.64 TATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGATCTCTCGCTCTCAAACAAGAATTCGAGAGAACCCCAGAGACTAGTGTAATTGGAGCAATAGAGATAGCATTATTGAAAGCCTTTAAATTAATTATTAACTTTTCAGA:1 + chr3L 26010652 3' - 1360 136 1 54.79 TAGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGGTCATCTTCAAACTTTTTTGATTTAGTTGCTGGCGCTTTGCTTTTATCCGCCACCCTGACCACCACCG:1 + chr2R 19343975 3' - G4 3405 1 83.80 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGCAACCTGCTCCATCGCAGAT:1 + chr2R 14973724 3' - FB 36 1 60.27 ACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCGCTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAAGTTCCGTGTACCACGGGGTGTATGCGCAATAAATTATTACATTTTAGGCTAACCCAG:1 - chr3R 7235186 3' - Burdock 6206 2 59.59 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGAAATCGACTATTGATGGTGTTTTCAGATGGTGTTTTCAA:1 + chr2R 4536701 3' + mdg1 7405 2 52.05 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACGTTTTTGATTAT:1 + chrX 2295267 3' - Transpac 34 2 50.68 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAAAACGCCTCC:1 - chr3R 20934678 3' - 412 68 2 63.01 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTAT:1 + chr3L 18253873 3' + blood 304 2 69.86 GGTATGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCATATCGTTAGTCGAATAATAAAAAAAACAATAGACAACATTGCGGTTGAGCCTCCCGACAACCACGACTTTACTAGTCTAGTCGGGTTGTTATGAAGAAATTTCCAATTTCGT:1 + chr2R 4481189 3' + Rt1b 5103 1 60.96 AGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAAGACATCTCCAATTTACATATCAAAACTTCAAACTATTTACATTTTCCATGACTTTATAGAAAGCGCAGTATTACTTTGCGAGGCGTTTTAAAGTC:1 + chr3R 7476185 3' - invader4 2630 1 73.29 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGGCGAAACATTCAAATTGATGTGACCCCAAGATGAGGAGGGAGGCAGGTGCTCATCTCCATTTGAGCGAGGAGAAGAACCGCAAGTAGTGATGCATTGGGGTCAGG:1 + chr2L 1807107 3' - roo 10 2 75.71 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTAAATGGAAGTTCAGCTTTCAGCTTGCCATTTGGGAAAAGCCACCACTGGCACCACCCCAAGAGTAAGAAATCCCGACACCTGAGCTTATTGATTTGTCGCTG:1 + chr2R 19852289 3' + Transpac 294 2 72.60 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGAACCGATGGCAATAACCATGATGGAGCTTCTGCCCGTGCAGCA:1 + chr3L 363534 3' + blood 7340 1 63.56 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGTTTACGCCCTCAATCAGCTGTTGTTTTTTCCGCCCTGTCAGTTGCATTCGGATCTGCCTCATTGCCGCATTGATGCAGTTGCACTCAG:1 + chr3L 16759428 3' - jockey 4831 1 60.27 AACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTAAACTCGATAAATATAACATTCTCTCTTGTCGATTTTGTAATTAAGGCAGAAATCCTATGTGAGCCAGAATGCTTTCGACATACTTTGAAAACATTGTT:1 + chrX 22784093 3' + INE-1 553 1 88.80 AGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATTGTATATTTTTGCAAAATTTATGTTTTAAATTACAGTAGTCATAATAATTTCCTTTATATTTTGTCGTTTTGTTGCAATAGTAAAGTACGGATATGGACCAAATAGTTTCGACTAATTTC:1 + chr3R 8555325 3' + 1360 235 1 66.21 AGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTCACTGAAATGGAATCTAATTGGTGTTGTTTTAGTTGTGTTCTCCAGCAAAACATCCAGATATA:1 - chr3L 21666405 3' + 1360 3312 1 56.85 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATTTTTGGCGAAAATAGTTCTCAATTGTTTTGA:1 - chr2L 17839352 3' - blood 33 2 61.43 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCATACTACTAACTAATGCTACATGACCCC:2 - chrX 1103570 3' - pogo 19 1 71.23 TCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCA:1 - chr3R 4679457 3' + hopper2 1540 1 62.33 GTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTATAAATAGCATTCCCTAAACGTATTTAATTTTCTTAAAATTGTCTTCAAGAACAT:1 - chr3R 7505677 3' + Doc 232 1 55.65 GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTGTTTATAAATAGGTACAACTGTACCCTAAACAAACAGAAGGGTT:1 + chr2L 19160464 3' - 3S18 5805 2 58.90 TGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCACTCTTGTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCTCTCTACTCTCTTAAATTGCACCAAATAGTCGACTTTCAAAAACTATTTTCAAAAACATTAAAGAG:1 - chr3R 18346578 3' + INE-1 563 1 63.01 CAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTC:1 - chr2R 6798229 3' - jockey 77 1 65.07 CGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATACATTTTTTCAAAATTCTAAAGGATGGGCAAACGATGTTATTGCGATTAAAAAAAAAAATTTAAATTTTTTTTCGGATAGTCCGAGAAGTTGACCTGAATTGAGGAAAT:1 + chr2R 18119957 3' - FB 271 1 75.34 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCGAAGTTGCGACG:1 + chr2L 17260793 3' + P-element 2826 1 34.40 AACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTATTTATTGCCATTTATGTAATATTTTATTTAGCTCAAGAAATGCTTGTTTAGAAA:1 + chr3R 16835654 3' - 1360 3218 1 63.01 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATAT:1 - chr2L 17295842 3' - Doc 70 1 61.64 ATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCTAAAGCACCTCCCACGGTCGTGCTGGCTTGTT:1 + chr2L 16073594 3' - F-element 116 1 71.70 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGCATTTCTAAGCAGATAA:1 - chr2R 7982401 3' - P-element 103 1 15.75 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACTTTCTGTTTGTCTTTGCCGGTTGGGAGGGTGCAACAAAAAATTGTTGGCCAAAG:1 - chr3L 7469091 3' + 412 411 2 54.84 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTGAGTGAAAGTTTCTAATACTGCTAGAAATGTATATTTATAGAAGGAACCTCTTTTTTTCTGGCAGTGCAGCTACCCTTGGCC:1 - chr3L 1358414 3' + 412 455 2 59.59 GCAGCGAGCGCCGAGAACCCTTACGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATATATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAGCTCCAAGCTACTATTACTTTTGTGTTAGTG:1 + chr2L 16562185 3' + opus 473 2 51.37 GGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTATCTGATTTGCTGGATATTCCATTACCTGTTAACTCGATTGCAGCGGCATTTAGCAGTTGTGGAACCACTTTTCGACG:1 - chr2L 7580192 3' + BS 5024 1 54.79 GACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATGAAAGTAATGAGGGGCAGAC:1 - chr3R 14049287 3' - transib2 17 1 73.97 ATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATATAACTAGTACAATAAATGTTACTAAGACCCTGCGA:1 - chrX 368742 3' + mdg3 5229 1 74.66 CCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAAACTTTTCCCTGTGCTGTGAAGTGCATTTAAGCTT:1 + chr3R 8539328 3' - F-element 4338 1 76.03 GACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGACTGACAGCCGCCGATAGGGGGGGGTTAACTTTTAATAAAGTCG:1 - chr2L 3743030 3' + blood 7235 2 66.14 ACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAACAACAAAAACGAGGCCCCAATTAGGGCCCAAATTAGGTGTTTTTCTCGAGGCTGAGGCTTA:1 + chr3R 10040393 3' + BS 5061 1 60.17 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTATGAAGCCAACGAAGTGGAAATTACCTTGTAAAATTTAAAAAAATCAAAATCAATATGGAAACGATTTAACTAATTTAATAATCCTTCTGTCATATGTGTT:1 - chr3L 2320569 3' - roo 8684 2 67.12 AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGA:1 + chr3L 21093202 3' - Ivk 55 1 75.93 AGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTCTAGAACACCAAATTGAGGCCAGCGGCGAG:1 + chr3R 27137834 3' - Tirant 8358 2 77.61 GAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACATGTCAATGGATATCTTAAATGAATCGTAGACAAATATTGATGCCAGAAGATC:1 + chr3L 15721870 3' + micropia 4966 2 62.96 GAATGTACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTATCTAAGCCAAGTTTGTTATGTGGGTCGAAATGCTGCG:1 + chr3R 25804193 3' + mdg1 339 2 71.92 AATGTGAAAAAAAAAGCTATTTCACAAGAATGTGAAAAAATGCTATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTATATTCCGTAAGACAATTTTTCTATTAATATTACAAATTCAAATTGCACATCGACATTTCCCTAACGCTTTACCC:1 + chr2L 16351291 3' - copia 372 1 55.48 ACGGTTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGGTTTCTCTCTGATTCGTGGTAAAATACATTGTGTTCTCTTTTGTTTTTGCGTAGCACCAGCGATTTTTAAGTAATTTTTTAAGTAATAAAAAATGTAATGTATTTCTAATTA:1 - chrX 21315334 3' + INE-1 554 1 73.29 AGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGATGTAATTGCCAAACATTTGAA:1 - chr3R 11151773 3' + mdg3 218 2 66.44 TAAGTATAACGCTTATCGAGCGAGTCAAAAATTTCAAAAATTTTTATTACACTACCTATGCAAAGAGTATTGATGACAAAAATACATGAGAAATACATAACCTCTTATGACCTCCGTTGGCCTTCAGTGCTCCTGCTGCATTTGCA:1 + chr2R 10383915 3' + Burdock 477 1 76.03 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACA:1 - chr3L 7837196 3' - jockey 4832 1 73.17 TCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTAGAAGTAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGTACTATAGTTGTTTTCTGTTAAAGCCAATTTTGATCAGATTAAAAAT:1 + chr2R 5863250 3' + F-element 254 1 45.89 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAA:1 - chr3R 26486024 3' - 412 7118 2 59.59 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCGACTAATTAACTATTAG:1 - chr2L 2494825 3' - Doc 65 1 59.59 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTATTGAGGTGTCTTATCTAATATTTAGAAAGAAATATATCCTTTCACAGGGTATACGAAAT:1 - chr3L 785832 3' - I-element 11 1 75.34 AATAATTATTAATAATAATATCTTTAATAATACCTTTTACATATCGGTTTAAAATATTTCTTGCAGTGCATACACCCCAAAGACTTGCCACCGAGCATCGAACACGTCAATTGGCCGCGAAATTAACGCATTTCGCGCTTTCGTTT:1 + chr2R 11534990 3' + gypsy9 5311 2 59.59 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGA:1 + chr2L 21910256 3' - Doc 44 1 54.11 GAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGTTGTGATGGGCGATGGGTGGTATCTGGTGGGTGGTGGAGACTAGGAACTTTGGTGTG:1 - chr3R 13091403 3' - Doc 4486 1 52.89 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTTAATGAACTACAATATCATCGCTTTAT:2 - chr2L 19691226 3' + roo 9020 2 53.42 TCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTT:1 - chr2L 13629087 3' - Tirant 58 2 67.80 TTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGATGTTAATAAAACATTCGATTTTTAGTCTACTCGAATCAAAACTAAAGGTCTACA:1 + chr2L 8251007 3' - F-element 279 1 61.43 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGACTTAATGCTGAAAATATTGGTAGCTCTAAAGTATCCAAATTTCTTTAAAGTATTCAAATGTATAAATGAACTGTAACATCTTTGGTCATTTTACAT:1 + chr3L 21665361 3' - 1360 23 1 70.55 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCGGGTACATTTGCGTGTATTTGGGTATCAGC:1 - chr3R 25049980 3' + P-element 2849 1 55.30 GGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGAGTTATTTATACAGAAAACATGC:1 + chr3L 21093210 3' - Ivk 64 1 69.60 ACGACAGTATCGCAAGACGCTGCGATCAATCGTTAAATAATTTACACACAAAAGTGCACCGAAATTAGTTAAACTGTTTTTTGAGTTCACGATAAAGAAATGTTACCGAACGTCAGGGTCACCAAATGTTGAGGCAATGAGCTTTT:1 + chr3L 25996040 3' + Gypsy6A_LTR 379 1 78.77 AATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAACTGGGTGGGGGGTAGAAGGCGCGGCAAACCTTTCAACTCGAATTATGCACAA:1 - chr2R 17083277 3' - hobo 2619 1 64.38 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTAATTCTTCAGATATCAAATCGATAGAAATTTACAAAACTAATTAGATGCTTGTACCCATTCTCAAAGCTACCATTGGAACTTACCATTATATTCAGAAGCGCAATTTG:1 - chr3R 26818306 3' - roo 8676 2 54.79 ACGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTGGCCCAAACGGGATGGCGGAAAAGG:1 + chr2L 12291985 3' - Tirant 12 2 77.86 GGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCTCCCCCCCCTAGTGTGGAGAGATGGCCATAACGAAGGGATAGCTGCCCACAAGTTGATTCTCTTCCTTAATGC:1 - chrX 10850067 3' - accord 21 2 72.65 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCATAAAACATTTGATGGTATTAACAATGTACTCCTAGACTATATGATGGTGTAAAGTGTAAAAAGTCACGATTTTCTTCGATCTCATCAATGTTAATGAATTAAAAAGCCTTTTAATC:1 - chr2L 7652132 3' - roo 2 2 77.40 CGCTAAGGGAGGCTATATTTTTTATTAATTTATCATAATTTTGTAGTTGACTTTTTTTTCAATTTATAACATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTGCTAATTTTTGTCTATCAACTTTTGCTTTCATTTTGTGGCGAA:1 - chr3L 14004341 3' + Tc1-2 1351 1 76.03 CCACTCTAACGCCCACAAAGAGCTCAAAACTTTTAAAAAGTCTTTTGATATTTGCTTGCAATTTCTTAAAATGAAAAATGTTAAATACTCCTGAGAAGATGGTATTGATATACGAAGACCATAGCCTTGTC:1 - chr2L 18612553 3' + INE-1 220 1 84.73 TAGTGAAGCATGTATACGAAGTTATGTATGTTATTATGTTCTGTTCTAATAAAGCATTCATTCGGCGCACATTTTCCCCAGCGGAAGTTACCCCTCGTTACTCTTTCGCAGCTCTCCACCGGCAACCC:1 + chr2L 6620990 3' - frogger 2372 2 52.34 ATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTGCCCAGAAATAAAGACGGAAAAAGGGAGTCA:1 - chr3R 31887286 3' + HB 1555 1 51.37 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTACGGCAAATAATAGAAGAGCGAATAAAAGGCAAGCCCCAGG:1 - chr3L 12874848 3' - jockey 17 1 74.78 ACGGGTATTTGATAGTCGGGCATAGCATTCTCTCTTGTTTCTTGATTACACGTAACGGCAGCATATTCGTGCATGTATTTAGTTATGTGTGAGAGAATCTGGCGCTTCCTCCAAACAATGATTTTTCAGAACATTTTT:1 - chr2R 25196942 3' + INE-1 554 1 69.57 AACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCTACTCGAACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTATTGTGACCTTTTTTATAAAATGTTTTTTATATATGTATGTAAGTTATTATCTTGGGGCATTATATGAGTTGGTCTATAGTTGACTG:1 - chrX 23064212 3' + INE-1 553 1 56.16 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGTCGCCTGTCTAGCTGCACGACGATGCGTCGCGACGTTGTCGCCGAGTGTCGTTCGAGGTAATTGCGGGGCAGTTAGAAAAACGAGCA:1 - chr3L 26057844 3' - P-element 23 1 67.16 ATGTAAGAGGCAGAAGGAAACGTTTCCGACTGTATAAAGTATGCGGAGGCTGGGGCGCCCACGGCGGCGG:1 + chr2L 113102 3' + INE-1 30 1 60.00 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTAGTATCTTATCGTGCATAGGTAATTAAATACCTTCTTTCAAGGTATTTATTTTGAAAGCAAAGAAAACATTATGAAG:1 - chr2L 23068790 3' + 1360 3379 2 76.71 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAATCCAAACATACAAACATACAAACTTGAATTTTATTTGGTACATTAGCTGTCTATAATATTTAACCAAAGAAAACTGCAGTGAAATATAG:1 + chr2R 19270521 3' - F-element 45 1 43.84 GACCATTTGAAGATATTAATTTTACTTAACTTAGTTAACTGATTAGTTAATTAATAACTTTGTATACAAAGTAAATACCTTCTACTTTAAATTATTTAAATCAAATGGAATGCGAGGCATTTGTCTGGGAAAAGCGGTGCTGGAAA:1 + chr2R 12016689 3' - Transib5 349 1 71.92 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGGGAGAACTAAATAAAGCGATCCATCGAAAGCTTT:1 + chr3L 2192327 3' - jockey 4745 1 75.78 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGATTTATGGCACAAAATATATATCAAAGTTTCTGCGTTTAAGCATGTCGCCATATCAAAGAAGAGTCTTGTAAGAAATGTTGAATTTTTTCAGCGCCTGCATATG:2 + chr3R 20203966 3' - 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chr2R 6799139 3' - jockey 4782 1 56.12 GAAGCCCCTTTTTGTACTTCTTACGGATTTTTCTCATATTGTTACACCCATATTCGTATACTTTTTCGATTTCAACTCTTTTGCCCGCAATCCCCAATCGACCATTTGCTTTCGGTTTTTGATATACCAGTGCGTAGGGGTCATAA:1 - chr3L 4601291 3' - X-element 4674 1 65.07 AAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATTTACTTTGCCATTCCCCCAGTTATTTTCCAGGCGTGTCCTTCGCCACTGGTACCATAAAAAAGAGCCCTGGTAATAATATTTCCT:1 - chr3R 11540111 3' + hopper 340 1 60.71 ACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGTAAGATGTTAGCTTCTTGCA:1 - chr2R 5582119 3' - Cr1a 438 1 79.45 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTACGGCAAATAATAGAAGAGCGAATAAAAGGCAAGCCCCAGGAGTTGGGTACGTTGATGCGTTAA:1 - chr3L 12874825 3' - jockey 25 1 74.66 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTAGTCACTCTGCATTTGAATGTCTGAATGCCGCAAAACGTTGCTCGGCAAACCGACATAAATACAAA:1 - chr3L 7460608 3' - 412 7108 2 56.16 CTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAAC:1 + chr3L 3453676 3' + Tirant 311 2 79.45 TCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTTACCGGTTAAACGCCAAGGTCGCAGATTGTTGGCCAACT:1 - 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chr2R 10910233 3' + Tabor 399 2 76.03 AAATAACGTAAAGAAATGAAGTTATTTTCTATCAACTATATTACCATTATAAAATAAAAATTACTTAAATATTATTTTTAATGAATTAACATTATTTACGCCAAGTGATCGCTTCCTAGTGCTCCAATGCGCTGACGTCACACTGC:1 - chr3R 14017048 3' - blood 6974 1 67.12 TTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAACGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAA:1 + chr2L 23034082 3' + FB 386 1 42.47 GGATATTGATCCTGATCAAGAATATATACCTCATATGGACGGAAACGATTCCTTCTACCTGTTATATACAACGTAGAAGGATATGTATATGTAGAAGGATGTATATACTTTACAACGAATCTATAAAAGACAAAAAACAGACAAAA:1 + chr2L 21371884 3' - INE-1 87 1 71.23 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTA:1 + chrX 4673673 3' - roo 8718 2 75.23 ATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATTTCACGGTGAGCTTGATATGCCTAGTAACTAATAATATAAATACTAAACTAAAATCTT:1 - chr2R 16224718 3' + hopper 1088 1 60.27 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTT:1 + chr3R 11095872 3' - hopper 39 1 57.80 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAATAAACGCTTCTATTGTAGTTAGTAACTTCAGCCTTCTTGGTATTGATATATGAGATCATAAGGATAGGATCGATCGCTAAGCTCATCCATGCTTACATATATATATTCTGCACAT:1 + chr3R 18153711 3' + copia 250 1 81.51 AGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACTAAAATAAATGGTAAAAAGTCACAGATTATAATCAAAAAAGTGTACTGATTATTGTATCAAATAGTACGTGGTCAATACGACAACATGCTATTTTCTCAGTGCAGATTGCTG:1 + chr3R 12744788 3' - Stalker2 7259 2 64.38 GCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAAAA:1 + chr2R 10160610 3' - hobo 58 1 57.86 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTAATACGGTAACTCCAGGAAAACAGCAAAACGGCAAGCTGCGATCAGTTTTGATTCTTACTTCGCAGCGAGAAGTTGTGATTTTCTCGAT:2 - chr2L 8984826 3' - pogo 28 1 66.44 CTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAGCTCCACAAGATGTTACTAGACATCCATGTCTCTGCTCACCCTCATTGAGTGGCGCA:1 - chr3L 8848784 3' + I-element 5292 1 60.96 ATAACACGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAATGGCGCAGTCGGTAGAATATATATAAAAAATTGTGCGAGTTGTTTAAAAATATCAATCTAGTGACAAAAGATCCTTGTTATCCCAGTTATC:1 + chr2R 2144584 3' - F-element 4600 1 65.07 AATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTT:1 - chr3R 7470981 3' - Doc 128 1 80.14 TTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAACTCAGGCAAGTTCATTAACTTTTGAATTGTGCGCGGGGGCAACAATTTGT:1 + chr3L 21887471 3' + roo 348 2 57.24 ACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCAC:2 - chr3L 18484401 3' + hopper2 1520 1 74.66 TAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCTTTTCGCTGCCCCTTATTTGCGTTTTACCGGAGTTGCAATGACGTACG:1 - chr2R 18689114 3' + Burdock 222 2 63.01 GTACATGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGCTCTAGCTCATGGCATTGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTGCAGATATATTTTCCTTACATACAATAATGAATGACTAGAATAGTATGATGTTAGGCTGACTTTGATCTGTTGAT:1 - chr2R 5434568 3' - gypsy12 10154 2 69.23 GAGGGATGGGCATGAGTTTAATATATGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAAAGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTAGTGGGTTATTTTTGTGTGTGTCTGGTCGGTCGGTCGCCGCTCGAAATA:1 - chr3R 20265216 3' - I-element 5048 1 77.86 TATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTATATATACGCATCTGATTACTCCAAATTGCAATAACATGTGAATGATTACATATGAGCACCTTTCAC:1 + chr2L 19310436 3' + Juan 4196 1 70.34 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGTCAGAGAACGCAGACAACACATCGCACATATTAAGACAGATTTTGGCCTTAGGCAGCCATCTCAGCTGGCCTGACCAGCA:1 + chr3L 5069523 3' - opus 36 4 60.96 CAGAGTTCAGTTTAAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGTTTTGTATTCATTTAGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCATTGAATACATAAATCTTTACGTGCTTGTTTCAAAATACTCAATGT:1 - chr2L 3694378 3' + Idefix 7289 2 69.18 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTAACG:1 - chr3L 23146438 3' - 1360 28 1 66.44 GCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAATGCCTGATTCTTAATTTAAAACACTATAAATCAACACTACTCTCACATATGAATTTCTCATGTGTGGTAACC:1 + chr3L 22759298 3' + 412 294 2 51.37 CCTCAAGACTTGACTGACCGGGACTTGACATAAATCCTACTAAATTAAAATCTGCATAAACATTCTATTCCTCAAAAACTCTTACTCATATAACCTTTTTTAAATAGTCATACACGTAACAAAAAATTACACAGACTTCCCTGAGG:1 + chr2R 8436664 3' + jockey2 3189 1 69.86 CGGACTCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAATAAAGACAGTTCATTAAGTCTCGCCTGGCAAGTTGATGGGCTGCACATGGATATAAATGTATGTATCTGTGTAGATCCTGCCTCT:1 + chr2L 5490477 3' + Idefix 265 2 58.22 GTATTTAGGTTTTTAGAAATTCATATTTTCAGTATTCAATGTTGCTTAAAAATTAATAACAATGTTGGCAGTTGCTGATGACGGTGCTGCTGTCGCTCTTCCAGGTGCCCAACACCTTCC:1 + chr3R 16166748 3' - gypsy12 9815 2 55.00 GTTTACCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGGCTCCGCAGTCCAAAACGCAGAGCTCAGGACTGTGTCCCTCCATGTCCCGCGCTGCTGGACTGTCCCACCGACACGTCCTGCTAATCT:1 + chr3R 17733401 3' - INE-1 556 1 64.80 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGGTCGATAAACCAAAAAGCAAACACTTTTATGGTTTGTTTGGT:1 + chr3L 2425999 3' + hopper 1404 2 73.95 CAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTAGGCAAAGAATGGAAAGTGAAATATTACTGGAAACTGATTGAACCCTCCTCAGACATTGACCA:1 - chr2R 10160865 3' + transib2 2768 1 56.16 GACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCACATATCAAACTACAGAAACAATTATCAAAGCTTACATGTTAATTATCGAAAAACCCCACACGAAATATGAACAAG:1 + chr2L 19548794 3' + Porto1 223 1 73.29 CTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATTTAATTACATATTAAACAAATTGTTGAAGTTAGGTAAGTACAACATTTAT:1 - chr2L 22315516 3' - frogger 25 2 56.16 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGAAAATACGTTTGAAGATTTGTTTCCAGTGCATGGCCGCAGGCCTAGCGAAATGTCTTCGATTTC:1 + chr3R 28117110 3' - hobo 19 1 71.22 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGG:2 - chr3R 14049322 3' - transib2 52 1 53.42 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAGTAGAAGAAGCAGCGCTGGCAGCGACGCCGACTGCGCTGCCTTGGCGCTCGG:1 + chr3R 31724942 3' - P-element 48 1 44.72 GTCTAAGGTCGTTACAATAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTCTTACATCTACATCTGCAATTTTTGTTACTTCTAGGAGTTTTTCGAAACATGCTGAAAATTCTTACATAAGCACGAAGAGAAGA:1 - chrX 3726523 3' - I-element 499 1 71.92 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTAATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGAAACAAACGTGAATCACATCTAACGCTGGACGCGAAATAGTTCATTGTG:1 + chr2L 23049748 3' + opus 473 2 65.04 AGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACAGAGAGGAAGCGAACGAACAAATGAGTTGTGTATTAGAGGAACAGGACGT:1 + chr2L 22690051 3' - Tabor 6889 2 51.72 TAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTGAGGTACCTCTGGGCTGCTGCTCTGGATGTTTTGTAGCCCAGTG:1 + chr3R 27810105 3' - Burdock 59 2 65.65 TGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGG:1 + chr2L 1361029 3' - Stalker2 7309 2 58.22 CCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGACACATTTTATTGCATGCAGTCGTCGTCAGTGGCCTG:1 + chr2L 14965809 3' - 412 7145 2 76.09 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAATATCACTTTAAGGTGATTCCCAGCGCATATTATGACGGAGATAAACATCGCT:1 - chr2R 25106039 3' - roo 8732 2 65.07 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTATAGTCAAGAGGTGGCTGGCGAAAAAACAAAGAAAAAAAAACTGTATTCTTAGTGCTCGACGTCGGGG:1 - chrX 3646895 3' + 412 7502 2 52.21 GATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTATCTTTTGTTGACTATCAACTTAATCTATCTATGAAGTTTGGTTTGATTTAAATTACC:1 + chr3L 5666273 3' - jockey 4987 1 60.27 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGCGCAGGATAATTGCCAGTCGCTGAGCAACAAAAGCGATTAGTT:1 + chr3L 10112263 3' - I-element 63 1 65.38 TAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGTATGCTTTTAAATTTTAAACAGTTTACCATTCATAACTCCCCCTGCCAATAGATATTATA:1 + chrX 7385000 3' + I-element 5295 1 57.53 CAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCA:1 - chr3L 18484397 3' + hopper2 1526 1 71.53 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTGTAACTAAATAAATGTGGTTTTCTTATTATTTAGCTAGTTTATAACAGTTCATATCCTTTTCCCATTTCCAATCATTCTTAACCCACTGTGTGAGCAATTTGCGTCG:1 + chr2L 6601427 3' + roo 397 1 48.63 ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTGGCATATAAATAAAATTCTATTATGTGGTTGTGGCTTATATATGCTGTGATCGTTACCAAAATTTTCCACTACGCCAGCGAAATGGGAAGGATTTTTGG:1 + chrX 4032274 3' + transib2 2808 1 73.43 CAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTACATTTGCATCAAGGACTTCCGGTTTGTGCACACCAGCCGAAAA:1 - chrX 7741898 3' + hobo 2882 1 67.20 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTATGATTCTTAACAAAACTTTGTGATGCAGATGAGTAACAGTTTGTTAAAATGGGTCGCTTGAATAGAATAGA:1 + chr3L 3238345 3' - roo 49 2 50.68 GTTAATCCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAATATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTTTGCTAAAGAAGAAATAGCAAAACATATTGCACTGCATTTTGAGCGCTTCGGCTGGTTCGGTTAGCTTCTTGAACATATC:1 + chrX 11991905 3' + G4 3519 1 61.59 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGAT:1 + chr3L 18253879 3' + blood 7322 1 65.52 AAAGAACGGAAAAAGAACGGTATTGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGATTATGCAAGTTAATGTTTGTTTGTGATTTGGTCGCTCTTTTTTTGGTGGTTCGCTTTGGGCCA:1 + chr3R 19413528 3' - rover 7086 2 63.01 CGGGTATCTGATAGTTGGGGAACAAGGTTATAGCATTCTCTCTTGTTACATTTTATGTTTTGCCATTCAGGTTTTTGCGGCTGCTGGGTGATACG:1 + chrX 22838757 3' + INE-1 555 1 70.53 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGATCGATGGAAACCGGTTTCTGTGAAAAGTCTTTGCTTTCGTCTAAGGAGAAAAGTTGCCACGAC:1 - chrX 4673584 3' + roo 9029 1 56.16 GTGTGTGTAAGTATATGTAGTCTTATACTACTATGCTACTATATATATGTATAGAAAAAAAAAAGACGAAACAACAAAATTTTCGAATTTCGCCAAGCGGCGACGTCATCAGTGGTCGCATTTGTTGTTGTTGGCGCCCGTGGCCG:1 + chr3L 9764164 3' - Quasimodo 25 2 54.11 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCATATAATTTTACAAGCTACTACTCATATCTAATTAGTGTACCCAAACTAAGAAATACCG:1 + chr3R 7664573 3' - I-element 52 1 58.52 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGC:1 + chrX 21403463 3' - roo 8751 2 79.31 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAGTTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGCGATTATGTTGCT:1 - chr2L 14239118 3' - 412 20 2 65.60 TTGGATTTTCGAAACTTTTGCTGCAGACCGGCAAATAAAAGGAATGGAAATTTCGTACTTATCTTATAATTTGTTCGCTGGTAAGAGGGAGGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGGACAAAT:1 + chr2R 1686210 3' - GATE 377 1 56.16 TTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAGCATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTT:1 - chr2L 16456795 3' - BS 5083 1 80.82 GGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGCCCATCCGGCTCTCAGTTCATCCGATAAGCGGCGGATTGTTTGCTTTTTGCGCACAGGCTGCCAAATAAAACCGCCCGCCGCC:1 + chr3L 3308864 3' + R1A1-element 5334 1 78.70 CGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATGGGGGCATTGCATACTTTCGGGCACAAATCGACATCGTTCCAGTGGTGCAGTTCCGAAAAATCAACCTTCCATAAT:1 + chr3R 23601830 3' - jockey 10 1 75.54 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATTGTTATTTT:1 + chr3L 18484479 3' - hopper 54 1 57.04 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGTTGCCAGGCAACAGATTTAATAAAGAAAAAAACAGCAGCCACTTTACTTTAGCATTTCAATTAAAGTTTGCCCATTCTGTGAAACTT:1 + chr2R 15075701 3' - mdg1 7072 2 62.33 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCCTTTTGCACAATGATTATGTAAATTTATTGATTTACCTGCGCTGCTCGAACGAGCAATAATAGTAATATTTACTTTTCGCTC:1 - chr2R 22463113 3' - roo 8681 2 67.20 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTCCCTTTCTCACATTCTCCCCTTCTCTCGTTCTCTCGCG:1 - chr3L 19580865 3' + roo 390 2 65.85 TAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATGCA:2 + chrX 20685953 3' + Ivk 5328 1 52.05 CAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGCGCAGGATAATTGCCAGTCGCTGAGCAACAAAAGCGATT:1 + chr3L 10112259 3' - I-element 72 1 69.63 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTAATCTCTTAAGTTTAAAGATAATTACTTCTAGTTATATATCGGTTTAAAACTATGTTCCACAGTAGCTTTAACTGGGATGGCCATTGAAATTTAGCGT:2 - chr3R 18528231 3' + roo 388 2 68.49 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATTTTTCTTGTCCACAAATGTATGATATATAATTTTCTTTTTTTACGGTTAAA:1 - chr2L 15081016 3' - Doc 15 1 74.48 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCTGGCAACAGTTTAACAAGCTTTTTAAAACTACAGGAAGCGCTGGCAAAGGTCTGGAAAAATATCGAAAAAATATTCAACCAGCTTCATTCATTT:1 - chr3R 7585694 3' - Doc 32 1 63.38 CTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATATTCCACACCTCCGAGGTAATGCGAGCAAGCTTTTCTTCTTT:1 - chr3R 6870595 3' - jockey 396 1 71.92 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAAATGAAAAAACTTTTCCCAACTGCCAAAGTTCGGCCAGTCAACAGTTTAACATCGATGCTGGCTTATTTGTTACAGAGTCGAAA:1 + chr2R 12202375 3' - Tirant 8142 2 60.27 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTG:1 - chr3R 26486018 3' - 412 56 2 54.55 GAACTGATCCTTGTCTGTTGTCAAAAGTATTTACACACAATTTTTACGCGTCAAAATTATTTACACAGTTCAAATTGAAAATTAGTCTTTGAAGATTAATGGTAGAGATAATACATTTATGAAAAATGTGTTCGTGACAGTTTAGT:1 - chr4 897388 3' + Bari2 55 2 61.64 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTAAAAACAGTTAATACTATGTACATATTTAATT:1 + chr3L 7870256 3' - roo 87 2 83.56 GTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTAATATTAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATTTATGCATATCCTATTCATTTCACCG:1 - chr3L 129024 3' + P-element 98 1 17.81 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATCAAAAGAAATAAAGCAAACGTTGCTTTCTTTGGCTTTCTTCAACTTCTTCTTCAATTTGAAAGAATGGAAAAACCTTGTTTTGTGCAATCATGGCTGCAGCCTATGTTAATTATAA:1 - chrX 4400244 3' + roo 407 1 79.17 GCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCTCCATTTGCTTTGAAGATGGTTTATTGTAAATGATTCGTTTTGGCCAAATGACATAGATTTGTTGCGCATT:1 - chr3R 17099883 3' - Tirant 8119 2 70.48 ATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAAACCATTATTAAGGGGTGGGCAATCAAAATTATTTATTTTTAAGGGTGGGTAAACGAAAAAAAAACAAATTTTAAAGGG:1 - chr2R 23000263 3' + FB 77 1 57.24 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATATAAGTTAAGTGCAGCCGGCTGAAGTTGAACTACCTCGATTGGCCTCTACGAAAGTGTTGTTCTCAGTTGGCACACAGCCCTGACATTTAACTAG:1 + chr3R 24673691 3' + roo 9054 2 73.05 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTCTGTGTGGTATGTACAGTCAGCGACACAATCGTATGCACTTTCGGGGCAGGGAGTAGGGCAAGGCCAGAGTTGCCATTGTT:1 + chr3L 21910498 3' - pogo 14 1 71.43 ACATATAAATATATAAATATACGTGTGTATATAATTGATTTGGCCCCTTAAACGATGCAGTAAGTTAAGGGGGAAAATGTGTGCGAATGTGGGGCTGGTCAATTGAAACTTCAACCCGGCGCACAACGTTTTCCAATTAGCCAAAT:1 - chr3R 12393402 3' + Stalker 6938 4 73.97 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTTAAGTGGTTCCAATGGCTCTCAATTTGAGTTTG:1 + chr3R 18205692 3' - 412 7139 2 76.71 GACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAAG:1 + chr3L 25232914 3' - GATE 8310 2 60.96 CACACACATACATACACACATACTAAAGGGATTCGAATGTGAAATGCATAAATTAAACATTGCGGCATAATGGATTTGAAGGGCTGTAAAGTAAACAGGGCGGGGCGCTTGATGTCAAATCTAAAATAA:1 - chr3L 7281796 3' + Quasimodo 46 2 50.39 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTGTCAAAGATGATTAGG:3 - chr3L 19031186 3' + roo 387 2 69.86 TATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGATGGGTTTCCCCTTGACCAGTCTGTGATATTCTAAAATAAATCAAA:1 + chr3L 6095559 3' + transib2 2751 1 68.49 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAATGTGTTCACTTTTAAATAATATCGAAAATCACACTGTC:1 - chr2L 18112446 3' + transib2 2809 1 72.60 GACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGGGCAAACCGATGGAAATTTCTGCCTTCATGAGGCGGCAACAGGTTACACAGCAGCATCAATTAATTTTTTTAATAACCGACAGTTCACGCCTAATAAATATTC:1 + chr2L 12144341 3' + transib2 2807 1 72.60 CTAGCAAATATAAAATGTACGTTACAATTGGAAATTAAAAAGGAATACACGACATATATATATTATTATTATTATATTAAATTATAATATAATATTATAAAAATATATATTTTATAATAATTGTAAGTGTTAGAACTATGTGGCG:2 + chr3L 23392861 3' - invader5 33 2 62.76 AAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACAACGCTTTGTCTATGCTCTCTGACCATCGATGAGCGATTTTCGCCGGCGTTTCTGTTTTT:1 - chr3R 25521289 3' + Doc 4433 1 58.62 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGATCGGAAACATGCTATTGATCCCAAATTCTATCACGAGCCTAATGGTCATTACAGTACGAGTA:1 + chr2L 6229521 3' - transib2 52 1 55.63 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGCATATGAAATCGTCAATTTTATACCGATTCATTTTGCTGCGACTCAAAAGCTGCCTAACCAGGTGCGGACATTGCGGCAGGAG:1 + chr2R 5438332 3' - flea 22 2 66.67 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACAACTTGCAGTAATGGAGACATAACCA:1 + chrX 3647027 3' - 412 7088 2 60.27 AAGAGAACTGTATAAGAACAATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGATGGCAAAGTTCTACACTGCGCTCTGTTACTCTTTTGAACTCCACTGCACTTCACATCCAATATGACCGTTCGTGCTTCCTTAACAG:1 - chr2R 544877 3' + Dm88 4153 1 60.00 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTATCTCAGTGCTATTATCCTTGTTATAATGACTTATTTATTGATCAGTCGCCTTGGTAACTGGCAAGACGGATGTTAGAACGGATGGGCTGCCTCCTTTGGGCACCCTC:1 + chr3R 6136120 3' - mdg1 7051 2 77.08 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTGCCGGGAAA:1 + chr2R 1923585 3' - pogo 50 1 57.53 GTTTTTTTTTTAATAATTTGAAACATAAATACATTACAAATTTTCTCAGTGTAAAGGCAAGGGCATGCCAGCCAGCTGTTACTAAAATTCAATAACAAATGCATATTTAATGCCAATGATGATCTCAATTATAAAATATAACGAAT:1 - chr2R 7194426 3' - P-element 2683 1 73.97 AGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGTTTGATTTTGTAAACATTTACTTCCAATCAACGGCGTTCAATTAATAGTGTTGCTATTGG:1 - chr2R 9294260 3' - Tirant 13 2 77.93 CATAAATAATAATAAAATATGGCTGGGGTCGGAAAGCCAGGAGAATAGAAAATCGTTTGAATAAAATATTTAAATAGAAACCATTTTCGTGCAATTGTTTTGCATGAGTAGTGGTTGCCATTGTGGCTG:1 + chr3R 31422924 3' + transib2 253 1 46.51 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGGCAACTTTGGCGCACGTTGCATTTTTATT:1 - chr3R 7470925 3' - Doc 49 1 65.04 TTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCTCACTTGCCAGTGCTTCACTCCACTCCACTCCACTCTCTCTCCGGC:1 - chr3L 3141706 3' - F-element 4455 1 68.49 GGTATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCGTCTGTGTAGAGTATTGTATAGTTGTTGTTCTTAAGTTGGTTCTTGAT:1 - 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TART-C 11092 1 90.38 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTT:1 - chr2L 14969105 3' - 412 7125 2 70.50 GATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCACTCTCGAGCGGATGGCGAGTCTCGTGAGGAATGCGATGGGAATGGGGGCAATGAAATTTGGATT:1 + chrX 18121448 3' + hopper 352 1 56.16 TTTAAAGTTGAAGTTTTAAACAGCTGATTGAGAGAATGCAATTCCCGCCAAATTATTTGTTTACTTTTGCACGTAGTACGATCGTTAATACGCATCCAAATGTGGATGGTGGTGCCGAGACTGGCAAGCGCGG:1 + chr3R 17020231 3' + transib2 157 1 75.19 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTAAAATCGTCAGCAACGAAAG:2 - chr3R 16276285 3' - pogo 19 1 72.60 GTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATACAAACACGTGTACCGAGAATATTTGAAGAAATTTAATACTTTTAGTGCACAAAGCGAAAACTGTTGAATGCCGAGCGATGGAGC:1 - chr2R 23353946 3' - gypsy 7020 2 63.01 GTGCGTGTTTTGGGGAGGCATTCGTGCGTGTTTGTTTGGGGTAACTGTAATGTGTGTGCTACTGAGCCTTTATTTTTTTT:1 - chr3R 32039689 3' - Fw3 2766 1 62.50 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGCGATTATGTTGCTCGTACC:1 - chr2L 14239112 3' - 412 35 2 61.64 AGATCGACTGAGCTATTGATCCTGATCAATGGAATACACGGTAACTTCTACCTGTTAAAAACTTTTCAAGGAATCTAGTATACCATTTTACTCTACACTTAACACTTTAAAGTGTTTGCCCTAAATCGCTAAGCTGCTT:1 + chr2L 12157210 3' - INE-1 97 1 47.48 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCTTAGGGTCTTTTATTTGCGATGGTTGGCAAGTAAGTGATAAACAACATCAAAGAAATACATTTT:2 - chr2L 15777783 3' + 297 6925 2 55.48 ATCAGGATCATAAGCCGAGTCGATCTGACCATGTCCGTCTGTCTCGACCTCAAGTTCAAGTTGTTGACCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTTCGTTTAATGTGACGAATTTATTTACTTGACTTAAGGCCATATTTTAAGG:1 - chr2R 1949247 3' + INE-1 93 1 65.75 AAAATTATTAAATGTTTTTTTTTTTAAGTCAGATTGCATGAATAATAACATTAAGCAGTTCATTTTAGACATGGATCGATTTTCAATAATAAATCTCAGGACTTATATACATTTTCGAGACAAAATATAGGGGGAAGAATATAAT:1 + chr3L 21445675 3' + Tc1 58 2 73.79 AACTAGACTATAGTATTCTCTCTTATTTTCCAAATATAAATAATAAGCTTTCCAAAGGGCTATATAAGTAATTTGCATCACTGCTCGAATCGGATTTGATGGGTGCGATCAAATGCTGGAACCAGTGATTGCAATTCTGTGCATTG:1 + chrX 19304083 3' + INE-1 575 1 50.00 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACGAAAGTTGACAGGGCGGGGAATGAGCTACACTGCTGTAAAGCAACCTTATGGAATAATTATTCAAAACGCTGAGTTTGTGCCAGGACGGTAATAAAGA:1 - 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chr3R 8470965 3' + Doc2-element 4613 1 62.35 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTTTAAACATTTTGCCTTT:1 - chr3R 19450007 3' + roo 8994 2 70.55 TAGCTGAGTACCGGGTATATGATTTAATTGTGGTATTTTTTATGCGCTTCTATACCATTTATCCTCCAAGGATCAGGGAAGGCGGAGAGAGTGAGAGCGAGTCGCTGAACAGGAGAAGGC:1 - chr3R 31937709 3' + INE-1 544 1 66.67 GCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACATGACCAGTTCG:1 - chrX 14061529 3' - INE-1 567 1 51.16 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATAAGACAAAGACATTTTTCAGCATTCAACTCACTATTTATTCATCATTGCTAACGAACGGACGTGTATTGTCCAGACATATTTTGTAAACTTAAAATAAAAATAT:1 - chr3R 2845489 3' - flea 4770 2 71.92 GTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAACCGCAGTTGGGTAATCACTTCAAAATG:1 + chr2R 11095851 3' + diver 6063 2 52.05 CTGAACTCGAATCAGAATCAGAATGTGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGTATATTTTATGATCAAAAACAATGCACCTGATATCTTTTCTATTATTT:1 - chr3L 14954368 3' - transib2 2541 1 81.51 TCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAATATGTATATATGTGTGACAGAAAAGAGACTAAAATAGATTCTGCGCGTAATTGGAAACACATAGCAAATAGTTCTTAATCATAACCATAG:1 - chr2L 13138940 3' - McClintock 20 2 72.41 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTTATTTGGGCCTATCTAAAGTCCCTAAAATTAATTATAAGACACTTTGAATT:1 + chr2R 21844032 3' - pogo 64 1 63.70 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACT:1 - chr3L 19580905 3' + roo 326 2 73.29 CAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGGTTTCGCCCTCAGACTC:1 - chr2L 12291826 3' + Tirant 8494 2 67.89 CTGGGTTGGTTGGTCGTTCTGGTGCAGAGTGCTTTATTTATGGGTTGGACAACTCTCCCCCCTCCTCTCTCCCGCGCCACGCATCATTACGAATTTCGCTTAAAAATTAATTCTGTTAAAAATTCTTTCTCAGTATTTTGTTTT:1 + chrY 593812 3' - Doc3-element 4581 1 45.14 AAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAA:1 + chr3L 7801306 3' - Transpac 5086 2 56.85 GATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGCTTACGATGACTGAATGACATAATGCTAATAACGTGAACATATTTCCTGCTA:1 - chr3L 7791238 3' - jockey 4621 1 61.48 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTAAAATCGTCAGCAACG:1 - chr3R 16276289 3' - pogo 12 1 75.56 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCATAAGAACTAAAATAC:1 + chr3R 14954052 3' - jockey 4830 1 64.83 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCATATAATTTTACAAGCTACTACTCATATCT:1 + chr3R 7664544 3' - I-element 70 1 78.23 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTAGACTTTGTAAAAGGGTTCTAAGAAAGCCATTTAAAAGCACACTTTAAAAGCAGGTTATAAATTTTCA:1 - chr3R 18153548 3' - copia 4923 2 53.42 GGGGGGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCAC:1 + chrX 21772491 3' + gypsy3 6567 1 65.12 TTGGATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTG:1 - chr3L 14944556 3' - G5 4809 1 59.59 AAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAG:1 - chr2R 3338793 3' - Juan 69 1 63.70 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATATTATTACAGTAGTTCATAAATCCATACTTTAATTGGATTAAGAGCGGCTCGACTGGGCACGGCTTGATGCACTTGGAGAAACAGGGGAATATATTAAATTATTTATGGAAATATATA:1 + chr3R 27415608 3' + blood 7375 2 73.94 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGCGA:1 - chr2L 14239128 3' - 412 45 2 52.86 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAAAAAAAAGGCAATTATCAAGATAAAGTAGACATGATAGTAAATATTTAATAACAAAAAAGTTTGCCCTTAACAGTTCAGTGCAC:1 - chr2R 13046460 3' - 412 38 2 59.59 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATTACTATAAATTTTTAAACCATTTCCCTGCCACGGACTACAGGTGCAAAAAGGCT:1 - chr3L 13678841 3' - hobo 21 1 69.86 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGACTAGAATGCGTGTTTAAGTGAACTGTCCCTTTC:1 + chr3R 28450763 3' - roo 8718 2 58.90 CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAAAACATTTTCAAATTAGCTC:1 + chr2R 10160627 3' - hobo 35 1 52.99 AACGTCGAGATCTCAGGAACTAGAATGTTAAGATAAACCATACTGATTCTAGAGACATCACGCCCACACTTTCGATACATTTTTAAATATTTTCTCATTGATGGAGAAACAGCGAAACCACTACTTTCGTCGATTCCGCTTCT:1 + chrX 23089141 3' + INE-1 142 1 68.53 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGATTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGCTTATTTTTGGCTGAGCAATGAGGTGTTAAAATTCCAC:1 - chr2L 13842296 3' - jockey 4748 1 70.71 GCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTAT:1 - chr2R 5582161 3' - Cr1a 474 1 52.86 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTAAAACGAATGCAGAAACATGCAGATCGTTAGGCGCTATTTTTTGGTCTTAAAGGCCGGGCTTTATATATTCAAATTGTGCGGGAGTCGA:1 - chr3R 7778218 3' + transib2 2795 1 65.75 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGTCTTGGGTTGAGGGGCAGGTTTTCACCGGGTCAGAGGTGCAGGCGCCACCTAATGACTTGCAGCGTGGCATTAAATTGCCATTGCCTGGAAAACG:1 - chr2L 12486289 3' + roo 391 2 75.36 ACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAAACAGGCTAACAAACAACATCAACAACAACGCCGGCGTATTCATGATGCACTCATAAAAACCGGGGGTAAAGTACGGCGCCGGAAAGCGGGCAGAGTTCT:1 - chrX 10110965 3' - mdg3 5273 2 71.72 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCCGGCAAGTAGGCAGCAGAA:1 + chr3L 15723943 3' - jockey 4742 1 67.12 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTATGTACTTTGTATATCTCATTTCGTGTCTTGTT:1 - chr2L 17626608 3' - roo 8750 2 81.38 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCACCACACACAAACACACGCACTCAGAAACACACGCACACATAAGCAACCACTCAGTTACCAACACTTTGAC:1 - chr2R 23671765 3' - hobo 51 1 51.37 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTCCCCTCTTTTTTAAAATAAAACTCCATATCCTCAAGCGCGCACACTGC:1 - chr2R 10887756 3' - blood 7073 2 78.36 CAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTCACTTCCGAGCGCATTTGATTTTAATTTTACGCCACTAAAAGTGCTTGGACCGTAAATCCAATTTATTTTC:2 - chr2R 7599105 3' - diver 18 2 71.92 TAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCA:1 - chr3L 13952769 3' - I-element 5159 1 56.85 GGTGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATACATATA:1 - chr2L 17921318 3' + Stalker2 177 2 71.92 CTTCTTTTGATTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGCTTATTTTTGGCTGAGCAATGAGGTGTTAAAATTCCACTGCATACTTTCTAGTAGCATGTAAGG:1 - chr2L 13842270 3' - jockey 4728 1 54.11 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGA:1 + chr2L 3231946 3' + roo 8991 2 71.92 ACTATAGCATTCTCTCTTGTTTCTTCTCAAGTTTTTGGTGCTGACCATCAATGAAAATTTGGCAAATTTCTCTTGGTGCGCTTCGTCACTACGCGAATATGGCCTTGCGTTTCATCTATTTCATATACTCCTTCAACGTCCTTTGT:1 - chr2L 11621466 3' + INE-1 581 1 80.14 GATGTTGTTGTTGGCACATCCGGTGTTGGATGGCATTTCGGCTGGTCGTTGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTATATGCAAATTAACTTTTTTTGCTTTGAGTGAGACCTAGCTAACAATTTTTTCTGAGTGTTTTCC:1 - chr2R 2873992 3' - gypsy10 57 2 66.67 TTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACTACATATATACATAGATAGATACTTTCGACTGAAATTCATGCTGGGCCTTTCGATTGCCGCA:1 - chr3R 8849754 3' + 297 6920 2 63.01 TCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATAAAAGTTCTACTGTAGCTGGGAAAAACTGTCGGGCAAATGTGTTGCATACTTTTAGGCAGCCACCGCACATGCAATCCCCTCCATGAATCCCCACCACCTC:1 - chr3R 25388564 3' - BS 4997 1 79.07 AGAGGTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGGTTCTGTTCTCTTTTCTTCTCGCGAATCGTGCGAAAAAAACAAATAATTGAATAAATTAAAACCAATTATTTAAATATTTTTACCACGACTACTTTGTCATCGATA:1 - chr3R 15933737 3' + Cr1a 4319 1 63.50 GCGAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCATTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGCTTTACTGTGCTGGTTGTTGAGGTTGTTGTTGTCGTTGAAGTAGTTGTGATGTGTGGCTTTTTAACAGCCTCTTTTTCC:1 + chr2L 7155790 3' - Idefix 7020 2 56.85 TCTTCTAGAACTCTCTTCTTCCGAATATATTAATTTTCTTCCTGCGATTTTGTATAGTAGCTCCTATTCTCTTTTGTCGCAAGCATGCTCAATGCGATTTTCTGCAACAACTGTAGTTACAGTTATTTTAATAAATTATATGCTAG:1 + chr3L 14285954 3' + Gypsy12A_LTR 2033 1 63.70 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTTTTTTTTTATAATTGGAGATCTGTTAATTAGGAATGTTGCTGTTAAAAGAGCTTCACCCCAATAACTTTTATTAGGCTAAGTACAGAGACTTTTCACTGATTG:1 + chr2L 22775625 3' + pogo 2087 1 74.66 AGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATCCAGATCACGATAACCATGTCATGTTAGAGGAAAACCTAGATACTTATTGAAAACAATGACCAATAGGGCGAAATTTACAAGACTAA:1 + chr3R 3076897 3' - Quasimodo 30 2 65.75 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACCCTTGGGCTTTGGATACGGGCTAAGGATGTGGGTCTCGGTTTCGGTTTCGGGCTAGCGT:1 + chr3L 19580984 3' - roo 62 2 61.64 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACAGTTATCGTTTAACGTCCCAATGACAG:1 - chr2L 22724080 3' - pogo 36 1 53.60 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGTATCTTCTATGCATGCAACAAGTGGAACCAACTGCAACTCCTAGCAGTCGTGGG:1 + chr2R 18612000 3' + P-element 2857 1 53.64 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTAGCTTATGACCAGGTTAAGGTAATGTCCATTGGATACTGTTGCCTATTTTGTGGCGCCCAGTTTAGCGGCTATTTCTGTTATTTGTTACC:1 + chr2L 6388187 3' - jockey 15 1 74.40 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACTTCTGTGGTTGCCCCGGTTGTTGTATTCGAAAACATGTCCAAAACCTAATTGTCTGTCGCCACAAATGTGCGACCGACG:1 + chr3L 9924776 3' + roo 9031 1 54.79 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATGAAGTTATTGATTTATACAT:1 - chr2L 16857879 3' - P-element 102 1 16.44 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCCACTCAAAGTCAGCACAGGCCACAAAGTCGCACAATATTTAAGAGAGCTCAGAATGCACAAAAATATT:1 + chr2L 11554620 3' + roo 9053 2 73.29 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTAATATCACCCGAGATTGCACACGAACTCCATCTAGCGGCAGCCGTAGATGTGCCCAAAACTTAACGGACGGACATTTGCCACTTG:1 + chr3R 5422977 3' + roo 9042 1 62.14 TGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAAAATGTTCAGGCTTTATGGCCTTTGCATTTAA:1 - chr2R 7146734 3' - Doc 4473 1 78.08 ACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTATAATGTTTTTAAAAAATGTTTGGGAATATTAAAATTTATTGAAAATAAT:1 - chr3R 13548426 3' + Quasimodo 7176 2 66.44 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCGAAGGTGCGACGATGCCCGC:1 + chr2L 17260801 3' + P-element 2881 2 62.82 CTTTTCCCTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGGTTGTTGTAATGAAAATAAATGCGTTTCATTTCAATACGTTTTCCACAATCCCTTCGTTTT:1 - chrX 7480716 3' - Bica 338 1 72.73 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATTGGACTGTAC:1 - chr2R 15070063 3' + 412 7501 2 52.14 GCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATCAAGCAATATCTTAAAACAACGAAAAATAGTAATACAAGTCATATATCATATATCAAAGGGAAAATGGTTTGTATTTAAGCTATAGGACCAAGGAAGTGGA:1 - chr3R 17586790 3' + Max-element 8513 2 67.81 ATGATATCAAATAACTGAATGGCGCGCATTTGAAAAAATGGAAGGGATGCTGCCGCACCCATTCGTAAAATTTACAAATGTCGAAAAGAAACAAAAAAAAACTGGCTGAAATGGCGCTATGGGTTA:1 + chrX 22819367 3' - mariner2 40 1 75.40 CACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACACACACACTTGCGACTTGCTCGAATGCCGATGATTGCTCTCCCCTTCCTGCGTGTGGGTGTGTGTGTTGTTCTGGCGTTTGCAATCAACCTTCCTGCTGACAATTGATTTTT:1 - chr2R 8665972 3' + P-element 2886 2 79.29 GACTTAGAGTTTTGTCTGTCGTACTCGTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTAAATAATTACAATTATTTTCTTTAAATTTGATACGGTATCCATTTCCATAAAACAAAATGCAGTTTTCCAATATTAAAATGAATTCTTA:1 + chr2R 2641592 3' - HMS-Beagle2 365 1 49.32 TATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGCCGCACCGCACCTCTGCACCTATGCTC:1 - chr3R 5773144 3' - Stalker 6914 4 59.59 GTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCCAAGCGCTTCGTTTATTTTATAAATTGTTTGCTCAAATTTCCTCTTCCACTGTGCA:1 + chr3R 24454921 3' - F-element 245 1 73.97 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACC:1 - chr3R 9125641 3' - Doc 50 1 56.16 ATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATA:1 + chr3L 21093215 3' - Ivk 54 1 67.50 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTTGTTTGTTTTACCTTTTTTTATGGCCTGACGCCAGGAGTCAGCTTCCACGGCGTTTTCAGCTTTATTTACTTATGTTTGTTGTATTTGCTGGTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 10111148 3' + mdg3 228 2 72.60 TTACGTTATTTACGTTAAGGACATCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCCACGACAAAATAAAGGAAAAATAGTTAAGATAGTGAAGTGCATTCTAACTGGGAAAAACATATCCATGTCTGGTGAGTACAGTCGCAGTCTAAATTC:1 - chr3R 7997279 3' - Circe 7019 1 53.42 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATTTAATTGCGGATGTTGTGTACAACTACAAAAAACTGAAGTAAAAGACTTTAAAGTTAAAGTTTAAAGTTATATCG:1 + chr3L 18382061 3' - copia 46 2 54.11 AAAAAAACAAATATGAAAAAAGGAAAGGAAAGGAAGGGAAGGGAGGGGAGAGCGGTATCGAGTCTGGTTTTTAAAAAATTCACGGCACGCGCATGCGCAGCATTTTTTCTACTGCTGTCCGCATGTTGTTCTTTTCATTC:1 + chrX 8213155 3' - FB 173 1 62.14 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAATGTGCTAATTTATAA:1 + chr3R 19436131 3' + roo 391 2 72.60 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGAAAGCTTTTGTCTCACCTAAATGAAGGCGAATTCGACTTCACTTTGTGTAGACTTTACGCGATAGAGAAAGA:1 + chr3L 22642084 3' + hopper2 1564 1 55.48 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAGACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGGCAACTTTGGCGCACTTT:1 - chr3R 7470936 3' - Doc 83 1 49.32 TAGATGTAGATGTGGTAACTAACGCGCTAGTTATCGGCGTCTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGAGGGGGAATAGATCCGACGTTGGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGAATCTTTTTAGTTATAAGTTGAGTTTCAGA:1 - chr2L 23286572 3' - gypsy5 6938 1 77.40 ACAATTTGTTCAAATTGGTTCAGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGATCCCCGATACGTTTGCACGCATATGACGAGCGGATGCTTATAAGCAC:1 + chr2L 17293585 3' - hopper2 1201 2 67.12 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACACGCCAAACCGAGTATCAAACATGGAAATAGACGCAAAGGGGCGAATAAAAAA:1 + chr3R 24564833 3' + opus 435 2 63.01 TTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGCCGCACCGCACCTC:1 - chr3R 5773157 3' - Stalker4 7026 4 66.67 GCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGGGAGAGCGAAGGGCGCTACAGCGAACCGCTCTTTTCTATTTTAAGATGTTACTTAATATATAGCGCTATTTGATGCTTTT:1 + chr3L 20828881 3' + 1360 87 1 57.01 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCC:1 + chr3L 15723925 3' - jockey 4760 1 79.45 GATTGATTATCCATTTCATATTACACAATAAAGTATTTACCTTTCCCGTCCTGACTGACTAACTCGAATAAAAAAGTCTTACTGTAAAAGCCTTCTTATGTCAAAAATAGGGGACTTGACTGATTTATATGTTTAACATTTGGTT:1 - chr3R 21346618 3' + hopper2 1356 2 69.66 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAATTTCTGCGGTTTGTCG:1 - chr3R 9125653 3' - Doc 62 1 53.42 TCTATAAAAAAATAAAAAAAAATATTCTATAAAAAATAAATTCCAAAAAGAAGGTGCTGAAATCTTTAATACGGAGGAAAAGCATTGGGTGTTTTTGAAGGCTAGATAAGAGGATATACTCTGACGGCTTAAACATACACCAAATG:1 + chr3R 16478378 3' + HMS-Beagle2 480 1 52.74 AAATATTTTAAAATTCTAGACGCAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTGTGGGTTCCTGGAGTTGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTG:1 + chrX 21907825 3' - springer 484 1 77.60 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATATAAGTTAAGTGCAGCCGGCTGAAGTTGAACTACCTCGATTGGCCTC:1 + chr3R 24673643 3' + roo 9001 2 67.81 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTTCCTGGAAAAGTATTCCCATATAATTTTTAATTACAAAACAAAAAGATTTTATATTTATAATATAACATAA:1 - chr3L 18035450 3' - mdg3 5257 1 70.55 CCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCAGCTAAATTTCTAGCTTGT:1 - chr3L 14944519 3' - G5 4766 1 62.86 ATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGAGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTTAATGTATTTATGTTAATGCAATAAAAAACACTCCATTTGCAGCACACTCGAAATGTTTTCCATGTTGC:1 - chrX 1091010 3' + pogo 1877 1 51.37 GGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAAATATTAATGAAGTCATCAAAAGTGAAAAGATTAAAATTACATTTCTAGTTGTAT:1 + chr2L 9418590 3' - rover 7016 2 64.38 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTT:1 - chr3R 9125634 3' - Doc 31 1 66.42 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTAATTATTTTTAAATAATGTTTAGGGAATTATTGTTACGAGAAACCCTTGCTTCGCCAAC:1 + chr3L 14375717 3' - roo 8726 2 63.70 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTG:2 - chr3R 9125623 3' - Doc 32 1 68.49 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCTCTCTTTTCTCTGACTAGCGAATCTCTATCATAAAATTATATACCCCTTTAAAAGATAAAAAGAAAGTAGCA:2 - chr3L 4651537 3' + roo 9032 1 58.22 TCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATACTATCCGTTCTCATATTCGGGTTTCTATGCGGCACAGTGTATGGATGTTGTGG:1 - chr3R 24664868 3' + blood 133 2 56.80 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATA:1 - chr3L 17667570 3' - F-element 86 1 68.28 GAGGAATATTGTGTTAGCTTTAAGAGTCAGTCGAGTTTTACAACTGATAGGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGATCTATGCTCCACGCCAGTGGATTCGAATTAATTGATTACTATCCCAAAGAAATATGCAAAATCTACAGCTA:1 - chrX 9118346 3' + gypsy11 4312 2 56.16 ATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAACAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACG:1 + chr3R 934269 3' + Rt1b 4725 1 44.52 AAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAACTTAATCTCTTTTGTGCAATATTCCCTGCTTCTTTTTATAGCCCCACAACCTCGTACCCCTCCGGAATGAAGAAGAGTAAAGTGTGGGTCCCCGGGAGATACTCCAC:1 + chr3R 10598236 3' + Doc2-element 225 2 62.02 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGT:2 + chr3R 19436101 3' + roo 361 2 52.05 GTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTGAGTCCTTTCCAGTCCACCATGTTTTTGCATTTACTGCGACTGCTATTTTAGCGCTGCGTCATTGTGTGTCATTTTG:1 - 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Ivk 64 1 62.33 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTGCATGCATGCAACACCCTGTAAGATA:1 + chr2L 18522346 3' + roo 357 2 51.03 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGATCGGAAACATGCTATTGATCCCAAATTCTATCAACTTACACTAAAGGACACGTAGAAGGTGGCTCCTGCCTTA:1 - chr3L 6095454 3' - transib2 45 1 54.79 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATAAAGCGAACACATGAAACTATTATTGATCCGATATCCCCCCTTTTCATAGTCTC:1 - chr2R 9607103 3' + pogo 2038 1 63.70 AATTATTATTATTTTTTAAAAAGATTTATGGCCTATGAGGGCCTAAGTTTCTACTGACAAATTCTTTGCCAGCTATCAGTCATAAAATAGTAATTTTAGAAAAACTCTACGCATTTCTTTGCGCTTCGTTTGAGGCGGAAAATGCG:2 + chr3R 18053736 3' + Porto1 4638 1 69.86 GAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACACCTGTACATCATAATATTGTATTAACAT:1 + chrX 22900306 3' + Tc1 1547 1 78.01 AGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGATGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGTACAACTAGGAAGCGATTTGAGTTGGTCAACTAGGGCAATTGACACTACGGG:1 - chr3R 18968784 3' - I-element 180 1 63.01 ATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAAACATCAGATTAGTTCATTTTGGACCCCATACTTAACATGTCTTAATAAAATTGCCTTCTTCGCGC:1 - chr2L 14802829 3' - Circe 7191 1 76.03 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCGACTAATTAACTATTAGAACTAGTATG:1 - chr2L 2494815 3' - Doc 52 1 51.75 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTT:1 - chr2L 10514297 3' - 1360 86 1 78.08 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAA:1 + chr2R 1923568 3' + pogo 2034 1 65.75 CTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCT:1 + chr3L 23678152 3' - Osvaldo 20 1 71.00 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTT:1 - 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chr2R 5237712 3' - Doc 42 1 46.58 TGGTCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTATATGTCCACCTAATTATTTGAAATATTAAAATGG:1 - chr3R 15126504 3' - FB 87 1 76.03 ACGCGAAATTGCATAATTTTTCTGGGATATTGACAGATATTCGGAAATAATATGAGAACAAATCATAATTGTAGGCGTGGCACTTGTGGGCGATTAAAAAACATTTTTACAATTGTATTTATATACAAAAAAAGAGACAAGTAAAC:1 + chr2L 3911822 3' - INE-1 516 1 64.38 TTTTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTCATACTCTTTAATATTGTAAGCCGATTCAGTACTCTATCCTGTTGGATTATGTGGACTGTCCCCTTGAGGAATCCCTTTTTTCAAGCCCCTCATCTTTCAGT:1 + chr3L 12100027 3' + diver2 4532 1 52.74 CCTACGGATTCCAGTTGTGAAAACTGAAATTGTCCTAAAGGGACTTGTAACGAATCCAAATCAATTGGCCAAATCACTTATAGAAGTGAATAATAACACGCACATCCAACGTAACGATTCACCTGCCCAGATGCCAAAACTTACG:1 + chr2L 16857038 3' + Doc4-element 2733 1 77.24 CCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAGGACAAGCGTCGATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCTGTGTCAGTTCGTAGTTCAGTAAGTGATATGACTTGTCGTCGT:1 - chr3L 26386225 3' + HMS-Beagle2 6806 1 70.55 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTGGCCAGAACGTCAGTGCCAC:1 + chr2R 10910317 3' - 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Stalker 6899 4 51.37 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATG:1 - chrX 7756416 3' + roo 8989 2 74.66 CAGGATCAATAGCCGAGTCGATCAAGCCATGTCCGTCTGTCACAGGCGCAGCGCAACCTCCAATTCCAGATATAAACTGCGCTATGAAAAGCAAAAGTTGGGGCGCAAAGTTTCCTTCACCGACCTCGCACTC:1 + chr2R 22226043 3' + INE-1 95 1 53.38 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATAAATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGC:1 + chr3R 18528351 3' - roo 82 2 73.97 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTAATACTTAAAAAGGCTGAAGAATGACTAAAACTAAAGACTTTAGTACTCACCATATGAAGATGCTCTTGTAGGCATTTTCATTCGAGCATGAACCACACA:1 + chr3L 19999315 3' + 1360 3374 1 76.03 CAGGCGCACCGGCTAACAAGAGTTAGCTGTACAAAACAATAATACAAATATAACAATTAACATCAACTGCGAAGGGTTTAACGATCTGTCATATTTTTGTTGGTACATCACCATACATCATAGAAAATAAGTAAAG:1 - chr3L 10546014 3' - BS3 1686 1 52.94 GCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAACACACAAATTGTAACTTGTATTATAATGGTTTTAGACTTAAATTGAGGC:1 - 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chr2R 22146029 3' + 1360 3348 1 46.58 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCCTTTTGCACAATGATTATGTAAATTTATTGATTTACCTGCG:2 - chr2R 22463154 3' - roo 8743 2 73.29 AGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTATTTTAAGGCCCAGGAATCGAGCTTCTCGCAAAGCAACCAGCAGATACAGGATAGCTCCTACAAAATTCAACAGTTCT:1 + chr3L 14187535 3' - roo 8932 2 53.42 GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAACCTTTATGGAGTTTAAAG:1 - chr3L 15364799 3' - 1360 43 1 51.45 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCG:1 - chr3R 20450424 3' - hobo 71 1 69.18 AATTACGTTTTTGTTTTATCTGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTCAGAAAACGTGGCATACATTCG:1 - chr2R 6798208 3' - jockey 56 1 52.74 GCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCCTTCGCAACT:1 + chr3R 5773218 3' + Stalker 325 4 73.29 GGCGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCCAAGCGCTTCGTTTATTTTATAAATTGTTTGCTCAAATTTCCTC:1 + chr3R 24454909 3' - 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roo 8676 2 73.97 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTATATGTCCACCTAATTATTTGAAATATTAAAATGGCTTGATAACGCCAATGCGGCGAAGTAATAGTAATTTTTAATAATCAGCAAAATAATTAAAATGAGCTTTTTGCAA:1 - chr3R 15126429 3' - FB 12 1 74.66 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCACCGGAAAAGATGGAGTGCCACGTCCGGTTTCGGTGAGGACTAGCGATCGAGCCAAATTAGGGCTATCGATAAGTAGTTAAGTAATTTCTCACCGATAGAG:1 + chr2R 5106258 3' + roo 351 2 70.55 AGAGAAAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGCGTAAGATCGCGTGCACTCGGAAGAATAACGCGTAAGTAAGTTGCATATATTAATAAAAGATCTCTTGTATTCTTAGAAAGCCAATAAAATGTACAGAAACATAACTAAATTAACAATG:1 - chrX 17178681 3' - Cr1a 294 1 83.45 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGATCGATGGAAACCGGTGTCTGTGAAAAGTCTTTGCTTTCGTCTAAGGAGAAA:1 - chrX 4673596 3' + roo 385 2 59.13 AAAGTAAAAAAAAAAGCAAAATGAGCTAATGTTGGGTAATTTTCAAACGTCAAGTGTTGACTAATGTCGAGAGGTACGCGAAACATTGTCTAACATTTGCTGAACAGCTGTATATGCACTTATGCATATATGCATATGTATGCTTC:1 + chrX 4930233 3' + Doc2-element 247 1 72.60 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGAACACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACA:1 + chr2L 15777897 3' - 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P-element 27 1 53.85 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATAGCAGCAAATTGTGTTAAACACACACAAAAAAAAAAAGAAAAGAAACTTCTTTTTATGATTTTTTTATGCCGCAAAAAAAAACGAAATAAA:1 + chr3R 19171563 3' + opus 470 2 60.00 ACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCTACCCCAGATTTCCTTGT:1 + chr3L 16973507 3' + S-element 1698 1 71.23 ACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGAATATTCGTAGCCTTGTGGACACACTTTATCGTGGATCGTGGAA:1 - chr2R 17095438 3' - P-element 187 1 42.50 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATTTCGAGGCGATCGCGAGATTTTCGAACA:1 - chr3R 18399193 3' + P-element 2840 1 47.69 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTAC:2 - chr3L 19031232 3' + roo 9004 2 60.96 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATGCTGAAATAAAAACTTATAATATAGAAAGCTTCACTTTTTAAAAATTATCTCCCCATGGTATGTTAATGCTGTC:1 + chr3R 15054232 3' - 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roo 8750 2 82.39 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAAGTAATTAAAGAGATTAGAGATTAGATAGAGATTGACTTTGAAGTCACACTGAACGAGTTCCTCGATGAG:1 + chrX 10899760 3' - mdg3 5323 2 52.05 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTATATAACCCACCGATTCCGGCCCTCGAGGACATGCATCTCGACGTCGCTTCGACTGTCTTGCCG:1 - chr3R 19435977 3' - roo 20 2 60.87 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCTAAAAAGGGGTCCCTATGTGTACT:1 - chr3R 27323090 3' - 297 62 2 75.44 AAAAGAAAAAAAAAATAAAAGAAAATATCTATAAAAAAGAATAGACCTTATTCTCAACTGAAAAGCCAGATAACCATGTCATTTTAATAATTTTTAAGAAACTTCTTATATCGACTGCTGTATCCTAGCAAGTATTTTCATAAATC:1 + chr3L 18381469 3' + Doc2-element 224 3 80.82 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACCTTTTCTTTTGGCCAAACTTTCTGCCCCCGTCGA:1 - chr3L 20497754 3' + P-element 2831 1 34.75 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATAAAGCGAACACATGAAACTATTATTGATCCGATATCCCCCCTTTTCATAGTCTCTAATT:1 - chr2R 9607098 3' + pogo 2043 1 60.27 CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTAAAAATTCTGTTATTGCTGTCGAACACACATTAAAATTAGACTAAAATAAACCCAAAGCAACTTTTAAATTGTACAATTG:1 - chr2L 15644835 3' + transib2 2785 1 58.90 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAAGCCATTCCCTCGCTCCCTGCTCCACAGCGGATCTGAACAA:1 - chr3R 23161233 3' - 412 7082 2 64.14 ATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGTAACGATCAGCAAAAATGGTATATCAGACATAGAAAGATTTCACAAGACCGTGAACGAAAAACTAAGAATCAATGGTAGCGAGAGTTACAGGTTCCAACCGGCACAC:1 - chrX 21939675 3' + Tabor 7310 2 75.34 GTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAAAGAAC:1 + chrY 3648907 3' + 17.6 7364 2 62.33 GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACACACACACTCTTGAGCATGGTGGGGGCTACAGGATAATAAAGGAAATTGCTGG:1 + chr3L 13678976 3' + hobo 2893 1 62.90 ACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTTCAGCGATTTGCTGTTTCAAAATGGGAATAATATTTCAGTATGTTTTT:1 - chr4 123927 3' - HB 99 1 66.44 AACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATTAATAACTACAGTTATGGATCGACACAGACTAAAATTTCATTAGCCCCCTTTCAT:1 - chr3R 2474289 3' + Juan 4147 1 65.07 CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTCAGCCTGTATATGTATGTGTATTTGCTTTGTACA:1 - chr3L 22339413 3' - hopper 83 1 71.23 CGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCTTTTCGCTGC:1 - chr2R 18689152 3' + Burdock 188 2 67.83 GGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAAGCCCACAGGCACATTTAGTTATGCCGTGGTGGA:1 + chr3R 15920271 3' - 412 89 2 78.77 GTTCCTGAGATCTTGACGTTCATTCGGACGTACAGAGGGACAAACAAATGGACCTAGCCAGATCGACTCGGCTAGTGATTCTGATCCACGGTTTCAGCTTAGTCTATTTAAAATCATATTTCTC:1 - chr2R 557478 3' - INE-1 140 1 78.23 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGCACTTGATTTTAACGGTAAGTTTTTGTTAACCAGTTAACACAAGTTATTGCGAGGTGTACATAAGTTTTTGGTTGAAAATGAAGATATC:1 - chr3L 12964691 3' - hobo 23 1 66.67 ATGGGTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATGGGGGCATTGCATACTTTCGGGCACAAAT:1 + chr3R 23601774 3' - jockey 65 1 54.11 AAATCATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTGCCCAGAAATAAAGACGGAAAAAGGGAGTCAACGCCAGAGAAAAACGTCTGCCTACCT:1 - chr3R 31887259 3' + HB 1582 1 69.86 ATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCAGATCCAATACTACATTTGCCAAATATTACCCTATTGGTATCTTCATGGAATACTTGCATATAAAGGGACCTCGACACGTTAGAGCACATGATGGCTTCCACAGCCTGAAGACG:1 - chr2L 19961888 3' - Idefix 6958 2 59.86 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGCTATTTATACTCT:1 - chr3R 11870058 3' - pogo 50 1 56.16 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGATCGGAGCTGAAGCAGCTTCAGCAACAGCTCACCAGCT:1 - chr3L 6355557 3' - Tirant 8120 2 75.38 TAATAACATAATGTGTAATATTGGGGTTTCTGAATGGGCTGATGTTCTTCGAATATCTTACGTAGAGTGAAAAAGTTCAAGATTCATAATTAAATGCATCCTATTTACCTGTAGATGTTCTGGCCAGAAAACCGAAAAGTTGGGCA:1 - chr2L 8166033 3' - G5 4687 1 60.96 CATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAAATATTAATGAAGTCATCAAAAGTGAAAAGATTAAAATTACATTTCTAGTTGTATGTTTTCCGGGAATACCG:1 + chr2L 9418607 3' - rover 6999 2 54.11 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTCTAACTCTGAGGATTATGACTGTGACACATTGTTTCGCCAGCGAATTATAACTTAAGCACTTTGTTAGCACTTGGCTAACAAGGAAATTTGGTAAT:1 + chrX 10580035 3' + pogo 2079 1 70.55 CTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCG:1 - chr3L 25232767 3' + accord2 173 2 53.47 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCTGGCAACAGTTTAACAAGCTTTTTAAAACTACAGGAAGCGCTGGAAAAGGTCTGAAAAAATATCGAAAAAATA:1 - chr3R 7585715 3' - Doc 21 1 68.18 GGGTCCACGAGTGAGCAAATCCTGATCGTCCTCGCGAAGAATTCTTCATGGGATTTGCCCTCCTTAATGTTGTAATGTTATTTTGTAAAATTTACTTTAAATAGTAAAGTATATACATCTGCAATATCAAATGATGCAGAGTATCG:1 + chrY 1995257 3' + Rt1c 5294 1 60.96 TGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAACTAAAC:1 - 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chr2L 17839360 3' - blood 47 2 53.42 AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATATTATTACAGTAGTTCATAAATCCATACTTTAATTGGATTAAGAGCGGCTC:1 - chr3R 30264028 3' + blood 7329 1 65.29 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTAATTATTTTTAAATAATGTTTAGGGAATTATTGTT:1 + chr3L 14375693 3' - roo 8749 2 80.00 GCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAA:2 + chr2L 17599965 3' - 1360 486 1 73.79 GCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTATCGGTGTGATGGTATCCAGGTAGGG:1 - chr3R 24750951 3' - G6 7 1 75.79 AATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAATATTCTCTCATTCTTCGCCGTCTTCCCTTCGTATGGACTTATCGATG:1 + chrX 22856945 3' + hopper 35 1 67.81 TGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATCGGGTAACAACATAATAATGTCACCTCAAGAAATCACTTAATGGATTTTGTTATGCAA:1 + chr3R 9299604 3' + Stalker4 6967 4 60.27 AGGATCAATAGCCAAGTCGATCTGGCTGTATACGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTTTTTTTCATAATTTTTTTAGTCTTGTACATTGCTTTCAATATAGCATTCTCTCTTGTTTCATTAATTCTTTTAACAAA:1 - 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chr3R 15484561 3' - Doc 4665 1 63.01 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAAAGTGCAAAAGGT:1 + chr3L 10469634 3' + roo 9031 1 57.53 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCCG:1 + chr3L 15723926 3' - jockey 4748 1 77.04 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTTTAATTCGGTACTCTCCCCTCCCCA:1 - chr3L 22594157 3' - 297 6608 2 58.51 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTGGCCCAAAC:1 + chr2L 12291969 3' - Tirant 8131 2 68.38 AATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTGTACATCAATCGCTGAAAAGGCACCGGGACCACAACATTGAAATCGACCAGATCTTGGAGAATTAGTGGTAATTACACTTTTCACGCTCCAATTGCTCATTTCCGTT:1 + chr2L 12831517 3' + gypsy 7432 2 43.84 AGACAAGATCATTCGCCAACGTGTTCGGGTGGGCGATAAGTCTGTCGGCATATCGGCTGCTGTGGAATTAATTTCGCCAAGAAGGGGGGAAAAGTCAAACATTTTACGGAGGCT:1 + chr2L 16957104 3' - 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Burdock 6163 2 54.29 CTAGAATAACAAGATGCGTAAGGGCCATACATTGGTTTTTCACTAAGCAGCTACTTGTTTGGTGACGGCCAAGATTGTGATCTTTTCTCTCGAATAGACTTGGTCTGGCCGCACACCTTCTCCACTGTGCTGGAGGTATACTACG:1 - chr2L 14976994 3' + 1360 9 2 64.83 AACCAAAGACACTAGAATTCTATTATTATTCTAGTGTCTTTGCACCAACCATATCTACCTTTATATAAATAAAGGTAGATAGTTCATATAACCCCTATTTCATCCAGTTTTCGCAAATCATTTTCTCTAATATCAATGAG:1 - chr2R 11728490 3' - Tc3 313 1 67.14 AATAACTTTGTGCCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTTACCCAGCTCCTTTCGATGTGATTCGACCATTTCCTGAGTGGAGAGCTG:1 - chr3R 22131130 3' - pogo 315 1 66.44 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTGCCGGGAAATCCGCACATAAATCTTACCGACACGC:1 + chr2R 1923611 3' + pogo 2077 1 68.49 CTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCATGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTTGTACTCTATTGATTTTATCCTATATCAT:1 + chr3R 5027278 3' - Chouto 78 1 96.88 TTTTAATTTTTTTTTTAATTTTTACCATAATTGGTACAAACGAGAAGATTCATGTCACTTCCTTCTTCTCTTATTTTGTTTTGCTGTTTCTAATCGACAACTTATTAGCTTTTAAAGCACAAGTGGGCATTTTCTGGTTTGTTAAA:1 - 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chr2L 14939838 3' - Doc 4675 1 76.15 AGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATCATTCATTCATTCCCGGACTTTATAGTCAACACACTGTAAAAAAGGACCT:1 - chr2R 5915825 3' - HMS-Beagle2 6960 2 65.28 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTGAGGTACCTCTGGGCTGCTGCTCTGGATGTTTTGTAGCCCAGTGATTGACGATAATTGACTGTCGCCAGCATAGGACATCAATCATGACGT:1 + chr3R 27810152 3' - Burdock 6163 2 67.12 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGATCGGAAACATGCTATTGATCCCAAATTCTATCAACTTACACTAAAGGACACGTAGAAGGTG:1 - chr3L 6095466 3' - transib2 57 1 57.53 TTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACTACATATATACATAGATAGATACTTTCGACTGAAATTCATGCTGGGCCTTTCGATTGCCGCACTT:1 - chr3R 8849751 3' + 297 6923 2 61.64 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTAGTCTTGAATGCCGGCCAGTCGTTTTTCCGGTCGGAAAAACTTCAGACATTTTCAGCAGACAATCAACAA:1 + chrX 4673742 3' - roo 8670 2 76.15 TTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACACTGGACCGATTCC:1 - 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chr3L 21013868 3' - roo 8743 2 73.97 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGGGAGAACTAAATAAAGCGATCCATCGAAAGCTTTTGGAGAGAAGATATATGCTTAGTCAGTTTCGG:1 + chr3L 2192359 3' - jockey 4709 1 50.81 TGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCACATATGATGCATGCCATATGCCATTACGTTTGGCGTGGTTTTGCGCTGTGACAAGTGGTTAGATGTTGGGAGAAGCTGGTCAAA:1 - chr3R 12520713 3' - Burdock 6173 2 58.90 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAA:1 + chr2R 11095818 3' + diver 6060 2 68.10 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTACGCATATCGGCACACATACATAAATACACACTGCACTGACAATGAGAGGAGACACAGTGCCGAAGAG:1 - chr3R 1267670 3' - P-element 52 1 52.74 CCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTTTAGTTATCATATTTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTAGGCGTGTGAAAACAGGAAATGTGTGATAACGACCGGCAGCACACATG:1 + chrX 20332284 3' + 1360 488 1 34.25 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACGTTTAGATACATTTATATCTAGTTATGGAGTGGGGGAGGGGGGGAATATTCTATCGAAGCCATTATCTTCGGCAG:1 - chr3R 25713998 3' + flea 240 2 65.00 GGATCACAATTGCGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGTGACACATATAACATGCGTATTATTCTATGCAATAATTTTGTGCTGCATACTTTTAGACACCTTACG:1 + chrX 18179885 3' - jockey 63 1 53.47 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCTCTTACTGTTTTAGAATATATCTCCTCATTTTGGCACGATATGCTGTTAAGCGCTC:1 - chr3R 20635408 3' - 1360 61 1 60.96 ATCTACGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTATCAGATACACGTTACTCAGCTGATAAATTTAAAAACAATAAATATGCCTCCATATATGGATGTTATATATTTGCCGCC:1 - chr2R 5504347 3' - pogo 6 1 73.76 TCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACA:1 - chr2R 21848702 3' - Transpac 5007 2 77.93 AAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATGTATATATATACATATAGATACATCGATTCTCTGGCGATTCTTCGAATGACTCATACTCATCAGTAAATTGCGCACTCATTCACTGACCAATTGAATGCA:1 - chr2R 7720647 3' - Bari1 17 1 71.92 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTATCTAAGCCAAGTTTGTTATGTGGGTCGAAATGCTGCGACTGCTAGCCATGCCATTTGCCCAAATGAAAC:1 + chr3R 25804225 3' + mdg1 7409 2 51.37 ATGGCGACTGAACCGTGTCGAGACAAGCAACGATTCATTTTACATGATTTTTTTGGTCTTTTCAAATAGGAATTCCCGAGACTAAAACGTTCGCAAGCATTCCGCTTCCAGAACGATTTAATTTGTTTTTGTTATCAAAT:1 + chr3L 25846612 3' - mariner2 111 1 84.29 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTCTAACTCTGAGGATTATGACTGTGACACATTGTTTCGCCAGCGAATTATAACTTAAGC:1 + chrX 10579997 3' + pogo 2041 1 60.27 ACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAAACCCTGTTGGAATGCTGTAACGTGCTGCAAATATTTCGTTTTCAGGTACCAGAACAAACTTCG:1 - chr3L 19999166 3' - 1360 45 1 51.49 CCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAATGGAAAACACTCTCTCCGATGTGTAGAGTATAATAATCAGGCTA:1 - chr2L 17295572 3' + Doc 448 1 73.53 GGTTATAAAGCCTGAGCAGGCAAAAATGAATTTTTTGGCTATGTGATAAAAGTGTAGTTATTTTAATGCGAAATTACTTATTGATAATAATAATAATAATAATAATACCCTTTGCACGGGTAGGAGTAAAAGGTTGTGCCTTACGC:1 + chr2R 5179660 3' + Cr1a 479 1 47.95 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAATGTATTAGGAATTCGTTGCCACTTGCCCATGTTGTATTA:1 - chr2R 13293369 3' + roo 8992 2 73.10 AGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCATAATACCTACAGCAGCTTCTCATTGAAGTGAGCCTCCATTTGGCGCAGCTGCATCTCGCTCATCTCC:1 + chrX 3492548 3' + roo 8962 2 53.62 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGTTCTTCCATAAAAGTGAAGCGAAAAGGGTTAACCTTTAAAATTTACAATGTCCCACGGTCGCCGTTTTTATGACAGAGGG:1 - chr2R 19843285 3' - jockey 21 1 71.43 ATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCAAAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGATCAATCG:1 - chr3R 16582507 3' - BS 5052 1 71.92 ATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTCTGACTTGTTCATTTTGCGAGCTGCCTCCTTGCTGTTGGCTAAAGTCAAAAGTTACTGTAAGAAAAGTG:1 + chrX 5549082 3' + Tirant 8382 2 52.74 ATTAAACGCAATTTTTTTATTCAATATAATTAAACAATATTTTAATTTAATTCATTTTCGCTATCCGCCTTCTTGTCTTATTCTTCGCGACAATCCGTTGAGTTTCTCGCCTCGGCTGCTCTTAATTGAAAATTGTTTCACACATT:1 - chr3R 9290760 3' + S-element 84 2 75.34 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGATCGGAGCTGAAGCAGCTTCAGCAAC:1 - chr3L 6355569 3' - Tirant 8148 2 58.90 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGCATTGTGACAGGTGCAGCCGTATTTATTATAACAAAATGATCAAAATTGTGATA:1 + chr3R 17047901 3' - 412 7121 2 61.64 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACGCCCATAATGCGACCCAAAAAGTTTTGCATATTGCGTTTTTAGGACATGTGTCCCTAGCATCGTATCTATAATATGTGG:1 + chr2R 14135382 3' - copia 43 2 54.79 GGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGAATTTACATATTTGGAGAGTTTTGACCAATTTCGTAGCAATATGATGAAAGTGGAATATAAAAAAAAATGAATATGAAAAACAACTGAATCTAATGTGCATTTTAAATTATAAAAT:2 - chrX 11451798 3' - 1360 3177 1 80.82 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGATCGATGGAAACCGGTTTCTGTGAAAAGTCTTTGCTTTCGTCTAAGGAGAAAAGTTGCCACGACCAAAACTCGAGGTTAACACACTC:1 - chrX 4673561 3' + roo 389 2 71.92 TCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTCTAACTCTGAGGATTATGACTGTGACACATTGTT:1 + chrX 10579973 3' + pogo 2018 1 75.86 GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGTCTTGAAAAAAGAGCGAGGAGTACACACGAACACAAAAACGATTACGAATACGAGTGGGACGTATATATGTGT:1 + chr3R 25050116 3' - P-element 25 1 66.91 ATCCCCATGAACTCCTTACACGTAAGATAGTATAATCTCTACATACGTATACACTATAATTGAGGAACAGAATCCATCATCATCTTTAGCGCGACTAACATCGAAATCGACAGCGCTGTGGGCAAGCTCTTCCAGTAAAATGATGT:1 + chr2R 2944494 3' + G5A 2696 1 56.85 CAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGAAAAAGCACAAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAATATTTCGCAGCTCCCATGGAAAATCGTAAA:1 - chr3R 6015104 3' + Juan 4128 1 73.97 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTTTCCTTGATGCGCATTTGGCACAGCGCTGCAAAGCGTGC:1 + chr3R 26846824 3' - hopper 80 1 69.86 CCTTAACGTTATTATTAGTTAAATATATCTTAGAATAATATAATATCACAAAATGACACAAAAGGACGAGTAAATGTAAACTTTTTGGTGGCAGTGGTGGGTTCTTAGTTTGGTTTCGTCTACTCCAGTCATCATTTATTTTGAGG:1 + chr3R 5287741 3' + 1360 308 1 67.12 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTCTTGCTTTCCGGTTTTTTGCAACACGAGCCTCTTTTCAGGACCTTGCATTAAATTTCGT:1 + chrX 21403524 3' - roo 8685 2 68.57 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAAAACATTTTCAAATTAGCTC:1 + chr2R 10160627 3' - hobo 38 1 51.82 AAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGAGTCTTGACAAACTGTATATGACCTTCGAGTCGACTTGAAATATTTTAATGTTTAACATTAAAACATTAAGTTCGTATCGGGAAGTCCTACAAGTGGGGTATCAGTTT:1 + chr2L 19245127 3' - S-element 32 2 72.60 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCT:1 - chr2R 17097501 3' + P-element 2823 1 25.44 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATA:1 - chr3R 26486021 3' - 412 7115 2 57.53 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTTATTTGGGCCTATCTAAAGTCCCTAAAATTAATTATAAGACACTTTGAATTTATTCTTTTATTCAACAATAGCTGCAG:1 + chr2R 21844059 3' - pogo 35 1 61.11 AAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATTCTTTGTACATATTTCATTTAAGCCTACGTAGGGTTTCTGTTCCAATTGAATGACTACGATATCTGGAGATCCCC:1 - chr2L 9418475 3' + rover 7255 2 51.03 AAAAAAAAAAATGGAAAAAAGGGAAATCGAAGCTGAAGCCTATGGGGGGGGATGCCCCCTTTGTA:1 - chr3R 22322280 3' + Bica 341 1 87.69 GATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTTCCACCACTCCTAGCCCCATCATAATGAGACAA:1 - chr3R 14743492 3' + Quasimodo 7133 2 76.92 GAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAAACTCGCATAACGATACATAGAACATTACGCGCGAAGTAAAAGTTCCTCCTAAACAAACTAA:1 - chr2R 12065532 3' - Stalker2 12 2 78.77 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTAAA:1 - chr3R 6645326 3' - blood 7076 2 59.31 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGTATGCTTTTAAATTTTAAACAGTTTACCATTCATAACTCCCCCTGCCAATAGTTATTATAGCCAGATCTCTCAGCCAGATTGGCCTCTTA:1 + chrX 7385030 3' + I-element 5325 1 68.49 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGGCTATATGGCAAAGGATGTGGAAAGAGGTCGGTTT:1 - chr2R 21748263 3' - 1360 74 1 74.07 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATATATATAAGATACGCATATAAGCGTTGCTGCGCTGCAGGC:1 + chr3R 972122 3' - 297 40 2 68.47 ATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAAACTCTGTACAGTAAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAATAAAGATCTAAAGTAAAAATACCTCGTGTGTGTGTTGGGCGCTTACCTTGTGAGAACTACGTGA:1 + chrX 16500503 3' + rover 174 2 76.03 CGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTAAAAAAGAACTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTTTCTCGCTCTCTTTCGGCATTCAACTTCACTCCCTTGCTCCGTCCCTCCGACTGTTTATTGATTCCCCGTACC:1 + chr3R 30563720 3' - 1360 169 1 58.22 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATACATATGTATTTGAAAAACTATTGAATATAAATAGTTAATTCTGTGCGATGTTTTTCTACACAAATTTGAATGTGGCTAAAGTAAGC:1 - chrX 5772980 3' + jockey 4960 1 57.64 ATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTG:1 + chr2L 19160421 3' - 3S18 5848 2 71.23 TATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACTAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACT:1 + chrX 1018156 3' - 1360 239 1 67.81 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAACGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTT:1 + chr2L 8574483 3' - Transpac 4956 2 58.90 TTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAACTACCTAGTATAATTGCAGTATTATTATGAAACAATTTGATTTAATTCTTGGGCATGCTTATTTAGCGATATATTTTTT:1 - chr3R 9583266 3' - Juan 4068 1 56.16 AAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTGATGGATTACTCTCGTTCAAA:1 + chr3R 7616835 3' - Stalker2 7298 2 55.48 ACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGCGGAGTAAGTACCTCGGCCGATGGCCGCCGGCAGAGTCGC:1 + chrX 17461513 3' + F-element 4242 1 72.60 ACTTATCCATTCTCACGGGCGCCGCCATATTACCCACCGTTTTCCTTTCACACTCATTCGTGAAAATTTCTATGTCCAAATTTCCGAATATTTCGCTTAAAAAATCATTTACGCGCTGCATTTCATATTTAAATGCTGTCTTCGAT:1 + chr3R 21973815 3' + GATE 473 1 62.33 TGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGGGTTATGCAAAGTAGGTAGCCGCGACCGGATGTGCAATTTCAATCACTGTAATTTGAATATTCAAATTTCAGAGCGAACGTAGGAAAATAA:1 - chrX 7150521 3' + roo 43 2 64.38 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCTGTTTCGTTCTGGAGTGGTATTTTCTAATTCATTTAAATGTTGCTAATATTTAAGGAATTTTTAAAAT:1 - chr3L 8658708 3' + roo 9020 2 52.05 TAATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGAATTTAGGGGGCCGCAGTGTACAGTTGAGAAATTGCAAACTGAAGCCTCCTTTTATATATAGTATATATCCCTGCTTTTGATGGCTCACCT:1 - chr3R 25804084 3' - mdg1 31 2 61.64 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCCTTTTGCACAATGATTATGTAAATTTATTGATTTACCTGCGCTGCTCGAAACAGCAATAATAGTA:1 - chr2R 22463130 3' - roo 8694 2 57.02 ACACACACACATAAACAACCACACTTGACCAGCTTTTCCGAGACAGGGAATTGAAAATCGAACTGGCGAACTGTGGAGCTGTGGAGCTGTAGTGGAACTGGAGAAAGAAAAGTTTCTTTC:1 + chr3R 28051363 3' + Quasimodo 43 2 82.50 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCGTTTTGGTTGGAAGCCACTAGCTTTCAGCAGGCGAATCGCTCCTAGATACTGAGTG:1 - chr3R 23098169 3' + roo 9006 2 62.33 GGCTGTTGCGAGCATATACCACGTGGCTGCTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGTTCGTGAAAACATTAAGAATATACGGTAAGAAAATAAAAAAGCAATTGATTTAAAAAGAAAGCA:1 + chr3L 24152844 3' - hopper 1248 1 56.16 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGCATTTTACGTCCTTG:1 - chr2R 15075576 3' + mdg1 362 2 58.87 TTAATAGAACAATTAATTTTTTTTCATGATCATGCATTATTAATTTTAGTAATAATTACAGTATTGGTAGGATATTTAATACCCTGCTCCGCAACCGGAGTCCCCGGCAGAGTTGTGGCTCTGCGTGCTTCGAGCACC:1 + chr2L 15070049 3' + TAHRE 61 1 41.30 AAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACATATTAACCCATTATGCCATCAACAGGTGATTTTAAAAT:1 + chrX 3001352 3' - Transpac 4990 2 73.85 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAATTTCGAAATTCTATGGTATCCCCAAGTCGATTGCTTCTCACATATTTTGCTCCAGCTTGTTTTGAATGTCCTTGCTGATTTGATTTCATTGAAAATTAATGCGAGA:2 - chr3L 4081527 3' - mdg1 15 2 73.97 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTTATATATGTATGTGTATTTATTCACTTCGCTCTTCGTGTTTTTAATGAATTGTTGATGGGAATTAATGTGCGCATATTTAA:1 - chr2R 14973581 3' - FB 40 1 56.85 GCGCCTGCAAGGGCTGAATTAATAGAGACCAAGATGACAAAGGGGTGTTTAGCTACCCCGTATGCCTTAATAAAGTATAATACGTAGATTTCAAATTTCAATCAATATAATCGAAAAATATCGGCAACTCGAAGTGGAAAATCCAA:1 - chrX 5467907 3' + BS3 1701 1 54.79 TTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAACGTACAAGAATAATAAATTAAAAGCAATAGAAAATGAAGTGACTATTTATATGCTCCATAAAATATTCATAGTTTAGGCTTAGACTTTTGA:1 + chr3R 5316595 3' - copia 5043 2 55.17 ATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGAGTTAATATGAAATGAATACGGTTTCCTTACTATTCGTATACCTTTT:1 + chrX 8977517 3' + I-element 5282 1 66.44 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGGCTATATGGCAAAGGATGTGGAAAGAGGTCGGTTTGCTATTCACTTGACTTAAAATGAATTTAAGTGGTTTGCT:1 - chr2R 21748224 3' - 1360 46 1 50.68 TAATAATCCTGGCGATTTTGTGATTCTCAATCACGGAGATCTGTGGACCACCAATATTATGTTCGAGTACGATGCAAAGGGACATCCCATTAATGCTGCCTTCATCGATTTCCAGTTCAGCGTGTGGAACTCACCAGCCCTCGATC:1 + chr3R 25268094 3' - BS3 1373 1 71.92 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTCA:1 - chr2R 6798228 3' - jockey 32 1 55.34 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGT:1 - chr3R 9125679 3' - Doc 88 1 71.23 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCATTAATGGTTAAATAAATAAATTGATAATAATGGCTGTGTTTATTAGGCATAAGAATGTTAATGCTCGATACGAATAAACGTAAGCTATATTTAGCAAGCCATTTT:2 + chr2R 13293495 3' - roo 8680 2 76.71 AGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAGATTTAGTATGATAAATAAATGCTTAGCGACGACAATTTGTTGTCGCACC:1 + chr3R 7868018 3' + Transpac 4957 2 60.98 TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTGGCTCAAAGTCGCAGAGAACGGCTAGAGCAAGCGAACGACCGTCAGAGAA:1 + chr2R 1320503 3' + Transpac 5198 2 52.29 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCGACTAATTAACTATTAGAACT:1 - chr2L 2494821 3' - Doc 57 1 55.63 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACGTGGCCAAGCACGCGAC:1 - chr2L 13629021 3' - Tirant 8115 2 79.85 CGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGACTTAATGCTGAAAATATTGGTAGCTCTAAAGTATCCAAATTTCTTTAAAGTAATCAAATGTAT:1 + chr3L 21665328 3' - 1360 44 1 52.99 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGTTGCCAGGCAACAGATTTAATAAAGAAAAAAACAGCAGCCACTTTACTTTAGCATTTCAATTAAAGTTTGCCCATTCTGTGAAACTTAAACCGCAAGCTC:1 + chr2R 15075714 3' - mdg1 7059 2 71.23 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATTAATGCCGCTTTAAGGTATTTTTGCGCTGCCCGCAAATGAATCGATCCGTGCGACAATTGCGAAAATATCGTTTAATTAAAACAAATATGCATAGATTACTTTAAATACGAC:1 + chr2R 22463307 3' + roo 402 1 65.75 AAAAGTGAATCATTTGTTGAATTGTTTGAAAATAAATACCAAATGATATTATAAAAAAAGATTACACATTAAAACTTAAAATCACTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTAGATAAGAATATGATGCGATATGATATGAAACAAGAG:2 - chr2L 21149227 3' + HB 1504 1 56.85 GTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGG:1 - chr2R 12065608 3' - Stalker2 7336 2 76.71 GCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGACCCTTCTGGAATGGCCTTGAGAGCATAGAACATGGAACATGTTCTTTTCATT:1 + chr3R 5801064 3' + mdg1 7239 2 62.59 AATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGATAGGGTTCCATGGTGTAAACGGTGTAAGCAATTGGTGTTGTGCTGGTTGTTGTTGTTGATGTGGTGGTGCTTCCAGCAGTTGTTGTTGTAGTTCCTATTTCAGTGCTG:1 + chrX 4244596 3' - Idefix 292 2 78.62 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCTTTTCGCTGCCCCTTACTTGC:1 - chr2R 18689141 3' + Burdock 6357 2 52.50 TCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCATCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGCCCCCAGCTCCAAAGTTCAATCGCAAATGCCCAGATAAAAATATGTGGAAGGTTCTACTTATTTGTGTGGT:1 - chr2L 19388506 3' + 1360 241 1 51.37 ATTGGCTTTAGCTACAAGTTGAAGCCTTTTTTTCATGGATTGGACAAGTTTTTGCAGGTCATATTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAGGCTCTTCTCTTTCACACGTATTTACTACAATGTTT:1 + chr2L 16276992 3' - S-element 1399 1 75.35 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGGCATTAAATAAATAAAGGCCAACTTGATGCCGTCCTA:1 + chr3R 18528391 3' - roo 8706 2 54.79 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTAGACTTTGTAAAAGGGTTCTAAGAAAGCCATTTAAAAGCACACTTTAAAAG:1 - chr3R 18153565 3' - copia 71 2 65.07 TGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTTTAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATGAATCCATGAAAATGTTACCAAAAAGTAAAAACTGAATTTCGAACTTGTTTTCCC:1 - chr3R 16947770 3' + 1360 463 1 64.38 ATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGTATGTACTAATGACTTATTCTCATAAAATTG:1 - chr2R 19159454 3' - opus 7353 2 69.00 ATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTACCAAAATACCGTACTACTTGTTGAACCTATCACACCTGATTATTCCAAATTGCTTCGAAAATGGCAAATAGCAACA:1 - chrX 18583995 3' + Stalker3T 289 1 70.83 ATTTCTATCGATTTGCCAAAAAAAACTTTTTCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGCGGTCCTAGTATACCCGGATACCAAAGACCCTAGAATAACTTTGCGGATACCCTAGCATACCGGATTTTACTGTATAAAAGGAAGTTGCG:1 - chr2R 5738121 3' + INE-1 310 1 73.97 TGATTTTACAGTTTTTAATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGTCACACATTCAACATGATTAGACTCCGTCTCGTTTAATT:1 + chr3R 10988110 3' - 412 7402 2 73.29 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTG:2 - chr2L 14969104 3' - 412 78 2 71.23 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAATG:1 + chr3L 8658804 3' - roo 59 2 66.92 AAAAAAAAGAAAACAAAAAAAAACCAAACCATAACCAGAATATAAAAGCCAGTCACC:1 - chr2R 16329296 3' + gypsy7 5008 110 78.95 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAAA:1 + chr2R 10160609 3' - hobo 49 1 55.38 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGACTTTTGTATTTTCATTTTTGTATTTCACCTCAAGTATCACACTGATAATAATTGATTAAAAATTTAATGAAA:1 + chr2R 1373234 3' + pogo 2094 1 77.60 ATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGTGCATTGGAGATCTAAATCCTCCTAATAATATTAATGGGTATGGGTAAGTGAAAATTGGCTCATCAGGATAGCGCCC:1 + chr2R 5312211 3' - 1360 3211 1 42.86 AACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGAGCCCACAACAACCACAGAACCAACAACAACCACAGAGTCTACTACAACCACAAAACTTGATACAAATACAGATCTAACGACAACAACGACCCTCTTAACAACAACAAAA:1 + chrX 12969187 3' + I-element 5171 1 76.03 TAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAGTTTTGTATGCGACTGGGTCTGGTTGCTGTTTG:1 + chr2L 5646948 3' - jockey 4646 1 76.03 ATACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACATATGCTATGATATATGCTCACCAGGTTTTTCAAGTGCACACATATATATTT:1 - chr2R 17169209 3' + hobo 2904 1 54.46 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACTGGCGCACCGCACTGCATTTATTTATTTGGACACTA:1 + chrX 16117302 3' + opus 470 2 65.07 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGCAAGCCCTTTTAACGGCC:1 + chr3R 30264097 3' - blood 45 2 59.66 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATACGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCCCGCCCCTAACCACCCTTC:1 - chr3L 9469937 3' + 412 421 2 63.70 GAATTCTTTTTCATATGTATGCACATAAGCATACGCAAGAGGCGCTCTCGCGCAGATCAAGTAAACAATCCACTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTATTTATTGTCTAACTTGTGTATTACATTTTGTTGATGTCGTA:1 - chr2R 23340554 3' + Tom1 171 1 71.92 GTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTG:1 + chr3R 7616815 3' - Stalker2 7318 2 69.18 CTTGATTTGTTGGTACAAGAAGGTTCGTTGGGGTATGGGTTATTGGCCTCTCGTTGTCTGCGTTTGAGTTGAAAAGTACGAACCCCCACCATCGTGTGTGTGCGCAAATATTTTAACTTTTTCGGATTGTTTTGGGTCATGTGGG:1 + chr2L 20144809 3' - F-element 342 1 55.17 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAGAAAGAAATA:1 + chr3L 13364399 3' - hobo 49 1 53.19 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGACTTTTAACCATTTCATTACTTTTTTAAGCATAGATGGTAGTTACACGTCATGTAGTTTAGCTTACATTAATTTAATA:1 + chr3L 8246734 3' + 412 476 2 49.32 GTTACTTAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGGAATATAATCATTTTTCTGTGATATCGATACATATGGGGGAAAAAAGTGAGAGAATCTGGATTGTGGGGGAAAAATGGTAAATGGCCAGACATTGTTGCGTATGCGGAAAGGAGGAA:1 - chrX 2510860 3' - INE-1 534 1 57.53 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGGATCTACTGGC:1 + chrX 16117270 3' + opus 7467 2 54.17 CTGAAACCAGAAGGATGCAGGACAACAGAAGGATAAGGTGGAAGGAACAAGGGAGCTGCCTATGCGAGGAGCGTCATGAAATGTGTTAGCTCAACATGCTTATATTTTTTGTATAAGAACTTATGCACAAACTTACAAATTAGTAA:1 + chr3R 23388410 3' + gypsy8 4538 1 50.00 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCA:1 - chr3L 21013877 3' - roo 8735 2 77.52 CCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGTTAGAAAGTTAAAAGTTGACATTTAGTTTCTTTAATACCTATATTGTGTGGCGCATTCAATTCGGGATGGTAGCATTATGTAAACGATATTTTTCATTTACGCACATTTCAATGATGGCCAA:1 + chrX 19403176 3' + INE-1 146 1 54.11 ATTATTATTATTATTATTATCATATTATCATTATTGCAAATGAAAATCCTGTAGCACAGACAAGTTTTGTTCACTGTGGGCCCCGCAGGTTTTCTGAATGTGTTAATCATTTCACTTGGCGCACGTTTCG:1 + chr3R 25767850 3' - mdg1 7068 8 73.85 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGGCGTACTTCAGTGCAG:1 - chr2L 13629047 3' - Tirant 8142 2 58.52 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAA:1 - chr3L 27415200 3' + transib2 2779 1 54.17 AAATTCGTTGGTTAAATTAGTGCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAATTCGCGAACAGTTGTTCCCATCGCCACAAGAGAGAAAACAAAATTACTATTACTATCTTGCGCGCTTTATGATTTTTAGTGTTTATTTGCGATT:1 - chr3R 19569761 3' + HMS-Beagle2 415 1 57.53 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTAAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGACAAAAAAACGAATGATAAGTAATGGGATGAAAACAACTTGTTAAAACCTCTATAAA:1 - 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chr3R 9125629 3' - Doc 37 1 64.83 GGCTATTGATCCTGATCAGAAATAAAATACTTTATATGGTCGGAAAAGCTTCATTTTACCTGTTACATACTTTTCAACCAATATGGTATACCCTTTAAATCTACGAATTTAAAGCTAGAAAGGCGTATACTTTAAGGGTTAAAT:1 + chr2L 22192268 3' - INE-1 87 1 68.75 AAACACAACCCTGCACAAAGACCTCAAGATAGCCACTGTCTCCGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCCCGCTTAATGTGTCTTAAAATTTAAAGTCTGGGTTGGTTTCAAGAATACAAAGCCCATATGTAAATGAGTCTGATAAGA:1 + chr2L 12494373 3' + BS3 1417 1 49.32 GCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCATTTT:1 + chr3L 7801331 3' - Transpac 136 2 57.86 ATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACAATTTAATCGGC:1 - chrX 15746257 3' - jockey2 3205 1 76.32 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAAGCCAAAGCAAAGCGTTCGAGTGGCAAAAAATAAGTTAGCCCGCGTTATAA:1 + chr2L 17839517 3' + blood 358 2 70.55 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTAGTTGGCAATTTTTTTTTGTTGCCCGAATGTGAG:1 + chr3L 4524004 3' + roo 9008 2 71.54 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGGGTTTCCA:1 + chr2L 14239231 3' + 412 424 2 64.38 GCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCGGCGGAAGTAGAAGTTAAAGCTACATGGTGGAAAATGTTGATTGATAATCGACCTTGCGAAGGGGAAAATTAACTTTCC:1 + chr3R 23235330 3' - BS 37 1 53.42 CCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAACGAAATGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3L 5685501 3' + F-element 460 1 74.45 TTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAATTAATCAACAATATTGACTTAAAGCTGTCAACTGAATTAAATTAAACTGATT:1 + chr3L 11396008 3' - I-element 66 1 63.01 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGACTTGGGGGCCAGTTGGCTAACCCC:1 - chr3L 10761018 3' - accord 183 4 89.36 CGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGGGATTATTGTGCCGGCTCCAAGGAG:1 - chr2R 13367405 3' - jockey 4580 1 69.18 CAGCTTACATTTTTACTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACAACTTTAAATGACTGCCAAAGCCTCAAATGGGTGTATAAATCCCCTGTAAAGAACTTCAACACAA:1 - chr3L 5398651 3' + rover 7037 2 54.79 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTT:1 - chr3R 6413567 3' - 1360 63 1 69.23 ATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTTATTTCTAAGTGGAATATGTGAATTAAAGAAAAGCTTTTGGACTGCAAAATGATTAAAGTTGCCAGCCGTGCCCCAAAAAACG:1 + chr3L 15355998 3' + Bica 124 1 65.75 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAAACGCTACGAAACAAGGAAAATGTTACTACTTCTATTCATGAGAGTGTGGGCGGGGCTTAAATCGAATAACTTTGTATAAAGATTT:1 + chr2L 23068966 3' - 1360 35 1 61.64 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTCGCCCTTCACGACATTTTCATACG:1 - chr2R 11263986 3' - jockey 4736 1 61.64 AAAAGAGAGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGAATGTTTACAAGAACGGCTAACAGTTTTCTTAATGTCAAATGAAACGGAAATTGATAAGGTCGCATCAATTTGTAGCCATGTTGCGGATGGTAGATACTTTCCACCCC:1 - chrX 22742957 3' - 297 6739 2 61.64 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTGGCACT:1 - chrX 7756375 3' + roo 9018 2 54.79 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTAAAAATTCTGTTATTGCTGTCGAACACACATTAAAATTAGACTAAAATAAACCCAAAGCAACTTTTAAATTGTACAATTGTTGTTCC:1 - chr2L 15644828 3' + transib2 2792 1 63.70 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAGTCTTCAGATACATTTAGTATCTTGAAGCTTCAAGAAGTTTTCTAAGATGATTAACCATAGAGGTCATTGATCCT:1 - chr3R 6135958 3' + mdg1 7413 2 52.05 ATATATATAAATATACATATATGAATGAAAAACAAACTGTGAACTAGACCACCGATCGTAACCTAAATGTATAGTATTAAAAATCATTTGTATAACTGACTTTGCCCTATTTTTAGGTTCCTAGCTTTGTAATGATTAAACCTCTT:1 + chr3L 20580183 3' + Stalker4 87 4 61.64 AAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATGAGTGCCCCACATGGGGCGCCATATGTTACTTCAGGGAAGTTCATACA:1 - chr3L 21093153 3' + Ivk 5305 1 67.12 GTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGATTATAATTCCAATTCGGTTATCCAATAATAAGTGGAAGTGAAATACGAAACAAAATAATTACGTGGCGCTGTCTTATTTTAATAATT:1 - chr3R 11289399 3' + 297 487 1 77.46 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGATTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGCTTATTTTTGGCTGAGCAATGAGGTGTTAAAATTCCACTGCATACTTTCTAG:2 - chr2L 13842282 3' - jockey 4739 1 62.07 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAATATTTATGAAGCATATTTTGCGGCTCCGTTATTTATATTTCTTTGGTCAAAATATCTCTTCTACTTTTAGGCAGAT:1 + chr2R 11264090 3' + jockey 4948 1 51.37 TGGGTTTTAAAACGGAGTTATATAAGAGGACTTTGTACTCCAAGCTTACGGGAGAGTGAACGTTTATAAGCCAGTGTAGATCCCTTGCTTTTAGTCTCTACGCTTCCAGTTGGCCTAGGTTACCCTTGTGTTG:1 - chr2R 15155831 3' - Doc3-element 4297 1 72.93 GTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATGTCGAAATGGAATTATATGGTAATTGTGATTTTCCTCTTTGTACCGGTAAGTCCGACTTATATGAACGTATAGAAG:1 + chr2L 4643059 3' + mdg1 99 2 58.22 GACATTTATTTATGCAATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTAAAGAAATCT:1 - chr3R 6645319 3' - blood 7070 2 54.79 CGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGACGGTAAGAATCAACTTTCACAGCGTAAGAGTCTCCAGAAATTGCTTGC:1 - chr3R 8042248 3' - BS 1 1 73.97 AACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAATTCAACGGGCGCGGTTTGTCAATCAGCCACATCAACTGGGGCTCAACTAAGGACCCGCATATG:1 - chr2L 4732240 3' + Bica 4600 1 52.50 TATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTTCTTCATTGGCATTTCATAAATAGTTTTATTTGGCGCATTAAA:1 + chr3R 15152704 3' + opus 7426 2 70.55 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTTAATGAACTACAATAT:1 - chr2L 19691237 3' + roo 345 2 60.96 CTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTGGTATTTTAGAATATCTAAAAACGACCTTTCAATTTGTTGTGGACTTGGCTCAGTTTCGCCTTTTTTGGCATGTGCGCATTTAATTGAAATTTCAACAGACGCCCAC:1 - chr2L 19310277 3' - Juan 4087 1 63.70 AGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACATAGTACAATCAAATATAATAAAGATTACATTGAGAAATATAATAGAACTGGATTTGTATCTTGAAGCATCTGACCATTATG:1 - chr3R 12744629 3' + Stalker2 7615 2 50.68 CAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAATATCTTTCTGACGAGCATTTTCATTTATATAGATTTAAGG:1 + chr3L 16682144 3' + 297 203 2 72.60 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTGGTATAATTTTATTATATTGCATATTATCCTTTTAAGGTGATATTTTACAGAATCACAAAATAGTTAAATCAATCAAACGATTCAT:1 + chr3L 19864064 3' + roo 9037 1 64.38 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTTTTAGTTGAAATGTTTAACGGATTTAAGAAAGTTATGCAGTCATA:1 - chrX 16994503 3' + roo 335 2 67.81 GAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATCTGAAGCTGAAGCTGGCATTCCATTTGAATTATTCATTGCCAAGGCAGCCACATGGGATCGAAAGTGGAAATGGAAGTGGCAATAGCAATTGGAGCTGGTTTAATTG:1 - chrX 8219319 3' + opus 487 2 77.40 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGACTCTGATC:1 - chr3L 18253805 3' - blood 7090 2 72.22 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTGTATACTTCACCGGACCAGCGTGCACATT:1 - chr2R 4830309 3' - 1360 71 1 94.52 TAAGAAGATCCCTTCAGTCAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCAAAAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTCTCGCCGACATGTATATTATTGGTGCATTCATAGAAAGTT:1 - chr3R 7481534 3' + invader4 2991 2 76.03 TAGCCCCGTTGGCTCCCGTCCCAGACCGCAAGAAGTTAAACCACCTTCTATAGTATCAATTTTGGCGCAGAGAATAGGCAAATAATCAATACTCCGTAGCATTATTTATATTATTTATGATCACATCGATAGACAGTAGACATGTA:1 - chr2R 5183760 3' + mariner2 237 1 78.77 CCGTGTGTCCGCATGAACGTCGATATCCCCTATAAAAGCAATAGATTAGGAGTGCAGCTTCTAGTGACGCCGACGTTGTGAGAGTTTCTTCTCATTTTATTATTTTTCGTAATATTGTTTATTTTATCCAAAGTCTACACATCTCA:1 - chr2L 20840107 3' + INE-1 127 1 78.77 ACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGTAAGATGTTAGCTTCTTGC:1 - chr2R 5582120 3' - Cr1a 438 1 79.31 AAACATGGTCGTCCATATTCGCGCACGAAAGTCAGAGCATCCTGTAAATATTCTTGCATATGACGTGGACTGCCTATTTACGATTACGGTAAAATGATATGGTTATTAAAATGAAAATTCAGCTTTTTATAA:1 + chr2R 19652259 3' - Helitron 152 1 79.55 AAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACACACACACACACACACACTTTCTCACCGACGCACCCGCACGCACAGGATATTCTTCTCGCCGCCCTGGCAATGTCCCCTTTTTTAGGAGCACCCTTA:1 + chr3R 14046818 3' + hobo 2624 1 65.07 GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGG:1 + chr3R 11095878 3' - hopper 70 1 64.38 ATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGACCGTCTAGAAAGAAAATTAAGTGGGTGAAGAG:1 + chrX 5035755 3' + 17.6 147 2 78.08 GTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGGGATTATTGTGCCGGCTCC:1 - chr2R 13367411 3' - jockey 4577 1 69.34 TAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATAATAGTTATCACTTTTCCACTTGCAACCTGATGAA:1 - chr2L 2895573 3' - Burdock 6215 2 77.08 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTTCAATATGACTTTCAAACGCCGAAGCTAAAATGAAAATTTAGCTTATTAAAATATGAAAAATGTTGCACTTCAATAGGTTGCCTGTG:1 + chrX 20975871 3' + copia 257 1 62.76 ATATTTTTGTTAGTGTGTTAATTTTTGGTGGTGTCCCTCTTAAATTGTTGCTGCTGCTCCTTCTGTTGCTGTTGCTTTAATTAAATGCTGCAATCAACTGCGTACACCTTTTCCACGGCGTGTTTTAAAACTAAAAGCCCAGCGGA:1 + chr3L 11371861 3' - gypsy10 493 1 71.23 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACAC:1 - chr3R 16276310 3' - pogo 35 1 59.12 GGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTTAACTATCCGGCTCAACTATGCAAATGGATGGACGG:1 - chr3R 25277589 3' - 3S18 5785 2 66.67 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCATAAGAACTAAAATACTTAAAGGCATACTTATAATTTCCAGAAGAGGATAGCTATACATTAA:1 + chr3R 14954112 3' - jockey 4785 1 40.41 GCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCG:1 + chr2L 8574439 3' - Transpac 4978 2 70.16 CAGAGAGAGAATGCTATAGTCGAGAGCTCCAACTTTTTGTTTTAAGTGTTTAAAGATTGGTGTGAACAATCCAAAAATTATAAATGTTTGTTTATAATACACATGTGTAATTTTCACTCCCACTTAATTATTATATTTATGTCTTT:1 + chr2R 21778561 3' - INE-1 579 1 76.71 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTACTTTTTCGGGCACGC:1 - chr2L 12325007 3' - jockey 4700 1 57.72 TTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAATG:1 + chr3R 934289 3' + Rt1b 4745 1 59.59 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCC:1 - chr3L 7837160 3' - jockey 4777 1 60.58 AGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTTGTTTGTTTTACCTTTTTTTATGGCCTGACGCC:1 + chrX 10111077 3' + mdg3 5470 2 67.06 AATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCAC:1 - chr3L 7837164 3' - jockey 4797 1 50.83 AACGGAGTTTTAATAATTATGTTAAAAAAATAGAATTATAATAAACCTCAGCTGGTTTTACAAACCCAAAAGTAAATTCGCAGAAATACCTATATTGAGCTACAAATTGATGTGTGCATGCAAATTTATTTTAATTACAATGAACG:1 - chr3R 16296334 3' - Cr1a 110 1 54.79 TTCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGACATCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCCACGACAAAATAAAGGGCAAAGCGAGTGAGTGTTAGATAGATTGGATACCCCATTAGA:1 - chr3L 27387148 3' - Circe 7058 1 69.86 TAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATGATTATGTAGCATACTTTTCAGGAGAGTCCTTTTAGGGCAGAACTCATCGCG:1 - chr2L 15013198 3' - BS 4905 1 68.49 GGGGATCGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACA:1 - chr2L 11554510 3' - roo 167 2 78.08 GTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAAACAGGCTAACAAACAACATCAACAACAACGCCGGCGTATTCATGATGCACTCATAAAAACCGGGGGTAAAGTACGGCGCCGGCAAGCGGGCAGAG:1 - chrX 10110969 3' - mdg3 5278 2 67.12 TAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCTCTTGAATAATTCGG:1 - chr2R 14135271 3' + copia 187 2 63.01 ATTTGACGCCGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGTTATTAATAAATGGCATTAATTGAAAATGGTTAATGGGACATGACCATT:1 + chr3R 10063949 3' - invader4 454 1 66.44 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTG:1 + chr3R 15790062 3' - flea 4782 2 78.52 AATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACTCATCTGCCTAATTGAATTCCTTAACGCTT:1 - chr2R 9340540 3' + 412 41 2 78.10 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCCATTTAAAATTTGATTCCTTTTGGTTAGCCACACTTGCTCGACTCAATTACGTTTTCAATCGCATATAGTCCGATATCTACTGCTTATATCAAAG:1 + chr3R 25713802 3' + flea 4952 1 71.23 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATCTTTGAAGTTGGGAGCCACTTTTGAATTTGCCTCCTAAAGCGGGACAACTATAATAGCATAAAACCAGTGTTGCAAGGTGACACTCAAGATCTTTT:1 + chr2R 9607246 3' - pogo 20 1 71.92 CAACATGACCATACATCATAGAAGACTGATAAAATCATAACTTATGGTCTAAAAAATATTTCATTTCCCAAGAAATTGATAAGTCAAAGTTCATAATTGGCTTCTTACGCCTCCAACTTTTTCGTGGATCCGTTTGGAAGGCTTTA:1 - chr3R 7590290 3' - Transib5 2776 1 57.53 ACTAGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATATTTTATATGGTCGGAAACTAATCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGTACTCGTGAAGGGTATACATCCTGTCTTATATTTGGTTGCAATTCTATGAGACTATTTAGGC:1 - chrX 6009228 3' - INE-1 91 1 69.18 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAGAAAGAAATATCCCAGGAATTATTTCATATATACATA:1 + chr3L 13364426 3' - hobo 27 1 67.81 GTCGCTGAGAACGTATGTCTTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTATTCTTCTTGCCCTTCCGGTTCCCCTTGCCACGTTTTTGGGGCTCTGATGGCGACG:1 + chrX 1159876 3' - Doc 222 1 60.96 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTTGGTGTTTTGCACATTTCTCTGCCATTTTGAATT:1 + chr3L 11795522 3' + 1360 3336 1 71.05 ATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCATAACTACTGTGCGTCGTCGACGCAAGCAGCGCATCAGCGTTCCAGCT:1 + chr3R 24906390 3' - micropia 243 2 60.83 CTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACGAGATTTTAAATCGATGCGATGTGTCCAAGATCACGAAAGCGAATGATAATGAGCGACCTAATTGCAGGCAGATCAGCATAAGGTTATGCCAAA:1 - chr4 905407 3' + 1360 88 1 61.64 ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTAGGCAAAGAATGGAAAGTGAAATATTACTGGAAACTGATTGAACCCTCCTCAGACATTGA:1 - 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chr3R 23161259 3' - 412 56 2 55.48 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAA:1 - chr3L 19031218 3' + roo 9024 2 52.86 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGGTTTTCCAGCATGCAACTCTCA:1 + chr2L 14239245 3' + 412 7491 2 55.48 AATAAAACAAAGTTAAGAGAAAACAACTCGCGTCTATCTTTCTCTAATTATTTAAAAAAAAAACTAATTAAGGCAAGAAAAGGATATTTAGCTGGGAATTTTAACGACCCCAAAAGCCAACAAATTCCTAATAATATGAACAATTA:1 - chr2R 15851667 3' - frogger 2170 1 51.37 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATAAACTGTGCCCTGTCAAATATTTATGGGTTAAGGTGTTCAAACGCTTATCAGGGTAGCGTTAAGAGCCATTTGAATACATTTATTGAATGGAA:1 - chr3L 12835961 3' + 1360 3361 1 64.83 AGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATAAATTTCACACCCACGTATTAGATCTTAATTGAACATCTTCTGCTCAGCTCTGGTATATGAATATTTCAATTTATTTGT:1 - chr3R 16538338 3' - G2 2624 1 56.85 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTCAGAAAACGTGGCATACATTCGGGCG:1 - chr2R 6798204 3' - jockey 14 1 74.31 TTCTCTTAATTTTGTTTTTTTTTCATACATAGCTTTTTGCATAGCCGAATTGTTTAAAGCTGGCATTCGACCGATAAAAACACGTCCGCCAGCCAAGCCGTATCATTAAAAGCATTATTTTCGTTTAAAAAAATAATGATCGGA:1 - chr3L 16047470 3' + frogger 2171 1 67.36 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTACTTTTTCGGGCACGCAATTCAAAGTCATA:1 - chr2L 12324993 3' - jockey 4705 1 59.86 AAAGGACAAAGTTAACAAAAGTTAGCAATATCAGGATAATATAACAGTCTACAAGATGACAAACATATATTGACTTTTTATTTAAATTACATTTACTTATCTATTAAGTGTTCTTATTGCCATAACTATAGATTTCAACTTAAAAT:1 + chr3R 17550501 3' - frogger 348 1 60.27 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGAG:1 + chr2L 21910254 3' - Doc 35 1 55.56 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTACC:1 + chr3L 21093266 3' - Ivk 29 1 65.75 TAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAGTTAAGAAAAAAAAAACGACTTCTTCAAACATTTCTTGTTTTGTTCGCAATAACAGCCTTTGCCCATCCTTAGAATTTAGAGATAAGACGCCGAGTAGTTTGCATTTAC:1 + chrX 1022594 3' + FB 113 1 71.92 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACT:1 + chrX 7706820 3' - P-element 4 2 64.79 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTGCTGAGCGCGATGGGTCGCTTGGACTCATCGCTCGATCTACC:1 - chr2R 21820703 3' - Doc 56 1 51.37 TAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGGATGAATTTTATTTATTTCATTTTCCTCCTTTCAACTA:1 - chr3R 23424631 3' - F-element 4536 1 73.97 TATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTG:1 + chr3L 2425945 3' - hopper 87 1 78.72 CTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAACAAAAATAACTTCATTTAAAAATCGTTTATTTCC:1 - chr2L 5792010 3' + blood 7305 2 77.40 TGTGTAATTTGTTGTTGGTTGCGGCATTGTGGATTTCCAAGATTTTGGAACTGTTCTTGGCAACGACGGAGACCAATCCGCCTTCATTTGTTTACATGTAGTTCGGAACTTCCTCCCATTGGCTTGT:1 - chr3R 27185019 3' - Doc4-element 198 1 56.69 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGG:1 + chr2L 5792086 3' - blood 63 2 58.90 GTGTTCTCGTCTCTTGTTTTAACTCTCACAAACAAGCAAATTCTATTTTCAGATTGCTTACGCTCTCATCGTAAGCGAGCGGACAGAGAGCAACGGTGCATAAAGTCCTTGCCCATACGGGCGCCCTTCATCGC:1 - chr2R 6252433 3' + 1360 3235 1 67.91 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTAGGTAAACCGGTTGGTTGTTGTGTTGTACTTGTAAGTATGTAGACACATACATACATAATCCGCC:1 + chr3R 7089573 3' + P-element 2853 1 55.65 GTAGTCAAAAAGAAATACAAAACACAACTCAAATCTTAACTTTCGTAGTTACAAAATGTGGTTTCAAATATGGTAAGATATTCAACATTTTTCAAGAGTTCCTAAAGCTGTTCAAAGCTTATTCAAATATATTATTATTATTATAC:1 + chr2L 13740078 3' - Bari1 1575 1 61.64 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGCTATTTATACTCTTCTGTCGTC:1 - chr3R 11870049 3' - pogo 41 1 56.16 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATTTCATTAATGAATAATTGCAATTATGACCGCCTTGCAGATTTATGCGATGATGACT:1 - chr3L 21910365 3' + pogo 2042 1 57.53 ATACGCGTTTTTTTTTATTGAAGAGAGCTTACGCTCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTC:1 - chr2R 5532368 3' - Doc4-element 54 1 58.16 TTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAG:1 + chr2L 21910231 3' - Doc 68 1 65.52 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCGGTTAGGTTTCAAAAGTTATAGTAGTTGTAGTTGTTATGAAAA:1 + chr3R 8218033 3' + P-element 2844 1 54.68 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTTACCGGTTAAACGCCAAGGTCGCAGTTTGTTGGCCAACTGCCAC:1 - chr2L 18522251 3' - roo 8739 2 69.18 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTATGATTCTTAACAAAACTTTGTGATGCAGATGAGTAACAGTTTGTTAAAATGGGTCGCTTGAATAGAATAGAATAGGTACG:1 + chr3L 3238354 3' - roo 40 2 46.58 AAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAGTTAGGTTTTGTAATAATATATAATAATGATAATGATATTTACCAAGAATATGGTTCTTTATGGGTGTTTATTATTATGAAATTTGTACAAAACTTGAATATCACAGAAATTTTGAAAT:1 + chr3L 13987320 3' + diver 220 1 75.34 AACAATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGAAATTTTTCCGCGGGGAAATGAAAAAGTTTGTCCTGGTGGACACAATGCGGCTGCCC:1 + chr3R 28194908 3' + Stalker4 421 2 55.47 ATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGTTGGTTTTACCTGACTCACCTGTAATACGTATTCCCCTATCTACTCCAACAATCCCCCCTGCGTCCGACGAACAAGAGTCACGTCTCTGGCGTTG:1 + chr3R 18006554 3' - Quasimodo 39 2 48.33 GTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTCTTTCATTTTGTTGGCAATCGATTCGATGGCCATTGCAGTCAAATTAGCAGAC:1 - chr2L 19406989 3' - Doc 13 1 65.75 TGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGA:1 - chr3L 13690293 3' - hobo 59 1 72.03 GAGCATACGTGTGCACACATGCAGTTGTCTGCTATCACGGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTTTCGCGCTCTTGAACAAAAATTCTACACATATGAGTTTAATAACTTTGCCGTTGCCGAGAATGGTC:1 + chr2L 8610767 3' - 1360 176 1 69.86 AGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAAGGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAATTTCATAAAAATATGACCGGCGTCGCTGCCCGCAGCG:1 + chr3R 11777294 3' - 1360 406 1 67.12 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCAAACATTTTCCGCAGATACAATAAAGA:1 + chrX 1103745 3' + pogo 2076 1 66.91 ATCCCAGAAAAATTATGAAATTTTGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTGAGTGTTTTTGGTATATTCCTGTAAGCAGGGTTGACTTACG:1 + chr2R 5795112 3' + INE-1 510 1 54.44 CAGTTTCGTTAGCCTACCTCTTGAAAATAAAAATTCAGAATAAAAAACGTTTGCCTAGCCTTTAAAAATAAATTATCATTTACACATACTTTAACATTAGTTTCCACTGTCTGCCCTACATAGTGATTGCCAAGCCGGTGTTTATG:1 + chr3L 9645420 3' + FB 452 1 69.18 AAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCATGGAATTCATTTCGAGAGCCGAAAAGATAGCGCTGATGCCTATGTTACGCCTGGTGGTTGTATCATATCCACTTGCCAGGAAGTTACTCGGCCTC:1 - 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opus 7024 2 66.15 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTT:1 + chr3R 19436090 3' + roo 9014 2 57.53 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAAATTTAT:1 - chr2R 13761626 3' - jockey 4750 1 71.92 CTAACGCTGCACCACTGTGGTTCCCACTGTGGGGGTCCATTCACAGTAACCGCAAATTCTGCTGATTTATCGTAGTAGATTCGGACCGGATACTGACTTAGTATTAAGTCCAGTATTATTCCCAGTTGAATAAGGCCAAGGGG:1 + chr3L 4261122 3' - gypsy9 5131 2 68.53 ACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAAGTCAAAATTGTTGACAGCTTGAAAAAATGACTGTGAATTATAAACTATCTTGCAAATTTAAATAAAAT:1 + chr2R 10161020 3' - transib2 16 1 70.55 GTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACT:1 - chr3L 12159671 3' - Quasimodo 61 2 67.59 GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTAAAAATTCTGTTATTGCTGTCGAACACACATTAAAATTAGACTAAAATAAACCCAAAGCAACTTTTAAATTGTACA:2 - chr2L 15644839 3' + transib2 2781 1 56.16 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATG:2 + chr2L 5792085 3' - blood 64 2 59.59 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACTTGTGATAACGCAACATTTGCTTGTTCTATCTATGTATGTATTTTGTATATCTATTAGCAGCGCTG:1 + chr2L 6177635 3' - pogo 19 1 62.83 AATAAAGTTTAAAAAAAAAATAACTTAATATGGGTCGAATGGGCGTACTCACTTCGAGTTGAAGTCATTCATTGCGTTGGTGTATGGAGGCGGGTTCTCGACTGTTGGCGCCGATGGCAGGGATTCCTGTCCATC:1 + chr2R 12643938 3' + BS3 1769 1 69.63 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTTCTACCCACTTTTGTTCACAGTGCATCCATATTTTGTGGCGCATCCTTGGCGTTCCTCTTTAT:1 + chr3L 1358593 3' - 412 6 2 76.03 GTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAG:1 - chr2R 14135292 3' + copia 166 2 77.40 GATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATAAATTTCACACCCACGTATTAGATCTTAATTGAACATCTTCTGCTCAGCTCTGGTATATGAATA:1 - 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roo 24 2 69.86 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCTACCAATTTAAAATGTCGAAACTGACAACGATG:1 + chr3L 20252017 3' + copia 5069 2 56.55 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCGCACACTGTGCGGAGAAAGAGATGGGGCCACATGGGCAGAAAGAGATGGCACGACGAGCACATTTGCATTTTCATAGTTTCTGTGCGGACGACT:1 - chr2L 16615720 3' - hobo 29 1 67.12 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAG:1 + chr3L 21013927 3' + roo 8987 2 76.71 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTG:1 + chr2R 21439496 3' - jockey 82 1 73.64 AAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGAACCGATGGCAATGACCATGATGGAGCTTCCGCCCGTGCAGCAGCAGCCAA:1 + chr3L 363542 3' + blood 7321 1 64.14 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTCTTTCATTT:1 - chr2L 19407033 3' - Doc 57 1 58.22 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAGCTGGCTGCTATTGGACGGCAACTTTGGCGC:1 - chr3R 7470941 3' - Doc 81 1 50.36 GTCACGCCCACACTTTTGAACAATTTTTAATATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAGCTAGACTATAGCATTCTATCTTGTTTTGGATTTACGTTTTGCGTGCTGATCTAATGTCGATG:1 + chr3L 23004847 3' + INE-1 251 1 58.21 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCACACCGGCCACGGGGCAACTTTCGG:1 + chr3L 13690330 3' + hobo 2891 1 75.51 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACCTTTTCTTTTGGCCAAACTTTCTGCC:1 - chr3L 20497762 3' + P-element 2795 1 22.60 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTATTATATATAAATAACCTTTTAAACCAATTTTGAAGAAT:1 + chr3L 18801850 3' - I-element 82 1 74.66 CTAACAAATTTAACGCTGAGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTGGGTTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTGAGTTGGAAATTAGATTGACAGAAGAAGTTTTACAGAAATGTTCGAAAATTATTTAATA:1 + chr2R 1115990 3' - Doc3-element 4596 1 59.59 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCACGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTCAAC:1 + chr2L 15777903 3' - 297 48 2 57.14 ATCCAATTTATGTGACTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGTTGTGCTCCACCATCTTGTTTTGCTACGTTTTGTTTGCTTGGGTATAATTTATGCAAATCTGTTAAAG:1 - chr3L 12238404 3' - Bica 4704 1 61.64 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACACTTGATGTCATAAGTGTTTGAATAGCATGTTGAACGATTTATAATTTTGTTCTTTTCGATTTTAGTTGCCAAATTATGT:1 - chrX 8349857 3' + roo 9031 1 58.22 GCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTATCGGTGTGATGGTATCCAGGTAGGGACTCTTCGAGAACGCGTTCTT:1 - chr3R 24750930 3' - G6 19 1 71.09 GGAAGTGGAAAATACTTGTCGGACGATGATTTGGCTGGAATGGCTACCGAATAATGCCAGGTTATTTGCCGTTCGAGGTTCATAAGATGCACGTGGCCAAGTCCTATGCCATCCACAGTTCCAGTTAGCAG:1 + chr2L 12107509 3' + HMS-Beagle 457 1 59.54 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGATTATGGGCCATTGTTACATGGGCTTTGTGTGTATGTAATTAATTGAGTTCTTGTTTGCTTCTGTACATCGCAAAATATCTAATTAAATGTGAAATCGATAGTCGA:1 - chr3R 10743708 3' - FB 16 1 75.17 AGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTATATCATAACAGTTTAGACAGTGAATGTAACAGTGGCCATTTAGTGTAATATATATTAACAGTA:1 - chr3L 6975708 3' + hopper 1242 1 67.12 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACAGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACAAGTTTCAAGATTTCTATTCAAATTTCATCAATCGAATCAAAGAGAAACCTGA:1 + chr2R 21690554 3' + 412 429 2 60.14 TTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTCAAAACTGGCACGCCCAGACTTCTGCATAATG:1 + chr2L 23034120 3' + FB 772 3 69.86 AATATTTATTTTAATTTTATTTTATTTTTGTAGTTTAAAAAATGATATAGGCTATAGGGATCGTTAGTATTCAGTTTTAAAAAACTGTAACATGCCAAGGTAATTGTTCATCTATTATATATAAGCATTATGTAACTATTGTGGG:1 + chrX 13007406 3' - NOF 3961 1 45.52 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAAGCCCACAGGCACATTTAGTTATGCCGTGGTGGAAATATTTTTGCGAGCACAGCAGCAGAACAACGAAAACGGAAAAGTAGCACAACAT:1 + chr3R 15920326 3' - 412 7087 2 62.33 TGCTTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGA:1 + chr2L 19160413 3' - 3S18 90 2 76.55 GCCATACGATTTTTTTGCACACAATTTTTACGGGTTGGCTCCAGGATCTCTCGAATTTTCGTTCAAGAGTGAGAGAGCGGAGATGAAAAGACTTTGACAAGTGGAAAGAGTCAACGAGAAATTTATAGCCAAGCCCAGTGGAGGAG:1 + chr3L 19167771 3' + 1360 31 1 56.85 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCACATTAAATGAAGGGTGGTCTGAAAACCGGGTCGCGG:1 + chrX 6633079 3' + P-element 2876 1 76.12 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTAGTCTTGAATGCCGGCCA:1 + chrX 4673690 3' - roo 52 2 64.52 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTCGCTGTCGATGATTGCCAGCTGCGCTC:1 - chr3L 18183042 3' + Tirant 8493 2 75.71 ATCAGTATCAATAGCCCAGTCGATCTGGCACTGTCCGCCTGTCCGGCCGTATAACGTCGACATCTCAGGAATTATAAAAGCTGGAAGGTTTATATTAAGCATACATAACGAGGATAATACTGGACGACAAGCTTTGCTCTAAACAT:1 + chrX 308858 3' + INE-1 93 1 71.92 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAAGCCA:1 - chr3R 23161269 3' - 412 64 2 61.81 ATATATATATATATATGGATTGGTTTTTCTATCCGTTATTTATGCATGGTAATATTTTGCTTTTGATTAACTAATTGAATACATTTGCGTAAGAGGGGCGATGAGGGGTG:1 + chr3L 3530031 3' + G3 4513 1 60.00 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAATATTTATGAAGCATATTTTGCGGCTCCGTTATTTATATTTCTTTGGTCAAAATATCTCTTCTACTTTTAGGCAGATTCTCACATTACCTAGGCACCTAA:1 + chr2R 11264113 3' + jockey 4978 1 70.50 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGTAATATTGCGAACTCACTCAGCGCCGTTTTGAATGAGTGGAACCTTTTAAATAAGGTAGTAACGATTGTAACA:1 + chr2R 6493207 3' + transib2 2778 1 58.22 CAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGAAAGCAAAATCGGTCCCAACTGCTCATCCAGTCCAATCAAATTCGAGTGCTCCCTGGCGGCAT:1 + chr2L 7500999 3' + mdg1 251 2 57.53 GTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATCGTCTTAAATCATTTTAGCTGAAGTTCA:1 - chr2L 19140373 3' + Max-element 8479 2 73.15 GGGGAGAAGTGGGTTTCGGCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCATTCCAGACGACTACGCTTGATTTGGATTCCAATGTAATGTTTCTTGAAG:1 + chr3R 6047567 3' - G6 1711 1 75.17 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAATTATTGTCGTTGTTGCAGAGTCGGTTAGGTAGAAATTAGAAAATAGAGAGCGCAGATAGTTAAA:1 - chr3R 15295678 3' + roo 397 1 75.37 AAAATCCTATGATTTACAGTTTTAGTGGGCAATTTTTTTATAATATCATTAGGTATTTAATGCCAAACAATGACGAAACAATGATGAAGACGTAAGGTACGATGCAAACTAGTGTTGACCGGGACGAGATACGCTAAAACGGAAAT:1 - chr3R 7640102 3' - HB 1575 1 47.95 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTCTTGCT:1 + chrX 21403471 3' - roo 8732 2 71.64 GAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTTTTTATCGTTACCAATACGTAACCAAAATTATCGATCTAAGCTGATATAAAACATAAATTGCTCAGCTTA:1 - chr3L 19631568 3' + F-element 122 1 52.05 AAAAAAAAACAAAAAAAAACTATAAAAAATTAAAAACAAAAATGTTAATTAATTTCTGTATAGAAATTTCTGTGCATAGAAACTACGGCCGATAATCTTGCTTTGGTTTACTCTCGGAGAAATCCAATCAAGATCCATTCAAAATC:1 + chrX 3353712 3' + HMS-Beagle2 490 5 77.40 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGT:1 + chr2L 5792104 3' - blood 45 2 54.79 ACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGC:1 - chr3L 7837161 3' - jockey 4788 1 54.39 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACTCAATTGATACCAATGCAGTCCCTTCATTAGTTATGTATTTAACTATATTTTTTTAAATCTTATGGTAAAACTGGCAGGT:1 + chr3L 4081709 3' + mdg1 384 2 44.14 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCTAACAC:1 - chr3R 16276310 3' - pogo 15 1 67.52 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCCCTTTGCTTTTAATAAACAATTTTTCGCTGTTTGATTTCGTTTGCTCTTTTCG:1 + chr2R 18014122 3' - Doc 44 1 52.59 TTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGGGATTAGCGTAGAACGAAACGGAAAGTGAA:1 - chr3R 10029592 3' - BS 5082 1 65.75 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTGCATGCATGCAACACCCTGTAAGATATGGAGATACGAGGCCAAAAGCTGCTCTTCGAATTAT:1 + chr2L 18522382 3' + roo 9056 1 73.29 AGATCGATTCGGCTATTGATCTCCTGTTCAAGAATATATTTGCCTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACGAATCTATTATACCCTTTTACTCTTCGAGCAACGGGTAGTAATATAATAAATAAAATACAGAT:1 - chr3L 23942444 3' - INE-1 97 1 66.44 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTCTAACTCTGAGGATTATGACTGTGACACATTGTTTCGCCAGCGAATTATAACTTAAGCACTTTGTTAGCACTTGGCT:1 + chrX 10580016 3' + pogo 2062 1 58.33 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTACACCTGATGTCTGAGCAAAGAGGAGAAGAGAAAACTTGCACTTAGGCAAGCTTATGTAATGGTATGCATATTGCATTATGCATATTAATT:1 + chr3R 1267807 3' + P-element 2856 1 66.44 CATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCCTTTACCCTACGAGTAATGGGTATAAAAAGCAAAGCAGCAAGAACCCAAAAACCCAATAGCACTTTTTTACCCCCTCAATATTCGTGGTTCATTTGCCATCATCGTCAGTAATATGAC:1 + chr3R 17835546 3' - INE-1 11 1 69.18 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTATAGTCAAGAGGTGGCTGGCGAAAAAACAAAGAAAAAAAAACTGTATTCTTAGTGCTCGACGTCGGGGGGTTAGTTTTA:1 - chrX 3646884 3' + 412 7503 2 50.68 GCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTCCGGTTTATTTTCCAGTGTACTATATAGTTTTCAGACATTTGCCGCATGTCTCGCATTAAATGGCTTACC:1 + chrX 11005810 3' + hobo 321 1 51.72 CGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGACTTTGAATATTTATATTTGGAATGATCATCGTGTCACGCACACATCTCTATTCGCATTC:1 - chr3L 493778 3' + 1360 433 1 65.07 TAGTTCAAGGTGCGTCCTCTTTGTGCATGTACCGTTACCGGTCGTCCTCTGCGCCCTTGGCCAACTCGAGTCCAAGGTCCAGCGCGGTACCGTTAATTCACAGTCTCTCC:1 - chr2L 22601692 3' - gypsy8 4901 2 79.09 AGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAATATTCATTT:1 - chr3R 22341150 3' - hopper 114 1 72.60 AGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGGGCAAGCC:1 - chr3R 1433808 3' - Osvaldo 25 1 60.80 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTGCTTATTGTACCATGCTAACAGACAATTAGATTCTCCGTTAGTTTATGTGTACA:1 + chr2R 5311504 3' + 1360 3358 1 54.05 GAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATACAAACACGTGTACCGAGAATATTTGAAGAAATTTAATACTTTTAGTGCACA:1 - chr2R 23353979 3' - gypsy 66 2 65.07 GCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCGAATGCCCCATAGTGCAGTGGGTGAAGTTGGAGTGGCAAACGGGCAACAATAAAATGAAATCAAC:1 + chr2R 20447883 3' - hopper 76 1 67.12 CACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGAAATATATAGATGGGATGCTTTGGGGGGCGAGGCAAACATTGGCTGGCATTTGGGCGAGCGTATGACATTATTTATGGTTTGTTATTTGTGCAAAAAG:1 - chr3R 7449028 3' + Doc 15 1 72.60 AATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAAAACTGAAACAAATTCGCCACCTCTCATGACCATCACTCACAACGAAATGCTGATACCTGTTGTCCATTTCCGATCATCTCCTCGAAACAATGCAAAAATTAACAAA:1 + chr3R 31729173 3' + P-element 2649 1 77.40 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTAATTTAGTGAGAAGCAGAACTATGAAAGAAGTTTTCTTGGCTCACTTTTAGGGTTTCACAGCAGGCAAGTGCAAAAGAAA:1 - chrX 7446179 3' - jockey 4711 1 46.58 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACTC:1 - chr3R 20450417 3' - hobo 63 1 64.14 TATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAACGACACGCCCATATCTTGTGTAAAATATGAGCGTACGGGGAGAAGTTCTTGGCTTAAATGTGGCTTTTTAAGGGGGCTAAAGC:1 + chr3R 14912065 3' - Stalker4 6992 4 60.14 CTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATTCAATTAATTGATAGAAAATATAACTAAGGGCCTATGTTGCTTTTTA:1 - chr3R 8140859 3' - pogo 69 1 67.81 CCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGTGTCTGCCTCTGTCTGTGCTTTATTTCAAATT:1 - chr3L 14303263 3' + Quasimodo 172 2 76.03 CTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGACACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGAT:1 + chr3R 16997464 3' - G6 50 1 52.24 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGACCCTTGGGCTTTGGATACGGGCTAAGGATG:1 + chr3L 19580954 3' - roo 8743 2 80.45 ATAAAAAGACGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATTTGTATTACTTAGTTTCCCTACTTACAACTTCAAATTTCATTTTTATATATTCTTGTATATATGTCTATTAACTCTATCGTAGAACGCACTCGGGACAAGAAGCTGCGAC:1 - chrX 21626864 3' - HB 72 1 60.27 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAACGAGTCAGCTGTTCGCCCGTATATATTCATATCGATTACGCAGAAGACACATTAGAAGATCGATTAGATTAT:1 - chr3R 8217887 3' - P-element 8 2 76.15 CTGACTCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAAGCTCAAGTGTCGGCGATAGGCATCATAGCTCCGAAATCGATGCTAACTGGACAGCTAACTGGGC:1 + chr3R 28459109 3' - Tabor 155 2 55.48 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAGACTCGCATTTACGATTAATATACTCACAATATTATTATCTGCTACGT:1 + chr3L 21013974 3' + roo 388 2 68.99 ATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTATTTCACTGCCAA:1 - chr2R 11095725 3' - diver 5935 2 52.05 ATATTTACATATTTTTATCTATTTGTAAATCTATATGGCAGGGCCAGTACAAAATTTATAATCGAGTCACTTGACTAAGGAAAAGGGAAGATCTGTTGATAGCTTATATTACATTTTTTTTT:1 + chrX 292569 3' - G3 4497 1 55.74 TGAACTCCCTACACGTAAGATAGCATACATTTGTGTACACTATAATTAAGGAACAGAATCCATAATATCTTTTAAGCTACACATCAGGTTATCTGACAAATGCTGCGTGCGGCTGTGCATGTGTGAGTGTAAGCATATAAATATAA:1 + chrX 22678630 3' + G5A 2703 1 62.33 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGACATCGTATAATGTTTTTGTTAACGTCGCTGTTTTCTTGCCATGCCCAACACGTTTCAATTGTTAGGCCTGGATGGCCG:1 - chr2L 19692242 3' - roo 8689 2 59.12 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCC:1 - 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chr3R 24422038 3' - G4 3497 1 64.38 GGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTTTGGTGCAAAAAGAATGGGAAAAATATACAATGCACTTTCAAGAAATTAAATATCTTCGTAGACTTTAAGA:1 - chr3R 12827154 3' + copia 4767 1 51.37 ACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCCTTTGGCTTCTGTAACTGCTCAGGTTCCTCTGCTTCCTTTTTGCATCCCCTCTAGCTTCACT:1 + chrX 8808071 3' + G2 2941 1 55.71 AACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGG:1 + chr2L 21643119 3' - Tabor 6903 2 62.59 ATTAATTTTAATTTAATTTTAACTACTGTGACAATGATCGTGGAAAACTTAATTGGAAAACTTAATTAATGATATAATCCATTGAGGAATTTAATATATAATTATTTTAAGGTGGACTGAATACTTAATACAAATAAGAAGAACAC:1 + chr2R 3536095 3' + Rt1b 121 1 63.70 GACCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGACCTGTTCGCTTTAGCGATATGATACCACTTTAAGTCGTTTGACTTTAGCAAAAATTAAAACGCATCGACACTAGCAATTTTATTTAAGTGT:1 + chr4 184064 3' - 1360 176 1 47.26 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGTTTGATTTT:1 - chr2R 9294311 3' - Tirant 8148 2 54.92 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCTACCCCAGATTTCCTTGTAAA:1 + chr3L 16973510 3' + S-element 1701 1 73.29 AGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTCATTTACATAATTTTTGCGTTTGGCCATTTCGCATCCTTTGCGCTTGA:1 - chr3R 18635156 3' + opus 7489 2 77.40 GTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAG:1 - chr3R 11151838 3' + mdg3 5428 2 76.42 TTCTTTCGAAAGAGTTTTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTCTGGCCAGGGAGTCTACATGAGTAAAATTAAATTATTTTACTTA:1 - chr2L 16646177 3' - I-element 277 1 68.79 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATATCTAAGTTGCATTTAAAAGTTTAGTTAAACTGAAAATAAAGAAGTGTTTTCAAAATATACATTTAAATACCCATAAATGTTACGTGAAATAGAAAAGTTTCAGAAAAATATGAAGACA:1 + chr3L 4651718 3' - roo 8666 2 73.29 CCGTGTGTCCGCATGAACGTCGATATCCCCTATAAAAGCAATAGATTAGGAGTGCAGCTTCTAGTGACGCCGACGTTGTGAGAGTTTCTTCTCATTTTATTATTTTTCGTAATATTGTTTATTTTATCCAAAGTCTCCACATCTCA:1 - chr2L 20840107 3' + INE-1 127 1 77.40 ATTGAAAAAAAAAATAATTTAAAAGTTCATAATTATCGATCATTAAAAAGGGCAAGTTAAACAGGGGATTAATCAATTATAAATCTCAATGGCTTTTAAATTACCATTTTTATGCTAATTTCTCAGGTGCAATAACAATTGATATT:1 + chr3R 23108196 3' + jockey 4925 1 62.33 GTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGACTGATTCCATAAATTGGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGC:1 - chr2L 12325030 3' - jockey 4744 1 63.89 CGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCATTATTCACTATGAGGATGCAACAACGTGCTTTTGAG:1 - chr3R 25862596 3' + roo 8989 2 74.66 GTTTGCCCACCAATTAGTATTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAAATATGAATTTTCCAAAAGTGCAAAAATATTCGAAAATCAAAAATTTCACTTTTACTGTTTTGCTTACTTCGTTTAATGGGAGTTTCCAGCAATTTGTACAG:1 - chr3L 18708156 3' + FB 79 1 67.12 TGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATAATAGTTATCACTTTTCCACTTGCAACCTGATGAAGTGAAACATTTAATCATCCTTCGAGTCTTAAGAAACTGACTCAT:1 - chr2L 2895529 3' - Burdock 37 2 57.53 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGTTTAGCAAAACTTGAAGTTGAATGTATAAATGTAATTTTC:1 + chr3R 6422898 3' - jockey 89 1 69.86 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAGCATTAAGTATGTCAAAAGATTTAATATTAAAGGGCTTGCTTGTGGTTCTTGATAGAATAGAATCAATAGAACTTGTAGGATTAAAGTAAA:1 - chr3L 5350176 3' + I-element 5325 1 54.11 CCTTTTTGAGCATTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTTAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAATCAATGTTGCGCTTCCCTCTCGCTATCCACTTTGTCG:1 - chrX 12119780 3' - invader2 484 1 76.71 ATGCACACACACACACACACATATATTTGTACGCACGCGCACTCGTAATCCGCAAATGT:1 + chr2R 15305245 3' + accord 181 2 84.75 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTAAAAT:1 - chr3R 16276300 3' - pogo 34 1 62.33 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCCAGACGGACAGACACATTTGGGCCCACACACACACACACAAGTCGGGATGG:1 + chr2R 15528546 3' + 1360 3330 1 62.59 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACTGTTTGTTGACAAAAAGGTAAACAAAGTGAAAATTTCGCAAATGTGCAAAATAATTAAGTAAGGGTCAGTAATAGGTGCTACTGGTTAATCGGACCATAACAACTACCCATTTAA:1 + chr3R 20635566 3' + 1360 3386 2 82.19 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTTGTGTCACTCTCTT:1 + chrX 7706839 3' - P-element 60 1 44.52 AGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTATCAACTGTTAAGAATGCTGCAGTGTAGGCACCTTGTTTTCCCAGCAATCCATTTCCCATAC:1 - chr3R 14521509 3' - hopper 1036 1 58.22 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCT:1 + chr2L 19652603 3' - roo 8742 2 73.97 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGC:1 - chr3R 7885604 3' - jockey 82 1 70.71 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACG:1 - chr3L 21013867 3' - roo 8737 2 72.34 GAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAATATGTATATATGTGTGACAGAAAAGAGACTAAAATAGATTCTGCGCGT:1 - chr2L 13138982 3' - McClintock 63 2 68.49 ATCACAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTTATAATTATGTTTACAATAAATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAACCCAAACGGCAGCATTAACCTACTGCACGAGCGATCCTAGAGAGGTGTCGTGACATTGTCTTTA:1 - chr3L 18938286 3' - Cr1a 135 1 59.59 AAAGCGAAATGTGTCACTGGGCTGATTCAGCGTCGTCGATGTTGTTGTTGGCACATCCGGCCTGGGGAAGCATCCATCAGTTGAATTCTTTGGAAACTCCACAAATCCGATGAATTGTCTATCCTTTCTAAGCACAAAATCATTGG:1 - chrX 4588318 3' - gypsy10 5736 2 51.37 AGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTATTTAAAAAAAAAAACCTCAAACTGAAAAACTGAGAACCTGAGAAACAA:1 + chr3R 7774664 3' + transib2 2594 1 63.04 TGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCAGCAATAGCTGCTGCGGCCCCACAGCCACAAATTACTGTAAAGCGCAAAAATTTAATTATGCAAAACACG:1 + chr2R 14913555 3' - X-element 4457 1 52.05 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATC:1 + chrX 16117258 3' + opus 452 2 64.17 ATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTATTTATTACACCATTAGTAGCTGCATAGCAGAGCAATGGAGCCATTATTCTGTCCTCACCTGGTCACGC:1 + chr2R 12065678 3' + Stalker2 7588 2 61.11 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTTTGTACGATAGATTCGGC:1 + chr3R 21674950 3' + roo 398 1 71.43 TCAATGAAAACTATTGTAGGCATCGGAAAATATTTATTTATGACATTCCAAATCACTAATCAAAATAGGGAAACCAAATACTACAAAACACAATTTAAGAAACAAATAACTAATATCTAAAACCGTTTAACTTCCGCAGGAGCCTT:1 - chr2L 19553636 3' - mariner2 856 1 68.49 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAACGAGTCAGCTGTTCGCCCGTATATATTCATATCGATTACGC:1 - chr3R 8217918 3' - P-element 48 1 48.92 GTGGCTGGGCACAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTT:1 + chr3R 16997449 3' - G6 73 1 66.90 GAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTAGGGGTAATGGAACGTCTTCTATTTCTATTTGTTGTGCTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCCGAATCCTTTCTATGCCGAAAGGCAAGGGAACTTTTAAACAATTTGC:1 - chr2R 10370285 3' - 297 6546 2 67.81 AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAA:2 + chr3L 21093240 3' - Ivk 55 1 56.16 AGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGTGTCGGATAGGCAATTTTCTGTGGATTGTTGGCGTGGCAACGTTCCGAAACAACCTC:1 + chr2R 2122308 3' + transib2 2679 1 67.74 GAATAAAACTCAGCTGCATTTACAAACGCAGACTGCGGCGTCTTATAAGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAGCCTATGTACGAATGAATAAAAGGCGAAACTTTCATGATTGGCGCAGATAAATGCTTGCAAACTGCACT:1 - chr3L 21872556 3' + rooA 7436 2 75.34 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAATGCTGAAATAAAAACTTATAATATAGAAAGCT:1 + chr3R 15054189 3' - 297 6636 2 75.44 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCATATAATTTTACAAGCTACTACTCATATCTAATTAGTGTACCCAAACTAAGAAATACCGTCATT:1 + chr3R 7664578 3' - I-element 52 1 56.43 TATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTTGGCAAAGCAATTTGGGTTAAATGCACCTTGTTTCATTTCGGCATTATTGCTTTTCAATCGGGCTG:1 - chr3R 27475526 3' - Stalker 152 4 54.79 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCCGCTGTT:1 - chr3R 9125634 3' - Doc 31 1 64.93 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATTTTTGGCGAAAATAGTTCTCAATTGTTTTGAAAAAGTACCGAAAT:1 - chr2L 17839338 3' - blood 25 2 68.49 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTTCCCGTTGTTTAAAATATGTCGTCGAGCCAAGAATTTGTAC:1 + chr3L 2330199 3' + roo 9031 1 55.00 AAAACAAAAGAAAATTGTGCATGAAATTATGAGTGAGATGGCAACTGCCGGAGGGAGGGAGACAGACGCACACAAGTGGATATATAGATAACAAAATAATGCAACTCACA:1 + chr2L 3713379 3' - S2 227 1 67.27 AGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTT:1 + chr3R 6413632 3' + 1360 3312 1 71.23 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTC:1 + chr3L 15723916 3' - jockey 4703 1 73.75 GACATGTCCATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAACAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTTCTTCGTCTAATTAAATTACGTAGCG:1 + chr2R 5045694 3' - invader6 4530 2 58.90 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTACATATGTACGGACATATATGTAGATATATAACCATATGCACATGGGTGCCATCCCATCCGC:2 - chrX 16117168 3' - opus 7065 4 68.49 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAATATCACTTTAAGGTGATTCCCAGCGCATATTATGACGGAGATAAACATCGCTTAAAGCGAGAGACGGCGACACCGTCGACGA:1 - chr2R 25106009 3' - roo 37 2 60.00 CTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTACATACATACATGTATGTATGTACGTACATATGTACATAAGTACC:1 + chr2L 115080 3' + gypsy 409 2 41.78 TAAATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATAT:1 + chr2L 18112579 3' - transib2 2620 1 64.38 CTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCATAGCTGCCAAGCTGACC:1 - chr2R 21848631 3' - Transpac 4937 2 67.81 TGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTTACAATTTTGGGCTCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATGAAACTCATAAATTGTAATTAAAAAGTGAAAACTATTTTAATCAGCATTTCAGCAATTCTATTAG:1 - chr3L 6466360 3' + roo 8675 2 54.48 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTTAAGTGGTTCCAATGGCTCTCATCCCCCTGCCCGCTGCAACAACGCATTTAATTT:1 - chr2R 13754785 3' - 412 64 2 61.64 TATTATTATTATTATTATTATTATAGCTTCAAAAGAACCATTTGAAAATCTTAAACAAAAGTAGCCATAAAATACATTGTACCGATTCTTTCACAACACTTATTGTTTTCGAAAGTTGTGTAACTGCCTGATGGGATTTTTACTG:1 - chr2R 6902204 3' - mdg1 37 10 82.07 TCTTACTCTGCCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTCGTATGAG:1 + chr2L 18689242 3' + Gypsy6A_LTR 244 1 71.23 CTGATCTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTA:1 - chr3L 27356099 3' + Tc3 1632 1 77.27 GTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGC:1 + chrX 12273132 3' - jockey 4750 1 78.36 GAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCCCAAAAAGTTCAATTAAATGGTGCTGACTCTTATCTGCCACCTAAAAACCATAAATTAATGGACGTTGCCAGTGATTAGTTA:1 - chr3L 20857885 3' + Quasimodo 285 2 56.16 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATGGACCGTGAACCGTCGTCGAGTGTGTGCGTATTCACTCTTTGTTTGCAGACTTTT:1 + chr2R 17332219 3' - jockey 74 1 61.64 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACATAATTAGTCTGATAGATGTAAAATTTATTAAACAAAAA:1 + chr3R 6413693 3' + 1360 3373 1 74.66 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCGGCACAATGATTGCTGCATTTATGAGATAAGTTTTTACTGTCGACAACAATTAAATTACATTTTAGAGTTTATTGCCTT:1 + chr2L 16615871 3' + hobo 2899 1 55.48 ATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACGTTTAGATACATTTATATCTAGTTATGGAGTGGGGGAGGGGGGGAATATTCTATCGAAGCCATTATCTTCGGCAGTTATGTAAAATTG:1 - chr3R 25713985 3' + flea 255 1 77.12 CTACAATTCTATATTGAAACCTATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATCAAGAATAAAGACATGATTGCAGGCCTGCACATCGATGCCTTCTTCTAGGACGCTTGAACATATCATAAGATTG:1 + chr2R 17579302 3' + F-element 4240 1 52.05 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTATAGCCCTTGGCACACATCACATTTTTTCACATCCCATCGAAAGCCATATAATTCATGGAGC:1 - chr2L 16456719 3' - BS 5021 1 39.73 CACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTCTTGTCTCTTTTGTTGCGAGCCAACGACCCGGCATCGCATTGAGATTACTTAT:1 + chrX 19107468 3' + roo 342 2 65.07 TATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAA:1 + chr3R 11151902 3' - mdg3 66 2 62.33 GATTTTTTTGCACACGATTTTTTCGTGCGTGGCTCCAGGCTCTCTCAAATTTTTGTTATTTATAATACTGTTTTTTAATATATGTTTTTTTTTGAATGCAGAAAGGGAGCAATGCAAGGAAACTCTTGGAACTTCCGCTTTTCTAA:1 - chr2R 17799303 3' + 1360 38 1 65.75 TTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCC:1 + chr3R 24454866 3' - F-element 300 1 63.01 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCCACTCAAAGTCAGCACAGGCCACAAAGTCGCAAAATATTTAAGAGAGCTCAGAATGCACAAAAATA:1 + chr2L 11554618 3' + roo 388 2 73.29 ACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGCGCTCATAACCCTACAGTTTGCCTTCATAAGCATGTTTTGGGATAATATCTTTAAGCACTCCACTCTTTTACCGATTTCAGTAACCTATTGACGAATAAT:1 + chr2L 10446182 3' - flea 4775 2 69.18 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCCGGTCACTCGCCAATTCACGCTAATGGGTTCCGATGCCTCGACCTGATCC:1 + chr3R 31141102 3' - Burdock 14 2 74.66 ATGGCTAGATCGACTCGGCTATGGATTCTGATCAAGAATATATTTACTTTATATAGTCGGAACCGCTTCCTCCTGCCTGCTACATACTTCTCAACGAATCTAGTATACCCTATTACTCTACGAG:1 + chr3L 25245594 3' - INE-1 103 1 85.48 AATATAAAATAAATAAGTAAATATATTTAATCAGCCCTATTCCCCGAAACTAACAATTTTCGAGGTAAAACTTCAATATAAAAAAAAAAGTTCAATCTAATAAATTTAAGTGAGCTACAACGTTCCACAGTAATACCCAAGCCAAA:1 + chr3L 14605037 3' + Doc3-element 79 1 83.56 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGAAGAAAACGAAGAGGAATAAACAAATGCATAATGGTAATGGTAAACAGTAGCAACCCAGAAAACTTCATGCCGCCCCCGCTCGCTTGACACAA:1 + chr2L 13629201 3' + Tirant 373 2 66.44 TCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGCCACTAGCAGTTTGACAGCCACTGGGAAGTGTAAAAGTAGGGGGCTAGAATG:2 - chr3L 2425882 3' + hopper 1347 1 62.33 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGTAAGCCCTTTTAACGGCC:1 + chr3R 30264097 3' - blood 7047 2 56.36 TAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACA:1 - chr3R 4679476 3' + hopper2 1523 2 75.00 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTAGTCACTCTGCATTTGAATGTCTGAATGCCGCAAAACGTTGCTCGGCAAACCGACATAAATACAAACAAACATGGCTGCCTGGCGGCCACTTCCTCATCCTTTC:1 - chr3L 7460570 3' - 412 7070 2 73.97 CGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTGATAATAATATATTAATATTGCATCAAGTGTATCTCAGACTTCTCATTATCCTACAGATCAAGGCCTT:1 + chr3R 17586936 3' - Max-element 54 2 54.79 ATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTGGTATTTTAGAATATCTAAAAACGACCTTTCAATTTGTTGTGGACTTGGCTCAGTTTCGCCTTTTTTGGCATGTGCGCATTTAATTGAAATTTCCA:1 - chr2L 19310288 3' - Juan 4098 1 57.53 CTCAATTAGAGGCGATTTGGAATGGCCGGCACGCTCTCTCAATCTGTCCCCTGTCATATTTGCTGCAACATTTTCGCTCAAAACTTTTTCCGCTTGGTCATGCGGCAACGATATTTCCAC:1 + chrX 22785522 3' + mariner2 538 1 60.00 AGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAG:2 + chr3R 13349580 3' - Ivk 65 1 59.03 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCT:1 - chr3R 9125637 3' - Doc 29 1 66.67 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTCGCCCTTCACGACATTTTCATACGCTTCGCTGGGAAATTTTAGCACATGCC:1 - chr2R 11263959 3' - jockey 4701 1 60.87 TAAGTGTACGCACAAGTTTATAGTATGAACAAATATTTTAATTGTTTTCTTATTTCTTTTAATTTTCTAGAATAAAAGTATCTCAATGACAGACATGTATTATTATGCTGGGGGTAATATAAGGTATTAGTCGGACTAGTGGCAG:1 + chr4 271790 3' + rooA 7591 2 69.66 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGACTAGAATGCGTGTTTAA:1 + chr3R 28450747 3' - roo 8734 2 69.86 TAACTACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATTATAAAATTTACTTATTTTCATACTTTTTTAAGATAAATAAGATTACTCCGCAGCAGTCGAGCCGCAGCAACAAAAACAGCAAACAAGCCATCCGTCGTCTTCGTGGTAGTCGCC:1 - chr3R 8946174 3' + G4 3775 1 52.05 TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATCCTGCGCTCACTCCCCATTTCCCCAAATCAAGTCATAAAACAAAACAAGGGGAAAAAGCAAAAAGAACGAGAAACACCGA:1 - chr3L 10112168 3' + I-element 5314 1 56.16 ATATCAAATTTTTGACTTTTTTAGATCATTTGAGCATTTGTTCTTCATCATTGTGCGGGAAATTAAAGGTTTTGTACGGCCATAGGGTTTGCGGAGCAATAGATCTGGTGTAGGAAACTCAGTTGCTAATGCAAGTGATGCCAATG:1 + chr4 349621 3' + Tc1-2 263 1 73.97 AGAATATTTGTCATTAGAATTTTTCTCTGTGGCATTTCAAGTGAACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAACTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGCG:1 - chr2L 11219886 3' + 1360 400 1 43.84 AGGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGTAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACATAGTACAATCAAATATAATAAAGATTACATTGAGAAATATAATAGAA:1 - chr3R 12744663 3' + Stalker2 7581 2 64.38 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGATCGGAGCTGAAGCAGCTTCAGCAACAGCTCACCAGCTTCCAGCTCTCCAGCTCT:1 - chr3L 6355540 3' - Tirant 8115 2 80.28 ATTATTTACACATTTCACATTGAAGCACTTATTCGAATGTCAATAATTGGTCTTACTAATTGTTAACTGGATTTCCTCGATCAAGTATACTGCAGCATTGCTAGAAACACTGCACAGAGTCAACTCCA:1 - chr3L 17945062 3' + Bari2 110 1 75.78 GTTACCCAACTAGTGTGAATGCGAACACGAAATTTTATAATTTTGCTGGGATATTGATAGATATTGGGGAATAAACTGAGAAAAAATTTTTAAATTGTTCTAAGTAAGATAAGATAAGATATGTCTTAGGTTGGGTGTCCCTAATG:1 + chr2R 6172755 3' - INE-1 534 1 66.44 AGCTCCGTGTACTGGATGCCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGGCGTTAATCTTT:1 + chr3R 21395202 3' - G2 481 1 76.42 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAATGTGCTAATTTATAAGAAAAAC:2 + chr3R 19436138 3' + roo 398 1 76.03 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATG:1 - chr3L 15364835 3' - 1360 80 1 76.98 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAG:1 + chr4 311577 3' - 1360 74 1 73.88 ACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGACGACTTTTGCTGTTTCATTCTTTGGCTTTTCCTCATTCTTTCGTCTTCAGTCT:1 + chrX 9477341 3' - 297 6563 1 63.01 AGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAATGGATAGAGCCGCCCTCCCTCTGCGCCCATTCTCATTTATTCTCTTTT:1 - chr3L 18564018 3' - I-element 5235 1 67.12 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATTTCATTAATGAATAATTGCAATTATGACCGCCTTGCAGATTTATGCGATGATGACTCG:1 - chr3L 21910363 3' + pogo 2044 1 56.16 ATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGTTTTGCTCTATAGCTTGAGCCTGTGACTCCTAAAATATAATCGAGCTGTTTAGCGCAC:1 - chrX 4626157 3' - F-element 4313 1 56.39 ATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAGAAGCTTCTTTTATGCGAAGCCTTCGCTTGCATTTAAACAAATTTTCCCTCGGTCGGAAG:1 + chr2L 17748656 3' + Stalker 280 4 63.01 CAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGGGTCTCCTTCATAATTTAGGCGGTTTAT:1 + chr2R 2875248 3' + TLD2_LTR 123 1 75.18 ATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGCAGCGATTTCATTTCTCCAATGAGTCATGCGGCCAGTCCGTCGCTTGAAATAATATTATTAAATATTTTGTAAACAAAAAC:1 + chr3L 13952887 3' + I-element 5320 1 54.11 ACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAATGTCTCCGCCATGCGGGCGACTCTTTT:1 + chrX 7631251 3' + Doc 4317 1 80.58 GGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGTCCCAGCACACTCAACTGTGTGGAA:1 + chr2L 15777912 3' - 297 6626 2 53.42 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTACTTTTTCGGGCACGCAATTCAAAGTCATA:1 - chr2L 12324993 3' - jockey 4709 1 58.22 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCCAGACGGACAGACACATTTGGGCCCACACACACAC:1 + chr2R 15528530 3' + 1360 3369 1 59.52 AAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAAAAGAAAATCCATAAAGACGAAAAGAGGAAAGAAGACCGCAACCAGGAAAAGTCAAAAAAAAGGAAACAAAAGGATTCATTATAATTATGCGGCCCAGCGGGCTGGCA:1 - chr2R 20683479 3' + TAHRE 266 1 69.70 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTTAAGTGGTTCCAATGGCTCTCAATTTGAGTTTGTCGTAAAACTGAATCAGTTACACTTATGTGTGTTCTTACCAGGGACTTAAGC:1 + chr3R 18205744 3' - 412 7087 2 59.59 AAACGAAGAAAAAAAAAAACAAGAAGAAAAGCGGGGAGC:1 - chrX 14982168 3' + gypsy7 5009 1 89.74 TTCAAGCCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGCAATATATTTATGCTTTTGAG:1 + chr3R 14049418 3' + transib2 2783 1 58.04 ACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTTAATCTTTGTTTTCCTTTATTTATTTCGAACAACATAAAAGCGCTTAAAGT:1 + chr3R 21395245 3' - G2 461 1 50.68 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAA:1 - chr2L 17295823 3' - Doc 51 1 48.63 TTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACCGCCTAATTATCTTCGAAAGTATTGAGTTGTCCGATTCGGTGACAAGAAAGATGTTATTGACAGAAAGAGAC:1 - chr3L 23185003 3' - 1360 488 1 53.42 GCGTGGCATGGCACATCCTGTCAATTCCTGGAGCTTTATGTTTCGGCAGTTATTTAGGCCAAGACATCTGCAATAGCATTTGTAGGTACTGGTGAGTCTCTCTTATTTGTTCTGTCGTGGCGAAGTCATAAGGAGTGAAGCGATCC:1 + chrX 22727594 3' - Helena 16 1 63.01 CACAGTGCAGTTTATGTGCATGCCAAAAACAACACAAAAAGGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAATCAACGAAGACATCACAAGAAACCTAATCATTAGTATAGCATAGTAGTCGAAAAGGGGTTACACATAATAGAAACAGAA:1 + chrX 455570 3' - Cr1a 268 1 58.22 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTTAAGTGGTTCCAATGGCTCTCAATTTGAGTTTGTCGTAAAACTGAATCAGTTACACTTATGTGTGTTCTTACCAGGGACTTAAGCTTTCTAATCTGGA:1 + chr3R 18205757 3' - 412 21 2 68.49 AATAATAATAATACTTTAAATTAACATTATCGGGCACTAAAATGTAATATAATCAGAAAATGATGAGATGTTATTGTTAAAACTTTTTAAAATAGACGATAATTGCTTTATGACATAGTGCTAATTAATTACCACAATTGTGCCAC:3 + chr3L 16762446 3' - Burdock 499 1 63.70 AAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCAATATTCAAATCAACAAAGACGGGATTTGCATCCATGATTTTCAATTTGAAATTTATCCATGCAAATTGAGTTTAATTGGGTTGTATATT:1 - chr3R 28955582 3' - jockey 4923 1 58.90 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCC:1 + chr3L 16973450 3' - S-element 74 1 69.86 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACAGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACAAGTTTCAAGATTTCTATTCAAATTTCA:1 + chr2R 21690529 3' + 412 412 2 76.30 ACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAACCAGCAAACAAATTGTATTCAAATTGTTGCTATCTGTACTTATATATGATTGCTGT:1 - chr2R 9884280 3' + gypsy4 306 1 69.86 TTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAACAAGCAGA:1 + chr3L 3453683 3' + Tirant 8432 2 73.38 TTCCATGTCCCTTTTTGGAATCGACTTTTTATTCCACTTATTTTTGTTAAATGTGTAGATAGGGATTTTGAGCATGACTGCTTCTTAATTTTTCGAGTGTGTCACGATTCATCTGTTTCGCCCCCCTTTCAAAGGCACTTTCCC:1 - chrX 22849186 3' + HB 62 1 59.03 TGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCGGATACAGAAACAGCGCACCACTGTCCTTCAGAATGGCAACGAGCCGGCTCCATTCAATGAATATGAATTTCCATTGGACTCAAACTGGGAACTGCCCAG:1 - chr3R 18046683 3' - G2 232 2 64.38 ACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCACACACACGTGCTGCTGATGAAGGCGGCGTCGGCGGAGTGGGCGTGGCCTTTAAGTAGTCATCGTAGTTTGCGTTAAGTAACAAAACTTCA:1 - chr2L 15246967 3' + F-element 271 1 76.00 CCTTTTGCAGACGTTTTGGTACAGACTGTACCAAGCTGTGGATATAATCTATTGAAATATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAATCGTTTCCCACTTAAAGAGCACCATCCGTGGTTTCATGTTACTTGGCGAATGACAGT:1 + chr3L 26718377 3' - Tc1-2 1322 1 65.28 ATAATAATAATAAAGTTAATAATTGTTATTGATTTTATATTTAACATTTCAGACAATATATAATGGTGTGACGTCACAATTAGTTTGGGGAGTAATGAGTTCGTAACAGCGCAGATTTAACTGGATGTATGAGTGGGGGGGGCGCT:1 - chr2L 15808844 3' + mdg1 7076 2 56.16 GCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTATAGTATACAAATATAAGTCAATATTTAACAAATTTAAAAGAGAGTCCTTACACTT:1 + chr2L 6390251 3' - jockey 348 1 61.64 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAAGTCAAAATTGTTGACAGCTTGAAAAAATGACTGTGAATTATAAACTATCT:1 + chr2R 10161002 3' - transib2 34 1 58.22 TATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAACGACACGCCCATATCTTGTGTAAAATATGAGCGTACGGGGAGAAGTTCTTGGCTTAAATGTGGCTTTTT:1 + chr3R 14912051 3' - Stalker 6894 4 52.17 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTACGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATT:1 - chr3R 9125625 3' - Doc 34 1 65.75 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGTGTTTGTGGTAAATTAGTTTAAAATGGTAACTA:1 + chr2L 19140466 3' - Max-element 8258 2 65.67 ACTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGG:1 + chr3R 11095863 3' - hopper 83 1 73.61 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGAT:1 - chr3R 9125630 3' - Doc 38 1 64.14 GGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATA:1 + chr3L 25232912 3' - GATE 8266 2 54.46 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGAGCTATAGAGGCAGAGAGAGTCAAAGAGAGAGCCGCGGCGAAGGAGAAAGAAAATAATATCGTGGCAAAAGCGAAACGGCGAAAAAGTT:1 + chr2R 8666150 3' + P-element 2882 2 78.33 AGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTAATAAAGTAAAATCAAATCGAATTCGACTGTATGTGAAGCGAATTCGATTGGTAAAAAC:1 - chr3R 6171073 3' - rover 6968 2 74.66 AATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACGACTAAACTGCGATCCCATCTCCTGTCCATTTGGCCTTCTTTTAACCAACCCACC:1 - chr3L 21992367 3' + roo 8731 2 62.33 GTAAAAAAATCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGCCGTAAAACCCCGGGCATAAACTGCGGTCAACTTGACCAGGCATGTGTGAGCGGGCTTGTTTAACCAGCGA:1 - chr2L 19476950 3' - hopper 10 2 71.56 AATTTTCCTTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAAAACAAACAAAATGAAAAACAACAACAGAATGACAAACTCACACATATGTGCCCACGACAAACAGGCAAGTAAACATTAAGAAATTTGTAGGAAGCGAATGCGTTTTAT:1 - chr2L 16151594 3' + Doc3-element 149 1 74.66 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATCACCTATGCCAGTCAAACATTTCGCTAAGCCTGTCAACTTATTTCTGCCCAACTTAGTATAAACACTTCTGCCTATAAAACAAAGGTCAGCACATGTATTAAC:1 - chr2L 22235137 3' - 1360 17 1 73.79 ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGACGTGGGGAGTGGGTGAGCG:1 + chr2L 9879735 3' + jockey 4923 1 80.00 AACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAATTCTAAGGTAATTCACCGACCCTCAAACAAACTGCTCGACTTTTTTACACCTCA:1 - chrX 20685859 3' - Ivk 5259 1 63.01 CTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTTGCTTAGATTGAACCCTATTACAAACCTATTACGGAGTGTATCTCCAAAGCACTTACATAAAAGTATTCCTCA:1 + chr3R 15502580 3' + Ivk 5331 1 56.55 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGACACGAAAAACGGAAA:1 - chr2L 17260758 3' - P-element 95 1 14.49 TTGAATTACAATTAACTTAAAAAAATGCATAAATATTAAATGTCTAATGCCTCTTTAGAAAGGAATTATGGCGGTATTTGTCTCACTTCGTCCACAAACACACTCGACCGCCATTTTGACTTT:1 - chr3R 19533168 3' - Juan 4008 1 65.04 GGCGCACAAAATCGCGAAGTAAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGGATAAAGGCAACA:1 - chr2L 21325100 3' + invader4 3048 2 78.07 AGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTTTTGAACATAAAAGCAGTTCTATTGAATCTATAC:1 + chr2L 8574516 3' - Transpac 4923 2 80.14 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTAGTGCTAAACTTTCACCTGAAGGACCAAACTCTAGTGGGGTACCGGGCGGTCCG:1 - chr3L 13364305 3' + hobo 2910 1 51.46 GAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAAGAAAAAAAAATGGATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAAAACCTCCTCAGAACGAGATGGAAGACGAGATAGTCCACCTTTCTACCCGCGACTGAAACTTAACAATTTTAAGTACTTTG:1 + chr3L 20921694 3' + invader2 273 1 54.11 CATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAAACCATTATTAAGGGGTGGGCAATCAAAATTATGTATTTTTAAGGGTGGGTAAACGAAAAAAAAACAAATTTTAAAGGG:1 - chr2R 23000263 3' + FB 76 1 55.48 TAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGTAAATGTGGTAACAGCGGACGACACTGATTGTGAGTCGTCAAGCCGGAGAACCCGAACGGAGG:1 - chr3L 20582166 3' + I-element 386 1 55.81 AACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACCTAGTATTTAACGTTCTACGTATTTATAATAATCAGTCGGAAACTTTGAATTTCACAAGGATTTTCGAAACAGAATAGCCCAGACGGAAAATAGT:1 + chr3R 25277737 3' + 3S18 6077 2 69.18 ACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTATATTTGACCATTCAGCCTGCGATTCAAATAGTAGTATGAATTCGGTAATAA:1 - chr2L 18858712 3' - roo 182 2 65.07 GTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGAATTTAGGGGGCCGCAGTGTACAGTTGAGAAATTGCAAACTGAAGCCTCCTTTTATATATAGTATATATCCCTGCTTTTGATGGCTCACCTCGCTTTTGATCTTTCCCGACTGCTGATA:1 - chr3R 25804056 3' - mdg1 3 2 79.45 CAAGTATGGGCGTCGGCAGCGAAGCCGTCAGCGGCCACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATTGCACTTTACCACACGGTTTATGAAAAGTTGATATCTATTATATCGTGTGTTGAAGATGCAATCTATTGTGATGGAACACCTTCAA:1 - chr4 1120492 3' - HMS-Beagle2 194 2 47.26 AATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGAAAAAGCACAAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAATATTTCGCAGCTCCCATGGAAAATCGTAAAAAGTCATAAAATCATAATATAAATCCCA:1 - chr3R 6015076 3' + Juan 4156 1 54.79 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATTGGACTGTACGGCAGAG:1 - chr2R 15070056 3' + 412 449 2 54.79 TAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAATAGAACAGAGTATATAGCATATGTACATACATCCATATGTGTA:1 - chr3L 10584213 3' - 17.6 7396 2 65.32 TATTATTTTTTAAGATATTGATTCAATCTGTAAATGTATTGCTAAATGTGTCTAACTTGCAGAGATTACATAACATACATAACATAACAACATAACATAGTAGAATCTTAGAATATTGCCAAAGCAAAGTTTTGTCCTTGCTTTAC:1 + chr3R 27075408 3' - S2 130 2 46.58 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCACATGGCCCACACC:1 + chr3L 18183231 3' - Tirant 8118 2 76.09 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAACTTCTCAGCTCTTCTACGGTGGAGTTAAGGTTGAT:1 - chr3R 7450256 3' - Doc 23 1 50.00 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGAGCTATAGAGGCAGAGAGAGTCAAAGAGAGAGCCGCGGCGAAGGAGAAAGAAAATAATATCGTGGCAAAAGCGAAACGGCGAAAAAGTTCAGAAACA:1 + chr2R 8666158 3' - P-element 23 1 69.86 GCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGAT:1 - chr3L 13690264 3' - hobo 58 1 57.53 GGAATGTACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTATCTAAGCCAAGTTTGTTATGTGGGTCGAAATGCTGC:1 + chr3R 25804192 3' + mdg1 338 2 72.60 TACCAATCGCAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATCAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAATTTCACCATTCATCATAAAGAAATGAACAGACGAGGCTTCTGTAGCGATTTCGAATAGCTGAATAGATAACGCAAC:1 - chr2R 5304407 3' + I-element 229 1 64.38 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCATAAAACATTTGATGGTATTAACAATGTACTCCTAGACTATATGATGGTGTAAAGTGTAAAAAGTCACGA:1 - chr2L 7652179 3' - roo 49 2 52.74 GACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGATGTGGGTGAAG:2 + chr3R 16997474 3' - G6 52 1 50.68 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGAATTTGAGGCAGTTCGTAGAATAAGTCGTCTCTCTGA:1 - chr3R 4576976 3' + mdg1 338 2 75.34 GCGTGTGACGACGAACGACACACGAAGCTATACTTCGGATGCTGGTCGGCGGCCGTGATCTGTGCGAGATAGGGGAATCTTAATCGTCTGTGTGCATTGTTTTTAATGTTCTCTGGCAGGGCAAATGTAATGCAATATAAA:1 - chr3L 13629394 3' + Chouto 28 1 57.45 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAATAGTATATATTTGATATCGCTGGATCTGTCGTCGGGGCACTGCGATCTT:1 - chrX 7188580 3' - mdg3 5270 2 63.70 ACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTTCTCAAGATTTTCAAGACTCCAGTCACCACCCCTCCATATACATAAAT:1 - chr3R 10437024 3' + BS 5061 1 62.14 CGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTC:1 - chr2R 11264009 3' - jockey 4759 1 76.71 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGAC:1 - chr3L 18381924 3' + copia 214 2 47.26 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGT:1 + chr2R 11146141 3' - Quasimodo 45 2 57.24 AGCGTGGGATTGCTGACCATGCACTTATGCAGTGTGCTACACTTCCACTTGAACATTATTGTTTATGCTAGCACTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGAACTCTATGTATATATGTACTCTAAATATATATGTAC:1 - chr3L 24272122 3' - gypsy11 4152 2 69.86 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGCGTATATTTC:1 + chr3R 25751903 3' + roo 9024 2 53.42 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCATATATATAGAAAATATACACATATGTATATGTACCTAGACGTGCCTATATCCCGCCGATTTTGAG:1 - chr3L 16059234 3' + 297 6924 2 64.38 ACTATAAAAGCTAGAAGATTTAGATTCAGCATACAGAAATTAATTAGTAGTAATTAGTAAAAGGGCTAAAAATAAGTAAACGACATATTTAAAACATTGCTCCATTATTTTCTTAAAGGAATCCATCCATAAATACCATACATCAT:1 - chr4 176334 3' + INE-1 160 1 71.23 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCCTTTTGCACAATGATTATGTAAATTTATTGATTTACTTGCGCTGCTCGAAAGAGTAATAATAGTAATAATTACTTTTC:1 - chr2R 22463117 3' - roo 42 2 54.79 CATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATAAAAACTCATAAAAATGACATTAGCCAAATGGAGCACG:1 - chr3L 14322765 3' + pogo 216 1 73.97 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTC:1 - chr3L 17537739 3' - Doc 67 1 63.01 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAGTAGAAGAAGCAGCGCTGGCAGCGACGC:1 + chr3R 31724918 3' - P-element 48 1 31.31 CTAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAAACATTTGAATTTTGATAGATCTAAAACATTTTCAAGGCAACACTGC:1 - chr2L 4028186 3' + gypsy7 5008 2 69.44 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACTCTATATGGTAGCAAACAGTCGAATAGAAATATGAAGAATGAATATAGAAGCAATAGATAGTACATACATGTACATATGTATGTATATACTT:1 + chr3R 6461876 3' - 297 27 2 67.81 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGATTGGGCACGATTAAGTGCTCCACCTCGGTGCGATTCATCAGGTTTAGTTCGTCCACAGTGCGCAGGTGCAAGGT:1 - chr3L 363434 3' - blood 7057 2 52.74 AGACAACTGTACGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCATTCACCTTAGAATTTCTTTTCCTGTTTTATTTAACTTTCATTAGTTTTTTTTAAATTTTGTTTTTGCCTTATTGCCTCTCGAACCAC:1 - chr2R 954367 3' + 1360 168 1 52.74 GAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGTTAGGTCGCCGAGCTCAAAACGGTTAACGGGTAACGGTTACGGCGA:1 - chr2R 6245439 3' - roo 253 2 60.00 AAATTTATTAAATATATTTCTTTAATAAATAATTAAATATATTTGTTTGGTATTTTCAGTATTCTAATATTAGTATTTATTAGATATTAGTATTTATTAACTGCATAGTATTAAAAGTATATTCTGCAGAGCCGGGAAGTGTGGAT:1 + chr3L 4626699 3' + Tc1-2 1598 1 69.18 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCTCTAAAGTGCATGGCGAACCGTTAAAAATGAATTGCCCGGGCATATTTT:1 + chr3L 19031366 3' - roo 8685 2 69.66 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGCTAAA:1 - chr3L 21013851 3' - roo 62 2 62.33 CCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCA:1 + chr3L 19031296 3' - roo 8756 2 81.51 CTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACCACTTCCAATTTGCAGGTACGCGAGGGACTCGAGAAAGGCTTTTCACTTGTTTTTT:1 - chr2R 6885300 3' - flea 4818 1 60.96 AGGACTTTGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATGTAACCATAAAAGATTCAAGACCTTAATGACACATGGGAAAAACACCGTGCGCATTTTAACTGGCCTTCTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATAT:1 + chr2L 13250393 3' + baggins 5037 1 73.29 TGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGGGATTAAGCCGTTTTTGAATTGATTAACCACTAATTGAGGAACCACAAAGTCCGATGGTTTGGAAAATAAATCCTTCTTTTGATGCTG:1 + chr3R 5548584 3' + INE-1 91 1 63.64 TGTGAAATTAAATTTTGAAATATGTGTCTTGTATAGGCACATCTAGTTCAAATATGAAATTTAATATATCTTGGACACCTAAATTAGCCAAAAATTTCATTGTAACGTGATTGTATGTCAAATATTCCATGCAAAATGAAAGTCAG:1 + chr3R 26310123 3' + copia 329 1 76.03 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTAAATAAGTACTCTAACAACAACCGATTTAATCAAACGTAACAAGGCGGAATTTTCAGGTGCGTTTCGTCACTACGTAGAATTTATT:1 + chr2R 21848818 3' + Transpac 5211 2 71.23 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTAAATAAGTACTCTAACAACA:1 + chr2R 21848752 3' + Transpac 5166 2 71.20 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAATTTCGAAATTCTATGGTATCCCCAAGTCGATTGCTTCTCACATATTTTGCTCCAGCTCGTTTTGAATGTCCTTGCTGATTTGATTTCA:1 - chr3L 4081545 3' - mdg1 7071 2 60.27 TAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAGCCACGCCCCGTCGCAGTCCACAAAATAGTGTTTGCTGCACAGCTTGCCGCCTGGGGGTATG:1 + chr2L 795157 3' + jockey 4939 1 55.64 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGA:1 - chr2L 4929823 3' - blood 86 2 77.40 TTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCATCCTTTGTCACTTTCTCACACTTCTGCGTTTCAG:1 - chr2L 3933091 3' + Transpac 169 2 75.18 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGCAATCGACTGCAGAGACCATAAATTTCGATGGGATATTTAATAAAACAGAATATTGTTAACGTGGCAGAAGGGTTAAGTAAACT:1 + chr2R 15070197 3' - 412 38 2 59.59 GCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAAGAGTCTGTTCCTCTTGGTGGCAAGCGCCATTGCACAAACTTTTTCAACTTATCCAGGGATTCACTAACCGACTGTATTTCCCCAATTTCCTTTTCGTTACAGGTAAGC:1 - chr2L 5870240 3' - baggins 5303 1 53.42 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGCGCAGGATAATTGCCAGTCGCTGAGCAACAAAAGCGATTAGTTTAATAGTTGGCCATTAATGCGCTGCCTTCGATTTATATCTCATTGCCACATTACGCATAC:2 + chr3L 10112323 3' - I-element 19 1 69.86 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCATTATTCACTATGAGGATGCAACAACGTGCTTTTGAGCTCTATTAGATTCGCACTGCATAAACTTGGCTTTAACCCCACCATTTGACATTCACTTTGAGA:1 - chr3R 25862533 3' + roo 389 2 71.92 TAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTA:1 + chr2L 8574452 3' - Transpac 68 2 65.75 CTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATT:1 + chr3R 15790095 3' - flea 4751 1 54.74 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTATTAAATTGTTCGTATGAAATTAAATTTTATACGAATATTTCCAAAACTTTCCCGAAATATTTAACAC:1 - chr2L 6601269 3' - roo 8715 2 57.93 GATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAGG:1 + chr3R 15790119 3' - flea 4723 1 72.93 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAAGCCAAAGCAAAGCGTTCGAGTGGCAAAAAATAAGTTAGCCCGAGTT:1 + chr2L 17839513 3' + blood 7369 2 70.63 CAAGAAATTGCAATAATAAAGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATCGGCGGAAGTAGAAGTTAAAGCTACATGGTGGAAAATGTTGATTGATAA:1 + chr3R 23235299 3' - BS 57 1 58.90 AGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATTAAAAAAATACCA:2 + chr2L 1361082 3' - Stalker2 7256 2 67.81 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTG:1 - chr2R 17097493 3' + P-element 2836 1 33.94 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAGGGCTGCAGTCGAAAATGGGGTGACTTGGCTTGACTTA:1 - chr3R 7885551 3' - jockey 34 1 66.44 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGAAAGACGGCAGCTTAGGACCACCCAAAGAGGTCACTCCTCATCGGTGGCCATTATGACATCAAAGCG:1 - chr2R 9340111 3' - 412 7101 2 51.43 CATAAAAAAGGTAGCAAACTGTCATCTACACTGATTTTAGTAAAGCATATGACTCTGTTAATCATTACCTTCTAATAAGTAAACTTGATCTTTTATGGAACCGAAGCAGCGGCAGCCAGCGCAGAGATCATAAATAACATTGTCAA:1 + chr2R 7696137 3' + Q-element 76 2 65.07 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCA:1 + chr2R 5754577 3' + P-element 2850 1 47.47 CTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTGTATGTATGTAGATAGATGTGTGTGCCTGTGCGTATCCATCCGAGTGG:1 - chr2R 11146036 3' + Quasimodo 7325 2 58.56 CCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGCTGCAGTCCGATGGAAGACTTCGCGCCGGG:1 - chr3L 10960392 3' + roo 205 2 78.10 ATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACT:1 + chr2L 23034078 3' + FB 382 1 41.10 GGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCCTGACCTAGCAGTTTCGTCTGCTCTCTCTGAGGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTACCGAAGAGGCTCCAATATCCTTTCAGCCAC:1 + chrX 18271898 3' + McClintock 62 2 79.45 TGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTT:1 + chr2R 11146144 3' - Quasimodo 26 2 64.66 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGTTCACAGGTCACTGTATCAGTATATCAATGCTCCACAACCACCAACACACCAACTTGGAAAACTAAAACAGCAAACTTGGCTCGA:1 - chr2L 3960126 3' - jockey 16 1 78.77 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACAACTTGCAGTAATGG:1 + chrX 3647016 3' - 412 7099 2 52.74 GTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAGATCCTTGTGAGCAATCACCAACAGCCAGAGCATCCTCATTCACTAGACGTAATCGGTGT:1 + chr3L 5148298 3' + roo 51 2 58.90 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCAAAATACATTTGGAGGAATTTGTAAACAAC:2 + chr2R 11256284 3' + roo 9037 1 60.27 GTGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTAAGTCATTTGACTTAATATGATTTATATATGATTTAGATTCAGTTGTTTTTCAGTATGTTTTTTTTTT:1 + chr3R 28943685 3' + 1360 3087 1 38.60 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTTCTTCATTGGCATTTCATAAATAG:1 + chr3R 15152685 3' + opus 7453 2 76.00 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCATGTGGT:1 - chr3L 11803972 3' - blood 66 2 61.64 GTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAACTTGTAATAACAAGTCCGTAACGTCAACCGCGCTATGTAAGTT:1 + chr2L 16857317 3' + P-element 2566 1 30.22 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGCGCAGGATAATTGCCAGTCGCTGAGCAACAAAAGCGATTAGTTTAATAGTTGGCCATTAATGCGCTGCCTTCGATTTATATCTCATTGC:1 + chr3L 10112309 3' - I-element 7 1 75.00 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGGGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACG:1 + chr3L 18484467 3' - hopper 65 1 65.25 ATATCACCATAAGCACATTTTGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTGTGTTTTCTGACACTTTTTCATAATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATCCCATTTGGTGCAGTTTCGTTGGCCAGATGCCGTGAATGGTCCAGAACT:1 - chr3L 7971193 3' - Tc1 1626 1 66.44 ATTAGTTACGTTGAGAGGAACAATCCTCTTTAAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGATAGAGTAAGTAAAAATAAAAATTAATTATTTACCAGGCAGCGAAATGTTTTAACATTTTTCGGGCCTTTTCAGCATATTTTCAGCATGCGCG:1 + chr2L 11887572 3' - Gypsy6A_LTR 286 1 54.79 ATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTATAATAAGAAAAAAAAATAATAAAAATTAGAAAAAAGGAAAAAAAGCACAATCAAGATGCAAATTGTTGGAACAACAATGGCGCAGCCAACTAAAATAGCGAA:1 + chr2L 4804694 3' + Bica 184 1 73.79 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTAACCCCTGTTGAGAGGCGGCAGGATTCTCGTCAGTTGTTTGCTTAAAA:1 + chrX 7741968 3' - hobo 52 1 61.90 TAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCT:1 + chr3R 10030779 3' - BS 5077 1 62.33 CTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTTTTTATGAAATAATAAATAATACTTTTTCGGCC:1 - chr2L 8574382 3' + Transpac 5158 2 77.86 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAG:1 + chr3R 25862646 3' - roo 90 2 80.14 GTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTAACTTTCAGCGTTACAGCTTTAGAACTATTTTAGAGTGTAACCTTCACTTGCAAGCACATTTAAGGGTATTGCCCCCTTCGATATTCATCGCCCAAGGCACTT:1 - chr2R 23408993 3' - opus 15 2 72.60 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAATATTCATTTATGTGAGAGCAGCAGCTGTGTCAGTTACTGCAAAAAAAGT:1 - chr3R 22341110 3' - hopper 74 1 53.42 TATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTGCTG:1 + chr3R 7616818 3' - Stalker2 7315 2 67.12 GCTTCCTTCCGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATTTACTCTACGAGGAACGTGTATAAATACATACATTTTTGTTATTATTCTTGTTTAAGCATTTAATTACTCTAAAGTTTTCTTTCCAAGATACGAAAATTAAAATAAATTA:1 - chr3R 24988798 3' - INE-1 29 1 77.24 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATATGAATATTTCTAGAGCTGATACATTAAGCCATGTTAAAGCTTGTAACACAATTGGTAATTAAAAATGAAC:1 + chr2L 2120473 3' + I-element 5307 1 50.68 CGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTAGATAAAGGTAAATTAAAGGTGCAGAGTAATAAAGGTCAAGTAACTAG:1 + chr2R 17014467 3' + flea 4940 1 67.81 TACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTTTTTTTCTCTTTGATTAAAAAGCTGGGTGCGTACTTATGGAATTAAATTTAAAAATTATA:1 + chr2R 16966920 3' - mdg1 165 2 58.90 CAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGTATGTCCGTTTGTCCGTATAAATCATTCGAACCAAACTGTTGATATAAGCAACATTAAGCAACACTATTCTTTTATCTCACATCAGTTACACAA:1 + chr2R 7695703 3' - Tirant 130 2 65.07 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATAATAGAGTTTGCGGT:1 - chr2L 9274993 3' - F-element 76 1 61.64 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTAGTCTTGAATGCCGG:1 + chrX 4673687 3' - roo 8735 2 70.71 TTTTTGCATATATTTTTAGAAAGTTCGTATTTGGATAGATTGATTGTTTAGAATTGTATATGGCGTATAAGCCGCCAAAATGGCTAAGCTATAAAAAATTTGTGTAAATTTCGCAATTAGCGGGGGCGAAAAGGCGCGTG:1 + chrX 12005150 3' - looper1 1806 1 84.29 GCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCTTTAAGTTTAAGATGTTGGTAGATTACACAAACATGTTCGGGGTGGGGTTTCGAAAAAAAGAGCACATAAAGTTGGTAACTTCTAAC:1 + chr3R 7585860 3' - Doc 4236 1 55.48 CATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGGAAAGATTTATAATTGTAGCAACATTATAGAGGGGACCATAGCCATACATGAAACTATTAGA:1 - chr4 311142 3' + 1360 3379 2 78.77 GTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCA:1 - chr3L 18484393 3' + hopper2 1528 1 69.18 GGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCT:1 + chr3L 20251985 3' + copia 5036 2 78.08 CTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGTGTTTGTGGTAAATTAGTTTAAAATGGTAACTAAATCCAGTTTCTAGCTTAGCC:1 + chr2L 19140487 3' - Max-element 10 2 76.76 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACAGCACGCGGCTGTCACGTCAAGTGGTGGCCCACCTGGA:1 + chr3L 7460692 3' + 412 7501 2 66.36 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAATAAAGCGGAATCATGTGCAGAAAT:1 - chrX 21403380 3' + roo 356 2 50.68 GAATGCTGAGTCGGCTTGCCGCTCATGTCTTGGTGGCGCGATGCATTGTCGTAGGGTAGACTAAGCAAGAATATTGTATGTACTTCTGACGACTCCCATGCTCTGTTTCCATTTGCTCATTTGGATTGCTGCGAATGGAGGAAG:1 + chr3R 7573650 3' + gypsy 7142 4 59.72 GTTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAACGATAAGAAATGTTTAGTATTGCCATTGTCTTTAGCTTCACGGTATGCCAGGCCCACTT:1 - chr3L 874884 3' - Rt1b 4807 1 55.56 AAACATATAGGGACATTCAAAAAACCCTTGAATGTTTTCCAAAATGGTATCCAATGCCATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAACCCGTGGTACCAAACAAACAGCTCCCAAAGAGAAGCTCAACATTTTGTAATATTAAAACCTGC:1 - chr3L 18276449 3' + HB 418 1 69.18 CGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGCACACCGCTTTTGCTATAGTTTTTCATTGCAAATCATTTGCATGGCTATTTTCGAAAGCGCTTTTTTATTATATTTTCTTTCATTTCTATAACCC:1 - chr2L 19406418 3' + Doc 324 1 71.43 CTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTAGGAAGCGACAGCGATAGATGGCCCCAAATTGTATGGCTTAGCCCTTTTGTGTGTTTGCCGCCTGGCCCCAAGAAAAAGTTAACAAATTTTCGCATGAATATTT:1 - chr2R 19841610 3' + Transpac 185 2 75.34 GCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTAGCATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGACATTCTTTCGAAAGAGTTATTGTCTAAAATTATTAACTAATCTATCGTGGGAGTTCTATT:1 + chr2L 12346730 3' - I-element 364 1 74.48 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATGGACCGTGAACCGTCGTCGAGTGTGTGCGTATTCACTCTTTGTTTGCAGACTTTTAGGCGTTCGTCGTTGTT:1 + chr2R 17332236 3' - jockey 56 1 53.10 CGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGG:1 + chr2R 21439497 3' - jockey 35 1 58.33 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAGCATACATTATGCAACTCCAAATCTCCTCTAAGATCGATCGGAAATGGTTTTTAAGGGCATATAATCTTCGGTTTATTCTTTCGCGACTTTCGGAGAA:1 + chr3L 786010 3' + I-element 5332 1 69.18 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACATTTTTGATTATCTTAAAAAATTGTAATCACACGTA:1 + chrX 2295291 3' - Transpac 4929 2 65.75 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGAAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGACCTCTCACTTCCC:1 - chr3R 10213053 3' + P-element 2816 1 27.34 GAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATATAAGATTAATTATAAAATGTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAGATCGTAGTCATTTTAATCACAAAATTTAATCACAACATTATTATAAT:1 - chr3R 7080608 3' + G4 3751 1 67.12 AAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACAGAGAGGAAGCGAACGAACA:1 + chr2L 22690021 3' - Tabor 6916 2 69.72 CGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGACTATTTGACTATATGGCTATACCTTGACTATGATAAATATATGTTATGAAAATATTTTATGTTGAAATATTTGAGTTTTCTACA:1 - chr3R 12770886 3' - HMS-Beagle2 6974 2 56.16 ACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCTGATCCCTGCAGCCTATTCAAAATAGCGAGCGGAATGGGGATGAAGGAACTGGACAGACTTGCTCCCAAACTAAAAGTGTGAGAGCG:1 + chr3R 11944956 3' + roo 9039 1 67.81 TAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCCAAACCAGCAACAAAGTGGCCGGGAAAAGCAGCCAACTTTTCCCCAGTTTGGAAGTGCAAGAGCGAGTTTTAGTTGCACACACACTC:1 - chrX 14979125 3' - jockey 4829 1 65.75 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACACTTTTGCTTCGTTGAGCAAGAATGCTTGTTTTTTACATTCCAATTTTTGGTCCATTATTTATGGCTGCAAATATTCGCAGAATA:1 + chr3L 2320737 3' + roo 9043 1 65.22 AATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAAT:1 - chr3L 18381937 3' + copia 201 2 56.16 CATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTGCCCAGAAATAAAGACGGAAAAAGGGAGTCAACGCCAGAGAAAAACGTCTGCCTACCTTTG:1 - chr3R 31887256 3' + HB 1586 1 72.41 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGATTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGCTTATTTTTGGCTGAGCAATGAGGTGTTAAAATTCCACTGCATA:1 - chr2L 13842290 3' - jockey 4748 1 67.81 TATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTGATGGATTACTCTCGTTCAAATGTCGAATCTTGTTAGCACAGCTTCCCAGCCA:1 + chr3R 7616867 3' - Stalker2 18 2 73.29 GACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTATCGGTGTGATG:1 - chr3R 24750965 3' - G6 52 1 57.94 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCTCTCTTTTCTCTGACTAGCGAATCTCTATCATAAAATTATATACCCCTTTAAAAGATAAAAAGAAAGTAGCAAACTTTT:1 - chr3L 4651530 3' + roo 9039 1 63.01 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAATTGCCATGTAATTTGGACTTCAAACGCATTCACGTGTTGCAGTTGATGCTGCTGTTGATCTTTCCTCCTTTTTTTT:1 + chr2R 20574545 3' + jockey 4966 1 58.46 GCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTATCGGTGTGATGGTATCCAGGTAGGGACTCTTCGAGAACGAGGTCT:1 - chr3R 24750931 3' - G6 30 1 65.22 ACTAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCTTAAAACAGATGCCATCTACAGGAATCATCGATGTTTCTTTTTTCGGAGCTTCATATGGCGCCATAAATAATCAAATGAAAATAACAAAGGACT:1 - chr3R 30976243 3' + Q-element 241 2 50.00 CTGAGATATCAACGTTCATACGGACGGACGGACGGAGTCAGATCGACTCAGCTATTTTTCCTGATCAGGAATTTCTATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGGGTATAA:1 - chr3R 31045706 3' - INE-1 136 1 71.92 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTATACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGCGTATATTTCTGCGAATATTCTAGGTATTTTAGTTATTTA:1 + chr3R 25751933 3' + roo 391 2 70.55 ATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGCCCCAATTTTTTTCCGCTTGGCACACACAACACTCGCCCATC:1 + chr2R 7207533 3' + hopper 36 1 80.00 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCTACATTTCCATACATATATATATTT:1 + chr2L 17380683 3' - 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chrX 8977413 3' - I-element 37 1 60.27 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTACACCTGATGTCTGAGCAAAGAGGAGAAGAGAAAACTTGCACTTAGGCAAGCTTATGTAATGGTATGCATATTGCATTATGCATATTAATTGGCGCTCAACGCG:1 + chr3R 1267820 3' + P-element 2872 1 76.92 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGGCTTTGACGTCGTTGTTTTTCCCCTGCTCGTCATGTTTTGTGTGCTGTATAGATATAGATATGGATATATAGTATGCCTTTGCCATTTCGCCGTTCTCTGCCATTTGG:1 - chr2R 15528403 3' - 1360 12 1 76.71 TGGGGCAGTCACATGTTAGTGAATATCGGGGGGAAAAGTGATCTGTTAGTTGACGCGAAGGCTGTACTACATTTGTGTTCTTCTGCTTGGCTACCATTTCGACCTTGC:1 - chr2R 4973008 3' + Gypsy12A_LTR 434 1 61.11 TTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTGTATGGACTGAGACTTACCTGATCGGATCGGGAGTGC:1 + chrX 18220659 3' - Burdock 6216 2 75.34 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGTTCCAAACGTATGTCAAGGGGCGAAACTGAAGCGAACGCAGCTAATCACA:1 + chr2R 21388527 3' - Doc 46 1 47.14 GCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATTGAAGTTGTGAAGTACCAAATGAAACTCCAACTTGGCCAACTGGTGGCCCAAAAACAGCAAATAGACAGATAGATCTGAGCGCGGCTTAAATGCCA:1 + chr2L 14621764 3' + Tirant 499 1 53.42 CTTGCGGCGTGTGAAAAATAAAAAAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCTTTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACCAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGTGAGAACGATAAAAGGAACAACACGCAGT:1 - chr2R 2498405 3' + 1360 426 1 73.97 GCGCAGTCGGTAGGATACAAAAAGGTATCCGAAAAAAAGAACTGCGAGTGAAATAAATTAACTTTTATATAGCCTAGGGGCAACAGTAGTGATTGACTCTAGTTCGCTGCGGTTG:1 + chr3L 1772549 3' + 297 416 1 54.78 AGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATATAAGGTCTTTTTAATTAACCAACTTATTCGAAATACATCGATTACATTCCAATAT:1 - chr2R 18344543 3' + 1360 3323 1 62.33 GGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTATCGCCATGGTCAGACCGACATGGCAATCCCTCTGATTTAATATATAATATATGTATATATGGTTTTATATGGTATCGGACCGGCACGGTCATAT:1 + chr3L 7939173 3' + R1A1-element 5309 1 59.59 GACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCTGCTGTAGTTCGTGTCGCAATACAAGTTATTATGGTGATTATGAGTGCGTTTGAGTGGTTTG:1 - chr2L 22673684 3' - Cr1a 4073 1 50.41 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTTGTGTCACTCTCTTTGGCTCT:1 + chrX 7706846 3' - P-element 53 1 49.32 AATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAAACA:1 + chr2L 22684613 3' - transib3 58 1 53.42 TCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCCTTGTTTAAAGCCGGTGGTTTTTTTTACAGTGTTGATTAGCAAAGAGCTCCAAGTCACGT:1 + chr2L 21976838 3' - Idefix 4 2 56.16 TAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGCAACGACATCAGCCACCTGTTCTACACTATCCTGAAGAAGCAACAACGCTGCACGTGGGCGGTGGACCGATGACTTTAGAGCCGCA:1 + chr2L 23370368 3' - Idefix 185 1 64.93 CTTAGTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTTGGGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGGAGCCCCAAAAGCGGGCTACATAAAAAAATCACTAAAAACTTGTAAAAGCATC:1 - chr3R 17362831 3' + Cr1a 204 1 52.07 CAAGAGAGAATGGTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCTGACACGAGGGAAGATATGAAACGCAAGCATATAACTGAAAACGAGCTAAGATCCATTTTGAAAATGGTCAGCCTTGAGCACATCGCTCAACGG:1 - chr4 185977 3' - INE-1 578 1 68.84 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCTGTTTCGTTCTGGAGTGGTATTTTCTAATTCATTTAAATGTTGCTAATATTTAAGGAATTTTTAAAATACTAATGATGCGAAACCCTTAGGATTCTTGATTCTATTCT:1 - chr3L 8658668 3' + roo 397 1 73.29 ACAAGAAAGAATGCTATAGTCGAGATCCCCGACTATCATATAACCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTAATCCTCTGGGATATTAATAAATATTGAAAATTAAGAAAATACACAAAAAGTTTTAGCACATTTTT:1 - chr2L 16690242 3' - INE-1 579 1 70.55 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTTTCGATTTATTTAATTATATATATATTTCCAATTACATTATATTCTTTAGTAGCTAAGATCGCCCCACTGTGCCTGCGTTAGGGTTCTGCTTTTGGGGGC:1 + chr3R 6555352 3' - Juan 4030 1 77.69 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGCGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGGATTCGTATATTACATTATTTCACTGCCAATTGTTTTTCCCGGCCACAA:1 - chr2R 11095706 3' - diver 5916 2 62.33 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCAAAATACATTTGGAGGAATTTG:1 + chr2R 11256276 3' + roo 9030 1 55.17 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAA:1 - chr2L 17295810 3' - Doc 38 1 56.16 ATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCAAACACACAAGTATTGTTGGCTACGATGGAAGTTAT:1 - chrX 3648730 3' + 412 7102 2 71.31 GTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGTTAAGCTATGATAAATAATTAGGATTATATTTTGGCCTT:1 + chrX 20851798 3' - Doc 4312 1 71.74 CTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCCGATCCTAATTCAGCATAGTACAGCATATTGTCACGAACCGTGTGACTTATCGATAAGATAAGGTATTTTCCGCAGTCGGAAATATCG:1 + chr2L 21992082 3' + Idefix 331 2 67.81 GTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTAGGTACTCACATCCTGCCCTTTTCGATTTACATGCAGCATGCATTAAAAATAGAACCTTCGGAAAAGGTTCGTG:1 - chr3L 23027519 3' + INE-1 551 1 54.35 CACGAACACACACACACACACACACTCGTGCATGCATTTGCCCATCTGATGGGCAACAAAATCATTTATCATAACCAACAGCAGCGGCGCATTTCTCTCAACTGGCGAATGTGATTGCGGCG:1 + chr3R 18894558 3' + accord 7026 2 90.16 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCC:1 - chr3R 9125649 3' - Doc 58 1 50.68 GTCGTAAAAGTCGACTAAAGGGTGGAAGAAGGAGCCCTCATGGACTACAATGAAGGAAGGGGGCGCGACTTGGCCTCACATCCTGCTCACCGCACCGGCACATCGAGGTAGTGGTCCAGGAACT:1 + chr3L 19609626 3' + Rt1b 4887 1 74.19 ATATAGTAATATAGTAATAATAAATAGTGCAAACTAATATAGTGTAATATATTACATGCAGGGGAAATATGCAATTGGAATGCGTAGTTTTTTGAGATAGAACAGAAAGCATATGGCCTCGGCGACTTCATCTTCTACTCGGTATT:1 + chr3L 20434805 3' + Tc3 293 1 78.77 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTCTAATATTCACCTGATTTAAATCTTCAATA:1 - chr3L 17537710 3' - Doc 38 1 61.64 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAA:1 + chrX 3647000 3' - 412 7115 2 60.27 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAAAACGCC:1 - chr3R 20934681 3' - 412 71 2 65.07 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCAAATGAAAAAACTTTTCCCAACTGCCAAAGTTCGGCCAGTCAACAGTTTAAAATCGATGCTGGCTTATTTGTTACAGAGTCG:1 + chr2R 12202372 3' - Tirant 8137 2 63.04 GAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTGACCCCAAAAAGTTTTCTTTCTTTTGCAACACCTGACATTTCGACCAATTTATTTTTAATCCATTTTCACTGGCAACACTCAACACCTTCTCCAGCTTTACC:1 + chr2R 4214795 3' + I-element 20 1 69.18 CTTACTCTGCCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATTTCGCAGGTCAACTGACCCATGTCAGACGATGTTAACACCTGGT:1 - chrX 12531563 3' + Gypsy6A_LTR 245 1 40.74 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATCTTTGCGAGAGAGTTTGTTTATGCGCCGTTTGTCCCACATAATTTTTGTTTGTTAGTTTTTCTCTATGGTTGTCAT:1 - chrX 7706700 3' + P-element 2868 1 69.86 GTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCCTTGTTTAAAGCCGGTGG:1 + chr2L 21976796 3' - Idefix 33 2 52.63 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATG:1 - chr2R 5237725 3' - Doc 52 1 53.85 GGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGATTCGGGAAGGTATTTGAAATGTAGACATGTTGTGTGCTGTGTTCCAGTCGGATTTTTAAACTTATGACGTTAAT:1 - chr2R 16774216 3' - I-element 4965 1 62.02 ATATATATATGTATATATATTACACAATCTTTTAGAGAAGTGCGCCTGCAGCTGCGACAATTATCACCCGATTATTTCGCAGCGTGTATTGCGAAATGTGCGCCTTCGATTTGCTAAATACTTTTGCTTAATTATACGCACGCACA:1 + chr3R 18298639 3' + 1731 4411 1 75.34 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATTAAAAAAATAC:1 + chr2L 1361080 3' - Stalker2 10 2 66.44 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACAATGTATTTGGAAAACAATCAT:1 + chr3L 24766010 3' + 1360 3346 1 78.17 CTATTAGATACCCGTTACTCACTCGGCGGACACACCGCACACACCCGACGGTGGCGTAACTATTTTTTTTTTCGCTGCATATGAAACTTTTTTAATAATATTCAGCTAAAGAGCA:1 - chrX 3593826 3' - INE-1 547 1 79.13 AAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGACTAATGCACTTTGTACATATTTGTCCTGGTATTTACACAATAT:1 + chr2R 19333622 3' - 1360 229 1 70.55 CAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTACCACTACACTGTTCGGTGAATAACTTTCTGGGGACTTTAGGTACTGTGCATGGTGCAGCCATTTAAGCCCTCAGATTCGGACCCTTCCTGCG:1 - chr3L 13690933 3' + hobo 467 1 63.70 AGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAATGTCTGGCAAATAACTGAAGACTTTCAAGCGATGCACGAGTACAAATTAAAACCATAAAATATTTGCAATCACAACGAAAGGACAACAGCCAG:1 + chr3L 14378208 3' + roo 461 1 74.42 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTAATCTTGACGGTTTAAGTTGTAACGTTTAAT:1 - chr3L 14375565 3' + roo 401 1 77.40 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATTCTTGATCAACAGCAAAGTCGATATAGCCTTGTCCGTTTCAGAGTAAACTTGTTGATACTTTCCCAAA:1 - chr3R 6461724 3' - 297 6615 2 60.00 AGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTATCAGGGATTAAAGATAGTGGGAATTTGAAAGGAGAAACACTGAAATGGA:1 + chr2L 12816347 3' - I-element 231 1 66.44 ATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATATATACTTAATATGGTCAGAATCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATTCTCTT:1 + chr2R 8568839 3' - mdg3 5287 2 48.63 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGCAAATGCCACCCATTTTATCGTTATTTACTTAGAGGATTTGGCTTTTG:1 - chr3R 13838193 3' - 297 6628 2 54.11 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATTACTATAAATTTTTAAACCATTTCCC:1 - chr3L 13678869 3' - hobo 43 1 54.29 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCCA:1 - chr3R 14277885 3' - P-element 41 1 47.11 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACAC:1 + chr2L 7652278 3' + roo 9007 2 64.38 GCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGACGATTGGGCATACCCAGTCGAAGAATGTGTAACGTATTAAAT:1 - chr2L 6322286 3' - P-element 143 1 29.58 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATGGCAA:1 + chr3R 22494185 3' - 297 6613 2 55.96 GTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAAATCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGAGAATGAACATCTCGTGGCCCATTTGCTTATGCCTCTTGCCATTGTTTGCGCTACACTTCAACGCACTTTCGTCATTGATCCGGA:1 + chr2L 5750990 3' - Cr1a 4186 1 56.16 ATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATCAGGCAATTAATTCGATTCAT:1 + chr3R 15790136 3' - flea 4719 1 76.71 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCATAAAACATTTGATGGTATTAACAATGTACTCCTAGACTATATGATGGTGTAAAGTGTAAAAAGTCACGATTTTCTTCGATCTCATCAATGTT:1 - chr2L 7652156 3' - roo 26 2 60.96 TTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGTGTTTGTGGTAAATTAGTTTAAAATGGTAACTAAATCCAGTTTCTAG:1 + chr2L 19140480 3' - Max-element 21 2 69.86 AGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTAGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTACGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTCCTACCCAGGATAATCATTCCGATTGTGAAACACGTGGCTTA:2 - chr3L 23241872 3' + 1360 3308 1 69.86 ATATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAG:1 - chr3L 16973377 3' - S-element 1594 2 62.76 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGCAAACAAGAGTAACACCACACCCGAAATGGCAATGAGCATGGAAATCATAAT:1 - chr2R 12202253 3' + Tirant 8457 2 61.90 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGGTCAGGGTCCCAGGCCGGGGTCCCATTGTCTTG:1 - chr3L 14302177 3' + 297 6896 2 76.55 CTAATTTGCAAAGCGAAAGCTTAGCAAACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGCTGTTGATCAGCTTCCTCCTCATTATAGGCGCTTGTTTATGCCTAACTCTTCCAG:1 + chr3R 19612149 3' - Quasimodo 7246 2 62.33 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTTCCCGTTGTTTAAAATATGTCGTCGAGCCAAGAATTTGTACTTTAAATGTTTTTCTC:1 + chr3L 2330215 3' + roo 9042 1 64.14 TTTGTTATTTTTTTTTATTATTAAAATCCAAACATTACCTTTTCTTTCGATTGTTTCACAAAAATTAAAAGAGGTGTTAGGTGACCGGAACAACTTAACTTAAATTGAAAGAAAACAAATGATTTAAGTTGAATGTATAGATAAAA:1 - chr3R 8238463 3' - BS 5099 3 61.64 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTGCAACTTCGTTTACACTTTCAGCCCTCTGGGCCAAACCCACTTGACCTGCCATTACGAGCAGAGTTCT:1 + chrX 6936705 3' - hobo 54 1 61.64 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGCAAGTGGAGTGGAGGAGCCATGGAAAAGAACTAAGAGTTAAGTGAGTAAAGTCAACGTTTAATGAAGTA:1 + chr2R 21439573 3' - jockey 21 1 71.92 CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCC:1 + chr3R 31141053 3' - Burdock 63 2 62.33 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTGTCAAAGATGATTAGGCATAAA:1 - chr3L 19031180 3' + roo 393 1 73.97 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCGCACACTGTGCGGAGAAAGAGATGGGGCCACATGGGCAGAAAGAGATGGCACGACGAGCACATTTGCATTTTCATAGTTTCTGTGCGGACGACTATGCTC:1 - chr2L 16615714 3' - hobo 23 1 71.23 GGCTATTGGTCCTAATCAAGAATATGTGTACATATATACTTTATATGGTCGAAAACGCTTCCTTTCCGAGGCCGATGAGGACGAGGCCATATTACCCGAAAGCGATGTACCGGTGGTCAGTTCCAAGACGCGGGCACGCAAAAAGG:1 - chrX 15745541 3' - INE-1 87 1 56.85 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCGAAGTTGCGACGATGCCCGC:1 + chr2L 17260801 3' + P-element 2844 1 44.35 TGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATAATTAAGT:1 + chr3L 18484456 3' - hopper 81 1 73.97 AAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTACAGCACCTTTGTACCCTTGTGTCCGATACTCTGCTGTTGAGGGCAAGCGAGATCTCCGGGAGAAGTTGGTTCCATGTGTTCTGCGG:1 - chr2R 5024441 3' + Q-element 124 2 53.28 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTG:1 - chrX 7756411 3' + roo 330 2 71.23 AACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGTATTTTAGAGCACGCTAAGCTGTTTTTTTCC:1 - chr2R 23667520 3' + hobo 242 1 76.15 GTGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTTGTGCGAATTTTACTTTATTTTTGGGCCT:1 + chr2R 11146172 3' - Quasimodo 11 2 78.08 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACTTGCACTTGTGAAAGTTCATCCTCATGCACATACATA:1 - chr3L 18484347 3' - hopper 2 2 78.26 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCATCCAAATACGTCACTATATATATATATATATAGGACCCGCAAATGGAGAACTCAACTTTAGCAGGATGAACATGTATATATATAAAA:1 - chr3R 9300742 3' - 297 53 2 60.96 TATATATGTGTGTGTGTGTATATCCAAAAAAGGGGATGAGGCGACACATGTTCTGTCCGTTTCGAGCTGCTTTGGCGGCTGGG:1 + chrX 13975261 3' - Quasimodo 38 2 66.27 TATGCATGTGTGTGGGTGTGTATTCTAGCTGGTGCGACAGAATTGATTAATTGTTTATCTGTGGTTAATACTCTTGAAGATCTTAAACTATCCATGCACTTCACAAAATTTGATTAGCTTAGGAATTATCATAGGTTATTTTTTTA:1 - chrX 9583176 3' - Quasimodo 38 2 55.48 GCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGATGTGGGTGAAGGCCATGGACATTGTCCTGGACCGACTGGTTATGCAGCAAGCG:1 + chr3R 16997516 3' - G6 7 1 80.42 GTGTTATCTGAAGAAATGCGGCTGCATTGAAATTGCCCTTCGATTAAGCTAAGCTGTCATTTACGCACAGCTAAAAACCAAAAGTCCGAAGTCCAAAGTCTAGACTCTGTGGAGAGCCAACGTCCACGTC:1 + chr2R 2144185 3' - Chimpo 418 1 71.54 AATGGTTATTTTAAAAAGAATTTAAAGTATGCCTCTTTAGTTATAGATATCCGTGGGGCAATGTCTCTAATGATTGCTAATACTGTTGTACTTGTAGTTGGCCTCTCATTAAGACGAGGGAGCCATAAATTCACGAATATACGCGA:2 - chr3R 13353265 3' - Tc1 1495 1 71.92 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACA:1 + chr3L 10469618 3' + roo 352 2 59.31 CCTGAAGAGAATACATCCCCATGAACTACCCCCATGAACACGTAAGATAACATAATCTCTTCACTGTACATTTGTACACATTATAATTAAGGAACAGATCCATTAGGATCCGAAATCCCAGGGGTCAG:1 + chr3L 11816231 3' + G5A 2682 1 61.72 GAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTATATGTAAAAATGTAATTAAGAATACATACATTAGCGTATTTATATTTATGGAAAATGGAAAAGTG:1 - chr3R 17874171 3' + Tc1 1587 1 74.48 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATCTTTGCGAGAGAGTTTGTTTATGCGCCGTTTGTCCCACATAATTTTTGTTTGTTAGTTTTTCTCTAGGGTTGTCATATTTCAACAAAAGT:1 - chrX 7706686 3' + P-element 2882 2 80.82 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGTCAGAGAACGCAGACAACACATCGCACATATTAAGAC:1 + chr3L 5069480 3' - opus 7023 2 56.32 AGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATATACCACATATGCGATTTTTTGGGGCTGCAC:1 - chr3R 15152641 3' - opus 7078 4 78.52 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCCCGTTCGTTGATATGCACAGAGT:1 + chrY 311461 3' + 1360 3386 2 53.42 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGACCACCGACCGACCGCTGACCATAATTCACTCAAGTTAGACAAAAGCATTTTGGTTGCCC:1 - chr3R 21341318 3' - hopper 44 1 53.85 GCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATTGTA:1 + chr2R 21870247 3' + copia 177 2 73.29 AACGTCAGCGTGAACAAGACGAGCGTCGGCTCTCTTCAATTAAAAACAACGCGTATTTCTCGTACGTTTCTACGGAAAAGCTCAAGCCCTCCCAAGATCATGCGCCTTTGGGACAATATCCATTTGCTTTTCACGACTTGCGAGC:1 + chr2L 1781560 3' + Doc4-element 20 1 66.90 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATCACCTATGCCAGTCAAACATTTCGCTAAGCCTGTCAACTTATTTCTGCCCAACTTAGTATAAACACTTCTGCCTATAAAACAAAGGTCAGCACATGTATTAACTAAT:1 - chr2L 22235133 3' - 1360 14 1 76.03 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTAAAAACAGTTAATACTATGTACATATTTAATTAACAACTTTTTCTGAATTCAAGTTCACTTTTCT:1 + chr3L 7870289 3' - roo 8718 2 60.96 AAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCCAAGCGCTTCGTTTATTTTATAAATTGTTTGCTCAAATTTCCTCTTC:1 + chr3R 24454912 3' - F-element 253 1 68.28 ATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATAACTACTATCTTGGGCAATTATAGCTTCTCGGAAACATC:1 - chr2L 22689963 3' + Tabor 401 2 76.71 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGCT:1 - chr3R 11870069 3' - pogo 61 1 63.70 ATTCACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATTTAATTACATATTAAACAAATTGTTGAAGTTAG:1 - chr2L 22315533 3' - frogger 2322 2 52.74 CATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCCGAATGACAATTGAAAGGGACACAAATGAGCATGCAAAGAACGCCACTCGACTGCATAGCCGCCTCTCTCCTGGCA:1 - 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pogo 41 1 57.53 AGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGCGGTACACATTAATATAACTTATTGTAAGACCTTATAATATATAAATTAAAAATATAACCTTATTTCTCGTAGTGCAGAA:1 - chr2L 6104817 3' - Ivk 43 1 54.79 TAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTACTTTCGTGAATAAAATCAACAAAACTGAAAGTTCCGATAGACT:1 + chr2L 22150678 3' + S-element 1682 2 83.56 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTAATATCACCCGAGATTGCACACGAACTCCATCTAGCGGCA:1 + chr3R 5422932 3' + roo 9010 2 67.72 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTTTTAGTTGAAATGTTTAACGGATTTAAGAAAGTTATGCAGTCATAATAAGGAG:1 - chrX 16994495 3' + roo 9007 2 62.33 GTCGAAGGTCAGGAATCCGGATTGGATAACCTTTGGATAAACATCTGCTCCTAAGACCATGGAGACGGTAGCATATAATTGAATTTTGATAAATATAAATATGTTGCAGTCTTTGTAAATTTATTAATAAAATTCACCTGTTTGGT:1 - chr3L 6029765 3' - GATE 8105 1 50.00 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAAAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACCAGCCAAAATCGACTGTTGCGCTGAACGGAGTGTAGTTAAGCACTCTTATCTT:1 + chrX 21087718 3' + mdg3 247 1 66.44 GAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGAGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGAT:1 + chr2L 19140426 3' - Max-element 74 2 66.21 CGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCACCTACTTATAGTTATCGCCGCCCACACAGACGCCACAAGGCGGCTTAGATGAG:1 - chr2R 12057369 3' + Stalker2 7403 6 57.60 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTATATGGTCGTCTGCGGATGTGGATGCTGCTAC:1 + chr3R 13437278 3' + hopper 1392 1 68.57 GCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTGTTTATAAATAGGTACAACTGTA:1 + chr2L 19160443 3' - 3S18 61 2 56.16 AAACACGGAATCTGGCCCAGTGTGCACTGGAAGGAATCGCTGTCTCTCTTTCTGTTTTTGTTCGGGTCTCTTTGCAATGCTGAGATCGAGTTCAGTTGCTTGTAGACAACGAGTACGTGCACATCGAAAAAAGATAAAATAAAACA:1 + chrX 22908589 3' - transib3 3 2 50.68 TGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTTGTTTGTTTTACCTTTTTTTATGGCCTGACGCCAGGAGTCAGCTTCCACGGCGTTTTCAGCTTTATTTTCTTATGTTTGTTGCATTTGCTGGTGTTTTTTT:1 + chrX 10111145 3' + mdg3 225 2 67.81 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTACGGCAAATAATAGAAGAGCGAATAAAAGGCAAGCCCCAGGAGTTGGGTACGTTGATGCGTT:1 - chr3L 12874827 3' - jockey 27 1 73.29 ATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAATATTAAATAATTTTACAACTTGAATGATATAAAAATAAGATAATTC:1 + chr3R 4303723 3' + flea 275 1 68.49 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCAAAATACATTTGGAGTAATTTGTAAACAACC:1 + chr2R 11256285 3' + roo 9038 1 59.59 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGTTGCCAGGCAACAGATTTAATAAAGAAAAAAACAGCAGCCACTTTACTTTAGCATTTCAATTAAAGTTTGCCCATTCTGTGAAACTTAAACCGCAAGCTCTT:1 + chr2R 15075716 3' - mdg1 19 2 72.60 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTTTTCTCAGTGCCATTTCAGCTGTCTTGCTAGGGGCGTCTTGAAAAATAAACGAGTCAGCATTTGTAGCGT:1 - chr3R 17267597 3' - 412 51 2 51.37 AATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTAAGTCATTTGACTTAATATGATTTATATATGATTTATGCATTAAACAATTAATTAGTCGGGGGAATTGAAGATTTGTAATTGGTGCATATAAAAGATACTTAAATTAAACGGT:1 - chr3R 6773066 3' + 1360 3100 1 51.37 AATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATTCCTAGTATTACTTTTAGTCCAGAGCATCAGGAA:1 - chrX 4745198 3' - 17.6 491 2 76.39 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCGAGGGACACAAACACACTCGCACTTAATCTCACACTAAGCACGCACACAATGACCGGCTTTGAGCAGGGCTAATTGTATTGGTAATGCGCATGAAAGCTT:1 - chr3R 11095743 3' + hopper 1397 1 71.92 GTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGACGAGCTGGAAAAGCTTGCGTCTGAATTGAGAAAAAAACATAAAAGGACGGGTCTGA:1 - chr2L 4420460 3' - gypsy5 6962 2 68.49 CAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATAAGCAGAAGGATAATTGAAAAGGTAAACGGCAAAACATACCTCTCGCGTGTTTCCCTTTGCCACGGCCGCCCGACTGCACCATTTTTGTTGCTGTGCGTTATAATC:1 - chr3R 20597778 3' - Tc1-2 178 1 58.96 TTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTCGGTGTTCGAGATTGTGATTGCGGTGCACTTTAAGCCCAGCCATCAATGGCCATCATTAGACGGAATATTCATCTTTGGCATGCGA:1 - chr3L 4571132 3' - I-element 228 1 67.16 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAATA:1 - chrX 21403402 3' + roo 334 2 65.75 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAGTAATTTCAAATTGGAAGCCGTAACTTTTGCACG:1 + chr3R 12379771 3' - roo 87 2 80.00 ATTAGTTTTTTTTTTAGTTTTAGTTAGTTTTCCCATGGTCAGTTGTACGTGGTCCAAGTCAATGGACAATTCTCGTTGTTCCTATCTGTATCTGTCCTATCCCGTTGTAAATCGTCACAGTCTGTGCGTCGGTG:1 - chr3L 26386105 3' - rover 6829 1 82.84 GAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTTTGCGTTATGTTTAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATTTGATAAAATAAAAAATGTATTAAA:2 + chr4 854997 3' - 1360 3256 1 48.63 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGG:1 + chr2L 14239224 3' + 412 429 2 66.42 GCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTAGCTTATGACCAGGTTAAGGTAATGTCCATTGGATA:1 + chr2L 6388133 3' - jockey 80 1 70.37 AAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAAACAATTACAATCCGCGTTCCTCTCCGGCGTTAAAGTCACCGGATCCGTGCGGCGAGTGCAACTTTAGAG:1 - chr3R 6495269 3' + Stalker 346 4 56.16 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTGGCCAGAACGTCAGTGCC:1 + chr2R 10910315 3' - Tabor 6847 2 66.67 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTTGCGGCGTTG:1 - chr2L 13629063 3' - Tirant 8147 2 53.23 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCAAATG:1 + chr3L 18183222 3' - Tirant 4 2 80.33 GAGATCTCGACGTTCATACGGACATGGCCAGATCGACAAGTCTATTGATTCTAATTAGGAATATGTATACTTTATATGGCCGGCGACTTATCTATTACATGGATGTTGCAACATGGCTACGTGCTATCTCCTTTC:1 - chrX 9783524 3' - INE-1 134 1 60.00 GGATCTATTGTACTACCCCTTCATCACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTAGGGTTCAGGGCTGCACCATTGAGAAGCGAGATAATTTACACAGCTATAGTTTAAATCCGTTTCGTTG:1 + chr2L 11839739 3' - baggins 5391 1 67.12 TTTCAATAATAATAATAATATTCATATCACAGCAGCTGAGAGTTATGATCTATCTACCCAATGATCTATCTAGTATTTAAATGAAATGTATACAAGTTATTACACTTTCATGTTTTTGGAATCTCCACTGTCT:1 - chr2L 3665363 3' + mdg1 7071 2 84.96 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAGTAATTTCAAATTGGAAGCCGTAACTTTTGCACGCATATACCCCTAAAAGTATATGTACATATGTATGTGTTCATTA:1 + chr3R 12379814 3' - roo 8709 2 54.79 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTCGATTGAAATATCTTAATTGAAAATT:2 + chr2L 19674012 3' - roo 8716 2 56.16 AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCG:1 + chr2L 8574472 3' - Transpac 4967 2 52.05 TAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGAAGATGTGGTAACTCGGGCGCCGATCATACTCGCTACTCGTAACGAAGGATAGAGAAGG:1 + chr3R 2637715 3' - gypsy5 7019 2 69.18 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTTGCCCAGCACACTCAAC:1 + chr2L 15777903 3' - 297 39 2 54.96 GCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACACACACACGTACTCTGAGCCCACATTACCCGTAATTAATGGGATTTTAGTTAAAAATACATTTTTGCTTGTAATAATGACATGGAGGCAAATTCAAAT:1 - chr2R 24643359 3' + Quasimodo 5 2 71.92 GGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTAATCAACTGTTAAAACTGGTTTTTCAATTAGAGTGAAAATGTTGATGATATGATGGCACTGGCACCCCAAAGC:1 + chr3L 19697630 3' - roo 185 2 52.05 AGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTGGCATGCCCATTGCTTCATATACCCTCTACCCACAACCCTTCGACAAGTCTGGCG:1 - chr3L 7791834 3' + Transpac 5224 2 78.08 ATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTAATCAACAGATACACTCACACACCATAAAAAGCATACTGCGTAACCGTGTCTATGTGTGGAATGTAATTGTCTATAATTGTGCAACC:1 - chr2R 22746664 3' + jockey 4870 1 60.96 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCGCACACTGTGCGGAGAAAGAGATGGGGCCACATGGGCAGAAAGAGATGGCACGACGAGCACATTTGC:1 - chr2L 16615747 3' - hobo 56 1 56.16 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGTCAGAGAACGCAGACAACACATCGCACATATTAAGACAGATTTTG:1 + chr3L 5069488 3' - opus 59 4 65.67 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCATTGTATCAGTGTGACAATGGCAAATAGT:1 - chr3R 28450648 3' + roo 9018 2 56.85 GAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTGTTTATAAATAGGTACAACTGTACCCTAAACAAACAGAAGGGTTGAAC:1 + chr2L 19160468 3' - 3S18 5790 2 66.67 AGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGTATACTGACATAGTACAGGAAGTTCGTAATAAG:1 - chr2L 18630458 3' - G-element 64 1 59.59 ATAGGTTTAAAGACGGAGTTGTATAGGAGAGCTTTGAACTCCAGGCTAAGTGAGTAATGAAAAACTGAATCGTTTCAGAAAATTAATCCGTACAAATATTAAATGTATAGACTTTATATCAACCATTTACTGGCGCTTAAGAAGTA:1 + chr2L 22938918 3' - Doc 4266 1 69.86 CGCAGCCGGAAAACTGGTGTGGCCGGGCCACCCAGTTGAGCCTCCCAG:1 + chr3L 4798121 3' + ZAM 476 1 87.50 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTTCCCGTTGTTT:1 + chr3L 2330169 3' + roo 8995 2 69.18 CGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCTCGCGACGCAGAGTAGCGTATTGATTCGGG:1 + chr3R 27609901 3' + gypsy5 355 2 74.77 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATCTACAGTATAGGGTCTCTACGAGTAATAATTTTGCGACAAAGGCTGAAATAAGAAATGTAAGAA:1 - chr3R 20872092 3' + 297 343 2 60.27 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTTGAACCTTAACATCCCCGGAGTGAAGCAAGTTTTTCGCTGGTTGTTTGACAAATTGTTTTGTGCAGC:1 - chr3R 8639226 3' + copia 204 2 54.17 GTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAACACACACAAAAAAGGATAACCCTTCGACACTTCACCCACACCCGC:1 + chr3R 20450496 3' + hobo 2873 1 69.63 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCCGAGTTCCAGGATCCATAAAT:1 + chrX 388335 3' + 1360 3336 1 58.57 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCGAGGCATTTCGAGGCGATCGCGAGATTTTCGAACAGAAGTCGCGGCAG:1 - chr3R 18399180 3' + P-element 2870 1 65.49 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTT:1 - chr3R 9125633 3' - Doc 36 1 64.29 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTTTCTTTTCTTTTTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTACCAGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTACCAGTGTGTTTGTAACCCACCT:1 - chr2R 8177694 3' - FB 32 1 57.53 GTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTTGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAAAAAAGAAAATTTTGCTTTCGAATTATTATTGTCTTAAGCCTTTTGCTTTGTT:1 - chr3L 9687096 3' - Tc1 1635 1 64.38 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTT:1 + chrX 21667925 3' + opus 7427 2 73.38 TTTGGGCGGTTTTAAGGCGTTAGAGTGGGCGTTGCAAAAATTTTGTTTTGCATATCGATAGAAATTTACAATACTAATAAAAAAATATATCTTATATAGTTTCTTCGGGTCTATTTGAAATCTTTGAAATGTAAAAATGTCTACAC:1 - chr4 696356 3' - INE-1 343 1 54.11 AAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACA:1 + chr2L 21643098 3' - Tabor 6915 2 76.15 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACG:1 - chr2L 13629037 3' - Tirant 5 2 79.13 GTGGAGCCTTCTTGGTGGGCGAGCTCTGGACAGTAGCTTGACTATGCGATTTCTCTTGCTAACGGCTGGAGGGCATGTTTATTGCCTCGAAGACCCATTTGTCATTTGGACAACGAGCTGACAACAAGTTCAGTGCCACTTGTCAT:1 - chr2L 18017022 3' - BS3 1543 1 60.27 CTACTGGTATCAGAAACCCACTTTTGTCCCAGATCCCATTTTAGCATTAGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCACGGCGAACCGCCGCTCCACCCAAAACCACCCAAA:1 - chr2L 16096504 3' + G2 360 1 72.87 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTCAATCGTTTTAAAGATTTAGCTGATGTCATAGGATGTTCTTCTCGATG:1 - chr3L 25607277 3' - 412 73 2 68.97 TGATCAGGATCAATAGCCGAATCAATCTGGCCGCATGAACGTCTCGATCTTAGGAGCTATAAAAGCAAGAATGTTTAAGATTAAGCATGCATCTTCCAGACCCATGTTGCCACGCCCGCAAATTGTTATGCCGTTTTTCGTTTTA:1 + chr3R 21558571 3' + INE-1 91 1 77.93 GTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAATAATTTTCATATTGTTAAATACATCTTCTACTAAGTTTCTGTTCTTAAATTAGACGTTATTTATTTTGGTAGCA:1 - chr3R 16818900 3' + Ivk 5327 1 51.37 TTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCGAATAATAATAAAAAAAACCCTTGTAACCAACCTACGAAGGCCTACCTGACAATCTTGATAGATTCATCCACCATGGTGGGTATTGGTGAATATGGATGGCTTTTGAGCCTGG:1 + chr3R 25058404 3' + Rt1b 5117 1 68.75 GACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACAGAATAGAGTGCAGAACCACATCCTGTCGTACATCGATCTGCAGATGGATGGAATGCTCACGGTCAATGC:1 + chr3R 4808490 3' + roo 269 2 52.74 TCTTTACTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGAAACAAGCAATCGATTTTGAATTCCCCTTTGTGCTATGTTCCTCTCTTTCAATAGAGAGCGAGCACAGCTGTTTAAATCTTTATTTTGTGAGACTTGCTCATTTGCCT:1 - chr3L 25996280 3' - 1360 491 1 68.28 AGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAACTCGACTATAGCTTTCTTCCTTGTTTTGCTTCCCTTTAATTTTAGTTACTCCATTCCTTCGAATGATTTTGTAACTCCTCCGAGAAACTTCTACTGTCCAGGACAAGCTTTCCAATTGTT:1 + chr3L 20259644 3' + INE-1 550 1 63.70 GCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGCAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAATAAACGGCGAGTCTCTGTTCTACATGCCCGAAAGTACATAAATACATAAGAGGGTTTCCAAATGGAGACAGCTC:1 + chrX 1265810 3' - BS 5068 1 54.55 AATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGCGCATTTTCTCTCATTTGGACCTTTTTTTCCCCCAGATCCTTTT:1 + chr2L 21030990 3' - FB 72 1 70.00 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGT:1 + chr3R 25795820 3' - jockey 85 1 70.55 ACTGCTTCCACTGACTACCTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACACACACTTATTGGAAAAAAAGATAGGAAGGCAGAAGAGAATT:1 - chrX 6872681 3' - diver2 66 2 66.41 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGGTCGATAAACCAAAAAGCAAACACTTTTATGGTTTGTTTGGTCTCGTCTTTACTTG:1 + chr3L 2426013 3' - hopper 24 1 69.86 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATGTAGTTGCACTTTTTCCCAGTGTATCAGTTGTGGTGTCAAGTAGCAACGGCTGCGGCCAGGACAACATCA:1 - chr3R 15054101 3' + 297 6930 2 52.74 ACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTTGACTATAGTATTTTCTCCAATTTTAACCATTTTCTCGAAGTGCAGCTTCTGTGCGTCAAAGTCGCTCTGCTGCGTGTCA:1 + chr2L 19019604 3' + INE-1 554 1 64.76 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGGCGAAACATTCAAATTGATGTGACCCCAAGATGAGGAGGGAGGCAGGTGCTCATCTCCATTTGAGCGAGGAGAAGAACCG:1 + chr2L 1807082 3' - roo 8705 2 55.48 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCGAGGGACACAAACACACTCGCACTTAATCTCACACTAAGCACGCACACAATGACCGGCTTTGAGCAGGGCTAATTGCATTGGTAATGCGCATGAAAG:1 - chr3R 11095746 3' + hopper 1394 1 68.49 CTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGCAAACAAGAGTAACACCACACCCGAAATGGCAATGAGCATGGAAATCATAATAATAAGCGA:1 - chr2R 12202244 3' + Tirant 8448 2 60.42 TGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACAACCCGATCAATGGCGAGAAATCCCTAAGCCCCAAACAATTTAC:1 - chrX 20975758 3' - copia 53 2 64.23 TAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAAACAAGCATTAACCGTGTGCATCGTTACTTCTGTAGCTAAGTAATTTAAATAGTTTAATTTT:1 + chr2R 6673453 3' - BS 5073 1 58.90 AGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTATGAAGTGTGAAGCATTAATTTGATTTCGTATTTAGCCGGGAATAAATTAGGTCAAAATGTGAACGATTTACTGGCCAATTCAT:1 + chr3L 18483920 3' - hopper2 1331 1 57.53 TAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGATTAGACTTGATAGGATGACTTTTCTTTCAAATATCTTTTTAAGTCCTTAAATGTTTTT:1 + chr2L 15644958 3' - transib2 61 1 61.64 CCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGCCAAGCAGAACAAGGAGCGGCACATATGCTCCCCGAAAGCAGTAAAAAAAATGCTGTGACAAAAATTGCCTTGCAAAGTTTATAAAAATTAAGCGTGAAA:1 - chr3R 8458369 3' + hobo 2665 1 73.79 GCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATTGATCCAACATTTGGTCCAACATTTCATCCCGAT:1 - chr3L 19244135 3' + Doc 4385 1 76.55 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTT:4 + chr3R 11151885 3' - mdg3 5335 2 73.97 CGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCTGTTTTAACAAAGCTTACCATCGACGATGGTAGTACAATTGTATAAATTTGTATAAGTCTTTAACACATCGGGTTGTTCTCTTTAGAAGAT:1 + chr3R 2557721 3' - Cr1a 4415 1 67.67 GTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATTGCTCTAGTTTACTGCGCGTCTGCTCCAATTTTCCTTCCTTCATC:1 + chr3R 17440684 3' + jockey 250 1 67.63 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCATTTATTTTTAATTTATCTTTTTTGTCAAGG:1 + chr3L 18253920 3' + blood 7362 2 63.70 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTGGTGAGTGTTAAACGCACAACAAGAAAAGC:1 + chr2L 12486466 3' - roo 1 2 79.07 ATGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCATTTATTTTTAATTTATCTTTTTTGTCAA:1 + chr3L 18253918 3' + blood 348 2 63.70 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGGTTTCGCCATCAGACTCTAAATGGAGGCCAGGCCAAATCCAACC:1 - chr2L 12291799 3' + Tirant 377 2 70.55 GCTTTCCGTTTGTTAAATAATTAAATTAAAGTAAACGAAACGAAACGAAACGAAGGTGTAGGTGAGTGCTTTAAGAAAACCCGTGAAGCTCCTTGTCATAAATCCGGCACGCACTAACCCGGCCAA:1 - chrX 4050976 3' - invader2 408 1 61.90 TATGTATATATATATAAATAAGTGCTTATTCTTTACGCGGAGCTAAAAAAAACGCAGGAATTTCATTTTAGCTTATTACACAATAACTGATTGTTATTATCTGGAACAAGAGACTAATTCGATCATGTGTAACCTTACTGCTTAAT:1 + chrX 18223255 3' + invader3 5089 1 76.71 ACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGCAAACAAGAGTAACACCACACCCGAAATGGCAATGAGCATGGAAATCATAATAATAAGCGAGCGAAACAAAAGCGAAACAGTTATAAACTTTC:1 - chr2R 12202212 3' + Tirant 371 2 66.44 CTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTACTTCTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGAAGTCTGTTTGTATATAATAA:1 + chr3R 26566149 3' - F-element 310 1 63.19 CGACAGAGTTCACTGTCTGCAACACCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGACGGCCAGTCAAAATCGTATGTATGATTTAGTGTTCTAAATAAACCTAAACATGTTTCCAAGCTGAATTCATTCGTTT:1 - chr2R 25116179 3' - baggins 5186 1 56.85 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTAGTCTTGAATGCCGGCCAGTT:1 + chrX 4673693 3' - roo 8689 2 54.00 GGTGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTAAA:1 - chr3R 16276302 3' - pogo 36 1 60.96 ATAAAAAAATTTTTAAAAATTCGCCCCCTGAATATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTAATCTCTGCACTCGTCCGCCAGCAACTCGATTTCCGCATCGTCAAGTG:1 + chr3L 11178673 3' - 1360 3089 1 65.97 CCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAAACAATTACAATCCGCGTTCCTCTCCGGCGTTAAAGTCAC:1 - chr3R 6495299 3' + Stalker4 316 4 75.34 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTAGCCCAGCAAAATCATACTGAATATATTTTTGCTCCTATTATTTTGACCGCTGCTGTGGATGCTGG:1 + chr3R 17492910 3' - jockey 4800 1 52.59 CCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGAGTTGACTGACATATTGACACACTCGCACAAAGGGCAAATCCAATTCCATCGCAGCCAAGCAGCTCAAACCTCAGC:1 - chr3R 31140934 3' + Burdock 214 2 57.24 AAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATG:1 - chr3L 18484391 3' + hopper2 1532 1 67.36 CATAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAATTGTTTGAGAACGTTGCTATGCAATCGCTAATGCACAAAACTGTTACAACTACATTTTTGAAACAAGTCGGTATTTTTTCCA:1 + chr2R 6647627 3' + Chimpo 145 1 56.85 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGG:1 - chr3L 19031221 3' + roo 9036 1 56.80 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACAACTTGCAGTAATGGAGACATA:1 + chrX 3647023 3' - 412 7092 2 57.53 ACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGTAGAGCCAATCGACAGCTCTCGGTAATTTCGAGCCGAATAACCCTTTTGCTGCCTTTTGCCTG:1 + chr2L 16364468 3' + roo 14 2 56.85 GAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTTAGATTCAGCATACAGAGACAAAGACGCAAGTAGCCATGCCCACTCTAACGTCCACAACTACTCCACTTCCAACCACAACATCTACTCCACAACCTACAACAACAACTACACCG:1 - chrX 4244716 3' + INE-1 148 1 61.64 ATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGACTTCCATAAATATTTTCGGGAGAATGTTCATCATTTATGAAGAAACCAGCCTCATA:1 - chr4 1069371 3' - mdg1 7341 2 61.64 CAATTTTGAGTGCGGGTGCCACTCACCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACCCAGTAAAAAAGCCTACATGTGCAGGCAAGCACCGCAGGAGGTGAGCGTAAACAAAGTGATAGTGCATCCATTGGTTCTGCTGTCCGTGGTG:1 + chr2R 24403234 3' + hobo 49 1 60.27 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCATAAAATGACCAGATTGTTGGGAAAAAAACGCTAACGTGGCTCTTTT:1 + chr3R 26486109 3' + 412 420 2 67.81 AAATTGACTTGCCGATGCAACCGATCACTCCCAGCGAGATTGCAGACGTCATCGCCAAACAAAACACAAAAAAAACTTTGGCGCTTTGTTTTGTGTGTGTTTTTTTTTGTCATTTTCCTCACTTATCACCCGCCACCC:1 + chrX 7758177 3' + BS3 180 1 55.80 TATATGTATTTATATACTATATGGATATATGTATTTCCGTATGTAAATATTGATAATAATATATATTTATTTGTGAGATATTCAAATGGAGAGGTTGTGGACCAGGAAACACTCAACCGCATCGAAAAGCAATTGAAACGTCGCTT:1 + chr3R 10790800 3' - INE-1 63 1 73.97 TCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATTTTTTATGCGAAAAATTCCATTAAAATGTTATCCACAGTTTTCGGGGAGATTGAATTTTTCTG:1 - chr2L 18158989 3' - INE-1 153 1 64.38 TCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTAAAACGAATGCAGAAACATGCAGATCGTTAGGCGCTATTTTTTGGTCTTAAAGGCCGGGCTTTATATATTC:1 - chr3R 7778236 3' + transib2 2797 1 61.90 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTACACCTGATGTCTGAGCAAAGAGGAGAAGAGAAAACTTGCACTTAGGCAAGCTTATGTAATGGTATGCATATTGCATTATGCAT:1 + chr3R 1267800 3' + P-element 2849 1 61.64 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGA:2 + chr2R 14973693 3' - FB 67 1 62.33 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCTCTCTTTTCTCTGACTAGCGAATCTCTATCATAAAATTATATACCCCTTTAAAAGATAAAAAGA:1 - chr3L 4651545 3' + roo 9024 2 52.74 TTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATC:1 - chr2L 18112517 3' + transib2 2738 1 76.71 GCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCATTAAATAACATCAAAAATGTGCGGTGAA:1 + chr3R 13349610 3' - Ivk 37 1 58.90 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCGAACTACTTAAAGGAAGAAAGGCTATGAAAAACATACACACATCATATGCTTTGATTTCTAATGATAAATGGATTTCCAATTTTT:1 - 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chr3R 15180440 3' - P-element 2616 1 18.49 GCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTATCTCCCCGATGGTAATTTTTTTAAAAAAAA:1 + chr2R 19237769 3' + opus 7161 4 71.15 CTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGG:1 + chr3R 10736108 3' - McClintock 6020 2 76.52 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTCAACTGTGTGGAAACTCATGAGTATAATACATTTT:1 + chr2L 15777934 3' - 297 6603 2 70.34 AAGAATATTTCTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGGTGCAAAAAGGGCTGACAACAATCGCATTCAGCAATCGATGAATATTTCGAGTGCAACAAAAGTGCAATATTAATGGCCTATATAAATGGCAGATATACTATATCCCGATA:1 - chr2R 21749279 3' + 1360 399 1 77.93 CATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTATACCAAGTCCTCGACCTGCGGCTATTTCACCTTCTCTTGCAACATTGTCTACGGCGCCAATGGAAGGAGCAAGATCTGCCGTCCCCAGG:1 - chr3L 11959145 3' + 1360 303 1 58.90 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATT:1 - chr3R 26486047 3' - 412 88 2 75.34 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTTTAAGGCCCTTGGGAATCA:1 - chr3R 26485990 3' - 412 31 2 64.38 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGCAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTTTAAGGCC:1 - chr3R 26486001 3' - 412 7093 2 56.25 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCTTAGGGTCTTTTATTTGCGATGGTTGGCAAGTAAGTGATAAACAACATCAAAGAA:1 - chr2L 15777792 3' + 297 6916 2 61.64 ATTTGAAAATATTTGAACACTTTGTGTATTTTTAACAGAATCACAAAGTTGAGTAAAAGTTTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAACAGCTGGTCAAACATATGATCTTTAAGTGTAATAACTTTCTATTGAACGAAAAATAGTTCA:1 + chr3R 6671515 3' - transib3 246 1 71.23 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGT:1 + chr2R 5754565 3' + P-element 2812 1 28.00 AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTTTGTGGGTGTCTCCTTTGCGTTTGTTATATACTTTTAACTAGTTT:1 - 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chr2R 6798206 3' - jockey 25 1 66.95 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCACTCCTA:1 + chr3L 8658801 3' - roo 78 2 72.60 GAGCGAGCAGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATCTAAGGTCTTTTTAATTAACCAACTTATTCG:1 - chr2R 18344568 3' + 1360 3307 1 78.83 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGATGGAAC:1 - chr3R 8217958 3' - P-element 73 1 24.19 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAACGGTGAAAACTAGTACATGCACACAATTTTGATGAATGAT:3 + chr3R 12363842 3' - jockey 4705 1 63.01 GTATGCTGAATCTCAGCCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACCGACAGACTAGCATCCTCGCTTCCTTTGCTCATTTTTTGCGTAACCGGAATGTTTGACGAATGTCTATCGACTGCT:1 - chrX 667077 3' - INE-1 172 1 51.13 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTTCGCGAAAAGAAATTCTATATATGCCACCTTGAAACTTCGCTTATTTTGCGTACCATTCCATTTT:1 - chrX 10579880 3' - pogo 14 1 68.47 CGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCTCATATCACAGAGTATCAGGTTCGC:1 + chrX 21994026 3' - McClintock 5 2 76.42 CGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAACTACTTTCACCCGTCTCGTTTGGTTTATCGATGCACAACAAT:1 + chr2R 12698099 3' + F-element 85 1 71.23 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAAACAGGCTAACAAACAACATCAACAACAACGCCGGCGTATTCATGATGCACTCATAAAAACCGGGGGTAAAGTACGGCG:1 - chrX 10110986 3' - mdg3 43 2 56.85 GTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTATGATTGATGTATGGACGTGTTAATT:1 - chr2L 17283536 3' - mdg3 5321 2 79.84 ATCCGCAAACACAATTACACCGGTGTTTCGCCAGCAACAGTTGTCTCAAGCTTTCTTTCGAATATAATAATTGGCTTCTGGCGATTATATCGATCTTATTCACCAAGATAAGCAGACGAAATATATGCATCCAGTTCTTTTTTAAT:1 - chr2L 18442555 3' + Gypsy12A_LTR 1974 1 68.49 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACAC:1 - chr3L 7837171 3' - jockey 4813 1 55.04 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAAACGCTACGAAACAAGGAAAATGTTACTACTTCTATTCATGAGAGTGTGGGCGGGGCTTAAATCGAATAACTTTG:1 + chr2L 23068955 3' - 1360 46 1 48.63 ATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGATAATCATAATAATAATGGTGCAAGTGCTCCGCCGCCCCATCTCCATCATT:1 + chr2L 12296761 3' - accord 7184 2 57.98 AGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTGGCTCAAAGTCGCAGAGAACGGCTAGAGCAAGCGAACGACCGTCAGAGAACG:1 + chr2R 1320505 3' + Transpac 255 2 59.26 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAATGATGCAAAATACATTTGGACCCCGCGC:1 + chr2R 16413133 3' + roo 8979 2 78.77 TAGCTAATAACATATAATAAATATATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTACAAAATATTCTGTGTGTGGAATGAAAAAAAAAAACATATATTTCTGTTTGCATTTCAAGATTTTCGCGTCA:1 + chr3L 3590519 3' + Doc3-element 71 1 77.40 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTCTTGCTTTCCGGTTTTTTGCAACACGAGCCTCTTTTCAGGACCTTG:1 + chrX 21403511 3' - roo 38 2 57.64 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTTTTGAACATAA:1 + chr2L 8574493 3' - Transpac 27 2 65.75 CAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCTCTTGA:1 - chr2R 14135280 3' + copia 178 2 69.18 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACTGTTTGTTGACAAAAAGGTAAACAAAGTGAAAATTTCGCAAATGTGCAAAATAATTAAGTAAGGGTCAGTAATAGGAGCTACTGGTTAATCGGACCATAACAACTACCCATTTA:1 + chr3R 20635565 3' - 1360 2 2 81.25 ATGTTTGTGATGGATCACAATTGCGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGACACATATAACATGCGTATTATTCTATGCAATAATTTTGTGCTGCATACTTTTAGA:1 + chrX 18179876 3' - jockey 74 1 61.64 CCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCC:1 + chrY 311346 3' - 1360 47 1 60.43 CGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGTATGTATATCAGCAATACCGGCCGTATTGGCTGCCTTAATT:1 - chr2L 974029 3' - pogo 74 1 73.43 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAGCTTTGTTTTGGTT:1 - chrX 6632960 3' - P-element 78 1 30.82 TATTATAATAAAAAAAAAATAATTTAAAAAAGTAATTCTGCGAGCTCTGCAATATATATATTTTCTGGACCATAATCCGATAGCATCCTGTGCG:1 - chrX 17154670 3' + Rt1a 5072 1 71.28 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTGCGTGCGG:1 - chr2L 14969097 3' - 412 7124 2 66.44 ATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATATATAAGTTATAACCTTACTATTTAATATTTATTACATATATGAGGTATGGTTATGACTGATTATACATACCTAATCCTTTAAGGCCACTAAATATTTGGAAATTAATCCGCATAAA:1 + chr3R 11482036 3' + BS 5081 1 67.81 CATGGTATCTTCGGAACGAGAATATACACCGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAACCTCACGTCCAAATCCCACTCACTCATACGAACACACGCATGGTG:1 + chr2L 9133305 3' + Doc3-element 4421 1 79.17 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGAAAATACGTTTGAAGATTTGTTTCCAGTGCATGGCCGCAGGCC:1 + chr3R 28117089 3' - hobo 21 1 65.00 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAAACCCTGTTGGAATGCTGTAACGTGCTGCAAATATTTCGTTTTCAGGTACCAGAACAAACTTCGTGGTAATGCACCTCTGACCGAGC:1 - chr3L 19999143 3' - 1360 34 1 60.96 ATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTTTTTGAGAAGCCAGTTTGGACGTTGAGCTTGTTGTTTCGGTTTTTACCAGTTTCTGGTTGTT:1 + chrX 2655094 3' + FB 91 1 60.27 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGC:1 + chrX 4673671 3' - roo 81 2 79.85 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTTACCGGTTAAACGCCAAGGTCGCAGTTTGTTGGCCAACTGCCACCCAATCGGGCAAAAGGGCAAATATA:1 - chr2L 18522226 3' - roo 8685 2 64.10 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCCCTATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGTAAATGCCACC:1 - chr3R 13838230 3' - 297 6636 2 68.38 CATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGACACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATAATAACAATCATAATAATT:1 - chr2L 12569979 3' - micropia 4990 2 60.00 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTAGCGCTTGATTATAAAAATCGTTAATCTTTGTATATTCTCCAATAAAGTAATAAGCCATGATCGTCATACCAATAGTGTGCAGTCGGTGAGATAATATTT:1 - chr2R 11256116 3' - roo 8684 2 69.18 ACTATCACATACACGTTACTCAGCTATTGTGAATGCGAACGCGATATTTCATCATTTCATTTTCGGGGTTATATTGGGTGATATTGGGTGAGTGTTACTTATGCAAAAGTAAATTATCGACTAAATAAGAGAAATGGAAGAAATGA:1 + chr3L 25971494 3' - INE-1 548 1 65.07 ACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATTCAACTTTCAACAATCAACAATCAACAATCACCAATCACCAATCCAGTGGCAGCAACAGAAGCGACAGCAACGGGA:1 - chrX 16902436 3' + Bica 122 1 77.67 GAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACG:1 - chr3R 8042302 3' - BS 54 1 55.86 AAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGGTTGAGCTCACAGCAAATGGATGTAAACACATAAACAAGCATTCGTAGTCACAATACTGATTTGGCTCACCTTTTGCTGACGTATGACATTGCAGCA:1 + chr2R 19804225 3' + R2-element 472 1 61.38 CAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCAAGCGTAGCCGCATGGACTGATTTTTATCGCAACG:1 + chr2R 17544218 3' + gypsy5 322 2 76.71 GAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAATAATTTTCATATTGTTAAATACATCTTCTACTAAGTTTCTGTTCTTAAATTAGACGTTATTTAT:1 - chr3R 16818910 3' + Ivk 5317 1 58.22 ACGTGTTTCGTCCTTTTCGACAAACAGCATTGTGGATCATTTTGTTTGAACACCCGACAATTCGACCAATTTCAGCGTAGGTTTTACATTCAGAGATCATCAAAGAGTTTTAGTGTTTTAAACTAGGCAGATAAAACCGTTGCATC:1 + chr3L 20602129 3' - Tc1 493 1 67.12 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTATTAAATTGTTCGTATGAAATTAAATTTTATACGAATATTTCCAAAACTTTCCCG:1 - chr2L 6601282 3' - roo 8729 2 67.12 TCAGTTTTCGATCGTTACGCATAACAGACATGCCTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACATATGTATGTAAGTGACTTTTACTCTAATAACATAGGCACCACATAACTGTATATCCCGAGATACCCATTATT:1 + chr2R 5862392 3' + invader1 3917 2 52.74 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAATGGCCAGCGCAAACTAAATAATACTGCATTGTTCACGTTTTTTAACAATACA:1 - chrX 18239105 3' - jockey 63 1 59.26 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCACATTAAATGAA:1 + chrX 6633054 3' + P-element 2855 1 59.23 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGGTTTTCCAGCATGC:1 + chr2L 14239237 3' + 412 7483 2 60.27 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCACATAATGCATATATCTCATGCTCGAAGCATCATTAGCACAAG:1 - chr2R 17074349 3' - Doc 83 1 71.23 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCACATTAA:1 + chrX 6633049 3' + P-element 2847 1 54.14 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCACTAGAAGCGCATAGAATGGAACTCGAGCAAAGGACATCCGGCAGATACAAGATACATTT:1 - chr2R 17332109 3' + jockey 4967 1 57.93 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCAAATGGCCCACACCCTCAACCCG:1 + chr3L 18183240 3' - Tirant 10 2 79.45 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGG:1 - chr2L 2494853 3' - Doc 54 1 71.03 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAGGGCTGCAGTCGAAA:1 - chr3R 7885574 3' - jockey 58 1 52.05 AGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTCATACCCTTGATGTTGAAACCAGAGAGAATAAACGACTTTTTGATATATGACAACGAACAATGCAATTTTAT:1 - chr3L 3446989 3' - G2 2776 1 49.30 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCG:1 - chr3R 10213067 3' + P-element 2795 1 17.04 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTCTTGCTTTCCGGTTTTTTGCAA:1 + chrX 21403487 3' - roo 64 2 63.01 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTAGTCACTCTGCATTTGAATGTCTGAATGCCGCAAAACGTTGCT:1 - chr3L 7460631 3' - 412 7131 2 71.92 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGACTAAACATTTTGGCTGTGTA:1 - chr3L 18381905 3' + copia 233 1 58.90 CCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACGTATATAAAGCGTAGAAAAAGTGCGAAGAGCTAG:1 - chr3R 27810039 3' + Burdock 6308 2 77.40 AAAAAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATTCTTTGTACATATTTCATTTAAGCCTACGTAGGGTTTCTGT:1 - chr2L 9418509 3' + rover 269 2 73.29 GTTGGTGGCGAGGTGGTTGGGGTTCGGTTCGGATCTTTGGGGCTC:1 - chr3L 13666794 3' - G6 1824 1 57.78 TGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTCATTTACATAATTTTTGCGTT:1 - chr3R 18635183 3' + opus 7462 2 58.90 GGTTGGTGTTGTTAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAACAAATTAATTTTGTCTGGGGCGACGGCACTGGCG:1 - chr2L 20515225 3' - I-element 5085 1 66.44 AAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGATGGCGCTTGGCCATCAAGAGAAACAGAATCCTAAACCACAATAAAATTCTGGCATTTATACACTGCATTGGCAAACTTTTTCCCACCAAGAGATTTTCATAAACTGCGAATTCAGT:1 + chrX 1024409 3' + baggins 5193 1 65.75 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGACTAGAATGCGTGTTTAAGTGAACTGTCC:1 + chr3R 28450758 3' - roo 8723 2 62.33 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCTTCAGTGAAAATGGTACTTTCTGCAAGAACGATAATAGCGTTTCAGTTCGGCGATATAAAAAAAATGATAATAGTAGGGGAGCC:1 + chr3R 21216963 3' + 1360 3364 1 66.42 CATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTATTTCACT:1 - chr2R 11095730 3' - diver 5940 2 50.00 ATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGACGGGAGGTTAGTCGCGGAAGCTGCTCTTGCACCGGTTGCTGAACATAC:1 - chr2R 18791287 3' - I-element 5011 1 55.05 CTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACATAGTACAATCAAATATAATAAAGATTACATTGAGAAATATAATAGAACTGGATTTGTATCTTGAAGCATCTGACCATTATGCCATAATATTTT:2 - chr3R 12744617 3' + Stalker2 379 2 58.22 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAACTCGCGTCGCACTCATGGGCATTTTTTGTTCGAAAGAATTTCTATCTGTTCCCAT:1 + chr3R 8849881 3' - 297 40 2 58.90 GTATTACTTAATGAAATAATTTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGTTATAAATGAAGTTCCACAATTGGATTAAAGACCACCTTCATATTCTATTTTCATGGGTAA:1 - chr2L 19619354 3' + Transpac 4868 1 60.27 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTATGTTCATATATGTAGGTTTACCTAGTGCCGAAACAATCACACCATAAGGTAGTGAAAGA:1 - chr3R 22494083 3' + 297 344 2 61.54 AGAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTG:1 + chr3R 16276424 3' + pogo 2033 1 69.18 CCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCG:1 - chr2L 22719600 3' - 1360 59 1 76.32 CACAAACAAAAAGAAAAAAAAAACAAGTAAAAATAGGGTGGTTCAGGATGGTGTGGAAGCAGGGGGAGTTTGCGGGGGGATGGGGGACGTACTCCACCGGGGACTGTGCGGCACCACACTGAGTTCAGTGGCAATGACAGTGGCA:1 - chr2L 3773059 3' + gypsy7 5004 1 66.21 AGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATCCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTT:1 + chrX 21587753 3' - INE-1 141 1 61.19 TCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCACGTGACATGATATCACGTGATGTGGCTGCTTCACTGAGTCAT:1 + chr3L 1856766 3' + Transpac 5219 2 44.30 CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGAAAGCTTTTGTCTCACCTAAATGAAGGCGAATTCGACTTCACTTTGTGTAGACTTTA:1 + chr3L 22642069 3' + hopper2 1549 1 58.22 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGCAGCAATGATCGTCTGGTGTCCT:1 - chr2L 17380656 3' + hobo 2895 1 73.91 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGTTCTTCCATAAAAGTGAAGCGAAAAGGGTTAACCTTTAAAATTTACAATGTCCCACGGTCGCCGTTTTT:1 - chr2R 19843296 3' - jockey 36 1 60.16 AGATTCTGAGAACCATCACTGGTTCACATTGGTACGGATCGGAGACCTCGAATAGACGTTCTCGCAGGAACTGAGCGGCGCCGTGGGAGATCTGGCAATCACGCTCCATCTCACCGAAACGCAAGCCACCATCACGAGCA:1 - chr3R 14129447 3' + F-element 4338 1 77.14 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAACACCCGGCCCCGCCCCCTTTTTGCCCCCCTGCGCGACAGGG:1 - chr3L 3453548 3' - Tirant 8117 2 80.14 GCTGCGTTCAAAATAATAGCAGCAGTTACGAGGATATTTCCCTTTAAAGCTTATCAATTGTTCCTTGAAAGCATTAATTTGCAACTCCAGCACGGTCACATTCGATTGGTTTGTTTTTTTTTTCTCGTTTCAAAGCTTAATTTG:1 + chr2L 9957344 3' - HB 1625 1 50.69 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATGTCACTTACTTTGCGATTATGTTGCTCG:1 - chr2L 14239116 3' - 412 7092 2 57.53 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGAAATCGACTATTGATGGTGTTTTCAGATGGTGTTTTCAGAATGCAGC:1 + chr2R 4536709 3' + mdg1 7424 2 57.04 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTC:1 + chr2L 7652262 3' + roo 8991 2 75.34 AAGCTTACAAACAAAGACTGTTCCAAGCATCGTTCTATCGATAGCTAGGGTAGGGAAATTAATTAAAAGTGATCTAATGAAGCTTTTGGCGCTTTGCTTTTAGCCTTATCTGAAAAAAAGCATGTATCATTCTTTGCTTTGCAACG:1 + chrX 6301776 3' - Cr1a 4036 1 51.37 ACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTCCCGCCCTCCATGGGCAGGCAAAGGAGTCGACCGTGAAGCCACTTGGTGAACTCC:1 + chr2L 2991942 3' + roo 8618 1 61.64 AGCTATTTTGGCCGCAGGTGTACCGGCTTTAAACCTAGCAACAATACCAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTTTGTTTTGGGCATTTTATCCTTTTCTTCTTTGCCTTGCACTCGTGTTTGAACCCTCGAC:1 - chrX 18036789 3' - Bari1 444 1 69.17 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACGTTTAGATACATTTATATCTAGTTATGGAGTGGGGGAGGGGGGGAATATTCTATCGAAGCCATTATCTTCGGCAGTTATGTA:1 - chr3R 25713991 3' + flea 221 2 58.22 AATTTGAATTTTAAATTTTTTTTTTACCGTATTTTTATTTTTTTTGAAAACCATGGTTTTTCTAGTCCCTAAATATGATGATATGATGGTTCGGGTAAGTCATAGAAAATTCTGAGAAGAGTGGCGAAAATCCCCTATTCTATCTT:1 - chrX 9872153 3' - 1360 3037 1 80.82 AAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTGTTTATAAATAGGTACAACTGTACCCTAAACAAACAGAAGGGTTGAACAATTATA:1 + chr2L 19160475 3' - 3S18 29 2 66.44 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGTTCACAGGTCACTGTATCAGTATATCAATGCTCCACAACCACCAACACACCAACTTGGAAAACTAAAACAGCAAACTTGGCTCG:1 - chr2L 3960127 3' - jockey 17 1 78.08 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTTATTTGGGCCTATCTAAAGTCCCTAAAATTAATTATAAGACACTTTGAATTTATTCTTTTATTCAACAATAGC:1 + chr2R 21844054 3' - pogo 41 1 57.24 CAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCATAACTGGTTCGATTATGTCACGTTTAATGGCTTCCTCCAGCTAGCTGCAGCTC:1 + chr3L 25729855 3' + Quasimodo 217 2 59.85 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATATTATATTTAACTTAGGATATGCAACTCAATGCCTACTTAAATTCTTGTCTACGATTCTC:1 + chr3R 23161366 3' + 412 7486 2 59.59 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGA:1 + chr3R 12363796 3' - jockey 4751 1 67.12 AACTTACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAATCGCAGCTGTATAAAATTTAAATAAAAATAAATAATAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAAT:1 + chr3L 19339417 3' - Tc1 72 1 60.96 GCATTGTATGGATTTATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAGCTAGCGGGAGTGAGAACAATGTTTGGTCAGTACTTTGACATTCGGCGGGGCTGTAAGTGAATTTCAAATCGATATCAACGCTAAGTGACTTTGATTTA:1 - chr2R 21948046 3' + BS 5070 1 54.11 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCCCTTTTTGTTTTTACAAGCTAAGCTCAGTGTGTACGTAACTTTGAAATTTTCACTGCTCGTTGT:1 + chr3R 24599979 3' - I-element 34 1 45.83 ATGAGGCAATGCATGCAACAGCAACATTGAAATAATACAACGAGGACAATCAAAAATCCTCCGAACATTTACCAGGACCTACGGATTCCAGTTGTGAAAACTGAAATTGTCCTAAAGGGACTTGTAACGAATCCAAATCA:1 + chr2L 16856956 3' + Doc4-element 2619 1 45.00 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTAACCCCTGTTGAGAGGCGGCAGGATTCTCGTCAGTTGTTTGCTTAAAACAAATTACAAGCAGAGTGAGAGAAATTAATGAACTTTAAGCCAGGCC:1 + chrX 7742015 3' - hobo 5 1 77.78 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCACATATGATGCATGCCATATGCCATTACGTTTGGCGTGGTTTTGCGCTGTGACAAGTG:1 - chr3R 12520740 3' - Burdock 47 2 57.36 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATAGCAGCAAATTGTGTTAAACACACACAAAAAAAAAAAGAAAAGAAACTTCTTTTTATGATCTTTTTATGCCGCAAATAAAAACGAAATAAATTCTACTAAATAGCTC:1 + chr3R 19171579 3' + opus 485 2 73.29 GTATGTAACAGACAGAAGGAAGCGTTTCCGACTGATAATAATATTTTAACAATTGAAATTGGGTTTTATGTTTTATATTAAATCGTGGGAGATCTGAAATAAATATATTTTAGAATAGTATTCTAGTGTCTTTGGTCGAACATAGT:1 - chr2L 21593039 3' + INE-1 28 1 57.53 AAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATTGAAAAATGGGGCTCATAGCCCCCAACTCAAGAGTATGATATTTCATCAACTAAATGTATGAAAATAATAAGTTAAGCAATTTTCTTACAATTATGT:1 - chrX 14039981 3' + Stalker2 7293 2 66.44 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAAT:1 - chr2L 14239162 3' - 412 85 2 73.97 CCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCTTTTGCTTGAACTATTAAAAGGTGACTGATGACTCAAGCTATTTTGTATGGAGTAAGTCCTAACATACTCAAATT:1 + chr2L 64270 3' + X-element 4418 1 54.07 ATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCAAAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGATCAATCGCATGTCTGACAGAGTGTAGCATACTTT:1 - chr3R 16582480 3' - BS 5025 1 53.42 CAGACTGCAAATCAATTGTAACATGAGTCACTACATTCAGGCAAACTGCAACGTCATTGCCTGCAGGATGTATCCAATGCAGCAGATTATGAACCAGGCCACGTCCGCAAAGGCATCCCAGGTATTCCACAGGACTTGACGCCAGC:1 + chr2L 21069419 3' + mariner2 258 1 61.64 AACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTTTTCGATTTATTTAATTATATATATATTTCCAATTACATTATATTCTTTAGTAGCTAAGATCGCCCCACTGTGCCTGCGTTAGGGTTCTGCTTTTGGTGGCATTGAAAGCGCGGC:1 + chr3R 6555366 3' - Juan 4032 1 77.40 ATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACAGTACCCTCATCACCGTCATCGTCATCTTCATCGTCATCTTCATCGTCATCAACATCTCCGCAGTGGGCATTGTT:1 + chr2L 20551537 3' - blood 299 2 50.68 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGCGCAGGATAATTGCCAGTCGCTGAGCAACAAAAGCGATTAGTTTAATAGTTGGCCATTAAT:1 + chr3L 10112281 3' - I-element 36 1 51.24 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTATGTACTTTGTATATCTCATTTCGTGTCTTGTTACCTCTATCTAAAGACC:1 - chr2L 17626591 3' - roo 8734 2 69.86 GCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGGGATGTGGGTGAAGGCCAT:1 + chr3R 16997479 3' - G6 30 1 58.91 TTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTT:1 - chr2R 3338780 3' - Juan 56 1 54.79 TAATGAGATCCTTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCAGCAATAGCTGCTGCGGCCCCACAGCCACA:1 + chr2R 14913515 3' - X-element 4497 1 79.45 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAAAAAAAAGGCAATTATCAAGATAAAGTAGACATGATAGTAAATATTTAATAACAAAAAAGTTTGCCCTTAACAGTTCAGTGCACAAAGTGAAAATCGCCAA:1 - chr2R 13046443 3' - 412 21 2 71.23 TTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAAGATCAATTAGGGATTTGATAAGAGGTTTGAGATCACGGCAAGTGTAGTTCGATTCTTACCTGCCCAGAATCTCCTTGGGCTCGTATTTGGCA:1 - chrX 11696508 3' - TLD2_LTR 95 1 54.79 GGGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATTAAAAAAATACCAAATACAA:1 + chr2L 1361089 3' - Stalker2 1 2 72.60 GAATTTGAGCTGCGTAAGTGGTTTTGGCCCTTTGGTGGGAATGCGACGCGAATGCGTCTGTGGATGTTTATGTTTACATTAGGGCAAGGACAAGACCATTAAAGAGTAACTGAAGCCCCAGGTTTTGTATATTAAACAAAGACAG:1 + chr3L 20325504 3' - Quasimodo 6957 2 55.86 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTATATATACGCATCTGATTACTCCAAATTGCAATAACATGTG:1 + chr2L 19310410 3' + Juan 4169 1 52.05 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCGCGGTACACATTAATATAACTTATTGTAAGACCTTATAATATATAAATTAAAAATATAACCTTATTTCTCGTAGTGCAG:1 - chr2L 6104819 3' - Ivk 44 1 55.17 GTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGC:1 + chr3L 20251984 3' + copia 5035 2 79.45 AACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAACTACCTAGTATAATTGCAGTATTATTATGAAACAATTTGATTTAATTCTTGGGCATGCTTATTTAGCGATATATTTTTTTAAACGAATA:1 - chr3R 9583256 3' - Juan 4058 1 63.01 AGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAAACTAACTAGCAGGATAATAAAGAAATTCGTTATTTATTAATCTAATGCGTGCCTTTAAAGTAAAAACTGCTCAATTGTTTACAAATATTTTTCAGTATTTTTAC:1 - chr3L 21882636 3' + invader2 4870 2 32.19 ACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTGGCCACATAACCCCCGCTGGGCCAATTGATTCAACGATCCCACAGCTTAGCTCCCCCATC:1 + chr2R 11145249 3' + Quasimodo 188 2 51.61 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTAGGCTA:1 + chr2L 5270363 3' + jockey 4922 1 67.12 ACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAATCGCAGCTGTATAAAATTTAAATAAAAATAAATAATAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTATATATATGTATTATATGTATATTAATGACCACGGC:1 + chr3L 19339473 3' - Tc1 15 1 56.85 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTATATTTTGTATTTTTAGTTCTCCCCATGTAGAGTCTCTTTATAGGGTCGTTTCCCATTCTCTTGAAGCAGTTCTCCCGTTTTCTGATTT:1 - chr3L 2192249 3' + jockey 4955 1 51.37 AATAATTTAAACTGTATTTTAAGTTAAAGAAAGTTTTTTATTTCTTAAATACCAAGGGATTGACGTATATTCGTGTGGTTTTCCACCATCACAAATTGAGTATCCATTTCAGAGCCAACTTTTCGGTCAGCTGGGCAGGCT:1 - chr2L 13927073 3' + Transib5 262 1 75.18 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTAGTGCTAAACTTTCACCTGAAGGACCAAACTCTAGTGGGGTACCGGGCGGTCCGTATATTGTGTGTGGTGCGAGCCGGAAAGATAAAGGC:1 - chr3L 13364269 3' + hobo 2926 1 69.11 TTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTTCTCAAGATTTTCAAGACTCCAGTCAC:1 - chr3R 10437045 3' + BS 5035 1 57.93 GTAGCGGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGGATACTGACATAGTACAGGAAG:1 - chr2L 18630469 3' - G-element 75 1 67.12 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCAC:1 - chr3R 9125644 3' - Doc 53 1 54.11 GGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGCCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAAACATCTTGTCCGTGGCTTTGTTTGAAT:1 - chr2L 1520590 3' + Quasimodo 7099 2 79.45 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGACTAAACATTTTGGCTGTGTATGGGTGAAAT:1 - chr3L 18381895 3' + copia 243 1 64.38 CACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTAGTCTAGTGTCTTTTAAAAAAAAAACATAAACCACCTACTCATGCTTTTTTCTCTGTGTATCATCG:1 - chrX 6152018 3' - 1360 58 1 62.31 CACGGTTTTATGAAACGCAGATCAACTACCACTAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATGCAGGGTTTCAAAAATAATAGTATTTGACTCTGTTAATCTTGAGAGGAACACACAAATCATAATACTAGATACGCGAACCGATC:1 - chr3L 8745132 3' + Q-element 211 2 69.18 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATGTTGCGGCTTGGCGAATTTTTATGGCACCTTGGAGATGGGGACTGGAAGG:1 + chr3L 22226101 3' - jockey 4805 1 62.81 AATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTATCGTGTCGCGAAGGAAATTACACAAAAGTTGGGGGTTGCAACTTACAGGGTAT:1 + chr3L 11286121 3' - 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chr2L 4637213 3' + mdg1 340 2 71.92 ATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACCACTTCCAATTTGCAGGTACGCGAGGGACTCGAG:1 - chr2R 6885322 3' - flea 4836 1 75.35 GCTCTCCAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTTGGGTTTTGATTATTCTTTCTAGGC:1 - chr3L 25272531 3' - 1360 91 1 52.74 ATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGACTTTCATATTTATTTATTATGCACACAATTTTG:1 - chr2L 14387812 3' + roo 245 2 77.40 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAATACTAGGTAGTTTGGCAACGCATAGCGATTCGATTAATGGGTTGGTTTCTATAATAAGACAGTCAATTTGTTCCATGATTTAAATATGC:1 + chr3R 9583402 3' + Juan 4181 1 62.07 CCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATTTCGCTACATTTGCTGGCAAAACAATAAGAAGTGCGTAAAAGTTGCCAGCAACTTTCAGCAGC:1 + chr3R 24486320 3' + I-element 159 1 56.85 ATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCCACTCAAAGTCAGCACAGGCCACAAAGTCGCAAAATATT:1 + chr2L 11554591 3' + roo 9024 2 54.79 AAATCATTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAA:1 + chrX 22900313 3' + Tc1 1549 1 75.34 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAGACTCGAATTTACGATTAATATACTCACAATAT:1 + chr3L 21013959 3' + roo 9020 2 54.48 CGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGAGCGGTCCATAAATCTAAACGATATGCGCCCCATTGCCGCCCACTTGCAACTTGCAGCTTGCCACTTGCGATTTGCAGTGCTGAT:1 + chr3L 20986892 3' + Tc3 1670 1 59.59 ATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTATCCAATTAAAAAAACAAAAAACAAAAAGGA:1 - 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chr3L 7837139 3' - jockey 4785 1 61.65 CAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATA:1 + chr2L 19140430 3' - Max-element 71 2 63.70 TGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAGTTAACTTAATGGTTATAAGATTTGATCTTG:1 + chr2L 11296221 3' + 1360 3312 1 76.87 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTCAATCGTTTTAAAGATTTAGCTGATGTCATAGGATGTTCTTCTCGATGATTTCAT:1 - chr3L 25607270 3' - 412 67 2 64.38 ATTTTCAAAAATTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATG:1 + chr3R 8049023 3' - Q-element 135 2 60.96 AACCATTATTATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTTAAAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATGGAGTGCCATACCATACATACAGCTCATAGCCCTTCAAAACTGAACTGAATAACTGCTGAAAAGTCATCGTTATATG:1 - chr2R 19198564 3' + FB 362 1 56.85 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGGCATTAAATAAATAAAGGCCAACTTGATG:1 + chr3R 18528383 3' - roo 48 2 52.78 ACGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTGGCCCAAACGGGATGGCG:1 + chr2L 12291978 3' - Tirant 8119 2 76.69 TCTTTATTTGGTTTTTATTCAGCATGTGTACATTCCTGATCTATTCCTGATTCATAACTGAACTTGGTGTGCAATTTACATAACACGCTAACAAATTTCCCAGTGCTGATCATCTTGGGGGCGTCGGGGGCGTGG:1 + chr3L 13090411 3' - mdg1 352 2 52.59 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTGCCGGGAAATCCGCACATAA:1 + chr2R 1923596 3' + pogo 2062 1 58.90 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACT:1 + chr2R 11164504 3' - roo 8726 2 64.38 CAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAATGTAGTTGTAGAGCAGCTCACTGAACTGATT:1 + chr2L 20755498 3' - 1360 408 1 78.77 TAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTCGTGGTATTATTGCAGACGTTTGCAAAGATTTAAAGTGTACTTGACTAAACAACAGCGTTTAGTTGGTCGATCGAAATAT:1 - 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chr4 865652 3' - Cr1a 4240 1 63.70 AGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGAAGGAGATGTCTGCAGAAATAACGGTGTTTTACACATTTTTGATTTAAAAAGGCATAGAT:1 - chr3L 23427736 3' + invader1 3700 2 72.41 TATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGCCTTTCCCCC:1 - chr3R 14049309 3' - transib2 37 1 58.33 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATCAAAAGAAATAAAGCAAACGTTGCTTTCTTTGGCTTTCTTCAACTTCTTCTTCAATTTGAAAGAATGGAAAAACCTTGTTTTGTGCAATCATGGCTGCAGCCTATGTTAA:1 - chrX 4400250 3' + roo 405 1 77.14 ATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGAC:1 - chr3R 8042295 3' - BS 45 1 50.35 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGCTATTTATACTCTTCTGTCGTCTGGGGAGTTTTGGAGCCCACT:1 - chr3R 11870028 3' - pogo 20 1 70.55 CACACGGTTTCGTCGCATCACAATTATTTTCACAACGCAATTTCTTTCTGCAGCTGGAACACTTTCTTCGGTTTTGTGAGTTTGGCAGGATTCGATTGCAAATGTTTTAGCTTTGGCAGTTGTGTCTGCAT:1 + chr3L 18601115 3' + Bari1 223 1 66.41 TAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGGTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAACATTTTCCATCTTTTATGGGAGTATTAAATTTTAACACCC:1 + chr2L 9296212 3' + Quasimodo 7179 2 66.40 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAACCATCGCTGGCACAAGGACCCGCTCCCGTTTTCTTGGCACACAGGGAGCTCGGCTGGACCAGAAC:1 + chr3R 14218532 3' + roo 9034 1 52.80 GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCATTTCACGCACACCAAATACA:1 + chr3L 15364912 3' + 1360 3332 1 56.16 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACAAGTTTCAAGATTTCTATTCAAATTTCATCAATCGAATCAAAGAGAAACCTGAAGTGAATATCATAGAAAGAGCTGCGAACTAGATACA:1 + chr2R 21690590 3' + 412 7515 2 59.59 CTATACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTGCTGAGCGC:1 - 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copia 4946 2 71.23 ACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATCTGAAGCTGAAGCTGGCATTCCATTTGAATTATTCATT:1 - chrX 8219388 3' + opus 7421 2 74.66 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAGTCTTCAGATACATTTAGTATCTTGAAGCTTCAAGAAGTTTTCTAAGATGATTA:1 - chr3R 6135979 3' + mdg1 7392 2 66.44 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTTGTTTGTTTTACCTTTTTTTATGGCCTGACGCCAGCAGTCAGCTTCCACGGCGTTTTCAGCTTTATT:1 + chrX 10111111 3' + mdg3 247 1 74.44 TTTATCATATTGCTACGAAATTAGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATTTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAAGCGATTCTTTGGCATTATCCTTGGCGGCCTCGCGTTGTAAAACCAGAATTATGCT:1 - chr3R 26810073 3' + 1360 3111 1 62.33 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTGGTGAGTG:1 + chr2L 12486444 3' - roo 8694 2 58.82 GGAACACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTCAGAACACGTGGCA:1 - chr2R 6798216 3' - jockey 63 1 54.48 AGATCTACAATGATTTAAGATATGGGGTATATAATTTCTAGTGAATATACCTGGAACAGAGAAGTTAAGCCGACTAATCATCGCCACCTAACGTTAATTCCAAAAACTAACATTTCTACATGCCACTTGTCAAAGCTTCGTCAGAT:1 + chr3R 6912332 3' - Cr1a 4144 1 54.79 TAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAATCAGAGGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAAAAAGGCCCAATGAAAGGCTTTCATTGATGAGTACTTG:1 - chr3L 24088985 3' + 412 7392 2 68.89 CAATATATTAAAAAAAATAAAATAATTAAAATAAGAATTTTATTTGTAATTCAATAACTAAAATAAATTAATATTACTTATATGTGAAATAACAAACGCCAATAGACTCCCGAAA:1 - chr2L 17038357 3' + BS4 732 2 44.35 GTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCCAAGC:1 + chr3R 24454870 3' - F-element 271 1 52.07 TTTTTTTTTTATTTTTTTTAAAACTTTTTTTTCCTTTACCTAAACCGAAGTTTTTGTTTCTTTTAATTCGAAAATCCGTTTCGTTTTTTTGATTGTTTGTTTTAGGGTTTTGTTTTTTTT:1 + chr3R 25371252 3' - TART-C 11100 1 28.33 GTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGTACATATATGTGTGTTCAGATACAATGG:1 - chr2R 12269921 3' - Cr1a 391 1 77.95 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATCTTTGAAGTTGCGAGCCACTTTTGAATTTGCCTCCTAAAGCGGGACAACTATAATAGCATAAAACCAGTGTTGCAAGGTGACAC:1 + chr2R 9607234 3' - pogo 32 1 62.33 GTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAGTTTTTTTGTAAATATCACCAGCTTACTGCGAATGGCTCCTTGGTGGATTTTCACTT:1 - chr2L 2120333 3' - I-element 4926 1 67.12 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGATGCCTGCTTTTGTTGTC:1 - chr3L 13690248 3' - hobo 39 1 58.74 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATTTCTATTCAGTCGTTTGTGGTGCGAGAAGTCGTATATTGCTTATAATAAAGTCAAAAAGTTTCTAT:1 - chr3L 14167326 3' + mdg1 374 2 52.52 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAACGCTTGTAAAATATTACAATCGTGCGATCAAAGTAAAGGAGTGCTTAAATATAACA:1 - chr3R 11944830 3' - roo 8727 2 63.45 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAATTCGGG:1 - 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chr3L 465933 3' + Juan 4190 1 69.86 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCATATCAGTTAAATTAGCAATCAGTCTCCAATCTTTCGTGTCTTTATTCGACCATTAGGAGATTTAAGAATATTTTAATTTTAGTTTCGATTTGA:1 + chrX 4400433 3' - roo 8691 2 64.38 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCAT:1 + chr3R 16276434 3' + pogo 2046 1 62.94 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCTAATTATTTAGTACACATTTATGCTGAATGTCTCGACTATATTTAATGGGTCTTGCACAAATTTGATTCAATG:1 - chr3R 17047795 3' + 412 444 2 54.79 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGGTGGACCATTGATGCTGCGGGAACAGGACGTTTGGGTGCTGCGGGGAGTGATCTCCG:1 - chr3R 14218430 3' - roo 29 2 55.75 AGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATATTATTACAGTAGTTCATAAATCCATACTTTAATTGGATTAAGAGCGGCTC:1 - chr3R 30264028 3' + blood 7316 2 68.66 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGGTTTTCCAGCATGCAAC:1 + chr2L 14239240 3' + 412 7486 2 58.90 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTCGATTGAAATATCTTAATTGAAAATTGCATTTCTCCCGGAAATATTCAATTTTTCTTGGTGATATTT:1 + chr2L 19674053 3' - roo 8674 2 48.97 GCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAAATAAATTTTCATGCCAGCATCATCATTATCAAC:1 + chr2R 14557361 3' + Bica 490 1 77.40 GATATAATAATCTTTTCTAATACAATTGAACAACATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGAATAGAAATGAAATGAAATATGAAAACGAGGCATAAAGAAATTTGACTCAAGGATCGCGGCGGTTCCTTA:1 - chr3L 14181688 3' + TLD2_LTR 52 1 56.85 AACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGAATCAGAATGTGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGTATATTTTATGATCAAAAACAATGCACC:1 - chr3L 14954388 3' - transib2 2561 1 65.75 ATAATGATAATATGATAATAATAATAATAATAATATTACATATATAGAAATTAACATGCTTACAGTTTGTGACAACTGTTTTCTCTCTGTGTAGAATAAAGCTTTGCTGGAATGTTGATAACTAAGATCTCTTGAGTGTCGAAGTG:1 - chr3R 25767619 3' + invader3 5049 6 79.45 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAATAATGATGATGTATCTAAGTTAGCGTGTAAGACTTTCTGTAAACAGCATTTAGTTGGCACAGATCAAAG:1 + chr3R 15295828 3' - roo 8713 2 54.11 ATGGAGTCCACCAAGTCCTGGCGCCGTTATTGAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTTGACCAGACCCCAAAGATCATCGTTATTATTGGGTTTGGCTTCACGCTCATTACACTCATGGGTTTGAATTCCCTTAGGGAAAAAACATAA:1 - chr2L 20615672 3' - Tc1 1278 1 67.81 ACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAAGGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAATTTCATAATCATAAAATTCATATTCTGACATTGAGAGTATATAAC:1 - chrX 8008573 3' - 1360 398 1 61.64 ACTCGTTTCTAATCTCGTGAGGTAATTTGCCAGCTATTGAGAACATTGTTCTATGGTTACTCTGCTTATTTAAAAGCTGGTGTGTATGTGTGTGGCTAATTACATTATTACGTTTAGTTAACTATTAATGTGTGTGCACGGATTAA:1 - chr3L 12621488 3' - BS 425 1 56.85 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGATCGATGGAAACCGGTTTCTGTGAAAAGTCTTTGCTTTCGTCTAAGGAG:1 - chrX 4673599 3' + roo 9056 1 64.42 GTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACTTCCGTTTATGGCCGAAGTGCCCGCACTTCAACCGCCATCCTACTGCCAACTTGCAAC:1 - chr2R 7889535 3' - jockey 4730 1 60.14 CACGTGAAATCTTTTAAGTCTCCTTCTTTATTTAGAATTTAAATAGTTTCGATCTCTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTAGCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTGAAAACAAGAATCCACGA:1 - chr2L 8776789 3' - G4 3683 1 68.49 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTTGTGTCACTCTCTTTGGCTCTCTCATTTG:1 + chrX 7706854 3' - P-element 15 1 68.97 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGGTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCTGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGTGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATG:1 + chr3R 23601746 3' - jockey 87 1 70.71 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATCAAGCTCAGATCAAAATATGCAACATTCTGCATAAA:1 - chr3R 2649194 3' - 412 87 2 76.71 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAA:1 - chr2R 13761632 3' - jockey 4756 1 76.03 GACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATATACTCTATGATTTCTATTGCTATTGCTATTGCTGCTAGTTGGCGAGTGGTGCTATCTGGGCTGGTTGGTTCGT:1 - chr3R 25021429 3' - invader2 49 2 51.37 GTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGATGTATAAACCATTCTTCCCTTTCCTTACATCATCT:1 + chr2L 4165599 3' - I-element 374 1 75.86 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATATTCTTGATCAACAGCAAAGTCGATATAGCCTTGTCCGTTTCAGAGTAAACTTGTTGATACTTTCCCAAA:1 - chr3R 6461724 3' - 297 6626 2 55.48 CCAATAGGCCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAAAAAAAAAATGAGGAAACACGGTAAGCGACTAAAATAGCTTTGGTATTGGTTTACTT:1 - chr2L 16215429 3' + Rt1b 5065 1 66.90 ACACAGTTCAGTTCTAATAAAGCATTCACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATGTAATT:1 - chr2L 22315570 3' - frogger 65 1 70.42 ACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGCATTTGTAGGGTAATGGGGCTGGGCGCTGACTGTGGACTGCAGCG:1 + chr2R 11527634 3' + Idefix 180 1 66.17 GGACTGCCAGTCAAAGTTTGACTTTGATGAGCAGGATGTGAGGCCAAGTCGCACTCCCTTCCTTCAATGTAGTCCATGAGGGCTTCGATGAAATTCAAATCAAATATTTGTGCTAGGAGGTTGGAACCGAGCCTCAGAGTTCGTCC:1 - chr2L 14005246 3' - Rt1b 4981 1 62.33 GTATAATTGGCTATAATAAAAAATAGGCAAGGAAAATGAAAGTGCACCATAAAACCATATAGTTATATGAAGAATTGCAATTTATAAATCTTAGACCCACTGTGCATTGCTTTGCCGCAAAGTACCAAAGTCAGTGCCAGCTAAAA:1 + chr2L 8920033 3' - gypsy7 5072 1 69.18 CAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCCTGCCGTTCGTTCGTCCTTCGGCTCTTCCTTGTTATGAGGGCCGTAAATAATTTTTTCGGTACCGAGCTGCTCATCATTTTATTCTATTAAAGC:1 - chr3R 9111155 3' - Doc 4436 1 68.49 GGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTATAATTGAGCGTTGCCAGATCAAAACATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATCGTGGCTATGCACATATATACATATACATATATATTGGGGTATATCCACGAAAAACCAACCCA:1 - chr2L 522346 3' - Copia1_DM 69 1 56.85 ATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAATTAAAGAGAAAAGAATCAACTATATAAATTTAACAGCAATCGATCTCCAAATCTCTGTGTTCGTC:1 + chr3L 23079693 3' - Transpac 5046 2 55.48 CAGACTGGAGAACCACCACAATCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCCATTTGATTCATTCAACTTTGAGGCCTGCTCTTGTTGCGTTCATTCCCCCAAAGACTTTGAGCCGGATGATAAGCAAATGAAATGTTGTC:1 - chr2R 22754507 3' + G2 2852 1 67.13 GTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTTTCCCTCCGCCTGCCACTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTTTCCGAGGTTTTTCCTGTTTTTCCATCCTTGCACTGCTGTTATTGTTGTTTACAT:1 - chr2R 17259697 3' + Cr1a 215 1 73.61 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAATACTAGGTAGTTTGGCAACGCATAGCGATTCGATTAATGGGTTGGTTTCTATAATAAGACAGTCAATTTGTTCCATGATTTAAA:1 + chr3R 9583397 3' + Juan 4175 1 58.22 GCATTACTGACTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGGTACTCTCCCTTCCCCAAGTGGCATATGATATGGC:1 - chr3L 22594139 3' - 297 40 2 52.80 AAGCTTACAAACAAAGACTGTTCCAAGCATCGTTCTATCGATAGCTAGGGTAGGGAAATTAATTAAAAGTGATCTAATGAAGCTTTTGGCGCTTTGCTTTTAGCCTTATCTGAAAAAAAGCATGTATCATTCTTTGCTTTGCAA:1 + chrX 6301774 3' - Cr1a 4036 1 52.08 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGGTGGATGAAATACAAACAAAACTGTCAAAAAAGCCAGCAAAAATTTTACATAATCAAAATAATGACTCTGATGCTGGATGAATGTGGCTTCGGATGGGGGGCTG:1 + chr2R 13366962 3' - jockey 4742 1 74.66 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGTATGCTTTTAAATTTTAAACAGTTTACCATTCATAACTCC:1 + chrX 7384980 3' + I-element 5284 1 69.34 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAACTTCTCAGCTCTTCTAC:1 - chr3R 7450274 3' - Doc 35 1 40.71 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAGAAAGAAATATCCC:1 + chr3L 13364403 3' - hobo 50 1 52.05 GCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGT:1 - chr2L 2494852 3' - Doc 92 1 78.08 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTT:1 + chr3L 18253871 3' + blood 304 2 70.83 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTAACCCCTGTTGAGAGGCGGCAGGATTCTCGTCAGTTGTTTGCTTAAAACAAATTACAAGCAGAGTGAGAGAAATTAATGAACTTTAAGCCAG:1 + chrX 7742012 3' - hobo 28 1 65.07 TGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCA:1 + chrX 21667935 3' + opus 427 2 67.81 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTA:1 - chr3R 6645328 3' - blood 68 2 60.96 GTCGATTAAGATAATATTAAATGCATGCATTAAGTAATGGGAGACTGCTTTCCCGTATTACCAGATTAAAAGTTGGCAAATTTTAATTTGAAACGAGGCATTGGGTTATTTTTTTCCAAATGTCTGATGTCATGCTATAACCACT:1 + chrX 2081801 3' - Transib-N1_DM 439 1 78.62 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTGCCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCCAACCTTTTACAATTTCCA:1 + chrX 1103719 3' + pogo 2043 1 58.22 TAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTGCCCAGAAATAAAGACGGAAAAAGGGAGTCAACGCCAGAGAAAAACGTCTGCCTACCTTTGAGG:1 - 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chr3R 16276330 3' - pogo 64 1 66.44 AGTAGGTAGTAACACGTTATCAAGAACAAATGCTCTGCGCTTCTATGTCGTGATTTGGTTTTCGTAAGTACCGTTTATTTAAAACACTGACGATTTTGACGACTCAAAATTAAAATGCAACTGAATAGAAACGTATAA:1 + chr3L 26711217 3' - Tc1-2 307 1 78.99 TATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTAAAATAGTTGCAATGCATTCAACTGAATCGGAGTGCAGTGGTAGTCCTGGCCGGGAATTTCTGG:1 - chr3R 20448305 3' + copia 404 1 56.16 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAA:1 + chr3R 25795816 3' - jockey 89 1 73.29 TGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCAT:1 + chr3R 11151879 3' - mdg3 5341 2 78.08 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCATGAGATAAAAGCATTAAAAACAGTTTGCATTAGTGTCAATTTCGCAGAGTGTGTTGCTAATTTGATTTCATTCT:1 - chr3L 20251896 3' - copia 45 2 53.42 CGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTGATCGGTGGCAAGCACCGCAG:1 + chr3R 12068889 3' + P-element 2719 1 15.07 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATGCAGTTATTGATTTATACATTCATTTCA:1 - chr2L 16857871 3' - P-element 86 1 21.01 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGTGCATACTAAAATGCAATCTCTGTCCGGCATTAAGCCTAAATTAAATATATTTCATCCAGTGTCCAAAAACCAATTAATTCTTTGTCCGGCCGC:1 + chr2R 23212732 3' + Tirant 386 2 72.73 AACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGTTGTCCTTCCCTTTGACTTAGAGCACTCTCTTGCAATCTGTTTGTTTTTCGGCTTCTGTCG:1 + chr3R 4843987 3' + Doc 277 1 57.64 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATTACTATAAATTTTTAAACCATTTCCCTGCCACGGACTACAG:1 - chr3L 13678854 3' - hobo 34 1 62.33 GTATCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCT:1 - chr3R 10213061 3' + P-element 2790 1 19.86 GAAACCACTTGGTCTTATATACATTTATACATACAATAGGTTAGGTTCAGAGGATTTGACTGAACGATTCCTTTTGGATCCAAAATAAATAGAATATTTATTAAATTTATGTCGCTTAATTATAGACCTTAAACAGCCGCCGCGAA:1 + chr2R 22135586 3' + G5 4748 1 71.92 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTTTAGGCACTGAAAAAAGTAGACAAAGTAAAAAGTTATTGCTACAAAACGGGACTGTACCTGAGAGAAATAGCTCAAGCA:1 - chr3R 12609150 3' + 297 6940 2 56.85 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTGCACGTTGCTCGCATTTG:1 + chr3R 11095897 3' - hopper 50 1 51.03 ATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGACAATTTCATTTTAATTTACCGACATATTTATTTAATCGATTTGACATCACTGCTGATGATTGGGTTAGTTGTGCGGGGAGAGTGGTAAAAAAAAATCGGTTGGAACTACGCACCTC:1 + chr2R 15568133 3' - Quasimodo 39 4 46.58 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAAAAATAAAAATAAAATTTAAAAAAATTAAAATTCCACTTACGAAACAAAATTTCCCTCTAGTTGTATTATGTATAC:1 + chr3R 15030808 3' + I-element 5301 1 55.48 GAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCC:1 + chrX 388315 3' + 1360 3322 1 70.15 CAAGTATGGGCGTCGGCAGCGAAGCAGTGGCCGTTAGAGGCGGAGAAGTGCAGATGATTGCACTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGCTCTCTTCGACTCACTATTT:1 + chr3R 16296162 3' - HMS-Beagle2 7077 2 53.23 ATAAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTATACTTATACGTGAATTATAATTATTATAATACGATATTATATCGTAATTATTTTTTTTGGCCTATTATAGGGCATTGAAAAGAAGGAAATCCGCTTTCGCAAGATCTTAACTTTCCTTT:2 + chr2L 16673119 3' + Tc3 309 1 63.01 GGATGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTTCCTGGAAAAGTATTCCCATATAATTTTTAATTACAAAACAAAAAGATTTTATATTTATAATATAA:1 - chr3L 18035455 3' - mdg3 5261 1 67.59 ATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACA:1 - chr3L 27356085 3' + Tc3 1639 1 68.35 GGTCCATCATACCAGACCAATTCACCAAACAAGGCACATGGCACAATGAGTCCGGCATATATAGTCTAAGTAGGTTACTTATTCTTAATTAGCCTTCCAATTTTCATATGATCTCAATATGTCTGAGAAAACGCACCAG:1 + chr2R 5149306 3' - R1-2 3087 1 51.08 AAAATTTTAAAATTATAATATACGTATGAGCACTGTTACCGTGCAAGTGCACAGGGAAAAACTTCGATGTCAAACATAAATTATGCCTGATATTTTATGGTTTTATTTCGTAGCAATCGTTGCCCAAAAGTGTGCTATGGAATATT:1 - chrX 16878522 3' + 1360 3059 1 70.55 ACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGCCCATCTGCCCCCTGCTA:1 - chr3L 7837130 3' - jockey 4788 1 62.76 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACGTGGCCAAGCACGCGACCAGCG:1 - chr2L 13629016 3' - Tirant 8116 2 80.00 ATTTTTAAAGTTTATTTTTAATTTCAATAAGAACGCCATAGTTTCCACCTCTATTTAGTTTCCTGAAAAAACAAGTCAAATTTTCGCTACCATGGATTATATCTTTAATATTATTATAAACTTAATGTAACTTTTTCGTACAAAAT:1 + chr3R 11091862 3' + hopper 179 1 38.36 TAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATGCATAAC:1 + chrX 20685957 3' + Ivk 5332 1 52.05 AAAATTAAAAAGAAGAAAAAAATCCGAAAAAATACCAAAATCACAGACATAACCAAGCAAAAGAGAACATAAGC:1 - chrX 4402035 3' + Doc 4698 1 33.78 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCCTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCAAAATAAATCTATGCCAATTATTGACCAACTGCCAGCAGACGAAACA:1 - chr3L 4523941 3' - roo 73 2 71.03 GAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTACCAAAATACCGTACTACTTGTTGAATAGACCTTGCCCTGGCTTATTATGCATGTGCATAAATTATCGAAACACGTAAATTTA:1 + chr3R 4678685 3' + Stalker3T 293 1 60.96 GGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGGTGACCTAATAATCTGTATATATTCAGAGAAGTCTATAATTATTTGCAGAGAATGCTTCCTGCAAAATTAAATGA:1 + chr3L 18953026 3' - I-element 179 1 49.32 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATCT:1 - chrX 7706772 3' + P-element 2823 1 28.21 ATTATTAATTATTATTATTAAAAAAGGTTGAATTTTGGTATTCCATTTATCAACAATTTTGTTAAATTTAGAAATAAAATATTTCCATCATCAAAAGGACTGGGGAAAATAATGTTTATAATTAATATAAAAATAAATTTTCAATA:1 + chr3L 18367325 3' + Tc3 272 1 70.55 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTCTTTTTTTT:1 + chr2L 21643145 3' - Tabor 9 2 73.64 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGATTGCGATTTCTTCAGTTTATTTGGGTCTGTTTTAGATTCGAACTTCAGAATTGATTCATATTACGCATTTAA:1 + chr3R 20840170 3' - roo 8712 2 50.34 ACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCAACCTGGAGAAGAAGAACTTATGTAATTGATATATACCACAATATAATA:1 - chr2L 14831606 3' + Transpac 455 1 78.12 TCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCCTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCATGTGTGTGCGTGAGTGCTGTGGCCTTCCAAGAAATGCAGCAACAACACAACGACAACGACCACGACCGCCGACGTCGATAATACG:1 + chr3L 16043742 3' + mdg1 324 2 58.22 ATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGATGTAATT:1 - chr3R 11151787 3' + mdg3 204 2 56.85 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCATTTATTTTTAATTTATCTTTTTTGTCAAGGCAAGTGTCTGACGTT:1 + chr3L 18253935 3' + blood 7377 2 73.97 ATAAAATTTTAATTTAATTTTTAAGCACTCGCAACGATTACGCGTAATTCAATCGAAATGAATGGGCAGGAACGAAGGGAAGTCGGGAGTCATGGACTGGGCTTTATCAGCGTTGCGCCAGGG:1 + chr3R 18833130 3' - 1360 3047 1 71.54 AACAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGATATTCGAGCTACTCGACTATGGCGGTCTCTCCAGTTTTTAATAAACAAAATTGATATTTTTAAGCCGATACTGACGTAAAAAAAAACTAAAAAGACAT:1 + chr2R 6885444 3' + flea 5010 2 70.34 GTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTATGATGTTTATACCGATGGTTAGATCGACATACTT:1 + chr2L 12322150 3' + 1360 3243 1 76.03 CGCGAAACCTTCAGCTGCCTTCGACAGGTGGTGCTCTTAGACCCATACAGTGAAAGCGTCGAGCAGCAAGAGGACCAACAGGACACGGAAGGACACGGAAGGACGACCAGTGCGTGTAGAGAGCGATCCT:1 - chr2R 3182901 3' - Osvaldo 1338 1 64.62 TCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAAT:1 + chr2R 11146104 3' - Quasimodo 83 2 74.66 TAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTATCTCGTATCCCATGCTTACATCATGCCACCGCTGGGGCCATAAAGATACAACTCAA:1 - chr3R 14280748 3' + P-element 2707 1 45.07 TGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCATTTTTTGCGGTTTTTTTCGTCATTTTCATATAAGTTATCAGCAATAGAATTTGCAACAACAAT:1 + chr2R 2307691 3' - hopper 991 2 71.23 AGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTCTTAAGTTCTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACTACTTAGTTGGTAATCCA:1 - chr2L 1090985 3' - 412 116 2 58.90 CAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAAAGAATCCGCCGGAACTGGCACGGAATCCACTCAGCGAGGACGGCTGTGGGCGCGGAAAGGAA:1 + chr2R 17615062 3' - Transpac 152 2 57.53 ATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGACGGTAAG:1 - chr3R 8042289 3' - BS 42 1 47.26 GGGGTTAAAACAAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGGTCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTA:1 + chr3L 7801310 3' - Transpac 5081 2 52.41 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCTTAAGTAAGTTAAATGTGTGCACCTCATCCGATTTT:1 + chrX 14137276 3' - 3S18 24 2 55.42 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCATATCAGTTAAATTAGCAATCAGTCTCCAATCTTTCGTGT:1 + chrX 4400379 3' - roo 8745 2 75.34 AAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAAGAAAACCCAAACACACAAAACAGTAAGGAGAAGTTGAGGCAAAAGCCGAAGACAAAGTATAAAACATATGCCAAAACACCGATTGCAATT:1 - chrX 7384492 3' + I-element 316 1 66.44 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCATTTTCGGGTCTTCCAGCTATAT:1 + chr3R 16276455 3' + pogo 2080 1 66.15 TCGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAACGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCAAGTTCATAGATCCCTCTCACGTTCGCGATCCCCC:1 - chrX 13306857 3' + 1360 105 1 81.25 AGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCAAGTAAACTTGATTTTCTTAGTAACTTTTAAAATATATATGATGGAATATATAAAATGTATAAGTG:1 - chr2R 1926038 3' - pogo 1793 1 52.86 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGTGCAGCGATTTCATTTCTCCAATGAGTCATGCGGCCAGTCCGTCGCTTGAAATAATATTATTAAATATTTTGT:1 + chr3L 13952877 3' + I-element 5310 1 47.95 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATTTTT:2 - chr2L 15081063 3' - Doc 63 1 62.33 ATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCA:1 - chr2R 21848697 3' - Transpac 84 2 75.34 AAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTTAATAACGGTGCCAGGACTTGGTGGACTCCATGCCAACAAAAGGTCACGCATCCAAATATTTTCGGTGCGTATCACATTACAGACCATTAAGTATGTTTACTACTACATTCCCAGCAACCAA:1 + chr3R 6322035 3' + Tc1 1244 1 42.47 ATAATTGCTAAAAGCTGTTTGGCAATTTTATCTTCGTGGTCGGCTTCATCCAGATAAATCACCGTGCCTACGTTTTCTATCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGTTGATTTATTTTTAAATCCGATAGCCAAGATAAATACTGTT:1 - chr2R 14915026 3' + diver 290 1 71.92 AAGAAAAAGAAAAAAAAAAGAACGGGAAGCGGGGGGGCGAAACCACGCCCCATTCGGATTT:1 + chrX 9720791 3' + Doc2-element 220 1 88.52 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAA:1 - chr3L 7837157 3' - jockey 4810 1 48.57 CTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGTTATTCTAGGGTCTTTGCATAAACTATAAAGTTCGGTTTCCATTTACATACATATGTATTAAAATATGGATCCATTTTATAATAGATAACCAAATT:1 - chr3R 19448332 3' - 1360 3380 2 73.97 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAATTATTGTCGTTGTTGCAGAGTCGGTTAGGTAGAAATTAGAAAATAGAGAGCGCAGATAGGTAAATAGACCCAAAAACC:1 - chr3R 15295664 3' + roo 400 1 77.93 CTAATTAAAGAAGATTATTAAAATAATGTTAATTGCAAGAAAAGAAAATTTGATTTTCGCAAGTAGTAGTCCATAAAAAAAGCAAGTGCATTATATTAAACAGCAGAAATTAGAACTTTGCAAATGAAATTCGGCCTGAGAAACGT:1 - chr3L 7433137 3' - Cr1a 76 1 77.40 GTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGGGCAAACCGATGGAAATTTCTGCCTTCATGAGGCGGCAACAGGTTACACAGCAGC:1 + chr2L 12144293 3' + transib2 2759 1 64.38 ATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACTAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTA:1 + chrX 1018145 3' - 1360 250 1 67.81 TGGCAAAGCGAATATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAATCTTGTTTTGGCATATCTAATCCGAATATTTTACCCATT:1 + chr2L 12772082 3' - Ivk 213 1 71.92 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTAGAAAGGATAAAATTCGACATAACTTTCATTTGGTGCAGGAGTACCCCATTTTAGAATATAGTTCTAGCAGTTCCCCCTTACCCGCCTTAATA:1 - chr3R 8017705 3' - mdg1 7068 2 65.75 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGA:2 + chr2L 21910251 3' - Doc 49 1 52.05 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTGTCTTAGCCAGGCCAAGGATCTCCTTTCCT:1 - chr2R 16413094 3' - roo 8755 2 80.82 GTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATGTTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATTGATTTGAAGCCAGAAAGGCAGAAATTGCA:1 - chr3L 24190824 3' + Doc 103 1 78.08 GCGAGCATATACCACGTGGCTGCTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAATGGCCCCCAACAGCGTTTCGCCCAACTAATTGAACAGGCTTGAGCTGCTGTCAGACACAGAGCACACACCC:1 - chr3R 25428410 3' - hopper 1241 1 51.03 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAAAGACCCTACAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACACTTTCAATCAGAAACAGGTGGAAACAGGT:1 + chr2L 17432134 3' + 1360 3342 1 58.22 GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGATGTAATTGCCAAACATTTG:1 - chr3R 11151775 3' + mdg3 5471 2 66.43 ATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAA:1 - chr3L 16973374 3' + S-element 124 2 62.33 ATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATACGTACATACATCGGTATGTGTGGTGGCTATCAGTTGAGCAATGAAGGTTTTGATATCATCTTATAATCTC:1 - chr4 540456 3' + flea 206 2 54.11 CTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATCATTGTAACAAAATAAATGATTTCTTCGTCTGAATAGAAAACATGGCCAAA:1 + chr3R 8303287 3' - copia 4791 1 75.34 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAG:1 + chr2L 5792062 3' - blood 7097 2 75.17 GACTAAAAAATTAAACTTATTTTCAACATATAAATAAATAATCATAATAAAAAATAAAGAATGATTTTGGGCTTCCTTCAATTCATTATTATTATTTTCAAATTATTGTAGTATTGTTGAAATATTATTTATTTTGATTTTACCAC:1 - chr2L 17897742 3' - 297 468 1 45.89 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAAGTGGCAGTATCCTTGAATCAGGTGTTAAGAG:1 + chr2L 3232010 3' + roo 9055 2 71.92 CAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGCACTCTTAAATTAAAACTTAATATTTTTAACAAGATTATAACTCTTTATA:1 - 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mdg3 15 2 61.64 AATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTATATATACGCATCTGATTACTCCAAATT:1 + chr2L 19310397 3' + Juan 4156 1 56.85 ATGCTTACTTTGCAGAATGCCGTTGTTGTCGCTTATTTTATTTGGACGTCCGCGGACGTTAACTTTATATAAGTTATATATATTATACATATACTTGAATTGTCACCAACCAGGGGATGTCCTTAGTGTTGGCAAAAAGCAACAGT:1 + chr2R 21416904 3' - gypsy2 52 2 74.66 AAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCATTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAACCCCTCATCAGTTCAGATTGAAGGTCAC:1 + chr3L 10862082 3' + GATE 339 1 80.14 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTT:1 + chrX 6633011 3' + P-element 2796 1 23.29 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACAACTTGCAGTAATGGAGACATAACCAAACTCA:1 + chrX 3647033 3' - 412 7082 2 64.38 AACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGTCGGTGGTGCGATGGTGAGCGGTTCACAGGACACTGTATC:1 - chr2L 3960193 3' - jockey 84 1 68.49 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGACAAAAAAACGAATGATAAGTAATGGGATGAAAACAACTTGTTAAAACCTCTATAAATTTATCTTTATATGTCTCACGTTTATTAAAGTCATATACTTTTTGAAGA:1 - chr3L 3238206 3' + roo 393 1 64.38 TATTATGGATACTGTTCCTTAATTATAATGTATACGAATGTACCGTGGAGAGATTATGCTATGCTTCAGACGTCGAGGGGAAATAGAGTCAACAAGATCACTAAAGAGCTTATGGACTTTACCCCAACTTAATCTGTTGGCAAGCG:1 - chr2L 4358898 3' - G5A 2755 1 68.49 ACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGACGTGGGGAGCGGGTGAGCGGGAGTTAGAGAGAGC:1 + chr2L 9879750 3' + jockey 4915 1 72.46 GAAATCAATTCTGATCCAAGAAACGAATTTCCATCTTGGAGTTTTGGCCAATTCGTATCAATATGATGAAATAAATTAATAATTAAAAAACGAAAAATCATTTTATCCTCGGGAATGCCATAAATGCTGCCTAGAAAGTTATTATA:1 - chr3L 20526407 3' - 1360 3172 1 60.96 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCA:1 - chr3R 7885611 3' - jockey 95 1 76.71 TATAATCTTGAACAGGATCAATTGTGGAGTCGATCGAAGGTCGAAATCTCAGGAAATATAAAAGATAGAAGATCCAGCATACGGATTGATTATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACACAAATAACTAATTTGCAATTTGGTACAC:1 + chr2R 18487379 3' + INE-1 83 1 30.14 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAA:1 + chr2L 3231967 3' + roo 352 2 56.34 AATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAGTAATCCATTCCATCATATCACCGTACCGGCCGCACCGCACCTCTGCACCTATGCTCTGTG:1 - 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jockey 4787 1 40.41 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTTAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAAATTGCTAATACGTAGGTTATGGCATGCCCATTTAAACCCAATTTTTCACT:1 + chr2L 13092441 3' - F-element 85 1 65.73 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCTCTAAAGTGCATGGCGAACC:1 + chr3L 19031337 3' - roo 51 2 53.42 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATACATGCACGCAGACACTTTATTTATTTACATTCCAGCCAGATTGAAAGTGACATCACAAAGTTTTGGGGCCAGAAGTTTTCTAGTTG:1 - chrX 11008280 3' + hobo 2923 1 71.54 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCTAAAAAGGGTTCCCTATGTGTACTT:1 - chr3R 27323089 3' - 297 6626 2 78.57 AAATAAATAATAAACTGTAAAAAAGCTAAAGAAAAATTAGCTTGGGGTGCCTATTGGATACATGGGTATACACCCAAGGACATAACACTAGGTGCGCAAACTTCATTAACGAGTGCACTGCGAATTGCTCTTTACCTCTTTTGAG:1 + chr3L 104564 3' + 412 346 2 66.21 AGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATATTAAATGGTTAAGAATAATTGAATAGTAATCCAATAAGTACTTATTATTACTTGTTCTTTACAAATAGTATTTAT:1 + chr2L 13139104 3' + McClintock 6392 2 59.59 CGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATAACTCAAAGATTGCTTGATGCGAAAATAAAAAATTTTTAATTCCTGTAATCTGTGTTACAAAGTGTTTTGTTTGCACTTTTTAATTTACTG:1 + chr3L 415424 3' + McClintock 6414 2 76.71 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGACACGAAAAACGGAAAGCGAATGTATCTGAAAGATACGTTTAGTCTATTTC:1 - 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roo 83 2 94.48 GTTACCGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCACCCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTATCGCATTCAATCTGCTCGGATGGAAAACCAACCCC:1 + chr3L 15730381 3' + ZAM 7964 2 67.81 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGGCTTTGACGTCGTTGTTTTTCCCCTGCTCGTCATGTTTTGTGTGTTGTAT:1 - chr2R 15528461 3' - 1360 64 1 65.00 AGCTGAGTAATGGGTATGTGATAGTCGGGGAAATTAACTATAGTGATTTATTGAACATTTGTGTAATGTAGCCAAATAACAAAGGCATATAACGTTATAAGGATGACAATTGATTGATAAAAACATCATATAGTGTATGATATGGG:1 - chr2R 16298576 3' + INE-1 545 1 69.18 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAATTATTGTCGTTGTTGCAGAG:1 - chr3R 15295722 3' + roo 340 2 69.86 CCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCACATGCACACACAGCCATAATGCAGTGTGCCTGTGTGAGTGTTTGTGTGTGTGTTTGTGTATGCATAGACTGACCGCTCGAAA:1 + chr2R 10168701 3' + hobo 44 1 42.07 CTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAGCTTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGTGTTTTTATTGCAGTTCCGCAGATGCTGTCATGACATTTGCCAATTGTGAGTGAATTGTGTCGAAAATT:1 - 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chr2R 11095716 3' - diver 5926 2 58.22 GATGTAGATGTGGTAACTCTTGCACTTGTAAACTGAACTGAGATAGCGAATTTGTCTTGGCAAGAATTTGAATGCTGGAACTTTAAAAATAATTATCAAGAGAACCGCTTTCCTATAGATATGAAACTGCAGATATAACTTAAACG:1 + chr2R 17543683 3' - gypsy5 6936 1 68.49 TCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACTAACTAATATAATCAGCTTTGTTCCCGTTTTTA:1 - chr3R 10150170 3' - 1360 89 1 78.77 GATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAAAACGGGGTAAAAAAGAATGTAAAAGCCGAACCATTTTCGCAACGC:1 - chrX 9718736 3' + roo 8939 2 69.18 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCTTCAGTGAAAATGGTACTTTCTGCAAGAACGATAATAGCG:1 + chr3R 21216919 3' + 1360 3360 1 67.81 ACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAAACTTGATCAAAACCCATTTACCCAACTAAACGCA:1 + chr2L 20922646 3' - roo 8813 2 76.03 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACT:1 + chrX 16117267 3' + opus 7438 2 64.38 TCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTCATTTGTAAGTCTCGGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATACCACAACTTTGTGAAGCGAATTGTGCTAAAAGAAAATGTCCTTCTCTGCCTTCTCCAGTGCGCTGTCTCCAACAGGGATTT:1 - chr3R 11368230 3' - Doc3-element 4469 1 53.42 TTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCCGCTTGTTAGGCTGCTTCGGTGGCAAGGGAATGTACGAGTGGTTAAGTGGGTGCTTGTAATGGGCCGCCAAGAGTCCTTAGCC:1 - chr2L 13693336 3' - F-element 4587 1 59.59 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAGCCGATACACCAACTTATTCCTACAACGAGCGAAACAGTAAGAAAGCC:1 + chr2L 22719658 3' + 1360 3334 1 61.24 AGTTCGACTCGGCTATTGATCCTAATCAAGAATATATGTATATACATTATATAGTCGGAAACCCTTTTTTCTGATTGATTTCAACTCCAGCAAACAGGAGTTCAAAACATATTAATACAATGCATCCGTAA:1 + chr4 1121529 3' - INE-1 97 1 58.78 ATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAGAAAGATTGCAAAGGTTGTTAAATCCAAAATTAAGTATAAATATTTACA:1 - chr3R 31934776 3' - hobo 100 1 66.44 GCCATTCGTGGTAATAATTTTTGTTTGCATTTAGATATGAGACCGAAAGTGAAAGGTTTGTCTAACGAAGACAAACGGCTACCATGGCGATCGTCGCCGAACCCATTATGAAGATGCAGAGACAT:1 - chr3L 5593512 3' + looper1 392 1 60.80 AATCTACACATTCCATTTTACACTAATAAGTGGAATAAAAAGACGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATTTGTATTACTTAGTTTCCCTACTTACAACTTCAAATTTCATTTTTATATATTCTTGTATATATGTCTATTAACTCT:1 - chrX 21626898 3' - HB 106 1 55.48 GATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGGGATTCC:2 - chr3R 25543450 3' - G2 228 2 46.58 TTTAAATTTAAAAAATATATATATTTAAAAGCTTTCTGATAGCGCAAACATACTTGTAACTTGATATCGAAGATATCTCAAAGATTGTATTTGTATTCAAAGTATGCCCTGAACTTTTTAAGAATGTTTCCAATTAAATTCTTAGC:1 + chr3R 14386336 3' - copia 4669 1 45.89 AAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAGAAATGACCAAAGCAAAGACACTAGACGCGGAGGAGATTTCTCATGGCAGCTG:1 + chr3R 17134913 3' + 1360 449 1 72.45 TGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCGATAAGAGAGGATTCAATTTTAAACT:1 - chrX 388205 3' - 1360 32 1 64.38 GTAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCGCGTCTAATTGTGGCATATCTTTCTAGCATCCAGATCTATTCTGTTTGCATGCCATATGGATAATGTGTATAATACAGAAGCAATTTGGGTCTCAAGAAGGGGG:2 - chr3R 12368893 3' - Tirant 8123 2 71.92 GGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATTTATAGTGAACAAGAGCAGTTGAAGAACCCATTAGTGCAATGAAAAGTTATA:1 - chr3L 17812731 3' - I-element 5281 1 64.38 ATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCATTAAATAACAT:1 + chr3R 13349593 3' - Ivk 54 1 51.37 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTGGCACTGTGAGAATTGAAAA:2 - chrX 7756361 3' + roo 9032 1 45.21 TACGCTTTCCATTTATTTATTTATTTTATGTTATTAACTATTTGCTTCTCTAAAATCAAGTGATTTTATACGGAGATCGATGATCAATGGCCTTCGAGTCGAGGCAGTGGGTCTGGTGGAGCTGACTGGCGCAGG:1 + chr3L 4514500 3' - Doc3-element 89 2 61.48 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGTTTTAACCAACACCAA:1 - chr3R 25050013 3' + P-element 2818 1 30.77 GATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGTCCATTTCGAATTCAAAAGTTACAAAATGGTCACAAGAAATGTTCGCCCCTGCCTCCTTTAGTTAACGGAAACCATT:1 - chr3R 23202269 3' + Stalker 7132 4 52.74 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAG:1 + chr2R 5754564 3' + P-element 2790 1 23.29 ACGAGAGTACTCCTTATCTATAGTTCCGATTGGCCATCTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGGAGACGATGATCGCGCGTTGGGGGATGTTCTGGAGGCCCTTAT:1 - chr2R 17575705 3' - Rt1a 4775 1 72.22 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATTCTCGCTTGTTTAACGCAGCTATAAATTATGATGCCAAAGTTTTTGGCCACTCAACGAGCG:1 + chr2L 20515302 3' - I-element 22 1 62.50 CGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATCGATCAATAGTCTTTCATATATTTAGTTACATACAATATAATACATATTGATTTAATTGGTGTTTTCGTACGTTTTCGTTTTTGCGGATTT:1 - chrX 14836137 3' + invader4 301 2 69.18 AGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTTCCTGGAAAAGTATTCCCATATAATTTTTAATTACAAAACAAAAAGATTTTATATTTATAATATAACATA:1 - chr3L 18035451 3' - mdg3 5258 1 69.86 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAAATCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGT:1 - chr2R 21848652 3' - Transpac 39 2 53.42 TATGACCTCGATGAGCAGGATGTAAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCGTCTGTGTAGAGTATTGTATAGTTGTTGTTCTTAAGTTGGTTCTTGATTT:1 - chrX 19820576 3' - Rt1b 4965 1 73.97 TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGAGTTGACTGACATATTGACACACTCGCACAAAGGGCAAATCCAATTCCATCGCAGCCAAGCAGCTCAAACCTCAGCTC:1 - chr3R 31140932 3' + Burdock 247 2 74.56 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTTTGTACGATAGATTCGG:1 + chr3R 21674949 3' + roo 9047 1 64.38 GTACACTCGCCTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGC:1 - chr2R 15075590 3' + mdg1 343 2 67.81 CTGACGTTTTGAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATAAAATTAAAAAAAAAACTTAGGGAGAACAGACAGTATTAACGAAATTGACTAAAAATATATACAAGCTCAAGATCTCGGAAGGCAAAGCGGTAGAATTGAACAATTAG:1 - chr3L 25255829 3' - transib2 436 1 78.77 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGC:1 - chr3R 13225475 3' - hobo 52 1 53.47 CTTGATCAGGATCATAAGCCGAGTCGATCTGACCATGTCCGTCTGTCTCGACCTCAAGTTCAAGTTGTTGACCCACGCCCACACTTTTCACTACAAACTGCGCATGTTCCCCGTAAGAGCTGCCAAAAGAGAGTTTTCTCTCTGGA:1 - chr2R 14449079 3' + INE-1 89 1 60.27 ATTCGTAGAAGTGTATTCTAACACAACGTGACCCTCTTTTATGACTTCTCTAATGAAATGATATCGAATGTCGATGTGCTTCGTCCTACCAAATTTATATTTGTGTGTTTGCCCGACCAAGGAAAAGCAGATGTTCTAATTAAAAT:1 - chr3R 1319286 3' - 1731 4179 1 60.27 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAAAGTGCAAAAG:1 + chr3L 10469632 3' + roo 9036 1 58.99 ATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACG:1 - chr3R 907908 3' - gypsy11 4338 2 27.74 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTG:1 - chr3R 6413566 3' - 1360 62 1 68.46 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGTTTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCTCT:1 + chr3L 19031320 3' - roo 8688 2 51.96 GATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTATAGCCCTTGGCACACATCACATTTTTTCACATCCCATCGAAAGCCATATAATTCATGGAGCCACACACGTT:1 - chr2L 16456709 3' - BS 5011 1 40.41 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTATGTTCATATATGTAGGTTTACCTAGTGCCGAAACAATCACACCATAAGGTAGTGAAAGACTAGGTAACCAGATCATATAGTTGCTAACAGCTTGGAAGGAA:1 - chr3R 22494041 3' + 297 6970 2 73.57 TTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTAATGGTTTCGTTGGAAGTCCTTTTCCCCAACCCGCGAGTCACG:1 - chr3L 14379219 3' - I-element 5003 1 68.38 ACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCATTTCTATGCCTGCATTCCGGCGAGAACAGAACTTTTCAGCTTAGTAAGCATTACTTGAACTTTACTCGGCGTTAGT:1 - chr3R 25844134 3' - hobo 2913 1 53.42 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATT:1 - chr2L 15081066 3' - Doc 66 1 64.38 ATCTTTTCTCACTCTTCGACTATATTCGACTATCATAAGCTGTTGTCGTGTTTCAGGGCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAACCAACCAGCATAGAGGTGTTGTGTCAGTTGAGTTGGTGTAAAATATGCGATAAATACCATTG:1 + chrX 1306789 3' - S-element 1326 1 57.24 GATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTTTGTGATATCCCAGAGAATTTTAAGTAGTTCTCCCCCTCTT:1 + chr3R 15633607 3' + roo 8916 2 71.23 AGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATAATTCCATTCAAACTTTCCTCAGGATTTGCATTTTCATTAGCGAATCAAAGCGGATCGAATTAATGCAACGATCCAGAAAAATGCAACC:1 + chr3R 19170651 3' - opus 144 4 55.48 ATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGTATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATG:1 + chr3R 22341205 3' + hopper 1326 1 75.86 ACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATACTCAGTGCCAGAGACGTGAAAATATTAATGGTTAATATATGTGGTTGGCTCACATAGTCGTTTACAATAATTAAAAAAAAATT:1 - chr2L 7000986 3' - springer 25 2 68.15 AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCTCTTGA:1 - chr2R 14135280 3' + copia 5048 2 68.97 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGATTAACTATATTTCGAGTAAATTTCTTTGTTAAATATGGATTAATATGTGGATTATTCTAATATT:1 - chr3L 17537732 3' - Doc 60 1 58.22 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCATATATATAGAAAATATACACATATGTATATGTACCTAGACGTGCCTATATCCCGCCGATTTTGAGGC:1 - chr3L 16059232 3' + 297 6926 2 63.01 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATTTTCATCTAATT:1 + chr3L 9470018 3' - 412 7123 2 64.38 ACAGAGTCAAATACTTTACTAAAGTCAGTGTAGATGACATCTGTTTAAAGATTATTTTTGATTTGAAAGTTTGTATAATGCTCTCATGTTTCATCAGTTGATCACAGAAAACGTTGCTGAGAATGCTCTTGCCGTGATGCAAGTAA:1 + chr2R 16026029 3' - Q-element 320 2 58.22 TATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTATCTGGTATCCGCAGCCTCTCAGCGAAGAAAGCTGGTCAAATCCAGCGCGACTTTGGGCTC:1 - chrX 18309141 3' - I-element 4913 1 51.61 GAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATTGTACCAATTGCTGTGATCCTCCGCCGGC:1 + chrX 5080146 3' - roo 8877 2 76.80 TGTAGCAACAATCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGTGAAGTACCAAATAAACCAATGAGGCCAACTCCTGCGTTCGCTCGCACTGGCAAATGAAGTGGCACCCAGCCCAGTTC:1 - chr2R 12251650 3' + invader2 4976 2 73.29 TACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGAGAACATCAGCATTAGCCAAACCACACAGCTCC:1 - chr3R 19087921 3' + Stalker 7126 4 77.40 GAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTTAAGCGAGCTAGCATTGCATATATACATACATACATTGCTACATATGGAAGGTGTCGAATAATTAAGGCACAAACAACTAGAATTGGATGTAGATGTCTGATATTCATTTGTGTT:1 + chrX 20864460 3' + diver2 491 1 52.74 AATGACTTTATATAAGAATATTTCTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATAGGTTTGCGAATGATGGAATTTTGAAAGGACATCA:1 - 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Ivk 57 1 53.42 CCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGTATATAGATACATATAAAGCGTATCCTGATTTCCCCCTGCCGTAGGCGCCTATTTTTATTTTCCCATTCACTGCCAA:1 - chrX 18220555 3' + Burdock 6351 2 55.48 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAACTCGCGTCGCACTCATGGGCATTTTTTGTTCGAAAGAATTTCTATCTGTTCCCGAGGGCATTTCCCATTTTTCC:1 - chr3R 8850092 3' - 297 6589 2 63.16 ATCAGCCGAGTTCAGTATTCAAATATTTAAAAATTCATGTATTCATGTTGGTGATATTATTTATAAATATATATAATTCATATTATTCCTCACATTGTAGCACAACTATAAAAGCAAAAAACAACCGGAATGCCTTTGAAAATCAG:1 - chr2R 15557204 3' - Gypsy12A_LTR 1874 1 42.47 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCCAGACGGACAGACACATTTGGGCCCACACACACACACACAAGTC:1 + chr2R 15528539 3' + 1360 3322 1 67.86 CTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGCCATTTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTC:1 - chr3R 4487815 3' + 412 408 2 77.40 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCTAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAAAACATTTTCAAATTAGCTCGCGAA:1 + chr2R 10160632 3' - hobo 1 1 67.62 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATG:2 - chr3R 9125680 3' - Doc 89 1 71.92 TTTTTTTATTTAACTTATTTATGTGTTGATGAAATTTAAATGGACAACGGCTGGCGAGATACAAAATTTTCGAGTCAAGACTGAAAAGTCGGGTCCGAAACTGGTGTTAATTCAATTATGACGGGACTAATAACTAATATGCATAG:1 + chr3R 21706559 3' - X-element 4717 1 72.60 TACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACACAAGAAATATAGGGCGATTCCAACTCGTTTTTGATGAATGACATCCTTTGTCCTGCTGCAGTTGCAAGGCAG:1 + chr2R 13195429 3' + I-element 5002 1 50.34 GATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAG:1 + chr3L 21093231 3' - Ivk 61 1 61.54 AACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATTTGCAAAGGCGACTACTATATAATCACGAAGAATTGAAATCTGTAGTCCAATCATAGTGATACACCCAATAGAAAAGTAACACAAAATCTAAAGAAA:1 + chr4 488318 3' + Quasimodo 59 2 69.86 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACACACCCTGTGAATTCAGGCGGCTCTCTC:1 + chr3R 18399257 3' - P-element 93 1 21.92 ATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATCTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGCAGCATTCGTTTTTGCCACTCTAATCCCTCAGCACTAGATCATCTCTG:1 + chr3R 16110398 3' + 297 6580 1 73.97 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCATGAGATAAAAGCATTAAAAACAGTTTGCATTAGTGCCAATTTCGCAGAGTGTGTTGCTAATTTGATTTCATTCTTTTCGTTGCAAATTGTTG:1 - chr3L 20251878 3' - copia 4895 2 67.59 ACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGAAAAAGCACAAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAATATTTCGCAGCTCCCATGGAAAATCGTAAAAAGTCATAAAATCATAATATAAATCCCATTG:1 - chr3R 6015073 3' + Juan 4159 1 52.74 AGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTAGATAAAGGTAAATTAAAGGTGCAGAGTAATAAAGGTCAAG:1 + chr2R 17014460 3' + flea 4933 1 72.60 AAATAACGTAATTTTTAGTTTAAAGATTAGGTTAAGGAAAATGTATGTATGTATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAGCGCTTTATCTCGCGTCGCCCCATTTTGC:1 + chr3R 20930216 3' + Circe 7030 1 78.77 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACGAGCGAACACACATAAGCAACCCCCGTTACCTGCGAAGGTTTACCTAGGATAGCAGAAACAACAACTATGAGTGCAGCTGCA:1 - 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hopper 1394 1 54.11 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCATATATATAGAAAATATACACATATGTATATGTACCTAGACGTGCCTATATCCCGCCG:1 - chr3L 16059242 3' + 297 335 2 69.86 CAAAAATGCATTACAATTATTACATAACTACTATCTTGGCCAATTATAGCTTCTCGGAAACATCATTCAGATTCAATCCCAACCAGTCTGATGTTAATGAAATTCTAT:1 - chr2L 22689919 3' + Tabor 483 2 75.00 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGCCCATCTGCCCCCTGCTAAAACATTGGAACTCATCC:1 - chr3L 7837112 3' - jockey 4771 1 73.29 CTTAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATATTAAATGGTTAAGAATAATTGAATAGTAATCCAATAAGTACTTATTA:1 + chr2L 13139076 3' + McClintock 412 2 69.18 TATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGAAATGGCTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAATAAAAGTCATTTAATATAGGGCTTACAGCAAAACCAAAGTCAAAGTCAAGAAAAACACGAAACCGA:1 - chr3R 30291025 3' - INE-1 153 1 43.84 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCCTGCCCGCTCGAATTTCGCTTAACATTATTTAAAGGTGAAGTTCTTGGGCCTCATATTTCGAAA:1 + chr2R 25106163 3' + roo 9041 1 65.07 AGATAGGAAAAATAAAAAAAATACTTTGAAATTCTCTAGATTTGTGTGGTGCAGCAGCTTACGCAAGTAATCGCGGAAAATCCATTAGCTGGAATTGATTTTTCGGTTTGCTTTTCAATCAACTTAAATCCTTGCGCCTGCTGAGG:1 - 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flea 4780 2 65.67 CTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGT:1 + chr3L 23678156 3' - Osvaldo 20 1 68.27 ATATTATTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACACTATAACCTTGAAAAGTACTTCTAATTGGCGCAGGGCCAAGTCTCCAGCTGCTCCTTTAATGGCCATCATGCCCAGCCATTTTTGCATATCCTGTTTAATCAG:1 + chr2L 4637335 3' - mdg1 32 2 72.60 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTAAGTGAAAAATATTTTTGCACACTTCTTTCATTTTGTTGGCAATCGATTCGATGGCCATTGC:1 - chr2L 19407005 3' - Doc 29 1 54.79 AAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCATAGCTAAGAACACGTTATAGACACCCAATGCTTACGATCCTTAAGGGCCAAGACATTCAGTAGATGCAATGCGAGTGAGAGGATAAAAAGATAGAT:1 - chr2L 3765525 3' + P-element 156 1 69.18 AAAATCAACTTTCCAACTGCAGGAGTGTTATTATTTTAACCGCAACTGAACTTGAATTAATTCATTAATATAGTTTCC:1 + chr2R 14218729 3' - Tc1 29 1 88.46 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGG:1 - chr3L 22594173 3' - 297 26 2 67.53 TACGGCGTTTATTCTTTCCTTCCATCCGATTCCTAAATTCAGTTAAAAGCGATATTTTTATATATAATTACAAGTTTGAAATTTGCATAAGTCACCACAGTCGGATGGGCAGATCCATTAATTATACG:1 + chr2L 11412157 3' + Max-element 434 1 70.31 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATTCTTTTTCAAAATTTAAAGGTTGTTCTCCAGGACTAGAATGCGTGTTTAAG:1 + chr3R 28450748 3' - roo 8733 2 69.18 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATACATGCACGCAGACACTTTATTTATTTACATTCCAGCCAGATTGAAAGTGACATCACAAAGTTTTGGGGCCAGAAGTTT:1 - chrX 11008288 3' + hobo 2919 1 67.46 TAATAGGGGACAGCTACGCCTATTAAGCGTAAATGTGACATGTTTGCATTTCTGTTCGTTGATTGCAATACGCCAGTTAGCCAGCTAATTCTCCACATCCTCATCGATTTGCGGCTCCTGCAGCCGCCTT:1 + chr3R 20289516 3' - Doc4-element 2367 1 74.62 CTCGGCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACCTATTTTTTAACGAATCCAGTGTACCCTTTTAGTCTACGAGTAGCGGGTTTAGAAATGGAGCAGATGGTATCCT:1 + chr2R 5293308 3' - INE-1 90 1 73.97 CCGCCATAACTAAAAGGAGAAGAAAATCCATAAAGACGCAAAGAAGAAAGAAGACCGCAACCAGGAGAATCTAAAAGAAAATGAGAAAAGGCTAACAAGCTCAAGCGGACAGTTTGGAATGCCTGGCCGGACTGCATATGGTAAAC:1 + chr2L 12586034 3' + TAHRE 272 1 67.12 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCGCACACTGTGCGGAGAAAGAGATGGGGCCACATGG:1 - chr2L 16615779 3' - hobo 72 1 75.38 GTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTATAACTTTTTCTTGAAATATGATTATGTA:1 - chr2L 15013241 3' - BS 4948 1 63.70 AGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTATTCTGATTGATTTCAGTGGACAGTGAGTGCATCGATGTGAATCAGAATGTTATGCAATTTAA:1 + chr3R 11850631 3' + jockey 182 1 57.53 CCCCGACTATCAGATACCCATTACTAAACTAGTGGGAGTGCCTAATGACAACTTTTGCTGGCCACTCGCGATCGC:1 - chr3R 14707217 3' - INE-1 553 1 49.33 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGCAAGTGG:1 + chr2R 21439511 3' - jockey 23 1 54.65 AAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATG:1 - chr3L 15364829 3' - 1360 81 1 73.97 CTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTGTTTATAAATAGGTACAACTGTACCCTAAACAAACAGAAGGGTTGAACAATTATAATTTTATGTTTTTT:1 + chr2L 19160489 3' - 3S18 5780 2 76.03 TGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAATATCGTGTTTGTGGTAAATTAGTTTAAAATGGTAACTAAATCCAGTTTCTAGCTTAGC:1 + chr2L 19140486 3' - Max-element 8250 2 73.97 ATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAATAAACAGAAGTGACCAAGTGCAACGTGCCACTGCCAACTAAATACGTAA:1 + chr3L 7605169 3' + roo 8703 2 69.18 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGAAAATGGAACGGTCCATTAAATTTAGCTGGCCACTAGAAGCGCATAGAATGGAACTCGAGCAAAGGACATCCGGCAGATACAAGATA:1 - chr2R 17332114 3' + jockey 4961 1 54.11 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCTGTTTCGTTCTGGAGTGGTATTTTCTAATTCATTTAAATGTTGC:1 - chr3L 8658732 3' + roo 332 2 68.49 GCGTGCCTTTGCCGATGAGGCCTACTTTTCAAGCGGATGTTCGGTTATTAAAACACAGCGTGCATTTCGGAATTTTGCATGATGATCTTCAATTTCATCCATATAAGATGGCGTGGTATAAGATGGCAGGAACTTTCAGAAGCCCA:1 + chr2R 7394655 3' + mariner2 154 1 45.89 CCGAGTTGTGGTAGGATGAACATTCATAAGGCCCACGAAGCATACGATCATATCCCTATATTATATAGGGATATATATCATATCCATATATTTTAAAAATTGCGGCATTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTG:1 - chr2L 2545707 3' + invader3 5181 1 41.86 CTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAA:1 - chr2R 21848696 3' - Transpac 5001 2 75.17 GGCTAGATCGACTCGGTTATTGACCCTGATCAAGAATATAAATACTTTGAAGGGGTTTCTAACATTTTAAGTATAGTACGGTCATTTTTTAAATCTAGATAGATGGTAAACTAGATTTGTGCAAATGTAAGGAATGTCAAGTCCTT:1 - chr4 857030 3' - INE-1 101 1 67.12 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGGTCGATAA:1 + chr3L 2425965 3' - hopper 72 1 65.75 GAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTATTATATATAAATAACCTTTTAAACCAATTTTGAAGAATCGTCTAATAAAAGCTTGGATCGATATT:1 + chr3L 18801877 3' - I-element 55 1 56.16 GTCTATATTCTTTAGAACGACTTGAAGGCCATTGCTACTTTTCAGTTGATAGGTGTAGTAGATTTTTGTAGTGTATTTTTCATTAAATCTAAACTCTTGAATCTCAGCTTACCCTAGTTAATATTAATATTCAAATAACTATTTTT:1 + chr3R 26746112 3' - Fw3 199 1 54.11 CAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATACGAATGTGCGCTTTTGGTTACCTATTGTTTTTCGCCCTATTGTTAACAACAATTCTGGTGCTGTCCATTATATTCGCCACCACCTCCA:1 - chr2R 16765530 3' - 1360 256 1 58.90 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAA:1 + chr3R 12363802 3' - jockey 4745 1 63.01 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGC:1 - chr3L 21013855 3' - roo 8730 2 65.07 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTG:1 + chr2L 14239217 3' + 412 437 2 68.91 ATAAGAAAGCCGCTCCGCCGCTGCCGTATCCTGCAGCGCAGCTACGCGGCTTAGCCTAAGACGAAATATATTCAAAACTCACAACTCAGACACTGTAAAGACGTTGAACCAAAATATTAAAGAAAAATCAAATAA:1 - chrX 21948993 3' + 412 283 2 72.59 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACACACACACTTGCGAC:1 - chr2R 8666065 3' + P-element 2783 1 14.38 TCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCCGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 + chr2L 9019833 3' + Stalker4 7117 6 66.44 CCAGGGTTCTTTTCAGGCTTTCCAGGCTTGTAAATCATGGAAATAATACCGAGCTTCCACTGTGGAGGGAAGTATTGCTGCCTTATCTTATCGCGTCTCAGACACTCGCCGTTTGTTTGTTATTACATATTTGTGTTGGTTTTGCG:1 - chr3R 15093103 3' - BS3 408 1 56.85 ATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAATCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTT:1 - chr3L 18183102 3' + Tirant 322 2 72.22 TATATGGCCAGCGGCCAGCGGGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATAATTTGCGTGAGTTCACTGAGAAAAAAAAAGTGTTTGATAACTAAAAAGCCTCACAGCATCA:1 - chr3R 22283350 3' - blood 7148 2 54.79 GCGTAGCTGTCCCCCATTAACGCTAAATAACGTCCAGTCACTTTTAATAGGTGTAGCTGTCCCACATTAACTCTAAATAACGTCCAGTTTTATTTCGTTTTTCTTATAACCTAATAATTGATAAATTTTTTATAATTAATACATTT:1 - chr2L 15535019 3' + Doc4-element 2370 1 60.27 AGCGGGGGTTTAGGGGGTGGGGCGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAATCACCCGGCC:1 - chr3L 3453580 3' - Tirant 8118 2 72.17 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTAATCTCTTAAGTTTAAAGATAATTACTTCTAGTTATATAT:1 - chr3R 18528289 3' + roo 330 2 71.03 ACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTTTACGCAATAAACATTAACAAATTGTGCCTTT:1 - chr3R 17458090 3' - pogo 1751 1 75.94 AAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAACTAGCCGGCTGGCAGATGACAAAGTTTCCAGCT:1 + chr2L 5890588 3' + invader3 230 2 51.37 CATGCAAACTTACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAATCGCAGCTGTATAAAATTTAAATAAAAATAAATAATAATAAATAATTTCATCAATTTGC:1 + chr3L 19339411 3' - Tc1 78 1 65.07 AAATACCAATTCAATACCAACTTGTGCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTTTTACATTGCCATCCACATTGCGTTCAGTTACGGTCCCCTTGATTAACACAATTTTCCCATGGAAAAAACCCAACCAA:1 + chrX 7580340 3' + I-element 4988 1 54.79 ATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCGTGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGG:1 + chr3R 24454840 3' - F-element 301 1 73.55 AGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGGATATATGTACTTTCAGGCATATTAAACTGCATACCCAA:1 - chr3R 11513469 3' + roo 8992 2 69.18 GTATCTTCGGAACGTGAATGTACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAATATATATTTAATTGATTAACTTTATATTGCTTACATTGAATCGGACTTCATGCTCACCATCCTGCTGGT:1 - chr3L 13175967 3' + Doc3-element 4425 1 52.74 CGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAAC:1 - chr2R 4577078 3' + Chouto 459 2 65.12 AGATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGGTATACCTTAGCGTCATACAAAAAAATAACACAAATTCGTCAAAAATCAAAATCGAATCACACAAA:1 + chr3L 18419051 3' + Stalker4 6924 2 67.81 TGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTT:1 + chr3R 15790090 3' - flea 4765 1 60.96 GCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAA:1 - chr2L 9275018 3' - F-element 100 1 78.62 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAACAAGAAAAAAGCTGA:1 - chr2L 17295794 3' - Doc 20 1 66.67 CTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCATGCAAGCTGTTACTTTTCACTAAAAATAAA:1 - chr3L 20224093 3' + Chimpo 167 1 72.60 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCAAATGGCCCACACCCTCAACCCGT:1 + chr3L 18183241 3' - Tirant 9 2 80.14 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATACAAAGATGTATATATACACTTTTTAAACATTTGCAAGATAAACCTTTTCGATCAAAATTATGATATTCTTTGGAAATTCTTGAATAGTATCAATAAACTAG:1 - chrX 15454635 3' + 1360 3368 1 71.92 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGATTGCGATTTCTTCAGTTTATTTGGGTCTGTTTTAGATTCGAACTTCAGAATTGATTCATATTACGCATTTAAATTATTTAAACCGTTCAGTTAGAGTTTCAAATTCGTTGCATGCT:1 + chr3R 20840214 3' - roo 5 2 79.45 TCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCA:1 + chr2R 1923562 3' + pogo 2028 1 67.81 ATCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTACACTTTATGACATATTATGAAGAACGTTATTACAATTAATAAGTATTCTTTGGGACCTTTTATACATTTATGTCGCGCAACTTGGTAACAATAATAAA:1 + chrX 20870299 3' - G6 23 2 55.48 GCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGATTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCCTTTTTAAATTTGATTGACGTTATTACATTACATAACATCGCACACTAAGAGGAAAGGCGAAG:1 - chr2R 22753994 3' - G2 2901 1 51.85 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTTACCGGTTAAACGCCAAGGTCGCAGTTTGTTGGCCAACTGCCACCCAATCGGGCAAA:1 - chr2L 18522238 3' - roo 62 2 60.27 TTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGCCACTAGCAGTTTGACAGCCACTGGGAAGTGTAAAAGTAGGGGGCTAGAATGTGAATAACATTTAGTGGCG:1 - chr3L 2425863 3' + hopper 1371 1 52.48 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATTAATCAATTAGTGACCTTCAGTGCGGCCCACTTCCCACGACTCT:2 + chr3R 14986161 3' - jockey 4751 1 71.23 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACCTTTTCTTTTGGCCAAACTTTCTGCCCCCGTCGACGTCACAGCTGATCGATTTGCTGCACTCGCTCGGCGATTTATCCGCCTCCTGGCTTTGCCTGCTTTTTCGATTTTTC:1 - chr3L 20497677 3' + P-element 2882 2 80.56 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAGCCACGCCCCGTCGCAGTCCACAAAATAGTGTTTGCTGCACAGCTTGCCGCCTGGGGGTATGCAACGAAAAAAGGATGAAAAGCCATGGAGAAGGCAAAAACTT:1 + chr2L 795199 3' + jockey 4970 1 72.22 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGTCTTGAAAAAAGAGCGAGGAGTACACACGAACACAAAAACGATTACGAATACGAGTGGGACGTATATATGTGTAGTGC:1 + chr3R 25050121 3' - 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chr3R 7585681 3' - Doc 23 1 73.29 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGCTGCTCCTCCGAGTTCCAGG:1 + chrX 388325 3' + 1360 3371 1 58.95 CCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACCTAGTATTTAACGTTCTACGTATTTATAATAATCAGTCGGAAACTTTGAATTTCACAAGGATTTTCGAAACAGAATAGCCCAGAAGGAAAATAGTTA:1 + chr3R 25277739 3' + 3S18 314 2 71.92 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATAATTTTTCACTGCCGATTCGCAATTTTTCGGTTTATACTTGGAGTGTG:1 - chr2L 19652473 3' + roo 400 1 75.71 AACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTAAACACGTGAAGTATCAAATAAACTGAAACTTATGCGAGATATTCGGGCTTTGGAATCTTAGGATTTTTATGCTAAGGGTGGGTGGGTCAGTTGCATGCATTTATAATAATGGG:1 - chr2L 22075076 3' + invader2 5005 2 62.33 GTCAGCAGAAGCTGACGCTTATCAAAAAACCTATCTGTATACTGTCATCACACAGTCATCATTAGGAATATTCGGAGCGGCCGATGCACACAAGGTGGCAGCGGCATCATTACAAACTTGTGGAGTTTCTATACCATCACTGGTTT:1 + chr3L 23213102 3' + X-element 4539 1 78.77 AAAACAAAGCGAAAACAAAAATTGCTTTTTGGCCGCTGTCGTAAAGTAATCTTCTACTTATTGAACAACCGAGTAAATAAGGTAAATAGGTCTGGCTAAAGCAATTGTCCCGCAAAGCTGACACA:1 - chr2R 9834139 3' + gypsy4 492 1 73.60 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATGTGTATATCTCGATGTATACCTTTAAATATAAAACGAAACAAAGGAATTTCCATTGAATATTTACTCTCTACAAGCATTTTGCCATCTAAGCTAGATACA:1 - chr3R 19139330 3' + pogo 2087 1 74.66 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATTCACTATCTCTCCGTTTGTGAGGCAACATGCCAATTCGAATTAGTTATTGACTTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGT:1 - chr2R 21848650 3' - Transpac 37 2 53.42 GACGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACGGTTAAAACAACATACAAATTAAAAATACACCCTCCCTGGGTGGCGGCAGCAGCAAGAACAACAT:1 - chr3L 8395927 3' + gypsy4 464 1 70.55 CCAGCAAGGGAAGGTTACCATCCCGAAGATTAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGCGGGGCGAAGAACGGAATTGGAGTTTCAATCAATC:1 - chr3R 7128353 3' - Ivk 450 1 74.66 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGATTTTCAAATTCACATTACAAACAAGAAATGCTTGTTTGGGCTTTGCTGATGGGTATCGTGTTAATATCAGTTGGAATCATAGGCATATCCGTTAAA:1 - chr3R 4190855 3' - pogo 22 1 70.55 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAGATTTTTATACAAAAGTG:1 + chr3R 11151934 3' - mdg3 34 2 60.96 TACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGAAAGCTTTTGTCTCACCTAAATGAAGGCGAATTCGACTTCACTTTGTGTAGACTTTA:1 + chr3L 22642069 3' + hopper2 1561 1 54.48 ACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACAC:2 - chr3L 7837173 3' - jockey 4832 1 61.64 AGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTATTTCACTGCCAATTGTTTTTCCCGGCCAGACACGCCGC:1 - chr2R 11095699 3' - diver 21 2 68.49 TTTCGAAAATAAAGATTAAAACGACATAATAGGCAGAAAAAAATGTTTATAAGTGTGGGCGTTGGAGTTCTGGGCGGTATAATAAAATATCGAAACATTTTTAATAGTTTGGGCGTGGCAGTTTT:1 + chr3R 4322610 3' - HB 1469 1 54.40 ATTTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTGCAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGTAATATTGCGAACTCACTCAGCGCCGTTTT:1 + chr2R 6493164 3' + transib2 2735 1 76.03 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCAAAGCAGTTAGCGTGTTTAGCAGGTGCCCGAGGCATTCCTAATGACGCAGCACATCCCCGTTTCTCTCCTGCGACCTGCTCCACCGATTCTTCTGATTCCTCAGATTCA:1 + chr3L 8658869 3' - roo 10 2 79.45 GGCAGATGGCATACAGTATGGGAATCAATTTAGTGCACTATGGCTTATTGTTCTTTGAGTTAGCTGAGCTGGCCAATTTGGGTGGCGCTAATATTCAATTAACTGAGTATACTTTAAGTGCTTAATGGACTCGGGAG:1 + chr3R 20771918 3' - 17.6 132 2 78.10 TACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTTTGCCGATAGCTTCTTCAATATTGATAAACATGGGCCAAACAACAGTTACAGTTTCAGTATAATACTCTTAATCCTCATA:1 - chr2L 10514218 3' + 1360 3382 2 73.97 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATACACTTTTGCTTCGTTGAGCAAGAATGCTTGTTTTTTACATTCCAATTTTTGGTCCATTATTTATGGCTGCAAATATTCGCAGAATATGCAGCGATAAAT:1 + chr3L 2320750 3' + roo 385 2 70.55 GGAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAAGAACGCACAAAATGGAGAGTAAACAAAACACAATTTACTGCCCATCTGACATAATCTCTTGGTTAAACATTTCCCCAGCCAGTTGCCTGGCTTCCATCTC:1 - chr2R 7785073 3' - Cr1a 262 1 53.79 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATATATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAGCTCAAAGCTACTATTACTTTTGGGTTAGTGT:1 + chr2L 16562186 3' + opus 484 2 58.82 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGACACGAAAAACGGAAAGCGAATGTATCTGAAAGATACGTTTAGTCTATTT:1 - chr2L 17260724 3' - P-element 43 1 46.67 ATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAAACAAACGGAAAGAAAGTGGCAAGACAACCTACCAGCTAAACTGATCTGGAATTGAGCACACTCAGTCAGCAGAAACAAAACAAAAGCCCCAC:1 + chr3R 13767353 3' + I-element 310 1 67.81 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATATACGAATTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATG:1 + chr2L 15777875 3' - 297 6608 2 61.54 CTCTCTCTTTTGAAAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAATATATATGTACGCACATGCCGGAGGCT:1 + chr3L 27350097 3' + invader3 5341 2 78.40 GCGTTTAATTAAGCAAAAAACTCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAACCTTTGTTATTACTATTGATTGTTATGTACTATTAAAGCTCACGCCTG:1 - chr4 968712 3' - S-element 71 1 66.44 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCTTATCTTCTCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACT:1 + chrX 21667924 3' + opus 447 2 68.70 CTAATACTTGGTTGGATATCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCTACGCGGCATGGAGTCCATCAGGTCCTGGCAACGTTTGTGTGCATATAAGGAATTAGCCGGCCAAGTACGTGGCACATGGGGCTCCATTTCCCAATTG:1 + chr2R 21468277 3' - HB 1329 1 58.62 CTAATATAAAGCCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTCCTAATCTATTTTCATGCTCTTCTGCAGCTTCCATTACAATCCCAAGGGCGTTTCGTCGTTCTGCAAGCTGCCCATGCTG:1 - chr2R 17777977 3' - 1360 380 1 53.57 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCATTATGTATCATTATGCTTGATCATGATAAGAATTAGTGACAAGAATTAAACTTGAAATGTCAAAATATACATATTTGTATATCTATATATTTTT:1 + chr3R 7515422 3' + copia 232 1 60.96 GCGACATCCCCGACCCCGTAAATAACCGATTCACTTAAATCCACAACTGCACATTTAGATGTTACCGTAGTGTTATAAAAAAAATAGCGAGGAAGGGTAAGATTTAAATTTCGAACACTTCTTTGGCGGATGGGATTGGTGG:1 - chr3R 20055159 3' - aurora-element 4030 1 71.83 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAACCGTCTATCTATTGATCGATGGAAACCGGTTTCTGTGATAAGTCTTTGCTTTCGTCTAAGGAGAA:1 - chrX 4673597 3' + roo 9037 1 53.60 CCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATATGTTTATGTATTTGTGCGTTGACCAGGGACATTTCAATAAATCTGCCAGGTGGTG:1 + chr3R 18635310 3' - opus 7161 4 61.65 CAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCG:1 + chr3L 23678155 3' - Osvaldo 31 1 74.07 CATTTCAATATCCGATTCTGAAATGGAATCGTCTGATAGTGCCTGTATTAGACGGTTGTTCGTCACGTCTCTTGGGTTAAAGTTGATTATTGCTGCTGTTATTACACTTATTGTTCTTGTTCGAGTTCACGGTGTTGTTGGGTCTT:1 - chr3L 5479229 3' - Bica 4548 1 58.90 ATAAGGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATGATTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTTTATTTAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTATCCCCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAA:1 + chr3L 10590622 3' - 1360 375 1 58.90 GGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAACATTGCGGCAGCAAAATTGATCGTGACACTCAGATTGCTCTTATCCTGTTGCAGTGGAGGACACCAGCGCAGCTTCTC:1 + chr2R 6669332 3' - G2 2978 1 57.14 TGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATATAACTCCGGCAAGCGCAGTAT:1 + chrX 21772524 3' + gypsy3 6583 4 50.68 ATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGACCAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCGATTCAATGCAGTGTGCTTTGGGTCATTCTCTTGCTGAAGCCAATATATGTACATTTTCCATCCCCAATTTTTC:1 + chr2L 21911719 3' + Doc 167 1 54.48 GACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGATTAGAATTACTTTTAGAAATATACAAAAGGACACTCGCTATATACAAAAGTGCTATAGATAAACGATAAACGCT:1 + chr2R 14277656 3' - mdg1 7298 2 50.68 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGG:1 + chr3R 22494167 3' - 297 6616 2 68.09 ACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGGCTCCGCAGTCCAAAACGCAGAGCTCAGGACTGTGTCCCTCCATGTCCCGCGCTGCTGGATTGTCCCACCGACATGTCCTG:1 + chr3R 17733394 3' - INE-1 548 1 70.91 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATTTTCAT:2 + chr3L 9470012 3' - 412 7129 2 68.49 GATCGACTGAGCTATTGATCCTGATCAATGGAATACACGGTAACTTCTACCTGTTAAAAACTTTTCAAGGAATCTAGTATACCATTTTACTCTACACTTAACACTTTAAAGTGTTTGCCCTAAATCGCTAAGCTGCTTAAAGAGGA:1 + chr2L 12157218 3' - INE-1 96 1 50.00 GCTGCACCCGAGAAGTTTTGGGATAATTTGGTTATCAGCTGATCGTGATTTCAGTTATATATTTTTTTTAATAAAATAGTCGTGGAGTCAAGTCGTGAACAGTTCGGGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGTTCGTTT:1 + chr3R 9407794 3' + Gypsy12A_LTR 151 1 78.87 AAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTGTTTATAAATAGGTACAACTGTACCCTAAACA:1 + chr2L 19160452 3' - 3S18 46 2 52.86 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGTATCAACATATTACGGCATTTATGGTAATTTTATTGGTGCTTTGATTC:1 + chr3R 10150230 3' + 1360 3317 1 73.97 CTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTATCATTCCATCAGCACCTCATATCGGGCTTGCTGAACCGAAAATGAAATGATCGTAAAAC:1 + chr3L 13734809 3' + jockey 4734 1 55.64 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAAGCCATTCCCTCGCTCCCTGCTCCACAGCGGATCTGAACAATGCTGAACTTGTTTCCAATG:1 - chr3R 23161213 3' - 412 10 2 77.40 GAGTCGATCTAGCCATCTCCGTTTCTCCGTATGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTATATGGTAAAAAATGAAATATATATATTCCAACAATTGTTGAGAAGTATGTATGAGGCCTTTCCGAACCTGTTTC:1 - chrX 22905200 3' + INE-1 109 1 49.30 TAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACACTGGACCGATTCCGAGGGATCCGAGAAGTCCTCCCTTTGCAACTTGTTCAACTCC:1 - chr2R 10910158 3' + Tabor 474 2 77.40 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAACGGGGAAAACTAGTACATGCACACAATTTT:1 + chr3R 12363832 3' - jockey 4705 1 60.29 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAATAGTTTACCGCCTACAGCCCTTT:1 - chr3L 12433418 3' + roo 9028 1 56.25 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATG:1 + chr2L 5792102 3' - blood 14 2 69.03 AGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAATATGTATATATGTGTGACAGAAAAGAGACTAAAAT:1 - chr2L 13138995 3' - McClintock 75 2 77.24 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAACGGGCAAACCGATGGAAATTTCTGCCTTCATGAGGCGGCAACAGGTTACACAGCAGCATCAATTAATTTTTTTAATAACCGAC:1 + chr2L 12144319 3' + transib2 2786 1 57.93 AACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGATAGCCAAATGGAAAACACTCTCTCCGATGTGTAGAGTATAATAATCAGGCTAACACACTAAAAGGGG:1 - chr2L 17295557 3' + Doc 277 1 54.93 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCGGCTATATGGCAAAGGATGTGGAAAG:1 - 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chrX 1096430 3' + Helena 1277 1 77.45 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGCTCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGACTATTAATGCTAGAATTTTGAGACAATAATATTTCTAAACTTGAAATAGTTGAAGAAATAAAATCCAAGGAATTTGA:1 - chr2R 25217508 3' + INE-1 92 1 62.76 TGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCAC:1 - chr3L 7837178 3' - jockey 4799 1 52.78 TGTGATCTCGTCGTTCATACGGCTATAATGAGAGCCAATTCTCTGAATTATTTTATTAAATTTTTTCCAAAAAACTAAGCTATTGAATGTATTTCGAGATTTTGGTGAAATCATTAAGTAAATAGTACAATTTAAATATATTCACA:1 + chrX 19326714 3' - INE-1 135 1 76.03 ACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCGATAAGAGAGGAT:1 - chrX 388218 3' - 1360 45 1 55.48 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACAGTTATCGTTTAACGTCCCAATGAAAGACGAAGCGATTATTGC:1 - chr2L 22724064 3' - pogo 40 1 57.24 AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGTATGCTTTTAAATTTTAAACAGTTTACCATTCATAACTCCCCCTGCCA:1 + chrX 7384988 3' + I-element 5285 1 65.28 AGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTATCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCATTCAATTTGTAACAATATCTACAAAAATATTTGCCTATATATTGCTATTCGATT:1 + chr3R 15593201 3' + R1A1-element 276 1 63.01 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACACGCCAAACCGAGTATCAAACATGGAAATAGACGCAAAGGGGCGAATAAAAAATAATTTATTACACA:1 + chr3R 24564847 3' + opus 7462 2 54.41 AATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCATTTTCGAAGTTGAAAATAAACAAGAGTAGGGTCTTTAAAATATCAAAATTTTAAGCAAAGTCTTTCTTTACGCTTTACACTCATTAGCACGCACTTTCATTGGGGTCAGG:1 + chr2L 9592177 3' - 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Tirant 8135 2 51.00 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTGTTTATTAAGCACTTACACTTGCGCTATGTTAATCTCCCTAGAATATACATCCG:1 - chr2L 4637199 3' + mdg1 7392 2 62.33 GGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGT:1 - chr3R 11151833 3' + mdg3 198 2 67.92 CTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCATGAGATAAAAGCATTAAAAACAGTTTGCATTAGTGC:2 - chr3L 20251934 3' - copia 4952 2 76.71 ATAATCGAGTTCCCCGACTATCAGGACTATCAGATACCCGTTGTAACTCAGCTAGTGTGAATGCGAGCGCGTTTTCGTAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGCGTTTCCACTGCCAGCATTCCGTGCTT:1 - chr2L 10558389 3' - INE-1 564 1 82.27 ATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAATAGATTTAAACATGAAAAGTGTATCAAAGGGATGCTCATTTTTTTTCCCGCCCAACTAAATGGGCTGTGTAAATTTCTCAAGATCT:1 - chr3R 25424630 3' + Dm88 4211 1 54.78 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGCTTTACAAAGTATAGTATTGTTTATCTGCTCTTATCAA:1 - 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pogo 79 1 70.55 CAATATTATTATTATTATTATTTGATAATATATAGCAGCTGTTCAAATCATCAACAAGTATAAAATTGAAAATGTTAAAAATTGAAGCAATCTTGTTTTTGCCTGCAACATGTTGCTGCCGATCGT:1 - chrX 15626644 3' - mdg1 7072 4 50.00 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATATAAAATCTGTTACAGATTTATGTAACTGAACAATGTAAATGATATGCTTATCGTGTGATTTATCGAACATAATTCAAATGCAGACTTGCG:1 - chr2L 8578044 3' - 412 7092 2 57.93 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTATATAACCCACCGATTCCGGCCCTCGAGCACATGCATCTCGACGTC:1 - chr3R 19435995 3' - roo 33 2 55.45 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTC:1 + chr2L 3231953 3' + roo 8998 2 67.12 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGACTAAACATTTTGGCTGTGTATGGGTGA:1 - chr3L 18381898 3' + copia 240 1 60.27 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCAGTAAAAAACCCTCAAAGCGTAGCGGATTTTTCATTTGGAATAGAAAATCCCAAAAACCAAAGGCCAATGAT:1 - 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chr2L 19691257 3' + roo 8989 2 74.66 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAGTTTTGCTATGGCGTTCTATTTTAGTACTGAGTGTTTTTTTTTTTAATT:1 + chrX 17565258 3' + 297 6952 2 57.28 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCTGTTTCGTTCTGGAGTGGTATTTTCTAATTCATTTAAATGTTGCTAATATTTA:1 - chr3L 8658723 3' + roo 341 2 62.33 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAAT:1 - chr3L 16015239 3' - 1360 71 1 67.12 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGCGTATATTTCTGCGATTATTTTAGG:1 + chr3R 25751918 3' + roo 9047 1 66.67 CTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGAAAATACGTTTGAAGATTTGTTTCCAGTGCATGGCCGCAGGCCTAGCGAAATGTCTTCGATTTCAAA:1 + chr3R 28117113 3' - hobo 17 1 72.86 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGGCTTTGACGTCGTTGTTTTTCCCCTGCTCGTCATGTTTTGTGTGCTGTATAGATATAGATATGGATATATAGTATGCCTTTGCCATTTCGCC:1 - 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chr2L 19652517 3' + roo 9013 2 57.53 ACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAAACAAGCATTAACCGTGTGCATCGTTACTTCTGTAGCTAAGTAATTTAAATAGTTTAATTTTCGAGTTTAAATAGTTTAT:1 + chr2R 6673471 3' - BS 5055 1 54.79 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTCTAACTCTGAGGATTATGACTGTGACACATTGTTTCG:1 + chrX 10579976 3' + pogo 2037 1 71.32 ATACATACATATGTACATACAATACATACATATATTTCGATCGGAAAAGCCTAATTGACCTCTTGGACATTGGCAAAGGTGTAAGCCATGTGCAGAGAGATCGAAGCCGAAGGGGGTTGGCAATGGGGAGCGGGTATGGCCAGTTC:1 - chrX 6863121 3' - invader3 5086 1 78.08 AACCTTTAATACAACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTTATTAATTTTATTCAGTAAATACGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCATCACATTCCAAGAACCCTG:1 + chr3R 25599526 3' - Tc1 294 1 78.77 TGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTAAACCCTGTCCTTTGCCGATTTAATTATGATAGCTATCTTTTGAATTCCCAGAGATGGTAAATCAATTGCTATCGGAATTAAGCTCCGAG:1 - chr2L 11296121 3' - 1360 32 1 62.33 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGGTTTTGGTTTTTTTTTTATTTCAATAATTTAGGTCATTTAAAAATGTACATTTACAGTATACATAATCCAACACGTATGTATACACAAAACTTCATAAATAATATAAA:1 - chr3R 20840008 3' + roo 399 1 79.17 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTCATAAAATGACCAGATTGTTGGGAAAAAAACGCTAACGTGGCTCTTTTTGAAAATGCATATAAATTCCTTGGAAGA:1 + chr3R 26486137 3' + 412 7501 2 54.79 GTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACT:1 + chr3R 10030770 3' - BS 5075 1 66.67 AAAGTAAATTAAAAAATAAAATGTTTTGAAATTGCCTTTGTTTTAGTTTAAGAGTAAAAAGCGTTATTTTTATAATTATTAGATATAGTCTATTATTCTAAATCTGTAGATCAAAGAATATATTTTATTATTAAATCACTCAGCAT:2 - chr3L 18080982 3' + HeT-A 309 1 59.59 ATTTCGGTGATAGTGTCTGTGTTTAAGCGAGCTAGCATTACATACATATATACACACATACATTGCTACATATATCGTTAATAGAGAGTTATGAATTATAGAATATATTTGAGTATTGCTAAAATCCCACCTGGCTATCCCTGG:1 + chr2L 16302253 3' + diver2 499 1 54.17 AAGCTTTTAAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGATCGAATTAGCTACCGTTTACACATATATATTTATCCGTTGCCAGTGCCCGCTTGGTTGCCCTGCTCCCTCATCGGGCTCT:1 + chr3R 17797583 3' - 1360 3008 1 59.29 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGGGAGAACTAAATAAAGCGATCCATCGAAAGCTTTTGGAG:1 + chr3L 2192332 3' - jockey 4758 1 75.34 CATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTA:1 - chr3R 14049337 3' - transib2 29 1 53.70 ATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGGCTATAGATTCATTCTTTCTTGTTAGAGATGGATAAATGTTTTGTTGTCCGCCACTGATTTCGTCCCTGG:1 + chr2R 5439244 3' + INE-1 498 1 63.70 AGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATCAAGCAATATCTTAAAACAACGAAAAATAGTAATACAAGTCATATATCATATATCAAAGGGAAAATGGTTTGTATTTAAGCTATAGGACCAAGGAAG:1 - chr3R 17586794 3' + Max-element 274 2 65.07 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCTACTTCGTGCACACACAACTCGGCAAATCCTCCTCTCTCGA:1 - chr3R 31724874 3' + P-element 2823 1 34.11 TCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGCATAGCTGTTTGGACAAGGATTTTGTAAAAGGAAAAGTGAACTACTTGAATTTTAATAGCTTCAATCGCATAGCA:1 + chrX 17985981 3' - hobo 2584 1 53.10 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCCCGCCCCTAACCACCCTTCCATTAGTTTTAAACCAGCTTACACCTTTC:1 - chr3L 9469908 3' + 412 461 2 60.00 CATTGTAGATCTAAATATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTTTAATAGACTTATCCTATCTTTATCTTTTTTATTTTTATCTTGACACATTGCGTGCTGATGAGGCAAACGGTAAGGGCATATGCCTGTATT:1 + chr2R 9820644 3' + Cr1a 4154 1 53.42 TAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTA:1 + chr3L 7801278 3' - Transpac 195 2 76.03 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGGCCTCGCGGTGTGCTGTCCGCTCTGCAACTAGGT:1 - chr2L 22319230 3' - Transpac 26 2 65.07 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTCTTGCTTTCCGGTTTTTTGCAACACGAGC:1 + chrX 21403494 3' - roo 8720 2 57.93 AGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTAC:1 - chr2R 5070931 3' - gypsy5 24 2 26.52 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTTGTGCGAATTTTACTTT:1 + chr2R 11146160 3' - Quasimodo 23 2 69.86 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTGGCATGCCCATTGCTTCATA:1 - chr3L 7791869 3' + Transpac 5190 2 57.24 ATAGTTCATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAAGGGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGGCGCGTAGGCGTGGAACCAACTTCGCCCGTCA:1 - chrX 11896550 3' + blood 6957 1 78.08 ACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCT:1 + chr3L 15099685 3' - G4 3803 1 58.70 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTATGGA:1 - chr3R 13225469 3' - hobo 19 1 65.81 CAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACGTACAAGGAGGAAAGGAAGGAATAAAAAGAGAGGTATTCTCTCACAATATTTTTAATTCGCGTATGCTGCAATTTCTGTTGAAT:1 + chr2L 1542779 3' - copia 162 2 72.80 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCT:1 - chr2L 21153502 3' - 1360 71 1 72.73 GTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTT:1 + chr2L 18112584 3' - transib2 2611 1 59.86 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGTTCACAGGTCACTGTATCAGTATATCA:1 - chr2L 3960184 3' - jockey 75 1 63.70 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATTAACTCATTTATTTTTCTCTAAACTTTCATTAATCTAAAGTCGGTAGCGTAATTTGTCTATTAG:1 - chrX 8977433 3' - I-element 57 1 55.48 GTAGGTCCAGATGGGCTTGAGAATTGCCTTGTACACCAGGATTTTGTGGTTCTGCCTTAGCTTGGACCCTCTCCTATTAATATTTATCAATATTCAATATTTCCTAAAATGCAGTATCCAATTTCTATTTTGTTCAATTATTATT:1 - chr2L 21870678 3' - G2 2648 1 51.03 GCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCACCTTACATTAAAAGATCAGTTGAACAAAGAGCGTAAAGTG:1 - chr2R 5505211 3' - pogo 1706 1 68.99 CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCG:1 - 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Doc2-element 4453 1 67.36 TTTGACTCTGTTAATCATTAGCTTCTAATAAGAAAACTTGATCTTTGAGGTTTCCCTGTTGATCTTCTAAATTGGTTTAGCAGTTGGTTTAGGTGTGTTTCTGAGAGTTGTGGGACTGCCATGATGTCTTTTAGTTTTCTGGTGCT:1 - chr2R 2996277 3' + Q-element 331 2 51.37 TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAG:1 - chr2R 21690475 3' - 412 77 2 70.55 AATGTAAACTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTGTGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGGTCGAAGGAGGTCTATATATATGCACGTAATTTGACTCGTGTA:1 - chr3R 6171131 3' - rover 7026 2 73.29 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGCAGAGTTTTCATTGCCGTTGTTGGTTCGATTGATTTTGGGTTGATTACCTGCCTTATTGTTT:1 - chr3R 7598811 3' + 297 332 2 57.53 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATAAACTGTGCCCTGTCAAATATTTATGGGTTAAGGTGTTCAAACGCTTATCAGGGTAGCGTTAAGAGCCAT:1 - chr3L 12835984 3' + 1360 3356 1 55.91 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACACACACACTTGCGACTTGCTCGAATGCCGATGATTGCTCTCCCCTTCCTGCGTGTGGGTGTGTGTGTTGTTCTGGCGTTTGCAATCAACCTTCCTGCTGACAATTGATGTTT:1 - chr2R 8665972 3' + P-element 2883 2 76.22 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGTTTAGCAAAACTTGAAGTTGAATGTATAAATGTAATTTTCGTTATATTTATTTTGTGCATTTCCCT:1 + chr3R 6422924 3' - jockey 63 1 52.05 GACATCCTACCGACTGCGCCAGGATCTTGTAGTGTGGATATGCCCGGTACCTGAAGTACGGTTGGTAAGTGGCCGGGGAATGCGGTCTTTCCGCCTGGAATAGA:1 + chr2R 23210526 3' - Tirant 418 1 79.81 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTAACCCCTGTTGAGAGGCGGCAGGATTCTCGTCCGTTGTTTGCTTAAAA:1 + chrX 7741968 3' - hobo 51 1 61.60 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATCTTTGAAGTTGGGAGCCACTTTTGAATTTGCCTCCTAAAGCGGGACAACTATAATAGCATAAAAC:1 + chr2R 9607215 3' - pogo 50 1 53.79 TATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACAAGTAAATGGTTTTGGTATGAAAAGTACACCTTTGCCACCCAAAGTATTTCAAAAAATAATTGATATTGAGTTGAGCCGACATTAAGTGGAGCTCTGA:1 - chr2L 11554393 3' - roo 8734 2 62.33 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAATAGTTTACCGCCTACAGCCCTTTGAATGTTTATCTCATGAATTAATCAATA:1 - chr3L 12433390 3' + roo 9038 1 60.96 GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCATTAAATAACATCAAAAATGTGCGGTGAAAGTTATCTTCGATTTGAGTGTATAT:2 + chr3R 13349635 3' - Ivk 11 1 76.55 AACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGAATGAGAAAGCGACATAATGAAAAGGGAATGACAAAAATTGAGAAGACAAAAATGTGAGCTGCAGGCACTGCCGAGGGGCCCCAGGATCGAGCTCTACTGTTTCCCATTGCGGCCCAA:1 + chr3R 12779418 3' + micropia 5208 1 47.26 GTCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTGCGGGTGGCCAACCCAAGCCGAGGAGAAAAACGAAAAACCCAAAAGTTACTTGCGTAAAATTTGATAAATTCCGGCTAAGGCTCCAGAGCCTCCAGACTGACGGCAAATCTAAT:1 - chr2L 17635692 3' - accord 7031 2 71.23 TACTTATCTTATAATTTGTTCGCTGATGGACAAACTTGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATTAGGTGCATCCGACGATTTTGATTTTCTCAACAGTGTAGTACTCCTTATAAAACAGCAACTAAAAATGCGATAT:1 - chr2L 12928979 3' - GATE 322 1 49.32 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCACATTAAATGAAGGG:1 + chrX 6633057 3' + P-element 2842 1 54.79 TCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGAATCAGAATGTGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGTATATTTTATGATCAAAAACAATGCA:1 - chr3L 14954390 3' - transib2 2563 1 64.38 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACGAAAACAGAAATTTGAAAACATCTATAAAAGTAGCATCTCAAATTAAGATAAACTTTTTTCGTTGCAGTTTT:1 - chr3R 5422837 3' - roo 8712 2 52.74 TCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAACCTTTATGGTGTTTAAAGCAGCAAACAAAACTGAAACAATACCAAATTCTA:2 - chr3L 15364766 3' - 1360 18 1 72.60 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTGGTATAATATCGAGTCCGCAAAGGAAGCAAAATGTGATTAGTCATGTCAATATCATAAATGTG:1 - chr2R 12371052 3' + I-element 5301 1 54.79 ACACACACACACACATATACACACAGCCAGGATCTGAAGCTGTGTGCAAACAGTGAACATGGCCAAAAGGAGCACTGCCAGCGGGCCAAGATGGAAAAGAAAAAAAAAAATAAG:1 + chr2R 9541062 3' + accord 7033 2 56.14 TAAAAAAAGAACAAAAAAAAAAACAGGGTTTACGTATAGTAAAAAAATGT:1 - chr2R 18151483 3' + Doc 4703 10 94.00 CTTTTACAGTTCCTGAGATCACACCGTTCATATAGATTGACATACGGCACAGGAAATAACGCACACTCTTACTCAAAAATAGCAGTGGTCAAAAACGAGTTCACTTAAAACTTTTGTGAAATGA:1 + chr4 389359 3' - INE-1 148 1 69.35 ATTTTTTAAAACCATTTTTAATAAACATTCTATCTATTATGGCAGCCTTTCAATGAAAACAAATTGAATTACTAAACAAAAACAAGCTAAACCGTAATGCATGTCTTCAGGGTCAACTAACATCGATCAAACGCACCGATTTGTAC:1 + chr3R 18421007 3' + Juan 3782 1 67.12 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTTCGCGAAAAGAAATTCTATATATGCCACCTTGAAACTTCGCTTATTTTGCGTACCATTCCATT:1 - chrX 10579882 3' - pogo 51 1 56.85 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGCAAATGCCACCCATTTTATCGTTATTTACTTAGAGGATTTGGCTTTTGATACAACACATTTGTTGGATTGTTT:1 - chr3R 13838168 3' - 297 22 2 69.86 GTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAAAAAATATATGTTCTCTAATTAAATGGTTTCCCTTTTCT:1 + chr2L 13305874 3' - roo 8914 2 70.87 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTAGTACCTGTACTTGCTAAAGACGGAACGAGTCAGCTGTTCGCCCGTATATATTCATATCGATTACGCAGAAGACACATTAGAAGATCGATTAGATTATCGATTATCGCC:1 - chr3R 8217876 3' + P-element 2881 2 77.70 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCA:1 + chrX 7706797 3' - P-element 102 1 15.75 GATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGATCGGAAACATGCTATTGATCCCAAATTCTATCAACTTACACTA:1 - chr3L 6095484 3' - transib2 75 1 69.86 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAA:1 + chr2L 17626671 3' + roo 8998 2 71.23 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAATAGTTTACCGCCTACAGCC:1 - chr3L 12433422 3' + roo 9006 2 64.38 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACACGCCAAACCGAGTATCAAACATGGAAATAGACGCAAAGGGGCGAATAAAAAATAA:1 + chr3R 24564836 3' + opus 455 2 55.81 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTAATTATTTTTAAATAATGTTTAGGGAATTATTGTTACGAGAAACCCTTGCTTCGCCAACGCCTTTACTTAAATGTCCCCAA:1 + chr3L 14375739 3' - roo 40 2 58.90 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAAACAGGCTAACAAACAACATCAACAACAACGCCGGCGTATTCATGATGCACTCATA:1 - chrX 10111009 3' - mdg3 42 2 52.46 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGTCTCAAAGGAATGCGCAACAAGGACGCAAAAG:1 - chr3R 17258106 3' + 412 7468 2 77.04 GTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGCCCATCCGGCTCTCAGTTCATCCGATAAGCGGCGGATTGTTTGCTTTTTGCGCACAGGCTGCCAAATAAAACCGCCCGC:1 + chr3L 3308860 3' + R1A1-element 5330 1 75.00 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATTAATGCCGCTTTAAGGTATTTTTGCGCTGCCCGC:1 + chr2R 22463229 3' + roo 8990 2 74.83 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACTCGCTGCGTATACGTAATTTTT:1 - chr3R 20450397 3' - hobo 24 1 64.29 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCCTGTGGGTGTGTGTGTGGGTCTGTGCGTGTGTGTGTCTATGATGCGAGCTTTCGCGAATTTGTGTGCGAAACGAATGCACTTGTTGCTGTTTTCCAT:1 - chrX 12905387 3' - Tirant 8118 2 68.66 GCGAACGCAATCGGAAATGCTCAGAATAATCCCAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAGCATAGAATGGCAGGCGGTCAAAATGTGCTTGGCATTCGAGTCCACCTCCATGTCG:1 - chr2L 1935789 3' + Porto1 4328 1 64.71 AACGACGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGGCAATTACTGGGTTT:1 - chr2R 11574987 3' + INE-1 142 1 63.49 CATTTGTTCGACTTAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATATTAAATGGTTAAGAATAATTGAATAGTAATCCAATA:1 + chr2L 13139065 3' + McClintock 6352 2 76.71 TTGTATACATTATAATTAAAGAATAAAATAAGATAAATGTGCTGATATTACGATTTTTGTGGAAACCCATCTAAGTTAACAATATATAAGAATAACAAAGGACGTTGCCCATTTTGTGCACTATTAAAATCCCTCTTCTATCAAAA:1 - chrX 7045312 3' + G5A 2740 1 87.67 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATATATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAGCTCAAAGCTACTATTACTTT:1 + chr2L 16562175 3' + opus 464 2 51.03 AAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGATAGTATAAATAGTGTACCCATGTATGAATATATATTTT:1 - chr2R 9237364 3' - copia 5085 2 73.97 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCATAAGAACTAAAATAC:1 + chr3R 14954052 3' - 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Quasimodo 31 2 62.86 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGACTAAACAT:1 - chr3L 18381917 3' + copia 221 1 50.68 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAATATCACTTTAAGGTGATTCCCAGCGCATATTATGACGGAGATAAACATCGCT:1 - chr2R 25106039 3' - roo 8707 2 57.85 ATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCACTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATTTTTTCGTCTTCTTCGCTCTGTTTCACTGGGAAATTGTCGATGT:1 + chr2L 12834130 3' + INE-1 498 1 70.55 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTGCACGTTGCTCGCATTTGGCAGATAGGGTCAAATATCCTCTACA:1 + chr3R 11095923 3' - hopper 24 1 67.59 AGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTG:1 + chr2R 1982172 3' + 1360 75 1 55.45 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTTTACACAC:1 + chr4 311591 3' - 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Transpac 199 2 79.31 TATTGGTAGCGTTGTAGAATCTCAATATTTGAGTTGCTGGCAGTACCCCAAAGCTGTATGTCATAAGTCAACACGGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGATCTTCGTTTTTTTAACATGTCTTGTATGT:1 + chr2L 14734174 3' - G4 3478 1 80.14 AATAATAATAATAATTTAAATATTGTTCCTTAGCTGTTGTAAAATTTCTATCATTATACATTATTATTTCATTGTTAGAAATTGTCTCATACCTATATATACTCAGTTCAAAAACCCCACCCATCTTTTAGCAACTTCAGCCAATG:1 + chr2R 16963355 3' + mdg1 7075 2 82.19 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATCTATGTACGAGTAT:2 + chr2L 17626698 3' + roo 9025 2 54.11 TATGTACACAGTTCAGTTCTAATAAAGCATTCACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAG:1 - chr2L 22315578 3' - frogger 70 1 75.54 AGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAA:1 + chr2L 21643099 3' - Tabor 50 2 69.52 AAAAATATCCACTCTGCATTTTGGTTTAATTATATTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAAACACGATCTCGTCAATTGGTCGCGTATTTGTCGCCGCTCATTTGGTAAACATTTGGAGTTTTT:1 + chr2L 21051835 3' + 17.6 7031 2 56.85 AGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAACATTGCGGCAGCAAAATTGATCGTGACACTCAGA:1 + chr2R 6669288 3' - G2 3023 1 75.89 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTTGAACCTTAACCTCCCCGGAGTGAAGAAAGTTTTTCGCTTGTTGTTTGACAAATTGTTTTGTGCAGCCTTCGAAGGAAATAA:1 - chr3R 8639211 3' + copia 5086 2 58.90 CTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAATCAACATTTTATTACACCGCTTTGTTTGCGATCGTTTTGTTCCCTAGAAAAAACAGCAACATCAAAATAA:1 - chr3R 17205580 3' + copia 114 2 52.05 AGGGCACCCAATCCACCAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAAAGGGTCAAACTGCTTACTGTGCGGTGCTATAAAGACAAATGTGCCGTTATCGGCG:1 - chr3R 4476892 3' + Quasimodo 286 2 75.00 ATTATTGTTATTATTATTATTATTATGTTCGTATAACTACTTATTAATAACTACTTATAAATAACTACATTATTTCTTTTTTTTTTGGGAATTCTTATTGTTCAATCGCCCAGAAATCGAAGGCCGTCACGTCTGCGTTTTGATAT:1 + chr2R 16796982 3' - mdg1 7059 2 47.95 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATCGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATAT:1 + chr3R 21674922 3' + roo 356 2 54.11 AAAATCAAAAATTTCGCTTTTTTCAAAATTTTTTTTTTTAAATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTATACATTTATACTCATTTGCATTGTTTTACATCAATTTATAGTTCGACCACTTGTTAT:1 + chr3L 12596359 3' + FB 157 1 58.70 ATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGCGCGCACATAAAACAAGATGAAACAAAGGCCAAAACGGCATTAAATACAA:1 - chr2L 21030919 3' - FB 71 1 65.07 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTGCACGTTGCTCGCATTTGGCAGATAGG:1 + chr3R 11095906 3' - hopper 42 1 55.48 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACTAACTAATATAATCAGCTTTGTTCCCGTTTTTAATAACCTAATTTTGGGACTTCGATTTT:1 - chr3R 10150143 3' - 1360 62 1 60.27 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAAATGAGCGCTAAACGAGCTCGAAGCCTCCAAGAGCAGCACGATTTTTTTTGGGGCTGCCTGAAGAAAGCCGCCTTGGAGTTTTGATTCCGCACTTTT:1 + chr2L 11405900 3' - 412 7075 2 68.97 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCTACCAATTTAAAATGTCGAAACTGACAACGATGATTTCAAGGGAAGTGTTTTTAATAGAAA:1 + chr3L 20252045 3' + copia 227 1 65.75 GGCAATGATTGTTGAGGGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAAGGCGGATGTCTGAGTGCTCTGGTTCTCTTCCTCCAGCGGATGTG:1 + chr3L 12014746 3' + 1360 451 1 61.40 ATCAGATATCCGTTACTCATCTAGTGAATGTGCGAACGCGATTGGGGAAGTGAAGGTAATAGACGAGCGCATGGAAAGCGAAACCAAATCTAACTCGGCACACTTTCGAAATGCATTGTTAGATAAAACTGAACAGGAATTCACC:1 - chr4 919740 3' - INE-1 545 1 68.97 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTAAAATCGTCAGCAACGAAA:1 - chr3R 16276286 3' - pogo 20 1 71.92 AAACATTTTTTTGTTTTTTTTTTTCTCTTTCGCACACATGCCCAAGAGCGAGAGACATGTGCACACAAGTTTATATTTTTATATTTTAAACTTCAATTTATCGGGTATTGAAGAAATCGGGCTTGGTTTATCTCGAGCACAAAAGC:1 + chrX 15921441 3' - mdg3 5108 1 51.37 CATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGG:1 + chr3R 15790110 3' - flea 4744 1 60.69 GTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTATTTTACCCAGCTGCGAGGTAGCATTACCCACGGAATGATCAAGGACAAGGCGGAGAATGCCAGACAAGTCATAG:1 - chr3L 694431 3' + invader2 5017 2 52.74 GGCGGGTTTTATATGTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGCTTGCGTACCAAATTAAGCAAATTGTATTGTGATAGTTTTTTATTTGCATCCCATATAAT:1 - chr3L 3111575 3' - G6 1914 1 60.00 ACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCTACCAATTTAAAATGTCGAAACT:1 + chr3L 20252007 3' + copia 5058 2 63.70 AAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGAAAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATCGATCGAAATGTTTATGTTAATGGCTGAGGAATTTTCCATATTAATATT:1 + chr2R 23584297 3' - Cr1a 4363 1 56.14 TACATACGTACATACCATATTAGTAGTGACTCATTTCGCATGCCCATTTATAATCCCTCCGAGAGGTTGTTCCAATTTCCAGTTGTGGCAAGTGCGGGTTAAAGAAAAGCGATTAATGCCAAGCTCCTTGGATCATGTGCTTCTG:1 + chrX 4997802 3' - invader3 5081 1 78.62 CACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGAGCACACTAAAATGCAATCTCTGTCCGGCATCAAGCCTAAATTAAATATATTTCAT:1 + chr2R 23212694 3' + Tirant 8492 2 51.58 TATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATACATATTTATGATACTACTACTACATTTTACATTAAAATTATTGGAGAGCGTGAAGTTTAAGTTACTATTTTTAATTTAAATATTAAACCATAAA:1 + chr3R 7481634 3' - invader4 29 2 65.07 GGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTAGAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTAAGTCGGGACTCTCAACATCCTCACGAATAAGCTTACAAATAAACCAAATCACATTACACGGTGAACTGGGCAGGTTT:1 + chr2L 5792162 3' - Cr1a 4164 1 76.71 CTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGCAACGCAAACGGGTTGTTTTCGTTGTTGTTGTTATTGTTGGTGGTGGCGTGTATCCGAAATTGAACGATTTACTACAAATTTGT:1 - chr2L 15105462 3' - F-element 315 1 56.16 ATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCC:2 + chr3L 21093211 3' - Ivk 96 1 73.29 AAAGGGCCAACAAAGCTGAGATGTAAATTTGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTAGACTGTATTTATCTGAGGTGGTCTTATGTAATATGTAGATATCAGTTCTTGTAGACGAAATGCAATTAGATACTTTTAACCAAACCT:1 + chrX 14931751 3' - roo 8636 1 47.26 GGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAACATTTTTATTTTACCTCTACGCTGGCTTAGCTGTCACTGAATGCAATGCATTTTCGATCA:1 + chrX 19975633 3' - F-element 268 1 55.15 AGACAAATGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCCAAGTTGAATAACTTGTTGTCAATGACAATATTGAGTTTTAACAAATATTATATTTCTTATAAATTTACAAATACAAAAAG:1 + chr4 299963 3' + 1360 168 1 54.11 GTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATATGCGCTGTATCAAATTTAATTTATAAATTAATTACTACTTAAATAACCTCCAACGTTTTGGTCTGATCTTGCATGCATTCCACTTGTTTG:1 - chr3R 14051068 3' + transib2 50 1 68.49 ATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACTGCCAAAATTACTCTTTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAACGCCCACTTGGCCTTTGGCACTTTGTCAATTCACAAACAAAAACGAATTGTATGCTGGATTA:1 + chr2L 9327432 3' - 1360 3350 1 57.53 CTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGGGCGCCGATCATACTCGCTACTCGTAACGAAGGATAGAGAAGGCAAAC:1 + chr3R 2637720 3' - gypsy5 6967 2 52.53 AATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTTCTTCATTCCATTTCACCCATTAATCAGGGAGTCAGAACCCCTC:1 + chr3L 63549 3' + F-element 90 1 75.34 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTAGTCACTCTGCATTTGAATGTCTGAATGCCGCAAAACGTTGCTCGGCAAACCGACATAAATACAAACAAACATGGCTGCCTGGCGG:1 - chr3L 7460588 3' - 412 35 2 61.64 ACTCGGCTATTGATTCTGAACAAGAATATATATAGTAACGTAATTATGCCTTCCTCATATTTCACTTATACAAAAGAACGACCGCGGTGGTCCGCCGTATTAATGTGAAGAATTTGAGCAGCGAGCTCTTGCCCACGGTGCTGTCG:1 - chrX 7735275 3' - INE-1 91 1 63.01 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGCAGAAAAGTTAATTACAATATTTCATTGCTCAGACGTTGGTGGAGGGGCGGGTGCGGTGTAATTTTTATATCCAACAAATT:1 - chr2L 12144173 3' - transib2 38 1 58.22 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGATTGGGCACGATTAAGTGCTCCACCTCGGTGCGATTCATCAGGTT:1 - chr3L 363464 3' - blood 76 2 69.18 AAGCAAGGACTGAAGAGCACGCGGAGGTTTTTGCTTTAGTATGTAGGTATAATTCCAATAGGGCTTTTAAACGTGCCTCACAAAAGTCATATTACATATCCTTTACATTAAGATGAAAAAGTGGCCAACTTTGCGGACTTCAACGA:1 + chrX 3639715 3' + Rt1b 5011 1 54.79 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTTTGTACGATAGATTCGGCATTCGG:1 + chr3R 21674956 3' + roo 9054 2 69.18 AGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATATGTGTGTATCATAATTTCCAATCCGTGTAATCATGCCCGTCAAAAA:1 + chr2R 18344624 3' - 1360 68 1 66.43 CAGCAGAAGGAAAATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACGGAAACGGACGGAAAGACAGACGGAACTGAACTCGTAAACGAGAAAATACCAGCT:1 - chr2R 5501129 3' - Tc1-2 150 1 62.33 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATTTCTATTCAGTCGTTTGTGGTGCGAGAAGTCGTATATTGCTTATAATAAAGTCAAAAAGTTT:1 - chr3L 14167330 3' + mdg1 7401 2 56.85 AGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCATATTTTCCATCTTTTTTATGTAAACTTTTGGATTTACCTGAATAACAAATGTTCAAATGTTAAG:1 - chr2R 11987607 3' + Quasimodo 91 2 53.96 GGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGAATAATAATTTAATTTTTCGACAAAATAACAAATGACGACAATGGCAT:1 + chrX 7388149 3' - I-element 5046 1 62.10 ATCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCCCTCTGTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCTTGTGTGAGTAAGAACAAGAGACGAGAACGCGTATAGCCGCTGTTTTTGACAACTTACTCGTGCGTCGCGCGACCGTCTACCGAATGT:1 - chr2L 2938003 3' - 1360 3332 1 64.38 GGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGACGAG:1 - chr2L 4420512 3' - gypsy5 47 2 58.47 CTTATGAATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTTCCAACCTGAAGCGAGTGTTACGAAATGGAAG:1 - chr2R 21200852 3' - Stalker 7007 6 76.71 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATTAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAACAC:1 - chr3L 3453586 3' - Tirant 48 2 52.74 ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAATATTTATGAAGCATATTTTGCGGCTCCGTTATTTATATTTCTTTGGTCAAA:1 + chr2R 11264065 3' + jockey 4923 1 67.81 GATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAG:1 + chrX 12657099 3' + Stalker4 7115 6 78.08 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCATCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATATAGGACCCGCAAATGGAGAACTCAA:1 - chr3R 9300774 3' - 297 19 2 67.86 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCA:1 + chr2L 7652275 3' + roo 340 2 66.44 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTTTCCTTGATGCGCATTTGGCACAGCGCTGAAAAGCGTGCTACACTTTTTGAA:1 + chr3R 26846837 3' - hopper 67 1 63.70 AATATGATAAAATAAAATAATTTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGTTTTTTCACGACATGATCTCGAAATAGATTCGTATATAGTTTTTACTTTTTGAAACAATTTAACTTCATTTTCAAATATCATCTAA:1 - chr3L 16064044 3' - 1360 3100 1 54.79 TATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCACCTTTCTGCTGGAAAAATTAAGGAAAAATGCGGTGTAAATGCTAGTGTGGCAACGG:1 + chr3R 4577051 3' - mdg1 64 2 62.07 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTAATACTTAAAAAGGCTGAAGAATGACTAAAACTAAAGACTTTAGTACTCACCATATGAAGATGCTCTTGTAGGCAT:1 + chr3L 19999291 3' + 1360 3350 1 59.59 AGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTTATGGGCAAGTAGTCGTACGCGTTGTGGTTTCTTTAACGGCGTAGCGTGCATGGAATTGGTTTCAATGAGTTCTTTGATTTTGCACGTAATTT:1 - chr2R 16920102 3' - jockey 4611 1 36.30 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAAAACGCCTCCCGTTGCCACTCAACGAAGCGTATTAGCAAATTAAATTCCATTTTCGCAGGTGGGAG:1 - chr3R 20934622 3' - 412 12 2 76.03 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCG:1 + chr3R 21674886 3' + roo 331 2 77.04 ACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTCATTGAACGTTTTTGATAAGACACGACATATAATTGAATATGACACGCCAGAAAACTTAATAGATATACTAAGGGAATATCTAAAAC:1 + chrY 20754 3' + Quasimodo 6943 2 63.01 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCCACGTCTGTGTGTGCTTCCTGTGTATTGGTGTGCACGGCTGTTTGACTGTG:1 - chr2L 9879691 3' - jockey 78 1 66.90 ACATTATTATTATTGTTTATTTAAGCTATCTATTTTTTCAGCAGTACTGAAAAAACTATTCAACTCTAAGCTGGCAGACGTAATGCGGACATCAGGAAAATCGTATTAATTAATTCTAGGTTATGATTAAGCGCAGGACCCTTTTC:1 - chr2L 18042673 3' - invader3 5040 1 71.23 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCACGTGACATGATATCACGTGATGTGGCTGCTTCACTGAGTCATCTGTCGGATAACTTTCTCAAACATCCATAAACAATGCA:1 + chr3L 1856804 3' + Transpac 271 2 47.26 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATAACGAC:1 + chrX 6633033 3' + P-element 2851 1 47.79 GTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAA:1 + chr3L 18183181 3' - Tirant 62 2 70.50 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAATAGTTTACCGCCTACAGCCCTTTGAATGTTTATCTCATGAAT:1 - chr3L 12433399 3' + roo 9039 1 58.82 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAG:1 - chrX 21087600 3' - mdg3 54 2 64.49 AGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAACCGATGCATTGACAAACGAGCCCTTTGTGGTAGCACATCTAGAAAAGAAATCAATAAGGTATTATT:1 + chr3R 25030125 3' + opus 300 2 54.48 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAA:1 - chr3L 3453590 3' - Tirant 8132 2 63.03 GAAGTGTCAAGAGATATGACCACGCGGGAGGTGTTAGCGCGGTCATAGGCCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTCAGCTGCATTTACCAACGCAGACTGCGTAACCAAGCCAGCATGGGAAACTCCGAGTGACTAGCCACCAT:1 + chr3R 16252755 3' + rooA 133 2 69.18 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAAC:1 - chr3L 7837156 3' - jockey 4815 1 50.00 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATATCAAAATACTTGAACTCTATTACGACGGCATGCTGTGGAGGCGCGGTGATCCTCCATTCGCATAACGTATTGTGGGC:1 + chr3L 11804087 3' + blood 342 2 58.99 ACTGTGAGCCATAGGTCCAGATAGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTTGCCCGACACGTTTTACCCTTTTATTTGCTCGTG:1 + chrX 15149989 3' - F-element 4262 1 76.71 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCGAGATGGCGGGGGGGCAGCAAAATGTTAATATATCTTATTTTT:1 - chr3R 8230087 3' - Quasimodo 37 2 82.19 GATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGGTCCATTGTCTGATGGCACGCTGATGACCCATTTGCC:1 - chr2L 15172096 3' - Ivk 5224 1 71.76 AATTCTCAAAGTAAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTTTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAACAGTTAAGAAAACAGTGGCAGGAACGTAAGATAGACAAGCAATATTTGTCAGAGAGG:1 - chr2R 5046059 3' + diver2 293 2 55.97 TTGTAAATTCGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAAACTTTAAATCTATATTATTTTTTGGTGTTAATATTACGATTAGAATGATAAGATTTAGGTGTCTTTTTTTTAATGGTGAGTAGACTTTAAGTGAGCACACAC:1 - chr2R 5641501 3' + 1360 203 1 63.01 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCATGTGGTCAGCGAGGAGCAGAGAACGGGCCCACTATGCGGCAATGTGACCAATCCTGAGACTATC:1 - chr3L 11803914 3' - blood 7019 2 78.77 GGACTCGTATATGTCGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAATGATCTCCAACAGCA:1 - chr2R 2666310 3' - Rt1a 48 1 48.97 CAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGAAGCAAAGATTTACAACTATAAGTGTGGAGTTTTATACTTGTCTCTCTGCTTA:1 - chr2R 4879553 3' + F-element 198 1 64.38 TTTAGAAAGGAAAAATTTTTTTTGAAATTGATTTTTCTTATTAATTATTAGCAATGTTTTGTCTCAAAGCATTTTTGTATATTGACAGAATATTACAAGATATACAAAATTATAAAAATATATAACGCAGAATGTTTAAATAAGGT:1 + chr3L 25977699 3' - Stalker 6765 2 65.75 AAATGAAGTTATTTTCTATCAACTATATTACCATTATAAAATAAAAATTACTTAAATAGATGTGCACTAGGCTGTATTTAGCACGCAACTACTTATAATGTTGCTAAAACACATTGTTATTAATATTGATGGGACACCCTGTCGTA:1 - chr3L 2705502 3' - blood 6961 1 50.68 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATTGGACTGTAC:1 - chr2R 15070063 3' + 412 7506 2 54.07 ATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTTATTAATATATACAATAAAATAATAATTAATTTGTTGCTCATTAAGTGCTTG:1 - chr2R 21586312 3' + BS 4981 1 66.44 ATATGTATGTACAGTATGTACAGTATGTATGTATATAAAGACTTTACGTACATGCATATGTATGTATGTATGTAAATCTTACTTTCCTACAATATAATTCTTTAATTACACATTGATCTGAAAAATGAAACCATGTTACTTTGAAA:1 - chr2R 11638698 3' + Stalker2 7510 2 75.34 ATGTATATAAATAAGTAAATAATTTTTGTTTAAACATTTTGTTAGCATAATTCAAGCAAGAAGCAAAATACAAGCAATTTGAATATGGAAATATTCTTCGACCAACTCATATTACTACATATACATGCAGAATGTGTATAATACAT:1 - chr3R 7410450 3' + 1731 4419 1 43.84 ATATGAAAGGCCACGCCTTTTACTTTACTTACTTTAAACGATTGTTATAAACAACTTATTGCACAACTTAGCATATTTTTTTCTGCCAGTGTACTGGGTAAGCCGGACACGGACTGAGCTGGAGGTCAGCGCGTGCGGCG:1 - chr3R 29711497 3' + copia 4929 2 60.71 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTAATTTAGTGAGAAGCAGAACTATGAAAGAAGTTTTCTTGGCTCACTTTTAGGGTTTCACAGCAGGCAAGTGCA:1 - chrX 7446186 3' - jockey 4707 1 47.41 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGT:1 - chr3R 9125679 3' - Doc 67 1 66.40 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGGTTTTGGTTTTTTTTTTATTTCAATAATTTAGGTCA:1 - chr3R 20840080 3' + roo 8989 2 77.40 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTCTTTTTTTTTAGATTTCTATTCCGAAGAAACA:1 + chr2L 21643168 3' - Tabor 6858 2 71.33 GCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGAAATTGTGAAGTGAAAGTGACGTACCACGCCCACATTTTTACAAAACTGTTTTCATATTTTTAATATTATCTTGGTTAATACAAGTAT:1 - chr4 857151 3' - Q-element 80 2 47.26 CAACCATCATATAAAAGCGAAAAGACGCTAACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTTATACATCTCTGTGAACAAGATAAACAAAAATAAAAACAATAAACACAACGGCGATAAGCAGGACAATGGACAATGAAGCAGCGAGGCA:1 + chrX 4005366 3' + Porto1 86 1 65.75 CAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGCCAATTTGTAAAGATTATATCTTGTATGCTCCTAGGCA:1 + chr3R 8001418 3' - Juan 380 1 73.97 ATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAACTAGAAGGTTAAGATTCACCATACACAAATTGTATAAAATTCCTAACAAATCCCAAATCCGC:1 + chr3L 22214173 3' + INE-1 86 1 74.66 AAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAA:1 + chr3L 21093204 3' - Ivk 99 1 77.46 AGGCCGCGGGGATCCCGTTATTTCTCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTGT:1 - 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chr3R 25713984 3' + flea 228 2 63.01 GTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTAAAGGAGCACATCAGCATTTGACTAAGATACCCTTCCGTTGGAGTTCTACGTTAATATATTTGCTTTTGGTCTTTACTTTCACACGACATAAGGTGTGGATAAA:1 - chr3L 22596627 3' + 297 2 2 74.66 CGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTAGGGGCACGAAAGCCAAATTAAAAAAAAACCAAAAATGAAACAAAAAAGCATGAAAAAATCATCAATTTCGCAATTTTTACGAGCCAGCAGACT:1 + chr2L 13631503 3' - Tirant 8431 2 60.96 AAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTCCGCCGACTCTGCACTTTCTTTGA:1 + chr2L 18112609 3' - transib2 2590 1 54.11 GAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACACACATATGCAGAGCAGGAGCTTGAGGGACACGCACACAAAGAGACTAATGCGGGCCACAGG:1 - chr2R 9293570 3' + hopper 953 1 64.71 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTAG:1 + chrX 4673674 3' - roo 86 2 78.87 CTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGGTCAGGGTCCCAGGCCGGGGTCCCATTGTCTTGCGATTTTTATG:1 - chr3L 14302166 3' + 297 325 2 69.18 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCCTTTTGCACAATGATTATGTAAATTTATTGATTTACCT:1 - chr2R 22463157 3' - roo 48 2 67.86 TTTTTTCCTTCTTGCACGTTTTTGCCGCTCATTCCTGTGTCATTTCTCTTGGCATTTCTCCTCGTTTTTTTCGGTCACTTCACTTGTCTTGTCTTGTATTTAATTTCAAATTTTTTGTTGTATTTTTCGCCGCTCCGCTGTTGAGC:1 - chr2L 14918510 3' + copia 125 2 55.48 CAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAAT:1 - chr3R 11151818 3' + mdg3 5426 2 66.21 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACAGATGCGAATGCCGCGGGGGTAGCGCAGAAATGCAAAAAG:1 + chr3R 28951901 3' - jockey 4750 1 72.41 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCA:1 + chr3L 10469621 3' + roo 9019 2 57.24 ATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGAATCAAACAAAAACCAGAGAATGAGACCCAAGTCGGTCCGAGAATTTTTAACATCTTTCAAGAATATCGATTGAACTTGGGAAAAAAGTTAATTTTA:1 + chr4 250424 3' - INE-1 564 1 79.69 CTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCCCTTTTGCTTTTAATAAACAATTTTTCGCTGTT:1 + chr2R 18014101 3' - Doc 94 1 76.03 CGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGTATCTACTGGAGTTTTAAATTCCCGAACGCCTTTGAAGTAGTAGCGAACTAATTACCTTTTACATAC:1 - chrX 22738542 3' - 297 6 2 77.14 TATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTCCGCACTTCGTGCCTCAAATACGAATATCTATAACTCTTCGTCCCATTTCACTCATTACCA:1 - chr3L 19321991 3' + 1360 396 1 70.34 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTT:1 - chr3R 9125657 3' - Doc 60 1 54.29 ACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGACATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAGAAAG:1 + chr3R 10030816 3' - BS 5038 1 61.11 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCATGTGGTCAGCGAGGAGCAGAGAACGGGCCTACTATGCGGCAATGTGACCAATCCTGA:1 - chr3L 11803921 3' - blood 15 2 75.34 CTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGATATTGCTTCACAGCTGAGGTGTCGCTGAGTTTAACTGTCT:1 + chr2L 22319350 3' + Transpac 5151 2 71.23 GCGGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGATTTTCAAATTCACATTACAAACAAGAAATGCTTGTTTGGGCTTTGCTGATGGGTATCGTGTTAATATCAGTTGGAATCATAGGCA:1 - chr3R 4190866 3' - pogo 33 1 63.01 CTCGAAGAAAAGCGAACACTAGACTTTTCATAATTGCGCGGGCGCGACCGGGCGTATGTTTATTCAGCGAAATTAGTCTTTACACTGGTGCTTATTCAGTGCGAAAAATATGGAGATATCACACACGAAATAAAGATGCACGGAGC:1 - chr3R 2136307 3' - GATE 8432 2 66.44 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTCGCAGTTCCGTGTCCTATGCCGCACCAAAC:1 + chrX 12997903 3' + roo 8989 2 78.77 GCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTTAATCTTTGTTTTCCTTTATTTATTTCGAACAACATAAAAGCGCTTAAAGTCTGTTTAAGTGCCCATTGCTTAGTGTAAACAGTATT:1 + chr3R 21395281 3' - G2 425 1 75.34 AACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCTGTTTTAACAAAGCTTACTATCGACGATGGTAGTACAATTGTATAAATTTGTATAAGTTTTT:1 + chr3R 2557692 3' - Cr1a 4424 1 50.44 AAAGCTATACTAAAGCCCGTGTTGTCACCCCTATTACCGATAGACCGGCGATAGCACGCGATAATCGATAGCACTCTCCGCTCTTTGCCACGACTTGCA:1 - chrX 21053905 3' + G4 3408 1 73.74 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCAAATCTTGTAAGCGCTTTGAAAGAGCATCGTAAGCCATTAGTGGTAAACTTTGCAAGTAAAATGTCTGGCGATGACG:1 - chr2R 21843913 3' + pogo 2098 1 75.47 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAAACGCTACGAAACAAGGAAAATGTTACTACTTCTATTCATGAGAGTGTG:1 + chr2L 23068929 3' - 1360 72 1 66.44 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATACTGATAAGATATGAAATACTTTGGCGTACTTGTTAGCTTGTTAAATGTAATAGCAAGTTTATTATTTTTTATTGCTTTGTCTAACATTATA:1 + chr3L 17922073 3' - copia 30 2 65.07 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGATCGTAGCTGAAGCAGCTTCAGCAACAGCTCACCAGCTTCCCGCTCTC:1 - chr3L 6355547 3' - Tirant 8118 2 75.36 GTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAAGGAATTTTAAGCATTTTGAGATTTGAGATTGCACGGCCGGCAGATCGGTGGCGGAATTAT:1 - 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chr3L 8189410 3' + invader4 148 2 60.56 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGACCCCGCCCATCAAAATGACCAGCCATATTCATATATTAAAAGACCATCAGCTTATAAATGCCCATAATCA:1 - chr3L 9038793 3' - hopper 47 1 48.63 TGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGT:1 - chr2R 5582138 3' - Cr1a 457 1 66.44 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACCCTTTCACTCGACAAGTAACGGGTATTACAAGATGGAAATGGGCTGTTCGATTCTTCAGCGGGAAATCTAATATTACAG:1 + chr3L 22885052 3' - P-element 39 1 58.62 GCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATGACTATGGAATTTAGTTCAGGAGGTGTGAAAGTCAAAAAGAATGGCTGTTTGGTATTTGGCGATAACTATGAGTATAATGTTCCAATTATTAAATTGCAA:1 + chr3L 23529688 3' + 1360 128 1 76.03 GATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCC:1 + chr3R 24454855 3' - F-element 275 1 60.91 CTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCTCAAAATATTTAAGCATCTAAGAAATATGTTAAAATATTTAAGTATTTAAAAAAGATAA:1 - chr2R 14001523 3' + 17.6 193 2 73.97 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATCTTTGAAGTTGGGAGCCACTTTTGAATTTGCCTCCT:1 + chr2R 9607186 3' - pogo 56 1 68.85 AAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTAGGCTCCAATTTCGTTTTGG:1 - chr3R 7089510 3' - P-element 94 1 17.27 TAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATAATAGAGTT:1 - chr2L 9274999 3' - F-element 82 1 65.75 TCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCAGCTAAATTTCTAG:1 - chr3L 14944524 3' - G5 4777 1 56.85 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTGCTGAGCGCGATGGGTCGCTTGGACTCATCGCTCG:1 - chr2R 21820710 3' - Doc 42 1 51.20 GATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTCCATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTT:1 + chr2R 5045669 3' - invader6 4555 2 61.64 ATCGGATTGAGGAGAAGTCTCAGTATTTGAACAATATTTCTATTTCGGGAGAGCATCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAAGGTTCAAAGAGAGCAGTCAAATTGTAGGAGGCGGCTTCACTGACGGCAGCAGGGTCACCGG:1 + chr2R 16241445 3' - 297 245 2 73.10 AGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTGTTCTTAGTGCCGTTGGTGTTTTCCCCTACCGATTTGACTGA:1 - chr2L 21978211 3' - Idefix 161 2 71.23 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACGGAGCCGAAA:1 - chr3L 486738 3' - roo 8747 2 76.71 GTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGTAGCT:1 - chr2R 13761640 3' - jockey 4744 1 78.57 TAATTATTATTATTTTTTAAAAAGATTTATGGCCTATGAGGGCCTAAGTTTCTACTGACAAATTCTTTGCCAGCTATCAGTCATAAAATAGTAATTTTAGAAAAACTCTACGCATTTCTTTGCGCTTCGTTTGAGGCGGAAAATGC:1 + chr3R 18053735 3' + Porto1 4637 1 69.86 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCAAAGCCCAGTAGAAAGCTATGGATGATGAAAATGAAAACATTAGTAT:1 + chr2R 5754623 3' + P-element 2870 1 72.80 GAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACCAGACGGGAACGGGCAAGAGCTACTCAATGGGCATGACACCTCCGGGAG:1 + chrX 11581276 3' - 297 370 2 61.72 ACGGCTGCACCCAACTGCCAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGTAATACCATATAAGCCAAGCTATTGAGTACATTCCATTTCATAATAACAACTAATACATAATTCATTTCCACTCAATT:1 + chr2L 4929917 3' + blood 334 2 54.79 AATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATTCAACGAGGCCACATTTCTGGACAATTTGAAAACGCGTTACTATAAAGACAAGATCTACGTGAGTATT:1 - chr3R 24258376 3' + F-element 4332 1 52.78 CAAGTCCTCTTTAAAAATTCTCTATCTTGTATCCGAGACACATCCGGTGTCCCATAAGGAAAAAAAACATCATAAAGAAAGTGTAGCTTGAGATCTCTTTGAGTCCGTTTTCTAGAAAAAAAATCTTTTTGCATTTGGTGATGTAT:1 - chr2L 7088966 3' + Q-element 436 2 53.42 CCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACG:1 - chr3L 486747 3' - roo 92 2 82.88 GTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATTAATAATTATTAAAGACACATTTTTCGTAATGTACGCAATTTAATCCAATTTAATCTGACGAAT:1 - chr3L 18342920 3' - Ivk 57 1 57.53 ACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACTGATGACAGATTTGGAACCAAGAAAACCACACGAACGAAAGAAACATAGTCGCATAATAAGGCATAAATTAGAAAATTTTTAGTGACCAGTTGGCGTTGCGAACAAATA:1 - chr3R 8494175 3' + Porto1 4467 1 59.03 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGGTATTGTTTTTGTGCATATTACATCTGTACGCGTAAGCTTTCGGTTCGAGTATGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGAGGGAATTTCGTTTTTGTCTGT:1 - chrX 3322660 3' + roo 400 1 68.79 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCCCGCCCCTAACCACCCTTCCATTAGTTTTAAACCAGCTTACACCTTTCATGTTGCAACCCACCCCC:1 - chr3L 9469890 3' + 412 468 2 67.81 TATAGACATATACATATGTATGTAGCGCGAAGGGGGCGTGACAGCGTCTGGCAATTGGCGATGATGCAAGGCGGCGGCCCATCCCCTTTGTGGTTTATTTTTTACGACAACATTATTT:1 + chr2L 7087765 3' - Stalker2 7499 2 64.41 ATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATCTACCGGCTTTAATTACCGTCCCGATTCCGCCATCCATTTTGCTCCGATCTCTGGCGATGCAATGGGCCAAA:1 + chr2L 15278041 3' - roo 141 2 50.68 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAGGCCATTCGTATGTATTTC:1 + chr3R 25862664 3' - roo 8736 2 67.81 AAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATCGATCAATAGTCTTTCATATATTTAGTTACATACAATATAATACATATTGATTTAATTGGTGTTTTCGTACGTTTTCGTTTTTGCGGATTTGTGTTTTGAATT:1 - chrX 14836125 3' + invader4 3072 2 77.40 ATTAATATTATTAATATTATTACTTCTTGGTAAATATAAAATATATCTTGTATTATGCGATGCCAATGTAAATAAATAAGCCTTTGCTTTGCACTCGCCTATGTGGATATACCCTACCCTTTACCCTATAAGTGAAGCAATCATAA:1 - chr3R 21725610 3' - mdg1 45 5 61.64 GCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCTACATACTCACTCCACGCCACTCCACTCGACGGCGTGTGTGTGTGCTAGTTGCTGG:1 - chr3R 11332512 3' - Doc 246 1 57.38 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCGCACACTGTGCGGAGAAAGAGATGGGGCCACATGGGCAGAAAGAGATGGCACGACG:1 - chr2L 16615758 3' - hobo 50 1 58.91 ACTTGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATGCTTTTGTATACTATTTTACACTACGAGTAACGGGTGTAAAAACTCAAAAGCTGACCAGTGCAAAGAAGTTTTACTTCGATTTATCCTAAACCGACGCGAACATATCACACCCTTTG:1 + chr2R 9105880 3' - INE-1 91 1 79.45 CAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCTACTGACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACACCAGAAGGGTTCGGGCCGAATTAGAGGGTTCTCTGCTCTTTCCTGGCTTTTAAGCAGGCAAGCGACAAACGACAAACG:1 + chr3R 9103638 3' - baggins 5003 1 79.45 CAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAAAACATCATAGATTTCTCAACACGTTCATTGAGAGCGC:1 + chr3L 1230907 3' - transib2 378 1 79.56 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGTTTTCAATATAAGCTAATCCGTG:1 + chr3R 13225547 3' + hobo 2917 1 59.46 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTGTT:1 + chr3L 27415333 3' - transib2 43 1 56.16 ATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATAAATATTAATGAAGTCATCAAAAGTGAAAAGATTAAAATTACATTTCTAGTTGTATGTTTTCCGGGAATACCGC:2 + chr2L 9418608 3' - rover 47 2 53.42 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTTCGGCAGG:1 - chr3L 9212706 3' - hobo 56 1 69.09 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCGAGGGACACAAACACACTCGCACTTAATCTCACACTAAGCACGCACACAATGACCGGCTTTGAGCAGGGCTAATTGTAT:1 - chr3R 11095764 3' + hopper 1376 1 57.53 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTT:1 + chr3R 15790072 3' - flea 15 2 71.11 ACTATCTGATACCCCTTACTCAGCTGGAAGAAGTGCTTCTGGGCTTTAGGACAAATAATTACACGCATCGCGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCAATGTGCGTGTAATTGCAAATTCAATGAATTGTTTACATTTCTTT:1 + chr3R 10451586 3' - INE-1 548 1 56.52 CGAACACAGAATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTGTTAGCTATAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATACCAAGAAGATGGAAAAGAAGGAGAATTAATAAGCTGGTTGGGGCAGGGAAATGGAAAATGCACAC:1 + chr3R 6152777 3' + Gypsy6A_LTR 101 1 53.42 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCTTGTTTAACGCAGCTATAAATTATGATGCCAAAGT:2 + chr2L 20515282 3' - I-element 68 1 65.75 AGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTC:1 + chr2R 10910289 3' - Tabor 75 2 69.29 CAATAATCAAAATCAAATGCCCGAACGAAACGCACTTCCGGTTATCCGGCTCGAAGGACCAATTTTTAGCTAATAAAAGAAACTAATATTTACCTACAACAAATAAATACGAATACGAATGTATTTAACAAGTCAAGGTGTACTAC:1 + chr3R 25275573 3' - 3S18 408 1 56.85 ATGAAAAGCATAGCGCGGCAGTTGGAAGTTAATGTCGTCTAAATACTTATGCCACCTAGTGTATATTCATATACATTTCATTTGTACTTTCCACTCTCATCTGCTGCAATATTGTCTTCTCTCAGGCTTATAGCCTCGTTCCCATC:1 - chrX 500703 3' - Tc1-2 40 1 59.59 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGACCACCGACCGACCGCTGACCATAATTCACTCAAGTTAGACAAAA:1 - chr3R 21341333 3' - hopper 44 1 60.87 ATCATAACAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAAAAAGCCAAGTGAGGCACGTGAGATGCAATAGATGGCTTTACGACTCCTTTAGTTCGGTTTT:1 + chr2R 4336820 3' + 1360 363 1 58.22 GAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGCATTTA:1 - chr3R 11151809 3' + mdg3 185 2 59.44 GCTTCCTTCCGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATTTACTCTACGAGGAACGTGTATAAATACATACATTTTTGTTATTATTCTTCAATAATTTTCGGAAAATGTAATAACCATCATTGATGGGACTTTAAATAATATGCGCTGTA:1 + chr2L 11527038 3' - INE-1 29 1 58.22 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTGAGTGAAAGTTTCTAATACTGCTAGAAATGTATATTTATAGAAGGAACCTCTTTTTTTCTGGCAGTGCAGCTACCCTTGGCCCGAACCAGTCT:1 - chr3L 1358403 3' + 412 7519 2 67.12 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATA:1 + chr3R 10030764 3' - BS 5071 1 69.60 AGTAAAAGCTTCGCGCCAATTTTGCTTGAACAAAAAGCTGATCTAACATATGAAACCTCGCCTCGTGGAATCAATATTTATTTTCAGAATGACGTTGCACTAATATGTGCGCAGTGAGCTCAGTTTTAGCTGGTACTGGGGTCAG:1 + chr3R 20565371 3' - transib3 195 1 63.45 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTTCTTCATTGGCATTTCATAAATAGTTTTATTTGGCGCATTAAAA:1 + chr3R 15152705 3' + opus 424 2 69.86 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAAAGTGCAAAAGGTTGGGG:1 + chr3L 10469639 3' + roo 9044 1 64.49 TTTCTGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGACTTTACGTATTTGGGGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAAAAAAAATACAAGTTACAGCCAGACTAAAGACACTTTTGCTAAAGCATTCTCTCTTGTTC:1 - chr2L 22105974 3' - 1360 3181 1 60.14 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGCAACCTGCTCCATCGCAGATAATTGCTCTGCGGATCGAAGCCGATCAT:1 + chr2R 14973752 3' - FB 8 1 79.45 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGTGCGGCACAATGATTGCTG:1 + chr2L 16615808 3' + hobo 2897 1 78.82 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTAGTCACTCTGCATTTGAATGTCTGAATGCCGCAAAACGTTGCTCGGCAAACCGACATAAATACAAACAAACATGG:1 - chr3L 7460599 3' - 412 46 2 54.11 GAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAACTTTTTGCAGTATTCAGTGTGGCTTTACCTATTTTATTTAATTGAGTACTA:1 + chr2L 4631360 3' + mdg1 7110 2 65.07 ATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTCCGCCGACTCTGCACTTTC:1 + chr2L 18112604 3' - transib2 2588 1 54.68 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAATGGCCAGCGCAAACTAAATAATACTGCATTGTTCACGTTTTTTAAC:1 - chrX 18239111 3' - jockey 78 1 65.97 ACCACAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTTGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACT:1 + chr3L 25232865 3' - accord2 7476 2 48.06 CTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGCCAGTGGACAGGATAGCACCGGTTAAAACGTCAGCAGATATTTCATATTATATAAGAGGCTAAGAGGCAGCTTCTAGCCCGAAGACCTAGACCTAG:1 - chr3R 3697534 3' - Doc 234 1 67.67 ATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAATTTGACTGCTCTCTTTAAACCTTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAGTGAAATACAAATATTGTTCTAATGCCTTGGCTCCTACCACTGCCTCCGGCCATCCTGTCCGCTCCTGGCGAAG:1 + chr3L 6446535 3' + 297 6580 1 65.75 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCAT:1 + chr3R 25795812 3' - jockey 93 1 76.03 TGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTTGCTTAGATTGAACCCTATTACAAACCTATTACGGAGTGTATCTCCAAAGCACTTACATAAAAGTATTCCTCAATTAGCCAGACTCCCACTCATTTGGAACTAAGAC:1 + chr3R 15502614 3' + Ivk 5364 1 79.45 GTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTGTATGTATGTAGATAGATGTGTGTGCCTGTGCGTATCCATCCGAGTGGGGCCGAATGTATCTG:1 - chr2R 11146021 3' + Quasimodo 7330 2 52.89 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCGAAGTTGCGACGATGCCCGC:1 + chr2L 17260801 3' + P-element 2813 1 34.93 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGC:2 - chr3R 11870070 3' - pogo 62 1 64.38 ATATAGCTCTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATATACACGCCATGGCGACAAATTCCCGCTGCCCAAAAACCTAATTAAGCCAGGCC:1 - chr2R 15587818 3' + I-element 5286 1 57.36 AGAGTTATTTTATATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTCCTCTTTACTATCTCGTCCATCTTCTCACGAATCGAGCCGTACAAAACCAGAGGAATCGGGATAAAAAACGGGCTCAAATCATGTTGGCTGTGAATTCCA:1 - chr3L 23941557 3' + Cr1a 4319 1 47.83 GTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATATTATTACAGTAGTTCATAAATCCATACTTTAATTGGATTAAGAGCGG:1 - chr3R 30264031 3' + blood 290 2 73.29 CATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATTAAATTATTACCACATGGTGACTACTTTCTGTTCATTTAAA:1 - chr3R 15479384 3' + Stalker 6903 4 71.72 CTTATGTATGCTCTTTGATAATATATAGTTAAGTTCAAAATAGAATTTACAAAATTTTTTGACTTAATGCGAACCCGTTGCTTAGGTGGTAAAACTAAAATCTAAAGAAATTGGCAAAAAAAAAA:1 + chrX 392250 3' - transib3 77 1 58.40 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGCATTTTACGTCCTT:1 - chr2R 15075577 3' + mdg1 7394 2 60.96 TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGTATGCTTTTAAATTTTAAACAGTTTACCATTCATAACTCCCC:1 + chrX 7384982 3' + I-element 5277 1 69.86 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGGGTAGGGCAATCTGCGAACACAATTACACCCGTATTTCGCTAGCAACAAATTTCTCATTTTTCTGCTCTTCTTCTAGAACTCGGATGAAATGGAAAGTCTGCCCGACGAAGATGA:1 - chr2L 16345036 3' + 1360 3383 2 76.71 CGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAGGAATTTGTATCTCTGCGCACTTTGTTATTGCCAGCATTTTCGACTCGTATTTGCCTAAACCGGCCCCTCAGGAATAGCAGAAAGCTCCTGA:1 + chr2L 19099643 3' + F-element 130 1 63.70 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCATTGTATCAGTGTGACAATGGCAAATAGTGTTTTGCGTCTATA:1 - chr3R 28450634 3' + roo 9032 1 57.53 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATTAATCAATTAGTGACCTTCAGTGCGGCCCACTTCCCACGACTCTTTGCGTAGCATACTTTT:1 + chr3R 14986178 3' - jockey 4693 1 58.10 GGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGTAACTTTTACTTTTGGCTGACGGAACCCGTTTAAGTCCGACTT:1 + chr2R 7939611 3' - gypsy4 6487 1 60.91 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCATTTTCGGGTCTTCCAGCTATATACACTCA:1 + chr3R 16276462 3' + pogo 2072 1 62.76 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTGGTGAGTGTTAAACGCACAACAAGAAAAGCC:1 + chr2L 12486467 3' - roo 17 2 70.55 ATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTT:1 - chrX 8967397 3' - HMS-Beagle2 6957 2 69.18 CAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGTATATGTTACATTTATTAAGTGTCTCAATGAATTCGCCAGCAAATATCAAGTGGAATTGAAAGTTGCATCGGGGTAACTTAG:1 + chr3L 7870859 3' + roo 221 2 56.55 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATTATGATCGCGGGAAGGAGTCGCTGTGGGCCATGTCACCA:1 + chr3R 4320880 3' - blood 7039 2 41.10 TAGAGATAAGAACTCTTGCTACGTCGGTCATCGCCACGTGCTTACAATTTGCCTCATTAAGTGCAGACCGCACAAGCCCTATTATAATTACCATTTCTTATGCGCTTGTCGGTTATCGTTTTTA:1 + chr3L 19126386 3' + Burdock 6242 2 70.97 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTCAATCGTTTTAAAGATTTAGCTGATGTCATAGGATGTTCTTCTCGATGATTT:1 - chr3L 25607273 3' - 412 70 2 66.44 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACC:1 - chr3R 9125641 3' - Doc 17 1 72.57 AATTAAACAAAAAAAACAAAAATATACCTGCGGCCTATTTATAAAATGTCTAGAATGGCAAAAACAATTAAATTAAATTTTGCTACGTAAATCTGGCATATTTTCAAATGGAATACGTCTGCCTGTTGAGAAATGCCAGATGGAAG:1 + chr3R 7405075 3' + Doc 4700 1 48.63 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGTGCAAACTGCTGACAGCAAAGTGCAAAAGGTTGGGGAACTGCAGAAATGGG:1 + chr3L 10469654 3' + roo 391 2 72.73 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTATGAAGCCAACGAAGTGGAAATTACCTTGTAAAATTTAAAAAAATCAAAATCAATATGGAAACGATT:1 - chr3L 2320603 3' - roo 8718 2 55.48 AAAAAGTATCCGAAAAAAAAAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTGTAATCCATTCAGTCCAAAGGCAACTAAGTTTTAAAACCAACATATAAAAATAAAACAAAAATTACAATGTAGAAATTTAATAATACAACACAAAA:1 - chr3L 6536325 3' + 297 433 1 60.27 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGATTAGACTTGATAGGATGACTTTTCTTTCAAATATCTTTTTAAGTCCTTAAATGTTTTTGTTTTTTAATATTCC:1 + chr2L 15644973 3' - transib2 46 1 54.11 TCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATTTTTCTTGTCCACAAATGTATGATATATAATTTTCTTTTTTTACGGTTAAACTAT:1 - chr2L 15081012 3' - Doc 12 1 76.71 GTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGACGAGCTGGAAAAGCTTGCGTCTGAATTGAGAAAAAAACATAAAAGGACGGGTCTGAAATAAGGAATCGAAG:1 - chr2L 4420445 3' - gypsy5 6947 2 78.77 AATAGATTATTTAAAAAAAAAATGTCTAATTTGAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGATTATTCATATTTTGGTAATGTTGGCAATAGAAAAAAAAATCTTTACCCCTATGTCTGAAACTTACCGTTA:1 + chr3L 14944690 3' - hopper 160 2 78.46 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCTATTTTCACTTGCCATTAAGACAAGCCAATAACATTTTCTTTATTTCAGCATAATGATGTTATTTAAATATATATATTATGAGAAAAATA:1 + chrX 21973954 3' + pogo 2072 1 63.70 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATA:1 - chr3L 14375636 3' + roo 8993 2 71.23 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCAGGAATGGCAACTGTGGGGATATTTGGCATGCTTTTTCTTTCAATGCTCTATCAAGGGGTATATATAATATTATTACATT:1 - chr3R 26846720 3' + hopper 1388 1 64.18 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGCGTATATTTCTGCGATTATTTTAGGTATT:1 + chr3R 25751922 3' + roo 9043 1 65.75 TCGACTATAGCATTTTCTCTTGTTTTATTGTTTTTTTTCCTATAAATCGACCTACCGTTGTGCAAATATACATATGCTTGCACGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCAAAGGGGGCACACAAATCATTTTC:1 - chrX 19121819 3' + INE-1 578 1 70.55 ATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCCCTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGATCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACGGATTCGGCATATTTGTTCTCAAGATTGCATCTCGTTTAAGCTCAATTCTATCA:1 - chr2L 12182477 3' - Quasimodo 7004 2 69.86 CAATAAACAAAACCAAAATATGTTGACATAAAAGCCCATTGAGAGTGACACAAAAAATGCAGAATGGCATGGGGTGCAGCTGGAGGGGGCAACTTCGGAGCAGCCAGGCGCATTAATCCAATTCCGATTGTCACAATGCATGCCCC:1 + chr3R 30268554 3' + Porto1 192 1 61.64 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCTTCCTTACTTTTTTCATTTCTAGCATTGG:1 + chr2L 16331017 3' + roo 8983 2 80.82 TTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAACTCCTTTCAGCTCCGACAAAACCCACGCCGAAATCTTAGCCAAATTGTTGGTTGCACTTGCAACA:1 - chr3L 6517647 3' - HMS-Beagle2 287 2 55.48 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTCTAACTCTGTGGATTATGACTGTGACACATTGTTTCGCCAGCTAAT:1 + chrX 10579985 3' + pogo 2035 1 67.14 CGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATACAAAGATGTATATATACACTTTTTAAACATTTGCAAGATAAACCTTTTCGATCAAAATTATGATATTCTTTGGAAATTCTTGAATAGTATCAATAAACTAGTGGTTCA:1 - chrX 15454628 3' + 1360 3375 1 76.71 GTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCCAGACGGACAGACACATTTGGGCCCACACACACACACACAAGCCGG:1 - chr2R 17339880 3' + 1360 3324 1 66.43 AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAA:1 - chr2R 10910216 3' + Tabor 416 2 64.38 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGCATTGTGACAGGTGCAGCCGTATTTATTATAACAAAATGATCAAAATTGTGATACATTTTGACTTTTAAACATAAACGAAGTTCCGATGATCGGAAA:1 + chr3R 17047944 3' - 412 7078 2 68.49 GCACCCAAGAAATTGCAACAATACAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTCAGTAAAAATTCTGGAAATG:1 + chrX 22945365 3' - BS 62 1 56.16 ACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAA:1 + chr3L 21093240 3' - Ivk 17 1 64.81 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATGGACCGTGAACCGTCGTCGGGTGTGTGCGTATTCACTCTTT:1 + chr2R 17332205 3' - jockey 30 1 52.81 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTGGAGAAAAATATTCATAAAACACGGAAAGCGG:1 + chr2L 21910285 3' - Doc 15 1 73.97 CGAGCAGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATATAAGGTCTTTTTAATTAACCAACTTATTCGAAATACATCGAT:1 - chr2R 18344556 3' + 1360 3310 1 70.55 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCGTTGGATTGATGTTCGGAAACTGAGTCATCAGT:1 - chr2L 21153451 3' - 1360 34 1 59.59 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACACATCCTTATCCTATCTCTTACAAAAAACAGGAAAAAATGTC:1 + chr2L 7652324 3' + roo 9047 1 67.81 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGAGTTGACTGACATATTGACACACTCGCACAAAGGGCAAATCCAATTCCATCGCAGCCAAGCAGCTCAAACCTCAGCTCTCGCCTGTGGC:1 - chr3R 31140921 3' + Burdock 6368 2 68.57 ACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGT:1 + chr2L 8574440 3' - Transpac 4999 2 73.29 ATCCCGGTGCCTTATCAGCGTTTGATGTACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTAAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATTTTTCAATACGCTTTTCCATATTTTATGGATATTTACGACTTAT:1 + chr3R 25473748 3' + accord2 7189 1 77.40 AGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAGTTTTTTTGTAAATATCACCAGCTTACTGCGAATGGCTCCTTGGTGGATTTTCACT:1 - chr2L 2120334 3' - I-element 4927 1 66.44 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCAAAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGATCAATCGCA:1 - chr3R 16582505 3' - BS 5042 1 68.84 AAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGGATATATGTACTTTCAGGCATATTAAACTGCATACCCAATCGCAATCCAATCCACGACACCGCAATCATTGCCGCCTGCATT:1 - chr3R 11513426 3' + roo 9036 1 60.69 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGGCCTCGCGGTGTGCTGTCCGCTC:1 - chr2L 22319241 3' - Transpac 4954 2 58.33 GTATATGTATATATATAAATGTATACATTCATTTGACTCATCTCAGGGACGTCTTACAGACAAACCCTGCTGAACCCTGCCTATGTTCTGCCGCAAATCCACTCTGAAACTAAACCTTCGCCAACATCATTTCGGCCGTACGAGAA:1 - chr2R 4706942 3' + Stalker 246 4 67.12 AGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATTTTAGTAACAAATGCTAACCCTGCGCTTTTCATTTAAG:1 + chr3R 11870154 3' + pogo 2032 1 71.11 ATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAGTTTTGTATGCGACTGGGTCTGGGTGCTGTTTGTAATATTTTGTGTTGCATACTTGCAGG:1 + chr2L 5646975 3' - jockey 4598 1 50.40 CCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATCTGAAGCTGAAGCTGGCATTCCATTTGAATTATTCATTGCCAAGGCAGCCACATGGGATCGAAAGTGGAAATGGAAGTGGCAATAGCAATTGGAGCTGGTGTAATTGCCG:1 - chrX 8219316 3' + opus 490 2 78.08 ACTCTTCTAGACCAAGTACAAGGCAGTCGTAAAGGAGTCGTCATCGATGCGGCTTTCCGGTCCTGAACGCCTGTTCCAATGGCAGCCAAGACAACATGGCGTCG:1 - chr2R 10918618 3' + Tabor 7171 2 63.46 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAAG:1 - chr3R 23161272 3' - 412 69 2 64.38 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATAATAATAGATGACTGAACAGGTAAGGTCTTAGATAAGTACTTAAATATACTTAGAGGGCCCATTCTTTTGAAAAAGTTTAATTATATCT:1 - chr3L 18801747 3' + I-element 5327 1 63.70 TTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGACGGTAAGAATCAACTTTCACAGCGTAAG:1 - chr3R 8042268 3' - BS 21 1 60.27 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTATTGAGGTGTCTTATCTAATATTTAGAAAGAAATATATCCTTTCAAAG:1 - chr3L 785844 3' - I-element 20 1 69.93 AACTGCGCAAATGTTTGTGATGGGTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGACGTCTGTGCGTGCTTCCTGTGTATTGGTGTGCACGGC:1 - chr2L 9879703 3' - jockey 84 1 69.78 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATGTGTATATCTCGATGTATACCTTTAAATATAAAACGAAACAAAGGAATTTCCATTGAATATTTACTCTCTACAAGC:1 - chr3R 19139354 3' + pogo 2063 1 59.59 AAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAATACTAGGTAGTTTGGCAACGCATAGCGATTCGATTAATGGGT:1 + chr3R 9583355 3' + Juan 4134 1 69.66 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCGAACCCTTAGCTCATAATAATTTCACAACGCATACACTAGCCGTAAAATAATTTTCCAGCATTTTT:1 + chr2R 21748343 3' + 1360 3333 1 58.22 GACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATCTAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGG:1 - chr3R 18635225 3' + opus 417 2 76.71 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTAATACGGTAACTCCAGGAAAACAGCAAAACGGCAAGCTGCGATCAGTTTTGATTCTTACTTCGCAGCGAGAAGTTGTGATTTTATCGATCCG:1 - chr2L 8984823 3' - pogo 16 1 71.53 GAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATATTATCAACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACAACAGAGTGCAGTAATTGAAAACTATAATTGCATAACCATTCCTCATATAGGC:1 + chr3R 4663744 3' + FB 302 1 63.70 ATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACAT:2 - chr3R 8042298 3' - BS 51 1 53.42 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATCTTTGCGAGAGAGTTTGTTTATGCGCCGTTTGT:1 - chrX 7706743 3' + P-element 2825 1 41.78 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATTAATGCCGCTTTAAGGTATTTTTGCGCTGCCCGCAAATGAATCGATCCGTGCG:1 + chr2R 22463248 3' + roo 9006 2 62.33 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTTTTTCTGTTAATGAAAACAGTGTATTTAAGCTTAAATCAGAAACATTACTCCTTAACCCATTTTAATTATTGAAATTCTAAACAAGTATTTCTGCATGTGTAAACCGAGTA:1 + chr2L 19691387 3' - 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Tabor 69 2 67.41 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGCGTGTGTGTGTCTATGATGCAAGCTTTCGCGAATTGGTGTGCG:1 - chrX 12905416 3' - Tirant 8117 2 70.19 ATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAACAAGC:1 + chr3L 3453680 3' + Tirant 315 2 76.71 ATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTGGCTAGTTAGATAATAAAAATATGTTAACTTATTCTATATACCAAATTTGAGTAAATGTATTAGTTTTTTTTTTAAGTCCTTTGGGACTTTG:1 + chr3R 6816816 3' - Juan 422 1 63.01 ATAATAATAATAATAATAATAAATCTAAGTATAGAAATATAGAACTATAGAGAATAAAGTATTCTAACTGCTTAGAAATATATATATTTTGGCAACTTCCGCTTTAATATTTTTGTATAAATGCCACACCTAGCTGTTACATACCT:1 + chrX 13550602 3' + mdg1 29 8 77.40 TGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCCCGCCCCTAACCACCCTTCCATTAGTTTTAAACCAGCTTACACCTTTCATGTTGCAACC:1 - chr3L 9469897 3' + 412 7541 2 77.31 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTTATTTCCGCTGATGTGAAAATGAATTAATTGGAATATGATTGAATTTTCTCAGCGTTAAATATAATAAACA:1 - 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Transpac 252 2 78.77 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAATACATTTTATTTTTCTTGTCCACAAATGTATGAT:1 - chr2L 15081043 3' - Doc 27 1 60.77 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGAGGAAGTCCTTCCAATCTTCCTACTGTATTATAAATAAAATTCTATTATGTGGTTGTGGCTTATATA:1 + chrX 4032217 3' - transib2 53 1 53.42 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAAGGA:1 - chr3R 4679422 3' + hopper 1382 1 60.96 GTTATACAACACAGTTCTAAAACCAATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACAGCAACATTTAAATAATACAAAGAAATCTCGAGTTTCTTGACTTTTCTGCCTGCTTTTCCGCTCGACTCTTACGCACAA:1 + chrX 6707127 3' + Doc4-element 2571 1 60.27 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTGTCAAAGATGATTAGGCATAAATTG:1 - chr3L 19031177 3' + roo 396 1 76.03 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCCTTTGATGAAATCAAATGCATTCTTGTAACTACATTTTCAGCGGATTTAAGATTG:2 - chr3L 2330089 3' - roo 8730 2 64.38 ATTAGCTACCGTTTACATATTTATAATTATGTTATTAATTGTAAGGTGATTGGAACTACGATAACGAAATATAAGGATCCTACATCGCAACGAATTGTTAGAGATCTTATAGTAGACCTTGTAACTATTCATCACGATTTAACAAT:1 - chr3L 27988567 3' - 1360 2971 1 73.29 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCTCTAAAGTGCATGGCGAACCGTTAAAAATGAATTGCCCGGGCAT:1 + chr3L 19031361 3' - roo 27 2 65.75 GTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCG:1 - chr3L 25232767 3' + accord2 146 2 61.72 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGATCGGAGCTGAAGCAGCTTCAGCAAAAGCTC:1 - chr3L 6355564 3' - Tirant 8118 2 73.55 TATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAGTTTGTTTATAAATATAATTGTTTCTTCATTTATTGG:1 + chrX 18130615 3' + F-element 191 1 74.66 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAAGCCATTCCCTCGCTCCCTGCTCCACA:1 - 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Doc 4527 1 59.59 TCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAACCCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCAATTCTAATTCGCCTGGCCAAAGCGAACTCTTGATTGAAG:1 - chr3R 16240913 3' + Tirant 326 2 69.29 AGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGATCAATAGCCATGTCTGTCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCTCAGGAAGATAAAGAAGAGGCAAAAGCAATCAGAACTCTAAATCTGATGTACACCGCTAATTG:1 - chr2L 21779433 3' + INE-1 14 1 43.85 GGCACGGAACTCCAGACGGCACGAGGCGCTGACTAAGCGCTCTGCTGGGACCGCTGCCTCCAACCGAAGACTTGGCGGCCTGAATATCACAACAGAGCAGCCGACCACAGAAGCATCCGGATTGTGCCCACATGATGG:1 - chr2R 21063467 3' + gypsy10 183 2 62.32 CGCTAGATGAGCGCGAATTAAACTAATTCTGTTTGGGTAGATCTCGGTGGGCGCCTGATCATGAATAAATTTGGCCAACAGAATTGTCGGCGAC:1 - chrX 22752240 3' - gypsy6 401 1 31.91 TGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATATTTGTTTGCTCTTGGTCTATTTGACTTAAGGTCTTATCTGGCAGATGGAAAAGTTCCTCTATCTGCTGACCGAAATTCTTGT:1 - chr2R 7637018 3' - I-element 4979 1 52.74 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTAGCTTATGACCAGGTTAAGGTAATGTCCAT:1 + chr2L 6388127 3' - 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INE-1 576 1 53.47 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAAGCCATTCCCTCGCTCCCTGCTCCACAGCGGATCTGAACAATG:1 - chr3R 23161231 3' - 412 28 2 65.07 GTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGTATGCTTTTAAATTTTAAACAGTTTACCATTCATAACTCCCCCTGCCAATAGTTATTATAGCCAGATCTCTCAGCCAGATTGGCCTCTTAAATGC:1 + chrX 7385035 3' + I-element 5330 1 71.92 ATATAAAATTTAACAATATAACATAACACCCATACAAGAAAATTTGATTATATTTCTTTGAAATGTTTCAGCATTTTAATGTTTTGCGTGTCAAAATCGATAGTTCTCAGCAAGGATTGTGTACAACGATTTTATGAGTTAGCATC:1 + chr3R 30209199 3' - BS3 1638 1 87.67 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCTAAAAAGGGTTCCCTATGTGTACTTGCGGGAATT:1 - chr3R 27323080 3' - 297 52 2 68.42 GGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGATCGTATATGTGTACATTCCTGGATCAGGTAATTTATCAATTAGATCAATTAACAAT:1 - chrX 5109982 3' - accord2 7296 1 72.41 GAACTCGGCTTATGTTTCTTCGAACATTGGGCACCAAGCAGCCACTAGACCGTACTCTTAAGGAATGTGGTCATTGGTTGGGTAGGCAGAAGTGTGCCAGCACAAAGTCAAACGCAAGCGGAAAAAACAGCAAAA:1 - chr3R 27332196 3' + Gypsy12A_LTR 1883 1 63.70 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTC:1 - chr3R 10213055 3' + P-element 2828 1 30.70 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACGGAGCCGAAAAGAAAACTCTTTTGGGGCATTTTCTGCTTCGTAGGAAAGTGAAGGAAATTG:1 - chr3L 486687 3' - roo 8696 2 62.33 CATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTATATTTCAGTCGGAGCTGCTTTGGCCACGGCCATTTGACACCGTGATTGTTGGC:1 + chr3L 19967087 3' - Cr1a 4160 1 52.34 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGGCCCAAAACGTTGCAAGCACATACGTACATACATATGTGAATATGAAGTTGATGCGGCATGGGGCAAAGGAAGGCGACTACTGAGAAAGG:1 - chr3L 16055820 3' - 297 6629 2 75.00 GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGGCAATGAATTCAGCCAGTGCTCATGGAGCTAGGTCAACAGTTAGTATTCCATGTAAGCTGGTACATAAATGGTTATATACAATTCTCGCCCAA:1 - chr3R 4663874 3' - FB 29 1 65.75 TCTGATAGTCGGGGAAGTCGACTATAGCATTCTCTCGTTTTAAATGTATTAAAAAAAATCGAAGTATAAAAATCACAGACTGCTTATTCTTCACACTTAATTTATATACTACCAGCAATAGAAAAGTTTTAAAGTTTTAGGACTGG:1 + chr2R 4823481 3' + INE-1 561 1 70.55 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCTCATACTACATAGCATTGTGACAGGTGCAGCCGTATTTATTATAACAAAATGATCAAAATT:1 + chr3R 17047895 3' - 412 7127 2 64.38 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGTAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTTAACTATCCGGCTCAACTATGCATATGGATGGACGGCAGATGGATTTATGGGCTGTGAAGT:1 - chr3R 25277564 3' - 3S18 21 2 69.18 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCGAGGGACACAAACACACTCGCACTTAATCTCACACTAAGCACGCACACAATGACCGGCTTTGAGCAGGGCTAATTGTATTGGTAATGCGCATGAAA:1 - chr3R 11095747 3' + hopper 1393 1 69.18 GGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGCTTTGGTGCGTTTATAAGATAAATATCAATATAATAATATAAAGTTTTCGTAATTGTTT:1 - chr3L 16855204 3' - FB 64 1 61.64 CTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTAAATGGAAGTTCAGCTTTCAGCTTGC:1 + chr2R 19852213 3' + Transpac 5158 2 79.20 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCGAAGTTGCGACGATGCCCGCCGACAGCACACG:1 + chr2L 17260813 3' + P-element 2834 1 45.99 CCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTCTGCAACACG:1 + chr3L 23678145 3' - Osvaldo 16 2 73.64 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTGTAACGACAATTATTGTCGTTGTTGCAGAGTCGGTTAGGTAGAAATTAGAAAATAGAGAGCGCAGATAGTTAA:1 - chr3R 15295679 3' + roo 9047 1 67.12 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCATTTATTTTTAATTTATCTTTTT:1 + chr3L 18253912 3' + blood 342 2 59.59 GATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCTCATTAAAAATGTAAATCAAATATGTAAACAACAAAAGAGCACAGCCGCTAGACGGCGACACAATGTTCCGCACAAGC:1 + chr3R 9203431 3' + jockey 387 1 54.79 CTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTGTCTGTCCGCTCGCTTACAATGAGAGTGTAAGAAATCTAAAACTGCGAATTTTATCGTTGTGAACGTTTATGCACAAATTGCTTCCAGGTTTTAGCGCTGTTGTGTCTG:1 - chr2L 13742054 3' - 1360 3338 1 54.11 AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACT:1 - chr3R 13225500 3' - hobo 72 1 69.78 GCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAAATCTTCGCACCGAGTGCGCTGGCCAGGATTATGTAAAATCAGTTGGGAAAAAAT:1 - chr3R 26879350 3' + 1360 429 1 63.70 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACGCCCATAATGCGACCCAAAAAGTTTTGCATATTGCGTTTTTAGGACATGTGTCCCTAGCAT:1 + chr2R 14135364 3' - copia 4930 2 57.53 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCC:1 + chr2L 21910218 3' - Doc 82 1 74.66 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCTACCCCAGATTGC:1 + chr3L 16973502 3' + S-element 1699 1 69.29 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGA:1 - chr3R 7885591 3' - jockey 75 1 63.01 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTT:2 - chr3R 9125633 3' - Doc 42 1 61.64 AAAAAAAAAAACAAATAAAAGCAAACATGGCAAAAGCATGAGAGATGATAATAAAATAAACTGTTATGTTCAATTGAGATGTGATGTTTTATTATTATGTTTCTCTCACCCGAACAGCTGTGATCCACATCTTCATCCAATACCTA:1 + chr3L 20298127 3' - Circe 423 1 65.75 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATG:1 - chr2L 17295813 3' - Doc 40 1 54.48 AAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACATTTTTTTAACCGATAAAAATGAGCTTGACCAATAAAACCCTGCTATAATACTTTAAAATATTG:1 + chr2R 5434001 3' - Transpac 50 2 55.17 CGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCACAGATGGAGATGAAAACGCTTTTTAAATTTAATGTTCAAGTTTTACAAT:1 - chr3L 6353861 3' + Tirant 8176 2 66.44 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCTGGCAACAGTTTAACAAGCTTTTTAAAACTACAGGAAGCGCTGGAAAAGGTCTGAAAAAATATCGA:2 - chr3R 7585722 3' - Doc 64 1 54.11 AAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAA:1 - chr2R 3338797 3' - Juan 69 1 65.49 GAGAGTGAGATCTAAATAAAATCACAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAACATCGGGAAGAAACAATAGAATGAAAAGAATGAATGAATGGGCGCATGGAAAAAGCCGATCCTAGCCTGGTTCCGACCGCTAGCGAAGGGG:1 - chr2R 25079538 3' + gypsy5 7237 2 52.74 GGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAA:1 + chr3R 12363798 3' - jockey 4749 1 65.07 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTATACTTATTTGGTTTTCCGTTTTAAAGTCAATTTCGAAAATAACAATACAGACCAATCA:1 - chr3R 21216839 3' - 1360 63 1 66.44 GTTATTAACATAAATATAAATATGTAAACGGTAGCTTATTCGAGCAAACGAATATTAAAACTTTTAAATAATAATAGTCACGGCGTGAATTTGTTCTGCTTCTGCTTCTTCAAAGTCTCTGGAGCTGATGCCGCACAAAGTTTCAT:1 - chr2R 21572257 3' + 1360 2954 1 64.38 GATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGGATACTAAAAGGGATATTCGTTGCCAAGTATGTAACAGGTATT:1 - chr2L 22112994 3' + 1360 3286 1 62.07 GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACTGCCAACTTTGAGGAGGGTTTCGGAGGACAAACACG:1 - chr3L 12159636 3' - Quasimodo 27 2 66.44 GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATT:1 + chr2R 21870244 3' + copia 5043 2 75.34 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATAT:1 - chr2L 17295842 3' - Doc 54 1 56.92 AGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAAACAAAATACTATGGCCAAATAGACTGCGAATCGCCATCTCAACGCATTTTTGAATCCGTCTGTGACTAGCTCCTT:1 - chr3L 51916 3' + 1360 334 1 51.37 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATGTAACCCCTGTTGAGAGGCGGCAGGATTCTCGTCAGTTGTTTGCTTAAAACAAATTACAAGCAGAGTGAGAGAAATTAATGAAATTTAAGCCAGGCCA:1 + chrX 7742016 3' - hobo 24 1 66.44 TTTTTTTCCTCTTTTTTTTTTTAAAGTTGTATTCCGTGATCATTGTAATTGTGTTTGTGTGTCAATCTGCTACACGCCGAAAAAGACAGGTAGATGGGAAGTGAAAGAGATGCATCTCGGAATGCCAAAATAAAACAATTATAAAT:1 + chr2L 4236732 3' - Doc2-element 230 4 73.29 TTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTCGTGTTGAAATATTTAAGGGGACTCGTGAATTTGCTC:1 + chrX 15559558 3' + hopper 1336 1 75.86 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCATTTATTTTTAATT:1 + chr3L 18253903 3' + blood 333 2 53.42 TATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGATGAAAACGATTACTTTCCAATTGAGCTCCGGCGTGCAGCCGGGCGAAGTGCCCGACGACCGATCACTGGTG:1 + chr3R 18588317 3' + 412 224 2 50.35 GCGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGTAAAAAAACCACCCGAGGCCTGCTGCGCAAGAGCCGTATGGGTGAGTGGATATTTTGGCGCCCAAGCACATTTGCAGCCAAAGAAGTGG:1 + chr2R 15925839 3' - hobo 2849 1 72.54 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATTGTATCAGGCGATGTGTTGAGCGAAAACGATCACCTAA:1 - chr3L 19863958 3' - roo 8747 2 74.66 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGCTAAAAAAGCTAAAGAGCC:1 - chr3L 21013837 3' - roo 48 2 52.74 CGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGGGGTCCCATTAGGAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCGTTTTTCATATAATTGTTCTATTCTGCCTGTTACCCTATAGGGATTTTTAGTTTTTAACAGTGGTACTGGGTTTG:1 - chr2R 2953416 3' + G5A 2545 1 50.00 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGGGTGTGGCGGTATT:1 - chr3R 9125606 3' - Doc 15 1 80.14 AGGGTGGTGTTTCGAACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATCCAGTTTTCGGTTAACCGAAGATTATATTATTCATAACTTTCCTAGCTTCGTTTCAATTTGGCTTT:1 + chr3L 7038597 3' - X-element 4336 1 54.79 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAATTATTGTCGTTGTTGCAGAGTCGGTTAGGTAGAAATTAGAAA:1 - chr3R 15295700 3' + roo 9026 1 54.79 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTAAACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTCAACTGTGTGGACAC:1 + chr2L 15777914 3' - 297 6623 2 53.79 ACGCGAGGGCGTGGTCGCACAGAATTTTGTCTGCAAACTATTTGTTTGCAAGAAAATGTTTGTATCAAGTCTGTAACTCAATTTTTAGACTTTAAGCCAGATTCCCTATAGCCTTCGATTTGACCTTTTTCAACATC:1 - chr2R 4715559 3' + transib2 2707 1 72.26 TTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTACTTCTAAAATATGTATTTATACATATACTTCTAAATTATTCTTTTTCCCAGCTTATTATTTAATTATTGTGATAGGCA:1 - chr2L 8717810 3' + mdg1 192 2 52.74 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATTTTCATCTAATTAAAATGCATTACT:1 + chr3L 9470031 3' - 412 7110 2 55.48 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTAATCTTGACG:1 - chr3L 14375586 3' + roo 9043 1 63.01 TCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTATACTTATTTGGTTTTCCGTTTTAAAGTCAATTTCGAAAATAACAATACAGACCAATCAGAAAACTATACTTTATACAGTACAAAGCAAAAAGAATTCTGAAGCAATATACAAAGTAAACT:1 - chr3R 21216777 3' + 1360 3388 2 79.45 CATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACA:1 - chr2R 13367461 3' - jockey 4636 1 69.18 ACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGCACACATTTATGCAGAGCATGGCTTTCAAACTTTTAATGC:1 + chr3R 25714107 3' - flea 4833 1 74.66 CTGGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGACTACAATAAAACTCTCTTGTGCAGATTTTGTTGTTCTTGGATTTTCGCCCATTGTCTCCTTCAATAAAATGCGTCAAGTCAATTTCATTCACCAGCAGCTGCT:1 + chr2L 19161898 3' + 3S18 5760 1 77.14 GTCTGTCCGAATGAGCGTCGAGATCCCAGGAACTGTTCTCGAAAGCGATTCGGATAAACTATCGTGTATGCGTTTCTGCCGAAACGCTTATTTTCGTGCCATATATGGCCATATAAAATTAAAAATTTCTAAATCAA:1 + chr4 915049 3' + INE-1 129 1 78.10 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCC:1 - chr3R 16276344 3' - pogo 60 1 72.66 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTGCGTGCGGTTG:1 - chr2L 14969094 3' - 412 7120 2 64.14 ATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAGTACATATTTCGGAGAATATCATTGAGCAACTAATTATATAGTTTAATTCAAT:1 - chr2R 17014382 3' - flea 4800 2 59.20 AGAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATAATTTTTCACTGCCGATTCGCACTTTT:1 - chr2L 19652494 3' + roo 9036 1 56.16 AAAAAACAAAAAACAAAAAACTTCGACTGCACTTGGGCCGATGAAAATGTTAAAACAATCGATCGGCAAAAGGGGCACGCCCATTATTTGGGCGGATTGTTTGTTTGCTTTAATCTTGGCCCAACGGCTTC:1 + chrX 2554573 3' + HMS-Beagle2 489 1 70.23 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCC:1 + chr3L 2330156 3' + roo 351 2 68.14 ATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGACCTGTTCGCTTTAGCGATATGATACCACTTTAAGTCGTTTGACTTTAGCAAAAATTAAAACGCATCGACACTAGCAATTTTATTTAAGTGTACCT:1 + chr4 184068 3' - 1360 172 1 50.00 ACTATATTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAATAAAGTTAAAATAGTATCCCTGTAAATGTGCGCATAAATGAATTACCAATGAACCGCATGGTTCACGTTTTCAATTTGAGCAGGCTGGGCGCTAATTTTCGG:1 + chr3L 10006963 3' - Cr1a 4302 1 60.96 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAATATTTATGAAGCATATTTTGCGGCTCCGTTATTTATATTTCTTTGGTCAAAA:1 + chr2R 11264066 3' + jockey 4924 1 67.12 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGTTTAGCAAAACTTGAAGTTGAATGTATAAATGTAATTTTCGTTAT:1 + chr3R 6422903 3' - jockey 84 1 66.44 AATTATTTCATTACATTCTACTTTTTCACGAACAAAATGATACTCAATATCTATGTGCTTATGGGGATGGGGAATGGGAATGGGTATGTTCAGGTCCAACACTCTGAGGAACGACAAACGAGGCTTGTTGCTGTCAAAAGCAAGAA:1 - chr3R 13853263 3' - Copia1_DM 4165 1 58.90 ATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATCGAAGGCAACGCAATTTCGCATTTTAATGTGCTCAAGGATGTG:1 - chr3L 7276085 3' + Doc 189 1 70.55 GGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAAAACGACGCATTGAAGTCGAAAGCCAAACACTGCGTGTTATCTTATCGCAGTA:1 + chr3R 19223513 3' - FB 69 1 63.01 ACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTCAGAGCCCCATTATTGGTGCTAGATGGTGGGCATTG:1 - chr2R 19654796 3' - Tc3 312 1 79.45 ACATTCCATTTAACAAAAATAAGTGGGATAAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATATCTTAGCGTAGTTCCGCAAAAATGTAAATACTAAATTTCTAAGATGATTTTCAAGCTACCTTTGTCCAAATTTTTATCCCTG:1 + chr3R 31885035 3' - HB 99 1 54.11 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACATATACATAGAAGGGACTAACAATGCAAGTCTCTCGACTCCTTTTGT:1 + chr3L 14302274 3' - Quasimodo 45 2 68.22 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGGGGGAACTAAATAAAGCGATCCATCGAA:1 + chr3L 2192321 3' - jockey 4746 1 75.61 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTACGGCAAATAATAGAAGAGCGAATA:1 - chr3L 12874864 3' - jockey 65 1 56.16 TATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTGTGAATATTGAAGTTTGATTGTAGTTGGTCGTGGTTGTT:1 - chr3R 15296278 3' - 412 7480 2 72.58 AAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCGAT:1 - chrX 388228 3' - 1360 39 1 54.62 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGCGTAT:1 + chr3R 25751898 3' + roo 9019 2 56.85 GGTCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTATATGTCCACCTAATTATTTGAAATATTAAAATG:1 - chr3R 15126505 3' - FB 86 1 76.39 ATAACATTTAAAATATTTGTGCGGAGTACACTAACAATAATCTGTATTTCCATGACAATCCTAATCTTTGTATGTGTTGTGAATTTAAGTTATATTAACATATGAACTATATTTATCCCATTAATGTTTAGGAGTAGATTAATCT:1 + chr2L 11815140 3' + gypsy3 497 1 72.41 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGAAATGTTAAGAGAAAG:1 - chr2L 4929808 3' - blood 7082 2 67.12 ACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATATGTGTTGTTGACTTTTGCCGCGC:1 - chr3L 6840058 3' - 412 176 2 78.50 TATGTCCAGAGGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAGGAGTACTTTGTATTCCAGACTATGGGGAGATAGAATTCCCGGTCATTGTGAAAGTCTGGAGGTGGCCTGCGTGGACAACGCGGC:1 - chr3L 21195910 3' - Doc2-element 4349 1 52.94 GAAGAGACAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGGGCTACCTATACACAGAGATGGCAGCGTGAAAAGTGAGAGAAACTC:1 + chr3R 24499580 3' + blood 7314 2 67.81 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGT:1 + chr2L 5792070 3' - blood 79 2 69.86 GAAACGCAGGTAGCTCCGTGTACTGGATGCCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTGGCCGCACCTGCAACTTACTGGGTCGTTAATCTTTGTTTTCCTTTAT:1 + chr3R 21395214 3' - G2 492 1 70.55 CTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATTTAATTACATATTAAACAAATTGTTGAAGTTAGGTAAGTACAACATTTATAAGCGTAT:1 - chr2L 22315508 3' - frogger 2297 2 61.64 CGAATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATTAACTTTTAAAGTTACCCAATTAATAAACTATAACCACCAATTGGGAAAATCTTTTCCAGAATTAGTATAAATGTTGATATTCCAATTTTACTATGATTCTGAAATTCA:1 + chrX 3374348 3' + S-element 383 1 76.03 AAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATAATAATATTAAAAACATTCGGTAATTTAGATATTTTTACGGGAAATCCGAAATGCATGTTTTGTCCTGTCGTCTCACGTTATCAGAAGA:1 - chr2R 3901676 3' + Quasimodo 7345 2 69.29 AAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAGAGGAGGAGGAAAAGGGCTTTGCATATCTAGTCAGGGTTTGTCTGGGTTATAACTTCATTAGGCGGCGCAGTCGAAATGTTTTTTTCGGAGACGACGGACTTCTGGTACCGCACCACCTTGG:1 + chr2R 18520802 3' - hopper 146 111 70.34 TATATAATATTAATAAAAAATTTGTTTTGATACAAAAGTCAATTTAGATTATTTCCAACACTTTTTAAATTATCCTGTCACCCAGCGATAAAAGGGCATATTTCGGCAGCCATTTTGAAGCGACTTTTTATT:1 - chr4 452137 3' + transib1 1923 1 53.79 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCAAATCTTGTAAGCGCTTTGAAAGAGCATCGTAAGCCATTAGTGGTAAACTTTGCAAGTAAAATGTCTGGCGAT:1 - chr2R 21843917 3' + pogo 2065 1 56.30 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCCCGGCATGTTGTCGACATTTTTATGGCTGCCACGTTT:1 + chr2R 8688152 3' - F-element 24 1 52.63 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACCAATAATAATTCGGATATCTAAGCATAAATTTAGTTTATCTGTTCCAATCCTTCATGGATAAGTT:1 + chr3L 16015359 3' + 1360 3362 1 62.07 CTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATGTTTCAAATACTAAAATTTGGTTTATTTTAACTCCACAGTAGTGGTTCTTTATTCAAGGATCGATAGCTGAACCCTTTTGCGCAAGCGATCAGTTAGCCACGGTTAAT:1 - chr2R 1577173 3' - HMS-Beagle2 331 2 66.67 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAAT:1 - chr3L 16015245 3' - 1360 77 1 71.23 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTGCAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGTAATATTGCGAACTCACTCAGCGCCGTTTTGAATGAGTGGAA:1 + chr2R 6493176 3' + transib2 2747 1 69.18 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAATAAATAAATTATCTAACTAGCCTCAGCTACTAAACGGCTGAACCCAAATAGTGTGATGGAAATTTATCAATCTTTAATGATATATAC:1 - chr3R 6816681 3' + Juan 4172 1 53.42 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGACATACATGCACGCAGACACTTTATTTATTT:1 - chrX 11008340 3' + hobo 2891 1 75.49 TGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTTTAAAACCAAAAAAAAAAACGCGGACTAATAGCCCCAAGCCAAGCACTACCCAAGACAAATTTTATCGAAACAAATTTA:1 - chr3R 13228725 3' - accord 406 2 54.11 AATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTC:1 + chr2R 5532365 3' - G4 3781 1 50.00 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTTGGCCAATATGCAGTTGTCTTTATTTCATTTCATTTGGCGACTTTTTGGTCCAAAAGAGATAAGCTGGGCGAAAAGCAGGGAAAA:1 + chr3R 16241029 3' - Tirant 10 2 73.60 CCAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTACCAGCACAACAATCACGATATATACTGCAACTGCACCTTTAGCACAACAACAACAACAACCATAAAACACCAACCGCAAACGTGCTTTCTGATAAGGGTTGTGT:1 + chr3R 8113407 3' + Doc3-element 463 1 65.38 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAAC:1 - chr3R 7450290 3' - Doc 57 1 52.05 GTAGATTAGTCCAATATGCTACACAGGAACGTTATCAAGTAAGTGCCGCTCAATTGTCTCTCGATGTCCCTCGAACACACACACACTACAACGCAAACGTACTGTTTGATCTAACTTTGTCTGAGAACCAGGCTCAATTGGATAAG:1 - chr3R 16271331 3' - Stalker 2 4 58.90 GAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAG:1 - chr2R 6798250 3' - jockey 98 1 79.45 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAATGTGCTAATTTATAAGAAAAA:1 + chr3R 19436137 3' + roo 398 1 75.86 ACAATATGTTTTCTGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACCAATAATATTCATCCAACAACTTTTGTTCCATAATATTTCAT:1 - chr2R 21870175 3' - copia 4947 2 70.55 TTAATCCATAATTAGATCCTACTAACAATAATATTTATTAGAGTTTTTACATTATATTCATTTCCTAGCTATGTTAACCCGACTGTCATAATCCAGGCAAGTTGACCGAAGGGACGAACTGCAGCG:1 + chr3L 22938126 3' + Cr1a 4280 1 52.38 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACTCTATATGGTAGCAAACAGTCGAATAGAAATATGAAGAATGAATATAGAAGCAATAGATAGTACATACA:1 + chr3R 6461853 3' - 297 39 2 56.30 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATT:1 + chr3R 25751875 3' + roo 332 2 72.60 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTATGGAACTACTTAATGGCTAACAAACACTCGTCGCGGGC:1 - chr3R 13225435 3' - hobo 14 1 76.03 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAACCTTTATGGTGTTTAAAGCAGCAAACAAAACTGAAACAATACCAAATTCTACTCATTAG:1 - chr3L 15364758 3' - 1360 10 2 76.71 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTTATTTCCGCTGATGTGAAAATGAATTAATTGGAATATGATTGAATTTTCTCAGCGTTAAATATAATA:1 - chr3L 4640997 3' - jockey 59 1 53.85 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGCAGAAAAGTTAATTACAATATTTCATTGCTCAGACGTTGGTGGAGGGGCGG:1 - chr2L 12144203 3' - transib2 36 1 53.51 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAA:1 - chr3R 23161273 3' - 412 7123 2 65.07 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATCTGAAGCTGAAGCTGGCATTCCATTTGAATTA:1 - chrX 8219394 3' + opus 433 2 75.20 CATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACATAAAAAGGAGTGCTGATGGAAAAACTGCTGGACTATACAGCCGCCCCCGGCAATCGGACACGA:1 - chrX 10676489 3' + roo 314 2 56.52 GTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTTAATCCAATCCTTAAAGTGCAAAACCACACAAATCGCTTGTGACAG:1 + chr3R 9959061 3' - I-element 5075 1 55.77 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAATGTATTAGGAAATCGTTGCCACTTGCCCATGTTGTATTATGTTCATAAAATAGTGCTTATGAGTGATTTGTCGGATGTGTACGAGTTCATGTAAACACAATCGAA:1 - chr2R 13293303 3' + roo 394 1 74.66 TTTTTCAATAGCTGTTGCAAATAATAAATAGCCGAATAAAGTTTGTTTAGTTTTACGATAGTAAACATGTTAAACCCATATAGTTTAAATGTGCAACCACTATTCAAGATGCCATGTTTTAGGTGGCTTAAAGAGGACATAACTGC:1 - chr3L 14725401 3' - diver2 4880 2 58.90 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCAAGTGCTAAATTTAACAGGCT:1 + chr2R 5754562 3' + P-element 2850 1 35.71 TAAGCAGAGTAACCATAGAACAATGTTCTCAATAGCTTGCAAATTACCTCATGAGATTAGATTTAATTGCTTTTCAGTAAGAGTAGCGCGGATGCGAGACTACGACCCAAACGTAAATAGTTCACGACTCTTTTAAGGATTTTCCC:1 - chr3R 25781646 3' + BS 379 1 60.27 CTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGGGATTCCCCAACATTAATAGTTAAGTTCTTTGAATCCGAAATGGGTCACTGAACTA:1 - chr3R 25543401 3' - G2 179 1 52.05 GCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGGTAGAGAATATATGGAAAATGAGTTATGGATTTTAGTGGGTACT:1 + chrX 10578635 3' + pogo 157 1 69.23 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCATTGTATCAGTGTGACAATGGCAAATAGTGTTTTGCGTCTATAAATTAAAATGGTTTCTGGGG:1 - chr3R 28450614 3' + roo 9054 2 72.22 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAAAGACCCTACAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACACTTTCAATCAGAAACAGGTGGAAACA:1 + chr2L 17432131 3' + 1360 3345 1 58.57 CCGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCAGGAGTGGTCAATACGTTAAAAGATTGATAGCGAAGGGTCTCCTCAGAAAATATTTCACTTCGCACAACAAAAGGCAAAGAAATTAATTATGAAAA:1 - chrX 19229220 3' + R2-element 3155 1 71.23 ACATGTTCGCGTATACAGGGGGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTGTTTATAAATAGGGACAACTGTACCCTAAACAAA:1 + chr2L 19160454 3' - 3S18 16 2 66.07 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAATTGCATGGAAAAGCATTGGAAAAGCGCGAAAAACTAAAA:1 - chr2L 16264703 3' + 297 373 2 71.92 AATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAGTAGAAGAAGCAGCGC:1 + chr3R 31724906 3' - P-element 107 1 13.01 AGTTGGTTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTGGCTAGTTAGATAATAAAAATATGTTAACTTATTCTATATACCAAATTT:1 + chr3R 6816773 3' - Juan 465 1 66.44 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCGGTTTGTTCTTGGTCCACTCCGTTG:1 + chr2L 18113007 3' + transib2 2747 1 78.03 CGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGGATCTTATGCGGTTTGTATATTACGATCATGAAA:1 + chr3R 12363798 3' - jockey 4747 1 64.58 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCATTGTATCAGTGTGACAATG:1 - chr3R 28450657 3' + roo 345 2 63.01 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGCATTTTACGTCCTTGAACTTACCCGGTTGCCATGAATCCTACCGTGAATCCTACGAAAACCAGACATTTC:1 - chr2R 15075521 3' + mdg1 412 2 79.45 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCATGTTTATGCTTATTGCTGTGCTTTCGTTCTGTTTTTTCCCTACTAATTGTTCAGCGATAAGA:1 + chrX 7756496 3' - roo 8723 2 62.33 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTAAAAACAGTTAATACTATGTACATATTTAATTAACAACTTTTTCTGAATTCAAGTTCACTTTTCTTTGACTTGGAATTCCCTGAACTTCT:2 + chr3L 7870314 3' - roo 8693 2 62.33 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGGGTATCAAGTTAAATATTGTTTTGCTTTT:1 - chr3R 26486008 3' - 412 7102 2 52.05 TTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATAATA:1 - chr2L 9275004 3' - F-element 87 1 69.18 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGGTGAGCAAACTGAATCGCGCCAAACTCCAAACGAAACTCCCAAAAGGGAGACGCAGACCGGAAACGGAAGTGCGTAATGCCATACGTGACC:1 - chr2L 19997025 3' + Tirant 8487 2 71.01 GGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTTTCCGTTTGCGATCTCAAGTTATATGAAAATTACTAATTGAG:1 - chr2R 16225650 3' - invader2 5049 2 73.27 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTAAAACGAATGCAGAAACATGCAGATCGTTAGGCGCTATTTT:1 - chr3R 7778266 3' + transib2 2747 1 74.66 GATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGGGATTATTGTGCCGGCTCCAAGGAGTAGATG:1 - chr2R 13367399 3' - jockey 4573 1 73.79 CGTGTGAAGCGCAATGTCAGCATTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAGAAGACGGGCTACTTCATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAAACAAAAAAAAATATGTCTCATTTTACACAATTGCTGTTT:1 + chr4 482602 3' + gypsy4 6699 2 71.43 CTTAAAATGATTCTTATAGTTAACAAAGACTCGCAGCGGCCAGGCAAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGGTTTTGTGTTTTGCACATAAATAAACATGATAAA:1 - chr3R 20697734 3' - Gypsy6A_LTR 140 1 67.27 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACATTCTCGGAGGGAAACTTGGTGGTGCTGCCTCAGCTTCTTTGGAAGGTACGTGCAACAATCAAGTGTCAGCGTAATGAGCTATCAAGCTGCAAAATAT:1 - chr3R 24499455 3' - blood 23 2 68.49 AAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTA:1 - chr3R 24750976 3' - G6 61 1 66.13 ATATTTTATTTTATTTTATTTTATTTACAAAACGCACGCAGTTTACTTCCCTTCCCTTCCACTGCCCACCATTTGTATACGCCGCTTTGCCCATCAGTATTATCAGTTCCTATCTCGAGTTTAGCGCGGTGACAAGGCTTCTCCTC:1 - chr3R 31990803 3' + transib1 1898 1 65.07 TTTGTTTTTTTTTTTATTTTTTAGTTTCAAGTTCTGCCAGCGGTTTTTTTTGGGTTTTTGGGG:1 + chr2L 17735538 3' - BS 5098 111 57.14 CATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGGGATTCCCCAACATTAATAGTTAAGTTC:1 - chr3R 25543429 3' - G2 207 1 34.25 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAGCATTGTGACAGGTGCAGCCGTATTTATTATAACAAAATGATCAAAATTGTGATACATTTTGACTTTTAA:1 + chr3R 17047916 3' - 412 53 2 51.37 GGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTGATTACATAAAATATAATATTAATTACTGTTTGATTATAGGAGAAGATCTTCTTGGTACAAATATTTTTACATACCGTG:1 - chr3R 14631197 3' + Burdock 335 1 65.07 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGTTTGCAATATAAGCTAATCCGTGTGTTCTAAGTGAAAACATAGGGGTTCAAGCGAGTTTTCGCAACGAAATTCGGGGG:1 + chr3R 13225602 3' + hobo 2906 1 60.00 AATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAAAACTTGATTTATTTTCGCTCGTTTCGAATTAATTTG:1 + chr2L 19943227 3' - FB 347 1 74.66 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCATGTTTATGCTTATTGCTGTGCTTTCGTTCTGTTTTTTCCCTACTAATTGTTCAG:1 + chrX 7756488 3' - roo 8731 2 67.81 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCAAATGAGCGCTAAACGAGCTCGAAGCCTCCAAGAGCAGCACGATTTTTTTTGGGGCTGCCTGAAGAAAGC:1 + chr2L 11405872 3' - 412 7104 2 52.05 GTTCCCGCGCCGCAGTCGTTTGGTGAGTATCTCTTCTACCCTCATCGGTAGATGTTTGCAATTAATACATCGTTTATTCCAGAACAGCTTTGTCTCTCTCGCTCTCGCAGTGATGCTGCCGGGGAAAAAG:1 + chr3R 5772086 3' - HeT-A 5586 1 69.23 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCTTCAACTCCATTCTCCATGGTCGGCGAACATTTAGTAGCCTCTTAATTCAGT:1 + chrX 5503746 3' - hobo 71 1 64.38 AATCATTGTAGTATTTAAGTTTGGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTATACATCATAATATTGTATTAACATGCATCAAA:1 + chrX 22900314 3' + Tc1 1550 1 69.86 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAATATTCGTATTATTTAAATAAGTAGCCTCAATCGATTTGCGTGATGGAAGCCTCGTC:1 + chrX 7712833 3' - roo 49 2 61.64 GGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGCATTTATACTTATTTACATTATAATACATTTTTAAAAGACTTAAGTTTGCTTTCAAATTTAGA:1 - chrX 14963009 3' - jockey 4664 1 56.85 TGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAGTTGTTTGCGAACAAAAGCTCATTTAAAATACCTTTTCTCAAGATTTTCAAGACTCCAGTCACCAC:1 - chr3R 10437042 3' + BS 5057 1 54.76 GTGTAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTGGCATATAAATAAAATTCTATTATGTGGTTGTGGCTT:1 + chrX 4032212 3' + transib2 2743 1 73.29 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTGTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGC:1 - chr2L 13629041 3' - Tirant 8 2 74.56 AAGATATTAGGATAATTTTCTTAAATAAACTATTTTTTCGATTATATATCTAGTGATATCTACTGATAATTAAGAGTAACTTTCAAATATTTATAGAACCTTTCTTTCTGAAACTTTGATGTTCAACCCAACTTCATTTAGAAATA:1 + chr2L 12331955 3' + Transib-N1_DM 58 1 57.53 ATGTGTCATATGCGTAATAATCGGTACCCAGGGAACACCACGAGGAGGCCATTACAATTTTAATGGGGTCCTATATTTACGTATATATCAAGTCTAAAATATTTAACTACCCAGCATGGCCGTAAAGCTCCTCCTCTGCGTAGACA:1 + chr3L 6398754 3' - 1360 2927 1 69.18 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATT:1 + chr3L 19031303 3' - roo 58 2 71.43 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAATCGCTCTCTCAGTCGGAGCGTACGCTCAAAAAAAAAATTGGTGATAATTTGATAAAGG:1 + chr3R 14278002 3' + P-element 2865 1 67.18 CCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTAATATCACCCGAGATTGCACACGAACTCCATCTAGCGGCAGCCGTAGATGTGCCCAAAACTTAACGGACGGACATTTGCCACTTGACTC:1 + chr3R 5422981 3' + roo 9040 1 62.33 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGTTCACAGGTCACTGTATCAGTATATCAATGCTCCAC:1 - chr2L 3960175 3' - jockey 66 1 57.53 CAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGAAGGTACTCACAACGATTTCTTTTAAGCGTAATTATATTTTT:1 + chr3L 9212753 3' + hobo 2870 1 67.91 AACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTGGCC:1 + chr2R 10910301 3' - Tabor 6903 2 60.99 AACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCAACTATGGCCAGGTAAGGGCTGCCATCCCATTCCATTCTCCACTCCTCCATTTAAGAGGCGAAACCACTGCGGTTCTGGGCTG:1 - chrX 19199756 3' + jockey 445 1 74.56 ATATCGCATAAAAAATGCAGTGTTGCAACTTAAGTGTTTTTAAATATCTTTTTGGTGTCCCTAATCTAAAAATTCTAATCTAAACTTAAAAAAGGGAATCTGACCTTGTGTTGGTTTAGCACGATCCTAAATATTAAACAGCATTG:1 + chr2R 401501 3' - transib3 137 1 71.92 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGCCACTAGCAGTTTGACAGCCACTGGGAAGTGTAAAAGTAGGGGGCTAGAATGTGAATAA:1 - chr3L 2425875 3' + hopper 1358 1 56.34 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACT:1 - chr3R 20450418 3' - hobo 51 1 61.36 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGC:1 - chrX 6632984 3' - P-element 102 1 15.75 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAGTACTAGAAAAAACCTAATTTAACCCAAAAAATGTAAAAAGGTATAGAGTTCCGATCCTGCCAGGA:1 + chr3R 8140962 3' + pogo 2049 1 54.79 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGAAATGTTAAGAGAAAGTAACTGCTGATAGCATTTAACCCATATAA:1 - chr2L 4929779 3' - blood 42 2 56.85 AAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTGCACGTTG:1 + chr3R 11095887 3' - hopper 61 1 58.22 ATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAATTTATTTAAAAATGTCAATACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTG:1 + chrX 392290 3' - INE-1 300 1 64.38 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATCTATGTACGAGTATCATGC:1 + chr2L 17626703 3' + roo 9030 1 57.53 ATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTAATATCACCCGAGATTGCACACGAACTCCATCTAGCGGCAG:1 + chr3R 5422933 3' + roo 9026 1 62.50 AAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATGATTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTATATTTAAATAATATTCTTATTGCGGTGTGAAAAGTGAACAACTCAGTCTCGCCATTTGCGCGCATCCAATCAGAATGCATTCATT:1 + chr2L 1669747 3' - 1360 373 1 50.68 CACTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTGGCTTTTAAGTTGTCCGCTCGTAGC:1 + chr3R 21561672 3' + Cr1a 283 1 82.14 ACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTTCTTGCTCAATAGTTTTCATCATGCATATACATATGTATGTATGTCTGAGAAGCCCAGAGCGACTTTTTCATTCACTTCAGCGTCCATATTGTTCAGCACAGCAAGTCGCC:1 + chr2L 22996463 3' - 1360 3285 1 77.40 TGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGATGTCGCTTAGTGGTAATTTGGAGGAGTGACCTCAGCCTTTCCATGTGCAGACGG:1 + chr3R 18901839 3' - Quasimodo 304 2 60.58 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAG:1 - chr2L 19652528 3' + roo 338 2 65.07 ACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACACTTTTTTCTTCAAATAAACCCACAAATTTTCTTTAGGCTTCAGATCTGGACTCTGAGGAGGCGTATTGATTACCTTGCCGCAGCTGTAAAGCAGCCAGTTCCGCACGTAAAG:1 - chr3R 7239510 3' - invader2 4781 1 78.08 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAACAAGCAGATGTATCTGCTAAATGAATGAAACAACACAATAAACGCAACTATTCCATAAATGC:1 + chr3L 3453737 3' + Tirant 372 2 67.12 GCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCTCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGGAAAATTCAAGATAAGTACGGCTTTAAATCCTATTCCGTCCGTGGAGATATCTGGTTGGACGTTCTCAAATTTGAAACATTTTT:1 + chr3R 17588052 3' + Max-element 307 1 73.29 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACG:1 - chrX 388237 3' - 1360 63 1 61.38 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTACGGCAAATAATAGAAGAG:1 - chr3L 12874870 3' - jockey 71 1 60.27 CATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTTTTGTAATAGATTTGAGATTTAAAATAATATTGTCAAAATGTATCATTTAAAATTACGCGGTATCGATTGA:1 + chr3L 17027460 3' + pogo 205 1 54.79 CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCG:1 - chrX 388230 3' - 1360 56 1 56.55 CATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATAAGACAAAGACATTTTTCAGCATTCAACTCACTATTTATTCATCATTGCTAACGAACGGACG:1 + chr3R 443317 3' - flea 4801 2 57.04 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGAGCAGCAATGATCGTCTGGGGTCCTTCGTTACTGAGCG:1 - chr2L 17380643 3' + hobo 2910 1 56.67 AGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTCAATTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTACTAAAACAGTTAAATCCATGCCTAGACGAACTAGGGATAGATGAATGCTTCCGACATATCTGATCATTGT:1 - 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chr2L 13842294 3' - jockey 4745 1 69.06 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTCATAAATTAACAAAATTATAATTAATTTGTATTCAACGTGAATAAGTGGGGCTTTACAAAGAATAGTATTGTTTATCTGCTCTTATCAAA:1 - chr3L 17667524 3' - F-element 41 1 57.53 GGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACGTTTTTGATTATCTTAAAAAATTGTAATCACACGTACTCCTGCC:1 + chrX 2295299 3' - Transpac 2 2 62.33 GTTTACATTTAAGAACCTATGTACTCTTAAGAACAAAACACTTATGTACAAAACAGAGAGCTAGAGGAGACTTCTCCAAAAGAATAAACTTCACTCTGGTTTTGATTTATGGCTATAACAAGCAAGCAGAGCAGCAACAACTGAAT:1 + chr2R 15615147 3' + Tirant 8302 2 71.92 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGGAGTGGAAAAAGCAGCAATGGCAACTGCCTCCTGCAATAAAAGTCACAATGGCGA:1 + chr3R 22494216 3' - 297 6608 2 62.22 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCGTAAGTTTCAAGTATGTGGTTGAAATTATTTCATTAAGTAATACATATGTAAATAATAGGAGTACTATTAGAAGTGAACGATTATGAGAACCGATTTCAACACACACGTG:1 - chr2L 13302562 3' - Transpac 4926 2 69.18 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAATCACATCTAACGCTGGACG:1 + chr2L 23049731 3' + opus 433 2 67.81 ATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACAACTTCGACGACGACAACTACAATATCCACTCTCTGACAGGCTAACCCAACGCAAACAAAAACGACAAATCCGTCGTCGAGAGCCCC:1 - chr2L 19420145 3' + Doc 170 1 64.14 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGTTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCTAATCCAAATTTGTAATTTATTGAACTCAA:1 + chr3L 16059361 3' - 297 20 2 66.67 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCGTTTAGAATCCGTTTTGCAAACCAAAAACTTCTATTCATTGAAATCACTTGTTCGACATAAATGACCGAAAAATTGGGTCAATCACTGGCCGAACCTTTCGTTTTTG:1 + chr3L 14167485 3' - mdg1 12 2 77.08 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACCAAAGCACCCACAGCATATTGTTCACTCATATGTGCACATTCTGTCCAAAGTGGACAAACCCGTGAAACCGAACAACACCCATTAC:1 + chr3L 16855324 3' - FB 37 1 52.74 ATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATGTATATATATACATATAGATACATCGATTCTCTGGCGATTCTTCGAATGACTCATACTCATCAGTAAATTGCGCACTCATTCACTGACCAATTGAATGCACAT:1 - chr2R 7720644 3' - Bari1 14 1 73.97 CATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTACCGGGTGATGTTAATTTCAAACATTTCAATTTCGTTGCCAGTTTTAATTTAAATTTTCAGCTTGTGTGTATGTGATTTTATGAAAT:1 - chrX 20901891 3' - accord 184 2 62.07 GTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCGAAATATTTTTTTTGAAACACTTTTATCCATCGCCATATACTCATTGTCCTTGCAACATGTCACCCACGTGCCATTCAGGTGA:1 + chr3L 21573116 3' - 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P-element 73 1 32.37 ACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTGGAGTGGATGGAGTGGCCGGGGGACACGGCTGACGGGGCCGGG:1 - chr3L 8461717 3' - mdg1 7244 2 61.47 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTATATATACGCATCTGATTACTCCAAATTGCAATAACATGTGAATGATTACATATGAGCACCTTTCA:1 + chr2L 19310435 3' + Juan 4194 1 69.18 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCATCAAAAGAAATAAAGCAAACGTTGCTTTCTTTGGCTTTCTTCAACTTCTTCTTCAATTTGAAAGAATGGAAAAACCTTGTTTTGTGCAATCATGGCTGCAGCCTAT:1 - chrX 4400255 3' + roo 394 1 70.55 GCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGGACGATGTCAAGTGACTGACTCATGTAGTACCAAAAATCAAAAAGTATGAAGTCT:1 - chr2R 5527390 3' - roo 243 2 77.78 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATGATTTAAATTCTATTACTTTTTATAATATTGCTGCTTTTAAGATTACTATATGATCATCGATATTGCTTT:1 + chr3L 5630456 3' - I-element 57 1 53.42 GTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATACATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTCGCCCTT:1 - 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blood 28 2 61.60 GCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCATTCTCCTCCTCAGTCTTTTGGGCCTTCTGAGCCTTCTGGCCCTCATGTGTCACTTTG:1 + chr2R 20925421 3' + 1360 3214 1 61.64 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGAAATGTTAAGAGAAAGTAACTGCTGATAGCATTTAACCCATATAACTCCGAATCAACTGCACCCATGCCCCACATTAT:1 - chr2L 4929746 3' - blood 7019 2 78.62 GACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATAAAAAAATGGAACATATTTTATGGGAATTAAAACAAAACCTTCAACATTCATTGTAGGTTGCCCATTAATGAAAG:1 + chr2L 13332731 3' + micropia 5406 2 61.15 AAGTTGCACAGCAACATTGTCCGCAAGCAACCCGACCAGCCAAAAACTTGAGTAACCAAGAGCTAGAGGAGACTTCTCCGACACAATAAAGACCACTCTGGTTTTAAACTCGAAAGAGCTCAGTATGCCCCCTTTGGGAATACCGA:1 + chr2R 5071100 3' + Tirant 133 2 72.60 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTTTCCTTGATGCGCATTTGGCACAGCGCTGAAAAGCGTGCTACACTTTTTGAAATCCTCGGAAGAGCCAAGAATATGCACCAGATGTGATG:1 + chr3R 26846875 3' - hopper 29 1 67.12 ACAAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTAT:1 + chr3L 7801299 3' - 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Quasimodo 51 2 64.38 GGTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGT:1 - chr2L 3960210 3' - jockey 101 1 79.45 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCGAAGTTGCGACGATGCCCGCCGACAGCACACGAAGTAGCGCCCTCTTGTGGATTTTATGTGTAACCTCAGTCT:1 + chr2L 17260854 3' + P-element 2866 1 71.23 TGGGGGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACATTCTCGGAGGGAAACTTGGTGGTGCTGCCTCAG:1 - chr3R 24499519 3' - blood 7098 2 73.97 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGTTCTTCCATAAAAGTGAAGCGAAAAGGGTTAACCTTTAAAAT:1 - chr2R 19843323 3' - jockey 87 1 69.18 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTTTCTGACACATTTTTTATTATTTAATGCTATGGATATAAACGGTTTTTTTTTGTTTGGAATAAATTTATAATA:1 + chr2R 5106929 3' - roo 48 2 55.48 CATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATAGACGTGATCTTTCGATTTGCAACTAAAACAACTAAAGCACGCCTCAT:1 - 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P-element 27 1 60.94 GTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACACACACACTCTTGAGCATGGTGGGGGCTACAGG:1 + chr3L 13678956 3' + hobo 2880 1 77.78 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGCTTAATTT:1 - chr3R 9125624 3' - Doc 24 1 70.80 CAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGC:1 + chr3R 31141040 3' - Burdock 6212 2 71.23 AATAATAACATTAAGGCAATGCTAATCAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATTGACATGACGCAGTGCAAATTATTTATTCACATTTTATTTTTAGCGCACTCGTTGCGCGGCTGCCATTTTATTTGTGTTGTTGTCCATGG:1 - chr3L 9186040 3' - 1360 302 1 62.07 AAATCGAAATTCTTTAAATCAGAATGCATACAATTTACCGCTGAGTACAAGAGCTTTTAAATGAATAGTATAAAGATGGCAAGAGACGTCATAGAAATAAATTTGACTCGGCTAACGCTCTGCCTGATTATGGGGTTGAGGAGTGG:1 - chr2L 13683139 3' + TLD2_LTR 153 1 53.42 AAGCATGAAAAGAACCCTGGGTCCTACCGTCCAATCAGTCTACTCCCTTCTATTTCGAGAGATTAGCATCAGATGCCAAAGCGTAGATTACCCGAAATGAACACTGAGTGTAGAGCAGAATTTAACAAATCTTTGGGGTATTGGCT:1 - 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Transpac 9 2 73.97 ATCGAATGCTGAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGCTCGCGACAGGAGCGCCTAAAGGTCAGCGTGGGGTCCATCTCGTTCTTGATCTTGATCAGGGCA:1 - chrX 18895449 3' + copia 4646 1 50.00 GGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTAAGTCATTTGACTTAATATGATGTAACATTAACATTAGAAGTGTTTCAAAAAAAATATTTCGCTTTTAAAAAATTGTCAATCAGCACAAATCACAATATTTAAAACTAT:1 + chr2R 21432904 3' + 1360 2983 1 56.85 ATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATGTATATATATACATATAGATACATCGATTCTCTGGCGATTCTTCGAATGACTCATACTCATCAGTAAATTGCGCACTCATTCACTGAC:1 - chr2R 7720659 3' - Bari1 24 1 65.96 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGACCGTTTCATTTTGTGCGAAAGTCGAATGTATTATCTTGGCTACAACCAAACACCAATAGATACAAAAACTTGGTTGAAGGCT:1 - chr3R 6413497 3' + 1360 3380 2 78.08 CTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATTTTTTATGCGAAAAATTCCATTAAAATGTTATCCACAGTTTTCGGGGAGATTGAATTTTTCTGT:1 - chr2L 18158988 3' - INE-1 152 1 65.07 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTT:1 + chr2L 11554549 3' + roo 331 2 75.19 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCATAGGCCGACTACCAATAATAAGAAGGAAGACCTCTGGACTGTCTGGAACCTCATAATTTATACACTGCAGAA:1 - chrX 21670007 3' + mdg1 374 2 52.74 GAGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAACACCCGGCCCCGCCCCCTTTTTGCCCCCCTGCGCGAC:1 - chr3L 3453552 3' - Tirant 14 2 77.40 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGCGGCAGTTATCGAGAAATGGCAG:1 + chrX 12273154 3' - jockey 4703 1 54.13 CCGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGCAAGTGGAGTGGAGGAGCCATGGAAAAGAACTAAGAGTTAAGTG:1 + chr2R 21439548 3' - jockey 36 1 60.29 AAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGCGTTGGGTTGAACCATCTAGGAAGAAGTATATATGGATTGATTAAGGAAATCTTTGACTGAAAACCTTCTTTCCAAGCGTACCATTCTCCAATCTGGCGAAGCATC:1 + chr2R 21822657 3' - Doc 4559 1 71.92 AAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTACAGGAGAGTCATCGCCGTCGCCGACAGCGTGGTTCGACGAGGTACAATTAGAAAG:1 - chr2R 5853814 3' + Bica 4612 1 69.86 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGTTGTTTTAAGCCTAATAAAATATTCCAATATGAATCAAGTATTTTATAGAAATCTTTTCAAAATTTTTCGACATTTTGTATTAAT:1 - chr3L 12223105 3' - Transpac 4953 2 62.33 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTA:1 + chr2L 5270358 3' + jockey 4917 1 70.55 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATATATAAGAAGGGGTCTAATTCCATATTGATGAGACCGAGATGGGATTGTCATGGGTGAGGGTTGGGCCAGC:1 - chr3R 28406334 3' + opus 455 2 53.42 CTACATCTACTTCCCCGCCCCCAAAACCTCCACGCCAAAACTGTTAGTTCTTTGACCTCTCTCCTTACCACATTAGCAGTCTACATCTTCTCCTCCTTTTCTGAAGGATCGCATCCGTTGGTCCGCAACAAAAGCAACAGGATC:1 + chr2R 15132376 3' + gypsy5 12 2 64.58 CTTTTACCAAAGACACTAGAATAAGGGTCTTTGCTTTTACTATACGAGTAAGGAAGTTATCGGGCTGTTGAGGTCGCTAAAGAAAAATGTCCCACATTATTAGCATGGCTTCATAAATTGAAAAGATAACGTTTCTGCGCCCGCCG:1 - chr2R 6045142 3' + Tc3 236 1 76.03 AGGGTTGGTGTTGTTAAATGTATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAATATGTTTAGTGCTTTAAAAGGTTAAAATATTTCAGTGATATTTATCTAAAATAA:1 + chrX 8981465 3' - I-element 5087 1 61.64 AAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAGTAAAGGAACCGAAAAAAAAAACAAAAATGAGTGAATGAAAAGAAAATTA:1 + chrX 5210662 3' - hopper 145 112 81.82 AGTAAAATAAAAAATAAAAATAATATAATAGAAGGAGGTGTATATTTCATTAGTCAATGTTAATTAACGGACTCAAAATATACCCAATCTTCGAATTATCCCATTAAAAGATAGTAAGGGGTGTATCTTTCTTATAGTATAGTCCG:1 - chr2L 1303812 3' + F-element 4683 1 39.04 GGGGTATTGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACCCAGAGGTACAGTGGCACGAAATGGGGTTAAGATTTGAATGTAATCGGTACTATATCATATGATATTTGCAAGAAA:1 + chrX 8638238 3' + BS 4691 1 54.11 GCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCCAGTCATGTTCATATGTAACAGAAATATATAGAGCTGAAGTACAATATAT:1 - chr2R 4577026 3' + Chouto 494 1 69.18 TAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTT:1 - chr2R 10910238 3' + Tabor 7233 2 79.45 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAGGGCTGCAGTCGAAAATGGGGTGACTTGGCTTGAATTATGACTTGTTTTGA:1 - chr3R 7885538 3' - jockey 21 1 76.71 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGCAAATGCCACCCATTTTATCGTTATTTACTTA:2 - chr3R 13838209 3' - 297 6644 2 63.01 AATAAAAAAAAAAGAGGGAAAACCGGGAAAATCTGGCAA:1 + chrX 11017409 3' + Bica 337 1 79.49 ATAAATTAAAAAACAAATTCAAAATATCAAATATACAAGAAAATAAATAAATAAAATAAATATCAAGAAACTCTCCGACTCGTGCACCCGTTCCGGTTCCCAAGTGAGATGGCTACATTCGTGTCCTGCGCAACAGGACGAC:1 - chr2L 13921053 3' + S-element 135 2 52.11 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGACGAACTGATCTGACGCGCCAATGTGACCAATTACATTAACAATAAAAACGCATACATTAAAATACTAAATCCGAGTGCCCTCTATCG:1 - chr2R 5106272 3' + 1360 3357 1 41.10 GCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAATTGACCGCGATAAAAATAGCACCAGATTTGCAGAAAAGTGACG:1 + chr3R 7890871 3' + jockey 4706 1 69.86 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGAAGTAACTAATAAATCGGCCACATCTTATGAAAATACGTTTGAAGATTTGTTTCCAGTGCATGGCCGCAGGCCTAGC:1 + chr3R 28117093 3' - hobo 43 1 56.16 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACTAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGCCC:1 - chr3L 7837145 3' - jockey 4804 1 53.42 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGATCGGAGCTGAAGCAGCTTCAGCAACAGCTCACCAGCTTCCAGCTCTCCAGCTCTCCAGC:1 - chr2L 19308946 3' - Tirant 6 2 78.62 CTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAAAGCTGGGGAAAGTGCACATAGGTAGTACAGAGTAAAATG:1 - chrX 7383216 3' + I-element 37 1 73.29 CGTGCCTTTGCCGATGAGGCCTACTTTTCAAGCGGATGTTCGGTTATTAAAACACAGCGTGCATTTCGGAATTTTGCATGATGATCTTCAATTTCATCCATATAAGATGGCGTGGTATAAGATGGCAGGAACTTTCAGAAGCCCAT:1 + chr2R 7394656 3' + mariner2 155 1 45.89 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATATATAAGAAGGGGTCTAATTCCATATTGATGAGACCGAGATGGGATTGTCATGGGTGAGGGTTGGGCCAGCTCTCGC:1 - chr3R 28406328 3' + opus 461 2 57.53 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAGATTTGTTTTGGTTTAAGATCCCAATCAGTCCGGAGTTTCAATTAAAGTTCCATTAACGCTTCGCGACACACACAATT:1 - chrX 6632896 3' - P-element 14 1 76.03 TGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAACTCG:1 + chr3R 8849830 3' - 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chr3L 14167343 3' + mdg1 7388 2 65.75 ACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATGCATAACGATA:1 + chrX 20685961 3' + Ivk 5336 1 54.79 CCATTTGAATCCAAAATAAATATCTAGAATAGATTATTTAAAAAAAAAATGTCTAATTTGAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGATTATTCATATTTTGGTAATGTTGGCAATAGAAAAAAAAATCTTTACCCCTATGTCTGAA:1 + chr3L 14944679 3' + G5 4817 1 62.33 CCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAACTAATAACGATATTAAAAAAAAATCTTCGTAGTTTTGGGAACAATTTTTTTGGTATAATTTTTTATTTTTATAATTTGTAGCTACGATATAATAAACTGGATTTATCCAGAGCGC:1 - chr3L 13987104 3' - diver 5895 2 63.70 AAAAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATTTTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATGATCGTTGGCTGTCACACTGATCAGGTGGCGACCCACAGTGGTGG:1 + chr2R 22720739 3' + I-element 5269 1 67.83 CCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGGTGGTAACGTTGGTCGAGCTCCAGCGACATTGACTAAAAGCCAATGACCAAATGAAGTTGCAGCCATAGGAAACGAGTTTCTCGTTTTCTAT:1 - chr3L 284354 3' - roo 208 2 68.22 GAAAAAATAAAATAAAATAAAATATCGGCGGCGATCGGGCTTTCACTTGTGCTTTCACTCAAATCCCTTTGACATCCGACCAGCTTAGGCCTGGTTTAATCAGGCTAATTATGTAAGCTGCTGAAATTAAACAACAACA:1 + chr2L 2330808 3' - transib1 1901 1 80.58 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAAT:1 - chr3R 15295741 3' + roo 321 2 82.88 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGTATCAACATATTACGGCATTTATGGTAATTTTATTGGTGCTTTGATTCAACAGCAGCATGAATATTTATAATCTTTGAATAAAT:1 + chr3R 10150266 3' + 1360 3353 1 60.96 CGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCTCATATCACAGAG:1 + chrX 21994014 3' - McClintock 5981 2 60.74 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATATCTTTTTATAAAAATTTTAACGGTAACAATATATTGATCA:1 - chr2L 7822234 3' - Juan 61 1 56.85 CAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAAACAAGCATTAACCGTGTGCATCGTTACTTCTGTAGCTAAGTAATTTAAATAGTTTAATTTTCGAGTTTAAATAGTTTATATTCCTCCTTTGGTTGAAAATGA:1 + chr2R 6673494 3' - BS 5032 1 70.55 TTTAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAATAAGAAAAAATCATGCAAAATAAAAATATTAAAAATAGCAAGTCAATCCCAACCCATTTAAAATATTGAACGCATCCGTTAATTCGACGATAAGATCCACAGACATTTGCAAGAATTC:1 - chr3L 12335902 3' + TART-C 11100 1 72.60 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGCTTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTC:1 + chr2L 21910225 3' - Doc 24 1 48.42 GAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTAGATACCAGATAAGCAGATGTTTAACACAGACATTTTATTATTATTATGGTCTTTCGTTG:1 + chr3L 7529982 3' - Doc 162 1 58.90 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCAC:1 + chr2L 3231939 3' + roo 336 2 73.85 GCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATGAGGTGTCTAAAGTATTTTACAATCGATTGTAACTTTTTCTTGAAATATGATTATGTAGCATACTTTTCAGGAGAGTCCTTTTAGG:1 - chr2L 15013213 3' - BS 4891 1 72.65 TTGTGGGCGTTAGAGTGGGCATGGCAAAAAGTGAAAAGTTTAGTTGCAACTGCCAAGCTCGTCAGTGTGGCTAAGACTAAACTTTAAAGCATTTTAGTGTTTTTTCAACTATATGTGTCCCCCACTCGGGCTCC:1 + chr3L 15323604 3' - INE-1 216 1 71.64 GCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACACTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAACAACGAAGGAGTATCTTTTTTAAATGCCTTGGAAACCCCCTTTTGGGTACGCAGCTGTTGGCCATCAGCTACT:1 - chr2R 17347820 3' - INE-1 19 1 69.63 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTGGTGAGTGTTAAACGCACAACAA:1 + chr2L 12486459 3' - roo 8689 2 65.07 GTTACCACATCTACATCCACATCCTCAGTGCCGCGTCTGGTGATCTTTTGTTACCACTTTACCACTGTACCATGTGGCCAGGCTGGGTGTCTCGCTG:1 + chr3R 19287905 3' + gypsy5 6941 2 80.41 ATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTAAAATATGTACAGAAGGGAG:1 - chr3L 365257 3' + blood 7123 2 83.72 ATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAATCACATC:2 + chr2L 23049719 3' + opus 7424 2 76.03 CCGGTAAAACTCACCACAGTGTGTCTGTGTAGTGGTGTATGAAGGATAATGAGAAAGGGAAACGCTTGGTTTTGGTCATTCTTGGTGATGAAATAAAGAAACATTCATTGCCCAAGTTACGCCAATTGCTTGCGGGCCAATTAAAC:1 - chr2R 22369163 3' + invader5 164 2 67.81 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTGCGACCGGGCAATAAATACAGCATAGAAATGATGTACGGAAAACGAACGGAGCTGAAGCAG:1 - 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chr3L 269785 3' + diver2 97 2 54.11 TGTCCCACAAGGGAGCCATATTGGTCCACTTCTTTTTACCTTATTCATCAACAACTTCCCCTTAGCAATAAAACATTCGCGTGTACTTATGTACGACGAGATTAATTTTTTGTTCAACAACTTTTTTTATAACAGGGCTTAAATTG:1 - chr2L 8563793 3' + Q-element 486 2 67.81 ACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATAAAAGTTCTACTGTAGCTGGGAAAAACTGTCGGGCAAATGTGTTGCATACTTTTAGGCAG:1 - chr3R 25388605 3' - BS 5055 1 58.22 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCATTTTCGGGTCTTCCAGCTATATACACT:1 + chr3R 16276460 3' + pogo 2080 1 65.93 TTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCA:1 - chr2L 19479165 3' + R1A1-element 81 1 58.90 CTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAGGGAAATACTTATCATACTTCCAACGATAAGAGCTAT:1 - chr3L 13952725 3' - I-element 5115 1 72.60 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTCTTGCTTTCCGGTTTTTTGCAACACGAGCCTCTTTTCAGGACCTTGCATTAAATTTCGTTATTTCGTG:1 + chrX 21403533 3' - roo 8682 2 71.92 ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATTT:1 - chr2L 17839381 3' - blood 7069 2 59.56 AAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAATGACATTTCGCTTATAATTTTCCCATTTCGGCGCACAAATGCACAATGCACATAAGCAAATGCA:1 + chr2R 10774009 3' + Doc 4498 1 55.56 TTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAAGGAAGTACAATATTTTAACACATTTACCTGACAGCTTATTGAACAAAAAGCTTCGGC:1 - chr3L 3776266 3' - 1360 429 1 36.30 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGGCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTCGTGGGACCGAAGTTGCGACGATG:1 + chr2L 17260796 3' + P-element 2811 1 32.17 ATTAATATTATTATATTTATTGTATGAAGTAACTTTGTATATCTTCACTCCGATAGATACGCTTGTACGCTTACAGGGTATTTAAGTCTCTGCCTGCCTGCCGAAATGAACTACTCCGCCTCGTTCCTTTTCTGCGTGACCATGTC:1 - chrX 19409301 3' - mdg1 36 2 73.29 AGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTTACCTACTTACATAGTTGTAGTCCAAGTTTGCGCTCT:1 + chr3R 27374457 3' - jockey 92 1 71.92 AATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTAAAGAAATCTATAGTTCTTGTTTCG:2 - chr3R 6645304 3' - blood 7055 2 55.48 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTACATTTGCATCAAGGACTTCCGGTTTGTGCACACCAGCCGAAAAGGATGCAATGGAT:1 - chrX 7741885 3' + hobo 2895 1 56.80 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATGGGAGTTCATCATTACACTTAACTGGCATACAAAAAGAGAGCCCCTCAAGATTCCATGCTGAAAATCTTAAAAAAAGAGGCTTAAGAGCACGGCTGAGTGGATCTGTACAT:1 - chr3R 15920167 3' + 412 463 2 64.38 CACAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAATTCTAAGGTAATTCACCGACCCTCAAACAAACTGCTCGACTTTTTTACACCTCAACCGCAGAAAATAGAACGAAGGACAC:1 - chrX 20685833 3' - Ivk 5216 1 60.47 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACACATCCTTATCCTATCTCTTACAAAAAACAGGAAAAAATGTCATGTATAGGTCACGGATA:2 + chr2L 7652342 3' + roo 402 1 80.14 AAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGCGAGTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATTCGAAACTAGTTTGATTGTCATTTTTGATAGGTGCTGAAC:1 - chr2L 11056154 3' - 1360 3263 1 72.60 TGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATGGGAGTTCATCATTACACTTAACTGGCATACAAAAAGAGAGCCCCTCAAG:1 - chr3R 15920228 3' + 412 409 2 75.54 TCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGATTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCCTTTTTAAATTTGATTGACGTTATTACATTACATAACATCGCACACTAAGAGGAAAGGCGAAGAAGCTG:1 - chr2R 22753988 3' - G2 2906 1 51.37 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTGAGTGAAGAAAACAGTCGAATCGGTTGACTTGACGATCCAG:1 - chr3R 10213003 3' + P-element 2848 1 59.59 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATGTATTAAATAGT:1 - chr3L 12433437 3' + roo 8991 2 74.66 AAAGCAGCGGCCATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGTCTAAGATTTCGTTTTAGGCATCTAATAGAGGTTAAAAAGATTTTTGAGATTGGGGTCCTCCAACCCTTTACCAGGAATTCCCAGATCGCTTACCTCTTCCTCGCGTC:1 + chr3R 5606322 3' - Transib5 2960 1 71.23 AATAATGCGGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGATTTTCAAATTCACATTACAAACAAGAAATGCTTGTTTGGGCTTTGCTGATGGGTATCGTGTTAATATCAGTTGGAATCA:1 - chr3R 4190872 3' - pogo 39 1 58.90 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACG:1 + chr3R 12363789 3' - jockey 4758 1 71.92 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATATCAATTCCGCCTTTTATATTTACTTATAAGCCATTTTTAATAAACAAATGAACTTGCTTTTTTAACTGATTAGATA:1 + chr2R 13046605 3' + 412 458 2 55.71 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCGTTTTGGTTGGAAGCCACTAGCTTTCAGCAGGCGAATCGCTCCTAGATACTGAGTGCCCACCGATTTCATGTCCTGAGTACCCCGTGCAAAGATCCTACCCTCTTCATCCA:1 - chr3R 23098114 3' + roo 399 1 73.10 CACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGCCTAGCGATCCTGTTTAAGAATATATCCATTTCAGCTGTTACATAATTCACCTATACTTGTTATTATACATATGTACAC:1 + chrX 698544 3' - Ivk 6 1 60.96 AAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCAT:1 - chr3L 27356067 3' + Tc3 1650 1 58.22 GGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAATGAT:1 + chr3R 934291 3' + Rt1b 4747 1 60.96 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGATTGCGATTTCTTCAGTTTATTTGGGTCTGTTTTAGATTCGAACTTCAGAATTGATTCATATTACGCATTTAAATTATTTAAACCGT:1 + chr3R 20840184 3' - roo 8699 2 58.90 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTA:1 + chr3R 21674902 3' + roo 336 2 67.81 ATGATAAGTAGGCAAACTATAAATATGTTCTAATTATGGGCTGCAATAAACATGTCACTGGACAGCATAAGTGTTTTTATGTAGATATACTGGCAATGAAACTGGGAAAAACAATAAACGTTTGAAGGAAACCAAGCGAAACAAGG:1 - chr3R 4420671 3' + rooA 7257 2 56.16 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTCATTTACATAATTTTTGCGTTTGGCCATTTCGCATCC:1 - chr3R 18635167 3' + opus 7478 2 69.86 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTTCGGCAGGCCGC:1 - chr3L 9212702 3' - hobo 37 1 60.00 ACATATTACATACGTACATATTCCATATTAAACCTTTAGTTTTTTCACATTTTTCTTTCTTAAGCTAAGAAAATCAAATTTTTAAGTGTTTTCTGCTGAGAGCGAGTAGAGAAAAAGGAACCAAGAAAGCCACATGAAAGGCATTT:1 - chr2R 18511617 3' - Stalker3T 37 3 79.45 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCGCTCTATTATTCTTCTCTTGGTACTCTGTCGTT:1 - chr2R 1373082 3' + pogo 2055 1 55.48 ACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTATTTTCAGTTTTTTAGGCAGTTTTGTTATATAATGGGTCGGTCGTTCCGAAATACATATAATC:1 - chr4 1001545 3' + P-element 292 1 42.47 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATACATATGTATGAAATATTTCAAGAGTTTCCTGATTTTTCGACTAGCCCATATATCAGTTTTCGTTACCAACTTGTATTTCATTGTATTAGGTAGTTGAGTGGAGAATGTTT:1 + chrX 5773111 3' - jockey 17 1 45.89 TAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAGATCTCTAAGAGGTGAGCTTCTTTACCTCTTGATTAAGAATCGCAAGGACGTCAATTACGTGCTAAAAGCCTCCTTCATGGAAATCTACAATGAGCGGGTAAGTGTCGCC:1 + chr2R 17561150 3' + Bica 129 1 54.11 CCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATGTTTCAAATACTAATATTTGGTTTATTTAACTCCACAGTAGTGGTTCTTTATTCAAGGTTCGATTTTAGACTAATTTTACGGAAGTGCATTCAAAGGGTTAAGCGCAAATCCGCACAATGGCAG:1 + chr3R 22991068 3' - HMS-Beagle 260 1 69.86 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTGTAACTAAATAAATGTGGTTTTCTTATTATTTAGCTAGTTTATAACAGTTCATATCCTTTTCCCATTTCCAATCATTCTTAACCCACTGTGTGAGCAATTTGCGTCGCCCATGGCTT:1 + chr2L 6601437 3' + roo 407 1 55.48 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACTTGTGATAACGCAACATTTGCTTGTTCTATCTATGTATGTATTTTGTATATCTATTAGCAGCGCTGAATGCATTT:2 + chr2L 6177644 3' - pogo 43 1 54.79 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCCGGTCACTCGCCAATTCACGCTAA:2 + chr3R 31141076 3' - Burdock 6176 2 58.22 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTGGCCCAAACGGGACGGCGG:1 + chr2L 12291979 3' - Tirant 8117 2 76.52 CATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAGTTTTGTATGCGACTGGGTCTGGTTGCTGTTTGTAATATTTTGTGTTGCATACTTGCAGGCGCCCGTCACTTCCCATTCC:1 + chr2L 5646995 3' - jockey 4558 1 78.10 GGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGGAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGAT:1 - chr3R 11151793 3' + mdg3 198 2 51.37 AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTTCCTGGAAAAGTATTCCCATATAAT:1 - chr3L 18035496 3' - mdg3 51 2 49.32 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCATAATTCCAGCTTATTTGCTGGTGCAAATAGTGCTAAATAAATAAACTAAGAGCTCGATGGATTTTAAAATCCAAACAATTTAATTTCATATATTCCAGTAT:1 - chr3R 25751748 3' - roo 8684 2 60.96 AAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTTATAAATATTATTTCAGCTATTTGATTCTATT:1 - chr3R 8594046 3' + R2-element 3441 1 78.08 AACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAAATAAGAATGATTTAAATAACATATATGTAAACTATGCATTAGTGAAAAAGTGGAAAACTATTTATATAT:1 + chrX 15864103 3' + Tirant 471 1 57.53 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAA:1 - chr3L 19031225 3' + roo 9032 1 53.60 AGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTGCTAGTTGGATCTAATTATGTAATAAAAGAGTTAAAATTGATTGCTCTAACGAAATAAGAGAAACAATGCTATTAGAGATTGTGGTAATA:1 + chr2L 21742732 3' - Cr1a 4340 1 71.23 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTATTATATATAAATAACCTTTTAAACCAATTTTGAAGAATCGTCTAATAAAAGCTTGGATCGATATTTG:1 + chr3L 18801879 3' - I-element 53 1 54.79 GCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGTGAGTGTGTGCCGCAGCATGGGAAGCGAGTGATTCGCTGATTCGCCAAATTCGTCGTATTTACTTGGA:1 - chr3R 14031967 3' - hobo 2726 1 54.79 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTTCTACCCACTTTTGTTCACAGTGCATCCATATTTTG:1 + chr3L 1358566 3' - 412 7086 2 57.53 TTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGAAGAAAACGAAGAGGAATAAACAAATGCATAAT:1 + chr2L 13629141 3' + Tirant 8420 2 77.40 ACACACACACACACACACATGCCCACACACACCGTCTGAGGCGACACAAAAGCTGAATAACAACACAACCACAGTAATAGCAACAGCAGCAGCAACGGCAACAACAACAGCAACAGCTACGTCTACAACAAGCTACAGAAAGAACA:1 + chr3R 20974149 3' + accord 7031 3 62.33 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCTGTTTCGTTCTGGAGTGGTATTTTCTAATTCATTTAAATGTTGCTAATATTTAAGGAATTTTTAAAATACTAATGATGCGAAACCCTTAGGATTCTTGATTCTATTC:1 - chr3L 8658669 3' + roo 396 1 72.60 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACA:2 - chr3R 9125672 3' - Doc 81 1 66.44 CCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTCTTCAGACTCTACTGATTGGGAAGGAAGCGAAAAGGAAATATCATATCGACAAGAACTGAGAACTAATATGATAGATGGAATATTCATAATAGAAAG:1 - 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chr2L 9879709 3' - jockey 96 1 77.93 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTC:1 - chr3R 20450425 3' - hobo 65 1 68.35 TTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTAGGCTCCAATTTCGTTTTGGCAAATCAACCCCCATTAAAGGCCTGCACAAAGTACATACATAATGTGTATGTACAAACGCTGTCACTTCAAT:1 - chr3R 7089438 3' - P-element 29 1 64.38 GAAAAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTTATTGACCGTATGCAGTAGGTTTGACTATTGCGTGTCAACCACCGATTATAA:1 - chr2R 4189587 3' + 1360 136 1 64.14 AATTAAAGAAGATTATTAAAATAATGTTAATTGCAAGAAAAGAAAATTTGATTTTCGCAAGTAGTAGTCCATAAAAAAAGCAAGTGCATTATATTAAACAGCAGAAATTAGAACTTTGCAAATGAAATTCGGCCTGAGAAACGTAT:1 - chr3L 7433135 3' - Cr1a 74 1 78.77 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGATGTAATTGCCAAACATTTGAATTT:1 - chr3R 11151770 3' + mdg3 5473 2 68.49 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAATTATTGTCGTTGTTG:1 - chr3R 15295727 3' + roo 8999 2 73.29 AAAAAAAAAAACGAAAATAATACGTTTTATCAATTGCAGCGACTTTGCGTCAGACAAAAATGATTCTTCTTTTTTTTTAAATTGAGCGACGGAAATTATCAATTGGAG:1 + chr3R 11887657 3' + Doc2-element 251 1 63.89 ACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGGAACAAAAACGCTGCTTAAGTGACCAATCAAAGGTAATCGCCGGACTGCAGAAAACATACCTCCACTTTCTGATACTCCCACTTCTCGTGGGACGGGCTACTTTCCAAT:1 + chr3R 15016118 3' + I-element 5100 1 77.40 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGACTTAATGCTGAAAATATTGGTAGCTCTAAAGTATCCAAATTTCTTTAAAGTATTCAAATGTATAAATGAACT:1 + chr3L 21665337 3' - 1360 47 1 54.11 TCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGGTTTTGGTTTTTTTTTTATTTCAATAATTTAGGTCATTTAAAAATGTACATTTACAGTATACATAATCCAACACGT:1 - chr3R 20840040 3' + roo 365 1 56.16 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCAGGAATGGCAACTGGGGGGATATTTGGCATGCTTTTTCTCTCAATGCTCTATCAAGGTGTATATATAATA:1 - chr3R 26846730 3' - hopper 16 1 61.95 AATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACAAGTAAATGGTTTTGGTAT:1 - chr2L 11554492 3' - roo 8771 2 53.85 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGATAAACTGTGCCCTGTCAAATATTTATGGGTTAAGGTGTTCAAACGCTTATCAGGGTAGCGTTAAGAGCCATTTGAATACATTTATTGA:1 - chr3L 12835967 3' + 1360 3356 1 61.11 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTGAGTGAAGAAAACAGTCGAATCG:1 - chr3R 10213021 3' + P-element 2847 1 53.49 AAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATTGTTGTTGTTGTTGTTACACAAGCGTAACAATAAAATTTCAGACTGGCCCGCCATGAAAATAGTTAAAATTTTATATGTGCTGTTATGATCATGTTTTATCTGATAGTTGTTCGCTT:1 - chr2R 14138749 3' + copia 26 2 78.77 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTTGTGTCACTCTCTTTGGCTCTCT:1 + chrX 7706848 3' - P-element 33 1 57.81 ATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTTAC:1 - chr2R 3338777 3' - Juan 53 1 52.74 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATTTTTCTTGTCCACAAATGTATGATATATAATTTTCTTTTTTTACGGTTAAA:1 - chr2L 15081016 3' - Doc 16 1 73.97 CTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGCAGAAAAGTTAATTACAATATTTCATTGCTCAGACGTTGG:2 - chr2L 12144214 3' - transib2 79 1 70.55 ATAATAATAATAATAATTTCGTACTATTTAGTAATATATTTTAGTAAATTATATAGTAAATAATTATTTATTTGTAAATATGTATTAGAGTAAATGTGATAACAATGTTTAATAATCTATTATATTATATATTTCTTGCTTTTGTT:1 + chr3L 10942817 3' + invader6 4389 1 55.48 TGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGATTATGGGCCATTGTTACATGGGCTTTGTGTGTATG:1 - chr3R 10743778 3' - FB 87 1 77.40 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCGGCAATGTCCGGCCGATAAAAGTTTTGGGGCAAAATGCGGTTCTCGGTGGC:1 - chr3L 972911 3' + opus 489 2 71.72 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCGCCTAATCATGATGGTT:1 + chr2L 5792105 3' - blood 7049 2 57.86 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAAGCCCACAGGCACATTTAGTTATGCCGTGGTGGAAATATTTTTGCGAGCACAGCAGCAGAACAACGAAAACGGAAAAGTAGCACAACA:1 + chr3R 15920325 3' - 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chr2R 545173 3' - Bari1 1464 1 51.37 CTTAACGAAGAAGGTGGCAAAAAGGGACCTAAAACACGACAACAGCTTATGACTGTAATAGTCGAAGATTGTGAAAAGATTATATTTAGCTTATTAAGTGTGTGAGAGTTTCGTTTTAAACTGTTGATCATGATGTGATGTTTAAT:1 - chr2R 12628916 3' + S-element 1267 1 52.05 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGTGCTGCCTACTTTCAGGTGGCCCACCAAAGACATTTACCTTTAATTGCGGCCATAAATATAT:1 + chr3R 25795881 3' - jockey 23 1 71.92 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATTTCATTAATGAATAATTGCAATTATGACCGCCTTGCAGATTTATGCGATGATGACTCGCATTAATAACAAAAGGCAATCGAGTTCAAT:1 - chr3L 21910333 3' + pogo 2074 1 70.55 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGGG:1 - chr3R 9125618 3' - Doc 27 1 71.92 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAGGCCATAACTGCCATTAAATATTGAAAATATTTTAG:1 - chr2L 7771939 3' - jockey 71 1 69.60 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAA:1 - chr3L 19031224 3' + roo 9012 2 55.48 GCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGAGGGTTCCATTTCATTTGTTGTGCAACCGTGTGTGTATATGTACATAAGCCAGA:1 + chrX 886876 3' + Quasimodo 6922 2 63.01 AGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCGTGGAATGGGTAATGGGGATCGGTAGCTGCCAGCAGCAGGCGTATCGAAAACCGAAACTTTTGATGGAAAAAGTTTGCAACAACA:1 + chr2L 18112045 3' - transib2 2710 1 56.85 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGG:1 + chr2L 3231975 3' + roo 9020 2 52.05 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTAAAGAAATCTATAGTTCTTGTTTCGCTGTATAACGCACTGC:1 - chr3R 6645288 3' - blood 28 2 66.44 CTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGAAAACTCGACATTATCATTCTCTCTTGTATTTATTTGCACTTTACAAACAATTAACTTAATTCTGAGCTTTCCTGTATTAACTCCTCTTCGGTTCCATCTGTTTTAGTTTCACGATCATC:1 + chr2R 5195023 3' + INE-1 547 1 65.75 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACACGGTTCTGCTAAAATTCCGTATAAGGCTTCTCGAAATCTTTGGTTGGTGTTGCAGCTGGATGATATGGCCTTATCGATAGGTATTGCGATAGGGCG:1 - 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chr3R 16750561 3' + jockey 4935 1 55.48 GATAGCCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAA:1 + chr2L 23373498 3' + Tc1-2 1533 1 77.40 CAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATATGTTTATGTATTTGTGCGTTGACCAGGGACATTTCCATAAA:1 + chr3R 18635296 3' - opus 7075 4 74.66 GTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGTGCTGCCTACTTTCAG:1 + chr3R 25795835 3' - jockey 70 1 59.59 GACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAAATTTATGTTTATTTTTTAAACTTTCTAACGAAACGA:1 - chr2R 13761596 3' - jockey 4720 1 51.37 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCAGATATATGTACTTTCAGGCATATTAAACTGCATACCCAATCGCAATCCAATCCACGACAC:1 - chr3R 11513448 3' + roo 9015 2 55.56 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGGGTG:1 - chr3R 9125616 3' - Doc 11 1 81.06 CATACCTAATTTTACATATCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACATTTGTGTGTATTTATATATCTTTTGTTTTATCCAGTGTCCGAAAAAACGAGAGCGACAAGTTGACACAATCGTGGACA:1 - chrX 10111982 3' + mdg3 5299 2 56.85 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGTCTTGAA:1 + chr3R 25050050 3' + P-element 2789 1 18.49 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTAAATAAGTACTCTAACAACAACCGATTTAATCAAACGTAACAAGGCGGAATTTTCAGGTGCG:2 + chr2R 21848794 3' + Transpac 5187 2 56.16 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATATTATATTTAACTTAGGATATGCAACTCAATGCCTACTTAAATTATTGTCTACGATTCT:1 + chr3R 23161365 3' + 412 7498 2 56.39 AACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGT:1 + chr2L 21643107 3' - Tabor 83 2 72.60 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCCCTTTGCTTTTAATAAACAATTTTTCGCTGTTTGATTTCGTTTGCTCTTTTCGGGACTTT:1 + chr2R 18014129 3' - Doc 55 1 53.73 ATAGAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGG:1 + chr3R 16276409 3' + pogo 2031 1 75.94 CACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCGCATATATATATTTTTGTATCTCTGTACAAACAAGCAGATGTATCTGCTAAATGAATGAAACAACACAATAA:1 + chr3L 3453716 3' + Tirant 8492 2 68.75 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAATAGTTTACCGCCTACAGCCCTTTG:1 - chr3L 12433417 3' + roo 347 2 60.96 AACGCCCTTAAACGGCCCAAAACTACAACATCTACATTTTGGAAAAATTTTTGGATATTATTTTAAAACCGATTTCAGCCCGATTCGATCGATGGCCATATATTTTCTATCCCCTGGCACATAACTCATTGCGGCATTCGGCGCA:1 + chr3R 23085156 3' + INE-1 344 1 53.79 CTAAAATACTTCAAATTTGTATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATGCAACACTTTGCCCGACT:1 + chr3R 22341222 3' + hopper 1362 1 58.73 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATACAAAGCGGCTTAATTCGAAATATTTTAAACACATTAAATGGCAACCGCAGCTGGGTAATCACTTCAAA:1 + chr2R 11095848 3' + diver 6060 2 54.11 GGGGGGGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGGGCTCTTTTGCTGACCAAGCATTGGGCCGGAAGCTCATCCATAATAAAGAGCACCTACCACCTCCT:1 + chrX 21772496 3' + gypsy3 6566 1 60.00 CCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTCGATGGCCATGTGGTTTGCAGATAGTGTGCGTCACCATCGCGATTAACCATTTATTTTATTCCCCTTTT:1 - chr3L 3453368 3' + Tirant 108 2 60.66 GTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAA:1 + chr2L 17599966 3' - 1360 481 1 72.34 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATTTTTGGCGAAAATAGTTCTCAATTGTTTTGAAAAAGTACCGAAATAAATA:1 - chr2L 17839333 3' - blood 20 2 71.92 GAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGAATTTTAAATTTTATATGTGCGTTGATTTTTTATGTATGGTGTATTTTAGATTTTAGATGTGAACTTAAT:1 - chr2R 1000290 3' + HMS-Beagle2 7149 2 54.11 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGCAATCGACTGCAGAGACCATAAATTTCGATGGGATATTTAATAAAAC:1 + chr2R 15070160 3' - 412 75 2 69.18 CTGGAATGTACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTATCTAAGCCAAGTTTGTTATGTGGGTCGAAATGC:1 + chr3R 25804189 3' + mdg1 7374 2 74.48 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCA:1 + chr2L 5270351 3' + jockey 4917 1 74.10 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGCG:1 + chr2L 21910254 3' - Doc 45 1 51.72 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCTGGCAACAGTTTAACAAGCTTTTTAAAACTACAGGAAGCGCTGGAAAAGGTCTGAAAAAATATCGAAAAAATATTCAACCAGTTTCATTCATTTGTACGAGCTAAAAGTTTCGC:1 - chr3R 7585674 3' - Doc 15 1 80.00 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATATGTAAGTTCCACAGAATGGAAAGGTCATCCCTTACATAATGGCCTCATTCTTCAGCTAACCAACTTTATGAAGTTCAGTTTCCATGTAGATTATTTTAATTTAT:1 - chr2L 21691766 3' - 297 6589 2 79.45 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTGTTTGTAAATAATTTTAAAAAAATATTTGAAAATCACGTTGTTTCTATAAATTTCCCTTAACGCATATACATATGTACTTAATTTTTTTGTGTAGCCCAAGCATTTCCTCA:1 - chr3L 7870130 3' + roo 400 1 77.40 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCCGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACAC:1 + chr2L 3231965 3' + roo 388 2 55.24 TTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTGGCATAATTACAGCAATTTCCACTCTACGCTGTGCTCTGTAT:1 + chrX 10047387 3' - I-element 77 1 71.23 ATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTTAACTATCCGGCTCAACTATGCAAATGGATGGACGG:1 - chr3R 25277589 3' - 3S18 5809 2 55.56 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTAGTTGGCATTTTTTTTTTGTTGCCCGAATGTGAGTGTGTTGGAGTGTTCGTATG:1 + chr3L 4524024 3' + roo 9019 2 64.39 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCC:1 - chr3R 10213053 3' + P-element 2816 1 28.91 GACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTTTTGGTGTTATGAGCGTTCAAAAGTCACTACCGTTTCCCACTTAATACTTTGTTAACTGTT:1 + chr2L 10437686 3' + jockey 4589 1 56.12 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTAACTATATTATAATATGTTGCCACCTGGCTGGGAGTGGAGGCCGCTCCTCCGCACCGGTTTCGGTTTGGCAAATAAATGATAAGCATTACATTT:1 + chr3L 22594267 3' + 297 6940 2 61.64 ACTTATGTTTAGTGTTTTTTGTAAAGAGTTTCTTGACACTCTTAAAAGTGTCTAAACTTGAAAGCGTGCGTGAGATATGTAGTGATCGCTGTTGTTTAGATTTTTAATAGCGGAAAGTGAGTCTGAACATATGCAGAATTTTCCTC:1 - chr4 195279 3' + S-element 1486 1 56.85 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACATTCTATACTTAGCCACTATATATGTATATATTTGAATAGTTCAGCGATTGTTGTCCTTCATGCAT:1 + chrX 11008415 3' - hobo 51 1 55.48 ACAGCTGCAGTTCCTAGCCTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATAAGAGCCACTCTGTGAGCTACCCACCGAAGCACCACTGTGGATATCAGGATATCCTGGGCAAGCGAATTATAACAACAATGTGGTGAACAGCGGGCA:1 - chrX 14329130 3' - jockey 4692 1 62.94 CCTTCGCTATGGCCGTCACTTCGAACTGGGGTGGTAACTAACGCGATGATCACTCCGATCGCTTTCCGTACATCATTTCTATGC:1 + chr3L 6355598 3' + Tirant 8072 1 36.90 ACGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTCGGAAATAATAAACAGTTCAGGGACAAGAAACAGTTGGGAAAACTGGAAGATTGGATGCTCTTAAGATATAAATAAAATCATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATA:1 + chr3R 10462635 3' + gypsy8 442 1 75.34 GACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTAAATGGAAGTTCAGCGTTCAGCTTGCCATTTGGGAAACGCCACC:1 + chr2R 19852231 3' + Transpac 244 2 68.12 GGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTGTGCAAGAATTTCTTGCATACCTCAAAATTTTTAAATGGCATTTGAAGTAAATCAAATCAAATGGCGTAAGAATTCTATATC:1 + chr2R 23409191 3' + opus 7468 2 43.84 GTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATTCATCAATATGGAGAATTGAACCCCTAGTACTTAGTACCT:1 + chr2L 2895636 3' + Burdock 176 2 73.29 TATGGCTGTTACGCATCTTGTTATTCTTGTGTCTTTAGTTGTACGAAGGTGCTACTAGTGAGAACCGCTTGACGAAATTCAATGCATATTTGATTTTATGATTCCTTCGGCACAAAGAAGCATTAATGCATATCG:1 + chr2R 18979791 3' + 1360 3373 1 55.56 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAATGTATTAGGAAATCGTTGCCACTTGCCCATGTTGTATTATGTTCATAAAATAGTGCTTATGAGTGATTTGTCGGATGTGTACGAGTTCATGTAAACACAA:1 - chr2R 13293308 3' + roo 9052 2 71.23 CCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATAAATTTCACACCCACGTATTAGATCTTAATTGAACATCTTCTGCTCAGCTCT:1 - chr3R 16538365 3' - G2 2650 1 62.76 CGAAAACGTAAGCGGCTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTCAATTGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAACGATTCTGCAGACTGTGCTGATTGTGAAGATTTCCCAGTTTTTATCATTCTTGTTCC:1 - chr2R 15467246 3' - hopper 311 1 75.78 AATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCTTAGCTGTGCTGCCGCCCTGGTCGCCGTCGGAGTTGATG:1 + chr2R 19328810 3' - copia 258 1 72.54 AGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACATCACAGG:1 - chr3R 907897 3' - gypsy11 4335 2 33.79 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTGAAAGAGAGTGTTTGCTTGGTGAGAGCGGCAAGCGTATAAAAGCAGCGTCGCCGGCAGAAGAAAGTCAGTTGCAGTGCAG:2 - chr2R 17097414 3' + P-element 2878 2 78.08 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGCATCTTGATTAATTAAATTAATTAAATCTAATTAATTACTACGAGAAAAATATTTTTGCACACTACT:1 - chr2L 19407040 3' - Doc 45 1 57.48 GCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGATTTTTTTTCCTTATGCGAAGCAGTCTTTTTTTTGGTTTAGCATTTTTACAATTCAATTGAATTGTTGCAAACTGTCCAGAAATATGTACAT:1 - chr3L 5404354 3' + INE-1 546 1 60.27 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGATGCCTGCTTTTGTTGTCAA:1 - chr3L 13690246 3' - hobo 39 1 59.31 TTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCATTTTCGAAGTTGAAAATAAACAAGAGTAGGGTCTTTAAAATATCAAAATTTTAAGCAAAGTCTTTCTTTACGCTTTACACTCATTAGCACGCACTTTCATTGGGGTCAGGATCCACG:1 + chr2L 9592184 3' - X-element 4704 1 67.81 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTT:1 + chr2L 12291930 3' - Tirant 46 2 63.03 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTT:1 - chr2L 17295851 3' - Doc 54 1 61.16 GGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGCCTGTCCTTCTGGTTACAAATTAAACTTCCGTATTTGTTTAGAAATCCATTTGTTAAATTACTTTGCCCAACAAACAACACACACAGCA:1 - chr3L 13740721 3' + Doc 185 1 63.01 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATATTATATTTAACTTAGGATATGCAACTCAATGCCTACTTAAATTATTGTCTACGATTCTCAGATAGTCGGCTAATAATAGAACACACATATTTTAGTTCAATAA:1 + chr3R 23161408 3' + 412 7530 2 73.29 AAGATTATTATTATTATTGCTATTACTACTATTAGAGCCAGTGTGCAGCTCTTTCTGCTGGCACTGTATAACATTTATTGTTATTTTCATGCACTTCCTTTGTTTCCCTTTCTGTGATTAACAATTACAAAAGCCAGCTAAAA:1 - chrX 858750 3' - mdg1 33 2 79.72 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATGGTAGGCTTAATGGACGATTGTGTGAGTGCGAGTCTTCGGCAGCGCA:1 - chr3L 9469158 3' + hopper 1376 1 55.45 GTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGTGCACTCATTTACAATCAAATAATTATATGCTAGAAATCACGGTAATTATGATATTTAAGCCCGT:1 + chr3L 735004 3' + opus 184 4 55.48 TCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTGCGAAAGTCGAATGTATTATCTTGGCTACAACCAAACACCAATAGATACAAAAACTTGG:1 - chr3R 6413506 3' - 1360 18 1 73.29 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGGCACAGAAAGCTAAAACCCACAA:1 + chr3R 17099960 3' + Tirant 8496 2 61.67 CGAGGACGGCCTCAATCTTGGGGGGGGGGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATA:1 + chrX 21772476 3' + gypsy3 6546 1 75.18 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTTTCTTTTCTTTTTGCGGCTCTTTAAGCAGGTGTTACCAGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTACCAGTGTGTTTGTAACCCACCTTACAAACTTGTT:1 - chr2R 8177682 3' - FB 20 1 65.75 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTTATTAAATTGTTCGTATGAAATTAAATTTTATACGAATATTTCCAAA:1 - chr2L 6601291 3' - roo 8738 2 73.29 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAACCTTATCCATTGATTAGCACATATTAATGAAGCTAAATGTCAATTTGGACTTAATTTTCTTTTTAAGCGGATCCAATGTCAGGGAAA:1 - chr2L 12486595 3' - roo 27 2 60.96 GAATACAGCACCCTACCTCTGGGACGCATCCTGTAATTTCCCCACCATCTGTGTTTTGCGTTCCAGCCACCTGCTGCTGAGGACAGCAGGAGAGC:1 - chr2R 5487770 3' - G5A 467 1 73.68 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATATATACTTAATATGGTCAGAATCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAG:1 + chr2L 22211544 3' - mdg3 5295 2 54.48 GTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGTATCAACATATTACGGCATTTATGGGAATTTTATT:1 + chr3R 10150217 3' + 1360 3305 1 77.24 TGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAGGGTACAGTGTGCAAATAATTTTATTAACTTTCATAATTGTGTTGTTGATGTGGTATTTAATAGTGCATGAGGCCACCTATGATATGAGTGGCAGGGTTTTG:1 - chr3R 21045347 3' - Juan 3743 1 68.46 GATCCGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACGAAACACGGCGAAGAAAGCCCTCAATGTCCAACGTGGAGATCAAGCGCTTGGATCGTCAAGGCAAGAAGGAGCCTTGTATCATGCATGCATTTTGTTATCTGTGACAAAGAT:1 - chr3L 22176802 3' + Tc1 472 1 72.60 TCAGTGCACGAAATATAATATCATAACGTTAAAGTGCTGACCCACTTGTTGTAGTTGTTGTTTGTTTGGCCTTGGTCAACCGCTGCCCACACAGGCAGGGTTGTTTGAGAACCCACGATGAAATCCTACTGTTGGGTCAAAGAGAA:1 + chr2L 21291399 3' + Gypsy6A_LTR 35 1 67.12 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATGTTGCGGCTTGGCGAATTTTTATGGCACCTTGGAGATGGG:1 + chr3L 22226091 3' - jockey 4789 1 63.16 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGTTCACAGGTCACTGTATCAGTATATCAATG:1 - chr2L 3960181 3' - jockey 72 1 61.64 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTGG:1 + chr2L 12291962 3' - Tirant 28 2 64.66 CCGAAGTGTCAAGAGATATGACCACGCGGGAGGTGATTAGCGCGGTCATAGGCCTTAAACATAGATTTAAGAATAAAACTCCGCTCAGCTATACAGCAAAACACAGAAACACTGCGACAGGGTTCTACTGTACTAACTGAGACAAC:1 + chr3R 7181143 3' + rooA 131 2 55.48 CATACATACTACATAAATATTTCATTTGAGCAAAAGTGTAATATATAAAAGCAAATAGCAAATATATATGTAATATAATATACAAAAGTATAATATATAAGTATTTGTTTTTACTTTTCCACCATAAGCTTTAAAATGTGGAAATA:1 - chr3R 14730268 3' - Dm88 4367 2 60.27 ACAGTAGCCGATATGCCGGCAGACTTAGCACCCACCCGAACACGTTTGCGAATTTTCTTGTCGACCCTATTTCCTTCCGACGTTTGAAGAGAATAATCAAGATTTAATTAATATACACGTTTAAAATGTCAACAAAAAACTTTAAT:1 - chr2L 10271439 3' + G5A 2600 1 63.70 TATTACAATAAATAAATATTTTTATTGTGAAAGAAAAGGGACAGTTTCTTCGATGTAGATGTGAGATCGCTACTAAGGGTTAAACCCATCGGTGGTACGACCTGACGTATACGCAATGGC:1 - chr2L 7283458 3' + mariner2 830 1 45.83 GGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAATCTGGTCTCCGGATCGGTTTGCCACCTCTTTTGTGTTTGCGTTACAAATTTGAGCTAGAGTCTCCTGCT:1 - chr3R 31527917 3' + Ivk 4947 1 52.74 AGCAAAATCAAATTATGCAAAAAATGCGAATGAAAAAATAATGACCAGGAGAGAGAGTTATGATATAAGTGAATTTATCAGATCGTGAAAGGGAATTACCTTGTATTATTAATGGGAAATGGTAGATGAGAGCTTTAGTTCGATAG:1 + chrX 14559746 3' + HMS-Beagle2 391 1 69.18 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAAAAATGCCTTTGTATTGAATTTGCTTGATCGTAACAGCCAAAAAGTAGGCTATGATATGTGAA:1 + chr2L 5270374 3' + jockey 4933 1 59.59 TCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAAACACATCTCACAGAGGAGAGCCCTCGCTTGGGGAAACAGCGCAAGTGCACCG:1 - chr2L 5274788 3' + jockey 4830 1 66.67 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTATGTTCATATATGTAGGTTTACCTAGTGCCGAAACAATCACACCATAAGGTAGTGAAAGACTA:1 - chr3R 22494080 3' + 297 344 2 60.27 CCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAATATTGAAATTGAAATGGCGTGCGGAAAATTTGTTAATTAAAGTTG:1 + chr2L 16220363 3' - 297 192 2 69.18 AAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACCACAAAAAGTATCTGAAGTTAAAAAAACTGGGTAATATGTTTCTTATTATTGTCTATGGTTCTAGGTGC:1 + chr3R 7666761 3' + I-element 480 1 71.23 AGTGTGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAATCGTCTTGTCACCTTAATACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTATGCGAT:1 + chr2L 17551102 3' - Transib-N1_DM 226 1 51.37 GTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTTAAGCGAAATAAATAATCCATCCTGTTTTTTTACTGCCCTCTTGAATTTCATTGAAGAATACAAAACGTTCTATAGATAGAATCGCTTTGATCTCTCATC:1 - chr3L 3416250 3' - Tc3 1683 1 63.77 GTTGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGG:2 - chr3R 25543456 3' - G2 234 2 50.68 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAG:1 - chr3L 18253793 3' - blood 7075 2 63.12 ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGTCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATAT:1 - chr3R 9125681 3' - Doc 90 1 69.86 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCAAAATAAATCTATGCCAATTATTGACCAACTGCCAGCAGACGAAACAACAATCGCCGTAGACGCTGCAACATTCGAGTGGAAACTGGCTAAAAGCTGAAAAA:1 - chr3L 4523886 3' - roo 18 2 73.10 GTCTGTTATGCGTAACGATCGAAAACTGACTGACTGATCTCTCCTTCACAAAATCAGAATTACAACGACGCATGTTTTTGGTTTTTGCTGGCAGATTTATTTGCATATTTGGGCTAACTCGGCTAGCCCGATTTTTTCGCTTTTG:1 - chr2L 15961334 3' - invader1 3924 2 42.76 GATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAACCCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAACACGTGCATGTAATACCATACGCCCACCTTGTCACAATTCGCG:1 - chrX 7544670 3' + Idefix 6930 2 69.18 AACGGGGGGAGGATGTTTGGTCCCAGCGAGCAATACATTGCTCTGTGCAGCAATAGATTTTGCATTCCCCTTTGCGCTATGTGGAACTTGCTCATTTGCCTTCTGCATAGCAAATTCAGTTACA:1 - 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chr2R 7771300 3' - FB 45 1 53.79 ACAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAATGTACACCAAAGCTCTCACACACACATAAATACTGAGTTGATATATATGGACATCATAATTTTTTCAAATTCCAATAAAAGGCTACTCAAGGAATTTCGTTATAAAATATTTGTATTTTT:1 + chrX 15245257 3' + G2 3076 3 66.44 TTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGC:1 + chr2L 21643133 3' - Tabor 6896 2 54.79 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAGATTTGTTTTGGTTTAAGATCCCAATCA:2 - chrX 6632946 3' - P-element 64 1 41.78 ACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGCAGAAAAGTTAATTACAATATTTCATTGCTCAGACGTTGGTGGAGGGGCGGG:1 - chr2L 12144202 3' - transib2 16 1 61.05 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACTTGTGATAACGCAACATTTGCTTGTTCTATCTATGTATGTATTT:1 + chr2L 6177613 3' - pogo 71 1 69.23 GTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGTCATTAGTTGTACACTGTCCAAATTGCAACGTCGAAACTAAAAAGGGCCAAGTTTTGCACTTCAACAAACAAATA:1 + chrX 17973389 3' - hobo 2592 1 52.74 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCCACGTCTGTGTGTGCTTCCTGTGTATTGGTGTGCACGGCTGTTTGACTGTGCATTGGTATGGGTGGTAGTAAATAAGCAACAGGCAAAGAC:1 - chr2L 9879651 3' - jockey 22 1 66.92 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCATTTACGCTTTATGCGTTGGAGCAGGACGTAAAAATAAAATTTCCAACCGGTTAGACCGACTTATTAAGCGAAAAATTTATAATCGCGAGCACAGCTGCATACTAATAAGCTGC:1 + chr2L 7142092 3' + 1360 3380 2 78.77 ATTTTTTCATAAAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATAAAAAAAATATTTAAAAAATATTAATTATACAAGAAAATACACAACAAATTCCAAATTATAGTATAATTTGGTATCTTCCTTAATTAACATTTTTCTA:1 + chr2R 5416470 3' - S-element 1622 2 70.34 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGATTTATGGCACAAAATATATATCAAAGTTTCTGCGTTTAAGCATGTCGCCATATCAAAGAAGAG:1 + chr3R 20203926 3' - 412 57 2 57.53 ATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGTATGCCGTGTGTCTAATTAATAATCAACAATTTCATATACACAAATATATAATTTGTATAATTTTGTCA:1 - chr3L 14304559 3' + Quasimodo 16 2 55.48 GCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTATTATATATAAATAACCTTTTAAACCAATTTTGAAGAATCGTCTAATAAAAGCTTGGATCGATATTTGTTTTCAAATGCCAAGAGATTGTTAAAATTT:1 + chr3L 18801909 3' - I-element 23 1 67.12 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCATTTGCTTTGAAGATGGTTTATTGTAAATGATTCGTTTTGGCCAAATGACATAGATTTGTTGCGCATTTGTTGCATTGATTTTTCATTGCCCGTCAAATGAAAGGGGCA:1 - chr3R 17099842 3' - Tirant 12 2 78.77 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAACTTCTCAGCTCTTCTACG:1 - chr3R 7450273 3' - Doc 40 1 40.41 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTTTTGAACATAAAA:1 + chr2L 8574495 3' - Transpac 4944 2 67.12 AATTAATATTATTATATTTATTGTATGAAGTAACTTTGTATATCTTCACTCCGATAGATACGCTTGTACGCTTACAGGGTATTTAAGTCTCTGCCTGCCTGCCGAAATGAACTACTCCGCCTCGTTCCTTTTCTGCGTGACCATGT:1 - chrX 19409302 3' + Tc3 278 1 72.60 CTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTC:1 + chr2L 8574438 3' - Transpac 82 2 74.66 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATT:1 - chr3R 4679442 3' + hopper 1378 1 53.85 TTTATTTGTTCAATAGTTTCGAAAATAAAGATTAAAACGACATAATAGGCAGAAAAAAATGTTTATAAGTGTGGGCGTTGGAGTTCTGGGCGGTATAATAAAATATCGAAACATTCTTAATAGTTTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCG:1 - chr3L 19271025 3' - HB 1485 1 45.21 AGGCAGTATTATTTAGAAGATTTCAATTAAGTAGGATTTTTGTCAAGGCCCGGTCAGTCAGGTCTTGGGGGTGGTGGAGTTTCAATCTTCTTCTCGTACTTGTGTTTGTTTGCCCACCTTCGCTGCATTTGTTGATTTTGAGGCCG:1 - chr3R 9490832 3' - jockey2 3237 1 69.18 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGCTAAAAAAGCTAAAGAGCCAGCAAGCTACATA:1 - chr3L 21013824 3' - roo 31 2 63.38 CGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATAATATTTCATTGAATATAATTCGGTACAACATGGTCATTTAT:1 + chr3R 20049410 3' - roo 420 1 71.03 CTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATACCTTAGAAGTTCAATGGGAAAGTAATTAAAGGTTCATTGCTTTATTGGTACAACATCTTGTAAAGATGCATAACGATAA:1 + chrX 20685962 3' + Ivk 5337 1 55.48 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGTCTCGCTTTTGGTGGCAAAATATTCACCGACTCA:1 + chr3L 19031313 3' - roo 75 2 74.66 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCATATATATAGAAAATATACACATATGTATATGTACCTAGACGTGCCTATATCCCGCCGATTTTGAGGCATTTGCTCTGTGTGAAATATTCTAAC:1 - chr3L 16059206 3' + 297 371 2 70.55 AGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAT:1 + chr2R 5206900 3' - G4 3761 1 62.14 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTTATTTGGGCCTATCTAAAGTCCCTAAAATTAATTATAAGACACTTTGAATTTATTCTTTTATTCAAC:1 + chr2R 21844048 3' - pogo 48 1 52.74 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGTTCTTCCATAAAAGTGAAGCGAAAAGGGTTAACCTTTAAAATTTACAATGTCC:1 - chr2R 19843312 3' - jockey 76 1 61.64 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATATCTAAGTTGCATTTAAAAGTTTAGTTAAACTGAAAATAAAGAAGTGTTTTCAAAATATACATTTAAATACCCATAAATGTTACG:1 + chr3L 4651684 3' - roo 36 2 54.11 GATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCATTCACATTTCCATTGTCTTTGCGAAAGGTGTACTCGCACTTCCTG:1 - 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chr3R 8217877 3' - P-element 14 1 74.66 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTAAGTTTTGCTATGGCGTTCTATTTTAGTACTGAGTGTTTTTTTTTTTAATTTCACATTTACCCTATACTGTTTGATTTTTAGTAAGCTAT:1 + chr2L 21698373 3' + 297 6948 2 67.12 ATCATAAAAACCTAAAGATTGATTATCAATTTCACTCTTCCTCTTCTTCTCTTTAAATTTTATCACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAATGCAGCCACATGGTATATCATTTTACTGCATTCTAACCAAGTCCGGTG:1 + chr3R 17016144 3' + hopper 1136 1 79.17 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAACCCAGCGCTATTAACAAAACGGGAGACACAACACCGGGAATTACGCCACTCGGCACTACACACTAAAGTATGCAAAAAGTGGGGGAAAGTAGCAGTACCCTGTAGACGCTTTTTA:1 - chr2R 19852084 3' - Transpac 4922 2 82.19 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTG:1 + chr2R 11256235 3' + roo 8989 2 75.17 TGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAA:1 + chr3L 21093229 3' - Ivk 59 1 61.87 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCG:1 - chr2L 13629060 3' - Tirant 15 2 66.67 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGGCCGGTTAACTGGAAAGAGGTAGTGTTTTAATTTTAAGTTT:1 + chr2R 17097546 3' - P-element 40 1 41.12 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATGGGAGTTCATCATTACACTTAACTGGCATACAAAAAGAGAGCCCCTCAAGATTCCATGCTGAAAATCTTAAAAAAAGAGGCTTAAGAGCACGGCTG:1 - chr3R 15920182 3' + 412 452 2 55.63 AATATGAATATATGTATATATATATAGATTTATATGTGTTGGTGGTACTCGAATATACATATACACACACTGTATGTTTCATGTGCAAATTGAACTAGCAGGTCAGGCGAGGACATATTGGGGCCATCGGGCCGCGATACAGACAC:1 - chr2R 22063054 3' + G3 4506 1 68.49 GTATGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTTTGAGTGTCCGTGTGAATAAAAATCGATTCTGTTGTAAGTTTTTGCCATTAATTACTCATGCATGTATACGCCTAAAGCATACATAAACAGACGTTCCGGACAGACAGACAAACAT:1 - chr2L 19575407 3' - Quasimodo 35 2 58.90 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTCATTTACATAATTTTTGCGTTTGGCCATTTCGCA:1 - chr3R 18635170 3' + opus 472 2 67.81 TCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTGTGTGTGGGCATTATAAAAGATGAACTACTGAGATCGAGATCGAGTTGATGGCACTATACCAAGAAACGCGCGCAGGCAAATGTTTCTGGCTTATTTG:1 - chrX 2295079 3' + Transpac 293 2 73.97 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTTCTACCCACTTTTGTTCACAGTGCATCCATATTTTGTGGCGC:1 + chr3L 1358572 3' - 412 7080 2 61.64 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAAGTGGCAGTATCCTTGAATCAGGTGTTAAGAGCA:1 + chr2L 3232012 3' + roo 394 1 73.29 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGG:1 - chr3R 9125660 3' - Doc 66 1 57.34 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCATAAGAACTAAAATACT:1 + chr3R 14954053 3' - jockey 4830 1 64.38 CGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCTGCTCAGCTGTTGGAAAGAAACAAAATAACTGGCGAGAGTTGGA:1 + chr3L 12191785 3' + F-element 4325 1 69.66 GAAATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTTCAATAAACAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATTTATAATTGCATCAGCAGACAACACACGCACATGGCCAGCCCAGAAACGGAGGAAA:1 - chr3L 18316091 3' + 1360 494 1 61.64 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTGGCACTGTGAGAATTGAAAAAAGGGGAAACTGTTACCAAATACATGGGGACTTTGT:1 - chrX 7756325 3' + roo 405 1 51.37 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGTTGAAACCTTCAAAAATGTTTCACTGTGTCATTCATTATGGAATTCCAAC:1 - chr2R 11164368 3' + roo 9047 1 59.59 ACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAACGACATGACGGTAAGAATCAACTTTCACAGCG:2 - chr3R 8042272 3' - BS 25 1 57.53 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTAACTATATTATAATATGTTGCCACCTGGCTGGGAGTGGAGGCCGCTCCTCCGCACCGGGTTCGGTTTGGCA:1 + chr3L 22594244 3' + 297 343 2 59.71 ATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCATCCATAAGATATTGACCAGTTAGTATGTTAAGCTGTATGTATACGT:1 + chr3R 17814304 3' - F-element 4332 1 68.49 AAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAACAGAACCCATATAAGTACTAACTGAAGAGAGCACTCAATATATTTAATTCAGTAATGAAGTCGTTTTATATAAACCATACCCTAGCAACTATATAGCTTTACACG:1 - chr3R 829867 3' + 1360 3099 1 70.55 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATTA:1 - chr3L 18253789 3' - blood 7076 2 61.64 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAG:1 + chr2R 14973701 3' - FB 59 1 56.85 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATATTATATTTAACTTAGGATATGCAACTCAATGCCTACTTAAATTATTGTCTACGATTCTCAGATAGTCGG:1 + chr3R 23161376 3' + 412 443 2 52.74 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAGGCCATTCGTATGTATTTCTATGTTGGATCAGGGCCAAG:1 + chr3R 25862684 3' - roo 52 2 54.11 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGAAGAAAACGAAGAGGAATAAACAAATGCATAATGGTAATGGTAAACAGTAGCAACCCAGAAA:1 + chr2L 13629170 3' + Tirant 354 2 53.73 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTAAAGTTGGTCGATTACTGAGACGTTCGAGATCGCATTGA:1 + chr2L 22293400 3' - blood 7087 2 71.43 ATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTCCTATTACGATCTAACACAGTTTAAGTATTCTAGTAACCACATTGAAAATAATATCAAGAACTCCGCCATTCTTT:1 - chr3L 7020472 3' - Quasimodo 7321 2 48.63 GCCAATTTCACAGCCATTTGCATCTGTATCGTATGCAAAATTTTGTTCAAATTCTGAATTTCTACCTCATAAGTCTTTCACTCGCACCCCATTATTTGCACCTTTCGCCTCTGTTGTTATCCGCCGCTCTTCGCTATCCTTTGGCA:1 + chr3L 917248 3' + baggins 5153 1 66.44 CGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTACCTGATACTTCTTCAGATCCACTTTCAGCTTCTCCAACTCGTGTTCCGACT:1 + chr3L 4325181 3' - roo 8661 1 65.07 AATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCTGTTCCTGAAAAATACATCTAA:1 + chr3R 7778356 3' - transib2 56 1 55.48 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACTCTAGTATGGCGTATATTTCTGCGATTATTTTAGGTA:2 + chr3R 25751920 3' + roo 9041 1 64.38 CATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTTCATTCGTTTTCATTCGTTTTCATTGTACATAT:1 - chr3R 19084961 3' + Stalker4 7199 4 77.24 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTCGCCCTTCAC:1 - chr2R 11264000 3' - jockey 4750 1 71.23 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTTTAGGAAAAAATTTTAAATAAGTACTCTAACAACAACCGATTTAATCAAACGTAACAAGGCG:1 + chr2R 21848779 3' + Transpac 259 2 55.00 AAGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATACAAGTTGTCCACGTACATGTTGATATACAAATTCAACACTCCACTCTCAGCAGCAGATAAATAAC:1 + chr2L 21657078 3' - invader1 3655 2 73.29 TTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTGGTATTTTAGAATATCTAAAAACGACCTTTCAATTTGTTGTGGACTTGGCTCAGTTTCGCCTTTTTTGGCATGTGCGCA:1 - chr2L 19310305 3' - Juan 4115 1 45.89 AAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACATCACCATATATCATAAAAAATCGGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCCTGTTAATAATGTGGTGGTTTCACAAAGGTAGACCCTAGACCCT:1 - chr2R 4430822 3' + I-element 274 1 76.03 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGCAATCGACTGCAGAGACCATAAATTTCGATGGGATATTTAATATAACAGAATATTGTTAACGTGGCAGAAGGGTTAAGTAAACTAC:1 + chr2R 15070199 3' - 412 35 2 60.00 TATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTGTGTTATCCTCTTTACTTAAGATCGTAGTCACGTAACTAAATTTGTCCAAAAACGTAGTAAAAG:1 - chr2L 4296143 3' + Dm88 29 2 66.44 ACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTTCCTAGTGCTCTCGCACCTTACCGTTCTGCTGTTTGCTCTGTAATTAAGTCGCTCATTAACATTCGCTTTCGTAACCTATGTATGCGCGA:1 + chr2R 5089667 3' - 1360 140 1 65.75 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCG:1 - chr3R 14277912 3' - P-element 87 1 22.86 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACCACACATCC:1 + chr2L 7652282 3' + roo 347 2 61.64 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATGGGAGTTCATCATTACACTTAACTGGCATACAAAAAGAGAGCCCCTCAAGATTCCATGCTGAAAATCTTAAAAAAAGAGGCTT:1 - chr3R 15920195 3' + 412 7488 2 54.11 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACGTTTTTGATTATCTTA:1 + chrX 2295271 3' - Transpac 4949 2 43.15 ACTTATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTGAGACGGTAAATGGATAAATGACTATGTCAACGAGCAATGTTGCCGTGTTTGGGAGGAGACCAA:1 - chr3L 25676402 3' - Cr1a 4072 1 64.38 TTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTTATCCACTCAAGAATTAAGCTCCTTGGCACCTTGGTGCTTACCTTTCAGCTTTCAGC:1 + chrX 7834958 3' + Quasimodo 185 2 69.86 GATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAGTTTTT:1 - chr2L 2120384 3' - I-element 4971 1 65.00 AGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAATTCGCGAAAAACGCACTGTGAAATGTTTCAATTTGAAATGCACAACGAATTAATGCATTTTTT:1 - chr3L 21115455 3' + gypsy4 6571 2 63.01 AAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTATCCAATTAAAAAAACAAAAAA:1 - chr2L 21643032 3' + Tabor 7260 2 59.31 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTATATAACCCACCGATTCCGGCCCTCGAGGACATGC:1 - chr3R 19436006 3' - roo 80 2 73.97 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGTTACTCTCCCTT:1 - chr3L 22594162 3' - 297 53 2 68.70 AAACTAAAATATGAGCGCATCTGACGATCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTTATACCTCTCATTCACACACATATCAAACTACACCAGATGCCTTGAACGTGTTGTCATTAAAGCTTTTGCCC:1 - chr3L 13790997 3' + Porto1 201 1 73.97 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACTCGCTGCGTATA:1 - chr3R 20450407 3' - hobo 38 1 54.62 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATTAATGCCGCTTTAAGGTATTTTTGCGCTGCCCGCAAATGAATCGATCCGTGCGACAATTGCGAAAATATCGTTTAATTAAAACAAATA:1 + chr2R 22463283 3' + roo 9041 1 49.32 GTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 1202714 3' + 1360 3305 1 94.44 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATTTTTGGCGAAAATAGTTCTCAATTGTTTTGAAAAAGTACCGAAATA:1 - chr2L 17839337 3' - blood 7035 2 69.18 TATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCAAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAAACATAAATAGGCTTAATCGAAACTATTGGTATTATACATGCGCGGTTAGG:1 + chr3R 21572846 3' + hopper2 192 2 63.70 AGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAGGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAATTTCATAAAAATATGATAACTAAAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGA:1 - chr3L 10590623 3' - 1360 406 1 69.18 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTCTTGTCTCTTTTGTTGCGAGCCAACGACCCGGCATC:1 + chrX 19107451 3' + roo 9026 1 70.64 ACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGATTCCTTTTTTGTCACACGATAATTTGTAGAAGACTGTCGTCGTGGCCGTAAATTGTCTTTGGCAGGCGGGATGTCTGGTTTTCCCTTGGCCG:1 - chr3L 9197579 3' - Cr1a 235 1 63.01 CTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGCATATGAAATCGTCAATTTTATACCGATTCATTTTGCTGCGACTCAAAAGCTGCCTAACCAGGTGCGGACATTGCGGCAGG:1 + chr2R 5438330 3' - flea 4791 2 60.43 CTCGTTGTCGCCTCTGTATCTGTGGTGTGGTACCAGCATCCGAAGTATAGCACCTGAAAATTTCTTTGCACTTCCCACTTTCCCATTTCCGCTACCATTTGCAACAACTCCCACTTCCTGGTTTTC:1 - chr2L 1777378 3' - Chouto 447 1 58.73 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATTTTTTGTTTAGCACTCTGTGGATGCTCCTCGGGCTCCATTGGCCGCTGATCTTTGCCAAATTTGTCAATGTTCTT:1 + chr3L 6356205 3' - Tirant 8177 2 64.17 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAG:1 + chr2L 3231972 3' + roo 9017 2 54.11 AGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGAATAAGACGACACCACAGTATAGTGCTTCGAAAGTGAGTCGGTAAATATTAGGCACTTTCGCAC:1 - chr3R 16986096 3' + BS 4818 1 59.63 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAGGATTGAAGAGGATAAAAAATATCTAAGTATCTAAAGTTAAAAACAATGCCAATATCATAGTGCTTACATCCAAGACGACATTTAAA:1 + chr3L 25607391 3' + 412 7511 2 60.96 TTTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCAAGATGTGCTTAAAATAATAAATACGCCCAGGAATCGCTCTTTCTT:1 - chr3L 13238025 3' + copia 420 1 78.08 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTGCACGTTGCTCGCATTTGGCAG:1 + chr3R 11095901 3' - hopper 26 1 60.80 GGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTTTAGTTCTCATTGTTGCCATCAACAACGACGCGCCTATAAACCGTTTATTATTATTTACAATTTTCGCCTCGACGCTGGCAAATATTTTCAAATCGC:1 - chrX 4790514 3' - Quasimodo 40 4 58.06 GTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGAAAGCTTTTGTCTCACCTAAATGAAGGCGAATTCGACTTCACT:2 + chr3L 22642055 3' + hopper2 1535 1 67.81 ACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATGTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATGGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGGACCTTATTAGAAATGAATTCATAAT:1 + chr2R 12702170 3' + 1360 3294 1 78.08 ATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCAACAGCAATTAGGGAATCGTCGGCCTCTTCATTACGGTGATCAATGGGTCTCCTTTATGTCACTTATAGCCAGTCC:1 - chr2R 3171048 3' + 1360 34 1 62.60 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAAC:1 + chr3R 21674926 3' + roo 9024 2 51.37 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAAACAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCGATAAGAGAGGATTCAATTTTAACCTTTTTATTTCCTTCTGTCATTCGA:1 - chrX 388182 3' - 1360 9 2 77.40 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCTTGTTTAACGCAGCTATAAATTATGATGCCAAAGTTTTTGGCCACTCAACGAGCGGGAAAGCACGGGCGACTTTTCACC:1 + chr2L 20515326 3' - I-element 14 1 74.26 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGGTTTCGGG:1 + chr2L 12291936 3' - Tirant 41 2 58.33 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTTAATCTTGACGGTT:1 - chr3L 14375583 3' + roo 9046 1 65.07 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGCAACACCAG:1 + chr2R 1923575 3' + pogo 2048 1 58.99 AAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTATTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAATCGTAAGAGTTTTCCACAGCCGCACAAATCGAGCAATCAATTATGTTATTAA:1 - chr3R 19542577 3' + invader2 4924 2 62.33 AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATTGTAAG:1 + chr2R 21870249 3' + copia 179 2 71.92 ACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTCAAAACTGGCACG:1 + chr2L 23034101 3' + FB 405 1 56.85 TGTTGTCTGCTTTTATAAAATTTGCTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAATGATTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAATTGCGTTGGTTTTAATGGCCTTAAATGCCATCTAACGTTAATAATGGGCGAGAG:1 - chr2R 16926323 3' + Cr1a 449 1 76.71 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGTAAACAACAGTATCAAAAGTTGGCAGACAGATTACGTAACTCGTGTATCAAGTTAAA:1 - chr3R 26486023 3' - 412 64 2 58.90 CAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTTATTTGGGCCTATCTAAAGTCCCTAAAATTAATTATAAGACACTT:1 + chr2R 21844026 3' - pogo 70 1 67.12 CACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACCGTGTTATTGCATCAATGTCATTTTCTAAATTAGTTTCGAGTTACGGGTTATATGTTCTATTTAAAAATCTGTAAAACCCATTTCAAAA:1 + chr2L 17174010 3' - 1360 3340 1 44.52 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGACCTTTCTAAAAGCTATCGCAGGCAGTAACCCTCTAGTCCTCGTCCTACACAAAAACTCGAATATCAAGTGCGACATTCTGAGGGATTGTACTGAAAAACACAAGA:1 + chr3R 6645469 3' + blood 363 2 75.34 AATTTGACAAAATATTCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCTTTGGGCATCGTGACCATTCTTGTTTTGTTCTTATATTATGTATTATGTTATGTAATTTTGTTTATCCTGAAGTGTGGGAA:1 + chr2R 2143945 3' + 1360 208 1 52.74 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCATTATGTATCATTATGCTTGATCATGATAAGAATTAGTGACAAGAATTAAACTTGAAATGTCAAAATATACATATTTGTATATCTATATATTTTTTAATCTTTTCCTA:1 - chr3L 5552700 3' + copia 245 1 73.97 ACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTTCCTGGAAAAGTATTCCCATATAATTTTTAATTACAAAACAAAAAGATTTTATAT:1 - chr3L 18035466 3' - mdg3 21 2 59.59 CACTATGCAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAATTTTCACATCTGACTGCCAATTTCAATGCATAGGCGATGAGG:1 + chr2L 14102634 3' - 1360 3340 1 63.93 TTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGTTCGATGAT:1 - chr2L 18112518 3' + transib2 2737 1 77.40 TTAAGAGAACAGGAACTTTGCTAGTAAACAAATGACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATTGGATTGCATACAACTAAGTTACAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATGTCC:1 + chr3L 24088957 3' + Tc3 1597 1 86.99 ATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATGTATATAGATACATATAAAGCGTATCCTGATTTCCCCCTGCCGTAGGCGCCTATTTTTATTTTCCCATTCACTGCCAACTTATTTACGGGCAGCAATTATTTCCAGCAT:1 - chrX 18220524 3' + Burdock 6382 2 75.34 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATAAAGCGAACACATGAAACTATTATTGATCCGATATCCCCCCTCTTCATAGTCTCTACTTATTTTAACATTTAGG:1 - chr2R 9607083 3' + pogo 2074 1 56.92 TGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACACTGGACCGATTCCGAGGGATCCGAGAAG:1 - chr2R 10910185 3' + Tabor 447 2 58.90 CGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGACTATTTGACTATATGGCTATACCTTGACTATGATAAATATATGTTATGAACATATTTTATGTTGAAATATTTG:1 - chr3R 12770897 3' - HMS-Beagle2 6974 2 51.11 TTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAATCATATACAATGCATATAAGATAACACAGTAAGTATACATGTATGTATATAGAGAGTACCAGCAACGGTACTACATGTTTTTGTAGATAATTTTAATAACCTTTGCAGAAG:1 - chr4 818644 3' - INE-1 82 1 70.55 ATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCACAAAGACGACTGCGATTATGGGGTCTCTTAAAAAAAAAGA:1 + chrX 14336424 3' + mdg1 77 2 72.60 AAATACACCACGTGTCCAAATATTTACAAATAAAATGGAACATCAAGGTCAAGGTGATTATGTATGCAATTGGGCTGATCAATAGGAATCGCATCGCATCTCATCCGCTTGCT:1 - chrX 6036989 3' + transib3 237 1 53.10 TATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTTGTCTCTTGTATTTACAAGTAAGCAGCAATTTTTAACTTATTTTTTTCAGTTAATT:1 - chrX 12771657 3' + 1360 3152 1 77.40 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAACAAGAAAAA:1 - chr2L 17295800 3' - Doc 28 1 61.64 GCTATCTTTAAAATTGTAATTAATATCAAAATTTCCGGCTTTTTACCCACAGTGCAGTGGTAATCATCAAGTGGGCGTGCCCCTCGTCCGTACCCACCCCTCCTCCATCGACCATTTTCGACCTCAAGTGCAGCG:1 + chr3R 23386966 3' + transib4 2603 1 55.56 ATAAATATTAAAAATTAAAAATTAACGATAAATAATGTAATAATGTTGACAACATATCGTATATTGGTATATTGGCATATTGGCATATTGGCAAATGGGTATATGGGTATATAGGTTTAGTATCAAAAGTGTGTAAGGCAAGCAAT:1 - chr3R 15959097 3' + Doc 4688 1 64.38 AGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATA:1 + chr3R 13349561 3' - Ivk 98 1 73.29 GAAAACATAAGCGACTATCTATTCCACCAGAAGCTGATTGTGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTTTTATACAATATTGAAATCAAAAATAAACTTTGTGAGGATCAATAGACCGTTTTCTAGTGTCATAATACTTTTGCTGAATTT:1 - chr2R 2920217 3' - hopper 310 1 65.75 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTCATCTGGGTACTGAACAATTTGGAATATTGGAGCTTTAGTGACTTCGCTAGGAACATGGGAAATATAGTTTATGCAAATATTAAATACA:1 + chr3L 1258686 3' - pogo 30 1 48.63 AAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACTCATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACTCGACAGCTGAGCACTCGTATCACAGATGTC:1 - chr3R 21040247 3' + 1360 3201 1 75.40 GTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTACATATCAGAAACCTGGACAAGGAGTGAGGAAAATGCTGGAAAATGTTTCCAAGCTAA:1 + chrX 887401 3' + Quasimodo 7311 2 61.64 CAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCCTTCGCAACTACCGATGATGCAGCTCGAAAATGCTGGCTG:2 + chr3R 5773248 3' + Stalker4 7311 4 52.74 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGTATGGAAACTTATTTATCATAGATTTTTATACAAAAGTGCAAAGCTA:1 + chr3R 11151942 3' - mdg3 26 2 66.44 CTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACACATTCACATACGCATTGGCAAAACTCAAACACAAACACACACACGCACAGGCAATACAACGATTTAATTTG:1 - chrX 12642674 3' + accord 6989 2 63.08 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAGGCAAAGGCGAGATGGTGTGCATCGATCGCTGTGTGGCCAA:1 - chr2R 21690435 3' - 412 28 2 59.85 AGAAAAAACATCAAAATATATTCTAGTCCTATATATAGTCCTATATATCAAAATAAACTTAAAGTCAAACCATTAATTAACATACCAATCTAATAGGCTTAACTTTATAAATAATTTGTATATTTAAAATGTGTATCTTTATTTC:1 - chr2L 15822291 3' + Transib5 30 1 73.10 TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAGAAAGCGGACACAGAAAGGCG:1 + chr3R 10030832 3' - BS 5024 1 71.23 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCTTCCTTACTTTTTTCATTTCTAGCATTGGCTGGTTTTTTATCAATAT:1 + chr2L 16331035 3' + roo 341 2 67.61 ACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCCCCTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATTATATGAATGATGAGCGTGGAAACAATATTTTTTTGCAAATCGATAGAAATTTACAT:1 + chr2R 5667273 3' - Rt1b 4826 1 61.11 AACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATATAGCACTCACAACACAAATAATTAGACAAAACCAGTCTGGGCTTAAACAAATCGCACAAACAACAAAATGGGGGTAAATATACGCCGACG:1 + chr3L 5632516 3' + I-element 97 1 70.34 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAGGTTCCGCCATAAAAATGAAAATGAAAACAACTTGCAGTA:1 + chrX 3647012 3' - 412 7103 2 52.05 GCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCT:1 + chr3R 19436081 3' + roo 353 2 59.70 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTATGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCAATCGAATTGAATAACAATTGAATTGAAGCACAAAATTGAAGTAATTTATTTGTGGATG:1 - chr3L 26741223 3' - F-element 64 1 66.67 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACCCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATA:1 + chr2L 21643124 3' - Tabor 66 2 60.96 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGATGTTGCGGCTTGGCGAATTTTTATGGCACCTTGGAGATGGG:1 + chr3L 22226091 3' - jockey 4788 1 62.77 TTGCCTTAACGTTGTTATTATTTAAATATAGCTTAAAAATAGTAATAGTCGAATCTTAATATCACACACTTCGTCCACACATCGTTCCTCAAGATATGACTTGCAATAAACAGTAGACTGGAACTGAAAACGGGAACAGGTTTTGA:1 + chrX 19503401 3' + 1360 305 1 78.08 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACTGGCGCA:1 + chrX 16117273 3' + opus 441 2 60.27 CTTACAAAAACTGAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACACCTTGTTTGAGATGCTAATGCTGCTAAGAACACGAATATCTCAGTTGTCGGGGAATAGAGAGGTTAACCTAAAGGGGAAAGAGGGAAAGTCAAG:2 + chr2L 1776216 3' + roo 9047 1 67.14 AGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAAATCAATAGGGGGCAGAATAAGTAAAGCCCGAATAAATATAGGGGGATCCAAAACCAATCCCATCTAAGTAATCATCAAAAGTGCAAGTTCGCTATGCCT:1 - chr2R 10158044 3' - hobo 2699 1 72.60 GTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCAAACTCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGAAATTTACAAAACTAATAAAAAATTTGAAAAAATATTAAAACATTTTTC:1 - chr3L 24300800 3' + INE-1 558 1 66.44 TCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAACTAGCCGGCTGGCAGATGACAAAG:1 + chr2L 5890579 3' + invader3 233 2 53.73 ACTTTCTGCTGTGTCAGATACTTCTAAGAACTTTAACATTGTAACACACACATATTCACTGTTAGCTTATTTAAGGGCTGGAGAAGAAGAAGGCGGAGCTGACGCAAAAGTCCAGGAAGGAAATAGCCGACTATTTGGCCACGGG:1 - chr3L 6756265 3' + ZAM 223 2 50.34 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTTTGCCGATAGCTTCTTCAATATTGATACACATGGGCCAATCAACAGTTACAGTTTAAGTATAATACTCTTAATCCT:1 - chr2L 10514222 3' - 1360 11 1 69.86 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTCTTTCATCATGGTACTACTTATATATCAACAGATT:1 + chr3R 8217982 3' + P-element 2807 1 18.40 ACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCCACGTCTGTATGTGCTTCCTGTGTATTGTTGTG:1 - chr2L 9879709 3' - jockey 89 1 78.99 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGAAATTACAAAAACCGAATGAAATAACTCCAAATGGATGCAGGTCAGCAAGTGGTG:1 + chr3R 11513547 3' - roo 8729 2 63.70 GAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGGCCCAGCACACTCAACTGTG:1 + chr2L 15777907 3' - 297 14 2 68.18 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCTTGCGAATGAGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAGGGCTGCAGTCGAAAATGGGGTGACTTGGCTTGAATTATGACTTGTTTT:1 - chr3R 7885540 3' - jockey 20 1 76.92 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTATGTTCATATATGTAGGTTTACCTAGTGCCGAAACAATCACACCATAAGGTA:1 - chr3R 22494091 3' + 297 6914 2 67.81 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACAAAATGATTGCCAAGCTGCGCAAGATTTATCCCAGTGGAAAGGTGGTAAGCCATTCCCTCGCTCCCTGCTCCACAGCGGATCTGAACAATGCTGAACTTGT:1 - chr3R 23161221 3' - 412 7071 2 71.92 AGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATATTCTTAAATTATAAAAGCAAAATTAGATACAATCAGTGCAACATCT:1 + chr3L 12159766 3' + Quasimodo 7299 2 71.23 CGATCTGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCATCTTCTTACACAAGTACGCACACATATACGCATTCTCGTTTCTTGTTGTTACTCACACAAGCAAGCAAACTCTATTTTTAGATTTCTTACTTCCTTTATTTTTGTTTATGCCGAAT:1 + chr3L 16074843 3' + 1360 3177 1 71.23 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATCTTTGAAGTTGGGAGCCACTTTTGAATTTGCCTCCTAAAGCGGGACAACTATAATAGCATAAAACCAGTGT:1 + chr2R 9607221 3' - pogo 44 1 55.17 AAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGATTCATGATCGGTGAGGCTGCAATCACTCCGTGGTTCAATGGAGCTTCCGGACGTG:1 - chr2R 7639805 3' + Doc 4446 1 59.26 ACACACACACACACACACTGCCAATTTTGCGACTCGAAAGTCCTTGAATCTTGAATGTTGAATCTTGAAGGCATCGCCGTGTATTTTCATTTCTTTTATTTATTTAACCGATTGCCTTATGATAATGCGACCAGCATCCACGGGCA:1 + chr3R 10814500 3' + accord 7104 2 73.29 CACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGTTGCATAAGCGTTTCGCGGCATATAGCCATTGGCCTACCCATACGTGTATGGCCCTATGACCACG:1 - chr2R 16020089 3' + micropia 5297 1 58.99 GCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGC:1 + chr3R 31141043 3' - Burdock 51 2 63.71 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTG:1 + chr3R 19436102 3' + roo 362 1 52.74 GTGATAAATATATATATATATAAACACTCGAAGTTCTATAGAGTTATAATATACCTTACCTGAATTCGTACTGCCCGTCCAG:1 - chrX 13534782 3' - accord 6935 2 89.02 TACATACATATATATGCTGCTCGACAAAAGCTGCCACAAACGGGGGAAAATTGTAGCATGCTTTTGAGCGTTCGCTTAGAAAATTTCCTTCACTTGCCAGCTAAAATGCGAGATAAGCATTTATTACATACAAAAAAAAATGCATA:1 - chr3R 30330791 3' + blood 189 2 67.12 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCACCAGCGTTTCTTCTACCACCGAAGAGCCAAGCTCATC:1 + chr3L 12886460 3' + 412 7490 2 58.16 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAGTAATTTCAAATTGGAAGCCGTAACTTTTGCACGCA:1 + chr3R 12379773 3' - roo 86 2 78.77 ATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTAAAAAATTCGCGCCCTTGTTATTATACTACCAAGAAACCACATACGGTGACCACCACCCATCGTCCCTTCAGCAAGATCAAGTA:1 + chr3L 17323901 3' - 1360 3140 1 59.59 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGT:1 - chr3L 14375604 3' + roo 361 2 50.68 GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTGTTTATAAATAGGTACAACTGTACCCTAAACAAACAGAAGGGTTGAACAATTATAATTTTATGTTTT:1 + chr2L 19160487 3' - 3S18 17 2 74.66 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATTGTTAATTATGTTTTCCTTACATGAGCTGGTTTGCTAGTTACACTATTTGCGAATAACTCATAATTTGTTTACGTTGAAACTTAAAATGCAATAAACTAATTTTGAGGCTATCTTC:1 + chr2L 14969245 3' + 412 7542 2 75.34 TGATCCATCACACCCATCTGCGTGAGCGGAACATCCAGCACCCGGATCGGCCGGACTGATACCGTCGCCGGAGCTGCAGGAGTGG:1 - chr3R 21789492 3' + jockey 79 1 52.94 GACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACACTATAACCTTGAAAAGTACTTCTAATTGGCGCAGGGCCAAGTCTCCAGCTGCTCCTTTAATGGC:1 + chr2L 4637296 3' - mdg1 7106 2 52.45 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTATTGAGGTGTCTTATCTAATATTTAGAAAGAAATATATCCTTTCAAAGGGTATAC:2 - chr3L 785837 3' - I-element 16 1 73.29 ACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATGTATTATCTTGGCTACAACCAAACACCAATAGATACAA:1 - chr3R 6413514 3' + 1360 6 2 70.99 ACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACCCGGGTGCATACTAAAATGCAATCTCTGTCCGGCATTAAGCCTAAATTAAATATATTTCATCCAGTGTCCAAAAACCAATTAAT:1 + chr2R 23212717 3' + Tirant 8464 2 56.85 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTCTAAAATTAAGTTAAGTTAATCAAACTTTTATAATTTAATAAGTGAAATCAAAATAAAATTATAAGGAAAAATGTTTGAAATAA:1 + chr3L 25008741 3' - Transpac 4955 2 62.33 CATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTCCGCCGACTCTGCACTTTCTTTGAAAACCGCTGACTGATGCATGCTGATGACTTT:1 + chr2L 18112640 3' - transib2 2559 1 75.34 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTGGCACTGTGAG:1 - chrX 7756370 3' + roo 359 2 51.37 GAACAGACGCTCTGAGCTGTTCAATATCTATTGCACTGAGCTATTACTTAATACTTATTACAGTATACGGACGCGAAGGTTTCAGTTTCATATCGGGCCACGGGTTTTTCCTCCTATTTTTCAATCGCTTTTAATGTGCGGCATTT:1 - chr3R 7616702 3' + Stalker2 363 2 56.85 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCATAAAACATTTGATGGTATTAACAATGTACTCCTAGACTATATGATGGTGTAAAGTGTAAAAAGTCACGATTTTCTTCGATCTCATCAATGTTAATGAATTAAAA:1 - chr2L 7652144 3' - roo 14 2 69.18 CGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAAA:1 - chrX 21087550 3' - mdg3 5261 1 70.43 TCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAGTAGATAAGCTTTAGTATCTTATGCGTTTTGTATATTACGATCATGAAATGAAC:1 + chr3R 12363803 3' - jockey 4729 1 58.02 GAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTTTTATGTATTAAGCCCTTGAGTGCGATATTGCGGCTCAAGTGCGACGGCGGGGAAGCCTTGAGCT:1 + chr3R 5095919 3' + Quasimodo 435 2 55.17 CCAGTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGTCTCAAAGGAATGCGAAACAAGGACGCAAA:1 - chr3R 17258108 3' + 412 402 2 78.77 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTCGATTGAAATATCTTAATTGAAAATTGCATTTCTCCCGGAAATATT:1 + chr2L 19674032 3' - roo 8696 2 42.47 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCACACCGGCCACGGGGCAACTTTCGGATGCGGGGTTTT:1 + chr3L 13690342 3' + hobo 2925 1 52.63 TATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTAAACGCCAGTGGAGCGTCAAATGCTGGACAGT:1 - chr2L 10486542 3' - roo 8603 1 78.62 GTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTGTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCG:1 + chr3R 24454864 3' - F-element 271 1 54.78 TGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTTTGTGGGTGTCTCCTTTGCGTTTGTTATATA:1 - chrX 8967366 3' - HMS-Beagle2 6926 2 56.16 CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACGGACATATATGTAGATATATAACCATATGCACATGGGTGCCATCCCATCCGCATAT:1 - chrX 16117164 3' - opus 171 4 65.07 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTC:1 - chr3L 7837150 3' - jockey 4809 1 50.00 CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATG:1 + chr3R 14049446 3' + transib2 2777 1 52.05 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTTGTGCGAATTTTACTTTATTTTTG:1 + chr2R 11146167 3' - Quasimodo 16 2 74.66 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATTTTAGTAACAAATGCTAACCCTGCGCTTTTCATTTAAGCCAGGCTTTCATGCATTACATTTCATTTTCATTTTTCTTAGTTTGTGTAAGATTTAAAAATCTCCCCCATAAA:1 + chr3R 18954361 3' + pogo 2094 1 59.59 AAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAACTAGCCGGCTGGCAGATGACAAAGTTCCCAGCT:1 + chr2L 5890588 3' + invader3 230 2 51.37 AAACACAAAATCAAAACTTGCATCGGGATGTCAAATGTACCGCTAGAGTGCGAGAGAGCGGGAGCACAGTGCAGTTTAAGTGCGCTCGGAAATGGGAAAGGCTTTGAAAGATCAATAACATCGATGTTTCTGCACTTCCATTTTGA:1 + chr2R 5179425 3' - Cr1a 383 1 67.12 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCTTGAAATCCCTCGGCATAAACCCCACCAAC:1 + chr3L 12223244 3' + Transpac 5193 2 56.49 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTGAGTGAAAGTTTCTAATACTGCTAGAAATGTATATTTATAGAAGGAACCTCT:1 - chr3L 1358445 3' + 412 425 2 61.64 GATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAACACAACATGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTGCTCACAACTCATCATAGCCAGTGGCATTTGGCTGTGCTGATCCAAAAGGGACACACAGCA:1 + chr3L 19615043 3' + 1360 3188 1 56.59 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTTTGTACGA:1 + chr3R 21674940 3' + roo 9038 1 58.22 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGTATCAACATATTACGGCATTTATGGTAATTTTATTGGTGCTTTGATTCAACAGCAGCATGAATATTTATAATCTTTGAATAAATTTGTCTGCTCGTATGGCTAA:1 + chr3R 10150286 3' + 1360 3373 1 74.66 CCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATCGTCTTAAATCATTTTAGCTGAAGTTCACTGTAATCCCTTAGTTCGAAACTTTGCTCTTTCGAATACAACAGCGGAAGATCCAACAAAAGCACATTAAACAAAGAAACACATG:1 - chr2L 19140288 3' + Max-element 8526 2 77.40 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTG:1 + chr2R 5754571 3' + P-element 2799 1 28.47 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGCAAACCGTAGCATATTTAACAATAACAAAATGTAGCATACATTTGAGGTCCGCCTGTGGAATGGAAAGTGAGAGAA:1 + chr3L 2216640 3' - jockey 31 1 59.68 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTTCTACCCACTTTTGTTCACAGTGCATCCATATTT:1 + chr3L 1358564 3' - 412 7 2 69.49 CATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAAGATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGGTCAGAATTGATTTCGGCCCGAAATTTAATTGAGCATTGATTTCAAGTGTCAATTCC:1 + chrX 2524983 3' + 1360 3116 1 72.03 AAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACATTTTTTTAACCGATAAAAATGAGCTTGACCAATAAAACCCTGC:1 + chr2R 5433981 3' - Transpac 4990 2 69.18 CGACTATCGGATACCCGTTAATCAGATAGTTCTTTTTTGCTTCCTTCTACCAGTTACACACTTTTCAACGAATCTAGTATACCTTCTTAATAGTTACAATGTTATTTAGCTAAAAACCCCTATTGCACTCCTGACGGCAACTGCAA:1 - chrX 16116084 3' - INE-1 550 1 29.45 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGTTTGATTTTGTAAACATTTACTTCCAATCAACGGCGTTCAATTAATAGTGTTGCTATTGGAT:1 - chr2R 9294258 3' - Tirant 10 2 79.86 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGCTTTTTGCTTTCCGGTT:1 + chrX 21403479 3' - roo 8720 2 64.62 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGGGTATTGTTTTTGTGCATATTACATCTGTACGCGTAAGCTTTCGGTTCGAGTATGTGTGTGAGTGTGTGTG:1 + chrX 16457452 3' + roo 9036 1 51.52 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACGAGCGAACACACATAAGCAACCCCCGTTACCTGCGAAGGTTTACCTAGGATAGCAGAAACAACAACTATGAGTGCAGCTGCAGGCAGATAAAAGGAAAAAGGGAGAT:1 - chrX 8271475 3' - P-element 14 1 76.03 AAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCAGTCCCAGGCAAAGCTCCACAAAAGCCACTCAAAAGTAGAAAAAACTACACA:1 + chr3R 31723613 3' + P-element 2696 1 35.17 GGGGAGGGCTTGAGAGTTTCCGTAGAAACGAACGAGAAATACGCGTTGTTTTTGAGTGAAGAGAGCTGACGCTCGTCTTGTTCACGCTGACGCTGCTCACGAATTATGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTAGTGATTTATT:1 - chrX 23155935 3' - Doc4-element 92 1 79.17 GATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTCTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAAACGACAAATGGCCGCCGGTCAGTATGTACAATCA:1 + chr3L 6527635 3' - 1360 405 1 75.34 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGCGATTA:1 - chr2L 14239125 3' - 412 48 2 52.74 GACATGTAAGCGAAATGGTTAAACATTGGCCAAGCATCGACCATAGTTGTCGTTCGTTGCAGCGCTGGTGGTCATTACAACGATGGTTCAATTTGTGCTGGTCTCTCCATGTCTCCACTCAACTTGAAAATTTGTTATAGTTTACC:1 - chr3L 8037525 3' + G4 270 1 56.16 TTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCCCGGCATGTTGTCGACATTTTTATGGCTGGCAC:1 + chr2R 8688148 3' - F-element 87 1 75.56 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCC:1 + chr2L 21910217 3' - Doc 78 1 74.47 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCCACGTCTGTGTGTGCTTCCTGTGTATTGGTGTGCACGGCTGTTTGACTGTGCATTGGTATGGGTG:1 - chr2L 9879677 3' - jockey 61 1 56.34 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGGTCGATAAACCAAAAAGCAAACACTTTTATGGTTTGTTTGGTCTCGTCTTTACTTGGCTTGC:1 + chr3L 2426019 3' - hopper 17 1 74.48 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAATATCACTTTAAGGTGATTCCCAGCGCATATTATGACGGAGATAAACATCGCTTAAAGAGAGAGACGGCGACACCGTCGACGA:1 - chr2R 25106009 3' - roo 8695 2 61.15 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTACTTAATTTTCATTTCTAATTCGGTACTCTCCCTTCCCCAAGTGGGATATGATATGGCTT:1 - chr3L 22594137 3' - 297 6617 2 52.03 GTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCATGCAAAATGAAAAGGGACCCTTTAACTTCGTTTCAGCGACTTACGTCGGAGATCGATCTTCATCTTTGGAAGTATTCTGAGTGTGTTATATCAAAGACACTAGAATA:1 - chr2L 14588752 3' + 1360 65 1 80.30 CAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAATAAACGCTTCTATTGTATTTAGTAACTTCAGCCTTCTTGGTAT:1 + chr3R 18153639 3' + copia 178 2 71.23 ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATA:1 - chr2L 17295843 3' - Doc 71 1 62.33 CAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCCTTCGC:1 + chr3R 5773214 3' + Stalker4 7279 4 75.69 GGACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGGTTGCAGCGGCCCATTGCCGAAGTGTCAAGAGATAGGTCTCAAACATAGATTTAAGTGCACTTCTTGTCCGCTAATCCGTAAACCTGGCCATGGTG:1 + chr3R 31641144 3' + rooA 7316 2 68.99 GAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAACTATACAACAATCGTCTCAGAATTCAGGATACTCCTATTTTTCGGGAGCTCCTCTATTAACGGAAGAACA:1 + chr3R 2999861 3' - McClintock 49 2 53.42 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTGTGTGCTGAGTAACAGAGAGTGCG:1 - chr3R 18399227 3' + P-element 2791 1 20.00 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTCCAATTCAAACCCCG:1 - chr3R 20934699 3' - 412 56 2 70.80 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCATAATTCCAGCTTATTTGCTGGTGCAAATAGTGCTAAATAAATAAACTAAGAGCTCGAT:2 - chr3R 25751791 3' - roo 63 2 63.01 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATAATGTATGCTATTTACGCAGAACTGAACAATCAGTAAAATAATGATGTTTTAT:1 - chr3L 785890 3' - I-element 69 1 63.70 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTACACCTGATGTCTGAGCAAAGAGGAGAAGAGAAAACTTGCACTTAGGCAAGC:1 + chr3R 1224292 3' + P-element 2817 1 39.73 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATCTATGTACGAGTATCATGCA:1 + chr2L 17626704 3' + roo 9031 1 58.22 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATAGATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAGCTCAAAGCTACTATTACTTTT:1 + chr2L 16562176 3' + opus 470 2 47.86 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGAGAACATTTATTAGATTGACATCCCGAAATGGCAGAGGACAGAA:1 - chr3R 19538964 3' + hopper 1414 2 65.81 ACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTGTGTGTGGGCATTATAAAAGATGAACTACTGAGATCGAGATCGAGTTGATGGCACTATACCAAGAAACGCGCGCAGGCAAATGTTTCTGGCTT:1 - chrX 2295084 3' + Transpac 289 2 71.03 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTAACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCATTATGTATCATTATGCTTGATCATGATAAGAATTAGTGACAAGAATTAAACTTGAAATGTCA:1 - chr3L 17921936 3' + copia 5069 2 54.79 AAAGACAATAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATATGTATCCACTTTTTTAGCAACGGCCAAAACTGCCTTTTTTCCGCTCAGAGCGTAAGAAACCTATACTCATCGCTTGCTAAGGGTAGCCCTTTCA:1 + chr3L 3611318 3' + 1360 2 2 74.62 AGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAGTTAAGAAAAAAAAAACGACTTCTTCAAACATTTCTTGTTTTGTTCGCAATAACAGCCTTTGCCCATCCTTAGAATTTAGAGATAAGACGCCGAGTAGTTTGCATTTACA:1 + chrX 1022595 3' + FB 114 1 71.23 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAA:1 + chr3R 21674925 3' + roo 359 2 52.05 ATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGTATTAAGAATAATATAGTCTATCTACGAAAAAAGAACACCCTATCTTTGCCGAAATCAATGCAAATTTAGTTTG:1 - chr2L 5890465 3' - invader3 50 2 52.74 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTAGCCCAGCAAAATCATACTGAATATATTTTTGCTCCTATTATTTTGACCGCTGCTG:1 + chr3R 17492900 3' - jockey 4789 1 53.51 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCT:1 + chr3L 10469590 3' + roo 343 2 75.40 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATAAAGCGAACACATGAAACTATTATTGATCCGATATCCCCCCTTTTCATAGTCTC:1 - chr2R 9607103 3' + pogo 2041 1 62.94 ATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGCCCTTAGCTAAGTTTGCTTATAGCCGTACATT:1 - chr3L 6575395 3' - McClintock 179 2 74.80 CTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTATTTTAGCACAACACGCACACATATAGGCGTTCTCTTCTCTTTTTTTACGCACACAAGCAAGAAAAACTTTTTGTGTATTGACAGTGTGTGGGAAAGCGAAGTCAAAAAAA:1 + chr3R 11598227 3' + 1360 3174 1 68.97 CGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCACGTGACATGATATCACGTGATGTGGCTGCTTCACTGAGTCATCTGTCGGATAACTTTCTCA:1 + chr3L 1856785 3' + Transpac 252 2 56.85 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTTTTTCTGTTAATGAAAACAGTGTATTTAAGCTTAAAT:1 + chr2L 19691313 3' - roo 8747 2 76.71 AGAATACCACTCTTTTTATTCTTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAATATTTTACAAAAATTTTAAAGCATCATTAGGCTTAAATTATAAAATTAATTAATCAAATGTCTATCTGTCTACTATTATTTGTGTAAT:1 + chr3L 5973458 3' + copia 103 2 59.15 CAATGCCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCACGGTCTTTTTCCCGTGTGTCATTACGGTCTTGAACTTTTTTATTCGACTGGATAGAGAGCGGAAAA:1 + chr3R 18641931 3' - baggins 5167 1 78.91 TTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGTATGCTTTTAAATTTTAAACAGTTT:1 + chrX 7384965 3' + I-element 5260 1 81.51 GGCACGACATGCATTTGGGCTACCCTGGTATGTGAGGAACCGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTGGTCCCATTAGGAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCGAGAAATTAGATAAATGTCCCAATATAAGTGCGT:1 - chr3R 5607396 3' + G5A 2505 1 78.08 CACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAAACCCTGTTGGAATGCTGTAACGTGCTGCAAATATTTCGTTTTCAGGTACCAGAACAAACTTCGTGGTAATGCAC:1 - chr3L 19999155 3' - 1360 46 1 54.11 AAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGAACGCCTCCCTCCCGTGCCTCCGCCCCCCGTTTC:1 + chr3L 22045727 3' + 412 181 2 74.62 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACTTCCGTTTATGGCCGAAGTGCCCGCACTTCAACCGCCATCCTACTGCCAACTTGCAACTTTAAGTAGCGCGCCCA:1 - chr2R 7889518 3' - jockey 4716 1 49.32 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGTCCATTGGTGTCTGAGGTCATCTTGAGTGATTTGTTGTTTTTACACTTTAAGGCTTTTTCGTTTTGATTTTATGAGCCTATTAAT:1 + chr2L 14501252 3' - 1360 35 1 61.64 TTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACGGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATGGGTTCATTGTTACAATTTCATTTCAAACATATTGGGTTTC:1 - chr3L 5290378 3' - jockey 4920 1 70.55 AACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATTCGTTGTATATTTGTTTAAACTACTTCACAAATCACAACAGAACCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTAAATACACTTTGAAAATATTGAAAATATGTTTTTGTATACA:1 + chr3R 6865192 3' - Cr1a 196 1 68.49 GTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGGTAATTAAACGAGATGGGATAAACCGACGTGCTGACGACTATAGCCATTCTACGAAAC:1 - chr3R 5545307 3' - roo 8606 1 55.38 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACGACTTCGCATGTACACGGCACTTAAACATTATGACATATTCTTTGTCCCAGCACACTC:1 + chr2L 15777900 3' - 297 6623 2 57.25 GGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTATTCACAACACATTTGAATATTTATTGCACACATAACGTGCATTACG:1 - chr3L 6067024 3' - F-element 4523 1 67.81 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGCAATCGACTGCAGAGACCATAAATTTCGATGGGATATTTAATAAAACAGAATATTGTTAACGTGGCAGAAGGGTTA:1 + chr2R 15070189 3' - 412 7098 2 54.48 CTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTCTACCGAGCTTCCTGTATCTCAAGAGTACTTTTTTGTGTTGTTCTGGCATCTCTAGTGAGTGCCGGCAACTGGCGGAACTATAAAA:1 + chr2R 9798485 3' - mdg1 398 2 58.22 ACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATGTAGTTGATGTTGCTGAAGGAGGAGGTCTTGTTGAGGTTTATTTTCAAAGCAGCTGAAA:1 - chr3L 22883014 3' - P-element 2837 1 44.52 AGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGAGAAACTACAAACAGATTGCGGACGGGAGAAGAGGTTAAATGGATCGGCGTTAATA:1 - chr3L 27415183 3' + transib2 2794 1 62.33 ATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTGATTAACCTTATTTCCCCCGCACTGTCAGAATTGCTCAGATGCAG:1 + chr3L 15256272 3' - Juan 408 1 76.71 ATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACCATCTGCTTATACGTAATATTCTTACATTGTATTTATTACTATTATTATTTCGAAT:1 - chr2L 1360934 3' + Stalker2 7584 2 60.96 TTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTAT:1 + chr2L 23034068 3' + FB 372 1 46.58 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAACCAATAATATTCATCCAACAACTTTTGTTCCATAATATTTCATTCCCCCAGAACCTTTAAAAATTTACGAA:1 - chr2R 21870145 3' - copia 48 2 52.08 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCGGTTAGGTTTCAAAAGTTATAGTAGTTGTAGTTGT:1 + chr3R 8218025 3' + P-element 2832 1 47.55 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAATTATTGTCGTTGTT:1 - chr3R 15295728 3' + roo 352 2 70.31 TGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCTTCTCCCTCGAAACGCTTTACCAGCATTTCATAAGATCCCATCAGGTTGATTT:1 - chr2R 9294312 3' - Tirant 8173 2 63.01 CTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCCTATAAACGTAGAGATCTTAAAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGTATGCAGACATCTAAATAACCAGAAATTATTTCAATTATAACTCCC:1 + chr3R 17255540 3' + INE-1 89 1 66.44 TTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGCGGTGGAGCGTTGCCAAATGTTTTCATACCGATTCAAATGTCGTGTTTCGCATGCAATTGAGTTGAAGTGCTTTGAACCTTTGA:1 + chr3L 9767185 3' - accord 299 2 61.64 TACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCATGACGGTAGAAATTAAAGCGTTTCGATGAATACATTACGCAATTTATAGCAGATTTATGAGTAAGC:1 - chrX 17298120 3' - 412 362 2 54.79 GATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGG:1 + chr3R 15790110 3' - flea 4723 1 70.97 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACACAGGGATTCTGATCCGTAATCCTAAGATTAGATTAAATGACTTAATATTTTTTTATTCGCAGTTGAAACCTCTCTCACAAT:1 - chr3L 18253738 3' - blood 13 2 76.55 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTACATATCAATTCCGCCTTTTATATTTACTTATAAGCCATTTTTAATAAACAAATGAACTTGCTTTTTTAACTGATTAGATACACGTGGG:1 + chr2R 13046613 3' + 412 7513 2 58.90 GAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACACCCACACACAGAGATAAATACACACATAAAAATTTAA:1 + chr2R 1000388 3' - HMS-Beagle2 6963 2 73.29 CCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAACAAGAAAAAAGCTGAAGAGTCAAATTTTTAAC:2 - chr2L 17295777 3' - Doc 5 1 76.03 TACACTTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTGCTGAGCGCG:1 - chr2R 21820735 3' - Doc 86 1 71.53 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAACCTTTATGGTGTTTAAAGCAGCAAACAAAACTGAAACAATACCAAATTCTACTCATTAG:2 - chr3L 15364758 3' + 1360 3380 2 77.24 TAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAAACAGGCTAACAAACAACATCAACAACAACGCCGGCGTATTCATGATGCACTCATAAA:1 - chrX 10111007 3' - mdg3 5316 2 58.90 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCACCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTG:1 - chr3R 6413564 3' - 1360 65 1 65.93 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATACATGCACGCAGACACTTTATTTATTTACCTTCCAGCCAGATTGAAAGTGACATCACAAAGTTTTGGGGCCAGAAG:1 - chrX 11008291 3' + hobo 2905 1 58.39 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCGTACTTCAGTGCAGAATGGCAACGTGGCCAA:1 - chr2L 13629030 3' - Tirant 29 2 67.12 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAAGGGTACCGAGTTGCTCCGCTCAAAGGAAAGCGCCCGTCGCAATAGATCGCACATTGCAGATAGAGGCG:1 - chr2R 18649147 3' - 1360 49 1 54.17 ACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAAGGAAGTACAATAGATTTTGTACGAACAGGTATTCTACGCACTGGACATCATCGAGAAGGATTACTTTGGGCTGCAGTTCATG:1 - chr3R 13433368 3' - 1360 398 1 48.57 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCG:1 + chr3L 10469588 3' + roo 8985 2 80.14 GGACAAGCGCCAATTAAGAGGGGAGAAGGTACTACCCTACAATCGATTCTTTCACATCTTGTGTTCCTACATTGTTCTGGGTAAACGCAAGTGCCCAAAATGTGGTAATCGATAAGCTTGGTTACCTGTTGATACACTCACTTCAG:1 - chr3R 16203987 3' + HMS-Beagle 6771 1 69.86 ACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTAATGCCGTGCACGTACCGAGTTATTTTTCTCTGGCCCCCGCACCCGCACCACCAATTTTCTACACTCCCAACCGTTGACGACC:1 - chr3R 9122303 3' + Doc 377 1 80.95 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGTGCTGCCTACTTTCAGG:1 + chr3R 25795836 3' - 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gypsy10 5655 2 61.64 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGAAAATTACTTTACGACTAGAGTTGGATTTCTAATTTAATTTTCATCTAATTAAAATGCATTACTACTTCGTTATCTAAAATTTTTGAACGAAGGCCACCATAGCTGGGTTTCAA:1 + chr3L 9470081 3' - 412 7 2 80.82 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGTTGCCAGGCAACAGATTTAATAAAGAAAAAAACAGCAGCCACTTTACTTTAGCATTTCAATTAAAGTTTGCCCATTCTGTGAAACTTAAACCGCAAG:1 + chr2R 15075711 3' - mdg1 7046 2 77.69 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACGAAAGTTGACAGGGCGGGGAATGAGCTACACTGCTGTAAAGCAACCTTATGGAATAATTATTCAAAACGCTGAGTTTGTGCCAGGACGGTAATAAAGAACATTTCCGA:1 - chr3L 10469464 3' - roo 12 2 76.03 AATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGAATTTTAAATTTTATATGTGCGTTGATTTTTTATGTATGGTGTATTTTAGATTTTAGATGTGAACTTAATTTTG:1 - chr2R 1000286 3' + HMS-Beagle2 270 2 56.85 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATA:1 - chr3R 13437148 3' - hopper 32 1 46.77 TATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACTGCCA:1 - 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Gypsy12A_LTR 422 1 80.82 AGTATACTTTGTTCCGCTGCGAAGAGGGTTTGCGCTCATCTTGGTCTTTTCGCCGCCGAGCGCGCAATTCGTTGGCTCATTTTAGAACGATCGATTCGTTCGTTGTCTATCTGTATTTTTTTTTTAGTTTTACTTTAT:1 - chr3R 836744 3' - Doc3-element 281 1 77.54 ATATTTTTTTAAAAAAGAAGAAATCTTTATCTGTATTGACAACCACCAAACACTCAAGCAAGTAAATTACTAATTGTTAAATGTCAAGTTGTCTCCTATGATGTTTATGAACATGTCTTTAAAAACGTGTCTGTTTTAGCTAATGG:1 + chr3L 18423904 3' + TART-C 11035 1 63.01 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCCTTTAAAATTTTAACTCAGGTAGTAAAGATGTTTTTCATTGTATCAGTGTGACAATGGCAAATAGTGTTTTGCGTCTATAAATTAAAATGGTTTCTGGGGAAAT:1 - chr3R 28450610 3' + roo 393 1 73.97 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCAGAGATATGAATTTCCAAGTAGAACTCACACACGGTCATAAAGAAATAAAGCGGAATCATGTGCAGAAATTTTTATA:1 - chrX 21403373 3' + roo 9027 1 53.42 AACATTTAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGTCAGAAATTTTAGAGAGGGGAGAGCGTGGGAGGAATGTGAGTGAAAGAGAGAGGGCAGCTGCATATTAACTCTTCTTCGCCACGAAGAAAGTGGGAG:1 - chr3L 2824827 3' - Cr1a 369 1 50.36 GTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAAAGAGATTTTATTTAGTTATAATATTTCTAATTATGATGTGCTTTTTTTGCAGACCAAACATTCTAAGGTTGATACTTGAACTGCA:1 - 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chr3R 7470980 3' - Doc 127 1 79.45 AAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAAAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCATCCCAGATTCCAATTTCCTTGCGGCCCAAAGTTCAAACTA:1 - chr3L 13699754 3' - 1360 3233 1 61.11 TTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAAC:1 - chr2L 9275016 3' - F-element 98 1 77.24 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGGACAAACTGGCGACACTTTATTTTTAGAATATCAAACGAAACAATAATAGAGTTTGCGGTTTTGACATTTTATAATTGAAAATATTT:1 - chr2L 9274966 3' - F-element 42 1 62.59 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAACGCTTGTAAAATATTACAATCGTGCGATCAAAGTAAAGGAGTGC:1 - chr3R 11944842 3' - roo 8740 2 71.92 AGTGCACACTAGATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTTACTTCACGCATCATCCCTTTAGATACGCCTAGTTATTATAATCTATATTTTCTAAATTAA:1 - chr3L 17526655 3' + roo 8813 2 56.85 ATTTCTAAAGTTTATTTTTAATTTCAATAATGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTTATACGAGGAACCGAATTTAAGGCGAATGTTTCTGAATCCTGCTTAAAATTGTTTTTTAAA:1 + chr3L 21162815 3' + hopper 179 1 56.85 GGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGGTGCTCTTTTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATA:1 + chrX 21772476 3' + gypsy3 6571 1 72.73 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTCAAATCTTGTAAGCGCTTTGAAAGAGCATCGTAAGCCATTAGTGGTAAACTTTGCAAGTAAAATGTCTGGCGATGACGAGCTGAAGTCGGAGGGCATAGGCCAAACACA:1 - 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chr2R 21690466 3' - 412 7121 2 64.38 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCCTGCCCGCTCGAATTTCGCTTAACATTATTTAAAGGTGAAGTTCTTGGGCCTCATATTT:1 + chr2R 25106158 3' + roo 9036 1 61.64 GGCAACTCAACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTTATTTAATTCATTTCTAAATTTATGAAATTAATGGTATACATAAACTTAAGTGTATATGATGGCTATGAATAGTTTCAAGTTTCACATACCACATATGCATGGTGACCAGT:1 + chrX 22981649 3' + INE-1 572 1 72.60 ATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAGTTTTTT:1 - chr2L 2120383 3' - I-element 4976 1 65.75 AAGACCTTGTGATCTAAGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGTTGTTTTGCTCAAATGCCTTTGACATTCTGCTCGGCTCTGTCCTTTTGCGACATGAGATGCGAATATTTGTCGCAATCAAATAAA:1 - chr2L 5583068 3' - F-element 4215 1 56.85 TTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTAATTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGGGCGGGCTAGGAAACCATGGACAAAACTGTACTCTTATATACAACGATTCGAGGAGGAGGACTCTG:1 + chrX 18130835 3' - 1360 420 1 60.27 AGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAACCTTCCCTTGCTTTAGCCTCCATGAAAATATTATCTTTAATATTTATTAATACTTAACAATCAATTTGCCTGACCCTATATGAACTTCT:1 + chr3R 6321476 3' + Ivk 401 1 56.85 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCTTGTGATTCCATCATCGAAAAACCATACAGAAGGCGAAGGACAAAGGGTCCAGGACACAATTGAAGGCG:1 - 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chr3L 2425888 3' + hopper 1341 1 66.44 CGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAAC:1 + chr2L 5890556 3' + invader3 198 2 73.29 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGG:1 - chr2R 13761644 3' - jockey 4736 1 79.82 CCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACATAAGCTAATAAGAACCTATTGACTTGCACTGCAATCAAATACACTTATTTCTTATTTTTGCACATGAATCTTTTTAATTTGTATACTAAAACGATAAA:1 - chrX 14137167 3' + 3S18 6079 2 65.75 ATAAGCACACACACACACACATGACACATGGGCATGGGGTATCTATGTACTTTGACCACTCGATGTGCGAATGAAGCGCGGTCCAAAAAGGGGGCGGTGGAGTGGGTGTAAACATTTGTTAACCTAGATGTGAATTAATTTACTCA:1 + chr2L 17006960 3' + accord 7027 2 71.23 CCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCAGCAATAGCTGCTGCGGCCCCACAGCCACAAATTACTGTAAAGCGCAAAAATTTAATTATGCAAAACACGTGCAATGCTGTTCGATCTAATTGCATGCCCCAACTCACTTGACAG:1 + chr2R 14913600 3' - X-element 4406 1 80.00 ATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACATATCGGTAAACTAAAGCGCGACTTGGACTATCTTCAATCAACAAGCCAA:1 - chr3R 7935341 3' + hopper 1014 1 66.44 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTAGCTTATGACCAGGATAAGGTAATGTCCATTGGATACTGTTGCCT:1 + chr2L 6388142 3' - jockey 25 1 53.33 TTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTATTGAACGCTCCCTCTCACTCGCTCTCCACACACATAATTAGCACTGACCAAACGGAAT:1 + chrX 17346260 3' + blood 7120 2 57.34 GATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATACCTGTGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTATCAAAGTAGCGAAACTAGCCGGCTGGCAGATGACAAAGTTCCCAGC:1 + chr2L 5890587 3' + invader3 5430 2 55.73 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCATAATTCCAGCTTATTTGCTGGTGCAAATAGTGCTAAATAAATAAACTAAGA:1 - chr3R 25751798 3' - roo 70 2 67.81 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTG:1 + chr3R 21674917 3' + roo 351 2 57.53 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCCGGAAAGTAGGCAGCAGAAAGCA:1 + chr3L 15723947 3' - jockey 4706 1 54.39 GTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCATGAGAATTAAACTGTTGACAGTTCTGACAAAGGAAATGATTGCCAGATTTT:1 + chr2L 14434091 3' - Doc 263 1 62.50 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAAGGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGAGTAAACATTT:1 - chr3L 18381915 3' + copia 223 1 49.32 CGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCAAGATGTGCTTAAAGTAGTTGATGGTTTAATGCCTAACTTTGGCTAACCAAAAAGTCAGGCCAAATTGTCACTGCCAAACGGGCGCCCAATAATTATAACAATG:1 - chr3R 18154232 3' + copia 479 1 54.48 GTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAACCCCCCACTTCCATTGCAATTTTCGCACTCAAG:1 - chr2R 17234051 3' + I-element 325 1 72.50 TATTAATAATTATTCTTTTTATCCATATATTATTGCCCTCCATTGTGGACTTGGGCTTAGTTTGTTGGTGATGGTTTGAAACCAGTCCTTGTTGATGGGCAAGTCCTATGTCCTCAGTGTCGAATTCGGTAGGCCAATGACCATGG:1 - chr2L 15879618 3' - gypsy9 5306 2 55.48 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATAAGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCAAGGAGCGCGCAACGAGAA:1 - chr3R 14277868 3' + P-element 2879 2 70.48 TAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGC:1 - chr3L 7837147 3' - jockey 4802 1 53.52 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTACACCTGATGTCTGAGCAAAGAGGAGAAGAGAAAACTTGCACTTAGGCAAGCTTATGTAATGGTATGCATATTGCATTATGCATATTAATTG:1 + chr3R 1267808 3' + P-element 2857 1 67.12 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGTCTTGGGTTGAGGGGCAGGTTTTCACCGGGTCAGAGGGGCAGGCGCCACCTAATGACTTGCAGCGTGGCATTAAATTGC:1 - chr2L 12486305 3' + roo 393 1 71.67 ACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCAATAATAATAATAATAATAGTAGTAATAATAAAGGCCGCCAAGTGGCCCGTAAATTGCAGTTTACTCTGACCCATCAGCCACATCACTCACCTCCATTCGCA:1 + chr3R 22664186 3' - Ivk 31 1 47.95 CTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCTTAAAGGAAGTGAGGGATTGTTCATGAAAAATCAGCAAATCAGTATATAACATATACCTGTATGCAG:1 + chr2L 18632351 3' + opus 125 2 54.11 TGGATAGCCGACAATTTGGAGATTCCTTTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTAACTTTTTTATCGGGGAACCTGGTGGGCGGTGGTCCCAGTGCCGGAAGCGGCGGTGGAGGCAATAGGGCCG:1 - chr3L 9473428 3' - Q-element 119 2 61.29 CGGCACGACCAACCAGCTCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCAAACAGCACGAATCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGATTAAGATTTGAAAACTTATTTTGTCACTGTCTAAATGCTTTTACGATGCTGTCTGGCTGGTG:1 + chr3L 23614288 3' + Doc3-element 4582 1 71.23 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACGAAAGTTGACAGGGCGGGGAATGAGCTACACTGCTGTA:1 - chr3L 10469534 3' - roo 8746 2 74.66 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGAAAGACGGCAGCTTAGGACCACCCAAAGAGGTCACTCCTCATCGGTGGCCATTATG:1 - chr2R 9340122 3' - 412 65 2 60.96 GGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTATACCCTTCCCTAAACACTTCAATAGCTCCTCTCCATTCAACCCATTT:2 + chr3L 15364895 3' + 1360 3315 1 69.18 AACAGCTCGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTCCATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACT:1 + chr2R 5045661 3' - invader6 71 2 67.12 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCCGCCATCTCAAACTCCTCACAAGTGTCAAATTGGCATTGAAT:1 - chr2R 23212611 3' - Tirant 46 2 61.40 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTCCATATAGTTTTCAAATAATTTTCTAAGGTAAAACTAATTGTAAGTTTTACTTAATGCAACAACCCATGTTTTAAGTCTTATGTCTAT:1 + chr2R 21870292 3' + copia 222 1 48.63 CAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAGCCTTGTTAAGCCCTGTTGTATGAAGCACAAGTAA:1 - chr2L 11554505 3' - roo 155 2 74.82 ACAGAGGCAGACTCGAGACCAAGTCACGGTCGCCATGTAATAAGTAATAATAATGGCTTTTGCGGCGTATACCTTACATGGGCTTTTGGAAATTTTGGGTAGCGAAATTGTCGACAACATTTGGCCTTTTATAAAGCAATA:1 + chr3R 4678469 3' - Stalker2 438 1 63.12 CATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGATTTTCACCATATATCATAAAAACGGTTGCAATTGCAAGTTGCTGCTGCGTCAAATGCAAAATGTGATTTAATGCC:1 + chr3L 14379618 3' + I-element 227 1 59.59 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAGGC:1 - chr2R 21690473 3' - 412 7128 2 69.18 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGA:1 - chr3R 10213051 3' + P-element 2800 1 26.71 TTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGCCGTCTGCCATTACGATCGGTTTGCATCCCTGTTTAATTAGCTAACTAAATTTTGTATTATTGCAATTTATTTACT:1 + chr2R 11441908 3' - FB 618 3 49.66 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAGAAAGAAATATCCCAGGAATTATTTCATATATACATATTTAAGGAT:1 + chr3L 13364435 3' - hobo 18 1 73.97 GATGCTTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCT:1 - chr3R 25277635 3' - 3S18 92 2 77.40 ATATTACTGGTGACTTAAATTTTTTTATAGTGTGGGCCGTACAATCTCGGGCCGGCTTCTCTTGCGGAGTACATATAGCCGTGAGCTGGTGTCGTACCCCCAGCTGGGCACTCCGTATCTGGCCACTATCCGCTCTCGAAGAGCCT:1 - chr3R 3906779 3' - Osvaldo 1402 1 67.81 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTACATGGGCATTACCATTGGACATGTAGACTCTTGTGACCCCTACACACCCGCATGCTGACCAAAACTGCAA:1 + chr3R 4191011 3' + pogo 2053 1 54.79 ATCAGTACCCATGAGCAATCCACTCAAGAGGGCATCCAATCCAACAGACTACATCGAACAGGACTTCAACGACGACAAGTCATATCACTTACTGAACTACGAACTGACACAGACGAAGAACCTGCTTGACACTGTGATCCTGGCAA:1 + chr3L 26386281 3' + Quasimodo 6986 2 71.23 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTATATTTTGTATTTTTAGTTCTCCCCATGTAGAGTCTCTTTATAGGGTCGTTTCCCATTCTCTTGAAGCAGTTCTCCCGTTTTCTGATTTGGAAACACCGCTGA:2 - chr3L 2192235 3' + jockey 4969 1 60.96 ATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATCGATCAATAGTCTTTCATATATTTAGTTACATACAATATAATACATATTGATTTACTTGGTGTTTTCGTACGTTTTCGTTTTTGCGGAT:1 - chrX 14836139 3' + invader4 299 2 66.44 CGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACAAAAAGAAGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACTCCAGTCTCCGGTCTTCAGGCTTCTTCAGTCTGTCGTGTGTTTTCGTCGCAGCCACATTGGA:1 - chr2L 714948 3' - Cr1a 221 1 57.53 CGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTTTTAAAGGTGAAGTGTTGAACAGCTGATTGAGAGAAAGCAATTCCCGCCAACATAATTTTCAATTTAGCTCCTGGGGAAGCATCCATCAGTTGAATTCTTTGGAAACTCCACAAAT:1 - chrX 4588358 3' + transib2 127 1 55.48 GTATGTGTGGATGTGTGTGTGTCTGGTTGTGTGTGTTTTAGCCGCTGCCTTCCGGGCTTTACACGTTTGTTGGTATTGGGGTTGCTTTTCCTCTTAATAGCCTTTACACGGGCTGGTTAACTTGCATGGTGCCATGC:1 - chr2R 3157680 3' - accord 7039 2 70.07 AGATCAGAAACTTTGATATTTAACAAATGACTGATCATTCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATCCGATCAAAATCAAAGTTCAATTTGTAAATGCCTTCATGCA:1 + chr3R 21715833 3' + Tc3 1602 1 74.48 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAGGCAAAGGCGAGATGGTGTGCATCGATCGCTGTGTGGCCAAATATCTGGACATTCACGAGAAGATCGGCAAG:1 - chr2R 21690404 3' - 412 6 2 77.40 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCAAGGAGCGCGCAACGAGAAAC:1 - chr3R 14277866 3' - P-element 8 2 72.90 GATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAAGCAACCACCCACATGTGGTGGGAAATTATGTGATGTGACGTGTGATTTGCTGACTGCCAATGTCTCGATGGCGAATGCAAAGCGG:1 + chr2L 19475852 3' + hopper2 1360 2 64.38 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTGTTTAATAACTAAGTACTTATTACTTATACTATCAGTGGGTTAATGAACT:1 - chr2L 19691244 3' + roo 338 2 65.75 AAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATACCGCGAAAGATTTCGCTAATTAATCAATTTGCTGTGCACATTATGTAATTGAAAATTAAAATTACTTG:1 + chr2R 5705221 3' + invader4 77 2 53.42 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTTTGTCTCTATAAAATATTAAGAACCTCACTGACTTTTCATTCAACAGACAACACATCCT:1 + chr2L 7652283 3' + roo 9019 2 58.99 AGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAACTAAAAAAGTAAGAACCTCTTATTACTAGACCTGAAAAC:1 + chr3R 26403202 3' + I-element 42 1 72.27 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATTCAATAGTTTAATTATTAAATTAACTAAAACATAATTAGTCTGATAGATGTAAAA:1 + chr3R 6413678 3' + 1360 3358 1 64.38 ATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATACAGTCAACTCCGTCTCATTGCATGCTAACTGTACTTAACTATCTTTATAA:1 - chr3L 7939044 3' - R1A1-element 5331 1 53.70 TAACGGGTATCTGATAGTCGACTATAACGGGTATCCGACTATAGCCTACTCTCTTGTTTCTTTTGCACATAAATACACAAATAATTTTTGCCTTCATTTAAACAATTTGAGAAAGTCGCCGGGTTCTATATACAATATTTGCCTTC:1 - chrX 22806230 3' + INE-1 552 1 58.22 GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTCTTTT:1 + chr2L 21643141 3' - Tabor 49 2 52.74 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCATGAGATAAAAGCATTAAAAACAGTTTGCATTAGTGCCAATTTCGCAGAGTGTGTTGCTAATTTGATT:1 - chr3L 20251903 3' - copia 4921 2 56.85 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAACACCCGGCCCCGCCCCCTTTTTG:1 - chr3L 3453566 3' - Tirant 8135 2 67.81 TAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATTAAAAATCTATAAAACGTTCTTAATTGGTATTCGATAAATGTTT:1 + chr3R 7805837 3' + roo 8620 1 69.86 CCTTCTTCAACATATTCTCTAATGTCCTATACACGCTGCCTCCCACCACCCCTCTCTCTCTATCTTTCTCACTCTTTCTAATGCTCTACGTTGCGTCTTATTCCTGCTGCTTAGCAATTGAAACGGATTCTATTCAACTCGTTTTG:1 - chr2R 14562492 3' - invader4 204 2 44.52 CTATTAATCCTGATCAAAAATATATATTTATATATTTGATTATATGGTCGGAAACGCTTCCGTCTGCCTGTTGCATACTTTTCAACGACTTCACCTCTCTTTTTCCTATCAACGTTTGTTATGCGATCCTATTA:1 - chr2R 5705578 3' - INE-1 85 1 69.40 CACGAACAAAATGATACTCAATATCTATGTGCTTAGTGCGTTTAGGGTGTACTGGATTCTTCGCAACTACATTCGCTCCGTTTGGCTTTCGTTTTCTGCCCTGGTTGCGAAAGAAGACGCTTTCGATTTTCACCCACCTAAAGATT:1 + chr3R 20777661 3' - Copia1_DM 4139 1 53.42 GTGCGGGTTAGCTGAACCCGACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGATTTTGAAGTTCTGAGTACTATTTAGTTACTATAATGAAATTGTGTTTTGATTGATTTAAGCTTTGCTTA:1 + chr3R 17823193 3' + Stalker 7148 4 51.37 GTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGCCCGCAGGAGCAGGAGCCTCCCGTAGCCGGCGGGAATCCGGCGGAGTGAG:1 + chr3R 17253919 3' + 412 7361 2 62.35 AACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAAACAATTACAATCCGCGTTCCTCTCCGGCGTTAAAGTCACCG:1 - chr3R 6495297 3' + Stalker4 318 4 73.97 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGGTTCACAGGTCACTGTATCAGTATATCAATGCTCCACAACCACCAACACACCAACTTGGAAAACTAAAACAGCAAAC:1 - chr2L 3960135 3' - jockey 22 1 74.13 GACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTGTGTGTGGGCATTATAAAAGATGAACTACTGAGATCGAGATCGAGTTGA:1 - chrX 2295128 3' + Transpac 5163 2 65.07 GTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTC:1 + chr2R 11146142 3' - Quasimodo 40 2 59.57 CAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAA:1 - chr3L 14944549 3' - G5 4802 1 55.48 CTTGCATAATAATCCAACATGCCATACTTTGTCGAAGTATGTTGCATATCTATAAAGACAGCGTTGGAGTACTCGCAGTCGTCATGTAATATGTGTTTCTTATATGAAATGGTTCAACAGGGTTGCGTGGCATTGAGAACCTACTA:1 - chr3L 17760133 3' - Helena 426 1 71.23 GGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTTCAGCTTGATAAATTCGATTCTTCGGTAAAGAGTGCAAGAGTGAAGCTTTGTTGTTTATAATTAATTAATGTTTGCGTTTTCTTGATTTAGTTTCT:1 + chr2R 19568238 3' - Doc 4483 1 69.23 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAATT:1 + chr3R 6413624 3' - 1360 86 1 63.45 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTC:1 + chr2L 21643137 3' - Tabor 53 2 52.05 AAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAAC:1 - chr3L 14375614 3' + roo 9015 2 56.16 GGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGGGATTCCCCA:2 - chr3R 25543447 3' - G2 225 1 44.52 GCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCTCTGGTGATGCGCCTAAGTCCCTTTGTCCATGTG:1 + chr2L 19477043 3' - hopper 83 1 75.34 AAAAGAAAAAAAAAATGGGGGGGGGAACGGGGGGCAAAGGGGGGAAATGGGAAAAACTTTGGGGAAAACC:1 + chr3L 14814863 3' - hopper 137 1 78.57 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCTACCCCAGATTTCCTTGTAAACTGATTC:1 + chr3L 16973517 3' + S-element 1708 2 78.08 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTGTTTATTAAGCACTTATACTTGCGCTATGTTAATCT:1 - chr2L 4637217 3' + mdg1 336 2 74.66 GGAACTCGACTTTAGCATTCTCTTTTGTTTAATCTTTGGTTTGTAAAATAAGTTCTAAGCTTTCTTAGTTTAAGTTATTTTCACTGATTGATGTAGGATTTATTAAGATCATTCGATAATATAGTTTTTCTTAACTCATTCAGTG:1 + chrX 22672495 3' + INE-1 573 1 48.97 ACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGATTGGGCACGATTAAGTGCTCCACCTCGGTGCGATTCATCAGGTTTAGTTCGTCCACAGTGCGCAGGTGCAAGGTGCCCCTCTGCGGTGCTTTCACAATGTC:1 - chr3L 363407 3' - blood 7015 2 77.86 CAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCATTAACGAAGTGGTTTTCCACCGCCCCGCTGCTTCGC:1 - chr3L 12229444 3' + F-element 4391 1 75.34 ATTAGTTTTTTATTTATATAAAAGATATTCACGTAAACAACACATTTTAGTAAATATTTTAAAATATAATAGTTTTTAATTGCAGAATGTGGATAATTTTGCTATCTTCATTTTGGTGTCTTTGAGTTCAAATAATTCGTTTGCGT:1 - chrX 20703999 3' + Bari1 1394 1 43.84 TAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGTCGAAGGTCCCAAGACCAAAACCACACTGTT:1 + chr2R 19632737 3' - hobo 2673 1 73.95 GGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAAAGCAAAAGAAGAGTGAAGACAAGCAAAATACCGTACCATGGCCATAGAGTCACGCTCTGCGAGCACTGC:1 - chr3R 25759145 3' + opus 7336 2 52.74 CATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAAAAAAATAATTTTAAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATCATCCACACACCATGGGAATAATAAGGGACAAATTAATAATTAACCACTCCAGAG:1 + chr3R 29665640 3' - 1360 3141 1 59.59 CATACCCATGTATATGTACATATGTATGTACGGAAATGTTTTGTTTGCGGGTGTCTGAGGCTTGTGGCATTTTTTGGCTC:1 - chr2L 14678150 3' + Stalker2 251 2 75.00 AATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAACTGCTGCCGCCGCCTTTGCCCTTCAGCTCTTCAGCTCTTCGGCTCTTGTGAG:1 + chr3R 10907598 3' + X-element 4667 1 57.94 AACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAACAGGGAGAGTAAACAAAACACCAAGACGAAAAATGCAAAATAAGAAAAAACAGAAAAACTTCTAGCAAGTTGAAAAGTTGAAAGCCGTTAGCGGTCGGTCCAAGTTAGCGCA:1 - chr3R 22045466 3' - Cr1a 241 1 52.05 ATAAATATATAAATAAATAAAACTCATTGTACATGATTTAAAAAAACACATTTTCTAATTGAGTTTTTTTAACTTCACATTAACTTCAATTGTAACCTATAAATACTATTAAAAACTGACCCAAGACACAAATATCTCTGCTTAAG:1 + chr2L 8303328 3' + Juan 4215 1 36.30 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGCTAAAAAAGCTAAAGAGCCAGCAAGCTACATAAGCCCAGTTAGTCAG:1 - chr3L 21013809 3' - roo 8683 2 72.41 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGTAAGCCCT:1 + chr3R 30264087 3' - blood 7092 2 73.79 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCATTGAATCGAACTGAATTATGTATCGTTTT:1 - chr3L 14375596 3' + roo 9033 1 56.16 TCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGATGATAAATTAGAATTAAAGAGAAATCTGCGTTAAAAGTTATGCATTGGATAC:1 - chr3L 17666582 3' + F-element 283 1 61.19 GACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACCACGGTGATGGTGACGCCGCTGCTTAAAATGGGTCTCGAAATGATGTCAACGGAGAGAGAGACGGCAGGATACGCACTTGCACTCATGCACCTCAAACAACAT:1 - chr3R 25586868 3' - gypsy4 6461 1 61.64 GACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTCAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTGCTGTATCAATCTAATATCTCGCGATCATATGTATATCATTCGTAGACCTCA:1 + chr3L 20224271 3' - Chimpo 5 1 78.40 GTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAAACTCGCATAACGATACATAGAACATTA:1 - chr2R 12065566 3' - Stalker2 46 2 56.85 GTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAGTCAATTAAAATGTCACAGTCACCTACAAAATATTGCTTATAAATCGATTTCA:2 - chr3L 14375625 3' + roo 340 2 63.70 ATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCATAAGAACTAAAATACTTAAAGG:2 + chr3R 14954059 3' - jockey 4824 1 60.27 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCTGGCAACAGTTTAACAAGCTTTTTAAAACTACAGGA:1 - chr3R 7585752 3' - Doc 66 1 68.64 AAACTGAAAATATTTAATGTCCGGTATTACTGTTGGTGCAGCTCGAGTATGGCGTTGTCCTGGATTCGTAATGGAGGTTTTTGTGGCTAATATGATTGCGTTTATTCAAGAGTTAACAACTTCCATGGTTTGGAACTATGTT:1 - chr3L 25764247 3' - Juan 69 1 36.62 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATGGTTTCGCCATCAGACTCTAAA:2 - chr2L 12291822 3' + Tirant 354 2 54.79 CTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCACCTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGCTTTTTTTTTTTAGGATAAATGGTGAGCGGAGCGGCAAAAATGAAGCGCAGCTGAATGATGTACCAGAATGCCAAAGGAAATCA:1 + chr3L 20766947 3' - I-element 352 1 57.04 GTTAGATCTACAATGATTTAAAATAAGGGGTGTATAGTGAATCTAGTAGAATATACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGAATAATCAAGTCGGGCCTCTCAACATCACCACCAATATTTAATGCCAATTTATGTTGTGTGTTCTCTG:1 + chr3L 1986000 3' - Cr1a 4147 1 78.77 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGCATATGAAATCGTCAATTTTATACCGATTCATTTTGCTGCGACTCAAAAGCTGCCT:1 + chr2R 5438305 3' - flea 4785 2 54.63 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAACCCCACTAAAACGCCTCCCGTTGCCACTCAACGAAGCGTATTAGCAAATTAAATTCCATT:1 - chr3R 20934636 3' - 412 7079 2 66.44 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAA:1 + chr3R 22494179 3' - 297 6628 2 64.41 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATGAAAATTGTGAAAAAGATGATGACCGATTTTCAGAAAAAGATC:1 - chr2R 5237683 3' - Doc 13 1 65.07 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCATTTGCTTTGAAGATGGTTTATTGTAAATGATTCGTTTTGGCCAAATGACATAGATTTGTTGCGCATTTGTTGCATTGATTTTTCATTG:1 - chr3R 17099862 3' - Tirant 32 2 65.07 GGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTAATAAACGCTTCTATTGTATTTAGTAACTTCAGCCTTC:1 + chr3R 18153632 3' + copia 5040 2 76.03 ATTAAAGTATTGTAAAAGTAAACTCAATATAAATTAAATACATTAATATTGTAAATAGAGAAAAACTTACCTTCATTGGGAGATGTGAAACATTCGGTTCCAATGTTATACCACCGAAGCCACCAAAGACCTTTTTGACTCTAGTC:1 - chr4 355128 3' - looper1 243 1 59.59 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCCCGGCATGTTGTCGACATTTTTATGGCTG:2 + chr2R 8688144 3' - F-element 32 1 63.16 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAACACCCGGCCCCGCCCCCTTTTTG:1 - chr3L 3453566 3' - Tirant 8 2 78.57 GGGCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTAGATAAAGGTAAATTAAAGGTGCAGAGTAATAAAGGTCAAGTAACTAG:1 + chr2R 17014467 3' + flea 4941 1 66.21 ACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAG:1 - 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chr3L 8658730 3' + roo 8999 2 66.90 GATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGACGAAGGACTCGTGTGGAAAACCCCTTGTAAAAAGTACGAAGCGAATTATTTGCAAACAAAAGTGC:1 - chr2L 2894340 3' + Burdock 303 1 68.93 CCATTCTCGAGGATCATATAACAATATTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTAACAAGGCAGTGACGATATCTAAATGTAATTAACTACGAAACATAATATTGGATACGATAGAAAGTCCTTCTGAAATTTC:1 - chr3R 5124455 3' - Idefix 6945 2 54.11 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATAATTTTTCACTGCCGATTTGCAATTTTTCGGTTTATACT:1 - chr2L 19652482 3' + roo 385 2 66.44 GGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTATATATACTTAATATGGTCAGAATCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATTCTCTTTTACTCTACGAGTAAAGG:1 - chr2R 2749412 3' - mdg3 31 2 64.38 GAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATCGATCAATAGTCTTTCATATATTTAGTTACATACAATATA:1 - chrX 14836188 3' + invader4 3009 2 71.23 AGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGTTCCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCGTTTTCAAGCATCACGTTGTTCATACTTGTTCGTTATTTTCATGTCCAACCATTGCACTTGGCATGGAAT:1 - chr2L 5153316 3' + 1360 235 1 54.11 AAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTC:1 + chr2L 18112586 3' - transib2 2613 1 59.59 CTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTATTTCACTGCCAATTGTTTTTCCCGGCCAGAAA:1 - chr2R 11095705 3' - diver 27 2 65.75 TCAGTGTATGAAACATAATATCAAAGTGCTGAACCAGCATTGGGAAACCCGTGCGCAGCCAGCAAGCACAGCATATTTGCGTGGCCTCGACACCACCGTTTGTGGGCAAGAAAAAGGAGAACGTAAAGCCCG:1 - chr2R 9825707 3' + Gypsy6A_LTR 35 1 63.64 CTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTGGCTCAAAGTCGCAGAGAACGGCTAGAGCAAGCGAACGACCGTCAGAGAACGGTGGCGGTTGCTGAAAGGTCTATG:1 + chr2R 1320529 3' + Transpac 310 1 77.88 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGCCCATCTGCCCCC:1 - chr3L 7837135 3' - jockey 4777 1 66.67 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGAAAGACGGCAGCTTAGGACCACCCAAAGAGGTCACTCCTCA:1 - chr2R 9340137 3' - 412 53 2 64.71 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGCGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTT:1 + chr2L 17839440 3' + blood 7335 1 74.04 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGCAACCTGCTCCATCGCAGATAATTGCTCTGCG:1 + chr2R 14973736 3' - FB 24 1 68.49 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTGCTGAGCGCGATGGGTCGCTTGGACTCATCGCTCG:1 - chr2R 21820710 3' - Doc 62 1 55.86 TCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGT:1 + chr2R 3104462 3' + Gypsy6A_LTR 356 1 64.23 ATAGCCGAGTTTCCCGACTATCGGATACCCATTATTCAGCTAGTGAAAGTACGAACCAGAAATTTCAACATGTTCTATTAGGAAAAATCGGCAGCAACAACAGAAACAACAGAAACAACGAGCCACCGCAACACC:1 + chr3L 16464288 3' - INE-1 564 1 62.22 AGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTT:1 + chr2L 19140411 3' - Max-element 8308 2 73.64 ATTATTGTTATAATTATTGTTATTTCACAAAATACTGCATAAGGACTAAGTTGTACCTGCAACATCTAAATTAACGTTGAAAATCAGAATTTCTTATTAGGTTTAAAATAATTAGATATGGCTTTTCGTTTAACATAACGCATAC:1 - chrX 3558103 3' - mdg1 7059 2 43.45 CTCGTCGTAAAAGTCGTCTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGGAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCATACTTGCTCGTTCGTTAGGAAATACCAGGTATTCGTACTCCC:1 - chr3L 10271949 3' + Rt1b 4884 1 68.66 CAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTACTTGTTCTTCTTTAGATACTTTGTACAACCAGTGAT:1 + chr3R 16997464 3' - G6 62 1 57.53 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGACCGCATTTTACGTCCTTGAACTTACCCGGTTGCCATGAATCCTACCGTGAATC:1 - chr2R 15075541 3' + mdg1 393 2 66.21 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCATGTGGTCAGCGAGGAGCAGAGAACGGGCCTACTATGCGGCAATGTGACCAA:1 - chr3L 11803927 3' - blood 14 2 74.82 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTGAGTGAAGAAAACAGTCGAATCGGTTGACTTGACGATCCAGTGCAGAACCG:1 - chr3R 10212993 3' + P-element 2860 1 67.36 ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTAAAAATTCTGTTATTGCTGTCGAACACACATTAAAATTAGACTAAAATAAACCCAAAGCAA:1 - chr2L 15644854 3' + transib2 2767 1 57.24 TGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTGCGGCCAGCTACAAATTGGGTCCTTTTAATTGCAACCAGATCACCTGCTGTTGTTGCTGGCTCTAGTATTTTGCGCTTTTGTGCGCTT:1 + chrX 2108164 3' - flea 4585 1 74.29 TAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAACAAAACTAGACTAGCAACCCTATATGACCGAAAAATGCATCTCATGCA:1 + chrX 8903502 3' + TART-C 11102 11 90.00 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTGTTTTAGTTCTCGTTTAACCTTTTCAACTGCGTATTCGTTGTATAATGCATACATTA:1 - chr2R 9769536 3' - 1360 64 1 60.27 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCC:1 - chr3R 10213054 3' + P-element 2829 1 31.58 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATATAAGTTAAGTGCAGCCGGCTGAAGTTGAACTACCTCGATTG:1 + chr3R 24673638 3' + roo 8996 2 71.23 CATATATGTATATACTATATATGTATATCTCCATACATCCAAATGCCATAATACGTTGCACTTACCTGACAGGCAGTACTTAGACCTTACTCGGTCTTCCGAAACAAAAACAAACGCAAATGTAACACACAAAAGCCAATTCACA:1 + chr2L 18935370 3' - INE-1 61 1 68.28 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTGATAATAATATATTAATATTGCATCAAGTGTATCTCAGACTTCTCATTATCCTACAGATCAAGGCCTTGGGTATTTAAAATGATGCTTCTTCGTGTCTG:2 + chr3R 17586967 3' - Max-element 23 2 68.49 AAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATGAGGATGGGAAATCGTATGAAGATTAGGCTCAGAATTATTAACATTCGTGCCCAGGGCGCTACCAATCAAATGAGGTGTA:1 + chr4 546107 3' + flea 459 1 66.67 TAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTTTAGTTATCATATTGTTATGGGGCTTGTCTATATTTTGTGTCAATTTAATAATTATATCCGTTACTCG:1 + chr2R 7995234 3' + 1360 448 1 65.75 GCTAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACAGAGCGAAAAAACAGCAGAACAAATAGCTCAGCAGAGCACAGGAGTACCAGAAATCCGACAGATACTTCCACTAGCCTAGCTACATAGCGCTGTTAGTGGCTATAGATATTATGCCTATATG:1 + chrX 20652430 3' + G-element 4325 1 72.60 GGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATATTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCTGCGTGATTTTAATATTTTCACTTCGGGGGATTGCTTTT:1 - chr3R 803551 3' - G5 4638 1 74.42 AACGTTTGCCCAACCATTATTTTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATG:1 + chr2L 23034047 3' + FB 351 1 60.27 AAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAACAGAACCCATATAAGTACTAACTGAAGAGAGCACTCAATATATTTAATTCAGTAATGAAGTAGTTTTATATAAACCATACCCTAGCAACTATATAGCTTTACACG:1 - chr3R 829867 3' + 1360 3099 1 71.92 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTGCGAAAGTCGAATG:1 - chr3R 6413551 3' - 1360 49 1 57.58 TGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAACTTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGTATTGCTGCG:1 + chr2R 14973672 3' - FB 87 1 75.17 GAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGGATAGGGTTAGTACTTGCAATTTCAAGGCCGTTTCATTTTGTGCGAAAGTCGAATGTATTATCTTGGCT:1 - chr3R 6413538 3' - 1360 50 1 52.74 TATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAACTACCTAGTATAATTGCAGTATTATTATGAAACAATTTGATTTAATTC:1 - chr3R 9583297 3' - Juan 4099 1 65.07 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTAAATGGAAGTTCAGCTTTCAGCTTGCCATTTGGGAAAAGCCACCACTGGCACCACCCCAAGAGTAAG:1 + chr2R 19852254 3' + Transpac 267 2 51.45 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCCGCCATCTCAAACTCCTCACAAGTGTCAAATTGGCATTGAATCATGACTGG:1 - chr2R 23212602 3' - Tirant 63 2 60.71 GAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAAATTAACCTGTTGGTAAACAAGATCTCCTAC:1 + chr3L 21093265 3' - Ivk 24 1 67.86 CTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACCTACACATTCTCTCTTGTTTGTTGCGATCCCAATACTTGCCACCTTGATGACACAAAACCGCTCTAAAGCGTCCGTCAACTCACA:1 - chr2R 1728216 3' + INE-1 539 1 66.67 AAATATAAATATCAAAATGAAGATTGTGAAACCTAACATTTCTGTACTCCTATTATTTACATATGTATTACTTAATGAAATAATTTCAACCACATACTTGAAACTCACGCTGGGGTCACCAAAACGTTGGAATAATACTCTTTTTT:1 - chr2L 22319501 3' + Transpac 4804 1 77.40 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAACGCTTGTAAAATATTACAATCGTGCGATCAA:1 - chr3R 11944855 3' - roo 89 2 80.82 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTGAGTGAAGAAAACAGTCGAATCGGTTGACTTGACGAT:1 - chr3R 10213007 3' + P-element 2866 1 66.94 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCA:1 - chr3L 23146490 3' - 1360 36 1 60.78 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTTCCCGTTGTTTAAAATATGTCGTCGAGCCAAGAATTTGTACTTTAAATGTTTTTCTCTGTGCTCTG:1 + chr3L 2330224 3' + roo 9055 2 70.92 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGCATATGAAATCGTCAATTTTATACCGATTCATTTTGCTGCGACTCAAAAGCTGCCTAACCAGGTGC:1 + chr2R 5438315 3' - flea 23 2 61.06 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATACTCGATTTGTTGCAAAGTATGTAACTGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATTTAAAGTATGTATATATATACTTGATCAGGATCAATAGCCGAAT:1 - chr2L 21737997 3' + P-element 2864 1 69.86 CGTGTTCATGTGTGAACAATTTGTCTTAACCAGGCCAAGGATCTCCTTTCCTATCTCACCCACACCAAACGTACAGCCACCCACACACACACACATAAGTAC:1 + chr3R 20279543 3' - roo 8661 1 70.59 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCCGAGTTCCAGGATCCATAAATAAATGTAGATTAGTCGCCGCGCGTGCAGCACATCCGGC:1 + chrX 388373 3' + 1360 3374 1 75.71 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACACTGGACCGATTCCGAGGGATCCGAGAAG:1 - chr2R 10910185 3' + Tabor 7287 2 59.31 AAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTTAATAAAAAGAGAGAAAACAAACTTTAGCGGTTTTATACTTTTTCGAGTGGAAACTCCCCAGATAGGCCGCCTGTTGCCAGTCCGCATTATGTGAAATAACTTTCTT:1 + chr3L 23694212 3' + G4 3809 1 64.38 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTCAATCGTTTTAAAGATTTAGCTGATGTCATAGGATGTTCTTCTCGATGATTTCATAGGTTTTGTA:2 - chr3L 25607260 3' - 412 57 2 57.53 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGGCGAAACATTCAAATTGATGTGACCCCAAGATGAGGAGGGAGGCAGGTGCTCATCTCCATTTGAGCGCGGAGAAGA:1 + chr2L 1807078 3' - roo 45 2 51.37 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATTCAATTAATTGATAGAAAATATAACTAAGGGCCTATGTTGCTTTTTAATTTAAGTTGTTGTTTTTATTTAAATAAA:1 - chr3R 8140830 3' - pogo 40 1 57.53 AATTTTTTAAATTTATTTTTTTGTCTTCCATTAGAATGTATTGTGGACCAAAAGGCAACGTTGAACTGCATCGCTTATGACAGTCACAGCTTTCAGCCGAACATCAATGTTATAACTCAG:1 + chr2L 21318191 3' + 1360 3090 2 90.00 ATCGAATAAGTTTTCTTGCAAGGGGATTTGGACGTGAGGTTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTCTCGGAGTCCTGTCGTAAATGTTGTAAGCGAAAGATATGTC:1 - chr2L 14235993 3' - Doc3-element 4537 1 73.97 ATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAAGCTTGCATCGTAATGTTTAAACAATTTAAAATGGACAACATTTGGCTTTTATTTTGACAGAACCAGTTGCGAAATGGCCAAAGTGTGCGAGT:1 + chr3R 7013964 3' - F-element 4252 1 60.96 GAACTGACTATAAGCTAACAAAGGGAAAAACATCATAGCGGCCTCTGCCAATGCGCAGAGCTTCTGCCGGCTATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTAAAGCCAATTCATTTGACTTTATTGATTCTTAAGA:1 - chr2R 22858393 3' - springer 136 2 75.69 AAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTATGGAGTATGACAAACGAAGTTATTTGAATACGACCGTAAATGTCATAGGAGAACAAATCAAATTTAAG:1 + chr3R 12342640 3' - blood 7108 2 53.10 GGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTTTCTGGAAGGGAATTTAGCGGACTTGGATACCGAAAGGATTTTGATTAGCTTACCTTGAC:1 + chr3R 23161192 3' - 412 7345 2 55.26 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACACACCCTGTGAATTCAGGCGGCTCTCTCG:1 + chr3R 18399258 3' - P-element 92 1 22.60 ATACATATGTACATATATTTATAAGCATTTAGTTTGCCAAGCCGATACCAATATGGTTATGGTTAACCTTAAGTGCACCAATGATTCTAATATATGTACGGGCGAGCGAGCAACGTGATGCGTGTGCGTGTGTTTCACTATTAAAG:1 - chr3R 10388436 3' - G3 4501 1 58.90 TATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAGGGAAATACTTATCATACTTCCAACGATAAGAGC:1 - chr3L 13952728 3' - I-element 5118 1 70.55 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACTAAAATAAATGGTAAAAAGTCACAGATTATAATCAAAAAAGTGTACTGATTATTGTATCAAATAGTACGTGGTCAATACGACAACATGCTATTTTCTCAGTGCAGAT:1 + chr3R 12744783 3' - Stalker2 7264 2 60.96 GGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCACAGCAAGTTCCGATCGACGTCATACGCGGGCGTGCGAAGGAGACGCGCAGCG:1 - chr3R 26262749 3' - invader4 3080 2 70.91 GAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAACTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCCTTTTAT:1 + chr3L 18253873 3' + blood 304 2 67.81 AAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACATATAATCAGTGGCCTAGAGTGGGTAATTAAGGAAAACTAGTTTC:1 + chr3R 15126558 3' - FB 78 1 70.55 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTAGTCACTCTGCATTTGAATGTCTGAATGCCGCAAAACGTTGCTCGGCAAACCGACATAAATACAAACAAACATGGCTGCCT:1 - chr3L 7460593 3' - 412 40 2 58.22 AGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTGGCATGCCCATTGCTTCATATACCCCCTACCCACAACCCTTCGACAAGTCTGGCG:1 - chr3L 7791834 3' + Transpac 305 2 79.45 TATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCAGCTAAATTTCTAGCTTGTAACTTTTTTTATGCTGTAATTGTATTC:1 - chr3L 14944492 3' - G5 4745 1 78.77 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATGTGTATATCTCGATGTATACCTTTAAATATAAAACGAAACAAAGGAATTTCCATTGAATATTTACTCTCTACAAGCATTTTGCCCTCTA:1 - chr3R 19139341 3' + pogo 2076 1 68.49 AACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCACTCTTGTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCTCTCTACTCTCTTAAATTGCACCAAATAGTCGACTT:1 - chr3R 18346608 3' + INE-1 553 1 50.79 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTAATTTAGTGAGAAGCAGAACTATGAAAGAAGTTTTCTTGGCTCACTTTTAGGGTTTCACAGCAGGCAAGTGCAAAAGAAAATTAT:1 - chrX 7446174 3' - jockey 4706 1 43.15 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCATTTT:1 + chr3R 16276437 3' + pogo 2046 1 61.64 ATGTGCAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGTAATATTGCGAACTCACTCAGCGCCGTTTTGAATGAGTGGAACCTTTTAAATAAGGTAGTAACGATT:1 + chr2R 6493201 3' + transib2 2772 1 54.11 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTAAAGTTGAAAACTCAAGTGGGTTTAGGATTTTTTTTGGCCAGGTGCTCGAAGCCAAAGCAAAGCGT:1 + chr2L 17839482 3' + blood 7337 1 53.47 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTTACCAAGATTGTAGCCAAAAGGGCCAAATCTTGGTCCCACTTCAACTTGAGCATACGAGCTGCAATAGGTAGCCTGTGCATTTGACCCCCGGCCACATTA:1 - chr3L 17875726 3' - 1360 21 1 71.23 GATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTTACCTACTTACATAGTTGTAGTCCAAGTTTGCG:1 + chr3R 27374453 3' - jockey 96 1 74.66 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATAAATATTCGAAATCCAAATAGGTTCCACTTTCGCCCTTCACGACATTTTCATACGCTTCGCTGGGAAAT:1 - chr2R 11263972 3' - jockey 4705 1 55.04 TGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTAGATAGACTTTCTGTTGGTGTTGGAAGTTAGCCAAATTAATTGCAAAATAAACAAAATGTACACTCACTTTGAGAACGTTTCCAGCT:1 + chr3R 25170738 3' + Transpac 43 2 56.16 ATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCCGTTTTAGTTGGTGCTTTTTTGCATTTGCTTTGCCGTTGCGCTAGAATGAATTTCACAGAGGAAACGTGTGTTCCAGGTTTTCC:1 + chr3L 18380067 3' + copia 4935 2 61.64 GTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCCCGTACAAAAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTT:1 - chr3L 3453612 3' - Tirant 54 2 62.70 CGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGGTGTTCAACTACATC:1 + chr3R 10736132 3' - McClintock 6010 2 62.33 TTTCGGGTCAAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATATTTGGGGAGTTTTGCCAATTTCGTAGCATGAAATTGTGCGCTGTTTAAAAATATCAAATTGGAATATAATTTTGACTACCGATGTTATGTTTGTGTACTCTT:1 + chr3L 12781388 3' - 1360 3181 1 77.40 CGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGG:1 + chr2L 19140424 3' - Max-element 77 2 67.81 CTTTTTATTTTCCTTTTTCTTTTGCTTCTTACGGCCATTGGTTGCGTCATCAGTGATAACGTCAGAAGATTTATCATCGGCGATTTTGTTTTTGGTAACACGCATAGGAGAAACAGTTCACTTCTCATCGCTTTTATTTTCTCCGC:1 + chr3L 5498514 3' - Doc2-element 253 1 68.49 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTAAAACGAATGCAGAAACATGCAGATCGTTAGGCGCTATTTTTTGGTCTTAAAGGCCGGGCTTTATATATT:1 - chr3R 7778237 3' + transib2 2776 1 54.79 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATCTAAGTATAGAAATATAGAACTATAGAGAATAAAGTATTCTAACTGCTTAGAAATATATATATTTTGGCAACTTCCGCTTTAATATTTTTGTATAAATGCCAC:1 + chrX 13550583 3' + I-element 5340 1 64.38 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTAAGTGGTGCACGCTGC:1 + chr3R 11095888 3' - hopper 32 1 51.69 TGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGCTGCGACATTGGACACGGTCCTCAT:1 + chrX 4557404 3' + Stalker 265 4 77.27 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGTGGTGAAGTGGAAAGGGCGCAGCCAGTGATGGATGAAAAGGTCGATAAACCAAAAAGCAAACACTTTTATGGTTTGTTTGGTCTCG:1 + chr3L 2426003 3' - hopper 32 1 63.89 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTTTGTGGGTGTCTCCTTTGCGTTTGTTATATACTTTTAACTAGTTTAAGCCATGCCCACT:1 - chrX 8967338 3' - HMS-Beagle2 6898 2 75.34 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGAGAGAAATTGTCAAAGGAAAAACTCAAGGAGGCGTCCTGCAGCCGCGTCACTTTATGACACACCCAATGGCATCGTAAAAATCCAACATGCACTCACA:1 - chrX 15559437 3' + hopper 1409 2 78.46 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAATTCATTTACATAATTTTTGCGTTTGGCCAT:2 - chr3R 18635176 3' + opus 466 2 63.70 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACATTCTCGGAGGGAAACTTGGTGGTGCTGCCTCAGCTTCTTTGGAAGGTACGTGCAA:1 - chr3R 24499497 3' - blood 65 2 62.33 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGCTAAAAAAGCTAAAGAGCCAGCAAGCTACATAAGCCCCGTTAGTCA:1 - chr3L 21013810 3' - roo 8685 2 69.86 AAAACACATAAAAAACCAGTGTGCAATGGTGGTCTCTTTGAGTACCACGTTGAATATCGTAAAGAAAGCCAATGGCCGATGTCTTTTTCATGGAATTTTCGAGTACCTTATGTACTTTGGATTTCGATGATGTGGGTGCATTGG:1 - chr2R 6482880 3' - transib1 2 1 53.47 TCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCCCGCGCAAATGAAAAAACTTTTCCCAACTGCCAAAGTTCG:1 + chr2R 12202324 3' - Tirant 44 2 64.42 ATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTAAGTCATTTGCCTTAATATGATGTAACATTATTATTTGAATGGAATTACTAATGATTTACAAATTGGCTTTGCATTTTTTCTTTTATCTTGTCTGTTATT:1 - chr2L 3753559 3' + 1360 2991 1 53.49 GAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAGCGAGGCATGTCTGTTACGAGTAACGATCGAAAACTGACTGATTTAATGCTCATATTCTATCTTTGTGCTCATCC:1 + chr2R 670672 3' - invader1 395 2 77.40 AGGCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACACTTTGAACAGTCGAATAA:1 + chrY 3648902 3' + Stalker 7027 4 60.27 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGTTGCCAGGCAACAGATTTAATAAAGAAAAAAACAGCAGCCACTTTACTTTAGCATTTCAATTAAAGTTTGCCCATTCTGTGAAACTTAA:1 + chr2R 15075703 3' - mdg1 7070 2 63.70 GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAGTTGATTAGTTTTTTATGTGGTTAGCTGGTGGAAAGAGAGG:1 - chr3L 7195449 3' + jockey 4920 1 73.33 GGTGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATAAAAGTTCTACTGTAGCTGGGAAAAACTGTCGGGCAAATGTGTTGCATA:1 - chr3R 25388616 3' - BS 5066 1 64.38 ATTCTCATGTCACCTATTAAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCGACTGACATTTGATCGTAAATCAAATGAAAACTTCCAACGATTTG:1 + chr2L 18522321 3' + roo 332 2 66.90 GACTTTGCGCCCACACGAACACGATGGCGAATGATCTTGTTGACTCTATTTCCCCTCGACGTCTGAAGCATAGCATAATCTCTCCACGGTACATTCGTATACACAAAGTTGAACCTTTGTACACAATATGTTTCCACTCCTTGCT:1 + chr2L 23311658 3' + G5A 2621 1 71.03 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCATGTGGTCAGCGAGGAGCAGAGAACGGGCCTACTATGCGGCAATGTGACCAATCCTG:1 - chr3L 11803922 3' - blood 15 2 75.17 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGAAAGACGGCAGCTTAGGACCACCCAAAGAGGTCACTCCTCATCGGTGGCCATTATGACATCAAAGCGAATGTTCGAGGGCGCAG:1 - chr2R 9340094 3' - 412 37 2 57.53 TAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAGATTTGTTTTGGTTTAAGATCCCAATCAGTCCGGAGTTTCAATTAAAGTTCCATTAA:1 - chrX 6632917 3' - P-element 24 1 66.67 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACACCATTTTCATTTACCTGGGTGGCGAATGGGAGATTGAGGAGAGCATGGTAAGCGCTGGTCACTGGTATGATATG:1 + chr3R 19390733 3' - 412 7110 2 51.03 CGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTCCGCTGACCCAACTCCAAATGGGTTCCGGGTGGAATCCCTATCGGTGTGATGGTATCCAGGTAGGGACTCTTCGAGAACGAG:1 - chr3R 24750935 3' - G6 25 1 68.22 TCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCGGTTAGG:1 + chr3R 8217997 3' + P-element 2803 1 27.78 GCTACGTTTTTGCAAAACGTCAACGGAGTCCGCAACGTACAACAGGTAATAGAGCCAAAAAAATTGTGGTAGCGAAATAAAAAAACCAATATGCCCGAAGAGCTAGTATCGTGCTCGGACTGTGGTCGTTCCGGTCATCCATCGTG:1 + chr2R 5295641 3' + Doc4-element 485 1 56.16 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATTGGACTGTACGGCAGAGTTGAAACCTCAGTGAAGGCTTAATGCA:1 - chr2R 15070029 3' + 412 479 2 74.83 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAGTAGAAGAAGCAGCGCTGGCAGCGACGCCGACTGCGCTGCCTTGGCGCTCGGGAACTTGGAG:1 + chr3R 31724952 3' - P-element 39 1 52.42 ACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTACTAGCATAAACAATAATGTTCAAGCATTAGTAAGATGTCTTGTGTGGTGGCAG:1 + chrX 13386457 3' + gypsy11 3989 2 76.03 CCTTTCGACCATTCCTTCGAGGTAATTTTTATGTTACGATTCTGCTTAATAGAGCTATCCTCAAGAAATACCCATAAACGTGATTTTTTGGGGATTCCCCAACATTAATAGTTAAGTTCTTTGAATCCGAAATGGGTCACTGA:1 - chr3R 25543405 3' - G2 180 1 50.35 GGATTCCAGTTGTGAAAACTGAAATTGTCCTAAAGGGACTTGTAACGAATCCAAATCAATTGGCCAAATCACTTATAGAAGTGAATAATAACACGCACATCCAACGTAACGATTCACCTGCCCAGATGCCAAAACTTACGGCCAT:1 + chr2L 16857043 3' + Doc4-element 2738 1 77.24 GTGACGGGTTTTATATGTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTAGATTTTTGCCTTTTGGTTATTTTTTGTGCGATATGCAAATGCGCTGGGTGTCATTTGTGCTGG:1 - chr2R 15070634 3' - G6 1916 1 52.52 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGTCCTGACAGGGGGAGTTTATTAAAGGACGAAATTCCAAGCGTGTTCGTAACGATCGCTCTGAAA:1 - chr2R 12743855 3' - Doc 76 1 55.86 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAGACTTTAATAGCCACTGTTGC:1 - chr3L 465955 3' + Juan 4168 1 56.16 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGTTCTTCCATAAAAGTGAAGCGAAAAGGGTTAACCTTTAAAATTTACAATGTCCCACGGTCGCCGTTTTTATGACAGAGGGCGGCCGACAA:1 - chr2R 19843275 3' - jockey 24 1 70.45 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCACACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCAAAGCCCAGTAGAAAGCTATGGATGATGAAAATGAAAACATTAGTATGGAAGTGGTGGAGCCCG:1 + chr2R 5754640 3' + P-element 2866 1 71.23 GAAACGCTGGGAAAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTGTTACCGCAACTGTTCATATACACAAAGCACAACAAAAGTCAATAATATTCAAGTTGAACAAGAGAGAATGCTAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 - chrX 15903342 3' + Tc1 1608 1 40.69 CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTCTTTTTTTTTAGATTTCTATTCCGAAGAAACAGTAAACAACCAG:1 + chr2L 21643180 3' - Tabor 10 2 78.08 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGACGTTTAGCAAAACTTGAAGTTGAATGTATAAATGTAATTTTCGTTATATTTATTTTGTGCATTTCCCTTCCCCAC:1 + chr3R 6422931 3' - jockey 56 1 51.37 CTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAAAGCCCTAAATTTAGCTTGATTTGATTTGGTTTCAATTGTACTCGAGTCGAAAATAGGCATTTT:1 + chr3L 17708236 3' + F-element 4214 1 55.94 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGTTTTGTGTGTGCGTGGCATTGCATACAAATGTGCTAATTTATAAGA:3 + chr3R 19436133 3' + roo 393 1 73.29 ATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACAGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACAAGTTTCAAGATTTCTATTCAAATTTCATCA:1 + chr2R 21690532 3' + 412 404 2 76.03 ATCTCTAATAAACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTTGTCTTCGTTTCTTTTTGATCGCTGTTCGCTGTGTTCCGTTATGCGAGTTTAACGTTAGGTGCGTATCTATTGTGCGAAAATGAGCCATAAGC:1 - chr2R 10355467 3' + invader6 42 2 73.97 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTAGTCACTCTGCATTTGAATGTCTGAATGCCGCAAAACG:1 - chr3L 7460636 3' - 412 83 2 75.34 ATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGTAGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGATTTGGGTAAACAACCAAACTCTATTCCGACATTAAAGATGT:1 + chr2L 21403588 3' - 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chr2L 12156847 3' + INE-1 548 1 41.10 GAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAATAAATTGTAAGCAACAACCATAGCAGCAACAA:1 - chr2L 13956158 3' - Doc 421 1 76.64 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGATTTTCAAATTCACATTACAAACAAGAAATGCTTGTTTGGGCTTTGCTGATGGGTATCGTGTTAATATCAGTTGGAATCATAGGCATATCCGTTAAAAAA:1 - chr3R 4190852 3' - pogo 19 1 72.60 AGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAGACAATTAAATACTGAATATTTCTTCGTCTAATTAAATTACGTAGCGGAAAAAGAAAAC:1 + chr2R 5045706 3' - invader6 26 2 67.12 ATATGAAAATTTCTCTAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAGACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTTTCACAATGTAATTAAAACAGATCTCTCCCGCTCCTGAGTCTGTGACGTCTCTGCTTGTT:1 + chr3L 25725328 3' + TLD2_LTR 133 1 95.35 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTTCC:1 + chr3L 2330161 3' + roo 323 2 74.66 AGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCCTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAAAAGGTATATTCGTTGCCAAGTA:1 - 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Doc 26 1 66.44 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATATAAGTTAAGTGCAGCCGGCTGAAGTTGAACTACCTCGATTGGCCTCTACGAAAGTGTTGTTCTCAGTTGGCACACAGCCCTGACATTTA:1 + chr3R 24673686 3' + roo 402 1 78.40 GTATTTGTGAGTATGTGTGTGTGCGAGCGTGTGTGTGTGCACTTGGGCAAATCAAAAAGCCAAACGAGCCATCTATAGCACTGAGCACCATGTGCGTTGACTATTTCCACCAATTAAACTCGTTCTGTTAAGAGCTACACAGACTC:1 + chr2R 8245945 3' - accord 7039 2 75.34 TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCACATTCTCGGAGGGAAACTTGGTGGTGCTGCCTCAGC:1 - chr3R 24499518 3' - blood 7086 2 74.81 TTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAGGTGGCGGTGG:1 + chr3R 6495335 3' - copia 8 2 60.96 AGGAGGAAATGCTTGAGAATTTGTTGCCTGCGAAACACCGGTGTAATCGTGTTCGCGGATTTTGTTTGTCTAGTCCAACAAAAGCGGGTATAAATTTTCATTTATTCCTCGGCTCCTC:1 - chr3L 15594295 3' - Gypsy12A_LTR 2012 1 52.54 GGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAGACTTTAATAGCCACTGTTGCCAGACACTAAATAATGTCTTTTCTTAAGATTCTATTC:2 - 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chr2R 14973623 3' - FB 82 1 75.34 TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGT:1 - chr2R 22746077 3' - jockey 4836 1 68.49 AAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTCTACCTCTGAGGATTATGACTGTGACACATT:1 + chrX 10579970 3' + pogo 2014 1 78.08 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGGTACAATCGTCAG:1 - chr3R 16276294 3' - pogo 20 1 68.84 ATTAACAGACAACAATTTTATATTTTGCAAATTTACCTCAGCAAGTCTGTCGAAACGTGCAAAGAGCTCGTTAAGCATTTTTACCAAATCTTGCGCACTATATGTGCTGCCAGACTCATTGAAATTTATGAAGCAATCGTTGCCAC:1 + chr3R 22639607 3' - gypsy4 260 2 72.60 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATTTCATTAATGAATAATTGCAATTATGACCGCCTTGCAGATTTATGCGATGATGACTCG:1 - chr3L 21910363 3' + pogo 2045 1 55.86 GGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCTAAATGGCACTATAATTTTAAAAGGACTATTTGATGAAACAACATTTAAATATGCCTTGAAAT:1 + chr2R 14443808 3' + jockey 4562 1 56.85 ACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACGTACAAGGAGGAAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTAGTGGCAGACACCAGAGAATCCGTGGCAGAGGCGATGGGAAAGG:1 - chr3L 13324811 3' - copia 5021 2 69.86 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGTGACCATTCATTTTGATTGTGGTCGTGCTGTCGACAGCCCCCAAGTATG:1 + chr2R 23671846 3' + hobo 2908 1 55.24 TTTCTGCCACTTTTTCATCATTTTACTCACTTAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAATTAGTAACACAACATCACACACTTGTGATGTTGCTCCCAACATAGCATATAAATGACCAGAACTAGCCACTCC:1 - chr2R 5094157 3' - Tc1 1581 1 57.24 TACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGTATAAATTTCACACCCACGTATTAGATCTTAATTGTACATCTTCTGCTC:1 - chr3R 16538371 3' - G2 2647 1 63.97 TAGCAATATACAAAGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAATTTTCTTTAGCTTTCCCAAGCACCGCACATGGAAAATGCTTGCAAAATGGCACACTGACCACATATAAACACTCGCACGCACGCACACAC:1 - chrX 6406077 3' + Porto1 4237 1 68.89 ATTTAATGGCATTGGATACCGTTCAACATTTGGTACAACATTCAAGGGTTTTTTGAATGCCCTTTCATGTTATTCCTTCCTTAGCTTAAGATGTTGTTTACAAACAACATGTTTAGGTTATTTATTTTTTTATTTTCGGTTATAAA:1 - chr2L 21719005 3' - HB 462 1 62.33 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCCTTTGATGAAATCAAATGCATTCTTGTAACTACATTTTCAGCGGATTTAAGATTGATGAACTGCTTTTTATTTATCTCAGTGCATCAGATCGTGGGAGGTCTTAGAAT:1 - chr3L 2330036 3' - roo 13 2 73.29 AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTATAGCCCTTGGCACACATCACATTTTTTCACATCCCATCGAAAGCCATAT:1 - chr2L 16456731 3' - BS 5014 1 40.16 GTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGGCGCACAAAATCGCGAAGTAAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGG:1 - chr2L 21325112 3' + invader4 253 2 68.12 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATAAAGCGAACACATGAAACTATTATTGATCCGATATCCCCCCTTTTCATAGTCTCTAATTATTTTAACATTTAGGAGTTTTGCAGCGCAGAACT:1 - chr2R 9607064 3' + pogo 2077 1 66.44 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGGTTTTCCAGCATGCAACTCTCACCGTTTTTTATTAAAACTATTAA:1 + chr2L 14239268 3' + 412 461 2 63.01 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAGTAATTTCAAATTGGAAGCCGTAACTTTTGCACGCATATACCCCTAAAAGTATATGTACATATGTATGTGTTCATTACCTGGCCATTAGCTAAACACTTCATATTAC:1 + chr3R 12379844 3' - roo 8679 2 75.34 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATGGTAGGCTTAATGGACGATTG:1 - chr3L 9469184 3' + hopper 1364 1 76.04 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAGGCAAAGGCGAGATGGTGTG:1 - chr2R 21690456 3' - 412 7105 2 55.71 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAAATTTATGTTTATTTTTTAAACTTTCTAACGAAACGCATTCTTCGCTTGACAAGGGTTAGTTTCCAAGTCGCCAAAC:1 + chr2R 13761198 3' - jockey 4680 1 45.89 CAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCACTCCGCGGTCTGGAGGAATTAGCCGCAACAACAAACAATTCCGCCCACTCCACTTCAG:1 + chr3L 25186379 3' + Max-element 8316 2 61.60 TAGGTGGCATAAGTATTTAGACGACATTAACTTCCAACTGCCGCGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCAAATATATAAGTACATTTATCAGCGTAAGTGGCACTGCAGGGCGGACTGCAGATG:1 + chrX 6946424 3' + Tc1-2 4 1 65.57 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACGAAAACAGAAATTTGAAAACATCTATAAAAGTAGCATCTCAAATTAAGATAAA:1 - chr3R 5422856 3' - roo 8731 2 64.38 ATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTACTTTCTAAGTGTGTTCAATTTGTGTCATCTAGTAAAAGCACAACTATTACTAGCATACAAAATATTAGCAATAACTGACATATAATAAACTGTAATATTACCAAT:1 + chr2L 16276664 3' + S-element 1702 1 73.97 CATGAGCGGCAAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCCGAACGGTCTCAGCACAGAG:1 - chr2R 1276187 3' - gtwin 167 2 46.58 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAGGATCATAAAGTTCTAGAATCGCAGACATAGGGATTCTGATCCGAAATCCTAAGATTAGATTAAATGACTTAATATTTTTTTATTCGCAGTTG:1 - chr3L 18253754 3' - blood 13 2 70.54 AGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGAACCGTTTTATTTGGTTTTAGCACCCACCGCACAAATG:1 + chr3R 17831337 3' - F-element 473 1 69.11 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCTACTTCGTGCACACACAACTCGGCAAATCCTCCTCTCTCGAAAGGAACGCTCTTGCTCACACACACACGCACACAAACAGGCAATAGGGCTGCGGTTCGTG:1 - chr3R 31724814 3' + P-element 2866 1 71.23 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATGTACATTCTATACTTAGCCACTATATATGTATATATTTGAATAGTTCAGCGATTGTTGTCCTTCATGCATTGGTTTATTTCGTTCTGCCCCACCATGTTTCTTCCCCCCAT:1 + chrX 11008456 3' - hobo 10 1 73.97 TTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTTATTATTGGGTAAGCAAAACGAAAT:1 - chr3L 17120742 3' - 1360 472 1 63.70 GAGCCACCTGTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAACAAATCGTATGGCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTAATAAATAATTACCATAAACAGCAGGCTCGTACTGGAGCCTCCAACCTTCCGGGTTTTTGCATT:1 + chr3L 18309895 3' - 1360 62 1 58.22 AACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGGTGAGCAAACTGAATCGCGCCAAACTC:1 - chr2L 19997089 3' + Tirant 8442 2 76.47 ACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTGATTTCGGTGTGGAAAATAGAATCAAAACAAACACCAAATCCGCGATCACATTTC:1 + chr2L 19097432 3' + F-element 159 1 61.81 TTCACAATCTTTAATTCACAATTTAATTGTTTATTAGGCATGGACTGGGCCCATAACCTGTTGTAATTTATAATTTTTGAATTTAATTATAAATCATCCTCGCTGGCTTTTCTCTTTCTTGGATTGCCTTTCCGGGATTCGGGCGG:1 + chr2R 23313082 3' - copia 313 1 52.05 GGTGTCTCGTTCCCAAACACACCAGCTCGGGCAACCTTTTTGAAAACTCGAGAATTTACTGTTTATAAATAGGTACAACTGTACCCTAAACACGATTTAATCAACACTATTACACCTGCATATATCACTTGAAAAGTTTCAATCTA:1 + chr2R 7986271 3' - 3S18 5763 1 50.68 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAGCCACGCCCCGTCGCAGTCCACAAAATAGTGTTTGCTGCACAGCTTGCCGCCTGGG:1 + chr2L 795151 3' + jockey 4941 1 57.60 ACTATGAGGCAATGCATGCAACAGCAACATTGAAATAATACAACGAGGACAATCAAAAATCCTCCGAACATTTACCAGGACCTACGGATTCCAGTTGTGAAAACTGAAATTGTCCTAAAGGGACTTGTAACGAATCCAAATCAAT:1 + chr2L 16856958 3' + Doc4-element 2616 1 45.52 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTACATATATACCTTACATT:2 + chr3R 4679602 3' + hopper 1405 2 77.40 ACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGATTATAATGAAGTGGCGCAGCCAAAGGGTTCTCAACCACAACGCTAAGCT:1 + chr2L 10635497 3' + I-element 278 1 66.44 ATGTGTGTGTGTATGTGCATGTGCATGTATATGTATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCACCCCGAGCTCGAGGTCAAAGAGATAAACGGAAGCTGATCTGCGCTCCAATTGAACCTTAGGACAACGACTGCCGTCGCAAAACAA:1 + chrX 14631497 3' - accord 248 2 54.11 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGCAGTAAAAAACCCTCAAAGCGTAGCGGATTTTTCATT:1 - chr2L 16330968 3' - roo 8749 2 76.71 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATTTTTGGCGAAAATAGTTCTCAATTGTTTTGAAAAAGTACCGAAATAA:1 - chr2L 17839336 3' - blood 7034 2 69.86 GTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATACAAAGATGTATATATACACTTTTTAAACATTTGCAAGATAAACCTTTTCGATCA:1 - chrX 15454682 3' + 1360 3324 1 65.03 GCAATACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGAAAGGGTTGAGATTGCCCTTCTGGCGAGCATACTCCGTGCAACAATACTA:1 - chr3L 23215386 3' - pogo 1847 1 66.44 CCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACGTATATAAAGCGTAGAAAAAGTGCGAAGTGCTAGGAGGAAGCAACATTTTACTACCGTACTTCGCTATACCCATGCA:2 - chr3R 27809996 3' + Burdock 6350 2 57.53 AGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAACTCACACGCCGATTTGAGAGTTCCCCGTGATTCTATACAGATAACCCTCTCTCTCGTCTATAGCATATAGATGCCGATAT:1 + chr3L 8885450 3' - accord 7030 2 79.31 TGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTCGTGTTGAAATATTTAAGGGGACTCGTGACTTTGCTCAATAA:1 + chrX 15559563 3' + hopper 1352 1 70.15 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAATATCACTTTAAGGTGATTCCCAGCGCATATTATGACGGAGATAAACATCGCTTAAAGCGAGAGACGGCGACACCGTCGACGAATGACCA:1 - chr2R 25106002 3' - roo 31 2 64.38 GGGATGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAGTTGGGGTTTTTCCACTCTAGGTAGCAGCTCCATACTTCCTAATACCCAGCTAAGAAAGGACGGCGTTCCCAGAAAAATGCCACCCAGCTTGGACAGAATAAAAGA:1 - chr2L 22183260 3' - Idefix 182 1 60.27 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCC:1 - chr3R 10213054 3' + P-element 2864 1 45.57 AGCTGGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCCGCAAGGCAAAAAGTACGAAGTTTTTTGTATTGATGAAAATTTCACTTTAAAAAATGGGCA:1 - chrX 159859 3' - Cr1a 3994 1 72.86 CAAAGAGGATGCACCGTGAACTAACTAGACATTAGTTGGACTTTGTACCACAAAGGGTCGTGCGCAGCTCGAAACAGTTAGTCACAACACGCGAGGAGTCTTACCTACGCGAGGATAGTCGCGGAGAGTACAGGCGC:1 + chr3L 23894752 3' + gypsy8 4900 2 39.42 CGTATAAACGACGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGGCAATTACTGGGTTTTA:1 - 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roo 8720 2 60.27 GTTCTCTCTCTCTCTCTATTATAATATTAACTCCGAATCAATGTTTACCCCCCCAAATTAATGTTGACAGACGACTGATCAATGACCTGGCTTGATTGAATCATGGGCATGGAAAATGGTTAAATGCAGTTGTGAGCGTTTTGGGT:1 - chrX 5380490 3' + blood 168 2 46.58 GTATATACAATATGTACAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAAAGTAGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGATAGTATCTCTTAAACTGTTGGTTGAT:1 - chr2L 3115660 3' + Stalker2 7514 2 74.42 GGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAAATCTTTTGGAAATATAAATGGAAATGGAAAATGCAATTCAAAGCATACTTTTTGGCTGGACAGAAATAAA:1 + chr3L 21262667 3' - jockey 4525 1 51.72 CGGAAACGCTCAAGCCCTCCAAGCGCATTTGGAGCGAAGATTGCGCTTCCCCAATGCCGCAACCAACAACAAATTACACACAAACT:1 + chr2R 18885049 3' + Doc4-element 92 1 62.79 TAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCCTCTCCAGCCCCAAAATATATGTACACAGCTTTCGTCTCGTTTAAATCTACTAATTGTTTCTGGCTTCTAAGTGTTTTGTTTTCTCTATTCATTTTGT:1 - chr2L 4321243 3' - Quasimodo 449 2 77.21 TATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACATTGGCCTCATATGGTCGCTTGACATCACGTTACAATAGCGTCGTCCACATTGATCGATCTGGCGTGGCAGTCAAATCGCCAGACCGATACATTGTG:1 - chr3R 23192585 3' - Bica 4864 1 56.91 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTG:1 + chr3R 16276431 3' + pogo 2040 1 65.75 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCAGCTAATTATTCAGATGAAAT:1 - chr2L 2621227 3' - Tirant 8119 2 64.38 TAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAGCTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTCATTTATAGAACTAGGTGCGTAGCTTAGCATACTTTTTT:1 - chr3R 23809585 3' + 1360 105 1 71.92 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAAAAATATATTTGACTCTGTCTTCGGGGACACAAGGCTCATTAAAATGTGCTGCCT:1 + chr3R 25795827 3' - jockey 78 1 67.12 AAAATTTATCAAAAATTTACAAGACTACAAAGAAAAAATTTGAAAAAATATGATAATCTTTTTCAAACGTGGGCGTTAGAATGGGCGTGTCAAAATGGGTAGAATCTGTATGCTTTCTAACTGTTATAGTTCCCGAGATCTCGGCT:1 + chr2R 5523979 3' + Ivk 5238 1 53.42 AATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAAAATTGATTTCCGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACCCATACACACTCGATTATTGAATTAACAGACACACGCGCTGAGAAAGAATGGGCTGCGTAACTTGAAAGGAAGATGCG:1 + chr2L 11466287 3' + 1360 3159 1 52.05 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACTAAAATAAATGGTAAAAAGTCACAGATTATAATCAAAAAAGTGTACTGATTATTGTATCAAATAGTACGTGGTCAATACGACAACATGCTATTTTCTCAGTGCAGATTGCTGA:1 + chr3R 12744789 3' - Stalker2 10 2 65.07 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAATGTGTACCCATGGTGCTACTAATAAATTACG:1 + chr3R 19436071 3' + roo 8995 2 70.55 ACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTACAATTCGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACAAGTCACTAGACTGACTTGTGACGGAACATCTCGACGGACCAATCGTACTCCTTGCAAACTTTCACGGCTGCTAACGCTGCTGGGCGT:1 + chr2L 22325288 3' - invader2 15 2 47.95 AAATACAAAGACGAAAAATGCAAAAGACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAGTTTTGTTGTAATTACATACATTAGAGCAAAGAAGCCTGGTGATAGTATCGACATTGCGTTATCTAAAAGTTTTTGGTTCCA:1 - chr2R 1983182 3' - Cr1a 192 1 63.01 CCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCAATCATTAGATTAATTGGCGCCCCACTAAGGAAACCCACAACAACACACACACACACACTGACTGACACACACGAATGGACGCACAAGCGAATACAACGGTAATCACAGAGT:1 + chr2R 7380928 3' + Gypsy6A_LTR 372 1 62.33 ATGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACACCCACACACAGAGATAAATACACACATAAAAATTTAAACATGTTATATACATACTTTACACAAAAATAAATACACATCTAAAA:1 + chr2R 1000434 3' - HMS-Beagle2 33 2 64.83 GATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCATTGGGTGGTTGACAGGTGATAACCTCTCACTTTGCCTAACA:1 + chr3R 7617859 3' - FB 322 1 70.71 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAG:1 + chr2L 3231972 3' + roo 9018 2 53.79 ATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTT:1 - chrX 8967396 3' - HMS-Beagle2 6938 2 64.06 GCTGATTGTGAAGAGGAAGGCGACTGTGAATTTTTATACAATATTAAAATTGAAAATGAACTTTGGACATAAAATATAAAAAATTACATCAGAACGCCACTGGAGCCAAGTTCCTACTGAGGAGTTAAAATTCCGCACAATGCAGA:1 + chr2R 5256999 3' - hopper2 62 1 54.11 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGAAAGACGGCAGCTTAGGACCACCCAAAGAGGTCACTCCTCATCGGTGGCCATT:2 - chr2R 9340125 3' - 412 7121 2 63.01 TCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACTCGTCTGTGACTGCGATTGTTGCGGGAAAGGTAAGCCCTTT:1 + chr3R 30264089 3' - blood 7091 2 72.60 TCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTAAGGAACAATAAGTTCTATTTGTCAGTTATAATTGAG:1 - chr3L 15099522 3' + G4 3803 1 71.33 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCCAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGTAATACCATATAAGCCAAGCTATTGAGTACATTCCATTTCATAATAACAACTAATACATAATTCATT:1 + chr2L 4929906 3' + blood 7335 1 52.74 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATATATAAGAAGGGGTCTAATTCCATATTGATGAGACCGAGATGGGATTGTCATGGGTGAGGGTTGGGCCAGCTCTCGCCCAAATTGTAACTTGTTCATTAAGG:1 - chr3R 28406303 3' + opus 486 2 74.66 ACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGACCCTCCTCAATTCTCACTCACATTTGTAATCAGTCTTAAGTTGAAAGTTAAAAGGCAAACAAAACTGCGAAAGCCTAATTA:1 + chr2L 13136327 3' + McClintock 181 2 77.40 TACCCGTTACTCAGCTAGTGTGATCGCGAAAGTTTATAATTTTTCTGGGATATAGACAGATAAAATGAATAAAATGATTCAAAAGTGTCTGAGTAGAACAAAGTAAAATGTTTTACTTCTGATTTTTCTGAGTAACGTCCACGACA:1 - chr3R 32036833 3' - INE-1 539 1 60.27 GTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTTGCACTTGTAAACTGAACTGAGATAGCGAATCCCTAATGGCAGGGGG:1 - chr2R 17544159 3' - gypsy5 6962 2 50.54 CAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAATAAATTTCACACCCACGTATTAGATCTTAATTG:1 - chr3R 16538385 3' - G2 2660 1 74.81 GATCCTGATCAAGAATGTATATATGTTTATATGTATAGTATACCCTATTAATTTACGAGTAACGGGTATAACAATCCGAGTCGAAATCATAATTTTTATAAAATAAGATTAATTCCTGATTCGCAACATAGACTTTAGATTTTAGT:1 - chrX 15903121 3' - INE-1 80 1 70.55 GCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTATAGCCCTTGGCACACATCACATTTTTTCACAT:1 - chr2L 16456748 3' - BS 5050 1 59.59 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGGGAAATTCTTTACACTTTGTTTTTTGGCCCAAACGGGATGGCGGAAAAG:1 + chr2L 12291984 3' - Tirant 11 2 78.26 GTATTAAAGGTTTTAATTGAATTTTTTCCAAACGACACCCCAAGGCGAACTCCGAAGCCAAGTCAGTTGCTCCGAGCTCGGATACTGATTTTCCCGCAGCTCCTGGTGCTGTCAACACTCAACTCTCAGGCCTGTCTATC:1 - chr2L 18107710 3' + Tc1 304 1 77.14 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTTTAAGTGGTTCCAATGGCTCTCAATTTGAGTTTGTCGTAATACTGAATCAGTTACACTTATGTGTGTTC:1 + chr3R 18205727 3' - 412 7099 2 51.06 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATAGAATGCCGAAATTCAGATAGAAAAAGAAACTAATTTTTCAAATGAAATGAAAATGATGTAGCAATGATGAAAATTGT:1 - chr2R 5237717 3' - Doc 46 1 48.97 AATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCAC:1 - chr3L 7837168 3' - jockey 4801 1 49.17 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACAC:1 - chr3R 13225510 3' - hobo 33 1 64.44 AACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTAAATGGAAGTTCAGCTTTCAGCTTGCCATTTGGGAAAAGCCACC:1 + chr2R 19852231 3' + Transpac 236 2 69.86 GGTTTGCACTGTGGGCATCGCAATTGCTACCACTGACTAATTCGGCTTACCATATTAAAGTTGTGATTAAGTGCTAGTTAAGTGAGATAAAACCACCTTATCGGTACGCGATAAGAAATAATTCCGT:1 + chr3R 20772675 3' - diver2 4620 2 55.91 CGTTACTCAGCTAGTGTAAATGTGAACGCGAAATGTTATCATCCTTCTGTGATATCGATAAAATAATAAAACGGTAAAACATTTATAAATTGCTTAAAAGGGTGGGTGTGACCATTTTGGGCATTTTGTAGATGAAAGAAGGGGCG:1 - chr2R 5789340 3' - INE-1 535 1 40.41 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGCAAGTGGAGTGGAGGAGCCATGGAAAAGAACTAAG:1 + chr2R 21439539 3' - jockey 56 1 50.00 TAATCAAGTCAGGACTCTAAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAATGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTGGCGAGACAAGCAATAAAAAGAAGGAAAATCGAAACATTTTTTAAAA:1 - chr2R 4721526 3' - Cr1a 4070 1 64.54 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTCCTTTTGACTATCTCATAACTCGCTGATAGGCCATTCGTATGTATTTCTATGTTGGATCAGGGCCAAGTTCCTATCTCTTGGCGATCGGCAGAATATAGTTTGGCACAAT:1 + chr3R 25862726 3' - roo 10 2 76.03 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCTGGCACTCGC:1 - chr3R 20450415 3' - hobo 62 1 63.01 TATGCAATGCAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTAGAGGGGGAATATTTAATGGAATGGCTCTGGATATGCCATCTCCATGCTTAAAGAAATCTATAGTTCTTG:1 - chr3R 6645309 3' - blood 7060 2 52.05 TTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTACATATCAGAAACCTGGACAAGGAGTGAGGAAAATGCTGGAAAATGTTTCCAAGCTAAAATATTTATTTGATTTTTTG:1 + chrX 887421 3' + Quasimodo 7331 2 57.53 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGT:1 + chr2L 17626674 3' + roo 9001 2 69.18 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCCAAAATCCAAAAGACAAAACGAACTTAATTTCAGCGGCAACCAGAAA:1 + chr3R 11149520 3' + mdg3 222 2 55.06 GGACTCTTCTAGACCAAGTACAAGGCAGTCGTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACATTAACTTTCGTCAGGGTTATCTTGCCGCTCCCTCGCCTGTGCCCTCTGGTACTCCC:1 + chr2L 384022 3' + Tabor 330 2 61.64 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGGTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAAC:1 - chr3R 4679452 3' + hopper 1375 1 52.85 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAACTTACCACCCAGTTTAGTAGATAGTAATTGTTTTTTGG:1 - chr3L 11795471 3' - 1360 74 1 75.56 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAACAATTAATCAACAATATTGACTTAAAGCTGTCAACTGAATTAA:1 + chr3L 11395996 3' - I-element 78 1 71.23 GCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATGACTGCACGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTAAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTACTATCCAAAGCAATGAAATCTGAAATCGAATCCAAAAA:1 + chr2L 21855661 3' + Doc3-element 382 1 73.05 CTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAACATTTGAATCTATTCAAAATAAGCATTTGATTTCGATTATAAGAAACATAGGCTATTTAATTAACAATATATTGACATTAAGGTACATATTAAAATACTTAAGGCTTAACTAAATTG:1 + chr2L 16456912 3' + Tc1-2 478 1 79.45 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACCTTTTCTTTTGGCCAAACTTTCTGCCCCCGTCGACGTCACAGCTGATCGATTTGCTGCACTCGCTCGGCGATTTATCCGCCTCCTG:1 - chr3L 20497702 3' + P-element 2882 2 78.15 TAGTTGTTATATTTTTAAGTCGAACTTTTGATTTCAGCTTAAGAATAAATGTTAGTGAATGGAGATCGGAGCAGTCCGTATTGCAGATATTTCGCCAGCCCTCCGAATGAATGTGGTAGAGACGCACGATTCCACCAGAATAGGC:1 + chr2R 23308937 3' - McClintock 408 2 60.00 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCTCTTGAATAATT:1 - chr2R 14135274 3' + copia 5053 2 65.07 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACTCGC:1 - chr3R 20450415 3' - hobo 40 1 56.45 ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTATCACAACAATGTGCAAGAGGTCTTATCTGTCACCAAAATACATTACCAATTTATTGCCAAAAAAAAGAGTGTTGGATGGATGGCTA:2 + chr3L 12836121 3' - 1360 34 1 61.64 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGGATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGGAGAAGGAGCAGCCTACTACACAATTACTCTTTATATAGAATTTAATAACATAGCATGCTTTTAATACTTTAGT:1 + chr3R 11151896 3' - mdg3 5323 2 63.45 CCCTCTTGAGTGGATCGCGCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTCATCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAGTAGCGAATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTAAGTTTAAGACCCAAGTCTTCTAAGCGAAGAGGAAA:1 - chr3L 9406469 3' - Quasimodo 7144 2 71.92 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGCCATCTGCTAACAGCAATGTGTTGCCTAGCCATAGGCGCATTACTATAAATTTTTAAACCATTTCCCTGCCACGGA:1 - chr3L 13678860 3' - hobo 40 1 58.22 AACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGGGCAAACAAGAGTAACACCACACCCGAAATGGCAATGAGCATGGAAATCATAATAATAA:1 - chr2R 12202248 3' + Tirant 335 2 63.70 TCCCGACAATCAGATACCTGTTATTGTTCAAAGGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGTTTCTGGATGCTACAATGGGTCGTGGCAACAATCCTAGATCATTCCAACCACTCGTCGTTGTCTGTACGCTGCCGCTATAACCGCCA:1 - chr2L 21678679 3' - INE-1 553 1 63.45 GGTATCGAGCTTTCCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGGGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAATTGGACAGGCTAATGTCTTTAATCGACTTAATTGTGAGTA:1 + chr3R 9953808 3' - Idefix 7233 2 70.55 GGTAGGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCCAGTGACTTAAGTAAGCCCCATACTAATTGGGTGCGGGCCCAATTAGAGGGTTTCTTTACGCCTTTCCTGTTCAGTTGCAAAAGCATGGTGTCTGTCCCAGCGAAGCG:1 - chr2R 19901485 3' - baggins 5015 1 73.97 CTCGCTCTCTCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAAAGCCGCACCATCACTAAATAAAACAAGAATGAAGTTATGCG:1 - chr2L 14358989 3' + 412 7299 2 56.47 GGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAAGCTTCCGTTCAAGCCTTTCTCTTAAGCTCGAG:1 + chrX 3646973 3' - 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jockey 68 1 69.75 CAAAAAAAAAGCAAAAAAAAATACAAAGGACTCTTGAATAAATAAGTGTTTCTGTCTGTGCTGAAGGATGGCACAGAAAAATTATATGTTTGTGCTCCCAACTATGATACAATTTGGTAACATAGCCTAGATTTTGTTATTAAATA:1 + chrX 11275740 3' + gypsy7 5006 1 60.96 GAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTCTTTTTACTACGTTAATTAGGGTCTAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTATATGTACCGGTAGCAAGGGCGAGTACATCTACGAGAACCAGACGTATTATCTCAATTAC:1 - chrX 17648178 3' - HB 1417 1 59.59 AAGCTCAATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTATTTGATAGTTGTTAGAAAGTATTTACTTAGCTTGTAAGCAGCAGATGGAGCTGATTATGCGAGCTCAGGTGAA:1 - chr3R 14010946 3' + Idefix 426 2 50.00 GAAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAATACTATTGACAACTTGCATGCATATTTTCTTTTGCTTTAAATGCTGAAGCAGTTTTCCGGCCAAACCGTGAGCATACTGGTTCGCGT:1 - chrX 11615669 3' + Bari1 1453 1 67.81 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAATATTCGTGCAGATGAAAACAAAAAATAAAGCCTATTCATCAATTATTTCAGTAAAGGAGATAAGAATAGCGGAAACAGTTGTTATTAAGAAACAACAA:1 + chr3R 19446786 3' - F-element 33 1 67.36 ACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGACACGGATGGGGCAGCAAACAAAAATTCACGATTCGGCATCGTCAACAGGAAGCACATTAGGCATAG:1 - chr2L 14006944 3' - roo 8794 2 54.48 GTTTTAAGAGGTGGGCAAAGGATTACCCTCTGATTCGATCGGGGTAAACTTAAAAGTCTTATATTTTCTAAAGTATAAACTTTTTGAACTAGGCTGTCTGTGAAAAATCATAGCAAACTAAGGCAACTCAAAAATTCTGCATCATC:1 - chr2L 4113416 3' - FB 311 1 56.85 CGTTACTGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTGTTATGTTCACTTGCTCTTACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTCTAGGAGAAACGGATCCCAGCATCCTGTGTAAAATCAAATGTTTTTTTGGCCCGAGACGATT:1 + chrX 7599040 3' - I-element 490 1 62.33 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTATCTATTAAACTCATAATGCTGCGTTTACCATTACTATCATTATGTTTGGGGGTGTCTATAACCTAACATAAGCCTTGTTTGCTTGTGCTTCCC:1 - chr3R 7823261 3' - flea 4780 2 68.49 AGAGCGTCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAATTTATTATAGTCAGAGCATAAAACTCTGTAAGGGTCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGAAGATAACATTTTATTTGCAATCGATAGGCGACCCAGAGC:1 - chr2R 9882380 3' - Cr1a 4235 1 73.97 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGCGAAGATTATTTTTTGAA:1 + chr2L 8574488 3' - Transpac 32 2 62.33 ACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGATCCTAACTATCCAATCAAGCCGCAATGCAACAACCTTGGTGTCCAGTGTTTGTACTCAAATACGTCTCAAATACGCTTGA:1 + chrX 10057288 3' + I-element 278 1 55.86 GTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACTGC:1 - chr3L 12159669 3' - Quasimodo 59 2 66.21 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGC:1 - chr3R 20450431 3' - hobo 66 1 71.64 GCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCCAGTCATGTTCATATGTAACAGAAATATATAGAGCT:1 - chr2R 4577040 3' + Chouto 484 1 61.27 ATTGCAACAATACAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTCAGTAAAAATTCTGGAAATGATGCGGCCTTG:1 + chrX 22945376 3' - BS 51 1 51.37 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATCCTGCGCTCACTCCCCATTTCCCCAAATCAAGTCAT:1 - chr3L 10112212 3' + I-element 5275 1 73.76 GTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACAATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATAAATTTAAAAAATTACTTT:1 + chr2R 5260086 3' - 1360 3213 1 68.49 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGATAGCTGTATTCA:1 + chr3L 18253890 3' + blood 7332 1 58.22 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATCGCCTTTAGAATTGCTGGCCATTCAAAGAGATTTGTTTTGGTTTAAGATCCCAATCAGTCCGGAGTTTCA:1 - 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FB 77 1 71.03 TCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAATCAAAACTACTACAATTTGTCCAGAAAATCGATCAATCGCATGTCTGACAGAGTGTAGCATACTTTTCAGCACTGCCTAACATTTGTCAGCTATCT:1 - chr3R 16582450 3' - BS 4995 1 67.12 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATTTTTTTTTAATGTTCGTCGCATTTCTTTGGCCAAAACGAACATTAAAACCTCGTCGCAGAGACAGATAATGATTAAAA:1 - chr2R 13686320 3' - 297 13 2 73.44 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCACATTAAATGAAGGGTGGTCTGAAAACCGGGTCGC:1 + chrX 6633077 3' + P-element 2875 1 75.19 TGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATACAAAGTGTAGATATTACAAATCAGAGAACAAGAATGCAGATTTACTAGCAGTTGTTTACTTCTTGGAA:1 + chr3L 17497603 3' + hobo 416 1 53.42 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATATAAGTTAAGTGCAGCCGGCTGAAGTTGAACTACCTCGATTGGCCTCTACGAAAGTGTTGTTCTCAGTTGGCACACAGCCCTG:1 + chr3R 24673679 3' + roo 9037 1 62.33 AGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCCTATGTGGCTCTTTCGCTCTGAATTTTGTTGCTCCTCC:1 + chrX 388315 3' + 1360 3321 1 70.37 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCATAAAACATTTGATGGTATTAACAATGTACTCCTAGACTATATGATGGTGTAAAGTGTAAAAAGTCACGATTTTCTTCGATCTCATCAA:1 - 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chr3R 7175876 3' + Idefix 6979 2 53.24 TAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAGGGGGCGTGGGCGAAACGTGCGACATTTGAAACAGAAACCGGAAA:1 - chr3L 5285234 3' + jockey 4686 1 60.26 CAATCAATTTTAACTTTTTTAGTACATAACACTAATATATATTAGAGTTATTTTACATTATATTAATTTCATCGTTTCTGTTCTAAATCAAACCAAGTTTTCTTTTTATTTAAATGGGGTGGTGAATTTTATTGAATCTTCTCTTG:1 + chr2R 5284492 3' + Cr1a 4262 1 60.96 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCTCTCTTTTCTCTGACTAGCGAATCTCTATCA:1 - chr3L 4651578 3' + roo 8991 2 71.92 CACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCGTTCTCTCTCTTGTATGGTTATCAGGTACCCCTTACTCAGCTAGTAAAAAAGCGAACACACGGTGTCACCAAACTAAAACCAAAAT:1 + chr3R 20142083 3' + INE-1 541 1 43.28 TCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCCGCCCATCTGCCCCCT:1 - chr3L 7837134 3' - jockey 4772 1 69.60 ATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCATGAAGCTGTGGCCGCGTCAGGTTTAAAAAGAAAGCGTCAAAGAAAGGTAAGATGGGATTATTATTGATATGTATCTCA:1 + chr2L 19798259 3' + pogo 430 1 77.40 AAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATAGAGATTCTAGAGACATAGTTTGCCGGCGCTATTGATGAAATTCCTCGAGTGTTTGCCTTTGCGGATGAGATACCACGGTATGCGACCACAGGTTTCGACGATTTTCGCTAT:1 - chrX 15840590 3' + INE-1 166 1 71.01 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTAC:1 - chr3R 9125677 3' - Doc 86 1 69.86 AATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCACGCGAAGAACGGGGGCTTCTTGCATTTTGCATTGTCTTGGCCGCAAGGCCGTTTGGGGATTTATTTTTGGT:1 - chrX 2991775 3' + gypsy 15 2 58.90 TTAATATTATTATTATATTATTTCGTAGACAAGTAATTCCATAAAATCGTTATAAGAATTGAACTTCAAAATGCCTATAATCACTGTTTTGTTTGAAAAGCAATCATATCATTTTCATTCCTTTCAACTTCAGCATCCTTTACAG:1 - chrX 7374023 3' - invader3 5054 1 75.17 TCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAGGGAAATACTTATCATACTTCCAACGATAAGAGCTA:1 - chr3L 13952726 3' - I-element 5116 1 71.92 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAATGATGCAAAATACATTTGGACCCCGCGCACCACGAAAATGGAGGCAAATTTTTCATTTACCTGCTGCCA:1 + chr2R 16413174 3' + roo 356 2 51.37 ATGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGACCAGCGATGTCACTGACATCGACAATAGCGCGAAACCGTATAGCGCAGTGTCAACAACAAACCTGAATTTAATGGTTGAATTATGCATTAGTGGGACTCCTTGTGTGTTATTAGCTT:1 - chr3R 30045847 3' - Doc2-element 16 1 69.66 AGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAGTTTTTTTGTAAATATCACCAGCTTACTGCGAATGGCTCCTTGGTGGATTTTCACTTCCTGCTGTTTTTCCAAC:1 - chr2L 2120316 3' - I-element 4909 1 78.77 AAAAAAAAAAAGAAGAAATGCAGACAGTGCAGTAGGGGCAATACCAAACACCCCACTTTGGTAATTATAACCCGTTCATTAGTCTCAGGGACTTAAAAACTTGGATTTATAATTTGAAAAGGGAAC:1 - chrX 11440702 3' + gypsy2 403 1 88.10 TTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTGTATGTATGTAGATAGATGTGTGTGCCTGTGCGTATCCATCCGAGTGGGGCCGAATGTATCTGAGTATCTGAGTATCCGCCGGATCGCC:1 - chr2R 11145995 3' + Quasimodo 7331 2 60.27 CTCCAACAGAATTAAATTATTAATGTATTAGCGTATCCTTGCACTGGGAAGGGCAGCTTCTTTTATTGTTCACATCAAGTCAACCAATTACTTATTGTTAATTTTTAAAAAACAAATTGTAATTTAAAGAAAAATAATAATAAAAA:1 - chr3L 560422 3' + Porto1 4541 1 89.73 AGGCTAGCATTTCACTTATATCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGTCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCATCATTTACCATTTCGAGATCTTCGGTGTGTATATTAACACATGAACTGCAACGTGCCTATTTGGAATTA:1 + chr3L 26345050 3' - G4 194 1 70.55 GCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGACGAGGGAAATAACTATCTGCGCTCTTTTTT:1 + chr2L 21643143 3' - Tabor 47 2 54.11 CAAATCCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGAGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTGTCTGTTTGCGCTGCGAAAACAATCAAATAAAAGGCTGTGCAGTGGAAAAACAGGCGAAAAACCATAGA:1 + chr3R 29364371 3' + Ivk 153 1 53.42 AGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATAGGTTCAAGGTTATACGGTATTTAGGTAGTTGATATAATGGAGGGAGCACTCCACTCCTCACCGCTCTTTCCACTGATCTCCAGG:1 + chr3R 17957632 3' - Stalker 413 1 58.47 ATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCTTGTCCGTATGAACTTCTCGATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGTAGTTTAAGATTCAGCACACAGATTCTAGAGACAAAGATCTCGTAGGGTATGACCCCATAGTCCCAAGTTCGCTCCTTC:1 - chr3R 24750425 3' + INE-1 99 1 71.92 ACTGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACT:1 - chr3R 14049316 3' - transib2 46 1 54.11 ATTTATCAGTTAATTATTTATTATGTTTGTATATATTTAATTGTTGGTATAATGCAGTCTTTACGGCAAAACATTACCCAATAATGACATTTATACGGTGTTGAAGGCCTCATTGTTTCCTTAGCTACATTTCT:1 + chr2R 8199741 3' + INE-1 413 1 52.99 ATAGTCAAACTTAGTTAATAGTGAATAACAAGTAAGTAAATAATTTTTAAACTTGCTAAGTTGCTTGTGAGCAACCTTGGGCATTCGTAGTAATAATTTTTGTTTGCATTTATATATATATATTAAATTGTTTAAAAAAAACTAGT:1 + chr2R 11360277 3' + looper1 321 1 78.77 AAAAAAATTTTAAAATTATAATATACGTATGAGCACTGTTACCGTGCAAGTGCACAGGGAAAAACTTCGATGTCAAACATAAATTATGCCTGATATTTTATGGTTTTATTTCGTAGCAATCGTTGCCCAAAAGTGTGCTATGGAAT:1 - chrX 16878525 3' + 1360 3056 1 73.29 GATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTAGGTACTCACATCCTGCCCTTTTCGATTTACATGCAGCATGCATTAAAAATAGAACCTTCGGAAAAGTTTCGTG:1 - chr3L 23027519 3' + INE-1 564 1 61.60 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATGGAGCCGCAGTGTTGCGGTTATGCAATAAAATGTTGCATTTTGCTTTCGGTTTGC:1 + chrX 14743024 3' - FB 42 1 57.38 TATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTTGTGCG:1 + chr2R 11146149 3' - Quasimodo 30 2 64.08 ACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGATTGGGATCTCCTGGCTTCTGACTCCTTGACTTCAGCTGGGCTTTTCCTGGGCT:1 - chr2L 19369690 3' - F-element 4546 1 58.00 CTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGGCTCCGCAGTCCAAAACGCAGAGCTCAGGACTGTGTCCCTCCATGTCCCGCGCTGCTGGATTGTCGCACCGACATGTCCTGCTAATCT:1 + chr3R 17733401 3' - INE-1 547 1 71.55 GTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTTTAGTTATCATATTTTTATGTCACTGTGTAAGAACAGATGGATGAATGGTGAGTCA:1 + chr3L 8445309 3' + 1360 436 1 75.34 TACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATATCTTTTTATAAAAATTTTAACGGTAACAATATATTGATCAACTTTAAAAGC:1 - chr2L 7822223 3' - Juan 50 1 49.32 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATTTAATTGCGGATGTTGTGTACAACTACAAAAAACTGAAGTAAAAGACTTTAAAGTTAAAGTTTAAAG:1 + chr3L 18382053 3' - copia 52 2 55.56 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGAGTTATTTCCGATCAAAAGTGAAAGCTATATTCATACAGAATGACAAAAAGTGGGCATTCATCTATGTACGAGTATCATGCAATTTGCGAGAATGTG:1 + chr2L 17626719 3' + roo 388 2 70.92 GTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACGCATATTGCATATTATTTAATTAGCAAAGGCCTTCGGCGTGTGTT:1 + chr2R 7599231 3' + diver 6063 2 64.96 ATATACATTATAATTAAGGAACGATATCCATAATATTATCTTTTGAGCTACACATCACATTTAACATCTACAAACCGCCCAAAGCTATTACGACTTTACATTTTTCTCCAAAATATATAAAGGTAAAGGTTACTAAAATGAAGTAT:1 + chr2R 2782960 3' + G5A 2742 1 59.59 TAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGCACACATTTATGCAGAGCATGGCTTTCAAACTTTTAATGCTCGAA:1 + chr3R 25714112 3' - flea 4821 1 69.78 ATCTTAGTGGGTAGAGGACAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTATTAAGCTAAGAAGAAACGAAAAACATACAGGGATCCACGGCCTTACCGCGCAGTCCCTTCATTCGACTGAAAAATCGAATGTG:1 + chrX 21297233 3' + HB 345 1 62.96 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTAATATCACCCGAGATTGCACACGAACTCCATCTAGCGGCAGCCGTAGATGTGCCCAAAACTTAACGG:1 + chr3R 5422959 3' + roo 401 1 69.00 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACCTGTCTCACCTGACTAACTTCAATTCAAACCCCGAAAC:1 - chr3R 20934695 3' - 412 7132 2 73.57 ATATTGCTACGAAATTGGTCAAAACTCCCCTAATATGAAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTAATTTCGGCCAGAAAATCGTCTTCTTACACAAACGTGGAAAATTGCTCTTCAAACGAAGATAATTCCTGTTTTGCTCTTTCG:1 - chr4 1068134 3' + 1360 3117 1 65.97 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATAAGAGCCACTCTGTGAGCTACCCACCGAAGCACCACTGTGGATATCAGGATATCCTGGGCCAGCGAATTATAACAACAATG:1 - chrX 14329146 3' - jockey 4710 1 52.41 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTATATAACCCACCGATTCCGGCCCTCGAGGACATGCATCTCGA:1 - chr3R 19435999 3' - roo 73 2 69.86 AAAGACAGCAACATAGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAATATATTAAAATAATAAATTAAAATGAAAATAAATAAA:1 - chr3L 10970453 3' + Stalker2 7567 2 78.77 AGGTGGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGGCGCAGCGCAAGTTAGTTTACCCTTGTTGATACGCCCATTTTAAAGCCCACAAACCGCACAAATCTGTCACGCCCACACATCTCTTTTCATAAAATTAAATTTCAACAGCA:1 + chr4 1113942 3' + INE-1 175 1 78.72 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTCTTTATTACAAGCATTTTGGCGGCGTTGTCG:1 - chr2L 13629060 3' - Tirant 28 2 59.13 TAATTAATTGGCGCCCAACTCGTGTTGACTACCCACGCGAAAGTGACACATAGTGACACATAACTAACAAGTGGTGATCTTAAGGCATCAGTACCAGTGCGAAAGCCATAGATTTTATATTAGTTCTTATGAATATTAAATATG:1 - chr3R 7743354 3' + springer 396 1 74.31 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCTGATCCCTGCAGCCTATTCAAAATAGCGAGCGGAATGGGGATGAAGGAACTG:1 + chr3R 11944921 3' + roo 9004 2 63.01 AAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCTGCACTTGTTTCGGGTAACGCGGTTATCTTATCACACGCGGCACACGCAAAACATGGCCAAAATGAAGGGAAATACTTATC:1 - chr3L 13952748 3' - I-element 5138 1 58.22 CATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCAACCTGGAGAAGAAGAACTTAACCCGGGGCAACAAATGCCGTAACTGCATTAAATGTGACCAAAATATTCCAGTCCTCCACATCCACTCG:1 + chr3R 23628756 3' + Transpac 478 1 53.42 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAG:2 - chr3R 9125639 3' - Doc 48 1 57.53 CTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTGTTCTTGTTGCGGTTTGCTTTGCACGGCCCTGGAATCGCGGGGTTGG:1 - chr3L 21264433 3' - jockey 4899 1 67.81 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTTGTTAGTCAAGCTACGGTTTCACACCGAAACCAAGTGGATTGTGAAACTTTCTCAATGGCCG:1 + chr2L 5792089 3' - blood 60 2 56.85 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGGTGGACCATTGATGCTGCGGGAACAGGACGTTTGGGTGCTGCGGGGAGTGATCTCCGGAGGTGTGATCAACGAAAAGGAAAACACCTGTGAGCTATCCAAGCCA:1 - chr3R 14218383 3' - roo 8678 2 75.86 AGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTACAT:1 + chr3R 4679588 3' - hopper 24 1 67.81 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAA:1 - chr3R 4679449 3' + hopper2 1548 1 56.85 ATATAAATAAAACACAAAAACATAACTTAAAAAGGCATGATAAAATAAAAAAAAAGGCAAGCAAAAATCTACAAATATGTAAGCAAACGTAGGCAGTCATTCATTTTACACCGGTTTTTTGCCATTTACACCGCCGCAAATGGACC:1 + chrX 9446483 3' + transib2 97 1 86.99 AGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGGGC:1 + chr3L 23678167 3' - Osvaldo 30 1 64.80 AGTCGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAAAATAAAGATTTTAGAGTTAACTTGTACAAAGGGCAGGGACGTAATCAATAACACTCGTTTAAGAGCACTAATGCAGGGTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAG:1 - chr3L 23635041 3' - gypsy6 7607 2 56.85 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCTTGC:1 - chr2L 22719601 3' - 1360 31 1 69.41 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCGGTTAGGTTTCAAAAGTTATAGTAGT:1 + chr3R 8218016 3' + P-element 2820 1 40.41 GCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCA:1 - chr2R 13367444 3' - jockey 4579 1 58.49 ATAAATTGAAAAAATTTAAAAACATGTCTTCTGTAACTTTTAATAGTTGATAAACAAAACTGTGTCCACTCTATTCTTGGATCAAATCAAATCAAAAAATCCAAATTTTTTGACACGGTGACACTGTGACACTTAGAGTCCTTCTA:1 + chr2L 22001762 3' + HB 318 1 54.79 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGCCCTTTTGCACAATGATTATGTAAATTTATTGATTTACCTGCGCTGCTCGAAAGAGCAATAATAGTAATAATTACTTTTCGCTCGCAGCCATG:2 - chr2R 22463104 3' - roo 8693 2 66.44 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTACTTCCGTTTATGGCCGAAGTGCCCGCACTTCAACCGCCATCCTACTGCCAACTTGCAACTTTCAGTA:1 - chr2R 7889527 3' - jockey 4714 1 51.85 TGAGACGTATGAGAAATACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTTCCTATTTTGCAGCTTAAAGTGTCGACGGCGCCGGGTGGAAGCCAGGACAAAGGACATAGTCA:1 + chr3L 3008557 3' - F-element 266 1 56.85 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCGGTTAGGTTTCAAAAGTTATA:1 + chr3R 8218011 3' + P-element 2815 1 36.99 AAATGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTC:2 - chr3R 22341161 3' - hopper 125 1 80.14 ACAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATTAATCAATTAGTGACCTTCAGTGCGGCCC:1 + chr3R 14986146 3' - jockey 4766 1 80.82 GTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGCAGCATTCGTTTATCTTTGGCAGCGCAGCCGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGCCGAGTCTAGCGTTTTGTTATAATTTCACGACTT:1 - chr2R 15615039 3' + 297 6636 2 76.71 TAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATTGGAGTATTAATAATAAAGTGCGACAAATTGTCTCGCTCTCGTTTGATTTGCATGCAGATACACACGAATTTTCAAGA:1 + chr2L 21830827 3' - Doc 30 1 58.21 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATGTCAAAGACAATTATTAGGGTTTTATGGATTTAAATGGGTTGGTGGTTAGTTGTCAATTTGGCACTGTGAGAATTGAAAAAAGGGGAAACTGTTACCAACTA:1 - chrX 7756339 3' + roo 391 2 40.41 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCCTATCAAAGGACAAATGATTTTTAAAATCACTCCACCTAAGCCCTGCGGTCCAAAAGTCAAGCCACTTGCAAGCAGAGTG:1 + chr2L 21910254 3' - Doc 46 1 52.74 CTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACTGTATGGACTGAGACTTACCTGATCGGATCGGGAGTGCTAGTGGCTCCGCTCAGCCTGTTTAGTGCTCTGAGTGCTGCCAGCGTACTTCGGCA:1 + chrX 18220714 3' - Burdock 6155 2 68.57 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGATAAAGTGTTTCATTATGAGCCTGGCAACCCGCTTGTATGGAAATCGT:1 + chr3L 10469604 3' + roo 9001 2 69.18 ATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTATCTCTTTTTCTTAACCCCACCCAATAGAGTGACCTTATCGGGGCAACACC:1 + chrX 5194811 3' + blood 112 2 60.00 AAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGACAAAAAAACGAATGATAAGTAATGGGATGAAAACAACTTGTTAAAACCTCTATAAATTTATCTTTATATGTCTCACGTTTATTAAAGTCATATACTTTT:1 - chr3L 3238212 3' + roo 9050 2 60.27 TCTGGAATGTACACTCGCTTTATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCCTATCTAAGCCAAGTTTGTTATGTGGGTCGAAATGC:1 + chr3R 25804189 3' + mdg1 335 2 74.66 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGCAAAGCTCCTTTAGAATTAACCCATGGCAACATAACTCCGGCGGTAAATATACCCAAGAGTGGTCCATTTGCCACCGACG:1 - chrX 7420955 3' + roo 9001 2 57.34 GATTCTAGTCTGTCGTTGTATAAAAAGTAAATTCAGAGAAGTCAACAAAGCGAATTCCCTGTTTTCGCAAGGCTTATAAAATGTTTTAGTTTTTTTTTTCCCATACGTTTAAAAACTTTTTTTGTGGACGTAGAATCTCTTTGCTT:1 - chr2L 5760955 3' - jockey2 3082 1 52.74 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGGGAAAATATGGAGGTGTGAGTATATTGCATTATTAAGTTTCCCATTACGGATTGTTATTTTAAGATCGAAAAGT:1 + chr3L 18484492 3' - hopper 45 1 55.48 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTTGAGATATCTTAACAGAAAAGCGTTAAAGAGACGTCGCTTTCCAATGAGCAGTATTAGTTAACGTTCCTAGTAG:1 - chr3L 22275760 3' - FB 16 1 65.79 CTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCTTTCACCTTCCATCTGCTGCTGCTGTCTGCTCTGCTTCATCAGTTCGATATTTGAATTCCCCGCCTTGAACTTCAATTCAAGTGGCTTTGGCTCCGATCCCCATCTCCACTG:1 - chr2R 23803644 3' - gypsy8 4550 1 44.83 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGAAATGTTAAGAGAAAGTAACTGCTGATAGCATTTAACCCATATAACTCCGAATCAACTGCACCCATGCC:1 - chr2L 4929755 3' - blood 7029 2 73.29 CTTGAAATTTTTCGGACGGCTTAATAAGTCCGCCGTGAGACACCTCGTCGACGTATGTAAATGTCAAATTTTCTTTTACTTTGTTGTTTGTTTAACCTTTGCTTATCGAAAAAGCCATACCCTTTCAAATAGCCAATTTTACAAA:1 + chr3R 8948156 3' - P-element 2440 1 42.07 CTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAGCGAAGTCTTAGTTCCTAAAAGGAGTAAGAGCTAGTAGTAAGAGCATGGAATAATATCTTAAAAATTG:1 + chr2R 17170030 3' + hobo 2631 1 52.11 GAAGTGGCTGGGCACAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGCGTGTTCGATCGCGACTGATATGTGCTAACCTGACTCCACCTTTCCTTGTTCTTCT:1 + chr3R 16997439 3' - G6 76 1 71.11 CGGCAGGCTGCAGGCACCGGACACGATCCACCCAAAAACAGTTTTCTGAGCGACCGGCATTCCCTCGTCGAAGGTCAGGAATCCGGATTGGATAATCGATACACCGTTTTTTACATTATTTCCCCAGCCAAATTCC:1 - chr3L 18329831 3' - GATE 8171 1 69.85 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACACCCTAATGGGTTAATTACGGATCAAGGGTTAAGCTGCTGGCAAAGGTTTTCCAGCATGCAACTCTCACCGTTTTTTATTAAAAC:1 + chr2L 14239262 3' + 412 455 2 60.27 CATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATCCTGCGCTCACTCCCCATTTCCCCAAATCAAGTCATAAA:1 - chr3L 10112209 3' + I-element 5274 1 72.41 ATTAAAAAAAAAACATTAACCATTATGTATGTAAAGCAAACTCAATTGAATTAAATCAGTTGCCATCAGAGCACTTAAACGGGTAAATAAAGTTGTCCTACATAACGATATTTCGCACTCACAATGACACATTCCGAAAGTCTGTA:1 - chr2L 14378622 3' - Circe 72 1 52.05 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGAAGTAGAAGAAGCAGCGCTGGCAGCGACGCCGACTGCGCTGCCTTGGCGCTCGGGAACTTGGAGCCCAGTTGCCGATCGG:1 + chr3R 31724968 3' + P-element 2884 2 77.88 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCGCTCTATTATTCTTCTCTTGGTACTCTGTCGTTGTTGGCT:1 - chr2R 1373075 3' + pogo 2068 1 62.86 GGAAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGAATTCGGTAGTGTTTGTGGGTTATATTTGATGTGGCATAACTTTAGCTGTTTACCTTAGATTCCC:1 + chrX 7615011 3' - I-element 5001 1 64.58 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTAATACGGTAACTCCAGGAAAACAGCAAAACGGCAAGCTGCGATCAGTTTTGATTCTTACTTCGCAGCGAGAAGTTGTGATTT:2 - chr2L 8984833 3' - pogo 35 1 61.64 AGACGCATAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATTCAGGCCCTTTTTTGGTGATGACCCATTTTTTAAAAGGAGTTCTACTATTGAGGGATTATTGTAGTGCGTGGCCACGTGTAATGGGGTCACATCATTTTT:1 + chr4 121430 3' - 1360 3369 1 61.48 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGCTAAAAAGGGTTCCCTATGTGTACTTGCGGTAATTGCAGAGCGTTTT:1 - chr3R 27323068 3' - 297 6616 2 55.96 TATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAATGAATTTACATGGTACATCCTCACTACTCGCCGCACAACTTGGCTCAACACCTGCTGGCCATCCCC:1 + chr3R 26540886 3' - 1360 3212 1 62.79 TCTTGGTCAGGATCAATAGCCGAGTCAATACGGCCCTGTCCGTCCGTATGGACGTCGACATCTCAGGAACTATAAGAGATTGTATTGTTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATAAGGCGTATGAATTACTATATAATACTTACAAC:1 + chr3R 18568418 3' + INE-1 88 1 76.71 TTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATAAATATATAATGTTGGCTAAGATGGAACCCAAAGGATAAGCATTTAACACTTTATAACTTCATATTTTATATATGGTTGAGTGAAGCGAAATTTAAATATCAACACAT:1 - chr3R 26860066 3' - hopper 366 1 71.92 ATAATAATAACAATAACAATAACAATGGCGATTCGGGCAGCAATGCCACCAAGCAAATTTCCAATGTCGGCATGATCATGATCCATTGCGTATCTCTCTGGTACACCACCATTA:1 + chr2L 2738576 3' + mdg1 7064 2 75.44 TGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGACGTACCATCCTTGGTCCGATTCCCGGATATTGGTCAGGTTGAGCG:1 - chr2L 4303448 3' + jockey 249 1 69.18 AGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGCAAACTCGCATAACGATACATAGAACATTACGCGCGAAGTAAAAGTTCCTCCTAAACAAACTAAA:1 - chr2R 12065531 3' - Stalker2 11 2 78.77 ACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAGGTGGCGGTGGGCAGGAAACGTTGGCTGCAACTGCAACTGAAATTGCGCAACA:1 + chr3R 6495377 3' - Stalker4 7007 4 50.68 GCATGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTGTAATAGACCTAATATAATATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTTTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTTTAAGTTTTGGTCAATTCGTCTGGCAGCGAGGATGGCCAGCTGCG:1 + chr3L 20771816 3' + Cr1a 4177 1 75.34 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTAGCTTATGACCAGGTTAAGGTAATGTCCATTGGATACTGTTGCCTATTTTGTGGCGCCCAGTTTAGCGGC:1 + chr2L 6388167 3' - jockey 35 1 58.40 TAGTCTAGCTAAACGACTTAGTATCGCAGCCCAAGTACGAGAAGAAGATTAAAACGCCACCACCCTCAAGACCTGTCTGACCGGATGACATATGTTTAGGGTCTGACGTTAGAGGACTAGATGATATTCGGTGAAAATTACCTTAG:1 - chr3L 7424152 3' + jockey2 3113 1 60.96 TGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTT:1 - chr3L 18484405 3' + hopper2 1516 1 77.40 GCTATAAATATCTGAATGTGAAATTGTATCTTAGTTAAGCAGTAATGTTGGGCTTTTGCGATAGGGGATCGAGCTTTGGCATTGGCTTG:1 - chr3R 29102417 3' + gypsy9 5220 2 49.44 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTGCCGG:2 + chr2R 1923581 3' + pogo 2047 1 56.85 CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGT:1 + chr3R 31141031 3' - Burdock 63 2 73.39 AAGTTATTATTATGTGTTCTTAGTCTGTCTATATATTTTTTAATATGTTTTGCTATTTCTGTGCTGGATCTCTTATACATAAACAGGTGGTTTTGACCGCTGCGCACTGTGTTGAGTCGCTTAGAACAGGATCGTTTACTGTCC:1 + chr3L 26225285 3' - G4 3625 1 64.58 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCAAAATAAATCTATGCCAATTATTGACCAACTGCCAGCAGACGAAACAACAATCGCCGTAGACGCTGCAACATTCGAGTGGAAACTG:1 - chr3L 4523902 3' - roo 8699 2 61.64 AAACAGCTGTTGCACGCACAAAAAAAGTTTATCTGCAATGAAAAGTTTTTCCCTTGACACAAATATTTTAATCTCTTTTGTTGCTCTTTTTCAGTTGCTTTTGCTGTTCTCTTTGATGTTTGTTTCGCTGTTGTTTCTGTTGCTGC:1 - chr2L 17559057 3' - Transib-N1_DM 345 1 52.05 GAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATAATTTTCAACGAATCTGGTATACCCTTTTGTTCTGCGATTAACGGGTATAATTAATCCCCGTTCACGGGCAGCTCCGACAACTGAAATCCGCGATCCTGACGAACCATATATGCGGGCA:1 - chr2L 13267882 3' - INE-1 35 1 48.63 ATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACGTATATAAAGCGTAGAAAAAGTGCGAAGTGCTAGGAGGAAGCAACATTTTACTACCGTACTTCGCTATACCCATGCAGCAT:1 - chr3R 27809992 3' + Burdock 6360 2 62.86 GACATCTGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCACCAAAATATAGATGAATTTTCGGCGGCGAATATTTATTTTC:1 - chrX 22980112 3' + 1360 169 1 71.92 GGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTATTCCCAGAAGGATAGACGTTTTTCTTCCTCTAGTGACTTTAGTAAGCCCCGTACTCCGTGGTGACCAAGACCACAGAAGGTTTCAAAAAAAATAAAGGAGATGGGAAAA:1 + chr3L 24709840 3' - baggins 5044 1 77.40 AAGTCGATTCCGGAAAAGGACATGGAGGGAGTGTGTGTGGCAGATGATTGGGCCAGGGCACTGAAGTCGGTGTTAATGGTCTGGCCATGTTGTGATACCAGTCCCTGTCCGTGGAGCTACGGTCGCGTGAGTCCAAGTCGCGGG:1 - chr2L 1173691 3' - HB 67 1 47.92 GAAATTCATTTGTTTTTTTTAAATACAGTTAAGCTTAAGCAGTTCTATTAATCATCGTAAAGAGGCTTAGTTGTTTAGGATGATTATTTCATTTCTGCCTATGTTTAATACCAGAATTTGTCTCTCATACAAATATAAATTAGACT:1 + chr2L 12124307 3' - pogo 475 1 69.18 GGGGTGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGTCTTCCATTGACCGTCCGAGCAC:1 + chr2L 9141398 3' - Doc 429 1 80.80 GATGTTAAGAGTCCAGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAGGTAGATTCACTAGAAACTATATACCTCTTATCTAAAATTTCCCTCGCCCCGTACCATTGTAGCGAATTTTCTATTTTTCTCCAATTCTATTTTCGTT:1 + chr3L 6841802 3' + Cr1a 4067 1 64.38 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTGAAAGAG:1 - chr2R 17097487 3' + P-element 2826 1 34.40 AATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGGCTATAGATTCATTCTTTCTTGTTAGAGATGGATAAATGTTTTGTTGTCCGCCAC:1 + chr2R 5439229 3' + INE-1 497 1 59.09 TTTTTTTTGCAAATCGATAAAAATTTACAAGACTTATAAAATTATGAAAAAATTTCGAAAAATGTTTACAGAAATTCCTTTTCACATATTGTTTTTGTTTTTCGATTTATTCGATTTATAATTTAGGGTAATTTGTTATCGCGCTC:1 + chr2L 17449915 3' - INE-1 312 1 68.49 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTCCCTTTCTCACATTCTCCCATTCTCTCGTTCTCTCGCGCTTCTCTGCTCAGAAGTACATATTT:1 - chr3L 19580840 3' + roo 398 1 75.71 GATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACTAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGT:1 + chrX 1018160 3' - 1360 235 1 67.81 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTTTGTACGA:1 + chr3R 21674940 3' + roo 391 2 65.38 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCAAAGCCCAGTAGAAAGCTATGGATGATGAAAATGAAAACATTAGGATGGAAGTGG:1 + chr2R 5754631 3' + P-element 2857 1 66.44 GCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCTTTTTACTTGGCCATTGCCAAACTGTTTGTTTTTATTACAAGCATTTT:1 - chr2L 13629073 3' - Tirant 72 2 67.12 AGTTAAATATTAGTTTTTGTTTTGGCTCTGGATTGTTTTTGTCTTGCATTTAAGAAGGTTTCGTTTGTAGTGCTTAATTTTAAAATGTAAATCAAACTCCACTGCATTATGGCATCATTTACAAATTGAATAAACCTTTATTTCTC:1 + chr2L 12828567 3' - Transib5 305 1 71.92 ACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGTGTTCGCCCCTATATCATTGCCACTGTTTATTTGCTTAGCTGGCAAGG:1 - 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jockey 4798 1 52.54 GGATGGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGAAAGGACGAGATGGCCAATCGGAACGATAGATAAGGAGTACTACCGTATGTTTGCGTTGTTTGGATTTTGTTATTTTAATGTTCACTGAGCAGTCCCTGA:1 + chr3L 13903722 3' + Rt1a 4706 1 66.90 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGCTAAAAAAGCTAAAGAGCCAGCAAGCTACATAAGC:1 - chr3L 21013821 3' - roo 32 2 63.70 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCGTATAGTTTCTATTTAAATAACT:1 + chr3R 25751884 3' + roo 342 2 66.21 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTGTATGAAAACTTTCCAAGCAAA:1 + chr3R 8849826 3' - 297 6634 2 80.77 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGTTGGCAGAAAAGTTAATTACAATATTTCATTGCTCAGACGTTGGTGGAGGGGCG:1 - chr2L 12144204 3' - transib2 22 1 56.57 GCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCCAGTCATGTTCATATGTAACAGAAATATATAGAGCTGAAGTACAATATATTAG:1 - chr2R 4577023 3' + Chouto 497 1 71.23 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAAT:1 - chr2R 15070087 3' + 412 7478 2 67.63 CCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAATATATAATGACTTGCTCAGCAATTTATACCTTTAAATCAGATCGCTATGAACTGCCAACTTTGAGGA:1 - chr3L 12159657 3' - Quasimodo 48 2 58.22 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAATAGATTCAAATGTACCCACTTATAGTATTAACTTATAGCCCTTGGCACACATCACATTTTTTCACATCCCATCGA:1 - chr2L 16456740 3' - BS 5042 1 54.11 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTGCCGGGAAA:1 + chr2R 1923585 3' + pogo 2051 1 54.11 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACTACCTATATATCAACAGATTGTAAACGCGGTTAGGTTTCAAAAGTTATAGTAGTTGTAGTTGTTATGAAAAGCAACTATGTACCTAATAATCATCGCC:1 + chr3R 8218060 3' + P-element 2864 1 70.55 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCTCTGGCAAATATGTTTACTCACAAGCTTCTTTGCCACTCAAAGTCAGCACAGGCCACAAAGTCGCAAAATATTTAAGAGAGCTCAGAATGCACA:1 + chr2L 11554612 3' + roo 9045 1 69.18 CTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTAAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAA:1 + chr2L 17599965 3' - 1360 485 1 73.61 ACAGCCAAAGCTTAAGTTAGTCACATTTTTGATCTGCAAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAATTAATTAATATTAAGTGTCTGAAATTAACCAATAAATCAAACTAAACAGTAAAAAGGTGTGGGTGAAATGCGAGTGTGAGACT:1 + chr3L 3569898 3' + 3S18 223 2 78.77 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACTAATTTTAAACTTGTTATCCATCCGCTCATCTCTTTCGATGATGAATGGGTGCGCATTCTTGTCGTTTTTCATACTACTAACTAATGC:1 - chrX 1103581 3' - pogo 30 1 63.70 AGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTTGCACTTGTAAACTGAACTGAGATAGCGAATCCCTAATGGCAGGGGG:1 - chr2R 17544159 3' - gypsy5 54 2 62.10 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAACCATCGTATGTTTTCGGTAACTAAAGAAAATTTCTAATAAAAGCGCATGGTAATTTAATAAAATTTATA:1 - chr2L 13255267 3' + pogo 2050 1 54.11 AGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAATGATGAACTATGTTTCTAACGCCCTAAAACTGTCCAAAACTGCCACACCCACATTTTTCATCAGATCGTTTTTGAGTTCCTGCGATTTCCGTGACCTCTTGTCCCGTACTCCCCGAAAT:1 - chr3L 13876491 3' + INE-1 149 1 59.59 ATTTTGGAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTCTGGGCGGTTTGTGGGCGTGTCGACATGAATCAAGAAACTTGCGCTGCGTCTATGTGTCTAGAATTTAATAATTATATACCAATTCCGAAAACCTTATTAATAGATCATGAACTTC:1 - chr3L 15681540 3' - INE-1 253 1 64.58 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGAGCAGCAATGATCGTCTGGTG:1 - chr2L 17380660 3' + hobo 2933 1 56.00 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATTTTAGTAACAAATGCTAACCCTGCGCTTTTCATTTAAGCCAGGCTTTCATGCATTACATTTCATTTTCATTTTTCTTAGTCGCTGATTGTTTGTT:1 + chr3R 11870211 3' + pogo 2080 1 70.83 CACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGTGCTTTATGATCGAAAAATATGCGCATAACCACTGTAGCAAACCTTTTTCATGCAGCTCCATTCAGCTTTTCCGTC:1 - chrX 5286630 3' + 1360 154 1 49.32 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTATCAGTTACACCTGGGACTTGGGGCTTCTATAGGGGCTACCATGGCG:1 - chr2L 3231876 3' - roo 8735 2 68.06 AACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTGTTTTGATTTTATAAGGTCACTTCAAATTTTGCT:1 - chrX 8437216 3' - hobo 119 1 73.91 GGAACGGCAAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAATCATTTCATAAAATGATATATATGAGTAAATTTGATTCCCTCTTTGGCTGCGCTCTTAAAGTGAGATTATCTCGGCTGCAAAACTTGTAA:1 - chr2L 8850863 3' + Doc3-element 4583 1 51.43 ATGTGTAGCTTAAAAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTATAGTGTATACAAATGTACCGTGAAGTCAACGTGTTCAATTAAACACTGCAGAATTTTTTAAATCGCGTGTTTTCAGATTAACACGTTAAATGTATATTCGTGA:1 + chrX 19664516 3' - G5A 2772 1 57.24 CGGCTATTGATCCTAATCAAGAATATATATGTATATAATTTATAAGTTGGAAACTCATCCTCCTACCTTTTACATACCTCGTTGGCTGTGTCTTTTTAGCTCAGCAAAAATGTCCGCAGGAATTCGCCAAAGCCACACAGTTGAAG:1 + chr3L 20543339 3' - INE-1 88 1 52.74 CGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATTTTTCTTGTCCACAAATGTATGATATATAATTTTCTTTTTTTACGGTTAAACT:1 - chr2L 15081014 3' - Doc 14 1 75.34 CAATATACTAATACTAAAATACAGCTAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCAGGAATGGCAACTGTGGGGATATTTGGCATGCTTTTTCTTTCAATGCTCTATC:1 - chr3R 26846747 3' + hopper2 1542 1 58.22 GTCATCGGTATTTGTCTTAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGATGATTTGTGTTTTTTTTCGTTGGCTGGAAGCGTTGTAACCTGGTGAGTCACGTATAACTTGTG:1 + chr3L 23436464 3' - Porto1 4487 1 57.41 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGATGCCTGCTTTTGTTGTCAAAT:1 - chr3L 13690244 3' - hobo 38 1 60.27 CGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGATAAATTGAGTTTTAAAATATAATGTAAGCTTAATCCTTCGACTTTTTA:1 + chr3L 20230246 3' - 1360 3315 1 67.12 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCGTTGAAAAGCGAAAGGCGAACTCACGTCAAGTTCAACCTTTGACCTCCGTTACTCTGCGGCCTATGCGGTGGGTGGTGAGTGTTAAA:1 + chr2L 12486449 3' - roo 8698 2 58.62 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTTGGTTGGTGTGTGCCAAAAATCTTGTACTATATACATATGTACATACATAGTTTCTGCGGTTTGTCGTTCCTGCACACCAGCTGTTTGATTAATTTGATGGGT:1 - chr3R 9125617 3' - Doc 26 1 72.60 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTTGAAATAGCAGCAGCAACCTGCTCCA:1 + chr2R 14973716 3' - FB 44 1 54.79 AAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGCCTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCTTAGGGTCTTTTATTTGCGATGGTTGGCAAGTAAGTGATAAACAACATCA:1 - chr2L 15777797 3' + 297 330 2 63.70 CAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCACACACACATACACACACAGAGAGAGTCCACATAATTAAATCAACTAAATATTTAATGGGACATTTGTTTGGCTCCC:1 + chr2L 14900464 3' + I-element 144 1 53.73 GCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATGAGTGCCCCACATGGGGCGCCATATGGTACTTCAG:1 - chr3L 21093166 3' + Ivk 5292 1 76.03 CATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGCTTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTTGGCCAATACGCAGTTGTCTTTATTTCATTTCAT:1 + chr3R 16240978 3' - Tirant 78 2 71.83 ACAAAAAAAAAAACAACAAAAAAACGAAGGTTAAAGACTAGCCCTATTTGTTGTACCGCATGACGTTTGTACCTTAGGTACTTTTTCTACTATTGTGGTTGGCAGCTCTGAAGGGAACCTACACAGGTACGCAGAACGAACCTTCT:1 + chr2R 16343886 3' + gypsy11 3931 6 79.45 GTTTAAGATAAAAAATTCCTATGATTTAAAGTTTTGATGCGCTATTTTTTATAATATCATTATTGCCGGAAACGGAGGAGAAAGAAAGCTCGCGGTATTAGCCAGCAATGCCTGCGCTT:1 - chr3R 20330010 3' - HB 1587 1 52.10 GGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACCCCATGGTTATGTGGCTATATGGTTTGAGCTGTCATATGAGCCGCAGCCGCTGCCGGTCACTCGCCAATTCACG:1 + chr3R 31141072 3' - Burdock 3 2 77.14 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCACATTAAATGAAGGGTGGTCTGAAAACCGGGTC:1 + chrX 6633075 3' - P-element 6 2 78.40 ATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTGTTAAGGTTTTCAATAGTTGTAAGATGTTAG:1 - chr2R 5582128 3' - Cr1a 443 1 75.35 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACA:1 + chr2R 1923571 3' + pogo 2037 1 63.70 ACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATTTAATTACATATTAAACAAATTGTTGAAGTTAGGTAAGTACAACATTTATAAGCGTATGTAAACAGATGT:1 - chr2L 22315496 3' - frogger 5 2 69.86 ACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATAAAAAATGTGTGTGTTATTAAGTTTGATAGTTAAAGTCAACGAACCATTCGACGTAACATTCACGTGCACCGTAACGCGCTTGCTTAACGTCGC:1 + chr2L 12300889 3' + Tirant 8247 2 69.29 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAATGTAAAGACGAAAACTCGTGTGCATGACTAATTCGACACTTTGTTCCTTACA:1 - chr4 916301 3' - roo 8733 2 65.07 TATAGAAATAAATAAATATTTAACATTAATGAGCACAACTAAGTTTGAATCAAAGTAATATATTCTTGATTTAGGGGGTTCTTAAGCCGTAGAAACGATCGATCAAAATAAATCTTAAATGCGTACGAAAGACAACCACAGCCAG:1 - chr3L 15262625 3' + mariner2 830 1 53.10 AAATCAGAATTATGCGTAGTTTTTAACTCTACACGCAATACCAATACATTTTGGAGACTTACATATTCTAGTCCGCATACACCAATACTAATGCGACCAGACTAGCAACTATCTGAATTCCGGGGTCGAAGCAGGAAGGATGGGCA:1 - chr3R 20563159 3' - invader1 3874 2 71.23 TATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTGTAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAAGAGAAAGTGAATAATATTTTAAAACAAATCCTAAAAC:1 - chr3L 23559103 3' - mdg3 5349 2 73.97 TAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATCTCCGACTTGATTTAGAAGGAGCTTTCAGTTGGGGAAAGCTGAAACTAACT:1 - chr3R 28211394 3' - Tabor 474 2 65.07 GGGCAATCGAAAAAAAATTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAATAATGGTTGGGTGACATTCTTGGAGCGTCCCACCACAACGGCGTTACGACCGAGAGTTTCGATTTTCATATG:1 + chr3R 9043164 3' - FB 414 1 54.01 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATGGACCGTGAACCGTCGTCGAGTGTGTGCGTATTCACTCTT:1 + chr2R 17332204 3' - jockey 89 1 71.92 CACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGCAAAACACCCATATAAAGACATATGCATTCAACGGACGTAGAAAAACATTTATAAACACTCGATACAAAAACCCGGAAT:1 + chr2R 5953736 3' + I-element 4876 1 66.92 AGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACAAATAGATCGGATCGGTTGTGGATCGG:1 - chr2L 2163213 3' + 17.6 7113 2 79.84 ATACCACTCTTTTTATTCCTTTTCCTTCTTGTAGGTTATGCTGAAAGCAGGAGATGCGCTCATTAGGCCAGATGCGAGTGGAGTGTGCTGATCTGATTGTCGGCTTTTCGGTCTGCCCATTAGTAGGATGTCGAAATGACGGGACA:1 + chr2R 6897312 3' + copia 4975 2 78.08 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCGTTGAGAAGATTTATGGAATTGATTCGATGGGC:1 + chr2L 8574471 3' - Transpac 4968 2 52.74 GCCTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCACTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAATAGACAGAC:1 - chr2R 15075593 3' + mdg1 7389 2 67.41 GATGACAATGTGGCACACGCCACTGAGCAGGGGAAAGTTGCGACGGTGGGAGATATACCGCTCTTCTTTTTGCAAAGCCAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAATAAAGGAAACCG:1 - chr2L 22218254 3' + invader4 2928 2 80.67 GTGTCAATAATTTTGACGCGTAAAAATTGTGTGTAAATACTTTTGACAACAGACAAGGATCAGTTCAATGCTTGTCCTGGCCGACCGCGCCACCACCTATGCCACCCACTTCTGGGCGGAGCTCTTCGGACTGCTGCACATCGCCG:1 - chr3L 20797643 3' - Bari2 99 1 55.48 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGAAATATTATTCTATCCTCTACTTTAATGTCATCACTCTCGATTGAAATATCTTAATTGAA:1 + chr2L 19674008 3' - roo 8720 2 58.90 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGACTTTTGTCGCCATTTATGTACGTGGAGCCAGCCAGCGAGCGAACGACACGTCAGAAAACGGGGCATACATTC:1 - chr2R 6798209 3' - jockey 25 1 64.35 ATACAAATAATAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTGCTTATACATATGTTGAAATGTTTAC:1 - chr3R 7659009 3' + P-element 2498 1 19.18 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTAATTACGACTTGATGGCCACATTAAATGAAGGGTGGTCTGAAAACCG:1 + chrX 6633071 3' + P-element 2856 1 64.38 TAGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCG:1 - chr2R 5070917 3' - gypsy5 6964 2 26.71 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCG:1 - chr3R 20450429 3' - hobo 64 1 70.15 ATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAA:1 - chr3R 3617313 3' + micropia 170 2 72.60 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGTATTGTATTTTGTATGTGCATTGTATATTGTATATTTCGATGTGCATTTTGGTATCGAGGCAACCTAACTTCTCAGCTCTTCTACGGTGGAGTTAAGGTTGATGCCGAGCAGA:1 - chr3R 7450246 3' - Doc 13 1 56.85 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATTAATATCACCCGAGATTGCACACGAACTCCATCTAGCGGCAGCCGTAGATGTGCCCAAAACTTAACG:1 + chr3R 5422958 3' + roo 9054 2 62.39 ACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATATATTCTTTTTTATATAATCTTAATATTGTTAGTGTTGTTCTTAGTTTGATGTGTTTTTGTGTTTGATGGTTT:1 + chrX 22252868 3' + flea 4971 2 56.85 AATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAAAAACACCATCGTGCATGAGACCCATTTGCTCGTAGAGGCAATGGGTGAAACACTGGACCGATTCCGAGGGATCCGA:1 - chr2R 10910189 3' + Tabor 7300 2 64.06 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTACACATTTCGATAAATTAAA:1 - chr3L 3453589 3' - Tirant 8127 2 66.09 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTAATACGGTAACTCCAGGAAAACAGCAAAACGGCAAGCTGCGATCAGTTTTGATTCTTACTT:1 - chr2L 8984854 3' - pogo 56 1 58.90 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGTATCTTCTATGCATGCAACAAGTGGAACCAACTGCAACTCCTAGCAGTC:1 + chr2R 18611995 3' + P-element 2816 1 36.99 AATGTTTTATTATTATTATTATTGCCATTATCATTTAGTAGACTAATTTTGAAACCAAATTAGAGGAACATACTTGATTTTATGCTTTCAAATCATAATTAACCCGTAAGTACAACCTTAGTAACAATTGAGCTACGCCGTATTTA:1 + chrX 21452882 3' - invader3 5060 1 52.05 AAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCTGATCCCTGCAGCCTATTCAAAATAGCGAGCGGAATGGGGATGAAGGAACTGGACAGACTTGCTCCCAAACTAAAAG:1 + chr3R 11944946 3' + roo 9037 1 64.49 ATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATGATTTATGGGAAAACCGATGGGGAAAGCTGAAAAAGCCAACAAGGTCAAAAGCCTTTACACTACCGAATTCCAACCAGC:1 + chrX 691775 3' + FB 205 1 54.79 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTAAGTGGCAAGTGGAGTGGAGGAGCCATGGAAAAGAACTAAGAGTTAAGTGAGTAAAGTCAACGTTTAATGAA:1 + chr2R 21439570 3' - jockey 23 1 71.72 GAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAGTAAAAATAAAGATATTTGAATTGCAAATGCCACCCATTTT:1 - chr3R 13838224 3' - 297 14 2 58.54 GAGTCGAACTAATGTCCCGTCTAAGTCCCAACTAAGTACAAAAAAATTATCTGAGAAGAAATAGTTTTCACGTCTTTATTTATTTGATCTCAGCTAAAGACTAAAAATAAAAATTAATGAATGATTGAATTGAACTTTGCATTCGC:1 - chrX 21411465 3' - 297 6951 2 51.37 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCTCTCTTTTCTCTGACTAGCGAATCTCTATCATAAAATTATATACCCCTTTAAAAGATAAAAAGAA:1 - chr3L 4651544 3' + roo 9025 2 53.42 AACGATTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAGCAAATCTAGTATGCCCTTTTACTCTACGAGAAACGGGTATAATTATTTCAAAAAACGGGGAAGGGCCAAAGTTTGAAATATACATAAGCTGACATTACGTACCCATTAAATTA:1 + chrX 22760239 3' - INE-1 32 1 65.75 TTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAAAACATCAGCAACAACAGCGGCGAATAGCGAGTAAAATTCATTATTTTTCCAAAGCACAAAAGGGTTATGAAATATGCAAGAAATGTGCAGCAATCTGGGCAAACTCTTCAAAAAATA:1 + chr2R 19198462 3' - FB 5 1 80.82 GAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTTGCTGTAGTATATGTACTCTATGTAATTACCATGCATTTAAGGCTTCTTTATTCATACTCCAGTTTT:1 + chr2L 3724308 3' - 1360 176 1 53.91 AAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTC:1 + chr3L 7801273 3' - Transpac 194 2 78.57 AACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATTTTAGATTTCACTTTCAGAACATTTTGGCACAGTTTC:1 - chrX 20278682 3' + hopper 286 1 74.66 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAATGTTTCATCTAATCATATCTTTTCCACCTCCCTTCCCGTTGTTTAAAATATGCCGTCGAGCCAAGAATT:1 + chr3L 2330194 3' + roo 9021 2 51.72 TATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGGCTTAAGTTTTTGTTAGCATTACAAATTCGTAAGACCGCTGGTGCCGTATGACCTTTGACCCAGCTGCTACCGCGTTGAGCAGAAACA:1 + chr3R 28950492 3' + jockey 4849 1 60.27 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACACACACACACACACACACACACAAGGCTG:1 - chrX 5934659 3' - accord 7028 2 59.62 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCAAAATAAATCTATGCCAATTATTGACCACCTGCCAGCAGACGAAATAACAATCGC:1 - chr3L 4523933 3' - roo 54 2 64.18 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTATTATTATTATTACCATTATTATAATTATTATTTAATGAGGGGAGAATCCCGTCGATCCAGATGTAAAAAAAAATAATCAATGTATCTAATATATCGAAATTC:1 - chrX 22759885 3' - mdg1 37 10 45.52 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATAGTATCATTTGTTAACTTCGAGCCCCTAATGTTGCTCTTCGGGCTAATGACCATTGTGGATATTATGGCGACAACGGGCGTCTTCGATTTCCTG:1 + chr2L 22016042 3' - Tirant 8111 2 81.60 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTATATGGTCGTCTGCG:1 + chr3R 13437261 3' + hopper 1369 1 54.11 TTAGTCTCATAATGAGAAGCTTCAATAAACAAAGCAACGCATAAAAATATATATATATATATTACAACCATGAGTAAGAGCAGAAATGTATTTGTGATGCACGCAACTAAATTTTTAGCAAACCGAGAGTGTAATCAAATTTTT:1 - chr2R 1732872 3' + Fw2 3915 1 56.94 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTAGTAAGTACACGACCCATGGGATGCCCTGGCGCAGTTAAAAATATTTACTTCTGGCCACGAGTTTACCATAACTT:1 + chr3R 27323180 3' + 297 6935 2 55.48 CCTTGGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCCATGTTAATTTCGAGCAATTATTGGAC:1 + chrX 16994559 3' - roo 8756 2 82.76 ATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGCACTCATAAAATGTGTTATTTATACAGAAAACCTGCCAATAGGCCCCAATATGAAAGCGAA:1 + chr3L 21093235 3' - Ivk 60 1 59.59 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACGGACATATATGTAGATATATAACCATATGCACATGGGTGCCATCCCATCCGCATATTCATGTGTGTTGTGGTTGGCCATGTCACACCCGGCGTACTCACCAACCCCA:1 - chrX 16117113 3' - opus 7 2 75.34 AACGGGAAGCTCGGTTGTCAAACGACAAGTGCCTAATCAGGCTATGACATTGATGATGACTTTTAAATTGAGTTAAGAACTAGGGAATATCTTAGGGATTTTACTAGAAATTGAGCGGTTTAAGTTCTTCAAAATATAATGATAAA:1 + chr3R 23310302 3' - Circe 297 1 75.34 AGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACTAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATTCAGGATACATGCCATTCAGTTGG:2 + chrX 1018186 3' - 1360 212 1 69.86 TATTTATTGTAAAGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACCACCAAAAGTAACTGAAGTCAAAAAAATAATGAAACCTCAAAACAGTTACGGCCATGCCACGCCACAATCGACGACGCCACTCCACC:1 + chrX 17028395 3' + I-element 498 1 68.49 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAGTCGAATCTACTCGTGTCTTTATAACTTGAGTGTTTCTTGCGGCAGTCGGG:1 + chr3R 10213116 3' - P-element 32 1 50.00 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCATATCAGTTAAATTAGCAATCAGTCTCCAATCT:1 + chrX 4400372 3' - roo 8736 2 77.69 GGGTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCATTTT:1 + chr3L 7801331 3' - Transpac 5061 2 55.48 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATCTGAAGCTGAAGCTGGCATTCCATTTGAATTATTCATTGCCAAGGCAGC:1 - chrX 8219377 3' + opus 433 2 66.20 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTGAAAGAGAGTG:1 - chr2R 17097483 3' + P-element 2824 1 35.88 TGTACCCTCGATATATTCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGTCCAT:1 - chr3L 11803977 3' - blood 7 2 63.41 GCGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTTATATATGTATGTGTATTTATTCACTTCGCTCTTCGTGTTTTTAATGAATTGTT:1 - chr2R 14973608 3' - FB 67 1 63.70 ATAAATTAAAAAAGTTTTATTTAACTGCAATAGGTATTGATTTTAAATTCCAAGATTTTGAATTCTATTAAGCACAATTAAAACGTGTTTATTTTGCAGAAACGTTTCCAATGCTCAACTGTATTTTGCTTTTTGGCGCAATAGA:1 + chr3L 19421390 3' + HB 327 1 80.69 ATTAAAACTGTAAATCATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATTGTCATACACGAGTAAGTGCCCAGAAATAAAGACGGAAAAAGGGAGTCAACGCCAGAGAAAAA:1 - chr3R 31887272 3' + HB 1571 1 61.81 CATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGTCTGGCTGTGAGTAACATTATTTGCACCTCCATGAAATGAAACTCGCGAGCAGCCGGCAATTATTGAAATAAATTTACGAGCCTGAAACGAATTATGG:1 + chr3R 28114780 3' + hobo 246 1 69.86 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCAGCCATCGTCATAAGGCACAACTTAAGGTTGGCTTACGTCACGTAAGGCGATACTCCTTCGCTGCTTCGTCTTTTCATGGGACTG:1 - chrX 6936576 3' + hobo 2937 1 69.91 AGATCTGGAATGTACACTCGCCTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTTTACCCCTTCACAGCGTATCTAGGCTTATTAAT:1 - chr2R 15075601 3' + mdg1 332 2 75.34 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATTATTCATAATACTTGAGCAAATGACTTACCCACGATTTGACCACGCCTTTTAAGACTTTAATAGCCACTGTTGCCAG:1 - chr3L 465952 3' + Juan 4171 1 56.85 CTTTAAGATGCGATTCTCATATCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCATTATTCACTATGAGGATGCAACAACGTGCTT:1 - chr3R 25862601 3' + roo 8984 2 77.40 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAAGCTTATGGGTAGGGCATGGGATTTGGCAAATGCACATGCTACTACTTTAACCTTTATGGTGTTTAAAGCAGCAAACAAAACTGAAACAATACCAA:1 - chr3L 15364772 3' - 1360 24 1 68.49 CCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTCAAAACTGGCACGC:1 + chr2L 23034102 3' + FB 406 1 57.53 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGGCATAAACCAACCGTCTGACTTATTGCCGTATCTTCAGCATCCTGACAAGCAGAAATAATTTTTCA:1 - chr2L 19652512 3' + roo 354 2 54.11 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAATCACATCTAACGCTGGACGCGAAATAGTTCAT:1 + chr2L 23049744 3' + opus 7455 2 57.14 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCGAGGGACACAAACACACTCGCACTTAATCTCACACTAAGCACGCACACAATGACCGGCTTTGAGCAGGGCTAATTGTATTGGTAATG:1 - chr3R 11095756 3' + hopper 1384 1 63.01 GTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCTGTTTTCCCAATCATATCGATTACTTCATCCTGTTGGTCGCCCATTCTCGAATTGAAATGTACTCCTTGAATATAGTCGTTCATTATAAACTAGTCCTTTTATTTCT:1 + chr3R 7506052 3' + Doc 419 1 77.14 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGTATGATCAGAATTTCGGTAATGTGAGAAATGGAAAAGTCAAAATTGTTGACAGCTTGAAAAAATGACTGTGAATTATAAACTAT:1 + chr2R 10161000 3' - transib2 36 1 56.85 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCATGTTCATGTGTGAACATGTCAATTACAAATATCTAAAATAGAATAGTAACAAAAATAATAGAATCGTT:1 + chr3R 2861125 3' - roo 8737 2 94.52 TTCGCATTCACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATGTGTATATTCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATCATTGAATATCTCG:1 - chrX 10445531 3' + INE-1 531 1 70.90 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAACTTACCCTGCTGGTCTCCAGTTTCGGCAGGCCGCCGCTCACTAGGATCTCCGTTTTCAAATCTTTCATCGTAAGGCGTTGCTAGAAAT:1 - chr3L 9212648 3' - hobo 31 1 62.94 AAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACAAAAAGTCACAAAAAGCAATATTAAATTGGCCAACCCTTCTCCCATAGATTTTCTTTTTGTTAACTAGGAAAGAAAATTTTGCT:1 + chr3L 22985593 3' + jockey 4690 1 60.27 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCAATTAATGCCGCTTTAAGGTATTTTTGCGCTGCCCGCAAATGAATCGATCCGTGCGACAATTGC:1 + chr2R 22463256 3' + roo 9014 2 56.85 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACGTATATAAAGCGTAGAAAAAGTGCGAAGTGCTAGGAGGAAGCAACATTTTACTACCGTACTTCGCTATACCCATGCAGCATTACTCATACGCACCG:1 - chr3R 27809977 3' + Burdock 233 2 70.55 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGACTAAACA:1 - chr3L 18381918 3' + copia 220 1 50.00 CTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTCTTGTCTCTTTTGTTGCGAGCCAACGACCCGGCATCGCATTGAGATTACTTATAAAAGGTTA:1 + chrX 19107477 3' + roo 9019 2 57.75 CAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGGGGCTTGTGAAAGTTTGTACATTCATAGGGGTGACTAAAAACGCCTGGTAATTGGATGCGTCTTGTTTTTAAATCGATACCTTGAAATG:1 + chrX 19376740 3' + Dm88 380 1 72.73 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTTCGCGAAAAGAAATTCTATATATGCCACCTTGAAACTTCGCTTATTTTGCGTACAAT:1 - chrX 10579888 3' - pogo 57 1 60.96 GTAGTTTAAAGAAATATACGAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTAACTCTGATTCCCCAGTTGGTTTTCAGTAGACACCTGCTACTGATTATGATCGCCTAAAACGTTGAGTAAATCGATTTCTTACAGCGCCTAA:1 + chrX 2424702 3' + Cr1a 164 1 65.07 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCGTTGGATTGATGTTCGGAAACTGAGTCATCAGTGAAGTTTATCTCGAACCCCC:1 - 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chrX 6645878 3' + X-element 4533 1 76.03 AATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCAGCAGCAACACCAATGCAAGTGTTACCTGCACTTGTTCGAGAATCTGGATCTGGATCTTGTATTTGGATCTTGGGATCTTTCCGAATCTCCGTGCGTGTTGTTTTCTTGCGGTT:1 + chr3L 16483171 3' + jockey 499 1 55.48 GATAAATGCGTGCGAAAACAGCGGTTTGCACTATGTGCAACGCAACTGCTACCACTGACTACTTCAGCTTACAATATTAAAGAGTATCAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTTGGCATACTGGCACTGAAAATATTAACCTTAAGAC:1 - chr2L 22217613 3' - diver2 4642 2 76.03 TAAGAACTCATGAAAATAACTTAGCCTTAAGTTTGGCAAATAATAATAACAAAGTCAGTAGACTTACAAACTTACACGTGCTAGATCTCCCTGACAGGTATTAAGTAGAAAAACATGTTATGTTTTTAAATTATAAAATTTACAAT:1 + chr3R 10644676 3' + G4 3625 1 77.40 GGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATCATTGTATCAAAATATGTTTACAGGAATTTAAATTTGACTCTCTCATGCTCTCTTTTCTCTGGGT:1 + chr3R 15286208 3' - copia 4776 1 80.00 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCTGTTCCTGAAAAATACATCTAAATTCCAAATTTCAGC:2 + chr3R 7778371 3' - transib2 41 1 56.16 CGGACTCGTATATGTCGAAATTCGCGCAGCGCAGAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAA:1 - chr2R 2666325 3' - Rt1a 49 1 51.54 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTATATATATAAGTAGGGGTCTAATTCCATATTGATGAGACCGAGATGGGATTGTCATGGGTGAGGG:1 - chr3R 28406344 3' + opus 459 2 55.30 TTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCTAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCAGGAATGGCAACTGTGGGGATATTTGGCATGCTTTT:1 - chr3R 26846764 3' + hopper2 1538 1 66.92 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGGTGGACCATTGATGCTGCGGGAACAGGACGTTTGGG:1 - chr3R 14218451 3' - roo 8747 2 75.34 TGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTGTTTAAATAATTTTATAAGTGCTAGCTTACGAACAAGCAAGAAAGAGAGAATTGCTGCACTGCATAAGTTTGTTGTTCGAGAATGAAGGAGACTGAAGTAATCGTCAAAGATTAC:1 - chr2R 1341257 3' - F-element 4431 1 65.07 GAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAATATACATTTGTACATTTATATGGAAATCAGGTTGGCGACACTTC:1 + chr2L 15186528 3' + Quasimodo 6928 2 70.55 TAAGGGATTTCCTTAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAACTTTAGGTCGTAACACTGATGTTACTGTGCGGCCCCCCAATGCTACTGAACTTATTGCC:1 + chr3R 2916284 3' + Circe 7011 1 59.59 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATACAAAGATGTATATATACACTTTTTAAACATTTGCAAGATAAACCTTTTCGATCAAAATTATGATATTCTTTGGAAATTCTTGAATAGTATCAATAAACTAGTGG:1 - chrX 15454632 3' + 1360 3371 1 73.97 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATAGGTTAATGAAGGAGTATCAATACATTTTTCACACATATGTTTCTACGATTAGTGAACATAATTAATACACGAAATCGACTAAACATTTTGGCTGTGTATGGGTGA:1 - chr3L 18381898 3' + copia 241 1 60.69 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACCTTTTCTTTTGGCCAAACTTTCTGCC:1 - chr3L 20497762 3' + P-element 2866 1 44.00 GAACTGTTATCTTAAATAAAAATTTTAGTTTTTAGTCATTAAAACAGAGTAACGGGTAACTGTGTTTTGTGATCGTTGCTATTCTTTTAGTTTCGTTTGTAGTTGTTAAAAACTCTGACTATCTGACTTTAAGTATATCTTATGTA:1 - chrX 9016610 3' + F-element 166 1 70.55 AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCAC:1 - chr3L 7837175 3' - jockey 4833 1 62.76 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAATACATTTTTTTAACCGATAAAAATGAGCTTGACCAATAAAACCCTGCTATAATACTTTAAAATATTGGTTGTTTTTAATTTTTTATTCCGAAACGAAA:2 + chr2R 5434032 3' - Transpac 4939 2 67.81 CGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGAGCGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACACTGAGGGGTAAATATTTGCTATTTAATTTAAGAGTTCTTAGTTCTCTGTTTTCCGGGTAAATTAAGTCGTACAA:1 - chr3L 12148468 3' - 1731 205 2 49.32 GAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATTAAAAAAATACAAA:1 + chr2L 1361083 3' - Stalker2 7 2 67.12 CGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATAAGTACATATTTCGGAGAATATCATTGAGCAACTAAT:1 - chr2R 17014400 3' - flea 4838 2 77.24 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAATGTAGGATTGGCACGATTACTAATGATCCAAAACATGCAAGATCAAAATGTAAATCCAGAGACTAATGATTTCA:1 + chr2R 21436654 3' - jockey 4785 1 47.95 ATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTATCCAATTAAAAAAACAAAAAACAAAAAGGACCTGGAATTGGTAGAATAAACATTG:1 - chr2L 21642998 3' + Tabor 7295 2 64.58 CTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTTTTTTCGGTTTTTTGAGAAATTTCATTTTTTAGCGGGCAATGTCTCGACTGCCAATGCTGCCCTGCTGGATTTTCGCTGTTGAAGCAACTCCATCTCGTTAATCGTCAG:1 + chr3L 14513056 3' - hopper 938 1 73.10 AGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAACTACCTAGTATAATTGCAGTATTATTAT:1 - chr3R 9583317 3' - Juan 4119 1 78.77 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGAATTTAGGGGGCCGCAGTGTACAGTTGAGAAATTGCAAACTGAAGCCTCCTTTTATATATAGTATATATCCCTGCTTTTGATGGCTCACCTCGCT:1 - chr3R 25804080 3' - mdg1 27 2 64.38 CTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATCATCTCGCCCTCTTGCAACTGCTTGGCGAAGCCAAAATCCGTGATCTTAACGTTGTGGTTCTCGTCCAGCAAGATATTCTCGGGCTTA:1 - chrX 11697501 3' + hopper 299 1 58.90 GTACTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAGTGGGGCTGATTCGGTTTTTCTGGTGTCAATTAAAATCTGCCAGAAACAAAATTTCATTAGGCCTACCCGAAAATGGCAAAATGGCAAAAAAGAGCAGTCCCTCACGACG:1 - chr2L 1759596 3' - Quasimodo 40 2 59.29 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTGTGGGCTTGGAAAATGAAAAGCTGGCGCTGGTA:1 + chr2R 21439499 3' - jockey 95 1 74.48 AAACGAAGACAAGAACAGCTCGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTCCATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGTCTAATAATGATGCGACATATACTTTAATAATATGCATATATTTTTATTTATACGTTAG:1 + chr2R 5045648 3' - invader6 4576 2 76.03 ATTAAAAAAAAAACATTAACCATTATGTATGTAAAGCAAACTCAATTGAATTAAATCAGTTGCCATCAGAGCACTTAAACGGGAAAATAAAGTTGTCCTACATAACGATATTTCGCACTCAC:1 - chr2L 14378646 3' - Circe 72 1 49.18 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCGCTTCC:1 + chrX 1103701 3' + pogo 2040 1 68.70 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTTAATTTGTTTGTTTTACCTTTTTTT:1 + chr3L 9177400 3' + mdg3 240 2 52.00 AAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACGCATTGTCTGAATCTGGCAGCTGTGTGCACAACCGGCAGTTAATGA:1 + chr2L 21643113 3' - Tabor 6916 2 68.49 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCCTATGAGCAGGCGCAGAGAAAATGAGACTCTCACCCACTCTCCCTTTCTCACATTCTCCCATTCTCTCGTTCTCTCGCGCTTCTCTGCT:1 - chr3L 19580855 3' + roo 9051 2 68.89 AAGAACACATGAAAATAACTTAGCCGTAAGTTTGGTAAATAATGTAAAAATTGAATTTTCTGTAAGTGAGTAAGCCTTTGGTTAACTGTTTAAAATATTTCAACTCGAAAGATTAAATACTAG:1 + chr3R 5463255 3' + G4 3626 1 68.29 TAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCATACGCAAGGTGTCCAATTAGACCACTCAACGGCAATTGGCTTTTCGCTGCCCCTTATTTGCGTTTTACCGGAGTTGCAATGACGTACGCACGCACACACACACATG:1 - chr2R 18689096 3' + Burdock 6376 2 75.34 GACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGACTGATTCCATAAATTTGGCATCACTGCAGCCCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGTCTACTTTTTCGGGCACGC:1 - chr2L 12325007 3' - jockey 4720 1 48.95 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACATATAATCAGTGGCGTAGAGTGGGTAATT:1 + chr3R 15126542 3' - FB 68 1 77.50 GAGCTCTACATCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGACAGCCAACAAAATATGCCCTTCATCTTAAAAGTTCTTAGACTAAGTCTATATTATTATTGATCAATTGGCATTTCAGTTTCCAGGCCACATGCTGCAATTGCTCCA:1 - chr3R 30468411 3' + 1360 124 1 71.92 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGACGTGGGGAGTGGGTGAGC:1 + chr2L 9879734 3' + jockey 4922 1 80.87 TGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGAGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGCAGTGTTTGTCCAAGGAGATGGTACACAGAAAG:1 + chr3L 13364394 3' - hobo 59 1 56.85 ACGTGTAAGGAAATAAATTGATGGAAGGGAAGGGAACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAATCCGGCTCTGGCTCAAGCCGTTTCTTGTGGGGGCAATCTTGTACATTTTGGGGGTTGCATTTTCACTCTCTCGAATATTTAT:1 - chr3L 809533 3' - Gypsy12A_LTR 2255 1 60.96 GTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTTACCTACTTACATAGTTGTAGTCCAAGTT:1 + chr3R 27374449 3' - jockey 100 1 77.40 GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGACGTCAGAAGGTCTTGAAAAAAGAGCGAGGAGTACACACGAACACAAAAACGATTACGAATACGAGTGGGACGTATATATGTGTAGTGCGG:1 + chr3R 25050123 3' - P-element 25 1 68.49 ATAATTAACATTCTTTTCTCCTGGGAGCAGTGCTGTCCTCTATTAAGTATGTTAAACTGGTTTCACAGAAAAAAATTAAACGTTTCAAACTCATTAGGCCGAAAGAAAAATGAAAATGCTAGAT:1 + chrX 5023681 3' - HB 376 1 66.13 GTTTACACATTTATATTTATGTTCAATTCTAATTTATCTCTCATCTGACAATTTTTTATAAGCGAAAAAAACAGTGATGAAGTGCTCGCCACAAAATCTTCTGTAAACTGGCACTAAATGAATGGCACTGCAAGTGGCCAGAGAGG:1 + chr3L 2537922 3' - 1360 2961 1 78.77 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATATATCTTAATACTGATGTCATTTAGTAGCTGGTACAGAATGTCGACTAATTAACTATTAGA:1 - chr2L 2494824 3' - Doc 38 1 50.83 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTG:1 - chr2R 21820746 3' - Doc 35 1 65.85 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCATATAATTTTACAAGCTACTACTCATATCTAATTAGTGTACCCAAACTAAGAAATACCGTCATTTATTTGATAAGGAAACTAAAACTCTAAAACTGGT:1 + chr3R 7664612 3' - I-element 24 1 65.75 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTAACGACCTTATAAGTTATGCCAATTGCGAGGGCAACGTTGCGTATGCGTAATAAAATGTAGAACCAATACATGGGTATTAAATTCACTTAATCAATTCT:1 + chrX 15116184 3' - pogo 3 1 50.00 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTACCACAATTCCGCACTTATAATTTTAATGCTTTCCGCACCCTACAGGCAAAGGCGAGATGGTGTGCATCGAT:1 - chr2R 21690449 3' - 412 50 2 52.41 CTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATAGAGGAGGCCGCAAATGAAAACACACATACCAGTGGAAAACGGCA:1 + chr2R 7772138 3' + FB 259 1 64.52 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACGATCTTCGGGCTGATTTTCCCGTAGCTCGATTTCCCG:1 + chrX 1103696 3' + pogo 2049 1 69.23 AATAAAACTATTAAGTTTATTTGGTAGTTACGTGCCCTTTTATTGGTGTTTCCCGATAAAGATAAGGGTAATATTATGTGGCATTTGTTGTAAAATTTACAAGAACAACTTCCACAAAGAAACATTCATTATTTATTTATGTTTT:1 + chr2R 13170879 3' + TAHRE 63 1 64.83 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCATATATATAGAAAATATACACATATGTATATGTACCTAGACGTGCCTATATCCCGCCGATTTTGAGGCATTTGCTCT:2 - chr3L 16059223 3' + 297 354 2 58.90 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCATTATGCAACGCCAGCGAAACGAAGGTGCTCACGAAGTGGCCAAGCTGCTCTCTGATTGGTCGGCGGTCAGTGCCACGAGG:1 - chrX 19887017 3' + P-element 2868 1 67.74 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCTCAATGGTGGTATATCTTTTTGATCTTCGTAACCACATTTCATTTTATATTGA:1 + chr3L 18253878 3' + blood 7320 1 66.44 TAAAAATTAAAAAAAAAATTAAAAATTAAAATCTAAAATCCCGTCTGACCTTATGATAAACTTAGAGTTTTGTTTTTCATTCATTTCGATTCTTCTTGGGTTTTCCAACACCATAAATCTCTTCTTAGTTGATAGCCCTTGAC:1 + chr3R 26800495 3' + Doc 4696 1 65.73 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAAGGCCATGCCAGCTACAGGGTAAACACTGCGAAAACCAAATTGGCCAATCCATCTTTTGATGCCTGCTTT:1 - chr3L 13690255 3' - hobo 49 1 52.74 GTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACGTGCTTTAGCCTGTTGAGAATTTTGATTAAAAATGCTTTCACGTGAAACTCAAACGTGCCCCATCGCTGCTC:1 + chr2L 19647953 3' + G6 1848 1 50.68 ATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACAAATACACACACACACAGACAAAACCATTCATGCTTATGGGGCACACTAATAAATACTCAACAGTTGCACATTTGAAAATGTCT:1 + chr2L 4420205 3' + gypsy5 10 2 57.53 ATAGTCGTGGAGTTAAGTCGTGAAAAGTTCGAGTCGTTAAGAAATTATAACATGAGGGCCACCGCCCAGACCCCAAGGTTCGAGTGGAGCAGTCACAGGTTAGTGAAGATCGGCAAGATGGTTAAGTATACATTCACGTTCTTGAA:1 + chr4 878526 3' + Gypsy12A_LTR 275 1 77.40 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTGAGGTACCTCTGGGCTGCTGCTCTGGATGTTTTGTAGCCCAGTGATTGACGATAATTGACTGTCGCCAGCATA:1 + chr3R 27810134 3' - Burdock 6178 2 55.94 ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGGGTGGGCTATTCGAGGGGGTGAGTTAAGTGGTGGGAAAGTTTTA:1 + chr3R 11095873 3' - hopper 63 1 64.93 GACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTGGTATTTTAGAATATCTAAAAACGACCTTTCAATTAAGGAGGCAAAACACGGGTTAGGTAACAAGTGCCATTCAGAGTATCGAGTATCCTTTCTCCGAAGTAGCGATGTTTGT:1 + chr2L 19309641 3' - Juan 4081 1 57.53 GGCCTTGTACAGGAGGAGTTTTAGGTTTTCCCTAAGTTTGGACCTTTTCCCGATGAGCTTTCTTTAATCTTCGTTTCAGCCAGCTAATTAAATTGTAATCCTTCTTCTGTTTTTGGACAGCTACTCGGACTTCTTGTTGCATTTTC:1 - chr2R 16736328 3' - G-element 3874 1 63.70 TAACGATATTATTATTTGAATACAGCTTGGAAATAGTAATAGCCGAAACTATGTACATAATATCACAAAATAAATTTCAAAATGTCCGTTCAACTCGAACGATTGAATCACCGCCACAGGACGCTTTCTCATTTT:1 + chr3R 28355433 3' + 1360 311 1 62.22 GGTATCTAATAGTCGGGGAACTGGACTATAGCGTACTCTTATGTTATTTAGTCGAGTCTTTATAATAATGCTTAATATATTTTGTATCAACATATTGAAGCTACCGTACGCATCCCTAAATCCTAATTAATTGCG:1 + chr2R 5950006 3' + INE-1 557 1 49.63 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCAAAGCCCAGTAGAAAGCTATGGATGATGAAAATGAAAACATTAGTATGGAAG:1 + chr2R 5754628 3' + P-element 2861 1 69.06 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGGGACGGCGGGAAGGCGGAACAAGGCCAAAAGTACCGCACCGCAGCCGTCAACACCGCAGTCATCGGC:1 - chr2R 6799067 3' - jockey 4763 1 57.63 GCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAGCAACAGCAGCAGCAGCATCCGCAGCAGCAACAAGTGCGGCGCAGCAAGAGCAACAAGTGCGATTTAGTGACCGC:1 - chr2R 7894165 3' + F-element 396 1 72.38 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCAAATGGCTAAAAAAGCTAAAGAGCCAGCAAGCTACATAAGCCCAGTTAG:1 - chr3L 21013813 3' - roo 21 2 70.63 AATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCATTTTCGTTCGAATACACC:1 + chr3L 7801345 3' - Transpac 5047 2 63.70 GAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACAAAAGATCTTTCAGCCGATCCCACCATCAAATGGCTTTACGCTCCCGCATGTTTTTGATGGACAACCCACTGATCCACTGAATTTT:1 - chr2R 5285503 3' - Circe 15 2 64.66 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATCCAACAAATATTTGCAGAAGGCAGAACTAGCACAAAGTTAACTAAAGTGGAGGCAAAACATTTTCAAATTAGCT:1 + chr2R 10160626 3' - hobo 28 1 46.83 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTTTTCGCGAAAAGAAATTCTATATATGCCACCTTGAAACTTCGCTTATTTTGCGTACCATTCCATTTTAAGTACGGCATTATCCATTGTCCATCGGTATATTT:1 - chrX 10579845 3' - pogo 14 1 76.03 AAATTTTGTGTGTAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTGGCATATAAATAAAATTCTATTATGTGG:1 + chrX 4032203 3' + transib2 2734 1 79.45 GGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAACTGGGCAATTTAGATTACAACGACCTAGAGCCTTCCTGAAAGTATG:1 + chrX 12545847 3' + BS 5019 1 67.12 AAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAACCGATAGCTGCTTTAGACTTGTGGGATGAATTTCTCGTAGATCTGAATTCCAAACAGAATATACCGAACTAGTGCAGAAAGTGAGT:1 + chr2R 1717173 3' + Stalker4 288 4 64.38 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCTCTCTAGCGTCTCTCGACTCACATCTTTGCG:1 - chrX 7706767 3' + P-element 2799 1 26.03 GACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCCGATCGTTGACTGTGCGTCCACTCACCCATACGGCTCTTGCGCAGCAGGCCTCGGGTGTCATTTTAATGTCTTATACAATTCTTACAGCAGCCGAGTTTTAGAA:1 + chr2R 5467458 3' + hobo 2709 1 68.49 AAACGTATTTGGTTTAATTAGCGTCCAACGCGCTTAAGTGTCGTAATAACGTAAAATCCGTAATAAAAAGATCTAGAAATCAAGGTCTTGCAATCGGGTTTTCTTTGCCGACTCGGCTCTGTTTGCCCCCCGGGCAGGCCACACGC:1 + chr2L 17051352 3' + gypsy10 346 1 73.29 ATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATAGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGGCTAAGCTCAACTAATTTCGTTTTTCTGTTCTTTGTGTTTTCT:1 + chr3R 7778335 3' - transib2 77 1 68.49 GCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAATAAAAACGTTTTCATGTGCAATCAAACCCAACTCTTCGCCGGCGAAATGGG:1 - chr3R 30088342 3' + Idefix 7040 2 65.07 ATAATTATATTAGTCATTTATATCCGGAGGCAACGCATAAATGAATTTAAAGTAGACAATGGAGCACCCAGTTATGTGTGGGCTTATATAAATAAGTGGGTATATTTAAAAGTGTGTTCGGTATCGAGTGGCGTGAGATTTATGGC:1 - chr3R 17964885 3' + rooA 7162 1 71.92 GCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGGATGAAAGGACAAGGACACAGGTGGCGGTGGGCAGGAAACGTTGGCTGCAACTGCAACTGAGATTGTGCAACAAGCGAAATATACA:1 + chr3R 6495390 3' - Stalker 6887 4 56.85 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCACACGGACGCAAATATTTGCCCACCTCGTATTACATACCCACGA:1 - chr3R 13437119 3' - hopper 4 2 66.40 GGGGTAGTATAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAAAACAATTCGTCAACAGTTAGTACACACTGCCATTTCCCCCGCGGAAGGTCTACCAATTGAACATCCGTGTTTCGTTAGATTACT:1 - chr2L 7252365 3' + baggins 5394 1 63.70 CAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCTATCACTTTGAGGGTATAAGGTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATCATAAATGTTCAGCAGTCAAAGGAACTGGCTTCTTAGTCATGAATTCGTGCGGTTACT:1 + chr2L 14666367 3' - Porto1 351 1 57.53 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTAGGTAAACCGGTTGGTTGTTGTGTTGTACTTGTAAGTATGTAGACACATACATACATAATCCGCCTGCTCCGTTTGCGCCC:1 + chr3R 7089589 3' + P-element 2883 2 77.27 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATCTTCCTTACTTTTTTCATTTCTAGCATTGGCTGGTTTTTTATCAA:1 + chr2L 16331032 3' + roo 342 2 68.84 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCTTGTTTAACGCAGCTATAAATTATGAT:1 + chr2L 20515274 3' - I-element 63 1 68.42 AGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTCTAATAAATATTAACGTTAGTAGGATCTAATTATGTACTAAAAAAGTTACACTTAATTGCTTTAAATTTAAGGCCGAATGCAACTTATTGATTTATGTGCGTGCCTGCAAATGAGGCTG:1 + chr2R 16358548 3' - Cr1a 4326 1 61.64 GATTTTTTTGCACACGAGTTTTTCGGTGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGATCTCTTGAATTTTTGTTCAAGAGCGAGAGGGCGAAACACAATAAAAATTCTTTACGATTTTCCAAAAGCTAAGCGTGAAGTATTTGTTTTCATTT:1 + chrX 12389683 3' + 1360 38 1 57.53 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCGTTGTTTACTCAGTCGCCACAAGCACCTTCTCCACGTTCGGATTTCGTCCGAGGACTACACAAACAAGTGGCTAAGTGGCAGTATCCT:1 + chr2L 3231992 3' + roo 9037 1 59.59 GTGAAATTGTATTAGAATATTAATTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGATATGGTGATATGGTTTGTGCATTCAGATCGTTGGGAAAACCATAATGTGAATTTATCTCGAACAAACAGATGTAATTGCCAAACATTTGAATTTCT:1 - chr3R 11151768 3' + mdg3 224 2 70.34 GCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGTAAAACGAATGCAGAAACATGCAGATCGTTAGGCGCTATT:1 - chr3R 7778268 3' + transib2 2745 1 76.03 CAGATCGACTCAGCTATTGATCCTCATCAAGAATACTTTATATGGTCTGAAACGCTTCCCTCTGCCTTTTAAATACTTTTTAACGAATCTAGTATAAATAAATAAATAAATAATAAAAATACCAGTCCAGCGTACTATATTGACAA:1 - chr2L 20413512 3' - INE-1 98 1 60.27 TGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTAAATATACTTTTGCCTAACCTCTATGACAGCTCAACCATAAGAAC:1 + chr3R 14954044 3' - jockey 4839 1 70.55 TTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTAAGTCGGCGAAACCAAAATATTATTTCAGTCTGGCAAGGGCATTTATAAGGTGGCAAGC:1 + chr2R 5764599 3' - S-element 1511 1 60.27 TAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTACGGATGAGAAGCCATGGTGTGGGATACCAAAAGTACGGACTTCGTTTTACCCATGGCAAGGGG:1 - chr3L 3809948 3' + Stalker4 7044 4 55.00 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACTTGCACTTGTGAAA:1 - chr3L 18484370 3' + hopper2 1557 1 51.43 AAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTAAGTCATTTGACTTAATATGATGTAACATTAACATTAGAAGTGTTTTTAGTTGAGTTTTCTATTGGCTTTTAATGGGGACTGTTGAACTAT:1 - chr3L 22801792 3' + 1360 2965 1 37.67 GCTCATAAAACGATTTAGTGAAGCTTTCGGTCAATTTTGTTTTTGGCTAAAGCCAGGCATTCCAACTACTGGCGGATGCCAATTCCCGTAAAGTCGTGAAATCAGTAACAAGCCTCTTGCGTTAAGAGCATTCGTAACTTATTTG:1 - chrX 678691 3' - transib2 134 1 68.28 AGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGC:1 - chrX 21087570 3' - mdg3 5298 2 54.11 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACATACCGGTTTTACTGGTTGGTAAAACCCCGCCCCTAACCACCCTTCCATTAGTTTTAAACCAGCTTACACCTTTCATGTTGCAACC:1 - chr3L 9469897 3' + 412 7514 2 63.01 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTACGGATATATAACGGACAAAAATGAATAAGTCGACTCGGCCAGTGATGTAAAACATATTATTTTTCTTGTCCACAAATGTATGAT:1 - chr2L 15081043 3' - Doc 41 1 57.64 CCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAAACTACCTAGTATAATTGCAGTATTATTATGAAACAATTTGATTTAATTCTTGGGCATGCTTATTTAGC:1 - chr3R 9583278 3' - Juan 4079 1 51.72 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGAGATTT:1 - chr2L 17839403 3' - blood 86 2 76.76 AGATCTCAGGAACTAAAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCGTACAGAATCTAAAGACAAAGACGCAGCGAAAGTTTGTTGACCCATGCTGCCACGCCCACAATCGCCCAAAATTGCCACGCCCATAAAGTAATCAATATTAAAAA:1 + chrX 3523530 3' + INE-1 149 1 68.49 AAATTCATTTGTTTTTTTTAAATACAGTTAAGCTTAAGCAGTTCTATTAATCATCGTAAAGAGGCTTAGTTGTTTAGGATGATTATTTCATTTCTGCCTATGTTTAATACCAGAATTTGTCTCTCATACAAATATAAATTAGACTG:1 + chr2L 12124308 3' - pogo 474 1 68.49 TTTTTTTTTTTGTTATTTAGTTTTAGCATAACCATTTCTTTTTTGGTGGCATTCGGTTTAACTTGTGCCAAAACTCCC:1 - chr2R 16972739 3' - BS 5094 4 83.33 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGTGTAAAGCCAACGCAACTCTGCAACGGAAGCAGCCAATGACGACCCCACATGGCTAAA:1 - chr3L 21013851 3' - roo 8726 2 62.33 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCGGCCCCAATTGTTTACTCACAACTTTTTTACGCGACGCCACTGTGTTTGTGTCACTCTCTTTGGCTCTCTCATTTGATT:1 + chrX 7706857 3' - P-element 16 1 69.17 GGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTAAAGGAAAACTTTTTTCACGCACCACACAGAAAGAAATATAA:1 - chr3R 7373990 3' - Quasimodo 117 2 71.43 CGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAATTGAGGGGATGTGAGTCGCTTAGTTGTAAACTTGAATCCTTCTGGGCGAAACTGGAGCAAA:1 - chrX 10011868 3' + 412 212 2 56.12 AGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGAAATATTCATATATTTTGCGCCTTATTAAGCAGTGATAATCCCAGTTTTTTTGTAAATATCACCAGCTTACTGCGAATGGCTCC:1 - chr2L 2120350 3' - I-element 4943 1 55.48 AGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGC:1 - chr3L 7837194 3' - jockey 4853 1 76.03 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTGATGGATTACTCTCGTTCAAATGTCGAATCTTGTTAGCACAGCTTCCCAGCCAC:1 + chr3R 7616868 3' - Stalker2 17 2 73.97 CTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGGAATTTAGGGGGCCGCAGTGTACAGTTGAGAAATTGCAAACTGAAGCC:1 - chr3R 25804128 3' - mdg1 78 2 66.44 ACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACCACTTCCAATTTGCAGGTACGCGAGGGACTCGAGAAAGGCTTTTCACTTGTTTTT:1 - chr2R 6885301 3' - flea 4819 1 61.64 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGAGTCCAGCAGAAATTGTGGTTTCGACAGTCTAACCATCTATCGTGGCCAT:1 - chr3L 11803977 3' - blood 71 2 65.07 GTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAAACGACACGCCCATATCTTGTGTAAAATATGAGCGTACGGGGAGAAGTTCTTGGCTTAAATGTG:1 + chr3R 14912044 3' - Stalker 54 4 55.00 GATCAATATTTTCTAAAAAGTGCGATGGTTAAGTTAGTTCGTATATTTTAAAGGTCAATAAATTAAAAAAAAAAATTGGTTTTTAGTGGGTAGCACTGCCAGATATTCGAAACACCATTGGAACAACGAAAAACATTATTACATTT:1 - chr3R 4568915 3' + HB 260 1 66.44 AATGCATATATATACATATATACAGCTTGACATCGATTCAGGACCTAAAGAGGATCATCGACGCCCGGCATGGTTTCCCAACCAGGTTATAATCATTGAGCCCGGCGGCTTCCGAATGCAGTCCCATTCCAGTGTTGTCT:1 - chrX 21185147 3' - G3 4512 1 31.43 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTAGTCTTGAATGCC:1 + chrX 4673685 3' - roo 16 2 55.42 CAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATACTATACACACACACATTTCTTCTTAATCCATTTTTGTACTCAACGTTAGCTGATGGATTACTCTCGT:1 + chr3R 7616830 3' - Stalker2 7303 2 58.90 CAAATTTCTTTTTTCGACGGTACAATGCTTTATGCGACCCATGACTTGAGAATTTTGGGCCTTCGTTTGGAAAAAATTCAATTAAAACCTTCAATTCAATTCCTTTTTATAATCTCTGGGTGTTCCCATCGTTCCAACTAGAAGGG:1 + chrX 2162373 3' - Tc1 379 1 76.71 AACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATTAGGGAATGCCATG:1 - chr2L 12291843 3' + Tirant 335 2 63.19 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGGCGAAACATTCAAATTGATGTGACCCCAAGATGAGGAGGGAGGCAGGTGCTCATCTCCATTTGAGCGAGGAGAAGAACCGCAAG:1 + chr2L 1807086 3' - roo 16 2 68.00 GTATCCATATAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCAAAACATAGTATAAAAGATATAGCATGCGAGTCAGTGTGCATATTGGAATTATTCATGGTTTCTTTAAAGATGG:1 - chr2R 14801385 3' + G4 3550 1 57.50 TACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTGGC:2 + chr2R 10910300 3' - Tabor 6909 2 63.01 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAAGTAGCTCAAAAATTCTATTCCAAATTGCTATGTCGTACTTCTAGAAATTCACCAATAATCATTGAATCAATGCATATTTGCAATTAT:1 - chr2R 19843796 3' - jockey 4771 1 59.59 GTAATTAATATTATTATATTTATTGTATGAAGTAACTTTGTATATCTTCACTCCGATAGATACGCTTGTACGCTTACAGGGTATTTAAGTCTCTGCCTGCCTGCCGAAATGAACTACTCCGCCTCGTTCCTTTTC:1 - chrX 19409315 3' + Tc3 276 1 70.37 AATTGATTTCGTCACGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCTTCTCTCGTTTTTACTCACACACGCTCAGCGGGGTCGGGGCGTTTTATTCCGATTCAGATTCCGACTAACATTTCAACGGAAGCCC:1 - chr3R 13910936 3' + 1360 3184 1 55.86 AAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCAACTATGGAATGGAAACTGAAACCCGACTGGCTCTTAGATT:1 - chr2L 12291856 3' + Tirant 8427 2 72.60 GAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAA:1 + chrX 23182914 3' - Idefix 70 2 68.49 AAATAACTGAATGGCGCGCATTTGAAAAAATGGAAGGGATGCTGCCGCACCCATTCGTAAAATTTACAAATGTCGAAAAGAAACAAAAAAAAAATGGCTGAAATGGCGCTATGGGTTA:1 + chrX 22819367 3' - mariner2 32 1 75.42 AACTATTATAATTCTCCCTAACATTTTTGGAGTTGGTTTAAAATACCTCAAACTTAAACACACCTTAACCATGTGCAACACCCCGTAGAAACAACAAATTGTTGTCCAAAAATGTCCTGAAAACCAGCTGCTAGTTTGGTGGTGAC:1 - chr2L 4351485 3' + jockey 4860 1 58.22 CAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAAATATATTAAAATAATAAATTAAAATGAAAATAAATAAAAGTGAATTTAGTATTTCCATTTTA:1 + chr2L 16707938 3' + Stalker2 343 2 62.33 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATCTCTGTGTGGTATGTACAGTCAGCGACACAATCGTATGCACTTTCGGGGCAGGGAGT:1 + chr3L 21910472 3' - pogo 57 1 60.14 ATCCCCATGAACTCCTTACACGTAAGATAGTATAATCTCTGCACGGTACATTTGTATACACTATAATTAATAAGGTTTCACATAATGAAACATTCTCACACGTTTCATAAGATTTTTCCCATCGACATTACGAAACGTGTGAGAAA:1 + chr2L 3117012 3' + G5A 2696 1 61.64 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTCATTTATCAGGCCGAATTTGCCAAAGACTTTGGCGGAGAAATTCGGAAA:1 - chr2L 16852163 3' + P-element 2838 1 34.96 CCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTTCTTATTATAATTTTAAAAGGCCAGGGCTAGCGAACCCAATCTGTATAATCCTGGGGCTCTGGACATCAGCGGCTATCATTTCCCGACACTCA:1 - chr2L 12328872 3' - 1360 3113 1 49.32 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCTCTTGTCTCTTTTGTTGCGAGCCAACGACCCGGCATCGCATTGAGATTACTTATAAAAGGTTATTTAGC:1 + chrX 19107483 3' + roo 357 2 56.16 TGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGGATCCGGAGGTGTCTTCCCTGGTGGACTTGCGTTGGAGCGAAGTGAGGACACAAGATTTTGGCGAGTGCGATTTGTCTTCTTGAAGATCGTCAGGACC:1 - chr2L 22228318 3' - transib4 2400 1 68.94 TACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAGTTAATCACTAAAATATTTCAGAGAATTTGTTGTTTCG:1 + chr2L 8574439 3' - Transpac 81 2 73.97 AGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAAATGGGTGATCTTATTCATAAGTCACCTACATCCTTGCAATTACTGAAAAGAGCCCAAATGTATTTAAAAATA:1 - chr2L 16150578 3' - blood 161 2 58.90 AAAAAGGATAACATGAAAAGCTAACGGGATTTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTTC:1 - chr4 123973 3' - HB 150 1 62.76 CTCGACTGGACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGTAGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGTTTTTTCTGGGCCATATAAATATTTTTCCGTTTGTAAATT:1 + chr2L 17256499 3' - 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chr3R 3697528 3' - Doc 241 1 66.44 ACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAACCTATATACTCCCATCTACGTGCCACAATTA:1 + chr3R 11574393 3' - R1A1-element 5287 1 76.12 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATATTATATTTAACTTAGGATATGCAACTCAATGCCTACTTAAATTATTGTCTACGATTCTCAGAT:1 + chr3R 23161370 3' + 412 7490 2 56.85 ACTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTCAGCCTGTATATGTATGTGTATTTGCTTTGTACA:1 - chr3L 22339413 3' - hopper 83 1 70.55 TTCTGCATGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTTTGGGTGAGTGTGTGTGTTGATGTGCGTGTGAGTGTACCAGTTCCCAAAGCTCTGACGCCTGTGTCA:1 - chr2R 22520873 3' - Quasimodo 39 2 58.59 GCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTCAGCCTGTATATGTATGCGTATTTGCTTTGTAC:1 - chr3L 22339414 3' - hopper 65 1 68.50 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACTAACTAATATAATCAGCTTTGTTCCCGTTTTTAATAACCTAATTTTGGGACTTCGA:1 - 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jockey 4719 1 51.37 CACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAGGAACTCTCAAAATAGAATTTGCTTGCTAGTGTAAGTACAAACATGTGCACTGGTCGTTTGATGTCAATAATAAAAG:1 + chr3L 15200609 3' - 1360 3340 1 73.29 GGCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGGTGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCATTCCAGACGACTAGGTGGATTAATTAATATTTTATTCATGGTAGAAAACCCATTTTCCAGGCCACAT:1 - chr3L 10529205 3' - G6 1694 1 71.23 TTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACATATAATCAGTGGCCTAGAGTGGGTAATTAAGGAAAACTAGTTTCCACAGATGAGGCATAATCTGAATGCGATGCCTGACT:1 + chr3R 15126594 3' - FB 26 1 63.08 TCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTAGCCCTGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAAGCTCGAATGTTGAGATTCAGCATTCATGGCCTCCACCATTTCTGTAAAGAGGACATAACAAATGAAAGGTGTGGTCTTT:1 - chr3R 18247395 3' + INE-1 94 1 61.64 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATTAAAAACAGTTAATACTATGTACATATTTAATTAACAAC:1 + chr3L 7870262 3' - roo 8745 2 79.45 GAATATAAATTCATTTCTTAGAGTTGGCACCCAAACGAAGTTATAAGCAAGTTTCATAATTTTCCAACCCTTAAATGCCAGAAAATGCAACTTTATATAACCAAGCTATGGATGATCTCAGTCAGTAACGATTTAACCAGCA:1 - chr2L 13679403 3' + 1360 3158 1 90.14 TTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAAACAACAAGGCAACAACCACGAGGACAACAC:1 - chr3R 31829461 3' - F-element 4661 1 79.45 TTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATGCTGCCAAAGTAGTAGCGTCGCCTTGTGTCCTGCGCAACCGAACCTCG:1 + chr3R 11642801 3' + copia 175 2 66.43 GGGGTGGTGAATTGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTCTTTCATGATTTGTTGCGCATCATTTGGTTTCCAAAACATTGTTCCGGCTCATTGTTGCCAGCCATTTGCATCCCAGGATCATTGTTGCTAGCCATCCAAACATTTG:1 - chr2R 2864922 3' - ZAM 7974 2 66.44 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGTTTTCAACCAACTATATTAATGTATTAAGAACGGAAATGTTAAGAGAAAGTAACTGCTGATAGCATTTAACCCATATAACTCCGAATCAACTGCACCCA:1 - chr2L 4929759 3' - blood 11 2 76.30 AACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTTGGCTCAACAGTATATGCACTAAATAAAGTGCGAAAGC:1 - chr2R 1376085 3' + Bari1 1626 1 71.92 AAAACAGTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGACAGTTTTGCCCGACTTGTGGGCGTTAGAGTGGGAGTG:1 - chr3L 22511715 3' - INE-1 258 1 80.00 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCACAGACGCCATGCGTTGCATAGCCGGCATTCCCCATGTTCACGTATCTGATAGATACTTTTTGGCATGCCCATTGCTTCATATACCCCCTACCCACAACCCTTCGACAA:1 - chr3L 7791842 3' + Transpac 303 2 77.14 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGAATGGCCAGCGCAAACTAAATAATACTGCATTGTTCACGTTT:1 - chrX 18239117 3' - jockey 86 1 70.55 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGGGAGAACTAAATAAAGCGATCCATCGAAAGCTTTTGGAGAGAAGATATATGCTTAGTCAGTTTCGGTTGCGATATGGAATGAGAGAGTCTT:1 + chr3L 2192384 3' - jockey 4706 1 60.27 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAACAAAAACAGAGATACACAGACACAGGAAGACTTCGGCCCAACAAGAACCTAGAAATGTCAATAAGCGAACACGAGG:1 - chr3R 16276306 3' - pogo 40 1 58.22 CTAATAAATATATGGAAAATCCCCTAAAATGATAATTTATACACGTATATAAAGCGTAGAAAAAGTGCGAAGTGCTAGGAGGAAGCAACATTTTACTACCGTACTTCGCTATACCCATGCAGCATTACTCATACGCAC:1 - chr3R 27809979 3' + Burdock 239 2 73.19 ATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCGTTTATATCTATGTATGCCGTAAGTTTTAGCAGTTATC:1 - 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chr3R 4679405 3' - hopper 16 1 73.29 AGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGTTCCCCTAACAGCCAACTACAGTGGAGATTCGGCAACTTGAACGC:1 - chrX 17552246 3' + 17.6 36 2 69.18 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATGATTTAAATTCTATTACTTTTTATAATATTGCTGCTTTTAAGATTACTATATGATCATCGATATTGCTTTAAAAATATTGTATAATTTTTTTATTTTTGTGTGTT:1 + chr3L 5630491 3' - I-element 22 1 69.86 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACTTGTGATAACGCAACATTTGCTTGTTCTATCTATGTATGTATTTTGTATATCTATTA:1 + chr2L 6177626 3' - pogo 61 1 60.96 TACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGTCACTGGTTGGTCGATC:1 + chr3R 15790116 3' - flea 4739 1 64.38 GTATGAACGTTGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTATATGGTAAAAAATGAAATATATATATTCTAACAATTGTTGAGAAGTATGTATGAGGCCTTTCCGAACCTGTTTCCTAAAGAATGTTTTAACACCCTTACATATTACGTAT:1 - chrX 22905164 3' + INE-1 137 1 71.23 CGCTTTTACCCATGCGGCAACTAAAGTTGATGTGCTAAAGCATTTCGTTGCGGTTTTGTATCTTAATAGTGCTAGGGAGTACGATGCTGTCGGTATTGGTTTCTCTTTTAGCTTTTTAGTGCAAAAGGCGTGATCAAGAATACAC:1 + chr3R 28600238 3' - 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Ivk 59 1 54.79 GCTAAGCCACTCCCCTGCACGAGATTTGTGGGGAGTATTTATACTCCTCACATTTTTTGTTAGAGAAAATTCTACGTCTTCACGTAAATATATTCATAAATTGATTAAGATCGTC:1 - chr3R 29605005 3' - gypsy8 29 2 65.22 GAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAATACGAATGTGCGCAATTGTCATGGCCAATTCTGAGATGCAGTAGAACATTGATAACATGCACAATGGTGCTAAAAACGAAAAAAAAAGTGAAAGATTTAGTGGACATTTGTGGTGCAACCCA:1 + chrX 19503951 3' - FB 83 1 76.71 TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGTATCATAGATATGTAGCATATCATGGTATATGTAGCATATACTT:1 + chr2R 17169284 3' - hobo 74 1 70.83 ATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTTTTGGTGCACATATTTGAAATTGTAATTAAACCCACCTTAATCAAG:1 + chrX 9933243 3' + Stalker 7057 4 68.49 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCATAAAACATTTGATGGTATTAACAATGTACTCCTAGACTATATGATGGTGTAAAGTGTAAAAAGTCACGATTTTCTTCG:1 - chr2L 7652170 3' - roo 8704 2 51.37 GCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGATCTATAAATGATGCTGCTCCGTATGCAAGCATAACGTATCGAAATCTCATTGTAGGAGGTACAATAAGCTGAAAAAAGGA:1 - 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chr2L 2120398 3' - I-element 4991 1 76.03 GACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGATCGGAAACATGCTATTGATCCCAAATTCTATCAACTTACACTAAAGGACACGTAGAAGGTGGCTCCTGCCTTAACG:1 - chr3L 6095451 3' - transib2 42 1 56.85 TAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCATTTTCGAAGTTGAAAATAAACAAGAGTAGGGTCTTTAAAATATCAAAATTGTAAGCAAAGTCTTTCTTTACGCTTTACACTCATTAGCACGCACTT:1 + chr2L 9592163 3' - X-element 4711 1 59.09 GATTCCTAAGTCTTTATGGATATTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGGATTATCAATTTGTCTTAATACTTTTGATTGGTAGCGTTGTAGAATCTTATTACGTTGTTGTACAATGCAGCCGCCGCACGCAACGCTAGCATTTTTGT:1 + chr3L 13134012 3' - G4 3551 1 62.33 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATATACACGCACAGGAATTTACAACAATGGCGGCAGTTATCGAGAAATGGCAGCAGCGACTGCATTT:1 + chrX 12273168 3' - jockey 4685 1 63.81 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTCAAACTGTGTTTGTCGTTTTATCACCACTTTTGACGGCCTGTGACTACGAGTAATCATGGCAGGCAAATATCAATCATGTTC:1 - chr3L 11285999 3' + S-element 1678 2 60.27 ACACAAGCACTCCACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACTCGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTGGCTCAACTCCCTGAATTTGATGTGATAGAACATAGTACTAGA:1 + chr3R 28488885 3' - 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chr2R 23409032 3' - opus 7055 4 54.86 GTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTTATTTTATATTTCTTAAGCTTACATAAGTTTTTTCTATCTAACACTTTAGCATGGGAAAATAACATTTAT:1 + chr2R 5023363 3' - rover 45 2 55.48 ACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGCACTATTTATAGAAAATGCTTCACACTTTCGAT:1 - chr3L 16053071 3' - 297 6568 1 77.40 CTGCGACGCTGCCGACGCCCACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGGTCCCACGATTGACCCTGTCTCCAAGCTCTGTATTAGAGATTAATAGGTTTTGCGATGCCAGCATTGAATCTCATGGAGCCTGTG:1 - chr3L 23235976 3' + HMS-Beagle2 189 2 65.38 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCTTGTTTAACGCAGCTATAAATTATGATGCCAAAGTTTTTGGCCACTCAACGAGCGGGAAAGCACGGGCGACTTTTCACC:1 + chr2L 20515326 3' - I-element 20 1 71.13 CTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCAATTCTAATTCGCCCGGCCAAAGCGAACTCTTGATTGAAGGTCAGCGCAGGAGAAG:1 - chr3R 16240897 3' + Tirant 8501 2 68.18 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGAAAATGTAAAGGAATTCAATTTGAAATGCAAACAATGCAGCTCACACACACGCATACTAACGCATACGAATGGGAAGTGCAGTAAAATGGCAATGGAA:1 + chrX 19788923 3' - hobo 23 1 69.86 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAAGTGTTTTGCTGAAGGCAGCTTGTCTGACAGCTTCCCCTGCCACCCACCACACACCACCCACAGCCTAACCATTTCC:1 - chr3L 7837149 3' - jockey 4808 1 50.68 GAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTAAATGGAAGTTCAGCTTTCAGCTTGCCATT:1 + chr2R 19852217 3' + Transpac 5142 2 79.31 GATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGGGGGGCGGTGGTGCGATGGTCAGCGG:1 - chr2L 3960211 3' - jockey 96 1 80.00 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAGATGGGATGCGATGGGACGGAATGGGTGAGTAGTGCTCGGAACACACGATTGGCACAGTTATTAAAAACGACATGTAGAA:1 + chr2R 9340245 3' + 412 7511 2 59.59 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCTCTCTTTTCTCTGACTAGCGAATCTCTATCATAAAATTATATACCCCTTTAAAAGATAAAAAGAAAGTAGCAAACTT:1 - chr3L 4651532 3' + roo 9037 1 61.64 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATCATTATAAAAGTGACCATTATTATAACGACAATTATTGTCGTTGTTGCAGAGTCGGTTAGGTAGAA:1 - 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chr2R 13761618 3' - jockey 4742 1 66.44 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCTCAAATTCCACTTCGCTTAGTAAGAAGTATGAGAATGCTTTGCGTGCGGTTGCTTTTC:1 - chr2L 14969088 3' - 412 7114 2 60.00 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATT:1 - chr2L 17839382 3' - blood 7080 2 63.01 AACTCTGCTATTGATCCTGATCTAGAATATATGTACTTTATATGTTCAGAAAAGCTTCCTTCTGCCTATTACATGCTTTTCAACGAATCTAGCAGAAATCATATGACTATATTATTTTAGTATGCAGAAAAGCTTTCGCATTACTG:1 - chr3R 18084361 3' - INE-1 92 1 52.74 ACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCAAAATTTATGTGACCCCAAGTAAAAGTCGGATATGAAGGCGGAAAAGTGAAAAACCAACGGCAGCTGGTCAATTACAAAAGAATTACCCGCCGCAAG:1 - chr2R 21876779 3' + copia 4917 2 77.04 AGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCGTGAATGAATGGGTGAGCAAGAGAGCGGTTTCAATTCGATTCGCTTCAATTCTTCCGATCGCGCTTACAGACGTGAGTG:1 - chr2L 6870432 3' + 1360 430 1 70.59 CTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAGTTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGA:1 + chr3R 24454838 3' - F-element 315 1 78.95 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATATATGTAAGTTCCACAGAATGGAAAGGGCATCCCTT:1 - chr2L 21691837 3' - 297 6622 2 71.30 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAACGCTTGTAAAATATTACAATCGTGCGATCAAAGTAAAGGAGTGCTTAAATATAACAATATTCT:1 - chr3R 11944823 3' - roo 8721 2 58.90 ACAAGAGAGAATGCTATGGTCGGAGAACTCGACCATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTATAATTTTACTAGTCTTTCTATTTCGGTGCTCTGCGCTCTGCGCTCTGCGTTCTAAGGTCCACGAAAATGAAAATGATTTTT:1 - chr3R 6837138 3' - INE-1 579 1 45.65 CGATATAAATATTTTAATATCTTTTAAACCAAAGCGTTTTTTTTTTCATTCTGCAAAATTAGTTGTATTCAGTGTGGCTAGTATTGAATTTAAGCACTCTTGTGTCTGCGCAAAAACTATAATACTCCCCAT:1 - chrX 2085572 3' - Transib-N1_DM 294 1 60.61 GTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATGTACATACAATATTTCAAGACCTCAATAATCTAGCTTTAACATTGGTCC:1 + chr2L 21976779 3' - Idefix 63 2 68.49 TTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTATTTAACATTTAACATTAGCATTTAAAAATG:1 + chrX 3370112 3' + S-element 1631 2 78.77 AAAAACTCGACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGTTGAAACCTTCAAAAATGTTTCACTGTGTCATTCATTATGGAATTCCAACTAAAG:1 - chr2R 11164363 3' + roo 389 2 63.01 ATTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAACACACGGGTGCCTAGAAACCCAGTGTTTAGCGGGTGCACTTAGAGTGCCAGTGGCTTGCTGCAGTTCTCTGCACTCGACATGAAAAACATGAGCATG:1 - chr3R 20098337 3' + hobo 2863 1 67.48 ACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCATATTTTATGTTATTATTTTACAAATAGCA:1 - chr3R 10433318 3' + Tirant 54 2 80.00 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTA:1 - chr3L 12874888 3' - jockey 89 1 72.60 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTGCAGAAAGCGACCTTTGGAATGACGCAAATCAAATTGGGCAAACTGAAAAAATTTCACTTACTTTGCGATTATGTTGCTCGT:3 - chr2L 14239115 3' - 412 38 2 59.59 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAGTCTTCAGATACATTTAGTATCTTGAAGCTTCAAGAAGTTTTCTAAGATGATTAACCATAGAGGTCATTGATCCTTACCAAAACGATATCCTTAAAAAGGTCATTAACTTT:1 - chr3R 6135922 3' + mdg1 412 2 77.24 AACAGCAATAATAATAACAATAACAATAACATACTCAATCACAACAATCTCAATATCATTATCAATAACCATGCCTCCCTCAACAACAACAACAACAACTTGAACAGAGTTGAGTCGCCTTCACCGTCATCGCTAGGGACACCGCA:1 - chr2L 35174 3' + mdg1 7057 4 67.81 CGAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCACACCGCACACAGTCCATTGAAATTCGAAAAGACAAACGCAAGAATCGT:1 - chrX 5370185 3' + accord 182 2 75.00 CACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGTGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGATACTTGAGAGCTTTTATTACAGCAGGTATGCTTGATATGGGCTATACGAG:1 + chr3L 15536576 3' - 1360 163 1 65.75 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAACAGAATGCAGTTTTGGGCATCATTTGCTGGCTACCAATTTAAAATGTCGAAACTGACAACGATGATTTCAAGGGAAGTGTT:1 + chr3L 20252034 3' + copia 5085 2 58.22 TCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTCTCCAAGTGATGCTGCTCACCGCATTCCACCCACAAAAGTATGCAACGAATGGCTTGGTTCAGATGATTAATTCGTGATTACTCATCCGGCTGGCAACGGCAAGATCCGGAATCCA:1 + chr2L 3323259 3' - jockey 4681 1 78.08 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATT:1 - chr2R 15070072 3' + 412 433 2 58.90 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGC:1 - chr2R 22746047 3' - jockey 4806 1 52.05 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGGCTTGGTGAGCACATAGCAAATGGAAATATTTTGTTGATTAGTAATGGGACAAAGCAAAATACATTTGGAGGAATTTGTAA:1 + chr2R 11256279 3' + roo 9032 1 56.85 GTTCATACGGACAGACGGAAATGGCTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3L 5685501 3' - INE-1 123 1 82.26 GATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACAAAACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATGTATGGAGACACGTCTAAATTTAGCGCGGGTCTCGAGATATGAGTAT:1 + chr3R 30304874 3' + Stalker4 182 4 71.23 CGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTCTCCCCCCCCCTTGCGTAGGCAAAGGTATCCCTGGCCGGCTAGACATCAGGATCGTCCTCTTCATTTCATCAAGCAATATCTTAAAACAACGAAAAATA:1 - chr3R 17586862 3' - Max-element 24 2 77.40 CTGCACCCAACTGCCAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGTAATACCATATAAGCCAAGCTATTGAGTACATTCCATTTCATAATAACAACTAATACATAATTCATTTCCACTCAATTGTGC:1 + chr2L 4929921 3' + blood 338 2 57.53 ACTTTGTGATTCTGTTAAAAATACACCACGTATCCAAATATCTACAAATAAAATGGAACATAACGGTCAAGGTATGTTTCATCTTCAAGGGAAAAATGTCAGGTTGGCAACTCATTTGGAGCGACAAATTAATGAGTTCACTTTGG:1 - chr3R 19358605 3' + transib3 219 1 54.79 TGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTCGGCGGTTGCTGGCTGTTTGTTTCGGGCAATTT:1 + chr3R 21341396 3' + hopper 1404 2 55.56 GGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCAACCTGGAGAAGAAGAACTTAATGGAAGAGGGATGGAATTGGAATGAGACGCGAAAGAAATCAAAACGGCCCATTTAAGCAGCACA:1 - chrX 2295408 3' + Transpac 474 1 56.16 ACGTATTCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCCAGGCCCATGACCAAAGCTCAATCGATCTCCAATCTGGTTTCAATAGTTCGTCGACCCCATTGGATCGGTTAATCTCCCAAAAAACTAACCAGCATTTCTT:1 + chr3R 9998270 3' + 1360 188 1 79.29 TCTGTATTTTCTGACACTTTTCATTATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAACGAAATTAGTAACAGATCTAATGGATATTTTAAAAATTAAGTGTTGATCGCACAGCTGTGATACACTTTAACT:1 - chr3L 24050876 3' - Tc1 1588 1 72.60 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCGAGGGACACAAACACACTCGCACTTAATCTCACACTAAGCACGCACACAATGACCGGCTTTGAGCAGGGCTAATTGTATTGGT:2 - chr3R 11095760 3' + hopper 1380 1 60.27 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCATATGGGTTATGTATCTTCTTTGCACTTTTATCTTGTGGCGCTAATCCAAATTTGTAATTTATT:1 + chr3L 16059353 3' - 297 38 2 56.92 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGTTAGCGCTTGATTATAAAAATCGTTAATCTTTGTATATTCTCCAA:1 - chr2R 11256173 3' - roo 72 2 71.63 GATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTG:1 - chr2R 13367446 3' - jockey 4621 1 58.90 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCAGTCCCCAATTTTACAAGACTCGAGTCCACACAAGACTCGAATT:1 + chr3L 21013936 3' + roo 8996 2 70.55 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTCAGTGCTTCCACAATAACATAAATTCTTGAACTTGTTCTTGAAATCCCTCGGCATAAACCCCACCAACACTCGCACTCA:1 + chr3L 12223255 3' + Transpac 270 2 58.22 ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATACATATGTACATATTTCTTGAGTCGCTTGGCTTGTTTGTGCAATTTTGGCTTGATGTGGGCATATTTTTCTCGATGCGTGTCTTGTGCGAATTTTACTTTATTTTT:1 + chr2R 11146166 3' - Quasimodo 11 2 77.14 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTGTTTACTCTTCAAATGGCGAAACAGTGCAGATAGTATGAAAGTCCAACTTTTCTACCCACTTTTGTTCACAGTGCATCCATATTTTGTGGCGCA:2 + chr3L 1358573 3' - 412 7078 2 62.76 TCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACAGCACGCGGCTGTCACGTCAAGTGGTGGCCCACCTGGAGGGGATCCG:1 + chr3L 7460701 3' + 412 7522 2 52.63 GAGCATACTTGTGCACACATACAGTTTTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTTAAACAAATGGATACGTGGATAAGCCACATTACCACATAGCTGTGCTCAAAGAAAC:1 + chr2R 8819920 3' - 1360 176 1 61.64 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGACACGAAAAACGGAAAGCGAATGTATCTGAAAGATACGTTTAGTCTATTT:1 - chr2L 17260724 3' - P-element 60 1 40.88 GCAAAAATTCCTCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCTATCCAGCCAAGTATTAGGCCCTAATTAAAAGCCAAGAAGTGATGCCCAAATCAAAGATTAAATC:1 - chr2L 9041990 3' + HB 1252 1 75.34 GATAAAGTCTATTATAGTCAGAATATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAAAAGAGAGATCGAAAGTCGAGTGTGTGGGGGCGATTTTAATAAACTATATAGTTTAGCCGGCTTA:1 - chr2L 8255158 3' - Cr1a 4202 1 60.27 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGAGTTAATATGAAATGAATACGGTTTCCTTACTATTCGTATACCTTTTACTTCCTTTAATTTACTTTTAAA:1 + chrX 8977540 3' + I-element 5305 1 51.37 ATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCCTTCGCAACTACCGATGATG:1 + chr3R 5773228 3' + Stalker 7184 4 66.44 AATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCACATTTATTTTTTAGCTTGTTAACATAAGTTATAAATGACAAGCCACTTGGCTTACTT:1 - chrX 14590660 3' - GATE 441 1 60.96 AATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAACCCAAATTGACGATAAAATTATTACAAATTTATGCAAATATTTGCCTGGCAGGGGAGGGCTAAAGTAGCTGCAATAGAACACCCTGGCCTCAG:1 + chr3L 14170276 3' + mdg1 7360 2 75.94 ATTCATTAATGTCTGTAGCGAAAAGGTATCTGTACAAGCAACACCACCAAACTCCACGCCAACGAGCTAGAACCGGATTCCTTCCATCAATTTATTTCGTTTCACGTTACAATGCCGCAGCGCACGTCACATAATTGCCATTCATG:1 - chr2R 18688881 3' + Gypsy12A_LTR 2136 1 68.49 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGTGACCATTCATTTTGATTGTGGTCGTGCTGTCGACAGCCCCC:1 + chr2R 23671839 3' + hobo 2922 1 54.76 GTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGGTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGGCTTCTTCAGTCCGCAGGCATTGCGTATGCGTAATGCGTACGTCTGTGTCTAATTGAAAA:1 + chr3R 26344085 3' - jockey 104 1 56.06 ATTCGCTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTGTATGTATGTAGATAGATGTGTGTGCCTGTGCGTATCCATCCGAGTGGGGCCGAATGTATCTGAGTATCTGAGTATCC:2 - chr2R 11146006 3' + Quasimodo 7320 2 54.11 GTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTCCGAAATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACAAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTATTACATATTTAATTTGCCTCTGTCTGCGTCTCTGGGGGCCAGCTGTTGCTTTT:1 + chr3R 17357709 3' - transib2 443 1 63.45 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCATGAGATAAAAGCATTAAAAACAGTTTGCATTAGTGCCAATTTCGCAGAGTGTGTTGCTAATTTGATTTCATT:1 - chr3L 20251898 3' - copia 47 2 53.42 GCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATTATCATTTTCGGGCATGAATTCGACTTCAGCTAATACCTTCCAAAACGCTTTATTTGCCAATCTAATTGGTATCGATTTGCATTTTCGTTC:1 + chr3L 7801336 3' - Transpac 5055 2 59.31 GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATATATATATATTCGTCATTAATTATAGCATGTTTGTATTT:1 + chr3R 19139463 3' - pogo 73 1 69.86 AAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATATATCTTTTTATAAAAATTTTAACGGTAACAATATATTGATCAACTTTAAAAGCTTTTCAG:1 - chr2L 7822216 3' - Juan 43 1 44.52 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGACGAACTGATCTGACGCGCCAATGTGACCAATTACATTAACAATAAAAACGCATACATTAAAATACTAAA:1 - chr3R 1869764 3' + 1360 3340 1 53.10 ATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAAACTCTGTACATTCCACGGACAAATACTTTTATTTGCCCAGAT:1 + chr3R 21156896 3' + rover 116 2 76.03 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTT:1 - chr2R 13761637 3' - jockey 4756 1 78.72 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGCTATTTATACTCTTCTGTCGTCTGGG:1 - chr3R 11870045 3' - pogo 15 1 69.35 GGCGATTTTAACAAACGAATATTAAAAAACTTTAAAATTATAATAGTCACGACGTGAATTTTTTTTTTAAATTTTATTTCATCATTATGATACGAAATCGGCCATAGTGAGCAAAACAGTCTGTTTTGTAATTCATGTTTCCTTC:1 + chr3R 1446560 3' + 1360 2999 1 71.72 AAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGATGTGTAGACTTTAACTGGGCACAATAACAAATATTGAAACAAGCGCAACACCACGTATACGTAA:1 + chrX 18751588 3' - roo 397 1 56.16 CAAGTCGCTACGTGATCGGCTGACTGGAGTTGTGCAGGTATTGGCACCTCATCATCAAATGGTAAACAATGTTTGCTATTTTATACACTTGAGTGTTGAATAATAATATCTTAATGCGAAAGTTATGTAATATTTATGGTTTTAGG:1 + chr3L 24164867 3' + R1-2 2953 1 69.86 AGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGTCAGATTTAAACTCGTCGCATGTTTTTCTTTTTATTGAGCACCTAAGTGACTTTAGGCGTCTT:1 - chrX 18143514 3' + jockey 349 1 55.00 GTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGATTCTGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAATCTGTTCCTGATGGAAAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTAT:1 - chr3R 26435576 3' - baggins 5347 1 69.18 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTAATACTTAAAAAGGCTGAAGAATGACTAAAACTAAAGACTTTAGTACTCACCATATGAAGATGCTCTTGTAGGCATTT:1 + chr3L 19999293 3' + 1360 3352 1 60.96 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACAGTAGCTTATGACCAGGTTAAGGTAATGTCCATTGGATACTGT:1 + chr2L 6388137 3' - jockey 87 1 69.86 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGTGTGGATTTGGGACTCGATTTGGGTGGCAAAATATTCACCGATTCACAGCTCTAAAGTGCATGGCGAACCGTTAAAAAT:1 + chr3L 19031346 3' - roo 42 2 55.48 AAAGTTGCACAGCAACATTGTCCGCAAGCAACCCGACCAGCCAAAAACTTGAGTAACCAAGAGCTAGAGGAGACTTCTCCGACACAATAAAGACCACTCTGGTTTTAAACTCGACAGAGCTCAGTATGCCCCCTTTGGGAATACC:1 + chr2R 5071098 3' + Tirant 8239 2 70.34 TGATGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGACACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGATGACTGGGATTTGTGTGTCCGTGGCGG:1 + chr3L 7914522 3' + invader4 2686 1 71.28 ACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTTGAAATGATTAATGTGCTAAAAGAATATTATG:1 + chr3R 17521190 3' + roo 8934 2 78.08 AAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTA:1 - chrX 21087601 3' - mdg3 5315 2 67.12 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTACGCATATCGGCACACATACATAAATACACACTGCACTGA:1 - chr3R 1267698 3' - P-element 80 1 33.56 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGGTCAGGGTCCCAGGCCGGGGTCCCATTGTCTTGCGATTT:1 - chr3L 14302171 3' + 297 6901 2 72.60 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTCGGG:1 + chr2L 12291936 3' - Tirant 8141 2 55.75 ACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGTATGTTGAGATTTGCAATAGTTAACAACATAAATATTCTGCCTCTGATCAAAAATAAAAAAAAAATGTTGAGTCTTGGGATATCAAGGAATCAAAATATCTATATATGAAAATAT:1 - chr4 1123503 3' + INE-1 143 1 70.55 TGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCGTGAATCAGGTGTGTGATATTCGAAGTGGAAAGTATGCCT:1 - chr2R 14135285 3' + copia 173 2 72.60 TTTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTA:1 + chr2L 23034067 3' + FB 371 1 46.58 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCGCTCTATTATTCTTCTCTTGGTACTC:2 - chr2R 1373089 3' + pogo 2048 1 55.48 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCACACACACACTTGCGACTTGCTCGAATGCCGATGATTGCTCTCCCCTTCCTGCGTGTGGGTGTGTGTGTTGTTCTGGCGTTTGCAATCAACCTTCC:1 - chr2R 8665990 3' + P-element 2864 1 64.58 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAGACGAAACCGTTCGTGTC:1 + chr2L 17260773 3' + P-element 2823 1 21.30 AAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATATTCCGCTTTGTTTCGTCCTTTTCTGCCTGCAAGGGCCTCACGAAAAATGTAGGCATCGTTTTAGGCTATAAT:1 + chr3R 6805028 3' - Stalker 311 4 50.68 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAATCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGCCGTAAAACCCCGGGCATAAACTGCGGTCAACTTGACCA:1 - chr2L 19476982 3' + hopper 1354 1 64.84 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATCAGTGCCCAGTTTCCCGGGAGAGCCCCTGCCCGCTCGCATTTCGCTTAACATTAT:1 + chr2R 25106128 3' + roo 9017 2 57.04 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTCATTCTTGGTTACATCTAGTTTTAACCCACTGTGCTGGGCATTAAATAAATAAAGGCCAACTTGATGCCGTCCTAACCAAATGTTATTCAGACG:1 + chr3R 18528410 3' - roo 12 2 71.85 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGAAAGACGGCAGCTTAGGACCACCCAAAGAGGTCACTCCTCATCGGTGGCCATTATGACATCAAAGCGAATGTTCGAGGGCGAAGAGATCG:1 - chr2R 9340088 3' - 412 31 2 63.01 AGTATACATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGTCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAGTCAGTCTGTCTCCCAAGTGCCTTAGACTGTGGCTTATTTTCTGGCTTCTGCGAGCTTTTCCAATTTCCCTGCAATTTT:1 + chr3L 22140097 3' - FB 239 1 61.64 CTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAAACAGGCTAACAAACAACATCAACAACAACGCCGGCGTATTCATGATGCACTCATAAAAACCGGGGGTAAAGTACGGCGCCG:1 - chrX 10110983 3' - mdg3 20 2 68.25 GAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAAAATAATTATAAAAAATTATACGATCGTACT:1 + chrX 9037666 3' + 1360 3307 1 77.17 TGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAAATTTATGTTTATTTTTTAAACTT:1 - chr2R 13761609 3' - jockey 4733 1 60.27 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACATACCTACGAGTGTGTACCCATGGTGTTACTAATAAATTACGCCAGAGTTCTGTTCTGT:1 + chr3R 19436088 3' + roo 349 2 58.62 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATCTACTTTTGCCATACAGAAGCCAAAAACGAAAGCCTAGTACGGCAAATAATAG:1 - chr3L 12874875 3' - jockey 76 1 63.70 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCGAT:1 - chrX 388228 3' - 1360 53 1 54.86 GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAATATTCGTGCAGATGAAAACAAAAAATAAAGCCTATTCATCAATTATTTCAGTAACGGAGA:1 + chr3R 19446748 3' - F-element 66 1 57.55 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAAACCCTGTTGGAATGCTGTAACGTGCTGCACATATTTCGT:1 - chr3L 19999190 3' - 1360 69 1 69.40 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCATTATCTGTCTTGGTTCAGTGTGTAGGTTTATTTATTTTGCCGATAGCTTCTTCAATATTGATAAACATGGGCCAAACAACAGTTACAGTTTAAGTATAATACTCTTAATCCTC:1 - chr2L 10514221 3' + 1360 3379 2 73.29 GCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATAATATGTATGTTTATAGTATATAGTACCTTACCGCTTGTATGGAAAC:1 + chrX 8219456 3' - opus 182 4 76.71 AACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTCGTATGAGTAATTGGAATGAG:1 + chr2L 18689255 3' + Gypsy6A_LTR 263 1 67.86 CGGCACTCTTATAGAACTCACAATGTTCGTTAACCACCCAAAGCTGTGACAAAGAAACGAAAGTGCAAAGTGAAGCATTTTTTCCGACCAACAACACAACAATTAAAAGGAACTCAAGTGTATAACCCAAGTGTAAGTTCAACGCA:1 - chr2L 15895510 3' + gypsy4 291 1 69.86 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTGAAAGAGAGTGTTTGCTTGGTGAGAGCGGCAAGCGTATAAAAGCAGCGTCGCCGGC:2 - chr2R 17097438 3' + P-element 2880 2 75.00 AAAATATTATCCGAAAGGGTTGACATATTGCATTAAATTTGTCTGTGCAACGAAACATGCACTTTCAACTTTTCTTTCATTTTGGAACATAAACAAATCACTTTGCAGTTCAGCAATCAAAACAACTTTATTCTTATCATTTTTTA:1 - chr3L 4864583 3' + Dm88 4318 1 79.45 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCACCGATACCTTACCCCCTCTCAAGCGCCTCAGTAACCCACCATGTCCGAGCGATCCCCTTCGAAAAGTTGCACTTGCTTCT:1 - chr3R 14275782 3' + P-element 2865 1 63.31 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGAC:1 - chrX 388238 3' - 1360 65 1 62.33 AGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGCACATATGATGCATGCCATATGCCATTACGTTTGGCGTGGTTTTGCGCTGTGACA:1 - chr3R 12520744 3' - Burdock 6204 2 63.70 CCTTGAAATGAATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTCTTAGACCATATATAGTATATACATACATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCACTCTATTCGAAAGAATCTAGGGTACATAGAAAAACAAGTTGAAGAA:1 - chr3L 14698618 3' + INE-1 19 1 66.44 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTTTTTGTTTACTACATTTAAAAATCTTTTTTAAATAGATTAATAACTTCCTGGAAAAGTATTCCCATATAATTTTTAATTACAAAACAA:1 - chr3L 18035479 3' - mdg3 34 2 50.68 GTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGCGTAAATAGTATGTTGGGCGCCAGTTAATAGATTTCAGTTTTCATGGATGTCGTGGCTATGTGGTGGTGGTATGGGCGGTATGGGGCGTG:1 + chr2L 1267557 3' - gypsy7 290 1 78.83 CCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAAGCAAGAAACAACGGTAAAAGTTAAAAAAAAAGGGACTGTACGTATTACTATGCCATTATGTAAGAA:1 + chr3L 17869041 3' + Bica 443 1 74.82 ATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCTGCATTGGGAGAAATTTTACATCGATGGAGGTCCTTTTAATGGC:2 - chr2R 12065595 3' - Stalker2 7323 2 67.81 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATATATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAG:1 + chr2L 16562155 3' + opus 7446 2 65.07 GCAAGCAATTACAAAGGAATCTCTCAATTTCCGGCTTTCCCTACGCTTTGTAGCAATTTGTCTGACTGAACAAGCGAGTCGCACCACTCTATGTGTGCAAATTAAAATTGTTACTACTTATTTATTTAAAAAAAATGGTTTTTATT:1 - chr2R 2054282 3' + Q-element 100 2 69.18 GACTGCGCACAGTTGCATAAAATTAAATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATACATAAAAAAATGGAACATATTTTATGGGAATTAAAACA:1 + chr2L 13332691 3' + micropia 374 2 76.03 AGGACGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGAAGTTATTTCGTATATACCTTATTGTTGTGCTCTTTGTTCGATTTTAGATACTGTCGTAATGTCTAGAAAGAGTCATAAATAACCTATCGGGA:1 + chr2R 1411055 3' + 1360 3082 1 67.12 ATCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATCGTCTTAAATCATTTTAGCTGAAGTTCACTGTAATCCCTTAGTTCGAAACTTTGC:1 - chr2L 19140346 3' + Max-element 253 2 54.76 TTTATAACATTTTTATTTTTTTTCTTTTGGTTCTACACACAACCAGAGGTATTTAAAATGCGCTTAATTTGCGGGCTGCATTTTATTTTCATTGCAATTTTTATTGGACTGCTCTGTGCGCGTTCATTT:1 - chr3L 10657600 3' - Tc3 1568 1 78.29 GTCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 5901734 3' - accord 187 2 76.60 ACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATGGCGACCGTGACTTGGTCTCGAGTCTGCCTCTGTTAAGTAAACACTCCGAGCTGCAATTTGTATTACTTATTATATGACC:1 - chr2L 1360989 3' + Stalker2 7608 2 68.49 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAATGTATTAGGAAATCGTTGCCACTTGCCCATGTTGTATTATGTTCATAAAATAGTGCTTATGAGTGATTTGTCGGATGTGTACGAG:1 - chr2R 13293323 3' + roo 400 1 74.17 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACACGCCAAACCGAGTATCAAACATGGAAATAGACGCAAAGGGGCGAATAAAAAATAATTTATTACACATTGACTGCCGAAAAAAAGCAGAAATAAAAAAAGGCCC:1 + chr3R 24564884 3' + opus 7489 2 74.66 TGGAACAGTTTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGAGAAGTTAAGAGTCATGACTTGGTTAGTCGTTTAGATTAACTTGTTTTAGTTAGTAAATTATTAATTATATAACCTAAGCCTCTACTTTTAAAATGTATGGTTCAGAGCATAT:1 + chr2L 16597508 3' + Cr1a 4033 1 56.85 GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTGTTGCTTCTTAAAAGGATCCAAAAATGTAATCGAAAGC:1 - chr2L 16605875 3' - F-element 93 1 76.03 GCGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTT:1 - chr2R 13761637 3' - jockey 4748 1 75.94 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCATGATATGCATAAATTATGTTTCGTCTATGCG:1 + chr3R 25751862 3' + roo 319 2 81.51 GAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTACCAAAATACCGTACTACTTGTTGAATAGACCTTGCCCTGGCTTATTATGCACGTGCATAAATTATCGAAACACGTAAATTTA:1 + chr3R 4678685 3' + Stalker3T 293 1 60.96 TCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCGACTGGATTAAATGCACTTGGTGCTTTAACTTCACTTCCGAGCGCATTTGATTTTAATTTTACGCCACTAAAAGTGCTTGGACCGTAAAT:1 - chr2R 7599118 3' - diver 31 2 63.01 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAATGTATTAGGAAATCGTTGCCACTTGCCCATGTTGTATTATGTTCATAAAATAGTGCTTATGAGTGATTTGT:1 - chr2R 13293337 3' + roo 360 2 51.72 ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAACAACCCGATCAATGGCGAGAAATCCCTAAGCCCCAAACAATTTACGCACATTTGCCAATTAATTATGGCACGAAATTTGATTTCGTTTTGCAATTAGA:1 - chrX 20975705 3' - copia 15 2 73.91 GAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTATCCAGGGGTTTGATCGGATCCACGGGTTGTTGGTCATCAGG:1 - chr3R 28919091 3' - 412 231 2 66.93 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTTTTCCACTGCCATTTGAGATGTTTGGAACAAATGCATTTTCACATTTCTGTG:1 + chr3R 17258171 3' - 412 7122 2 63.70 AATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAACCCGACGCACATTTTGCATTCGTTTCCGAATTGGCGCGTGTTGTACATTTTCCATTT:1 + chr3R 11725920 3' - pogo 2094 1 55.38 GCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTTTAGTTATCATATTTTTATGAATGTAAAGTCAAAGTGTCGAATTGTAAAGATCAGTCACCTTTTG:1 + chr3R 29300033 3' + 1360 452 1 69.06 GTTGTAAATATAAAAAAAAAAATACGCCAAATTGTTCAAAAATCAATAATATTGCTCTAATTTTTATTTAAAAGCAAAATTAAAAAATAATATGCCAGAGATTTATGGCCGCTCACAAGGTTGATTGCAGTTGGTAGGGTCAGTTA:1 - chr2R 16593035 3' + TART-C 11092 1 54.79 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATATTTGCCCAC:1 - chr3R 13437139 3' - hopper 45 1 48.63 GTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATTTTATTTTATATTTCTTAAGCTTACATAAGTTTTTTC:1 + chr2R 5023328 3' - rover 7031 2 73.97 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGACACGAAAAACGGAAAGCGAATGTATCTGAAAGATACGTTTAGTCTATTTCGACGCGAGCATTGTAACGGATCGCAG:1 - chr2L 17260697 3' - P-element 40 1 57.64 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATATAAACGTATTTAAATGCAAACATGATATATTAAATAGTTTACCGCCTACAGCCCTTTGAATGTTTATCTCATGAATTA:1 - chr3L 12433397 3' + roo 9032 1 56.55 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTTTATACATACATACGCGCATATGTTTGCCATTGGGTCTTCCCAATGTTTGCTGTCTGCATTTTCGGGTCTTCCAGCTATATACACTCACAC:1 + chr3R 16276465 3' + pogo 2099 1 77.69 TTTGTGCTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATTGAGAGTATGCTTATATAATTATATTGCTGTGCTGAGCGCGATGGGTC:1 - chr2R 21820728 3' - Doc 81 1 67.12 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATATATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAGCTCACAGCTACTAT:1 + chr2L 16562169 3' + opus 7463 2 54.55 AAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGGAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATCTATTCTTGACCAGGATCA:1 - chr3L 24757196 3' + Cr1a 4259 1 53.79 TATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGTATGCTTTTAAATTTTAAACAGTTTACCATT:1 + chrX 7384971 3' + I-element 5266 1 77.40 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAGAAAGAAATATCCCAGGAAT:2 + chr3L 13364409 3' - hobo 44 1 56.16 GATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAACCCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCGACTAGCTTTCGCCGACCCAGCCCCAAAAACAG:1 + chr3R 31467453 3' + Transpac 5036 2 75.86 GTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTTTTGAAACAACATTAATTTACATTTATTTACTGTATCAG:1 - chr3R 7470971 3' - Doc 118 1 73.29 GTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGAAAGAAAGAATCACTCACTTACCAATCCCTTAAGTTGAATTATAGCTTAATGTGCACGATGCAGCTTAAACTGTTCACTTTGCCGCGATAA:1 + chr3R 29866271 3' - invader3 5228 4 71.23 GGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAGCAACAATATACACACTTTTATAAAAAAAAAACGCGACAAAGTAATGGAAAACGAGAGGAGAAGTTAAGTGCGAAAAGCCGAATTCTCTGCACCCTATCAGTAATATATATGTGTAGGTTAAT:1 - chr2R 10221451 3' + transib2 2594 1 63.70 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCAATATTTCATTAATGAATAATTGCAATTATGACCGCCTTGCAGATTTATGCGAT:1 - chr3L 21910372 3' + pogo 2035 1 62.33 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACGATGCTTAGACTATGTGCACATGTGTATTAGTTTTAACCATGAAGGATAAT:1 + chr2L 19140429 3' - Max-element 53 2 59.06 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTA:1 + chr2R 11164526 3' - roo 40 2 58.22 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATAACCATATAAGATAGGAGCGAAAACCCGGACTGCATGTGCAGTATCGTATCTACTGGCGCACCGCACTGCATTTATTTATTTGG:1 + chrX 16117296 3' + opus 466 2 61.81 CATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTATCGTATTACTCACCCACTACAAATCTTTTAATGTGAGCTTTGGAATCGGGCTCCAGTGATACGACCTTTATAAATTTGCCA:1 - chr2L 22925431 3' + 17.6 7061 2 54.17 CTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCGAGGGACACAAACACACTCGCACTTAATCTCACACTAAGCACGCACACAATGACCGCCTTTGAGCAGGGCTAA:1 - chr3R 11095770 3' + hopper 1370 1 52.05 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGTACGCATATCGGCACACATACATAA:1 - chr3R 1267714 3' - P-element 95 1 22.76 ACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACATTTAATGAGCGTCAGCAACATTCCGCAAAACTTGTAAACGAAACGAAACTCATTTGTGGGGAATCTGTTCGGT:1 - chrX 5000346 3' - flea 4619 1 56.16 CGGCGTCTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTG:1 - chr2R 982350 3' + rooA 236 2 39.73 AATAGTTCCTGAGCTCTCGACGTTCATGCGGGCAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTTT:1 + chr3L 25482718 3' - INE-1 144 1 78.08 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAACACACACAAAAAAGGATAACCCTTCGACACTTCACCCACACCCGCCAGCCCATTTCGCTGGCTAGCACTAAAAAATGAAAGGGCATCGGCAAAAAA:1 + chr3R 20450547 3' + hobo 2937 1 77.05 AGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATGGTCATATAATAAGTAATACAAATTGCAGCTCGGAGTGTTTACTTGTTATTTAAAACTCTGGGAATAATTATGGTTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATTAAAAAAATA:1 + chr2L 1361079 3' - Stalker2 11 2 65.75 TTTATTTTTAATATTTTGGCGTAATATTAGGAGCAATATATTAAAAGCTATATACATTAATACGAAATAGTAGAAATACTATGCTCAAAATGATGCTAAATTTTAAAGAAAATTTAAAACAAGGACATCCGTAAAGCACTGCGCAG:1 + chrX 12583864 3' - P-element 2681 1 77.40 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTGCAAATGGCCCACACCCTCAAC:2 + chr3L 18183237 3' - Tirant 13 2 77.40 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTACCAAAAAAGGGTTTGTTCTAAATGAAAGACTGTTAAAATATATATATTTAGATTTGGTTCATGGCCTTTATTTATAAATGTCTTTCCTCATACCTATT:1 - chr3R 21674775 3' - roo 19 2 65.07 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTTTCTTTTGCCAATTACCGCACGCTTCGTGAGGCATGGTCGCCGCTTCGGGCACTCGCTGCGTATACGTAATTTTTATTTGACACTCTCACGCG:1 - chr3R 20450379 3' - hobo 12 1 73.48 CACAATCTTTAATTCACAATTTAATTGTTTATTAGGCATGGACTGGGCCCATAACCTGTTGTAATTTATAATTTATCCTTTGTTGCCAGCAAACTTGTCAAAAAGTCGGGCTAGATTTTTGCCTAATTCATTCAACAAACTGTCCG:1 + chr2R 16712078 3' - copia 311 1 52.05 CGGACTCGCTAGTCAGAGTGGTTACATTAAAGACGAAATCTGGCATTCAAAAGAGGTCAATCACAAAGCTTTGTCCACTTCCGATTTCAACATAATTATGATCAACATGATGGATGCTGGAATACGGGCAGCGACTGTGGCACC:1 + chr3R 28321713 3' + diver 5726 1 74.31 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTA:1 + chr2L 19310370 3' + Juan 4129 1 75.34 AACAAAAAAAAAGGAAAAAAAAACGAAAAAGAAAGTCTATTTTGGGATACCCATTCCCATTCCCAAGATATATACATATTTCAGCTGAAGGAGATTGCATTGGGCAAATCCGAATTTAATAAATTAAGTGCATAAAATCACACAAA:1 + chr2L 18505532 3' + gypsy7 5004 1 71.92 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGCACGTGCTAAATTTAACAGGCTAGTTTCGTGAATCCA:1 + chr2R 5754577 3' + P-element 2819 1 36.15 GCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTAT:1 + chr2L 12291902 3' - Tirant 8172 2 81.82 ATAGCTAACAAAGACTCGAAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGCTTGCTGGCTGCGCACGGGTTTCCCAATGCTGGTTCAGCACTTTGTGTTCTCAGCTCGCCCGGTTGCCGTGGCATCTTTTTGCCAGGACCCTTCCCCG:1 - chr2R 19974412 3' - Gypsy6A_LTR 125 1 60.71 GGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTAAGTTGGTATGGATACAAGAGCGTGGTATTTTATGCTCT:1 + chr3R 19169904 3' + opus 300 2 72.60 GGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTATACCATTTACCTTTGAACTTCTGTACCTGTTAAA:1 + chr3R 6413622 3' + 1360 3302 1 77.40 TGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCCAACTGCAATGAAATAAAAGCTCGACAGCCCC:1 + chr3L 15723925 3' - jockey 4747 1 76.69 GGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAATGGTCACTGCCCGGAGCTATAGAAATTAAGAATACTTTTCAAGCATTTTATTTCTCTAAAAT:1 + chrX 1063165 3' + gypsy4 52 2 66.17 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAATATTTATGTAGCATATTTTGCGGCTCCGTTATTTATATTTCTTTGGTCAAAATATCTCTTCTACTTTTATGCAGATTC:1 + chr2R 11264092 3' + jockey 4950 1 52.74 AAGAGAGAGAATGCTATAGTCGAGAGCTCCAACTTTTTGTTTTAAGTGTTTAAAGATTGGTGTGAACAATCCAAAAATTATAAATGTTTGTTTATAATACACATGTGTAATTTTCACTCCCACTTAATTATTATATTTATGTCTTT:1 + chr2R 21778561 3' - INE-1 579 1 71.92 ATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCGAAATATTATTTAGGTGAAGGCTTATTTTTTTCTGTGTACGGCCTGATTCTTGAGCTGCTT:1 + chr3L 16452600 3' - 1360 2983 1 68.49 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGAGAATTTGAGGCAGTTCGTAGAATAAGTCGTCTCTCTGATGGTGTTGTTGCATACAATA:1 - chr3R 4576956 3' + mdg1 358 2 60.27 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTTGACCACCCCAATACGTCACTATATATAATTCCTTTTCATATAGTTTTAATTGAAATATTGC:1 + chr2L 4876943 3' - 297 6624 2 74.29 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTTCATTTTTTAACACACTCTTTGGGAGCTGTTAACAAATTTATGTTT:1 - chr2R 13761622 3' - jockey 4746 1 69.18 CGGGGAACTCGACTATAGCATTTTCTCTTGTTTTATTGTTTTTTTTCCTATAAATCGACCTACCGTTGTGCAAATATACATATGCTTGCACGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCAGAG:1 - chrX 9543638 3' + INE-1 570 1 58.21 TGAGTCTGATTAACTTGTATTACATTTTTAGAATTTATTTTAGTTTGTTTTGCACATTTTTTGTGTTCGTGGGTACAAAAAATCTCTAATCGTAAAACCAAATAAAAACAGGGCAACTCGTGAAAAGGTGGCCTTAGCTTGTGCGA:1 - chrX 20803591 3' - gypsy2 480 1 51.37 GAGATCTGACGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCAGCGCAAGTTTGGTGACCAATGTTGCCACGCCCACTCTAACCCCCACACTTCTGAACCATTTTT:1 - chr2R 5722312 3' + INE-1 148 1 89.31 CGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCACATATGATGCATGCCATATGCCATTACGTTTGGCGTGGTTTTGCGCTGTGACAAGTGGTTAGATGTTGGGAGA:1 - chr3R 12520724 3' - Burdock 48 2 51.37 ACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAAAACGCTGACCAGAAATGACAAACTTTTTTCACGCATT:1 - chr3L 5028081 3' + gypsy4 323 2 73.97 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGATTGGGCACGATTAAGTGCTCCACCTCGGTGCGATTCATCAGGTTTAGTTCGTCCACAGTGCGCAGGTGCAAGGTGCCCCTCTGCGGTGCTTTCAAAATGTCCACGTTTTT:1 - chr3L 363398 3' - blood 8 2 78.47 GTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATGAAACAACTTTATAAAAGCGCATTTAGCAAACAAAGCCAAAATGACGACAACGACGACGA:1 - chr3R 16290466 3' - roo 8650 1 57.14 ATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACTAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTG:2 + chrX 1018157 3' - 1360 238 1 67.81 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAAGTTGCCAGGCAACAGATTTAATAAAGAAAAAAACAGCAGCCACTTTACTTTAGCATTTCAATTAAAGTTTGCCCATTCTGTGAAACTTAAACCGCAAGCTCTTTAT:1 + chr2R 15075719 3' - mdg1 16 2 74.66 GGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGCGCCCATCACTCGACGCCCAGCCACCCACGCATCCCGTTATC:1 + chr3R 20986118 3' + mdg1 7165 2 71.23 CGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTT:1 + chr3L 27415330 3' - transib2 46 1 54.11 GCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCGCGGCAACGAGTGAGTGACTGCCTTTGTGTTTGTGTGTGTGAGTGTTAAGTGTGTGCATTGCTTTTTACTCCTAGCTAAATA:1 + chr3L 16865449 3' + FB 965 3 53.42 ATATATGTATATATGTATATATGTTTGTATGTACTTGACCTGAAATTGTCTCCCACTCCCAATTATAATACATTTCCATTGTCATCAGTTTGTCGCTTCCCTTATGGACCCTTCTTATATGTATGCCGCCCATTAGTCCCTCCATT:1 + chrX 18048950 3' + G3 4505 1 73.29 ATTTTCAAAATTGTGGGCGTGACGGTTCATTATTCATTAAGATTAGGTTTTTTTTTAATATTTCTACATATTCGCCTATTTAATATAGCAATGGTCAAATCAGGAAATTAAAAAATTTATGTTTTCAAATTATGAAATCATATAAC:2 - chrX 21283263 3' - INE-1 252 1 76.03 ACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTACTCGAAAAATCCCCCAAAACTCACGCACACATACGAACACTTGGTTTCATAGGCAAATTTATTTATTGAAGCATAATTTTC:1 - chrX 7442702 3' + jockey 4672 1 55.48 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAATGGACCGTGAACCGTCGTCGAGTGTGTGCGTATTCACTCTTTGTTTGCAGACTTTTAGGCGTTCGTCGTTGTTTGGCATTTGACTTAATTTAAAGTGCTGGCGACTAAG:1 + chr2R 17332272 3' - jockey 20 1 77.40 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCTAAATGGAAGTTCAGCTTTCAGCTTGCCATTTGGGAAAAGCCACCACTGGCACCACCCCAAGA:1 + chr2R 19852249 3' + Transpac 254 2 57.53 GAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCTACGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACAAAAAGTAACTGAAGTTAAAAAAATAATGAAACGGCAAAAGGTGCTCGTCTTCAATATTATCAGATAGGTAATCGACCACATA:1 + chr3L 25874007 3' + I-element 494 1 70.55 ATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGGATATCCAAAACAAACTTAATGTTGCACATACTACAATTCAACATTTTTTTAATATCCCGCTCCCTTTAACTAAGCTTGATGTTATCGCGATACCTAGTCTTGCAACAC:1 - chr3L 23890098 3' + 1360 304 1 73.29 GGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGTCCC:1 + chr3R 15790070 3' - flea 14 2 71.97 AGAGACTAAACTAGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGGTGTAAACAATTCGCGAAATAAACAGTATCGTAAAACTAAACAAACTTTATTCGGCTATTTACGAGAAGAGATGAAAAATATTACATTACTATTATTA:1 - chrX 13508810 3' + diver2 4769 2 73.97 AAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACACTATTATGTGCTGACATCGAAGGCCATCCCCTTCGCAACTACCGATGATGCAGCTCGAAA:1 + chr3R 5773238 3' + Stalker 7195 4 59.31 AATGTATGTGTGTGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAGGGCAGAAGCTCTTCTATTCTTATAATACATATATACATATCGAATATTTCAAATATGTTGTCTGGCTTTGATTTC:1 + chr3L 16835793 3' + Stalker 292 4 65.52 AGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAAGATACGTATGTATATAAGCGTCGCTGCGCTGCAGGC:1 + chr2R 2308822 3' - McClintock 7 2 48.65 GTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAATTTTTCTCTGTGGCATTTCAAGTGAACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAACTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAA:1 - chr3R 25099124 3' + 1360 391 1 48.97 CAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAAA:1 + chrY 3648903 3' + 17.6 7360 2 65.07 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCAAACGATCGATCGATCCGATCTCTCACTTCCCGAACAACTTGAGTGAAGAAAACAGTCGAA:1 - chr3R 10213024 3' + P-element 2837 1 48.53 ATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAATTTCGAAATTCTATGGTATCCCC:1 - chr3L 4081610 3' - mdg1 130 2 69.18 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCTGTTCATTATAATTAACAGGATTGTATTCCATCCAAATGTGCATGTGCGATATCTATTCGTTGCATACTCGAAGGCGCATCATCGGAGCC:1 - chr2R 22746033 3' - jockey 4768 1 73.77 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATCGTTTCAACAACGAGCGTA:1 + chrX 6633025 3' + P-element 2813 1 33.57 TTTCATATCATATTTATTTTTTATTTAACATATACATAATACACTATCCCGATTTTAATAATTTTCTAAGGGTACAGCATAAAGTTGCCTCGAATTTGGGGTCTACTAGTTTCCGAATCCCTTCGAATTTTTCGTATATCTCATAA:1 - chr3R 11830911 3' - Tc3 1569 1 45.21 GTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATGCAACACTTTGCCCGACTCTCTATGCGCATCTTTATTAATTATGCCAGCGATTTAATTAAAAACTTAACAAGCTGTCGCCT:1 + chr3R 22341285 3' + hopper 1406 2 78.08 CAGAGTTTTCAAACATAAGTGTACAGTTCAACAACGCTCTATCTCGCTTGATACATGCTGGTCCGAACTCACCACAGGACAAGCATTTGTCTCACTCTAACGCATTTTAATAACCCGGCCACATGCCACGAAGCTGGTGCTCCTGC:1 - chr3R 19007844 3' - invader6 275 2 71.23 GGCAAAAAGAAGCGGACCAAGGAGGCTTTCTTGTGGGACACTGCATGTGACTCGGAGAATACAAGATAGAGAATTTTTAAAGAGGACTTGTTGAGTGTGCGATTGCATTTTCTAATTATTGCACATTGTTCGCTTCAATGGTAGTA:1 + chrX 10386724 3' - Q-element 504 2 63.70 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGAACGCGATCTATTCGGGCTTCTTTCCGATGTCAGTAATTCCGATTACTGGCCAGAACGTCAGTGCCACGCGATTCGTGGCAATAACAAATGTGAGACAGCCTACAGG:1 + chr2R 10910356 3' - Tabor 6853 2 71.92 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTAGCACACTTTAAGTTGCCTCATTAGAGTCGAAGTGTTTGTCCAAGGATATGGTACACAGAAAGAAATAT:1 + chr3L 13364400 3' - hobo 37 1 56.15 CACGGGAAACAATTGCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCTTTAAACATAATTTATTATTTAATCTAACTATGTGTTTGCCACAAGGCAAACAACGTTGAACAATCAAGAAACACAGAAA:1 + chr4 237670 3' + baggins 5306 1 60.96 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACACGCCAAACCGAGTATCAAACATGGAAATAGACGCAAAGGGGCGA:1 + chr3R 24564825 3' + opus 435 2 66.67 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGGCTTACACACACAGTCAAACGCCTGAAGCTTGAAAGAGAGTGTTTGCTTGGTGAGAGCGGCAAGCG:1 - chr2R 17097459 3' + P-element 2850 1 53.49 TTATTATTATTGTTATTTTGTTCGTATATACTACAAGGAATTTAGGGGGCCGCAGTGTACAGTTGAGAAATTGCAAACTGAAGCCTTCTTTTATATATAGTATATATCTCTG:1 - chr3R 25804101 3' - mdg1 14 3 61.61 ATTGTTCCTGATCAAGAATATGTGCATTTTATATGGTTGTAAACGCTTCCTATTACCTGTTAAATTCTTTTCAACGAATCTGCGTAACGGCCATACATTGCTCTCTGTCCGCTCGCTTACGCTTACGCATTAATCTATTCGGTTC:1 + chr3L 27269271 3' - INE-1 83 1 56.55 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATCCACAACGCCCACGTTGAATGATCTGTCAGAGGTGCCTCTCTACCGGCTTTAATTACCGTCCCGATTCAGCCACCCATTTTGCTCCGATCTCTGGCGATGCAATGGGCCCAA:1 + chr2L 15278041 3' - mdg1 7047 2 75.34 ATGTAAATATGTGTATATATGCCACCTATGCGATTGCGAGACCCTTCCACACGCCTGTCACTTTTGATAAATTTGACGCTTTTTGTTTGCTGCGACTGAGAATTAAATTTTTATGGATGACGCACGCCCCATTTGCATACCCTGCC:1 + chrX 405792 3' + G3 4509 1 68.49 AATGTCGCTAAGAGCCAAAAGAGCAGTATACGTGGATTGTATAGCCCCAACTGACTTAAAAGACTGGGATTCAGCAAGACGATTCGTTAATCGTCCAGCCCTCCCACACGTTGTGCAAATAAATTCCCCCATGTTATTGTTAGCTG:1 - chr3L 3772410 3' + BS4 522 1 72.60 TGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATGTATGTAGACATATAGTATGGCAAACGCATCAGGATCGGCACCACATGCAACAGGAAA:1 - chr3R 18635206 3' + opus 7472 2 55.75 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATCTCGTAACGAGCAATGTCCAGTAGGATATTTAAACTTTAATGGGGGTTAATTTTTGGCGAAAATAGTTCTCAATTGTTTTGAAAAAGTACCGAAATAAATATAACATT:1 - chr2L 17839326 3' - blood 7024 2 76.71 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCAATTCTAATTCGCCTGGCCAAAGCGAACTCTTGATTGAAGGTCAGCGCAGGAGAAGTTGAAGTCGGCCAGTCCGTCGCAGGCTGCGTACCAACGCTGACTGATTGT:1 - chr3R 16240847 3' + Tirant 8493 2 75.34 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATAGACAGAGACTTGACTCGACGCGGCTAGTCTTGAATGCCGG:1 + chrX 4673687 3' - roo 8733 2 70.29 AGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCAAGCGTAGCCGCATGGACTGATTTTTATCGCAACGCCCAACTGAC:1 + chr2R 17544228 3' + gypsy5 7308 2 61.11 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATATGTGTGTATCATAATTTCCAATCCGTGTAATCATGCCCGTCAAAAAGGGTA:1 + chr2R 18344629 3' - 1360 69 1 64.38 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGTATCAACATATTACGGCATTTATGGTAATTTTATTGGTGCTTTGATTCAACAGCAGCATGAATATTTATA:1 + chr3R 10150252 3' + 1360 3339 1 60.27 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAACACCCTGGCCTGCTCTATTTTGCCGTTTTATGCAAATGAATTGGTTTTC:1 + chr2L 12291933 3' - Tirant 39 2 59.13 ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTGAAATTGAAAATACTAGGTAGTTTGGCAACGCATAGCGATTCGATTAATGGGTTGGTTTCTATAATAAG:1 + chr3R 9583371 3' + Juan 4150 1 58.62 CACGTTGTGTTAGAGTACACTTCTACGAATGAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAATCTTTCAAAGGGCTATTTTTAAGCCATTTATATGAAATTGTATAAATATGTTTCATCCTGGCTTCCATGTGGGATGTTCATTTATAT:1 + chr3L 1699133 3' + 1731 4171 1 49.32 GTTAGAATTTTTTTTTTTAATTTCTTGGTCATATTTGCTTGATGTAAGTCAAATCTTTTTTAAATGAATTATATTCAGGCCAAATAAATTGTTACATTTTAATTTTAAATTTTTACAGTTTATGTCTAAATTATGAATTACTTTGA:2 + chr3R 20689766 3' - gypsy2 431 1 59.59 GGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTTTCTCAAATGCCCTAGGCTAGAAAGGGTATACTGACATAGTACAGGAAGTTCGTAATAAGGGTAGAAAAATGGCCGGATATTATTCATAACTT:1 - chr2L 18630425 3' - G-element 25 1 68.57 GAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGGAAATGCGGATA:1 + chr3L 25232912 3' - GATE 8312 3 62.33 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGAACCGATGGCAATGACCATGATGGAGCTTCCGCCCGTGCAGCAGCAG:1 + chr3L 363538 3' + blood 7336 1 62.70 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGCAATGCAATTTGATGTCTTCATC:1 + chrX 6633007 3' + P-element 2795 1 20.98 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGATTAGACTTGATAGGATGACTTTTCTTTCAAATATCTTTTTAAGTCCTTAAATGTTTTTGTTTTTTAATATTCCATAATTGT:1 + chr2L 15644981 3' - transib2 38 1 59.59 GCACCCGGAAAGTTTTGAAATAATTTATTTATCGTAAATAGAGTGACTTTTAGCTGATCGTGATTTCAGCCGATGGCCTAGATTCCGTATAGTCTAATGAGTTGTTGCCACAGGTTGCAAGTAGCAAGTAGCCAG:1 + chr2R 24317264 3' + Gypsy12A_LTR 154 1 68.15 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCCCTTTGCTTTTAATAAACAATTTTTCGCTGTTTGATTT:1 + chr2R 18014107 3' - Doc 89 1 72.60 GTGAGGGTAGATACACTACAACTAAAATAAATGGTAAAAAGTCACAGATTATAATCAAAAAAGTGTACTGATTATTGTATCAAATAGTACGTGGTCAATACGACAACATGCTATTTTCTCAGTGCAGATTGCTGAGCAACTGCTCC:2 + chr3R 12744800 3' - Stalker2 7247 1 72.60 ATAATAATAATAATAATAATAATGGCTGCCCTGATTCGGTCTTGTGGTTGGTGGCGTTTTGTAAATGATGACGCAGCTCGATGGCGTTATAATTAAGGTTCAAAGCGCCATCATATGAACGCGTCCAAAAAAACA:1 - chr3R 6943350 3' + mdg1 7076 8 75.56 CAAACAAAAAGCAAACTATAAAGCAGATATGGTCCTTGCCGTATCCCCAGCTTAAAAGGACATTCCTGGATGCAGTCGCCACCATCCACCATGCCCTGGTAGCCTTCACGAATGAAGTAGACCTTGC:1 - chr2R 10112612 3' + TAHRE 226 1 51.18 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAATTTTAGTAACAAATGCTAACCCTGCGCTTTTCATTTAAGCCAGGCTTTCATGCATTACATTTCATTTTCATTTTTCTTAGTCGCTGATTGTTTGT:1 + chr3R 11870210 3' + pogo 2077 1 69.18 TAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCACAGATTTTACCCCTTTCCCTCTTGGTCCCTCAATCCAAATGTTA:1 + chr2L 14204884 3' + 17.6 7294 2 69.66 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATTTAGCGAGCACTGTGT:1 - chr3R 25050028 3' + P-element 2787 1 17.12 ACCTGAGATTTCGACGTTCATATGCCCTTTGCATACTTCTCTTTTACATCCCAGAAGCGTCTTCTTACCTTAATTAATCAAATCTTTTGTTTTCTTATCCCTATCTATTGATTACACTTGCCTCTAAGGTTATCCTAAGCTTATTA:1 - chr3L 21362932 3' - INE-1 138 1 71.92 GAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACACAACATTTTCAATTACCATTTTGGGTGAATCGGCCAAGACCTCACCCCGTCTTTCTCAACACTCGACCCCCAAAATTGGACCAAGTTTAGCTACGAAATTGAGACATGTTGTTT:1 + chr3L 12962446 3' + hobo 3 1 79.45 GTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGCGGGTGGATTCTGCTTCTGAGCCAAGAAATACACGACAACAATAACAAAAAT:1 + chr2R 13367014 3' - jockey 4841 1 67.81 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCGTCGTCAGGTGTCCATATCTTTTGTGCCACAGTACA:1 - chr2R 1747118 3' - Transpac 4974 2 68.07 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACGCAGATGCTCGTACAATAACTCATTTCATTGATCAAATAAACATTTGCTAC:1 - chr3L 3453607 3' - Tirant 8176 2 64.38 AATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCTAAAC:1 - chr3R 8042303 3' - BS 52 1 55.63 CTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCTGAGTAGACTGAGTAGATTGTGCAATTTGGCAAAGTATTCCCCGGTGCACCGTTCCACTCTTTGGGCGGGCCCAAGTTGATGTCTCTGTCTCCCGATTT:1 + chr3L 4920928 3' - jockey 4667 1 72.41 GTTTACACATTTATATTTTTGTTTAATTCTAATTTGTCTGCACGTGGAGCAGCAATGCACAATGTCCATCGGTCCAGGGCAGTCAGCTGGACAATTTTTTTTCAGTTGTGGTATCACCTTTGGAGACTGTTTTATTATTTATTTTT:1 + chr2R 3170104 3' - 1360 2961 1 75.34 AAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCGAAGCAAACAAAGTGAAAACAAGAATAAAAAAAAGCTAAACCAACGGTTAAAACAATTAGATAAAATTGGAAACTGTCGGTCTTCGTGATTAAACTAATCATTTTAGCACGGGCAAAG:1 - chr3L 26367175 3' + gypsy4 331 2 56.85 ATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCGTTGGCAATTATATTCCCACTTTTTAGCCCGTTCTAAGCTATTGAGCTCGTGCGTGACTGCCGTTGCCATTG:1 - chr3R 6254892 3' - S-element 64 1 50.68 GAACAAGAAATTTTTAGTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCTAAAGTGCGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACGTATTTACTGATCTGAGCAACTTTCACTTTAAACGCCTGAAC:1 - chr3L 4325997 3' + Tc1 128 1 78.77 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATATAAGGTCTTTTTAATTAACCAACTTATTCGAAATACATCGATTACATTCCAATATACAGCATATATTATGTTATAATTTGCAATAACCTGTATTTTCGAACCAAAACGTGTA:1 - chr2R 18344483 3' + 1360 3380 2 70.55 ACCGGAGATTGTTTGCCTGCACCGCCCACTTCGCCTGACTCTGGTGAAATTCAACGCGGCAACAGCGCAGGCACCGTTATTCCTGTCGTCGAGTCGGCGTATGAGCAATCTGAATTTCTTCTTG:1 - chr2R 19636333 3' + Chimpo 240 1 78.23 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAATTCAATTAATTGATAGAAAATATAACTAAGGGCCTATGTTGCTTTTTAATTTAAGTTGTTGTTTTTATTTA:1 - chr3R 8140836 3' - pogo 46 1 53.42 CATAAAAATTTCTTATCATTATCGTAAGGGTAATAGGCAACCAAAGTTGGCCAGTAAGTCGGGGGCGTTAGTGGGAGTGGGCGAAGTGGTAAAAGATGTTGTCCAATTGCCGACTCTGCAATTTAGAGTCCAAAGTTTA:1 - chr3L 27190402 3' - TART-C 10772 1 67.63 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTAATTTGTTATCCTCGCTTGTTTAACGCAGCTATAAATTATGATGCCAAAGTTTTTGGCCACTCAACGAGCGGGA:1 + chr2L 20515305 3' - I-element 45 1 54.79 GGAAGTCAGCGTTGCAGGCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATATCTTCTTATTAATGTTTATATTTACTTGCCTTATCTTGCATTCGCGTCTATTTTTATTAATGAATATATACGTATATATATTT:1 - chr2R 17014651 3' + flea 135 2 61.64 ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAGTAGAAGTGCAAATAGTTACCCGGCCTAATTATAAATACATTTTTTGTGGGTGTCTCCTTTGCGTTTGTTATATACTTTTAACTAGTTTA:1 - chrX 8967351 3' - HMS-Beagle2 28 2 66.44 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCCTAGAGATGGTCCGCCCATCGAAGGCGTTCGTTCTACACACACACACACACACACATCGC:1 - chr2R 19076525 3' + hopper 1355 1 66.21 TTTTAAATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCATTTACATAATTATTATTATCTGAGTAAGAGGGAATAATTTGTAATCACTATTATTCGTAAACAATGATGATTGAAGAATTGAAGAAACAATGACAGGCAGATA:1 + chr3R 10153018 3' - 1360 3003 1 64.38 AATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGTGCGTGTGTGTGTGTCTGTGTATGCTATTCGTGTGCCCCTCCGCAATTCTGATTGTTTGTATGTGAGA:1 + chr2L 4420606 3' + gypsy5 366 2 49.63 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAAAACTATAAGTCCATTCGTGTGGATTGCTGCGGTGACATTAAGTTGAACTT:1 + chr2R 14973691 3' - FB 46 1 56.91 AGCTAAACACTGTAAATACCTAATTGGGTACGATTTTCGTTTTCTTTTTTATTGCCGGGTTTGAATTGTCGTTGTTCTGAGAATCTGAGGAGGTTGACATGGCTTCAGCAGCAGCTAAGCTAATTACCTCCGCAAATTCCTTTCAT:1 + chrX 20144652 3' + Juan 4142 1 79.45 ACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTACGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAAGGCCCCAAGTCCTTTCAACAATATGTCTGCTGGCATCTCGTTCGTTGGGATGTAGTT:1 + chr2R 3118476 3' + Bica 4575 1 58.99 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTAAAAATTCTGTTATTGCTGTCGAACACACATTAAAATTAGACTAAAATAAACCCAAAGCAACTTTTAAATTGTACAATTGTTGTTC:1 - chr2L 15644829 3' + transib2 2791 1 63.01 ACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAGTCATTGGTTAAAGGAAAATATTAAATTTACATAAAGAAAGTAAAACTAACAAAACCT:1 - chr3R 8042307 3' - BS 60 1 59.59 CTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGGCCTCGCGGTGTGCTGTCCGCTCTGCAACTAGGTCGCTCAAT:1 - chr2L 22319222 3' - Transpac 4937 2 70.55 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATTTAATTGCGGATGTTGTGTACAACTACAAAAAACTGAAGTAAAAGACTTTAAAGTTAA:1 + chr3L 18382044 3' - copia 4932 2 62.33 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTATTTATTTTGCAGGCATTAAGATATAATTGCCGTTTGCTTTTTGGCTTAATGACTGTTGGCTTGGATATTAACTGGCCTTTGTACGATAGATTCGGCATTCGGC:1 + chr3R 21674957 3' + roo 392 2 69.86 AATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGTGTGAGGGCATTAATCGTGTCAGCGAGGTCTGCACCACGCACTTGTAGTCGCCGGTGGTGGCGATCGTGGGGTTGATCAAAGCCAGCGAG:1 - chr2R 23888190 3' + micropia 278 2 52.59 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCAGAGAAAGATAGTTTTCCAATCGTTTTTCACGTCAGTCATGATGTTACTTGCACTTGTGAAAGGTCATCCTCATGCACATACATAGGTGGCA:1 - chr3L 18484340 3' + hopper 1388 1 67.81 GTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAATAATTTTCATATTGTTAAATACATCTTCTACTAAGTTTCTGTTCTTAAATTAGACGTTATT:1 - chr3R 16818913 3' + Ivk 5314 1 60.27 GAGGTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGCCAGTGGAACGAGTGACAGAGGCACCTAAATTAA:1 + chr2R 23179944 3' - accord2 7365 1 67.62 AAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAGAGAGTTAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAATAAAACACAATTTAGAGGAAAAACTGTTTACAGTTGTAATTAAATTCACAAT:1 + chrX 9896714 3' - Cr1a 316 1 69.18 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGGAGTTGTAATTC:1 - chr3R 14277894 3' - P-element 37 1 44.44 TAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCACGCACACACTGCACCACACAATTACAGACGGCGTTTTGAAAGGACGAGCTGGAAAAGCTTGCGTCTGAATTGAGAAAAAAACATAAAAGGAC:1 - chr2L 4420468 3' - gypsy5 14 2 72.87 GCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCAT:1 + chr3R 13349583 3' - Ivk 63 1 57.93 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCTTCAGCCTGTATATGTATGTGTATTTGCTTTGTAC:1 - chr3L 22339414 3' - hopper 72 1 70.15 CAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGACTAATCGTATGGCGTGATTACAGCCAAAGCTTAATTTTTAATCTTATGATCTGATTTATATACTAATGATGCGGTAATGAGCAT:1 + chr3L 27140537 3' + 3S18 143 2 63.45 TGTGATCCGCCTCGAAGGACCAAAGCCTTTCGAAGAAGCTCTAGCCAAGATCGGAGGAGCATTTTTAAAGGAGTGTAGAAAGAAGTGGACTCACGAGGCACCAATAAACTGTTATTATTTTGTACATTTCACTTGAACAATTTCTG:1 + chr2L 2938842 3' - GATE 276 1 69.86 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAATACTATGTATATATGTACATCACACGTATATACAATATTTTATACATATACAAGTATTAAGCATAGTCAGTTATTTTAATTCAAGAAAATGTTTTAGAGATACACATATGTATAT:1 - chr3L 18386743 3' + 1360 3383 2 70.55 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACGTTTTTGATTATCTTAAAAAATTGTAATCACACGTA:1 + chrX 2295291 3' - Transpac 4929 2 67.12 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATATGAGCATATGTACATATGTACATATATGAGCATATGTATGTACATAAGTCATATGTAAGTACATACGTTTTTGA:1 + chrX 2295263 3' - Transpac 38 2 45.89 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATAGCTATATATATATAGTTATATATATCTATCAAATTGCATTTAAGTTTATATTACAATATAGCTCAAAGCTACTATT:1 + chr2L 16562170 3' + opus 458 2 54.79 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACGAACACACTGCCATACAACGGCGAAGAACCAAAACGCAGATACTCCCACTGTCAAAACCACAGGAGAGACCAACAATTAAGCAATAAAACATC:1 + chr3L 381313 3' - 1360 29 1 41.78 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACGGAGCCGAAAAGAAAACTCTTTTGGGGCATTTTCTGCTTCGTAGCAAAGTGAAG:1 - chr3L 486694 3' - roo 37 2 56.94 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAAAAACAAAAGAAAAGTGAAATCTGGCACGGAGCCGAAAAGAAAACTCTTTT:1 - chr3L 486725 3' - roo 8704 2 59.48 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACACACACCCTGTGAATTCAGGCGGCTCTCTCGGCGCGG:1 + chr3R 18399264 3' - P-element 39 1 39.39 GCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAACATTTGAATCTATTCAAAATAAGCATTTGATTTCGATTATAAGAAACATAGGCTATTTAATTAACAATATATTGAC:1 + chr2L 16456871 3' + BS 5050 1 51.37 AATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACGTTTAGATACATTTATATCTAGTTATGGAGTGGGGGAGGGGGGGAATATTCTATCGA:1 - chr3R 25714016 3' + flea 4955 2 58.90 TAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTACATTCAGTGGGCGACAACTAGATAGTAGAACATCCTGAACAATGTCTGCATAATACTTGATCTATGATAAACGGT:1 + chr3R 18400682 3' + P-element 2607 1 55.48 AAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGTTGTTTCCCGTGGGGCTACATACTTGCCCAGGAGTCTATTCCTTCTGATGGAAGTGAAAGTGAAAACGTGACAACACGATAAAACG:1 - chr2L 20917079 3' - baggins 5362 1 77.40 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCCTGTTTCGTTCTGGAGTGGTATTTTCTAATTCATTTAAATGTTGCTAATATTTAAGGAATTTTTAAAATACTAAT:1 - chr3L 8658702 3' + roo 9026 1 49.32 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGAAAAAGCACAAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAATATTTCGCAGCTCCCATGGAAAATCGTAAAAAGTCAT:1 - chr3R 6015097 3' + Juan 4135 1 69.18 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCCCATCAGTCACGTAACCAAAACGGAATCAAATCCGAGCTATCAAAATTTCTTGGAGTTCATTGGACTGTACGGC:1 - chr2R 15070060 3' + 412 445 2 52.05 GATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTTATGGGCAAGTAGTCGTACGCGTTGTGGTTTCTTTAACGGCGTAGCGTGCATGGAATTGGTTTCAATGAGTT:1 - chr2R 16920123 3' - jockey 4621 1 46.67 TAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTCAATGACACCCAGGTAAAACACCGTGGCGTGTTGATATAATTGTGGTAGGATGAATACGCAAGAGGCCCACTCTACCACACACACA:1 - chr3L 24007244 3' + baggins 5043 1 53.96 CCACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTAATATTGATTTATTGATAAACTATATCCTAATTTTTCAATATTTTTCAATACTATTTTTGACATTTACACTCAATGTGCTCCAGAAACGACACCTTTAGGATTTGCTCGAAACATTTT:1 + chrX 15836128 3' + INE-1 574 1 49.32 AGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTACTCGAATCCTCTGTGTTCCTTCCCGTCAACATGGAAATTATATTCTTAATT:1 - chr2R 12202843 3' - Tirant 311 2 68.66 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTATGAAGCCAACGAAGTGGAAATTACCTTGTAAAATTTAAAAAAATCAAAATCAATATG:1 - chr3L 2320612 3' - roo 63 2 61.64 CATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATATTTTGACATGCGCATCAGCTAGTCGGAAAAACTTAACAACAAATCGACCGCCAAGTGAAATTAAAGTTGATGAG:1 + chr3L 14004004 3' + hopper 1059 2 50.69 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACAAGAGTTGGGAGATTTTGGGGCGAGAGTTGGTGCAAAATTGATGGCAAGTGCTTACGGATAAAAAGGTAAACCAGGCATACTCTTTG:1 - chr3L 19031201 3' + roo 394 1 71.77 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTACTAAACAAATGTTTCAACATTGAGCTTCGGC:1 + chrX 21403463 3' - roo 8752 2 79.45 CTGGAGTTAACCAGCAAGAGAAGGTTACCATCCCGAAGATTAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGCCACAGAAATTACGGAAGACAAAAACATTTTCCATTTTTTTTTGGGT:1 + chrX 3025558 3' - Ivk 460 1 67.81 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTAATACGGTAACTCCAGGAAAACAGCAAAACGGCAAGCTGCGATCAGTTTTGATTCTT:1 - chr2L 8984858 3' - pogo 42 1 56.25 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCCACCGAAAATCAATTGTAACTTTTTATTTTGATGAATTGATTTTAAATTGGACGGATTTCGATAAGAGAGGATTCAATTTTAAACTTTTTATTTCCT:1 - chrX 388194 3' - 1360 21 1 71.92 GACTGGTGAAACACATATTACAGGCTTTTGACGACTGCGAGTACTCCAACGCTGTCTTTATAGATATGCAACAAGCCTTTGCATTGAAGCCAACATCCTCCAGGTAGTAGGCCAAATCGTGATCGTAGTTCAGGGAACCGTGCACG:1 - chr3L 12130030 3' + Helena 335 1 55.48 TCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAAATTCCCATTTTCCCTTCCACTAGCTGAGTAACGTGTATCTGATAGTCGAGGCACTCGACTATAGCATTCTATAATATCATGTTTTTTCTACCATTTT:1 + chr2R 5504458 3' + INE-1 501 1 69.05 ATGATCCGTATTTAAACTAGGATCAACTCCGAAATAAATTAAACACTATTAAATTCGGTTTTGGTTTTTATTAAATTGATTTATGCCAGAATAATTTTTCATTTGCCTGTATTGGATAATTATTCTGGTCTGATATGCTCTTTTCT:1 - chr2L 171954 3' - McClintock 381 2 52.05 CATCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTGGGCATGGCATGGGGGGCAGGATCAGTGGCGAGGCCCGAGGTACACTTTTAGGAGGAGGAGACGACGACAACGGTTTGTTTTAATTT:1 - chr2R 22154349 3' - HMS-Beagle2 6827 1 60.96 GATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCATTTGTATATTGATTTCTGTTTGAGAGGAGTTCTTATGCCCCCAAGTTTCCGCCAAGCGCTTCGTTTATTTTATAAATT:1 + chr3R 24454891 3' - F-element 275 1 53.42 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGGCTTTGACGTCGTTGTTTTTCCCCTGCTCGTCATGTTTTGTGTGCTGTATAGATATAGATATGGATATATAGTATGCCTTTGCCATTTCGCCGTTCTCTGCCATTTG:1 - chr2R 15528404 3' - 1360 13 1 76.03 GTGTGTGTGTGTGTGTGTAGCTCGAATAATAACAATAACTATCTTTTATATCTGCTTAACAGCACAACACACTCCAAAAAGCTTACATAATAATACAATAACAACAAAGGCCGAGCCGCCAAGGATAAAAGGCAAATGA:1 - chrX 4530549 3' - accord 254 2 58.99 AGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAAAGTAACTGTGCAAACGCTGCAGCTGCAAATCCGCAATCAGACAAAGCAAATAATTTTGCAAAAATAAATATGAGGGATTATTGT:1 - chr2R 13367420 3' - jockey 4584 1 63.70 TACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGTTGTGGCTTAAATGTGGCTAACTGCAGCATGGATATTAGGGTCCGAAGTTTACATTATGTGAATTATCCT:1 - 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Helena 450 1 63.01 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTTGGCGCAAAATCAAATGGGTTTAATCGCGGTGGCTCTTAAATCCTCCTTACCTGCTATTTATACTCTTCTGTCGTCTGG:1 - chr3R 11870046 3' - pogo 38 1 58.22 GATCCTGATCAAGAATGTATATATGTTTATATGTATAGTATACCCTATTAATTTACGAGTAACGGGTATAACAATCCGAGTCGAAATCATAATTTTTATAAAATAAGTTTAATTCCTGATTCGCAACATAGACTTTAGATTTTAGT:1 - chrX 15903121 3' - INE-1 80 1 71.92 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTATCAGTTACACCTGGGACTTGGGGCTTCTATAGGGGCTACCATGGCGGTGGACAGTGGGATT:1 - chr2L 3231861 3' - roo 52 2 56.43 TTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAATGTGCGTTTAAAATTAGCTAAGGACGTAACTGAGAACTGAGATGCACTCAGC:1 + chr3R 12933076 3' + jockey 4883 1 67.81 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTATGTATATAGATACATATGTATGTATGTGCAACATAAAAAAAGATGCATTCGTATATTACATTATTTCACTGCCAATTGTTTTTCCCGGCCAGAAACGCCG:1 - chr2R 11095700 3' - diver 5910 2 69.18 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCCCCTTTGCTTTTAATAAACAATTTTTCGCTGTTTGATTTCGTTTGCTCTTT:1 + chr2R 18014119 3' - 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